isoform	chrom	strand	length	exons	structural_category	associated_gene	associated_transcript	ref_length	ref_exons	diff_to_TSS	diff_to_TTS	diff_to_gene_TSS	diff_to_gene_TTS	subcategory	RTS_stage	all_canonical	min_sample_cov	min_cov	min_cov_pos	sd_cov	FL	n_indels	n_indels_junc	bite	iso_exp	gene_exp	ratio_exp	FSM_class	coding	ORF_length	CDS_length	CDS_start	CDS_end	CDS_genomic_start	CDS_genomic_end	predicted_NMD	perc_A_downstream_TTS	seq_A_downstream_TTS	dist_to_cage_peak	within_cage_peak	pos_cage_peak	dist_to_polya_site	within_polya_site	polyA_motif	polyA_dist	ORF_seq	TSS_genomic_coord	TTS_genomic_coord	experiment_id	entry_id	LRGASP_id
3	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_1571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
7	contig_4364_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_2530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCAGCTCTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
96	contig_4364_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCACACCTCGGCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
103	contig_8538_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_5070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842836	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
106	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
110	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842784	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
113	contig_8538_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_5072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842838	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
165	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
170	contig_8538_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_4858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842775	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
174	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
176	contig_16496_pilon	-	1454	3	Intergenic	novelGene_5146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1221_1301_1354_3413
177	contig_16496_pilon	-	1486	3	Intergenic	novelGene_5147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	389	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_386_434_1354_3413
179	contig_6062_pilon	+	6209	19	Intergenic	novelGene_5267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	330.246059592758	756	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	904	3576	662655	766005	FALSE	30	TATAAGGTAATTGAGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGIVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIVYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIYAYTHNLVYPKHFIMAPNPDDMEEDP	660773	768638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245_744299_748666_748740_752906_753014_758768_758931_759167_759267_761712_761981_764681_764768_765831
192	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
209	contig_10958_pilon	+	2234	5	Intergenic	novelGene_5395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	27	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	97	420	888255	895286	TRUE	50	ATCTAAAACTAGGGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVPLRVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSN	888158	901703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893916_895279_895855_900457
300	SIRV2	-	391	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4482	34	3307	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
301	contig_8538_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_5075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842841	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
344	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	489	51	489	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
416	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
568	contig_11285_pilon	-	1994	12	Intergenic	novelGene_5639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	477	1214	769622	768472	TRUE	20	GGTCCAGGCAGCAGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSTWANGQQPQAPVERRQHV	770186	766159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_766191_766305_766442_766551_766637_767063_767176_767265_767402_767722_767836_768024_768147_768426_768531_768612_768855_769083_769320_769421_769649_769736
628	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
662	SIRV5	+	452	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	878	-11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
995	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1138	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	881	-36	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1200	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	268	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1536	contig_8538_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_4749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842757	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
1634	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1659	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	876	4	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1709	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1748	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1752	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1885	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1911	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
1992	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
2010	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
2044	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
2251	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7483	-4	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
2373	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
2710	SIRV6	+	508	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGAAGTTGTTCAACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721
2944	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3027	SIRV5	+	288	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3044	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-121	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8194	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3101	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
3298	SIRV5	+	239	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	278	151	164	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8479	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
3307	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3385	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	877	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3427	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3434	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
3539	SIRV5	+	285	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	45	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8360	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4311	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4423	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4565	SIRV5	+	452	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4680	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4684	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4703	SIRV5	+	286	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4744	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
4906	SIRV5	+	396	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2064_2270_2316_3298_3405_3483
4954	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
4964	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5053	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
5094	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5156	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5162	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5266	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5293	SIRV5	-	328	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTTCTCAATGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
5316	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5375	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5440	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	877	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5475	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	553	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5517	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5611	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5680	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5779	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5846	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
5970	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6026	SIRV5	+	286	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	41	878	41	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8356	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6042	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6098	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6102	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6114	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6295	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6376	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6417	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6425	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6428	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6459	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6467	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6482	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
6520	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	878	5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6638	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	875	51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6669	contig_12622_pilon	+	1707	9	Intergenic	novelGene_5918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1197	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCGGGAGGAAGAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583547	1589010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585708_1586269_1586406_1586527_1586838_1587626_1587784_1587863_1588042_1588434_1588608_1588834
6911	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6940	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6973	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6991	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
6995	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7052	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7143	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7193	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	876	-35	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7204	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7297	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7364	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7669	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	878	-8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7739	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7742	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7769	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7786	SIRV5	+	281	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	880	44	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7797	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7845	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
7940	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
7947	SIRV5	-	476	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGACTACAGTAAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
7957	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8059	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8070	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8154	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
8206	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8229	SIRV5	+	325	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	878	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8441	SIRV5	+	424	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	886	9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8496	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
8535	SIRV5	+	372	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7589	1	-196	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
8665	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8759	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8768	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
8788	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8799	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
8848	SIRV5	-	462	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCACCTTCACGGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
8964	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9125	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9298	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9323	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9456	SIRV5	+	374	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	-56	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8376_8460_8586_10858
9516	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9520	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9558	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9667	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3294_3405_3483
9705	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9715	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9724	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9760	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9909	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9932	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
9959	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10036	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10209	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10217	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10238	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10261	SIRV5	-	325	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCTCAATGTATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
10279	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10311	SIRV5	+	448	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	115	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10350	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10396	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10520	SIRV5	+	427	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8371_8454_8586_10858
10571	SIRV5	+	501	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7381	1	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCCACGCCGACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
10622	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10632	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	877	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10747	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10778	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10797	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10842	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
10861	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10884	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	877	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
10963	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11059	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11203	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
11283	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11397	SIRV5	+	288	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11440	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11557	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11591	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2163_2279_2316_3298_3405_3483
11707	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11718	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
11764	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	880	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11886	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
11996	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12017	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	41	877	41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8356	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12032	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12070	contig_12357_pilon	+	3722	11	Intergenic	novelGene_6088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	576.87638190517	14	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	117	1520	26079	51388	TRUE	55	AGAATAGAAGAAATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVSLCKLKGDICWQEKIVQLCGGTPKRKSDISVLLESPWVGQTVKCLATN	25962	53916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_52844_53169
12092	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12119	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12143	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
12172	SIRV5	+	258	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	256	154	142	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8457	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
12192	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12307	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12315	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
12327	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12482	SIRV5	+	422	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	886	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12489	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12525	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	878	33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12529	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12551	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	880	4	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12631	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12683	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12744	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12774	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
12898	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	878	5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12930	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
12964	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
12977	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13146	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13181	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13189	SIRV5	-	458	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTCCACCTTCACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
13274	SIRV5	+	286	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13358	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13511	SIRV5	-	366	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8482_8590_10863
13529	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13560	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13666	SIRV5	-	414	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8598_10877
13766	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	880	-37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13848	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13882	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
13930	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	877	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	124	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14011	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
14014	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
14058	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14082	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14216	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14361	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14432	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14495	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	882	7	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14579	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	332	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14626	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	876	-56	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14688	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14855	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	880	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14912	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14919	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14940	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
14983	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	878	-52	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
14993	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15047	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
15054	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	135	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15160	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
15189	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15214	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	876	-9	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15258	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15273	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15294	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
15313	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	880	-35	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15396	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	882	-7	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15404	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15488	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15501	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15633	SIRV5	+	448	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15665	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15677	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15695	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15720	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	876	-35	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15734	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	880	47	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15799	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	876	5	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15954	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15957	SIRV5	+	447	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-117	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8198	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
15999	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
16020	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16081	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16094	SIRV5	+	442	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7434	-4	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTATGACACTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
16252	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	882	-55	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16264	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16379	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	222	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16400	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16420	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	289	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16445	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7474	-5	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
16506	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	886	3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16518	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	876	6	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16526	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16622	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
16929	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16933	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	880	-7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
16986	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
17152	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17183	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17311	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	877	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17332	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17355	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-67	264	-67	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
17379	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	878	-35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17512	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17513	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
17645	SIRV5	+	290	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	37	878	37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17688	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17691	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17785	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	174	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17822	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17883	SIRV5	+	441	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7441	1	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
17929	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17963	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
17993	SIRV5	+	325	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	887	-7	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18030	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18074	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18268	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18298	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	876	-34	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18333	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18433	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18493	SIRV5	-	441	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTCCTGCCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
18504	SIRV5	+	379	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
18522	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18526	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18542	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	880	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18575	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18705	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18793	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18799	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18817	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	887	11	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18843	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
18937	SIRV5	+	203	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5324	4098	-1821	3295	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCAAGTAACAACGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6380	6893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
19039	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7469	-5	-76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
19127	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19244	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19275	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19302	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19312	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19428	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19462	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19656	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19755	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19809	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19907	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	878	5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19935	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
19957	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	878	-33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20066	SIRV5	-	409	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1121	1163	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGCTTCGGTCCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3527	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1144_1981_2067_2270_2316_3298_3403_3481
20102	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20117	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
20120	SIRV5	+	426	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
20208	SIRV5	+	264	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	152	138	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
20218	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20314	SIRV5	+	483	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-153	875	-39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8162	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20369	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	39	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20387	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	876	2	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20409	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20437	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20446	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	879	57	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGTTTACCGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20469	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	878	-54	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20489	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	884	57	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20674	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20719	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20757	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
20758	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
20760	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21035	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21135	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
21188	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21223	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
21268	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
21359	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
21512	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21528	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21621	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
21692	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	876	-30	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21751	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21840	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
21852	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
21872	SIRV5	+	391	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7486	-5	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
22008	SIRV5	+	395	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-65	875	49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8250	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22049	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22109	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22159	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	878	13	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22196	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
22217	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22264	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22305	SIRV5	+	282	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	48	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22324	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22375	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22393	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
22486	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22540	SIRV5	+	359	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
22546	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	880	3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22575	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7471	-5	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
22607	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22636	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22749	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22760	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	878	-56	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22779	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22787	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2267_2316_3298_3405_3483
22845	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22885	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
22904	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22925	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22940	SIRV5	+	262	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	255	151	141	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8456	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
22968	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
22979	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23039	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23081	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
23112	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
23136	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23182	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
23192	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23209	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
23230	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23256	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23448	SIRV5	-	396	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAATTTACGGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
23461	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	886	8	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23633	SIRV5	-	252	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTTAAGTTCTTCCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
23715	SIRV5	+	201	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5324	4100	-1821	3293	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGCAAGTAACAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6380	6891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
23722	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23725	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	880	5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23753	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23851	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
23873	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23916	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23953	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
23966	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24010	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24080	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
24116	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	5	7471	5	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
24204	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24225	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
24249	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
24328	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24338	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24346	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
24371	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24376	SIRV5	-	286	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAACGTGTACCTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
24417	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24446	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24524	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24537	SIRV5	+	395	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-65	875	49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8250	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24582	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24790	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	880	-51	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24831	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
24931	SIRV5	+	290	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	38	877	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8353	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
24979	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25015	SIRV5	-	304	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGTTACCAAAGTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
25077	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25107	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25132	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25152	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25167	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-73	876	41	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25214	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3402_3483
25229	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	880	-51	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25337	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	884	-8	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25407	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25471	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25498	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25517	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25561	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25581	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25591	SIRV5	+	357	4	NNC	SIRV5A	novel	2085	17	NA	NA	-1823	3631	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGGAAGCGCGACGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6378	7229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_6453_6658_6723_6823_6958_7144
25638	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25644	SIRV5	+	391	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7491	1	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25674	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	878	55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25725	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25755	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25786	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7489	1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25794	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25843	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
25906	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
25984	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26012	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26059	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26120	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26123	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	880	-9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26186	SIRV5	+	282	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	48	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26204	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26215	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26329	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26342	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26389	SIRV5	+	437	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
26424	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	909	-35	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26482	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26503	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7484	-5	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26511	SIRV5	+	371	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-199	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
26540	SIRV5	+	426	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	886	7	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26565	SIRV5	+	427	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8460_8586_10858
26589	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7484	-5	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26599	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26624	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2030_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26770	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26849	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26856	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	875	-46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26875	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
26959	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
26981	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27017	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27035	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27101	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	886	8	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27133	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27213	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27313	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27324	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	876	-56	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27330	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	878	47	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27333	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27349	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-116	878	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8199	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27426	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27600	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7488	1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
27611	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	157	138	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
27616	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27634	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
27668	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27671	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27858	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	880	-53	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
27880	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
27888	SIRV5	-	419	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACTTCGCACGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
28254	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	880	54	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28300	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28333	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
28345	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28394	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCGTAAGCACTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
28401	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	878	52	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28445	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
28448	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28604	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28608	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28653	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28716	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28878	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	875	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
28890	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
28984	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29035	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29051	SIRV5	+	471	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-38	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8376_8454_8586_10858
29180	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	887	-36	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29191	SIRV5	+	396	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
29194	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29216	SIRV5	+	364	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	899	56	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGACGTCCTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29252	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29255	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29350	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29401	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29543	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	890	11	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29637	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	876	42	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29656	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	886	-36	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29742	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	3	7472	3	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
29866	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
29952	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	877	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29956	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
29985	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30064	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30089	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	876	-1	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30113	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30121	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30180	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30219	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTCCTGCCAGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
30266	SIRV5	+	382	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-56	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
30280	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30286	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30330	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	878	-51	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30341	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30363	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
30420	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
30464	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30481	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	878	-50	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30515	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30536	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
30545	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30568	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30593	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30669	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30690	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30780	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	880	-1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30810	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	880	6	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30828	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30851	SIRV5	-	391	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1094	1163	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGCTTCGGTCCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3500	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2315_3292_3403_3481
30867	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30927	SIRV5	+	235	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	282	151	168	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8483	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
30965	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-116	878	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8199	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30976	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	880	-32	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
30994	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31006	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31013	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	880	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31030	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
31060	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31199	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31228	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	902	9	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31260	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31280	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	878	-27	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31368	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
31413	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	887	-36	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31507	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	880	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31516	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-121	882	-7	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8194	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31582	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
31585	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-97	877	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8218	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31775	SIRV5	+	395	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	51	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8452_8586_10858
31925	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
31979	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32003	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	40	878	40	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8355	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32100	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32136	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	115	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32144	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32199	SIRV5	+	450	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7432	1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATGACACTTTCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
32252	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32266	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32284	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32317	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32349	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
32357	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	880	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32370	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32374	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	882	57	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32437	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	878	-6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32449	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	876	-24	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32502	SIRV5	+	379	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7478	6	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
32550	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	880	-2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32561	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32616	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	881	2	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32642	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
32751	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32779	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32783	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32856	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
32902	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32938	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	880	-56	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
32980	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
33000	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	878	-56	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33108	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33130	SIRV5	-	448	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTCTCCACCTTCACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8385_8457_8590_10863
33155	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	880	10	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33182	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33416	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33425	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2116_2157_2270_2316_3298_3405_3483
33473	SIRV5	-	383	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
33487	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	875	52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33601	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33623	SIRV5	+	447	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	876	-4	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33644	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	877	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33648	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33673	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	882	8	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33818	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33884	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33893	SIRV5	-	431	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGACCTAGAGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
33980	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	876	-32	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
33999	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34045	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34053	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34057	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34065	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	893	-35	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34094	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	880	55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34111	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34155	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34185	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34230	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34261	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	878	-55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34271	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
34423	SIRV5	+	422	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	886	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34513	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
34656	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	43	875	43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8358	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34679	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	880	-33	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34749	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34753	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	878	10	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34817	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
34854	SIRV5	+	374	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	11	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35069	SIRV5	+	442	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8451_8586_10858
35168	SIRV5	+	390	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7486	-4	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35231	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35383	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35413	SIRV5	+	391	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	55	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8596_10866
35423	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	886	3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35427	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35433	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35440	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	880	-43	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35463	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35473	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35481	SIRV5	+	253	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	264	151	150	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8465	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
35537	SIRV5	-	285	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAACGTGTACCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
35574	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2116_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35590	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	880	-56	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35602	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35655	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35686	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35759	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	878	55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35818	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
35890	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35941	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
35999	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
36064	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
36150	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	880	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36208	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36241	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36297	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36322	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36345	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36444	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36505	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36551	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36559	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36662	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	880	-55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36680	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36712	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	886	-37	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36733	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	886	-3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36771	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	882	36	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36811	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	880	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36829	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	880	-33	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36843	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
36878	SIRV5	-	375	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298
37069	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	6	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8321	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37091	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37124	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7477	1	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37141	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	878	-27	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37219	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37284	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37296	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37473	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37494	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37527	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37668	SIRV5	+	290	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	920	-5	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCCATGTCGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37710	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37731	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37738	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	39	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37791	SIRV5	+	239	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	278	151	164	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8479	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
37884	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37920	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37933	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
37934	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
37990	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38083	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38175	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38200	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38206	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38326	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
38367	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	886	-29	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38384	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-65	878	49	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8250	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38514	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	880	5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38538	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	880	3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38669	SIRV5	+	362	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	894	-51	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38727	SIRV5	+	204	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5323	4098	-1822	3295	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCAAGTAACAACGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6379	6893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
38785	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	880	-50	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38852	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7612	1	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCGCCAACAGCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
38878	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38885	SIRV5	+	293	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	37	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38899	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	878	-49	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38939	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
38994	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39016	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39034	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	15	875	15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39040	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39081	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	878	-8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39116	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39161	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	875	18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39273	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	887	-50	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39302	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
39332	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39340	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39361	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39389	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39424	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39459	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39503	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
39517	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39577	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
39597	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39638	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39642	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39645	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39681	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
39821	SIRV5	+	401	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
39906	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7481	-4	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
39977	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
39986	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40019	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40033	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	875	-45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40096	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
40124	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
40144	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40197	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	878	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40315	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40337	SIRV5	-	404	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1107	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3513	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
40340	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40376	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
40396	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	875	29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40412	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40443	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTCCACCTTCACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
40485	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40681	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40759	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40803	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
40813	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	876	-55	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40820	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40842	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
40910	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
40936	SIRV5	+	385	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7476	2	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
40943	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41057	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	874	4	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCGCCAAAAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41070	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41076	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
41100	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41132	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
41172	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	878	-35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41208	SIRV5	+	382	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	27	7474	7	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
41260	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
41286	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41319	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41334	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2151_2270_2316_3298_3405_3483
41438	SIRV5	+	367	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
41443	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41447	SIRV5	-	433	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10872
41503	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7470	-5	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
41539	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	886	-1	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41575	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
41608	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41612	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	878	-35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41689	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41707	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7470	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
41752	SIRV5	-	441	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
41766	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	876	11	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41888	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41907	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41911	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	880	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41917	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
41959	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	878	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42024	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	875	12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42041	SIRV5	+	286	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42067	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42091	contig_16496_pilon	-	1479	3	Intergenic	novelGene_5150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2	331	3594	1149	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYIIFVVV	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1168_1223_1354_3413
42133	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42137	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42155	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42175	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	880	55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42195	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42223	SIRV5	-	436	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
42260	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42272	SIRV5	+	466	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42289	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42326	SIRV5	+	447	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7442	2	-49	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTAACATAACTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42350	SIRV5	+	279	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	40	886	40	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8355	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42368	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7482	-4	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42409	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42418	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42432	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42453	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42461	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	880	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42465	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7472	1	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42473	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42502	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42514	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42527	SIRV5	+	361	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	41	7481	-7	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42607	SIRV5	+	426	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	887	6	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42638	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42688	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42697	SIRV5	+	289	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	39	877	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42809	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42845	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42851	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42917	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
42968	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
42997	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	887	11	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43109	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7472	-1	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43142	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43163	SIRV5	+	390	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43229	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	878	-56	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43306	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43326	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43336	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	880	-52	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43340	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	875	-45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43360	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43381	SIRV5	-	364	4	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2043_2253_2316_3298
43404	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43411	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	878	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43465	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43471	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43494	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43512	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43527	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	884	-56	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43658	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43673	SIRV5	+	376	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
43729	SIRV5	+	400	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2058_2270_2316_3298_3405_3483
43781	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43933	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
43979	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
43998	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44009	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44016	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	882	-38	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44022	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44033	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-127	875	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8188	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44133	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
44139	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	877	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44155	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
44301	SIRV5	+	391	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-4	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
44362	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	880	-37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44366	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44387	SIRV5	+	288	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44488	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
44498	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
44553	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44587	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
44649	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44816	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
44847	SIRV5	-	417	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGTTCTCCACCTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10952	8188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
44867	SIRV5	+	346	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-44	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8469_8573_10858
44892	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	878	-49	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
44931	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45038	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45108	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45125	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45135	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45159	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45172	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7474	-5	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45230	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	878	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45251	SIRV5	+	442	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7440	1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45285	SIRV5	+	484	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-36	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8450_8586_10858
45299	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	882	6	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45338	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	886	4	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45407	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45499	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
45506	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45538	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45570	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
45600	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	878	-34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45629	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45658	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45686	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	875	52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45723	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45823	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45827	SIRV5	+	397	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	875	47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45858	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	878	-48	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45881	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45896	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45900	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	875	-46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
45934	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
46046	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	880	-37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46060	SIRV5	-	377	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAAGCACTTTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	8267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8450_8590_10863
46090	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46096	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46108	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46165	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46270	SIRV5	+	286	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46321	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-42	875	-42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8273	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46357	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7477	1	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
46371	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46379	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46420	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46573	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
46585	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2039_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
46594	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	878	-55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46648	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	882	-35	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46784	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46843	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46846	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	878	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46850	SIRV5	+	368	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
46872	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46877	SIRV5	-	441	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGATGTCCTGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
46894	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	878	4	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46904	SIRV5	+	466	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
46923	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
47023	contig_16496_pilon	-	1389	2	Intergenic	novelGene_5123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	551	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3449	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
47060	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47080	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	878	56	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47098	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47121	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	876	-35	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47156	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47181	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47201	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7474	-5	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
47208	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	878	-51	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47212	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47228	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47276	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47291	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
47390	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	876	4	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47417	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	886	2	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47461	SIRV5	+	290	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	40	875	40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8355	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47469	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
47472	SIRV5	+	393	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2279_2316_3298_3405_3483
47479	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47515	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47528	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	875	51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47670	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47690	SIRV5	+	375	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-202	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTGGTCCCACCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
47697	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
47722	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47759	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	893	-24	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47828	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
47941	SIRV5	+	380	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-12	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2273_2316_3298_3405_3483
47957	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48000	contig_12357_pilon	+	3734	11	Intergenic	novelGene_6119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	576.87638190517	20	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	116	1519	26079	51388	TRUE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVSLCKLKGDICWQEKIVQLCGGTPKRKSDISVLLESPWVGQTVKCLATN	25963	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_52844_53169
48004	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48033	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48045	SIRV5	-	422	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1123	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3529	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2035_2118_2157_2270_2316_3298_3403_3481
48057	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48069	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48129	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48156	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
48167	SIRV5	+	274	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	8670	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
48173	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48208	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48277	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	878	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48281	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48282	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48289	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48290	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48310	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48338	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48450	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48472	SIRV5	+	369	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-45	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8460_8586_10858
48483	SIRV5	+	387	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7490	-5	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48489	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-140	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8175	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48526	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48538	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48545	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	882	-1	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48574	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48606	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48612	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48625	SIRV5	+	475	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8456_8586_10858
48650	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	886	-11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48653	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48743	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	878	-34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48802	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48875	SIRV5	-	417	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1120	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3526	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1144_1981_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
48883	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3480
48902	SIRV5	+	386	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2121_2157_2270_2316_3298_3405_3483
48976	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	878	-55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
48991	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49001	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7474	-5	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49014	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49015	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49169	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49288	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	878	10	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49295	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49308	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	877	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49330	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49378	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	878	-33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49452	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	886	57	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49459	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49491	SIRV5	+	453	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49599	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	878	-29	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49658	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49789	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49811	SIRV5	+	400	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
49828	SIRV5	+	358	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7592	1	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
49852	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49873	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49874	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
49885	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
49888	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	880	23	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50024	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	909	-29	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50080	SIRV5	+	191	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	320	157	206	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8521	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
50095	SIRV5	+	417	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	893	9	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50108	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	882	-18	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50124	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
50144	SIRV5	+	402	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
50159	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50181	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50280	SIRV5	+	364	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7597	1	-204	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTATTTGGTCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
50310	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	878	-35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50342	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	900	6	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50359	contig_11338_pilon	+	4084	15	Intergenic	novelGene_6169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_6	450.513952534848	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	446	2224	6086	11749	FALSE	30	AGCTGAATTTAACCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRVGDVPGQGCRNGRCPQRQLRPHWLLPLQALRPSESSM	745	13609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539
50394	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50397	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50419	SIRV5	-	305	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACAGATTTCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
50434	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	880	-37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50460	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
50482	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCTGCAATCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
50528	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50604	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50613	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50638	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
50671	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
50741	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	875	52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50751	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50816	SIRV5	+	417	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	893	9	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50817	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
50894	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
50915	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51041	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51231	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	911	4	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51292	SIRV5	+	378	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2123_2157_2270_2316_3298
51298	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51356	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7474	-5	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51404	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51424	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51482	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51571	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	880	-1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51580	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51618	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51636	SIRV5	+	437	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8397_8469_8586_10858
51654	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	878	23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51697	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51730	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51739	SIRV5	+	481	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-34	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8451_8586_10858
51789	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51811	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	900	8	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51833	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51841	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51850	SIRV5	+	199	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5328	4098	-1817	3295	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCAAGTAACAACGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6384	6893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
51893	SIRV5	+	183	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	329	156	215	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8530	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
51910	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51935	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51949	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
51952	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
51978	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52057	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52058	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTCCTGCCAGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
52071	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52082	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52123	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52155	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52163	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52231	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52244	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52255	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52335	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7484	-4	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52348	SIRV5	-	430	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1144	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3550	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1151_2085_2157_2270_2316_3298_3403_3481
52521	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52540	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	880	-56	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52561	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	878	11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52656	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52683	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	878	11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52710	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	878	-50	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52721	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52736	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	900	-8	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52747	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52756	SIRV5	+	471	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-35	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10866
52830	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	319	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52831	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2040_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
52967	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	893	-23	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
52974	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCGTAAGCACTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
52993	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53049	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53065	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53087	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53130	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53148	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53190	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53211	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	876	-28	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53265	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53310	SIRV5	+	299	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	911	-5	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53335	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53374	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	882	-11	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53429	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	878	-34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53484	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53514	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53531	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53550	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53597	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53608	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53663	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53713	SIRV5	+	395	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-68	878	46	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8247	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53867	SIRV5	-	334	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCAATCTCTCTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10967	8287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
53970	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
53981	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
53999	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	875	16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54037	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54081	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54093	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54168	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	278	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54219	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54231	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	880	-3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54372	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54444	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54513	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	876	-11	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54542	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	876	-35	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	466	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54632	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
54702	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	909	-50	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54715	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	878	-9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54735	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	878	-16	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54775	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54830	SIRV5	+	384	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2115_2157_2270_2316_3298_3405_3483
54869	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54887	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54920	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	878	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54939	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
54960	SIRV5	+	393	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298_3405_3483
54985	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	881	2	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
54992	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	878	-51	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55013	SIRV5	+	427	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTGTAGAAAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55057	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55104	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	880	-21	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55115	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55138	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55145	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
55158	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1142_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55172	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55248	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55274	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55279	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55350	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
55360	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55374	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7484	-4	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55383	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55421	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
55438	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55466	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55467	SIRV5	+	376	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	31	7476	11	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55568	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55573	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	887	-28	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55576	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55637	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55688	SIRV5	+	443	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-4	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTATGACACTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55697	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-99	875	15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8216	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55734	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55752	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55801	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
55827	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55892	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	880	-31	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
55983	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56001	SIRV5	+	381	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-196	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
56010	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	875	12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56018	SIRV5	-	329	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTCTCAATGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
56052	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	880	-6	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56068	SIRV5	+	391	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7486	-5	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
56092	SIRV5	-	481	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
56136	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56189	SIRV5	+	441	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7441	1	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
56207	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56252	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	882	4	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56258	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56346	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	894	52	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56428	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56432	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56449	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
56528	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56539	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56596	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56630	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
56658	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56674	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56715	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
56741	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	876	-29	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56793	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7484	-5	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
56823	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56875	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	882	-37	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
56987	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57038	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57092	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7473	-2	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57221	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57232	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7484	-4	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57237	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57285	SIRV5	-	478	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTACAGTAAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
57340	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	880	-51	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57388	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57402	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57422	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57436	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57488	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57548	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57555	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	880	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57562	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57574	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7471	-5	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57586	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
57607	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	880	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57651	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57671	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57710	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	882	-25	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57754	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	880	-3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57809	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57844	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	880	55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57887	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
57915	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	878	8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58020	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58052	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
58073	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	880	-29	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58132	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58155	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3400_3478
58176	SIRV5	+	389	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7477	-2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58195	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58208	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	878	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58225	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58228	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	878	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58304	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58324	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58337	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58366	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58382	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58402	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58474	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58489	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58530	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58534	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58582	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	920	8	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCCATGTCGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58602	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	886	57	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58616	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58700	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58722	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58758	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58766	SIRV5	+	264	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	253	151	139	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8454	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
58770	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58779	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7489	-1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58783	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1980_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
58815	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58825	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58884	SIRV5	+	422	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	886	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
58924	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59022	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59032	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59041	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59052	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59102	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	886	-54	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59195	SIRV5	+	392	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-53	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8445_8586_10858
59217	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59220	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59266	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59301	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTATTTGACCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
59311	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7464	2	-71	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59384	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59432	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59510	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59604	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59635	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59644	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	878	-3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59645	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7482	-2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
59726	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59731	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	886	-30	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59749	SIRV5	-	316	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTACATATACAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
59872	SIRV5	+	374	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7587	1	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
59967	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	880	-35	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59980	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	880	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
59999	SIRV5	-	480	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACAGTAAGGACTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
60003	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60016	SIRV5	-	335	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
60098	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60158	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7445	2	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATCTAACATAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60165	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	882	53	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60193	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60210	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
60270	SIRV5	+	427	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-97	875	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8218	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60312	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60364	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2273_2316_3298_3405_3483
60388	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60392	SIRV5	+	375	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2069_2270_2316_3298
60438	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60478	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60496	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	34	880	34	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8349	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60530	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	875	29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60584	SIRV5	+	372	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
60587	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60590	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60648	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60660	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60716	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60751	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60780	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60784	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60812	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	875	31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60834	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
60870	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60937	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60944	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60971	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
60975	SIRV5	-	440	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGCCAGTTCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
61030	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61032	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61094	SIRV5	+	283	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	40	882	40	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8355	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61121	SIRV5	+	397	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	875	47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61192	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	875	56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61213	SIRV5	+	443	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7433	-4	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61237	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61268	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	878	-56	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61275	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7484	-5	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61308	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61312	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	878	55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61343	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	876	2	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61361	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61367	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61412	SIRV5	+	458	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-128	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8187	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61436	SIRV5	-	359	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1102	1157	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCAGTATGCTTCGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3508	1020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2052_2280_2316_3298_3403_3481
61489	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61525	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61531	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61571	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	887	1	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61630	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
61645	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61680	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61717	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	875	16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61718	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61729	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61762	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	878	55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61819	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61833	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61843	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
61866	SIRV5	+	387	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	18	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
61949	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62012	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
62040	SIRV5	+	237	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	280	151	166	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8481	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
62119	SIRV5	-	388	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10858
62157	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	886	8	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62164	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	882	-33	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62167	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62175	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7427	1	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACTTTCGGTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
62198	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62219	SIRV5	-	377	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAAGCACTTTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
62248	contig_4364_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_1085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
62302	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62311	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
62407	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	875	53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62411	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62445	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62456	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62484	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62575	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	877	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62599	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	880	55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62737	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62746	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
62762	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62784	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
62801	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	207	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62805	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	0	7482	0	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
62866	SIRV5	+	446	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-116	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8199	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62890	SIRV5	+	452	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	886	-19	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62901	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	882	-9	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62956	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
62971	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
62995	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	880	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63019	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63057	SIRV5	+	302	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGGGTGCAATGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298
63080	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63103	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63114	SIRV5	+	369	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	893	57	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63167	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63211	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63262	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63263	SIRV5	+	441	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7441	1	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63301	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63311	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63314	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63331	SIRV5	+	426	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	886	7	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63332	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63341	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63355	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63381	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63449	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	878	-35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63461	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63476	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
63555	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7487	1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63562	SIRV5	+	452	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAATCTAACATAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2112_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63581	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63630	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	880	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63662	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63702	SIRV5	+	379	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-48	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
63708	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63713	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63768	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63771	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63819	SIRV5	+	254	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	909	42	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63827	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63942	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	878	-55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63959	SIRV5	+	369	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7586	-4	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
63968	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63977	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
63983	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
63995	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64098	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7469	-5	-76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64121	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64128	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64155	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64203	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
64240	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7478	-5	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64246	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64277	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	880	5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64310	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7471	-5	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64317	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64321	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64463	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64468	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64519	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64557	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64586	SIRV5	-	403	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGCACACTTCGCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10979	8229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
64628	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64657	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64665	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7474	-2	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64692	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	878	-31	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64726	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64765	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64773	SIRV5	-	434	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
64793	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	876	0	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64818	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64836	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64862	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64865	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64877	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	964	7	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACACTGAAGGGAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64892	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
64915	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	878	-9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
64976	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	875	-46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65006	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
65021	SIRV5	+	255	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	3372	-35	-2495	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTTACTTCAAAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	8494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
65025	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65033	SIRV5	+	282	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	48	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65071	SIRV5	+	282	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	48	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65121	SIRV5	+	427	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	887	5	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65165	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65184	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
65247	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
65279	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65287	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65348	SIRV5	-	378	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1100	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3506	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2052_2270_2316_3298_3403_3481
65376	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
65414	SIRV5	+	284	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	46	875	46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8361	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65577	SIRV5	+	441	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7443	-1	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65586	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7488	-1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65619	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65679	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7485	-1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65695	SIRV5	+	388	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65717	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
65758	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
65780	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7490	1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
65819	SIRV5	+	347	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7614	1	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGCGCCAACAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
65966	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	878	47	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
66025	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
66038	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
66154	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
66163	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
66232	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
66351	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
66355	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	880	-53	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
66372	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
66396	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7472	-5	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
66474	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
66573	SIRV5	+	346	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7615	1	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATAGCGCCAACAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
66642	SIRV5	+	222	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	284	162	170	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8485	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
66732	SIRV5	+	353	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7608	1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
66831	SIRV5	+	448	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGGTAAATTCACCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67051	SIRV5	+	257	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-5	8680	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCGTATCGCGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
67112	SIRV5	+	173	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	332	163	218	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8533	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
67255	SIRV5	+	249	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-5	8688	-5	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGAAGGTCGCCGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
67420	SIRV5	+	424	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7416	-5	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTCACCACCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67421	contig_10674_pilon	-	4481	10	Intergenic	novelGene_6449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_9	673.270459110684	2239	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	229	1287	355630	305906	FALSE	55	AAGAAAAAAACGTTTCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKSTTGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTLTEEKVSLDPELEEALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTQFCNIVGSSNGVDQKQFSNVVKGEKILPVFDEPPNPTNVEESLKRMKENDARLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKYFSLAATRSNDPVAVAFADMLRVNRTLKSLNVESNFITGAGILALLDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ	395364	302711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_305941_313927_314073_315665_315810_318345_318454_320217_320349_326400_326491_327662_327786_353817_353975_355504_355707_395212
67424	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	20	7450	0	-57	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAAACAATCTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028	3541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67425	SIRV5	+	303	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	3	7656	3	-263	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGTTTCGGGTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
67426	contig_9363_pilon	+	4577	30	Intergenic	novelGene_6569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	17	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2964	3320	765954	773635	TRUE	55	CCAGGAAGGGCAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLPQENSLTLPLGPPPGQGADRHLAPPALLIVMGGPDEDQVGVAIYVHVHGAEGGPKVGADLAPLDNTIGLPGSSILFEHHHHTSMLISRCPQKQTLYPISQDDFGSITQVSIIHV	753393	787920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_754505_755014_755120_755356_755465_755551_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757119_757203_758065_758146_758713_758844_758930_759075_759297_759373_759533_759664_759759_759921_761690_761850_761942_762081_765794_766002_766093_766235_773175_773317_773608_773741_773893_773970_774894_775043_776035_776192_776977_777124_777528_777664_780573_780688_780835_780908_781246_781354_786543_786648_787826
67427	SIRV5	-	310	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-935	1169	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGTCCTGGACTGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3341	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2165_2280_2316_3298
67431	contig_16121_pilon	+	4690	5	Intergenic	novelGene_6858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	595	junction_1	263.684470532491	1702	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	115	1521	57746	62826	FALSE	15	CTTTCTAGTTCTGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	65995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
67432	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCAGCAACGCGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532877	1533263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67440	SIRV5	+	470	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7412	1	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCACCACCTTTACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67442	SIRV5	+	303	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	3	7656	3	-263	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGTTTCGGGTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
67448	contig_16496_pilon	-	1486	3	Intergenic	novelGene_5153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_840_888_1354_3413
67449	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	887	-20	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67452	SIRV5	+	337	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	3280	-25	-2403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
67460	SIRV5	+	338	5	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	965	6	936	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGTCGTAAGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992	3592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67461	SIRV5	+	371	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7469	-5	-76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67465	contig_4797_pilon	-	3728	5	Intergenic	novelGene_6929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	383	junction_4	602.8749352063	5783	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	141	686	671697	658501	FALSE	30	AACTCTAGCCACTGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	671837	655458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_658729_659533_659644_661289_661351_665223_665308_671634
67466	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7431	-5	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67471	SIRV5	+	425	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7457	1	-64	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTGTAGAAAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67472	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
67473	SIRV5	+	248	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	168	138	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCCTCGTAGTATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
67474	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532887	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67476	SIRV5	+	481	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	164	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGGTCAAGCCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2039_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67478	SIRV5	+	400	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	914	5	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCGGAGACCTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67479	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7444	-5	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67483	SIRV5	+	292	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-94	3280	20	-2403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8221	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
67486	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	884	57	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67488	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	914	-30	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCGGAGACCTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67491	contig_12150_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_6972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTATCACCACTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177213	176666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_176700_177200
67493	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67494	SIRV5	+	446	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	3	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGGTCAAGCCACGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059	3603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67497	contig_18272_pilon	+	4016	3	Intergenic	novelGene_7083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_1	2675	4676	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	121	510	535645	538332	FALSE	15	AATGATGTGGGTTTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSWTGNGFSPGVETGKGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	535524	541838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_535700_537077_537197_538116
67504	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	883	-20	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTATAGGTTTACCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67505	SIRV5	+	423	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7448	1	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACAATCTAACATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67509	SIRV7	-	1829	3	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	104845	11	71660	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCAAGCGTAATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43078	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028
67511	contig_5023_pilon	+	2720	14	Intergenic	novelGene_7346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1726.14142666587	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	165	1505	611764	646990	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	609637	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_609725_611686_611820_614402_614458_616496_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647643_647738
67514	SIRV5	+	266	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	959	-20	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAAGGGAACGGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67515	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7444	-5	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67519	SIRV5	+	472	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	3	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTTACCAGGGTCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3483
67521	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	59	7440	11	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67525	SIRV5	+	382	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	22	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67527	contig_4364_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_1071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTTTTCTACTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533200
67528	SIRV5	+	458	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-3	7428	-3	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACTTTCGGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	3563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67529	contig_10990_pilon	+	4580	2	Intergenic	novelGene_7447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	1172	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	980	2943	1365	4307	710426	713368	FALSE	50	AAAAATAGTGCAGCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICTLNVPVSSLSPGRRCSTLTGTGILGCVPTNSNTDEEDVVEAKMVAEGVDKEAKLPARKKRKKGLRIKGKRRRKKLLLAKKFSKDLVAGRPIADAPALLASSATEQDEENLFESNIEKQIYLPSTRAKTSIVWHFFHVDPQYTWRAICNLCEKSVSRGKPGSHLGTSTLQRHLQARHSPHWTRANKFGVTSGEEDFTLDVPLSPSSPGSNGSFEYIPTDPLDGNRMGKKLHKSASYALRAERGRFLIKSNIVKHALIPGTRAKTSAVWNFFYTDPQHISRAVCNICKRSVSRGRPGSHLGTSTLQRHLQATHPIHWAVANKDNGAVGNGLDEAETERNDVLSDPLRGEKSTGSQDLTAEDLSDSDSDEPPVLEVENRRSESPAPIAEQDSVMNAQEGERTYCENSVSSQISQAIIQMIVEDMHPYNYFATPAFQRFMQIVAPNYRLPSETYFFTKAVPQLYDWVREKIFLTLENVQSQKIHLTVDIWTNDPFTNYFIVTVHWVSLETVPSNNGRIPNFRKWAVLCVTGLAKDCLITNILQELNDQIGLWLSPNFLIPSFIVSDNSSSVVHAIKDGGFTHVPCFLHCLNIVIQDFFCEHKSIENMLVAARKTCHHFSHSVKARQILQEFQNDRQLPWKNLKQDETGHWISTFYMLRWLLEHCYSVHHSLGRASGVVLTSLQWTLMTHVCDILKPFEETTQKVSVKTTGLNQVLPLIRHLLLSLQKLREDFQVRGITQALNLVDSLSLKLETDSLLSAMLKSKPCILATLLDPCFKNSLEDFFPQGADLETYKQILAEEVCNYMESSPEVCRVATSEAAGPSATGGADSFTSSIKEGTSSSGPIDSSAADNIAIGSKSFMFPSAIAVVDEYFKEKYSEISGGDDPLIYWQRKVSIWPALTQVAIQYLSCPMCSWQSECIFTTNSHFHPKQIMSLDFDNIEQLMFLKMNLKNVNYDYSTLVLSWDPENEVVQSSEKEILS	708543	713641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189
67532	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	2	7471	2	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67535	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	958	13	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGGGAACGGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67536	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	884	24	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67538	SIRV5	+	235	4	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	954	199	925	-199	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298
67540	SIRV5	+	440	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	31	7412	11	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCACCACCTTTACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67542	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7458	1	-65	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67550	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67555	SIRV5	+	460	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-5	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCACGCCGACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67557	contig_17440_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_7663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCATATTAGCCTGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3583	3975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
67559	contig_10324_pilon	+	3808	24	Intergenic	novelGene_7725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	1214.82801882073	362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	850	2421	69577	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51827	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_57251_57429_57928_58047_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
67564	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	908	30	-31	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACCTCAGTGGTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67565	SIRV5	+	380	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	36	7467	-12	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGGTCGTTCTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	3524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67566	contig_10958_pilon	+	1908	4	Intergenic	novelGene_5448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACCGCTTGATTGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888251	901582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889033_895279_895855_900457
67567	SIRV5	+	416	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	4	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
67569	SIRV7	-	1837	3	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	144021	44	110841	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGATGAAATAGAGCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809
67572	contig_5727_pilon	+	3803	22	Intergenic	novelGene_7943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	693	junction_13	842.057998875011	3032	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	937	3042	173359	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168146	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
67574	SIRV5	+	398	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-163	970	-49	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAAAGAACACACTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8152	10896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67575	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67576	contig_6069_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_8029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTATCTCACAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178952	179403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_179000_179400
67577	SIRV5	+	340	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	61	7482	13	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67588	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGATGTCCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10907	8201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
67590	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAAATAAAGTGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67593	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATAAAGTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67600	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAAGTGCTGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67605	SIRV5	+	438	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	6	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAAGTGGTCAAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3280_3405_3483
67607	SIRV5	+	448	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	-45	-31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACCTCAGTGGTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8156	10958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8391_8471_8586_10858
67610	contig_11338_pilon	+	3998	16	Intergenic	novelGene_6167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_6	446.334025391547	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	446	2140	6086	11749	FALSE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	745	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
67611	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
67612	SIRV5	+	438	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	14	7431	3	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67613	SIRV5	+	265	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	896	44	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGACGTCCTCGTAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67614	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	877	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67615	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	924	16	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGGTGTCCATGTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67617	SIRV5	+	417	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	54	7412	6	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	15	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCACCACCTTTACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062	3579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67622	SIRV5	+	312	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	3280	0	-2403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
67626	SIRV2	-	413	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4488	6	3313	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTGACATCCCAACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
67628	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	31	7440	11	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67630	contig_4364_pilon	-	406	3	Intergenic	novelGene_235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCGCGGCCTCCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531297	1530442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
67631	SIRV2	-	313	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1300
67636	contig_16496_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_5117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1300
67637	SIRV5	+	378	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	22	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67638	SIRV5	+	486	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-217	936	-103	-59	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGTCCGGGACTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8098	10930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67639	SIRV5	+	301	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-103	3280	11	-2403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8212	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
67640	SIRV2	-	427	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	41	-320	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
67644	contig_13021_pilon	+	3502	13	Intergenic	novelGene_8133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2493.0695312205	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	172	1392	174676	178735	TRUE	45	CATGGCCTTCCAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174504	181118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440_180478_180520
67651	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	936	57	-59	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGTCCGGGACTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67652	SIRV2	+	466	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	131	-74	-131	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGACTCTAATACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
67653	contig_4180_pilon	+	3386	6	Intergenic	novelGene_8352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1177.34436763421	2254	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	45	701	865772	888134	FALSE	30	AAACTTTTTCTGTCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865727	890819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
67654	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67655	SIRV5	+	454	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	0	7437	0	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67658	contig_10958_pilon	+	2032	4	Intergenic	novelGene_5400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCTAAAACTAGGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888186	901702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_888972_895279_895855_900457
67660	contig_15063_pilon	+	1218	4	Intergenic	novelGene_14334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	258	1079	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34904	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
67661	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-231	961	-117	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTGAAGGGAACGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8084	10905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67665	SIRV5	+	455	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	35	7393	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTAAGTGGTCAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043	3598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67668	contig_4364_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532873	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67669	contig_4364_pilon	+	412	3	Intergenic	novelGene_421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	77	412	1530895	1531309	FALSE	45	AAGGCCAACAGGGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530448	1531309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
67670	SIRV5	+	476	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	3	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1127_1937_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67672	SIRV5	+	430	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1139_1973_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
67675	SIRV5	+	338	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-3	-237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCCACATTTAGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	3361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2118_2157_2270_2316_3298
67676	SIRV5	+	345	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	86	7452	38	-59	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67677	contig_233_pilon	-	2855	16	Intergenic	novelGene_14626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1352.95463667075	752	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	1086	2420	101691	78579	FALSE	15	TCCTAGAAGCTGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127048	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101749_104174_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
67681	contig_3956_pilon	+	3055	16	Intergenic	novelGene_15042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	14	junction_15	1084.00927835308	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	81	2657	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290492_1290617
67682	contig_13633_pilon	+	4072	13	Intergenic	novelGene_15305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_2	378.217190322645	2039	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	55	1455	20259	49142	FALSE	10	TACATTTCCTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLAGDPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5024	51759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
67684	contig_4426_pilon	-	4172	8	Intergenic	novelGene_15338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	514.181933973268	23	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	69	656	171430	10019	TRUE	35	TATTATTATACTGGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRARRRPGPEDAEPWLRPSPEQMMAIRELKVCLLGDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERFHSLAPMYYRGSAAAVIVYDITKQDSFHTLKKWVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	171498	6413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_9835_9923_10117_25070_25181_71325_71433_72710_72783_97613_97696_110145_110226_171391
67688	SIRV5	+	427	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	3	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCGTAAGTGGTCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059	3596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3297_3394_3483
67691	SIRV5	+	462	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7399	2	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGTCGTAAGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67693	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_2870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGGTGTGTTAAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67696	contig_4364_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATATCATCCCTCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
67699	SIRV5	+	390	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	8	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
67700	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_2935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67701	contig_16496_pilon	-	1471	3	Intergenic	novelGene_5156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_990_1053_1354_3413
67702	SIRV2	-	246	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3487	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1200
67710	SIRV2	+	347	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	13	163	13	-163	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCTATAAATACCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
67711	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_1400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67718	SIRV5	+	340	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-219	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCGCCAACAGCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
67722	contig_4364_pilon	+	437	3	Intergenic	novelGene_560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	75	437	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530450	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
67724	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67725	contig_4364_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_2453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCAGCAACGCGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67726	SIRV5	+	436	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7437	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67728	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-162	951	-48	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTGTAGGTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8153	10915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67729	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	913	16	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCGGAGACCTCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67733	SIRV5	+	201	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	313	154	199	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8514	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
67734	contig_5419_pilon	+	3791	10	Intergenic	novelGene_15499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	499.8206591949	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	294	1502	243802	249830	FALSE	30	TGACATCACAGACTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238855	252119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240675_241836_241949_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
67741	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67742	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_4076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
67751	SIRV2	-	347	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4439	121	3264	-86	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCGATGCGGCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
67752	contig_4114_pilon	+	4728	6	Intergenic	novelGene_15583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	567	junction_1	227.069504777722	2907	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	219	869	218346	249670	FALSE	50	AATAACTGATTAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFSSRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRQAVMLPEGEDLNEWIAVNTVDFFNQINMLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDSVMQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLGSKDR	218127	253529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_218360_222874_223042_232345_232440_234095_234230_247835_248000_249592
67755	SIRV5	+	399	4	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5333	3706	-1812	3687	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAGCGGATGTTACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6389	7285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826_6958_7144
67758	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_3052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATGTGCGAACATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533200
67762	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGAACATTAGGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532945	1533251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67763	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACAAATTTTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532875	1533222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533200
67769	SIRV5	+	463	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7377	-5	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACGCCGACCACTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67770	SIRV5	+	277	3	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	1243	-11	1214	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCACGCCGACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270	3609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2316_3298_3405_3483
67774	contig_4180_pilon	+	3171	6	Intergenic	novelGene_8344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1898.343656981	61	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	187	534	882886	888134	TRUE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865710	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888640_888690
67775	contig_8538_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_4632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGTAAATAAGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828114	828429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_828100_828400
67784	contig_16496_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_5157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
67787	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67788	SIRV2	-	587	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4123	86	2944	-86	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCGATGCGGCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	1121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
67793	SIRV5	+	345	5	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	965	-1	936	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAAGTGGTCAAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992	3599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67794	contig_4364_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_1399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCGGCGGTGTGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67796	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67801	SIRV2	+	484	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-676	270	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACCATTTGGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3357	4727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3374_3664_3828_3967_4095_4340_4478_4686
67803	SIRV5	+	388	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2310_3292_3405_3483
67804	SIRV2	-	276	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3457	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1300
67807	contig_6062_pilon	+	5867	19	Intergenic	novelGene_5261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_10	328.82261438106	667	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	764	3436	662655	766005	FALSE	20	TCACCATCTACTTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGIVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIVYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIYAYTHNLVYPKHFIMAPNPDDMEEDP	652589	768436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_652698_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245_744299_748666_748740_752906_753014_758768_758931_759167_759267_761712_761981_764681_764768_765831
67810	SIRV5	-	491	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCCACCTCCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
67813	SIRV2	-	347	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4439	121	3264	-86	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCGATGCGGCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
67816	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_2698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCAACTCTGAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532955	1533207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533200
67820	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	33	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGTCGTAAGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67826	SIRV5	+	400	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	914	5	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCGGAGACCTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67832	contig_5023_pilon	+	2617	12	Intergenic	novelGene_7287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2448.7137794266	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	67	1335	607279	646923	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGNWLLKMLGQICHFHGPKNWSTSVCPSRRPG	580862	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625874_646857_647643_647738
67834	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7431	-5	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67836	SIRV2	-	555	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3846	275	2667	-275	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTCAACAGTGCAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2065	1310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973
67839	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_2767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532988	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67840	SIRV2	-	455	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	23	-310	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACAGTGGTTGTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5872	3975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
67842	contig_4364_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_2515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67844	SIRV2	-	326	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1836	2313	661	330	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTCCTAGCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
67846	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
67847	contig_16496_pilon	-	1534	2	Intergenic	novelGene_5144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	310	327	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3594	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
67850	contig_4364_pilon	+	418	3	Intergenic	novelGene_678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	64	417	1530895	1531327	FALSE	15	TGACCCAGGTGACTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREK	1530461	1531328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
67852	SIRV5	+	438	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7433	1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67854	SIRV2	-	246	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3487	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1200
67855	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532887	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67857	SIRV5	+	396	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-9	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTCACCACCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	3575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_3280_3405_3483
67858	contig_3956_pilon	+	2995	15	Intergenic	novelGene_15147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1490.21945548641	24	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	1654	2832	1287290	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281627	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1284004_1284072_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286721_1287161_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289794_1290594
67862	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532887	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67864	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	906	-36	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCTCAGTGGTGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67865	contig_4364_pilon	+	412	3	Intergenic	novelGene_422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	77	412	1530895	1531309	FALSE	45	AAGGCCAACAGGGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530448	1531309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
67866	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
67869	SIRV2	-	345	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4480	82	3305	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCGTAATTGTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1427	1082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
67880	SIRV5	+	429	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-231	3280	-117	-2403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8084	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
67883	SIRV2	-	447	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4420	40	3245	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
67888	SIRV2	-	415	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4410	82	3235	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCGTAATTGTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497	1082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
67890	SIRV5	+	458	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	3	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1124_1931_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67893	SIRV2	-	478	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	8	2950	4	-320	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5903	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
67900	SIRV5	+	424	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	28	7431	8	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
67903	SIRV2	-	603	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1107	2313	-68	330	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTCCTAGCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4800	3313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
67912	contig_233_pilon	-	2772	16	Intergenic	novelGene_14602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1354.64398603061	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	100	2184	126907	79061	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQSC	127006	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79070_91489_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
67921	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
67927	SIRV5	+	365	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-35	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8280	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
67945	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
67965	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68006	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	661	37	661	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACATTCTTGAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
68020	SIRV5	+	367	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68037	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68060	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	34	3126	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
68089	contig_4364_pilon	+	415	3	Intergenic	novelGene_724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	53	415	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530472	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
68101	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
68110	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68127	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68136	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68159	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
68172	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_3780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
68188	contig_4364_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_2765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532987	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68193	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4441	34	3266	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
68217	contig_4364_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532869	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68228	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	875	14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68238	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	35	3386	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
68251	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68259	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68277	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842770	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
68283	SIRV5	+	174	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	319	175	205	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGACGTCCTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8520	10967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
68292	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	44	3227	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
68295	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68342	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
68381	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68399	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
68403	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
68416	SIRV2	-	580	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	35	3117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
68440	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
68492	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	882	33	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68502	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68511	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
68513	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68588	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7471	-1	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
68609	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4303	34	3128	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
68624	SIRV5	+	187	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	305	176	191	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8506	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
68633	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68639	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68656	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3028	1	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
68692	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68718	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
68724	SIRV2	-	575	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4298	34	3123	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
68745	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	878	39	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
68757	contig_4364_pilon	+	295	3	Intergenic	novelGene_570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCACCAACTGGGACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
68794	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68854	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
68875	SIRV5	+	395	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2063_2270_2316_3298_3405_3483
68912	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
68970	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
68984	contig_4364_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_3153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAAGGCTCAGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
68991	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69002	SIRV5	+	366	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-36	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
69008	contig_4364_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_4503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533115	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69011	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69034	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69039	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69053	SIRV5	-	416	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1116	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3522	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1141_2065_2165_2274_2316_3298_3403_3481
69065	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
69101	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69124	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	34	3087	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
69129	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
69158	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69272	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	38	3076	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
69319	SIRV2	-	354	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	747	1787	-747	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGCCTAGAACGAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
69328	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_4020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69386	SIRV5	+	380	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	24	7479	4	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
69392	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69400	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
69423	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69435	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
69436	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
69438	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69451	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69459	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4303	34	3128	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
69479	SIRV2	-	186	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-1065	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTTGTCACCCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5790
69501	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2310_3298_3405_3483
69508	SIRV2	-	1019	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2969	-1	1790	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2942	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
69540	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69543	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
69569	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4606	34	3431	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
69607	SIRV5	+	333	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	37	7592	-11	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
69610	SIRV2	-	393	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3034	5	-404	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
69651	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
69678	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69681	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532967	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
69695	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
69727	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-153	893	-39	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8162	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
69771	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
69801	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_2825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
69812	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69843	SIRV5	+	379	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7589	2	-196	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
69868	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
69872	SIRV5	-	287	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACGTGTACCTACCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
69875	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
69890	SIRV5	+	263	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	254	151	140	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
69907	SIRV2	-	259	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	654	35	654	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4078	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
69917	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
69971	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
70025	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	39	660	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
70049	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70103	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_3940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
70122	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
70131	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70147	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70152	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4389	44	3214	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
70163	contig_4364_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_1985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAATACCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
70180	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70184	SIRV2	-	557	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4304	46	3129	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
70232	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70255	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
70276	SIRV2	-	382	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-2	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
70282	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70299	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70312	SIRV2	-	269	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4604	34	3429	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
70336	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
70343	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4450	34	3275	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
70371	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	41	3372	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70394	SIRV2	+	449	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	148	-74	-148	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCCACAGCTATTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
70400	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70455	SIRV5	+	314	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
70458	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
70491	SIRV5	+	362	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7599	1	-206	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTATTATTTGGTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
70494	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
70515	contig_8538_pilon	+	372	2	Intergenic	novelGene_4668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842828	843061	FALSE	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842529	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842541_842768
70539	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70540	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7440	-1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
70583	contig_4364_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_2844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
70598	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	880	-22	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
70609	contig_4364_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_2227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGCATTAATACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
70641	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
70662	SIRV2	-	500	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1189	2334	14	309	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
70688	SIRV2	-	266	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4574	67	3399	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
70703	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70707	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
70730	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	38	3373	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70766	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	38	3380	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
70773	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70775	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
70776	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAAGATGCGTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8490_8590_10863
70781	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
70788	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
70797	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	72	404	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530453	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
70815	SIRV5	-	234	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAACTGCTCTAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
70819	contig_4364_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_2688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532950	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
70852	contig_4364_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_2702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532955	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
70881	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
70899	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70913	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70916	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70943	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
70952	SIRV2	-	404	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
70972	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
70974	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	886	7	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
70978	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
70990	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
71025	SIRV5	+	367	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
71036	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71039	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71062	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	35	3374	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
71142	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	878	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
71177	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
71192	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	151	144	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
71207	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71217	SIRV5	+	401	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-71	875	43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8244	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
71218	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	72	395	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530453	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
71222	contig_4364_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_3890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
71232	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	663	36	663	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTCTTGAAAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
71240	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
71245	SIRV5	+	447	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-117	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8198	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
71246	SIRV5	+	316	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-254	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGTGCAATGGTATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
71255	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
71353	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71365	SIRV2	-	464	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	38	3230	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
71395	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71403	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71410	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
71421	SIRV2	-	284	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4588	35	3413	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
71458	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71470	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	36	3083	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
71485	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	42	3077	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
71502	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71507	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_2255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCATTAATACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
71520	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
71570	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71582	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	36	3071	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
71597	contig_4364_pilon	+	287	3	Intergenic	novelGene_569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGTATTGTCACCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
71609	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71659	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71704	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
71709	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71729	contig_4364_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_2712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532960	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
71734	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71750	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
71753	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71787	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
71814	contig_4364_pilon	+	411	3	Intergenic	novelGene_530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	76	411	1530895	1531309	FALSE	45	AAGGCCAACAGGGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530449	1531309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
71820	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
71826	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71866	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	878	-29	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
71867	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71881	contig_8538_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_4980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
71897	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	34	3126	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
71898	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3028	1	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
71904	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
71914	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_2141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71929	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71948	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
71991	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72009	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533089	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
72023	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
72037	SIRV5	+	431	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7451	1	-58	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGAAAACAATCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72062	contig_4364_pilon	+	342	3	Intergenic	novelGene_581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	72	341	1530895	1531243	FALSE	20	ATAACGAGCTGCGTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530453	1531244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
72083	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
72087	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	878	5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72110	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72138	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	24	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8339	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72162	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72177	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_2093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72195	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72253	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72265	SIRV5	+	431	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7440	1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72305	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
72313	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	34	3388	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
72342	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72402	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72405	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72446	SIRV5	+	263	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	254	151	140	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
72532	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
72563	SIRV2	-	437	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4436	34	3261	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
72569	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-2	7484	-2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72584	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
72697	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	894	-19	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72705	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	37	3378	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
72737	SIRV2	-	375	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
72749	contig_4364_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_2816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCAACCCTGTCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
72823	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	41	3082	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
72828	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7484	-4	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72840	contig_4364_pilon	+	142	1	Intergenic	novelGene_4557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533172	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
72846	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7476	2	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
72869	SIRV2	-	410	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4459	38	3284	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
72885	SIRV2	-	402	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2958	707	1779	-707	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCCCAAATTGTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2953	1742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
72912	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
72937	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
72957	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-121	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8194	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
72980	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
73018	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73032	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2968	703	1789	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
73040	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
73049	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73067	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	38	3222	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
73074	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	37	3225	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
73082	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
73089	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
73113	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73150	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73155	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73189	SIRV5	+	435	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7441	-4	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73258	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
73293	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73325	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
73332	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	880	-6	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
73356	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
73359	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73366	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73388	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
73391	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_1904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73394	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
73413	SIRV5	-	412	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTTCGCACACTTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
73422	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
73425	contig_4364_pilon	+	134	1	Intergenic	novelGene_4554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533163	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
73435	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	35	3373	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
73449	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
73464	contig_4364_pilon	+	440	4	Intergenic	novelGene_680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	62	439	1530895	1531633	FALSE	30	TCAACACGCCAGCCATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFET	1530463	1531634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
73473	SIRV2	-	352	4	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1545	2334	370	309	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4362	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338
73517	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	276	-71	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
73525	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
73549	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	882	24	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
73581	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
73599	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73611	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_2828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
73624	contig_4364_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	TGACGGAGGCGCCCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
73642	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
73652	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73659	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	35	3078	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
73685	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73696	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
73724	SIRV5	+	447	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACATAACTATGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73738	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
73757	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
73775	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73811	SIRV2	+	437	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	195	-109	-195	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGCTGTTGGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
73853	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73859	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73869	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
73878	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
73891	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
73903	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
73936	SIRV2	+	324	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	269	-70	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
73988	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	878	-20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
74002	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	46	3374	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
74013	SIRV5	+	303	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-276	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAAGCCTAAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298
74049	SIRV5	+	301	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	19	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8579_10858
74076	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
74086	SIRV5	+	369	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-39	875	-39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8276	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
74098	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
74108	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74116	SIRV2	-	450	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-349	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATGTTAAAGCAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
74142	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74215	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
74256	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
74343	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
74361	SIRV5	+	251	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	263	154	149	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8464	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
74364	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74401	contig_4364_pilon	+	411	3	Intergenic	novelGene_360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	81	410	1530895	1531303	FALSE	35	ATCCCAAGGCCAACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530444	1531304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
74420	SIRV5	-	391	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTAGGACGAATTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
74426	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
74483	SIRV5	+	241	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	276	151	162	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8477	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
74485	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74520	contig_4364_pilon	+	368	3	Intergenic	novelGene_722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	53	367	1530895	1531288	FALSE	15	CGGAGGCGCCCCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530472	1531289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
74548	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	274	-74	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
74583	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
74586	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74587	contig_4364_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
74615	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74661	contig_4364_pilon	+	418	3	Intergenic	novelGene_533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	76	417	1530895	1531315	FALSE	40	ACAGGGAGAAGATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKA	1530449	1531316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
74689	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	42	3072	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
74701	SIRV5	+	416	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7473	2	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
74714	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74718	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	3	2960	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
74728	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
74733	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
74806	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
74821	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
74857	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
74879	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
74892	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74904	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
74924	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	878	12	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
74928	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
74939	SIRV5	+	348	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7588	6	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
74946	SIRV2	-	418	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4455	34	3280	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
74958	SIRV2	-	653	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	0	2964	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
74973	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
74980	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	887	-13	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75038	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75043	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	880	-33	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75073	SIRV2	-	595	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	58	3079	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
75087	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
75126	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7485	-1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
75129	SIRV2	-	297	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3383	0	-753	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGGCAACATGCCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
75143	SIRV2	-	569	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	37	3126	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
75145	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75148	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75149	contig_4364_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_2386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCTTTGCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
75164	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
75181	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
75192	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75247	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75255	SIRV2	-	569	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4304	34	3129	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
75260	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75312	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
75330	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75334	contig_10324_pilon	+	3557	22	Intergenic	novelGene_7704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_1	985.803494927993	4450	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	57	2171	51839	79380	FALSE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51782	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
75366	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533078	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
75381	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	51	3387	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
75384	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
75423	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
75545	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75548	contig_4364_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
75561	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75598	contig_6735_pilon	-	2252	9	Intergenic	novelGene_15665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	896.123701003383	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	918	1772	545923	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	551908	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179
75627	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
75633	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75647	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75665	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_1520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
75671	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
75694	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
75703	SIRV2	-	622	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
75732	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
75745	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75768	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	35	3080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
75802	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
75814	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	43	3371	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
75830	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
75880	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
75886	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
75910	SIRV2	+	307	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	290	-74	-290	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACCATACTTATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
75923	SIRV2	-	601	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	53	3078	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
75927	SIRV2	-	568	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4305	34	3130	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
75937	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
75948	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
75975	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	44	3072	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
75979	SIRV5	+	354	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-209	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGTTATTATTTGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298
75996	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	875	14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
75997	SIRV5	-	393	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGACGAATTTACGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
76002	SIRV5	+	305	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGCCTAAGTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2115_2157_2270_2316_3298
76010	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
76098	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	34	3127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
76120	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	58	3376	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
76130	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
76156	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
76165	SIRV2	-	565	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	40	3127	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
76178	contig_4364_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_2845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
76193	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	16	2959	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
76201	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
76212	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
76218	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_3124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
76230	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	35	3078	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
76266	SIRV5	-	412	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTAGAGATGTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10960	8204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8388_8457_8590_10863
76310	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	38	3083	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
76312	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
76333	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4602	34	3427	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
76355	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76386	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76393	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4270	67	3095	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
76420	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
76441	SIRV2	+	691	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-109	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1046	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
76449	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76475	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76494	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
76518	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76562	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
76586	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
76613	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
76644	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76645	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
76658	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76661	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
76662	SIRV5	+	354	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7614	2	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGCGCCAACAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
76697	SIRV5	+	387	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7474	2	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
76704	contig_5023_pilon	+	2944	16	Intergenic	novelGene_7327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2052.73192491264	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	27	1910	607279	646990	TRUE	20	TGTAGATGTTTCCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607252	648312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647452_647739
76742	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76752	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
76784	contig_5988_pilon	+	2994	10	Intergenic	novelGene_16066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2317	junction_1	1138.72889933155	2564	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	120	833	1218380	1224777	FALSE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209824	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
76800	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
76816	SIRV5	-	113	1	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTTCCCGGTCTACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	10878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_10900_11000
76844	contig_4364_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_4504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533115	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
76847	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
76862	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
76866	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
76876	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
76886	contig_15063_pilon	+	2203	6	Intergenic	novelGene_12295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3081.6009735201	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1397	1948	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28148	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
76889	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
76892	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
76901	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
76915	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
76928	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
76940	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
76949	SIRV5	+	425	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7464	2	-71	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
76960	SIRV2	-	603	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	44	3085	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
76961	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
77006	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77045	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77054	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77081	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3031	0	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
77180	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	880	30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
77230	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	35	3382	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
77244	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	904	-25	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCAGTGGTGACGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
77245	SIRV2	-	404	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4337_4480_4687_4801_5788
77292	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77297	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	72	350	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530453	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
77339	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
77346	SIRV5	+	371	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7597	2	-204	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTATTTGGTCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
77348	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3031	1	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
77382	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
77383	SIRV2	-	699	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	310	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTCAGCGCTAGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
77392	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77393	contig_8538_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_4967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842805	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
77404	SIRV5	+	333	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	33	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
77454	SIRV5	-	401	5	Intergenic	novelGene_5486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3519	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_SIRV5_-_1149_1986_2032_2117_2165_3277_3403_3481
77465	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
77472	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
77488	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
77494	SIRV5	+	313	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-264	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTGTTTCGGGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
77502	SIRV2	-	250	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	661	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGACATTCTTGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
77520	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77586	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
77595	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77615	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_3125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
77631	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7476	-1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
77644	SIRV2	+	627	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-31	-73	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
77670	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77691	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	887	-15	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
77703	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
77708	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
77737	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
77763	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	880	17	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
77773	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77783	SIRV2	-	260	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	398	3074	-363	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCAGCAGGCATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
77818	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-4	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
77854	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
77858	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3039	1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
77874	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
77901	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
77959	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78006	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78025	SIRV5	+	296	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7672	2	-279	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGCAAAAGCCTAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
78039	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
78050	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	161	-74	-161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATAAATACCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
78058	SIRV5	-	407	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAATTTACGGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8454_8590_10863
78125	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78165	contig_4364_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_3342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGGGTCCTAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
78217	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78220	SIRV5	-	262	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10858
78235	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	878	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
78254	SIRV5	+	369	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7481	13	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78260	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78283	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
78291	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78317	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	880	3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
78336	contig_4364_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19840	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	63	383	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFFVCSFCSLLPPGLSGKIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530467	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530524_1530888_1531018_1531096
78371	contig_4364_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_2853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
78437	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78448	contig_4364_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_4490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533111	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
78456	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
78464	SIRV2	-	354	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2964	749	1785	-749	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAGGCCTAGAACGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2947	1784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
78508	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
78514	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78537	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-38	886	-38	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
78553	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78561	SIRV2	-	587	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	70	3075	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
78565	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
78573	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	76	402	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530449	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
78633	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78645	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19840	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	57	395	1530895	1531312	FALSE	40	CAACAGGGAGAAGATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQFFVCSFCSLLPPGLIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPK	1530464	1531314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530515_1530888_1531018_1531096
78660	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
78667	SIRV2	-	403	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
78684	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78762	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
78776	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
78784	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	77	352	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530448	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
78787	SIRV5	+	296	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7665	1	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTAAGTGCTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
78825	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
78828	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
78890	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
78928	SIRV5	+	343	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7586	13	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
78934	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
78968	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
78979	SIRV5	+	300	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7668	2	-275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAAGCCTAAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
79008	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	34	3231	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
79062	SIRV5	+	279	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	893	33	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
79088	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
79096	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
79099	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79101	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
79129	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
79173	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79207	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79263	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
79277	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79287	SIRV2	-	367	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4506	34	3331	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
79295	SIRV2	+	660	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	140	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGGCCTACGTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
79306	SIRV2	+	454	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	143	-74	-143	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCTATTCGAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
79318	contig_4364_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_3627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATCAGCTAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
79355	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79368	SIRV5	+	290	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	35	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8350	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
79388	SIRV2	+	613	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	-20	-70	20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGGTAACCTGGAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
79469	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
79476	SIRV5	+	203	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	311	154	197	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8512	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
79494	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	40	3087	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
79523	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	63	3376	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
79560	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	44	3073	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
79563	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79569	SIRV2	-	366	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2968	733	1789	-733	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTATAGAAGTGGTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
79603	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	38	3075	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
79653	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	878	36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
79687	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
79713	SIRV2	-	381	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	77	3274	-42	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATTGTGAAGATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
79746	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
79765	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
79773	contig_4364_pilon	-	378	3	Intergenic	novelGene_604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGAGACCGACCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531280	1530453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
79854	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
79880	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79892	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	878	33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
79898	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
79916	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
80002	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	11	886	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80022	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
80046	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	880	40	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80057	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
80061	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80082	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80090	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	40	3421	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
80114	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
80128	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1146_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
80159	SIRV5	+	303	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-270	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298
80167	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
80180	SIRV5	+	1078	4	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-20	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGCAATAGTAACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	11862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10986_11128
80196	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80208	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
80277	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80295	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	255	154	141	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8456	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
80306	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80361	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80365	SIRV2	-	384	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3296	0	-666	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCACGCCTCCTACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
80402	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	45	3382	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
80424	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
80429	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	36	3222	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
80566	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
80568	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
80572	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3033	-1	-403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
80619	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	880	12	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80635	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80636	SIRV2	-	199	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3684	1	-1054	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCATTTACATTGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
80662	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-140	880	-26	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8175	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80683	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	34	3127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
80701	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
80704	SIRV2	-	348	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1792	-724	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGTTAACAAAGATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2940	1759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1825_1968_2065_2674_2803_2881
80709	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80712	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80723	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	35	3084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
80742	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
80744	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	882	25	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80759	SIRV5	+	424	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	900	-5	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
80767	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
80801	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7478	1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
80807	contig_3956_pilon	+	2765	15	Intergenic	novelGene_14843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1116.30724137347	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	84	2603	1281682	1290847	FALSE	20	ACTGTGTGGAGCCTACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281598	1291009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289810_1290628
80818	SIRV5	+	360	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7608	2	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
80873	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
80894	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532948	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80948	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	CTGCGTGTGGCCCCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
80950	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
80999	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81091	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
81111	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81117	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81131	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81144	contig_233_pilon	-	1841	9	Intergenic	novelGene_14548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1350.81979159879	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	79	1401	101691	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	101769	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99858_101673
81147	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_3756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
81172	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
81180	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
81210	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-117	878	-3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8198	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81218	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
81232	SIRV5	+	369	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7586	-4	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
81283	SIRV5	+	203	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	314	151	200	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8515	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
81286	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
81351	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81382	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81416	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
81439	SIRV2	+	440	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	157	-74	-157	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATACCACTCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
81475	contig_4364_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_2756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGACAACTGCTTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
81482	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81522	SIRV5	+	411	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1142_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
81524	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81580	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
81613	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81616	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81655	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81665	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
81669	SIRV5	+	295	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	35	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8350	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81670	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
81678	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
81679	SIRV2	-	385	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	14	-389	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGACGTCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5881	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
81690	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
81705	SIRV5	+	258	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	151	145	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
81723	contig_4364_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_3866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
81742	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
81770	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
81795	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	878	28	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81871	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
81911	contig_10958_pilon	+	2043	4	Intergenic	novelGene_5424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	7	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889013_895279_895839_900445
81955	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-406	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
81969	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
82068	SIRV5	+	335	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	13	-199	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1161_2000_2034_2119_2157_2270_2316_3298
82083	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82084	contig_4364_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_1756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
82113	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	72	353	1530895	1531255	FALSE	15	CGTGTGGCCCCCGAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530453	1531255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
82157	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82185	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
82268	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
82272	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
82276	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	878	33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
82309	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82352	SIRV2	-	199	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3689	0	-1059	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACCCCCATTTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
82392	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	886	-9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
82413	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
82437	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
82452	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
82463	SIRV5	+	379	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7589	2	-196	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
82489	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	880	-17	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
82527	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
82603	contig_4364_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_1989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82608	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
82632	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7482	-2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
82656	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	41	3382	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
82685	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
82692	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	44	3077	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
82724	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
82730	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
82756	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82807	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
82829	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82850	SIRV5	+	219	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	298	151	184	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8499	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
82854	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
82886	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
82965	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2968	703	1789	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
82994	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
83035	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
83037	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83068	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83167	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
83184	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83193	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	50	3077	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
83196	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
83197	SIRV5	+	382	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
83207	SIRV5	+	442	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	0	-51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	14	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
83216	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	45	3075	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
83222	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	40	3375	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
83276	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
83320	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
83329	SIRV2	-	585	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4288	34	3113	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1619	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
83337	SIRV2	+	241	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-369	-412	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCTTCAATGAAAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3664	4045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
83351	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
83358	SIRV2	-	577	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	70	3085	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
83370	SIRV2	-	609	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1100_1700
83430	SIRV2	-	617	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
83444	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2930	732	1751	-732	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAGAAGTGGTTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	1767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
83470	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
83488	SIRV5	+	446	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-116	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8199	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
83500	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83510	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
83518	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	35	3229	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
83538	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_4021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
83587	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
83617	SIRV5	+	455	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-4	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTCAAGCCACGCCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052	3605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
83634	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	76	357	1530895	1531255	FALSE	15	TGTGGCCCCCGAGGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530449	1531257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
83665	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
83671	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83686	contig_4364_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_2733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532968	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
83694	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83709	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
83732	SIRV2	-	394	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-410	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
83761	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-406	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
83778	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
83807	SIRV5	+	217	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	300	151	186	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8501	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
83827	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
83860	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
83869	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
83915	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
83944	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
83945	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
83994	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
84055	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
84093	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84098	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
84126	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_1703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84130	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
84155	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
84162	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
84165	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	878	-46	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
84247	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84276	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
84289	SIRV5	+	732	8	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	2564	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	30	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGGTATTTGTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	6162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2231_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111
84295	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	34	3256	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
84317	SIRV5	+	353	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7592	-2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
84350	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
84365	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
84367	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3038	-1	-408	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
84383	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
84415	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
84446	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	34	3126	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
84451	contig_17440_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_7595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTCTGGCTATAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3334	3034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3000_3300
84492	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7475	-1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
84533	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
84601	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
84660	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
84671	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
84708	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
84716	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
84717	SIRV2	+	643	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	127	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTATACCTCGTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
84733	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_1854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84769	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
84810	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84836	contig_4364_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_1842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCAACGCGGCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84937	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
84976	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85013	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7591	2	-198	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTCCCACCCCCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
85025	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
85062	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	36	3084	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
85095	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
85097	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	666	33	666	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4066	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
85100	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
85105	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85141	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
85161	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
85186	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85257	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85260	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_2929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
85287	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85334	SIRV5	+	446	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
85355	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	661	38	661	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
85364	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85381	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
85444	SIRV5	+	352	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	6	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
85463	SIRV5	+	208	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	298	162	184	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8499	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
85473	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85477	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	880	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
85529	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85560	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85580	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532944	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85605	SIRV2	-	351	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4514	42	3339	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85621	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85649	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4307	34	3132	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
85656	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85676	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85690	SIRV5	+	408	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1983_2034_2119_2196_3298_3405_3483
85708	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85762	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85768	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85795	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85816	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
85821	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
85826	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
85837	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85897	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	878	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
85914	SIRV5	-	332	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGACCTGGCTCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
85924	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	886	28	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
85935	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
85940	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
85946	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	3	2970	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
85947	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
85964	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
85983	SIRV2	-	551	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1138	2334	-37	309	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4769	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
86011	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
86073	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
86093	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
86130	SIRV2	-	252	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	653	43	653	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACAAGACATTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4079	3686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
86137	SIRV2	-	448	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	2988	0	-358	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTTGAGACAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
86179	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	878	-52	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
86211	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86214	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
86219	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
86220	SIRV2	-	195	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3688	1	-1058	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCCCCATTTACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
86241	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	35	3087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
86257	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
86324	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86332	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
86333	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
86342	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
86363	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
86379	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86398	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	72	350	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530453	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
86421	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86496	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
86506	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
86511	SIRV2	-	364	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	34	3334	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
86519	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
86525	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	878	-28	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
86528	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_2088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTAATACCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
86535	contig_4364_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_4486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533109	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
86546	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86551	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3030	-1	-400	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
86560	contig_4364_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_2736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532969	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
86595	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
86633	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	875	40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
86636	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86704	contig_4364_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_3539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGAAAGGAAACTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
86809	contig_4364_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_1831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATACCCTGCACAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
86881	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
86911	SIRV5	+	282	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7663	-2	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
86918	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86929	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
86941	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86972	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
86989	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
86990	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
86993	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87022	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532945	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87050	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87054	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
87070	SIRV5	+	389	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-3	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
87073	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
87101	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87122	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
87135	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
87157	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
87211	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
87258	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87274	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87303	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87315	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
87330	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
87347	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87350	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87373	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
87382	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87394	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	875	-40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87400	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87403	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87416	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87445	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87461	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	880	-36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87477	SIRV2	-	367	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4498	42	3323	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
87523	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
87530	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87547	contig_8538_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_4847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
87595	contig_4364_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_3988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCAGCGGGAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
87598	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
87670	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87673	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87701	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	20	ATAACGAGCTGCGTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
87719	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	38	3081	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
87747	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
87762	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87781	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87807	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
87813	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87853	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-77	880	37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8238	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87877	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
87912	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4303	34	3128	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
87922	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87934	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
87952	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	72	401	1530895	1531303	FALSE	35	ATCCCAAGGCCAACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530453	1531304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
87954	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
87959	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
87986	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2938	726	1759	-726	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGGTTAACAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2973	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
88006	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-88	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8227	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
88011	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	38	3375	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
88020	contig_4364_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGACTTGGCCACACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
88074	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
88080	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
88094	SIRV2	-	411	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4462	34	3287	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1445	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
88098	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	880	-26	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
88168	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88194	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
88197	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88225	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
88229	SIRV5	-	261	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
88265	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88275	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
88342	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAAGCACTTTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
88349	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88374	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
88377	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88396	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88397	contig_8538_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_4845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
88398	SIRV2	+	306	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	291	-74	-291	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAACCATACTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
88408	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88418	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
88428	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
88458	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88470	contig_4364_pilon	+	344	3	Intergenic	novelGene_583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	72	344	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530453	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
88494	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
88505	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88506	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
88533	SIRV5	+	205	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	312	151	198	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8513	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
88555	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88601	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88661	SIRV5	+	389	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7477	-2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
88663	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
88726	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88742	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	34	3088	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
88767	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
88788	contig_4364_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_1208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGAGGTCGGTGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
88793	contig_4364_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_2602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACCATCAGCTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
88799	SIRV2	-	626	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
88831	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
88842	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88882	SIRV5	-	442	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
88890	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
88903	SIRV2	-	569	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4304	34	3129	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
88912	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
88924	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
88931	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	80	352	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530445	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
88951	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
88956	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
88965	contig_4364_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_2042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
88970	SIRV2	-	391	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3040	1	-410	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
88976	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89007	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
89027	contig_4364_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_1643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAACGCGGCGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89038	contig_4364_pilon	+	267	3	Intergenic	novelGene_732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGTCACCAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530476	1531192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
89045	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
89057	SIRV5	+	453	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7436	2	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAACTATGACACTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
89059	SIRV5	+	253	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	163	138	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
89105	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89137	contig_4364_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_4481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533108	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
89146	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
89203	SIRV5	+	227	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	254	187	140	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
89206	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2964	703	1785	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2947	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
89259	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	38	3227	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
89287	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	0	2962	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
89297	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
89300	contig_4364_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_2188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCGGCGGTGTGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89304	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
89307	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_2464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
89324	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	72	398	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530453	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
89379	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89383	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
89392	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	44	3083	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
89396	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
89397	SIRV2	+	480	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	117	-74	-117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTGCAACTTGGACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
89427	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89437	contig_233_pilon	-	2711	16	Intergenic	novelGene_14563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1354.64398603061	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	84	2210	126907	78640	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQGVQAIREGEAQVPVEQ	126990	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79024_91489_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
89477	contig_4364_pilon	+	163	1	Intergenic	novelGene_4523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533122	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
89548	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
89553	SIRV5	-	444	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACAGTAAGGACTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10952	8164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8450_8590_10863
89563	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89586	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
89592	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89593	contig_10134_pilon	-	3732	3	Intergenic	novelGene_16202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_1	787.5	211	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_35178_38558_39164_39594
89607	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	656	42	656	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAAGACATTCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
89625	SIRV2	-	400	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
89638	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_2915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
89650	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
89661	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89680	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	38	3371	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89688	SIRV2	-	364	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	34	3334	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89697	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
89708	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	151	144	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
89720	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	37	3371	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
89768	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
89802	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	ACGGAGGCGCCCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
89815	SIRV5	+	446	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7443	2	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
89841	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	886	-11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
89907	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
89931	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
89933	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
89954	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	0	2959	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
89966	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
89993	SIRV2	-	400	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
90004	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
90072	contig_4364_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGACGGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
90080	SIRV5	-	328	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATTTGACCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8375_8453_8590_10863
90130	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	44	3078	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
90182	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
90185	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90220	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	44	3227	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
90225	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	38	3226	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
90254	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
90257	SIRV2	+	652	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGTTCTAGGCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
90265	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90287	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
90295	SIRV2	-	403	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
90307	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532961	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
90361	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-80	882	34	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8235	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
90399	SIRV2	-	374	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3303	-1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
90403	SIRV2	+	649	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	132	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCTCGTTCTAGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
90413	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	880	-25	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
90445	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3031	1	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
90459	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
90471	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
90548	contig_4364_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_2708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532959	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
90559	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90574	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90596	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90614	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	5	886	5	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8320	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
90636	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90679	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90684	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
90742	SIRV5	+	376	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298
90748	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90761	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	45	3383	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
90773	SIRV2	+	433	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	160	-70	-160	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATAAATACCACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
90779	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
90811	SIRV2	-	565	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4306	36	3131	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
90821	contig_4364_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_4445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533098	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
90822	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
90825	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
90838	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	38	3379	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
90851	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	46	3373	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
90860	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
90871	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
90880	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	884	-21	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
90894	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
90925	SIRV2	-	385	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	17	3034	1	-404	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
90935	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
90976	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
90984	SIRV5	+	466	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
90991	contig_4364_pilon	+	408	3	Intergenic	novelGene_358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	81	407	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530444	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
91031	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	80	442	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530445	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
91068	contig_4364_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_2905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATTTTTTCCAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
91093	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
91127	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
91153	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
91210	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91211	contig_3956_pilon	+	2698	15	Intergenic	novelGene_14908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1116.30724137347	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	83	2530	1281682	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281599	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289803_1290693
91245	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
91285	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	878	35	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91310	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91318	contig_4364_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_3432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
91341	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
91353	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	80	3377	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
91364	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91386	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91395	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
91414	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
91439	SIRV5	+	426	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	887	6	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91456	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	875	-45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91540	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_1401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91563	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91567	contig_4364_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_3332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGGGTCCTAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
91600	contig_4364_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_3977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGGCCCCAGCAACGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
91606	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91610	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
91674	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
91723	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
91738	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91756	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
91794	SIRV2	-	606	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	44	3082	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
91821	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	878	-20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91833	SIRV5	+	382	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-195	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
91835	SIRV5	+	359	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-41	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
91837	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
91860	contig_4364_pilon	+	379	3	Intergenic	novelGene_294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	81	377	1530895	1531270	FALSE	10	GCACCCTGTGTTGCTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPE	1530444	1531272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
91863	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
91880	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
91905	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-140	911	-26	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8175	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
91928	contig_4364_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_2043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
91933	SIRV5	+	252	3	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGAAGGTCGCCGTATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270
91996	SIRV5	+	252	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	265	151	151	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8466	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
92026	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92030	contig_4364_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_4295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACCCACAGTGTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
92057	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
92065	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92077	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
92111	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
92197	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
92209	SIRV2	-	436	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	34	3262	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
92214	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
92223	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92239	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3399_3483
92244	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92264	contig_8538_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_4760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
92267	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92282	SIRV5	+	223	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	289	156	175	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8490	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
92313	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92336	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92344	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
92371	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	40	3374	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
92389	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
92426	SIRV2	-	376	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4497	34	3322	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
92521	SIRV2	-	424	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	34	3274	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
92533	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
92541	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
92544	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-95	887	19	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8220	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92549	SIRV5	+	330	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-7	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298
92558	contig_4364_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_4428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
92581	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92629	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGCTAAGAAAGGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1533048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
92672	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
92676	SIRV5	+	262	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	255	151	141	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8456	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
92698	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
92728	SIRV2	+	310	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	287	-74	-287	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCATACTTATTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
92732	SIRV5	+	371	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7592	-1	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
92735	SIRV5	+	275	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	913	17	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCGGAGACCTCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92737	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
92741	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
92754	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
92759	SIRV5	+	367	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	878	-40	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92780	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	64	297	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842764	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
92830	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
92838	SIRV2	-	364	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	143	3225	-108	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGAGTGCAAAGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
92867	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
92879	SIRV5	-	336	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
92880	SIRV5	-	406	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1115	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3521	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1143_1989_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3399_3481
92915	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
92916	SIRV5	+	369	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-208	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGTTATTATTTGGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
92927	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	38	3419	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
92941	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
92967	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
93013	SIRV5	-	320	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATATACAGATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
93030	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
93075	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
93087	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93105	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
93125	contig_4364_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_2502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCAGCTCTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
93136	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
93165	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
93238	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
93245	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
93267	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
93299	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93332	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_2922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93365	SIRV2	-	579	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4294	34	3119	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
93387	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93405	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93425	SIRV2	-	401	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3030	1	-400	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
93433	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4396	40	3221	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
93471	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
93497	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93498	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
93508	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	ACGGAGGCGCCCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
93520	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93521	SIRV5	+	388	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
93523	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
93528	SIRV5	+	247	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACTATTTAGCGAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
93540	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_2932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93543	SIRV5	+	423	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2279_2316_3298_3405_3483
93551	SIRV5	-	332	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
93557	contig_8538_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_5018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842818	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
93567	SIRV5	+	378	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-2	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
93605	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93620	SIRV5	+	257	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	153	144	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
93640	SIRV5	-	335	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
93650	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93669	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
93673	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93754	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93791	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93832	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93840	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842766	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
93866	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
93883	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93921	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
93956	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
93959	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
93975	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
93992	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	50	3231	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
94000	SIRV5	+	430	4	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	6898	0	-247	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7954	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858
94013	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94016	SIRV5	+	214	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	284	170	170	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8485	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
94021	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
94029	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94063	contig_4364_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_2832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCAACCCTGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
94067	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94073	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94097	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
94129	SIRV5	+	241	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	951	13	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTGTAGGTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94135	SIRV2	+	324	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	273	-74	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
94163	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94164	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
94206	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94231	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	CTGCGTGTGGCCCCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
94233	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94243	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94268	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	38	3377	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
94295	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
94300	SIRV2	-	356	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	745	1787	-745	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTAGAACGAGGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
94316	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	887	-8	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94321	SIRV2	+	431	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	162	-70	-162	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTATAAATACCACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
94327	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94350	SIRV5	+	311	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	16	878	16	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8331	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94363	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
94375	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_2011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
94403	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	41	3381	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
94428	contig_4364_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_2763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532984	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
94472	SIRV5	+	457	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7432	2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATGACACTTTCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
94501	SIRV2	+	312	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	285	-74	-285	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATACTTATTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
94554	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94565	contig_4364_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_2865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTTCCAACCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
94582	SIRV2	+	610	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-14	-73	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTACATGGTAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
94593	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
94606	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94642	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94664	contig_4364_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_2959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
94676	contig_4364_pilon	+	358	3	Intergenic	novelGene_286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
94689	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
94716	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
94733	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
94767	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	928	-24	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGACTAGGTGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94782	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94795	SIRV2	-	369	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4504	34	3329	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
94810	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	659	41	659	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAGACATTCTTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4073	3684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
94829	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-38	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94866	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4414	38	3239	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
94908	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
94921	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
94926	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533099	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
94927	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1990_2034_2119_2153_2270_2316_3298_3405_3483
94939	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
94954	SIRV5	+	447	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-117	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8198	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
94963	SIRV2	-	408	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3028	0	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
94971	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
94984	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
94995	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-127	875	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8188	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95095	SIRV2	+	614	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-18	-73	18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACATGGTAACCTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
95101	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
95111	SIRV5	+	373	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7484	6	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
95119	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
95120	contig_4364_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_2293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTTGCATTAATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
95136	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
95142	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95145	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	880	-15	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95185	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95201	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
95218	contig_8538_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_4734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	73	306	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842755	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
95255	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
95269	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95270	contig_6175_pilon	+	4513	19	Intergenic	novelGene_16305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	193.522767984532	1285	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	79	2400	1466806	1520939	FALSE	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1445243	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1445309_1466792_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518667_1518761_1520852
95275	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	14	7472	3	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
95279	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95282	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
95286	SIRV5	+	387	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
95312	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95375	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95388	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	39	660	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
95412	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3039	1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
95440	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
95456	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	38	3225	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
95460	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	44	3074	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
95524	SIRV2	+	296	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	301	-74	-301	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAGTAATGCTAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
95529	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	65	358	1530895	1531267	FALSE	15	AGGAGCACCCTGTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAP	1530460	1531268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
95545	SIRV5	+	309	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-13	-34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8452_8586_10858
95548	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
95572	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95593	SIRV5	+	508	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-4	31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAAGCATTGGTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3394_3478
95600	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	35	3071	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
95622	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95652	SIRV5	+	379	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	45	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8556_10848
95653	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-406	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5787
95693	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95710	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95765	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	880	-11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95772	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	34	3127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
95788	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-126	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8189	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
95815	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533078	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
95829	contig_7202_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_18281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTCATGCAGGTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
95840	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
95849	contig_4364_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_2709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532959	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
95880	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
95900	SIRV5	+	255	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	138	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8579_10858
95901	contig_8538_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_4945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842798	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
95919	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	80	442	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530445	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
95932	SIRV2	-	369	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4504	34	3329	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
95981	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
95997	contig_4364_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_2716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532962	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
96027	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96033	SIRV5	+	398	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
96036	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96074	SIRV5	-	431	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1118	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3524	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1158_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
96094	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
96108	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
96115	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2117_2157_2270_2316_3298_3405_3483
96120	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96154	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
96155	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
96163	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
96201	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
96214	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
96216	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
96221	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96245	SIRV2	-	450	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-349	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATGTTAAAGCAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
96250	SIRV2	-	405	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-394	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTGAAGACGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4477_4687_4801_5787
96273	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	543	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
96298	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96320	SIRV5	+	243	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	274	151	160	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8475	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
96376	contig_8538_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_4808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
96388	SIRV2	-	258	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4615	34	3440	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
96408	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_3870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
96467	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96491	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96494	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
96529	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532863	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96535	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
96553	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
96557	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
96584	SIRV5	+	357	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	48	7478	0	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
96598	SIRV5	+	373	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2076_2157_2270_2316_3298_3405_3483
96621	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96626	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
96651	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
96674	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96679	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7481	2	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
96681	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	880	24	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
96698	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96707	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
96715	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_1908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96731	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
96739	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
96763	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
96774	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
96776	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
96824	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-88	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8227	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
96927	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96933	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96953	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96958	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96963	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_2094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
96964	SIRV5	-	338	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
96983	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
96987	contig_4364_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_2677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAATTCTGTAACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
97120	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
97146	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
97173	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97201	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
97203	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97219	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
97231	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	38	3072	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
97260	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97264	SIRV2	-	561	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4308	38	3133	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
97271	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
97276	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
97280	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
97297	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97302	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
97327	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	878	32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97334	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97337	SIRV2	-	397	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3036	-1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
97340	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
97343	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
97361	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
97395	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
97402	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	72	353	1530895	1531255	FALSE	15	GTGTGGCCCCCGAGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530453	1531256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
97453	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
97460	SIRV5	+	438	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8596_10866
97461	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
97471	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1145_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
97487	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97503	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
97525	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
97533	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
97546	SIRV2	-	254	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	662	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4070	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
97558	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
97603	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
97606	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
97611	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97623	contig_4364_pilon	+	425	2	Intergenic	novelGene_1342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGAAGAGTTTCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1547919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533310_1547900
97650	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	886	-18	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97664	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
97671	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
97679	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97687	SIRV5	+	390	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7484	-2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
97693	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
97715	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97737	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4602	34	3427	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
97738	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	72	398	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530453	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
97765	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
97773	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
97786	contig_4364_pilon	+	296	3	Intergenic	novelGene_439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTCACCAACTGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
97804	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97874	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
97906	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97919	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
97932	SIRV5	+	386	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298
97935	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
97950	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
97954	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
98038	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	44	3384	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
98048	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	137	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
98058	contig_4364_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_2402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGCTCTTTGCATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
98102	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
98133	SIRV5	+	228	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	289	151	175	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8490	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
98135	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98146	contig_4364_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	76	390	1530895	1531288	FALSE	20	ACGGAGGCGCCCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530449	1531288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
98187	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
98200	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
98244	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
98260	SIRV5	+	223	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	273	172	159	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGACGTCCTCGTAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8474	10970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
98268	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
98303	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98320	contig_4364_pilon	+	388	3	Intergenic	novelGene_666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	65	388	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530460	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
98367	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
98408	SIRV2	-	545	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1142	2336	-33	307	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGCTCAGCGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4765	3336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
98414	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	893	-23	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
98420	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98431	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
98440	SIRV5	+	497	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTAAGTGGTCAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3406_3483
98457	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
98471	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98482	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98491	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_1653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98502	SIRV2	-	495	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1181	2347	6	296	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGAACTAGTCTCTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4726	3347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
98522	SIRV2	-	478	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	34	3220	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
98565	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_2585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCATCAGCTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
98572	contig_4364_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_2775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533007	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
98595	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	878	-26	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
98607	SIRV5	+	412	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2273_2316_3298_3405_3483
98617	SIRV5	+	205	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5348	4072	-1797	3321	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCAGCTACGCGATCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6404	6919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
98634	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98672	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	470	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
98680	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
98690	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	37	3369	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
98695	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98706	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98727	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
98767	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
98771	SIRV2	+	610	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-14	-73	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTACATGGTAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
98778	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	882	-22	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
98803	SIRV2	-	448	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4425	34	3250	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
98814	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
98818	SIRV2	+	317	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	280	-74	-280	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGACTTTGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
98839	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98916	SIRV2	-	592	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	67	3073	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
98924	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98930	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98957	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
98971	contig_4364_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	81	407	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530444	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
98991	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99013	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
99038	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99048	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99085	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99090	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99117	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99149	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
99156	SIRV5	+	373	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7588	1	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
99287	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	59	3385	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTTATCTAAGGAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
99311	SIRV5	+	361	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-34	878	-34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8281	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
99315	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGGAATACATCAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
99325	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99369	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99391	contig_4364_pilon	+	376	3	Intergenic	novelGene_293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	81	374	1530895	1531267	FALSE	15	GGAGCACCCTGTGTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAP	1530444	1531269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
99403	contig_8538_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_4807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
99418	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
99436	contig_4364_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_4477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533107	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99445	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
99446	SIRV2	-	676	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	13	2346	1	297	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAACTAGTCTCTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
99459	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	15	CGGAGGCGCCCCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
99462	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
99529	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
99568	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99579	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
99589	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99602	contig_4364_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_2610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99610	contig_8538_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_5028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842820	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
99618	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
99621	SIRV5	+	466	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-24	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
99634	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99635	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
99676	contig_4364_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_3552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAAGAAAGGAAACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
99689	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
99704	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
99718	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	399	3080	-364	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGCAGCAGGCATTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
99787	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99810	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
99819	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99831	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
99850	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	38	3079	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
99858	contig_4364_pilon	+	358	3	Intergenic	novelGene_601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	72	356	1530895	1531258	FALSE	15	GGCCCCCGAGGAGCACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELR	1530453	1531260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
99881	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
99888	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	657	38	657	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4075	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
99894	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
99944	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
99968	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
99994	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
99995	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100000	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
100029	SIRV2	-	255	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	668	25	668	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAATTGACGTGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4064	3668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
100037	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100038	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100054	SIRV5	+	415	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100088	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
100102	SIRV2	-	399	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3023	-2	-393	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
100171	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100172	SIRV5	-	399	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	17	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTACGGTGGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8457_8590_10868
100203	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100204	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
100209	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
100270	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100284	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
100299	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
100302	contig_4364_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_4340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
100312	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100343	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100345	SIRV5	+	446	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	878	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
100351	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
100365	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_3981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
100383	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
100388	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
100389	SIRV5	+	446	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7443	2	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100447	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	35	3228	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
100463	SIRV2	-	495	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1190	2338	15	305	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTGCTCAGCGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4717	3338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
100506	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
100523	contig_4364_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_1764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100527	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100548	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	44	3366	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
100601	SIRV2	-	1023	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2965	-1	1786	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2946	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
100615	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100644	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532941	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100647	SIRV5	+	442	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7434	-4	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTATGACACTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100663	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
100701	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100729	contig_4364_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_2703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532956	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
100736	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
100739	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	878	39	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
100772	contig_4364_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCATATCATCCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
100826	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100842	contig_4364_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_4500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533114	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
100860	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100876	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	661	39	661	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
100945	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
100951	SIRV5	+	367	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	890	-52	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
100973	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
101018	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101029	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
101194	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101259	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
101280	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101281	SIRV5	+	342	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7626	2	-233	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACATTTAGCCGAATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
101304	SIRV6	-	200	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTTTTTCCAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11234	10726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
101321	contig_4604_pilon	+	3574	19	Intergenic	novelGene_19132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_7	1343.6765483801	2418	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	444	2711	358980	379856	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQVVCAVPHNLESKSPAAPGQSPTGSVCYERNGEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339836	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_360707_360801_361428_361527_363854_363937_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
101337	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	39	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
101378	SIRV5	+	453	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7429	1	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACTTTCGGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
101385	contig_4364_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_3398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
101401	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
101425	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
101455	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101492	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	38	3079	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
101554	SIRV2	-	257	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	40	3435	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
101558	SIRV2	-	652	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
101565	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGTGCTGCAGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101596	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101600	contig_4364_pilon	+	336	3	Intergenic	novelGene_256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	255	81	335	1530895	1531228	FALSE	30	GGCACCACACTTTCTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKI	1530444	1531229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
101626	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101628	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	886	-37	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
101637	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
101641	SIRV5	+	447	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7442	2	-49	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTAACATAACTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
101651	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
101655	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
101711	contig_4364_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_2359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101712	SIRV5	+	361	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-216	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCCAACAGCGTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
101736	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101743	contig_4364_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_3709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
101761	SIRV2	-	1020	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2968	-1	1789	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	100	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
101768	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	42	3222	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
101795	SIRV2	+	428	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-57	152	-57	-152	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCACTCCCACAGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	1479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
101810	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
101823	SIRV2	-	583	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	73	3076	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGAAGATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
101858	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
101865	contig_4364_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_2724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532966	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
101880	contig_4180_pilon	+	3245	6	Intergenic	novelGene_8386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2030.10112063414	16	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTGTCAGTATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874331	890823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874384_875234_875364_882860_882933_886082_886187_886317_886468_888085
101892	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
101920	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	880	-21	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
101929	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
101952	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
101955	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102040	SIRV2	-	300	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-743	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCCATATAAGTCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
102051	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102066	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102095	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
102108	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_1650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
102117	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
102120	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
102136	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102163	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102226	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102247	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102278	SIRV2	-	602	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	44	3086	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
102320	SIRV5	+	447	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
102330	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102331	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
102367	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102370	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
102373	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
102379	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102407	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
102427	contig_4364_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_3510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAAGGAAACTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
102442	contig_4364_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_1763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTGTTAAGGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102453	contig_4364_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532872	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102472	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102475	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4337_4480_4687_4801_5790
102489	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102505	contig_4364_pilon	+	349	3	Intergenic	novelGene_451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
102559	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
102589	contig_4364_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_2101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCATTAATACCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
102666	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
102678	SIRV2	-	577	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	80	3075	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
102703	contig_4364_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_4082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
102731	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
102738	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
102758	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
102762	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
102775	SIRV2	-	603	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	47	3082	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
102779	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	36	3082	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
102782	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
102830	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCTCTCTGCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8453_8590_10863
102854	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_5029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842821	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
102859	SIRV2	-	303	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	50	3379	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
102867	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
102871	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	38	3074	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
102885	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
102905	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
102915	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	80	406	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530445	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
102942	SIRV5	-	261	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
102946	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3036	1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
102952	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103010	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
103011	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	880	40	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
103020	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
103026	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
103067	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103069	contig_4364_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_4479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533107	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
103113	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103136	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	35	3076	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
103143	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
103193	SIRV2	-	693	2	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4135	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
103208	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
103221	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842768	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
103270	SIRV2	-	358	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3313	5	-683	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCATGTCTGTCACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
103284	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103364	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
103366	SIRV2	-	300	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	1837	2258	658	350	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTATCAAATGCAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4074	3293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3326_3665_3826_3966
103411	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103412	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
103419	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
103430	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
103442	SIRV2	-	181	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3707	0	-1077	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAAATGGTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
103453	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	37	3073	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
103456	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
103476	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
103516	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103548	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103556	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_2914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103566	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	887	-2	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
103576	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103592	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
103598	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	4	2962	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
103608	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103694	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
103697	SIRV5	+	448	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
103706	SIRV2	-	690	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	10	2335	-2	308	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGCTCAGCGCTAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
103725	SIRV2	-	367	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4506	34	3331	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
103730	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	12	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
103751	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532942	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103787	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
103801	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
103829	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103900	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
103908	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
103932	SIRV2	-	196	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3692	0	-1062	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTCACCCCCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
103940	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
103957	contig_4364_pilon	+	234	3	Intergenic	novelGene_706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAGAGAGGCATCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
103960	SIRV5	+	402	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
103971	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
103977	contig_5023_pilon	+	2434	14	Intergenic	novelGene_7247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2364.84793911742	8	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	83	754	607279	629249	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQTDTLPCTNQRTRTSTGGLLKVRRGRSGHLGTG	580846	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_625784_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643465_646989_647643_647738
103981	SIRV5	-	244	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCTAACAATTTAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
104008	contig_4364_pilon	-	266	3	Intergenic	novelGene_707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGACCAGCAGCGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531182	1530467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
104035	SIRV2	-	404	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1777	-706	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCCAAATTGTAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2955	1741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1848_1968_2065_2674_2803_2881
104037	SIRV5	+	386	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1980_2058_2270_2316_3298_3405_3483
104040	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
104055	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
104105	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
104109	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104110	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
104117	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104130	SIRV2	+	475	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	157	-109	-157	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATACCACTCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
104175	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
104178	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
104246	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4603	34	3428	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
104280	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104307	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
104341	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
104345	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3296_3405_3483
104351	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
104368	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	878	1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
104385	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
104390	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
104396	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
104405	SIRV2	-	269	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	37	3426	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
104418	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
104426	contig_4364_pilon	+	176	1	Intergenic	novelGene_4519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533121	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104441	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
104456	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_1438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
104503	contig_4364_pilon	+	149	1	Intergenic	novelGene_4556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533169	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
104529	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	51	3225	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
104533	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
104589	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
104592	contig_4364_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_1732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533311	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
104612	SIRV2	-	417	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4452	38	3277	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
104629	contig_4364_pilon	+	326	3	Intergenic	novelGene_721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	53	325	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530472	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
104676	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_2811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
104685	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	44	3384	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
104689	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3026	1	-396	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
104707	contig_4364_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_4506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533116	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104753	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
104771	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5790
104824	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	35	3075	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
104835	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
104855	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
104888	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
104895	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	39	3085	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
104914	SIRV2	-	397	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3036	-1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
104923	SIRV2	-	277	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	34	3421	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
104955	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4269	34	3094	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1638	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
104973	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105010	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105015	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	37	3383	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
105017	contig_4364_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_2755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532979	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
105038	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
105073	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
105088	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
105091	contig_4364_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_3631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACATCAGCTAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533248	1533053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533200
105162	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105174	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
105209	SIRV5	+	385	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7465	13	-72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCGTTCTTTTGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
105213	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7592	2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
105229	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
105232	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105235	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105241	contig_12671_pilon	+	2395	7	Intergenic	novelGene_19224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	529	junction_1	342.201086107764	208	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	53	775	197316	211199	FALSE	35	AGAATAGAACTGCATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDVSMLFNTFDIYIKTNKPVLEEVQPECSP	197263	212819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053
105261	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
105264	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105274	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105288	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
105306	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	893	4	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
105326	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
105337	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
105340	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
105346	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105355	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105363	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105374	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
105383	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
105395	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
105398	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
105405	contig_4364_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGTCACCAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
105410	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105411	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
105439	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105487	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19840	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	110	400	1530940	1531309	FALSE	40	GGCCAACAGGGAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLRCWSVQFFVCSFCSLLPPGLSDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530444	1531311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530904_1531018_1531096
105505	SIRV5	+	379	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7487	-2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
105514	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105517	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105521	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
105524	contig_4364_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_4160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTTCCAGCGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
105541	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
105550	SIRV5	+	452	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7419	1	-26	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAAATTCACCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
105558	SIRV5	-	324	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTCAATGTATTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
105595	SIRV5	+	332	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7608	2	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
105601	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
105616	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105696	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
105710	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105747	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105748	contig_4364_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_3274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTCCTAAGGCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
105773	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4304	37	3129	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
105797	SIRV2	+	603	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-61	-19	-61	19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTAACCTGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
105818	SIRV2	-	368	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3312	0	-682	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATGTCTGTCACATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
105822	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
105827	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532943	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105856	SIRV2	+	620	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-24	-73	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAACCTGGAGGATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
105862	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
105873	SIRV2	-	402	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4455	50	3280	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
105879	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
105905	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
105917	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105922	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
105929	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
105942	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	42	3381	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
105966	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
105969	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
105975	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106020	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
106050	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7477	2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
106052	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
106073	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
106100	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
106120	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	39	3392	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
106130	SIRV5	+	410	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-80	875	34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8235	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
106147	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_3777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
106176	SIRV5	+	346	5	NNC	SIRV5A	novel	1984	18	NA	NA	1	-197	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTCCCACCCCCGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2333_3329
106178	SIRV5	+	428	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	899	-8	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGACGTCCTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
106185	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
106186	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
106205	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
106210	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106220	SIRV2	-	369	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-676	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCACATCTATCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
106243	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-109	893	5	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
106358	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	38	3073	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
106431	contig_4364_pilon	+	367	3	Intergenic	novelGene_736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	46	366	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530479	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
106466	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
106483	contig_4364_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	65	382	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530460	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
106484	SIRV5	+	424	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
106539	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7488	1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
106544	SIRV2	-	390	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3041	1	-411	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
106550	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106574	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
106586	SIRV2	-	420	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	38	3274	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
106612	contig_4364_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_1724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
106620	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106642	SIRV2	-	462	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	45	3225	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
106649	contig_4364_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_4453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATCCAACTCAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
106688	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
106697	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
106709	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106760	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
106783	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	72	401	1530895	1531303	FALSE	40	AATCCCAAGGCCAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530453	1531303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
106790	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106802	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106839	SIRV2	+	652	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-72	137	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTTCTAGGCCTACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
106861	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
106932	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106935	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
106937	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_3902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
106945	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
106955	SIRV5	+	361	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
106993	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
106996	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	880	-5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107020	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107049	SIRV2	-	394	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	-1	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4352_4480_4687_4801_5788
107053	SIRV2	+	449	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	147	-73	-147	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCACAGCTATTCGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
107057	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2163_2279_2316_3298_3405_3483
107077	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
107084	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGACCTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
107124	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
107139	contig_4364_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_2611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107191	contig_9706_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_20796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTGGCTATAAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2061	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1800_2100
107204	SIRV2	-	559	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4314	34	3139	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1593	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
107214	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4604	35	3429	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
107238	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3026	1	-396	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
107263	SIRV5	+	307	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	902	-4	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107286	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	59	400	1530895	1531315	FALSE	40	ACAGGGAGAAGATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKA	1530466	1531316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
107300	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
107304	contig_4364_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_1700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATTAGGCCCCAGCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107318	contig_4364_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_2396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGCTCTTTGCATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533300	1532929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
107362	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107384	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAATACCCTGCACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
107389	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3033	1	-403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
107422	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107428	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
107499	contig_4364_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_1561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
107523	SIRV5	+	236	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	151	167	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
107526	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	886	-11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107535	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107570	SIRV2	-	694	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	5	309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4340_4480_4687_4801_5788
107629	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107634	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107639	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	878	-27	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107649	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	35	3086	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
107652	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107670	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
107688	SIRV2	-	595	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	53	3084	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
107698	SIRV2	-	567	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4306	34	3131	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
107761	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532970	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
107826	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	878	32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107831	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107881	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107882	contig_4364_pilon	+	347	3	Intergenic	novelGene_587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	72	347	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530453	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
107905	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	38	3237	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
107911	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
107921	SIRV2	+	615	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-18	-74	18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACATGGTAACCTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
107962	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	875	-19	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
107968	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
107976	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
107977	SIRV2	-	404	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3027	1	-397	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
107980	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
108003	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
108004	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
108032	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108048	contig_4364_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_4489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533111	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
108061	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	5	882	5	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8320	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108075	SIRV2	-	453	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	14	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963_4095_4338_4480_4687
108115	SIRV2	+	372	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1454	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4479_4686_4793_5785
108134	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	45	3232	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
108172	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
108186	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	882	-20	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108191	SIRV2	-	370	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4503	34	3328	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
108200	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
108240	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
108253	SIRV2	-	405	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGAAGACGTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5790
108281	contig_4364_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	673	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTGACCAGATCACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
108292	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
108302	SIRV5	+	402	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
108314	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108317	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
108360	contig_4364_pilon	+	360	3	Intergenic	novelGene_289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	81	359	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530444	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
108372	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
108397	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
108411	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	900	-10	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108439	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	35	3368	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
108447	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
108473	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	34	3430	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
108487	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
108491	SIRV2	-	565	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4308	34	3133	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
108535	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
108545	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108580	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108586	SIRV2	-	257	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	653	38	653	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4079	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
108595	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108598	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108619	SIRV5	+	364	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
108631	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
108683	SIRV5	+	453	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATGACACTTTCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2116_2157_2270_2316_3298_3405_3483
108686	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
108689	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
108698	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108716	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
108722	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108771	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108793	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
108816	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
108833	SIRV5	+	364	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
108838	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-9	886	-9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108870	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108908	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5792
108937	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
108993	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	894	-5	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
108995	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
109029	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	35	3226	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
109132	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	880	-25	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109147	contig_8538_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_5016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
109162	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
109168	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	878	12	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109174	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	0	2962	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
109216	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	35	3374	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
109246	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109260	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109285	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
109293	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109305	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109309	SIRV2	-	497	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	161	3074	-126	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACGATTCAGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1200_1700
109345	SIRV2	-	296	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3379	1	-749	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAACATGCCCATATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
109368	SIRV5	+	423	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	931	-35	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCGGGACTAGGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109394	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109400	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	-31	-71	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
109420	SIRV2	-	402	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2961	704	1782	-704	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAAATTGTAACTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2950	1739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
109427	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
109445	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	35	3080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
109469	SIRV2	-	564	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4306	37	3131	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
109470	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	72	395	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530453	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
109505	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	38	3383	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
109506	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2163_2279_2316_3298_3405_3483
109557	contig_4364_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_2718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532963	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
109577	contig_4364_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_4079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGTGTGTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
109585	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	34	3423	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
109602	contig_4364_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_2116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCATTAATACCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
109629	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109630	contig_4364_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_2183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCATTAATACCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
109643	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109660	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109675	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
109688	contig_4364_pilon	+	364	3	Intergenic	novelGene_292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	81	362	1530895	1531255	FALSE	15	TGTGGCCCCCGAGGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530444	1531257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
109709	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	115	396	1530929	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSLLVRAVFRLFFLLAAASRPLRSPWKKTSPRWSLTMALACAKLALLATTPPAPSSPQSSAAPDTRQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531092
109730	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109740	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109742	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109750	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
109790	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	902	-27	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
109794	SIRV5	+	376	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-196	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
109849	contig_4364_pilon	+	391	3	Intergenic	novelGene_401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	80	391	1530895	1531285	FALSE	20	CTGACGGAGGCGCCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530445	1531285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
109863	SIRV2	-	648	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	2638	5	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
109868	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532942	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109873	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
109880	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACGCGGCGGTGTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109882	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
109892	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
109894	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	34	664	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCTTGAAAGGTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
109928	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
109958	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	38	3377	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
110016	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	44	3075	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
110101	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	72	395	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530453	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
110119	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
110128	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
110146	SIRV2	-	290	3	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	672	302	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTCTCTTGCTCAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4060	3341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3963
110156	contig_4364_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_4514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533118	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
110163	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
110201	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
110216	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
110217	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4345_4480_4687_4801_5790
110218	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	672	27	672	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4060	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
110223	SIRV5	+	294	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7667	1	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGCCTAAGTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
110263	contig_4364_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_2404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGCTCTTTGCATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
110300	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
110303	contig_4364_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_4460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533102	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
110306	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
110316	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	875	-52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
110317	contig_4364_pilon	+	242	3	Intergenic	novelGene_658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGAGAGGCATCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530460	1531151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
110365	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
110405	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
110412	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
110416	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
110427	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
110431	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
110441	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	880	-28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
110473	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_3834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
110489	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
110500	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4606	36	3431	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
110522	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
110549	SIRV2	-	420	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	38	3274	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
110551	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
110587	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
110632	SIRV5	+	273	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7663	6	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
110823	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
110916	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
110960	SIRV5	+	427	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7462	2	-69	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
110977	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	876	6	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	147	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
110983	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111004	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_3666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111008	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	15	875	15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111023	SIRV5	+	455	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111033	SIRV2	-	562	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4311	34	3136	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
111044	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCAGTGAACGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111120	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7408	6	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACCTTTACCAGGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
111128	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
111141	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111183	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111212	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111237	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
111264	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111268	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111278	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111347	SIRV2	-	669	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4127	0	2948	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
111352	SIRV2	-	424	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	34	3274	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
111369	contig_4364_pilon	+	302	2	Intergenic	novelGene_756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGCACTGGTTCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532321	1532705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
111375	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
111382	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	900	-32	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111396	SIRV5	+	387	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
111409	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3296_3405_3483
111414	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_1906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111426	SIRV5	+	249	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	257	162	143	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8458	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
111469	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
111494	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111500	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	878	-6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111508	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
111528	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111534	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111576	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111581	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111587	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
111591	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	72	401	1530895	1531303	FALSE	35	ATCCCAAGGCCAACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530453	1531304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
111646	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111653	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111654	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3035	-1	-405	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
111660	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111666	SIRV2	-	379	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-411	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5787
111680	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
111719	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
111722	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	880	-49	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
111725	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111730	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_2837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111736	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111741	contig_8772_pilon	-	1547	9	Intergenic	novelGene_21113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	960	1289	19240	15784	FALSE	25	CGGGGACGAGGCATAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23421	15525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20694_21474_21522_21965_22051_23061
111756	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
111768	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111786	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	35	3085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
111800	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	46	3421	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
111801	contig_4364_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
111812	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111816	SIRV2	-	602	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	51	3079	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
111841	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111857	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_2926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
111880	contig_4364_pilon	+	141	1	Intergenic	novelGene_4558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533173	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
111890	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
111914	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_1990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
111947	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
111952	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
111955	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
111978	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
112012	SIRV5	+	399	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2079_2157_2270_2316_3298_3405_3483
112072	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112112	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
112117	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	880	-28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
112147	SIRV2	-	410	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3021	1	-391	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGAAGACGTCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
112151	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
112158	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
112166	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112178	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
112195	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112204	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
112235	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112238	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112239	contig_4364_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_3321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGGGTCCTAAGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533315	1533033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
112247	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	51	3076	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
112250	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112293	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
112298	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112305	SIRV2	+	250	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-358	-392	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCACTACATGACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3675	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
112326	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
112327	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
112345	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
112356	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112396	SIRV5	+	283	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7673	-5	-280	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGGCAAAAGCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
112415	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112448	SIRV5	+	392	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2273_2316_3298_3405_3483
112473	SIRV5	+	452	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	902	-35	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
112477	SIRV5	+	336	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-17	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8450_8586_10858
112484	SIRV2	+	446	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	151	-74	-151	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTCCCACAGCTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
112494	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	72	398	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530453	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
112509	contig_4364_pilon	-	399	3	Intergenic	novelGene_320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGACCGCGGCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531291	1530444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530519_1530887_1531015_1531093
112550	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112553	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112575	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4423	35	3248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
112580	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112581	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTAAGAAAGGAAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
112620	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
112649	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
112667	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112708	SIRV2	-	447	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4426	34	3251	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
112717	SIRV2	-	406	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1786	-703	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2946	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2065_2667_2803_2881
112721	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
112730	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
112749	contig_4364_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_1843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112754	SIRV2	-	427	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4445	35	3270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
112757	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7490	1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
112795	contig_4364_pilon	+	176	1	Intergenic	novelGene_4540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533133	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112823	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
112831	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7592	2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
112844	SIRV2	-	500	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1124	13	-39	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4771	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
112878	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
112881	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
112925	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	37	7440	-11	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
112981	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
112984	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	878	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
112999	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
113008	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113017	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113034	SIRV5	+	386	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7475	2	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
113043	SIRV2	-	681	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	5	296	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGAACTAGTCTCTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4340_4480_4687_4801_5788
113046	SIRV5	+	268	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	8676	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATCGCGGGTGGCGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
113053	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113075	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113121	SIRV5	+	338	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7614	-1	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGCGCCAACAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
113145	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113149	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
113158	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
113228	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113267	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113285	SIRV2	-	290	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1533	22	370	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACACAAGACATTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4362	3687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
113299	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
113307	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113310	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
113369	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113403	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
113406	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113412	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	42	3072	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
113466	SIRV2	-	436	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	34	3262	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
113491	SIRV5	+	311	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	16	878	16	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8331	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113501	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113505	SIRV2	-	663	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	642	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1700
113576	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	21	886	21	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8336	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113626	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4603	34	3428	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
113686	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113713	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	10	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8325	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113714	SIRV5	+	452	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACATAACTATGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
113743	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113753	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
113788	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	72	353	1530895	1531255	FALSE	15	GTGTGGCCCCCGAGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530453	1531256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
113798	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-182	979	-68	-102	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTACTCCGAAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8133	10887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113799	SIRV5	+	1000	12	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	4099	1	3294	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGCAAGTAACAACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	6892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826
113804	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	886	3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113818	SIRV2	+	398	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	195	-70	-195	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGCTGTTGGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
113826	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	880	-1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113840	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
113852	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4804_5792
113853	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	665	30	665	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4067	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
113867	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
113904	SIRV2	-	567	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4306	34	3131	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
113909	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
113960	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113974	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
113989	contig_4364_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	65	343	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530460	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
113991	contig_4364_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_2747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532974	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
113996	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114006	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
114036	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
114054	SIRV5	+	390	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
114126	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114131	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114132	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1145_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
114155	SIRV5	+	398	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2078_2157_2270_2316_3298_3405_3483
114229	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
114277	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
114290	SIRV5	-	346	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
114331	SIRV2	-	452	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	37	3243	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
114350	contig_4364_pilon	+	186	1	Intergenic	novelGene_4505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533116	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
114366	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
114378	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
114388	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
114406	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114425	SIRV5	+	299	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7657	-5	-264	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTGTTTCGGGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
114427	SIRV5	+	467	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-37	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
114488	SIRV2	-	333	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	34	3365	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
114533	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
114534	SIRV5	+	374	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2045_2126_2157_2270_2316_3298
114541	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	85	3077	-50	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCTTGCGTAATTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
114612	SIRV5	+	385	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	6	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
114625	SIRV2	-	409	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4464	34	3289	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
114626	SIRV5	+	228	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-246	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAGTAAAGGTCTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119
114636	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
114637	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	72	395	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530453	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
114644	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
114667	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
114675	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114697	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
114698	SIRV5	+	303	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7665	2	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTAAGTGCTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
114705	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
114707	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
114708	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3305	-1	-675	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCACATCTATCACGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
114721	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
114727	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
114773	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114776	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	20	875	20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8335	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
114817	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114856	contig_4364_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_2749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532976	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
114900	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
114904	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
114920	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
114921	contig_4364_pilon	+	252	3	Intergenic	novelGene_564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGGCATCCTGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
114923	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115000	SIRV5	+	300	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	909	-4	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115019	SIRV5	+	201	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	305	162	191	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8506	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
115065	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	879	9	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGTTTACCGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115087	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115118	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115147	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
115170	SIRV5	+	254	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	162	138	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
115183	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3028	1	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
115187	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	34	3231	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
115220	contig_4364_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_2836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115244	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115246	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115250	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115269	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	654	45	654	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGACACAAGACATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4078	3688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
115295	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	878	-11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115302	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
115317	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115374	contig_4364_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_2696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532954	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115382	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115387	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
115422	contig_14273_pilon	+	3373	8	Intergenic	novelGene_21137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_1	471.402380224827	1679	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	319	2049	128229	151187	FALSE	15	TGATTTGTTTTTTCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127910	152511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
115432	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115467	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
115480	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
115505	SIRV2	-	297	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4576	34	3401	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
115529	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115535	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115560	SIRV2	-	427	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4446	34	3271	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
115561	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	268	-74	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
115592	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
115600	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115641	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	40	3376	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
115649	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115665	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115769	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-80	880	34	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8235	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115778	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115795	contig_4364_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_3352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTGGGTCCTAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1533035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
115802	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
115819	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	83	3078	-48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGCGTAATTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
115881	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
115885	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
115888	SIRV5	-	419	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
115898	SIRV2	-	652	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	2643	0	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
115922	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
115961	SIRV2	-	620	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	35	2962	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
115964	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
115974	SIRV5	+	361	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
115995	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116083	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116126	contig_4364_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_2697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532954	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
116138	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
116154	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116198	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116208	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
116232	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	39	3410	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
116273	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
116280	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116290	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1790	-703	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2942	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2804_2881
116302	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
116305	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116310	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116346	SIRV2	-	222	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4651	34	3476	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
116360	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116386	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	20	875	20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8335	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
116392	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_3943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
116433	SIRV2	+	445	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	133	-55	-133	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATGACTCTAATACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
116494	contig_4364_pilon	-	181	1	Intergenic	novelGene_4541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTTAAATCCAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
116511	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116553	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	42	3082	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
116562	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
116568	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116606	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
116677	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
116696	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
116725	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116746	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
116752	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116767	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
116802	SIRV5	+	398	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-71	878	43	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8244	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
116819	SIRV2	-	363	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4500	44	3325	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
116820	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_2572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCATCAGCTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
116834	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116838	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	11	880	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
116855	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
116895	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_2907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
116896	SIRV2	-	389	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-410	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5788
116902	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116908	SIRV2	-	296	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-747	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACATGCCCATATAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
116938	SIRV5	+	374	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-7	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2153_2270_2316_3298_3405_3483
116949	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
116966	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
116996	SIRV2	-	601	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	51	3080	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
117005	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
117013	contig_8538_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_5004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842814	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
117022	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-27	876	-27	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8288	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
117035	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_3088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
117065	SIRV2	-	250	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	660	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTCTTGAAAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3821_3963
117080	contig_4364_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_1239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCGTGAGGTCGGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1532900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
117092	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	34	3394	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
117100	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117159	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	34	3394	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
117189	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCAGCGGGAATACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
117202	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	34	3126	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
117207	contig_4364_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_4317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACAACCCACAGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
117218	SIRV5	-	410	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTTCGCACACTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
117270	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	34	3232	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
117286	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2968	703	1789	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
117354	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117403	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117422	SIRV5	-	309	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCAATGTATTTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8459_8590_10863
117435	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117478	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
117483	contig_4364_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_4107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
117489	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
117511	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
117514	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117522	SIRV2	+	540	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	57	-74	-57	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGCCACTCGTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
117578	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4152	-1	2973	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	180	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1759	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
117579	SIRV2	-	399	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3032	1	-402	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
117619	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
117629	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117639	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
117657	SIRV2	-	478	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	34	3220	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
117666	contig_4364_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_3835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGTGTGTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117683	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117684	contig_4364_pilon	+	414	3	Intergenic	novelGene_532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	76	414	1530895	1531312	FALSE	40	GCCAACAGGGAGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPK	1530449	1531312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
117692	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
117697	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117702	contig_8538_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_4762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
117736	SIRV2	-	602	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4271	34	3096	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
117749	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117780	SIRV5	-	404	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGCACACTTCGCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
117785	contig_4364_pilon	-	362	3	Intergenic	novelGene_291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGACCGCGGCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531255	1530444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
117827	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
117861	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-72	893	42	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
117875	SIRV5	+	365	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7475	-5	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
117877	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
117880	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117881	contig_4364_pilon	+	349	3	Intergenic	novelGene_591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	72	347	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530453	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
117899	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
117917	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	35	3274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
117964	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
117965	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3036	1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
117984	SIRV2	+	627	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-31	-73	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
118007	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
118045	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118053	SIRV2	-	422	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4450	35	3275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
118061	SIRV2	-	407	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-393	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4337_4480_4687_4801_5790
118072	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	37	3374	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
118077	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298
118161	SIRV5	+	244	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	273	151	159	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8474	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
118179	contig_4364_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
118182	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	662	33	662	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4070	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
118185	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	672	26	672	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATTGACGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4060	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
118197	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118207	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
118213	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118214	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_2873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTTTTTCCAACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
118227	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118253	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118300	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	65	421	1530895	1531330	FALSE	10	CCAGGTGACTGTCGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKM	1530460	1531332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
118329	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	53	3256	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
118345	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118363	contig_4364_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_1940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGTGTGTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118368	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-27	902	-27	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8288	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
118396	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
118398	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118403	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	50	3231	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
118408	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
118426	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	47	3422	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
118437	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	38	3375	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
118465	SIRV5	+	376	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298
118478	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
118528	SIRV5	-	222	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCTACCACCCATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10866
118544	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
118549	SIRV2	-	277	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	34	3421	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
118552	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118582	contig_4364_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_1902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118618	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118629	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118651	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118657	contig_4364_pilon	+	188	1	Intergenic	novelGene_4534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533126	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118666	contig_4364_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_1274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGTGAGGTCGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
118686	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
118707	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118734	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7473	-2	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
118767	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
118769	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118782	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
118787	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118816	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118826	SIRV2	-	643	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
118831	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118881	SIRV5	-	333	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
118890	SIRV2	-	601	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	47	3084	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
118899	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	81	305	1530895	1531198	FALSE	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530444	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
118931	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
118940	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
118942	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118958	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
118999	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
119001	SIRV2	+	445	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	151	-73	-151	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTCCCACAGCTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
119023	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_3192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
119038	SIRV5	+	401	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	880	38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119051	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7488	-1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119103	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119133	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119141	contig_4364_pilon	+	295	3	Intergenic	novelGene_244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACGGTATTGTCACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
119146	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119192	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3030	-1	-400	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
119223	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
119251	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	20	TATAACGAGCTGCGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
119296	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119302	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
119312	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
119364	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119370	SIRV2	-	584	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4278	45	3103	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
119392	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
119420	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
119467	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	266	-74	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
119498	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
119529	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
119542	SIRV2	+	365	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	316	1454	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4349	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4479_4686_4804_5792
119555	contig_4364_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_2069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTAATACCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533312	1532920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
119560	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
119593	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119600	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119707	SIRV2	+	484	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	112	-73	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
119713	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119729	contig_4364_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_2468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
119737	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
119742	SIRV2	-	587	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	63	3082	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
119744	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
119764	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
119765	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-2	-394	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTGAAGACGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
119783	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	878	-41	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119794	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119795	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119811	SIRV5	+	380	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7491	1	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119819	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
119821	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
119859	SIRV5	+	445	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7444	2	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119867	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_1604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119880	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119881	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2095_2157_2270_2316_3298_3405_3483
119882	SIRV5	+	395	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-68	878	46	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8247	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119896	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
119906	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
119913	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-88	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8227	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119929	SIRV5	+	374	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7594	2	-201	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTGGTCCCACCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
119932	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119934	SIRV5	+	387	4	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	2	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1178_2119_2196_3298_3405_3483
119937	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	875	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
119938	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
119951	SIRV5	+	256	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	261	151	147	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8462	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
119974	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
119993	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
119999	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120008	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533098	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120017	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
120023	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120061	contig_4364_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_2738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532970	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120071	contig_4364_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_4496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533114	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120083	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120090	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
120095	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120107	contig_4364_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_4461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533102	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120114	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
120116	SIRV5	+	397	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	884	38	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120117	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7488	-1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
120119	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	19	880	19	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120163	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	893	33	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120174	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120196	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
120215	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120231	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
120234	contig_4364_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_1476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
120260	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
120262	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	876	-18	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120263	SIRV2	-	361	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGTCATGTCTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
120318	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
120321	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120338	contig_3956_pilon	+	2748	15	Intergenic	novelGene_15146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1322.82381938898	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	64	2298	1281682	1290491	TRUE	15	TACGCGACTTATTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281618	1291022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282890_1284191_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290676_1290756
120352	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
120355	SIRV2	-	637	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2655	-1	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
120365	contig_4364_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532866	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120374	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_3122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120378	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	878	-8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120392	SIRV5	+	281	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	880	44	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120397	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	44	3376	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
120430	SIRV5	+	297	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120431	SIRV2	+	608	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	-14	-71	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTACATGGTAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
120443	SIRV2	-	659	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAATTGACGTGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4685_4801_5788
120472	contig_4364_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_1143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTCGGTGAAGCAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
120504	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120516	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120551	SIRV2	-	418	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4455	34	3280	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
120570	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120572	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120601	SIRV2	+	618	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	-25	-70	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
120650	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120681	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	886	24	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120692	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
120704	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120707	contig_4364_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_2750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532977	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120732	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	875	28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120763	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
120796	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	38	3393	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
120799	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533103	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
120824	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120843	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
120847	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	886	28	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
120877	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
120882	SIRV5	+	385	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
120918	SIRV5	+	304	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-265	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGCTGTTTCGGGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298
120922	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
120926	SIRV2	+	442	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	155	-74	-155	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATACCACTCCCACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
120952	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121002	SIRV2	-	393	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
121030	SIRV2	-	600	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	58	3074	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
121052	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3399_3483
121053	SIRV5	+	399	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	40	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
121086	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	81	305	1530895	1531198	FALSE	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530444	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
121097	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	23	7464	3	-71	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
121105	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
121115	contig_4364_pilon	+	444	4	Intergenic	novelGene_735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	49	444	1530895	1531651	FALSE	15	TATGTTGCCATCCAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAM	1530476	1531651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
121138	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
121145	contig_4364_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_1184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGAGGTCGGTGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
121151	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	3	2959	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
121179	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121195	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
121203	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
121205	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
121220	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	875	-19	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
121231	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	900	-7	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
121254	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121259	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	35	3376	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
121272	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
121282	SIRV2	-	299	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	40	3393	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
121394	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121402	SIRV5	+	389	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
121440	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121443	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121469	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
121478	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
121481	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	878	17	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
121516	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
121518	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
121531	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3031	0	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
121565	contig_4364_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_2778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
121572	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
121612	SIRV2	-	583	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	63	3086	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
121621	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
121622	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_1941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAATACCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1532918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
121635	contig_4364_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_3793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGGGAATACATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
121638	SIRV5	+	390	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3403_3483
121661	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
121664	SIRV5	+	238	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	178	138	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
121700	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
121733	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
121778	SIRV2	+	468	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	129	-74	-129	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTCTAATACCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
121794	SIRV5	+	301	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	886	18	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
121812	SIRV5	-	393	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTTACGGTGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
121867	contig_4364_pilon	+	386	3	Intergenic	novelGene_665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	65	385	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530460	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
121897	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
121957	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
121989	SIRV2	+	375	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	222	-74	-222	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCGAGCACAACGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
122031	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-25	-74	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
122037	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	5	2961	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
122075	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
122085	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
122099	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122106	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
122114	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122124	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	34	3253	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
122134	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
122157	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122171	SIRV5	+	197	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	2	-363	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCCACGGTCGTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985
122188	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
122196	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7475	-1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
122199	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122202	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122203	SIRV5	+	397	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	3	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2069_2270_2316_3298_3405_3483
122240	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122258	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
122260	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122278	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122290	SIRV2	-	374	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4499	34	3324	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
122291	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	228	76	303	1530895	1531201	FALSE	35	CAACTGGGACGACATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIV	1530449	1531203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
122320	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122339	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
122353	SIRV2	+	300	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	297	-74	-297	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAATGCTAAACCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
122370	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
122398	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
122463	SIRV2	+	677	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-105	129	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATACCTCGTTCTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	1760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
122466	SIRV2	+	306	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	291	-74	-291	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAACCATACTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
122545	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
122578	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
122597	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
122605	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
122650	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
122667	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7482	2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
122678	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
122704	SIRV2	-	450	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4423	34	3248	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
122729	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	875	52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
122741	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	37	3080	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
122742	SIRV2	+	281	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	310	-68	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
122772	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
122773	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
122774	SIRV2	+	407	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTTCTTTGTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1742	2959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2881
122785	SIRV2	-	403	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGAAGACGTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
122807	SIRV5	-	259	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
122856	SIRV2	-	554	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1139	2330	-36	313	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCGCTAGTCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4768	3330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
122877	SIRV2	-	264	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4609	34	3434	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
122881	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3026	1	-396	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
122890	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-399	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTTTCATTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5787
122908	contig_8317_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_20026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16417	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
122920	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7477	2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
122940	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	880	-12	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
122956	SIRV5	+	261	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	256	151	142	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8457	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
122970	SIRV5	+	276	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	43	886	43	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8358	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
123034	contig_8538_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_4914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGTTGTAATCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
123037	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123061	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
123064	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	875	12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
123073	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
123112	SIRV5	+	244	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	166	144	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
123134	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298
123157	SIRV2	-	586	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	70	3076	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
123175	SIRV2	-	220	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4653	34	3478	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
123177	contig_4364_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_3439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAAACTGGGTCCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
123199	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
123234	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGTGAGGTCGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
123248	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
123254	SIRV5	+	391	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
123260	SIRV5	+	502	6	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	933	1990	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATCGATGGGCGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989	5588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_2034_2119_2196_3298_3405_3483_3641_5376_5451_5543
123286	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123295	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	81	359	1530895	1531252	FALSE	10	CTGCGTGTGGCCCCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530444	1531252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
123315	contig_4364_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_4438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533096	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
123328	contig_8538_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_4689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
123359	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	35	3081	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
123371	SIRV2	+	377	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1454	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4479_4686_4800_5787
123381	contig_4364_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_2361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123403	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123408	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	37	3375	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
123415	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
123424	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	35	3378	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
123527	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4603	34	3428	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
123561	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123562	contig_4364_pilon	+	335	2	Intergenic	novelGene_740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	8	334	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530887	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096
123567	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123614	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	80	355	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530445	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
123616	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123625	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
123646	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4307	34	3132	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
123664	SIRV2	-	598	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	58	3076	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
123700	SIRV2	-	277	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	34	3421	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
123752	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_4018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
123768	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
123803	SIRV5	+	252	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	262	154	148	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8463	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
123867	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	902	-17	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
123872	contig_4364_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTCATCCTTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532813	1533167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
123899	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
123909	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	880	-28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
123919	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
123999	contig_4364_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_2362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124021	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
124033	SIRV5	-	251	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCTTCCGACCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
124076	SIRV2	-	588	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	70	3074	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
124104	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124130	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
124135	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124146	SIRV5	+	397	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	26	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8227	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8366_8459_8586_10858
124169	contig_4364_pilon	+	436	3	Intergenic	novelGene_424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	77	436	1530895	1531333	FALSE	10	CAGGTGACTGTCGGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530448	1531333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
124172	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_1911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
124177	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124220	SIRV5	-	390	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGGTGGTAATTTCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10859
124231	contig_4364_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_2769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532989	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124246	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
124278	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2961	711	1782	-711	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGGTTCCCAAATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2950	1746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
124315	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124318	SIRV2	-	377	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	7	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
124326	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124332	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_1701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124380	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124393	SIRV2	-	607	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	47	3078	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
124407	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1144_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
124442	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
124443	SIRV5	+	447	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	0	7444	0	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
124479	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124500	SIRV2	-	575	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4298	34	3123	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
124511	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124558	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
124579	SIRV5	+	369	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-42	878	-42	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8273	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
124582	SIRV5	+	292	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	887	26	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
124600	SIRV5	-	296	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10972	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
124610	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124611	SIRV2	-	693	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	5	309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4798_5788
124624	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124676	SIRV2	-	406	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3027	-1	-397	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
124688	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124728	SIRV2	-	360	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	17	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
124744	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124756	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124761	SIRV2	-	450	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4423	34	3248	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
124786	contig_8538_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_4732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	74	307	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842754	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
124794	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124807	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124826	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124858	contig_4364_pilon	+	323	3	Intergenic	novelGene_734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	49	321	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530476	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
124860	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124946	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	44	3084	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
124949	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
124952	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
124955	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
124972	contig_4364_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_1288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCGTGAGGTCGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
124993	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125049	contig_4364_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_2707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532959	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125073	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533078	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
125076	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125081	SIRV2	-	358	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4514	35	3339	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125099	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125121	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125128	SIRV2	+	310	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAATCGTATTAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1817	2942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2804_2888
125133	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125141	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
125164	SIRV2	-	413	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4460	34	3285	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125173	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125182	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125187	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	37	3226	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
125204	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125211	contig_4364_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_4108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
125234	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
125246	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125252	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGGGAATACATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
125268	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125337	SIRV2	-	252	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	667	29	667	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAAGGTAATTGACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4065	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
125342	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	80	442	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530445	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
125364	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
125389	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
125398	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125407	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
125421	contig_4364_pilon	+	296	3	Intergenic	novelGene_571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
125446	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
125452	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125530	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125543	SIRV5	+	412	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2067_2270_2316_3298_3405_3483
125548	SIRV2	+	300	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-325	-65	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACTTATATGGGCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3708	4392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4338
125549	SIRV2	+	219	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4700	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4793_5784
125572	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-405	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
125580	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
125588	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
125596	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-38	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
125612	contig_8538_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_4672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842535	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842543_842770
125619	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125632	SIRV2	-	515	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	136	3081	-101	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAAGCCATGATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
125650	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
125682	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	36	3082	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
125696	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
125717	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125725	SIRV2	-	249	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4624	34	3449	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1283	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
125765	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
125766	SIRV2	+	468	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	126	-71	-126	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAATACCTCTTGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
125790	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7482	2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
125826	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125828	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7470	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
125848	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
125849	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
125862	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	38	3380	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
125870	SIRV2	-	374	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3303	-1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
125885	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	875	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
125904	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	34	3232	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
125921	SIRV2	-	582	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4287	38	3112	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
125924	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125927	contig_4364_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_2723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532966	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
125954	contig_4364_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_4465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTAAATCCAACTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
125973	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
125991	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
126025	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	39	3127	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
126084	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533099	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
126101	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	34	3396	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
126120	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126156	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
126159	SIRV2	-	303	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4570	34	3395	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
126160	SIRV2	+	659	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	142	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGCCTACGTGAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
126192	SIRV5	+	438	4	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	4	7586	4	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2316_3298
126217	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
126258	SIRV2	+	313	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	284	-74	-284	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTATTTGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
126276	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	39	3419	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
126281	SIRV2	-	190	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4666	51	3491	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1200
126297	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_2936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
126304	SIRV2	-	251	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	666	31	666	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAAGGTAATTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4066	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
126322	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
126402	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
126439	SIRV5	+	377	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7489	-2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
126452	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126457	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
126461	SIRV2	+	611	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-14	-74	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTACATGGTAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
126510	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126579	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	34	3231	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
126606	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
126620	SIRV5	-	426	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1124	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3530	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2165_2276_2322_3308_3403_3481
126640	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
126649	SIRV2	-	393	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	66	3273	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
126662	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	0	2962	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
126704	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126711	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
126721	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
126730	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
126749	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126751	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126766	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
126830	SIRV2	+	653	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	134	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCGTTCTAGGCCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
126844	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	878	32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
126864	SIRV2	-	607	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	37	3088	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
126871	contig_4364_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_2327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTCTTTGCATTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
126891	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	886	-17	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
126896	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
126900	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
126904	SIRV5	+	253	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	264	151	150	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8465	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
126909	SIRV2	-	345	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	756	1787	-756	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTCACGTAGGCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
126947	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
126951	SIRV2	+	430	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	148	-55	-148	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCCACAGCTATTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
126968	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127028	SIRV2	-	574	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4299	34	3124	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
127045	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
127052	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
127066	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	37	3087	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
127117	SIRV5	+	390	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	11	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3411_3483
127158	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127174	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAATTGTCCTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532422	1532673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532400_1532700
127189	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	35	3074	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
127216	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127256	SIRV5	+	295	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	902	8	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
127263	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
127272	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127279	SIRV2	-	576	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	80	3076	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
127313	SIRV2	-	409	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4462	36	3287	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1445	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127314	contig_4364_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_3452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAACTGGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1533039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
127324	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
127337	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
127364	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
127397	contig_4364_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_2727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532967	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
127429	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
127465	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127490	SIRV2	+	432	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	165	-74	-165	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGCTATAAATACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
127509	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127516	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
127537	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	878	36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
127561	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	40	3083	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
127564	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
127607	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
127634	SIRV2	-	277	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	34	3421	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
127654	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127667	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127679	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127691	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127700	contig_4364_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532855	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127703	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127704	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
127713	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127723	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
127731	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127832	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
127855	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	35	3382	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
127860	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
127938	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
127945	SIRV5	+	395	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
127982	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
127993	SIRV7	-	2287	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	173	2	168	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147750	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
128005	contig_4364_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_4507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533116	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
128020	SIRV2	-	365	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4500	42	3325	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
128031	SIRV2	-	261	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4612	34	3437	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
128059	SIRV5	+	370	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	41	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8556_10858
128060	contig_4364_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_1939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAATACCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533263	1532918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
128093	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	34	3422	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
128116	SIRV2	-	421	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4450	36	3275	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
128124	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
128135	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128161	SIRV2	+	459	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	119	-55	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTGCAACTTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
128203	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128206	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
128211	contig_4364_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	76	405	1530895	1531303	FALSE	35	TCCCAAGGCCAACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530449	1531305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
128220	SIRV5	+	413	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
128223	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	878	-25	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
128272	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4603	34	3428	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
128277	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128297	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
128300	contig_4364_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_2711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532960	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128304	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	398	3081	-363	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCAGCAGGCATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
128334	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128343	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	45	3079	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
128346	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128372	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_2937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128395	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128402	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
128436	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128456	SIRV5	+	376	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	6	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2307_3293_3405_3483
128486	contig_4364_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_4521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTCAAGGCAAGTAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
128489	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	65	400	1530895	1531309	FALSE	40	AGGCCAACAGGGAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530460	1531310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
128507	contig_3956_pilon	+	2864	14	Intergenic	novelGene_14940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1144.81363047472	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	81	2414	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGGTGTCATCGTGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282887_1284089_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
128566	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128582	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	274	-74	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
128588	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128591	SIRV5	+	445	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7437	1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
128628	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
128694	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128701	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
128715	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128721	SIRV5	+	248	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	266	154	152	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8467	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
128727	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
128759	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	35	3387	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
128772	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
128773	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
128791	SIRV2	-	200	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3683	1	-1053	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATTTACATTGCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
128821	SIRV2	-	247	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	663	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969
128840	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
128916	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
128979	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
128998	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129016	SIRV2	-	393	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-411	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
129020	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
129023	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129031	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	10	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8325	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
129038	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
129039	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
129043	SIRV2	-	555	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1139	2329	-36	314	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCGCTAGTCCATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4768	3329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
129049	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
129075	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
129080	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129113	contig_4364_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_1194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGAGGTCGGTGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533289	1532898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
129151	SIRV2	-	286	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3391	-1	-761	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGGTAAGTGGGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
129183	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129190	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129201	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
129285	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
129310	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129311	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3031	1	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
129324	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129371	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129372	contig_3956_pilon	+	2628	13	Intergenic	novelGene_14818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1165.64618166635	2604	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	86	1282	1281682	1288915	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSQEPRRPAQAGGGPEAPGQVGPHGAVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281596	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285789_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
129381	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129396	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
129402	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842812	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
129418	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_3778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129425	SIRV2	-	205	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	662	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCATTCGCTGGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4070	3726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3831_3969
129441	SIRV2	-	655	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	2631	5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
129479	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
129497	SIRV5	+	417	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7472	2	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
129512	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
129514	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129542	SIRV2	-	393	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3040	-1	-410	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
129552	SIRV5	+	367	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
129554	SIRV5	+	391	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	55	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8596_10863
129572	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
129574	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129578	SIRV5	+	334	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	878	-7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
129593	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129597	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
129612	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129695	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-126	887	-12	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8189	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
129699	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	882	1	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
129714	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
129746	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129770	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129782	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
129785	SIRV5	+	350	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7586	6	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
129794	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
129797	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129803	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	278	-74	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
129822	contig_6215_pilon	-	2976	10	Intergenic	novelGene_21199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_5	584.51019908938	2114	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	107	1468	243029	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243135	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
129823	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
129831	SIRV2	-	568	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4273	66	3098	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
129846	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
129867	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	38	3380	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
129907	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	38	3255	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
129923	contig_4364_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_2752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532978	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
129956	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
129973	SIRV5	+	369	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-196	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
129997	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130003	SIRV2	+	307	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	289	-73	-289	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACCATACTTATTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
130021	SIRV5	+	383	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7474	6	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
130042	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130048	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
130066	contig_9955_pilon	-	3055	4	Intergenic	novelGene_21287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_3	476.504168105823	863	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	266	958	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49874	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794_49380_49692
130067	SIRV2	-	399	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3034	-1	-404	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
130068	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	663	32	663	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
130074	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130086	SIRV2	-	415	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4458	34	3283	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
130115	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	34	3249	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
130134	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
130152	SIRV2	-	454	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1172	11	9	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4723	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
130156	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130177	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	GACGGAGGCGCCCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
130179	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130206	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130220	SIRV5	+	315	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8469_8586_10858
130263	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
130313	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
130328	SIRV2	-	226	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4647	34	3472	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
130336	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
130361	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130362	contig_4364_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_1525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCACAGACCGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
130384	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
130423	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130454	SIRV5	+	303	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	900	2	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
130455	contig_4364_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_1061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTGAAGCAGACGGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
130463	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	703	1787	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
130483	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130489	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
130519	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
130531	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
130532	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
130545	contig_4364_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532785	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
130564	SIRV2	-	153	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	726	69	726	-47	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGACCTACTGCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
130591	contig_4364_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_3707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
130623	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
130640	SIRV5	+	400	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-73	878	41	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
130696	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
130705	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
130711	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
130715	SIRV2	-	454	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-345	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAAAGCAAACGACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
130737	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130738	contig_4364_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	76	408	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530449	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
130746	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130774	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130797	SIRV2	-	364	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3311	1	-681	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGTCTGTCACATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
130812	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	38	3225	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
130821	contig_4364_pilon	+	488	4	Intergenic	novelGene_702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	59	487	1530895	1531684	FALSE	10	CCTCTGGCCGTACCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLY	1530466	1531685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
130858	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	42	3081	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
130865	contig_4364_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_3493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGGAAACTGGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
130890	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130896	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130925	SIRV5	+	466	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	880	-27	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
130926	SIRV5	+	446	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	14	7423	3	-30	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCGGTAAATTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022	3568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
130929	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	893	-23	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
130932	contig_4364_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_2640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
130994	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
131011	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
131016	SIRV2	+	278	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	319	-74	-319	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACGCAATCGCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
131038	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
131058	SIRV5	+	427	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	876	16	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
131068	contig_4364_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_3139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAAGGCTCAGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
131105	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
131126	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
131157	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
131176	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
131190	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532940	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
131200	SIRV5	-	285	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACCTTAGAGCGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
131209	contig_4364_pilon	+	303	3	Intergenic	novelGene_249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	222	81	302	1530895	1531195	FALSE	25	TTGTCACCAACTGGGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHG	1530444	1531196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
131221	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
131265	SIRV2	-	597	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	61	3074	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
131280	contig_4364_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532818	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
131340	SIRV2	-	366	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
131368	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
131422	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
131460	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
131480	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
131501	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
131512	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	63	3376	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
131563	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
131575	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	884	33	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
131594	SIRV5	+	387	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2090_2157_2270_2316_3298_3405_3483
131605	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
131614	contig_4364_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACTGGGACGACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
131619	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	41	3087	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
131646	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
131669	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7479	2	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
131686	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-393	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4342_4480_4687_4801_5790
131694	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
131701	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
131704	SIRV5	+	255	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	8689	1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAAGGTCGCCGTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
131746	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
131786	SIRV2	-	656	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	6	2633	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAATTGACGTGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5905	3668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
131865	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
131900	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
131906	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
131915	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
131941	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4579	34	3404	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
131967	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
132000	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3036	1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
132013	SIRV2	-	298	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1841	2336	666	307	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGCTCAGCGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4066	3336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
132032	SIRV5	+	397	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	875	47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132056	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132067	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	298	-74	-298	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATGCTAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
132074	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132130	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132181	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132191	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132203	SIRV5	+	144	1	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	7067	2780	-134	-2778	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGCGAAGTGTGCGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8067	8211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8100_8200
132209	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	886	29	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132216	SIRV2	-	648	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	2638	5	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
132219	SIRV2	-	303	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4570	34	3395	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
132278	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132295	SIRV5	+	215	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	302	151	188	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8503	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
132298	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132314	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_1702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132315	SIRV5	-	452	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCCAGTTCTCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
132318	contig_8538_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_4722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	78	311	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842750	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
132368	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132382	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132395	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
132404	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
132414	SIRV5	+	415	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
132419	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132428	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
132469	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
132514	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
132523	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132564	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132565	SIRV5	+	387	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7486	-1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
132573	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132582	contig_4364_pilon	+	438	3	Intergenic	novelGene_537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	76	438	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530449	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
132593	SIRV5	+	372	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	4	7586	4	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
132598	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
132604	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2150_2273_2316_3298_3405_3483
132628	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132643	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	34	3232	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
132652	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	882	4	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132653	SIRV2	+	417	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	161	-55	-161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATAAATACCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
132677	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
132700	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
132717	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132754	contig_4364_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_2609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAACCATCAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533288	1532937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
132766	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132778	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
132788	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	38	3370	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
132821	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
132829	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	62	3226	-27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCCAGTTATCTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
132837	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
132876	SIRV2	+	643	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTCGTTCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
132880	SIRV2	-	386	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3036	-2	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
132885	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
132895	SIRV5	+	609	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-286	882	-172	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8029	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132928	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
132931	SIRV5	+	369	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7586	-4	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
132934	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132939	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
132944	SIRV2	-	348	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2969	750	1790	-750	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTAGGCCTAGAACGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2942	1785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
132951	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
132960	SIRV5	+	443	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	886	-10	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
132965	SIRV2	-	333	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	34	3365	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
132975	SIRV2	-	302	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1524	19	361	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAGACATTCTTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4371	3684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
133000	SIRV2	-	374	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3303	-1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
133011	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
133033	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133132	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	34	3087	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
133150	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	253	156	139	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8454	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
133172	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
133205	contig_4364_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532873	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133210	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133261	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
133275	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
133337	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133352	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	38	3085	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
133389	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3400_3483
133408	contig_12120_pilon	-	3663	6	Intergenic	novelGene_21404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_1	528.942189657811	1864	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2630	2968	21900	21562	FALSE	5	ATCCTGGTTTGGTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEFKK	156967	20866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_156911
133409	SIRV2	-	636	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGACATTCTTGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
133443	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
133448	SIRV2	+	615	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-69	-23	-69	23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAACCTGGAGGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
133455	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	41	3423	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
133494	SIRV2	+	606	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	-28	-55	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1700
133510	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
133511	contig_8538_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_5015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
133527	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133534	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
133542	SIRV2	-	580	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	69	3083	-34	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATTTGCCAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
133552	SIRV2	-	641	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	18	2958	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
133557	contig_4105_pilon	-	3766	16	Intergenic	novelGene_21488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	734.620579316667	2298	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	36	1859	137447	100151	TRUE	30	TTTAATGCAGAAATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137482	98166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_98604_98680_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
133616	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133621	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
133641	contig_8538_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_4901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
133655	SIRV2	-	462	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	50	3220	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
133698	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
133733	contig_16496_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_5115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATTTTTATACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_0_1300
133739	SIRV2	-	195	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3690	-1	-1060	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCACCCCCATTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
133753	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	41	3371	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
133769	contig_4364_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_4491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533111	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
133798	SIRV5	-	163	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2010	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_1149_1986
133827	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
133828	SIRV5	+	379	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2273_2316_3298
133835	contig_4364_pilon	+	361	3	Intergenic	novelGene_602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	72	359	1530895	1531261	FALSE	15	CCCCGAGGAGCACCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRV	1530453	1531263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
133862	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_1997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
133866	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
133882	SIRV5	+	453	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-123	875	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8192	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
133885	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTGAAGCAGACGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533316	1532890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
133902	SIRV2	+	399	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-341	18	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCTAATTCTTGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3692	4475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4338
133911	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
133921	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
133934	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
133939	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
133975	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
133986	SIRV2	-	286	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	34	3412	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
133993	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134004	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134013	contig_10958_pilon	+	1986	5	Intergenic	novelGene_5414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4654.45353263947	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888229_888895_889054_893824_893874_895279_895855_900457
134033	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
134044	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
134046	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134061	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134068	contig_4364_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_3668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
134075	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
134077	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134082	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134089	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134128	contig_4364_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_2824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
134198	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_3941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATAAAGTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134210	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	35	3078	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
134213	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
134264	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134294	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_3801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134306	contig_4364_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_3915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCGGGAATACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
134327	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	38	3386	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
134331	SIRV5	+	401	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2066_2270_2316_3298_3405_3483
134375	SIRV5	+	437	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	878	4	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134384	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134398	SIRV2	-	366	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4499	42	3324	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
134405	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134435	SIRV5	+	445	5	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	1216	5382	1216	2011	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAACGCAGACGATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2272	5609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543
134437	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
134443	SIRV5	+	344	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-222	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATAGCGCCAACAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2279_2316_3298
134472	SIRV2	-	251	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	37	660	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACATTCTTGAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
134475	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
134490	SIRV2	-	418	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4455	34	3280	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
134500	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	41	3376	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
134505	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134515	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
134542	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134569	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134598	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
134628	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
134650	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134654	SIRV2	-	502	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1189	2332	14	311	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCAGCGCTAGTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
134683	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134687	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
134697	contig_4364_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_4516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533119	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134701	contig_4364_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_4315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACAACCCACAGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533300	1533080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
134710	contig_8538_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_5019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842818	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
134730	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134738	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	38	3376	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
134744	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134756	SIRV2	-	266	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	36	3430	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
134775	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
134824	SIRV5	-	409	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTAATTTCGCACACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
134840	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
134859	SIRV5	-	300	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTAGAGCGTTACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
134889	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
134975	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_1715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
134993	SIRV2	-	189	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-1063	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTGTCACCCCCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4798_5786
135009	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135022	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
135033	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135052	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
135061	contig_4364_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	TGACGGAGGCGCCCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
135083	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135137	SIRV2	-	370	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2964	733	1785	-733	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTATAGAAGTGGTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2947	1768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
135151	contig_8538_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_5002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842814	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
135155	contig_3956_pilon	+	2675	14	Intergenic	novelGene_14966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1126.08594793212	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	739	2481	1285728	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWPAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285681_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290367_1290613
135158	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135161	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_1212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACGCGGCGGTGTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135193	SIRV2	-	362	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4511	34	3336	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
135202	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	72	404	1530895	1531306	FALSE	40	CCCAAGGCCAACAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530453	1531306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
135233	SIRV2	-	596	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4277	34	3102	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1630	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
135248	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
135260	contig_4364_pilon	+	434	3	Intergenic	novelGene_366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	81	434	1530895	1531327	FALSE	20	ATGACCCAGGTGACTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREK	1530444	1531327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
135305	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
135320	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
135345	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
135362	SIRV2	-	198	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3687	-1	-1057	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCCCATTTACATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
135408	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
135436	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	880	-43	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
135445	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGGCGGTGTGTTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135463	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135464	contig_5988_pilon	-	2785	8	Intergenic	novelGene_16101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2057	2428	1224879	1222038	TRUE	5	CTTCTTCAGGTGCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIITEHATCNVCKEEMRGGGRSHQTEKGWMAISLLLFFLVLLIHSQDHHEFSEQSNKIQEEVNTMPDIILISIFSLFNNKLSIKKDKATHDHQPHIQVCLEKPNGSKEKVAQGGQDHQAHG	1226935	1218898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1218975_1219913_1220035_1221371_1221421_1221715_1221814_1222024_1222105_1222577_1222678_1223381_1223459_1224751
135476	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135482	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
135497	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135568	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
135570	SIRV2	+	439	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	158	-74	-158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACCACTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
135582	contig_4364_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_2266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135590	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
135599	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-140	878	-26	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8175	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
135630	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
135632	SIRV5	+	457	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7427	-1	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACTTTCGGTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
135646	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135671	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	37	3381	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
135682	SIRV2	+	190	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4733	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4800_5787
135685	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135694	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135742	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
135760	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
135766	contig_4364_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_2742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532971	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
135779	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135800	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135806	contig_8538_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_4798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842766	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
135820	SIRV5	+	430	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7452	1	-59	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
135829	SIRV2	-	495	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2936	1	-306	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTTGTGATCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
135844	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2279_2316_3298_3405_3483
135847	SIRV5	+	325	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	5	875	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8320	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
135859	SIRV2	-	604	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1100_1700
135882	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7588	-1	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
135909	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135919	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	78	3084	-43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAATTGTGAAGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
135936	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
135957	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
135962	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2152_2270_2316_3298_3399_3478
135988	SIRV5	+	2061	17	FSM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	19	5	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	206127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
135990	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
136017	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136030	contig_4364_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_4343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAACAACCCACAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
136051	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
136086	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
136101	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	47	3379	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
136104	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136162	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
136164	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
136188	SIRV2	-	364	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	34	3334	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
136226	contig_4364_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_3667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
136253	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136338	SIRV5	+	399	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2082_2157_2270_2316_3298_3405_3483
136356	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136373	SIRV5	+	374	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7587	1	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
136388	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
136392	contig_4364_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_1481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACAGACCGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533258	1532908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
136395	SIRV2	+	462	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	134	-73	-134	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAATGACTCTAATACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
136421	SIRV2	+	309	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	288	-74	-288	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCATACTTATTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
136464	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
136469	contig_8538_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_4662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842087	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842308_842991
136500	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
136503	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136505	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
136540	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
136569	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	-31	-68	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
136583	SIRV2	-	251	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4622	34	3447	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
136596	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-58	876	56	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8257	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
136597	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	77	400	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530448	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
136605	contig_8317_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_19758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
136613	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7481	-2	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
136654	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
136669	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136683	SIRV5	+	305	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	22	878	22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8337	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
136693	contig_4364_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_4022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
136711	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
136714	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
136724	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4427	35	3252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
136823	SIRV2	-	375	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
136829	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
136840	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
136892	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
136916	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
136925	SIRV5	+	448	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-127	884	-13	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8188	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
136926	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
137014	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
137078	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_3979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137079	contig_8538_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_5048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842826	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
137113	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137132	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
137203	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	900	-55	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
137209	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137215	SIRV2	-	640	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	16	2961	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
137230	contig_4364_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_2771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532989	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
137242	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
137261	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7490	-1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
137304	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137314	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137350	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137414	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137420	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	882	32	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
137422	SIRV5	-	405	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1102	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3508	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1147_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
137425	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7485	-1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
137489	contig_4364_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_2757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532980	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
137512	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137518	contig_8538_pilon	+	363	2	Intergenic	novelGene_4661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842083	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842172_842854
137540	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532854	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137550	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137610	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137651	SIRV2	+	636	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-98	-15	-98	15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTACATGGTAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	1646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
137671	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
137675	SIRV2	-	413	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1415	17	252	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4480	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
137677	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
137684	SIRV5	+	211	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	26	8695	-11	-104	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTATTTAGCGAAGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	2294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
137686	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-42	875	-42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8273	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
137693	SIRV5	+	197	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5329	4099	-1816	3294	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGCAAGTAACAACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6385	6892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
137707	contig_4364_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_3651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACATCAGCTAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1533054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
137719	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4390	51	3215	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
137728	contig_6871_pilon	-	4824	1	Intergenic	novelGene_21656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	745	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2536	2898	767382	767020	NA	70	TTATTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETLLFSSLPVGSTYATFQIVTGEYLVSWFSSFSTLTQFCHLGCKGHSNVFDCSSDCGLLGVWWEGCLTRGLVRKEDDLLSSCSEGLRKSMCCLKLLEDFTTQQGQMLALNPLCSVAIL	769917	765093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_765100_769900
137736	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137742	contig_8538_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_5006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842815	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
137757	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137775	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137807	SIRV5	+	374	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298_3405_3483
137818	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
137838	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
137920	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
137952	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
137963	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
137992	contig_8538_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_4958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842803	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
138019	SIRV5	+	343	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7625	2	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTTAGCCGAATAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
138021	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	892	-46	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCCTCGTAGTATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
138052	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
138085	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
138110	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
138146	contig_4364_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_2459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
138167	SIRV2	+	277	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	320	-74	-320	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCACGCAATCGCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
138215	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138281	SIRV2	+	606	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	-19	-64	19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTAACCTGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
138367	SIRV5	+	312	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8457_8586_10858
138418	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
138421	contig_4364_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_3818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
138435	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138470	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
138483	SIRV5	+	194	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	323	151	209	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8524	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
138517	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138544	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138548	SIRV2	-	297	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4127	372	2948	-372	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCAGGTAGCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784	1407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
138592	SIRV2	-	458	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4415	34	3240	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
138638	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138642	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
138649	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138665	SIRV2	+	322	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	275	-74	-275	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTTTGATGTTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
138691	SIRV5	+	395	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2163_3271_3405_3483
138694	contig_4364_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_4172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTTCCAGCGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
138731	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
138748	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
138770	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138788	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138864	contig_4364_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_2773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532992	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
138876	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
138882	contig_8538_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_4747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842757	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
138895	contig_4364_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_2460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
138970	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
138984	SIRV2	-	255	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4618	34	3443	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
139022	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
139034	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139040	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139043	contig_4364_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_2437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGCTCTTTGCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1532930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
139078	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
139179	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
139200	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
139204	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
139207	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
139212	SIRV2	-	262	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4611	34	3436	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
139232	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
139271	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
139284	SIRV2	-	362	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3313	1	-683	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCATGTCTGTCACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
139317	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
139339	contig_4364_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532876	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139362	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139376	SIRV2	-	463	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	38	3231	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
139396	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
139414	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139430	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139446	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139459	SIRV2	-	360	3	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4486_4693_4801_5788
139482	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
139487	SIRV5	+	303	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	22	880	22	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8337	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
139494	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	80	355	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530445	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
139512	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
139524	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139532	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	34	3087	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
139554	SIRV2	-	372	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4501	34	3326	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139578	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
139597	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	76	423	1530895	1531321	FALSE	35	GAGAAGATGACCCAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR	1530449	1531321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
139598	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139604	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139615	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	34	3426	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
139648	SIRV2	-	252	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	657	39	657	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4075	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
139706	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139759	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139767	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4608	34	3433	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
139777	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139791	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7607	-5	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACAGCGTTATTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
139794	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-73	875	41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
139800	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
139805	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	37	3380	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139851	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACAGACCGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
139862	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
139880	SIRV2	-	698	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	-2	322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCCATGAAAATGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	3321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4342_4480_4687_4801_5790
139909	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139919	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
139926	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139933	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
139953	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
139979	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
139990	SIRV5	+	355	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-202	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTGGTCCCACCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298
139993	contig_4364_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_4546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAACAGACTTAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
140022	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
140048	contig_8538_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_4761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
140067	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	6	878	6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8321	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140076	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140084	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
140096	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140125	SIRV2	-	393	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3029	-2	-399	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTTTCATTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
140139	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	886	-19	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140163	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140185	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140193	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	38	3394	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
140200	SIRV5	-	290	3	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	85	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2321	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2038_2228
140204	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	16	2959	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
140238	contig_8538_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_4979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
140240	SIRV5	+	249	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	2492	5364	2492	2029	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAGGAGTCGTCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3548	5627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_3644_5380_5451_5543
140250	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140272	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_3980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140299	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140342	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_2927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140350	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140356	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140382	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
140424	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140446	SIRV2	-	389	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-410	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
140466	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	35	3073	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
140474	SIRV2	-	368	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4505	34	3330	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
140479	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140485	SIRV5	-	345	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
140506	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140552	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140589	SIRV5	+	271	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
140626	SIRV5	+	282	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	45	878	45	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8360	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140648	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140664	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
140684	SIRV5	+	439	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7445	-1	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATCTAACATAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
140685	SIRV5	+	309	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8469_8586_10858
140770	SIRV7	-	200	1	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	3	146715	3	-91678	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGCTGAATGCAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147915	147715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
140777	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140782	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
140793	SIRV5	+	317	5	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	959	33	930	-33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTTTCGGTAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1986	3565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
140801	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140807	contig_4364_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_3690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACATCAGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533308	1533056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
140827	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140832	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140833	contig_10958_pilon	+	2020	4	Intergenic	novelGene_5404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	8	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888219	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889009_895279_895855_900457
140838	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
140841	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
140852	SIRV5	+	250	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	2486	5369	2486	2024	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGTAGGAGGAGTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3542	5622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_3644_5380_5451_5543
140880	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140884	SIRV5	+	362	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	880	-37	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
140894	contig_4364_pilon	+	385	3	Intergenic	novelGene_677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	64	384	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530461	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
140907	SIRV3	+	152	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	2654	4189	595	-1968	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGTGGTCAGCTAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4598	4750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4600_4800
140911	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140931	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
140940	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
140941	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7612	1	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCGCCAACAGCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
140968	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
140972	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141010	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141016	SIRV2	+	623	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	9	-109	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	550	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTAGGCCATGGCGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
141040	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
141143	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
141148	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	35	3371	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
141157	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
141191	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
141201	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141203	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
141210	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141214	SIRV5	+	299	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7669	2	-276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAAGCCTAAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
141219	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141224	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	268	-74	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
141237	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4406	34	3231	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
141247	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
141258	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141271	SIRV5	+	306	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	32	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10845
141276	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
141290	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
141309	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7471	1	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141314	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141335	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_2961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
141343	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141349	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141365	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3035	5	-405	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
141372	contig_4364_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_4518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533120	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141380	contig_5023_pilon	+	2460	14	Intergenic	novelGene_7336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2223.06221714593	13	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	3	1511	607312	646990	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607309	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_622560_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647374_647735
141418	SIRV5	+	415	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141439	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141448	contig_4364_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_4456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533100	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141452	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	893	-30	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
141453	contig_4364_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	68	382	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530457	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
141469	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4574	60	3399	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGTTATCTAAGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333	1060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
141474	SIRV2	-	575	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4298	34	3123	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
141477	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141531	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
141560	SIRV5	+	366	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-211	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCGTTATTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
141583	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
141590	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	201	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
141615	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
141622	SIRV5	+	457	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7432	2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATGACACTTTCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141634	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	38	660	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
141637	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	72	350	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530453	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
141679	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141685	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141693	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	61	423	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530464	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
141705	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141711	contig_4364_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_3864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGGCCCCAGCAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141716	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141728	contig_4364_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_4243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGTGTTCCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
141748	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
141765	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141781	SIRV2	-	391	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3031	-2	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
141829	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141836	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-52	880	-52	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
141866	SIRV2	-	255	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4611	41	3436	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
141881	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
141890	SIRV2	-	403	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
141898	contig_8538_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_4781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
141903	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141907	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
141908	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
141945	SIRV2	-	380	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4492	35	3317	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1415	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
141948	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
141975	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
141985	contig_4364_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACGGTATTGTCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
142010	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
142027	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142043	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142044	SIRV2	-	405	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5787
142056	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142112	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
142138	SIRV2	+	311	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-61	273	-61	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
142162	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142228	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGTGAACGGCGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
142268	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
142270	SIRV5	+	289	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	11	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8457_8586_10858
142283	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
142299	SIRV5	+	366	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2058_2270_2316_3298
142318	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
142333	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_1609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGCAGTGAACGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142338	SIRV5	+	366	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2062_2270_2316_3298
142354	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
142436	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	-1	2961	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
142441	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	40	3382	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
142456	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
142491	SIRV2	-	194	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3694	0	-1064	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTGTCACCCCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
142504	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
142509	SIRV2	-	280	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	35	3417	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
142568	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	38	3388	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
142571	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	35	3078	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
142659	SIRV5	+	179	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	1	-363	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCCACGGTCGTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	2035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985
142665	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
142754	contig_4364_pilon	+	382	3	Intergenic	novelGene_295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	81	380	1530895	1531273	FALSE	10	CCCTGTGTTGCTGACGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEE	1530444	1531275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
142761	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142769	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7475	-1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
142781	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
142844	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-399	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTTTCATTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
142851	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142865	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142889	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142917	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142921	SIRV2	-	251	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	657	40	657	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGACATTCTTGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4075	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
142927	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	12	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2310_3298_3405_3483
142943	SIRV6	-	406	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATGCGAATGTAAACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	11414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
142961	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
142985	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	882	17	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
142990	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
142996	SIRV2	+	626	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-29	-74	29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGAGGATATGGTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
143004	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143009	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	34	3394	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
143039	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143090	contig_4364_pilon	+	322	3	Intergenic	novelGene_720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	53	322	1530895	1531243	FALSE	20	TATAACGAGCTGCGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530472	1531243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
143123	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143129	SIRV2	+	288	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	309	-74	-309	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAAGATACGCAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
143139	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143154	contig_8538_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_4834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
143159	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143164	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4574	35	3399	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
143182	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143192	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
143205	SIRV5	+	350	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-17	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8448_8586_10858
143233	contig_4364_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_2746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532974	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143239	SIRV2	-	450	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2981	1	-351	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAATGTTAAAGCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
143243	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
143257	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842799	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
143313	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143322	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	878	30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143350	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
143370	SIRV2	-	594	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4275	38	3100	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
143388	SIRV2	-	251	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	667	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4065	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3831_3969
143405	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_1991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143423	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
143434	contig_4364_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_4529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533123	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143457	SIRV5	-	431	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGACCTAGAGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
143464	SIRV2	+	477	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	120	-74	-120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTCTTGCAACTTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
143475	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143496	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	45	3083	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
143502	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	887	-24	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143525	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143541	contig_4364_pilon	-	374	3	Intergenic	novelGene_698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACCAGCAGCGAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531289	1530466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
143557	SIRV5	+	269	3	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCGCGGGTGGCGGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270
143562	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143579	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143692	SIRV5	+	381	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	31	7471	11	-78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
143693	SIRV5	+	407	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-77	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8238	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143713	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	53	3228	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
143741	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	880	50	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
143744	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143747	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143764	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
143770	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143782	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
143791	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
143817	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143822	contig_8538_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_5098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842920	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
143833	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
143858	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
143862	SIRV2	-	501	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	146	3085	-111	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTGGAGTGCAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
143870	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	2	1161	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
143904	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
143913	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_2309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTTTGCATTAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
143940	SIRV2	-	614	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	2681	0	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATTTAGACCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	3716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
143955	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143958	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
143969	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
143971	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
144057	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144064	contig_5023_pilon	+	2837	16	Intergenic	novelGene_7292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	1860.47279534591	4	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	65	1948	607279	646990	FALSE	30	TTTAGCAGCCCTAATAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580864	647879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
144069	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
144075	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
144083	SIRV5	+	381	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
144112	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144135	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144155	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7485	-1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
144177	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144185	SIRV2	+	621	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-67	-31	-67	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
144214	contig_8538_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_4968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842806	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
144226	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	34	3430	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
144245	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	34	3227	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
144263	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
144269	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144297	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144305	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
144355	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842812	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
144392	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	34	3411	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
144398	contig_9471_pilon	+	3209	11	Intergenic	novelGene_21784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_10	676.23578728133	4242	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	1980	2981	412726	417296	FALSE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406947	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
144401	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144402	SIRV2	-	361	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGTCATGTCTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
144446	contig_8538_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_5050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842827	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
144460	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144526	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
144535	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144543	SIRV5	-	418	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1121	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3527	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
144545	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144570	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	7	2962	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	226	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
144573	SIRV5	+	467	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	887	-35	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
144595	SIRV2	-	299	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4574	34	3399	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
144613	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
144619	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532964	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144744	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7482	2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
144777	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
144788	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144790	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	878	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
144801	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
144812	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3483
144832	SIRV2	-	400	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
144836	contig_8538_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_4709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	82	315	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842746	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
144837	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
144848	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
144850	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
144862	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	401	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
144866	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
144892	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	369	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
144895	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_2913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144904	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144930	SIRV5	+	343	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-200	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGTCCCACCCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2312_3298
144948	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
144956	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
145032	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
145050	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
145091	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145108	SIRV5	+	398	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2064_2270_2316_3298_3405_3483
145114	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
145143	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
145147	SIRV2	-	587	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4282	38	3107	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
145157	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
145172	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	35	3224	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
145178	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7479	-1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
145180	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
145187	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_3942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
145237	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145338	SIRV2	-	409	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-393	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4342_4480_4687_4801_5788
145365	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
145374	SIRV5	+	392	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-4	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
145385	SIRV2	-	196	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3689	-1	-1059	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACCCCCATTTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
145389	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	47	3380	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
145413	SIRV5	+	720	9	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	2545	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	20	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTCGAAGAAGGTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	6143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3641_5380_5451_5543_5627_6111
145423	SIRV5	+	366	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	880	-41	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
145428	SIRV2	-	403	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4467	37	3292	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
145451	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145471	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145517	contig_4364_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532778	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
145526	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
145527	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
145534	contig_4364_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_3517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAAGGAAACTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533315	1533043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
145549	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
145550	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
145552	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
145553	contig_4364_pilon	+	302	3	Intergenic	novelGene_246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTATTGTCACCAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
145558	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
145586	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
145602	SIRV2	-	574	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4299	34	3124	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
145621	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145626	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145661	SIRV2	-	197	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3686	1	-1056	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCCCATTTACATTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
145670	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	875	12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
145697	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145702	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
145711	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145725	SIRV2	+	651	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	132	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCTCGTTCTAGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
145731	contig_4364_pilon	+	304	3	Intergenic	novelGene_250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	222	81	302	1530895	1531195	FALSE	30	TGTCACCAACTGGGACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHG	1530444	1531197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
145763	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3041	0	-411	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
145768	SIRV2	+	616	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	-23	-70	23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAACCTGGAGGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
145784	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145823	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
145858	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
145876	contig_4364_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCATCCCTCACACCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533300	1532859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
145898	SIRV5	+	289	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-281	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTGGCAAAAGCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
145930	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_2826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533011	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
145933	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145972	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
145974	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
145983	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
145997	SIRV5	+	380	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7588	2	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
146046	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146049	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
146054	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	34	3430	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146072	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
146076	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146098	SIRV2	-	395	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3038	-1	-408	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
146102	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	38	3394	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146108	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	48	3373	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGACGTGGTGATTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
146111	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
146124	SIRV2	-	295	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-748	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACATGCCCATATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
146144	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146148	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7477	2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
146180	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146183	contig_4469_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_21883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTAGTCCATGTGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235062	234201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_234200_235100
146212	scaffold_12124_pilon	+	3112	10	Intergenic	novelGene_22291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	5	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1154	1933	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
146227	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146238	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_2949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
146274	contig_4364_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_3632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACATTAGGCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146286	SIRV2	+	658	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-72	140	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGGCCTACGTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1651_1727
146322	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	34	3411	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146325	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146329	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
146356	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146390	SIRV2	-	642	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2648	1	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGACATTCTTGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
146396	SIRV2	+	463	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	169	-109	-169	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTATTATGCTATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
146399	SIRV2	+	490	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-677	274	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTGGTATGTTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3356	4731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3374_3664_3828_3967_4095_4340_4479_4686
146407	contig_4364_pilon	+	412	3	Intergenic	novelGene_531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	76	411	1530895	1531309	FALSE	40	AGGCCAACAGGGAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530449	1531310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146420	SIRV2	-	280	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4593	34	3418	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146430	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
146433	SIRV5	+	292	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	38	875	38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8353	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
146471	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
146490	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
146503	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146517	SIRV2	-	451	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2980	1	-350	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAATGTTAAAGCAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
146540	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146550	contig_8538_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_4680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	108	341	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842720	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
146570	SIRV2	+	427	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	170	-74	-170	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTATTATGCTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
146575	SIRV5	-	240	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10967	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
146650	SIRV2	+	459	4	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-344	283	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTTTAGTTTACACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3689	4740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340_4469_4674
146658	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146659	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
146668	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146681	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
146682	contig_4364_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	76	408	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530449	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146703	SIRV2	-	426	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4443	38	3268	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1464	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
146709	contig_4364_pilon	+	392	3	Intergenic	novelGene_487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	76	390	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530449	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146726	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146738	SIRV5	+	221	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	296	151	182	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8497	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
146741	SIRV7	-	245	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146674	1	-91640	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTAGCACGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
146783	contig_4364_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_1137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCGGTGAAGCAGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
146792	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	80	400	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530445	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
146794	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146826	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146851	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	38	3384	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
146894	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_1993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146911	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146918	SIRV5	+	464	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACTTTCGGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
146924	SIRV5	+	362	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	886	-43	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
146927	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146960	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
146984	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
146995	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
147016	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	48	3392	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGACGTGGTGATTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
147017	contig_4364_pilon	+	430	3	Intergenic	novelGene_655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	68	430	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530457	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
147030	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147066	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
147082	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147083	contig_10904_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_22557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400160	402586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_400200_402600
147095	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147113	SIRV5	+	281	4	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	8670	2	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
147116	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	884	-25	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147122	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147125	contig_4364_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_2675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532945	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147152	SIRV2	-	213	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4652	42	3477	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
147153	SIRV5	+	455	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147170	contig_4364_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_1937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
147191	SIRV7	-	2015	4	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	33098	5	-82	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114820	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_114680
147196	SIRV2	-	431	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4442	34	3267	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
147248	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_1998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
147261	SIRV2	-	374	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3303	-1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
147276	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
147301	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	878	-20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147312	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147327	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	882	2	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147332	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	9963	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	8	397	1530895	1531645	FALSE	20	GCCATGTATGTTGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTP	1530887	1531645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096_1531337_1531618
147404	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
147405	SIRV5	+	278	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
147425	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
147431	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147462	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
147482	contig_4364_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACACCTCGGCGACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1532852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
147485	contig_4364_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	76	387	1530895	1531285	FALSE	20	CTGACGGAGGCGCCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530449	1531285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
147508	SIRV2	+	466	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	131	-74	-131	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGACTCTAATACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
147592	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	884	-56	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147598	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7480	-5	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
147606	SIRV5	-	397	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAATTTACGGTGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
147628	contig_4364_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532871	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147631	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
147644	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147685	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147698	contig_4364_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_1234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCGTGAGGTCGGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1532900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
147716	SIRV5	+	391	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	899	29	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGACGTCCTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
147745	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
147800	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
147808	SIRV2	-	496	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1189	2338	14	305	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTGCTCAGCGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
147812	SIRV2	-	357	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	20	3303	4	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
147823	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147836	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
147859	contig_4364_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_2810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
147870	SIRV2	-	550	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4312	45	3137	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
147873	contig_4364_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_3779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGGGAATACATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
147927	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
147985	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
147991	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	0	2961	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
148007	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
148018	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-137	897	-23	-20	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGACGTCCTCGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148043	SIRV5	+	283	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	47	875	47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8362	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148074	SIRV5	+	437	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8596_10875
148095	SIRV5	-	370	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGATGCGTAAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
148109	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	35	3075	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
148129	SIRV5	+	415	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
148142	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
148156	SIRV5	+	289	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	30	886	30	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8345	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148233	SIRV5	-	400	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTACGGTGGTAATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
148253	SIRV5	+	586	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-256	875	-142	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8059	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148279	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
148315	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
148346	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
148371	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
148406	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
148413	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
148423	SIRV2	-	462	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	45	3225	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
148435	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
148439	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
148472	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
148475	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4144	0	2965	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
148479	contig_4364_pilon	+	462	4	Intergenic	novelGene_635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	72	461	1530895	1531645	FALSE	20	CCATGTATGTTGCCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTP	1530453	1531646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
148497	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
148524	SIRV5	+	436	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7435	1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTATGACACTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
148533	contig_4364_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_2748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532975	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
148556	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	887	14	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148577	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7472	-1	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
148599	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
148619	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
148639	contig_4364_pilon	+	198	2	Intergenic	novelGene_239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGGTGAGTAGCGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888
148678	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	38	3396	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
148720	SIRV2	-	1016	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2961	10	1782	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	175	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2950	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
148737	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_3094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
148740	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
148751	SIRV5	+	218	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	294	156	180	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8495	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
148761	SIRV2	+	465	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	132	-74	-132	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGACTCTAATACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
148791	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
148836	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
148839	contig_4364_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_1343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGACCGTGAGGTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533288	1532904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
148844	contig_4364_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_2142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCATTAATACCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1532922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
148853	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
148877	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
148901	SIRV2	+	469	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	128	-74	-128	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCTAATACCTCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
148919	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
148935	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
148987	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
149064	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
149065	SIRV2	+	616	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-19	-74	19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTAACCTGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
149070	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
149074	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
149090	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
149115	SIRV2	-	384	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4517	6	3342	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTGACATCCCAACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
149185	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	878	9	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
149202	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
149215	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
149221	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
149244	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	35	3274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
149292	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	34	3403	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
149293	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	81	359	1530895	1531252	FALSE	10	CTGCGTGTGGCCCCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530444	1531252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
149308	contig_4364_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_4526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533122	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
149310	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
149321	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
149344	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
149360	SIRV2	-	426	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	63	3243	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
149366	contig_4364_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532879	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
149384	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
149395	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
149411	contig_4364_pilon	+	342	3	Intergenic	novelGene_648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	68	340	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530457	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
149418	SIRV2	-	182	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3706	0	-1076	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAAATGGTAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
149435	contig_8538_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_4769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	67	300	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842761	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
149461	SIRV2	+	621	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-24	-74	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAACCTGGAGGATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
149470	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	53	3390	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
149495	SIRV2	+	432	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	161	-70	-161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATAAATACCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
149526	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
149544	contig_8581_pilon	-	3640	18	Intergenic	novelGene_22828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	507.402060708343	1691	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2760	127	2886	386058	307094	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	386184	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
149564	SIRV5	-	440	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTAGAGATGTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
149577	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298
149597	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
149615	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
149647	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
149648	SIRV5	+	357	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7606	-1	-213	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACAGCGTTATTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
149670	contig_4604_pilon	+	498	3	Intergenic	novelGene_19135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_2	69.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAGAGGAGCCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339846	350250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_350185
149673	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
149731	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	875	31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
149761	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
149856	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
149857	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
149926	SIRV5	+	411	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
149928	SIRV5	+	188	3	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2645	2855	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCGTGACAGCCGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5556	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_5627_6111_6170_6393
149977	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
149993	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
150004	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3039	1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
150006	SIRV2	-	1025	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2963	-1	1784	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2948	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
150043	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
150047	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
150060	contig_4364_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_2735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532969	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
150108	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	880	-18	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
150113	SIRV2	-	280	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4593	34	3418	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
150119	contig_4364_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_2684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532949	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150140	SIRV5	+	233	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	277	158	163	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8478	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
150147	SIRV5	+	361	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
150155	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
150158	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150165	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
150186	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150233	SIRV7	-	2322	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	27	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2309_2446_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147611
150241	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
150256	SIRV2	-	282	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	38	3412	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
150375	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
150386	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
150423	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
150436	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
150445	contig_8538_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_4782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
150457	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_3865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
150474	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	279	-74	-279	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGACTTTGATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
150489	SIRV2	-	499	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1189	2335	14	308	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGCTCAGCGCTAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
150501	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
150519	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
150565	SIRV5	+	388	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
150567	SIRV5	+	254	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	254	160	140	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
150615	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150632	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
150650	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150661	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150666	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	678	21	678	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTGACGTGGACGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
150674	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	876	44	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
150700	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
150793	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
150802	contig_5727_pilon	+	3660	22	Intergenic	novelGene_7956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	950.717998156204	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	794	2899	173359	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKPSPTPSSPFPPPFFVFRSPSLSFPCSRRPDPEEAAAVAAAEFSVKVFHLSLPVPSPSINIILLKILRCQAAKVESAIAEGGASRFSASSDGGGSRGAPQHYPKTTGNSEFLGKTPGQNAQKWIPARSTRRDDNSAANNSANEKERHEKFDKLCLELLNVGVESKLILKGVILLIVDKALEEPKYSSLYAQLCLRLAEDAPNFDGPAAEGQPGQKQSTTFRRLLISKLQDEFENRTRNVDVYDKRENPLLPEEEEQRAIAKIKMLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168241	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171302_171912_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
150809	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	40	3388	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
150813	contig_8538_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_4667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAGCTGTTTCCCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843128	842524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842642_842868
150814	contig_8538_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_5103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842944	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
150830	contig_11338_pilon	+	3250	11	Intergenic	novelGene_6175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	418.493596127826	22	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	299	1441	6086	11802	FALSE	25	CTGAATTTAACCTCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFCPQAFGIQHVKAGFGQAGSSHSSFCTC	745	13611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10555_11719
150833	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
150845	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
150851	SIRV2	-	405	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4284	218	3109	-183	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGTCAGGTGAATGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623	1218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1200_1600
150867	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	38	3238	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
150883	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
150887	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
150904	SIRV2	+	444	4	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-327	283	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTTTAGTTTACACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3706	4740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4089_4331_4480_4686
150907	contig_4364_pilon	+	334	3	Intergenic	novelGene_712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	58	333	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530467	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
150941	contig_4364_pilon	+	358	3	Intergenic	novelGene_284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
150976	contig_4364_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532774	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
150982	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	878	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
150991	contig_4364_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_2587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151009	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4421	63	3246	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
151013	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
151066	contig_4364_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	52	387	1530895	1531309	FALSE	45	AAGGCCAACAGGGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530473	1531309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
151073	contig_4364_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_1067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151078	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151079	contig_8538_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_4982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
151110	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
151120	SIRV2	+	465	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	132	-74	-132	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGACTCTAATACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
151141	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	34	3127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
151175	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	49	3079	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
151187	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
151205	SIRV5	+	230	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	183	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8498	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8586_10848
151237	contig_4364_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_3234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTAAGGCTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
151241	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
151324	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
151340	SIRV2	-	399	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3037	0	-407	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
151346	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
151349	contig_4364_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_3502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAGGAAACTGGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
151387	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	62	7651	62	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
151408	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
151446	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
151465	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
151468	contig_14273_pilon	+	2871	6	Intergenic	novelGene_21158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	565.516754835787	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	182	1546	138031	151187	FALSE	15	GATTTGTTTTTTCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	135636	152512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_135723_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
151477	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151519	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
151543	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-113	893	1	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8202	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
151544	SIRV5	+	440	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTCGTAAGTGGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3401_3483
151559	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_2928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
151600	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
151628	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
151632	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
151651	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
151664	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
151669	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151701	SIRV2	-	561	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4312	34	3137	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
151716	SIRV2	-	408	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3028	0	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
151745	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_1925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
151789	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
151846	SIRV5	+	345	3	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	3	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGCCAGTTTAGCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022	2404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2267
151870	SIRV2	-	561	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4312	34	3137	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
151907	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	34	3367	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
151908	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_4102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
151929	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
151986	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4590	38	3415	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
151995	SIRV2	-	477	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4396	34	3221	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
152026	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	882	-10	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152047	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152050	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152076	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
152089	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152090	SIRV5	+	230	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	22	8680	13	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCGTATCGCGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
152103	SIRV5	+	422	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
152105	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	887	-19	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152119	contig_4364_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_1284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAACATTAGGCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152181	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152220	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-42	875	-42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8273	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152253	contig_4364_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	72	344	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530453	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
152289	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152291	contig_4364_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	60	386	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530465	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
152293	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152321	contig_4364_pilon	-	269	3	Intergenic	novelGene_566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGAGACCGACCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531171	1530453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
152331	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	38	3374	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
152356	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152360	SIRV5	+	301	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	902	2	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152373	contig_233_pilon	-	2667	16	Intergenic	novelGene_14637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1472.76980776585	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	96	2549	126907	78267	FALSE	15	GGGTGTCCTAGAAGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEPCPTGHGLQLLIISSINQNFSLYFLSCPRNDRYGQVFIRTHQKGQSPIHDLYNFFDGDLKMESLKSSKVRYMFSS	127002	78148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78495_78998_79142_91473_91677_92138_92350_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
152378	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152456	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	38	3424	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
152470	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
152494	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	887	-4	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152513	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
152534	SIRV2	-	539	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	118	3075	-83	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATGCGGCAAATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
152552	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	81	305	1530895	1531198	FALSE	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530444	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
152558	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4307	34	3132	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
152573	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152575	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152585	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152588	SIRV5	-	459	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTCTCCACCTTCACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
152592	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152595	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152626	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152642	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	886	13	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152652	contig_4364_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_3060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGCTCAGATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
152665	SIRV2	-	420	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	38	3274	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
152713	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152723	SIRV5	+	439	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7445	-1	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATCTAACATAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
152763	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152782	SIRV2	-	354	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4519	34	3344	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
152801	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152834	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533099	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152838	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
152840	SIRV5	+	458	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	880	-19	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152875	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
152879	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533109	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152890	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
152901	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-38	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
152909	contig_4364_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
152939	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
152952	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
152985	contig_8538_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_5052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842827	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
153002	SIRV5	+	381	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7587	2	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
153005	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
153024	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
153054	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153069	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
153076	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
153086	SIRV2	-	392	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-409	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
153092	contig_8538_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_4973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842809	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
153122	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	234	-1	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
153128	SIRV5	+	390	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1205_2270_2316_3298_3405_3483
153130	SIRV5	+	452	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
153194	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4417	35	3242	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
153265	SIRV5	+	296	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	900	9	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
153271	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
153276	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
153297	SIRV5	+	427	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7430	6	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGACACTTTCGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
153311	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153342	SIRV5	+	380	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7588	2	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
153352	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	257	151	143	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8458	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
153355	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
153377	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153417	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
153474	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
153499	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
153509	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153510	SIRV2	-	196	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3692	0	-1062	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTCACCCCCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
153532	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
153571	SIRV2	-	455	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-346	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTTAAAGCAAACGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
153599	SIRV2	-	565	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4308	34	3133	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
153603	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7483	-5	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
153618	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	886	-30	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
153663	SIRV2	-	442	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	23	2971	7	-341	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAAACGACAACGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
153688	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153757	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	880	10	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
153758	SIRV5	-	382	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCAGTAGGACGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
153769	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7440	-1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
153771	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
153831	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
153841	SIRV6	+	382	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10443	1	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11443	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
153877	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	42	3217	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
153880	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
153892	contig_4364_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_1771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACCCTGCACAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
153911	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
153951	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
153956	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
154013	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154023	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	496	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
154031	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154078	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154148	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154169	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	35	3375	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
154191	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
154194	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154196	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154232	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
154240	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154268	SIRV5	+	431	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7443	-2	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
154288	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154292	SIRV2	+	599	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-61	-15	-61	15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTACATGGTAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	1646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
154299	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154323	SIRV5	+	381	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298_3405_3483
154335	SIRV2	-	185	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3703	0	-1073	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGGTAAAACTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
154355	SIRV5	+	274	4	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	8677	2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTATCGCGGGTGGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
154377	SIRV5	+	462	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8178	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8459_8586_10858
154384	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154397	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154408	SIRV5	+	354	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7602	-5	-209	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGTTATTATTTGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
154461	SIRV5	+	455	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154478	SIRV5	+	281	4	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	8670	2	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
154486	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
154521	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154526	SIRV2	-	196	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3689	-1	-1059	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACCCCCATTTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
154571	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
154573	contig_4364_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_2809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
154646	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
154653	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154656	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154659	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154702	SIRV5	+	369	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2150_2270_2310_3298
154705	SIRV5	-	331	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGTATTTGACCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
154732	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154765	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	-1	2962	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
154799	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	665	35	665	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4067	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
154829	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	900	-1	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154846	SIRV5	+	235	3	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAAGGTCGCCGTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2267
154862	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
154882	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
154886	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842820	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
154891	SIRV5	+	303	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	876	26	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
154935	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
154945	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
154947	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533018	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
154982	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
155011	SIRV5	+	337	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	0	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3271_3405_3483
155012	SIRV5	+	398	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-68	875	46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8247	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
155013	contig_4364_pilon	+	377	3	Intergenic	novelGene_715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	58	375	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530467	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
155035	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155048	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155061	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155065	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155095	SIRV2	-	1013	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2975	-1	1796	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	539	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2936	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
155155	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155159	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
155250	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
155293	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
155311	SIRV2	-	547	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	2734	-2	-104	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGATCGTAATGCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	3769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
155313	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
155338	SIRV2	-	391	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
155365	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155368	contig_4364_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_3802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
155374	SIRV2	-	190	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4683	34	3508	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
155380	contig_4364_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_3330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGGGTCCTAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1533034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
155390	SIRV2	+	211	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4713	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4804_5790
155415	SIRV5	-	418	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACTTCGCACGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
155459	contig_4364_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_3591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAGCTAAGAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
155499	SIRV5	+	242	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	275	151	161	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8476	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
155513	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155528	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_3734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155584	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155596	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	915	-29	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGTCGGAGACCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
155620	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
155632	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_1994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155665	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
155682	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
155696	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
155701	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
155709	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_3868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155749	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
155758	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_2871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
155771	SIRV5	+	473	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	878	-32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
155774	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155779	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
155795	SIRV5	+	315	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-9	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8460_8586_10858
155801	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155809	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	34	3243	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
155836	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
155840	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
155883	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
155982	SIRV2	-	360	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4513	34	3338	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
156026	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
156061	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156068	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156082	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
156104	SIRV5	+	391	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2085_2157_2270_2316_3298_3405_3483
156109	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-126	880	-12	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8189	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
156137	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156143	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
156146	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
156151	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
156166	SIRV2	-	307	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	34	3391	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
156196	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
156213	contig_4364_pilon	-	388	3	Intergenic	novelGene_296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGACCGCGGCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531283	1530444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530514_1530885_1531015_1531093
156232	SIRV2	-	331	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-717	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGTTCATCCAGTAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
156254	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
156270	contig_8538_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_5027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842820	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
156369	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156396	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156409	SIRV2	-	379	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4494	34	3319	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
156412	contig_4364_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_2754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532979	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
156443	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	880	3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
156466	SIRV2	-	440	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	34	3258	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
156480	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	35	664	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
156528	contig_4364_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_1945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAATACCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
156543	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
156655	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2163_2279_2316_3298_3406_3483
156668	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
156672	SIRV2	-	591	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	61	3080	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
156684	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
156689	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156739	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156743	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	40	3398	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
156753	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-25	-74	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
156803	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
156806	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156836	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
156848	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156852	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
156879	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	37	3220	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
156888	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
156925	SIRV2	-	460	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	34	3238	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
156934	SIRV2	-	269	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4604	34	3429	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
156989	SIRV2	-	256	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	401	3075	-366	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGTAGCAGCAGGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
157009	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157034	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
157045	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157048	contig_4364_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532812	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
157068	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
157070	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	887	-36	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
157076	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	77	400	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530448	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
157089	SIRV2	-	452	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1177	8	14	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
157131	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
157187	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
157202	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_2869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGCAACGCGGCGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157213	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157219	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157231	contig_8538_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_4711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTTTCCCAGCAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
157248	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157310	SIRV2	-	364	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	34	3334	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157317	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	38	3381	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157323	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
157365	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157371	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7472	-5	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
157378	SIRV2	-	483	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4390	34	3215	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
157406	SIRV5	+	458	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-128	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8187	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
157408	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	674	26	674	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATTGACGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4058	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
157410	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	0	2959	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
157481	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
157512	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157533	contig_4364_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGTCACCAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
157538	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
157551	SIRV2	-	344	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3336	0	-706	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGACGACGATGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
157563	contig_4364_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	76	408	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530449	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
157565	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157609	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157619	SIRV2	-	403	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4425	79	3250	-44	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGTAATTGTGAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	1079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
157640	contig_4364_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
157653	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
157689	contig_4364_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_2731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAAGTGCTGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532968	1533293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157750	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
157755	SIRV5	-	385	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1100	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3506	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1142_1981_2034_2119_2179_3292_3403_3481
157762	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
157768	contig_4364_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_3846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCGGGAATACATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
157796	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157823	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
157843	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157891	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	34	3394	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
157903	SIRV2	+	433	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	160	-70	-160	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATAAATACCACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
157911	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
157937	SIRV2	+	654	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	137	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTTCTAGGCCTACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
157951	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
157961	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
157965	contig_4364_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_1533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCACAGACCGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
157978	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
157985	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
158000	SIRV2	-	422	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4451	34	3276	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
158031	SIRV2	-	697	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1	2337	1	306	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCTCAGCGCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
158034	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	47	3379	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
158073	SIRV5	+	198	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	312	158	198	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8513	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
158080	SIRV5	-	408	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTAATTTCGCACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
158098	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
158133	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158151	SIRV2	-	706	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	5	321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTCCATGAAAATGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
158157	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
158167	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
158197	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
158207	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158251	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158315	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
158366	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	51	3394	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
158367	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
158380	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_4992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
158444	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
158469	SIRV5	+	397	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	875	47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
158470	SIRV2	+	306	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	291	-74	-291	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAACCATACTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
158504	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	20	875	20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8335	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
158512	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158544	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158551	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158553	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533019	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
158579	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
158639	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
158646	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
158662	SIRV5	+	359	4	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1124_2186_2316_3298_3405_3483
158674	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842820	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
158712	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	878	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
158746	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158758	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
158782	contig_4364_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_4418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAAGGCAAGTAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
158816	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	34	3256	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
158834	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
158846	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3031	1	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
158980	contig_8598_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_22902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	GCTGTCCTGATTGTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
159016	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
159042	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	878	-25	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159051	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159091	SIRV5	+	281	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	38	886	38	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8353	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159094	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159105	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159118	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159120	SIRV5	+	305	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	920	-20	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCCATGTCGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159132	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
159182	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159185	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	887	-30	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159195	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
159233	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159253	SIRV2	-	416	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4457	34	3282	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1450	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
159263	contig_4364_pilon	+	188	1	Intergenic	novelGene_4535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533126	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159282	contig_8538_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_5043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842823	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
159329	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159367	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
159372	SIRV2	-	478	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	34	3220	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
159377	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
159381	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	65	355	1530895	1531264	FALSE	15	CCGAGGAGCACCCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVA	1530460	1531265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
159431	contig_4364_pilon	+	178	1	Intergenic	novelGene_4537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533131	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159453	SIRV2	-	188	2	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-1067	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAAACTTGTCACCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5791
159490	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
159491	contig_4364_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_3633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACATCAGCTAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
159507	contig_4364_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_2745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532973	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
159511	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159525	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
159568	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159576	SIRV5	-	387	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTACGGTGGTAATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8454_8590_10863
159605	SIRV5	-	226	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTACCACCCATAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
159631	contig_4364_pilon	+	356	2	Intergenic	novelGene_752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATAGAACTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532277	1532715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
159633	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
159638	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159659	contig_4364_pilon	+	409	3	Intergenic	novelGene_359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	81	407	1530895	1531300	FALSE	35	GAATCCCAAGGCCAACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530444	1531302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
159670	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	663	36	663	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTCTTGAAAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
159673	SIRV2	-	366	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4507	34	3332	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1400	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
159688	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
159689	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842781	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
159690	SIRV2	+	441	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	156	-74	-156	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACCACTCCCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
159735	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159749	SIRV2	-	573	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4300	34	3125	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
159757	SIRV5	+	309	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	878	18	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159792	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
159795	SIRV5	+	439	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	880	0	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
159846	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159849	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
159854	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
159863	SIRV5	+	300	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7663	-1	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
159887	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
159888	contig_8317_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_19255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	7575.5	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	63	386	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	13263	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730
159902	contig_4364_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_2268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTTGCATTAATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
159935	SIRV2	+	616	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-19	-74	19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTAACCTGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
159997	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_3944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
159999	contig_4364_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_4244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGTGTTCCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
160011	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	899	32	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGACGTCCTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160054	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160093	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160109	SIRV5	+	248	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	257	163	143	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8458	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
160114	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
160126	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	10	875	10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8325	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160138	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	878	30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160235	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160246	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCAGCGGGAATACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
160266	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	161	-74	-161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATAAATACCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
160306	SIRV5	+	383	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7483	-2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
160313	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	39	3397	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
160330	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	38	3224	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
160348	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
160371	SIRV2	-	199	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	457	3076	-422	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATTCCCAACAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1500_1700
160383	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160404	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160416	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160422	contig_4364_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532873	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160425	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
160429	SIRV5	+	411	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
160444	SIRV2	-	333	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	34	3365	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
160488	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160647	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	79	312	842828	843061	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842749	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
160654	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
160656	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160662	contig_4364_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_4414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAGGCAAGTAACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
160674	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160697	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160703	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
160714	SIRV5	+	255	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	154	145	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
160719	SIRV2	-	354	4	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1534	2343	359	300	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTAGTCTCTTGCTCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4373	3343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338
160728	contig_4364_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_2687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532950	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
160730	SIRV5	+	420	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
160736	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160750	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160758	SIRV5	+	162	1	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	6916	2913	-285	-2911	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGTCGGCGGTCATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7916	8078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_7900_8100
160759	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160766	SIRV5	+	427	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-126	904	-12	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCAGTGGTGACGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8189	10962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
160786	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_1436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160800	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160815	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
160825	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
160831	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
160858	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGACCGTGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
160866	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532964	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
160867	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842799	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
160890	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
160909	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160917	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
160942	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
160989	SIRV5	+	453	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	902	-36	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
161032	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161060	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
161073	SIRV5	-	340	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8452_8590_10863
161081	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_1766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACCCTGCACAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
161090	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161095	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
161110	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	875	-13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
161121	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
161124	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	35	3083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
161151	SIRV5	-	352	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTGCAATCTCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8450_8590_10862
161274	SIRV5	+	380	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298_3405_3483
161318	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
161320	SIRV2	-	651	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2641	-1	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
161330	contig_9609_pilon	+	3127	25	Intergenic	novelGene_22981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_24	224.337403999719	1472	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	166	2613	311574	332820	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309939	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
161337	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
161348	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	40	3075	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
161397	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161428	SIRV2	-	264	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	38	3430	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
161447	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
161491	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	878	38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
161503	contig_4364_pilon	+	177	1	Intergenic	novelGene_4548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533140	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
161527	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
161531	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	0	2961	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
161542	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
161560	SIRV5	+	204	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5317	4104	-1828	3289	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACTAGATGCAAGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6373	6887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
161563	contig_4364_pilon	+	391	3	Intergenic	novelGene_486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	76	390	1530895	1531288	FALSE	15	CGGAGGCGCCCCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530449	1531289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
161582	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
161609	SIRV2	+	624	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-27	-74	27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTGGAGGATATGGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
161631	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161671	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161721	SIRV2	+	388	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	209	-74	-209	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTTGGCTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
161729	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
161730	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7487	1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
161735	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
161756	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	34	3249	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
161771	contig_4364_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_1369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGACCGTGAGGTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
161797	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	43	3233	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
161831	contig_4364_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_3705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
161863	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
161886	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	34	3249	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
161897	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
161919	SIRV2	-	368	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1789	-727	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTGGTTAACAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2943	1762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2061_2674_2803_2881
161969	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
161980	SIRV2	+	396	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTATCTTTGTCGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	2969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1859_1982_2062_2671_2802_2877
162044	SIRV2	-	368	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3303	5	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
162096	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162121	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	887	8	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
162159	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
162173	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATAAAGTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162175	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162193	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162203	SIRV2	+	663	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
162286	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-87	880	27	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8228	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
162307	SIRV5	+	233	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	154	167	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
162309	SIRV5	-	336	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGTATTTGACCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
162314	SIRV2	-	284	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4589	34	3414	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
162319	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162351	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
162370	contig_4364_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532813	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
162392	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
162398	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	878	4	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
162399	SIRV5	-	472	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGACTACAGTAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
162407	contig_8538_pilon	+	372	2	Intergenic	novelGene_4670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	69	302	842828	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842531	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842542_842769
162415	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162456	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
162473	SIRV2	-	225	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4648	34	3473	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
162513	contig_4364_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532825	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
162521	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
162544	SIRV5	+	387	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
162548	contig_4364_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_2876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTTTTTCCAACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
162567	SIRV2	+	464	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-72	131	-72	-131	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGACTCTAATACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
162612	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTGAACGGCGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
162625	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
162644	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
162647	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_3945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
162678	contig_4364_pilon	+	239	3	Intergenic	novelGene_433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACGAGGCCCAGAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
162696	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
162708	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
162718	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
162791	SIRV2	+	322	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	275	-74	-275	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTTTGATGTTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
162817	SIRV2	-	204	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3679	1	-1049	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACATTGCGACAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
162835	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2116_2157_2270_2316_3298_3405_3483
162854	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
162874	SIRV5	+	503	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-173	875	-59	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8142	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
162880	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
162885	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
162912	contig_4364_pilon	+	440	3	Intergenic	novelGene_415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	78	440	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530447	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
162966	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
163012	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
163022	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
163041	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163079	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	35	3387	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
163089	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532884	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163092	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163113	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_1374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163118	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
163123	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
163129	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-72	272	-72	-272	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGATGTTCTATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
163134	SIRV2	-	408	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3023	1	-393	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
163141	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
163170	SIRV5	+	365	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-35	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8280	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163175	SIRV5	+	461	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	878	-20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163194	contig_7202_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_17303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCTCATGCAGGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
163204	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163237	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-69	-30	-69	30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGATATGGTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
163276	contig_4364_pilon	+	391	3	Intergenic	novelGene_297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	81	389	1530895	1531282	FALSE	15	GCTGACGGAGGCGCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPV	1530444	1531284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
163299	contig_8538_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_5051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842827	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
163313	SIRV5	-	446	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTCCTGCCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
163333	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCATATCATCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533270	1532867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
163345	contig_4364_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_4468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGACTTAAATCCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
163373	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163398	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
163404	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	34	3127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
163460	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163485	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-394	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTGAAGACGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4090_4338_4480_4687_4801_5788
163504	SIRV2	-	385	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	20	3031	4	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
163522	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4590	34	3415	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
163540	contig_8538_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_4701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
163557	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
163579	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
163589	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163605	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	6	882	6	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8321	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163645	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
163654	SIRV2	-	367	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4426	114	3251	-79	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGCAAATGTTGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	1114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
163726	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163732	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163740	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
163770	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	878	29	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
163817	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
163846	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163850	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_1905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163864	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
163888	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
163929	SIRV2	+	299	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	282	138	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTCTAGGCCTACGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390	1769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
163945	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
163964	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
163975	contig_2069_pilon	-	2629	10	Intergenic	novelGene_23281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTGGTGAAGGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346440	334773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_334801_335607_335707_339002_339105_339556_339708_341057_341218_341298_341474_341998_342074_342571_342734_343524_343650_344887
163986	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
164012	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164014	SIRV5	+	300	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	19	886	19	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
164030	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7485	-5	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164051	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
164064	SIRV2	-	195	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4678	34	3503	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
164106	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164126	contig_4364_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_2950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
164131	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164133	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
164166	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164171	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
164185	SIRV5	+	380	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1991_2034_2119_2157_2270_2316_3298
164252	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
164266	contig_4364_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_3235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTAAGGCTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
164283	contig_4364_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_3880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
164290	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
164307	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164324	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
164327	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
164331	contig_12622_pilon	+	2961	12	Intergenic	novelGene_5911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	966	1451	1586088	1586695	TRUE	10	CTGACTGCAGCTGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNWHDGNWVLVINLLNCIHQEGAAFSNLRKDVLWLILQFSVLLTGEGWGTGKEKWELTREEENLLGERVLKGRVQLWRKLGPRVRDKEGALCPAAPALRESPVPPVLEEMQMVPDLRYGVKDVHVACIVRWIQRHRGGLRRASGGGLRRASSGGTRGAS	1583539	1590985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1586406_1586527_1586838_1587626_1587784_1587863_1588042_1588434_1588608_1588834_1589010_1589098_1589228_1589523_1589694_1590003_1590238_1590833
164370	contig_8538_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_5060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842831	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
164394	contig_4364_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_4439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533096	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
164407	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164413	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
164415	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	881	3	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
164419	SIRV5	+	452	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7437	2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164426	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
164442	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
164457	SIRV5	+	481	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTTACCAGGGTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164480	SIRV5	-	465	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTCACGGGTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
164532	SIRV2	+	652	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	136	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTTCTAGGCCTACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1652_1728
164561	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
164567	SIRV2	+	435	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	162	-74	-162	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTATAAATACCACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
164577	SIRV5	+	435	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164597	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	50	3372	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
164623	SIRV2	-	441	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2992	-1	-362	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGTTAGTTGAGACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
164629	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164741	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
164744	SIRV5	+	339	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-19	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
164792	SIRV2	+	325	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	272	-74	-272	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGATGTTCTATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
164796	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7441	2	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
164832	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164834	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
164845	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
164864	SIRV2	+	410	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTTTATCTTTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1748	2965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2064_2674_2802_2877
164867	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
164940	contig_4364_pilon	+	501	4	Intergenic	novelGene_703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	59	499	1530895	1531696	FALSE	20	CACCGGTATTGTCATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGR	1530466	1531698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
164997	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
165037	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165050	SIRV5	+	339	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	59	7485	11	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
165054	SIRV2	-	252	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	659	37	659	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACATTCTTGAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4073	3680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
165055	SIRV2	-	394	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2967	706	1788	-706	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCCAAATTGTAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2944	1741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
165059	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
165070	contig_4364_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_2701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532955	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
165084	SIRV2	-	252	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	394	3086	-359	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGGCATTAACCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1600
165085	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165091	SIRV2	+	309	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	288	-74	-288	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCATACTTATTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
165121	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	35	3387	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165132	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165143	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165164	SIRV5	-	322	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATACAGATTTCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
165170	SIRV5	+	373	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	5	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
165187	contig_4364_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	72	347	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530453	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
165188	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
165204	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
165224	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
165252	SIRV2	-	395	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4474	38	3299	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
165271	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	34	3232	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
165300	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	654	41	654	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAGACATTCTTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4078	3684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
165303	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165319	contig_4364_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_1105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGGTGAAGCAGACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
165347	SIRV5	-	351	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGCAATCTCTCTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
165371	contig_4364_pilon	+	344	3	Intergenic	novelGene_582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	72	344	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530453	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
165378	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
165388	SIRV2	+	283	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	314	-74	-314	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCGCAAGATACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
165412	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
165460	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	878	-21	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
165472	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165506	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	9	2960	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
165518	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
165615	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165624	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	894	-11	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
165685	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
165704	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1980_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
165745	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
165747	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
165750	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165786	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165830	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165843	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	19	-371	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGCTATGAACGTTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5876	4036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
165853	contig_4364_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_4419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533091	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
165860	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
165866	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165868	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGACCGTGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
165875	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
165876	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
165885	SIRV5	-	262	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10985	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10859
165891	SIRV2	-	625	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
165914	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
165922	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
165968	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
165977	SIRV2	+	280	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-44	287	-44	-287	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCATACTTATTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064	1344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
166001	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	39	3382	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
166004	contig_7009_pilon	-	3108	2	Intergenic	novelGene_23676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540399	537216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_537326_537400
166020	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
166059	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166069	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7486	-1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
166074	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
166079	SIRV5	+	450	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7427	-5	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACTTTCGGTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
166086	SIRV2	-	250	2	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2949	-419	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCCCAACAGCATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	1454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1662_1740
166103	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	880	3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166133	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166134	SIRV2	+	317	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	280	-74	-280	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGACTTTGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
166147	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166158	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166177	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTCTGCAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10966	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
166210	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
166331	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
166355	contig_4364_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166358	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166387	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166390	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532943	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166394	SIRV5	+	430	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATAACTATGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
166449	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	27	7586	7	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
166468	SIRV2	-	203	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3680	1	-1050	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTACATTGCGACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
166480	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166482	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166489	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
166540	SIRV5	+	440	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	9	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATCTAACATAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
166545	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCAGTGAACGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166546	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
166575	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
166594	contig_4364_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_4457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533100	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166620	SIRV2	+	651	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGTTCTAGGCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
166631	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166638	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
166652	SIRV2	-	424	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	34	3274	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
166654	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	886	-20	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166676	SIRV2	-	391	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-2	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
166683	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
166726	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166734	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166739	SIRV5	-	222	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAACCTACCACCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
166758	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
166771	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
166781	SIRV2	-	195	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4669	43	3494	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1238	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
166799	SIRV5	+	419	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	875	25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166819	SIRV2	-	410	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-389	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGACGTCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
166831	SIRV2	+	439	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	158	-74	-158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACCACTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
166853	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533091	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166888	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
166901	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	880	-20	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
166908	SIRV7	-	1117	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-67	-844	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAACTCAATCTTCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114805	1849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2685_3003_3112_43028_43078_114680
166911	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
166955	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_1483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166961	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
166968	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-127	882	-13	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8188	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167009	SIRV2	-	253	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	668	27	668	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4064	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
167041	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
167050	SIRV2	-	246	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	654	48	654	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4078	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
167063	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167127	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167265	SIRV5	+	287	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	900	18	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167287	SIRV2	-	395	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4478	34	3303	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1429	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
167292	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167297	SIRV2	-	436	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	34	3262	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
167307	SIRV2	-	409	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3027	0	-397	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
167328	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
167342	SIRV5	-	432	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTCACGGGTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8599_10894
167348	SIRV2	-	358	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4515	34	3340	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
167359	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167360	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
167361	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167396	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
167427	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
167437	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167496	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4602	34	3427	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
167508	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167510	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	877	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167527	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCTTGAGTTGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532864	1533137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533100
167532	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
167576	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	893	-14	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167583	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7483	-1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
167601	contig_4364_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_2732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532968	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167605	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
167621	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167657	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3028	-1	-398	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
167704	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_3020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
167782	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532868	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
167783	SIRV5	+	390	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2264_2316_3298_3405_3483
167819	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
167866	SIRV2	-	590	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4283	34	3108	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
167902	contig_8317_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_20091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16431	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
167913	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
167915	contig_9955_pilon	-	2957	5	Intergenic	novelGene_21277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	262	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	229	921	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_45954_46014_47737_48794_49380_49692
167916	contig_4364_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	72	389	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530453	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
167922	contig_4364_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_2693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCTGGGAAATTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533320	1532951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
167932	contig_4364_pilon	+	388	3	Intergenic	novelGene_606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	72	386	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530453	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
167941	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
167944	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
167947	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
167953	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	310	-74	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
167961	SIRV5	+	454	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7435	2	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTATGACACTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
167994	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
168042	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
168086	SIRV2	+	263	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	334	-74	-334	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTGTTGACCACCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
168102	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168126	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168190	SIRV5	-	312	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCAAAGTACATATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
168194	SIRV2	-	410	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
168198	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
168266	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168277	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	10	887	10	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8325	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
168280	SIRV7	+	2215	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	36	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTGTCACTCTACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	147632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_3808_3892_114674_114993_147610
168295	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168321	contig_4364_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_4246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGTGTTCCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
168369	SIRV2	+	314	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	283	-74	-283	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTATTTGACTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
168379	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
168413	SIRV2	-	244	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	67	3421	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
168416	SIRV2	+	295	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	301	-73	-301	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAGTAATGCTAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
168464	SIRV2	+	409	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTTTATCTTTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751	2966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877
168481	contig_4364_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_4493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGTAACAGACTTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
168484	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	78	350	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530447	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
168513	contig_5538_pilon	+	2141	14	Intergenic	novelGene_23699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_11	247.397076800571	3016	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	94	2139	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44767	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
168529	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7449	1	-56	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACAATCTAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
168548	SIRV2	-	497	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	160	3075	-125	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACGATTCAGGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1200_1700
168553	SIRV2	-	384	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	-13	700	-1	-700	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGACGATGTCCTAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
168565	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
168602	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168605	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168638	SIRV2	-	349	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	752	1787	-752	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGTAGGCCTAGAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
168642	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168645	SIRV5	+	400	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2231_2316_3298_3405_3483
168653	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168656	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168675	contig_4364_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_4155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
168682	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7461	6	-68	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTTCTTTTGTAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
168714	SIRV2	+	269	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	328	-74	-328	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACCACCAGCACGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
168757	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168793	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168794	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
168801	SIRV2	-	388	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
168824	contig_4364_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_1825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATACCCTGCACAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
168834	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168847	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532965	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168855	SIRV2	-	338	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4535	34	3360	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1372	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
168872	contig_4364_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_4522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533121	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
168884	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7479	2	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
168899	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
168902	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168924	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3402_3483
168931	SIRV5	+	251	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-109	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGGGACTATTTAGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2036_2119_2157_2270
168941	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168944	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
168979	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_3025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
168985	contig_17440_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_7594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGGCTATAAAGGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3330	3031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3000_3300
169000	contig_4364_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_2483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAGAAATAAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169034	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
169043	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169048	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
169065	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	310	-74	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
169069	contig_4364_pilon	+	716	3	Intergenic	novelGene_377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	81	551	1530895	1531444	FALSE	25	CCCCCACAGATCATGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQVTVGLRHWIHSCCLLNRFLLDCVYFLKFKCFFHYF	1530444	1531609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
169085	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATCAGCTAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
169104	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-4	-393	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTGAAGACGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5899	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
169119	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
169132	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
169137	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169142	contig_4364_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_2878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
169149	SIRV2	-	415	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4458	34	3283	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
169157	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169188	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	38	3393	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
169227	SIRV2	+	438	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	159	-74	-159	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAATACCACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
169256	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	64	297	842828	843061	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842764	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
169259	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	880	-29	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
169269	SIRV2	+	312	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	285	-74	-285	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATACTTATTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
169273	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
169348	SIRV2	+	475	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	157	-109	-157	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATACCACTCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
169354	SIRV5	+	360	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCGTTATTATTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
169368	SIRV2	-	339	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4534	34	3359	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
169385	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	34	3253	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
169391	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
169401	SIRV2	+	438	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	159	-74	-159	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAATACCACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
169418	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	39	3374	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
169430	SIRV2	+	455	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	138	-70	-138	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTCGAATGACTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
169436	contig_4364_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_2395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169441	contig_4364_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532802	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
169507	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	38	3076	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
169537	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
169551	contig_8538_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_4660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	80	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841633	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841683_842822
169554	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842770	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
169579	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169587	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169599	contig_4364_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532884	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169620	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
169639	SIRV2	-	372	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
169656	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
169657	SIRV2	+	248	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	349	-74	-349	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCCACTAGGTTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
169670	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
169671	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_4977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
169713	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
169728	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
169741	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
169764	SIRV5	+	307	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7661	2	-268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAAGTGCTGTTTCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
169776	SIRV5	+	369	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7592	1	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
169778	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
169781	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
169784	SIRV2	+	252	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-354	-386	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACATGACTTCAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3679	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
169791	SIRV5	+	409	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2264_2316_3298_3405_3483
169793	contig_4364_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_3978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCAGCGGGAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533280	1533066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
169807	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
169824	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169835	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169840	SIRV2	-	234	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4639	34	3464	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
169867	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169873	contig_4364_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532866	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
169890	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	266	-74	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
169894	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-127	900	-13	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8188	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
169902	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
169929	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	35	3086	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
169933	SIRV2	-	454	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1166	17	3	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4729	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
169935	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
169963	contig_4364_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532842	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
169992	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	0	2963	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
170011	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
170021	contig_8538_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_4795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842766	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
170035	contig_8538_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_5003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842814	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
170040	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170053	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10402	5	1252	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
170060	SIRV2	+	444	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	152	-73	-152	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCACTCCCACAGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
170116	SIRV5	-	377	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAAGCACTTTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
170135	contig_8317_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_19266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	28	351	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14266	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
170143	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	38	3372	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
170180	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170192	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
170259	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532942	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170267	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
170292	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
170318	contig_4364_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_2513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170339	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
170347	contig_9921_pilon	+	4180	4	Intergenic	novelGene_23748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	58.1893461039046	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	309	977	321085	323378	FALSE	40	TGTTTAAAAAAACATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGQSSLA	299188	326581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_319519_319701_321058_321732_323356
170360	contig_4364_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_4441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCAACTCAAGGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
170410	SIRV5	-	463	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACCTTCACGGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
170441	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	37	3430	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
170446	SIRV2	-	194	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4664	49	3489	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
170448	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170449	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_1716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
170493	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170514	contig_4364_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_2234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCATTAATACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
170530	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
170542	SIRV5	-	442	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGGGTGACTACAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10962	8173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
170547	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
170569	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
170604	contig_4364_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
170759	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	81	499	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
170796	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
170801	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	43	3238	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
170813	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
170818	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	34	3426	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
170823	SIRV3	-	211	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTTACCGTACATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6764	6553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6600_6800
170862	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
170895	contig_4364_pilon	+	189	1	Intergenic	novelGene_4512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533118	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
170900	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
170904	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
170923	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
170931	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7480	-4	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
170944	SIRV5	+	208	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	306	154	192	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8507	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
170964	SIRV2	+	446	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-45	122	-45	-122	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCTCTTGCAACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063	1509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
170967	SIRV2	+	252	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-355	-387	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACATGACTTCAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3678	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
170979	SIRV5	+	386	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298
170988	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
170996	contig_4364_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532859	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171003	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
171043	contig_4364_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_4399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
171048	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171092	SIRV5	+	282	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2126_2163_2270
171095	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171100	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	45	3078	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
171112	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
171115	contig_8538_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_4993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
171120	SIRV2	-	463	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4410	34	3235	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
171121	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	GAGGCGCCCCTGAATCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
171183	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	35	664	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCTTGAAAGGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
171202	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171217	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171227	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
171255	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
171300	contig_4364_pilon	+	249	3	Intergenic	novelGene_659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCATCCTGACCCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530460	1531158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
171349	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7477	1	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171357	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
171376	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171438	SIRV2	-	419	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4454	34	3279	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
171447	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	38	3238	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
171449	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
171466	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
171493	SIRV2	+	646	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-64	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
171499	SIRV5	+	300	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	19	886	19	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
171508	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171597	contig_18081_pilon	-	3947	8	Intergenic	novelGene_23837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	376	junction_7	168.291292655543	3291	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	50	1048	485227	430068	FALSE	0	TCTGTGCTTTGGGTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGEARPGFLRSGLAMAAAPLKVCIVGSGNWGSAVAKIIGNNVKKLQKFASTVKMWVFEETVNGRKLTDIINNDHENVKYLPGHKLPDNVIAVSNLNEAVQDADLLVFVIPHQFIRRICDEITGRVSEKALGITLIKGIDEGPDGLKLVSDIIREKMSIDISVLMGANIASEVAAEKFCESTIGSKVMENGLLFKELLQTPNFRITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQDHSRTGGRDAEWTETPGSSNFCRSVPHPQAEGTDGQVSAVYCRVSDLL	485276	427168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_430107_434819_434927_435608_435844_448204_448318_454649_454789_456513_456655_465890_466069_485180
171600	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171602	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171642	SIRV5	+	378	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171676	SIRV2	+	346	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-342	-34	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGGTTCGACTATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3691	4423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340
171686	SIRV5	+	382	4	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-5	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2204_2316_3298_3405_3483
171722	SIRV5	+	446	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7443	2	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
171726	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171737	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
171761	SIRV2	-	443	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-356	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTGAGACAATGTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
171770	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171846	contig_4364_pilon	+	518	4	Intergenic	novelGene_413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	80	517	1530895	1531693	FALSE	20	GTACCACCGGTATTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASG	1530445	1531694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
171853	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
171877	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
171886	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	882	57	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
171922	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171966	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532939	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
171972	contig_10958_pilon	+	2042	4	Intergenic	novelGene_5418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	105	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889033_895279_895855_900457
171998	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
172003	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
172022	SIRV2	-	478	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4394	35	3219	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
172028	SIRV2	-	241	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4632	34	3457	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
172040	contig_6361_pilon	-	4245	28	Intergenic	novelGene_23871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_8	265.160954821013	594	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1249	3750	85	3834	109608	55091	FALSE	20	ATCCTACTTTACGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVAVKDSDQVAQSDGEENSAAEEQLLGERIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHVRIAPTVTTWSNKTPTALPSHPPAASPSDTQGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	119069	54679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73524_73867_75463_75585_76275_76369_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_89922_90001_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529_109610_118986
172049	contig_4364_pilon	+	601	4	Intergenic	novelGene_543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	76	600	1530895	1531780	FALSE	10	TGCGTCTGGACCTGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAI	1530449	1531781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
172069	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
172072	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
172100	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
172123	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
172142	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
172158	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
172163	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
172218	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
172238	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	63	516	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
172292	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
172309	SIRV2	-	434	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	41	3257	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
172315	contig_4364_pilon	+	375	3	Intergenic	novelGene_603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	72	374	1530895	1531276	FALSE	10	CTGTGTTGCTGACGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEH	1530453	1531277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
172332	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
172371	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
172388	SIRV2	-	690	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	296	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGAACTAGTCTCTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3963_4095_4338_4480_4687_4801_5788
172396	contig_4364_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_2717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532963	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
172401	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
172471	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
172483	SIRV5	+	354	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7614	2	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGCGCCAACAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
172488	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
172495	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
172558	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4606	34	3431	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
172559	SIRV2	-	581	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAGCCAAAACAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4477_4687_4801_5790
172575	SIRV2	+	289	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	308	-74	-308	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGATACGCAGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
172631	SIRV5	-	343	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCTCTCTGCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
172686	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
172694	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
172718	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	66	3376	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
172762	SIRV2	-	361	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-2	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
172768	SIRV2	-	242	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-385	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCTCGCGACTAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1400_1700
172782	SIRV5	+	392	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	3	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2064_2270_2316_3298_3405_3483
172790	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7422	-2	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCGGTAAATTCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
172842	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-50	274	-50	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1400
172845	SIRV2	+	253	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-348	-379	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCAAATGGGGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3685	4078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
172868	SIRV6	-	314	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCATGACCATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
172888	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2310_3295_3405_3483
172896	contig_12622_pilon	-	1795	10	Intergenic	novelGene_5919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1401.67672960672	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	197	955	1588902	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1589187	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098
172957	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
172992	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	875	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
173026	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	264	-73	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
173030	contig_4364_pilon	+	307	3	Intergenic	novelGene_446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	231	76	306	1530895	1531204	FALSE	35	ACTGGGACGACATGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVT	1530449	1531205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
173051	SIRV5	+	413	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
173062	SIRV2	+	313	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	284	-74	-284	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTATTTGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
173071	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
173073	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
173075	SIRV5	+	237	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	262	169	148	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8463	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
173094	SIRV5	+	382	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2163_3280_3405_3483
173095	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-61	882	53	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
173172	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
173212	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7444	6	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTAACATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
173214	contig_4364_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_3620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATCAGCTAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
173257	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	35	3397	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
173259	SIRV2	-	246	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	656	46	656	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACACAAGACATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
173273	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
173285	SIRV5	+	530	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-200	875	-86	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8115	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
173294	contig_4364_pilon	+	361	3	Intergenic	novelGene_290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	81	359	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530444	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
173306	contig_4364_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_4483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533109	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
173307	contig_4364_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_3685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACATCAGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533279	1533056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
173335	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
173341	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532942	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
173350	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
173409	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	44	3374	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
173479	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	534	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
173500	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
173530	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
173654	SIRV2	-	479	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4394	34	3219	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
173718	contig_4364_pilon	+	298	3	Intergenic	novelGene_573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAACTGGGACGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
173811	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
173873	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
173891	contig_4364_pilon	-	169	1	Intergenic	novelGene_4545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAACAGACTTAAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
173896	contig_14287_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_24051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1630	2007	22217	22594	NA	25	TCTGCCTCATCCCTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCILFLMFDEFLMHLTVVSTRLAVFRSTAFTTPSQWPVDKSLLALDFADNLFECSTMLVETLVIAAAVPSPIPVAESDRLTPAVTGARAKPRMVRTPEKALTELATTQEMVQSLCVLSTLSARA	20587	22741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_20600_22700
173908	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
173927	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
173933	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_2392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCTTTGCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
173984	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
174005	contig_8538_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_4690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
174017	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174036	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
174059	SIRV2	-	601	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4272	34	3097	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
174066	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
174082	SIRV2	-	404	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4469	34	3294	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
174098	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174135	contig_8538_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_5054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842828	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
174139	SIRV5	+	300	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-269	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAAGTGCTGTTTCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2108_3298
174141	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
174163	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
174192	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
174244	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174300	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
174306	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_1907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174326	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174337	contig_8538_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_4739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
174376	contig_4364_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_1167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTCGGTGAAGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
174408	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
174505	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
174554	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
174562	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
174585	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7470	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
174593	SIRV2	+	653	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	136	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTTCTAGGCCTACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
174600	SIRV2	-	189	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3699	0	-1069	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAAAACTTGTCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
174665	SIRV5	+	418	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7466	-1	-73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
174677	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
174682	SIRV2	-	409	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4464	34	3289	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
174720	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
174733	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
174756	contig_15063_pilon	-	1563	5	Intergenic	novelGene_8685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GCCATGTGACCCGTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
174874	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
174882	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	893	14	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
174883	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-112	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
174900	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3037	-1	-407	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
174901	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	38	660	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
174908	SIRV5	-	443	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGATGTCCTGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
174919	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174934	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174944	contig_4364_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_3985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCAGCGGGAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
174966	contig_4364_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_2666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532943	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
174985	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175015	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842767	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
175047	SIRV5	+	433	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	882	4	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
175060	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
175080	SIRV5	-	339	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATTTGACCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
175089	SIRV5	-	227	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10964	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10873
175117	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
175136	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175155	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
175162	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4417	34	3242	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
175175	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175195	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_5030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842821	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
175273	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
175290	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
175310	SIRV2	-	462	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4411	34	3236	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
175324	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
175327	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175344	SIRV5	+	379	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7589	2	-196	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
175373	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	34	3396	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
175392	SIRV5	+	379	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2325_3305
175400	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	34	3407	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
175405	contig_4364_pilon	+	189	1	Intergenic	novelGene_4517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533120	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
175411	SIRV5	+	417	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7472	2	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
175412	SIRV5	+	359	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-49	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8474_8586_10858
175417	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
175438	SIRV2	+	351	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	246	-74	-246	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGCTGCTACCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
175465	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175467	SIRV2	+	448	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	106	-31	106	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1200_1700
175477	contig_4364_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_2854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTTCCAACCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533275	1533014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
175487	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
175492	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
175501	SIRV5	+	614	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-284	875	-170	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	263	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8031	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
175514	SIRV2	-	450	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2983	-1	-353	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACAATGTTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
175535	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
175552	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
175598	contig_8354_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_24091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCAAATTAACTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181522	182203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_181500_182200
175623	contig_4364_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_2866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175644	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
175683	contig_4364_pilon	+	448	4	Intergenic	novelGene_634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	72	446	1530895	1531630	FALSE	25	CTTCAACACGCCAGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFE	1530453	1531632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
175689	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	15	TAACGAGCTGCGTGTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
175708	SIRV2	-	457	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	-4	-334	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGACAACGTCATTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5899	3999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5788
175717	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
175773	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
175776	SIRV2	-	386	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3041	5	-411	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
175806	SIRV5	+	438	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
175868	contig_8538_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_4970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842807	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
175882	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
175910	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
175991	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
176058	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176059	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176072	SIRV2	+	333	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	264	-74	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
176094	SIRV2	+	424	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	173	-74	-173	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACACTTATTATGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
176098	contig_4364_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_2740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTCAGGACTCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533250	1532971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533200
176108	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
176110	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176118	contig_4364_pilon	+	351	3	Intergenic	novelGene_262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	20	ATAACGAGCTGCGTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
176131	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
176137	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
176139	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
176158	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	72	401	1530895	1531303	FALSE	40	AATCCCAAGGCCAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530453	1531303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
176192	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176199	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	278	-74	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
176209	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176226	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176242	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	34	3085	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
176257	SIRV6	-	296	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACTTTGACGCAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
176289	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
176308	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176368	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176389	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176425	SIRV2	-	393	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	17	3026	1	-396	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
176439	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-88	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8227	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176493	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176501	SIRV6	+	442	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10306	2	1156	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
176521	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	895	-22	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACGTCCTCGTAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176523	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
176535	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
176548	SIRV2	-	661	5	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGACGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
176563	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176604	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176610	SIRV2	+	359	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	230	-66	-230	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTAGTCGCGAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
176616	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
176619	SIRV5	-	418	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1114	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3520	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1144_1981_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
176658	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
176719	contig_12512_pilon	-	4138	8	Intergenic	novelGene_24178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	624	junction_5	248.630370680031	1110	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	235	1479	599702	588331	FALSE	25	AAATTGTTCGGAGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQTPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLGLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQRRNNLVPVSACDDFERALQGPLFAIIQEFRFLPPPLYSEVDPNPDQSTEDRPSCPSR	599936	585671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_590824_591103_591267_591594_591852_592236_592340_593331_593480_595423_595506_599422
176761	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3035	-1	-405	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
176790	SIRV2	+	615	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	-26	-66	26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCTGGAGGATATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
176795	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	34	3087	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
176799	SIRV5	+	217	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	300	151	186	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8501	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
176808	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176864	contig_4364_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19840	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	75	407	1530895	1531306	FALSE	40	CCCAAGGCCAACAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530444	1531306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530894_1531018_1531096
176866	contig_4364_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_2614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176879	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	878	-17	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176888	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
176949	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176973	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
176978	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
176981	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2939	732	1760	-732	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAGAAGTGGTTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2972	1767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
176982	SIRV2	-	653	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4144	-1	2965	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
176986	SIRV5	+	380	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2039_2126_2157_2270_2316_3298
176988	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	875	-46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
176994	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-672	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACATCTATCACGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4477_4687_4801_5790
177003	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4441	34	3266	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
177021	SIRV5	+	247	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	267	154	153	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8468	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
177034	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177043	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
177058	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	880	-18	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177067	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177082	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
177127	contig_233_pilon	-	2624	15	Intergenic	novelGene_14515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1383.77589941288	7	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	82	2181	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126988	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_91528_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
177129	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177181	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
177185	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
177186	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177192	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
177215	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
177220	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
177237	contig_8538_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_4889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTAATCAGACAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843128	842780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
177245	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	44	3398	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
177250	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
177297	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4416	34	3241	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
177326	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
177380	contig_4364_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532797	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
177394	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
177401	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
177412	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
177453	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2116_2157_2270_2316_3298_3405_3483
177527	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_2575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCATCAGCTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
177532	SIRV2	-	384	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3296	0	-666	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCACGCCTCCTACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
177536	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
177574	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGAACGGCGACTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177577	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
177583	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
177620	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTGTTAAGGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177635	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
177664	SIRV5	+	422	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-92	875	22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8223	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177666	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177675	contig_4364_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_2525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCAGCTCTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
177684	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177718	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
177732	contig_4364_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_1173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGTCGGTGAAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
177744	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
177755	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
177787	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
177800	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	42	3076	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
177808	SIRV5	+	401	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-71	875	43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8244	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177855	SIRV2	-	441	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	6	-353	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACAATGTTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5901	4018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
177877	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	880	-15	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
177885	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
177896	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
177966	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	44	3076	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
177985	SIRV5	+	301	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	886	18	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
178041	SIRV2	-	367	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-678	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTCACATCTATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
178046	SIRV2	-	300	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1835	2340	660	303	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCTCTTGCTCAGCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
178060	contig_4364_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_4482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533108	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
178082	SIRV2	-	447	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4425	35	3250	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
178102	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
178126	contig_6047_pilon	+	2832	18	Intergenic	novelGene_24193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_3	415.142206843768	5525	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	162	2573	105237	123624	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105075	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
178143	contig_4364_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	76	420	1530895	1531318	FALSE	30	GGGAGAAGATGACCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKAN	1530449	1531319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
178153	SIRV5	-	344	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGCAATCTCTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
178158	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
178195	contig_3956_pilon	+	2274	10	Intergenic	novelGene_15079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1072.55480161581	4	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	378	1754	1286460	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281602	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282864_1286144_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
178236	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	58	3233	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
178274	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
178278	SIRV2	-	333	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	34	3365	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
178281	SIRV5	-	405	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGTGGTAATTTCGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
178289	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	34	3084	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
178310	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	278	-74	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
178361	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
178369	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
178420	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
178427	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	34	3388	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
178432	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
178482	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
178496	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
178501	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
178513	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
178557	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
178649	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
178662	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
178685	SIRV2	+	602	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-57	-22	-57	22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTAACCTGGAGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1700
178693	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
178722	SIRV5	+	390	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7487	-5	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
178740	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
178780	SIRV5	+	365	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	90	7428	42	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACTTTCGGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
178822	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
178898	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	79	312	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842749	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
178899	SIRV2	+	333	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	264	-74	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
178909	SIRV2	-	198	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-1055	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCCATTTACATTGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5790
178915	contig_4364_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_4527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533122	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
178957	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_1942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
178971	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
178978	SIRV2	+	322	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	275	-74	-275	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTTTGATGTTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
178982	SIRV2	+	296	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	301	-74	-301	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAGTAATGCTAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
179007	contig_4364_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
179078	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
179133	contig_1725_pilon	+	2867	20	Intergenic	novelGene_24288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_17	403.91125845802	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	264	2546	207418	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201489	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
179159	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2310_3290_3405_3483
179172	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	19	878	19	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
179210	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
179216	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	875	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
179238	SIRV2	-	295	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1841	2339	666	304	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTCTTGCTCAGCGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4066	3339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
179245	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	42	3072	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
179262	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
179277	contig_4364_pilon	+	304	3	Intergenic	novelGene_577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	231	72	302	1530895	1531204	FALSE	35	CTGGGACGACATGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVT	1530453	1531206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
179282	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
179323	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_1644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
179345	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
179399	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7482	2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
179413	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
179432	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
179527	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
179552	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
179557	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
179579	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
179584	contig_8317_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_20740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16930	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16900_17200
179587	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
179591	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGGGAATACATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
179615	SIRV2	+	307	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	280	-64	-280	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGACTTTGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
179664	SIRV2	+	282	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	315	-74	-315	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAATCGCAAGATACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
179686	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAGACCGTGAGGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
179690	SIRV2	-	652	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2638	1	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
179740	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533089	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
179750	SIRV5	+	364	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	882	-41	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
179799	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
179811	contig_4364_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_2679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532946	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
179827	SIRV2	+	650	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	131	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACCTCGTTCTAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
179894	SIRV5	+	381	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7587	2	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
179896	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
179898	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	878	-14	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
179915	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
179975	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_3607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
179996	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
180021	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180024	contig_4364_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_2842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
180112	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	35	3378	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
180208	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	51	3232	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
180209	SIRV5	+	300	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7668	2	-275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAAGCCTAAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
180234	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_2962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
180238	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180240	contig_4364_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_4509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533116	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180241	SIRV2	+	304	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	292	-73	-292	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAAACCATACTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
180247	SIRV2	-	464	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1143	30	-20	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGACGTCGACACAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4752	3695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
180262	SIRV2	-	298	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1530	17	367	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4365	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
180296	contig_4364_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532871	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180299	contig_4364_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_4508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533116	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180314	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
180339	SIRV5	+	293	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7675	2	-282	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACTGGCAAAAGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
180387	SIRV5	+	373	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7588	1	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
180388	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	15	882	15	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
180402	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180417	SIRV2	+	452	4	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-360	264	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGTTTTACCATTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3673	4721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3969_4096_4340_4478_4686
180443	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180492	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180514	contig_8538_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_5088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842860	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
180529	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180550	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180666	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	880	-21	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
180752	SIRV2	-	477	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4396	34	3221	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
180755	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180773	contig_4364_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	TGACGGAGGCGCCCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
180779	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
180782	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
180793	SIRV2	+	289	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	308	-74	-308	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGATACGCAGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
180811	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180827	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	878	-31	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
180836	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
180940	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
180998	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181021	SIRV5	+	381	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7587	2	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
181067	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19840	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	56	397	1530895	1531315	FALSE	40	ACAGGGAGAAGATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKA	1530460	1531316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530510_1530888_1531018_1531096
181089	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181103	SIRV5	-	255	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCTTCCGACCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
181131	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
181141	SIRV2	-	613	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	45	2959	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
181197	SIRV6	-	202	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCGTTCATCAATTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11260	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11037_11111_11205
181216	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
181240	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
181245	contig_4364_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_4494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533112	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
181334	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
181366	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
181376	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
181394	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
181398	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181400	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181425	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181452	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
181463	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7486	-1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
181512	SIRV2	-	448	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2985	-1	-355	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGAGACAATGTTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
181526	contig_6215_pilon	-	4578	9	Intergenic	novelGene_21208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_5	493.757215137156	118	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	2428	3081	231913	228234	FALSE	35	ATTCAGACAAAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243066	226736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
181532	SIRV5	-	299	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCTTAGAGCGTTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
181584	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
181619	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
181769	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
181772	SIRV2	-	402	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2947	718	1768	-718	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAAGATTTGGTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2964	1753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
181825	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	887	-41	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
181846	contig_8538_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_4863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842775	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
181847	SIRV5	-	460	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTCACGGGTGACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8457_8590_10866
181885	SIRV5	+	368	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	49	7466	1	-73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
181910	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	880	-16	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
181911	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3413_3483
181929	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
181975	SIRV2	-	430	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2932	705	1753	-705	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAAATTGTAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2979	1740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
182013	SIRV2	-	254	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	657	37	657	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACATTCTTGAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4075	3680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
182024	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
182042	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	40	3084	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
182047	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
182055	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
182068	SIRV2	+	626	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-29	-74	29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGAGGATATGGTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
182071	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3038	0	-408	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
182075	SIRV5	+	391	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGGTCGTTCTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1209_2270_2316_3298_3405_3483
182078	SIRV5	+	367	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	882	-44	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
182087	contig_4364_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGTCACCAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
182140	SIRV2	+	333	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	264	-74	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
182155	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
182197	contig_8538_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_4663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842089	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842311_842993
182232	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
182236	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	65	7651	65	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
182249	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
182279	SIRV5	+	452	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-4	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGGTAAATTCACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023	3570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1982_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
182287	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
182293	SIRV5	+	358	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7592	1	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
182302	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
182342	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
182357	SIRV5	+	354	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
182409	SIRV6	+	407	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	21	1161	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTTTAAGATAGTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
182418	SIRV2	+	386	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	211	-74	-211	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCTTCTTGGCTACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
182445	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7480	-1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
182451	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
182463	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	882	-25	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
182466	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532940	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
182499	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
182517	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
182524	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
182578	contig_8538_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_4787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	64	297	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842764	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
182628	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
182651	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	875	12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
182675	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_3021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
182688	SIRV2	+	682	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-105	134	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCGTTCTAGGCCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
182747	contig_4364_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_2705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532957	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
182836	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
182870	SIRV2	+	372	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	225	-74	-225	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCGCGAGCACAACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
182881	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
182980	SIRV2	-	406	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3030	0	-400	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
182984	SIRV2	-	416	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4453	38	3278	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
182990	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183015	SIRV2	+	441	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	156	-74	-156	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACCACTCCCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
183068	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183080	SIRV6	+	444	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10304	2	1154	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
183110	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183120	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	35	3369	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
183140	SIRV5	+	254	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	162	138	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
183301	SIRV5	+	353	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7608	1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
183305	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	876	-18	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
183314	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183317	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183337	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183353	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7484	-4	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
183369	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532967	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
183398	contig_4364_pilon	+	287	3	Intergenic	novelGene_568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGTATTGTCACCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
183420	contig_4364_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_1285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGGCCCCAGCAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183423	SIRV2	+	653	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	133	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTCGTTCTAGGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
183501	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	893	-8	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
183513	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183535	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
183552	SIRV5	+	405	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2058_2270_2316_3298_3405_3483
183569	SIRV2	-	246	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	657	45	657	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGACACAAGACATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4075	3688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
183607	SIRV5	+	401	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
183626	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
183677	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183691	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
183703	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183747	contig_8538_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_4763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
183751	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	2	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
183757	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
183768	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
183825	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
183849	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
183850	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7485	1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
183872	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	34	3088	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
183884	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183887	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
183953	contig_9345_pilon	-	3272	5	Intergenic	novelGene_24655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1844	junction_4	1437.26493730279	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	277	747	955353	949413	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQAWSGAGLCLPVAFLNPGPQE	1001351	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
183963	contig_4364_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_4190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATAAAGTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
183965	SIRV6	+	448	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1489	533	60	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
184057	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
184137	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
184154	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2113_2157_2270_2316_3298
184177	SIRV5	-	450	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGCCAGTTCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
184202	SIRV5	+	253	4	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	1109	33	1080	-33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTTTCGGTAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2136	3565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2157_2270_2316_3298_3405_3483
184211	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
184230	contig_4364_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	72	347	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530453	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
184329	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
184412	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
184489	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
184495	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_5021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842819	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
184538	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
184570	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2090_2157_2270_2316_3298_3405_3483
184573	SIRV5	+	445	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2325_3307_3405_3483
184637	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
184715	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
184757	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
184765	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_1995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
184791	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
184842	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
184857	SIRV5	-	414	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCGCACACTTCGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
184960	SIRV2	-	281	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-346	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTGATAGAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1400_1700
184964	contig_4364_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532842	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
184975	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
184991	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
185006	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
185007	contig_4364_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
185047	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185054	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
185119	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	34	3243	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
185135	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185149	SIRV2	-	336	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3344	0	-714	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCATCCAGTAGACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
185210	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	878	12	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
185235	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
185256	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185258	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185282	SIRV5	+	542	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-230	893	-116	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8085	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
185444	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185454	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185468	SIRV5	+	361	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7600	1	-207	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTTATTATTTGGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
185498	contig_3747_pilon	+	2544	8	Intergenic	novelGene_24903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	4	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	135	1142	201481	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201346	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
185503	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
185506	SIRV2	-	402	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2943	722	1764	-722	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAACAAAGATTTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2968	1757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
185552	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
185575	SIRV2	-	358	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3317	1	-687	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGTCATGTCTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
185588	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185620	SIRV2	-	448	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	-1	-353	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACAATGTTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5788
185627	contig_4364_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_2725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532966	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
185650	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185698	SIRV2	-	339	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4534	34	3359	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
185699	SIRV5	-	481	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	19	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTACAGTAAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8385_8454_8590_10863
185741	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
185765	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
185767	contig_4364_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_4388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
185821	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
185828	contig_4364_pilon	+	338	3	Intergenic	novelGene_580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	267	72	338	1530895	1531240	FALSE	20	TTCTATAACGAGCTGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHT	1530453	1531240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
185846	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
185905	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
185916	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_5032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
185977	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185986	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_1992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
185994	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
186087	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	880	55	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
186102	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
186103	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	65	403	1530895	1531312	FALSE	40	CCAACAGGGAGAAGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPK	1530460	1531313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
186113	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532866	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
186155	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
186223	contig_4364_pilon	+	289	3	Intergenic	novelGene_241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGAGCACGGTATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
186250	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
186296	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	200	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
186314	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
186337	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
186360	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
186381	SIRV5	+	378	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2065_2270_2316_3298
186428	contig_4364_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_2219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGCATTAATACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
186439	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
186444	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	279	-74	-279	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGACTTTGATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
186453	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
186461	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
186494	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
186512	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7477	2	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
186549	SIRV5	+	392	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-62	875	52	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
186593	SIRV5	-	405	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGTGGTAATTTCGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
186602	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
186628	SIRV2	-	400	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-405	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4482_4687_4801_5791
186631	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	5	2960	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
186653	SIRV2	-	481	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	34	3217	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
186670	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10441	2	1291	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11528	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
186740	contig_8538_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_4862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCAGACAGGGTGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843120	842775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
186756	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
186766	SIRV5	+	386	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1980_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
186805	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
186861	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	34	3426	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
186956	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	34	3411	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
186986	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
186989	SIRV5	+	297	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
187036	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	35	3080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
187090	SIRV2	-	446	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4427	34	3252	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
187102	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_5041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842823	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
187115	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	38	3390	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187130	SIRV5	-	344	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10871
187158	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4144	6	2965	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
187167	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
187184	SIRV5	+	260	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	138	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8586_10863
187197	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7476	2	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
187271	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1144_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
187276	SIRV2	-	221	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3667	0	-1037	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGACACAGTTATGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
187279	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	4	2971	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
187310	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
187327	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
187328	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
187376	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	886	-31	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
187377	SIRV5	-	329	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGATTTCTCAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10859
187382	contig_4364_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532764	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
187424	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187473	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187525	SIRV2	-	437	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4419	51	3244	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
187540	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	38	3393	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187582	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
187596	SIRV2	-	282	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	41	3409	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187619	SIRV5	+	289	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	41	875	41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8356	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
187650	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
187653	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
187658	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
187685	SIRV2	+	396	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-102	229	-102	-229	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTAGTCGCGAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	1402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
187703	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
187757	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
187781	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
187812	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	228	-1	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
187850	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	396	3083	-361	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGCAGGCATTAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1600
187851	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	37	3386	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
187857	SIRV5	-	255	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10872
187893	SIRV2	-	595	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	60	3077	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGTTATCTAAGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
187894	SIRV5	+	524	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7353	-5	40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGGTTTATAACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
187911	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
187926	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
187965	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-14	875	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
187975	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7440	-1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
187991	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
188020	SIRV2	-	371	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	6	3303	2	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5905	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
188026	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188041	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	878	-28	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
188048	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	38	3080	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
188049	contig_4364_pilon	+	537	4	Intergenic	novelGene_689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	61	537	1530895	1531732	FALSE	25	ACCCACACTGTCCCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGV	1530464	1531732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
188072	SIRV5	+	239	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5305	4081	-1840	3312	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTACTAAAATCAGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6361	6910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
188116	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2117_2157_2270_2316_3298
188118	SIRV2	+	651	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-69	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
188154	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
188156	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	882	-37	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
188184	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	48	3375	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGACGTGGTGATTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
188200	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188232	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	242	-2	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
188252	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATTATACGCACTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11248	10740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11038_11109_11205
188334	SIRV2	-	307	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	34	3391	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
188347	SIRV2	-	595	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	4	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGACCTACTGCACGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4342_4480_4687_4798_5786
188374	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
188382	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
188386	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7481	-1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
188388	SIRV5	+	601	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-282	886	-168	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8033	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
188406	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
188418	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	81	440	1530895	1531333	FALSE	5	GGTGACTGTCGGGCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530444	1531335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
188436	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
188439	SIRV5	+	454	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACATAACTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2113_2157_2270_2316_3298_3405_3483
188456	SIRV2	-	400	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1751	-730	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAAGTGGTTAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2888
188465	SIRV2	-	611	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1100_1700
188510	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
188537	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
188543	SIRV5	-	466	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCACGGGTGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
188580	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
188590	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
188592	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
188705	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4144	0	2965	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
188732	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188744	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	34	3255	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
188751	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
188757	contig_4364_pilon	+	491	4	Intergenic	novelGene_409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	80	490	1530895	1531666	FALSE	5	CTGTGCTGTCTCTGTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQ	1530445	1531667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
188793	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188799	SIRV2	+	325	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	272	-74	-272	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGATGTTCTATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
188843	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
188870	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188877	contig_4364_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_2802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188888	SIRV5	+	290	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCTAAGTGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2085_2157_2270_2316_3298
188893	SIRV2	+	298	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	299	-74	-299	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAATGCTAAACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
188914	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
188925	SIRV2	-	279	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	638	31	638	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAAGGTAATTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4094	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
188930	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
188953	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
188956	SIRV2	-	759	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2963	265	1784	-265	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAACCTAGTGGCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2948	1300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
188957	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
188960	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
189020	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
189024	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	35	3425	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
189038	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
189073	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189074	SIRV5	-	412	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGACCTAGAGATGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10966	8207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
189091	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4620	34	3445	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
189126	contig_8538_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_4771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	66	299	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842762	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
189137	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
189150	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189207	contig_4364_pilon	+	286	3	Intergenic	novelGene_567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACGGTATTGTCACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
189314	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
189339	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189368	SIRV2	+	627	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-30	-74	30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGATATGGTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
189382	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
189406	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
189410	SIRV2	+	314	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	283	-74	-283	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTATTTGACTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
189431	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
189446	contig_4364_pilon	+	181	1	Intergenic	novelGene_4536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533128	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
189448	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
189475	SIRV7	-	2273	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	182	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147736	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43088_114680_114989_147622
189497	SIRV2	+	388	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	209	-74	-209	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTTGGCTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
189544	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	37	3364	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
189555	SIRV2	-	1002	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2986	-1	1807	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2925	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
189588	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	38	3081	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
189594	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
189606	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	160	-73	-160	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATAAATACCACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
189611	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAACTTGTTGCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532422	1532719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532400_1532700
189622	contig_4364_pilon	+	382	3	Intergenic	novelGene_483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	76	381	1530895	1531279	FALSE	10	TGTTGCTGACGGAGGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHP	1530449	1531280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
189644	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
189742	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189748	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	72	350	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530453	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
189808	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189813	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
189849	SIRV5	+	415	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
189864	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	76	399	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530449	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
189866	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_1437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189927	SIRV6	+	283	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10542	1	1305	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
189956	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCAGTGAACGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532859	1533303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
189976	SIRV5	+	364	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
189979	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
190034	SIRV2	+	467	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	129	-73	-129	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTCTAATACCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
190037	SIRV2	+	288	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-687	-393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACCACTACATGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3346	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3377_3666_3828_3967
190074	SIRV5	-	386	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAGTAGGACGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
190135	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
190145	contig_4364_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532850	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
190151	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	35	3228	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
190155	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	187	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
190171	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
190175	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
190180	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
190214	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
190288	SIRV5	+	303	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	932	-30	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCGGGACTAGGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
190346	contig_12008_pilon	+	4156	8	Intergenic	novelGene_25001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_3	551.32408336473	1329	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	10	TGATTTTCTTGCCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	42486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39215_39300
190365	SIRV2	+	253	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-364	-395	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAACCACTACATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3669	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
190391	contig_4364_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_4501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533115	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
190486	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	83	501	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
190503	SIRV5	+	240	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	270	158	156	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8471	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
190584	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
190630	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
190631	SIRV5	+	669	8	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	2029	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAGGAGTCGTCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	5627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543
190659	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
190685	contig_4364_pilon	+	412	3	Intergenic	novelGene_670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	65	412	1530895	1531321	FALSE	35	GAGAAGATGACCCAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR	1530460	1531321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
190691	contig_4364_pilon	+	251	3	Intergenic	novelGene_434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCAAGAGAGGCATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
190701	contig_15821_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_25020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAAACACTCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122663	122258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_122300_122700
190718	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
190770	SIRV5	+	242	2	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTCGCCGTATCGCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1216_2270
190797	SIRV2	+	478	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	119	-74	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTGCAACTTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
190806	SIRV2	-	407	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3024	1	-394	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTGAAGACGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
190850	contig_4364_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	65	427	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530460	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
190884	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
190888	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
191081	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
191133	contig_3956_pilon	+	2716	16	Intergenic	novelGene_15171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1086.40744147345	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	15	2591	1281682	1290491	TRUE	30	TAAAAGGTTTATTTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281667	1290827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290548_1290758
191149	SIRV2	+	542	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-706	302	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAACTATTTCAACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3327	4759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3376_3673_3828_3968_4095_4340_4480_4684
191201	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
191247	SIRV2	+	440	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	153	-70	-153	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCACTCCCACAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
191282	SIRV5	+	276	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-277	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAAAAGCCTAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
191295	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
191316	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
191344	contig_4364_pilon	+	377	3	Intergenic	novelGene_723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	53	376	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530472	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
191409	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
191456	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
191478	SIRV6	-	304	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCGAACTTTGACGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
191610	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3022	-2	-392	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGAAGACGTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
191660	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
191667	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
191683	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
191717	contig_4364_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_3243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTCCTAAGGCTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
191766	SIRV5	-	458	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTCCACCTTCACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
191793	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
191838	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
191870	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	38	3426	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
191904	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
191919	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
191976	SIRV2	-	1015	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2973	-1	1794	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2938	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
192032	SIRV5	+	206	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	308	154	194	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8509	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
192046	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-25	-74	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
192065	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
192091	SIRV5	+	305	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	22	878	22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8337	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
192117	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
192157	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
192168	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	875	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
192192	SIRV5	-	397	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAATTTACGGTGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
192222	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	38	3424	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
192226	SIRV5	+	342	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-220	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGCGCCAACAGCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2058_2270_2316_3298
192242	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
192261	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	38	3082	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
192264	contig_4364_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_3382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACTGGGTCCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
192267	contig_4364_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_4091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
192271	SIRV6	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGGTTAGCCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
192309	contig_4125_pilon	-	3635	12	Intergenic	novelGene_25121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_11	405.998534378334	1477	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	209	889	822728	813780	TRUE	35	AAAAAAAGCTGGGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846549	808960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846387
192342	contig_8538_pilon	+	302	2	Intergenic	novelGene_4653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841231	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841379_842974
192347	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
192363	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	5	62	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
192420	SIRV2	-	417	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4440	50	3265	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
192471	contig_4364_pilon	+	499	4	Intergenic	novelGene_380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	81	497	1530895	1531672	FALSE	5	GTCTCTGTATGCCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAV	1530444	1531674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
192485	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
192554	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	11	875	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
192559	contig_8538_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_5056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842830	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
192617	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
192626	SIRV5	-	474	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGTGACTACAGTAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
192633	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
192772	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
192791	contig_4364_pilon	+	344	3	Intergenic	novelGene_259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	81	344	1530895	1531237	FALSE	25	ACTTTCTATAACGAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHH	1530444	1531237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
192821	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
192837	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	880	-28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
192875	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
192902	contig_4364_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_3045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
192957	contig_8538_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_5067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842835	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
193014	contig_17440_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_7596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGAACCTCTGGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3333	3039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3000_3300
193032	SIRV5	+	347	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-221	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGCGCCAACAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298
193035	SIRV5	+	365	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-35	875	-35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8280	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
193041	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
193135	SIRV2	-	448	4	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1427	2356	252	287	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATGCACGTCGAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4480	3356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338
193160	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
193171	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-106	301	-106	-301	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAGTAATGCTAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	1330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
193173	SIRV2	+	254	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-364	-394	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAACCACTACATGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3669	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
193185	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
193326	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
193338	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
193343	SIRV5	-	446	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTCCTGCCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
193379	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	72	398	1530895	1531300	FALSE	35	TGAATCCCAAGGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530453	1531301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
193381	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
193418	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
193451	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
193479	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
193491	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
193501	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
193540	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
193564	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	902	-16	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
193572	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_3755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
193575	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
193596	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	7	2958	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
193608	contig_8538_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_4866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842776	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
193631	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
193632	SIRV5	+	243	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	262	163	148	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8463	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
193668	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	893	-25	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
193670	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
193710	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
193788	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	66	3224	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
193798	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	2	61	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
193801	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10457	2	1307	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11544	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
193806	SIRV2	-	595	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	53	3084	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
193867	SIRV2	-	458	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4415	34	3240	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
193872	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	34	3422	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
193873	contig_5023_pilon	+	2534	15	Intergenic	novelGene_7278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2154.60943120103	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	73	1584	607279	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580856	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611777_618605_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647374_647735
193910	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
193957	contig_4364_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_2126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCATTAATACCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
194028	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	38	3369	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
194065	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
194078	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
194138	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194166	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	76	402	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530449	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
194186	SIRV2	-	460	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	34	3238	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
194211	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	900	-22	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
194241	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
194290	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
194322	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194370	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532941	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194432	SIRV2	-	476	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	34	3222	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
194487	contig_8538_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_5057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842830	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
194575	contig_4364_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_1407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGACCGTGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
194588	SIRV2	+	265	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	326	-68	-326	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCAGCACGCAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
194589	SIRV2	+	256	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	320	130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTCGTTCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1428	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
194672	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
194707	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
194754	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
194792	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194807	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194849	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194852	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
194876	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
194907	contig_7272_pilon	-	3734	21	Intergenic	novelGene_25350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	697.061948466562	1397	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	59	1882	633189	603571	TRUE	20	GTATAGTTGCTGAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPCSPPAAWAARRSPKMASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKDMAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKMGGARKRRELPLIKKGTRTIEGRRSCPLKR	633247	592738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603664_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
194910	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
194967	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
195031	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195059	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
195072	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
195110	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
195113	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
195128	SIRV5	+	413	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	0	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
195135	contig_9609_pilon	+	3062	24	Intergenic	novelGene_22978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	175	junction_5	222.247005759353	1181	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	620	2551	320989	332820	FALSE	15	TGATACTGTGTCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309927	333331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
195154	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
195193	SIRV2	-	418	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	59	3255	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTTATCTAAGGAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
195247	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
195257	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
195265	SIRV5	+	351	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-29	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
195275	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
195397	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195485	SIRV2	+	305	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	292	-74	-292	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAAACCATACTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
195540	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGACCGTGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
195613	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195659	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
195723	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
195809	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195812	contig_4364_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_2613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195823	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195825	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
195863	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842771	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
195925	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
195955	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
196076	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
196085	SIRV5	+	334	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8579_10858
196104	SIRV2	+	338	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	259	-74	-259	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACTGGGTTAATGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
196137	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533099	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
196156	SIRV2	-	406	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3027	-1	-397	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
196185	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
196266	contig_4364_pilon	+	392	3	Intergenic	novelGene_298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	81	392	1530895	1531285	FALSE	20	CTGACGGAGGCGCCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
196331	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
196408	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
196418	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
196437	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
196528	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
196539	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
196553	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
196557	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
196644	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	5	886	5	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8320	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
196678	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCGTTCTTTTGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2102_2157_2270_2316_3298_3405_3483
196754	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
196769	SIRV2	-	229	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4644	34	3469	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
196788	contig_4364_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_2741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTCAGGACTCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
196797	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
196841	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
196849	SIRV2	-	464	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4409	34	3234	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
196868	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
196873	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
196886	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4620	34	3445	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
196896	SIRV2	-	472	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4401	34	3226	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
196975	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
196991	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
196994	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
196995	SIRV2	-	407	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-394	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTGAAGACGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
197014	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
197095	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7475	-4	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
197116	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
197128	SIRV5	+	257	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	253	158	139	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8454	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
197256	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
197257	contig_4364_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_3799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
197286	SIRV2	-	356	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1800	-737	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAGGTATAGAAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2932	1772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2063_2667_2803_2881
197331	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
197337	contig_8538_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_5073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842838	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
197393	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
197527	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
197542	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	216	-10	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTGCCTAACGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
197575	contig_8538_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_5065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842832	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
197584	SIRV5	+	352	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCGAATAGCGCCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
197721	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	82	499	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
197746	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
197772	SIRV2	+	292	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	305	-74	-305	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATACGCAGTAATGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
197778	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
197842	contig_8538_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_5035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
197875	SIRV2	-	471	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	37	3224	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
197931	contig_4364_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_3525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGAAAGGAAACTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
197965	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
198085	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
198115	contig_4364_pilon	+	408	3	Intergenic	novelGene_654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	68	406	1530895	1531312	FALSE	40	CAACAGGGAGAAGATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPK	1530457	1531314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
198142	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
198153	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	235	-2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
198171	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
198216	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
198264	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
198278	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
198298	SIRV5	+	451	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7438	2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATAACTATGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
198371	SIRV2	-	266	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4607	34	3432	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
198373	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
198387	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
198473	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_4978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
198608	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
198626	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
198630	SIRV2	+	311	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	286	-74	-286	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATACTTATTTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
198650	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2045_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
198674	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
198675	SIRV5	-	323	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACAGATTTCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
198682	SIRV2	+	284	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	313	-74	-313	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCGCAAGATACGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
198758	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
198767	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
198845	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
198872	SIRV5	-	479	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTACAGTAAGGACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
198998	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
199004	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
199068	contig_4364_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_4024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCCAGCGGGAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
199131	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	67	300	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842761	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
199180	contig_4364_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
199209	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
199246	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
199253	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
199370	SIRV5	+	384	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
199372	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	878	-47	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
199375	contig_4364_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_2766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532987	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
199415	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
199424	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533015	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
199429	SIRV2	-	440	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	34	3258	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
199435	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
199492	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
199546	contig_4364_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAACCAGTGCTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533275	1532722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532700_1533300
199554	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
199558	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
199611	SIRV5	-	466	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCACGGGTGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
199622	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
199644	SIRV5	+	391	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
199660	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	880	28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
199670	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
199673	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	584	502	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
199709	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	82	503	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
199769	SIRV2	+	278	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	318	-73	-318	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACGCAATCGCAAGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
199801	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
199816	SIRV5	+	446	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7443	2	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
199833	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
199894	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
199899	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
199928	contig_4364_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_1268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGTGAGGTCGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
199950	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
199974	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
200026	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
200045	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
200068	SIRV5	-	346	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
200081	contig_1406_pilon	+	2706	4	Intergenic	novelGene_25568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	3646	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	102	497	2173822	2185260	FALSE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCCRLPPPRISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173720	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
200087	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	96	15	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
200152	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
200217	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532951	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
200257	contig_6589_pilon	+	207	2	Intergenic	novelGene_26058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2887	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCCGGGCTGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1726908	1727251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1727040_1727175
200295	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
200330	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10348	2	1198	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
200418	SIRV2	-	562	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4311	34	3136	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
200428	SIRV5	+	300	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7663	-1	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
200434	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
200514	SIRV2	+	289	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	308	-74	-308	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGATACGCAGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
200581	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
200584	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
200586	SIRV2	-	487	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-312	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	17	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACACAGTGGTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
200635	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
200683	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
200687	SIRV2	-	285	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4588	34	3413	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
200693	SIRV6	-	328	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGTTGGTTAGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
200725	contig_4364_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_2714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532961	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
200726	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
200764	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
200798	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
200861	SIRV2	+	286	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	311	-74	-311	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCGCAAGATACGCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
200903	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
200931	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
200969	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	36	3407	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
200991	SIRV2	-	692	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963_4095_4338_4480_4687_4801_5751
201025	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
201031	SIRV2	-	685	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	-7	8	5	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
201068	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	6	2960	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
201126	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201188	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
201190	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
201192	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-27	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8288	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201223	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
201252	contig_4364_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532871	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
201253	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
201265	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
201269	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
201283	SIRV2	-	269	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4604	34	3429	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
201339	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	234	18	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
201350	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
201506	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201512	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	266	-74	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
201540	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	886	44	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201644	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	5	1261	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
201652	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
201673	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	34	3422	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
201846	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
201881	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	878	-11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201891	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
201921	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
201992	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
202036	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
202064	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
202094	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	882	44	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
202135	SIRV2	-	1024	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2964	-1	1785	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2947	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
202153	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
202200	SIRV2	+	377	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	220	-74	-220	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGAGCACAACGCTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
202212	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
202237	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
202343	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
202352	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
202391	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
202423	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
202450	contig_8538_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_4870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
202473	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
202484	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
202487	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
202500	SIRV5	+	353	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7615	2	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATAGCGCCAACAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
202549	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	83	499	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
202579	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
202614	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
202715	SIRV2	-	667	2	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4147	13	2972	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCCAGATTGACATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
202717	SIRV2	-	453	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-31	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCACGACGACGTCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4763	3702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4340_4467_4687
202757	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
202775	contig_4364_pilon	+	302	3	Intergenic	novelGene_443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	76	300	1530895	1531198	FALSE	30	CACCAACTGGGACGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530449	1531200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
202791	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
202823	contig_4364_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
202828	SIRV5	+	307	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7654	1	-261	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTTCGGGTGCAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
202869	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533101	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
202874	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
202887	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
202913	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
202943	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
202948	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
203027	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
203067	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
203079	SIRV5	+	313	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	878	14	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
203088	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	274	-74	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
203144	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	886	-20	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
203175	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
203179	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	208	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
203203	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
203316	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	34	3411	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
203336	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
203410	SIRV6	+	385	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	1	1203	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
203459	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
203506	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
203554	SIRV2	-	193	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4680	34	3505	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
203643	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
203686	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	1	1308	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
203690	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	38	3079	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
203745	SIRV5	+	307	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	20	878	20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8335	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
203771	SIRV5	+	408	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
203780	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
203796	SIRV5	+	251	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-109	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGGGACTATTTAGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
203832	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
203839	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
203874	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
203884	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
203908	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
203962	contig_4364_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_2891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATTTTTTCCAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1533017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
203971	SIRV5	+	257	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	260	151	146	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8461	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
203991	SIRV2	-	451	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-348	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGTTAAAGCAAACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5790
204009	contig_4364_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCATATCATCCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
204047	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532858	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204140	SIRV2	-	460	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1177	0	14	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
204185	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
204195	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204210	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204216	contig_4364_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_4248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGTGTTCCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
204239	contig_11285_pilon	-	3330	30	Intergenic	novelGene_5691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_25	382.62302661942	2320	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1036	3111	30	3140	798530	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
204273	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10455	2	1305	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204278	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204317	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204330	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204335	contig_3155_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_26428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCCTCTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268540	268961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_268500_269000
204353	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204374	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
204432	SIRV2	-	401	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
204457	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	35	3083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
204468	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
204480	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
204495	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9646	592	496	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
204507	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204508	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3036	0	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
204610	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
204617	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204731	SIRV5	-	454	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGTTCTCCACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
204750	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
204858	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
204873	contig_8538_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_5020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTTCAATAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842819	843099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
204899	contig_17274_pilon	+	3778	25	Intergenic	novelGene_26528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_24	338.332543102525	829	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	69	2156	131715	213531	TRUE	10	TAGGGCTTATTGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	131646	216907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439
204966	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
204973	SIRV5	-	265	3	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	84	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2322	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2052_2268
204978	SIRV2	-	217	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4656	34	3481	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
204995	SIRV2	-	460	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	34	3238	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
204996	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	397	0	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
205033	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
205057	SIRV2	-	454	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	40	3238	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
205062	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
205071	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
205109	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	12	1259	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
205167	SIRV2	-	406	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2949	712	1770	-712	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGTTCCCAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2962	1747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
205200	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
205223	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	586	499	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
205277	contig_4364_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532862	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
205288	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
205330	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
205334	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
205421	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	882	57	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
205482	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
205507	SIRV5	+	363	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	47	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8368_8474_8586_10858
205528	contig_4364_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_3205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCTAAGGCTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
205543	SIRV5	+	341	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-7	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2264_2316_3298
205561	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
205580	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	653	47	653	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4079	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
205592	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_16621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
205691	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
205787	SIRV6	-	390	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATAGGTCTCTTTCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
205803	contig_4364_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_2960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
205809	SIRV2	+	385	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	212	-74	-212	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCTTCTTGGCTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
205814	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
205898	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
205950	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	887	0	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
206017	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
206084	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
206130	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
206140	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
206169	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
206200	contig_4364_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_2670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATTCTGTAACCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
206214	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
206239	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_3869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
206265	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
206276	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_3781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
206304	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	878	-31	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
206335	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
206378	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
206485	SIRV5	+	356	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7589	-2	-196	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCCACCCCCGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
206547	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
206571	contig_4364_pilon	-	380	3	Intergenic	novelGene_482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGACCGACCGCGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531278	1530449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093
206586	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
206717	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
206779	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
206807	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
206932	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
206977	SIRV5	+	443	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGACACTTTCGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1980_2098_3298_3405_3483
206979	contig_4364_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	72	344	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530453	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
206997	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
207034	SIRV6	-	443	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCGCGATGCCAATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
207048	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
207099	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
207157	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
207212	contig_8538_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_4954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842801	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
207223	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
207279	SIRV5	-	255	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGTTCTTCCGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
207328	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	231	15	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
207506	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	236	15	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
207515	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
207593	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
207599	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-72	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
207615	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
207691	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
207701	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
207706	SIRV5	+	376	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-7	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3394_3474
207720	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	5	1254	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
207757	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
207761	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
207781	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	72	392	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530453	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
207826	contig_4364_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGATATGTACAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533268	1532802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
207837	contig_4364_pilon	-	179	1	Intergenic	novelGene_4452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATCCAACTCAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533279	1533100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
207889	SIRV5	+	325	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	27	7610	7	-217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGCCAACAGCGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
207893	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
207912	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
207917	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
207931	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7481	1	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
207958	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208004	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
208027	contig_4364_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_4284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCCACAGTGTTCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
208035	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
208077	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
208132	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208146	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208169	contig_4364_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_4497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAAGTAACAGACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
208201	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
208206	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208264	SIRV2	+	478	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	119	-74	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTGCAACTTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
208272	contig_4364_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_2233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCATTAATACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533289	1532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
208306	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208348	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
208373	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
208424	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
208445	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
208451	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
208508	contig_4364_pilon	+	347	3	Intergenic	novelGene_449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	76	345	1530895	1531243	FALSE	15	TAACGAGCTGCGTGTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530449	1531245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
208525	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
208557	SIRV5	+	434	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-107	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8208	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
208562	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208569	SIRV5	+	375	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	878	-48	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
208612	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	34	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
208623	SIRV2	+	466	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	130	-73	-130	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGACTCTAATACCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
208670	SIRV2	-	463	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	41	3228	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
208694	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208712	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
208757	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
208776	SIRV5	-	378	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
208780	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
208782	contig_4364_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_2431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
208800	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
208887	SIRV2	-	463	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	2973	0	-343	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAGCAAACGACAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
208913	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
209017	SIRV5	+	417	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTAGAAAACAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2126_2157_2270_2305_3288_3405_3483
209102	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
209160	SIRV2	-	534	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4324	49	3149	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
209190	SIRV6	-	300	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCGCGAACTTTGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
209213	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
209227	contig_15063_pilon	+	1833	7	Intergenic	novelGene_9124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2955.6669721063	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	243	779	34808	35816	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRLLQQSPPLCSGETTPPQTFSPTGH	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35739_36158_36266_36600_38975_39092_39506
209232	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
209245	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	880	-43	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
209269	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
209286	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
209288	SIRV5	-	465	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCACGGGTGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
209298	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533090	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
209323	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	35	3372	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
209352	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	ACGGAGGCGCCCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
209365	contig_4364_pilon	+	501	4	Intergenic	novelGene_379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24336.6158836159	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTCTGTATGCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096_1531337_1531618
209373	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_5022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842819	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
209437	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
209551	SIRV6	+	333	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1268	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
209645	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
209662	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
209787	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
209816	SIRV2	-	448	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4419	40	3244	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
209862	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7484	-1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
209875	SIRV5	+	309	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	21	875	21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8336	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
209909	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
209943	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
209953	contig_4364_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_4092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
210014	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
210053	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
210073	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
210112	contig_4364_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCACACCTCGGCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1532854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
210129	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
210169	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
210186	SIRV5	+	361	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7607	2	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACAGCGTTATTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
210191	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
210210	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
210317	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	887	-26	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
210343	SIRV5	+	331	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7625	-5	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTTAGCCGAATAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
210352	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
210356	SIRV5	-	354	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTGCAATCTCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
210382	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
210398	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
210550	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
210584	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
210605	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
210653	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
210719	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
210722	SIRV5	+	397	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
210730	SIRV7	+	2113	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37373	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAACTAATTAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	114954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
210782	SIRV5	+	248	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	168	138	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCCTCGTAGTATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
210789	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
210811	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
210827	SIRV2	+	621	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-24	-74	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAACCTGGAGGATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
210868	SIRV6	-	256	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-54	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1874	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1542_1647_1735_1844
210875	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
210928	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
210968	contig_3077_pilon	+	1725	10	Intergenic	novelGene_26631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	76	1227	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
210999	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	230	0	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
211071	SIRV2	-	234	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4639	34	3464	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
211146	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
211153	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
211181	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	585	502	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
211202	SIRV2	-	254	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	656	38	656	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
211228	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
211271	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
211282	contig_8538_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_4907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842784	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
211303	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
211339	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
211352	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_1944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGCAGTGAACGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
211369	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
211399	SIRV2	-	351	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4514	42	3339	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
211409	contig_4364_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_1564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
211489	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_1709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
211490	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	234	15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
211496	contig_4364_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_4498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533114	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
211540	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
211566	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
211599	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
211665	SIRV6	+	210	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	64	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3163_10724
211734	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
211750	SIRV2	+	273	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-357	-368	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGCTGACCCGTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3676	4089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
211761	contig_4364_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_4332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAACAACCCACAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
211912	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	38	3382	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
211922	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	292	-68	-292	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAAACCATACTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
211963	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
212040	contig_6735_pilon	-	1807	13	Intergenic	novelGene_15709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1005.75912112306	37	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	572	1426	545923	542464	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568282	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542198_542296_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_552829_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
212053	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
212133	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	276	-71	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
212161	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
212175	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
212200	SIRV5	+	357	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-29	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
212318	contig_15021_pilon	-	3340	13	Intergenic	novelGene_26948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_12	317.624078992062	2618	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	118	1203	269638	243699	TRUE	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQRQAGDGDGSAHGHHA	279877	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
212333	contig_4364_pilon	+	435	3	Intergenic	novelGene_536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	76	435	1530895	1531333	FALSE	10	CAGGTGACTGTCGGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530449	1531333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
212335	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
212378	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
212472	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
212477	SIRV2	-	253	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	667	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAAGGTAATTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4065	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
212583	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
212610	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
212638	contig_4364_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_3391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACTGGGTCCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
212690	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
212693	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
212720	SIRV2	-	259	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	50	3423	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
212766	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
212769	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	69	302	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842759	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
212838	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
212905	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
212910	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
213030	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	63	7653	63	622	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
213073	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
213075	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	878	-20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
213095	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
213111	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
213193	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	56	486	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
213267	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
213287	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_5046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842825	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
213366	SIRV2	-	255	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	60	3417	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGTTATCTAAGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
213371	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
213393	SIRV5	+	447	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7426	-1	-33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTTTCGGTAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
213436	SIRV2	-	403	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3033	0	-403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
213440	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	34	3388	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
213463	SIRV2	-	454	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	56	3222	-21	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCTAAGGAGACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
213573	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
213615	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
213641	SIRV2	-	1018	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2966	3	1787	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	627	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
213667	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
213687	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
213736	SIRV5	+	440	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	3	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
213738	SIRV5	-	343	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCTGGCTCTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
213753	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
213760	SIRV5	+	261	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	256	151	142	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8457	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
213774	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	45	3255	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
213778	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
213783	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
213830	SIRV7	-	2118	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	32962	2	-45	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	39	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114961	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
213847	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	235	-2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
213864	contig_4364_pilon	+	323	3	Intergenic	novelGene_738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	40	321	1530895	1531255	FALSE	15	TGTGGCCCCCGAGGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530485	1531257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
213902	contig_4364_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_2863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTTCCAACCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
213959	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	95	2	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
214028	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
214110	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	34	3426	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
214171	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
214236	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
214252	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
214303	contig_4364_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_2454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
214368	SIRV6	+	397	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1493	580	64	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
214435	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
214456	SIRV5	+	346	4	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5088	4033	-2057	3360	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCATAAGGAGACCGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6144	6958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6170_6327_6453_6658_6723_6826
214481	contig_6047_pilon	+	2736	19	Intergenic	novelGene_24201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	508.23399454373	56	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	170	2479	106282	123624	FALSE	10	TACCCAGTGTCTTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSIEGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105131	123881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106296_106333_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
214485	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
214556	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	82	500	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
214576	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
214590	contig_8317_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_20191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	700	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
214596	SIRV5	+	279	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	-276	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAAGCCTAAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2267_2316_3298
214659	contig_8538_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_5011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
214662	SIRV5	+	363	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7605	2	-212	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGCGTTATTATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
214686	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTTAAGGAGAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
214689	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
214849	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	230	0	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
214865	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
214866	contig_8317_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_19240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	216	578	14294	15131	FALSE	25	GAATTTGAAGCTGGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVG	13110	15131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
214868	SIRV2	-	459	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2972	1	-342	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGCAAACGACAACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
214943	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	131	7	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
214967	SIRV2	+	603	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-52	-28	-52	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1700
214970	SIRV2	+	375	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1451	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTACCTGGTTGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4480_4686_4800_5787
215079	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_5040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842823	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
215098	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
215183	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4591	40	3416	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
215254	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	2	1161	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
215323	contig_4364_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_2619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAACCATCAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
215373	SIRV2	-	307	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	34	3391	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
215416	contig_4364_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_3521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAAGGAAACTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
215440	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
215492	SIRV2	-	624	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	35	2958	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
215553	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACAGACCGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
215606	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
215636	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
215721	SIRV6	+	179	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	101	503	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGCGGTAAACGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
215807	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
215811	contig_4364_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_2831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCAACCCTGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
215866	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
215887	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
215910	contig_8538_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_5010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842816	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
215997	SIRV2	+	324	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	273	-74	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
216010	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
216076	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	2	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
216162	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
216218	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
216237	contig_4364_pilon	+	438	3	Intergenic	novelGene_538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	76	438	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530449	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
216314	SIRV5	+	419	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	875	25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
216316	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
216361	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCCCTCACACCTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533104	1532858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533100
216370	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
216376	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	1	63	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
216407	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	45	3381	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
216546	SIRV2	-	705	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	5	2325	5	318	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGTCCATGAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
216587	SIRV5	-	335	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGTATTTGACCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10861
216638	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
216655	SIRV2	-	625	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
216688	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
216823	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
216967	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	4	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
217063	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
217080	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217101	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
217174	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
217199	SIRV2	+	387	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	202	-66	-202	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTACACATATGCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
217214	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217239	SIRV6	+	196	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	499	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10815_11031_11109_11205
217318	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
217341	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217361	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
217373	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
217472	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
217478	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
217533	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217538	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
217540	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	3	64	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
217602	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_1767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACCCTGCACAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
217638	SIRV5	+	418	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7466	-1	-73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
217720	SIRV2	+	422	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	165	-64	-165	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGCTATAAATACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
217730	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217733	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	3	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8318	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
217799	contig_4364_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_4510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533117	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
217869	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
217889	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
217952	SIRV5	-	372	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATGCGTAAGCACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
218083	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
218119	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
218162	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
218194	SIRV2	-	349	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3322	5	-692	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAGACAGTCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
218221	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
218308	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
218356	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3033	-1	-403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
218369	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	886	45	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
218403	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
218463	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	40	3083	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
218525	SIRV2	-	402	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4798_5786
218538	SIRV2	-	408	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2940	719	1761	-719	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAAAGATTTGGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2971	1754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
218563	SIRV2	+	294	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	293	-64	-293	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAAACCATACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
218645	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
218725	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
218771	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
218825	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	40	3380	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
218847	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
218849	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
218887	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
218928	SIRV5	+	452	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7437	2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
218953	contig_4364_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_4351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
218979	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
219083	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
219104	SIRV5	+	283	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
219109	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	83	497	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
219126	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219155	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
219185	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	25	1260	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219195	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4342_4480_4687_4801_5788
219217	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219233	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219375	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	238	0	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
219456	contig_8598_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_22900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	4	342	191218	191556	NA	5	TGATTGTTGCTGCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAV	191214	191557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
219473	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-117	880	-3	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8198	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
219492	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	245	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2530	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
219498	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
219503	contig_5041_pilon	-	3358	18	Intergenic	novelGene_27054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_6	650.569534887074	29	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	106	2244	616721	521597	FALSE	20	ATGGGTTTGCCAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERVAECFP	636085	520482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_521619_525501_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
219557	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_4899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCATTGCACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
219590	SIRV2	+	270	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	327	-74	-327	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCACCAGCACGCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
219608	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
219610	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	928	51	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGACTAGGTGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
219686	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219707	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
219715	SIRV5	-	441	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
219737	SIRV5	-	250	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAATTTAAGTTCTTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
219814	contig_12873_pilon	+	3008	4	Intergenic	novelGene_27153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2397	junction_1	433.996159737234	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1682	2437	17632	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15950	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_18014_18984_19264_19611_19703_19851
219861	SIRV6	+	397	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1493	580	64	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
219926	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	45	3374	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
219963	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
219996	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
220020	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	34	3423	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
220046	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
220219	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	276	-74	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
220385	SIRV2	-	905	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3108	53	1929	-53	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGTCTTGCGTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2803	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
220391	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	11	1257	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220397	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	242	4	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
220406	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220439	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
220481	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220517	SIRV2	-	390	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3041	1	-411	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
220536	contig_4364_pilon	+	298	2	Intergenic	novelGene_747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCCCCTGAATCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530916	1531293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096
220565	contig_4364_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_4323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACAACCCACAGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
220572	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220582	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532965	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
220606	contig_8538_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_5101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842927	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
220631	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220696	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
220747	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220780	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7488	-1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
220849	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
220929	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
220988	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
221006	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
221022	contig_5640_pilon	+	3740	16	Intergenic	novelGene_27271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	346	junction_10	164.21102953889	2606	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	77	1828	945874	955989	FALSE	20	CTCTAATTTGAGCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAAVEAVNAAPLTGSKEMSLEEPKKMTREDWRKKKELEEQRKLGNAPAEVDEEGKDINPHIPQYISSVPWYIDPSKRPTLKHQRPQPEKQKQYSSSGDWYKRGVKENFITTKYRKGACENCGAMTHKKKDCFERPRRVGAKFTGTNIAPDEHVQPQLMFDYDGKRDRWNGYNPEEHMKIVEEYAKVDLAKRTLKAQKLQEELASGKLVEQANSPKHQWGEEEPNSQTEKEHNSEDEDEDKYADDIDMPGQNFDSKRRITVRNLRIREDIAKYLRNLDPNSAYYDPKTRAMRENPYANAGKNPDEVSYAGDNFVRYTGDTISMAQTQLFAWEAYDKGSEVHLQADPTKLELLYKSFKVKKEDFKEQQKESILEKYGGQEHLDAPPAELLLAQTEDYVEYSRHGTVIKGQERAVACSKYEEDVKINNHTHIWGSYWKEGRWGYKCCHSFVKYSYCTGEAGKEIANAEECIPSDVTGEESMKKPQTLMEMHQEKLKEEKKKKKKKKHRKSSSDSDGEEKREKLKKALNAEEARLLHVKEIMQIDERKRPYNSIYETREPTEEEMEAYRMKRQRPDDPMASFLGQ	942184	957901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_942245_945857_946044_946911_947066_947410_947492_947857_948023_949186_949256_950704_950753_950947_951080_951342_951441_951611_951680_951814_951955_952838_953001_954372_954478_954630_954703_954816_954925_955809
221083	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221199	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
221225	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
221275	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
221280	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221364	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	81	398	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530444	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
221400	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221435	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
221483	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
221530	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	84	499	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
221558	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221644	SIRV5	+	231	3	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	8834	2	-241	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGTCTAACATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119
221674	SIRV5	-	339	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACCTGGCTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
221677	contig_8394_pilon	+	4141	2	Intergenic	novelGene_27319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	469	junction_1	0	1129	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	135	1394	86395	87654	FALSE	15	TGTCATGCATCGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGIFSSPSHNEQHQNLLSSMDEYFKNFKTENKILSEETINLIKSNLEKGYIDNVSTVLDKALKEIDSAPLNIAVTGESGTGKSSFINALREVRCGEENAAPTGVVETTKKPISYEHPRFPNVKFWDLPGIGTTNFQPQYYLQRVKFVEYDFFIIVSATRFKDNEAQLATAIKSMKKNFYFVRSKVDIDLQNEQRNKPKNFEREEILQQIRDNCSLCFEKIKMDVPQIFLVSSNDVSKYDFPTLTDTLLKDLPAQKRHILMLSLPSVTEEAIEIKRNSLRQKIWLDALKAGVLATLPMVGIINDNDVKKLEASLKEYRVLFGVDDISLQNLAEDLQVPVEQLQAIIESPTLLEKKEDKSIRETLLKCLEKFCSANGGLLATGLYFRKNFYLQYHFLDIVTNDAKILLKKTFSEKKLMSH	75595	90401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_75716_86380
221723	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
221735	SIRV5	+	174	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	-17	8854	11	-261	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCGGGACGGACACGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	2137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119
221759	contig_4364_pilon	+	434	3	Intergenic	novelGene_632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	72	434	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530453	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
221859	SIRV5	+	466	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-136	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8179	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
221894	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221901	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
221923	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221972	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
221977	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	11	1254	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
221986	contig_8317_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_19757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTGTTTGCTGAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
221990	SIRV6	+	384	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10441	1	1204	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11441	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
222028	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
222057	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	11	878	11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8326	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
222099	SIRV2	-	247	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	659	42	659	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAAGACATTCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4073	3685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
222102	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4608	34	3433	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
222120	contig_4364_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_3691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACATCAGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
222135	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
222138	contig_8317_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_19898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCATATCTCGAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
222144	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
222159	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
222186	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	588	502	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
222241	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	35	3258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
222250	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
222294	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
222403	contig_1450_pilon	+	3268	22	Intergenic	novelGene_27347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	524.885436155772	50	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	222	2243	244426	349147	TRUE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEVGSVTGGKTKGFSPFPEPSQPA	243327	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244355_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349209_350303_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
222412	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
222418	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	243	11	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
222490	SIRV2	-	453	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4420	34	3245	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
222501	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
222513	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	886	7	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
222514	SIRV6	+	250	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	391	4	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
222522	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
222534	SIRV5	+	385	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
222573	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
222630	contig_8538_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_4864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842776	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
222647	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
222728	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
222729	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
222784	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
222798	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
222915	contig_8538_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_4756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	69	302	842828	843061	NA	25	TTTTCTTTCAATAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842759	843099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
222926	SIRV6	-	288	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCACCGCGAACTTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
222983	contig_7426_pilon	-	4448	8	Intergenic	novelGene_27526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	244.807129414658	2743	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	26	817	1102797	1087105	FALSE	15	AATCTGTTATTGTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102822	1083473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
222984	SIRV5	+	412	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
223013	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
223022	contig_4364_pilon	+	293	3	Intergenic	novelGene_242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCACGGTATTGTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
223027	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	394	15	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
223052	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	875	-17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
223066	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
223103	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
223151	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-120	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
223189	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-120	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
223244	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
223251	contig_4364_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCTCGGCGACGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
223283	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
223309	SIRV5	+	305	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	22	878	22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8337	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
223381	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	4	59	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
223407	SIRV2	+	288	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	309	-74	-309	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAAGATACGCAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
223486	SIRV2	+	428	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	169	-74	-169	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTATTATGCTATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
223549	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
223563	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
223615	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
223661	contig_4364_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	69	431	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530456	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
223682	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
223785	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_3597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
223825	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
223851	SIRV2	+	454	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	100	-31	100	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1200_1700
223855	SIRV5	+	374	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7587	1	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
223922	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	878	-50	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
223944	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
223950	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	45	3420	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
223997	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
224038	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
224125	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
224135	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
224197	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
224291	contig_4364_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_3062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGCTCAGATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
224334	SIRV2	+	371	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	218	-66	-218	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCACAACGCTTCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
224352	SIRV2	+	271	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	326	-74	-326	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCAGCACGCAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
224385	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
224400	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
224444	SIRV6	+	266	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10559	1	1322	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11559	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
224493	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
224523	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
224552	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
224571	SIRV5	+	332	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	886	-13	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
224589	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
224610	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
224622	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7487	-1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
224685	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	4	1198	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
224723	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
224764	SIRV2	-	603	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4270	34	3095	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
224827	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	39	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
224833	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
224852	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
224891	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
224915	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	233	5	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
224959	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
225001	SIRV5	+	452	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2172_2279_2316_3298_3405_3483
225025	SIRV2	-	446	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4427	34	3252	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
225059	SIRV2	-	254	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	668	26	668	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATTGACGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4064	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
225096	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
225193	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
225259	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
225285	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	45	3393	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
225313	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
225326	contig_8538_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_4892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842781	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
225373	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
225416	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
225497	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
225509	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
225562	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	3	222	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
225591	SIRV6	+	298	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	-16	501	15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACCATAAATTTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
225594	contig_6063_pilon	-	3984	14	Intergenic	novelGene_27569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	413.526084407268	1306	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	1565	2611	44494	17150	FALSE	55	TGAAAAGGAAAAAATCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70251	15776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
225608	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
225631	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
225633	SIRV5	+	265	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	928	12	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGACTAGGTGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
225636	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
225642	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	239	0	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
225658	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
225708	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	133	11	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
225735	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
225779	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
225791	SIRV5	+	314	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	37	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8607_10858
225848	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_5008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842815	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
225853	SIRV5	+	420	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7469	2	-76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
225926	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226019	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
226074	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
226077	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	878	51	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
226094	SIRV5	+	357	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-208	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGTTATTATTTGGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
226098	SIRV2	+	441	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	156	-74	-156	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACCACTCCCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
226099	SIRV2	+	238	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	316	-31	316	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1400_1700
226121	SIRV6	+	238	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-221	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645
226166	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226259	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
226264	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226349	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
226357	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	9	1262	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226369	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
226373	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
226394	contig_4364_pilon	+	358	3	Intergenic	novelGene_285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	5	GCTGCGTGTGGCCCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
226424	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
226465	SIRV2	-	487	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-300	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
226481	SIRV5	+	211	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	306	151	192	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8507	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
226486	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226525	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7433	1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
226542	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	4	1259	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226576	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	80	499	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
226593	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842779	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
226646	contig_4364_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532873	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
226658	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
226672	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	658	42	658	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAAGACATTCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4074	3685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
226704	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
226722	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
226750	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
226775	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226802	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
226817	SIRV2	-	427	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4442	38	3267	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
226831	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
226832	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7481	-5	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
226835	contig_15063_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_10992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	985	1308	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27173_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
226852	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	38	3411	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
226875	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
226910	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
226945	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	880	-11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
227012	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
227048	SIRV6	+	193	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	89	501	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
227090	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	4	1262	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227094	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
227141	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	880	-11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
227142	SIRV5	+	187	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	-5	-361	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACGGTCGTAACTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985
227146	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
227154	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_1645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
227176	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	238	3	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
227238	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
227297	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
227335	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
227384	SIRV5	+	254	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	8692	-1	-99	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCGAAGGTCGCCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
227386	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
227404	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227407	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
227419	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227444	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	240	-4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
227457	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227458	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
227515	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533090	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
227541	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
227546	SIRV2	+	315	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	282	-74	-282	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTATTTGACTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
227571	contig_4364_pilon	+	297	3	Intergenic	novelGene_440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTCACCAACTGGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
227587	SIRV6	+	441	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8846	15	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
227635	contig_4093_pilon	-	2703	6	Intergenic	novelGene_27617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1827.41047386732	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	59	622	69245	45507	TRUE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEPLLNLIH	72482	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45531_45661_45784_46300_46425_68951_69257_72435
227760	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
227812	SIRV6	+	285	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10540	1	1303	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11540	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227861	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	87	498	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
227900	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
227933	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227966	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227978	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
227981	contig_6795_pilon	+	4131	30	Intergenic	novelGene_27731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	376.746835897923	1353	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	30	2555	320577	331261	TRUE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRCESGAMEGTGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVCSRPSSRIGMMC	320547	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327430_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330847_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
227984	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
228016	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
228024	contig_4364_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	72	344	1530895	1531246	FALSE	10	ACGAGCTGCGTGTGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530453	1531247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
228044	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
228057	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
228076	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
228084	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
228108	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
228238	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	587	501	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
228324	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	89	497	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
228343	contig_8538_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_4937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCTTTCTGGATGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
228442	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842782	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
228485	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
228496	SIRV6	+	192	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	508	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10814_11031_11109_11205
228510	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	82	500	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
228516	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
228521	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	83	3078	-48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGCGTAATTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
228532	SIRV2	+	315	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-60	268	-60	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
228548	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
228621	SIRV5	+	404	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
228654	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
228705	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
228717	contig_233_pilon	-	2778	17	Intergenic	novelGene_14573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1337.06303609815	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	90	2411	126907	78579	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126996	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78260_78332_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
228796	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
228812	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
228817	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	38	3386	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
228867	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
228912	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
228988	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
229016	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
229017	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
229136	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
229141	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	88	496	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
229144	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
229182	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
229206	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
229258	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
229369	contig_233_pilon	-	2604	17	Intergenic	novelGene_14517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1337.06303609815	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	86	2407	126907	78579	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126992	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78319_78564_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
229560	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	2	1310	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
229561	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	124	15	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
229670	SIRV6	+	203	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	499	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
229732	SIRV6	+	436	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8845	-16	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
229746	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	35	3079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
229756	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
229802	SIRV2	+	639	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-61	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGTTCTAGGCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
229884	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
230027	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
230038	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
230042	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4608	34	3433	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
230137	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
230157	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
230158	SIRV6	+	298	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
230222	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	72	398	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530453	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
230300	SIRV5	+	263	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-284	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAACTGGCAAAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298
230323	SIRV2	+	284	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	313	-74	-313	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCGCAAGATACGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
230391	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
230513	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
230538	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
230545	contig_4364_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGGACTTGGCCACACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
230585	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
230588	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
230592	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	5	63	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
230640	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
230642	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
230683	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
230686	contig_4364_pilon	+	190	1	Intergenic	novelGene_4530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533124	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
230690	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	38	3083	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
230742	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
230863	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
230871	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
230901	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	239	0	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
230931	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9648	588	498	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
230994	SIRV5	-	224	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2157	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119
231135	SIRV2	-	594	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	56	3082	-21	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCTAAGGAGACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
231158	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
231203	SIRV2	+	179	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	418	-74	-418	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGAATAGCCATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1200
231239	SIRV6	+	376	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	11	1202	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
231348	SIRV6	+	279	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10546	1	1309	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
231364	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
231366	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
231377	contig_3956_pilon	+	2962	14	Intergenic	novelGene_15116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	1146.35573338106	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	774	2325	75	2399	1281682	1290447	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1281607	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1290372
231397	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7478	-1	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
231446	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	230	-16	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
231486	contig_4364_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_3933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCGGGAATACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
231507	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
231518	SIRV2	+	386	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	203	-66	-203	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTACACATATGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
231535	contig_4364_pilon	+	438	3	Intergenic	novelGene_539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	76	438	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530449	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
231579	contig_14273_pilon	+	3199	7	Intergenic	novelGene_21141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	582.707402275505	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	519	1883	138031	151187	FALSE	25	TAAAATCTTGATTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127916	152503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
231591	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
231597	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
231601	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
231637	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
231658	contig_12622_pilon	-	2305	13	Intergenic	novelGene_5933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1916.40566338828	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	707	1465	1588902	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590997	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589613_1590019_1590234_1590830
231683	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
231691	SIRV5	+	432	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-120	893	-6	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
231704	SIRV2	+	298	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	293	-68	-293	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAAACCATACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
231746	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
231757	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
231790	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
231793	contig_4364_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_2758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532981	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
231853	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
231886	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
231914	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
231915	SIRV2	-	465	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-331	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACGTCATTGTGATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
231948	SIRV6	-	338	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGTTGGTTAGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
231960	SIRV6	-	316	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATGACCATTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
232032	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
232037	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
232068	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
232071	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
232113	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
232117	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
232127	SIRV5	+	248	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-107	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGACTATTTAGCGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
232157	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
232206	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
232220	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
232231	contig_4364_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_2691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCTGGGAAATTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1532951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
232236	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	80	501	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
232318	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
232348	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
232373	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
232384	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
232390	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842782	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
232495	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
232536	SIRV2	-	436	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	34	3262	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
232673	SIRV2	-	361	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	37	3334	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
232684	contig_4364_pilon	+	188	1	Intergenic	novelGene_4520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533121	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
232753	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
232777	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
232878	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
233013	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
233020	SIRV5	+	372	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
233112	SIRV5	-	319	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10859
233134	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
233175	contig_4364_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
233177	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3033	1	-403	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
233189	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	4	59	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
233314	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
233319	SIRV6	+	336	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	188	11	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCACGAGTAGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
233346	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
233372	SIRV2	+	402	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	195	-74	-195	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGCTGTTGGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
233373	SIRV2	+	306	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	280	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
233440	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	1	1310	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
233468	contig_4364_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_2864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
233610	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
233624	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	44	3382	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
233756	contig_4364_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_2532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
233884	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
233925	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	0	2971	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
233951	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
233999	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234007	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234057	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
234067	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
234096	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
234101	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234148	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
234203	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
234226	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	4	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234236	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGTCTTCCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
234258	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234294	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
234297	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
234317	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
234321	SIRV6	+	453	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10295	2	1145	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11382	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
234445	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
234473	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
234512	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234566	SIRV5	+	290	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCTAAGTGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2279_2316_3298
234698	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234740	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	886	25	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
234786	SIRV6	-	247	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11278	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
234802	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234815	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	235	4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
234840	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234843	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
234848	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
234929	SIRV2	-	495	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2938	-1	-308	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGGTTGTGATCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
234933	SIRV2	+	1028	5	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	1314	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGTATTAACCGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726_1853_1972_2062_2671_2802_2877
234949	contig_4364_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	68	346	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530457	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
234952	contig_4364_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
234963	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7476	2	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
235015	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235067	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-30	240	-17	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
235097	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
235190	SIRV2	-	641	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	21	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4340_4480_4687_4801_5788
235191	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2964	707	1785	-707	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCCCAAATTGTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2947	1742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
235240	SIRV2	-	285	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4588	34	3413	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
235296	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235310	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	880	-28	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
235363	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	3	2968	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
235386	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235427	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
235439	SIRV5	+	351	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7617	2	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGAATAGCGCCAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
235443	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
235480	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
235487	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235505	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
235597	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
235622	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
235662	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	2	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235663	SIRV6	+	298	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	232	5	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
235767	SIRV5	+	386	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	875	-56	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
235771	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
235827	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
235834	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
235866	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
235958	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_5033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
235960	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
235961	SIRV2	+	658	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	138	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTCTAGGCCTACGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
235986	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	35	3384	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
236224	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	86	499	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
236236	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
236300	SIRV2	-	480	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4393	34	3218	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
236355	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	11	1262	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
236381	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
236389	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
236430	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10533	1	1296	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
236494	SIRV5	-	413	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTCGCACACTTCGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
236537	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
236577	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
236674	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
236675	contig_5988_pilon	+	2660	11	Intergenic	novelGene_16075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1635.29770989872	9491	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	86	799	1218380	1224777	TRUE	0	CCTTTTTTCTTGTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209858	1226933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1226068_1226362
236685	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	4	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
236688	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	399	0	-229	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACACCACATGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
236712	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533091	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
236724	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
236785	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	128	11	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGGTATGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
236803	SIRV2	-	499	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-300	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
236814	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
236874	contig_5020_pilon	+	1534	9	Intergenic	novelGene_27803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	871.911943661744	10	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	368	1219	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118457	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_124984_125061_125091_125657
236875	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
236887	contig_4364_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532882	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
236994	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
236998	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
237114	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
237117	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
237149	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	385	-1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
237238	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237247	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237250	SIRV5	-	382	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298
237270	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_5014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
237326	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237346	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237371	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237414	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
237525	contig_233_pilon	-	2690	14	Intergenic	novelGene_14576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1121.41800028399	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	96	1067	126907	98408	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFRPFLPTETLLQSLPGAQHPP	127002	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98471_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
237533	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	268	-74	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
237541	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237579	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
237603	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237652	SIRV6	+	241	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	389	15	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAGTGGACGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
237665	SIRV5	+	188	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	329	151	215	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8530	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
237719	contig_8538_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_4908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842784	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
237735	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
237774	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
237843	SIRV5	-	440	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
237875	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237892	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	15	1257	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
237936	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
238070	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	37	3254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
238100	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238115	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238139	SIRV6	+	456	5	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	0	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
238150	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
238168	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238311	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238355	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
238371	contig_4364_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_4054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTTCCAGCGGGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1533068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
238398	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
238424	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
238463	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	85	502	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
238488	SIRV2	-	518	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1160	2345	-15	298	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAACTAGTCTCTTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4747	3345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
238564	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	4	62	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
238567	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	2	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238577	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
238595	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
238598	SIRV5	-	336	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGCTCTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
238606	contig_233_pilon	-	2623	15	Intergenic	novelGene_14575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1345.26462763552	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	93	902	126907	101700	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPWASWHTNWPRAISSPSSP	126999	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99831_101696_101757_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
238607	SIRV5	+	267	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-3	8668	-3	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
238609	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	875	-27	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
238613	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
238643	SIRV2	-	447	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4426	34	3251	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
238713	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
238775	contig_2834_pilon	-	1816	3	Intergenic	novelGene_28012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2090	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1379	1690	290748	285565	TRUE	45	CCTAGGGGGAAAAAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPAVQKGLWRDVHSSTHLRLFFGSGGSRAANIASSNTFFRPFCVSAEHSTYLTAFRSRASFSAVSGVIGFCLFLASFSIVEGSSLRSIWVPTSKKGVFGQW	292126	285324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_285432_285545_285743_290614
238913	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238916	contig_4364_pilon	+	135	1	Intergenic	novelGene_4559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533179	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
238919	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
238940	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
238973	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
238993	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
239094	SIRV2	-	233	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4640	34	3465	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
239104	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239129	SIRV6	+	399	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	121	15	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGCTATTGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239139	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	65	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
239153	SIRV6	+	233	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	294	4	63	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
239172	SIRV6	+	780	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	553	11	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
239191	SIRV6	+	398	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10350	2	1200	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
239198	contig_7919_pilon	+	4768	16	Intergenic	novelGene_28049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	453	junction_15	710.915172311171	1327	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	351	1868	973941	984965	FALSE	30	ATAATCCTGAGTGACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAEMGRFNISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSRYADVDPENQNFLLESNVGKKKYETDFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIVSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGHKAFGLVGKLAASGSVTMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALMNLEDTTGLWYLNGDYLVLLVSLVLILPLSLLRNLGYLGYTSGLSLLCMMFFLIVVICKKFEIPCPMEIALLINETINSTLTQPTFAPDVTFNMTEDDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILTFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSRISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVEAELLHTYSAVMAADILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSITQLLCAGKDFSWWRHSFITTSILGLTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAAAMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALLFLLSGIVVMTGSMTLIVLDWVHNAPGGGH	972454	987865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_972723_973858_974057_974362_974445_974589_974706_977857_977932_978020_978114_978244_978327_979793_979877_980315_980375_980476_980642_980948_981029_981137_981239_981791_981917_982269_982415_983745_983844_984866
239205	SIRV2	-	458	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1168	11	5	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4727	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
239227	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
239325	SIRV6	+	293	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	15	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1845
239346	SIRV2	-	377	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	41	-370	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCTATGAACGTTAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	4035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
239369	SIRV5	+	351	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7617	2	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGAATAGCGCCAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
239405	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
239434	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239442	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
239524	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
239563	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	230	-16	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239597	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	242	0	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239609	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239624	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	278	-74	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
239647	SIRV6	+	225	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	420	0	-250	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACGCTACGGTCAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
239801	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	89	504	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
239815	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1183_1468_1535_1640_1736_1845
239820	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
239854	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10304	5	1154	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
239896	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
239916	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
239929	SIRV6	+	443	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10305	2	1155	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
239934	SIRV2	-	476	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4393	38	3218	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
240015	contig_4364_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_2659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCTGTAACCATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
240032	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10455	5	1305	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
240035	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
240042	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
240043	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7488	1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
240068	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	233	-15	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
240141	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_2085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
240166	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
240197	SIRV6	+	195	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	505	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11210
240219	contig_1443_pilon	-	2990	10	Intergenic	novelGene_28277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	440.923973738426	567	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1434	2318	776427	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_804491_805718_808694_808741_809399
240240	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	231	-2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
240274	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
240281	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	902	-15	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
240294	SIRV2	+	613	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-330	1449	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACTACCTGGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3703	5906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3970_4095_4340_4475_4684_4804_5794
240299	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	875	29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
240338	SIRV2	-	264	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4609	34	3434	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
240346	SIRV2	-	392	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
240374	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
240392	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
240412	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	875	14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
240445	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
240476	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
240505	SIRV2	+	288	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	309	-74	-309	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAAGATACGCAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
240511	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	-1	2961	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
240517	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
240658	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
240679	SIRV6	+	344	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	187	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
240706	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_3706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
240729	SIRV6	+	227	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	385	-4	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
240767	contig_12622_pilon	-	2473	13	Intergenic	novelGene_5963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2159.44043034815	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	13	1638	1590968	1586655	TRUE	35	CTTCAGAAGCGAATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGHRDSPAPSLALPWILMRSTYPTHPRPWVSPADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590980	1583552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588135_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
240768	contig_233_pilon	-	2441	13	Intergenic	novelGene_14596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1226.02245312048	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	68	2002	108727	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTVNQPGQDRSLTCPNAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108743_126941
240826	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
240940	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	44	3376	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
240943	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
240973	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	77	502	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
241046	SIRV6	+	439	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	2	1159	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
241057	SIRV2	+	268	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	329	-74	-329	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGACCACCAGCACGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
241100	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	59	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
241137	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
241243	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
241266	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
241267	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
241343	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	38	3084	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
241354	SIRV5	+	373	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7588	1	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
241383	SIRV6	+	496	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1494	480	65	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
241418	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	392	15	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
241464	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
241595	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_1912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
241605	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_1286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
241648	contig_4364_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTTAAATCAAAGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533245	1532810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
241667	SIRV6	-	211	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	85	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640
241689	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
241711	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
241751	SIRV5	+	423	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	890	6	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
241771	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
241824	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
241834	SIRV5	+	299	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	15	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10871
241838	SIRV6	+	295	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	1	1293	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
241861	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	6	59	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
241905	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
241906	SIRV5	+	395	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	880	44	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
241938	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
241983	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTCCAGGTAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11278	10722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
242000	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
242016	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842771	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
242034	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	57	3386	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATCTAAGGAGACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
242039	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
242054	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
242072	contig_4364_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	77	397	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530448	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
242118	SIRV5	+	189	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	325	154	211	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8526	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
242139	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4602	34	3427	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
242162	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	-1	2961	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
242246	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
242251	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
242261	SIRV2	+	646	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTCGTTCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1651_1727
242271	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
242356	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
242368	contig_12671_pilon	+	3776	8	Intergenic	novelGene_19219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	529	junction_1	321.106759537086	2190	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	70	732	197316	212313	FALSE	20	CAGAAATGTGCTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197246	215357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286
242398	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	6	61	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
242552	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_3949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
242557	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
242604	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_2051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
242606	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	9	60	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
242636	SIRV2	-	392	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
242648	SIRV5	+	297	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	15	893	15	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8330	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
242657	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
242734	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGGAATACATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
242895	contig_4364_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_4400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGCAAGTAACAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533289	1533088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
242948	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
242967	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
242977	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
243015	SIRV6	+	242	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-224	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
243026	SIRV5	+	250	2	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	2271	-29	2242	29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATAAGCATTGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3298	3627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_3405_3483
243074	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533091	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
243076	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
243116	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
243127	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAAACCTGTGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
243130	contig_4364_pilon	+	515	4	Intergenic	novelGene_382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	81	515	1530895	1531690	FALSE	15	GGCCGTACCACCGGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYAS	1530444	1531690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
243132	contig_4364_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_4426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
243143	SIRV2	-	709	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	4	327	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGTCCTAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5782
243200	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_3449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGTGTGTTAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
243241	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
243271	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
243290	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
243341	SIRV2	-	695	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	306	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCTCAGCGCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
243382	SIRV2	+	313	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	278	-68	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
243465	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	47	3384	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
243478	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
243481	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
243539	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
243544	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
243593	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-63	299	-63	-299	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAATGCTAAACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	1332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
243615	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
243629	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
243710	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	588	503	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
243720	SIRV2	-	259	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4614	34	3439	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
243735	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
243759	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
243802	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
243917	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
243934	SIRV5	+	429	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
243944	SIRV2	-	374	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3303	-1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
243948	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	41	3368	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
243985	contig_233_pilon	-	2462	16	Intergenic	novelGene_14577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1362.52519487409	249	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	96	1631	126907	91635	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCEVSGLPLALQPLRLLCRVPEIPKGPL	127002	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92176_93976_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
244004	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244042	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	231	-15	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244091	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
244166	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
244186	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244196	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244201	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244204	contig_4364_pilon	+	178	1	Intergenic	novelGene_4543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533136	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
244274	SIRV5	+	373	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGGTCGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2048_2270_2316_3298_3405_3483
244287	SIRV5	+	246	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	271	151	157	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8472	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
244304	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
244345	contig_3956_pilon	+	2926	14	Intergenic	novelGene_15030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1372.71558270674	5	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	1306	2403	1287410	1290491	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282899_1284089_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286583_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
244358	SIRV6	+	398	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10350	2	1200	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
244363	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244378	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_4270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACAGTGTTCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
244389	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	236	-1	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244447	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244498	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
244514	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
244569	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
244580	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
244589	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	245	0	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244667	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244703	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244774	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	243	-4	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244810	SIRV6	+	197	3	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	502	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10812_11034_11109_11205
244825	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10449	2	1299	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11536	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
244890	contig_4364_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_1083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTGAAGCAGACGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
244902	contig_5954_pilon	+	1831	11	Intergenic	novelGene_28680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCAGGCGGGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944728	956292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947096_947204_947434_947560_947660_947714_947798_947935_948094_948197_955828_955927_956116
244920	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
244995	contig_4364_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_2654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532940	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245011	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
245047	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTGTTAAGGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
245128	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
245170	contig_8538_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_4764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
245177	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
245179	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	100	11	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
245225	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7477	1	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
245267	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	392	3	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
245289	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
245305	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
245352	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
245384	SIRV6	+	260	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
245407	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	38	3393	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
245468	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
245475	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10308	5	1158	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
245476	SIRV2	-	615	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2675	1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGACCTACTGCACGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
245479	SIRV6	-	432	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCGCGATGCCAATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
245485	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245492	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245526	SIRV6	+	196	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	498	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11214
245583	contig_4364_pilon	+	684	4	Intergenic	novelGene_656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	68	682	1530895	1531870	FALSE	25	TGAGATCGTGCGTGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAE	1530457	1531872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
245699	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
245717	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	15	1259	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
245753	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	65	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
245759	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245785	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_2045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245822	contig_4364_pilon	+	300	3	Intergenic	novelGene_248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	219	81	299	1530895	1531192	FALSE	25	GTATTGTCACCAACTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEH	1530444	1531193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
245867	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
245894	SIRV6	-	198	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACTTCGACTTCGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11272	10764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031_11111_11206
245907	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
245953	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532939	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
245980	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
246010	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	407	0	-237	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACGCTTCCACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
246027	SIRV6	+	280	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-16	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845
246033	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	4	64	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
246049	contig_233_pilon	-	2569	14	Intergenic	novelGene_14564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1121.41800028399	9	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	87	2129	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_104245_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
246112	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
246141	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
246175	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
246185	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
246193	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
246219	SIRV2	-	188	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3700	0	-1070	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTAAAACTTGTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
246228	SIRV2	-	250	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	656	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGACACAAGACATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
246346	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
246441	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	5	58	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
246447	contig_8538_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_4664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842311	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842320_842775
246490	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
246543	SIRV5	-	442	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
246574	contig_4364_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_2054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTAATACCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
246786	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	886	-16	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
246809	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
246877	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
246895	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
246965	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	40	3223	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
247024	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	1	1308	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
247055	SIRV5	+	366	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3296
247058	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
247082	contig_4364_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTTTCTACTGTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532870	1533234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533200
247116	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
247139	SIRV2	+	440	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	157	-74	-157	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATACCACTCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
247185	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
247235	SIRV5	-	440	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTAGAGATGTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
247369	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	9	1263	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
247375	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
247428	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	875	51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
247455	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
247563	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
247603	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
247681	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
247732	SIRV6	+	410	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10414	2	1177	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11414	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
247735	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
247815	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10305	4	1155	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
248014	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
248110	contig_4364_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_2884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATTTTTTCCAACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
248151	contig_4364_pilon	+	285	3	Intergenic	novelGene_708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACTGGGACGACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
248173	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
248241	SIRV5	+	407	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	880	32	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
248267	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
248289	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
248337	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
248366	SIRV5	+	389	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1980_2034_2119_2157_2270_2316_3298
248395	SIRV2	-	427	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4446	34	3271	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
248401	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
248444	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
248492	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
248531	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
248580	contig_8538_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_4971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842807	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
248588	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
248671	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
248682	SIRV2	-	500	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1500
248683	contig_1230_pilon	+	2914	6	Intergenic	novelGene_28855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1543.43326386339	17	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2079	2516	407610	408591	FALSE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQVYGREGRI	404458	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_406280_406375_407788_408003_408241_408568
248699	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
248711	contig_4364_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_2031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATTAATACCCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
248795	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
248839	SIRV2	+	275	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	322	-74	-322	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGCACGCAATCGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
248863	contig_4364_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_4447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533099	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
248909	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
248952	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTAAGGTTTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532790	1533184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
248983	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249064	SIRV5	-	407	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTAATTTCGCACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
249073	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
249084	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249109	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
249110	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249163	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	38	3372	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
249188	contig_14260_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_28886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTCACCAAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12416	12084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14260_pilon_-_12100_12400
249199	SIRV5	+	425	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-100	880	14	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8215	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
249237	contig_4364_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	65	427	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530460	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
249300	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
249325	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	84	502	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
249362	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
249379	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
249449	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
249468	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
249474	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249499	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
249502	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	80	507	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
249509	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	96	-16	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249537	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
249610	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	85	499	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
249629	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
249689	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
249692	contig_5033_pilon	-	2664	15	Intergenic	novelGene_28993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531429_531508_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
249761	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
249798	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
249818	contig_15063_pilon	+	2013	4	Intergenic	novelGene_12541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2895.41296229436	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1387	1875	36064	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_36158_36266
249978	contig_4364_pilon	+	364	3	Intergenic	novelGene_714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTTGCTGACGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
250021	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
250072	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
250130	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
250220	SIRV6	+	705	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106
250261	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
250288	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
250308	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
250320	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
250340	contig_4364_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	59	388	1530895	1531303	FALSE	35	TCCCAAGGCCAACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530466	1531305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
250363	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	62	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
250388	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
250427	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	83	500	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
250445	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
250446	contig_4364_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	72	347	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530453	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
250448	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
250486	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_19443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
250540	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
250614	SIRV2	-	395	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5790
250619	contig_4364_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_4367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
250636	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
250647	contig_8317_pilon	+	491	2	Intergenic	novelGene_19340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16198	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
250695	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
250702	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
250734	SIRV6	+	247	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	63	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
250756	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
250772	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
250832	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	35	3075	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
250971	SIRV5	-	413	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCGCACACTTCGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10864
250997	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
251053	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
251171	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
251198	SIRV6	-	248	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	85	446	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTAAGCTTGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735	1098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1540_1646
251313	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
251359	SIRV5	+	422	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298_3405_3483
251417	SIRV6	+	269	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10556	1	1319	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11556	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
251435	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
251451	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
251516	contig_17144_pilon	+	4225	10	Intergenic	novelGene_29117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	286	junction_2	393.842639503848	3801	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	955	2868	38	2905	5087	22548	FALSE	25	GATGTAAATGGGCTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKMKEKGSFSDTGLGDTKMTSDPFAPKTDAEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIAGVNKNQEEEKSGKWEGLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFSERSRKEDRGGAKRSESGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRGKGDFSTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGSYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSEKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNLQPTTE	5049	23868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_11654_12357_13329_13503_14254_14367_15442_15528_17464_17653_19971_20171_20624_20769_22326
251585	contig_19564_pilon	-	2210	4	Intergenic	novelGene_29593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	2949	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	162	1349	15529	12201	FALSE	40	AAGAAACCTTTGCAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15690	11339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_13953_15517
251597	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9669	566	519	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTATTAGCCTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
251699	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
251709	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
251763	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
251800	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
251831	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
251869	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
251893	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
251926	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
251931	contig_4364_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_2700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532955	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
251937	contig_4364_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_2715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTTGCCAGCCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
251968	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
252052	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
252057	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	5	1264	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
252063	contig_4364_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCGGCGACGGAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
252169	SIRV5	+	289	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	41	875	41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8356	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
252172	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
252191	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
252213	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
252232	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	74	506	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
252288	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
252333	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533096	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
252364	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
252437	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
252485	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
252560	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
252588	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
252634	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	239	0	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
252646	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
252697	SIRV2	-	397	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3030	5	-400	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTTTCATTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
252746	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_1569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
252782	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
252792	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
252813	SIRV6	-	247	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-61	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1881	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
252848	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
252890	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7482	2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
252904	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7481	-4	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
252961	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
252967	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
252972	SIRV2	+	309	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	288	-74	-288	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCATACTTATTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
253207	SIRV5	+	209	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	302	157	188	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8503	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
253229	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10317	5	1167	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
253365	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
253391	SIRV2	+	296	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	301	-74	-301	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAGTAATGCTAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
253413	SIRV5	+	447	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	876	-4	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
253429	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
253448	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	395	0	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
253468	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
253469	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	242	11	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
253477	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
253535	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
253546	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
253680	contig_4364_pilon	+	428	3	Intergenic	novelGene_630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	72	428	1530895	1531330	FALSE	15	ACCCAGGTGACTGTCGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKM	1530453	1531330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
253682	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
253691	SIRV5	+	302	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	25	878	25	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8340	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
253696	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
253709	contig_8538_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_4813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACAGGGTGCGCCCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843105	842770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
253724	contig_8538_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_5061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842831	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
253749	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
253787	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533092	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
253805	SIRV2	+	482	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	115	-74	-115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCAACTTGGACGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
253817	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	51	3373	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
253834	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
253879	SIRV5	+	366	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	880	-41	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
253880	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
253946	SIRV2	+	652	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGTTCTAGGCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
254012	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
254015	SIRV5	-	418	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACACTTCGCACGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
254034	contig_8317_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_20087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACACCCACAGCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
254042	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254063	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
254078	SIRV6	+	385	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_1845
254095	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254157	SIRV5	+	448	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTAACATAACTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
254301	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
254344	SIRV6	+	274	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
254447	SIRV5	-	304	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
254455	SIRV6	+	263	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10552	11	1315	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11552	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
254460	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254508	SIRV2	-	404	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
254511	SIRV2	-	600	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	50	3082	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
254535	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254550	SIRV6	+	492	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8803	7	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
254582	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
254638	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
254662	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
254718	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
254732	contig_4364_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	25	GAGGCGCCCCTGAATCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
254743	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
254757	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
254783	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254795	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
254800	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
254855	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	15	1261	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
254871	contig_8317_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_20675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16487	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
254951	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	12	2960	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
254962	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	231	15	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
255014	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
255015	contig_19777_pilon	+	1000	2	Intergenic	novelGene_29717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGCCTTTGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23895	24994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_23982_24080
255060	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	34	3396	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
255128	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
255129	contig_4364_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_3277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTCCTAAGGCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
255149	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
255150	SIRV2	-	367	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-676	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCACATCTATCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
255192	SIRV5	-	341	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1132	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGGTAATTCATGGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2036_2119_2157_2270_2316_3298
255220	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7487	-1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
255225	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
255262	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
255265	SIRV2	-	370	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
255286	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	80	313	842828	843061	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842748	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
255310	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	2	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
255336	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	87	499	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
255345	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
255355	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
255442	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
255443	SIRV5	-	215	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAGATGTAACCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
255458	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
255477	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
255492	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
255508	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
255519	SIRV6	+	243	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	298	4	67	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
255542	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533102	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
255588	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
255690	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
255711	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
255763	SIRV2	+	415	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTCGGCTTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754	2975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877
255799	contig_4364_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_3687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACATCAGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
255836	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
255883	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	296	1	65	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
255893	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	34	3259	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
255941	SIRV6	+	339	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	194	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGATCAGCCTCACGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
256052	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
256053	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
256093	contig_8538_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_5068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842835	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
256097	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
256101	contig_12671_pilon	+	3517	6	Intergenic	novelGene_19222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	472.615276943097	3	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	61	471	197316	212313	FALSE	15	GAAATGTGCTTTTCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197255	215359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200345_207130_207206_210609_210724_211053_211113_212286
256125	SIRV5	+	221	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-241	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGTCTAACATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119
256137	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
256151	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
256186	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
256203	contig_8538_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_4818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTCTTTCAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842771	843097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
256209	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
256234	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	34	3253	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
256379	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-123	886	-9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8192	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
256406	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
256414	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
256446	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
256454	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
256483	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
256508	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
256579	contig_4364_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_4423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533092	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
256580	SIRV2	+	281	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	316	-74	-316	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAATCGCAAGATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
256612	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	911	-28	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGAGACCTCAGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
256658	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
256659	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	237	3	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
256674	SIRV6	+	417	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	107	11	63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTGGATGCAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
256695	SIRV2	-	390	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-405	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
256733	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	879	-36	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGTTTACCGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
256742	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
256752	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
256773	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
256816	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
256818	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
257017	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257022	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257028	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
257140	SIRV2	-	499	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1134	4	-29	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATTGACGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4761	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
257201	contig_12299_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_29737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATTGCTCCCTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128116	128720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_128100_128700
257262	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-50	875	-50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8265	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
257353	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	12	1280	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257379	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_1651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
257419	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
257424	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	2	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257447	SIRV6	-	256	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCGACCATTCATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11261	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11109_11205
257541	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
257590	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257600	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	234	-15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
257626	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
257686	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
257694	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
257748	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
257761	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
257797	SIRV6	+	419	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	95	-16	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
257804	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	15	1159	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
257834	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	234	-2	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
257849	SIRV5	+	445	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAATCTAACATAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
257919	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	5	1264	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
257949	SIRV2	-	270	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	642	36	642	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTCTTGAAAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4090	3679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
257952	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
257979	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
258182	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	82	500	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
258239	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	298	-74	-298	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATGCTAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
258243	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	230	-16	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
258265	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
258298	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258307	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
258315	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
258319	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	399	2968	-399	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCAAGAAGCGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
258406	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	9	1261	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258411	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258426	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258434	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258467	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_2967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
258502	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258503	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
258523	SIRV5	-	349	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCTCTCTGCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8451_8590_10863
258550	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	12	1258	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
258599	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7481	2	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
258689	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	5	1161	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
258713	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
258714	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
258902	SIRV5	+	235	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	282	151	168	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8483	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
258950	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
258955	SIRV5	+	314	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271
258981	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
259048	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
259070	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
259097	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
259161	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
259257	SIRV5	+	246	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	0	-277	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAAAAGCCTAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056	3321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
259273	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
259303	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	82	501	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
259345	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
259374	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	5	1159	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
259384	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
259400	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
259437	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	242	11	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
259468	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
259514	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
259530	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	247	1	16	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
259541	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
259549	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
259555	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
259575	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
259628	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
259634	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
259676	SIRV2	-	624	2	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2969	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1626_1720
259677	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
259721	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	782	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
259799	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842768	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
259840	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
259902	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
259922	SIRV5	+	257	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	260	151	146	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8461	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
259993	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
260044	contig_4364_pilon	+	314	3	Intergenic	novelGene_578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	72	314	1530895	1531216	FALSE	35	ATGGAGAAGATCTGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDD	1530453	1531216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
260054	SIRV6	-	202	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11231	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11034_11111_11206
260135	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	15	1261	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
260190	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	648	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
260217	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
260248	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
260252	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	2	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
260319	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
260429	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842804	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
260437	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
260439	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
260546	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
260580	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
260619	SIRV5	+	381	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7490	1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
260639	SIRV6	+	288	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
260770	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
260779	SIRV2	-	599	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	-4	-48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTAGACCTACTGCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5899	3713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4089_4338_4480_4687_4801_5788
260782	SIRV6	+	241	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	393	11	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
260800	SIRV6	+	191	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	541	51	541	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10778	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
260805	SIRV5	+	441	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-111	875	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8204	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
260830	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
260908	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
260921	SIRV6	+	385	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	1	1203	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
260925	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	46	1199	-44	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
260943	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
260972	SIRV6	+	229	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10595	2	1358	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11595	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
260980	contig_4364_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_2231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGCATTAATACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
260989	contig_8317_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_20090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16431	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
261025	SIRV2	-	350	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1457	38	294	-38	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGCACGACGACGTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4438	3703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
261031	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
261036	SIRV5	+	276	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	8670	-1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
261045	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
261061	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
261094	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
261191	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
261249	SIRV2	+	434	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	159	-70	-159	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAATACCACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
261266	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	584	500	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
261309	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
261310	SIRV5	+	363	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-194	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271
261395	SIRV6	+	249	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	385	11	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
261415	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	241	0	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
261447	SIRV2	+	621	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-24	-74	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAACCTGGAGGATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
261503	SIRV2	-	351	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4514	42	3339	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
261510	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
261526	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
261533	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
261536	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
261538	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	878	-25	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
261553	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
261564	SIRV6	-	302	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACGCAAGAATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
261576	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
261600	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
261634	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
261643	SIRV6	+	218	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	60	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
261694	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
261715	SIRV6	+	228	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	255	2	-85	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGAAATCGCACAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
261758	SIRV2	+	305	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	292	-74	-292	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAAACCATACTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
261792	SIRV6	+	449	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8842	11	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGCAGTTGCTAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
261885	SIRV5	+	394	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2267_2316_3298_3394_3490
261906	SIRV5	-	318	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTACATATACAGATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
261944	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
262089	SIRV6	+	289	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10460	1	1310	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262131	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
262134	contig_4364_pilon	+	190	1	Intergenic	novelGene_4531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533124	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
262140	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262189	SIRV6	+	283	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10542	1	1305	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262213	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
262214	SIRV6	+	243	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	12	59	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
262238	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
262259	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
262264	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262344	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262513	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
262556	SIRV5	+	337	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	62	7484	14	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
262695	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
262756	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262835	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	76	357	1530895	1531255	FALSE	15	TGTGGCCCCCGAGGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530449	1531257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
262845	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262861	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_1765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
262862	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
262878	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
262891	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
262897	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
262918	contig_4364_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_4476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533107	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
262966	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263008	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
263028	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
263032	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
263048	SIRV2	-	389	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5788
263072	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263112	SIRV6	+	229	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	405	11	-235	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGCTTCCACACCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
263202	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
263220	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
263231	SIRV5	+	465	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTTACCAGGGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2273_2316_3298_3405_3483
263321	SIRV2	-	226	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4647	34	3472	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
263360	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263434	contig_15063_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_8493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
263498	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263499	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
263501	SIRV5	-	400	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTACGGTGGTAATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
263510	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	4	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263516	SIRV5	+	456	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7433	2	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGACACTTTCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
263581	SIRV5	-	259	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8575_10853
263637	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
263681	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
263685	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	4	1159	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
263730	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-120	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
263780	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
263833	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
263863	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
263948	SIRV2	+	613	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-16	-74	16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACATGGTAACCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
263955	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
263989	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_9584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
263991	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	5	60	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
264011	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264061	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
264087	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264110	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
264129	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	76	393	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530449	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
264137	contig_4364_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCACCAACTGGGACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
264148	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
264156	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264250	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264313	SIRV6	+	774	8	NIC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724
264417	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
264443	contig_5780_pilon	+	4187	5	Intergenic	novelGene_29777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_4	104.67897353337	1885	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2337	2726	111869	112258	FALSE	35	TAAAAAGGAGTTTTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	73990	113719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990
264467	SIRV5	+	440	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	887	-8	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
264482	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGACCGTGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
264510	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	84	502	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
264593	contig_4364_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_4334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAACAACCCACAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
264647	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
264693	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	122	15	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264723	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264837	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
264861	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	578	500	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
264904	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
264920	contig_3077_pilon	+	2695	7	Intergenic	novelGene_26717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_6	2786.35588877101	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	509	1015	13867	16408	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIEGEEGQGALVGGLTLDFPAGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10109	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144
264931	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	228	-16	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
264946	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
264961	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	81	503	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
264992	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
265032	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
265058	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
265060	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
265094	contig_4364_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	76	402	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530449	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
265096	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
265102	SIRV6	+	285	4	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	0	-74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGTCGGTCGCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856
265145	contig_233_pilon	-	2555	13	Intergenic	novelGene_14507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1146.98642283449	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	55	2112	108522	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	108576	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98413_99785_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401
265167	contig_8317_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_20326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
265175	SIRV6	+	198	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	501	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11209
265271	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10316	2	1166	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
265280	SIRV6	+	311	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	187	0	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
265321	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7485	-1	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
265322	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	886	-21	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
265336	contig_4364_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGTCACCAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
265385	SIRV5	+	330	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7633	-1	-240	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCCCACATTTAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
265434	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
265563	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
265609	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGATTAGGCGCGCGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
265635	SIRV6	+	383	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	4	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
265712	contig_4364_pilon	+	337	3	Intergenic	novelGene_447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	261	76	336	1530895	1531234	FALSE	30	ACACTTTCTATAACGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWH	1530449	1531235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
265739	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
265749	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
265813	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	882	-18	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
265818	SIRV2	-	251	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4622	34	3447	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
265867	contig_4364_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_4218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGTGTTCCAGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533311	1533073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
265907	SIRV5	-	348	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCTCTCTGCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
265966	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
265987	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	225	-4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
265996	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266004	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
266034	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	5	1261	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266054	SIRV2	-	359	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4506	42	3331	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
266067	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7482	-1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
266100	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	235	3	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
266141	SIRV6	+	467	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470
266172	SIRV5	+	542	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-219	882	-105	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8096	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
266277	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266344	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
266378	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
266410	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266432	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	137	11	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
266474	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266489	SIRV2	-	575	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4298	34	3123	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
266535	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
266563	contig_19851_pilon	+	2581	5	Intergenic	novelGene_29818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_4	974.85806659226	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53430	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_55753_55840_55882_56006
266605	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
266658	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7612	1	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCGCCAACAGCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
266677	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
266763	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
266766	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
266896	contig_4364_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	58	345	1530895	1531261	FALSE	15	GCCCCCGAGGAGCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRV	1530467	1531261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
266898	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
266914	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
266942	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
266997	contig_233_pilon	+	2646	16	Intergenic	novelGene_14662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2278	2631	108497	127014	FALSE	20	GCTGGGTGCCCCAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGQPFISSCCLVLQRTESGSPSPVKFIFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRPEEEQSHQSEQQGMLAWHDLHSCPRTLVLRVLGGLGQVKLRSCPGWFTVTSGKRYWP	78382	127029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92361_93762_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107471_108400_108583_108724_108818_109917_109978_126899
267047	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	15	1265	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
267052	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
267056	SIRV6	+	381	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10444	1	1207	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11444	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
267131	SIRV6	+	272	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
267149	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
267207	contig_15063_pilon	-	1720	7	Intergenic	novelGene_11203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
267232	SIRV6	+	201	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	306	38	75	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2591	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
267341	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_2952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
267391	SIRV6	+	195	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	401	-1	-231	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCACACCACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
267530	SIRV5	+	428	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-2	7457	-2	-64	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTGTAGAAAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
267532	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
267551	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
267586	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
267606	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
267609	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	80	505	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
267652	contig_4364_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_2380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCTTTGCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
267667	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	38	3389	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
267676	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	197	1432	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
267766	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
267816	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	587	501	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
267845	contig_17936_pilon	+	819	6	Intergenic	novelGene_29927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	786.44735360989	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	768	50	817	50646	106452	FALSE	10	TTGGGGCACGGTGCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQY	50596	106454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374
267880	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
267890	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
267918	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
267966	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	2	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
268000	SIRV6	+	294	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
268015	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	238	3	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
268035	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
268058	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	878	-8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
268096	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
268223	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	232	15	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
268257	SIRV2	-	621	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTACTGCACGACGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963_4095_4338_4480_4687_4801_5788
268260	SIRV5	-	319	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10972	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
268354	contig_4364_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_4189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
268409	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
268450	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
268456	SIRV6	+	427	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1174	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
268465	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
268536	SIRV2	-	610	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTGCACGACGACGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3817_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
268679	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
268683	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
268807	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	34	3259	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
268814	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
268857	SIRV2	+	256	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	290	-23	290	23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAACCTGGAGGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1400_1700
268899	SIRV6	+	209	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	496	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
268937	SIRV6	+	394	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	5	1201	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
268953	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
269047	SIRV2	-	303	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	50	3379	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
269052	SIRV2	-	355	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4509	43	3334	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
269081	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
269093	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
269120	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
269211	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
269287	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
269323	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269326	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
269330	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
269365	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
269384	contig_4364_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	72	389	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530453	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
269404	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533049	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
269435	contig_10324_pilon	+	3963	22	Intergenic	novelGene_7705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_21	1125.3747695244	4306	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	56	2182	51839	78985	FALSE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWAGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFCEDLERNDGSQERPYFMSPELRDILLKGSAEEGKREEVA	51783	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_78866
269439	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7472	1	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
269473	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
269507	SIRV2	-	294	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	363	2960	-363	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCAGCAGGCATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
269508	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	41	3387	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
269530	contig_8317_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_20031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACTGTCTGTCTCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
269553	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269575	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269631	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
269642	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
269668	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
269691	SIRV5	-	391	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTTACGGTGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
269706	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
269710	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269712	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
269735	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	5	61	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
269753	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	5	1253	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269775	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	245	11	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
269834	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	58	3385	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
269858	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
269868	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_20052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16422	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
269951	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
269952	contig_4364_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_1294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCGTGAGGTCGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
269998	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
270027	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
270088	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10349	2	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
270093	SIRV5	+	195	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	-6	363	2	-363	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCCACGGTCGTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
270167	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
270187	contig_8538_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_5078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842850	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
270262	SIRV2	-	262	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4611	34	3436	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
270288	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
270371	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
270482	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
270495	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
270552	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
270573	SIRV6	+	246	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	66	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2745_2829_3106_3165_10723
270615	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
270618	SIRV6	-	170	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTCTTTTTCCAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	10727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035
270677	SIRV2	-	321	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	34	3377	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
270697	SIRV5	+	495	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7394	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTAAGTGGTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
270717	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
270773	SIRV2	+	258	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	335	-70	-335	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACTGTTGACCACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
270881	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
270921	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	2	63	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
270977	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
271029	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
271049	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
271060	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	245	11	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271079	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
271111	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
271184	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271199	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271245	SIRV6	+	440	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10308	2	1158	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
271296	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
271303	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
271323	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271365	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
271454	SIRV2	-	245	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	65	3422	-30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGCCAGTTATCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
271460	contig_4364_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_4368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGTAACAACCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
271494	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	587	503	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
271546	SIRV5	+	303	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	16	886	16	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8331	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
271550	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
271565	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
271589	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7480	-4	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
271591	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	876	-20	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
271597	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
271626	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	880	-19	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
271631	contig_17144_pilon	-	2609	18	Intergenic	novelGene_29459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.25036233754	19	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	209	2578	179764	166106	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPHPLAFCTCFL	183290	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_166551_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
271670	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271699	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
271718	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	782	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
271755	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	12	7651	12	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
271782	SIRV6	-	307	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGAATTTTCCATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
271850	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTCTGCAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10987	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
271869	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
271922	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271936	SIRV6	+	188	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	93	502	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACGTAAATTTACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
271951	contig_4364_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_2704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532956	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
271974	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
271981	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	886	29	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
272000	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
272045	SIRV2	+	421	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	172	-70	-172	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACTTATTATGCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
272086	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
272108	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
272124	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
272140	SIRV2	+	233	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	364	-74	-364	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACATTTGAGTGCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
272144	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
272271	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
272280	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
272323	SIRV5	+	348	4	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	3	7677	3	-284	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAACTGGCAAAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059	3314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2316_3298
272383	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	78	499	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
272418	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
272425	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
272452	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	581	11	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
272457	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
272461	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	2	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
272482	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	3	2964	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
272505	SIRV6	+	192	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	82	509	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
272568	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	273	-73	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
272600	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
272662	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	224	-1	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
272693	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
272714	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
272722	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	900	1	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
272739	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
272826	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	5	1261	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273030	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273079	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273112	SIRV6	+	283	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10542	1	1305	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273126	SIRV6	-	276	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTCGTAAACGTCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
273191	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
273211	contig_4364_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_2743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532972	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
273228	SIRV2	+	621	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-41	137	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTTCTAGGCCTACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067	1768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
273264	SIRV6	+	302	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	231	2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273320	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273344	contig_12622_pilon	-	2568	13	Intergenic	novelGene_5960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	3308	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	198	1730	1590968	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591165	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
273390	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273394	contig_7657_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_30045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286082	283678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_283700_286100
273419	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3399_3483
273441	SIRV2	+	339	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	258	-74	-258	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGGGTTAATGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
273455	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273464	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
273498	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	34	3430	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
273509	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273580	SIRV2	-	498	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1177	2348	2	295	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCGAACTAGTCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4730	3348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
273589	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
273593	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10308	5	1158	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
273675	SIRV5	+	373	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298
273715	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
273759	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273776	contig_5023_pilon	+	2922	17	Intergenic	novelGene_7220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	1989.3062075759	13	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	88	1971	607279	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647372_647732
273790	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
273841	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	229	-16	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
273852	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	878	30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
273859	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	273	16	42	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTAGGTAGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	10772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
273884	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
273909	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-142	882	-28	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8173	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
273929	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
273961	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	952	8	-75	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACGGTGTAGGTTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
274023	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	70	508	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
274028	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274060	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
274173	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274189	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274215	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274283	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	4	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274297	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274335	SIRV6	+	149	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	281	1159	-145	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTAAACTTGTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11500
274353	SIRV2	-	219	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	435	3078	-400	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCCAAGAAGCGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
274370	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274412	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
274436	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9647	593	497	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
274449	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274484	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274493	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274509	SIRV6	+	395	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAATCTGTATCGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
274525	SIRV5	-	271	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACCCAATTCCACCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10858
274537	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	233	3	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274548	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
274549	contig_12923_pilon	-	3371	16	Intergenic	novelGene_30080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_6	288.749918710907	1455	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	108	2279	93727	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101275	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
274590	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274645	contig_8210_pilon	-	4476	8	Intergenic	novelGene_30213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1371	junction_7	780.902852668706	2335	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	270	1388	37758	15712	FALSE	45	TGGTTGAAAATTAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	53099	12623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37636_37803_52874
274656	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	396	3	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
274730	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274739	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
274814	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
274847	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
274889	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	276	-74	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
274925	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
274934	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
274956	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
274979	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	15	1262	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
274991	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
275073	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	587	501	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
275135	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
275256	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
275267	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	10	32	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
275275	SIRV5	-	284	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACGTGTACCTACCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
275281	SIRV2	-	698	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	10	2327	-2	316	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGCTAGTCCATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	3327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
275287	SIRV2	-	501	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	154	3077	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCAGGCAAAGTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1200_1700
275315	contig_4364_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532857	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
275376	SIRV2	+	228	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACCAACTACCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4686	5902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4800_5787
275380	SIRV5	+	187	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	327	154	213	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8528	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
275570	SIRV5	+	390	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	0	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2151_2270_2316_3298_3405_3483
275575	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
275608	contig_4364_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_2764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532986	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
275673	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
275719	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
275775	contig_4364_pilon	+	517	4	Intergenic	novelGene_727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	52	516	1530895	1531720	FALSE	20	GCGACGGTGTCACCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDS	1530473	1531721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
275795	contig_4364_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_1176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGTCGGTGAAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
275888	SIRV5	-	436	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
275897	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	-1	-399	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTTTCATTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4089_4338_4480_4687_4801_5788
275909	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
275987	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	1	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276015	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4583	34	3408	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
276032	SIRV6	+	456	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8809	0	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAGCAATCGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
276063	SIRV2	-	243	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	672	33	672	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4060	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
276066	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7470	-5	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
276087	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_1570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGCACAGACCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
276118	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276244	contig_3747_pilon	+	2664	9	Intergenic	novelGene_24865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3826.39692628718	5	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	294	1469	201313	203804	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201019	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204335_204541
276266	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	5	63	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
276272	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
276288	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
276290	SIRV6	+	353	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	181	1	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTAGCCTGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
276304	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276320	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
276332	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276394	SIRV2	-	602	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	-4	-48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTAGACCTACTGCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5899	3713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969_4095_4338_4480_4687_4801_5788
276405	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276458	SIRV5	-	324	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTTCTCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	8317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8454_8590_10863
276471	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	4	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
276492	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
276534	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
276536	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
276553	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
276555	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
276563	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
276638	contig_8538_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_5034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
276639	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
276668	SIRV5	+	457	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-134	882	-20	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8181	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
276717	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	236	-16	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
276783	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
276821	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	2	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
276834	SIRV6	+	444	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10304	2	1154	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
276867	SIRV6	+	487	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
276874	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	87	499	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
276961	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
277009	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7592	2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
277025	SIRV6	-	241	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10817_11031_11109_11205
277052	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
277120	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	17	1155	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
277121	contig_3956_pilon	+	2278	10	Intergenic	novelGene_14873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1072.55480161581	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	84	1754	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1286178_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
277140	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
277144	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
277177	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
277193	SIRV2	-	399	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTACTTTTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4337_4480_4687_4801_5788
277316	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
277341	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
277433	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
277455	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	240	-15	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
277461	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	65	7651	65	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
277483	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
277524	contig_8538_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_4803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842768	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
277537	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
277662	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
277719	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	231	15	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
277796	SIRV2	+	317	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	280	-74	-280	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGACTTTGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
277811	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
277844	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10550	1	1313	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
277848	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
277865	SIRV2	-	362	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	19	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5876	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
277895	contig_4364_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_2358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
277989	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
278051	contig_4364_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_4484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAACAGACTTAAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
278056	contig_4364_pilon	-	444	3	Intergenic	novelGene_372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGACCGCGGCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531336	1530444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531016_1531093
278092	contig_4364_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_3323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGGGTCCTAAGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
278169	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
278173	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
278190	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	232	15	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
278259	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
278283	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	4	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
278304	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	67	300	842828	843061	NA	25	TTGCATTCCCAAATAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842761	843118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
278373	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
278401	SIRV6	+	285	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10463	2	1313	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
278451	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	232	-16	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
278504	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
278523	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	2	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
278538	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
278578	contig_4364_pilon	+	547	4	Intergenic	novelGene_719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	58	546	1530895	1531744	FALSE	20	CCATCTACGAGGGCTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTV	1530467	1531745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
278591	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	10	1266	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGACCGGGAGTATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
278614	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	20	CGCCCCTGAATCCCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
278618	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	89	496	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
278711	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	78	505	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
278768	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
278791	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	2	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
278803	SIRV6	+	453	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-38	8844	5	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
278815	SIRV2	-	243	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-384	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCTCGCGACTAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1400_1700
278817	contig_8317_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_20432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTCCACTGCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
278829	SIRV2	-	251	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	33	664	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
278844	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
278874	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	85	503	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
278932	SIRV5	-	320	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATATACAGATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
278936	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
278939	contig_17427_pilon	-	2508	14	Intergenic	novelGene_30321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1128.60638260817	372	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	40	1464	188879	178046	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204682	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177202_177254_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
278953	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
278997	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
279019	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
279069	contig_8538_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_4776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	40	AAGCTTTCAAGAAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
279122	contig_4364_pilon	+	545	4	Intergenic	novelGene_737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	46	543	1530895	1531753	FALSE	10	GGGCTATGCCCTGCCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIY	1530479	1531755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
279188	SIRV6	+	406	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10342	2	1192	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11429	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
279191	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
279223	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
279236	contig_4364_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_2843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCCAACCCTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
279280	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
279339	contig_8538_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_5023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842819	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
279410	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
279444	SIRV6	+	191	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9661	585	511	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
279492	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
279511	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
279542	SIRV6	+	925	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	592	11	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
279606	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	94	8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
279611	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	119	15	51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCTATTGTCGGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
279644	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
279655	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
279707	SIRV5	-	363	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1163	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGCTTCGGTCCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1140_1985_2034_2119_2165_2274_2317_3302
279809	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	1	62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
279989	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
280017	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
280030	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9654	584	504	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
280046	SIRV2	-	302	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	351	2964	-351	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAACCCAGTGATAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
280047	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	34	3396	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
280077	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
280089	SIRV6	+	287	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1466_1535_1640_1736_1845
280096	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
280109	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7607	-5	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACAGCGTTATTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
280132	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	233	15	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280161	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280218	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
280255	SIRV2	-	362	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4503	42	3328	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
280277	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280305	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	79	502	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
280358	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280421	contig_4364_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_1444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
280436	SIRV6	+	269	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
280472	SIRV6	+	212	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-224	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642
280483	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
280526	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	235	4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280610	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	242	-4	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280636	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
280644	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280651	SIRV6	+	438	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10310	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
280674	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	238	-2	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280688	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
280691	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
280741	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280775	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7586	-5	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
280792	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	5	1259	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
280798	SIRV6	+	425	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-34	94	16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280814	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
280870	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	5	1263	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
280879	SIRV2	-	234	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3651	-1	-1021	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCATCATGTACTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
280884	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
280892	SIRV6	+	169	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	489	222	489	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
280921	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
280936	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
281034	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
281037	contig_4364_pilon	+	444	3	Intergenic	novelGene_237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	83	442	1530895	1531333	FALSE	5	GGTGACTGTCGGGCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530442	1531335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
281069	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	4	1156	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
281096	SIRV6	+	249	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	385	11	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
281122	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
281154	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
281203	contig_4364_pilon	+	177	1	Intergenic	novelGene_4533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533125	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
281274	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
281298	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	880	-49	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
281311	contig_8317_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_19619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTTTAAAATCAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
281385	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
281451	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
281495	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
281497	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
281521	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
281527	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
281587	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	880	-5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
281599	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
281652	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	5	1258	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
281715	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
281720	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	0	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
281781	SIRV6	+	203	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	503	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
281867	SIRV6	+	438	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	5	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
281899	SIRV2	-	409	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3027	0	-397	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTCATTGAAGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
281903	SIRV2	-	366	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4505	36	3330	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
281938	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
281991	contig_8538_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_4888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842780	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
282033	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
282067	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
282069	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
282096	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
282126	contig_8538_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_4826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
282149	contig_15304_pilon	+	1787	4	Intergenic	novelGene_30640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1185	1628	103122	105744	FALSE	10	GGCCAGCTCATCCCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQHGQRAVRGQRAGRGSVGGWSHLKPMAGSSFYVFVSEQPLGSLPYHIPVVGDDRPLQLHHRREDPLHLEEGDGGTVAHAEQEERDEDGDGGPQPIQLPILGLRTALIWVQLWRQGDGLLSVVVVQCLVQHHAGEGAFSLPAILGH	101818	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_102841_102959_103327_103546_103683_105641
282233	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
282239	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	2	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
282261	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
282262	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	266	-66	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
282266	SIRV6	+	499	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8792	11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
282391	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
282439	SIRV5	+	457	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	5	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGGTCAAGCCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033	3601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2244_2316_3298_3403_3483
282446	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	5	1255	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
282508	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
282518	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
282607	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
282608	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
282644	SIRV6	+	296	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
282656	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
282678	SIRV5	-	436	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGACCTAGAGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
282685	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
282690	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
282762	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	583	502	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
282785	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
282802	contig_4364_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_2435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGCTCTTTGCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
282819	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10326	4	1176	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
282830	contig_10324_pilon	+	3394	21	Intergenic	novelGene_7739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	977.512806821476	7	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	485	1423	69577	74872	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPGTTQARWPLGPSF	66149	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74702_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
282875	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
282916	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
282987	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
282996	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
283001	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283045	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	233	-16	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283051	SIRV6	+	432	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1843
283089	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283106	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	5	1255	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283114	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	79	502	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
283159	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
283203	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
283208	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283222	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
283268	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
283287	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283311	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283341	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_1903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
283360	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283389	SIRV6	+	371	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	131	-4	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283483	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
283487	SIRV2	+	194	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACTACCTGGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4724	5906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4800_5787
283510	SIRV2	-	658	2	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2959	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1635_1715
283544	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
283609	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
283630	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7486	-1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
283680	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_3798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
283742	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	880	50	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
283775	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283827	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
283854	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	4	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283862	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
283892	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
283903	SIRV5	+	410	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-80	875	34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8235	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
283911	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
283919	SIRV6	+	242	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	392	11	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
283959	SIRV2	-	238	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4635	34	3460	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
283999	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
284015	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	94	7	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284021	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
284050	SIRV5	+	146	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1252	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCAAGCGGTCATCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2308	2454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2300_2500
284053	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-27	882	-27	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8288	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
284059	SIRV6	+	293	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
284069	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284189	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
284212	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
284242	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
284266	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	9	38	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
284293	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533023	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
284294	SIRV2	+	461	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	136	-74	-136	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCGAATGACTCTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
284341	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
284365	SIRV6	+	274	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
284404	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284409	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
284419	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
284422	SIRV5	-	390	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTAGGACGAATTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8451_8590_10863
284425	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284499	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	25	1262	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
284504	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
284515	contig_8317_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_19788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTCAACACTGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
284579	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
284592	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
284601	SIRV2	-	247	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	667	34	667	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCTTGAAAGGTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4065	3677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
284603	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	48	3076	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGACGTGGTGATTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
284705	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	235	0	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284799	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
284808	SIRV2	-	462	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4411	34	3236	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
284866	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
284885	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
284922	SIRV6	+	445	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
284974	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285001	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10355	5	1205	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11442	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
285043	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
285132	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285144	SIRV6	+	289	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
285179	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285199	SIRV6	+	289	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10459	2	1309	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285216	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-139	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8176	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
285229	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	89	499	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
285230	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
285244	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
285245	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
285249	SIRV5	+	427	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-97	875	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8218	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
285382	SIRV6	-	413	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGAATGTAAACGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
285391	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285443	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
285457	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
285522	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285556	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
285654	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
285658	SIRV6	+	283	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10542	1	1305	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285685	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
285700	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	227	-15	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
285719	SIRV5	+	232	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	285	151	171	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8486	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
285829	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10468	2	1318	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
285880	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4601	34	3426	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
285889	SIRV6	+	389	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	135	11	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
285926	contig_6630_pilon	-	3699	14	Intergenic	novelGene_30693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_13	534.347425929641	1860	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	646	1959	374404	357618	FALSE	15	GATGTTGCTTGGATGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVLINLVMLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQAFYLVRHPNEISWPVASVIIALKLFGYIIFRCANSQKNAFRKNPTDPRLAHLKTIHTSTGKNLLVSGWWGFVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGFNHILPYFYVTYFTMLLIHREARDEHHCRKKYGLAWEKYCQRVPYRIFPYIY	384212	355877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358778_358860_360550_360720_364054_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379916_380096_384123
285960	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
286076	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
286105	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-106	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8209	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
286131	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
286173	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
286226	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
286260	SIRV2	-	227	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4635	45	3460	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
286407	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
286412	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
286426	contig_4364_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532881	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
286563	SIRV5	+	453	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7436	2	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	127	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAACTATGACACTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
286580	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
286592	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
286601	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
286631	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
286682	SIRV6	-	318	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCATTTCTGGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
286698	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	4	1308	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
286751	contig_4364_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_4370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAGTAACAACCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
286778	SIRV5	+	391	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
286811	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
286829	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
286836	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
286877	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
286901	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
286972	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
286980	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_16447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27809	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
287125	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
287134	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
287144	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
287160	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	72	353	1530895	1531255	FALSE	15	GTGTGGCCCCCGAGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530453	1531256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
287185	contig_6795_pilon	+	3983	30	Intergenic	novelGene_27736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_27	378.75584862235	15	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1112	3339	45	3383	322269	332960	TRUE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTRCIQISTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVLQ	320625	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327430_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332775_332948_333055_333147_333214_333300
287206	SIRV6	+	264	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
287222	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	266	-74	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
287323	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
287344	contig_8538_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_5090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842868	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
287384	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_2925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
287416	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
287442	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	686	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
287444	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
287505	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
287542	SIRV6	+	542	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8749	11	42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
287562	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
287567	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
287617	contig_4364_pilon	+	438	3	Intergenic	novelGene_540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	76	438	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530449	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
287627	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
287736	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	8	62	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
287742	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
287812	SIRV6	+	442	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	5	1153	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
287846	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
287850	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
287989	contig_4364_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_3149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAAGGCTCAGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
288055	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10523	1	1286	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11523	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288056	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	226	-16	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
288115	SIRV2	-	466	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	38	3228	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
288130	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288157	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	86	498	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
288180	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288198	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
288244	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
288258	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	36	3383	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
288288	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
288315	SIRV5	+	494	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	1	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACGCCGACCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
288326	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
288368	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_10201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
288373	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288420	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	236	-2	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
288513	SIRV6	+	654	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	798	574	-400	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
288555	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288556	SIRV6	+	399	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
288570	SIRV6	+	406	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	127	2	43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
288587	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
288675	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_19862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTTGAGACCCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
288726	SIRV5	+	408	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7474	1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
288742	SIRV6	-	288	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCACCGCGAACTTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
288798	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4542	49	3367	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
288816	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	34	3255	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
288856	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
288894	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
288934	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
288994	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289026	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
289046	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	129	-4	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTTGGTATGGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
289061	contig_8538_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_4728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	76	309	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842752	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
289101	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	2	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289131	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289168	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
289272	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
289286	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	288	10	57	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
289351	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
289359	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	44	3394	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
289405	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
289440	SIRV6	+	369	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
289467	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-47	875	-47	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8268	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
289473	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
289555	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
289563	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	89	497	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
289591	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
289654	SIRV6	+	351	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	194	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	90	299	2569	10736	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2479	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
289665	contig_8538_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_4923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842789	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
289671	contig_4364_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_1844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAATACCCTGCACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
289693	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289698	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10546	2	1309	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289709	SIRV5	-	392	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGACGAATTTACGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
289780	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
289785	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289812	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
289902	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
289908	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	882	-55	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
289918	contig_8538_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_5001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842814	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
289927	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	908	-34	-31	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACCTCAGTGGTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
289964	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_2132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
289967	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2089_2157_2270_2316_3298_3402_3483
289976	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
289987	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTGTTGTTTATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842767	843130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
290077	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	136	1	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290112	SIRV6	-	269	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTAGCTTCTTCGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
290160	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
290195	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	102	26	20	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
290220	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	9	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
290259	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
290338	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290394	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290426	SIRV6	+	384	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	4	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
290514	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290535	SIRV5	+	302	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	904	-1	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCAGTGGTGACGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
290542	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
290597	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290602	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	445	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
290636	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
290652	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
290703	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	239	-2	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
290712	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
290761	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	61	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
290765	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	555	11	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
290780	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
290796	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
290807	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
290833	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	236	-16	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
291001	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
291037	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
291042	SIRV2	-	393	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	-1	-407	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4477_4687_4801_5788
291144	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
291169	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	136	2	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
291182	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
291220	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
291328	SIRV6	+	252	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	31	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10723_10819_11031_11109_11205
291407	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
291440	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
291537	SIRV6	+	552	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGTCTAGGACGCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470
291552	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9656	580	506	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
291576	contig_4364_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_1302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCGTGAGGTCGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
291591	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	396	0	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
291604	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
291609	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
291671	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	285	9	54	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
291718	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
291812	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
291860	SIRV2	+	335	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	262	-74	-262	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATCACTGGGTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
291894	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
291895	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
291912	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	69	302	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842759	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
291974	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
292011	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	4	1198	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
292027	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_2963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
292054	contig_8538_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_4721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	78	311	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842750	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
292119	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
292121	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
292150	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
292167	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
292181	SIRV2	-	248	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4619	40	3444	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
292203	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
292207	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
292215	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_8551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	249	1484	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26347	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
292255	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
292271	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
292282	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	2	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
292341	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
292351	SIRV6	+	382	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	142	11	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
292398	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
292411	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	94	8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
292463	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	875	-25	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
292546	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	504	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10827_11034_11109_11205
292552	contig_19990_pilon	+	3305	1	Intergenic	novelGene_30771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAGAATGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135429	138734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_135400_138700
292573	SIRV6	+	253	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	31	499	20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
292620	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10428	2	1278	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
292650	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
292699	SIRV6	+	348	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	105	-76	23	15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACCATAAATTTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3128	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
292732	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	15	1256	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
292739	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	886	9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
292767	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
292793	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
292808	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	86	498	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
292821	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
292834	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
292857	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	96	2	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
292927	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
292979	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
293084	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293106	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293145	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293204	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293231	SIRV2	+	293	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	304	-74	-304	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATACGCAGTAATGCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
293266	SIRV5	-	409	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTAATTTCGCACACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
293297	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
293332	contig_4364_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_4386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGCAAGTAACAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533288	1533087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
293371	contig_8317_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_20088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
293393	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293420	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293435	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293456	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293467	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	229	-2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293501	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293524	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293529	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	395	0	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
293583	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	85	499	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
293628	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293657	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
293658	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	130	8	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
293730	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
293738	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
293814	SIRV6	+	233	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	304	-6	73	6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAATAGTGCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	10794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
293860	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293870	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293934	SIRV2	+	313	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	284	-74	-284	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTATTTGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
293952	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	-1	2969	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
293957	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
293988	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
294011	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7483	-1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
294049	SIRV2	+	625	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-28	-74	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGAGGATATGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
294059	contig_15063_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_8492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
294097	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	46	3243	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
294128	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	5	61	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
294175	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	2	1161	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
294284	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
294339	contig_10159_pilon	+	3609	13	Intergenic	novelGene_30866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	124.868903477029	425	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	866	1900	978504	996016	TRUE	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTQGLKRGHCWVSCTSSASLQGQTQTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	957469	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874_996707_996795
294355	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	2	1161	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
294372	SIRV2	-	504	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	302	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTCTCTTGCTCAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4731	3341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4340_4480_4687
294374	SIRV2	-	618	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
294375	contig_8538_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_4961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842804	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
294479	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
294508	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	14	33	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
294543	contig_4364_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_4538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533132	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
294580	SIRV5	+	412	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
294583	SIRV6	+	294	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	378	95	212	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
294592	SIRV2	+	649	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	133	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTCGTTCTAGGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
294598	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	4	62	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
294655	SIRV6	+	544	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGACGCGTTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
294690	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
294710	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	224	11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
294734	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
294749	SIRV6	+	424	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	18	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
294771	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
294798	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
294814	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
294886	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
294904	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
294984	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	15	1266	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295016	SIRV6	-	381	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCACGAATAGGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
295028	SIRV2	-	547	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4323	37	3148	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1584	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
295049	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295071	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
295093	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
295113	SIRV6	+	351	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	181	3	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTAGCCTGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295135	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
295188	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295218	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295222	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295230	SIRV6	+	174	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	434	0	-264	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCAAAACGTCTATACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
295270	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295300	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533080	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
295350	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295395	contig_500_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_31079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	181	495	1499321	1497896	TRUE	20	CCTCCTGTGCCCAAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHLILRSFKADSKLFTSQMLMPPSMPVVQNWEHLALPPLSTEIWHTVLMQRVEPGARGRGALRARLFCRGSGSARGPSGRVVSSAWARPASRRSSASPWRCRR	1499501	1492656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1492722_1493604_1493718_1494241_1494465_1495350_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498075_1498881_1498972_1499275
295448	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295468	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	3	59	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
295476	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	9	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295541	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
295646	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295661	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
295839	SIRV2	+	277	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	319	-73	-319	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACGCAATCGCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
295845	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
295868	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	4	61	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
295897	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
295959	contig_8538_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_4924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
295996	SIRV5	+	347	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	887	-29	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
296002	SIRV2	-	640	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2652	-1	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACACAAGACATTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
296008	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	264	-70	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
296012	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	396	11	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
296023	SIRV3	+	127	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5161	1707	3102	514	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATCAAAAGATAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7105	7232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7100_7200
296033	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1850
296041	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	442	15	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
296073	SIRV2	+	298	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	299	-74	-299	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAATGCTAAACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
296107	SIRV6	+	353	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1454	223	68	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
296114	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296127	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	251	0	-81	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCGCACAAGTCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296146	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296162	SIRV6	+	778	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
296183	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296221	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296228	contig_4364_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_4444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533098	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
296238	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_3091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
296239	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296257	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	236	3	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296261	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296313	contig_4364_pilon	+	172	1	Intergenic	novelGene_4550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533142	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
296336	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
296345	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	880	-19	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
296374	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4416	34	3241	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
296424	SIRV5	+	453	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATGACACTTTCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2067_2270_2316_3298_3405_3483
296432	SIRV5	-	481	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
296484	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296492	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296502	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296541	SIRV2	-	261	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4612	34	3437	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
296621	contig_5041_pilon	-	2781	18	Intergenic	novelGene_27066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	516.897525533944	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	103	2391	616721	525456	FALSE	25	TAGTCTCACGAAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636082	525065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
296636	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
296692	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
296727	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
296845	contig_4364_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_4434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533094	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
296953	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
297008	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
297046	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	74	307	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842754	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
297143	SIRV5	+	369	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	877	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
297186	SIRV2	-	249	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4624	34	3449	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1283	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
297291	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	11	1260	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297293	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
297365	SIRV6	+	241	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	389	15	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAGTGGACGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
297389	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
297434	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
297438	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297491	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	230	0	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
297522	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297619	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	245	11	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
297623	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
297678	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	15	CGGAGGCGCCCCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
297692	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297708	SIRV2	-	551	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4306	50	3131	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
297720	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297780	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
297812	SIRV2	-	424	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4449	34	3274	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
297824	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	84	500	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
297831	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
297842	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
297910	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
297927	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16391	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
297938	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	4	58	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
297951	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298004	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
298035	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
298115	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298140	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
298191	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
298232	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533054	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
298246	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298275	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
298278	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842788	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
298353	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298422	contig_4364_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_2510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGGCCCCAGCAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
298450	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	4	1262	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298481	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298518	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
298537	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
298564	SIRV6	+	444	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8843	15	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
298601	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
298616	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
298753	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_3812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
298800	SIRV5	+	392	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298_3405_3483
298861	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
298863	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
298892	SIRV6	+	782	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	581	337	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
298909	SIRV6	+	322	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	180	-4	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCTGCTTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
298919	SIRV2	-	297	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4570	40	3395	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
298969	contig_1948_pilon	-	4345	2	Intergenic	novelGene_31146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGACCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124313	116690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_119644_122921
298990	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
299003	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	719	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
299034	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
299153	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
299175	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10533	1	1296	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
299177	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
299208	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
299251	SIRV6	+	279	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10546	1	1309	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
299271	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
299295	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9637	599	487	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
299317	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
299324	SIRV6	+	132	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	77	787	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
299400	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	15	1278	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
299484	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
299595	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_2880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
299613	SIRV6	+	394	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	130	11	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
299635	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
299708	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
299907	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	38	3072	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
299959	SIRV2	+	627	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-30	-74	30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGATATGGTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
299997	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
300013	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
300061	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7490	-1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
300115	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	398	0	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
300223	SIRV6	-	396	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATAGGTCTCTTTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
300236	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
300266	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
300290	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
300302	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
300319	SIRV6	-	248	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-48	424	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1868	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1184_1466_1536_1641_1736_1846
300403	SIRV2	+	659	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-67	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1726
300467	SIRV6	+	412	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	108	15	62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCTGGATGCAAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
300548	contig_4364_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_4084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
300588	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
300608	SIRV2	+	433	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	164	-74	-164	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGCTATAAATACCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
300624	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
300664	SIRV6	+	516	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8753	-4	38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGCGTCTAGGACGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
300723	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4422	34	3247	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
300726	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
300867	SIRV6	-	399	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATAGGTCTCTTTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
300875	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
300876	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
300895	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
300913	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	75	502	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
300917	contig_4364_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_2699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532955	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
300927	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	4	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301036	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301053	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
301067	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301129	SIRV5	+	375	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
301145	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
301165	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301184	SIRV5	-	304	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCGTTACCAAAGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10865
301188	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
301200	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
301222	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
301257	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301296	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10426	2	1276	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301324	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
301383	contig_4105_pilon	-	3826	15	Intergenic	novelGene_21489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_2	697.253332142395	14	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	20	1843	137447	100151	FALSE	30	TTTTAATGCAGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137466	98167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
301432	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301446	contig_8317_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_20194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
301485	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	398	-1	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
301497	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301538	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
301615	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_1652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCTGCACAGACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
301667	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	232	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
301684	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	124	15	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
301691	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
301720	SIRV5	-	323	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACAGATTTCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
301877	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	391	11	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
301909	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
301915	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	2	63	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
301935	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10428	2	1278	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
301954	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
301999	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
302013	contig_4364_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_4467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGACTTAAATCCAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533291	1533105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
302019	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	11	1259	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
302049	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
302075	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
302081	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
302150	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	465	1	234	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2750	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
302156	SIRV6	+	205	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	499	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11210
302160	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
302205	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
302245	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
302292	SIRV6	-	429	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGCGCGCGATGCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
302295	SIRV6	-	262	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-61	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1881	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1540_1646_1735_1844
302317	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
302381	SIRV6	+	223	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	385	0	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
302478	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	1	1301	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
302520	SIRV5	-	477	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTACAGTAAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
302532	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
302565	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
302569	SIRV2	-	579	5	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	-68	321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTCCATGAAAATGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4800	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3678_3826_3966_4095_4340_4480_4687
302584	SIRV6	+	438	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10310	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
302599	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
302603	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
302646	SIRV6	+	272	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1193_1479_1535_1640_1736_1845
302666	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
302703	contig_8317_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_19657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
302709	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	4	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
302770	contig_8317_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_20352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCCACTGCCTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
302779	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7487	-1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
302787	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
302815	SIRV6	-	174	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035
302833	SIRV5	-	354	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCTGCAATCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
302936	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	245	11	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
302951	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
302997	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
303019	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
303039	contig_13295_pilon	-	3701	1	Intergenic	novelGene_31248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGGAAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122429	118728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_118700_122400
303053	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
303076	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
303115	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
303181	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	444	5	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACGCCATTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
303230	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
303270	SIRV6	+	221	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	403	-16	-233	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCTTCCACACCACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
303292	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	9	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
303344	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
303398	contig_8538_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_4796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842766	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
303418	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
303512	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
303533	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
303570	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
303581	SIRV6	+	295	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
303740	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	81	356	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530444	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
303778	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
303812	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10523	1	1286	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11523	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
303887	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
303997	contig_8538_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_4965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842805	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
304003	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304025	SIRV6	+	241	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	237	7	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304037	SIRV5	+	237	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	276	155	162	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGTTTACCGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8477	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
304041	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	886	0	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
304045	SIRV6	+	381	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-27	131	-14	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304057	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
304107	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304148	SIRV2	-	354	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	-1	-699	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACGATGTCCTAGACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4486_4687_4801_5788
304159	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
304165	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304170	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304177	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	583	500	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
304200	SIRV5	+	472	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	882	-35	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
304219	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_19959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
304235	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
304260	contig_7457_pilon	+	4333	29	Intergenic	novelGene_31639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_8	145.096818485775	820	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1101	3306	142	3447	1005828	1040226	FALSE	10	TGTACTGGTGTCTCATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPTAAHTANFLLNASGSTSTPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQDSVPSPRPLQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1001537	1041112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1019001_1019771_1019863_1021032_1021063_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
304262	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_3946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
304264	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304269	contig_4364_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_3840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCGGGAATACATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
304301	SIRV6	+	355	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-299	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1986	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
304398	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304422	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304450	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	228	15	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304523	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533087	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
304653	SIRV6	+	301	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	20	1268	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304660	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
304667	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	12	32	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
304785	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
304792	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	380	3073	-345	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTGATAGAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
304795	SIRV5	+	240	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	176	138	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
304892	SIRV2	-	201	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-1053	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATTTACATTGCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5787
304909	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	4	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304931	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-104	880	10	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8211	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
304951	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
304959	contig_4364_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_2784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
304991	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
305001	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
305014	contig_4364_pilon	+	439	3	Intergenic	novelGene_425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	77	439	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530448	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
305071	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305084	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
305128	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
305136	SIRV6	+	298	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	233	4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
305159	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
305164	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	2	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
305166	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305203	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
305208	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
305217	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
305295	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305340	contig_4364_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_2751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532978	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
305348	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
305413	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
305422	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
305470	SIRV6	+	271	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
305476	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305550	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305625	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
305627	SIRV6	+	529	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	726	544	-429	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1856	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
305652	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-69	271	-69	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
305731	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
305743	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
305748	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	79	506	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
305759	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	222	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10723
305781	SIRV2	-	1019	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2969	-1	1790	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	480	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2942	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
305818	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
305862	SIRV2	-	653	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
305907	SIRV2	+	611	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-14	-74	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTACATGGTAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
305920	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
305989	contig_4364_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_1311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACATTAGGCCCCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
306059	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
306113	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	100	11	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
306137	contig_15063_pilon	-	1621	7	Intergenic	novelGene_11431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	880	1203	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39670	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
306155	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
306165	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
306199	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	6	58	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
306202	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
306218	SIRV5	+	219	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	295	154	181	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8496	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
306268	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
306274	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	75	505	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
306303	SIRV6	+	327	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	208	0	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACGTTTCTAGACCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
306385	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	209	2	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACGTTTCTAGACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
306388	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9675	562	525	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
306396	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
306410	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
306461	SIRV6	+	413	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	15	1161	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
306526	SIRV2	+	254	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-355	-380	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTCAAATGGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3678	4077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3814_3958
306574	contig_4364_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_2933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTCAGATTTTTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533275	1533021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
306638	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
306646	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3040	0	-410	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTTGTCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
306657	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
306820	SIRV6	+	554	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8746	2	45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGACGCGTTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
306834	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	232	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
306868	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
306884	contig_8538_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_5007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842815	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
306886	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	50	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
306913	contig_4364_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_3095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAAGGCTCAGATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533280	1533025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
306918	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	4	58	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
306944	contig_4364_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_2846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533012	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
306982	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	34	3259	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
307094	SIRV2	+	252	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-336	-368	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGCTGACCCGTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3697	4089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
307106	SIRV5	+	205	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	191	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8506	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8579_10858
307148	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	588	499	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
307186	contig_8317_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_20135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCCTTGATGACACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
307386	contig_8317_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_20027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGTCTGTCTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
307419	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
307420	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
307426	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
307448	SIRV5	+	311	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	880	14	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
307455	contig_4364_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_4495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533113	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
307504	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
307523	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	4	61	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
307547	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
307550	SIRV2	-	300	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1818	2357	643	286	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTATGCACGTCGAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
307599	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
307604	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
307609	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	241	11	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
307691	contig_8538_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_4932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842791	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
307757	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
307788	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
307793	SIRV6	+	217	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10594	15	1357	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11594	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
307905	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
307988	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
308056	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308082	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	398	11	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
308104	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	229	-15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308120	SIRV6	+	195	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9657	585	507	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
308146	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_4046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
308187	contig_8317_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_19492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
308194	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
308260	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
308276	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308294	contig_6102_pilon	+	3196	28	Intergenic	novelGene_31884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	545.530687623112	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	20	2275	371166	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVKTLYMSHRELPAWIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	371146	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393790_394736
308320	SIRV2	-	265	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4608	34	3433	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
308327	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308378	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308482	contig_4364_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_2652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532940	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
308490	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
308508	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	137	1	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308512	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308574	contig_8538_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_4859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842775	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
308638	SIRV2	-	448	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	9	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4723	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4693
308646	SIRV5	+	546	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-216	875	-102	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8099	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
308649	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	229	3	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308671	SIRV2	+	439	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	158	-74	-158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACCACTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
308758	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308859	SIRV6	+	405	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	129	1	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTTGGTATGGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308872	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
308918	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16394	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
308925	SIRV6	+	392	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	132	11	38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
308941	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
308970	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
308971	SIRV6	+	258	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
308976	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309010	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309040	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
309051	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309058	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	241	3	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309077	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
309078	SIRV5	+	187	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	1	364	1	-364	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGCCACGGTCGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
309128	contig_4364_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_4233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGTGTTCCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1533074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
309139	SIRV2	-	250	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4621	36	3446	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
309166	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_4019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
309179	SIRV6	+	438	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8843	-16	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
309223	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	241	-4	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309253	SIRV2	+	646	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	133	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTCGTTCTAGGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
309267	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309275	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
309285	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	42	3076	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
309303	SIRV6	+	180	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	96	507	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
309329	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
309348	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
309359	SIRV6	+	389	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	138	8	32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTATCGTGCCGCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	1982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309377	SIRV5	-	329	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTATTTGACCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8577_10853
309384	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	88	495	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
309392	contig_5780_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_29764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCATACAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15357	15037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_15000_15400
309408	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309426	contig_9091_pilon	-	2769	8	Intergenic	novelGene_32426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	70.4145161286553	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1884	2489	32042	18674	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEVWRNHPQMIAVLVDKMIRTQIVDCAAVANWIFSSELSRDFTRLFVWEILHSTIRKMSKHVLKIQKELEEAKEKLARQHKRRSDDDDRSSDRKDGALEEQIERLQEKVESAQSEQKNLFLVIFQRFIMILTEHLVRCETDGTNVLTPWYKNCIERLQQIFLQHHQIIQQYMVTLENLLFTAELDPHILAVFQQFCALQA	36139	18393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_18788_24577_24692_25320_25450_28659_28775_31150_31255_32012_32107_33094_33198_34423
309446	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
309504	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_9442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
309514	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	4	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
309521	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
309524	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
309538	contig_17976_pilon	-	2606	4	Intergenic	novelGene_32472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCCAGCTGAGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48781	41594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_48464_48518
309593	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
309618	SIRV6	-	343	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTTAGCCGAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
309667	SIRV5	+	252	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGAAGGTCGCCGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2244
309680	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
309738	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
309819	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
309874	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	875	29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
309905	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
309975	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
309985	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
309996	contig_4364_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	81	353	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530444	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
310004	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	142	-16	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
310023	SIRV6	+	394	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	130	11	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
310041	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
310048	SIRV6	+	254	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	25	1310	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310058	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	58	3381	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
310060	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	1	62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
310063	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310089	SIRV6	+	299	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	4	-64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
310102	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310123	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
310217	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
310234	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
310240	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
310245	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
310292	SIRV5	-	397	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGGTGGTAATTTCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
310361	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
310399	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310482	SIRV6	+	701	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	798	527	-400	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
310510	SIRV5	-	223	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTACCACCCATAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
310531	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
310537	SIRV6	+	454	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
310561	SIRV5	-	464	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACCTTCACGGGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
310640	contig_9177_pilon	-	3090	21	Intergenic	novelGene_32567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	792.475644736165	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	845	2538	114	2651	10300	2152	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKAPGQLECESAIAALNSCLRDLDQASLAAISQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	10413	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_8991_9222_9319_9407_9510_9728_9862_10295
310674	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310697	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	6	1257	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310716	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310752	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
310776	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	932	-21	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCGGGACTAGGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
310811	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
310874	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	288	9	57	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
310893	SIRV2	-	259	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	389	3084	-354	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATTAACCCAGTGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1600
310894	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
310897	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146676	1	-91642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAATTAGCACGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
310900	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
311015	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
311016	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
311032	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
311047	contig_8538_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_4848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
311096	SIRV5	+	249	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	263	156	149	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8464	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
311123	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
311185	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
311205	contig_4364_pilon	+	173	1	Intergenic	novelGene_4549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533141	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
311212	contig_9807_pilon	+	3076	16	Intergenic	novelGene_32893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	574.488967111931	1062	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	64	1779	109130	157176	TRUE	15	CTTCGTTGTGGATCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	109066	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_157171_157384_158676
311248	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26353	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
311253	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311258	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311269	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	235	1473	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
311339	contig_4364_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_3776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGGAATACATCAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
311362	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311397	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311434	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
311440	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311468	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
311491	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	122	4	40	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3145	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
311510	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-58	282	-58	-282	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTATTTGACTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050	1349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
311537	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	142	2	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
311545	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311663	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	395	-1	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
311669	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
311682	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
311699	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_14076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	191	1426	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34617	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
311724	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
311738	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	82	503	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
311741	SIRV6	+	202	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	48	64	-48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACGAGTCGAAGTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
311812	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	3	60	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
311830	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
311884	contig_4364_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_2762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532984	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
311901	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842768	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
311914	SIRV6	+	355	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	858	586	-297	-43	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1988	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
311918	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
311992	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	230	-16	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
311996	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
312090	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
312112	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	91	496	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
312119	SIRV2	+	278	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	319	-74	-319	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACGCAATCGCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
312131	SIRV6	+	438	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10310	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
312137	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
312182	SIRV5	+	254	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	162	138	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
312338	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
312358	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
312374	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_1718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
312386	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	131	11	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
312404	contig_8538_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_5069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842835	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
312436	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
312476	SIRV2	+	308	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	283	-68	-283	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTATTTGACTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
312493	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	9	1260	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
312518	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
312542	contig_8538_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_4842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
312559	contig_4364_pilon	+	386	3	Intergenic	novelGene_605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	72	386	1530895	1531288	FALSE	20	ACGGAGGCGCCCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530453	1531288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
312561	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
312590	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
312642	SIRV6	+	494	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8806	2	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
312697	SIRV2	-	404	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4469	34	3294	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
312705	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
312782	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
312819	SIRV6	+	216	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	392	0	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
312956	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	94	7	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
312971	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	15	1265	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
313001	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313016	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
313056	contig_8317_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_19934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTCATATCTCGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
313064	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAGAAATTGTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532422	1532670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532400_1532700
313070	SIRV6	+	390	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	124	-16	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313088	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
313109	SIRV6	+	203	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638
313114	SIRV2	-	586	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	2700	5	-70	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCAAAACAAATCATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
313128	SIRV5	+	450	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7439	2	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACATAACTATGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
313186	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
313212	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
313215	contig_4364_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_1169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGTCGGTGAAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
313233	SIRV6	+	209	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	510	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
313258	SIRV6	+	296	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
313302	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	4	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
313312	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
313329	contig_15063_pilon	+	1683	6	Intergenic	novelGene_14060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	193	1428	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34615	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
313331	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-138	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8177	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
313359	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313393	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
313459	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
313531	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
313545	SIRV6	+	647	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	802	577	-396	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	113	445	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1889	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
313590	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	274	-74	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
313599	contig_8538_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_4724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGCTGTTTCCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843120	842751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
313625	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313630	contig_233_pilon	-	2990	16	Intergenic	novelGene_14608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	1298.68537631971	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	387	2552	108727	78579	FALSE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127006	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109783_109976_126898
313659	contig_12671_pilon	+	3690	8	Intergenic	novelGene_19217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	460.947072972193	68	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	83	652	197316	212313	FALSE	20	CTTTGTCAGAAATGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197233	215351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200328_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286
313706	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	230	7	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313818	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
313848	SIRV6	+	234	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10591	1	1354	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11591	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
313856	SIRV7	+	1543	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCGGTCTTTTAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004	114785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1262_1663_2679_2996_3111_43027_43083_114683
313874	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	4	1476	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
313887	SIRV6	+	393	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	5	1202	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
313904	SIRV2	+	281	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	316	-74	-316	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAATCGCAAGATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
313911	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	65	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
313915	SIRV2	+	406	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-41	158	-41	-158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACCACTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
313986	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
314001	SIRV2	+	424	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	173	-74	-173	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACACTTATTATGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
314008	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
314119	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
314154	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	1	1310	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
314189	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
314206	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	1	1289	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
314233	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
314248	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	235	2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
314264	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
314304	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	25	1259	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
314388	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
314418	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
314471	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
314545	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
314562	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
314576	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
314581	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
314595	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
314638	contig_4364_pilon	+	346	3	Intergenic	novelGene_448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	76	345	1530895	1531243	FALSE	20	ATAACGAGCTGCGTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530449	1531244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
314653	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
314704	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-5	397	2	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
314709	SIRV2	-	399	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3037	0	-407	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTCTACTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
314713	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	50	3374	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
314722	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
314727	contig_4364_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_3078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGCTCAGATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
314960	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
314973	SIRV2	+	570	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	27	-74	-27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGAACAAGCATTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
315012	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
315050	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	881	-29	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGGTTTACCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
315055	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
315066	contig_8317_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_20075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	500	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCCACAGCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
315068	contig_4364_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_4080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTCCAGCGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
315127	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	277	-70	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
315191	contig_4364_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_4478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533107	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
315235	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
315273	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	9	32	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
315309	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	117	11	35	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3140	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
315334	contig_4364_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_2674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532945	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
315335	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
315368	SIRV6	+	200	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	68	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCGAAGTTGTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2820_3106_3165_10724
315380	SIRV2	-	644	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
315408	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
315437	SIRV6	+	156	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	452	0	-282	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAATGAACAAGACGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
315442	SIRV6	+	788	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	545	11	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
315510	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	78	505	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
315574	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
315614	SIRV6	-	327	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGTTGGTTAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
315625	SIRV2	-	557	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4315	35	3140	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
315650	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
315728	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
315904	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
315908	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10323	9	1173	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
315948	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316042	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_2857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
316127	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316133	SIRV6	+	288	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-16	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1842
316142	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
316184	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
316195	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
316199	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
316214	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
316223	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
316245	SIRV6	+	725	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	586	-4	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
316263	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316289	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
316322	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
316367	SIRV2	-	391	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2965	711	1786	-711	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGGTTCCCAAATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2946	1746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
316377	SIRV6	-	308	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-88	442	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCGACATTTAAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1908	1102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
316487	SIRV6	+	241	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
316557	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316573	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
316586	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316601	SIRV6	+	246	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	59	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10723
316679	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316684	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316722	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4590	34	3415	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
316841	contig_17976_pilon	-	2502	5	Intergenic	novelGene_32488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTCCTCCCCTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48913	41620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41855_45522_45583_46441_46549_46674_48152_48289
316842	SIRV6	+	379	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-19	125	-6	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
316891	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	17	1267	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316900	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
316911	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
316988	contig_12622_pilon	-	2479	12	Intergenic	novelGene_5927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	2001.36614498222	318	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	18	1136	1590968	1588027	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVGEILSHSNPRVPSPLIPVTSHPHPVFFLPQWFLPALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1590985	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
317007	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317008	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	1	63	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
317044	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
317052	SIRV6	+	369	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	133	-4	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317086	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	241	0	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317105	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
317109	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	1	63	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
317174	contig_4364_pilon	+	398	3	Intergenic	novelGene_508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	76	396	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530449	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
317176	contig_8538_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_4693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
317195	SIRV6	+	239	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	109	29	27	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3132	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
317209	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317216	contig_8538_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_4713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	80	313	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842748	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
317290	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317309	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-77	893	37	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8238	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
317313	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
317524	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
317655	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10349	2	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
317666	SIRV5	+	395	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
317686	SIRV6	+	449	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	64	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11039_11109_11205
317695	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
317703	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
317757	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	232	15	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
317780	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
317809	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
317835	SIRV6	+	787	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	546	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
317845	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
317923	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
318017	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318019	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
318027	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
318036	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318045	SIRV2	-	478	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4395	34	3220	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
318046	contig_8538_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_4759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	842828	843061	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842760	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
318049	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318062	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	15	1261	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318076	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
318091	SIRV6	+	432	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8843	-10	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
318158	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
318174	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318181	contig_8317_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_20143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
318205	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
318263	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318267	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318277	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318286	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
318295	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	599	1483	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35032_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
318351	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318352	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318361	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
318374	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTCTACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
318385	SIRV2	+	249	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-47	321	-47	-321	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACGCAATCGCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061	1310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
318403	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	235	2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318467	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGACCTGGCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
318488	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
318492	SIRV6	+	442	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	5	1153	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
318644	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
318654	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318659	SIRV6	+	390	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	142	3	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
318704	contig_4364_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	72	401	1530895	1531303	FALSE	35	TCCCAAGGCCAACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530453	1531305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
318736	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845
318781	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_3181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAAGGCTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
318857	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
318908	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	5	64	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
318926	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
318962	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319062	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319158	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	4	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319192	SIRV6	+	248	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	67	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
319229	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	396	11	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
319282	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
319315	SIRV5	-	384	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGAATTTACGGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
319322	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
319342	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
319348	SIRV6	+	445	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1180_1462_1535_1640_1736_1845_2027_2470
319419	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319455	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	131	11	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319474	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
319486	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
319506	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319519	contig_8317_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_19973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCTCATATCTCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
319524	SIRV6	+	346	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10402	2	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319527	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7482	-2	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
319593	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
319619	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
319647	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319652	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319686	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319757	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	880	-43	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
319781	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319787	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
319814	SIRV6	+	786	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	547	11	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
319880	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	2	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
319901	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	120	11	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319906	contig_3747_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_24870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGACAGCTCGGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201113_202406_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766_204108_204161
319938	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319951	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
319986	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
319990	SIRV5	-	316	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10992	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
320100	SIRV2	+	338	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	259	-74	-259	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACTGGGTTAATGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
320183	SIRV5	-	445	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGCCAGTTCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10862
320261	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_8592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26353	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
320284	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_19618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAGTTTTTAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
320298	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	310	-74	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
320347	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
320411	contig_4364_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532849	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
320523	contig_4364_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_4462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533102	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
320611	SIRV2	+	303	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	284	-64	-284	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTATTTGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
320620	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
320623	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
320664	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	279	-74	-279	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGACTTTGATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
320769	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
320780	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	240	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
320791	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
320804	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
320833	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
320834	SIRV6	+	417	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	96	-15	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
320847	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
320868	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
320880	SIRV5	+	700	7	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	17	5589	8	1802	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTACACCAACCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	5400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2489_3298_3405_3483_3644_5380
320886	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
320901	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
320944	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
320981	SIRV6	-	303	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-82	446	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTAAGCTTGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1902	1098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
320986	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
320987	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	230	-16	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
321026	SIRV6	+	248	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	37	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11033_11109_11205
321042	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	474	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
321052	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
321069	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
321107	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10409	1	1172	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
321138	SIRV5	-	322	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
321265	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
321340	contig_8317_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_20246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCACTGCCTTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
321353	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
321505	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
321531	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
321536	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
321562	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
321566	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
321570	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
321585	SIRV2	+	438	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-47	132	-47	-132	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGACTCTAATACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061	1499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
321665	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	234	15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
321700	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
321736	contig_4364_pilon	+	466	4	Intergenic	novelGene_378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	81	464	1530895	1531639	FALSE	20	GCCAGCCATGTATGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFN	1530444	1531641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
321770	SIRV2	+	373	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	224	-74	-224	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGCGAGCACAACGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
321780	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
321799	SIRV5	+	362	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7599	1	-206	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTATTATTTGGTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
321843	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10331	5	1181	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
321889	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
321899	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	37	1262	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
321903	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
321932	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
321965	SIRV6	+	263	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1474_1535_1640_1736_1845
322005	contig_8538_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_5005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842814	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
322114	SIRV2	+	615	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	-21	-71	21	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTAACCTGGAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
322164	contig_6557_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_32939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTAGGCAGTAAGATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300507	300828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_300500_300800
322166	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
322182	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	880	-31	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
322195	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
322305	SIRV2	+	424	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	172	-73	-172	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACTTATTATGCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
322353	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
322385	SIRV6	+	322	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	186	-10	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCACGAGTAGCCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
322391	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
322414	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	234	15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
322446	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	76	508	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
322460	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
322492	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10314	2	1164	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
322528	SIRV6	+	211	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	41	62	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
322550	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4269	34	3094	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1638	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
322561	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
322578	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
322636	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
322694	SIRV2	-	189	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4673	45	3498	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
322701	SIRV6	+	299	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-15	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTAACGTTTCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
322737	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
322793	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_2315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTTTGCATTAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
322826	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
322833	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	89	498	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
322895	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
322897	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
322898	contig_8538_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_5093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842873	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
322910	SIRV2	-	583	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	67	3082	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
322922	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	38	3402	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
322925	SIRV6	+	299	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	225	11	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
322936	contig_4364_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_4375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
323039	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
323097	contig_8538_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_5100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGATCTTTGCCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842900_843100
323126	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
323138	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7483	2	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
323175	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_4085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
323183	contig_4364_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_2737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532970	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
323216	SIRV6	+	975	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	538	15	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
323249	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	226	-16	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
323254	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
323259	SIRV6	+	225	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	393	-10	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
323273	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
323318	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
323325	contig_4364_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	72	419	1530895	1531321	FALSE	30	GAAGATGACCCAGGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR	1530453	1531323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
323329	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
323339	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	1	1250	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
323363	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
323413	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
323447	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
323448	SIRV6	-	314	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTCCATGACCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11828	11514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
323544	SIRV2	-	327	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4546	34	3371	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
323557	contig_8317_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_20121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	635	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTGATGACACCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
323560	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATAAAGTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
323572	SIRV6	+	255	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	57	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10727
323676	contig_4364_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_4485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533109	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
323679	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	224	1459	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28177	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
323713	SIRV6	+	271	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
323714	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	4	60	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
323744	SIRV5	-	220	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCTACCACCCATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10868
323819	SIRV5	-	330	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGACCTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
323893	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
323913	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
323953	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
323969	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
323970	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
323980	SIRV6	+	553	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8747	2	44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTAGGACGCGTTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
323994	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	15	1262	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324030	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	77	503	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
324043	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324080	SIRV6	+	1495	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
324084	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
324088	contig_8538_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_4933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842791	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
324125	SIRV2	+	271	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-47	299	-47	-299	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAATGCTAAACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061	1332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
324133	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10317	2	1167	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
324144	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324149	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324186	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324238	SIRV6	+	271	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10551	4	1314	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11551	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
324260	SIRV5	+	370	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298
324263	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	882	0	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
324274	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	225	-4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324287	SIRV2	-	280	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	35	3417	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
324298	SIRV6	+	439	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	2	1159	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
324317	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	5	1256	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324369	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
324379	contig_4364_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGACGGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
324392	SIRV5	+	353	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	0	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1146_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
324404	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324408	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
324417	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
324429	contig_12638_pilon	+	2777	17	Intergenic	novelGene_33082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	545.857922076569	3324	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	319	1503	171697	195520	TRUE	40	ATAAGAAATCTCATTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDIDIEAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAVLL	170765	200477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195509_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
324477	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324510	SIRV6	+	258	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	68	1263	-66	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTATGGATTTAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324511	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	152	11	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGCTAGTCCAATCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324527	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	230	0	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324592	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
324609	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
324662	SIRV5	-	219	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATGTAACCTACCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
324670	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324759	SIRV2	-	463	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2968	1	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAACGACAACGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
324762	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
324764	SIRV5	+	363	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-36	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
324772	SIRV2	-	247	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	669	32	669	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4063	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
324808	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324827	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
324843	contig_4364_pilon	+	302	3	Intergenic	novelGene_575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	231	72	302	1530895	1531204	FALSE	40	AACTGGGACGACATGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVT	1530453	1531204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
324888	SIRV6	+	333	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	181	-16	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTAGCCTGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
324910	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324920	SIRV2	+	313	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	283	-73	-283	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTATTTGACTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
324945	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
324946	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
325003	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
325014	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325016	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
325020	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325036	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325041	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325091	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325092	contig_12622_pilon	-	2147	4	Intergenic	novelGene_5915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_3	468.788509529262	2	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1522	1950	1585756	1583745	FALSE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAPSRVARPMRPFSPAGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1587399	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1586407_1586528
325100	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325101	SIRV6	+	240	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	394	11	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
325108	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
325150	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	17	1160	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
325223	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	98	-17	16	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3121	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
325242	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
325330	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
325342	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_3867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
325379	contig_8538_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_5047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842826	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
325431	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4564	34	3389	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
325432	SIRV6	+	262	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
325484	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325488	SIRV6	+	398	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10350	2	1200	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
325508	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10431	2	1281	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11518	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
325517	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
325522	SIRV2	+	365	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	232	-74	-232	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTTAGTCGCGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
325555	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	133	11	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
325605	contig_4364_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCTGAATCCCAAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
325608	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325616	SIRV5	+	455	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-132	882	-18	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8183	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
325626	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325674	SIRV5	+	362	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2000_2034_2119_2157_2279_2316_3298_3405_3483
325736	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
325790	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10322	2	1172	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
325825	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325848	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
325877	contig_4364_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_4037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCCAGCGGGAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
325903	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	893	-15	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
325934	SIRV6	-	242	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-47	420	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGGCGGCGCAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1867	1124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
325954	SIRV5	-	380	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTAGGACGAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
325977	SIRV2	-	244	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	661	43	661	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACAAGACATTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
326013	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
326039	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	78	503	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
326049	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
326071	SIRV6	+	430	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	760	8169	-395	622	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1890	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
326085	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
326109	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
326121	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	35	3253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
326192	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	2	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
326237	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
326264	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	225	-4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
326275	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGACCAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
326286	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	5	1254	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
326345	contig_4364_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_1910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
326347	SIRV5	+	435	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7454	2	-61	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTAGAAAACAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
326356	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
326461	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	4	1251	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
326498	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	37	564	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
326540	SIRV6	+	942	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	584	2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
326556	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
326599	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
326608	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
326628	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	67	300	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842761	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
326765	SIRV6	+	196	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	507	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
326800	SIRV6	+	795	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	589	532	373	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	57	548	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1676	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
326821	SIRV5	+	252	1	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	7103	2636	-98	-2634	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGATATAAAAAGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8103	8355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8100_8400
326841	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
326857	contig_8598_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_22906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	TGTCCTGATTGTTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
326968	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7592	2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
327006	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
327016	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327040	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10533	1	1296	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327110	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327113	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	86	498	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
327125	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327189	SIRV6	+	316	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	182	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327195	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
327232	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327269	SIRV6	+	427	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1845
327330	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327382	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
327424	SIRV6	+	206	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	402	0	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTCCACACCACATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
327430	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
327447	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327458	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327500	SIRV6	+	202	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	506	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
327505	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	11	32	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
327561	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327599	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10409	1	1172	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
327646	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327650	SIRV5	+	442	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-123	886	-9	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8192	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
327658	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	12	1258	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327673	SIRV2	-	260	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4613	34	3438	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
327716	SIRV2	-	954	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2972	61	1793	-61	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTATTCTATGGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2939	1096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
327725	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327783	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	231	3	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327807	SIRV2	-	280	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4593	34	3418	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
327819	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10534	1	1297	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327820	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
327834	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327887	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
327908	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
327913	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	875	-46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
327957	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
327994	SIRV5	-	379	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCACTTTCAGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
328012	contig_2537_pilon	+	3529	29	Intergenic	novelGene_33408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	127	junction_28	192.807308376175	2230	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	669	3023	232453	297712	FALSE	10	GGTCTCATCTATGTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRMHNNSSPSVSPNTSFTSDGSPSPVGGIKRKAEDSDSEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVLRYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIASLPSDFEKGTKPFKPLEQLMGVFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALLPFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFVLELYKTGSTEPMDVPPELCHGIQGKFSLDEEAVLPDQIVCSPVPLLRDLSQNTAISINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAPVLKPGDWEKSSNGRQWKPQLGFSRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGVYSNAAPPPATYQGSLYRPLLRGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFERGVGAEPLLPWNRMLQTQNAAFQPNQYQLLAGPGGYPPRRDDRGGRQGYPREGRKYPLPPPSGRYNWN	205800	298218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846_239892_241320_241453_245173_245293_249123_249260_250522_250631_250723_250814_251426_251500_258097_258182_259021_259120_259201_259282_266057_266115_278243_278313_278407_278540_280631_280760_290367_290432_295098_295238_297646
328020	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328023	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	2	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328050	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	3	60	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
328071	SIRV6	+	235	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	64	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2815_3106_3165_10724
328100	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	231	3	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328144	SIRV2	+	322	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	275	-74	-275	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTTTGATGTTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
328185	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	230	3	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328190	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	123	11	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328218	SIRV6	+	441	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8846	15	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
328223	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328275	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328474	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328489	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
328548	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
328578	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328614	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
328620	SIRV6	+	422	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	95	18	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328624	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCGGGAATACATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
328655	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
328656	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328682	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4591	35	3416	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
328683	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	246	1481	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27123	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
328697	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	4	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328713	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328766	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
328809	contig_1230_pilon	+	2566	7	Intergenic	novelGene_28852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1171.59373883991	1465	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1612	2325	407256	408754	FALSE	15	TATAGTTGTTTCATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404454	408995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_407352_407588_407788_408003_408237_408568
328810	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
328834	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-173	900	-59	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8142	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
328880	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
328889	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
328914	SIRV6	+	249	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	385	11	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
328931	SIRV6	+	370	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10455	1	1218	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11455	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
328935	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
328998	SIRV6	+	338	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1263	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
329025	SIRV6	+	199	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	498	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11199
329027	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
329057	contig_4364_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532790	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
329083	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
329102	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
329165	SIRV2	-	221	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4648	38	3473	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
329192	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
329212	SIRV6	+	203	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	43	68	-43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
329278	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329289	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
329325	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
329340	SIRV6	+	903	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	583	-1	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
329363	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
329390	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
329418	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	82	503	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
329451	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAACGCGGCGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532865	1533269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
329454	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	228	0	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329502	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
329529	SIRV6	-	203	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCGACTTCGACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031_11109_11205
329532	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
329533	contig_18108_pilon	+	2834	7	Intergenic	novelGene_33473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_3	116.683927294589	2579	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	56	910	226815	260192	FALSE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226759	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
329534	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-44	132	6	38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329545	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329620	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
329623	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-63	875	51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8252	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
329629	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	16	31	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
329653	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
329732	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
329785	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	40	3374	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
329819	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	236	-2	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329835	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
329847	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
329859	contig_4364_pilon	+	192	1	Intergenic	novelGene_4524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533122	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
329863	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
329873	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	2	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
329955	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	5	61	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
329959	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
329989	SIRV6	+	427	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-12	8844	-6	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
330001	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
330064	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
330072	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330141	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330150	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10430	2	1280	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330197	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
330206	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_2325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
330235	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330257	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330315	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330334	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
330365	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16413	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
330379	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9647	589	497	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
330447	SIRV6	+	442	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10306	2	1156	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
330454	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
330465	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	15	1263	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330466	contig_4364_pilon	+	340	3	Intergenic	novelGene_257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	258	81	338	1530895	1531231	FALSE	30	CCACACTTTCTATAACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIW	1530444	1531233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
330510	contig_8317_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_19979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCTCATATCTCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
330531	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	82	501	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
330532	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
330595	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
330609	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	15	1261	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330671	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	230	2	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330672	SIRV6	+	689	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
330683	SIRV6	+	164	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	444	0	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACGCCATTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
330692	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
330713	SIRV2	-	614	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	33	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCTACTGCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
330737	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
330744	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330803	SIRV2	+	320	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-695	-368	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGCTGACCCGTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3338	4089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3374_3664_3828_3967
330817	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
330941	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330948	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	63	515	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
330962	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	131	11	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
330979	SIRV5	+	398	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-68	875	46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8247	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
331002	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331046	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
331053	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
331063	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTTGGTTAGCCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
331078	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331084	SIRV6	+	384	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	133	18	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
331141	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
331192	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
331264	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
331287	SIRV6	+	216	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	392	0	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
331378	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331388	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
331434	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
331476	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331499	SIRV6	+	585	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8710	7	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
331550	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331571	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	9	1256	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
331586	SIRV2	-	383	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4473	51	3298	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
331602	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_9071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
331617	contig_6743_pilon	-	4734	1	Intergenic	novelGene_33547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	945	1334	207475	207086	NA	65	AAAATGAATGAAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVASYAWESWTMNKEDRRIDAFELWCWRRILNIPWTCQKNEQICLGRSTIRMHLRGKDGETSSHVLWTCYQEGPVLEKDIKLGRVSVKKRKTFNEMDWHCGCNSGLKHNKDYGDGVGPGSDSFCFA	208419	203685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_203700_208400
331631	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
331735	contig_4364_pilon	+	1941	6	Intergenic	novelGene_548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
331765	SIRV5	-	474	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	13	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGTGACTACAGTAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
331778	SIRV6	+	237	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	393	15	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
331806	SIRV6	+	396	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	58	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034_11109_11205
331812	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
331818	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
331851	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
331859	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
331876	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	102	22	20	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
331885	SIRV6	+	264	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
332098	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
332121	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
332123	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
332146	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
332189	contig_8538_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_4985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
332258	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842800	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
332352	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	235	4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
332402	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
332461	contig_8538_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_4944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842798	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
332502	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
332539	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
332609	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
332621	SIRV2	-	196	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3689	-1	-1059	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACCCCCATTTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
332679	SIRV6	+	448	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8843	11	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
332696	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
332765	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
332802	contig_12671_pilon	+	3751	8	Intergenic	novelGene_19223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	398.602866143683	1913	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	61	702	197316	212313	FALSE	5	ATGTGCTTTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197255	215362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200256_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286
332853	contig_4364_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_4511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533117	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
332855	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
332884	SIRV6	-	301	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGCAAGAATTTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
332890	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
333094	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
333158	SIRV5	-	324	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACAGATTTCTCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
333183	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
333215	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	9	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
333217	contig_4364_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_4103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
333269	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_19438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAACTTGACCAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
333287	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
333307	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	34	3423	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
333471	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	79	501	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
333502	SIRV5	-	257	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTTCCGACCCAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
333507	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
333585	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
333633	SIRV5	+	393	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
333636	SIRV5	+	388	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-65	882	49	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8250	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
333664	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
333681	SIRV6	+	281	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10541	4	1304	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11541	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
333748	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	5	1168	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
333781	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	492	92	492	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
333796	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
333833	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
333884	SIRV5	+	389	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
333893	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	588	500	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
333898	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-72	266	-72	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
333911	SIRV5	+	307	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	909	-11	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
334026	SIRV6	+	191	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638
334085	contig_8317_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_19615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAAACCTGTGTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
334100	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_4887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTGCACTTTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842780	843089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
334135	contig_8538_pilon	+	292	2	Intergenic	novelGene_4658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841468	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841645_843013
334180	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	17	1253	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334185	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334210	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	77	505	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
334251	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
334316	SIRV6	+	161	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	447	0	-277	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAAGACGCCATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
334323	contig_4364_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_2896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
334332	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334354	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	235	-2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334386	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334402	SIRV6	-	323	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCATTTCTGGTTGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
334473	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	230	-1	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334519	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4583	34	3408	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
334539	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
334564	contig_4364_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_4158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTTCCAGCGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533280	1533071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
334576	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
334610	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	1	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334637	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_1646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
334679	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334775	SIRV6	+	327	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	175	-4	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTTGTGGTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334779	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334821	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
334830	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334865	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
334878	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	229	15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
334967	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
334971	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	225	0	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335014	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
335021	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	94	18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335025	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
335055	SIRV6	+	219	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	385	-2	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
335073	SIRV5	-	362	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
335078	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	90	495	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
335079	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
335183	SIRV6	+	653	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	798	575	-400	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
335198	SIRV5	+	191	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	317	160	203	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8518	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
335206	contig_8317_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_20689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16493	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
335210	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
335293	SIRV6	+	546	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8745	11	46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACGCGTTGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
335319	SIRV6	+	152	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	444	-1	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACGCCATTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
335389	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	130	3	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335408	contig_15449_pilon	+	4722	8	Intergenic	novelGene_33646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2114	2449	129919	130254	TRUE	20	CACAGGGCGTACTGGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMISHFLLDNQPASSSATTSWVAKANHFIFFVILPLPMASLSSANCFTPLEPLKTKLLTVAIQCLKDHTCENAIVIILKYAYPFLISLLTDFVFLGEMRGTCLINHCSHS	127805	162985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_131505_136565_136738_138824_138934_139935_140053_140886_141070_145801_145947_161162_161351_162876
335421	contig_4364_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_2537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCAGCTCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
335480	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335493	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
335549	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
335557	SIRV6	+	163	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	445	0	-275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGACGCCATTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
335564	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_8702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27121	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
335636	contig_4364_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_3384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACTGGGTCCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
335647	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335650	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
335682	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	94	18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335732	SIRV6	+	299	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	187	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335758	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335763	contig_17144_pilon	-	2736	16	Intergenic	novelGene_29547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2122.09083060394	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1040	2470	173384	166363	FALSE	15	CTTAAACTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183270	166096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
335782	SIRV5	-	188	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTAGGGCACCGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
335816	SIRV6	+	160	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	444	-2	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACGCCATTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
335865	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
335875	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
335879	SIRV6	-	337	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
335904	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336004	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532914	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
336043	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336056	SIRV6	+	913	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	582	-4	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
336063	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
336067	SIRV6	+	917	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	578	-4	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
336085	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
336086	contig_7457_pilon	+	4177	29	Intergenic	novelGene_31643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	150.246820741263	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	932	2799	130	2928	1005828	1037059	TRUE	25	TAGTATGAAGGTGTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPTAAHTANFLLNASGSTSTPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQDSVPSPRPLQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSWALVIE	1001549	1041101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1019001_1019771_1019863_1021032_1021063_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036708_1037035_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
336087	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	245	-4	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
336104	contig_4364_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_3841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCGGGAATACATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
336149	SIRV5	+	354	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298
336175	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336176	contig_9345_pilon	-	1744	5	Intergenic	novelGene_24648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1971.40817374282	602	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	248	607	955353	948024	FALSE	20	TAAACTTCCTGTATCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLERHGKQDWCFWVHGVFSKDQRWSEGGF	1001322	946886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948107_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
336183	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	12	1266	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336210	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	239	2	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
336223	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_12331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
336267	SIRV6	+	206	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1527_1640
336274	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336278	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	233	-2	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
336291	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336293	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_19662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
336328	SIRV6	+	237	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10569	20	1332	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11569	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
336391	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
336419	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336449	SIRV6	+	453	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8845	4	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
336458	SIRV6	-	253	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-51	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
336584	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533109	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
336618	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336631	contig_8317_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_20130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336635	SIRV2	-	309	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	38	3385	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
336669	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336674	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336681	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
336684	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
336740	SIRV2	-	233	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4621	53	3446	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
336746	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
336753	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336821	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
336847	SIRV6	+	242	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
336852	SIRV6	+	654	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-399	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
336874	SIRV2	-	297	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4576	34	3401	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
336930	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	2	1474	28164	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
336946	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10519	1	1282	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11519	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
336977	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
336999	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
337090	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
337118	contig_4364_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGCAGTGAACGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532709	1533301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
337124	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
337189	SIRV6	+	262	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1853
337211	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
337296	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
337312	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
337337	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
337343	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
337409	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	84	499	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
337419	contig_4364_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532859	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
337442	SIRV6	+	913	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	33	591	-4	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
337470	contig_8317_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_20082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACACCCACAGCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16777	16430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
337512	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	398	11	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
337517	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
337602	SIRV6	+	697	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	572	-441	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
337618	SIRV6	-	255	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-56	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1876	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
337784	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
337806	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	4	1158	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
337941	contig_15063_pilon	+	1689	7	Intergenic	novelGene_10972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	233	1324	34808	38987	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
337948	SIRV5	+	412	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
338062	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
338129	SIRV6	+	301	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	241	3	10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
338168	SIRV2	-	197	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-1054	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCATTTACATTGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5790
338169	SIRV2	-	256	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	28	664	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGGTAATTGACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
338216	SIRV5	+	277	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	886	42	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
338223	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
338244	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	878	57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
338266	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
338271	contig_8317_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_20058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCAACTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16739	16424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
338284	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338346	SIRV5	-	439	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTAGAGATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
338382	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338486	SIRV6	+	157	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	447	-2	-277	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAAGACGCCATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
338512	contig_5419_pilon	+	3677	7	Intergenic	novelGene_15511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	735	junction_2	319.570936308879	3838	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	177	1385	243802	249830	FALSE	25	CATCACAGACTCCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	243625	252122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
338532	SIRV6	+	272	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1542_1645_1736_1845
338545	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338560	contig_4364_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_1439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
338575	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
338603	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338608	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338622	contig_4364_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_3626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATCAGCTAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
338652	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
338660	contig_8317_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_19786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	574	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
338661	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
338679	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
338734	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
338796	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
338800	SIRV6	+	361	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	137	0	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
338820	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	79	499	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
338830	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	880	-13	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
338874	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
338894	SIRV6	+	202	3	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	501	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11034_11101_11205
338915	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	66	299	842828	843061	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842762	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
338940	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	296	1	65	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
338964	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
339002	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
339038	SIRV5	+	309	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	21	875	21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8336	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
339079	SIRV6	+	415	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	94	-11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339210	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
339214	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
339265	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
339270	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
339309	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
339313	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
339327	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339455	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
339486	SIRV6	-	433	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCGCGATGCCAATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
339512	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
339520	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339543	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	396	2	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
339551	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
339558	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
339573	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
339576	SIRV2	-	412	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2930	725	1751	-725	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGTTAACAAAGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	1760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
339598	contig_8317_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_20619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTCCAGCAGCCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16785	16462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
339630	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339642	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339693	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	55	486	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
339724	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
339752	SIRV5	+	380	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2121_2157_2270_2316_3298
339753	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
339761	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
339796	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	12	1270	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
339836	SIRV6	-	329	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-95	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1915	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
339925	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	15	1256	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
339929	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
339943	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339958	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	182	4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
339982	SIRV6	+	382	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10443	1	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11443	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
339989	SIRV6	+	412	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-10	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
340031	SIRV6	+	491	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCAATCGGTAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470
340088	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
340133	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340160	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16394	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340172	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
340206	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
340288	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
340332	SIRV6	+	248	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	386	11	-216	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATAGTGGACGCCGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
340338	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
340367	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340436	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
340449	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
340455	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340484	SIRV5	+	442	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAAAACAATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1164_2085_2157_2267_2316_3298_3405_3483
340505	contig_8538_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_4860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCAGACAGGGTGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843118	842775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
340567	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340568	SIRV6	+	415	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8846	-2	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
340627	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
340641	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
340644	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	229	0	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340649	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340706	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340711	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
340747	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	131	11	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340780	SIRV6	-	296	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-88	430	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAACCCAATTTCCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1908	1114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
340787	contig_8317_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_19883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATATCTCGAACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
340810	SIRV5	-	267	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCCGACCCAATTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10858
340823	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
340831	SIRV2	-	451	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-2	-339	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAACGACAACGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
340844	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	878	-29	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
340875	SIRV6	+	901	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	49	578	-1	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
340879	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340889	SIRV6	-	382	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCACGAATAGGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
340911	SIRV6	+	222	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	579	486	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
340959	contig_4364_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_2661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCTGTAACCATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533312	1532942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
340973	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
340997	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
341018	SIRV6	-	329	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTTGGTTAGCCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
341033	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
341080	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
341087	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
341090	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341096	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
341160	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	123	11	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341174	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
341194	SIRV2	-	372	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3303	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
341212	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
341263	SIRV6	+	394	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	130	11	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341293	SIRV6	+	241	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	393	11	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
341314	SIRV5	+	504	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	1	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCACGCCGACCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
341382	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
341412	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
341469	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532967	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
341478	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
341537	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	223	-4	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341565	contig_12873_pilon	+	2702	5	Intergenic	novelGene_27167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1320.73748337813	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1376	2131	17632	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15964	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16709_18014_18984_19264_19611_19703_19851
341570	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10541	1	1304	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11541	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
341598	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
341615	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
341657	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	231	2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341683	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
341691	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
341693	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
341770	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
341804	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
341806	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
341811	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	400	3	-230	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACACCACATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
341820	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
341842	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
341930	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532932	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
341979	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342007	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
342031	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
342057	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342069	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342113	SIRV2	+	311	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	321	-109	-321	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACGCAATCGCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
342131	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342189	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342205	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	235	0	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342306	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342405	SIRV6	+	497	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-402	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1883	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
342434	SIRV6	+	411	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	94	-7	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342508	SIRV2	+	242	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-374	-416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACGTCTTCAATGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3659	4041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
342527	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
342529	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
342589	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342603	SIRV6	+	360	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-12	137	1	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342634	contig_8598_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_22898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	7	339	191218	191550	NA	5	CTGTCCTGATTGTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191211	191551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
342663	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
342670	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342688	SIRV2	-	460	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4389	58	3214	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
342696	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	584	500	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
342704	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
342705	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342731	SIRV6	+	213	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-227	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
342762	SIRV6	+	254	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2052	571	34	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
342781	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342787	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	128	11	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGGTATGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
342801	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	-1	2962	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
342815	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342828	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
342861	SIRV2	-	396	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4476	35	3301	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
342916	SIRV6	+	437	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8844	-16	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
342959	SIRV6	+	250	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2056	571	38	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
342997	SIRV2	-	396	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTACTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4798_5786
343059	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	234	4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
343073	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	5	1159	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
343081	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343104	SIRV6	+	286	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	40	1263	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAAGCAGCAGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343176	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	15	1255	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343216	SIRV2	-	564	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1141	2318	-34	325	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGAAAATGTCCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4766	3318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
343223	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343224	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
343255	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343414	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
343416	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
343420	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343455	contig_8538_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_4947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842799	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
343468	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	76	500	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
343515	contig_8538_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_4725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	77	310	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842751	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
343532	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	234	5	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
343549	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
343618	contig_4364_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_1706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
343659	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
343689	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343701	SIRV5	-	260	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCTTCCGACCCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8584_10853
343749	SIRV6	+	204	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	507	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
343791	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
343798	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	242	0	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
343878	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
343882	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
343910	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
343917	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
343989	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
344005	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
344006	SIRV2	+	275	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	322	-74	-322	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGCACGCAATCGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
344031	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	2	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
344092	SIRV6	+	244	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	397	4	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
344101	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
344170	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842788	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
344211	contig_13592_pilon	+	3717	15	Intergenic	novelGene_33709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_7	474.475870873131	162	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	513	1178	256608	260292	TRUE	20	TTTCAAGAAGTCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVY	249305	269607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_260283_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
344233	SIRV6	+	200	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	504	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
344261	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
344300	contig_17796_pilon	+	1994	12	Intergenic	novelGene_33765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_4	210.864180171358	772	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	387	1709	12080	42369	FALSE	40	TAACAAACACATCCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8152	42654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
344336	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
344337	SIRV2	-	386	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3036	-2	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
344342	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344380	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344387	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344395	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	15	1257	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
344466	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344469	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	77	504	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
344471	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
344521	contig_8538_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_4828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
344524	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
344525	SIRV6	+	987	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	247	735	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1098	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
344540	SIRV5	+	407	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7475	1	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
344575	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
344596	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344598	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
344666	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344699	SIRV2	+	332	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	265	-74	-265	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCACTGGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
344715	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	2	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
344784	SIRV2	-	415	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	63	3254	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAGTTATCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
344789	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
344813	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	233	7	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
344821	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
344844	SIRV6	+	392	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	136	7	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
344861	SIRV6	+	496	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-38	8801	5	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
344926	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10321	2	1171	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
344967	SIRV6	+	275	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
345077	SIRV6	+	194	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	502	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11210
345081	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
345122	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
345139	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
345171	SIRV2	+	324	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	273	-74	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
345179	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
345245	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
345283	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	882	4	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
345343	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
345393	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
345403	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTCTGCAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10866
345435	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
345505	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
345516	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
345538	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	ACTGCGTTCTTGTGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
345539	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCTGCACAGACCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533313	1532911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
345543	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
345551	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
345571	SIRV6	+	362	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	171	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGGTGTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
345602	SIRV2	-	629	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4144	23	2965	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
345635	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
345638	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
345668	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	76	508	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
345703	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
345710	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
345779	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	156	138	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
345826	SIRV6	+	446	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	21	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2537	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
345830	contig_8317_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_20687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16492	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
345832	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_19565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTTTTTAAAATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
345833	contig_8317_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_20017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTCTGTCTCATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16719	16416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
345847	contig_4364_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532810	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
345878	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
345879	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCCAGTTCTCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
345886	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
345903	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
345942	SIRV2	-	712	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	5	2318	5	325	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGAAAATGTCCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	3318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
345950	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	886	-12	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
346003	SIRV6	+	272	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10553	1	1316	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11553	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
346015	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346019	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	11	1261	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
346038	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346068	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
346128	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
346142	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
346143	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	94	14	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346162	SIRV2	-	407	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3026	-1	-396	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCATTGAAGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
346173	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
346186	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACAGACCGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
346214	SIRV6	+	431	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8844	-10	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
346243	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
346302	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
346303	SIRV6	+	515	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTATGGCACTTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
346329	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
346382	SIRV6	+	400	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1491	579	62	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
346445	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
346470	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	1	1295	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
346484	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
346487	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_11204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	983	1306	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
346499	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346540	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
346587	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
346616	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346711	SIRV5	+	233	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-241	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGTCTAACATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119
346785	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
346812	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
346875	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
346890	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	88	500	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
346937	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
346970	contig_4364_pilon	+	181	2	Intergenic	novelGene_705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTAGCGGGGGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888
346981	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
347025	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
347040	SIRV6	+	403	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	95	0	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347148	contig_15063_pilon	-	1737	7	Intergenic	novelGene_8870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
347175	SIRV5	-	395	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGAATTTACGGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
347180	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	83	498	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
347224	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	2	59	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
347230	SIRV6	+	450	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-8	-31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTAAGGTTCGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
347298	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
347302	SIRV6	+	394	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	130	11	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347357	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347378	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	233	2	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347439	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
347501	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	5	1261	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
347539	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
347564	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	76	503	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
347608	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
347647	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347674	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10550	1	1313	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
347697	SIRV6	+	240	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	243	2	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
347713	SIRV2	-	355	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1400
347734	contig_7457_pilon	+	1167	4	Intergenic	novelGene_31674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTCCTCGGTGGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174111	1176853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
347747	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	2	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
347761	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
347779	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
347805	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
347896	contig_8317_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_20032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16418	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
347906	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
347922	SIRV2	+	315	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	281	-73	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
347934	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
347987	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
347988	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348066	SIRV6	+	565	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8576	-2	215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACGTCGTGGGACGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
348097	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10470	2	1320	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11557	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
348102	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348112	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348122	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10320	2	1170	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
348138	contig_4364_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_4492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGTAACAGACTTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
348176	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4409	66	3234	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
348192	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
348215	SIRV6	+	203	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	298	44	67	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
348218	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348222	SIRV6	+	342	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	182	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348253	SIRV6	+	443	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8844	15	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
348264	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
348300	SIRV6	+	451	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8843	8	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
348323	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	135	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
348327	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	217	-4	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCTTGCCTAACGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348336	contig_8317_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_19765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCTCGAACAGCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
348359	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	240	-1	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348363	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348427	SIRV6	+	256	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	385	4	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
348452	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
348458	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	135	2	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348506	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	123	15	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348525	contig_4364_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_2235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCATTAATACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
348527	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	15	TATTCTCCTTATACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
348567	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
348616	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348661	contig_8317_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_20488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAATCAGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
348806	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348822	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
348824	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
348874	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	80	499	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
348890	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	5	1277	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
348962	contig_15063_pilon	-	1638	7	Intergenic	novelGene_12037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	908	1231	35891	35108	TRUE	15	CTGGCCCCAGTAGCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39698	27149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
349015	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	224	11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
349031	SIRV6	-	264	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGTTTAGCTTCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
349074	SIRV6	+	203	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	45	66	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
349111	SIRV2	+	304	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	293	-74	-293	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAAACCATACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
349128	contig_8317_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_20061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCAACTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
349132	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
349167	contig_8538_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_5039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842823	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
349194	contig_4364_pilon	+	339	2	Intergenic	novelGene_741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	8	337	1530895	1531303	FALSE	35	TCCCAAGGCCAACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530887	1531305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096
349324	SIRV6	+	201	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	501	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
349355	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
349367	contig_16496_pilon	-	1196	3	Intergenic	novelGene_5149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_950_1288_1354_3413
349400	SIRV6	+	300	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10445	5	1295	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
349498	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	222	2	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
349507	SIRV6	+	274	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
349520	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
349525	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
349559	contig_4364_pilon	+	333	3	Intergenic	novelGene_711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	58	333	1530895	1531249	FALSE	10	GAGCTGCGTGTGGCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530467	1531249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
349569	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
349573	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4606	34	3431	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
349575	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
349601	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
349643	SIRV6	+	738	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	587	591	371	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	59	550	1733	10736	TRUE	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1674	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
349663	SIRV2	+	263	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-65	325	-65	-325	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCAGCACGCAATCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043	1306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
349670	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	392	-2	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
349707	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
349724	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
349735	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
349831	SIRV6	+	688	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	581	-441	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
349853	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	21	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
349866	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
349898	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	86	500	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
349910	SIRV6	+	369	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-18	134	-5	36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGTGCCGCTTGGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	1986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
349932	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
349940	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	42	3409	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
349990	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
350037	SIRV2	-	498	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	1	-301	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGATCGTAGTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
350041	SIRV2	-	307	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	44	3381	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
350211	contig_8538_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_4773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGCCCGTCTTCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843120	842762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
350243	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	222	500	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
350246	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
350261	SIRV5	-	284	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTGTACCTACCTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
350299	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
350312	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
350327	SIRV6	+	425	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	99	11	71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAGCACTAACGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
350370	SIRV5	+	221	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	293	154	179	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8494	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
350441	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2042	587	24	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3129	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
350447	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
350456	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
350468	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
350501	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
350515	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
350539	SIRV6	+	443	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	18	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11101_11205
350585	SIRV6	+	227	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	385	-4	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
350622	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
350639	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
350672	SIRV6	+	261	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845
350742	SIRV6	+	236	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	289	6	58	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
350745	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
350753	contig_8317_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_20456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
350760	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-49	875	-49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
350947	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
350977	SIRV6	+	491	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8790	-16	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAGTCAAGTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
350988	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
351005	SIRV6	+	321	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	180	-3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCTGCTTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351049	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351065	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351098	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10541	1	1304	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11541	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351122	contig_12622_pilon	-	2332	12	Intergenic	novelGene_5937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	2157.05325091263	425	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	89	1492	1590968	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGVTDSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591056	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
351129	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	2	64	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
351140	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
351160	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
351170	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
351192	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	388	-1	-218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTATAGTGGACGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
351264	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
351293	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351302	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351317	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351351	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	35	3080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
351352	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351450	contig_8317_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_19852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
351557	SIRV6	+	240	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	394	11	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
351573	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
351592	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
351607	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10470	2	1320	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11557	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
351638	SIRV2	-	398	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4475	34	3300	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
351653	contig_8317_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_19996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTCTCATATCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
351674	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	0	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351688	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351771	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351801	contig_4364_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532825	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
351826	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
351860	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	137	11	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351888	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351889	SIRV2	-	700	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1	2334	1	309	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
351902	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	246	11	-76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACAAGTCGGTCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
351913	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
351946	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	5	1261	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
351992	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352039	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
352053	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352090	contig_4364_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGGGAGAAGATGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530887	1531315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531100
352094	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
352134	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	87	498	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
352146	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	15	34	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
352161	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
352231	SIRV5	-	346	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCTGCAATCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8584_10853
352352	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352380	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352417	contig_8317_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_19853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
352442	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352447	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352475	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352479	contig_1406_pilon	+	2617	5	Intergenic	novelGene_25581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	3256	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	64	459	2173822	2185260	TRUE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173758	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2187290_2187340
352482	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
352505	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	15	1153	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
352565	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352588	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	34	3259	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
352594	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842784	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
352606	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
352611	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10428	5	1278	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352616	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352635	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
352649	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	77	510	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
352677	SIRV6	+	234	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	305	6	74	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
352680	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352743	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
352809	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	20	1262	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352812	contig_4364_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_1452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCACAGACCGTGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
352861	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
352864	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_10520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
352865	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	246	0	-76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACAAGTCGGTCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
352875	SIRV5	+	404	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7485	2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
352883	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	5	CGAGCTGCGTGTGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
352888	SIRV6	+	346	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10402	2	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352930	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
352950	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	467	2	236	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2752	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
352966	SIRV2	+	622	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-25	-74	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
353075	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
353103	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	7	2968	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
353144	SIRV6	-	433	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCGCGATGCCAATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
353167	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
353202	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
353300	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
353339	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
353391	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
353513	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	4	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
353521	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	405	-2	-235	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGCTTCCACACCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
353578	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3646.33575966644	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	8	1375	28164	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	28156	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
353619	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
353621	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
353676	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10453	5	1303	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11540	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
353699	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
353708	SIRV6	+	440	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10308	2	1158	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
353714	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	4	63	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
353725	SIRV6	-	198	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGACTCGTTCATCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11262	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10820_11035_11111_11205
353781	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	233	-16	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
353820	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
353826	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	10	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
353857	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	11	1154	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
353885	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
353961	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
354002	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
354023	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
354060	SIRV6	+	167	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTGCAAAACGTCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645
354097	SIRV6	-	201	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11234	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11039_11111_11205
354140	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
354160	contig_8538_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_4913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842785	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
354205	SIRV6	+	439	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	2	1159	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
354208	SIRV6	+	144	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	226	510	136	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
354231	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
354247	SIRV6	+	388	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	136	11	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
354256	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
354260	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
354284	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	586	503	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
354348	SIRV5	+	451	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7438	2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATAACTATGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
354382	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
354411	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
354427	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
354430	SIRV2	+	271	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	326	-74	-326	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCAGCACGCAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
354473	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	70	513	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
354493	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_2140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532921	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
354522	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
354540	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
354563	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	242	-16	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
354567	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
354576	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	492	90	492	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
354600	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
354655	contig_8317_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_20167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCTTGATGACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
354694	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
354730	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
354744	contig_8317_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_19826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	568	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATCTCGAACAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
354751	SIRV6	+	292	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1843
354781	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
354812	SIRV6	+	263	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
354839	contig_8317_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_20405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTCCACTGCCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
354852	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7479	-1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
354902	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	62	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
354906	contig_9955_pilon	-	2814	5	Intergenic	novelGene_21278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	229	921	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46948_47151_47737_48794_49380_49692
354928	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	3	61	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
354973	SIRV6	+	240	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	394	11	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
354986	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
354987	contig_4364_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	58	387	1530895	1531303	FALSE	40	AATCCCAAGGCCAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530467	1531303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
355020	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-75	875	39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8240	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
355023	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
355097	SIRV6	-	333	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTTAGCCGAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
355176	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
355182	contig_8317_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_19437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATCAGTACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
355184	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
355187	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
355197	contig_15063_pilon	+	1662	4	Intergenic	novelGene_10460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3454.48696946771	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	699	1520	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_35380_35839_36158_36266
355199	contig_4364_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_2710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532959	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
355210	SIRV6	+	338	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1263	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
355223	contig_4364_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_2430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGCTCTTTGCATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
355255	SIRV5	-	416	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCACACTTCGCACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
355264	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
355293	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
355319	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
355346	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	3	64	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
355391	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
355444	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	576	11	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
355501	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2163_2270_2316_3298_3405_3483
355503	SIRV5	-	382	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCAGTAGGACGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8453_8590_10863
355559	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	15	1153	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
355566	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
355572	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
355603	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	77	504	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
355604	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
355684	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	241	-10	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
355695	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
355696	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
355748	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	1	62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
355752	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	234	-1	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
355858	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
355916	SIRV2	-	308	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4565	34	3390	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
355918	SIRV6	+	397	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1489	584	60	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
355926	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16490	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
355932	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
355947	SIRV6	+	252	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	64	1273	-62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
355967	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	224	0	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356028	SIRV6	+	289	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10536	1	1299	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11536	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356038	SIRV6	+	246	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
356057	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356059	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
356155	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356176	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356208	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356212	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	1	1310	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356215	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
356230	SIRV6	+	375	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	142	18	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356252	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356255	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356259	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
356262	SIRV6	+	999	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	518	11	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
356275	SIRV2	-	447	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4422	38	3247	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
356288	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356301	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
356326	SIRV5	-	460	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCCACCTTCACGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
356329	SIRV6	+	273	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
356335	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356341	contig_8317_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_20131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356392	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	234	15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356414	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356420	SIRV6	+	919	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	403	717	2021	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
356423	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356464	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356480	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	461	5	230	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2746	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
356582	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356621	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
356632	SIRV6	+	442	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10306	2	1156	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356660	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356661	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
356677	SIRV6	+	366	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	117	2	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTATTGTCGGCCTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
356686	contig_8317_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_19658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356697	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
356740	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356746	SIRV5	+	299	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7662	1	-269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAAGTGCTGTTTCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
356770	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	139	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
356787	SIRV5	+	377	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7586	-1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
356822	SIRV5	+	331	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7605	6	-212	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGCGTTATTATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
356862	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356892	contig_8538_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_4881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
356894	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
356928	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356933	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
356934	SIRV5	+	357	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7604	1	-211	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCGTTATTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
356963	SIRV6	+	412	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	8841	-1	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
356971	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10321	2	1171	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
356975	SIRV6	+	348	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10400	2	1250	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
356995	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	2	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
357001	contig_15063_pilon	+	1645	7	Intergenic	novelGene_10411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	237	1277	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36520_38977_39092_39506
357002	SIRV6	+	929	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	562	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
357024	contig_8317_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_20615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
357031	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
357033	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	3	66	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
357042	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357120	contig_17964_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_33850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCTGGTGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135459	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135500
357139	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
357207	contig_19564_pilon	-	1378	4	Intergenic	novelGene_29605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	915.548044737261	27	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	145	522	15529	12201	FALSE	60	AAAAAAAGAAACCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15673	11344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12366_13618_13666_13945_14055_15472
357219	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	920	-19	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCCATGTCGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
357237	SIRV6	+	700	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	569	-441	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
357245	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
357281	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	223	-4	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357289	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
357296	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
357309	SIRV6	+	934	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	11	592	11	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
357318	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_3901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
357321	contig_4364_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAATCTGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532829	1533151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
357322	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533078	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
357336	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	236	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
357350	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357470	contig_8317_pilon	+	324	2	Intergenic	novelGene_19275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	2	322	14294	14907	FALSE	30	GGTTTGTAGATTTAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTS	14292	14909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
357506	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
357511	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	95	2	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357517	SIRV6	+	480	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8804	18	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
357551	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
357652	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
357673	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
357682	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
357687	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
357693	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357712	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357724	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531101
357735	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	81	502	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
357738	SIRV5	+	397	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7476	-1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
357741	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	5	60	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
357791	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
357799	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
357833	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
357841	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	234	-10	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357854	contig_4364_pilon	+	302	2	Intergenic	novelGene_753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGAAAGAAATTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532284	1532668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
357855	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
357856	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	396	-1	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
357862	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	880	-35	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
357893	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
357900	SIRV2	+	369	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1454	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4475_4684_4793_5786
357931	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
357936	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	6	36	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
357945	SIRV6	+	933	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	15	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	243	737	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
357961	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	2	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
357989	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
357998	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842786	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
358024	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358040	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358065	contig_8317_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_19659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358106	SIRV5	-	329	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACCTGGCTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8383_8457_8590_10865
358108	SIRV2	+	275	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	322	-74	-322	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGCACGCAATCGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
358126	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358205	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	97	1	73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358221	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
358224	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
358231	SIRV6	+	240	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	714	12	-441	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
358298	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
358355	SIRV6	+	482	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-24	8801	-18	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
358362	SIRV6	+	258	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	0	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
358426	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
358477	SIRV6	+	279	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10546	1	1309	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
358538	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358568	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358585	contig_4364_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_2531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCAGCTCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533243	1532934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533200
358587	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358635	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358647	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358658	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	118	2	52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTATTGTCGGCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358667	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
358700	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358710	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358736	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
358755	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	73	3386	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGAAGATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
358761	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
358765	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
358790	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	239	4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
358798	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
358814	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACTTCTTCTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11244	10731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10819_11034_11111_11210
358847	contig_4364_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_1591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
358867	SIRV5	+	291	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-264	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTGTTTCGGGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298
358889	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
358936	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
358938	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
359030	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
359048	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
359049	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
359085	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
359279	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	111	17	29	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
359306	contig_567_pilon	-	3219	12	Intergenic	novelGene_33952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	34	junction_11	932.177358714088	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	61	1059	331097	308820	FALSE	15	TATTGACTTTCCCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSLPRPRPPAASGPWIPANMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338244	306659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338185
359317	contig_8317_pilon	+	342	3	Intergenic	novelGene_19288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	2	340	14294	15107	FALSE	5	GATTGTTGCTGCTGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAV	14292	15109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
359337	SIRV5	+	379	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
359372	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
359378	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3041	-1	-411	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
359390	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
359432	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
359476	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
359615	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10350	5	1200	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
359631	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
359645	SIRV6	-	312	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTCCATGACCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
359662	SIRV5	+	393	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7489	1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
359704	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_20425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
359713	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
359731	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
359771	SIRV5	+	344	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7617	1	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGAATAGCGCCAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
359820	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
359824	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
359834	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	226	1461	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
359870	SIRV5	-	390	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAATTTACGGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8460_8590_10863
359894	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
359901	contig_8317_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_19854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
359913	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	240	1	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
359919	SIRV6	+	624	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	854	548	-344	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	61	393	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
359969	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
360027	contig_8317_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_19729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCTCGAACAGCAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
360097	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360099	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	87	496	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
360104	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	240	1478	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
360109	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360123	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
360137	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	2	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360185	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360189	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360254	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360272	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
360275	contig_4364_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_4469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
360313	contig_8317_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_20065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCACAGCAACTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16774	16426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
360356	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360394	contig_233_pilon	-	2860	15	Intergenic	novelGene_14500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	1271.1414222289	3	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	108	2333	126907	78579	FALSE	20	CTCACTGTGGATGTATACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127014	78051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
360429	SIRV5	+	320	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	878	7	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
360463	SIRV6	+	357	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	145	-4	25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCAATCTGTATCGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360532	SIRV6	+	166	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	442	0	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
360543	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	229	3	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
360616	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4605	34	3430	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
360617	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
360618	SIRV5	+	369	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-39	875	-39	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8276	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
360631	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	401	-2	-231	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCACACCACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
360672	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
360683	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
360703	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360704	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
360709	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360803	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
360838	SIRV6	+	939	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1661	-10	232	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2748	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
360843	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360854	SIRV6	+	363	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10461	2	1224	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11461	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360858	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	1	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360870	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360917	SIRV6	+	281	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	15	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
360925	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
360950	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
360992	SIRV5	+	318	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	2	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
361071	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	9	1253	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
361080	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4570	36	3395	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
361087	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	1	63	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
361090	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
361131	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
361154	SIRV6	+	248	4	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	32	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10727_10819_11034_11109_11205
361164	contig_16303_pilon	-	1650	4	Intergenic	novelGene_34114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.156280884762	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	53	556	47976	34697	FALSE	25	TTTGAATTGTGTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYSCSCWQESVHLGLLY	48028	33602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_34746_38776_38856_40433_40731_47897
361199	SIRV7	-	1687	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33021	374	14	-372	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACATTCAAAATAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114902	1377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
361230	contig_8317_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_19698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAACAGCAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
361305	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
361310	SIRV6	+	431	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
361415	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	133	11	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
361426	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532950	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
361480	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
361513	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
361515	SIRV2	-	398	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	9	3029	5	-399	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTTTCATTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
361519	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	38	3238	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
361531	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
361568	SIRV6	+	219	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	389	0	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAGTGGACGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
361581	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
361602	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	71	513	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
361611	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
361615	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	4	1276	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
361617	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	2	66	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
361626	SIRV5	+	396	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-66	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8249	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
361639	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
361645	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
361696	SIRV2	-	239	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4634	34	3459	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
361727	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
361733	contig_3469_pilon	+	1710	16	Intergenic	novelGene_34177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_15	136.247161030566	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	1	1653	427985	474457	FALSE	20	CTCTAACTTGTCAACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASRAIGSLRHFTASRTFRSPGYICRNFTRSSALLARTHINYGVKGNVAVIRINSPNSKVNTLNKELHTELVEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAGCKTSQEVVQISQEGQKIFEKLEKSTKPIVAAISGSCLGGGLELAISCHYRIATKDKKTVLGAPEVLLGILPGAGGTQRLPKMVGIPAAFDMMLTGRNIRADKAKKMGLVDQLVEPLGPGIKPPEERTIEYLEEVAVTFAKGLADKKISAKRDKGLVEKLTSYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKVKAYRTNSFS	427984	474514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464_443604_445564_445685_447278_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_474424
361818	SIRV5	+	337	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-23	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8452_8586_10858
361838	SIRV6	+	168	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	440	0	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGCCATTGCAAAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
361955	contig_15063_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_11780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
361996	SIRV2	-	486	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4374	47	3199	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
362012	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
362034	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
362064	contig_4364_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_3578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
362074	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
362077	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	97	496	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
362213	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
362236	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
362259	SIRV2	-	424	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4446	37	3271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
362296	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_1946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
362354	SIRV6	+	241	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
362364	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7479	-5	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
362397	SIRV6	+	240	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	63	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2740_2815_3106_3165_10724
362473	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	8	56	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
362486	SIRV5	+	432	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7425	6	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTCGGTAAATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
362572	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	238	-2	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
362671	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
362681	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	72	511	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
362703	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
362704	SIRV6	+	779	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	544	-16	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
362723	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
362746	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
362759	SIRV6	+	399	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
362800	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	89	497	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
362801	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
362864	contig_19851_pilon	-	2639	4	Intergenic	novelGene_29827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1789	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGAGCCTCCTCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	53460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53701_53922_55751_55838_55880_56001
362928	SIRV2	-	586	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	67	3079	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
362976	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
362988	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
363009	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	77	504	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
363053	SIRV6	+	435	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	95	5	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363057	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363070	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
363082	SIRV6	+	255	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	61	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
363084	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
363109	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
363116	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533069	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
363129	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
363171	SIRV2	+	654	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	134	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCGTTCTAGGCCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
363180	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
363223	contig_4364_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	77	433	1530895	1531330	FALSE	15	ACCCAGGTGACTGTCGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKM	1530448	1531330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
363247	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
363252	contig_8317_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_20230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
363257	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363275	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363276	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363285	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	123	11	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363309	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363316	SIRV6	+	345	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	188	2	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCACGAGTAGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363333	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9658	577	508	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
363338	SIRV6	+	298	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	48	337	-48	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGTTGCTAAAGTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
363368	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
363390	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363394	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363401	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
363486	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363491	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363533	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363537	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	230	3	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363573	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
363591	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363600	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	18	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
363622	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
363689	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	391	11	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
363715	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	4	1260	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363726	SIRV6	+	432	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	96	7	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363729	SIRV6	+	348	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10400	2	1250	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
363760	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
363763	SIRV6	-	404	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTTCCATGCGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
363768	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
363780	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	886	-17	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
363810	SIRV6	+	194	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	60	529	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
363842	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	241	11	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
363924	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
363928	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10333	2	1183	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11420	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
363949	SIRV2	-	394	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3039	-1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
364028	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364039	SIRV6	+	385	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	1	1203	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
364050	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	236	15	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364091	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
364113	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	15	1160	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
364145	SIRV5	+	352	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-26	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8451_8586_10858
364150	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
364157	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
364182	SIRV6	+	549	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8751	2	40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGTCTAGGACGCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
364207	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
364252	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364256	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	25	1260	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
364266	SIRV6	-	338	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGGTTAGCCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
364319	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	85	501	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
364336	SIRV5	-	344	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACCTGGCTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
364391	contig_8317_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_20661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16479	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
364401	SIRV6	+	425	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	95	15	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364445	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
364471	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
364494	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
364531	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
364538	SIRV6	+	391	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1490	589	61	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
364590	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
364610	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364643	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	94	3	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364653	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
364665	SIRV2	+	339	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	258	-74	-258	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGGGTTAATGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
364679	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	442	11	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
364718	contig_15063_pilon	+	1683	7	Intergenic	novelGene_11629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	230	1321	34808	38987	TRUE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27139	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
364765	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	9	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
364788	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
364791	contig_15063_pilon	+	1694	6	Intergenic	novelGene_13785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	201	1439	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
364797	scaffold_19766_pilon	+	950	4	Intergenic	novelGene_34360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	626	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	185	736	676855	677607	TRUE	20	GCCTGATGAGCAGGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKNVRSPGTRLPPDGKFQRPGRQGKPGGLGASLIELSVPPWLGLQRVREWDEVGATWARVRRAPSCLSIEYILNRDETAVGGRRQGCPGGQCLGLGCGGNGERWPPGELLVVVGHLQGCWAEVVSVDGGVGDVEGGPGGLASRLQDSPLCPGAGVGWQKPRDRPMPLLKQVQEEDTTKEEDP	676670	677938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_677295_677399_677451_677546_677670_677786
364818	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	18	33	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
364861	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	15	1252	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
364910	SIRV5	+	249	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-5	8688	-5	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGAAGGTCGCCGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
364934	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
364965	SIRV6	+	343	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	189	3	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCACGAGTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
364974	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	84	499	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
365024	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
365049	SIRV5	+	443	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAACTATGACACTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
365055	SIRV6	+	267	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	0	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1639_1736_1845
365066	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365114	contig_8317_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_19789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAATCAGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
365174	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
365181	contig_8538_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_5055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATAGTGTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842829	843125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
365214	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
365262	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
365287	contig_15063_pilon	-	1715	7	Intergenic	novelGene_11439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	974	1297	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39764	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
365406	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_4271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACAGTGTTCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
365426	SIRV2	-	202	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3683	-1	-1053	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATTTACATTGCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
365429	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
365439	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
365496	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10317	2	1167	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
365508	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
365540	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365545	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
365565	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
365590	SIRV6	+	244	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	390	11	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
365610	contig_4364_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_3114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAAGGCTCAGATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
365634	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365646	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	886	-10	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
365702	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
365711	SIRV5	+	377	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	887	55	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
365734	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365735	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3668.38635809019	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	229	1467	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27542	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
365761	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365770	SIRV6	+	375	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	99	11	71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAGCACTAACGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
365807	SIRV6	+	270	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
365831	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365890	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
365898	SIRV6	+	261	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1843
365907	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
365939	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_12896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28165	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28191_34606_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
365959	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
365962	SIRV6	+	339	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1262	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
365996	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
366023	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
366040	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	12	1270	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
366115	SIRV6	+	937	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	598	2	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
366116	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
366139	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
366153	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
366163	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10467	5	1317	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11554	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
366184	contig_12622_pilon	-	2303	13	Intergenic	novelGene_5990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_7	2158.3792466159	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	18	1262	1590968	1587661	TRUE	30	GATTCTCTAACCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGVLDLYQGGPQRWASLVFHHLELRPRQEVGLLPGPRIQPVPCGGARVRSRAGLRSHVGAGGTHVPHVPLHRGAPPA	1590985	1583563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1587971_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
366219	SIRV6	+	456	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1443	571	14	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2530	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
366231	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
366246	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_12944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28169	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
366286	SIRV2	-	291	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	638	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGACGTTTCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4094	3659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969
366335	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	875	40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
366336	contig_3386_pilon	-	4424	6	Intergenic	novelGene_34499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_5	630.228339572254	4581	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	108	602	409604	404912	FALSE	20	GTTGATTTGTCATTTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	412201	401089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
366410	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
366452	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
366462	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
366469	contig_4364_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_4502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533115	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
366493	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
366531	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
366546	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	11	1266	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
366550	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
366567	SIRV5	-	245	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTTCTTCCGACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
366587	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
366650	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
366669	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
366691	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
366700	SIRV5	+	336	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	31	7595	11	-202	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTGGTCCCACCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
366775	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
366868	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
366888	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
366904	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
366915	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842767	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
366921	SIRV5	+	359	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7586	-2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
366934	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCTGCACAGACCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
366971	SIRV6	+	435	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	95	5	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367022	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	78	500	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
367043	SIRV5	+	267	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	920	18	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCCATGTCGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
367057	SIRV2	-	331	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	35	3366	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
367058	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	95	-15	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367064	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
367101	SIRV6	+	938	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	575	15	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
367135	SIRV6	+	443	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10305	2	1155	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
367140	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367181	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTCTTTCAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
367188	contig_8317_pilon	+	325	2	Intergenic	novelGene_19276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	GTTTGTAGATTTAATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
367194	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
367208	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10425	5	1275	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367230	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
367307	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367334	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	18	875	18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8333	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
367349	SIRV6	+	240	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	243	2	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367360	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367364	SIRV5	+	312	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	909	-16	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
367379	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-12	104	1	66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAGCACTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	2016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367400	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	1	1277	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367417	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	85	501	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
367419	SIRV6	+	273	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
367481	SIRV6	+	242	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	392	11	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
367516	SIRV6	+	397	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	62	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
367529	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367555	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
367565	SIRV5	+	367	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-37	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8278	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
367576	SIRV6	+	460	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8830	12	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTGCCAACTAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
367585	contig_10134_pilon	-	3392	3	Intergenic	novelGene_16227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	536	1358	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_35178_38558_38817_39584
367587	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
367640	SIRV6	+	538	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCGTCTAGGACGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
367655	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367665	SIRV2	-	434	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	45	3253	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
367684	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8719	11	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAAGGTGAGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
367697	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
367774	SIRV6	+	314	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	187	-3	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367800	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
367801	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	GCGTGTGGCCCCCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
367851	SIRV2	-	247	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4267	393	3092	-358	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGGCATTAACCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	1393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1600
367886	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
367894	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	15	1262	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
367904	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
367962	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	394	3	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
368063	contig_4364_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_2541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCAGCTCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
368085	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368097	SIRV6	+	1491	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
368102	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
368129	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
368143	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
368181	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
368190	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
368203	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533089	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
368233	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
368243	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1	8530	1	261	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTCTTACAAATGTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
368281	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
368283	contig_8317_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_20726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16509	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
368289	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533051	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
368309	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
368323	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
368359	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842769	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
368372	SIRV2	-	178	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4695	34	3520	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
368399	contig_8317_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_20694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16496	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
368468	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	576	11	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
368516	contig_4364_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_3615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATCAGCTAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
368524	SIRV5	-	419	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACTTCGCACGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
368529	contig_4364_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532853	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
368541	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368548	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	274	-70	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
368569	contig_4364_pilon	+	408	3	Intergenic	novelGene_525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	76	408	1530895	1531306	FALSE	40	CCCAAGGCCAACAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530449	1531306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
368574	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	78	501	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
368647	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368652	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
368662	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368672	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	5	1257	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
368683	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
368684	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	249	46	18	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
368704	SIRV6	+	245	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	64	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
368718	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	215	0	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCCTAACGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
368778	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
368785	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
368805	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
368840	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368843	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533090	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
368895	SIRV2	-	435	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	57	2944	41	-314	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATACACAGTGGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	3979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
368922	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
368942	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
368967	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
368970	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	81	501	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
369004	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533031	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
369018	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369081	SIRV6	+	428	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8844	-7	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
369229	contig_4364_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_3208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533028	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
369258	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
369287	SIRV6	+	165	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	443	0	-273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACGCCATTGCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
369326	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
369341	SIRV6	+	791	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	546	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
369389	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369411	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369428	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369440	contig_5538_pilon	+	2252	15	Intergenic	novelGene_23693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_12	243.296367521136	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	205	2250	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44356	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44481_44780_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
369451	contig_15063_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_8676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	26	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27115	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
369472	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
369570	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
369581	SIRV6	+	230	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	313	2	82	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2598	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
369678	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
369689	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
369696	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
369736	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
369770	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	15	1266	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369771	SIRV5	+	425	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-4	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAATCTAACATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2294_3280_3405_3483
369777	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
369781	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
369843	SIRV2	-	446	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4427	34	3252	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
369849	SIRV5	+	408	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
369851	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
369867	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533078	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
369881	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370015	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370021	SIRV5	-	315	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
370039	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370088	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
370094	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
370156	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	15	32	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
370164	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
370178	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
370189	SIRV5	-	231	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCATAAACTGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8596_10868
370194	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
370214	contig_8317_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_20030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTTTAATGAGAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16418	16782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370310	SIRV2	+	285	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	308	-70	-308	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGATACGCAGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
370334	contig_13740_pilon	-	3173	9	Intergenic	novelGene_34607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3825.24442846467	5	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	141	629	165243	161045	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165383	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919_162031_165237
370370	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370386	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	229	-15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370402	SIRV6	+	400	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1489	581	60	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
370427	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	15	1267	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
370428	SIRV6	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGGTTAGCCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
370432	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	229	-2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370442	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	310	-74	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
370470	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAGAAATAAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
370496	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370507	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370540	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370574	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370608	SIRV5	+	438	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-108	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
370649	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370652	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
370670	SIRV6	+	366	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	136	-4	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370674	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
370694	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_9077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
370710	SIRV6	+	385	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	1	1203	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
370741	SIRV2	+	234	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	362	-73	-362	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATTTGAGTGCGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
370752	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
370801	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
370811	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
370882	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
370899	contig_8538_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_4974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842809	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
370966	SIRV6	+	195	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	503	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10805_11024_11109_11205
370980	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_20057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16423	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
370982	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
371025	contig_8317_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_20062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCAACTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
371032	contig_12873_pilon	+	2528	5	Intergenic	novelGene_27165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_1	1003.98369010657	411	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1457	1948	17896	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15961	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
371050	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
371063	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	34	3088	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
371090	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
371118	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
371123	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
371138	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	653	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16413	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
371186	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
371206	contig_4364_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_3608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATCAGCTAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533306	1533051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
371209	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371221	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	229	15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371247	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	97	-2	73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371259	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10320	2	1170	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
371281	SIRV5	+	431	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-101	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
371286	SIRV2	-	286	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	34	3412	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
371296	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371352	SIRV2	-	246	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4627	34	3452	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
371366	SIRV6	+	279	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	4	1306	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
371384	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	5	1265	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
371387	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371394	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371489	SIRV2	+	660	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	140	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGGCCTACGTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
371526	contig_4364_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_3385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACTGGGTCCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
371558	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
371559	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	235	3	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371569	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
371595	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	13	1485	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28151	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
371630	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
371644	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
371669	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371775	SIRV2	-	618	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
371790	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	235	0	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371805	SIRV6	+	605	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACGTCGTGGGACGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1639_1736_1845_2027_2470_2621_2740
371827	SIRV5	-	312	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCAAAGTACATATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
371878	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
371955	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372045	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	581	11	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
372061	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	390	-1	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
372137	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
372160	SIRV6	+	162	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	446	0	-276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAAGACGCCATTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
372163	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
372175	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
372178	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
372209	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	231	3	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
372293	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372306	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
372334	SIRV2	-	287	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4569	51	3394	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
372338	SIRV6	+	349	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10399	2	1249	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372393	SIRV6	+	501	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	759	539	-396	4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGTAATAGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1889	10792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
372412	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
372414	SIRV6	+	191	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	86	506	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
372432	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
372445	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531285	FALSE	20	CTGACGGAGGCGCCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVL	1530444	1531285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531093
372468	contig_8317_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_19855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATATCTCGAACAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16799	16405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
372474	contig_4364_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_1096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGGTGAAGCAGACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
372516	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	12	1272	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372517	contig_12923_pilon	-	3291	17	Intergenic	novelGene_30095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	320.39496499438	6	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	91	2205	93727	48997	TRUE	20	TTTTTATGAGGTTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101258	45345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93637_93693_93733_101173
372524	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
372533	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	2	64	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
372542	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
372558	SIRV5	+	315	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	886	4	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
372559	SIRV6	+	484	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2484
372575	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
372594	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
372627	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	4	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372628	SIRV6	+	244	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	390	11	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
372685	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372688	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
372692	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	12	34	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
372781	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
372900	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
372915	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	5	59	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
372931	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
372939	SIRV6	+	199	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	498	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11114_11210
372952	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
372994	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
373050	contig_8317_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_20123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGACCAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
373072	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
373098	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
373110	SIRV6	+	458	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2030_2470
373118	contig_15063_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_12406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	40	AATCACAATGGTAGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
373122	SIRV6	+	436	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	8817	-1	-26	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTCGTCTTGAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
373136	contig_4364_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_2653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532940	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
373141	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
373145	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
373185	SIRV6	+	411	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10414	1	1177	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11414	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
373219	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
373220	SIRV6	+	569	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
373226	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
373254	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
373269	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	232	3	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373300	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
373309	SIRV5	-	450	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCAGTTCTCCACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
373320	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
373347	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	228	-15	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373356	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	212	-4	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTAACGTTTCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373465	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	224	-4	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373506	SIRV5	+	262	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	154	138	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
373533	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
373543	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_20020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16416	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
373556	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	2	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
373600	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373618	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532880	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
373634	SIRV5	+	416	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7458	-2	-65	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
373635	SIRV5	+	295	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-282	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACTGGCAAAAGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
373681	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	38	3388	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
373696	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_19719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTTTTAAAATCAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
373700	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
373718	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
373744	contig_11285_pilon	+	2746	11	Intergenic	novelGene_5597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	497.646752224909	2209	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1674	2423	768710	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763523	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
373770	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
373772	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
373822	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
373831	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
373867	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
373877	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
373897	SIRV2	-	252	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	398	3082	-363	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCAGCAGGCATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1600
373924	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	224	-16	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373932	SIRV6	+	557	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1389	524	4	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	93	302	2569	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2476	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
373962	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	242	11	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
373969	SIRV6	+	205	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	583	499	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
374019	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
374040	SIRV2	-	415	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	80	3237	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
374046	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
374075	contig_4364_pilon	+	535	4	Intergenic	novelGene_638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	72	533	1530895	1531717	FALSE	20	TGGCGACGGTGTCACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMD	1530453	1531719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
374078	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842799	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
374084	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	887	-24	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
374112	contig_4364_pilon	-	158	1	Intergenic	novelGene_4553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATGCAACTCAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533200_1533300
374130	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374180	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
374182	SIRV5	+	419	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
374234	SIRV6	+	415	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8846	-2	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
374258	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
374261	contig_15063_pilon	+	1611	6	Intergenic	novelGene_12618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3667.21665572134	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	5	1384	28164	39538	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	28159	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
374338	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
374394	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374405	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
374477	contig_8317_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_20722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16505	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
374485	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4600	34	3425	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
374512	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
374536	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
374548	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	390	0	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
374628	SIRV6	+	419	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	94	-15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374671	SIRV6	+	444	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8846	12	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
374683	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
374690	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
374711	contig_8317_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_20714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16502	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
374724	contig_8317_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_20681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16489	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
374738	contig_8317_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_20010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTCTGTCTCATATCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
374744	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374753	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374758	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
374762	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
374779	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
374850	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
374863	SIRV5	+	398	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-68	875	46	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8247	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
374882	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	16	875	16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8331	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
374920	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	67	516	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
374936	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
374989	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	10	33	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
374991	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375015	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	5	1162	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
375023	contig_8538_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_4999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
375061	SIRV2	+	317	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	277	-71	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
375092	SIRV6	+	245	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	395	5	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
375190	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10455	5	1305	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375296	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	94	8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
375299	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375343	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375356	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7487	2	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
375357	contig_233_pilon	-	2473	15	Intergenic	novelGene_14597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1379.11565127506	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	87	1973	126907	78640	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQGVQAIREGEAQVPVEQ	126993	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79024_92191_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
375361	SIRV2	-	408	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4465	34	3290	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1442	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
375371	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
375390	SIRV6	+	375	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	126	-3	44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTATGGCTATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
375444	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	880	-24	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
375451	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
375466	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
375469	contig_17427_pilon	-	2481	14	Intergenic	novelGene_30322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1128.60638260817	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	44	1468	188879	178046	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204686	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177362_177445_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
375523	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
375543	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10527	1	1290	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11527	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375571	SIRV6	+	948	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	576	4	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
375608	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
375675	contig_15063_pilon	+	1676	6	Intergenic	novelGene_13956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_1	3798.72333291068	9	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	198	1421	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
375684	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
375685	SIRV5	+	452	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7419	1	-26	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAAATTCACCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
375745	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375775	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
375789	SIRV2	+	431	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	166	-74	-166	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTATGCTATAAATACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
375805	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	137	-1	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
375847	SIRV2	-	232	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4641	34	3466	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
375867	SIRV5	+	378	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2153_2270_2316_3298
375878	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375901	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
375920	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
375926	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	129	5	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTTGGTATGGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376026	SIRV2	-	404	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4442	61	3267	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
376029	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
376037	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
376056	SIRV6	+	416	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	15	64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATGCAAGCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
376072	SIRV6	+	650	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	795	581	-403	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	120	452	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1882	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
376075	SIRV6	+	166	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	442	0	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
376091	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
376092	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	232	15	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376103	SIRV5	+	361	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-34	878	-34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8281	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
376123	SIRV5	-	480	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10864
376157	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376198	contig_8538_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_5096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842901	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
376255	contig_4364_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_3553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
376265	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	1	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
376316	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
376342	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
376352	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
376386	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	136	2	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376394	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
376411	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
376418	contig_8538_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_4726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	77	310	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842751	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
376443	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
376462	SIRV5	+	221	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	20	8691	11	-100	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTAGCGAAGGTCGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	2298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
376467	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376482	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	244	0	-74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGTCGGTCGCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376500	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	590	499	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
376510	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
376512	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
376513	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376537	contig_8317_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_20442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTCCACTGCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
376552	SIRV6	+	362	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	140	-4	30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTGTATCGTGCCGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376574	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376601	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
376612	SIRV2	-	555	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3108	403	1929	-403	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTAGCCAAGAAGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2803	1438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
376624	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	532	18	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
376678	SIRV5	+	381	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7485	-2	-92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
376696	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_10206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
376713	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	5	1274	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
376729	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
376730	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
376820	SIRV6	+	421	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	96	18	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
376835	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
376913	SIRV6	+	468	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8804	-7	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
376966	SIRV6	+	483	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2023_2470
377005	SIRV6	+	407	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	8843	2	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
377031	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
377032	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7476	-5	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
377038	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
377072	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
377083	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
377093	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
377138	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
377160	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
377166	contig_4364_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_4513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533118	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
377193	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	4	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
377399	SIRV6	+	463	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10362	1	1125	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11362	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
377441	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	79	499	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
377529	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	226	3	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
377534	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
377593	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
377594	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	231	3	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
377617	SIRV6	+	952	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	565	11	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
377620	contig_8153_pilon	-	4209	8	Intergenic	novelGene_34797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	817	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48644	26579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_27259_29108_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001_38169_39359_39488_46171
377634	SIRV6	+	445	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
377663	SIRV6	+	196	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	515	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10827_11037_11109_11205
377770	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	37	1258	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
377783	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
377787	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
377809	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	79	504	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
377827	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTCGGTGAAGCAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
377854	contig_8317_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_19656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
377874	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
377904	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_2529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
377974	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
377996	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
378022	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	225	-2	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
378075	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
378079	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
378131	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842771	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
378166	SIRV2	-	643	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	0	2974	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
378204	contig_8317_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_20390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTCCACTGCCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
378243	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378262	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	15	1254	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378411	scaffold_12124_pilon	+	3040	11	Intergenic	novelGene_22265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3243.94140668416	3	114	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1092	1871	1508626	1509405	FALSE	55	GTACAATAAATTTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1510574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506638_1506687_1508010_1508158_1508215
378427	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533056	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
378435	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9644	595	494	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10731	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
378449	SIRV6	+	235	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	18	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106
378542	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
378622	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378645	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
378650	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378678	contig_5189_pilon	-	2351	11	Intergenic	novelGene_34837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
378705	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
378715	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378745	SIRV6	+	765	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	546	-4	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
378767	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
378806	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
378848	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
378858	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
378940	SIRV6	+	193	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	89	501	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
378970	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
379008	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379017	SIRV6	+	400	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
379103	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_9074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
379107	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	1	1276	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
379141	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379217	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
379221	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379273	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
379314	contig_16496_pilon	-	1485	2	Intergenic	novelGene_5128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3545	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
379338	SIRV2	-	500	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	6	2930	2	-300	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5905	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
379354	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379359	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	94	3	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379373	contig_2834_pilon	+	2066	6	Intergenic	novelGene_27978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_1	2002.52746298272	4235	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	86	661	274763	290707	FALSE	50	AAAAAAATCCTTTACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238723	292112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
379396	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16394	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379437	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	8	1483	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
379464	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379504	contig_8538_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_4708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	83	316	842828	843061	NA	25	CCCAAATAGTGTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842745	843125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
379509	contig_3386_pilon	-	3677	7	Intergenic	novelGene_34500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	763.78400087983	4444	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	578	1204	406716	404773	FALSE	35	TTGAAGAAAAACTGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412205	402299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407838_409398_409607_412096
379514	SIRV6	+	297	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
379541	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
379551	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
379564	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	228	-2	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379572	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_19925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
379577	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
379582	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379597	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	12	1487	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
379601	contig_8317_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_19426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16394	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379602	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	412	15	-242	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTCAAAGACGCTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
379623	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	231	-2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379641	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	85	498	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
379668	SIRV2	-	1018	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2970	-1	1791	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2941	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
379697	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379773	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379774	SIRV6	+	443	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-27	8843	16	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
379786	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
379796	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533085	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
379797	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379804	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	229	15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
379817	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
379831	contig_8317_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_20680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16489	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
379873	SIRV6	+	205	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	581	501	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
379921	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	3	66	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
379960	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
379991	SIRV6	+	277	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
380028	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380049	contig_6102_pilon	+	3971	31	Intergenic	novelGene_31876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	529.14077101992	1	106	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	20	2593	370803	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSLEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370783	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379738_379985_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393757_393856_393929_394036_394221_394272_394467
380094	contig_4364_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_2885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
380146	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
380149	SIRV6	+	159	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	444	-1	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACGCCATTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
380186	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
380201	SIRV6	+	449	7	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	193	-23	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
380202	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	247	-10	-77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCACAAGTCGGTCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380209	SIRV6	+	343	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	180	12	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCTGCTTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	1940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380219	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	235	-1	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380331	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380378	SIRV6	+	853	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	52	729	2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
380400	contig_8317_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_20078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACCCACAGCAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
380435	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	2	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
380446	contig_4364_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532813	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
380463	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
380489	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	2	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380496	SIRV6	+	657	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	798	571	-400	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
380519	SIRV6	+	747	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	585	12	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
380530	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380541	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
380562	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380565	SIRV2	-	394	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3039	-1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
380586	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	224	11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380637	contig_8581_pilon	+	3430	17	Intergenic	novelGene_22817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1532	1933	319207	326088	TRUE	10	GTCGGAGCGCGGGGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTVSLTTATTSRSTHRIQAFLLAGKGEREAQRHSGAFDPHVVQEVGDAGNDMVKQLFPSALHDLDGNGIDLVVHFHCSPFPTTDFHQQDTEIRSSKIEGQEVTILRPIRSAPDKGGQHLDSGLLMRRLLQP	306339	386065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_307245_308912_309147_312483_312636_314546_314736_319155_319252_323305_323432_324016_324166_326006_326310_327805_328044_329828_329981_339262_339448_339552_339653_340260_340357_344624_344749_353027_353177_366651_366814_385995
380689	SIRV6	+	341	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
380709	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380742	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_2316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
380757	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
380761	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
380763	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
380764	SIRV6	+	360	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
380777	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	240	15	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380786	SIRV2	-	444	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1140	53	-23	-53	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGGATTTAGACCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4755	3718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
380791	SIRV6	+	159	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	222	499	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
380817	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380825	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10451	2	1301	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380849	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
380852	SIRV6	+	571	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8710	-16	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
380856	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	651	47	651	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4081	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
380879	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	75	486	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
380899	SIRV6	+	470	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	8794	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTATCTGCAGTCAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	2537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
380924	SIRV6	+	786	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	555	3	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
380960	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	229	-2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
380978	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
381026	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	50	3225	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
381028	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAAACCTGTGTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	16792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381073	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
381086	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
381115	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381124	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	5	1265	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
381126	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
381156	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381270	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	86	499	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
381303	SIRV6	+	418	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845
381330	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
381342	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7473	1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
381352	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381353	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	385	-1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
381358	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381365	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
381370	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
381373	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381380	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	9	58	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
381384	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
381482	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	240	11	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
381489	contig_15063_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_12894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	971	1294	35891	35108	TRUE	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36159_36273_36597_38972_39090_39504
381525	contig_8377_pilon	+	2604	10	Intergenic	novelGene_35138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2724.9154704298	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	328	1452	185763	197939	FALSE	25	TACAGTTTTCATTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	182895	199091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_183052_183262_183363_185691_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
381538	SIRV2	+	269	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	328	-74	-328	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACCACCAGCACGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
381550	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	239	0	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
381575	SIRV5	-	257	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
381662	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
381667	SIRV6	+	276	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-10	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
381682	contig_8317_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_20059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCAACTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16748	16424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
381766	SIRV2	-	398	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4475	34	3300	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
381785	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381811	contig_15063_pilon	-	1725	7	Intergenic	novelGene_9657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
381817	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
381872	contig_8317_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_20704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16499	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
381896	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	87	506	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
381897	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	15	1255	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
381977	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
381996	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
382003	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1	1476	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
382011	contig_8317_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_19271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10612	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	10	342	14294	15097	FALSE	30	AGCTGGTATCTCCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQVC	14284	15139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14915_15092
382075	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
382083	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
382084	SIRV2	+	623	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-26	-74	26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCTGGAGGATATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
382127	contig_8317_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_20272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCCACTGCCTTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
382144	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10535	1	1298	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11535	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
382145	SIRV6	+	287	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1847
382161	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842812	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
382181	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	5	1254	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
382198	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	241	3	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
382253	contig_8598_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_22903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	CTGTCCTGATTGTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
382254	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
382276	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	1	68	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
382310	contig_3956_pilon	+	2306	11	Intergenic	novelGene_14967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1358.74808555523	2	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	81	941	1281682	1288915	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTGGQEPRRPAQAGGGPEAPGQVGPHGAVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284706_1287456_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289851_1290233
382383	SIRV5	+	266	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	150	138	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCGCCAAAAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
382401	SIRV6	+	553	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	903	570	-295	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	12	344	2002	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1990	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
382435	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
382441	contig_8317_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_20033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16418	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
382518	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	232	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
382528	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_12461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
382573	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_11002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	985	1308	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
382618	contig_4364_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	72	356	1530895	1531258	FALSE	15	GTGGCCCCCGAGGAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELR	1530453	1531258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
382620	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACTGGCTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
382631	SIRV5	+	395	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
382638	SIRV6	+	132	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	579	3	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTAATTTGGGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
382656	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	1	62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
382659	SIRV6	+	397	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
382694	SIRV6	+	249	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	385	11	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
382703	contig_4364_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_2635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
382712	SIRV6	-	338	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCGAATTTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
382729	SIRV6	+	242	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	241	2	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
382737	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
382764	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	9	1258	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
382812	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
382832	SIRV2	-	459	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	50	3223	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
382840	SIRV6	+	983	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	21	524	-16	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	237	728	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1108	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
382950	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
382993	contig_18081_pilon	-	3726	9	Intergenic	novelGene_23843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	252.921801156009	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	19	1017	485227	430068	TRUE	55	ATAAACATATAAAGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSGLAMAAAPLKVCIVGSGNWGSAVAKIIGNNVKKLQKFASTVKMWVFEETVNGRKLTDIINNDHENVKYLPGHKLPDNVIAVSNLNEAVQDADLLVFVIPHQFIRRICDEITGRVSEKALGITLIKGIDEGPDGLKLVSDIIREKMSIDISVLMGANIASEVAAEKFCESTIGSKVMENGLLFKELLQTPNFRITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQDHSRTGGRDAEWTETPGSSNFCRSVPHPQAEGTDGQVSAVYCRVSDLL	485245	427189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_427929_428097_430107_434819_434927_435608_435844_448204_448318_454649_454789_456513_456655_465890_466069_485180
383028	contig_4364_pilon	+	284	2	Intergenic	novelGene_749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTGCCACCCCTGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532214	1532580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
383098	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	880	40	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
383109	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	249	3	-79	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGCACAAGTCGGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
383145	SIRV2	-	478	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-326	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTGTGATCTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	3991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
383185	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
383193	contig_8598_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_22901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	2	328	191218	191544	NA	5	TTGTGCTGTCCTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQA	191216	191546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191500
383198	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
383214	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16457	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
383216	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	4	66	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
383224	SIRV5	+	297	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7671	2	-278	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCAAAAGCCTAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
383232	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383238	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	184	2	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGAGTAGCCTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
383252	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	149	0	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGTCCAATCTGTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
383257	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
383297	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
383335	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	15	1263	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383346	SIRV6	+	302	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	239	4	8	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2524	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
383365	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
383395	SIRV6	+	203	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	43	68	-43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
383443	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10457	2	1307	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11544	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383465	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383498	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
383499	contig_12790_pilon	+	2873	9	Intergenic	novelGene_35230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_8	205.263854587212	130	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	207	959	307252	311112	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKVKPLPTWPHF	305937	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_312035_312348
383558	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
383586	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
383608	contig_8538_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_4765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCCCGTCTTCCAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843105	842761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
383641	SIRV6	+	276	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10472	2	1322	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11559	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
383677	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
383686	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383707	contig_4364_pilon	+	506	4	Intergenic	novelGene_412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	80	505	1530895	1531681	FALSE	15	ATGCCTCTGGCCGTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSL	1530445	1531682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
383734	SIRV6	+	400	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1494	576	65	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
383754	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	234	7	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
383783	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
383804	SIRV6	-	200	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTTTTTCCAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11234	10726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
383817	SIRV6	+	600	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	853	573	-345	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	62	394	2002	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1940	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
383852	contig_5727_pilon	+	3134	18	Intergenic	novelGene_7962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	971.609829561051	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	268	2373	173359	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	171962	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_172033_172647_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
383983	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384035	SIRV6	+	454	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8846	2	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
384040	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384052	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384064	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	234	0	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384098	SIRV6	-	337	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGTTGGTTAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
384169	SIRV6	+	266	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	15	1308	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
384175	contig_1443_pilon	-	2942	11	Intergenic	novelGene_28307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	419.737251146476	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1522	2406	776388	748649	FALSE	40	ATAGTGTAATAGTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809521	748112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_787303_787358_804491_805718_808694_808741_809399
384181	SIRV6	+	249	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1645
384188	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	240	-4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384247	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-37	135	13	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384266	SIRV6	-	392	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTCTCTTTCTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
384280	SIRV6	+	810	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
384289	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384347	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
384364	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	83	500	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
384389	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4264	34	3089	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
384401	SIRV6	+	915	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	580	-4	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
384414	SIRV5	+	385	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7481	-2	-88	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
384468	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384508	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384530	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_8502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	253	1488	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26343	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
384540	SIRV6	-	336	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAGCCGAATTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
384553	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	388	0	-218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTATAGTGGACGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
384556	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
384571	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384628	contig_8317_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_20261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTAAAACAAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
384629	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	893	-41	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
384636	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	75	508	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
384652	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384675	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_8657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26559	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
384688	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384706	SIRV5	+	498	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-171	878	-57	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	35	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8144	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
384712	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
384734	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
384754	contig_8317_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_20040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAACTGTCTGTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
384789	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
384798	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCTTCTTTTTCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11246	10728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10819_11034_11111_11215
384820	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
384834	SIRV6	-	305	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCAAGAATTTTCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
385006	SIRV2	+	308	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	283	-68	-283	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTATTTGACTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
385017	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
385026	SIRV2	-	258	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	643	47	643	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
385031	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
385057	contig_15063_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_9654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	240	1382	34808	39538	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27129	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
385060	contig_4364_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_2734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532969	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
385073	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	239	3	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385087	SIRV6	+	135	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	579	0	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTAATTTGGGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
385147	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	78	504	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
385160	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
385166	contig_8538_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_4882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
385192	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
385204	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842776	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
385283	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
385304	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298_3405_3483
385325	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
385345	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	875	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
385351	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
385412	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	12	1155	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
385507	SIRV6	+	348	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	173	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGTGGTGTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	1947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385512	SIRV5	-	353	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGCAATCTCTCTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
385570	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385575	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	231	2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385583	contig_4364_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_2682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532948	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
385620	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
385635	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
385659	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_20686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16492	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
385675	SIRV6	-	310	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTTTCCATGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
385684	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	9	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27541	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
385706	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
385709	SIRV6	+	162	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	446	0	-276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAAGACGCCATTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
385735	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
385783	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
385789	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
385805	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
385876	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	97	11	73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385882	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
385909	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	95	-1	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
385950	SIRV6	+	307	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	1	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
386010	contig_15063_pilon	+	1662	6	Intergenic	novelGene_14091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	190	1425	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34618	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
386022	SIRV5	-	339	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTTGACCTGGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
386089	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
386105	SIRV6	+	201	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	304	40	73	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
386143	SIRV6	+	383	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	4	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
386162	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_2317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTTTGCATTAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
386202	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
386222	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	5	1267	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
386226	contig_4364_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACACCTCGGCGACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
386232	contig_4364_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_3466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
386265	contig_15449_pilon	+	4980	12	Intergenic	novelGene_33574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	846	junction_1	476.966897685367	94	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	2299	3666	44312	51340	FALSE	30	AAATAGCTGGAGGAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGKI	27790	52654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_36986_38069_43216_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106
386297	contig_4364_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	59	421	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530466	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
386318	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
386354	contig_4364_pilon	+	324	3	Intergenic	novelGene_710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	267	58	324	1530895	1531240	FALSE	20	TTCTATAACGAGCTGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHT	1530467	1531240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
386362	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
386367	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
386444	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
386459	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
386463	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
386491	SIRV6	+	752	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	581	11	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
386506	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
386547	contig_5419_pilon	+	3939	10	Intergenic	novelGene_15493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	499.8206591949	360	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	157	1647	238919	249830	FALSE	25	CATCACAGACTCCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREKVTASLVFAISIATIGSFQFGYNTGVINAPELIIRDFLNYTLDMRLDELPSAMLLTSLWSVSVAVFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGSRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238762	252122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240675_241836_241998_243788_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
386558	SIRV6	-	391	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTCTCTTTCTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
386584	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
386626	SIRV5	+	384	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-54	875	-54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8261	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
386708	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
386718	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
386731	SIRV6	+	726	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	576	-1	-33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGTTGTTCAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
386824	SIRV6	+	347	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	186	2	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCACGAGTAGCCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
386830	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
386844	SIRV5	+	400	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
386852	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_1163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532895	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
386879	SIRV5	+	311	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	12	882	12	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8327	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
386892	contig_8317_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_20067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16426	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
386903	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
386915	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
386938	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
386957	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
387023	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
387026	contig_18163_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_35310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2828.66285646691	168	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	6	860	11553	9401	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTQTGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAQTLRVNLGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11558	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10375_10616_10994_11226_11489
387066	contig_4364_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532844	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
387069	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	236	2	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387070	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	283	11	52	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
387084	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
387146	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
387191	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10461	2	1311	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387212	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387214	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	589	502	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
387228	SIRV6	+	457	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	72	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAATTGGCGATGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2588	11309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2833_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
387250	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7468	-5	-75	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
387297	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387318	contig_8045_pilon	+	2979	3	Intergenic	novelGene_35376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_1	581	27	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACACTTGAGTTCAGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116049	119415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_118243_118527
387327	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
387371	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387410	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
387460	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	4	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387465	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387490	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	877	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
387506	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387551	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
387552	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387557	SIRV5	+	354	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3271
387623	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387630	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	15	1257	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387651	SIRV6	+	385	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	139	11	31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTATCGTGCCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387686	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387708	SIRV6	+	935	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	404	736	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
387715	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
387721	SIRV2	-	304	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	58	3370	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
387756	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
387760	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387769	SIRV6	+	436	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	94	5	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
387777	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
387790	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532884	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
387818	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
387820	contig_8317_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_19272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	4	351	14294	15116	FALSE	10	TGCTGGTGTTGGTGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIV	14290	15118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
387831	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
387880	SIRV2	+	250	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-347	-381	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTTCAAATGGGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3686	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
387882	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
387883	SIRV6	-	438	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATGCCAATTACTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
387894	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
387911	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	460	5	229	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2745	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
387948	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	83	504	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
387951	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	3	7482	3	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
387955	contig_233_pilon	-	2556	17	Intergenic	novelGene_14659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1337.06303609815	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	87	2249	126907	78579	FALSE	25	GTTAGGTGTCTGATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92182_92340_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
387986	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
388001	SIRV6	+	904	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	46	578	3	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	212	703	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1133	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
388034	SIRV2	-	261	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	39	648	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
388041	SIRV6	+	961	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	565	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
388049	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388068	SIRV6	-	402	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTTCTTCTTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11833	11431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
388111	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
388118	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
388141	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	94	18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388234	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388246	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	235	-3	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388253	SIRV6	+	184	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	66	7651	66	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
388258	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
388297	contig_5033_pilon	-	2579	15	Intergenic	novelGene_29006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_1	3291.93377276726	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	31	1605	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566817	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531367_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
388339	SIRV6	+	695	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	8167	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
388351	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	11	1272	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388358	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
388400	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
388462	SIRV6	+	370	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	139	-11	31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTATCGTGCCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388484	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388487	SIRV5	+	394	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7477	1	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
388504	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	238	0	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388530	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
388541	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	5	1259	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388544	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	15	1270	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388548	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388622	SIRV6	+	457	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1434	579	5	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2521	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
388640	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
388667	contig_4364_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_3351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
388702	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
388708	contig_4364_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_3455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAACTGGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1533039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
388765	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842780	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
388772	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	268	-66	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
388778	SIRV2	-	244	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	643	61	643	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTGCACGACGACGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
388781	SIRV2	-	433	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4436	38	3261	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
388805	SIRV5	-	445	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGCCAGTTCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
388812	contig_8317_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_20105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGATGACACCCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16796	16435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
388815	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAACCTGTGTCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16397	16793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
388844	SIRV6	+	426	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	816	557	-339	-14	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1946	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
388855	SIRV6	+	913	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
388869	contig_8598_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_22915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTGATTGTTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191299	191552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191300_191600
388879	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388892	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533047	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
388893	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	123	11	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
388897	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
388922	SIRV6	+	263	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
388942	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
388973	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
389001	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
389003	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	585	500	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
389008	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	88	496	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
389132	SIRV2	-	415	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2945	707	1766	-707	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCCCAAATTGTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2966	1742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
389146	contig_5981_pilon	+	2749	8	Intergenic	novelGene_35499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_6	255.779959643249	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	249	935	25511	34744	TRUE	30	AAATTATTTTTTGTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGESRC	23508	38413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_35758_37612
389175	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
389188	SIRV5	-	400	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1096	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3502	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
389233	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
389267	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
389302	SIRV2	+	301	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	296	-74	-296	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATGCTAAACCATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
389349	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
389358	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
389410	SIRV5	+	451	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7438	2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATAACTATGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
389483	SIRV6	+	1233	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	793	0	-405	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	122	454	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1880	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
389484	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
389491	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
389498	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
389548	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
389559	SIRV6	-	319	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACCATTTCTGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
389582	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
389586	SIRV2	-	603	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	53	3076	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
389594	SIRV6	+	426	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
389625	contig_8317_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_20553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
389633	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
389646	SIRV2	-	367	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4498	42	3323	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
389655	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
389695	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_19720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
389725	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
389753	SIRV6	+	983	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	186	518	1673	2560	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1099	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
389765	SIRV6	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTTGGTTAGCCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
389823	contig_8538_pilon	+	303	2	Intergenic	novelGene_4652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841230	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841379_842974
389876	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
389903	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	49	3410	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
390022	SIRV6	+	278	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTAACGTTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1177_1468_1535_1640_1736_1845
390057	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
390065	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
390077	SIRV6	+	239	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	12	63	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
390081	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
390134	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
390150	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
390160	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
390184	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390186	SIRV5	+	358	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7598	-5	-205	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTATTTGGTCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
390251	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	1	66	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
390258	SIRV6	+	393	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10432	1	1195	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11432	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
390354	SIRV6	+	247	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	393	5	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
390382	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390471	SIRV6	+	252	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	63	1274	-61	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGATTTAGTCGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390486	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	6	59	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
390492	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
390519	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
390529	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	85	501	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
390591	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
390639	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390683	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
390733	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390781	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	78	505	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
390853	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
390871	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_1482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGTGTGTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
390882	SIRV6	+	571	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	400	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	12	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
390886	contig_8045_pilon	+	2419	4	Intergenic	novelGene_35377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	583.850627776965	1344	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116049	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075_118243_118527
390897	contig_8317_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_20098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATGACACCCACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
390903	SIRV6	+	492	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8799	11	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
390920	contig_8317_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_20035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16419	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
390976	SIRV6	+	750	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
390982	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	1	1268	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
390989	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
390996	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	78	505	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
391011	SIRV6	+	249	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2059	569	41	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3146	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
391017	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9658	579	508	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
391046	contig_6497_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_35657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860488	859924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_859900_860500
391047	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	396	11	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
391093	contig_4364_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_3051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGCTCAGATTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
391109	contig_4364_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532808	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
391133	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
391261	SIRV5	-	388	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTTACGGTGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8453_8590_10863
391277	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
391316	SIRV6	+	555	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8710	0	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
391325	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
391328	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	76	499	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
391344	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
391352	contig_4364_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	20	TATAACGAGCTGCGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
391360	SIRV5	-	352	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
391381	SIRV6	+	296	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1630_1736_1845
391398	contig_4604_pilon	+	3753	20	Intergenic	novelGene_19143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1332.99190065139	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	1437	2639	367291	379856	TRUE	30	CACCACTAGCACCCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	348360	381088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_348679_358979_359179_360197_360312_360707_360801_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367136_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_380041_380158
391442	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	251	46	20	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2536	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
391467	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
391479	SIRV6	+	450	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGCTAAAGTGCCAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
391492	SIRV6	+	308	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	233	4	2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2518	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
391510	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
391569	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
391586	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_12943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28169	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
391593	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
391607	SIRV5	+	396	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2146_2264_2316_3298_3405_3483
391627	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	15	1269	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
391640	SIRV6	+	270	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10555	1	1318	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
391672	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
391688	contig_4364_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_4256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACAGTGTTCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
391745	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_19448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
391754	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	15	1250	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
391767	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
391769	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
391787	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
391847	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_20528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
391848	SIRV6	+	943	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
391851	SIRV6	+	269	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-10	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856
391863	SIRV6	+	517	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
391871	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
391903	SIRV5	+	407	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-77	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8238	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
391923	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
391929	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
391937	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
391940	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
391953	SIRV6	+	398	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1493	579	64	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
391957	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
391987	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
391995	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
391999	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
392109	SIRV6	+	383	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	137	15	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392153	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
392160	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	104	-4	66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAGCACTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392181	contig_8317_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_20457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
392225	SIRV6	+	156	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	222	502	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
392226	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
392256	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
392277	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392283	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
392299	SIRV6	+	1004	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	520	4	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
392315	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	875	-19	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
392340	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
392375	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
392376	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
392395	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
392396	SIRV6	+	581	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	8718	3	73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAAGGTGAGTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
392432	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
392441	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
392463	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	393	0	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
392484	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	10	1485	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
392511	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
392534	contig_12357_pilon	+	2117	12	Intergenic	novelGene_6092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	782.47034110613	3578	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	392	1432	30281	53235	FALSE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26118_27488_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
392600	SIRV6	+	383	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	4	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
392603	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	35	3072	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
392607	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392643	SIRV6	+	233	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	385	-10	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
392660	SIRV6	-	201	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCGACTTCGACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	10762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11106_11201
392668	contig_5023_pilon	+	3286	16	Intergenic	novelGene_7231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2041.54939418298	1	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	1091	1966	625679	646990	FALSE	10	TCTGTAGATGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580842	648310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618664_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
392697	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
392711	SIRV6	+	505	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1394	571	9	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
392752	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	37	3393	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
392772	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	586	500	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
392792	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
392808	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
392815	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	242	1	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392826	contig_4364_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532792	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
392839	SIRV5	+	328	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
392870	SIRV5	+	445	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTAAATTCACCACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
392878	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
392896	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_12211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	224	1459	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27547	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
392906	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
392915	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
392959	SIRV6	+	926	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	584	18	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
393001	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
393009	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393042	SIRV6	+	160	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	448	0	-278	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAACAAGACGCCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
393076	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
393078	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
393103	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393104	SIRV6	+	395	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	125	15	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
393132	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393133	SIRV6	+	413	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
393146	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
393200	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393279	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	385	-1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
393298	contig_8317_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_19422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16393	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393325	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
393337	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	886	-5	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
393341	SIRV6	+	254	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	66	1269	-64	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATGGATTTAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393350	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393396	contig_5640_pilon	+	3630	17	Intergenic	novelGene_27273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	216.996390738994	18	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	711	1718	951005	955989	FALSE	20	CTCTAATTTGAGCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQNFDSKRRITVRNLRIREDIAKYLRNLDPNSAYYDPKTRAMRENPYANAGKNPDEVSYAGDNFVRYTGDTISMAQTQLFAWEAYDKGSEVHLQADPTKLELLYKSFKVKKEDFKEQQKESILEKYGGQEHLDAPPAELLLAQTEDYVEYSRHGTVIKGQERAVACSKYEEDVKINNHTHIWGSYWKEGRWGYKCCHSFVKYSYCTGEAGKEIANAEECIPSDVTGEESMKKPQTLMEMHQEKLKEEKKKKKKKKHRKSSSDSDGEEKREKLKKALNAEEARLLHVKEIMQIDERKRPYNSIYETREPTEEEMEAYRMKRQRPDDPMASFLGQ	942223	957901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_942245_945857_946044_946911_947066_947410_947492_947857_947889_947959_948023_949186_949256_950704_950753_950947_951080_951342_951441_951611_951680_951814_951955_952838_953001_954372_954478_954630_954703_954816_954925_955809
393436	SIRV6	+	648	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	844	534	-354	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	71	403	2002	10736	TRUE	30	TTGTTGGTAACAATGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1931	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
393441	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
393498	SIRV6	+	204	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	302	39	71	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
393511	contig_4364_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_2517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCAGCTCTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
393535	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
393549	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	88	497	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
393560	contig_8538_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_4938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842793	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
393572	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393613	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
393665	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
393674	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
393686	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393706	SIRV6	+	513	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	5	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAAGTCGTAGTCGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
393723	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
393724	SIRV5	+	195	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	-6	363	2	-363	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCCACGGTCGTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
393727	SIRV6	+	436	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
393749	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	4	1293	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393755	SIRV5	+	217	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	300	151	186	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8501	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
393778	SIRV6	+	436	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8845	-16	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
393867	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
393885	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
393893	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393954	SIRV6	+	432	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	103	0	67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATGCAAGCACTAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
393958	SIRV6	+	248	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10525	53	1288	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11525	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
393994	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394045	contig_8538_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_4740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
394054	SIRV6	+	547	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	898	581	-300	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	17	349	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1985	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
394072	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16464	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
394089	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10461	2	1311	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394104	SIRV6	-	387	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATAGGTCTCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
394159	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	237	-2	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
394177	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-60	263	-60	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
394185	contig_8317_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_20005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTCTCATATCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
394191	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
394209	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
394256	contig_5023_pilon	+	2436	16	Intergenic	novelGene_7209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2041.01657024141	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	88	1425	607279	631518	TRUE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRETAL	580841	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630270_631503_631550_639072_639197_643413_643539_646857
394266	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
394284	contig_4364_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532827	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
394321	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
394329	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	10	33	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
394342	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394347	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394384	contig_8317_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_20656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGACCTTGCCAGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
394435	SIRV6	+	439	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTATCTGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
394455	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
394456	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
394461	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
394471	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394483	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
394511	SIRV2	+	402	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-341	23	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCTTGACCTTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3692	4480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340
394519	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-147	875	-33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
394520	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
394606	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
394614	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_12975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28176	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
394615	contig_12357_pilon	+	2136	12	Intergenic	novelGene_6102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	778.607784860021	4353	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	117	1247	26079	51186	TRUE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSAV	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46545_51178_51239_52759_52844_53169
394639	contig_4364_pilon	+	494	4	Intergenic	novelGene_542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	76	492	1530895	1531672	FALSE	5	GTCTCTGTATGCCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAV	1530449	1531674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
394641	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
394650	contig_15063_pilon	+	1653	8	Intergenic	novelGene_11922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3646.68247891708	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36404_36466_36600_38975_39092_39506
394680	contig_8317_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_20599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16457	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
394866	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
394887	SIRV6	-	385	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAATAGGTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
394898	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	112	20	30	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3135	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
394903	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
394919	SIRV6	+	159	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	222	499	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
394969	SIRV2	+	286	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	310	-73	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
394996	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
395029	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395036	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	11	1155	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
395070	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	2	1277	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395080	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395081	SIRV5	+	402	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7480	1	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
395090	SIRV6	+	437	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2027_2470
395094	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395095	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	227	-16	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395229	contig_8598_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_22907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	TGTCCTGATTGTTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
395265	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
395269	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_1094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532891	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
395338	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395367	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395369	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395372	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	247	1482	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27122	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
395406	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_2512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTGTTAAGGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
395418	SIRV6	+	390	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	130	15	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395424	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395470	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395471	SIRV6	+	163	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	440	-1	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGCCATTGCAAAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
395513	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395535	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395539	SIRV6	+	245	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	385	15	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
395546	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10413	1	1176	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
395547	SIRV6	+	106	2	ISM	SIRV6A	SIRV611	454	3	164	271	164	-271	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGCCATTGCAAAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640
395559	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
395571	contig_4364_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_1109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532892	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
395594	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	4	1294	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
395648	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395656	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
395664	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
395677	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	880	-56	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
395713	SIRV7	-	2436	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	19	7	14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	69	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCGTAATTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147904	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
395732	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_4417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533091	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
395798	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
395801	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
395821	SIRV6	+	950	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	567	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
395894	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	235	4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395908	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	133	15	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395925	SIRV6	+	253	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	38	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10727_10819_11031_11109_11205
395941	SIRV6	+	440	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10305	5	1155	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
395953	contig_8317_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_19790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAATCAGTACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
395964	SIRV6	+	406	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	96	-4	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
395984	SIRV6	-	299	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGCAAGAATTTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
395990	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
396065	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
396101	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	390	-2	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
396130	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532896	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
396132	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
396151	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
396156	SIRV5	-	364	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1152	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTTGCAGTATGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1150_1982_2034_2119_2157_2270_2316_3298
396203	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	240	-2	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
396225	SIRV6	+	147	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	502	16	-236	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTAGGTAGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	10772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
396260	contig_17936_pilon	+	2308	11	Intergenic	novelGene_29930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	725.524748027247	5141	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	45	1109	50646	114788	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLLLPEMGKGGWRNLWNVSGGNFHQIGTIQKAVELT	50601	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114679_114934_118635_118827_121017_121063_125766
396301	SIRV6	+	394	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	68	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
396313	SIRV6	+	273	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10549	4	1312	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11549	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
396357	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
396494	SIRV6	+	655	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-406	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
396498	SIRV6	+	648	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-405	-31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	125	378	122	499	2002	10780	TRUE	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPEVRIIDERVEVEVVQQES	1880	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
396543	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	281	17	50	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
396548	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
396631	SIRV6	+	530	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	715	554	-440	-11	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1845	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
396662	contig_8538_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_4723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	77	310	842828	843061	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842751	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
396674	SIRV6	+	953	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	574	1	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
396676	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
396761	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
396776	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
396782	SIRV6	+	267	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1844
396806	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	229	2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
396847	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
396865	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
396881	contig_12923_pilon	-	3179	17	Intergenic	novelGene_30097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.39496499438	29	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	62	2233	93727	48997	TRUE	25	AATTTTTATGAGGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101229	45347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45685_45822_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
396901	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
396922	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
397037	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
397038	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
397118	SIRV6	-	240	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGACCGACCATTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11252	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10818_11031_11109_11205
397140	SIRV6	+	502	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2480
397227	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	5	1262	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
397248	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	230	3	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
397335	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10316	5	1166	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
397438	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
397531	SIRV2	-	448	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	10	-330	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACGTCATTGTGATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5885	3995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
397567	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
397571	contig_8317_pilon	+	369	3	Intergenic	novelGene_19290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	2	367	14294	15134	FALSE	30	TGAAGCTGGTATCTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGE	14292	15136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
397587	SIRV5	+	357	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7611	2	-218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCGCCAACAGCGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
397600	contig_8317_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_20071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCCACAGCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16776	16428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
397647	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
397666	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
397668	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
397705	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	2	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
397738	SIRV5	+	233	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	279	156	165	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8480	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
397752	SIRV5	+	238	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-4	8698	-4	-107	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGACTATTTAGCGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	2291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
397788	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
397821	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
397823	SIRV5	+	186	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	331	151	217	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8532	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
397837	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_19718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTTTTTAAAATCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
397903	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
397920	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	70	486	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
397933	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	228	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
397941	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	122	11	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
397964	SIRV6	+	689	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	580	-441	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
397967	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
397985	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
398114	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
398154	SIRV6	+	277	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
398173	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842828	843061	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842757	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
398188	SIRV6	+	380	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	515	-39	342	39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCGTCTAGGACGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
398203	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	64	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
398231	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	15	1155	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
398241	SIRV5	+	476	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-146	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8169	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
398261	SIRV6	-	395	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTTCTTCTTGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
398295	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAAAACAAAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
398335	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	2	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398339	SIRV6	-	244	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10817_11031_11109_11205
398355	SIRV6	+	201	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	507	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
398434	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10314	2	1164	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
398449	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
398459	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398490	SIRV6	+	389	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	135	11	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
398500	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	2	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
398520	SIRV6	+	486	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8805	11	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
398521	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	1	60	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
398541	SIRV6	+	264	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
398552	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	83	503	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
398586	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
398611	contig_8317_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_19964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCTCATATCTCGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
398614	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_3239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGAACATTAGGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
398648	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	5	222	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
398656	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398696	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
398700	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10533	1	1296	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398741	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	2	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398747	contig_8317_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_19913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAATCAGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
398770	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
398776	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
398818	SIRV2	-	460	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4413	34	3238	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
398858	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
398919	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
398956	SIRV6	+	199	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	502	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11208
398973	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_12198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDCGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27541	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34611_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
399035	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399065	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
399066	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	16	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
399072	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399123	SIRV6	+	274	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
399168	contig_4364_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_3601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCAGCTAAGAAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1533050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
399204	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399205	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399244	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	225	0	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399302	contig_15063_pilon	+	1678	7	Intergenic	novelGene_8751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	10	CTGCTTTGTGGTGTAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27124	39713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
399316	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
399495	SIRV2	-	251	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	667	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4065	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
399513	SIRV6	+	291	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
399524	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
399538	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399540	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399546	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
399585	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399590	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399606	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399620	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	116	15	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399629	SIRV6	+	738	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-9	572	-3	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTTCAACAAGAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	10759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
399637	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	4	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
399644	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399676	SIRV6	+	656	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-397	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	114	449	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1888	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
399692	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
399696	SIRV6	-	296	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTGACGCAAGAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
399763	SIRV3	+	176	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5169	1650	3110	-533	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTAAATGACGATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7113	7289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7100_7300
399788	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399799	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
399804	SIRV5	-	477	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACTACAGTAAGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
399806	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533090	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
399814	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	88	490	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
399822	SIRV5	+	350	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7618	2	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCGAATAGCGCCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
399902	contig_8317_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_19515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
399914	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
399917	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
399992	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	90	495	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
400006	SIRV6	+	353	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	181	1	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTAGCCTGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400029	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
400037	SIRV6	+	449	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
400044	contig_8317_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_20636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCTCCAGCAGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
400046	contig_8317_pilon	+	263	2	Intergenic	novelGene_19262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTGGAAATTTGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14257	14813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
400081	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	279	19	48	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGAGTTAGGTAGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	10769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
400083	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10446	2	1296	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400120	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400194	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_19721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
400221	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400268	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
400270	SIRV6	+	503	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1394	573	9	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
400288	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
400306	SIRV6	+	242	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	241	2	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400333	SIRV6	-	392	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTCTCTTTCTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
400417	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400423	contig_6898_pilon	+	2955	6	Intergenic	novelGene_35726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2678.3643814836	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	158	898	122646	125646	FALSE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWPPSPSCVYCVPSAARQLPAKLCQLCRFIHHHAQDGECQGALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59569	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59693_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
400425	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16436	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
400461	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400533	contig_8317_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_20048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCAACTGTCTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
400536	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
400544	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	575	-14	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
400574	SIRV6	+	184	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	66	7651	66	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
400606	SIRV6	+	400	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	95	3	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400613	SIRV6	+	904	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	58	566	8	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	200	691	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1145	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
400628	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400675	SIRV5	-	470	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACGGGTGACTACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
400728	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400731	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
400750	SIRV5	+	455	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-125	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8190	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
400832	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10345	9	1195	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11432	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
400842	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
400874	SIRV5	+	370	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7598	2	-205	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTATTTGGTCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
400892	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	127	11	43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400908	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
400924	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
400958	SIRV6	-	428	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGGCGCGCGATGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
400986	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401064	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
401068	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	45	1260	-43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTACTAAGCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401097	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401100	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
401109	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16435	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401210	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	461	4	230	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2746	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
401247	SIRV6	+	497	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
401276	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	200	1438	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
401281	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401293	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	3	56	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
401328	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401438	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401465	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	229	162	-59	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
401474	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	226	3	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401486	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401524	SIRV6	+	1518	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	-13	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
401525	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	225	-16	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401563	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
401568	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401577	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401580	SIRV6	+	191	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	593	503	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
401581	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	9	1263	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401586	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	40	3391	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
401601	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	7	1479	28164	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
401644	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401651	contig_4364_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_4436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533095	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
401684	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	228	0	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401696	SIRV6	+	669	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-33	8503	10	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
401711	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	4	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
401747	SIRV6	+	195	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	499	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11104_11205
401759	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAACCTGTGTCTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401760	contig_8317_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_19847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATATCTCGAACAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
401765	contig_4364_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_4528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACTCAAGGCAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
401778	SIRV2	-	582	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1107	2334	-68	309	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTCAGCGCTAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4800	3334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
401798	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTTCAATAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
401799	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401816	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
401847	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401897	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
401903	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
401908	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401937	contig_8317_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_19663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
401948	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
401975	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
402000	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
402019	contig_8538_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_4715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	80	313	842828	843061	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842748	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
402139	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402143	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402159	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402170	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402188	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	286	11	55	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
402203	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
402207	SIRV2	-	373	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4496	38	3321	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
402220	contig_15063_pilon	+	1693	7	Intergenic	novelGene_10941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	45	TGAAATAAATGTGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
402265	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	9	1263	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402299	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402303	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402316	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10475	1	1238	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11475	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402343	SIRV6	+	643	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	797	586	-401	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	118	450	2002	10736	TRUE	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1884	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
402353	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	76	309	842828	843061	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842752	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
402368	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402391	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	12	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
402424	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	20	1270	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402440	contig_4364_pilon	+	388	3	Intergenic	novelGene_717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
402487	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
402490	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402533	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
402541	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	133	0	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402562	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
402567	contig_5791_pilon	+	3365	5	Intergenic	novelGene_35827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_4	706.160215531858	708	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	182	787	999654	1042396	FALSE	25	CTCCATCTGAGAGTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLRTRFPRPIWSFGGQAREGSRVRRKGTRSGRREFGEATLSCRHLGSGLTRPPRPALGTMRLGARGVWAALLLGALQVLALLGTAVDSSGSAESTSQNSSVGQQNSGANSSGNPQQVLSSDKNPSCNNTVKLSTTAVSSVSSNVSVTTSKPKVTSHTSAITTSTTVKPAPNRTSISQSTSQMLTSTMTTTHNSSVTSASSSVTTSINFKENKGSKFDTGSFVGGIVLTLGVLSILYIGCKTYYSRRGIRYRTIDEHDAII	999472	1044974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_999754_1003677_1003735_1036750_1037027_1038176_1038325_1042371
402578	SIRV6	+	734	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	589	-16	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
402587	SIRV6	+	726	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8167	11	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
402599	contig_5538_pilon	+	1797	13	Intergenic	novelGene_23694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	348.654666380487	2618	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1668	128	1795	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44733	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_224909_258887
402643	SIRV6	+	987	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	537	4	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
402691	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
402720	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	5	1159	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
402723	SIRV6	+	257	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
402783	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
402808	SIRV6	+	608	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-339	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1946	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2617_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
402826	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402841	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
402888	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402952	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	98	4	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
402996	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403016	SIRV6	+	167	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	441	0	-271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGCCATTGCAAAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
403030	SIRV2	+	532	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-688	310	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAACTAAACTCGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3345	4767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3379_3673_3835_3971_4082_4331_4479_4686
403031	SIRV6	+	442	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8845	15	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
403034	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
403036	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAAAACAAAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
403043	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532945	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
403055	contig_4754_pilon	+	3719	14	Intergenic	novelGene_35945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_13	117.301967073404	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	2079	3311	409328	420387	FALSE	50	ACAGAGAAATAAAGGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380049	420795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
403056	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	23	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403070	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_10519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403087	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403090	contig_4364_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_4363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533084	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
403141	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
403147	SIRV2	-	316	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1818	2341	643	302	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTCTCTTGCTCAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
403156	SIRV6	+	686	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	583	-441	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
403166	SIRV6	+	231	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	66	486	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
403169	SIRV6	+	259	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
403188	SIRV6	+	165	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	443	0	-273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACGCCATTGCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
403219	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	227	-1	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
403270	SIRV2	+	416	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	181	-74	-181	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTTTTTTACACTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
403328	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
403354	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
403365	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
403373	contig_8317_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_20228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAATCAGTACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
403404	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	230	2	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
403438	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403445	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
403479	contig_8317_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16498	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
403497	SIRV6	+	646	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	800	580	-398	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	115	447	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1887	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
403512	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
403541	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4590	34	3415	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
403570	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403595	SIRV6	+	426	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_1845
403610	contig_4364_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCGTGAAACTGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532214	1532646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
403651	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	240	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
403656	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
403793	SIRV6	+	495	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	756	548	-399	-5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
403839	contig_6980_pilon	+	3070	4	Intergenic	novelGene_36068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1400	junction_1	420.842277132683	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	554	1090	364894	370691	TRUE	20	ACTGTTACTGTGTCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKVKNRTSALFCQFYFRK	364340	373884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_365032_368206_368383_370468_371523_372735
403858	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
403885	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
403904	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCGGGAATACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
403944	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	231	-15	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
403957	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
403988	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
404026	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
404036	SIRV6	+	223	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	385	0	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
404041	SIRV5	+	382	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3280_3405_3483
404059	contig_8317_pilon	+	330	2	Intergenic	novelGene_19284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14442_14730
404073	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8845	11	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
404100	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404119	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404143	SIRV6	-	389	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATAGGTCTCTTTCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
404189	SIRV6	+	705	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	564	-441	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
404214	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404250	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
404279	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	380	3080	-345	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTGATAGAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1400_1700
404282	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	128	11	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGGTATGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
404305	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	388	0	-218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTATAGTGGACGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
404402	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404420	SIRV6	+	367	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	59	1163	-57	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTAGTCGATTATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
404449	contig_5954_pilon	-	2770	7	Intergenic	novelGene_28785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	360	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	103	813	1462068	1392942	FALSE	55	GAAAAATTACTAATGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462170	1390984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
404465	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404469	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	127	11	43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
404477	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_20016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGAAACCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404486	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
404519	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	234	-1	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
404531	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
404540	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404564	contig_8317_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_19723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404571	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
404579	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404581	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	3	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
404592	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404611	SIRV5	+	406	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	882	31	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
404618	SIRV6	+	913	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	3	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	21	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	1673	2560	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGDNCGPYGLHYAGTPRVNRSKAKLLDKQLCVTVKQGAQVDTERQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1133	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1541_1645_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
404624	SIRV6	+	266	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10559	1	1322	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11559	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
404638	contig_4364_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_2680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGAAATTCTGTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
404640	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
404666	SIRV5	-	318	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATTTGACCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10967	8305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8453_8590_10857
404691	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_1948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
404719	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
404723	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404756	SIRV5	+	549	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-230	886	-116	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8085	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
404803	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404814	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	7	38	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
404847	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
404858	contig_4364_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_1315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGACCGTGAGGTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
404876	SIRV6	+	937	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	15	585	15	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
404906	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
404913	SIRV6	+	909	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	577	-1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
404933	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_8712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	247	1449	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27122	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35872_36158_36266_36600_38975_39092_39506
404969	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	77	505	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
404985	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
405014	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	85	496	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
405113	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	220	-4	-50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGTCTTGCCTAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405119	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405150	SIRV2	-	569	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	80	3083	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
405197	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405207	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405234	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
405261	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	9	1260	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
405268	contig_8317_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_20089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
405280	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-46	878	-46	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
405339	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
405350	contig_17936_pilon	+	2209	11	Intergenic	novelGene_29899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	5938	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	67	1350	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50579	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
405358	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7587	-1	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
405382	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
405399	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_5009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842815	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
405453	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	164	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
405471	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
405519	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405529	contig_4364_pilon	-	171	1	Intergenic	novelGene_4542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGACTTAAATCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
405544	contig_8317_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_20023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTCTGTCTCATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
405617	SIRV6	-	322	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATTTCTGGTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
405641	contig_3469_pilon	-	3508	6	Intergenic	novelGene_34210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1543	junction_5	396.726807765747	1858	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	488	1090	659538	545916	FALSE	5	GCTGTGTGGTTTGGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC	660025	543497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_546000_550259_550362_550975_551066_565792_565932_590930_590992_659411
405649	SIRV6	+	206	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	514	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
405668	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	15	1266	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
405677	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
405698	contig_1406_pilon	+	2591	5	Intergenic	novelGene_25570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	93	488	2173822	2185260	TRUE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLPPPRISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173729	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2185947_2186052
405725	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
405726	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
405731	SIRV6	-	388	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTCTCTTTCTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
405739	SIRV6	+	387	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
405754	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405784	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
405818	contig_4364_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_1559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
405825	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1495	573	66	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
405859	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
405861	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
405864	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	117	-10	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTATTGTCGGCCTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
405904	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
405913	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
405918	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
405920	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
405952	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	4	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
405972	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
405993	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	236	-1	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406065	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
406098	SIRV6	+	305	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	12	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2726_2829_3106_3165_10723
406104	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	1	1250	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
406114	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
406152	contig_4364_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_1254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCGTGAGGTCGGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
406210	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
406222	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406226	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
406232	contig_4364_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_4166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTTCCAGCGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
406260	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	101	1	69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406271	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	240	-2	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406314	contig_4364_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_4358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
406318	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16497	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
406335	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	234	15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406358	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
406380	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
406430	contig_8538_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_4657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841405	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841455_842820
406438	SIRV6	+	379	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	135	-16	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406494	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406611	contig_4364_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_2330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTCTTTGCATTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
406650	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
406656	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
406668	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
406723	SIRV6	+	361	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	125	-1	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406728	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1636_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106
406742	SIRV2	-	210	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4614	83	3439	-48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGCGTAATTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293	1083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
406753	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
406755	contig_4364_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	68	394	1530895	1531300	FALSE	35	GAATCCCAAGGCCAACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530457	1531302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
406771	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
406783	SIRV2	-	404	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-391	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGAAGACGTCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
406786	SIRV5	-	218	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGATGTAACCTACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
406797	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
406815	SIRV6	+	425	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	102	8	68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGCAAGCACTAACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
406826	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
406897	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
406898	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
406915	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	7	61	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
406920	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	15	1424	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28149	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
406933	contig_8598_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_22914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	2	343	191218	191559	NA	0	TGTTGCTGCTGGTGTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVL	191216	191561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
406959	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	5	1259	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
406986	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
407014	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	62	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10723
407040	contig_8538_pilon	+	374	2	Intergenic	novelGene_4669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842600	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842529	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842747_842974
407044	contig_4364_pilon	+	409	3	Intergenic	novelGene_526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	76	408	1530895	1531306	FALSE	40	CCAAGGCCAACAGGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530449	1531307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
407052	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
407083	SIRV6	+	271	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10554	1	1317	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11554	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
407104	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
407150	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	21	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
407152	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
407157	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	11	1267	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407166	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9655	590	505	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
407203	SIRV6	-	307	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTTAGCCGAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11799	11492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
407221	contig_854_pilon	-	3192	23	Intergenic	novelGene_36479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	191	508	1699021	1697806	TRUE	15	GCGCGCCTCACCGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMS	1702085	1612767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612927_1649493_1649847_1656036_1656198_1672788_1672896_1677513_1677609_1678131_1678196_1678749_1678848_1679248_1679390_1681774_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689441_1692593_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700885_1702022
407264	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407402	contig_8317_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_20577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
407449	SIRV6	+	382	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	123	-7	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
407467	SIRV6	-	334	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTAGCCGAATTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
407526	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407540	SIRV6	+	463	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1848_2027_2470
407572	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407580	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
407599	contig_4364_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	72	392	1530895	1531294	FALSE	25	GCCCCTGAATCCCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530453	1531296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
407602	SIRV6	+	646	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	803	577	-395	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	112	444	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1890	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
407605	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
407630	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
407646	SIRV5	-	346	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTCTCTGCAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
407654	contig_8538_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_4942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842797	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
407682	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407715	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	111	19	29	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
407730	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407752	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
407779	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
407821	contig_4364_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_3054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGCTCAGATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
407853	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	3	56	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
407866	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
407897	SIRV5	+	413	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7476	2	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
407931	SIRV6	+	273	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
407941	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
407961	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	131	2	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
407972	SIRV6	+	231	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	297	3	66	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
408007	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	2	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408008	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
408025	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
408029	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408035	contig_4364_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_1829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
408047	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408102	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	2	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408121	SIRV2	-	194	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4673	40	3498	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
408153	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408154	SIRV5	-	310	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAAGTACATATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10861
408184	contig_15063_pilon	+	1682	7	Intergenic	novelGene_9478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	241	1314	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHRGK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36551_38975_39092_39506
408185	SIRV6	+	231	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	403	11	-233	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCTTCCACACCACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
408226	SIRV6	+	451	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-353	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1932	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
408239	SIRV6	+	245	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10566	15	1329	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11566	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
408247	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	5	1264	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408251	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408279	SIRV6	+	400	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	94	-2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408287	SIRV6	+	401	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10424	1	1187	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11424	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
408339	SIRV6	+	540	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	8710	2	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
408340	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	4	61	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
408367	contig_8317_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_19787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408387	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
408412	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408417	contig_10324_pilon	+	3479	22	Intergenic	novelGene_7724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1125.94073340802	29	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	521	2092	69577	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51827	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69042_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
408438	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_20129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408460	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408470	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408501	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
408511	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
408529	contig_7357_pilon	-	2293	10	Intergenic	novelGene_36790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2080.08627551365	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	161	1411	166824	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167042	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772_166916_166973
408534	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408562	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
408563	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408575	SIRV6	+	486	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-30	8803	13	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
408603	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
408626	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
408636	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408651	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
408694	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	100	11	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
408729	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	576	11	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
408733	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408743	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408754	SIRV5	+	404	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
408768	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
408824	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
408847	contig_4364_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
408850	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
408886	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1531_1640_1736_1845
408922	contig_11285_pilon	+	2250	12	Intergenic	novelGene_5566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	487.830040854733	60	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	43	1491	766060	769349	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHVSAHLPDPG	763515	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769653_769740
408949	SIRV6	+	199	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	314	32	83	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2599	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
409015	SIRV2	+	290	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	307	-74	-307	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGATACGCAGTAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
409019	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
409048	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409092	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	229	11	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409107	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
409113	SIRV6	+	736	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	393	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	165	498	37	534	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIKCV	1696	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
409184	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
409186	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409193	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	7	37	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
409199	SIRV6	+	429	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTAAAGTGCCAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
409220	SIRV6	+	492	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10256	2	1106	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11343	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
409221	contig_4364_pilon	+	303	3	Intergenic	novelGene_444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	228	76	303	1530895	1531201	FALSE	35	ACCAACTGGGACGACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIV	1530449	1531201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
409230	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	236	-15	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409237	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	2	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409242	SIRV6	-	301	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGACGCAAGAATTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
409257	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409271	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409292	SIRV6	+	525	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACGCGTTGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
409298	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	714	-81	-441	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
409318	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409321	contig_4364_pilon	+	297	3	Intergenic	novelGene_709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATGGAGAAGATCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530467	1531213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
409345	SIRV6	+	596	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	847	592	-351	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	68	400	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1934	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
409346	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10309	5	1159	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409396	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409466	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
409468	contig_8317_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_20563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
409471	contig_1230_pilon	+	2603	6	Intergenic	novelGene_28877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1696	junction_3	1129.58983706476	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1769	2365	407610	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	405266	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_405446_405707_406280_406375_406932_407148_407788_408003_408237_408568
409486	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
409527	contig_6735_pilon	-	2691	13	Intergenic	novelGene_15783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_7	778.637039247998	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	1241	2221	546049	542464	FALSE	20	TTCACCCTTATGCTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDTSCNGPAPNTACWVPATPSLPPPPILFSHLQSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568289	541993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
409557	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409593	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409598	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10323	2	1173	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
409634	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
409636	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_19971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
409659	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409667	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4399	34	3224	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
409668	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	398	11	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
409685	contig_8598_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_22904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	CTGTCCTGATTGTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
409707	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	234	1	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
409735	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409785	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
409801	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409820	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
409823	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
409833	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_19889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
409902	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	75	508	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
409907	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2054	575	36	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
409915	contig_233_pilon	-	2284	12	Intergenic	novelGene_14558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1195.68609579163	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	144	1844	108727	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	109971	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93983_101692_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
409935	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
409947	SIRV6	+	335	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	338	94	172	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
409970	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	89	499	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
410032	SIRV6	+	194	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	440	11	-270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGCCATTGCAAAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
410065	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410067	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
410075	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
410079	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10425	2	1275	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410098	SIRV5	+	391	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3402_3483
410109	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
410142	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410151	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410152	SIRV6	+	400	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	98	0	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410185	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	15	1263	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410215	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
410227	contig_11285_pilon	+	2505	12	Intergenic	novelGene_5555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	502.258502472367	122	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	1029	2189	767746	769878	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763477	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
410234	SIRV6	+	161	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	442	-1	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
410254	SIRV6	+	498	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-396	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1889	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
410263	contig_10930_pilon	-	2493	8	Intergenic	novelGene_37036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	1639.88517517389	29	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	305	1708	280211	268388	FALSE	25	AATGCCTATGATTTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	289048	267602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157_280340_288872
410310	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
410325	SIRV5	+	382	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7489	1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
410330	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
410331	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
410339	SIRV6	+	140	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	69	787	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
410357	contig_4364_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_2036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532919	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
410371	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410376	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
410390	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
410418	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
410447	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
410475	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410478	SIRV6	+	435	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1166	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
410486	contig_8538_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_4836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
410488	SIRV6	+	773	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	557	14	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
410496	SIRV6	+	726	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8167	11	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
410510	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
410528	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410589	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	240	15	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410599	SIRV5	-	391	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGGACGAATTTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
410618	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410692	contig_3747_pilon	+	2221	8	Intergenic	novelGene_24750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5156.99857336749	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	289	1029	202422	203804	TRUE	25	AAAATGTTGAGTTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200977	205202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201245_202400_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204336_204541
410694	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
410699	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3668.38635809019	5	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
410700	SIRV6	+	193	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	400	2	-230	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACACCACATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
410748	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410784	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	38	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
410882	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
410910	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
410920	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
410981	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532943	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
411037	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
411039	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533038	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
411090	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
411099	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
411102	SIRV2	-	598	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4275	34	3100	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
411116	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
411130	contig_8317_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_19267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	28	351	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14266	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
411147	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411153	SIRV6	+	223	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	385	0	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
411185	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411240	contig_13592_pilon	+	3977	14	Intergenic	novelGene_33697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	387.400577052476	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	2919	3827	266585	269322	FALSE	20	ATACTTATTGTGTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249299	269472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
411241	SIRV6	+	1538	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	-13	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2424	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
411250	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
411262	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	0	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
411276	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
411295	SIRV5	+	230	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	287	151	173	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8488	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
411317	contig_15063_pilon	+	1675	7	Intergenic	novelGene_11208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3372.67841139156	72	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	232	1029	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPGAAESA	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36151_36309_36600_38975_39092_39506
411334	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411340	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
411346	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411358	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411411	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411442	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411452	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
411499	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_19722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
411536	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
411550	SIRV6	+	418	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-18	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
411561	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411562	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
411606	contig_12622_pilon	-	2471	12	Intergenic	novelGene_5997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1973	junction_2	1876.28803582724	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	9	1541	1590968	1586655	TRUE	35	ATTTCTAATAAATTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590976	1583579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
411621	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
411646	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	1	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411681	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
411715	SIRV2	-	252	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	48	648	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
411724	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411756	SIRV2	-	486	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1143	8	-20	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4752	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
411772	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	9	1269	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411796	SIRV6	+	444	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8843	15	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
411821	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	5	1279	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411859	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10426	2	1276	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411886	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
411908	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
411917	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
411925	contig_15063_pilon	-	1721	7	Intergenic	novelGene_10974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	976	1299	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39089_39504
411939	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
411942	SIRV5	-	404	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGGTAATTTCGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8582_10857
411997	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	5	1162	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
411999	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1496	572	67	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
412004	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
412059	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
412071	SIRV7	-	1863	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-82	-111	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAGGTTAAGATAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114820	1116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2673_2993_3112_43028_43078_114680
412077	SIRV6	+	943	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	581	4	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
412083	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
412101	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_19865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
412170	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412180	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
412206	SIRV6	+	355	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	177	3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCCTGCTTGTGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
412216	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	223	-4	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
412221	contig_4364_pilon	+	445	3	Intergenic	novelGene_367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTGACTGTCGGGCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
412267	SIRV6	+	463	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8806	-4	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
412293	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412307	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
412342	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
412355	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
412383	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16413	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
412384	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_10413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
412409	SIRV5	+	330	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7633	-1	-240	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCCCACATTTAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
412422	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412436	contig_8317_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_20554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
412467	SIRV6	+	422	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-31	94	-18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
412539	contig_4364_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCATCCCTCACACCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533300	1532859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
412577	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412583	SIRV6	+	503	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8798	1	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAGTATCTGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
412602	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
412612	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412651	contig_8317_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_20729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16510	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
412705	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	5	1257	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412710	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
412731	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
412752	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	1	1276	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412755	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
412777	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
412781	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	151	-64	-151	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTCCCACAGCTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
412785	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
412786	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
412824	SIRV2	+	372	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	224	-73	-224	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGCGAGCACAACGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
412846	contig_4364_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_4252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533074	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
412847	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
412870	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
412874	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412889	SIRV2	-	268	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4589	50	3414	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
412893	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
412906	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
412930	SIRV6	+	255	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10534	37	1297	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
412931	SIRV6	+	426	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
412964	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_10951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
412977	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
412987	contig_15087_pilon	-	2743	25	Intergenic	novelGene_37179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	990.352202186172	2005	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	96	1610	158925	132710	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRVRASAWSPVHAPPLMELGWSQSALPSWAPGSSWQWGPMWSPWSVSSIELGLHANTSLQSPSSLWLATPCELAQRSGRLSSGPRSGLPFAGPNG	181135	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126026_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132738_133178_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
412988	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
413047	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
413099	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413125	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413147	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	79	504	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
413165	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
413184	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
413188	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413205	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_5042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842823	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
413212	SIRV6	+	202	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	44	68	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
413230	contig_10324_pilon	+	3519	22	Intergenic	novelGene_7723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1122.17527460677	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1083	2132	73345	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51825	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73065_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
413287	SIRV5	+	359	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	875	-29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
413291	SIRV6	+	473	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10352	1	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11352	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
413311	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413345	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
413363	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
413380	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413392	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_20678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16488	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
413443	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	75	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	229	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
413450	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
413479	SIRV6	+	238	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	59	486	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTATTAGCCTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
413497	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
413548	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
413579	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
413580	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	228	-1	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
413584	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413593	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
413700	SIRV6	+	450	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	798	551	-357	-8	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1928	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
413714	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413715	SIRV6	+	882	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	11	741	11	128	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAATTTAAAGTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	11096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
413740	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
413745	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413755	SIRV6	+	327	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	208	0	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACGTTTCTAGACCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
413816	SIRV5	+	400	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
413839	SIRV6	+	277	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-10	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
413842	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
413855	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	77	505	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
413859	contig_15304_pilon	-	2349	7	Intergenic	novelGene_30437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1367.58286362797	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	186	2303	66228	52925	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	66413	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991_54295_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104
413863	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
413868	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
413896	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
413936	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414015	contig_4364_pilon	+	224	3	Intergenic	novelGene_731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCAAGAGAGGCATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530476	1531149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
414018	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533040	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
414019	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
414130	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_9194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
414180	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	5	1256	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414204	SIRV2	+	389	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTGTTTATCTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	2964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2795_2877
414206	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
414219	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	234	0	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414253	SIRV6	+	517	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8748	0	43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
414303	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_19958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTTTAATGAGAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
414334	contig_4364_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATTTATGTAAGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532658	1533180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533200
414342	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
414356	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
414361	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
414370	SIRV6	+	201	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10623	2	1386	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11623	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
414377	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
414420	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414449	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414463	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10316	5	1166	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
414490	SIRV6	+	595	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	844	587	-354	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	71	403	2002	10736	TRUE	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1931	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
414522	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
414563	SIRV6	+	383	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	141	11	29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTGTATCGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414592	SIRV6	+	205	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	398	-1	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
414607	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
414639	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
414702	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414704	SIRV6	+	454	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1491	525	62	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
414731	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414744	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
414770	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414809	SIRV6	+	583	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	868	575	-330	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	47	379	2002	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1955	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
414854	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
414866	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
414896	SIRV6	-	402	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTGTTCCATGCGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
414913	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	240	4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414925	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
414952	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
414960	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
414964	SIRV6	+	232	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	398	15	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
415010	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	357	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	241	1368	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTERGK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38973_39092_39506
415015	contig_4364_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_2838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCCAACCCTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
415031	SIRV6	+	760	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	583	1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
415035	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415041	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
415057	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	240	4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415067	contig_9807_pilon	+	4182	5	Intergenic	novelGene_32924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	542	junction_2	255.568361696044	90	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	137	649	147193	154326	TRUE	15	CTTCGTTGTGGATCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSVSGPQPPFSAGGTWRAAT	147056	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147279_148960_149049_151711_151820_154095_156770_158676
415100	contig_4364_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_4515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533118	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
415106	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	239	15	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415136	contig_4180_pilon	+	4422	14	Intergenic	novelGene_8422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	78	junction_13	66.2344768014345	848	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	245	1963	1072695	1155294	FALSE	15	GGGATGTGTCTGTGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKASLAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDITEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDSQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRSITIANQTNCPLYITKVMSKSAAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSIKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG	1072450	1157753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1072734_1076123_1076213_1078057_1078243_1125305_1125471_1127668_1127731_1128287_1128369_1128940_1129010_1136507_1136629_1144951_1145109_1145581_1145724_1147773_1147945_1152735_1152916_1153722_1153889_1155202
415151	contig_4364_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_3524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
415154	contig_8317_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_20066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCACAGCAACTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
415165	contig_18145_pilon	+	3710	17	Intergenic	novelGene_37320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	252	junction_12	448.199714831458	2160	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	806	2421	285	2705	86893	100744	FALSE	25	AGCATTAAATGTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86608	101749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
415166	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_9078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	243	1334	34808	38987	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
415181	SIRV5	+	384	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	10	7489	-1	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
415195	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
415217	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
415225	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
415268	SIRV6	+	872	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	33	729	-4	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
415290	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
415302	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
415314	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	81	502	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
415352	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	900	-12	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
415410	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
415583	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
415600	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
415603	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415608	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842782	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
415647	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415662	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10315	2	1165	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
415664	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
415688	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	32	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27124	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
415720	SIRV6	+	924	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	593	11	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TGCGGTAAACGTAAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
415759	SIRV6	+	126	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	586	2	-416	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGACTCTTACTAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
415813	SIRV6	+	440	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	94	1	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415832	SIRV2	+	316	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	281	-74	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
415838	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
415843	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
415844	SIRV6	-	351	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCGAATTTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11838	11487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
415906	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
415931	SIRV5	+	377	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7473	13	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
415956	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
415980	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
416020	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	0	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1632_1736_1845
416027	SIRV6	+	794	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	547	3	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
416039	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	17	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416079	SIRV6	+	240	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10582	4	1345	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11582	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
416167	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
416187	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_9128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	247	1485	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27179_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416233	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416283	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
416285	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
416320	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416323	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
416324	SIRV6	+	949	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	164	495	242	736	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1098	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
416329	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
416342	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416360	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
416385	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
416386	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416405	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
416417	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	35	3076	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
416422	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
416444	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
416471	SIRV2	+	250	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-338	-373	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGGGAAGCTGACCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3695	4084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3966
416475	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	235	-1	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416492	SIRV5	+	429	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-110	886	4	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
416540	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_10966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	233	1459	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
416561	SIRV6	+	250	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2050	577	32	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
416574	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
416580	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
416582	SIRV6	+	603	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-351	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	87	398	2021	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1934	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
416598	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
416623	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
416637	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416696	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
416699	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
416720	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10428	2	1278	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
416740	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
416744	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842784	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
416815	SIRV6	+	407	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-34	112	16	58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCGGCCTGGATGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103	2008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416827	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	70	513	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
416830	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416833	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
416845	SIRV5	-	478	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTACAGTAAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
416863	SIRV6	-	301	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGCAAGAATTTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
416870	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-194	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
416882	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
416903	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
416937	SIRV6	-	419	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAAACGATTAGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
416951	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
416953	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	9	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
416975	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	226	2	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
416984	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_12396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3646.33575966644	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	10	1377	28164	38994	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	28154	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
416985	SIRV2	+	484	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	113	-74	-113	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAACTTGGACGACCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
417023	SIRV6	+	787	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	546	11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
417031	contig_4364_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_4352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533083	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
417043	SIRV6	+	279	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10546	1	1309	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11546	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417065	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417070	SIRV5	+	299	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7669	2	-276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAAGCCTAAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
417074	contig_8538_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_5094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842887	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
417081	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	62	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
417157	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417182	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	83	503	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
417223	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417228	SIRV5	-	334	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATTTGACCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
417254	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417263	SIRV6	+	1487	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	41	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	217	708	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1128	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
417295	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	56	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
417307	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	43	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
417313	contig_8317_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_20688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTTCTGAGCAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
417330	contig_4364_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_4052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
417351	SIRV5	-	281	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCACTAACGTGTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
417366	SIRV6	+	360	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	133	-1	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417370	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10548	1	1311	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417410	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417439	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	2	1277	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417492	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	238	15	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417507	contig_4364_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532809	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
417510	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417517	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417541	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417579	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417585	SIRV6	+	287	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
417618	SIRV2	-	310	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	34	3388	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
417665	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	4	1156	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
417725	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
417733	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	9	1257	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417741	SIRV6	+	474	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1127	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11364	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
417754	SIRV5	+	183	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	222	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8537	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8596_10866
417770	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417780	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	891	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417792	SIRV6	+	319	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	175	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTTGTGGTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417813	SIRV6	+	338	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	19	128	19	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGGTATGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	1992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
417895	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
417914	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	4	1255	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
417942	SIRV2	-	220	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4653	34	3478	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
417960	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
417985	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	199	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
418039	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418090	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
418107	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10447	5	1297	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
418170	SIRV6	+	970	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	525	-4	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
418206	SIRV2	-	612	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	51	289	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCACGTCGAACTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5844	3354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3969_4095_4338_4477_4687_4801_5788
418232	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418314	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	2	63	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
418322	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	6	1268	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
418386	contig_8538_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_4774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	66	299	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842762	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
418432	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418441	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
418445	SIRV5	+	408	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
418459	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
418462	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533017	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
418489	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_10584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	234	1460	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
418499	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
418511	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	63	517	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
418550	SIRV6	+	454	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCGTAGTCGTAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470
418567	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418574	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418576	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
418597	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418663	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	73	508	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
418674	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
418731	contig_8317_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_20231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
418733	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	82	501	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
418760	SIRV6	+	399	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	59	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
418772	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	236	4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
418776	contig_4364_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_1617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCTGCACAGACCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
418780	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_19974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
418783	contig_13633_pilon	+	3688	10	Intergenic	novelGene_15331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	454	junction_6	325.278683934595	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	61	1071	23703	49142	FALSE	10	TACATTTCCTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	22845	51759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
418824	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
418854	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
418886	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	234	-15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
418895	contig_15304_pilon	-	1792	4	Intergenic	novelGene_30648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	374.130399133184	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1	459	105867	103154	FALSE	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRWLHPPTEPRPAL	105867	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103194_103269_103329_103548_103680_105638
418906	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
418985	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	77	507	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
418992	SIRV6	+	319	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAGTAGCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
418995	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
419028	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419048	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
419053	SIRV6	+	470	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2029_2470
419090	SIRV6	+	289	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	37	1263	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419103	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16435	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
419104	SIRV6	+	449	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
419115	SIRV6	+	448	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1439	583	10	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
419124	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419157	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
419211	SIRV6	+	448	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8843	11	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
419225	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419250	SIRV6	+	990	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	13	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	245	739	1733	10736	TRUE	45	GTAACAATGTAATGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1100	11297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
419254	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
419265	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	4	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
419298	SIRV6	+	350	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	133	2	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
419304	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16436	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
419307	contig_8538_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_4846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
419326	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419414	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419447	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
419473	SIRV6	+	940	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	577	11	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
419478	SIRV6	+	243	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-223	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
419560	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	235	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419570	contig_4364_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532786	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
419603	SIRV2	-	269	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4604	34	3429	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
419622	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10543	1	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11543	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419623	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
419638	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	35	1270	-33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCAGTTTAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419660	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_1943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532918	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
419684	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
419721	contig_15063_pilon	+	1913	8	Intergenic	novelGene_8440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3646.68247891708	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	425	1660	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	5248	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_5421_27116_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419741	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
419771	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
419796	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_11209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419820	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	27	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419830	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_12118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419844	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_2583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
419948	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
419961	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
419982	SIRV6	+	870	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	223	1	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
419994	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
420008	contig_4364_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_1845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
420065	contig_4364_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	72	389	1530895	1531291	FALSE	25	AGGCGCCCCTGAATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLT	1530453	1531292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
420083	contig_6047_pilon	+	2672	18	Intergenic	novelGene_24195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	519.281517211663	79	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	1113	2417	117956	123624	FALSE	20	AATACCCAGTGTCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105085	123879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115073_115950_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
420084	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
420127	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
420132	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	5	1253	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
420135	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	387	-1	-217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATAGTGGACGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
420217	SIRV6	+	487	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
420232	contig_12357_pilon	+	2138	12	Intergenic	novelGene_6128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	563.361839303543	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	45	1448	26079	53235	FALSE	30	GAAATAGTATTTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	26034	53925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
420240	SIRV6	+	405	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1500	574	71	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
420278	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	79	499	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
420318	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
420319	SIRV6	+	184	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	66	7651	66	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
420335	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
420347	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	15	1269	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
420378	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	230	0	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
420414	SIRV6	+	282	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-16	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
420433	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
420446	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
420456	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
420468	contig_4364_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
420469	SIRV6	+	249	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	385	11	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
420474	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	58	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
420480	SIRV6	+	527	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	736	536	-419	7	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAATAGTGCAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1866	10795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
420505	SIRV6	+	918	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	580	-7	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
420533	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	82	500	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
420567	contig_4364_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_2646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532938	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
420578	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842822	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
420589	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
420610	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10319	5	1169	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
420611	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
420694	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
420707	contig_8317_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_20695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16496	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
420722	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
420762	SIRV6	+	1489	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	-13	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
420779	SIRV6	+	173	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	39	222	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
420783	SIRV6	-	402	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTTCTTCTTGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
420792	SIRV2	+	329	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	268	-74	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
420796	contig_5033_pilon	-	2402	15	Intergenic	novelGene_28985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1295	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	24	1598	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531213_531549_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
420838	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
420842	SIRV2	-	335	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4538	34	3363	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
420849	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
420860	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	129	2	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTTGGTATGGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
420897	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10468	2	1318	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
420914	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
420949	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
420959	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_19620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
420965	contig_9807_pilon	+	2713	15	Intergenic	novelGene_32885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	540.19227491473	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	869	1867	140826	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109040	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109106_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
420969	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
420985	SIRV6	+	443	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10305	2	1155	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
420986	SIRV6	+	924	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-4	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	403	717	2021	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
421003	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
421020	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
421052	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
421055	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
421057	contig_1532_pilon	-	2008	8	Intergenic	novelGene_37406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	68	1261	32217	13113	FALSE	45	AATAATGAGTATGTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34928	12365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
421068	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10528	1	1291	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11528	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
421069	contig_12622_pilon	-	2329	13	Intergenic	novelGene_5925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2070.77664409328	5488	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	10	831	1590968	1588575	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLCPRTLHPERQCGR	1590977	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588615_1588894_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
421087	SIRV5	+	240	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	169	145	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
421088	SIRV6	+	944	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	582	2	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
421102	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
421104	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	457	11	226	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
421153	SIRV6	-	294	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCGAACTTTGACGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
421182	contig_11285_pilon	-	3104	27	Intergenic	novelGene_5659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	410.98905274872	2376	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	967	2904	8	2911	798530	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798537	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
421268	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
421275	contig_4364_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_2760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532984	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
421350	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16436	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
421373	SIRV6	+	335	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	182	18	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
421447	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	233	-16	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
421454	contig_7775_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_37524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATGAGAAACAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473148	473483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473100_473500
421462	SIRV5	+	381	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
421484	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
421489	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
421505	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	10	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
421515	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	239	1366	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
421530	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
421551	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_10031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
421558	SIRV6	+	363	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	115	7	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGTCGGCCTGGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
421564	contig_8317_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_20024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTTTTAAATGGAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16417	16720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
421575	SIRV5	-	477	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGTGACTACAGTAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
421583	SIRV6	+	280	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856
421635	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
421648	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
421658	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
421686	SIRV5	-	333	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
421787	SIRV6	+	466	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAGTATCTGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
421838	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_11952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
421842	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	-1	2961	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
421848	contig_4364_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	76	348	1530895	1531246	FALSE	15	AACGAGCTGCGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY	1530449	1531246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
421872	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	398	4	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
421905	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
421910	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
421919	SIRV6	-	329	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTTGGTTAGCCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
421950	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
421951	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_8852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
421961	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
421975	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422029	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	234	0	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422043	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422058	SIRV6	+	392	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	132	11	38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422098	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
422104	contig_15063_pilon	-	1684	6	Intergenic	novelGene_13606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	972	1295	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39762	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
422116	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16459	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
422121	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422128	contig_4364_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	81	395	1530895	1531288	FALSE	20	GGAGGCGCCCCTGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLL	1530444	1531290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
422131	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422151	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	402	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422152	SIRV6	-	322	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATTTCTGGTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
422162	SIRV6	+	404	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10421	1	1184	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11421	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
422169	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422175	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
422213	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422254	SIRV6	+	413	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	15	1161	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
422274	SIRV6	+	135	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	579	0	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTAATTTGGGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
422279	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7482	1	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
422280	SIRV5	+	464	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	886	-31	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
422301	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10428	5	1278	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422380	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422391	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422407	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	1	62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
422417	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
422433	SIRV5	+	403	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298_3405_3483
422470	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	1	1279	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422516	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	242	-4	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422519	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
422537	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422556	SIRV5	-	207	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGAAGTAAATAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
422609	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACCCATTAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422610	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	51	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
422625	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_4181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
422646	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
422667	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422683	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
422709	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	81	503	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
422760	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	5	1265	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
422795	SIRV5	-	332	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
422841	contig_5988_pilon	+	2594	3	Intergenic	novelGene_15916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1102	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	604	939	652391	652726	TRUE	55	GCTTTAATTAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVTFHHLVGWLKASISNLCYRKLFMVGFLSRDDGGVCGQREVDAGVGHQVGLEFCQIDIQGTIKSEGSSDGGHNLANKAVKVSIGWALNIKVSTTDVIDGLIVYHEGTI	651787	654839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652946_653275_653422_653549
422850	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
422860	SIRV2	-	243	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	57	648	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACGACGACGTCGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
422862	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
422907	SIRV6	+	953	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	11	573	11	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
422953	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	98	4	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
422981	contig_8317_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_20377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCCACTGCCTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
423015	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	30	1262	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423042	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10433	5	1283	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423066	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	55	486	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
423092	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10518	1	1281	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11518	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423137	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	581	11	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
423143	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
423176	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
423195	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423256	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
423258	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
423269	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	218	-2	-48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCTTGCCTAACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
423274	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	1	1284	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423322	contig_5189_pilon	-	2404	12	Intergenic	novelGene_34852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1151.81927243975	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	111	1271	244235	199237	FALSE	20	ATTACTTCTCTAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKCSCSTSAINNQSQRFLVYKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_200622_200680_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
423327	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423328	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGCTCTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
423365	contig_3077_pilon	+	2307	8	Intergenic	novelGene_26708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_6	2908.03170687035	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	517	1023	13867	16408	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10101	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_17054_17449
423401	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
423418	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10548	1	1311	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423442	contig_12923_pilon	-	1948	12	Intergenic	novelGene_30104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.138882718155	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	62	1474	93727	45874	FALSE	15	GCAGATTGTCTCTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVLIFGERRTFVLCCLQWPEAQTLKSVLGLSVE	101229	45399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45973_57276_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
423466	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16497	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
423494	contig_4364_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_1084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
423552	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_9959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
423597	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
423623	SIRV7	+	1929	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	67	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATGTTCATTGGGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	114822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2695_3044_3151_114676
423638	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
423643	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_12152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27538	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
423654	SIRV6	+	496	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-18	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1627_1736_1845_2027_2470
423687	SIRV5	-	349	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAAGATGCGTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
423701	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
423751	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
423823	SIRV6	+	508	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8792	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
423888	contig_5033_pilon	-	2714	14	Intergenic	novelGene_29018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_11	2862.43701566324	9659	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	1	1575	566787	532125	FALSE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566787	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
423941	SIRV5	-	261	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
423955	contig_4125_pilon	-	3531	12	Intergenic	novelGene_25125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_6	395.886827471298	1543	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	111	791	822728	813780	TRUE	65	AAAAAAAAAAAAAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846554	808966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
423973	SIRV6	-	292	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACGCAAGAATTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11814	11522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
423990	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424006	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
424063	SIRV6	+	1005	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	512	11	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	AATTGGCGATGACTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
424115	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424120	contig_15063_pilon	-	1645	7	Intergenic	novelGene_10155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	897	1220	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39687	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
424139	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	37	3407	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
424140	contig_8317_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_20119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTGATGACACCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
424142	SIRV5	-	449	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTCCTGCCAGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8450_8590_10863
424184	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_19972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
424204	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424310	contig_8317_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_19830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
424332	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-143	880	-29	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8172	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
424354	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	880	-15	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
424387	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424388	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
424420	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424456	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424457	SIRV5	+	420	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7462	1	-69	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
424474	contig_4364_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTAAGGTTTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532845	1533184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
424569	SIRV6	+	147	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	223	510	139	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
424576	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
424614	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
424671	SIRV5	+	204	3	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	-5	8847	-5	-256	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACGGACACGCGAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119
424712	SIRV6	+	495	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2028_2470
424721	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424744	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_19569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCAAAAATCTGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
424758	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424783	SIRV6	+	217	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10528	5	1378	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11615	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
424796	contig_8317_pilon	+	346	2	Intergenic	novelGene_19370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTTTTTAAAATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16256	16701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
424804	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	4	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424810	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_19661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
424833	contig_15063_pilon	+	1613	7	Intergenic	novelGene_9849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	239	1258	34808	38987	TRUE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNRGK	27130	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36497_38975_39092_39506
424840	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
424878	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	236	3	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
424903	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
424919	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
424944	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4415	35	3240	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
424975	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
424990	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
424998	SIRV6	+	241	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	393	11	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
425021	SIRV6	+	282	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-19	222	-6	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
425029	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10327	2	1177	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11414	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
425031	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	242	-4	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
425032	SIRV6	+	691	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1844	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11034_11109_11205
425038	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
425049	contig_8538_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_5063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842832	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
425068	contig_8538_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_4915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAATTTCATTGCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842786	843083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
425084	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_9713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
425096	contig_8317_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_20674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16487	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
425186	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
425194	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
425278	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
425325	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
425447	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
425455	SIRV6	+	400	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	124	11	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
425472	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	2	1163	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
425480	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10354	175	1117	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGACTTGCGTCGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11354	11651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
425499	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
425505	SIRV2	-	237	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4636	34	3461	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
425510	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	215	-2	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCCTAACGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
425521	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
425527	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
425572	SIRV6	+	273	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10475	2	1325	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11562	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
425608	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_11838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	25	TATATATTCTCCTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
425609	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
425625	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
425648	contig_4364_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_1147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTCGGTGAAGCAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
425702	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	15	1263	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
425708	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
425731	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	76	405	1530895	1531303	FALSE	35	ATCCCAAGGCCAACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530449	1531304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
425739	SIRV6	+	193	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	400	2	-230	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACACCACATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
425767	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
425805	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
425806	SIRV6	+	401	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
425824	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
425833	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	17	1276	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
425884	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10322	2	1172	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
425897	SIRV6	+	448	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8843	11	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
425925	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	406	0	-236	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGCTTCCACACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
425963	SIRV5	+	378	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-199	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
425998	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
426023	SIRV2	-	678	6	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	29	2328	17	315	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGCTAGTCCATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5878	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
426063	SIRV6	+	162	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-269	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCCATTGCAAAACGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1477_1535_1640
426081	SIRV6	+	303	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10522	1	1285	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11522	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426090	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
426132	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28168	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
426141	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	73	512	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
426149	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGTAGAGGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2124_2157_2270_2316_3298_3405_3483
426154	SIRV6	+	1536	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-10	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5774	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
426170	contig_4364_pilon	+	325	3	Intergenic	novelGene_739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	40	324	1530895	1531258	FALSE	15	TGGCCCCCGAGGAGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELR	1530485	1531259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
426186	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
426219	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
426230	SIRV6	+	406	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1494	570	65	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
426248	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	240	1478	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
426249	SIRV6	+	455	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8845	2	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
426259	SIRV6	+	473	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	8806	-14	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
426285	contig_12622_pilon	-	2321	13	Intergenic	novelGene_6001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	72	1604	1590968	1586655	TRUE	30	GCCGGATACAAACTAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591039	1583670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
426313	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	661	38	661	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACATTCTTGAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
426353	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	15	1276	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426375	SIRV6	+	301	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	11	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2527	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3162_10721
426405	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426450	contig_4364_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_4059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
426471	SIRV5	+	369	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7592	1	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
426483	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_19444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
426573	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426576	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	76	503	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
426613	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
426654	contig_8317_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_20734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16544	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
426672	SIRV6	+	944	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
426681	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426694	SIRV6	+	223	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1635
426714	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	11	1268	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426730	SIRV2	-	627	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	34	3071	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
426775	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
426789	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
426834	contig_4364_pilon	+	296	3	Intergenic	novelGene_245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGTATTGTCACCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
426877	contig_8317_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_20073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCCACAGCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16782	16428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
426884	contig_8538_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_5013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842817	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
426973	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426980	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	1	1277	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
426989	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	234	-15	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
426994	SIRV5	+	447	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	9	7427	-2	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACTTTCGGTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
427006	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
427025	SIRV6	+	269	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
427055	contig_1230_pilon	+	2770	6	Intergenic	novelGene_28856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1229.01303491867	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1821	2534	407256	408754	FALSE	25	CACCATATAGTTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404458	408990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_407352_407588_407788_408003_408237_408568
427123	SIRV6	-	244	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTGACGCAAGAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	11526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
427145	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	9	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
427180	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
427211	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
427215	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
427216	SIRV6	+	242	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	392	11	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
427254	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16457	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
427277	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
427300	contig_7173_pilon	+	842	2	Intergenic	novelGene_37540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTCAATATTACTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244499	249979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_244845_249482
427305	SIRV6	+	543	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	8	39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCGTCTAGGACGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
427322	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
427456	contig_8538_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_5044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842824	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
427528	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	65	421	1530895	1531330	FALSE	10	CCAGGTGACTGTCGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKM	1530460	1531332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
427533	SIRV5	+	419	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7447	-2	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAATCTAACATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
427560	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
427568	SIRV6	+	511	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACTTGTCGTGCGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
427597	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	215	-4	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCCTAACGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
427621	SIRV6	+	476	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	8169	-441	622	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
427692	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
427714	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
427744	contig_8538_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_5092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842871	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
427785	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
427823	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
427882	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10471	2	1321	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11558	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
427896	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	5	1277	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
427900	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
427961	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
427976	contig_15087_pilon	+	2547	4	Intergenic	novelGene_37257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	4276	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	171	752	284653	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284482	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
428148	SIRV6	+	245	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	52	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
428162	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	74	511	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
428169	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	14	31	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
428173	SIRV6	+	746	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	523	-441	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
428225	SIRV6	+	271	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
428233	SIRV6	-	310	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8220	-145	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAACTGCACTAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10767	2503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2618_2733_2828_3105_3162_10721
428261	contig_4364_pilon	+	303	3	Intergenic	novelGene_576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	231	72	302	1530895	1531204	FALSE	35	ACTGGGACGACATGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVT	1530453	1531205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
428280	SIRV6	+	946	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	567	15	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	182	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
428284	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428290	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
428298	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1	1476	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
428337	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	4	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428391	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	80	502	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
428408	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_20316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
428429	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428430	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
428439	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
428442	SIRV6	+	414	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	94	-10	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
428503	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428505	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
428515	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	15	1270	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428527	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10534	2	1297	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428533	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	223	7	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
428583	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428630	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	405	0	-235	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGCTTCCACACCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
428771	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_12802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
428799	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	34	3422	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
428807	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
428820	contig_8317_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_20589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
428832	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
428852	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	283	6	52	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
428871	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	10	1485	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
428885	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
428903	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428914	contig_15063_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_11181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	35	TGGCCATGAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
428917	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
428933	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
428945	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
428959	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429031	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACATCAGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
429037	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7490	1	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
429045	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
429055	SIRV5	-	388	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTACGGTGGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8476_8590_10863
429100	SIRV6	-	306	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTTTCCATGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
429107	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_3990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
429173	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	4	60	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
429181	SIRV6	+	539	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8755	8	36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGTGCGTCTAGGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
429199	SIRV6	-	431	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	449	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTAAGCTTGATGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1524_1631_1735_1844
429200	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_9482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	76	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	241	1335	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
429219	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
429241	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429258	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	141	1114	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTATCTAAAATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
429267	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
429273	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429277	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
429315	SIRV6	+	400	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470
429317	SIRV6	+	249	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2039	589	21	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3126	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
429354	SIRV6	+	474	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	1	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
429362	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
429377	contig_17440_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_7597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAATCAACATGAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3043	3333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3000_3300
429382	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
429383	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
429387	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
429395	SIRV5	+	288	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	42	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
429469	SIRV2	+	377	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1454	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4479_4686_4800_5787
429494	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
429496	contig_4364_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_2179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCATTAATACCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
429506	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
429508	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16429	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429555	SIRV6	+	944	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	532	2	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
429572	contig_10324_pilon	+	2904	15	Intergenic	novelGene_7700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1312.37118318294	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	79	1521	51839	79380	FALSE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCSPRSLPPAWAGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51760	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67910_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
429612	SIRV6	+	1006	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	520	2	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	276	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
429619	SIRV6	+	151	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	485	29	-253	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTTCAACAAGAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2770	10759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
429620	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
429648	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	4	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
429666	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429674	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	71	511	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
429682	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	237	0	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
429694	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	94	-4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
429704	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	225	2	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
429743	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
429746	SIRV6	+	543	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-298	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	15	350	2002	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1987	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
429796	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	886	-10	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
429803	SIRV6	+	927	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	583	18	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
429812	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	228	-15	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
429853	SIRV6	+	586	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGAGTGTGGCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
429864	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
429891	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	393	0	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
429898	SIRV6	+	234	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	63	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
429915	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
429918	contig_9706_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_20795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATAAAGGTTTAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2055	1755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1800_2100
429920	SIRV6	+	353	5	NNC	SIRV6A	novel	1163	5	NA	NA	-296	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2046_2492_2621_2740_2829_3106_3165_10723
429947	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
429948	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
429967	contig_15063_pilon	+	1756	7	Intergenic	novelGene_11007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	233	1501	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTADPPLCPVTVAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38942_39092_39506
429985	contig_12622_pilon	-	2398	13	Intergenic	novelGene_5981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2147.5038659259	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	63	1568	1590968	1586655	TRUE	35	CTAACCTTCAGAAGCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591030	1583557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589000_1589115_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
430012	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
430014	SIRV6	+	403	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-347	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1938	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723
430036	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
430042	contig_8317_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_20666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16483	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
430077	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430126	SIRV6	+	393	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10348	9	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
430156	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430162	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	8	58	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
430189	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
430192	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	80	507	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
430202	SIRV6	-	288	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACGCAAGAATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
430208	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
430230	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
430252	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_20053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16422	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
430255	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
430284	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
430312	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	67	515	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
430337	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430360	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
430372	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
430378	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
430434	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
430441	SIRV6	+	298	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	245	2	14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2530	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
430468	contig_8317_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_20564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
430506	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	248	45	17	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2533	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
430523	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430598	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
430599	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
430616	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	2	1277	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430625	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	4	1251	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430641	contig_8317_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_20706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16500	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
430656	SIRV6	+	597	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-338	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	74	388	2021	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1947	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
430677	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9657	577	507	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
430679	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
430714	contig_8317_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_20063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCACAGCAACTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
430721	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
430741	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
430767	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
430776	SIRV6	+	255	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	74	1260	62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGCAAAAATTATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430803	SIRV6	+	227	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	23	7651	23	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
430811	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
430840	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
430860	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	4	1155	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
430892	SIRV6	-	314	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCATGACCATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
430909	SIRV6	+	182	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	68	7651	68	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
430943	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_2651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532939	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
430984	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
431015	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	133	11	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
431022	contig_4364_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532821	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
431035	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
431051	SIRV2	-	223	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4646	38	3471	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
431079	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431098	SIRV6	+	252	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	67	1270	-65	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTATGGATTTAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431102	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	5	1163	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
431122	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
431126	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	4	1164	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
431133	contig_8317_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_19566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTTTTTAAATGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
431138	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27542	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
431143	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431194	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	9	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431199	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
431202	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
431226	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_9441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
431274	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
431297	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
431381	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	238	3	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
431401	contig_4364_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_4547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533139	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
431402	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
431405	contig_4364_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_2588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACCATCAGCTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
431489	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
431503	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	94	12	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
431548	SIRV6	+	132	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	579	3	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTAATTTGGGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
431579	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
431584	SIRV2	+	656	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
431613	SIRV6	+	688	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	105	318	177	494	2021	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2474_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
431618	SIRV2	+	224	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	363	-64	-363	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACATTTGAGTGCGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
431665	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431675	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
431686	contig_6215_pilon	-	2729	10	Intergenic	novelGene_21202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	786.833739320661	84	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	48	1094	243029	228364	FALSE	30	AAAGTGTGTAGTGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSSGFTLYHDDPYQLVQV	243076	226728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229764_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
431707	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	67	513	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
431716	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	652	47	652	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4080	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
431758	contig_9955_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_21318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTATTTTTGAATAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49837	48609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_48600_49800
431810	SIRV6	-	334	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTAGCCGAATTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
431821	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	568	11	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
431837	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
431843	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	397	3	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
431864	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
431898	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	586	500	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
431905	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	492	87	492	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
431937	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431945	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
431960	contig_8317_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_20064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16425	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
431984	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
431987	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
432000	contig_8317_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_20509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
432016	SIRV6	+	738	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106
432027	scaffold_12124_pilon	-	2767	6	Intergenic	novelGene_22238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2460	2765	1506661	1473573	FALSE	5	GGCGCCGGAGGGCGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVHVPLFPIFFEAELLFLVCDEAGDGPSHSNHYSPYDPRDDPGGFSLLVAVISGAPPRHLQDRRKLVPGTERPAGRAEAQRGRPGAPWCAPRRGGTVHG	1510597	1473570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473669_1496324_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1509828_1509980
432059	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
432060	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	34	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
432075	contig_12671_pilon	+	3265	9	Intergenic	novelGene_19214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	453.128275850228	36	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	87	749	197316	212313	TRUE	45	AAGTTTTGTATTACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197229	214904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286_213517_213591
432163	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
432195	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
432201	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
432206	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	404	0	-234	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCTTCCACACCACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
432221	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7479	1	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
432232	SIRV6	+	378	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10433	15	1196	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11433	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
432237	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
432260	contig_8317_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_20448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTCCACTGCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
432267	SIRV6	+	519	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8750	-4	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
432273	SIRV6	+	179	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	71	7651	71	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
432362	contig_10324_pilon	+	2937	15	Intergenic	novelGene_7748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1160.03566315692	4262	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	48	1550	69577	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	69529	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69628_69814_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
432366	SIRV6	+	301	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	106	-30	24	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3129	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
432392	contig_4364_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	72	431	1530895	1531333	FALSE	10	CAGGTGACTGTCGGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530453	1531333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
432410	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
432436	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
432456	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	75	502	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
432496	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1674	33	-225	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2798	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
432521	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
432568	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	2	59	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
432583	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
432629	SIRV6	+	503	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-2	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCGTGCGTCTAGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470
432661	contig_4364_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_1774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACCCTGCACAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
432689	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
432779	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
432817	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
432828	SIRV5	-	257	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTCTTCCGACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
432844	SIRV6	-	332	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTTAGCCGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
432855	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
432890	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	587	503	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
432900	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
432914	contig_11752_pilon	+	3412	7	Intergenic	novelGene_37651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_4	786.834374778666	52	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	2094	3122	87165	105616	FALSE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85071	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
432925	contig_8538_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_4820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGACAGGGTGCGCCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843119	842771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
432937	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_9946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
432985	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	63	522	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
432993	contig_8538_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_4898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCCTCTTAAGCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
432996	contig_4364_pilon	+	169	1	Intergenic	novelGene_4551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533145	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
432997	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
433016	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
433027	contig_1230_pilon	+	2163	9	Intergenic	novelGene_28853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1236.63896813096	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	172	1932	405421	408754	FALSE	25	ATTGGCACCATATAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404455	408985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404466_405259_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
433074	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	2	1293	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433194	SIRV6	+	405	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10359	62	1122	-60	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATTTAGTCGATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11359	11764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
433205	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	5	1255	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433231	SIRV6	+	195	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9648	594	498	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
433237	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
433241	SIRV6	+	489	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8811	2	-20	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTTGAAGCAATCGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
433253	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433258	SIRV2	+	283	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	314	-74	-314	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCGCAAGATACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
433335	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
433375	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	4	58	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
433378	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	34	1259	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGTTTAGAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433380	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	3	63	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
433396	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	2	59	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
433411	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_20021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16416	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
433415	contig_4364_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGCGGCGGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532825	1533270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
433429	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433430	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
433435	SIRV6	+	441	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8846	15	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
433446	SIRV6	+	691	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
433452	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
433465	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
433487	SIRV5	+	470	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	887	-38	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
433489	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
433490	contig_4364_pilon	+	497	4	Intergenic	novelGene_410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	80	496	1530895	1531672	FALSE	5	TGTCTCTGTATGCCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAV	1530445	1531673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
433553	SIRV6	+	951	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	566	11	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
433586	contig_4364_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_2774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533000	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
433710	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
433729	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_9170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	630	1451	35271	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_35129_35203_35380_35839_36158_36266
433735	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_8534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	251	1486	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26345	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
433743	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
433761	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
433764	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
433772	SIRV6	+	306	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGCCTGCTTGTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
433802	SIRV6	+	525	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	8735	-1	56	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
433822	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
433869	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	70	486	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
433881	SIRV5	+	260	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTAGCGAAGGTCGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
433883	contig_15063_pilon	-	1537	5	Intergenic	novelGene_8767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
433914	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	536	51	536	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10773	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
433929	SIRV6	+	559	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8710	-4	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
433932	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	2	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
433965	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
433980	SIRV6	+	462	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-43	8840	0	-49	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
433985	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
433986	contig_12622_pilon	-	1457	6	Intergenic	novelGene_5904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1973	junction_2	199.564926778229	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	694	1248	1586444	1583745	FALSE	20	TATGTACATGTGTGTGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQCLPLSFHIPRRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1588006	1583535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586840_1587628_1587785_1587864
433993	SIRV6	+	216	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	392	0	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
434001	SIRV6	+	725	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106
434011	SIRV6	+	233	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	297	1	66	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
434029	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
434044	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
434072	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
434077	contig_6215_pilon	-	2878	10	Intergenic	novelGene_21198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	782.780624551246	849	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	99	1370	243029	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243127	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229807_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
434186	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
434197	SIRV6	+	945	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	162	489	247	735	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
434221	SIRV2	+	288	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	303	-68	-303	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACGCAGTAATGCTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
434226	contig_3077_pilon	+	2683	6	Intergenic	novelGene_26744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_2	3638.64158168952	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	354	1007	12050	16408	FALSE	15	AGTGTGCGGCACTTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	11161	18084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144
434304	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
434330	contig_15063_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_8479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	255	1427	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26341	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
434352	SIRV6	+	250	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
434356	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
434361	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
434397	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
434410	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
434467	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
434469	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
434479	SIRV5	+	391	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7459	13	-66	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTTTTGTAGAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
434495	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	64	297	842828	843061	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842764	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
434496	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
434518	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	336	229	170	-59	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
434524	SIRV6	+	148	2	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	222	7651	222	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106
434527	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
434529	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
434540	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	2	62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
434611	SIRV6	+	415	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	94	-11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
434621	contig_15063_pilon	+	2486	7	Intergenic	novelGene_13016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	996	2231	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	29521	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
434673	contig_15063_pilon	+	1686	7	Intergenic	novelGene_12976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3737.29513002236	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	225	1316	34808	38987	TRUE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	28176	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
434718	SIRV6	+	168	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	225	487	137	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
434720	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10528	1	1291	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11528	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
434728	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	87	501	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
434762	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	392	3	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
434798	SIRV5	-	296	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACCTTAGAGCGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8377_8449_8590_10863
434823	SIRV6	+	372	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	15	1202	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
434860	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
434866	contig_9345_pilon	-	1890	6	Intergenic	novelGene_24647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	239	820	955353	947957	FALSE	20	TAAACTTCCTGTATCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001313	946886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
434884	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGATGCGTAAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8584_10853
434924	SIRV2	+	643	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTCGTTCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
434966	SIRV6	+	240	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	394	11	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
434993	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	279	12	48	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
434997	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	98	11	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
435004	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	73	505	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
435123	SIRV6	+	293	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	754	-81	-401	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1884	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
435146	contig_5485_pilon	+	3366	5	Intergenic	novelGene_37715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_4	151.943040314455	1396	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	30	689	180585	217366	FALSE	5	TTTCTGGTGTTCTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGERVSGTMSGVSGLLAQRGPCPLALLLLLLLGPSSVLAISFNLPLNSRKCLREEIHKDLLVTGAYEVTDQSGGAGGLRTHLKITDSAGHILYSKEDATKGKFAFTTEDYDMFEVCFESKGTGRIPDQLVILDMKHGVEAKNYEEIAKVEKLKPLEVELRRLEDLSESIVNDFAYMKRREEEMRDTNESTNTRVLYFSIFSMFCLIGLATWQVFYLRRFFKAKKLIE	180555	220043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_180810_202875_202988_208495_208570_216702_216830_217244
435179	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
435197	contig_11285_pilon	-	2953	27	Intergenic	novelGene_5665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	428.750213483481	2277	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	909	2730	31	2760	798530	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798560	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_793795_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
435221	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
435244	contig_8317_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_20685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16492	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
435257	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
435268	SIRV2	-	476	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4397	34	3222	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
435294	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
435335	SIRV5	+	452	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7437	2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
435365	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
435384	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435443	SIRV5	+	389	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
435459	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435503	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10439	2	1289	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435522	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
435551	contig_4364_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_3774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
435552	contig_8538_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_4972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842808	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
435609	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_12462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
435619	SIRV6	+	940	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	577	11	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
435639	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
435657	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
435666	SIRV6	-	425	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11815	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
435691	contig_233_pilon	-	2237	12	Intergenic	novelGene_14601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1176.26701162815	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	94	933	126907	93977	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKL	127000	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93983_104227_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
435705	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
435706	SIRV6	+	161	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	442	-1	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
435787	SIRV6	+	230	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	248	7	-78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGCACAAGTCGGTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
435788	SIRV6	+	452	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1432	586	3	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2519	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
435843	SIRV6	+	364	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10461	1	1224	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11461	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435845	SIRV6	+	593	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
435866	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
435870	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	4	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435928	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
435939	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
435961	SIRV6	+	470	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAGTCAAGTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
435973	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
435980	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
435985	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436011	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436020	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436046	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436099	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533013	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
436109	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
436144	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436232	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_19660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
436233	contig_4364_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_3490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGGAAACTGGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
436239	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	15	1278	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436267	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_19440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
436268	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	76	351	1530895	1531249	FALSE	10	AGCTGCGTGTGGCCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYN	1530449	1531250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
436275	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
436288	contig_4364_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532864	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
436289	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
436311	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	11	56	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
436337	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436357	contig_12357_pilon	+	2082	13	Intergenic	novelGene_6103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	756.321410769845	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	117	1520	26079	53235	TRUE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169_53659_53783
436425	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
436432	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436442	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
436451	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
436461	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436465	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10353	2	1203	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
436484	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
436491	SIRV5	-	350	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8372_8450_8590_10859
436501	SIRV6	+	945	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	565	18	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
436506	SIRV6	+	238	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	245	2	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436520	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436546	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	15	1265	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436658	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	585	500	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
436686	SIRV6	+	486	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-16	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_1845_2027_2470
436694	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436716	SIRV5	+	249	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	268	151	154	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8469	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
436752	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	5	1271	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436763	SIRV5	+	436	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	26	7421	6	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGGTAAATTCACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	3570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
436776	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436804	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
436818	SIRV6	+	579	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	917	530	-281	16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	121	330	2569	10736	TRUE	45	TGGTAACAATGTAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2004	11295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
436826	contig_4364_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_2818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCAACCCTGTCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
436866	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26355	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
436871	SIRV6	+	382	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	123	-7	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436908	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436941	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
436954	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	4	1165	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
436959	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	727	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
436967	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
436986	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	222	-4	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
436991	contig_5023_pilon	+	2573	17	Intergenic	novelGene_7195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2141.19235820693	15	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	102	1985	607279	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580811	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580889_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647013_647736
437025	contig_1331_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_37846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTCACATAGCAAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169889	168830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_168800_169900
437031	SIRV6	+	303	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10519	4	1282	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11519	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
437110	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	229	-2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
437112	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	76	507	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
437130	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
437139	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
437141	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_19860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437183	contig_8317_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_20081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16429	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437184	contig_8317_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_20604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGCAGCCTTTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
437186	contig_15063_pilon	-	1562	5	Intergenic	novelGene_9037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
437198	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	14	31	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
437270	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35034_35380_35839_36158_36266
437281	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
437317	SIRV6	+	240	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	54	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGAGAGTTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
437321	contig_4364_pilon	+	300	3	Intergenic	novelGene_442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	76	300	1530895	1531198	FALSE	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530449	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
437329	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGAAACCTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437346	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437354	SIRV6	-	404	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTTCCATGCGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
437419	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	399	0	-229	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACACCACATGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
437447	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
437460	contig_15063_pilon	-	1512	5	Intergenic	novelGene_12962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	35891	35108	TRUE	30	GTAGTCCATACCGTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36772	28172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
437522	SIRV6	+	446	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1645_1736_1845_2027_2470
437528	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437549	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	78	505	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
437572	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
437600	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_19449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437643	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
437660	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	34	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
437668	contig_4364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_3116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
437719	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437741	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437747	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	85	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
437774	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9656	584	506	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
437779	contig_15063_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_12595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	TAGTAATCACAATGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
437789	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
437793	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	2	66	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
437819	contig_8317_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_20719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16503	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
437829	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
437835	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	233	0	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
437850	contig_18145_pilon	+	3054	18	Intergenic	novelGene_37325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	491.226429301489	2378	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	1432	2529	97299	100744	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86647	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93413_94929_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97250_97292_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
437887	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
437944	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
437945	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
437951	SIRV6	+	661	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8503	18	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
437963	SIRV2	-	231	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4642	34	3467	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1265	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
437975	SIRV5	+	335	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7626	1	-233	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACATTTAGCCGAATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
438007	SIRV6	+	950	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	567	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
438021	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-13	880	-13	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8302	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
438051	SIRV2	-	219	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4651	37	3476	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
438055	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
438057	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
438101	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	249	-2	-79	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGCACAAGTCGGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
438137	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
438161	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-72	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
438174	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
438177	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	239	-2	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
438200	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
438246	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
438294	SIRV5	+	385	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	875	-55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
438307	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
438353	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
438362	SIRV5	-	353	3	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-999	1170	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTCCTGGACTGCGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3405	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1209_2270_2316_3298
438380	contig_15063_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_11781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438385	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_19888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
438403	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	224	1459	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLRSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34620_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438411	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438421	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_19441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
438426	SIRV6	+	367	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	135	-4	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
438434	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438491	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
438515	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	3035	1	-405	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTACTTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
438552	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
438578	SIRV5	-	304	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACCAAAGTACATATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
438581	contig_1244_pilon	-	2509	12	Intergenic	novelGene_37978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_6	941.574143532306	436	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	47	1045	948448	924560	TRUE	35	ATTTAAATGATGGGCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKVAHSSWQ	948494	922434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
438658	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16459	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
438665	SIRV2	-	239	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	656	53	656	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACGACGTCGACACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
438675	SIRV2	-	267	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	33	648	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGAAAGGTAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
438740	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
438796	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
438812	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	289	1	58	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
438858	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26356	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438867	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	94	8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
438908	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
438910	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
438912	contig_8317_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_20608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16459	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
438943	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
438963	contig_8317_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_20192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
438965	SIRV6	+	435	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1493	542	64	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTAATTGTTGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
439047	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_19829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
439099	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
439107	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10427	5	1277	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
439111	contig_7357_pilon	-	2265	7	Intergenic	novelGene_36786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1434	junction_2	1963.4336774018	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	391	1383	154994	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	155384	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861
439125	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_1928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATACCCTGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
439175	SIRV6	+	234	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	406	5	-236	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGCTTCCACACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
439204	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
439248	SIRV6	+	601	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	902	523	-296	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	13	345	2002	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1989	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
439262	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
439318	contig_15063_pilon	+	1673	7	Intergenic	novelGene_11182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	232	1323	34808	38987	TRUE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27137	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
439328	SIRV6	+	1269	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	0	-441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
439351	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	239	-3	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
439382	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
439435	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
439471	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	391	15	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
439502	SIRV2	-	619	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	34	3079	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
439519	contig_8581_pilon	-	3276	18	Intergenic	novelGene_22816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	482.641083233611	14	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	864	2595	83	2677	366792	306939	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPAALPAHLSSSSAPSFLPVSRAGRCRRRSLLPPQLGGKQNPTYGV	386056	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307077_308917_309147_312483_312640_314552_314690_319172_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
439524	SIRV6	+	927	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	590	11	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
439587	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_4015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
439598	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	136	-15	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCGTGCCGCTTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
439604	SIRV6	+	446	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8844	12	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
439625	SIRV5	+	374	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3301
439692	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	1	1284	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
439716	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
439722	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_11885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	TAAGTGAGCGCTGCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
439736	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
439748	contig_8317_pilon	+	370	3	Intergenic	novelGene_19291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2	370	14294	15137	FALSE	35	GAAGCTGGTATCTCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEF	14292	15137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
439753	contig_10437_pilon	+	3050	4	Intergenic	novelGene_38152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_3	125.881778753806	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAGCAAAAGCGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159572	164079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160203_160732_160844_161549_161639_161859
439767	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	70	486	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
439794	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
439840	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
439908	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
439933	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	882	-21	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
439961	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	4	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
439967	SIRV5	+	276	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	8670	-1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
440000	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440019	contig_4364_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_2326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
440054	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440056	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	2	68	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
440060	contig_15063_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_10409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	979	1302	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
440075	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	20	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
440091	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440097	contig_4364_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTGTGTTAAGGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532802	1533279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
440098	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
440106	contig_4364_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_4209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
440156	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
440178	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842782	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
440193	contig_8317_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_20092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGACACCCACAGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
440216	SIRV5	+	296	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	34	875	34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8349	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
440268	SIRV5	-	357	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8453_8590_10863
440294	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16435	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
440299	SIRV6	+	356	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10469	1	1232	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11469	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440345	SIRV6	-	299	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTGACGCAAGAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
440350	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	236	5	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
440391	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
440404	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
440450	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
440468	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
440484	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_9130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	243	1334	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
440491	SIRV2	-	292	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	356	2969	-356	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCATTAACCCAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
440492	SIRV2	-	238	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4631	38	3456	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
440527	contig_12357_pilon	+	2163	13	Intergenic	novelGene_6108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	756.321410769845	4509	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	117	1520	26079	53235	TRUE	30	GAAATAGTATTTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169_53544_53590
440566	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
440602	contig_15063_pilon	+	1616	8	Intergenic	novelGene_9879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3646.68247891708	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	239	1363	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35151_35261_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
440607	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440632	contig_8538_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_5077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842847	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
440636	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
440646	contig_8538_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_5076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842842	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
440654	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
440667	contig_8317_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_20707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTTCTGAGCTTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
440669	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_19379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATGGAAACAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
440670	contig_8317_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_20725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCATTTAGCCTTCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
440692	contig_8317_pilon	+	382	3	Intergenic	novelGene_19256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	7575.5	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	62	382	14294	14907	FALSE	35	CAGGTTTGTAGATTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTS	13264	14907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730
440704	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10321	2	1171	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
440706	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
440717	SIRV6	+	271	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATATGTCTTGCCTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
440721	contig_21013_pilon	+	3506	12	Intergenic	novelGene_38512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_10	437.180693395404	1702	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	188	2119	19282	85337	FALSE	10	TGTTGAACTGCTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPELMNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEHGKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASPDQNASTHTPQSSVKTSVPSGKSSGDLVDLFDGASQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSLPAQGTAASGNGDFGDWSAFNQAPSGPAASSGELFSSASQPAVELFSGSQPALGPPSAASNSSDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQPLQNVSTVLQKPNPLYNQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSQSNMLPVRPQTNPLMGGPMPVSMPNVMTGTMGMAPLGNTPVMNQSMMGMNMNIGMSSPGMGLSGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFTNFNK	19094	86724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_19323_55721_55827_56372_56470_58356_58466_59403_59569_62439_62618_69125_69373_71484_71555_78665_78741_81938_82232_83940_84146_84990
440750	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	79	505	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
440752	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440772	SIRV6	+	197	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	527	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
440774	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3741.956425306	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	6	1466	28164	39510	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTL	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39085_39506
440793	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
440884	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	401	0	-231	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCACACCACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
440892	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	4	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440893	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_8778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
440919	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	236	2	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
440929	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
440952	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
440963	contig_8317_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_20712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16501	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
440969	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
440973	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10451	2	1301	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441079	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
441080	contig_15063_pilon	+	2516	7	Intergenic	novelGene_13015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	20	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	1049	2284	34808	39515	FALSE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	29468	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
441087	contig_4364_pilon	+	255	3	Intergenic	novelGene_565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCATCCTGACCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
441093	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441132	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
441155	SIRV2	-	480	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	35	3217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
441192	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441285	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
441300	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGACCTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
441307	contig_8317_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_20618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16461	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
441312	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
441350	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
441379	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	404	-1	-234	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCTTCCACACCACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
441398	SIRV6	+	242	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
441402	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441405	contig_4364_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_2570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
441421	contig_4364_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_3300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533032	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
441441	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
441462	SIRV6	+	956	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	570	2	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1447	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
441469	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441471	contig_4364_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_4454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533100	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
441473	SIRV2	+	413	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	184	-74	-184	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAATGTTTTTTACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
441515	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	4	1261	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441523	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
441536	contig_17976_pilon	+	2338	4	Intergenic	novelGene_32463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	2268	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	271	1287	41843	47385	TRUE	25	GTTGGTTGAAGCCAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41572	48898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_48215_48676
441537	SIRV6	+	409	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	12	71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAGCACTAACGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_1847
441547	SIRV6	+	591	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8710	1	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
441558	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	3	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCTTGCCTAACGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_1845
441568	contig_4364_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_2253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCATTAATACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
441594	SIRV5	-	285	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGTACCTACCTTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
441639	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
441687	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441704	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
441710	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1618	39	226	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
441711	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
441716	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
441718	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	586	499	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
441748	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	17	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
441762	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
441770	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	50	7650	50	625	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTATGAGTAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	3165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
441784	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	9	1421	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
441785	contig_8538_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_4988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842812	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
441816	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9657	577	507	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
441818	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	5	1273	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441829	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
441859	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	395	0	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
441864	SIRV6	+	1008	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	518	2	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
441882	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
441896	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_12956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3848.82919697666	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	230	1390	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28171	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266
441932	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	269	-74	-269	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTCTATCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
441940	SIRV5	+	380	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7486	-2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
441945	SIRV2	+	663	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
442012	SIRV2	-	566	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4307	34	3132	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
442031	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_1719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
442105	SIRV6	+	927	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	33	577	-4	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	113	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
442109	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442125	SIRV5	-	390	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACGAATTTACGGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8451_8590_10863
442128	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442139	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
442156	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
442167	SIRV6	+	526	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTAGGTATGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470
442208	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	4	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
442220	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
442287	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442304	contig_15063_pilon	+	1705	7	Intergenic	novelGene_10945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
442320	contig_4364_pilon	+	192	1	Intergenic	novelGene_4525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533122	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
442335	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442385	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442386	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
442409	SIRV6	+	422	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	15	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
442422	SIRV6	+	393	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	5	1202	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
442461	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442557	contig_4364_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_4437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533095	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
442573	SIRV6	+	1527	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	-10	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
442601	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
442603	SIRV5	+	342	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7587	13	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
442607	SIRV2	-	483	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	2939	-2	-309	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACAGTGGTTGTGATCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	3974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
442615	SIRV6	+	281	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10544	1	1307	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11544	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
442621	contig_5954_pilon	-	2520	15	Intergenic	novelGene_28620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	421.284721211831	59	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	660	2159	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKDGSPFLASPPTPSLPPGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960577	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947253_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
442630	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16421	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
442670	SIRV6	+	398	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	20	1171	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
442719	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	1	1284	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
442720	SIRV6	+	211	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-222	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1642
442729	contig_8538_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_4830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
442750	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
442756	SIRV6	+	920	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	575	-4	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
442761	SIRV6	+	263	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-65	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
442775	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_10122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
442794	contig_8317_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_20720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16503	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
442843	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
442844	SIRV5	-	478	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACAGTAAGGACTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	8164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
442877	contig_4364_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_2803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
442893	SIRV6	+	655	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	854	517	-344	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	61	393	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
442905	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
442917	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10318	2	1168	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
442992	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
442996	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443004	SIRV2	-	391	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	33	3012	17	-382	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTCCACCTCAACGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5878	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
443016	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532912	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
443031	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
443048	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443054	SIRV6	+	747	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	585	12	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
443068	SIRV6	+	403	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10345	2	1195	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11432	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
443075	contig_4364_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532831	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
443076	contig_15063_pilon	+	1551	6	Intergenic	novelGene_9326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3867.09686457425	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27159_27560_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
443107	SIRV5	+	749	9	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	2571	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGTGCTACTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	6169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3641_5380_5451_5543_5627_6111
443116	contig_4364_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_3964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533065	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
443122	contig_8317_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_20455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
443123	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7484	2	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
443142	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
443147	SIRV6	-	391	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTCTCTTTCTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
443191	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	387	15	-217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATAGTGGACGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
443209	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443216	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
443222	contig_8317_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_20041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAACTGTCTGTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
443246	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
443267	contig_8538_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_4953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAGTAGATTCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843118	842801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
443276	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
443278	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
443279	contig_4486_pilon	+	2388	13	Intergenic	novelGene_38560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1254.17054262967	4138	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	221	1375	343083	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRLWRIGGLRCAGVGRGGGRGCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311687	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
443282	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
443290	SIRV6	+	346	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	182	7	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
443346	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	81	500	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
443352	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
443372	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
443380	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443381	SIRV6	+	725	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	586	-4	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
443415	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
443465	contig_9921_pilon	+	3331	2	Intergenic	novelGene_23759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAAACATCTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321217	326584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_321344_323379
443481	SIRV6	+	499	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8792	11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
443485	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
443489	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443509	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	4	1271	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443517	SIRV6	+	245	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	65	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10723
443522	SIRV6	-	403	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACGCGTCCTAGACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	2600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
443533	SIRV6	+	392	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10433	1	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11433	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
443548	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443600	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
443626	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	78	500	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
443737	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
443740	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	80	497	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
443747	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	1	1277	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443752	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443755	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	225	-2	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
443786	SIRV6	+	403	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	1	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1527_1640_1736_1845
443828	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
443855	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443866	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	1	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443931	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	20	1275	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
443968	contig_9807_pilon	+	2708	15	Intergenic	novelGene_32876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	528.131964994526	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	102	1862	109130	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109028	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126756_128577_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
443985	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444011	contig_6557_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_32938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGTAGGCAGTAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300480	300827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_300500_300800
444012	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	238	11	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444015	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444032	SIRV6	+	934	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	412	732	2458	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2014_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
444036	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
444040	contig_15063_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_8490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	GGTGTAGGCACTTGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444088	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	239	-2	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444094	SIRV6	+	399	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	61	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
444118	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16465	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
444134	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10464	2	1314	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11551	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
444146	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_19568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAACTTGACCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
444147	SIRV5	-	385	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGGACGAATTTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
444172	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444182	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444192	SIRV6	+	390	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	96	-1	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444231	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444240	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	5	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444244	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10315	5	1165	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444248	SIRV6	+	538	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGAGTGTGGCTCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1850_2027_2470
444263	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
444296	contig_8317_pilon	+	411	2	Intergenic	novelGene_19341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATCAGTACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16200	16710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
444307	SIRV6	+	392	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10433	1	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11433	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444322	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
444365	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
444400	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	29	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444436	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	242	1480	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444442	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532925	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
444447	contig_12622_pilon	-	2391	12	Intergenic	novelGene_5984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2066.51902387398	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	85	1443	1590968	1586655	TRUE	25	TTCTCTAACCTTCAGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGVTDSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591052	1583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588494_1588894_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
444532	contig_1406_pilon	+	2564	3	Intergenic	novelGene_25591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	428	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	143	355	2183789	2185260	FALSE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSWSQEQRHRHGRHQSQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173786	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2183697_2183885_2185143
444548	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	15	1269	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
444561	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
444567	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_8648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	40	GCCATGAAATAAATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26553	39738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444682	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
444692	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
444723	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	228	0	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444745	SIRV6	-	375	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATAGGTCTCTTTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
444749	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
444802	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
444808	contig_4364_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_3152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
444819	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_19891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTTGAGACCCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
444824	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	4	1476	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
444828	contig_12357_pilon	+	2029	14	Intergenic	novelGene_6093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	864.62289211085	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	117	1469	26079	53235	TRUE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGKTFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34229_34279_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169_53659_53783
444849	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
444907	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
444961	contig_8317_pilon	+	448	2	Intergenic	novelGene_19367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	77	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAACCTGTGTCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16246	16793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
444996	SIRV6	+	361	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	172	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGTGGTGTTTATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
445018	contig_10134_pilon	-	2537	4	Intergenic	novelGene_16200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_2	648.783648238935	134	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	43	300	39679	38991	TRUE	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLLYSSGLWPSSEMTFETQVFQDIYPGNLCLLQPLTVLLLLASADTRAGKFTLWFLGLMVLFPYNVMLYLLYRKMSVLPRIRFRFSMDSSPISVGPET	39721	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_39164_39594
445096	contig_8538_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_4916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842786	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
445105	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
445117	SIRV6	+	603	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-344	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
445153	SIRV6	+	512	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1442	516	13	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAATTGGCGATGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2529	11309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
445171	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532926	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
445186	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	65	7651	65	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
445202	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	6	61	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
445205	SIRV6	+	170	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	438	0	-268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCATTGCAAAACGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
445248	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
445287	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	81	495	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
445290	SIRV6	+	593	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470
445305	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10471	2	1321	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11558	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
445314	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
445356	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	4	1479	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
445369	SIRV6	-	384	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTTCTTCTTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11815	11431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
445380	contig_6795_pilon	-	2009	11	Intergenic	novelGene_27742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGGTAGCCCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333737	330492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_330568_330651_330840_331216_331409_331550_331687_331764_332277_332380_332435_332538_332669_332733_332842_332947_333063_333153_333219_333303
445382	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	284	15	53	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
445383	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
445386	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	446	11	-276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAAGACGCCATTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
445402	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
445406	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
445412	contig_567_pilon	-	3408	12	Intergenic	novelGene_33955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_1	823.965186217945	2040	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	190	1257	338158	308820	FALSE	30	CAAACTGGATATTGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKQDPSVLHMEEMRFLREWVESMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338347	306668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338090
445440	SIRV2	+	471	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	126	-74	-126	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAATACCTCTTGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
445466	SIRV5	-	224	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGCTTCTGCAATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6886	6352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_6450_6655_6722_6825
445547	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
445555	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
445563	contig_15063_pilon	+	1649	7	Intergenic	novelGene_12261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3668.38635809019	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	211	1449	34808	39515	FALSE	10	GCTTTGTGGTGTAGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27560	39715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
445608	contig_4364_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	81	401	1530895	1531294	FALSE	20	GCGCCCCTGAATCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTE	1530444	1531294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
445610	contig_4364_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_2608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
445616	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_9303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
445684	SIRV6	+	914	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	577	0	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
445700	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
445702	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
445728	SIRV6	+	148	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	550	85	550	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10787	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
445736	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
445783	SIRV2	-	249	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	39	660	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
445801	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
445804	contig_4364_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_4442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533097	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
445847	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	4	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
445887	contig_16121_pilon	+	3702	3	Intergenic	novelGene_6857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	452.5	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTCTAGTTCTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33596	65993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_60693_60856_62565
445906	SIRV6	+	392	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	138	5	32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTATCGTGCCGCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
445924	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
445943	SIRV6	+	267	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
445955	contig_1725_pilon	+	2552	16	Intergenic	novelGene_24307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_13	446.360223237789	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	189	2231	235987	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	235798	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
445960	contig_10324_pilon	+	3508	23	Intergenic	novelGene_7702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	1105.73593252609	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	65	2179	51839	79380	TRUE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPPAWAGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51774	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80435_80491
445967	contig_4364_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_4499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533114	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
446002	contig_4364_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAGACGGACTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
446011	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
446020	contig_9955_pilon	-	2980	5	Intergenic	novelGene_21279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	714.724203801718	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794_49257_49294_49380_49692
446102	contig_8317_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_20221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCACTGCCTTGATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
446114	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842765	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
446125	SIRV6	+	139	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	70	787	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
446130	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_2970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
446166	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_2953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
446180	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	4	1277	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446210	SIRV5	-	458	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTTCTCCACCTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10861
446224	contig_15063_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_10393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	237	1379	34808	39538	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
446230	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	4	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446236	SIRV6	+	256	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	29	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11097_11205
446246	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
446279	contig_8317_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_19710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAACAGCAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
446295	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
446308	SIRV6	+	242	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
446342	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446373	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	131	2	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
446410	SIRV6	+	299	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-441	46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACGCGTTGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470
446412	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	13	38	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
446420	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_2354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532927	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
446430	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	396	-2	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
446435	SIRV5	-	329	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTCTCAATGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
446441	contig_8538_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_5024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842820	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
446491	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	213	1388	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34611_34926_35034_35380_35839_36158_36266
446524	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446587	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
446601	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
446621	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446667	contig_4364_pilon	+	174	1	Intergenic	novelGene_4539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533133	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
446671	SIRV6	-	400	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATAGGTCTCTTTCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
446678	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	134	5	36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGTGCCGCTTGGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
446688	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446709	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10350	5	1200	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
446764	SIRV5	+	228	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	289	151	175	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8490	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
446772	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10409	1	1172	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
446807	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	15	1252	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446827	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16413	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
446840	SIRV5	+	419	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-128	914	-14	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCGGAGACCTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8187	10952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
446848	SIRV6	+	425	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
446868	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
446885	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
446924	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446925	contig_4364_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_1191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532897	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
446939	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
446991	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2052	577	34	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
447014	contig_8317_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_19574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
447034	contig_4364_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_1318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGACCGTGAGGTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
447055	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447108	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
447141	SIRV6	+	273	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10475	2	1325	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11562	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
447159	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	9	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447161	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	248	-4	-78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGCACAAGTCGGTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
447184	SIRV2	+	290	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	307	-74	-307	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGATACGCAGTAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
447209	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
447211	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447285	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	233	-2	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
447289	SIRV5	-	225	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAACAATTTAAGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10969	8470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
447302	SIRV6	+	830	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
447311	SIRV6	+	498	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1482	490	53	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGCAATCAACTCACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	11335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
447312	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	2	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
447357	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	209	-4	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACGTTTCTAGACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
447360	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	1	1284	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447370	SIRV6	+	923	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	28	577	-9	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	230	721	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1115	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
447411	contig_4364_pilon	+	413	3	Intergenic	novelGene_729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	51	413	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQVIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530474	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531100
447452	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16423	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
447453	contig_8538_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_4969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842806	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
447515	contig_4364_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532722	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
447520	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10458	5	1308	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447536	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447588	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
447591	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447609	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	234	2	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
447614	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447649	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447667	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
447745	SIRV5	+	184	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	333	151	219	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8534	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
447750	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447765	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	40	1255	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAAGCAGCAGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
447806	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447911	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533073	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
447924	SIRV6	+	689	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
447934	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_1432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
447938	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
447954	SIRV2	+	513	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	65	136	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTTCTAGGCCTACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173	1767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1663_1743
447957	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
447986	SIRV6	+	448	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	541	52	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTAATTGTTGGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
448040	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_11055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448055	SIRV6	+	934	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	583	11	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
448064	SIRV6	+	954	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	574	0	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
448068	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	2	64	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
448071	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	20	1264	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448085	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	121	9	39	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
448107	SIRV6	+	501	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	3	8755	3	36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGTGCGTCTAGGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
448119	SIRV6	+	782	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	551	11	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
448143	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
448166	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	284	13	53	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGTAGTGCCGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	10775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
448173	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448184	SIRV6	+	895	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	43	590	0	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
448203	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448228	contig_8538_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_5062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842831	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
448242	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448255	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
448272	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448285	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
448334	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448343	SIRV6	+	376	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	561	-81	388	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1691	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
448360	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448365	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448376	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448392	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_8597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26354	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
448402	SIRV6	+	401	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10424	1	1187	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11424	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
448444	SIRV6	+	291	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845
448453	SIRV6	+	763	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	579	2	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
448485	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448497	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_11053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448513	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
448525	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_19890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
448558	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448590	contig_4364_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_2827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCAACCCTGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
448599	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
448605	contig_8538_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_4841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
448639	contig_15063_pilon	+	2201	6	Intergenic	novelGene_8484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3125.35310005126	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1399	1950	36064	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
448642	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
448643	SIRV6	-	400	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTTGTTCCATGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
448648	SIRV2	-	329	3	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	644	313	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCGCTAGTCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4088	3330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3963
448656	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
448660	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448661	contig_8598_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_22905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	CTGTCCTGATTGTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
448662	contig_8317_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_20038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
448664	SIRV6	+	399	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	125	11	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
448696	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_1065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
448725	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
448753	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
448783	SIRV6	+	406	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10419	1	1182	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11419	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
448804	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448814	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10520	1	1283	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448844	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
448856	SIRV6	+	403	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	11	8845	4	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
448900	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
448916	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
448917	contig_6980_pilon	+	2256	9	Intergenic	novelGene_36034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	695.347170483925	13	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	427	1155	362370	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346100	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356942_361141_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
448960	SIRV6	+	780	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGTAATAGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
448971	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	40	3380	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
449115	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
449153	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	241	-4	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
449165	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449169	SIRV6	+	404	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	20	1165	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
449170	SIRV6	+	428	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8841	-4	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
449179	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	15	1255	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449191	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
449214	SIRV6	+	203	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	65	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2743_2829_3106_3165_10724
449239	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
449263	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
449271	SIRV6	-	230	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11261	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
449306	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449311	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
449312	SIRV6	+	914	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-2	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	217	708	1733	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1128	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11106_11205
449331	contig_8772_pilon	+	1145	5	Intergenic	novelGene_21083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	2260.31539558089	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1002	143	1144	15355	20116	FALSE	35	GAACTGTAAGTACCACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALK	15212	20117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996
449336	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	85	498	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
449368	SIRV6	+	554	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	902	570	-296	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	13	345	2002	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1989	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
449370	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449376	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
449393	SIRV6	+	262	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10560	4	1323	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11560	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
449418	contig_8317_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_20042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
449419	contig_5196_pilon	-	1260	2	Intergenic	novelGene_38670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_1	0	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	76	429	14523	14170	FALSE	15	TGGATTGGATGCCTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRVLWSELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTGIPLILTSLSFTYSIKDKVT	16081	13338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_14542_16024
449437	SIRV5	+	412	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7470	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
449453	SIRV6	+	746	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	592	578	376	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	54	545	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1679	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
449467	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
449503	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
449534	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
449542	contig_6735_pilon	-	2128	14	Intergenic	novelGene_15713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	890.716166879679	378	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	86	1126	564868	543756	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEVSIPPKGLCP	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543301_543731_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
449593	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449618	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10435	2	1285	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11522	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449619	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_12203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	33	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27542	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
449620	SIRV5	+	351	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7610	1	-217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGCCAACAGCGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
449623	contig_8317_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_19655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCGAACAGCAAAACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16792	16400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
449627	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
449628	contig_8317_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_19664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAACAGCAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16759	16401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
449637	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	249	2	18	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
449674	SIRV6	+	918	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	592	18	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
449684	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
449689	SIRV6	-	332	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTTAGCCGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
449692	SIRV6	-	210	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	85	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1525_1631
449740	contig_8317_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_20080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACCCACAGCAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
449754	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
449762	SIRV5	+	415	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	875	29	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
449806	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	234	0	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
449809	SIRV6	+	382	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	142	11	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
449841	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449848	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4607	47	3432	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
449869	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449874	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	15	1276	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
449899	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_19858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
449999	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
450003	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
450011	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
450016	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450050	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450060	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
450119	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	6	1481	28164	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450120	contig_15063_pilon	+	1666	8	Intergenic	novelGene_12333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3484.75527791246	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	12	1412	28164	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLIIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35129_35203_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450122	contig_8317_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_20311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
450124	SIRV6	+	797	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	566	337	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
450150	contig_4364_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_1859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
450170	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
450175	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450187	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
450217	contig_4364_pilon	+	181	1	Intergenic	novelGene_4544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533136	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
450231	SIRV6	+	455	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-3	8807	3	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCAATCGGTAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	2524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
450276	contig_4364_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_4431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
450293	contig_5643_pilon	+	2510	15	Intergenic	novelGene_39034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	633.520516556456	565	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	647	1816	634983	640732	TRUE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSK	631202	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_641244_641412
450316	contig_8538_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_4656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841399	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841425_842792
450338	contig_6215_pilon	-	3084	9	Intergenic	novelGene_21186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	758.530971269466	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	725	1576	233835	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243071	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_231991_233714_234147_235190_235361_238588_238751_242990
450344	SIRV6	+	698	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	757	580	-441	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
450366	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
450402	SIRV2	-	339	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4534	34	3359	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
450406	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
450457	SIRV6	+	918	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	577	-4	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
450520	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	4	1169	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
450524	contig_8317_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_20025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16417	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
450543	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	71	508	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
450604	contig_4364_pilon	+	149	1	Intergenic	novelGene_4555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533168	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
450619	SIRV6	+	768	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-11	544	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	108	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
450623	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	225	-4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
450641	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
450646	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
450689	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	124	-4	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
450701	contig_5189_pilon	-	2237	10	Intergenic	novelGene_34848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	1046.45774041245	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	111	1103	244235	199237	FALSE	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_244163_244289_247694
450716	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
450734	contig_4364_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	798	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532855	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
450821	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
450839	SIRV6	+	771	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-27	557	16	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
450855	SIRV6	+	550	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	904	572	-294	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	11	343	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1991	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
450863	SIRV6	+	286	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	216	-4	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTGCCTAACGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
450875	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
450925	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
450926	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
450951	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	232	1359	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27137	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
450968	SIRV6	+	347	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	5	1248	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
450975	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
450994	contig_8317_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_19856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAATCAGTACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
451032	SIRV6	+	912	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	583	-4	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
451039	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
451040	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	122	11	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451043	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
451044	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
451074	SIRV6	+	698	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106
451101	SIRV6	+	635	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	8509	1	282	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTACGTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	2822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
451115	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	89	495	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
451118	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451120	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9657	578	507	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
451177	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451185	SIRV6	-	241	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCACCTAACTTTCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
451190	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
451195	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451235	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451236	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
451237	SIRV6	+	347	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	186	2	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCACGAGTAGCCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451261	SIRV2	+	269	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-58	312	-58	-312	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCGCAAGATACGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050	1319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
451295	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
451302	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10547	4	1310	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451321	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	9	1266	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451326	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451334	SIRV6	-	409	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCATGCGAATGTAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
451338	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	572	7	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	305	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
451352	contig_5023_pilon	+	2231	16	Intergenic	novelGene_7253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2049.62895720719	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	82	1854	607279	647924	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLNCFTKSFFTRHLSSCKAKPEQCKFSSPNRSRNLHQTN	580847	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643444_647807
451394	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
451427	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532950	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
451480	SIRV2	+	239	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	358	-74	-358	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTGCGAAGCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
451498	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451509	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
451534	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
451642	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
451685	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	120	11	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451749	SIRV6	+	204	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	297	44	66	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
451753	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451770	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
451829	SIRV6	+	841	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	279	11	84	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACAAAACGTCACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	11052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
451848	contig_9345_pilon	-	2453	4	Intergenic	novelGene_24696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1844	junction_3	1376.35759242365	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTACCTGATGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001312	950500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
451851	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9658	575	508	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
451861	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
451877	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451878	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451891	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
451892	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451900	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_19914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAATTTTGAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
451902	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
451933	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	233	-10	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
451934	SIRV6	+	652	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-344	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	80	394	2021	10736	TRUE	30	TGTAATGGAAATTGGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
451940	SIRV6	+	490	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10255	5	1105	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11342	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
452022	SIRV6	+	468	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8801	-4	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
452134	SIRV6	+	524	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTATGGCACTTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2477
452141	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
452187	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10520	1	1283	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
452191	contig_8317_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_20639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTCCAGCAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16748	16465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16700
452196	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
452207	SIRV5	-	449	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCCTGCCAGTTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
452217	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
452229	SIRV6	+	168	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-272	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
452326	SIRV5	-	470	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACGGGTGACTACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
452335	contig_8317_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_20097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGACACCCACAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16783	16432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
452345	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	67	511	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
452350	SIRV6	-	389	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATAGGTCTCTTTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
452383	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_19828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTCACAGAATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
452388	SIRV6	+	326	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1275	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
452405	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
452414	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16390	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
452457	SIRV6	+	380	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	45	1164	-43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTACTAAGCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
452466	SIRV6	+	204	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	504	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11027_11109_11205
452472	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26367	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
452476	SIRV5	-	320	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATATACAGATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8377_8448_8590_10863
452492	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
452512	SIRV5	-	445	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
452514	SIRV5	-	338	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
452561	SIRV2	-	568	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4266	73	3091	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGAAGATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	1073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
452577	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	36	3423	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
452578	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
452633	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
452672	contig_8317_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_19447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16749	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
452724	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_12463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
452742	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
452774	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
452793	SIRV6	+	252	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2057	568	39	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
452815	SIRV6	+	348	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	185	2	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAGTAGCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
452837	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
452852	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
452869	SIRV2	-	578	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	66	3088	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
452882	contig_4364_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_3504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTGTCATGTGCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533200
452885	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
452899	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
452924	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
452946	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	7	1482	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
452970	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453033	contig_4364_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAACTTGTTGCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532284	1532719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
453129	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10333	5	1183	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11420	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
453164	contig_8317_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_20144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCCTTGATGACACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
453166	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453187	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	7	59	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
453190	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453196	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533060	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
453222	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453254	SIRV6	-	339	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCGAATTTGGCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
453281	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_19975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
453292	SIRV5	-	379	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCACTTTCAGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
453332	SIRV5	+	445	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7437	1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTATGACACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
453335	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453384	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	465	2	234	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2750	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
453385	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	81	499	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
453448	contig_8317_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_20178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
453452	SIRV6	+	262	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10560	4	1323	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11560	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
453456	contig_4364_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGACGGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533272	1532884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
453479	SIRV5	+	400	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_3210_3405_3483
453516	SIRV6	+	652	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	854	520	-344	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	61	393	2002	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
453537	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453580	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
453594	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
453595	SIRV6	+	913	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	578	0	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
453625	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
453629	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453633	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
453634	SIRV6	+	591	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8710	1	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
453649	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453650	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	5	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453700	SIRV6	+	253	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10548	25	1311	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453705	contig_9955_pilon	-	2679	5	Intergenic	novelGene_21276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	228	932	49296	47196	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSGNGRIMDFILA	49836	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47232_47569_47737_48794_49380_49692
453731	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	75	503	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
453748	SIRV6	+	690	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	72	219	158	376	2002	2780	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGESRKSGTRRGTYR	1844	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2625_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
453761	SIRV6	+	454	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	374	266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740
453770	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	591	1412	35271	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35032_35380_35839_36158_36266
453779	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
453785	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	68	512	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
453789	SIRV6	+	346	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGTCAAGTCGTAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1848_2027_2470
453823	contig_4364_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	76	354	1530895	1531252	FALSE	10	TGCGTGTGGCCCCCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE	1530449	1531253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
453830	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	21	577	-16	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	237	728	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1108	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
453845	SIRV5	-	287	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGTTACCAAAGTACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10866
453854	SIRV6	+	407	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10341	2	1191	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11428	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
453857	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453860	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453863	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
453865	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	12	56	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
453887	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	4	1275	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
453903	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	875	31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
453913	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
453917	SIRV2	-	250	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	674	24	674	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGACGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4058	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
453937	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
454003	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
454017	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
454043	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	237	-4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
454071	SIRV6	+	295	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	240	0	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
454093	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	229	15	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
454112	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454119	contig_10861_pilon	+	2146	6	Intergenic	novelGene_39261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	306.616764055718	669	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	257	697	1339531	1348775	FALSE	45	TATAGCAGGATACATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRPNCSWNTQYSSAYYTSRKI	1337558	1350224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1348714
454147	SIRV6	+	440	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8844	18	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
454158	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	161	-74	-161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATAAATACCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
454165	SIRV6	+	172	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	222	486	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
454187	SIRV6	+	867	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	166	501	157	657	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2022_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
454215	SIRV6	+	499	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2038_2470
454241	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	24	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
454284	SIRV6	+	501	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8800	1	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
454303	contig_4364_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_1068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
454314	SIRV6	+	452	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-11	8818	-5	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGTTCGTCTTGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	2513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
454344	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	15	1267	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454378	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
454386	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
454405	contig_4364_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_2897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATTTTTTCCAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
454425	SIRV6	+	949	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	26	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	247	780	1733	10780	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1098	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11031_11109_11205
454429	contig_4364_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_2823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533010	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
454433	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
454449	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
454461	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
454468	SIRV5	+	376	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7592	2	-199	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTCCCACCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
454470	contig_4364_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	76	357	1530895	1531255	FALSE	15	CGTGTGGCCCCCGAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNEL	1530449	1531255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
454494	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454496	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
454529	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
454534	SIRV6	-	305	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCAAGAATTTTCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
454576	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
454592	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	2	222	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
454631	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	15	1259	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454677	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454701	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
454736	SIRV6	+	205	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9644	588	494	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10731	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
454758	contig_8317_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_20107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGATGACACCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
454764	SIRV6	+	926	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	565	0	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
454805	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	886	-17	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
454806	contig_8317_pilon	+	361	2	Intergenic	novelGene_19263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	37	360	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14257	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
454827	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
454866	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	390	-2	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
454873	SIRV2	-	226	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4647	34	3472	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
454887	SIRV6	+	538	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8749	15	42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
454930	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	4	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454933	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
454940	SIRV2	-	263	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	658	27	658	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4074	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
454948	contig_8538_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_4719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	79	312	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842749	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
454950	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
454951	SIRV2	+	300	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	297	-74	-297	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAATGCTAAACCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
454955	SIRV2	+	221	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4702	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4800_5787
454968	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842767	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
454974	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	4	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
454978	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	31	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11033_11109_11205
454990	SIRV6	+	253	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	69	1267	67	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTATGGATTTAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455001	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	203	1378	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
455066	SIRV6	+	652	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-397	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1888	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
455070	SIRV6	+	593	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-349	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	66	398	2002	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1936	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11031_11109_11205
455073	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
455105	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455162	SIRV5	-	394	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTACGGTGGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
455178	SIRV6	+	249	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	70	1270	66	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAATTATGGATTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455179	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	232	-2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
455208	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
455241	contig_1725_pilon	+	2557	19	Intergenic	novelGene_24290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	562.916241055847	74	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	124	2238	218463	255543	FALSE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGKAPADQHPRHRGRGECGRAEEGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201496	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201569_209823_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
455246	SIRV6	+	666	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
455250	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
455251	SIRV5	+	403	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-95	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
455316	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	4	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455338	SIRV6	+	991	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	530	7	16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	45	TGGTAACAATGTAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
455366	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
455385	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
455386	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533016	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
455402	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_19760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
455409	contig_8538_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_5000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842813	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
455411	contig_12622_pilon	-	2291	13	Intergenic	novelGene_5907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2157.1701032062	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	78	2084	1590968	1583745	FALSE	25	TATATGTACATGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTDSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYAAGPSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591045	1583537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586671_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
455440	SIRV5	-	328	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
455443	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	591	1412	35271	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36266
455501	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	53	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3103_3163_10724
455533	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455549	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
455580	SIRV5	+	379	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	900	40	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
455627	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
455636	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455640	SIRV5	+	258	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	151	145	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
455677	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
455693	contig_4364_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_4161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTTCCAGCGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
455698	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
455704	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
455707	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
455712	SIRV6	+	169	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	439	0	-269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCCATTGCAAAACGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
455717	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
455726	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
455733	SIRV6	+	451	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8824	-10	-33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAACTAAGGTTCGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
455762	SIRV6	+	761	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	546	0	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
455789	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
455808	SIRV6	+	438	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10310	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
455818	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
455834	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
455850	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
455858	contig_8317_pilon	+	438	2	Intergenic	novelGene_19366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16246	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
455908	SIRV6	+	958	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	569	1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
455913	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	70	515	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
455933	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_19450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
455967	SIRV6	+	367	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	59	1163	-57	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTAGTCGATTATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
455992	SIRV6	-	320	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGACCATTTCTGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
456008	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_10211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	238	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36107_36248_36600_38975_39092_39506
456011	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
456018	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
456023	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
456031	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	9	1481	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
456059	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456073	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
456078	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456109	contig_3956_pilon	+	2681	11	Intergenic	novelGene_14924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1282.05401212273	2	138	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	81	1760	1281682	1289798	FALSE	15	CTCTGCAGGGACTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPVQSKWSVVSMVS	1281601	1290719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284132_1286138_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289655_1289758
456183	SIRV6	+	550	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8719	-4	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAAGGTGAGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
456201	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10425	1	1188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11425	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
456202	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456224	contig_9807_pilon	+	2623	15	Intergenic	novelGene_32875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	547.450827164655	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	842	1795	140826	158783	FALSE	55	AAAAGTAAGTATAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNDYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109028	159611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128668_139428_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145159_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
456248	contig_15063_pilon	-	1720	7	Intergenic	novelGene_11645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
456254	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
456269	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	56	514	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
456282	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
456299	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456310	SIRV6	+	338	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGAGTAGCCTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
456331	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456398	contig_12622_pilon	-	2306	13	Intergenic	novelGene_5999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	6	1538	1590968	1586655	TRUE	5	GGGCTGGCCCCCTCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590973	1583619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
456474	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10434	2	1197	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11434	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
456494	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	243	-15	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
456503	SIRV6	+	927	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	572	-8	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
456512	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456544	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
456550	SIRV6	+	485	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8809	8	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAGCAATCGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
456573	SIRV6	+	288	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10457	5	1307	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11544	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456581	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456592	SIRV6	+	338	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	13	31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTATCGTGCCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
456600	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10441	5	1291	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11528	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456607	contig_4364_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_2432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
456608	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456612	SIRV2	-	247	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	649	52	649	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGACGTCGACACAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	3695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
456645	SIRV6	+	199	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	514	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11036_11109_11205
456651	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
456687	SIRV2	-	241	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4632	34	3457	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
456707	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	222	-4	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
456719	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	41	3086	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
456730	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456752	SIRV6	+	289	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
456808	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456809	SIRV2	+	279	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	318	-74	-318	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACGCAATCGCAAGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
456834	contig_15063_pilon	-	1725	7	Intergenic	novelGene_10535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	GAGGTAGTCACATTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
456871	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
456877	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
456890	SIRV6	+	425	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
456942	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457002	contig_15063_pilon	-	1546	5	Intergenic	novelGene_11121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
457053	contig_4364_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATATCATCCCTCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533274	1532864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
457059	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
457086	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26355	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
457092	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457100	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	12	33	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
457134	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	5	1256	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457190	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16497	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
457296	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
457300	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457352	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
457360	SIRV6	+	951	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	566	11	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
457366	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	237	-2	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
457374	SIRV6	+	395	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	125	15	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
457393	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	442	11	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
457408	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
457425	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457487	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457498	SIRV6	+	553	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	375	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
457519	SIRV6	+	797	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	545	2	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
457523	SIRV6	+	1530	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	-13	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
457540	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
457546	SIRV6	+	183	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	67	7651	67	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
457563	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
457575	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	15	1268	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457623	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457634	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457646	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	121	5	39	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
457654	contig_14666_pilon	+	1428	5	Intergenic	novelGene_39574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	90	1421	477340	485206	FALSE	20	GTGAAGTGCTCCCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQILKGLIASAHSVNFSFLAK	477250	485213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484861_485150
457676	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457682	contig_8317_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_20257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
457711	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	4	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457785	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10523	1	1286	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11523	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
457896	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
457930	contig_4364_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_4406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAGGCAAGTAACAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
457975	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
457993	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
457994	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458000	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_9509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458039	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458042	SIRV7	-	2423	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	38	1	33	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	65	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAGTGTTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147885	1004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
458056	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
458057	SIRV6	+	1516	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	22	-10	-15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	236	727	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1109	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
458063	contig_15063_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_8518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	319	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
458072	contig_8538_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_4865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842776	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
458086	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458089	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
458093	contig_8317_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_20624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTTTAATGAGAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
458165	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	131	11	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
458183	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	122	11	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
458203	SIRV2	+	222	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4702	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4793_5779
458209	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-44	95	6	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
458270	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458311	SIRV6	+	599	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	851	576	-347	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	64	396	2002	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1938	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
458316	SIRV6	+	276	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10549	1	1312	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11549	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458348	contig_8357_pilon	-	3183	7	Intergenic	novelGene_39761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	90	junction_3	502.330789641868	2056	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	274	843	891622	885537	TRUE	0	GGTGTTGGTTTTTCCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGQLAEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKVTHVEPWEKGSRKTAGQTGMCGGVRGVGTGGIVSTAFCLLYKLFTLKLTRKQVMGLITHTDSPYIRALGFMYIRYTQPPTDLWDWFESFLDDEEVWD	891895	882285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885477_885549_887117_887179_887257_887410_887717_887787_891346
458349	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458355	SIRV6	+	899	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	45	584	2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	213	704	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1132	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
458394	SIRV6	+	656	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	798	572	-400	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
458407	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458434	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	67	513	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
458458	contig_15063_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_9160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458469	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
458498	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458499	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
458543	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
458567	contig_8538_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_4934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842791	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
458579	SIRV6	+	443	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-344	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	80	394	2021	10736	FALSE	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
458602	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458640	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
458642	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
458662	SIRV6	+	900	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	586	-1	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
458671	SIRV5	-	388	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTAGGACGAATTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8383_8455_8590_10863
458716	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
458724	SIRV6	+	416	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	4	1169	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
458731	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
458749	contig_8538_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_5064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842832	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
458770	contig_8317_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_20664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGACTTGGTGACCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16796	16481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
458779	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10527	1	1290	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11527	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
458781	SIRV6	+	402	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	70	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
458810	contig_8598_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_22911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	191218	191553	NA	5	TCCTGATTGTTGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191216	191554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
458815	contig_19564_pilon	-	2304	5	Intergenic	novelGene_29589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	96	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	177	1511	15529	12201	TRUE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15705	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11396_11465_13259_13554_13666_13945_14055_15472
458834	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	467	1	236	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2752	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
458878	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
458891	SIRV6	+	394	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	5	1201	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
458899	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
458902	SIRV6	+	381	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	97	7	73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
458919	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
458965	SIRV6	+	199	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	310	36	79	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2595	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
458991	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-44	95	6	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
459032	SIRV6	+	748	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	521	-441	25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	TGTAATGGAAATTGGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
459053	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
459087	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459104	contig_8317_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_20647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16467	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
459105	SIRV6	+	730	8	NIC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724
459226	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10317	5	1167	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
459320	contig_8317_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_20110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16436	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
459327	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7434	1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTATGACACTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
459328	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-6	878	-6	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8309	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
459335	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_19861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
459365	SIRV5	-	325	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTTCTCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8451_8590_10861
459372	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
459435	SIRV6	+	346	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	543	-33	370	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCGTGCGTCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673	2573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
459440	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
459489	SIRV2	+	275	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	322	-74	-322	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGCACGCAATCGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
459537	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_11049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
459552	SIRV5	+	344	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-25	886	-25	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
459554	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
459581	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
459629	SIRV6	+	318	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-15	182	-2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
459663	SIRV6	+	900	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	223	8	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
459667	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
459692	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	62	520	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
459729	SIRV2	-	356	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1786	-741	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAACGAGGTATAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2946	1776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2053_2667_2803_2881
459740	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459756	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
459761	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10438	2	1288	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11525	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459770	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459794	SIRV6	+	238	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	52	493	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
459810	contig_4364_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_2934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTCAGATTTTTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533297	1533021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
459821	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	12	1278	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459826	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459861	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	30	1268	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
459870	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
459904	SIRV6	+	235	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	62	486	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
459923	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
459952	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
459978	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
459996	contig_14273_pilon	+	3283	9	Intergenic	novelGene_21152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	532.80595670469	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	354	1964	135370	151187	FALSE	15	AATCTTGATTTGTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127939	152506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128016_128071_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
460008	SIRV6	+	366	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1638	3	246	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
460012	SIRV6	+	517	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8748	0	43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
460021	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
460057	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
460094	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
460102	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460111	SIRV5	+	344	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2279_2316_3298
460126	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460139	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
460156	SIRV6	+	502	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1397	571	12	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2484	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
460162	SIRV2	-	336	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4537	34	3362	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
460200	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460221	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9655	575	505	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
460238	SIRV6	+	409	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8795	164	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATCTGCAGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
460263	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460283	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460315	SIRV6	+	770	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	377	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	53	547	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1680	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
460318	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	218	0	-48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCTTGCCTAACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
460332	SIRV6	+	404	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10421	1	1184	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11421	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
460417	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
460431	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
460439	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
460458	contig_4364_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_4435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533095	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
460464	contig_8317_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_20682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCTGAGCAGACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
460493	contig_8317_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_20251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCACTGCCTTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
460533	SIRV6	+	427	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-81	337	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
460554	contig_15063_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_13145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
460562	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
460587	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
460591	SIRV2	-	427	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4446	34	3271	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
460592	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_9714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
460598	contig_8538_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_4843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842773	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
460611	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
460629	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
460645	SIRV5	+	375	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	13	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
460651	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27551	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
460659	SIRV6	+	1514	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	3	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
460672	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
460678	SIRV6	+	753	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	589	2	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
460694	SIRV6	+	198	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	507	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
460744	SIRV6	+	302	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	222	11	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
460752	SIRV6	+	548	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	891	596	-307	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	24	356	2002	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1978	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
460798	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
460818	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	21	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
460841	SIRV6	+	604	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATGGGACTAGTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1840_2027_2470_2621_2740
460846	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
460851	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
460874	contig_15063_pilon	+	1740	8	Intergenic	novelGene_8447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3646.68247891708	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26030	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26038_27126_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
460899	contig_10958_pilon	+	1424	2	Intergenic	novelGene_5480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895684	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
460916	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_20258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCAAAAATCTGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
460917	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	238	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
460936	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10303	2	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
460937	SIRV6	+	552	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1389	529	4	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	93	302	2569	10736	TRUE	45	GGTAACAATGTAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2476	11296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
460978	contig_4364_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_3852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCGGGAATACATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
460990	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
461009	SIRV6	+	708	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	174	494	2458	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2011_2450_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
461047	SIRV6	+	198	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
461055	contig_8317_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_20605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGCAGCCTTTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
461064	contig_15063_pilon	+	1612	6	Intergenic	novelGene_12809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3667.21665572134	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	1	1380	28164	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	28163	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
461088	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	9	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461131	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7483	1	-90	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
461135	SIRV6	+	492	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8799	11	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
461139	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	4	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461154	SIRV6	-	398	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTCTTGTTCCATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
461178	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
461196	contig_4364_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_4427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533093	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
461238	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	218	-4	-48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCTTGCCTAACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
461250	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	4	1301	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461255	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461265	SIRV6	+	717	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8166	-16	625	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTATGAGTAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	3165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
461272	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
461279	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
461329	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	105	23	23	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3128	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
461337	SIRV6	+	691	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	578	-441	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
461348	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-73	875	41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
461376	SIRV6	+	300	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10525	1	1288	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11525	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461396	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	1	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461398	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	12	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
461399	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_10273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
461425	SIRV6	-	337	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGTTGGTTAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
461431	contig_4364_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532852	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
461501	SIRV6	+	497	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
461512	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
461543	SIRV6	+	276	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
461561	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
461566	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1638_1736_1845
461625	SIRV5	+	345	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7605	1	-212	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGCGTTATTATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
461681	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_19976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
461707	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
461745	contig_8317_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_20659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16477	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
461754	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-27	94	-14	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
461767	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461779	SIRV5	+	510	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-326	3294	-212	-2417	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATGAACGATGGTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7989	8572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
461790	contig_15063_pilon	+	1651	5	Intergenic	novelGene_9771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	3079.04640270328	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	239	775	34808	35816	TRUE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRLLQQSPPLCSGETTPPQTFSPTGH	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35739_36158_36266
461794	contig_8538_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_4946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCATTCCCAAATAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842799	843118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
461795	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
461809	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
461869	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	227	11	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
461872	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10326	2	1176	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
461897	SIRV6	+	941	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	199	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	242	733	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
461901	SIRV6	+	255	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
461924	SIRV6	+	736	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8167	1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
461929	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
461933	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	1	1284	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
461937	SIRV6	+	690	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	579	-441	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
461963	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
461965	SIRV6	+	402	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10364	60	1127	-58	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTAGTCGATTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11364	11766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
461966	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
461987	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	672	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
461989	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_8902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462010	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	1	1301	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462012	contig_8317_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_20074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16428	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
462062	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462063	contig_12873_pilon	+	2135	7	Intergenic	novelGene_27133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	1182.41673420725	6019	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1070	1561	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15936	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
462065	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462068	contig_3956_pilon	+	2413	14	Intergenic	novelGene_15038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1440.92996762425	7	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	121	1731	1282731	1289798	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGPASWSLSTLWRSSVQSKWSVVSMVS	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287499_1289637_1289677_1289758_1289892_1290297_1290492_1290620
462069	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
462077	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10325	5	1175	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11412	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
462094	SIRV6	-	201	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTTTTTCCAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11240	10726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10819_11034_11109_11205
462103	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	9	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
462104	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	221	-4	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATATGTCTTGCCTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
462117	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
462118	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462119	SIRV2	-	348	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2973	746	1794	-746	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCTAGAACGAGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2938	1781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
462133	SIRV5	+	343	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-22	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8458_8586_10858
462175	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	82	503	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
462176	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	15	1272	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462191	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_19791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
462192	SIRV6	-	292	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGCGAACTTTGACGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
462197	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
462210	contig_5954_pilon	-	2427	16	Intergenic	novelGene_28630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	407.158423985336	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	729	2066	956150	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956185_956242_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
462212	SIRV6	+	706	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	771	549	-427	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	144	476	2002	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1858	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
462231	SIRV6	+	370	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10454	2	1217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11454	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462255	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	33	1265	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTTAGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462258	contig_4364_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532825	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
462302	SIRV6	+	256	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	45	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2743_2829_3106_3165_10724
462322	SIRV6	+	292	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
462327	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462339	SIRV6	+	273	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	15	1301	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462340	contig_9345_pilon	-	1890	6	Intergenic	novelGene_24623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	235	816	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001309	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
462342	SIRV2	-	549	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4324	34	3149	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
462390	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462459	contig_4364_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532883	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
462482	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533082	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
462483	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	15	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845
462507	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
462525	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
462535	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532930	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
462538	SIRV6	+	444	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10304	2	1154	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
462564	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462571	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	67	511	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
462594	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462615	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
462665	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
462713	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_12243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	213	1448	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27558	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
462730	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
462744	SIRV6	+	438	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
462780	SIRV5	-	215	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAGATGTAACCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
462812	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
462826	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	390	0	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
462878	SIRV6	+	845	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	518	337	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
462881	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
462904	contig_8598_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_22909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	191218	191553	NA	5	GTCCTGATTGTTGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191216	191553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
462921	SIRV6	+	1019	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	476	-4	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	ACCATAAATTTGTGAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
462931	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
462937	contig_4364_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_3363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
462942	SIRV6	+	940	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	577	11	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
462945	SIRV5	+	413	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	875	31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
462951	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	62	7651	62	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
462957	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	64	496	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
462985	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
462986	SIRV6	+	1467	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	59	2	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	GGATTTAGTCGATTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
463000	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
463016	contig_1450_pilon	+	3037	22	Intergenic	novelGene_27342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	524.573127396357	45	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	865	2598	245	2842	244426	355748	FALSE	85	GCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243311	355943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345765_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
463017	SIRV6	-	318	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGACCATTTCTGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
463055	contig_8045_pilon	+	2714	3	Intergenic	novelGene_35349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	70.5	1453	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116039	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075
463068	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
463081	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842778	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
463082	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
463105	contig_12622_pilon	-	2368	12	Intergenic	novelGene_5973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_3	1968.46638295564	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	98	1453	1590194	1586655	TRUE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590888	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
463153	SIRV6	+	326	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	346	95	180	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
463158	SIRV6	+	784	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	546	14	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
463189	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
463208	SIRV6	+	393	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	124	18	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
463244	contig_8317_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_20060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16424	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
463278	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
463329	SIRV6	+	332	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470
463335	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
463362	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
463374	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
463379	SIRV5	+	375	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
463419	contig_5023_pilon	+	2275	12	Intergenic	novelGene_7221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2236.16364959468	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	579	1253	629246	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609693_625714_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647452_647741
463463	contig_4364_pilon	+	412	3	Intergenic	novelGene_361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	81	410	1530895	1531303	FALSE	35	TCCCAAGGCCAACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPL	1530444	1531305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
463494	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
463509	SIRV6	+	337	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTATCGTGCCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
463553	SIRV6	-	336	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTTGGTTAGCCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
463563	SIRV6	+	548	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGACGCGTTGAAGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2477
463591	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
463595	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463600	SIRV6	+	288	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10527	11	1290	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11527	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463604	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	2	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463627	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	82	503	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
463645	contig_8598_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_22896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	366	10	375	191218	191583	NA	30	GGAAGCTGGTATCTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGE	191208	191585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
463647	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	397	0	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
463665	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463671	contig_4364_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_1154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTCGGTGAAGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533279	1532895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
463693	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463726	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463731	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
463757	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
463795	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
463820	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463863	contig_3077_pilon	+	2339	8	Intergenic	novelGene_26710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3101.92362963398	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	554	1060	13867	16408	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10105	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_11972_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_17054_17449
463867	contig_7229_pilon	-	2242	5	Intergenic	novelGene_39797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1636.39945841472	118	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	34	645	877522	875611	FALSE	25	GCAAATGGACCTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLQTI	878211	874013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875621_875666_875960_876729_876867_877350_877535_878190
463896	SIRV5	-	453	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTCCACCTTCACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
463903	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
463921	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
463929	SIRV6	+	379	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10443	4	1206	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11443	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
463936	contig_4364_pilon	+	434	3	Intergenic	novelGene_633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	72	434	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530453	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
463945	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
464006	contig_8317_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_20653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16472	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
464036	SIRV5	-	327	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTTCTCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
464045	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
464056	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	397	3	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
464064	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_3982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
464086	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	240	-4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCGGTCGCCCAGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464145	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	232	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464157	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
464177	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
464185	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
464191	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
464194	contig_8317_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_19420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16392	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
464203	SIRV6	+	214	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10611	1	1374	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11611	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
464275	contig_8538_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_5017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842818	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
464286	contig_4364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_3887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
464287	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	392	15	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
464301	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	492	87	492	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
464323	contig_8317_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_20022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTCTGTCTCATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
464330	contig_6215_pilon	-	2747	9	Intergenic	novelGene_21193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	766.993959803465	76	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	583	1239	233768	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPGLKKWKKGIRDVGMQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243076	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
464341	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
464364	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464384	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10523	1	1286	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11523	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
464397	SIRV2	-	206	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4663	38	3488	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
464412	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
464436	SIRV6	+	734	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	20	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTCAACAAGAGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
464447	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
464448	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
464478	SIRV6	+	423	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1852
464492	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
464506	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_8579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26351	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
464510	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_19792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
464550	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
464593	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10533	1	1296	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11533	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
464610	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
464637	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
464650	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
464694	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	214	-4	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTAACGTTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464699	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	95	2	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464723	contig_2027_pilon	+	3588	26	Intergenic	novelGene_39887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	56	junction_1	359.351763040061	979	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1058	3177	218	3394	122795	136487	FALSE	15	AGATGTGGCATGCCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	114012	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_114230_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
464725	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
464775	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
464790	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	82	486	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
464799	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
464833	SIRV6	+	714	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
464872	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	233	3	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
464884	contig_4364_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_4289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533077	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
464922	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16443	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
465038	SIRV6	+	284	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10541	1	1304	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11541	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
465042	SIRV6	+	387	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-16	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
465045	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10323	2	1173	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
465059	SIRV6	+	722	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8167	15	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
465067	SIRV5	-	558	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-3013	1154	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTTGCAGTATGCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5419	1023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1141_1977_2052_2253_2316_3298_3403_3481_3643_5379
465087	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
465092	contig_6215_pilon	-	2753	10	Intergenic	novelGene_21196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	772.049333164343	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	352	1245	233835	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243093	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235221_238629_238751_242990
465161	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
465230	SIRV6	+	441	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1843
465235	SIRV6	+	606	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	369	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
465243	SIRV5	+	263	4	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	8688	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGAAGGTCGCCGTATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
465253	SIRV5	+	363	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-202	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTGGTCCCACCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
465265	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10404	2	1254	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
465271	contig_233_pilon	-	2772	16	Intergenic	novelGene_14617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1409.21227168467	6	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	112	1074	109959	99823	TRUE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCCSLWWDCSSSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPKVSSRRAL	126993	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78633_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99849_101711_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109919_109976_126898
465302	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
465334	contig_8317_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_19287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
465336	contig_34_pilon	-	3352	1	Intergenic	novelGene_39971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2397	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTTGTCCTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211855	208503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_208500_211900
465367	SIRV6	+	450	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470
465419	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
465426	contig_4364_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_1748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCTGCACAGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
465457	SIRV6	+	535	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8749	18	42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
465508	SIRV5	-	350	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
465542	SIRV6	+	238	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	392	15	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
465645	contig_4364_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_1295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
465659	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
465662	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
465673	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	15	1272	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
465676	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
465681	SIRV6	+	685	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
465694	SIRV6	+	1495	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
465733	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
465734	SIRV6	+	204	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	301	40	70	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
465753	contig_6735_pilon	-	2056	14	Intergenic	novelGene_15751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	28	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	83	1579	564868	542464	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
465758	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
465772	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
465814	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	114	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
465827	SIRV6	+	922	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	569	0	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
465833	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
465852	contig_4364_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTCACACCTCGGCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533230	1532855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533200
465855	SIRV6	+	1511	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	-10	-10	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
465874	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
465939	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
465941	SIRV6	+	493	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1445	532	16	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
465985	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10312	2	1162	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
466001	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	1	64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
466013	contig_8317_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_19650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCGAACAGCAAAACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
466029	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	222	-3	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
466046	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10458	5	1308	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466053	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
466065	SIRV6	+	305	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	229	1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
466072	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
466086	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466087	SIRV6	-	405	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACGATTAGGCGCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11808	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
466128	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
466158	contig_8317_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_20132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
466160	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_8917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
466167	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10327	2	1177	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11414	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
466168	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	235	2	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
466171	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466175	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	2	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
466188	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	38	3396	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
466222	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466257	SIRV6	+	258	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10553	15	1316	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11553	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
466259	SIRV6	-	302	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCAAGAATTTTCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
466269	SIRV6	+	796	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	541	7	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAAAAGTAATAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	10790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
466317	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	73	510	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
466337	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4145	-1	2966	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
466352	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
466354	SIRV6	+	527	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	8752	-14	39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCGTCTAGGACGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
466414	contig_4364_pilon	-	177	1	Intergenic	novelGene_4464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTAAATCCAACTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533280	1533103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
466419	SIRV5	-	434	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTGACCTAGAGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
466420	contig_15063_pilon	-	1693	6	Intergenic	novelGene_13858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.6	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
466428	SIRV6	+	942	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	575	11	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	300	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
466437	SIRV6	+	938	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	575	15	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
466446	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
466447	SIRV6	+	718	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	2	581	2	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
466453	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
466459	SIRV6	+	480	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8789	-4	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAGTCAAGTCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
466497	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
466499	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
466508	SIRV6	+	272	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10539	15	1302	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11539	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466522	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
466555	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466565	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
466593	contig_8729_pilon	+	3358	13	Intergenic	novelGene_40058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_10	180.481974323076	1756	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	76	1053	33998	40362	TRUE	5	TTTCCTGTGGTCTTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAELADVLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVNKIIELKKKVCGDSNKGFVVINQKGIDPFSLDALAKEGIVALRRAKRRNMERYA	33922	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_36925_37784_37959_38491_38596_39239_39351_40001_40162_40269_41054_41327_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
466634	SIRV5	-	439	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTCCTGCCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
466690	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_4074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
466697	SIRV6	+	701	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
466704	SIRV6	+	763	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	579	2	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
466725	contig_8317_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_20660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16478	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
466771	contig_8317_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_20019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTTGACCAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16416	16736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
466776	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	224	-4	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
466796	SIRV6	+	216	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-219	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAGTGGACGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1177_1461_1535_1640
466808	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	88	499	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
466849	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	72	502	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
466854	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9657	580	507	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
466864	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_19793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
466881	contig_15063_pilon	+	1666	6	Intergenic	novelGene_13848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	35	ATAAATGTGTATATATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
466891	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
466892	contig_15063_pilon	+	968	4	Intergenic	novelGene_9157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	237	968	34808	36108	FALSE	10	CACGCTGACCTCCCTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVT	27127	36108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27170_34613_34926_35034_35380_35839
466934	contig_8317_pilon	+	395	4	Intergenic	novelGene_19257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	56	394	14294	15107	FALSE	5	TGATTGTTGCTGCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAV	13270	15108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
466939	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	34	3253	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
466943	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
466960	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
466999	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_3326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
467017	SIRV6	+	693	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	628	595	412	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	18	509	1733	10736	TRUE	35	TATGCGGTAAACGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1715	11230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
467074	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAATTTTGAGACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
467079	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
467119	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
467126	SIRV6	+	648	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-395	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	131	445	2021	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1890	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2477_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
467129	SIRV2	-	352	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGTCATGTCTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
467138	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	2	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
467170	SIRV6	+	608	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCAACAAGAGAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10727
467183	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
467185	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
467247	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	241	1368	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
467260	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10362	2	1212	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11449	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
467277	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467282	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	TAGAAATAAAAATATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
467285	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
467299	SIRV5	-	433	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1129	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3535	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481
467345	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	4	63	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
467366	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	136	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
467383	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
467384	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	106	11	64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATGCAAGCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467416	contig_8317_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_20111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
467419	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
467441	SIRV6	+	477	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
467449	SIRV2	-	325	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4548	34	3373	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
467467	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467473	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	288	3	57	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
467510	SIRV6	-	413	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCGCGCGATGCCAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
467539	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
467540	contig_4364_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_3904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCGGGAATACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
467585	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
467588	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	1	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
467598	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
467613	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
467623	SIRV6	+	219	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	389	0	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAGTGGACGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
467636	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
467643	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467694	SIRV6	+	432	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-41	94	9	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467710	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
467731	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467740	contig_8317_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_20600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16457	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
467741	SIRV6	+	315	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	187	-4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467747	SIRV6	+	1073	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	901	52	-297	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	14	346	2002	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1988	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
467776	SIRV6	+	321	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	352	94	186	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
467787	SIRV5	+	373	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7595	2	-202	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTGGTCCCACCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
467820	SIRV6	-	322	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATTTCTGGTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
467822	SIRV6	-	207	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTATACGCACTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11254	10739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
467824	SIRV6	-	440	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
467861	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	401	3	-231	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCACACCACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
467862	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	285	14	54	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
467880	contig_8317_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_20713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16502	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
467886	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_19983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
467887	SIRV6	+	391	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	123	-16	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
467919	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
467926	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
467962	contig_9955_pilon	-	2618	5	Intergenic	novelGene_21274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	214	906	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49822	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46798_47182_47737_48794_49380_49692
468005	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
468027	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468038	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468041	SIRV5	+	448	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7418	-2	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTAAATTCACCACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
468051	SIRV6	+	288	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10537	1	1300	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11537	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468059	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
468156	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-33	886	-33	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8282	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
468173	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
468191	contig_4364_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_1720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
468261	SIRV5	+	244	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	5	-74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTGTAGGTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8320	10915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
468275	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_10444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	25	AGGTAGTCACATTGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	27133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
468279	contig_8317_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_20259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
468297	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468307	SIRV5	-	392	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGACGAATTTACGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
468329	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	20	1261	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468340	contig_4364_pilon	+	1936	6	Intergenic	novelGene_238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	82	1209	1530895	1532568	FALSE	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530443	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
468384	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
468386	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16483	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
468411	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533052	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
468413	SIRV6	+	604	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8572	6	219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCGTGGGACGTATCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
468433	contig_8317_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_20603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16458	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
468486	contig_13021_pilon	+	2278	14	Intergenic	novelGene_8184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2490.34436914317	2282	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	164	2014	174676	180850	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174512	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440_180867_180905
468506	contig_8317_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_20668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGACCAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16485	16737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
468507	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468515	SIRV6	+	201	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	303	41	72	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2588	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
468550	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468553	contig_8122_pilon	+	5212	9	Intergenic	novelGene_40230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_8	173.490453627858	1009	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	172	2151	577009	607348	FALSE	25	CTGGCTTGAAATGCAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGSYKNRHSSGDPSAEGPSSGGSISKLSSEMQLQVQSQQEELERLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCDGVPKDTLELLHQKDDQILGLTSQLEKFNLEKENLQQEVRKLKSKVGEVNEQLGMLMETIQAKDEVIIKLSRQLSECEGNPSSPAALPGSPSTTLASRDQLELDRLNDNLQGYKTQNKFLNKEILELAALRRNAERREKDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEEQGPTRDVIAQLLEDALQVESPEQPEQAFIKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDLHTRKFKDSTEPGYFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHTHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKIQDAMSIFKYLRYFTRTILDARKLISISFGDLNPFPLRQIRNRRTYHLEKVRLELTELEAIREDFLRERDTSPDKGELVSDEEEDT	576837	610409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_577171_577889_578286_583377_583489_584468_584663_589124_589620_592243_592362_599436_599623_601069_601192_607152
468567	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	1	1279	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468568	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_19982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
468584	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	2	1248	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468616	SIRV6	+	726	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
468667	SIRV6	+	499	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8801	2	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
468686	SIRV5	-	376	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGTAAGCACTTTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
468724	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468735	SIRV6	+	488	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8812	2	-21	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCTTGAAGCAATCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
468746	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	20	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10727_10819_11034_11109_11205
468749	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
468755	contig_8317_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_20658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGACCTTGCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16748	16476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16700
468757	contig_8317_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_20721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTAGCCTTCTGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
468771	contig_12357_pilon	+	2025	11	Intergenic	novelGene_6109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	814.254407418222	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	117	1259	26079	52833	TRUE	30	GAAATAGTATTTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQHPGTFGQIQR	25962	53925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46532_52800_52844_53169
468817	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
468849	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
468890	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
468899	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533101	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
468925	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	77	486	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
468954	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
468955	contig_9183_pilon	-	3132	7	Intergenic	novelGene_40294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	49	junction_6	426.362424079171	440	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	242	2125	323783	312131	FALSE	10	TAGGCATTGTGGTTGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQGDPPAPLPAAQDPELPCRLRPPQRASQAEELVQNPCYSALNFGRQITITCDTQLLPCFCSLAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325974	311123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323919_325868
468973	SIRV6	+	243	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	299	3	68	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
469008	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	13	1422	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
469031	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	494	94	494	-34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10731	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
469032	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
469077	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469079	SIRV6	+	246	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2053	578	35	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3140	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
469100	SIRV6	+	245	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2053	579	35	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3140	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
469141	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	6	1259	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
469154	contig_10134_pilon	-	2205	4	Intergenic	novelGene_16204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	916	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38817_39584
469167	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-82	878	32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8233	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
469169	contig_15063_pilon	+	1708	7	Intergenic	novelGene_11628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
469188	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	242	-4	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469218	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	51	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
469234	SIRV6	+	414	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	94	-10	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469257	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
469264	SIRV6	+	736	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	556	2	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	31	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGTAGTGCCGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
469271	contig_8598_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_22913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	191218	191553	NA	5	CCTGATTGTTGCTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191216	191555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
469285	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469291	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
469387	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
469409	SIRV5	+	376	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	882	-53	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
469440	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
469444	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
469510	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_9072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
469518	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
469542	contig_8317_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_20673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16486	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
469543	SIRV6	+	237	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	241	7	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469566	contig_4364_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_4006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533066	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
469612	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7484	1	-91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
469621	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	3	62	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
469641	SIRV6	+	577	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8710	15	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
469642	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	294	1	63	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
469649	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
469706	SIRV6	+	172	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	436	0	-266	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTGCAAAACGTCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
469728	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	6	1266	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
469761	SIRV6	+	733	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8167	4	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
469766	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	237	1073	34808	36333	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	28164	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36150_36266
469795	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
469842	SIRV6	-	194	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGAACAACTTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
469844	SIRV2	+	620	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	-29	-68	29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGAGGATATGGTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
469855	SIRV6	+	573	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8576	-4	215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACGTCGTGGGACGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
469867	SIRV1	-	242	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3566	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6800	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
469868	SIRV6	+	477	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8798	-10	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAGTATCTGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
469878	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
469886	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469913	contig_8317_pilon	+	411	2	Intergenic	novelGene_19342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATCAGTACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16200	16710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
469914	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469918	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
469931	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	101	7	69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
469981	contig_8317_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_20028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16417	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
470008	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-148	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8167	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
470032	SIRV6	+	348	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	185	2	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAGTAGCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470125	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	11	1258	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470169	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
470178	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470196	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470224	SIRV5	-	441	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGAGATGTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
470228	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9656	581	506	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
470235	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470272	contig_854_pilon	-	3098	14	Intergenic	novelGene_36156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	192.058731155388	1609	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	63	1322	509201	471803	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARQSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509263	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
470273	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
470279	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_19977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16411	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
470305	SIRV6	+	228	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	380	0	-210	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGACGCCGTTAGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
470331	contig_8317_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_19955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCTCATATCTCGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16708	16410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
470333	SIRV6	+	542	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8742	18	49	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACGCGTTGAAGCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
470369	SIRV2	-	1016	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2972	-1	1793	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2939	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
470409	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	1	1276	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470422	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10334	2	1184	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11421	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
470429	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470445	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_2186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
470501	SIRV6	+	253	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10562	11	1325	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11562	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
470529	contig_8317_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_19762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCTCGAACAGCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16777	16403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
470531	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
470537	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
470538	SIRV6	+	467	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8834	1	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTAAAGTGCCAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
470571	SIRV2	-	193	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	733	22	733	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
470584	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGAAACCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
470614	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
470649	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	226	0	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470679	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	4	1276	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470681	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	568	11	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
470682	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10319	2	1169	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
470687	contig_8317_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_20154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAATTTTGAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
470701	contig_8317_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_20046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16421	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
470730	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
470731	SIRV6	+	717	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
470769	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	11	1262	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470770	contig_15063_pilon	+	1479	5	Intergenic	novelGene_13543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2459.40006658128	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	202	1335	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35836_36058_36102_36158_36266
470772	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
470778	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTTGGTTAGCCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
470782	SIRV6	-	198	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	95	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640
470861	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
470864	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	236	11	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470875	contig_5033_pilon	-	2528	15	Intergenic	novelGene_29024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	5745	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531434_531647_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
470877	contig_8317_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_20620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16462	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
470884	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	2	1262	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
470917	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
470928	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	116	11	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470968	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
470983	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
470991	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
470995	SIRV6	-	291	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACTTTGACGCAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	11529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
471013	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471055	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
471066	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
471071	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	2	1474	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
471073	SIRV6	+	610	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	182	609	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1628_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
471150	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	7	32	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
471163	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	35	3384	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
471202	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1636_1736_1845
471212	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471223	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	24	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3129	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11037_11109_11205
471263	SIRV6	+	471	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
471327	contig_8317_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_20068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16427	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
471334	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471344	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
471371	SIRV6	+	234	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845
471382	SIRV6	+	282	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1856
471385	SIRV6	+	444	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10304	2	1154	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
471390	SIRV6	+	598	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	581	337	-38	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
471399	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
471413	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
471423	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
471433	SIRV6	+	746	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	588	582	372	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	58	549	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1675	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
471440	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
471469	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
471500	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
471502	contig_8317_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_19827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
471538	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7487	1	-94	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
471568	contig_15063_pilon	+	1593	6	Intergenic	novelGene_12998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3667.21665572134	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	220	1362	34808	39538	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	28181	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
471575	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
471576	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
471625	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
471655	SIRV6	+	948	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	575	5	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
471679	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
471738	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471743	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471748	SIRV6	+	438	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10310	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
471751	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
471754	SIRV6	+	781	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	561	574	345	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	85	576	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1648	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
471760	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	4	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471762	contig_8317_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_20730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16521	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
471775	SIRV6	+	747	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	579	18	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
471781	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2051	579	33	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
471784	contig_15063_pilon	+	1648	6	Intergenic	novelGene_13586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	TAGGCACTTGTGGCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
471798	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
471818	contig_4364_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	81	407	1530895	1531300	FALSE	35	CTGAATCCCAAGGCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAP	1530444	1531300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
471823	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
471829	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471872	contig_8538_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_4743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
471874	SIRV5	+	377	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-55	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8462_8586_10858
471883	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	4	1251	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
471884	contig_8317_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_20124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTTGATGACACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16759	16438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
471931	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
471932	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
471935	contig_18272_pilon	-	2869	9	Intergenic	novelGene_6981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	514.887472536476	1198	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	177	1403	262678	122209	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262854	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172674_184348_184551_262660
471938	contig_8598_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_22912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	191218	191553	NA	5	TCCTGATTGTTGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191216	191554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
472022	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472054	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9675	563	525	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
472070	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
472114	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472150	SIRV2	+	628	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-31	-74	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
472163	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
472189	SIRV2	-	318	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	34	3380	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
472190	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472253	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_9960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472269	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
472281	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472286	SIRV6	+	205	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	399	-2	-229	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACACCACATGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
472291	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
472299	SIRV5	+	398	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7491	2	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCAGCGACAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
472304	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472308	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_19761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
472318	SIRV6	-	302	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTCTCTTTCTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11735	11433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
472332	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_12078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	217	1452	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27152	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
472334	SIRV6	+	448	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1498	524	69	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472340	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
472344	SIRV2	-	256	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4611	40	3436	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
472346	contig_5928_pilon	-	2274	16	Intergenic	novelGene_40377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGATTCCAGATGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327071	252008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_252048_257798_257852_269041_269141_270199_270343_273361_273468_274965_275119_276353_276487_278848_279010_280225_280336_283032_283171_283666_283731_296733_296851_297695_297773_321795_321933_325164_325244_326406
472394	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	233	7	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
472407	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
472447	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4405	34	3230	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
472448	SIRV6	+	210	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
472455	SIRV6	+	757	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-440	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCGATGACTATGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1845	11315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472481	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	71	510	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
472484	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	236	-15	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
472498	SIRV6	-	405	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTCCATGCGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
472509	SIRV6	+	926	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	569	-4	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	216	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472521	SIRV6	+	440	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10308	2	1158	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
472542	SIRV6	+	331	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	861	8167	-294	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1991	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
472561	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	225	-4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
472567	contig_4364_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	35	CCTGAATCCCAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
472570	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	94	18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
472601	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_20008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16414	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
472631	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
472634	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	79	505	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
472648	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
472660	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	2	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
472668	contig_8317_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_20454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCAAAAATCTGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
472672	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
472674	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
472704	contig_12427_pilon	-	2286	7	Intergenic	novelGene_40518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	1412.05425611845	3541	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	299	922	522337	506035	FALSE	10	CATCTGATTTTGCCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578155	504670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_569680_569776_577960
472720	SIRV6	+	679	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	859	488	-339	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	56	388	2002	10736	TRUE	50	AGCAATCAACTCACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1946	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472748	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	2	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
472810	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
472815	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
472822	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
472832	contig_8317_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_20562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTTGACCAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
472850	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
472865	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_11435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
472870	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
472875	SIRV6	+	507	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1441	522	12	24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472910	SIRV6	+	299	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	542	15	369	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
472949	SIRV6	+	500	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1383	587	-2	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
472994	SIRV6	+	562	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8714	-11	77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTGAGTGTGGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
473031	SIRV6	+	939	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-11	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	234	728	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473034	SIRV6	+	955	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	571	2	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473051	SIRV6	+	896	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	20	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	146	478	1673	2560	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1139	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473067	SIRV6	+	942	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	575	11	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473075	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	78	506	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
473078	SIRV6	+	302	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	4	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
473098	SIRV6	+	380	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10445	1	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11445	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
473118	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
473166	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
473190	SIRV6	+	249	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	714	3	-441	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTATCTGCAGTCAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
473228	SIRV5	+	333	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7596	13	-203	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTATTTGGTCCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
473257	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_8640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_5	3804.37421120595	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	248	1339	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGYFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	26542	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
473320	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
473326	contig_4364_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTGTTAAGGAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532827	1533281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
473348	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_19859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAATTTTGAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
473354	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_12807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3739.8486340433	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	1	1365	28164	38994	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	28163	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
473385	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
473386	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_10416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
473390	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
473396	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	227	3	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
473410	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_9307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
473412	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	387	15	-217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATAGTGGACGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
473419	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
473485	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	15	1270	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
473579	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	391	0	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
473580	SIRV6	+	810	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	592	514	376	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	54	545	1733	10736	TRUE	30	GAAATTGGCGATGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1679	11311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473593	SIRV6	+	753	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
473608	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
473609	contig_8538_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_4975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842809	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
473617	SIRV6	+	356	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATGGCTATTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
473631	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
473644	contig_8317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_19421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16393	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
473669	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
473677	SIRV6	+	252	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	393	0	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
473681	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
473687	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
473693	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
473701	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
473718	SIRV6	+	267	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
473719	SIRV6	+	658	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	800	568	-398	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	115	447	2002	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1887	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
473733	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
473758	contig_4364_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_3871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533063	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
473768	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
473773	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10413	1	1176	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
473781	contig_8317_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_19990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTCTCATATCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
473822	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_19564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAGTTTTTAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
473833	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
473861	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCCTGCCAGTTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
473878	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
473888	SIRV6	+	203	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	79	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2595	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
473959	contig_8317_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_20034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16418	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
473960	contig_5033_pilon	-	2454	13	Intergenic	novelGene_29037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	325	junction_4	3047.89510587042	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	24	1316	566787	532125	FALSE	15	AGACCTGGGCCTGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534318_535027_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
473994	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	292	5	61	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
473999	SIRV6	+	805	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	430	575	214	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	110	601	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1517	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
474010	contig_10324_pilon	+	2977	15	Intergenic	novelGene_7708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1483.2803500818	6	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	309	1589	72946	79380	FALSE	10	CCAGGCCTGGCGAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51789	80768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_57251_57429_68091_68126_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
474049	SIRV5	-	451	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGCCAGTTCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
474061	SIRV6	-	295	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTTTCCATGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
474082	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474093	SIRV6	-	249	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCGACCATTCATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11257	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3162_10721_10825_11038_11109_11205
474101	SIRV2	-	641	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	41	311	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	26	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCAGCGCTAGTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	3332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4347_4480_4687_4801_5788
474118	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
474133	contig_8317_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_20576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
474144	contig_13787_pilon	-	2446	9	Intergenic	novelGene_40616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_7	814.940642010202	3016	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	321	1133	205032	159290	FALSE	20	TACATGTCTTTTGGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWQLSFLMMCPNYGSQVSPYSLLRSMLVALSPRQLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205352	157976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_195275_195372_204972
474209	SIRV6	+	758	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCGATGACTATGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
474237	SIRV6	+	433	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1847
474257	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474259	SIRV6	+	271	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	508	94	342	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
474372	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474377	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474403	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
474417	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	9	1269	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474435	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	5	36	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
474437	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10525	4	1288	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11525	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474460	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10403	2	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474485	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474504	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
474518	contig_8317_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_20649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16469	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
474538	contig_15063_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_8535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	251	1486	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26345	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
474539	SIRV6	+	361	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-16	19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCTAGTCCAATCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
474543	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474584	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
474591	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
474592	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
474593	SIRV5	+	360	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7490	13	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
474597	SIRV6	+	699	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	570	-441	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
474607	SIRV5	-	286	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAACGTGTACCTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
474634	SIRV6	+	432	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
474644	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
474659	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532910	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
474666	contig_8538_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_4849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
474688	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_11492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
474695	SIRV2	+	365	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	228	-70	-228	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGTCGCGAGCACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
474733	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
474736	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474754	contig_15063_pilon	-	1523	5	Intergenic	novelGene_12955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	30	TAGTCCATACCGTAGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
474764	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	400	0	-230	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACACCACATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
474770	SIRV6	+	336	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1265	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
474776	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
474790	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
474824	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
474830	contig_8317_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_20628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTCCAGCAGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16785	16463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
474833	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_2804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533009	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
474846	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474893	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	46	3412	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGTGGTGATTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
474921	SIRV6	+	195	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	401	-1	-231	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCACACCACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
474925	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
474935	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	5	1417	28164	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
474961	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
474974	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
474975	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
475010	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
475011	contig_5988_pilon	-	1625	4	Intergenic	novelGene_15931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
475016	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4606	34	3431	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
475024	SIRV6	+	430	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_1845
475045	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533058	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
475052	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
475059	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	4	1272	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
475068	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
475108	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27532	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
475109	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	398	11	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
475171	SIRV5	-	295	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCTTAGAGCGTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8384_8453_8590_10864
475176	contig_7151_pilon	+	1912	11	Intergenic	novelGene_40668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	700	1038	5253	6217	TRUE	45	CAATTCCACAAAAAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETGSEPELVPKEKKDVPPLTRAPHSSILLVLTVVLPPGLRSTGPQGRLPASAPHLVQPDAPISWAKCSLLQGFQGRATVQLLTHHLGLCQAPGVVTHCAPGAVVPNLHSP	1821	18225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2089_3098_3248_4314_4398_4633_4730_5148_5303_5928_6259_6347_6388_12487_12813_13365_13681_13787_13876_18160
475202	SIRV6	+	201	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	300	44	69	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
475206	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
475237	SIRV6	+	285	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
475260	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	239	-4	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
475293	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475294	contig_3956_pilon	-	2370	11	Intergenic	novelGene_15190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	709	1722	1289815	1286558	TRUE	20	GATCTGGTCTACTGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSHLWIGFRYRSSFFPGV	1290929	1282721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1282913_1283793_1283973_1284051_1284138_1286179_1286223_1286408_1286611_1287276_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
475317	contig_4364_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_3910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCGGGAATACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1533064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
475322	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
475350	SIRV6	+	729	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8167	8	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
475386	contig_8317_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_20490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
475411	contig_15219_pilon	+	2768	7	Intergenic	novelGene_40809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	232.65830930549	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	127	957	19617	23972	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19490	25923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_24314_24453
475429	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
475447	contig_233_pilon	-	2216	13	Intergenic	novelGene_14600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1524.8932476297	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	261	1364	105485	91657	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRVCVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	126997	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105586_109914_109976_126898
475471	SIRV5	-	378	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
475485	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	133	-7	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
475523	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_20069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16427	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475524	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
475535	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAACAAAGTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	16775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475539	contig_4364_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_2394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532928	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
475542	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
475552	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
475569	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	34	3255	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
475589	contig_4364_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532800	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
475602	SIRV6	+	442	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1159	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
475673	contig_8317_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_19429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16395	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475695	SIRV2	-	401	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	14	3021	-2	-391	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGAAGACGTCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5897	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
475700	contig_8317_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_20056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16423	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475727	SIRV6	+	304	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGCTAAAGTGCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1847_2027_2470
475754	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475756	contig_8317_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_20430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475766	contig_8317_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_19652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
475788	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
475821	SIRV5	+	412	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
475835	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	5	1258	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
475854	contig_15063_pilon	-	1725	7	Intergenic	novelGene_10188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	977	1300	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
475918	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	489	91	489	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
475959	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
475979	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	4	2962	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
475980	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	203	1438	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
475991	SIRV6	+	715	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	36	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
475995	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
475996	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
476023	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	10	56	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
476028	SIRV2	+	614	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	-17	-74	17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACATGGTAACCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
476043	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_19926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
476051	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476069	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_10672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476075	contig_1443_pilon	-	4351	26	Intergenic	novelGene_28348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	253.116934241864	1012	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	976	2931	85	3015	937429	898613	TRUE	0	TTGTTGTTGTTGTTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFRGRERVVEPGPRVILGTRGGAASGAMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEEVMLRKGIQSLKLKMRLLTLRKMTMKRKRRIAMKTIHLKQKNQTIPRNHWAVKKRVERIGMN	937513	895919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898936_899596_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125_909222_909341_909408_910547_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913985_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
476088	SIRV6	+	921	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	0	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
476125	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10520	1	1283	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476140	contig_4364_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_2607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
476164	SIRV2	-	377	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4496	34	3321	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
476188	SIRV5	-	495	5	Intergenic	novelGene_5487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCACGTCATACGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5627	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_SIRV5_-_2165_3268_3403_3481_3643_5379_5448_5538
476198	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476204	SIRV6	+	314	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	182	2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
476289	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
476290	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476322	SIRV6	+	267	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10481	2	1331	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11568	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
476342	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	5	1273	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476377	contig_11285_pilon	+	2557	11	Intergenic	novelGene_5602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	503.673118202669	65	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	979	1800	767746	769349	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHVSAHLPDPG	763527	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769653_769740
476397	SIRV6	+	652	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-402	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1883	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
476404	SIRV6	+	665	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	338	580	165	-37	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCGAAGTTGTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	10751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
476408	SIRV6	+	574	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8710	18	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
476427	SIRV6	+	270	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-4	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_1845
476432	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476439	SIRV6	+	491	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8800	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
476444	contig_12873_pilon	+	2207	6	Intergenic	novelGene_27149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_2	905.273306797456	865	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1136	1627	17896	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15946	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
476472	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476489	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476505	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476511	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476521	SIRV6	+	504	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	8755	0	36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGTGCGTCTAGGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
476535	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476547	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	2	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476556	contig_8317_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_19984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTCTCATATCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
476558	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476562	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	230	11	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
476590	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	66	517	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
476594	SIRV6	+	802	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	376	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	90	273	54	326	1733	2560	TRUE	30	TGTAATGGAAATTGGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1679	11304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
476597	contig_7119_pilon	+	2350	4	Intergenic	novelGene_40907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	200	1354	137033	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140481_140635
476644	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476645	SIRV6	+	170	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	-258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACGTCTATACGCTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1177_1468_1535_1640
476659	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476680	contig_4364_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_2421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
476710	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
476715	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_10713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	207	1379	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34639_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476723	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476734	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
476740	contig_15063_pilon	+	1745	7	Intergenic	novelGene_8485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	255	1490	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
476745	contig_8317_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_20616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
476762	SIRV6	+	480	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10268	2	1118	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11355	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476771	SIRV2	-	191	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4666	50	3491	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1200
476779	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476791	contig_15063_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_8646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26553	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
476806	SIRV6	+	989	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	528	11	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	164	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	GTAACAATGTAATGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
476808	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
476840	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
476861	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	232	0	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
476915	SIRV5	+	449	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTAACATAACTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
476918	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
476929	contig_8317_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_20593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
476936	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
476976	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	71	304	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842757	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
477061	SIRV6	-	295	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAACTTTGACGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
477071	contig_8317_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_20676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16488	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
477132	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	27	1272	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAAGTTTTTAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477152	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477181	contig_8317_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_20550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
477191	SIRV6	+	436	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1847
477226	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477230	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	229	2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
477245	contig_8538_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_4919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGTTGTTGCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842788	843109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
477260	contig_15063_pilon	+	1633	8	Intergenic	novelGene_10167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3646.68247891708	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	238	1386	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36437_36523_36600_38975_39092_39506
477275	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10329	2	1179	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11416	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
477289	contig_8317_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_20193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
477294	SIRV6	+	716	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8167	-16	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
477306	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
477341	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
477342	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
477348	SIRV6	+	204	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-215	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1472_1535_1640
477370	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	2	1201	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
477394	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
477398	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477402	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
477408	contig_15063_pilon	-	1735	7	Intergenic	novelGene_8519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	973	1296	35891	35108	TRUE	25	AGCAGCCACAGTGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	26344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39083_39504
477418	contig_5023_pilon	+	2581	14	Intergenic	novelGene_7284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2108.59270773201	3	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	504	1379	625679	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580859	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609644_618636_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647419_647528
477428	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	1	1279	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477451	contig_15063_pilon	-	1589	7	Intergenic	novelGene_11625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	846	1169	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39636	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
477535	contig_4364_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_2665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTAGGCCCCAGCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532943	1533257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
477542	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477544	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533044	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
477584	contig_8538_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_5031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842821	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
477592	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
477608	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
477624	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
477636	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	5	1270	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477669	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	25	1273	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477699	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	1	1277	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477707	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
477754	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
477762	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
477775	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
477787	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	89	499	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
477800	SIRV2	+	272	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	325	-74	-325	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCAGCACGCAATCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
477812	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10314	5	1164	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
477819	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
477855	contig_7775_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_37514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTGTCCTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471914	472156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_471900_472200
477862	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
477868	contig_8538_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_4925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
477893	contig_4364_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_1080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTGAAGCAGACGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
477905	SIRV6	+	354	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10416	56	1179	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11416	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
477947	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
477962	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_8541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26346	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
477972	contig_15063_pilon	+	1487	4	Intergenic	novelGene_13154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
477973	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
477994	SIRV6	+	634	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	545	337	-2	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
478002	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478011	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16434	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
478022	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
478051	SIRV6	+	500	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-43	8802	0	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
478078	contig_8317_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_20655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16473	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
478079	contig_4364_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	81	443	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530444	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
478136	contig_4364_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_4359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTAACAACCCACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
478169	contig_1230_pilon	+	2254	9	Intergenic	novelGene_28830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1052.5022268385	1362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	76	2016	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
478214	contig_9471_pilon	+	3347	10	Intergenic	novelGene_21795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_9	710.578029355305	4047	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	2126	3127	412726	417296	FALSE	40	CAAATTTATATGAATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	407010	417516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
478229	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478278	SIRV6	+	352	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	131	2	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
478321	SIRV6	+	295	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	1	1293	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478333	SIRV6	+	376	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10446	4	1209	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11446	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
478385	SIRV5	+	436	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	893	-10	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
478394	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
478395	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
478409	SIRV6	+	1536	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-10	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	634	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
478410	contig_9177_pilon	-	2713	16	Intergenic	novelGene_32543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1366	junction_4	625.648619878247	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	173	2272	8773	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	8945	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686
478421	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478432	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478469	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	15	1256	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478510	SIRV6	-	170	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTTTTCCAGGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	10724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031
478592	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478601	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478621	SIRV6	+	967	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	57	504	7	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	40	ATGACTATGGGGAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
478631	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10349	2	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
478654	SIRV6	+	371	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10454	1	1217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11454	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478656	contig_8317_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_20526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTATTAGTTTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
478750	SIRV6	+	435	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	98	2	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
478800	SIRV6	+	695	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	574	-441	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
478826	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	35	3423	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
478832	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	9	1269	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
478877	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
478886	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
478897	SIRV5	+	161	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	356	151	242	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8557	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
478899	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_1364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532904	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
478952	SIRV6	+	183	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	494	106	494	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTATATGCGGTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10731	11224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
478974	SIRV6	+	540	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8744	18	47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGACGCGTTGAAGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
478983	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	98	487	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCGGTAAACGTAAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
478987	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
479001	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
479010	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3757.05393227193	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	243	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266
479030	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10423	2	1273	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479060	SIRV2	-	313	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4560	34	3385	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
479084	SIRV5	-	384	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTTCGCACACTTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10964	8233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
479100	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_2855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533014	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
479101	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
479132	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
479136	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
479137	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
479155	contig_13592_pilon	+	2493	15	Intergenic	novelGene_33713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	503	2431	256608	269322	FALSE	25	TTTGTGAATAAGGAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249315	269384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
479183	contig_8317_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_20717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16503	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
479194	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479202	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479203	SIRV6	+	934	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11207
479218	SIRV6	+	913	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	0	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
479221	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	229	-1	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479225	SIRV6	+	247	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	59	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721
479262	SIRV6	+	305	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	0	180	0	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCTGCTTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	1940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479266	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10417	2	1267	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479291	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_2943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
479303	contig_8317_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_20029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16417	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
479312	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532922	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
479332	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	34	3403	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
479333	SIRV6	+	157	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	439	-1	-269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCCATTGCAAAACGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
479360	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	86	499	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
479361	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479383	contig_8317_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_20453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTTTTTAAATGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
479393	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479398	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479408	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
479429	SIRV6	+	394	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10351	5	1201	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
479451	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
479454	SIRV6	+	740	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-48	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACGAGTCGAAGTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
479534	SIRV2	-	346	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3331	-1	-701	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGACGATGTCCTAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
479550	SIRV6	+	666	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	794	566	-404	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	121	453	2002	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1881	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
479585	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_19576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTAAAACAAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
479592	SIRV6	+	351	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	182	2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479601	contig_4364_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	68	352	1530895	1531258	FALSE	15	GGCCCCCGAGGAGCACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELR	1530457	1531260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
479604	contig_4364_pilon	+	450	3	Intergenic	novelGene_426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	77	448	1530895	1531345	FALSE	15	GCTCCGGCACTGGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQVTV	1530448	1531347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
479637	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479647	contig_4364_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_3465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAACTGGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
479733	contig_15063_pilon	-	1521	5	Intergenic	novelGene_11487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	781	1104	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36780	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
479742	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
479758	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	60	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
479774	SIRV6	+	658	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	792	576	-406	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	123	455	2002	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1879	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
479793	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	390	0	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
479832	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	9	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
479849	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
479862	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
479942	contig_8317_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_20329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCCACTGCCTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
479949	SIRV6	+	292	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1635_1736_1845
479951	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	54	488	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
480010	SIRV6	+	351	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	182	2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480011	SIRV6	+	1082	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1388	0	3	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
480015	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	20	1267	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480039	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	37	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27124	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
480043	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
480045	SIRV6	+	835	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	588	493	372	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	58	549	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1675	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
480047	SIRV6	+	244	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10529	53	1292	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11529	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480075	SIRV6	-	335	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCCGAATTTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
480116	SIRV2	-	235	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	649	64	649	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTACTGCACGACGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	3707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
480151	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480173	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
480184	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
480216	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	4	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480221	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10431	2	1281	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11518	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480252	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	4	1476	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
480265	SIRV6	+	429	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8846	-10	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
480268	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
480301	contig_8317_pilon	+	322	2	Intergenic	novelGene_19274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	2	322	14294	14907	FALSE	35	CAGGTTTGTAGATTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTS	14292	14907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
480357	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
480361	SIRV5	+	407	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2164_2279_2316_3298_3405_3483
480375	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480381	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
480432	contig_19342_pilon	+	2046	5	Intergenic	novelGene_41055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.03108891324554	4	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	621	974	5070	5544	TRUE	30	CCTGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGGV	3234	6762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_4199_4575_4916_5293_5413_5994_6139
480439	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
480440	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	199	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
480482	contig_15219_pilon	+	2909	6	Intergenic	novelGene_40813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	218.050819764568	438	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	125	955	19617	23972	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19492	25926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690
480487	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	274	-74	-274	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTGATGTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
480569	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
480602	SIRV6	+	312	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	1	1276	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480631	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10316	2	1166	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
480632	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480689	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
480711	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480722	contig_4364_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532828	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
480729	contig_4364_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_1846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
480771	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480779	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480788	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480799	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	69	486	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
480830	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480892	contig_15063_pilon	+	1442	5	Intergenic	novelGene_9961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	138	1313	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27145_34683_34926_35034_35380_35839_36158_36266
480903	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
480909	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3031	0	-401	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
480913	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
480938	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
480947	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	35	3256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
480956	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
480967	contig_4364_pilon	+	493	4	Intergenic	novelGene_636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	72	491	1530895	1531675	FALSE	10	TCTGTATGCCTCTGGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVL	1530453	1531677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
480975	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
480992	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
480996	SIRV6	+	286	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10539	1	1302	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11539	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
480997	contig_15063_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_10790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
481006	contig_4180_pilon	+	2530	8	Intergenic	novelGene_8347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1889.94768311135	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	59	715	865772	888134	TRUE	30	AGTATATCATTTTATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865713	890833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888217_889037_889118_889180
481010	SIRV6	+	372	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	15	1202	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
481016	SIRV6	+	391	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10434	1	1197	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11434	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
481024	contig_15063_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_8889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481045	SIRV6	+	955	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	562	11	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
481141	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842804	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
481146	SIRV6	+	939	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	596	2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	157	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
481159	SIRV6	+	957	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	578	2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	517	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
481174	SIRV6	+	247	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	74	1268	62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGCAAAAATTATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
481196	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	82	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481215	SIRV6	+	271	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10554	1	1317	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11554	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
481217	SIRV6	+	257	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	19	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACGAGTCGAAGTCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	10741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3171_10721
481228	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	67	513	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
481252	SIRV6	+	169	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	439	0	-269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCCATTGCAAAACGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
481267	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
481268	contig_12512_pilon	-	3922	6	Intergenic	novelGene_24179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_4	526.496875584272	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	235	600	599702	591848	TRUE	25	GTAAAATTGTTCGGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQT	599936	585674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_590862_591103_591267_591594_591852_595423_595506_599422
481272	SIRV6	+	343	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10402	5	1252	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
481295	SIRV5	+	394	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACAATTCCACTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
481300	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
481308	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	0	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
481322	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842776	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
481342	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
481343	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_9504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481378	SIRV5	+	385	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2048_2264_2316_3298_3405_3483
481386	SIRV2	-	240	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-387	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGCTCGCGACTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1400_1700
481387	SIRV2	-	440	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	34	3258	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
481415	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	33	1259	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTTAGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
481438	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	86	500	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
481478	SIRV6	+	906	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	2	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	203	694	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1132	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
481487	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481498	contig_8317_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_19394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
481515	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533030	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
481516	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
481547	SIRV6	+	221	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	385	2	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
481563	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10430	9	1280	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
481576	contig_8317_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_19622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
481587	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
481638	contig_4364_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_2759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532981	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
481662	contig_8317_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_20652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16472	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
481682	contig_8317_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_20711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16501	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
481691	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481693	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	8	34	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
481711	contig_9807_pilon	+	2984	15	Intergenic	novelGene_32834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	480.712295686817	2336	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	182	1999	109130	158783	FALSE	15	TCGTTGTGGATCACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108948	159768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
481728	contig_8317_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_20607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16459	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
481750	contig_8317_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_20611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
481776	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
481818	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
481844	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
481845	SIRV6	+	602	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	513	574	340	-31	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTGTTCAACAAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	10757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
481858	SIRV6	+	759	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	585	572	369	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
481865	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
481880	SIRV6	-	421	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACGATTAGGCGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
481915	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	58	526	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
481926	contig_10324_pilon	+	3312	21	Intergenic	novelGene_7719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1257.27653680485	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	739	1956	69577	79380	FALSE	40	CAACCACTAATAAAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51820	80736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_57251_57429_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69582_73013_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
481972	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2052	578	34	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
481981	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_1390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
482010	SIRV6	+	928	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	567	-4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
482030	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
482065	contig_10500_pilon	-	3757	10	Intergenic	novelGene_41172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_9	378.448228597248	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	118	1206	1380886	1318487	FALSE	20	AACCTGTTTATGCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIQLKELSQSGLYRRRRDRPDSLRLNGLPEEKLSNMANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1381003	1315935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1380779
482085	SIRV6	+	367	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10455	4	1218	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11455	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482113	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482114	contig_9753_pilon	-	4328	5	Intergenic	novelGene_41310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	815	junction_3	75.021246990436	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTCTGCCTGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93331	69093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_73317_85980_86095_86172_86247_93251
482125	contig_8317_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_20508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16451	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
482126	contig_1450_pilon	+	2842	20	Intergenic	novelGene_27343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	533.199904823843	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	245	2641	244426	355748	FALSE	70	AAGAAAAAAAAAAAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243311	355949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350482_354180_354330_355589
482142	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
482149	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
482157	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	4	1278	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482172	contig_8317_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16458	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
482210	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
482214	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10409	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482218	contig_8538_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_4897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842782	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
482224	SIRV6	+	355	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10467	4	1230	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11467	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482241	contig_2069_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_23318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	406	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACCTCTGGTGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524095	525752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_524100_525800
482246	SIRV2	+	438	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	159	-74	-159	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAATACCACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
482257	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
482285	SIRV6	+	340	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	333	94	167	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
482295	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	4	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482299	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
482302	SIRV5	+	364	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-34	875	-34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8281	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
482319	SIRV6	+	677	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8503	2	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
482345	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	85	501	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
482348	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
482369	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	83	497	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
482373	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
482376	contig_8317_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_20645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16466	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
482401	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_10164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482408	SIRV5	-	472	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGGGTGACTACAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
482428	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	14	1423	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28150	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
482463	contig_8317_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_20671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16486	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
482470	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482486	SIRV6	+	591	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8710	1	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
482487	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	300	1	69	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
482500	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	15	1265	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482504	SIRV6	+	454	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8844	4	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
482508	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482511	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
482518	SIRV6	+	943	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	584	1	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
482523	SIRV6	+	937	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	590	1	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
482534	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482543	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482558	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
482563	SIRV6	+	436	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1851_2027_2470
482572	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
482573	SIRV6	+	291	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	233	11	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
482586	SIRV6	+	261	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10564	1	1327	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11564	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
482587	SIRV6	+	430	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8839	-4	-48	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGTTGCTAAAGTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
482592	SIRV6	-	404	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTTCTTCTTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
482605	SIRV6	+	219	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10555	52	1318	-50	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTATTGCCTACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	11774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
482614	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAACAAAGTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
482647	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
482688	SIRV6	-	267	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGCACAAGTTTAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
482702	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	95	11	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
482710	contig_4364_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_2565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532935	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
482711	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482717	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	38	3077	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
482752	SIRV6	+	400	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1724_1845
482774	SIRV6	+	507	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8762	-4	29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCACTTGTCGTGCGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
482795	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
482799	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
482810	SIRV6	+	419	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1340	271	-2	92	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	35	ACGTCACATATTTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
482887	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
482891	contig_8317_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_20133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16439	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
482892	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
482941	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	61	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482946	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482951	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	222	-4	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
482956	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
482987	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
482989	contig_12638_pilon	-	2441	17	Intergenic	novelGene_33113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGGCAGCACAGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200223	170858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_173507_173560_178085_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191806_195503_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
482995	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
483003	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483029	SIRV2	+	387	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	210	-74	-210	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTCTTGGCTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
483033	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	233	-2	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483052	SIRV6	-	239	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
483056	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483092	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	21	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483094	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_11418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
483107	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	18	1277	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAGATAGTTACGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483116	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	135	-10	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483141	SIRV6	+	498	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8802	2	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
483166	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483167	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_10159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
483168	SIRV6	+	906	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	0	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	161	493	1673	2560	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1124	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
483176	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	396	-1	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
483190	SIRV6	+	300	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	137	164	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
483210	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	101	-11	69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483227	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483272	SIRV5	+	235	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	270	163	156	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8471	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
483274	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	257	38	26	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
483275	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	7	37	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
483283	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483286	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483318	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
483340	SIRV6	+	242	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	244	-1	-74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGTCGGTCGCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483345	SIRV6	+	733	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8165	6	626	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTATGAGTAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	3166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
483352	SIRV6	+	351	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	65	1173	-63	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGGATTTAGTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
483369	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_9947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
483383	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483428	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	442	11	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
483430	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9648	591	498	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
483433	SIRV5	-	445	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGATGTCCTGCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
483439	contig_4364_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_2067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
483448	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9679	570	529	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
483465	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483481	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483514	SIRV6	-	247	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-54	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1874	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
483519	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483529	SIRV6	+	741	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	585	18	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
483540	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
483542	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532915	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
483551	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
483556	SIRV5	+	411	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2273_2316_3298_3405_3483
483557	SIRV5	+	250	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	267	151	153	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8468	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
483568	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483593	SIRV2	-	392	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2970	705	1791	-705	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAAATTGTAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2941	1740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
483604	SIRV5	-	343	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8457_8590_10866
483618	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	2	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
483653	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483699	SIRV6	+	672	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8199	-4	592	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTCTTGTGGTCGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	3132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
483709	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
483724	SIRV5	-	223	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAACCTACCACCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
483730	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
483742	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483747	contig_15063_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_13146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483748	contig_8538_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_5099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842921	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
483754	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	11	1153	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
483760	SIRV2	+	330	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	267	-74	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
483788	SIRV6	+	414	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-50	121	0	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGCTATTGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	1999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
483808	contig_15063_pilon	+	1491	5	Intergenic	novelGene_9294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483810	SIRV6	+	619	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-370	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	90	273	87	359	2002	3120	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCYL	1915	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
483828	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	249	1421	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26347	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
483860	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
483874	SIRV6	+	741	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	589	14	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
483881	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
483883	SIRV6	+	593	7	NIC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-351	-17	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	83	252	68	319	2002	3109	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	1934	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
483966	SIRV5	-	263	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
483973	SIRV6	+	272	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10553	1	1316	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11553	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
484014	SIRV6	+	266	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10559	1	1322	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11559	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
484015	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484040	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484051	contig_4364_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_1508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532908	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
484069	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484094	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484112	SIRV6	+	311	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	1	1277	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484114	contig_8317_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16494	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
484117	SIRV2	+	310	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	284	-71	-284	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTATTTGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
484125	contig_12622_pilon	-	2281	13	Intergenic	novelGene_5912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2287.9316471919	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	18	848	1590968	1588838	TRUE	20	TTTATATGTACATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGARRRVSFRREGRAPGTRLSSRPRHSGRRPLRRRRIVVVGQGRRGSYPLWKCRWRSLPLSLHLRGPLIHRLHRRRPLRRHALVQHHGRLRHRPQVWLLPQ	1590985	1583539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585603_1586273_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589531_1589691_1590000_1590234_1590830
484163	contig_15063_pilon	+	1635	7	Intergenic	novelGene_9066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2090.07572962215	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	243	1484	34808	39515	FALSE	30	CTAGACATGTGTGCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
484174	SIRV6	+	341	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	192	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGCCTCACGAGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
484180	contig_8538_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_4714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	80	313	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842748	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
484188	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
484201	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	4	37	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484209	SIRV2	-	339	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4534	34	3359	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
484246	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16438	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
484248	SIRV6	+	201	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	302	42	71	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
484259	SIRV5	+	260	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	257	151	143	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8458	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
484280	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484314	contig_1406_pilon	+	2508	5	Intergenic	novelGene_25584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	1460	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	53	448	2173822	2185260	TRUE	50	ATAAAGATTTTAAATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173769	2187451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2186274_2186404
484321	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	229	-4	-59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
484323	contig_8317_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_20705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16500	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
484329	SIRV6	+	918	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	577	-4	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484349	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
484354	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	74	505	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
484360	contig_5954_pilon	-	2378	15	Intergenic	novelGene_28603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	410.785285788583	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	673	2016	956264	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRPQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946341_946787_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
484367	SIRV6	+	962	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	564	2	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484386	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484388	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
484393	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	11	1276	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484437	contig_3077_pilon	+	2666	7	Intergenic	novelGene_26722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	3326.03491412823	265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	480	986	13867	16408	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10110	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144
484440	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484447	contig_6980_pilon	-	2030	9	Intergenic	novelGene_36052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	655	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1287	1604	370598	365020	TRUE	5	GGTGCCGCCTCCTCCACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	373887	346146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_346164_356700_356766_361141_361226_362331_362441_364868_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734
484472	SIRV2	-	307	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	351	2959	-351	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAACCCAGTGATAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
484477	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
484481	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484495	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484497	SIRV6	+	920	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	575	-4	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484506	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
484509	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16458	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
484529	SIRV6	+	929	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	581	18	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484539	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484553	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484561	SIRV6	+	177	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	431	0	-261	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAACGTCTATACGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
484578	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484605	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-19	886	-19	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8296	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
484628	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10353	2	1203	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484629	contig_8538_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_4926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
484641	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-11	226	2	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
484646	SIRV5	+	256	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	154	144	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
484668	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
484670	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	288	6	57	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
484689	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
484694	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
484714	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484726	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10411	2	1261	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484747	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
484748	SIRV6	+	959	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	563	6	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	135	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484761	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484769	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
484770	contig_15063_pilon	-	1512	5	Intergenic	novelGene_11667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36146_36264
484778	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484827	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
484866	SIRV6	+	193	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	85	505	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
484870	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
484889	SIRV2	+	442	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	151	-70	-151	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTCCCACAGCTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
484903	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
484923	SIRV6	+	695	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	574	-441	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
484967	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	4	1153	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484977	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
484980	contig_8317_pilon	+	911	2	Intergenic	novelGene_20743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACATATACAAACTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30067	32288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_30198_31507
485003	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	11	1268	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485009	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	4	1279	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485019	SIRV6	+	385	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	1	1203	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
485020	SIRV6	+	343	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	94	164	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
485025	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485084	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
485095	SIRV6	+	281	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10467	2	1317	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11554	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
485125	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485157	contig_1725_pilon	+	2704	17	Intergenic	novelGene_24294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	593.176354468045	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	40	1380	209791	248740	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACDEAIYQLGLDMEELEETYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRESAL	207462	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_207490_209778_209810_218484_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
485165	SIRV6	+	415	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	162	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1632_1736_1845_2027_2470
485179	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_14012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	196	1431	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34612	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485186	SIRV6	+	197	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10628	1	1391	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11628	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
485194	SIRV6	+	420	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1181	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
485197	contig_8538_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_4957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842802	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
485199	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	233	-3	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
485209	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485234	contig_8317_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_19887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATCAGTACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
485249	SIRV6	+	471	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-12	8800	-6	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
485268	contig_8317_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_20561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
485270	contig_4364_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532871	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
485307	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	70	508	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
485352	contig_15063_pilon	-	1493	5	Intergenic	novelGene_12760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	744	1067	35891	35108	TRUE	35	ACCGTAGTAATCACAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36743	28163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28199_34604_34924_35035_35380_35839_36156_36264
485369	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
485371	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	110	9	28	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3133	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
485449	SIRV6	+	414	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10411	1	1174	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11411	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
485467	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
485476	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10491	1	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11491	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485482	contig_8317_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_20591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
485503	contig_4364_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_4422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTCAAGGCAAGTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
485523	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	101	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485538	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485549	contig_8317_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_19575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
485593	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	1	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
485606	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	238	4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
485616	SIRV6	+	263	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	231	-2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
485655	contig_5954_pilon	-	2594	16	Intergenic	novelGene_28613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_10	445.216421779591	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	950	2233	955906	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960555	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955997_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960121_960201_960474
485684	SIRV5	-	391	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGGACGAATTTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
485686	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485703	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485704	SIRV6	+	195	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	398	2	-228	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
485727	SIRV6	-	317	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGTTGGTTAGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11814	11497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
485731	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
485772	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485780	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
485790	contig_4364_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_4066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533068	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
485791	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485805	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	41	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485823	SIRV1	-	195	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3613	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6753	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
485831	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
485832	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485848	contig_4364_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGTGTGTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532827	1533275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
485854	SIRV5	+	462	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7427	2	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACTTTCGGTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
485871	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485881	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10524	4	1287	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11524	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
485904	contig_10581_pilon	-	3985	10	Intergenic	novelGene_41394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	84.8266205595599	22	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	628	1407	627511	609845	FALSE	50	AAAGGATCTAAACCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649696	607266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
485913	SIRV6	+	396	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10352	2	1202	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
485914	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_10620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
485931	SIRV6	+	798	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	513	-4	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
485935	contig_3956_pilon	+	2860	10	Intergenic	novelGene_15134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1071.40147055672	1	167	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	378	1808	1286091	1289956	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281613	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1285752_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
485947	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_14077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	191	1426	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34617	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
485987	SIRV6	+	163	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	445	0	-275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGACGCCATTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
486027	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	878	33	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
486056	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	1	1295	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486061	SIRV6	-	338	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGTTGGTTAGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
486072	SIRV5	+	362	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-32	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8283	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
486107	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486119	contig_8317_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_20644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCAGCTCCAGCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
486145	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	2	1274	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486149	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	61	522	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
486211	SIRV6	+	298	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	233	4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
486230	contig_8317_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_20232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
486244	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
486254	contig_4364_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_1730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
486260	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486280	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10421	2	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486293	SIRV5	-	450	6	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1141	1170	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTCCTGGACTGCGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3547	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2165_2273_2315_3292_3403_3481
486302	contig_3077_pilon	+	2562	7	Intergenic	novelGene_26728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	3671.65220151486	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	384	890	13867	16408	FALSE	20	TAACAGTGTGCGGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRAGCTGRWSDLGFPCRLCSPGAAPVLFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10119	18080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144
486304	contig_8317_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16498	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
486315	SIRV6	+	997	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	525	6	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
486322	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486327	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	52	529	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
486336	SIRV5	-	381	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAAGCACTTTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10859
486347	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
486366	contig_9404_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_41455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGTTAGGACTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720766	719974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9404_pilon_-_720000_720800
486367	contig_1532_pilon	-	3453	7	Intergenic	novelGene_37422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_6	978.943591610648	20	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	1775	2710	27492	13113	FALSE	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREFAIDRLPSSFDSLNRLDFSTLSKLYKGDFTYIFQKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_28964_29438_29505_32049_32227_34870
486398	SIRV6	+	407	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10418	1	1181	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
486425	SIRV6	+	941	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	425	739	2021	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
486444	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533042	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
486474	contig_8317_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_20529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
486476	contig_8317_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_20621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16462	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
486485	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	4	60	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
486504	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4576	39	3401	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
486535	contig_8317_pilon	+	474	2	Intergenic	novelGene_19351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16208	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
486536	SIRV6	+	263	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
486541	SIRV5	-	303	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAAGTACATATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10866
486590	contig_15063_pilon	+	1476	5	Intergenic	novelGene_11808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	228	734	34808	35888	TRUE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNNHQYLRHPPILC	27141	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35845_36158_36266
486616	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
486623	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_8894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486624	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486680	SIRV6	+	285	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	15	1289	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486692	contig_7753_pilon	-	3224	1	Intergenic	novelGene_41478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978831	975607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_975600_978800
486699	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486706	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	1	222	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
486733	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCTGCAATCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8368_8451_8590_10863
486783	SIRV6	-	306	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACTTTGACGCAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
486787	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28171	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
486789	SIRV5	+	295	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7666	1	-273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCTAAGTGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
486821	SIRV5	+	358	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-28	875	-28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8287	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
486861	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
486869	contig_4364_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_2384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCTTTGCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
486904	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10425	2	1275	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
486906	contig_4364_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_1081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532890	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
486923	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	50	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGTAGTGCCGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	10775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3162_10721
486951	SIRV6	+	235	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCGCACAAGTCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1847
486953	SIRV6	+	187	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	25	222	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAACAAGAGAGTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
486955	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	4	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
486966	contig_7695_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_41651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819479	821689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_819500_821700
486979	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGAAACCTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
487015	scaffold_12124_pilon	+	2908	10	Intergenic	novelGene_22297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3150.78283041603	7	113	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	935	1714	1508626	1509405	FALSE	30	TATGTGTTGAAATCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473583	1510599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508224
487021	contig_8317_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_20260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
487032	SIRV6	+	476	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2474
487036	contig_12638_pilon	+	2677	17	Intergenic	novelGene_33104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	556.405708543685	783	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	753	1796	183468	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170803	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_183008_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
487042	SIRV5	+	344	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-213	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACAGCGTTATTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298
487070	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487072	SIRV5	+	408	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-83	880	31	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8232	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
487090	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487105	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	232	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487132	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487158	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487164	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487191	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	243	1085	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
487199	SIRV6	+	691	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-384	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	120	434	2021	10736	TRUE	35	TAATGGAAATTGGCGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1901	11306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
487202	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
487206	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10319	5	1169	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
487244	SIRV6	+	884	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	592	2	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
487270	SIRV6	+	166	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	442	0	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACGCCATTGCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
487275	SIRV6	+	748	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
487283	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487291	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10418	5	1268	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487360	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487373	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487374	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	120	11	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487395	SIRV5	+	293	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	37	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
487396	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	95	10	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487413	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-21	223	-8	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487442	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_12040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	220	1455	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27149	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
487456	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487459	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487481	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
487483	contig_7119_pilon	+	2363	4	Intergenic	novelGene_40944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	145	1299	137033	139798	TRUE	25	GATGGCTGAATCCTTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127513	140951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140359_140447
487484	contig_8317_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_19269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	26	349	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14268	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
487496	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	241	0	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487507	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
487511	SIRV6	+	440	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1492	538	63	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
487512	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
487513	contig_8538_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_4861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842775	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
487521	SIRV5	-	406	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTAATTTCGCACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	8236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
487523	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487572	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
487575	contig_4364_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_1305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
487580	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487582	contig_8317_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_20683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16490	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
487594	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487631	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
487632	SIRV6	+	743	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	586	15	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
487676	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	1	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487677	contig_9705_pilon	-	3635	30	Intergenic	novelGene_41709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	645.216510039526	324	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1104	3315	256	3570	170705	108338	FALSE	30	CATCAAACTCCTCTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQKQGKGKTCKKGKKGPGEKGKGGNGGGKPPSGPNRMNGHHQQNGVENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRDIALLDLINFFIQCSGCKGVVTAEMFRHMQNSEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMAGPQWKKFKSSFCEFIGVLVRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNLSINMDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNAIFKGVFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTALQGLYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPEEDGVMKRRGRQGPNANLVKTLVFFFLESELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTIRQAAECHPPVGRGTGKRVLTAKEKKTQLDDRTKITELFAVALPQLLAKYSVDAEKVTNLLQLPQYFDLEIYTTGRLEKHLDALLRQIRNIVEKHTDTDVLEACSKTYHALCNEEFTIFNRVDISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLFACNYKLLKTGIENGDMPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFCQICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFILDHVFIEQDDDSNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALSKNIVNSSPQLL	237817	108272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_108359_111259_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624_118765_122724_122900_125531_125625_127537_127619_127715_127804_128161_128233_129482_129687_133472_133563_133701_133795_134811_134916_135330_135449_136914_137027_138205_138314_142253_142334_142414_142514_143289_143414_144686_144761_146549_146702_148862_149068_152276_152354_156967_157065_162930_163096_166745_166825_170661_170802_237658
487678	SIRV6	+	724	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
487697	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	62	521	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
487719	SIRV6	+	702	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-396	21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	113	448	2002	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1889	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
487728	SIRV6	+	901	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	575	2	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
487731	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
487738	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
487748	contig_15063_pilon	+	1651	8	Intergenic	novelGene_10181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3646.68247891708	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	594	1400	35349	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35131_35203_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
487762	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
487765	SIRV6	+	201	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	501	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
487780	contig_177_pilon	+	2492	3	Intergenic	novelGene_41811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	4059	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	89	1165	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415642	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418817_418892
487790	SIRV6	+	499	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8795	8	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATCTGCAGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
487800	SIRV6	+	414	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	94	-10	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487823	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16455	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
487834	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	76	510	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
487840	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487843	SIRV6	+	926	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	569	-4	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
487850	SIRV6	+	957	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	36	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	169	510	254	763	1733	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2450_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
487882	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
487903	SIRV6	+	308	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	226	1	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
487953	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
487970	SIRV6	+	407	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10418	1	1181	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
487971	SIRV6	+	705	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	623	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
487985	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
488016	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
488028	contig_7229_pilon	-	2149	5	Intergenic	novelGene_39799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1636.39945841472	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	38	514	877522	875649	FALSE	25	GCAAATGGACCTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAICLEKAQYSPAPPLPLI	878215	874013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875700_875842_875960_876729_876867_877350_877535_878190
488033	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7486	1	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
488043	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	58	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
488047	SIRV6	+	717	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-17	623	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2477_2621_2740_2829_3106
488057	SIRV6	+	562	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8710	-7	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
488059	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	584	501	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
488066	SIRV6	+	1513	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
488067	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146665	1	-91631	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGAAGTAAGTATAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
488135	SIRV6	+	925	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	592	11	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
488140	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	221	0	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATATGTCTTGCCTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
488159	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10416	5	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488177	SIRV6	+	413	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-7	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1558_1657_1736_1845
488202	SIRV6	+	150	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10426	250	1189	-114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCGTCCTGGTTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11426	11576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11600
488223	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488227	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
488239	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_10641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488247	SIRV6	+	891	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	52	594	2	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
488250	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
488251	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
488252	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
488256	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
488267	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488286	contig_7775_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_37525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473159	473434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473200_473400
488296	SIRV6	-	308	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATTTCTGGTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
488312	contig_4364_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532865	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
488319	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28168	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
488416	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	38	3083	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
488431	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488490	contig_3077_pilon	+	2885	6	Intergenic	novelGene_26743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_5	2997.32578142584	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	710	1216	13867	16408	FALSE	25	GATTAACAGTGTGCGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	10980	18077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144
488527	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488553	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	11	33	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
488560	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_11437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
488561	contig_8317_pilon	+	227	2	Intergenic	novelGene_19260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCTGAACGCGAGCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14255	14775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
488569	SIRV6	-	935	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8712	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	27	5	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2603_2730_2826_3094_3164_10723_10825_11035_11109_11205
488615	contig_15720_pilon	-	5239	1	Intergenic	novelGene_41869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3763	4065	279917	279615	NA	65	GGGGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGINMWKRSHCPDSPSLSAQDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWVSVGWGGQAEYLAARWNPCQCYDFLICHLTPC	283679	278440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278400_283700
488643	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488645	SIRV6	+	240	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	69	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3163_10721
488648	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488718	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_19445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
488719	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3846.59686476241	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	202	1329	34808	38994	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGSEC	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38980_39092_39506
488738	contig_4364_pilon	+	253	3	Intergenic	novelGene_240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAGCAAGAGAGGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
488773	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	25	7425	5	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTCGGTAAATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033	3566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
488819	contig_9345_pilon	-	2063	7	Intergenic	novelGene_24635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_5	2203.15750685238	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	396	989	991509	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLMAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001347	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_991499_991635_997013_997093_1001156
488832	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	5	1267	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488867	SIRV6	+	918	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-1	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	165	498	216	713	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIKCV	1129	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
488902	SIRV6	+	244	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
488906	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488913	SIRV6	+	261	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	233	-2	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
488918	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
488922	SIRV6	+	440	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	94	1	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
488927	SIRV6	+	259	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
488961	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
488978	SIRV5	-	379	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACTTTCAGTAGGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
488991	contig_8317_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_20252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCACTGCCTTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
488997	SIRV6	+	929	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	37	571	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
489032	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	290	5	59	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
489034	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489044	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
489059	contig_8538_pilon	+	356	2	Intergenic	novelGene_4665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842319	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842330_842785
489062	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
489072	SIRV6	-	253	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-58	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1878	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
489080	contig_13863_pilon	+	2554	10	Intergenic	novelGene_42022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1247	junction_1	601.664686566968	139	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	55	1128	98341	118962	FALSE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98286	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886
489090	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGGAATACATCAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
489133	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10414	2	1264	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489156	contig_8317_pilon	+	387	2	Intergenic	novelGene_19371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16256	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
489189	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489206	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489212	contig_8317_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_19343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16200	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
489222	contig_8317_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_20076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16428	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489240	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533035	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
489241	SIRV6	+	1360	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	3	337	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489244	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
489290	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	295	2	64	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
489330	SIRV6	+	929	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	227	718	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489342	contig_8317_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_20099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16433	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489343	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-119	875	-5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8196	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
489347	contig_8538_pilon	+	364	2	Intergenic	novelGene_4671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	FALSE	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842535	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842543_842770
489352	contig_8317_pilon	+	325	2	Intergenic	novelGene_19277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2	325	14294	14910	FALSE	30	GTTTGTAGATTTAATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	14292	14910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
489393	SIRV6	+	492	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	354	8575	181	216	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACGTCGTGGGACGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484	2756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
489407	SIRV5	+	404	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-74	875	40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8241	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
489420	SIRV6	+	424	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	1	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
489428	SIRV6	+	409	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	15	1165	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
489436	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_20677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16488	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
489480	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_20070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16427	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489481	SIRV6	+	939	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	114	345	225	569	1733	2742	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGE	1120	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2475_2627_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489522	SIRV6	+	639	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8532	11	259	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGGTCTTACAAATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
489527	SIRV6	+	869	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	167	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	16	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	314	646	2002	10736	TRUE	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
489617	contig_4364_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_3736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGGAATACATCAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
489642	contig_8317_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_20700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16498	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
489647	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10529	1	1292	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11529	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489649	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	128	11	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGGTATGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
489653	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	4	1266	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489680	SIRV5	-	300	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTAGAGCGTTACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
489690	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	231	3	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
489701	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489720	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
489728	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	222	-4	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
489736	SIRV6	+	960	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	41	527	-2	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	217	708	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1128	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489740	SIRV6	+	938	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	578	12	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489745	contig_4364_pilon	+	347	3	Intergenic	novelGene_258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTCTATAACGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530444	1531236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096
489755	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	4	1293	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489759	SIRV6	+	406	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
489785	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	65	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
489824	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
489834	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_12390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3741.956425306	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	10	1479	28164	39510	FALSE	45	GAAATAAATGTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKV	28154	39743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39094_39506
489857	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
489873	contig_7066_pilon	+	2844	4	Intergenic	novelGene_42144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATGGCCGCCGCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747327	757841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_749880_750335_750427_754194_754283_757728
489874	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489888	contig_3469_pilon	-	2415	16	Intergenic	novelGene_34154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_15	72.0300554552673	683	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	223	1650	413507	380499	FALSE	45	TGACAACCAAACTGTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427658	379733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444
489906	SIRV6	+	1495	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489916	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	2	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
489928	SIRV5	+	355	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-217	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGCCAACAGCGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
489948	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
489965	SIRV6	+	970	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	557	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
489986	SIRV5	+	460	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-33	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTTTCGGTAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
490031	SIRV6	+	349	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	5	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	83	252	92	343	2569	10780	FALSE	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	2477	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3163_10724
490063	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490072	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490109	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490137	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490148	SIRV5	+	192	1	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	6921	2878	-280	-2876	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTCATAAATAGTCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7921	8113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_7900_8100
490175	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9642	593	492	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
490201	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
490206	SIRV6	+	685	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	8205	14	586	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGGTCGGTCTTGTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	3126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
490216	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490222	contig_9345_pilon	-	2042	6	Intergenic	novelGene_24637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	289	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	627	968	949643	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPQILCILLLSENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001351	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949717_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
490230	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490231	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490256	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490288	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_11253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490325	SIRV6	+	167	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	441	0	-271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGCCATTGCAAAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
490360	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490390	SIRV5	+	469	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
490413	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
490423	SIRV6	+	968	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	256	744	1733	10736	TRUE	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1089	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
490447	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490464	contig_1406_pilon	+	2612	5	Intergenic	novelGene_25572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	40	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	89	484	2173822	2185260	TRUE	10	CTATTTTAGTTTGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPPPRISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173733	2187468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2187142_2187221
490502	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
490504	contig_4364_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_3520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533043	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
490508	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490513	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16460	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
490542	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	32	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490546	contig_8317_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_19289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	2	346	14294	15113	FALSE	10	TGCTGCTGGTGTTGGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLI	14292	15115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
490549	contig_15063_pilon	+	2380	5	Intergenic	novelGene_13012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	1068	2240	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29449	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
490586	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
490588	contig_4364_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_3216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTAAGGCTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
490604	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4140	12	2961	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
490610	contig_8317_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_20255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
490652	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	86	498	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
490663	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	182	4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
490689	SIRV5	-	290	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACCTACCTTAGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
490712	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	62	517	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
490716	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	397	0	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCACATGGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
490758	SIRV6	+	407	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10418	1	1181	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
490790	SIRV6	+	654	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	800	572	-398	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	115	447	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1887	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
490803	SIRV6	+	296	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10529	1	1292	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11529	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490806	SIRV6	+	560	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-281	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	100	303	17	319	2021	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSAWMQALTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2004	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2489_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
490882	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	11	1256	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490903	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490915	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	9	1272	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490947	SIRV5	+	449	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-122	878	-8	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8193	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
490956	SIRV6	+	300	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10524	2	1287	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11524	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
490969	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
491009	contig_8317_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_20527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTTTTTAAAATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
491024	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
491067	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	273	18	42	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTTAGGTAGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	10770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
491075	contig_15063_pilon	+	1705	7	Intergenic	novelGene_11442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	231	1064	34808	36333	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	27138	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36277_36600_38975_39092_39506
491095	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	15	1258	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491123	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	89	496	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
491128	SIRV6	+	475	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1427	568	-2	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
491134	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	33	1262	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTTAGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491135	scaffold_12124_pilon	+	2191	6	Intergenic	novelGene_22272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2738.58065428061	57	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	855	1634	1508626	1509405	FALSE	45	TGTTATCCAAAGAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473574	1509962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1506664_1506687_1508010
491148	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10325	5	1175	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11412	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
491161	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
491162	contig_8538_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_4918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842786	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
491188	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27541	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
491206	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	4	1271	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491234	contig_8317_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_20669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16485	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
491240	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
491253	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	2	1269	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491322	scaffold_12124_pilon	+	2048	11	Intergenic	novelGene_22220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	18	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	TRUE	35	ATAAATGCGAAATGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508123_1508164
491324	contig_1244_pilon	-	2448	11	Intergenic	novelGene_37976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	291	junction_6	896.560226644033	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1237	1671	924306	923211	FALSE	30	TTTAAATGATGGGCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948502	922433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924715_927036_927227_928758_928894_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
491353	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
491359	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
491377	SIRV6	+	438	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAAAGTGCCAACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1848_2027_2470
491430	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	4	1268	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491431	SIRV6	+	903	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	227	1	136	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
491437	SIRV6	+	300	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	20	1269	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491460	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10469	15	1232	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11469	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491481	SIRV6	+	496	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8805	1	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
491499	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
491500	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
491506	SIRV6	+	769	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	545	-7	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
491510	contig_8538_pilon	+	296	2	Intergenic	novelGene_4666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842368	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842420_842875
491516	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7472	1	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
491525	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_11507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
491540	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
491562	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
491566	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	54	526	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
491585	SIRV6	+	470	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTATCTGCAGTCAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
491601	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	233	0	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
491630	SIRV6	+	815	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAAAACGTCACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	11053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11026
491680	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_20342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
491681	contig_5033_pilon	-	2373	15	Intergenic	novelGene_28994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1271	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531163_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
491683	contig_8317_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16498	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
491689	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-37	94	13	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
491695	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
491710	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
491746	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	73	510	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
491750	SIRV5	+	461	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7428	2	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACTTTCGGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
491778	contig_20984_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_42216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAACTATTTGATATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877	1465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20984_pilon_+_900_1500
491779	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_11810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
491785	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
491807	contig_18145_pilon	+	3323	14	Intergenic	novelGene_37338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	290.039662662126	71	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	223	1200	86893	96121	TRUE	15	GAGTCTGAGTCCTGATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKVGTSPREGWG	86670	101267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96301_97169_97335_97426_97550_97824_98541_98826_98983_100326_100482_100638
491818	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
491825	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532931	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
491847	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
491879	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
491892	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
491919	SIRV6	+	592	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
491927	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
491928	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	96	11	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
491981	SIRV5	-	381	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCACTTTCAGTAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
492019	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4596	44	3421	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
492057	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	206	-4	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTTTCTAGACCGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
492080	SIRV6	+	716	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	30	555	23	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
492091	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492097	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492122	SIRV6	+	1526	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
492151	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16429	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
492154	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	7	34	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
492158	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	240	65	304	1530895	1531213	FALSE	35	ACATGGAGAAGATCTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWD	1530460	1531214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
492182	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492224	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	78	500	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
492270	SIRV5	+	352	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCGAATAGCGCCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
492272	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492288	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	4	1263	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492298	SIRV6	+	431	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	1	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
492312	SIRV5	+	343	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7586	13	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
492321	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	9	31	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
492326	SIRV6	+	324	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	1	1264	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492337	SIRV6	+	417	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-11	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
492340	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	1	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
492357	SIRV6	+	765	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-10	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
492371	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10424	5	1274	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492372	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492389	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	4	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492401	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492402	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_9485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	241	1353	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKGK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36592_38977_39092_39506
492418	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492432	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492464	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492467	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	528	57	528	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10765	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
492472	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
492500	SIRV6	+	968	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	7	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	244	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	251	745	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
492507	contig_6735_pilon	-	2000	14	Intergenic	novelGene_15684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	893.832761716172	7320	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	78	1520	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568275	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552910_554255_554374_564157_564232_564784_564869_568198
492512	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492534	SIRV6	+	820	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	513	11	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
492573	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492593	SIRV6	-	299	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-96	424	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGCAAACCCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1916	1120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1729_1834
492603	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492641	SIRV6	+	957	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	519	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	18	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	TAATGGAAATTGGCGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
492670	SIRV6	+	278	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	224	-4	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
492691	contig_15063_pilon	+	1677	6	Intergenic	novelGene_13776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	25	ATATATTCTCCTTATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
492720	contig_8317_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_20137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCCTTGATGACACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
492722	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	-72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
492739	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492755	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
492806	contig_8317_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_20458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCATTAAAACAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16449	16770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
492823	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
492845	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
492850	SIRV6	+	233	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	390	-15	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
492874	contig_8317_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_20727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16510	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
492878	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10420	2	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
492913	SIRV6	+	213	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	395	0	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
492927	contig_8538_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_4705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
492950	contig_8317_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_20626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
492963	SIRV2	+	281	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	316	-74	-316	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCAATCGCAAGATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
492975	SIRV5	-	249	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAATTTAAGTTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
492992	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493020	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10349	2	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493033	SIRV2	+	254	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-50	319	-50	-319	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACGCAATCGCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058	1312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
493038	contig_8317_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_19478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16785	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
493080	SIRV6	+	286	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10462	2	1312	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11549	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493137	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493156	SIRV6	+	375	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	1	1213	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493170	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	97	11	73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493182	SIRV6	+	196	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	89	498	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
493195	SIRV5	-	289	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGAGCGTTACCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10865
493212	SIRV6	+	385	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	139	11	31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTATCGTGCCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493234	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493236	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16454	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
493250	contig_4364_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_2772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532990	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
493251	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	223	-4	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493258	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	94	8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493288	SIRV6	+	570	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-303	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2627_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
493301	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493305	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493312	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493356	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
493360	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
493367	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	130	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
493388	SIRV6	+	393	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10432	1	1195	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11432	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493413	SIRV6	+	364	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	157	14	13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTACGCTAGTCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	1963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493426	SIRV6	+	411	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1190	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11427	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
493457	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	16	31	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
493459	contig_8538_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_4779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
493530	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	133	15	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493533	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493538	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493584	contig_15063_pilon	+	1505	5	Intergenic	novelGene_11478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493645	SIRV6	+	402	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10423	1	1186	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11423	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493651	SIRV6	+	648	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	845	533	-353	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	70	402	2002	10736	TRUE	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1932	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
493659	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493665	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10422	5	1272	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493686	SIRV6	+	446	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	9	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2525	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
493717	SIRV6	+	274	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10551	1	1314	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11551	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
493787	SIRV6	+	437	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8844	-16	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
493842	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9653	581	503	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
493847	contig_15063_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_10714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	799	1122	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36798	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
493866	SIRV6	+	566	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8710	-11	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
493879	SIRV6	+	373	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	15	1201	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493909	SIRV6	+	283	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-45	247	5	-77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCACAAGTCGGTCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	1873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
493940	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	6	880	6	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8321	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
493950	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	9	1260	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
493952	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
493957	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
493969	SIRV6	+	291	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-441	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470
493978	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
493997	SIRV2	-	428	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4421	58	3246	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
494013	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494020	SIRV5	+	348	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-224	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGAATAGCGCCAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
494023	contig_6980_pilon	+	2275	9	Intergenic	novelGene_36011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	695.347170483925	596	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	446	1174	362370	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346064	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356930_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
494049	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494058	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	4	1263	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494067	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-86	875	28	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8229	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
494080	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
494092	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	42	3077	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
494096	SIRV6	+	419	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	94	-15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
494124	SIRV6	+	402	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	122	11	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
494142	SIRV6	+	502	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470
494146	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	1	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494165	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
494167	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494205	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16404	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
494210	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494215	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
494235	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
494254	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	535	58	535	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10772	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
494271	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTCCACTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3302_3405_3483
494300	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	244	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494307	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
494315	SIRV5	+	382	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-55	878	-55	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8260	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
494333	contig_15063_pilon	+	2879	6	Intergenic	novelGene_13071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	3744.9885767516	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	1420	2511	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	33388	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
494340	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
494345	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
494353	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_19451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
494357	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	15	1272	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494358	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_1057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532889	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
494368	SIRV6	-	497	5	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-238	33	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCATAACTGTTTGTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2785	1511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1542_1647_1735_1844_2030_2470_2619_2738
494382	contig_8317_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_20648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16468	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
494388	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494413	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494422	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494425	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494433	SIRV6	+	428	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8841	-4	-50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
494439	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
494445	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494446	SIRV6	+	214	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	394	0	-224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATGGTATAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
494462	SIRV6	+	958	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	563	7	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
494469	contig_8317_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_19241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	7575.5	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	69	392	14294	14910	FALSE	30	TTTGTAGATTTAATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQ	13257	14911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730
494483	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494486	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
494493	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494502	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
494538	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_12313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	768	1091	35891	35108	TRUE	30	CACAATGGTAGAATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36767	28152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
494541	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10410	5	1260	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494571	contig_4364_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_3123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533025	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
494578	SIRV6	+	1015	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	299	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	187	528	1673	2560	TRUE	25	TTGGCGATGACTATGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1098	11315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
494586	contig_4105_pilon	+	2684	12	Intergenic	novelGene_21463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	132.062970204269	961	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	660	1466	63728	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58732	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61304_61400_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
494594	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10470	2	1320	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11557	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
494605	SIRV6	+	696	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8167	-2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
494634	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	227	-4	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
494728	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
494789	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
494799	SIRV6	+	751	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	585	580	369	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
494800	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10548	1	1311	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494813	contig_8317_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_20590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16456	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
494814	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	239	0	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
494829	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	34	3223	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
494841	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
494876	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494892	SIRV2	+	271	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	326	-74	-326	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCAGCACGCAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
494899	SIRV5	+	480	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
494907	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	4	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494909	contig_4364_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_2539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
494928	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10511	1	1274	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
494987	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	235	-4	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
495015	SIRV5	+	376	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2065_2270_2316_3298
495023	contig_11285_pilon	-	3524	29	Intergenic	novelGene_5712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_24	389.325548420677	70	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1074	3225	121	3345	798530	784252	FALSE	15	GCTAAGCCCCCCTCCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVSARRPAPRHPEVPNRSSQLDNSCVGAGMTPSHAHPAQVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798650	784072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
495036	SIRV6	+	511	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8785	6	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCAAGTCGTAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
495045	contig_15063_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_8520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
495049	SIRV6	+	741	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	373	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	57	542	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1676	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2011_2460_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
495064	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	238	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
495081	contig_4364_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_1811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATACCCTGCACAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
495113	SIRV6	+	726	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	576	-1	-33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGTTGTTCAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
495121	SIRV6	+	910	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	46	572	3	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	212	703	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1133	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
495137	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_20426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
495141	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
495183	SIRV6	+	1193	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	843	-10	-355	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	72	404	2002	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1930	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
495192	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	22	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
495194	SIRV2	-	163	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3725	0	-1095	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATGTGTAAACTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
495204	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495216	contig_4364_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_2092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTAATACCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
495221	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
495235	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
495247	SIRV6	+	748	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	581	15	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
495268	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	89	497	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
495281	SIRV6	+	155	2	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	729	500	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034
495282	SIRV7	+	2118	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	52	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTCGATTCCTAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	114976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3129_114666
495288	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	226	1461	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
495324	SIRV5	+	260	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTCGCCGTATCGCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	2307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2062_2270
495344	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
495357	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10348	2	1198	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
495361	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
495390	contig_4364_pilon	+	438	3	Intergenic	novelGene_541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	76	438	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530449	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
495392	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
495409	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495435	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
495444	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
495459	contig_8317_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_20101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAAACCTGTGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16434	16791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
495466	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
495489	contig_6576_pilon	-	3208	16	Intergenic	novelGene_42245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	685.664057684228	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	113	1591	339439	322277	TRUE	75	AAAAAAAAGTTGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGF	339551	291094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_292503_315372_315452_319388_319444_322201_322285_322539_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339398
495490	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
495499	SIRV5	-	432	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACCTAGAGATGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8578_10857
495504	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
495505	contig_5023_pilon	+	2361	12	Intergenic	novelGene_7239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2448.7137794266	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	86	1351	607279	647201	TRUE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580843	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625835_647099_647643_647734
495550	SIRV5	-	335	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAATGTATTTGACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
495591	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
495597	SIRV6	+	836	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	594	164	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
495612	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	232	-4	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
495617	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
495620	SIRV6	+	173	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	77	7651	77	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2593	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
495689	SIRV6	+	474	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3110
495698	SIRV6	+	303	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10522	1	1285	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11522	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495703	SIRV5	-	404	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGGTGGTAATTTCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
495724	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	83	497	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
495753	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10481	4	1244	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11481	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495759	SIRV6	+	181	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	69	7651	69	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
495774	contig_12622_pilon	-	2261	13	Intergenic	novelGene_5913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2070.77664409328	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	30	905	1590968	1588038	TRUE	35	AGCGAATTTATATGTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERPALRLLSHPS	1590997	1583545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588466_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
495782	SIRV6	+	473	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10338	15	1101	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11338	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
495787	SIRV6	+	603	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	855	568	-343	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	60	392	2002	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1942	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
495792	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495806	SIRV6	+	289	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTAGTCCAATCTGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1638_1736_1845
495822	contig_8317_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_20036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16419	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
495823	SIRV5	+	390	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	62	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGTCAAGCCACGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118	3604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3296_3405_3483
495843	contig_8317_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_20489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTTGACCAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	16736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
495862	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495884	SIRV6	+	374	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10451	1	1214	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11451	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495888	contig_4364_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_2564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
495905	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10428	1	1191	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11428	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
495929	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10523	1	1286	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11523	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
495935	SIRV5	-	442	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGATGTCCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
495941	SIRV6	+	551	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8749	2	42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
495988	SIRV5	-	387	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGGACGAATTTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
496005	SIRV6	+	933	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	590	5	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
496011	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496025	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
496037	SIRV6	+	175	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	433	0	-263	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAAACGTCTATACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
496080	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	60	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
496112	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10430	2	1280	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
496117	SIRV6	-	410	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCATGCGAATGTAAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
496150	SIRV6	+	400	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	120	15	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
496154	SIRV6	+	301	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10444	5	1294	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
496177	contig_6215_pilon	+	2814	10	Intergenic	novelGene_21211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCCGACAAAATGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226741	243053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228367_229714_229951_230071_230215_231669_231760_231861_232035_233716_233856_234069_234114_235221_235361_238588_238755_242994
496209	contig_4364_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	81	350	1530895	1531243	FALSE	15	TAACGAGCTGCGTGTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTF	1530444	1531245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
496224	contig_8317_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_20236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAACAAAGTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
496227	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	162	31	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
496237	SIRV2	+	319	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	278	-74	-278	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGACTTTGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
496269	contig_8317_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_19857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTACTTTTTAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
496283	SIRV6	-	186	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	117	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1184_1466_1535_1640
496284	SIRV5	-	333	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
496299	contig_8317_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_20039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
496306	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_9115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
496325	SIRV6	+	822	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAGAAAGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	10805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
496330	SIRV6	+	292	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	232	11	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
496455	contig_15063_pilon	+	1491	6	Intergenic	novelGene_11271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	540	1361	35271	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34799_34843_34926_35034_35380_35839_36158_36266
496462	SIRV5	+	200	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	314	154	200	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8515	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
496489	SIRV6	-	407	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTTGTTCCATGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
496504	SIRV6	+	775	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	558	11	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
496518	SIRV6	-	200	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAATTATACGCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11253	10741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10817_11031_11109_11205
496523	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
496529	SIRV6	+	351	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	182	2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
496547	SIRV6	-	205	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACTTCGACTTCGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	10764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
496549	SIRV5	-	286	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
496560	SIRV6	+	1505	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	33	-1	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5960	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
496568	SIRV6	+	942	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	14	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	196	687	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1151	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1466_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
496581	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496594	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	122	8	40	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3145	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
496600	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
496623	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
496642	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496690	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2047	583	29	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
496693	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496705	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
496727	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496728	contig_8538_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_4681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	100	333	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842728	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
496729	contig_12638_pilon	+	2861	18	Intergenic	novelGene_33085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_10	465.891867104278	3740	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	859	1980	182987	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170769	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
496739	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
496749	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_10362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
496778	SIRV6	+	678	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	14	8169	7	622	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
496796	SIRV6	+	343	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	185	17	-2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	FALSE	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
496819	SIRV6	+	234	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	567	486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
496842	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
496843	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
496850	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	54	501	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
496861	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_4122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
496876	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_13609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
496908	SIRV6	+	400	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1651	-44	-248	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTATGGGGAAAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2775	11323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
496943	contig_8317_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_20199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16442	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
496951	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
496957	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	67	486	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
496960	contig_15063_pilon	+	1499	4	Intergenic	novelGene_14123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	184	1356	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34624	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
496970	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	12	1262	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
496977	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497004	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
497018	contig_10958_pilon	-	1818	2	Intergenic	novelGene_5467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901699	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
497023	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
497043	SIRV6	+	749	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	554	-2	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
497046	SIRV6	-	478	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGATTGCTCTTTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11800
497050	SIRV6	+	719	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
497080	SIRV2	-	1023	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2965	-1	1786	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	292	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2946	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
497092	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
497113	SIRV6	+	624	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	964	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11201	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11200_11800
497115	contig_6898_pilon	+	2307	2	Intergenic	novelGene_35784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124902	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125494
497169	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
497182	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
497188	SIRV6	+	743	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	27	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106
497192	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
497195	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
497211	SIRV6	-	312	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCAAGAATTTTCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
497241	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10349	2	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
497257	SIRV6	+	237	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
497275	contig_8317_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_20093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	507	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16431	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
497283	contig_15063_pilon	+	1826	7	Intergenic	novelGene_9664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2955.6669721063	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	240	776	34808	35816	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRLLQQSPPLCSGETTPPQTFSPTGH	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35739_36158_36266_36600_38975_39092_39506
497285	contig_4364_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_3136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533026	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
497338	SIRV6	+	703	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	566	-441	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
497346	contig_6980_pilon	-	2040	9	Intergenic	novelGene_36051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1291	1608	370598	365020	TRUE	20	GCCTCCTCCACGTCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	373891	346140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_346164_356700_356766_361141_361226_362331_362441_364868_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734
497387	contig_4364_pilon	+	523	4	Intergenic	novelGene_429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	77	523	1530895	1531702	FALSE	15	GGTATTGTCATGGACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTT	1530448	1531702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
497389	contig_4364_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_4272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533075	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
497391	SIRV6	+	457	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8843	2	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
497419	SIRV6	+	608	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	846	572	-352	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	69	401	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1933	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
497453	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10413	1	1176	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
497461	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497471	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497510	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
497519	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_12693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497524	SIRV6	+	410	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10415	1	1178	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11415	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
497528	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497543	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	74	505	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
497557	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
497565	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
497611	SIRV6	+	742	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
497639	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	90	491	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
497642	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	56	486	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
497684	contig_15063_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_9921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	GCCCCATGTGGTGACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497734	SIRV2	-	198	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-1055	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCCATTTACATTGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5790
497814	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497817	SIRV6	+	286	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
497823	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	293	3	62	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
497846	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	6	36	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
497853	contig_8317_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_20325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAATTTTGAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
497866	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	61	3227	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
497881	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	489	95	489	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
497907	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
497911	SIRV6	+	696	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	573	-441	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
497927	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
497930	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_9686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	240	1442	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35872_36158_36266_36600_38975_39092_39506
497989	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
498005	contig_5643_pilon	+	2187	16	Intergenic	novelGene_39014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_15	750.805031653062	3694	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	653	1933	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641370
498006	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
498017	contig_8538_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_4922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842788	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
498048	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10426	2	1276	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
498118	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10403	1	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11403	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498125	SIRV6	+	404	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10421	1	1184	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11421	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498172	SIRV6	+	1006	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	520	2	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
498186	contig_8538_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_4886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842779	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
498203	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	886	-24	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
498225	SIRV2	+	328	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	268	-73	-268	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTATCACTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
498244	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_12619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	6	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	5	1480	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
498253	SIRV6	+	389	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10422	15	1185	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11422	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498297	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16480	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
498298	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
498318	SIRV6	+	392	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10433	1	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11433	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498340	SIRV6	+	606	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	849	571	-349	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	66	398	2002	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1936	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
498350	contig_18145_pilon	+	3030	17	Intergenic	novelGene_37333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	473.09445079709	1078	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	226	2673	86893	100912	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPGVGALAQEGPGVRPWPASFFSLNSSATVRLWMGVSVAKNTK	86667	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100779
498363	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	11	1263	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
498372	SIRV6	+	288	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	15	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
498382	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
498404	contig_4364_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_4040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533067	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
498412	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
498448	SIRV6	+	932	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	569	-10	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
498454	SIRV5	+	211	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	303	154	189	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8504	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
498456	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
498457	SIRV6	+	904	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	39	594	2	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	219	710	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1126	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
498470	contig_8317_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_20638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16464	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
498475	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	239	1366	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27130	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
498495	contig_8317_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_20309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
498527	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
498537	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	392	2	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
498559	SIRV6	+	301	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	20	1268	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
498571	SIRV6	+	240	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	304	1	73	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
498635	SIRV6	+	397	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	123	15	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
498639	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_8503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	253	1488	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26343	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
498654	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
498660	contig_8538_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_4939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842793	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
498675	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	1	1252	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
498682	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10399	1	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11399	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498683	SIRV6	+	596	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8575	11	216	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACGTCGTGGGACGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
498707	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
498716	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	65	7651	65	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
498771	SIRV6	+	511	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAGTCAAGTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
498776	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGGCTCTCTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
498798	SIRV6	+	189	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	85	509	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
498808	contig_8317_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_20418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAAACCTGTGTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
498812	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_12256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
498813	contig_17427_pilon	-	2460	14	Intergenic	novelGene_30348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1128.60638260817	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	44	1468	188879	178046	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204686	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177686_177786_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
498820	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	81	497	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
498822	SIRV6	+	269	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10555	2	1318	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
498831	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
498840	contig_5023_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_7167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413070	414720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_413100_414700
498845	SIRV6	+	607	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	369	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGTAATAGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	10792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
498853	contig_1230_pilon	+	2149	9	Intergenic	novelGene_28842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1281.85543622321	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	73	1911	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405344_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
498870	contig_15063_pilon	-	1601	7	Intergenic	novelGene_10376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	854	1177	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39644	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
498892	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	233	-4	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCGGTGGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
498894	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	87	499	-27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
498919	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_20190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
498920	SIRV6	+	462	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10363	1	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11363	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
498963	SIRV6	+	267	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10558	1	1321	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11558	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
498965	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
499008	contig_15063_pilon	+	1699	7	Intergenic	novelGene_10379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3682.08194805904	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	237	1466	34808	39515	FALSE	30	AAATGTGTATATATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFK	27132	39748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39512
499009	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
499025	SIRV6	-	393	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTCTTTCTTCTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
499036	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9651	585	501	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
499037	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10412	5	1262	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499049	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	1	1295	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499075	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
499095	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10509	1	1272	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11509	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499097	contig_4364_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_4455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATCCAACTCAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1533100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
499144	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_1259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
499151	SIRV6	+	508	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1398	564	13	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
499156	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
499167	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10425	2	1275	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499172	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499218	contig_4364_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_3371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
499223	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
499227	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
499250	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
499253	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499262	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
499327	SIRV6	+	257	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	245	-4	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAAGTCGGTCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
499328	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
499350	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	34	3243	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
499361	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499363	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
499364	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499402	SIRV6	+	921	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	581	-11	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	212	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
499406	SIRV6	+	578	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-10	225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACGTATCGTTAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740
499443	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
499463	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499465	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499485	SIRV6	+	809	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	527	8	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGCAAATAAGAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	10804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
499543	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
499569	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	27	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499570	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499586	contig_19564_pilon	-	2213	5	Intergenic	novelGene_29592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	63	1397	15529	12201	TRUE	40	AAGAAACCTTTGCAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15591	11339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11923_11967_13259_13554_13666_13945_14055_15472
499587	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_9934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499604	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499619	SIRV6	+	276	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10549	1	1312	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11549	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
499639	contig_9909_pilon	+	5457	1	Intergenic	novelGene_42465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	457	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTGAATTGGTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546098	551555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_546100_551600
499656	contig_5954_pilon	-	2440	15	Intergenic	novelGene_28607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	434.48461728013	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	663	2078	956264	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960620	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947831_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959806_959941_960474
499719	contig_8317_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_19682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
499725	SIRV6	+	202	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	391	2	-221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGGTATAGTGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
499749	contig_8075_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_42477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGCTATGAGTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491135	493012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_491100_493000
499755	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499771	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
499836	SIRV6	+	293	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	231	11	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
499846	contig_4364_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_1292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532902	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
499867	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533059	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
499917	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
499919	SIRV6	+	610	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	860	556	-338	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	55	387	2002	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1947	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
499937	contig_8317_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_20640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16465	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
499959	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
499970	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	34	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
499975	SIRV6	+	529	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	553	8167	380	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
500030	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	1	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
500037	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	15	1267	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500093	SIRV2	+	287	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	310	-74	-310	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAAGATACGCAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
500105	SIRV6	+	437	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	8844	-16	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
500124	SIRV2	-	394	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3039	-1	-409	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGTTGTCTACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
500131	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	79	499	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
500140	SIRV2	-	302	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	39	3391	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
500163	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	284	6	53	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
500166	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10408	2	1258	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500198	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	231	-4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
500207	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	81	500	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
500229	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	4	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500241	SIRV6	+	341	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10407	2	1257	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500257	SIRV6	-	202	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTGGTTTCACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10779	2738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2826_3103_3161_10721
500288	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
500289	SIRV6	+	249	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	237	-1	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
500290	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
500308	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
500333	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
500334	SIRV6	+	882	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	197	682	1733	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1148	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
500364	SIRV6	+	316	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	7	1266	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGCTAGAAGACCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500384	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	99	-87	17	26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGAACGCAGTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3122	11357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
500409	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500411	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	228	-1	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
500430	SIRV5	-	308	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTATTTGACCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10962	8307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
500453	SIRV5	-	474	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGTGACTACAGTAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
500459	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10405	9	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCGGGAGTATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500480	SIRV6	+	447	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8844	11	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
500483	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10406	1	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11406	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
500488	contig_17936_pilon	+	2183	11	Intergenic	novelGene_29935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	41	1324	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50605	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
500516	SIRV5	-	315	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTACATATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
500518	contig_9807_pilon	+	2646	14	Intergenic	novelGene_32849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	480.403257629284	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	802	1800	140826	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108996	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_126683_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
500532	contig_6795_pilon	+	3524	24	Intergenic	novelGene_27739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	423.496794523459	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	920	2763	138	2900	324073	332823	TRUE	45	TTAAAAATCAGTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVCLPTCRSSTKARSPKTSSGWALGHRNLMTTTRST	323613	333733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327427_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_332010_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
500533	contig_12120_pilon	-	3579	6	Intergenic	novelGene_21402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	458.180924963054	1832	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2545	2883	21900	21562	FALSE	0	TCCTGGTTTGGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEFKK	156969	20865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118646_118731_156911
500537	SIRV6	+	454	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8844	4	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
500556	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10463	5	1313	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
500645	SIRV2	-	253	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4620	34	3445	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
500655	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500658	contig_10953_pilon	+	3794	13	Intergenic	novelGene_42519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_8	177.84301754325	840	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	23	1405	126980	161785	FALSE	5	GCTTGAGTGTGTCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRKCEHNLSKPEFNPTSIKFKIQLVAVNYIPEVRIMSIPNLRYLKESQVLLTLTNPVENLTHVTLLECEEGDPDNISSTAKVVVPPKELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFRKANKVGIFIKVTPQREEGEVTVCFKMKHDFKNLAAPIRPIEESDQGTEVIWLTQHVELSLGPLLP	126957	164174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408_145519_151635_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_161571
500677	SIRV5	-	313	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAAGTACATATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8450_8590_10863
500707	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	529	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
500716	contig_4364_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_2783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
500734	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	9	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
500740	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
500761	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
500790	SIRV6	+	207	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	303	35	72	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2588	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
500808	contig_4364_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_2401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532929	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
500834	SIRV6	+	199	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-226	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCACATGGTATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640
500865	SIRV6	+	939	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	235	729	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
500869	SIRV6	+	355	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-60	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
500872	contig_15063_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_9159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	TAACCATGTCTGTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
500894	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
500899	contig_15498_pilon	+	2752	9	Intergenic	novelGene_42636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	173.720995780591	1831	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	378	1502	679496	686124	FALSE	35	GAATGCACATGTGCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VACVPGGGRLGPRRHHGGATGAGLGLGLIEEKQAEGRRAAWACQEIQAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675019	687374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675088_675382_675458_679261_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866
500924	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	230	-4	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
500935	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-21	222	-8	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
500992	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10503	1	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11503	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500997	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
500998	SIRV5	-	385	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCAGTAGGACGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
501019	SIRV6	+	581	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8710	11	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
501051	contig_8538_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_5074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842840	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
501055	SIRV6	+	330	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10495	1	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11495	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501092	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501093	contig_9471_pilon	+	3617	8	Intergenic	novelGene_21788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_4	756.550226289015	3473	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2186	2716	412726	414785	TRUE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	406950	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936
501094	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	126	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501101	contig_4364_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_2239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532924	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
501139	SIRV6	+	287	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	399	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTCAAGTCGTAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702	2544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
501191	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501217	contig_4364_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_3084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
501218	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
501219	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501235	SIRV6	+	201	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9659	577	509	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
501238	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501247	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4256	34	3081	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
501294	SIRV5	+	350	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7613	-1	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGCGCCAACAGCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
501316	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10415	2	1265	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501322	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
501327	SIRV6	+	224	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	64	1301	-62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501338	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	70	511	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
501341	contig_4364_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGACTTGGCCACACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
501357	SIRV6	+	296	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
501389	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10515	1	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501398	contig_8317_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_20047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16421	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
501399	contig_7775_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_37526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAGACTTGGTGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473443	473177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_473200_473400
501403	contig_8538_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_4960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842804	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
501427	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	231	1346	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTE	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38982_39092_39506
501443	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532916	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
501465	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501508	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501520	contig_19564_pilon	-	2360	4	Intergenic	novelGene_29577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	4143	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	159	1493	15529	12201	FALSE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15687	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
501524	SIRV6	+	288	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	232	15	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
501528	SIRV6	+	972	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	556	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
501537	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
501551	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
501568	contig_8317_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_20009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16415	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
501575	SIRV6	+	995	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	531	2	15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	656	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	TTGGTAACAATGTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
501589	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10315	5	1165	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
501591	contig_4364_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_3217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533029	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
501610	contig_854_pilon	-	2860	15	Intergenic	novelGene_36159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	209.299073196267	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	88	1347	509201	471803	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509288	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471500_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
501611	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501634	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10413	5	1263	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501642	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533081	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
501662	SIRV6	+	244	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	59	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3110_3165_10724
501683	SIRV5	+	203	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	314	151	200	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8515	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
501700	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	40	1262	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAAGCAGCAGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
501732	SIRV6	+	497	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTCGTGCGTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1178_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
501743	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	241	15	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCGGTCGCCCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
501828	SIRV5	+	463	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	875	-19	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
501860	SIRV6	+	154	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	586	11	-416	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGACTCTTACTAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
501864	SIRV6	+	460	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	8	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGCTAAAGTGCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1847_2027_2470
501951	contig_4364_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_2225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGCATTAATACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
501957	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
501962	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	13	31	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
501968	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	80	486	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
501982	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	587	11	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
501984	SIRV6	+	753	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	33	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
501993	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502010	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
502013	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
502015	SIRV6	+	468	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTAAAGTGCCAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1844_2027_2470
502048	SIRV6	+	187	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	25	222	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAACAAGAGAGTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
502052	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502099	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	11	1163	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACGCTAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
502100	contig_401_pilon	+	2195	2	Intergenic	novelGene_42898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACCCACAGCCACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1818103	1820439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1820277_1820417
502109	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	4	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502129	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
502130	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
502144	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502150	SIRV6	+	772	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-3	532	3	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAGTGCAAATAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
502157	SIRV6	+	172	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-13	436	0	-266	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTGCAAAACGTCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	1684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
502165	SIRV6	+	996	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	187	501	1673	2560	TRUE	40	GACTATGGGGAAAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1098	11323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2497_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502196	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502199	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	4	56	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
502257	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16445	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
502285	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_9443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
502350	SIRV6	+	915	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	580	-4	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502359	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502383	SIRV6	+	720	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	630	566	414	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	16	507	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1717	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502407	SIRV6	+	986	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	527	15	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	16	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502418	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502420	contig_19342_pilon	-	937	3	Intergenic	novelGene_41133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCAGGTCAGGGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	5123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_5298_5420_5546_6132
502462	SIRV6	+	582	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10166	2	1016	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11253	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
502479	SIRV6	+	478	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	8167	-441	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
502505	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502513	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10550	1	1313	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
502537	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16428	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
502545	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	82	501	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
502587	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502600	SIRV6	+	402	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10409	15	1172	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11409	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
502620	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	15	1269	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502640	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	1	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502644	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502659	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502690	SIRV6	+	485	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8815	2	-24	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCGTCTTGAAGCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
502698	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
502712	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16405	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
502716	SIRV6	+	258	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10498	70	1261	66	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAATTATGGATTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11498	11756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502736	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
502769	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502780	SIRV6	+	1510	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502784	SIRV1	-	195	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3612	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
502788	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	228	11	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
502793	SIRV6	+	906	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	138	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	206	694	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
502823	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10506	1	1269	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502835	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10518	1	1281	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11518	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
502877	contig_8317_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_20536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
502901	SIRV6	+	189	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	445	11	-275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGACGCCATTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
502950	contig_4364_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_3862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533062	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
502951	contig_12923_pilon	-	3170	15	Intergenic	novelGene_30087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	327.403459832367	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	86	2080	93727	48997	TRUE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101253	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
502965	contig_5041_pilon	-	2606	17	Intergenic	novelGene_27064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	502.122479455959	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	6	2216	616721	525456	FALSE	25	TAGTCTCACGAAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	616726	525065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595089_598445_598587_605335_605439_616559
502966	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
502971	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503000	contig_7915_pilon	+	3247	1	Intergenic	novelGene_42993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1737	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	686	1156	158709	159179	NA	25	CCATCAAGTTGATTCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITISAQNPTDKLDNWDLLKMKHLCSSKDFTKRVKREPTGWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKMGKGNEQTLHQRRHSNGQQTHEEMLRITSH	158023	161270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_158000_161300
503045	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
503073	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503096	contig_8317_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_19724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
503110	contig_4364_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_3642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533053	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
503115	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503156	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_14046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	194	1366	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34614	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503160	SIRV6	+	255	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	124	-2	42	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3147	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
503184	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10419	5	1269	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11506	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503188	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	4	1260	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503220	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
503221	contig_2463_pilon	-	3432	5	Intergenic	novelGene_43020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1972	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2725	3036	522976	516959	TRUE	5	GCCTCTGCTTTACCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRIGYFIFLSVARLSWSLDISGSYASMTSVPLWSKNLAMDLVNSASRCCFVLPLMKVSFRVYLSSYLLRLEDSCQISSGSIPVGSFLWATRKMLFSLYEV	525700	504380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_504500_514671_514755_515353_515518_516928_517070_522775
503226	contig_4364_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_4162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533071	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
503229	SIRV6	+	131	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	78	787	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
503251	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	1	1170	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503254	SIRV6	+	1505	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	-10	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
503327	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	1	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503328	SIRV6	+	491	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-5	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTCGTAGGTATGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	2556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1847_2027_2470
503359	contig_8538_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_4976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842810	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
503379	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
503389	SIRV6	+	236	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	11	-218	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTATAGTGGACGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642
503400	SIRV6	+	795	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	568	337	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
503418	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10425	1	1188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11425	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503426	contig_20951_pilon	-	172	1	Intergenic	novelGene_43094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAATCGTGAGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28881	28709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
503436	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
503497	contig_12000_pilon	+	3768	9	Intergenic	novelGene_43158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	479	junction_1	416.262161984488	1409	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	98	931	417192	669327	FALSE	35	TCCACAGTTCAAAAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	416856	672164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_669224
503502	SIRV6	+	282	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10514	30	1277	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11514	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503510	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503512	contig_12357_pilon	+	1942	12	Intergenic	novelGene_6089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	920.63826224927	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	527	1261	34261	53235	FALSE	55	AGAATAGAAGAAATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26110_29589_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34188_34242_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
503514	SIRV6	+	652	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	813	561	-385	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	102	434	2002	10736	TRUE	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1900	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
503519	contig_8317_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_20643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCAGCTCCAGCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
503534	SIRV6	+	491	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8785	-11	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCAAGTCGTAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
503547	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-23	227	-10	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGCATATGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
503571	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
503576	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503579	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503602	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	232	-1	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
503614	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503649	SIRV6	+	291	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10534	1	1297	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503655	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	882	-10	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
503667	contig_8317_pilon	+	429	2	Intergenic	novelGene_19347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGACCAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16203	16737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16387
503670	contig_8317_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_19910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
503672	contig_8317_pilon	+	409	2	Intergenic	novelGene_19348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTACTTTTTAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16207	16715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
503681	SIRV6	+	591	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8710	1	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
503687	contig_11512_pilon	-	2935	7	Intergenic	novelGene_43270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_5	337.193523398986	2670	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	147	977	396169	367967	FALSE	25	CCCTTGGAACCTAGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396315	366008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
503711	contig_8317_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_20530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACCCATTAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
503727	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8846	11	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
503745	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	80	504	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
503748	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503757	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
503772	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
503774	contig_12622_pilon	-	2334	13	Intergenic	novelGene_5993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2122.04015271206	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	47	1015	1590968	1588027	TRUE	30	TAAATTTGGATTCTCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKGENARRETPTSTTTNCGRWARASWFLPALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1591014	1583571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589151_1589507_1589691_1590000_1590234_1590830
503781	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503812	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
503816	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	1	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
503823	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503842	SIRV6	+	239	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	395	11	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
503849	contig_15063_pilon	+	1479	6	Intergenic	novelGene_10131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	238	1335	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLIIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35129_35203_35380_35839_36158_36266
503868	contig_4364_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_4532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAACTCAAGGCAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533316	1533124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
503876	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10414	22	1177	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11414	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
503900	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503923	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	240	1367	34808	38994	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
503925	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503930	SIRV6	+	551	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8750	1	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
503954	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
503995	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	66	519	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
504004	SIRV2	+	227	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-58	354	-58	-354	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCGAAGCCACTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050	1277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
504012	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_20716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16502	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
504063	contig_8317_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_19452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
504088	contig_1406_pilon	-	4849	2	Intergenic	novelGene_25469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	681	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	146	1000	835192	834338	FALSE	50	AAAAATGGAACTGAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDIEYGYNCMAPSLRRERFAFKISPKPSKPLRPCIQLSSKNETSGMVAPTVQEKKVKKRVSFADNQGLALTMVKVFSEFDDPLDIPFNITELLDNIVSLTTAESESFVLDFSQPSADYLDFRNRLQTDHVCLENCVLKDRAIAGTVKVQNLAFEKMVKIRITFDTWKSFTDFPCQYVKDTYAGSDKDTFSFDISLPEKIQSYERMEFAVCYECSGQTYWDSNKGKNYRIVQAELKSTRGTGEPPNGPDFGISFDQFGSPRCSYGLFPEWPSYLGFEKLGPYY	841177	830488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_835221_841060
504108	SIRV6	+	990	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	527	11	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	433	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
504110	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	223	-2	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATATGTCTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
504144	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10400	1	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
504168	SIRV6	-	249	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-68	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1888	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1540_1644_1735_1844
504173	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_12325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504176	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	1	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
504177	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504224	contig_8317_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_20718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16503	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
504225	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504232	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	14	1423	28164	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28150	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504237	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	73	505	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
504249	contig_8317_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_19439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTTGACCAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
504256	contig_4364_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_2593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532936	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
504257	SIRV6	+	500	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8795	7	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATCTGCAGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
504266	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
504297	SIRV6	+	218	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	385	-1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
504341	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
504342	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	281	5	50	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
504380	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
504400	SIRV6	+	704	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	623	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
504409	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504438	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_8707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504468	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
504469	SIRV6	+	296	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	224	15	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATATGTCTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
504478	SIRV6	+	1006	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	520	2	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	210	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
504483	contig_4364_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532852	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
504531	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
504568	contig_5954_pilon	-	2622	14	Intergenic	novelGene_28645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_9	430.758516350268	66	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1553	2263	947127	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960563	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955997_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
504586	SIRV6	+	937	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	580	11	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
504609	contig_1532_pilon	-	2002	8	Intergenic	novelGene_37385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	4064	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	60	1253	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34920	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
504643	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
504660	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	236	-4	-66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGCCCAGCGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
504673	contig_18145_pilon	+	2871	15	Intergenic	novelGene_37340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	312.987945585182	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1452	2351	97864	100744	FALSE	20	ATGGAGTCTGAGTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86674	101264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90661_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96205_97443_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
504733	contig_4364_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_2770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532989	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
504779	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_10623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504802	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
504825	SIRV6	+	933	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	584	11	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
504831	SIRV6	+	813	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	513	18	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
504854	contig_4364_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_4446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533098	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
504873	SIRV6	+	431	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	855	513	-300	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	17	349	2002	10736	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1985	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
504876	SIRV6	+	235	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10590	1	1353	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11590	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
504906	contig_5125_pilon	+	2712	8	Intergenic	novelGene_43415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1542.87632263211	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	597	1730	35654	58893	TRUE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25948	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_59384_59493
504925	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_3187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
504927	SIRV6	+	415	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-28	98	-15	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
504932	contig_8317_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_19395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
504942	contig_8598_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_22908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	191218	191550	NA	5	TGTCCTGATTGTTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADC	191216	191552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
504943	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16500	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
505010	contig_8538_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_4984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
505034	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	7	1482	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
505037	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	1	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
505049	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTCGCCCAGCGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
505063	contig_15063_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_13109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	203	1438	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
505077	SIRV6	+	425	5	NIC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-344	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	83	252	61	312	2002	3109	TRUE	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	1941	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724
505083	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	106	11	64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATGCAAGCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
505098	SIRV6	+	285	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10537	4	1300	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11537	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
505116	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
505144	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16387	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
505145	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_10988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3682.08194805904	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	233	1456	34808	39510	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTL	27136	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39085_39506
505146	contig_1244_pilon	-	2233	13	Intergenic	novelGene_37967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	989.263600979144	120	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	55	885	948448	924672	TRUE	15	TGATGGGCTAAGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGNCLCSMLIIAEG	948502	922427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924709_927086_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
505149	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
505150	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_10515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	GAGGTAGTCACATTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
505163	SIRV6	+	448	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10374	4	1137	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11374	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
505168	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16403	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
505169	contig_8317_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_20737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTTCCGCCACTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16600_16800
505178	SIRV6	+	446	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTATCTGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
505185	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10548	1	1311	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
505222	SIRV2	-	437	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	41	3254	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
505251	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3739.8486340433	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	2	1465	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
505252	SIRV5	+	409	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
505254	contig_8538_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_4912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842785	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
505268	SIRV5	-	411	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGGTAATTTCGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10858
505317	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10453	5	1303	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11540	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
505347	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
505370	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	94	14	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
505376	contig_4364_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_2544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532934	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
505396	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	38	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
505427	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
505431	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
505448	SIRV6	-	299	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACGCAAGAATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
505494	contig_8538_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_4927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842790	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
505495	contig_15063_pilon	-	1663	7	Intergenic	novelGene_9067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	910	1233	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39701	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39089_39504
505496	contig_15063_pilon	-	1713	7	Intergenic	novelGene_12932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	970	1293	35891	35108	TRUE	35	TCCATACCGTAGTAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	28168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36607_38990_39090_39504
505512	SIRV5	+	246	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	271	151	157	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8472	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
505530	SIRV6	+	381	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10444	1	1207	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11444	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
505531	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	249	1424	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27120	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
505532	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	98	10	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
505542	SIRV6	+	897	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	60	571	10	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	445	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	198	689	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1147	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
505551	contig_4364_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_4312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533079	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
505618	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
505652	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
505660	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
505673	SIRV2	+	406	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTGTTTATCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751	2963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877
505759	SIRV6	+	151	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	561	71	561	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10798	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
505768	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	1	1270	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
505790	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	532	52	532	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10769	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
505800	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
505817	contig_8317_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_19405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16381	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
505818	SIRV5	-	400	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGAATTTACGGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10853
505829	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
505830	SIRV5	+	444	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7440	-1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
505842	SIRV6	+	433	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
505847	contig_9345_pilon	-	2106	6	Intergenic	novelGene_24605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	176	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	601	1023	949724	947957	FALSE	0	TCCTGGTGTTTGTGTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKLLKQHRKFYNLTRALRDSSKLNCMYPQILCILLLSENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001254	946873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949769_952339_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
505863	contig_12622_pilon	-	2331	12	Intergenic	novelGene_5964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2269.10010560491	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1585	2139	1586444	1583745	FALSE	35	CTTCAGAAGCGAATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQCLPLSFHIPRRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591101	1583552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586487_1586555_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1588889_1589496_1589691_1590000_1590234_1590830
505869	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
505870	SIRV6	+	244	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	242	-1	-72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
505898	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10428	1	1191	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11428	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
505955	SIRV2	-	204	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3681	-1	-1051	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTACATTGCGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
505979	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
506012	contig_13707_pilon	-	2544	11	Intergenic	novelGene_43536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_2	507.899842488654	2391	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	284	1498	275268	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275551	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197
506015	SIRV6	+	471	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1130	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11367	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
506039	SIRV6	+	272	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10539	15	1302	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11539	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
506042	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	74	505	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
506052	SIRV6	+	541	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1407	522	22	24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2494	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
506055	SIRV6	-	342	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAATTTGGCAGTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
506080	SIRV6	+	797	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	545	2	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	141	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
506106	SIRV5	-	395	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGACGAATTTACGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8387_8457_8590_10863
506133	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
506161	SIRV6	+	626	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-344	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	121	366	61	426	2002	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIRKQVTWKKKKCV	1941	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10697_10819_11031_11109_11205
506165	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
506189	contig_4364_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_4412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533090	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
506194	contig_7056_pilon	+	5672	9	Intergenic	novelGene_43608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	101	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACACACCTTTGAAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721891	730140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722606_723216_723276_723723_723819_724504_724590_724691_724746_725182_725316_725471_725606_725661_725729_725809
506230	SIRV6	+	206	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	390	-1	-220	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
506284	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
506312	SIRV6	+	280	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	222	-4	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATATGTCTTGCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
506363	SIRV6	+	538	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	2	8719	2	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAAGGTGAGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	2612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
506383	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	74	505	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
506401	contig_5189_pilon	-	2354	11	Intergenic	novelGene_34831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	3477	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	10	CTCTAATGTTTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
506411	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
506429	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
506452	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10253	178	1016	-42	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAGTGACTTGCGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11253	11648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11600
506459	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
506542	contig_4364_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_1132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCGGTGAAGCAGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
506547	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
506582	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
506630	contig_4364_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_2533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCAGCTCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1532934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
506632	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	237	3	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
506662	SIRV6	-	286	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCGCGAACTTTGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
506827	SIRV2	+	245	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	351	-73	-351	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGAAGCCACTAGGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
506830	contig_9955_pilon	-	2588	5	Intergenic	novelGene_21293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	714.724203801718	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49837	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794_48845_49272_49380_49692
506852	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_8616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	29	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26362	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
506894	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
506919	SIRV6	+	590	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	859	577	-339	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	56	388	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1946	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
506988	SIRV6	+	926	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11026_11109_11205
506991	contig_8772_pilon	+	1705	8	Intergenic	novelGene_21073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4570.98959053012	646	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	147	620	15355	19030	TRUE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRGC	15208	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15821_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
507009	SIRV6	+	914	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	572	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	19	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
507025	SIRV6	+	852	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	572	170	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
507028	SIRV6	+	697	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8205	2	586	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGGTCGGTCTTGTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
507057	contig_4364_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	61	393	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530464	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
507059	contig_4364_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_3491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533041	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
507065	contig_15063_pilon	+	2010	4	Intergenic	novelGene_9762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2701.27739330035	28	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1383	1871	36064	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266
507067	SIRV6	+	548	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	772	266	-383	97	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	100	432	2002	10736	TRUE	40	ACATATTTAGGTATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1902	11065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
507122	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
507175	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507176	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507203	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_12464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507239	SIRV2	+	184	2	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGGTTGTAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4739	5911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_4800_5787
507373	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	80	499	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
507385	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507387	SIRV2	-	607	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	38	3087	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
507394	SIRV6	+	319	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-15	181	-2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTAGCCTGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	1939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
507417	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
507439	SIRV6	+	494	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAGCAATCGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470
507452	contig_8317_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_20045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCAACTGTCTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16785	16421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
507462	contig_8538_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_4733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	73	306	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842755	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
507466	SIRV6	+	447	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
507472	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_3386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533036	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
507486	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507508	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
507522	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	80	503	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
507547	SIRV5	+	368	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-46	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8269	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10866
507566	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507578	SIRV6	+	612	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	213	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2625_2740_2829_3106_3165_10726
507591	contig_5189_pilon	-	2291	10	Intergenic	novelGene_34821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2180	junction_4	409.461977613442	18	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	42	1145	244235	199237	FALSE	0	TGTTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	244276	198090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163
507592	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507614	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_2945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533021	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
507643	contig_15063_pilon	+	1641	8	Intergenic	novelGene_11975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3646.68247891708	4	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	503	1387	35271	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27146	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35072_35142_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507649	contig_15063_pilon	-	1396	4	Intergenic	novelGene_13122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	684	1007	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36683	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
507650	contig_11720_pilon	+	1206	9	Intergenic	novelGene_43991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	418.034070830357	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	177	350	263924	264322	TRUE	40	AAAATATTTATTGAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGGLHGWSSREKALSSRWARKGSPGRPCRGCSGY	262926	272460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_263872_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265309_270641_270700_271268_271343_271806_271961_272096
507666	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
507685	SIRV6	-	398	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTCTTGTTCCATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
507692	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	542	539	369	4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGTAATAGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	10792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
507713	contig_8317_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_20732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16534	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
507809	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
507811	SIRV6	+	563	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	517	8169	344	622	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
507830	SIRV6	+	721	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	13	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2737_2829_3106
507842	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
507850	SIRV5	-	358	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
507871	contig_8377_pilon	+	2356	7	Intergenic	novelGene_35145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6021	junction_4	1240.86712512751	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	128	1069	191158	197939	FALSE	35	ATAAAAACGACTCCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	189182	199226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
507882	contig_1532_pilon	-	2388	7	Intergenic	novelGene_37382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	9	junction_4	1802.78688578422	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	875	1639	27321	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32228	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_27924_28520_28825_28964_32144
507897	SIRV6	+	606	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	344	8193	171	598	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
507906	contig_8317_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_20347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16446	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
507919	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507924	SIRV5	+	212	3	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5296	4117	-1849	3276	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTGGTGTAGGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6352	6874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6453_6658_6723_6826
507936	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507956	contig_12873_pilon	+	2017	7	Intergenic	novelGene_27144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1380.88491152916	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	946	1437	17896	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15941	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16381_16835_17021_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
507989	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
507993	contig_15063_pilon	+	1638	7	Intergenic	novelGene_9848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	291	1397	34860	39515	FALSE	25	ATATATTCTCCTTATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWCAKSNIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34885_35073_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
507997	SIRV6	+	189	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	84	510	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
508023	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508039	contig_233_pilon	-	2840	16	Intergenic	novelGene_14514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1311.84188410375	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	772	2319	79	2397	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126985	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109969_126894
508049	SIRV6	+	966	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	560	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	27	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
508060	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508069	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508079	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
508112	SIRV6	+	450	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1442	578	13	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2529	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
508155	SIRV6	+	403	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10402	21	1165	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTTTAAGATAGTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11402	11805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
508206	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508212	contig_4364_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACACCTCGGCGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533299	1532853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
508222	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
508238	contig_10569_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_44074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	773	1090	272618	272935	NA	30	TTGTGACATTGGTTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTRRSLLSHSPVGCKSKFRASAPGEHFLHWLWRKVHVISLHLVWELLCAGTSGPKDALCSQHCFLGFMRFLCVSACFSLLYLKRDCIKTLSNLVNLISITSSQ	271845	273875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_271800_273900
508245	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508265	contig_15063_pilon	+	1708	7	Intergenic	novelGene_10947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	25	TATATATTCTCCTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508287	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_19928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
508307	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_18843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
508340	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508345	SIRV6	+	274	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTAACGTTTCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1171_1468_1535_1640_1736_1845
508354	contig_3077_pilon	+	2489	7	Intergenic	novelGene_26639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	4097.81266856681	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	446	811	15160	16408	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	9602	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144
508382	contig_5954_pilon	-	2088	12	Intergenic	novelGene_28611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	467.472666810452	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	519	1727	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	959902	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947672_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766
508397	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508399	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508424	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508437	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	67	509	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
508453	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	315	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508455	SIRV6	+	234	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	407	4	-237	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACGCTTCCACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
508463	contig_8538_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_4827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGACAGGGTGCGCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843115	842772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
508482	SIRV6	+	395	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	8811	162	-20	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTTGAAGCAATCGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
508536	SIRV6	+	725	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106
508609	contig_15063_pilon	+	1690	7	Intergenic	novelGene_11800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3372.67841139156	32	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	229	1044	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36126_36266_36600_38975_39092_39506
508613	SIRV6	+	494	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1438	538	9	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2525	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
508636	SIRV6	+	753	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-33	581	10	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
508642	SIRV6	+	561	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-4	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1630_1736_1845_2027_2470
508650	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28181	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508665	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508679	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
508703	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	13	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
508704	SIRV6	+	350	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	185	10	-2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	FALSE	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
508716	SIRV6	+	340	5	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	64	129	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATTTAAAGTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	11097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034
508736	contig_5419_pilon	+	2643	3	Intergenic	novelGene_15489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	862	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACAGACTCCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238758	252122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238845_248828_248878_249614
508741	SIRV6	+	300	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	542	14	369	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
508744	SIRV6	+	432	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	1	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
508770	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508771	contig_8538_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_4869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842777	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
508787	contig_15063_pilon	+	1708	7	Intergenic	novelGene_11989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	218	1453	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27147	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508802	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508842	contig_15063_pilon	-	1519	5	Intergenic	novelGene_11904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CCAGTAGCTGAGGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
508856	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26351	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508857	SIRV6	+	453	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8751	164	40	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGTCTAGGACGCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
508879	contig_18145_pilon	+	2728	15	Intergenic	novelGene_37336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	285.876498595074	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1308	2207	97864	100744	FALSE	15	TGGAGTCTGAGTCCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86670	101265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96203_97486_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
508884	SIRV6	+	498	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	587	-441	-44	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
508903	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508904	SIRV6	+	497	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8803	2	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
508915	SIRV6	+	433	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10392	1	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
508928	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
508930	SIRV6	+	305	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	339	123	173	47	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
508954	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
508998	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	291	6	60	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
509020	contig_8317_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_20728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16510	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
509021	contig_233_pilon	-	2855	16	Intergenic	novelGene_14607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	654	junction_14	1221.65528143854	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	96	2417	126907	78579	FALSE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127002	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
509024	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509053	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509065	contig_5988_pilon	-	2373	4	Intergenic	novelGene_16105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	2037	2372	1224879	1222074	FALSE	35	CCCAGGGAGGACAAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIITEHATCNVCKEEMRGGGRSHQTEKGWMAISLLLFFLVLLIHSQDHHEFSEQSNKIQEEVNTMPDIILISIFSLFNNKLSIKKDKATHDHQPHIQVCLEKPNGSKEKV	1226915	1222072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1222105_1222577_1222678_1223381_1223459_1224751
509066	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509074	contig_233_pilon	-	2163	13	Intergenic	novelGene_14591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1577.86456211834	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	82	978	126907	99765	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNVSLP	126988	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91694_92294_92359_93764_93976_99741_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107440_108724_108814_109914_109976_126898
509097	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
509142	contig_3956_pilon	+	2312	13	Intergenic	novelGene_14959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1414.99788721868	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	81	1073	1281682	1287396	TRUE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDRHHHHL	1281601	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285790_1287377_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289818_1290610
509157	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	13	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509187	SIRV6	-	342	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACATAGCCATTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11802	11460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
509196	contig_8538_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_4884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842779	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
509232	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	51	500	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
509246	SIRV5	+	370	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1142_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
509271	SIRV5	+	359	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	13	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2270_2316_3298_3405_3483
509280	contig_7229_pilon	-	2111	3	Intergenic	novelGene_39792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2027	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	108	470	876863	875654	FALSE	25	CAAATGGACCTTGTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAAGSTASSLRCTGLPAPPGRIRRADWDTRPSKVMSSIGSACAGVAANAQCRKERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877454	874012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876806_876867_877350
509288	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
509322	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	241	1368	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
509332	contig_1225_pilon	+	2878	4	Intergenic	novelGene_44132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	15	AATGCTTTCCACTCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275526_275563
509334	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	70	TAAAAATTAGAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509353	contig_6215_pilon	-	2486	8	Intergenic	novelGene_21205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	788.559239036224	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	46	855	243029	228364	FALSE	30	AGACAAAGTGTGTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASLLLLSLHAFSGFTLYHDDPYQLVQV	243074	226732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229790_231889_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
509362	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509384	contig_12622_pilon	-	2134	12	Intergenic	novelGene_5965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	2158.07650428503	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	542	1300	1588902	1586655	TRUE	35	CCTTCAGAAGCGAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1583553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1588953_1589587_1589691_1590000_1590234_1590830
509415	SIRV6	+	346	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10461	19	1224	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11461	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
509426	contig_9482_pilon	+	1327	8	Intergenic	novelGene_44326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	953	1327	1240897	1242516	FALSE	20	CTGCTCATAGCCATCGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLWFRWLKRTGENRDLGILHFLWHLGVTEILVHDDALDELRVLQPPAHLALHLDELEVHISALHVCHCEDGVHRDLGHLLVTAVHHFGAQGGLGRLDQGLGVHHVHEDTVADEVQVLNGDAGG	1236246	1242516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240971_1241045_1241233_1242402
509440	SIRV6	+	694	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	109	330	158	487	2002	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2615_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
509448	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	100	11	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
509472	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509495	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509541	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509560	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509604	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509618	contig_8538_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_4940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842794	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
509629	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509634	contig_15063_pilon	-	2243	4	Intergenic	novelGene_13022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1049	1468	35527	35108	TRUE	60	CTAAAGTTAAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36684	29929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34924_35035_36156_36264
509681	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	389	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	234	1355	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38979_39092_39506
509684	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509688	contig_8598_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_22910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	191218	191553	NA	5	GTCCTGATTGTTGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191216	191553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
509695	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
509700	SIRV6	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGGCAGTTCATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
509705	SIRV6	+	645	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-436	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	104	315	172	486	2021	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2025_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
509719	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509720	contig_15063_pilon	+	1679	7	Intergenic	novelGene_9068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3810.76338225762	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	241	1365	34808	38994	TRUE	15	GTGTAGGCACTTGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGSEC	27126	39723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38980_39092_39506
509741	SIRV6	+	452	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	811	536	-344	7	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAATAGTGCAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941	10795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
509767	contig_4364_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_4424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533092	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
509772	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509780	contig_12357_pilon	+	2096	11	Intergenic	novelGene_6104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	785.780560971064	246	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	117	1409	26079	53235	FALSE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
509792	contig_12622_pilon	-	2234	13	Intergenic	novelGene_5932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1916.40566338828	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	24	1394	1590968	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590991	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589630_1590101_1590234_1590830
509793	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
509799	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_10946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509812	SIRV6	+	1020	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	506	2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
509819	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509846	contig_15063_pilon	+	2169	6	Intergenic	novelGene_8634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3125.35310005126	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1363	1914	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26377	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
509847	SIRV6	+	434	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
509850	SIRV6	+	718	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	620	578	404	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	26	517	1733	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1707	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
509865	SIRV6	+	456	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8748	164	43	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
509870	SIRV6	+	801	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	250	582	2002	10736	TRUE	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
509884	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	93	487	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACGTAAATTTACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
509886	contig_5189_pilon	-	2145	12	Intergenic	novelGene_34838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	955.749422535889	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	TRUE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_198684_198889_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
509924	contig_1532_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_37407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1339.82141667143	134	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	662	1426	27321	13113	FALSE	45	TAATAATGAGTATGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_29131_29438_29505_32049_32227_34870
509959	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
509986	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510024	contig_8317_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_20724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16507	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
510025	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	23	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510034	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510071	contig_8317_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_20735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16544	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
510096	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	576	11	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510113	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510173	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510179	SIRV6	+	444	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1437	589	8	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2524	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510203	contig_5967_pilon	-	2550	9	Intergenic	novelGene_44352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_3	223.183185690589	2829	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	92	931	488569	389166	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHGMSNYRLLYIYFTYRVTDI	517593	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
510223	contig_4364_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_2612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532937	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
510239	contig_8317_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_20723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16506	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
510240	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510252	contig_233_pilon	-	2362	13	Intergenic	novelGene_14534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1204.2406666997	21	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	121	1359	126907	92266	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEAPGWVNVSAGSASVTGLRTPRSASTGATASVTPSTVSATKARYAAERRGGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	127027	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93906_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
510264	SIRV6	+	425	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1176	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
510283	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_19428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16395	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
510285	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_9701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
510290	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28181	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510308	SIRV6	+	432	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
510312	contig_12357_pilon	+	2051	11	Intergenic	novelGene_6078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	737.455008797147	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	452	1402	30982	53235	FALSE	25	CTGCTTTATATTTTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29642_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
510350	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	94	-16	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
510364	contig_8317_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_19457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
510389	SIRV6	+	566	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8710	-11	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
510391	contig_8538_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_4850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842774	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
510434	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510444	contig_6980_pilon	+	2112	9	Intergenic	novelGene_35998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	685.78302645589	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	124	1020	356720	372790	FALSE	20	AGACTGTTACTGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	345573	373882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_345682_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
510454	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510464	SIRV6	+	832	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	410	568	194	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	130	621	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1497	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510472	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
510473	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510477	SIRV6	+	227	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9652	558	502	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
510478	SIRV6	-	676	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-279	451	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGCTTGATGGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2826	1093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1528_1631_1735_1844_2030_2470_2619_2738
510485	SIRV6	+	479	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	68	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCCGAAGGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470
510488	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510494	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510498	contig_15063_pilon	-	1507	5	Intergenic	novelGene_11237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	766	1089	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36765	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
510503	SIRV6	+	415	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	94	-11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
510505	SIRV6	+	319	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1614	171	222	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
510523	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
510538	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510539	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510541	SIRV6	+	529	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	233	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTAGGACTATGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737
510547	contig_8598_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_22899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	7	342	191218	191553	NA	5	GTCCTGATTGTTGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCA	191211	191553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
510550	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-37	142	13	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
510559	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_12817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510563	contig_17936_pilon	+	2272	11	Intergenic	novelGene_29910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	725.524748027247	14	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	63	1073	50646	114788	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSGGNFHQIGTIQKAVELT	50583	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114733_114934_118635_118827_121017_121063_125766
510590	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510601	SIRV6	+	710	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8193	1	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
510614	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	233	1354	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEC	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38983_39092_39506
510651	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_8895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510653	SIRV6	+	229	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	61	493	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
510654	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	247	1080	34808	36333	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	27122	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36277
510658	contig_12357_pilon	+	2014	11	Intergenic	novelGene_6098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	803.503509637637	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	117	1328	26079	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
510679	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
510693	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTTTTCTGTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16949	17247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16900_17200
510706	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510711	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510714	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510718	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510732	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_12360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510736	SIRV6	+	555	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8745	2	46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACGCGTTGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
510743	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510756	SIRV6	+	594	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-349	-27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1936	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510760	SIRV6	+	379	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-7	43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1639_1736_1845
510770	SIRV6	+	975	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	535	18	11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	ATTGTTGGTAACAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510783	SIRV5	+	355	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7608	-1	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAACAGCGTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
510790	SIRV6	-	211	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCGACTTCGACTCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
510794	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
510799	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
510805	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510829	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510833	SIRV6	+	378	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	171	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTCGTCTTGAAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2024_2470
510842	contig_15063_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_8740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	252	1427	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34606_34926_35034_35380_35839_36158_36266
510843	SIRV6	+	579	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2480
510850	SIRV6	+	946	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	500	32	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
510857	SIRV6	+	448	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	8831	-14	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAGTGCCAACTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
510868	contig_12644_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_44605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGTGATCGTCCTGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2675473	2676228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675500_2676200
510869	contig_12644_pilon	+	1949	8	Intergenic	novelGene_44676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_7	4055.97492243586	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	904	1875	2678073	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2676979	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
510871	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510874	SIRV6	+	571	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106
510879	contig_15063_pilon	+	1797	7	Intergenic	novelGene_10217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_3	2976.48034131291	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	238	774	34808	35816	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRLLQQSPPLCSGETTPPQTFSPTGH	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35739_36158_36266_36569_38975_39092_39506
510887	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510912	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	126	11	44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTATGGCTATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
510927	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_1378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532905	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
510940	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510943	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510960	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510963	SIRV6	+	400	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-402	586	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGGTCGGTCTTGTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1883	3126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106
510973	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9683	558	533	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10770	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
510978	SIRV6	+	236	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	565	486	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
510980	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
510983	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_9705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
510985	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3175.15750593573	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	12	761	28164	35888	TRUE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYGMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	28152	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
510990	SIRV6	+	423	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	514	-81	341	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
510994	SIRV2	+	223	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	371	-71	-371	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTTGTCTACATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
511016	contig_8317_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_20679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16489	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
511022	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511034	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511036	SIRV6	+	923	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	34	571	-3	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	224	715	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511040	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	104	11	66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAGCACTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
511041	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511044	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511062	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	82	486	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
511078	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	73	488	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
511091	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	13	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511102	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511104	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_8931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511114	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_10498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511123	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511146	SIRV6	+	442	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1351	237	9	126	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	TRUE	45	CAAAGAAATTTAAAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	11094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
511150	SIRV6	+	635	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8171	164	620	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGTTATTGTATGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
511152	SIRV6	+	856	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
511158	SIRV6	+	839	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	18	93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCACATATTTAGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
511159	contig_8045_pilon	+	2208	3	Intergenic	novelGene_35367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_2	145.5	159	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	26	322	116067	117529	FALSE	25	GAACACTTGAGTTCAGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKCKLRY	116041	119415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450
511170	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	18	578	18	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	33	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
511177	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10416	53	1179	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11416	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
511178	contig_177_pilon	+	2441	3	Intergenic	novelGene_41821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	316	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	78	1154	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415653	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419397_419512
511183	contig_8317_pilon	+	374	3	Intergenic	novelGene_19292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10612	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	14294	15111	FALSE	30	AGCTGGTATCTCCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQVLTVLS	14292	15139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14915_15094
511188	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511190	SIRV6	+	674	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2021_2470_2621_2740_2829_3106
511191	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511195	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511198	contig_15063_pilon	+	1459	6	Intergenic	novelGene_10649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	595	1338	35349	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35215_35284_35380_35839_36158_36266
511199	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511209	SIRV6	+	610	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8196	164	595	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTCGCTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
511212	SIRV6	+	504	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1394	572	9	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511214	contig_8772_pilon	+	2300	8	Intergenic	novelGene_21090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3336.55304230004	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	143	1501	15355	21608	TRUE	20	AAACTCTTGCTGTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRGKHLFSLTKITAAYHHFIYVKALVLYDI	15212	23418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_22053_23063
511216	contig_8317_pilon	+	438	2	Intergenic	novelGene_19373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	53	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16261	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
511217	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511226	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511229	SIRV6	+	458	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8837	7	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGCTAAAGTGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
511232	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511245	SIRV5	+	231	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	13	-84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTATCGCGGGTGGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	2314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2065_2270
511251	contig_8317_pilon	+	372	3	Intergenic	novelGene_19293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2	370	14294	15137	FALSE	30	AGCTGGTATCTCCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEF	14292	15139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
511259	SIRV6	+	974	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	524	-7	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511261	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511277	SIRV6	+	650	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	138	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	158	493	2002	10736	TRUE	25	AAGTCTTGTAATTATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1844	11106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
511285	SIRV6	+	851	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	14	223	7	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
511297	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511301	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511312	SIRV5	+	226	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-241	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGTCTAACATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119
511313	SIRV6	+	528	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	405	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
511322	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511327	contig_15063_pilon	+	1497	5	Intergenic	novelGene_12165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511331	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_11726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
511346	SIRV6	+	176	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	417	2	-247	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTACGGTCAAAGACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
511348	contig_19564_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_29609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	131	895	15529	12673	FALSE	50	TGAAAAAAAGAAACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQPAVPGPHRA	15659	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12703_12800_13259_13554_13666_13945_14055_15472
511354	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511355	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511360	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511362	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511373	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511396	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511401	contig_6488_pilon	-	3888	7	Intergenic	novelGene_44713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	729.135427902267	2203	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	269	1045	54113	31233	FALSE	15	ACCACAGGTGGTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFKGMSVSRPNAVVGKCRMIRHSRDRKNEPNPQRFDRIAHTKETMRLDGLNTLTYKVLDTQRYPLYTKITVDIGKPS	91395	28389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_31366_31558_31664_34242_34366_36841_37030_53885_54122_90850_90987_91271
511402	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511404	SIRV6	+	378	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10443	5	1206	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11443	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
511405	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511411	SIRV6	+	318	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10451	57	1214	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11451	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
511430	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
511434	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511454	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511462	SIRV6	+	712	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAATAGTGCAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1542_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
511470	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511477	contig_854_pilon	-	3207	13	Intergenic	novelGene_36171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	200.200784630497	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	238	1251	493192	471988	FALSE	10	TCCAACTCGTGCCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509263	470031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493201_495173_495239_497487_497571_509182
511483	contig_15063_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_9116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	243	1445	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
511495	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	65	TTATAAAAATTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511496	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511500	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511504	SIRV6	+	160	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	433	2	-263	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAAACGTCTATACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
511506	contig_233_pilon	-	2436	14	Intergenic	novelGene_14571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1325.15247308492	5	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	89	1996	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126995	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93925_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
511507	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511513	contig_9471_pilon	+	2729	12	Intergenic	novelGene_21792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_7	790.851419004954	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1760	2107	413930	414935	TRUE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMILKLWTLEVQRMMMNIIVHWYLQDITELLKLF	406967	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414836_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
511516	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2996.89670974642	18	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	8	784	28164	35938	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35858_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511527	SIRV6	+	905	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	77	546	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	181	672	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1164	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511536	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511544	SIRV6	+	317	4	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-2	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	FALSE	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	2470	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3162_10721
511545	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511546	contig_15063_pilon	+	1575	5	Intergenic	novelGene_8843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	10	GTGAGCGCTGCTCACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511548	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511549	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511558	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532868	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
511560	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511562	contig_15063_pilon	+	1517	5	Intergenic	novelGene_11246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511563	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511567	contig_4364_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532882	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
511569	SIRV6	+	840	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	38	756	1	113	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
511570	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511573	contig_8317_pilon	+	372	3	Intergenic	novelGene_19294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2	370	14294	15137	FALSE	30	AGCTGGTATCTCCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEF	14292	15139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
511592	contig_1230_pilon	+	2187	10	Intergenic	novelGene_28833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1209.82616851542	72	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	75	1949	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404451	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406416_406481_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
511600	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511601	contig_15063_pilon	+	1487	4	Intergenic	novelGene_13155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511611	contig_6059_pilon	-	4441	11	Intergenic	novelGene_44780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_10	194.482801296156	548	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	414	2930	126340	99949	FALSE	5	TCATTGTCTTTTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQETGFISKYNEGLCVNTGPDLILMSILDMSLHRQMGSDRDLQSSASSVSLPSVKKAPKKRRISIGSLFRRKKDNKRKSRELNGGVDGIASIESIHSEMCTDKNSIFSTNTSSDNGLTSISKQIGDFIECPLCLLRHSKDRFPEIMTCHHRSCVDCLRQYLRIEISESRVNISCPECTERFNPHDIRLILSDDILMEKYEEFMLRRWLVADPDCRWCPAPDCGYAVIAFGCASCPKLTCGREGCGTEFCYHCKQIWHPNQTCDAARQERAQSLRLRTIRSSSISYSQESGAAADDIKPCPRCAAYIIKMNDGSCNHMTCAVCGCEFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKILWQLGTLVGAPVGIALIAGIAIPAMIIGIPVYVGRKIHNRYEGKDVSKHKRNLAIAGGVTLSVIVSPVVAAVTVGIGVPIMLAYVYGVVPISLCRSGGCGVSAGNGKGVRIEFDDENDINVGGTNTAVDTTSVAEARHNPSIGEGSVGGLTGSLSASGSHMDRIGAIRDNLSETASTMALAGASITGSLSGSAMVNCFNRLEVQADVQKEQYSLSGESGTVSLGTVSDNASTKAMAGSILNSYIPLDKEGNSMEVQVDIESKPSKFRHNSGSSSVDDGSAARSHTGGASSGLPEGKSSATKWSKEATAGKKSKSGKLRKKGNMKINETREDMDAQLLEQQSTNSSEFEAPSLSDSMPSVADSHSSHFSEFSCSDLESMKTSCSHGSSDYHARFATVSILPEVENDRLENSPHQCSISVLTKTASCSEVPQLHHIAEEHGNNGIIPNVDLYFSDALKETNNNHSNQTMELKVAIQTEI	152109	98437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_100640_101554_101699_103289_103504_106696_106859_107389_107505_110669_110833_111483_111629_117575_117785_125666_126435_149503_149615_151901
511614	contig_8317_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_19623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAACAAAGTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16400	16774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
511616	SIRV6	+	989	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	5	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	142	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	253	747	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511617	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511620	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511625	SIRV6	+	662	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	581	167	-38	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
511626	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511630	contig_17427_pilon	-	2525	12	Intergenic	novelGene_30316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	984.505858349236	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	4	1428	188879	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188882	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
511638	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_11438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511645	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511647	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511653	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	25	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511656	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_8903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511668	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511687	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511695	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511698	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511700	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	252	1424	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26344	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511718	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_11456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	231	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511721	contig_57_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_44906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCTAAAAAAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120741	122624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_120700_122600
511738	contig_6361_pilon	+	3673	1	Intergenic	novelGene_23914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1375	1779	211144	211548	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKHFTKEDIQAANRHKRKCSGSPAIREMQIKTTMRYHLTQALMAQIKKTENNKCWRQCEEIGTLMHCRWECKMVQPFWKTIWRFLRKLETEIPYNPAIPLLVIYPREIRTLTQIDICTPMFTAAPFTVARRWN	209769	213442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_209800_213400
511749	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511753	contig_15063_pilon	+	1450	5	Intergenic	novelGene_13842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	200	1306	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLWSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35170_35238_35380_35839_36158_36266
511758	SIRV6	+	850	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	166	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	98	430	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1469	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511762	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	6	1481	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511771	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511782	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511803	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511818	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_13987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511830	SIRV6	+	497	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8764	-2	27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCACTTGTCGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
511833	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511844	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511845	SIRV6	+	659	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	340	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2625_2749_2829_3106_3165_10724
511848	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511849	SIRV6	+	419	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1651	529	222	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
511863	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-43	94	7	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
511864	SIRV6	+	558	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1396	516	11	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAATTGGCGATGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2483	11309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511870	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511876	SIRV6	+	385	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	356	8800	183	-9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
511879	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511882	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511884	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10412	64	1175	-62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11412	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
511885	SIRV6	+	248	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	393	4	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
511886	SIRV6	+	987	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	9	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
511909	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511918	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_8920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511924	contig_1725_pilon	+	2626	15	Intergenic	novelGene_24311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_12	454.263864029779	47	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	165	1496	235987	248928	TRUE	25	ACTACATTGGAGCACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKVSWFY	235822	255858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
511926	contig_14970_pilon	+	1899	9	Intergenic	novelGene_45000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4589.65932831621	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	108	560	136145	191980	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISNYC	136037	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
511932	contig_15063_pilon	-	1595	6	Intergenic	novelGene_13585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35372_35838_36156_36264_36597_38972_39090_39504
511934	SIRV6	+	805	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	513	-11	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	10	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
511935	contig_11720_pilon	+	3382	13	Intergenic	novelGene_43990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	394.069817206714	175	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	2379	3131	269766	272210	FALSE	40	AAATATTTATTGAGTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECALHISLLLSRRPQFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262925	272461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_266171_266240_266453_266610_267753_269262_269595_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
511958	SIRV6	+	725	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	399	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	123	372	31	402	1733	2794	TRUE	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEVWDTSWDVSLGLWD	1702	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856_2027_2470_2621_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511960	SIRV6	+	891	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	317	649	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
511972	contig_12638_pilon	-	3208	4	Intergenic	novelGene_33146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	449	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200485	196109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_198149_198734_198841_199333_199412_199500
511973	SIRV6	+	349	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-3	337	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGTCAAGTCGTAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
511976	SIRV6	+	692	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	26	583	19	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
511977	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
511978	contig_15063_pilon	+	1663	8	Intergenic	novelGene_10959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3646.68247891708	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	233	931	34808	36133	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISETGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36016_36070_36158_36266_36600_38975_39092_39506
511979	SIRV6	+	612	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-43	8570	0	221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGGGACGTATCGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
511982	contig_15063_pilon	-	1721	7	Intergenic	novelGene_11457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
511985	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
511987	SIRV2	-	588	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	69	2638	53	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAGGTAATTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5842	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
511997	contig_8317_pilon	+	372	3	Intergenic	novelGene_19295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2	370	14294	15137	FALSE	30	AGCTGGTATCTCCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEF	14292	15139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
511998	contig_233_pilon	-	2748	16	Intergenic	novelGene_14650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1378.38392652007	2	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	133	1764	126907	92266	TRUE	20	TCCATGGGGTGTCCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCESRKWRGAAERITVPLCAPGWVNVSAGSASVTGLRTPRSASTGATASVTPSTVSATKARYAAERRGGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	127039	78154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93953_94798_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
511999	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512000	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512007	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512008	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_10419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512017	SIRV2	+	468	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	125	-70	-125	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAATACCTCTTGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
512039	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512045	contig_15304_pilon	-	2488	9	Intergenic	novelGene_30417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1283.55107392538	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	99	2351	66228	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	66326	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991_54295_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104
512049	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512059	SIRV6	+	1004	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	501	-14	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	40	ACTATGGGGAAAGAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512061	contig_7457_pilon	-	4260	19	Intergenic	novelGene_31518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_5	222.216333255303	670	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	105	2489	694599	675289	FALSE	20	AATTTGATGGTATGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQLLEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQSTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLVREANNCSSPAGSLVDAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESLRIQAQFAQLAQLNPQERLSRETALQQKQVSLETWLQCEAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLLRKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLCQQLPIPGPVEKMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGKLNVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKSENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMSLKRIKRADRRGAESVTEEKFTVLFESQFSVGSNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDHNATATVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNSSSNHLEDYSNMSVSWSQFNRENLPGWNYTFWQWFDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLIHKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSPDRNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRLGDLNYLIYVFPDRPKDEVFSKYYTPVLAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASVDSVGGSATYMEQAPSPAVCAQAPYNMYPQNSDPVLDQDGEIDLDETMDVARHVEELLRRPMDSLGPPLPPPDGFFTSARGSLS	695502	673517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_675452_676860_676969_677222_677275_677982_678139_678612_678744_678840_678936_679758_679966_680452_680546_681158_681282_681381_681470_683262_683443_683880_684037_684455_684608_684865_684997_689155_689331_692716_692807_693980_694138_694471_694610_695408
512062	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512063	SIRV6	+	938	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	7	-29	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11030_11109_11205
512070	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512075	SIRV6	+	799	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	557	560	341	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512077	contig_15063_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_8679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	253	1488	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27116	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512081	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512093	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512094	contig_5981_pilon	+	2879	9	Intergenic	novelGene_35492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_6	259.197198094424	1741	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	80	1318	23508	37804	FALSE	25	ACAGAGTCGTTCAGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAACGSGFAPSAPPPSFLRAARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23428	39365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
512102	contig_15063_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_8910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512103	contig_1230_pilon	+	2118	9	Intergenic	novelGene_28868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1276.54009313261	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	648	1880	406520	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404476	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405918_406240_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
512105	contig_8045_pilon	+	2026	3	Intergenic	novelGene_35356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2698	junction_1	435.5	420	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACACTTGAGTTCAGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_118243_118527
512111	SIRV6	+	575	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	8506	167	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
512113	contig_1406_pilon	+	3087	4	Intergenic	novelGene_25577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	381.791391556524	129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGGTTCTTAGTGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173748	2188012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183831_2183885_2185143
512115	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512118	SIRV6	+	858	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	1	140	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	72	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	214	699	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGDLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1131	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2625_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512119	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10451	56	1214	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11451	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
512122	SIRV6	+	952	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	493	33	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512126	contig_15063_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_8533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	251	1423	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512128	contig_5988_pilon	+	2535	4	Intergenic	novelGene_15954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAACCTCGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651791	654858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652511_652584_652946_653275_653422_653549
512129	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512131	contig_177_pilon	+	2469	3	Intergenic	novelGene_41810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	3982	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	92	1066	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415639	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_417853_417954
512132	SIRV6	-	279	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTCCACATAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11745	11466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11700
512133	SIRV6	-	442	5	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	53	431	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAATTTCCCGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2494	1113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470
512134	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512136	SIRV6	+	759	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
512137	SIRV6	+	410	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	65	1114	-63	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGGATTTAGTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512138	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512142	SIRV6	+	775	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	345	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	111	336	242	577	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1648	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512144	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	3415.1833314626	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGPGTQVTISLESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	25978	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26016_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512145	contig_4754_pilon	+	2789	1	Intergenic	novelGene_35886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGACCAGTTGCATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73653	76442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_73700_76400
512147	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_8663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	798	1121	35891	35108	TRUE	45	GCAAAAACGCAGGGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36797	26752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26785_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
512151	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512153	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_10643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512154	SIRV6	+	344	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	189	12	2	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512155	SIRV6	+	764	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	271	162	92	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	35	ACGTCACATATTTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512156	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512157	contig_5189_pilon	-	2233	11	Intergenic	novelGene_34839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1000.33904252508	44	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	111	1181	244235	199152	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQCLESCRKIDFIVIGVREVRRENLSDCLFCLDDWF	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199257_200469_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
512158	SIRV6	+	884	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	546	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512160	contig_1575_pilon	-	2412	5	Intergenic	novelGene_45188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190545	181481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_183485_183572_183666_185019_185122_185308_185361_190383
512163	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_10447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512164	contig_5189_pilon	-	2285	12	Intergenic	novelGene_34840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	955.749422535889	125	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	111	1148	244235	199237	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWRFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218533_218598_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
512165	contig_13021_pilon	+	2395	13	Intergenic	novelGene_8163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2564.14754624005	6	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	169	1629	174676	180230	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGKTNLG	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180294_180450
512167	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26357	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512170	SIRV6	+	856	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	576	3	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	123	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512174	SIRV6	+	458	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8832	12	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAAGTGCCAACTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512175	contig_5686_pilon	+	2923	19	Intergenic	novelGene_45280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1655.15147193897	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	611	2644	202891	265109	FALSE	25	TGATGTATTATTCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGLLRKDVSLLSKVK	93821	265388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182675_200526_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_265065
512177	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512178	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512179	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512180	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512182	SIRV6	+	523	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8753	-11	38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGCGTCTAGGACGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512184	SIRV6	+	805	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-13	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512185	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512187	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512188	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512189	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	236	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512190	SIRV6	+	862	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	171	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	111	336	301	636	2002	10736	TRUE	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1474	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1856_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512192	contig_5041_pilon	-	2611	17	Intergenic	novelGene_27077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_5	609.578514092935	293	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	80	2242	616721	525456	FALSE	55	AATAAAAAGAATTCATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636059	525086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
512196	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	755	223	-400	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512197	contig_15063_pilon	+	1437	6	Intergenic	novelGene_11355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	231	1295	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35124_35231_35380_35839_36158_36266
512200	SIRV6	+	722	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	515	239	342	124	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	88	579	1733	10736	TRUE	50	CACAAAGAAATTTAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1645	11092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512202	SIRV6	+	412	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-21	94	-8	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512203	contig_9955_pilon	-	2480	5	Intergenic	novelGene_21288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_2	665.808155552333	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	283	939	49296	46990	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEKS	49891	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46999_47590_47737_48794_49380_49692
512204	contig_935_pilon	-	2354	2	Intergenic	novelGene_45588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2115	240	2354	630665	628551	FALSE	35	AGATCTGATAAAGCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQVGDVAVNGALFSGNVFCMCTGTPFMCYQMPFVQRLMISQS	632752	628550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_630678_632525
512205	contig_5041_pilon	-	2658	17	Intergenic	novelGene_27076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	612.772477657899	347	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	89	2287	616721	525456	FALSE	50	TAAAAAGAATTCATCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKVNKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636068	525084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525647_532088_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
512208	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512210	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_9075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512215	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512216	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_10948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	25	ATATATTCTCCTTATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512218	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGLLGPRNHGHCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34617_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512219	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26358	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512220	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512221	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512222	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512224	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_9702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512225	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512226	contig_5954_pilon	-	2828	14	Intergenic	novelGene_28627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	313.096824164307	29	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	670	1212	956264	947658	TRUE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFR	960587	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945741_946209_946335_946673_946908_947066_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512228	SIRV6	+	406	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	111	18	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGGCCTGGATGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512233	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512234	SIRV6	+	637	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8169	164	622	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
512235	contig_13021_pilon	+	2206	14	Intergenic	novelGene_8143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2490.34436914317	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	170	1906	174676	180850	FALSE	40	GAATTAAGTGGAAATTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174506	181150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440_180593_180706
512237	SIRV6	+	376	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	132	1081	4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAATGGGGTTTGCCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
512238	contig_15063_pilon	-	1529	5	Intergenic	novelGene_10650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
512240	SIRV6	+	375	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	130	-7	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512241	contig_1230_pilon	+	2131	9	Intergenic	novelGene_28843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	1279.46040872705	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	73	1893	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406824_407160_407352_407588_407788_408003_408237_408568
512246	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512247	contig_15063_pilon	+	2161	6	Intergenic	novelGene_9277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	3052.15993027888	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	242	967	34808	35645	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRKCTGSQGEGSCPKHSPCPSLAKQESRNTHRHTTHTHNTQTYTHTPHAHIHYTNIPTYTHVPHTDIHTRHTDIHTTCTCIHTHTHTQT	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266_36569_38975_39092_39506
512251	SIRV6	+	732	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	537	-441	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512252	SIRV6	+	624	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	281	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCTGGTACGTTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123	2821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2020_2470_2613_2737
512253	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512254	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512255	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512257	SIRV6	+	647	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	124	375	158	532	2002	10780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11031
512258	SIRV6	+	481	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10259	10	1109	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGACCGGGAGTATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11346	11827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
512259	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_9467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	241	1335	34808	38987	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27128	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
512260	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512261	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_11213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512263	contig_7775_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_37517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473021	473473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473000_473500
512264	SIRV6	+	732	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	537	-441	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512266	SIRV6	+	396	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	137	2	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512268	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_9707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512269	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	755	223	-400	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	117	449	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1885	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512271	contig_8317_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_19381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
512272	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	239	1363	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKGGSEC	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36592_38975_39092_39506
512273	SIRV6	+	477	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	626	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTATGAGTAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	3166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470_2621_2740_2829_3106
512274	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512275	SIRV6	+	559	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8525	164	266	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
512276	contig_15063_pilon	+	1495	5	Intergenic	novelGene_11659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512282	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512283	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_8542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26346	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512284	contig_15063_pilon	+	1563	6	Intergenic	novelGene_12744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_5	3673.08575451214	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	2	1327	28164	39515	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	28162	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
512285	contig_4364_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACCAGATCACACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533158	1532834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
512287	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10365	71	1128	65	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11365	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512288	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_10496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GAGGTAGTCACATTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512289	SIRV6	+	585	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	778	223	-377	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	94	426	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1908	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512290	contig_15063_pilon	-	1742	7	Intergenic	novelGene_8491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	20	CAGCCACAGTGATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	26342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
512291	contig_15063_pilon	+	2254	5	Intergenic	novelGene_13018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	938	2110	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29579	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512293	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512294	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512295	contig_15063_pilon	-	1693	6	Intergenic	novelGene_13110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	50	CCAAGAGTGGACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
512296	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512297	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	158	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512298	contig_15063_pilon	+	1670	6	Intergenic	novelGene_14136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	177	1415	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34631	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512299	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512300	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512301	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512303	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512304	SIRV6	+	409	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	19	1161	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512306	contig_5999_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_45615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGTGACCTGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109147	109936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_109100_109900
512307	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512309	SIRV6	+	984	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	36	7	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	198	530	1673	2560	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1089	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1466_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512310	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512311	contig_15063_pilon	+	1437	6	Intergenic	novelGene_11573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3599.786771463	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	230	859	34808	36116	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHGRLGVRGNVHMHRHPR	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_35951_36057_36158_36266
512313	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	554	584	338	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	92	583	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1641	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512315	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512317	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512318	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512319	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512320	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	20	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512321	contig_17976_pilon	+	2131	4	Intergenic	novelGene_32473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	249	1265	41843	47385	TRUE	30	AATGAGTGGCTGCCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41594	48911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_48025_48684
512323	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28166	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512324	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26558	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512325	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512329	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512330	contig_15063_pilon	+	1559	7	Intergenic	novelGene_11021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	233	1084	34808	36504	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTILQQLCHQHPDARASGPGLLLHLQHPERV	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36416_36600_38975_39092_39506
512331	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512332	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	46	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512333	contig_15063_pilon	+	2463	5	Intergenic	novelGene_13074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2539.00909559222	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1660	2211	36064	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34295	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512334	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512335	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_8733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512336	contig_10958_pilon	-	1704	2	Intergenic	novelGene_5461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1915	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901585	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
512337	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512338	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512339	SIRV6	+	802	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	512	-7	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512340	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512343	SIRV6	+	741	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	2	558	2	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512344	SIRV6	+	607	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	341	8195	168	596	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
512345	contig_15063_pilon	+	1501	5	Intergenic	novelGene_9217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	242	997	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTRWPSMHQPST	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36103_36266
512346	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	596	1417	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35035_35380_35839_36158_36266
512347	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512348	SIRV6	+	823	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1464_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512350	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512353	SIRV6	+	1502	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512354	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_10630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512356	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512357	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10319	80	1082	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11319	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
512358	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512359	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512363	contig_19564_pilon	-	2260	5	Intergenic	novelGene_29604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	917.826066038658	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	70	1404	15529	12201	FALSE	60	AAAAAAAGAAACCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSSLRGTFHRRSLRSAETKLYIVMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15655	11344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472_15531_15587
512364	contig_5485_pilon	-	2642	2	Intergenic	novelGene_37691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	665	junction_1	0	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1335	1832	85988	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88090	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_87027_87794
512367	SIRV6	+	637	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	35	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2011_2470_2621_2740
512368	SIRV6	+	415	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1638	-46	246	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512369	SIRV6	+	631	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2023_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
512370	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26366	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512372	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512373	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_11980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27168_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512374	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	238	750	34808	35888	TRUE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
512375	contig_15063_pilon	-	1544	5	Intergenic	novelGene_11343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512377	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512378	contig_15063_pilon	+	1665	7	Intergenic	novelGene_10420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	237	1286	34808	38976	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFT	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36538_38975_39092_39506
512380	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512381	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512382	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512383	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512384	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512386	SIRV6	+	636	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	540	513	367	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	63	554	1733	10736	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1670	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512387	contig_8317_pilon	+	384	2	Intergenic	novelGene_19346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAGTTTTAAGTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16203	16686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
512388	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512389	SIRV6	+	534	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2026_2470
512390	SIRV6	+	518	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	24	8717	17	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512392	SIRV6	+	1013	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	515	0	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	GGAAATTGGCGATGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512393	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512394	SIRV6	+	409	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
512395	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	243	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35371_35836_36158_36266
512396	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_13212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512397	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512398	contig_13707_pilon	-	2620	13	Intergenic	novelGene_43543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_12	785.877517315658	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	151	1581	278215	270728	FALSE	30	TACAAAAGTGGTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEAIKSPLRGNIRVRHSPCRPPRVQKPVPMGEMQGALARARLESLLRPRHKKRAEAQKRSESFLLSGLAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	278365	269688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_276315_276493_278181
512399	SIRV6	+	658	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	284	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTACGTTTGGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2737
512400	SIRV6	+	323	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	210	2	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAACGTTTCTAGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512401	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_11929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512402	SIRV2	-	326	3	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1836	2313	661	330	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTCCTAGCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4071	3313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966
512403	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512404	SIRV6	+	851	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	379	589	163	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	161	652	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1466	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
512405	SIRV6	+	611	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	365	8167	192	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
512406	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	112	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512407	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_14022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512408	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	38	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512411	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512412	contig_233_pilon	-	2190	12	Intergenic	novelGene_14574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1529.18667952165	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	196	1761	105485	78568	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNEPQVCRELGST	126998	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78604_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105606_126923
512413	SIRV6	+	992	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	532	4	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512414	SIRV6	+	821	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-33	513	10	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512415	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512416	contig_4364_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
512417	contig_1406_pilon	+	2504	3	Intergenic	novelGene_25569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	397.5	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATCTATTTTAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173729	2187463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2185143
512418	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512422	contig_6980_pilon	+	2185	9	Intergenic	novelGene_36024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	701.395561986958	19	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	94	441	356720	368053	TRUE	25	TGTTACTGTGTCATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIPSF	346089	373886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_364967_368042_368383_370468_370641_371430_371523_372735
512423	contig_7839_pilon	+	2390	12	Intergenic	novelGene_45721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	593	junction_1	512.666469637823	1137	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	99	2267	952473	956984	FALSE	5	CGGTCCTCTCCTGTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950900	957107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
512424	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_10624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512425	SIRV6	+	804	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	343	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	87	578	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1646	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11036_11109_11205
512426	contig_6898_pilon	+	2349	5	Intergenic	novelGene_35680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	712.952312570764	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	138	575	59668	125932	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYDHFPRSEAFPA	59530	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114463_125897
512428	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512429	contig_5643_pilon	+	2270	16	Intergenic	novelGene_38996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	656.984708091952	4021	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	778	2058	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631071	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
512430	SIRV2	-	988	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3000	-1	1821	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2911	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
512431	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_9521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512433	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512436	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512437	contig_15063_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_12635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512438	contig_6735_pilon	-	2165	15	Intergenic	novelGene_15679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	968.928084355625	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	189	1685	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568267	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_566476_566596_568198
512439	contig_5023_pilon	+	2226	10	Intergenic	novelGene_7215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2349.1227414337	6	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	88	1011	607279	646990	TRUE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAIILFSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609650_630189_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647643_647736
512440	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512441	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512442	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	94	18	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512444	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	19	1213	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512445	SIRV6	+	441	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-339	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	56	391	2002	10736	FALSE	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1946	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
512446	contig_854_pilon	-	3061	5	Intergenic	novelGene_36151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	155.108631287882	392	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	130	729	483594	474385	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	483723	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477
512447	contig_1230_pilon	+	2178	9	Intergenic	novelGene_28840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1236.63896813096	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	182	1942	405421	408754	FALSE	25	CACCATATAGTTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLNARQPFWLCFFCSFSGIYSEHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405306_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
512448	SIRV6	+	798	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	178	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	86	421	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1481	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2029_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512449	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_8730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	20	CATTGCCATGTGACCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512451	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512454	SIRV6	+	957	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	34	537	-3	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	224	715	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512455	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512456	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512457	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512459	contig_15063_pilon	+	1671	7	Intergenic	novelGene_10157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CTGCTTTGTGGTGTAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512461	contig_14970_pilon	+	2129	10	Intergenic	novelGene_44960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1140	junction_5	5247.33635662001	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	133	1428	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
512462	SIRV6	+	621	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	380	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512464	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512466	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512468	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_9942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	780	1103	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36779	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512469	contig_13707_pilon	-	2638	13	Intergenic	novelGene_43558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	787.585493595598	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	134	1603	278215	270728	FALSE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEAIKSPLRGNLALPESRRLLQGNIRVRHSPCRPPRVQKPVPMGEMQGALARARLESLLRPRHKKRAEAQKRSESFLLSGLAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	278348	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_276315_276532_278181
512470	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512472	SIRV5	+	302	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCCCACATTTAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298
512473	SIRV6	+	457	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	-49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
512475	SIRV6	-	460	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGCTCTTTCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11806	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11800
512477	contig_17936_pilon	+	2929	13	Intergenic	novelGene_29925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	891.498956190577	115	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	54	1337	50646	121021	TRUE	15	ACCGGTGTGTAGTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50592	129551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_127250_127708_128260_128323_128519
512478	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512480	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_8921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512481	contig_15063_pilon	+	1672	6	Intergenic	novelGene_14115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	187	1422	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34621	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512482	SIRV6	+	855	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	777	2	92	5prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCACATATTTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	11060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
512483	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	21	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
512484	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512487	contig_4364_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
512488	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512489	contig_19564_pilon	-	2314	5	Intergenic	novelGene_29581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	2891	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	174	1508	15529	12201	TRUE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15702	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11785_11845_13259_13554_13666_13945_14055_15472
512490	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512491	contig_15063_pilon	+	2228	5	Intergenic	novelGene_13019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	919	2091	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29598	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512492	contig_15063_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_9901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	239	1381	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
512493	SIRV6	+	807	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	226	164	137	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512498	contig_4364_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533264	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
512499	contig_17976_pilon	-	2512	4	Intergenic	novelGene_32483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	625	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCCTTCCAATGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48913	41614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_48423_48683
512500	contig_12622_pilon	-	2361	13	Intergenic	novelGene_5945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	168	1523	1590194	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590958	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
512501	contig_5023_pilon	-	2482	13	Intergenic	novelGene_7293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	904	1521	647301	622542	TRUE	20	AGGAACCCCCTTCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYLCIVELLLSIQVLSLSACCSIHSALWMSSFSLSPDMSMTTAGIPSSSPLGATCSSRW	648299	580864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580903_607252_607341_607933_608099_609592_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625700_643498_643538_646855_647647_647741
512502	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512503	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	231	1037	34808	36299	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	27138	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266
512504	SIRV6	+	764	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	176	110	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	22	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	143	432	148	579	1733	3120	TRUE	35	TAGTAGATTGCGTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCYL	1479	11078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3110_3165_10724_10819_11031
512505	contig_11285_pilon	+	2410	11	Intergenic	novelGene_5623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	526.43312965656	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	927	2087	767746	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766048	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767130_767252_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
512509	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27145	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512510	contig_15063_pilon	+	1586	6	Intergenic	novelGene_12584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_5	3673.08575451214	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	6	1331	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
512511	SIRV6	+	807	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	226	164	137	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512512	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	13	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512514	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512515	contig_15021_pilon	-	3147	11	Intergenic	novelGene_26945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	465.848687880518	2481	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	37	873	269638	248134	TRUE	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFQQVEETSLEMSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRT	269674	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_248098_248141_251262_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629
512520	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_12868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	780	1103	35891	35108	TRUE	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36779	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34606_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512521	contig_5033_pilon	-	2264	14	Intergenic	novelGene_29025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3800.6566312155	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	29	1495	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531537_532161_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
512522	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512524	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_8561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512526	contig_15063_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_10617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512527	contig_8317_pilon	+	380	3	Intergenic	novelGene_19250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	7575.5	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	68	379	14294	14898	FALSE	35	GAACATCACAGGTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMIT	13258	14899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730
512528	SIRV6	+	848	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	17	223	10	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	198	689	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1147	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512530	contig_1532_pilon	-	2097	8	Intergenic	novelGene_37403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_7	1182.69652118559	3880	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	155	1348	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	35485	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
512531	SIRV6	+	407	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-20	98	-7	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512532	contig_1532_pilon	-	2012	8	Intergenic	novelGene_37396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	58	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	70	1263	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
512533	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512534	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512535	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512536	SIRV6	+	1025	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	500	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512537	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512538	contig_5954_pilon	-	2398	14	Intergenic	novelGene_28631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	428.899375793685	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	673	2037	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRCPALWTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_956105_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512539	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_12577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	23	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512540	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512541	contig_15063_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_8811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	244	1275	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
512542	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512543	contig_5988_pilon	+	2365	11	Intergenic	novelGene_16072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1635.29770989872	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	106	819	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209838	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225865_1226478
512544	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512545	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512546	contig_15063_pilon	+	1473	4	Intergenic	novelGene_14089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	190	1329	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35872_36158_36266
512547	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512548	SIRV6	+	258	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	81	1250	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11700
512549	contig_9471_pilon	+	3173	9	Intergenic	novelGene_21800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	524.784583781765	1404	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2431	2961	414726	417296	FALSE	30	GTGCTTATCAAATTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	410804	417508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414595_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
512550	contig_177_pilon	+	2344	4	Intergenic	novelGene_41800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	411.992178998043	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	123	1199	417672	418748	TRUE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TADTAATAAPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	411723	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_411751_415635_415707_417647_419359_419612
512551	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512552	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512554	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512555	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512556	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512557	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_13001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	218	1456	34808	39515	FALSE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28183	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512558	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512559	contig_3469_pilon	+	2868	20	Intergenic	novelGene_34176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_10	142.402048757399	929	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1232	2506	461740	479914	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	427976	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464_443604_445564_445685_447278_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461491_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
512560	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28177	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512562	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512563	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512564	SIRV6	+	785	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	541	18	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAAAAGTAATAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512565	contig_15063_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_11230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	GTGGTGACCAGCCGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512567	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_12359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512568	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512570	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512571	SIRV6	+	693	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	343	547	170	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512573	SIRV6	+	806	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	571	539	355	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	75	566	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1658	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512575	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_9850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512576	contig_5727_pilon	+	3377	20	Intergenic	novelGene_7940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	851.820377590646	964	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	937	2616	173359	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168146	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176237_176978_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
512578	contig_233_pilon	-	2748	16	Intergenic	novelGene_14625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	1492.37499606797	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	227	1900	108727	91657	TRUE	15	TCCTAGAAGCTGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	126993	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104306_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108803_109919_109976_126898
512579	SIRV6	+	812	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	198	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	66	392	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1501	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1730_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512582	SIRV6	+	378	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-11	43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1636_1736_1845
512585	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512586	SIRV6	+	889	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	543	162	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512587	contig_12923_pilon	-	2876	14	Intergenic	novelGene_30079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	345.659321968763	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	97	1617	93727	51150	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIPVSTQQSRSA	101264	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51184_57103_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
512589	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	251	1423	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512591	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512592	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512593	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512594	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512595	SIRV6	+	499	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-14	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCGTAGTCGTAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_1845_2027_2470
512596	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512597	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512599	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512600	SIRV6	+	612	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	16	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
512603	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	221	1396	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512604	SIRV6	+	895	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	537	162	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512605	SIRV6	+	744	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	758	524	-440	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	157	489	2002	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1845	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512607	contig_15063_pilon	+	1584	4	Intergenic	novelGene_12960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3636.50127946568	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	692	1513	35271	36661	FALSE	30	CAAACTAACCATGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28172	36732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_35380_35839_36158_36266
512608	contig_16496_pilon	+	1526	2	Intergenic	novelGene_5134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTCCCCTATTAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
512611	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512612	SIRV6	+	374	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	10	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
512613	contig_16098_pilon	+	1334	8	Intergenic	novelGene_46100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	218	829	456282	457620	TRUE	20	CTGGGTAGAGGAGGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDEEGLAGCGPSLTAWGVLSLAGEAVGLRGSLDILLLGSLQVLLFPTPGLQGRGLQGSAIGEGQGPWLQQGALVDGVEVDGCLLLTLASREEGDSCNSGGHCAAQCCDSCHGNLLVRKLLRAGVAWSYHIGLQQGAFQVDVVVTQSLVDGSQHLLSYNLTVLQVMVPIREDLRLHNGHDTILLADAGITGQHVGIFHDGEG	456064	458837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456375_456462_456663_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458628_458707
512614	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512617	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512619	contig_15063_pilon	+	1660	8	Intergenic	novelGene_9650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3646.68247891708	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPCFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35083_35142_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512620	SIRV6	-	337	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGTTTTTCCACATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
512621	contig_8317_pilon	-	934	3	Intergenic	novelGene_19331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAACGGCGATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17248	16170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379_16838_16882
512622	SIRV6	+	741	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	13	547	6	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512623	contig_15063_pilon	-	1555	5	Intergenic	novelGene_9379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512624	contig_8772_pilon	+	1926	8	Intergenic	novelGene_21097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3846.65921314078	77	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	879	1619	19142	23105	FALSE	30	TTGAAAAAACTCTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVGEAAPILGKADHLFFLQEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15219	23412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
512625	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_9599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512626	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	17	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512627	contig_10235_pilon	+	2356	6	Intergenic	novelGene_46441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.272098859923	39	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTTGGATGCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210476	213702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210626_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
512628	contig_15063_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_8720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	246	1340	34808	38987	TRUE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27123	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
512629	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10379	19	1142	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11379	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512630	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512631	contig_5954_pilon	+	2614	14	Intergenic	novelGene_28632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1786	2184	955918	956801	TRUE	30	AGAAGGCAGCCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGTCCGAGSCPTWSLTAAGAAAGGGLAVAGADSACCSRPRFAHCLRSGLASPGTVQVPLPQPGRPWTSHTPLPLAPSPSFSSPSSQEPGAETAPQGAGYSGGGRWQPRPGRGAGRSWHAGAGRGDWAAAG	944721	960590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947065_947204_947434_947714_947798_947935_948094_948197_955828_955927_956116_956290_956378_956498_956703_956942_959766_959941_960474
512633	contig_5954_pilon	-	2552	14	Intergenic	novelGene_28633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	431.13757603282	3207	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1481	2191	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956413_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512635	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512636	SIRV6	+	519	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	8562	167	229	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATCGTTAGGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
512637	contig_12425_pilon	-	2162	11	Intergenic	novelGene_46677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	782.555071544489	3527	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	193	1215	211174	204225	FALSE	20	TGAAATTTGCTTTCTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226607	203277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_223590_223668_226517
512638	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512640	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_8764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512643	SIRV6	+	475	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10302	49	1065	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11302	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
512645	contig_6735_pilon	-	1851	13	Intergenic	novelGene_15739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	686.84089112561	7	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	76	777	564868	545864	TRUE	35	TATGCTGAGCTAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAGTS	568273	541985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543881_545848_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
512646	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512647	SIRV6	+	640	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	523	526	350	-10	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAGAAAGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	10805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512649	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512650	SIRV6	+	369	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGCTAGTCCAATCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1845
512651	contig_5643_pilon	+	2681	14	Intergenic	novelGene_39039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	635.617400084312	156	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	646	1815	634983	640732	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSK	631203	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636
512652	SIRV6	+	491	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-24	8792	-18	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512653	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512654	contig_8317_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_19378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTGTGTGGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
512655	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512656	SIRV6	+	934	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	57	537	7	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512657	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26755	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512659	SIRV6	+	323	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	116	162	54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
512662	contig_8317_pilon	+	442	2	Intergenic	novelGene_19358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
512663	SIRV6	+	587	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-38	8710	5	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512664	SIRV6	+	991	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	537	0	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512665	contig_8317_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_19399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
512666	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512667	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512668	SIRV6	+	621	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	8	240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATGGGACTAGTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740
512669	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512670	contig_4315_pilon	+	4385	33	Intergenic	novelGene_46736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_25	131.902629658917	859	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1224	3675	101	3775	163968	225537	FALSE	5	GCTTCTTGTCTTGCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFHKQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVWNWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPSEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESDVRGITGVDLFGTTDAVVKHVLEGHDRGVNWAAFHPTMPLIVSGADDRQVKIWRMNESKAWEVDTCRGHYNNVSCAVFHPRQELILSNSEDKSIRVWDMSKRTGVQTFRRDHDRFWVLAAHPNLNLFAAGHDGGMIVFKLERERPAYAVHGNMLHYVKDRFLRQLDFNSSKDVAVMQLRSGSKFPVFNMSYNPAENAVLLCTRASNLENSTYDLYTIPKDADSQNPDAPEGKRSSGLTAVWVARNRFAVLDRMHSLLIKNLKNEITKKVQVPNCDEIFYAGTGNLLLRDADSIILFDVQQKRTLASVKISKVKYVIWSADMSHVALLAKHAIVICNRKLEALCNIHENIRVKSGAWDESGVFIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFKLALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEIALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMMKIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDPEKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGSIASKGKGGALAADIDIDTVGTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLDLPPELDVPTGAGGGAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	163867	226147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_164008_168532_168647_168852_168927_172542_172624_174181_174259_175154_175265_180103_180214_181973_182074_182686_182823_183557_183641_185147_185299_186247_186315_188089_188166_190414_190498_191180_191321_191897_191984_192100_192240_207189_207353_207427_207575_214651_214842_214960_215057_216250_216340_216527_216652_218708_218799_218980_219091_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
512672	SIRV6	+	876	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	225	-7	138	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	25	AAGTCTTGTAATTATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512673	contig_6980_pilon	+	2080	9	Intergenic	novelGene_36012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	701.168667297677	575	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	119	979	356720	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346064	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370504_370641_371430_371523_372735
512674	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512675	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512676	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512677	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAACCTGTGTCTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16394	16794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
512678	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_12041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	220	1455	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27149	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512679	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	222	1397	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512681	SIRV6	+	757	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAAAAGTAATAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1484_1535_1638_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512682	SIRV6	+	634	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	165	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2743_2829_3106
512683	SIRV6	+	494	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8806	2	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512684	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_9846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512685	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	242	745	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNHQYLRHPPILC	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35848_36158_36266
512686	SIRV6	+	272	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	98	337	72	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
512687	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_8844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	40	ACTTGTGGCCATGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512688	contig_17936_pilon	+	2228	11	Intergenic	novelGene_29891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	192	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	88	1371	50646	121021	TRUE	25	TACCAGCCTAGTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50558	126582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
512689	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512690	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512691	contig_10246_pilon	-	3006	10	Intergenic	novelGene_46886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	407	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCACGGAGACTCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186385	140640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_140797_144692_144805_148216_148335_168073_168273_169670_169781_171153_171291_175052_175201_176293_176365_183544_183617_184502
512692	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512693	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512694	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512696	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_10134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512697	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512698	SIRV6	+	706	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	373	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	90	273	57	329	1733	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1676	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512699	contig_1406_pilon	+	2657	4	Intergenic	novelGene_25588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	2306	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	48	443	2173822	2185260	FALSE	10	TAGTTTGTGGGTGTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173774	2187474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
512700	contig_5018_pilon	-	2477	5	Intergenic	novelGene_47071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	892	junction_4	520.585487696305	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402761	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400966_1401052_1401446_1401873
512701	contig_4364_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	61	420	1530895	1531333	FALSE	10	AGGTGACTGTCGGGCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530464	1531334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
512704	SIRV6	+	330	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-16	171	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGGTGTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512705	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_8768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	246	1421	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512706	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512707	contig_4364_pilon	+	485	4	Intergenic	novelGene_416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	78	485	1530895	1531663	FALSE	10	CAGGCTGTGCTGTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAI	1530447	1531663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
512711	contig_15063_pilon	+	1692	7	Intergenic	novelGene_12038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	220	1455	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27149	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512715	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512717	SIRV6	+	682	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	767	577	-431	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	148	480	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1854	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512718	SIRV6	+	626	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	737	223	-418	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	135	467	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1867	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512722	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512724	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512726	contig_15021_pilon	+	2989	10	Intergenic	novelGene_26943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2310	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2350	2817	252040	263343	TRUE	45	TGTTGAAAAACAGATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNFIQNPFLQALPFLQREGVSLGDDRHDVHLIVNRFHECNIQGLQSVPERRDEVEAAVNPVVDDVPPVQATLIVQVPFKLLVDVGDDGLKAVSAVDGITVAGRVHHRQSQLHPTLFNLHGGGLDLDSSLNFFCSSGYDSFWVEVSQEQAVYER	239745	269660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241779_249291_249384_251250_251396_251960_252064_260956_261075_261238_261377_262376_262498_263276_263362_267740_267864_269629
512728	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	88	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512730	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	1	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512731	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512732	SIRV6	+	935	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	581	12	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512733	SIRV6	+	574	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1632_1736_1845_2027_2470
512736	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_10893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	805	1128	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36804	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512737	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_8899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512738	contig_16121_pilon	+	4616	6	Intergenic	novelGene_6862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	550.417078223414	2	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	106	1053	57746	60704	TRUE	35	TAAAAATACTTTCTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKAAWLNSTGLCLPSRPLHTCDSHPLLCTMEVEKHNRYSDCQ	33605	65987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59234_59280_59396_60693_60846_62565
512741	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512742	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512743	contig_8317_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_19385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCACAGAATTTTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
512744	SIRV6	+	509	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-14	8764	-8	27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCACTTGTCGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512746	contig_4364_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24336.6158836159	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	206	526	1531103	1531705	FALSE	20	ATTGTCATGGACTCTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTG	1530452	1531705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531022_1531096_1531337_1531618
512747	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512748	contig_4364_pilon	+	498	4	Intergenic	novelGene_657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	67	498	1530895	1531687	FALSE	15	TCTGGCCGTACCACCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYA	1530458	1531687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
512750	contig_5189_pilon	-	2520	12	Intergenic	novelGene_34844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_11	903.28620433512	2866	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	280	1383	244235	199237	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	252456	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694_247751_252286
512751	SIRV6	+	508	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
512755	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26351	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512756	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512757	SIRV6	+	820	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	598	498	382	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	48	539	1733	10736	TRUE	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1685	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512758	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512759	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512763	contig_8317_pilon	+	553	3	Intergenic	novelGene_19334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	20461.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATCTAGAGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	25464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381_16468_25109
512765	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512766	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_9652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512767	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512768	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512769	contig_15063_pilon	+	1674	7	Intergenic	novelGene_12666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	4	1476	28164	39515	FALSE	10	CTGCTTTGTGGTGTAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512770	contig_15063_pilon	+	1602	5	Intergenic	novelGene_9843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	15	ACCCTGCCTTTGCCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512771	contig_19564_pilon	-	2205	5	Intergenic	novelGene_29601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	165	1553	15529	11993	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMDLLLQLPLSSPSEFAFSASVSPPTPPLEGVLEQCLVHSRRSINICCLLNVSSLFPL	15693	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12162_12315_13259_13554_13666_13945_14055_15472
512774	SIRV6	+	771	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	571	2	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTCAACAAGAGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512776	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_10642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512778	contig_12357_pilon	+	2312	13	Intergenic	novelGene_6094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	899.520273380329	26	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	117	1433	26079	51479	TRUE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAAPRKKDVEFYVGKITAVKTL	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_51416_51524_52759_52844_53169
512780	contig_10341_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_47235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1939	2244	123717	123412	NA	45	CACAAAGACAATAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSNMGSTEPKLHIGSYINAHILILKHWILLHTTCLTRKMAHLVLRLQPQEIFHCLHTVGTFIYFTKLCSNTLLCNINMSFFFNNSCILKYYRLMEGKSRG	125655	122954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_123000_125700
512783	SIRV6	+	750	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	3	548	3	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512784	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512785	contig_8538_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_4986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
512786	contig_8772_pilon	-	1857	9	Intergenic	novelGene_21094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1421	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	959	1288	19240	15784	FALSE	30	CAGAGGACCGGACCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23421	15214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
512787	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512788	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512789	contig_2027_pilon	+	3578	26	Intergenic	novelGene_39892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	355.363664996859	955	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1058	3177	209	3385	122795	136487	FALSE	15	CAGATGTGGCATGCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117778	136680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
512791	SIRV6	+	487	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1445	538	16	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512792	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512793	contig_1301_pilon	-	2068	15	Intergenic	novelGene_47308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	514.427401117406	23	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	83	1972	322831	268749	FALSE	45	GAGGTAAGAAGACCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSSVTDQHRLQVQPLHLLHFLP	322913	268652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268810_269076_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
512794	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512795	SIRV6	+	819	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	341	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	27	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	89	577	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1644	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
512796	SIRV6	+	824	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	224	33	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512798	contig_6980_pilon	+	2098	9	Intergenic	novelGene_36009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	911.439520758234	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	333	1004	361220	372790	FALSE	20	ACTGTTACTGTGTCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSLYLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346064	373884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_353050_353141_356704_356771_361146_361238_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
512799	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	34	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512801	contig_9955_pilon	-	2532	4	Intergenic	novelGene_21280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	824.856081723082	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	229	921	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45154_46203_47737_48794_49380_49692
512802	contig_4469_pilon	+	3194	5	Intergenic	novelGene_21944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_1	241.80260544502	891	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	284	1522	751887	755841	FALSE	15	GAGTCTCCTGCATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIPSAQPPPACLPKAPGLEPGDLPGMDFAHMYQVYKSRRGIKRSDDSKETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELTLKHVKALTNLIDQQQQKILALQSGLQAGELSGRNVDAGQEMFCSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTFPHSSGEQSGSDTDTDSGYGGELEKGDLRSEQPYFKSDHGRRFATGERIGTIKQESEEPPTKKGRMQLSDDESHFSSSDLIGSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	751603	757513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752204_752461_752570_753495_753620_754984
512803	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512804	SIRV6	+	891	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	539	164	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	138	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512807	contig_11512_pilon	-	2838	9	Intergenic	novelGene_43286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	413.661697525889	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	129	959	396169	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409402	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367188_367262_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
512808	SIRV6	+	718	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	769	539	-429	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	146	478	2002	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1856	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512809	SIRV6	+	544	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	229	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATCGTTAGGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856_2017_2470_2621_2740
512810	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512811	contig_15063_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_8549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	249	1424	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26347	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512812	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512814	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10379	57	1142	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11379	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512815	SIRV6	+	651	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2477_2621_2740
512816	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512817	SIRV6	+	944	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-1	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	105	318	156	473	1673	2560	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAILCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1129	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2011_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11107_11205
512818	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512819	contig_8538_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_4676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAGCAGCTGGAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842673	842965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843000
512820	contig_14661_pilon	-	3297	15	Intergenic	novelGene_47436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_10	141.553336021358	633	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	77	1621	70794	46200	FALSE	30	GCATCCCTGAGAGATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAVKLRNEYGPVLHMPTLKENFKEKGLQNSSDSYGHKQYPDNQGQEVEYLVTGTHPYPPGPGVALTADTKIQRMPSESAAQSLAVALPSQARVDANRTAPGGSEYRLPGASDRSQPPVMTSVIMEAGNAKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF	70870	44523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_46260_46801_46996_47430_47571_48278_48388_49117_49221_49761_49864_49950_50101_63314_63408_64387_64490_66234_66323_66529_66621_67393_67448_68173_68317_69358_69466_70785
512821	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512822	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512823	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512824	SIRV6	+	694	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-15	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106
512825	contig_15063_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_8677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27115	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512826	SIRV6	+	720	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	760	546	-438	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512827	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512828	contig_15063_pilon	-	1736	7	Intergenic	novelGene_8876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	982	1305	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36158_36264_36597_38972_39090_39504
512829	SIRV6	-	342	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCGCGATGCCAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11735	11393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
512830	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512831	contig_15063_pilon	-	1517	5	Intergenic	novelGene_11664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512832	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	1	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512833	contig_15063_pilon	-	1512	4	Intergenic	novelGene_13327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
512834	contig_13216_pilon	+	3296	2	Intergenic	novelGene_47503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1286	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2320	2760	260572	261012	FALSE	15	CTTAGTTTTGTGTTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	256394	261548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_258573_260430
512835	contig_15063_pilon	+	1499	5	Intergenic	novelGene_12692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512836	SIRV6	+	264	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	-14	7651	-14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2502	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106
512839	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512840	SIRV6	+	1470	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	56	2	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512841	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512842	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512843	contig_233_pilon	-	2558	15	Intergenic	novelGene_14519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1519.10855471899	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	766	2115	105485	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYDSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_93787_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105668_107314_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
512844	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_11248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512846	contig_5954_pilon	-	2307	13	Intergenic	novelGene_28618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	440.20382747339	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1236	1946	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960567	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948161_956238_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512848	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512850	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512851	SIRV6	+	477	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8727	164	64	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTATTGCCCGAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512852	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26548	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512853	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512854	SIRV6	+	369	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	53	1167	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512857	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26349	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512858	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512860	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512861	SIRV5	+	420	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7451	1	-58	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGAAAACAATCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
512862	SIRV5	+	357	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
512863	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	70	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512864	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	235	1473	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512865	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512866	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	97	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512867	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512869	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512871	contig_15063_pilon	+	1616	4	Intergenic	novelGene_13412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3099.18971489144	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	202	738	34808	35816	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRLLQQSPPLCSGETTPPQTFSPTGH	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35739_36158_36266
512872	contig_12923_pilon	-	5050	41	Intergenic	novelGene_30138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_32	169.957818296188	736	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1660	4983	30	5012	201671	162599	FALSE	15	CACCTGTCTGCCAGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPASGPSLLLLLLTSLPLALGDPMYSMITPNVLRLENEETVVLEAHDVQEDIRVTVSVHDFPGKKQVLFSEDTQLTAANSHLSALPIKIPANKDLRSDRKNKFVVVQAAFRDVVVENVVLVSLQSGYLFIQTDKTIYTPGTTVLYRIYSVNHELLPVGRTVVTTIETPDGVPIKRDSLSSHNQFGILSLSWNIPELVNMGQWKIRAHYEDSPQQLFSAEFEVKEYVLPSFEVQVEPTEKFYYIYDPRGLEVTITARFLYGKNVDGMAFVIFGVQDGDQRISLTQSLSRVVIEDGYGEVVLSREVLLNGVKPSSPEALVGKSLYVSVTVILQSGSDMVEAERSGIPIVTSPYQIHFTKTPKYFKPAMPLDLMVLVTNPDGSPARQIPVVTKDNGVQSLTHNDGVAKLSINMPNSPTPQTITVRTKKDGIPEGQQASETMQVQAYSPPGNSNNYLHLSVPRLELKPGETINVNFHLRADPGLQARISYYTYLVMNKGKLLKVGRQGREPGQDLVVLPLTITADFIPSFRLVAYYTLIGANDQREVVADSVWVDVKDSCMGTLVVKGGEKDQKTYLPGQQMTLRIEGNRGARVGLVAVDKGVYVLNKKNKLTQSKIWDVVEKADIGCTPGSGKDYAGVFMDAGLALRTNKGLQTAQRADPECPKPATRRRRSVQLMEKRTDKAGQYQDKELRKCCEGGMRENPMGFSCEHRTQYVTGKSCIKAFLDCCLYITQLRIEHSRDSSLDLARSDLDEDIIPEEDIISRSQFPESWLWSIEELKEPEKNGISTKIMNVFLKDSITTWEILAVSLSDKKGICVADPYEVTVMQNFFIDLRLPYSVVRNEQVEIRAVLYNYQKDNIKVRVELLYNPTFCSLATAKKRHQQTLTIAGESSVSVPFVIVPLKIGLQEVEVKAAVYNQFISDGVKKTLKVVPEGMRVNKTVAVRTLDPEHKGQGGVQKEEITAADLSDQVPDTESETRILLQGTPVTQMVEDAIHGDRLKHLIVTPSGCGEQNMIGMTPTVIAVHYLDHTEQWEKFGLDKRQEALELIKKGYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQEAKDICEGQVNSLGGSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	201700	162560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172032_172190_172858_172958_174586_174747_175257_175334_175991_176196_177926_178014_178118_178186_179551_179765_179853_179994_183784_183871_184607_184717_190552_190751_190946_191019_191304_191435_192385_192545_193442_193650_193750_193961_196212_196360_196443_196560_196840_196968_197385_197489_197641_197733_197817_197901_198012_198108_199515_199587_199678_199842_200279_200473_201597
512873	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_12082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	215	1450	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27154	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512874	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512875	contig_4180_pilon	+	2284	7	Intergenic	novelGene_8377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1551.55725536207	38	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	146	682	875200	888134	TRUE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874279	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888598_889683
512876	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512877	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	177	491	2021	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512878	contig_15063_pilon	-	1736	7	Intergenic	novelGene_9140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
512879	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512880	SIRV6	+	467	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8827	8	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCAACTAAGGTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512882	contig_6898_pilon	+	2557	5	Intergenic	novelGene_35769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3596.21144400604	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	93	431	124380	125542	TRUE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNEQSWPMPAMSPRRLPMI	123061	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_123145_124370_124464_124782_124988_125492_126652_126689
512884	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_8932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512885	SIRV6	+	721	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	825	480	-373	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	90	422	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1912	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512886	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27542	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512887	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512890	contig_5954_pilon	-	2582	14	Intergenic	novelGene_28674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_7	401.663375795729	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1515	2225	947127	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512891	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512892	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	58	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512893	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512894	contig_5954_pilon	-	2357	14	Intergenic	novelGene_28615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	278.966181064148	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	646	1779	956264	946206	TRUE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVR	960563	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_946168_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
512895	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_8705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512896	contig_7898_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_47515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283945	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282000_283900
512898	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512901	SIRV6	+	490	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470
512902	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512903	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512904	contig_15063_pilon	+	1445	4	Intergenic	novelGene_14063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	192	1367	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34616	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512905	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512906	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512907	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512908	contig_9995_pilon	-	2370	2	Intergenic	novelGene_47719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTTGGTTTTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374966	372435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_374153_374313
512909	SIRV6	+	685	7	NIC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724
512910	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512911	contig_8317_pilon	+	383	3	Intergenic	novelGene_19268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	28	381	14294	15122	FALSE	20	TGTTGGTGAATTTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAA	14266	15124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
512912	SIRV6	+	511	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-400	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAGTGCAAATAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885	10799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
512916	SIRV6	+	302	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	137	162	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
512917	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	19	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512918	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512919	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512920	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512921	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512922	contig_4531_pilon	+	3908	18	Intergenic	novelGene_47839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	43.703863463782	472	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	58	2397	44823	103174	FALSE	30	ACACCTTTTATAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPIFPDRWACSPLLWARSMSRFPAVAGRAPRRQEESERSRDLQEERPSAVSIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRKKLIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYEAGFSQHGMIGVTQPRKVAAISVAQRVAEEMKCALGSKVGYQVRFDDCSSKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTLTTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFDIPGRLYPVREKFCNLIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGDILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVDYDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYVVDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPDHVIPEIKRTSLTSVVLTLKCLAIHDVIRFPYLDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVTRLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRHRELAAKAGGFNDFATLAVIFEQCKSSGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRKLKQQSDFPRETFEGPKHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHEQETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDARRRWTNKENVKQLKDGISKEVLKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRNQDHSDTLKETG	44765	104685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_44935_45757_45926_46934_47081_48186_48307_48508_48737_48959_49027_50062_50195_63615_63716_65734_65822_65953_66137_70550_70632_71205_71364_85297_85413_85937_86047_92231_92327_101061_101132_101405_101635_103034
512923	SIRV6	+	870	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	480	350	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512924	contig_1230_pilon	+	2060	10	Intergenic	novelGene_28829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1209.82616851542	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	76	1824	405241	408754	FALSE	25	CACCATATAGTTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406585_406776_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
512925	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512926	SIRV6	+	363	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10444	19	1207	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11444	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512927	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512929	SIRV6	+	854	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	187	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	137	631	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1490	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512930	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_10384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	20	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512931	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_9070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	50	ATGAAATAAATGTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512932	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
512935	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_12185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27540	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512937	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512938	contig_15063_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_13147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512939	contig_8538_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_4674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	205	438	842828	843061	NA	25	TTTTCTTTCAATAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842623	843099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842600_843100
512940	SIRV6	+	776	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	186	129	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	1673	2560	TRUE	45	AGAAATTTAAAGTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1489	11097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512941	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512942	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512944	SIRV6	+	857	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	493	350	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512945	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512946	SIRV6	+	619	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	359	8165	186	626	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTATGAGTAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	3166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
512947	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512948	contig_10437_pilon	+	2943	5	Intergenic	novelGene_38151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	204.90180575095	2794	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159570	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_159766_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859
512950	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512951	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512952	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512953	scaffold_12124_pilon	+	1761	11	Intergenic	novelGene_22259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	11	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	195	572	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508045_1508393
512955	SIRV6	+	900	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	223	8	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512956	contig_1450_pilon	+	2762	20	Intergenic	novelGene_27352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	522.470484527323	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	191	2563	244426	355748	FALSE	80	AAAAGAAAAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQSVEQEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243365	355947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_350333_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
512957	contig_8317_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_20651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16471	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
512959	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512960	SIRV6	+	963	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	54	511	4	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	206	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	204	695	1733	10736	TRUE	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1141	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512961	contig_2932_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_47960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAAAAATGCCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328125	328704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_+_328100_328700
512962	contig_15063_pilon	+	1636	6	Intergenic	novelGene_14159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	150	1385	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34658	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512963	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26353	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512964	SIRV6	+	395	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-6	96	1	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
512965	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512967	SIRV6	+	928	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	577	-14	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
512968	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512969	SIRV6	+	383	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10386	57	1149	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11386	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512970	contig_9471_pilon	+	2811	12	Intergenic	novelGene_21775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_3	683.441570410587	53	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1816	2592	413930	417296	FALSE	35	TCAAATTTATATGAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406911	417515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
512973	SIRV6	+	705	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	30	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106
512974	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512975	contig_7695_pilon	+	3381	2	Intergenic	novelGene_41687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	406	954	1096312	1096860	TRUE	55	GATAACGTTAACAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAARKNNNESVYHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1095906	1104178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1097354_1102244
512976	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512978	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_8691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	248	721	34808	35888	TRUE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPILC	27121	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35874_36158_36266
512979	SIRV6	+	772	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	199	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	103	312	303	614	2021	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1502	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2480_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
512983	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	72	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	571	1392	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34892_35031_35380_35839_36158_36266
512984	contig_5954_pilon	-	2399	15	Intergenic	novelGene_28634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	420.319387793499	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	587	2038	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959855_960474
512985	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512986	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512987	contig_10958_pilon	+	1836	3	Intergenic	novelGene_5440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCATATCTAAAACTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888227	901697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888253_895283_895855_900457
512988	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	34	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
512989	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
512990	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512991	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512992	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512993	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10423	53	1186	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11423	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
512994	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26348	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
512996	SIRV6	+	474	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8820	8	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAAGGTTCGTCTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
512997	SIRV6	+	695	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	8167	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
512998	SIRV6	+	601	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	172	596	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106
513002	contig_13216_pilon	+	2730	6	Intergenic	novelGene_47462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	749.330634633337	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1126	2193	243939	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229591	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
513003	SIRV6	+	740	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	339	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	31	363	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1642	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513004	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513005	contig_4364_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTATGAACCAGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533210	1532726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532700_1533200
513006	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPGDPGDCLLSISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34644_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513009	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513010	contig_15063_pilon	+	1497	5	Intergenic	novelGene_11235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513011	contig_1244_pilon	-	2175	13	Intergenic	novelGene_37969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1028.0221706429	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	139	1392	947595	923211	FALSE	15	TGATGGGCTAAGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTALWSVLLTGQSPKLMISWPVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948519	922427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946570_946620_947578_947655_948440
513012	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513015	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	14	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513016	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513017	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	25	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	12	1484	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513019	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513020	contig_1725_pilon	-	2328	16	Intergenic	novelGene_24313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1591	1917	246650	244943	TRUE	50	TCCAACAAAAATATCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKQLLHQLQRPALQGFGKHCVVGIRKGLLGDFPCLRPGQFFNIHENPHQLRDGKCRVSVIQLDGNLIWKGIKHSLGAVGGAKLGGFETPDDILQGSSHHEVLLLQS	255775	235935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_236132_239623_239738_240047_240131_244924_245067_245295_245389_246540_246690_247022_247187_247639_247759_248347_248446_248573_248724_248851_248911_249014_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252777_255364
513021	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513023	SIRV6	+	377	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	19	1193	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
513024	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28176	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513025	SIRV6	+	833	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	597	164	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	TATATGCGGTAAACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513027	SIRV6	+	398	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	94	0	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513028	SIRV6	+	789	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	480	-441	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513029	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2996.89670974642	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	7	1473	28164	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35845_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513030	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513033	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513035	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_13140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513036	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513038	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513039	contig_15063_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_13148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513040	contig_12357_pilon	+	2041	11	Intergenic	novelGene_6132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_1	566.694106198397	4168	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	304	1347	30278	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	27418	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
513042	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513044	SIRV6	+	881	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	250	582	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513045	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_10223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	8	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	599	1483	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34936_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513046	SIRV6	+	521	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8769	12	22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGTATGGCACTTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513047	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513048	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513049	SIRV6	+	721	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	525	164	-9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513051	contig_15063_pilon	-	1507	5	Intergenic	novelGene_11853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	770	1093	35891	35108	TRUE	30	CAGTAGCTGAGGTAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36163_36284
513053	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513054	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513055	contig_15063_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_9881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36158_36264_36597_38972_39090_39504
513056	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513057	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513058	contig_8452_pilon	-	3405	17	Intergenic	novelGene_47968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_4	278.676531798069	1290	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	189	2180	145829	75102	FALSE	45	ATCAGATACTGTCATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	146017	73876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
513059	SIRV6	+	699	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	6	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513060	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513061	contig_15063_pilon	+	1482	5	Intergenic	novelGene_11978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513062	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513063	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513064	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513065	contig_4125_pilon	-	3331	13	Intergenic	novelGene_25118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	414.775709135539	61	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	95	775	822728	813780	TRUE	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	845447	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809748_809940_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_845399
513066	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_9347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513067	SIRV6	+	502	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1391	577	6	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	91	300	2569	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2478	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513068	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513069	contig_8317_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_19387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAGACCCATTAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
513070	SIRV6	+	1030	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	496	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	402	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513071	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513072	SIRV6	+	553	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8741	8	50	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGTTGAAGCTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513073	SIRV6	+	594	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	842	590	-356	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	73	405	2002	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1929	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513074	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513075	contig_15063_pilon	+	1683	7	Intergenic	novelGene_12616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	GTGTAGGCACTTGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513076	SIRV6	+	343	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGTTTATAGTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1622_1736_1845
513077	SIRV6	+	564	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	182	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
513078	contig_15063_pilon	+	1462	5	Intergenic	novelGene_12467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	10	CCGCTATGTGTGTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513079	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27169_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513080	contig_1230_pilon	+	2083	10	Intergenic	novelGene_28861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1358.80359503371	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	66	1205	405241	407326	TRUE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYDDCPDQAQYYHSYQADADLYNLF	404460	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405740_405784_405914_406126_406280_406375_406926_407255_407352_407588_407788_408003_408237_408568
513082	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27124	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513087	contig_11318_pilon	-	3182	18	Intergenic	novelGene_48128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1043.17771114236	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	254	1480	49795	15006	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDRERERKDTQTQMQSSKGWNKRLRGAGSHK	58278	8464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17480_21480_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071_52142_58143
513088	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513090	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_9847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513091	contig_9653_pilon	-	206	3	Intergenic	novelGene_48225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	408.5	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAGAGGACTAAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530380	529099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_529193_529429_529462_530299
513092	contig_15063_pilon	-	1418	6	Intergenic	novelGene_10263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.6	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	668	991	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36511_36625
513098	SIRV6	+	668	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8206	-7	585	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGGTCGGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	3125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513099	contig_15063_pilon	+	2274	5	Intergenic	novelGene_13017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	960	2132	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29557	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513100	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_9166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513101	SIRV6	+	379	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	144	12	26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAATCTGTATCGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	1976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513102	contig_10324_pilon	+	3638	21	Intergenic	novelGene_7707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1122.06476083157	1	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1202	2251	73345	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51789	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70066_72928_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
513103	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	221	1459	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28180	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513105	contig_8254_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_48376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	224	709	57523	57038	NA	75	AACCAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCTKTADRKPKGKNMLSISQDDRAEEKIQASSCSTEGLYGKILNDPGTTQRRWKEYTESLYQKELVNIQPFQEVTYDQEPMVLKEEVQAALKALVENKAAGIDGISIETFQQMDTALEVLIHLCQEIWKIATWPMYWKRSIFMPIPKKGDPNEHRNYRTI	57746	55616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_55600_57700
513106	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_9738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	239	1081	34808	36333	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27130	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
513107	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_8647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26553	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513109	contig_15063_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_12321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	12	1424	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513110	SIRV6	+	738	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	514	224	341	139	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513111	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513112	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513113	contig_9345_pilon	-	1946	6	Intergenic	novelGene_24621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	658	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001279	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949623_952369_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
513115	SIRV6	+	462	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	8826	14	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCAACTAAGGTTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513116	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513117	SIRV6	+	909	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	35	584	-2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513118	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513121	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513123	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513128	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513129	SIRV6	-	440	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTCACAAATTTATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
513131	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513132	contig_16622_pilon	-	2532	9	Intergenic	novelGene_48420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_4	986.772128900589	1617	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	727	1212	115540	112952	TRUE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121966	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
513134	contig_4364_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACCAGATCACACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533264	1532834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
513135	contig_15063_pilon	+	2013	4	Intergenic	novelGene_9362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2701.27739330035	10	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1385	1873	36064	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266
513136	contig_5780_pilon	+	4141	4	Intergenic	novelGene_29791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_3	112.902120834327	1866	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2285	2674	111869	112258	FALSE	15	GGAGTTTTGCATGGGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	104878	113725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_104955_107366_107549_109432_109581_109990
513137	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513138	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513140	contig_15063_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_8504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	253	1491	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26343	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513142	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_9717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513143	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513144	contig_5791_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_35830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTTATCACTGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019586	1019228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1019200_1019600
513145	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513147	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513148	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513149	contig_15063_pilon	-	1428	5	Intergenic	novelGene_10603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	685	1008	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36684	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513150	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513151	contig_1532_pilon	+	1975	8	Intergenic	novelGene_37429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTGTGGCTGAAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12389	34919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13518_15732_15889_17971_18110_27255_27379_28825_28963_29437_29507_32051_32225_34868
513152	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513153	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_12225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27557	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513155	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513157	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	62	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513158	contig_13707_pilon	-	2594	13	Intergenic	novelGene_43540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	800.200478352491	48	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	460	1551	274534	270728	FALSE	20	AAAGTGGTGTGTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	278363	269684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275246_276315_276493_278181
513159	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513160	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513161	contig_8357_pilon	-	2415	10	Intergenic	novelGene_39737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_1	123.745956412301	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	905	1762	787951	762891	FALSE	10	CTTTATCTTGATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	788993	762237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105
513162	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_10910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
513164	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_8897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	50	TGTTTATAAAAATTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513165	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513166	SIRV5	+	393	2	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-217	3302	-103	-2425	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCCGAACATGAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8098	8564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454
513167	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513168	SIRV6	+	475	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470
513169	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_8624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26367	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513172	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513173	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_11839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513174	contig_5020_pilon	+	1392	7	Intergenic	novelGene_27859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	992.341465088169	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	359	1093	122915	125772	FALSE	25	AGCAAGCTCAACCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSERTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118466	126071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124444_124547_124909_125091_125657
513175	SIRV6	+	630	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	518	541	345	2	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAAAAGTAATAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	10790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513176	contig_11171_pilon	+	3133	9	Intergenic	novelGene_48567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	144.228063756677	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	373	1158	86219	105888	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70527	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86102_86168_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710
513177	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513178	contig_15063_pilon	+	1462	4	Intergenic	novelGene_13135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513179	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513182	SIRV6	+	563	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-16	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	26	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1628_1736_1847_2027_2470
513183	SIRV6	+	410	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10335	81	1098	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11335	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
513186	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513187	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513188	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	176	1081	-40	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGACTTGCGTCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11600
513189	SIRV6	+	430	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
513191	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28169	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513192	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513193	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_12051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513194	SIRV6	+	590	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
513195	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513196	SIRV6	+	902	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	730	2	139	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
513197	SIRV6	+	574	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	112	339	158	496	2002	10740	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVFENKLPGKRRSAYN	1844	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3140_10697
513198	SIRV6	+	810	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	223	164	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513199	contig_1450_pilon	-	2990	21	Intergenic	novelGene_27378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	53	1063	355898	348195	TRUE	30	TGCAGCTCGCAGTTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVLVPGQDLEGSHDLVCRICVSRLTRHKVDEGLECHYPQAVGIHDAHDAGKLCLSLGVVANIITQADEAGFELLGTQRAGVIPVKVVKGGPELVHLLLADALGVPGQDLVLHLIDGPGDGGEELFPAHADVLHSVVGVLVVEDERLLDELVVTLQLVDLWLVVDNALLVLPQVAELVLQEPTSIFVWIQGPMTLAWAPNCLRSLSLCCWRACSSVRAWSLRGTSCRTWSHLPLIS	355950	245226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_245475_308886_309002_315756_315873_322459_322541_324995_325084_325652_325732_329044_329127_331945_332038_339442_339534_340844_341074_342471_342621_345693_345846_346444_346552_347010_347150_348035_348220_348940_349086_350380_350524_351264_351413_352391_352470_354166_354328_355587
513201	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513204	SIRV6	+	616	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	229	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATCGTTAGGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740
513205	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	235	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28166	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513206	contig_15063_pilon	+	1596	7	Intergenic	novelGene_11845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	457	1341	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34804_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513207	contig_5033_pilon	-	2655	15	Intergenic	novelGene_29050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	35	GGTTTAACAATAAAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	531012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531619_531678_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
513208	SIRV6	+	940	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	580	8	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513209	contig_15063_pilon	+	1478	5	Intergenic	novelGene_11477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513210	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513212	SIRV6	+	823	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	184	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	80	406	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1487	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2020_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
513214	contig_17976_pilon	+	2766	4	Intergenic	novelGene_32524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	134	1105	41843	49735	FALSE	10	GTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMLGVIRGMVFPDPLGPVSLPSTLEIQSGSHQENHTIHLHSPEILSTSLLSIYF	41709	51396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47180_49574
513215	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_11255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513219	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513220	contig_15063_pilon	+	1468	6	Intergenic	novelGene_11730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	229	1326	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLIIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35129_35203_35380_35839_36158_36266
513221	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_9710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513223	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513224	contig_5988_pilon	-	1628	4	Intergenic	novelGene_15971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.817113950806	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	104	1468	654091	651962	FALSE	40	GTATTAAGAAGAAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDCCPKPNAGDGCITTNRGPSVPLQLSCLTGHKEMQSQRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	654194	651801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_654079
513225	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513226	contig_15021_pilon	+	3376	13	Intergenic	novelGene_26958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2488	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2598	3065	252040	263343	TRUE	25	AGAGACGGTGGGGAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNFIQNPFLQALPFLQREGVSLGDDRHDVHLIVNRFHECNIQGLQSVPERRDEVEAAVNPVVDDVPPVQATLIVQVPFKLLVDVGDDGLKAVSAVDGITVAGRVHHRQSQLHPTLFNLHGGGLDLDSSLNFFCSSGYDSFWVEVSQEQAVYER	239753	278845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251396_251960_252064_260956_261075_261238_261377_262376_262498_263276_263362_267740_267864_269629_269662_278707
513227	SIRV5	+	428	6	NNC	SIRV5A	novel	2085	17	NA	NA	0	-64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTGTAGAAAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	3534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
513228	SIRV6	+	817	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	546	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513229	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513231	SIRV6	+	424	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	513	-81	340	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
513232	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513233	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513234	contig_14287_pilon	-	2397	3	Intergenic	novelGene_24045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_2	16	3559	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	268	1080	22710	21898	FALSE	10	GCTCTTGCTGTGTTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33953	20580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33780
513236	SIRV6	+	853	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	18	763	18	106	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATAGTAGATTGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
513237	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	465	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513238	contig_12622_pilon	-	2479	12	Intergenic	novelGene_5928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	2001.36614498222	2	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	18	1136	1590968	1588027	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVGEILSHSNPRVPSPLIPVTSHPHPVFFLPQWFLPALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1590985	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
513239	contig_5041_pilon	-	2859	17	Intergenic	novelGene_27067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	561.518334378985	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	115	2469	616721	525456	FALSE	25	TAGTCTCACGAAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636094	525065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
513240	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513241	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513242	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513243	SIRV6	+	388	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1648	-29	-251	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2772	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513244	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513246	SIRV6	+	885	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	223	-14	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513248	SIRV6	+	627	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	736	223	-419	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	136	468	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1866	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513249	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513250	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513251	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513252	contig_20951_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_43091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	170	610	28919	28479	NA	20	CCACCGGCATTGTGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQVSGQMGSRVASATLSYLSQPRPFSLVLLSAVLLGVSSLISVFCGTLQVLFAFPQMQSLSGVCLSDQVF	29088	28144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28100_29100
513254	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	30	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513255	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513256	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_12518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513257	SIRV6	+	355	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	341	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCGTAGGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470
513258	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513259	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513260	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_11889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513262	contig_15063_pilon	+	2170	6	Intergenic	novelGene_8631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3125.35310005126	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1369	1920	36064	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26371	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513263	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513264	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513265	contig_15063_pilon	+	1554	7	Intergenic	novelGene_12453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3739.8486340433	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	8	1303	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYSTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36475_39027_39092_39506
513267	contig_15063_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_8626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	796	1119	35891	35108	TRUE	25	GCTGTTGAAGTAGTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36795	26367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513268	contig_4857_pilon	-	3504	6	Intergenic	novelGene_48646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	62.3204621292236	366	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1983	2288	443315	441598	FALSE	30	ACAGACCTATAATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448612	440381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_444537_444997_445070_447620_447760_448062
513269	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513270	contig_15063_pilon	+	1522	4	Intergenic	novelGene_13084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	206	1378	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34602	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513271	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	63	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513273	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513274	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513275	SIRV6	+	410	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10274	142	1037	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGGTATCTAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11274	11684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
513276	SIRV6	+	271	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10550	5	1313	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11550	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
513277	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513278	contig_15063_pilon	+	1442	6	Intergenic	novelGene_12490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	7	1272	28164	36632	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28157	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
513280	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513282	contig_14450_pilon	-	2668	1	Intergenic	novelGene_49029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	621	935	1245997	1245683	NA	10	TTTTTTTTTTTTTAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCPKYAVLLSRQICSFFWQSMVYSVFFANTVIKRHQFSGLPHSLSSFPMHVENTLGWVRHILVLKVTSLLLNTLKSSFAADLPSALSFDFLTAASMGIDCGSK	1246617	1243949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1243900_1246600
513283	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513284	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513285	SIRV6	+	509	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	13	8737	6	54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGAAGCTATCTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	2594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513286	contig_1532_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_37386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1339.82141667143	2264	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	659	1423	27321	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34921	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_29028_29333_29505_32049_32227_34870
513287	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513288	contig_15087_pilon	+	2304	5	Intergenic	novelGene_37281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	25	606	284653	301944	TRUE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCVDSPFTMTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284628	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_302677_302773
513289	contig_12622_pilon	+	1181	6	Intergenic	novelGene_5916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGGGAAAAGGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583547	1587784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585708_1586269_1586406_1586527_1586838_1587626
513291	contig_3956_pilon	+	1697	8	Intergenic	novelGene_14845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1184.8975672597	32	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	84	1178	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282743_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
513292	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_9523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513293	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513295	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513296	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513297	SIRV6	+	451	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-436	599	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1849	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106
513298	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513299	contig_15063_pilon	+	1502	5	Intergenic	novelGene_9926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	TGAGAAGTTGTATGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513300	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLGPRNHGHCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513301	contig_3747_pilon	+	2838	9	Intergenic	novelGene_24748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3826.39692628718	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	529	1443	202144	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200977	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201440_201507_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
513302	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	74	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513303	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513306	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513307	contig_14333_pilon	-	3604	2	Intergenic	novelGene_49151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	403	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2822	3187	441570	441205	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSEFISTGSKLFFDIRPDYYFPSLEEMGLIGKPSLDFEFSAQVFLPCRLVMTCKQCCENQISTFSRVPNTKDSHQLVNCRSSFRTLSVFTLLYLWPFGTSGWTPQDEQMNVFSHVSFMT	446875	440787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_443248_445731
513308	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513309	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513310	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-47	131	3	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513312	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513313	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513315	contig_15063_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_13414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513316	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513318	contig_15063_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_10466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	236	1267	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
513319	SIRV6	+	782	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513320	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_11662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513321	SIRV6	+	794	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	548	2	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513323	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	11	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513324	SIRV6	+	988	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	522	18	24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513325	contig_15063_pilon	+	1484	4	Intergenic	novelGene_13152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	70	TAAAAATTAGAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513326	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_8769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513327	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513328	SIRV6	+	517	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	19	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTGAGTGTGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
513330	SIRV6	+	1528	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	-13	13	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1927	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513331	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513332	SIRV6	+	805	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	228	164	135	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513334	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513335	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513338	contig_233_pilon	-	2525	15	Intergenic	novelGene_14535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1414.56484258501	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	123	899	126907	98408	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQQRGPAHQRCLQQTLLQSLPGAQHPP	127029	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99814_101715_101770_104152_104309_105461_105611_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
513339	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513340	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	5	1417	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513341	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	3	1415	28164	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513342	contig_15063_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_12117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513343	SIRV6	+	445	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8827	-7	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCAACTAAGGTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513344	contig_15063_pilon	+	1745	7	Intergenic	novelGene_8521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	252	1490	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513346	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_12014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513347	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513348	contig_10940_pilon	-	2039	5	Intergenic	novelGene_49253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	146	574	917000	875564	TRUE	30	CCAAGAACAGTTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917145	874039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875499_875557_875675_893147_893306_916664_916748_916923
513350	SIRV6	+	678	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-361	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	112	339	78	416	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2030_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513351	contig_10134_pilon	-	2297	5	Intergenic	novelGene_16221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	713.292147370206	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_37632_37774_38558_38817_39584
513353	SIRV6	+	877	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	252	2	111	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGATTGCGTTCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	11079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513354	SIRV6	+	733	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	513	164	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513355	contig_8978_pilon	+	2717	10	Intergenic	novelGene_49387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_6	209.852329031631	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	77	1048	339807	343861	TRUE	20	AAGCCTTTTAATTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGEYKPIKS	331586	348130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
513356	contig_13707_pilon	-	2493	11	Intergenic	novelGene_43561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	519.628338334237	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	51	1160	275489	271667	TRUE	35	ATATTTACAAAAGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFVSWIIFPVLVGCLGKYTRPHCPD	275539	269693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
513358	SIRV6	+	625	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
513362	contig_15063_pilon	-	1526	5	Intergenic	novelGene_12764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	35	ACCGTAGTAATCACAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	28163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513363	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513364	SIRV6	-	376	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCGCGATGCCAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11769	11393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
513365	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513366	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513367	SIRV6	+	462	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	5	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2521	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
513368	SIRV6	+	738	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	122	369	93	461	1733	2780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILFRSRKSGTRRGTYR	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2613_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513369	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28181	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513370	contig_4180_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_8416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTTATGTCATGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888304	890839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_888300_890800
513371	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	36	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513373	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513375	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513378	SIRV6	+	708	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2011_2464_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513379	SIRV6	+	627	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-5	272	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2617_2740
513380	contig_8317_pilon	+	311	2	Intergenic	novelGene_19261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGGACACAGAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14256	14860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730
513381	SIRV6	+	832	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	281	18	82	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTAACAAAACGTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513383	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513384	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	21	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513385	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_11493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513386	SIRV6	+	750	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	3	548	3	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513387	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513388	SIRV6	+	621	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-374	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
513389	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	54	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACGCCGACCACTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	3614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
513390	contig_7151_pilon	-	2834	14	Intergenic	novelGene_40637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	129.102454612537	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	60	2357	65162	4371	TRUE	25	CCAATGTTTTTCTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGKSVSELCCFPQSYLVLKVLSMRLCTRILMITFYNQRRRTCWTTQENCLMSH	65221	1817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4761_5679_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
513391	contig_177_pilon	+	2496	3	Intergenic	novelGene_41803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	104	1180	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTAPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415627	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419830_419916
513392	contig_5967_pilon	-	2374	10	Intergenic	novelGene_44357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	378.894232611388	3051	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	112	912	488569	389009	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHDGSEER	517613	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_389029_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
513393	SIRV6	+	521	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	8758	-14	33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCGTGCGTCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513394	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513395	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513396	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_11217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513397	contig_15897_pilon	-	2697	1	Intergenic	novelGene_49571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATGAGCTCTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817839	815142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_815100_817800
513398	SIRV6	+	959	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	6	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	430	744	2021	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513399	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513400	SIRV2	-	288	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	638	22	638	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4094	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
513401	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513402	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513403	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	15	GCTGGTCCTAAGTGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513404	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513405	contig_10352_pilon	+	2959	10	Intergenic	novelGene_49600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	369	junction_9	49.3108056672729	415	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	24	1151	16175	34079	FALSE	30	ACAATAGTCTACGCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	16151	35887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_16264_21362_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883
513406	SIRV6	+	251	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10556	19	1319	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11556	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
513408	SIRV6	+	970	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	475	33	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	35	CCATAAATTTGTGAACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513410	SIRV7	-	1617	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112298	1	112120	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2618	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2600
513411	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	3	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513412	contig_6227_pilon	-	2006	17	Intergenic	novelGene_49741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	247.221023327305	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	733	1707	1213164	1202920	FALSE	15	AGGTTATGGCTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224924	1202620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
513414	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513415	SIRV6	+	426	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	511	-81	338	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
513417	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513418	SIRV6	+	931	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	33	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	175	669	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513420	contig_6593_pilon	+	3520	14	Intergenic	novelGene_49836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	473	junction_13	771.650463532435	1497	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	110	1744	1180755	1277500	FALSE	30	TCATTCTTGGCCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSASGWDSRGTPTPSWSQFQVGCGACVLSGPAPGSAMNRCAEAAAVAATVPDAGVGDAGLRPPMVPRQASFFPPPVPNPFVQQTHIGTASRLRIFLLGIILLPIRALLVALILLLAWPFAAISTACCPEKLTHPITGWRRKVTEPALKFLGRALFFSMGFIVTVKGKIASPLEAPIFVVAPHSTFFDGIACVIAGLPSMVSRNENAQVPLMGRLLRAVQPVLVSRVDPDSRKTTINEIIKRATSRGEWPQILVFPEGTCTNRSCLITFKPGAFIPGVPVQPILLRYPNKLDTVTWTWQGYTFIQLCVLTFCQPFTKVEVEFLPVQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRNHDGSIDFREYVIGLAVLCNPANTEEIIQVAFKLFDVDEDGYITEEEFSTILQASLGVPALDVSGLFKEIAQGDSVSYEEFKSFALKHPEYAKIFTTYLDLQTCLVFSLPEEVRATPSIASNKVSPENHEESTSDKKDD	1180645	1279276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1180926_1191011_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1198315_1198377_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277315
513421	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	13	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513422	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513424	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513425	contig_12427_pilon	-	2076	6	Intergenic	novelGene_40524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	1205.4261653042	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	92	715	522337	506035	FALSE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	555762	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_555679
513426	SIRV6	+	464	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8837	1	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGCTAAAGTGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513427	contig_15063_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_13149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513428	contig_15063_pilon	+	1458	5	Intergenic	novelGene_11669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	594	1337	35349	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34936_35111_35380_35839_36158_36266
513431	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513432	SIRV6	+	587	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	13	8539	6	252	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTCTTCGGTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	2792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513433	SIRV6	+	317	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1616	171	224	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2740	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513434	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513435	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	27	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	227	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513436	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_11903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	226	1401	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513437	contig_10599_pilon	+	2804	9	Intergenic	novelGene_49862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	899.564582172953	1393	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	156	1106	123528	163915	FALSE	25	TATGAAGCCTGACTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123157	165613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158562_158682_161352_161488_163810
513438	contig_9807_pilon	+	2209	16	Intergenic	novelGene_32838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	533.029188277298	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	155	1972	109130	158783	TRUE	35	GCTTGATTTTAAGAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108975	159335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676_158956_159270
513439	SIRV6	+	1508	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	18	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513440	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513441	contig_5954_pilon	-	2480	13	Intergenic	novelGene_28628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_8	438.871556443973	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1409	2119	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960587	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
513443	SIRV6	+	549	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	8750	3	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513444	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513445	contig_4364_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCGGCGACGGAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533296	1532847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
513447	SIRV6	+	282	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	155	164	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTACGCTAGTCCAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
513449	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_19957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTGAGACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
513451	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532884	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
513452	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_9930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513453	contig_4364_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532819	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
513454	SIRV6	+	667	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	27	8167	20	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	17	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513456	contig_1230_pilon	+	2157	9	Intergenic	novelGene_28864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1276.54009313261	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	684	1916	406520	408754	FALSE	15	TATAGTTGTTTCATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404465	408995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406211_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
513457	contig_15063_pilon	+	1493	6	Intergenic	novelGene_9001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3793.00870550016	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	179	1351	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLRANLLQVSSPSSPVSTFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34658_34719_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513460	SIRV6	+	1515	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	9	4	9	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	249	740	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1096	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513461	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513462	SIRV6	+	746	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	584	14	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513463	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	13	1422	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513464	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	8	1420	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513465	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513466	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513468	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_9727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513469	contig_1516_pilon	+	2441	12	Intergenic	novelGene_49982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1133.65128662628	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	205	1800	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRSSPGQTLLSSQRSVQVGPKSHPEPKKEHYVTGGPSPEDQRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335194	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_345052_345170_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
513470	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_8666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26754	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513471	SIRV6	+	1046	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	480	2	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	294	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513472	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513473	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513474	contig_17427_pilon	-	2376	13	Intergenic	novelGene_30326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1158.65988202847	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	53	1279	188879	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179440_179819_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
513476	SIRV6	+	322	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-303	603	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106
513477	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513478	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513479	SIRV6	+	818	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAAATAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
513480	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	95	10	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513482	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513483	SIRV6	+	513	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	8737	2	54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGAAGCTATCTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513484	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513485	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513486	contig_3956_pilon	+	3163	15	Intergenic	novelGene_14858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1111.88583368206	1	110	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	84	1820	1281682	1288915	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKLVPGDCQ	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288891_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
513487	contig_6980_pilon	+	2027	9	Intergenic	novelGene_36050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	11	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	43	939	356720	372790	FALSE	15	TTTCAGACTGTTACTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346140	373878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
513489	contig_854_pilon	+	1230	9	Intergenic	novelGene_36459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	247.887291677085	141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	5	1105	1457382	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1457377	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
513490	contig_15063_pilon	-	1518	4	Intergenic	novelGene_13752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
513491	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_9304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513493	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513494	SIRV6	+	625	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-21	8535	-15	256	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTCGGTCTTACAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513495	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513496	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513497	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513498	contig_11294_pilon	-	4219	2	Intergenic	novelGene_50075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2700	3002	349671	349369	TRUE	60	AAAAAAGCAAGATCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLYQDYVKDKVLFSSRFPGNESCVSPGGSALGEPCGQVFPTFPRETEWQHIPTQPRVGWGRRQGQSRSLELTLRTSLSMLGRWYPCVSLSSDREDLTP	352370	346457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_347049_348742
513499	contig_5954_pilon	-	2561	16	Intergenic	novelGene_28659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_14	426.906578382984	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	752	2203	956264	945083	FALSE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960121_960201_960474
513500	contig_4364_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGGAGTGACCAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533225	1532840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
513501	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513502	contig_3077_pilon	+	2002	9	Intergenic	novelGene_26609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	273	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	823	1506	13867	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9532	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9806_11140_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
513503	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513504	contig_15063_pilon	-	1526	5	Intergenic	novelGene_10652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513506	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513507	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513510	contig_4364_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532853	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
513511	SIRV6	+	814	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	350	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	80	568	1733	10736	TRUE	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513512	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513513	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	572	566	356	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	74	565	1733	10736	TRUE	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1659	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513514	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513517	SIRV6	+	227	2	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	-38	7990	6	285	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2478	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
513518	contig_5018_pilon	-	2158	8	Intergenic	novelGene_47090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	831.436524262406	5	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	67	507	1402792	1401830	TRUE	0	TTCCTCCTGTGTCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGEGPCPALTSVPFL	1402858	1399087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400288_1400609_1400764_1400851_1400966_1401052_1401185_1401691_1402078_1402260_1402363_1402701
513519	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_11893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	227	1453	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
513520	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_19407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAATGGAAACAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16384	16724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
513521	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513522	contig_4364_pilon	+	417	3	Intergenic	novelGene_404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	80	415	1530895	1531309	FALSE	40	GGCCAACAGGGAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNP	1530445	1531311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
513523	SIRV6	+	701	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1628_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513524	SIRV6	+	389	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCGTCTTGAAGCAATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2028_2470
513525	contig_4364_pilon	+	520	4	Intergenic	novelGene_637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	72	518	1530895	1531702	FALSE	15	TATTGTCATGGACTCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTT	1530453	1531704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
513526	SIRV6	+	1430	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	4	1	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1466	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513527	contig_6871_pilon	+	2167	4	Intergenic	novelGene_21533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	814	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	81	1217	121971	135017	TRUE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121890	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135791_135878
513528	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513530	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_8891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513531	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513532	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513534	SIRV6	+	568	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	513	8168	340	623	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513536	SIRV6	+	897	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	177	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	23	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513537	contig_19851_pilon	+	2531	2	Intergenic	novelGene_29876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_1	0	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTAATTGTTCCGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53868	56524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_55882_56006
513538	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513539	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513540	contig_15063_pilon	-	1695	6	Intergenic	novelGene_13678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.6	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
513541	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513542	contig_15087_pilon	+	2315	5	Intergenic	novelGene_37260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	65	646	284653	301944	TRUE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284588	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_302160_302285
513543	SIRV6	+	483	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8534	337	257	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCGGTCTTACAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513544	contig_5023_pilon	-	2147	11	Intergenic	novelGene_7325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	867	1217	647062	639176	TRUE	25	GCAGGGGAGGGGGTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	648294	607252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608047_622521_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857_647374_647739
513545	contig_12279_pilon	+	2101	4	Intergenic	novelGene_50130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2945.57592934821	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	229	384	71894	72049	TRUE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKEGVEYKVKIHFKVSILPCVFAFYKIELFSYNYRLNLRYHISTLFVPPPHPPIPQFRHVLSQTLRSTCYRTTLVMSFPSQDTLLELYMDHLSQWDPSLYELLILISKRHPLLGIAPFVSFLPCTA	71665	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_72179_72394_73221_75031_75096_76928
513546	SIRV6	+	586	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	233	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTAGGACTATGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	2773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513547	SIRV6	+	583	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	866	577	-332	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	49	381	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1953	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513549	SIRV6	+	624	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	552	513	379	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513550	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513551	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513552	contig_15063_pilon	+	1670	6	Intergenic	novelGene_14092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	190	1425	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34618	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513554	SIRV6	+	1003	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	524	1	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513557	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513558	contig_15063_pilon	+	1665	7	Intergenic	novelGene_8644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	ATCCCAAGTGCTGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26548	39703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513560	SIRV6	+	458	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	8806	1	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513561	SIRV6	+	682	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	172	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2616_2740_2829_3106_3165_10724
513562	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513563	SIRV6	+	340	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	187	8	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513564	contig_15087_pilon	-	2416	25	Intergenic	novelGene_37204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	977.043538635249	75	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	96	1073	158925	136605	TRUE	30	TGTAAAATGAGTGACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKCCWPVLSGGSAGGLSDVGA	181135	110648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
513565	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513566	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	54	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513567	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16386	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
513568	contig_15063_pilon	+	1684	7	Intergenic	novelGene_9254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	GGTGTAGGCACTTGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513569	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513571	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513572	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513573	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513574	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513575	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513576	contig_8317_pilon	+	425	4	Intergenic	novelGene_19253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	65	424	14294	15128	FALSE	25	GTGAATTTGAAGCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGV	13261	15129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
513577	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_13159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513578	SIRV6	+	226	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	393	-11	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
513580	SIRV7	-	1847	3	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	71675	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43063	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3089_42985
513581	contig_2027_pilon	+	3569	26	Intergenic	novelGene_39895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	355.363664996859	1023	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1058	3177	198	3374	122795	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117789	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
513582	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513583	contig_3956_pilon	-	2794	15	Intergenic	novelGene_15136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1581	2156	1286221	1284227	TRUE	35	ACGACGGCGGAAGAGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1291015	1281613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281680_1282694_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286611_1287279_1287509_1287951_1288075_1288872_1289228_1289493_1289675_1289756_1289839_1290608
513584	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	230	1060	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36266
513586	SIRV6	+	812	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2479_2621_2740_2829_3106_3177_10724
513587	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513588	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	13	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513589	contig_13707_pilon	-	2291	11	Intergenic	novelGene_43574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	698.916990779306	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	410	1276	273826	270728	FALSE	55	TGCAATAAAACCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275540	269712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273836_274131_274253_274510_274587_275197_275274_275413
513590	contig_1450_pilon	+	2702	20	Intergenic	novelGene_27345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	527.714735539252	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	157	2508	244426	355748	FALSE	80	TGCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243324	355942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243404_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347145_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
513592	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513595	SIRV6	+	473	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-6	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513597	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_8724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513598	SIRV6	+	684	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	762	580	-436	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513600	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	13	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36249
513601	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513602	SIRV6	+	883	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	390	537	174	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	150	641	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1477	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513604	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513605	contig_15063_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_8506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	25	AGCAGCCACAGTGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	26344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513606	SIRV6	+	461	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10346	19	1109	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11346	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
513607	contig_11720_pilon	+	1902	8	Intergenic	novelGene_43927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	418	junction_1	259.278354873912	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	684	1478	264322	268041	FALSE	35	GAGGCGAGCAGACGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTGVGREM	262258	268465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753
513608	SIRV6	+	706	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	27	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513609	SIRV6	+	871	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	172	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	109	330	92	421	1673	2560	TRUE	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1475	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2482_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513610	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513612	SIRV6	+	1377	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	403	30	187	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	137	628	1733	10736	TRUE	30	GCAGTTTAGAAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1490	11795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513614	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513616	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513617	SIRV2	-	492	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1136	9	-27	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAAGGTAATTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4759	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
513618	contig_18251_pilon	+	2873	4	Intergenic	novelGene_50160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1001	junction_1	922.016027819232	129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2063	2434	48676	53991	TRUE	35	AGAATAGTGTGAATAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	46613	55321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48794_50696_50879_53919_54027_54917
513619	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513620	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_20050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACCCATTAAAACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16422	16768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
513621	SIRV6	+	641	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-3	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
513622	SIRV6	+	512	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-356	89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1929	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513624	SIRV6	+	860	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	380	579	164	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
513625	SIRV6	+	413	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	83	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2599	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
513626	contig_15859_pilon	-	3327	3	Intergenic	novelGene_50219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_2	432.5	1847	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	94	468	381181	380227	FALSE	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPLLRPGPDARLLRAAHGDSRGRQDPSKVMETAGSEAGSPEKQQSKSQQLRKIFKEYGAVGVSVHIGISLVSLGIFYTVVSSGVDMSALLLKLGFKESLVQSKLAAGTSTFVVAYAIHKLFAPVRISITLVSVPLLVRYFRKVGFFKPPAAKP	394805	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_380444_381023_381197_394727
513627	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513628	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513629	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	251	1423	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513630	contig_5799_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_50341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTAAGAATTAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717115	718030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_717100_718000
513632	contig_13707_pilon	-	2506	11	Intergenic	novelGene_43548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	554.595356994629	2403	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	603	1469	273826	270728	FALSE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275545	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
513633	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513634	contig_15063_pilon	-	1736	7	Intergenic	novelGene_8863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	979	1302	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
513635	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513636	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513637	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513638	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513639	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513640	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27145	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513641	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513642	SIRV6	+	532	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8207	337	584	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAATGGTCGGTCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513643	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513644	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513645	SIRV6	+	402	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-2	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
513646	SIRV6	+	976	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	72	480	22	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	186	677	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1159	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513647	SIRV6	+	577	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2028_2470_2621_2740
513648	SIRV6	+	696	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	599	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513650	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513652	contig_6047_pilon	+	2319	15	Intergenic	novelGene_24202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	455.197041882716	424	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	106	2217	105237	123781	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKKKNPKKNLKIQQKTQQKTQSKMKKKWMQERMKKNKKQQSNLQLKKMNCKLYSRHLDPVLRGNVKFKSFGETCFGCSPLPPSPLHCKTLGLWVTGRSGFFS	105131	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_119928_122985_123102_123594
513653	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513654	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513655	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513657	contig_19851_pilon	+	2088	6	Intergenic	novelGene_29836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_3	3097.84269452146	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_54606_55753_55840_55882_56006
513658	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513659	contig_5954_pilon	-	2479	15	Intergenic	novelGene_28601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_8	393.825592031264	3291	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	666	2117	956264	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960583	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
513660	SIRV6	+	542	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	512	8195	339	596	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513661	SIRV6	+	651	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
513662	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513664	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513665	contig_17936_pilon	+	2105	11	Intergenic	novelGene_29890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	802.318266026644	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	91	1146	50646	118726	TRUE	20	ATTACCAGCCTAGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRMK	50555	126580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114892_118717_118827_121017_121063_125766
513666	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513667	contig_8252_pilon	+	3922	3	Intergenic	novelGene_50346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_1	207	1577	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	90	395	172125	178415	FALSE	15	CTTTGATGTGTCCTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYPVYCQRTERGPGAYRLAAEPCCRRGAAMERLDKAALNALQPPDFRSESSLASTLKTLLFFTALMITVPIGLYFTTKSYLFEGALGMSSRDSYFYAAIVAVVAVHVVLALFLYVAWNEGSRQWREGKQD	172035	181942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8252_pilon_+_172178_177010_177121_178272
513668	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513669	contig_5954_pilon	-	2520	15	Intergenic	novelGene_28677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_10	419.968341858366	3121	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	882	2165	955906	945083	FALSE	10	GCTGGACCATCCGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960566	944727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955997_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
513671	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513672	SIRV6	+	273	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	94	340	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
513673	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513674	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	249	1421	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26347	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513675	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513676	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_12617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2996.89670974642	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	5	1468	28164	39515	FALSE	45	AAATAAATGTGTATATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513677	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513678	contig_16148_pilon	-	2828	12	Intergenic	novelGene_50357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_11	461.247571607753	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	1079	2500	111433	59018	FALSE	20	TTTGCAAAGCTTCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153327	58689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_153250
513679	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513680	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	8	1420	28164	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513681	contig_3077_pilon	+	1709	10	Intergenic	novelGene_26660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	62	1213	9676	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9614	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
513682	SIRV6	+	673	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	8506	3	285	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513683	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513684	SIRV6	+	1458	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	-13	33	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513685	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513686	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513687	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_11479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513689	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513690	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	10	1422	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513692	contig_10311_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_50426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	1030.54075510573	4132	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	34	1122	71526	66744	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71559	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66642_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
513693	contig_1516_pilon	+	2310	11	Intergenic	novelGene_49964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1078.63905454976	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	137	1669	347304	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRLIPAKERRVPSLQVFPAFASQPKPHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335173	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335256_347249_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
513694	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513695	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27559	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513696	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513698	contig_16622_pilon	-	1768	7	Intergenic	novelGene_48425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1035.10956210227	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	248	448	113714	112952	TRUE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSIILPQVAGGIWLTISPHKLGTFHHTKRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	126389	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115294_126306
513699	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513700	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513702	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	7	1077	28164	36333	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	28157	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36277
513703	SIRV6	+	919	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	32	577	-5	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513704	contig_10311_pilon	-	2225	10	Intergenic	novelGene_50445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	946.203029396707	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	34	720	71526	68584	TRUE	25	TTAAAAGTTGCTTTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVSFFSPCCTAGDVVKCRYC	71559	65130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66646_66754_67180_67236_67724_67962_68264_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
513705	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513706	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_9552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	584	1405	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34913_35031_35380_35839_36158_36266
513707	contig_15063_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_11218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39770	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264_36597_38967_39090_39504
513708	SIRV6	+	996	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	12	529	12	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
513709	SIRV6	+	853	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	577	164	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513710	contig_12970_pilon	-	1321	1	Intergenic	novelGene_50536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGTTGGGACCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271659	270338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_270300_271700
513711	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513712	contig_7334_pilon	+	2815	2	Intergenic	novelGene_50571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	419	1486	120109	121176	FALSE	5	CTCACTGTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116760	122505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_119959
513713	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513714	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513715	SIRV6	+	556	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-305	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	22	354	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1980	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11031_11109_11205
513716	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513718	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513719	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_11459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	231	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513720	SIRV6	+	590	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	856	580	-342	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	59	391	2002	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1943	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513721	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTTSTAGARANWSPSPQSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34630_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513722	contig_2100_pilon	-	1766	12	Intergenic	novelGene_50721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	116	1420	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185526	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
513723	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513724	contig_1725_pilon	+	2920	21	Intergenic	novelGene_24257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	538.213164090214	6	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	92	2647	201480	255543	TRUE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201388	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366_255640_255685
513725	contig_11285_pilon	+	2247	12	Intergenic	novelGene_5572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	487.830040854733	2261	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	40	1488	766060	769349	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHVSAHLPDPG	763518	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769653_769740
513726	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	225	1400	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513727	contig_5643_pilon	+	1338	12	Intergenic	novelGene_39101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.146311614074	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	350	1126	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFSRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	635211	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_635222_635412_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
513728	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513729	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513730	SIRV6	+	482	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
513731	SIRV6	+	381	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10364	81	1127	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11364	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
513732	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513733	SIRV6	+	709	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-43	8195	0	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513734	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	226	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513735	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	216	1388	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27153	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513736	SIRV5	+	443	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	9	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAAGTGGTCAAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	3599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2092_2157_2270_2316_3298_3405_3483
513737	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513738	SIRV6	+	478	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1415	577	-14	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2502	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513739	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_9167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	70	AAAATTAGAAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513741	SIRV6	+	952	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513742	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513743	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513745	SIRV6	+	836	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	180	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	29	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	84	416	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1483	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513746	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513747	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513748	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513750	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_10274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513751	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513752	contig_15063_pilon	+	1420	5	Intergenic	novelGene_12023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	220	1278	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35285_35858_36158_36266
513753	SIRV6	+	665	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2024_2470_2621_2740
513754	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513755	SIRV6	+	799	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	519	-11	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGTAAGACTGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	10812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513756	contig_4429_pilon	+	2967	11	Intergenic	novelGene_50784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	580	junction_1	277.42604419917	551	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	45	2120	154531	198515	FALSE	25	CCTAGTTTTGTTAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGVYGEEAAEAAAMAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154486	199362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
513757	SIRV6	+	573	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	172	286	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTACGTTTGGGGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1843_2027_2470_2621_2740
513758	SIRV6	+	631	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513759	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513760	SIRV6	+	784	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	186	137	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	144	435	138	572	1733	3120	TRUE	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCYL	1489	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3110_3165_10724_10819_11031
513761	SIRV6	+	942	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	171	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	93	425	1673	2560	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1474	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513762	SIRV6	+	494	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8710	164	81	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513763	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513764	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8512	164	279	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCCCTGGTACGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
513765	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	58	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513766	SIRV7	-	2270	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	30	-153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTAAGACATAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147888	1158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43076_114680_114989_147608
513767	SIRV6	+	273	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	94	340	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
513768	contig_2069_pilon	-	205	2	Intergenic	novelGene_23538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGGCCCCGCAATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509101	1508427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508563_1509031
513769	scaffold_12124_pilon	+	2576	12	Intergenic	novelGene_22063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	492.059208289826	283	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	68	961	836073	849900	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKAHSAVRS	829677	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_849876_850022_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
513770	contig_6735_pilon	-	2167	13	Intergenic	novelGene_15744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	13	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	50	1537	564868	542812	TRUE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGEWWGEKKLLNFVSSWGGKEGEEFSYCSAGSVSVCLLHFGQTMFKFLIMQDHQATQLGLSESQL	568247	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542596_542790_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
513771	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513772	SIRV6	-	440	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
513773	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513774	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_12234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	213	1388	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513775	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513776	SIRV6	+	459	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1436	575	7	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2523	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513777	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
513778	SIRV5	+	484	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-230	951	-116	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTGTAGGTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8085	10915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
513779	SIRV6	+	685	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	760	581	-438	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513780	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_8727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	245	748	34808	35888	TRUE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	27124	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35844_36158_36266
513781	SIRV6	+	355	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	166	14	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTTTATAGTTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	1954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513785	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513786	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513788	SIRV6	+	702	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	792	532	-406	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	123	455	2002	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1879	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513789	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513790	SIRV2	-	723	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3863	90	2684	-90	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGTCGATGCGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2048	1125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973
513791	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513792	SIRV6	+	1537	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-11	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	250	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513794	contig_15087_pilon	-	2522	27	Intergenic	novelGene_37209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1006.22454174124	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	220	2058	158925	113497	TRUE	30	TCTGTAAAATGAGTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181130	110650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110879_110935_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_176370_176500_181066
513795	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513796	SIRV6	+	1119	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	837	70	-361	65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513798	SIRV6	+	1401	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	394	15	178	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	146	637	1733	10736	TRUE	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1481	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513799	SIRV6	+	737	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2817_3092
513800	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513801	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513802	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513803	SIRV6	+	631	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	815	589	-383	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	100	432	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1902	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
513806	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_13006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	294	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	212	1387	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28189	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513807	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513808	SIRV6	+	606	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	534	549	361	-6	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513812	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513814	SIRV6	+	1538	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	-13	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14917	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513815	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513816	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513817	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513819	contig_8317_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_20646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAATGGAAACAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16467	16724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
513823	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513825	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513827	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513829	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513830	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513831	contig_3956_pilon	+	1969	9	Intergenic	novelGene_15138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1623.98091121786	46	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	252	1274	1282879	1290315	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSAVSPSSPRESPSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQASRLT	1281614	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1284717_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1290297
513832	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_12087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27528	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513833	SIRV6	+	1046	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	480	2	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513836	SIRV6	+	631	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
513838	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_8567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513839	SIRV6	+	426	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	833	540	-322	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1963	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513840	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513841	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513842	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_10249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513843	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513844	SIRV6	+	568	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2029_2470
513846	SIRV6	+	983	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	543	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513847	contig_5643_pilon	+	2420	15	Intergenic	novelGene_39049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_2	629.339956313156	27	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	928	2208	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
513848	contig_5189_pilon	-	2138	9	Intergenic	novelGene_34825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_2	1025.36859226329	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	111	995	244235	199237	FALSE	10	TAATGTTTTTTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
513849	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	90	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513850	contig_854_pilon	-	2787	14	Intergenic	novelGene_36136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	214.186668572259	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	181	1269	493192	471803	TRUE	0	GCCTGGGGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509275	470021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471500_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_497487_497571_509182
513851	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3848.82919697666	188	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	8	1405	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266
513853	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513855	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	203	1438	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513857	contig_15063_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_10816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513860	SIRV6	+	781	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	561	2	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTTAGGTAGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513861	SIRV6	+	791	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	210	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	178	537	114	650	1733	10780	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPEVRIIDERVEVEVVQQES	1513	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
513862	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513863	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513866	SIRV6	+	785	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	248	164	115	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	179	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	GATTGCGTTCACAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513867	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_9524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
513868	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513869	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513870	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513871	SIRV6	+	665	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
513873	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513875	contig_11752_pilon	+	3369	6	Intergenic	novelGene_37565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1897.97433070102	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	2250	2867	87165	94226	TRUE	10	ATGTCCAGTTGTGCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIK	84077	105910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_87547_88667_88776_92873_92996_94220_94414_105595
513878	contig_4364_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_2805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCAACCCTGTCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1533009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
513879	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513881	contig_12512_pilon	+	3993	7	Intergenic	novelGene_24177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	835	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	812	1141	586480	586809	TRUE	15	GACGGGCGGCTGAAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCLPCFRKGHLWKSLFVLYEALRQYLIRSSTKPDLQLFSATLLTVGLNGRIDVTPISHYVATSEMLIFIKNIRAEFHLKKKKNSSTLGTLENAILNIIMNAGIFMSQL	585668	599936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_588386_590666_590826_591105_591263_591590_591850_592234_592342_595425_595506_599422
513882	contig_5020_pilon	+	1353	9	Intergenic	novelGene_27817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1073.98678268171	7	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	364	858	122915	124469	TRUE	0	CCTTGGTGTCTCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGGCGPAYGCGEGPVPSSGPGWRWPEIPKHCGCLQDHCPGGRVSGTLERDLSQCCS	118461	126082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123356_124221_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125732_125919
513883	contig_5023_pilon	+	2008	16	Intergenic	novelGene_7331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2052.73192491264	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	24	1814	607309	648108	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLDT	607285	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646919_648099
513885	contig_15063_pilon	-	1419	6	Intergenic	novelGene_9313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	668	991	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36511_36625
513886	contig_15063_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_10681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	793	1116	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36792	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
513888	SIRV6	+	754	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513889	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513890	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	175	11	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTTGTGGTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
513891	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513892	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
513893	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_9073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513894	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513897	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513898	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513900	contig_8772_pilon	+	2482	8	Intergenic	novelGene_21086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3899.90357808592	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	143	1030	15355	19369	TRUE	30	TTTGAAAAAACTCTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKV	15212	23411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
513901	SIRV6	+	1035	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	20	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	161	486	251	736	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513904	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	548	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513905	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513906	contig_13707_pilon	-	2659	11	Intergenic	novelGene_43556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	537.068896883817	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	63	635	275489	273683	TRUE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGEVSRGNRS	275551	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
513907	contig_15063_pilon	+	1606	6	Intergenic	novelGene_12856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3667.21665572134	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	237	1379	34808	39538	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	28164	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
513908	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513909	contig_10354_pilon	+	2594	6	Intergenic	novelGene_50839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	489.542398572381	157	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	174	527	432370	454358	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKAGQGIRKTEEESTPLNCGVGEEY	432196	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_454287_454818_471873_472041_475056
513910	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_14033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513911	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513912	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513915	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_12246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27559	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513916	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513917	contig_8317_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_19397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAAACCTGTGTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
513918	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513919	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513921	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513922	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	577	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	243	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513923	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513924	contig_15063_pilon	+	1499	4	Intergenic	novelGene_13873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513925	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513928	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513930	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513931	contig_11815_pilon	+	3604	3	Intergenic	novelGene_50932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	35.5	43	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	128	1762	299082	300716	FALSE	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPKGQGNKVQNGSVHQKDGLNDDDFEPYLSPQARPNSAYTAMSDSYLPSYYSPSIGFSYSLGEAAWSTGGDTAMPYLTSYGQLSNGEPHFLPDAMFGQPGALGSTPFLGQHGFNFFPSGIDFSAWGNNSSQGQSTQSSGYSSNYAYAPSSLGGAMIDGQSAFASETLNKAPGMNTIDQGMAALKLGSTEVASNVPKVVGSAVGSGSITSNIVASSSLPPATIAPPKPASWADIASKPAKQQPKLKTKNGIAGSSLPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVAKAPSQALVQNIGQQAIQGSPQPLGQQANNSPPVAQASVGQQTQPLPPPPPQPAQLSVQQQAAQPARWVAPRNRGSGFGHNGVDGNGVGQSQAGSGSAPSEPHPVLEKLRSINNYNPKDFDWNLKHGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDAAYRSMNGKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSAVDYNTCAGVWSQDKWKGRFDVRWIFVKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEESVKKVTSLPFLRFLGKEEELGEVLM	295408	302558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_295438_296009_296090_299063
513933	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_9302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513934	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513938	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513939	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513940	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513941	contig_15063_pilon	+	1479	4	Intergenic	novelGene_14143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	167	1339	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34641	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513944	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513946	contig_6735_pilon	-	1886	12	Intergenic	novelGene_15734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	904.863863556418	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	90	1406	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568287	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_552854_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
513948	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513949	SIRV6	+	633	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	342	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	28	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTAATAGTGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	10793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724
513950	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513951	contig_4364_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532867	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
513952	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513953	SIRV6	+	678	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	524	274	351	89	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
513954	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513955	contig_8978_pilon	+	3158	10	Intergenic	novelGene_49370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_7	253.129206259824	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	290	1465	339807	344837	TRUE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAVYLPCAHHVSGHS	331373	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_345397_345627_345738_347113
513956	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513958	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10504	16	1267	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
513959	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513961	SIRV6	+	618	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	860	548	-338	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	55	387	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1947	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513962	SIRV6	+	627	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-324	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2022_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513965	contig_10734_pilon	-	2020	4	Intergenic	novelGene_51009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	4564	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	95	625	320632	311551	FALSE	10	CAGCCTTAGTGTTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEDFCLQITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320726	310155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319045_320540
513966	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	2	1474	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513969	SIRV6	+	962	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	564	2	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513970	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513971	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513973	contig_11512_pilon	-	2819	7	Intergenic	novelGene_43276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	345.630703690128	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	228	863	396169	367967	FALSE	35	AACCCTTGGAACCTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMNIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409501	366010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381732_396152_396210_409314
513975	contig_15063_pilon	+	1411	6	Intergenic	novelGene_11501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	230	1258	34808	36632	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27139	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
513976	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	222	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513977	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_10686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513978	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	18	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513979	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
513982	SIRV6	+	494	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8804	4	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
513983	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	240	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
513984	SIRV6	+	383	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	540	-67	367	67	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGCCCGAAGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	2607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
513986	contig_15063_pilon	+	1893	7	Intergenic	novelGene_8451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	403	1638	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26193	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
513987	SIRV6	+	1381	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	429	0	213	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	111	602	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1516	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
513990	contig_17936_pilon	+	2049	11	Intergenic	novelGene_29907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	802.318266026644	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	63	1193	50646	121021	TRUE	20	TTACCAGCCTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNELEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50583	126581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114834_118688_118827_121017_121063_125766
513992	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513993	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513994	SIRV7	+	1725	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGATATTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024	3112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1793_1837_2679_2996
513995	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_13160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513996	SIRV6	+	549	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-5	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470
513997	contig_9609_pilon	+	2924	24	Intergenic	novelGene_22989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	235.826343465296	1168	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	151	2142	311574	331474	TRUE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLENEIPRSSCRKTGEVRHSRTSRTQAQEAV	309954	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329833_331388_331487_331563_331694_332694
513998	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
513999	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514000	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514001	contig_1244_pilon	-	2115	13	Intergenic	novelGene_37983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1013.50344994753	128	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	79	768	948448	928723	TRUE	25	TCCAGACTCTTCAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEVSAQHCPMLSV	948526	922775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928608_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
514002	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514003	contig_366_pilon	-	3448	20	Intergenic	novelGene_51638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.316957297828	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	1551	2921	1423458	1406567	FALSE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYECRAHNWAGNATQAFWPISVEATVHRLKEPLFTPVLVACMSVMALLLLLLVLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNTYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGLSPDPGQDPDGVTGYKNIHLEKKCVHRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSSNDSFSEQGLDKEDRRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTSGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFLPSSETLQREQLMGGRRTPLLKPGPSLPASGWGLSPHPLPHCSQCCQPHVCYANW	1441007	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406736_1408101_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
514004	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLGPRNHGHCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514005	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514006	contig_1406_pilon	+	2646	4	Intergenic	novelGene_25590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	5	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	42	437	2173822	2185260	FALSE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173780	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
514008	contig_6735_pilon	-	2046	14	Intergenic	novelGene_15762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	74	1570	564868	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568271	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
514009	SIRV6	+	682	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	350	551	177	-8	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514010	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_12044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514011	SIRV6	+	456	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-322	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	39	374	2002	10736	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1963	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
514013	contig_15063_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_9468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
514014	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514015	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514016	contig_15063_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_12508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	969	1292	35891	35108	TRUE	40	GTAATCACAATGGTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39755	28157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39083_39493
514017	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_10277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514019	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514020	contig_9345_pilon	-	1845	6	Intergenic	novelGene_24608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	256	684	955353	948037	FALSE	5	TATCCTGGTGTTTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKAETWQTGLVLLGTWSVQQRPKME	1001330	946875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948109_949526_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
514021	contig_15063_pilon	-	1692	6	Intergenic	novelGene_13616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
514022	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10410	88	1173	48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTTGCGTTTGGTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11410	11738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
514024	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514027	SIRV6	+	743	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-400	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	124	375	117	491	2002	10780	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1885	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11034_11109_11205
514028	SIRV6	+	1481	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	45	2	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	533	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514029	contig_9955_pilon	+	2515	4	Intergenic	novelGene_21312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTTCTTCGAGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45115	49335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_45362_45924_46862_46945_47737_48794
514030	contig_4364_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCAACGCGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532827	1533264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
514032	SIRV6	+	890	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	186	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	138	629	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1489	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1622_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514034	SIRV6	+	719	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8167	18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514035	contig_6063_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_27595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCTCACACTTATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32888	32486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_32500_32900
514036	contig_6063_pilon	-	2555	1	Intergenic	novelGene_27594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCATCTATTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31740	29185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_29200_31700
514037	contig_2054_pilon	+	2727	2	Intergenic	novelGene_51655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1206	junction_1	0	1210	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACTGTTATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	19446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890
514038	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_9865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514039	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514041	SIRV7	+	2257	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	97	4	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTCAGCCGTCAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2683_2989_3111_43027_43083_114683_114993_147610
514042	SIRV6	+	384	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	67	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATGCGGTAAACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514045	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514046	SIRV6	+	1374	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	53	167	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	30	AGTCGATTATTGCCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514048	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514054	SIRV6	+	575	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	163	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1537_1645_1736_1845_2026_2470_2621_2740
514058	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514059	SIRV6	+	410	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	123	2	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514060	contig_6364_pilon	+	2942	1	Intergenic	novelGene_51706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAACTAGATAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431221	434163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_431200_434200
514061	contig_4103_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_52007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCACGTACCAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268360	269070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_268400_269100
514062	SIRV6	+	684	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	378	127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAATTTAAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681	11095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2022_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514063	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514064	contig_4364_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	8	370	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530887	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096
514066	SIRV6	+	389	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	94	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514067	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514068	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_8620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26366	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514069	SIRV6	+	596	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	583	337	-40	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514070	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514071	contig_2636_pilon	-	3125	1	Intergenic	novelGene_52100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85677	82552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_82600_85700
514073	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3682.08194805904	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	233	1465	34808	39510	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKV	27136	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39094_39506
514074	contig_5988_pilon	+	2346	3	Intergenic	novelGene_16108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3212	junction_2	152	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222594	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1222681_1223384_1223461_1224753
514076	SIRV6	+	374	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1621	12	229	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2745	11267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514078	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514079	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514080	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34619_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514081	SIRV6	+	654	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	279	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCCCTGGTACGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514082	SIRV6	+	703	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	511	262	338	101	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514083	SIRV6	+	738	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	22	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
514084	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514085	contig_15047_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_52125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	6878	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	30	653	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
514086	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514087	contig_17936_pilon	+	2062	12	Intergenic	novelGene_29911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	854.231334916789	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	164	1315	79133	125837	FALSE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLCGSSRCGGAGGSPGGRRSDGSHRHSSPGGKCGAGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKETKRRKINSAVCCMLHETQGPVWASCRRPSPAQQSWASPSLITL	50583	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50690_68362_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118735_118804_118827_121017_121063_125766
514089	contig_6215_pilon	-	2413	7	Intergenic	novelGene_21190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	836.809947890732	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	45	905	243029	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243073	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_231991_238659_238751_242990
514090	contig_854_pilon	+	2225	6	Intergenic	novelGene_36256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3058.78377137058	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3	560	543502	562402	TRUE	30	ATATGACCTCATCGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWCKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543499	564692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543624_556118_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
514091	contig_15063_pilon	-	1557	5	Intergenic	novelGene_9428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514092	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	53	1249	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
514093	contig_5515_pilon	-	2953	10	Intergenic	novelGene_52324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	447.150346191038	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	96	1226	99142	68158	TRUE	35	AAGGGGAAGTACATACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99237	65956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_67535_68008_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
514094	contig_7151_pilon	-	2891	15	Intergenic	novelGene_40657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	121.323568045394	878	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	908	2727	60	2786	65162	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65221	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4350_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
514095	contig_13608_pilon	-	2822	19	Intergenic	novelGene_52368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	209.274002266625	725	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	675	2240	416316	369353	FALSE	25	CAGCAAAATGTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470350	368770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_451597_451661_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
514096	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514097	SIRV6	+	680	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	347	89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514098	SIRV6	+	518	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2750_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
514099	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514100	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8167	337	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514101	SIRV6	+	805	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	133	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	27	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	321	653	2002	10736	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514102	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514104	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_8900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514105	contig_15087_pilon	+	2400	4	Intergenic	novelGene_37272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	167	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	36	617	284653	301944	FALSE	20	CTTGCTGCAAAATCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284617	303727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
514106	SIRV5	-	513	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCGCCGACCGTAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10952	8092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
514107	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_9935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514108	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514109	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514110	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514111	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	548	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514112	contig_14970_pilon	+	1914	9	Intergenic	novelGene_44950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	133	1221	136145	231550	FALSE	15	CACCTTAACTCTTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
514113	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_13141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514116	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514117	contig_15087_pilon	+	2479	4	Intergenic	novelGene_37258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	138	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	103	684	284653	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284550	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
514118	contig_15063_pilon	+	1454	6	Intergenic	novelGene_8619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3710.75095364806	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	230	1453	34808	39088	FALSE	20	AGGTAGCCCAGTCAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLF	26366	39089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975
514121	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514122	contig_15063_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_13796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514123	contig_11285_pilon	-	3336	11	Intergenic	novelGene_5544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	339.871210902012	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	2003	3013	744458	741540	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	747937	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_744159_744220_744373_744474_745950
514124	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514126	SIRV6	+	669	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1848_2035_2477_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514127	SIRV6	+	467	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	41	1081	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACTAAGCAGCAGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
514128	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514129	contig_5033_pilon	-	2372	15	Intergenic	novelGene_29026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	324	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531537_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
514130	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514131	SIRV6	+	620	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-5	256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTCGGTCTTACAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	2796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740
514132	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514133	contig_5727_pilon	+	3051	17	Intergenic	novelGene_7948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	814.58766409761	17	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1667	2290	177195	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168152	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_176978_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
514134	contig_15063_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_9173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514135	contig_8138_pilon	+	2036	4	Intergenic	novelGene_52449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1062	junction_1	35.2262528363278	99	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	197	652	280295	306552	FALSE	10	TTCTTAGTAGTGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280098	307936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364
514136	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514137	contig_15063_pilon	+	1575	5	Intergenic	novelGene_8469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	261	1433	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26335	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514138	SIRV6	+	901	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	104	315	332	646	2021	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1843_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514140	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514141	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	13	1485	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28151	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514142	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514143	contig_4364_pilon	+	495	4	Intergenic	novelGene_428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	77	493	1530895	1531672	FALSE	5	GTCTCTGTATGCCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAV	1530448	1531674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
514144	SIRV7	-	1969	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33109	4	-76	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	84	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTAATTAGTGTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114814	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
514145	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	234	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514146	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514147	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514148	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514149	contig_7230_pilon	-	2463	8	Intergenic	novelGene_52549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	407.230967909477	4017	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	138	704	177508	134622	TRUE	35	TACGGAATCTGGGAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177645	132813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_133510_133558_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
514150	SIRV6	+	467	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
514151	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514152	SIRV6	+	664	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1626_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514153	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	190	1362	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514157	contig_10904_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_22538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCAAATGTCTTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374352	374104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_374100_374400
514158	contig_10904_pilon	-	2952	1	Intergenic	novelGene_22537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	878	1240	373123	372761	NA	15	GTTATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAPLWVLEATYPSFGCATLAYLSSDLKTAGFVWGPDQQKALQQVQAAVQAALPLGPHDPADPVVLEVSVADRDAVWSLWQAPPGDSQHRPLEFWRKALPTSAGNYSPFEKQLLASYSP	374000	371048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_371000_374000
514159	SIRV6	+	377	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10368	81	1131	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11368	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
514161	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514162	contig_567_pilon	-	3180	13	Intergenic	novelGene_33953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	977.426222706007	72	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	104	1102	331097	308820	TRUE	15	TATTGACTTTCCCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGVTLLAPRLGIGPQSSLPRPRPPAASGPWIPANMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338287	306659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308280_308361_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338185
514163	contig_5954_pilon	-	2183	14	Intergenic	novelGene_28651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	402.960082889567	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	487	1824	956150	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960587	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956450_959777_959941_960474
514164	contig_5280_pilon	-	2371	8	Intergenic	novelGene_52625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5.24890659167824	1315	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTTGTAGCGCCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79154	38938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_39451_40882_41074_41732_41837_42906_42988_47317_47506_56216_56355_56456_56486_78026
514166	contig_15087_pilon	+	2107	2	Intergenic	novelGene_37286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3093	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	301265	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	301264	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_301421_301788
514167	SIRV6	+	371	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10420	35	1183	-33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCAGTTTAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11420	11791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514168	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514170	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514172	SIRV6	+	488	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	771	540	-384	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1901	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514173	SIRV6	+	837	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	424	549	208	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	116	607	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1511	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514175	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	83	1171	53	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTTTGGTCGCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
514176	contig_11285_pilon	+	2268	12	Intergenic	novelGene_5556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	505.686588332966	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	709	1950	767344	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763485	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
514177	SIRV6	+	791	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	32	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514178	contig_19564_pilon	-	2360	4	Intergenic	novelGene_29578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	159	1493	15529	12201	FALSE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15687	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
514179	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514180	SIRV6	+	950	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	480	164	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514181	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514182	SIRV6	+	442	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	14	-49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1632_1741_1856_2027_2470
514183	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514184	SIRV6	+	713	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-19	8167	-13	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514185	contig_3469_pilon	+	3572	1	Intergenic	novelGene_34226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610070	613642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_610100_613600
514187	contig_177_pilon	+	2475	3	Intergenic	novelGene_41820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	78	1154	417672	418748	TRUE	15	TAGTTTGTGGTATTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415653	420149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419634_419713
514188	SIRV2	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3411	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1300
514189	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514190	SIRV6	+	527	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8764	11	27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCACTTGTCGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514192	SIRV6	+	390	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	1	94	1	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514193	SIRV6	+	623	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-8	8524	-2	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514194	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	199	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514195	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_12981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3646.33575966644	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	224	1456	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28177	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36596_38977_39092_39506
514196	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514197	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514199	SIRV6	+	545	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8745	12	46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACGCGTTGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514200	SIRV6	+	975	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	524	-8	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514203	contig_1244_pilon	-	2221	12	Intergenic	novelGene_37968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	291	junction_7	854.975501074748	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	539	1438	928860	923211	FALSE	15	TGATGGGCTAAGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948504	922427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
514204	contig_11338_pilon	+	3854	15	Intergenic	novelGene_6171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_5	390.034064446391	48	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	299	1993	6086	11749	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	745	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
514205	SIRV6	+	524	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514206	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514207	SIRV6	+	428	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	8778	162	13	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTAGTCGTAGGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514208	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514209	contig_3986_pilon	-	2867	13	Intergenic	novelGene_52682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	108.198120747698	469	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	376	1659	55958	35282	FALSE	25	ATATTTTCAATGTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108511	34073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56058_57911_57964_60545_60655_108396
514211	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514212	SIRV6	+	832	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	196	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	128	619	1733	10736	TRUE	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1499	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11034_11109_11205
514213	SIRV6	+	563	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1741_1853_2027_2470_2621_2740
514214	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10388	2	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11388	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514215	SIRV6	+	713	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	782	531	-416	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	133	465	2002	10736	TRUE	40	TTGGTAACAATGTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1869	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514216	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514217	SIRV6	+	620	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	351	8172	178	619	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514218	contig_15063_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_11047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	50	TGTTTATAAAAATTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514219	contig_14225_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_52765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAGAAAAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494889	493661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_493700_494900
514220	SIRV6	+	586	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8710	6	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514221	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514222	SIRV6	+	806	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	30	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514223	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_9992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	238	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36275
514224	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514225	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514226	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_9444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514227	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	564	2	-21	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGAGAGTTAGGTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514229	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514230	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	26	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514231	SIRV6	+	988	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	539	1	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514233	SIRV6	+	449	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	4	8806	-3	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514234	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514235	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514237	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514239	contig_3386_pilon	-	4589	7	Intergenic	novelGene_34588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_2	80.5991452946135	919	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	49	1308	531475	518621	FALSE	10	TGTGTCTGTACTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTYLWSSRQFRIQSPRMNVHRASDGDRLLRQDASCLVDDTSTATQEREASSLASSGLQNLTYPSGPRSDDLSLDYASQPAHLQFPHIMPLPEDIKGSCFQTGNKRNHEPFIAPERFGNSSVGFGSNSHLQAPEKVTLLVDGTRFVVNPQIFTAHPDTMLGRMFGPGREYNFTRPNEKGEYEIAEGISATVFRTVLDYYKTGIINCPDGISIPDLRDTCDYLCINFDFNTIRCQDLSALLHELSNDGAHKQFDHYLEELILPIMVGCAKKGERECHIVVLTDEDSVDWDEDHPPPMGEEYSQILYSSKLYRFFKYIENRDVAKTVLKERGLKNIRIGIEGYPTCKEKIKRRPGGRSEVIYNYVQRPFIQMSWEKEEGKSRHVDFQCVRSKSLTNLVAAGEDVLEDQEILMHHPPQVDELDRLNAPLSQMASNDFQD	531523	515339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_518914_520332_520444_521996_522195_523515_523637_523989_524093_528528_528803_531315
514241	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514242	contig_1516_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_50012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCCAAGGCTCATGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351543	352047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_351500_352000
514243	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514244	contig_20641_pilon	+	1598	8	Intergenic	novelGene_52809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1226.78038884267	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	83	1306	14767	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14543_14691_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
514245	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514246	contig_9609_pilon	+	3005	24	Intergenic	novelGene_22986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	253.91983314329	39	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	153	2381	311574	332710	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELRIMNSPPKMALTTVTLATRCYRPWAGGKAQVWEGSVKVSQPPLRLKFG	309952	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330294_331563_331694_332694
514247	contig_15063_pilon	+	1692	7	Intergenic	novelGene_11888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	40	AATAAATGTGTATATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514248	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514250	contig_10324_pilon	+	2643	12	Intergenic	novelGene_7756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_9	947.322167615748	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	25	1257	72994	79380	FALSE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	72969	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
514252	contig_10629_pilon	-	2795	14	Intergenic	novelGene_52906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	331.112683942273	1094	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	584	1444	256216	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPALDLSL	267922	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_257145_267625
514253	SIRV6	+	370	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	161	4	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTTTACGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514254	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514255	SIRV6	+	426	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10381	19	1144	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11381	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514256	contig_15063_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_8731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGCCATGTGACCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34599_34924_35035_35382_35840_36156_36264
514259	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514260	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514261	contig_15063_pilon	-	1475	5	Intergenic	novelGene_9696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	727	1050	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36726	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34609_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514262	contig_5643_pilon	+	2238	15	Intergenic	novelGene_39025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	679.916276358452	471	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	651	1628	634983	640340	TRUE	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGEGHLWERRVGNGRVASL	631198	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640538_640636_640729_641102_641244_641412
514263	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514264	contig_15063_pilon	-	1558	5	Intergenic	novelGene_8815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514265	SIRV6	+	383	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-32	134	18	36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGTGCCGCTTGGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514266	SIRV6	+	476	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-421	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1864	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514268	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514269	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	234	746	34808	35888	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27135	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
514270	SIRV6	+	703	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-356	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	20	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1929	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514271	contig_13707_pilon	-	2786	11	Intergenic	novelGene_43542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	571.65178211915	2217	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	57	911	275489	272785	TRUE	30	ACAAAAGTGGTGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEVGALLIWFRCIPYNNTDCPQIF	275545	269687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
514272	SIRV6	+	988	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	517	-14	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514273	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_11761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSASESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34607_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514274	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514275	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514277	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514278	contig_15063_pilon	-	1526	5	Intergenic	novelGene_10654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514279	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514281	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514282	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_12235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	213	1388	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514283	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514284	contig_1516_pilon	+	2455	12	Intergenic	novelGene_49962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	1152.31335413407	63	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	663	1814	353572	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335172	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_350125_350235_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
514285	contig_6208_pilon	-	3076	7	Intergenic	novelGene_52981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_6	196.876794524449	850	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	292	663	383584	365189	TRUE	25	AAGTTTGTGTGGACTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGDYDYLIKFLALGDSGVGKTSVLYQYTDGKFNSKFITTVGIDFREKRVVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISQLQMHCIL	453476	354697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_383431_383607_420587_420701_453320
514286	SIRV6	+	1490	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	36	2	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514287	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514289	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514290	SIRV6	+	514	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1439	517	10	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514291	contig_15063_pilon	+	1484	5	Intergenic	novelGene_12862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2532.75298588315	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	236	742	34808	35888	TRUE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	28165	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35844_36158_36266
514292	SIRV6	+	581	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8720	1	71	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGAAGGTGAGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514293	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	16	1425	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28148	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514294	SIRV6	+	286	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	564	6	391	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTATCTGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1694	2534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
514295	SIRV6	+	912	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	317	649	2002	10736	TRUE	30	TGGAAATTGGCGATGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514296	SIRV6	+	627	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	179	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106
514297	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514298	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514299	SIRV6	+	499	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	347	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740
514300	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514301	SIRV6	+	689	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	342	100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	180	543	28	570	1673	10736	TRUE	30	TATTTAGGTATAGTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1645	11068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1727_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514302	SIRV7	+	2085	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCACTTAATTTGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	114938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3113_43026_43083_114683
514303	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_13595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_4	3392.44339488517	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	202	1344	34808	39538	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
514305	SIRV6	+	898	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	172	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	147	638	1733	10736	TRUE	35	TAATGGAAATTGGCGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514306	contig_18272_pilon	-	3002	9	Intergenic	novelGene_6986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	444	junction_7	411.632098329321	1245	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	182	1540	262678	122209	FALSE	30	GAAATGATGACACTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262859	120746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184551_262660
514307	SIRV6	+	623	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	379	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514308	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_9168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	70	AAAATTAGAAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514309	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514310	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514312	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_9950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514313	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_8594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26354	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514314	contig_12622_pilon	-	2102	11	Intergenic	novelGene_5942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1511.6048590819	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	506	1264	1588902	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1589792	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523
514315	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514316	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	19	1213	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514317	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514318	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_10574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	48	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	234	1472	34808	39515	FALSE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514319	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514320	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	93	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514321	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	75	480	25	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514322	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514323	contig_13707_pilon	-	2319	12	Intergenic	novelGene_43562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	699.430996602427	342	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	194	1285	274534	270728	FALSE	35	ATATTTACAAAAGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275551	269693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275230_275442
514324	SIRV6	+	504	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	562	8183	389	608	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514325	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514326	SIRV6	+	506	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	216	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACGTCGTGGGACGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2028_2470_2621_2740
514327	contig_1450_pilon	+	3007	22	Intergenic	novelGene_27351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	527.572212980647	4	44	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	867	2604	206	2809	244426	355748	FALSE	80	AAAAAGAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKVCTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243350	355946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325740_329058_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349010_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
514328	contig_6102_pilon	-	2994	7	Intergenic	novelGene_32121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	269.439799501773	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	2021	2836	819332	816763	FALSE	10	CAGATCTGTCTGCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYDLPQVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_820391_820920_821096_821337
514332	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_14125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	182	1354	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34626	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514334	contig_15063_pilon	+	1394	6	Intergenic	novelGene_10341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	237	1085	34808	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
514335	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514336	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514337	contig_8317_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_19416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16389	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
514338	contig_10159_pilon	-	3591	9	Intergenic	novelGene_30780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_8	98.8926185314152	452	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	793	2052	353226	317967	FALSE	60	ATAAAAACTGATACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642214	316427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_431854_431937_456756_456901_597817_597913_641956
514339	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	233	697	34808	35848	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRPR	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35376_35839_36158_36266
514340	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514342	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	13	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514343	contig_15063_pilon	-	1512	4	Intergenic	novelGene_13328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514346	SIRV6	+	627	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
514347	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514348	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_12223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	219	1454	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27552	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514349	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514350	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514351	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514353	contig_5023_pilon	-	2875	11	Intergenic	novelGene_7314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1492	1827	609714	607291	FALSE	55	AGCTAATCCACACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGANTGLLRGATNRTNPFLLVDCFSKGLGNICAFQPTKNLDKLIKADPPIFVQITCSHQVFCNFSHSITRQRQAGSLEQVIQLIAADVSIAISIYFGKSFSELHHFFIGH	630785	606242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629281_630190
514354	SIRV6	+	1461	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	65	2	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	AATTATGGATTTAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514355	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514356	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514357	contig_3956_pilon	+	2035	11	Intergenic	novelGene_15039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	106	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	81	1685	1281682	1290665	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKSPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287426_1290555
514358	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_11674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514359	SIRV6	+	817	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	546	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514360	SIRV6	+	554	5	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	0	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGTTGAAGCTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1180_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514361	SIRV6	+	474	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1454	551	25	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2541	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
514362	contig_233_pilon	-	1792	10	Intergenic	novelGene_14588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1478.45300363272	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	60	1364	109959	78568	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCCSLWWDCSSSGLIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQVCRELGST	126941	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78596_78984_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99858_109914_109976_126898
514363	contig_8823_pilon	-	3558	1	Intergenic	novelGene_53074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70288	66730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_66700_70300
514364	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514365	SIRV2	+	279	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	353	-109	-353	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCGAAGCCACTAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
514366	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514367	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514369	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_8759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514370	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514371	contig_15063_pilon	+	1375	6	Intergenic	novelGene_11505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	230	1078	34808	36494	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27139	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
514372	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514374	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514376	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514377	contig_8772_pilon	+	1712	8	Intergenic	novelGene_21092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4570.98959053012	354	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	142	1395	15355	23105	FALSE	5	TCTTGCTGTGTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15213	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15832_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
514378	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514379	SIRV6	+	566	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-318	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	109	330	35	364	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1967	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2615_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514380	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_10442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514381	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	190	1365	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514382	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514383	SIRV6	+	1491	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	29	8	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514384	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514385	contig_11130_pilon	-	2557	5	Intergenic	novelGene_53089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	729	junction_4	827.675170281192	2113	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTCATGGGTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
514386	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514387	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514388	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514389	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_10687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	233	1399	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPMLTAISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36122_36236
514390	contig_15063_pilon	+	1474	6	Intergenic	novelGene_13947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	25	AGGGAGTGCCACCTACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514391	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514392	contig_1516_pilon	+	2689	12	Intergenic	novelGene_49983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	1146.96080617826	3261	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	453	2048	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335194	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_336185_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
514393	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_12628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514394	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514395	SIRV6	+	488	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1405	577	20	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2492	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514396	SIRV6	+	767	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	565	12	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGAGAGTTAGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514397	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514399	contig_15063_pilon	+	1416	5	Intergenic	novelGene_12304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1404	13	1416	28164	36652	FALSE	15	TGCTACTGACCACTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYYGMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANT	28151	36652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514400	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514401	contig_15063_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_9262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	242	1276	34808	39605	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWIP	27127	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36516_39597
514402	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514403	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_9937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	238	1041	34808	36183	TRUE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLVG	27131	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36195_36319
514404	contig_4469_pilon	+	3019	6	Intergenic	novelGene_21949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	300.342071644983	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	242	1027	751887	755521	FALSE	15	GAGTCTCCTGCATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIPSAQPPPACLPKAPGLEPGDLPGMDFAHMYQVYKSRRGIKRSDDSKETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELTLKHVKALTNLIDQQQQKILALQSGLQAGELSGRNVDAGQEMFCSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKENWRRVTCAVSSRTSKVIMDAGLPREKGSALLSKNPKNPPPKRAECSFQMMKAISLAVT	751645	757513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752204_752461_752570_753495_753620_754984_755209_755341
514405	SIRV6	+	723	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	546	-441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514406	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514409	contig_9995_pilon	-	4053	7	Intergenic	novelGene_47699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_6	667.036918018786	1115	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	110	2191	328392	297529	FALSE	65	ATTTATAAAAATTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGSHQIDFQVLHDLRQKFPEVPEVVVSRCMLQNNNNLDACCAVLSQESTRYLYGEGDLNFSDDSGISGLRNHMTSLNLDLQSQNVYHHGREGNRMNGSRTLTHSISDGQLQGGQSNNELFQQEPQTAPAQVPQGFNVFGMSSASGASNSAPHLGFHLGSKGTSNLSQQTPRFNPIMVTLAPNIQTGRNTPTSLHIHGVPPPVLNSPQGNSIYIRPYITTPSGTARQTQQHSGWVSQFNPMNPQQVYQPSQPGPWTTYPTSNPLSHTSAQQPNQQGHQTSHVYMPISSPTTPQPPTIHSSGSSQSSAHSQYNIQNISTGPRKNQIEIKLEPPQRNNSSKLRSSGSRTSSSSSSVNSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPAVSPGVVSPTFELTNLLNHPDHYVETENIQHLADPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARGPHFNPSAIHNFYDNIGFVGPVPPKPKDQRSTIKTPKNQDTEDDEGAQWNCTACTFLNHPALIRCEQCEMPRHF	379527	295666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297672_299626_299708_300994_301089_301628_301790_321093_322595_328290_328481_379506
514410	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_8770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514412	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	24	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514415	contig_11285_pilon	-	2799	25	Intergenic	novelGene_5663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	440.217906900157	2151	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	30	2606	798530	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLGLLVFLQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794488_794619_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795411_798342
514416	contig_12873_pilon	+	2176	7	Intergenic	novelGene_27130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	1182.41673420725	195	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1108	1599	17896	19855	FALSE	30	AAATTTGTAGTATTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15898	20432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
514417	SIRV6	+	585	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	864	577	-334	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	51	383	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1951	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514419	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_13079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	206	1381	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34602	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514420	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_11670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514421	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514422	contig_15063_pilon	+	1662	7	Intergenic	novelGene_10156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	TCCCAAGTGCTGCTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514425	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	14	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514426	SIRV6	+	424	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGCACTTGTCGTGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1856_2027_2470
514427	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514429	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514431	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514432	SIRV7	-	2454	4	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	0	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	96	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147918	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3163_114680_114989_147608
514433	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514434	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514435	contig_7321_pilon	-	3540	14	Intergenic	novelGene_53115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_2	151.161225108595	417	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	72	1799	208319	114374	FALSE	15	TGAATTTTTTTTCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	208390	112632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
514436	contig_15063_pilon	+	1665	6	Intergenic	novelGene_14040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	195	1322	34808	38994	TRUE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	34613	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
514437	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514438	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514439	contig_12622_pilon	-	2429	13	Intergenic	novelGene_5934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	57	1589	1590968	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591024	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
514440	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514441	SIRV6	+	599	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	837	590	-361	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514442	contig_15063_pilon	+	2193	6	Intergenic	novelGene_9141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3022.71575904848	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1387	1938	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514443	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514445	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514446	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514448	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514449	contig_16098_pilon	-	2287	14	Intergenic	novelGene_46097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	2260.38548055637	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	983	2077	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	468580	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_461682_461766_462058_462470_466710_466868_467130_467275_468167_468204_468450
514450	SIRV6	+	977	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	550	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514451	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514452	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514453	SIRV6	+	551	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8724	-10	67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGCCCGAAGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514454	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514455	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514456	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514457	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	3776.06486820458	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAYFGYWGPGTQVTISLESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	25962	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26016_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514458	SIRV6	+	465	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCAAGTCGTAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2478
514459	SIRV6	+	769	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	378	223	205	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	119	610	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1508	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514460	SIRV6	+	938	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-1	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	28	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514462	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514463	SIRV6	-	527	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACGACTTGACTGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11354	2561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
514466	contig_6980_pilon	+	2067	9	Intergenic	novelGene_36037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	749.150925631812	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	165	1001	356720	372822	FALSE	30	TTACTGTGTCATTGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDGTKHYEKPDGSYRSRGLIKVKLQWKLS	346108	373888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_353050_353141_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_372735
514467	SIRV6	+	559	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8180	337	611	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514468	SIRV6	+	733	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8170	1	621	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTATTGTATGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514469	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_9851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514470	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514471	contig_12622_pilon	-	2376	12	Intergenic	novelGene_5948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2066.51902387398	3	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	18	1067	1590968	1588627	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSESECGVVARGGGAHHSQGPELWVLMPALPLVCDLRVTLLFSRPNVLISEVRREGLDYRQSVRLLTLSTSG	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586380_1586740_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
514472	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_12761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	1	1413	28164	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514473	contig_15219_pilon	+	3107	5	Intergenic	novelGene_40811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	207.196012268576	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	126	722	19617	23538	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVSDDLSSMSSYHKAT	19491	25923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346
514475	SIRV6	+	510	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8790	2	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAGTCAAGTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514476	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514477	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRYGLLGPRNHGHCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514478	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27115	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514479	SIRV6	+	712	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	22	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514480	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	11	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514481	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514482	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	115	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514483	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514485	contig_1244_pilon	-	2004	13	Intergenic	novelGene_38004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	902.721390974105	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	130	1581	948448	923211	FALSE	20	TTATGCTTTTTATCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948577	922787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
514486	SIRV6	+	774	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	547	-14	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514487	contig_15063_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_12189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514489	contig_15063_pilon	+	1459	7	Intergenic	novelGene_9874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	239	1207	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_38975_39092_39506
514490	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514491	SIRV6	+	621	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	880	525	-318	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	35	367	2002	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1967	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514492	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514493	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514495	SIRV6	+	370	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10376	80	1139	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11376	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
514496	contig_12873_pilon	+	2873	4	Intergenic	novelGene_27158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_1	1104.03693577505	265	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1463	1930	17896	19334	TRUE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15955	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19703_19851
514497	contig_15063_pilon	-	1557	5	Intergenic	novelGene_9009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514498	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514499	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514500	SIRV6	+	802	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	34	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
514501	SIRV6	+	590	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8711	1	80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGTGGCTCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514502	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514503	contig_1406_pilon	+	2617	5	Intergenic	novelGene_25574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	1448	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	83	478	2173822	2185260	TRUE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPRISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173739	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2186335_2186404
514504	contig_6215_pilon	-	2747	9	Intergenic	novelGene_21194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	766.993959803465	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	583	1239	233768	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPGLKKWKKGIRDVGMQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243076	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
514505	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514506	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514507	contig_3948_pilon	-	2529	7	Intergenic	novelGene_53212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	1476	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	66	872	866476	840803	FALSE	20	TTCAAGAGTGTCATGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869633	839145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
514508	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514509	contig_5020_pilon	+	1498	8	Intergenic	novelGene_27877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	930.938959835056	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	352	1113	122915	125701	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTALPWASTAALATVPLPCSRRRGPGPSTKGSCPPFFAWVPGMW	118473	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_125006_125091_125657
514511	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_11460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	23	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	231	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514512	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514513	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514517	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514518	contig_2596_pilon	+	4811	26	Intergenic	novelGene_53498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_1	110.63991323207	451	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1273	3822	367	4188	994680	1048715	FALSE	25	CATGTAATATTTTGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRKAFLVEHNLVLAERKSPEISEQVVQWPAIMYKSLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDVLKPIQDVNNLRLSLSDNQNVSKEFQALIVKHLDESHLLQGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATIVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIHVEVIHDKFVTCGNSTRIGAVKRKSSENNGNLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTVVFKEILLGCTAATPSSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEELSSCLNIKPEILRTKPDVCKAGLLSSKFSQIGTGDLKTLSEPKSSCTQLKTNTDQENRLESVIQPSAGPLKECLPTKASSKAELEIANIPELQKYLEHIPSTSNVRVALSNKPEEKACVNSDSPNNCVGKKVEPSTLGCRSQNLKESSVKVDKESCCTRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDTEAIGLWLPLIKNVVGTDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVRGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKKKNCQKGAAYKIFSWIRCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDIKQTSLAGEKPALGPGPQQNPSVLEQAAVGGDAASKPASSTRPACPASTSPLTWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCDQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP	993804	1049338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_993982_994490_994707_1003261_1003418_1007578_1007690_1010584_1010688_1011349_1011475_1011727_1011801_1011907_1011997_1019132_1019297_1021945_1022473_1025546_1025752_1027146_1027362_1030153_1030307_1030438_1030535_1030879_1031008_1032504_1032701_1033983_1034157_1034520_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046105_1046180_1046321_1047742_1047920_1047994_1048130_1048634
514519	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_14026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	195	1370	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514521	contig_10324_pilon	+	3478	22	Intergenic	novelGene_7727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1120.04921539098	1	98	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	5	1726	51839	76070	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKSPSTAPTSAPQPGTPSSCS	51834	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75874_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
514523	contig_5936_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_53552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTTTGGTGTGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100511	101521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_100500_101500
514524	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514525	contig_2054_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_51660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	563	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGAGAAAGTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19457	16461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_16500_19500
514526	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3751.57737491845	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	200	1432	34808	39510	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKV	34608	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39094_39506
514528	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_11029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3682.08194805904	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	233	1465	34808	39510	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKV	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39094_39506
514529	SIRV6	+	687	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-437	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1848	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514530	SIRV6	+	504	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	520	8503	347	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514533	contig_3386_pilon	-	3285	6	Intergenic	novelGene_34503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_5	693.652074169753	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1268	2035	406857	404773	FALSE	15	ACAGTCTTGTGGTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVTESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412175	403522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_407838_409398_409607_412096
514534	SIRV6	+	794	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	29	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514535	SIRV6	+	959	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	564	5	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514536	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514538	SIRV6	+	1033	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	493	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	206	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514539	SIRV7	-	1832	3	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	104845	8	71660	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGCGTAATTAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43078	1011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028
514540	SIRV6	+	953	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	574	1	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514541	SIRV5	+	485	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7355	-5	38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGTGGTTTATAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
514542	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514543	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514544	SIRV6	+	860	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	402	548	186	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	138	629	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1489	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514545	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	28	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514546	contig_14970_pilon	+	2096	9	Intergenic	novelGene_44961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4589.65932831621	9	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	133	597	136145	191822	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISKCGSLLP	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191800_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
514547	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514548	contig_4845_pilon	+	3022	13	Intergenic	novelGene_53615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	322	junction_1	281.785921499914	1160	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	110	1429	205637	221846	FALSE	20	CATCTGGCTGGAGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGCLPSFDRRGKGSSGRARFLFSFCRVRLWGTGLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	201994	223439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657
514549	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514550	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514551	SIRV6	+	573	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8711	18	80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGTGGCTCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514552	contig_10246_pilon	+	2730	9	Intergenic	novelGene_46899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	235.845255146251	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	71	553	144696	169725	TRUE	45	AAACTTTTCAATAAAACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFRFLMRWQIMTYQLQLTSF	140729	186362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168277_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176322_184553
514553	SIRV6	+	491	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-8	8776	-2	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCGTAGGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514554	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28171	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514556	contig_3747_pilon	+	2118	5	Intergenic	novelGene_24925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	60	716	202422	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMSSFLLLGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202362	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202851_203128_203228_203386_203498_203651_203768
514557	SIRV6	+	711	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8167	-11	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514558	SIRV6	+	1478	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	23	-10	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514559	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	221	1459	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27148	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514560	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514561	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	107	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514562	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514563	SIRV6	+	415	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	94	-11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514564	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	42	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514565	SIRV6	+	959	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	517	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514567	SIRV6	+	383	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10354	89	1117	47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAAGTTTGCGTTTGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11354	11737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
514568	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28177	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514569	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	9	1421	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514570	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514571	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514572	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514574	SIRV6	+	736	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	343	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	27	359	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1646	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514575	contig_7915_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_42969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACATTGAAAATCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108936	109707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_108900_109700
514579	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514580	SIRV2	-	482	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1155	0	-8	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4740	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
514581	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514582	contig_12074_pilon	-	3105	13	Intergenic	novelGene_53753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_9	410.268171105464	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1976	2854	33790	30226	FALSE	20	CATATTTAATGCCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45852	29974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
514585	contig_16594_pilon	-	3627	6	Intergenic	novelGene_53859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_5	1542.27087115072	247	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1144	2130	272836	132969	FALSE	50	CTTCCCTATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGKELGFINE	306356	131471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_306046
514586	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514587	SIRV6	+	769	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	572	575	356	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	74	565	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1659	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514588	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	165	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTTATAGTTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514589	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	4	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
514590	contig_13707_pilon	-	2741	11	Intergenic	novelGene_43552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	554.13612046139	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	60	725	275489	273324	TRUE	30	ATTTACAAAAGTGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYR	275548	269691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
514591	contig_11512_pilon	-	2791	7	Intergenic	novelGene_43294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	361.369155665874	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	325	843	378234	367967	FALSE	30	ACGTACGGAACCCTTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADREAVTGLLATAASQARPCPAFEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409387	366018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_409314
514593	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514594	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	43	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514595	contig_5018_pilon	-	1967	8	Intergenic	novelGene_47046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	417.226459332755	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	70	1407	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGAWARAVHCGGYGGTDSPANSDLVMYSQDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
514597	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	222	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28179	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514598	SIRV6	+	722	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	108	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	29	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	148	447	93	539	1733	3120	TRUE	30	TATAGTAGATTGCGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPWYVLSYL	1640	11076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2837_3106_3165_10724_10819_11031
514599	SIRV6	-	406	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCCCCATAGTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11745	11339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11700
514600	contig_13787_pilon	-	2142	8	Intergenic	novelGene_40613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	723.306382143127	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	228	998	205032	159121	FALSE	20	TACATGTCTTTTGGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIYHQENLFKIVMLCNFKYMNAVYVSSSCPIKMSHLSRLQISSNVSNIFKI	205259	157976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159272_171818_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
514601	contig_15063_pilon	+	1418	6	Intergenic	novelGene_11908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3793.00870550016	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	224	1252	34808	36632	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27143	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
514602	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514603	contig_8317_pilon	+	413	2	Intergenic	novelGene_19356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
514604	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514605	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514607	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514608	contig_8317_pilon	+	407	4	Intergenic	novelGene_19242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	69	407	14294	15107	FALSE	5	CTGATTGTTGCTGCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAV	13257	15107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
514609	contig_15063_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_10612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514610	contig_5643_pilon	+	2118	16	Intergenic	novelGene_39000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	801.04738658556	4320	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	176	1906	631341	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631165	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634798_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636521_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
514611	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514612	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514613	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	105	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	231	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
514614	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514615	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26348	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514616	contig_11656_pilon	+	3640	20	Intergenic	novelGene_54003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_14	154.217621536074	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	164	1687	465719	527478	TRUE	30	TTAAAAATTGTCTCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGIRK	464941	537350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_527470_527581_527842_527893_528001_528687_531208_531337_535319_535411_536453
514617	SIRV6	+	629	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9662	146	512	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTAAAATGGGGTTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
514618	SIRV6	+	704	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	262	337	101	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514619	contig_15063_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_13906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	25	AACCATGTCTGTGGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514621	SIRV6	+	1539	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-13	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27044	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514622	SIRV6	+	792	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514624	contig_5280_pilon	+	2492	10	Intergenic	novelGene_52580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	7	junction_7	722.551053345961	387	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	37	1437	38343	78098	FALSE	30	CTCACGTAGTATTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPETSPAAQNPIKAHDFAARATPTAQRSSTAKASFTQSLSTTQNSTALHAPAAKGLQTTQTSAPITATRGLPVPRATTRFHATSTSKGRGTLPSSGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38306	79153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_58735_59015_62043_62065_78042
514625	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514626	contig_6980_pilon	+	2039	9	Intergenic	novelGene_36047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	828.227135211109	6	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	603	938	368366	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346119	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356852_361116_361226_362331_362380_364940_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
514628	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	175	11	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTTGTGGTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514631	SIRV6	+	798	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	520	-11	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAGTAAGACTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	10811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514633	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514634	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514635	SIRV6	+	463	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	717	8179	-438	612	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAATCACCGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1847	3152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514637	contig_8357_pilon	-	3002	6	Intergenic	novelGene_39762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_4	511.993203079885	609	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	269	1909	891622	883484	FALSE	45	TATTTAAGACTATCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQLAEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKVTHVEPWEKGSRKTAGQTGMCGGVRGVGTGGIVSTAFCLLYKLFTLKLTRKQVMGLITHTDSPYIRALGFMYIRYTQPPTDLWDWFESFLDDEEDLDVKAGGGCVMTIGEMLRSFLTKLEWFSTLFPRIPVPVQKNIDQQIKTRPRKIKKDGKEGAEEIDRHVERRRSRSPRRSLSPRRSPRRSRSRSHHREGHGSSSFDRELEREKERQRLEREAKEREKERRRSRSIDRGLERRHSRSRERHRSRSRSRDRKGDRRDRDREREKENERGRRRDRDYDKEKGNDREKERERSRERSKERRSRGEVEEKKHKDDKDDRWHRDDKKDSKKEKKHSRSRSRERKHRSRSRSRNAGKRSRSRSKEKSSKHKNESKEKSNKRSRSGSQGRTDSIEKSKKREHSPSKEKSRKRSRSKERSHKRDHSDSKDQSDKHDRRRSQSIERESQEKQHKNKDETV	891890	882390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_887117_887179_887257_887410_887717_887787_891346
514638	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514639	contig_10331_pilon	+	3866	5	Intergenic	novelGene_54199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_2	107.143303570499	1554	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	129	566	628081	639267	FALSE	40	TTTCCCAGAAAAATAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRNSAIAAGVCGALFIGYCIYFDRKRRSDPNFKNRLRERRKKQKLAKERAGLSKLPDLKDAEAVQKFFLEEIQLGEELLAQGEYEKGVDHLTNAIAVCGQPQQLLQVLQQTLPPPVFQMLLTKLPTISQRIVSAQSLAEDDVE	627952	642567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_628202_631089_631137_633179_633262_637502_637646_639222
514640	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514642	contig_15063_pilon	+	1590	9	Intergenic	novelGene_10590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3017.52191375639	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	234	926	34808	36133	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_35986_36049_36149_36266_36403_36466_36600_38975_39092_39506
514643	SIRV6	+	669	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
514644	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514645	contig_7293_pilon	+	2028	3	Intergenic	novelGene_54265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4936	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATAAAGGAGACACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335737	338186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336245_336358
514646	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514649	contig_15063_pilon	+	1562	8	Intergenic	novelGene_11894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	2761.01596207938	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	227	1078	34808	36494	TRUE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27142	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36330_36486_36600_38975_39092_39506
514650	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514651	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514652	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514653	SIRV6	+	863	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	388	559	172	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	152	643	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514654	contig_14219_pilon	-	2785	11	Intergenic	novelGene_54370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_1	786.248058821133	1694	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	177	1301	1084399	1047262	FALSE	25	CACAAGCTGTATTCCGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLLNLNHLGLILLVLHYFVEFLFHISRLFYFSDEKYQKGFSLWAVLFVLGRLLTLILSVLTVGFGLARAENQKFDLSAGNFNVLAVRIAVLASICITQAFMMWKFINFQLRRWREHSAAQAPAVKKKPTVTKGRSSRKGTENGVNGTVTSNGADSPRNRKDKSS	1084575	1045777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
514655	contig_15063_pilon	+	1672	6	Intergenic	novelGene_14127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	179	1417	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34629	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514656	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514657	SIRV6	+	789	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	480	-441	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514658	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514660	contig_8772_pilon	+	1866	9	Intergenic	novelGene_21068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	319	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	150	1550	15355	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15205	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
514661	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514662	SIRV6	+	563	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	355	8503	182	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514665	contig_17936_pilon	+	2000	11	Intergenic	novelGene_29895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	81	1364	50646	121021	TRUE	25	AGGAGATCCTCTAGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50565	126361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
514666	contig_6980_pilon	+	2013	10	Intergenic	novelGene_36018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	105	1001	356720	372790	TRUE	25	TGTTACTGTGTCATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346078	373886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_372853_372936
514668	SIRV6	+	578	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	28	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
514670	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514672	contig_15063_pilon	+	1489	5	Intergenic	novelGene_12253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514674	contig_5023_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_7390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGATCGCCAGGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645279	645724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_645300_645700
514675	SIRV6	+	989	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	537	2	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514676	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514678	SIRV6	+	541	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1383	546	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514679	SIRV6	+	972	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11026_11100_11200
514680	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514681	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	7	1479	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514682	SIRV6	+	422	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10401	3	1164	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAGAAGACCGGGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11401	11823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514683	contig_3986_pilon	-	2909	13	Intergenic	novelGene_52677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_7	89.2874182377089	432	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	198	1700	60653	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153880	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
514684	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514685	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514686	SIRV6	+	343	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	94	164	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
514687	SIRV6	+	533	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	521	8195	348	596	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514688	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514689	contig_13592_pilon	+	2792	15	Intergenic	novelGene_33710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	42	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	513	2441	256608	269322	FALSE	20	TGTGTGTTATGGGGTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249305	269673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
514690	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514691	contig_6980_pilon	+	2213	9	Intergenic	novelGene_36038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	677.851465569707	396	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	480	1112	364894	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346108	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362583_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
514692	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514693	SIRV6	+	552	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-440	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1845	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514694	SIRV6	+	643	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	158	487	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034
514696	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514697	SIRV6	+	831	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	585	500	369	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514698	contig_15063_pilon	-	1727	7	Intergenic	novelGene_10528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	982	1305	35891	35108	TRUE	25	GAGGTAGTCACATTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	27134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
514699	contig_8317_pilon	+	452	2	Intergenic	novelGene_19360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
514700	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514702	contig_15063_pilon	+	1486	5	Intergenic	novelGene_12863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514703	SIRV6	+	497	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8803	2	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514704	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_11264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514705	contig_15063_pilon	+	1434	5	Intergenic	novelGene_10344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	237	1292	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34895_35123_35380_35839_36158_36266
514706	SIRV6	+	746	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	523	-441	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514707	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514708	contig_11285_pilon	+	2042	12	Intergenic	novelGene_5636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_1	459.873590248738	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	369	1724	767140	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766123	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
514709	contig_15063_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_12636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514710	contig_12427_pilon	-	1999	7	Intergenic	novelGene_40545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	162	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	200	823	522337	506035	TRUE	35	ACAAAGATCATCTGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578151	504678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504806_504985_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
514711	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514712	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514713	contig_5189_pilon	-	2348	11	Intergenic	novelGene_34849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
514715	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514716	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514717	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	255	1427	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26341	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514718	contig_12357_pilon	+	1995	11	Intergenic	novelGene_6130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	737.455008797147	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	364	1314	30982	53235	FALSE	55	AGAATAGAAGAAATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	26076	53916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30920_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
514719	contig_9177_pilon	-	2380	15	Intergenic	novelGene_32542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	857.159249843246	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	845	1939	4646	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	8573	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6575_6713_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487
514720	SIRV6	+	578	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	281	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCTGGTACGTTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2627_2743
514721	contig_15063_pilon	+	1568	5	Intergenic	novelGene_12326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	12	1424	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514723	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514724	contig_15063_pilon	+	1885	8	Intergenic	novelGene_8432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3690.10814508857	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	174	1646	28164	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	2640	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_2798_28147_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514725	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514726	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514727	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514728	contig_504_pilon	-	2980	11	Intergenic	novelGene_54435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGCGCTTCCCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238586	220177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_220237_222773_222959_227466_227652_228468_228552_230989_231052_231900_231949_232816_232967_234124_234186_234983_235106_236050_236134_236644
514729	SIRV6	+	661	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737
514731	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514733	SIRV6	+	740	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGAGAGTTAGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2468_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514735	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_8777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514736	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_9653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514739	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514740	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_8906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514741	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	230	697	34808	35848	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLR	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35843_36158_36266
514742	contig_12923_pilon	-	2808	17	Intergenic	novelGene_30100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.39496499438	96	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	53	2224	93727	48997	TRUE	35	AAGCATTGAATTTTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101220	45355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45564_46055_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
514745	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514746	SIRV6	+	904	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	34	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	257	790	1733	10780	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1088	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11031
514748	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514749	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_9939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514750	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514751	contig_15063_pilon	-	1511	5	Intergenic	novelGene_12364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	754	1077	35891	35108	TRUE	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36753	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514752	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514753	SIRV6	+	524	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10295	7	1058	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGCTAGAAGACCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11295	11819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
514754	SIRV6	+	343	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847
514756	SIRV6	+	549	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	178	266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1618_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514757	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514758	contig_10437_pilon	+	2830	5	Intergenic	novelGene_38145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	167.166832834746	2598	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAAAAGCGTTGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156677	164083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859
514760	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514761	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	247	1422	34808	36661	FALSE	70	AAAATTAGAAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514762	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514763	SIRV6	+	810	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	223	164	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514764	SIRV5	+	263	4	ISM	SIRV5A	SIRV502	1984	18	1	8668	1	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
514766	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514767	contig_8045_pilon	+	1885	4	Intergenic	novelGene_35389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	1367.60325630889	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116136	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_118243_118527
514768	SIRV6	+	477	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	8168	-441	623	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514769	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514770	SIRV6	+	733	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	341	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	177	534	89	622	1733	10780	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIIIDERVEVEVVQQES	1644	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10732_10819_11034
514771	contig_15063_pilon	-	1549	5	Intergenic	novelGene_8473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	GCCACAGTGATGTGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	26340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514772	SIRV6	+	915	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	411	484	195	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	129	620	1733	10736	TRUE	40	ATCAACTCACCATAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1498	11341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514773	contig_12103_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_54464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTCTCCCAGTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28552	29119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12103_pilon_+_28600_29100
514774	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_9703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514775	contig_15063_pilon	+	1625	8	Intergenic	novelGene_9282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3456.16527500686	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	242	1150	34808	36504	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCPGLLLHLQHPERV	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36351_36460_36600_38975_39092_39506
514776	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514777	SIRV6	+	812	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	421	577	205	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	119	610	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1508	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514778	SIRV6	+	1019	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	509	0	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514779	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514780	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_10575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514781	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514782	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_10541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514783	contig_20165_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_54486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1049	1459	120344	120754	NA	20	TTTTTGAAATGGTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTTPPLETPEAIAPPFEPPEVMAIPFEPQAARLLVSLVSSASASVSCGLLALGPHAHICPAGASVPKLCSSTGVSARRHPTPPGSLHRTGTQLSHFAGRLQCRLALVSWFCCCRFSAVTSTPLSIQSFKTTSTF	119295	121439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_119300_121400
514784	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514786	SIRV6	+	658	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2033	186	15	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGACTTGCGTCGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3120	11651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
514787	SIRV7	-	1785	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	33	-638	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	47	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACTATGGGCGTGGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147885	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147607
514789	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	16	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514790	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27559	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514791	contig_1867_pilon	-	353	3	Intergenic	novelGene_54543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGAATTTATTTCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385403	373826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_373869_379091_379204_385204
514792	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514794	contig_854_pilon	+	4196	30	Intergenic	novelGene_36530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2864.84103104776	1	203	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1035	3105	1092	4196	1679334	1705420	FALSE	15	GCCACCCTGCACGCCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMVLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQI	1612809	1705420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672902_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680810_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704499_1704689_1704893_1704999_1705285
514795	SIRV6	+	924	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	601	3	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	30	ATTGTATATGCGGTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514798	SIRV6	+	344	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	165	-11	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTTATAGTTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514799	contig_11752_pilon	+	1971	7	Intergenic	novelGene_37564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1534.6126185096	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	131	1090	84194	94417	TRUE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84063	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94430_105597
514800	contig_15063_pilon	+	1926	7	Intergenic	novelGene_13036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	436	1671	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30081	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514801	SIRV6	+	380	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	95	10	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
514802	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514803	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514804	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514805	contig_18794_pilon	+	3716	9	Intergenic	novelGene_54646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_4	418.017269380106	160	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1182	1739	160518	166900	TRUE	15	TATATTTGGGTGGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISVLPMEVLMYIFRWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRGCIKLVPYTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYNCSKLSE	157921	172953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_159080_160494_160595_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_168038_168360_168455_169970_170123_172359
514806	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514807	contig_16622_pilon	-	2658	8	Intergenic	novelGene_48421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_4	789.203835442752	1622	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	727	1338	115540	112952	TRUE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQVWGFCRVLGAEDPGGQLWGAMEPATHFPGIPKAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121966	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115559_118811_118884_121330
514808	contig_15063_pilon	+	1573	5	Intergenic	novelGene_12547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3175.15750593573	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	6	1433	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSDIDLNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35367_35808_36158_36266
514809	contig_6980_pilon	+	2027	9	Intergenic	novelGene_36016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	654.175423242879	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	108	926	356720	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346075	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370563_371430_371523_372735
514810	contig_7775_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_37518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473030	473471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473000_473500
514812	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514813	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_8760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514814	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514815	contig_5018_pilon	-	1883	9	Intergenic	novelGene_47058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	5942	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	73	1323	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
514816	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	513	-441	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514817	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514818	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_9143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	243	755	34808	35888	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514819	contig_9345_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_24636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	9813	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	276	857	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001350	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
514820	contig_8538_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_5102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842933	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
514821	SIRV6	-	715	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-617	434	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	24	4	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAATTTCCCGACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	1110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2826_3102
514822	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
514823	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514824	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514825	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514827	SIRV6	+	547	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1423	500	-6	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514828	SIRV6	+	394	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	2	1193	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514829	contig_3975_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_54953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	308	613	2356390	2356085	NA	40	CTCTAAACGCCACAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAHTHTHTIPPNYTNQSMSKGKGLLWLLIKTLGVDSRSELRGYAVLIFSLCERSLLSCSEIKNFGEYHHFHFKILVTISKSIILFCFLGWEEENLHICI	2356697	2354429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2354400_2356700
514830	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514831	contig_15063_pilon	+	1644	8	Intergenic	novelGene_10184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3646.68247891708	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	238	1269	34808	38976	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPNIHLHRGPRGPVPPGDREDRGQVH	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36447_36526_36600_38975_39092_39506
514832	contig_15087_pilon	+	2259	3	Intergenic	novelGene_37278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1545.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	36	464	284653	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284617	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_301237_301421_301788
514833	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514834	contig_6735_pilon	-	1888	12	Intergenic	novelGene_15680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_11	936.406318532948	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	128	1408	554315	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPEREPGVVVRSWDSESQTHDWSIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568267	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_568198
514835	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_8527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	251	1423	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514836	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514837	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514838	contig_16098_pilon	+	2752	8	Intergenic	novelGene_46082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	817	1365	457607	458873	FALSE	40	AAAGGAATGCAGCCTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARAEGVCSPIFSTQRHLAKSAPSFLYWAQRSDSPSSPWVVVSPFVPARGTTPLSTLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASCGLICSQDALARSHNAMSDFKKLLLLLRGQCWVLVGHGVGGGRFLGRGGRWGRTG	456062	460260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456663_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457907_458404_458621_458707
514839	SIRV6	+	394	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	186	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAAGTCGTAGTCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	2547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1847_2027_2470
514840	SIRV6	+	558	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	229	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATCGTTAGGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2011_2456_2621_2740
514842	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514844	contig_10134_pilon	-	2085	5	Intergenic	novelGene_16205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	719.424075215724	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38621_38740_38817_39584
514845	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514846	contig_5862_pilon	-	4494	5	Intergenic	novelGene_54957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	38.4016601203646	359	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	148	1554	221542	202458	FALSE	30	AAAAATCTGTTTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFRRRTCIILSLFILFIFLLMMGLKALRPNTATFGDPFGLDLLPEFRQQIFHLEKKTDSKKSDKINSETNPKNLKSVEITMKPAKPSELNLEELPPLNYYLHVFYYSWYGNPQFDGKYIHWNHPVLEHWDPRIAKNYPQGRHNPPEDIGSSFYPELGSYSSRDPSVIETHMRQMCSASIGVLALSWYPPDSKDENGEPTDDLVPTILDKAHKYNLKVTFHIEPYSNRDDENMYKNVKYIIDKYGNHPAFYRYKTRTGNALPMFYVYDSYIVKPEKWANLLTTSGSQSIRNSPYDGLFIALLVEEKHKFEILHSGFDGIYTYFATNGFTYGSSHQNWASLKVFCDNYNLLFIPSVGPGYIDTSIRPWNTHNTRNRVNGKYYETALSAALQTRPSLISVTSFNEWHEGTQIEKAVPKRTSSTVYLDYRPHKPGLYLELTRKWSEKYSKERATYASDHQSPGLNALIKV	235262	199517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_203134_203982_204060_215899_216010_220998_221578_235150
514850	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27123	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514851	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514852	SIRV6	+	1523	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	4	1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	768	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514854	SIRV6	+	1505	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	21	2	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514855	contig_16098_pilon	-	1786	8	Intergenic	novelGene_46094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1523.73815309051	11161	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	974	1576	457605	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460521	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458838_460148
514856	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514857	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514859	SIRV6	+	713	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8176	15	615	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACCGGTTATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	3155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514860	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514861	contig_10134_pilon	-	2290	4	Intergenic	novelGene_16216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	1727	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTGTGTCTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39813	32182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38817_39584
514862	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514865	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514866	contig_15063_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_13190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	783	1109	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35836_36156_36264
514867	contig_15063_pilon	+	1453	4	Intergenic	novelGene_13088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514868	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514869	SIRV6	+	973	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	183	524	1673	2560	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1105	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1538_1642_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514872	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514875	SIRV6	+	562	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8177	337	614	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514876	contig_8357_pilon	+	3053	2	Intergenic	novelGene_39714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGAGCTACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473595	477261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_476119_476731
514877	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514878	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514879	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514880	contig_15063_pilon	+	1540	8	Intergenic	novelGene_9660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3470.21586107392	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	240	1091	34808	36494	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_36486_36569_38975_39092_39506
514882	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514884	contig_9345_pilon	-	1851	6	Intergenic	novelGene_24667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	280	792	955353	947957	FALSE	25	AGGCAGTTTTCTAAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001354	946897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949538_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
514885	SIRV6	+	959	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	543	-11	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514886	SIRV6	+	352	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	24	1213	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
514888	SIRV6	+	539	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1390	550	5	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	92	301	2569	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2477	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
514889	contig_10629_pilon	-	2864	15	Intergenic	novelGene_52907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	346.425780548405	1093	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	587	1513	256216	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267925	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_257145_267625
514891	contig_12151_pilon	-	2996	14	Intergenic	novelGene_54976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_13	159.561232704716	804	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	166	2553	1023634	975052	FALSE	35	TACTAATTTTGGCCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	1023799	974608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016743_1023563
514892	SIRV2	+	500	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-749	261	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACAAGTTTTACCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3284	4718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3326_3665_3828_3965_4095_4340_4475_4684
514893	contig_15063_pilon	+	1588	6	Intergenic	novelGene_12466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_5	3673.08575451214	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	8	1333	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	28156	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
514894	contig_15063_pilon	-	1671	6	Intergenic	novelGene_14112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.6	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	970	1293	35891	35108	TRUE	20	TGGCTCTCTGAGGACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	34620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39081_39504
514896	SIRV6	+	977	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	165	497	1673	2560	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1120	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514899	contig_5954_pilon	-	2313	14	Intergenic	novelGene_28617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	278.966181064148	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	648	1952	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960565	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_946214_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
514900	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514901	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514902	contig_6735_pilon	-	1888	13	Intergenic	novelGene_15763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	920.941015574106	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	80	997	564868	543218	TRUE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKVTDL	568277	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543229_544847_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
514903	SIRV6	+	904	10	NIC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-22	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	136	411	225	635	1733	3109	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	1120	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514904	SIRV6	+	854	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	379	577	163	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	161	652	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1466	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514905	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514906	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514907	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514908	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514911	contig_5033_pilon	-	2660	15	Intergenic	novelGene_29043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3900.90955968696	3	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	982	1596	535015	532125	TRUE	20	CCACCAGACCTGGGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531415_531483_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536632_540604_540662_542092_542237_542663_542863_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
514912	SIRV6	+	594	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	364	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1848_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
514913	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_11072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	232	696	34808	35848	TRUE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLR	27137	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35843_36158_36266
514914	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514915	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514916	contig_15063_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_9729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	790	1113	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36789	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514918	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514919	SIRV6	+	278	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10451	97	1214	39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCTTGAAGTTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11451	11729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11700
514920	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16381	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
514922	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514923	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_13142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514924	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514927	SIRV6	+	613	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-439	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1846	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2023_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
514928	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514929	SIRV6	+	457	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-3	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
514930	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514931	contig_5698_pilon	+	2225	7	Intergenic	novelGene_55019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	730	junction_1	590.437314388431	2839	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	FALSE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
514934	contig_12622_pilon	-	2160	12	Intergenic	novelGene_5974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2099.42610418708	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	18	671	1590968	1588575	TRUE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGETLHPERQCGR	1590985	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1589145_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
514936	SIRV6	+	358	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8846	164	-55	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAGTGCAGTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514939	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514941	contig_14925_pilon	-	1630	6	Intergenic	novelGene_55290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	379	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	78	491	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129478	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113179_113222_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
514942	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514943	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514944	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	236	1474	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34610_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514945	SIRV6	+	853	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	171	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1848_2011_2461_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514947	SIRV6	+	1003	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	523	2	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514948	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_14048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	194	1369	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34614	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514951	contig_6735_pilon	-	2062	14	Intergenic	novelGene_15714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	326	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	86	1582	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
514952	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_12585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	6	1481	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514953	SIRV6	+	887	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	118	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCGTTCACAAAGAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	11086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
514955	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514956	contig_7775_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_37520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGTTTAATGAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473056	473476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473100_473500
514957	contig_854_pilon	-	3320	14	Intergenic	novelGene_36178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	218.643531994066	10	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	53	1231	509201	474385	TRUE	40	CGAGAATAAAGCTCATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	509253	470049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471653_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
514958	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_9907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	239	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
514959	SIRV6	+	725	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8167	12	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
514960	contig_15063_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_11875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	30	CAGTAGCTGAGGTAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
514961	SIRV6	+	922	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	524	32	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514962	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514963	contig_2100_pilon	+	1772	12	Intergenic	novelGene_50697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7491	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCACCTCCCCCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1185529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1180284_1182725_1182824_1185422
514965	contig_7119_pilon	+	1917	4	Intergenic	novelGene_40895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	204	1358	137033	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127454	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140043_140634
514969	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_14067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	191	1366	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
514970	SIRV6	+	257	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	344	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1728_1845
514971	SIRV6	+	650	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	72	219	158	376	2002	2780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGESRKSGTRRGTYR	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2625_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031
514972	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514973	SIRV6	+	913	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	577	1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514974	SIRV6	+	488	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8810	4	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
514975	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514976	SIRV6	+	933	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	581	14	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514977	contig_6735_pilon	-	1942	14	Intergenic	novelGene_15658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	893.307351177991	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	86	913	564868	543845	TRUE	30	GAGCTAAATAGTACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQLGLQQRVVHLQSLSL	568283	541979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544975_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
514978	contig_5023_pilon	+	2445	17	Intergenic	novelGene_7207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2137.60343956585	4	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	872	2059	618569	647201	FALSE	20	AGCAATCCTACTCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMDLLQASPLSPSPLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580841	647587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611841_614422_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646940_647063
514979	SIRV6	+	675	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8503	4	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
514980	SIRV6	+	605	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-402	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	92	279	119	397	2002	2844	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPWYVWG	1883	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2856_10697_10819_11031
514981	SIRV6	+	513	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCACTTGTCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470
514983	contig_18272_pilon	-	2862	9	Intergenic	novelGene_6980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	547.020109319575	1192	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	137	1396	184469	122209	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262847	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184493_262734
514985	SIRV5	+	520	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1214	2572	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTGCTACTCTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270	6170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_2316_3298_3405_3483_3641_5380_5451_5543_5627_6111
514986	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_12600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3283.11483198502	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	240	1379	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35872_36158_36266
514987	SIRV6	+	500	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	406	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106
514988	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_12063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	219	1454	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27150	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
514989	contig_7594_pilon	+	2727	6	Intergenic	novelGene_55423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	749.394795818599	126	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	539045	553008	FALSE	40	AAAGTGTTTGGAAAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKVT	538991	555163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953
514990	SIRV6	+	786	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	577	337	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
514991	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_14007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
514992	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514993	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
514994	contig_11720_pilon	+	2281	15	Intergenic	novelGene_43980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_3	325.455160082752	186	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	576	1943	264322	272210	FALSE	30	ACAAATGTTAGTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262282	272548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
514997	contig_4429_pilon	+	2832	11	Intergenic	novelGene_50785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	580	junction_1	277.42604419917	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	39	2114	154531	198515	FALSE	15	ATACCTTTTGTGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVYGEEAAEAAAMAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154492	199233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
514998	contig_12638_pilon	+	3455	2	Intergenic	novelGene_33148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAGAAATCTCATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196528	200476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_198843_199335
515000	SIRV6	+	1466	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	56	6	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	202	693	1733	10736	TRUE	30	TTACGCTAGAAGACCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1143	11819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515001	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515002	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_14100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515003	contig_15063_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_11426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
515004	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_12139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	50	TATGTTTATAAAAATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515005	contig_7230_pilon	-	2332	8	Intergenic	novelGene_52551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	407.230967909477	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	13	579	177508	134622	TRUE	30	TTTGCAAATACGGAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCEMSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177520	132821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_133989_134035_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
515006	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515007	contig_19851_pilon	+	2636	4	Intergenic	novelGene_29845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_3	1072.13898352779	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_55882_56006
515008	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	203	1378	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515009	contig_11285_pilon	+	2271	14	Intergenic	novelGene_5560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	531.93524097555	828	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	58	1953	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAERLQPRKLWGSCVLSYRVTMNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763500	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767527_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
515010	contig_15063_pilon	-	1559	5	Intergenic	novelGene_8745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	CATTGCCATGTGACCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515011	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	19	1213	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515012	contig_3424_pilon	+	2695	3	Intergenic	novelGene_55487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	200.5	1394	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	355	2439	163695	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149957	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150299_163681_163803_168701
515013	contig_3424_pilon	+	2539	3	Intergenic	novelGene_55469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	203	1389	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	199	2283	163695	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149855	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150041_163681_163803_168701
515014	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515015	SIRV6	+	347	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10426	53	1189	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11426	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515016	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515017	contig_3747_pilon	+	2200	6	Intergenic	novelGene_24888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4648.87854863945	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	744	1352	202422	203441	TRUE	70	TTGTAAAAAAAAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGEPDLMPFLPHSACCLGL	201108	205169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203728_204607
515018	contig_20819_pilon	+	2457	8	Intergenic	novelGene_55629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_3	380.921010613133	2279	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	25	1374	29817	42531	FALSE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	29792	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
515019	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515020	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	30	1114	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515022	SIRV6	+	461	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-21	8819	-15	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTTCGTCTTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515024	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515027	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515028	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515029	SIRV6	+	537	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	545	8167	372	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515030	SIRV6	+	766	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	575	3	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515031	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515033	contig_15063_pilon	+	1691	7	Intergenic	novelGene_12507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3739.8486340433	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	7	1470	28164	39515	FALSE	35	TGGCCATGAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
515034	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_12361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515035	contig_17427_pilon	-	2465	12	Intergenic	novelGene_30347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1169.15221810118	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	104	1372	188788	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METALQKEQLHMCRHLTRCSQVLWQSLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188891	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186477_188084_188140_188767
515039	contig_15063_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_12156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515041	SIRV6	+	495	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8777	-7	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTCGTAGGTATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515042	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10481	36	1244	-34	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAGCAGTTTAGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11481	11790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
515043	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515044	contig_5189_pilon	-	2205	11	Intergenic	novelGene_34855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	968.207358988765	4	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	111	872	244235	204937	TRUE	30	ACTGAATTACTTCTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEIK	247751	198108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_204946_205741_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
515045	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	52	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515046	SIRV6	+	889	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-15	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515047	contig_15063_pilon	+	1495	5	Intergenic	novelGene_12254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	209	1381	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515049	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515050	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515051	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	243	749	34808	35888	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNNHQYLRHPPILC	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35845_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515053	contig_16148_pilon	-	2701	11	Intergenic	novelGene_50361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	524.435658589307	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	1472	2380	78573	59018	FALSE	25	GTAATGTTTTGCAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153327	58696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_150789_151734_153250
515054	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515055	SIRV6	+	621	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
515056	contig_5033_pilon	-	2330	12	Intergenic	novelGene_29040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3673.71638121219	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	381	1193	540619	532125	FALSE	15	CAGACCTGGGCCTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_544624_544686_545249_545325_547551_547686_566747
515057	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	114	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515058	SIRV6	+	856	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	5	227	-2	136	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	30	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	210	701	1733	10736	TRUE	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1135	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515059	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515060	SIRV6	+	966	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	524	1	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515061	contig_11512_pilon	-	2831	8	Intergenic	novelGene_43272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	417.261382378587	161	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	195	641	396169	368489	TRUE	25	CCCTTGGAACCTAGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRSAGTQLARHPAPEDL	409468	366008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368536_374610_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
515062	contig_13608_pilon	-	2813	19	Intergenic	novelGene_52366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_18	186.520478470566	697	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	432	2228	453349	369353	FALSE	20	CAAAATGTGTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470332	368767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_468884_468954_470191
515063	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515064	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_9940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515065	SIRV6	+	417	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	343	8781	170	10	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTCGTAGTCGTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515066	SIRV6	+	401	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-55	337	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAAGCTATCTTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
515067	contig_15063_pilon	+	1745	7	Intergenic	novelGene_8486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	255	1490	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515068	contig_9982_pilon	+	2988	18	Intergenic	novelGene_55730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	86.6717148738246	1636	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	200	2695	311199	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	307531	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
515069	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-36	113	14	57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTCGGCCTGGATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515070	contig_8658_pilon	+	965	4	Intergenic	novelGene_55799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	295	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCATGGCGCTTCGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5697	30200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_6236_6700_6818_13111_13267_30045
515072	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515073	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515075	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	87	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515076	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515077	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515078	contig_15063_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_11031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	233	1375	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
515079	contig_5018_pilon	-	1826	10	Intergenic	novelGene_47059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	664.892305398233	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	73	1266	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHETDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1401914_1401970_1402078_1402260_1402363_1402701
515080	SIRV6	+	873	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	30	731	-7	138	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCTTGTAATTATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	11106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
515081	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515083	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515084	contig_12841_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_55897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCTCAATTATCTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903589	904211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_903600_904200
515085	contig_14273_pilon	+	3200	8	Intergenic	novelGene_21154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	501.418192810784	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	218	1876	128229	151187	FALSE	15	TGATTTGTTTTTTCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIVNGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	128011	152511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150945
515086	contig_18794_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_54629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGTAAATTTAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78344	78036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_78000_78300
515087	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515089	contig_15063_pilon	+	1650	7	Intergenic	novelGene_11779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3570.3112570506	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	229	1452	34808	39515	FALSE	10	CTGCTTTGTGGTGTAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515091	contig_4364_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGAACATTAGGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532788	1533251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
515092	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515093	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515094	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_10625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515095	SIRV6	+	681	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	572	223	399	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	31	522	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1702	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515096	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	132	2	38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515097	SIRV6	+	598	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	10	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	70	213	87	299	2569	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	2482	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
515098	SIRV6	+	1463	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	63	2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515099	contig_8544_pilon	+	628	7	Intergenic	novelGene_55917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	351.760177140935	11	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	139	627	83817	152800	FALSE	65	GGAACAGAACACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNGGRVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQRQKKVKVKKPKPEFPVYTPLESTYIESYEHGTSIEEIEEQMDDWLEN	83409	152801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90577_90625_91487_91586_92523_92618_120265_120357_152660
515100	contig_19564_pilon	-	2267	5	Intergenic	novelGene_29594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	164	1537	15529	12070	FALSE	40	AAGAAACCTTTGCAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAFFFNCPFLLPQNLHFLPLSPPPPLPLRGF	15692	11339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12162_12253_13259_13554_13666_13945_14055_15472
515102	contig_15063_pilon	+	1505	5	Intergenic	novelGene_9501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	35	GAGAAGTTGTATGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515103	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515105	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515106	contig_4180_pilon	+	3277	7	Intergenic	novelGene_8356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1707.08881497777	5	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	39	695	865772	888134	TRUE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865733	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888588_888693
515108	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515109	SIRV6	+	667	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	207	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724
515111	contig_18194_pilon	-	2391	3	Intergenic	novelGene_55942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	20	1014	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	80	1096	18897	4642	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKAKSPSSLDADWSAVTKISQSTAGTMNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	18976	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866
515112	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515113	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515114	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515115	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515117	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515118	contig_15063_pilon	+	1677	7	Intergenic	novelGene_12074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	218	1309	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27151	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
515121	SIRV6	+	394	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	81	1114	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
515122	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515123	SIRV6	+	689	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	8177	1	614	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515124	SIRV6	+	788	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	513	0	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515125	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515127	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515128	contig_10940_pilon	-	2045	5	Intergenic	novelGene_49242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	95	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	149	577	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917148	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874787_874846_875675_893147_893306_916664_916748_916923
515129	contig_15063_pilon	+	1671	9	Intergenic	novelGene_8442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3587.94199367827	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	6037	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_6046_27136_27175_34613_34926_35037_35380_35839_35940_35999_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515130	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515132	SIRV6	+	852	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	25	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	241	573	2002	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515133	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515134	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515135	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515136	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515137	contig_6215_pilon	-	2344	7	Intergenic	novelGene_21191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	836.809947890732	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	45	836	243029	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243073	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_231890_238627_238751_242990
515140	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_10229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	238	1068	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36266_36600_38975_39092_39506
515141	SIRV6	+	937	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	573	18	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515142	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515143	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27538	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515144	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515145	SIRV6	+	885	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	547	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2897	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515146	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515147	SIRV6	+	479	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1122	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11359	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
515148	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
515149	contig_12357_pilon	+	2091	11	Intergenic	novelGene_6126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	962.959215128034	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	365	1405	30281	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25974	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26159_29541_29659_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
515150	contig_12357_pilon	+	1814	10	Intergenic	novelGene_6110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	974.211564722728	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	425	1120	30281	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27476_29523_29655_30217_30323_30933_31060_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
515151	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515153	contig_5189_pilon	-	2360	11	Intergenic	novelGene_34822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	0	TGTTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
515154	contig_15063_pilon	+	1456	5	Intergenic	novelGene_11232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	10	GTGTGTGTCCATGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
515155	contig_19851_pilon	+	2542	4	Intergenic	novelGene_29856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3655.64899238912	32	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53475	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_54558_54721_55882_56006
515156	contig_12622_pilon	-	2275	12	Intergenic	novelGene_5994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	2137.40970907845	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	101	1459	1590968	1586655	TRUE	30	TAAATTTGGATTCTCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLAGRGGVTDSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSETDSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591068	1583571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
515158	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515160	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515161	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	7	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515162	contig_15063_pilon	+	1463	4	Intergenic	novelGene_14109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	188	1360	34808	36661	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34620	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515163	SIRV6	+	958	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	46	524	3	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	212	703	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1133	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515164	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515166	contig_18145_pilon	+	2663	18	Intergenic	novelGene_37346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	465.985297598384	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	190	2523	86893	100744	FALSE	35	GGTTTCTGTTGCAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86703	100884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98346_98432_98541_98826_98983_100326_100482_100638
515167	contig_15063_pilon	+	1762	8	Intergenic	novelGene_8439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3646.68247891708	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	275	1510	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	3410	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3447_27130_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515168	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515169	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515170	SIRV6	+	787	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	93	581	1733	10736	TRUE	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1640	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
515171	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515172	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10358	81	1121	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11358	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
515174	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	14	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515175	SIRV6	+	441	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	8	8810	1	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515176	contig_12790_pilon	+	2956	7	Intergenic	novelGene_35261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_6	191.202336108462	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1373	2101	309644	312473	FALSE	30	AGTTTAATTGTTTATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	308271	313328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
515177	contig_4180_pilon	+	2547	7	Intergenic	novelGene_8339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	1705.64149711089	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	71	727	865772	888134	TRUE	20	TTTCTGTCAGTATATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865701	890825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888217_889087
515178	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDLGSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26558	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26575_34599_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515180	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515181	SIRV6	+	1518	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	8	2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515182	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515183	SIRV6	+	786	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	577	337	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515184	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515187	contig_18869_pilon	-	2660	3	Intergenic	novelGene_55971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	49.5	1064	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	420	962	53041	52499	TRUE	25	TAACATTAGTCCAGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59903	49540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_49889_51148_53330_59772
515188	contig_3956_pilon	+	2031	12	Intergenic	novelGene_15023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1450.13127932361	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	81	1040	1281682	1289148	TRUE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLAPTS	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285757_1289129_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290435_1290555
515189	SIRV6	+	649	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	223	-441	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515190	SIRV6	+	666	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	513	337	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515191	contig_4364_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532819	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
515192	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	13	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515193	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515194	SIRV6	+	680	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-433	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1852	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515195	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515196	SIRV6	-	708	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	31	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCGACTCGTTCATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	10754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
515197	SIRV6	+	661	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8503	18	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	48	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515198	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_10621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515200	contig_6215_pilon	+	2038	3	Intergenic	novelGene_21214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGTTGTATTGTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226748	230161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228266_229519_229951_230071
515201	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515202	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515203	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515204	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515205	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34610_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515206	contig_20641_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_52877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	443	838	56705	54898	FALSE	25	GAACCCACCAGCTGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57147	54179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_54966_56377
515209	contig_11285_pilon	-	2784	27	Intergenic	novelGene_5682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	413.111902257708	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	942	2594	790656	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796678	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_794623_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604
515210	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10382	19	1145	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11382	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515211	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515213	contig_3233_pilon	+	3013	8	Intergenic	novelGene_56548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	239.058186068854	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2561	2875	746379	747909	FALSE	10	TGGGATTGTGTTGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738678	748047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
515214	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3978.41490891787	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26559	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515215	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515216	contig_4364_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAGCAACAAGTTCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533244	1532737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532700_1533200
515217	contig_15087_pilon	+	2332	5	Intergenic	novelGene_37264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	41	622	284653	301944	TRUE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284612	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_303220_303304
515218	SIRV6	+	532	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	33	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCGTGCGTCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1853_2027_2470
515220	contig_14727_pilon	+	3659	9	Intergenic	novelGene_56632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	65	junction_1	206.095510322278	2903	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	117	1400	163116	181989	FALSE	10	GTTGATGTGTGCTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDRNGGRRLRQWLIEQIDSNMYPGLIWENDEKSMFRIPWKHAGKQDYNQEVDASIFKAWAVFKGKFKEGDKAEPATWKTRLRCALNKSPDFEEVTERSQLDISEPYKVYRIVPEEEQKCKLGMAAPGCINEVTEMECGRSEIDDLIKEPSVDDYMGMIKRSPSPPEACRSQLLPDWWTQQAGPAALPLVTGYAAYDAHHSAFAQMVISFYYGGKLVGQTTTSSPEGCRLSLGQPGLPSAKPYGHESLEIVRFPPADAIPSERQRQVTRKLFGHLERGVLLHSSRQGVLVRRLCQGRVFYSGNSVACKDRPNKLERDEVVKVFDTSQFFRELQQFYNNQSRLPDSRVVLCFGEEFPDMAPLRSKLILVQIEQLYIRQLVEEAGKSCGTGSAMQVPEEPQPDQVFRMFPDICASHQRPFFRENQQITV	159140	184248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_159256_163114_163290_169869_170054_173662_173752_175615_175722_176854_176906_179305_179693_181080_181197_181812
515221	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515222	contig_5018_pilon	-	2398	7	Intergenic	novelGene_47073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	463.649172926638	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	952	1839	1401907	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873
515223	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515224	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_10633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515225	contig_5023_pilon	+	3538	14	Intergenic	novelGene_7328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_6	1979.4134897271	116	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	17	1816	607279	643587	FALSE	35	AAAAGCCTTCAGTCCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYVNEPETWTEGPDWQ	607262	645309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413
515226	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	584	14	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	43	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515227	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515228	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	206	1378	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34602	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515229	SIRV6	+	834	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	274	-14	89	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515230	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515237	SIRV6	+	904	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	29	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	155	643	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515238	SIRV6	+	806	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	341	223	168	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	156	647	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1471	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515239	SIRV6	+	779	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	381	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	162	489	49	537	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1684	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2615_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515240	contig_8317_pilon	+	470	2	Intergenic	novelGene_19323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
515242	contig_12357_pilon	+	2212	12	Intergenic	novelGene_6121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	563.361839303543	9	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	115	1518	26079	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25964	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
515243	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515244	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28168	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515245	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515246	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515247	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515248	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515249	contig_12873_pilon	+	2682	5	Intergenic	novelGene_27140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2101	junction_1	518.239809354704	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1355	2110	17632	19855	FALSE	40	AAGCCAAATTTGTAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15941	20427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_18014_18984_19264_19611_19703_19851
515250	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515251	contig_8772_pilon	+	1933	8	Intergenic	novelGene_21087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3846.65921314078	38	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	886	1626	19142	23105	FALSE	30	TTGAAAAAACTCTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVGEAAPILGKADHLFFLQEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15212	23412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
515252	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_14053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	194	1432	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515253	SIRV6	+	671	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8509	2	282	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTACGTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515254	SIRV6	+	426	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTCGTAGGTATGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1640_1741_1847_2027_2470
515255	SIRV6	+	814	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1847_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515256	contig_15063_pilon	+	2083	5	Intergenic	novelGene_14173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3236.39578659657	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1279	1722	36064	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	34673	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_36158_36266_36600_38977_39092_39506
515258	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515259	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515260	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515261	contig_8317_pilon	+	432	3	Intergenic	novelGene_19273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	4	432	14294	15197	FALSE	30	GGTGTGAAACAACTCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTL	14290	15197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
515262	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515263	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515264	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515265	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	537	18	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515266	contig_10953_pilon	+	4089	8	Intergenic	novelGene_42523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_1	151.680518168408	309	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	15	902	126980	145572	FALSE	10	TTCTGCTCTGTCCTATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRVSVPFCRVTICPREKQK	126965	148759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408
515267	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515268	contig_12427_pilon	-	2075	6	Intergenic	novelGene_40548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1207.39017720039	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	99	722	522337	506035	FALSE	45	AGAACAAAGATCATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578155	504681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_578065
515269	contig_15434_pilon	+	4507	6	Intergenic	novelGene_56701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	500.339085021348	21	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	3803	4345	31167	33302	FALSE	35	AAACCCAACTGTTGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26657	33464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26686_26899_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
515270	SIRV6	+	721	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	8180	3	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515271	contig_9345_pilon	-	1362	3	Intergenic	novelGene_24615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2740.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952509	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948112_949543_949607_952439
515273	SIRV6	+	702	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	612	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAATCACCGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	3152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2745_2829_3106
515275	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_13951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515278	SIRV6	-	331	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTTTCGCTTCTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11474	11046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11109_11205
515279	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515280	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_12745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34609_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
515281	contig_15219_pilon	+	2789	7	Intergenic	novelGene_40818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	311.172736952038	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	124	978	19617	23972	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKEQSIFLLTGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19493	25923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23127_23265_23346_23491_23690_24314_24453
515282	contig_3077_pilon	+	1792	9	Intergenic	novelGene_26694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	611	1294	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10090	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10232_11220_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
515283	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28172	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515284	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515285	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515287	contig_11285_pilon	+	2416	12	Intergenic	novelGene_5603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	488.013751330435	152	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1349	2098	768710	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763527	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
515288	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	56	1223	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
515289	SIRV2	-	396	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	57	2983	41	-353	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGACAATGTTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	4018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
515290	contig_6031_pilon	+	4818	1	Intergenic	novelGene_56727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3573	3935	152607	152969	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLIPCPEYVKRSLAILASEEHSGCTSSKTDLSVLLAVHGIFSSLRKHHDSRASILLPSSLFIVQVLQAYEVIENTRAWVRCTLVFKLASLLFNTLKRSFAAYLPNAMCRLIS	149034	153852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149000_153900
515291	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27169_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515292	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	23	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515293	contig_10424_pilon	-	3596	29	Intergenic	novelGene_56801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	242.739033779918	1141	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	997	2994	29	3022	347192	292433	TRUE	35	AAAACTATAATGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEGGAKLKMADKTPGGSQKASSKTRSSDVHSSGSSDAHMDSSGPSDSDLPSRTRPKSPRKHNYRNESTRENLCDSPHQNLSRPLLENKLKAFSIGKMSTAKRTLSKKEQEELKKKEDEKAAAEIYEEFLAAFEGSDGNKVKTFVRGGVVNAAKEEHETDEKRGKIYKPSSRFADQKNPPNQSSNERPPSLLVIETKKPPLKKGEKEKKKSNLELFKEELKQIQEERDERHKTKGRLSRFEPPQSDSDGQRRSMDAPSRRNRSSGVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQREKEKELERERERDKKDKEKLESRSKDKKEKDECTPTRKERKRRHSTSPSPSRSSSGRRVKSPSPKSERSERSERSHKESSRSRSSHKDSPRDVSKKAKSNLVSKFMGRDLWK	347220	291089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_291641_292409_292476_292818_292996_294205_294325_296963_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323828_324272_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
515294	contig_7695_pilon	-	2849	22	Intergenic	novelGene_41663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_19	289.244319985702	67	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	6	1982	912821	903701	TRUE	10	CACTCCTGGTCCTCCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMATEHPEPPKGELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGSREELVERLQTYTRQTGMVLNRPVLRRDDGDKAAPPPMSAQLSGIPMPPPPMGLPPLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAGGPHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQEERAKQQGDHSLKEHELLEQQKRAAVLLEQERQQEIAKMGTSVPRPPQDMGQMGVRTPLGPRVAAPVGPTPTVLPMGAPVPRPRGPPPPPGDENREMDDPSVGPKIPQALEKILQLKESRQEEMNSQQEEEEMETDTRSSLGQSASETEEDTVSVSKKEKNRKRRNRKKKKKPQRVRGVSSESSGDREKDAARSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVKKEKEKEPEKLDKLENSMAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQPENPGAELTHP	912826	896338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901674_901959_902068_903699_903809_903914_904005_904635_904786_905766_905995_906230_906312_906494_906633_907217_907434_907864_907957_908116_908214_908578_908680_908992_909111_910317_910369_910586_910836_912102_912181_912460_912508_912688
515295	SIRV6	+	844	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	389	577	173	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	151	642	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1476	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515297	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515298	contig_15063_pilon	+	1557	7	Intergenic	novelGene_8880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	244	1302	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYSTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36475_39027_39092_39506
515299	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	199	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515300	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	13	1485	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28151	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515302	SIRV6	+	530	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	6	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAAGGTGAGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	2612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1848_2028_2470
515304	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515305	contig_10235_pilon	+	2382	4	Intergenic	novelGene_46444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	231.064685507952	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210494	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211834_211924_212047
515306	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515307	SIRV6	+	402	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10368	56	1131	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11368	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515308	contig_14925_pilon	-	2349	5	Intergenic	novelGene_55254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_4	793.415520077595	47	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	210	623	116065	114666	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121617	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
515312	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515314	contig_12479_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_56847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGGCCAAAGAAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196344	195691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_195700_196300
515315	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515318	contig_17936_pilon	-	1987	9	Intergenic	novelGene_29960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	489	866	126099	121018	TRUE	25	CAACCCTGTCTCTCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVKGLLEKGRPSSVAQGKGVYRKPKLDPGSHAACSKQQS	126587	79117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_79298_90971_91159_95140_95305_106374_106471_110996_111164_114797_114932_118633_118827_121017_121060_125763
515319	contig_15063_pilon	+	1250	6	Intergenic	novelGene_14330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3669.23014268661	9	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	515	1000	36239	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34882	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_35931_36203_36600_38975_39092_39506
515320	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515321	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_10443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515322	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_10573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	25	TATATATTCTCCTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515323	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515325	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27123	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515326	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515327	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515328	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	57	1114	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515329	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_10680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3757.05393227193	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	233	1393	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266
515331	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515334	contig_5797_pilon	+	3624	17	Intergenic	novelGene_56949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	185.913580394225	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	85	2058	348953	418675	TRUE	45	GAGTGACTTAAATGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYSRGVLSPDRHVRTRLYFTSESHVHSLLSILRYGALCNESKDEQWKRAMDYLNVVNELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	348868	420290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_348955_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362793_363574_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_408614_408756_412625_412752_418562_419190_419238
515335	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515337	contig_7151_pilon	+	2847	14	Intergenic	novelGene_40651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	514	21	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	704	1042	5253	6217	TRUE	35	AAAGCAGTTTGTATCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETGSEPELVPKEKKDVPPLTRAPHSSILLVLTVVLPPGLRSTGPQGRLPASAPHLVQPDAPISWAKCSLLQGFQGRATVQLLTHHLGLCQAPGVVTHCAPGAVVPNLHSP	1818	46747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2089_3098_3248_4314_4398_4632_4730_5148_5303_5928_6259_6347_6388_12487_12813_13365_13681_13787_13876_18160_18482_18573_18879_40399_40718_46695
515338	SIRV6	+	515	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTAGTCGTAGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2023_2470
515339	contig_5499_pilon	+	2677	12	Intergenic	novelGene_56997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	254.905978453311	1569	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	403	1440	816585	840037	FALSE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803363	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
515340	SIRV6	-	939	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8691	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	4	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11238	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10818_11031_11109_11205
515341	contig_7020_pilon	+	2341	2	Intergenic	novelGene_57066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	0	2371	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	193	1542	102160	103509	FALSE	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98685	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106
515342	contig_15063_pilon	+	1810	7	Intergenic	novelGene_13055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	80	1555	30275	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30195	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515343	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_14068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515344	contig_12357_pilon	+	1968	11	Intergenic	novelGene_6111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	749.332296114347	15	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	117	1274	26079	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35155_46506_46568_51130_51239_52759_52844_53169
515345	contig_15063_pilon	+	1498	5	Intergenic	novelGene_9925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515346	SIRV6	+	1127	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	895	4	-303	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	20	352	2002	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1982	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515347	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515348	SIRV6	+	466	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1341	223	-1	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	98	307	2569	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2471	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515349	SIRV6	+	436	5	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-324	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGTAAGACTGTATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961	10814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2815_3106_3165_10724
515350	contig_15063_pilon	+	1571	5	Intergenic	novelGene_13617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_4	3392.44339488517	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	202	1344	34808	39538	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
515351	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	244	708	34808	35848	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLR	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35843_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515353	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	4	94	4	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515354	SIRV6	+	622	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	719	245	-436	118	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	40	TGCGTTCACAAAGAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515355	SIRV6	+	1032	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	478	18	16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	TCACCATAAATTTGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515356	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	9	1481	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515357	contig_8317_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_19389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTAAAACAAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
515358	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_12190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515359	SIRV6	+	929	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	398	483	182	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	142	633	1733	10736	TRUE	35	TCAACTCACCATAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1485	11342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515360	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515361	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_9505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515362	contig_13608_pilon	-	2775	18	Intergenic	novelGene_52363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_10	192.591756768265	715	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	125	2185	470234	369353	FALSE	15	TGTGTTTTGTTTCTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470358	368762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
515363	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	181	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515364	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515365	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515366	contig_17936_pilon	+	2109	12	Intergenic	novelGene_29933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	812.463074812563	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	43	1326	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50603	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766_126052_126127
515367	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515368	SIRV6	+	659	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	607	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106
515369	contig_6735_pilon	-	795	8	Intergenic	novelGene_15668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	783.137801620207	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	164	589	554315	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQMDTYLVVLPHPP	564815	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542228_546594_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
515371	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28169	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515372	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	548	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	595	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515373	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515375	contig_12873_pilon	+	1973	6	Intergenic	novelGene_27135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	6341	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	419	1399	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15938	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
515377	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10319	71	1082	65	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11319	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
515378	SIRV6	+	783	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	162	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	163	654	1733	10736	TRUE	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1541_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
515379	contig_15087_pilon	+	2260	5	Intergenic	novelGene_37265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	201	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	41	622	284653	301944	TRUE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284612	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_303285_303441
515380	contig_10074_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_57151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGTAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469218	467798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_467800_469200
515381	SIRV6	+	968	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	537	-14	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515382	contig_19851_pilon	+	2178	6	Intergenic	novelGene_29855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3332.68572775772	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53470	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54304_54666_55753_55840_55882_56006
515383	SIRV6	+	867	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	496	337	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515385	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_11502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515386	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
515387	contig_4364_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532845	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
515388	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_8893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	TGAGAAGTTGTATGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515389	SIRV6	+	570	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCGAAGGTGAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	2610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
515390	contig_19564_pilon	-	2450	4	Intergenic	novelGene_29590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1124	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	253	1587	15529	12201	FALSE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15781	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
515391	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515392	SIRV7	-	2223	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	134	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	60	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147784	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1199_1286_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147622
515393	contig_11285_pilon	+	2191	14	Intergenic	novelGene_5588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	544.632637710201	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	35	1873	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEPRGGVPALSDLFPARGAAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_768949_769001_769085_769320_769421_769653_769740
515394	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515395	contig_8317_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_20635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16464	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
515396	contig_6735_pilon	-	2006	14	Intergenic	novelGene_15715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	882.662459693103	129	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	86	1378	564868	542802	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEPLCRIIRLPSWGYRNLSCSPV	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542867_543071_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
515397	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515398	contig_5988_pilon	-	1747	3	Intergenic	novelGene_15922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2141	junction_2	52.5	6	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	677	1573	652858	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655548	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653773_655456
515399	SIRV6	+	845	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	274	12	89	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515400	SIRV6	+	827	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	33	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515401	contig_177_pilon	+	2263	4	Intergenic	novelGene_41798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	411.992178998043	62	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	161	1237	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	411685	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_411751_415635_415707_417647_419237_419613
515402	contig_1516_pilon	+	2348	11	Intergenic	novelGene_49999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	1075.70983076292	3246	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	112	1707	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLIAPARLHPGSQAHQQSPALVEPRARVHGGRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335951	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336050_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
515403	contig_15063_pilon	+	1568	5	Intergenic	novelGene_8531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	251	1426	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515405	contig_10134_pilon	-	2160	5	Intergenic	novelGene_16217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTGTGTCTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39815	32182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33353_33484_33731_34922_35178_38558_38817_39584
515407	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_10092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515408	contig_15063_pilon	+	1682	6	Intergenic	novelGene_13608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	202	1329	34808	38994	TRUE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	34606	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
515409	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515410	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515411	SIRV6	+	482	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10325	19	1088	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11325	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
515412	SIRV7	+	2091	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	62	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCGCGATAAGTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001	114927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2995_3111_43027_43083_114683
515413	contig_5643_pilon	+	2044	16	Intergenic	novelGene_39045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	702.997910539016	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	552	1832	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631210	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632053_634894_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
515414	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515418	contig_8772_pilon	-	1861	9	Intergenic	novelGene_21080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1455	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACCGGACCCAGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23421	15211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19119_19200_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
515419	contig_12790_pilon	+	2594	6	Intergenic	novelGene_35265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_5	184.07107322988	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	175	675	309644	311112	TRUE	10	GGGGTGTGGCCTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKVKPLPTWPHF	309469	313345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_312035_312348
515420	SIRV6	+	478	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8806	18	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515421	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515423	contig_7056_pilon	-	265	3	Intergenic	novelGene_43660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	899	junction_2	563	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGCAGTCGAGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728672	725977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_725993_726940_727080_728561
515424	SIRV6	+	732	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	537	-441	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515425	contig_12873_pilon	+	2278	5	Intergenic	novelGene_27187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1352.65135474741	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15985	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19044_19611_19703_19851
515426	SIRV2	-	573	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3135	358	1956	-358	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGGCATTAACCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2776	1393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
515427	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515428	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515429	contig_233_pilon	+	2242	11	Intergenic	novelGene_14531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	1614	2240	105585	127018	FALSE	10	CTCTTCTAAGCTGGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGLAWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCEVHLLAPGAARPQLHALPAGADLVLGALLGQESSYDLVQAGSLSLLGKGTGPDA	78135	127020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91684_92144_92359_93764_94007_94454_94639_105494_105703_107299_107471_108400_108583_108724_108814_126951
515430	contig_15063_pilon	+	1456	4	Intergenic	novelGene_14167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	140	1312	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34668	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515431	contig_17427_pilon	-	2458	13	Intergenic	novelGene_30368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1122.32344565489	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	8	1423	188870	178046	TRUE	35	AGTTAATACCAAACTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188877	176965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177701_177745_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
515432	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515434	contig_17936_pilon	+	2656	12	Intergenic	novelGene_29928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	931.448822582813	100	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	50	1354	50646	127275	TRUE	30	AAGCTTTAAACCGGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKNNPWLCTE	50596	129542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_127250_127463_128223_128333_128536
515435	contig_1244_pilon	-	2054	13	Intergenic	novelGene_38023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	997.973484812542	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	747	1646	928860	923211	FALSE	40	AAAGCTACATCATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948530	922802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931731_933667_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
515436	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	95	12	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515437	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515439	contig_10095_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_57238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTTTCCAAAACTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238308	237558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_237600_238300
515440	contig_8812_pilon	+	3464	13	Intergenic	novelGene_57255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	137	junction_11	156.1577505459	521	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	242	2584	3658	22770	TRUE	5	TTTGTATTTGGTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRRQRKDLANSDSQKTTEKLLKTFLKRQAIKTALKSKRDEALPSLTQVQREDDIYVLPPLQEEEKNSSEEEDEKEWQERMNQKQALQDEFFQNPHAIDIESEDFSSLPLEVKHEILTDMKEFTKRRRTLFEKMPEESDDFSQYQLKGLLKKNYLNQHIENIQKEMNQQHSGQIQRQYEDEGGFLKEVESRRVVSEDTSHYILIKGIQAKKTAEGDSESLPSSSRMHSMSFDVKSPPCEKLKPEKETDASPPSPRTLLAMQAAMLGNNPEEEVESGRKRPYNEKNASAAVDDGSVSPRTLLALQKALDDEEEVKGHAGNDVQTGGLGVKKLPTNNPDEESDEGHRDDGKGRLFTAVPHSAGVNFVEESATSTNSEKELTDSAGLSSAIFCQGSEPSVQKEQISFIHPVSEGLQTSDDSMEKDGKSPIPLQSTVLMSSDAPGLQNRKARIPASSTSTVVVSQDETYPEGLELQNDLGTSESKRDSSVLSSDDEMEGGENRACEISGTVCLQGTGGTAVVPSETLSNLESVVLFSDKQHENLLKTIQESEVTESASRDVISVPKSLELRETDSEDGESDGSFIEVDSVISNDESQAESLESWKPSSERGDQSVAEEGLVETEMEGAPGDVESLLRDSSESEGLGTEPRGEAEKDADDSLSEWQDINLEELETLESSLLEQQNSLKAQKQQQERAAATVTGQMFLESQELLRLFGIPYIEAPMEAEAQCAILDLTDQTSGTITDDSDIWLFGARHVYKNFFNKNKFVEYYQYVDFHNQLGLDRNKLINLAYLLGSDYTEGIPTVGCVTAMEILNEFRGHGLEPLLKFSQWWHEAQDNKKIRPNPYDTKVKKKITEVATHAWFP	1540	25782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_1658_2156_2244_3620_3682_6501_6646_10649_10858_11168_12285_14632_14896_15236_15357_15519_15734_17209_17355_22661_22864_23482_23568_25080
515441	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515443	SIRV5	+	639	8	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	46	5368	-2	2025	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTAGGAGGAGTCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054	5623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543
515447	contig_4315_pilon	+	2075	3	Intergenic	novelGene_46843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2593	junction_1	90.5	8032	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	66	422	575508	580260	FALSE	40	TCATGAAAAACACGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575442	581913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086
515448	contig_8317_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_19418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAACCTGTGTCTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16390	16794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
515449	contig_16594_pilon	-	2734	8	Intergenic	novelGene_53821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2351.47108102523	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	373	1179	165546	117272	FALSE	75	AAAGAAAAAAGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATAT	306316	115716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_117276_124174_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306046
515451	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515453	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	228	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515455	contig_12837_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_57371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCACATGAAAATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305231	303828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_303800_305200
515456	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515457	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	32	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515458	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515459	SIRV6	+	344	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	95	162	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
515460	SIRV6	+	997	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	246	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	220	714	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515461	contig_854_pilon	-	3131	12	Intergenic	novelGene_36143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_10	194.231267112087	1535	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	155	1168	493192	471988	FALSE	0	CGTGCCTGGGGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509249	470024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_497487_497571_509182
515462	SIRV6	+	578	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8506	164	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515463	contig_13707_pilon	-	2299	12	Intergenic	novelGene_43565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	706.666309319521	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	61	906	275489	271846	TRUE	55	TGAAAAATATTTACAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLKRTLNTMARHPPSVAHLSIWHQKYFISSLMTGLWTGGAWGPFYMRCCMACLLFIAGILLRCMITF	275549	269699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272905_273339_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
515464	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515465	contig_14273_pilon	+	2654	4	Intergenic	novelGene_21145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	645.743154994478	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	415	1578	147836	151187	FALSE	45	GAAAAGAAACAACCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127917	152263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128279_147782_148029_148891_149549_150873
515466	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	8	1483	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515467	SIRV6	+	1014	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	500	14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	679	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515468	contig_14243_pilon	-	4886	35	Intergenic	novelGene_57419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	217.842799500276	1002	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1497	4494	39	4532	671471	525729	FALSE	25	CAGCCTTCCAGTATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQSLWDSLQPWCPLHLSVAWVDTVWELDFTETEPLDSSIEAEIIENGLDAFTRLYESLFPFATEEHGSTENLWTFFTENNISHSVLVALFYHFVQIVHKKNISVQYREYGLHAAGLYFLLLEVPGSVANQVFHPVMFDKCIQILKKSWPQESNLNRKRKKEQPKSSQGNPRGNRKRGKPLRREDIEMDVILQEQEDEENICFSARDLSYIRNAIFHLLKNFLRLLPKFSLKEKPQCVQNCIEIFVALTNFEPVLDEFHVSQARNLNEAKYIPELAYHGLYLVCSPIHGEGDKVISCVFHQMLNVILMLEVGEGSHRTSLTITSQVINSRNQAVQFISLLVEELKESIFPVLRILLQHICAKVIDKSEYRTYAAQSLVHLLSKLPSVEYATFIAWLYRYSRSSKIPHRVFTLDVALALLELPEREVDNTLSLEHQKFLTHKFLVQEIMFDRCLDKAPTVRSKALSSFAHCLELSVTNTSESVLELLINSRAVSGIESHPGTLLRNSLGFSFQKQTFNPSGASEMTSTDKSAETARSGERCVMAMLRKRIRDEKTNVRKSALQVLVSILKHCEISGMREDLSILQDQCRDPAVSVRKQALQSLTDLLMAQPRCVQIQKAWLTGITPVVMDCESTVQEKALECLDQLLLQNIKHYSKFHSGDDSQVLAWALLPLLTTEGQELSRYLNKAFHIWSKKDKFSSTFINNLISHTGTEHSAPAWMLLSKIACSSPKLDYTKIIKSWEKISSQQNPNSNTLGHILCVIGHIAKHLPRSTRDKVTDVIKCKLNGFQWSLEVISSAVDTLQGLCRASAETPVEEQELLKQVCVDVLSTCECCLSNIVLKEDGAGNMDEELLVKCIFTLGDIAQLCPAKVEKRVFLLIQSILAASADVDHSSSQGASDIPTSQPLSQFRGSAMPSMIRAHAVITLGKLCLQHEDLAKRSIPALLRELEVCDDVAVRNNVIIVMCDLCIRYTVMVDKYIPNISMCLKDSDPFIRKQTLILLTNLLQEEFVKWKGSLFFRFVSTLIDSHPDIASFGEFCLVHLLLKRNPVMFFQHFIECIFHFNNYEKHEKYNKFPQSEREKRLFSLKGKTNKEKRMKIYKFLLEHFTDEQRFNITSKICLSILACFVDGVLSLDMEANELLSDTFEVLSSKEIKLLAMRSKPDKDLLIEEDDMALANVVMQEAQKKLISQVQKRNFIENIIPIIISLKTMLEKSKIPALRELMAYLREVMQDYRDEVKDFFAVDKQLASELEYDMKKYSEQLVQEQGLAKQPDANRTAEGGSMAPVGQVALSLEIMPAPVGQENAAVAPGVSHPSTPRSSTGRVPSVPSPPDTGPLKMLMPKARPMSLSTIAILNSVKKAVESNNRHRSQSLGVLPFTLNSRSSDKSSSHGSSYSLNQESRGSIDHLTKRAISTPDRTISEVSFGAAVSYISMPQTPFSHKEKSEVQSQGPEILCLSLPDKPPPQPQQWNVKSPARNKDNPTPSRRSLRKTPLKTAN	671509	525374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_525838_525926_525988_526074_526150_532899_532978_533833_533974_534171_534339_535057_535241_537244_537356_540587_540788_541052_541187_541495_541634_555935_556016_557098_557338_558452_558558_558655_558771_560969_561078_566106_566223_566364_566463_566793_566986_594490_594712_595518_595654_600733_600808_608932_609023_609264_609322_609776_610030_610156_610283_611047_611121_612507_612642_628844_628933_629119_629182_629296_629465_630128_630314_645348_645512_659673_659829_671410
515469	contig_15063_pilon	-	1642	7	Intergenic	novelGene_12457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	887	1210	35891	35108	TRUE	40	TAATCACAATGGTAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	28156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36501_38967_39090_39504
515471	contig_8394_pilon	-	2857	3	Intergenic	novelGene_27304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_1	170.5	1794	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1264	2508	35322	32466	FALSE	25	TAACCCTTTTCATTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39817	32116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35523_38754
515472	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_12186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27540	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515473	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515474	SIRV6	+	447	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1480	543	51	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515477	SIRV6	+	478	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	30	1081	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
515478	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515480	SIRV6	+	530	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	833	223	-322	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	39	371	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1963	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515483	contig_15063_pilon	-	1515	4	Intergenic	novelGene_13557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36153_36264
515484	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	217	1389	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27152	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515485	contig_13707_pilon	-	3027	11	Intergenic	novelGene_43554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_10	556.010791262184	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	57	1205	275489	271515	FALSE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVVSSYLF	275545	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
515486	contig_8598_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_22897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	10	387	191218	191595	NA	30	CTCCAAGAATGGGCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGELEAG	191208	191597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
515487	contig_15063_pilon	-	1529	5	Intergenic	novelGene_9944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	781	1104	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36780	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515488	SIRV6	+	713	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	31	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2022_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515489	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515490	contig_15063_pilon	-	1519	4	Intergenic	novelGene_13441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
515491	contig_12352_pilon	+	2760	9	Intergenic	novelGene_57451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	228.353207772521	742	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	261	923	238274	284811	FALSE	20	TGAGTTGCTTGTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	229985	286648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_237953_238083_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
515492	contig_3986_pilon	-	2783	13	Intergenic	novelGene_52668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	110.275003463563	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	223	1572	60653	35282	FALSE	15	TTTTCAATGTCTTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153905	34070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46175_47695_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
515493	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515494	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	4	1416	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515495	SIRV6	+	706	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-10	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1849_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515496	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515498	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515499	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515500	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	235	759	34808	35938	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35873_36158_36266
515501	contig_8317_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_19297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	140	466	14731	15239	FALSE	30	TGAGCCACCGTACAGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDS	14298	15241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
515502	SIRV6	+	712	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-415	486	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
515503	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	65	TTATAAAAATTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515506	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515507	contig_15063_pilon	-	1557	5	Intergenic	novelGene_9430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515508	SIRV2	-	447	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	24	-320	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5871	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5787
515509	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515510	contig_15063_pilon	+	1484	5	Intergenic	novelGene_12915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515512	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515514	contig_3077_pilon	+	2260	9	Intergenic	novelGene_26632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_7	2524.07496669572	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	788	1762	11934	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQTWGHQVSQQLRPTTTLPSSVPRRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
515515	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515516	contig_9482_pilon	-	2912	10	Intergenic	novelGene_44291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_5	118.758495472592	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	159	1082	1253164	1240765	TRUE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQVSLGVVSSGVEPRGCA	1253322	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
515517	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515518	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_12867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515519	SIRV6	+	953	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	537	1	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515521	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515522	SIRV6	+	808	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	317	649	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515525	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515527	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515528	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_9169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515529	contig_9955_pilon	-	2928	4	Intergenic	novelGene_21309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_3	476.504168105823	3	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	208	900	49296	47546	TRUE	35	ACGTGGTAATTGAATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49816	44953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794_49380_49692
515531	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515532	contig_18794_pilon	-	2797	8	Intergenic	novelGene_54658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_5	48.130774236152	841	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	172	1071	353203	325647	FALSE	20	TGATTATCTGTGCTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPPSSSHRGGFSLPGPSLLHPLLLTVTRSKAGWPRTLAAASPCRCVKLLLLLPFGFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404713	323920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145_353212_404550
515533	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515534	SIRV6	+	414	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1388	228	2	135	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2518	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515535	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10412	15	1175	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11412	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515536	contig_15063_pilon	-	1434	4	Intergenic	novelGene_13127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	719	1042	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36718	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
515537	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_8845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515540	SIRV6	+	876	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	429	505	213	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	111	602	1733	10736	TRUE	35	GATGACTATGGGGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1516	11320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515541	SIRV6	+	661	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8503	18	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515542	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515545	contig_1406_pilon	+	2358	4	Intergenic	novelGene_25573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	378.837109528034	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATTTTAGTTTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173736	2187467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2185143_2186270_2186412
515546	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515549	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	537	13	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	775	20	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515551	SIRV6	+	596	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	359	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515552	contig_3948_pilon	+	2943	3	Intergenic	novelGene_53372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	163	junction_2	28	1129	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	774	1475	1813956	1860572	FALSE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812923	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434
515553	contig_15063_pilon	+	2004	7	Intergenic	novelGene_13023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3666.41777943176	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	511	1749	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30006	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515554	contig_5018_pilon	-	1958	8	Intergenic	novelGene_47096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	500.7672480651	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	924	1406	1400899	1399645	FALSE	0	GTGTCTTCCTCCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402859	1399092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
515555	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515556	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	230	769	34808	35938	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35858_36158_36266
515557	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515558	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10383	56	1146	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11383	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515560	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	13	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515563	contig_6047_pilon	+	2167	14	Intergenic	novelGene_24216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1026	junction_3	392.468006459985	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	28	1908	109299	123624	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	109271	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
515565	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515566	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515567	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515569	contig_15063_pilon	+	1504	5	Intergenic	novelGene_9297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515570	contig_34_pilon	-	355	3	Intergenic	novelGene_40044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2924	junction_1	982	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	62	355	247052	230314	FALSE	20	TTCTTACTGATTGGCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHSLVRVDSHACCLLFLSLRMTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKK	247113	230313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_230387_243214_243354_246970
515571	contig_8317_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_19296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1	426	14294	15194	FALSE	30	TGGGTGTGAAACAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYT	14293	15195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
515572	contig_1532_pilon	-	2008	8	Intergenic	novelGene_37388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	4791	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	66	1259	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
515574	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	114	1	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTCGGCCTGGATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515576	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27147	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515577	SIRV6	+	626	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	169	621	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	37	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTATTGTATGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	3161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515578	contig_8317_pilon	+	432	2	Intergenic	novelGene_19354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAATTTTGAGACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16226	16757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
515581	contig_11171_pilon	+	2983	9	Intergenic	novelGene_48572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	144.228063756677	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	24	1088	70574	105888	FALSE	35	TTCGGAAGGAGAGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSLKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70550	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_85923_86036_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710
515582	contig_5967_pilon	-	2297	10	Intergenic	novelGene_44377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	482.292442403984	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	226	1290	488569	388566	FALSE	45	AGAACCAACAAATGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517635	387558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_512863_512956_517515
515583	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_12402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515585	contig_6735_pilon	-	1608	12	Intergenic	novelGene_15740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	800.062890090006	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	76	1245	564868	542464	TRUE	35	TATGCTGAGCTAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDSPQAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568273	541985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542198_542312_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543905_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
515586	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515587	contig_12790_pilon	+	2883	6	Intergenic	novelGene_35239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	264.361116656743	126	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	262	585	309644	310194	TRUE	15	TAAGGGGTGTGGCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	305942	313342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_309578_309756_309873_309924_310032_310494_311029_312035_312348
515592	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515593	contig_233_pilon	-	1809	10	Intergenic	novelGene_14547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1425.14147445867	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	79	591	101691	93890	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQERAG	101769	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93901_93944_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673
515594	contig_1450_pilon	+	2531	18	Intergenic	novelGene_27398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	439.824178460527	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	109	1296	322479	348046	TRUE	80	AAAAAGAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLIPGRLHGTTGVLLILTLTRPAAVSVEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEPRD	322370	355946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347057_348033_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
515595	contig_15063_pilon	+	1641	8	Intergenic	novelGene_10486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3456.16527500686	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	236	1387	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36437_36523_36600_38975_39092_39506
515596	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515597	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515598	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_9700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	70	TATAAAAATTAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515600	SIRV6	+	627	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	349	8167	176	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515601	contig_5988_pilon	-	1619	4	Intergenic	novelGene_15963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	120	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	30	AAGAAAGGTTTTTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
515602	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515603	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515604	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515606	contig_3077_pilon	+	2067	10	Intergenic	novelGene_26599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2863.31493117012	6	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	601	1575	11934	17590	FALSE	15	ACAGTGTGCGGCACTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQTWGHQVSQQLRPTTTLPSSVPRRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11551_11808_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
515607	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGYFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26543	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515608	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515609	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515610	SIRV6	+	990	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	3	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
515612	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515614	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515615	SIRV6	+	545	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-21	8735	-15	56	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515616	SIRV7	-	2056	3	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-30	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	45	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114946	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2652_2993_3115_114657
515617	contig_5727_pilon	+	3000	17	Intergenic	novelGene_7941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	927.770342592255	22	28	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1667	2239	177195	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168146	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174858_176978_177214_177545_177751_177921_178134_178272_178344_179257
515618	SIRV6	+	914	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	562	2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515619	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515622	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515623	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515625	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515626	SIRV6	+	378	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	43	1168	-41	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTACTAAGCAGCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
515628	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515629	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515630	contig_11285_pilon	+	2249	12	Intergenic	novelGene_5584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	487.050373283609	40	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	571	1926	767140	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763522	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763543_766052_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
515632	SIRV6	+	533	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8551	164	240	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATGGGACTAGTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515633	SIRV6	+	890	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	223	18	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515634	contig_7357_pilon	+	2011	8	Intergenic	novelGene_36813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1405	1782	139801	154908	TRUE	20	GCAAGCTGTTCCATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135548	159971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_154860_155083_159916
515635	SIRV6	+	815	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	162	656	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515636	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515637	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515638	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515639	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515641	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515642	contig_15063_pilon	-	1487	4	Intergenic	novelGene_14045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	30	TCTGAGGACCCAAGAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515643	SIRV6	+	768	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAGAAAGTAAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	10808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515644	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515645	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_11930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515646	contig_15063_pilon	-	1723	7	Intergenic	novelGene_10976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	977	1300	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
515647	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515649	SIRV6	+	632	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	817	577	-381	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	98	430	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1904	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515652	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	197	1435	34808	39515	FALSE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515653	contig_19564_pilon	-	2099	5	Intergenic	novelGene_29579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	539	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	162	1232	15529	12201	FALSE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15690	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12765_13028_13259_13554_13666_13945_14055_15472
515655	SIRV6	+	1502	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	8	18	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515656	contig_6735_pilon	-	1962	14	Intergenic	novelGene_15730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	893.832761716172	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	88	1482	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568285	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552883_554276_554374_564157_564232_564784_564869_568198
515657	contig_12425_pilon	-	1979	11	Intergenic	novelGene_46672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	695.151559014291	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	121	1143	211174	204225	TRUE	10	TTTGCTTTCTGGTAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226612	203272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_203398_203513_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
515658	contig_16622_pilon	-	2257	10	Intergenic	novelGene_48441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_4	1002.17934128516	77	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	728	1210	115540	112684	TRUE	10	CCTGACCAGTCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	121967	108209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
515661	contig_15063_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_8933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515662	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515663	contig_15063_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_11427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515664	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515665	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	253	1425	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26343	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515666	contig_6215_pilon	-	2187	6	Intergenic	novelGene_21187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	816.483190273995	21	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	43	669	243029	228244	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKIFQLDWHRALCLDTGGTTCSYKS	243071	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228314_233746_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
515667	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_12432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	775	1098	35891	35108	TRUE	40	TAATCACAATGGTAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36774	28156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515669	contig_2768_pilon	+	3360	7	Intergenic	novelGene_57484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_1	170.118994301701	1094	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	188	1063	656383	678767	FALSE	25	TGAATTTTTTTAAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGSVAERSQTGALHTTPAGDRAAGTRVPATLGSGHHLKEKAREEAGSARTSLLILVSIFLSAAFVMFLVYKNFPQLSEEERVTMKVPRDMDDAKALGKVLSKYKDTFYVQVLVAYFATYIFLQTFAIPGSIFLSILSGFLYPFPLALFLVCLCSGLGASFCYMLSYLVGRPVVYKYLTEKAVKWSQQVERHRDHLINYIIFLRITPFLPNWFINITSPVINVPLKVFFIGTFLGVAPPSFIAINAGTTLYQLTTAGEAVSWYSVFFLMILAVLSILPAIFHKKLKQKYE	656195	681064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656504_664570_664689_668729_668859_671910_672005_672644_672750_677124_677264_678597
515670	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515671	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515672	contig_15063_pilon	+	1436	6	Intergenic	novelGene_9643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	240	1370	34808	36740	FALSE	15	GCTGGTCCTAAGTGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWRTRPTPATDHWAPRPYSAPCGDQPLCVCPCVHSN	27129	36806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36517_36637
515673	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515674	contig_7457_pilon	-	1243	4	Intergenic	novelGene_31676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	88	429	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDVPSPLPAFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176929	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
515676	SIRV6	-	698	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8233	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10780	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723
515677	contig_5033_pilon	-	2480	14	Intergenic	novelGene_29038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3708.72890233378	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	29	1567	566787	532125	TRUE	15	AGACCTGGGCCTGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLHLTGLACCPQQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531140_531364_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536672_542106_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
515678	SIRV6	+	846	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	170	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	27	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	94	426	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1473	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515679	contig_15063_pilon	+	1478	4	Intergenic	novelGene_13965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515680	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_8628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GCTGTTGAAGTAGTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	26367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515681	contig_709_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_57606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	180	557	2360749	2360372	NA	65	AAAAAAAAAACCCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIRATTRIDICTPMFTAVLFTTAKRWKQPRCPSTDKWINKLWYIHTMEYYPTIKNNDESVKYLLTWRNLEGIMLSELSQSQKDKYCIRPLL	2360928	2358362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2358400_2360900
515682	SIRV6	+	851	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	174	494	2458	10736	TRUE	40	CATTCGCATGGAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2011_2450_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515684	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515685	SIRV6	-	479	4	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-56	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2603	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1542_1647_1735_1844_2030_2470
515686	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515687	SIRV6	+	959	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	546	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515689	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515690	contig_15063_pilon	+	1452	4	Intergenic	novelGene_13131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515691	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_8445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	3776.06486820458	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAYFGYWGPGTQVTISLESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	25962	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26016_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515692	SIRV5	+	415	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	100	7368	52	25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTCATAAGCATTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	3623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
515693	contig_15063_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_8786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	627	1370	35349	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35169_35214_35380_35839_36158_36266
515694	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_11244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515696	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27541	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515697	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8567	7	224	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	32	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGACGTATCGTTAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515699	contig_4364_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532839	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
515700	contig_19957_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_57709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTTCAAATAAAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195170	194526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_194500_195200
515701	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515703	SIRV6	+	554	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	606	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2614_2737_2833_3106
515705	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_12762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515706	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	23	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515707	contig_15063_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_13270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	798	1121	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36797	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
515708	contig_8317_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_20731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16531	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
515710	contig_5954_pilon	-	2538	14	Intergenic	novelGene_28635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	432.506551580162	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	762	2177	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947831_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956500_956705_956942_959766_959941_960474
515711	contig_5033_pilon	-	2358	15	Intergenic	novelGene_29010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	261	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	73	1647	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566859	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531138_531567_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
515712	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515713	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515714	contig_15092_pilon	+	2161	3	Intergenic	novelGene_57793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	283	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	235	702	325159	351140	FALSE	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLVEEDTNGHCPGCPGAAGRKLEQIH	324924	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348356_351064
515715	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515716	SIRV6	+	663	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-385	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	102	434	2002	10736	TRUE	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1900	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
515717	contig_18272_pilon	-	2303	3	Intergenic	novelGene_7086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1981	2301	539617	539190	FALSE	45	TTTAAATTATAGATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSETLQCMASLQLLTNQKAVHFSLLNNRREANAHAHSFSSKSDTLQAFLRFPSHHFQQRSYMHCSPESGCKIHSVQRLNASQLNIKSKPRGSANDKQVKRCADHF	541840	539187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_539416_539522_541429_541671
515718	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_8771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515719	SIRV6	+	513	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	6	56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1848_2027_2470
515720	contig_5033_pilon	-	2181	15	Intergenic	novelGene_29027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531432_531992_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
515722	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	225	1460	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515723	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515724	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515726	contig_6215_pilon	-	2177	5	Intergenic	novelGene_21206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	887.311494065077	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1231	1536	227679	227374	FALSE	30	AGACAAAGTGTGTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSAGFACRLRHIAFKERLAMVHTELSTQLDCNLPWVGMASFHTYTVNFVLVYKHMQNNGFSGDVRNAEGLDKGFEKENHGLRKKFFKKTLEISFEKERW	243076	226732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230203_238660_238751_242990
515728	contig_5954_pilon	-	876	6	Intergenic	novelGene_28695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	556.208809710885	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	72	791	959926	945083	FALSE	20	CGAGCTCAGCACGTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960531	944997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_959887_959941_960474
515729	contig_3077_pilon	+	2251	9	Intergenic	novelGene_26738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.53327500624	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	928	1758	12050	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10171	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10710_11125_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
515731	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_12866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515732	contig_15063_pilon	+	1456	5	Intergenic	novelGene_9695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	10	GCCGCTATGTGTGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515733	contig_14287_pilon	-	2192	4	Intergenic	novelGene_24043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.790698163809	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	339	875	22434	21898	FALSE	10	GCTCTTGCTGTGTTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33900	20580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22506_22657_22754_25823_25875_33780
515734	SIRV6	+	389	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-355	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1930	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470_2621_2740_2829_3106
515735	SIRV6	+	570	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-363	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1922	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515736	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515737	contig_15063_pilon	-	1520	5	Intergenic	novelGene_10267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27156_34604_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515738	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515739	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515740	contig_11720_pilon	+	2290	14	Intergenic	novelGene_43974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_10	288.570358961217	3151	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	667	2034	264322	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262275	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
515741	SIRV6	+	617	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	8523	-1	268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515743	contig_7293_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_54228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCGACTCCATGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220430	223901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220400_223900
515744	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8724	6	67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGCCCGAAGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515745	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_14018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515747	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515748	contig_16098_pilon	-	2738	21	Intergenic	novelGene_45838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	522.828126634365	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	53	2653	230275	201500	FALSE	25	GCTACAGTTCCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230475	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228272_228551_228592_230174_230286_230433
515749	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515750	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_13214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515751	contig_3077_pilon	+	1717	11	Intergenic	novelGene_26610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	3234.84800415723	85	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	144	1295	9676	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9532	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17603_17678
515752	contig_17311_pilon	-	2791	5	Intergenic	novelGene_57852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7709.72717983587	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	40	486	126865	121474	TRUE	15	ACTTATATGTGTCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126904	118801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_120490_120856_121642_123344_123555_123642_123709_126862
515753	SIRV6	-	436	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCGCCAATTTCCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11761	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11800
515754	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515756	SIRV6	+	359	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	7	1223	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGCTAGAAGACCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
515757	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515758	contig_177_pilon	+	2264	3	Intergenic	novelGene_41818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	79	1155	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415652	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419322_419615
515760	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515761	SIRV6	+	599	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	540	550	367	-7	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515763	contig_3975_pilon	-	2054	14	Intergenic	novelGene_54791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	309.955732666808	227	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	93	1454	2044892	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAQADWLERCPGCAAIGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052595	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052541
515764	contig_15063_pilon	+	1523	4	Intergenic	novelGene_13447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	202	717	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35384_35839_36158_36266
515765	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515766	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	229	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515767	contig_15063_pilon	+	1477	4	Intergenic	novelGene_13292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	202	726	34808	35938	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35873_36158_36266
515768	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515769	SIRV6	+	887	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	105	318	271	588	2021	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1640	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
515770	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515771	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_8553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	2937.36083712914	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	248	1423	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26348	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
515772	contig_15063_pilon	-	1564	5	Intergenic	novelGene_12308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	30	ACAATGGTAGAATCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515773	SIRV6	+	946	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	589	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
515774	contig_9345_pilon	-	1992	6	Intergenic	novelGene_24654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1871.03184366274	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	465	923	955160	947957	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFSVSIKKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001346	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952565_955131_955356_997013_997093_1001156
515777	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28180	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515781	SIRV6	+	455	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8845	2	-54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTGCAGTTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515782	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515783	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_10658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34925_35033_35380_35839_36156_36264
515784	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	88	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28174	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515787	SIRV6	+	519	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	826	787	-372	82	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	89	421	2002	10736	TRUE	45	GTTTAACAAAACGTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1913	11050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
515788	SIRV6	+	516	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-344	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	61	396	2002	10736	TRUE	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGESESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2627_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515789	contig_5954_pilon	+	2370	15	Intergenic	novelGene_28595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1542	1940	955918	956801	TRUE	30	AGAAGGCAGCCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGTCCGAGSCPTWSLTAAGAAAGGGLAVAGADSACCSRPRFAHCLRSGLASPGTVQVPLPQPGRPWTSHTPLPLAPSPSFSSPSSQEPGAETAPQGAGYSGGGRWQPRPGRGAGRSWHAGAGRGDWAAAG	944716	960590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946248_946708_946907_947096_947204_947434_947560_947660_947714_947798_947935_948089_948197_955828_955927_956116_956290_956378_956498_956703_956942_959766_959941_960474
515790	contig_5018_pilon	-	1029	7	Intergenic	novelGene_47109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_4	534.64113093634	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	70	1029	1402792	1400620	FALSE	35	GTGAGACACAGTGGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQ	1402861	1400619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
515791	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515792	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27159_34606_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515793	contig_3956_pilon	+	2310	12	Intergenic	novelGene_15164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1402.56413356407	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	25	1539	1281682	1289755	TRUE	15	GAAGTTGTGTGTGGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMEPLSP	1281657	1290932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282803_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287530_1289737_1289892_1290297
515794	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515796	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515797	contig_8317_pilon	-	480	2	Intergenic	novelGene_19325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAACGGCGATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16750	16170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16280_16379
515800	contig_7457_pilon	+	4558	21	Intergenic	novelGene_31367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_12	136.444640788856	727	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	192	2366	359330	376754	FALSE	5	GTTGTGTACTGTCTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRQLKRLQANVGAKALYVANFAKVQEKTQILNEEWKKLRVQPVQLMKPVSGHPFLKKCTIESIFPGFASQHMLMRSLNTVALVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLCNIPYMGDEVKEEDETFIEELINNYDGKVHGEEEMIPGSVLISDAVFLELVDALNQYSDEEEEGHNDTSDGKQDDSKEDLPVTRKRKRHAIDGNKKSSKKQFPNDMIFSAIASMFPENGVPDDMKERYRELTEMSDPNALPPQCTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNVYKRKNKEIKIEPEPCGTDCFLLLEGAKEYAMLHNPRSKCSGRRRRRHHVVSASCSNTSASAVSETKEGDSDRDTGNDWASSSSEANSRCQTPTKQKASPAPPQLCVVEAPSEPVEWTGAEESLFRVFHGTYFNNFCSIARLLGTKTCKQVFQFAVKESLILKLPTDELMNPSQKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDNSSTQVYNYQPCDHPDRPCDSTCPCIMTQNFCEKFCQCNPDCQNRFPGCRCKTQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGASEHWDCKVVSCKNCSIQRGLKKHLLLAPSDVAGWGTFIKESVQKNEFISEYCGELISQDEADRRGKVYDKYMSSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVVMVNGDHRIGIFAKRAIQAGEELFFDYRYSQADALKYVGIERETDVL	350143	378946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_350163_358575_358668_359249_359378_359511_359641_360766_360887_362202_362324_363701_363879_364869_364973_365433_365598_365943_366036_368845_369027_369288_369486_370882_370975_372147_372189_372657_372784_373813_373993_374731_374828_375249_375332_375812_375894_376327_376413_376693
515801	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515802	contig_5643_pilon	+	2038	16	Intergenic	novelGene_39050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.695495215857	276	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	636	1826	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635446_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640433_640538_640636_640729_641102_641244_641412
515803	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_14008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515804	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_10837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34924_35035_35380_35839_36156_36264
515805	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515806	SIRV6	+	1006	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	480	-1	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	171	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515808	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	9	1223	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
515809	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2988.60773396242	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266
515810	SIRV6	+	627	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	776	729	-422	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	139	471	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1863	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
515811	contig_15063_pilon	+	1663	8	Intergenic	novelGene_11201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3646.68247891708	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	232	912	34808	36116	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHRLHGRLGVRGNVHMHRHPR	27137	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_35997_36052_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515812	contig_12638_pilon	+	3227	3	Intergenic	novelGene_33147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_2	115	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCAACAATCTTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196120	200426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_198151_198736_198843_199335
515813	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515814	contig_15063_pilon	+	1680	6	Intergenic	novelGene_13682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_1	3798.72333291068	11	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	202	1425	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515815	contig_5727_pilon	+	1585	12	Intergenic	novelGene_7939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	880.359749906933	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGATGACAAAAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168146	177750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174060_176993_177214_177545
515817	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_11065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	785	1108	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36158_36264
515818	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_9513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515819	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515821	SIRV6	+	773	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	6	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2023_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724
515823	SIRV6	+	785	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1197_1468_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515824	contig_5988_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_15855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	451	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTCATCTGATTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268839	265787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_265800_268800
515825	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515826	contig_15063_pilon	-	1732	7	Intergenic	novelGene_9491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	981	1304	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39091_39504
515827	SIRV6	+	349	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-46	182	4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515829	contig_8317_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_19298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	113	409	14731	15209	FALSE	30	TCATCGTTGGTGTTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQ	14325	15210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
515830	contig_3861_pilon	+	3449	11	Intergenic	novelGene_57893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	598.51563053942	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	2486	3448	150245	171886	FALSE	35	AGGTAAGATTTTTGGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFV	141797	171887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_149684_149846_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793
515832	contig_3426_pilon	-	3640	29	Intergenic	novelGene_57911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	109	junction_18	171.983102367645	269	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	1346	3376	201351	145330	FALSE	25	GTAAGTTAAATCTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGTLKYYLTDNLMFTSIYALIQHYRESHLRCAEFQLRLTDPVPNPNPHESQPWYYERLSRGEAEDMLMRVPRDGAFLIRKREGADSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVNYYEKHALYRKMKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	240242	145065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196585_199924_200045_201190_201392_202899_203077_203772_203863_205426_205532_206870_207040_209112_209234_210469_210556_212649_212769_214096_214199_217057_217131_217970_218015_229166_229251_230844_230930_240192
515833	contig_5033_pilon	-	2259	14	Intergenic	novelGene_29044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3708.72890233378	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	840	1586	536585	532125	TRUE	20	CCACCAGACCTGGGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566838	530991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531140_531599_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536654_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
515834	contig_8317_pilon	+	458	4	Intergenic	novelGene_19243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	69	458	14294	15158	FALSE	20	GGGCAGACCCGTGAGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKN	13257	15158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
515835	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_12026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	216	1388	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515837	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515838	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515839	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515841	contig_15063_pilon	-	1723	7	Intergenic	novelGene_12137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	979	1302	35891	35108	TRUE	35	TGAACAAATTGTCACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	27537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
515843	contig_16098_pilon	-	1121	8	Intergenic	novelGene_45964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1399.09495527557	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	112	996	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSKEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354100	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348496_349663_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
515845	contig_11720_pilon	+	1492	10	Intergenic	novelGene_43780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	276	1337	68064	98482	FALSE	25	TATGTTACTGGTAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67788	98637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
515846	contig_15063_pilon	+	1921	7	Intergenic	novelGene_13032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	436	1671	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30081	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515848	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515849	SIRV6	+	874	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	388	548	172	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	152	643	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515850	SIRV6	+	808	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	571	537	355	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	75	566	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1658	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515851	contig_13021_pilon	+	2220	13	Intergenic	novelGene_8198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	71	1921	174676	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174605	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
515852	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515853	SIRV6	+	987	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	537	4	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515855	SIRV6	+	893	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	537	164	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515856	contig_3956_pilon	+	3109	15	Intergenic	novelGene_14871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1320.31966792524	1	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	84	2405	1281682	1290310	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEDRPSRRLHG	1281598	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287992_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289827_1290282
515857	SIRV6	+	532	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8740	-7	51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCGTTGAAGCTATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515858	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10363	118	1126	18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGATGCGGTCTTCAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11363	11708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
515861	contig_15063_pilon	+	1504	5	Intergenic	novelGene_12042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515864	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515865	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515867	contig_57_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_44902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114469	114179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_114200_114500
515868	contig_9807_pilon	+	2414	14	Intergenic	novelGene_32887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	604.100240516188	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	89	934	109130	145126	TRUE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQ	109041	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140850_145123_145219_147134_147279_148960_149049_151711_151772_156624_156770_158676
515870	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26354	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515871	contig_15063_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_14065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515872	SIRV6	+	310	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10453	63	1216	-61	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGATTTAGTCGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11453	11763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
515873	SIRV6	+	820	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	329	661	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1840_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10721_10819_11031
515874	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515876	contig_5643_pilon	+	2043	16	Intergenic	novelGene_39064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	732.665332118894	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	311	1831	631988	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631222	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631483_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
515878	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515879	contig_3975_pilon	-	2255	14	Intergenic	novelGene_54778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_13	243.420983376391	2166	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	206	1654	2052412	2016131	FALSE	5	TCTCCCGAGCTTCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052617	2015529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
515880	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515885	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515886	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515888	contig_12357_pilon	+	1937	10	Intergenic	novelGene_6105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	828.135180114461	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	210	1250	30281	53235	FALSE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26099_30207_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
515889	SIRV6	-	807	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8732	-109	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTCAGTCTACTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1736_1847_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
515891	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515894	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_12952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	23	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28170	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515895	contig_8663_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_57991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATAGACTGTGAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49919	49500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_49500_49900
515896	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3801.46355222418	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	237	1463	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
515899	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515901	contig_5023_pilon	+	2251	13	Intergenic	novelGene_7277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2172.88510683377	3	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	432	1307	625679	646990	TRUE	15	ATTTTTGGTGTCTGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580856	648300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609655_622582_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647374_647739
515902	SIRV6	+	779	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	547	18	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515903	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	229	1035	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266
515904	SIRV6	+	883	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	480	337	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515905	contig_8317_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_19396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAAACCTGTGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
515906	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	138	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515907	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515908	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515909	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515910	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_8494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	8	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	254	1483	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPATELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35043_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515911	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515912	SIRV6	+	327	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	110	164	60	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGCCTGGATGCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
515913	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515914	SIRV6	+	853	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	162	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	32	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	326	658	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
515915	contig_21083_pilon	-	2415	16	Intergenic	novelGene_58017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	63	junction_8	61.8605600434468	504	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2325	89	2413	39832	6061	FALSE	15	GTTCAGTTTTGTGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAG	39920	6058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_-_6232_6555_6755_7481_7637_11250_11363_11469_11610_11855_12000_14707_14895_15669_15790_15965_16163_18968_19134_22984_23144_23592_23813_23961_24075_26674_26826_32064_32138_39813
515916	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_10276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515918	SIRV6	+	616	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	385	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515919	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_12586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	6	1481	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515920	SIRV6	+	733	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8167	4	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
515921	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515922	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515923	contig_15063_pilon	+	1468	5	Intergenic	novelGene_10613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	233	1390	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35858_36158_36266
515924	contig_5988_pilon	-	1625	4	Intergenic	novelGene_15932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	334	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
515925	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	94	12	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
515927	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26549	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515928	SIRV6	+	718	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	762	546	-436	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515929	contig_15063_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_14057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	193	1356	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34615	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35848_36158_36266
515931	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515932	contig_12622_pilon	-	2152	12	Intergenic	novelGene_5936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2232.8115101077	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	64	1401	1590968	1586566	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFGRLSAPQSAPLLVPLAPLQLAPRVPPLLALLRPPPLALLRPPRCLWIQRTMHATCTSLTP	1591031	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586748_1587900_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
515933	contig_15063_pilon	+	1384	6	Intergenic	novelGene_11083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	232	1080	34808	36494	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
515935	SIRV6	+	566	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-15	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515936	contig_5954_pilon	-	2582	15	Intergenic	novelGene_28685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	452.700784183107	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1520	2230	947127	945083	FALSE	15	ATTGCTGGACCATCCGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947975_948088_948197_955828_955997_956121_956288_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
515937	SIRV6	+	658	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8506	18	285	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
515938	contig_15063_pilon	+	1490	5	Intergenic	novelGene_9708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3283.11483198502	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	237	1376	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35872_36158_36266
515940	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515942	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515943	SIRV6	+	677	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	176	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	28	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
515944	SIRV6	+	678	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
515945	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	119	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515946	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515947	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_9508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36772	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36158_36264
515948	contig_18096_pilon	-	2820	5	Intergenic	novelGene_58058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_4	45.9374574829735	810	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	26	376	130868	121550	FALSE	5	TCTGCTCTTTTTTCCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGRFGATMEEYHRHCDEVGFNADEAHNIVKECIDGVLGGEDYNQNNINQWTASIVEQSLAHLVKLGKAYKYIVTCAVVQKSAYGFHTASSCFWDTTSDGTCTVRWENRTMNCIASVFAIAIVL	130893	119105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_121627_121914_121993_122639_122764_128438_128481_130838
515949	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	47	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515950	SIRV6	+	890	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515951	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	20	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515952	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515953	contig_15063_pilon	+	1403	5	Intergenic	novelGene_13559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	202	1230	34808	36632	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
515955	contig_6735_pilon	-	1904	14	Intergenic	novelGene_15769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	869.711044988592	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	85	1521	564868	542371	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGVAFQSGSTPLPFLLQVSNRMS	568282	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542430_542772_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
515956	contig_6735_pilon	-	1970	15	Intergenic	novelGene_15716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	865.486061383417	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	86	1570	564868	542384	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGPIPASSV	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542407_542498_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
515957	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515959	contig_15063_pilon	+	1777	7	Intergenic	novelGene_12287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	50	1522	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28114	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515960	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515961	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515962	SIRV6	+	333	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	532	-9	359	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTCGTAGTCGTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	2549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
515963	contig_15063_pilon	+	1670	6	Intergenic	novelGene_13949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
515964	SIRV6	+	625	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2011_2456_2621_2740
515965	contig_3956_pilon	+	2135	11	Intergenic	novelGene_14912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1253.60129626608	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	358	1917	1286091	1290491	FALSE	20	GAAATGGCCTCTCTGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281600	1290709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281620_1284054_1284267_1284684_1284791_1286070_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
515967	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	9	1421	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515968	contig_10235_pilon	+	2526	4	Intergenic	novelGene_46447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	443	junction_1	37.973675092095	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACGAATGTCCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210517	213693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211662_211924_212047
515970	SIRV6	+	499	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8802	1	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
515971	contig_7151_pilon	-	2622	14	Intergenic	novelGene_40638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_13	126.40959067802	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	818	2457	60	2516	65162	1924	FALSE	25	CCAATGTTTTTCTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65221	1817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_65077
515972	contig_16098_pilon	-	1550	10	Intergenic	novelGene_46119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2126.4915520612	37	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	86	1342	459176	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFISLDNQVPQSGFPRKKFPLKCWQGDPMARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	461754	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459035_459190_461682
515974	SIRV6	+	420	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1387	223	1	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2517	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515975	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515976	SIRV6	+	700	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	548	162	-5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
515977	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515978	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515979	contig_15063_pilon	+	1477	6	Intergenic	novelGene_10231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	238	1377	34808	39670	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALIIYAAPFMSSLALSSKKQVSF	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36559_39603
515980	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515981	contig_15063_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_8706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TTGCCATGTGACCCGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34926_35035_35380_35839_36156_36264
515982	contig_6980_pilon	+	2172	9	Intergenic	novelGene_36025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	695.347170483925	316	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	346	1074	362370	372790	FALSE	30	TTACTGTGTCATTGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346089	373888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356849_361140_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
515983	contig_15063_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_12843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3808.65816791163	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	190	1365	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQRANLLQVSSPSSPDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34653_34699_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515984	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515985	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	87	1081	49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
515986	SIRV6	+	930	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	10	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	138	470	1673	2560	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1147	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
515988	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515990	contig_8317_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_19617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTGTGTCTTCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
515991	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515993	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	9	1421	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
515994	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515995	SIRV6	+	492	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10269	65	1032	-63	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGGATTTAGTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	11761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
515996	SIRV6	+	855	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	250	-11	113	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	24	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
515997	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
515999	contig_6980_pilon	+	2001	10	Intergenic	novelGene_36002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	126	1022	356720	372790	TRUE	20	ACTGTTACTGTGTCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346057	373884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_373261_373375
516000	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10359	81	1122	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11359	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516001	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	43	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516002	contig_15063_pilon	+	1392	5	Intergenic	novelGene_13875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	199	1227	34808	36632	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34609	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
516003	contig_5954_pilon	-	2339	15	Intergenic	novelGene_28622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	420.319387793499	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	527	1978	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960583	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959839_960511
516004	contig_8317_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_20641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGAGAAACCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16465	16787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
516007	SIRV6	+	574	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2737
516008	contig_8772_pilon	+	1840	9	Intergenic	novelGene_21104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	605	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	124	1524	15355	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15231	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
516009	contig_8598_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_22894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	65	418	191218	191571	NA	20	TGTTGGTGAATTGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAGVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAA	191153	191573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191600
516011	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516015	contig_10958_pilon	+	1703	2	Intergenic	novelGene_5462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTTGATTGCACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895279	901585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
516016	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516018	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_8653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26559	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516019	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516021	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	157	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516022	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516023	SIRV6	+	448	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10359	19	1122	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11359	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
516025	SIRV6	+	530	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	806	250	-349	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	66	398	2002	10736	TRUE	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1936	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516026	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516028	contig_9668_pilon	-	2575	16	Intergenic	novelGene_58181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	848.994375063162	523	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	290	2254	605373	503609	FALSE	20	TTTCCTGAAAGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669935	503287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504098_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_662727_662779_669866
516029	contig_5967_pilon	-	2409	9	Intergenic	novelGene_44339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.820529407333	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	111	1109	488569	388566	FALSE	15	TATGAGGTGTATGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430770_465445_465533_482468_482550_488455_488583_517515
516030	SIRV6	+	685	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	158	487	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516031	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516033	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
516034	contig_15063_pilon	+	1401	6	Intergenic	novelGene_12495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3687.08759863391	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	7	1092	28164	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
516037	contig_15063_pilon	-	1546	5	Intergenic	novelGene_8536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	784	1107	35891	35108	TRUE	25	GTAGCAGCCACAGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	26346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26398_34610_34925_35033_35380_35839_36157_36264
516038	SIRV6	+	789	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	480	-441	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516039	contig_15063_pilon	+	1761	7	Intergenic	novelGene_10232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	238	1506	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTADPPLCPVTVAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38942_39092_39506
516040	SIRV6	+	502	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1393	575	8	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	89	298	2569	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2480	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516042	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516044	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10363	64	1126	-62	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11363	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
516045	contig_1516_pilon	+	2378	11	Intergenic	novelGene_49981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1114.81090773279	1400	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	588	1739	353572	363092	FALSE	10	CACCTGTTTCCTCTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335194	363731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353055_353474_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
516047	contig_15063_pilon	+	1466	4	Intergenic	novelGene_13136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TGAGAAGTTGTATGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516048	contig_15063_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_11462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	231	1433	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
516049	contig_7963_pilon	-	2252	6	Intergenic	novelGene_58285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1512.68918155714	6	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGAATCCATGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48903	37066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38468_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
516050	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516051	contig_15063_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_13150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516054	SIRV6	+	754	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	33	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724
516055	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_10644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516056	contig_9008_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_58619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1309	1674	105083	104718	NA	20	TTCCCAGCAGTTCCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKCDLAYIPPEFRDHFKNRFDALNTNNRRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWKSEETLKLALECRIAKVTRRDPLTKRQSLERNKGILRGLKSEKVCIRLYPFTILIQSVC	106391	103543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_-_103500_106400
516057	contig_9471_pilon	+	3744	4	Intergenic	novelGene_21818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_3	146.439976327049	10	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1493	1798	413930	414785	TRUE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	412437	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414084_414633_416273_416936_417028_417152
516058	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516059	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516061	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516062	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516063	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516065	contig_3077_pilon	+	1771	9	Intergenic	novelGene_26720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	367	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	595	1278	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10110	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11189_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
516066	SIRV6	+	1054	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	859	113	-339	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	56	388	2002	10736	TRUE	30	TGCGGTCTTCAAAGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1946	11712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516067	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_11508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516069	SIRV6	+	715	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8177	12	614	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516070	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516071	SIRV6	+	821	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	558	537	342	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	88	579	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1645	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516072	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516073	contig_5727_pilon	-	3829	22	Intergenic	novelGene_7942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1602	1964	177001	176468	TRUE	30	GAAGCCGAACTATCACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSLGHWSNTFRKACMKLSLVAIPSCFSKLIKELAFSLSSSLLSSDRMITLLNISGRKCLGALISLTPLTASFAFPLFRYSVTTVSVNLSSSSFDGGGFLLVLAGFSWISGGLVLRPS	180084	168146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_168382_169823_169946_170281_170348_171185_171328_171890_171992_172571_172710_172797_172864_173289_173443_173717_173827_174028_174120_174208_174300_174718_174862_174958_175120_175472_175587_176189_176316_176460_176568_176652_176867_176952_177225_177536_177747_177914_178132_178219_178342_179255
516074	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516075	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516076	contig_2332_pilon	+	3569	5	Intergenic	novelGene_58635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	37.676252467569	494	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	190	489	180167	231727	FALSE	20	CGTTAGTAACACTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGFDPCECVCSHEHAMRRLINLLRQSQSYCTDTECLQELPGPSGDNGISITMILMAWMVIAVILFLLRPSNLRGSSLPGKPTSPHNGQDPPAPPVD	159942	234807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_160097_180131_180242_211956_212006_228805_228949_231694
516077	contig_8712_pilon	+	2155	5	Intergenic	novelGene_58782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	577.30640694522	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	35	478	314974	321793	TRUE	30	GAAGAAAGCCGTTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286986	323519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318198_321696_322330_322378
516078	SIRV6	+	458	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10349	19	1112	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11349	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
516080	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27123	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516081	contig_5485_pilon	-	2089	4	Intergenic	novelGene_37708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	154	1296	87935	85491	FALSE	40	ATTTAAGTTGAACGCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
516082	contig_10500_pilon	-	3638	10	Intergenic	novelGene_41173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_9	400.975477221904	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	110	1087	1345339	1318487	FALSE	20	AACCTGTTTATGCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAKSTLVGWLERYKNDGLEATGIEVKESVILKCQINMANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1413624	1315935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1413519
516083	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27124	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516084	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516085	contig_1443_pilon	-	4395	26	Intergenic	novelGene_28346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	128	junction_15	230.391062326645	1099	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1047	3144	78	3221	937429	897092	FALSE	0	GTTGTTGTTGTTGTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRERVVEPGPRVILGTRGGAASGAMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEHSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSAPPKKKRK	937506	895917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898936_899547_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125_909222_909341_909408_910547_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913985_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
516086	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516087	SIRV6	+	632	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	344	8167	171	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516088	SIRV6	+	521	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTCGTAGTCGTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470
516089	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516090	contig_5280_pilon	+	2225	11	Intergenic	novelGene_52614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	727.53356623595	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	38343	40148	TRUE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSRMKYLSFCTCIGFYGFQLFHIYYFTEIS	38342	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40056_40150_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56254_56299_56384_62043_62065_78042
516091	SIRV6	+	802	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-14	513	-8	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	120	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516092	contig_4364_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532810	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
516093	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516094	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516096	contig_10674_pilon	-	4163	6	Intergenic	novelGene_6417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_4	55.5712155706531	308	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	767	2935	113201	97346	FALSE	35	ACATGGCCAGCAAATACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVKHALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISQEALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPTDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHVYNWERYHDCQFSDHDWPIHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYSPEPCWQYPDHHENKYCDLECSHTCNYKTSSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWKEQSKEKSDKRGKSKCERNGLVKAQIALEEASQQLAEKEREKNQGFDFDSFIAGTIQLSSQHDPTDVVDKLNDLNSSVSQLELKSLISKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSGGEDCFLINQFCCEVRKDEQDGKENTYTSYLDKFFSRKEDAEMLETEPVEDGKLGERGNEEGFLNNSGEFLFNKQLESIGIPQFHSPVGSPLKSIQATLTPSAMKSSPQIPHKTYSSILKHLN	134176	96117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_98448_100324_100527_104232_104398_110297_110443_112646_113835_134043
516098	contig_3077_pilon	+	2217	9	Intergenic	novelGene_26630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_2	3342.02752597506	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	429	935	13867	16408	TRUE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	9600	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_17054_17449
516102	contig_17936_pilon	+	2114	11	Intergenic	novelGene_29905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	802.318266026644	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	63	1160	50646	118726	TRUE	30	ATACTATTACCAGCCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKEMK	50583	126575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118717_118827_121017_121063_125766
516103	contig_18145_pilon	+	3049	17	Intergenic	novelGene_37334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	479.342872945609	5	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	225	2528	86893	100744	FALSE	15	TGGAGTCTGAGTCCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86668	101265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97278_97486_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
516104	contig_15063_pilon	+	1445	4	Intergenic	novelGene_13128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CAAACTAACCATGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516107	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516108	contig_3410_pilon	-	3146	11	Intergenic	novelGene_58917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	473.261333725881	1303	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	126	1499	57649	15414	TRUE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSKEECPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	57774	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15192_15266_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
516109	contig_7775_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_37516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTACTTTTTAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473016	473411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473000_473400
516110	SIRV6	+	580	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	8506	162	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516111	SIRV6	+	360	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	349	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTAGGTATGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	2558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2470
516113	SIRV6	+	966	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	524	1	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	247	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516115	contig_11720_pilon	+	2055	15	Intergenic	novelGene_43968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_13	341.666056080423	3183	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	5	1468	262271	271346	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGW	262266	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271410_271806_271961_272096
516116	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_8772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	59	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516117	contig_15063_pilon	+	1778	7	Intergenic	novelGene_8465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	288	1523	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26308	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516118	contig_9345_pilon	-	1971	7	Intergenic	novelGene_24624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2208.08701141961	726	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	316	897	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001309	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_956381_956463_997013_997093_1001156
516120	SIRV6	+	262	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	126	1201	10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTTTGCCGATGCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516121	SIRV6	+	865	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	567	162	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516122	contig_10246_pilon	+	2828	9	Intergenic	novelGene_46896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	232.796014517002	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	74	1177	144696	184738	FALSE	20	TCATAGGTTTGTAGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPFASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFVSTGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140726	186389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_171141_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
516123	contig_233_pilon	-	2150	12	Intergenic	novelGene_14580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1176.26701162815	6	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	100	1710	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127006	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93814_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
516125	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516126	contig_17936_pilon	+	2064	11	Intergenic	novelGene_29942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	850.194660063212	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	9	653	50646	106417	TRUE	25	CAGCCTAGTGTCTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKMPTCHLLSLAAQKN	50637	126585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95217_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
516127	contig_3077_pilon	+	2234	8	Intergenic	novelGene_26701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_6	2691.11325116804	35	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	762	1736	11934	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQTWGHQVSQQLRPTTTLPSSVPRRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
516128	contig_12074_pilon	-	2250	15	Intergenic	novelGene_53744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	420.338930300931	1966	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	120	1997	43217	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45854	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
516129	SIRV6	+	704	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	611	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2477_2621_2740_2829_3106
516130	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516131	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516132	contig_4364_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTGACCAGATCACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533263	1532836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
516133	SIRV6	+	404	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-58	337	58	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTATCTTATTGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
516134	contig_15087_pilon	+	2325	4	Intergenic	novelGene_37275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1353.78046800637	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAAATCCTCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284617	303732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289357_301223_301421_301788
516136	contig_1532_pilon	-	1499	7	Intergenic	novelGene_37389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1234.38186285012	21	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	66	806	32217	13057	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTAQQNQEHPLLWKILLPLSPASLSVNKTILQYENAP	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13165_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
516137	SIRV6	+	912	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	177	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	32	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	125	378	147	524	1733	2780	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGESRKSGTRRGTYR	1480	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2625_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11040_11109_11205
516138	SIRV6	+	340	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847
516139	contig_7963_pilon	-	2284	6	Intergenic	novelGene_58281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	68	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	87	779	48838	38897	TRUE	25	GAATCCATGCTCTTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLFQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	48924	37061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43635_43819_48741
516140	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516141	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_11265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516142	SIRV6	+	377	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10368	81	1131	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11368	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516143	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516144	SIRV6	+	1003	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	513	12	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	30	AAATTGGCGATGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516145	SIRV6	+	741	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	93	626	1733	10780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVRIIDERVEVEVVQQES	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10726_10819_11031
516146	SIRV6	+	929	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	22	577	-15	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	236	727	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1109	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516147	SIRV6	+	808	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	347	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	83	577	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1650	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
516148	contig_5499_pilon	+	2883	12	Intergenic	novelGene_57013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	266.222146721415	26	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	907	1641	825148	840037	FALSE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803422	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818145_818295_824822_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
516150	SIRV6	+	796	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-14	519	-8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGTAAGACTGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	10812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516153	contig_9807_pilon	+	1292	5	Intergenic	novelGene_32911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	527.425113167737	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	217	528	140826	158865	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINILGAHPLGPTGSGTRTSLQQNVFFLSMFL	139444	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145215_158784
516154	contig_5222_pilon	+	3286	5	Intergenic	novelGene_58986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	340	junction_3	199.197138533665	1912	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	296	1093	155317	188217	FALSE	20	ATTTGTATTGGAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDSSMSSGYCSLEEELEDCFFTAKTTFFRNVQSKHPCKNVCKPAEEPRQPPTLQEIKQKIHSYNSREKNCLGMKLSEDGTYTGFIKVHLKLRRPVTVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSEVIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSVADCPLYLRLLAGPDTDVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYDKFRQKLEEALRESQGKPG	155021	190410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_155437_183985_184097_185448_185747_186224_186341_188064
516155	contig_13787_pilon	+	2164	8	Intergenic	novelGene_40614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1070	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTTTTGCTTGTCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157976	205259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_+_159340_171771_171862_174977_175080_179622_179670_179767_179843_183754_183890_189120_189190_204976
516156	contig_6215_pilon	+	2783	9	Intergenic	novelGene_21210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATCTAGAAAAAATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226741	238746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228367_229714_229951_230071_230208_231690_231760_231861_232035_233716_233856_234069_234147_235190_235361_238588
516157	SIRV6	+	508	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8509	337	282	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTACGTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516158	contig_14273_pilon	+	3327	9	Intergenic	novelGene_21142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	532.80595670469	1522	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	313	1518	128229	149377	TRUE	15	TGATTTGTTTTTTCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFSCLEVPWTCLFLLLKISVLGSFK	127916	152511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149262_149301_149549_150873
516160	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_8780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516161	contig_6735_pilon	-	2023	14	Intergenic	novelGene_15701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	969.272569306213	489	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	779	1543	545022	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568279	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545909_546577_546634_547243_547355_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
516162	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	39	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516164	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516165	contig_15063_pilon	+	1536	4	Intergenic	novelGene_13847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	5	TGCTCACCTGCCTGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516166	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516167	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516168	SIRV4	+	480	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	980	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACATGCTAGAAACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	3385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_2668_3137
516169	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516170	contig_13592_pilon	+	2870	16	Intergenic	novelGene_33704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_8	547.319772467004	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1311	2585	260422	269322	FALSE	20	TTTCAAGAAGTCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249302	269607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_260283_260425_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
516171	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	30	1223	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
516172	SIRV6	+	785	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	133	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	94	429	1673	2560	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1473	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2476_2621_2740_2815_3106_3165_10724_10819_11031
516173	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	82	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516175	SIRV6	+	1147	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	816	63	-382	-62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	99	431	2002	10736	TRUE	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1903	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516176	SIRV6	+	542	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	527	8180	354	611	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516177	SIRV6	+	681	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	337	85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAAAACGTCACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1732_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
516178	contig_15063_pilon	+	1491	5	Intergenic	novelGene_12430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	8	1420	28164	36661	FALSE	30	CAAACTAACCATGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516180	contig_15063_pilon	+	1424	6	Intergenic	novelGene_12777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1	1197	28164	36572	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFTGAPGTHSPASWSTRPCPTR	28163	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36386_36509
516181	SIRV6	+	447	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGTGCGTCTAGGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2027_2470
516182	SIRV6	+	681	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	394	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	36	569	1733	10780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1697	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11034
516183	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516184	SIRV6	+	438	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	95	2	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
516185	contig_13740_pilon	-	2096	13	Intergenic	novelGene_34610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4147.9339602854	402	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	169	1194	165243	157474	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_156375_156606_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
516186	contig_5643_pilon	+	2028	17	Intergenic	novelGene_39007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	800.096886223006	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	153	2009	631341	641584	FALSE	10	TGTGTAGCCTCTACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGAGRDTATGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631188	641603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634851_634950_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
516187	contig_12873_pilon	+	2149	6	Intergenic	novelGene_27191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_2	905.273306797456	92	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1084	1575	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15998	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
516188	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516189	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_10142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516190	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516192	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516193	contig_15063_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_8487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	253	1491	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTTTTSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516194	SIRV6	+	817	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	18	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTGCGACAGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	11615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516195	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516196	contig_1244_pilon	-	2069	11	Intergenic	novelGene_37972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	895.099324097611	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	79	1287	948448	923211	FALSE	20	ATGATGGGCTAAGCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948526	922428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928851_934510_934566_946439_946620_947578_947655_948440
516197	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516198	contig_17936_pilon	+	2209	11	Intergenic	novelGene_29904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	64	1347	50646	121021	TRUE	25	GCCTAGTGTCTTGAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50582	126587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
516199	SIRV6	+	937	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	242	730	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1105	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
516200	contig_9440_pilon	-	2808	5	Intergenic	novelGene_59092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	356.431181997311	1734	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	88	771	1716626	1700693	FALSE	10	CATTACTTTGTCTTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716713	1698655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
516202	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_12954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28171	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516203	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516204	SIRV6	+	327	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	346	94	180	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
516207	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516208	SIRV6	+	602	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	553	534	380	9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAATAGTGCAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683	10797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516209	SIRV6	+	589	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	822	-415	822	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11059	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
516210	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516211	SIRV6	+	647	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	180	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516213	SIRV6	+	883	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	480	337	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	38	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516214	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	253	1425	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTTSTAGARANWSPSPQVKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26347	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26406_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516215	contig_11285_pilon	+	2245	12	Intergenic	novelGene_5625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	508.553937589728	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	11	1267	766060	769026	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSLSWPGQVARLLSLCSSALFLAQGWRASSVRFVSSQRSCEQEWQGG	766049	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768792_768889_769320_769421_769653_769740
516216	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516218	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516219	SIRV6	+	682	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTTAGGTAGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516220	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_11490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516221	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	57	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516222	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516223	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516224	SIRV6	+	785	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	558	1	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516226	SIRV6	+	911	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-2	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11107_11205
516227	contig_6576_pilon	+	2991	3	Intergenic	novelGene_42408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	91	1437	1301228	1302574	TRUE	30	AACAGAGAAGTTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295686	1304277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303545_1303693
516229	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516230	SIRV6	+	909	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	577	-1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516232	SIRV6	+	656	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2011_2456_2621_2740
516234	SIRV6	+	673	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	344	566	171	-23	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGAGAGTTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516235	contig_15063_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_8674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	GTGACCCGTTAAAGGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516237	SIRV6	+	628	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	345	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516238	contig_15063_pilon	+	1411	6	Intergenic	novelGene_11707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	229	1272	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35075_35203_35380_35839_36158_36266
516239	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_12973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28174	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516240	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516243	contig_6137_pilon	+	3900	1	Intergenic	novelGene_59296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1214	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	411	734	1589653	1589976	NA	10	TGCCATGGTGTGTCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEGGLAPSQRGQGRVNTGLTSNGTGLGRDAYTHLPRRGGEAISTFRETFTLKRSSEGGRIKNGPQRRLTHPRAPGFPRASAEEPVERCSHLPLGSSLFISEGIKHQ	1589242	1593142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1589200_1593100
516244	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516245	SIRV6	+	1465	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	63	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4643	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	195	686	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1150	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516246	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516247	contig_10734_pilon	-	2092	4	Intergenic	novelGene_51000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	5231	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	90	695	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320721	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
516248	SIRV6	+	631	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	889	506	-309	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	26	358	2002	10736	TRUE	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1976	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516249	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_9318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516250	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516251	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516256	SIRV6	+	542	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	251	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCGTCTTCGGTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740
516258	SIRV6	+	665	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	838	523	-360	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	77	409	2002	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1925	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516261	SIRV6	+	451	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTCGTAGTCGTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155	2550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1636_1741_1856_2035_2470
516262	SIRV6	+	881	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	124	375	321	695	2002	10780	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVRIIDERVEVEVVQQES	1470	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10726_10819_11031_11109_11205
516263	contig_8317_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_19335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTTCTTTCCAGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16757	16179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16285_16379
516264	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	13	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	3	1415	28164	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
516265	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	197	1039	34808	36333	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34611	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36268
516267	contig_8317_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_20657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAATGAGAAACCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16474	16786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
516272	SIRV6	+	360	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10464	2	1227	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11464	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
516273	SIRV6	+	712	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	893	421	-305	73	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	22	354	2002	10736	TRUE	45	ATTCGCATGGAACAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1980	11404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516274	contig_10863_pilon	-	3888	18	Intergenic	novelGene_59335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_7	152.776268560579	346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	182	1981	111386	89018	FALSE	20	TTTTTATGTACCAATTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKLTRIAIVNHDKCKPKKCRQECKKSCPVVRMGKLCIEVTSQSKISWISETLCIGCGICIKKCPFGALSIVNLPSNLEKETTHRYCANAFKLHRLPIPRPGEVLGLVGTNGIGKSTALKILAGKQKPNLGKYDDPPDWQEILTYFRGSELQNYFTKILEDDLKAIIKPQYVDQIPKAAKGTVGSILDRKDETKTQAIVCQQLDLTHLKERNVEDLSGGELQRFACAVVCIQKADIFMFDEPSSYLDVKQRLKAAITIRSLINPDRYIIVVEHDLSVLDYLSDFICCLYGVPSAYGVVTMPFSVREGINIFLDGYVPTENLRFRDASLVFKVAETANEEEVKKMCMYKYPGMKKKMGEFELAIVAGEFTDSEIMVMLGENGTGKTTFIRMLAGRLKPDEGGEVPVLNVSYKPQKISPKSTGSVRQLLHEKIRDAYTHPQFVTDVMKPLQIENIIDQEVQTLSGGELQRVALALCLGKPADVYLIDEPSAYLDSEQRLMAARVVKRFILHAKKTAFVVEHDFIMATYLADRVIVFDGIPSKNTVANSPQTLLAGMNKFLSQLEITFRRDPNNYRPRINKLNSIKDVEQKKSGNYFFLDD	119247	87110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_89066_90223_90336_92156_92280_92408_92552_92624_92736_94860_94920_95018_95079_96699_96922_98844_98967_103048_103139_105476_105574_105833_105904_106048_106187_106639_106758_107764_107863_110316_110403_111283_111415_119094
516275	SIRV6	+	569	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8725	8	66	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGCCCGAAGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516277	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516278	SIRV6	+	976	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	15	537	15	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	335	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516279	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516283	contig_15063_pilon	-	1490	4	Intergenic	novelGene_13178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36779	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36256
516284	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516286	contig_10958_pilon	+	1662	2	Intergenic	novelGene_5473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACCGCTTGATTGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895317	901582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
516289	SIRV6	+	901	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	139	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10815_11031
516291	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516293	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516294	SIRV2	-	374	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4451	82	3276	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCGTAATTGTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456	1082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
516296	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516297	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516298	contig_15304_pilon	-	977	3	Intergenic	novelGene_30473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	198	599	54100	53260	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCRGTASHPRSTCCHHRRRSWR	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53579_53813_53991
516299	contig_17976_pilon	+	2233	5	Intergenic	novelGene_32523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1283.883951142	9	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	157	1209	41843	47798	TRUE	45	AAAAAGTTGGTTGAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRERACGHRSKPLIPTVLAFAPLLTLADPPWTSLLSPSLCCPYSPPAKPSLLPGFPSPGLTGRSGPSTQLTAGLSKSWLNNEWII	41686	48893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47174_47550_48646_48716
516300	contig_18272_pilon	-	2915	1	Intergenic	novelGene_6989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1028	1456	122637	122209	NA	35	TCAGAAATGATGACACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	123664	120749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_120700_123700
516301	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	239	706	34808	35848	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRN	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35844_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516302	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516304	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516305	contig_8317_pilon	+	453	2	Intergenic	novelGene_19355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16229	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
516306	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516307	contig_13216_pilon	+	2533	7	Intergenic	novelGene_47481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	946.023196802747	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1394	1993	259163	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEHLKLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229630	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256214_256296_258447_259181_260430
516308	contig_12622_pilon	-	2097	12	Intergenic	novelGene_5983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2232.8115101077	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	64	1914	1590968	1583745	FALSE	25	TTCTCTAACCTTCAGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTTGPTGPPSAGPTGPPTAGPSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591031	1583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586718_1587911_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
516309	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_8690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516310	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516311	contig_3424_pilon	+	2526	3	Intergenic	novelGene_55465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	154.5	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	208	2292	163695	170678	FALSE	30	CTCAAATATTTTTTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149796	170912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701
516312	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516313	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516315	contig_15063_pilon	+	1616	8	Intergenic	novelGene_8580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3722.07511246847	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	245	1237	34808	38976	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGHIHLHRGPRGPVPPGDREDRGQVH	26351	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36403_36521_36600_38975_39092_39506
516316	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516317	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516319	SIRV6	+	983	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	532	13	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516320	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516321	contig_12837_pilon	+	2164	8	Intergenic	novelGene_57307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	2390.08693377885	3659	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	293	736	129778	166049	FALSE	20	TTTTGTTTGACAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128777	167477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128939_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
516322	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_9943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	780	1103	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36779	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516324	SIRV6	+	436	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTAGGTATGGCACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470
516325	SIRV6	+	837	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	559	520	343	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	87	578	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1646	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516327	contig_15063_pilon	+	1506	5	Intergenic	novelGene_9300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	35	GAGAAGTTGTATGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516328	contig_12357_pilon	+	1808	10	Intergenic	novelGene_6112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	827.388275252128	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	74	1114	30281	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_25993_30237_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
516329	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516330	SIRV6	+	679	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	767	589	-431	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	148	480	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1854	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
516331	contig_15063_pilon	+	1835	7	Intergenic	novelGene_12283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	108	1580	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28056	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516332	SIRV6	+	492	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	165	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2028_2470
516333	contig_7775_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_37515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTAAAACAAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473000	473467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473000_473500
516334	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516335	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516336	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	24	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516337	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516338	contig_3077_pilon	+	1712	10	Intergenic	novelGene_26682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	3403.91831226062	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	66	1214	9735	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNVAEGGSDRSLGWPRWIGAVMFRLKGPGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9669	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9757_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
516339	contig_10235_pilon	+	2272	6	Intergenic	novelGene_46440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	1962	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	7	726	210483	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210476	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
516340	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516341	contig_15063_pilon	+	1517	5	Intergenic	novelGene_11247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516343	contig_15063_pilon	-	1700	7	Intergenic	novelGene_9492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	949	1272	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36566_38972_39090_39504
516344	contig_7594_pilon	-	3838	2	Intergenic	novelGene_55445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	3172	3591	559231	558812	FALSE	40	AAACTTTCCCATCCCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKSQAPLDPGSSELTGQHSQTHTQQDHDTDRKPSHFRLPDRPLLRRARCTPGATAAQKRLERRGLREPGGDAISALGVSSGLSLSSFQTGVVPGLWECGRESCSHFCYARFPDPGRGLGDPETQTREVNRVWSLLVR	566720	558564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_561750_566067
516345	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27553	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516347	contig_5023_pilon	+	2179	14	Intergenic	novelGene_7342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1824.69295787882	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	40	1737	608043	646990	FALSE	35	CCACGGAAGGTGTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	608003	647432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622542_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
516348	contig_14215_pilon	+	3965	2	Intergenic	novelGene_59356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCACCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176870	180997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_179890_180051
516349	SIRV6	+	638	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-422	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1863	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516350	SIRV6	+	432	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845_2027_2470
516351	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_11660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516352	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516353	contig_19579_pilon	-	2434	5	Intergenic	novelGene_59368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1390	junction_4	141.393953194612	154	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	88	309	13090	12869	TRUE	40	AAATCTATATGGGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGMGHSKGNVL	13177	7166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8825_12012
516354	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516355	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516356	contig_10496_pilon	-	2993	10	Intergenic	novelGene_59418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_9	91.571465715764	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	763	2235	55665	38747	FALSE	30	CAAAGTTGCATGCTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64722	37988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_56288_64482_64573_64672
516357	SIRV6	+	719	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-430	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	166	477	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1855	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516358	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516359	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516361	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516362	SIRV6	-	293	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAGTTCATGTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11769	11476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
516363	contig_13707_pilon	-	2314	11	Intergenic	novelGene_43532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	717.256969293432	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	192	1268	275210	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275541	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_275201_275274_275413
516364	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516365	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516366	SIRV2	-	349	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4089	358	2910	-358	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGGCATTAACCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1822	1393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
516368	contig_4364_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_2452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAGCTCTTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533263	1532931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
516369	SIRV6	-	382	3	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-259	495	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAGGCTACATGAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2806	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2470_2619_2738
516374	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516375	SIRV6	+	679	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	766	581	-432	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	149	481	2002	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1853	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516376	contig_9468_pilon	+	2886	12	Intergenic	novelGene_59496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_11	172.232305164126	2501	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	133	1350	347212	356943	FALSE	45	AAATGTATCAAACATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGDSEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQEQEEKQKLAEDAEMKSLEEKMGCLLKFSGDLDDQTCREDLHNLFSNHGEIKWIDFVRGAKEGVILFKEKAKEALDKAKDASNGNLQLRNKEVTWEVLEGEVEKAALKKIMEDQQESLNKWKSKGRKFKGKGKGNKVTQAGSAKGKVQFQGKKTKFDSDNECDENGAAGSVKRAREETDREEPASKQQKTENGSGDQ	345159	358479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_345271_347190_347278_350685_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_354779_355112_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
516377	SIRV6	+	763	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	321	662	2002	10736	TRUE	45	GTTTAACAAAACGTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1843_2022_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516379	contig_4364_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532845	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
516380	contig_15063_pilon	-	1739	7	Intergenic	novelGene_8543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCAGCCACAGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39770	26346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35378_35838_36156_36264_36597_38972_39090_39504
516381	SIRV6	+	746	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2029_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516382	contig_13216_pilon	+	2612	7	Intergenic	novelGene_47486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	887.300916638018	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1478	2077	259163	261012	FALSE	15	ACTTAGTTTTGTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEHLKLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229640	261547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_259181_260430
516383	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_12378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	10	1422	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516385	contig_8317_pilon	+	482	2	Intergenic	novelGene_19345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16200	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
516386	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	60	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516387	contig_12414_pilon	+	1687	2	Intergenic	novelGene_59549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	5849	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
516389	contig_19825_pilon	-	3058	10	Intergenic	novelGene_59681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_9	156.816240655531	683	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	35	1042	70117	17388	FALSE	20	CTGAATTTTGAGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRWFWCVSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCKQADEEFQILANSWRYSSAFTNKIFFAMVDFDEGSDVFQMLNMNSAPTFINFPAKGKPKRGDTYELQVRGFSAEQIARWIADRTDVNIRVIRPPNYAGPLMLGLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFNGGVTLGMVLLCEAATSDMDIGKRKIMCVAGIGLVVLFFSWMLSIFRSKYHGYPYSFLMS	70151	15371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_23163_23239_36715_36780_37429_37520_38098_38240_38733_38875_42313_42432_46551_46722_70015
516390	contig_13863_pilon	+	2581	10	Intergenic	novelGene_42029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_9	674.089912308843	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	944	1762	99260	118962	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98316	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
516391	SIRV6	+	565	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	8516	167	275	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAATGCCCTGGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516392	contig_5189_pilon	-	2351	11	Intergenic	novelGene_34841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	4	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
516394	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516395	contig_17936_pilon	+	2002	10	Intergenic	novelGene_29896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	833.088690015714	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	72	1145	50646	121021	TRUE	25	TACCAGCCTAGTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVVRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50574	126582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50680_79202_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
516396	contig_15063_pilon	+	1479	5	Intergenic	novelGene_11656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	20	CTAACCATGTCTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516397	contig_9593_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_59710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTAAAGCGATAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272764	271167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_271200_272800
516398	contig_14287_pilon	-	2250	4	Intergenic	novelGene_24047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	122.790698163809	40	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	400	936	22434	21898	FALSE	10	TGAGCTCTTGCTGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33921	20583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22464_22575_22754_25823_25875_33780
516399	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516401	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516402	contig_6215_pilon	-	2872	10	Intergenic	novelGene_21192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	750.891042711718	6	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	45	1364	243029	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243073	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_231991_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
516404	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	774	517	-424	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	141	473	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1861	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516405	contig_18272_pilon	-	3112	9	Intergenic	novelGene_6984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_8	544.93266499174	1192	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	387	1646	184469	122209	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	264425	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184551_264120
516406	contig_14986_pilon	+	1006	2	Intergenic	novelGene_59725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTAAGTACTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150255	171143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150537_170418
516407	contig_15063_pilon	+	1467	4	Intergenic	novelGene_13907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	40	AGTTGTATGTTTATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516408	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516409	contig_15063_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_8670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3779.87886710672	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	30	AAATGTGTATATATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26755	39748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516410	contig_6946_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_59748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATATGCACATGCGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12191	13676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_12200_13700
516411	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	249	1421	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27120	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516412	SIRV6	-	1444	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9215	431	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAATTTCCCGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11762	1113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
516413	contig_15063_pilon	+	1489	5	Intergenic	novelGene_9697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516415	contig_5954_pilon	-	2767	14	Intergenic	novelGene_28689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	286.900638429685	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	664	1206	956264	947658	TRUE	40	ATAAATAAATGTTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFR	960581	944745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945741_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
516420	contig_8729_pilon	-	3222	3	Intergenic	novelGene_40159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_2	187	36	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1301	1621	768761	766599	FALSE	40	TTCTCAAAGTGTATAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVRLK	770678	764997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_766779_768620_768822_769438
516421	contig_4469_pilon	-	2619	6	Intergenic	novelGene_21952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCGGTGTGTGCTCCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757433	751656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_751966_752132_752202_752459_752570_753495_753617_754981_755536_755977
516422	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516423	contig_15063_pilon	-	2216	6	Intergenic	novelGene_12515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1349	1768	35527	35108	TRUE	40	GTAATCACAATGGTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	28157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28210_34599_34924_35035_36156_36264_36597_38967_39090_39504
516424	contig_1225_pilon	+	2353	4	Intergenic	novelGene_44151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	64	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	221	538	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250593	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275511_276082
516425	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516426	SIRV6	+	732	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	20	549	13	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	30	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516427	contig_10311_pilon	-	2142	10	Intergenic	novelGene_50444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_9	842.580032466419	164	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	34	963	71526	67803	TRUE	25	TAAAAGTTGCTTTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALVRGVVT	71559	65129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
516428	contig_13021_pilon	+	1875	10	Intergenic	novelGene_8164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2821.33022211549	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	169	1572	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178246_180504
516429	contig_5698_pilon	+	2139	8	Intergenic	novelGene_55020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19809_19894
516431	contig_19459_pilon	-	406	2	Intergenic	novelGene_59847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15694	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6954_15574
516432	contig_5643_pilon	+	2035	16	Intergenic	novelGene_39035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	781.286278446569	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	1077	2021	636518	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631202	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635694_636211_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
516433	contig_15063_pilon	-	1448	5	Intergenic	novelGene_8546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	685	1008	35891	35108	TRUE	30	AGTAGCAGCCACAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36684	26347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26400_34610_34925_35033_35380_35839_36156_36264
516434	contig_15063_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_10327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516435	contig_12357_pilon	+	2115	13	Intergenic	novelGene_6084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	886.163485042248	4	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	117	770	26079	34295	TRUE	55	CTTAAGAATAGAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGRNFSI	25962	53912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34226_34275_34315_35038_35160_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
516436	SIRV6	+	566	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGCCCGAAGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_1843_2028_2470
516437	contig_5023_pilon	+	2853	16	Intergenic	novelGene_7267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2206.92174356551	2	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	77	1558	607312	639093	TRUE	40	AGGCGAAAGAGCAGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLVHTEYP	580853	647924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607286_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631542_639072_639197_643413_643539_646857
516439	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516440	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	87	1081	49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
516441	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	31	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516442	contig_10627_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_60020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATATAATGAAGATCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395030	394323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_394300_395000
516443	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516444	contig_4103_pilon	-	314	5	Intergenic	novelGene_51933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	731	junction_4	318.00972862477	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGCGAGAGCTAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91897	85779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
516445	contig_4429_pilon	+	3017	11	Intergenic	novelGene_50782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	580	junction_1	277.42604419917	606	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	95	2170	154531	198515	FALSE	25	CCTAGTTTTGTTAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154436	199362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
516446	contig_15063_pilon	+	1487	6	Intergenic	novelGene_8538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3752.95938693719	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	530	1351	35271	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26346	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35072_35142_35380_35839_36158_36266
516447	SIRV6	+	243	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10564	19	1327	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11564	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
516450	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_8633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	220	1455	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26376	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516451	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26348	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516452	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516453	SIRV6	+	411	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8793	164	-2	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516455	contig_15063_pilon	+	1388	6	Intergenic	novelGene_11387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	231	1079	34808	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
516457	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516458	contig_15063_pilon	+	1404	6	Intergenic	novelGene_11812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	3599.01434284444	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	228	1112	34808	36504	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRPGLLLHLQHPERV	27141	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36460
516459	contig_5018_pilon	-	1970	9	Intergenic	novelGene_47104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	686.128996617983	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	70	1149	1402792	1400500	TRUE	30	AGCTCGGCTCATACTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVRHSGRRKEGPGGRGDRILTQERRSRGGRIQMQAGLTAK	1402861	1399152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400028_1400466_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
516460	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516461	contig_15063_pilon	+	1444	5	Intergenic	novelGene_12073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	218	1300	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36068_36266
516462	contig_15063_pilon	+	1358	6	Intergenic	novelGene_10191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2716.51052639227	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	238	681	34808	36299	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKLPSLCPQRWPSMHQPST	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35310_36245_36600_38975_39092_39506
516463	contig_15092_pilon	+	2078	3	Intergenic	novelGene_57800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	128	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	76	642	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPAQLIRCRRRRHRIPKAKDARPRDMDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325083	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
516464	contig_15047_pilon	+	1719	6	Intergenic	novelGene_52109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3059.86722587762	15	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	62	1036	2194	4686	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2132	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4158_4434_4552_4722_21013
516465	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516466	SIRV6	+	815	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	162	656	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516468	contig_17936_pilon	+	2062	10	Intergenic	novelGene_29954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	833.088690015714	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	98	1207	79133	121021	TRUE	20	ATTACCAGCCTAGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	68326	126580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68395_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
516469	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	569	1390	35271	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34954_35049_35380_35839_36158_36266
516470	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_12167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	40	AGTTGAACAAATTGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516471	contig_1532_pilon	-	1907	9	Intergenic	novelGene_37390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1285.74375363056	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	66	1307	32217	12964	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSPLFWAQILVSKSCNNIF	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13015_13115_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
516472	contig_10134_pilon	-	2284	4	Intergenic	novelGene_16258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAGCATTTGAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39688	32509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38701_39022
516473	contig_3380_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_60103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGTTCCTTATAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405791	406180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_405800_406200
516474	contig_3380_pilon	+	3697	1	Intergenic	novelGene_60104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1307	1702	407536	407931	NA	85	ACCGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSLGNTAIPTARVENISPCAMTRVSGDASRVYMGMKGPGIAKTFLKKKSKVGKFTLPDFMTYSKSAIIETMWCRHKDRQVHLWNRIASSERNLHIWSVDFQQRQKGMSMQKGMSFQQMVVEQMISILKK	406229	409926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_406200_409900
516475	contig_5018_pilon	-	1918	9	Intergenic	novelGene_47040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	67	1317	1402792	1399645	FALSE	15	CCAAAGGTGGCCTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402858	1399043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
516476	contig_6980_pilon	+	1965	9	Intergenic	novelGene_36029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	701.395561986958	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	90	512	356720	368339	TRUE	20	CAGACTGTTACTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNTKHTKC	346093	373881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368318_368383_370468_370641_371430_371523_372735
516477	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516479	contig_17964_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_33885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCCGACCCTGCACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147743	147075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_147100_147700
516480	contig_15063_pilon	-	1987	4	Intergenic	novelGene_11495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.3137084989848	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1147	1566	35527	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27173_34610_34925_35033_36156_36264
516481	contig_6691_pilon	+	4349	12	Intergenic	novelGene_60159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	41.8260862094854	342	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	26	1258	360462	408909	FALSE	10	TTTCTCTATAGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRANMAAEIHSRPQSSRPVLLSKIEGHQDTVTAALLIPKEDGVITASEDRTIRVWLKRDSGQYWPSIYHTMASPCSTMAYHHDSRRIFVGQDNGAIMEFHVSEDFNKMNFIKTYPAHQNRVSAIIFSVATEWVISTGHDKCVSWMCTRSGSMLGRHFFTSWASCLQYDFDTQYAFVGDYSGQITLLKLEQNTCSVITTLKGHEGSIACLWWDPVQRLLFSGASDNSIIMWDIGGRKGRTLLLQGHHDRVQSLCYLQLTRQLVSCSSDGGIAVWNMDVNREEAPQWLESDSCQKCEQPFFWNLKQMWDTKTLGLRQHHCRKCGQAVCGKCSSKRSSYPIMGFEFQVRVCDSCYDSIKDEDRTSLATFHEGKHNISHMSMDVARGLMVTCGTDRVVKIWDMTPVVGCSLATGFSPP	360436	412000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_360599_380587_380656_385552_385627_389195_389251_392238_392390_394037_394151_396243_396371_399448_399555_403137_403240_406509_406641_407926_408036_408849
516482	SIRV6	+	530	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	19	8710	12	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516483	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_9145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3609.08325155664	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	243	1484	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKQVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39503
516485	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_8672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	223	1458	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26756	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26785_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516487	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10416	87	1179	49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11416	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516488	contig_9112_pilon	+	384	2	Intergenic	novelGene_60214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1280	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTGACAGCCAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108421	111616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553
516489	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516491	contig_15063_pilon	+	1665	6	Intergenic	novelGene_13592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	45	GAAATAAATGTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516492	SIRV6	+	906	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	88	267	92	358	1673	2492	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSKAKLLDKQLCVTVKQGAQTERQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASCARHFN	1470	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2028_2470_2625_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516493	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516494	SIRV6	+	1034	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	28	466	-9	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	230	721	1733	10736	TRUE	35	TGTGAACGCAGTTAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1115	11359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516496	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_12811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	7	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516497	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516498	SIRV6	+	608	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8573	1	218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCGTGGGACGTATCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516500	SIRV6	+	380	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	18	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
516502	SIRV6	+	575	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	8506	167	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516503	contig_6960_pilon	+	4849	1	Intergenic	novelGene_60238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	45	275	319	281707	281751	NA	35	TCCTTAATAATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFNCALGESVKLSSFLISQFIHILLRNISCSPCNVTAQSRFPPWVSCVCSTSSFPFLPSHPASGQHPFGFVYLLELRSTLLTSIIFVLVLSMSEEWTSGMVLVLG	281432	286281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_281400_286300
516504	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_9506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516507	SIRV6	+	509	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10260	57	1023	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11260	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
516508	contig_16098_pilon	-	1378	9	Intergenic	novelGene_46102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	76	1170	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460202	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
516509	contig_1225_pilon	+	2813	4	Intergenic	novelGene_44162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	209	526	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250605	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_276477_276576
516510	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	15	ACTGCGTTCTTGTGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516511	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516512	contig_10958_pilon	-	1821	2	Intergenic	novelGene_5469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901702	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
516513	contig_10958_pilon	+	1651	2	Intergenic	novelGene_5475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTGTGAATCATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895434	901688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
516514	contig_15063_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_11270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	231	1379	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36140_36272
516515	contig_15063_pilon	-	2142	5	Intergenic	novelGene_13020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	AAAGAGAATATCGGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	29668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516517	contig_15063_pilon	+	1453	5	Intergenic	novelGene_11231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	10	TATGTGTGTGTCCATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516518	SIRV6	+	694	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	8180	-7	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516519	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516521	contig_7357_pilon	-	3765	19	Intergenic	novelGene_36853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_16	184.075543067393	93	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	46	2220	249442	197341	FALSE	20	CATTCCTTGTAACTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADETPKKGNFSALVGHTNGLTKPASLAAAAAVTTKPGGGSGSKKLVIKNFRDRPKLPDNYTQDTWHKLHEAVKAIQSSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKVSPTLYKQLRQIMIRSIFLFLDRTYILQNSMLPSIWDMGLELFRNHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERNGEAVDRSLLRSLLSMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLTQMYQLFSRVKGGQQILLQHWSEYIKTFGTTIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHIIEVCFQKNEKFINLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERILDKIMIIFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQYMQNQSDPGSIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKTFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFREGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDEFSFEEIKMATGIEDNELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKDVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA	249487	195795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_197437_199280_199434_204278_204452_204644_204751_206605_206720_213683_213792_214172_214259_214367_214479_214796_214902_216660_216854_220279_220399_223589_223658_227155_227239_228379_228470_229094_229258_233562_233637_240209_240270_247801_247918_249285
516522	SIRV6	-	553	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8798	-168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGAACCTTAGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11345	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
516523	contig_15063_pilon	+	1661	6	Intergenic	novelGene_13589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	79	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516524	contig_11171_pilon	+	2746	5	Intergenic	novelGene_48558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	85.1832583316698	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	78	851	70574	105888	FALSE	35	TTCGGAAGGAGAGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70496	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88420_105710
516525	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_9651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516526	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516528	SIRV6	+	569	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	572	548	399	-5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516529	contig_12425_pilon	-	1915	10	Intergenic	novelGene_46682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	722.065555657287	22	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	104	1093	211174	204102	FALSE	15	CTTGAAATTTGCTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGAIWAGDGRHGSGNVFYYLSSDKI	226595	203279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204173_204835_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
516530	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516531	contig_5988_pilon	+	2171	5	Intergenic	novelGene_16106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1887.31681230259	5999	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222072	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225257_1225481
516532	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516533	contig_8581_pilon	-	2936	18	Intergenic	novelGene_22819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	529.648829275532	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	863	2592	39	2630	386058	306646	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEGWPRAPTVKMIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCDARPWGCIPRVKCIITSRHCRDSASQGTT	386096	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306735_309018_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
516535	contig_12923_pilon	-	2662	14	Intergenic	novelGene_30083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	345.659321968763	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	58	1572	93727	48997	TRUE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPPNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101225	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51126_57218_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
516536	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	224	1459	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28177	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516537	contig_19564_pilon	-	2212	5	Intergenic	novelGene_29608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.43123896188	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	160	1356	15529	12201	FALSE	60	AAAAAAAGAAACCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQADHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15688	11344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12360_12419_13259_13554_13666_13945_14006_15501
516538	contig_5954_pilon	-	2590	14	Intergenic	novelGene_28670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_7	405.863095231638	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	660	2468	956264	944848	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTEWGRGWGRGLTPPGQGRAAPASHLSLSNRPPGRPPALRWPSSLTSTSTWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960577	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
516539	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516540	SIRV6	+	785	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516541	contig_500_pilon	+	1843	11	Intergenic	novelGene_31023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1052.69274244672	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	452	1429	1492663	1498065	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485752	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492070_1492403_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
516542	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516543	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516544	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_13143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516545	SIRV6	+	450	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8826	-11	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCAACTAAGGTTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516547	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516548	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_11661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516549	contig_20693_pilon	+	2134	13	Intergenic	novelGene_60251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	573.573078507777	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	3	1232	14718	34261	FALSE	10	GATTTTCTGAGTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14715	35163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_25954_27037_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
516550	SIRV6	+	901	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	224	6	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516552	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516553	scaffold_12124_pilon	+	2537	12	Intergenic	novelGene_22023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	492.469338727577	1412	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	259	1194	836073	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829486	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858258_858358
516554	contig_9345_pilon	+	1771	6	Intergenic	novelGene_24627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGGCGGCGGCAGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946882	1001327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_947987_949468_949607_952439_952563_955199_955356_997013_997093_1001156
516555	SIRV2	-	530	5	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1180	2313	5	330	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTCCTAGCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4727	3313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687
516556	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516557	contig_5954_pilon	-	2424	14	Intergenic	novelGene_28687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	427.29486237057	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	630	2081	956264	945083	FALSE	25	AAATGTTTTATTGCTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	959755	944739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959508
516558	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516559	SIRV6	+	455	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10205	166	968	-30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTCGTAGATTAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11205	11660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11700
516560	contig_5499_pilon	+	2582	11	Intergenic	novelGene_57004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	277.798488116836	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	714	1448	825148	840037	TRUE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803402	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_818145_818295_824822_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
516561	contig_6980_pilon	+	2051	8	Intergenic	novelGene_36005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	728.8043045192	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	223	951	362370	372790	FALSE	30	ACTGTGTCATTGGAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDKLEGGCSQFSTLRVLEVCSWTWRRRHPADLCGLEAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346058	373890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_361150_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
516562	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516563	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_13895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516564	contig_2890_pilon	-	3063	7	Intergenic	novelGene_60280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	99.1715685063012	1151	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	115	711	316048	307251	FALSE	10	CTTGCTATCTCTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIFEWIYNGFSSVLQFLGLYKKSGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHEQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTGKGNVTLKELNARPMEVFMCSVLKRQGYGEGFRWLSQYID	320518	304898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_307368_308618_308751_312123_312228_315241_315308_315746_315867_315990_316065_320420
516567	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_14009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516568	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	225	1400	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516569	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516570	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	250	1425	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26346	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516571	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516572	contig_854_pilon	-	2779	15	Intergenic	novelGene_36163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.379205144089	26	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	127	1698	509201	471108	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVLTVCPLLRHASSLVLGKQRAWNTDVLAPLGATAISQSPPWMLGTGTTPTPPGWQKQSQCGTPTVVNWPASSSPGVSSPRKARIALGLPQGALGWRASTCLLSRGRV	509327	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471428_471810_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
516574	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516575	SIRV6	+	963	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	538	-10	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516576	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516577	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516578	contig_15063_pilon	-	1570	5	Intergenic	novelGene_12291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	20	TGGTAGAATCTTCTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28195_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516579	SIRV6	+	343	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	94	164	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
516580	SIRV6	+	954	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	563	11	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	33	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516582	contig_15063_pilon	+	1708	7	Intergenic	novelGene_10163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	25	ATGTGTATATATTCTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516583	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516584	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	235	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516585	contig_9243_pilon	-	2200	10	Intergenic	novelGene_60310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_5	128.232235310937	2319	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	56	916	64617	20056	FALSE	45	TTGTATAGATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHGKGEVRWPPRFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64672	18771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
516586	contig_3747_pilon	-	2253	6	Intergenic	novelGene_24924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAGGCCTGTGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	202318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202447_202632_202742_202867_203125_203217_203384_203496_203654_203770
516587	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516588	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516589	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_8658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26559	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516590	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516591	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516594	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	8	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516595	SIRV6	+	370	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	19	1200	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
516597	contig_12357_pilon	+	1852	10	Intergenic	novelGene_6085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	833.184090339621	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	117	1175	26079	53235	FALSE	55	CTTAAGAATAGAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
516598	contig_3948_pilon	-	2093	7	Intergenic	novelGene_53224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	72	878	866476	840803	FALSE	25	ATATTTCATTCCTTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869639	839587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
516599	contig_5698_pilon	+	2078	8	Intergenic	novelGene_55009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	20	ACTGTCCTCTGTATCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19954_20048
516600	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516602	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516603	SIRV6	+	622	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1178_1456_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516604	SIRV7	-	2343	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	107	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	78	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147811	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114689_114989_147608
516607	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26362	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516608	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516609	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516610	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516611	contig_7356_pilon	-	1881	4	Intergenic	novelGene_60390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	35	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	73	462	457848	433924	FALSE	30	GATCATAAAATTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457920	432504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
516614	contig_12425_pilon	-	2059	11	Intergenic	novelGene_46679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	695.151559014291	338	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	129	956	211174	204889	TRUE	20	TTGAAATTTGCTTTCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSDRRSLRCVYRLPGIQVWSVPACDWRGGGRPCHPHPGLGS	226620	203278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206601_206638_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
516615	SIRV6	+	953	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	73	502	23	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	185	676	1733	10736	TRUE	40	GACTATGGGGAAAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1160	11323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516616	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516617	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516621	contig_15063_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_10846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516622	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516623	SIRV6	+	851	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	33	365	1673	2560	TRUE	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1640	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516624	contig_4364_pilon	+	468	4	Intergenic	novelGene_408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	80	466	1530895	1531642	FALSE	20	AGCCATGTATGTTGCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNT	1530445	1531644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
516625	SIRV6	+	728	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	578	1	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516627	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516629	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_9704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36772	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516630	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516631	contig_15063_pilon	-	2340	7	Intergenic	novelGene_13021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	981	1304	35891	35108	TRUE	45	TACAAAGAGAATATCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	29671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39091_39504
516632	contig_11720_pilon	-	1668	11	Intergenic	novelGene_43987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	309	659	272327	271841	TRUE	15	GGAACACTCTGTGTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPYQVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272635	262334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_262356_262914_263051_266170_266238_266451_266608_267751_267912_269815_269906_270031_270151_270547_270697_271265_271340_271803_271964_272099
516634	contig_8317_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_20094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGGAAACAACTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16432	16727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
516635	contig_15063_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_13151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516637	contig_233_pilon	-	2355	16	Intergenic	novelGene_14658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1460.09907426403	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	291	1622	108522	91657	TRUE	35	TGAAAGTGTGCAAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRVCPAPGVHPVQGQHLPGVRGVGAWLRLVPEDDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCVSVTPATSHPCVKSVRAAPRPAAATSPVPSA	127003	78258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92217_93980_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108558_108724_108814_109914_109976_126898
516638	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516639	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	47	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516640	SIRV6	+	803	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	160	645	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516641	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516642	contig_11429_pilon	+	2704	4	Intergenic	novelGene_60448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	644.371011141873	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	243	926	46299	47714	FALSE	30	AATCGATACTGACAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSLGPLDFKKQKGQCSGPSRSSCVPMLRRTQSISPQDRWEGFLFQTTPCSLTLLVLTDSHFPVSPLLSPVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRWVLKGLGYSGAISLSLRAQVCFNSSISQLCNFGKSFGLQMGITIPALWGGCEY	45386	49492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46620_47263_47370_47457
516644	SIRV6	+	935	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	581	12	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516645	contig_2463_pilon	+	3177	5	Intergenic	novelGene_43024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	255.734603642135	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	152	523	515468	522956	TRUE	45	AAAAATGGAGTCATAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVKNSLDDSAKKVLLEKYKYVENFNLIDGRLTICTVSCFFAIVALIWDYMHPFPESKPVLALCVISYFVMMGILTIYTSYKEKSIFLVAHRKDPTGMDPDDIWQLSSSLKRFDDKYTLKLTFISGRTKQQREAEFTKSIAKFFDHSGTLVMDAYEPEISRLHDSLATERKIK	514717	525695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_514758_515356_515517_516927_517064_522769_523336_523420
516646	contig_15063_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_11557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36802	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34924_35035_35378_35838_36157_36264
516648	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516649	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_9709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516651	contig_15063_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_11256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
516652	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516654	contig_10629_pilon	-	2710	15	Intergenic	novelGene_52908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	363.836249330012	883	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	400	1359	256957	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPALDLSL	267925	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
516655	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_11257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516658	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516659	contig_12790_pilon	+	2239	10	Intergenic	novelGene_35198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_9	222.212333113296	2230	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	333	1313	307252	312473	FALSE	35	AACAGATTCTGATGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305811	313399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
516661	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516662	contig_16622_pilon	-	2392	10	Intergenic	novelGene_48423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	998.219080830122	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	683	1072	115540	112952	TRUE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121971	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115268_115489_115559_118811_118884_121330_121675_121723
516664	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516665	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516666	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_8495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3785.05140505237	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	254	1507	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVTHCGKNV	26342	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39511
516667	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_9812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
516668	SIRV6	+	568	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	964	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11201	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11200_11800
516669	SIRV6	+	701	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	547	162	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	33	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516670	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10357	81	1120	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11357	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516671	contig_15063_pilon	-	1512	5	Intergenic	novelGene_12045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	15	CCTGGCCCCAGTAGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516672	contig_10331_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_54055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	60	311	40430	40179	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDHKCPSIAQCIHKLCCIYMMKYSPKMRMNELLLYSIAWINFTNITLSKRSQAQRHTYHTRYIQYESRTGTTKLPGCDGKRQTGGYPGKRINSVENPKESTK	40489	38671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_38700_40500
516673	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_11258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516674	contig_15063_pilon	+	1476	4	Intergenic	novelGene_13251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	979	1341	36299	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34936_35066_35380_35839_36144_36266
516675	SIRV6	+	699	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	28	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10724
516676	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516677	contig_3602_pilon	-	2242	6	Intergenic	novelGene_60479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3214	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGCCCCGCCTCGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171132	161581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_161769_168464_168612_168748_168853_169141_169280_169420_170892_170937
516678	SIRV6	+	552	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	406	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2015_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516679	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	217	1392	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27152	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516680	contig_15063_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_8678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	253	765	34808	35888	TRUE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27116	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
516681	contig_10352_pilon	-	2907	10	Intergenic	novelGene_49604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	534	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1597	2031	34297	32994	TRUE	15	TGAGCCGCCTCTCAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPASPQPLLPQGESQPGLEALARHLCIRNGAAATCSTECMSSAVPLAHGAGGRGAHGAARDCCLLQPGGGRVYFSVSDSCKTCWSSASSSCSRSSRSSSSLAESSMASCKSLSKRLVSLGVPGHRPSELVRRLSWMALSYWAS	35893	16211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_16262_21360_21427_22733_22817_23719_23783_24829_24962_25652_25810_26498_26611_29267_29432_32944_33013_33881
516682	contig_15063_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_13641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516683	SIRV6	+	911	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	3176	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3177_10731_10819_11031
516684	contig_12357_pilon	+	2091	12	Intergenic	novelGene_6099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	788.713315606422	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	671	1405	34261	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34237_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
516685	SIRV6	+	486	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	345	8710	172	81	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516686	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516687	SIRV6	-	1040	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9277	-157	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	13	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTGGCACTTTAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	2515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2621_2739_2828_3105_3164_10723_10817_11031_11109_11205
516688	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516689	contig_9332_pilon	-	2959	1	Intergenic	novelGene_60715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83469	80510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_80500_83500
516690	SIRV6	+	500	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCGTAGGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1843_2027_2470
516691	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516692	contig_6208_pilon	-	3018	7	Intergenic	novelGene_52980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_6	310.457413433075	830	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	232	603	383584	365189	TRUE	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGDYDYLIKFLALGDSGVGKTSVLYQYTDGKFNSKFITTVGIDFREKRVVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISQLQMHCIL	454008	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_383431_383607_420587_420701_453912
516694	SIRV6	-	632	7	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8794	380	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	16	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAGCGTAAACTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11341	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2017_2481_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
516695	contig_4364_pilon	+	614	4	Intergenic	novelGene_431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24775.4876888876	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	93	614	1530895	1531777	FALSE	10	ATCTTGCGTCTGGACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHA	1530448	1531777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530872_1531018_1531096_1531337_1531618
516696	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516697	contig_15691_pilon	-	3180	13	Intergenic	novelGene_60747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	548.732099176517	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	74	1531	114377	18031	FALSE	65	CTATAATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVALLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQAQKDPKKDRALVRRKSELPHDPYTKRALDAHCRADELLSQGGH	114450	16381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_18163_27942_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
516699	contig_9807_pilon	+	2646	14	Intergenic	novelGene_32898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	479.695021455787	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	804	1802	140826	158783	FALSE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109556	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
516700	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516701	SIRV6	+	989	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	3	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	433	747	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516702	SIRV6	+	729	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	341	513	168	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516703	contig_15063_pilon	+	1416	6	Intergenic	novelGene_12475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	7	1272	28164	36632	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28157	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
516704	contig_12635_pilon	-	708	6	Intergenic	novelGene_60791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.845591188673	477	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	55	708	206945	50029	FALSE	65	AAACCAAAAGAGAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITGNR	206999	50028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_50037_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834
516706	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516707	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	33	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516708	SIRV6	+	583	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8717	2	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516709	contig_16098_pilon	-	2672	20	Intergenic	novelGene_45834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	531.190556394046	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	832	2499	88	2586	230275	201500	FALSE	25	CTACAGTTCCTAATTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAADKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230510	201413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215632_226812_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
516710	SIRV6	+	797	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	236	164	127	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	AAAGAAATTTAAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516711	contig_13592_pilon	+	2538	15	Intergenic	novelGene_33702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	528.128120084975	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	517	2385	256608	269322	FALSE	20	CTTATTGTGTTTATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249301	269475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257825_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
516712	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516713	contig_1225_pilon	-	2656	4	Intergenic	novelGene_44194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATCCTCTTGGCCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276788	251450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_251502_253414_253520_274220_276107_276174
516714	contig_9436_pilon	-	2933	15	Intergenic	novelGene_60926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_10	70.5747902611702	804	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	27	2030	458965	442131	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTEEDPEHRVRVRVTRLHHGGPNQDLTVLEMKRENPQLKQIEGLVKELLEREGLTAEGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVWGSQDGEGTGDLDEFDF	458991	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442658_442804_442970_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
516715	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516716	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516718	contig_6576_pilon	-	2296	12	Intergenic	novelGene_42266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	268	junction_4	540.491573010965	1749	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	122	1609	339439	322526	FALSE	20	GTGCAGTTTTGGTATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339560	321838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
516719	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516722	SIRV6	+	991	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	529	8	17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	45	GGTAACAATGTAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516723	contig_3956_pilon	+	1991	11	Intergenic	novelGene_14838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	84	1832	1281682	1290847	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281598	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287395_1290562
516724	contig_5189_pilon	-	2292	11	Intergenic	novelGene_34860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	968.207358988765	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	106	978	244235	204937	TRUE	60	GTGATGAAAATAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPKYCPLWRLNHVQGFWTSLAKRFEKNCRCQAEIK	247746	198127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205722_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
516725	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516727	contig_6980_pilon	+	2051	9	Intergenic	novelGene_36023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	677.851465569707	16	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	96	950	356720	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANTRPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346087	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362410_364879_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
516728	contig_15063_pilon	+	1579	7	Intergenic	novelGene_10491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	236	1324	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSNLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36488_39010_39092_39506
516729	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516730	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516731	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516732	contig_12624_pilon	-	1938	5	Intergenic	novelGene_61117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	768.464377834132	509	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955838	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950288_950427_950590_950768_952913_952985_955644
516733	contig_15063_pilon	+	1894	7	Intergenic	novelGene_13050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	404	1639	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30113	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516734	contig_7440_pilon	+	1321	10	Intergenic	novelGene_61161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCGATTTATGTTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53815	73011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_+_54325_56284_56407_56648_56709_58967_59064_59972_60069_65874_65929_66358_66442_69429_69520_71069_71184_72914
516735	SIRV6	+	369	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10296	161	1059	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11296	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
516736	contig_12635_pilon	-	2646	11	Intergenic	novelGene_60807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_10	389.325108360609	1468	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	622	1782	227344	180251	FALSE	20	TCCTTATGATCGAATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	263229	179386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_262709
516737	contig_3077_pilon	+	1718	10	Intergenic	novelGene_26637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	74	1225	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9602	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
516738	contig_5499_pilon	+	2643	11	Intergenic	novelGene_56989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	65	junction_1	220.934130455211	1658	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	1	1401	803317	840037	FALSE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRAAGRMGGRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803316	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
516739	SIRV6	+	891	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	539	164	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516740	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516741	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516742	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_13683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_4	3402.18653038013	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	202	1290	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
516743	contig_6898_pilon	+	2197	11	Intergenic	novelGene_35695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2496.31464563264	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	134	973	59668	124392	TRUE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRSGSVPRMRLRSWPRSVKKPKRPRRPCCRPLRTRRKPRSSWPWKWQS	59534	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_123024_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125643_126936
516745	contig_3956_pilon	+	2082	11	Intergenic	novelGene_15251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1193.07704696721	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	49	1884	1284838	1290816	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1284789	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289884_1290590
516746	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516748	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516749	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	249	1421	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRYGLLGPRNHGHCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516750	contig_15063_pilon	+	1595	6	Intergenic	novelGene_8522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_5	3736.73095633068	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	252	1340	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
516751	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516752	contig_5988_pilon	-	1545	3	Intergenic	novelGene_15945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	622	1371	652711	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786246	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652814_690048_690376_786054
516753	scaffold_12124_pilon	+	1674	7	Intergenic	novelGene_22226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1991.39708077855	32	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	38	376	1473608	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509106_1509345
516754	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516755	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26354	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516757	contig_10940_pilon	-	1968	3	Intergenic	novelGene_49245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	588	104	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	950	1330	875054	874674	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917169	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_916664_916748_916923
516758	SIRV6	+	667	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	782	577	-416	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	133	465	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1869	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516759	contig_11175_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_61182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	232	576	353577	353233	NA	65	GAAAAAAAAAAGCAGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIFYFLKKVEIEVPYDPAIPFLGIYPREIRTITLIDICIPMFIAALFTIAKRWKQPRQPSTDEWINKLWYIHTTEYYTMIKNNDESMKHLITWMNLKGIMLSDFSQS	353808	351934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_-_351900_353800
516760	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516761	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516762	SIRV6	+	1477	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	50	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	208	699	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1137	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516763	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	202	1353	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGETGVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34936_35068_35380_35839_36158_36266
516764	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516765	contig_5485_pilon	-	2012	5	Intergenic	novelGene_37681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.080902468334	43	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	149	1105	87935	85588	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSQLAGYGAPGHRAGAPVYPSSHLYSQLHYLHVFLRLHLPRG	88083	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85711_85799_86133_86257_86366_86774_87027_87794
516766	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516767	contig_15720_pilon	-	880	7	Intergenic	novelGene_41916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1201.78692186076	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	17	847	282735	278542	FALSE	20	GCATTCTGACTTTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	282751	278508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577
516768	contig_6059_pilon	-	2965	5	Intergenic	novelGene_44800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	198.300907713505	1002	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	227	913	411475	403416	FALSE	35	TCACAATATAGTGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYVFVNDSSQTNVPLLQACIDGDFNYSKRLLESGFDPNIRDSRGRTGLHLAAARGNVDICQLLHKFGADLLATEYQGNTALHLCGHVDTIQFLVSNGLKIDICNHQGATPLVLAKRRGVNKDVIRLLESLEEQEVKGFNRGTHSKLETMQTAESESAMESHSLLNPNLQQGEGVLSSFRTTWQEFVEDLGFWRVLLLIFVIALLSLGIAYYVSGVLPFVENQPELVH	437305	401363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_403633_409565_409725_411164_411508_415816_415920_437214
516769	SIRV6	+	952	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	480	162	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516770	contig_14925_pilon	-	2286	5	Intergenic	novelGene_55253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	925.481226173713	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	144	557	116065	114666	TRUE	40	CACCTTGTATGTATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	124629	111548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_124521
516771	contig_6593_pilon	+	3075	12	Intergenic	novelGene_49844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	956.556833233975	1390	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	347	1288	1195635	1277500	FALSE	35	CTTTAAAAAATTCGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGAFIPGVPVQPILLRYPNKLDTVTWTWQGYTFIQLCVLTFCQPFTKVEVEFLPVQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRNHDGSIDFREYVIGLAVLCNPANTEEIIQVAFKLFDVDEDGYITEEEFSTILQASLGVPALDVSGLFKEIAQGDSVSYEEFKSFALKHPEYAKIFTTYLDLQTCLVFSLPEEVRATPSIASNKVSPENHEESTSDKKDD	1191126	1279287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277315
516773	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516774	SIRV6	+	548	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-431	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAGAAAGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854	10805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516775	contig_15063_pilon	+	1331	5	Intergenic	novelGene_9431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	3883.29102534178	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	825	1187	36299	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35261_35380_35839_36158_36268
516777	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516778	SIRV6	+	1014	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	496	18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	108	29	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516779	contig_15047_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_52174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2827.28625285017	6	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	24	587	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2170	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2615_2826_3221_3498_4158_4200_4241_4434_4552_4687_21013
516780	SIRV6	+	891	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	539	164	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516782	contig_6980_pilon	+	1996	9	Intergenic	novelGene_36036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	701.395561986958	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	82	483	356720	368289	TRUE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSID	346101	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365027_368284_368383_370468_370641_371430_371523_372735
516783	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516784	contig_3956_pilon	+	2174	13	Intergenic	novelGene_15182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1479.01653463449	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	18	1409	1282731	1289548	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCRGRCVRRTCGVCALMSMM	1282713	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283900_1284215_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1289488_1289677_1289758_1289892_1290297_1290369_1290578
516785	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516787	contig_5485_pilon	-	2510	3	Intergenic	novelGene_37682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	665	junction_2	338.5	66	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1002	1700	86314	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88083	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_87027_87794
516790	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_13851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516791	contig_15063_pilon	+	1498	5	Intergenic	novelGene_9162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	TCTGTGGGTGAGAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516792	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516793	SIRV6	+	307	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	130	164	40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
516794	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516795	contig_6227_pilon	-	2033	18	Intergenic	novelGene_49766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	307.665222723265	2781	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	117	1742	1224979	1202920	FALSE	35	CACAAAAGAGGTTATGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVESVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225095	1202628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222043_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
516796	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_11266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516799	contig_233_pilon	-	2665	5	Intergenic	novelGene_14628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1192.90116417916	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1786	2232	93778	78579	FALSE	15	TGTCCTAGAAGCTGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRDSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	96279	78145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_93764_94010_94725
516800	contig_8317_pilon	+	462	2	Intergenic	novelGene_19361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
516801	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516802	contig_11086_pilon	+	2942	15	Intergenic	novelGene_61188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	161.867875700132	905	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	71	2794	24460	52082	FALSE	15	CCCAGTGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFFPEEGHGTRYSQTDASIQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	24389	52230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_49653_49738_50803_50951_51960
516804	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516805	SIRV6	+	952	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	480	162	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516806	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	13	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516807	contig_15063_pilon	-	1425	5	Intergenic	novelGene_10604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	685	1008	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36684	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516808	contig_12151_pilon	-	2871	14	Intergenic	novelGene_54969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	212.571602973051	764	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	151	2421	1023634	975052	FALSE	25	TTTGGCCAAAGCATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	1023784	974601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988074_989445_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016743_1023563
516809	contig_5316_pilon	+	400	2	Intergenic	novelGene_61240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1059	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGGGCAAGCTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453776	474257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_453972_474052
516810	contig_14970_pilon	-	1698	8	Intergenic	novelGene_45027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1328	1642	188827	177322	FALSE	40	TATGGGATGAGAGAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232222	177265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
516812	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516813	contig_4754_pilon	+	2178	16	Intergenic	novelGene_35955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	158.362958631956	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	46	1815	380119	420387	TRUE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380073	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370_420533_420602
516814	contig_13760_pilon	-	3158	12	Intergenic	novelGene_61297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	195.248601861641	805	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	137	1558	194443	167445	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPKAYWGVGQGPSCQPLP	194579	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
516815	contig_1150_pilon	+	3927	7	Intergenic	novelGene_61468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1146	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2952	3401	452511	468285	TRUE	20	GGGGGAGCCGCAGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGATGVGHVIHQDGHAVLHVTHQNHPVHFIRLLPLFVNQSKFHIQPVRNRRHPFGAACVRGDDDAVPPLGNVLPDPLQDRGLRIQVIHGDVEEALYLRGMQVHGDDVICPSHREHIGHKFCRNRSTALVLFILAGVRETRDHGRHPG	447040	479288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_449818_451164_451329_452500_452673_460378_460504_461860_461961_468222_468407_478883
516816	contig_15063_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_10614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516818	SIRV6	+	275	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	714	-23	-441	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTATGGCACTTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
516820	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516821	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28172	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516822	SIRV6	+	295	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	144	162	26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAATCTGTATCGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
516823	contig_6576_pilon	-	2824	14	Intergenic	novelGene_42223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_2	72.212949387015	1238	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	9	1277	261331	229096	TRUE	20	TTTCAAAACGCGTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261339	227429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
516824	contig_8317_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_19410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16385	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
516825	SIRV6	+	658	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2825_3106_3162_10724
516826	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516827	contig_3252_pilon	+	3583	18	Intergenic	novelGene_61507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	124.102536019079	1	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	297	1406	595578	718151	TRUE	40	AAGTCTGAGAAGCCAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKSAAGEFADDPCSSVKRGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGTEQDLGIQYKALKPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKANRDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGSGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVKLSMLHWH	561237	740383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_561330_563191_563388_595569_595737_596521_596642_604358_604629_607038_607243_675240_675322_676492_676646_705294_705393_718126_718284_725574_725776_726326_726479_730457_730569_731781_731964_732097_732204_733961_734097_739171_739382_739435
516828	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516829	SIRV5	+	364	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	22	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGAAAACAATCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078	3540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
516830	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516832	contig_15063_pilon	-	1546	5	Intergenic	novelGene_10847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
516833	contig_1450_pilon	+	2796	19	Intergenic	novelGene_27362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	493.925657923898	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2580	217	2796	244426	355944	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMSCAGSCRQTRPSIASREWPPTPAPTPCLVLWTTCPSPRRCTARVTSNPPLPDQLPSPLTPWAPSPARPALRLRFPPSAWVRFPLSALKGASWDPRGIESPCPRSDSLQNYFL	244209	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351374_355604
516834	SIRV6	+	1533	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	-13	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516835	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516836	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516837	contig_7708_pilon	+	2983	6	Intergenic	novelGene_61525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_3	50.6256851805484	639	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	185	1030	250654	264717	FALSE	20	CAGTAGTACTTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMGVPEKPHSD	249514	266670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187_257288_264687
516838	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_11463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	6	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	231	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516839	SIRV6	+	730	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	32	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2615_2740_2829_3106_3165_10727
516840	contig_15063_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_12763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3175.15750593573	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1	1377	28164	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35872_36158_36266
516841	contig_5253_pilon	+	4057	1	Intergenic	novelGene_61603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGTTGCCACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371908	375965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_371900_376000
516844	contig_9345_pilon	-	1640	4	Intergenic	novelGene_24649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2263.52335972042	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	233	571	952473	947957	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	955283	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955138
516846	contig_15063_pilon	+	1680	6	Intergenic	novelGene_13979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	11	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	197	1432	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516847	SIRV6	+	993	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	517	18	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516849	contig_10951_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_61628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAGCTCCTTAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164959	162990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_163000_165000
516850	contig_10951_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_61625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162441	159654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_159700_162400
516851	contig_10134_pilon	+	2153	4	Intergenic	novelGene_16207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1685	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAAGGAAACTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32180	39728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_33734_34876_35152_38639_38835_39598
516852	SIRV6	+	959	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-12	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	233	721	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1112	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
516853	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516854	contig_12969_pilon	-	4539	5	Intergenic	novelGene_61673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	5.40832691319598	203	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	297	2057	397994	388664	FALSE	15	TGTATACAGGGTTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEAQKLLTLEDVAVNFTWEEWQLLDPTQKELYWDVMLENYNNLISMGYQASKPHALSKLEQGEEPWIIEDEICSIVCPEMRKVDSHLKQHFQNQIFLKRIEQCTEQNAFENIIHLSKTHFPLMQNHDMFGLYRKTLKSNLSVASQNRTSEIKNPADFHRDRKNLLHGKHEQFHAEIKFPETAKCISTKSQVFKNQRTHSIEKPHACVECGKAYVKKSQLIYHQSIHQGENLHGCGQCGKSSRNFTFSKHQKTDTGEKPYIASEYGKSSTVKSSLTVHQQSHMGEKCYICSECGKGFTMKRYLIAHQRTHSGEKPYVCKECGKDFTVKSNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFTMKRYLVVHQRTHTGEKPYICNECGKGFTVKSNLVVHQRSHTGEKSYICNECGKGFTVKRTLIIHQRTHTGEKSYICNECGKGFTTKRTLVIHQRTHTGEKPYVCNECGKAFSQKICLIQHERCHTGNTPFVCTECGKSYSHKYGLITHQRIHTGEKPYECSECGKAFTTKSVLNVHRRTHTGERPYGCSDCEKAFSHLSNLVKHKRMHTREMCKFSQGESSFNRESKLITSK	405195	386181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_390187_390516_390613_390896_391024_397979_398196_405100
516855	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_12450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	15	GCTGGTCCTAAGTGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516856	contig_15063_pilon	+	1554	6	Intergenic	novelGene_14203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3751.57737491845	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	105	1301	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFQVK	34703	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39050_39503
516857	contig_15063_pilon	-	1544	5	Intergenic	novelGene_11590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516858	contig_11338_pilon	+	1796	12	Intergenic	novelGene_6159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	588.403077675654	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	871	1665	8000	13234	FALSE	0	CGGTTCTTCTCGCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLWAGSLQGLSQPAYSPLLLGHAPVDGNGWEVLFHEELGQGHAALHRLHKDHHL	745	13365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7992_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10579_13070
516859	SIRV6	+	524	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	184	252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTCTTCGGTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1538_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2740
516860	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	564	2	-21	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGAGAGTTAGGTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516861	contig_16666_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_61770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1779	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	29	343	59688	58085	FALSE	25	TCACCCACAATTTTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNGKTR	59716	57681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_58264_59552
516862	contig_16666_pilon	-	2056	2	Intergenic	novelGene_61758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCAAACATGGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57731	55131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584
516863	SIRV6	+	829	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	93	587	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516864	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516865	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516866	contig_8317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_19408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTTGAGACCCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16384	16761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
516867	contig_11512_pilon	-	2591	10	Intergenic	novelGene_43290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.11810416182	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	343	1173	396169	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409474	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367043_367578_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_401723_401866_409314
516868	contig_8772_pilon	+	1846	9	Intergenic	novelGene_21101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	130	1530	15355	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15225	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
516869	SIRV6	+	654	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	835	537	-363	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	80	412	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1922	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516870	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516871	contig_15063_pilon	+	1489	5	Intergenic	novelGene_11234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	TGTGGGTGAGAAGTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516872	contig_7357_pilon	-	3876	20	Intergenic	novelGene_36854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	185.652208126571	250	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	46	2334	249442	197341	FALSE	25	ACACATTCCTTGTAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADETPKKGNFSALVGHTNGLTKPASLAAAAAVTTKPGGGSGSKKLVIKNFRDRPKLPDNYTQDTWHKLHEAVKAIQSSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKVSPTLYKQLRQVCEDHVQAQILQFREYTLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYILQNSMLPSIWDMGLELFRNHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERNGEAVDRSLLRSLLSMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLTQMYQLFSRVKGGQQILLQHWSEYIKTFGTTIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHIIEVCFQKNEKFINLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERILDKIMIIFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQYMQNQSDPGSIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKTFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFREGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDEFSFEEIKMATGIEDNELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKDVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA	249487	195798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_197437_199280_199434_204278_204452_204644_204751_206605_206720_213683_213792_214172_214259_214367_214479_214796_214902_216660_216854_220279_220399_223589_223658_227155_227239_228379_228470_229094_229258_233562_233637_234983_235052_240163_240270_247801_247918_249285
516873	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516874	SIRV6	+	894	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1384	192	-1	-57	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	98	307	2569	10736	TRUE	60	TAAAACTTAACGACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2471	11633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516875	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10501	19	1264	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11501	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
516876	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	6	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28168	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516877	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_12844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	TACCGTAGTAATCACAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
516878	contig_8538_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_4675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	201	434	842828	843061	NA	25	GTTGTTGCATTCCCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842627	843114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842600_843100
516879	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516880	contig_19851_pilon	+	2394	6	Intergenic	novelGene_29824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3332.68572775772	4	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTTCCGTGTAAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53457	56530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54818_54976_55753_55840_55882_56006
516881	SIRV6	+	956	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1458	56	29	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516882	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516883	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516884	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516887	contig_8978_pilon	-	2243	11	Intergenic	novelGene_49399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1108	1569	345658	343441	TRUE	25	AAAGAGCGCGCGACCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSCLSSSCFRFCTSWLCSSSIRRSSSWRLIKSCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFSISMSAFQRMAYSYSKEPGCANLGGCSRSL	348141	331589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339968_341084_341130_342364_342670_343350_343447_343638_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
516888	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	194	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	239	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35836_36158_36266
516889	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_9936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516890	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516891	SIRV6	+	821	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	519	4	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGTAAGACTGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	10812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516892	contig_9345_pilon	-	2000	6	Intergenic	novelGene_24345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	3134	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	63	1001	176056	142100	FALSE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176118	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
516893	SIRV6	+	528	5	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	0	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCGTAGGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470
516894	SIRV6	+	529	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	378	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516895	SIRV6	+	886	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	323	655	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1843_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516896	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_10640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516898	contig_1331_pilon	-	1487	3	Intergenic	novelGene_37798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	4200.5	334	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATTGTTCTGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169997	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_169860
516899	SIRV6	+	697	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8181	-11	610	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGAAATCACCGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	3150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516900	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516901	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_11034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	233	1327	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
516902	contig_19564_pilon	-	2294	4	Intergenic	novelGene_29622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	159	1493	15529	12201	FALSE	35	TTTTTCATATTGAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15687	11399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
516903	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	13	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516909	SIRV6	+	565	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516910	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516911	SIRV6	+	474	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8543	337	248	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTAGTCGTCTTCGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
516912	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	200	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516913	contig_10324_pilon	+	2497	6	Intergenic	novelGene_7764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	1012.49699258813	68	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	204	716	75827	78985	FALSE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFCEDLERNDGSQERPYFMSPELRDILLKGSAEEGKREEVA	75623	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_78866
516914	contig_6434_pilon	+	2793	11	Intergenic	novelGene_61907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1219.96913485547	8	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	13	1416	918919	932457	FALSE	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGKCIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	918906	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_919000_919663_919773_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
516915	SIRV6	+	805	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	12	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	38	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTTAGAAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3117	11795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10805_11020_11109_11205
516916	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
516917	SIRV6	+	369	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10376	81	1139	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11376	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
516919	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516920	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516922	SIRV6	+	963	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	564	1	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516923	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
516924	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28166	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516925	SIRV6	+	638	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106
516926	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516927	SIRV6	+	1279	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	760	-13	-438	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516928	contig_4105_pilon	+	2555	12	Intergenic	novelGene_21455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	117.824494780364	35	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	93	1547	60529	73476	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHSLYSPFAGPCTQFLTCPRICLPSRPQGMHRHSDPCKTRPLPSSSVTTCLSWCCPCISPGA	58724	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73251_73292
516930	contig_15063_pilon	-	1689	6	Intergenic	novelGene_13642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	977	1300	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39089_39504
516931	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516933	contig_1244_pilon	-	2157	13	Intergenic	novelGene_37981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	902.721390974105	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	123	1574	948448	923211	FALSE	55	GGATAATATAAGAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948570	922627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
516935	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516936	contig_4845_pilon	-	2935	13	Intergenic	novelGene_53617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1413	2039	222002	219827	TRUE	35	TCAAAGCTCGGCAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWAGQRGGGAARSASSSFYVPGGFTAPSWAGVQEESKLGCQKIGLVGWRLGSQLLGVRAKKQLPLMIQQELGESIDGINGLEGDGSILGPQQVRAEDHSQVSVGHLVLVTVGRNLDQEGNQETKHLVVLLRQRLEDLQRHLHSLTLINVEEAHDVGVEVKSEQGLGKLPEEGLEDDGWQVQLIVLVEVHRQPHIVLLLHFPHNLGVG	223414	202021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_202054_205586_205766_205987_206086_212880_212966_218057_218198_218576_218661_218835_218933_219287_219373_219498_219565_219796_219875_220345_220476_221450_221553_221655
516937	contig_17993_pilon	+	4149	22	Intergenic	novelGene_61930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_15	96.0035430185201	255	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1114	3345	117	3461	67188	113878	FALSE	20	TTTCTTGCCTTGAACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRKKSVKTCLINSEIPEETIPDETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVVDLCAGRWWEYMPSGFTDSSFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSHLELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTKPQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLHTIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANADLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDSFGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDNDNNAQNNNANIHDNNHHHPDESDEENDFRQDLQQGEQQFAADALNEMEDMVQEDGEMVAESGNETPAHSQAVIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTPITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGARRYSEREEKIGESAQSRELSVSGKGKTPLRKRYNSHQMGQSKQFPLEESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDIPEKKKNKDVYPSCSSTTATTVGNSSSHSTASQSPDFVRTVNSGGSSEPSPTEVDVSRQCVCSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCHRPQESQRRTSRCSDEERPSTSRACVVNGPDEVAKTKPRHAMKRKRMADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLKVENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPPNVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSLRAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVEDDYI	55381	114566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_55437_67126_67316_68444_68579_72502_72667_72886_73053_76162_76301_77881_78020_79631_79726_80786_80918_85233_85405_86999_87143_88028_88243_94076_94197_95313_95494_96986_97497_102835_102937_103172_103276_106491_106659_108275_108422_109020_109125_109724_109839_113699
516938	SIRV6	+	765	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	340	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	127	384	90	473	1733	2794	TRUE	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGEFWDTSWDVSLGLWD	1643	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2627_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516939	SIRV6	+	818	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	341	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	89	583	1733	10736	TRUE	20	GCCTGCCTAATTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516940	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516941	contig_19851_pilon	+	2548	5	Intergenic	novelGene_29846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_4	974.85806659226	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_55753_55840_55882_56006
516943	SIRV6	+	566	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8735	1	56	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
516944	SIRV6	+	668	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-384	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	101	430	2002	10736	TRUE	30	TGCCTAATTGTTGGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1901	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516946	contig_4125_pilon	-	2955	11	Intergenic	novelGene_25143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_10	427.879246984473	2070	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	196	1218	875313	853458	TRUE	5	GGGACCTGGGTGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	935465	851438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177_858245_863756_863920_864951_865016_869024_869132_870351_870391_875256_875360_935316
516947	contig_10311_pilon	-	2100	11	Intergenic	novelGene_50396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	1073.55920190738	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	232	1209	70321	66744	TRUE	10	TTGCTTTGGTCATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71557	65123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66646_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70493_71497
516948	contig_15063_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_8539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	250	1422	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26346	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516949	contig_15063_pilon	-	1523	5	Intergenic	novelGene_11058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
516951	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516952	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516953	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_8919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516954	contig_12923_pilon	-	2817	17	Intergenic	novelGene_30088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.39496499438	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	86	2257	93727	48997	TRUE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101253	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45531_46060_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
516955	contig_5643_pilon	+	2031	13	Intergenic	novelGene_39096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_1	634.648125385678	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1043	1819	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631854	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_632046_634800_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
516957	contig_3426_pilon	-	4105	33	Intergenic	novelGene_57913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	180.833994574444	548	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	99	1799	326645	202933	TRUE	25	GTAAGTTAAATCTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRLPCPRLVRLGGTASLLVPSLLTSPPGCPTMTTMVSMDTLPEYEKSQIKRALELGTVMTVFSSRKSTPERRTVQVIMETRQVAWSKTADKIEGFLDIMDIKEIRPGKSSKDFERAKTVRQKEDCCFTIFYGTQFVLSTLSLAADSKEDAVKWLSGLKILHQEARNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLVNFKVSSAKFLKDKFVEIGAHRDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGSTDRPDASAIHLHDFQRFLLHEQQESWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENSIWDEKYDMVEMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSTEAYVRCLRMGCRCIELDCWDGPDGKPIIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEQHCSVEQQRYMAKVFKEVLDDLLLMKPTEASADQLPSPSQLREKVIIKHKKLGPRGDVDVNVEDKKDEHRQQGELYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTVEEELPQDTPPTELHFGEKWFHKKVEKRTSAEKLLQEYCAESGGQGRDFLGAGE	333414	145065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196596_199997_200045_201190_201392_202899_203077_203772_203863_205426_205532_206870_207040_209112_209234_210469_210556_212649_212769_214096_214199_217057_217131_217970_218015_229166_229251_230844_230930_240192_240241_241006_241101_244735_244880_326452_326692_333362
516958	SIRV6	+	692	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	614	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	32	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516960	contig_6589_pilon	+	1021	6	Intergenic	novelGene_26125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_2	2598.31137472013	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	97	525	1879232	1880585	FALSE	50	ACTAATAAATTATTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878958	1881081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
516962	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516963	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
516966	contig_12923_pilon	-	2734	12	Intergenic	novelGene_30091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	344.056885552183	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	77	1645	93727	48997	TRUE	20	TTATGAGGTTCTACTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101244	45342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64604_77683_77720_93602_93733_101173
516967	SIRV6	+	729	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8167	8	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
516968	contig_3424_pilon	+	2478	4	Intergenic	novelGene_55484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	191.629851536758	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	154	2238	163695	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149936	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_162271_162358_163681_163803_168701
516973	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	244	1482	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516974	contig_5033_pilon	-	2141	15	Intergenic	novelGene_29021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	17	1591	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566803	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531078_531666_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
516975	contig_15063_pilon	+	1299	6	Intergenic	novelGene_11099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	232	1239	34808	36740	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPCGDQPLCVCPCVHSN	27137	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36441_36687
516978	SIRV6	+	855	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	590	33	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516979	SIRV6	+	848	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	282	1	81	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTTAACAAAACGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	11049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
516980	contig_15063_pilon	+	1662	6	Intergenic	novelGene_14137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	175	1410	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34633	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
516981	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516983	SIRV6	+	949	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	5	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	253	747	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
516984	contig_5189_pilon	-	2115	8	Intergenic	novelGene_34836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1087.14629246688	24	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTAATGTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235827	198098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228229_235659
516985	contig_15063_pilon	-	1529	5	Intergenic	novelGene_10268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
516986	contig_4604_pilon	+	3098	17	Intergenic	novelGene_19149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_16	830.759808473544	2	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	266	2272	360296	379856	FALSE	80	ACAAAACAAAAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	359011	380682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
516988	contig_16650_pilon	+	2281	5	Intergenic	novelGene_61977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1398.09173518764	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244632	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_249462_249683_251255_251312_252975_253083_254186
516989	contig_5023_pilon	+	2103	14	Intergenic	novelGene_7246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2199.51241234756	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	83	1615	607279	647811	FALSE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNTHTHTHIQPDVTGKMNTSWMRLG	580846	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631507_647737
516991	contig_13707_pilon	-	2277	11	Intergenic	novelGene_43533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	734.581132346863	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	60	866	275489	271846	TRUE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYSIWHQKYFISSLMTGLWTGGAWGPFYMRCCMACLLFIAGILLRCMITF	275548	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
516992	SIRV6	+	557	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	268	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2627_2750
516995	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_11110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4154.41592615617	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	226	1062	34808	36333	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27169_34613_34926_35037_35380_35839_36150_36266
516996	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
516997	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	202	1383	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPAAVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35028_35380_35839_36158_36266
516999	contig_4426_pilon	-	280	2	Intergenic	novelGene_15369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATATGTTCAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171524	119335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_119483_171391
517000	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_8635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	216	1454	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26380	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517002	SIRV6	+	750	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	783	493	-415	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	132	464	2002	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1870	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517003	contig_12873_pilon	+	2336	5	Intergenic	novelGene_27183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1321.15259811272	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1423	2178	17632	19855	FALSE	50	CGTTATCAATATAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15985	20013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17114_17337_18014_18984_19264_19611_19703_19851
517004	contig_14925_pilon	-	1678	5	Intergenic	novelGene_55302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
517007	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517009	SIRV6	+	451	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845_2027_2470
517011	SIRV6	+	689	7	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	757	589	-441	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
517012	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517013	contig_8978_pilon	-	2585	11	Intergenic	novelGene_49371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1806	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1108	1569	345658	343441	TRUE	25	AAGAGCGAGGCTTTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSCLSSSCFRFCTSWLCSSSIRRSSSWRLIKSCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFSISMSAFQRMAYSYSKEPGCANLGGCSRSL	348141	331388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339964_340939_341130_342364_342670_343350_343447_343638_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
517014	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517015	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517016	contig_5018_pilon	-	1799	10	Intergenic	novelGene_47047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	664.892305398233	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	70	1239	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399708_1399788_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
517020	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517021	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517022	contig_10235_pilon	+	2189	5	Intergenic	novelGene_46449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_3	71.2618411213182	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	494	643	211879	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210728	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
517023	SIRV6	+	374	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-11	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
517024	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517025	SIRV6	+	989	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	59	480	9	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	199	690	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1146	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517027	SIRV6	+	583	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845_2035_2470
517029	contig_2100_pilon	-	1935	12	Intergenic	novelGene_50736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	869.976317717	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	113	1033	1182812	1174149	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPGECSTGPLTRNHAAEALG	1185523	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173421_1174078_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
517031	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26348	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517032	SIRV6	+	1379	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	155	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	157	645	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAIELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2823_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517034	SIRV6	+	474	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8543	337	248	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTAGTCGTCTTCGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
517035	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517037	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517038	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517039	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517042	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517043	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517044	contig_2100_pilon	-	1773	12	Intergenic	novelGene_50723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	123	1427	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185533	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
517045	contig_15063_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_11434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	7	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	40	GGCCATGAAATAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517047	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517048	SIRV6	+	910	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	38	589	1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
517050	SIRV6	+	1135	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	821	70	-377	65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	94	426	2002	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1908	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517054	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_10682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517055	contig_15063_pilon	+	1497	6	Intergenic	novelGene_9231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	534	1355	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35077_35135_35380_35839_36158_36266
517056	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517057	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_10161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	35	ATAAATGTGTATATATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517058	contig_15063_pilon	+	1774	5	Intergenic	novelGene_13028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	463	1635	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30054	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517059	SIRV6	+	791	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1515	164	86	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTCGTAGATTAACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2602	11661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517060	contig_854_pilon	-	3064	15	Intergenic	novelGene_36155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	214.648609383346	10	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	628	1398	487054	471803	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509253	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471653_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491563_493050_493197_495173_495239_497487_497571_509182
517061	SIRV6	+	880	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	335	649	2021	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517062	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517063	contig_12414_pilon	+	1871	2	Intergenic	novelGene_59550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	463	1335	373182	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_371097_373010
517064	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517065	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517066	contig_19564_pilon	-	2304	4	Intergenic	novelGene_29588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	5	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	323	1441	13615	12201	FALSE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSLSEPSCRRVRTSLLQPPGHVPSPQPAIRRDKIIYRSLAPHTIEASKKKTKINFHHEGNRAHPGWSVWQHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15702	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14003_15487
517067	contig_5988_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_15959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_1	571.5	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	885	1781	652858	651962	FALSE	25	AGAAAGGTTTTTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_653422_653549_653773_655456
517068	contig_709_pilon	-	3181	8	Intergenic	novelGene_57651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_7	55.7827418267898	1188	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	59	1039	3772541	3762534	FALSE	35	CTGAGCTTGCAAAAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSNEFKLNQPPEDGISSVKFSPNTSQFLLVSSWDTSVRLYDVPANSMRLKYQHTGAVLDCAFYDPTHAWSGGLDHQLKMHDLNTDQDNLVGTHDAPIRCVEYCPEVNVMVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPKST	3773011	3760391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3762544_3764736_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806_3769959_3771705_3771776_3772346_3772542_3772953
517069	SIRV6	+	855	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	250	-11	113	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517071	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517072	contig_5643_pilon	-	3361	5	Intergenic	novelGene_38711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_1	228.126472597987	1178	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	2137	2805	33052	31788	FALSE	10	GGGAGTGGTCTGTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	35351	31231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283
517073	SIRV6	+	846	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	98	430	1673	2560	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1467	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517074	SIRV6	+	889	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	163	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	318	650	2002	10736	TRUE	30	GCCTAATTGTTGGTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1466	11285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517075	contig_3463_pilon	-	2627	14	Intergenic	novelGene_61993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_12	158.801763214393	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	14	1576	551994	508757	FALSE	20	CACTGCAGTGTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	552007	507705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883
517076	SIRV6	+	366	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTTTACGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1856
517078	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517079	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_11926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517081	contig_8317_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_19380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAACTTGACCAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
517083	contig_15063_pilon	+	1694	7	Intergenic	novelGene_10158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	7	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	35	TGGCCATGAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517084	contig_4180_pilon	+	2460	2	Intergenic	novelGene_8415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888304	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_888619_888676
517085	contig_13894_pilon	-	1267	4	Intergenic	novelGene_62055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	201	680	287445	286808	FALSE	30	TAGTGAAAGTACTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSWLPLQTIPLV	288240	286220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286842_286902_287123_287219_287538_288132
517086	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517087	SIRV6	+	511	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10262	53	1025	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11262	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
517089	SIRV6	+	718	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8185	1	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
517091	SIRV6	+	876	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-11	223	-5	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517092	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_14031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517093	SIRV6	+	939	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	571	18	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517096	contig_15063_pilon	+	1454	6	Intergenic	novelGene_11259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	231	1304	34808	36632	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEGPWTSPLVNPPCTTCPW	27138	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36508_36577
517098	contig_9482_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_44272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCTTTTTATGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814365	813018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_813000_814400
517100	SIRV6	+	829	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	581	506	365	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	65	556	1733	10736	TRUE	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1668	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517101	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_10660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517102	SIRV6	+	792	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	179	135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	147	638	1733	10736	TRUE	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1482	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517103	contig_854_pilon	+	1634	6	Intergenic	novelGene_36205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3456.88625210608	45	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	137	643	543600	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543463	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562621_563013
517104	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_8584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517105	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517106	contig_20641_pilon	+	2744	5	Intergenic	novelGene_52808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1913.10101667424	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	152	328	14767	45875	TRUE	80	AAATAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPQLSSSWRIFCSLSRPPPTWVRTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKAQTGASEQ	14535	57162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14607_14686_14771_16769_16916_45848_45965_54835
517107	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	15	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517108	contig_5988_pilon	-	1817	4	Intergenic	novelGene_15999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	28.5929284186765	959	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	245	1081	693353	690042	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	693597	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_691009_691134_691358_693350
517109	SIRV6	+	1018	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	480	-7	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517110	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517111	SIRV6	+	850	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	31	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	317	649	2002	10736	TRUE	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517112	contig_15063_pilon	+	1577	7	Intergenic	novelGene_9645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	CACCCTTTATGTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517113	contig_15063_pilon	+	1562	7	Intergenic	novelGene_9250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	20	CCTGATCATTTATGCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517114	SIRV6	+	637	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-378	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1907	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517116	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517117	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	12	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517118	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517119	contig_5954_pilon	-	2443	13	Intergenic	novelGene_28590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_8	422.502950351303	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	613	2064	956264	945083	FALSE	5	GGTTGTGCTCGGGGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	959907	944703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956500_956705_956942_959766
517120	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517121	contig_14030_pilon	-	2504	8	Intergenic	novelGene_62221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_7	554.913083835879	2128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	525	857	344359	337410	FALSE	10	CTTGTTCACCTTGTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394733	335762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_370396_370447_394346
517122	contig_18194_pilon	-	2434	4	Intergenic	novelGene_55950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_3	51.6741930002029	1099	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	128	1144	18897	4642	FALSE	10	CCTAAGCTCTTGCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20413	3351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866_18976_20364
517124	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	496	-7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	192	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517125	SIRV6	+	987	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	539	2	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	193	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517126	SIRV6	+	656	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2011_2450_2616_2740
517127	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517128	SIRV6	+	945	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	40	543	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	218	709	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1127	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517130	contig_5092_pilon	-	2074	6	Intergenic	novelGene_62295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	86	400	451516	444945	TRUE	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451601	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_443625_443719_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
517132	contig_1725_pilon	+	2441	17	Intergenic	novelGene_24299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	592.537548256438	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	19	1155	218463	248410	TRUE	30	TAACTACATTGGAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIENWGRIRERFEPAEEAAQLPG	218444	255856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247750_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
517134	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517135	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28174	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517136	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_12766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	35	ACCGTAGTAATCACAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517137	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517138	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_8621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	10	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26366	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517139	contig_10734_pilon	-	1952	4	Intergenic	novelGene_51003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	250	555	318911	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320726	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319043_320608
517140	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517141	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517143	contig_11752_pilon	+	2625	7	Intergenic	novelGene_37571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	884.788000345594	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	121	804	87165	93067	TRUE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQGE	84081	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_94410_96442_96572_100956_100976_105597
517144	contig_17198_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_62429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	169	504	1201757	1202092	NA	70	AGCTACAAATAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAVVLVQGDTDQWNRTENPDVNSSTYEQLIFDKGPKSVKWGKESLFNKWCWQNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKLKTIKIMEVKIGTTLEALIHGINRI	1201588	1204219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1201600_1204200
517145	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517146	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517147	SIRV6	+	369	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1232	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11469	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
517150	contig_15063_pilon	+	1494	4	Intergenic	novelGene_14113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	187	1359	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34621	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517151	contig_5954_pilon	-	2175	12	Intergenic	novelGene_28684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	459.306681966607	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1111	1821	947127	945083	FALSE	10	TGCTGGACCATCCGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960588	944728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948134_956446_956500_956705_956942_959766_959941_960474
517152	contig_233_pilon	-	2168	13	Intergenic	novelGene_14631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1447.22438366228	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	95	1678	126907	78637	FALSE	15	GTGTCCTAGAAGCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTG	127001	78146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_93854_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517153	SIRV6	+	800	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGCAAATAAGAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	10804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1178_1462_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517155	contig_6898_pilon	+	2215	8	Intergenic	novelGene_35694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2934.58431503353	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	468	893	124380	126380	FALSE	15	TTTACTGTGACTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKMVPLRGFINIPEGHWPFYSDKAG	59534	127702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113077_123021_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125527_126308
517156	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517157	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517158	contig_9345_pilon	-	1863	5	Intergenic	novelGene_24641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	183	junction_4	2218.42989240138	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	208	789	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001361	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_1001156
517160	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517163	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517164	contig_15063_pilon	+	1696	6	Intergenic	novelGene_13111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	62	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	203	1441	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517167	contig_11285_pilon	-	2601	25	Intergenic	novelGene_5677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	428.128704363536	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	336	2411	794634	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	795733	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695
517168	SIRV6	+	986	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	539	3	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517170	contig_7151_pilon	+	3360	12	Intergenic	novelGene_40718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1327	1662	244252	244682	TRUE	35	TCTCCCAAAGAAGATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSPSAVKHVPPDLTTSFPKMCSSWGRKGNSTFKLLANDVGIFHIPVRVAEGTPGPKCLDLHSSLTWGLPIHQADFCVSLEQMTPTSLLWLQVPSGRGATGQSERWDSSP	240635	268548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_241156_241534_241862_243313_243623_243703_243797_244174_244486_244580_244903_254600_254925_255565_255886_262717_263037_266028_266346_267398_267492_268443
517171	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	38	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517172	contig_7744_pilon	+	2258	19	Intergenic	novelGene_62546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.940581754687	1549	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1012	1815	887347	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879800	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_881546_881629_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
517173	SIRV6	+	1201	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	762	63	-436	-62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517175	contig_7151_pilon	-	2460	12	Intergenic	novelGene_40652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.387331274688	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	732	2312	18419	1967	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	65125	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2078_5188_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
517176	contig_15063_pilon	+	1574	8	Intergenic	novelGene_11806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3667.41004090942	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	229	1206	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVHEALSHQRGK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36431_36544_36569_38975_39092_39506
517177	contig_15063_pilon	+	1676	7	Intergenic	novelGene_12327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3646.33575966644	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	12	1454	28164	39515	FALSE	40	GGCCATGAAATAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
517179	contig_15063_pilon	+	1503	6	Intergenic	novelGene_9406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3599.786771463	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	540	1361	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34813_34864_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517180	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	45	1157	-43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTACTAAGCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
517181	contig_15063_pilon	+	1463	4	Intergenic	novelGene_14128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	178	1350	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34630	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517182	SIRV6	+	551	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8750	1	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
517184	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517186	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517187	contig_1516_pilon	+	2520	11	Intergenic	novelGene_49957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	924	junction_9	910.419579095265	3314	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	284	1879	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPQRETWQPVRPPQLFLLKVPAPSEDAEGRAQCAGSRDWVRGGVAEGLQLGTRDNLEAEATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	334998	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
517188	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517189	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517192	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517193	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517194	contig_12873_pilon	+	1496	5	Intergenic	novelGene_27220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_1	767.731235524516	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	431	922	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16751	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
517195	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAACCTGTGTCTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16469	16794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
517196	SIRV7	-	2420	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	2	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	110	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAATAGAGCGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147921	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147611
517197	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517199	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517201	contig_2027_pilon	+	3104	25	Intergenic	novelGene_39889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	403.657684234633	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	944	2835	75	2909	122795	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALPLPRGFGSSPAGRRGFRPAQGMSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKSASMMMTSSKIWMVWPMPWTTWMPACTWIAAACTTVSPCWSQAHWAPRATCRPSPHVICLLCLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	114155	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_114230_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126852_128965_129038_129182_129266_131134_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
517202	SIRV6	+	871	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	173	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	91	423	1673	2560	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1476	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517203	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517204	contig_12050_pilon	+	3731	16	Intergenic	novelGene_62615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_12	345.940971201093	469	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	8	1669	321302	354706	FALSE	10	CAGTTGTGTGGCGTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIH	321294	356768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631
517205	contig_15063_pilon	+	1801	7	Intergenic	novelGene_13059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3666.41777943176	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	667	1551	35271	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30203	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35035_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517206	contig_4429_pilon	+	2629	10	Intergenic	novelGene_50788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_3	400.194705698533	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	483	1922	172238	198515	FALSE	30	CTTACCAAGTAATACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154497	199222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
517208	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_9299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	GGTGAGAAGTTGTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517209	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28165	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517210	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517211	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517212	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	231	1469	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517213	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517215	contig_5499_pilon	+	2586	13	Intergenic	novelGene_57011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	270.394606187985	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	346	1392	816576	840037	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPEGTQLPARHPRTAFRRHQHGCGPARCGRSAPRPADTHCSCYNWVRYGESLIQADAPGPALTLVVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803411	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840273_840320
517217	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517218	SIRV6	+	606	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	365	8172	192	619	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
517219	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517220	contig_3747_pilon	+	1132	3	Intergenic	novelGene_24926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGTTTTTTGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202362	205207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202419_204000_204765_204895
517222	contig_12357_pilon	+	2103	12	Intergenic	novelGene_6127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	782.47034110613	3	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	369	1409	30281	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	26033	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27459_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
517223	contig_7357_pilon	-	2345	10	Intergenic	novelGene_36796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2080.08627551365	3	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	213	1463	166824	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167080	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772_166952_166995
517224	SIRV6	+	450	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1151	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11388	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
517225	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	197	1432	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517227	SIRV6	+	915	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	321	653	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1628_1736_1844_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517228	contig_12790_pilon	+	2262	9	Intergenic	novelGene_35226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_8	232.815612395303	2594	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	210	785	307252	310194	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	305934	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310494_311029_311080_311898_312035_312348
517230	contig_11285_pilon	+	2304	13	Intergenic	novelGene_5567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	553.421849094843	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	989	1606	767746	769185	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEATRARTRGSVSRGTRRWLH	763517	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769125_769320_769421_769653_769740_769977_770097
517231	contig_15087_pilon	-	2494	25	Intergenic	novelGene_37184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_5	938.513925783144	2067	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	126	1964	158925	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181165	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
517232	SIRV6	+	598	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	342	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517233	contig_18272_pilon	+	2092	2	Intergenic	novelGene_7089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGATGTGGGTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539636	541837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539686_539794
517234	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	231	1358	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
517235	SIRV6	+	724	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	29	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1627_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517236	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	253	1425	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTTTTSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26341	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517237	contig_15063_pilon	+	1437	6	Intergenic	novelGene_10512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	235	1266	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
517239	contig_15092_pilon	+	1978	3	Intergenic	novelGene_57806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	173	544	348159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATGFRRRRTRGREIWTCRSPRCAPGTTSSRALTASLGRTSETSPNGTTAWFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325113	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325267_348139_348358_350992
517240	SIRV6	+	770	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1473_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723
517241	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	234	1469	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517243	SIRV6	+	535	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	836	-375	836	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCGATGCGGTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11073	11705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
517244	contig_10246_pilon	+	2725	9	Intergenic	novelGene_46901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	230.088026633287	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	457	1071	171203	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140729	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
517245	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	246	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517246	contig_1225_pilon	+	2620	4	Intergenic	novelGene_44142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275293_275599
517247	contig_2100_pilon	-	1894	12	Intergenic	novelGene_50694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	967.10122368835	175	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	116	1036	1182812	1174149	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPGECSTGPLTRNHAAEALG	1185526	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170339_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173421_1174127_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
517248	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_9931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517249	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	202	714	34808	35888	TRUE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35839_36158_36266
517250	contig_11978_pilon	-	3348	17	Intergenic	novelGene_62947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	147.566814845852	7	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	18	2024	1068764	1041965	FALSE	10	TTGATGTCCTGATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTPVMSTYLVAFVVGEYDFVETRSKDGVCVRVYTPVGKAEQGKFALEVAAKTLPFYKDYFNVPYPLPKIDLIAIADFAAGAMENWGLVTYRETALLIDPKNSCSSSRQWVALVVGHELAHQWFGNLVTMEWWTHLWLNEGFASWIEYLCVDHCFPEYDIWTQFVSADYTRAQELDALDNSHPIEVSVGHPSEVDEIFDAISYSKGASVIRMLHDYIGDKDFKKGMNMYLTKFQQKNAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTKQMGFPLIYVESEQVEDDRVLRLSQRKFCASGPYVGEDCPQWMVPITISTSEDPNHAKLKILMDKPEMNIVLKNVRPDQWVKLNLGTVGFYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSEEVRPQDTVSVIGGVAGGSKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKVCDNFAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1068781	1040640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044596_1044768_1045289_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699_1053835_1055522_1055663_1057598_1057663_1060456_1060567_1062723_1062785_1063404_1063510_1064384_1064550_1066985_1067101_1067939_1067974_1068083_1068181_1068635
517251	SIRV6	+	489	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	19	1081	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
517253	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517254	contig_18869_pilon	-	1453	4	Intergenic	novelGene_56420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13219.2706388145	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	38	397	79419	74943	TRUE	30	ACTAAAACACTTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTALRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79456	73813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73900_73972_74957_75486_75766_79352
517256	contig_12873_pilon	+	2302	5	Intergenic	novelGene_27176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	780	junction_1	1001.97639068992	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	976	1731	17632	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15977	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_18014_18984_19264_19611_19703_19851
517257	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517258	contig_15063_pilon	-	1732	7	Intergenic	novelGene_10430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27175_34611_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
517259	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517260	contig_10437_pilon	+	2874	3	Intergenic	novelGene_38162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_2	123	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	345	653	160610	161624	TRUE	60	TCAAATAAAAAAATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPSTTKPLAPPQVVFKTLFPSSIVTGGGDFRHDSPIFFKQKKKRRRIDRTMIGEPMNFVHLTHIGSGEMGAGDGLAMTGAVQEQMRSKGNRDRSWSHSRGL	160265	164066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160844_161549_161639_161859
517261	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_9706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517262	SIRV6	+	466	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGAAGCTATCTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470
517263	contig_15063_pilon	+	1706	7	Intergenic	novelGene_10942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517265	SIRV6	+	849	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	230	2	133	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517268	contig_8978_pilon	-	2333	11	Intergenic	novelGene_49379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1108	1569	345658	343441	TRUE	20	CGAGACGACGGAGCTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSCLSSSCFRFCTSWLCSSSIRRSSSWRLIKSCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFSISMSAFQRMAYSYSKEPGCANLGGCSRSL	348141	331566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339975_341024_341130_342364_342670_343350_343447_343638_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
517269	contig_15063_pilon	+	1203	4	Intergenic	novelGene_13195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	672	1082	36142	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35251_36002_36158_36266
517270	contig_11720_pilon	+	2082	16	Intergenic	novelGene_43944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_4	351.920041423553	1144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	459	1826	264322	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
517271	contig_4232_pilon	-	3249	10	Intergenic	novelGene_63476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_3	301.823634218461	73	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	1116	2033	614173	608965	FALSE	10	GATCTCTGCTGGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS	620493	607748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_614983_615283_615392_615783_615945_620456
517272	contig_5023_pilon	+	2168	14	Intergenic	novelGene_7203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2199.51241234756	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	95	1672	607279	647811	FALSE	10	GTGTCTGTAGATGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTHTHTHIQPDVTGKMNTSWMRLG	580834	648307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631552_647737
517274	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517275	SIRV6	+	584	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1386	500	1	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	96	305	2569	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2473	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517276	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517277	contig_15063_pilon	+	1494	5	Intergenic	novelGene_12468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517278	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517279	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517280	contig_16098_pilon	-	2845	22	Intergenic	novelGene_45839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	515.38491438664	4	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	64	2760	230275	201500	FALSE	25	GCTACAGTTCCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230486	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201739_201783_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
517283	contig_10629_pilon	-	2453	15	Intergenic	novelGene_52903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	387.808711788139	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	239	1198	256957	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPALDLSL	267676	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246856_246951_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_257145_267625
517284	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517285	SIRV6	+	984	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	34	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	254	742	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1091	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
517286	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517287	contig_9345_pilon	-	2046	6	Intergenic	novelGene_24383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	578.265890399909	209	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	75	374	176056	148860	TRUE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSG	176130	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148822_148948_173643_173789_175989
517288	contig_14925_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_55288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	895.406716246868	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	74	481	116065	113156	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTANLP	129474	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113166_114681_114779_115150_115208_115821_116101_129436
517290	contig_11285_pilon	+	2287	11	Intergenic	novelGene_5632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	502.998051686088	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	804	1964	767746	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766075	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766155_766394_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
517291	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517292	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34610_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517293	SIRV6	+	810	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	223	164	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517295	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517296	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517298	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517299	contig_6227_pilon	-	1969	18	Intergenic	novelGene_49742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	348.075122146699	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	74	838	1223803	1206219	TRUE	15	AGGTTATGGCTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGLCCFQKKLCLLTWGRRA	1224924	1202620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206275_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223810_1224857
517300	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_12153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27538	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517301	contig_15063_pilon	-	1590	8	Intergenic	novelGene_12428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	834	1157	35891	35108	TRUE	40	AATCACAATGGTAGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	28155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36411_36556_36597_38972_39090_39504
517303	SIRV6	+	962	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	57	509	7	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517304	contig_9345_pilon	-	1904	5	Intergenic	novelGene_24619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2308.99430218006	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	587	898	955353	947889	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPHAVNFEVLFINLSV	1000751	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947938_952453_952561_955197_955356_997013_997093_1000246
517306	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517307	contig_2480_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_63574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAGAAAGAACATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618765	619396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_618800_619400
517308	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	197	1432	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517309	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517310	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517311	contig_15063_pilon	+	2128	2	Intergenic	novelGene_13077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	996	1991	35557	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHTQIYTHATQTYTPHVHAYTHTHIHRHDHRLPEPAKGSPSFSVGREFLPAGVPRVPLPQDSCSKVHHCALGKPHLPKLSLLLDIDLNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34561	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
517313	contig_9482_pilon	+	2507	15	Intergenic	novelGene_44223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	123.456594041165	958	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1524	2039	230471	235868	FALSE	35	TAGAAGTAAATGGATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDKLRFADGSIRTSELRLNMQKSMQSHAAVFRVGSVLQEGCEKITQLYRDLQHLKTFDRGMVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKVRIDEYDYSKPIQGQQKKPFTEHWRKHTLSYVDVKTGKVTLEYRPVIDRTLNEADCATVPPAIRSY	212050	236336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216622_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230543_232975_233088_233345_233477_234032_234147_235781
517314	SIRV6	+	868	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	262	1	101	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	252	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517315	contig_7357_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_36779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAGAGAGAGAAAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119210	118547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_118500_119200
517316	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517318	SIRV6	+	980	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	537	11	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	328	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517319	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	78	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517320	SIRV6	+	1344	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	19	165	-18	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	239	730	1733	10736	TRUE	30	GCGTCGTAGATTAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1106	11660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517321	SIRV6	+	688	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-339	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1946	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
517322	contig_15498_pilon	+	2592	9	Intergenic	novelGene_42634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.75466993323	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	330	1454	679496	686124	TRUE	30	CTACAGAATGCACATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVACVPGGGRLGPRRHHGGATGAGPGPAAGPAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675016	687369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675112_679261_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866_686936_687042
517323	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517324	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_14034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517325	contig_10437_pilon	+	2513	3	Intergenic	novelGene_38142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.5	19	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAAAAGCGTTGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156674	164083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160076_161852
517326	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_10098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517327	SIRV6	+	1125	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	883	18	-315	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	32	364	2002	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1970	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517328	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517329	contig_15866_pilon	+	2019	14	Intergenic	novelGene_63635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	659.846889179424	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	371	1345	601021	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	459022	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519281_536005_536224_581434_581475_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
517330	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26369	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517332	contig_20641_pilon	+	1747	7	Intergenic	novelGene_52810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	806	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	64	1455	14599	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
517333	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517334	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517335	contig_11752_pilon	+	2004	8	Intergenic	novelGene_37643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1267.91881540144	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	89	1096	87165	97060	TRUE	45	GCCACAGGGGAAAAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVLQFH	85033	105875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_97043_97691_105597
517336	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26346	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517338	SIRV6	+	964	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	546	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517339	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_10521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517340	contig_5023_pilon	+	2005	13	Intergenic	novelGene_7279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2360.12567197173	4	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	73	1482	607279	647780	FALSE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYHALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRHTHTHSHTHPARCHR	580856	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625794_630210_630315_631415_631550_647731
517341	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	202	1368	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35845_36158_36266
517344	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517345	contig_12873_pilon	+	2472	5	Intergenic	novelGene_27198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_1	1003.98369010657	4	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1416	1907	17896	19855	FALSE	30	TGACTTTAAGCCAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16002	20420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
517346	contig_14871_pilon	-	2188	11	Intergenic	novelGene_63697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1410	1910	219739	213517	TRUE	20	GACTAGCTGGTGCTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVQGQVLPQVLLVVRHLDDQGHIEHVLQPLCENKRDQMTEMHCLGGGPPSRVQIKGLLIFIGIKDLIHISVREEDPPAQEAVRLLASGLLYPVYQLFVDLAASEPDNELVVVDALRTACLHRPWVHKVLLGVHGVGVTIALRGWVFWRAVSLVILAHCTSVAGF	233847	194860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_194921_201873_202054_213478_213694_214766_214875_218963_219086_219645_219828_224337_224439_227360_227472_227649_227825_230156_230296_233052
517347	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	14	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517348	SIRV6	+	1524	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	4	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517349	SIRV6	+	423	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	342	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
517351	contig_6862_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_63754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCTGTTGTTATTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96090	96913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_96100_96900
517352	contig_15063_pilon	+	1415	6	Intergenic	novelGene_8924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	3599.01434284444	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	243	1127	34808	36504	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRPGLLLHLQHPERV	27126	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36460
517354	contig_4884_pilon	+	3185	12	Intergenic	novelGene_63821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_11	562.758480556283	32	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	871	2616	164	2779	575052	593204	FALSE	35	AATTGCTTGTAGAGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNSRSHSSRSKSRSQSTSRSRSRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRIYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGYRPVWNRRHSRSPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSSRSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSATSGDIWPGLSAYDNSPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTVHSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTITPQNAPRDEARGRSSFYPDGGDQETAKTGKFLKRFTDEESRVFLLDRGNTRDKEAPKEKGSEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKDSGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKSREQDHSRSSSSSASPSSPSSREEKESKKEREEEFKTHHELKEYSGFAGVSRPRGTFHDDRDDGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGDGIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE	563341	593610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576827_577901_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_586137_586319_592827_593041_593198
517355	SIRV6	+	847	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	160	645	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517356	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517357	SIRV6	+	884	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-11	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517358	SIRV6	+	508	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	733	558	-422	-15	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1863	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517359	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517360	contig_5988_pilon	+	2465	6	Intergenic	novelGene_16008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	135.809278033572	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1110	2354	783406	786813	FALSE	25	AATGTCAGACTGGCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	692779	786924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_693600_746160_746223_752526_752652_783303_783527_783653_783803_785838
517361	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_10431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517362	contig_6980_pilon	+	1928	8	Intergenic	novelGene_36000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	749.557937747854	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	134	589	356720	370545	TRUE	30	GTTACTGTGTCATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNCIRIVLDMLVLSLKMEK	346049	373887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_370491_370641_371430_371523_372735
517363	SIRV6	+	879	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	392	539	176	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	148	639	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1479	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517364	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	4	1476	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517365	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517366	contig_19342_pilon	+	1358	7	Intergenic	novelGene_41092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.1446603773522	4	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	326	802	4349	6183	FALSE	45	CTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHGYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3257	6739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3267_3638_3892_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
517367	contig_567_pilon	-	489	3	Intergenic	novelGene_33978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTACTTCCTCTGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370612	358297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_358381_359696_359790_370299
517368	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	22	junction_2	3783.67020067817	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	592	1413	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34936_35049_35380_35839_36158_36266
517369	contig_15063_pilon	+	1443	6	Intergenic	novelGene_13583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	35	GTGGGAAAAATGTCTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517370	contig_10082_pilon	-	3503	12	Intergenic	novelGene_63870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.98156571025	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	379	1836	260762	212085	TRUE	20	CATGTGCGTGGAAATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAYDDSVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRLLVDKGPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSNLSVPSNPAQSAQSQPSYNPFEDEDDTGSTVSEKEDIKAKNVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	294521	210267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214928_215484_215608_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358_230595_232483_232641_260702_260842_294222
517371	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_8699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	248	1423	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517372	contig_15063_pilon	+	1501	5	Intergenic	novelGene_9298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517373	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_14078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	191	1426	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34617	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517374	contig_9345_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_24363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	498.769686328269	91	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	238	1263	175658	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESWVGGDATVVVDYSLMIHRRGSAGCGPVRGGNWNSPQPQPWQDEEPSRVAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	175895	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175504
517375	SIRV6	+	641	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	722	223	-433	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	150	482	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1852	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517376	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517377	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	10	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517378	contig_14871_pilon	+	2507	11	Intergenic	novelGene_63690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	771.517491700609	1174	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	212	1504	213505	233218	FALSE	5	TGTGTGGCCGAGTCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	193746	234221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_193813_201879_202023_213502_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
517380	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	204	1376	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34604	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517381	SIRV7	-	1495	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	41	926	36	-924	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATGCGCGACTACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147882	1929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
517382	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_8612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26360	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517383	contig_6102_pilon	-	2427	9	Intergenic	novelGene_32112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	323.19709060417	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	20	1132	822105	818878	TRUE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQVRKITWRKVYFV	822124	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
517384	contig_15063_pilon	-	1458	4	Intergenic	novelGene_13712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	747	1070	35891	35108	TRUE	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36746	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517385	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517386	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517387	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_12193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517388	contig_12312_pilon	-	3411	18	Intergenic	novelGene_63969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	864.998665918926	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	80	2038	326065	218747	TRUE	20	CTTTTTATCCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHQAGTDSMRQGHRQGLR	326144	214742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215071_215114_215985_218223_218329_218676_218799_229509_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
517389	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3283.11483198502	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	918	1406	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35384_35839_36158_36266
517391	contig_15063_pilon	+	1934	6	Intergenic	novelGene_8435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3599.786771463	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	627	1799	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	3080	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3459_27120_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517392	SIRV6	+	526	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	13	29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCACTTGTCGTGCGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	2569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
517393	contig_177_pilon	+	2415	2	Intergenic	novelGene_41846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	608	1012	418344	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	417684	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_417892_417943
517395	contig_15092_pilon	+	2060	3	Intergenic	novelGene_57802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	214	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	62	628	325159	351165	FALSE	10	GGTTTTTTTTTTCGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325097	352597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
517396	SIRV6	+	1515	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	-13	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517397	contig_15063_pilon	-	1732	7	Intergenic	novelGene_10432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	985	1308	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
517398	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517399	contig_15063_pilon	+	1666	6	Intergenic	novelGene_14135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	178	1413	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34630	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517400	SIRV6	+	838	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	180	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	30	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	178	537	144	680	1733	10780	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLYLEKEEVRIIDERVEVEVVQQES	1483	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3149_10707_10819_11031_11109_11205
517401	contig_401_pilon	-	4223	30	Intergenic	novelGene_42892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_18	47.7485486702885	363	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1062	3189	21	3209	1831260	1808758	FALSE	10	TCCTTCTACCCCACTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRTPRSPLHVVQPRWSPRRRTLLPPLPLLLPLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGADGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGISASQCTPIEFDSKGSRMLESSLSSPEGEEIVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDVRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDINGDGLDDLLVGAPLLMERTADGRAQEVGRVYVYLQHPAGMEPTPSFTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFIFPGGPGGLGSKPSQVLLPLWAAGHTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGAFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGSPVACINLSFCLNASGKHVPDTIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLTSRQASLTQTLLIQNGAREDCREMKIYLRNESEFRDKLSPIHITLNFSLDPQAPVDSHGLQPVLHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDNICVPDLQLEVFRTPPSREQNHYVYLGDKNSLNLTFHAQNVGEGGAYEAELRVTAPPEAEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFTVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWGGLRFTVPHLRDTKKTIQFDFQILSKNLNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVSLNGVSKPETVLFPVSDWHPRDQPQEEGDIGPAVHHVYELINLGPSSISQGTLELSCPQALEGQRLLYVTRVIGLSNCTTSHPLNPQGLELDPMGSQHHQLQRREAPGRTPASSGPRILKCPEAECFRLHCELGPLHRQESQSLQLHFRVWSKTILQREHQPFSLQCEAVFKALKMPYRILPRQLPQKELQVATAVQWTKAEGSHGVPLWIIILAILIGLLLLGLLIYVLYKLGFFKRSLPYGTTMEKAHLKPPATSDA	1831280	1807743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1808842_1809493_1809617_1810193_1810296_1811078_1811193_1811302_1811390_1812330_1812484_1812882_1812989_1813093_1813175_1813312_1813393_1813554_1813648_1813740_1813910_1814295_1814364_1814502_1814641_1814915_1815071_1815201_1815258_1815456_1815559_1815726_1815773_1816015_1816208_1816444_1816654_1816947_1817001_1817173_1817231_1820232_1820277_1820417_1820463_1820691_1820818_1821088_1821135_1821227_1821290_1821509_1821631_1821731_1821845_1823551_1823683_1831027
517402	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517403	contig_177_pilon	+	2335	3	Intergenic	novelGene_41816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	80	1156	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415651	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419333_419556
517404	SIRV6	+	857	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	8	223	1	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	39	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	207	698	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1138	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517405	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	4	1479	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517406	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	35	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
517407	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517408	SIRV6	+	577	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	786	223	-369	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	86	418	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1916	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517409	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	78	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517410	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517411	contig_11574_pilon	-	2484	9	Intergenic	novelGene_64067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	341.342363873868	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	209	925	456525	449890	FALSE	25	CCGTAACAGCCATAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQEVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463668	448330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463508
517414	contig_15063_pilon	+	1920	7	Intergenic	novelGene_13033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3695.17550327451	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	194	1564	30275	38994	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	30081	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
517415	contig_1986_pilon	+	1864	4	Intergenic	novelGene_64152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTTAGGGTAAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387011	410391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_388450_402862_402998_403605_403720_410214
517416	SIRV6	+	550	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-2	8711	-2	80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGTGGCTCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
517417	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517418	contig_5988_pilon	+	1550	2	Intergenic	novelGene_15949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	604	939	652391	652726	TRUE	15	GTATGCCAAGCGTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVTFHHLVGWLKASISNLCYRKLFMVGFLSRDDGGVCGQREVDAGVGHQVGLEFCQIDIQGTIKSEGSSDGGHNLANKAVKVSIGWALNIKVSTTDVIDGLIVYHEGTI	651787	786656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652782_786100
517419	contig_15063_pilon	-	1725	7	Intergenic	novelGene_9913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34609_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
517420	contig_4125_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_25047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208905	206447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_206400_208900
517421	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	1	1473	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517422	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517423	SIRV6	+	933	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	397	480	181	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	143	634	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1484	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517424	contig_10246_pilon	+	2891	10	Intergenic	novelGene_46894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	219.413865661322	808	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	80	1237	144696	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKDSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140720	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168117_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
517426	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517427	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_8929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	795	1118	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36794	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517429	contig_15063_pilon	+	1494	5	Intergenic	novelGene_9295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517430	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517432	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_9677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517433	contig_8978_pilon	+	2334	12	Intergenic	novelGene_49403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	300.125263104789	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	67	963	339807	343826	TRUE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQHSLRWRSNSRTKWTATLRKLGRSWRWRWRLLAMSTRSC	331596	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343669_343708_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
517434	SIRV6	+	498	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10319	9	1082	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11319	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
517435	SIRV6	+	1041	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1414	15	-15	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517437	contig_15063_pilon	+	1416	6	Intergenic	novelGene_12520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	6	1271	28164	36632	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28158	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
517438	SIRV6	+	604	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	792	736	-406	133	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	123	455	2002	10736	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1879	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
517439	contig_15063_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_12922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517440	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517441	contig_5485_pilon	-	2049	4	Intergenic	novelGene_37693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	290.872633447853	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	160	1239	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88094	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86070_86257_86366_86774_87027_87794
517442	contig_233_pilon	-	2027	13	Intergenic	novelGene_14604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1579.57999867757	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	120	1028	126907	92266	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPAYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSKVRHASASSPPKAA	127026	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92315_93916_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101682_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517443	contig_12357_pilon	+	1933	10	Intergenic	novelGene_6122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	786.445794479391	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	114	1247	26079	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQDGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25965	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_52790_52844_53169
517445	contig_15063_pilon	+	1657	6	Intergenic	novelGene_13958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	3744.9885767516	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	198	1289	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
517446	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517447	contig_11285_pilon	+	2400	13	Intergenic	novelGene_5557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	521.507004320705	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	852	2084	767584	769878	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763492	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
517449	contig_1450_pilon	+	2512	18	Intergenic	novelGene_27359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_17	506.245827015139	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	228	2462	244426	355901	FALSE	60	GAAAAAAAAAAAGTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEPCAPSPAPPLPAFRVGSVPALSPERGELGPTWH	244198	355951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_355799
517450	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517451	contig_12605_pilon	+	753	5	Intergenic	novelGene_64216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	309	620	4816	5984	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCGDQACGGRDLPEVGSHRGALWRGAKIHMPCAARGAD	3943	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5015_5871_6005_6124
517452	contig_10324_pilon	+	2729	23	Intergenic	novelGene_7735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	1247.38057113946	6	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	563	2146	69577	78985	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFCEDLERNDGSQERPYFMSPELRDILLKGSAEEGKREEVA	57996	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_58047_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_78866_79501_80699
517453	SIRV6	+	756	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	575	585	359	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	71	562	1733	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1662	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517454	contig_5189_pilon	-	2260	12	Intergenic	novelGene_34827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	955.749422535889	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	TRUE	10	TCTAATGTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_198734_198828_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
517455	SIRV6	+	721	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	8172	11	619	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
517456	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517457	contig_233_pilon	+	1671	9	Intergenic	novelGene_14648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	323	832	78477	91651	TRUE	15	GGCACCCAGCTTCCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78154	104218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_93776_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151
517458	contig_8317_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_20051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16422	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
517459	contig_9807_pilon	+	2300	16	Intergenic	novelGene_32894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	533.029188277298	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	60	1877	109130	158783	TRUE	15	CTTCGTTGTGGATCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109070	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676_158874_159433
517460	SIRV6	+	420	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	342	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845_2027_2470
517462	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517465	contig_8122_pilon	+	2782	4	Intergenic	novelGene_40262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2109	junction_3	528.460867887953	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740971	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_742163_744037_744784_745062_745148_748083
517468	SIRV6	-	504	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGCTCAGATGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11705	11201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11200_11700
517469	contig_12790_pilon	+	2099	11	Intergenic	novelGene_35222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	283.87407419488	2583	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	252	1232	307252	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHSIAEVGRAPERCRAESSRSRAKPRPALPRGSATQASSAFSTSHTDRTPRARTAVPAAPAPSGAGEIFAHGAARGIWWPANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305932	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_306378_306419_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
517470	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27535	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517472	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_11066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	232	735	34808	35888	TRUE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	27137	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35844_36158_36266
517473	contig_11171_pilon	+	2581	3	Intergenic	novelGene_48562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.5	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	66	515	70574	105797	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGAGLRAERVGAASRLSRRCKMADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTGEFCLLIQPSC	70508	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86240_105761
517474	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517475	contig_5954_pilon	-	2382	15	Intergenic	novelGene_28614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	394.861768631164	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	102	2021	959926	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEIKRKQDWSDHAIWWEQKKNGGCCRPTGRWTSTGSWLTPASSSGPSTSQLSCGCPIAAPCACELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960561	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956483_956762_956942_959766_959941_960474
517476	contig_5643_pilon	+	1645	14	Intergenic	novelGene_39083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	746.128635577272	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	477	1571	634983	641123	FALSE	40	ATTCCTTCAAGAAGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQTQGGYV	631271	641197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631977_634832_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641102
517478	contig_7644_pilon	+	2850	10	Intergenic	novelGene_64243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	118.652620891594	1269	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	59	910	162753	182983	FALSE	15	GTGTTTAACCGCCAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPPPPPRSVATCAKRVRPMVLSRGAMAAFRLALIQLQVSSIKSDNVTRACGLVREAAAQGAKVISLPECFNSPYGLKYFPEYAEEIPGESTQKLSEVAKECSIYLIGGSIPEADAGKLYNTCAVFGPDGNLLVKHRKIHLFDIDVPGKITFQESKTLSPGDSFSTFDTPYCRVGLGICYDIRFAELAQIYAQRGCQLLVYPGAFNLTTGPAHWELLQRGRAVDNQVYVATASLARDDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLARAGPEETIVYSDIDLKKLAEIRQQIPIFSQKRSDLYAVEAKKL	162694	184923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169247_169369_171093_171183_175984_176079_176578_176654_177755_177835_179596_179696_182476_182533_182891
517479	SIRV6	+	321	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	350	96	184	74	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
517480	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_9712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	779	1102	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36778	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517481	contig_5033_pilon	-	2212	13	Intergenic	novelGene_29028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3860.7099160071	1	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	29	1399	566787	534177	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQVCLGLL	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532161_534168_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
517482	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517483	SIRV6	+	408	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTATCTGCAGTCAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470
517486	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	233	1396	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
517487	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517488	SIRV7	-	2408	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	52	2	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	92	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147871	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
517489	contig_15063_pilon	+	1476	5	Intergenic	novelGene_8758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	35	ATGTGTGCATTCAAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517490	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517491	contig_6980_pilon	+	2197	10	Intergenic	novelGene_36010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	827.482184359336	8	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	209	1102	356720	372790	FALSE	20	CTGTTACTGTGTCATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346064	373885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_353050_353141_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
517492	contig_9609_pilon	+	2777	8	Intergenic	novelGene_23045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1509	junction_2	401.963649488612	888	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	44	1111	435608	454609	FALSE	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGAGRRPGRADGGMGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435564	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418
517493	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	5	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517494	contig_15063_pilon	+	1931	7	Intergenic	novelGene_13030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3800.74783942435	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	442	1671	34808	39510	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTIYR	30075	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39082_39497
517496	SIRV6	+	485	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGCGTCTAGGACGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
517497	contig_15063_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_9502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	40	GAAGTTGTATGTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517499	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_13988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517500	SIRV6	+	445	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10324	57	1087	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11324	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
517501	contig_15063_pilon	+	1725	6	Intergenic	novelGene_13688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	202	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTADPPLCPVTVAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38942_39092_39506
517502	contig_12644_pilon	+	1588	9	Intergenic	novelGene_44612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4313.12072163242	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	543	1514	2678073	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
517503	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517504	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_10449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517505	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517506	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517508	SIRV6	+	364	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10381	81	1144	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11381	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
517509	contig_5033_pilon	-	2132	15	Intergenic	novelGene_29022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	24	1598	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531428_532032_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
517510	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517511	contig_15063_pilon	+	1572	7	Intergenic	novelGene_9069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	472	1356	35271	39515	FALSE	40	ACTTGTGGCCATGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34804_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517512	SIRV6	+	895	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	398	517	182	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	37	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	142	633	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1485	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517513	SIRV6	+	919	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	9	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	139	471	1673	2560	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1146	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517514	contig_15063_pilon	-	1514	4	Intergenic	novelGene_13333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34926_35035_35380_35839_36156_36264
517516	contig_15063_pilon	-	1537	5	Intergenic	novelGene_12369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28205_34613_34924_35035_35378_35838_36156_36264
517517	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	21	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26362	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517519	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517520	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	294	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517521	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517522	contig_7334_pilon	+	2608	3	Intergenic	novelGene_50570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	254.5	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	283	1350	120109	121176	TRUE	20	CAACTGTACTCACTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116758	122497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097_121349_121411
517523	contig_233_pilon	-	2532	16	Intergenic	novelGene_14655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1563.70098875144	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	424	1344	107460	94856	TRUE	50	TTAACCAATAGGTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPWPRSVFRSSRL	126984	78188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79002_91563_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94892_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107467_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517524	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517525	contig_15063_pilon	-	1538	5	Intergenic	novelGene_11911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	802	1125	35891	35108	TRUE	25	CCAGTAGCTGAGGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36801	27143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517526	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517527	contig_15063_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_11287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	796	1119	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36795	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34925_35033_35380_35839_36156_36264
517529	SIRV6	+	1431	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	392	-13	176	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	148	639	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1479	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517531	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517532	SIRV6	+	1504	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	1	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517533	SIRV6	+	691	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	190	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	31	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGCAAATAAGAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	10804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517535	SIRV6	+	810	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	24	601	24	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATATGCGGTAAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024	11225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517536	contig_3077_pilon	+	1822	7	Intergenic	novelGene_26742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_6	3656.2850909997	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	758	1324	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10932	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
517539	contig_3469_pilon	+	2489	18	Intergenic	novelGene_34179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	145.414025301294	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	406	2127	445682	479914	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGIPAAFDMMLTGRNIRADKAKKMGLVDQLVEPLGPGIKPPEERTIEYLEEVAVTFAKGLADKKISAKRDKGLVEKLTSYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	436998	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_437078_438405_438540_443464_443621_445645_445685_447278_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
517540	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517541	contig_15063_pilon	-	2067	4	Intergenic	novelGene_13056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1142	1561	35527	35108	TRUE	15	GGATTGCATGTTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	30198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34924_35035_36156_36264
517542	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517543	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517544	contig_7051_pilon	+	2836	12	Intergenic	novelGene_64278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	179.286372337066	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	208	1014	184159	206260	FALSE	85	AAAAAAAAAAAACTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSFQ	183951	208082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206250
517546	contig_15063_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_11239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	65	TTATAAAAATTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517547	contig_5515_pilon	-	2262	8	Intergenic	novelGene_52331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_2	397.185249536006	1360	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	709	1332	71189	68158	FALSE	5	TCCCCTGAGCGGCTCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99255	67227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75893_75979_76045_89044_89139_99118
517548	SIRV6	+	495	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
517549	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	11	1420	28164	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517550	contig_5189_pilon	-	2274	12	Intergenic	novelGene_34859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	955.749422535889	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	111	569	244235	220269	TRUE	40	ATTAAAACTGAATTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDTGNC	247751	198114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220283_220344_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
517551	contig_6735_pilon	-	1902	15	Intergenic	novelGene_15738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	963.145847454781	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	642	1424	545923	542464	FALSE	35	TATGCTGAGCTAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPEHYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568264	541985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543108_543179_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552901_554259_554374_564157_564232_564784_564869_568198
517552	contig_13740_pilon	-	1866	12	Intergenic	novelGene_34611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	3995.31105544388	978	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	169	1194	165243	157474	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
517553	contig_177_pilon	+	2563	2	Intergenic	novelGene_41813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	890	junction_1	0	133	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	84	1160	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415647	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647
517555	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_13770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	536	1357	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34936_35063_35380_35839_36158_36266
517556	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517557	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517558	contig_3122_pilon	+	3324	1	Intergenic	novelGene_64377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243786	247110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_243800_247100
517559	contig_15063_pilon	+	1683	6	Intergenic	novelGene_14061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	193	1428	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34615	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517560	contig_13863_pilon	+	2215	10	Intergenic	novelGene_42070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_2	293.832151633094	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	224	1321	474588	489696	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKVSVYRA	455704	490590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556
517561	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517562	contig_366_pilon	-	3344	20	Intergenic	novelGene_51635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.316957297828	12	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1543	2817	1423458	1406567	FALSE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYECRAHNWAGNATQAFWPISVEATVHRLKEPLFTPVLVACMSVMALLLLLLVLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNTYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGLSPDPGQDPDGVTGYKNIHLEKKCVHRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSSNDSFSEQGLDKEDRRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTSGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMPASGWGLSPHPLPHCSQCCQPHVCYANW	1440999	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406654_1408115_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
517563	contig_6954_pilon	-	2716	1	Intergenic	novelGene_64414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAAAGAAGAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21728	19012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_19000_21700
517564	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517565	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517566	contig_10235_pilon	+	2423	5	Intergenic	novelGene_46445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_3	71.2618411213182	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210494	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
517567	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517569	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517570	SIRV6	+	925	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	601	2	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ATTGTATATGCGGTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517571	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517572	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517573	contig_15063_pilon	+	1813	8	Intergenic	novelGene_8437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3646.68247891708	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	327	1562	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAHCGPPAPAGGGNIVWVPVTVGGGVVVITYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	3360	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3455_27136_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517574	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517576	contig_13894_pilon	+	2000	9	Intergenic	novelGene_62084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2326.75538236726	285	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1190	1945	523580	528117	FALSE	15	ACACCTGCGTCTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520621	528172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
517577	SIRV6	+	354	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGTTTATAGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	1953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
517580	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	11	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	237	1364	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27132	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
517581	contig_15063_pilon	+	2346	2	Intergenic	novelGene_13075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1213	2208	35557	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHTQIYTHATQTYTPHVHAYTHTHIHRHDHRLPEPAKGSPSFSVGREFLPAGVPRVPLPQDSCSKVHHCALGKPHLPKLSLLLDIDLNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34344	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
517582	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_10492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517584	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_12219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4140.46851213724	188	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	221	1396	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27550	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36263
517586	contig_18272_pilon	-	2634	6	Intergenic	novelGene_6985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	509.720943262095	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	187	630	262678	124254	TRUE	25	ATGATGACACTGTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFFALLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQIHIRSWARPAVA	262864	120743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_168644_168665_172640_172796_184338_184551_262660
517587	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_13207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517588	contig_15063_pilon	+	1438	4	Intergenic	novelGene_14190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	124	1296	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34684	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517589	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517590	contig_12357_pilon	+	2135	12	Intergenic	novelGene_6080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	788.583540279659	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	429	1469	30281	53235	FALSE	60	AATAAAATAATCTTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29596_30209_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
517591	SIRV6	+	709	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	257	589	2002	10736	TRUE	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517592	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_11048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	50	TGTTTATAAAAATTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517593	SIRV7	-	1960	5	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	71848	42	71670	-37	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATGAAATAGAGCGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43068	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_4095_4180_4725_4811_43028
517594	contig_5084_pilon	+	3329	12	Intergenic	novelGene_64629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	589	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2375	2728	1330232	1335330	TRUE	30	AATAGAGCCGCGACTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWSRTDCMSPSGPPASTSRSRSSPLISTYTPLLRWPKMLSAGTLQSSKISSEVLEPLMPNLSSFLEALKPGMLTFSTIKAVMPREAGTAAGSVLAYTIRTSASGPLVIQHLVPFRM	1326293	1344247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1328435_1329068_1329144_1329243_1329350_1330179_1330261_1330745_1330841_1333776_1333871_1335194_1335338_1335727_1335822_1337106_1337283_1340933_1340982_1341203_1341295_1344062
517596	contig_7728_pilon	+	4652	3	Intergenic	novelGene_64738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	213	junction_2	17	279	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTGAATACGCTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867084	878055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_867366_867829_867855_873709
517597	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517598	contig_8772_pilon	+	1721	9	Intergenic	novelGene_21081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	32	junction_1	4476.64004688505	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	581	1405	16563	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15211	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15779_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
517599	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517600	SIRV6	+	802	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	137	222	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATCTAAAATGGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517601	contig_6980_pilon	+	1745	5	Intergenic	novelGene_36069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1400	junction_1	396.853247435371	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	29	661	364894	372790	FALSE	35	AAAATTTCAGACTGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	364865	373874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
517602	contig_12923_pilon	-	3263	17	Intergenic	novelGene_30081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	320.39496499438	1	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	53	2098	93727	51057	TRUE	20	ATGAGGTTCTACTGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKSGSSWRRTLPLLAES	101220	45340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51106_51157_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
517603	contig_16622_pilon	+	2280	7	Intergenic	novelGene_48444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGAATTGTCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108210	121928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_108469_110033_110147_110891_111029_112144_113160_113604_113741_115155_115295_121446
517604	SIRV6	+	582	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	22	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845_2027_2470
517606	contig_5988_pilon	+	1771	5	Intergenic	novelGene_15919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	1435	1770	653384	655531	FALSE	35	GAGTCGAGGTAAGTAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELAVGASANFINDRGFQVHKHCPGHVFASARLTEEGVEGVISSPNGLVTWHLAIRLDAVFQAVELPAGIANLDTSLANVDRDALTHAGYGLGGEGDRSTHRVPVTVLDKL	651787	655532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652308_652406_652901_652963_653422_653549_653773_655456
517607	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517608	contig_5039_pilon	+	3686	22	Intergenic	novelGene_64993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_14	121.318343994505	418	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1010	3033	87	3119	1688604	1717980	FALSE	15	AGGTTGCTCCCATTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLVIGSGGREHTLAWKLAQSPHVKQVLVAPGNAGTACSEKISNAAVSVSNHAALAQFCKDEKIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLTSAGVRCFGPTAEAAQLESSKRFAKEFMDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALKDGRVVTNGGRVLTVTAIREDLPSALEEAKKGLAAIKFEGAVYRKDIGRRALAFLQQPRGLTYKEAGVDIAAGDMLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPADSPRVKVRNLMESMQINRSVLENSSLENHVSVQPPRARVAVLISGTGSNLQALIDSTREPHSSARVVVVISNKAAVAGLDKAETAGIPTRVINHKLYKSRVEFDNAVDQVLEEFSTDIVCLAGFMRILSGPFVRKWNGRMLNIHPSLLPSFKGANAHEQALEAGVAVTGCTVHFVAEDVDAGQIILQEAVPVKRGDSVATLSERVKTAEHKIFPAALQLVASGAVQLGENGKICWVKKE	1687274	1718547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687322_1688564_1688749_1691365_1691462_1692008_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648_1698818_1700933_1701166_1703149_1703245_1703623_1703734_1704337_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710831_1712083_1712222_1713013_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
517609	contig_15063_pilon	+	1780	7	Intergenic	novelGene_8459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3837.21764071602	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	299	1138	34808	36333	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFVCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGQACTSRLPDATHPGAAESA	26297	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36271_36600_38975_39092_39506
517611	SIRV6	+	754	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	578	12	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517613	contig_20693_pilon	+	2183	13	Intergenic	novelGene_60258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	537.224632305291	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	230	1285	21258	34261	FALSE	15	TGAGGATTTTCTGAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	19365	35159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_19442_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
517614	SIRV6	+	604	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	575	337	-32	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517617	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_8901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517618	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517619	contig_15063_pilon	+	1594	7	Intergenic	novelGene_10154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	238	1044	34808	36299	TRUE	35	TTGAGCTCTAAGAAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	27131	39640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266_36600_38975_39092_39506
517620	contig_15063_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_10853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	233	1168	34808	36740	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFPLCVCPCVHSN	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36386_36704
517621	contig_15063_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_11394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517622	contig_15063_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_14295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517623	contig_233_pilon	-	2431	15	Intergenic	novelGene_14618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1502.87248091032	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	479	1603	107403	91635	TRUE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMLLCRVPEIPKGPL	126999	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_93942_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108423_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517624	contig_15063_pilon	+	1502	5	Intergenic	novelGene_9163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	CTGTGGGTGAGAAGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517625	SIRV6	+	632	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2026_2470_2625_2750_2829_3106
517627	SIRV6	-	342	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1540_1646_1735_1844
517629	contig_5018_pilon	-	1972	9	Intergenic	novelGene_47048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_7	699.084714108383	5680	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	525	1412	1401907	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402168_1402363_1402701
517630	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_12481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	40	GTAATCACAATGGTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	28157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517631	contig_10500_pilon	-	3673	10	Intergenic	novelGene_41171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	657	junction_4	256.690811755127	830	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	143	1120	1345339	1318487	FALSE	20	CCTGTTTATGCAGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1409686	1315933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1409548
517632	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517633	SIRV6	+	627	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-330	486	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTCGTAGATTAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
517634	contig_7775_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_37519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473030	473473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473000_473500
517635	contig_233_pilon	-	2563	15	Intergenic	novelGene_14647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1406.64038345533	3	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	87	2138	126907	78579	FALSE	20	CCATGGGGTGTCCTAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92334_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517636	contig_8317_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_20733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16542	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
517637	contig_4301_pilon	-	2351	7	Intergenic	novelGene_65110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	351.906553252738	1262	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575617	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_546046_546164_547294_547521_551248_551329_575543
517638	SIRV6	+	782	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	33	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2022_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517639	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517640	SIRV6	+	752	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	406	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517641	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517642	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517643	contig_10311_pilon	-	1842	12	Intergenic	novelGene_50405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.978539629779	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	32	1255	71526	65773	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65610_65670_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
517644	SIRV6	+	709	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTGAGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2479_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517646	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	231	743	34808	35888	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
517647	contig_5643_pilon	+	2006	16	Intergenic	novelGene_39005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	765.249890921623	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1019	1795	636518	641217	TRUE	15	ATTGTGTGTGTAGCCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631188	641597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634906_635216_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
517648	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517649	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517650	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517651	contig_15063_pilon	+	1420	4	Intergenic	novelGene_14016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	15	TGTGTCCATGTGTGCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517652	contig_7066_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_42150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	300	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATGTTAATCTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757865	748001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749885_750340_750424_757777
517653	contig_11364_pilon	-	3912	30	Intergenic	novelGene_65148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_8	167.976061371306	437	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	967	2904	122	3025	148611	61299	FALSE	5	GTTTGTTTGATTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSEPLSRVKVGTLCRPEGPPEPMVVVPIDVEKEDVRILKVCFYSNSFNPGKNFKLVKCTIQTEIREIITSILLSGRIGPNIQLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYERLHVEAEWRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGCLELRRFFKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYASLKEEECVMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPKGIRQLTSQDAKPTCLAEFKQVRSIRCLPLEEGQAVLQLGIEGAPQSLSIKTSSLAEAENMADLVDGYCRLQGEHKGSLIIHPKKDGEKRNSLPQIPLLNLEDRRSQFSESCSIESDIYVEIPDETLRRPGGPQYSVARENVILGRILGEGFFGEVYEGVYQNHKGEQLNVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPIWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEEYYKASVTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDIYQMEKDIAMEQERNTRYRAPKILEPTAFQEPPPKPSRPKYRPPPQTNLLAPKLQFQEEDFIQPSSREEAQQLWEAERVKMRQKLDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNNKSPLTPEKEAGYTEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	231195	60411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64315_64454_65141_65189_66590_66616_67011_67048_67659_67807_85522_85589_86482_86592_90472_90678_92018_92109_92225_92327_94548_94665_94952_95054_95295_95381_96227_96326_97000_97052_97849_97897_98273_98314_98863_98982_99694_99797_100385_100461_101040_101182_101802_101858_102056_102120_113991_114072_115471_115560_116113_116293_148407_148654_231116
517654	contig_12638_pilon	+	2934	19	Intergenic	novelGene_33083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_13	574.027414173071	12	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	863	1630	182987	194412	TRUE	40	TAAGAAATCTCATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAVVLWSYLQVPSVYISYISSAP	170765	200478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194347_194442_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
517656	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517657	contig_10235_pilon	+	2279	6	Intergenic	novelGene_46407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	192.272098859923	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	49	720	210483	212152	FALSE	15	ATGCATCATTTCTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210434	213711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210754_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
517658	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517659	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517660	SIRV6	+	840	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	523	337	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517661	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2532.75298588315	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	229	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28172	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35371_35839_36158_36266
517662	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517664	contig_3747_pilon	+	2477	6	Intergenic	novelGene_24803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5340.7820026659	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	409	1080	202676	203804	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGSDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVVDPCIVNNNVQ	200983	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201336_202619_202743_202870_203128_203228_203386_203498_203654_203768
517665	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28170	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517666	contig_12965_pilon	+	3391	4	Intergenic	novelGene_65195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	616	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCGGACGGGGAGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306100	315922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_+_308970_311951_312059_314849_314934_315591
517667	contig_3986_pilon	-	2873	12	Intergenic	novelGene_52674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	125.377446664986	13	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	280	1362	55958	35584	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPV	153852	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35589_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_153684
517668	contig_2537_pilon	+	2367	19	Intergenic	novelGene_33417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	238.039089278823	2200	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	69	1652	205895	290428	TRUE	10	GTCTCATCTATGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRPCDAPRLRNWGLQQCRTTSCHLPGQLIQAPVERTSPDSKTYVKYEAPGFLARSSSPFPATKI	205826	298219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846_239892_241320_241438_280631_280760_290367_290432_295098_295238_297646
517669	SIRV6	+	727	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	519	164	-3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGTAAGACTGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517670	contig_13216_pilon	+	2029	7	Intergenic	novelGene_47455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	890.114490139081	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	122	1489	229682	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRRSKGSGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229560	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243931_246000_246135_256120_256296_258447_258573_260430
517673	contig_11720_pilon	-	995	6	Intergenic	novelGene_44014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	173	523	272327	271841	TRUE	25	CTGCGGGGCCGAAGAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272499	270066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_270151_270331_270460_270547_270697_271265_271340_271803_271958_272093
517674	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517675	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_9503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517676	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517677	SIRV6	+	908	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-14	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	175	507	1673	2560	TRUE	35	TGCGGTAAACGTAAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1110	11232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
517678	contig_13707_pilon	-	2226	10	Intergenic	novelGene_43557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	725.781843221927	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	325	1191	273826	270728	FALSE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275551	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274238_275413
517681	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517682	contig_4151_pilon	+	3370	4	Intergenic	novelGene_65266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	127.761061708522	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	172	810	620441	663644	TRUE	30	TCTGAATCTCTTAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	620269	668989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_663078_664642_667275_667425_667575
517683	contig_15063_pilon	-	1529	5	Intergenic	novelGene_10269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
517684	contig_8317_pilon	+	361	3	Intergenic	novelGene_19258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	7575.5	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	54	359	14294	14892	FALSE	35	TACAGGAACATCACAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNM	13272	14894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730
517686	contig_5643_pilon	+	2072	16	Intergenic	novelGene_39089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	830.386003949703	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	514	1401	634983	640184	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSWALGPFLVRC	631330	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631344_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640150_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
517687	contig_9471_pilon	+	2349	9	Intergenic	novelGene_21802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_8	342.397338628676	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	1244	2245	412726	417296	FALSE	20	ACTACCATGTTTATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	411482	417400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
517688	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517689	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517691	contig_15063_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_14151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	158	1330	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34650	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517692	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_11436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517693	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_10635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517694	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517696	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517697	contig_3469_pilon	+	2528	19	Intergenic	novelGene_34175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	143.299317669152	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	192	2168	443466	479914	FALSE	5	CAGCCTCTGCCTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGCKTSQEVVQISQEGQKIFEKLEKSTKPIVAAISGSCLGGGLELAISCHYRIATKDKKTVLGAPEVLLGILPGAGGTQRLPKMVGIPAAFDMMLTGRNIRADKAKKMGLVDQLVEPLGPGIKPPEERTIEYLEEVAVTFAKGLADKKISAKRDKGLVEKLTSYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	427974	480274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_443464_443604_445564_445685_447278_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
517698	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517699	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
517700	contig_5954_pilon	-	2912	7	Intergenic	novelGene_28781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	143	853	1462068	1392942	FALSE	70	GGTATTAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462210	1390882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
517701	contig_15063_pilon	-	1580	6	Intergenic	novelGene_10438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	833	1156	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	99121	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36808_99096
517703	contig_10134_pilon	-	2146	5	Intergenic	novelGene_16229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	1232	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33372_33431_33731_34922_35178_38558_38831_39594
517706	contig_15063_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_11474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	660	983	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36659	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
517707	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517708	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517710	contig_12624_pilon	-	2043	14	Intergenic	novelGene_61031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_8	990.270550563637	190	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	157	873	903621	875480	TRUE	30	CCCAGAGTCCAGGCCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQGSGRGGSPCAVSVCT	903777	862020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
517711	contig_9807_pilon	+	2435	15	Intergenic	novelGene_32851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	546.307143370796	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	119	1741	109130	154326	TRUE	30	TTAAACCACGTGTGGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSVSGPQPPFSAGGTWRAAT	109011	159002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154550_156624_156770_158676
517712	contig_15063_pilon	+	1616	6	Intergenic	novelGene_9284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	242	1384	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
517713	scaffold_12124_pilon	+	2229	11	Intergenic	novelGene_22066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	506.394915061358	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	15	950	836073	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGCGMVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	836058	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858458_858622
517714	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517715	contig_15047_pilon	+	1761	5	Intergenic	novelGene_52150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	65.868714121349	5	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	27	944	2194	4510	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWGKRGWGRSLFSESMSLSGDFQQGWG	2167	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4158_4687_21013
517716	SIRV6	+	257	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	20	506	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAATTGGCGATGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
517717	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517718	contig_2367_pilon	-	1871	4	Intergenic	novelGene_65314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	720.306107768697	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	101	313	213194	206127	TRUE	10	TTTAAGTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKMLSRSGQEESDRLG	213294	192219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193724_206072_206172_208552_208634_213107
517719	contig_15063_pilon	-	2093	4	Intergenic	novelGene_12061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1268	1687	35527	35108	TRUE	15	CCTGGCCCCAGTAGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36903	27150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_36156_36264
517721	SIRV6	-	441	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTAAATTTACGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11695	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11700
517722	contig_8017_pilon	-	3384	5	Intergenic	novelGene_65374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_4	75.8699545274676	5136	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	60	617	1511273	1496306	FALSE	15	TTTGTATTTTCCCAGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASRPARPSRLLVPGSRSAMAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLNYILSISASSGLIALLSTGSK	1511332	1493538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1496373_1497435_1497568_1503095_1503195_1509748_1509876_1511140
517724	contig_15063_pilon	-	1514	5	Intergenic	novelGene_8665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	785	1096	35891	35108	TRUE	45	AGGCAAAAACGCAGGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36784	26754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26785_34607_34924_35035_35365_35836_36156_36264
517725	contig_5033_pilon	-	2341	14	Intergenic	novelGene_29015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3409.0263355118	448	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	142	1506	545288	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547656	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531163_531466_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
517726	contig_10246_pilon	+	2649	9	Intergenic	novelGene_46902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	232.796014517002	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	450	995	171272	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140729	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168181_171226_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
517728	SIRV6	-	419	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	449	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTAAGCTTGATGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1515_1631_1731_1843
517729	contig_4780_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_65401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAATGCTAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410259	408107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_408100_410300
517730	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517731	contig_6208_pilon	-	2939	6	Intergenic	novelGene_52977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	358.424887528754	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	153	524	383584	365189	TRUE	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGDYDYLIKFLALGDSGVGKTSVLYQYTDGKFNSKFITTVGIDFREKRVVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISQLQMHCIL	404438	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_383431_383607_404308
517733	contig_15063_pilon	+	1498	5	Intergenic	novelGene_9698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	TCTGTGGGTGAGAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517735	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517736	SIRV6	+	951	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	40	537	3	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	218	709	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1127	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517738	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_9648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	45	GAAATAAATGTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517739	contig_5210_pilon	-	2232	7	Intergenic	novelGene_65475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1420	2133	812652	807587	FALSE	15	CCCCAGATCCGTCAGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTQAKENRWAEWVGSGVAARELRRGHTADGTSEMVGVSQWFSKFCLFEQFVAIITFDPVGLHCRDVTHEVLGQADAKDLEEGDSHKDPSHDDQVVLQPLLKLAHAAFGVDEALLLQLLGFEPDVVATLGVENILRRVSDAAGEGHSAALPARVQVSAVEIDIEVPVVGPSGSTARPVFLSKVNEVLEVNVIPVGLNVAVDEEVELVSNPVLEDKGQDPCCQFQEEDEAKEHGEKL	814071	807487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_807596_808816_808988_810095_810221_811046_811093_811632_811754_811829_811891_812471
517740	SIRV6	+	847	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	246	1	117	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCGTTCACAAAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	11085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517741	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517743	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517744	contig_854_pilon	+	2301	6	Intergenic	novelGene_36224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	3042.23361364639	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	119	625	543600	562402	TRUE	35	TCGCTGAATACACAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543481	564703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
517745	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517746	contig_12790_pilon	+	1909	10	Intergenic	novelGene_35252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_9	222.212333113296	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	101	1081	307252	312473	FALSE	25	AATATGTACATTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	306043	313301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
517747	contig_18081_pilon	+	3147	8	Intergenic	novelGene_23836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	723	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	14	358	427182	427526	TRUE	10	TCTCCCGTTAACCGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLYMFIKPSFYIIYPPTVCKQIQYTCKQKASRSEVVEKRKFPLHTGASPSTLLELMPQGHIKAKRPMKNQKELILTPPPRMDFRTGICSTLQQAGVQQGNRVVFTFTDWLKQYKLSF	427168	465965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_429379_429979_430105_434817_434927_435608_435844_448204_448317_454648_454788_456512_456655_465890
517748	contig_12427_pilon	-	2156	7	Intergenic	novelGene_40543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	235	858	522337	506035	TRUE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578186	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505367_505427_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
517749	contig_15063_pilon	+	1410	5	Intergenic	novelGene_9293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1170	241	1410	34808	36655	FALSE	25	TACTGACCACTGGGCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTC	27128	36655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517751	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517752	contig_15063_pilon	+	1920	7	Intergenic	novelGene_13041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	430	1665	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30087	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517753	contig_4364_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCACACGTACTGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1532827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
517755	contig_15063_pilon	+	1491	5	Intergenic	novelGene_9296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517756	contig_10437_pilon	+	2470	7	Intergenic	novelGene_38149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	217.967632663405	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTCTTGTCTTGCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156738	163918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859_162419_162456_162590_162685
517757	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	40	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517758	contig_3956_pilon	+	2007	11	Intergenic	novelGene_14893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1406.69541834755	7	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	462	1298	1286460	1289548	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDS	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283830_1286148_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289196_1289545_1289677_1289758_1289892_1290562
517759	contig_8978_pilon	+	2258	11	Intergenic	novelGene_49378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	271.566363896562	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	97	1008	339807	344719	TRUE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEFDEAPRRTSADGRAAQPRGAKTKATGAQAGGGAQAP	331566	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343690_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
517763	contig_15691_pilon	-	3399	12	Intergenic	novelGene_60755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	69	junction_11	569.335817182858	979	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	254	1378	69449	27919	FALSE	55	GAAAAGAAAAGTAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRVT	120116	25897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_119994
517764	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517765	SIRV6	+	1001	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	527	0	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517766	SIRV6	+	591	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8710	1	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
517767	contig_19342_pilon	+	957	4	Intergenic	novelGene_41131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	97	366	5208	6183	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	5111	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_5960_5994_6139
517769	SIRV6	+	769	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAATAGTGCAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
517770	contig_15063_pilon	+	1517	5	Intergenic	novelGene_11484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517771	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	242	1048	34808	36299	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	27127	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266_36600_38975_39092_39506
517772	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	18	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517773	contig_15063_pilon	+	1492	4	Intergenic	novelGene_13869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517774	contig_11498_pilon	+	3079	10	Intergenic	novelGene_65504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	36.4958986364763	261	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	117	1556	150306	157778	FALSE	0	GTTGTTCTCTGGGCCGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRIEVFRAEELVACAGLTSPRIVPLYGAVKEGPWVSIFMELLEGGSLGQLIKQKGCLPEDRALYYLGQALEGLEYLHTRRILHGDVKADNVLLSSDGSRAALCDFGHAVCLQPDGLGNSLLTGDYIPGTETHMAPEVVMGKPCDAKVDIWSSCCMMLHMLNGCHPWTQYFRGPLCLKIASEPPPVKEIPPSCAPLTAQAIQEGLRKEPIHRASAVELGGKVSLALQQVGGLKSPWRGEYKEPRHLPPNQPNYHQTFCAQPRELSLGAPGPQPAEDTADGAPKLQPPLPPEPPERNKSPALNLSKEESGTWEPLPLSSLDPAPVKSPSSPERRATFPEQELQQLEIELFLNSLSQPFSLEEQEQILSCLSVDSLSLSDDSEKNPSKASQSSRDTLSSGVHSWSSQAEARSSSWNMVLARGRPTDTPSHFNGVKVQIQSLNGEHLHIREFHRVKVGDIATGISSQIPAAAFSLVTKDGQPVRYDMEVPDSGIDLQCTLAPDGSFAWSWRVKHGQLENRP	150189	159301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_150322_150547_150680_151200_151306_152584_152749_153232_153384_154977_155332_155517_155625_156096_156242_157134_157236_157613
517775	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517776	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	3	3435	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACATCCCAACGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
517777	contig_5643_pilon	+	2022	15	Intergenic	novelGene_39036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	815.73750279694	12	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	647	1810	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSARAWCRQRRSTSSSTWPLPSSLKQPRRSWRSCRQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631202	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640438_640538_640632_640729_641102_641244_641412
517778	contig_4105_pilon	+	2745	11	Intergenic	novelGene_21452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	122.957065677414	45	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	96	857	60529	70978	TRUE	25	TTTATCAGAACTGCCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTNIKACIVPLDPSSFTQWFLSNLGNWCPDSLGTRFSG	58721	74474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_70867_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
517779	SIRV6	+	918	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	509	167	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517780	contig_233_pilon	-	2826	16	Intergenic	novelGene_14642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	1430.69445452977	1	97	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	428	2398	107460	78579	FALSE	15	TGGGGTGTCCTAGAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107467_108401_108583_108724_108814_109919_109976_126898
517781	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517783	contig_2087_pilon	+	2156	3	Intergenic	novelGene_65560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	398	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	153	314	69092	70072	FALSE	30	ATTTCAAAGTGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNMKPGSAFIHSRIVILCRKPLPKITV	39521	71914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69176_69994
517784	contig_5967_pilon	-	2244	12	Intergenic	novelGene_44360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	506.24451022429	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	130	1380	488569	388411	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKGEWLQACDGSYLQPRGTRQLLKPVRDPVQSREVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSIDFFSPLAPFRDFCRNNSLFSILQFNQIMEMAF	517631	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388512_388657_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_448769_448866_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
517785	SIRV6	+	584	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8710	8	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
517786	contig_15063_pilon	+	1488	5	Intergenic	novelGene_9924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517787	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517788	contig_1532_pilon	-	1935	7	Intergenic	novelGene_37402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	1351.83439156659	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	149	1186	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	35479	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
517789	contig_10940_pilon	-	1927	5	Intergenic	novelGene_49246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	190	651	917000	875312	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKKPCCLLSPDAHGTSFFYFLLPFPPFLF	917189	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875395_875613_875675_893147_893306_916664_916748_916923
517790	SIRV6	+	895	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-30	223	13	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517791	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_10949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	37	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517792	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_14032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	195	1370	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517793	SIRV6	+	966	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	549	13	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517794	contig_11285_pilon	+	1675	15	Intergenic	novelGene_5699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	920	1240	787593	789161	TRUE	30	CTGCAAAGACACGCACGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPAKPERSSHPRSSTCASARTGTFSSTISLFGFWLFLYLLICSRKDTYSPASSRFPTLTNIVICIRASFSMGLPSSHSTTLVSFSFFWLQMSLSNPSRSLRACM	784062	790483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_784307_785381_785498_785701_785813_786071_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787621_787742_787832_788124_788208_788488_788581_789132_789284_789442_789509_789926_790052_790181_790247_790426
517795	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517796	contig_3602_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_60600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTAAGGGGCGCCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828003	827202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_827200_828000
517797	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517798	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_8651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	2981.39819338176	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26559	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
517799	contig_3986_pilon	-	2897	13	Intergenic	novelGene_52679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	110.130856509679	65	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	225	1688	60653	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153907	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60584_60655_153684
517800	contig_15063_pilon	+	1506	5	Intergenic	novelGene_11236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517801	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517802	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517803	contig_17796_pilon	+	1805	11	Intergenic	novelGene_33763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	249.363108739043	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	387	1523	12080	42369	FALSE	45	ATGTAACAAACACATCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKGTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8152	42651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
517804	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517805	SIRV6	+	921	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	509	164	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517808	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	61	423	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530464	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
517810	contig_9797_pilon	+	1116	2	Intergenic	novelGene_65604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	150	368	191150	191368	FALSE	45	GAAACTGTAAGCTTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	189283	192116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_189422_191138
517811	contig_15063_pilon	+	1699	7	Intergenic	novelGene_10433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	2840.63076426502	9	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	237	1331	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36569_38975_39092_39506
517813	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517814	contig_6980_pilon	+	2053	10	Intergenic	novelGene_36015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	711.08718709756	11	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	112	1005	356720	372790	TRUE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346071	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_373019_373071
517815	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517816	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-49	100	1	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
517817	contig_15063_pilon	+	1400	4	Intergenic	novelGene_14214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	93	1265	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34715	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517819	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10366	35	1129	-33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCAGTTTAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11366	11791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
517821	SIRV6	+	727	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	177	491	2021	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517822	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517823	contig_15047_pilon	+	1650	7	Intergenic	novelGene_52192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2827.28625285017	8	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	505	1008	3306	4686	FALSE	20	CTTCCAGAATCTGCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2174	21655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2482_2826_3221_3315_3411_3498_4158_4434_4552_4687_21013
517824	contig_9199_pilon	+	2940	11	Intergenic	novelGene_65616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_9	49.7135796337379	666	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	61	1191	42527	57407	FALSE	15	CATCAGCTGGACCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALAADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42466	59156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304
517825	contig_5033_pilon	-	2077	13	Intergenic	novelGene_29029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3858.05547595619	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	562	1308	536585	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536628_542748_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
517827	SIRV6	+	774	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	557	585	341	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517828	contig_6898_pilon	+	1965	3	Intergenic	novelGene_35786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124954	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_125789_126096
517829	contig_12622_pilon	-	2223	12	Intergenic	novelGene_5909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2099.42610418708	3	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	60	860	1590968	1588038	TRUE	20	TTATATGTACATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVSVHLRGPLLLCLHHRRPLRRPTLVRHHRQLRPGPALRLLSHPS	1591027	1583538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588565_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
517830	contig_10902_pilon	+	3373	9	Intergenic	novelGene_65663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_7	425.485531481389	1859	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	61	1113	79192	110079	FALSE	45	CTGAAAAAAATCTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPRALRGHLRVFPSVCPSDMEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDLSKTAVDGTSENPFLDNPDAFYYFPDSGFFCEENSSDDDVILKEEFRGIIIKQGCLLKQGHRRKNWKVRKFVLREDPAYLHYYDPAGGEEPLGAIHLRGCVVTSVESNSDGKKSDEENLFEIITADEVHYFLEAATSKERIEWIKAIQLASRTGK	79131	112339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102_100288_102136_102242_107118_107203_108075_108146_109942
517832	SIRV6	+	660	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	165	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
517834	SIRV7	-	2355	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	90	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	98	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147828	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43071_114680_114989_147608
517836	contig_5643_pilon	-	2101	16	Intergenic	novelGene_39040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	411	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	37	477	641562	640480	TRUE	15	GGGACTGCCACTGTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPGPCWAIYSGGEREVGTRPFKLQWNRGAPRFRLWVIHWRPLQGSGLRHGHLWRVPAHFFLKESLLFSLSADRCFFIFSSFLFLPCRFSYISSLCLEEVREALAWVFFMAGGYVMFPYSDSLPFWDCMTSSFFLVVSMNWAMAT	641598	631204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_631347_631433_631556_631847_632054_634807_634990_635154_635261_635362_635486_635631_635740_636218_636254_636429_636580_637767_637901_638045_638197_640212_640284_640384_640536_640634_640729_641102_641243_641411
517837	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517838	contig_7356_pilon	+	1749	4	Intergenic	novelGene_60388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTGGGCTGCAGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432499	457783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_434072_435515_435620_437471_437532_457770
517839	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517840	contig_854_pilon	+	2187	8	Intergenic	novelGene_36458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	250.620291700901	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1185	2063	1459076	1465350	FALSE	15	AGTCTCTTTCCTTTATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1457339	1465474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
517843	SIRV6	-	786	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8561	48	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACAACTTCGCTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
517844	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517845	contig_5954_pilon	-	2076	13	Intergenic	novelGene_28623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	446.418984500236	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	594	1715	948112	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960583	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948134_956446_956500_956705_956942_959766_959941_960474
517846	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517847	SIRV6	+	504	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	272	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2030_2470_2621_2737
517848	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517849	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	9	1481	28164	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517850	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517851	contig_8317_pilon	-	468	2	Intergenic	novelGene_19352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGACTTCAAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16778	16210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16280_16379
517852	contig_15063_pilon	-	1496	4	Intergenic	novelGene_13798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
517853	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_13007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	212	1387	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28189	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517855	contig_15354_pilon	+	3504	10	Intergenic	novelGene_65738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_5	93.7472304117649	462	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	72	1460	591728	607044	TRUE	20	TTTTATGGATTCTGCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTEPPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQVIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVLNGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRIPPRAHSRDSSDSADGRATPSENLVPSSARVDKPPSVLPYFNRPPSALPLMGLPPPPIPPPPPLSSSFGVPPPPPGIHYQHLMPPPPRLPPHLAVPPPGAIPPALHLNPAFFPPPNASVGPPPDTYMKASAPYNHHGSRDSGPPPSTVSEAEFEEIMKRNRAISSSAISKAVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIKQSRVANDERCRVLISSLKDCLHGIEAKSYSVGASGSSSRKRHRSRERSPSRSRESSRRHRDLLHNEDRHDDYFQERNREHERHRDRERDRHH	591035	613520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_591056_591676_591782_598174_598394_599232_599337_599700_599847_602548_602964_603669_603789_606055_606225_606881_607050_611481
517857	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517862	SIRV6	+	784	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	760	482	-438	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	35	CAACTCACCATAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517863	SIRV6	+	880	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	250	1	113	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517864	contig_1725_pilon	+	2478	16	Intergenic	novelGene_24310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	613.611111010513	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	659	2164	245349	255543	FALSE	30	AACTACATTGGAGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	235818	255857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_244999_245274_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
517865	contig_2087_pilon	+	2445	3	Intergenic	novelGene_65553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	118	658	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	32	721	39353	70191	FALSE	25	TTTCAAAGTGTTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWRVCLPVARGSLAAWLLVGLWVWALGGLCGLGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39321	71915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994
517868	contig_5033_pilon	-	2346	11	Intergenic	novelGene_29061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3265.81632827077	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	12	1133	544577	533747	TRUE	45	TCAGTCAACATCACACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLVSFAGRWVLSGGYDL	544588	531101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533700_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559
517871	contig_15063_pilon	+	1498	5	Intergenic	novelGene_12691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GTGGGTGAGAAGTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517872	contig_12644_pilon	+	1750	9	Intergenic	novelGene_44661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4384.03597584463	101	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	705	1676	2678073	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675483	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
517874	SIRV6	+	890	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517876	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517878	contig_10734_pilon	-	3772	1	Intergenic	novelGene_51520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	379	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2274494	2270722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2270700_2274500
517879	SIRV6	+	1458	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	65	5	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	30	AATTATGGATTTAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517880	contig_12151_pilon	-	2946	13	Intergenic	novelGene_54971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	207.656818252295	39	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	132	1733	1016612	983700	TRUE	25	TTTTGGCCAAAGCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSDVVRC	1016743	974602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983717_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306
517882	contig_12357_pilon	+	1829	11	Intergenic	novelGene_6106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	885.446672589603	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	117	1253	26079	53235	TRUE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLVARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29659_34162_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169_53711_53821
517883	contig_19098_pilon	-	3214	3	Intergenic	novelGene_65865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	34	560	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	394	951	488480	487923	FALSE	40	TAAACTATAAAGTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPKPWWSGHLLFLGILSLTVSVITLLFYALLWKAGDLTELPDLRIGFYNFCLWNESTGRLQCHQFPELEALGVPRAGLALARLGVYGALVLTLFVPLPLLLAQCKGNEGEWQLAVGFLAASTVLLAGGLGLFLSFVWRWLRLTLLGPGFLALATAQALLTLLLVATAAFPQVARRDKSQPESC	502996	485659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_488494_488671_488932_502876
517885	contig_12923_pilon	-	3225	16	Intergenic	novelGene_30072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	328.757431686173	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1111	2133	57556	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	93729	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64503_64543_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602
517886	contig_11171_pilon	+	3061	8	Intergenic	novelGene_48561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	113.096491221128	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	72	797	70574	93759	TRUE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKSWGSRSGLCEEG	70502	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90465_93720_93804_104185_104253_105710
517887	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517889	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_13208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517890	contig_233_pilon	-	2324	15	Intergenic	novelGene_14673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1261.95665414418	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	97	1203	126907	98408	TRUE	10	TGAGTGGCTGTCTTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNHPP	127003	78973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98420_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
517892	contig_15063_pilon	+	1362	6	Intergenic	novelGene_9098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2716.51052639227	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	243	686	34808	36299	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKLPSLCPQRWPSMHQPST	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35310_36245_36600_38975_39092_39506
517893	SIRV6	+	251	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	116	340	54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
517894	contig_13707_pilon	-	2222	11	Intergenic	novelGene_43534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	827.315030686618	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	445	1176	273826	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275548	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271826_272429_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274298_275210_275274_275413
517895	SIRV6	+	663	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	16	618	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCGGTTATTGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	3158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
517896	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517897	SIRV6	+	985	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	4	52	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517898	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_8781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517899	SIRV6	+	233	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	143	1213	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTGGTATCTAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
517900	contig_7321_pilon	-	2995	16	Intergenic	novelGene_53116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	188.318595293543	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	236	919	207675	173990	TRUE	85	AAAAAAAAAAAATTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLWKYPGREADRLWAGNTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKDPLGSKFGDSWLS	208358	113471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_172099_172272_173563_173702_173880_174031_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208307
517901	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517902	contig_5231_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_65899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAGGATCTGAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219536	217329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_217300_219500
517903	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517904	contig_15087_pilon	-	2808	18	Intergenic	novelGene_37138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	390.316445125798	917	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	615	1979	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89789	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
517905	contig_9807_pilon	+	2252	11	Intergenic	novelGene_32908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	448.247431671393	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	474	1265	140826	158783	FALSE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINIRGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	126740	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145210_149016_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
517906	contig_9345_pilon	-	2552	23	Intergenic	novelGene_24546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_14	164.556202562082	860	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	438	2453	729379	723552	FALSE	10	TCCTGGAGTCTGTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730160	723452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770
517908	contig_13592_pilon	+	2490	14	Intergenic	novelGene_33695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	536.830948675299	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	537	2345	256608	269322	FALSE	20	TGTACATACTTATTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLQVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249281	269467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_261268_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
517909	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517910	contig_3469_pilon	+	2719	20	Intergenic	novelGene_34171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_17	131.107386574535	1037	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	69	2360	427985	479914	FALSE	5	TCAGCCTCTGCCTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASRAIGSLRHFTASRTFRSPGYICRNFTRSSALLARTHINYGVKGNVAVIRINSPNSKVNTLNKELHTELVEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAGCKTSQEVVQISQEGQKIFEKLEKSTKPIVAAISGSCLGGGLELAISCHYRIATKDKKTVLGAPEVLLGILPGAGGTQRLPKMVGIPAAFDMMLTGRNIRADKAKKMGLVDQLVEPLGPGIKPPEERTIEYLEEVAVTFAKGLADKKISAKRDKGLVEKLTSYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	427916	480273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464_443604_445564_445685_447278_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
517911	contig_15063_pilon	-	1512	5	Intergenic	novelGene_11665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36777	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34610_34925_35033_35382_35839_36148_36264
517912	contig_7357_pilon	+	2458	15	Intergenic	novelGene_36878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	103.025952743838	576	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	817	1998	252235	273311	FALSE	45	AAAGATTGAATTTAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDRVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250825	273771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_251492_252250_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
517913	contig_10082_pilon	-	3325	12	Intergenic	novelGene_63867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.182960993917	793	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	199	1656	260762	212085	TRUE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAYDDSVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRLLVDKGPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSNLSVPSNPAQSAQSQPSYNPFEDEDDTGSTVSEKEDIKAKNVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	329409	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214928_215484_215608_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358_230595_232483_232641_260702_260842_329290
517914	contig_14744_pilon	+	1012	6	Intergenic	novelGene_66054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	4102.12815011916	51	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	443	976	1383399	1386652	FALSE	10	TTTAACTTGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382037	1386688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
517915	contig_5643_pilon	+	2038	15	Intergenic	novelGene_39008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	791.019159834002	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	657	1826	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNLVYWAQENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631192	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_638024_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
517917	SIRV7	-	2062	4	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	33056	0	54	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114862	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_114680
517919	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	7	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	587	1408	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35042_35380_35839_36158_36266
517921	contig_9921_pilon	+	2964	3	Intergenic	novelGene_23749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274.5	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	128	1303	321085	322260	TRUE	45	TTAAAAAAACATCTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPNATNVTCYYQPAPYVSDGNFNNYYVAHPPVTYSQPYPTWLPCN	299188	326584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_322949_325611
517923	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28173	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517924	SIRV6	+	873	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-15	230	-9	133	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517928	SIRV6	+	935	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	395	480	179	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	145	636	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1482	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517929	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517931	contig_6735_pilon	-	1850	13	Intergenic	novelGene_15717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	247	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	86	1450	564868	542384	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGEWPCDSPCPKWLYPTPIPASSV	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542448_542998_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
517933	SIRV6	+	327	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	49	1213	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
517934	contig_10923_pilon	+	2033	10	Intergenic	novelGene_66204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	790.903764962653	7	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	42	1106	21667	36705	TRUE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGE	13837	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36706_37053_37540_38578_38742_42554
517936	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517937	contig_15063_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_9581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	240	1268	34808	36632	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
517938	SIRV6	+	918	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	21	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	121	366	187	552	1733	2780	TRUE	40	TTGGTAACAATGTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEESGTRRGTYR	1158	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2748_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
517941	SIRV6	+	743	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	223	337	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
517943	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	198	704	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNNHQYLRHPPILC	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35845_36158_36266
517944	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517947	contig_13216_pilon	+	2089	7	Intergenic	novelGene_47456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	2742	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	122	1549	229682	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRRSKGSGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229560	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
517948	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
517949	contig_15063_pilon	+	1506	5	Intergenic	novelGene_12144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	233	757	34808	35938	TRUE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27538	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35873_36158_36266
517950	contig_7695_pilon	-	3359	18	Intergenic	novelGene_41599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_14	29.6360857377399	551	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	752	2965	524436	504301	FALSE	10	CCATCTTTGCCATGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525569	503906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_525168_525549
517951	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517952	contig_5988_pilon	-	1611	4	Intergenic	novelGene_15966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	101	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	89	1444	655459	651962	FALSE	30	GAAGAAAGGTTTTTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655547	651794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
517953	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517954	contig_3975_pilon	-	2471	12	Intergenic	novelGene_54796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	344.148343951599	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	1054	1971	2021058	2016034	FALSE	10	CTACTCTCCCGAGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKGSRRRSSWPEQTSPALASCRVPHISPLTPQSLYFLFLCVFI	2052430	2015533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
517955	contig_15063_pilon	-	1518	5	Intergenic	novelGene_11979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	GGCCCCAGTAGCTGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
517956	contig_5643_pilon	+	3193	11	Intergenic	novelGene_38940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	123.806138781564	863	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	235	1635	481872	501081	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFEHISAEVTKPSLHWAPNPHIETPVQEAEGKEDADLEDWSCSSPSIGTVSFKRARAPLCIPHSAPLSVQTSPTLSAGMAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462243	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_462492_462593_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
517958	contig_6102_pilon	+	2558	19	Intergenic	novelGene_31866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	568.938010574564	54	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	46	1254	370803	375279	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEM	370757	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374935_375273_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379723_394739
517959	contig_8317_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_19384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTCACAGAATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
517960	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517961	contig_10958_pilon	+	1903	5	Intergenic	novelGene_5436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	441	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	31	408	888255	895606	TRUE	50	TCTAAAACTAGGGATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPTCF	888224	901704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893965_895594_895855_900457
517962	contig_17274_pilon	+	3480	22	Intergenic	novelGene_26547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_21	372.253187191392	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	65	1861	163899	213531	TRUE	25	AAATAGGGCTTATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	163834	216904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439
517963	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517965	contig_8978_pilon	+	2439	12	Intergenic	novelGene_49372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	300.125263104789	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	237	1655	339807	347248	TRUE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331426	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113_347474_347578
517966	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3153.99135065396	6	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	202	654	34808	35836	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSV	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35834_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517969	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517970	contig_5210_pilon	-	2655	9	Intergenic	novelGene_65407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_8	158.738779130999	564	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	431	1267	439927	431502	FALSE	10	TGTGGACAGCTGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444363	430113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777_439957_442673_442763_443013_443119_444156
517971	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517972	contig_18272_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_7091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	522	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539684	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539766_539965
517973	contig_9345_pilon	-	1893	7	Intergenic	novelGene_24638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1956.1874200143	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	280	819	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001354	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949530_949571_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
517974	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517975	contig_5092_pilon	-	2157	6	Intergenic	novelGene_62301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	2488	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	115	429	451516	444945	TRUE	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGDVIATTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451630	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444887_444927_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
517976	contig_13592_pilon	+	2560	15	Intergenic	novelGene_33701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	519.406416508503	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	517	1422	256608	266507	TRUE	20	ACTTATTGTGTTTATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASGWMVYSV	249301	269474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266197_266484_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
517977	contig_3077_pilon	-	1529	8	Intergenic	novelGene_26756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGCTCGCATCGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18088	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
517978	SIRV6	+	618	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	605	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106
517979	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517980	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	234	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517981	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_11666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	786	1112	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36780	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35836_36161_36264
517982	contig_15063_pilon	+	1640	7	Intergenic	novelGene_9119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	243	1268	34808	38982	TRUE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEED	27126	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36513_38980_39092_39506
517984	contig_15063_pilon	+	1610	7	Intergenic	novelGene_12587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	6	1355	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITTFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28191_34720_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
517986	contig_14840_pilon	+	4287	13	Intergenic	novelGene_66237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	76.0991677571663	225	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	157	1542	27480	38511	FALSE	40	AAAGTGGTTATTAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYKPVVIQTYPVLGEKITQDTLYWNNYKTPVQIKEFGAVSKVDFSPQPPYNYAVTASSRIHIYGRYSQEPIKTFSRFKDTAYCATFRQDGKLLVAGSEDGGVQLFDISGRAPLRQFEGHTKAVHTVDFTADKYHVVSGADDYTVKLWDIPNSREILTFKEHSDYVRCGCASKLNPDLFVTGSYDHTVKMFDTRTNESVISVEHGQPVESVLLFPSGGLLVSAGGRYVKVWDILKGGQLLVSLKNHHKTVTCLCLSSSGQRLLSGSLDRKVKVYSTASYKVVHSFDYAASILSLALAHEDETIVVGMTNGILSVKHRKSEAKKDASSRRRRPAYRTFIKGKNYMKQRDDISVSRPSKKHLELYDRDLKNFRISKALDRVFEPEITIKTPEITVSIIKELNRRGVLANALAGRDEKELSRILNFLIRNLSQPRFAPVLINVAEMIIGKYISACDWSVTCSG	22535	41256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_+_22609_27396_27570_28757_28851_28968_29154_30141_30321_31610_31737_33400_33537_35490_35576_36434_36585_37384_37487_37668_37803_37978_38042_38468
517987	contig_9609_pilon	+	2926	23	Intergenic	novelGene_22984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	277.312534400335	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	1300	2412	325902	332820	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCGIIFAAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309943	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325215_325870_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
517988	contig_15047_pilon	+	1527	6	Intergenic	novelGene_52119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3077.58024428284	4	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	382	897	3242	4686	FALSE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADNVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2164	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2551_2826_3221_3363_4172_4434_4552_4687_21013
517989	contig_13021_pilon	+	2402	12	Intergenic	novelGene_8126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	103	junction_1	2542.8166948881	2	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	188	1408	174676	178735	FALSE	15	ACATTTCTTTTGGTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	173918	179729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_173970_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670
517990	contig_15063_pilon	+	1443	5	Intergenic	novelGene_11654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	10	GCCGCTATGTGTGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
517993	contig_16148_pilon	-	3514	6	Intergenic	novelGene_50378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_5	506.553215368336	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1150	1635	111433	85700	FALSE	75	AAAAAAGAAAAGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWGK	153109	83820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
517994	contig_5988_pilon	-	1835	5	Intergenic	novelGene_15940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	923.259985052964	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	303	1661	655899	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	657387	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655893_656071_657256
517995	contig_10235_pilon	+	2079	6	Intergenic	novelGene_46410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	33	752	210483	212152	FALSE	25	GTGTAACATTTTTTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210450	213479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
517996	contig_15063_pilon	-	1555	5	Intergenic	novelGene_8782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36797	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34925_35033_35380_35839_36155_36264
517997	contig_8801_pilon	+	3627	8	Intergenic	novelGene_66328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	146.663574488121	502	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2182	2499	938911	940089	TRUE	35	CATAAATAAACGGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGPTKQLV	936729	944544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_939100_939696_939803_940066_940189_940884_940938_941018_941130_941760_941871_942886_943037_943939
517999	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	49	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	202	1044	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38975_39092_39506
518000	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518001	contig_15063_pilon	+	1706	7	Intergenic	novelGene_9845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518003	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518004	contig_15063_pilon	+	1896	7	Intergenic	novelGene_8450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	759	1643	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26193	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35032_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518005	contig_15063_pilon	+	1442	4	Intergenic	novelGene_14174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	134	1306	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34674	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518006	contig_7334_pilon	+	3254	2	Intergenic	novelGene_50575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	5	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	670	1932	118911	121176	FALSE	20	AACTGTACTCACTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIMMQLSLTLPDWYLGQIHLDWWQHIENFKMKFTLKRLPLFLSVKQNSLSRLATEKEGLAGEARMEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	118241	122498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_119095_120097
518010	SIRV6	-	444	4	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-226	-109	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTCAGTCTACTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2773	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1732_1846_2030_2470_2619_2738
518011	contig_3986_pilon	+	2718	12	Intergenic	novelGene_52664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	666	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1851	2291	46192	52882	TRUE	20	GTGGCTAGAATGAGGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGFHHVGLTEEGFRRHSSFLQGLDGHFHIIFVITHPDFSKLPRPEFPDQFERLPGNFPFILNPGVLKSQAYTGQSQSLAQTIPFLRIVLHQVLERGKSNPGGDVIASFIQHKDLIVFDHLPLGGYILHRQGKGTFICVTLSNKE	34070	108508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_35487_39677_39808_41343_41498_44833_44910_46117_46297_47664_47820_48252_48398_52846_52951_54767_54869_55923_56018_57911_57962_108394
518012	SIRV6	+	898	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	529	167	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	45	GGTAACAATGTAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518013	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	5	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	249	1424	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27120	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
518014	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	10	1422	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518015	SIRV6	+	993	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	35	500	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518016	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	174	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518018	contig_11448_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_66390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCATAGTCTTTTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413769	412063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_412100_413800
518019	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518021	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_8896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518022	SIRV6	+	664	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1847_2027_2470_2621_2740
518023	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_12625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	7	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518024	SIRV6	+	858	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	138	30	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	160	654	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1467	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
518025	contig_11086_pilon	+	2845	14	Intergenic	novelGene_61186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	164.445059259295	5	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	71	2701	24460	52082	FALSE	15	TCAACCCAGTGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFFPEEGHGTRYSQTDASIQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	24389	52226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_49653_49738_50803_50951_51960
518026	SIRV6	+	759	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	271	167	92	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	35	ACGTCACATATTTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518027	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518028	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518029	SIRV6	+	487	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-322	102	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	124	375	39	413	2002	10780	TRUE	25	TTTAGGTATAGTAGATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1963	11070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11034
518031	contig_7816_pilon	-	1602	11	Intergenic	novelGene_66519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1205	1504	195781	192934	TRUE	20	CCAGGGAGCCAGTCGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLLIFYTRNSPALEGLGEDGCRLVLGLAEGLAQLLHAVSVHDDGVPAKGLAAFLVDVHLVLQWGRITLAQAVDVKNGDKVVQLVDASEGHCLPHGAL	211764	183023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_183083_192894_193088_194849_194972_195757_195948_196742_196909_207502_207660_207802_207933_209064_209149_209282_209377_210625_210749_211480
518032	SIRV6	+	511	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8506	337	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518033	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_12758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39770	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264_36597_38972_39090_39504
518034	SIRV6	+	1447	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	55	-11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	232	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518035	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_10448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518036	contig_6735_pilon	-	1852	13	Intergenic	novelGene_15764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1003.10551123332	4	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	375	1376	554315	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNM	568277	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542467_543084_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564078_564232_564784_564869_568198
518040	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_12991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	221	1456	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28180	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518043	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518044	contig_14184_pilon	-	2916	7	Intergenic	novelGene_66588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	414.091240616794	506	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1257	1649	90204	89812	FALSE	20	CCAAGTGTGTTGTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKKWPPSPSFLLALSPRDSPWAVIEQVCLGFLGPATSHHSHPPVSQSAHYTATKPNTAHLAEGPSCKSGPGPGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126342	88544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90772_91298_91348_91951_92112_103407_103502_105799_105915_109168_109327_126229
518046	contig_4469_pilon	-	2808	5	Intergenic	novelGene_21950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCCCTGCGCCGTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757495	751647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_751966_752132_752202_752459_752570_753495_753598_755286
518048	contig_3948_pilon	-	2343	8	Intergenic	novelGene_53202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.416155143367	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	78	884	866476	840803	TRUE	20	GTGTCATGTCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVGRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869645	839138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840258_840462_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
518049	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518050	SIRV6	+	750	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-402	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	105	318	135	452	2458	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1883	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2011_2450_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034_11114_11208
518051	contig_18145_pilon	+	2387	12	Intergenic	novelGene_37339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.81862579975	2375	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	264	1862	95966	100744	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86670	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86838_94925_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
518053	contig_6898_pilon	-	2283	14	Intergenic	novelGene_35666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	383	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1536	2075	115957	59656	FALSE	0	CCCGGCTTCCGCGCCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDPLLPLVLVEFVLLQDPLGQQLVPSQVARLVHLFIEVTVLGLDSIGGQQHGSLRWAVNIIIENALLHLQEEQALGDVLDQFLGYILRVKFGPELEEQGAFLPYILGSHLLIEFQPGGEALSVLVLQTKKPNFPQANSFHHLVKQLLAGGVGLDGKLQFCIHGGHTHIDRLGHGGG	127696	59447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104633_112966_113065_114249_114525_115894_115981_116670_116817_117863_117962_119611_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_125703_127423
518055	SIRV6	+	850	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	577	167	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518056	contig_8729_pilon	+	2498	14	Intergenic	novelGene_40055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	189.31839747183	179	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	113	1681	33998	43845	FALSE	25	GGTGACCAGGGAAGCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRARLFQKGAELAFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVNKIIELKKKVCGDSNKGFVVINQKGIDPFSLDALAKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSLDDLNPDCLGYAGLVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAIRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAIAAALMKYKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKVQAEHSESGELVGVDLNTGEPMVAAEAGIWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG	33885	44662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_36925_37784_37932_38491_38596_39239_39351_40001_40162_40269_40353_40956_41054_41327_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
518057	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_12746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	2	1474	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518058	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_9246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518059	contig_8317_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_19382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
518061	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_14035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518062	contig_401_pilon	+	2224	10	Intergenic	novelGene_42837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_8	1490.71962073836	436	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	49	885	1711949	1714182	TRUE	5	TCTCTTATGTTTTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGEYGFVAYLWGFYICVCKEHVGNLLSLE	1711900	1718329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
518063	contig_4496_pilon	+	3441	10	Intergenic	novelGene_66625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_7	89.7490328019689	802	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	256	1833	617857	672858	FALSE	10	TGTCTTTGTCTGTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDAKERQHWVSRLQICTQHHTEAIGKNNPPLKSRSFSLASSGNSPISQRRPSQHAISFFNVGHSKLQSVSKRAHLPPDHLVEVREMMSHAEGQQRDLIRRIECLPASGHLSSLDQDLLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQHASHQKGSLPPGTTIEWLEPKIPLSNHYKNGADQPFAAEQSKPLAAPEQQSVAESGLLAREPEEINADEEVEDTCDNKEDDLGAVEEQRSVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTFILEKRSLLEMYADFMSHPDLFIAITNGATAEDRMIRFVEYYLTSFHEGRKGAIAKKPYNPIIGETFHCSWRMPKSEVTSNVISSSSTQAITNQPPLSEEPLSQVGSDCYMVRFVAEQVSHHPPVSGFYAECAERKICVNAHVWTKSKFLGMSIGVTMVGEGILSLLEHGEEYTFSLPCAYARSILTVPWVELGGKVSVNCAKTGYSASITFHTKPFYGGKLHRVTAEVKHNSTNTVVCRVQGEWNSVLEFTYSNGDTKYVDLTKLTVTRKRVRPLEKQDPFESRRLWKNVTDSLKEFEIDKATEHKRTLEERQRTEERHRTETGTPWKTKYFIKEGDGWVYHKPLWKTISATQPAE	606687	674466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_606766_608804_608982_617856_618059_622314_622461_627391_627533_640710_641210_645178_645366_662079_662263_665409_665564_672792
518064	contig_11285_pilon	-	2370	20	Intergenic	novelGene_5660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	427.497193459223	2387	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	525	2177	790656	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798554	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791252_796641_796727_798342
518065	contig_7173_pilon	+	2837	3	Intergenic	novelGene_37530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	107	782	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2236	2670	225253	225687	FALSE	35	TACCAATTTTTATTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHCLKTGTFKDSLIRPSCRRLPSKPGVLHVEALGDFERSTYTVQRLLVLCLPTLFSPLDPDLCRKHALPDPLSGQEAPEHKLVTPFLVSSLVQIVLECGCLWPPGSLFLHSHKSFWRVATRPLKSFFSFLVFKMLWIRDWLNP	212937	225854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_213250_220273_220563_223618
518066	contig_3077_pilon	+	1759	10	Intergenic	novelGene_26673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3470.86519615449	28	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	578	1261	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9624	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13206_13725_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
518067	contig_8729_pilon	+	2588	1	Intergenic	novelGene_40147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1440	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTACTTGGCGTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677231	679819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_677200_679800
518070	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518071	SIRV6	+	1033	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	493	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518072	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518073	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518074	contig_15063_pilon	+	1412	5	Intergenic	novelGene_11475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	CCAAGGCCCTACTCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518077	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_13089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518078	contig_9482_pilon	-	2820	10	Intergenic	novelGene_44297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	147.214884513157	15	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	12	935	1253164	1240765	TRUE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQVSLGVVSSGVEPRGCA	1253175	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237496_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
518079	contig_8978_pilon	+	2801	11	Intergenic	novelGene_49404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	323.552777765854	21	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	175	1146	339807	343861	TRUE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGEYKPIKS	331600	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_333319_333432_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_344261_344692_344796_345356_345397_345649_345738_347113
518080	SIRV6	+	400	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8804	164	-13	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518081	SIRV6	+	712	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518082	contig_11548_pilon	+	2317	11	Intergenic	novelGene_66741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	726.118723074953	160	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	186	1523	63836	119638	FALSE	25	GCTCCAAATGATTTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63650	120432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
518083	SIRV6	-	573	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-244	395	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTGTCGCCCCCATCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2791	1149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1732_1846_2030_2472_2619_2738
518084	contig_15063_pilon	+	1616	6	Intergenic	novelGene_8753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	245	1387	34808	39538	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27124	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
518086	contig_1516_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_49972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1171.00053241388	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	97	1500	347241	363092	FALSE	15	AAGCACCTGTTTCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335185	363728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355039_356387_356526_359957_360125_362116_362299_362985
518087	contig_15063_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_14192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	123	1358	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34685	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518088	contig_11720_pilon	+	2099	15	Intergenic	novelGene_43945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_12	341.849120853881	3152	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	13	1431	262271	270732	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLVSRASLPPRC	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270803_271268_271343_271806_271961_272096
518090	contig_15063_pilon	+	1446	5	Intergenic	novelGene_11046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	10	GCCGCTATGTGTGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518094	contig_5643_pilon	+	2007	17	Intergenic	novelGene_39077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	813.796571247999	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	595	1815	634983	641217	TRUE	25	GCCCAGCAAGGCCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631254	641536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640439_640498_640538_640636_640729_641102_641244_641370
518095	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	125	378	158	535	2002	10780	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPEVRIIDERVEVEVVQQES	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
518099	contig_14519_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_66837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCTGTTATTCTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383048	383502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_383000_383500
518101	SIRV6	-	1446	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9223	428	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	6	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCAAACCCAATTTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	1116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
518102	contig_5033_pilon	-	2168	15	Intergenic	novelGene_29030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3686.66848113523	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	29	1672	566787	531948	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNSVDFVLKIGFPPLTPCLKSLVVTSLSVWEAPAPH	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531139_531604_532053_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
518103	contig_18194_pilon	-	2582	4	Intergenic	novelGene_55943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	98.9960717514701	1097	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	559	1287	5370	4642	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20413	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7160_18721_18976_20364
518105	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518107	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518109	contig_15063_pilon	+	1744	5	Intergenic	novelGene_13026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	463	1635	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30054	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518111	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518112	contig_13528_pilon	-	2681	11	Intergenic	novelGene_66872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_4	126.852512785518	228	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	322	1068	67880	47592	TRUE	40	TAAAATAAATTGTCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMM	68201	39848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
518114	contig_19459_pilon	-	1295	8	Intergenic	novelGene_59842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	18145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	174	959	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19137	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
518117	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518118	contig_15063_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_13884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	40	GGACCCAAGAGTGGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518119	contig_15063_pilon	+	1650	7	Intergenic	novelGene_12743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3850.44710246601	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	2	1444	28164	39515	FALSE	10	TGGTGTAGGCACTTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFK	28162	39721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36272_36600_38993_39092_39512
518120	SIRV6	-	1356	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9265	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	17	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11812	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2621_2739_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
518121	contig_5988_pilon	-	1614	4	Intergenic	novelGene_15961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	114	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	91	1446	655459	651962	FALSE	30	AAGAAAGGTTTTTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655549	651793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
518122	SIRV2	-	376	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1102	300	-61	-300	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4793	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687
518123	contig_15063_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_11708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36800	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
518124	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518125	SIRV6	+	552	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8748	2	43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518127	contig_15063_pilon	-	1517	4	Intergenic	novelGene_13474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	805	1128	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36157_36264
518128	SIRV6	-	389	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCGCGCGATGCCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11784	11395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
518129	contig_15063_pilon	-	1523	5	Intergenic	novelGene_11497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518131	contig_15063_pilon	+	1611	6	Intergenic	novelGene_10434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	237	1379	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
518133	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518134	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518135	contig_8317_pilon	+	420	2	Intergenic	novelGene_19357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAATTTTGAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
518136	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518137	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518138	contig_11855_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_67048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCCAGATGGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992495	1993203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1992500_1993200
518139	contig_2219_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_67190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTATCTCAGCCTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159949	159157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_159200_159900
518141	contig_3975_pilon	-	2001	14	Intergenic	novelGene_54781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	305.470497515015	33	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	11	1003	2052412	2017628	TRUE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNVLPI	2052422	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017642_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
518142	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518145	contig_500_pilon	+	3486	9	Intergenic	novelGene_30952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	474.93813741897	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2638	3186	1466134	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446829	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
518146	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518148	contig_10500_pilon	-	2559	8	Intergenic	novelGene_41232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	864.045610096209	5	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	639	1094	1635143	1629460	TRUE	20	ATTTCTATATTGTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640221	1626409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626903_1628487_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636936_1637067_1639871
518149	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518150	contig_10246_pilon	+	2899	11	Intergenic	novelGene_46888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	210.164697320934	121	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	123	1322	144696	184738	TRUE	0	GTGCGTTTGTGTGTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140677	186405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504_185756_185845
518151	contig_17270_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_67224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTGAGTAGGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69406	70252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_69400_70300
518152	contig_7331_pilon	-	3821	4	Intergenic	novelGene_67235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	52.0405824546788	726	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATTCATGGATCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645097	635579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_-_639040_642172_642287_642789_642841_644901
518153	contig_9708_pilon	+	2871	14	Intergenic	novelGene_67272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	105.685645294438	500	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	17	1552	768056	803598	FALSE	25	GTTACCTAAAGTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768039	804917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
518154	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518155	SIRV6	+	725	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1454	291	25	-156	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTTTACGAAGAAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2541	11534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518157	contig_10937_pilon	+	4114	3	Intergenic	novelGene_67335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	1.5	170	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2753	3187	183633	184067	TRUE	20	TGTGTGTGATGCACAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCSRPGKALLGTISNRPRWEEKECGHPCPGRPLLLPVSLGWEGQHHILLNGCGFQLTQISVSSKQVQLLSALGLGGPPVGRRVPVSSCFCTSDECPLFQTVFQGCLYCNLRACLSPEQKADTLFVCCGRFRFPVQEPWWHKG	180602	185983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181654_181931_184669_185657
518158	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518159	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518161	contig_5018_pilon	-	1896	9	Intergenic	novelGene_47068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	86	1336	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402877	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
518162	contig_12079_pilon	-	1989	7	Intergenic	novelGene_67446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	935.17106278299	77	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	137	409	638707	600804	TRUE	15	ATGTGCGGAGGCTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQELRKESPPPVQIPRQVLPGRCA	638843	579724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580953_598079_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
518163	SIRV6	+	729	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	604	583	388	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	42	533	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1691	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518164	contig_15063_pilon	+	1679	7	Intergenic	novelGene_8656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	25	GGCACTTGTGGCCATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26559	39728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518165	contig_233_pilon	-	1788	9	Intergenic	novelGene_14510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1193.1398702583	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	173	1345	108727	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLPPSFSHSLWSCAGAATTTHRPVCLLVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNIRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	108899	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92148_104174_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724
518166	contig_15047_pilon	+	2128	6	Intergenic	novelGene_52200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3086	90	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1191	1658	4112	21020	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNAEFLNFLTFFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGKTLFFRW	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2238_2840_3027_3170_4434_4552_4676_20997_21062_21232
518167	SIRV6	+	559	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1385	526	0	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	97	306	2569	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2472	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518168	contig_7357_pilon	-	2184	9	Intergenic	novelGene_36807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2062.08222662798	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	757	1305	139820	136424	FALSE	15	GTTTTTCTGGACCTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167047	135544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139889_154643_154721_154861_155079_159911_160031_166772
518170	contig_15063_pilon	+	1433	5	Intergenic	novelGene_8888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	10	CTACTCGGCCCCATGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518171	contig_4364_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_1440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532907	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
518172	contig_348_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_67616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326980	327724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_327000_327700
518173	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518174	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518176	contig_20610_pilon	+	3070	2	Intergenic	novelGene_67649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_1	0	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACATGCTGTTAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49829	53417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_52513_53030
518177	contig_10058_pilon	+	2735	10	Intergenic	novelGene_67730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.372505375153	6	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	376	870	97717	99369	TRUE	25	GTTTGTTTAAATTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72548	101647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72661_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100072_100358
518178	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518182	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518183	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518184	contig_11258_pilon	+	2408	8	Intergenic	novelGene_67771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	154.964380370695	3003	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	27	1160	278958	292582	FALSE	15	TTGTGATTTTGAGCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278931	293830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
518185	contig_16098_pilon	-	1808	7	Intergenic	novelGene_46114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1622.54341664218	46	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	998	1600	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460412	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457907_458405_458838_460148
518186	contig_15063_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_11942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	CCCAGTAGCTGAGGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518187	contig_3077_pilon	+	1596	9	Intergenic	novelGene_26692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	3516.32495476456	355	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	415	1098	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10088	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
518188	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518189	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518190	contig_5018_pilon	-	2066	8	Intergenic	novelGene_47082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	488.050766847475	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	620	1507	1401907	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402363_1402701
518191	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518192	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10407	80	1170	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11407	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
518193	contig_15063_pilon	+	1137	5	Intergenic	novelGene_9694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	239	1135	34808	36382	FALSE	20	TGTGCAGTGGCTGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	27130	36384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518194	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518195	contig_8317_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_19390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAATGAACAGAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16772	16380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
518196	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518197	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_12522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	AGTAATCACAATGGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28185_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518198	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_9076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	972	1295	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39762	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
518199	contig_4486_pilon	+	2459	15	Intergenic	novelGene_38567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1378.64252407347	31	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	344	1498	343083	412464	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311736	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_332818_332991_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424_413107_413158
518200	contig_17274_pilon	-	1899	2	Intergenic	novelGene_26595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGCATGTCTGTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259035	257063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_257177_257249
518201	SIRV6	+	326	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-31	0	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518202	SIRV6	+	638	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	364	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	28	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
518203	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518204	SIRV6	+	922	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	523	33	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	40	AATGTAATGGAAATTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518205	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518207	SIRV6	+	215	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10569	42	1332	-40	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACTAAGCAGCAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11569	11784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
518209	contig_2377_pilon	+	3339	3	Intergenic	novelGene_67907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	84	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	26	1438	253864	270398	TRUE	40	AGTCACATTTTTAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLFLTLMLCSSLERISHTSLLSLSHSAPWHCGRCPHRAAPCSVRSLRVVPRAWVAQLGCSCGICWRALGSRHFLSEVTWQWCALFSHFCNFQLAQRLRLGSGPRLRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLYSMRSSQKCSRATIDTGTEVVMPLSQMTVNCLKN	253838	272401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_271097_271198
518210	contig_8772_pilon	+	1724	8	Intergenic	novelGene_21069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5233.38665859569	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	150	896	15355	20004	TRUE	5	TCTTGCTGTGTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEVSGITFVC	15205	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19138_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
518212	contig_3948_pilon	-	2077	13	Intergenic	novelGene_53301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_12	390.476089394586	1857	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	240	1751	1494311	1468245	FALSE	15	TCAACAGGTTTGCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAQPQRQAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511004	1467918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
518214	SIRV6	+	632	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-384	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	120	434	2021	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1901	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2477_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518215	contig_15063_pilon	+	1482	6	Intergenic	novelGene_14275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	341	1228	35271	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34818	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518216	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518217	contig_15063_pilon	+	1346	5	Intergenic	novelGene_10762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3082.42741195961	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	233	787	34808	36133	TRUE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLPREKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_36038_36158_36266
518218	contig_15063_pilon	-	1731	7	Intergenic	novelGene_9088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	975	1301	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35836_36156_36264_36597_38972_39090_39504
518219	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518220	contig_18506_pilon	+	1059	9	Intergenic	novelGene_67951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	221.593659656589	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	411	1058	28506	53872	FALSE	50	CAAGTAAAACCAATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGVGLRAAGDRAAAFALLRGVFIVAAKRTPFGAFGGLLKDFTATDLTEFAAKAALSAGNVSPETIDSVIVGNVLQTASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQEICVKDAEVVLCGGTESMSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCDPTIMGIGPVPAINGALKRTGLSLKDMDLVEVNETFAPQYLAVEKSLDLD	11336	53873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_25013_25181_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_44530_44661_48546_48618_53815
518221	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	38	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518222	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_12191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	70	TAAAAATTAGAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518223	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26356	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518225	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_11509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518226	contig_15859_pilon	-	3618	6	Intergenic	novelGene_50190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	142.075191360068	401	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	192	1487	349672	341031	FALSE	25	ATTTTAAAGCTAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWRQRPGRPVAVLASAVLSRIDHLSGGQQLPGVRAAAYEIKPGEVNEPLERATDGEIVFLSSEMYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352975	338899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352816
518227	SIRV6	+	884	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	546	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	313	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518230	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518231	contig_12479_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_56886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560783	561321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_560800_561300
518232	contig_9578_pilon	-	3937	2	Intergenic	novelGene_68011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCACTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329120	1323512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1325041_1326711
518235	contig_1532_pilon	+	1941	9	Intergenic	novelGene_37397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	800	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGTTAGGTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12363	34930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13139_13209_13518_15732_15889_17971_18110_27255_27379_28825_28963_29437_29507_32051_32225_34868
518237	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_12213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	223	1458	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27548	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518238	SIRV6	+	642	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-436	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNDCSYSELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2815_3092_3165_10724_10819_11033
518240	SIRV6	+	571	5	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	14	8998	14	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740
518241	SIRV6	+	623	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATGGGACTAGTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1847_2027_2470_2621_2740
518243	contig_12357_pilon	-	2099	13	Intergenic	novelGene_6077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53864	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30321_30931_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42258_46444_46565_51127_51238_52758_52842_53167_53475_53523
518244	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518245	contig_10011_pilon	+	3031	10	Intergenic	novelGene_68095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	87.4795214131094	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	60	2003	322928	333199	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKLM	322868	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328476_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994_333045_333190
518246	contig_12951_pilon	-	2998	4	Intergenic	novelGene_68148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGCTCTACTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200200	192291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_193222_193594_193711_196923_197031_198355
518248	contig_15063_pilon	+	1924	8	Intergenic	novelGene_8441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3735.91445516711	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	438	1673	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQVSHKTCPVASRTRKAQSQDHGAGQAHVYAALPGIPRCRQQKVQRDSVLSCVKGPDTLSQCDNLFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	5249	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_5417_27500_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518249	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518250	contig_3077_pilon	+	2728	11	Intergenic	novelGene_26862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	76.3911644105521	646	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	138	1220	1337784	1346705	TRUE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336575	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611_1346892_1346948
518251	SIRV6	+	634	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	341	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	29	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721
518252	SIRV6	+	904	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	224	3	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518253	scaffold_12124_pilon	+	2380	12	Intergenic	novelGene_22027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	571.014784657561	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	231	593	836073	845376	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVEDLQPWKPYGAVLLCPIGWL	829514	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837456_845314_845396_846602_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858258_858358
518255	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518257	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518258	contig_6364_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_51810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACATCCAAACTCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475317	1476557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1475300_1476600
518260	contig_12357_pilon	+	1977	12	Intergenic	novelGene_6074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	780.514526206806	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	117	1511	26079	53235	FALSE	25	GTATTTTTATGAATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35183_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
518262	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	11	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28171	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
518266	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27536	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518267	SIRV6	+	784	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	93	626	1733	10780	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVRIIDERVEVEVVQQES	1640	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10726_10819_11031_11109_11205
518269	contig_5797_pilon	+	3535	4	Intergenic	novelGene_56960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	100.107719760044	1761	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1563	1925	408632	418675	FALSE	40	TATCAGAGTGACTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	400797	420285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_402343_408614_408756_412625_412752_418562
518270	contig_15063_pilon	+	1308	4	Intergenic	novelGene_14265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	345	1166	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34814	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518271	SIRV6	+	989	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	538	1	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518272	contig_15063_pilon	+	1374	4	Intergenic	novelGene_13255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	202	1239	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34889_35135_35380_35839_36158_36266
518275	SIRV6	+	861	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	172	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	147	638	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518280	contig_12425_pilon	+	2928	9	Intergenic	novelGene_46640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.635956779843	45	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	319	1383	174111	198400	FALSE	5	TGCTCTGCATTTGTGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167092	199945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_170066_170141_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186948_190682_190836_198178
518285	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518286	SIRV6	+	806	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	315	647	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518287	contig_5280_pilon	+	2260	9	Intergenic	novelGene_52593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	618.062484199615	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	32	574	38343	41668	TRUE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKSKHKKYQWFR	38311	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41630_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
518288	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518290	contig_9345_pilon	-	2170	5	Intergenic	novelGene_24384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_2	194.669431344523	567	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	86	1009	176056	142269	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGEYHGCLCGPAWPPDLGLPPLLVPRVSIPEYITEQALRPFLPTASCVLSLFRRCSHALPCQPTSLQPGLHGFPKGSPPEHAPASLAATVIMPCIYEWLC	176141	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
518291	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518292	SIRV6	+	374	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10369	83	1132	53	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTTTGGTCGCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11369	11743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
518296	SIRV6	+	992	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	524	12	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518304	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_10259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518305	contig_13700_pilon	-	3690	21	Intergenic	novelGene_68268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	303	junction_1	306.943883307682	1373	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	213	2516	163598	75730	FALSE	40	CTACAACTTAACGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKDKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKIRASGDAKIKKEKENGFSSPPRIKDEPEDDGYFAPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDVKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKDKDKKVPEPDNKKKKPKKEEEQKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPESVNFCYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMSNEEKNIITSLSKCDFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCVMDNHRERIANFKIEPPGLFRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVRHDNKVTWLVSWTENIQGSIKYIMLNPSSRIKGEKDWQKYETARRLKKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEEGETADTVGCCSLRVEHISLHPELDGQEYVVEFDFLGKDSIRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLNTGILNKHLQDLMEGLTAKVFRTYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNHQRAPPKTFEKSMMNLQSKIDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMKLEVQATDREENKQIALGTSKLNYLDPRISVAWCKKWGVPIEKIYNKTQREKFAWAIDMADENYEF	163810	74555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_75833_77159_77310_77539_77635_81021_81150_82446_82562_83117_83187_84246_84433_85361_85506_98304_98450_98709_98898_100905_101029_102734_102857_106505_106622_112534_112642_117817_117894_118876_118973_121767_121824_123039_123164_132820_132924_163213_163239_163565
518306	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518308	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518310	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518312	SIRV6	+	883	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	230	18	133	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518313	contig_21013_pilon	+	3441	12	Intergenic	novelGene_38513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_9	429.781820489351	1616	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	181	2058	19282	85337	FALSE	20	TCAATGTTGAACTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPELMNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEHGKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASPDQNASTHTPQSSVKTSVPSGKSSGDLVDLFDGASQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSLPAQGTAASGNGDFGDWSAFNQAPSGPAASSGELFSSASQPAVELFSGSQPALGPPSAASNSSDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSQSNMLPVRPQTNPLMGGPMPVSMPNVMTGTMGMAPLGNTPVMNQSMMGMNMNIGMSSPGMGLSGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFTNFNK	19101	86720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_19323_55721_55827_56372_56470_58356_58466_59403_59569_62439_62618_69125_69373_71484_71555_78665_78741_81938_82232_83994_84146_84990
518314	contig_15063_pilon	-	1629	7	Intergenic	novelGene_12665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	878	1201	35891	35108	TRUE	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39669	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36150_36264_36597_38967_39090_39504
518315	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518316	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518317	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518320	contig_12837_pilon	+	2005	8	Intergenic	novelGene_57297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	2380.33973737072	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	293	736	129778	166049	FALSE	15	GAGTTGTCATGAGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128471	167318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128633_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
518321	contig_14287_pilon	-	2053	5	Intergenic	novelGene_24053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.834016878647	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	245	1057	22710	21898	TRUE	5	CTCCCCATCTTGGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33885	20636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_21436_21700_22754_25823_25875_32891_32937_33780
518322	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518323	contig_16496_pilon	+	1058	2	Intergenic	novelGene_5222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
518324	contig_5643_pilon	+	1958	15	Intergenic	novelGene_39068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_8	750.524527464979	12	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	616	1746	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631233	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
518325	contig_15063_pilon	-	1695	7	Intergenic	novelGene_8511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	933	1256	35891	35108	TRUE	25	AGCAGCCACAGTGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39722	26344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39091_39504
518326	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	596	1417	35271	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36266
518327	contig_15063_pilon	+	1605	6	Intergenic	novelGene_11466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	231	1373	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
518328	SIRV6	+	854	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	18	105	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATAGTAGATTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
518329	contig_6735_pilon	-	1837	13	Intergenic	novelGene_15735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	686.84089112561	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	90	812	564868	543845	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPWCFILHRLGLQQRVVHLQSLSL	568287	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543915_545912_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
518330	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_8930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518331	contig_5988_pilon	-	3646	5	Intergenic	novelGene_15882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_4	100.395468025205	478	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	262	807	472159	470037	FALSE	20	GCAGCTTTGGAGCAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFGNLLKSLIGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLANQLKNKK	485541	467197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_470199_470752_470878_471111_471223_472011_472252_485372
518332	SIRV6	+	752	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	398	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	90	273	32	304	1733	2560	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1701	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518333	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	248	1423	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
518334	contig_5954_pilon	-	2680	13	Intergenic	novelGene_28669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_6	415.737063004437	2	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1491	2558	947127	944848	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTEWGRGWGRGLTPPGQGRAAPASHLSLSNRPPGRPPALRWPSSLTSTSTWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960566	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
518335	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518336	contig_11752_pilon	+	2071	9	Intergenic	novelGene_37604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	1166.85827518812	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	115	1122	87165	97060	TRUE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVLQFH	84087	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_97043_97682_100956_100976_105597
518337	SIRV6	+	559	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8731	12	60	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTATCTTATTGCCCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518338	SIRV6	-	675	7	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8686	511	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	14	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTTTACGCAAGGTATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11233	1847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2475_2619_2738_2826_3102_3164_10723_10825_11035_11109_11205
518340	scaffold_16539_pilon	+	1325	7	Intergenic	novelGene_68367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	534	983	490446	494660	TRUE	10	GCAGGATCTCCTCGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGPGPRLQGPRRVSDLDVQVGVVVTQISQGQQEGPHGRLRVAPAADQQAHLDTPLVGGPSQPIVNGGPEPEVADELHGGQIAHDCNVDEAPGAVHHAEQSLQVWGAATRTQWWRSTHCQVGQSRGSIEADLHWCLLIVAGIIGPGPG	489805	499053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_490286_490392_490496_490970_491149_491834_491958_494561_494767_498733_498866_498949
518341	contig_5967_pilon	-	1150	11	Intergenic	novelGene_44392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	409.597131337611	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	111	1148	488569	388613	FALSE	25	CAGCCTGATGGTGAACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSKMTMKTPTAVTQKTELMNTVLWSN	517612	388610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388686_388746_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
518344	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518345	contig_12873_pilon	+	1706	5	Intergenic	novelGene_27136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	1289.63742482141	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	419	1132	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15938	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
518346	contig_11989_pilon	-	2820	24	Intergenic	novelGene_68439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	302.23787249284	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	18	2228	226870	46235	FALSE	35	TCTTAAGGCTTCATAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	226887	45642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
518347	contig_14925_pilon	-	1754	5	Intergenic	novelGene_55310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	925.050640505697	4790	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	11	571	130595	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNYMSYLTWNFGIQIPREICLSALLHSLGRWIWRETDLFSESQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	130605	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_130483
518348	contig_10011_pilon	-	3790	4	Intergenic	novelGene_68063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	53.3249993488566	546	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	341	1495	242740	236529	FALSE	15	GTTTTTGTGTGGACATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKMEITLSLQPHSPDSPKQERHIIAKLEERQEPALHNNRRDPELSRQRFRQLCYQELSGPKEALCRLGQLCREWLQPELHTKEQILELLVLEQFLTILPPEIQTWVRKRCPVNSKEIVNLVEEFHRASKRPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGAQLGEQELPDFLEESSQAEPQDQLSHHHGEKYHLLQEPTLKLAGTEATRMRSDNKENPQQEGTKGAKPCAVSADRSKGNGLQSPEHTAVNMSEPWLSPRQVSPPNAQKPFTHHQRHCRQLEYISSPLKSHLLRDVEKSNHLERLGHPKKSYKCDHCGKSFSFNSELERHKRVHTGERPYTCEVCGNCFGRQSTLQLHQRIHTGEKPYHCNLCGKSFRQNSNLRKHQSLHHGE	243568	234233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_237092_241170_241355_242332_243019_243506
518349	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518350	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	233	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
518351	SIRV6	+	525	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8776	1	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCGTAGGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518353	contig_10629_pilon	-	2454	16	Intergenic	novelGene_52914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	398.054245326215	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	137	1108	256957	247382	TRUE	25	CCAAATCTATTTGTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267662	245858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256120_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
518354	SIRV6	+	1075	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	411	-1	83	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	60	AACAAGAAGAAAGAGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518355	SIRV6	+	249	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	184	1156	-48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGACAAAGAAGTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11600
518357	contig_15063_pilon	-	1501	4	Intergenic	novelGene_13714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	790	1113	35891	35108	TRUE	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36246
518359	contig_8978_pilon	+	2385	11	Intergenic	novelGene_49388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_7	243.323262348671	279	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	77	1495	339807	347248	FALSE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331586	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
518360	SIRV6	+	490	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1500	480	71	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518361	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	221	1396	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27550	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518362	SIRV6	+	941	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	163	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	171	662	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1466	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1622_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518364	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_8949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518365	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518366	SIRV6	+	420	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8784	164	7	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAAGTCGTAGTCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518367	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_8847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518368	SIRV6	-	539	5	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-261	50	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACTTCGCTTTAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2808	1494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1738_1845_2030_2470_2619_2738
518369	contig_9833_pilon	-	937	2	Intergenic	novelGene_68517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTCTCTAAGTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221953	216990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_217711_221736
518370	SIRV6	+	726	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	527	223	354	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	76	567	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1657	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518371	contig_3602_pilon	+	2169	6	Intergenic	novelGene_60504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	904.082164407638	1903	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	108	584	161745	169547	FALSE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREPGQLAMPVLLILSSRARALFLQHSPCVPWF	161637	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169244_169453
518372	contig_5643_pilon	+	2082	16	Intergenic	novelGene_39013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	721.741178601366	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	653	1777	634983	641123	TRUE	15	ATTGTGTGTGTAGCCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAGVGVREHHIPPSHEEYPCQGLPHLLQTQGGYV	631196	641597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640490_640650_640729_641102_641244_641412
518373	contig_9113_pilon	-	2469	6	Intergenic	novelGene_68586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	705.638320954864	1420	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	500	1747	348515	347268	FALSE	20	TAATCTGTTTTCCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364480	346545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_354544_354700_364042_364108_364434
518375	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518376	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518377	contig_9345_pilon	-	1842	6	Intergenic	novelGene_24639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	280	768	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001354	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949568_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
518378	SIRV6	+	846	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	334	648	2021	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1856_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518380	contig_4754_pilon	+	2179	16	Intergenic	novelGene_35952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	158.362958631956	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	55	1383	380119	415778	TRUE	25	TAGAAATAGCTGGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIWPSLSTCPCWLDSWGWSSLMRSSTPCAWPGWWIMSMPSVRRPPAT	380064	420812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414509_414578_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
518381	contig_11285_pilon	+	2029	13	Intergenic	novelGene_5574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	511.720212996212	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	351	1706	767140	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCRGARTRTQVYHVDPGELGGLGGRAGGWNTVPRWSVLFRGLLPGPSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766159_766390_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
518382	contig_15063_pilon	+	1643	6	Intergenic	novelGene_14149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	159	1394	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34649	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518383	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_8904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518384	contig_12624_pilon	-	2043	13	Intergenic	novelGene_61030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1117.37321863477	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	892	1671	875457	862389	FALSE	35	GAGTCCAGGCCCAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903908	862016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_878874_878935_882974_883083_888695_888805_900249_900333_903447
518385	contig_15063_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_8523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518386	contig_15063_pilon	-	1507	4	Intergenic	novelGene_13080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	785	1111	35891	35108	TRUE	45	AGAGTGGACACAAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36784	34602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35836_36156_36264
518387	contig_1244_pilon	-	1845	12	Intergenic	novelGene_38001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	907.088330687492	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	520	1419	928860	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948558	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_933809_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
518388	contig_10134_pilon	-	1960	3	Intergenic	novelGene_16234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	838	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39729	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35201_39594
518389	contig_12464_pilon	-	2843	8	Intergenic	novelGene_68694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	148.313099590711	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	240	2165	357758	337140	FALSE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	382191	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_381087_381156_382099
518391	SIRV6	+	515	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10254	57	1017	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11254	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
518392	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	19	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27120	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518393	contig_13216_pilon	+	2120	7	Intergenic	novelGene_47465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	954.824140294373	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	87	1583	229682	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSEFSQDENGVISLHIKRSHAFLLFFMQTVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229595	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245967_246135_256045_256296_258447_258573_260430
518394	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_10637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518395	SIRV6	+	516	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10229	81	992	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11229	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11700
518396	contig_15063_pilon	+	1734	6	Intergenic	novelGene_13078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	246	1481	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSSPLPSFVSTLGSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34562	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518397	contig_6735_pilon	-	1947	14	Intergenic	novelGene_15685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	882.662459693103	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	78	1319	564868	542802	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHENFSLCRIIRLPSWGYRNLSCSPV	568275	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542874_543129_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
518398	contig_9696_pilon	+	3528	16	Intergenic	novelGene_68835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_15	588.229411029404	506	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	265	1779	593219	626143	FALSE	25	AAGCCATCCTTCAGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKMGGIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDPRVLHHMGGMAGLQSMMRQFQQGAAGNMKGMMGFNNM	577939	627892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614244_618819_618991_624292_624389_626051
518400	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518401	contig_12923_pilon	-	2913	13	Intergenic	novelGene_30071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	361.991559140388	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	370	1821	68226	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	77695	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69738_75714_75878_77618
518402	contig_15063_pilon	+	1505	8	Intergenic	novelGene_9644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3646.68247891708	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	39515	FALSE	15	TCATTTATGCTGCACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPCFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35083_35142_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518403	contig_5854_pilon	-	2014	2	Intergenic	novelGene_68855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGCCAAGGGCCCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10513	8274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_9198_9422
518404	contig_12923_pilon	-	2389	16	Intergenic	novelGene_30085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.440205381523	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	78	2288	93727	45443	FALSE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQPIVTAETKLPASLKGLYVGY	101245	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45506_49020_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
518405	SIRV6	+	550	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTCTTCGGTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1626_1736_1845_2028_2470_2621_2740
518406	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518408	contig_12790_pilon	+	2075	10	Intergenic	novelGene_35234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	252.813941247094	796	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	207	1151	307252	312473	FALSE	35	GAAACAGATTCTGATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305937	313397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312384
518409	contig_5686_pilon	+	2362	17	Intergenic	novelGene_45266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_15	1801.23568696603	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	45	1937	93843	215344	TRUE	15	GCCCAGCTGGTGTCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKLQVSTSGSQGAS	93798	222811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_215305_215475_219533_219670_221783_221886_222754
518410	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518411	contig_14711_pilon	+	2646	15	Intergenic	novelGene_68899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	369.629827237567	69	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	478	2403	83997	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70423	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82196_83662_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
518412	contig_11285_pilon	+	2086	13	Intergenic	novelGene_5585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_8	507.977436889562	1494	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	36	1763	766060	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQMQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763522	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768089_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
518414	SIRV6	+	694	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	33	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518415	contig_15063_pilon	-	1561	5	Intergenic	novelGene_9247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	808	1131	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34924_35035_35380_35839_36158_36264
518417	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518419	SIRV6	+	1030	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	480	18	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518421	SIRV6	+	571	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGAGTGTGGCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470
518422	SIRV4	+	1503	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6317	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389_2964_3020
518426	SIRV6	+	818	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	183	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	164	495	141	635	1733	10736	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIKCV	1486	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11107_11205
518427	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518429	contig_17936_pilon	+	2091	11	Intergenic	novelGene_29913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	836.442490551502	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	455	1231	91140	121021	TRUE	25	CAGCCTAGTGTCTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50583	126585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68363_79190_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
518431	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518432	contig_18108_pilon	-	1310	10	Intergenic	novelGene_33493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	327.742257962444	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	61	1095	287446	266909	FALSE	20	AAGTGTGCCTCAGTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	287506	266693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_276346_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437
518433	SIRV6	+	686	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	342	89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACGTCACATATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	11057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518435	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_9514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518436	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	23	7451	3	-58	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGAAAACAATCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031	3540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
518437	contig_12427_pilon	-	1281	4	Intergenic	novelGene_40520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1287.24650147342	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTGATTTTGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578145	504671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505592_520324_520440_522284_522346_577960
518438	SIRV6	+	621	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	361	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2479_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518439	contig_15063_pilon	+	1662	7	Intergenic	novelGene_8481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	255	1490	34808	39515	FALSE	15	CGGGGCTTCAGACTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518440	contig_7840_pilon	-	3134	2	Intergenic	novelGene_69046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	59	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445700	403839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_406882_445608
518441	SIRV6	+	460	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1340	230	-2	133	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518443	SIRV6	+	1033	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	493	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518444	contig_233_pilon	-	2846	16	Intergenic	novelGene_14526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1358.18009933227	3	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	967	2403	104176	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126996	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105469_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
518446	contig_6102_pilon	-	2998	8	Intergenic	novelGene_32378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	182.741034566092	59	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733562	1728343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1732065_1732389_1732541_1732738_1732893_1733184
518447	contig_6938_pilon	-	3280	11	Intergenic	novelGene_69058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	336.874590908843	1085	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	97	1038	169148	137993	FALSE	30	AAGATTACTCTTCTCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGKLIENVDPEKAVQLYQQTANVFENEERLRQAVELLGKASRLLVRGRRFDEAALSIQKEKTIYKEIENYPTCYKKTIAQVLVHLHRNDYVAAERCVRESYSIPGFNGSEDCAALEQLLEGYDQQDQDQVSEVCNSPLFKYMDNDYAKLGLSLVVPGGGIKKKSPATPQAKPDGTTTTAAEEEEDEYSGGLC	169244	135750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138137_139249_139380_139953_140034_141959_142039_157629_157701_157886_157954_158074_158185_162374_162406_163983_164090_165469_165538_169092
518448	contig_7356_pilon	+	2282	3	Intergenic	novelGene_60349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	13	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTAAAAAAACAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86058	92237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_88054_88639_88819_92129
518449	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518450	contig_10235_pilon	+	2425	5	Intergenic	novelGene_46411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	184.814772136861	2274	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	29	619	210483	211768	TRUE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFGETNSTPFFYSHIPHPSVPES	210454	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211924_212047
518451	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518454	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_13004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	214	1386	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28187	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518455	contig_7151_pilon	-	2494	13	Intergenic	novelGene_40669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.552398164749	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2433	60	2492	65162	1826	FALSE	20	CTCAACCCAATGTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEESSMICFPSKRESCLHHCKVFICTYDERKLFTINTLS	65221	1823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_1936_4684_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
518456	contig_10940_pilon	-	2000	5	Intergenic	novelGene_49233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875274_875373_875675_893147_893306_916664_916748_916923
518457	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518458	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518460	SIRV6	+	855	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	43	736	0	133	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	35	ATTTAAAGTCTTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
518463	contig_11986_pilon	-	2724	16	Intergenic	novelGene_69198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1173.32555679241	4790	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1240	2193	744270	734510	FALSE	5	GGTGTTTGTCTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	794709	733978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744284_747980_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
518464	SIRV6	+	865	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	559	170	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	25	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518465	contig_15063_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_8471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	258	1493	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26338	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518467	contig_15063_pilon	+	1401	5	Intergenic	novelGene_13479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	202	1230	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEAW	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36510_36624
518468	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_12248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27559	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518469	contig_11285_pilon	+	2346	11	Intergenic	novelGene_5618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_1	462.074279742987	4	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	12	1208	766060	768868	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEVHG	766048	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_769320_769421_769653_769740
518470	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	225	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518471	contig_13894_pilon	+	1840	6	Intergenic	novelGene_62087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	1329.61747882615	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	27	572	520713	523486	TRUE	20	TGAGTAATGAGCTGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNCSARLCPMSSIQAPLAGGKGSLEAGNEPHPLLVPVRLPLTLPWKGDEGLCPVPSPTLLCS	520686	526580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525025_525637
518472	contig_15063_pilon	+	1651	6	Intergenic	novelGene_14039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	195	1430	34808	39515	FALSE	35	TGGCCATGAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34613	39736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518473	SIRV6	+	366	4	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	17	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	82	249	80	328	2569	10780	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	2489	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2743_2829_3106_3163_10724
518474	contig_14536_pilon	+	1934	2	Intergenic	novelGene_69273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	0	2867	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	89	397	23635	23943	FALSE	20	AACCTGTTGCCGTCGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTALLRRSRIPGRQWIGKHRRPRTVSFHAKQNMIRRLEIEAENHYWLSMPYLTAEQEYGHAAIRRAETFAAIKASSTSKFPPHRFVVDQLNHLNVTKKWS	23344	25480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_23428_23629
518475	SIRV6	+	644	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-295	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	31	345	2021	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1990	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518478	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518479	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	171	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518480	contig_5023_pilon	+	1810	15	Intergenic	novelGene_7241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	1914.54274393844	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1725	85	1809	607279	643512	FALSE	40	CTGAGGAGAAGCTCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLD	580844	643513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413
518482	contig_15063_pilon	+	1327	5	Intergenic	novelGene_10662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3082.42741195961	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	233	787	34808	36133	TRUE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLPREKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_36038_36158_36266
518483	SIRV6	+	601	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-372	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATATGCGGTAAACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1913	11227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518484	contig_6102_pilon	+	2291	9	Intergenic	novelGene_32128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1830	2138	820963	821513	TRUE	10	CTGAGTCCCGCACCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFMILPKVSGPTGILIGAPESRTFWPLTKPSVPSIAMVLTVLSPKCWATSKTSLVSLPCTSRAFRMGGSPSSNWTSTTAPMTATMCPVAAPAFGEGDVCAA	816624	822124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_816859_817267_817466_818032_818255_818915_819038_819150_820038_820267_820393_820921_821094_821335_821520_821977
518485	contig_8317_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_20043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
518486	SIRV6	+	446	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	377	8718	204	73	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAAGGTGAGTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518487	contig_1516_pilon	+	2159	10	Intergenic	novelGene_50007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1133.59527474032	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	2	859	347241	356123	TRUE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRKSSLLRR	347239	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355060_356096_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
518488	contig_8420_pilon	+	2337	14	Intergenic	novelGene_69334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	288.102812845052	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	26	1558	10943	51079	TRUE	15	GATCATATTTTTGTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10917	59222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33889_35346_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
518489	contig_8447_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_69432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCGAGAAACTTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82350	84481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82400_84500
518490	SIRV6	+	912	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-10	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	104	315	409	723	2021	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518493	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518494	contig_15063_pilon	+	1499	4	Intergenic	novelGene_13913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518495	SIRV6	+	656	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	521	512	348	4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518496	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_9962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518497	contig_15063_pilon	+	1678	6	Intergenic	novelGene_14013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	196	1431	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34612	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518498	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_8637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	214	1449	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26382	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518500	contig_7467_pilon	-	1984	12	Intergenic	novelGene_69462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_11	146.046579233425	1381	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	234	1559	92058	67563	FALSE	20	CAGCATGGTTCTCTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133043	67137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132844
518501	contig_11720_pilon	-	2437	13	Intergenic	novelGene_43902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	170.893302482377	925	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	269	1198	124674	118106	FALSE	20	AAACCCTGTATGGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134608	116866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_129063_129246_134558
518502	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518503	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_9699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	65	TTATAAAAATTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518504	contig_5643_pilon	+	1915	16	Intergenic	novelGene_39072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	702.997910539016	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	423	1703	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631244	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631864_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
518505	SIRV6	+	634	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	168	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106
518506	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518509	SIRV6	+	962	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	564	2	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	162	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518510	contig_8317_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_19415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTTGACCAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16388	16735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
518511	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	211	1383	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518512	contig_15063_pilon	+	2150	6	Intergenic	novelGene_10985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	3052.15993027888	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	233	958	34808	35645	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRKCTGSQGEGSCPKHSPCPSLAKQESRNTHRHTTHTHNTQTYTHTPHAHIHYTNIPTYTHVPHTDIHTRHTDIHTTCTCIHTHTHTQT	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266_36569_38975_39092_39506
518513	contig_10923_pilon	+	1798	10	Intergenic	novelGene_66178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	801.404985395826	4567	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	246	1682	23028	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13827	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21826_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
518514	contig_15063_pilon	-	1646	7	Intergenic	novelGene_12742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	897	1220	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39687	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
518516	contig_15063_pilon	+	1449	4	Intergenic	novelGene_13129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	CTAACCATGTCTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518517	contig_15063_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_8517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518518	SIRV6	+	687	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	791	548	-407	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	124	456	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1878	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518520	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518522	SIRV6	+	766	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	183	126	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	289	621	2002	10736	TRUE	45	CAAAGAAATTTAAAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1486	11094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518523	contig_15063_pilon	+	1502	5	Intergenic	novelGene_8890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GTGGGTGAGAAGTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518524	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_8608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQLGPGQTGHHLPSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26356	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518525	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518526	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_13144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518527	contig_2834_pilon	+	2141	6	Intergenic	novelGene_27972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_1	2002.52746298272	4521	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	158	733	274763	290707	FALSE	40	AAAATCCTTTACAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238651	292115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
518529	SIRV6	+	677	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8503	2	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518530	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518531	contig_20951_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_43060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27155	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27200
518533	SIRV6	+	694	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	552	164	-9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518534	contig_10011_pilon	+	3952	1	Intergenic	novelGene_68062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	402	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234233	238185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_234200_238200
518536	SIRV6	+	1400	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	396	14	180	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	144	635	1733	10736	TRUE	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1483	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518537	contig_12624_pilon	-	1736	5	Intergenic	novelGene_61119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	233	538	952979	948779	TRUE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955871	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948197_948293_948842_950590_950768_952913_952985_955644
518539	contig_19342_pilon	+	1830	5	Intergenic	novelGene_41111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.8613807855649	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	406	759	5070	5544	TRUE	35	ACCTGAGAACCTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGGV	3637	6761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3911_4285_4365_5016_5293_5413_5994_6139
518540	contig_15063_pilon	+	1676	6	Intergenic	novelGene_14120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	186	1421	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34622	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518541	contig_5018_pilon	-	1758	9	Intergenic	novelGene_47064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	705.070519522693	31	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	74	1198	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399717_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
518543	SIRV6	+	773	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	6	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	35	7	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518544	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518545	SIRV6	+	647	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740
518546	contig_2367_pilon	-	1685	4	Intergenic	novelGene_65329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	663.855908060376	258	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	141	347	213194	193580	FALSE	30	CTCGGTACTTTTAGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGHICSKTLNTFKIKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	230096	192241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208634_213107_213294_230055
518547	contig_2646_pilon	+	2756	9	Intergenic	novelGene_69510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_7	154.371912924599	1747	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	455	1021	566553	573396	FALSE	30	GTATCTGGAACTAATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	553998	575131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
518549	contig_5092_pilon	-	2196	5	Intergenic	novelGene_62300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_4	284.380906532067	2625	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	113	427	451516	444945	FALSE	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDVIATTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451628	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
518550	SIRV6	+	619	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	717	250	-438	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518551	SIRV6	+	794	8	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	378	744	162	125	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	50	ACAAAGAAATTTAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
518552	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518554	contig_3956_pilon	+	2014	13	Intergenic	novelGene_15090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1186.51685618031	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1935	78	2012	1281682	1290694	FALSE	25	TCAGAGGGCCGCGGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISR	1281604	1290696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1288967_1290564
518555	SIRV6	+	635	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	32	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3110
518556	contig_15063_pilon	+	1592	7	Intergenic	novelGene_9065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	5	CTTCCTTGGCTTTGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518557	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	171	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAAAAGTAATAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	10790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3110_3165_10724
518558	contig_12873_pilon	+	1807	7	Intergenic	novelGene_27178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	1104.74563437321	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	379	1233	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15978	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19044_19169_19264_19611_19703_19851
518559	contig_5794_pilon	+	2457	5	Intergenic	novelGene_69757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	297.193960234726	1164	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	133	1956	695501	733994	FALSE	20	TTAGTTCTTCACGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPCRPAASAGEPEGATARAALSTLRQPGQGRRRGAPAHSPQLKMMDLELPSPELPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEEAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSESASYSQVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN	695368	734495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_695546_730261_730529_731318_731409_731978_732171_732764
518560	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_12816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	775	1098	35891	35108	TRUE	35	TACCGTAGTAATCACAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36776	28164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36154_36264
518561	contig_13592_pilon	+	2647	16	Intergenic	novelGene_33687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_2	598.599684448816	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	566	2494	256608	269322	FALSE	20	CTTATTGTGTTTATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	221661	269475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_221797_246594_246779_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
518562	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518563	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518564	contig_5988_pilon	-	1428	5	Intergenic	novelGene_15976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	875	1327	652414	651962	FALSE	20	GTGTCTTAAATTTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655521	651860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652687_652777_652943_653272_653422_653549_653773_655456
518565	contig_5988_pilon	-	1621	4	Intergenic	novelGene_15956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	20	GAAAGGTTTTTGACTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
518566	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_12184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27540	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518567	contig_9297_pilon	+	2170	10	Intergenic	novelGene_69869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	360.595940213926	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	153	1826	909195	912790	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227_912338_912628
518569	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10379	57	1142	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11379	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
518570	contig_12622_pilon	-	2160	13	Intergenic	novelGene_5905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2086.84591049906	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	20	1951	1590968	1583745	FALSE	20	TATGTACATGTGTGTGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1590987	1583535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586334_1586699_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
518571	contig_17427_pilon	-	2555	13	Intergenic	novelGene_30354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	3	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	38	1462	188879	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204698	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
518572	contig_12644_pilon	+	1754	9	Intergenic	novelGene_44643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4384.03597584463	24	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	711	1682	2678073	2680545	FALSE	45	AAGAGGCAGTGAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
518575	contig_15087_pilon	-	2921	19	Intergenic	novelGene_37142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_17	418.325649184259	848	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	730	2094	66689	38999	TRUE	15	CATTCCATGACTGGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89721	33326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_87528_87712_89687
518576	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518577	contig_13863_pilon	+	3237	9	Intergenic	novelGene_42092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	361.398585359711	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1532	2347	478688	489696	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKVSVYRA	475536	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_476881_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556
518580	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	73	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518581	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518582	contig_3956_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_15081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1464.30491663755	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	80	574	1281682	1288974	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNSTTVCT	1281602	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284129_1288953_1289229_1289493_1289677_1290307
518584	contig_5033_pilon	-	2269	15	Intergenic	novelGene_29007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	10	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	31	1605	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566817	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531157_531633_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
518585	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	202	1368	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCTPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35374_35839_36158_36266
518586	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518587	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_14037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	178	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	195	1352	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35858_36158_36266
518588	contig_6958_pilon	-	3031	5	Intergenic	novelGene_69929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	496.818062775499	1726	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	763	1998	190008	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190770	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
518589	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	70	TAAAAATTAGAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518590	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518591	contig_16310_pilon	-	2593	14	Intergenic	novelGene_70041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1094.69120230427	1554	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	180	2201	66135	56545	FALSE	10	GTGCCAGACTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGFRGGRGGGGDHKPQGKKTKFE	66314	56152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56613_57055_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
518593	SIRV6	+	715	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGTAAGACTGTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	10813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3155_10721
518594	SIRV6	+	663	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-33	8509	10	282	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTACGTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	2822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518595	contig_7357_pilon	-	2296	10	Intergenic	novelGene_36808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.08627551365	5	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	229	1479	166824	136424	TRUE	15	GTTTTTCTGGACCTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167052	135544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136039_136100_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
518596	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518597	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518599	contig_11285_pilon	+	1659	11	Intergenic	novelGene_5634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	575.138800638594	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	381	1223	767140	769760	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAERLQPRKLWGSCVLSYRVTMNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRRHLLYR	766111	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767527_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768819_769740
518600	SIRV6	+	951	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	559	18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518601	contig_10331_pilon	+	3880	7	Intergenic	novelGene_54135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_3	128.866425245506	427	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	279	728	410802	520624	FALSE	80	AGTGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHM	409519	523776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528
518602	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518603	contig_15666_pilon	-	2125	5	Intergenic	novelGene_70187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	304.689185892772	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	93	1058	110619	108530	TRUE	35	TTTATCATCAGGGAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110711	107165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107235_107531_108859_109098_109378_109948_110246_110558
518604	contig_15063_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_9535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	791	1114	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36790	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518605	contig_13894_pilon	+	1291	10	Intergenic	novelGene_62091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2223.11118330445	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	27	1238	520713	528117	FALSE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
518606	SIRV5	+	2374	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11136	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_11267_11362
518607	contig_10246_pilon	+	2840	10	Intergenic	novelGene_46889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	220.593699472387	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	575	1189	171203	184738	FALSE	20	TCATAGGTTTGTAGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140683	186389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168148_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
518609	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518610	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518611	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_14015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	196	1431	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34612	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518612	contig_15063_pilon	+	1669	7	Intergenic	novelGene_8482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	2898.89528767234	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	255	1493	34808	39515	FALSE	25	GCTTCAGACTCTATCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518613	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	359	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
518614	SIRV6	+	815	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	158	649	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1469	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11023
518615	SIRV6	+	739	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	767	520	-431	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	148	480	2002	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1854	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518616	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518619	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518621	contig_19564_pilon	-	2200	5	Intergenic	novelGene_29616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	162	854	15529	12703	FALSE	65	AAATGGGAAATGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEAGSQHGALPTSPLFHAWLCPTHQPW	15690	11356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12780_12919_13259_13554_13666_13945_14055_15472
518622	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	577	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518623	contig_12079_pilon	-	2084	9	Intergenic	novelGene_67452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1080.88360121477	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	478	951	600738	581997	TRUE	10	ACTCCCTGCTATCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSAGELPRPGQPAGGGHRVHRLQRRALQ	638846	580106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582077_591682_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
518624	contig_12873_pilon	+	1874	6	Intergenic	novelGene_27205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	320	1300	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16037	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
518625	contig_233_pilon	+	2317	13	Intergenic	novelGene_14527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	1979	2317	108497	126999	FALSE	15	AGGTACTGGCCCTGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGQPFISSCCLVLQRTESGSPSPVKFIFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRPEEEQSHQSEQQGMLAWHDLHSCPRTLVLRVLGGLGQVKLRSCPGWFTVTSGK	78135	126999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92136_92351_93759_93916_101710_101769_104151_104308_105460_105711_107298_107471_108400_108583_108724_108818_109917_109978_126899
518626	contig_5499_pilon	+	2570	12	Intergenic	novelGene_56996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	276.470045304031	1652	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	126	1058	803476	835383	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGWSDILAGASNR	803350	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834950_835345_835511_839385_839446_839911_840284_840326
518627	contig_15063_pilon	+	1683	7	Intergenic	novelGene_9253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	10	TGGTGTAGGCACTTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518629	contig_15327_pilon	-	2886	6	Intergenic	novelGene_70534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_5	253.30819173489	2185	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	313	966	585509	513059	FALSE	5	CTCTGTATCTTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	592427	511138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_513245_513894_514064_517485_517609_525370_525469_585431_585647_592252
518630	SIRV6	+	971	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	40	517	3	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	33	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	218	709	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1127	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518631	contig_12951_pilon	-	3133	3	Intergenic	novelGene_68157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.5	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGTGTCTTTGCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326208	293599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_296625_307135_307220_326184
518633	contig_6102_pilon	-	1766	10	Intergenic	novelGene_32113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	304.713344345505	5464	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	20	1606	822105	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
518634	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518635	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518636	contig_18108_pilon	-	2609	18	Intergenic	novelGene_33511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	331	junction_4	219.457383682106	1876	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	202	2397	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335464	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
518637	contig_15063_pilon	+	1684	6	Intergenic	novelGene_14055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	194	1429	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518638	contig_13778_pilon	+	2567	1	Intergenic	novelGene_70844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTGCAGCTGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209067	211634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_209100_211600
518640	contig_233_pilon	-	2759	17	Intergenic	novelGene_14624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1435.42733184233	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	924	2324	104176	78579	FALSE	15	TCCTAGAAGCTGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNVNPKFAES	126991	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78602_78970_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104222_104267_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
518641	contig_15063_pilon	-	1537	5	Intergenic	novelGene_11685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	798	1121	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36797	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518642	contig_3077_pilon	+	1699	9	Intergenic	novelGene_26691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	3121.14872432811	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	371	1201	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10072	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
518643	contig_15991_pilon	-	2348	5	Intergenic	novelGene_70885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7128	junction_2	472.802548639493	123	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	656	1195	105108	101983	TRUE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	105763	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_102271_103583_103703_104975
518645	contig_15063_pilon	+	1584	6	Intergenic	novelGene_14213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	94	1329	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34714	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518646	contig_15063_pilon	+	1669	6	Intergenic	novelGene_14052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_1	3798.72333291068	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	194	1417	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518647	contig_10722_pilon	-	2602	2	Intergenic	novelGene_70986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	912	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1854	2177	30225	29902	FALSE	70	AAAAAAAAAACTCCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWPSGLWAAFPVRPRSRRGQSSLNVTLRVRAFFWTVGKLLGLSTVAIARRSAWGVGRGARALRGPVVTRLTECGLQTVSEFVEREKGLPKRSSLVKQRVSEKEEEP	32484	29476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_31134_31539
518648	contig_15021_pilon	-	2695	11	Intergenic	novelGene_26963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	471.542108406026	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	68	703	267752	251270	TRUE	5	GTGGTGCTTTGCTCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKAASTRGGWWRWRTQSTTTS	267819	240153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251330_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742
518649	contig_15063_pilon	+	1784	7	Intergenic	novelGene_8461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	294	1529	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26302	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518650	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518651	SIRV6	+	1468	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	48	12	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1016	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518652	contig_4105_pilon	+	2535	12	Intergenic	novelGene_21462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	117.824494780364	911	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	85	1371	60529	73266	TRUE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58732	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73510_73560
518653	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518654	contig_12873_pilon	-	2163	7	Intergenic	novelGene_27127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCAGTGGCTCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20401	15861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16416_16751_16999_17096_17254_17731_18012_18982_19264_19607_19700_19849
518655	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518657	SIRV6	+	765	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	598	337	-43	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	GTATATGCGGTAAACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518658	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518659	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_10013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518660	contig_13707_pilon	-	2451	12	Intergenic	novelGene_43538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	699.430996602427	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	191	1405	275268	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	277732	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_277547
518662	contig_1225_pilon	+	2263	5	Intergenic	novelGene_44129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	225	542	250814	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250589	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274958_275411_275854_276063
518663	SIRV6	+	1539	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-13	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57416	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518664	contig_3975_pilon	-	2468	14	Intergenic	novelGene_54777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	326.88314688276	2668	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	998	1867	2021058	2016131	FALSE	5	TCTCCCGAGCTTCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052451	2015529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021220_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
518665	contig_2403_pilon	+	4052	17	Intergenic	novelGene_71000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_8	197.326416994152	896	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	165	2192	109605	169508	FALSE	10	GCTCCCAATCTGGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCKCNGWKNPNPSPTPPRADLQQIIVSLTESCRSCSHALAAHVSHLENVSEEEMNRLLGIVLDVEYLFTCVHKEEDADTKQVYFYLFKLLRKSILQRGKPVVEGSLEKKPPFEKPSIEQGVNNFVQYKFSHLPSKERQTIVELAKMFLNRINYWHLEAPSQRRLRSPNDDISGYKENYTRWLCYCNVPQFCDSLPRYETTQVFGRTLLRSVFTVMRRQLLEQARQEKDKLPLEKRTLILTHFPKFLSMLEEEVYSQNSPIWDQDFLSASCRTSQLGIQTVISPPPVAGTISYNSDSSSLEQLNGRSTSPACKASSGLEVNPGEKRKMNDTHPLEEAKKPRVTGDIPMELINEVMSTITDPAAMLGPETNFLSAHSARDEAARLEERRGVIEFHVVGNSLNQKPNKKILMWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYITRLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPSQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHDILNFLTYADEYAIGYFKKQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGIRETGWKPSGREKSKEPKDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLIDK	93881	171368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_94005_109563_109710_114589_114683_116065_116248_123831_124024_128861_128969_133770_133897_135756_135894_138651_138861_139830_139958_148218_148330_151046_151191_161000_161116_163533_163571_163812_163877_163974_164060_169314
518666	contig_15063_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_13794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518667	contig_15063_pilon	+	1498	5	Intergenic	novelGene_12593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	217	1389	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGLLGPRNHGHCLLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28201_34632_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518670	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518672	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	211	1386	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518673	contig_10352_pilon	-	2953	10	Intergenic	novelGene_49601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1587	2021	34297	32994	TRUE	30	CATCTCCTGAGAGAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPASPQPLLPQGESQPGLEALARHLCIRNGAAATCSTECMSSAVPLAHGAGGRGAHGAARDCCLLQPGGGRVYFSVSDSCKTCWSSASSSCSRSSRSSSSLAESSMASCKSLSKRLVSLGVPGHRPSELVRRLSWMALSYWAS	35883	16153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_16262_21360_21427_22733_22817_23719_23783_24829_24962_25654_25810_26498_26611_29267_29432_32944_33013_33881
518675	contig_15063_pilon	+	1626	6	Intergenic	novelGene_14172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	14	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	136	1371	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34672	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518677	contig_12352_pilon	+	2751	10	Intergenic	novelGene_57449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	256.002941726925	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	293	955	238274	284811	TRUE	25	CAATGAGTTGCTTGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	229953	286645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_237953_238083_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742_284822_284859
518678	contig_15063_pilon	-	1560	5	Intergenic	novelGene_12556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	AGTAATCACAATGGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
518679	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518680	contig_854_pilon	-	3114	12	Intergenic	novelGene_36164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	207.193485650171	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	460	1155	487054	471988	FALSE	10	AACTCGTGCCTGGGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509263	470028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487099_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
518681	contig_6195_pilon	+	3622	17	Intergenic	novelGene_71023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_6	129.361653900992	270	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	83	2824	94384	140294	FALSE	35	GACTGAGAAAATTTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVRALGPGSRTQLWAPVKTRLPVASAMEAVVAREVENEDGDSSCGDLCLLDKGLRSISELSLDSTLHTINLHCNKISKIKAIDHIWNLQHLDLSSNQISQIEGLSTLTNLCTLNLSCNLITKIEGLEELINLTKLNLSYNQISDLSGLIPLHGIKHKLRHIDLHSNCIDNIHHLLQCMIGLHFLTNLILEKNGDDNPVCHIPGYRAIILQTLPQLRTLDCKNIFGEPVNLSEINLSHLQCLEGLLDNLISSDCPLNISEEETVDSMPVVTTNVDQLVPLDQFACTPTDTALTSVDSVCPSSEPEKINHENDFQNEMKLQKIDDQISQLLTESLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSCLQERDEDIKTLQEKISEIQKCTQEQLEEKSSQLDVVIEKLERHNERKGKLKQQLKEKEEELEEIRNAYSTLNQKWHDKGELLSHLETQVKEVKEKFDDKERKLKEERDKSIEMQKNALEKLQSMDDAFKKQVDAIVVAHQAEMLQLSNEKQKCIESANEKVYQVEEEMRGLLEETTKNKRAMEEKIKQLAFALTEIQQEF	94301	141092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_97122_97329_97627_97694_102785_102954_104900_105077_105171_105382_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_131449_135278_135488_135574_135713_137404_137541_140171
518682	contig_233_pilon	-	2014	12	Intergenic	novelGene_14627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1381.74575767142	39	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	87	1196	126907	99765	TRUE	15	GTCCTAGAAGCTGGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNVSLP	126993	78144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91623_99759_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
518683	contig_6227_pilon	-	1985	17	Intergenic	novelGene_49723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	240.849854356921	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	177	1685	1223803	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1223979	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746
518684	contig_13608_pilon	-	2714	19	Intergenic	novelGene_52367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	218.110184239837	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	904	2130	411020	369353	FALSE	20	GCAAAATGTGTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470373	368768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411667_416269_416379_451597_451661_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
518686	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	231	746	34808	35888	TRUE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27138	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35384_35839_36158_36266
518687	contig_3956_pilon	+	2026	11	Intergenic	novelGene_14968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	81	1832	1281682	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287431_1290564
518689	contig_3975_pilon	-	2082	14	Intergenic	novelGene_54785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_13	243.420983376391	2388	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	34	1482	2052412	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052445	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
518691	contig_19579_pilon	-	2360	6	Intergenic	novelGene_59370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1118	junction_4	227.741432330615	194	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	106	327	13090	12869	TRUE	40	AAATCTATATGGGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGMGHSKGNVL	13195	7166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012
518692	contig_10134_pilon	-	2125	5	Intergenic	novelGene_16206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	1188	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39727	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32876_32956_33731_34922_35178_38558_38817_39584
518693	SIRV2	-	535	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	125	3072	-90	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGTCGATGCGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
518694	contig_9345_pilon	-	3555	1	Intergenic	novelGene_24444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	605	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	42	305	399977	399714	NA	25	ATACCTGACTTTCCAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSNPVFTSLVQNGMSLQQFKCLIQSPKCKHPPFPVLLLLLLLEVTTKSAETCGATVDTLLQPFSREEMLVALDLLICPLRKSTFVHHCSHCFYSRKWRQI	400018	396463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_396500_4e+05
518695	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518696	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	199	1437	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518698	contig_12464_pilon	-	3036	9	Intergenic	novelGene_68672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_1	600.926459206948	617	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	171	1736	242417	159474	FALSE	50	CCTAGCTATATCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENREQEMRMGDMGPRGAINMGDAFSPAPAGNQGPPPMMGMNMNNRGTIPGPPMGPGPAMGPEGAANMGTPMMPDNGAVHNDRFPQGPPSQMGSPMGSRTGSETPQAPMSGVGPVSGGPGGFGRGNQGGNFEGPNKRRRY	242587	158173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_159660_161981_162152_165180_165239_182087_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_234642_234945_242051
518700	contig_3077_pilon	+	2760	9	Intergenic	novelGene_26677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_7	3079.419484152	64	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1582	2265	13867	17590	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9634	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
518701	contig_1244_pilon	-	1920	13	Intergenic	novelGene_37998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1028.0221706429	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	79	1494	948448	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948526	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946475_946620_947578_947655_948440
518702	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518703	contig_15063_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_8558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	6	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	20	ATTTATGCTGCACCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518704	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518705	contig_10134_pilon	-	1961	4	Intergenic	novelGene_16208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	504.405480629314	18	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33485_34922_35178_38558_38817_39584
518706	contig_12624_pilon	-	1948	4	Intergenic	novelGene_61133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	325	657	953006	948779	FALSE	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLISLTGNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955873	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_953055_955597
518707	contig_10413_pilon	+	3951	2	Intergenic	novelGene_71029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	602	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	65	811	33216	41703	FALSE	85	AAAAATAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGSSPGGVSGGLAHWAAASGMGLSQVRAVFFDLDNTLIDTAAASRSGMLEVIKLLQSKYHYKEEAKIICDKVEVKLSKECFYPSNTCITDLRTSYWEEAIQETKRGAANRKLAEECYFLWKSTRLQHMTLADDVKAMLTKLRKEVHLLLLTNGDRQTQREKIEACACQSFFDAIVVGGEQTEEKPSPSIFYYCCDLLGVQCGDCVMVGDTLETDIQGGLNAGLKATVWINKNRIVPQKSSPVPHYTISSVLDLPAVLQSIDCKVNMSD	33151	44843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10413_pilon_+_33306_41046
518708	SIRV6	+	617	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	28	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106
518709	SIRV6	+	611	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2610_2740
518710	contig_12074_pilon	-	2253	15	Intergenic	novelGene_53748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	428.288817533787	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	123	2000	43217	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	46696	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_46608
518711	contig_8317_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_19386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAATGAACAGAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16759	16380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
518712	contig_4845_pilon	+	3077	12	Intergenic	novelGene_53616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	322	junction_1	291.621570697141	3	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	90	836	205637	219405	TRUE	25	TGGAAAACTGCCCATCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDRRGKGSSGRARFLFSFCRVRLWGTGLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQQ	202014	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657
518714	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518715	contig_6227_pilon	-	2087	17	Intergenic	novelGene_49713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	247.221023327305	59	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	811	1785	1213164	1202920	FALSE	15	TTATGGCTTCAGCCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225002	1202617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
518716	contig_12624_pilon	-	2183	15	Intergenic	novelGene_61032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	965.89762893996	1044	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	283	1818	903621	862389	FALSE	25	GCACCCAGAGTCCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903903	862023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874106_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
518717	contig_1836_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_71049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGCCCAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828395	826732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_826700_828400
518718	contig_7342_pilon	-	2513	18	Intergenic	novelGene_71097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	103.639380098814	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	485	2179	81495	76155	FALSE	70	TAAAAAAGAAAATAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86806	75820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82884_83889_83979_86703
518719	contig_15063_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_8516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518720	contig_12074_pilon	-	2144	15	Intergenic	novelGene_53761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	308.104747958037	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	119	1354	43217	33343	TRUE	40	AAATACATATTTAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSENQHGGRAWESPGCEAARNKPLRN	45853	29979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33417_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
518721	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518722	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_13197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518724	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4154.41592615617	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	232	1035	34808	36299	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKRWPSMHQPST	27135	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36151_36266
518725	contig_1244_pilon	-	2218	13	Intergenic	novelGene_37994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_12	906.2048571132	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	380	1792	947623	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948243	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_947895
518726	contig_14727_pilon	-	428	2	Intergenic	novelGene_56682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403016	398202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_398357_402742
518727	contig_17936_pilon	-	2039	10	Intergenic	novelGene_29908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	581	1096	126002	111092	TRUE	30	CAGCAGAGCTGCTCCGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGTGNRTGMRGASPSHATAGFLTRGQTPSSDSQASMNFFFSLSLFRVCDPPAWEPWDWSSSAAVFLCLKAFTSSSRDFFLSSSFFFSSWCSFFSRSNFSCSSFSASLSSASFSLTLWTNICLISSSFFWSSPRNSFLLASYVSCKLKGLLSGSVSLKPISSSLQRRYSS	126582	50583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_50675_68274_68390_79102_79298_90971_91159_95140_95305_106374_106471_110996_111164_114797_114932_118633_118827_125885
518728	contig_10311_pilon	-	1827	11	Intergenic	novelGene_50465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_10	906.337045474806	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	32	1255	71526	65773	FALSE	35	ACCCCCAGTAAAATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
518730	contig_13216_pilon	+	2046	7	Intergenic	novelGene_47475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	935.064243188076	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	484	1509	246066	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSEFSQDENGVISLHIKRSHAFLLFFMQTVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229614	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243845_243952_245961_246135_256045_256296_258447_258573_260430
518731	contig_15063_pilon	+	1472	6	Intergenic	novelGene_10628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3599.786771463	10	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34653_34696_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518732	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27543	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518733	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_11240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	70	TATAAAAATTAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518734	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_8501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	2898.89528767234	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	253	1491	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26343	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518735	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_11627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	30	AAATGTGTATATATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518736	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_8510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	250	1422	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTTTSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26344	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518737	contig_12074_pilon	-	2116	14	Intergenic	novelGene_53747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	394.690531156519	1750	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	70	1863	45831	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45900	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
518738	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	62	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518739	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	575	1399	35271	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34913_35037_35380_35836_36158_36266
518741	contig_15063_pilon	-	1518	5	Intergenic	novelGene_11809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	30	AGTAGCTGAGGTAGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34606_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518742	contig_14287_pilon	-	1993	4	Intergenic	novelGene_24046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.790698163809	76	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	203	679	22710	21898	FALSE	10	TGAGCTCTTGCTGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIMRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33888	20583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22266_22601_22754_25823_25875_33780
518743	contig_5018_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_47018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGCTCCGCGGGTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391200	1391018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1391000_1391200
518744	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	65	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518745	contig_15063_pilon	+	1683	7	Intergenic	novelGene_9156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3810.76338225762	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	241	1272	34808	38946	TRUE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVPGSTLS	27126	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36499_38924_39092_39506
518747	contig_15063_pilon	+	1434	6	Intergenic	novelGene_10513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	235	1263	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
518748	contig_11396_pilon	-	3075	21	Intergenic	novelGene_71255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_4	367.87474430844	592	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	941	2826	133	2958	155228	121478	FALSE	10	GTCAGGGTGGTGACTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREHWIQDAEECDKAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHSALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENNEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVLGNLAAAQELCEEALKHYEDFPKLWMMKGQIEEQEELVEKAREAYSQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKVGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAVFLEARPQRKTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSERKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCENAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGEVLVLVAARIKNTF	155360	121360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121631_122169_122297_124392_124508_125485_125578_126107_126242_127268_127446_127615_127736_128716_128856_130392_130515_133875_133999_137866_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144292_146250_146407_146608_146786_147254_147334_147886_148006_153256_153426_155157
518749	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_10549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518750	contig_15063_pilon	+	1618	7	Intergenic	novelGene_9438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	241	1368	34808	38994	TRUE	15	TTTCTTTCTAGACATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27128	39659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
518751	contig_10986_pilon	+	2642	11	Intergenic	novelGene_71451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCGCACGCCGCGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66355	80380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71629_72178_72319_73922_74008_74225_74357_74984_75047_75474_75542_76169_76243_80187
518753	contig_177_pilon	+	2570	2	Intergenic	novelGene_41805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	890	junction_1	0	3	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	100	1176	417672	418748	FALSE	20	GTTATACTAGTTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415631	420142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647
518754	SIRV6	+	920	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
518757	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518760	contig_15063_pilon	+	1500	5	Intergenic	novelGene_10615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	40	GAAGTTGTATGTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518761	contig_13707_pilon	-	2260	11	Intergenic	novelGene_43555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	717.256969293432	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	203	1225	275206	270728	FALSE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275548	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274199_275197_275274_275413
518762	SIRV6	+	758	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	788	480	-410	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	127	459	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1875	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518765	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518766	SIRV6	+	717	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	594	-4	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGAACGAGTCGAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	10737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518768	contig_9177_pilon	+	1915	5	Intergenic	novelGene_32671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	638	junction_1	531.25205881954	4414	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	51	515	395377	415476	FALSE	30	TATGTAATATCTTCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIELSLSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395326	416876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315
518769	contig_14711_pilon	+	2602	14	Intergenic	novelGene_68888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	400.250912427952	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	525	2360	83997	90570	FALSE	15	ACCTCAGTTGTCATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70415	90812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
518770	contig_15063_pilon	+	1546	7	Intergenic	novelGene_8639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3854.53702364715	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	250	1074	34808	36504	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYGYFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGPGLLLHLQHPERV	26540	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36161_36460_36600_38975_39092_39506
518772	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	28	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518773	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518774	SIRV6	+	572	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	8514	162	277	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATGCCCTGGTACGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518776	contig_19564_pilon	-	1993	5	Intergenic	novelGene_29580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	689	1126	12638	12201	FALSE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15693	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12745_13117_13259_13554_13666_13945_14055_15472
518777	SIRV6	+	540	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-356	116	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	73	408	2002	10736	TRUE	40	ATTGCGTTCACAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1929	11084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11034
518780	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_8630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26369	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518781	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518783	contig_8317_pilon	-	493	2	Intergenic	novelGene_19338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCGTCTTCTAGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
518784	contig_12624_pilon	-	1829	4	Intergenic	novelGene_61132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	575	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	233	538	952979	948779	FALSE	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955871	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955644
518785	contig_12008_pilon	-	2065	8	Intergenic	novelGene_25000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	520	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAGAGGGAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40480	23637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_23682_23785_23928_28026_28169_30158_30215_34010_34145_34558_34711_38999_39213_39298
518786	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518787	SIRV6	+	397	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	529	-70	356	70	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCGAAGGTGAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	2610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
518788	SIRV6	+	425	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8779	164	12	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTAGTCGTAGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518789	contig_5826_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_71523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGCTTACTAGACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185847	187238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_185800_187200
518790	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518791	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	19	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518793	SIRV6	+	345	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	1	337	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
518794	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518795	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
518796	contig_3410_pilon	-	3223	10	Intergenic	novelGene_58918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	475.64342386568	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	128	1501	57649	15414	FALSE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSKEECPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	57776	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
518797	contig_10134_pilon	-	2011	4	Intergenic	novelGene_16198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	790.073976845769	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39683	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35094_38625_38817_39584
518798	SIRV6	-	717	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8271	526	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCAGATTCGTCTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10818	1018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1186_1466_1540_1646_1735_2469_2619_2738_2826_3107_3165_10722
518799	contig_2033_pilon	-	3202	12	Intergenic	novelGene_71533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_11	217.089995429781	769	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	211	1461	182354	125838	FALSE	10	TGGTTCTCAATGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGPGHRHTQRPAYRRRSSSSGGGGPSGGRAPERPRSKSLGGPPNYPRRRSHSEPQAPPQQEECGAAVAYMAHSPVAVQVPGMQNNIADPEELFTKLERIGKGSFGEVFKGIDNRTQQVVAIKIIDLEEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSSYVTKYYGSYLKGSKLWIIMEYLGGGSALDLLRAGPFDEFQIATMLKEILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEQGDVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGTPFWMAPEVIQQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPNSDMHPMRVLFLIPKNNPPTLVGDFSKSFKEFIDACLNKDPSFRPTAKELLKHKFIVKNSKKTSYLTELIDRFKRWKAEGHSDDESDSEGSDSESTSRENNTHPEWSFTTVRKKPDPKKLQNGAEQDFVQTLSCLSMIITPAFAELKQQDENNASRNQAIEELEKSIAVAEAACPGITDKMVKKLIEKFQKCSADESP	182652	124096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_125863_126936_127074_127154_127218_128180_128275_129861_130011_131069_131256_132093_132252_132335_132445_137972_138030_146861_147093_182312_182464_182551
518801	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518802	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518803	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_8642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	246	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26544	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518804	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518805	contig_8598_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_22895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATCTCCCTGTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191157	191436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_191200_191400
518806	contig_15063_pilon	-	1495	4	Intergenic	novelGene_13198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518807	SIRV6	+	474	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10271	81	1034	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11271	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
518809	contig_500_pilon	+	1699	11	Intergenic	novelGene_31036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1053.32293718498	6245	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	877	1290	1496587	1498065	TRUE	10	CGGGCATGTTTGACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485758	1499583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493788_1494191_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
518810	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518811	contig_3986_pilon	-	2996	12	Intergenic	novelGene_52680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	140.323062906534	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	400	1485	55958	35584	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGSAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPV	153932	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35589_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52845_52953_54769_54869_55923_56058_57911_57964_153684
518812	contig_13863_pilon	+	1901	12	Intergenic	novelGene_42014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	822.51740165972	3073	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	65	1084	98341	118962	TRUE	15	TATTTAGAGGTGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98276	120386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98452_98505_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
518813	contig_4364_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTACAGGGTATTAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
518814	contig_3956_pilon	+	1186	7	Intergenic	novelGene_15024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1412.41798188622	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	76	1020	1287410	1290847	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281609_1287341_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289834_1290748
518817	contig_15063_pilon	+	2025	7	Intergenic	novelGene_10990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	2956.06782736797	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	233	958	34808	35645	TRUE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRKCTGSQGEGSCPKHSPCPSLAKQESRNTHRHTTHTHNTQTYTHTPHAHIHYTNIPTYTHVPHTDIHTRHTDIHTTCTCIHTHTHTQT	27136	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266_36330_36486_36600_38975_39092_39506
518818	SIRV6	+	354	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	340	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCGTAGGTATGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2023_2470
518819	contig_13894_pilon	+	1474	10	Intergenic	novelGene_62092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	2545.565473573	36	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	666	1421	523580	528117	FALSE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
518820	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518821	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518822	contig_14638_pilon	-	2208	5	Intergenic	novelGene_71556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	1180	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	10	GTGGTGTGTTCTTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
518823	contig_3077_pilon	+	1587	9	Intergenic	novelGene_26671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_8	3201.29629017684	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	55	1089	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9621	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
518824	contig_3424_pilon	+	2495	3	Intergenic	novelGene_55490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	204.5	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	282	2366	163695	170678	FALSE	15	CATCTCTTAGTCCCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQGGAVGGQPYGPQLRPDGEAVAYSCSAVASVSVWGLQQGPGVGGNTSDTEPKKLAFESGNKQGIRVRPGFPSRLCAENASRSVHLSEAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	150048	170807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150317_163681_163803_168701
518826	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518828	SIRV6	+	676	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1496	298	67	-163	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGGTGACGTTTACGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	11527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518829	SIRV6	+	566	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8710	-11	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518830	SIRV6	+	638	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTCTTCGGTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518831	SIRV6	+	795	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	214	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	261	593	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1517	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1728_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518832	contig_5018_pilon	-	1703	8	Intergenic	novelGene_47084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	466.870038290166	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	258	1145	1401907	1399645	FALSE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402347	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260
518833	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518834	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518836	contig_10496_pilon	-	2555	11	Intergenic	novelGene_59409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	111.060388978249	629	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	49	1071	64679	47968	TRUE	15	CATGCTATGTATCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIAEI	64727	37980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_47979_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
518837	contig_11285_pilon	+	1969	14	Intergenic	novelGene_5563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	514.487025500434	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	46	1833	766060	769878	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763512	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740_769946_770125
518838	contig_11752_pilon	+	1852	9	Intergenic	novelGene_37579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1375.71288338083	9	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	541	1569	87165	105616	FALSE	45	GAAATATAAAGATGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85248_86949_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
518840	contig_5967_pilon	-	2160	9	Intergenic	novelGene_44353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	432.468622416702	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	102	797	488569	388910	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGSQNLSRTDIELGEIDFVKINLRNSLYINSRKEMSMMCVPSVWMNMKMETSSESFPVPTLITASV	517603	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
518841	SIRV6	+	782	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	581	337	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518842	SIRV6	+	583	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1414	473	-15	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATTTGTGAACGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	11352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518843	contig_12427_pilon	-	2168	6	Intergenic	novelGene_40536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1195.94287488993	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	221	808	522337	506035	FALSE	20	AGATCATCTGATTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578172	504674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507917_510421_510617_520312_520440_522284_522346_577960
518844	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28170	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518846	contig_4364_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	9963	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	32	466	1530940	1531735	FALSE	20	CACTGTCCCCATCTACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVT	1530908	1531737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096_1531337_1531618
518847	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	210	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518849	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_10636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518850	SIRV6	+	939	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	75	514	25	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	30	GAAATTGGCGATGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518851	contig_15063_pilon	+	1471	6	Intergenic	novelGene_14303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	332	1216	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34827	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518852	contig_2310_pilon	-	3004	11	Intergenic	novelGene_71607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGGCGAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129356	106071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118168_118358_118428_122874_123052_124479_124635_126506_126679_127455
518853	contig_15063_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_13221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	791	1114	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36790	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518854	contig_15063_pilon	+	1779	7	Intergenic	novelGene_8463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	293	1528	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26303	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518855	SIRV6	+	1063	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1399	8	14	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2486	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518858	contig_2204_pilon	+	1963	7	Intergenic	novelGene_71667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	10	GGGCATCATGCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
518859	contig_15063_pilon	+	1394	7	Intergenic	novelGene_10196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2157.90683688306	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	590	1141	36064	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35078_35872_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518860	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518861	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518862	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518864	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_12314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	772	1095	35891	35108	TRUE	30	CACAATGGTAGAATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36774	28152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36153_36264
518865	contig_15063_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_9494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34912_35025_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
518866	SIRV6	+	785	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	549	582	333	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	24	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	97	588	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1636	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518867	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	28	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518868	contig_15063_pilon	+	1579	5	Intergenic	novelGene_13694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3962.28023838547	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	202	1347	34808	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_39506
518869	SIRV6	-	354	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTATGGTGAGTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11713	11359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
518870	SIRV6	+	441	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-1	8819	-1	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTTCGTCTTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518872	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518873	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518874	SIRV6	+	840	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	109	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTAGATTGCGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	11077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10805_11031
518875	contig_12357_pilon	+	2071	11	Intergenic	novelGene_6095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	814.254407418222	4	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	117	1253	26079	52776	TRUE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSQELP	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46542_52759_52844_53169
518876	contig_15063_pilon	+	1630	8	Intergenic	novelGene_10593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3472.70309936316	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	234	1262	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYHIHLHRGPRGPVPPGDREDRGQVHWGK	27135	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36431_36525_36600_38977_39092_39506
518877	contig_18108_pilon	-	2645	19	Intergenic	novelGene_33495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_16	335.35188815465	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	235	2430	297156	266909	FALSE	20	AAGTGTGCCTCAGTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335421	266693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_298632_298709_316667_316759_335363
518878	contig_5954_pilon	-	2796	8	Intergenic	novelGene_28758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	5	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	124	834	1462068	1392942	TRUE	15	TAATGGTGGTGTCACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462191	1390851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391083_1391210_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
518879	SIRV6	+	560	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8716	-11	75	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGGTGAGTGTGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518880	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518881	contig_6735_pilon	+	2420	3	Intergenic	novelGene_15653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAACCCACTCAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541640	545516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_543291_543787_543896_544854
518883	contig_10902_pilon	+	3006	10	Intergenic	novelGene_65665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	470.816417264131	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	44	1096	79192	110079	TRUE	20	GTGTCCTTTTGATGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDLSKTAVDGTSENPFLDNPDAFYYFPDSGFFCEENSSDDDVILKEEFRGIIIKQGCLLKQGHRRKNWKVRKFVLREDPAYLHYYDPAGGEEPLGAIHLRGCVVTSVESNSDGKKSDEENLFEIITADEVHYFLEAATSKERIEWIKAIQLASRTGK	79148	112043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102_100288_102136_102242_107118_107203_108075_108146_109942_110417_110470
518884	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518885	contig_3956_pilon	+	2224	12	Intergenic	novelGene_15127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1402.56413356407	3	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	111	1481	1282731	1289861	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCLS	1281611	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287323_1289846_1289892_1290297
518886	SIRV6	+	778	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	111	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	102	309	340	648	2021	10736	TRUE	35	AGTAGATTGCGTTCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGDLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2625_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518887	contig_3424_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_55504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	547	1644	335	1978	169035	170678	NA	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	168700	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_168700_170900
518888	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518889	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
518891	SIRV5	+	325	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-35	915	-35	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGTCGGAGACCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8280	10951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
518892	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_12853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2996.89670974642	3	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	237	1466	34808	39515	FALSE	25	TGTATATATTCTCCTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35845_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518893	contig_15063_pilon	-	1523	5	Intergenic	novelGene_11498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518894	contig_1532_pilon	-	1848	7	Intergenic	novelGene_37425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	1227.72060701484	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	70	1107	32217	13113	FALSE	45	AAAGGTAATAATGAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
518895	SIRV6	+	457	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	170	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTAGGACGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2470
518897	SIRV6	+	476	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	355	8710	182	81	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518899	contig_10861_pilon	-	2421	3	Intergenic	novelGene_39286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1334	junction_2	248	1510	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	397	819	1355171	1354749	FALSE	10	CCCCAGTGGTTTGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERYNIPVPQSRNVSKNQQQLNRQKTKDQNSQMKIVHKKKERGHGYNSPAVAWQAMQNGGKNKVHFPNNQNWNSSLSSPSLLFKSQTNQNYAGAKFSEPPSPSVLPKPPSHWVPVSFNPSDKEIMTFQLKTLLKVQV	1356821	1353146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355190_1355520_1355727_1356649
518900	contig_16666_pilon	-	2629	3	Intergenic	novelGene_61756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	270.5	7	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCATACCTTGTCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59709	55101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098
518901	contig_15063_pilon	-	1427	5	Intergenic	novelGene_8671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	685	1008	35891	35108	TRUE	40	GTAGGCAAAAACGCAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36684	26756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26785_34607_34925_35033_35380_35839_36156_36264
518902	contig_12790_pilon	+	2118	10	Intergenic	novelGene_35228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_9	222.212333113296	2548	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	210	1190	307252	312473	FALSE	25	CAGATTCTGATGGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305934	313401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
518903	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_14098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518904	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518907	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518908	contig_3948_pilon	-	2451	7	Intergenic	novelGene_53197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	295.102618686374	13	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	70	786	866476	840803	FALSE	20	TGTCATGTCTTCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869637	839137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856680_866413_866480_869571
518909	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10381	108	1144	28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCAAAGTCTAAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11381	11718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
518911	contig_18145_pilon	+	2916	18	Intergenic	novelGene_37348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	487.836988486564	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	310	2010	90771	98857	TRUE	20	ATGGAGTCTGAGTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFLSTSHFLMRSPVLPSSRPICASPQLPRMLIWNSWLR	86714	101264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86906_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98261_98459_98541_98826_98983_100326_100482_100638
518912	contig_500_pilon	+	1679	11	Intergenic	novelGene_31053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	986.181124337715	46	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	287	1264	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485776	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
518913	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518914	contig_12873_pilon	+	1733	5	Intergenic	novelGene_27189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	873.220762465025	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	741	1169	17896	19860	FALSE	35	TTTAAGCCAAATTTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWASISVLIQLI	15998	20424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19828
518915	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28170	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518916	contig_6593_pilon	+	3342	15	Intergenic	novelGene_49839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	901.600300599338	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	110	1567	1180836	1277500	FALSE	30	ATCATTCTTGGCCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPRQASFFPPPVPNPFVQQTHIGTASRLRIFLLGIILLPIRALLVALILLLAWPFAAISTACCPEKLTHPITGWRRKVTEPALKFLGRALFFSMGFIVTVKGKIASPLEAPIFVVAPHSTFFDGIACVIAGLPSMVSRNENAQVPLMGRLLRAVQPVLVSRVDPDSRKTTINEIIKRATSRGEWPQILVFPEGTCTNRSCLITFKPGAFIPGVPVQPILLRYPNKLDTVTWTWQGYTFIQLCVLTFCQPFTKVEVEFLPVQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRNHDGSIDFREYVIGLAVLCNPANTEEIIQVAFKLFDVDEDGYITEEEFSTILQASLGVPALDVSGLFKEIAQGDSVSYEEVRATPSIASNKVSPENHEESTSDKKDD	1180670	1279275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1180772_1180827_1180926_1191011_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1198315_1198377_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277411
518917	contig_13894_pilon	+	1156	9	Intergenic	novelGene_62149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	45	1100	521729	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521684	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
518918	contig_5643_pilon	+	2180	16	Intergenic	novelGene_39043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	732.665332118894	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	692	1972	634983	641217	TRUE	10	GTCATTGTGTGTGTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631208	641594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631799_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
518919	contig_3956_pilon	+	1762	11	Intergenic	novelGene_15254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1193.07704696721	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	13	1617	1284838	1290665	FALSE	50	ATTTAAAATTAACGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRAARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1284825	1290810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289811_1290597
518920	contig_15063_pilon	+	1382	4	Intergenic	novelGene_14230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	68	1240	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34740	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518922	contig_177_pilon	+	2383	3	Intergenic	novelGene_41809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	93	980	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415638	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418215_418403
518923	contig_3424_pilon	-	2487	2	Intergenic	novelGene_55489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	571	873	170359	170057	TRUE	15	ACTCACGGCTCCCGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRLLMSCSDAALWGRAVRQFLRRSRVCRDRLPPNLGKLDKEFPDRSKSLRFPNPEKSNSMKLELRPTFLRDRTRNVGAICWRGAMLAFRIPQLLDRSK	170929	149996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_150255_168700
518924	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	202	1041	34808	36333	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36274
518927	contig_5954_pilon	-	2484	16	Intergenic	novelGene_28667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	457.500669094836	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	790	2127	956150	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960550	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956413_956500_956705_956940_959766_959941_960121_960201_960474
518928	contig_4730_pilon	+	3807	4	Intergenic	novelGene_71702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	500.022888365012	1666	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	51	572	118565	123105	FALSE	25	TCAGACCATGGTGAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNEDKPIAPCGAIANSMFNDTLELFLIGNDSDPMAIPLKKKGIAWWTDKNVKFRNPPGEESLEERFKVYALDSEADNNGFINEDFIVWMRTAALPTFRKLYRLIERKDDLHPTLPAGRYYLNITYNYPVHSFDGRKRMILSTISWMGGKNPFLGIAYITIGSISFLLGVVLLVINHKYRNSSNTADITI	118514	126340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_118575_119487_119632_120325_120500_122911
518929	contig_5280_pilon	+	2740	9	Intergenic	novelGene_52602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	762.497694668646	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	22	1191	38343	60670	TRUE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGSPGCAMIKSSPANQKVSSSNLPAPPWKPYGAVLLCRIGLL	38321	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_60545_60758_78042
518930	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518931	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518933	contig_12357_pilon	+	1725	9	Intergenic	novelGene_6100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	797.520522855055	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	305	1039	34261	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27547_34257_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
518934	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	220	1395	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518935	contig_6980_pilon	+	1792	10	Intergenic	novelGene_36007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	120	1016	356720	372790	TRUE	20	ACTGTTACTGTGTCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346063	373884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_373487_373804
518937	contig_15063_pilon	-	1449	4	Intergenic	novelGene_13130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	737	1060	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36736	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
518938	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518939	contig_709_pilon	-	2920	8	Intergenic	novelGene_57593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	109.037158990944	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	9	1220	2349986	2326707	FALSE	20	TAGTATTGTCTTAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASISGYTFSAVCFHSANSNADHEGFLLGEVRQEETFSISDSQISNTEFLQVIVFMTTQAKLMKKVWTGFLKIGERKLLGGTDFGRNTQQQMSYREQVIHKQLTRLLGAPDLVFLLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQITQRKNEKEQERRMQQAMLSRPVPSENLESGFSPRMPYSAFAAEGRSTLGDAEASDPPPPYSDFHPNNQESTLSHSRMESSVFMPRPQAVGSSNYASTSTGLKYPAGGADLPPSQRAAGDSGDESDDSDYENLIDPTEPSNSECPHSRDSRPVTHPDGDSRDTQTSQI	2349994	2325006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2327177_2329518_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200_2334393_2337517_2337585_2345847_2345939_2349914
518940	SIRV6	+	469	5	NNC	SIRV6A	novel	1163	5	NA	NA	-381	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1904	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2477_2621_2737_2829_3106_3165_10727
518941	contig_233_pilon	-	2586	15	Intergenic	novelGene_14562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1272.17058604576	4	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	941	2146	99790	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126988	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_93992_94725_94914_98310_98438_99779_99831_101692_101759_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
518942	contig_8330_pilon	-	3580	7	Intergenic	novelGene_71974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	347	junction_6	216.67749972918	615	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	352	1056	2056084	2038853	FALSE	40	CATTCTTTGAACTAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056546	2036328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056297
518943	SIRV6	+	534	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-440	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1845	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2823_3106_3165_10721
518944	contig_15063_pilon	+	1662	7	Intergenic	novelGene_9647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	240	1367	34808	38994	TRUE	10	TCCCAAGTGCTGCTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27129	39704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
518945	contig_8435_pilon	+	2548	5	Intergenic	novelGene_72006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	64.5387480510739	645	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	790	2478	94334	97944	FALSE	5	CTGTGAGCTGCTTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	90953	98014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_95334_96398_96685_97030_97164_97674
518946	contig_7594_pilon	+	3253	6	Intergenic	novelGene_55437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	772.385758542971	21	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2221	2631	551134	554556	FALSE	15	TAGTGTTTTGTGATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFICILNQCFNFTVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	539072	555178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_551292_552953_553000_554349
518947	contig_1244_pilon	-	1894	12	Intergenic	novelGene_37991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_11	825.441079185311	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	197	1468	946523	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947234	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947134
518948	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518949	contig_6364_pilon	-	4614	2	Intergenic	novelGene_51738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1741	junction_1	0	120	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521182	486324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_490802_521045
518950	SIRV6	+	691	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	765	570	-433	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	150	482	2002	10736	TRUE	30	TATGACACGAACTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1852	11255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518951	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518954	contig_5643_pilon	+	2082	16	Intergenic	novelGene_39006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	764.669933151989	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	661	1482	634983	640255	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNVRCPELPRPDQPAAGKFASRGAHHCALQRGHWPHRHHHRH	631188	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637905_638120_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
518955	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518956	contig_4754_pilon	+	2192	16	Intergenic	novelGene_35956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	158.362958631956	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	36	1388	380119	415778	TRUE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDSPPSWSWPRTPSGGCGWPSLSTCPCWLDSWGWSSLMRSSTPCAWPGWWIMSMPSVRRPPAT	380083	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414487_414532_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
518957	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	221	685	34808	35851	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLQ	27148	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35846_36158_36266
518958	contig_5988_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_15928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.91395240807	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	95	1339	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655553	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653660_653773_655456
518959	SIRV3	+	361	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5892	55	3833	-53	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATTAAGCATGCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7836	8884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
518962	SIRV6	+	661	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
518963	contig_12622_pilon	-	2072	12	Intergenic	novelGene_5998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2269.10010560491	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	34	915	1590968	1588027	TRUE	35	TGTTGGAATATTTCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1591001	1583588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586364_1586630_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1588999_1589531_1589691_1590000_1590234_1590830
518964	SIRV6	+	634	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	251	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCGTCTTCGGTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
518965	contig_7357_pilon	+	2279	10	Intergenic	novelGene_36816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1301	1678	139801	154908	TRUE	20	CGCAACCAGCCCCCACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135548	167083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136314_136415_136565_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_154860_155083_159916_160035_166774
518966	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518970	contig_15219_pilon	+	2104	8	Intergenic	novelGene_40824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_7	239.180659241298	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	118	714	19617	23538	TRUE	80	CATCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVSDDLSSMSSYHKAT	19499	25920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23910_24130_24314_24453_24588_25218
518971	contig_15063_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_10601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	233	1231	34808	36484	FALSE	25	AGCATCCTGAACGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTY	27136	36484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
518972	SIRV6	+	804	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	513	-10	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
518973	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_10238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
518974	SIRV6	+	1078	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	448	2	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	ATTGGCATCGCGCGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518975	contig_9113_pilon	-	2348	5	Intergenic	novelGene_68590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	651.758774394331	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	489	1736	348515	347268	FALSE	25	TGACTGGCACAGACTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364445	346655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364255
518976	contig_17427_pilon	-	2545	13	Intergenic	novelGene_30361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	29	1453	188879	178046	FALSE	10	ACTTGCTTCGTTGTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204689	176953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
518979	contig_11720_pilon	+	2059	16	Intergenic	novelGene_43924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	358.392857071678	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	16	1803	262271	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTHLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGEGVKFKMGQKRIPRQTLQRLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262255	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264105_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
518981	contig_7119_pilon	+	2335	4	Intergenic	novelGene_40938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	148	1302	137033	139798	TRUE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127510	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140738_140854
518982	SIRV6	+	777	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	190	135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	39	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	132	623	1733	10736	TRUE	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1493	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518983	contig_12427_pilon	-	2173	6	Intergenic	novelGene_40534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	466	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	190	813	522337	506035	FALSE	20	AGATCATCTGATTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578141	504674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
518984	SIRV6	+	568	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	795	223	-360	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	77	409	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1925	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
518985	SIRV6	+	1539	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-13	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	787	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518986	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518988	contig_3948_pilon	+	2159	14	Intergenic	novelGene_53297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	530	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1376	1747	1485692	1491198	TRUE	10	CCGCTGAACCGCTCGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHRVPVLGVVVTHGQRVAAFGGLTVSDHEGAQHIARGQEVTFRILPADALEEPLFCLQRVNMGDIVARDIAFFLGGQGSSPPPFPRLFQDHHLVPLLEAEVFAVNGLIIIQGDHDDVLRNCL	1467918	1510951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468447_1471755_1471948_1473199_1473354_1482576_1482656_1483426_1483605_1485096_1485250_1485600_1485750_1485882_1485986_1489827_1489927_1490736_1490842_1491191_1491234_1494195_1494313_1494783_1494861_1510768
518989	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_12782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	35	ACCGTAGTAATCACAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	28163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
518990	SIRV6	+	1529	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	-13	12	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
518991	contig_6980_pilon	+	1825	8	Intergenic	novelGene_36027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	573.535508571036	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	93	761	356720	372818	FALSE	20	AGACTGTTACTGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFMFNKSQVTMET	346090	373882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370526_372784
518992	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518993	contig_15063_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_13866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	TAACCATGTCTGTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518995	SIRV6	+	555	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-24	8728	-18	63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTATTGCCCGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	2603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
518996	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	54	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518997	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
518998	contig_15063_pilon	+	1314	5	Intergenic	novelGene_8925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	440	1183	35349	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35269_35380_35839_36158_36266
518999	contig_6735_pilon	-	1998	14	Intergenic	novelGene_15796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	80	1576	564868	542464	FALSE	10	ATCTTCTCTGTGCCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	542041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
519000	SIRV6	+	634	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8540	8	251	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCGTCTTCGGTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
519001	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519002	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	232	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36149_36266
519003	contig_8317_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_19264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10612	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	37	357	14294	15097	FALSE	25	ATTTGAAGCTGGTATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIITFSFKG	14257	15133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14883_15072
519004	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_8544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26346	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519005	contig_3956_pilon	+	2632	13	Intergenic	novelGene_15153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1415.17736422762	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	47	1825	1281682	1289798	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKGAAKSLSLPDSVQSKWSVVSMVS	1281635	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284060_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1289726_1289892_1290297
519006	contig_9609_pilon	+	862	4	Intergenic	novelGene_23034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.237616458973	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	148	348	331619	332820	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRCPGQASTALRSAQEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	329899	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_329946_331440_331487_331563_331694_332694
519007	SIRV6	+	374	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	10	64	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATGCAAGCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
519008	contig_13021_pilon	+	2310	13	Intergenic	novelGene_8185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	163	2013	174676	180850	FALSE	40	ACTGAATTAAGTGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174513	181147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
519009	SIRV6	+	992	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	506	-7	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519010	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519011	contig_8452_pilon	-	2710	17	Intergenic	novelGene_47974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	328.094308088391	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	128	2092	145829	75102	FALSE	15	GTCTTCCTTGCATCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESIIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	145956	74483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101043_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
519012	SIRV6	+	649	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	835	542	-363	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	80	412	2002	10736	TRUE	25	CTGCCTAATTGTTGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1922	11283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519013	contig_15063_pilon	+	1502	5	Intergenic	novelGene_13008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	209	1381	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28822	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28830_34606_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519014	SIRV6	+	963	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	539	-11	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	215	27	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519015	contig_12837_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_57300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGTACGGTGGCGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128571	129139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128600_129100
519016	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519017	SIRV6	+	615	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2614_2737
519018	contig_5988_pilon	-	2253	4	Intergenic	novelGene_15912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	874.727513127501	18	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1210	1662	652414	651962	FALSE	35	CTGATAAGGTGAAAGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655541	651370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652523_652628_653422_653549_653773_655456
519019	contig_9609_pilon	+	2182	10	Intergenic	novelGene_23064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1001.54984836773	4862	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	117	1166	449884	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSSGCTQKKLTWKGVPVESEQRPEGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYSATLDSVQGQPGSALGCWGWPPGDKAAPSPRPIPQAGGKLSQGFLIYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	441927	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_442006_449845_449889_450162_450305_450479_450641_452724_452863_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
519020	contig_7207_pilon	-	4149	5	Intergenic	novelGene_72086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_4	198.988064968731	74	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	430	1287	696514	675638	FALSE	35	ACTGTCAAGAAGACTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGMNFFYKLNCSFPSQLYTFGQQICFP	757985	672775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_757787
519021	contig_5954_pilon	-	2443	15	Intergenic	novelGene_28652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	413.391825052707	5	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	633	2084	956264	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959806_959941_960474
519022	contig_11720_pilon	+	2373	14	Intergenic	novelGene_43967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	338.637733858617	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	765	2132	264322	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262266	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262828_263052_263872_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
519023	contig_7707_pilon	+	3116	17	Intergenic	novelGene_72149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	313.033488374247	25	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	775	2976	233929	280854	FALSE	10	CCTCTTATATGTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPIKENQKKVKEEFKNKYFSNGPKKKNLVPEEATLTITKSQRISRRPSNWWEVTSEHSPVGSSSSLIKNELPLHHKSRQKLAEKNQSSKNTRRETTAFKRRKTATQGSSRAQTFLNAKDSGGIIDHDEISSSQNESLESDEANLAKKKHLDCSGATGSSQNQHSSDSISTEQNVRLKSQTSGYTWKKGSDSKKLGTSVLEGSGPSKLQKYMMSGKNNSDMGRKEAQESSVLPSNTPNVRRTKRTRLKPLEYWRGERIDYQASQSGGFVVGGVLSPDTVSPRGKKANRKTGKVNKITNKKRICHDSGERKNKLVANLNIPLGDPFQPTRVKDPETRESILMDLVRPRDTYQFFVEHEELRVYKTLDTPFFSTGKLILGPCQEKGKQHVGLDTLVFYVDFGDLLCTLHETPYLITTGDSFYVPSGNYYNIKNLLNEESVLLFTQIKR	182715	280994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_200052_200124_200805_200901_213078_213179_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626_240822_247976_248266_254333_254478_256572_256656_269222_269328_270102_270235_270865_270962_272829_272985_278604_278696_280783
519024	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_11199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	232	1068	34808	36333	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27137	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36150_36266_36600_38975_39092_39506
519027	contig_19564_pilon	-	2217	4	Intergenic	novelGene_29595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	32	1357	14420	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATAAAVRLLVPRPFFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	14451	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_14372
519028	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_9736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519029	SIRV6	+	722	7	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	1020	3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
519030	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	37	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519031	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_11480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	8	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519033	contig_9653_pilon	+	3327	10	Intergenic	novelGene_48282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	134	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACCTGGAAAAACCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005012	1018918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1007196_1007813_1007912_1009487_1009545_1013651_1013684_1014126_1014247_1015777_1016035_1016594_1016781_1017927_1018027_1018133_1018285_1018774
519034	contig_15063_pilon	+	1491	7	Intergenic	novelGene_12422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	9	1481	28164	39515	FALSE	40	GAAAAATGTCTGAGATCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519035	SIRV6	+	723	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	129	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	160	483	93	575	1733	10736	TRUE	45	AGAAATTTAAAGTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLRAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2024_2470_2615_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519036	contig_15063_pilon	+	1439	6	Intergenic	novelGene_12599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	5	1270	28164	36632	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28159	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
519037	contig_987_pilon	+	2760	6	Intergenic	novelGene_72338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	475.962351452297	1260	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	616	1887	1286769	1304627	FALSE	15	CCTAAGGTGGTGTACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTEGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNINRPLTMKKEGIQTRNRKMSSKSKKCKKVHDTLEDFPKSSSFNPAALSRHMSSLSHISPFSHSSHMLTTPTPMHPPSSLSFGPHHPSSMVTAMG	1285702	1305500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1285917_1286367_1287010_1289513_1289988_1295465_1295612_1300073_1300200_1304342
519038	contig_15063_pilon	+	1414	6	Intergenic	novelGene_10103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	238	1272	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35115_35252_35380_35839_36158_36266
519040	SIRV6	+	725	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	349	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2625_2745_2829_3106_3165_10724_10819_11034
519041	contig_11448_pilon	+	3985	4	Intergenic	novelGene_66335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	11.0453610171873	506	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	147	491	112239	129156	TRUE	20	TTTCACTCATTTATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLFLIWAQGLRQAPLPASGAVVGRIVTAGNISAEEGDSVTLQCHLTSTMATVTQVSWERLDQTLAIHHAELGWYIKPCFQERVVPGPGLGLTLQLLTTNDTGEYFCIYHTFPDGIYRERLFLAVLGSSVTEHHPGFQTPLVWSCGRSAGGHLHSSHRGGRMG	110232	135788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_110290_112149_112480_129052_129161_132298
519044	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519045	contig_10134_pilon	-	2387	4	Intergenic	novelGene_16201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	3	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	390	1016	39335	33552	FALSE	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNEYSHKRSAGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSDWLLLQTPHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQGPANSPFFLFWYQITFILVMGLLFTVDTGLYLSLQRDLQSLMGNRNNYNVTWSKSPQDK	39724	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38721_39304
519047	contig_15063_pilon	-	1465	5	Intergenic	novelGene_9158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	714	1037	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36713	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34609_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519048	SIRV6	+	902	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	36	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	411	743	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519049	contig_10011_pilon	+	3109	10	Intergenic	novelGene_68086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_8	75.8953145156676	180	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	69	2078	322928	333031	TRUE	40	TTAGAAAATTTGGTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322859	334208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
519050	contig_15063_pilon	-	1509	4	Intergenic	novelGene_13260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519051	contig_15063_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_12324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	12	1424	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
519052	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	21	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	226	1461	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519053	contig_8452_pilon	-	2644	18	Intergenic	novelGene_47976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	318.317799460362	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	472	2028	116486	75102	FALSE	20	ATGTCTTCCTTGCATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	145992	74485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658_145713_145839
519054	contig_8550_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_72367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAGGGAAATAAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160165	162019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_160200_162000
519055	contig_8616_pilon	+	1336	9	Intergenic	novelGene_72592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_2	648.64684873589	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	308	1261	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426928	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
519056	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519057	contig_2027_pilon	+	2972	22	Intergenic	novelGene_39893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	404.046123408293	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	204	2777	122795	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDGMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117783	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126341_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
519058	contig_17936_pilon	+	2183	11	Intergenic	novelGene_29936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	41	1324	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50605	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
519059	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	248	1483	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519060	contig_15063_pilon	+	1494	5	Intergenic	novelGene_12164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	TGGGTGAGAAGTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519061	contig_6898_pilon	+	2663	12	Intergenic	novelGene_35725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2099.73825602184	2	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	103	1656	59668	126699	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESLGCCFSSWDMSSPVLPKSPPARMIGTGTQKPSQPHSGIFSKREEMFTPGFSIFPAKGPPDHFPHQSYLGHSSCFSTI	59565	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124439_126464
519062	contig_14034_pilon	+	3015	8	Intergenic	novelGene_72660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	112.050644526373	279	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	433	1059	337852	407151	FALSE	35	AATATGGCAGATGGGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGGDFGNPLRKFKLVFLGEQSVGKTSLITRFMYDSFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSAAAVVVYDITNVNSFQQTTKWIDDVRTERGSDVIIMLVGNKTDLADKRQVSIEEGERKAKELNVMFIETSAKAGYNVKQLFRRVAAALPGMESTQDRSREDMIDIKLEKPQEQPVSEGGCSC	337419	409107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_337922_377287_377347_387756_387811_389248_389355_391385_391498_404226_404321_406464_406532_407086
519063	SIRV6	+	528	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	554	8167	381	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
519064	contig_12638_pilon	+	2658	17	Intergenic	novelGene_33102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	563.522501214459	3	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	281	1558	171697	198769	TRUE	45	CTCAAATAAAATTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDIDIEAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQN	170803	200451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198115_198762_198843_199335_199415_199503
519065	contig_8691_pilon	+	2969	3	Intergenic	novelGene_72681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1355.5	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	22	1344	17110	20695	TRUE	30	TGCTCATATAGAGAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLANLCWLSSVVLAAQSFLVVANNETEEVRDEAVKDACSVRLESRGKCEEGGECPFQVSLPPLTLQLPKQFGRIEEVFKEVQNLKEIVNNLKKCCQDCKLQADDNRDRGTNGRLVPGTGALGEAADNRVRELESDVNKLSSDLKNAKEEIDGLHGRLEKMNLVNMNNIENYVDSKMANLTFVVNSLDGKCSSKCPSQEQIQSRPVQHLIYKDCSDYHTIGKRSSETYRVTPDPKNSSFEVYCDMETMGGGWTVLQGRLDGSTNFNRTWQDYKVGFGNLRREFWLGNDKIHLLTKSKEMILRIDLEDFNGVKLYALYDHFYVANEFLKYRIHIGNYNGTAGDALHFSKHYNHDMKFFTTPDRDNDRYPSGNCGLFYSSGWWFDACISANLNGKYYHQKYRGVRNGIFWGTWPGMNETHPGGYKSSFKEAKMMMRPKHFKP	17088	22494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_17726_19988_21330_21503
519066	contig_8045_pilon	+	1576	5	Intergenic	novelGene_35359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1322.97439506591	17	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	27	371	116067	117928	TRUE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKLFIFFLAVCQFKQLAYWHPSF	116040	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_117863_118243_118527
519067	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_9310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	262	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519068	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519069	contig_13021_pilon	-	2307	13	Intergenic	novelGene_8176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTGCCGGCCGCCTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181137	174508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
519070	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519072	contig_15063_pilon	-	1517	4	Intergenic	novelGene_13261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	805	1128	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36164_36264
519073	SIRV6	+	469	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10304	53	1067	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11304	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
519074	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519075	contig_10176_pilon	-	2288	11	Intergenic	novelGene_72719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	250.892825724452	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	TRUE	45	AAACAAATTGGTACATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	259237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_260160_261011_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
519078	contig_233_pilon	-	2339	16	Intergenic	novelGene_14671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1536.80941636308	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	309	1922	108522	91657	TRUE	45	CTTGAAGAAGACAACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	126956	78572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108684_108814_109914_109976_126898
519079	contig_14184_pilon	-	1412	5	Intergenic	novelGene_66596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	501.554334045674	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	331	828	105839	89812	FALSE	20	GGGCAGAGTGCAGAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEAEPIELVESAGDEIVDLTCESLEPVVVDLTHNDSVVWPPSPSFLLALSPRDSPWAVIEQVCLGFLGPATSHHSHPPVSQSAHYTATKPNTAHLAEGPSCKSGPGPGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126326	89227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90190_103421_103502_105799_105915_109168_109327_126229
519081	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	191	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519082	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519083	contig_16703_pilon	+	2388	2	Intergenic	novelGene_72790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGAACACCGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42442	44878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42607_42654
519085	contig_12790_pilon	+	2681	9	Intergenic	novelGene_35250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_8	232.802457837111	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1098	1826	309644	312473	FALSE	30	AGTTTAATTGTTTATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	306035	313328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
519086	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_12979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3739.8486340433	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	224	1465	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28177	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38969_39092_39506
519087	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519088	SIRV6	+	711	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	368	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	2	334	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1671	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519089	contig_7151_pilon	-	2579	14	Intergenic	novelGene_40655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	127.979242029841	17	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	809	2430	45	2474	65162	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65206	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5243_6208_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
519091	SIRV6	+	486	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCTTGAAGCAATCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1531_1640_1736_1845_2027_2470
519095	contig_11285_pilon	-	1380	6	Intergenic	novelGene_5650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1378	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	888	491	1378	769622	768043	FALSE	25	CGGAGCAGCAGATGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHRYLGKRAAAPGPCREAAARVAIRAAHLRIAFHLLHCVRGQLGEEVCGILLGEALTLDQVAHSVLGAAVQV	770200	768040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_768147_768426_768531_768611_768855_769083_769320_769421_769649_769736
519097	contig_16622_pilon	-	2223	7	Intergenic	novelGene_48415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	706.955306618145	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121936	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_118811_118884_121330
519098	contig_15063_pilon	+	1506	5	Intergenic	novelGene_12961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28172	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519099	contig_13608_pilon	-	2635	17	Intergenic	novelGene_52371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_15	121.869743476385	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	124	2055	470234	369353	FALSE	35	AACAGCAAAATGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470357	368772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_466411_466478_470191
519101	SIRV6	+	665	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10827_11031
519102	contig_1230_pilon	+	2238	9	Intergenic	novelGene_28866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1280.61838090041	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	768	2000	406520	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404470	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406284_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
519104	SIRV6	+	912	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	19	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	189	680	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1156	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
519106	SIRV6	+	580	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	338	8503	165	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
519107	scaffold_12124_pilon	+	2086	10	Intergenic	novelGene_22065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	432.162720840138	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	30	587	836073	846649	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGPGLGCGMVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSL	836043	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857936_858329
519108	contig_15063_pilon	+	1445	5	Intergenic	novelGene_9058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	243	1301	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35285_35858_36158_36266
519109	contig_7840_pilon	+	2199	12	Intergenic	novelGene_68960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	420.453513512247	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	207	1712	238014	304863	FALSE	40	AAAGCCAAAATCTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQANGTDSAFHVLAAKPAHTALAPVAMPVRETNPWANAPDAANKEIAAIYSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVRVGVEVKGTKGTLLS	130636	305350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_303007_303155_304059_304306_304816
519110	SIRV6	+	557	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-431	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2025_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724
519111	contig_10734_pilon	-	1929	5	Intergenic	novelGene_51015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	96	701	320632	311551	TRUE	35	TAAAAACAGCCTTAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320727	310161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311057_311217_311676_315844_315953_318838_319032_320452
519112	contig_10496_pilon	-	2580	11	Intergenic	novelGene_59413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	110.059256766526	642	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	346	1818	55665	38747	FALSE	15	GTTGCATGCTATGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64723	37984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56259_64482_64573_64672
519113	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519114	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519116	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28165	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519117	contig_7119_pilon	+	2430	4	Intergenic	novelGene_40922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	173	1327	137033	139798	TRUE	25	TGATGGCTGAATCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127485	140950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140675_140723
519119	contig_15063_pilon	+	1422	6	Intergenic	novelGene_13696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	202	1167	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_38975_39092_39506
519120	contig_15063_pilon	-	1604	7	Intergenic	novelGene_11433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39686	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35379_35871_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519122	contig_15063_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_11150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	798	1121	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27182_34633_34924_35035_35380_35839_36146_36260
519123	SIRV6	+	585	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8713	4	78	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGAGTGTGGCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
519126	SIRV6	-	456	5	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8561	-123	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGAGCACAACTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	2481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2826_3105_3164_10723_10825_11035
519129	contig_9482_pilon	-	3203	6	Intergenic	novelGene_44293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_5	153.36283774109	2	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2460	2975	1238984	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1242213	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1241040
519130	SIRV6	-	925	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8769	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	28	4	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11316	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1540_1646_1735_1844_2030_2472_2616_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
519132	contig_15063_pilon	+	1352	6	Intergenic	novelGene_11222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2716.51052639227	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	232	672	34808	36299	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKPSLCPQRWPSMHQPST	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35310_36248_36600_38975_39092_39506
519133	contig_15063_pilon	-	1785	7	Intergenic	novelGene_13067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	TCAGTCTAGCTCAGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	32226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_32322_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519134	contig_1225_pilon	+	2455	4	Intergenic	novelGene_44196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300.756084264678	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAACTAGCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252364	276718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_252455_253416_253520_274222_275863_276096
519136	contig_1699_pilon	-	2939	4	Intergenic	novelGene_72834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	999	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGAGGCAGCCTTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126799	115310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_115448_116885_117064_119342_119521_124353
519137	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_14058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	19	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	193	1365	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34615	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519139	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519141	contig_5033_pilon	-	1872	15	Intergenic	novelGene_29045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	24	1598	566787	532125	TRUE	20	TCCACCAGACCTGGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531132_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519142	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519145	contig_6735_pilon	-	2096	14	Intergenic	novelGene_15710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	884.765926989806	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	336	1616	554315	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568282	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564122_564232_564784_564869_568198
519146	SIRV6	+	666	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8514	2	277	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATGCCCTGGTACGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
519148	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519150	contig_3948_pilon	-	2201	13	Intergenic	novelGene_53330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_12	415.474118394342	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1047	1904	1485208	1468245	FALSE	50	AATAAAATATATGGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510949	1467947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
519151	contig_12357_pilon	-	2146	12	Intergenic	novelGene_6113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53929	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30319_30942_31058_34120_34317_35050_35200_42135_42249_46434_46565_51127_51235_52757_52844_53196
519152	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_11273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	792	1115	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36791	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519153	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	27	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519154	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519157	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519159	contig_500_pilon	+	1983	9	Intergenic	novelGene_31064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	985.104658145519	36	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	851	1264	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1491817	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492755_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882
519161	SIRV6	+	523	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-8	43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
519162	contig_20402_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_72843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107367	106482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_-_106500_107400
519163	contig_15063_pilon	-	2125	5	Intergenic	novelGene_14134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.3923048454133	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1338	1757	35527	35108	TRUE	20	TGGAGAAGATTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39764	34630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519164	contig_3588_pilon	+	2424	20	Intergenic	novelGene_72860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	633.509112021169	13	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	433	1122	105570	125597	TRUE	5	TTCTTATTTGGTGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPHFTSSEGPVTPPRPHGWILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKL	84407	141454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_105494_105629_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
519165	contig_5033_pilon	-	2509	15	Intergenic	novelGene_29053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3717.0922096308	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	26	1582	566787	532125	TRUE	30	AAAGTTTCTGTGGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566812	531023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531728_531901_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536519_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547554_547686_566747
519166	contig_17737_pilon	-	2792	7	Intergenic	novelGene_72904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	123.501237060831	960	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	2	895	87502	53442	FALSE	15	CCAACGTGTTCGTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFGLWAAYFELTWLIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYAHKLELMRILTRVNWKVATEFESYSPDSTFHAKKQIPCIVSMLTKELYFNQ	87503	51544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_53672_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_87457
519167	contig_6375_pilon	+	2596	7	Intergenic	novelGene_72927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	247.772521120124	335	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	196	1152	20957	28930	FALSE	25	CTGGCAGTGATGATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16548	30374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_20907_20997_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
519171	contig_15063_pilon	+	1618	7	Intergenic	novelGene_11901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	227	1363	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36524_38998_39092_39506
519172	contig_6576_pilon	-	2090	11	Intergenic	novelGene_42270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	726	junction_8	374.971265565776	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	113	1507	339439	322526	FALSE	15	CTTTATGCCTTTTTATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339551	321942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
519173	contig_6048_pilon	-	3652	16	Intergenic	novelGene_73288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	109.083332060097	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	1593	3308	1985916	1978823	FALSE	25	CCTTGGAATAAAGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGRSLPLSLQADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2006303	1978478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1987061_1987366_1987496_1993750_1993800_2004860_2004938_2006110
519174	SIRV6	+	946	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	564	18	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519175	contig_8581_pilon	-	3546	18	Intergenic	novelGene_22836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	532.972346835508	2	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	67	2289	386058	314549	TRUE	30	CAAAGACTCGAGTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQR	386124	306343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312606_314548_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
519176	SIRV6	+	597	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	249	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGTCGTCTTCGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2737
519177	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	29	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
519178	contig_15063_pilon	+	1694	7	Intergenic	novelGene_12579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3647.79874262091	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	6	1577	28164	39651	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTCLRSEMGPEGVPPTSLGPPRPAFPDHLCCTLYVFLGFEL	28158	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39077_39531
519179	contig_12624_pilon	-	2030	15	Intergenic	novelGene_61046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	914.512708986572	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	179	1669	903621	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903799	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875457_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
519181	contig_8617_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_73441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAAGAAATATGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62424	62038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62400
519182	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	220	735	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35384_35839_36158_36266
519183	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	14	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519185	contig_9440_pilon	-	2621	4	Intergenic	novelGene_59099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	384.950501868602	19	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	93	431	1716626	1705435	TRUE	30	AGAACTGTGGACATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVSSRG	1716718	1698666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705450_1706375_1706549_1716475
519186	contig_8710_pilon	-	2526	16	Intergenic	novelGene_73534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_15	78.7888881054232	1133	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	164	2002	518747	459003	FALSE	20	TTGATTTACTCCTTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	521140	458478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459117_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500_495617_502005_502097_516296_516415_518639_518757_520986
519187	contig_6735_pilon	+	1895	12	Intergenic	novelGene_15788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGGGACAGGAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542000	564870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_542603_542792_542860_543008_543291_543787_543896_544853_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547357_551181_551235_552840_552952_554243_554380_564783
519188	contig_6102_pilon	+	2321	16	Intergenic	novelGene_31874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.293360025771	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	130	921	379418	393075	TRUE	30	ATACTCAAACCAGCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370783	395252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_370896_379400_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
519190	contig_12619_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_73561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAGAGAGGTCATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753548	753151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_753200_753500
519191	contig_15063_pilon	+	1465	4	Intergenic	novelGene_14079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	190	1023	34808	36333	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	34618	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36277
519192	contig_4782_pilon	+	4163	15	Intergenic	novelGene_73606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	49.1679753083078	218	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	263	2002	134610	272820	FALSE	25	ATCATTAGATGGAGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLYIGNLNENAVPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIETLSGKVELHGKLIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETAVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNASQQPRGRRGFGQRGSSRQGSPGSVSKQKTCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGSVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK	134347	274981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_134785_136249_136311_189647_189697_233394_233447_233543_233608_243963_244246_249350_249486_250936_251060_257041_257178_258860_258987_267533_267651_271124_271200_271532_271665_272303_272418_272721
519193	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_11931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519194	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519195	contig_15720_pilon	-	2437	4	Intergenic	novelGene_41923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2176.9068780165	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1406	1846	281554	279615	FALSE	10	CTGGTCTGCTGATGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIQSGCLVSASHPTAATPSLSPVAGTSWSRNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWVSVGWGGQAEYLAARWNPCQCYDFLICHLTPC	283995	279023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279855_280270_280377_281459_282750_283785
519196	contig_3449_pilon	-	2579	13	Intergenic	novelGene_73704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	182	junction_1	183.718232325725	822	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	186	1334	328842	299208	FALSE	20	CAGATGTTCTGTCACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLSVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVLEDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGSLLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLITLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAMLLQPNKKTIKKLREVLYELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK	347014	297962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_299304_305148_305276_306287_306386_307835_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_318314_318407_322018_322114_324625_324712_327360_327429_328710_328880_346866
519197	contig_10134_pilon	-	2200	4	Intergenic	novelGene_16228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38817_39584
519198	contig_18145_pilon	+	2517	11	Intergenic	novelGene_37362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	418.008325275945	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	954	2360	96213	100744	FALSE	55	ATACAAAATAAAAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	92892	100901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_93485_94907_95011_95954_96280_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
519199	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519201	scaffold_13553_pilon	+	4251	2	Intergenic	novelGene_73750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	585	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2806	3138	32107	32439	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAQLRQSEISAELPKRGNTSEGFSMGKTPGMLVGVLFLKEWGLGANEAMQPDQDLKGACTDSIFHRPLGYHYHKIFRLNFKDPQKTGVAKQGTQGSCPTCLTQETDDC	29301	33661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_32585_32693
519202	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519203	SIRV6	+	373	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	10	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
519204	contig_5643_pilon	+	2139	13	Intergenic	novelGene_39015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	747.617674684059	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	950	2125	634983	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_632051_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640499_641443
519205	SIRV6	+	590	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8710	2	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
519206	contig_15063_pilon	+	1424	5	Intergenic	novelGene_10558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	463	1284	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34804_35037_35380_35839_36158_36266
519207	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519208	contig_7426_pilon	-	2119	7	Intergenic	novelGene_27539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	262.150561064947	2583	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	428	934	1094562	1087105	FALSE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102854	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094740_1100318_1100420_1102705
519211	contig_15666_pilon	-	2330	5	Intergenic	novelGene_70204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_2	107.741588998863	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	12	950	132068	129963	TRUE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGKKVRKNWCPPNMEGDVP	132079	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_130298_130515_130795_131446_131711_132007
519212	contig_16622_pilon	-	2120	12	Intergenic	novelGene_48447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1099.8904904167	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	282	866	125335	113120	TRUE	55	TTACTGTAAAATAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	125980	108233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112836_113040_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765
519213	contig_7599_pilon	+	3735	4	Intergenic	novelGene_73761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	176	junction_3	4.49691252107735	331	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	292	2313	19763	26604	FALSE	20	TTTTATATTGCCTTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFQDFDIQGSRRCSLDWLTIETYKNIESYRACGSTIPPPYISSQDHVWIRFHSDDSISRKGFRLAYFSGKSEEPNCACDQFRCGNGKCIPEAWRCNNMDECGDSSDEEICSKEANPPTAAAFQPCAYNQLQCLSRFTKVYTCLPESLKCDGNIDCLDLGDEIDCDVPTCGQSLKYFYGTFNSPNYPDFYPPGSNCTWLIDTGDHRKVILRFTDFKLDGTGFGDYVKIYDGLEENPHKLLRVLTAFDSHAPLTVVSSSGQIRVHFCADKVNAARGFNATYQVDGFCLPWEIPCGGNWGCYSEQQRCDGYWHCPNGRDEVNCTMCQKEEFPCSRNGVCYPRSDRCNYQNHCPNGSDEKNCFFCQPGNFHCKNNRCVFESWVCDSQDDCGDGSDEENCPVIVPTRVITAAVIGSLICGLLLVIALGCTCKLYSLRMFERRSFETQLSRVEAELLRREAPPSYGQLIAQGLIPPVEDFPVCSPNQASVLENLRLAVRSQLGFTSIRLPTAGRSSNIWSRIFNFARSRHSGSLALVSAEGDEVVPSQSTSREPERNNTHRSLFSVEPDDTDTENERRDTGGASGGVAAPLPQKVPPTTGVEATVGAYGSSSTQSTRGGNTDHGRDVTSMEPTSVSPARHQLTSALSRMTQRLRWVRFTLGRSSSVNQNQSPLRQLDNGVNGREEDDDVEMLIPVSDAASDFDVNDCSRPLLDLASDQGQVFRQPFSATNPGVRPSNPGDGPCERCGIVHTAQIPDACLEATLKNETSDDEALLLC	18283	28026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_+_18489_19676_20782_22338_22472_25734
519214	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519215	contig_15063_pilon	+	1433	6	Intergenic	novelGene_10505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	235	1272	34808	36639	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDCDV	27134	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36513_36628
519216	contig_15063_pilon	+	1145	4	Intergenic	novelGene_10457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	236	1006	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35278_36248
519218	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	109	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519219	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519222	contig_4105_pilon	-	2615	6	Intergenic	novelGene_21478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1443	1892	72671	63850	FALSE	15	TTCTGTTCCCCACAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFRTFRTARAVGDRITVSQLSSLSPLTVQNVVPGEHDSTAHNVPFVTAGPKRVPHTTAMEDLAIICMIGHRPSTPSRMPVLGIILPGQAQGDVAFLSRVHNLHLEVVAAGAQWVPGLGQPHINDALALAQVLQLPQTLTSCSRPHSSS	74476	63126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_63897_71024_71171_71622_71680_72378_72502_72594_72768_73130
519223	contig_19378_pilon	-	2364	3	Intergenic	novelGene_73779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3289	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	223	771	18938	18006	TRUE	15	GAATATGTCTTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYGRPPPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVRFHDDAAAVLAAAAGPGPGADPATAAPSLGPARAPDRAPRPSPDPRGGPSPSRRRSPGRARAPGPGPGLGVLRPCPRGSPSPDRDPRVPPSLRKRKEQCPLKIMVMSAGSEHTSQSRKWGLE	19160	15991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_17346_17766_18363_18746
519225	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	9	1418	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519226	contig_14970_pilon	+	1922	9	Intergenic	novelGene_44962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	133	1221	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
519227	contig_17976_pilon	-	1966	4	Intergenic	novelGene_32496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCACCAGACAGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48770	41643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_48037_48671
519228	contig_10134_pilon	-	2050	5	Intergenic	novelGene_16209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32871_33027_33731_34922_35178_38558_38817_39584
519229	contig_6215_pilon	+	2014	6	Intergenic	novelGene_21184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1908	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGAGTTGTTTCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226725	238681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228201_231974_232035_233716_233856_234069_234147_235190_235361_238588
519231	contig_10437_pilon	+	2731	4	Intergenic	novelGene_38159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_3	125.881778753806	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAAGCGTTGCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159896	164084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160203_160732_160844_161549_161639_161859
519232	contig_1244_pilon	-	2158	10	Intergenic	novelGene_37985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	291	junction_7	689.106094789869	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	825	1724	928860	923211	FALSE	30	ATCCAGACTCTTCAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947045	922776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_933736_933856_934499_934566_946439
519233	SIRV6	+	749	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	341	280	168	83	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	37	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACAAAACGTCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	11051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519234	contig_17144_pilon	-	1598	13	Intergenic	novelGene_29436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1721.02174109839	15	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1383	214	1596	174597	166077	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWFFF	174926	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166086_167269_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
519235	contig_14513_pilon	-	1203	2	Intergenic	novelGene_70281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	381	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	184	348	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
519236	contig_15063_pilon	+	1680	6	Intergenic	novelGene_13950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519237	contig_12352_pilon	+	2663	8	Intergenic	novelGene_57450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	175.284608216326	698	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	164	826	238274	284811	FALSE	20	TGAGTTGCTTGTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGGCARAGRFTRKSEALQCQPPVGEGCWRPRADQCASVPSPRAFPRVPAQIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	229953	286648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
519238	contig_13021_pilon	+	1508	8	Intergenic	novelGene_8206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3095.5478497022	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	115	1209	177472	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	176702	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_176710_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
519240	contig_9515_pilon	+	1589	8	Intergenic	novelGene_73812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	306.634928851618	7	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1078	1467	68341	72530	FALSE	0	TTCCTTGGCTCTCTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57284	72652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_66248_66345_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
519241	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_8574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	775	1098	35891	35108	TRUE	30	TAGTAGTAGCAGCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36774	26351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519242	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519243	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519245	contig_11338_pilon	+	1730	9	Intergenic	novelGene_6190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	444.049194909753	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	363	1388	6086	10018	TRUE	50	AATAAAAATTTCTCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRP	4306	13588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10022_13249
519246	contig_6795_pilon	+	4060	30	Intergenic	novelGene_27730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_17	389.628158965975	1330	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	34	2205	320577	330523	TRUE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRASGRCESGAMEGTGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKASLQSSGRCWAGSPLRSRGTCPTISGRPHPNCTRWAWAWATWNCRRSTTDSP	320543	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327427_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329851_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
519247	contig_5954_pilon	-	2449	15	Intergenic	novelGene_28646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	280.339125899693	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	646	1821	956264	945474	TRUE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRAAGKTRSWALPTTG	960563	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945520_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
519248	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519249	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_9722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519250	contig_5988_pilon	-	1653	4	Intergenic	novelGene_15925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.817113950806	258	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	229	1479	653670	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655551	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653804_655456
519251	contig_4845_pilon	+	2546	9	Intergenic	novelGene_53622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	405	junction_6	307.989447871189	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	151	978	218620	221846	FALSE	60	ATAAAAATGGAGATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	218090	223414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657
519252	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519253	contig_15063_pilon	+	1679	6	Intergenic	novelGene_14108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	15	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	189	1424	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34619	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519254	contig_15063_pilon	-	1556	5	Intergenic	novelGene_10370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	14	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
519256	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519259	contig_233_pilon	-	2702	6	Intergenic	novelGene_14485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	301.302904068315	1927	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGGCGTTCCTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70182	40591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_42793_48419_48467_49313_49486_60123_60233_61595_61649_70062
519260	contig_15063_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_8846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3787.7218306875	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	244	1473	34808	39538	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGRLREPMGHGLHLHCPFPPEPLLQHHSHSVQGEVTHCGKNV	27125	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36149_36266_36600_38995_39092_39506
519262	contig_14513_pilon	-	1313	4	Intergenic	novelGene_70259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1373.54925487059	101	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	198	380	18880	14965	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRETLLLLKLHKLI	19077	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15003_18735
519263	scaffold_12124_pilon	+	2344	12	Intergenic	novelGene_22050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	492.469338727577	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	130	1065	836073	852375	TRUE	25	ACTGGCGTCTTCTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829615	858980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857907_858070
519264	SIRV6	+	426	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
519265	SIRV6	+	463	5	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	69	210	98	307	2569	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	2471	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10727_10819_11034
519267	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519268	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519269	contig_10106_pilon	-	3132	2	Intergenic	novelGene_73895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1684	2025	163968	163539	FALSE	60	AAATTCTAACTCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFHLTSGTDSRASRKWSWVMVWMKQGKGHFATGEWVQNIPGQRVFLIHHCLKKTIFYQTVFAAENTIMYNLVRDDTVRRLRAAFRARFLGSNPISITVIYTYLSVPQFAHL	165651	162431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_163728_163815
519271	contig_15063_pilon	+	1599	6	Intergenic	novelGene_14202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	106	1344	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34702	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519272	contig_19564_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_29633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	298	897	5	901	13097	12201	NA	10	GAATGTCTCCTCTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	13101	12020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12000_13100
519274	contig_6735_pilon	-	2199	15	Intergenic	novelGene_15687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	951.56274525817	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	439	1719	554315	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_554548_554692_564157_564232_564784_564869_568198
519275	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26351	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519276	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_10257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519277	contig_2027_pilon	+	3186	25	Intergenic	novelGene_39899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	200.001245655843	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	1025	3013	126391	136487	FALSE	50	CTAATAAAGAATTATTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117945	136660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_126316_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
519278	contig_5033_pilon	-	1946	14	Intergenic	novelGene_29023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3394.83025867378	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	24	1514	566787	531418	FALSE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAENVT	566810	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531428_533440_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519279	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519280	contig_8317_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_19383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
519281	contig_9807_pilon	+	2356	13	Intergenic	novelGene_32836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	575.538950318163	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	165	1685	109130	158956	FALSE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPDRPDQGLELHCSRTCSFSRCFCNTPHPCPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	108965	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151788_158795
519282	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519284	contig_3155_pilon	-	3618	11	Intergenic	novelGene_26448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	38.7169213652119	279	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	127	1833	382112	353200	FALSE	30	ATTAGTAAAGTACGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRLAMVGSAFVLFLFILQRDMSNREQVSTNQSCLPGFYTLAELKPFWERPPQDPNSPGADGKAFQKSEWTPQETQEKEEGYKKHCFNAFASDQISLQRALGPDTRPPECLDQKFRRCPRLPTTSVIIVFHNEAWSTLLRTVYSVLHTAPAIFLKEIILVDDASTEEYLKEQLDQYVKQLQIVRVVRQQERKGLITARLLGASVAQAEVLTFLDAHCECFHGWLEPLLARIAEDETVVVSPDIVTIDLNTFHFSKPVQTGRVHSRGNFDWSLTFGWEILPPHEKQRRKDETYPIKSPTFAGGLFSVSKSYFEHIGTYDNQMEIWGGENVEMSFRVWQCGGQLEIIPCSVVGHVFRTKSPHTFPKGINVIARNQVRLAEVWMDGYKEIFYRRNLQAAKMAEEKSFGDISERLKLKEQLHCRNFSWFLHNVYPEMFVPDLKPTFYGAIKSLGTNHCLDVGENNHGGKPLIMYVCHGLGGNQYFEYTTQRDLRHNIAKQLCLHANDGTLGLRNCHFTGKNSQVPKDEEWELTQDQLIRNSGSGTCLTSKDKQPAMARCNPSDPHQHWLFI	382238	351414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_353314_354399_354553_356069_356172_356842_356975_357542_357744_359066_359185_363628_363864_364922_365073_379231_379405_381645_381891_382028
519286	contig_15063_pilon	-	1555	5	Intergenic	novelGene_8962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	802	1125	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36801	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519287	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519288	contig_5780_pilon	+	2359	6	Intergenic	novelGene_29781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	25	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	281	763	107519	110295	TRUE	25	AAGGAGTTTTGCATGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73990	113723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110313_112144
519289	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	12	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519290	contig_9594_pilon	+	2322	10	Intergenic	novelGene_73928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	554	junction_4	363.686678337274	2801	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	259	1503	301335	322067	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGEVPSLFPAC	301076	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936
519291	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519292	contig_3948_pilon	+	2147	12	Intergenic	novelGene_53319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	500	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCGCTGAACCGCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467925	1510948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468447_1471755_1471891_1473201_1473354_1482576_1482656_1483426_1483605_1485096_1485250_1485600_1485986_1489827_1489927_1490736_1490842_1491191_1491234_1494196_1494313_1510766
519296	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519297	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519298	contig_12951_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_68164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1132	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCGCACCCGTCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295358	326246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_297133_298381_298508_326179
519300	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_10104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519301	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	33	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519303	contig_15063_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_14471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36583	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36600_36800
519304	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	4	1479	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28160	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519306	SIRV6	+	526	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	23	8710	16	81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
519307	contig_4364_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_3161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
519308	SIRV6	+	499	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-1	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	68	207	98	304	2569	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	2471	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034_11109_11205
519312	contig_9609_pilon	-	1755	6	Intergenic	novelGene_23075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGTCGTCCTGGGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456255	450488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_450638_453007_453140_453643_453775_453860_454014_454416_454633_455281
519313	contig_6227_pilon	-	1756	18	Intergenic	novelGene_49769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	301.905883728287	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	72	1112	1223803	1203660	TRUE	35	TGCCACAAAAGAGGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGTLYGRGCITRSSWPTSWPRLRP	1224894	1202631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204170_1204435_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
519314	contig_1309_pilon	-	3560	4	Intergenic	novelGene_73988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_3	21.853044537445	240	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	139	714	346480	337258	FALSE	15	TGTTATCTCTGTGTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLRPRTALALLGLLLASALRCQEQAQTTDWRATLKTIRNGVHKIDTYLNAALDLLGGEDGLCQYKCSDGSKPYPRYGYKPSPPNGCGSPLFGVHLNVGIPSLTKCCNRHDRCYETCGKSKNDCDEEFQFCLSKICRDVQKTLGLAQHVQACETTVELLFDSVIHLGCKPYLDSQRGACWCPYEEKTDL	346618	334411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_337377_340006_340173_341186_341264_346266
519315	SIRV6	+	727	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	343	513	170	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
519316	contig_3077_pilon	+	1733	11	Intergenic	novelGene_26606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3234.84800415723	320	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	144	1295	9676	17590	TRUE	30	AGATTAACAGTGTGCGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9532	18076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17771_17818
519317	contig_15063_pilon	-	1730	7	Intergenic	novelGene_10200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	979	1302	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519318	SIRV6	+	684	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1540_1645_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
519319	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519320	contig_8980_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_74008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGAATCTTTTTCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630087	629785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_629800_630100
519321	contig_8980_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_74007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATATTTTAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627479	625013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_625000_627500
519322	contig_10801_pilon	+	3066	13	Intergenic	novelGene_74030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	107	junction_11	396.942717319934	843	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	192	1451	319963	368988	FALSE	25	TATCTTTGATATTTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVCYQLPVLPLDRPVPQHVLSRRGAISFSSSSALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEFEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTTVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHMPLEDRQEMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDASHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLSVSPFCDRQSESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGLNKASWKGMQRAQSSSEDTDAALEELNSQLLPQENRSS	235415	370603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_235553_319908_319970_323393_323478_345671_345824_347622_347687_352563_352660_354573_354675_356986_357119_357317_357410_361966_362112_362717_362815_363829_363911_368779
519325	contig_8317_pilon	-	488	2	Intergenic	novelGene_19339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGGCCGTCTTCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
519326	contig_6059_pilon	-	3000	6	Intergenic	novelGene_44801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	273.029375708915	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	265	951	411475	403416	FALSE	40	TAATCACAATATAGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYVFVNDSSQTNVPLLQACIDGDFNYSKRLLESGFDPNIRDSRGRTGLHLAAARGNVDICQLLHKFGADLLATEYQGNTALHLCGHVDTIQFLVSNGLKIDICNHQGATPLVLAKRRGVNKDVIRLLESLEEQEVKGFNRGTHSKLETMQTAESESAMESHSLLNPNLQQGEGVLSSFRTTWQEFVEDLGFWRVLLLIFVIALLSLGIAYYVSGVLPFVENQPELVH	437268	401366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_403633_409565_409725_411164_411508_415816_415920_420013_420089_437214
519327	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_11191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519329	contig_11720_pilon	+	1919	15	Intergenic	novelGene_43988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	364.471409253545	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	189	1679	263924	272210	FALSE	55	AAATCATTCAAAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGGLHGWSSREKALLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262914	272450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_263872_263996_264079_264116_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
519330	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519331	contig_8317_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_20736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16547	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
519332	SIRV6	+	482	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	339	8720	166	71	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGAAGGTGAGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
519333	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519335	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	21	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519336	contig_15063_pilon	-	1553	5	Intergenic	novelGene_10371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519337	SIRV6	+	910	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	407	493	191	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	133	624	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1494	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519339	contig_10246_pilon	+	2931	10	Intergenic	novelGene_46895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	192.10555226197	899	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	78	1277	144696	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSPFASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140722	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
519340	SIRV6	+	697	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8195	12	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
519341	contig_7426_pilon	-	2154	9	Intergenic	novelGene_27528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	285.562602593547	2490	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	58	669	1102797	1091093	TRUE	35	TGTCAAAGATGCAAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGPAAGKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIALASWPLRENTGQIQWTGWDVMLGLSWRKLTFNERLLWART	1102854	1085915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1092305_1092422_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
519342	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519343	SIRV6	+	946	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	568	14	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519344	SIRV7	-	990	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-84	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114822	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1687_2993_3112_43028_43078_114680
519348	contig_12078_pilon	-	3225	23	Intergenic	novelGene_74080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	241.767052865438	566	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	859	2580	274	2853	786304	64691	FALSE	65	AAAAGGAGGAAAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLKNSKHECTLSSQEYVHELRSGISDEKLLNCLESLRVSLTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDVLEKLLDKKQQEHIDKKNQYKLIQCLKAFMNNKFGLQRILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIVGEENILDKLLGAITTAAERNNRERFSPIVEGLENHEALQLQVACMQFINALVTSPYELDFRIHLRNEFLRSGLKRMLPDLKEKENDELDIQLKVFDENKEDDLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAENYLLSILQHFLLIRNDYYVRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDFTHLIDSCVNKAKVEESEQKAVEFSKKFDEEFTARQQAQAELQKREEKIKELETEIQQLRTQGHALSGSSGISVPPPPPLLSVGPPPPPPPPPLPLAGGNPPPPPPPPPLIGMNGIPPPPLSAGPPLPPPLGGVPPLPGAPLDLPFGMKQKKIYKPEVSMKRINWSKIEPRELSENCFWLKVKEDKFENPDLFAKLALNFATQIKVQKNVEASEDKKITPAKKRVKELRILDPKTAQNLSIFLGSYRMPYEDIKNIILEVNEGMLSEALIQNLVKHLPEQKVLNELAELKNEYDDLCEPEQFGVVMSSVKMLRPRLNSILFKLTFEEHVNNIKPSIIAVTLACEELKKSESFNKLLELILLVGNYMNSGSRNAQSLGFKINFLCKIRDTKSSDQKTTLLHFLAEICEEKYPDILKFPEELEHVESASKVSAQILKSNLTAMEQQIIHLERDIEKFPQTEDQHDKFVEKMTIFTKIARDQYDKLFTMHSNMIKLYENLGEYFIFDSNTVSIEEFFGDLSNFRTLFLEAVKEINKRREMEEKTRRAKLAKEKAEQEKLERQKKKKQLIDINKEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRIPRNPDNRRVPLERSRSRHNEAISSK	818539	64318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_64756_244439_244536_290430_290567_327724_327888_432936_433064_534549_534680_566421_566662_580910_581013_608420_608516_610329_610432_741435_741551_743143_743459_748638_748744_754024_754090_757619_757739_760281_760399_762347_762467_768122_768234_780880_780990_782815_782953_786292_786363_786443_786519_818399
519349	SIRV6	+	712	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-415	486	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
519351	SIRV6	+	1207	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	801	18	-397	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	481	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	114	446	2002	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1888	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519352	contig_1244_pilon	-	1550	12	Intergenic	novelGene_38028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	825.865976760302	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	521	1417	928860	923211	FALSE	40	AGTCAAATAGTTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	946586	923077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924712_927036_927227_928758_928894_930958_931044_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439
519353	SIRV6	+	929	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1416	125	-13	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTTTGCCGATGCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2503	11700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519354	contig_13707_pilon	-	2404	12	Intergenic	novelGene_43537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_11	545.896563326094	2188	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	63	1358	275489	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275551	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
519355	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	57	1193	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
519356	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519357	SIRV6	+	798	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	364	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	6	338	1673	2560	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1667	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519358	contig_1244_pilon	-	2295	13	Intergenic	novelGene_37977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1074.36545871919	3	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	77	1195	948448	923807	TRUE	30	TTTAAATGATGGGCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRRQGR	948524	922433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923816_924210_924349_924583_924712_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
519360	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519361	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519362	contig_10629_pilon	-	2527	16	Intergenic	novelGene_52905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	414.553167746779	4	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	220	1176	256957	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267745	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253835_254174_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
519363	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_11481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519364	contig_2646_pilon	-	2923	21	Intergenic	novelGene_69630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	309.660313892497	767	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	46	2769	2078663	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078708	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
519365	contig_5092_pilon	-	2126	4	Intergenic	novelGene_62296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	600.807419690832	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	95	415	451516	444887	FALSE	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKCGMFLHEYPVKLKPAVQETSPRLLT	451610	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_447835_447995_449415_449498_451514
519366	contig_14030_pilon	-	2290	7	Intergenic	novelGene_62222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_6	538.627087036002	1754	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	161	643	395000	337410	FALSE	10	CTTGTTCACCTTGTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRDYNGDGQAIWKTFSFKPLLIFDDTRREDQVPETQGSQRGSNHQPRLNYREMPSLRFVASFSRRPWRRRGRRELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	395160	335762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_394937
519367	SIRV6	+	681	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-335	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCATAAATTTGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1950	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
519368	contig_1331_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_37824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159574	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159200_159600
519369	contig_14744_pilon	+	792	7	Intergenic	novelGene_66074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4471.39194087131	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	68	751	1383156	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382992_1383106_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
519371	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519373	SIRV6	+	934	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	396	480	180	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	144	635	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1483	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519374	contig_15063_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_13485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519375	contig_8772_pilon	+	1661	8	Intergenic	novelGene_21091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5233.38665859569	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	142	864	15355	20034	TRUE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLPEQ	15213	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19110_20022_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
519376	contig_16650_pilon	+	2076	5	Intergenic	novelGene_61960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.76438020109	1012	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	110	487	244670	254361	TRUE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCRLRRHKGSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244560	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186_255845_255901
519377	contig_15063_pilon	+	1733	5	Intergenic	novelGene_13040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	426	1598	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30087	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30319_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519378	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	4	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519379	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519381	contig_12357_pilon	+	1663	12	Intergenic	novelGene_6071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	782.47034110613	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	413	1453	30281	53235	FALSE	35	CCTAGGGTAATTAGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26156_27505_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
519382	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519383	contig_15063_pilon	+	1492	4	Intergenic	novelGene_13304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	202	741	34808	35938	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35858_36158_36266
519385	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519386	contig_20951_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_43066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGCAAGGAGTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27294	26558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26931_27185
519387	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519388	contig_5189_pilon	-	1838	7	Intergenic	novelGene_34850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1177.96670392484	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	111	704	244235	199237	FALSE	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199327_220285_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
519389	contig_12624_pilon	-	1932	15	Intergenic	novelGene_61064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	961.883030459377	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	801	1580	875457	862389	FALSE	60	AAAAACAAACAAGGCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903763	862036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883042_884763_884815_888695_888805_900249_900333_903447
519390	contig_7356_pilon	-	1887	4	Intergenic	novelGene_60383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	69	458	457848	433924	FALSE	5	TTGCTTTTTCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457916	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
519391	contig_13894_pilon	+	1156	9	Intergenic	novelGene_62150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	45	1100	521729	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521684	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
519392	contig_5770_pilon	-	202	2	Intergenic	novelGene_74170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	16344	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTGGTTGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262880	261896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764
519394	contig_19076_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_74222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAGGAAAAAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132916	133266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_132900_133300
519395	contig_6975_pilon	-	2370	10	Intergenic	novelGene_74252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_7	342.134404316906	1670	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	217	1218	164514	159453	FALSE	20	TAGTATGGCATCTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	170000	158300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_163849_164402_164538_169807
519396	SIRV6	+	781	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	356	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2609_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519397	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519398	contig_15063_pilon	+	1535	7	Intergenic	novelGene_13699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	3780.21125585448	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	202	1050	34808	36494	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486_36600_38975_39092_39506
519399	contig_13216_pilon	+	2143	7	Intergenic	novelGene_47460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_4	840.572704899595	3050	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	101	1603	229682	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSEFSQDENGVISLHIKRSHAFLLFFMQTVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229581	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256045_256296_258447_258573_260430
519401	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519403	SIRV6	+	812	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
519404	contig_5280_pilon	+	2122	9	Intergenic	novelGene_52594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	676.417955113553	18	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38311	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39087_39235_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
519405	contig_6227_pilon	-	2000	18	Intergenic	novelGene_49721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	307.721653311812	3021	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	725	1699	1213164	1202920	FALSE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225092	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214165_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
519407	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519408	contig_15063_pilon	+	1463	5	Intergenic	novelGene_12227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519409	contig_10902_pilon	-	2683	6	Intergenic	novelGene_65669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAGGCACTGCACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112099	96505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_96592_100106_100288_102136_102240_107116_107199_108073_108145_109939
519410	contig_10235_pilon	+	2242	5	Intergenic	novelGene_46422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	229.251363136623	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	23	670	210483	212121	FALSE	35	GAAAACGAATGTCCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPGAEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210460	213693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211834_211924_212047
519411	contig_5153_pilon	+	2625	16	Intergenic	novelGene_74362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	293.014948424138	2909	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	484	1902	1007835	1022174	FALSE	5	TTTTTTCCTGGTGCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGTPGGSYPPGPPGGFGQPPSAQQPIPPYGMYPPPGGNPPSGMPSYPPYPGAPVPGQPMPPPGQQPPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956635	1022897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005133_1005347_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
519412	contig_9345_pilon	-	1649	7	Intergenic	novelGene_24673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1956.1874200143	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	216	797	955353	947957	TRUE	15	GGTCTGGCTCTAGTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001290	947054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947643_947692_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
519413	SIRV6	-	303	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCACGAATAGGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11747	11444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
519414	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	32	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519415	contig_13787_pilon	-	2224	8	Intergenic	novelGene_40619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	734.921348006099	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	461	916	183794	159290	FALSE	15	TCTTATACATGTCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCHKRKPLHAHSAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205274	157981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179795_183751_183890_189120_189184_204972
519416	contig_9345_pilon	-	2027	7	Intergenic	novelGene_24381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	637.770509056528	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	352	1035	148904	142100	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176114	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173102_173141_173643_173789_175989
519417	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_10105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	35	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519418	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_8762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	70	TAAAAATTAGAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519419	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	65	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519420	contig_7457_pilon	-	2586	2	Intergenic	novelGene_31507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7889	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATTCCCAGGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671985	668577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_668906_669727
519421	contig_6027_pilon	-	3643	17	Intergenic	novelGene_74438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_16	84.9968519637639	573	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	866	2587	283869	263119	FALSE	5	CTCTGTCTGTTCTCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNVSRTDLDMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	290936	262062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265867_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_289209_289339_290862
519422	contig_5643_pilon	+	2863	6	Intergenic	novelGene_38758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	155.494565821446	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1614	2486	160417	163341	FALSE	15	AGCCCCTTGTATCCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSQPAILPSSIPTAQQSGNLKEKEVLISLFLTTVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157848	163718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_160859_161443_161747_163000_163085_163297
519423	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519425	contig_12622_pilon	-	1325	7	Intergenic	novelGene_5938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	453.648174984389	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	7	486	1588003	1586655	TRUE	40	AGAAGCGAATTTATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1588009	1583548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864
519426	contig_15063_pilon	+	1485	4	Intergenic	novelGene_13153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519427	contig_8317_pilon	+	430	2	Intergenic	novelGene_19321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAGTTTTTAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	16699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
519428	SIRV6	+	648	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1177_1462_1535_1645_1736_1845_2026_2470_2621_2740
519429	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	588	1409	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36266
519431	contig_12622_pilon	-	1954	11	Intergenic	novelGene_5980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2036.33597424394	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	1590968	1588838	TRUE	35	CTAACCTTCAGAAGCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHGRLRHRPQVWLLPQ	1591001	1583557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586271_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1588889_1590020_1590234_1590830
519432	SIRV6	+	722	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	764	540	-434	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	151	483	2002	10736	TRUE	30	GCCTAATTGTTGGTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1851	11285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519433	contig_15063_pilon	+	1383	5	Intergenic	novelGene_13181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	202	1263	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWVMSDTANTCY	34606	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36514_36627
519434	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	17	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519436	contig_12464_pilon	+	3015	1	Intergenic	novelGene_68673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGATCACAACAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163495	166510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_163500_166500
519437	contig_19459_pilon	-	1219	8	Intergenic	novelGene_59869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7597.31690285781	110	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	391	885	15518	7003	FALSE	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDQDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19134	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12633_15503_15702_16203_16265_18988
519438	contig_1267_pilon	-	3601	1	Intergenic	novelGene_74466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	505	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATCTTAGTCACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37345	33744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1267_pilon_-_33700_37300
519439	SIRV6	+	624	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1848_2027_2470_2621_2740
519440	contig_12074_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_53772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCCAGTTTTCAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38255	37858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_37900_38300
519441	contig_6576_pilon	-	2176	10	Intergenic	novelGene_42265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	79	junction_5	529.693225915007	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	138	1484	339439	322526	FALSE	20	GTTTTGGTATATCATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339576	321833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
519442	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519443	contig_14811_pilon	-	1747	3	Intergenic	novelGene_74476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	2813	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	111	890	375703	357434	FALSE	30	ACCCCAAAGTGTCTCGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386577	356576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
519444	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLGPRNHGHCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519445	contig_15063_pilon	+	1785	7	Intergenic	novelGene_8460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	7	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	295	1530	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26301	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519447	contig_8773_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_74526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCACAGAGTTGAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44138	43069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_43100_44100
519449	SIRV6	+	1033	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	493	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519450	contig_15118_pilon	+	2902	2	Intergenic	novelGene_74542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_1	0	622	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	108	1157	129085	130134	FALSE	5	TCTTTTGCCTCTGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLKSLELESLSPGDQDLELPGEGPQLVAIPGVGKMETNSSLPMNVSGGIQPESSSYAALNIFSQVVLGVTCVLGILGNGLVIWVAGFRMTHTVTTISYLNLAIADFSVTATLPFTMVSQAMRGQWPFGWFLCKLIYTVVDINLFGSVFLIAVIALDRCICVLHPVWAQNHRTVGLAKRVIIVPWILALLFTLPVIIRVTTISNEAGTFCKLDFSPWTTNRDEKKKVDIIMYTVRGIIRFIIGFSMPMSTVAICYGLVAAKIHRQGLIKSSRPLRVLSSVVVAFFICWFPYQLVALIATIRIRQRLLNMIQGLRIAINITVALAFFNSCLNPMLYVFMGHDFRERLIHSLPASLERALTEDSGQTSDTPANSTSPPSNAELKEM	125231	131879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_129073
519453	contig_5485_pilon	+	2228	3	Intergenic	novelGene_37703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	745	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTACGAGGCGCCGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84685	88090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_86366_86774_87026_87793
519455	contig_14219_pilon	+	2633	9	Intergenic	novelGene_54367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	752	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGGCCGCCCGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045775	1084564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1047336_1055720_1055882_1056614_1056761_1057564_1057669_1057774_1057848_1071994_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
519456	SIRV6	+	642	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	717	227	-438	136	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519457	contig_16098_pilon	-	2428	17	Intergenic	novelGene_45840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	321.616400973271	1448	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	523	2343	215535	201500	FALSE	25	GCTACAGTTCCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230486	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215623_228181_228387_228525_228592_230174_230286_230433
519458	contig_12357_pilon	+	1611	8	Intergenic	novelGene_6091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	844.529575610963	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	117	929	26079	53235	FALSE	50	GAATAGAAGAAATAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_34240_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
519460	SIRV7	-	1567	3	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	104850	268	71665	-266	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTCGCCACAATAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43073	1271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028
519461	contig_13740_pilon	-	2140	9	Intergenic	novelGene_34652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3060.42712501049	9	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	164	574	165243	160095	TRUE	50	CAAGAAATAAGAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQ	165406	155358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160099_161126_161270_161574_161722_161919_162031_165237
519462	contig_15063_pilon	+	1775	7	Intergenic	novelGene_13061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	42	1520	30275	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30233	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519464	contig_6227_pilon	-	1909	17	Intergenic	novelGene_49762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	313.431654980396	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	306	1616	1222052	1202920	FALSE	35	CAAAAGAGGTTATGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224994	1202626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223741_1223838_1224857
519465	contig_15063_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_8654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	ACTTGAAGTAGCCATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26588_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519466	contig_6215_pilon	+	2915	10	Intergenic	novelGene_21188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGCGCCTTTCTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226725	243071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228366_229710_229951_230071_230215_231669_231760_231861_232035_233716_233856_234069_234147_235190_235361_238588_238755_242994
519467	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519468	contig_5434_pilon	+	3281	12	Intergenic	novelGene_74658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAAAGTTCTCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256544	282115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_257645_257798_258802_259093_259529_262817_262893_273748_273824_275491_275544_276013_276123_276267_276334_276927_276992_279049_279118_279205_279251_281926
519470	contig_7342_pilon	-	2578	21	Intergenic	novelGene_71099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_17	96.529477363135	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	53	2281	86720	76155	FALSE	10	TGTTTTGTTTTTTTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86772	75857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
519471	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519472	contig_20406_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_74703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGTACCAGCACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4241	4792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20406_pilon_+_4200_4800
519473	contig_15063_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_13351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36800	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519474	contig_15063_pilon	+	1663	7	Intergenic	novelGene_11180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	AAGTGCTGCTTTGTGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519475	contig_9807_pilon	+	2563	13	Intergenic	novelGene_32847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	575.538950318163	2	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	137	1750	109130	158956	FALSE	15	CGTTGTGGATCACTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGAHNLPRRLRQRVDNHLLRPTPSDRPDQGLELHCSRTCSFSRCFCNTPHPCPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	108993	159769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_158734
519476	contig_12086_pilon	-	1375	4	Intergenic	novelGene_74708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	40.9416929574514	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	157	777	14945	11290	FALSE	20	TAAGTAGTCCTTGGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVVRRCPFLSRVPQTFLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEAGAKPAPRALSTSAVHCQQVKETPPANEKDKTAKAEVQQASDGSQKTPDGAQLPSEHLSPATSQGTASKCPFLAAQMSQRGSSVFRKASLELQEDVQEMHALRKEVVQTSVNPRVISVKTDGEEPSGLLKNFQDIMRKQRPERVSHLLQDNLPKCKPYCYLSDAGESL	16116	10691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_11484_12644_12873_14746_14967_15981
519477	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519478	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519479	contig_6735_pilon	-	1772	12	Intergenic	novelGene_15773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	707.62641308523	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	646	1296	544908	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568322	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_544915_547293_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
519481	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519482	contig_8978_pilon	-	2309	11	Intergenic	novelGene_49393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1108	1569	345658	343441	TRUE	25	AGAGCGCGCGACCGCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSCLSSSCFRFCTSWLCSSSIRRSSSWRLIKSCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFSISMSAFQRMAYSYSKEPGCANLGGCSRSL	348141	331587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339968_340942_341062_342374_342670_343350_343447_343638_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
519483	contig_19851_pilon	-	2422	4	Intergenic	novelGene_29874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	787	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCGGAGGCGGTGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	53677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53701_53922_55751_55838_55880_56001
519484	SIRV6	+	834	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	598	3	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATGCGGTAAACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519485	contig_15063_pilon	+	1898	7	Intergenic	novelGene_13049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	411	1646	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30106	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519486	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519487	SIRV6	+	372	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	24	1193	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
519488	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519489	contig_10923_pilon	+	1773	10	Intergenic	novelGene_66205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	801.404985395826	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	223	1659	23028	42718	FALSE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSSVQGNRTSGSRWWQWPCCYSAAQCCPGVSQASWARWLRLTSSCLVLDAVPSWPPKDQPILKSTLRQGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13837	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21833_23012_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
519490	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519492	contig_15063_pilon	+	1778	7	Intergenic	novelGene_8462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	293	1528	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26303	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519493	contig_12624_pilon	-	1443	8	Intergenic	novelGene_61037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	847.759881291	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	110	439	884793	877414	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFR	888783	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867751_877137_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695
519494	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519495	contig_2069_pilon	-	3018	20	Intergenic	novelGene_23401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	270.583201064037	1015	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	46	2082	1259894	1234847	FALSE	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPADFPRVEGDSVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMGSVLMRPRGCFRAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVASGLMEDDGKPRATQTPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWITQKDKLPPEPAVPPGPAACKGSHGSHVLRTQ	1259939	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234882_1235178_1235318_1236191_1236310_1236576_1236654_1236857_1237020_1245605_1245765_1246182_1246273_1246482_1246609_1247815_1247947_1249409_1249513_1249791_1249857_1250859_1250984_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1259834
519496	contig_3948_pilon	-	2464	7	Intergenic	novelGene_53216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	103	909	866476	840803	FALSE	25	TGTTGCGCTAAAATTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSSRGRAGGVGRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869670	839247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
519497	contig_3948_pilon	+	2587	4	Intergenic	novelGene_53390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	101.156644204257	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	334	1125	1813956	1860572	FALSE	30	ATTGAACAAAGGGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWISSDRGLGTVFHLSAMVMSGIVPLLLKNYKDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813363	1862034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1832655_1832746_1860434
519498	contig_3277_pilon	+	3645	9	Intergenic	novelGene_74718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_8	550.265844842291	381	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	186	1217	240775	263763	FALSE	65	TAGTTTAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVGMILPVFLNIRINLKELKVFTEFIC	188791	266191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618
519499	contig_18194_pilon	-	2223	5	Intergenic	novelGene_55947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	128	1147	18897	4425	FALSE	15	AAGCTCTTGCTGTGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLDEPPKSLP	20413	3348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_4451_4664_5501_7034_7162_18866_18976_20364
519500	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519501	contig_5196_pilon	-	2378	4	Intergenic	novelGene_38656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_3	169.340551027278	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	409	1170	14523	9642	FALSE	15	CTTAATTGTGTTGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	14931	8433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231
519503	contig_1532_pilon	-	1974	8	Intergenic	novelGene_37372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1223.85184844358	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	63	1178	32217	13113	FALSE	40	AAGATCTTACAAGCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQVQISMKMVLSYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34923	12316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13413_15705_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
519504	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	13	1422	28164	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28151	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519505	contig_10629_pilon	-	2465	15	Intergenic	novelGene_52917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	383.336433734874	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	102	1127	256957	247382	TRUE	20	TTGGCTTCCCAAATCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	257146	245866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083
519507	SIRV6	+	914	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	577	0	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519509	contig_12074_pilon	-	2851	15	Intergenic	novelGene_53769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	446.469780955131	3	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1851	2729	33790	30226	FALSE	40	GATGAGGAATTAAGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	30103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_34524_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
519510	contig_6233_pilon	-	2242	12	Intergenic	novelGene_74767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	292.851272438067	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	501	1340	149777	143464	TRUE	40	TACTCATACTATTAAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	117812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118501_136760_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
519511	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519512	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_11932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519513	contig_14176_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_74873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGCAGCTGAGCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508815	508244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_508200_508800
519514	contig_15063_pilon	+	1679	6	Intergenic	novelGene_13605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	202	1008	34808	36299	TRUE	10	TTCTCCTTATACTGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLPST	34606	39761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36175_36287_36600_38975_39092_39506
519515	contig_16622_pilon	-	2376	9	Intergenic	novelGene_48446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1095.87384510034	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	201	908	128619	113120	TRUE	50	AATAAACAAACTTCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	132314	108224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113158_113602_113739_115153_115292_126305_126420_128337_128679_132173
519516	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	6	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519517	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_10260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519518	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519519	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_11512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	2296.14247162496	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	230	1393	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35836_36158_36266
519520	contig_2027_pilon	+	2927	23	Intergenic	novelGene_39891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	401.571790459143	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	51	2732	122795	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSSPAGRRGFRPAQGMSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	114179	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_114230_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132480_135068_135153_135868_135971_136073_136175_136351
519521	contig_15087_pilon	+	2138	5	Intergenic	novelGene_37274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	36	617	284653	301944	TRUE	20	CTGCAAAATCCTCCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284617	303731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_302106_302371
519522	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519524	SIRV6	+	781	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	347	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	23	364	1673	2560	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1650	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519525	contig_15063_pilon	+	1440	5	Intergenic	novelGene_11045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	15	GTGACCAGCCGCTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519527	contig_15063_pilon	-	1441	4	Intergenic	novelGene_14188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	5	GGCCACCTGGCTCTGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	34681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34918_35031_35380_35839_36156_36264
519528	contig_5643_pilon	+	2066	16	Intergenic	novelGene_39041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	751.474414438413	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	644	2053	634983	641584	FALSE	15	ATTGTGTGTGTAGCCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631205	641597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641198_641435
519529	contig_12638_pilon	+	2684	16	Intergenic	novelGene_33099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_4	555.770800080593	1254	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	284	1810	171697	199604	FALSE	40	TAAGAAATCTCATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDIDIEAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170800	200478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
519530	contig_11130_pilon	-	2686	6	Intergenic	novelGene_53083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	30	junction_2	948.223475769293	2469	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATGGGTGTTTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_58684_58810_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
519532	contig_4301_pilon	-	2592	6	Intergenic	novelGene_65105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_3	297.914350107543	1486	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	176	778	551260	539500	FALSE	30	TTTTAGTGTAAAAGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNEMD	575650	537685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_547294_547521_551248_551329_575543
519533	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519534	contig_1639_pilon	+	2443	20	Intergenic	novelGene_74899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	187.782319311439	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	83	2089	289113	331594	FALSE	5	CGTGGTGGTGGTTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQQLRFLQHQMAVAAAAAQRAQLRRHRHPGSQSGSKVKRGAPATPQL	289030	331948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
519535	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519536	contig_15063_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_13156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	202	714	34808	35888	TRUE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	34606	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35839_36158_36266
519537	contig_10958_pilon	+	1781	3	Intergenic	novelGene_5452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888847	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888858_895280_895855_900457
519538	contig_5485_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_37704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	156	1298	87935	85491	FALSE	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88090	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
519539	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_12147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519540	SIRV6	+	947	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	577	4	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519541	contig_10734_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_51169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1220	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCAGCATACTGTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000776	999640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_999600_1000800
519542	contig_5981_pilon	+	3213	17	Intergenic	novelGene_35534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	113.250534628981	484	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	39	2429	289114	317012	FALSE	25	GGACATTTGTACCTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCSCCRLGGFAMPTTQQSPQDEQEKLLDEAIQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYELYMAISDELHYLEVYLTEEFAKGRKVADLYELVQYAGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFPQSRKDILKDLVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEPADEETTGDIGDSMDFVLLNFAEMNKLWVRMQHQGHSRDREKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLTGILEQVVNCRDALAQEYLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIIIALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLFDIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIATSSAVSKELTRLLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNVLDYNTEIVSQDQVDSIMNLVSTLIQDQPDQPVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRSEDPDQQYLILNTARKHFGAGGNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFLQGALAAGEIGFENHETVAYEFMSQAFSLYEDEIGDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLRRESPESEGPIYEGLVL	289075	317796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_289117_294391_294491_296426_296524_297238_297363_297842_298026_299492_299707_300849_300934_302162_302273_305007_305105_305209_305359_307394_307603_308170_308327_311271_311395_313213_313394_313869_314110_314545_314690_316832
519543	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519544	contig_7020_pilon	+	2136	2	Intergenic	novelGene_57072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	219	1337	102391	103509	FALSE	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98748	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98831_102254
519545	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519549	contig_5095_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_74944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACGATAAAGAACAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179165	178607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_178600_179200
519551	contig_12873_pilon	+	1769	7	Intergenic	novelGene_27159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1119.29572350951	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	704	1195	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15956	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16177_16362_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
519552	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519553	contig_15063_pilon	+	1136	5	Intergenic	novelGene_9291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	241	1134	34808	36382	FALSE	20	TGTGCAGTGGCTGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	27128	36384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519555	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519556	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519557	contig_4364_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_2514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532933	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
519558	contig_4364_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
519560	contig_18163_pilon	-	2050	2	Intergenic	novelGene_35309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	167	493	10631	10305	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVLLAGLP	11529	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_10652_11383
519561	SIRV6	+	919	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-3	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	385	717	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1843_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519562	contig_15063_pilon	+	2368	5	Intergenic	novelGene_13014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	1052	2224	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29465	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519563	SIRV6	+	512	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCAAGTCGTAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2024_2470
519564	SIRV6	+	850	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	584	482	368	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	62	553	1733	10736	TRUE	35	CAACTCACCATAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1671	11343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519565	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519566	contig_3095_pilon	+	2192	6	Intergenic	novelGene_75178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2004.05375177414	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	32	799	220513	226800	TRUE	25	TGTGACTTCCCAGGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220481	245832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_244376_245302_245387
519567	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519568	SIRV6	+	907	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	223	1	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519570	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	23	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519571	SIRV5	+	232	2	ISM	SIRV5A	SIRV501	1890	17	5779	3737	-1366	3656	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAAACTAGCAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6835	7254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6958_7144
519572	contig_15063_pilon	-	1474	5	Intergenic	novelGene_10608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	729	1052	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36728	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27156_34595_34925_35033_35380_35839_36156_36264
519573	SIRV6	+	898	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	31	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11107_11205
519574	contig_6735_pilon	-	1702	14	Intergenic	novelGene_15675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1078.58010979919	4	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	621	1496	545923	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568247	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542337_542779_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546636_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564792_568194
519576	contig_15063_pilon	+	1407	6	Intergenic	novelGene_11251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3035.47818967622	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	229	1260	34808	36632	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27138	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36511_36625
519577	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519578	contig_15063_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_12707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	793	1116	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36792	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
519579	contig_5643_pilon	+	2202	16	Intergenic	novelGene_38997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	792.627988963857	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1214	1990	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631103	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631315_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636176_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
519580	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519581	contig_15063_pilon	-	1495	4	Intergenic	novelGene_13199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519582	SIRV6	+	420	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1181	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11418	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
519583	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519584	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
519585	contig_16286_pilon	+	3629	1	Intergenic	novelGene_75269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	10417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16286_pilon_+_6800_10400
519588	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519589	SIRV6	+	789	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	480	-441	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519590	contig_15063_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_8498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	768	1091	35891	35108	TRUE	20	GCAGCCACAGTGATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36767	26343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26391_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519591	SIRV6	+	549	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	401	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2616_2740_2829_3106_3165_10724
519593	contig_9807_pilon	+	2168	11	Intergenic	novelGene_32890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	656.571123336992	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	686	1198	147193	154326	TRUE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSVSGPQPPFSAGGTWRAAT	109054	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128611_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154338_158670
519594	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	28	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	226	1461	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519597	contig_5033_pilon	-	2312	14	Intergenic	novelGene_28983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3708.72890233378	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	791	1537	536585	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566792	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536651_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519598	contig_8317_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_19315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGCTCAGCAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16759	16145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16280_16379
519599	contig_8772_pilon	-	1783	10	Intergenic	novelGene_21075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	880	1209	19240	15784	FALSE	25	GACCGGACCCAGCCAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23410	15209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061_23184_23251
519600	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519601	contig_5988_pilon	-	1625	4	Intergenic	novelGene_15933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
519602	contig_7357_pilon	-	2339	9	Intergenic	novelGene_36815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_8	1890.6231115693	3	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	214	1464	166824	136424	FALSE	10	CTTTGTTTTTCTGGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167037	135548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
519603	contig_5514_pilon	+	1415	6	Intergenic	novelGene_75276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	265.785326908767	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	81	1322	65296	68726	FALSE	20	GGCCTGGACCTTCAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGLGALGTSEPLPQFVDPALVSSAPESGVFFPSGPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61077	68819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
519604	contig_9345_pilon	-	1957	6	Intergenic	novelGene_24380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	27	965	176056	142100	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176082	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
519605	contig_1244_pilon	-	1880	13	Intergenic	novelGene_38018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1004.60236398399	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	561	1460	928860	923211	FALSE	20	TATTTATGCTTTTTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948526	922790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933786_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
519606	SIRV6	+	439	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	8837	-11	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGCTAAAGTGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
519607	contig_15063_pilon	+	1761	7	Intergenic	novelGene_12289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	31	1506	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519608	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_10779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27165_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519609	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_8763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	244	1401	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35858_36158_36266
519613	contig_10311_pilon	-	1826	11	Intergenic	novelGene_50406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1035.01917373544	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	32	826	71526	67861	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVERETQGGLAD	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67885_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
519615	contig_12425_pilon	-	1838	8	Intergenic	novelGene_46685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	729.48178419299	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	103	447	211174	209364	TRUE	20	ACTTGAAATTTGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWVRPAS	226594	203280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207272_209351_209497_210302_210389_211048_211200_226517
519616	contig_4232_pilon	-	993	3	Intergenic	novelGene_63223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGGAAATGAGCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149696	148231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_148536_148803_148883_149086
519618	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519619	SIRV6	+	801	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	372	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	58	546	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1675	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519620	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-423	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	102	309	159	467	2021	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1862	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2476_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519621	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519622	contig_2704_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_75306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	528	577	1104	209013	209540	NA	45	CTCATAGACATATATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSVITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLD	208436	209540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_208400_209500
519623	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_10709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	233	1063	34808	36333	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36266
519624	contig_15063_pilon	+	1514	6	Intergenic	novelGene_9105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	243	1262	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36497_39506
519625	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519628	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519630	contig_4364_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	83	442	1530895	1531333	FALSE	10	CAGGTGACTGTCGGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT	1530442	1531333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
519631	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519632	SIRV6	+	354	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10453	19	1216	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11453	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
519633	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519636	contig_17427_pilon	+	1789	6	Intergenic	novelGene_30313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGGCGGGCCAGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176948	181361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_178130_178703_178824_179136_179224_179351_179475_179656_179845_181271
519637	SIRV6	+	1472	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	45	11	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519639	contig_6980_pilon	+	1923	10	Intergenic	novelGene_36039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	709.686019950781	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	75	950	356720	372818	TRUE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRFNKSQVTMET	346108	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372784_373630_373729
519640	contig_13707_pilon	-	2187	10	Intergenic	novelGene_43547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	725.781843221927	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	284	1150	273826	270728	FALSE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275539	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274238_275442
519641	contig_5643_pilon	+	1857	15	Intergenic	novelGene_39016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	848.773043028246	31	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	653	1843	634983	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637798_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
519643	contig_12790_pilon	+	2377	9	Intergenic	novelGene_35207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_8	183.665073911727	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	216	1220	307252	312183	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGKRSLDPYGFLERGEPRGGGEELRVRPGSSRGQASFLIKLIWGYRQLEN	305928	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898
519644	contig_19579_pilon	-	1694	7	Intergenic	novelGene_59384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	88	927	13090	7943	FALSE	65	AAATAAAAAAAATCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13177	7175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
519645	contig_3424_pilon	+	2360	4	Intergenic	novelGene_55477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	117	2120	163695	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRFGCSRGAWAPAEPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149887	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_169068_169148
519646	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519647	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519648	contig_5033_pilon	-	2150	14	Intergenic	novelGene_29031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3815.19559860583	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	29	1489	566787	532074	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLKLQRLFLLL	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531134_531560_532104_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519649	contig_2027_pilon	+	2737	21	Intergenic	novelGene_39902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	386.423808790297	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1661	2542	132640	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	123283	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_129008_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
519650	SIRV6	+	880	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	171	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	27	6	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	153	644	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1474	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
519651	SIRV6	+	289	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	714	-37	-441	37	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGTGCGTCTAGGACGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
519652	contig_10331_pilon	+	3203	5	Intergenic	novelGene_54198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	295	junction_2	107.143303570499	1301	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	141	578	628081	639267	FALSE	10	TTTTGGCTTGTTGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRNSAIAAGVCGALFIGYCIYFDRKRRSDPNFKNRLRERRKKQKLAKERAGLSKLPDLKDAEAVQKFFLEEIQLGEELLAQGEYEKGVDHLTNAIAVCGQPQQLLQVLQQTLPPPVFQMLLTKLPTISQRIVSAQSLAEDDVE	627940	641892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_628202_631089_631137_633179_633262_637502_637646_639222
519653	contig_2537_pilon	+	3440	30	Intergenic	novelGene_33414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_29	189.585046596467	2411	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	950	2853	81	2933	205895	297712	FALSE	10	GTCTCATCTATGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRMHNNSSPSVSPNTSFTSDGSPSPVGGIKRKAEDSDSEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVLRYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIASLPSDFEKGTKPFKPLEQLMGVFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALLPFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFVLELYKTGSTEPMDVPPELCHGIQGKFSLDEEAVLPDQIVCSPVPLLRDLSQNTAISINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAPVLKPGDWEKSSNGRQWKPQLGFSRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGVYSNAAPPPATYQGSLYRPLLRGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFERGVGAEPLLPWNRMLQTQNAAFQPNQYQLLAGPGGYPPRRDDRGGRQGYPREGRKYPLPPPSGRYNWN	205814	298219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846_239892_241320_241453_245173_245293_249123_249260_250522_250631_250723_250814_251426_251500_258097_258182_259021_259120_259201_259282_266057_266115_278243_278313_278407_278540_280631_280760_290367_290432_295098_295238_297646
519655	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519656	contig_12427_pilon	-	2001	6	Intergenic	novelGene_40523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1114.72787710723	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	209	742	522337	505932	FALSE	15	ATCATCTGATTTTGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNAQNIN	578160	504672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505946_507807_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
519657	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519659	contig_13863_pilon	+	1499	9	Intergenic	novelGene_42039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_8	451.616661976726	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	252	683	110615	118962	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	104467	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
519660	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519662	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26767	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519663	contig_12869_pilon	+	2071	9	Intergenic	novelGene_75337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	309.004019998122	322	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	7	1086	67397	97384	TRUE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67390	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97881_97996
519665	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519667	SIRV6	+	640	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-374	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519668	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519670	contig_854_pilon	-	2617	14	Intergenic	novelGene_36157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.375506640098	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	63	1247	509201	471988	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARQSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509263	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471072_471662_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
519671	contig_5033_pilon	-	2144	14	Intergenic	novelGene_28995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3815.19559860583	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	29	1498	566787	532000	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLVSFAGRSPHPMS	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532022_533777_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519672	contig_4732_pilon	-	3792	28	Intergenic	novelGene_75473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	101	junction_3	343.930396984363	452	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1097	3294	118	3411	747726	700986	FALSE	50	GAAAGCAAGAATTAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGEGAEAGPCPSHPPWPPEPAPQPGPTWLSPRGPDASLAMGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIVGNLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGGEPDGGKISNFLLEKSRVVSQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSDTYKVDGTDDRSDFNETLSAMQVIGILPSIQQMVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESIDVTLNVEQAAYTRDALAKGLYARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEEGRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFPKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLQAVNMDPDQYQMGGTKVFIKNPESLFLLEEMRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEASNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSITKYDRRFKPIKRDLILTSKYVYVIGREKVKKGPEKGQVREVLKKKLELQALRGVSLSTRQDDFFILQEDAADSFLESIFKTEFVSLLCKRFEEAARRPLPLTFNDTLQFRVKKEGWGGGGTRSVTFSRGLGDVALLKAGGRALTVSVGDGLPKSSKPTRKGMAQGKPRRPAQAPVRAAPRPPIGLDRNGVPPTARGGPLPLELTSGRGSQRPPQGPPASAPGASRRHRARPPSEHNTEFLNVPDQGAAGMQRKRSIGQRPVPGVGRPKPQPRIHGPRCRTLYEYIGQDVDELSFNVNEVIEILMEDPSGWWKGRLHGQEGLFPGNYVEKI	747843	700604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_701063_701993_702164_702247_702444_703044_703129_703544_703694_703910_704058_704407_704554_706204_706375_706555_706671_712566_712712_712811_712911_713353_713461_715492_715575_720150_720237_721485_721654_722527_722612_723828_723916_724035_724117_727095_727293_727793_727927_728152_728288_728409_728542_729165_729256_729369_729458_730958_731054_731135_731226_732091_732230_747723
519673	SIRV6	+	796	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	164	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	161	486	158	643	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2746_2829_3106_3165_10724_10819_11037
519674	contig_15063_pilon	+	1337	5	Intergenic	novelGene_11751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3282.61827662005	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	222	776	34808	36133	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGDPGDCLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLPREKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27170_34615_34926_35037_35380_36038_36158_36266
519675	SIRV6	+	947	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	6	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	45	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	165	498	252	749	1733	10740	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSRSAYN	1093	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3161_10721_10819_11031_11109_11205
519677	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519678	SIRV5	-	410	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTAATTTCGCACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8377_8446_8590_10863
519679	contig_16098_pilon	-	1571	8	Intergenic	novelGene_46108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1543.937346725	7955	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	761	1363	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460262	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457907_458405_458618_458704_458838_460148
519680	contig_3986_pilon	+	2636	10	Intergenic	novelGene_52685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1846	2286	46192	52882	TRUE	30	AACAGGCAGAGGTGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGFHHVGLTEEGFRRHSSFLQGLDGHFHIIFVITHPDFSKLPRPEFPDQFERLPGNFPFILNPGVLKSQAYTGQSQSLAQTIPFLRIVLHQVLERGKSNPGGDVIASFIQHKDLIVFDHLPLGGYILHRQGKGTFICVTLSNKE	34075	153860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_35487_39677_39808_41343_41498_44833_44910_46117_46297_47664_47820_48252_48398_52846_52951_54767_54866_153676
519681	contig_5280_pilon	+	2297	8	Intergenic	novelGene_52613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	670.341582131598	5	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	45	884	38385	78098	FALSE	0	TGTTTTTTGTTGTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38340	79511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_56269_56384_62043_62065_78042
519682	contig_16098_pilon	-	2063	12	Intergenic	novelGene_46096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	2254.79587318943	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	759	1853	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	468536	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_461682_461766_462058_462470_466710_466868_468450
519684	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_14064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	192	1427	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34616	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519685	contig_15063_pilon	-	1661	7	Intergenic	novelGene_8559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	903	1226	35891	35108	TRUE	30	TAGTAGCAGCCACAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39693	26348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519687	contig_7457_pilon	-	2475	4	Intergenic	novelGene_31607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_3	23.3428552000155	1652	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	138	1400	962606	956489	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962743	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960896_962603
519689	contig_10801_pilon	+	2989	1	Intergenic	novelGene_74063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	693	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	86	487	367699	368100	NA	20	TTATCTTTGATATTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNNQEGFDRLVSSPSPTVPLSTEFQFKVMKKITMIKGRVAQLINVIAVTKLYTCKKLNWQKLCDIFTTKKGSCRGCLCTTKHLMGFSFLVWGLRSWFHGTSQLTGLILCLVLLFYLLVCCIAPGILKACKQLSKIQQLVSFHWSNRRRRRVRNRRKKWMCG	367613	370602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_367600_370600
519690	SIRV6	-	296	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGACTCCCACGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11746	11450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
519691	contig_1225_pilon	+	2720	4	Intergenic	novelGene_44180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	164	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251372	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_276477_276566
519692	contig_500_pilon	+	1469	10	Intergenic	novelGene_31070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_8	853.79672024796	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	77	1054	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQRPPPRGRIQPCAPWLQGSKRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1491999	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
519693	contig_5571_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_75529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	131	481	230194	230544	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRFLTKLEILYNPAIPFLGIYPREIRAVTRIDICTPMFTAAVFTTAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMKYYATIKNNDESVKHLIIWMKLEDTMLSEISQSQKGKYCMRPLL	230063	232210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_230100_232200
519694	contig_1516_pilon	+	2258	12	Intergenic	novelGene_49984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1199.05296652355	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	531	1445	353572	362233	TRUE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITHNRPHQVWQVCSPGGQVPPPRPHHCCDPEPPDSSSGPPVPRHLPRAV	335194	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353034_353510_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360032_360096_360125_362116_362299_362985
519695	contig_15063_pilon	+	1450	4	Intergenic	novelGene_13132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	202	708	34808	35888	TRUE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNNHQYLRHPPILC	34606	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35845_36158_36266
519696	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_12697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2591.14800812304	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	237	1403	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35034_35371_35839_36158_36266
519697	contig_15498_pilon	-	3150	12	Intergenic	novelGene_42679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_11	241.737409613431	1135	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	129	1676	828595	785428	FALSE	25	CTGCTGAACTGTAGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGSARRTAARRRQEAAGAAPRGRPGHRRQEAGSAEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	837865	783953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_837755
519698	contig_3956_pilon	+	1798	10	Intergenic	novelGene_14888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1346.98289283133	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	84	1595	1281682	1290816	FALSE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281598	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1290650
519699	contig_8310_pilon	-	2759	5	Intergenic	novelGene_75595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1415	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGACATATCCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328433	314978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320710_324736_324847_327866
519700	contig_12923_pilon	-	2580	11	Intergenic	novelGene_30077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	360.36066655505	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	199	1488	64485	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFLAAVANTVAAGLSGKHRAEHWVRCLTRRTWVPQQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101245	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64573_93693_93733_101173
519701	contig_7707_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_72221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCAACTGTGCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808983	809186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_809000_809200
519702	contig_9871_pilon	+	2624	6	Intergenic	novelGene_75702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2412	junction_1	869.977562929068	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	88	297	572939	580018	TRUE	15	TACGTCTGTATTGCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTPPEQPDRKRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKVSYRASNI	572851	584415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_579914_581826_582912_583040_583534_583630_584117
519703	contig_15777_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_75765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309365	308962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_309000_309400
519706	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_8476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	2937.36083712914	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	255	1430	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26341	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
519707	contig_5643_pilon	+	1944	16	Intergenic	novelGene_39012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	764.669933151989	13	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1225	1734	637774	641217	TRUE	15	CATTGTGTGTGTAGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPILARDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637796_638139_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
519710	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_12946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28169	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519711	contig_6735_pilon	-	2112	14	Intergenic	novelGene_15787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	880.764514599399	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	792	1646	545923	542464	FALSE	20	ATGGTTCACCCTTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568285	541997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552778_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
519712	contig_9098_pilon	-	2172	11	Intergenic	novelGene_75786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	460.355732016014	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	1118	1918	288130	264388	FALSE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	294143	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_290916_291814_292840_292905_294101
519713	SIRV6	+	626	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8180	164	611	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	31	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
519714	contig_12919_pilon	-	2473	16	Intergenic	novelGene_75883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	122.380644802282	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	547	1848	678703	667822	FALSE	25	TTTCAACATTAATCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSAIVDFEALNVIIRLIEQAPIQMGEESVRWAKLVIPLVVHSAEKVHLRGATALEMGMPLLLQKQHEIASITEQLMTAKLISELQKLFMSKNETYVLKLWPLFVRLLGKTLHRSGSFINSLLQLEELGFRSGAPVIKKIAFIAWKSLIDNFALNPDILCSAKRLKLLMQPLSSIHVRTESLALTKLEVWWYLLMRLGPHLPANFEQVCVPLIQSTISIDSNASPQGSSSRVTTPNLNPMTPVHKGASPYGAPVTPRMNLSSNLGGMATIPSIQLLGLEMLLHFLLGPEVLSFAKQNKLALSLEALEHPLISSPSFFCKHANTLITAVHDSFVTVGKDASDSVINAVWKELINLVKSVIESGNKKEKPSSDVLTLVLKSLESIVKSEVLPVSKTLVLMEITIKGLPQKVLGSPAYQVANMDILNASILNVMTD	683920	667196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_667939_669617_669719_669995_670059_670788_670900_671132_671307_671991_672107_673449_673602_674447_674587_675459_675553_677549_677740_678656_678744_678844_678977_679888_679986_682512_682592_683331_683446_683836
519715	contig_15491_pilon	-	2585	7	Intergenic	novelGene_75953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	353.922150887577	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	513	1058	45111	32303	FALSE	30	TGTCAAGTTCATTAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47045	30775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46368_46620_46879
519716	contig_990_pilon	+	2657	7	Intergenic	novelGene_76115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	399	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGATAAAATGGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585411	1608724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1587076_1591042_1591182_1598931_1599015_1601437_1601639_1605878_1606081_1606868_1607075_1608562
519717	SIRV4	+	1565	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
519718	contig_11720_pilon	+	2242	13	Intergenic	novelGene_43922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_4	353.126777281663	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	948	1988	266216	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262250	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265314_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
519719	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	19	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519720	contig_8045_pilon	+	2423	4	Intergenic	novelGene_35373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	583.850627776965	874	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116045	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075_118243_118527
519721	SIRV6	+	712	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	768	546	-430	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	147	479	2002	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1855	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519723	contig_10311_pilon	-	1843	11	Intergenic	novelGene_50452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	926.115700115272	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	34	1203	71526	65773	FALSE	25	ACTTAAAAGTTGCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTEFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67540_67835_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
519724	contig_15063_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_9161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	242	1087	34808	36333	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27127	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36268
519726	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519728	SIRV6	+	720	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8177	7	614	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
519729	contig_1443_pilon	-	2959	10	Intergenic	novelGene_28290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	451.275585779895	3	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1411	2295	776427	748649	FALSE	50	AAAAAAAAGAACCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809519	747984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776446_804491_805718_808694_808741_809399
519730	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519731	contig_12605_pilon	+	993	5	Intergenic	novelGene_64202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2172.25700597328	29	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	23	382	3897	4829	TRUE	5	GTGTGGGGTCTGAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGARSPPAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3874	6245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3935_4246_4535_4795_5063_5747_6005_6124
519733	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2	1051	28164	36299	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKERWPSMHQPST	28162	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36264
519734	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	223	1398	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27548	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519736	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_11050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519740	SIRV6	+	939	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	10	579	10	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	248	739	1733	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1097	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519742	SIRV6	+	825	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	193	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	30	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	111	336	286	621	2002	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1496	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519743	SIRV6	+	787	8	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	575	563	359	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	32	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	71	562	1733	10736	TRUE	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1662	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
519744	contig_9807_pilon	+	2419	13	Intergenic	novelGene_32870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	580.619131952168	3	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	865	1572	147193	158783	FALSE	5	CGTGCTCTGGAGTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	159630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139455_145127_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
519745	contig_14182_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_76178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	137	526	47185	47574	NA	30	ATTATCAATAGCTTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQMILTIMWFIREVTGYNSGSGTLRIQFFHQHSLFLAMPTGMPLSGPSASALLRQVLQSSFSSANKCPEAPHFTSKPQHKGTQPKIPLHHLLLVSPAAISLPLLLTVFSVTALSQSPGFRSFSV	47048	48757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_+_47000_48800
519746	contig_16098_pilon	-	2622	4	Intergenic	novelGene_46078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_3	959.379081605505	9	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459650	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_457182_457557_457907_458405
519747	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519748	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519749	contig_5643_pilon	-	1934	15	Intergenic	novelGene_39069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	711	1037	638099	636440	TRUE	20	CAGGCCACCACCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPAQVLVVPDLPNQVLIVQWADLQSAEFVLSCIVLRTVGHGVGPINALHAQLWPVWDTFVPAFFHLSSGHDNDAGVLLPYHLPEVINCGLQAALAGDVGLSILIGA	641598	631233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_631347_631433_631556_631847_632054_634807_634990_635154_635271_635370_635448_636182_636254_636429_636580_637767_637901_638045_638197_640212_640284_640384_640536_640634_640729_641102_641214_641412
519750	contig_17796_pilon	+	2650	12	Intergenic	novelGene_33809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	377.762748580211	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	111	1052	53527	96917	TRUE	25	TTCATGCCAGTGCTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLVISCLYFIKIL	53416	121181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_97313_99343_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
519751	contig_9471_pilon	+	2630	6	Intergenic	novelGene_21814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	611.987058686701	8	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412431	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413832_413916_414936_415630_416273_416936_417028_417152
519752	contig_4486_pilon	+	2260	14	Intergenic	novelGene_38568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1331.89473969722	10	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	157	1311	343083	412464	TRUE	40	AACAATGTTGTGATGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311751	413459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424_412620_412665
519753	contig_12125_pilon	+	2694	13	Intergenic	novelGene_76188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_10	144.44741449938	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	91	1569	64006	82984	FALSE	35	TAAATTTGTGATAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPITPSTYVRCLNVGLIRKLSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQAGKSPTCELLFDWGTTNCTVGDLVDLLVQNEFLAPASLLLPDAVPKTVNTLPSQEAITVQQKQLPVYGKDRTSVTPVQNLELNYMPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLDEVELLHRVSKAVNLYGSRLPHLSPTERLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56146	84109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_80613_80701_82650_82810_82939
519754	contig_15063_pilon	-	1494	4	Intergenic	novelGene_13217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	803	1105	35878	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGWRRPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36789	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35393_35860_36156_36264
519755	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519756	SIRV6	+	632	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	240	-441	123	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	50	TCACAAAGAAATTTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
519757	contig_3424_pilon	+	2273	4	Intergenic	novelGene_55473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	132	2027	163695	170678	FALSE	30	TTTACTCAAATACAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149872	170924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168797_168985
519758	SIRV6	+	726	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	543	-441	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519759	contig_5023_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_7149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	384	689	353590	353285	NA	40	TATAGGACAAAGTAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKGPMKKQRQLQSGSRSSPWLPPGGRKSCNGGCTSWGLIQVTLGLENRMSTGEGEWSESERQGEPSTSTESSLILSQGSTEVSCRPVDCDSIFPGSGLV	353973	352968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_353000_354000
519760	contig_9609_pilon	+	2244	11	Intergenic	novelGene_23039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	954.239283408517	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	62	1267	435608	454609	TRUE	35	TCACCTGGTTTGAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGLPTRELPAEGQRRADGGMGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYSATLDSVQGQPGSALGCWGWPPGDKAAPSPRPIPQAGGKLSQGFLIYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435476	456235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435521_435590_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_452724_452863_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
519761	contig_7356_pilon	-	2024	5	Intergenic	novelGene_60384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	538.766357060275	1057	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTTTTCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457920	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_448976_449110_457767
519762	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	25	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519763	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519764	contig_14513_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_70302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	187	615	18880	11918	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSAPTPLRITPTSSSFSRVPSTWPSWDSVCSEERQSMAVERVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12106_13087_13136_14952_15001_18735
519765	SIRV6	+	625	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	235	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGGACTATGGGACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
519766	contig_15063_pilon	+	663	4	Intergenic	novelGene_11473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	230	604	34808	36323	FALSE	20	TTTGTGCAGTGGCTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISSS	27139	36382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35286_36314
519767	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519768	contig_6102_pilon	-	2985	11	Intergenic	novelGene_32025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	112	junction_1	65.3103360885549	521	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	181	1581	545300	514588	FALSE	25	TTCTTGAGCCTGCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTAAARFFGAKHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNLYREGSSIGAIDTKLDWSHNFTNMLGYTDAQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQEVLVWLTQLQKEVGKDVSDEKLRDYIWNTLNSGRVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPNDPMFKLVAQLYKIVPNILLEQGKAKNPWPNVDAHSGVLLQFYGMTEMNYYTVLFGVSRALGVLAQLIWSRALGFPLERPKSMSTDGLIKSVDSKSG	545480	513183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514759_515065_515276_515614_515717_515835_515966_516535_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_545258
519769	contig_15063_pilon	+	1646	7	Intergenic	novelGene_10939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	233	1327	34808	38987	TRUE	10	TGGTGTAGGCACTTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27136	39721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
519770	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519773	contig_7412_pilon	-	2414	8	Intergenic	novelGene_76332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	1403.12108369528	266	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	233	1573	377290	365711	TRUE	5	TGGCTTCCTCTCATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMGEPWQPGLTAQPVRGQREVPKM	377992	364200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365367_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
519774	contig_6898_pilon	+	1999	7	Intergenic	novelGene_35703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	687.868204430665	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	134	1036	59668	126743	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRDRYPKAQPAPFRDFFQKRGNVHTWFQYFSCQGSPRSLSPSKLFGPQLLLQHHLGLDLVSPGPWYWLA	59534	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_126538
519775	SIRV6	+	872	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	347	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	159	480	83	562	1733	10736	TRUE	30	ATTTGTGAACGCAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1650	11356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2490_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519776	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_19956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACCAAAAATCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16410	16739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
519778	contig_12864_pilon	-	2538	7	Intergenic	novelGene_76435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_6	427.657573299012	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGAGTTGCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252151	242237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_246348_248963_249843_251887_251999_252111
519779	contig_6215_pilon	-	2276	6	Intergenic	novelGene_21217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_5	566.82364100309	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	149	802	231913	228234	FALSE	40	GTGTTCTACCTATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	233743	226759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714
519780	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_12351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	11	1423	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519781	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519782	contig_4486_pilon	+	1839	13	Intergenic	novelGene_38588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1539.52790382853	601	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	459	1190	377420	412828	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQMFQFNAREHFTVVQSCSGGLIVYRIFQNKRTLEGFH	311789	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_344726_344770_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407639_412717
519784	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_11483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519785	SIRV6	+	485	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	16	43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTAGGACGCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2481
519786	contig_5018_pilon	-	1821	10	Intergenic	novelGene_47060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	706.503440268419	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	73	747	1402792	1400931	TRUE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGP	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400939_1401048_1401263_1401350_1401446_1401873_1401944_1401982_1402078_1402260_1402363_1402701
519787	contig_14711_pilon	+	3085	16	Intergenic	novelGene_68930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	57.1006907916961	1392	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	225	1706	119007	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	100572	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_100757_118709_118739_118995_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133498_133699_133925_133978_134106_134197_135227
519788	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519789	contig_1213_pilon	-	2198	13	Intergenic	novelGene_76473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_12	157.588312983193	1030	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	28	1479	101775	71514	FALSE	10	TGTTTTAGTTTCGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRWKKRKKMALTSFLPAPTQLSQDQLEAEEKARSQRSRQTSLVSSRREPPPYGYRKGWIPRLLEDFGDGGAFPEIHVAQYPLDMGRKKKMSNALAIQVDAEGKIKYDAIARQGQSKDKVIYSKYTDLVPKEVMNADDPDLQRPDEEAIKEITEKTRVALEKSVSQKVAAAMPVRAADKLAPAQYIRYTPSQQGVAFNSGAKQRVIRMVEMQKDPMEPPRFKINKKIPRGPPSPPAPVMHSPSRKMTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQRNENRDISEVIALGVPNPRTSNELQYDQRLFNQSKGMDSGFAGGEDEIYNVYDQAWRGGKDMAQSIYRPSKNLDKDMYGDDLEARIKTNRYQSRELFSCLYQ	101802	70794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_71718_73622_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84386_85233_85341_85432_85529_92927_93090_96621_96776_101761
519791	contig_21025_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_76491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCGGCTGATGGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70614	69811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_69800_70600
519792	contig_8772_pilon	+	1690	10	Intergenic	novelGene_21070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	4623.64837774107	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	149	1549	15355	23105	TRUE	10	ACTCTTGCTGTGTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15206	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063_23190_23363
519793	contig_13707_pilon	-	2234	12	Intergenic	novelGene_43566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	721.972653496442	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	63	944	275489	271743	TRUE	55	TGAAAAATATTTACAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTGRPPAEGQDKETWSQG	275551	269699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271794_272414_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
519794	contig_6589_pilon	-	2788	2	Intergenic	novelGene_26283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	146	1696	2274715	2273165	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2289803	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274793_2289735
519795	contig_12008_pilon	+	2067	9	Intergenic	novelGene_24998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	590.136213089826	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	15	AGAGTCCAGGTTTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	40474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39215_39300_39911_39987
519796	contig_5499_pilon	+	2196	12	Intergenic	novelGene_56998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	249.812028506989	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	91	1332	803476	840037	TRUE	40	ATCTGTAAAGAATTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803385	841270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840100_840468
519797	contig_4754_pilon	+	2229	16	Intergenic	novelGene_35946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	158.362958631956	27	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	70	1668	380119	417062	TRUE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITLSPMSASTWLSPSRR	380049	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_416969_417011_417082_420159_420252_420370
519798	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519799	SIRV6	+	595	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	12	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1555_1645_1736_1845_2027_2470
519800	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_8545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26346	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519804	contig_12644_pilon	+	1487	9	Intergenic	novelGene_44650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4320.73175949399	17	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	977	1399	2679895	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679174_2679612_2679963_2680107_2680229_2680311
519807	contig_15063_pilon	+	1571	5	Intergenic	novelGene_8489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	257	1429	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26342	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34610_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519808	contig_854_pilon	+	1642	7	Intergenic	novelGene_36196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	2791.03294797225	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	285	869	543412	562402	TRUE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLQTAVGVQIGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543127	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543453_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
519809	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519810	contig_15063_pilon	-	1555	5	Intergenic	novelGene_12732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28195_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519811	SIRV6	+	448	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	10	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10726_10819_11031_11109_11205
519812	SIRV6	+	397	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	170	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2478
519813	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519815	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519816	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519817	SIRV6	+	534	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	10	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2482	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11123_11223
519818	contig_4093_pilon	-	2706	5	Intergenic	novelGene_27621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3703	junction_3	741.614244402034	4	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	9	746	69245	41737	FALSE	30	GAGGCAGTGAGTCTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	69253	39776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951
519819	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519820	contig_12622_pilon	-	2633	14	Intergenic	novelGene_6029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_13	254.296663170023	94	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	25	1104	1691275	1687762	TRUE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCK	1691506	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
519822	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_13980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	197	1435	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519823	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519824	SIRV6	-	581	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTTCTTATTTCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11715	11038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11120_11215
519825	contig_10940_pilon	-	1995	5	Intergenic	novelGene_49248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	37	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	175	603	917000	875564	TRUE	30	AAGAACAGTTTGATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917174	874037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874876_875009_875675_893147_893306_916664_916748_916923
519826	contig_12624_pilon	-	1807	5	Intergenic	novelGene_61134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	850.929785587507	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	211	516	952979	948779	FALSE	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955903	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955644_955721_955774
519828	contig_16098_pilon	-	1778	7	Intergenic	novelGene_46155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1643.81481283291	242	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1197	1595	456927	456273	FALSE	45	TGCCAATAAACAACTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460442	456089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458838_460148
519829	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_12166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519830	SIRV6	+	981	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	546	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519832	contig_13894_pilon	+	2335	9	Intergenic	novelGene_62095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	2521.03315874663	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1526	2281	523580	528117	FALSE	15	GACACCTGCGTCTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
519833	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27545	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519834	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519835	contig_15063_pilon	-	1657	7	Intergenic	novelGene_9251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	902	1225	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39694	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39098_39514
519836	contig_15063_pilon	-	1722	7	Intergenic	novelGene_11224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
519837	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519838	contig_19564_pilon	-	1880	3	Intergenic	novelGene_29585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	131	1225	15529	11993	FALSE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMDLLLQLPLSSPSEFAFSASVSPPTPPLEGVLEQCLVHSRRSINICCLLNVSSLFPL	15659	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12162_12315_13214_15501
519839	contig_15063_pilon	+	1682	6	Intergenic	novelGene_14054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	194	1429	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519842	contig_15063_pilon	+	1506	5	Intergenic	novelGene_9929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	45	AAGTTGTATGTTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519843	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519844	contig_4429_pilon	+	2835	10	Intergenic	novelGene_50795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	478.030682418329	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	551	1990	172238	198515	FALSE	20	TACCTAGTTTTGTTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	157358	199360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_157544_165210_165427_166681_166778_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
519845	contig_5317_pilon	-	4635	1	Intergenic	novelGene_76610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2545	2874	756866	756537	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGPLYKNPDLAGVTIAKMSFCSCLEAPRPSGEERGKLLTLKGNKRLKLSLPQTKQGTEQAASGNGGGIQVATHSAVPSLPRPVLGDSAASSEMRRTAVLPQEGRLQQV	759410	754775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_754800_759400
519846	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	23	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519847	SIRV6	+	831	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	585	500	369	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	34	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519848	SIRV6	+	1008	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1383	79	-2	56	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519849	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519850	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519851	contig_15087_pilon	-	2433	25	Intergenic	novelGene_37202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	977.043538635249	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	150	1106	158925	136588	TRUE	30	GTAAAATGAGTGACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFLLLASSFRRQRRWPIRCGSLVQCPE	181189	110647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_139565_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
519852	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	206	1378	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34602	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519853	SIRV6	-	700	7	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8717	509	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTTTACGCAAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11264	1849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2470_2622_2749_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
519854	contig_15087_pilon	-	2210	24	Intergenic	novelGene_37177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	983.334977837634	24	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	655	1680	139614	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181123	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139664_143079_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149080_150539_150572_158907_158952_181066
519855	SIRV6	+	963	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1427	80	-2	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519859	contig_9594_pilon	+	1933	11	Intergenic	novelGene_73934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	460.425672611769	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	331	1500	307498	322451	FALSE	15	GATTTTTTTTCCTGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301201	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301470_307435_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
519860	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_10255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519861	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519862	contig_15047_pilon	+	1533	6	Intergenic	novelGene_52136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3061.42317231708	12	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	29	697	2194	4409	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGMGPSRSGQPLWRPLERSKDTHVVCSTRG	2165	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3473_4319_4434_4552_4664_20960
519864	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519866	SIRV6	-	320	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCATTGACTCCCACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11773	11453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
519868	contig_15063_pilon	+	1691	7	Intergenic	novelGene_12062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	219	1454	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27150	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519870	contig_5033_pilon	-	2046	14	Intergenic	novelGene_28996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3359.07408170623	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	29	1000	566787	534298	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCVQEVG	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531137_531556_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534318_535023_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519871	SIRV6	+	516	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	552	8181	379	610	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGAAATCACCGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	3150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
519872	SIRV6	+	808	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	555	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519873	contig_1406_pilon	+	2085	5	Intergenic	novelGene_25578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.01329937745	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	73	468	2173822	2185260	TRUE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173749	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2186660_2187251
519875	contig_1725_pilon	-	2538	19	Intergenic	novelGene_24293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	390	848	255470	251033	TRUE	15	ACCAGGTGGTCGCGCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQMSLAYSLIVRSLENFPAAAMFLSTIVFQAFGFLQLTDFFLTLDIGFVVCKDFKPVMIKEHVDYVFEEVRLLGRKEAIINLINDQLQLWKGFIIFVCVIPFLVQSSHIIYPHAEDEQVLFPGFLCHFHIGPIHGSDSQGPIQHKLHIACP	255859	201673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_201726_207388_207482_209772_209855_218440_218546_235997_236132_239623_239738_240047_240131_244924_245067_245295_245310_246577_246690_247022_247187_247639_247759_248346_248446_248573_248753_249011_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252775_255364
519876	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519877	contig_3602_pilon	+	2104	7	Intergenic	novelGene_60498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	5206	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	121	570	161745	169451	TRUE	10	TGACTTGGCTCCACCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161624	171129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170710_170853
519878	SIRV6	+	568	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	359	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3157_10721
519879	contig_1450_pilon	+	2352	18	Intergenic	novelGene_27366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	548.646595273488	30	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	1049	2155	347091	355748	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244341	355945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_331984_345780_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
519880	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	96	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519882	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519884	contig_16622_pilon	-	2392	6	Intergenic	novelGene_48449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1059.77231516963	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCCAAAATGAAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121957	108281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113739_115153_115273_121714
519885	contig_12790_pilon	+	2261	10	Intergenic	novelGene_35231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	294.648985559696	70	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	227	1054	307177	311112	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGSAQGLLNRFQTGALCLLFTANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKVKPLPTWPHF	305937	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306120_307132_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311192_311898_312035_312348
519886	contig_610_pilon	-	1786	6	Intergenic	novelGene_76749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	1278.74870087911	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATTGTCAAAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252595	213501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_221826_222063_234998_235302_249275_249375_252475
519887	SIRV6	+	512	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAGTCAAGTCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470
519890	contig_10253_pilon	+	1632	11	Intergenic	novelGene_76864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	120.787623538175	475	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	140	1630	24178	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHRLLRPQMLLTKGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	16146	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_24152_24223_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
519891	contig_15063_pilon	+	1276	6	Intergenic	novelGene_10502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	235	1218	34808	36740	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYDQPLCVCPCVHSN	27134	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36431_36698
519892	contig_5954_pilon	-	2037	14	Intergenic	novelGene_28612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	439.305678645224	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	966	1676	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960550	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947905_948118_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956756_960466
519893	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519895	SIRV6	+	1031	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	34	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	164	495	238	732	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519896	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	116	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519897	contig_6227_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_49632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAGCCGGAAAGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344264	343512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_343500_344300
519898	contig_6445_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_77115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAGGCACAACAGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374923	1376146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1374900_1376100
519899	contig_6445_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_77116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	740	1096	1377498	1377854	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSCDCEESKAQSGVLLLRLCRGAKSPESCVLGKGGERLTEHMSASAPGCLASGGINHIAVYVNNGPLALCDTTMAQKGVLFHLCLSLGSTRVKVTCRRVTSLHLVEAEGQGDTELPC	1376758	1378364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1376800_1378400
519900	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519901	SIRV6	+	770	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1679	141	250	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGGTATCTAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2766	11684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519902	contig_13894_pilon	+	1566	9	Intergenic	novelGene_62096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2084.87385709544	11086	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	27	1010	520713	526612	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLVSNELSPPSL	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526948_527459_527580_528072
519903	contig_15063_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_12689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2188.25750059011	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	3	1340	28164	38994	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	28161	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35369_35858_36158_36266_36600_38977_39092_39506
519905	contig_13744_pilon	-	3688	1	Intergenic	novelGene_77202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	456	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACACCTTTAACGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043043	1039355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1039400_1043000
519906	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_8909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519908	contig_18081_pilon	+	2738	1	Intergenic	novelGene_23839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1097	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	10	354	427182	427526	NA	35	AGTCAAGCAAACATCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLYMFIKPSFYIIYPPTVCKQIQYTCKQKASRSEVVEKRKFPLHTGASPSTLLELMPQGHIKAKRPMKNQKELILTPPPRMDFRTGICSTLQQAGVQQGNRVVFTFTDWLKQYKLSF	427172	429910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_427200_429900
519909	contig_19604_pilon	-	2167	7	Intergenic	novelGene_77231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	44.6819003873182	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	202	315	263736	261859	TRUE	5	ATCTCGGTGGCTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPGRAPVGRLDRGSPGRQSEPGGAGGYLRGDIPETVPLSTVNRQCSSGLQAVANIAGGIRNGSYDIGMACGVESMSLADRGNPGNITSRLVEQKKARDCLIPMG	267729	255636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_255875_259412_259648_259907_261137_261708_261962_263725_263769_264035_264116_267640
519910	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_11175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519911	contig_16411_pilon	+	2852	2	Intergenic	novelGene_77289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	872	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGTGTGGATGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66577	69480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_66860_66910
519912	contig_12923_pilon	-	3224	15	Intergenic	novelGene_30065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	398.622961338308	5	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	557	1966	68226	49694	TRUE	10	CTACTGATCTGTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGEKDSLQVEP	93684	45332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45702_46239_46397_48961_49726_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602
519914	contig_7861_pilon	-	1765	5	Intergenic	novelGene_77400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_4	30.7194970661956	397	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	93	644	135970	45980	FALSE	20	ATTCCTATTGTGTCTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARHAAEGEIYTKLNQKIDEFVQLADYDWTMSEPDGRASGYLMDLINFLRSIFQVFTHLPGKVAQTACMSACQHLSTSLMQMLLDSELKQISMGAVQQFNLDVIQCELFASSEPVPGFQGDTLQLAFIDLRQLLDLFMVWDWSTYLADYGQPASKYLRVNPNTALTLLEKMKDTSKKNNIFAQFRKNDRDKQKLIETVVKQLRSLVNGMSQHT	136062	44858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_46113_47231_47345_83138_83213_103047_103190_135880
519915	SIRV6	+	903	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	729	2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	142	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
519916	contig_11752_pilon	+	1677	9	Intergenic	novelGene_37557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	1099.74607864725	179	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	246	1391	83758	105616	FALSE	35	ATATAAAGATGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQRLISLRILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	83512	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_83788_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
519917	contig_15047_pilon	+	1452	5	Intergenic	novelGene_52156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3251.26752205967	95	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	27	416	2194	4178	TRUE	25	AGAATCTGCATCTTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGECEVLTAGAGPGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2266_3199_3498_4158_4434_4552_4687_21013
519918	contig_14925_pilon	-	1710	5	Intergenic	novelGene_55273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	895.406716246868	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113306_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
519919	SIRV6	+	900	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	532	162	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519920	contig_4469_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_21942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTCTATATTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737262	737725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_737300_737700
519921	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519922	contig_16098_pilon	-	1605	8	Intergenic	novelGene_46109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1051.44239121353	2119	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	138	1034	458816	456727	TRUE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGEACTLILATGRWMNCTCNPYTPIWSDFQSSF	460264	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
519924	SIRV6	+	539	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1409	522	-20	24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2496	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519925	SIRV6	+	568	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	8	69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	25	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCCGAAGGTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2028_2470
519926	SIRV6	+	281	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10464	81	1227	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11464	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11700
519927	contig_7045_pilon	-	3326	19	Intergenic	novelGene_77478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_10	121.070941350541	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	897	2694	100	2793	585475	524577	FALSE	30	GTTACACTTGCTAATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQFTQALLQLCNRSYFLLVPGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKNYMDYLSRLYEREIRDFFEVAKIKMTGTTKESKKFGLHGSSGKLTGSTSSLNKLSVQSSGNRRSQSSSLLDMGNMSASDLDVADRTKFDKIFEQVLSELEPLCLAEQDFISKFFKLQQHQSMPGTMTEAEDLDGGAFSRQHNSGTPLPVSSEKDMIRQMMIKIFRCIEPELNNLIALGDKIDSFNSLYMLVKMSHHVWTAQNVDPASFLSTTLGNVLVTVKRNFDKCISNQIRQMEEVKISKKSKVGILPFVAEFEEFAGLAESIFKNAERRGDLDKAYTKLIRGVFVNVEKVANESQKTPRDVVMMENFHHIFATLSRLKISCLEAEKKEAKQKYTDHLQSYVIYSLGQPLEKLNHFFEGVEARVAQGIREEEVSYQLAFNKQELRKVIKEYPGKEVKKGLDNLYKKVDKHLCEEENLLQVVWHSMQDEFIRQYKHFEGLIARCYPGSGVTMEFTIQDILDYCSSIAQSH	591015	524043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_524730_526699_526895_529563_529764_533133_533318_536679_536909_537447_537525_538831_538940_539488_539653_546188_546295_552563_552714_567408_567463_568441_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585486_590926
519928	contig_9807_pilon	+	2338	13	Intergenic	novelGene_32833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	575.538950318163	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	187	1530	109130	158819	FALSE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSITDRIRD	108943	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151751_158798
519929	contig_11752_pilon	+	1609	9	Intergenic	novelGene_37585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1576.70324074475	9812	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	110	1207	84194	99946	TRUE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVLSTH	84084	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_99929_100018_105597
519930	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-98	913	16	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCGGAGACCTCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	10953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
519931	contig_18108_pilon	-	2503	19	Intergenic	novelGene_33502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	289.473084528884	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	141	2291	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335403	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_277927_277971_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
519932	contig_15063_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_9852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39760	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
519933	contig_15063_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_10470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	AGGTAGTCACATTGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519935	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519936	SIRV6	+	353	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10454	19	1217	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11454	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
519937	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	AGAAATAAAAATATCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519938	contig_10734_pilon	-	1977	3	Intergenic	novelGene_51011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	327.5	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	76	465	320632	311669	FALSE	15	ACAGCCTTAGTGTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEGEMNQ	320707	310156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_318828_319032_320452
519940	contig_12492_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_77500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAGAAAATTTTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265944	265280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_-_265300_265900
519944	contig_3948_pilon	-	2091	14	Intergenic	novelGene_53329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_13	401.533141727212	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	280	1791	1494311	1468245	FALSE	50	AAAATATATGGATGCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510969	1467944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
519945	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519946	contig_17936_pilon	+	2173	11	Intergenic	novelGene_29940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	11	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	37	1320	50646	121021	TRUE	20	CTATTACCAGCCTAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50609	126578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
519947	contig_15063_pilon	-	1424	5	Intergenic	novelGene_11653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	683	1006	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36682	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519951	contig_15063_pilon	-	1516	5	Intergenic	novelGene_12470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	762	1085	35891	35108	TRUE	40	GTAATCACAATGGTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36761	28157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
519952	contig_18145_pilon	+	3117	17	Intergenic	novelGene_37329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	506.288266300682	4	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	998	2596	95966	100744	FALSE	15	TGGAGTCTGAGTCCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86664	101265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92026_92163_92695_92824_93352_93468_94933_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
519953	SIRV6	+	1006	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	480	-1	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519954	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519955	contig_3948_pilon	+	2239	14	Intergenic	novelGene_53296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	525	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1460	1831	1485692	1491198	TRUE	10	TCTGCCGCTGAACCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHRVPVLGVVVTHGQRVAAFGGLTVSDHEGAQHIARGQEVTFRILPADALEEPLFCLQRVNMGDIVARDIAFFLGGQGSSPPPFPRLFQDHHLVPLLEAEVFAVNGLIIIQGDHDDVLRNCL	1467918	1510947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468447_1471755_1472031_1473198_1473354_1482576_1482656_1483426_1483605_1485096_1485250_1485600_1485750_1485882_1485986_1489827_1489927_1490736_1490842_1491191_1491234_1494195_1494313_1494783_1494861_1510768
519956	contig_5033_pilon	-	2014	15	Intergenic	novelGene_28986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	73	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	24	1598	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531166_531890_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
519958	contig_12357_pilon	+	1469	8	Intergenic	novelGene_6101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1079.3145784171	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	74	553	30281	51158	TRUE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQVVLRITTPTASVLQNNSVQPWSTAPRVLGMCSASTVLMRTTSLRCEHSIRMC	25962	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_25993_30237_30323_30933_31060_35038_35192_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
519959	contig_9594_pilon	+	2307	11	Intergenic	novelGene_73941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	464.912991859767	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	118	1182	301335	321999	TRUE	50	AATATATGAAAACATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVVETLPLAVPNGTQRIKSAM	301217	323499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321547_321936_322036_322410
519961	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2922.40458450837	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
519962	contig_10134_pilon	+	2104	2	Intergenic	novelGene_16242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAACTTAAAGATTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32190	35485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_33734_34924
519963	contig_5967_pilon	-	2173	9	Intergenic	novelGene_44381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	376.984229610471	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	111	1175	488569	388566	FALSE	45	TCCACGTTAAGAACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
519964	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519966	contig_9345_pilon	+	1650	5	Intergenic	novelGene_24620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1049	1351	947931	952481	TRUE	15	GCTGGCGGGTCGCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVLAARFHKTRHPDFFFPRLACRAALVAISKTSLTPSLVFAEHSMYPKAPILFAMSLPSSGFTGSCFILASSRLVCSSFRRSFLFPTRMMGTWRNTSV	946882	1001227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474_949557_952459_952555_955192_955356_1001164
519969	contig_12357_pilon	+	2034	11	Intergenic	novelGene_6114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	807.847782691764	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	117	1439	26079	53334	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKLAVHEAKHGVHTCNILICNILIAG	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51230_53256
519970	contig_6576_pilon	-	2100	2	Intergenic	novelGene_42393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCCCCTAGCAGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303204	1295655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1295756_1301204
519971	contig_15063_pilon	+	1446	5	Intergenic	novelGene_12690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	GTGACCAGCCGCTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519973	contig_9290_pilon	-	2012	13	Intergenic	novelGene_77535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	364.923384272492	19	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	348	1673	491418	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	496990	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_493574_493689_496883
519975	contig_5280_pilon	+	2082	10	Intergenic	novelGene_52611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	633.555652987248	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	8	1036	38343	78098	FALSE	25	TCACATTGTCTCACGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38335	79144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_40945_41037_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
519976	contig_7744_pilon	+	2149	16	Intergenic	novelGene_62570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_15	164.005880653374	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	825	1487	887347	890227	TRUE	10	AAGCGTCGTGTGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHVILRARAALGWVARWRGREASFSVFSS	882664	891226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890288_890539_890596_890680
519977	contig_401_pilon	+	2096	8	Intergenic	novelGene_42842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1649.83780278857	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	97	798	1712860	1714182	TRUE	5	TCTCTTATGTTTTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGEYGFVAYLWGFYICVCKEHVGNLLSLE	1712530	1718329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1715239_1717879_1717970_1718177
519978	contig_13021_pilon	+	2292	13	Intergenic	novelGene_8141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	170	2020	174676	180850	FALSE	45	GCCTTCCAATAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174506	181122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
519979	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519980	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	5	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519981	contig_5954_pilon	-	2124	12	Intergenic	novelGene_28636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	458.476222154423	7	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	673	1215	956264	947658	TRUE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFR	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946257_947478_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
519982	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
519983	contig_5988_pilon	-	1751	4	Intergenic	novelGene_15941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.817113950806	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	150	1577	657331	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTHSRQQNGVQLGGSLIVTLLVKRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	657480	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_657256
519985	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	21	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
519986	contig_4469_pilon	+	1968	1	Intergenic	novelGene_21962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	73	300	755614	755841	NA	30	AAAAGAGTCTCCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	755541	757509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755500_757500
519987	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519988	SIRV6	+	1498	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	16	14	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	930	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	35	TTTAAGATAGTTACGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
519989	contig_6735_pilon	-	2014	14	Intergenic	novelGene_15766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	897.997561968726	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	42	1538	564868	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEWQQPEREPGVVMWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568239
519990	contig_15219_pilon	+	2159	8	Intergenic	novelGene_40812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	314.125413664995	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	125	979	19617	23972	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKEQSIFLLTGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19492	25923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23127_23265_23346_23491_23690_24314_24453_24588_25218
519991	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
519993	SIRV6	+	394	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	367	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2474
519994	contig_12837_pilon	+	3213	1	Intergenic	novelGene_57326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTAGCACTGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144515	147728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_144500_147700
519996	SIRV6	+	342	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	95	164	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
519997	contig_1532_pilon	-	1847	7	Intergenic	novelGene_37391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	33	junction_5	1438.56641603137	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	334	1098	27321	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_32144_32227_34870
519998	contig_14415_pilon	+	1968	4	Intergenic	novelGene_77611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
519999	contig_15063_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_8505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	253	1488	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26343	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520001	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520002	contig_9471_pilon	+	2203	11	Intergenic	novelGene_21776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_3	716.506950419883	91	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	720	1205	413930	415737	TRUE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPVSDNDLF	406911	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_416273_416936_417028_417152
520004	contig_12357_pilon	+	2185	12	Intergenic	novelGene_6079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	563.361839303543	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	117	1520	26079	53235	FALSE	60	CAATAAAATAATCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
520005	contig_15063_pilon	+	1821	7	Intergenic	novelGene_13054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	331	1566	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30186	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520006	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_9542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520008	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28179	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520009	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520010	contig_9609_pilon	+	2174	10	Intergenic	novelGene_23061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1001.8360305453	26	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	119	1168	449884	454609	TRUE	75	AAGAAAAAAAATACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYSATLDSVQGQPGSALGCWGWPPGDKAAPSPRPIPQAGGKLSQGFLIYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	436484	456264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_436565_449845_449889_450162_450305_450479_450641_452724_452863_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
520011	SIRV6	+	490	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1500	480	71	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520013	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	34	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520014	contig_18898_pilon	+	3364	18	Intergenic	novelGene_77632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	405	junction_17	326.227445229186	539	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	144	2267	39608	70143	FALSE	30	AGTTGTATCTTGAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSATSHSGSGSKSSGPPPPSGSSGSEAGAGAAAPASQHPATGTGAVQTEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQEVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSQDQPHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGSRGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFNAPRDYSGYQRDGYQQNFKRGSGQSGPRGAPRGRGGPPRPNRGMPQMNTQQVN	39464	71240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_39818_53324_53388_53471_53559_56519_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66244_67304_67500_67957_68059_68476_68541_70078
520015	SIRV6	+	728	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	167	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520016	contig_12414_pilon	-	1687	2	Intergenic	novelGene_59551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	585	917	374006	373674	TRUE	25	GAAGTTTCTGGCAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374590	370805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_370913_373010
520017	contig_14711_pilon	+	3035	15	Intergenic	novelGene_68931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.3601333245452	37	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	223	1656	119007	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	100572	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_100773_118984_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133546_133699_133925_133978_134106_134197_135227
520018	contig_15063_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_12733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28199_34606_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520020	contig_15063_pilon	-	1537	5	Intergenic	novelGene_9723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	785	1108	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36158_36264
520022	contig_1861_pilon	-	3262	16	Intergenic	novelGene_77667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	115.774877336243	19	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	1339	3039	105785	88651	TRUE	30	AGAATCCCTACCTCATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVDSLALLDFFLLCGDQPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTGVNAVLILILTHCRSLVLT	115259	87345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_88604_88710_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_106923_112515_112582_115124
520023	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520024	contig_15063_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_12337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2863.4034188163	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	12	1487	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520025	SIRV6	+	421	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-75	337	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGGTGAGTGTGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
520027	contig_10235_pilon	-	2182	6	Intergenic	novelGene_46415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAATCAGCGGGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213698	210455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_210537_210819_211046_211193_211282_211659_211703_211830_211923_212046
520029	contig_6227_pilon	-	2072	18	Intergenic	novelGene_49761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	239.960564810887	2945	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	114	1778	1224979	1202920	FALSE	35	AAAAGAGGTTATGGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225092	1202625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
520031	contig_6227_pilon	-	892	6	Intergenic	novelGene_49755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	332.176699965545	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	29	595	1224979	1202920	FALSE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225007	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1223788_1223838_1224857
520033	contig_7428_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_77747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGATTTTATTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515503	513006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_513000_515500
520034	SIRV6	+	730	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	103	312	177	488	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2480_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520035	SIRV6	+	514	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
520036	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_12939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28169	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520038	contig_15063_pilon	+	1678	7	Intergenic	novelGene_11783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	229	1320	34808	38987	TRUE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27140	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
520040	SIRV6	+	816	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	20	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	33	365	1673	2560	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520041	contig_8866_pilon	-	3645	8	Intergenic	novelGene_77762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	428.530855222294	1168	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	229	1488	418087	342321	FALSE	40	AATATGATGCTGAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVSPFHSPPSTPSSPSVWSRSSEPEEVPVSFDQPPEGSHLPCYNKVRTRGSIKRRPPSRQFRRSQSDCGDLGNFRAAESSQENGAKEENGDEVFTSKSKAPGPPPSSDSAVGKEVRRSLELDQKPPLRRTSSWTEKREEKGGSAEDTKQWEKAAVHSVEEERQSTAQEEATEPPRASSPKAENGCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	420791	340163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349552_352283_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081_418271_420746
520042	contig_15063_pilon	-	1501	4	Intergenic	novelGene_14083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	25	GCTCTCTGAGGACCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36800	34618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520043	contig_15063_pilon	+	1446	4	Intergenic	novelGene_13793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	ACTAACCATGTCTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520044	contig_14744_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_66075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
520045	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520046	contig_15498_pilon	+	2286	9	Intergenic	novelGene_42635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.75466993323	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	49	1440	675068	686124	TRUE	45	ACAACTACAGAATGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVRQALGRSQAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675019	687365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675095_679255_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866_686619_687013
520047	contig_4364_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532836	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
520048	contig_9609_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_23148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGGTGAAAGGTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737012	736099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_736100_737000
520049	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520050	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520052	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	232	699	34808	35848	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRQPR	27137	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35376_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520053	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	245	1420	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSGDGSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27179_34602_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520054	SIRV6	+	495	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	356	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2030_2470_2621_2740
520056	contig_10235_pilon	+	2133	6	Intergenic	novelGene_46409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	190.386344048096	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	434	583	211879	212152	FALSE	15	TGTCCTTGGATGCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLFPLPTTSQPWPWFCSCCCSQELKGTRGPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210446	213702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210879_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
520059	SIRV6	+	697	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520060	contig_15063_pilon	-	1518	4	Intergenic	novelGene_13892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	40	GGACCCAAGAGTGGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	34609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
520061	SIRV6	+	981	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	539	8	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520062	SIRV6	+	714	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	225	222	-90	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520063	contig_18251_pilon	+	2663	8	Intergenic	novelGene_50152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	1102.64576064545	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	110	439	35708	47022	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMYFTFRFIVKLYSKFP	35598	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_46975_48337_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
520064	scaffold_19766_pilon	+	2782	13	Intergenic	novelGene_34432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	153.892526531415	589	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	713	1783	846171	848686	TRUE	20	CACCTTCTAATCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLR	844647	851577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844793_845085_845163_845497_845663_845845_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_849045_849980_850150_850925_851036_851215
520065	SIRV6	-	1375	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9288	-99	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTTTCAACAGTACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
520066	SIRV6	+	710	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	615	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACCGGTTATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	3155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1848_2027_2470_2621_2740_2829_3106
520067	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520068	contig_7357_pilon	-	2125	9	Intergenic	novelGene_36788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2203.96687815403	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	31	879	160025	137874	TRUE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMDYLFSLKECKF	166794	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137910_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
520069	SIRV6	+	342	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	95	164	75	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
520070	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_8655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3420.05887193481	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26559	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520071	contig_6735_pilon	-	1816	16	Intergenic	novelGene_15718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	937.201508036914	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	86	1525	564868	542464	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542193_542381_542601_542790_542857_543005_543040_543096_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
520073	contig_20641_pilon	+	1703	8	Intergenic	novelGene_52788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1226.78038884267	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	89	1423	14311	56882	FALSE	80	AAATAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFETSLANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14222	57162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14334_14678_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
520074	contig_13608_pilon	-	3233	17	Intergenic	novelGene_52372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_10	194.456132585218	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	107	973	470234	411475	TRUE	35	TAACAGCAAAATGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGNALCCSGFLVSSVLGLTTF	470340	368773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
520075	contig_4754_pilon	+	2029	15	Intergenic	novelGene_35954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	163.409152192918	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	53	1633	380119	420387	FALSE	25	CCCCTCCTTTTCACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380066	420783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409331_409626_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
520076	contig_9955_pilon	-	2787	4	Intergenic	novelGene_21311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_3	476.504168105823	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	225	917	49296	47546	TRUE	55	AATACTCAAATATTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49833	45111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794_49380_49692
520077	SIRV6	+	390	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1615	2	223	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2739	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520078	contig_3825_pilon	-	1624	2	Intergenic	novelGene_78002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	0	47	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1028	1336	1463725	1462075	FALSE	10	TTTCTTGTATGCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1464752	1461786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664
520079	contig_15063_pilon	+	1716	5	Intergenic	novelGene_8453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	399	1574	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26197	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520080	contig_9345_pilon	-	3501	14	Intergenic	novelGene_24413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_7	53.1361987848376	607	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	50	1459	221088	196247	FALSE	35	CACAAGAGTTTAAGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPVLHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDMVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALCDVRRFLSEEGGHVAVFDATNTTRERRETIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLGSPDYVNRDSDEATEDFLRRIECYENSYESLDEELDRDLSYIKIMDVGLSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221137	194204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205_205414_207634_207757_208548_208606_209024_209100_211740_211808_214946_215044_215211_215329_220991
520082	contig_7179_pilon	-	3507	6	Intergenic	novelGene_78130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.17066790642	155	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	81	521	933323	893275	TRUE	15	CTTGCCCTGACTACGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVEASSCDGKGQGVETSVTYYRLEEVAKRNSSKEIWLVIHGRVYDVTRFLDEHPGGEEVLLEQAGVDASESFEDVGHSFDAREMLKQYYIGDVHPNDLETENSSKDTSKNNTCKSCWSYWVFPIVGAILLGFLYRYYTSESKSS	933403	889706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_892322_892903_893366_896320_896350_907840_907871_908411_908541_933161
520084	contig_15063_pilon	+	1426	6	Intergenic	novelGene_9536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	240	1268	34808	36632	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27129	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
520085	contig_14980_pilon	+	2997	3	Intergenic	novelGene_78226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_2	137.5	697	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	11	478	421855	428232	FALSE	20	TGAGAGTGTTTGTCTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAMSKRNQVSYVRPAEPAFLARFKERVGYREGPTLETKRIQPQLPDEDGDHSDKEDEQPQVVVLKEGDLSVEEVMKIKAEIKAAKADEEPAPTDGRIMYRKPVKRPSDEKYSGLTASSKKKKTNEDEVHKQESFKKNSQKQIKNSSLLSFGNEDENE	421844	430751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_421963_426965_427111_428017
520086	SIRV6	+	801	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	364	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	66	557	1733	10736	TRUE	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1667	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2478_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
520087	SIRV6	+	698	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	345	100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	27	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTAGGTATAGTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	11068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
520088	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	248	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	8	1417	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520089	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	255	1490	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520090	contig_7020_pilon	+	2108	3	Intergenic	novelGene_57069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	321	166	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	143	1309	102160	103509	FALSE	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98735	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106_102995_103177
520093	contig_366_pilon	-	3111	18	Intergenic	novelGene_51641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.923988694014	11	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	852	1220	1432853	1423794	TRUE	15	AAAGCTGGCTCTCTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFLLWPWARGQGIPVIEPQGPELVVEPGTPVTLRCVGNGTVEWDSPISPGWTLGHEAPSSILTTTNATFRNTGTYHCTESGELSRGDANIHLFVKDPFRPWNILAEEVTVLEDQDALLPCLLTNPELEADVSLVRERGRPVRHDTSYSFLKWRGFTIHKTKYLDSSVYHCSTLVGGRKVLSIGIQLKVQRVSGPPALKLEPAELVRIQGEAAQIVCSASSVNPAFDVFLQRGDTKLTVYAATDFHDKHYHNVLTHNLHHVGFQDAGNYSCVATSAQGGSSTSMVFRVVESAYLNLTSEQNLLQEVSLGEKFNLKVKVEAYPALQGFNWTYLGPFSDQQHSLNFDIIEDTYRYTSTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNAGGWKTLTFEIILRYPPRGKGHADPHQWL	1440908	1406042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406736_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440875
520095	SIRV6	+	971	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	539	18	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520096	contig_12464_pilon	-	3602	10	Intergenic	novelGene_68647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	547.497764807434	40	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	865	1317	98468	96686	TRUE	15	CCCACCTTGATCTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAMQNLGFPPDNISGKPARSHLLGSGGGLDNRLALTSGTTRRFLPETLEQPWKLICLRLNHDSAGDTKCARVIWQSDPDIQKKTSRNMREVWSWGSHGLISLPTRYIPTGIRNRKRKKSLIRRVRSHSWLPPCREMTHLPADQEEEGP	234944	93017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_94328_95478_95560_95791_96912_98241_98524_101765_101890_127966_128068_182087_182194_192378_192459_222492_222589_234642
520098	SIRV6	+	363	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	513	-20	340	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTAGGTATGGCACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
520099	contig_15087_pilon	-	2371	4	Intergenic	novelGene_37270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGCTGTGGCGGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303696	284615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_284740_289294_289448_301234_301421_301788
520100	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	68	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520102	contig_9233_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_78254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACCCTGTCAGGAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679050	676351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_676400_679000
520103	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	203	1378	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520104	SIRV6	+	775	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	561	580	345	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	85	576	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1648	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520105	SIRV6	+	716	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGTGCAAATAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520106	SIRV6	+	837	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	6	126	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	204	692	1733	10736	TRUE	45	CAAAGAAATTTAAAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1143	11094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11031
520108	SIRV6	+	807	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	373	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	235	546	2021	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1676	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520109	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520111	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	591	1412	35271	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34936_35037_35380_35839_36158_36266
520112	SIRV6	+	536	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1434	500	5	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2521	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520113	SIRV6	+	685	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	804	537	-394	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	111	443	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1891	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520114	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	21	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	231	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
520115	SIRV6	+	744	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-8	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	26	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1725_1856_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520119	SIRV6	+	972	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	544	12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	20	GCCTGCCTAATTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520120	contig_5033_pilon	-	1979	14	Intergenic	novelGene_28997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3394.83025867378	40	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	29	1534	566787	531429	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSY	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531430_533416_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
520121	SIRV6	+	780	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	360	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	221	550	2002	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1663	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1728_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520122	SIRV6	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTAGCCGAATTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11821	11491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
520123	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520124	contig_15063_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_12384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	26	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	10	1425	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36164_36266
520125	contig_7744_pilon	+	2621	24	Intergenic	novelGene_62543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	241.243689986727	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	932	1735	887347	890785	TRUE	20	ACTTGATTATGATTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879798	893014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680_890865_891570_891756_891836_891897_892068_892276_892400_892536_892673_892787_892907
520126	contig_3956_pilon	+	1974	11	Intergenic	novelGene_15230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1271.34582628017	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	178	1629	1286220	1290665	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1284175	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284222_1284684_1284765_1286168_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290369_1290521
520128	contig_5499_pilon	-	3142	14	Intergenic	novelGene_56982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTTCGTTGCATCGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796470	776453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_776571_777636_777716_780032_780102_780187_780281_780366_780459_782346_782424_783299_783370_787845_787933_789165_789388_790463_790670_791054_791186_791871_791987_794159_794746_795272
520129	contig_15063_pilon	+	1623	6	Intergenic	novelGene_8433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3599.786771463	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	330	1502	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	2724	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_2798_27112_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520130	contig_1244_pilon	-	1772	12	Intergenic	novelGene_38010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_10	982.460000657819	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	79	1350	948448	923211	FALSE	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948526	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_947578_947655_948440
520132	SIRV6	+	692	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	577	-441	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520133	SIRV6	+	766	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
520134	contig_7677_pilon	-	3005	11	Intergenic	novelGene_78270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.574566004862	876	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	59	1324	524311	479264	TRUE	20	TGGTCATATCAGTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDPDNYIAYYRRATVFLAMGKSKAALPDLTKVIELKMDFTAARLQRGHLLLKQGKLDEAEDDFKKVLKSNPSENEEKEAQSQLRKADEMQHLRSQALYAFESADYTAAITFLDKILEVCVWDAELRELRAECFIKEGEPRKAISDLKAASKLKNDNTEAFYKISILYYQLGDHELSLSEVRECLKLDQDHKRCFAHYKQVKKLNKLIESAEELIRDGRYADATSKYESVMKTEPSVSEYSIRSKERICHCFSKDEKPVEAIRICSEVLQIEPDNVNALRDRAEAYLIEEMYDEAIQDYETAQEHNENDQQIREGLEKAHRLLKQSQKRDYYKILGVKRNAKKQEIIKAYRKLAMQWHPDNFQNEEEKKKAEKKFIDIAAAKEVLSDPEMRKKFDDGEDPLDAESQQGGGGNPFHRSWNSWQGFNPFSSGGPFRFKFHFN	524369	475894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_-_477416_479103_479422_484998_485148_486070_486204_494728_494850_494938_495045_503107_503228_503609_503792_505647_505801_521580_521656_524242
520135	contig_3817_pilon	+	3590	7	Intergenic	novelGene_78356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	116.56674292248	474	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	55	1002	600174	638773	FALSE	5	ACCTGTCTTCTGGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFCLPQTGFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDGAVPLPESRREIEELLAEAKYYLVQGLVEECQAALQNKDTYEPFCKVPVITSSKEEQKLIATSNKPAVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDNMLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNILLYEAQDGRGPDNALLEATGGAAGRSHHLDEDEERERERIERVRRIHIKRPDDRAHLHQ	600119	641361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547_612762_627206_627377_630762_630850_631177_631231_632474_632671_638548
520136	contig_5020_pilon	+	1156	6	Intergenic	novelGene_27884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1087.05344854795	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	502	1092	122915	126023	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSLLSLSCCRPDHLRQWRQPSQALLPFFSFPSLFISLPSPPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	118490	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121748_121929_122825_123041_123152_123356_125761
520137	contig_13707_pilon	-	1827	9	Intergenic	novelGene_43546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	768.097283877505	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	97	846	274534	270672	FALSE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKHPHHSQRQGGCRSFPGLLIRTSHGLFSLNSPRLLLKDFMCVFKCFS	275241	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270813_272432_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197
520138	contig_15063_pilon	-	1688	6	Intergenic	novelGene_13107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	50	CCAAGAGTGGACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	34605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36167_36278_36597_38972_39090_39504
520139	SIRV6	+	950	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	480	164	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520140	contig_17936_pilon	+	2041	12	Intergenic	novelGene_29918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	812.463074812563	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	57	1340	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50589	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766_126083_126240
520141	contig_9807_pilon	-	2777	15	Intergenic	novelGene_32877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAAGACCGCGCCGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159765	109030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_109146_109556_109679_122892_122982_126621_126716_128602_128716_139397_139476_140298_140382_140723_140956_145113_145204_147121_147276_148957_149047_151709_151818_154093_154270_156624_156768_158674
520142	contig_11285_pilon	+	1923	12	Intergenic	novelGene_5619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	508.553937589728	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	12	1142	766060	769225	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTPVSP	766048	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768787_769209_769320_769421_769653_769740
520143	contig_3948_pilon	-	2294	7	Intergenic	novelGene_53221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	295.102618686374	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	166	825	856685	840803	FALSE	80	GCCAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869611	839333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856695_866363_866480_869571
520144	contig_17936_pilon	+	1785	9	Intergenic	novelGene_29916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	717.802625639528	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	61	819	50646	118726	TRUE	25	GCCTAGTGTCTTGAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKKMK	50585	126587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106431_118713_118827_121017_121063_125766
520145	contig_18145_pilon	+	2783	9	Intergenic	novelGene_37363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	252	junction_4	569.963595328684	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	844	2271	96213	100744	FALSE	30	GGGTCAAAATGGAGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	95369	101256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
520146	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520147	SIRV7	-	1904	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-27	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTATTCTTCCAAGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114765	1021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43076_114680
520148	contig_19564_pilon	-	2025	4	Intergenic	novelGene_29576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	964.493649538451	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	721	1158	12638	12201	FALSE	15	CCTTTGCAAGATGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15686	11333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12744_12840_13259_13554_13583_15517
520149	contig_15063_pilon	+	1401	4	Intergenic	novelGene_14219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	88	1260	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34720	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520150	contig_8317_pilon	+	456	2	Intergenic	novelGene_19365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16243	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
520153	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	39	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520155	contig_12622_pilon	-	2339	13	Intergenic	novelGene_5966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	49	junction_10	2268.15590017529	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	18	848	1590968	1588838	TRUE	35	CCTTCAGAAGCGAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGARRRVSFRREGRAPGTRLSSRPRHSGRRPLRRRRIVVVGQGRRGSYPLWKCRWRSLPLSLHLRGPLIHRLHRRRPLRRHALVQHHGRLRHRPQVWLLPQ	1590985	1583553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585590_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589531_1589691_1590000_1590234_1590830
520156	contig_8330_pilon	+	4228	4	Intergenic	novelGene_71872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1141	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947119	959262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_947290_950737_950858_953218_953346_955451
520157	contig_1230_pilon	+	1872	8	Intergenic	novelGene_28857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1363.90284829669	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	189	1634	405362	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404458	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405372_406220_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
520158	SIRV6	+	395	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-5	95	2	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
520159	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_10547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	27	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520161	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520162	contig_3627_pilon	+	3002	1	Intergenic	novelGene_78548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCTTGCTTTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674830	677832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_674800_677800
520163	contig_3077_pilon	+	1711	9	Intergenic	novelGene_26693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_7	3052.85059155783	237	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	530	1213	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10088	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
520164	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_9027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520165	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_11852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520167	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520168	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520169	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_14118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	11	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	186	1358	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34622	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520170	contig_15063_pilon	+	1459	5	Intergenic	novelGene_14072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	191	1318	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36431_36475
520171	contig_8978_pilon	-	2105	11	Intergenic	novelGene_49380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1630	1944	343380	339872	TRUE	20	CGAGACGACGGAGCTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVTGRGNVVSRKEPSLHLSRAFRAAGFPENSTMPFPEGLPRSSTMTTALSTWVKVFSPGFLKFFRSIVKPSFWLLACCPFAGTGGGSGCGCCCCCWWCCWW	348141	331566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339964_340939_340998_342534_342670_343350_343447_343638_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
520172	contig_3602_pilon	+	2192	6	Intergenic	novelGene_60495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1292	junction_1	440.7209548002	25	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	122	571	161745	169451	FALSE	45	TTCAAGCTGTGAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161623	171072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422
520174	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_14047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	194	1369	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34614	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520176	contig_19579_pilon	-	2351	6	Intergenic	novelGene_59385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1118	junction_4	227.741432330615	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	106	327	13090	12869	TRUE	65	AAATAAAAAAAATCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGMGHSKGNVL	13195	7175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012
520177	contig_5485_pilon	-	2104	4	Intergenic	novelGene_37685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	6095	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	152	1294	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88086	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
520178	contig_15063_pilon	+	1481	5	Intergenic	novelGene_11658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	25	AACCATGTCTGTGGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520179	contig_7695_pilon	-	3322	18	Intergenic	novelGene_41610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	32.0468947045983	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	1746	2960	514768	504301	FALSE	60	ATAGCCAGAAAAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525096	503938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_515705_515792_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166
520182	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520183	SIRV6	+	617	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	387	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAGACTGTATCGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690	10816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
520185	contig_20844_pilon	-	2725	15	Intergenic	novelGene_78610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	379.274199448561	97	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2038	2619	206899	204834	FALSE	15	CATCCTCCACGTGCTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	228943	204727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120_209254_225631_225723_226767_226885_227109_227274_227669_227866_228865
520187	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	25	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	236	1477	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGENNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34932_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520188	contig_11086_pilon	+	2901	15	Intergenic	novelGene_61185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	164.285667701857	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	74	1783	24460	47662	TRUE	15	TCAACCCAGTGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRS	24386	52226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46653_47661_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_49653_49738_50803_50951_51960
520189	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520190	SIRV6	+	538	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	349	8534	176	257	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCGGTCTTACAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	2797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
520191	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520192	contig_5643_pilon	+	1264	8	Intergenic	novelGene_39136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAGGAGAAAGGGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647031	651393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650570_650869_650958_651155
520194	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520196	contig_16496_pilon	-	1053	2	Intergenic	novelGene_5224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	17	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	40	AGTGCTCAAAGTGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
520197	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	574	1395	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34913_35028_35380_35839_36158_36266
520198	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520199	contig_15063_pilon	+	1168	5	Intergenic	novelGene_11044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	232	1167	34808	36424	FALSE	25	ATTATGTCACCAGCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASN	27137	36425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520201	contig_15063_pilon	-	2497	4	Intergenic	novelGene_13072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2061	2402	34060	33719	FALSE	20	TCAGCCCAGCTCAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFQPGVYGVQMEGVCEGCRLGSMLHSLSPEPHQVTRGQHSTLSSRTVQHSQLRSHWTYLAQPSSMQSQSSSIDSAWLRPAQPSSAQLTRVIPAQPVKRSPTQPSSAQTSPA	36801	33623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520204	contig_14638_pilon	-	2197	5	Intergenic	novelGene_71573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	91	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	10	CCTGTTCTGAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
520205	contig_8772_pilon	+	2065	9	Intergenic	novelGene_21089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4605.17680001268	4	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	143	1444	15355	20769	TRUE	35	AAAAAACTCTTGCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRYRIQTYMFEVPGCCKQLMCSAAN	15212	23415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20909_21478_21523_21966_22053_23063
520207	contig_2204_pilon	+	1957	7	Intergenic	novelGene_71665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	21	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	25	TTTAAAGGGCATCATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
520208	contig_4874_pilon	-	3192	1	Intergenic	novelGene_78636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATAAAATAAGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383889	380697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_380700_383900
520209	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_8775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520210	contig_15063_pilon	+	1277	4	Intergenic	novelGene_14280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	335	1156	35271	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34824	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520211	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520212	contig_7744_pilon	+	2269	14	Intergenic	novelGene_62519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_13	72.126614510249	683	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1109	1879	828968	830740	FALSE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825260	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
520215	contig_15491_pilon	-	2600	7	Intergenic	novelGene_75972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	232.835719386485	1173	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	34	504	91394	83039	TRUE	25	TTGTGTTCCCCCAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGLFHSLLLGMSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSEMPNVANIWKI	91427	79265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_82905_83074_85966_86213_87650_87753_91306
520216	SIRV6	+	744	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-8	565	-2	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGAGAGTTAGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520217	contig_15063_pilon	+	1432	6	Intergenic	novelGene_12886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	236	1369	34808	36740	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSLTRPTPATDHWAPRPYSAPCGDQPLCVCPCVHSN	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36518_36635
520219	SIRV6	+	1027	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	254	748	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520220	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	17	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520223	contig_15063_pilon	+	1501	6	Intergenic	novelGene_14256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	12	1247	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34796	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520224	contig_10940_pilon	-	1861	5	Intergenic	novelGene_49232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	143	571	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917142	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874498_874735_875675_893147_893306_916664_916748_916923
520225	contig_10642_pilon	-	2945	1	Intergenic	novelGene_78650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	657	965	115546	115238	NA	75	AAAGGAGGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLAFLTSKEHSGCTSSKTDLFVLLAVHGIFNILHQHNSNASILLWSNLFIVQLSNVYEVTENTMAWVRCTLVLKLTSLLFKTLKRSFATDLPNAICHLIS	116202	113257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_113300_116200
520226	SIRV6	+	539	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1393	538	8	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	89	298	2569	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2480	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520227	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520232	contig_854_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_36320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	249	323	563279	563353	NA	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQPSQPDGSDPPGLLRKARWCPSWPRSPLPVVFFSSWLQSLVDVFFVLEAGVNLQALRPNPLCSRLPRGKKGSPRIQYATLMLLQSLLAASCGSIYPFTLVPPSA	563030	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_563000_563800
520233	contig_3018_pilon	-	3391	13	Intergenic	novelGene_78792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1851	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1873	2217	517532	499636	TRUE	5	GCAGGGGTGGTGGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKCLCTQQAFPRSAILTLILSAFRGSRGFTNKSAARVFVFGKSPVLEAETVLLLSWDGLLSSCSLRGDPSESAEPQATGSKGPGNNEVGNSGSCDSGILCCPFGNSPLNCS	536546	455349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_455430_478862_478976_479811_479899_480125_480214_483780_483884_495532_495727_498505_498752_499372_499857_517300_517401_517508_517617_522875_522945_523587_523681_534920
520234	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520236	contig_3077_pilon	+	1590	9	Intergenic	novelGene_26649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_8	3201.29629017684	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	63	1097	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9613	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
520237	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520239	contig_5954_pilon	-	2345	13	Intergenic	novelGene_28673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	414.744198271658	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	130	978	959926	947658	TRUE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEISIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFR	960589	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_959766_959941_960474
520241	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	206	1378	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34602	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520242	contig_5092_pilon	-	2102	6	Intergenic	novelGene_62303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	100	414	451516	444945	TRUE	10	TAATTTTGGCTCCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451615	443178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444633_444710_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
520243	contig_3948_pilon	+	2139	3	Intergenic	novelGene_53395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.5	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	98	667	1814088	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813884	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813958_1814063_1814520_1860434
520244	contig_10311_pilon	-	1850	11	Intergenic	novelGene_50431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.59539802372	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	36	1202	71526	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71561	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65871_67190_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
520245	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	557	1378	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35033_35380_35839_36158_36266
520246	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520247	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_12192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	230	1396	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCTPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35374_35839_36158_36266
520250	contig_11427_pilon	+	3189	1	Intergenic	novelGene_78965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	454	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	165	596	71148	71579	NA	15	TTTTTCGTAAGTAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLVSLPGIIFTRSQKEGLRYTCSPHFPSSQYHFWKNFQTLKITILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFAIMIVYFLFWAPYNIVLALTTFQELFGLDNCNSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFRKHIAKRLCKYCPSFQLEAPERVNSVFTRSTGEQEISTGL	70983	74172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_71000_74200
520251	contig_15063_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_12009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	221	1456	34808	39515	FALSE	25	TATATATTCTCCTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27148	39755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520252	contig_15063_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_13094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	800	1123	35891	35108	TRUE	50	CCAAGAGTGGACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	34605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36159_36264
520253	SIRV6	+	977	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	549	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	549	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520254	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520255	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	9	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520256	contig_15666_pilon	-	1995	7	Intergenic	novelGene_70127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	649.141676883149	132	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	96	1025	110619	107816	TRUE	35	TTAAGATACATTTAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110714	106660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_106909_107093_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110246_110558
520257	contig_3424_pilon	+	2378	3	Intergenic	novelGene_55486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	495	2138	169035	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149957	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150303_163681_163762_168965
520258	contig_15063_pilon	+	1195	4	Intergenic	novelGene_9638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	240	689	34808	36299	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNRWPSMHQPST	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35337_36266
520259	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520260	contig_15063_pilon	+	1494	6	Intergenic	novelGene_12126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3867.09686457425	11	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	531	1352	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27535	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35156_35214_35380_35839_36158_36266
520261	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	2	1250	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
520262	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10285	123	1048	13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCCGATGCGGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11285	11703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
520263	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520264	contig_14508_pilon	-	2902	14	Intergenic	novelGene_79043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	1231.65176531596	448	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	232	1158	172340	43875	FALSE	20	TCTTTATATTGTCATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASRALSSRWESEGRCTRVAARSRATCARVKVLGGAAGGIEAKVLLLQVVAACTCCRARVPVHSRRPPPSPAPAVRAMAPRKNAKGGGNTSSSSSGSGSTSAGSSSSSGSSRARREAKHGGHKNGKKGGLSGSSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEILGKLGVYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHGEDLYQEEDEPTRDQQLEDEDFLTGSDADDKIENLETETFHEETEDSYQVEETAPQDYNQDMEEIIYEQENPGSSEPVVDDERLHHDADDITYQVYDEQVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPDT	172571	42130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_43883_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387_63421_64057_64106_64597_64655_65526_65560_69277_69404_74524_74600_77847_77941_109280_109350_111889_112040_172225
520267	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520269	contig_12864_pilon	-	589	4	Intergenic	novelGene_76410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	663.172844907135	121	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252143	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242658_249821_249843_251887_251999_252111
520270	contig_4180_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_8311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTTAAGCTCTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743321	741935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_741900_743300
520271	contig_9609_pilon	+	2120	9	Intergenic	novelGene_23063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	846.146263952043	4898	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	193	1104	449884	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	441851	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_442006_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
520272	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520273	contig_16650_pilon	+	2108	4	Intergenic	novelGene_61966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	5838	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	85	462	244670	254361	FALSE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244585	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
520274	contig_9345_pilon	-	3348	22	Intergenic	novelGene_24562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_21	221.714234576986	354	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2889	21	2909	922013	881092	FALSE	5	TGGCATCCCCCTTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAADEMAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSIAPSRNFTTSPKSSASSYSSVSASPIANGDSTNTSGMHGSGVSRGGSGFSASYNCQESPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEVEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDTHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRIMEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRERKSRLSSTSSGAVLYGQPLLVSVPKHKLTLEFLYQAVCERISRYIKQPLPDEFGSSPLELGACNGSRGSCEGEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEEELGSDPSETIQKKVKGQPCPKRLFTFSVVNSYGTADINSLATDGKLLKLNSRSTLAIDWDSETRNLYYDEQESETCEKHVSMLQPQKKKKTSVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPVRALNMSEFVCDLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFSKTPSPITLPGSSDGGMRPSSSQQGLGDDEACSMDTN	922033	880652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053_890276_893010_893100_893734_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023_900183_902070_902245_905275_905394_906192_906334_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
520275	contig_17936_pilon	+	2275	13	Intergenic	novelGene_29900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	893.546410378331	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	67	1416	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQATCSFRGHQPADSGPIPGSCGMSKFPLSLMEKAFLKQKQMYLEQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50579	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79235_79279_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106449_106568_106703_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
520276	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_11851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520278	contig_9871_pilon	+	3071	6	Intergenic	novelGene_75651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	197.908059461963	827	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	518	1267	408711	419187	FALSE	40	TTTTCGCAAAGTAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384512	420991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384991_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
520279	contig_15063_pilon	-	1733	7	Intergenic	novelGene_9151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
520280	SIRV6	+	573	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8722	7	69	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCCGAAGGTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
520281	contig_10734_pilon	-	1902	6	Intergenic	novelGene_51013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	522.816985186977	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	83	742	320632	311391	TRUE	20	AACAGCCTTAGTGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEVITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFLFSELYVHSLCFFAINRYWGKTSL	320714	310157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310859_310931_311464_311572_311676_315844_315953_318838_319032_320449
520282	contig_15063_pilon	-	1514	4	Intergenic	novelGene_13973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	804	1130	35891	35108	TRUE	35	GAGGACCCAAGAGTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35836_36156_36264
520283	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2583.02558785235	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	231	773	34808	35938	TRUE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27540	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35858_36158_36266
520284	contig_15063_pilon	+	1870	8	Intergenic	novelGene_13039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3515.61926498398	93	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	809	1615	35349	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30082	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35157_35214_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520286	SIRV6	+	786	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	186	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	39	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	1673	2560	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1489	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520287	contig_854_pilon	-	1884	2	Intergenic	novelGene_36376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	75	395	977635	976188	FALSE	15	CCCTGAACTTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPGAEGSFSLGSGEGPAPPPPGPMTGTQDPKDSPSALHTGAGGPQDSVVASGYVTSADLVFTSAPEALSGSLTPPLGHPSHQNPSPCPGLASGPPGAPAPLQPGFEDYVELPPTTGQPPKSPLCSPASG	977709	974698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976194_977320
520288	contig_7412_pilon	-	1973	9	Intergenic	novelGene_76333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1400.70131987515	213	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	304	1959	377290	364215	FALSE	5	TGGCTTCCTCTCATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQSPALQASAPLLPGLAPSCLPPLVSSVRHVKGSLRSGEGTCFCHSLAKAMSRSPNHSAAFSGSGSPNYK	378063	364200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364422_364522_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
520289	contig_11720_pilon	+	1956	13	Intergenic	novelGene_43959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	391.082152494843	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	948	1700	269766	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECALHISLLLSRRPQFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269674_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
520291	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520292	contig_21422_pilon	+	2219	7	Intergenic	novelGene_79074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_3	79.0557117199988	454	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	190	1083	4766	12180	FALSE	25	TTAAAGTGCTTAATGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSPPGEGKATVPCLAERLTTELIVHIQKSLPLLEHQIIDSHQRATEELRRCGADVPDRETDKMFFLIEKIQTFNRDIEKLTEGVEAVKENEMRLYNQIRNEFKTWGLILAANTQKVRNIVHEEVSKYENQYRGKELPGFVNYKTFEAIVRHYIQQLVDPALDVLQKVTEIVRQAFTGMAKNNFGEFANLNQTAQTMIEDIKVKQAETAENVIQLQFRMEQLVFCQDQIYKMILNKIQEEMFNPLENTPQVFQMKKSNLFDTNVSDPSTSSITEIGVHLNAYFTETSSRLANQIPLIIQFFLLQENGDCLQRSMMQLLQEKERYVWLLQEEREMATKRRLLKERIYRLTQARHTLSQFST	1643	13316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_1728_4660_4784_5064_5207_6749_6909_7537_7615_9620_9888_11949
520293	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_9515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520297	contig_610_pilon	-	1550	3	Intergenic	novelGene_76719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	904.5	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCCTGAAGTTGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235504	213485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998
520298	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520299	contig_5643_pilon	+	2772	10	Intergenic	novelGene_38938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	124.663101553302	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	135	1217	481872	501081	FALSE	25	GGATGCTCCATGTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462243	502636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495658_498127_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
520300	contig_3463_pilon	-	2695	14	Intergenic	novelGene_61998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	174.659906218447	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	291	1649	532098	508757	FALSE	15	CTCCTCACTGCAGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597529	507710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_551883_552007_597388
520301	contig_500_pilon	+	1773	11	Intergenic	novelGene_31034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1052.69274244672	325	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	380	1357	1492663	1498065	TRUE	15	GTTTGACTGTGTTTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485757	1499590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492466_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
520304	contig_1443_pilon	-	2033	10	Intergenic	novelGene_28289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	442.790143421363	69	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	445	1368	776427	748649	FALSE	45	AAAAAAAGAACCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809528	747983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776485_805505_805718_808694_808741_809399
520305	contig_10235_pilon	+	2149	4	Intergenic	novelGene_46434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	237.8963359673	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	13	609	210483	212152	FALSE	35	TGAAAACGAATGTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHTHIAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210470	213692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211825_211924_212047
520306	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	172	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520307	contig_4857_pilon	-	2942	8	Intergenic	novelGene_48636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	92.6807115084594	505	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	909	1343	443714	441598	FALSE	35	ATTTATTGATGATTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCGWISANPSPLLEKPLWNPKHGLNINLCGKTGQRCVSGFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448624	439998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_443592_443746_444432_444537_444997_445070_447620_447760_448062
520309	contig_15063_pilon	-	1549	5	Intergenic	novelGene_9198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	799	1122	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36799	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34607_34924_35035_35380_35839_36155_36264
520311	SIRV6	+	612	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	109	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	158	487	2002	10736	TRUE	35	ATAGTAGATTGCGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1844	11077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11034
520313	contig_10940_pilon	-	2100	4	Intergenic	novelGene_49234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	6787	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
520314	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520315	contig_10011_pilon	+	2989	11	Intergenic	novelGene_68091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	90.0204976658094	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	60	1295	322928	328407	TRUE	15	AGTGTGGCTGGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSCCTASAPSLRPRVSVT	322868	334179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328274_328355_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
520316	SIRV6	+	310	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	165	10	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTTATAGTTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	1955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
520317	contig_10042_pilon	+	2250	14	Intergenic	novelGene_79203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	82.7790957804255	865	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	247	1245	1060566	1090129	FALSE	15	GGTATATTCTTTTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHKMEPSSYAAEPVSDSGLPALSPPSLRCVPPPAAAVIVPTYSTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028995	1091134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1060511_1060696_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
520318	contig_8820_pilon	-	2766	11	Intergenic	novelGene_79291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1115.46702775116	2902	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	58	1755	170762	167088	TRUE	50	AAAGAAATGGTGTGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLRPGAAALRSVCRLFAKMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQKES	171330	165785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167101_167604_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170763_171273
520319	contig_15063_pilon	-	1302	5	Intergenic	novelGene_10600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	535	882	35813	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRESLGRCGFPRAQWWTLLQESCNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36456	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35737_36156_36264
520322	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520324	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_14119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	186	1358	34808	36661	FALSE	20	TAAGTGAGCGCTGCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34622	36814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520325	SIRV6	+	943	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	30	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	160	648	1733	10736	TRUE	40	ATCAACTCACCATAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520326	contig_11285_pilon	+	2146	12	Intergenic	novelGene_5606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	531.806588840233	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	30	1391	766060	769349	TRUE	15	TCAACTGTCTCTTGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPAELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHVSAHLPDPG	763528	770192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767385_767792_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769653_769740
520329	contig_12427_pilon	-	2078	6	Intergenic	novelGene_40515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1207.39017720039	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	87	710	522337	506035	FALSE	5	TGATTTTGCCCTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	577713	504666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577635
520330	contig_1532_pilon	-	1684	6	Intergenic	novelGene_37377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1361.70613569889	22	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	399	935	15864	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32182	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18026_28842_28964_29438_29505_32049
520331	contig_9482_pilon	-	1944	11	Intergenic	novelGene_44290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_6	116.172285851661	1546	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	90	1715	1253164	1236365	FALSE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253253	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
520332	contig_7151_pilon	-	2943	15	Intergenic	novelGene_40658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	124.867460345205	3	110	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	60	1529	65162	12779	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSGENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLVPGPQAGE	65221	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13356_13676_13779_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
520333	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_13952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	198	1436	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520334	contig_14925_pilon	-	1992	8	Intergenic	novelGene_55320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	976.753619216771	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	41	595	322420	115866	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQSAVIQAHLWERNSCDCGTKKSASNQTICFRNEKWDEGCLSGEGFLSQGYKYNPQLRFSDVFSSTQQ	322460	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_115906_115995_116101_129436_129494_321808_322113_322371
520335	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27179_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520338	contig_6735_pilon	-	1333	6	Intergenic	novelGene_15662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_1	1004.41903606015	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	89	853	545022	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	545921	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874
520339	SIRV6	+	733	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	345	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	242	574	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1648	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520340	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_14021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520343	contig_8616_pilon	+	1568	9	Intergenic	novelGene_72566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1574	junction_2	580.546388650382	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	540	1493	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
520344	SIRV6	+	658	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	825	543	-373	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	90	422	2002	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1912	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520346	contig_12570_pilon	-	2451	9	Intergenic	novelGene_79346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	261.013140234357	979	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	721	1392	198025	190389	FALSE	15	CTGTATAGGTTATTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228672	189329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_201284_201386_204946_205018_205425_205534_211349_211479_228427
520347	contig_12873_pilon	+	1729	6	Intergenic	novelGene_27155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1470.18891303125	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	457	1158	16409	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPLFITTENLSSLPLQYNCNYTPLVRDRGGRTSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15952	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17103_17194_17784_18014_18984_19264_19611_19703_19851
520350	contig_13844_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_79398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGGGCAGTGGGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52611	53585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_52600_53600
520351	contig_5671_pilon	+	1012	6	Intergenic	novelGene_79441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2088.44123690373	39	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	69	485	370430	531238	FALSE	60	GTGAAAATTAAAATAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPEGYQDYEPEA	368856	531765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521297_531205
520352	contig_233_pilon	-	1721	9	Intergenic	novelGene_14538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1116.235974156	33	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	123	866	126907	91657	TRUE	10	AGCTGGGCTCTGTGACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDALLLPAAPVPSA	127029	78136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91694_105507_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
520354	contig_9345_pilon	-	2482	24	Intergenic	novelGene_24539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	169.92785080778	9	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	15	2381	730155	723552	FALSE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDSLSLFTSLGLSEHKARETLKNTALSAQLREAATQAQRTLGSTIDKATGTLLYGLASRLKDPRRLPFLVGYIANKKIHTETQLSAALEYVRSHPLDPIDTMDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKLSPLSPSPFPCFQGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730169	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724520_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
520355	contig_15063_pilon	-	1510	5	Intergenic	novelGene_11051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	768	1091	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36767	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520356	contig_10496_pilon	-	2644	11	Intergenic	novelGene_59410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	106.831877265168	692	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	52	1878	64679	38747	FALSE	15	CATGCTATGTATCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THKAHGLRPAPISCSCTMSPPRLSPSAGRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64730	37980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64597_64672
520358	contig_16666_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_61733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	766.601591441082	48	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	70	366	59586	56566	TRUE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWYVFKR	59655	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56372_56664_58098_58264_59552
520359	SIRV6	+	1036	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	480	12	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520360	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_12010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	221	1456	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27148	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520361	contig_9146_pilon	-	3955	12	Intergenic	novelGene_79503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	49.9553519663574	324	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	454	1107	324555	276068	TRUE	50	TTAAAAAGTGACAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTQLNLEFRFQDKKLRGFSCELIRSPYGVFPERVLTTACQILVPILLSGLGMITAGLVLNTVQHWPVFVEVKDLLTLVPPLVGLKGNLEMTLASRLSTAANTGQIDDPQEQHRVIGSNLALVQVQATIVGLLAAVAALLLGAVSSEEVDFAKMGLLCASSVLTAFLASLALGILMVCIVIGARKFRVNPDNIATPIAASLGDLITLSILALTAGT	359533	262276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_264631_265843_265993_272236_272372_274745_274826_275937_276083_279353_279473_284520_284666_289796_289869_315716_315825_324360_324578_338448_338754_359407
520362	contig_15063_pilon	-	1426	5	Intergenic	novelGene_8887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	673	996	35891	35108	TRUE	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36672	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520363	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_10743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520364	contig_4232_pilon	+	484	3	Intergenic	novelGene_63211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2674.5	995	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	74	355	146362	149550	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPAAAAAALVFSASFCHIPFASANMASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKGCQFLTAIVTLCLSV	146288	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148463_149503
520367	contig_7695_pilon	-	2798	22	Intergenic	novelGene_41666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	293.231522220212	1531	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	59	1942	912821	903701	TRUE	30	TGAATATGTAACACTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEHPEPPKGELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGSREELVERLQTYTRQTGMVLNRPVLRRDDGDKAAPPPMSAQLSGIPMPPPPMGLPPLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAGGPHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQEERAKQQGDHSLKEHELLEQQKRAAVLLEQERQQEIAKMGTSVPRPPQDMGQMGVRTPLGPRVAAPVGPTPTVLPMGAPVPRPRGPPPPPGDENREMDDPSVGPKIPQALEKILQLKESRQEEMNSQQEEEEMETDTRSSLGQSASETEEDTVSVSKKEKNRKRRNRKKKKKPQRVRGVSSESSGDREKDAARSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEKLDKLENSMAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQPENPGAELTHP	912879	896349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901674_901959_902068_903699_903809_903914_904005_904635_904786_905766_905995_906230_906312_906494_906597_907274_907434_907864_907957_908116_908214_908578_908680_908992_909111_910317_910369_910586_910836_912102_912181_912460_912508_912688
520369	contig_10354_pilon	+	2178	5	Intergenic	novelGene_50832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	1650	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	288	995	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432082	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
520370	contig_5092_pilon	-	2670	6	Intergenic	novelGene_62270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	416	junction_5	416.884444420753	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGATTGTTGCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254069	232280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_252780_253961
520371	contig_12622_pilon	-	2080	11	Intergenic	novelGene_5986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1511.6048590819	7	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	498	1256	1588902	1586655	TRUE	30	GATTCTCTAACCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1589784	1583563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523
520372	contig_7396_pilon	+	1862	16	Intergenic	novelGene_79604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCGCCTTCTCCCGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245933	257100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246054_246220_246476_247186_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249062_249736_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254699_255103_255191_257014
520374	contig_15063_pilon	+	1395	6	Intergenic	novelGene_11499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3752.51577478363	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	230	1117	34808	36504	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRPGLLLHLQHPERV	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_36460
520375	contig_8075_pilon	+	2484	9	Intergenic	novelGene_42484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_7	146.435779439316	355	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	111	803	664009	689159	FALSE	15	CTTCTGTGACTGTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAPGGADRESALSRSWQRPGAAVLSASDARSPSRCMCGNNMSAPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEALAGIRSSHIKYICPHAPIMPVTLNMNMAMPSWFDIIGLSPDSQEDEHGIKQAAENVKALIDQEVKNGIPSARIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVVGLSCWLPLRTSFPQGPISGANKDISILQCHGDFDPLVPLMFGSLTVEKLKTLVNPANVTFKTYEGMMHSSCQQEMMDVKQFIDKLLPPVD	663898	690840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_676735_676802_677759_677808_681283_681355_681594_681669_684219_684322_685194_685372_689105
520376	contig_6898_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_35794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125768	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125800_127700
520377	contig_10299_pilon	+	2756	24	Intergenic	novelGene_79680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	84.6151970333823	617	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	75	2594	320559	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320484	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
520379	contig_5018_pilon	-	2148	7	Intergenic	novelGene_47091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	485.42950626796	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	616	1086	1401907	1400834	TRUE	0	TTCCTCCTGTGTCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKVGLGF	1402861	1399087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402363_1402701
520380	contig_7457_pilon	+	3114	19	Intergenic	novelGene_31638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	182.894795368374	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	443	2239	1024080	1040226	FALSE	25	TAGTATGAAGGTGTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1001527	1041101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005902_1018956_1019001_1019771_1019895_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
520381	contig_12923_pilon	-	2559	16	Intergenic	novelGene_30090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.440205381523	30	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	62	2221	93727	45681	FALSE	20	TTATGAGGTTCTACTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQIS	101229	45342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45684_49011_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
520382	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520384	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27534	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520386	contig_8317_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_20095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTCACAGAATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16432	16750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
520387	contig_19579_pilon	-	1975	7	Intergenic	novelGene_59365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_6	589.374079473772	1203	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	106	327	13090	12869	TRUE	30	ATCTATATGGGATCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGMGHSKGNVL	13195	7164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12648
520388	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520390	SIRV6	+	557	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-430	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1855	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
520391	SIRV7	-	2049	3	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	5	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	48	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114911	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3115_114657
520392	contig_8317_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_19863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACCCATTAAAACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
520393	contig_15063_pilon	+	1568	6	Intergenic	novelGene_14225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	78	1313	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34730	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520394	contig_5033_pilon	-	2090	15	Intergenic	novelGene_29032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	90	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531338_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
520396	SIRV6	+	526	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	810	250	-345	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	62	394	2002	10736	TRUE	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1940	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520397	contig_17936_pilon	+	2126	11	Intergenic	novelGene_29934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	8	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	41	1324	50646	121021	TRUE	15	TCTGTAACTCTGGGTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50605	126527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
520398	SIRV6	+	734	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520399	contig_10940_pilon	-	1790	4	Intergenic	novelGene_49235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.326760020342	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	772	1152	875054	874674	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875486_893268_893306_916664_916748_916923
520400	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	4	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	233	745	34808	35888	TRUE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
520401	contig_13216_pilon	+	1848	7	Intergenic	novelGene_47488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	934.573996832544	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	868	1308	260572	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229646	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243845_243952_245961_246135_256214_256296_258447_258573_260430
520402	contig_11258_pilon	+	2495	7	Intergenic	novelGene_67775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_2	86.0569901609135	2894	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	340	1293	279290	292582	FALSE	35	ATTCCACATAAGTCAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278950	293784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
520404	contig_3789_pilon	-	2873	1	Intergenic	novelGene_79868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTCCCTGAAATGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509686	506813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_506800_509700
520405	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_12140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	10	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	233	700	34808	35848	TRUE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRN	27538	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35384_35844_36158_36266
520406	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520407	contig_5643_pilon	+	2924	11	Intergenic	novelGene_38947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	126.012102593362	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	124	1524	481872	501081	TRUE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462254	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050_502203_502360
520408	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27529	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520411	contig_8045_pilon	+	1232	5	Intergenic	novelGene_35388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1292.62571922425	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	442	537	118627	118722	FALSE	20	ACACTTGAGTTCAGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPKLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116135	119417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116147_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
520412	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_9453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	241	1362	34808	38994	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEC	27128	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38983_39092_39506
520413	SIRV6	+	766	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-429	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1856	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
520414	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520415	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_8721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	246	1481	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27123	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520416	contig_13021_pilon	+	2285	13	Intergenic	novelGene_8175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2564.14754624005	3	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	168	1616	174676	180467	FALSE	45	AATATTTGAAGACTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVVPGVEEA	174508	181136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180192_180440
520417	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3283.11483198502	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	233	700	34808	35848	TRUE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSGDPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRN	27127	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27179_34626_34926_35037_35384_35844_36158_36266
520418	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520419	contig_6227_pilon	-	1848	17	Intergenic	novelGene_49730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	317.034692255832	57	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	32	1087	1224979	1204205	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSATVLGVRRKPCYPMTSTCTALLPTSSRVTWSPTGSTLPSLAPEWTTRQAPSCGGSQGPMASMPSTSLSTKAPG	1225010	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1205934_1206606_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
520421	contig_8357_pilon	-	3047	4	Intergenic	novelGene_39711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	47.1475226166645	518	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	194	523	477223	476110	FALSE	20	AATATTTGTCCATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNSPCSACKDSDSSLNLLPTLATPGKLIPQKLPEFVVLERGGKGQLKLVQERCLQAILENSKCTLWMGFWCLVCSLFVPVPTSRKYLVLNPGCYRRRKEFGVCFTKPL	478905	473585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_476119_476731_476864_477034_477310_478798
520422	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_13223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520423	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520424	contig_15063_pilon	-	1536	5	Intergenic	novelGene_12947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	794	1117	35891	35108	TRUE	35	AGTCCATACCGTAGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36794	28170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34926_35036_35380_35839_36146_36255
520426	contig_7644_pilon	+	3647	19	Intergenic	novelGene_64228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	70.8549422376885	311	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	1	1956	75642	145129	TRUE	30	CCTTTGTTCTTAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGEEVPPLLTSSGDSWEKDLEEALEAGGCDLETLRSIIQGRPLPADLRAKVWKIALNVAGKGDSLASWDGNLDLPEQNTVHNNCQELIDQLSVPEEKSAALLLDIESVITFYCKSRNIKYSASLSWIHLLKPLVHLQLPRSDLYNCFYAIMNKYIPRDCSLKGRPFHLFRLLIQYHEPELCSFLDTKKITPDSYALNWLGSLFACYCSIEVTQAIWDGYLQQADPFFIYFLMLIILVNAKEVILAQESDSKEEIIQFLETTPSSLNLEDIEDLFSLAQYYCSKTPASFRKDNHHLFGSTLLGIKDDDADLSQALCLAVSVSEILQANQLQGEGVRFFVVDCRPAEQYNAGHLSTAFHLDSDLMLQNPSEFAQSVKSLLEAQKQSIESGSIAGGEHLCFMGSGREEEDMYMNMVLAHFLQKNKEYVSIASGGFMALQQHLADINVDGPESGYGHWIASTAGSRSSISSVDGESSNGANDRGMKSLVNKMTVALKTKSVNVREKVISFIENTSTPVDRMSFNLPWPDRTCTERHVSSSDRVGKPYRGVKPVFSIGDEEEYDTDEIDSSSMSDDDRKEVVNIQTWINKPDIKHHFPCKEVKENGHMFPSHLLVTATHMYCLREILSRKGLAYIQSRQALNSVVKITSKKKTS	75641	148538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_75695_104707_104820_106262_106369_107725_107931_112861_112986_116006_116132_116222_116270_117253_117358_122948_123072_124153_124247_126361_126533_128804_128848_131927_132035_135514_135655_136973_137019_140908_140998_143421_143558_144996_145193_146910
520427	SIRV6	-	743	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8213	423	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	28	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCGGCGCAAACCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	1121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3163_10721
520431	contig_12622_pilon	-	1730	10	Intergenic	novelGene_5924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2447.47334567259	23	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	9	575	1590968	1589495	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKGENARRGKP	1590976	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586625_1588884_1589010_1589098_1589305_1589480_1589691_1590000_1590234_1590830
520432	contig_15063_pilon	+	1686	6	Intergenic	novelGene_14041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	195	1433	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34613	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520433	contig_15063_pilon	+	1667	6	Intergenic	novelGene_14106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	189	1031	34808	36333	TRUE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34619	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38975_39092_39506
520434	contig_9848_pilon	+	1795	3	Intergenic	novelGene_79939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1199	1555	104327	104683	TRUE	25	ACTGCCCCCAGTTGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAGLAREDLQDQLLQAPQTLLALTPSHSWSLFKLAAGKLCPQATYPQPSWTPATVGWMPNSGSPRSCHLYWGEHGGGRRTATVIPQGPLYQVSCPHFGQLGEGGRCPQHIPSVTRC	98493	105870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_99394_104028_104894_105840
520435	contig_13412_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_80021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAAGCGATCCATCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501265	500650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_500600_501300
520436	contig_15063_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_13959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3669.23014268661	11	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	198	1001	34808	36299	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSRWPSMHQPST	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36148_36266_36600_38975_39092_39506
520437	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520438	contig_10011_pilon	-	559	6	Intergenic	novelGene_68037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	135746	133192	TRUE	20	CATGCCATACCTGTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQGHCVLVVTLKTPEPTKPLLSRGSGVQALQALIHLQGLSQGLGASITYAVTGEHELLQTPVLLQGVCHPLGSHGPNGVLLQAVACRGSGWRPRPQLWTQHHRP	135746	130805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_130946_131627_131713_133172_133258_134693_134780_135379_135464_135667
520439	contig_14219_pilon	-	2548	11	Intergenic	novelGene_54368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	876.324939734115	64	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	191	1252	1084399	1047072	FALSE	20	CAAGCTGTATTCCGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLLNLNHLGLILLVLHYFVEFLFHISRLFYFSDEKYQKGFSLWAVLFVLGRLLTLILSVLTVGFGLARAENQKFDLSAGNFNVLAVRIAVLASICITQAFMMWKFINFQLRRWREHSAAQAPAVKKKPTVTKGRSSRKGTEMF	1084589	1045775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047083_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
520440	contig_3077_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_26725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3405.09325845349	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	463	1146	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10114	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11311_11351_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
520441	SIRV6	-	398	4	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-11	71	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACCTGTATTTACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1736_1847_2017_2485
520442	contig_1230_pilon	-	2044	8	Intergenic	novelGene_28879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	380	706	408595	407721	TRUE	35	GTGCCAAGATCAATGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408974	405278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_405445_405706_405901_406124_406288_406422_406901_407146_407348_407584_407787_408002_408234_408565
520443	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_8571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	2937.36083712914	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	246	1421	34808	36661	FALSE	40	GAAGTTGTATGTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26350	36756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520444	contig_6898_pilon	+	2287	10	Intergenic	novelGene_35669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1546.80530987796	26	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	185	1324	59668	126743	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQDLGLDLVSPGPWYWLA	59483	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_126693
520445	contig_1331_pilon	-	1571	4	Intergenic	novelGene_37807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3563.14505271209	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGGCATTGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222550	158949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_222451
520446	contig_615_pilon	+	1952	3	Intergenic	novelGene_80033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	146.5	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	35	328	8806	25566	FALSE	30	TAAAAGCCTGGTATATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCQEIKPEERSMIFVTKCPCDECVPLIKGAGIKQIYAGDIDVGKKKADISYMRFGELEGVSKFTWQLNPSGAYSCEQKEPERKENGVLRPIPLDEEQHQNKKLCLGNR	8771	27190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_8965_22345_22407_25492
520448	contig_12638_pilon	+	1450	12	Intergenic	novelGene_33135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_4	510.97223809046	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	197	1300	182987	199604	FALSE	20	GGAATGCAGTGTGCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	180867	199754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
520449	contig_11285_pilon	+	2101	14	Intergenic	novelGene_5589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	514.487025500434	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	35	1783	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766127_766165_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
520450	SIRV6	+	804	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	13	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520455	contig_10734_pilon	-	1910	5	Intergenic	novelGene_51010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	61	666	320632	311551	TRUE	15	ACAGCCTTAGTGTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCGGSRDRSPGRGLGTSPTMVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320692	310156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310750_310899_311676_315844_315953_318838_319032_320452
520456	contig_233_pilon	-	1943	10	Intergenic	novelGene_14504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1287.27714360368	5	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	619	1500	93993	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	104306	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98397_99791_99870_101673_101770_104152
520457	contig_3602_pilon	-	2309	3	Intergenic	novelGene_60601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1842	2231	912560	912171	TRUE	15	CTGCACACAGGGCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLNTSRKRSALMAARSKMLAYMLSRMREGRMRQAASPKGQWLCRIMEVNRMGSARQERRSATARLRNQMALMARLASDPVTQTTKALPGTPTRKTRVKMKRAIVSRVSIFRGLRGPSTGSSGYRVVSS	914951	901991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_902034_912134_913844_914393
520458	contig_6227_pilon	-	1899	17	Intergenic	novelGene_49774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	313.431654980396	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	306	1616	1222052	1202920	FALSE	55	AAAAATGCCACAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225052	1202636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222143_1223817_1223838_1224857
520460	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520462	contig_8377_pilon	+	1979	7	Intergenic	novelGene_34963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4602.91562188818	7	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	180	668	131448	197939	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68097	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140855_197762
520463	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520464	contig_854_pilon	-	2700	6	Intergenic	novelGene_36138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_4	138.772619777822	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	130	735	483594	471988	FALSE	0	TGCCTGGGGCTCTGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	483723	470022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477
520465	contig_8552_pilon	+	1219	11	Intergenic	novelGene_80066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_10	399.777388054902	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	340	1218	385286	438223	FALSE	40	GTTAGAAAAACAGGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQAGPSETDDVDEKLPLSKSLQGSHHSSEGNEGTEMEVPAE	354725	438224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_436080_436141_438167
520466	SIRV7	-	1916	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	104	-433	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGCAATCACGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147814	1438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114981_147602
520467	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27145	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520468	contig_15021_pilon	-	2273	13	Intergenic	novelGene_26944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	434.910878482273	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	23	1108	269638	243699	TRUE	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQRQAGDGDGSAHGHHA	269660	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_240799_241770_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629
520469	contig_15063_pilon	-	1564	7	Intergenic	novelGene_11951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTAGCTGAGGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39760	27144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34609_34948_35195_35380_35839_36172_36284_36597_38972_39090_39504
520470	contig_513_pilon	-	2426	8	Intergenic	novelGene_80164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	237.551712952213	176	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	967	1737	451757	449687	FALSE	30	GAAGCTGCAAACGATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454715	448997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_452365_453009_453117_453312_453443_454593
520471	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520473	SIRV6	+	414	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	510	-68	337	68	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCCGAAGGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
520474	SIRV6	+	967	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	559	2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520475	contig_5020_pilon	+	1603	8	Intergenic	novelGene_27864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	359	1288	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118466	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
520476	SIRV6	+	854	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	28	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	33	365	1673	2560	TRUE	40	ATGACTATGGGGAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1640	11321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2625_2748_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520477	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520478	contig_15063_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_11282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	794	1117	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36793	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520479	contig_9345_pilon	-	2376	23	Intergenic	novelGene_24537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_19	172.927186941415	812	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	608	2275	727643	723552	FALSE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730167	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
520480	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	8	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	243	1085	34808	36333	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
520481	contig_7457_pilon	-	2348	5	Intergenic	novelGene_31610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	84.579474460415	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	79	1275	962606	956489	FALSE	10	TAGCTGTGTGCAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962684	955415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960404_960469_960896_962603
520482	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	250	1425	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27119	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520484	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520485	contig_5084_pilon	-	2703	7	Intergenic	novelGene_64551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	234.065280542748	399	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	229	816	580023	533474	FALSE	20	TCACGTGTTGATTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRASTLLRDEELEEIKKETGFSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580251	531586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_533528_533674_533798_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579956
520486	contig_15063_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_13137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	35	GTTGTATGTTTATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520487	contig_8242_pilon	+	3399	3	Intergenic	novelGene_80185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	389	junction_2	13	60	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	121	420	3532	29118	FALSE	75	ATAAAAAGAAGGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGKL	3411	32097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995
520489	contig_11720_pilon	-	2218	11	Intergenic	novelGene_43894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	151.466167839554	167	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	572	976	120497	118106	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134619	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
520490	SIRV6	+	1176	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	850	0	-348	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	152	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	65	397	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1937	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520491	contig_12638_pilon	+	2367	10	Intergenic	novelGene_33389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	124.421327217912	492	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	86	943	1515842	1530346	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGR	1515756	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530561_1534864_1535060_1537884_1538019_1538799
520492	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520493	contig_8045_pilon	+	1605	4	Intergenic	novelGene_35392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	977.268415306437	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116140	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118075
520494	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520495	contig_18613_pilon	+	669	5	Intergenic	novelGene_80211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1922.06001142004	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	128	427	28443	31105	FALSE	30	AAAGTTCTTTGCCTAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23695	31347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23703_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
520496	contig_1516_pilon	+	2234	11	Intergenic	novelGene_49961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1090.77871724745	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	113	1591	347241	363092	FALSE	5	TGTTTCCTCTCTTCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAEATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335169	363735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362223_363026
520497	contig_8772_pilon	+	1980	11	Intergenic	novelGene_21065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	5108.13216450005	23	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	264	1664	15355	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	14271	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_14328_14791_14948_15303_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
520498	SIRV6	+	851	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	37	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10799_11010_11109_11205
520499	SIRV4	+	1565	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7473	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
520500	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520501	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_9152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520504	SIRV6	+	552	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1445	473	16	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATTTGTGAACGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	11352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520505	contig_4211_pilon	+	2785	10	Intergenic	novelGene_80245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	474.506995616386	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	215	1351	1136047	1146161	TRUE	15	TTTTGGAGTGATGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSTSTSNLFLEPEQSTSNLNEKINHLEYEDQYKDDNFGEGNDGGILDDKLISNNDGGIFDDPPTLSETGVMLPEQPAHDDVDEDDNVSMGGPDSPDSVDPIEPLPTMTDQTTLVPNEEEAFALEPIDITVKETKAKRKRKLIVDSVKELDSKTIRAQLSDYSDIVTTLDLAPPTKKLMMWKETGGVEKLFSLPAQPLWNNRLLKLFTRCLTPLVPEDLRKRRKGGEADNLDEFLKEFENPEVPREDQQQQHQQRDIIDEPILEEPSRLQESIVETSRTNLDESAMPPPPPQGIKRKAGQVDPEPVMPPQQVEQMEIPPVELPPEEPPNICQLIPELELLPEKEKEKEKEKEDDEEEEDEDASGGDQDQEERRWNKRTQQMLHGLQRALAKTGAESISLLELCRNTNRKQAAAKFYSFLVLKKQQAIELTQEEPYSDIIATPGPRFHII	1135336	1147668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1135480_1135975_1136102_1136452_1136576_1138704_1138929_1140214_1140375_1141031_1141181_1142862_1143013_1144661_1144746_1145969_1147254_1147326
520507	contig_12790_pilon	+	2024	11	Intergenic	novelGene_35202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	265.297870326921	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	221	1201	307252	312473	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305923	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312904_312947
520509	contig_13707_pilon	-	2021	10	Intergenic	novelGene_43550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	767.113460792075	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	63	1040	275489	270672	FALSE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKLHRQVPRQHPHHSQRQGGCRSFPGLLIRTSHGLFSLNSPRLLLKDFMCVFKCFS	275551	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270837_272432_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
520510	contig_8452_pilon	+	2193	2	Intergenic	novelGene_48043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	392	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	139	1224	432928	434013	FALSE	5	CGTATGCTTGGTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423971	434982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424092_432909
520511	SIRV6	+	699	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-10	611	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
520514	contig_11720_pilon	+	1921	14	Intergenic	novelGene_43960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_5	352.267935277754	53	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	766	1665	266571	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
520515	SIRV6	+	777	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	117	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	315	641	2002	10736	TRUE	35	TTGCGTTCACAAAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGDLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2625_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520516	contig_3975_pilon	-	1951	13	Intergenic	novelGene_54787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	290.110934241829	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	38	1351	2052412	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052449	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017594_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
520517	SIRV6	+	933	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-11	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	36	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520518	contig_16622_pilon	-	2138	7	Intergenic	novelGene_48418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1035.10956210227	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121963	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115300_121516
520519	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_12429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	9	1484	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28155	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34929_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520520	contig_9112_pilon	+	1403	4	Intergenic	novelGene_60219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	194.18605053459	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	137	988	108641	114303	FALSE	40	ATGAGATGAGATGACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHETFTSSAGIDSCDFGREFYISLTTDHTPPYFYNRIDFIFQPDMDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108504	114718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251
520522	contig_3077_pilon	+	1556	9	Intergenic	novelGene_26702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	3358.14631716666	255	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	228	1058	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
520523	contig_10311_pilon	-	1765	10	Intergenic	novelGene_50427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_9	983.341920866457	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	326	1117	68953	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
520524	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_12694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520525	contig_15063_pilon	+	1136	5	Intergenic	novelGene_9292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	241	1134	34808	36382	FALSE	20	TGTGCAGTGGCTGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	27128	36384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520526	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_11186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520527	contig_5711_pilon	-	3387	9	Intergenic	novelGene_80275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1066	1389	113401	105614	TRUE	60	AAAAAAAAAGGCATATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTVSFLSKPISPRATLQATDPDTLPPSSPGLGVLGDINSTSSTIILWRSSFLRLSDKDSCLCLLSPLIVSRSNSSLTRVLLEITSSCLQEYRQVTSTTSSLENAIT	122717	86013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_87553_98810_99028_101967_102090_105493_105638_107303_107417_108769_108935_113379_113567_121457_121635_121994
520528	contig_11277_pilon	+	2203	9	Intergenic	novelGene_80303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	115.45067940467	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	141	1178	250372	269500	FALSE	20	CTGTCTTGTCCTAGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248197	270525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
520530	contig_5711_pilon	-	4185	2	Intergenic	novelGene_80252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	1	6	junction_1	0	449	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	762	1739	44104	43127	TRUE	40	TAACATGTGTTTATATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYLQNFLKITSHRLLYSRLCLQLRSKRFFGTVPTSSLRRRVVITGIGLVTPLGVGTQLVWDRLIRGESGIVSLVGEEYKRIPCSVAAYVPRGCDEGQFNEQNFVSKSDTKSMSSPTIMAIGAAELALKDSGWYPQSEADQAATGVSIGLGMVPLEVVSETALMFQTKGYNKVSPFFVPKILVNMAAGQVSIRYKLKGPNHAVSTACTTGAHAVGDSFRFIAHGDADVMVAGGADSCISLLSLAGFSRARALSTNSDPKLACRPFHPKRDGFVMGEGAAVLVLEEHEHAVQRGARIYAEILGYGLSGDASHITAPDPEGDGALR	44865	40619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_40652_40712
520531	contig_233_pilon	-	1922	11	Intergenic	novelGene_14589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1228.6385351274	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	49	978	126907	92211	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKFGMPVPQVHQRLLEQAEGCVQWARALPLQRV	126955	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92308_104228_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
520532	contig_8452_pilon	+	1993	3	Intergenic	novelGene_48042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	358	1020	433351	434013	FALSE	0	TGCTTGGTTTTCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423970	434986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_433195_433319
520533	SIRV6	+	876	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	114	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	38	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTGCGTTCACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	11082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10724_10819_11031
520534	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520535	contig_15047_pilon	+	1556	7	Intergenic	novelGene_52113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2814.05288981331	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	33	545	2194	4178	TRUE	45	TAAATGGAAGACCGGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2161	21635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3323_3433_3498_4158_4434_4552_4687_21013
520536	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520537	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520538	contig_16098_pilon	-	3066	21	Intergenic	novelGene_45830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_12	494.663461355294	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	57	2798	230275	201500	FALSE	40	TGAAAAAAGGTGGTGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230479	201231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
520542	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_13703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	202	1317	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTE	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38982_39092_39506
520544	SIRV6	+	509	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	480	52	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520545	SIRV6	+	396	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	344	8801	171	-10	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
520546	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520547	contig_9471_pilon	-	2772	5	Intergenic	novelGene_21821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416999	412445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_413828_413916_414084_414633_415714_416192_416271_416934
520550	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520551	SIRV6	+	692	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	577	-441	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520552	contig_9482_pilon	-	2376	7	Intergenic	novelGene_44285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_5	141.763202403006	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	97	546	1242459	1240765	TRUE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQVSLGVVSSGVEPRGCA	1242555	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1241040_1241234_1242403
520553	contig_11338_pilon	+	2018	11	Intergenic	novelGene_6151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	146	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1572	447	2018	6086	13613	FALSE	35	GAATTTAACCTCTAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRPRQVSGQAPFKGCPSLRTHRSSWAMPRWMAMAGKFCSTRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLSKA	744	13613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10015_13063
520554	contig_10904_pilon	+	2214	4	Intergenic	novelGene_22452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	188	1156	149100	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143858	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_151063_151520
520555	SIRV6	+	629	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	619	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	43	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
520556	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_13915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	33	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520557	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520558	contig_4364_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532834	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
520559	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520560	SIRV6	+	409	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1502	559	73	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520561	contig_15063_pilon	+	1628	5	Intergenic	novelGene_13058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	314	1486	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30203	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520562	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520563	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520564	SIRV6	+	893	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	40	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	164	495	157	651	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVDCSYSELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2818_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520565	contig_9871_pilon	+	2946	8	Intergenic	novelGene_75644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	182.22177562027	846	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	299	1108	391952	419187	FALSE	10	TGAGTTTTGGTTTGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384096	421025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384286_384900_384991_391932_391973_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
520566	SIRV6	-	285	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACGAGCAGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11258	3105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11109_11205
520567	contig_9345_pilon	-	2613	23	Intergenic	novelGene_24536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_13	162.154636175035	748	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	7	1887	730155	724871	TRUE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDSLSLFTSLGLSEHKARETLKNTALSAQLREAATQAQRTLGSTIDKATGTLLYGLASRLKDPRRLPFLVGYIANKKIHTETQLSAALEYVRSHPLDPIDTMDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEVNVWC	730161	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
520568	SIRV7	-	1965	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33118	-1	-67	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	76	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114805	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
520569	SIRV6	+	641	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	8167	162	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
520570	contig_5280_pilon	+	2332	9	Intergenic	novelGene_52585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	545.982829400339	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTGTCTCACGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38309	79146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39087_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
520571	contig_15720_pilon	-	2144	6	Intergenic	novelGene_41871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3875	junction_1	379.712206809315	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1395	1718	279842	278921	FALSE	15	TGGAAGTGTCTTTCTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQVSGSSQVDSASTISALGVIYQSQNHCL	283997	278494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_282750_283785
520572	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_10632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520573	contig_5280_pilon	+	2065	10	Intergenic	novelGene_52589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	623.484255842881	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	34	1011	38343	78098	FALSE	30	TCTCACGTAGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38309	79152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_40945_41037_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
520574	contig_9345_pilon	-	1924	5	Intergenic	novelGene_24367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	611.232924096862	3527	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	75	929	176056	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDRFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176130	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_173643_173789_175989
520575	contig_6593_pilon	+	2679	9	Intergenic	novelGene_49847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1028.38465566149	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	77	901	1209671	1277500	FALSE	35	ATTCTTGGCCTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHSWCSSAANTPEIPKQTGYCDLDMARIYIHSALRAHFLPALQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRNHDGSIDFREYVIGLAVLCNPANTEEIIQVAFKLFDVDEDGYITEEEFSTILQASLGVPALDVSGLFKEIAQGDSVSYEEFKSFALKHPEYAKIFTTYLDLQTCLVFSLPEEVRATPSIASNKVSPENHEESTSDKKDD	1199226	1279278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1199286_1209653_1209689_1212668_1212703_1232384_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277315
520576	contig_17198_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_62376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAACCCTCTAACTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911058	912652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_911100_912700
520577	SIRV6	+	842	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	23	223	16	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	192	683	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1153	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520578	contig_13021_pilon	+	3397	4	Intergenic	novelGene_8207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5817	junction_3	2035.95093806855	4	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2737	3123	180464	180850	FALSE	45	CTTCCAATAAAAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	177022	181124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177280_177364_177792_178170_178282_178522
520579	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520580	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520581	contig_12638_pilon	+	2888	18	Intergenic	novelGene_33076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_10	465.891867104278	105	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	896	2017	182987	199604	FALSE	35	GCATAAGAAATCTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170732	200475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
520582	SIRV6	+	808	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-21	514	-15	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	37	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAGACTGTATCGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	10817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520583	contig_8978_pilon	-	2298	11	Intergenic	novelGene_49386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1105	1479	345658	343441	TRUE	25	AGCGCGCGACCGCCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSCLSSSCFRFCTSWLCSSSIRRSSSWRLIKSCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFS	348138	331585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339964_340939_341130_342364_342670_343350_343445_343723_343835_344174_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
520584	SIRV6	+	1143	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	775	108	-423	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	40	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	140	472	2002	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1862	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520586	contig_1725_pilon	+	2706	20	Intergenic	novelGene_24267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	731.959019030551	2	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	76	1563	201480	248346	TRUE	40	AAAAGTGTCAATTCCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLL	201404	255695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247724_248345_248415_248562_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252748_255361
520588	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	202	1047	34808	36333	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36268
520589	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLRSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34620_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520591	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_10638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520592	contig_15859_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_50213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAAGCCTGTGCTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377367	379322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_377400_379300
520593	contig_16109_pilon	+	3120	12	Intergenic	novelGene_80338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	95.5381452095583	407	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	283	843	282776	316655	TRUE	15	TTTTGTAGCCACTGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNPPKQEHLLALKVMRLTKPTLFTNIPVTCEEKDLPGDLFNQLMKDDPSTVNGAEILMLGEMLTLPQNFGNIFLGETFSSYISVHNDSSQVVKDILVKADLQTSSQRLNLSASSGAVAELKPDCCIDDVIHHEVKEIGTHILVCAVSYATQSGEKMYFRKFFKFQVLKPLDVKTKFYNAEVTSD	282493	323921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_282822_295728_295798_296330_296431_297467_297553_303593_303722_309356_309430_311576_311626_316644_316785_317798_317998_319421_319523_321947_322096_322221
520595	contig_15063_pilon	+	1893	7	Intergenic	novelGene_8452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	40	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	403	1638	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26193	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520596	contig_15063_pilon	+	1895	6	Intergenic	novelGene_8434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3599.786771463	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	602	1774	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	3080	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3439_27125_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520597	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520598	contig_6980_pilon	+	2077	9	Intergenic	novelGene_35999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	830.872498867907	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	265	984	362370	372790	FALSE	15	GACTGTTACTGTGTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRRTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346037	373883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361195_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370477_370641_371430_371523_372735
520599	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520600	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3240.97886447906	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	244	1407	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26352	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
520601	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520602	contig_12357_pilon	+	1615	8	Intergenic	novelGene_6123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	809.721292438683	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	114	929	26079	53235	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25965	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27497_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
520603	contig_5317_pilon	+	832	4	Intergenic	novelGene_76531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3310.14242728147	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	86	430	35282	43442	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIHPASTPHTWRTCLRIHYDGKHFILLKKKILFFLLLVVLNVRYFFSMGSKGT	33703	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36747_43287
520607	contig_5964_pilon	-	4842	2	Intergenic	novelGene_80360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	64	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	540	1925	54144	52759	FALSE	70	TTAAAATAATAAAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDQHLRPGIDPQEGQLPGKMSPEHDGLGTDDGACSRILQEQVSPGDAVRDSDSHRPAKDAMTHEKRNPYVFKECGKVFNKRLLTQHERIHSGVKLYECTECGKTFSKSTNLIQHIKVHIGEKPYECTECGKSFSFRSRLARHQQFHTGEKPYACTECGKAFSHKSKLTEHQRIHTGEKPYECTECGKAFSHRSQLTQHQRIHTGQKPYECKECGKDFSHRSKLAEHQRIHTGEKPYECTECGKAFTHRSQLAQHQRIHTGEKPYECVECAKAFSRRSQLKRHQRIHTGEKPYECIECAKAFSCRFQLTQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFSFRSHLTRHQQFHTGEKPYECIECGKVFSHRLQLAQHQRIHTGKKPYECIECAKAFSRRSQLTRHQRIHTGEKPYECIECAKAFSCRSQLTQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSQKAHLIKHQRSHTVGDAL	71266	49841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_54291_70873
520608	contig_9345_pilon	-	2094	6	Intergenic	novelGene_24365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	578.265890399909	3415	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	59	1099	176056	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGASSSKWGPLGMGKVWTAGPGERRDAPGHDWPFGRFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176114	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143174_148863_148948_173643_173789_175989
520609	SIRV6	+	653	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	45	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1854_2027_2470_2621_2740
520610	contig_6062_pilon	+	3204	16	Intergenic	novelGene_5304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_7	349.437681616241	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1051	3156	10	3165	791734	822602	FALSE	20	CTAATTTTTGCTCTTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKKPLEFHAKRPWGPEKAVEDPDEDDEDDNDEAESGFSLEEVLRLGGTKQDYLMLATLDENEELVDGGKKGAIDDLQQGELEAFIQNLSLAKYAKTFLTEEDGEPSKKENAGKKEAKVSKIDNKKQNTAESDRTSVSKIKNKKRPEQLPDENSTISKVKKDKQEDIFEYSERQTLLLKPGGKWYDLEYTSEYSLELQPRDVVSKYKTLAQKLYEHEINLFKSKTNNQKGGSSTWMKAIVSSGTLGDRMAAMILLIQDDAVHTLQFVDTLLNLVKKKGSKQQCLMALDTFKELLITDLLPDSRKLRIFSQHPFNKLKELSSGNKDSRDRRLILWYFEHQLKHLVAEFVHVLETLSHDSLVATKTRALTVAHELLCNKPEEEKALLVQVVNKLGDPQNRIATKASHLLETLLSKHPNMKGVVCSEVERLLFRSNISPKAQYYAICFLNQMTLSHEESELANKLITLYFCFFRTCIKKKDIESKMLSALLTGVNRAYPYSQTGDDKVREQLDTLFKVLHIVNFNTSVQALMLLFQVMNSQQTISDRYYAALYRKMLDPGLLSCSKQAMFLNLIYKSLKADIVLRRVKAFLKRLLQVTCEQMPPFICGALYLVSEILKAKPALRSQLDDHPESDDEENFVDIGDNEDREKFTDADKETDTVKKVETEETKTPEPASWVHFDNLKGGKQLNTYDPFSRNPLFCGAEHTSLWELKKLSEHFHPSVALFAKTILQGNYIQYSGDPLQDFTLMRFLDRFVYRNPKPHKGKENTDSVVMQPKRRHFIKDIRSLAVNSKEFLAKEESQIPVDEVFFYRYYKKVAIAKEKQKRHADEESIEDVDDDEFEKMIDTFEDDNCFTSGRDDLDFAGNVKKKTKGAKDNPDEDSEGSDDDFNNLDDDEVSLGSMNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	791724	822641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_791890_793882_795385_800518_800751_801584_801745_803000_803090_804994_805049_806061_806165_806270_806340_813447_813515_814664_814766_815502_815561_815871_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
520611	contig_10861_pilon	-	2415	3	Intergenic	novelGene_39285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1334	junction_2	248	603	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	391	813	1355171	1354749	FALSE	10	CCCCAGTGGTTTGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERYNIPVPQSRNVSKNQQQLNRQKTKDQNSQMKIVHKKKERGHGYNSPAVAWQAMQNGGKNKVHFPNNQNWNSSLSSPSLLFKSQTNQNYAGAKFSEPPSPSVLPKPPSHWVPVSFNPSDKEIMTFQLKTLLKVQV	1356815	1353146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355190_1355520_1355727_1356649
520612	SIRV6	+	619	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	94	-336	12	-84	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCATTTTGTTGTTTGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3117	11606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520613	SIRV4	-	1565	3	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	19	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTCTCATTATAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3403	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1344_1675_1882_2385
520614	SIRV6	+	757	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	575	12	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520616	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10476	16	1239	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11476	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
520617	contig_8317_pilon	+	430	2	Intergenic	novelGene_19372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16259	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
520618	contig_10299_pilon	+	2864	23	Intergenic	novelGene_79689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	92.6006823065379	571	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	63	1295	320559	336895	TRUE	15	ATGCTTGTCTCATGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320496	340540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337898_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
520619	contig_15063_pilon	+	1690	5	Intergenic	novelGene_13047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	412	1584	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30105	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520621	SIRV6	+	507	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10238	81	1001	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11238	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11700
520626	contig_1725_pilon	+	2169	16	Intergenic	novelGene_24314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	707.442831612562	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	68	811	236065	247657	TRUE	30	TAACTACATTGGAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRIQGLQ	235997	255856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247101_247639_247755_248345_248448_248575_248634_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
520628	contig_6277_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_80414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATCAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737986	737399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_737400_738000
520629	contig_5643_pilon	+	1973	13	Intergenic	novelGene_39098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	925	junction_12	486.48035817378	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	305	1783	634785	641217	TRUE	30	GTAAATAAAGTCTCTCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPALGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	634480	641576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
520630	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	100	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520631	contig_15063_pilon	+	1706	5	Intergenic	novelGene_12084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	390	1562	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27381	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520632	contig_6735_pilon	-	1835	14	Intergenic	novelGene_15771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	822.046025864156	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	86	892	564868	544941	TRUE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAVVPVDSRQNLSPWLRRRGSRRKRRRQSRWPSSKRSERL	568283	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543122_543824_543894_544861_545057_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
520633	contig_2069_pilon	-	2120	5	Intergenic	novelGene_23436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_4	294.709496793028	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331453	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
520634	contig_4364_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	95	358	1530929	1531279	FALSE	10	TGTTGCTGACGGAGGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVFRLFFLLAAASRPLRSPWKKTSPRWSLTMALACAKLALLATTPPAPSSPQSSAAPDTRVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHP	1530464	1531280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531104
520635	contig_10253_pilon	+	1648	10	Intergenic	novelGene_76859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_8	96.5988267699631	482	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1500	147	1646	16207	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPGSKKVKLSNNTQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	16060	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
520636	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520637	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_9184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520639	contig_15063_pilon	+	1699	7	Intergenic	novelGene_9286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	242	1444	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
520641	contig_15063_pilon	+	1446	4	Intergenic	novelGene_14183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	130	1302	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34678	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520642	SIRV6	+	810	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	163	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	101	433	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1466	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520643	contig_12626_pilon	-	3824	1	Intergenic	novelGene_80469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	599	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGGGGGGAGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202747	198923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_198900_202700
520645	contig_3077_pilon	+	1540	9	Intergenic	novelGene_26640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_7	3245.57764263544	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	74	1042	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9602	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16936_17054_17449
520646	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_14073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520647	contig_854_pilon	+	2275	17	Intergenic	novelGene_36521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	2228.17586460175	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	164	2194	1649514	1716326	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNSHPPFLYNKSALA	1612782	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692741_1716279
520648	contig_2646_pilon	-	2827	21	Intergenic	novelGene_69623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	316.347257772215	712	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	118	2673	2078053	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGWPGQGTAVPAAPSDGPRRRGREAERSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078658	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078577
520649	contig_233_pilon	-	2203	13	Intergenic	novelGene_14592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1322.57586161332	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	82	1206	126907	92266	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYATKARYAAERRGGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	126988	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_93796_101677_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
520650	contig_3627_pilon	+	2632	9	Intergenic	novelGene_78536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	197.585701342481	912	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	72	1055	642322	676255	FALSE	15	CTGAGCTTGCTTTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLGGFFGPICEIDVVLNDGETRKMAEMKTEDGKVEKHYLFYDGESVSGKVTLAFKQPGKRLEHQGIRIEFVGQIELFNDKSNTHEFVNLVKELALPGELTQSRSYDFEFMQVEKPYESYIGANVRLRYFLKVTIVRRLTDLVKEYDLIVHQLATYPDVNNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIQHMELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	642250	677832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_660439_660516_661658_661816_667857_668023_670412_670520_672027_672097_673913_674057_676141
520651	contig_6589_pilon	+	3605	5	Intergenic	novelGene_26118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4895	junction_1	2159.95247343547	131	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2740	3093	1879501	1880585	FALSE	30	TAAACAAGATTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876584	1881097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
520652	contig_5210_pilon	-	2540	8	Intergenic	novelGene_65413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	172.696028811745	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	444	791	439927	432166	TRUE	25	AAATGTGGACAGCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKTKAAEWRDHKGREAACISPVHPKQQPPLFP	444376	430116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_436556_436660_439777_439957_442673_442763_443013_443119_444156
520653	contig_15063_pilon	-	1487	5	Intergenic	novelGene_12937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	742	1065	35891	35108	TRUE	30	GTCCATACCGTAGTAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36741	28169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
520654	contig_4754_pilon	+	2204	15	Intergenic	novelGene_35944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	152.070942091418	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	74	1774	380119	420387	FALSE	15	ATAGCTGGTTGTCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380045	420817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401401_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
520655	contig_1532_pilon	-	1988	8	Intergenic	novelGene_37434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1345.64508466295	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	149	1048	32217	15622	TRUE	45	AACATTACTGGAGAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQVQISMKMVLVFTWLGKTYGHGLPVLQFSWGKTIIIV	35479	12584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15614_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
520656	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_10258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520657	contig_12352_pilon	+	2576	7	Intergenic	novelGene_57452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	229.506717403507	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	377	736	247536	284811	FALSE	15	GTTGCTTGTTTAGAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	229985	286651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_238264_238420_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
520658	contig_8317_pilon	+	307	3	Intergenic	novelGene_19252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10612	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACCAGCAAGTATTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13261	14825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13295_14258_14438_14730
520659	contig_854_pilon	+	991	3	Intergenic	novelGene_36316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_2	435.5	8	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557650	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_557752_562271_562405_563029
520660	SIRV6	+	895	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	163	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	321	653	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1466	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1849_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520661	contig_5988_pilon	-	1467	4	Intergenic	novelGene_15998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	88.8906944261071	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	99	731	693353	690042	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	693451	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_690903_691232_691358_693350
520662	contig_8978_pilon	+	2336	12	Intergenic	novelGene_49402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	300.125263104789	203	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	70	1488	339807	347248	TRUE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331593	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113_347533_347577
520663	contig_854_pilon	+	1698	6	Intergenic	novelGene_36302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	3053.80833714233	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	493	939	556108	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	550197	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_550665_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
520664	contig_5023_pilon	+	2056	14	Intergenic	novelGene_7269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2345.81888403312	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	75	1040	607279	622621	TRUE	30	TCCCAGGAAGGAAGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKLITTCLNRWLLKEMKKVFPLLSLTCQD	580854	648216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622537_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_647726
520665	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_10675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	19	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520666	SIRV4	+	1563	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	-1	5	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGTTATATTGTAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	3398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
520667	SIRV7	+	1876	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	87	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGTTAATATGCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2669_2989_3111_3808
520670	contig_854_pilon	+	1793	9	Intergenic	novelGene_36200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	3006.35185638258	126	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	169	1035	543631	562402	TRUE	40	AGTTTGGAAATATAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPLPPVPLLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMELWARPAFSSVTPPTPSRESTSPLYGDPEACSVAGPVLGVGGCKDMAGKTPPSGCLRHSGYPPRPSHPYIAFSDGNPEIGLQPFFLVHLSLEAPLKPVQHRSNIQASTTDEWWLCTRCLSWESRPGLLPGRFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543462	563785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_549265_549425_550504_550665_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
520671	contig_9290_pilon	-	2281	11	Intergenic	novelGene_77529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	312.333619708158	1219	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	871	1929	486324	478940	FALSE	25	AAATTATTTGGGTGCCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGFQGLVLVPPLCAREQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497059	478587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
520672	SIRV6	+	666	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	513	337	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520673	contig_15063_pilon	+	1468	4	Intergenic	novelGene_14153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	157	1329	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34651	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520674	contig_4315_pilon	+	1947	4	Intergenic	novelGene_46840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1267.17033845757	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	74	430	575508	580260	TRUE	45	GAATCATGAAAAACACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575434	581910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086_580539_580671
520676	contig_15063_pilon	+	1426	5	Intergenic	novelGene_13367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	114	1286	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREPIFSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34626_34713_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520677	contig_15063_pilon	+	1444	6	Intergenic	novelGene_10471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	236	1135	34808	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPPRCPSLRPRASTSPTAS	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_36438
520678	contig_1443_pilon	-	2948	15	Intergenic	novelGene_28349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_6	222.685694123684	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	39	1781	909034	897092	FALSE	0	TTTTTTTGTTGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEHSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSAPPKKKRK	909157	895924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898936_899547_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125
520679	contig_5033_pilon	-	2221	15	Intergenic	novelGene_28998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531504_532026_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
520681	contig_6215_pilon	-	2416	6	Intergenic	novelGene_21183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_5	566.82364100309	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	15	908	233835	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	233849	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714
520682	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_11675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520683	contig_1230_pilon	+	2182	10	Intergenic	novelGene_28849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1358.93047088192	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	73	1764	405241	408579	FALSE	15	TAGTTGTTTCATGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQV	404453	408997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406722_406790_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408241_408577
520684	contig_13863_pilon	+	2195	10	Intergenic	novelGene_42084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	353.564704120759	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	224	1321	474588	489696	FALSE	30	TCAGGTCCTTTGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKVSVYRA	455893	490570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556
520685	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_12815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520686	contig_11512_pilon	+	2879	9	Intergenic	novelGene_43300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1110	1535	367144	367569	TRUE	25	GGAATGAGCCGGAGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAHTVPGPPFCFPTCSLPSPICLALFRTGEAAHICTSGFVSGVCQRYLLIQVCTGGLCASFPSPASPWVPHCLTKPANKEGQHLVSLKSLQRRRGASPRSLDGWVKKAQCREKFASPCLPGHRFVVHGLPRLFSCRSFLE	366034	409402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_368187_368474_368536_374609_374658_378192_378291_381689_381785_382664_382771_396119_396210_401724_401866_409314
520687	contig_12090_pilon	-	553	3	Intergenic	novelGene_80479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	575	junction_1	54.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	233	553	58998	57083	FALSE	40	ACAGATGTAAGTAGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMRVIDPATADSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVANSGITRVEKAKIGLIQFCLSAPK	59230	57082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_57210_57565_57688_58926
520688	contig_12090_pilon	-	2831	5	Intergenic	novelGene_80475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_4	79.4449494933441	28	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	922	1296	55954	54616	TRUE	15	CATTTACGTGTTGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGFFGLFSFKRSFTLQNSYNAIFLISFLKQMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVVKDIEREDIEFICKVMNFNISVCENVQ	56875	51516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_54363_54465_54755_55718
520689	contig_8616_pilon	+	1890	10	Intergenic	novelGene_72411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	158.873114990129	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	113	1177	239674	246027	FALSE	10	TCACCCTGCTTGGCCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEGKSYNEHDDRVNLPRRRKGRGPFRWNYGEGNRRSGRGGSGSRSARLGEDDGDVAMIDAQDGPRVRYNPYAARPNRRGDNWHDRGRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSLIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKIVDRENRRISIIINPSAPPQTVQNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYIRSVVASVSPPGDLHPPGG	239561	246740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243885_244040_244576_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862
520690	contig_15063_pilon	+	1679	6	Intergenic	novelGene_13894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	199	1434	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34609	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520691	contig_12624_pilon	-	1765	3	Intergenic	novelGene_61123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	799	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	108	470	955789	948779	FALSE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGKWRRQPVGSCWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQAGPDEGEDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955896	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_955666
520693	contig_3986_pilon	-	2570	10	Intergenic	novelGene_52670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	115.067130165154	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	384	1361	48331	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108508	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_108396
520694	contig_9807_pilon	+	2189	11	Intergenic	novelGene_32869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	555.969828318048	4	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	105	1343	109130	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_148979_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
520695	SIRV6	+	578	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1475	417	46	77	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	108	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATGGAACAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	11408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520697	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-428	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1857	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520698	SIRV6	-	591	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8561	455	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCACCGCTGGGCGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2024_2468_2619_2738_2826_3103_3164_10723_10825_11035
520699	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_9463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	9	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520700	contig_4105_pilon	+	2492	12	Intergenic	novelGene_21453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	117.824494780364	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	96	1487	60529	73476	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSALYSPFAGPCTQFLTCPRICLPSRPQGMHRHSDPCKTRPLPSSSVTTCLSWCCPCISPGA	58721	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73190_73294
520701	SIRV6	+	872	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	75	581	25	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520703	contig_12250_pilon	-	2614	7	Intergenic	novelGene_80640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_3	146.390649367445	118	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	690	1196	378386	377252	TRUE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAFASLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRGEAVPTEPLPLTSGYPVDPTW	380563	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_377659_378286_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
520704	contig_8317_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_19409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTGTAATGAACAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
520705	contig_1301_pilon	-	2395	1	Intergenic	novelGene_47273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	1089	1736	240053	239406	NA	35	CATTCCTCAGGCTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSITLSDIVPGDEPCRMEGTQNTTGEQLPPQSRVSLNEVDGVKLSRPSFAHAARLKMRRNNHKYPLIIGIWNVQSMNLGKLKVIKERMECIKIDILGISELKWIGIGHFESDNLMVHYAGNDSLKRNGIVFIIKRNISRSILKYTAAGDRIISIHLQGRPVNTTIIQFYAPTTNAKYENIEDFYQLLQSEIDQTCKHNALIITGDWNAKVGNN	241141	238746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_238700_241100
520706	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520707	contig_19402_pilon	+	2211	13	Intergenic	novelGene_80753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1260	junction_11	1362.96979668174	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	10	2190	23458	130678	FALSE	15	ATGCTTTACTGGTGTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQVGHGLMLQNHTGIYTVDNLFFSSQSF	23448	130699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468
520708	contig_5196_pilon	-	2060	5	Intergenic	novelGene_38658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_4	248.863793067614	1568	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	91	852	14523	9642	FALSE	15	CTTAATTGTGTTGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRGESRVLWSELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16096	8433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
520709	contig_15063_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_10667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	784	1107	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36784	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36155_36264
520710	contig_14711_pilon	+	2963	15	Intergenic	novelGene_68937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	56.1537612093721	1340	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	103	1584	119007	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPLLFWSCSFEKLIVYSVSSSPEQRPAQKDFVLMADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	118647	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_118739_118995_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133498_133699_133925_133978_134106_134197_135227
520711	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520712	contig_15063_pilon	+	1925	7	Intergenic	novelGene_13035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	436	1671	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30081	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520713	contig_500_pilon	+	1378	11	Intergenic	novelGene_30991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1053.32293718498	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	202	963	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485749	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493657_1494396_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
520714	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_9957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520715	contig_1331_pilon	-	443	4	Intergenic	novelGene_37847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.77123616632825	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTCTTGTGACAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172700	169876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_169955_170279_170331_170564_170786_172607
520716	contig_10734_pilon	-	2043	4	Intergenic	novelGene_51002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	458.659641419066	4965	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	93	431	320632	315935	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTITS	320724	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315945_318882_319032_320452
520717	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	234	1073	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36153_36266
520719	contig_10134_pilon	-	2256	4	Intergenic	novelGene_16233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	29.227080289044	46	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34874_35178_38554_38817_39584
520720	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520721	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520723	SIRV6	+	1308	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8469	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3108	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
520724	SIRV6	+	551	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	562	576	389	-33	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGTTGTTCAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520725	contig_9696_pilon	-	3057	15	Intergenic	novelGene_68780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_10	415.301642281406	787	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	488	1372	239300	198460	FALSE	35	TGCTTTGAAAATGTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLTEIKLLPTLVLLVCCEYLAIFKKTVAMHEVFLCRVAAHPILRKDLNFHVFLEYNQDLSVRGKNKKEKLEDFFKNMVKSADGVIVSGVKDVDDFFEHERTFLLEYHNRVKDASAKSDRMTRSHKSAADDYNRIGSSLYALGTQDSTDVCKFFLKVSELFDKTRKIEARVSADEDLKLSDLLKYYLRESQAAKDLLYRRSRSLVDYENANKALDKARAKNKDVLQAETSQQLCCQKFEKISESAKQELIDFKTRRVAAFRKNLVELAELELKHAKGNLQLLQNCLAVLNGNT	255827	196774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_198514_206411_206498_206589_206750_210595_210683_214715_214756_216376_216453_224243_224350_226518_226615_238468_238593_239244_239379_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599_255648_255804
520726	contig_12414_pilon	+	2814	17	Intergenic	novelGene_59626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	351.766829510331	1810	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	998	2479	661576	695975	FALSE	15	TACTTGTCTTTTGGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDIRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPVGGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEDSIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKRLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEESQMEVDEGPGGINGHVDSPAPENGINGHVDDINQESVPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVEEEQDESALKRSELINWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIQRLTRYDHVLIELTQAGLKGSTGESESYEEDPYLVVNPNYLLED	652957	696310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653078_655641_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_679840_679949_681136_681293_683109_683239_684738_684901_690260_690397_690966_691123_693031_693172_695858
520727	contig_15063_pilon	+	1592	6	Intergenic	novelGene_13584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	202	1317	34808	38987	TRUE	20	TGCAGAACCCCGGGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTE	34606	39677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38982_39092_39506
520728	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520729	contig_10734_pilon	-	1988	4	Intergenic	novelGene_50994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	675	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	82	591	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320713	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320548
520730	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	46	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	235	1050	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMPSLCPQRWPSMHQPST	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36144_36247
520731	contig_17936_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_29973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAGAAAAGTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122509	123656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_122500_123700
520732	contig_1443_pilon	-	2321	8	Intergenic	novelGene_28313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	284.348736732964	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1168	2037	804678	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSQKAIFLLFPVKPHPAFPVHCPSQTTSCSNMDAQPGAAAARMTWSQGGLRNRCTPFLGDDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809527	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_804491_805718_809399
520734	contig_8435_pilon	+	2467	5	Intergenic	novelGene_72017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	81.1707305621922	644	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	711	2399	94334	97944	FALSE	5	TGCTGTGAGCTGCTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	92921	98012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_93056_93757_95334_96398_96685_97030_97164_97674
520737	contig_11594_pilon	+	1767	11	Intergenic	novelGene_80930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_10	433.882484089874	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	447	1334	560394	568385	FALSE	30	AGAGCTATACTTCAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	540511	568818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
520738	contig_14513_pilon	-	1295	4	Intergenic	novelGene_70297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	117	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	185	601	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19064	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
520740	contig_9345_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_24657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	183	junction_4	2218.42989240138	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	129	710	955353	947957	FALSE	20	TCTAAACTTCCTGTATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001282	946888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_1001156
520741	contig_15063_pilon	-	1737	7	Intergenic	novelGene_12403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
520742	contig_11656_pilon	+	2614	17	Intergenic	novelGene_54014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	155.59250413741	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	128	1822	465719	536565	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLA	464977	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_536558
520744	SIRV6	+	316	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	10	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGTTTCTAGACCGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097	1913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
520745	contig_10861_pilon	+	2439	11	Intergenic	novelGene_39395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	417.997715304761	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	238	1704	1910254	1934728	FALSE	45	CAAAACATTACCTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGVARAPFLVVFKAPRADSHGPGRRPLLCPGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNHRSATASARW	1903787	1935463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191_1934639_1934694
520746	contig_15063_pilon	+	1745	7	Intergenic	novelGene_8488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	255	1490	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26341	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520747	contig_3975_pilon	-	2407	13	Intergenic	novelGene_54782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	395.900967905976	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	987	1904	2021058	2016034	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKGSRRRSSWPEQTSPALASCRVPHISPLTPQSLYFLFLCVFI	2052440	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021220_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
520748	SIRV6	+	857	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1445	177	16	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTCGTAGATTAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	11660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
520749	SIRV6	+	795	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	547	2	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
520750	contig_5643_pilon	+	1491	10	Intergenic	novelGene_38851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3957	junction_1	1760.47878588626	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	856	1281	237186	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233891	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
520751	contig_15063_pilon	+	1570	6	Intergenic	novelGene_14227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	77	1315	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34731	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520752	contig_15063_pilon	+	1642	7	Intergenic	novelGene_9646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	20	AACCCCGGGGCTTCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520753	contig_15063_pilon	+	1390	6	Intergenic	novelGene_10243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2716.51052639227	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	238	744	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35360_36266_36600_38975_39092_39506
520755	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520756	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	202	1020	34808	36299	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEARWPSMHQPST	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36166_36266
520757	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520758	SIRV6	+	552	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	345	8524	172	267	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
520759	contig_14711_pilon	+	2224	13	Intergenic	novelGene_68891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	359.071594145544	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	731	1981	86227	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70416	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82173_84872_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
520760	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520761	contig_177_pilon	+	1894	3	Intergenic	novelGene_41840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	96	491	417721	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKSSASWPGLNLSQKWKNLASRISALTISLEMIVITVTALAYPLFYQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415684	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_417769_418400
520764	contig_13977_pilon	-	4597	26	Intergenic	novelGene_80952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_15	61.5828027942866	341	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1097	3294	11	3304	203033	155523	FALSE	20	TGATTTGCATTACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAEQQQFYLLLGNLLSPDNVVRKQAEETYENIPGQSKITLLLQAIRNTTAAEEARQMAAVLLRRLLSSAFDEVYPTLPSDVQTAIRSELLMIIQMETQSSMRKKICDIAAELARNLIDEDGNNQWPEGLKFLFDSVSSQNMGLREAALHIFWNFPGIFGNQQQHYLDVIKRMLVQCMQDQEHPSIRTLSARATAAFILANEHNVALFKHFADLLPGFLQAVNDSCYQNDDSVLKSLVEIADTVPKYLRPHLEATLQLSLKLCADTNLNNMQRQLALEVIVTLSETAAAMLRKHTNIVAQTIPQMLAMMVDLEEDEDWANADELEDDDFDSNAVAGESALDRMACGLGGKLVLPMIKEHIMQMLQNPDWKYRHAGLMALSAIGEGCHQQMEGILNEIVNFVLLFLQDPHPRVRYAACNAVGQMATDFAPGFQKKFHEKVIAALLQTMDDQGNQRVQAHAAAALINFTEDCPKSLLIPYLDNLVKHLHSIMVLKLQELIQKGTKLVLEQVVTSIASVADTAEEKFVPYYDLFMPSLKHIVENAVQKELRLLRGKTIECISLIGLAVGKEKFMQDASDVMQLLLKTQTDFSDMEDDDPQISYMISAWARMCKILGKEFQQYLPVVMGPLMKTASIKPEVALLDTQDMENMSDDDGWEFVNLGDQQSFGIKTAGLEEKSTACQMLVCYAKELKEGFVEYTEQVVKLMVPLLKFYFHDGVRVAAAESMPLLLECARVRGPEYLTQMWHFMCDALIKAIGTEPDSDVLSEIMHSFAKCIEVMGDGCLNNEHFEELGGILKAKLEEHFKNQELRQVKRQDEDYDEQVEESLQDEDDNDVYILTKVSDILHSIFSSYKEKVLPWFEQLLPLIVNLICPHRPWPDRQWGLCIFDDVIEHCSPASFKYAEYFLRPMLQYVCDNSPEVRQAAAYGLGVMAQYGGDNYRPFCTEALPLLVRVIQAADSRTKENVNATENCISAVGKMMKFKPDCVNVDEVLPHWLSWLPLHEDKEEAVQTFGYLCDLIESNHPVVLGPNNTNLPKIFKIIADGEMHEAIKHEDPCARRLANVVRQVQTSGGLWTECIGQLSPEQQGAIQGLLSSA	203043	154229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_-_155610_156535_156678_158052_158282_159330_159551_160091_160215_161212_161269_161359_161472_162555_162729_163633_163731_166254_166377_166462_166596_169176_169261_170053_170273_172707_172882_172970_173061_173149_173275_177085_177193_181307_181396_183918_184040_184128_184252_189143_189249_189448_189546_190693_190797_192585_192779_195786_195868_202943
520765	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520766	contig_10311_pilon	-	1876	11	Intergenic	novelGene_50428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	1102.94945033759	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	326	982	68953	66744	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71559	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66642_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
520767	contig_7775_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_37523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAACTTGACCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473116	473427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473100_473400
520768	contig_16622_pilon	-	2238	9	Intergenic	novelGene_48430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	1211.97047715693	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	317	751	115540	113120	TRUE	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENQAEAGAEALRPAPENGKHANILCHFSSSLPLGRIQFQKHCLSTYYVQGNRLGIQNKTLCRLQRKLINSSHLLQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	121377	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_119063_121330
520769	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520770	SIRV6	+	826	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	537	337	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520771	contig_3414_pilon	-	2541	9	Intergenic	novelGene_80979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	525	junction_6	161.13193352033	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	16	1245	101974	79114	FALSE	35	AAGGTATGAATTTTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGA	101989	77817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
520773	contig_6227_pilon	-	1918	16	Intergenic	novelGene_49765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.758022059716	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	74	769	1224979	1206634	TRUE	35	CACAAAAGAGGTTATGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNADTFSVSLSG	1225052	1202628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203143_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206662_1213186_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
520774	contig_9482_pilon	-	3068	10	Intergenic	novelGene_44305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	151.055545339381	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	1767	2840	1241211	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253204	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1242603_1244305_1244471_1245325_1245391_1253059
520775	contig_5684_pilon	+	2931	4	Intergenic	novelGene_81051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	184.896968306376	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1857	2420	443906	447039	FALSE	75	AATTAAAAAAAAAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403593	447550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_443223_443891_443949_446518
520776	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520777	contig_15063_pilon	+	1464	6	Intergenic	novelGene_14300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	332	1216	35271	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34827	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520778	contig_4103_pilon	-	2679	18	Intergenic	novelGene_51927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	463.806747430369	6	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	69	1271	91854	80996	TRUE	15	CTTACCTACTGTCTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91922	77539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
520779	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520780	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	217	1389	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27152	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520781	contig_15047_pilon	-	1024	5	Intergenic	novelGene_52266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCAGCCGTGTCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21664	3372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_3498_4157_4439_4558_4683_20996_21070_21243
520783	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520784	contig_6418_pilon	-	1460	2	Intergenic	novelGene_81119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	836	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAATAAACGGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70794	68241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615
520785	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520786	SIRV6	+	955	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-8	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	35	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	169	501	1673	2560	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1116	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520787	contig_15087_pilon	-	2212	23	Intergenic	novelGene_37193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1055.16698083195	1	36	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	60	947	150508	134865	TRUE	15	ATGAGTGACGTGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCW	150567	110642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116893_118100_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134873_138330_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480
520788	SIRV6	+	806	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	34	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	177	534	93	626	1733	10780	TRUE	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	1640	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11031_11109_11205
520790	SIRV6	+	561	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-18	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	81	246	71	316	2569	10780	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIDERVEVEVVQQES	2498	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3171_10738_10819_11041_11109_11205
520793	contig_12528_pilon	-	2026	10	Intergenic	novelGene_81318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	577	junction_4	414.848417951115	1853	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	557	1432	966228	933323	FALSE	10	TTTTTAACCTTCTCGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968167	932728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
520794	contig_2204_pilon	+	1867	7	Intergenic	novelGene_71668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	176.575526805576	2457	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	30	869	13204	50221	FALSE	10	GGGCATCATGCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25702_38762_38845_48669_48717_49912
520795	SIRV6	+	514	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1389	567	4	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	93	302	2569	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2476	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520796	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520798	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520799	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520800	contig_5954_pilon	-	2449	14	Intergenic	novelGene_28624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	423.178924766893	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1378	2088	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960583	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956812_959766_959941_960474
520801	contig_15063_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_8514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520802	contig_500_pilon	+	1666	12	Intergenic	novelGene_30990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_4	1058.74237729846	39	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	316	1254	1492663	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485747	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492727_1493615_1493645_1493683_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
520803	contig_8317_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_19326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAACGGCGATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	16170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
520804	SIRV6	+	1307	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8779	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3109	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
520805	contig_12635_pilon	+	3732	16	Intergenic	novelGene_60873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	86.4767149134507	248	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	123	2015	822700	862627	FALSE	25	TGTGTCAGTATTTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSTTTISREELEELQEAFNKIDIDNSGYVSDYELQDLFKEASLPLPGYKVREIVEKIIVAADHNKDGKISFEEFVSIMQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSSISSEGTQHSYSEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMDPNNDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDERAINKKKLTPFTVSENLNLALNSASAIGCTVVNIGAQDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFADIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWRTISNFSQDIKDSRAYFHLLNQIAPKGDRDGGPSIDIDMSGFNERNDLKRAEFMLKEADKLGCRQFVTPADVVSGNPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPDNNNIDINLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYSDLADALVIFQLYEMIRVPVDWNHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKANFSLVGIAGQDLNEGNATLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKTANKKTSISSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIKRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIYALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK	775862	864344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_775949_822663_822770_826084_826249_828103_828234_832898_833032_834373_834456_838922_839089_839169_839313_841154_841251_843524_843721_848396_848476_851752_851868_854412_854547_855241_855366_862116_862242_862491
520806	contig_1230_pilon	+	2042	8	Intergenic	novelGene_28826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	1363.07172614366	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	578	1810	406520	408754	FALSE	20	TTGGCACCATATAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
520807	contig_15063_pilon	-	1495	4	Intergenic	novelGene_13200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
520808	SIRV1	-	361	2	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	66	9281	66	366	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGATCCTATTCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10720	10281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10367_10444
520809	contig_5954_pilon	-	511	4	Intergenic	novelGene_28691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	438.90646940879	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	183	440	956264	944841	FALSE	20	TTTTATTATTATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLTTATGTHCPHPLQAFTELSTSTCLHHGFVQTRVLTGLDSATTGLGRGRAPLPLPEWPRPIPRPICSP	956741	944769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945044_956209_956291_956379_956500_956705
520810	contig_5954_pilon	-	2428	15	Intergenic	novelGene_28604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	447.74565142204	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	131	1147	959926	947803	TRUE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEITQAGLVRPRHLVGAEKKRWLLQTHWTLDKYGILADARLFFGPQHQPVILRLPNRRALRLRASFSQPLFQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALPHQQAVEERGSWRASGQRLRAGRPGCSPEQPGGEARGVGTH	960590	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947197_947478_947561_947661_947712_947795_947931_948093_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956940_959766_959941_960474
520811	contig_3077_pilon	+	2367	9	Intergenic	novelGene_26617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_7	2780.08362059489	3	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	119	1093	9676	16408	TRUE	25	ATTAACAGTGTGCGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	9557	18078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_17054_17449
520812	SIRV6	+	814	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	347	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	240	572	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1650	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520813	contig_500_pilon	+	1674	12	Intergenic	novelGene_31062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1064.431427788	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	331	1401	1492663	1499316	FALSE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK	1491539	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1491703_1491908_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498000_1498048_1498078_1498882_1498974_1499277
520814	contig_1406_pilon	-	1392	6	Intergenic	novelGene_25558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	345.068920652092	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	56	1078	2159494	2137428	FALSE	40	AAGCATTCAGAATGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159549	2137113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391
520815	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520816	contig_7412_pilon	-	2347	7	Intergenic	novelGene_76329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	1439.31611847047	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	166	1506	377290	365711	TRUE	5	TGGCTTCCTCTCATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWPQEEQGELAEGGQCWERNGGGPAVEWGLLGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMGEPWQPGLTAQPVRGQREVPKM	377455	364200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365367_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
520818	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	5	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	12	1421	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28152	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520819	contig_10923_pilon	+	1939	11	Intergenic	novelGene_66165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_3	774.652025105466	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	117	1835	21667	42718	FALSE	40	AGCAAACTGCAACACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13762	42822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
520820	SIRV6	+	835	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	354	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	127	384	76	459	1733	2794	TRUE	35	GCGATGACTATGGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEPKVWDTSWDVSLGLWD	1657	11318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2617_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520821	contig_17936_pilon	+	2422	11	Intergenic	novelGene_29937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	844.012138538303	380	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	41	1324	50646	121021	TRUE	15	ATGGCTGTGTGATCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50605	130810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_129753
520822	contig_15063_pilon	+	1611	6	Intergenic	novelGene_9674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	240	1382	34808	39538	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27129	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
520823	contig_5988_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_16065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGCTAGAGGCGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209368	1209585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209400_1209600
520824	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520826	contig_15063_pilon	+	1487	4	Intergenic	novelGene_13157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520827	contig_5302_pilon	+	2150	4	Intergenic	novelGene_81491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	473.765999436665	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	64	807	342315	355700	FALSE	45	AAGATATAAATCCATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342251	357043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353479_353526_353862_355568
520828	contig_15063_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_13797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520829	contig_12357_pilon	+	2022	11	Intergenic	novelGene_6096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	950.135195643231	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	117	986	26079	42105	TRUE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPDGQCLFHL	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35160_42079_42251_46436_46513_52779_52844_53169
520830	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520831	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520832	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27529	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520833	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520834	SIRV6	+	1518	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	8	2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	563	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520835	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520839	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_13206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520840	contig_10311_pilon	-	1767	11	Intergenic	novelGene_50471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_10	906.337045474806	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	34	1257	71526	65773	FALSE	25	TAAGTGTGAACTGGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
520841	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520844	contig_5033_pilon	-	2243	14	Intergenic	novelGene_29052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3545.836309828	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	172	1179	545288	534421	TRUE	30	AAAGTTTCTGTGGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKGEPSGPGG	547686	531023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531137_531558_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534418_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
520845	contig_5954_pilon	+	2505	15	Intergenic	novelGene_28657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1579	2082	955878	956801	TRUE	30	TTCAGAAGGCAGCCCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPALTPCCMRHRDESSHLGTAQECQGHTRCGGGGGRQGTCCGAGSCPTWSLTAAGAAAGGGLAVAGADSACCSRPRFAHCLRSGLASPGTVQVPLPQPGRPWTSHTPLPLAPSPSFSSPSSQEPGAETAPQGAGYSGGGRWQPRPGRGAGRSWHAGAGRGDWAAAG	944724	960587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947096_947204_947434_947560_947660_947714_947798_947935_948094_948202_955865_955992_956116_956290_956378_956498_956703_956936_959764_959941_960474
520846	contig_8710_pilon	-	2551	17	Intergenic	novelGene_73533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_13	107.788566183988	1796	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	129	2027	518747	459003	FALSE	20	TTGATTTACTCCTTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRTLHWDTDPSVLQLHSDSDLGRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	520859	458478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459117_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500_495617_497794_497855_502005_502097_516296_516415_518639_518757_520740
520847	contig_5549_pilon	+	3441	12	Intergenic	novelGene_81603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	28.2491863409483	333	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	158	1987	304420	369342	FALSE	10	TTTTTTTTGGCTAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEIAPKSGILLALPLAEEEAADGRRGREGCGREGSVRAGSALECGEGYFSWCMEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW	303530	370796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
520848	contig_12837_pilon	+	1988	6	Intergenic	novelGene_57312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3116.43022703862	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGCTATCTGTGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128793	167488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129786_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
520849	contig_10940_pilon	-	1785	5	Intergenic	novelGene_49251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	45	473	917000	875564	TRUE	30	CAAGAACAGTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917044	874038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874505_874717_875675_893147_893306_916664_916748_916923
520850	SIRV4	+	1562	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6590	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1848_2354
520852	SIRV6	+	1397	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	395	18	179	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	145	636	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1482	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520853	contig_12357_pilon	+	2156	12	Intergenic	novelGene_6090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	786.755876951266	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	117	1475	26079	53235	FALSE	55	AGAATAGAAGAAATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKNIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51235_52800_52844_53169
520854	contig_14744_pilon	+	769	6	Intergenic	novelGene_66093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	45	728	1383156	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1383111	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
520855	contig_12635_pilon	+	482	4	Intergenic	novelGene_60824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGATATTGAAACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201071	227448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_201162_206834_206998_219680_219803_227341
520859	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_8509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	252	1424	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26344	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520860	contig_8772_pilon	+	1732	10	Intergenic	novelGene_21071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4623.64837774107	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	474	1415	15814	23105	FALSE	5	TCTTGCTGTGTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCHSRSGIPALETQECFHRTHPPRPCSPLLPESVCTVAAAQPTATLCSHVLQVRVFILLPPDGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15207	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15396_15528_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
520861	contig_6076_pilon	+	2357	3	Intergenic	novelGene_81736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53110	55620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_53627_53726_55027_55079
520862	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520863	contig_15021_pilon	+	2374	8	Intergenic	novelGene_26961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1698	2198	241703	252006	TRUE	45	TAAAGAAATTGTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVLRTKKKKKKPHIKSLKRNGILRHRCCNTPSPACLCICICACILAIISCMRRNFSFLFQQDLVFIHVLILYFSAASLEPLGAEVLIVEVLGHLLEVLHVSYEHGPQLQEVVVLWVLHLHHPPRVEAASDLLAFGFNQLVGSNHRKWDTGLKKPGLLFKIFILI	239827	261075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241131_241308_241797_243727_243800_248096_248157_249299_249384_251250_251396_251960_252064_260956
520864	contig_15063_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_14097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520865	SIRV6	+	1327	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	571	18	355	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	75	566	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1658	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520866	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	109	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520867	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520868	contig_11986_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_69264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTGTCATACAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843168	842484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_842500_843200
520869	contig_11720_pilon	+	1331	11	Intergenic	novelGene_44000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	379.863409661947	18	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	83	1075	265261	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	264398	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270558_271806_271961_272096
520870	contig_8228_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_81785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATCCTTCCCCTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131417	131811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_131400_131800
520872	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_11784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27140	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520874	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	5	1477	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28159	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520875	contig_9345_pilon	-	3407	13	Intergenic	novelGene_24411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	64.9296093216852	592	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	610	1365	205391	196247	FALSE	35	CACAAGAGTTTAAGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGLSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221110	194204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205_205414_207634_207757_208548_208606_209024_209100_214946_215044_215211_215329_220991
520877	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520878	contig_18145_pilon	-	2307	12	Intergenic	novelGene_37353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCGCGGGTAACGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101261	86860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_86910_90460_90570_90761_90934_92015_92161_92690_92822_93350_93483_94905_95013_97818_98036_98229_98539_98824_98982_100325_100480_100636
520879	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520880	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_8964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	586	1407	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34913_35032_35380_35839_36158_36266
520881	contig_7457_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_31480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCTTTTTAAAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544332	543626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_543600_544300
520882	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	10	1251	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTACGCTAGAAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
520883	contig_7644_pilon	+	3601	18	Intergenic	novelGene_64225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	68.1504543570015	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	15	1925	75642	145129	TRUE	25	TACAGTTTGCTCAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGEEVPPLLTSSGDSWEKDLEEALEAGGCDLETLRSIIQGRPLPADLRAKVWKIALNVAGKGDSLASWDGNLDLPEQNTVHNNCQELIDQLSVPEEKSAALLLDIESVITFYCKSRNIKYSASLSWIHLLKPLVHLQLPRSDLYNCFYAIMNKYIPRDCSLKGRPFHLFRLLIQYHEPELCSFLDTKKITPDSYALNWLGSLFACYCSIEVTQAIWDGYLQQADPFFIYFLMLIILVNAKEVILAQESDSKEEIIQFLETTPSSLNLEDIEDLFSLAQYYCSKTPASFRKDNHHLFGSTLLGIKDDDADLSQALCLAVSVSEILQANQLQGEGVRFFVVDCRPAEQYNAGHLSTAFHLDSDLMLQNPSEFAQSVKSLLEAQKQSIESGSIAGGEHLCFMGSGREEEDMYMNMVLAHFLQKNKEYVSIASGGFMALQQHLADINVDGPESGYGHWIASTAGSRSSISSVDGESSNGANDRGMKSLVNKMTVALKTKSVNVREKVISFIENTSTPVDRHVSSSDRVGKPYRGVKPVFSIGDEEEYDTDEIDSSSMSDDDRKEVVNIQTWINKPDIKHHFPCKEVKENGHMFPSHLLVTATHMYCLREILSRKGLAYIQSRQALNSVVKITSKKKTS	75627	148523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_75695_104707_104820_106262_106369_107725_107931_112861_112986_116006_116132_116222_116270_117253_117358_122948_123072_124153_124247_126361_126533_128804_128848_131927_132035_135514_135655_140908_140998_143421_143558_144996_145193_146910
520884	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520885	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520886	contig_20819_pilon	+	2288	7	Intergenic	novelGene_55632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	488.592110046816	2328	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	24	1202	29817	42531	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	29793	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
520887	SIRV6	+	1016	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	489	-14	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	45	GAGCAATCAACTCACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520889	SIRV6	+	548	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	18	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_1845_2027_2470
520891	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_13954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520892	contig_12622_pilon	-	2285	13	Intergenic	novelGene_5923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2380.73467302287	3	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	161	988	1590194	1588027	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1590951	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583847_1585373_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587882_1588042_1588434_1588609_1588860_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
520893	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_11963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	224	1459	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27145	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520894	SIRV6	+	623	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	719	244	-436	119	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	45	GCGTTCACAAAGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520895	contig_17936_pilon	+	2047	10	Intergenic	novelGene_29914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	739.885042789223	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	63	1187	50646	121021	TRUE	25	CAGCCTAGTGTCTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50583	126585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91164_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
520897	SIRV6	+	1375	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	41	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	113	342	98	439	1673	2560	TRUE	30	ATTATGGATTTAGTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1467	11761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2035_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520898	contig_5247_pilon	+	3359	22	Intergenic	novelGene_81797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	199.549799421046	15	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	834	2505	68	2572	141111	157807	TRUE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKYEPAAVSEHGDKKKAKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRGLTTARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIVHLLCDSG	141043	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_141141_141772_141833_144123_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157781_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
520899	SIRV6	+	1541	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	-13	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	497	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520901	contig_18637_pilon	-	4089	1	Intergenic	novelGene_81855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	130	702	182585	182013	NA	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLNKQQTTMVNQMLLSREAPSPTTHQDLVVNTNNTSYSKELTTDSWARFISMNDSITTKVNMVSPSTDFINNPDNKTVSPFFVPTDTKLSHIPIPSQLNSSKQFLNKTKGYNARNHTSDTEDETSDRASVIPKTWLVPVAFCTSVIFLSCCIVILVSGCCRKQQGQYKPGQRKSESRQIKKCNTLKENS	182714	178625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_178600_182700
520902	contig_5084_pilon	+	2530	6	Intergenic	novelGene_64549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1380	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	2131	2529	544658	580147	FALSE	35	AGGGAGAAAACCCAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFVASAVKWFWSINIFALFIILNGSEMSQSSHESTEVYLVLSLWKKGIDDPVPQRVDSKFWNSLEIFTEPVSFLISSSSSSRSNVEARDPIPESGVPLGAAAAEATAKEGRKEKEKERVGVKKGEGSVSTAD	531586	580148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_533526_533672_533796_537727_537795_544656_544785_549014_549096_579956
520904	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520905	SIRV6	+	785	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	38	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	33	365	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1640	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520907	contig_10311_pilon	-	1862	10	Intergenic	novelGene_50419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1000.18120580445	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	33	830	71526	67506	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREDQGQAVFS	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67282_67367_67533_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
520910	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	132	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520911	contig_5434_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_74649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCTCAGTCTCTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178859	178620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_178600_178900
520912	SIRV6	+	460	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1347	223	5	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	92	301	2569	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2477	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
520913	contig_1532_pilon	-	1896	9	Intergenic	novelGene_37411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1403.55875812165	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	149	1207	32217	13057	FALSE	40	GTAATAATGAGTATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFHQAQQNQEHPLLWKILLPLSPASLSVNKTILQYENAP	35479	12367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13171_13361_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
520914	contig_2940_pilon	-	3138	17	Intergenic	novelGene_81891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_16	90.5524709767768	678	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	305	2251	483505	453111	FALSE	20	GGTTTAATGGCTGTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHIQGAWKTISNGFGFKDAVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDSSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTVGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRVIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPRTPVPAQRERAPGSGTQEKNKIRSRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSILWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	550724	452223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236_454356_455835_455883_458238_458416_459146_459232_466868_466987_467360_467489_467597_467626_470951_471106_472710_472810_474434_474593_474886_474990_477286_477400_483298_483532_550446
520915	SIRV6	+	907	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	254	748	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1091	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
520916	contig_7151_pilon	-	1969	12	Intergenic	novelGene_40648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	107.689790180364	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	59	1864	18221	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	18279	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
520917	contig_10311_pilon	-	1853	12	Intergenic	novelGene_50407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	992.978539629779	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	363	1205	69004	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70264_70313_70358_70446_70493_71497
520918	contig_4857_pilon	-	2840	7	Intergenic	novelGene_48641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	66.3467323150801	464	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1314	1619	443315	441598	FALSE	20	CCTATAATTTTTGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448630	440376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443746_444432_444537_444997_445070_447620_447760_448062
520920	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_14103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	189	1364	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520923	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520925	contig_3095_pilon	+	1308	5	Intergenic	novelGene_74993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	82	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	68	415	147241	150367	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVESLGCNFNCSFSIALDHISVKEGKG	147173	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149839_150290_150696_150996_151163_151848
520926	contig_5643_pilon	+	678	2	Intergenic	novelGene_39113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640721	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_641214_641412
520927	contig_15063_pilon	+	1588	6	Intergenic	novelGene_8723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_5	3582.33619862793	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	246	1334	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	27123	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
520928	contig_15327_pilon	-	1348	3	Intergenic	novelGene_70586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTCAACATCATCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844141	821846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_823026_823180_823266_844057
520929	contig_15327_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_70585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1292	1702	820015	819605	NA	10	AGGTATTTCTTTTGGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPCLLKSEEDLKHLLMKIKNYSYQFGYLNIKKTKILTTVPISNVMINGENSEVVKDFILLGSTINTHGSGSQEIYRCIALGKSAAKDLLKVLKSKVVTLRTKVRLTQAVVLSIASYACESWTMNKEDRRIDAFE	821306	819238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_819200_821300
520931	contig_12873_pilon	+	1629	6	Intergenic	novelGene_27214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	78	1058	16357	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16279	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
520932	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520933	contig_12873_pilon	+	1888	6	Intergenic	novelGene_27204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	334	1314	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16023	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
520934	contig_3077_pilon	+	2222	9	Intergenic	novelGene_26633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2557.74693028357	6	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1182	1724	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_12071_13047_13171_13863_13981_15142_15262_16144_16328_16936_17054_17449
520935	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	8	1420	28164	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520939	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27529	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520941	contig_15063_pilon	+	1568	5	Intergenic	novelGene_13051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	388	1428	34860	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWCAKSNTYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30179	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34890_35081_35380_35839_36158_36266
520942	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_12588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
520943	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520944	contig_10434_pilon	-	3061	13	Intergenic	novelGene_82052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_5	186.571906751496	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	126	1061	191899	169319	TRUE	10	GAATTGGTTCTTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSAPAPAAFLPFSTVCLLLGGTRFPILPPLYPVLVAGFFPHMDLVGVASPEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFAPEFQVGDGIGMDLKLSNHVFNALKQHAYSEERRSARLHEKKEHSTAEKAVDPKTRLLMYKMVNSGMLETITGCISTGKESVVFHAYGGSMEDEKEDSKVVPTECAIKNAESWDSLSNSCNAQETHFSYVFYWP	192024	162878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167670_167762_167844_169239_169400_170768_170824_174791_174920_175623_175768_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_191854
520946	contig_5033_pilon	-	2124	15	Intergenic	novelGene_28999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3694.170759039	6	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	243	1607	545288	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531174_531797_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547690_566747
520947	contig_14353_pilon	-	2072	11	Intergenic	novelGene_82085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	528.344773798322	121	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	55	687	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104426	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80165_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
520948	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520949	contig_5201_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_82176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAACACAAGGCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278629	276120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_276100_278600
520951	SIRV6	-	424	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGCTCTTTCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11800
520952	contig_12622_pilon	-	2781	12	Intergenic	novelGene_5949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1978.23527668408	2	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	18	1091	1590968	1588376	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGTSAQPTRFSPVPWSFIGP	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
520954	contig_8386_pilon	+	4468	6	Intergenic	novelGene_82224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	101.489703911284	576	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	33	1550	51627	75773	FALSE	5	CTTCTTGTGTTTTACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRIAALGEDMGRTIAELVSSLLGLWLLLCSWGCPGSAEPRAPPDKIAIIGAGIGGTSAAYYLRQKFGNDVKIDMFERGEVGGRLATMTVEGQEYEAGGSVIHPLNLHMKRFVKDLGLSAVKVSGGLMGVYDGEKLVFEESPWFIVNMIKLVWYYGFQFLRMHMWVEDILDKFMRIYRYQSHDYAFSSVEKLLHALGGDDLLGMLNRTLLETLEKAGFSEKFLNEIVTPVMRVNYGQNMSIGSFVGAVSLAGAESGLWSVEGGNKLVCSGLLQASKGNLISGSVMYIEEKTRTKQTGNPTKMYEVVYQTGSETHSDFYDIVLVATPLNRKMSNITFLNFDPPIKEFHQYYQHIVTTLVKGQLNTTIFTSRALDKFDLTAVLTTDNPDLFINSIGIVSPVREKDNPEPSTDGTHVWKIFSQDTLTKEQILKLFLSYDYAVKNPWLAYPQYKPTEKCPSIILHDRLYYLNGMEYAASAMEMSAIAAHNAALLAYHRWNGHTDMIDQEGLYEKLKTEL	51594	78691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_51739_52837_53045_54095_54271_73109_73322_74343_74497_75114
520956	SIRV6	+	837	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	350	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	258	572	2021	10736	TRUE	30	GAAATTGGCGATGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520957	contig_15063_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_10244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34932_35042_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
520958	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520959	contig_15063_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_13024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	490	1662	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30027	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520961	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520962	contig_13894_pilon	+	2091	9	Intergenic	novelGene_62115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	2640.37127775148	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	27	572	520713	523486	TRUE	10	ACCTGCGTCTTGACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNCSARLCPMSSIQAPLAGGKGSLEAGNEPHPLLVPVRLPLTLPWKGDEGLCPVPSPTLLCS	520686	528174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
520964	contig_6048_pilon	-	2550	16	Intergenic	novelGene_73281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_15	81.4967211337705	786	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	143	2179	2006289	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049135	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
520966	contig_10861_pilon	+	2478	10	Intergenic	novelGene_39401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_1	344.187430994104	1476	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	216	1814	1910254	1934804	FALSE	35	CATTACCTATTTCAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVFKAPRADSHGPGRRPLLCPGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903809	1935468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
520967	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520968	contig_5649_pilon	+	2334	10	Intergenic	novelGene_82253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	132.50418115928	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	905	1255	29018	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12677	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26839_28382_28451_28928_29095_33635_33787_34645
520969	contig_7342_pilon	-	2784	22	Intergenic	novelGene_71096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_21	79.582612989581	839	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	76	2424	86720	76155	FALSE	15	CCCACCCTCCCTGGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86795	75794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
520970	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520971	SIRV6	+	417	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	19	1153	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
520973	contig_8616_pilon	+	2777	23	Intergenic	novelGene_72416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	196.668791719387	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	738	1595	243631	247393	TRUE	25	AGAGTGACATTGTATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDAQDGPRVRYNPYAARPNRRGDNWHDRGRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSLIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKIVDRENRRISIIINPSAPPQTVQNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYIRSVTWQN	239593	251925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_242458_242942_243484_243666_243885_244040_244576_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245980_247378_247462_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
520974	contig_3986_pilon	-	3120	6	Intergenic	novelGene_52691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_2	97.9277284531812	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1198	1947	47670	35282	FALSE	30	TTGGTACTTTTTCATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	48867	34108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666
520976	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520977	SIRV6	+	902	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	45	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	3176	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIV	1105	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3180_10727_10819_11031
520978	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520979	contig_10235_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_46533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357292	356891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_356900_357300
520980	contig_15063_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_10618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520981	contig_9698_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_82495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGTGCTCCTTGGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167415	165581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_165600_167400
520982	contig_10134_pilon	-	2110	5	Intergenic	novelGene_16231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.943801361527	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39727	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32761_32901_33731_34874_35178_38558_38817_39584
520985	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
520986	contig_6980_pilon	-	2407	7	Intergenic	novelGene_36078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	34.2425985514469	296	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	682	1122	382289	377052	TRUE	30	TGTAATGAAAGCAGTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSCLLLPGDATVLSSSWDNNVYFYSIAFGRHQDTLMGHDDAVSKICWHDNRLYSASWDSTVKVWSGIPAETPCTRRHHFHLLAELEHDVGVDTISLNAASTLLVSGTKEGTVSIWDLTTATMLHQIPCHSGTVYDTAFSPGMY	382970	374602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544_377214_378717_378802_380128_380253_380644_380713_382286
520988	contig_3424_pilon	+	2194	2	Intergenic	novelGene_55503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	70	1938	163767	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	163697	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_163769_168811
520989	contig_2027_pilon	+	2650	19	Intergenic	novelGene_39906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	407.270487514134	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2433	23	2455	124999	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	124976	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129369_131483_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
520991	contig_11978_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_62827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444003	441652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_441700_444000
520992	contig_16098_pilon	-	1538	10	Intergenic	novelGene_46093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1870.64435983638	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	234	1328	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460472	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148_460195_460306
520993	contig_6137_pilon	-	3432	2	Intergenic	novelGene_59297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	906	1268	1591778	1591416	FALSE	25	TAAATTCTAGAGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGHKNVQKSFPVPGGNGLHENLAHFLLPLVWTTCEEGDPPLLPGWCLRSMDSECLLVTLSGPYFPLATGCALHTAEGLQPFLYGRTFQGPRRVWEMDTFSAADNSTSLRPKLSAHTLTM	1593142	1589251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1592077_1592535
520994	contig_7334_pilon	+	2560	3	Intergenic	novelGene_50576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	11.5	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	57	620	118911	120565	FALSE	5	CTCACTGTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIMMQLSLTLPDWYLGQIHLDWWQHIENFKMKFTLKRLPLFLSVKQNSLSRLATEKEGLAGEARMEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGTWPSSTLCFPCGPGPSPLVS	118854	122505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_119095_120097_120413_120500
520995	contig_15063_pilon	+	1343	4	Intergenic	novelGene_14244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	31	1203	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34777	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
520996	contig_3956_pilon	+	2000	12	Intergenic	novelGene_14944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1450.13127932361	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	81	1694	1281682	1290665	FALSE	30	GTCAGTGCCATTGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQVASGTTLCHRPNIHT	1281601	1290971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285773_1289006_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290369_1290617
520997	SIRV6	+	643	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	859	524	-339	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	56	388	2002	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1946	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
520998	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
520999	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_8532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	251	1423	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26345	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521000	contig_20199_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_82605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	86	310	42784	42560	NA	20	TGTGTGTGCACAGTGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQADSRGGPYHPGYTGAECFRPPDWGHIMGVHGESVGYLPPLRVNWSVGGAVRAPWACRIGSQKQQLDAKWTSLGTPASPSPPQRGMATEMTFASQSRQVPL	42869	42460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_42500_42900
521001	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521002	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_12701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	35	CCGTAGTAATCACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521003	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521004	SIRV6	+	989	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	25	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGTTTAGAAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2541	11794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521005	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	31	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521007	SIRV6	+	705	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	8172	-10	619	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
521008	contig_709_pilon	-	2962	9	Intergenic	novelGene_57594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	72.4386593953809	1094	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	240	1262	2337558	2326707	FALSE	20	TAGTATTGTCTTAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVWTGFLKIGERKLLGGTDFGRNTQQQMSYREQVIHKQLTRLLGAPDLVFLLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQITQRKNEKEQERRMQQAMLSRPVPSENLESGFSPRMPYSAFAAEGRSTLGDAEASDPPPPYSDFHPNNQESTLSHSRMESSVFMPRPQAVGSSNYASTSTGLKYPAGGADLPPSQRAAGDSGDESDDSDYENLIDPTEPSNSECPHSRDSRPVTHPDGDSRDTQTSQI	2349999	2325006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2327177_2329518_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200_2334393_2337517_2337585_2340273_2340311_2345847_2345939_2349914
521010	SIRV6	+	824	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1686	80	-250	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2773	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521011	contig_5643_pilon	+	1159	10	Intergenic	novelGene_38868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	66	947	236108	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236042	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
521013	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521014	SIRV6	+	378	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10442	6	1205	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11442	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
521015	scaffold_12124_pilon	+	2084	8	Intergenic	novelGene_22068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	567.663596845591	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	172	861	837401	852375	TRUE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	837229	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852388_857205_857236_857793
521017	SIRV6	+	948	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	35	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	102	431	1673	2560	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1465	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2023_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521020	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_10986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521021	contig_8317_pilon	+	515	4	Intergenic	novelGene_19244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	38	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	69	515	14294	15215	FALSE	35	GTTGGTGTTAACAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLI	13257	15215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
521023	contig_17936_pilon	+	1995	10	Intergenic	novelGene_29912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	739.857160054527	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	63	1136	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKDYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFRSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50583	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79294_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_118706_118827_121017_121063_125766
521025	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521026	contig_15304_pilon	-	840	3	Intergenic	novelGene_30567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	786	815	52954	52925	FALSE	20	CTCCGTGCTCCACCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54090	52899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
521027	contig_8823_pilon	-	2736	2	Intergenic	novelGene_53073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70292	66725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_68111_68941
521028	contig_12427_pilon	-	2159	6	Intergenic	novelGene_40525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	467	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	175	798	522337	506035	FALSE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578126	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
521031	contig_15063_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_12312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2922.40458450837	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	248	1486	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITTVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28151	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521032	SIRV6	+	840	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	388	582	172	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	32	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	152	643	1733	10736	TRUE	45	TAAATTTACACATATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521033	contig_5988_pilon	-	1508	4	Intergenic	novelGene_15979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	93	1448	655459	651962	FALSE	25	AAAGCCTTCTTGTTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655551	651901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
521035	contig_11720_pilon	-	2119	10	Intergenic	novelGene_43901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.399578214402	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1	747	124674	118239	FALSE	20	AAACCCTGTATGGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVIPGL	124674	116866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_119754_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472
521036	contig_14925_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_55263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	78	491	116065	114666	TRUE	10	CTTTGGCTTGATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129478	112089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
521037	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521039	contig_9345_pilon	-	1931	5	Intergenic	novelGene_24350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	157.356879417457	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	111	935	173741	142100	FALSE	10	TGCTTCCCTCGTTCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	173851	141103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643
521040	contig_16121_pilon	+	2333	5	Intergenic	novelGene_6861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	442.591515960259	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	107	1162	57746	62826	FALSE	20	TGTTTTTCTGTGGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33604	63997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_59218_59396_60693_60856_62565
521041	contig_8317_pilon	+	462	2	Intergenic	novelGene_19344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTTGAGACCCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16200	16761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
521043	contig_12125_pilon	+	2606	12	Intergenic	novelGene_76187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	120.505066592157	677	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	91	1482	64006	82984	FALSE	35	CTAAATTTGTGATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPITPSTYVRCLNVGLIRKLSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQAGKSPTCELLFDWGTTNCTVGDLVDLLVQNEFLAPASLLLPDAVPKTVNTLPSQEAITVQQKQLPVYGKDRTSVTPVQNLELNYMPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56146	84108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
521044	contig_11720_pilon	+	2433	14	Intergenic	novelGene_43936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	336.688994904706	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1441	2193	269766	272210	FALSE	55	AAATCATTCAAAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECALHISLLLSRRPQFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269674_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
521045	contig_9345_pilon	-	1581	7	Intergenic	novelGene_24625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1956.1874200143	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	238	1056	955353	947408	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSANPPLHSHLTHQALIQGISSCFFLEREKVGNFCELGCNYFITNMSCLFFCQLQDTLVSHHFRTFLLNGFHWHSSEVGIQFFENVLSQKGPSPCSCGIVTVLWFHVSYLIVTV	1001312	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947742_948053_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
521046	contig_5485_pilon	-	2106	4	Intergenic	novelGene_37686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	154	1296	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
521047	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521048	contig_15063_pilon	+	1709	7	Intergenic	novelGene_12803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1	1476	28164	39515	FALSE	30	AAATGTGTATATATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521050	contig_4315_pilon	-	2813	17	Intergenic	novelGene_46722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_16	164.070678367586	444	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	9	2138	163741	147905	FALSE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARIFLIASKELEFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163749	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
521051	contig_854_pilon	-	3245	13	Intergenic	novelGene_36131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_4	173.48508981722	13	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	94	1278	509201	471988	FALSE	0	CCTGGGGCTCTGTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509294	470020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
521052	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521055	contig_10163_pilon	+	2748	15	Intergenic	novelGene_82621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	126.238133408771	702	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	137	1741	120881	185589	FALSE	5	TTTCTGTTTTACGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLRRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANYGVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPDVGASVWPKKGTAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE	87357	186596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_87463_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146_152324_154314_154386_165096_165197_175174_175229_181219_181286_183288_183358_183871_183969_185518
521056	contig_14704_pilon	-	3567	8	Intergenic	novelGene_82694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	197	junction_7	296.436385439178	3321	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	46	795	116413	77600	FALSE	30	TCGAGTCAGAGTCTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPGSAWERRTVWPAMLFSAALRAGAAGLTAPWGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGIQAGL	116458	74827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_116359
521057	contig_10235_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_46456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAATGTCCTTGGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212155	213697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_212200_213700
521059	contig_15063_pilon	-	1668	7	Intergenic	novelGene_9255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39739	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27175_34612_34925_35033_35391_35849_36149_36264_36566_38972_39090_39504
521060	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	232	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35848_36158_36266
521061	SIRV6	+	696	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	837	493	-361	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521062	contig_14513_pilon	-	1598	4	Intergenic	novelGene_70364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	23	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	198	512	18880	12378	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSGKFLHLFAHRHFFSTWTHSLKMQP	19077	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12424_13059_13136_14952_15001_18735
521063	contig_2027_pilon	+	3166	17	Intergenic	novelGene_39905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	426.852415215142	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	2090	2971	132640	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	124958	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_129182_129380_131171_131237_131481_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
521064	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521065	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSPQSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34624_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521066	SIRV6	+	763	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	158	484	2002	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2746_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521067	SIRV6	+	1017	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	509	2	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521068	contig_9807_pilon	+	2295	12	Intergenic	novelGene_32860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	578.837678327214	11	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	433	1449	126721	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109023	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126729_140815_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
521069	contig_16650_pilon	+	2110	4	Intergenic	novelGene_61962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	5637	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	87	464	244670	254361	FALSE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244583	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
521070	contig_16098_pilon	-	1836	6	Intergenic	novelGene_46077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1772.92790603566	59	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1228	1626	456927	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	459162	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457182_457557_457719_457851_457907_458405
521071	contig_15498_pilon	+	2687	8	Intergenic	novelGene_42633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.672657022128	1822	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	52	1443	675068	686124	FALSE	35	ACTACAGAATGCACATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVRQALGRSQAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675016	687368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675095_679255_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866
521074	contig_8317_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_19391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
521075	contig_11978_pilon	-	2745	10	Intergenic	novelGene_63004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	91	junction_8	171.178341770675	1442	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	171	1448	1582074	1557862	FALSE	20	GAGCGACTATGCCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGDLNLKKSWHPQTLRNVEKVWKAEQKHEAERKKIEELQRELREERAREEMQRYAEDVGAVKKKEEKLDWMYQGPGGMVNRDEYLLGRPIDKYVFEKMEEKEAGCSSETGLLPGSIFAPSGANSLLDMASKIREDPLFIIRKKEEEKKREVLNNPVKMKKIKELLQMSLEKKEKKKKKEKKKKHKKHKHRSSNSERSSSEDERSRGRSQKKMASSSSVLSKAAGYGLQVRDSNHSQRLQGPLMAEPKGVHGLKNHSRSRSSSHSPPRHASKKSTREAGSRDRSSRSPGRRSRSPRPSKLHNSKGNRRERGRTTSPSPKKEVHQRRHASGYTRKLSAEELERKRQEMMENAKWREEERLNILKRHMKDEEQEQRLEKLNSQDGKFIHRMKLESASTSSLEDRVKRNIYSLQRTSVALERNFMKR	1582244	1556564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1557977_1558489_1558652_1561324_1561424_1561996_1562209_1562841_1562906_1563608_1563737_1564437_1564508_1565731_1565969_1579213_1579387_1582056
521077	SIRV6	+	650	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	272	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740
521078	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521079	contig_3747_pilon	-	1798	8	Intergenic	novelGene_24892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGCTGGCTGAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205198	201202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201510_202370_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766_204114_204809
521080	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_10763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521081	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521082	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	198	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521083	contig_7898_pilon	-	1640	6	Intergenic	novelGene_47525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6110	junction_4	1418.61473275869	18195	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	915	1571	284247	282118	FALSE	20	AAGCCCTCTGCACTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286097	282048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284598_285533
521084	contig_5018_pilon	-	1800	9	Intergenic	novelGene_47055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	618.47047979269	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	71	1240	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402862	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401133_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
521085	contig_9708_pilon	-	2806	2	Intergenic	novelGene_67242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	0	1275	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCACACAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40214	17759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_40077
521086	contig_6227_pilon	-	2001	19	Intergenic	novelGene_49724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	339.671941404906	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	193	1701	1223803	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224539	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224020_1224087_1224447
521087	contig_6958_pilon	-	2641	6	Intergenic	novelGene_69928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	550.592916772455	42	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	501	968	190008	183132	TRUE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPCSACLSRGPQTVLGTGLRGPRSKTRKQRPKPVTWAAYRSLQGRPGSLQCRPPRKKRISRQLASNLPSPLESTERSTEEVAPEKPPPEPPKEGPSPAPQAGTQSLHAQARAHPQSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAHHGEDPAEVLQYAQGLLTREEDCRPAQDLQTHL	190508	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183239_183366_183418_189698
521088	contig_6898_pilon	+	2244	9	Intergenic	novelGene_35673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	2760.1444227386	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	546	983	124416	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59526	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114290_123015_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126611_127407
521089	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521090	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521091	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_10616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	40	TGTATGTTTATAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521092	contig_15063_pilon	+	1677	7	Intergenic	novelGene_12354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	4	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	11	1483	28164	39515	FALSE	10	AGTGCTGCTTTGTGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28153	39709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521093	contig_10009_pilon	-	3864	2	Intergenic	novelGene_82725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1932	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1553	1879	45300	44974	TRUE	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLWTSTRQEKGSRVISPSYGLQMGYSGPCKWTGLWTTGTVQINCPRAGSLNDLLSLATSHRGWNGVGIHFYCIGPWICAIMRINSLREGTSGSKNSLEAKAERQGTS	46852	41549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42023_43461
521094	contig_14513_pilon	-	1516	5	Intergenic	novelGene_70342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1339.33516622987	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	198	536	18880	12738	TRUE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSGTPFIPVTYVSNGWGKHGIKFFLNFFSAFSSW	19077	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_12626_12836_13087_13136_14952_15001_18735
521095	contig_9609_pilon	-	2539	5	Intergenic	novelGene_23127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	90.0277734924062	173	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1199	1543	522751	521807	TRUE	25	TACCTCTATTGAGTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523949	520725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521862_521982_522081_522171_522309_522696
521098	contig_10311_pilon	-	1783	11	Intergenic	novelGene_50408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1173.19164674831	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	324	668	68953	67865	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREG	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66642_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67871_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
521099	SIRV6	+	606	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	796	730	-402	139	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	119	451	2002	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1883	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
521100	contig_13863_pilon	+	1857	11	Intergenic	novelGene_42037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	851.859031765233	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	130	1041	99042	118962	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAHIFLAGLAGPSSPPLWDHARSPSLSLSVFLFPTLLDTVDWVMRSLGCPDSGRNGKRERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98912	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_99086_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
521101	contig_12873_pilon	+	1769	7	Intergenic	novelGene_27150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	1118.38350607771	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	411	1391	16357	19855	TRUE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15946	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851_19951_20152
521102	contig_7396_pilon	-	1867	16	Intergenic	novelGene_79617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3167.82057292111	4	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	100	1485	255163	246385	TRUE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257453	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246215_246282_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
521103	contig_8538_pilon	-	3349	18	Intergenic	novelGene_4606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	95.0008923651405	576	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	178	2196	742030	688211	FALSE	15	CCTATCCACGTGCATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKERRIRREEIMECKVMWEPASKKNTQMDRFRAAVGASCGLALDNYDDLYHWSVKSYSDFWAEFWKFSGIVFSCMYDEVVDTSKGITDVPEWFKGSRLNYAENLLRHKDNDHVALYVAREGKEEIVKVTFEELRQQVALFAAAMRKMGVKVGDRVVGYLPNSMHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGGTLIQHLKEHILHGNMGSNDIILYYTTIGWMMWNWMVSALATGASVVLYDGSPLVPTPNVLWDLVDRIGITILGTSAKWLSVLEDRNMKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPYTLNGKKVEVAVKQVIAGKSVEHRGAFSNPETLDLYQSIPELQDF	742207	687057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688349_692701_692905_693724_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928_697994_702430_702556_703455_703537_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672_724787_729514_729636_730740_730845_741897
521104	contig_13295_pilon	-	2854	2	Intergenic	novelGene_31255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	420	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134771	131651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_134421_134686
521105	contig_5084_pilon	-	2699	7	Intergenic	novelGene_64557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	275.949874675335	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	257	823	579908	533474	FALSE	45	TTAAAACAAAATCACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRTVVAEVWSSGAVSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580164	531597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_533528_533674_533798_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579862
521106	contig_14711_pilon	+	2376	15	Intergenic	novelGene_68902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	375.88293336069	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	887	2137	86227	90570	FALSE	20	CAGACCTCAGTTGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70429	90809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_84855_85537_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
521107	SIRV6	+	684	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1614	-291	222	-120	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTTAGGTGCGTCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521108	contig_12427_pilon	-	1102	6	Intergenic	novelGene_40474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2208.75887321364	110	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	120	653	316061	314393	TRUE	20	ACGTGTGTTAATGTCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325958	313884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_313960_314018_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325856
521109	SIRV6	+	712	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	610	594	394	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	36	527	1733	10736	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1697	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521110	SIRV2	-	229	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2930	1638	1751	970	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAGTACCACACGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	2673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_2803_2881
521111	contig_15063_pilon	+	1553	6	Intergenic	novelGene_14138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	174	1409	34808	39515	FALSE	15	TTTCTTTCTAGACATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34634	39659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521112	contig_10324_pilon	+	2503	22	Intergenic	novelGene_7713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	1131.71208769417	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	41	2083	51839	80346	FALSE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCGQTGAGGEEEKANGFLMET	51798	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78422_80282
521113	contig_11386_pilon	+	2203	8	Intergenic	novelGene_82759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_6	447.3382959466	1282	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	890	1594	17940	27749	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7886	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
521114	contig_16846_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_82937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551667	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550900_551700
521115	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521116	contig_12644_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_44636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	21157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	52	1323	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
521117	SIRV6	+	418	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10328	80	1091	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11328	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
521118	contig_5988_pilon	+	2044	6	Intergenic	novelGene_15985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	136.134639236309	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	685	1929	783406	786813	FALSE	20	TCAGACTGGCTTCTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	655145	786928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_655541_746160_746223_752526_752652_783303_783527_783653_783803_785838
521119	contig_11285_pilon	-	1831	12	Intergenic	novelGene_5620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	598	939	769124	768472	TRUE	50	AAAATACCAAGCAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSTWANGQQPQAPVERRQHV	770196	766048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_766197_766307_766444_766551_766637_767063_767176_767265_767393_767718_767836_768024_768147_768426_768531_768612_768855_769083_769320_769421_769433_769805
521120	contig_709_pilon	+	2415	11	Intergenic	novelGene_57625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	32.7354547852936	455	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	529	1347	2691473	2701317	FALSE	15	TTGACTTTGTGATGAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681018	2702385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2686056_2686096_2688679_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696654_2697545_2697649_2698790_2698936_2701156
521121	contig_2646_pilon	-	2665	20	Intergenic	novelGene_69626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	325.754585326893	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	16	2511	2078663	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078678	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073801_2074627_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
521122	contig_5033_pilon	-	2337	15	Intergenic	novelGene_29049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	35	CAATAAAGTTCTGTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	531005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531157_531541_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
521124	contig_15063_pilon	+	1684	7	Intergenic	novelGene_11990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	222	1316	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27147	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
521125	contig_5894_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_83018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCAGATTTGTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279941	280592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_279900_280600
521126	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_13065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30278	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521127	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521128	contig_15063_pilon	+	1609	6	Intergenic	novelGene_14193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	121	1356	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34687	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521129	SIRV6	-	670	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-279	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2826	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1540_1644_1721_1834_2030_2476_2619_2738
521130	contig_7457_pilon	-	2192	2	Intergenic	novelGene_31680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4787	junction_1	0	114	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176983	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1176132_1176811
521131	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521134	contig_14811_pilon	-	1765	3	Intergenic	novelGene_74472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	136	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	128	907	375703	357434	FALSE	30	CCCCAAAGTGTCTCGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386594	356575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
521135	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521136	contig_3077_pilon	+	2638	5	Intergenic	novelGene_26760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_1	2882.52120547274	4	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	208	963	11948	16408	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPSVTTASPHYYPPLLCTSQEPQPEDPAVYWRMELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	11740	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144
521138	SIRV6	+	1023	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	294	42	8	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	415	744	2002	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPCV	1089	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
521139	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_11178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521140	contig_14273_pilon	+	3026	8	Intergenic	novelGene_21149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	666.686659564159	5	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	622	1965	138042	151187	FALSE	75	ATGGAAGAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127923	152248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128224_128777_128846_135360_135508_137935_138052_139067_139185_147782_148029_148891_149549_150873
521141	contig_5643_pilon	+	2769	9	Intergenic	novelGene_38941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	116.454323127139	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	135	1211	481872	501081	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462243	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495078_497962_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
521143	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521144	contig_7898_pilon	-	1073	7	Intergenic	novelGene_47531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5680	junction_5	1651.6703329929	23	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	51	1007	285587	282118	FALSE	25	TAAAAGCCCTCTGCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	285637	282051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533
521145	contig_4754_pilon	+	2259	15	Intergenic	novelGene_35953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	159.360520550744	11	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	55	1836	380119	420397	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTEFCLWPEAG	380064	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420368
521146	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521148	contig_12622_pilon	-	2212	13	Intergenic	novelGene_6002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	18	1550	1590968	1586655	TRUE	20	GCAGTGAAGTGAGCGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1583725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
521149	contig_12357_pilon	+	1563	8	Intergenic	novelGene_6115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	794.9017395315	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	117	869	26079	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29624_42155_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
521150	contig_12790_pilon	+	2052	10	Intergenic	novelGene_35232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	336.639859585475	8	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305937	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308812_309548_309756_309875_309924_310032_310494_311029_311093_311898_312035_312348_312410_312627
521152	contig_15304_pilon	-	1063	3	Intergenic	novelGene_30469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	5499	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	196	1020	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54295	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
521154	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521155	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_8599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26355	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521157	contig_9177_pilon	-	1913	12	Intergenic	novelGene_32540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	830.633214595999	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	144	1472	6586	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELASTTLSYSPSHCKIFLPVLPQQIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	6918	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4767_6472_6590_6688_6815_6904
521159	contig_1244_pilon	-	1731	12	Intergenic	novelGene_37997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1055.40574626832	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	71	1180	948448	923434	TRUE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQASPCPASPLRFPSMMGTDMKCCQPT	948518	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923512_924291_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
521160	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_13066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3966.53629600184	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30289	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521161	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10359	80	1122	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11359	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
521163	contig_8263_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_83103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151243	148789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_148800_151200
521165	SIRV6	+	1121	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	876	29	-322	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	39	371	2002	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1963	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521166	contig_1225_pilon	+	2143	4	Intergenic	novelGene_44107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	542.098597018005	8	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	159	524	147032	148934	TRUE	20	TTGGCGCAATATTGCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134365	150604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007_147173_148709_149339_149389
521167	contig_15047_pilon	+	1383	6	Intergenic	novelGene_52247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	238	513	3242	4178	TRUE	25	AGAATCTGCATCTTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2608	21660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
521168	contig_11752_pilon	+	1668	9	Intergenic	novelGene_37569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1102.2025675891	17	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	353	1381	87165	105616	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84081	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_84884_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
521169	SIRV6	+	860	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	245	-11	118	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCGTTCACAAAGAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	11086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
521170	contig_10311_pilon	-	1727	13	Intergenic	novelGene_50441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1067.72401695798	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	33	1121	71526	66744	TRUE	20	AAAGTTGCTTTGGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71558	65127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65341_65625_65918_66642_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
521172	contig_9049_pilon	+	2388	6	Intergenic	novelGene_83128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_5	1816.50021745113	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	50	298	88356	104397	TRUE	30	CTCAAGGTCATATCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKAHGENNHPLCGHHQSRRSPREICGVGFIHLLESIGYG	88306	113761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_104284_104398_108616_108724_111558_112809_113028
521173	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521174	contig_15063_pilon	+	1388	6	Intergenic	novelGene_11334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3751.14368693069	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	231	1082	34808	36494	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27138	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_36486
521177	contig_15063_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_8472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	257	1492	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26339	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521178	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_11890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	10	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521179	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_10539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521180	SIRV4	+	1458	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1135_1237_1347_1678_1886_2389
521181	contig_4301_pilon	-	3261	10	Intergenic	novelGene_65071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_4	144.286751528568	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	26	1567	62379	42274	FALSE	15	ATGGCTGTATTCTCTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGGPSGQPALLSLLLAVVLPFFCLAISIDEARNELIKREKMMRLGGQLVLKKEEEEANGKLMTLKKAEITKAMKTQMFPPSMHFFQAKKLIEKSEVFHILKKMPKGAALHLHDFGIVDVDWLVKNVTYRPHCHVCFTPNGTLHFKFAHPTPPAPNQEDCSKWILLQQYRKELKNVTEFDNSLQKTFTLVTENPEVTYVDQNVIWTKFETIFLTISGLVHYAPVFKDYIFRGLEEFYMDNVIYLELRARLPPVYELNGETHDRKWCVKTYKEVAEAFAKDHPEFVGLKLIYSDHRSKDASLIKISVKTAMELRTDFPTTVAGFDLVGREDTGHTLYDYKEALLIPSLKGIKLPYFLHAGETDWQGTSVDGNLLDALILNSTRIGHGFALSKHPAVMEDLQKRDIPIEVCPISNQVLKLVTDLRTHPATAFMAVGYPMVISSDDPAFFGAKGLSHDFYEVFMGISGMDADLRTLKQLAINSIKYSALSPTEKKTAMKTWEKTWDKFIHDLSKK	65041	40579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_42368_42626_42830_43377_43536_46294_46404_48416_48508_50463_50592_59025_59237_60477_60704_62057_62388_65024
521182	contig_10082_pilon	-	3203	11	Intergenic	novelGene_63868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	250.244760184904	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	200	1534	260762	212085	TRUE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAYDDSVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRLLVDKGPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	329410	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214928_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358_230595_232483_232641_260702_260842_329290
521184	contig_9871_pilon	+	2271	7	Intergenic	novelGene_75633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	282.18399238007	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	586	1011	349812	351454	FALSE	20	CAGTCTCAATTTGGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK	341404	352714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_341499_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364
521185	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521187	contig_6735_pilon	-	1628	11	Intergenic	novelGene_15719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	687.502589086034	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	86	733	564868	543218	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDSGCPPSGGRADL	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543260_546592_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
521188	contig_12873_pilon	+	1860	6	Intergenic	novelGene_27197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	355	1335	16357	19855	FALSE	25	TCATCCCTGCATGTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16002	20380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
521189	contig_6871_pilon	+	2186	4	Intergenic	novelGene_21532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	123	1259	121971	135017	TRUE	70	TAAAAGAGAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSQLKRGLYHFLRRQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121848	136015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135791_135861
521190	scaffold_12124_pilon	+	1651	3	Intergenic	novelGene_22381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2523	junction_1	1107	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	725	1504	1508626	1509405	FALSE	40	CAATAAATGCGAAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497069	1509552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1508010
521191	SIRV6	+	1509	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	18	1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4995	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521192	contig_7457_pilon	+	2676	16	Intergenic	novelGene_31646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	181.44501462794	11	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	125	982	1005828	1035320	TRUE	10	TACTGGTGTCTCATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPRLCQWTTPGPGSWA	1001554	1041114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013224_1033517_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
521193	contig_14353_pilon	-	2203	12	Intergenic	novelGene_82090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	483.767941773329	167	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	87	716	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLCEVLPLCRGLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104458	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80070_80425_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
521194	SIRV6	+	905	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	84	52	51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGCGTTTGGTCGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521195	SIRV6	+	360	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10354	112	1117	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTCTTCAAAGTCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11354	11714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
521196	contig_8317_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_19398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
521198	SIRV6	+	538	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470
521199	contig_5189_pilon	-	1752	6	Intergenic	novelGene_34820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2180	junction_4	451.635871028863	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	328	606	205010	199237	FALSE	0	TGTTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	220291	198090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258
521200	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521203	contig_6735_pilon	-	1822	15	Intergenic	novelGene_15688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	963.145847454781	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	273	1616	554338	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSRRRRWNGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRLALPHSHSCFKCLTGCHELPEVLGRLPSPIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542423_542516_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552877_554308_554374_564157_564232_564784_564869_568198
521204	contig_20693_pilon	+	1916	13	Intergenic	novelGene_60255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	534.124491314733	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	218	1273	21258	34261	FALSE	25	GCTAAAACCAGTTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14732	34904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
521205	contig_15063_pilon	+	1664	6	Intergenic	novelGene_13590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521207	SIRV6	+	549	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10272	5	1035	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11272	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
521208	contig_15021_pilon	-	2601	12	Intergenic	novelGene_26954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.605380757224	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	44	1093	269638	241346	TRUE	35	TAAACAAGTGGTTCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRDRCLVPGPLRQRARYGDSHLPFARLCTSPEASLAAIVQCF	279803	239749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241170_241257_241470_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
521209	contig_15063_pilon	-	1505	5	Intergenic	novelGene_10626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	762	1085	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36770	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36167_36284
521210	contig_15063_pilon	+	1615	5	Intergenic	novelGene_8458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	302	1474	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQFVCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26294	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521212	contig_20739_pilon	+	3249	14	Intergenic	novelGene_83177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_2	98.0936637296483	479	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	236	2683	122793	197279	FALSE	80	ATGTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLSFRARALDASKPLPVFRCEDLPDLHEYASINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAISAQQVYGEKRDNMVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSEDEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIKKRKNCRGPSLIPSVKQEKRDGSSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAVTILEMIKRREKSKRELLHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPVKPTYTIPIIPITNTNSNQFKHQEAMDVKEFKVNKQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATSQQTSPAALPVFNAKDLNQYDFPSSDEEPLSQVLSGSSEAEEENDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQTGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSMFRHLDLEMLSSPQHSPVNQFANTSETNTSDKSFSKDLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPSLHDSDNDELSCRRLYRSINRTGTAQPGTQTCSTSTQSKGSSGSAHFVFTAEQYQQHQQQLALMQKQQLAQIHQQQANSNSSTNTSQGFVSKTLDSASAQFAASALVTSEQLMGFKMKDDVVLGIGVNGVLPASGVYKGLHLSSTMPTALVHTSPSTAGSTLLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPLNARHIPRTLSAVPSSALKLAAAANCQVTKVPSSSSVDSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT	122557	197845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_122946_166863_167024_179289_179436_179848_180056_180279_180429_181306_181473_183694_183872_183961_184052_184133_184283_185754_186108_193469_193589_194732_194875_194980_195345_197206
521213	contig_13608_pilon	-	2693	19	Intergenic	novelGene_52361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	199.784297261068	11	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	103	2103	470234	369353	FALSE	15	TGTGTTTTGTTTCTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470336	368762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456325_456384_456419_466411_466478_470191
521215	contig_11720_pilon	+	1904	15	Intergenic	novelGene_43925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_11	334.030282447321	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	15	1271	262271	270649	TRUE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEWPSSGI	262256	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270628_270700_271268_271343_271806_271961_272096
521216	contig_6898_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_35789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125487	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125500_127700
521217	SIRV6	+	1510	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	18	0	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	506	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521218	contig_15063_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_14221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	84	1256	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34724	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521219	SIRV6	-	334	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCGAATTTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11821	11487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
521220	SIRV6	+	733	7	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	37	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2627_2750_2829_3103_3165_10724
521221	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521223	contig_12622_pilon	-	2309	13	Intergenic	novelGene_5988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1948.59204869111	2	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	130	1485	1590194	1586655	TRUE	30	GATTCTCTAACCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590920	1583563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
521225	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	94	12	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
521228	contig_3948_pilon	-	1975	13	Intergenic	novelGene_53311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	429.58690590173	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	187	1116	1494311	1482626	TRUE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMAREHVSGSLPGRGQRDEDSAAWQAGEVACSGDRGAHLHHHGVHGQRKPAGLSEK	1510951	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483561_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
521229	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521232	contig_8697_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_83216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTAAAACGTTTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43267	43909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_43300_43900
521233	contig_12624_pilon	-	2043	15	Intergenic	novelGene_61054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	974.435338845958	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	191	1684	903621	862389	FALSE	40	AACAAGGCACCCAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903811	862029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888747_900260_900333_903447
521234	contig_15047_pilon	+	1434	8	Intergenic	novelGene_52110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2653.98825797504	4	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	58	570	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWYLENGKEMLQRADPQRQM	2136	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3349_3459_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
521235	contig_10734_pilon	-	1879	3	Intergenic	novelGene_51005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	96	482	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320727	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311609_318882_319032_320452
521236	contig_15063_pilon	-	1713	7	Intergenic	novelGene_10165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	964	1287	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39754	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
521237	contig_15063_pilon	+	1488	5	Intergenic	novelGene_10440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	CATGTCTGTGGGTGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521238	contig_14638_pilon	-	2020	6	Intergenic	novelGene_71561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	CTGAAGTGGTGTGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253983_254165_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
521242	contig_12357_pilon	+	2091	12	Intergenic	novelGene_6086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	924.096029141117	2	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	117	956	26079	42181	TRUE	55	CTTAAGAATAGAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPTTFRYL	25962	53912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27428_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35140_42156_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
521243	contig_3956_pilon	+	1891	11	Intergenic	novelGene_14969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	81	1697	1281682	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287328_1290596
521245	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_11755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521246	contig_5189_pilon	-	2176	10	Intergenic	novelGene_34832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1013.7223790212	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	111	1121	244235	199152	FALSE	10	CTCTAATGTTTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTKLDLAFVVTIQCLESCRKIDFIVIGVREVRRENLSDCLFCLDDWF	247751	198096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199290_204962_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
521247	contig_12427_pilon	+	3012	24	Intergenic	novelGene_40492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	182.146111814525	604	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	232	2640	399645	419950	FALSE	25	GACAGCTGCTTCTACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNYRGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397735	420322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399321_399642_399672_399853_399934_401068_401145_401423_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
521249	contig_3948_pilon	+	2524	4	Intergenic	novelGene_53374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	92.8954011539622	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	455	1156	1813956	1860572	TRUE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813242	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434_1861535_1861634
521250	scaffold_9100_pilon	+	1826	8	Intergenic	novelGene_83284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	509.642131343962	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	195	1280	646830	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPSGGYTYTQTSILFFHAKVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	646635	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_646893_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
521251	contig_18108_pilon	-	2609	17	Intergenic	novelGene_33500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_16	289.663321536832	1800	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	64	2397	298886	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHCSAFVLLGALVLALCTLSPPARGATTPRGAVQARAPQVRPSSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	298949	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_298757
521252	contig_848_pilon	+	2922	11	Intergenic	novelGene_83339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1835	2155	555067	556535	TRUE	5	GTCCCGTCTCTGGGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESRTQGIFVAPRTKIPSLSTPTPCIWTRNSVLILRAASLSFSLLEAHKESISSMKIMEGLFSLASWNKFLTSFSLSPSHLETRSEEDSEKNVELFASVATALAK	547974	571782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_549439_551874_552014_552744_552965_555055_555142_555810_555957_556435_556593_559110_559229_563376_563448_566201_566360_567558_567673_571533
521253	contig_1532_pilon	-	1941	9	Intergenic	novelGene_37409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1285.74375363056	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	70	1263	32217	13113	TRUE	40	GTAATAATGAGTATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12722_12788_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
521254	contig_10793_pilon	+	1386	15	Intergenic	novelGene_83366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3315.677934958	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	132	1058	146975	163940	TRUE	45	AAGCAACAGTGAAGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	166425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054_165151_165325_165377_166401
521255	scaffold_9100_pilon	+	1781	8	Intergenic	novelGene_83255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	509.907234460448	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	239	1237	647136	654304	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_646970_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
521256	contig_12951_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_68188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCCACTATTCCCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754958	754618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_754600_755000
521257	SIRV6	+	436	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-344	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
521258	contig_5643_pilon	+	3180	11	Intergenic	novelGene_38946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	123.806138781564	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	228	1628	481872	501081	FALSE	25	AGAGGATGCTCCATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HISAEVTKPSLHWAPNPHIETPVQEAEGKEDADLEDWSCSSPSIGTVSFKRARAPLCIPHSAPLSVQTSPTLSAGMAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462250	502633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_462492_462593_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
521259	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521260	contig_12570_pilon	-	2353	8	Intergenic	novelGene_79350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_7	219.401039939492	1006	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	212	1297	228467	190389	FALSE	15	GTTCTGTATAGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLIAAYSGVLRGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228678	189332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211479_228427
521261	contig_15063_pilon	+	1345	5	Intergenic	novelGene_11596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3082.42741195961	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	230	784	34808	36133	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLPREKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_36038_36158_36266
521263	contig_12008_pilon	+	2054	8	Intergenic	novelGene_24999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	531.542883250913	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	5	GTCCAGGTTTGCTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	40477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39150_39328
521264	contig_19564_pilon	-	2331	4	Intergenic	novelGene_29617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	154	1488	15529	12201	FALSE	65	TAAATGGGAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15682	11357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
521265	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2382.00592988347	31	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	2	1417	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
521266	SIRV6	+	1520	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	4	4	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521267	contig_15304_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_30474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	198	392	54100	53906	NA	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52900_54300
521268	contig_6047_pilon	+	2036	14	Intergenic	novelGene_24217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1026	junction_3	392.468006459985	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	382	1788	115917	123624	FALSE	25	GTTCCCAAATACCCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	109391	123872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
521269	contig_6589_pilon	+	2941	13	Intergenic	novelGene_25935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	277.600582372108	714	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	75	1490	1228758	1257861	FALSE	25	CACCAGATTTTATTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPVSGPALLSSQDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTEEELRRFEEELAAREAELNAKAQRLSQETEALGRSQDHLEAQKRELQQAVLQMEQRKQQQQALNALAPAPGREGQLKFHPGTDGVPVPGAADDQKDRDTSEKKVPEQPPKLPQLDSQKL	1228272	1259312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228920_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256925_1257394_1257498_1257748
521270	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521271	contig_12046_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_83484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410936	413371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_410900_413400
521272	SIRV6	+	1031	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	10	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	583	32	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	405	737	2002	10736	TRUE	45	AATCAACTCACCATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1097	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521273	contig_15063_pilon	+	1440	6	Intergenic	novelGene_12796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2954.27374493292	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	1	1269	28164	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36511_36625
521275	contig_1331_pilon	+	1608	5	Intergenic	novelGene_37802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCGCAGTATAACTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158944	193993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_160214_160867_160949_166406_166534_193763_193862_193960
521276	SIRV6	+	588	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2480
521277	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521280	contig_2204_pilon	+	1822	8	Intergenic	novelGene_71661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	165.946143218153	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	TRUE	35	AATTTTTAAAGGGCATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912_50831_50961
521281	contig_233_pilon	-	1950	12	Intergenic	novelGene_14629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1205.33385519504	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	93	884	126907	94801	TRUE	15	TGTCCTAGAAGCTGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAAGLHGHGDGARAPTV	126999	78145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92192_93937_94010_94725_94847_105468_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
521282	SIRV6	+	590	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCGTCTTCGGTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
521284	contig_15063_pilon	+	1097	4	Intergenic	novelGene_13118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	202	1095	34808	36382	FALSE	20	TGTGCAGTGGCTGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	34606	36384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521285	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521286	contig_10923_pilon	+	1722	10	Intergenic	novelGene_66192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	801.404985395826	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	50	1606	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13829	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21779_23019_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
521287	contig_7035_pilon	-	3557	1	Intergenic	novelGene_83509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	464	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGAAATCTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225710	222153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_222200_225700
521288	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521289	contig_10923_pilon	+	1885	11	Intergenic	novelGene_66185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_3	774.652025105466	4455	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	51	1769	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
521291	contig_15304_pilon	-	1294	5	Intergenic	novelGene_30414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	1538.77857406451	281	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	198	1157	54100	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54297	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991
521292	contig_15063_pilon	-	1436	5	Intergenic	novelGene_10605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	691	1014	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36690	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521293	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26355	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521294	contig_7342_pilon	-	2556	22	Intergenic	novelGene_71122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_18	94.5517411052369	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	817	2511	81495	76155	FALSE	30	AGAGCCCAAAGCTAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86811	76109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83520_83642_83789_83834_83913_83979_86703
521295	contig_13528_pilon	-	2739	10	Intergenic	novelGene_66868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_4	127.328485461332	880	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	230	991	67895	47592	TRUE	20	AATTGTCTTATTCTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMM	68124	39841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
521296	SIRV6	+	655	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	854	517	-344	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	61	393	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1941	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521298	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521299	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521300	contig_3077_pilon	+	1596	9	Intergenic	novelGene_26641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_8	3201.29629017684	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	71	1105	9676	17590	FALSE	20	AACAGTGTGCGGCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9605	18081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
521301	contig_12644_pilon	+	1312	10	Intergenic	novelGene_44651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4641.51974100863	34	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	235	1224	2678055	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675485_2677275_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
521303	contig_8552_pilon	+	2419	1	Intergenic	novelGene_80096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	316	693	532155	532532	NA	30	TCCCCCACATACTCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEVSPSSLPRSTLALLLPRQTCSSFWPSMVHSILPQHLNSKASVLLWSSLFTVQLSHAYEATENMMSWVRCTVVLKVASLLFNTLKKSYATDLLQKLKYYEKRGTWIFVFGLYCGCAIHLIHS	531839	534258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_531800_534300
521304	contig_10734_pilon	-	2078	5	Intergenic	novelGene_51007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	431.654592816988	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	153	518	320506	315834	TRUE	10	AGCCTTAGTGTTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRASEL	320726	310154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315794_315953_318838_319032_320452_320541_320608
521305	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	524	-11	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	355	30	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521306	contig_5954_pilon	-	2219	14	Intergenic	novelGene_28637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	264.38205276169	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	673	1695	956264	945246	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLQHASVERQLGHPAGGHRV	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945425_946712_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
521307	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_10374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34610_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521308	contig_15063_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_8524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	252	1487	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521311	contig_13740_pilon	-	1632	13	Intergenic	novelGene_34643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	4363.93575148117	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	99	1160	165243	157474	TRUE	30	TAAATACTTGGTGTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165341	155097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
521312	SIRV4	+	1425	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	17	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATATTGTAACCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389_3098_3237
521313	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_12262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	210	710	34808	35888	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLHNHQYLRHPPILC	27561	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35847_36158_36266
521314	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521315	contig_4211_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_80238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAACAAAACAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122349	1121444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1121400_1122300
521316	contig_4211_pilon	-	3609	1	Intergenic	novelGene_80237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1021	1350	1119048	1118719	NA	30	AATCAGAAGTTCCCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQFFFSLPYPLSSFPTAYEVTENTMAWVKHILVLKVTSHNLRSLEVQTQGTGSRGRLSLSIEGKSAFSASVPWFLGDLHVASIFPQSVLFSVPNLFFLYLKGLRHTLH	1120068	1116459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1116500_1120100
521317	contig_10923_pilon	+	1747	10	Intergenic	novelGene_66202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	790.903764962653	4288	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	44	1183	21667	37418	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLSVSRQGLWLCGWLHSQHPRLGGHGALLCCGLHLHHFIAPHGALWCSGVCAAP	13835	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36621_37258_37540_38578_38742_42554
521318	contig_3975_pilon	-	2569	13	Intergenic	novelGene_54788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_12	252.257088877377	154	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1100	1969	2021058	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052476	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
521319	contig_6576_pilon	-	2030	9	Intergenic	novelGene_42264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	579.221986266923	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	117	698	339439	326605	TRUE	20	GTTTTGGTATATCATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLICSTSWNSSNDSSTGCFSARYSQ	339555	321833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326675_330876_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339398
521320	SIRV3	+	323	3	FSM	SIRV3A	SIRV306	2373	3	16	2034	-3	-460	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACAAAATTGACCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1960	6258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_2006_4003_4081_6057
521321	contig_10354_pilon	+	2019	4	Intergenic	novelGene_50835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	385.836177095352	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	231	836	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432139	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_434101_434164_471873_472041_475056
521322	contig_15744_pilon	+	480	2	Intergenic	novelGene_83612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4201	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152572	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152706_153245
521323	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521326	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	34	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521327	contig_5967_pilon	-	2255	10	Intergenic	novelGene_44370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_9	490.207313161017	1	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	180	1244	488569	388566	FALSE	35	CCAACAAATGTTTTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_501673_501743_517515
521328	contig_15063_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_14044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	195	1430	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34613	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521329	contig_6735_pilon	-	1980	14	Intergenic	novelGene_15785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.668061289286	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	217	1785	564309	542190	FALSE	15	GTTCACCCTTATGCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVISCVAPGMAHLFPSLTAKCCLLQNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYHSHSCFKCLTGCHELPEVLGRLPSPIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568283	541994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542410_542795_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564357_564784_564869_568198
521330	contig_6885_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_83652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCTGACATCTGTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155904	154602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_154600_155900
521331	contig_13216_pilon	+	1871	8	Intergenic	novelGene_47477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	825.965903333417	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	62	1339	229682	261012	FALSE	30	AAAACTTAGTTTTGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229620	261544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430_260747_260896
521333	contig_15063_pilon	-	1760	5	Intergenic	novelGene_13027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	787	1110	35891	35108	TRUE	30	AGAAGTCTTTTGTTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36786	30054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521334	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521336	contig_4301_pilon	-	3621	6	Intergenic	novelGene_65082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	189.633752270001	162	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2789	3253	425037	420112	FALSE	30	ATTTTATTGTAAATTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVSAYLEQSLACHRSLLKDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDQETYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD	427825	419743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_420175_421107_421196_422457_422553_424140_424210_424761_424852_424977
521337	contig_11752_pilon	+	1622	8	Intergenic	novelGene_37558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1099.37091473409	140	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	281	1309	87165	105616	FALSE	5	TTCTTGACTCTTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	83512	105929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_83788_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
521338	contig_15063_pilon	-	1520	5	Intergenic	novelGene_11927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	CCCAGTAGCTGAGGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34606_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521339	contig_4845_pilon	+	2650	14	Intergenic	novelGene_53614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	329.095694793112	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	112	1431	205637	221846	TRUE	20	CATCTGGCTGGAGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	201992	223439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657_222206_222579
521340	SIRV6	+	343	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	96	162	74	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
521341	scaffold_19766_pilon	+	3605	12	Intergenic	novelGene_34437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	152.882875279473	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	598	1668	846171	848686	TRUE	15	CCTTCTAATCTGGGCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLR	844762	851579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844793_845085_845163_845497_845663_845845_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_850150_850925_851036_851215
521342	SIRV6	+	837	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	373	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	57	551	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1676	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521343	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27145	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521344	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	231	1073	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
521346	contig_3747_pilon	+	2040	6	Intergenic	novelGene_24942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5655.41161720347	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	90	1049	202676	204120	FALSE	40	GTAAAAATTACATTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTETMCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	202376	205111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202667_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203790
521347	contig_14559_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_83711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCATTCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220361	219607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_219600_220400
521348	contig_14744_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_66076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
521349	contig_5280_pilon	+	2228	11	Intergenic	novelGene_52574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	762.794920014548	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	125	1204	38385	78098	TRUE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSANLPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38260	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56359_56460_56486_62043_62065_78042_78839_79220
521352	contig_14513_pilon	-	1304	4	Intergenic	novelGene_70365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
521353	SIRV6	+	532	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8758	12	33	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCGTGCGTCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
521354	SIRV6	+	986	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	537	5	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	38	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521355	contig_7898_pilon	-	1540	7	Intergenic	novelGene_47519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3421.40044426255	21	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1041	1469	283799	282118	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286095	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284099_284218_284318_284421_284598_285533
521356	contig_9345_pilon	-	2009	7	Intergenic	novelGene_24373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	132	944	176056	142170	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPGREFREPAGRGEEAGGLGGLLRPRHRRDPGLSVRPPVRLAMAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPLCTCGFL	176187	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142195_142250_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
521357	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521359	contig_6102_pilon	-	2487	8	Intergenic	novelGene_32104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	286.583250005428	214	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	1356	2294	819997	816763	FALSE	25	TGCTTAAATATTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820391_820920_821096_821337
521360	contig_12638_pilon	+	2755	19	Intergenic	novelGene_33078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	626.686081259544	1	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	781	1533	182987	195551	TRUE	50	ATAAAATTCTCTTAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGKLFADSTSSTTGSADEWLFGFWCCGRILFCYRFANQTFPAD	170758	200456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_170780_170909_171071_171683_171748_171972_172087_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191365_191733_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
521361	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521362	contig_11285_pilon	-	2143	19	Intergenic	novelGene_5692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	436.235314939082	2287	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	166	1953	798394	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLGFHWTSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791128_798362
521363	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	11	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521364	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_8622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	2898.89528767234	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	230	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26366	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521365	contig_7357_pilon	+	3677	12	Intergenic	novelGene_36885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	80.2285990104125	124	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	2410	3288	260068	273311	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250831	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
521366	contig_15063_pilon	+	1157	4	Intergenic	novelGene_11946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	225	653	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVMHQPST	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35327_36277
521368	contig_12357_pilon	+	2046	11	Intergenic	novelGene_6097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	962.368224745601	3	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	429	1361	30281	53235	FALSE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29596_30209_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_52759_52844_53169
521369	contig_7151_pilon	-	2194	11	Intergenic	novelGene_40646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	106.546750302391	175	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	57	1226	18221	5915	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREG	18277	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
521370	contig_6735_pilon	-	1740	11	Intergenic	novelGene_15742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	976.887076380888	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	408	1262	545923	542464	FALSE	35	TATGCTGAGCTAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSEWQQPEREPGVVVRSWDSESQTHDWRWKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568283	541985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552916_568194
521371	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521373	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_8797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521375	contig_15063_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_12558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3808.65816791163	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	544	1365	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34643_34694_34926_35035_35380_35839_36158_36266
521376	contig_10082_pilon	-	2530	15	Intergenic	novelGene_63848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_14	141.563589951654	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	173	1492	182059	128693	FALSE	10	AGATTGTGTCCCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGGNANASSFFHQHGCTTSDTNAKYNSRAAQLYREKLKSLASQATRKHGTDLWLDSCVVPSLSPPPKEEDFFASHVSPEVSGTAWASAQAEPSTLMPRAMGTTPENNEGGPEQGPSVEGLNTATKAALEVSSIIKKKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLASKNFNEIEKQAQAVDKVKEQEDRLARAAPKEESMVASLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKTVESERLGMGFGNCRSAISHSVTSDMQTIEQETPITAKPRKKYSEDNDDSYFTSNSRYFDEPMELRSSSFSSWDDSSDSYWKKEAIKDTDTILKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSDMYFGRQAQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEQRKQPSGNYNLTSVLPAAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVMTSIQDRYGS	198585	127654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_128711_131093_131216_142328_142420_145619_145744_152999_153132_160521_160645_161094_161224_167892_168036_168681_168729_170066_170127_174231_174320_178513_178598_178963_179096_182032_182106_198459
521378	contig_7457_pilon	+	3173	20	Intergenic	novelGene_31637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	169.40304183136	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	157	1314	1005828	1032699	TRUE	25	TGTAGTATGAAGGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGASGPVPPCSPLRFSLAMLGLVPTRLLKPQ	1001522	1041099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1030390_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
521379	contig_3986_pilon	-	2423	9	Intergenic	novelGene_52671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	134.658596086548	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	465	1214	47670	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108508	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_52848_52953_54769_54869_108396
521380	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521383	scaffold_12124_pilon	+	2157	12	Intergenic	novelGene_22038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	492.469338727577	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	172	1107	836073	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829573	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857936_858329
521385	SIRV6	+	1454	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	56	18	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521387	contig_12106_pilon	-	4328	1	Intergenic	novelGene_83740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	519	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158229	153901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_-_153900_158200
521388	contig_6227_pilon	-	1853	17	Intergenic	novelGene_49748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	367.658554232048	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	902	1555	1205908	1202920	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224989	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1205967_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214260_1214388_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
521391	SIRV6	+	1361	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	71	3	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521393	SIRV6	+	772	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	571	1	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTCAACAAGAGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
521394	scaffold_9100_pilon	+	1421	6	Intergenic	novelGene_83287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_3	213.036147167564	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	60	875	649053	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	648993	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
521395	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_12251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2147.27569647371	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	212	1453	34808	39515	FALSE	10	CTCCTTATACTGCGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27559	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521396	contig_2444_pilon	+	2433	12	Intergenic	novelGene_83770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	295.646678786835	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	244	1965	231271	243030	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	230308	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230550_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
521400	SIRV6	+	418	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	19	8822	12	-31	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTAAGGTTCGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
521401	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34609_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521402	SIRV6	+	777	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	544	-14	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
521405	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_11040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521406	contig_15063_pilon	+	1465	5	Intergenic	novelGene_11655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	30	CAAACTAACCATGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGDPGDCQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27168_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521407	contig_7457_pilon	-	2265	5	Intergenic	novelGene_31620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	123	1193	962606	956489	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962728	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956666_956857_956939_958234_958375_960225_960896_962603
521409	contig_4754_pilon	-	1758	12	Intergenic	novelGene_35967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	847	1728	414941	407780	FALSE	20	CGGGAGGTGAACCAGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKELSFSSKNSTPCCPASRGMYSMMASRTRHLASSASSTMAGSKDWDSCRMPITSFTQSRLEMMFSRTSGHSSFSCARKRGRRCSIVLSLPRMGERPMITEARADLTCWLASDTSSWIQGRIWVIITFSWQSAERFSQNSLTLWEAAALTSASQSFIRFWKAGTRSVLVISGPTAFWSSVNLSATMYRTRQDLSSAAWRRVGITRASKSSWGRSWAMFTHASTASSRTESCSSEARLENIGMISLLTLSSSSTLANSPSLEAAARRTMGVSSEHRFRKYCRSSALTALDTRG	420806	407749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_407822_409293_409439_409545_409703_410230_410346_410459_410530_411001_411138_414444_414618_414897_414960_415740_415898_416938_417079_420156_420249_420367
521410	SIRV6	+	567	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	796	223	-359	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	76	408	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1926	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
521411	SIRV6	+	512	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	512	8503	339	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
521413	contig_7744_pilon	+	2315	17	Intergenic	novelGene_62549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	181.496976128392	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1347	1874	889529	890785	FALSE	10	AAGCGTCGTGTGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESAILFPCFHLFFSRFSSRYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879804	891226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
521415	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521416	contig_15063_pilon	+	1691	7	Intergenic	novelGene_10940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	40	GCCATGAAATAAATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521417	contig_9463_pilon	+	1832	8	Intergenic	novelGene_83828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	123.814871679373	2012	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1065	1433	222660	223028	FALSE	15	TATTGGCTCTGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185926	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961
521418	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_9978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	238	735	34808	35888	TRUE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVPANNHQYLRHPPILC	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35369_35839_36158_36266
521419	contig_9389_pilon	+	3014	4	Intergenic	novelGene_84112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_1	348.29967939501	877	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	250	903	1408796	1423232	FALSE	10	TCCTGCTCATATTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVGTPFPKNFLQAVKKILSRLFRVFVHVYIHHFDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVREFGLIDTKELEPLKEMTMRMCH	1398378	1425343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1398531_1408698_1409217_1418063_1418267_1423202
521420	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521421	contig_6980_pilon	-	1720	5	Intergenic	novelGene_36070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1288	1605	370598	365020	FALSE	35	ATATAGTTCATACTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	373888	364904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734
521422	contig_10134_pilon	-	2037	5	Intergenic	novelGene_16196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39682	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33353_33479_33731_34922_35178_38558_38830_39594
521425	contig_15063_pilon	+	1275	5	Intergenic	novelGene_11964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	223	1275	34808	36541	FALSE	10	GTGGTCCACGAGGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCI	27146	36541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521426	contig_10599_pilon	+	2641	9	Intergenic	novelGene_49875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	791.156392567234	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	42	1025	123528	163915	TRUE	30	ATTGATATGAAGCCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRCREGESGADKMADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123486	165608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810_164885_164961
521427	contig_7334_pilon	+	2280	2	Intergenic	novelGene_50567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	526	951	120751	121176	FALSE	5	CTCACTGTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116754	122505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120500
521429	SIRV6	-	949	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8698	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	5	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11245	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
521430	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_8664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26753	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521431	contig_10923_pilon	+	1797	10	Intergenic	novelGene_66214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	856.098875101829	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	189	1118	23028	37303	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLVAVWVAT	21694	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37280_37540_38578_38742_42554
521433	contig_3277_pilon	+	2739	9	Intergenic	novelGene_74720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	695.587880860499	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	514	1122	258281	263763	FALSE	75	AAAAGAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVGMILPVFLNIRINLKELKVFTEFIC	188797	265380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240956_250616_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618
521436	contig_3900_pilon	+	1950	3	Intergenic	novelGene_84185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACCAAACAATAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230627	243539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_232166_242270_242486_243342
521439	SIRV6	+	1316	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	569	31	353	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	77	568	1733	10736	TRUE	35	AGCAGTTTAGAAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1656	11794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521440	contig_6062_pilon	+	3367	16	Intergenic	novelGene_5303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	260	junction_7	349.437681616241	1212	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1051	3156	11	3166	791734	822602	FALSE	25	CTTTTTCAGATTCCTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKKPLEFHAKRPWGPEKAVEDPDEDDEDDNDEAESGFSLEEVLRLGGTKQDYLMLATLDENEELVDGGKKGAIDDLQQGELEAFIQNLSLAKYAKTFLTEEDGEPSKKENAGKKEAKVSKIDNKKQNTAESDRTSVSKIKNKKRPEQLPDENSTISKVKKDKQEDIFEYSERQTLLLKPGGKWYDLEYTSEYSLELQPRDVVSKYKTLAQKLYEHEINLFKSKTNNQKGGSSTWMKAIVSSGTLGDRMAAMILLIQDDAVHTLQFVDTLLNLVKKKGSKQQCLMALDTFKELLITDLLPDSRKLRIFSQHPFNKLKELSSGNKDSRDRRLILWYFEHQLKHLVAEFVHVLETLSHDSLVATKTRALTVAHELLCNKPEEEKALLVQVVNKLGDPQNRIATKASHLLETLLSKHPNMKGVVCSEVERLLFRSNISPKAQYYAICFLNQMTLSHEESELANKLITLYFCFFRTCIKKKDIESKMLSALLTGVNRAYPYSQTGDDKVREQLDTLFKVLHIVNFNTSVQALMLLFQVMNSQQTISDRYYAALYRKMLDPGLLSCSKQAMFLNLIYKSLKADIVLRRVKAFLKRLLQVTCEQMPPFICGALYLVSEILKAKPALRSQLDDHPESDDEENFVDIGDNEDREKFTDADKETDTVKKVETEETKTPEPASWVHFDNLKGGKQLNTYDPFSRNPLFCGAEHTSLWELKKLSEHFHPSVALFAKTILQGNYIQYSGDPLQDFTLMRFLDRFVYRNPKPHKGKENTDSVVMQPKRRHFIKDIRSLAVNSKEFLAKEESQIPVDEVFFYRYYKKVAIAKEKQKRHADEESIEDVDDDEFEKMIDTFEDDNCFTSGRDDLDFAGNVKKKTKGAKDNPDEDSEGSDDDFNNLDDDEVSLGSMNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	791723	822803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_791890_793882_795385_800518_800751_801584_801745_803000_803090_804994_805049_806061_806165_806270_806340_813447_813515_814664_814766_815502_815561_815871_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
521441	contig_15047_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_52185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	24737	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	20	382	2194	3042	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAASPGRSAWGRG	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3007_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
521442	contig_15063_pilon	+	1682	7	Intergenic	novelGene_12220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3841.03538197132	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	219	1571	34808	39651	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKLWEKCLRSEMGPEGVPPTSLGPPRPAFPDHLCCTLYVFLGFEL	27550	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38981_39092_39519
521444	contig_1337_pilon	-	3845	12	Intergenic	novelGene_84257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_11	71.995523276804	407	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	13	1383	655231	548911	FALSE	15	TTTTACAGTTGGTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPQTQGAAAGGEQGRDGSHSGVGDVGFEDSKDYILEPLSLPESPGGITTLERSPTVPCIFCEEHFPVAEQDKLLKHMIIEHKIVIADVKLVADFQRYVLYWRKRFTEQPITDFCSVIRINSTAPPEEQDNYFLLCDVLPEDRLLREELQKQRLKEILEQQQQERNDTNFYGICMFCNVECFGNRSVLLNHMAREHAFNIGLPDNIVNCDEFLYTLQKKLDNLQCLYCEKTFRDKNTLKDHMRKKQHRKINPKNQEYDRFYVINYLELGKSWEQVQLEDDRDLLDHQEDDWSDWEEIPASAVCLFCEKQAETVEKLYVHMEDAHEFDLLKIKSELGLNFYQQVKLVNFIRREVHQCRCYGCHVKFKSKADLRTHMEETKHISLLPERQTWDQLQYYFPTYENDTLLCTLSDSESDLTAQEQNENIPIISEDTSKLQALKQSSILNQLLLQECLKN	655243	546448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_549098_550768_550944_552352_552396_554072_554170_555741_555810_563527_563661_564516_564628_565297_565390_583671_583755_584028_584118_593253_593456_655140
521445	contig_3018_pilon	-	3047	16	Intergenic	novelGene_78826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	474.392758048528	17	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	403	2589	600079	550193	FALSE	35	TTCATGAATAAAAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKSHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKREKRREQALERISTAKTEVKTECKDAQIVSDAEVIQEQAKEETATKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRTVSMCSDIQPSSPDIEVAAQQNDIENAVLAIEPETETAVAEIIPETEVPALNKCPTKYPKTKKV	625060	549734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570215_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
521446	contig_12624_pilon	-	1827	4	Intergenic	novelGene_61128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	838.628642487245	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATTTTACTTTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955899	947486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948824_950603_950768_952913_952985_955644
521447	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_9165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521448	contig_7963_pilon	-	2079	4	Intergenic	novelGene_58600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	495	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACGTTAAGATGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298889	293129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296366_296813_297950_298386
521449	contig_2444_pilon	+	2310	12	Intergenic	novelGene_83764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	268.40548454201	78	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	121	1842	231271	243030	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLDLRRARRFPESSGTERGPGTSLTRWRELSPLAWPYAEMLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	230025	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230144_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
521450	contig_16650_pilon	+	2106	4	Intergenic	novelGene_61965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	85	462	244670	254361	FALSE	35	CATCAAAGCTCCATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244585	256005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
521453	contig_1699_pilon	+	2930	4	Intergenic	novelGene_72836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	68.9782574439221	938	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	90	992	116892	124907	FALSE	35	TAATATTTCATCATTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLDDKLLGEKLQYYYSSSEDEDSDCEDKDRGRGALAGSLPAEAELAGEGISVNTGPKGVINDWRRFKQLETEQKEEQCREMERLIKKLSVTCRSHLDEEEEQQKQKDLQEKISGKMTLKDFAMMSEDQDDEEFLQQYRKQRMEEMRQQLHKGPQFKQVFEIPSGEGFLDMIDKEQKSTLIMVHIYEDGIPGTEAMNGCMICLAAEYPAVKFCRVKSSVIGASSRFTRNALPALLIYKGGELIGNFVRVTDQLGEDFFAVDLEAFLQEFGLLPEKEVLVLTSVRNSAACHSEDSDLEID	115754	126845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_115839_116886_117061_119340_119523_124355
521455	contig_2027_pilon	+	3211	25	Intergenic	novelGene_39890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	387.671071109259	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	60	2318	122795	134383	TRUE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGFGSSPAGRRGFRPAQGMSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNMCPSSPPSLASRSMSLTRSSRAPMPLLMTAV	114170	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_114230_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131644_132729_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
521456	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521457	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521458	contig_6980_pilon	+	2097	9	Intergenic	novelGene_36021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	101	997	356720	372790	FALSE	30	ACTGTGTCATTGGAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346082	373890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
521460	contig_1244_pilon	-	1969	11	Intergenic	novelGene_37993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	291	junction_7	771.744672803123	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	644	1543	928860	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947823	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578
521461	SIRV6	+	730	7	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3158_10721
521464	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_12017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	15	CTGGCCCCAGTAGCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36800	27149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521465	contig_6735_pilon	-	1501	12	Intergenic	novelGene_15743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1129.79747325727	2	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	157	888	554315	543853	TRUE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKVSLASSRELSIFRA	564856	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542381_543136_543292_543788_543894_544847_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564187_564787
521466	contig_7396_pilon	-	1994	16	Intergenic	novelGene_79566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3524.5726209003	8	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	438	1613	254680	245580	FALSE	25	AGATATGGTGCGTGCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIIFVFANACPYFATVFYISNDEEPKWGAVQQIE	257477	245198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245676_247745_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257142_257294_257381
521468	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	9	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521469	contig_1331_pilon	-	1253	4	Intergenic	novelGene_37836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	2134	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	19	495	169924	160009	FALSE	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169942	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
521472	SIRV6	+	779	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	160	222	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521473	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_12818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3175.15750593573	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	237	1400	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35848_36158_36266
521474	contig_9482_pilon	-	1946	10	Intergenic	novelGene_44299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_3	79.9444251409134	200	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	18	782	1253164	1240999	TRUE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKASRSRRAPDGPRR	1253181	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
521475	contig_7457_pilon	-	2123	4	Intergenic	novelGene_31605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.8094996374153	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	132	929	962606	956608	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFSTPWAMGAGC	962737	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956642_958283_958375_960225_960896_962603
521476	contig_10968_pilon	+	4737	2	Intergenic	novelGene_84285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	0	507	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	12	407	134947	135516	FALSE	40	AAACATTTGAAAGTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGMTLTGVHTCGDYMFSGHTVVLTMLNFFVTEYTPRSWNFLHTLSWVLNLFGIFFILAAHEHYSIDVFIAFYITTRLFLYYHTLANTRAYQQSRRARIWFPMFSFFECNVNGTVPNEYCWPFSKPAVMKRLIG	134935	139846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_135038_135211
521477	contig_8772_pilon	+	1555	8	Intergenic	novelGene_21088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4570.98959053012	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	143	1246	15355	23105	FALSE	30	GAAAAAACTCTTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15212	23414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15687_19027_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
521478	SIRV6	+	575	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-307	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	105	318	43	360	2021	10736	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTWSSDCSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1978	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2050_2489_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521480	contig_15063_pilon	+	1440	4	Intergenic	novelGene_14189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	126	1298	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34682	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521481	SIRV6	+	749	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	520	-441	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521482	contig_5954_pilon	-	2883	7	Intergenic	novelGene_28757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	3	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	83	793	1462068	1392942	FALSE	15	TAATGGTGGTGTCACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462150	1390851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
521484	contig_6795_pilon	+	3894	29	Intergenic	novelGene_27735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_28	370.76173657232	50	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1197	3594	11	3604	320577	333469	FALSE	45	GACAGCACTAATTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTRCIQISTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGLGAQKPYDDNAEYMKYTRLFRCSNEKGFFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNAL	320566	333759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327430_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333045_333459
521486	contig_5005_pilon	-	2252	5	Intergenic	novelGene_84311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	706	junction_4	283.258164048276	2009	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	84	803	539718	512817	FALSE	15	ATGCTTTGGAGACCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGCSGLGVSPSSSARRLTLSPPFPQRMSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539801	511367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649
521487	contig_3975_pilon	-	1956	13	Intergenic	novelGene_54776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_12	322.024412463127	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	95	1354	2027179	2016131	FALSE	5	CTCCCGAGCTTCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052430	2015528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2052363
521488	SIRV5	+	512	7	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	42	1962	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	19	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGCATAGCCATAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	5560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2264_2316_3298_3405_3483_3641_5380_5451_5543
521489	contig_7744_pilon	+	2371	18	Intergenic	novelGene_62566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	195.373619537216	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1125	1928	887347	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	880360	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_880663_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
521490	contig_12923_pilon	-	2451	10	Intergenic	novelGene_30086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	400.021696942418	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	615	1361	57165	48997	TRUE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101251	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57312_57487_57629_62784_62962_64467_64582_101215
521491	contig_11574_pilon	-	2320	9	Intergenic	novelGene_64061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	355.344111390635	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	246	857	456525	449782	FALSE	10	TAGTTGTCGCGTGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQQKSSSGTTAVPLT	463700	448318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449787_452890_452928_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463503
521492	contig_15087_pilon	-	2234	23	Intergenic	novelGene_37199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	1052.66953837602	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	661	1710	141733	113497	TRUE	30	GTAAAATGAGTGACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	150518	110647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143091_144026_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149713_150476
521493	contig_2341_pilon	+	2782	5	Intergenic	novelGene_84355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	44.2118479595685	331	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	65	517	129118	157640	FALSE	30	GATGGTAGATATACGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAGSALPALQGVYKSCSHCGMVSLSDDTPAMPWWKDKFWIFLAGAIIVTSVSLGLILYCVCRRLFRQGKKLKTAKPLKQNEDEEMTYENVLNQSPGKLPPLPPRDLPSLEDASPADTQSEPPAAYSSIHKVKKAKRVSIPSYIEPEDDYDDVEIPTTTGKHHIKTKVSHF	129053	159905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129136_147326_147451_149686_149748_155756_155831_157464
521494	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_12942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	232	1473	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPAVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28169	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35031_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521495	contig_14635_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_84379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAAGACCCCCTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619583	619335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_619300_619600
521496	contig_18056_pilon	+	304	2	Intergenic	novelGene_84384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGTAAGTGTCTTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3380	11544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18056_pilon_+_3563_11422
521497	contig_5125_pilon	+	2402	8	Intergenic	novelGene_43429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	175	1308	35654	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25977	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26079_26471_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
521498	scaffold_19766_pilon	-	2626	14	Intergenic	novelGene_34435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1223	1642	848460	847420	TRUE	15	CCATATGATTTCCTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRSASAILSNSSMQHTPWSASTRAPPSKVSSPVTESLSTAAVSPTPEEPRPVVVLTAGCQAINVRQELRLGHTRIPHQADVNVASDLHASRGLVHTSYQQEQKCLLHIFMPIYFWGDGGCQLFIEILLCNLPQLLPA	851572	844730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_844796_845086_845162_845496_845661_845843_845971_846043_846224_846508_846648_846978_847127_847333_847449_847532_847665_847880_847976_848296_849043_849978_850147_850920_851032_851211
521499	contig_5247_pilon	+	3765	1	Intergenic	novelGene_81838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408317	412082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_408300_412100
521500	contig_6063_pilon	-	2097	15	Intergenic	novelGene_27581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	480.686626247352	1647	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	623	1669	44494	17150	FALSE	40	TGAAGCTTTAGTAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70286	16721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45483_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
521501	contig_1532_pilon	-	2003	8	Intergenic	novelGene_37415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	66	1259	32217	13113	FALSE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
521502	SIRV6	+	893	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	537	164	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	35	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521503	contig_11285_pilon	+	2448	12	Intergenic	novelGene_5558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	482.712240820571	1	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	1014	2132	767746	769878	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNVMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763492	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767840_768070_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
521504	contig_3077_pilon	+	1809	9	Intergenic	novelGene_26713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2571.57335108295	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	381	1313	11948	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPSVTTASPHYYPPLLCTSQEPQPEDPAVYWRMELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10106	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11488_11876_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
521505	contig_17427_pilon	-	2532	13	Intergenic	novelGene_30350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1061.76088017343	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	33	1439	188879	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204693	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179829_181274_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
521508	contig_7457_pilon	-	1966	3	Intergenic	novelGene_31701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	12	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176978	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967
521510	contig_1450_pilon	+	2721	19	Intergenic	novelGene_27364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	504.120637629477	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	141	2519	244426	355748	FALSE	65	AGAAAAAAAAAAAGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQVGCSPTEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244285	355950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347172_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
521511	contig_12624_pilon	-	1806	5	Intergenic	novelGene_61124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	261	566	952979	948779	TRUE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955899	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947583_947637_948842_950590_950768_952913_952985_955644
521512	contig_12477_pilon	+	1719	5	Intergenic	novelGene_84386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	69.6432875444576	316	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	8	589	6155	19221	FALSE	60	TAAAAAAAAAAAATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGVQGVADAYRTCLPKIRLYGPTNFSPIINHVARFAAVATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNAAKLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPSGEAAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATK	6147	20351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12477_pilon_+_6203_6287_6340_14774_14909_16073_16311_19110
521513	SIRV6	+	1407	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	25	3	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1525	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521514	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521515	contig_15888_pilon	-	1441	9	Intergenic	novelGene_84405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1502.6340570395	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	154	516	254586	253529	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLP	259714	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253535_253601_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
521516	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521517	contig_21203_pilon	+	1266	8	Intergenic	novelGene_84473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	276.875349541402	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	99	1094	53950	121989	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQK	53851	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120265_121983
521518	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-385	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	102	428	2002	10736	TRUE	30	GAAATTGGCGATGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLRAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1900	11311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2615_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521519	contig_6735_pilon	-	2019	13	Intergenic	novelGene_15698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1001.97632484783	2	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	716	1564	545923	542439	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGEWWGEKKLLNFREVMRFPLIQMTSSLTLRWWMRAGGGDVVTATLDSSLQITSSSSSDSHCFFAL	568278	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542970_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551228_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
521520	SIRV6	+	492	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	794	513	-361	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	FALSE	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
521521	contig_7457_pilon	-	2192	5	Intergenic	novelGene_31611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	131	1393	962606	956489	TRUE	10	TAGCTGTGTGCAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962736	955415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955550_955823_956939_958234_958375_960225_960896_962603
521522	contig_15063_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_11054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	232	1119	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35346_36090_36158_36266
521523	contig_5988_pilon	+	1655	4	Intergenic	novelGene_16022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	128.90565025113	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	293	1537	783406	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	782357	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_782548_783303_783527_783653_783803_785838
521524	contig_3161_pilon	-	3006	1	Intergenic	novelGene_84501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1524	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGTGTCTATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348840	345834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_345800_348800
521525	contig_7816_pilon	+	2019	14	Intergenic	novelGene_66487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1042.96311496217	1736	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	443	1912	183050	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170076	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182076_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
521526	contig_7342_pilon	-	2896	21	Intergenic	novelGene_71105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_20	80.688846812927	761	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	83	1147	86720	80779	TRUE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGLALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPVSSRDPGEEASWILEGVTITMISGI	86802	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
521528	contig_1532_pilon	-	1832	9	Intergenic	novelGene_37392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1285.74375363056	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	66	1232	32217	12964	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTNIF	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12974_13149_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
521529	SIRV6	+	382	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10299	145	1062	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGTGGTATCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11299	11681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
521530	contig_7428_pilon	-	3087	12	Intergenic	novelGene_77738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	129.002338373322	517	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	48	1778	443769	438797	FALSE	20	GAGAATTCCGTGCCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNNDNPAPAETRLPSPNSLLGLLALTVAGKCSYSPEPDQRRTLPPGWVSLGRLDPEEELSLTFALRQQNLEKLSELVQAVSDPGSPRYGKYLTLKDVAELVQPSPLTLHTVQKWLLAAGARNCHSVTTQDFLTCWLSVRQAELLLAGAEFHRYVGGPAETHVVRSPHPYQLPQALAPHVDFVGGLHRFPATSSLRQRPKPQVAGTVGLHLGVTPSVIRERYNLTAQDVGSGTTNNSQACAQFLEQYFHDSDLAKFMRLFGGNFAHQASVARVVGKQGQGWAGIEASLDVEYLMSAGANISTWVYSSPGRHEAQEPFLQWLLLLSNESALPHVHTVSYGDDEDSLSSAYIHRVNTELMKAAARGLTLLFASGDSGAGCWSVSGRHQFRPSFPASSPYVTTVGGTSFQNPFRITNEIVDYISGGGFSNVFPRPSYQEEAVSQFLKSSPHLPPSSYFNASGRAYPDVAALSDGYWVVSNSVPIPWVSGTSASTPVFGGLLSLINEHRILNGHPPLGFLNPRLYQQHGAGLFDVTHGCHESCLNEEVQGQGFCSGPGWDPVTGWGTPNFPALLKTLLNT	443816	437487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440337_440577_440767_440915_441115_441303_441483_441615_441744_441950_442102_443218_443359_443641
521531	contig_12622_pilon	-	2078	13	Intergenic	novelGene_5982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2257.38583444558	4	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	18	914	1590968	1588027	TRUE	25	TTCTCTAACCTTCAGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLASPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPELTQQ	1590985	1583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586364_1586650_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1588960_1589181_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
521532	contig_15063_pilon	+	1479	4	Intergenic	novelGene_13139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521533	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521534	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521535	contig_3789_pilon	+	2981	8	Intergenic	novelGene_79850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_7	140.615701506639	805	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	171	926	445610	472341	FALSE	50	ATTGTAAATTAAAATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVITGLAMDMQLLMIPLIMSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	445439	474396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465169_465197_465816_465913_467056_467110_468585_468697_472202
521536	contig_401_pilon	-	3055	15	Intergenic	novelGene_42786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_14	113.9804181177	659	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	74	2149	1129059	1114797	FALSE	30	GTGTGACTAGAGCGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVQLSESKRELTELRSALRVFQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDAATEDEEAAAGLSCPAVLTDSEDESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPTGPRESSPLVVISQPAPIAPHLSGPAEDSSSDSEAEDEKSVLMAAVQNGGEEANLLLPELGSAFYDMARGFAVGSLSEASTGGPVIPPWKECPICKERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE	1131690	1113890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407_1116608_1116836_1116946_1117319_1117416_1117939_1118066_1118523_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
521537	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_8856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521538	contig_15087_pilon	+	2405	4	Intergenic	novelGene_37276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	4	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	36	617	284653	301944	FALSE	20	TGCAAAATCCTCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284617	303732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
521539	contig_5941_pilon	-	2454	9	Intergenic	novelGene_84548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	523.599083268869	1611	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	111	1145	151020	144460	FALSE	20	CTACTTTGCAATTGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLGTEDLAGHEGVQFFGLLSLYLEQEQRFQPREKGLSLIETTPENDNTLCSRLRNAKVEDLRSLTNFFGSCTETFVLAVNILDRFLALMKVKPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELLEILLLVKKHSKVNDTEFFYWRELVSKCLVEYSSPECCKPDHKKLVWIVSRRTAQNLHNSYYSVPELPTIPEGGCFDESESEDSCEDTSCGEESLSSSPLSDQECTFFFSFKVAPALCFPS	152264	143150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527_145734_148032_148132_148227_148307_148486_148738_149827_149966_150882_151021_152010_152062_152205
521540	contig_9177_pilon	-	2147	17	Intergenic	novelGene_32574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1988.4280498361	980	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	174	1928	26442	1932	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISPEY	28507	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1944_20425_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
521542	contig_10581_pilon	+	3600	1	Intergenic	novelGene_41444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	757	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	397	900	792752	793255	NA	45	TAAAAATTCAGAGTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSWKSLLELRLPLRRGASCCHCCLSRSDLCCLCPSSLPPPPHLSLQEVAMGSQAQAHPIAALLPLPRGPQRLSGLAHEALEKGTLRRGWAWHLWLLPAQQHLGLSCFRDPALREATSSLGGGHRDAPWERDRGQVLISLLLASSPSSGEGASVLSELSAYWREGNC	792355	795955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_792400_796000
521544	contig_12074_pilon	-	1541	11	Intergenic	novelGene_53771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_6	480.73398049233	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1422	120	1541	43217	33107	FALSE	10	GTGAGTGGCCATGCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDK	45854	33106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
521548	contig_11752_pilon	+	1394	7	Intergenic	novelGene_37658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1286.44169017574	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	7	1011	87165	99946	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVLSTH	87158	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88670_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_99929_100018_105597
521549	contig_14970_pilon	+	1655	10	Intergenic	novelGene_44979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	5041.40011661468	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	131	1219	136145	231550	TRUE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136014	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231724_231985
521550	contig_15063_pilon	-	1462	4	Intergenic	novelGene_13138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36762	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35357_35832_36156_36264
521551	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	154	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521552	scaffold_12124_pilon	+	2455	11	Intergenic	novelGene_22055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	461.655975808827	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	94	1344	836073	857868	FALSE	30	AACTGGCGTCTTCTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRHSDIWSDWSETLHFGLPEQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVVLMLIFSRNSVRQTLFLPIPQVKSLLTPNAEIAWEGNHQPPDTQEPEFLIVEEMG	829630	858979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836064_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
521553	SIRV6	-	1296	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	856	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATACGAGCAGTCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	3106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3163_7102_7451_7806_7923_10723_10825_11035_11109_11205
521554	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_9106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521555	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_13161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521556	contig_5643_pilon	-	1945	9	Intergenic	novelGene_38859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	684	1136	237140	236148	FALSE	30	ATCACTTAGAGATCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCGHESLHDAKVVMDDLGQGGQTVGGAGGIADNLEGVVILLVVHAHYKHGGIGRRGRDDYPFGATLQVSLSFLQGCEDTGGLYNILSTSITPLDVGGISLLEDSDGLPIDDKLSVLSLDGAMELAMGGIILEHVDLGGASEGIRGLPLS	238195	235338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_236300_236418_236508_236637_236752_236844_236930_237127_237280_237375_237456_237550_237631_237716_237816_237910
521557	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_14102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	189	1364	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521559	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521560	contig_3077_pilon	+	1365	7	Intergenic	novelGene_26761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_1	2453.92397781368	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	39	869	12050	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPQPEDPAVYWRMELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	12011	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
521561	contig_12864_pilon	-	2150	8	Intergenic	novelGene_76418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_7	468.548736384324	87	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252173	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_248963_249843_251887_251999_252111
521562	SIRV6	+	613	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-429	125	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGAAATTTAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1856	11093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2825_3106_3161_10721_10819_11034
521563	contig_5954_pilon	-	2000	12	Intergenic	novelGene_28625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	282.792976872827	14	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	666	1370	956264	945474	TRUE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKAGKTRSWALPTTG	960583	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945515_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
521565	contig_11285_pilon	+	2084	14	Intergenic	novelGene_5575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	514.487025500434	11	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	40	1827	766060	769878	TRUE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740_770031_770096
521566	contig_15063_pilon	+	1598	4	Intergenic	novelGene_13076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	286	1461	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34522	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521568	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_10480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521569	SIRV6	+	875	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-11	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	35	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	127	384	232	615	1733	2794	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGEFWDTSWDVSLGLWD	1113	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2627_2750_2829_3106_3177_10739_10819_11031
521570	contig_3975_pilon	+	2758	11	Intergenic	novelGene_54762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.989517061877	584	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	11	679	1961329	1975668	TRUE	20	AAGCTGGAAGGTGTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQSLAGRRKKRSLWAFHPHLQKKQRSP	1961318	1986271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961334_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973676_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
521571	SIRV6	+	415	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10376	35	1139	-33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCAGTTTAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11376	11791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
521572	contig_15063_pilon	-	1722	7	Intergenic	novelGene_12945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	30	GTCCATACCGTAGTAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	28169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28195_34599_34924_35035_35380_35839_36157_36264_36597_38972_39090_39504
521574	SIRV6	+	465	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTCGTCTTGAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1856_2027_2470
521575	contig_12624_pilon	-	1714	5	Intergenic	novelGene_61103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	211	558	952979	948635	FALSE	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTVASVSLSFAFVLPFSYLQR	955849	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948696_948797_948842_950590_950768_952913_952985_955644
521576	contig_1725_pilon	+	2327	16	Intergenic	novelGene_24309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	614.957068058865	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	407	2188	239717	255543	FALSE	70	GCTAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	235818	255682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239720_240052_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
521577	SIRV6	+	1498	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	4	-11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521578	contig_3747_pilon	+	1974	4	Intergenic	novelGene_24880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4257.29572485738	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	231	911	201313	204120	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYESSSSCHHLLTLRWIPALSTTMCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	201082	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202176_203614_203651_203768
521579	contig_9363_pilon	-	1424	9	Intergenic	novelGene_6766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.972887157356	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	90	902	1548961	1505849	FALSE	10	TGCCCAGTTGTTGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDPG	1549050	1505326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505858_1539087_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
521580	contig_6807_pilon	-	2749	8	Intergenic	novelGene_84561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_7	237.262878405763	673	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	373	1842	121535	111018	FALSE	40	AAATATATGCTGTGTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAIIANLQEEVTCPICLELLREPLSLNCGHSFCQACITVNNKTSMISSEGESTCPMCRISYQPDNIRPNRHLANIVEKLREVKVSLKEEQKRDVCNRHGEKLLLFCKEDGKVICWLCERSQEHHGHHTFLVEEVAQENQAKLKTALERLRMMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQDVNNIIKRSEICTVKRTKTIPKKQSRVFQAPDLKEMLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124796	110110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_113438_113462_117941_118173_120423_120520_121112_121693_124581
521581	contig_15063_pilon	+	1406	6	Intergenic	novelGene_14332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	270	1154	35271	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34889	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521582	contig_6215_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_21180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGCCCAGAAAGTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220799	221100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_220800_221100
521583	contig_12624_pilon	-	1786	4	Intergenic	novelGene_61122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	838.628642487245	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955894	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948818_950636_950768_952913_952985_955644
521584	contig_15063_pilon	+	1696	6	Intergenic	novelGene_13086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	206	1441	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34602	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521586	contig_4114_pilon	-	2402	2	Intergenic	novelGene_15596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGGCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253561	250988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_251072_251242
521587	contig_12837_pilon	+	2040	7	Intergenic	novelGene_57323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	2580.38392922879	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	256	612	153893	166049	FALSE	20	TTTTGTTTGACAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	130386	167477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_130579_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
521588	contig_15063_pilon	+	1500	5	Intergenic	novelGene_12814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	GTGAGAAGTTGTATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521589	contig_8452_pilon	+	2026	2	Intergenic	novelGene_48055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	71	529	433027	433601	FALSE	20	AGGGAATGTAGTTGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILAWCMFNRICASAHNHSHLLFPNLLQTL	432956	435098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_433402_433517
521590	SIRV6	+	701	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	513	262	340	101	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	31	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
521591	contig_5018_pilon	-	1599	9	Intergenic	novelGene_47106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	74	1324	1402792	1399645	FALSE	5	TCCCTTGGTTCCTCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
521592	SIRV6	+	1317	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	210	1	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	522	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	TTGTTTGCGACAGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521593	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521594	contig_1037_pilon	-	2322	2	Intergenic	novelGene_84612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTAGCAGCGCTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506790	504244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_504423_504646
521595	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3978.89176624597	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	593	1414	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34936_35049_35380_35839_36158_36266
521596	contig_13787_pilon	-	1537	8	Intergenic	novelGene_40625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_1	501.824304565912	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	304	1020	205032	159290	FALSE	30	TTATTGTGGGGACAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205335	158772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
521598	contig_12125_pilon	+	2742	13	Intergenic	novelGene_76186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_3	123.641591123519	608	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	663	1619	67320	82984	FALSE	40	ACTAAATTTGTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56146	84107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_65031_65169_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
521599	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_8766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521601	contig_9345_pilon	-	2027	6	Intergenic	novelGene_24379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	498.769686328269	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	211	1035	173741	142100	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	174615	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_174452
521602	contig_233_pilon	-	1747	9	Intergenic	novelGene_14554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1070.87324179849	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	426	1307	93993	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	107345	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98406_105622_105704_107300
521603	contig_10940_pilon	-	1996	4	Intergenic	novelGene_49230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.326760020342	110	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	139	468	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKSELKKAGGANYDAQTE	917138	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875615_893186_893306_916664_916748_916923
521604	contig_5005_pilon	-	2226	6	Intergenic	novelGene_84310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	446.203361708538	57	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	92	811	539718	512817	TRUE	15	CTTTGGAGACCCTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539809	511364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_511789_511825_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649
521606	contig_2027_pilon	+	2680	20	Intergenic	novelGene_39904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	302.036568386444	153	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	128	2485	124948	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	124599	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_124699_124919_125011_125121_125185_126002_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
521607	SIRV6	+	454	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-431	611	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106
521609	contig_5189_pilon	-	1916	8	Intergenic	novelGene_34823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.65900708742	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	111	770	244235	199237	FALSE	0	TGTTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199319_218623_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
521611	contig_15063_pilon	+	1819	7	Intergenic	novelGene_13053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	2912.14044990965	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	331	1569	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30186	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521614	contig_10141_pilon	-	2904	9	Intergenic	novelGene_84623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_4	115.766400026087	1597	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	70	2646	418688	395520	FALSE	15	CTGGCGTGTCATCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKETKSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFKKIYKTLKKDEDIPVFPVQTKYMDTVKERICLARQIEKAEYRNFQACLHNSWIEQAAAALEIELEEGMYKGGKADEQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPLFKDDLKTKYPTQSGKPIVVSAPGNGKSALSCISKQKKKKKKKLKEQQQPQPSTSAD	421158	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397364_399918_400108_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835_409370_417973_418694_421094
521616	contig_4924_pilon	-	2711	2	Intergenic	novelGene_84755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3980	junction_1	0	978	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	89	412	252576	197716	FALSE	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFFLPVPHRAALTLPPGSVFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGVSRFPFVPKSLYCLKMVPFN	252664	195416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_197862_252398
521617	contig_233_pilon	+	2515	14	Intergenic	novelGene_14598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	2204	2515	108497	126993	FALSE	25	GGGAAAAGGTACTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGQPFISSCCLVLQRTESGSPSPVKFIFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRRQTETEAHSVHSPHSCPRTLVLRVLGGLGQVKLRSCPGWFTVTS	78139	126993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79137_91467_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101767_104145_104308_105460_105567_108411_108583_108724_108829_126871
521618	contig_15063_pilon	-	1497	4	Intergenic	novelGene_13209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36785	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35378_35838_36156_36264
521619	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_8718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27123	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521620	contig_9436_pilon	-	2768	14	Intergenic	novelGene_60927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	86.9301562808092	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	27	1865	458965	442131	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVWGSQDGEGTGDLDEFDF	458991	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442658_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
521621	contig_15063_pilon	+	1683	6	Intergenic	novelGene_13645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3751.57737491845	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	202	1425	34808	39510	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTL	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39085_39506
521623	contig_11285_pilon	-	2683	25	Intergenic	novelGene_5707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	406.822013959012	4	53	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	279	1682	796496	787805	TRUE	5	CCCCTCCGCCAGCGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHPESKQ	798481	784064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787823_790218_790335_790427_790484_790567_790673_790794_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
521624	SIRV4	+	1558	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	38	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAGGTTATATTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1677_1886_2389
521625	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_9675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	8	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521626	contig_13740_pilon	+	2299	5	Intergenic	novelGene_34730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1125	junction_1	69.2364607703196	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	596	1147	167703	176906	FALSE	15	TTTATGTGGTTAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	167107	178058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
521628	contig_11720_pilon	-	2287	12	Intergenic	novelGene_43904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	155.852653447982	1182	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	124	1053	124674	118106	FALSE	35	AATTAAAACCCTGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134645	116871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
521629	contig_1146_pilon	+	2221	7	Intergenic	novelGene_84846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	226.944682442416	1095	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	73	684	937672	944381	TRUE	15	TCCTACTTTCTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	937599	945961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262_945323_945365
521630	contig_10235_pilon	+	2285	6	Intergenic	novelGene_46418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	10	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	27	746	210483	212152	FALSE	35	ATGAAAACGAATGTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210456	213691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
521631	contig_17964_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_33872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCTTCTCTCTGGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135349	134200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135300
521632	contig_15063_pilon	+	1460	4	Intergenic	novelGene_14158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	150	1322	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34658	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521633	contig_14744_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_66077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	491	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
521635	contig_14925_pilon	-	1763	9	Intergenic	novelGene_55135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	1486.30178631394	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	235	648	116065	114666	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121642	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_103145_103312_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
521637	contig_15063_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_10619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	GTTTATAAAAATTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521638	contig_401_pilon	-	3381	13	Intergenic	novelGene_42789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	115.33815018843	2	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	75	1490	1129059	1117910	TRUE	35	CAAGTGTGACTAGAGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVRYPATHES	1131691	1113893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116832_1116946_1117319_1118066_1118523_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
521639	contig_5020_pilon	+	1602	8	Intergenic	novelGene_27861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	359	1288	122915	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118466	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
521640	contig_13863_pilon	+	1896	9	Intergenic	novelGene_42013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	943.80864056227	256	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	71	976	98341	114328	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSFCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRR	98270	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114354_118886_118965_119571
521641	contig_6227_pilon	-	1804	16	Intergenic	novelGene_49728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	314.993728332627	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	17	1504	1224979	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224995	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222108_1224857
521643	contig_7428_pilon	+	2461	6	Intergenic	novelGene_77681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	289.953513515529	1159	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	195	1343	221272	223939	TRUE	10	GCCCTCTGTGACTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALALPDCLVLWVPAEAHPLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTRSVLSPSEACGLLLGSTCGHWDVFSSWNISLPAVPKPPPRPPSPPAPGAPVSRILFLTDLHWDHDYLEGADPDCVDPLCCRQGSGLPPTSRPGAGYWGEYSKCDLPLRTLESLLSGLGPAGPFDMVYWTGDIPAHNVWQQSRQDQLRALTTITALVRKFLGPVPVYPAVGNHESTPVNGFPPPFIEGNHSSSWLYEAMAKAWEPWLPAEALQTLRIGGVLCPVPTPPASASSLSI	221077	225742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221584_222563_223337_223875_224050_224356_224434_224643_224790_224957
521645	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521648	contig_5189_pilon	-	2053	9	Intergenic	novelGene_34842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1018.66179832906	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	111	299	244235	220303	TRUE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLK	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220309_235736_235848_244163_244289_247694
521650	contig_5643_pilon	+	1062	9	Intergenic	novelGene_39076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	337	junction_3	729.353609369283	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	597	1061	634983	636478	FALSE	20	AGGGCTGCCTGGAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIAS	631252	636479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430
521651	contig_10235_pilon	-	2583	11	Intergenic	novelGene_46260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	388.705595534718	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	345	1178	25335	19534	TRUE	15	TGCGTCTGTGGTATCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	26836	13952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_18878_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_26625
521652	contig_19851_pilon	+	1594	5	Intergenic	novelGene_29870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_2	3212.14515549967	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	72	359	53637	54149	TRUE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPPPAVQVQGLGPQREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKGNAAAGRGRDKSGASHPPRGQHCVPFCRFVRRWFRRAPLLPLSGCRSAQGALDSGR	53565	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_54717_55650_55753_55840_55882_56006
521654	contig_9797_pilon	-	1431	4	Intergenic	novelGene_65599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1811	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	718	1104	191434	189331	TRUE	20	AGGTCAGTCCCCCAGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSLLQLRVADGARVVPVILLEEVFPLLDEFP	192151	183870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_183983_188571_188734_189277_189420_191136
521656	contig_9705_pilon	+	910	9	Intergenic	novelGene_41750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	189.919020571927	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	11	847	450139	505996	FALSE	15	TACAATGGTTGTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVVVPAEWIKNWEKSGRGEFLHLCRILSENKSHDSSTYRDFQQALYELSYHVIKGNLKHEQASNVLNDISEFREDMPSILADVFCILDIETNCLEEKNKRDYFTQLVLACLYLVSDTVLKERLDPETLESLGLIKQSQQFNQKSVKIKTKLFYKQQKFNLLREENEGYAKLIAELGQDLSGNITSDLILENIKSLIASVAGCFNLDPNRVLDVILEVFECRPEHDDFFISLLESYMSMCEPQTLCHILGFKFKFYQVIKKYIYVHIYIYIFTSS	450128	506059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_462681_462741_466106_466199_468452_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492016_492239_505982
521657	contig_7151_pilon	-	2312	13	Intergenic	novelGene_40679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	139.918701593302	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	60	2225	65162	1924	FALSE	25	ATACTCTGAGTTTCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65221	1836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6168_13518_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
521659	SIRV6	+	564	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
521660	contig_5954_pilon	-	2303	14	Intergenic	novelGene_28694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	454.292831036723	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	648	2012	956264	945083	FALSE	20	AAACTGGAGTGTCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRCPALWTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960518	944791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_956105_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959988_960474
521662	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521663	contig_6980_pilon	+	1663	5	Intergenic	novelGene_36067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	718.713564293871	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	39	596	362370	372822	FALSE	30	TACTGTGTCATTGGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPKLYPELSQYMGLSLNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDGTKHYEKPDGSYRSRGLIKVKLQWKLS	362331	373889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_362385_364923_365032_368206_368383_370468_370641_372735
521664	SIRV6	+	1237	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	761	28	-437	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	154	486	2002	10736	TRUE	35	AGTTTAGAAGTTTTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1848	11797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521665	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	588	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	37	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCGGTCTTGTGGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	3128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1519_1618_1736_1845_2027_2470_2621_2750_2829_3106
521666	contig_12790_pilon	+	2015	9	Intergenic	novelGene_35235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	248.780996812458	2	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	359	1087	309644	312473	FALSE	25	CAGATTCTGATGGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305937	313401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
521667	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521668	contig_6175_pilon	+	2557	12	Intergenic	novelGene_16311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	219.685236886289	6	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	179	1420	1471148	1521911	FALSE	20	CTCATTCTGTGACAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGQNGQILCVQGVHRRKKM	1466834	1523048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498533_1521854
521669	contig_14513_pilon	-	1203	2	Intergenic	novelGene_70283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	228	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	184	348	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
521670	contig_1856_pilon	-	3776	1	Intergenic	novelGene_84882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	637	1056	259750	259331	NA	85	AAAAAAAAAAAAATAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYIPALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSGKGKFHFPFPPPTTFDSTKPK	260386	256610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_256600_260400
521673	SIRV6	+	810	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	183	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	45	6	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	305	625	2458	10736	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1486	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2000_2450_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521674	contig_19564_pilon	-	1804	5	Intergenic	novelGene_29607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.43123896188	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	181	948	13615	12201	FALSE	60	AAAAAAAGAAACCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCRRVRTSLLQPPGHVPSPQPAIRRDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15683	11344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12683_13033_13259_13554_13666_13945_13999_15606
521675	contig_14970_pilon	+	1904	9	Intergenic	novelGene_44995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	115	1203	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136030	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
521676	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521677	contig_5643_pilon	+	1394	12	Intergenic	novelGene_38771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2517.61825659698	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	310	1182	236199	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233468	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236085_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
521678	contig_2204_pilon	+	2149	5	Intergenic	novelGene_71647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	180.672874278349	1638	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	30	989	13204	34631	FALSE	65	TTTAAAAAAAAAAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIGATLQMQKMGKKQNGKIKKVEKAEPEEFVVEKVLDRRVVIGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSENESDDSNSKKKREAADKPRGFARGLDPEQIIDATDNSGELLFLMKWKDSDEADLVLAKEANVKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	13174	35791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_34086
521679	contig_8978_pilon	+	2482	12	Intergenic	novelGene_49375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	301.001468929174	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	117	1070	339807	343977	TRUE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGK	331546	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_343969_344028_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
521681	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521682	contig_15063_pilon	+	1497	6	Intergenic	novelGene_9153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	243	1397	34808	39670	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCHLRALGPPGLRSLIIYAAPFMSSLALSSKKQVSF	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36536_39562
521684	contig_10042_pilon	+	2224	13	Intergenic	novelGene_79196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	62.1129683184867	875	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	256	1221	1054190	1090129	FALSE	20	GAGGTATATTCTTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028835	1091132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
521685	contig_15063_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_10160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521686	SIRV6	+	922	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1490	58	61	-57	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	44	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTAGTCGATTATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	11767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521687	contig_7594_pilon	+	2654	5	Intergenic	novelGene_55420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	676.964317745034	118	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTGTGATTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538972	555180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953
521688	contig_15063_pilon	+	1664	6	Intergenic	novelGene_13591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	202	1014	34808	36299	TRUE	45	CATGAAATAAATGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTISLCPQRWPSMHQPST	34606	39740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36144_36250_36600_38975_39092_39506
521689	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521690	contig_15063_pilon	-	1685	6	Intergenic	novelGene_13955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	977	1300	35891	35108	TRUE	40	AGGACCCAAGAGTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	34610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
521692	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521695	contig_408_pilon	-	2129	2	Intergenic	novelGene_84909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAAGGTGAATCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149616	131322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133231_149395
521697	contig_11338_pilon	+	2220	5	Intergenic	novelGene_6204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	309.194113786146	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	115	360	8903	11749	FALSE	30	AGCTGAATTTAACCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLLHMPLRGLRYLPGRHRERGRPGGAALPPGGRTAALLLALRPSESSM	8788	13609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8924_9814_9899_9942_10007_10508_10556_11719
521698	contig_15092_pilon	+	1855	4	Intergenic	novelGene_57794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.242056920641	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	135	653	325159	351399	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTTPQFCLKFQVCL	325024	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992_351073_351354
521699	contig_15063_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_14024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	793	1116	35891	35108	TRUE	30	CTGAGGACCCAAGAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36792	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521700	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_13861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_4	3402.18653038013	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	200	1288	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	34608	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_39506
521701	contig_10437_pilon	+	2308	4	Intergenic	novelGene_38143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	66.4680374315355	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	156675	162086	TRUE	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGERAREPHAGRRRAEPASRSRRLDAREEQGSKSEEDNLVPDCSTLPPGPGSLSGSETSTFTDQLRAPRTLLFLNPSRSLLEPVTPGPLFSLSNSASGLGGWTPSTPSGCSPSWRWDQGSRTDHVTTGWPEELS	156674	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160021_161905_162802_162906
521702	contig_1244_pilon	-	1860	11	Intergenic	novelGene_38006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	735.76795934588	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	167	1438	946523	923211	FALSE	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	946689	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439
521704	contig_16622_pilon	-	2228	12	Intergenic	novelGene_48436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	225	junction_4	1002.04627827344	28	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	157	741	125335	113120	TRUE	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	126121	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056
521707	contig_2310_pilon	+	2563	13	Intergenic	novelGene_71595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	227.644947719518	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	52	1080	106097	124759	TRUE	20	GAGCCAGATTTGTCGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGDDYESEAAYDPYAYPGDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKVNASFPQPIFQEPECPSASREIDVLGQFQGEERGPFPQPN	106045	134642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_125291_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
521713	contig_10793_pilon	+	2428	8	Intergenic	novelGene_83430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3152.71614675994	18	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	95	898	152887	163940	FALSE	40	ATTCTTTAATAACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	152792	165470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929
521714	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521715	contig_9290_pilon	-	2034	12	Intergenic	novelGene_77532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.473484304131	14	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	767	1693	486192	478940	FALSE	25	GTTATCTTTGCAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497076	478598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486774_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
521716	contig_14925_pilon	-	1948	7	Intergenic	novelGene_55265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	983.356567522122	41	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	347	760	116065	114666	TRUE	10	CTTTGGCTTGATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	302308	112089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129528_136213_136405_302279
521717	contig_1443_pilon	-	2341	8	Intergenic	novelGene_28311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	552.134780942598	4	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1434	2057	776427	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRYEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748964_766773_766826_767440_767556_776186_776462_804491_805718_808694_808741_809399
521718	contig_9696_pilon	-	2674	6	Intergenic	novelGene_68760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	525	junction_2	212.235718011837	2600	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	67	927	150836	136106	FALSE	75	TAAAATTAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAAQVTKKKKKKRYRIPTNDELLYDPEKDNRDQAWVDAQRRSYHGFGIQSPRQQQPVPNSDAVLNCPACMTTLCLDCQRHESYKTQYRAMFVMNCSVNKEEILRYKTPENRKKRWGHKKMRSSQEDTAKWAETEAEEIYHPVVCTECSTEVAVYDKDEVFHFFNVLASHS	150902	134358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_137980_138092_139913_140032_140957_141057_146412_146595_150762
521719	SIRV6	-	542	5	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-241	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2788	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2625_2746
521720	contig_14333_pilon	-	2841	3	Intergenic	novelGene_49152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	346	junction_2	28.5	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	69	503	446908	443128	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIK	446976	440789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_443248_445731_445820_446681
521722	contig_12074_pilon	-	1979	14	Intergenic	novelGene_53757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	428.178224243102	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	404	1729	36661	30226	FALSE	25	ACATATTTAATGCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45854	29975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40134_41118_41228_45769
521724	contig_12074_pilon	-	1903	13	Intergenic	novelGene_53751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_11	425.899407789628	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	491	1651	36135	30226	FALSE	20	ATATTTAATGCCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45854	29973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_41067_41228_45769
521726	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_14099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521727	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521728	contig_16098_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_46110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1543.937346725	8	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	763	1365	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460264	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457907_458405_458618_458704_458838_460148
521729	contig_5189_pilon	-	2057	9	Intergenic	novelGene_34826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1018.66179832906	5	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	111	914	244235	199237	FALSE	10	TAATGTTTTTTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLVRIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220303_235732_235848_244163_244289_247694
521730	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_8583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	597	1418	35271	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26352	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35035_35380_35839_36158_36266
521731	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_13182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
521733	contig_5033_pilon	-	1967	15	Intergenic	novelGene_29055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3981.30759978197	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	29	1495	566787	532125	TRUE	20	TTGTTTGTTTTGCACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLAVEHCKRHVWN	566815	531039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531166_531541_531679_531915_532161_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
521734	contig_15063_pilon	-	1487	4	Intergenic	novelGene_13162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	775	1098	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36775	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36155_36264
521735	contig_13894_pilon	-	953	8	Intergenic	novelGene_62159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGTCTTGAAGGTCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528173	522796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_522844_523482_523623_524835_525017_525632_525797_526475_526577_526850_526947_527457_527585_528076
521737	contig_7334_pilon	+	2285	4	Intergenic	novelGene_50566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	233.195673678184	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	302	670	120109	120565	TRUE	10	TGTACTCACTGTTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGTWPSSTLCFPCGPGPSPLVS	116739	122501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097_120413_120500_121363_121683
521738	contig_11130_pilon	-	2112	6	Intergenic	novelGene_53090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	254	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGTCATGGGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55193_55636_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
521739	contig_16999_pilon	+	956	6	Intergenic	novelGene_85011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	186.119746399999	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	249	632	234457	236848	FALSE	25	GTTATGCAGCAATGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYIQPATCTDAEFRQMWAEFEWENKVTVNTNIIDLNEYLQHILKSTNMKCLTPEKALSGYCGFMAANLYARSIFGEDALANVSIEKPIHQGPEAPVTGHIRIRAKSQGMALSLGDKINLSQKKTSI	224557	237172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_224618_230975_231096_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
521740	contig_12923_pilon	-	3213	16	Intergenic	novelGene_30101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	330.895512208915	2	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	58	2142	93727	48997	TRUE	40	GAATAAAGCATTGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSPWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101225	45360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62958_64550_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
521741	contig_4315_pilon	-	2233	9	Intergenic	novelGene_46782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_8	172.265737670031	231	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	41	1096	343489	328205	FALSE	5	CATCCTGTGTCTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	343529	327067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485
521742	contig_8772_pilon	+	1704	9	Intergenic	novelGene_21108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4830.52468035306	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	56	1105	15355	20584	TRUE	10	ACTCTTGCTGTGTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQSAPSQPPSPLPPSAAMSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTKTLLAVCRMRFRT	15299	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20542_20697_21478_21523_21966_22053_23063
521743	SIRV6	+	537	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	548	-441	-5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
521744	contig_1225_pilon	+	2195	4	Intergenic	novelGene_44113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	597.993496805962	1975	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	184	549	147032	148934	FALSE	35	CAATAAAGTATATTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVARGFIPAEESTATGSRGSHSPLGGWQTQDRQVGEQCSCSQAVKISKTRDWQVFRTSAVKMGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134425	150580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_143612_143698_147007_147173_148709
521745	contig_6735_pilon	-	1653	11	Intergenic	novelGene_15792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	825.243897281283	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	121	720	564868	543287	TRUE	55	AAAAATAAAATGGGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRGDALEADYPRG	568235	542014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543815_547239_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568115
521748	contig_15063_pilon	+	1683	6	Intergenic	novelGene_13953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521750	contig_6980_pilon	+	2117	9	Intergenic	novelGene_36001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	489	junction_4	551.877647219019	3	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	128	1021	356720	372790	FALSE	25	TGTTACTGTGTCATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346055	373886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
521751	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521753	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521754	SIRV6	+	884	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	27	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
521755	contig_1443_pilon	+	2186	9	Intergenic	novelGene_28270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCGAGTCTCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747586	809528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748993_749234_749349_750369_750530_766776_766826_767440_767556_776186_776463_808700_808736_809398
521756	contig_15063_pilon	+	1139	4	Intergenic	novelGene_9619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2640.18383198342	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	509	997	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34885_35871_36158_36266
521757	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521758	contig_11088_pilon	+	1260	4	Intergenic	novelGene_85034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	57.9271573232759	196	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	635	1063	17314	17742	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	13625	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_16250_16348_17119
521760	contig_1450_pilon	+	2973	21	Intergenic	novelGene_27356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	513.132758163031	1	78	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	237	2822	244426	355748	FALSE	15	GAGTCTCCTTGCCCGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEINELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244189	355899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345753_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
521761	contig_14638_pilon	-	1939	3	Intergenic	novelGene_71567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	163.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277696	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_277509_277556_277660
521762	contig_10311_pilon	-	1821	11	Intergenic	novelGene_50429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.59539802372	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	34	1173	71526	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65871_67217_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
521763	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3647.79874262091	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	6	1472	28164	39510	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLL	28158	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39088_39506
521764	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_11067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	50	AAAATATCAGTTCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521765	contig_12638_pilon	+	2208	9	Intergenic	novelGene_33387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	116.579372103301	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	90	1088	1515842	1539055	FALSE	30	ACAAGGGCTTCACCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVNSPPQEQMALTLRLVCHCPLRSTP	1515752	1540175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530515_1538982
521766	contig_5153_pilon	+	2320	16	Intergenic	novelGene_74353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	286.955250092337	2841	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	528	1598	1010261	1022174	FALSE	10	ATTTTTTCCTGGTGCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956530	1022896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010032_1010227_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
521767	contig_10940_pilon	-	1969	4	Intergenic	novelGene_49224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	13	441	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917012	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
521769	contig_15063_pilon	+	1755	7	Intergenic	novelGene_12290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	67	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	28	1500	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521771	contig_17964_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_33877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCAATAAAGCAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135243	134218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135200
521774	contig_16703_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_72758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTGTTGGAAGAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12100	12556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_12100_12600
521775	contig_15063_pilon	+	1480	5	Intergenic	novelGene_12245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4140.46851213724	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	212	1054	34808	36333	FALSE	35	GTTGTATGTTTATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27559	36759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
521776	contig_9807_pilon	+	2214	11	Intergenic	novelGene_32879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	610.886478815827	70	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	96	929	109130	154223	TRUE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGISWSPDSTHLLHAEERGQDTGGQRPRDRPGLLPGWRLSRRV	109034	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140373_140723_140753_154126_154270_156624_156770_158676
521777	contig_5643_pilon	-	3031	9	Intergenic	novelGene_38934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACAGGAAGCTGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502638	462241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_462356_481849_481953_482078_482247_494955_495119_495527_495760_497909_498246_499451_499656_500128_500251_501049
521778	contig_5686_pilon	+	2893	3	Intergenic	novelGene_45297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	539	880	94439	94780	TRUE	65	AAAAAAAAAAATGGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93900	99212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94960_96907_97734_98204
521781	contig_7839_pilon	+	2492	12	Intergenic	novelGene_45727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	605.934194392332	2	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	95	1282	952473	955395	TRUE	15	TATACACTTCTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEHLPRNAPAEQNLEGHPQKHCQEVP	950904	957263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955055_955319_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
521782	contig_4730_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_71713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTCTTATTTTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140897	141666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_140900_141700
521783	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521784	contig_10299_pilon	+	2774	17	Intergenic	novelGene_79681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	85.4323334209595	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	71	844	320559	336816	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTVPSGDPGAGAADPGCAAVH	320488	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335216_336757_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
521785	contig_14711_pilon	+	2998	16	Intergenic	novelGene_68933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	59.9476067541946	1389	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	516	1619	120484	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	100596	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_100757_118709_118739_119058_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133498_133699_133925_133978_134106_134197_135227
521787	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10425	81	1188	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11425	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
521788	contig_3745_pilon	+	2555	3	Intergenic	novelGene_85068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	143	797	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	141	536	364282	370795	FALSE	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRTLPSTWIENKLYGMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364141	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369328_370637
521789	SIRV6	+	737	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	337	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	32	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	93	581	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11034
521790	contig_19564_pilon	-	1938	3	Intergenic	novelGene_29641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_2	656.5	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	656	1774	13615	12201	FALSE	20	ATATTTGTTGTTTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15688	12036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_14055_15472
521792	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4154.41592615617	11	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	229	1071	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36268
521793	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27171_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521794	SIRV6	+	873	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	57	598	7	-43	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	40	GTATATGCGGTAAACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521795	contig_10940_pilon	-	1815	4	Intergenic	novelGene_49225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	621.731631994241	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	836	1216	875054	874674	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917055	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874451_874489_875675_916664_916748_916923
521796	contig_15063_pilon	+	1598	8	Intergenic	novelGene_12395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3690.10814508857	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	10	1347	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35114_35248_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521797	contig_15384_pilon	-	2816	19	Intergenic	novelGene_85141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	41.0814081886859	285	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	46	1113	127943	123213	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMKTSPGSTAACCLWGAGRLTARE	127988	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
521798	contig_15063_pilon	-	1510	4	Intergenic	novelGene_13762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35373_35839_36155_36264
521799	contig_500_pilon	+	1753	11	Intergenic	novelGene_30958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	573.978536184063	2534	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	134	919	1452302	1466791	TRUE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVHVRWNSLNFNSCLSGCCPALEEEH	1446837	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1466718_1466925_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
521803	contig_3386_pilon	-	2320	7	Intergenic	novelGene_34514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	865.785513597655	14	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	114	488	409604	406808	TRUE	5	GCCTGTTGTTTTTCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412207	404141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404263_404696_404940_405102_405190_405426_406842_407702_407838_409398_409607_412096
521804	contig_15063_pilon	-	1491	4	Intergenic	novelGene_13795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	778	1104	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35836_36156_36264
521805	contig_8330_pilon	+	2277	13	Intergenic	novelGene_71789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_7	544.072579921303	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	270	1373	852673	856687	TRUE	15	GGACACCGCTGCCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837481	857805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
521807	contig_854_pilon	-	3182	13	Intergenic	novelGene_36152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	204.555344317593	3	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	41	856	509201	474744	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTGDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLGAA	509241	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476682_476788_483477_483627_486993_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
521808	contig_1406_pilon	-	2160	5	Intergenic	novelGene_25579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1656	1970	2185301	2183728	TRUE	10	TGCGGGGCGGCGGCAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSSFYESSATPFHHCCQLKSSLLPKTKKKPRIVAKMTVFPVRTSAQAPHSIWCALAKTIGSPKAETTMPVVRNMASSLQALLIASVSSTNLLAMQYGIGERM	2187468	2173753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2173836_2179472_2179551_2183697_2183882_2185140_2185307_2185818
521810	contig_8357_pilon	-	2566	19	Intergenic	novelGene_39740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	275.76744205719	756	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1056	1913	787951	762891	FALSE	10	CTTTATCTTGATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818368	762237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790655_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808821_818245
521811	contig_20693_pilon	+	1876	15	Intergenic	novelGene_60244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	570.28587532205	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	8	1315	14718	32971	TRUE	25	TTATGTATAGTCCTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCMTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKKTVTVALPRTAPILAVRPGPAN	14710	34772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29893_29941_29968_32928_33015_34254
521813	contig_9332_pilon	-	2729	2	Intergenic	novelGene_60717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	199	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86307	80510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_83110_86177
521815	contig_4364_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAACACAAAGTCAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533199	1532753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
521816	contig_14513_pilon	-	1293	4	Intergenic	novelGene_70336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
521817	contig_8772_pilon	+	1860	9	Intergenic	novelGene_21076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	581	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	146	1546	15355	23105	FALSE	15	AACTCTTGCTGTGTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15209	23419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
521818	contig_5423_pilon	-	2446	16	Intergenic	novelGene_85236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	229.086436865118	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1283	2140	502766	497362	FALSE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534281	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
521819	SIRV6	+	853	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	28	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	160	654	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521820	contig_4125_pilon	-	3464	12	Intergenic	novelGene_25127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	433.449969469439	3	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	74	460	822728	815563	TRUE	65	TTGTAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMRTT	846517	808970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813005_813261_813415_813773_813879_815228_815309_815466_815576_815911_816029_820537_820622_822555_822775_846490
521821	contig_9436_pilon	-	2916	15	Intergenic	novelGene_60921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_10	70.5747902611702	762	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	10	2013	458965	442131	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTEEDPEHRVRVRVTRLHHGGPNQDLTVLEMKRENPQLKQIEGLVKELLEREGLTAEGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVWGSQDGEGTGDLDEFDF	458974	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442658_442804_442970_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
521822	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_9063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	196	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521823	contig_15063_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_8496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	8	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	254	1489	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521824	contig_14513_pilon	+	1081	2	Intergenic	novelGene_70260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	193	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATATCAATTAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11284	19077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12134_18845
521825	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532903	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
521826	SIRV6	+	1035	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	480	13	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521827	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	201	1439	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521828	contig_15991_pilon	-	2181	3	Intergenic	novelGene_70883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7327	junction_2	522	36	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	35	574	105108	101983	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	105142	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_102271_103583_103703_104975
521829	SIRV6	+	805	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	228	164	135	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
521830	contig_13021_pilon	+	1606	8	Intergenic	novelGene_8157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2358.09600642345	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	169	1224	174676	180767	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDSIPLEIGKITIEVTLVCLREILGQKLRMVFTVLLQIIPMGALEVILCLLVYRPVLGLVIQQGLTRTVMIALSNMELMFQIYTMV	174507	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177511_180506
521831	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521832	contig_14925_pilon	-	1870	5	Intergenic	novelGene_55130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	1560.49623517649	783	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	501	938	103374	29812	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSGKNECEKPSKFCFFFLFVCFFAECLLQSRNLKESYVDEGMLHGVAVATSRTTCVKNIKNSLGQTRYPRL	103874	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_102952
521833	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521835	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_14117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	186	1358	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34622	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521836	contig_4364_pilon	-	1126	3	Intergenic	novelGene_4563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTCCTGTAAGGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538328	1534953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1535358_1536202_1536237_1537640
521837	contig_12873_pilon	+	1943	6	Intergenic	novelGene_27169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	391	1371	16357	19855	FALSE	40	AAGCCAAATTTGTAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15966	20427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
521838	contig_19825_pilon	-	2983	11	Intergenic	novelGene_59682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.551642167231	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	11	1018	70117	17388	TRUE	30	ACAATCTGAATTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRWFWCVSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCKQADEEFQILANSWRYSSAFTNKIFFAMVDFDEGSDVFQMLNMNSAPTFINFPAKGKPKRGDTYELQVRGFSAEQIARWIADRTDVNIRVIRPPNYAGPLMLGLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFNGGVTLGMVLLCEAATSDMDIGKRKIMCVAGIGLVVLFFSWMLSIFRSKYHGYPYSFLMS	70127	15376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_15668_15713_17404_19816_19908_23163_23239_36715_36780_37429_37520_38098_38240_38733_38875_42313_42432_46551_46722_70015
521839	contig_12512_pilon	-	3885	6	Intergenic	novelGene_24180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_4	445.09729273497	989	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	647	1231	591804	588331	FALSE	25	TTGTAAAATTGTTCGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPKAAIYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLGLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQRRNNLVPVSACDDFERALQGPLFAIIQEFRFLPPPLYSEVDPNPDQSTEDRPSCPSR	599939	585676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_590824_591103_591267_591594_591852_595423_595506_599422
521841	contig_7357_pilon	-	1935	7	Intergenic	novelGene_36785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1434	junction_2	1963.4336774018	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	61	1053	154994	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	155054	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861
521842	SIRV6	-	897	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8732	76	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	36	5	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTATTTACAACTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1518_1631_1778_1866_2030_2474_2617_2733_2828_3105_3164_10723_10818_11031_11109_11205
521844	contig_9345_pilon	-	2045	6	Intergenic	novelGene_24668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2002.75294532301	3	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	650	988	952473	947957	FALSE	35	AAAGGCAGTTTTCTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001304	946899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952719_955182_955356_997009_997093_1001156
521845	contig_8447_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_69430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGAGAAACTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82349	84483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82300_84500
521846	SIRV6	+	1498	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	43	-13	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521847	SIRV6	+	432	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	760	8167	-395	624	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1890	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
521848	SIRV6	+	955	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	475	164	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	35	CCATAAATTTGTGAACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521849	contig_12074_pilon	-	1948	13	Intergenic	novelGene_53759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	446.976664814718	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	717	1700	34934	30226	FALSE	30	ATACATATTTAATGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	29977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_36089_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
521851	contig_20365_pilon	+	3441	3	Intergenic	novelGene_85320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	315	junction_1	20.5	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	31	711	9641	13547	FALSE	50	GAGTAAAACTTGTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPVQQPPQPADGKRKGKAQYVQAKRARRCDAGGPRQLEPGLQGILITCNMNERKCVEEAYSLLNEYGDDMYGPEKFTDKNQQPSGDEGEDDDVEAALKKEVDDIRAFTEMRLRRFQSVESGANNVVFIRTLGIEPEKLVHHILQDMYKTKKKKTRVILRMLPISGTCKAFIEDMKKYAETFLEPWFKAPNKGTFQIVYKSRNNSHMNREEVIKELAGMFFGDST	9610	16277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_9872_12098_12274_13272
521852	contig_12644_pilon	+	1602	9	Intergenic	novelGene_44623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4313.12072163242	152	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	543	1514	2678073	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
521853	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521854	contig_7396_pilon	-	1929	17	Intergenic	novelGene_79620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3220.05044542686	33	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	209	1597	255163	246442	TRUE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257477	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246001_246175_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
521855	contig_9440_pilon	-	2160	6	Intergenic	novelGene_59093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.9542031573	61	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	100	783	1716626	1700693	TRUE	15	GGACATTACTTTGTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGVPRSARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716725	1698658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699083_1699739_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
521856	contig_15087_pilon	-	2243	23	Intergenic	novelGene_37203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1014.69351314564	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	154	1719	158925	113497	TRUE	30	GTAAAATGAGTGACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181193	110647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134870_141733_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
521857	SIRV6	+	693	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
521858	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	232	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
521859	contig_8102_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_85333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGATACAATCCTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148693	149632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_148700_149600
521862	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_12064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521863	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521865	SIRV6	+	595	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-329	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	46	381	2002	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1956	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
521867	contig_8712_pilon	+	2246	4	Intergenic	novelGene_58776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	399.961942633991	23	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	39	518	314974	321793	FALSE	30	AGAAAGCCGTTCTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286982	323521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684
521868	contig_5954_pilon	-	2687	15	Intergenic	novelGene_28656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	299.33603395597	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	124	1842	959926	945692	TRUE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEITQAGLVRPRHLVGAEKKRWLLQTHWTLDKYGILADARLFFGPQHQPVILRLPNRRALRLRASFSQPLFQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVSSPIFQIRSLRPRQPR	960583	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945741_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956940_959766_959941_960474
521869	contig_8978_pilon	+	2254	9	Intergenic	novelGene_49412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	281.443044859879	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	10	693	341053	343977	TRUE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGK	341043	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_343969_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
521870	SIRV4	+	1473	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389_2949_3040
521871	contig_9345_pilon	-	1669	5	Intergenic	novelGene_24632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1980.68061218865	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	257	595	952473	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001346	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952486_997038_997093_1001156
521872	contig_9186_pilon	-	3265	11	Intergenic	novelGene_85339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_10	55.0287197743142	1201	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	15	1148	310847	274201	FALSE	20	TGTAGAATGTGTTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVHRLLVRALPMSRSGITAIATSVFHGPPRCQLHHAVMPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRPFLPYPLPHFAYKLIARLFEISPFEPWTTRDKMERVHLTDMKLPHLPGLEDLGIQATPLEAKAIEVLRHHRAYRWLSSEMEDVKLTKTVNI	310861	272083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_310798
521873	contig_13894_pilon	+	1520	10	Intergenic	novelGene_62086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	2545.565473573	220	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	709	1464	523580	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520643	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
521874	contig_15063_pilon	+	1062	5	Intergenic	novelGene_9620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	240	1040	34808	36781	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPFKLTMSVGEKLYVYKN	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36128_36728
521875	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_12081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	210	1382	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27170_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521876	contig_15063_pilon	-	1559	5	Intergenic	novelGene_9434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	43	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34609_34925_35033_35380_35839_36156_36264
521877	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521878	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_13201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521880	contig_18096_pilon	-	2256	6	Intergenic	novelGene_58060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.239339982561	642	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	10	360	130868	121550	TRUE	10	TGTACTCTTGCTTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYHRHCDEVGFNADEAHNIVKECIDGVLGGEDYNQNNINQWTASIVEQSLAHLVKLGKAYKYIVTCAVVQKSAYGFHTASSCFWDTTSDGTCTVRWENRTMNCIASVFAIAIVL	130877	119595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_121094_121151_121627_121914_121993_122639_122764_128438_128481_130838
521881	contig_5033_pilon	-	1909	8	Intergenic	novelGene_29014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3804.84236579801	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	141	770	545288	532125	FALSE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547655	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534529_544559_544686_545249_545325_547551
521883	contig_11752_pilon	+	1972	10	Intergenic	novelGene_37614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1510.82867458578	5	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	105	1220	84194	105616	TRUE	35	GCATCACCTTGTGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84089	106430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88670_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597_105992_106053
521884	contig_8420_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_69358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115158	114681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_114700_115200
521885	contig_14846_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_85375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAAGGTCATGGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166000	165211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_165200_166000
521886	contig_1532_pilon	+	2056	8	Intergenic	novelGene_37383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAGTAAGAGATTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12363	34909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13524_15737_15889_17971_18112_27255_27381_28826_28984_29397_29507_32051_32225_34868
521887	contig_15063_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_9499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	240	1133	34808	36382	FALSE	20	TGTGCAGTGGCTGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	27129	36384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521889	contig_11932_pilon	-	2358	2	Intergenic	novelGene_85424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATATGCTTCACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423195	394500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_396711_423047
521890	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521891	contig_15063_pilon	+	1459	4	Intergenic	novelGene_13985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	25	GTGAGAAGTTGTATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521892	contig_8317_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_20663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16480	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
521893	contig_6871_pilon	+	2148	4	Intergenic	novelGene_21565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	54	1211	121971	135112	FALSE	25	GATAAACGAGTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTGSRCNDSEPKSC	121917	136049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134996_135069
521894	SIRV6	+	775	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	8	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	35	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3167_10727
521897	contig_15087_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_37287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATCCTCCTTTGTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301788	303736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_301800_303700
521898	contig_8520_pilon	-	2201	4	Intergenic	novelGene_85439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	38.3086877294897	393	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	387839	215717	FALSE	70	AGACAAAAAAAAAAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLVSGHLDSWDVGQGAMDDGGGAFISWEALSLIKDLGLRPKRTLRLVLWTAEEQGGIGAFQYYQLHKANISNYSLVMESDLGTFLPSGLQFTGSDKARAIMEEVMRLLQPINITQVFRNAEGTDINYWIQAGVPGASLLDDLFKYFSFHHSHGDTMTVMDPKEMNIAAALWAVVSYVVADMEEMLPRS	387892	214087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_292468_292671_321751_321844_387778
521899	contig_12357_pilon	+	1965	12	Intergenic	novelGene_6129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	920.482311590187	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	36	929	26079	42134	TRUE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQSFCLS	26043	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42116_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52801_53280
521900	contig_5649_pilon	+	2194	8	Intergenic	novelGene_82251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	86.4983189644369	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	552	1115	28327	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12675	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_28313_28451_28928_29095_33635_33787_34645
521901	contig_18272_pilon	-	2708	8	Intergenic	novelGene_6990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	547.803256802354	4	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	398	1249	168542	122209	FALSE	35	TCAGAAATGATGACACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262810	120749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168566_184326_184551_262660
521902	contig_15063_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_9728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	239	1075	34808	36333	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	27130	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36277
521903	contig_5643_pilon	+	2168	16	Intergenic	novelGene_39044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	726.676990752349	3	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	639	1964	634983	641217	TRUE	10	TCCGGTCATTGTGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTVGSASHTGGEALGFPNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631210	641590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636300_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
521904	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521906	contig_15047_pilon	+	1451	6	Intergenic	novelGene_52102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	30	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2107	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2603_3291_3498_4158_4434_4552_4687_21013
521907	contig_15063_pilon	-	1499	4	Intergenic	novelGene_13211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	787	1110	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36786	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521908	contig_854_pilon	-	3040	15	Intergenic	novelGene_36162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	210.760091873511	37	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	115	1374	509201	471803	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509315	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471653_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
521911	SIRV6	+	866	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	41	7	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2625_2746_2829_3106_3165_10724_10799_11014
521912	contig_5649_pilon	+	2422	11	Intergenic	novelGene_82255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.504530677906	888	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	163	1344	21124	34768	FALSE	30	ACCACTGTCTACTAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYNRSPRRGISSRLLALRCGLSLATDLLPPTAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12685	35846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12777_12818_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
521913	contig_9177_pilon	+	2223	4	Intergenic	novelGene_32681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	638	junction_1	613.410864664858	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	481	837	405899	415476	FALSE	25	AAATCTTTTTCTTTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGRYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395364	416862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_406017_407998_408077_415315
521915	contig_10311_pilon	-	1786	12	Intergenic	novelGene_50461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.978539629779	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	27	1250	71526	65773	TRUE	35	TTGTATATTCACTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71552	65142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65256_65349_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
521916	contig_1244_pilon	-	1856	13	Intergenic	novelGene_38015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1024.72910715738	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	79	1275	948448	923469	TRUE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLHHCAFLL	948526	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923494_923763_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
521917	SIRV6	+	671	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	816	539	-382	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	99	431	2002	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1903	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521919	contig_854_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_36341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGGAGTAGTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976418	974681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976213_976335
521920	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521921	contig_15063_pilon	+	1320	5	Intergenic	novelGene_11111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	116	junction_2	3758.88829143671	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	359	1180	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35261_35380_35839_36158_36266
521922	contig_1301_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_47401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCAGGAATGGATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785262	783488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_783500_785300
521923	contig_15063_pilon	+	1197	4	Intergenic	novelGene_13120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	996	202	1197	34808	36481	FALSE	25	TACAGCATCCTGAACGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFT	34606	36481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
521924	contig_15063_pilon	+	1452	4	Intergenic	novelGene_13133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521925	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26350	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521926	contig_9199_pilon	+	2789	12	Intergenic	novelGene_65607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	91.5376452388184	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	78	1208	42527	57407	TRUE	25	GACACATCAGCTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42449	59152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304_58059_58222
521927	contig_15063_pilon	+	1418	6	Intergenic	novelGene_8689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	248	1276	34808	36632	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27121	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
521928	contig_12079_pilon	+	2716	16	Intergenic	novelGene_67396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	137.45195524255	962	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	566	2395	491184	578891	FALSE	15	TAACCTGTGTCTCCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	478363	579212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_478403_490657_491294_494619_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
521929	contig_1532_pilon	-	1598	5	Intergenic	novelGene_37420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1788	junction_4	824.498142811735	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	91	855	27321	13113	FALSE	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	28858	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825
521930	contig_15063_pilon	+	1522	7	Intergenic	novelGene_13706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3673.76259212995	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	540	1037	35271	36494	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34913_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486_36600_38975_39092_39506
521931	contig_2799_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_85599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATAAAATTCTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784798	786300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_784800_786300
521932	contig_10011_pilon	+	2625	10	Intergenic	novelGene_68101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94.8360508625801	121	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	543	1436	326391	333031	FALSE	25	GTCATAATTGCATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322903	334220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_325658_326255_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994
521933	contig_7426_pilon	-	2837	7	Intergenic	novelGene_27544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	252.148545284102	43	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	28	774	1102797	1087990	FALSE	45	CTATCAATATATGTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTG	1102824	1085926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
521934	contig_12357_pilon	-	1982	11	Intergenic	novelGene_6135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATCTGGTAATGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53922	27465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_27530_29522_29655_30220_30321_30931_31058_34120_34315_35040_35190_42109_42249_46434_46565_51127_51238_52758_52842_53167
521936	contig_5954_pilon	-	2590	14	Intergenic	novelGene_28678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	477.132063392474	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1576	2235	946886	945083	FALSE	10	GCTGGACCATCCGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960587	944727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947066_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956105_956291_956413_956500_956705_956942_959766_959941_960474
521937	contig_15063_pilon	+	1533	4	Intergenic	novelGene_13505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	202	1029	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLRWPSMHQPST	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36175_36266
521938	contig_15063_pilon	+	1442	6	Intergenic	novelGene_14318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	305	1189	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34854	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521940	contig_12357_pilon	-	1918	12	Intergenic	novelGene_6073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53671	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30321_30931_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42258_46484_46565_51127_51240_52758_52843_53167
521942	contig_6227_pilon	-	1763	19	Intergenic	novelGene_49735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.073657263785	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1716	47	1762	1224979	1202621	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKLIFQAHIHIVHIPGRKIKMPQK	1225025	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202687_1202934_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
521943	contig_14405_pilon	+	2784	17	Intergenic	novelGene_85625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_16	238.42981638996	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	84	1754	351768	432993	FALSE	25	TGTGTTGTAATGAGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAGRAAGVGTSGPASGPEAAVARRPGMAFMEKPPAGKVLLDDTVPLTAAIEASQSLQSHTEYIIRVQRGISVENSWQIVRRYSDFDLLNSSLQISGLSLPLPPKKLIGNMDREFIAERQKGLQNYLNVLTTNHILSNCELVKKFLDPNNYAVNYTEIALQQVSMFFRSEPTWEVVEPLKDIGWRIRKKYFLMKIKNQPKERLVLSWADLGPDKYLSDKDFQCLIKLLPSCLHPYIYRVTFATANESSALLIRTFNEKGTLKDLIYKAKPKDPFLKKYCNPKKIQGLELQQIKTYGRQILEVLKFLHDKGFPYGHLHASNVMLDGDTCRLLDLENSLLGLPSFYRSYFSQFRKITTLESVDVHCFGHLLYEMTYGRPPDSVPVDSFPPAPSMAVVAVLESTLSCGACKNGMPTVSRLLQMPLFSDVSLTTSEKPQFKIPTKLKEALRIAKECIEKRLIEEQKQIHQHRRLTRAQSHHGSEEERKKRKILARKKSKRSAIENSEEHSAKYSNSNNSGTSALPPPPPPPPPAAPLPPASTEAPAQLPPQAVNGVSRGALLSSIQNFQKGTLRKAETCDHSAPKIG	351684	434023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_351870_374857_374909_377440_377489_385722_385910_399701_399780_400567_400642_401404_401480_405954_406060_406590_406693_408162_408325_408731_408850_410043_410123_412693_412743_414456_414535_415065_415153_415607_415678_432787
521944	contig_2100_pilon	-	1660	12	Intergenic	novelGene_50743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	837.172543606511	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	123	1316	1182812	1170268	FALSE	20	CATAAGAGTGCTCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185533	1169923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174398_1175668_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
521945	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521946	SIRV6	-	818	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8529	416	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	30	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11076	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1741_1861_2030_2470_2622_2742_2828_3105_3164_10723_10811_11028
521947	contig_5549_pilon	+	830	5	Intergenic	novelGene_81592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	192	665	86768	96749	FALSE	30	ACTAAAATTTTCTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82164	96914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
521948	contig_6654_pilon	-	3126	19	Intergenic	novelGene_85696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	102.679547652747	562	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	34	2268	130794	99139	FALSE	75	TTAAAAAAGAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALEEEFTLSGVPLSAGPDGLLGVEPSDRTDQFLVTHSGRTVILYKVSDQKPLGSWSVKQGQIITCPAVCNFQTGEYIVVHDDRVLRIWNNEDVNLDKVFKATLSAEVCRIHSVQGTEPLVLFKKGAIRGLEALLAEPQQKIETVISDEEIIKWTKIFMVFKHPVLIFITEKHGNYFAYVQMFNSRILSKYTLLPGQEEKSAIQSFAASANRKFISLMSLSSDGCIYETLIPTHPSDREKNQVVVRSLLLKAVVSGDVRNGVALSVLDQDHIAVLGTPLSASKECLSIWNIKFQTLQASKDLLQGTSGQLWYYGENLFMLHGKFLTVIPYKCEVSSLAGALGKLKHSYEPGSHAVPHFVNWETSQEYGLGSQNSEQSRILRTRKVEVSLQPAVSASAQLLLTIKNDTEKHIEVELRKFLAIKQTPEFHTTIGDIVTGLLGRCKAEPSFYPRNCLMQLIQTHVLSYSLCPGLMEVALEKTDVQILQLCLQQFPDIPESVTCACLKIFLSIDDDSLQETDISTESVFDYSDTVRDEKMEEQTEIMENGFNPEEDNSNKEKPQGTTEETTLSPVTPKRAALLNAVLHSAYSEAFLLPHLKNIPAQHVTLFLQYLYFLYLKCSENATMTLPGIQPPTLNQHFLSCIGRRQGEADNRRSPSNIPLKNKRMKINEIMDWICLLLDANFTVVVMIPEAKRLLINLYKFVKAQISVYSELNKIEVSFRELQKLNQEKNNTELYSIEVLELF	130827	98280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_99256_99423_99532_101098_101198_101466_101560_102065_102145_102576_102790_102940_103067_103179_103365_103822_103898_104401_104488_104966_105091_107018_107096_109212_109402_111222_111368_111644_111703_126505_126655_128623_128681_129399_129514_130653
521949	contig_10986_pilon	-	2612	12	Intergenic	novelGene_71455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	170.137086195731	61	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	87	962	80340	71463	TRUE	35	ACTTCAGATGAACAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVCVAVLFL	80426	66363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71317_71383_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
521950	contig_4105_pilon	+	2623	11	Intergenic	novelGene_21451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_10	100.106992762744	860	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	119	1405	60529	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58698	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
521951	contig_2100_pilon	-	1673	12	Intergenic	novelGene_50687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	837.172543606511	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	749	1324	1174340	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185518	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175650_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
521953	contig_11989_pilon	-	2814	23	Intergenic	novelGene_68429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	315.159624385763	885	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	15	2186	226870	46235	FALSE	10	TTTTTTTTTTAATGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	226884	45606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
521954	contig_500_pilon	+	1657	11	Intergenic	novelGene_31032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1053.32293718498	355	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	832	1245	1496587	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485756	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493742_1494192_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
521955	contig_2100_pilon	-	1806	13	Intergenic	novelGene_50729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	919.059343235729	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	157	1461	1182812	1170268	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1183612_1183687_1185420
521956	contig_8907_pilon	-	191	3	Intergenic	novelGene_85809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3431	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179867	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173362_179391_179544_179839
521957	contig_12869_pilon	+	2076	9	Intergenic	novelGene_75323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	309.004019998122	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	69	1148	67397	97384	TRUE	20	TGATTTTAAACTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67328	98475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97674_97836
521960	contig_10011_pilon	+	3087	10	Intergenic	novelGene_68084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_8	73.9726342459423	554	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	71	2068	322928	333199	FALSE	25	TGGTCATAATTGCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKLM	322857	334218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994_333045_333190
521961	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521962	contig_5862_pilon	-	3566	4	Intergenic	novelGene_54958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	85.7217721598324	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	263	637	204014	202458	FALSE	45	TCTTAGACATAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKNVKYIIDNVGPGYIDTSIRPWNTHNTRNRVNGKYYETALSAALQTRPSLISVTSFNEWHEGTQIEKAVPKRTSSTVYLDYRPHKPGLYLELTRKWSEKYSKERATYASDHQSPGLNALIKV	235257	199528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_202801_203982_204060_215899_216010_235150
521964	contig_8330_pilon	+	2118	11	Intergenic	novelGene_71784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	573.306061366876	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	283	1209	852673	856687	TRUE	5	CCGCTGCCCAGCCTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837468	857810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855079_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
521967	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521969	contig_12425_pilon	-	2040	10	Intergenic	novelGene_46671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	687.426117242185	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	297	1088	209477	204225	FALSE	10	TTTGCTTTCTGGTAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226601	203272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210346_210389_211048_211200_226517
521970	SIRV6	+	363	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10444	19	1207	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11444	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
521971	contig_3825_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_78020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2269	8	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	842	1195	1465358	1470959	FALSE	10	ATGGTGGCTCTGCTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYQPLRAFPWVSSSLQVCGAVLQYSECPGSPFILCHVVTFGPCLSRDARWTLISSPSFGACFSLGPWGSRHPRAASENAELVGALQTHHLTWTGVSSLDSQGLEAQEQNEVDSGPQG	1461817	1470960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1462325_1463666_1463796_1464669_1464806_1465288_1465419_1465864_1465900_1467906_1467974_1469009_1469116_1470874
521972	contig_12624_pilon	-	1719	4	Intergenic	novelGene_61106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	757.822465283848	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	100	462	955789	948779	TRUE	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKWRRQPVGSCWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQAGPDEGEDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955888	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947583_947625_948842_950590_950768_955666
521973	contig_7420_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_85862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTTATCCATTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246680	246062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_-_246100_246700
521975	SIRV6	-	1498	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9255	445	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACATTTAAGCTTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11802	1099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
521977	contig_15063_pilon	-	1469	6	Intergenic	novelGene_14302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
521978	SIRV6	+	1428	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	2	164	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	35	GCTAGAAGACCGGGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
521979	SIRV2	-	419	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	67	2950	51	-320	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5844	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
521980	contig_10311_pilon	-	1841	12	Intergenic	novelGene_50446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	992.978539629779	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	25	1200	71526	65773	FALSE	25	CTTAAAAGTTGCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71550	65131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68319_68366_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
521981	contig_1443_pilon	-	1920	9	Intergenic	novelGene_28285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	579	junction_4	476.222637009204	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	229	1137	776427	748763	FALSE	30	AAAGAACCTGGTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQVKTTGKERKRWWRGDQGHMECL	809521	747979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805224_808694_808741_809399
521982	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28167	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521984	contig_7396_pilon	-	2024	15	Intergenic	novelGene_79637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2902.34727313558	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	137	1525	255163	246442	FALSE	15	GTGAACCTATTTTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257490	245942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
521985	contig_15063_pilon	+	1400	4	Intergenic	novelGene_14222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	83	1258	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34725	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
521986	contig_15063_pilon	-	1519	5	Intergenic	novelGene_11249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
521988	contig_15063_pilon	+	1711	7	Intergenic	novelGene_11920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	15	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	226	1461	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27143	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
521989	SIRV6	+	570	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-273	486	-87	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACCATTTTGTTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
521990	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	158	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
521991	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
521992	contig_9345_pilon	-	840	3	Intergenic	novelGene_24353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144553	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141838_143005_143072_144512
521994	contig_11677_pilon	+	2491	12	Intergenic	novelGene_85972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_10	69.2443272730997	738	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	23	1690	727262	736807	FALSE	40	TTGAAATGATATGAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKPEKID	727239	737608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531
521995	SIRV6	+	658	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	278	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGCCCTGGTACGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1844_2026_2470_2621_2740
521997	contig_12414_pilon	+	1619	3	Intergenic	novelGene_59552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	5541	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	211	1083	373182	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373069_373136
521998	contig_8820_pilon	-	2093	8	Intergenic	novelGene_79287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1327.58811537375	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	58	900	170762	167623	TRUE	35	GAAATGGTGTGTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLRPGAAALRSVCRLFAKMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKR	171330	165782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167630_169164_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170763_171273
521999	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_14010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522000	contig_1861_pilon	-	2064	16	Intergenic	novelGene_77652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_7	88.2517610778013	1158	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	176	1903	112534	87440	FALSE	25	GGCTGGAGTTGGCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESCRAGRGWDPEVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115252	87278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
522001	contig_6654_pilon	-	3500	18	Intergenic	novelGene_85692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	99.4682749235301	579	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	13	2052	130794	99239	FALSE	20	CTCCTCAGTCATTCTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALEEEFTLSGVPLSAGPDGLLGVEPSDRTDQFLVTHSGRTVILYKVSDQKPLGSWSVKQGQIITCPAVCNFQTGEYIVVHDDRVLRIWNNEDVNLDKVFKATLSAEVCRIHSVQGTEPLVLFKKGAIRGLEALLAEPQQKIETVISDEEIIKWTKIFMVFKHPVLIFITEKHGNYFAYVQMFNSRILSKYTLLPGQEEKSAIQSFAASANRKFISLMSLSSDGCIYETLIPTHPSDREKNQVVVRSLLLKAVVSGDVRNGVALSVLDQDHIAVLGTPLSASKECLSIWNIKFQTLQASKDLLQGTSGQLWYYGENLFMLHGKFLTVIPYKCEVSSLAGALGKLKHSYEPGSHAVPHFVNWETSQEYGLGSQNSEQSRILRTRKVEVSLQPAVSASAQLLLTIKNDTEKHIEVELRKFLAIKQTPEFHTTIGDIVTGLLGRCKAEPSFYPRNCLMQLIQTHVLSYSLCPGLMEVALEKTDVQILQLCLQQFPDIPESVTCACLKIFLSIDDDSLQETDISTESVFDYSDTVRDEKMEEQTEIMENGFNPEEDNSNKEKPQGTTEETTLSPVTPKRAALLNAVLHSAYSEAFLLPHLKNIPAQHVTLFLQYLYFLYLKCSENATMTLPGIQPPTLNQIMDWICLLLDANFTVVVMIPEAKRLLINLYKFVKAQVYKRLF	130806	97790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_99256_99419_99532_101466_101560_102065_102145_102576_102790_102940_103067_103179_103365_103822_103898_104401_104488_104966_105091_107018_107096_109212_109402_111222_111368_111644_111703_126505_126655_128623_128681_129399_129514_130653
522002	SIRV6	+	736	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8167	1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
522003	contig_15063_pilon	+	1433	6	Intergenic	novelGene_10322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	237	1271	34808	36639	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDGDV	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36626
522004	contig_12566_pilon	+	2656	20	Intergenic	novelGene_86009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	84.0315532348306	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	74	2293	47511	86354	FALSE	35	AATCAAACTTCATTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSCWCALLRPGEPVLPAERWNTQTMATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44388	86717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82782_83210_83277_86264
522005	contig_9833_pilon	+	1826	12	Intergenic	novelGene_68546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	451.958620939265	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	630	1430	250070	259941	FALSE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKERAPTSSCRMLTWTGPWSRPTSPCSSTRASAAVPAPEPSCRRMCMLSFWSEALPRPRHGWLATPLIARLSRGHRWTRLSLRRFLAISNLGSRRGAKLLCGGGAAADRGYFIQPTVFGDVQDSMTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	230851	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248904_249395_249497_250051_250181_251857_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
522006	contig_15063_pilon	+	1626	6	Intergenic	novelGene_14154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	155	1390	34808	39515	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34653	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522009	contig_5669_pilon	+	3253	6	Intergenic	novelGene_86034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.604832605232	1163	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	231	956	9446	19184	FALSE	5	CGTTGTGGGGATGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVDKIDADKDGFVTEGELKSWIKHAQKKYIYDNVENQWQEFDMNQDGLISWDEYRNVTYGTYLDDPDPDDGFNYKQMMVRDERRFKMADKDGDLIATKEEFTAFLHPEEYDYMKDIVVQETMEDIDKNADGFIDLEEYIGDMYSHDGNADEPEWVKTEREQFVEFRDKNRDGKMDKEETKDWILPSDYDHAEAEARHLVYESDQNKDGKLTKEEIVDKYDLFVGSQATDFGEALVRHDEF	4095	21481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_4325_9444_9639_13206_13374_14081_14143_17622_17823_19079
522010	SIRV6	+	591	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	262	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCTTACAAATGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1586_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522011	contig_3077_pilon	+	1615	9	Intergenic	novelGene_26700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3429.10957830163	22	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	518	991	13867	17462	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPKPQSTDSLASRSPTPPRATSGWGTMTRKVSKARCST	10100	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16263_16953_17054_17449
522012	contig_15063_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_12953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	230	1036	34808	36299	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLPST	28171	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36175_36287
522014	contig_1472_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_86110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGATGTGAATCTACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281	696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_700_1300
522015	SIRV6	+	1529	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	-13	12	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522018	SIRV6	+	958	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	61	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	36	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522019	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	81	1158	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
522020	scaffold_12124_pilon	+	2230	12	Intergenic	novelGene_22059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	536.931317460084	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	466	957	846536	852375	TRUE	40	TAAACTTGGATCTCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829655	858961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837421_844307_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857962_858112
522021	contig_15063_pilon	+	1573	5	Intergenic	novelGene_12388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	273	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	608	1429	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34936_35037_35380_35839_36158_36266
522022	contig_5023_pilon	+	2152	17	Intergenic	novelGene_7289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2014.98985341738	5	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	497	1945	611764	646990	TRUE	40	GTGATCAATGCTCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580862	649297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609731_611697_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647001_649100
522023	contig_4754_pilon	+	2199	15	Intergenic	novelGene_35940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	144.583568095636	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	150	1766	380119	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	379969	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411119_414578_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
522024	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522027	contig_10103_pilon	-	2216	16	Intergenic	novelGene_86155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	141	junction_5	288.5894122952	1756	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	96	1703	656948	638598	FALSE	15	TGTGTGGTCTAAGTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLSSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657043	638084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645753_649864_649969_651346_651475_651637_651739_653443_653647_654456_654570_654694_654772_655131_655244_655980_656047_656148_656224_656945
522028	contig_16385_pilon	+	1891	16	Intergenic	novelGene_86185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	189.702574222562	383	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	49	1710	3004	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22392_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
522029	contig_1331_pilon	-	1254	4	Intergenic	novelGene_37828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	2461	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	FALSE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
522030	SIRV6	+	867	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	496	337	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522031	contig_6726_pilon	+	2565	12	Intergenic	novelGene_86227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	653	junction_8	566.731851703729	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1638	2441	308170	333034	FALSE	10	TTGGCCGTGCTTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287823	333158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
522032	SIRV6	+	460	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10357	9	1120	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11357	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
522038	contig_9345_pilon	-	2041	11	Intergenic	novelGene_24504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	249.883272749498	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	573	1343	670952	669047	TRUE	25	AAGTAATGCCTGGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNGEAGKTEGRRVLGSWAPTWTFA	671524	667019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910
522040	contig_4232_pilon	-	3296	11	Intergenic	novelGene_63479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	380.935755738418	51	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	1122	2081	614173	608965	FALSE	10	AGATCTCTGCTGGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDNSFKQKHTSKAPQRVCGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS	620499	607749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613083_613126_613618_613698_613873_614983_615283_615392_615783_615945_620456
522041	contig_15063_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_12759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3667.21665572134	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	2	1381	28164	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	28162	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
522042	contig_15063_pilon	+	1357	4	Intergenic	novelGene_14238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	43	1215	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34765	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522043	contig_9727_pilon	-	3616	15	Intergenic	novelGene_86282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_13	258.509029566371	48	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	139	1872	163331	138676	FALSE	45	TTTATTAAAAGACAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQISECGAGGGTKVPEG	169674	136931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_165639_165728_169653
522045	contig_7020_pilon	+	2263	2	Intergenic	novelGene_57071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	0	200	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	130	1479	102160	103509	FALSE	55	TTAAAAACTGGAAAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98748	104293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106
522046	contig_15063_pilon	+	1414	5	Intergenic	novelGene_13102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	7	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	203	1270	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36499_36606
522047	contig_20493_pilon	-	2590	13	Intergenic	novelGene_86392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_12	48.7427345013251	494	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	40	1614	54655	37388	FALSE	30	CCTGATTATTGCAAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55241	36411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
522048	SIRV6	+	1046	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	480	2	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	63	6	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522050	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	10	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27549	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522051	contig_15063_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_12297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	15	1424	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522052	contig_12622_pilon	-	2087	12	Intergenic	novelGene_5943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1887.55363997998	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	491	1249	1588902	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590887	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589192_1590000_1590234_1590830
522054	contig_7321_pilon	+	3183	1	Intergenic	novelGene_53144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGGCAGGCTCATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188769	191952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_188800_192000
522055	contig_13216_pilon	+	2049	7	Intergenic	novelGene_47469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	82	1509	229682	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229600	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
522056	contig_14513_pilon	-	1216	2	Intergenic	novelGene_70304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2780	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12129_18691
522057	contig_5033_pilon	-	1861	12	Intergenic	novelGene_29033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4028.13123416671	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	397	1143	536585	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531140_531560_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_544617_544686_545249_545325_547551_547686_566747
522058	contig_14970_pilon	+	2001	11	Intergenic	novelGene_44980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	5927.70458525052	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	131	1426	136145	231550	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136014	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231874_231999
522059	contig_15063_pilon	+	1446	4	Intergenic	novelGene_14168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	139	1311	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34669	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522060	contig_6980_pilon	+	1903	8	Intergenic	novelGene_36059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	701.14262428684	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	199	813	362386	372790	FALSE	20	TCAGACTGTTACTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKYDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	356705	373880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_356771_361146_361226_362331_362401_364926_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
522062	contig_8140_pilon	+	3151	8	Intergenic	novelGene_86439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_7	217.962550612227	617	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	75	1004	555480	823290	FALSE	30	TTATACATTTGTAAGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQGCPRCKTTKYRNPSLKLMVNVCGHTLCESCVDLLFVRGAGNCPECGTPLRKSNFRVQLFEDPAVDKEVEIRKKVLKIYNKREEDFSSLREYNDFLEEVEEIVFNLTNNVDLDNTKKKMEIYQKENKDVIQKNKLKLTREQEELEEALEVERQENEQRRLFIQKEEQLQQILKRKNKQAFLDELESSDLPVALLLAQHKDRSTQLEMQLEKPKPIKPVTFSTGIKMGQHISLAPIQKLEEALYEYQPLQIESCGPKVPELEMLGRLGYLNHVRAASPQDLAGGYTSSLACHRALQDAFSGLFWQPS	555405	825437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_555569_662788_662942_664649_664724_676299_676404_682875_683017_687699_687826_738431_738554_823169
522064	contig_13216_pilon	+	2002	7	Intergenic	novelGene_47457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_2	878.712631574674	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	111	1463	229682	261012	FALSE	15	AGTTTTGTGTTCATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKGSGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229571	261551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243096_243845_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
522065	contig_9313_pilon	+	2292	4	Intergenic	novelGene_86478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	65	junction_1	1115.36212355749	17	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAACCCACTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387212	463693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387290_432540_432583_457278_457360_461601
522066	SIRV6	+	461	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGCCAACTAAGGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470
522067	contig_8177_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_86504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTAGAGGACAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54521	53510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_53500_54500
522068	contig_12140_pilon	-	1280	9	Intergenic	novelGene_86520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_6	53.1105862799499	333	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	72	1280	84789	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATGTDDVDKLKTKFISAWNNMKYSWVLKTKTYFSRNSPVLLLGKCYHFKYEDENEMLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRAWTWPDALNIENSDSESWTSHTVKKFTASFEGSLSGESELKTPSISLKKMVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84860	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_45850_46085_64263_64348_84713
522069	contig_12873_pilon	+	2487	5	Intergenic	novelGene_27179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1321.15259811272	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1420	1911	17896	19855	FALSE	30	CAAATTTGTAGTATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15978	20431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17206_17703_18014_18984_19264_19611_19703_19851
522070	contig_6102_pilon	-	3226	6	Intergenic	novelGene_32127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	294.761327178448	3	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	2263	3078	819332	816763	FALSE	25	ATACATCCCTCAGATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYDLPQVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_820391_820920
522072	contig_13778_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_70842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAGAGTGGGTTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32883	31459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_31500_32900
522073	contig_15063_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_11886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	5	CACCTGCCTGTGCTGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522074	contig_2054_pilon	+	2495	3	Intergenic	novelGene_51654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTAACTGTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	19443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16887_18402_18633
522075	contig_15063_pilon	+	1771	5	Intergenic	novelGene_12083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	457	1629	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27314	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522076	contig_7457_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_31681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	1765	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
522077	contig_9345_pilon	-	2160	6	Intergenic	novelGene_24660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2428.95083523731	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	509	931	955353	948121	FALSE	20	TTTTCTAAACTTCCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQAWSR	1000673	946891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949470_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1000246
522078	contig_990_pilon	-	3004	7	Intergenic	novelGene_76121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	131.55153193922	674	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	894	1418	1605903	1586999	FALSE	25	CTCACCTTTGTGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1635366	1585412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875_1606081_1634280_1634336_1634705
522079	contig_2894_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_86564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTGACAGAGTACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849372	849660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_849400_849700
522080	contig_7457_pilon	-	1617	3	Intergenic	novelGene_31704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4050	junction_1	368.5	566	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176983	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1176132_1176811
522081	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_9164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	40	TGTATGTTTATAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522082	contig_854_pilon	+	1758	8	Intergenic	novelGene_36213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2551.23317120908	58	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	283	600	549318	557514	TRUE	25	TCAAGGGCTCAAACGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRHGRQDPTLRVPETQWLSSAPLPSLYRILRWKPRFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKCPSPPRAPS	543476	563817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_549265_549425_556082_556201_557001_557065_557484_557752_562271_562405_563029
522086	SIRV6	+	985	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	194	526	1673	2560	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1091	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522087	contig_19459_pilon	-	1242	8	Intergenic	novelGene_59825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_7	7322.9125130285	187	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	120	905	16240	7003	FALSE	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16767	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_16672
522088	SIRV2	-	615	6	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	69	306	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	36	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCTCAGCGCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5826	3337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5790
522089	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522090	contig_1143_pilon	-	4332	13	Intergenic	novelGene_86600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	80	junction_4	111.274778763603	246	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1800	2567	224408	207933	FALSE	25	CTCATTATTTGTAGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAISLVHGGPSPGFFSKTLFNCLAYGPENTQPILDDVSDFDVVQVIIRINTATNMDDLNSAINECYNYLKLIGCLKVTRTLSDKYHLVNDILFYHVIKRVQAPFESFKQGLKTLGVLEKIQTYPEAFCSILCHKPEAPSAKVLSDLFTVHTLSDVQALGFWNTYLQTVEGGKSATTMEDILIFATGCSSIPPTGFKPTPSIECLHMDFPIGNKCNNCLALPMTSTYKEFQENMDFAIRNTLRLEKEESSHYTER	295020	206167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_208190_208911_209103_214458_214632_224261_224444_228833_228967_229069_229195_231297_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_294929
522091	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522092	contig_19851_pilon	+	2720	3	Intergenic	novelGene_29828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_2	823.5	3	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53461	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_55882_56006
522093	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	10	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522095	SIRV6	+	971	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	1	-4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	440	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
522096	SIRV6	+	372	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10374	80	1137	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11374	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
522098	SIRV6	+	1300	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	629	-13	413	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1159	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	17	508	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1716	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522099	contig_14638_pilon	-	2145	6	Intergenic	novelGene_71576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	72	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	CCCCTGTTCTGAAGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254323_254372_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
522100	SIRV6	-	403	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCTCTTTCCCCATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11746	11343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11700
522101	SIRV6	-	413	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	431	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAATTTCCCGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1540_1647_1735_1844
522102	contig_8978_pilon	+	2216	10	Intergenic	novelGene_49398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	314.849170238703	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	74	1168	339807	345714	TRUE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQDLPL	331589	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344742_345699_345738_347113
522103	contig_15063_pilon	-	1757	7	Intergenic	novelGene_8466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACACACAAACTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39765	26313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35365_35835_36156_36264_36597_38972_39090_39504
522104	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_12141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522105	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_11260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522106	contig_15063_pilon	+	1475	6	Intergenic	novelGene_14270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	344	799	35271	36299	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	34815	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36154_36266_36600_38975_39092_39506
522107	SIRV6	+	691	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8195	18	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
522108	contig_6102_pilon	-	2900	21	Intergenic	novelGene_31867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTTGCCTAGTCCTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395261	370758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371186_372696_372754_372946_373074_373198_373272_373402_373476_373632_373726_373902_373955_374378_374502_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375537_375637_375730_375966_376037_376205_376292_378875_379031_379329_379355_393763_393855_393928_394034_394219_394270_394465
522109	contig_9982_pilon	+	2281	16	Intergenic	novelGene_55739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	85.3693673918747	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2172	110	2281	311199	333567	FALSE	25	GAAATCTTAGATTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFP	307621	333567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522
522110	contig_4232_pilon	+	995	4	Intergenic	novelGene_63216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	16	516	146362	149200	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146346	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
522111	contig_15063_pilon	+	1133	5	Intergenic	novelGene_8830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	244	1086	34808	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKDVVTSRYVCVHVCIQTNHVCG	27125	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36691
522112	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522113	contig_5954_pilon	-	2219	16	Intergenic	novelGene_28621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	407.158423985336	4	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	664	2100	956264	944841	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHDSATTGLGRGRAPLPLPEWPRPIPRPICSP	960581	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944933_945189_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
522114	contig_3077_pilon	+	1572	9	Intergenic	novelGene_26718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	503	1186	13867	17590	FALSE	30	TCTATGCAAAGCCCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10110	17976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10200_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
522115	SIRV6	-	308	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCTGGTTGGTTAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
522116	SIRV6	+	489	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	342	267	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740
522117	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	202	1365	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35839_36158_36266
522118	contig_19459_pilon	-	1339	8	Intergenic	novelGene_59818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	7597.31690285781	19453	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	660	1001	11335	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19130	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12724_15474_15702_16203_16265_18988
522120	contig_11321_pilon	+	4878	2	Intergenic	novelGene_86655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTCCCAGCAGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160294	165229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_160778_160834
522122	contig_10019_pilon	-	2725	2	Intergenic	novelGene_86676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1460	junction_1	0	682	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	167	373	261562	259852	FALSE	70	TAAAATGATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGRCEWQAQSPFPGARGAADCAGGRIRSSFRRGHHGSVDRLFQVLELRWVGESEMEVGAEAVVGEDGLRERRGLSEAGRQEQNRDVQPQSGSNMIPKHSYWLDVWLFILFDLVVFFFVYFMP	261728	257499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356
522123	contig_1532_pilon	-	1777	9	Intergenic	novelGene_37393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1285.74375363056	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	66	1235	32217	12906	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNIFIFTT	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12926_13156_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
522124	contig_5569_pilon	-	2880	20	Intergenic	novelGene_86746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	152.035077597062	633	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	22	1686	518064	467456	FALSE	35	CAAAATTAATGTTGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAWLQVLPVILLLGAQPSPLSFFSVGPAPVAAADRSKWHIPLPSGKNYFSFGKILFGNTTIFLKFDGEPCDRSLNVTWYLKSADCYNEIFNFKAEEVETYLENLKEKRGLSGKYQTSSKVFQNCSELFKTQSFSGDFVHRLPLLGEKQEAKDNGTNLTSVGDKTVMHEPLKTWQDAPYIFIVHIGIPSSKESVKEKSLSTLFTMTVEVKGPYEYLTLEEYPLMIFFMVMCIVYVLFGVLWLAWSACYWRDLLRIQFWIGAVIFLGMLEKAVFYAEFQNIRYKGESVQGALILAELLSAVKRSLARTLVIIVSLGYGIVKPRLGVTLHKVVVAGALYLLFSGMEGVLRVTGAQTDLASLAFIPLAFLDTALCWWIFISLTQTMKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	518085	466261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487366_489335_489409_490831_490926_493479_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517923
522126	contig_15063_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_12865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	CTGTGGGTGAGAAGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522128	contig_10225_pilon	+	2652	13	Intergenic	novelGene_86837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	573.202892138164	12	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	875	2515	42707	47636	TRUE	30	TAAGAATTTCTAGTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21396	49302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21494_34904_34930_35637_35785_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_47660_49188
522129	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	233	1396	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
522130	contig_3307_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_86898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTATACTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182763	181703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_181700_182800
522131	SIRV6	+	1459	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	40	-8	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	163	34	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	35	CTACTAAGCAGCAGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522132	contig_10923_pilon	+	1371	9	Intergenic	novelGene_66190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	834.697400259519	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	50	1264	21667	42718	FALSE	35	AAACTGCAACACTTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAAGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13829	42825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_32895_37387_37540_38578_38742_42554
522133	contig_2100_pilon	+	1625	11	Intergenic	novelGene_50752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGAGAATAGACATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169930	1182797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175787_1176285_1176418_1176765_1176835_1178767_1178825_1180187_1180284_1182725
522134	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522135	contig_13244_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_86939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCTATTTCACACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257129	256583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_256600_257100
522137	SIRV6	+	899	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1658	33	229	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGTTTAGAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2745	11792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522138	contig_10629_pilon	-	2042	13	Intergenic	novelGene_52913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	436.520681704264	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	62	904	256132	247382	TRUE	25	AAATCTATTTGTTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	256193	245856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246898_247107_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066
522139	contig_3986_pilon	-	2822	12	Intergenic	novelGene_52666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	120.316318631039	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	328	1611	55958	35282	FALSE	15	TTTTCAATGTCTTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153860	34070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56058_57911_57964_153684
522140	contig_15063_pilon	-	1440	6	Intergenic	novelGene_10114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.6	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	689	1012	35891	35108	TRUE	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36511_36625
522141	SIRV6	+	513	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCGTCTAGGACGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	2579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470
522142	contig_5033_pilon	-	1986	14	Intergenic	novelGene_29017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3409.0263355118	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	164	1528	545288	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547678	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531387_532067_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
522143	contig_3948_pilon	-	2132	13	Intergenic	novelGene_53315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	429.09797994035	375	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	238	1572	1494311	1471793	TRUE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAQPQRQAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREAETQPWLLPTLSLTWICPTPQGPSSPSSGQLLKPSILAPSPLSQTSGPLVFC	1511002	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471951_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
522144	SIRV6	+	382	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10420	24	1183	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11420	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
522145	contig_20402_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_72840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAAAACTGTCAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59194	59609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_59200_59600
522146	contig_10813_pilon	+	3188	10	Intergenic	novelGene_87019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_3	50.0954644209988	430	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	60	1568	55923	83959	FALSE	25	TTGAAACTTTGACCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKMLSRNPDNYVRETKLDIQRVPRNYDPTLHPFEVPREYVRALNATKLERVFAKPFLASLDGHRDGVNCLAKHPKSLATVLSGACDGEVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKYVLGHLTLFHLLLLVAVEPATTYGSPMYVELFCRVFKAVTFWKQIARTVFLDASGCVQIASLLAGSQPLNHLRHPGAAFCVSTLF	55863	85579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_62537_62738_63303_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536
522147	contig_8581_pilon	+	2921	16	Intergenic	novelGene_22818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1868	2182	329833	339429	TRUE	10	CGTCCTCCGCAACCTGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTSLVLNFPLVSSSGVIRPSNKRPSLAILTRISRTSSPMYMPLTIFSNSCFPGLREPRSISRSNSVRMSSRDPSSPKAPHSVLMHILPSSPSTRSMYLSSSM	306339	386087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_307095_308985_309152_319221_319254_321762_321862_323310_323432_324016_324166_326006_326310_327805_328044_329828_329981_339262_339448_339552_339653_340260_340357_344624_344746_353025_353177_366652_366814_385995
522148	contig_5988_pilon	-	1490	5	Intergenic	novelGene_15955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	15	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	93	1031	655459	652251	FALSE	20	GAAAGGTTTTTGACTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGWH	655551	651791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652262_652389_652943_653272_653422_653549_653773_655456
522150	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3630.48768150445	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	236	1318	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALEC	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36559_38984_39136_39506
522151	contig_1154_pilon	+	2448	8	Intergenic	novelGene_87085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_7	205.606320874806	342	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	525	1826	439267	445998	FALSE	25	ATCTATTCAGTGCTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	330752	446620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330874_331888_331963_389032_389099_389755_389836_434841_434975_439216_439505_442410_442505_445028
522155	contig_11855_pilon	+	2226	2	Intergenic	novelGene_66936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	1277	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	449	1483	1003891	1004925	FALSE	35	AATTAAAGATGCTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQPSQPPLPPPPPPPQQQQQQKTSALSPNAKEFIFPNMQGQGSSTNGMFPGDGSLNLSPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSNQQFQPVMAN	1001547	1005668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747
522156	contig_6589_pilon	+	2476	7	Intergenic	novelGene_26023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_6	676.685159845814	95	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1157	2143	1726632	1731484	FALSE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725369	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
522157	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_8800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522158	contig_1719_pilon	-	1545	7	Intergenic	novelGene_87324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	60.4032743777649	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	5	778	467728	458348	FALSE	35	ATTTTAAAATATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAAAGKLLRASVACHMSAIPWGVSASAALRPAASGRKCLTNALWSGSHPAKRAFSTSSSYLAPAVTQHAPYFKGTAVVHGEFKELSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVDETLRLVKAFQFVEAHGEVCPANWTPHSPTIKPSPTASKEYFEKINQ	467732	457580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_458761_458928_461153_461258_462091_462228_463065_463208_466480_466617_467692
522159	contig_15020_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_87401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAAAGATTACAGCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104649	105777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_104600_105800
522161	contig_10217_pilon	-	1462	10	Intergenic	novelGene_87412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	109070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
522162	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_8477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGCCACAGTGATGTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	26341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522165	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	230	748	34808	35888	TRUE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSQLSFESSPANNHQYLRHPPILC	27139	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35367_35819_36158_36266
522166	contig_9807_pilon	+	1758	9	Intergenic	novelGene_32907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	531.175347696032	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	269	835	140826	158819	FALSE	45	GAGAAATCATTAAATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPRTDRIRD	126726	159742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_126734_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151786_158791
522168	contig_15063_pilon	+	1443	6	Intergenic	novelGene_12654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3808.65816791163	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	4	1272	28164	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
522169	SIRV6	+	474	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-361	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
522170	contig_5988_pilon	-	1548	4	Intergenic	novelGene_15974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	50	1405	655459	651962	FALSE	45	CATGTCGCAAAGTAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655508	651818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
522171	SIRV6	+	589	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	344	8210	171	581	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATGAATGGTCGGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	3121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
522173	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_12819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	35	TACCGTAGTAATCACAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522174	contig_15063_pilon	+	1450	4	Intergenic	novelGene_14170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	138	1310	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34670	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522175	contig_12414_pilon	-	1607	3	Intergenic	novelGene_59571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	711	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACCAACAAACCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374586	370819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_370913_373010_373731_373792
522177	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522178	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_12263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	208	1380	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27561	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522179	contig_10793_pilon	-	2125	11	Intergenic	novelGene_83361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCCGAGAGCCCGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165007	130870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_130981_146953_146992_151413_151496_152862_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161472_162548_162689_163140_163288_163929
522180	contig_9345_pilon	-	1832	6	Intergenic	novelGene_24394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	565.083569040899	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	59	520	176056	142579	TRUE	15	ATTTGGAACTGCTTCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRLPTTLPSPAHGPTCLP	176114	141112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142629_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
522181	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_10441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522183	contig_6980_pilon	+	1868	10	Intergenic	novelGene_36040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	72	968	356720	372790	TRUE	20	AGACTGTTACTGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346111	373882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_372843_373034
522185	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_12637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522186	contig_14273_pilon	+	2174	4	Intergenic	novelGene_21134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	635.725482334072	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	430	858	149434	151187	FALSE	25	TAAAATCTTGATTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127893	152503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128810_149414_149549_150873
522187	SIRV6	+	1416	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	32	80	-5	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	601	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522189	contig_10940_pilon	-	2042	4	Intergenic	novelGene_49264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1047.00238777187	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	149	538	917000	875564	FALSE	0	GTGTTTTTTTTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917148	874059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916962
522190	contig_13863_pilon	+	1754	11	Intergenic	novelGene_42036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	854.960379198943	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	175	480	99254	110588	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDDCGLVRVHTSLLSLAMNEVAAGSGSM	98415	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104551_105528_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
522191	contig_16496_pilon	+	1356	3	Intergenic	novelGene_5152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_998_1176_1352_3411
522198	contig_10217_pilon	-	1459	10	Intergenic	novelGene_87415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	109073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
522199	contig_3233_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_56558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	306.803267417345	131	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1558	1872	746379	747909	FALSE	20	ACTCCCCAATGGGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738716	748038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_742724_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
522200	contig_8317_pilon	+	530	2	Intergenic	novelGene_19317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16152	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
522202	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522203	contig_15063_pilon	+	1440	6	Intergenic	novelGene_10115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	238	1269	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
522204	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522205	contig_5280_pilon	+	2555	8	Intergenic	novelGene_52597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	700.8037950694	3	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	28	1281	38343	78235	FALSE	0	TCTGTTTTTTGTTGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPVFLTFRTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38315	79509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_78026
522206	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522207	contig_610_pilon	-	1777	5	Intergenic	novelGene_76734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	1539.27212912467	747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	116	562	252557	222001	TRUE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGFCGASRLRWTRKKGLVMSF	252672	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_221826_222063_234998_235302_252475
522208	SIRV6	+	634	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-430	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	147	479	2002	10740	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSRSAYN	1855	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3155_10721_10819_11031
522209	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522210	SIRV6	+	684	7	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	17	1044	17	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
522211	contig_10496_pilon	-	2554	11	Intergenic	novelGene_59412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	84.3730407179924	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	474	1790	55312	38747	FALSE	15	TGCATGCTATGTATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64730	37982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55401_55661_55782_56170_56288_64482_64573_64672
522213	contig_18108_pilon	-	2248	16	Intergenic	novelGene_33510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	297.496397737295	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	345	2036	296996	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335447	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_296987_297166_316667_316759_335363
522214	contig_6227_pilon	-	1907	19	Intergenic	novelGene_49716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.073657263785	47	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	17	1843	1224979	1202683	FALSE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINPSCPYCHSLHCMVLPYPAQSTLRLQAWTTSLLGDAGLESLHPPLSRSTSPVTELTGVFQCS	1224995	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202870_1202944_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
522215	contig_12279_pilon	+	1130	6	Intergenic	novelGene_50100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2027.46428821817	8739	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	279	632	69434	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57542	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68444_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
522216	contig_15063_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_8474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	35	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	256	1491	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26340	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522218	contig_14925_pilon	-	1687	9	Intergenic	novelGene_55134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1555.62967556549	7	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	36	449	116065	114666	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116100	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_93556_93680_103145_103312_114664_114779_115150_115208_115821
522219	SIRV6	+	687	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106
522220	contig_16907_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_87477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGGGGAGATAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524847	524044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_524000_524800
522223	contig_2100_pilon	-	1850	12	Intergenic	novelGene_50707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_11	844.215808060067	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	200	1504	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1184719	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1184529
522224	SIRV6	+	316	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1651	729	222	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034
522227	contig_15063_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_12590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	5	1081	28164	36328	FALSE	20	GTGAGTCAGCCTCTATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSL	28159	36329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522228	contig_7440_pilon	-	290	3	Intergenic	novelGene_61171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	846	junction_2	289.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAGGTAAAACGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74565	71076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_71185_72915_73011_74478
522229	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522230	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_12241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3668.38635809019	3	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	213	1451	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27558	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522232	contig_11285_pilon	+	2391	10	Intergenic	novelGene_5641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	552.535457775124	6	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1311	2234	768442	769878	TRUE	30	TGCTCCAATAAAGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYGGELPGWLHVLPPLYRGLGLLPAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766315	770169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768517_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740_769964_770097
522233	contig_16322_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_87559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGACTAGAGTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144428	145547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_144400_145500
522235	contig_15063_pilon	+	1156	4	Intergenic	novelGene_12614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3227.07094574769	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	5	1012	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISLPTEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35278_36248
522236	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_12460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522237	SIRV6	+	567	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8517	164	274	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522239	contig_20641_pilon	+	1559	7	Intergenic	novelGene_52789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1613.36887874066	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	201	1268	14767	56882	FALSE	45	AAAAAGATCTCTGTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14222	57173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14335_14678_14771_16769_16916_38522_38690_45848_45965_54835_54968_56379
522240	SIRV6	+	758	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	402	21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2028_2470_2625_2758_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522241	contig_9883_pilon	+	2893	4	Intergenic	novelGene_87586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	418.9004124557	1943	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	25	723	83842	96211	TRUE	20	TTTATTTTCACTGTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARRCAAKMAASSWARTAVVLLCACDLVLLLLLPPRACATGDPAGTPGEATPPPRKKKKDIRDYNDADMARLLEQWEKDDDIEEGDLPEHKRPSAPIDFSQIDPGKPESILKMTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPGKGGGSKEKNKTKQEKSKKKKEGDPKSRTSKEDNRAGNKREDL	83817	99626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84049_94067_94301_95952_97587_98831
522242	contig_19851_pilon	+	2515	5	Intergenic	novelGene_29860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_4	974.85806659226	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCCTTTGATTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53479	56514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_55753_55840_55882_56006
522244	contig_16431_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_87605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGAAATAATGAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150119	152291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_150100_152300
522245	contig_12019_pilon	+	1703	4	Intergenic	novelGene_87623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	774	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTCCTGTGATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2031	8675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_5511_5559_6226_8298
522246	contig_5794_pilon	+	2208	6	Intergenic	novelGene_69760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	486.785620165592	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	103	1794	695501	733994	FALSE	30	TGGCATTTTTTATATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEPEGATARAALSTLRQPGQGRRRGAPAHSPQLKMMDLELPSPELPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEEAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSESASYSQVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFMHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN	695398	734408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_695546_730261_730529_731318_731409_731978_732171_732764_733294_733425
522247	contig_5941_pilon	-	2615	8	Intergenic	novelGene_84547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_7	532.383243882963	1597	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	272	1306	151020	144460	FALSE	20	CTACTTTGCAATTGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCPGAACWPGVPPSVASGRPGLSGHRRPVPCCATPEAGGSDPALAGGRDHCPSPCHTSLAVGEVCPGPQADVTSLLLPSSSGCARTPQLKMKDLGTEDLAGHEGVQFFGLLSLYLEQEQRFQPREKGLSLIETTPENDNTLCSRLRNAKVEDLRSLTNFFGSCTETFVLAVNILDRFLALMKVKPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELLEILLLVKKHSKVNDTEFFYWRELVSKCLVEYSSPECCKPDHKKLVWIVSRRTAQNLHNSYYSVPELPTIPEGGCFDESESEDSCEDTSCGEESLSSSPLSDQECTFFFSFKVAPALCFPS	151371	143150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527_145734_148032_148132_148227_148307_148486_148738_149827_149966_150882_151021_151100
522248	contig_14405_pilon	+	2835	18	Intergenic	novelGene_85626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_17	248.092361972722	733	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	81	1814	351768	432993	FALSE	40	TCAAGAAAATGTGTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGRAAGVGTSGPASGPEAAVARRPGMAFMEKPPAGKVLLDDTVPLTAAIEASQSLQSHTEYIIRVQRGISVENSWQIVRRYSDFDLLNSSLQISGLSLPLPPKKLIGNMDREFIAERQKGLQNYLNVLTTNHILSNCELVKKFLDPNNYAVNYTEIALQQVSMFFRSEPTWEVVEPLKDIGWRIRKKYFLMKIKNQPKERLVLSWADLGPDKYLSDKDFQCLIKLLPSCLHPYIYRVTFATANESSALLIRTFNEKGTLKDLIYKAKPKDPFLKKYCNPKKIQGLELQQIKTYGRQILEVLKFLHDKGFPYGHLHASNVMLDGDTCRLLDLENSLLGLPSFYRSYFSQFRKITTLESVDVHCFGHLLYEMTYGRPPDSVPVDSFPPAPSMAVVAVLESTLSCGACKNGMPTVSRLLQMPLFSDVSLTTSEKPQFKIPTKLKEALRIAKECIEKRLIEEQKQIHQHRRLTRAQSHHGSEEERKKRKILARKKSKRSAIENSEEHSAKYSNSNNSAGSGASSPLTSPSSPTPPSTAGTSALPPPPPPPPPAAPLPPASTEAPAQLPPQAVNGVSRGALLSSIQNFQKGTLRKAETCDHSAPKIG	351687	434014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_351870_374857_374909_377440_377489_385722_385910_399701_399780_400567_400642_401404_401480_405954_406060_406590_406693_408162_408325_408731_408850_410043_410123_412693_412743_414456_414535_415065_415153_415607_415678_418804_418868_432787
522252	SIRV6	+	1429	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	57	-1	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	25	ATTTAGTCGATTATTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522254	SIRV6	+	1176	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	93	-441	42	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	35	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	15	ATTCTTGAAGTTTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522255	SIRV6	+	354	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1640_1736_1845_2028_2470
522256	contig_15063_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_9526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522257	contig_14925_pilon	-	1658	8	Intergenic	novelGene_55136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1482.89474216026	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	296	709	116065	114666	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	130922	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_114664_114779_115150_115208_115821_116101_130662
522258	contig_3612_pilon	-	2516	12	Intergenic	novelGene_87798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	73.6360269352572	1355	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	169	1470	830950	815098	FALSE	30	GGATCTGTTTAAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDYLGADQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTYGQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN	831118	814051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_815256_815341_815439_815532_815736_818129_818218_819092_819258_820136_820233_820631_820705_821430_821563_825044_825145_825858_825941_826555_826594_830880
522259	contig_5018_pilon	-	1704	9	Intergenic	novelGene_47056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	701.09053445329	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	71	1144	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402862	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1401914_1402273_1402363_1402701
522260	contig_15063_pilon	+	1515	5	Intergenic	novelGene_12986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	222	1394	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28179	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522262	contig_10982_pilon	+	2685	8	Intergenic	novelGene_87878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_5	196.644504689274	391	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	215	1147	145192	201769	FALSE	55	ATTATAATAAACTAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	142013	203307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_145185_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
522263	contig_10982_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_87895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGCTTTGTTAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203571	204260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_203600_204300
522264	contig_8538_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_4987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842811	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
522265	contig_19459_pilon	-	1220	8	Intergenic	novelGene_59859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7597.31690285781	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	394	885	15518	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19137	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12640_15513_15702_16203_16265_18988
522266	contig_15092_pilon	+	2046	4	Intergenic	novelGene_57798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.242056920641	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	95	610	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325064	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992_351025_351075
522267	SIRV6	+	630	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	242	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGGACTAGTCGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740
522268	contig_6735_pilon	+	4012	2	Intergenic	novelGene_15823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGACTCAACCACTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639342	645386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_643255_645286
522270	contig_15304_pilon	-	1055	3	Intergenic	novelGene_30556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	25	TCCACCAGAAGCAGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
522272	contig_6007_pilon	+	2158	10	Intergenic	novelGene_87911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_2	33.8464214786967	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	122	1012	58451	80410	FALSE	30	TAAACATGTGTTGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	58329	81556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
522273	SIRV5	+	329	5	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	957	23	928	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTCACCACCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1984	3575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
522274	SIRV6	+	718	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1653	219	224	-84	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCATTTTGTTGTTTGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2740	11606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522275	contig_7963_pilon	+	2462	12	Intergenic	novelGene_58580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	181.933736007154	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	176	1786	260459	268582	TRUE	45	TTACATCAACAATACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQ	259720	270160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268318_268579_268697_269102_269240_269735
522276	contig_18145_pilon	+	2586	17	Intergenic	novelGene_37352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	476.775481096711	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	65	2404	86893	100744	FALSE	35	CGAGCGGCAGAAAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86828	100926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98460_98826_98983_100326_100482_100638
522277	contig_7753_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_41515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTCTGCGGTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1250360	1252835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1250400_1252800
522279	contig_14513_pilon	-	1098	3	Intergenic	novelGene_70305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725_18816_18923
522280	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522281	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_8661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26752	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522284	SIRV6	-	653	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-613	76	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTATTTACAACTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3160	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1540_1640_1736_1834_2030_2470_2619_2738_2828_3105
522285	contig_6048_pilon	-	2542	16	Intergenic	novelGene_73276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_15	73.5299183250525	793	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	135	2171	2006289	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2009363	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2009242
522286	contig_1532_pilon	-	1588	5	Intergenic	novelGene_37412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1788	junction_4	824.498142811735	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	80	844	27321	13113	FALSE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	28847	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825
522287	contig_7898_pilon	-	630	6	Intergenic	novelGene_47542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_5	2159.3805963748	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	71	628	285587	283770	FALSE	20	GATCATCCAGCAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFG	286096	283767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
522288	contig_14638_pilon	-	1930	2	Intergenic	novelGene_71566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254810	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_254737
522290	contig_13760_pilon	-	2940	13	Intergenic	novelGene_61293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	196.429571065277	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	59	1024	194443	170885	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPQVATRLLPQGSAQLARMTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNR	194501	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851_170888_171027_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
522292	contig_5499_pilon	+	2126	9	Intergenic	novelGene_57021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	200.302895635585	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	75	938	818231	840037	TRUE	40	TGTAAAGAATTTGTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	818156	841273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840273_840320
522293	SIRV6	+	590	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	768	774	-430	95	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	147	479	2002	10736	TRUE	35	TCACATATTTAGGTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1855	11063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
522294	contig_6980_pilon	+	2000	8	Intergenic	novelGene_36058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_3	429.678759929664	3	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	16	912	356720	372790	FALSE	15	TTTCAGACTGTTACTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNSAKMSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	356704	373878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
522296	contig_5033_pilon	-	2282	15	Intergenic	novelGene_29035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3690.33054282487	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	726	1538	540619	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566817	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531183_531577_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542245_542738_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
522297	contig_5643_pilon	+	2931	9	Intergenic	novelGene_38944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	126.359605887325	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	132	1373	481872	501081	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPVIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462246	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
522298	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_11486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	230	1393	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
522299	contig_5005_pilon	-	2115	5	Intergenic	novelGene_84316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	706	junction_4	283.258164048276	1878	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	92	811	539718	512817	FALSE	30	TGCACGAATTGTTATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539809	511512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649
522300	contig_15063_pilon	+	1332	5	Intergenic	novelGene_14370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	197	1081	35271	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35074	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522302	contig_15063_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_14468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	112	327	36446	36661	NA	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36334	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
522303	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_12892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	9	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	236	1474	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28165	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522304	contig_18272_pilon	-	2883	10	Intergenic	novelGene_6992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.16822415864	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	184	1542	262678	122209	TRUE	35	TCAGAAATGATGACACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262861	120749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_120946_121063_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184551_262660
522305	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522309	contig_233_pilon	-	2397	15	Intergenic	novelGene_14664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1452.83704860384	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	144	1820	108727	91657	TRUE	35	CTCGAAATGATAGATATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	109971	78412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
522310	contig_10990_pilon	+	2027	2	Intergenic	novelGene_7509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	175	303	752016	752144	FALSE	20	CTTGACGTCGTAAGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	751475	753868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_751520_751885
522311	contig_15691_pilon	+	3412	12	Intergenic	novelGene_60757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1257	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCAAACTGGAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25907	114446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_28016_29700_29802_32386_32514_32812_32984_39822_39879_41356_41468_43424_43480_50441_50579_50661_50755_51871_51962_69380_69581_114283
522312	contig_2100_pilon	-	1640	13	Intergenic	novelGene_50758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	836.139687127031	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	113	1468	1182812	1170114	FALSE	40	AATAAAGCATCTGTAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAQTRTAGPSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185523	1169941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170201_1170303_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
522315	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522317	contig_5485_pilon	+	2672	5	Intergenic	novelGene_37716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	257.249271135994	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	14	559	180585	217928	FALSE	5	CATTTCTGGTGTTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGTMSGVSGLLAQRGPCPLALLLLLLLGPSSVLAISFNLPLNSRKCLREEIHKDLLVTGAYEVTDQSGGAGGLRTHLKITDSAGHILYSKEDATKGKFAFTTEDYDMFEVCFESKGTGRIPDQLVILDMKHGVEAKNYEEIAKVEKLKPLEVELRRLEDLSESIVNDFLPLSQVWQPLICSPSL	180571	220041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_180810_202875_202988_208495_208570_216702_216785_217875
522318	contig_2646_pilon	-	3085	18	Intergenic	novelGene_69547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	72.5364005983527	489	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	202	1968	877063	847260	FALSE	30	CCTGAGAAGTATATGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGSKSPDGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCSRRPGGRRHGRGNPEGPLTWKPREQAITEMISEEGGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRRLLERLKEGGHGNPAPPAASNPHSSQRSQMDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPVFRKKMVWEILHQQLLY	877264	846142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847267_847377_847437_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863816_863997_864102_865297_865467_867268_867360_869457_869525_869942_870077_874678_874735_876962
522319	contig_17936_pilon	+	2102	11	Intergenic	novelGene_29922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	765.56489600817	5	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	55	849	50646	111097	TRUE	20	TTACCAGCCTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQGEHSAL	50591	126581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91156_95149_95305_106374_106476_111081_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
522321	contig_14353_pilon	-	2373	12	Intergenic	novelGene_82083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	483.767941773329	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	53	682	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104424	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_79941_80092_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
522323	SIRV6	+	660	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-15	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522324	scaffold_12124_pilon	+	2108	10	Intergenic	novelGene_22034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	577.037153520646	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	307	798	846536	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829556	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858225_858358
522325	SIRV7	+	1645	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	35	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTATGTGGCGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	114778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1471_1760_2679_2996_3111_43027_43083_114683
522327	contig_5018_pilon	-	1793	9	Intergenic	novelGene_47092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	5	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	353	1240	1401907	1399645	FALSE	0	TGTCTTCCTCCTGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402781	1399091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
522329	contig_9053_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_87941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTGTGACTGTCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185427	186269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_185400_186300
522330	contig_9871_pilon	+	2738	8	Intergenic	novelGene_75696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	32.6921322370396	453	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	90	944	552248	561732	FALSE	20	TGTAACTTTTTTCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRYAQLVMGPAGSGKSTYCATMVQHCEALNRSVQVVNLDPAAEHFSYSVMADIRELIEVDDVMEDDSLRFGPNGGLVFCMEYFANNFDWLENCLGHVEDDYILFDCPGQIELYTHLPVMRQLIQQLEQWEFRVCGVFLVDSQFMVESFKFLSGVMAALSAMISLEIPQVNIMTKMDLLSKKAKKEIEKFLDPDVYSLLDDCTSDLRSKKFKELTKAICGLIDDYSMVRFLPYDQSDEESMNIVLQHIDFAIQYGEDLEFKEPKEHEDESSSVFDEYFQERQNE	552158	563526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_552296_552830_552940_555670_555839_556798_556924_557753_557870_558461_558559_560958_561088_561669
522331	contig_7342_pilon	-	2624	21	Intergenic	novelGene_71117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_20	76.9774479961501	27	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	1016	2569	81141	76155	FALSE	10	GCTAGTTTTCTCCTGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86822	76099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
522333	contig_15063_pilon	-	1510	4	Intergenic	novelGene_14000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	TGAGGACCCAAGAGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522334	contig_4754_pilon	+	2234	15	Intergenic	novelGene_35939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	163.409152192918	4	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	764	1801	409630	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	379939	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409373_409627_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
522335	contig_13740_pilon	-	2295	8	Intergenic	novelGene_34618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4214.8177678669	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	85	570	160838	157474	TRUE	25	TGTATATTCAGCGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	161077	154901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156606_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058
522336	contig_10734_pilon	-	1916	6	Intergenic	novelGene_50992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	479.968332288704	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	141	620	320506	311551	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320701	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310907_311007_311676_315844_315953_318838_319032_320452_320575_320629
522337	contig_9848_pilon	-	1963	13	Intergenic	novelGene_79951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_12	357.180266889921	3422	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	266	1051	113970	104044	TRUE	5	GCAGTCGTTCTCCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	114235	98496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
522338	contig_3386_pilon	+	2668	13	Intergenic	novelGene_34556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_7	617.127823064234	516	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	247	930	476274	498673	TRUE	25	GATTGAAATTTTTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSRRTGLPWSLRLAVFSGSWFASCCPHPQRLFGPYSRSRHAFLLLLPAAAAAGASPVLTSRPLAGPASGLPAALPPRGSAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKLSRI	470064	509489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231
522339	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_10664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	779	1102	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36172_36284
522340	contig_15063_pilon	+	1420	4	Intergenic	novelGene_14201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	108	1280	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34700	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522341	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522342	contig_9871_pilon	+	2420	8	Intergenic	novelGene_75622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	290.945958934659	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	840	1265	349812	351454	FALSE	20	CTTGTTAAATCCTCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK	331188	352609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_341139_341261_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364
522344	contig_12638_pilon	+	2705	14	Intergenic	novelGene_33175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	198.680022849027	64	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	366	1178	269238	270926	TRUE	15	ACCACTGCTTGCCACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVKQ	235656	274461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_271746_273449_273584_273761_273999_274124
522345	contig_15063_pilon	+	1450	6	Intergenic	novelGene_14315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3153.99135065396	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	317	1195	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCTPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34842	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35374_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522346	contig_5988_pilon	+	2945	10	Intergenic	novelGene_16081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1655.58655451963	4	138	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	72	785	1218380	1224777	FALSE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209865	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209926_1218368_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
522347	contig_11338_pilon	+	1881	11	Intergenic	novelGene_6176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	446	1666	6086	13398	FALSE	35	GAATTTAACCTCTAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRPAAPTSQRSPPVRQQQSGHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	745	13613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10015_13199
522349	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_14069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522350	SIRV4	+	490	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	27	433	27	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
522352	SIRV6	+	895	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	167	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	157	651	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
522353	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_11999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522356	contig_16098_pilon	-	1798	8	Intergenic	novelGene_46104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1573.5799818197	9	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	120	773	458816	457444	TRUE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQVGMQVPNRPPPTLFSSRVPASLPPICQHACLPNGSRS	460246	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
522357	contig_5403_pilon	-	2651	19	Intergenic	novelGene_87972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	70.4965632644512	483	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	102	2273	458189	424565	FALSE	30	CATAAGTTTCAAGACTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKASDPAGKMGGKEKPVGAGEEKRKEGGKKKNKEGSGDGGRTELNPWPEYINIRLEMYNKLKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYHIACGISQGLADNTVIAKVNKVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFTSLETLCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLEMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKTLKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNTLIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIYNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	458290	424186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434718_435798_435946_436744_436824_436907_436973_438891_439010_439918_440041_441204_441329_449848_450040_453795_453877_458132
522358	contig_5954_pilon	+	2070	12	Intergenic	novelGene_28682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAACTTCCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944728	960575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947096_947204_947434_947714_947798_947935_948094_948197_955828_955880_956862_956937_959754_959941_960474
522359	contig_11896_pilon	-	2288	2	Intergenic	novelGene_88004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGAACACATGTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135076	131985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_133937_134739
522361	contig_6589_pilon	+	2243	9	Intergenic	novelGene_26098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3084.55442233964	147	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	26	583	1876599	1880585	FALSE	15	GTTGGTCTTGATTTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876573	1882245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880181_1880234_1880274_1880498
522362	contig_10163_pilon	+	2838	16	Intergenic	novelGene_82623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	155.667680225109	649	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	236	1840	120881	185589	FALSE	30	TTAAAAATGTTTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLRRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANYGVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPDVGASVWPKKGTAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE	87362	186587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_87463_116321_116426_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146_152324_154314_154386_165096_165197_175174_175229_181219_181286_183288_183358_183871_183969_185518
522363	contig_15063_pilon	+	1502	7	Intergenic	novelGene_9154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	243	1247	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36413_39022_39092_39506
522364	contig_11285_pilon	+	2144	11	Intergenic	novelGene_5587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	537.907882448287	7	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	898	1377	767746	769225	TRUE	20	TTTGTACACTTCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVSP	763523	770182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768767_769213_769320_769421_769653_769740
522365	contig_21203_pilon	+	1358	8	Intergenic	novelGene_84478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	70	1356	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53880	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
522366	SIRV6	+	650	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	859	517	-339	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	56	388	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1946	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522367	contig_19459_pilon	-	1280	8	Intergenic	novelGene_59817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	406	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	157	942	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19120	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
522368	contig_4364_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_1158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTCGGTGAAGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1532895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
522369	contig_18406_pilon	-	3077	4	Intergenic	novelGene_88051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	45.3210767744986	227	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	89	559	61017	49572	FALSE	75	ACATTAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLALRNELVVDKTKRKKRRELSEEQKQEIKDAFELFDTDKDEAIDYHELKVAMRALGFDVKKADVLKILKDYDREATGKITFEDFNEVVTDWILERDPHEEILKAFKLFDDDDSGKISLRNLRRVARELGENMSDEELRAMIEEFDKDGDGESKF	61105	47053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_49775_57039_57155_58991_59128_61000
522370	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522371	contig_14686_pilon	-	1260	5	Intergenic	novelGene_88065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_4	119.676647680322	608	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	243	752	65799	44645	FALSE	20	TCTGAGCACTGTCTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGSRIELGDVTPHNIKQLKRLNQVIFPVSYNDKFYKDVLEVGELAKLAYFNDIAVGAVCCRVDHSQNQKRLYIMTLGCLAPYRRLGIGTKMLNHVLNICEKDGTFDNIYLHVQISNESAIDFYRKFGFEIIETKKNYYKRIEPADAHVLQKNLKVPSGQNADVQKIDN	66041	44136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_44823_45948_46016_46726_46847_47276_47414_65791
522372	contig_14686_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_88064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	544	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTAGTGATCTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43982	41836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_41800_44000
522373	contig_8254_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_48360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAAGCAGCAGAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7050	6360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_6400_7000
522374	contig_15087_pilon	+	2374	4	Intergenic	novelGene_37282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	4	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	18	599	284653	301944	FALSE	30	CTTTTTAACTTGCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPFTMTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284635	303719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
522375	contig_10134_pilon	-	1933	5	Intergenic	novelGene_16224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	464.189616428459	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39683	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33069_33188_33625_34922_35178_38558_38817_39584
522376	contig_4156_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_88092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGCAAGAGAGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250801	251539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_250800_251500
522377	contig_9199_pilon	+	2836	10	Intergenic	novelGene_65617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	128.397050079571	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	285	1085	52006	57407	FALSE	10	TCAGCTGGACCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42466	59158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51970_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56380_57344
522379	contig_15063_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_9820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	239	1267	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
522380	contig_3424_pilon	+	2315	3	Intergenic	novelGene_55499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	203.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	74	2158	163695	170678	FALSE	25	CATCATTATCCTTCATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDSPDVSGRKVRALQLCVNRAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	162527	170835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_162588_163681_163803_168701
522382	contig_5499_pilon	+	2090	10	Intergenic	novelGene_57020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	245.772453227436	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	44	1012	816654	840037	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	816610	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840157_840320
522383	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
522384	contig_15304_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_30498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	189	383	54100	53906	NA	15	AGCAGCCCTGCTTTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54288	52882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52900_54300
522385	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522387	contig_12074_pilon	-	1968	14	Intergenic	novelGene_53755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	318.234831977934	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	102	1718	43217	30226	FALSE	25	ACATATTTAATGCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45836	29975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33417_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
522388	SIRV6	+	1361	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	71	3	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522390	contig_15063_pilon	+	1705	7	Intergenic	novelGene_11782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	229	1071	34808	36333	TRUE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27140	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38975_39092_39506
522392	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522393	contig_7840_pilon	-	3302	3	Intergenic	novelGene_69047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_2	211	71	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	194	535	427684	406615	FALSE	70	AATAAATTATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTPARSFGRGLGRAALRAEISHRQGRSECSGRSLGCERPAAAATEKKPQEALCSVKKYFYTIAPMTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLYV	445752	403847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_406882_427609_427738_445612
522396	contig_15087_pilon	+	2325	5	Intergenic	novelGene_37273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	36	617	284653	301944	TRUE	20	GCTGCAAAATCCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284617	303730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_302944_303021
522397	contig_10003_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_88264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776627	777290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_776600_777300
522398	contig_12873_pilon	+	1848	8	Intergenic	novelGene_27192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1290.32835561578	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1008	1499	17896	19855	TRUE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15998	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851_20035_20259
522399	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1	1410	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522400	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_14085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	190	1032	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34618	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36268
522401	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_10537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	234	1409	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
522402	contig_5669_pilon	+	3011	7	Intergenic	novelGene_86035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	101.828286836222	1115	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	14	961	4109	19184	TRUE	5	TTGTGGGGATGTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLIIMDLRQFLMCLSLCTAFALSKPTEKKDRVHHEPQLSDKVHNDAQSFDYDHDAFLGAEEAKTFDQLTPEESKERLGMIVDKIDADKDGFVTEGELKSWIKHAQKKYIYDNVENQWQEFDMNQDGLISWDEYRNVTYGTYLDDPDPDDGFNYKQMMVRDERRFKMADKDGDLIATKEEFTAFLHPEEYDYMKDIVVQETMEDIDKNADGFIDLEEYIGDMYSHDGNADEPEWVKTEREQFVEFRDKNRDGKMDKEETKDWILPSDYDHAEAEARHLVYESDQNKDGKLTKEEIVDKYDLFVGSQATDFGEALVRHDEF	4095	21483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_4330_9444_9639_13206_13374_14081_14143_17622_17823_19079_19508_19756
522404	contig_12074_pilon	-	2006	14	Intergenic	novelGene_53745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	411.096311726088	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	593	1753	36135	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45854	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36710_40036_40171_41067_41228_45769
522405	contig_15063_pilon	+	1692	6	Intergenic	novelGene_13707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522406	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	4829	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
522407	contig_4315_pilon	-	2738	17	Intergenic	novelGene_46725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	179.553613163311	25	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	13	1329	163741	150695	TRUE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPFLAAITRAFTTLLRTLM	163753	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150752_153016_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
522409	contig_6980_pilon	-	1719	9	Intergenic	novelGene_36062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1039	1356	370598	365020	TRUE	40	ATCTTCAAGAGATGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	373850	356746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_356766_361141_361226_362331_362441_364868_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734_372797_373007
522410	contig_15304_pilon	-	754	2	Intergenic	novelGene_30445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	682	711	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53807	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
522411	contig_15063_pilon	+	1602	5	Intergenic	novelGene_12286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	55	1464	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28109	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522412	contig_15866_pilon	+	2606	6	Intergenic	novelGene_63680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	647.006831494073	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1516	1932	623258	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	621421	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_622528_622848_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
522413	contig_8978_pilon	+	2208	8	Intergenic	novelGene_49373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	327.851882933219	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	237	1334	339807	347264	FALSE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLHSIVQLLELNSLQTSVADTNKFAV	331426	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344250_347186
522414	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522415	contig_1244_pilon	-	1624	13	Intergenic	novelGene_38030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	902.721390974105	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	52	1503	948448	923211	FALSE	35	CTCCTCTGAAAGAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948499	923089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
522417	contig_1406_pilon	-	1880	6	Intergenic	novelGene_25545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	614.612918835912	2494	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	111	1079	2159494	2137428	FALSE	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159604	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141067_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391
522418	contig_15063_pilon	+	1516	5	Intergenic	novelGene_11245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522419	contig_14209_pilon	+	2335	14	Intergenic	novelGene_88330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	207.216406332256	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	44	862	32366	37768	TRUE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32322	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38271_38783_40142_40344_40418_40859_40901
522421	contig_6735_pilon	-	1916	13	Intergenic	novelGene_15772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1005.75912112306	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	586	1440	545923	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568283	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546608_547247_547298_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
522422	contig_10861_pilon	+	2505	10	Intergenic	novelGene_39398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_1	344.187430994104	1502	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	227	1825	1910254	1934804	FALSE	35	TTCAATTGTGTCCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPFLVVFKAPRADSHGPGRRPLLCPGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903798	1935484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
522423	contig_11328_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_88461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCACTCATTTACTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836988	837494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_837000_837500
522425	contig_5302_pilon	+	1767	9	Intergenic	novelGene_81475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_1	108.472850866012	2019	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	63	914	318287	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCAAAPAVAAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306686	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
522426	contig_10311_pilon	-	1834	12	Intergenic	novelGene_50436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1066.59623906616	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	68	1282	70487	65678	FALSE	10	AGTTGCTTTGGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALREWTPMVSLSNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYRMPCSLLLNRRDHNVHCAAFFGNF	71559	65125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65753_65820_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70356_70446_70493_71497
522427	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	200	1435	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522428	contig_5018_pilon	-	1483	7	Intergenic	novelGene_47069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	463.649172926638	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	37	924	1401907	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1401943	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873
522429	contig_9839_pilon	+	2737	9	Intergenic	novelGene_88562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_2	225.830135278709	3048	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	16	1311	255906	269866	FALSE	15	TACATGTGGTCAGTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	255890	271292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
522430	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_10450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522431	contig_8317_pilon	+	389	3	Intergenic	novelGene_19270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	21224	junction_1	6566	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	23	388	14294	15134	FALSE	25	TTGAAGCTGGTATCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGE	14271	15135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092
522432	contig_14415_pilon	+	1526	4	Intergenic	novelGene_77612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	227.216979021277	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	79	300	33410	38282	FALSE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLASVTVPLPACRDARFRQRCAWPCSG	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36156_38204
522433	contig_18272_pilon	+	2662	9	Intergenic	novelGene_7044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2476.79220149269	158	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	194	1519	468524	538332	TRUE	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	468330	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_468606_507832_507953_509541_509743_512634_512713_514111_514361_518778_519040_537077_537197_538116_538951_541315
522434	contig_9345_pilon	-	3288	7	Intergenic	novelGene_24509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_1	243.479237079651	14	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	581	1225	670952	669257	TRUE	40	TGAAAAAAGTAATGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLVSCCTGGVLA	671532	667025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910
522435	contig_15327_pilon	-	2660	6	Intergenic	novelGene_70538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.340191774008	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	242	895	585509	513059	TRUE	30	AATGAATTCTTCACTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	585750	511151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_512874_513015_513245_513894_514064_517485_517609_525370_525469_585431
522436	contig_12638_pilon	+	2008	10	Intergenic	novelGene_33385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	112.348773529488	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	90	1259	1515842	1538931	FALSE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515752	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530035_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
522437	SIRV6	+	557	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	341	619	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106
522438	contig_6215_pilon	-	2908	10	Intergenic	novelGene_21197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	884.467838886577	2	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	80	883	243029	231675	TRUE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSIIWFVTVFSNYNLHNVFDMVCYDQ	243108	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231747_231877_232021_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
522439	contig_4125_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_25116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	811473	811045	NA	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRVRGWCSWWHEQGEGVTGLGRGLAVNSQVPSVQSSPPGRQAVRAGGGPWGQTCGLLLSCCLTSLGTYSGSPGCGLTWPHHISPCLSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	811475	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809000_811500
522440	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522441	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522442	contig_7426_pilon	-	3105	9	Intergenic	novelGene_27473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	56.3332716962187	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	16	708	652755	643777	TRUE	45	TAAAAAAGTTTCCAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPR	652770	637243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724
522444	SIRV6	+	181	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	913	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11150	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11200_11300
522445	contig_17212_pilon	-	3241	1	Intergenic	novelGene_88619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTGTTAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119395	116154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_116200_119400
522446	contig_12079_pilon	-	2046	7	Intergenic	novelGene_67442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	935.17106278299	5259	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	140	412	638707	600804	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQELRKESPPPVQIPRQVLPGRCA	638846	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581014_598087_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
522449	contig_15063_pilon	-	1449	5	Intergenic	novelGene_13919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	741	1064	35891	35108	TRUE	40	AGGACCCAAGAGTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36798	34610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36349_36406
522450	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_8570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3677.14317326191	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	247	1470	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVK	26349	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39077_39506
522451	SIRV6	+	659	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522452	contig_7963_pilon	+	2619	12	Intergenic	novelGene_58585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	176.276126367902	587	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	124	1593	260459	267847	TRUE	35	TTTTCATTATTACATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFVSEEPALAAFFPVFFTLAFWALGFTCSLFKKKTSFCYGEFQAYAKKKREEPSIHVGRYAEQRGSC	259772	270151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464_265742_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
522453	contig_11512_pilon	-	2292	10	Intergenic	novelGene_43269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	456.265706646608	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	129	959	396169	367967	TRUE	20	CCTAGGAGAGCTTCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409402	365999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366169_366309_367425_367917_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
522454	contig_20693_pilon	+	2143	12	Intergenic	novelGene_60249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	592.010805128107	6	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	651	1265	27396	34261	FALSE	55	TTAAAAAAAATACAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14713	35139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20431_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
522455	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522456	contig_16650_pilon	+	2041	4	Intergenic	novelGene_61976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1101.12709933454	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	66	395	244670	254361	FALSE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELILLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244604	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253070_254221
522457	contig_15063_pilon	+	1764	7	Intergenic	novelGene_8467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	274	1509	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26322	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522458	contig_15063_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_8883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	244	1479	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27125	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522459	scaffold_19766_pilon	-	2892	20	Intergenic	novelGene_34251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	83.6140718981595	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	111	2792	166371	152785	FALSE	20	AGCACTTCCCCAGTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESQGLGPALAPSDRAMGDSDDEYDRRRRDKFRRERSDYDRSRERDERRRGDDWNDREWDRGRERRSRGEYRDYDRNRRERFSPPRHELSPPQKRMRRDWDEHSSDPYHSGYEMPYAGGGGAPTYGPPQPWGHPDVHIMQHHVLPIQARLGSIAEIDLGVPPPVMKTFKEFLLSLDDSVDETEAVKRYNDYKLDFRRQQMQDFFLAHKDEEWFRSKYHPDEVGKRRQEARGALQNRLRVFLSLMESGWFDNLLLDIDKADAIVKMLDAAVIKMEGGTENDLRILEQEEEEEQAGKPGEPSKKEEGRAGPGLGDGERKANDKDDKKEDGKQAENDSCNDDKTKKSEGDGDKEEKKEDSEKEAKKSSKKRNRKHSGDDSFDEGSVSESESESESGQAEEEKEEAEEVLKEKEKPKEEEREKPKEAPGLECKPRPLHKTCSLFMRNIAPNISRAEIISLCKRYPGFMRVALSEPQPERRFFRRGWVTFDRSVNIKEICWNLQNIRLRECELSPGVNRDLTRRVRNINGITQHKQIVRNDIKLAAKLIHTLDDRTQLWASEPGTPPLPTSLPSQNPILKNITDYLIEEVSAEEEELLGSSGGAPPEEPPKEGNPAEINVERDEKLIKVLDKLLLYLRIVHSLDYYNTCEYPNEDEMPNRCGIIHVRGPMPPNRISHGEVLEWQKTFEEKLTPLLSVRESLSEEEAQKMGRKDPEQEVEKFVTSNTQELGKDKWLCPLSGKKFKGPEFVRKHIFNKHAEKIEEVKKEVAFFNNFLTDAKRPALPEIKPAQPPGPAQILPPGLTPGLPYPHQTPQGLMPYGQPRPPILGYGAGAVRPAVPTGGPPYPHAPYGAGRGNYDAFRGQGGYPGKPRNRMVRGDPRAIVEYRDLDAPDDVDFF	166481	152684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_153647_154068_154263_154454_154609_154706_154881_155442_155632_155935_156015_156138_156201_156535_156694_156873_156992_157076_157176_157390_157576_157717_157888_159685_159875_160118_160266_160520_160650_165948_166089_166338
522460	contig_4469_pilon	-	2407	4	Intergenic	novelGene_21954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGCTGGGCGATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757272	752539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_752570_753495_753634_754992_755208_755248
522462	SIRV6	+	518	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	734	547	-421	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1864	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
522463	contig_12119_pilon	+	3450	6	Intergenic	novelGene_88654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	770	junction_1	163.711453478368	194	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	278	1345	319835	348999	FALSE	30	TTCAAAGCTTCTTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKRKCLISF	306469	351104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682
522464	contig_6227_pilon	-	1966	18	Intergenic	novelGene_49764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	307.724262048489	59	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	32	1675	1224979	1202920	FALSE	35	CACAAAAGAGGTTATGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225010	1202628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1205996_1206148_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
522465	contig_14513_pilon	-	1475	5	Intergenic	novelGene_70381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1340.07910214285	16	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	184	456	18880	13056	TRUE	40	AAAACATTAGAACTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSGKFLHLFAHR	19063	11296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_12626_12748_13013_13136_14952_15001_18735
522466	contig_6059_pilon	-	2868	5	Intergenic	novelGene_44799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	222.996076198663	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAATATAGTGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437273	401363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_403633_409565_409725_411164_411443_415816_415920_437214
522467	contig_5280_pilon	-	2568	8	Intergenic	novelGene_52621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGGGGTCCTGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79508	38722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_38944_39265_39451_40882_41074_41730_41837_42906_42988_47317_47506_56216_56341_78036
522468	contig_15063_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_14017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522469	contig_3975_pilon	-	3739	6	Intergenic	novelGene_54720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	394.504955608925	227	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	56	1321	1603436	1560510	FALSE	25	AACGTTCTTGTCAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLVPSEQSSGTSLLPKDNARFSWSSLDEDGLDDSLLELSDGEEDDGHFSFTEEEIQELLKDDDLSNEHFSWRGGLLKDDSRHVEKGERESQIPLDALQEKNSLYSLGPVAETPGLFRLPQLSTSIGHGPTATKPLNRHFALEKNVIKITVVAPFDPTVYDAVLDKDKTDSSKDIKKPSSVGEELRENGLNPNESKLCTESEGISPTNSAWDGNTFPSPSNNNFQETVSDKNMPDCKKPTPVFSQVLDHSKSSSNIGSSWRNGGSHKSSCEVRFPVSSKQDVLDKDSGKMKVHERRLGKVIPVLQTKTRTSFLTFSQSDLEQQKQIYLRSVIAHIEDPVDSNQGALGELYALMDQVHHMQNQKWQHPSDLTMRNYARFRQKPLQRYSLTQWVDRNMGSHHRFQHLPDFPNSPFVSSHQQ	1609607	1558091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1560652_1562840_1562929_1599911_1600016_1601762_1601852_1602593_1603439_1609554
522470	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522471	contig_5643_pilon	+	2200	15	Intergenic	novelGene_39004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	785.926880329519	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	661	1512	634983	640255	TRUE	5	GTCTCTCCGGTCATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGHHHRH	631188	641585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638180_640236_640538_640636_640729_641102_641244_641412
522472	SIRV6	+	719	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	19	563	12	-20	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGAGTTAGGTAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	10768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
522473	contig_15063_pilon	-	1454	5	Intergenic	novelGene_10606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	710	1033	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36709	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522475	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522476	contig_13787_pilon	-	2118	9	Intergenic	novelGene_40623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	723.143992836143	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	306	1022	205032	159290	TRUE	35	GCTATGAACATTCTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205337	157992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_158295_158495_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
522477	contig_1225_pilon	+	2410	5	Intergenic	novelGene_44154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTCTGGCCTGGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250596	276795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274377_274841_276132_276175
522480	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_18724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAGATCAACCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30126	29845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
522481	contig_9345_pilon	-	1749	4	Intergenic	novelGene_24359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_3	443.50297506205	743	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	107	754	144517	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144623	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_144512
522482	contig_7045_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_77474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACATATACAAAACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384152	386258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_384200_386300
522483	contig_13894_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_62119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2745.44626789099	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	500	979	522731	525785	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGGTCWAEGLPSPH	520691	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522448_522847_523488_523625_524837_525025_525744_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
522485	contig_15219_pilon	+	1938	9	Intergenic	novelGene_40819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	294.918526884969	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	124	1335	19617	25321	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKEQSIFLLTGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGRDSFPWEVPKKLKY	19493	25924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23127_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24588_25218
522486	contig_15063_pilon	+	1610	8	Intergenic	novelGene_8578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3722.07511246847	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	245	1360	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26351	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36413_36532_36600_38975_39092_39506
522487	contig_12050_pilon	+	3471	17	Intergenic	novelGene_62612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	347.917712074278	242	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	18	1856	321302	355149	FALSE	20	GTAACAGTTGTGTGGCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIHTHTHTHTHTPHWLSPQDRGCPETAAWLFLLLSLSYLKPRPAKELESAVRVGRLPTASPE	321284	356764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631_354700_354965
522489	SIRV6	+	810	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	102	309	271	579	2021	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2029_2477_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522490	contig_5988_pilon	-	2536	14	Intergenic	novelGene_15870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	332.819762157899	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	57	1850	398182	387838	FALSE	15	GGCTGTGTCTAGTTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGELADKKDRDASPSKEERKRSRTPDRERERDRDRKSSPSKDRKRHRSRDRRRGGSRSRSRSRSKSIERERRHKERERDKERDRNKKDRDRDKDGHRRDKDRKRSSLSPGRGKDFKSRKDRDSRKDEDDEHGDKKPKAQPLSLEELLAKKKAEEEAEAKPKFLSKAEREAEALKRRQQEVEERQKMLEEERKKRKQFQDLGRKMLEDPQERERRERRERMERIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	403608	387151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390433_390653_390806_391212_391456_392440_392619_393678_393723_395172_395223_395505_395645_395796_395863_395972_396067_397411_397523_397973_398183_403552
522491	contig_3077_pilon	+	1462	8	Intergenic	novelGene_26697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	3891.34313415755	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	403	969	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
522492	contig_1639_pilon	+	2550	22	Intergenic	novelGene_74897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	186.27769239715	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	426	2384	289113	331557	FALSE	35	GAAGCACAACCCTATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQAAVAILAASDGCGGGGGTKSSATSASPSRQPVRK	286850	331723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331452
522493	contig_10134_pilon	-	2401	2	Intergenic	novelGene_16243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGTTTAAGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36143	32191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33447_34997
522494	contig_3602_pilon	+	1968	7	Intergenic	novelGene_60500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	124	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	119	568	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161626	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170667_170947
522496	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	201	1367	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36272
522497	SIRV6	+	542	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-339	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1946	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031
522498	contig_3571_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_88699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1093	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	2108	2590	29273	29755	NA	60	AAAAAAAAAAAACCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAVAVGGNHGSLWNSSAELGALAKKSGSNSADWLHLWLKKSSDNGYEDKPHEHPATGPVENALIPDTLRLRGNPTCCVRPQDPGIRRWEWMLPFSHLAVFHLNMYLPLVSLILFSSWKKVHLKKSIFLSSFFQVSVSFSFFFFQVSFFPFSVSPEQDGK	27165	29756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_+_27200_29800
522499	SIRV6	+	1390	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	56	32	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522500	contig_5791_pilon	+	2663	10	Intergenic	novelGene_35862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1313	1630	1085717	1088260	TRUE	25	ATCAGTGGCCTGGCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTGLNLTYELLSFNSYQVLSPWKPLGMFHPWIISRFPTSQSTVTAKAFDIIAMTQIIKTSTCKLLRMNWHTRWPVTECFKPSCLCLHAQIRNSVSRRFLKLIF	1079303	1094572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1080015_1080126_1080169_1080455_1080711_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085780_1087896_1087999_1088107_1089006_1090660_1090731_1094354
522501	contig_15063_pilon	+	1388	4	Intergenic	novelGene_14223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	80	1252	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34728	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522502	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_13000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	218	1456	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28183	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522503	contig_15859_pilon	-	2355	2	Intergenic	novelGene_50217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380260	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377977_378514
522504	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	221	1396	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27550	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522505	SIRV6	+	886	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	172	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	153	644	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1475	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1631_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522506	contig_20819_pilon	+	2200	8	Intergenic	novelGene_55631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	511.03416555779	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	24	986	29817	41320	TRUE	10	ACCGGGCCTCTTATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHF	29793	43616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_40962_41319_41400_41530_41569_42519
522507	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_14147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	164	1336	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34644	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522508	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522509	contig_13787_pilon	-	2293	8	Intergenic	novelGene_40615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_1	501.824304565912	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	264	980	205032	159290	FALSE	20	TACATGTCTTTTGGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205295	157976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
522510	contig_5643_pilon	+	1832	10	Intergenic	novelGene_38860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	750	1622	236199	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	235367	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
522512	contig_15063_pilon	+	1501	5	Intergenic	novelGene_12255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	209	1381	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27560	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522513	contig_15063_pilon	+	1473	5	Intergenic	novelGene_12228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	574	1395	35271	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34936_35037_35380_35839_36158_36266
522514	contig_16121_pilon	+	2421	6	Intergenic	novelGene_6875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	538.033233174309	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	671	2164	51510	63096	FALSE	5	CTCCTTGATTTTTCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLQAILSYKYIFNGCNILLYIVLTAKYALNLISLVVDIMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCFLRGHRADVEISLVVSH	50839	63353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_51628_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565_62738_63040
522515	contig_9696_pilon	+	2566	16	Intergenic	novelGene_68840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	597.291092256438	30	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	232	1662	593219	626143	FALSE	20	AAGGTTGATCTGGTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKMGGIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDPRVLHHMGGMAGLQSMMRQFQQGAAGNMKGMMGFNNM	577972	627047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614160_618819_618991_624292_624389_626051
522516	contig_10734_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_51262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290955	1293854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1291000_1293900
522518	contig_12638_pilon	+	2125	13	Intergenic	novelGene_33124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	623.34943718057	2	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	66	932	173541	198068	TRUE	40	GCAACAATCTTTGTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVAKRGKKAKAEVVVTNEREAKVRNGNEVEIENGKRAKAVKRTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAVFVCFF	171713	200429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171748_173509_173560_178085_178195_182970_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_198048_198151_198736_198843_199335_199415_199503
522519	contig_8772_pilon	+	1688	10	Intergenic	novelGene_21067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5336.12883911683	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	157	597	15355	19024	TRUE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQV	15198	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15370_15558_15918_16549_16615_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
522521	contig_6227_pilon	-	2048	18	Intergenic	novelGene_49760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	352.995260562006	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	105	1394	1224979	1203660	TRUE	30	AAAGAGGTTATGGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRCTLRPLLAVRRPPVLPLPSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQVTSSSRSRPSTLYGRGCITRSSWPTSWPRLRP	1225083	1202624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203567_1203700_1204139_1204198_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
522522	contig_9609_pilon	+	2054	9	Intergenic	novelGene_23067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	844.624435770124	4134	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	126	1037	449884	454609	TRUE	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	442305	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_442393_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
522523	contig_7744_pilon	+	2176	18	Intergenic	novelGene_62547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	176.090138918173	1707	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	930	1733	887347	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879800	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
522524	contig_17427_pilon	-	2552	13	Intergenic	novelGene_30369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	2	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	49	1473	188879	178046	FALSE	40	AAGTTAATACCAAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204709	176966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
522525	contig_15866_pilon	+	1920	14	Intergenic	novelGene_63633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	632.844662507242	1224	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	272	1246	601021	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458989	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581479_600020_600107_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
522526	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_8710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522527	SIRV6	+	1384	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	363	695	2002	10736	TRUE	10	CTTGAAGTTTGCGTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522528	contig_8576_pilon	+	2335	9	Intergenic	novelGene_88782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	519.968688961172	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	21	1334	893619	916055	FALSE	70	AAACAGCAACAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPISVPTL	893598	917056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338_915395_916033
522529	contig_7744_pilon	+	2009	16	Intergenic	novelGene_62565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	196.476246797305	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	883	1566	887347	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879847	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890680
522530	contig_15063_pilon	-	1494	4	Intergenic	novelGene_13183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522532	contig_10324_pilon	+	2363	23	Intergenic	novelGene_7720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	1105.73593252609	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	17	2131	51839	79380	TRUE	45	TCTCTTTGTAAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51822	80404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_79402_80193
522534	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522535	SIRV6	+	480	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	509	52	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522536	contig_10331_pilon	+	2046	15	Intergenic	novelGene_54139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	285.481950178205	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	264	1814	410802	546107	FALSE	50	ATCAGGAAAAAGAAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLVNQILLIVLCLLWFIFYSLFKFPKLIYCIIYFIVYAFSSLSAIFVWF	409534	546339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719
522537	contig_6735_pilon	-	2014	14	Intergenic	novelGene_15795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	2	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	89	1585	564868	542464	FALSE	20	CTGTGCCCAGTCCTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568286	542034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
522538	contig_5018_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_47065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	851.492477946811	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	959	1774	1401907	1399224	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYFFKKKLVFLSLILPQPSPLALIFLDRHLFFLLSSLRIPWFLSTPGAGGVKPRPEIPSALLPGAQGGRRRGVASRSPSTEKEWGC	1402865	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399479_1400655_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873
522539	contig_5643_pilon	+	2133	9	Intergenic	novelGene_38858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_2	1664.74284331695	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1308	1928	236700	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	235180	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
522540	contig_15063_pilon	+	1305	5	Intergenic	novelGene_13126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	202	1230	34808	36632	FALSE	10	CTATGTGTGTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34606	36707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
522541	contig_2100_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_50655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	540	839	1171434	1171135	NA	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPWEAPKHRFAPFLLFSSFHKLSHIEPAAIELIPTHRDPIGQSRVSKTVIFTEADCHVFVPWSGLWVQNTKLLVSSQVLNHCDTRALLSHINPSLKLS	1171973	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1169900_1172000
522542	contig_12605_pilon	+	941	5	Intergenic	novelGene_64174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	384	941	4816	6231	FALSE	20	TCAGGTAGAGAGGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKS	3868	6231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5055_5792_6005_6124
522543	contig_10082_pilon	-	2687	10	Intergenic	novelGene_63864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281.724846062411	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	35	1018	230442	212085	TRUE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSNLSVPSNPAQSAQSQPSYNPFEDEDDTGSTVSEKEDIKAKNVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	230476	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214928_215484_215608_218341_218464_221744_221866_224043_224073_224177_224220_228798_228955_230358
522544	contig_15732_pilon	+	2921	14	Intergenic	novelGene_88841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	244.751679494513	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	64	2235	11208	398257	TRUE	25	CCTACGTCTGACTTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPRVPGFRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQLPTRPQVEKEFGFSSRKDY	11144	399201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_398197_398263_398520
522545	contig_12425_pilon	-	2002	10	Intergenic	novelGene_46699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	722.065555657287	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	127	1065	211174	204313	FALSE	10	CCAGCGTTCACTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGELL	226618	203375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204825_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
522546	contig_8772_pilon	+	1592	8	Intergenic	novelGene_21077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4570.98959053012	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	903	1274	20497	23105	FALSE	5	CTTGCTGTGTCAGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15209	23423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15697_19012_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
522547	contig_8045_pilon	+	1462	4	Intergenic	novelGene_35355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	541.917787942866	8789	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACACTTGAGTTCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117513_118075_118243_118527
522548	contig_12624_pilon	-	1740	5	Intergenic	novelGene_61127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	227	532	952979	948779	TRUE	30	GAAGATTTTACTTTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955865	947486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947583_947666_948842_950590_950768_952913_952985_955644
522549	contig_9708_pilon	+	2815	14	Intergenic	novelGene_67275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	116.464180439497	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	10	957	768056	795563	TRUE	35	GAAGTTACCTAAAGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVTCIQI	768046	804914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795542_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
522550	contig_7513_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_89004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	172	567	634071	633676	NA	75	CTAATAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVDNRGETVGAGVGEGVYGNSWNFLLSFCKPKTTLKNNKCWRGCGDTGSFLHCWWGYKMAQPLWKTVLRFLKMLNIELPKDPAIPLVGIYPIYPRELKTYVHTEVCKQIFISSIIHNSQNMDTTQTCID	634242	631948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_631900_634200
522551	contig_5684_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_81088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGCCCCTTAGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492197	491623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_491600_492200
522552	contig_15063_pilon	-	1493	4	Intergenic	novelGene_13715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522553	contig_6710_pilon	+	262	2	Intergenic	novelGene_98321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653653	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
522554	contig_16703_pilon	+	2280	2	Intergenic	novelGene_72786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAATGCAGTCTCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42205	44868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42966_43348
522556	contig_15063_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_12187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	985	1308	35891	35108	TRUE	40	AGTTGAACAAATTGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
522557	contig_4496_pilon	+	2641	7	Intergenic	novelGene_66664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	151.26687233716	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	190	2574	911498	998163	FALSE	25	ACTCTGTGTAAGATGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEEGEEEEKGAGVGAVAEAATAKVLPPSPFPSSPGPSEGWSCRRLQSVTARLGARPRQLYLSMNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859265	998230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
522558	contig_9345_pilon	-	1999	7	Intergenic	novelGene_24388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	576.763864640943	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	124	1008	175785	142100	FALSE	10	GGAACTGCTTCCCTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176046	141108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175772_175852_175989
522559	contig_1443_pilon	-	2181	10	Intergenic	novelGene_28272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	416	junction_5	484.261280358363	2909	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	242	1126	776427	748649	FALSE	40	CAGCTGCAGAATGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809534	747593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_805197_805224_808694_808741_809399
522560	contig_15498_pilon	-	1730	11	Intergenic	novelGene_42662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_9	74.9965999229298	2155	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	69	1475	697795	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPPKLQLQTPGPDVFRSLPGGMSRPGAAIGQPWKGHFRCPSAGLFGRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697863	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
522561	contig_15063_pilon	-	1581	6	Intergenic	novelGene_14216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	40	AGCCAGGCAGAAAGTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34918_35031_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
522562	contig_1725_pilon	+	2227	16	Intergenic	novelGene_24308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	724.352848333524	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	169	1914	235987	252717	TRUE	35	ATTTGCTAATAATCTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQV	235818	255618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247749_248351_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252218_252711_252779_255366
522563	contig_7412_pilon	-	1949	8	Intergenic	novelGene_76320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1575.8002696395	83	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	74	1375	377290	365442	TRUE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMDTGTSRWPR	377363	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365367_365471_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
522564	SIRV6	+	1035	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	186	518	1673	2560	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1099	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522566	contig_2646_pilon	-	2850	21	Intergenic	novelGene_69627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	316.237489871141	730	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	555	2696	2075709	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078690	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075761_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
522567	contig_15063_pilon	+	1200	4	Intergenic	novelGene_13121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	202	1200	34808	36487	FALSE	25	ATCCTGAACGTGTCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYS	34606	36487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522568	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522570	contig_9732_pilon	-	831	2	Intergenic	novelGene_98352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	92	487	192843	192448	FALSE	40	ACCTTCTAATGGAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEEILRIMWDTIKSKNFRVIGVPEQGEKTEDTERIIEELLTENFRNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILKEAQEKQKVTYRGETIRLSSDYLAETMQAEGNGMTYIKP	217430	192103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_-_192904_217399
522571	contig_9609_pilon	+	2089	9	Intergenic	novelGene_23065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	844.624435770124	4921	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	162	1073	449884	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	442269	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_442393_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
522572	contig_5485_pilon	-	2842	15	Intergenic	novelGene_37750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_13	96.9900320988225	295	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	35	1402	478711	459244	FALSE	20	GATGTTCTCAAACGGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	478745	457803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
522573	contig_4418_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_98390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887390	889885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_887400_889900
522574	contig_10286_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_98416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	207	602	414162	414557	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVLSRSPKTSKASVLLSKWSLLSLHLIQTICSILHSWLLGSSWIGILHLASQTISSLSFSPTLLSHSLSVVSFADPSSSLPPLRTEGPFELSLYHLKNPGSNPGCTTRWLHDLGQLVNFREPCVSICKV	413955	414589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_414000_414600
522575	contig_8122_pilon	-	1771	11	Intergenic	novelGene_40240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1708	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAGACCTCACAGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748843	720144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_720327_725253_725294_726995_727065_731391_731481_732309_732399_737500_737594_742060_742161_744035_744127_744610_744783_745061_745152_748087
522576	contig_15063_pilon	+	1010	5	Intergenic	novelGene_9821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	468	947	35271	36740	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLPLCVCPCVHSN	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34804_35037_35380_35839_36175_36704
522577	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_11183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	232	1359	34808	38994	TRUE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27137	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
522578	contig_6576_pilon	-	2361	14	Intergenic	novelGene_42222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.0822503639482	44	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	36	1304	261331	229096	TRUE	5	CGCGTCCTTTCTTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGRGRCESGKMAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261366	227421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228479_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
522579	contig_7457_pilon	-	2390	4	Intergenic	novelGene_31601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	87.4236174548325	1579	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	118	987	962606	956817	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDDDWGPGGAERAGAAVVAK	962723	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956874_958234_958375_960225_960896_962603
522580	contig_9290_pilon	-	1955	12	Intergenic	novelGene_77553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.782436018821	52	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	80	1294	496936	480817	TRUE	55	TTATTTAAATAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKVVG	497015	478625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480131_480767_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
522581	contig_9177_pilon	-	2207	15	Intergenic	novelGene_32541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1013.91084621954	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1068	1826	3704	2152	TRUE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	7726	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1944_2003_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6531_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7587
522582	contig_233_pilon	+	2416	12	Intergenic	novelGene_14555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	339	695	78477	91497	TRUE	25	GCCGGGGAGAAGGCAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHSHLAYPSPG	78138	107473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79137_91467_91678_92144_92359_93764_94021_94731_94914_98310_98454_99780_99869_101673_101769_104151_104308_105460_105694_107299
522583	SIRV6	+	869	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	170	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	332	646	2021	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522584	contig_11816_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_98444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGATCATGCAATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340945	342861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_340900_342900
522585	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDPGDCLQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27171_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522586	contig_2890_pilon	-	2810	5	Intergenic	novelGene_60277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	227.181095164188	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	37	453	315795	307251	FALSE	10	TATCTCTGTGTGAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHEQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTFMCSVLKRQGYGEGFRWLSQYID	315831	304893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_307323_308624_308751_312123_312228_315241_315308_315746
522587	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522588	SIRV6	+	689	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	52	-163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGGTGACGTTTACGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
522590	contig_10940_pilon	+	2511	2	Intergenic	novelGene_49182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1946	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCTGTTGAAATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172920	176215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_173218_174001
522591	contig_5302_pilon	+	1881	10	Intergenic	novelGene_81474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	202.651741653166	849	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	177	1028	318287	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306683	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_308086_308198_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
522592	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	543	12	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522594	contig_16951_pilon	+	2724	6	Intergenic	novelGene_98645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	276.737131588806	305	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	74	532	85909	91405	TRUE	20	CAATTTGCTTTGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAEGLPCLPEHGARAGTWRSPERSVREGCLVAETQPPKRVGTVLPGKGLPRLSPRWPLELLSDLCFSALPSCLAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	85835	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91066_91463_103952_104099_106692_108229_110476_110582_111169
522595	contig_15063_pilon	-	1478	4	Intergenic	novelGene_14121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	15	GATTGGCTCTCTGAGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522597	contig_8133_pilon	-	3570	15	Intergenic	novelGene_98670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	85.0444061676496	877	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	19	1758	391898	334334	FALSE	30	CTTTTTTGTAGAAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAIAALAASYGSGSGSESDSDSEGGRCSLPAADSLMHLTKSPSAKPSLTVAVDSAPEVAVKEDLETGVHLDPAVKEVQYNPTYETMFAPEFGPENPFRTQQMAAPRNMLSGYAEPAHINDFMFEQQRRTFATYGYALDPSLDSHQVSTKYIGSVEEAEKNQGLTVFETGQKKTEKRKKFKENDASNIDGFLGPWAKYVDEKDVAKPSEEEQKELDEITAKRQKKGKQEDEKPGEEKTILHVKEMYDYQGRSYLHIPQDVGVNLRSTIPPEKCYLPKKQIHVWSGHTKGVSAVRLFPLSGHLLLSCSMDCKIKLWEVYEDRRCLRTFIGHSKAVRDICFNTAGTQFLSAAYDRYLKLWDTETGQCISRFTNRKVPYCVKFNPDEDKQNLFVAGMSDKKIVQWDIRSGEIVQEYDRHLGAVNTIVFVDENRRFVSTSDDKSLRVWEWDIPVDFKYIAEPSMHSMPAVTLSPNGKWLACQSMDNQILIFGAQNRFRLNKKKIFKGHMVAGYACQVDFSPDMSYVISGDGNGKLNIWDWKTTKLYSRFKAHDKVCIGAVWHPHETSKVITCGWDGLIKLWD	391916	332521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_334512_335516_335662_336855_336933_339730_339865_340103_340220_342113_342216_344308_344355_348353_348429_349241_349382_350680_350778_351893_352034_357702_357787_360618_360749_366687_366775_391709
522598	contig_13740_pilon	-	1681	12	Intergenic	novelGene_34627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4486.89599309952	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	70	975	165243	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165312	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_156375_156606_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
522599	contig_12919_pilon	+	4826	1	Intergenic	novelGene_75874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTGATTCCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625535	630361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_625500_630400
522600	SIRV6	+	638	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	9	59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTAATCGTTTACATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2747_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522601	contig_15063_pilon	+	1669	7	Intergenic	novelGene_12984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	223	1458	34808	39515	FALSE	25	TAGGCACTTGTGGCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28178	39726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522602	SIRV6	+	871	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATAGTAGATTGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	11074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
522604	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522606	contig_15063_pilon	+	1484	5	Intergenic	novelGene_11233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
522607	contig_19342_pilon	+	1420	6	Intergenic	novelGene_41097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.57681974534502	77	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	207	647	4349	6001	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGVPDPPPAALGGPCPDPDPGRLPLPEVFPHRRVPARPRGAPLHRRRKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSK	3259	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3699_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960
522608	contig_11285_pilon	+	1776	12	Intergenic	novelGene_5590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	532.512026015601	81	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	35	1147	766060	769479	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPALCAVRIASTAAQQGIPAM	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768727_769421_769653_769740
522609	contig_2236_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_98684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCTGAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52550	50317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_-_50300_52600
522610	contig_15087_pilon	-	1965	20	Intergenic	novelGene_37196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	1008.85110871565	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	84	665	158925	134865	TRUE	20	AATGAGTGACGTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQVSTEGNCAPGW	181123	110643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_145202_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
522611	contig_15063_pilon	+	1372	5	Intergenic	novelGene_14359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	236	1120	35271	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35035	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522612	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
522613	contig_9199_pilon	+	2551	8	Intergenic	novelGene_65615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	110.059724046278	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	61	804	42527	57407	FALSE	20	CACATCAGCTGGACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALAADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42466	59154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_54515_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304
522616	contig_5988_pilon	-	1557	4	Intergenic	novelGene_15943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	918.817113950806	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	487	1383	652858	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	785980	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653646_785823
522617	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	137	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522618	contig_3386_pilon	-	2197	6	Intergenic	novelGene_34512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_3	762.736022487466	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	114	488	409604	406808	TRUE	40	ATAATTGTGTAATATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412207	404018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405466_406382_406842_407702_407838_409398_409607_412096
522619	contig_16369_pilon	-	2951	2	Intergenic	novelGene_98690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	0	302	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	27	302	16597	13251	FALSE	40	TTTAGAAAATTAATACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTPPYQWMSLCSLTPPSTKSTTAWMTSLQVATVFWRDRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKQAFQDRYFMIGGMLLTCVVMVLVVHYLT	16623	10601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_13413_16483
522621	contig_15866_pilon	+	2042	14	Intergenic	novelGene_63624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_4	547.725139465377	1833	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	398	1372	601021	633133	FALSE	15	CTAAGTGTGGCTTGGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458792	633803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581475_581685_581705_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
522622	contig_5780_pilon	+	2355	2	Intergenic	novelGene_29790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	522	911	111869	112258	FALSE	40	GCAATAAAGCATTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	104878	113702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_104955_111423
522623	contig_20641_pilon	+	1665	7	Intergenic	novelGene_52855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	45	1376	14659	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14614	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
522624	contig_15063_pilon	-	1345	4	Intergenic	novelGene_14237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	789	1112	35891	35108	TRUE	10	GGTGTTGATAGCGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36160_36262
522626	contig_11370_pilon	+	807	3	Intergenic	novelGene_98726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	140	562	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145691	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
522627	contig_10311_pilon	-	2036	11	Intergenic	novelGene_50440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1054.11942397434	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	324	821	68953	67803	TRUE	20	AAAGTTGCTTTGGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALVRGVVT	71557	65127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65691_65767_65918_66642_66754_67180_67261_67491_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
522628	contig_14928_pilon	-	2605	8	Intergenic	novelGene_98791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	118.154516612436	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	14	1078	308373	278576	FALSE	25	CTTTTTTTTTTAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARPGRLFPWLPRQLPLAALLLLLGSGGRWGFCPRAWAQEAAGADGSPATDREEAQDPHAKHLYTADMFEHGIQSAAHFVMFFAPWCGHCQRLQPTWNDLGDKYNNMKDARVYVAKVDCTADSDVCSAQGVRGYPTLKFFKPGQEAVKYQGPRDFQALETWMLQTLNEEPATPEPEVELPRAPEPKQGLYELSANNFELHVAQGNHFIKFFAPWCGHCKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKGTVLALTESNFDNTVAEGITFIKFYAPWCGHCKNLAPTWEKLSKKEFPGLAAVKIAKVDCTAERNICSRYSVRGYPTLLLFRAGKKVSEYNGGRDLKSLYQFVLRQAKDEL	308386	277048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_278699_280380_280511_282073_282157_289948_290065_293589_293687_298585_298692_303504_303655_308113
522630	SIRV6	+	449	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10358	19	1121	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11358	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
522632	contig_9807_pilon	+	2314	13	Intergenic	novelGene_32863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	628.555282417987	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	923	1504	140826	158956	FALSE	15	CTTCGTTGTGGATCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	109024	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140302_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151753_158880
522635	contig_12620_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_98802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTTTGCCAGTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159037	159713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_159000_159700
522636	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522637	contig_12624_pilon	-	1109	6	Intergenic	novelGene_61062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1492.26142481805	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAACAAGGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875905	862035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_864537_864583_867656_867769_867898_867982_875662
522638	contig_13112_pilon	-	3835	17	Intergenic	novelGene_98846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_14	216.318260541615	433	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	226	1800	707186	661883	FALSE	30	GATAAGACTTTATTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPGVGEELKQAKEIEDAEKYSFLATVTKAPKKQIQFADDMQEFTKFPTKTGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAGVAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRVVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY	707411	659847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_661890_662445_662567_663701_663781_664261_664331_664724_664824_664906_665002_665369_665441_665787_665877_666683_666748_667003_667121_667931_668039_668618_668714_669900_670004_670453_670555_671813_671958_674199_674312_707084
522639	contig_15498_pilon	+	2239	8	Intergenic	novelGene_42637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.513489902466	13	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	42	1196	675068	686124	TRUE	25	TATCTGGCTTTAAGAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVRQALGRSQAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPERPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675026	687399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675095_679255_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_685866_686714_686945
522640	contig_10923_pilon	+	1723	11	Intergenic	novelGene_66191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	760.434803254033	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	709	1611	32909	42718	FALSE	25	GCAACACTTGTAGGTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13829	42830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30166_30256_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
522641	contig_12624_pilon	-	1671	3	Intergenic	novelGene_61114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTACTTTTCTAATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955907	947482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948820_952913_952985_955644
522642	contig_10058_pilon	+	2522	11	Intergenic	novelGene_67734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	162.829389239167	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	8	538	72602	98445	TRUE	35	ATAAACGTTTATTTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVMATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQEQPCLQQLFLYPESKYRRTDL	72594	101623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98140_98204_98262_98437_98541_98697_98810_99357_99407_99532_99637_99999
522643	contig_17274_pilon	+	2515	15	Intergenic	novelGene_26553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_14	217.527994914284	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	82	1065	181233	213531	TRUE	35	TGTAAGTAATAAACTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	179160	216879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_215439
522650	contig_1127_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_98857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTATATAGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40875	40394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_-_40400_40900
522651	SIRV6	+	429	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	728	8202	-427	589	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCGGTCTTGTGGTCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1858	3129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106
522653	contig_6102_pilon	-	2820	11	Intergenic	novelGene_32023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	85.7559910443579	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	43	1416	541217	514588	FALSE	25	TTCTTGAGCCTGCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETTHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNLYREGSSIGAIDTKLDWSHNFTNMLGYTDAQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQEVLVWLTQLQKEVGKDVSDEKLRDYIWNTLNSGRVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPNDPMFKLVAQLYKIVPNILLEQGKAKNPWPNVDAHSGVLLQFYGMTEMNYYTVLFGVSRALGVLAQLIWSRALGFPLERPKSMSTDGLIKSVDSKSG	541259	513183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514759_515065_515276_515614_515717_515835_515966_516535_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_541202
522654	SIRV6	+	1481	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	45	2	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522655	contig_3745_pilon	+	2585	5	Intergenic	novelGene_85062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	119.589663014827	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	23	556	361531	370795	FALSE	20	TATTTTCTCTTCTTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGYRMERPDNCSEEMYSLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	361508	372824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_361581_363125_363264_364271_364372_369179_369268_370637
522656	SIRV6	+	648	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-439	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	44	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	125	378	156	533	2002	10780	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVRIIDERVEVEVVQQES	1846	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10726_10819_11031
522659	contig_8658_pilon	-	1404	7	Intergenic	novelGene_55814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	329	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	66	1055	55624	6049	FALSE	25	AAGCAGTGTGATGTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55689	5699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
522661	contig_9436_pilon	-	2642	14	Intergenic	novelGene_60923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	108.52943864802	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	18	1739	458965	442131	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETLHFPSTLLWAFQTEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVWGSQDGEGTGDLDEFDF	458982	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442566_443944_444110_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
522662	contig_11285_pilon	-	2142	20	Intergenic	novelGene_5680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	493.147845766291	17	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	534	1952	790656	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796232	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_786082_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793835_795574_795621_795695_795746_796126
522663	SIRV6	+	927	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	180	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	146	637	1733	10736	TRUE	45	GAGCAATCAACTCACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1483	11336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522664	contig_11186_pilon	-	2738	8	Intergenic	novelGene_98875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	198.356615565944	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	159	659	285822	238580	TRUE	50	TAAAATAAGAAGTTAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKEGSGGFRKRKHDNFPHNQRREGKDVNSSSPVMLAFKSFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKENKTC	285980	234342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_237099_237265_238537_238586_239957_240086_266595_266727_280493_280609_285290_285396_285806
522665	contig_20641_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_52786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1063.95796700601	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	258	1286	38568	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KINRLSNEATGPERRRNREKKGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14059	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14126_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
522667	contig_5845_pilon	-	370	3	Intergenic	novelGene_98884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	13	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	165	204	368	34562	20809	FALSE	15	GTAACCAGCTTCCGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTYALDVVLKLVTPRLISLCVFIGKLYGDVSFIEERHRHRYEVNPNLINQFEHSDLHFVAQDVDGERMEMIELANHPYFVGVQFHPEFSSRPMKPSPPYLGLLLAATGNLNGYVQQGCKLSS	35275	20806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_-_20952_34540_34638_35147
522671	contig_12414_pilon	+	1588	3	Intergenic	novelGene_59543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	93	1031	370898	374023	FALSE	30	GATAAACTTAGTGTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPIERKASWTFFCFN	370805	374580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373894_373982
522673	contig_8156_pilon	-	2259	6	Intergenic	novelGene_98930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	37.6435917521163	4456	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	925	1833	441382	395622	FALSE	20	GTCCCTTCTTTAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWTTKAFLPRMLELQNGHIVCLNSVLALSAIPGAIDYCTSKASAFAFMESLTLGLLDCPGVSATTVLPFHTSTEMFQGMRVRFPNLFPPLKPETVARRTVEAVQLNQALLLLPWTMHALIILKSILPQAALEEIHRFSGTYTCMNTFKGRT	442306	395195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403531_403883_404004_404665_404810_441187
522674	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_8725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522675	contig_14450_pilon	+	2405	2	Intergenic	novelGene_48960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	474	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1694	2002	1038017	1038325	FALSE	30	ACCTATGATGCAAACGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKCLQKPKTKSQHLGSCDPPERNQSQSEESLKGKRNHIELNPTPYRKPSHFGHLDVTLIPSQRALRCEARGPQTQCIVIETSGFLHASRHYSVLSCPGVL	1036240	1038728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1037178_1037260
522676	contig_15063_pilon	+	1380	5	Intergenic	novelGene_12591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3175.15750593573	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	5	1378	28164	36634	FALSE	25	TGACACGGCCAACACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVM	28159	36636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
522677	contig_11422_pilon	-	1241	3	Intergenic	novelGene_99082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2220	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_888_991_2016_2145
522678	contig_3747_pilon	+	1986	2	Intergenic	novelGene_24878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAAATAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201081	205178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202530_204640
522680	contig_13216_pilon	+	1860	8	Intergenic	novelGene_47476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	825.965903333417	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	68	1495	229682	261012	TRUE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229614	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430_261193_261367
522681	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522682	contig_15063_pilon	+	1926	7	Intergenic	novelGene_13037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	5	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	436	1671	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30081	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522683	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522684	contig_15087_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_37288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301788	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_301800_303700
522685	SIRV6	+	653	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740
522686	contig_12622_pilon	-	1605	10	Intergenic	novelGene_5959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2307.27886866278	53	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	64	1410	1590968	1583745	FALSE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591031	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586630_1588947_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
522688	contig_12414_pilon	+	1553	3	Intergenic	novelGene_59563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	90	854	370898	373887	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISWKSSSKAVNLRTLCTSGFPSPRPSPFSTVA	370808	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373664_373790
522691	contig_11285_pilon	-	3265	28	Intergenic	novelGene_5737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_19	136.080112368293	375	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	1470	2948	1199468	1192895	FALSE	5	GACCTCTGCCTGGCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM	1230706	1192577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
522692	contig_10734_pilon	+	2399	10	Intergenic	novelGene_51177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	412.70824896703	440	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	394	1386	1129441	1141057	TRUE	30	CTGGTGTTAATGTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGVSSFIYSFNSTKENHARSKSSFSLAANQKVDSSNPPAAPWKPYGAVLLCPIESL	1123672	1143377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1141417_1142723
522693	contig_14643_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_99127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGTAAACAACCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46815	45974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_46000_46800
522695	contig_19721_pilon	-	2478	2	Intergenic	novelGene_99154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	493	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	221	2233	148734	146722	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRKLISATDTQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHRNILSASSTYFHQLFAVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDELIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGSTQDGNAETLPPGSNDKSLEIQKSKDEAQDNGTTIMPIITESFSLSAEDYETKKIIVTDSDDDDDDDVIFCSEILPAKETLPNNNAQVHANPGSVAISDVAPCASNNSSPLTNTTPTQKLPTSMSQVTLSQTQGSEKVLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLTTPPNVSSSLPNHMAPSINILVQNQQPPNSAVLTGNEANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAVSNTSLVPQADVPQNTTFDGSLIQKMPIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTNDPGVGSKHLTEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKDDPDEGEARLENDVPKTSGSEMTNKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCKRSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRYQCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYSYLSDRSSTMPVMKDDGIGYKVDAGKEPPVGTTSTQNKPMTWDDIFNQQENDSIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY	152160	146476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_148737_151942
522696	contig_8357_pilon	-	2786	3	Intergenic	novelGene_39709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	29.5	408	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	110	334	478808	476036	FALSE	10	TATTTGTCCATTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPGSGSVKPEPASPAFASWLPLLTPEPLTGLGPAAMTNVYSLDGILVFGLLFVCTCAYFKKVPRLKSWLLSEKKGVWGVFYKAAVIGTRLHVAVAVACVVMAFYVLFIK	478917	473583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_476119_476731_476864_478798
522697	contig_17796_pilon	+	2172	10	Intergenic	novelGene_33793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	388.87752364345	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	152	1168	53527	110323	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAGTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53375	111373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_99617_99648_110237_110706_110751
522698	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_8892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	25	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	25	GTGAGAAGTTGTATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522699	contig_12644_pilon	+	2283	8	Intergenic	novelGene_44662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4177.26967757454	8	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1517	2203	2679113	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675483	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
522700	contig_12125_pilon	+	2666	13	Intergenic	novelGene_76197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	130.371557693983	652	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	586	1542	67320	82984	FALSE	35	CTAAATTTGTGATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56181	84108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_65031_65127_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
522701	contig_8317_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_19892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAACAAAGTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16407	16775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
522702	contig_2403_pilon	+	1643	6	Intergenic	novelGene_71014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	523	junction_1	69.5079851527866	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	102	761	151026	169508	FALSE	20	TTTTTTTTTCTATGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLFDLQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGIRETGWKPSGREKSKEPKDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLIDK	150924	170390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_151191_161000_161116_163533_163571_163812_163877_163974_164060_169314
522703	contig_9807_pilon	+	953	7	Intergenic	novelGene_32854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	763.946860426532	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	115	678	109130	158783	TRUE	5	CTCCAGGTCGTCGGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINIPDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109015	159439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128611_158670_158862_159242
522706	contig_9423_pilon	-	3213	10	Intergenic	novelGene_99169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_9	172.059493012744	73	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	607	2187	61283	33642	FALSE	35	AGTGAACAAATGGACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKKYGQLEEYLSLADYFQDEKFD	74876	32615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_33708_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_62246_62375_73820_73917_74502
522707	contig_7051_pilon	+	2352	6	Intergenic	novelGene_64332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_4	369.972215172978	472	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	1879	2352	335902	338759	FALSE	55	GAAAGAATGGAACAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEK	321842	338759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_336118_337641_337814_338673
522708	contig_3818_pilon	+	2882	8	Intergenic	novelGene_99259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	117.556065651367	784	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	10	897	497371	528488	FALSE	35	GATACAAAAGAGTGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLMAALAGVFVWDEERIQEEELQRSIDEMKRLEEMSGVFQSSGVEHHSPEPKSQTEGNEESGDRAQPWEMVMDKKHFKLWRRPITGTPLYQYRVFGTYTDVTPRQFFNVQLDTEYRKKWDALVIKLEVIERDVVSGSEVLHWVTHFPYPMYSRDYVYVRRYSVDQENNVMVLVSRAVEHPSVPESPEFVRVRSYESQMVIRPHKSFDENGFDYLLTYSDNPQTVFPRYCVSWMMSSGMPDFLEKLHMATLKAKNMEIKVKDYISAKPLDMGSEAKATTQSSERKNEGSRGPAQIEYA	497361	530473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_497436_516071_516281_516627_516678_519656_519768_519846_519930_520393_520494_527216_527302_528303
522709	contig_5698_pilon	+	1896	8	Intergenic	novelGene_55021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19434_19762
522710	contig_15063_pilon	+	1684	6	Intergenic	novelGene_14056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	194	1429	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522711	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522712	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	55	TAGAAATAAAAATATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28155	36778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522714	contig_1450_pilon	+	2211	3	Intergenic	novelGene_27435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	34	1050	419840	423253	TRUE	30	AACCATGATGGTGAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419806	425088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423375_424048
522715	contig_5350_pilon	+	3230	9	Intergenic	novelGene_99344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.8586385440963	126	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	314	946	178819	223532	FALSE	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIALGYQISKLCNSERSAWLHDARDAEQLSKNKVTHILSVHDSARPMLEGVKYLCIPAADSPSQNLTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILGKYKEQGHVEAQPGTRRWSGFSNLAPLSCSDYTTET	142210	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177874_178497_178575_178742_178889_184664_184748_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349
522716	contig_14513_pilon	-	1248	4	Intergenic	novelGene_70332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	139	555	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19018	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
522717	contig_5018_pilon	-	1739	9	Intergenic	novelGene_47042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	292	1179	1401907	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402720	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
522718	contig_8210_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_30211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTACATTTGTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13784	12601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_12600_13800
522719	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_8512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	243	1478	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26344	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26397_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522721	contig_9345_pilon	-	3898	13	Intergenic	novelGene_24412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_7	52.2772390455179	11	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	735	1856	208770	196247	FALSE	35	CACAAGAGTTTAAGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNLVPPEEGPPGAWAAGQYGPQWGGELCGARSRALNISVIPSLLPISLPLGGQTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLGSPDYVNRDSDEATEDFLRRIECYENSYESLDEELDRDLSYIKIMDVGLSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221115	194204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205_205414_207634_207757_208548_209100_211740_211808_214946_215044_215211_215329_220991
522722	contig_16650_pilon	+	2102	4	Intergenic	novelGene_61974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	5752	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	79	456	244670	254361	FALSE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244591	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
522723	contig_9833_pilon	+	1980	13	Intergenic	novelGene_68541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_6	410.477660442346	1681	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	18	1208	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230805	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
522724	SIRV6	+	1520	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114860	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522725	contig_15063_pilon	+	1517	5	Intergenic	novelGene_8714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	246	758	34808	35888	TRUE	40	GAAGTTGTATGTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27123	36756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
522726	contig_19579_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_59374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	106	945	13090	7943	FALSE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
522727	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522728	contig_17993_pilon	+	4398	22	Intergenic	novelGene_61926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_15	93.0839233167863	286	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1189	3570	142	3711	67188	113878	FALSE	15	TTTTCTTGCCTTGAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRKKSVKTCLINSEIPEETIPDETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVVDLCAGRWWEYMPSGFTDSSFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSHLELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTKPQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLHTIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANADLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDSFGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDNDNNAQNNNANIHDNNHHHPDESDEENDFRQDLQQGEQQFAADALNEMEDMVQEDGEMVAESGNETPAHSQAVIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTPITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGARRYSEREEKIGESAQSRELSVSGKGKTPLRKRYNSHQMGQSKQFPLEESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDIPEKKKNKDVYPSCSSTTATTVGNSSSHSTASQSPDFVRTVNSGGSSEPSPTEVDVSRQCVCSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCHRPQESQRRTSRCSDEERPSTSRACVVNGPDGTRSAFSFRTLPHGGSSGPAHDERTNGNGSGATGEDRRGSSQPESCDVQSNEDYPRRPLTRARSRLSHVPLVSESEVAKTKPRHAMKRKRMADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLKVENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPPNVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSLRAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVEDDYI	55356	114565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_55437_67126_67316_68444_68579_72502_72667_72886_73053_76162_76301_77881_78020_79631_79726_80786_80918_85233_85405_86999_87143_88028_88243_94076_94197_95313_95494_96986_97722_102835_102937_103172_103276_106491_106659_108275_108422_109020_109125_109724_109839_113699
522729	contig_15185_pilon	-	1790	9	Intergenic	novelGene_99459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	389.825922688576	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	521	1345	444599	429911	FALSE	10	CTCTCTGAGCCCATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472449	429465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_451259_451520_472290
522730	contig_11752_pilon	+	1507	9	Intergenic	novelGene_37580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1547.39191363242	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	110	787	84194	92979	TRUE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDDFLKASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYLAWYHGLYSPFGRLQLQFTVCLQLL	84084	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87422_88653_88909_92903_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
522731	contig_5918_pilon	+	2773	2	Intergenic	novelGene_99487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	720	junction_1	0	63	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	187092	187445	TRUE	10	TGTTCTAGTCTCTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYGGFGALLVQWLKARLLVKRLAVRIHQPLLGNPIAGSSTLSCRDARSWNLTQWPQICFCILRGYRSPGGAVVKSSAAKRKVGSSNPPAALQEKAVAVCFSKIYSLVSAAGPLSSVL	187089	190540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_188308_188985
522732	SIRV6	+	371	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-38	152	12	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGCTAGTCCAATCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	1968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
522733	contig_5189_pilon	-	1614	5	Intergenic	novelGene_34828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1132.25358798283	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	111	473	244235	199237	FALSE	10	TCTAATGTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_235736_235848_244163_244289_247694
522734	SIRV6	+	383	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	12	32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTATCGTGCCGCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	1982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
522735	SIRV6	+	399	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10408	19	1171	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11408	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
522736	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522737	contig_14287_pilon	-	2117	4	Intergenic	novelGene_24044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.790698163809	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	240	1052	22710	21898	TRUE	10	GCTCTTGCTGTGTTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33925	20580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_21461_21712_22754_25823_25875_33780
522738	contig_7695_pilon	-	2697	19	Intergenic	novelGene_41598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_17	31.4576434802948	84	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	395	2302	522053	504301	FALSE	10	CATCTTTGCCATGTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525573	503905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524349_525015_525168_525549
522740	contig_15063_pilon	-	1557	5	Intergenic	novelGene_12664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	TRUE	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522741	contig_5643_pilon	+	1358	11	Intergenic	novelGene_38827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2017.95636474132	4829	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	201	1148	236124	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVERQNLAEGQPPDAFTCSPQVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
522742	contig_233_pilon	-	2762	16	Intergenic	novelGene_14565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1488.70651685728	1	121	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	87	2261	126907	78640	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_93990_94789_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
522743	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522744	contig_12425_pilon	-	1996	10	Intergenic	novelGene_46678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	732.672597960692	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	181	1050	210361	204225	FALSE	20	TTGAAATTTGCTTTCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRQRHREPHEARLSTFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226595	203278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211159_226552
522745	contig_5643_pilon	+	1489	10	Intergenic	novelGene_38819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2111.28702775825	64	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	794	1279	236928	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233609	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236510_236639_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
522747	contig_7457_pilon	+	2201	12	Intergenic	novelGene_31335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	270.474422493404	1692	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	230	1576	281205	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280842	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281070_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
522748	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522749	contig_13592_pilon	+	2720	15	Intergenic	novelGene_33712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	511	2439	256608	269322	FALSE	30	ATCATTTCAAGAAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249307	269603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
522750	contig_14684_pilon	+	2972	1	Intergenic	novelGene_99679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCACAGTCAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375810	378782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_375800_378800
522752	contig_11338_pilon	+	1792	11	Intergenic	novelGene_6154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	58	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	447	1574	6086	13398	FALSE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENECSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	744	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9998_13275
522753	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522754	SIRV6	+	1393	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	430	-13	214	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	110	601	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1517	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522755	contig_7744_pilon	+	2169	18	Intergenic	novelGene_62550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	176.090138918173	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	925	1728	887347	890785	FALSE	10	AAGCGTCGTGTGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879805	891226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
522756	contig_15063_pilon	+	1700	7	Intergenic	novelGene_11976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	3	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	223	1332	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTRGK	27146	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36584_38975_39092_39506
522757	contig_4315_pilon	-	2172	9	Intergenic	novelGene_46790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	285.546406035867	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	59	1099	343489	328146	FALSE	25	CAAAACATCCTGTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRQQRAPSFHLERALTAEMAVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHKPPPSQLRRTGTPSS	343547	327072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328194_333555_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341095_343485
522758	contig_4301_pilon	-	2030	5	Intergenic	novelGene_65118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	371.669544084527	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACGCTATTGTTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575648	538019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_551248_551329_575543
522759	contig_12938_pilon	+	1496	9	Intergenic	novelGene_99702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	805.208474557987	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	118	765	78117	85540	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51945	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468_85940_85989
522760	contig_14925_pilon	-	1678	5	Intergenic	novelGene_55281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_4	793.415520077595	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLIFGTGTQIIVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121489	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
522761	contig_13787_pilon	-	2080	6	Intergenic	novelGene_40620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	850.085266311562	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	276	773	205032	159290	FALSE	15	TTCTTATACATGTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205307	157982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
522762	contig_12638_pilon	+	2837	18	Intergenic	novelGene_33092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_10	485.75063020081	2	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	853	1956	182987	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170775	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
522763	contig_11285_pilon	+	1640	11	Intergenic	novelGene_5599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	548.075368904679	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	157	819	767140	769185	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGERDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPRRWLH	763524	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763536_766567_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768749_769167_769320_769421_769653_769740
522764	contig_1516_pilon	+	2020	10	Intergenic	novelGene_49975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1277.87314619949	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	88	1122	347241	356416	TRUE	25	ACAGCTGAAGCACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQAYAGEHDQEASPHPG	335194	363721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356178_356372_356526_359957_360066_363040
522765	contig_15219_pilon	+	3136	4	Intergenic	novelGene_40832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	237.217668444453	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	21	323	19617	22915	TRUE	90	AAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTVTKMNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGEC	19596	25928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_23491_23690
522766	contig_14215_pilon	+	1996	18	Intergenic	novelGene_59347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	109.649709637233	110	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	721	1836	35427	47528	FALSE	20	TAAGCGGTATGTTCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIAEDLGGPYVWGQYDLLVLPPSFPFGGMENPCLTFVTPTLLAGDKSLSNVIAHEISHSWTGNLVTNKTWDHFWLNEGHTVYLERHICGRLFGEKFRHFHALGGWRELQNTIKTFGETGPFTKLVIDLKDVDPDVAYSSVPYEKGFALLFYLEQLLGGPEVFLGFLKAYVKKFSYKSITTDDWKDFLYSHFKDKVDILNQVDWNAWLYSPGLPPVKPNYDMTLTNACIALSQRWIDAKEDDLNSFSAGDLKDLSSHQLNEFLAQMIQKAPLPLGHVKRMQEVYNLNAINNSEIRFRWLRLCIQSKWEDAIPLALKMATEQGRMKFTRPLFKDLAAFDKSHDLAIRAYQQHKASMHPVTAMLVGKDLKVD	5199	47688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_5412_22406_22538_26111_26233_28774_28844_30734_30840_35081_35155_35417_35559_36841_36866_37352_37424_38424_38537_39140_39286_40288_40393_40796_40868_41400_41456_43126_43223_45741_45825_46478_46584_47410
522770	contig_15063_pilon	+	1478	4	Intergenic	novelGene_14146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	13	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	164	1336	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34644	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522771	contig_5967_pilon	-	2213	10	Intergenic	novelGene_44366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	548.185086343006	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	554	1198	423985	388566	FALSE	25	CAAATGTTTTACTGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHMKKEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412582_423963_424055_430708_430782_465401_465508_482468_482550_488455_488583_517515
522774	contig_15063_pilon	+	1324	7	Intergenic	novelGene_10522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	191	1075	35271	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34755_35261_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522781	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522782	contig_15063_pilon	+	1411	4	Intergenic	novelGene_14200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_1	3780.69308754654	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	111	1271	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34697	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35049_35380_35839_36158_36266
522783	contig_15063_pilon	+	1949	8	Intergenic	novelGene_8448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3722.07511246847	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	554	1696	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26042	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36431_36523_36600_38975_39092_39506
522785	contig_15063_pilon	+	1591	6	Intergenic	novelGene_14210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	101	1336	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34707	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522786	contig_15063_pilon	+	1471	6	Intergenic	novelGene_14304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	117	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	332	1216	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34827	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522787	contig_12079_pilon	-	2796	5	Intergenic	novelGene_67540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	415.315843665998	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	883	2040	862522	861365	FALSE	45	TTTGAAAGTACAAACGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	868553	860608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246
522788	contig_6735_pilon	-	1660	13	Intergenic	novelGene_15676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1008.94616019224	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	168	1454	554315	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568248	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542337_542794_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564217_568198
522789	contig_8377_pilon	+	1566	2	Intergenic	novelGene_35152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8924	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	116	406	196203	197939	FALSE	35	TCATTTTATTTAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	196087	199099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_196218_197663
522790	contig_17144_pilon	-	1953	11	Intergenic	novelGene_29429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2158.0621422934	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	945	1664	167982	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183313	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169058_174933_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
522791	contig_3745_pilon	+	3791	2	Intergenic	novelGene_85071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_1	0	146	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAATTTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364170	372769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179
522793	contig_15047_pilon	+	1483	6	Intergenic	novelGene_52234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	4	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	349	624	3242	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETRGGGADRGAGLTAGAGLTAGAGLTAGAGLTAGAGPGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2551	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2773_3114_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
522794	contig_13366_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_99788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTATTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138551	135676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_135700_138600
522795	SIRV6	+	603	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-301	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	18	350	2002	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1984	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
522796	contig_11171_pilon	-	2025	2	Intergenic	novelGene_48581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	480	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1134	1550	106730	106314	TRUE	25	CATCATCATCTTCATCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNGKHLKSPASEELTQLASEPNPGCDECHARLGQVTMQPLPAVTPRRLRQLGQGIWYNPRKKGNMNFDNVLWVARNGKSLPSQELGCTLIAVQQFTCPCHVALSGTPRLELITVREQGPVTRSPPRLTVELFRIPL	107863	88391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_88464_105910
522797	contig_20693_pilon	+	2008	11	Intergenic	novelGene_60250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	616.62180467447	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	5	1111	14718	34261	FALSE	15	TTGAGGATTTTCTGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14713	35158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19429_25859_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
522799	SIRV6	+	550	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	23	8566	16	225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACGTATCGTTAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522801	contig_500_pilon	+	1547	12	Intergenic	novelGene_30987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1013.21095842919	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	235	1212	1492663	1498065	TRUE	20	ATTTGTAGAGCATGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485716	1500109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277_1499359_1499958
522802	contig_7179_pilon	-	2883	10	Intergenic	novelGene_78164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	136.045743940942	36	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	746	1498	1061981	1058685	FALSE	10	GCCCCCTGAGTGTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKWLGESEKLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTEFLVQMQGVGNNNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMVSDQWGERTAQSPENWGLDPRIKINFSPFLSWAAMALQNRDFL	1071737	1057299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058958_1060225_1060446_1060733_1060816_1061212_1061362_1061952_1062110_1062591_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
522803	contig_8820_pilon	-	2900	11	Intergenic	novelGene_79286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1119.69511921773	390	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	56	1429	170762	168126	TRUE	20	TGGTGTGTGAAAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRPGAAALRSVCRLFAKMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEHLEYMKILKIGRSFQSC	171328	165778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168314_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170763_171273
522804	contig_7898_pilon	-	733	5	Intergenic	novelGene_47540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_4	2235.06588269787	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	70	375	285587	284346	TRUE	20	GATCATCCAGCAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKSVNPWSCAILPSQCPSRFSQGRMC	286095	283767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284106_284229_284598_285533_285636_286074
522807	contig_18145_pilon	+	3612	11	Intergenic	novelGene_37309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_1	24.5283509433472	309	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1090	3273	75	3347	66694	73109	FALSE	25	AATATGTGTGTCTGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKVSVLLFLAWVCFLFYAGISLFTSGFLLTRLELTNHSSCQEPPGPEPLPLGHRGEPGACWMASRFSRVVLVLIDALRFDFAQPQSSHMPGEPSASLPFLGKLSSLQRILEIQPHRGRLYRSQVDPPTTTMQRLKALTTGSLPTFIDAGSNFASHAIVEDNLIKQLTGAGRRVVFMGDDTWKDLFPGAFSQAFFFPSFNVRDLHTVDNGILEHLYPTMDSGEWDVLIAHFLGVDHCGHKHGPHHPEMAKKLSQMDQVIQGLVERLENDTLLVVAGDHGMTMNGDHGGDSELEVSAALFLYSPTALFPSVPPEEPEVVPQVSLVPTLALLLGLPIPFGNIGEVMTELFSGNKDSQPHTSAMAQASALHLNAQQVSRFLHTYSAATQDLQVKELQRLQSLFSKASADYQRLLQSPQGAEAALQAVIAELQQFLRGARAMCIESWAQFSLVRMAGGATLLAAACFFCLLASQWATSQGFPFHSHRLSVAWGLAGTIIYAGLLATAGLKLDPVVLGAVAAVGSLLPFLWKAWAGWGARRPLAALLPIPGPVLLLLLIRWAAFFSDSFVIAEARATPFLLGSLILLLVAQLHWEGQLLPPKLLAIPRLGPSTPAVPPRHNGMHALGLGVGLLLCTRLAGLFHRCPEETPACRSSPWLSPLATMVGGRAKNLWYGACVGALVALLASVRLWLRRYGNLKSPEPPVLFVRWGLPLMALGIAAYWALASGADEAPPRLRALVAGASVVLPRAVAGLAASGLMLLLWRPVTVLVKAGMGAPRTRTVLTPFLGPPTSQADLDYVAPQIYRHMQEVFRGQLERNNSQGPLTVAAYQLGSVYSAAMVTALTLLAFPLLLLHAERVSLVFLLLFLQSFLLLHLLAAGIPITTPGPFTVPWQAVSAWALMATQTFYSTGHQPVFPAIHWHAAFIGFPEGHGSSIWLPAFLVGANTFASHLLFAVGCPLLLLWPFLCESHGPQKRRQTPRNEAETRVRPEEEEEEEPLMEMRLRNAPHHFSAALLQLGLKYLFVLGVQILACALAAFILRRHLMVWKVFAPKFIFEAVGFIVSSVGLLLGIALVMRVDGAVSSWFKQLVLAQQR	65869	73374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_65914_66663_67205_67820_67965_68158_68283_68601_68762_68949_69130_69376_70902_71494_71702_71918_72140_72755_72827_72979
522808	contig_15063_pilon	+	1918	7	Intergenic	novelGene_13044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3666.41777943176	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	425	1663	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30092	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522809	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522810	contig_15304_pilon	-	1064	3	Intergenic	novelGene_30471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	197	1021	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54296	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
522812	contig_5643_pilon	+	2105	8	Intergenic	novelGene_38861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_2	1816.38392732059	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1468	1893	237186	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	235376	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236300_236418_236510_236639_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
522813	contig_5649_pilon	-	1634	8	Intergenic	novelGene_82269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCCTGGGTGGAAGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35847	12840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_12865_21098_21259_23144_23281_25343_25400_25890_26060_26789_26893_28297_28363_34926
522814	contig_6270_pilon	+	1526	10	Intergenic	novelGene_99799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	366.781732786916	949	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	81	1070	27433	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27352	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
522815	contig_18145_pilon	+	2748	17	Intergenic	novelGene_37327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	478.763886874313	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	967	2565	95966	100744	FALSE	40	GAGCGGCAGAAAGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86654	100927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93408_94924_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
522817	SIRV6	+	765	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	162	98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	42	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGGTATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
522818	contig_10299_pilon	+	2432	19	Intergenic	novelGene_79682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	81.706792863262	11	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	1011	2270	337016	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320488	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335222_336796_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
522819	contig_10246_pilon	+	2294	5	Intergenic	novelGene_46890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	254.645341602787	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	221	640	175160	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140687	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140803_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
522820	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	26	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	8	1480	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522821	scaffold_19766_pilon	+	2379	14	Intergenic	novelGene_34439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	137.919451666286	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	263	2101	845891	851417	FALSE	25	CACCTACTCTACATGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	845110	851695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
522822	contig_7816_pilon	+	2012	14	Intergenic	novelGene_66486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1006.13863197154	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	947	1912	195914	211658	FALSE	45	AGAAAAATGAATTGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170076	211758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194974_195811_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
522824	contig_12425_pilon	-	1945	9	Intergenic	novelGene_46668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	642.343645858663	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	28	993	210925	204225	FALSE	10	TTTGCTTTCTGGTAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTFLLDIWKMALIQSHGGSGPCPPPLLSPQLCAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	210952	203272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_210856
522827	contig_252_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_99922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218269	218781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_218300_218800
522828	SIRV6	+	1069	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	19	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	196	687	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1149	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
522830	contig_5918_pilon	-	2686	10	Intergenic	novelGene_99476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1496	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGAGGAAGCGCGCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190540	153985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_154145_158565_158668_158901_159013_160170_160267_161124_161246_166005_166190_182922_183061_184112_184262_188236_188306_188983
522831	contig_9345_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_24658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	289	714	949473	949048	NA	20	TTCTAAACTTCCTGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWGRALSSCSILKPWAPRVEVPGTHQKPSQARLFQRKAQTSLFSSSLIDWGLHRVSLKPLSLVRCGASCGVMLCPQRLPASEGAITAIVSVPEAGTSGFFSSSVITLVDVRPKITLLATEGSGNLEGREYSHGQRSLMPL	949761	946889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_946900_949800
522832	contig_16098_pilon	-	2851	7	Intergenic	novelGene_46123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1687.5860471889	6	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1453	2202	458816	456972	TRUE	5	GGGAGTCTGTTGTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCLPAWAVWWAGDPGSHPCTPPHPTLVLPCSRCWLPSTRL	460268	456066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704
522834	contig_15087_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_37291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAATCCTCCTTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301886	303734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_301900_303700
522835	contig_1443_pilon	+	2241	11	Intergenic	novelGene_28288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGAGTCTCCTCTGCCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747981	809532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748993_749234_749349_750369_750530_766776_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805471_805553_805720_808696_808744_809402
522836	contig_14638_pilon	-	2126	3	Intergenic	novelGene_71555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	66.5	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	86	373	262373	254501	FALSE	10	GTGGTGTGTTCTTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	262458	252747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339
522837	contig_3975_pilon	-	2012	14	Intergenic	novelGene_54829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.477106319855	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	98	1663	2066301	2056722	FALSE	10	TGTACATCTCTCTGCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTAASLSLTWGDTVLVLYPCGLCT	2079238	2056372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056789_2056867_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
522838	contig_5092_pilon	-	2427	7	Intergenic	novelGene_62274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_5	557.28678035241	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAATGATTGTTGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254047	232281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_251143_252780_253961
522839	contig_14928_pilon	-	3911	5	Intergenic	novelGene_98788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_2	57.2860148727418	9	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTAGTCTCTCCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289310	277033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_278699_280380_280511_282073_282157_286607_286752_287421
522840	contig_5033_pilon	-	1773	15	Intergenic	novelGene_29000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	77	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531123_532093_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
522841	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_11269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522842	contig_5020_pilon	+	1568	8	Intergenic	novelGene_27852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	930.938959835056	631	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	362	1036	122915	124987	TRUE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDAPISPLPLGQASVPLSSPPLST	118463	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124523_124922_125091_125657
522843	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36161_36266_36600_38975_39092_39506
522844	contig_3077_pilon	+	1750	11	Intergenic	novelGene_26601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	3234.84800415723	4	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	147	1298	9676	17590	TRUE	15	AGTGTGCGGCACTTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17634_17675
522845	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522846	contig_15063_pilon	-	1544	5	Intergenic	novelGene_11545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36800	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264
522847	contig_10011_pilon	+	2767	9	Intergenic	novelGene_68090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	92.6943060549029	36	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	62	1495	322928	330980	TRUE	20	GTGGCTGGGCTTCATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQPRVPGHCSS	322866	334182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328494_330950_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994_333045_333190
522849	SIRV6	+	516	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8568	164	223	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGACGTATCGTTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
522850	SIRV6	+	1212	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	780	34	-418	-33	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	135	467	2002	10736	TRUE	30	AGCAGCAGTTTAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1867	11791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522851	contig_7119_pilon	+	1737	4	Intergenic	novelGene_40892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	26.3986531642978	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	172	1257	138713	139798	TRUE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127435	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_139893_139961_140170_140769
522852	contig_8291_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_99941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGGAGACTGTTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32050	33796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_32000_33800
522853	contig_2204_pilon	+	1785	6	Intergenic	novelGene_71659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_4	171.316082140586	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	30	800	13204	50221	FALSE	35	TTAAATTTTTAAAGGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_48669_48717_49912
522856	contig_3077_pilon	+	1679	9	Intergenic	novelGene_26602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_8	3201.29629017684	203	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	147	1181	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
522858	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_12589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3631.70633296373	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	6	1358	28164	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	28158	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
522859	contig_233_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_14681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAACCCCAACTCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96263	97856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_96300_97900
522860	contig_8138_pilon	+	1976	6	Intergenic	novelGene_52441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	198	680	280295	306552	TRUE	10	CTTCTTAGTAGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280097	307935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306854_306940
522861	contig_13044_pilon	-	3496	1	Intergenic	novelGene_100004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	461	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAAAAAAGATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240386	236890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_236900_240400
522863	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522864	contig_3077_pilon	+	1356	7	Intergenic	novelGene_26764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_5	2896.69378583393	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	176	859	13867	17590	FALSE	10	GTGCGGCACTTGCTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	12049	18087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
522865	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522866	contig_4732_pilon	+	2603	4	Intergenic	novelGene_75427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	424.811592225176	1734	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	372	689	626741	629177	FALSE	55	GAAAAGTAAGATGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCFLFITPLAAISGWLCLRGAQDHLRLHSRLEAVGLIALTIALFTIYVLWTLVSFRYHCQLYSEWRRTNQKVCLKLRDAEGFEGAQHSPLAAGLLKKVAEETPV	616845	631091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_616927_622451_622691_626689_626900_629018
522867	contig_5033_pilon	-	1836	15	Intergenic	novelGene_29001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	105	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531098_532005_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
522868	contig_12622_pilon	-	2185	12	Intergenic	novelGene_5921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1990.46746866199	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	587	1345	1588902	1586655	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590190	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589105_1589228_1589523_1589691_1590000
522869	contig_7457_pilon	-	1199	4	Intergenic	novelGene_31690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	46	387	1176842	1174926	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176887	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
522870	contig_15063_pilon	+	1436	6	Intergenic	novelGene_10472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3876.00885447905	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	234	1265	34808	36632	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
522871	scaffold_9100_pilon	+	1756	8	Intergenic	novelGene_83282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	508.582744657411	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	212	1210	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	646183	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_646371_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
522872	contig_2637_pilon	+	3185	6	Intergenic	novelGene_100020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	25.4275441205005	190	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	186	563	38745	46419	FALSE	25	TACTGCTTGCTTAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLFNLKFAARELNRNAKKCDKEEKAEKAKIKKAIQKGNTEVARIHAENAIRQKNQAINFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQVAVWILS	13292	49041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_13391_38657_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322
522873	contig_10311_pilon	-	1783	12	Intergenic	novelGene_50420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.978539629779	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	33	1256	71526	65773	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65243_65363_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
522874	contig_12427_pilon	+	3231	23	Intergenic	novelGene_40496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	169.60354841914	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	206	1993	399645	414241	TRUE	20	CCTCTGAAATTTGTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEHLGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNYRGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQVSRDS	397823	420252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_399599_399672_399853_399934_401068_401145_401423_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
522876	contig_16846_pilon	-	1233	4	Intergenic	novelGene_82963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	274	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	86	604	555239	551492	FALSE	5	ACTTCGGGTCTGTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
522877	contig_4845_pilon	+	2872	13	Intergenic	novelGene_53621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	328.216222769212	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	11	1330	205637	221846	TRUE	20	CCATCTGGCTGGAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	205626	223438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657_222116_222165
522878	SIRV2	-	814	3	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2667	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2065	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1662_1741_1837_1973
522880	SIRV6	+	630	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-430	140	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	147	479	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1855	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11039
522881	contig_15063_pilon	-	1735	7	Intergenic	novelGene_12671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	982	1305	35891	35108	TRUE	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34606_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
522883	SIRV6	+	1251	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	18	-441	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	572	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522884	contig_11572_pilon	+	862	7	Intergenic	novelGene_100057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	165.844974465781	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	261	701	265178	266522	TRUE	40	ACATGCTACAAGTAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPNSNFYVSRTAYRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHICQYYIYDLQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKVKNKAVKDAEKLPTFEVTK	256089	267101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_256152_257659_257837_265156_265322_265592_265721_266166_266308_266494_266591_267008
522885	contig_9345_pilon	-	2326	23	Intergenic	novelGene_24544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	173.633965952032	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	25	2226	730155	723552	FALSE	10	CCTGGAGTCTGTGTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDSLSLFTSLGLSEHKARETLKNTALSAQLREAATQAQRTLGSTIDKATGTLLYGLASRLKDPRRLPFLVGYIANKKIHTETQLSAALEYVRSHPLDPIDTMDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPLVFNRTVTLKEDPGKV	730179	723451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
522886	contig_16951_pilon	+	2358	5	Intergenic	novelGene_98639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	314.172723195379	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	85808	106694	TRUE	20	CAATTTGCTTTGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKRSLQTSTRVSVQGCSEGKEEICWFLPPETFLRCPQQKVFPASQSTEHVLGPGVHLRGACVRAAWWQRHSHPSLKPFSRWTGRQAAQEQEPLHLDSGGCGLVRERCRPSGFGASRGALQKA	85805	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_103952_104099_106692_108229_110476_110582_111169
522887	contig_7080_pilon	+	2362	10	Intergenic	novelGene_100090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	1045	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	120	932	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REDGGSRALLPCVAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460762	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_541100_541282
522888	contig_15063_pilon	+	1441	4	Intergenic	novelGene_14179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	131	1303	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34677	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522889	contig_15063_pilon	+	1832	7	Intergenic	novelGene_12086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	342	1577	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27429	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522891	contig_2078_pilon	-	3081	14	Intergenic	novelGene_100167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_7	58.4091870864051	502	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	81	2231	535379	505518	FALSE	70	CCCCACAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535459	504667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
522892	contig_6576_pilon	+	1891	9	Intergenic	novelGene_42271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1430	1795	330902	337942	FALSE	45	ATTACAATACCTGATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCLEAFLVLLGPVADLAVPLEGYNLAEVEQAVVEMKLMLQSHHHHIHQNHLVASFFDSLAFSVQEVVVFHPCLFLEYLPYHIFPILYLFSQVLHLVQHLLSLYVPNIKTTPPPLHAMNS	321954	338038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_322685_322833_323000_323861_324104_326530_326689_329123_329193_330837_330913_331027_331197_332093_332259_337921
522893	contig_15063_pilon	+	1637	6	Intergenic	novelGene_14162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	147	1385	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34661	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522894	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522896	contig_6227_pilon	-	1881	16	Intergenic	novelGene_49768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	314.993728332627	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	283	1593	1222052	1202920	FALSE	35	TGCCACAAAAGAGGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1223178	1202631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1222968
522897	contig_5018_pilon	-	2385	7	Intergenic	novelGene_47072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	463.649172926638	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	939	1826	1401907	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402845	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873
522898	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522900	contig_9471_pilon	+	1852	13	Intergenic	novelGene_21770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_4	680.098134258742	3151	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	174	1628	410634	417296	FALSE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSRRTYCPDWDEKDWDCGKWRSSSSYKRRKRSHSSARENKRCKYNHSKTSDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYNQGCEPGHRHRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHHRSHGKSHRRKRPRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406870	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
522901	SIRV6	+	601	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1445	424	16	70	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATTCGCATGGAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2532	11401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522904	contig_4782_pilon	+	189	1	Intergenic	novelGene_73675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAGAATTGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604274	604463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_604300_604500
522906	SIRV6	+	1003	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1423	44	-6	-43	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTACTAAGCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	11781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522907	SIRV6	+	370	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	163	2	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTATAGTTTACGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
522908	contig_6283_pilon	-	2695	14	Intergenic	novelGene_100219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	167.575294390136	3	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	89	1063	641399	615071	TRUE	40	TATAATAAATTTATTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEYLSLVARLIIHFRDIHNKKSQASVSDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQTS	643997	610883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615080_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_642229_642260_643944
522909	contig_6576_pilon	-	2004	10	Intergenic	novelGene_42263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_8	361.866696689319	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	80	1312	337927	322526	FALSE	20	GTTTTGGTATATCATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	338006	321833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921
522910	contig_16098_pilon	-	2566	12	Intergenic	novelGene_45763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_7	196.662314935278	440	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	296	997	36010	31519	TRUE	15	ACTGACTTGACTTGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36305	29790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907
522911	contig_10159_pilon	+	2798	11	Intergenic	novelGene_30900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGATCATGCGCGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002459	1056804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_1003148_1003186_1004188_1006171_1006304_1012819_1012872_1016484_1016574_1026963_1027073_1029101_1029301_1038413_1038532_1040922_1041033_1050918_1051088_1056673
522912	contig_8075_pilon	-	2205	6	Intergenic	novelGene_42486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	396	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCCGCCGGGCGCGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690849	663920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_664082_676724_676802_677759_677807_681282_681327_685239_685370_689103
522913	contig_9696_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_68823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGGGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438815	439079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_438800_439100
522914	contig_3817_pilon	+	2083	6	Intergenic	novelGene_78314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	660.608628463177	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	672	1064	199102	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178614	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_193112_193445_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
522915	contig_5023_pilon	-	1780	13	Intergenic	novelGene_7344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	68	418	647062	639176	TRUE	55	ATCTGCAAAAAAATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VESKVTGRQSGEGERGEACNRSMGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647129	609596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622624_625650_625856_629232_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
522916	contig_7707_pilon	-	3631	1	Intergenic	novelGene_72153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218332	214701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_214700_218300
522917	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522918	contig_9345_pilon	-	3604	15	Intergenic	novelGene_24415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_8	53.1716991625877	556	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	809	1564	205391	196247	FALSE	35	CACACAAGAGTTTAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGLSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221110	194206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205_205414_205734_205867_207634_207757_208548_208606_209024_209100_211740_211808_214946_215044_215211_215329_220991
522919	SIRV6	+	1042	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	480	6	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522920	SIRV6	+	479	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	398	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1848_2000_2450_2621_2740_2829_3106
522921	contig_5258_pilon	-	1566	13	Intergenic	novelGene_100228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	62.4892768578916	543	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	176	1564	227517	62405	FALSE	30	GTAATGTACGTTAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLRVFAYDHCFWSMDESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGLFARTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKNIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKSPELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVLLTPQKNT	248741	62402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_62534_70947_71083_75784_75896_97662_97876_112359_112472_113950_114064_116236_116372_117308_117397_120813_120995_122677_122771_124268_124330_227499_227605_248653
522922	contig_1867_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_54573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	193	300	449733	449626	NA	35	CTGTTACATTAAGTAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSHNTAGNCGKRLSSASANTLRNSVGTFKRHFCSPPSGIHCRNTKKENLTQKEQEANENKLGMLKSLKLCTGKQSKIDNFNLNIPELKETLILEHLP	449925	448580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448600_449900
522923	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522924	contig_15063_pilon	-	1512	5	Intergenic	novelGene_12046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	15	CCTGGCCCCAGTAGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
522925	contig_14513_pilon	-	1309	4	Intergenic	novelGene_70268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	FALSE	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
522926	contig_5928_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_40375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	569	1710	177	1886	243349	245058	NA	60	CTAAAAAGATAAAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRATKKKLSRDTEDLKGTISQPDLIDIYRTRHPKTAKYMFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKTFLESNENENTSYQKLWDTANAVHRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLEAHGLPKLQQSDVEKLNRHITREEIEKVIKKLPTKKSPGLDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQGGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTFNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKVSLFADNMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINFKNQLDSYTPVRRMMKRKSGKQYHFQ	243172	245061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_243200_245100
522928	contig_14970_pilon	+	2521	5	Intergenic	novelGene_44934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	10459	junction_2	3386.42579831598	245	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	359	871	177395	192239	FALSE	65	ATAGAAGAGAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATSKENEPLCFLQ	135981	193889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970
522930	contig_12624_pilon	-	1660	4	Intergenic	novelGene_61130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	838.628642487245	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	204	560	952979	948588	FALSE	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDCKENRLTQQELDICWAVGVAGTKTKTTKCHCCPVGSICVSQLCLRASFFISAKIKTTRVSFPLMKIGII	955842	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948798_950686_950768_952913_952985_955644
522931	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522932	contig_8386_pilon	+	4459	6	Intergenic	novelGene_82225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	101.489703911284	543	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	24	1541	51627	75773	FALSE	5	CTTCTTGTGTTTTACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAALGEDMGRTIAELVSSLLGLWLLLCSWGCPGSAEPRAPPDKIAIIGAGIGGTSAAYYLRQKFGNDVKIDMFERGEVGGRLATMTVEGQEYEAGGSVIHPLNLHMKRFVKDLGLSAVKVSGGLMGVYDGEKLVFEESPWFIVNMIKLVWYYGFQFLRMHMWVEDILDKFMRIYRYQSHDYAFSSVEKLLHALGGDDLLGMLNRTLLETLEKAGFSEKFLNEIVTPVMRVNYGQNMSIGSFVGAVSLAGAESGLWSVEGGNKLVCSGLLQASKGNLISGSVMYIEEKTRTKQTGNPTKMYEVVYQTGSETHSDFYDIVLVATPLNRKMSNITFLNFDPPIKEFHQYYQHIVTTLVKGQLNTTIFTSRALDKFDLTAVLTTDNPDLFINSIGIVSPVREKDNPEPSTDGTHVWKIFSQDTLTKEQILKLFLSYDYAVKNPWLAYPQYKPTEKCPSIILHDRLYYLNGMEYAASAMEMSAIAAHNAALLAYHRWNGHTDMIDQEGLYEKLKTEL	51603	78691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_51739_52837_53045_54095_54271_73109_73322_74343_74497_75114
522935	contig_12414_pilon	+	1541	3	Intergenic	novelGene_59559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	91	1005	370898	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVALDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370807	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373244_373387
522936	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522937	contig_11982_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_100258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	1144	1692	103330	102782	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNISKNGIPEYLILLMRNLYVDQEAVVRTEQGDTAWFKIRKGVHQGCILSPYLLSLHAEQIIREAGLYEKEFGIRIGGRLINNLRYADDRILFAESEDDLNHLLMRMKDYSFQYGLHLNIKNTKILAAEPISSIMINGEKIEFVRISFYLDPQSMPMEGAVKKSNNVLYWANMLQKTSLKC	104473	101681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_101700_104500
522938	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522939	contig_233_pilon	-	1744	11	Intergenic	novelGene_14561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1426.71780321127	85	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	81	1304	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126987	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79060_99798_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
522941	contig_9594_pilon	+	1911	10	Intergenic	novelGene_73945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_9	416.051575625243	2348	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	435	1478	310644	322451	FALSE	15	GATTTTTTTTCCTGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVVLKCQTTQVSPSLALLRDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301226	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
522942	contig_5967_pilon	-	2042	11	Intergenic	novelGene_44387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	509.584575904726	6	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	162	650	488569	424495	TRUE	0	GCTTTTTCCTTCCTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYSASLWKTGDKWCHFSDCYEVLFS	517663	388042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_389029_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_424460_424565_430698_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
522943	contig_16650_pilon	+	1945	5	Intergenic	novelGene_61963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.76438020109	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	85	462	244670	254361	TRUE	45	CACAATGAAAAACTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244585	255989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186_254624_254768
522944	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10358	56	1121	-54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11358	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
522945	SIRV6	+	862	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1431	177	2	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAGTGACTTGCGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2518	11648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522947	contig_13608_pilon	-	2487	17	Intergenic	novelGene_52370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	210.64588175419	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	260	1504	453349	383023	TRUE	35	AACAGCAAAATGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCRLGGSWRSR	470229	368772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383053_391811_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
522948	contig_15063_pilon	+	1664	7	Intergenic	novelGene_9252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	242	1477	34808	39515	FALSE	15	TATCCCAAGTGCTGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522949	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522952	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522953	contig_500_pilon	-	1838	11	Intergenic	novelGene_31040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3493	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1298	1756	1493641	1491969	TRUE	10	GAGCCAGGTCTGGGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGADSDLGAVLVPGVAADGLHQEAVVGHGAPPVPKRGSPSQLYPAEARASRPPLRTRKPLGFREGTAVCREGGKVTLVLSTPSLDSSLACCFPPGASVSLIKRLLPQDVSEAPGNNGWTCCPGAKVRRAGSGLGVGVSGKPLRWLRCRCS	1499583	1485761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485802_1491926_1492068_1492392_1492727_1493615_1493718_1494241_1494465_1495350_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498076_1498880_1498972_1499275
522954	contig_6102_pilon	+	2296	17	Intergenic	novelGene_31857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	506.313884858	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	58	1902	370803	394867	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQCFLLCLYLVLLSCQLPRAFCTCAWPLAALAVASAYAKYSF	370745	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378974_394746
522955	contig_15087_pilon	-	1927	20	Intergenic	novelGene_37180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1072.49121286006	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	96	1397	158925	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181135	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132677_143047_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
522956	contig_7707_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_72168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTCTTCTGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280032	281001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_280000_281000
522957	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27538	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522958	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_14104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522959	contig_16492_pilon	+	2404	10	Intergenic	novelGene_100271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_8	99.1819627169934	1013	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	103	1650	78509	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQEATNQLLDVNLFENQRFVKVTESGHRSESEHLEVTVGATVPTGFEQTAADEVREKLGSSCKISKDRGKIYFDISVESLAKVHCLRSVDNLFVVVQEFKDYQFKETKEEVLKDFEDLAGKLPWTDPLKVWKINTSFKKKKAKRKKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKSKCFTHWNLFYRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76789	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78764_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99946_100104_100258
522960	contig_15063_pilon	+	1647	6	Intergenic	novelGene_14152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	158	1393	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34650	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522961	contig_17274_pilon	-	2910	15	Intergenic	novelGene_26487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	701	1009	80996	80688	TRUE	5	CCATCTCCTGGGTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSLCMCCPGRQPERSLEARMVRLGLTYFGHVIRMDQSLEKDTFLVERQRKRGRPSTGWIDTVAATMGSSITTVMRMMQDWAVFHSVVHRITMSQNQLNGT	81696	31321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_31346_36252_36336_42654_42711_47231_47294_51701_51784_54320_54383_69749_69855_73732_73876_74917_74966_76378_76418_77044_77166_77891_78000_78278_78360_78575_78718_79942
522962	contig_19851_pilon	+	1044	6	Intergenic	novelGene_29837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	175	690	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
522964	contig_13894_pilon	+	1561	9	Intergenic	novelGene_62120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2084.87385709544	44	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	22	1005	520713	526612	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLVSNELSPPSL	520691	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526948_527459_527580_528072
522966	contig_233_pilon	-	1511	9	Intergenic	novelGene_14663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1350.81979159879	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	464	1345	93993	78579	FALSE	35	CTCGAAATGATAGATATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	101711	78412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99860_101673
522967	contig_14441_pilon	+	1609	4	Intergenic	novelGene_100527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	403.5693524318	6487	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	509	1423	111703	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111194	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117220_117344_117539
522969	contig_15063_pilon	+	1329	4	Intergenic	novelGene_14253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	18	1193	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34790	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
522970	contig_2689_pilon	-	2695	7	Intergenic	novelGene_100822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_3	233.059184185763	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	14	730	189399	153572	TRUE	30	CTTTATTCTTTTAGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTPAMLNPANVPTHLMVLCCVLRYMVQWPGMRILRRQELDAFLAQALSPKLYEPDQLQELKIENLDPRGIQLSALFMSGVDMALFANDACGQPIPWEHCCPWMYFDGKLFQSKLLKASREKTPLIDLCDGQAEQAAKVEKMRQSILEGLNFSRQNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	189412	142615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153581_153954_154098_157135_157320_158472_158683_164367_164483_189343
522972	contig_15720_pilon	-	1329	7	Intergenic	novelGene_41909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1205.18209781298	338	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	983	1288	279842	278542	FALSE	15	ACTTTTTGGAAGTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281935_282577_282750_283785
522973	contig_8616_pilon	+	1957	12	Intergenic	novelGene_72468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_8	545.030683797703	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	556	1884	320431	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318025	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
522974	contig_5020_pilon	+	1914	9	Intergenic	novelGene_27828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	871.911943661744	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	364	1344	122915	125970	FALSE	45	TTTATAAATGGAAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALLPPHPFPPPYSHPSSLPYLPLFSQSWWY	118461	126540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125733_125879
522975	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_11225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
522976	contig_9561_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_100862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAAAGCTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247829	248022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_247800_248000
522978	contig_9345_pilon	-	1806	4	Intergenic	novelGene_24342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	562.211308633645	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	262	807	142974	142100	FALSE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144500	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_144336
522979	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522980	contig_11285_pilon	+	1847	10	Intergenic	novelGene_5568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	545.292400890693	75	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	989	1528	767746	769878	FALSE	10	TGTCTCTTGACTTGGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763517	770197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768701_769740
522981	contig_20324_pilon	+	1114	6	Intergenic	novelGene_100867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.1073079651235	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	80	670	7068	9228	TRUE	30	GGTAGATGTGACTGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPQAIEFPGESPTRSPVVLLNRNIAPMASTMPLAMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQACISEVGKDGGSVCPVCRHKFLLRNIRPNRQLANMVNNLREMSQSAKEGAKGGQCGVHGEKLHLFCEEDGKILCWVCAQSRKHRNHSMVPIEEAVQEYQEKLQVELEKLRRRRELAEKLEVDVTEKRTAWKKRLRHRNQGFTQSLYSRKTFWLKKNRGS	5124	13586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_+_5156_7019_7476_7941_8037_9140_9372_12951_13078_13411
522982	contig_16622_pilon	-	2051	8	Intergenic	novelGene_48433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1205.6878805504	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121958	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115436_121607
522983	contig_16385_pilon	+	2062	17	Intergenic	novelGene_86184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	230.347080171966	462	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	443	1648	8986	33714	TRUE	25	TTAAAAGTGATTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPEIATAIPAFSNHHPDQSAAVNIEARPSTSKKITTC	2955	36824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4113_8888_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_33607_33767_34231_34324_35622_35680_36611
522984	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	554	1375	35271	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34921_35031_35380_35839_36158_36266
522985	contig_15063_pilon	+	1205	6	Intergenic	novelGene_9979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	238	1149	34808	36740	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVHSN	27131	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36386_36725
522986	SIRV6	+	1445	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	65	18	15	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	193	684	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1152	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
522987	contig_12790_pilon	+	2180	10	Intergenic	novelGene_35224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.216938536028	23	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	153	728	307252	310194	TRUE	40	TCTTTTTATAAAAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	305934	313315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_305989_306045_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310494_311029_311080_311898_312035_312348
522988	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_13202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
522989	contig_12357_pilon	+	1758	9	Intergenic	novelGene_6124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	949.976151016435	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	663	1073	42229	53235	FALSE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25970	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27490_34150_34315_35038_35184_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
522990	contig_5236_pilon	+	2356	17	Intergenic	novelGene_100894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	147.204033041727	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	42	2114	62791	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYLFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	62749	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75187_75494_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
522991	contig_5515_pilon	+	2088	9	Intergenic	novelGene_52334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1118	1474	68936	75509	TRUE	45	GAAAAGTATCAACACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSACSSGCSGDEAELRCRGDRLVHSSRPLEAAAVAELHVALAFRGCRWGRGPDGPVSPDPAATAGRIPEPPAPQWPHWWPPSLWPASCLPASAVQSMTPLMFLWHSSSGTALQTLV	67337	100446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_68278_68669_68782_68870_69081_71006_71208_75498_75648_75735_75896_75982_76047_89046_89139_100286
522992	contig_19402_pilon	-	2430	5	Intergenic	novelGene_80795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAATCTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71982	36526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437
522993	SIRV4	+	1565	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
522994	contig_10990_pilon	+	4056	1	Intergenic	novelGene_7420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAACCGTGCTGTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643356	647412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_643400_647400
522995	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	4	1083	28164	36333	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	28160	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
522996	contig_9436_pilon	-	2420	15	Intergenic	novelGene_60922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.9038313089347	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	11	1915	458965	441733	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVCYPPRACWFFSHSLPRDTVRSFVWSRGGRTRSVGPFSRP	458975	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_441851_442182_442257_442544_442658_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
522997	contig_1244_pilon	-	2224	13	Intergenic	novelGene_38017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1024.72910715738	3	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	410	1678	948448	923434	TRUE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLVQVSRQASPCPASPLRFPSMMGTDMKCCQPT	948857	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923529_923761_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
522998	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523000	SIRV6	+	656	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	171	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	43	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGTTCAACAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10727
523001	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_14074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523002	contig_2100_pilon	-	1728	12	Intergenic	novelGene_50745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_11	842.368502625114	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	81	1385	1182812	1170268	FALSE	20	CCATAAGAGTGCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTARSTRSAPDTGFSPDRSDHEQKFTMSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1184503	1169924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1184432
523003	contig_6445_pilon	-	3413	1	Intergenic	novelGene_77034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	126	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	2528	3124	542546	541950	NA	20	TCTACATTCTACCTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRCKQCRCPATDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	545073	541660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_541700_545100
523005	contig_9482_pilon	+	2282	14	Intergenic	novelGene_44225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	136.044588931404	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	33	1475	212091	230430	TRUE	10	CCTGGCATCTCCTCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAGTAVAAGMSGVRVLSQLLRGRRLAQMRVQCPAASQTKARCFHFNVDGNKRSSAKVSDSISTQYPVVDHEFDAVVVGAGGAGLRAAFGLSEAGFNTACVTKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMEEDNWRWHFYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTEQAPASVVELENYGMPFSRTEDGKIYQRAFGGQSLKFGKGGQAHRCCCVADRTGHSLLHTLYGRSLRYDTSYFVEYFALDLLMENGECRGVIALCIEDGSIHRIRAKNTVVATGGYGRTYFSCTSAHTTTGDGSAMVTRAGLPCQDLEFVQFHPTGIYGAGCLITEGCRGEGGILINSQGERFMERYAPVAKDLASRDVVSRSMTLEIREGRGCGPEKDHVYLQLHHLPPRTAGHAPAGHLGDGHDLCGCGRHQGAHPCAPHSALQHGWHPHQLPGPGSEARERPGPGRAGPVRLRGGCLRLGAWRQPPWGKLTPGPGRLWPGLCPEYRRVLQTRR	212058	236255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216622_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230519_233345_233477_234032_234147_235781
523006	SIRV6	-	388	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGGTGAGTTGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11745	11357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
523007	contig_16098_pilon	-	1486	10	Intergenic	novelGene_46090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1870.64435983638	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	287	1276	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460413	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458455_458559_458618_458704_458838_460148
523008	contig_11752_pilon	+	1896	9	Intergenic	novelGene_37586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1358.4997009569	13	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	110	706	84194	94236	TRUE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYHLWSIWKLVISGTILSSDSV	84084	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88728_93007_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
523009	contig_14450_pilon	+	1301	2	Intergenic	novelGene_48985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2676	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAACAAACAAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042180	1065960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1043374_1065852
523010	contig_7342_pilon	-	2427	22	Intergenic	novelGene_71114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	93.943993543507	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	68	1633	86720	76989	TRUE	10	GCTAGTTTTCTCCTGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGGSAGQQLLGVWRTGFAE	86787	76099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77044_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
523011	contig_11752_pilon	+	1523	8	Intergenic	novelGene_37608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1472.32973791296	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	107	1219	84194	105606	FALSE	10	ATGTCCAGTTGTGCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDNLSFFIQHE	84087	105910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_105574
523012	contig_610_pilon	-	2600	5	Intergenic	novelGene_76718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1569.08333112043	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	87	533	252557	222001	TRUE	25	TTCCTGAAGTTGTCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEHWRPGLLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGFCGASRLRWTRKKGLVMSF	252643	213483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_213663_213857_214263_220517_222063_234998_235302_252475
523015	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523016	contig_15063_pilon	+	1571	5	Intergenic	novelGene_8470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	258	1430	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26338	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523017	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523019	contig_3095_pilon	+	2247	6	Intergenic	novelGene_75164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2004.05375177414	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	42	809	220513	226800	TRUE	30	ATGTGACTTCCCAGGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220471	245831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_244376_245302_245341
523020	contig_16650_pilon	+	1929	2	Intergenic	novelGene_61978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3003	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252974	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_253083_254186
523021	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_18817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAACTACAGTCAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
523022	contig_19812_pilon	-	2444	19	Intergenic	novelGene_100989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	96.9548864163122	383	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	165	1769	44592	19488	TRUE	10	AAGTGGTTTTTGTCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIR	46775	15744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19491_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710
523026	SIRV6	+	543	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	19	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2491	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3101_3171_10721_10819_11031_11109_11205
523027	contig_19777_pilon	-	2288	3	Intergenic	novelGene_29715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACACACGCACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24929	22554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_22784_22825_23614_23658
523028	contig_3233_pilon	+	2366	9	Intergenic	novelGene_56542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	226.853476940513	161	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	405	1025	740857	745484	TRUE	15	CCCCAATGGGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGTGGGARFYLAWFPRDLPNWRVEWGLDEDWKPSSL	738496	748041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
523029	contig_3233_pilon	+	2229	10	Intergenic	novelGene_56549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	311.012603452292	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	429	929	742531	745484	TRUE	65	TTTAAAAAAAACACATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVSLRPRPSRPSTLRQETIWAQLPLRGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGTGGGARFYLAWFPRDLPNWRVEWGLDEDWKPSSL	738687	748000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742517_742613_742724_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
523031	contig_13740_pilon	-	1725	11	Intergenic	novelGene_34609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	3811.31394797122	64	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	165	1190	165243	157474	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165407	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
523032	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523033	contig_7816_pilon	+	1832	13	Intergenic	novelGene_66488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1081.21825258466	1349	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	649	1725	195803	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170076	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183038_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
523034	contig_6980_pilon	+	2089	8	Intergenic	novelGene_36041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	444.29297192051	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	71	871	356720	370691	TRUE	30	CACCTTTATTCAAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKVKNRTSALFCQFYFRK	346112	373122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_371523_372735
523035	contig_3424_pilon	+	2488	3	Intergenic	novelGene_55463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	203.5	6	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	148	2232	163695	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	145885	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_146020_163681_163803_168701
523036	contig_15063_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_10876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2640.18383198342	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	504	992	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34888_35872_36158_36266
523037	contig_5799_pilon	+	3043	18	Intergenic	novelGene_50306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	269.723002856442	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	1129	2355	667965	704733	FALSE	25	TGGGATATCAGTTTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGKYSSVFTQTAFAIWEVGFWFLLNETSDEMFIHQTKKVSQLHA	561011	705421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_609572_609706_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650972_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547
523039	contig_5452_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_101024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	74	307	498461	498016	FALSE	30	GAGGAGCCATTTGGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTYLTLSEDPSPRIIFHNRCPVTMLVKENIKDIPKFEVYCRKIPSECSIHHELYHQISSYPDCKTKDLLPSLLLRVELLEEVATEWSDAIDINHQGTQVK	498534	497821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_498225_498436
523040	contig_1225_pilon	+	2061	2	Intergenic	novelGene_44119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1325	junction_1	0	8	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	26	391	147032	148934	FALSE	20	TTGGCGCAATATTGCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRTSAVKMGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	147006	150604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_147173_148709
523041	contig_8978_pilon	+	2020	9	Intergenic	novelGene_49377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	360.155153197896	11	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	97	1281	339807	347264	TRUE	25	GTTTTCCTGATAAATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRRPHQQLSVLAKLLQWKELGQLVEPLLHSIVQLLELNSLQTSVADTNKFAV	331566	348076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_347110_347535_347607
523042	contig_3747_pilon	-	1809	4	Intergenic	novelGene_24897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCCAAGATCCAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205179	201266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201573_203511_203649_203766_204838_204884
523043	contig_20819_pilon	+	2389	9	Intergenic	novelGene_55630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	478.693991501878	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	24	1316	29817	42531	FALSE	15	CCAGTGCTTCCAACCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	29793	43604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40434_40490_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
523044	contig_15063_pilon	+	1285	4	Intergenic	novelGene_14287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523045	contig_17796_pilon	+	2003	12	Intergenic	novelGene_33766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_4	210.864180171358	682	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	387	1709	12080	42369	FALSE	20	CATCCCATCGTATTCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8152	42663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
523046	contig_13740_pilon	-	1637	12	Intergenic	novelGene_34659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3842.87225353964	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	173	1198	165243	157474	TRUE	25	TGTGTAATTATAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165415	156798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156994_157076_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
523047	contig_12427_pilon	-	2033	6	Intergenic	novelGene_40527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1207.39017720039	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	121	672	520420	506035	FALSE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578155	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522327_578096
523048	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523050	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	202	1035	34808	36333	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36277
523051	contig_9199_pilon	+	2780	10	Intergenic	novelGene_65613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	98.4603699182795	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	62	1066	42527	57407	FALSE	40	CCCAGTGTACTTAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALAADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42465	59121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304
523053	contig_9848_pilon	-	2276	6	Intergenic	novelGene_79982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	691.625794776337	441	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	12	551	149215	134114	TRUE	30	ATAATATTTAATGCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGMGGSRESRGGWDSRDDFNSGISIYSITTYLFSSGLAAVAQFL	149226	128389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_130078_134076_134245_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
523055	contig_9471_pilon	+	1873	13	Intergenic	novelGene_21787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	489.30159978847	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	192	1646	410634	417296	FALSE	25	ATATGAATCTGCATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSRRTYCPDWDEKDWDCGKWRSSSSYKRRKRSHSSARENKRCKYNHSKTSDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYNQGCEPGHRHRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHHRSHGKSHRRKRPRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406950	417523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407142_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
523056	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_9933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523057	contig_14353_pilon	-	2531	9	Intergenic	novelGene_82138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	143.895741337261	546	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	892	1542	407973	402843	FALSE	35	AAAACAACTATTGTGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420580	401853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415447_420261
523058	contig_15063_pilon	+	1373	5	Intergenic	novelGene_14019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	195	1223	34808	36632	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34613	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
523059	contig_7457_pilon	+	2153	12	Intergenic	novelGene_31328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	283.210286034428	249	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	431	1519	285209	290630	FALSE	15	AGAGGTGCACTGTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280833	291264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285145_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
523060	SIRV6	-	832	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8694	62	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	19	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAGCGGTTGACCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11241	1482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1528_1631_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10818_11034_11109_11205
523061	contig_2100_pilon	+	1128	10	Intergenic	novelGene_50699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGAGACCTGGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169919	1180275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170132_1170280_1170340_1171935_1171994_1172341_1172449_1173169_1173335_1175607_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187
523062	contig_9345_pilon	-	1558	4	Intergenic	novelGene_24629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	912.516422987675	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001336	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949527_997013_997093_1001156
523064	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523065	contig_7457_pilon	-	2451	4	Intergenic	novelGene_31617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_3	23.3428552000155	50	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	117	1379	962606	956489	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962722	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960896_962603
523066	contig_3077_pilon	+	1596	10	Intergenic	novelGene_26615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2506.45096589669	2	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	138	1136	9676	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9538	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11397_13033_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17699_17736
523069	contig_16411_pilon	+	1077	2	Intergenic	novelGene_77291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGATGGTGTGGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68185	69476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_68610_68823
523070	contig_15063_pilon	+	1570	5	Intergenic	novelGene_12299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	15	1427	28164	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28149	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
523071	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_9507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	240	752	34808	35888	TRUE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27129	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
523072	contig_5643_pilon	+	1928	15	Intergenic	novelGene_39017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	687.618546365732	12	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	653	1660	634983	641161	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQNTGRICMRTCTVRTRRRRR	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640413_641102_641244_641412
523074	contig_11986_pilon	-	2117	10	Intergenic	novelGene_69200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.41212016964	50	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	122	1246	792566	747958	TRUE	20	AAAAGGTGTTTGTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVSVPLRGY	794706	733982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734827_747930_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
523075	contig_5988_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_16112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTTTCTTGTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224442	1226933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1224400_1226900
523077	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523079	contig_13216_pilon	+	1889	8	Intergenic	novelGene_47471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	825.965903333417	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	463	1413	246066	261012	FALSE	35	ATAGAAACAGTTTTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229608	261488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243830_243917_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
523080	contig_7748_pilon	-	2826	16	Intergenic	novelGene_101054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_1	213.359227595152	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	219	2564	164891	150982	TRUE	20	TTGCTTGTTAAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	191003	150414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_150665_150969_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878_164940_190833
523081	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523083	contig_11285_pilon	+	2040	14	Intergenic	novelGene_5561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	514.487025500434	5	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	56	1843	766060	769878	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763502	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740_769977_770097
523084	contig_854_pilon	-	2072	3	Intergenic	novelGene_36147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	176	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1085	1657	471014	470442	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	473712	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471107_471194_472061_473586
523086	contig_1443_pilon	-	1933	10	Intergenic	novelGene_28321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_8	395.259439724541	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	728	1651	776427	748649	FALSE	40	TATCAACTGTCTCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	748366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805718_808694_808741_809399
523087	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	1	1413	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28163	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34610_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523088	SIRV6	-	536	5	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-242	68	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTTGACCTGTATTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2789	1476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1542_1647_1735_1844_2030_2470_2619_2738
523090	contig_16187_pilon	-	2078	8	Intergenic	novelGene_101067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	73.0864738037157	458	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTAAAATTATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53102	40164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_41962_42110_46088_46170_47523_47615_47823_47902_48721_48836_53034
523091	contig_15063_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_9306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	774	1097	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36776	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36153_36264
523092	contig_1076_pilon	-	2208	17	Intergenic	novelGene_101093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_12	351.487858743015	36	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	699	2009	65958	50922	FALSE	55	TATACAAATAAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	79724	50722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_65952_66033_66231_66354_72589_72712_72921_72975_75351_75429_79474
523093	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	153	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523096	contig_10777_pilon	+	1432	10	Intergenic	novelGene_101160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	272.645883478511	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	258	1004	8328	50625	FALSE	65	AAAAAAAAACCAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSGKMVES	6467	51053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560
523098	contig_7171_pilon	-	2600	30	Intergenic	novelGene_101296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_12	109.22677105391	25	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	68	2479	1075454	1057742	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARYQPPMAPRPPVISPTAVPPPFTPPAFCRKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075697	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
523099	contig_9807_pilon	-	1777	8	Intergenic	novelGene_32916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGATGCTGAGCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159629	140895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_140958_145113_145204_147121_147276_148957_149047_151709_151818_154093_154270_156624_156762_158668
523100	SIRV6	+	949	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1503	18	74	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523101	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_12540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	10	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523102	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523103	contig_11989_pilon	-	2626	20	Intergenic	novelGene_68430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	341.511379255018	802	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	119	1999	107068	46235	FALSE	10	TTTTTTTTTTTAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPTTPQQRIRSRGGEKGVLGSSPRLPPLEAQRGRGPWRMAFLLATCGGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	107186	45607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_107041
523106	SIRV6	+	1281	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	620	15	404	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	26	517	1733	10736	TRUE	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1707	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523109	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSAESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34610_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523110	contig_18156_pilon	+	2286	16	Intergenic	novelGene_101448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	69.1820786042166	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	435	2147	22145	64324	FALSE	40	TCTGAACAAAACTTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPEPVLKTSGHVDKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQLDNYGQQELGDLFVNYNVKSPTTGNDLSPPVPFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFSQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7372	64463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_22028_22171_23411_23501_23893_23971_29472_29619_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
523111	contig_9345_pilon	-	1801	4	Intergenic	novelGene_24369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	548.593555274658	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	261	806	142974	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRRSGWVGWVAEAAAPPRPWSVCPSARPPRNGCAVPRAASPAAVVAAPASSWWFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176152	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_175989
523113	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_11510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523114	contig_2087_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_65567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTAAGAGAAAGTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71540	69994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_70000_71500
523115	contig_8447_pilon	+	2329	13	Intergenic	novelGene_69407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	574.559517272918	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	484	1719	48468	82214	TRUE	25	AGAAACTTTTTTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	44525	84486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_44773_44811_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82241_83902
523116	contig_10434_pilon	-	3007	12	Intergenic	novelGene_82051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_4	194.810100371135	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	75	914	178895	169319	TRUE	10	GAATTGGTTCTTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFAPEFQVGDGIGMDLKLSNHVFNALKQHAYSEERRSARLHEKKEHSTAEKAVDPKTRLLMYKMVNSGMLETITGCISTGKESVVFHAYGGSMEDEKEDSKVVPTECAIKNAESWDSLSNSCNAQETHFSYVFYWP	191877	162878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167844_169239_169400_170768_170824_174791_174920_175623_175768_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_191854
523117	contig_11720_pilon	-	1873	4	Intergenic	novelGene_44011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGACGGGGGTCGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272343	269745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_269914_270036_270803_271272_271964_272095
523118	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523119	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	253	1425	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPGDQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26343	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26406_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523120	contig_17274_pilon	+	2174	18	Intergenic	novelGene_26455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	483.477054557646	139	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	730	1917	31318	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTQSIHEQDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6938	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26474_27831_28001_30127_30212_31277_31349_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
523121	contig_3095_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_75151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151963	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_152000_152200
523122	contig_16650_pilon	-	3258	2	Intergenic	novelGene_61956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	175	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	833	1219	242153	241767	FALSE	30	TATGTATTCTGTGAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLCCSRLHRQLLNHSKPVGSPGSDCWDYQKQSQERKESPFLCLQELGLCSSISCFWLNTLFRAGTIWKRLPNQEEALPGNTVHCFQAKESWLLNPGLMTHSHTVTLGSLCIPSRVLSLHLGTTYHC	244368	239727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_242784_244166
523123	contig_8658_pilon	-	1567	8	Intergenic	novelGene_55819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1297.59672676303	80	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	541	1221	34564	6049	FALSE	20	CTGAAGCAGTGTGATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55657	5702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34633_35900_36092_36521_36674_55528
523124	contig_5947_pilon	+	3147	1	Intergenic	novelGene_101587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873358	876505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_873400_876500
523125	contig_2703_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_101750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAACAAACAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557568	556838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_556800_557600
523126	contig_7457_pilon	-	1295	4	Intergenic	novelGene_31692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	1176842	1174926	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
523128	contig_15063_pilon	+	1477	5	Intergenic	novelGene_12188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	CTAACCATGTCTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27541	36736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523131	contig_18108_pilon	-	2381	18	Intergenic	novelGene_33506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	273.151541650203	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	157	2169	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335419	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_269964_271371_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
523132	SIRV6	+	467	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1481	522	52	24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523133	contig_3986_pilon	-	2901	14	Intergenic	novelGene_52672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	115.968828703101	4	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	166	1692	93453	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPGNLRRMGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108508	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_93430_93507_108396
523135	SIRV6	+	1482	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	19	-10	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	786	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523137	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_8638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_1	3778.0528347579	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	250	1485	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYGYFKYWGQGTPVKVFSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26540	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26596_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523138	contig_2100_pilon	-	1445	11	Intergenic	novelGene_50722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	876.208200144235	14	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	119	1099	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185529	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173297_1175611_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
523139	contig_8357_pilon	-	2788	3	Intergenic	novelGene_39713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	29.5	66	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	120	344	478808	476036	FALSE	25	CCCTACAATATTTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSPRPGSGSVKPEPASPAFASWLPLLTPEPLTGLGPAAMTNVYSLDGILVFGLLFVCTCAYFKKVPRLKSWLLSEKKGVWGVFYKAAVIGTRLHVAVAVACVVMAFYVLFIK	478927	473591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_476119_476731_476864_478798
523140	contig_15063_pilon	+	1690	7	Intergenic	novelGene_12163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3803.49979185837	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	232	1485	34808	39538	FALSE	45	GAAATAAATGTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVTHCGKNV	27539	39743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39511
523141	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_12443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	600	1421	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36266
523142	contig_14575_pilon	+	2786	26	Intergenic	novelGene_101873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_21	116.521242698488	69	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	2073	2786	51080	63898	FALSE	55	AAATTGAAGAGAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEK	17125	63898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
523143	contig_16098_pilon	-	1594	10	Intergenic	novelGene_46084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_9	2119.18505184201	79	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	128	1384	459176	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460262	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459035_459190_460148
523144	contig_9345_pilon	-	1668	5	Intergenic	novelGene_24652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1359.01545245078	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	243	599	955353	947957	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001317	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949557_955251_955356_997013_997093_1001156
523145	contig_4496_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_66620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591741	589371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_589400_591700
523146	contig_7446_pilon	-	1854	10	Intergenic	novelGene_101941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_9	188.980761970794	295	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	80	1459	260350	156374	FALSE	35	TAAGATATCCTGAATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTSQSDVSSLPPVPSSTDLEVGETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTVSAQALLASSSAESPPSTSLLSSSDSEQRQSVEASGHHTHHQSDDSNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSTASSSRGNGSHCKSEGQEEDFAPLSSMQPPKGDSETKAPEASSEDVTRYQEGTSAENTVENRIDVDKFTSEPLDSSSGEKNDLNLDRPCGVPEESILSEKGKEPETSDQLSTKSATNQNTTNPEPQSQTEAIESSVHEETSARYSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE	260429	155978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_156439_163488_163595_165971_166061_166683_166841_168390_168530_185009_185329_185568_185656_186937_187054_193589_193708_260166
523147	SIRV6	+	1013	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	478	0	16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	35	TCACCATAAATTTGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523149	contig_12790_pilon	+	2012	11	Intergenic	novelGene_35218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	265.297870326921	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	213	1268	307252	312598	FALSE	15	TAAGGGGTGTGGCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAPIMVALVQRSRTLIGPVDTAKCDPTA	305931	313342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312470_312519
523150	contig_9753_pilon	-	1949	6	Intergenic	novelGene_41311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_2	235.655171808301	3146	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	79	399	93294	70810	TRUE	0	TCTGTTGTCTGCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRRRRNYFLA	93372	69096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70838_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
523153	contig_3956_pilon	+	1689	11	Intergenic	novelGene_14894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1527.89969893315	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	83	1495	1281682	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283871_1284207_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287341_1290555
523154	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_12880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	799	1122	35891	35108	TRUE	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36798	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28197_34603_34925_35033_35380_35839_36156_36264
523157	contig_1146_pilon	+	2454	6	Intergenic	novelGene_84847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	223.870855628865	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	357	881	939880	944381	FALSE	5	TCTTGTGTCCTACTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	937610	945954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937916_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262
523159	SIRV6	+	696	8	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	7	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_1906_2540_2621_2740_2829_3106_3165_10724
523160	contig_11285_pilon	-	1943	17	Intergenic	novelGene_5709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	437.923723381139	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	32	1756	798530	784252	FALSE	5	CCCCTCCGCCAGCGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798561	784064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790190_796461_796514_796604_796727_798342
523161	contig_15063_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_10622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	60	TTTATAAAAATTAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523162	contig_1861_pilon	-	2087	17	Intergenic	novelGene_77661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	119.683028637105	1112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	173	1978	112534	87440	FALSE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCRAGRGWDPEVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMESTLCDRACGTHLFQIKKLRLRGRLPAGLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115249	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_94644_94723_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
523163	contig_15118_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_74546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGTATAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125272	127503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125300_127500
523164	contig_12790_pilon	+	1870	10	Intergenic	novelGene_35208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	269.080326709743	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	275	1003	309644	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305928	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306020_306100_306139_307246_307339_309590_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
523166	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_13872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	199	1374	34808	36661	FALSE	45	AAATATCAGTTCACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36161_36266
523167	contig_1406_pilon	-	1840	6	Intergenic	novelGene_25551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	513.085801791474	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	137	1045	2159494	2137428	FALSE	25	ACCCAAGAATTCTGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGGPVVAERCPLLGLRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159630	2136632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147855_2159440
523169	contig_10793_pilon	+	2180	10	Intergenic	novelGene_83428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2823.02745293063	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	907	1710	152887	163940	TRUE	10	GCTGTCTGGATGTCTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	150613	165132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789
523170	contig_6980_pilon	+	2079	9	Intergenic	novelGene_36028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	92	988	356720	372790	FALSE	20	CAGACTGTTACTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346091	373881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
523172	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523173	contig_15063_pilon	+	1463	5	Intergenic	novelGene_12080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	215	1387	34808	36661	FALSE	20	TAACCATGTCTGTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27154	36737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523174	contig_13894_pilon	-	1160	9	Intergenic	novelGene_62151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	453	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTCATCCTTGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528173	521684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_521769_522677_522844_523482_523623_524835_525023_525635_525797_526475_526577_526847_526946_527457_527578_528070
523176	contig_19459_pilon	-	1525	9	Intergenic	novelGene_59811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	8498.89282127384	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	202	681	16240	11160	TRUE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKPLKREISFR	17257	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_10989_11190_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17080
523177	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_11909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523178	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_10688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523179	contig_7412_pilon	-	1821	8	Intergenic	novelGene_76336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1250.18654934504	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	108	1634	377290	364445	FALSE	5	TTCTGCAGCTTTTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377867	364257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
523180	contig_8452_pilon	+	2213	2	Intergenic	novelGene_48051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	177	1262	432928	434013	FALSE	40	GGGAATAAAGAATTTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	427703	434964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_427862_432909
523181	contig_9727_pilon	+	2047	13	Intergenic	novelGene_86252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_10	117.300421520508	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	19	942	4844	17361	TRUE	15	TGAGACTGTTGTTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISTPVDINNRDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACSIALDAVKTVQFEESGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISGSTPSIFPTYL	4825	21380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_4872_7376_7439_8182_8234_8327_8391_8706_8804_12793_12912_14765_14953_15673_15824_17193_17602_19150_19333_20045_20292_20547_20680_21075
523182	contig_593_pilon	-	2581	6	Intergenic	novelGene_101970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_5	95.2357075891181	815	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	124	810	118610	110585	FALSE	20	CTCATTGTGTTGCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSEIFVELQGFLAAEQDIREEIRKVVQSLEQTAREILTLLQGVHQGAGFQDIPKRCLKAREHFGTVKTHLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGIEPDREKGFHLDVEDYLSGVLILASELSRLSVNSVTAGDYSRPLHISTFINELDSGFRLLNLKNDSLRKRYDGLKYDVKKVEEVVYDLSIRGFNKETAAACVDK	118733	108813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_110819_113012_113093_113732_113849_116125_116223_117343_117438_118544
523183	contig_15087_pilon	-	2656	17	Intergenic	novelGene_37139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_16	390.486670507138	860	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	463	1827	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89806	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_89687
523184	contig_2646_pilon	-	3330	19	Intergenic	novelGene_69624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	337.582253351354	12	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1084	2007	2074596	2071292	TRUE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRADRSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQVMWALSARRGRL	2078658	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074177_2074583_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075586_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
523185	contig_9290_pilon	-	2762	14	Intergenic	novelGene_77570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_13	20.0461007142575	228	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	463	1371	509725	504291	FALSE	20	CAGGCCTCTGCAGGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516550	502899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510196_510337_511094_511204_515706_515813_516446
523186	SIRV6	+	874	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-9	223	-3	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	224	715	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523187	contig_15063_pilon	-	1396	4	Intergenic	novelGene_13123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	684	1007	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36683	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523188	contig_6227_pilon	-	1951	17	Intergenic	novelGene_49775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	317.034692255832	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	28	1017	1224979	1205919	TRUE	55	CGGGTAGAAAAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGECWNFCRAPWGPALPHRAPGEERPRPAGSAGHLVHQLFWV	1225006	1202649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206546_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
523190	contig_10324_pilon	+	2095	6	Intergenic	novelGene_7762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_3	532.504046932979	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	208	708	75827	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	75619	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
523191	contig_15304_pilon	-	1640	2	Intergenic	novelGene_30647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103680	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103329_103548
523192	contig_7412_pilon	-	1776	7	Intergenic	novelGene_76310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1245.5007917389	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	86	1519	375758	364445	FALSE	10	TTTGCCTTTCCATACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377282	364187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
523194	contig_5324_pilon	-	2091	2	Intergenic	novelGene_102069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	118	717	444540	443941	TRUE	50	AAATAAATAACTACAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444657	442042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443068_443591
523195	contig_20819_pilon	+	2178	7	Intergenic	novelGene_55625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	585.465531768429	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	29	1153	29817	42592	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEALPRGWHRPLPLSLSPPWPHQGTGLGRKYSEGIITSTLLKHHHLWPELLQ	29788	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_40972_41319_41400_42519
523196	contig_11752_pilon	+	1529	9	Intergenic	novelGene_37577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1375.71288338083	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	445	1473	87165	105616	FALSE	30	ATCCCTCCATGAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85246_87043_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
523199	contig_3588_pilon	+	2040	16	Intergenic	novelGene_72871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	650.241131341973	2	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	853	1524	127440	140944	FALSE	0	TTTGGTGGTTTTTTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQKRECKYVHQRPLPQPALPSMSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	84530	141460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96206_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_125539_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
523200	contig_4103_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_51907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	363	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79140	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77837_79071
523201	contig_7426_pilon	-	1960	7	Intergenic	novelGene_27531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	279.395627500981	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	58	834	1102797	1087044	FALSE	40	TATGTCAAAGATGCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGPAAGKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGQHPTRLSLAQAGSSSDLSTLFSSYNFWKGATSSGT	1102854	1085917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
523204	contig_1861_pilon	-	2087	17	Intergenic	novelGene_77651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	119.683028637105	1039	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	162	1517	112534	94418	TRUE	25	GGCTGGAGTTGGCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGWDPEVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMEYKEAEAQRAAPSRLDHWRI	115238	87278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_94644_94682_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
523205	contig_11720_pilon	-	2093	10	Intergenic	novelGene_43889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	191.600342792033	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	88	954	124674	118003	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIARYIQGQLFPGSTCSMPLWGPLFSPCSWLMTHSWFWGTGSIPSARRTTSLAPCRSTLTSSTSSPLCCSWWGIAIKEHIPVPPHPGLSLPRGLGPVTGISASDPFLPFK	134609	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_120459_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
523206	contig_9436_pilon	+	2213	4	Intergenic	novelGene_60918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	771	1532	441998	444104	FALSE	25	CAGGAGTAAGAGCCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTAQHHSAVLPSGTQGEVEGSKGGRTSLERFWTPWRGNCSGGLRSQTRPGPLCPPHPESPKPGGNCSPALSAAAALSVPLQLPAPENIEENLLEVFRVFISQPARVLLSPFSPRSDNFDLNFTFCCESLPLQQLFHQPLDLFQLWVFPFHLEDSQILIGASVMEPGDPDPDSVLRILLLGCGEAGGFLETTPLFRCLFTSCGLCFSSSLLMSLLTVDVRASIARSRSDSFFSPSGSSSFSVWNAQRSVEGK	441227	444785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_442260_442545_442656_442802_442975_443886
523208	contig_15063_pilon	+	1442	4	Intergenic	novelGene_14096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	189	719	34808	35938	TRUE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVLSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	34619	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35858_36158_36266
523209	contig_854_pilon	-	2889	7	Intergenic	novelGene_36142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	219.677541460711	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	66	665	483594	474385	TRUE	0	CGTGCCTGGGGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	487029	470024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477_483627_486996
523210	contig_15063_pilon	+	1743	5	Intergenic	novelGene_13042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3966.53629600184	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	428	1603	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30089	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523211	contig_11285_pilon	+	1859	12	Intergenic	novelGene_5609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	463.182879827492	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	787	1536	768710	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767748_768497_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
523212	contig_7963_pilon	+	2238	5	Intergenic	novelGene_58596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	102.416734472448	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	112	813	293211	297210	TRUE	20	CCTATTGCCATTGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPVSVEWSESQLLCSLGLTQDHTESIWGLCYLCTLLGHNTNSFP	293099	298889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815_297024_297077_297939_298192
523213	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523216	contig_5954_pilon	-	2059	13	Intergenic	novelGene_28605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	419.414100263689	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	360	1697	956150	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956199_959745_959941_960474
523217	contig_6230_pilon	-	2402	12	Intergenic	novelGene_102108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	25.3089994773688	397	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	145	1617	181988	166056	FALSE	15	CTTGGGGCTTGAGATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRIKSAAASRVEGSSGAPTKGKRKPRQEEDEDYREFPQKKHKLYGRKQRPKTQPNPKSQTRRIRKEPPAYAAGSLEEQWYLEIVDKGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182132	165270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179926_180772_180857_181156_181253_181942
523218	contig_10494_pilon	+	2812	1	Intergenic	novelGene_102234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGAAAAAAAAAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270682	1273494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1270700_1273500
523219	contig_9482_pilon	-	1967	10	Intergenic	novelGene_44312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_3	79.9444251409134	1213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	41	805	1253164	1240999	TRUE	0	GCCTTTCTCTTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKASRSRRAPDGPRR	1253204	1236138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
523221	contig_6589_pilon	+	1329	7	Intergenic	novelGene_26106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_3	2480.88705014065	88	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	274	810	1879124	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSWEFGPGALGLIRQGVSCSLLSTVKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876577	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
523222	SIRV6	+	968	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1439	63	10	-62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523223	contig_14176_pilon	+	2753	8	Intergenic	novelGene_74843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	122.700232024131	218	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	90	800	246102	271823	FALSE	10	GTCTGTGTGTCCACGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTGRCVNYSSALRTCEIQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRFAKYYKMENGSEYRTLLKAFGIRFDVLVYGNAGKFNIIPTIISAVAAFTSVGVGTVLCDIILLNFLKGADQYKAKKFEEVNETMLKVAASANPVYPSDQTTEEKQSTDSGAYSIGH	246012	273776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_270173_270268_270557_270624_271207_271286_271709
523224	contig_16622_pilon	-	2207	7	Intergenic	novelGene_48434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1035.10956210227	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121963	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115299_121445
523225	contig_5671_pilon	+	1529	6	Intergenic	novelGene_79452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_1	1790.7705157278	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	547	969	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	369225	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
523226	contig_11855_pilon	-	3574	15	Intergenic	novelGene_67028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	112.257266479952	292	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	145	1980	1937414	1911014	FALSE	10	GTCTGTTTCATCCAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVRQEALGIVRRFGTATEAATEPAGATVPTAAAAAARIGTIGPQPPAMPRRKRNAGSSSDGTEDSDFSTDLEHTDSSESDGTSRRSARVTRSSARLSQSSQDSSPVRNLQSFGTEEPTYSTRRVTRSQQQPTPVTPKKYPLRQTRSSGSETEQVVDFSDRETKNAADHDESPPRTPTGNAPSSESDIDISSPNVSHDESIAKDMSLKDSGSDLSHRPKRRRFHESYNFNMKCPTPGCNSLGHLTGKHERHFSISGCPLYHNLSADECKVRAQSRDKQIEERMLSHREDDNNRHATRHQAPTERQLRYKEKVAELRKKRNSGLSKEQKEKYMEHRQTYGNTREPLLENLTSEYDLDLFRRAQARASEDLEKLRLQGQITEGSNMIKTIAFGRYELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSISVFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKNSFLNYNVSCILTMPQYMRQGYGKMLIDFSYLLSKVEEKVGSPERPLSDLGLISYRSYWKEVLLRYLHNFQGKEISIKEISQETAVNPVDIVSTLQALQMLKYWKGKHLVLKRQDLIDEWIAKEAKRSNSNKTMDPSCLKWTPPKGT	1937558	1909419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1911116_1911748_1911856_1912484_1912632_1914058_1914153_1915280_1915422_1915657_1915748_1917914_1918107_1919633_1919745_1922355_1922455_1923983_1924074_1927210_1927294_1931559_1931800_1933180_1933358_1934848_1934997_1937399
523227	contig_14744_pilon	+	762	7	Intergenic	novelGene_66061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4471.39194087131	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	43	726	1383156	1386652	FALSE	10	TTTAACTTGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPFRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382038	1386688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382049_1383123_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
523228	contig_14353_pilon	-	2696	10	Intergenic	novelGene_82143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	167.323225310759	151	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1179	1718	405634	402843	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420580	401864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_406851_407028_407877_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415447_420261
523229	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_14087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	190	1365	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
523230	contig_14513_pilon	-	1132	3	Intergenic	novelGene_70274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12166_18691_18816_18924
523232	contig_9113_pilon	-	2296	4	Intergenic	novelGene_68585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_3	693.746831824598	155	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	327	1571	348512	347268	FALSE	10	TCTGTTTTCCTTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	362772	346542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_362682
523233	SIRV6	+	1005	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1409	56	-20	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2496	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523234	contig_14925_pilon	-	1423	8	Intergenic	novelGene_55213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1368.31353072582	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	79	492	116065	114666	TRUE	40	GTAATTTGGAAGAGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129479	25807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
523235	contig_12873_pilon	+	1709	6	Intergenic	novelGene_27139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1260.0543797789	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15941	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19149_19647_19703_19851
523236	contig_19769_pilon	+	767	7	Intergenic	novelGene_102278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1382.0083714974	42	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	32	733	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_87926_87997_88040_88841_88958_89163
523237	contig_7357_pilon	+	3306	10	Intergenic	novelGene_36893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.2613500346891	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2378	2917	269181	273311	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	256856	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
523238	contig_14811_pilon	-	1762	3	Intergenic	novelGene_74485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	129	908	375703	357434	FALSE	35	ACAACCCCAAAGTGTCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386595	356579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
523239	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523240	contig_8045_pilon	-	1494	5	Intergenic	novelGene_35345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3331	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	884	1195	118535	117274	TRUE	15	GGGCGGGCAAGCGCGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISFGASFSMKSVYIFLAFEDSFWGDLVFLKSSQASQNSIFSSQNSDFKKALNAARPYLLASSSSNASDQSWASSGDGLIKVCCLLFLLVLGFPGVEEFCKK	119418	116036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_116317_117254_117349_117450_117513_118075_118241_118525
523241	contig_3787_pilon	+	1873	1	Intergenic	novelGene_102449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACGAAAATTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746588	748461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_746600_748500
523242	contig_3787_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_102450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748924	750760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_748900_750800
523243	contig_4125_pilon	-	2789	19	Intergenic	novelGene_25069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_16	24.3954686138407	310	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	858	2573	461615	454981	FALSE	5	CCTCTGCGCTTTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTPPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPDAKKPRLLQGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDARKEQETVMRVYSHLKSILKDHCVQHLPDGSVTVESILIQAAAHSEDPGTKVLLVSWTYQDEELGSYLTSLLKKGLPQAPS	470018	454764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_467581_467809_467999_468247_469694
523244	contig_7334_pilon	+	2686	3	Intergenic	novelGene_50562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	254.5	408	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	360	1427	120109	121176	TRUE	5	CTCACTGTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116681	122505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097_121477_121546
523245	contig_14353_pilon	-	2254	12	Intergenic	novelGene_82089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	483.767941773329	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	75	704	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLPLCRGLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104446	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80203_80495_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
523247	contig_13707_pilon	-	2298	12	Intergenic	novelGene_43573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	828.356293366768	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	110	1279	278215	270728	FALSE	55	ATAAAACCTTGAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEAIKSPLRAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKETADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	278324	269708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273755_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_278181
523248	contig_4884_pilon	+	2974	12	Intergenic	novelGene_63818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	582.814927459328	23	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	183	2657	575052	593295	FALSE	25	TTGCTTGTAGAGACCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNSRSHSSRSKSRSQSTSRSRSRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRIYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGYRPVWNRRHSRSPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSSRSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSATSGDIWPGLSAYDNSPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTVHSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTITPQNAPRDEARGRSSFYPDGGDQETAKTGKFLKRFTDEESRVFLLDRGNTRDKEAPKEKGSEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKDSGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKSREQDHSRSSSSSASPSSPSSREEKESKKEKMKKKPWKIMKRRRTDAKKKRNSKSEVRLQQRTELNTHHFIFKPDFCFQIRM	563322	593612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576827_577901_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_586137_586238_592978_593041_593198
523249	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	200	1033	34808	36333	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	34608	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36277
523250	contig_9345_pilon	-	1995	6	Intergenic	novelGene_24362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	610.082158401637	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	455	1000	142974	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	175859	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148822_148948_173643_173789_175772
523251	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523253	contig_7051_pilon	-	2566	5	Intergenic	novelGene_64297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	156.156171828077	479	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	10	489	231129	216979	TRUE	5	TTCTGATCTTTTTCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPKMVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231138	187331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_189291_216860_217052_217573_217734_217824_217999_231056
523256	contig_5018_pilon	+	1706	8	Intergenic	novelGene_47070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	1376	1705	1401408	1402348	FALSE	20	TCGGTCCACCCATCTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLRKQLHITAPTVNVLLVLHSKLHHQRLVLVAEGLESRRQGVEAGVLARLQPFIFLLVTIELARTQNEFAKIRLVFGFDPA	1399085	1402349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399842_1399928_1400029_1400626_1400763_1400850_1400972_1401057_1401262_1401349_1401445_1401872_1402077_1402259
523257	contig_5261_pilon	+	3937	10	Intergenic	novelGene_102472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_8	50.4192301154242	453	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	127	1602	632965	666496	FALSE	25	TTATAATGACATGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSEPGQQAAAGGGSPEEEEDEDEEREPLLPRIAWAQLRKVAPGSAVRLIEPAEEAGAASPPKAPDGKLLLPLGSATCSPSRNRAPFQSSPSHRSGFACSVSGITSEMNTFLDDPEFADIILRAEQAIECGVFPERIFQGSSGSYFVKDPKRKSIGVFKPKSEEPYGQLNPKWTKYVHKVFCPCCFGRGCLLPNQGYLSEAGAYLVDEKLHLGIVPKTRVVWLVSETFNYSAIDRAKSRGKKYALEKVPKVGRKFHRIGLPPKIGSFQLFVEGYKEAEYWLRKFEADPLPENVRKQFQSQFERLVVLDYIIRNTDRGNDNWLIKYEKQKEVDSKETKWTDDKESLIKIAAIDNGLAFPFKHPDEWRAYPFHWAWLPQAKVPFSEEIRNLVLPCISDMNFVQDLCEDLYELFKTDKGFDKATFESQMSVMRGQILNLTQALRDEKSPVQLVQMPCVIVERSQSGGQGRIIHLSNAFTQTVHCRKPFFSSW	632838	668831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_633272_641465_641621_643927_644129_644728_644861_646865_647020_648139_648199_650437_650538_664004_664139_664893_664954_666322
523260	contig_5643_pilon	+	1886	14	Intergenic	novelGene_39002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	780.150835059341	10	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	675	1145	634983	638095	TRUE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTVGEPDSGDLALPVPELA	631174	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636259_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
523261	contig_7457_pilon	+	2217	13	Intergenic	novelGene_31331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	298.357575830673	1665	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	111	1592	281205	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARHTHQFLMPPLSPSRPDFVLCVPVEDQHGLPLGERCPWEVIQARSGMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280836	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_284952_285088_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
523262	SIRV6	+	329	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-119	385	18	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
523263	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	231	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523264	contig_12969_pilon	-	5009	5	Intergenic	novelGene_61685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	59.3464404998312	169	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	1276	2919	509012	493044	FALSE	15	GTGAGTATGGTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKNQESLTYRDVAVDFTWEEWQLLDTAQKDLYRDVMLENFSNLVSVGFQAGKPDALSKLERGEEPWTVEDEIQRQARSEIEKVDDYLQGHLQNQRCLKRMEHCQGHNVFGNIVYQRKSHFPLRQNHDIFDLCGKTLKSNLYLVNQSRSFEVKKPHKANGGGKSFLHTKHEQFHPEIKFPECGKPLNTKSQFIKHQRTHKIDKPHVCSECGKAFIKKSRLIDHLRVHTGEKPHGCSVCRKAFARKSRLTEHQKSHIREKHYACTECDKTFPKKSQLIIHQTAHTGEKPYVCNECGKDFVKKSRLINHQRVHTGEKPHGCSICEKAFARKSRLIEHQRTHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKTHTGEKSYICSDCGKGFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLLIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKTCLISHQRFHTGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYICSDCGKAFRDKSCLNRHRRTHTGEKPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCIGSVKV	510868	490953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_494450_504289_504386_504665_504793_508997_509204_509784
523267	contig_19899_pilon	-	2508	6	Intergenic	novelGene_102517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	47	junction_5	63.6207513316213	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1033	1455	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156653	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_145554_156555
523268	contig_10354_pilon	+	1897	4	Intergenic	novelGene_50840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_3	529.677469996811	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432196	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_475056
523269	contig_3095_pilon	+	1171	6	Intergenic	novelGene_75025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2979.94225447407	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	103	828	147280	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848_152030_152091
523270	contig_11720_pilon	-	2097	13	Intergenic	novelGene_43897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.296040039848	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	109	1038	124674	118106	TRUE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134630	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117670_117852_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
523271	contig_6102_pilon	-	2010	9	Intergenic	novelGene_32100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	308.958305237131	196	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	874	1812	819997	816763	FALSE	30	AAATATTTTATTTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822100	816564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820391_820920_821096_821337_821521_821978
523272	contig_18364_pilon	+	2151	2	Intergenic	novelGene_102586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATATAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189606	191997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_190596_190835
523273	contig_10674_pilon	-	3267	8	Intergenic	novelGene_6450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.547817191109	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	130	771	326479	305906	TRUE	85	AAAAATACAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFIPKQKPVQTLTEEKVSLDPELEEALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTQFCNIVGSSNGVDQKQFSNVVKGEKILPVFDEPPNPTNVEESLKRMKENDARLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKYFSLAATRSNDPVAVAFADMLRVNRTLKSLNVESNFITGAGILALLDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ	327780	302721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_303531_304218_305941_313927_314073_315665_315810_318345_318454_320217_320349_326400_326491_327662
523274	contig_5005_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_84328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTTAAGAGTTCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531955	532298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_532000_532300
523276	contig_13702_pilon	-	2621	8	Intergenic	novelGene_102607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	109.304293472071	496	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	361	1239	151513	144255	FALSE	10	TTGGCATGTAGGTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	158846	142872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151585_157337_157448_158667
523277	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	242	1480	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34929_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523278	SIRV6	+	756	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	351	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	36	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	257	568	2021	10736	TRUE	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1654	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523279	contig_15087_pilon	+	2102	23	Intergenic	novelGene_37190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3	488	110644	126729	TRUE	10	CAGGGGCGGGCTGGGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRKAQYVFGFQKVQTRTEAVARDGSWEKAEEADVEWGWTESVATALQSLRHEQGCDRAGPPPGPSGWEPFPNIPSHLLLDGVLHVIVGHFDELLEDFAEVRVAASTQDGHETCLQGSFVSTGLVCYFLCIFPGLIPAFSTFLTVPRGQRNEDPPEVARCI	110641	181178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_110855_116828_116908_118079_118173_126036_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133527_134810_134896_136587_136665_138314_138374_139527_139650_141726_141787_143036_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149623_149716_150479_150574_158909_158954_181067
523280	contig_8452_pilon	-	2735	17	Intergenic	novelGene_47975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	327.891982737837	1179	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	193	1323	145829	93883	TRUE	15	GTCTTCCTTGCATCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSDFCHLLTEAR	146021	74483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93916_94596_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
523281	contig_5935_pilon	-	2441	13	Intergenic	novelGene_102660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	68.9292612433614	1322	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	141	1886	423849	412799	FALSE	25	TTCAATTTGTTTTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METENGSQDKVMEEENIEKKKDVEKKKRSRVKQVLADIAKQVDFWFGDANLHKDRFLREQIEKSRDGYVDISLLVSFNKMKKLTTDGKLIARALKSSAVVELDLEGTRIRRKKPLGERPKDEDERTVYVELLPKNVNHSWIERVFGKCGNVVYISIPHYKSTGDPKGFAFVEFETKEQAAKAIEFLNNPPEEAPRKPGIFPKTVKNKPIPALRVPEEKKKKKKKKGRVKKEDNVPTKEANMDTSNENVCKLKRSRTTSEGSDVEVTEAQKPPSKKKKKREKAEVSNLPEVRTGKRKRSAFADTECLAPRSKVKKLTQKENIKKEVKEVTKENKDLEVSTEEEKDTRDIKDGSLLKAKRKHKKKHKERHKMGEEVIPLRVLSKSEWMDLKKEYLALQKASMASLKKTISQIKSESEMETDHGEPNKSGMKNEKTNSEECRPQEVNAMGPQFVSGVIVKIISAEPLPGRKQVRDTLAAISEVVYVDLLEGDTECHVRFKTPGDAQAVINAYTEIKKKHSWKLEVLSGDHEQRYWQKILVDRQAKLNQPREKKRGTEKLITKAEKIRLAKTQQASKHIRFSEYD	431655	412243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_412880_415238_415331_415558_415719_418976_419093_419846_419999_421668_421814_421907_422262_422333_422428_422509_422675_422837_422922_422997_423099_423647_423851_431516
523282	contig_11115_pilon	+	2013	7	Intergenic	novelGene_102810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	502.906441486773	2119	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	288	1925	165608	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165320	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
523283	contig_3463_pilon	-	2647	14	Intergenic	novelGene_61995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_13	177.265921994589	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	97	1596	597436	508757	FALSE	20	CACTGCAGTGTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTDGHTLSEKRNYQMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597532	507705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_597388
523284	contig_5302_pilon	+	2177	3	Intergenic	novelGene_81494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	38	829	342315	355700	FALSE	40	ATAAATCCATGATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342277	357048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
523285	contig_12790_pilon	-	1731	11	Intergenic	novelGene_35221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	1342	1731	308833	305933	FALSE	20	TGCCAGAGAAGCGGCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLLNRQASLLMSQPCLAACFHGIWKIISSLLIQTSPGIWLELICISSQGLMRIRVMGMLALQRPRVPARRGLLCGRGECDRCGKWRKRRMPESRSRGAGLALAWHGSGWTQLGTALVHVLPRRWSGAL	313333	305932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306137_307244_307339_308741_308840_309576_309754_309871_309922_310030_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312033_312347_312387_312706
523286	contig_15691_pilon	+	3441	12	Intergenic	novelGene_60756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1359	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCAAACTGGAGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25900	114447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_28016_29700_29802_32386_32514_32812_32984_39822_39879_41356_41468_43424_43480_50441_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
523287	contig_13894_pilon	-	967	2	Intergenic	novelGene_62025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1628	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	81	887	287096	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	287273	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219
523288	contig_9995_pilon	-	2478	6	Intergenic	novelGene_47698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	593.610983725874	31	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	137	646	321124	297529	TRUE	20	TTATATTCTAATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVSPTFELTNLLNHPDHYVETENIQHLADPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARGPHFNPSAIHNFYDNIGFVGPVPPKPKDQRSTIKTPKNQDTEDDEGAQWNCTACTFLNHPALIRCEQCEMPRHF	321260	295646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297069_297118_297672_299626_299708_300994_301089_301628_301790_321093
523289	contig_15087_pilon	-	2735	17	Intergenic	novelGene_37140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	396.941569220207	94	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	632	1906	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQLLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89806	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
523290	contig_13863_pilon	-	1874	10	Intergenic	novelGene_42076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	509	1009	490209	482108	TRUE	40	CGGCGAACGACAAGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLGGGPLPSRSRIIPPPTIPRGPPGPRSLRLISLRSSPPPLVSRSLAALVFFSSTFKRTSPRNIIGHEEFFQFIFINIMWQVTNKKLMTVWIANYSTVVRFILFSISSAWSWSSRRKTRSLPRSLFTHTRWLRLNFWFSFNSRLWWFLWQRNRFCRRRRSRFLL	490717	455722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_455902_474561_474681_477706_477791_478582_478757_479276_479366_481368_481474_481992_482172_487478_487581_488864_488997_490006
523291	contig_12919_pilon	-	1945	6	Intergenic	novelGene_75890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	447.686050709646	1650	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	77	721	743659	720289	FALSE	30	ATATACCAGGCACTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDNTVEMSFQKTSLVQEMS	743735	719064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_731011_731210_734916_735079_737596_737735_743565
523292	contig_15304_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_30667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	2311	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
523293	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_12057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523294	contig_3948_pilon	+	2511	3	Intergenic	novelGene_53362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	76.5	813	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	348	1049	1813956	1860572	FALSE	30	ATTGAACAAAGGGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812241	1862034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812478_1813844_1814520_1860434
523295	contig_10861_pilon	+	2222	7	Intergenic	novelGene_39268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	311.558448235105	591	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	219	761	1339531	1348775	FALSE	75	CATACAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRFKHRNRSFSRSKSNSRSRSKSQPKKEMKAKSRSRPNCSWNTQYSSAYYTSRKI	1337596	1350236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1345204_1345307_1348714
523296	contig_15087_pilon	-	2453	17	Intergenic	novelGene_37126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	431.541201501954	23	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	365	1036	66689	49262	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEVS	73993	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_42998_49197_49267_52528_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969
523297	contig_15063_pilon	+	1364	5	Intergenic	novelGene_14360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2539.00909559222	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	558	1109	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35035	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35850_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523298	contig_4364_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	51	512	1530895	1531717	FALSE	20	TGGCGACGGTGTCACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMD	1530474	1531719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
523300	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_8729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	245	1417	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27124	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523301	contig_7151_pilon	-	2388	11	Intergenic	novelGene_40673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	113.285303548166	33	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	1054	2292	12708	1924	FALSE	20	GTTTCTCAACCCAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65183	1827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_13467_40526_40716_65077
523302	contig_12622_pilon	-	1692	10	Intergenic	novelGene_5969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2350.5772340711	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	204	1532	1590194	1583714	FALSE	35	CCTTCAGAAGCGAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWAPYCVLAVK	1591031	1583553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583745_1586712_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590197_1590830
523303	contig_18272_pilon	+	1966	2	Intergenic	novelGene_7093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539810	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539874_539937
523304	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	26	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	233	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
523305	contig_9668_pilon	+	2131	11	Intergenic	novelGene_58108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	428.677979373795	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	382	1752	220737	359314	FALSE	15	TGATGGTGCTGGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRLDGNGDSLRWISKSEIAGPEGKPICNFAAYHQQCNRVSFALTLATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214029	359693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_220571_220766_281470_281586_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
523308	contig_8122_pilon	+	2321	3	Intergenic	novelGene_40265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1054.5	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743458	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_744458_744585_745148_748083
523309	SIRV6	+	1496	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	45	-13	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	213	704	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1132	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523310	contig_15063_pilon	+	1570	5	Intergenic	novelGene_9249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	63	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	10	GTGAGCGCTGCTCACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523311	contig_854_pilon	-	3064	7	Intergenic	novelGene_36167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	187.038691778525	1	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	136	735	483594	474385	TRUE	10	CAACTCGTGCCTGGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	491505	470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477_483627_488620_488655_491436
523312	SIRV6	-	609	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGCTCAGATGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11810	11201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11200_11800
523316	contig_8581_pilon	-	2341	11	Intergenic	novelGene_22814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	525.986397162512	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	3	1742	366738	306939	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELRAQDPQPAALPAHLSSSSAPSFLPVSRAGRCRRRSLLPPQLGGKQNPTYGV	366740	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307098_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650
523317	scaffold_19766_pilon	-	2532	13	Intergenic	novelGene_34422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1219	1929	848460	846215	TRUE	15	CTGCGGGAACTCGCACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRSASAILSNSSMQHTPWSASTRAPPSKVSSPVTESLSTAAVSPTPEEPRPVVVLTAGCQAINVRQELRLGHTRIPHQADVNVASDLHASRGLVHTSYQQEQKCLLHIFMPIYFWGDGGCQLFIEILLYRRVEVTHCTTCRKPVRRIGKNIPVTLMWSPGWAILVFSPSTNTVMLRGMFPTGTWSLCSCIFSSWNLMNLEPRVCRYSRPPERLVWHSWLGHMIRGMKVGDWIGW	851568	843835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_843899_845083_845162_845496_845661_845843_845971_846043_846224_846508_846648_846978_847127_847508_847665_847880_847976_848296_849043_849978_850147_850920_851032_851211
523318	contig_12427_pilon	-	1430	6	Intergenic	novelGene_40464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2208.75887321364	131	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	138	671	316061	314393	TRUE	25	GAGTTTGACTAAAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325976	313519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314073_314186_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325856
523319	contig_15063_pilon	-	1303	4	Intergenic	novelGene_14277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	AGAGCTGGCCATATACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523321	SIRV6	+	817	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
523322	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523323	contig_20819_pilon	+	2702	7	Intergenic	novelGene_55607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	37.9418414594407	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	130	1809	22116	24224	TRUE	5	TTTTCTTATTGTTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGISGNQSPHVSVPSTLLSISHVFETLFFLFSPCSVLSGVFFSLVLMPSFLPLFFFSPRQGWKQEPHVRTTVLP	21092	25486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22066_22323_22476_23309_23427_23643_23798_24654_24809_25033_25245
523325	contig_5033_pilon	-	2329	15	Intergenic	novelGene_28987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3863.02818791324	4	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	24	1016	566787	534624	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIEKK	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531162_531549_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534986_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547680_566747
523327	contig_5649_pilon	+	2308	10	Intergenic	novelGene_82266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.85439986551	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	116	1231	21190	34768	FALSE	35	AACCACTGTCTACTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12740	35845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12803_21136_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
523329	contig_500_pilon	+	1525	11	Intergenic	novelGene_31006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1053.32293718498	3144	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	289	1110	1493640	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTSMRRAGPSGSRCTSSRNRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493701_1494292_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
523330	contig_8674_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_102894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	496	858	134121	134483	NA	25	GCAGTTTCAATCCACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVGQSVTILASREHSGCTSSTTDLFILLAVHGIFNILCQHHNSKASILLQSSLFIVQLSHAYEVTENTMAWVRCTLVFNVTSLLFNTLKRSFAADLPSAMCRLIS	133625	135327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_133600_135300
523331	contig_10940_pilon	-	1838	4	Intergenic	novelGene_49174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTTTGTCCGCACAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176194	172533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_172628_173149_173218_174001_174121_174637
523333	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	29	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523334	SIRV6	+	831	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-43	513	0	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	245	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
523335	contig_15327_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_70635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCACATTGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900503	898969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899000_900500
523336	contig_9345_pilon	-	1746	6	Intergenic	novelGene_24609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	282	734	955353	947889	FALSE	5	GTATCCTGGTGTTTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKEKIWVPCFVKPRCKHSPHAVNFEVLFINLSV	1001356	946876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947984_949525_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
523339	contig_15063_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_13510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523340	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523342	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_8581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	245	1480	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26351	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523344	contig_17976_pilon	+	1689	4	Intergenic	novelGene_32510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	182	1198	41843	47385	TRUE	30	AATGAGTGGCTGCCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41661	48911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47631_48665
523345	SIRV6	+	807	8	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	722	3	136	5prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	42	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523346	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523347	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCATGTGCGAACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532819	1533244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
523348	contig_21422_pilon	+	2172	15	Intergenic	novelGene_79075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_1	97.8895931597409	371	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	1998	174	2171	21493	40703	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSEVEKAIPDSAATTNNLPLLDGAANVAKDTYISEKTEDGSTACSLGSQYEEKVRPCIDLIDSLRTLGVEQDLALPAIAVIGDQSSGKSSVLEALSGVALPRGSGIVTRCPLVLKLKKLVHEDKWIGKVSYRDLEIDLSDPLKVEEEVNKAQNVIAGEGMGISHELINLEISSPNVPDLTLIDLPGIARVAVGNQPADIGRQIKSLIKQYIHKQETINLVVVPSNVDIATTEALSMAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKSKVEDIKLEQEREAEKSIRLHFQMEQIVYCQDRVYRDALQKVREKEAEKEKNNKGNFTFCQQSSSEESSVEEIFQHLLAYHQEISNRLSSHIPLVIQFFILRMYSQQLQKGMLQLLQDKDGYSWLLKERSDTSEKRKVLKERLSRLAQARRRLAKF	18411	40704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_18477_19945_20029_21467_21619_24358_24552_25736_25875_27016_27172_28309_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_38751_38998_40481
523349	contig_15063_pilon	+	1426	6	Intergenic	novelGene_11089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	232	1260	34808	36632	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27137	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
523350	contig_3975_pilon	-	2115	14	Intergenic	novelGene_54825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	240.328990487288	8	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	101	1117	2066301	2060446	TRUE	15	GTACATCTCTCTGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENDSASRLPVCEKGLVASP	2079241	2056371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056794_2056900_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060499_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
523352	contig_6227_pilon	-	1850	17	Intergenic	novelGene_49753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	366.626592862206	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	795	1553	1206145	1202920	FALSE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224990	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206275_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214190_1222077_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
523353	contig_5671_pilon	+	968	4	Intergenic	novelGene_79465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	47	junction_1	2015.99255951008	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	28	408	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370402	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_392775_392919_521218_521303_531205
523354	contig_5947_pilon	-	1309	7	Intergenic	novelGene_101618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	346	789	1006184	1005741	TRUE	20	CTCTAGAGCTGTGAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTWKETSGFKKCRLIIPRAVSAELQLLHPPKFAPCPGGLGAGARRWLHPSALWAPSTPRASGRSEEHVPAEDQTAGSSLSRAQACPHRGGEGGWAAPGQWEQRPQPPPEKAAWLLCPPKSQLQRTQHSAGQLRVQRSPSTGGWQRR	1006600	998429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_998532_1000060_1000131_1001268_1001437_1003316_1003423_1003732_1003802_1005735_1006186_1006256
523355	contig_18108_pilon	-	2353	18	Intergenic	novelGene_33507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	273.151541650203	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	159	2141	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335421	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_269946_271383_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
523356	contig_15063_pilon	+	1424	6	Intergenic	novelGene_10710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	233	1288	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDANTCY	27136	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36527_36643
523358	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523360	contig_7457_pilon	-	1178	4	Intergenic	novelGene_31716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	62	403	1176842	1174926	FALSE	35	TTTAAGCTCTTATTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176903	1174150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
523361	SIRV6	-	873	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8728	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	4	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11275	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1546_1655_1736_1847_2030_2476_2614_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
523362	contig_16303_pilon	-	1777	8	Intergenic	novelGene_34065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	270	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	45	1157	47976	35759	TRUE	25	ATATATGCATCACTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48020	32966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33225_35396_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
523363	contig_14956_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_102959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	29	379	39911	39481	FALSE	15	ACTGTGGTCCAGGTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLPVLLYLLAILHGVEVKDHIVQWGYGTVVSSQKLRLACATYTLPVSESSMSWIRLHPGKGLEWVSVISANGNTNYSPNLQSRVSISRDTGENQVFLQLSTVTAEDPGVYYCTQG	39939	39480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14956_pilon_-_39786_39865
523364	contig_15327_pilon	-	1683	4	Intergenic	novelGene_70728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	357.297572837482	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	334	687	961905	960518	FALSE	20	CCTTGATCTGTTTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	962238	959521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814
523366	contig_10861_pilon	+	2705	11	Intergenic	novelGene_39391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	355.326835462789	1495	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	138	2039	1907049	1934804	FALSE	35	TTACCTATTTCAAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQVNGNAVQLKEEEEPMDTSSVTHTEHYKTLIEAGLPQKVAERLDEIFQTGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903750	1935470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1907039_1907206_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
523367	contig_5033_pilon	-	2061	16	Intergenic	novelGene_29054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3875.65588198379	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	31	1815	566787	531735	TRUE	20	GCACTAAAGTTTCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNVGCRALQTSCVELEGMFHPGETAAGILRPGVLACLCTVATWRRDTWCWHEPVLPDNSCPPAVPGPCSEPGQALGHWGAWAF	566817	531028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531127_531586_531910_532093_532161_533378_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
523368	contig_8710_pilon	-	2499	16	Intergenic	novelGene_73532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_14	72.8018925272932	1785	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	131	1969	518747	459003	FALSE	25	TACTCCTTGCAATTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	520861	458472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459117_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500_495617_502005_502097_516296_516415_518639_518757_520740
523369	contig_10134_pilon	-	1884	5	Intergenic	novelGene_16251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	464.189616428459	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTAATGTCTGCTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39721	32247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33485_33607_33668_34985_35178_38558_38817_39584
523371	contig_11681_pilon	+	3350	2	Intergenic	novelGene_102977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	21	junction_1	0	273	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	166	2559	190373	192766	FALSE	15	TACATCCTATTCCTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQGWAPKQPEERELTTNCSNMSLRRVPADLTPTTTTLDLSYNLLFQIQSSDFHSVSKLKVLILCHNRIQQLDIKAFEFNKELRYLDLSYNRLKIVTCYPLAGLRHLDLSFNDFDTVPVCEETGNMSHLEILGLSGAKIQKSDFQKIAHLHLNTVFLGLKTLSHYEEGSLPILNTVKLHIVLPMNTNFWVLLHDGIKTSKILEMTNIDGKSQFGSYEMQRNLSLENAKTSILLLNKVDLLWDDLLLIFQFVWHMSVQYFHIQNVAFGGNVCLDHNSFDYSNTVMRAIKLEEVHFRVFNIPQDRVYLLFTKMDIENLTISDAQMPHMLFPNYPTRFQYLNFANNVLTDALFEKPIQLPHLKTLVLKGNKLETLSLVSYFANNTSLKHLDLSQNLLQHENSENCSWPETLITMNLSSNKFSDSVFRCLPRSIQILDLNNNKIQSVPTAIIHLESLRELNVALNFLTDLPACSHFRRLSLLNIEMNLILSPSQEFFQSCQEVKILNAGRNPFRCTCELRDFIQLEKNSEGMLVGWSDSYICEYPLNLKGTQLKDIHLPELSCNTALLIFVIVVIMLSLGVTVAFCCFHFDLLWYIRMLSQWTQTWHRVRKTTQERLKRNVQFHAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILICLHERNFDPSKSVTENIINCTEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELFFAHHKLVHENSDYIILILLEPIPLYCIPTRYHKLKALMEEQTCLEWPKDRRKCGLFWANLRAALNVSLSETREMCELQTLAELNEESRGSTVSLIKTDCL	172935	193557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_172997_190268
523372	contig_15063_pilon	+	1693	7	Intergenic	novelGene_11468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3605.68335717686	17	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	231	1325	34808	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
523373	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27170_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523374	contig_5018_pilon	-	1965	8	Intergenic	novelGene_47093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	500.7672480651	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	930	1412	1400899	1399645	FALSE	0	TGTCTTCCTCCTGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
523375	contig_20693_pilon	+	2195	13	Intergenic	novelGene_60257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	532.664033159948	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	11	934	19372	28903	TRUE	15	TTTGAGGATTTTCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEVCILT	19361	35157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27986_28900_28998_29789_29968_32928_33015_34254
523376	contig_5954_pilon	-	2755	9	Intergenic	novelGene_28777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1876.48584044085	2	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	107	817	1462068	1392942	TRUE	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462174	1390877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391295_1391368_1392314_1392365_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
523377	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_13802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	52	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523378	contig_9127_pilon	+	3332	6	Intergenic	novelGene_102993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	86.716549746862	69	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	359	1219	26294	29117	FALSE	80	AGGTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPRTFLPALCKIFLDESAPDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELICTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLLKHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTASGPSSACKPGRSTTGAPSTAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPVVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVDLLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVNFMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKVKSKFLKY	18622	31230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_18858_26170_26399_27362_27645_27742_28014_28829_28907_28991
523379	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523381	contig_4654_pilon	-	2028	6	Intergenic	novelGene_103099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	898.704934892426	117	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	191	511	500418	499009	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVHLVFR	515980	494401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494970_496408_497031_497816_497941_498805_499030_500118_500422_515793
523382	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523383	contig_11752_pilon	+	1493	8	Intergenic	novelGene_37648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1099.89517125729	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	172	1200	87165	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85047	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85214_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
523384	contig_19579_pilon	-	1622	7	Intergenic	novelGene_59369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	584.494867385506	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	88	846	13090	7943	FALSE	40	AAATCTATATGGGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13177	7166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12181_12900
523387	contig_15063_pilon	-	1502	4	Intergenic	novelGene_13219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	790	1113	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36789	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523388	SIRV6	+	639	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAGAAAGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1722_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
523389	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523390	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523391	contig_9177_pilon	+	1827	4	Intergenic	novelGene_32675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_3	542.326674820834	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	34	420	395377	415476	FALSE	20	TATCTTCCTCCAACGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395343	416883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_415315
523392	contig_15063_pilon	+	2146	7	Intergenic	novelGene_13064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3047.82051910323	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1400	1897	36064	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30259	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35037_36158_36266_36445_36498_36600_38975_39092_39506
523393	contig_10253_pilon	+	1507	9	Intergenic	novelGene_76861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	118.885186209216	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	207	1505	41610	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	16086	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
523394	contig_9485_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_103109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATAAAGTACATTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213487	211375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9485_pilon_-_211400_213500
523395	contig_14925_pilon	-	1034	6	Intergenic	novelGene_55137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1760.40854349211	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	239	496	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSATYLCAVEESGLKLVFGQGTRLTVNPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	276311	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_94214_94271_276281
523396	contig_3745_pilon	+	2742	4	Intergenic	novelGene_85063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	116.482712117388	69	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	172	723	363058	370795	FALSE	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGQQRARGPGHSHSLCCTLRRWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGYRMERPDNCSEEMYSLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	362886	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_363264_364271_364372_369179_369268_370637
523397	contig_11413_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_103228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876664	878864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_876700_878900
523398	contig_13787_pilon	-	2288	8	Intergenic	novelGene_40618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	772.561390467331	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	301	924	205032	171777	TRUE	15	CTTATACATGTCTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQYYHSYWNSIWIGIY	205332	157980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171822_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
523400	contig_1450_pilon	+	1716	14	Intergenic	novelGene_27354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	647.187835697301	6	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	678	1514	347091	355748	FALSE	65	AGAAAAAAAAAAAGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243440	355950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244352_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325661_347045_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350433_352422_352474_354170_354330_355589
523401	SIRV6	+	1343	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	555	18	339	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	91	582	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1642	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523403	contig_7816_pilon	+	2076	14	Intergenic	novelGene_66483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_7	853.910177779827	1802	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	98	1969	170169	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170071	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
523404	contig_12869_pilon	+	2066	9	Intergenic	novelGene_75339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	309.004019998122	6	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	44	994	67502	97410	FALSE	20	AAACTCTGTGTGTGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRP	67458	98482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97358_97407
523405	contig_10299_pilon	+	2971	20	Intergenic	novelGene_79706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.8645229888719	13	23	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1952	2809	337976	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320525	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334594_334719_334789_334912_335029_335130_335211_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
523406	contig_21203_pilon	+	1309	8	Intergenic	novelGene_84476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	278.730723686017	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	71	847	53950	108269	TRUE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLAPINRFS	53879	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106357_108248_108379_120210_120376_121973
523409	scaffold_16539_pilon	-	1958	12	Intergenic	novelGene_68352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	25	junction_11	267.91512162753	1610	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	171	1646	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502814	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502245_502747
523410	contig_17796_pilon	+	2532	15	Intergenic	novelGene_33812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_14	360.302997489613	47	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	105	1289	53527	117926	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGTYISDESHREVKFISL	53422	122384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_117874_117961_120424_120724_121474
523411	contig_3077_pilon	+	1613	8	Intergenic	novelGene_26723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3985.53131172428	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	554	1120	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10111	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10252_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
523412	contig_11896_pilon	+	2233	2	Intergenic	novelGene_88010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATGTAATAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131998	134280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_133117_133165
523413	contig_15063_pilon	+	1389	5	Intergenic	novelGene_13948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	198	1217	34808	39515	FALSE	15	CGGGGCTTCAGACTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVK	34610	39687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36497_39506
523414	contig_10734_pilon	-	1874	5	Intergenic	novelGene_50995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	82	687	320632	311551	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320713	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310349_310558_311676_315844_315953_318838_319032_320452
523417	SIRV6	+	541	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATCTTATTGCCCGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2022_2470
523418	contig_12079_pilon	+	2289	12	Intergenic	novelGene_67401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	161.817977527961	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	350	1978	491184	578891	FALSE	15	CGTTCACTGGTAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEELSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	490834	579202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494839_510897_510963_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
523419	SIRV6	+	770	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	782	474	-416	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	133	465	2002	10736	TRUE	35	CATAAATTTGTGAACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1869	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523420	contig_5018_pilon	-	2016	6	Intergenic	novelGene_47107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	505.274024663845	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1351	1833	1400899	1399645	FALSE	5	GGTGTTTTTGTCTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402764	1399461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401446_1401873
523421	contig_1865_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_103239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57688	60039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_+_57700_60000
523422	contig_11285_pilon	+	2018	13	Intergenic	novelGene_5581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.428581631951	3	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	33	1700	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAERLQPRKLWGSCVLSYRVTMNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEPQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763521	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763547_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767527_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769415_769653_769740
523423	contig_12790_pilon	+	1839	11	Intergenic	novelGene_35214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	265.297870326921	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	213	1397	307252	312898	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSRLLRAWQARAWAHLWGKAGPASQEVGVLKLVCQMEGSDRSQPLAFPSEPSCLDRVSLSLSWPEEHRPVTSEKYSTNPRAGSALRDNCTK	305931	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312407_312627
523425	contig_7342_pilon	-	2615	22	Intergenic	novelGene_71125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	106.467479837923	8	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	825	1757	81495	77074	TRUE	50	ATAAAGCCACAAGAGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKPWLPVFTAPLSTPPSKSVLCRTGPFALARDSGKKKDLLSPQGHPL	86819	76120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77333_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83520_83642_83789_83834_83913_83979_86703
523426	contig_6589_pilon	+	1350	7	Intergenic	novelGene_26097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4405	junction_1	2222.83770712624	50274	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	478	831	1879501	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876573	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
523428	contig_11417_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_103330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACCAGATAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580218	582439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_580200_582400
523429	SIRV6	+	740	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	595	581	379	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	26	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	51	542	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1682	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523430	SIRV6	+	786	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	178	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	56	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	111	336	294	629	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVICV	1481	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10727_10819_11033
523431	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523432	contig_5210_pilon	-	2570	8	Intergenic	novelGene_65408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_6	172.984722694561	524	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	346	1182	439927	431502	FALSE	10	TGTGGACAGCTGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444367	430113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777_439957_443013_443119_444156
523433	contig_11507_pilon	+	1576	6	Intergenic	novelGene_103347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	33.4149667065523	723	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	147	725	1165	21461	FALSE	40	GAATAAGATGACTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRVVCICLGNPPETFTWEYRDKDKNYQKIGPITPLEFYREHVKPVFDMENKVCLVNDPRPQHKYNKLYTVDYLSNMVGGRKTLYNNQPIDFLKKMVAASIKDGEAVWFGCDIGKHFNDKLGLSDMNVYDHELVFGVSLKNMNKAERLTFGESLMTHAMTFTAVSEKEDQDGVFLKWRVENSWGEDHGDKGYLCMTDEWFSEYVYEVVVDKKHVPEEVLAVFEQEPIVLPAWDPMGALAE	1018	22312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_1177_2068_2228_2345_2414_3695_3814_7753_7824_21309
523434	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	229	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36154_36271
523435	contig_12786_pilon	-	3041	8	Intergenic	novelGene_103416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_7	527.359846938753	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	309	1166	614067	592726	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRGRQAFSWPQSSIFFSLSPLG	629494	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_629303
523436	contig_6496_pilon	+	2231	13	Intergenic	novelGene_103482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	59	junction_1	70.4418593987663	450	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	235	1662	452626	467595	FALSE	20	GCGTCTGAAGGAAGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTELFNYIDENQDRYVKKLAEWVAIQSVSAWPEKRSEIRRMMEVAAADITKLGGSVELVDIGKQKLPDGSEIPLPPVLLGKLGTDPKKKTVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLEERDGKLYGRGSTDDKGPVAGWMNALEAFQKTNQEIPVNVRFCLEGMEESGSEGLDKLIFAQKDTFFKDVDYICISDNYWLGKRKPCVTYGLRGICYFFIEVECSDKDLHSGVYGGSVHEAMTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDVGAKTLLHSCKKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	450209	468164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_450279_451306_451439_452592_452686_453536_453681_455572_455736_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461578_462836_463002_463278_463421_463637_463786_467525
523437	SIRV6	+	708	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8195	1	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
523438	contig_15063_pilon	+	1746	5	Intergenic	novelGene_13031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	194	1609	30275	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30081	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523439	contig_990_pilon	-	2071	6	Intergenic	novelGene_76120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	125.705369813704	307	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	27	551	1605903	1586999	TRUE	25	CTCACCTTTGTGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAGGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1605929	1585412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1586147_1586212_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
523441	contig_5153_pilon	+	2514	15	Intergenic	novelGene_74354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	275.21301582889	2994	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	373	1791	1007835	1022174	FALSE	5	TTTTTTCCTGGTGCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGTPGGSYPPGPPGGFGQPPSAQQPIPPYGMYPPPGGNPPSGMPSYPPYPGAPVPGQPMPPPGQQPPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956533	1022897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
523442	contig_500_pilon	-	1684	11	Intergenic	novelGene_31050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	1226	1684	1493641	1485774	FALSE	20	AGTCGACGCGCCGAGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGADSDPGAVLVPGVAADGLHQEAVVGHGAPPVPKRGSPSQLYPAEARASRPPLRTRKPLGFREGTAGWIRPRGGGLWEAAQMAPMSVFIKWPVSFQAAVPALGCGLRLGVTFPVRHTCSCLRPLHSCSLGWQHSSPGAAGLRAPRRRTLG	1499509	1485773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485801_1491813_1492039_1492545_1492728_1493616_1493718_1494241_1494465_1495350_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498078_1498883_1498971_1499271
523444	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523445	contig_14811_pilon	-	1718	4	Intergenic	novelGene_74480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	421.842255930921	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	128	499	375703	375288	TRUE	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREKKLQCDPASYRGVPSVLSGDLQ	386594	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375357_375400_375765_386528
523446	contig_5018_pilon	+	1835	10	Intergenic	novelGene_47085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1334	1765	1401408	1402786	FALSE	20	GATAGGACCGACGCCGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLRKQLHITAPTVNVLLVLHSKLHHQRLVLVAEGLESRRQGVEAGVLARLQLTFIFLLVTIELARTQNEFAKIRLVFGFDPAVGPPISVQKLLLEVHDGLSGGQAEKAEQQRHG	1399086	1402856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399842_1399928_1400029_1400626_1400763_1400850_1400972_1401057_1401142_1401182_1401262_1401349_1401445_1401872_1402076_1402255_1402363_1402701
523447	contig_5033_pilon	-	2198	14	Intergenic	novelGene_28980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3409.0263355118	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	151	1515	545288	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547665	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531157_531614_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
523449	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523451	contig_9594_pilon	+	1817	11	Intergenic	novelGene_73932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_10	395.189182544259	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	134	1387	301335	322451	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301201	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
523456	SIRV1	-	1309	6	FSM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	252	0	106	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	380040	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10534	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444
523457	contig_3948_pilon	-	2162	13	Intergenic	novelGene_53324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	441.366250031271	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	436	1395	1490755	1472006	TRUE	40	CAAAGACTTCATCAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGVPDCGKS	1511002	1467929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1472032_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494259_1510757
523458	contig_19459_pilon	-	1331	8	Intergenic	novelGene_59851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	8445.01792025745	20	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	655	996	11335	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16770	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15783_16196_16265_16672
523459	contig_12919_pilon	-	1816	6	Intergenic	novelGene_75891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	952	junction_3	145.099414195923	22	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	80	913	743659	720131	FALSE	10	TTGATTTTGTTGTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743738	719227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_730980_731210_734916_735079_737596_737735_743565
523460	contig_9463_pilon	+	1565	3	Intergenic	novelGene_83844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	375	junction_2	69	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	798	1166	222660	223028	FALSE	15	TATTGGCTCTGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	218622	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_218671_219238_219290_221961
523461	contig_8772_pilon	-	1385	9	Intergenic	novelGene_21115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	959	1282	19240	15784	FALSE	10	TCCTGCAGCTCTACTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFTESYSTYLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23421	15680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19147_19235_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
523462	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523464	contig_15063_pilon	+	1785	8	Intergenic	novelGene_8438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3646.68247891708	10	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	295	1530	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLGPCHCGWWCSSNYHSDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	3409	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3459_27123_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523465	contig_5196_pilon	-	2052	5	Intergenic	novelGene_38659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	274.813118318613	1248	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	120	527	14523	10132	TRUE	15	CTTAATTGTGTTGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPSREVRQRRRGESRVLWSELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTF	16125	8433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10137_11763_11875_14231_14542_16024
523466	contig_6898_pilon	+	2764	6	Intergenic	novelGene_35761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2286.58947780313	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	348	785	124416	125646	FALSE	20	GGTGGTTAAAACGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119750	127625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124386_124464_124782_125008_125481
523467	contig_3018_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_78936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	1110	1505	671528	671133	NA	50	AGCCACTCATCAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPCEQLHNRTCRSGDEEEGSKVKAKASWNGKASQEPHCLFLKTFPSTPTLPQILTKALDISLSMPLFWHMAWFWCLKHFCAPVLTLQLNFTVLQSRCLNFSNSVSLVQETGMAQWLSTGLLTERLAVQTH	672637	671131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_671100_672600
523468	contig_14811_pilon	-	1709	4	Intergenic	novelGene_74492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	421.842255930921	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	130	909	375703	357434	TRUE	45	AAATGACAACCCCAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386596	356584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_356677_356725_357613_375102_375765_386528
523469	contig_3948_pilon	-	1977	13	Intergenic	novelGene_53327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_5	444.028613630048	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	322	1671	1494302	1468245	FALSE	35	TATGGATGCCAAAGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKTTYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511002	1467938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
523470	SIRV6	+	811	8	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	553	561	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	49	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
523471	contig_11386_pilon	+	2078	9	Intergenic	novelGene_82768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	433.047052870701	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	765	1469	17940	27749	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7901	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11261_11370_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
523472	contig_4604_pilon	+	2019	9	Intergenic	novelGene_19162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1168.94139475638	14	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	470	1186	373631	379856	FALSE	75	AAAAAAATAATAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	367294	380689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_367444_372056_372161_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
523473	contig_14513_pilon	-	1075	3	Intergenic	novelGene_70358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1722	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	176	340	18880	12143	TRUE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19055	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11464_11579_12153_18725
523475	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	29	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	4	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523476	contig_13863_pilon	+	1842	12	Intergenic	novelGene_42019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	822.51740165972	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	61	1134	98341	118962	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98280	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571_119798_119905
523477	contig_5222_pilon	+	2296	2	Intergenic	novelGene_58997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1495	1929	189560	190041	FALSE	20	TGATTTGTATTGGAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTTQASSRDCRDTPKQRRGFPFQSGAGFPAQPLRDHVFAVLCLQVPLGLAPAAASHRKNADPCHMDSVQSSELRKQDKLAALKKIFRSQKAWLSPSAAQPYHVPSFQNSLSPLCPEGSGQSFLLPPACLSTLQKAWLLLQVL	188065	190408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_189730_189776
523480	SIRV6	+	866	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-14	236	-8	127	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAATTTAAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	11095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523481	contig_12425_pilon	-	2035	10	Intergenic	novelGene_46694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	598.821641246115	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	92	1114	211174	204225	FALSE	35	GCCAATAAAAGATTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226583	203303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
523483	contig_4315_pilon	-	2784	3	Intergenic	novelGene_46781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_1	63	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1436	1855	333701	327997	FALSE	5	CATCCTGTGTCTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLPTSAPGRGTNRRGHPPRPPTGLWYLATAPPAPAPPAFAYVSSVPVMPYPAATVYYVSPGPTSAQAATEWPPKASSQPAAAHRHSIQLDLAGLEELNKALSRAVQAAKSVRSTTKQMSRSLSADLRQARGLRGSCLF	335399	327067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991
523484	contig_15063_pilon	+	1807	7	Intergenic	novelGene_8457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	325	1560	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKSWGRAGQFVCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26271	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523485	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	233	1396	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36149_36266
523486	contig_1443_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_28202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	155	460	344287	344592	NA	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344132	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344100_344900
523488	contig_10299_pilon	+	2755	23	Intergenic	novelGene_79685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	90.3812517127143	248	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	69	1217	320559	336895	TRUE	15	TTGACATGCTTGTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320490	340535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334551_334713_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
523489	contig_11258_pilon	-	2370	6	Intergenic	novelGene_67814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	12.9243955371228	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	351	722	332334	328661	TRUE	75	AGAAAAAGAAAGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPALLSFIVTMRNLTVEDEGTYWCGIALKWLKDGAYPFDPAFQAVVSVSPAATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRVELLHRVFLAAIFMEADCQDFLHGAAWWVQTANL	360413	325999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328660_328767_330514_330660_332213_332365_354892_355099_360299
523490	contig_11285_pilon	+	2083	8	Intergenic	novelGene_5635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	519.805929248246	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	371	586	767140	767445	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAGKGVGKEPWWHSG	766121	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768527_768610_768778_769756
523492	contig_15304_pilon	-	1237	2	Intergenic	novelGene_30476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	198	728	54100	53391	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
523493	contig_15063_pilon	-	1544	5	Intergenic	novelGene_10757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36800	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523494	contig_5196_pilon	-	2037	6	Intergenic	novelGene_38660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	338.408865132106	83	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	120	881	14523	9642	TRUE	15	CTTAATTGTGTTGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPSREVRQRRRGESRVLWSELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16125	8433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_8697_8748_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
523497	SIRV6	+	920	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	10	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	24	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	346	678	2002	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1147	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523501	contig_15327_pilon	-	2712	7	Intergenic	novelGene_70535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.656117407913	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	284	937	585509	513059	TRUE	10	ACTCTGTATCTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	592398	511139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_512879_513022_513245_513894_514064_517485_517609_525370_525469_585431_585647_592252
523502	contig_17936_pilon	+	1719	8	Intergenic	novelGene_29893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	580.510542364149	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	88	861	50646	121021	TRUE	25	ACCAGCCTAGTGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYPDHVRSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50558	126583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91062_114783_114934_118635_118827_121017_121063_125766
523503	contig_3130_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_103571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTATCTGCAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105701	107967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_105700_108000
523504	contig_10134_pilon	+	2083	5	Intergenic	novelGene_16210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1454	1939	34954	38820	TRUE	45	TAAGGAAGGAAACTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILPYHSRAVIISTVIVVCLWDGEVGIFTKKLLGFSILVERDLVQKPVLPAVAPQHNGLPLLKHQVRGLEQQPIGKHVQLHRVAEAGLACLAPVLPAAAGSGVKAVAGLDLSWDGDPSVEPLDGVVPRGVGPVALQSHIVPLEHIDPWGFKVHHCLREIC	32180	39728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_32928_33056_33734_34924_35178_38558_38835_39598
523505	contig_7171_pilon	-	2586	31	Intergenic	novelGene_101310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.91457526931	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	828	2487	78	2564	1075756	1057865	FALSE	25	GAATGAACTGACTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPSCDFPPQRLGPHLPSHRYSSATCWHSLYNYFVKE	1075833	1057842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057968_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
523506	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_8507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3240.97886447906	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	252	704	34808	35836	TRUE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSV	26344	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35371_35834_36158_36266
523507	contig_12391_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_103613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCCCCATCACTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87738	87470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_87500_87700
523508	contig_1516_pilon	-	2465	8	Intergenic	novelGene_50013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	323	850	363406	362192	TRUE	60	AAAACTACAAATCAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTKEREVVTSCIKYARGLQSCTPHSSLAWVEPHDGQPVSGPPHLSRVLKQSCVSRDFHPSFLVSQPTSAALQPLNEHYKRRWPNGGVEGRGRDRAWRRGSRAHHGTGTTRMVLVKPEPGRHPVSTMTTSPVLKKPRALPTFMPRFTRRSTSSAQASWTGSLHSTGKMPRYRWA	363728	352419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_353030_353505_353691_354791_355063_356020_356171_356369_356523_359953_360122_362113_362298_362984
523509	contig_4812_pilon	-	1966	5	Intergenic	novelGene_103652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_4	4812.09761954181	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	98	538	82626	81138	TRUE	40	AGAGAGACTAATACAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQVNNICIKGVYSFN	82723	78725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_81286_81547_81739_82268_82343_82598
523510	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	190	1362	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523511	contig_6735_pilon	-	1849	14	Intergenic	novelGene_15802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	753.712390016182	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	82	1578	564868	542464	FALSE	20	TGAATGTTTCCTCTAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568279	542192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
523513	contig_9848_pilon	-	1881	12	Intergenic	novelGene_79950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_5	488.937775959611	3195	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	215	940	113970	104073	TRUE	5	GCAGTCGTTCTCCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKETPLPWTITTGGSSGSPWKMRTTPVPTRTCSSAGQEPPSQMTTPRTTRIRHPSNSGGSPGGLWSLSWVKHLLPWQEAPTRTTVSQTM	114184	98496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
523515	contig_10106_pilon	-	3197	1	Intergenic	novelGene_73893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	565	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165624	162427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_162400_165600
523516	contig_12622_pilon	-	2304	13	Intergenic	novelGene_5971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	60	junction_2	2144.76865334909	3	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	154	1509	1590194	1586655	TRUE	40	AACCTTCAGAAGCGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590944	1583555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585590_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
523517	contig_10629_pilon	-	2078	12	Intergenic	novelGene_52897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	435.763147433508	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	62	838	256132	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPALDLSL	256193	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246727_246837_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066
523518	contig_5643_pilon	+	2528	6	Intergenic	novelGene_39167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	747	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGACCTGAAAGAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771491	784168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_773345_775227_775287_775434_775559_776616_776805_783323_783560_784100
523519	SIRV6	+	431	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1415	730	-14	139	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2502	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
523520	contig_3948_pilon	-	1948	13	Intergenic	novelGene_53298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	406.042861722202	2799	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	111	1622	1494311	1468245	FALSE	15	TCAACAGGTTTGCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510981	1467918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510872
523521	contig_8772_pilon	+	1686	8	Intergenic	novelGene_21079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5233.38665859569	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	144	1091	15355	20584	TRUE	30	AAAAACTCTTGCTGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEVILRLLTGTMMPCARRSRSLTSTGDRSSPSPVKWMLLKELTNLWSARCVKWRRTLLLKLLTTKTLLAVCRMRFRT	15211	23416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19123_20007_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
523522	contig_5981_pilon	-	3178	2	Intergenic	novelGene_35507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	330	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	808	1257	51396	50947	FALSE	20	TGAGTACAGACCTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	53079	49025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_52013_52888
523523	contig_5941_pilon	-	2603	8	Intergenic	novelGene_84549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_1	444.026061011224	1651	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	260	1294	151020	144460	FALSE	20	CTACTTTGCAATTGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLGTEDLAGHEGVQFFGLLSLYLEQEQRFQPREKGLSLIETTPENDNTLCSRLRNAKVEDLRSLTNFFGSCTETFVLAVNILDRFLALMKVKPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELLEILLLVKKHSKVNDTEFFYWRELVSKCLVEYSSPECCKPDHKKLVWIVSRRTAQNLHNSYYSVPELPTIPEGGCFDESESEDSCEDTSCGEESLSSSPLSDQECTFFFSFKVAPALCFPS	152269	143150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527_145734_148032_148132_148227_148307_148486_148738_149827_149966_150882_151021_152010
523525	SIRV6	+	380	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	41	1168	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACTAAGCAGCAGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
523526	contig_8242_pilon	+	2512	10	Intergenic	novelGene_80188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	462.847893847975	46	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1462	1923	33759	37065	TRUE	20	CAAATACGGGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3417	37692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29854_30702_30795_31973_32157_33721_33804_33959_34062_35060_35185_36874_37398_37435
523527	contig_12869_pilon	+	2102	9	Intergenic	novelGene_75328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	309.004019998122	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	64	1242	67397	97618	FALSE	20	TTTTAAACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEETDIPCYSNSDLYLNFCVFVFCFLNHFSTRPAQVLSRL	67333	98478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97366_97500
523528	contig_3155_pilon	+	1881	4	Intergenic	novelGene_26405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1141	junction_3	654.274322351786	7	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	36	542	258156	261211	FALSE	25	ACCTCACTCCAAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258120	262550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082
523530	contig_18081_pilon	-	2516	8	Intergenic	novelGene_23841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	263.711654529514	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	62	943	465998	430068	TRUE	15	CTAAATCTGTGCTTTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAKIIGNNVKKLQKFASTVKMWVFEETVNGRKLTDIINNDHENVKYLPGHKLPDNVIAVSNLNEAVQDADLLVFVIPHQFIRRICDEITGRVSEKALGITLIKGIDEGPDGLKLVSDIIREKMSIDISVLMGANIASEVAAEKFCESTIGSKVMENGLLFKELLQTPNFRITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQDHSRTGGRDAEWTETPGSSNFCRSVPHPQAEGTDGQVSAVYCRVSDLL	466059	427173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_428180_429500_430107_434819_434927_435608_435844_448204_448318_454649_454789_456513_456655_465890
523531	contig_7898_pilon	-	1592	5	Intergenic	novelGene_47535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6110	junction_4	1301.24197884175	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	876	1532	284247	282118	FALSE	20	TTCTCTTAAAAGCCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	285122	282057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229
523532	contig_11285_pilon	+	1759	12	Intergenic	novelGene_5633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	504.390148087374	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	399	734	767140	768082	TRUE	20	TTTGTACACTTCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPSAAPTTCTAAPRTLCAT	766093	770182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767829_768024_768149_768428_768527_768610_768718_769238_769320_769421_769653_769740
523533	contig_15063_pilon	+	1362	5	Intergenic	novelGene_13511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3981.51682779315	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	202	1053	34808	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36330_36486
523534	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523535	contig_6227_pilon	-	1834	19	Intergenic	novelGene_49757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.073657263785	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	72	1736	1224979	1202920	TRUE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225050	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202687_1202885_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
523537	contig_2365_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_103754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGGAAAAGAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244606	245168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_244600_245200
523538	contig_6163_pilon	+	1188	7	Intergenic	novelGene_103775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.882415786794	146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	18	1073	9548	16461	FALSE	45	AAAAATAAATTCTTGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGQVALEIFHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9581_9630_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
523539	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523540	contig_1213_pilon	-	2065	15	Intergenic	novelGene_76475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	200.231562375737	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	21	1586	101775	71277	FALSE	25	AAATGTTTTAGTTTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKKRKKMALTSFLPAPTQLSQDQLEAEEKARSQRSRQTSLVSSRREPPPYGYRKGWIPRLLEDFGDGGAFPEIHVAQYPLDMGRKKIKYDAIARQGQSKDKVIYSKYTDLVPKEVMNADDPDLQRPDEEAIKEITEKTRVALEKSVSQKVAAAMPVRAADKLAPAQYIRYTPSQQGVAFNSGAKQRVIRMVEMQKDPMEPPRFKINKKIPRGPPSPPAPVMHSPSRKMTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQRNENRDISEVIALGVPNPRTSNELQYDQRLFNQSKGMDSGFAGGEDEIYNVYDQAWRGGKDMAQSIYRPSKNLDKDMYGDDLEARIKTNRFVPDKEFSGSDRRQRGREGPVQFEEDPFGLDKFLEEAKQHGGSKRPSDSSRPKEHEHEGKKRRKE	101795	70797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_71476_71553_71718_73622_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84386_85233_85341_85432_85529_92927_92972_93016_93090_96621_96776_101761
523541	contig_10923_pilon	+	1759	11	Intergenic	novelGene_66174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	838.743727249271	81	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	54	1643	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13825	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42554
523542	SIRV6	+	774	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-13	540	-7	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
523543	contig_9807_pilon	+	2123	11	Intergenic	novelGene_32909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.764952471281	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	299	1297	140826	158783	FALSE	55	TTAAAAGTAAGTATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWDSGSSVGEITGHNKVINSVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	128551	159609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_128611_139421_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
523545	contig_10962_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_103892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAGAAAAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285263	287393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_285300_287400
523546	contig_3077_pilon	+	3196	12	Intergenic	novelGene_26826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.5519228556589	418	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	215	1480	492711	520670	TRUE	30	CTCAAATGCCTAGGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGSASLEPPASPAPHPTPPPRAGDGPGAIGWARERRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPDLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTTDEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGI	490520	522574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_490635_492610_492726_496881_497036_498360_498579_503787_503938_507593_507709_517678_517786_518599_518796_519232_519392_519712_519812_520617_520806_520993
523547	SIRV6	+	696	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8206	2	585	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGGTCGGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
523548	contig_177_pilon	+	2269	3	Intergenic	novelGene_41838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	3	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	63	866	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415668	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_417923_418195
523549	contig_513_pilon	-	2004	9	Intergenic	novelGene_80166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	269.751245363205	211	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	144	1319	453421	449687	FALSE	35	CCATGAAGCTGCAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454715	449001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
523550	contig_13216_pilon	+	1746	8	Intergenic	novelGene_47479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	885.000149890452	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	949	1389	260572	261012	TRUE	15	TAGTTTTGTGTTCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229626	261550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256214_256296_258447_258573_260430_261187_261367
523551	contig_4754_pilon	+	1935	13	Intergenic	novelGene_35959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	174.753854670569	4	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	13	1509	380119	420387	FALSE	30	AGAAATAGCTGGTTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHGECLQQEGSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380106	420813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414987_420159_420252_420370
523553	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523554	contig_3386_pilon	-	1874	5	Intergenic	novelGene_34504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	880.673428405785	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	114	509	409604	404888	FALSE	15	ACAGTCTTGTGGTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSSLQEE	412207	403522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404904_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
523556	SIRV6	+	768	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-7	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGCCGCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	10778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3099_3165_10724
523558	contig_6870_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_103973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGTTGTACATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434622	1434055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1434100_1434600
523559	contig_10354_pilon	+	1971	6	Intergenic	novelGene_50856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	439.365633612826	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	128	835	432370	475314	TRUE	30	CATATAGTTAATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432242	476495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056_475961_476005
523561	contig_10159_pilon	-	2857	13	Intergenic	novelGene_30786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	134.637682524454	14	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	941	1603	353226	349428	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKIGLSSH	638048	317387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_349371_349450_352585_353440_431854_431937_456756_456901_577727_577806_597817_597913_606778_606838_626384_626594_637988
523562	contig_7119_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_41043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACCATGGTCTCGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517300	515618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_515600_517300
523564	contig_2069_pilon	-	3050	21	Intergenic	novelGene_23400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_20	249.122153772	1034	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	42	2114	1259894	1234847	FALSE	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPADFPRVEGDSVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVASGLMEDDGKPRATQTPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWITQKDKLPPEPAVPPGPAACKGSHGSHVLRTQ	1259935	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234882_1235178_1235318_1236191_1236310_1236576_1236654_1236857_1237020_1245605_1245765_1246182_1246273_1246482_1246609_1247815_1247947_1249409_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1259834
523565	contig_10311_pilon	-	1742	12	Intergenic	novelGene_50434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.978539629779	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	32	1255	71526	65773	TRUE	10	AGTTGCTTTGGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65544_65703_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
523566	contig_5485_pilon	-	2568	2	Intergenic	novelGene_37695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1263	1760	85988	85491	FALSE	20	AACCAACCTTGTGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_87209_88046
523569	contig_3837_pilon	+	2022	2	Intergenic	novelGene_104024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGATTTCAGTGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131776	134608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_133267_134076
523570	contig_7070_pilon	-	1881	2	Intergenic	novelGene_104039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCATATCCTATCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87753	83435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_83549_85985
523571	contig_14711_pilon	+	2499	3	Intergenic	novelGene_68926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_2	109.5	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1861	2256	89519	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	87658	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_89673_90032_90194_90489
523572	SIRV6	+	906	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	223	2	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523574	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	580	18	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523575	contig_5967_pilon	-	1922	8	Intergenic	novelGene_44365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.221853826757	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	471	983	430750	388566	TRUE	25	CAAATGTTTTACTGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWILMTSLAWDPTTVSTVLSVTGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517605	387550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_387730_387805_388931_389224_389321_430698_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
523576	contig_10217_pilon	-	1446	10	Intergenic	novelGene_87417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	45	GCAGTTATTTAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	109086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
523578	contig_11285_pilon	-	3227	28	Intergenic	novelGene_5739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	141.724389111881	358	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	1438	2916	1199468	1192895	FALSE	10	CATTCTGACCTCTGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM	1230737	1192583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207799_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
523579	contig_854_pilon	+	1311	5	Intergenic	novelGene_36202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2878.59258145365	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	169	540	543631	562402	TRUE	25	AACTTCAGGTGCAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPLPPVPLLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMGSCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543462	563798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543639_556991_557065_557591_557752_562271_562405_563029
523580	contig_13224_pilon	-	3784	2	Intergenic	novelGene_104138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGACGGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420101	413809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_414834_417341
523581	contig_11285_pilon	+	1861	11	Intergenic	novelGene_5608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	513.777432357631	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	188	1543	767140	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARTRTQVYHVDPGELGGLGGRAGGWNTVPRWSLLSTDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766131_767052_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
523582	contig_13707_pilon	-	2238	13	Intergenic	novelGene_43531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	776.576711528802	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	17	574	275441	273376	TRUE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINVVLPSPEGAMLPGTTGSFLCC	275457	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271783_271846_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273714_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
523583	SIRV6	-	684	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-589	431	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAATTTCCCGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	1113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1528_1631_1736_1847_2030_2470_2613_2733_2826_3104
523584	contig_7412_pilon	-	1838	7	Intergenic	novelGene_76311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1245.5007917389	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	55	1581	377290	364445	FALSE	10	TTTGCCTTTCCATACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377344	364187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
523586	contig_7963_pilon	-	2091	5	Intergenic	novelGene_58601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	506	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACGTTAAGATGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298889	293129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296366_296813_297937_298190_298227_298397
523587	contig_8045_pilon	+	1304	5	Intergenic	novelGene_35385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	19	609	116118	118722	FALSE	20	ACACTTGAGTTCAGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116099	119417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
523588	contig_14924_pilon	+	3010	16	Intergenic	novelGene_104145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_13	44.702672055358	387	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	208	1770	44129	53716	FALSE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGLGAKKGLGAQKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPKYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISERATNRREVESWSSGLESNEARQKFAGAKAISSDMFFGREMDSEYEARSRLQQLSGSSAISSSDLFGEVDGAHGAGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQDRYGSY	43921	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_48758_48896_49018_49151_51163_51293_51371_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695
523589	contig_7171_pilon	-	3188	2	Intergenic	novelGene_101426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	476	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGAAACTGTTTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568081	1564847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1567954_1567999
523591	contig_12923_pilon	+	3405	18	Intergenic	novelGene_30092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	113	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	876	1214	46218	51175	TRUE	5	GCCTCCGCGCCTTAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTNSKTYEDSVALKSVAGPTTGISKACVTVGSSCLRRSGSHERLHPGRQRYNLEICCLYFSVMKCLFTFAVGPSPPAMVKSFSKMIHFWIFWALETATAFTSSMHFWIAA	45342	101245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_46283_46347_46397_48961_49072_51060_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57334_57447_57631_62785_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69783_73223_73314_75647_75878_77618_77717_86539_86684_93605_93731_101176
523592	contig_3077_pilon	+	1514	8	Intergenic	novelGene_26627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1792.01159343917	8	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	337	1020	13867	17590	FALSE	15	AGTGTGCGGCACTTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9599	18084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
523593	contig_9363_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_6483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361856	361166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_361200_361900
523594	contig_10930_pilon	-	1682	7	Intergenic	novelGene_37041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2097.9763000462	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	634	1239	276835	268573	FALSE	15	CCATTGTGCAACCTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKY	280341	268129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272895_273009_273950_274325_276723_277013_278495_278637_279700_279832_280157
523596	contig_12622_pilon	-	2300	13	Intergenic	novelGene_5961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2533.49207150701	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	13	1026	1590968	1588027	TRUE	35	TCAGAAGCGAATTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGWFLPALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTRTGSTASVPPE	1590980	1583550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586350_1586512_1586840_1587653_1587785_1587864_1588030_1588434_1588609_1588835_1589010_1589102_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
523598	SIRV6	+	436	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_1847
523599	contig_3410_pilon	-	2389	7	Intergenic	novelGene_58912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	582.859235912831	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	117	953	57649	15127	FALSE	15	ACACGTTGAGCCTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTAGRGVETLFCLGVGPSKKAGWTMAELALDLLDSPG	57765	13690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15235_30398_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
523600	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523601	contig_8330_pilon	+	3606	13	Intergenic	novelGene_71735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	561	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCGGAAGTGCTCACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513346	566429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_515528_517907_518028_518616_518786_519044_519098_519353_519484_519761_519821_520378_520463_521227_521313_524730_524851_526013_526229_549837_550003_566111_566265_566357
523602	contig_16310_pilon	+	2213	2	Intergenic	novelGene_70084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8087	junction_1	0	56	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	175	315	285976	288728	FALSE	30	CTAACAAAGCTGCCTCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNAVSVPPCS	285801	290626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632
523603	contig_13112_pilon	+	3048	1	Intergenic	novelGene_98831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTACAACAATTGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261188	264236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_261200_264200
523604	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523605	contig_15063_pilon	+	1333	5	Intergenic	novelGene_12252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1122	211	1332	34808	36610	FALSE	15	TGTACAACGTGTCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPS	27560	36611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523607	contig_7356_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_60351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGAGGAGGGCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95902	95154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_95200_95900
523608	contig_3077_pilon	+	1582	10	Intergenic	novelGene_26634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_4	3171.77107903105	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	254	1084	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
523609	SIRV6	+	305	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	735	-74	-420	74	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1865	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
523610	contig_15304_pilon	-	953	3	Intergenic	novelGene_30452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	121	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	189	305	54100	53702	TRUE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVA	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53710_53991
523611	contig_1532_pilon	-	2018	8	Intergenic	novelGene_37404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1559.7490509825	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	506	1270	27321	13113	FALSE	40	ATAATGAGTATGTGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34909	12364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27396_28815_28965_29438_29505_32049_32227_34870
523612	contig_3745_pilon	+	2481	3	Intergenic	novelGene_85069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_2	121.5	808	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	127	462	364282	370795	FALSE	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364155	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369268_370637
523613	contig_10642_pilon	-	3279	1	Intergenic	novelGene_78695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACTTCCAATTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234384	231105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_231100_234400
523615	contig_5988_pilon	+	1841	3	Intergenic	novelGene_16002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGCCGGGGCCTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689314	693503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_690503_690858_691360_693351
523617	contig_8801_pilon	+	3445	7	Intergenic	novelGene_66330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_6	110.930909428647	32	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	2096	2971	938911	944080	FALSE	15	CGGCTTGTGTAATTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGEIDTRFSFCAVATLSLLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSESHAGQIYCCTGFLAITSQLHQVNSDLLGWWLCERQLPSGGLNGRPEKLPDVCYSWWVLASLKIIGRLHWIDREKLRSFILACQDEETGGFADRPGDMVDPFHTLFGIAGLSLLGEEQIKPVNPVFCMPEEVLRRMNVQPELVS	936815	944554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_939100_939696_939803_940884_940938_941018_941130_941744_941871_942886_943037_943939
523618	contig_14711_pilon	+	2343	14	Intergenic	novelGene_68882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	396.712928865438	8	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	537	2102	83997	90570	FALSE	15	GACCTCAGTTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70403	90811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86182_88238_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
523619	contig_11631_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_104202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGCTGATTGACCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257264	258858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257300_258900
523620	contig_11631_pilon	+	3089	6	Intergenic	novelGene_104208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	511.22582094413	4	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2431	2943	261647	283438	FALSE	40	AAAATGAAAATTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	259216	283584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_261689_262604_262671_264543_264616_273522_273622_281390_281540_283353
523621	SIRV6	+	696	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	378	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	52	537	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1681	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2007_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523622	contig_12566_pilon	+	2309	19	Intergenic	novelGene_86000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_18	94.4251614301565	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	177	2189	47610	86359	FALSE	25	TATCTAACTCTTTAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQCLLS	44346	86479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44421_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82815_86344
523623	contig_8452_pilon	-	2103	2	Intergenic	novelGene_48044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2285	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGTAGCGGTCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434986	423985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_424012_432909
523625	contig_8045_pilon	+	1926	4	Intergenic	novelGene_35369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_2	493.689736125388	166	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	26	322	116067	117529	TRUE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKCKLRY	116041	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_118243_118527
523626	contig_2114_pilon	-	1961	13	Intergenic	novelGene_104313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.936980328498	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	71	1279	1167512	1139050	TRUE	15	ATTCGTCCAGTAGTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSWPTEEGKEVWDYVTVRKDAHMFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1167582	1138269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1138871_1138968_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437
523628	contig_7467_pilon	-	1923	12	Intergenic	novelGene_69463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_11	173.463550366598	1237	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	173	1498	92058	67563	FALSE	20	CAGCATGGTTCTCTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133043	67137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132905
523629	contig_11507_pilon	+	1579	6	Intergenic	novelGene_103348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	33.4149667065523	737	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	147	725	1165	21461	FALSE	30	TAAGATGACTTATTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRVVCICLGNPPETFTWEYRDKDKNYQKIGPITPLEFYREHVKPVFDMENKVCLVNDPRPQHKYNKLYTVDYLSNMVGGRKTLYNNQPIDFLKKMVAASIKDGEAVWFGCDIGKHFNDKLGLSDMNVYDHELVFGVSLKNMNKAERLTFGESLMTHAMTFTAVSEKEDQDGVFLKWRVENSWGEDHGDKGYLCMTDEWFSEYVYEVVVDKKHVPEEVLAVFEQEPIVLPAWDPMGALAE	1018	22315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_1177_2068_2228_2345_2414_3695_3814_7753_7824_21309
523632	contig_6735_pilon	-	1792	14	Intergenic	novelGene_15707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	869.711044988592	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	84	1586	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568281	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542337_542794_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
523633	contig_2054_pilon	+	1870	2	Intergenic	novelGene_51650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1206	junction_1	0	66	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	18589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890
523634	contig_177_pilon	+	1829	3	Intergenic	novelGene_41812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415645	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_417750_418485
523636	contig_10141_pilon	+	3125	7	Intergenic	novelGene_84630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1834	2307	408859	409332	TRUE	20	CCACCCCTTAGGGGAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCLTWTASSRVGVRTSPSRGRFGCSLQVAILPFGSCFNFSVCSSLSFSSLSSFCLEIGSSLIREEGPSPASSSQSSSTWSETVAPVFALALQGGAPALASASLDTALLSIPVSSSNVPDSVPALFGDPVSALASPGGTLVLLGVGAGFFFCHCSTA	399044	421155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_+_400106_402330_402411_404650_405163_405448_405605_408834_409369_417972_418694_421094
523638	contig_19459_pilon	-	1361	8	Intergenic	novelGene_59814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	7391.62659185848	1622	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	238	1023	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	17800	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17587
523639	contig_5041_pilon	-	2495	18	Intergenic	novelGene_27053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	672.570496427222	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	121	1539	616721	570908	TRUE	60	GAAAATAGAGGAAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSVK	636100	519104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_519174_525502_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_565859_565986_569904_570009_570821_570913_572065_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
523640	contig_9609_pilon	-	3006	3	Intergenic	novelGene_23133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	19	16	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1587	1931	522363	521807	FALSE	25	TTAACCTACCTCTATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLLEEMRLRMWLGPLADESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523949	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_521862_521982_522081_522171
523641	contig_16303_pilon	-	1928	8	Intergenic	novelGene_34094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	8	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	76	1188	47976	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48051	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33350_35233_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
523642	contig_14034_pilon	-	3507	2	Intergenic	novelGene_72652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	0	1134	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAAGTATATTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337286	333581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_336797_336994
523643	contig_15063_pilon	-	1118	5	Intergenic	novelGene_9498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	368	691	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36367	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523645	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523646	contig_11338_pilon	+	886	2	Intergenic	novelGene_6157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	825	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	152	334	6086	6268	FALSE	35	TAATAGCATATGTACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKVIGCSGPRKQEIPPHSIHPFALPPSPTSGLSDLLIFLSPDPLPLL	745	6820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_6083
523647	contig_11338_pilon	+	2092	7	Intergenic	novelGene_6196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	591.00378359383	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1150	1881	8000	13398	FALSE	30	AGCTGAATTTAACCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	6770	13609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_7537_7616_8189_8743_8924_9814_9899_10610_10736_10853_10903_13293
523648	contig_5954_pilon	-	1928	12	Intergenic	novelGene_28616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	437.078335169315	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	116	1567	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960563	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_960474
523649	contig_15304_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_30596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_1	0	13	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	186	650	66228	65380	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLGTALP	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65721_66104
523650	contig_15063_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_14296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523651	contig_6215_pilon	-	1903	11	Intergenic	novelGene_21203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	766.672426789956	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	223	1404	238609	228234	TRUE	30	CAAAGTGTGTAGTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243071	226729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_227092_228096_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
523652	contig_2646_pilon	+	3008	8	Intergenic	novelGene_69511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_6	84.5533281788626	5	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2078	2401	569631	573396	FALSE	20	TAAATGTGGATTTGTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	553999	574003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
523653	contig_513_pilon	-	2384	10	Intergenic	novelGene_80154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	383.461717631485	241	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	192	1061	453421	447909	TRUE	20	GCATTTTTTGTGGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYG	454763	445778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_447914_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
523654	contig_8447_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_69433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAACTTTTTTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82702	84485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82700_84500
523657	contig_2817_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_104356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATACAGTGATTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422412	424229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_422400_424200
523659	contig_15063_pilon	-	1354	5	Intergenic	novelGene_14305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	863	1186	35891	35108	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_39504
523660	contig_7025_pilon	-	1462	10	Intergenic	novelGene_104392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_8	463.458256540495	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	370	1170	85393	66952	TRUE	25	CTGCAAAGTCTTGTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLVRSYLFV	90882	65747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_65830_66741_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763
523661	contig_11338_pilon	-	2480	5	Intergenic	novelGene_6206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	661	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1614	2066	12003	11362	TRUE	15	ACCTGCGGGGCGGAGCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSWDEARAARVEQREAAGSGSTCPGCCSVVRCQTTAVAPHTPLLGALWQRWEGGGSREVGEEGSFSACAKAAVAAASLSKTCLHMLDSEGLRARVWWLVADVVELNSEYLLLVTRQTHFQYSSLTFLLSRQCSRKRKKPCRQLRMEKM	13616	10510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_10733_11045_11140_11263_11433_11537_11635_11718
523662	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523663	contig_1230_pilon	+	1970	9	Intergenic	novelGene_28869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1281.85543622321	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	50	1732	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404476	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405269_405788_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
523664	contig_13760_pilon	+	2963	6	Intergenic	novelGene_61317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	61.0815847862512	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	92	715	201094	204271	FALSE	40	GGGTAAAAAGGTGTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRGGAWSTAAGPGAGAAAAGGGGGALEAAMAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKAKHRKTGKKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGVAKRG	201002	206519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_201186_201650_201733_202500_202592_202950_203118_203240_203413_204251
523666	contig_15063_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_13179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523668	contig_4364_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	95	427	1530929	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALACAKLALLATTPPAPSSPQSSAAPDTRQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530464	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531092
523669	contig_19564_pilon	-	2356	4	Intergenic	novelGene_29600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	162	1496	15529	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15690	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
523670	contig_15063_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_12950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	40	GGCCATGAAATAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28170	39737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523671	contig_1516_pilon	-	2236	11	Intergenic	novelGene_49971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	320	847	363406	362192	TRUE	20	AGTCGCCTCAGCCTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTKEREVVTSCIKYARGLQSCTPHSSLAWVEPHDGQPVSGPPHLSRVLKQSCVSRDFHPSFLVSQPTSAALQPLNEHYKRRWPNGGVEGRGRDRAWRRGSRAHHGTGTTRMVLVKPEPGRHPVSTMTTSPVLKKPRALPTFMPRFTRRSTSSAQASWTGSLHSTGKMPRYRWA	363725	335185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_335267_347225_347394_347974_348076_352900_353030_353513_353625_354812_355063_356020_356171_356369_356523_359953_360122_362113_362298_362984
523672	contig_5791_pilon	-	2602	10	Intergenic	novelGene_35857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	374.630418702598	687	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	323	2083	1088908	1079821	FALSE	20	TTATTGCTGTTTTTAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESDDLSLIRKNRMALFQHLTCVLPILDSLLTARVINEQEHDVIKQKRQTPLQARELIDTILVKGNSAATIFRHFLHENDPVLYKNLFVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094482	1079301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1080455_1080711_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1089034_1090661_1090729_1094352
523673	contig_12622_pilon	-	2046	12	Intergenic	novelGene_5987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1887.55363997998	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	464	1222	1588902	1586655	TRUE	30	GATTCTCTAACCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590868	1583563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589184_1590000_1590234_1590830
523674	contig_9614_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_104421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACATTTTGATCAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110444	109311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_109300_110400
523676	contig_3077_pilon	+	1493	9	Intergenic	novelGene_26721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3802.80189260169	6782	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	393	872	13867	17462	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPQSTDSLASRSPTPPRATSGWGTMTRKVSKARCST	10110	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16274_16958_17054_17449
523677	contig_9833_pilon	+	1893	13	Intergenic	novelGene_68532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	431.162833380718	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	28	1218	230823	254740	TRUE	15	ACAGCTCTGCTCTTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230795	260321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254795_256860_256954_258491_258607_259908
523678	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	585	337	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523679	contig_9345_pilon	-	1806	6	Intergenic	novelGene_24644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2365.33321119879	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	203	733	955353	947957	FALSE	10	ACTTCCTGTATCCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001356	946883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952491_952541_952561_955197_955356_1001156
523681	contig_854_pilon	-	2896	10	Intergenic	novelGene_36154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	199.664409806079	1	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	111	935	497521	471988	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWVSGQLEHWLQNGPVPPRSSGTEQWGDGGATADQMAPEAASGGHPEVEGRDRRGVCPNRLLRKCGGEPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509243	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487085_495173_495239_497487_497571_509182
523682	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	16	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523684	contig_11285_pilon	-	1920	11	Intergenic	novelGene_5642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	479	1216	769622	768472	TRUE	15	GGGCCCAGACGTCTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSTWANGQQPQAPVERRQHV	770188	766355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_766442_766551_766637_767063_767176_767265_767402_767722_767837_768020_768147_768426_768531_768612_768855_769083_769320_769421_769649_769736
523685	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523687	contig_8447_pilon	-	2892	1	Intergenic	novelGene_69424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4245	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1455	1799	83037	82693	NA	20	GGGATTCAGCTGGGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDLSLNRGSCVGAKMMLECSPCLLCASGAKAHHSPYQLLLPIRSVAQAQAANVFQPPACKRPRVEAGRVRVCVCVRVCVHVCVGGMNISGVPPLAADTASSQVEGKPEELEG	84491	81599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_81600_84500
523688	contig_11720_pilon	+	1910	16	Intergenic	novelGene_43965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	333.628709129708	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	7	1671	262271	272210	FALSE	55	AAAATCATTCAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262264	272449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267820_267882_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
523689	contig_15087_pilon	+	2563	26	Intergenic	novelGene_37176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	90	11	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGACGCGTCGGAGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110641	181112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113503_114523_114579_116814_116910_118086_118173_118902_118919_126034_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133633_134801_134896_136587_136665_138314_138366_139517_139650_141726_141787_143036_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149623_149716_150479_150574_158904_158954_181067
523690	SIRV6	+	1196	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	765	65	-433	-64	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	150	482	2002	10736	TRUE	30	AATTATGGATTTAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1852	11760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523691	contig_15063_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_14234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	51	1223	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34757	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523692	contig_233_pilon	-	2566	16	Intergenic	novelGene_14623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1375.44732117713	1	95	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	82	1077	126907	98333	TRUE	15	TCCTAGAAGCTGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEQEGPTTGPAQRGL	126988	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78267_78324_78642_78970_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98375_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108547_108724_108814_109914_109966_126903
523693	contig_5799_pilon	+	3953	17	Intergenic	novelGene_50300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	248.745854236809	2	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	22	2232	561019	704733	FALSE	40	AATTATGGAAAATGCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRYGADKMAAGGAVSAAPECRLLPYALHKWSSFSSTYLPENILVDKPNDQSSRWSSESNYPPQYLILKLERPAIVQNITFGKYEKTHVCNLKKFKVFGGMNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKELLASALFKSGSDFTALGKYSSVFTQTAFAIWEVGFWFLLNETSDEMFIHQTKKVSQLHA	560997	706454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704553
523694	contig_4364_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTGAACACAAAGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533223	1532756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
523696	contig_10311_pilon	-	1678	10	Intergenic	novelGene_50404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1118.77321480845	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	323	1030	68953	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71556	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65871_67217_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
523697	contig_10937_pilon	-	3303	9	Intergenic	novelGene_67292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1691	2230	40942	40403	TRUE	10	GCGGCTCGCTCGCTACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPHQSRAQASCEAPTHLGKGFKQGQVKPLEEGQGLGAAGHLTGCQAGHVGQQIGCQPLEYLGLVEVEFAFRTEQTTTFYLARATGSPVYPTSLPHATFSSRSRSLVSVTKFIPEAQERGTGPMSYSVSVAAFWPVPAMGGAGTESDTAAGISQPSQIWQEPPPPTHTQRAHHRHRPGP	45545	33191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_33230_35742_36209_38926_39257_40163_41722_42769_42912_43272_43519_43892_44006_44131_44249_45252
523700	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523701	contig_14441_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_100553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	31	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	935	1363	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112618_113209_116578_116963_117220_117344_117539
523703	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_14006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
523705	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523706	contig_15720_pilon	-	2420	5	Intergenic	novelGene_41921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_3	1267.85061718643	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2076	2399	279842	278921	FALSE	35	ATTAGCCATGCTTATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQVSGSSQVDSASTISALGVIYQSQNHCL	284012	278899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279116_279713_279855_280270_281935_282577_282750_283785
523708	contig_3270_pilon	-	2652	15	Intergenic	novelGene_104445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_14	76.0830641671405	382	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	221	2404	68067	48840	FALSE	25	CTGGTGTACCACTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEKKKKFKLIRNGHVIWKGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMVCYEEKEVLVKTSWDPGF	78136	48591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_50386_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68088_70709_70822_78048
523709	contig_11258_pilon	-	2564	4	Intergenic	novelGene_67857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_3	66.5482281256734	20	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1326	1697	353988	353617	TRUE	55	AGTATACCTACAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSQCPPTLSSTWEYPCRIKVLILQEIHSAATLSRAISLSGAAMQSSLRHCSVAQWGRESGTGTITVQCVLRQTDIQSIADSSSQGVRTQRVTLCHGVREGSLGELTSLLCLDAGEGGAES	360655	351860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_355099_358490_358581_360530
523711	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAGATCAACCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30089	29845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
523712	contig_6975_pilon	+	2161	15	Intergenic	novelGene_74284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	125.754153580934	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	873	2114	440519	468675	FALSE	30	CTCAGCTGTTGCATTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTQIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWLPYNGQCPPDIDYEDYFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPDPSKQIWTVNEALVQKWLSYPSGRVPVEIANEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFSGVDMTAARLLFHKLIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPFGTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGIPPSERRIFNSFLHTALKVLEILHRCKK	401139	468722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_401486_402769_402801_403282_403588_437079_437157_440405_440628_441781_441874_448648_448780_457464_457626_464105_464183_464466_464592_465445_465506_465619_465732_466248_466439_467794_467968_468663
523713	contig_1230_pilon	+	2149	8	Intergenic	novelGene_28874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	822.744783995521	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	8	1345	405241	407613	TRUE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVSVP	405233	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407598_407779_408021_408237_408568
523714	contig_5945_pilon	-	1297	7	Intergenic	novelGene_104528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	791.068563540622	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	702	1295	32224	2616	FALSE	15	GAGTCTTTGGGGACCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILPGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKLAEDYNSSNTLNVKAVSETPAVPPVSEDEDDDDDATPPPVIAPRPEHTKS	55446	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_2733_12606_12645_16208_16357_16847_16949_32034_32246_34108_34300_54957
523717	contig_14925_pilon	-	2059	8	Intergenic	novelGene_55322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	997.683582410899	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	644	1057	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322476	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113037_113217_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129496_321827_322113_322212
523720	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523721	contig_9258_pilon	+	623	3	Intergenic	novelGene_104608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	82	474	97238	99582	FALSE	5	AGTGCTTGGCTTGCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96739	99731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
523722	contig_11720_pilon	+	2813	14	Intergenic	novelGene_43940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_4	346.858308809999	20	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1521	2561	266216	272210	FALSE	35	AATATTTATTGAGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_264816_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
523725	contig_6375_pilon	+	2515	7	Intergenic	novelGene_72921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	229.971314636316	440	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	4	1071	16524	28930	FALSE	25	CTGGCAGTGATGATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLSSTRQCLFTMADDLEQQPQGWLSSWLPTWRPTSMSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16520	30374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
523727	contig_3153_pilon	+	3024	11	Intergenic	novelGene_104630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	302.75772492209	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	321	2999	63009	190713	FALSE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVKENSQNLIQRMGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	57779	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_63010_66684_66946_67756_69121_69516_69752_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
523728	SIRV4	+	1579	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	41	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATATTGTAACCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1677_1864_2350
523729	SIRV6	+	186	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	906	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11143	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11100_11300
523730	contig_3122_pilon	-	3011	15	Intergenic	novelGene_64381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	133.403351088467	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	95	2104	276393	250499	FALSE	0	TTTCTGTGTTTGTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQLKIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEKKENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRLMQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKEHLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENSVTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG	277580	249591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256546_257951_258084_262106_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277512
523731	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523732	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523733	contig_10988_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_104728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGAAAACATCTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85054	85443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_85100_85400
523734	contig_16098_pilon	-	1752	8	Intergenic	novelGene_46132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1574.55496790007	57	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	355	1104	458816	456972	TRUE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCLPAWAVWWAGDPGSHPCTPPHPTLVLPCSRCWLPSTRL	460481	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
523735	contig_12427_pilon	-	2094	7	Intergenic	novelGene_40540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	200	823	522337	506035	TRUE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578151	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505126_505213_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
523736	contig_13740_pilon	-	1587	10	Intergenic	novelGene_34691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_3	4007.63692572008	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	170	1075	165243	157474	TRUE	45	TAAAGGAAATTGTGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165412	156808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
523737	contig_15304_pilon	-	2377	7	Intergenic	novelGene_30586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	194.876670401222	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	281	1585	66228	60349	FALSE	15	CGCTTTATTGTCACCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSELEVQDLCMEEDESKELDELWTSTFVFITLFLLSVSYSAMVTLFKVQWIFSALLQGKLQDSHEYSNIM	71754	59556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104_66402_71647
523738	contig_15219_pilon	+	2378	10	Intergenic	novelGene_40826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	344.95317270323	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	113	1201	19617	24591	TRUE	30	CAATCAGTCTTGCATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19504	25872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24904_24949_25325_25382
523740	contig_16098_pilon	-	2244	16	Intergenic	novelGene_45844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	330.174539700848	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	340	2160	215535	201500	FALSE	25	TGCTACAGTTCCTAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230478	201415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215653_228525_228592_230174_230286_230433
523741	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523742	contig_9594_pilon	+	1771	10	Intergenic	novelGene_73935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	483.158589101159	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	134	1336	301335	322451	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301201	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
523743	contig_5539_pilon	-	2934	4	Intergenic	novelGene_104782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2593655651606	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTCACGTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302041	282434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_284679_287369_287921_297220_297298_301979
523745	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523747	contig_15063_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_8560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3047.82051910323	3	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	922	1473	36064	39515	FALSE	45	AAATAAATGTGTATATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35369_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523749	contig_1076_pilon	-	2071	13	Intergenic	novelGene_101090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_10	315.705680007327	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	433	1845	66339	50922	FALSE	20	TTTTAAGGCAGTTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	73339	50695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921
523750	contig_14441_pilon	+	701	3	Intergenic	novelGene_100671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.5	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112452	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_116578_116914_117635
523752	contig_11285_pilon	+	2042	12	Intergenic	novelGene_5591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	528.862243620466	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	975	1724	768710	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
523753	SIRV2	-	347	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4439	121	3264	-86	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCGATGCGGCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
523754	contig_9945_pilon	+	3091	1	Intergenic	novelGene_104800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27590	30681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_27600_30700
523756	contig_6208_pilon	-	2892	8	Intergenic	novelGene_52983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	338.413465260157	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	177	548	383584	365189	TRUE	45	AATAAAAAGCTGTCTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGDYDYLIKFLALGDSGVGKTSVLYQYTDGKFNSKFITTVGIDFREKRVVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISQLQMHCIL	453361	354716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_355800_355849_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_383431_383607_420587_420701_453320
523757	contig_8060_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_104839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGATTGAATTGCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239681	237993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_-_238000_239700
523758	contig_7446_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_101957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATAGTCCTTGAGAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221010	220728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_220700_221000
523761	contig_15063_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_13646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523762	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	239	1051	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKERWPSMHQPST	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36264
523763	contig_17936_pilon	+	2115	10	Intergenic	novelGene_29906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1020.08409239413	3	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	490	1266	91140	118830	TRUE	20	CTATTACCAGCCTAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKK	50583	126578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68387_79103_79300_91049_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118868_125766
523764	contig_12158_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_104841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCTTTCATTTGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33947	30830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_30800_33900
523765	contig_7898_pilon	+	2757	1	Intergenic	novelGene_47634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	442	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	812	1237	718842	719267	NA	5	TCTCAGTGTGCGGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKAPHYPCVRALDPTTEGRDCVPCRKVASHQTRQISELGLTSHLGALRVAVPVCCWGSGVAVLPSSSSVDRQQHCLLPLCFSSWSLSWDLYVPKSLLSATEAQSGEVLLFNIKIFNRHVVSALPRVCLGNVPQGRLSLEP	718030	720787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_718000_720800
523767	contig_9807_pilon	+	2308	11	Intergenic	novelGene_32910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	475.764952471281	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	464	1462	140826	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	133127	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_133330_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
523771	contig_12279_pilon	+	1315	6	Intergenic	novelGene_50082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2027.46428821817	269	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	464	817	69434	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57507	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68578_69346_69447_71633_71711_75031_75096_76928
523773	contig_13547_pilon	-	4362	1	Intergenic	novelGene_104851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	70	348	8359	8081	NA	45	TTGGTGGAATCAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYCVTSPKKDNRYREPPPTPPGYMGISLADLKEGPHPHLKPPDYSVAVQRSKMMHSSLPRLLPAPLSSSPMACVPSKIVTQPQRHNLQPCHPKLADVTDADSEADGMLTHHLNGS	8428	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_4100_8400
523774	contig_11335_pilon	+	2519	6	Intergenic	novelGene_104931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATCCTCTAAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417723	451458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_418403_419081_420608_422035_422077_427384_427504_442122_442234_451415
523775	contig_13055_pilon	-	2913	16	Intergenic	novelGene_104953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_5	39.7670997461749	251	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	134	2014	143110	88287	FALSE	15	GTTATCTTTATATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDAAIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVTGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHSGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAVISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD	159265	87387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88371_89894_90042_98669_98832_103038_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115979_116548_116625_119247_119368_138770_138846_139427_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_159175
523777	contig_12566_pilon	+	2323	19	Intergenic	novelGene_86007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_18	85.2632995310033	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	92	2203	47511	86359	FALSE	25	TATCTAACTCTTTAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPKQDSSSCWCALLRPGEPVLPAERWNTQTMATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQCLLS	44370	86479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82815_86344
523778	contig_5317_pilon	+	1039	4	Intergenic	novelGene_76504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	46725	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	113	523	35282	43326	FALSE	10	TACCTGTTTTTGGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33676	43842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
523779	contig_6063_pilon	-	1881	14	Intergenic	novelGene_27578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	334.507710350634	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	13	945	70243	26073	TRUE	45	AAGCTTTAGTAACAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMNFQPTQLPLLKVLPC	70255	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27902_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
523780	contig_5210_pilon	-	2403	7	Intergenic	novelGene_65415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	163.976285548314	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	357	1022	442701	431502	FALSE	25	TCTCAAATGTGGACAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQPEVPALEPSEPLGKMSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444346	430120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_439777_439957_442673_442763_443013_443119_444156
523781	contig_11338_pilon	-	2705	14	Intergenic	novelGene_6291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	258.076659406033	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	973	1872	207642	196726	FALSE	35	CCCCAAATATCAGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLPVQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	233736	195892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_207621_207757_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225289_227961_228010_233579
523784	contig_12414_pilon	+	1609	3	Intergenic	novelGene_59562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	614	1081	373587	374054	FALSE	25	TAAACTTAGTGTTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370808	374582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373365_373431
523785	contig_15063_pilon	+	1858	5	Intergenic	novelGene_8449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	541	1716	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26055	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523786	contig_2703_pilon	-	3232	6	Intergenic	novelGene_101733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	361	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCGGGGGAAGAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585278	526213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526416_559432_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629
523787	SIRV6	+	570	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	345	8506	172	285	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
523788	contig_6163_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_103777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	15	ACGTGACGAGTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
523791	contig_6102_pilon	-	2537	8	Intergenic	novelGene_32120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	287.217047984727	7	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1563	2378	819332	816763	FALSE	10	AGATCTGTCTGCTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYDLPQVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_820391_820920_821096_821337_821521_821978
523792	contig_15063_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_13638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	13	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523793	SIRV6	+	463	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10349	14	1112	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATAGTTACGCTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11349	11812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
523794	contig_12884_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_104969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGACATGTCGTGGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12845	13773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_12800_13800
523795	SIRV6	+	904	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	459	337	35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	30	GCAGTTAAGTAATTGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523796	scaffold_12124_pilon	-	2152	10	Intergenic	novelGene_22069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1093	1401	857198	847715	TRUE	40	AGATACAGCCGATGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWCWVLTFFWMSS	858981	837253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846898_847601_847752_852322_852461_854702_854801_857162_857231_857788_858238_858370
523797	contig_177_pilon	+	2378	3	Intergenic	novelGene_41839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	3	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	62	1138	417672	418748	TRUE	15	TACTAGTTTGTGGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415669	420146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419447_419604
523798	contig_12644_pilon	+	2205	9	Intergenic	novelGene_44634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4643.81324990573	14	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1526	2131	2679113	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311_2680408_2680488
523799	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_11880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	227	1378	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35851_36158_36266
523800	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523802	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2382.00592988347	16	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	8	1423	28164	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28156	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
523803	contig_5643_pilon	+	1670	14	Intergenic	novelGene_39062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	815.977643561942	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1071	1457	640257	641217	TRUE	10	TGTGTGTGTAGCCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631221	641599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636437_640236_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
523804	contig_9345_pilon	-	2305	24	Intergenic	novelGene_24535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	166.471760010241	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	189	2204	729379	723552	FALSE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730077	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729381_729770_729919_730038
523805	contig_5280_pilon	+	2249	9	Intergenic	novelGene_52618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	764.022210082927	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	13	1455	38385	78235	FALSE	30	TATTTATTTATGTCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPAETSPAAQNPIKAHDFAARATPTAQRSSTAKASFTQSLSTTQNSTALHAPAAKGLQTTQTSAPITATRGLPVPRATTRFHATSTSKGRGTLPSSVFLTFRTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38372	79029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_58732_59015_78026
523806	contig_17753_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_105037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	988	1317	28767	29096	NA	55	TAAAACAAACAAGATACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGHLFNSVLKLLLKFTIQPKIRQAYKTNNNRCSSSMCMRVGPAHRTSQWTHQPKGKMQREEVTGKLDERKWGTWEREGESVDTSQGLQPLSQNSMCINCLMRNEFAL	27779	29707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_27800_29700
523807	contig_10753_pilon	+	1488	3	Intergenic	novelGene_105136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52	2	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	163	591	90354	100792	FALSE	20	CATGTGCTTATTGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEVRKQRRLLHQEERMKRQERIKEDQQTVLKPQFYEIKAGEEFRSFKDSTTKQKLMNKTLEDRLKLEAKNGTLNVSDTAVGSKQLTFTLKRVSFSFSFSFLMLFFNSQKKNQLPVVFCVCPPWKPLPKLLPYGGGLCSLS	90191	101689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_90362_90706_90875_100539
523808	contig_17281_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_105191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2482	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGATATGGAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	3418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3400
523809	contig_8616_pilon	-	4357	1	Intergenic	novelGene_72547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAACTCCCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418724	414367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_414400_418700
523810	contig_11258_pilon	-	2879	5	Intergenic	novelGene_67847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	143.743695513925	52	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	455	910	360591	354704	TRUE	40	AAGAATATTCAACACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSTRAA	369721	351845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_355099_360530_360777_361438_361618_369631
523811	contig_14871_pilon	+	2188	13	Intergenic	novelGene_63703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	740.620891924847	25	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	120	1547	201945	233218	TRUE	5	CTGTCTGTGTGGCCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	194870	234216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233404_233477_233900_234182
523812	contig_12837_pilon	-	1940	9	Intergenic	novelGene_57294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	71	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1578	1919	159366	128313	FALSE	15	GAGCTAGGGCTAGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCQKEYTALIWAVILSHNCGLPMKHIIPNWTCRTLCWRVTGQITKFLINPFQRHSLCFSSGSALSRCALKGPAKTLDYPDGGEGLSLRLTPALPDTGAWYRGDGSRENLVAA	167475	128291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_128359_129646_129800_153827_153894_153981_154012_159319_159398_161385_161492_163872_163967_166001_166344_166471
523814	SIRV6	+	1449	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	50	29	0	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	603	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	208	699	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1137	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523815	contig_3077_pilon	+	1616	9	Intergenic	novelGene_26635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3561.65246058624	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	552	1118	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10241_11276_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
523816	contig_15063_pilon	+	1394	4	Intergenic	novelGene_14224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	80	1252	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34728	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523817	contig_10311_pilon	-	1779	10	Intergenic	novelGene_50438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1075.85749893966	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	33	1133	71526	65773	FALSE	15	AAGTTGCTTTGGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLVSGFFTYKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71558	65126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65856_67472_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
523818	contig_5643_pilon	+	1909	16	Intergenic	novelGene_39071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	773.74652754561	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	447	1895	634983	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631240	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631972_634888_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
523819	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_8662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2988.60773396242	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGARGPRSLSLQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26752	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266
523821	contig_9727_pilon	+	2727	6	Intergenic	novelGene_86333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	199.309207012621	110	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	165	824	425838	430935	FALSE	5	CTTTTTGGGCTTTTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGAILPGRGRGHRSAPAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425197	432838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704
523822	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_8627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26367	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523824	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27544	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523826	contig_15063_pilon	+	1453	4	Intergenic	novelGene_14164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	145	1317	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34663	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523827	contig_15063_pilon	+	1503	5	Intergenic	novelGene_9927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	35	GAGAAGTTGTATGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523828	contig_7357_pilon	+	3982	2	Intergenic	novelGene_36852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	504	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1396	1827	197191	199466	FALSE	60	AAAAAAAAAGTTGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPESFPFLLIRKYPQRVQSQKGRETAQMCFIALKVHSSVLLKENSLLTSLCHVVVLIGIVFISLHIVSVYKRFNSLFQISRLYWKFQLIIQFRNQKIMTKSLSHLHYSYYSSINLVLSILKHSFRGANLFLNLYKKRKKSKV	195795	201621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_197437_199280
523830	contig_5005_pilon	-	2199	6	Intergenic	novelGene_84315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	530.141339644439	1936	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	566	895	520418	512817	FALSE	30	TGCACGAATTGTTATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539801	511512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_523352_523445_539649
523831	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_9918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523832	contig_13093_pilon	-	2961	5	Intergenic	novelGene_105221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.4425681598796	123	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	842	2529	232	2760	80341	57754	FALSE	25	TCCAAGAATGGTTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHSGEKPYVCRECGRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCKKCGRGFNRKSDLLMHCRTLLGEKPHVCKECGQGFTNKSNLLRHHRTHSGEKPYMCLECSRGFNRKSNLITTISYTSSCTRKHSGRELCGAGSVGGTSF	80572	57552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57841_58544_60770_77589_77717_80070_80127_80307
523834	SIRV6	+	577	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	282	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTACGTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1540_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740
523839	contig_5954_pilon	-	2085	14	Intergenic	novelGene_28647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	447.800700597511	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	104	1726	959926	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRCPALWTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960563	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_956105_956291_956379_956500_956705_956721_959829_959941_960474
523840	contig_10958_pilon	+	2008	5	Intergenic	novelGene_5415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	34	342	888255	895385	TRUE	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHKIYV	888221	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893894_895371_895855_900457
523841	contig_6589_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_25972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	22233	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296184	1297585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493
523844	contig_3948_pilon	-	2032	14	Intergenic	novelGene_53318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	430.685967227705	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	255	1175	1494311	1482626	TRUE	25	GACTTCATCAACAGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKTPEAMGERCLGDSPGVPQVGEETWSRAVWGSLDGHLQQAHQGGREDDEAREHVSGSLPGRGQRDEDSAAWQAGEVACSGDRGAHLHHHGVHGQRKPAGLSEK	1510944	1467925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485197_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
523845	contig_11307_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_105259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAATATTAGTGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212559	210726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_210700_212600
523846	contig_12427_pilon	-	1615	5	Intergenic	novelGene_40458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2469.20669193569	141	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	138	674	316061	314393	FALSE	35	TAAAGAGGGGAATGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325976	313451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315937_316079_325856
523847	contig_9482_pilon	+	2502	14	Intergenic	novelGene_44226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	126.447641010656	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	13	1452	212091	230430	TRUE	10	CGTGCTTTCTCTTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAGMSGVRVLSQLLRGRRLAQMRVCPAASQTKARCFHFNVDGNKRSSAKVSDSISTQYPVVDHEFDAVVVGAGGAGLRAAFGLSEAGFNTACVTKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMEEDNWRWHFYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTEQAPASVVELENYGMPFSRTEDGKIYQRAFGGQSLKFGKGGQAHRCCCVADRTGHSLLHTLYGRSLRYDTSYFVEYFALDLLMENGECRGVIALCIEDGSIHRIRAKNTVVATGGYGRTYFSCTSAHTTTGDGSAMVTRAGLPCQDLEFVQFHPTGIYGAGCLITEGCRGEGGILINSQGERFMERYAPVAKDLASRDVVSRSMTLEIREGRGCGPEKDHVYLQLHHLPPRTAGHAPAGHLGDGHDLCGCGRHQGAHPCAPHSALQHGWHPHQLPGPGSEARERPGPGRAGPVRLRGGCLRLGAWRQPPWGKLTPGPGRLWPGLCPEYRRVLQTRR	212078	236104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216625_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230543_232975_233477_234032_234147_235781
523848	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_11891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	3	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	227	739	34808	35888	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27142	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523849	contig_5671_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_79455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_4	418.042088192086	284	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	539	961	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	369891	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
523850	contig_15063_pilon	-	1492	4	Intergenic	novelGene_13986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	786	1109	35891	35108	TRUE	35	TGAGGACCCAAGAGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36785	34612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523851	contig_5643_pilon	+	2147	16	Intergenic	novelGene_38999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_15	733.805169419422	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	685	2133	634983	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631164	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
523852	contig_4486_pilon	+	2334	13	Intergenic	novelGene_38563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1254.17054262967	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	201	1355	343083	412464	FALSE	65	AAAAATTCACATAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLRCAGVGRGGGRGCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311707	413443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
523853	contig_1867_pilon	-	3056	13	Intergenic	novelGene_54604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_12	182.319983514942	323	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	388	1971	551098	517583	FALSE	30	TACAACAAATGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFSLCSEEELQLIRQACVFGNAGNEVLYTTVNDEIFVLGTNSCGCLGLGDVQSTLEPRRLDSLSGKKIACLSYGSGPHIVLATTEGEVFAWGHNAYSQLGNGTTNHGLVPCHISTNLSNKQVIEVACGSYHSLVLTSDGEVFAWGYNNSGQVGSGSTANQPIPRRVTGCLQNKVVVNIACGQMCSMAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566915	516497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972_551129_553162_553377_566772
523854	SIRV6	+	805	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	134	222	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTAAAATGGGGTTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523855	SIRV4	+	1557	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	8	2	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACAGGTTATATTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
523856	contig_1867_pilon	-	2859	13	Intergenic	novelGene_54599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_12	181.298326890607	58	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	114	1769	553353	517583	FALSE	20	CAAATGTGTTTTTTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEELPLFCGESGKPVQATLSSLKMVDVGKWPIFSLCSEEELQLIRQACVFGNAGNEVLYTTVNDEIFVLGTNSCGCLGLGDVQSTLEPRRLDSLSGKKIACLSYGSGPHIVLATTEGEVFAWGHNAYSQLGNGTTNHGLVPCHISTNLSNKQVIEVACGSYHSLVLTSDGEVFAWGYNNSGQVGSGSTANQPIPRRVTGCLQNKVVVNIACGQMCSMAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566862	516492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972_551129_553311_553377_566772
523857	contig_9243_pilon	-	2000	8	Intergenic	novelGene_60317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	222.091909637723	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	51	767	64589	20056	FALSE	55	AAAAAAAACACCACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSPEERWRIWRISCLMRRSAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64639	18822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_64578
523858	contig_7426_pilon	-	1815	7	Intergenic	novelGene_27534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	296.387509108524	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	298	783	1094562	1086952	FALSE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGAPLTDWAH	1102724	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1086980_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094740_1100318_1100420_1102705
523859	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_12923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	2856.40897807019	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28168	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
523860	contig_15063_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_8562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3655.2629484378	6	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	248	1486	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26348	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523861	contig_9345_pilon	-	1860	3	Intergenic	novelGene_24354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_2	534.5	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	64	696	144517	142269	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGEYHGCLCGPAWPPDLGLPPLLVPRVSIPEYITEQALRPFLPTASCVLSLFRRCSHALPCQPTSLQPGLHGFPKGSPPEHAPASLAATVIMPCIYEWLC	144580	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142781_142955_143072_144512
523862	contig_12837_pilon	+	2171	9	Intergenic	novelGene_57311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_2	2702.72450212281	38	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	387	743	153893	166049	FALSE	20	TTTTGTTTGACAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128786	167477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_136752_136828_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
523863	SIRV6	+	523	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	355	8543	182	248	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTAGTCGTCTTCGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	2788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
523864	contig_10134_pilon	-	2150	4	Intergenic	novelGene_16240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTTAAGTGTGTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39711	32188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38795_39594
523866	contig_9049_pilon	+	1748	8	Intergenic	novelGene_83134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1658.25419631365	16	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	38	322	88356	104158	TRUE	45	ATATTGCCACATAAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLRANHC	88318	113636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104137_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112869_112981
523867	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_9311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523868	contig_5936_pilon	+	2636	1	Intergenic	novelGene_53553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCTAAATAGCTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103205	105841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_103200_105800
523869	contig_5033_pilon	+	2143	14	Intergenic	novelGene_29048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1553	2140	542138	547683	FALSE	55	TAAAAGGAAAACCAACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQGLDKGGVGPYSNLDVSHQLNAVLTNVPISLWLGLAVGPLLRVEEKGDIGHEGSHHLGHVQFGNLIGLELFLVIQLSQVLLKRLAESESGAYLLRPALSACMRQLSLDYEAIHRSSPSFQGSPHLGAIAFQHAASCHDDVFADVTGKGFHCWLVPDSLQTVLHGPTVGRRLHILAPHCRAFAAFFEAEDRAA	531004	547686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_531148_531619_532160_533381_533498_533797_533878_534199_534356_534446_534633_534969_535069_536506_536637_540604_540662_542092_542236_542662_542868_544609_544683_545244_545325_547551
523870	SIRV6	+	755	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	563	598	347	-43	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	83	574	1733	10736	TRUE	40	GTATATGCGGTAAACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1650	11227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523871	contig_3424_pilon	+	1988	4	Intergenic	novelGene_55471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	196	1740	163748	170678	FALSE	30	TACTCAAATACAGCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQKCDGHSSCPRGLQVGGWSRRLPRAAPCFRAQRSLALFPDTHPGCQPLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149861	170926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168796_169282
523872	contig_4103_pilon	-	2082	19	Intergenic	novelGene_51917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	498.739076739197	1508	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	450	1457	85855	80996	TRUE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVSLTHSLFSGHSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91898	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_86025_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
523873	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	235	1470	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523874	contig_15063_pilon	+	999	5	Intergenic	novelGene_9031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	243	896	34808	36700	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPMW	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36021_36687
523875	contig_9833_pilon	+	1856	12	Intergenic	novelGene_68544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_11	166.637578728893	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	9	1199	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230814	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_259908
523876	contig_16385_pilon	+	2017	17	Intergenic	novelGene_86192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_13	205.114564024596	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	44	1621	3004	33714	TRUE	50	TGACAAACATAATAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPEIATAIPAFSNHHPDQSAAVNIEARPSTSKKITTC	2960	36806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_33607_33767_34231_34324_35622_35680_36611
523877	contig_10159_pilon	-	2587	9	Intergenic	novelGene_30902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	209.036928555698	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	531	986	1027025	1004067	FALSE	15	TGATTTTTCTGCACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1056758	1002465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1038415_1038456_1050930_1051092_1056677
523879	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523881	contig_8075_pilon	+	2331	10	Intergenic	novelGene_42490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	184.877002823065	12	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	47	724	664024	689159	TRUE	15	CTGTTTTTCAAGTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEALAGIRSSHIKYICPHAPIMPVTLNMNMAMPSWFDIIGLSPDSQEDEHGIKQAAENVKALIDQEVKNGIPSARIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVVGLSCWLPLRTSFPQGPISGANKDISILQCHGDFDPLVPLMFGSLTVEKLKTLVNPANVTFKTYEGMMHSSCQQEMMDVKQFIDKLLPPVD	663977	690849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_676735_676802_677759_677808_681283_681355_681594_681669_684219_684322_685194_685372_689105_690295_690377
523884	contig_16724_pilon	-	2015	11	Intergenic	novelGene_105292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	773.73972367974	1116	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	297	1280	569099	541872	FALSE	20	TGTTTGTGTACCGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMCHRSDSAPRNKISRFQAPISAPEYTGTPSPQQARVCPPRTLPDDGANLSSVRGILSLIQSSTRRAYQQILDVLDENHSVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575951	541136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_553367_553527_557699_557775_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
523886	contig_12644_pilon	+	1263	9	Intergenic	novelGene_44686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_8	3972.40007544243	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	192	1181	2678055	2680545	FALSE	30	GAGAAATATGTGTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677311	2680627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
523887	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523889	SIRV6	+	743	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	223	337	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523890	contig_7457_pilon	-	2284	5	Intergenic	novelGene_31625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.0696848572564	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	96	1217	960838	956489	FALSE	20	TAATCCTAGCTGTGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVSTIV	962465	955421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956502_956582_956939_958234_958375_960225_960896_962427
523891	contig_3529_pilon	-	3508	3	Intergenic	novelGene_105359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	164	151	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTCAGTGCTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621478	541519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_544892_550497_550582_621426
523892	contig_17936_pilon	+	1702	8	Intergenic	novelGene_29892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	767.362245830827	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	88	957	50646	125837	FALSE	25	TACCAGCCTAGTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARHVCCMLHETQGPVWASCRRPSPAQQSWASPSLITL	50558	126582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106449_121027_121063_125766
523893	contig_12414_pilon	+	1675	2	Intergenic	novelGene_59565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	3	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	89	1147	370898	374054	FALSE	25	TAAACTTAGTGTTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370809	374582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
523894	contig_11003_pilon	+	2287	9	Intergenic	novelGene_105419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_8	155.56344164038	1336	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	484	1788	56015	72538	FALSE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW	55531	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476
523895	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_12047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523896	contig_12046_pilon	+	232	2	Intergenic	novelGene_83506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTATGTAGTAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962293	964053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_962405_963932
523898	contig_5033_pilon	-	2075	15	Intergenic	novelGene_29012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3863.12809964745	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	125	925	545288	534624	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEK	547639	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531172_531549_531966_532136_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534630_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
523899	SIRV4	+	512	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	-1	439	-1	-439	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATTCCAATTGCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454	2332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
523900	contig_1225_pilon	+	1987	3	Intergenic	novelGene_44110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	367	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCGCAATATTGCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134406	150604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007_147081_148783
523902	contig_19579_pilon	-	1461	6	Intergenic	novelGene_59390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	562.77647427731	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	106	696	13090	7943	FALSE	65	TTAAATAAAAAAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12900
523903	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523904	contig_13740_pilon	-	1760	12	Intergenic	novelGene_34608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	4339.53171484346	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	164	1225	165243	157474	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165406	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
523905	contig_15063_pilon	-	1490	4	Intergenic	novelGene_13175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	778	1101	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
523906	contig_1443_pilon	-	2203	7	Intergenic	novelGene_28312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	536.46354851834	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1401	1919	750529	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_804491_805718_808694_808741_809399
523908	SIRV6	+	776	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	161	486	93	578	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2021_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523909	contig_10990_pilon	+	2775	2	Intergenic	novelGene_7398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	479	junction_1	0	1203	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	131	619	119582	121424	FALSE	45	GAGAAGGTAAAATTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119451	123580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089
523910	contig_8801_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_66276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGGCTGACATGTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422496	420229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_420200_422500
523911	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3675.05889597553	1	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	239	1477	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTGAKESRSLSPQSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28166	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34609_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523912	contig_15063_pilon	+	1740	5	Intergenic	novelGene_13045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	424	1596	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30093	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523913	contig_1813_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_105525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGCTGACCTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563244	562321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_562300_563200
523914	contig_9471_pilon	+	2063	7	Intergenic	novelGene_21813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_6	353.305069624287	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	322	852	412726	414785	TRUE	40	TAAGATGATTTATTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	412404	417480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414936_415630_416273_416936_417028_417152
523915	SIRV6	+	673	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-5	8193	1	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
523916	contig_15063_pilon	+	1483	6	Intergenic	novelGene_14271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	344	1228	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34815	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523917	contig_14167_pilon	+	2548	4	Intergenic	novelGene_105529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	821	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	145	537	21790	22182	TRUE	50	CTACAGAAGGCAAACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIKFQIRRQVRGHLISDAVARQVPGGGSPPKSFGAPISQGTQISVRAGLRDSSDGGVKACLAKGWPMGRDEGPRQTSVLSSQLPSSRGQGSGTDPGADDGAPSGCTSTWVGAGEEEESHWVTLGGNPA	21645	64528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_23606_26712_26946_28238_28392_64326
523918	contig_5954_pilon	-	2427	15	Intergenic	novelGene_28638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	417.595870698562	2	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	673	2301	956264	944848	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945233_945412_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
523919	contig_6227_pilon	-	1917	18	Intergenic	novelGene_49763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_17	300.463770708967	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	117	1625	1223803	1202920	FALSE	35	ACAAAAGAGGTTATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSRGVVAPDWKTLWPASLSSGSVPGLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224271	1202627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224189
523920	SIRV6	+	393	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2021	560	3	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3108	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034
523921	contig_7357_pilon	+	3286	13	Intergenic	novelGene_36889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	118.308301343002	7	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2454	2906	270199	273311	FALSE	45	ATGAATTTATACAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250862	273691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_251492_252250_253750_253841_256778_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
523922	contig_15498_pilon	-	4095	1	Intergenic	novelGene_42644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1706	2212	679185	678679	NA	75	GTACAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGPHCQHQEPIKTQPNRVLMLVLGSSHPAFLSDYSELFSSNSVSSLQPETQPNTAHWVLVRRSKLLSSAVGTPLHPAGTFLEIPDYETALSAKTVAGATRWLPGPVVGQEHGVDSHTLHLAVTSGCFCRQGCVTRSVLGAELLYPACLSLPLRQGFQPVRSGLNPC	680890	676795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_676800_680900
523923	contig_5279_pilon	+	902	5	Intergenic	novelGene_105562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTATGAGTGGAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322493	340247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_322654_330136_330285_332947_333064_339166_339278_339880
523926	contig_6102_pilon	-	2032	10	Intergenic	novelGene_32102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	351.639335430811	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	585	1835	821069	816763	FALSE	25	TAAATATTTTATTTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821749
523927	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523929	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	228	1466	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523930	contig_10134_pilon	-	1824	5	Intergenic	novelGene_16238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	454.748282019844	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGTGTGTGTCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39714	32185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33282_33541_33627_34922_35178_38558_38817_39584
523931	contig_233_pilon	-	2155	13	Intergenic	novelGene_14581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1543.39989957237	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	195	1715	105485	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLFPEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRVCAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGMCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127006	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94731_94914_98310_98416_99809_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105511_109914_109976_126898
523933	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_9561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523934	contig_19851_pilon	+	1859	6	Intergenic	novelGene_29829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_3	3097.84269452146	24	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGTTGTTGCATGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_54606_55753_55840_55882_56006
523935	contig_8541_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_105590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	10.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	156	308	567317	564912	FALSE	45	GTAAGTGTACAGTACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKARERKLARMAAEEHTLQDTGQDRGRTCKT	567472	564850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_564935_565360_565419_567245
523938	contig_12638_pilon	+	1955	17	Intergenic	novelGene_33081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	515.568947710924	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	863	1813	182987	199604	FALSE	30	TGTTAACAGGAATGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170765	199746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
523939	contig_10299_pilon	+	2675	16	Intergenic	novelGene_79693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	93.779504986727	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1661	2518	337976	340377	FALSE	15	TTTGACATGCTTGTCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320501	340534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334009_334412_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335222_336733_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
523940	contig_4315_pilon	-	2839	17	Intergenic	novelGene_46727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_16	164.070678367586	483	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	35	2164	163741	147905	FALSE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARIFLIASKELEFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163775	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
523941	contig_11677_pilon	+	2223	11	Intergenic	novelGene_85978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	75.3288789243541	519	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	13	1416	727262	736807	FALSE	35	TGATATGAAGTATGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKPEKID	727249	737614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732037_734234_734354_735086_735188_735996_736208_736531
523942	contig_8386_pilon	+	600	2	Intergenic	novelGene_82232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCAGCAGCTAATGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58368	60719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_58577_60327
523943	contig_8435_pilon	+	2293	6	Intergenic	novelGene_72011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	13	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1226	2224	95024	97944	FALSE	5	GCTGTGAGCTGCTTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91115	98013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_94887_94978_95334_96398_96685_97030_97164_97674
523944	SIRV6	+	582	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	33	277	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATGCCCTGGTACGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170	2817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2024_2470_2621_2740
523945	contig_12414_pilon	+	1320	2	Intergenic	novelGene_59599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	326	793	373587	374054	FALSE	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373010	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373207_373457
523946	contig_10331_pilon	+	2087	18	Intergenic	novelGene_54129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	298.28243043213	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1782	306	2087	410802	573480	FALSE	60	CCAAAAATAAAACACCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGDETNKDEDEDDEDAEEEDEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYDEWIKADKIVRPADKNV	409492	573480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_550874_551019_573425
523947	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_12342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	30	TCACAATGGTAGAATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28211_34618_34925_35033_35380_35839_36156_36264
523948	contig_10235_pilon	+	2304	6	Intergenic	novelGene_46408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	3	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	39	758	210483	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210444	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
523950	contig_9484_pilon	+	2667	12	Intergenic	novelGene_105633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	607.446831329757	16	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	31	1260	95848	103315	TRUE	20	AGAAGTTTCGTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQVDLLGNRIVLQRYPPCH	95817	109359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103261_103374_103495_103641_104260_104412_108306
523951	contig_6735_pilon	-	1519	10	Intergenic	novelGene_15689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	721.792333597072	83	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	80	1039	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543265_547310_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
523952	contig_513_pilon	-	2250	9	Intergenic	novelGene_80151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.3609123401	244	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	144	1049	453421	450583	TRUE	15	TTTTTTGTGGAAATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGKILVEGLGTSPA	454715	445775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_446444_450049_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
523953	contig_10126_pilon	-	989	2	Intergenic	novelGene_105707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGTAAACATTCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107215	103943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_104778_107060
523954	contig_10126_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_105706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATTTTTAGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103488	101097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_101100_103500
523955	contig_12603_pilon	-	3027	12	Intergenic	novelGene_105782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_2	201.075907709395	788	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	92	1585	547909	523691	FALSE	10	TCTAGTGTGTTGTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLKDKFWNFIFYKFIFIFGVLNVQTVEEVVMWCLWFAGLVFLHLMVQLCKDRFEYLSFSPTTPMSSHGRVLSLLIAMLLSCCGLAVVCCITGYTHGMHTLAFMAAESLLVTVRTAHVILRYVIHLWDLNHEGTWEGKGTYVYYTDFVMELTLLSLDLMHHIHMLLFGNIWLSMASLVIFMQLRYLFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEARFAVATPEELAVNNDDCAICWDSMQAARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADNSRVREDHQGENLDENLVPVAAAEGRPRLNQHNHFFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGITQASNSQLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQLTRSVEITTDNVLEGRIQVPFPTQRSDSIRPALNSPVERPNSDQEEGEASTQTERVPLDLSPRLEEALDFSEVEVEPSEVEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQRKDDLLQQARKRFLNKSSEHDSASESYLPSEGTSSDPVTLRRRMLAAAAERRLQKQQTS	548000	522248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_523839_524716_524902_527234_527319_529031_529167_534723_534828_536501_536693_541021_541133_541991_542126_543674_543808_544425_544467_546346_546500_547834
523956	contig_15063_pilon	+	1009	6	Intergenic	novelGene_8886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3599.786771463	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	424	1008	35271	36424	FALSE	25	ATTATGTCACCAGCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASN	27126	36425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34653_34822_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523957	contig_15063_pilon	+	1684	6	Intergenic	novelGene_14014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	6	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	196	1431	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34612	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523958	contig_15087_pilon	+	2294	4	Intergenic	novelGene_37269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	38	619	284653	301944	FALSE	10	TGTCCATTCGTCCGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284615	303619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
523959	contig_15063_pilon	-	1492	5	Intergenic	novelGene_9724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	743	1066	35891	35108	TRUE	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36172_36320
523960	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523961	contig_20641_pilon	+	1255	5	Intergenic	novelGene_52870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1213.29942718193	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	97	966	38688	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	38591	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_38690_41462_41580_45848_45965_54835_54968_56379
523963	contig_12873_pilon	+	1730	4	Intergenic	novelGene_27157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_2	705.279771123173	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1129	1596	17896	19334	FALSE	45	TGGGAGGAGAGAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15953	19468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17257_17734_18014_18984
523964	contig_13760_pilon	-	2720	11	Intergenic	novelGene_61288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	175.782365440905	646	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	173	1120	191898	167445	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPKAYWGVGQGPSCQPLP	192070	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857
523965	contig_20375_pilon	+	3618	10	Intergenic	novelGene_105828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	111.308824093095	440	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	43	1500	31789	55908	FALSE	15	CTTGGAGTATGTTTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCKVQRARAAFRSGRSRPLQFRLQQLEALRRMVQERERDILEAIGADLCKSEFNAYGQEVISILGEIDHVLEKLPKWVTPKPAEKNLLTMLDEAYIHSEPLGVVLIIGAWNYPFVLTIQPLIGAIAAGNAVIIKPSEVSENTAKIVSKLLPQYLDQDLYVVINGGVKETTELLRQRFDHILYTGNTAVGKIVMEAAAKHLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDIACRRITWGKYMNCGQTCIAPDYILCEPSLQSQIVQKIKETVKEFYGENVKESPDYERIINLHHFKRIINLLEGQKIAYGGETDEATCYIAPTVLTDVDPEAKVMQEEIFGPILPIVPVKNADEAIKFINDHEKPLAFYIFSRNNKLIKRMIDETSSGGVTGNDVIMHFTLSSLPFGGVGSSGIGAYHGKHSFDTFSHQRSCLLKSLKREGINKLRYPPNSQSKVDWAKFLILKRFNKGKLCLLMLTVLGIVAAVLIKAGYY	31746	58026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_31942_33506_33739_34676_34763_36921_37131_38335_38454_40445_40588_44736_44904_46452_46553_52600_52837_55893
523966	contig_7695_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_41691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137044	1139286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1137000_1139300
523967	contig_15087_pilon	+	1770	18	Intergenic	novelGene_37174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	299	610	110940	114589	TRUE	15	AGCATCTCGGCATCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQSGLVMETGSQQGCASKLEILVLTTTDSQQGLQEVSGGVALNGLVERCVIFLNEFPPDIQQVDLTPGDHDPGESLLIRASALPSWICKVCRQKKRGLFLTL	110641	150503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114529_114591_118079_118173_118902_118919_126034_126090_126680_126762_127598_127686_132603_132723_133431_133525_143073_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149623_149716_150479
523968	SIRV6	+	817	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	341	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	41	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
523970	contig_13894_pilon	+	1370	10	Intergenic	novelGene_62097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2509.51212611358	22	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	352	1314	522731	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521845_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
523972	contig_9199_pilon	+	2364	12	Intergenic	novelGene_65605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	91.5376452388184	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	82	1212	42527	57407	TRUE	15	CATCAGCTGGACCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42445	59156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304_58339_58935
523973	contig_14711_pilon	+	1661	8	Intergenic	novelGene_68912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.189687128573	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	825	1418	89183	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85016	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85247_87765_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
523975	contig_15063_pilon	+	1524	5	Intergenic	novelGene_12048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	219	1394	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
523976	SIRV6	+	376	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	8825	167	-34	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAACTAAGGTTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
523977	contig_5649_pilon	+	2421	10	Intergenic	novelGene_82246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	162.652625380625	870	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	569	1342	25982	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12670	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23232_25357_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
523978	contig_5643_pilon	+	1314	12	Intergenic	novelGene_38808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2489.94694423877	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	230	1102	236199	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_234026_236007_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
523979	contig_15063_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_9287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	242	1480	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
523980	contig_15118_pilon	+	2592	6	Intergenic	novelGene_74587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	137	junction_4	234.645605115459	471	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	602	1048	377560	378861	TRUE	40	CACATATTAACCATTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	376610	380638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376995_377342_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151
523982	contig_14925_pilon	-	1634	6	Intergenic	novelGene_55307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	909.532715189509	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	257	451	115846	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQAHLWERNSCDCGTKKSASNQTICFRNEKWDEGCLSGEGFLSQGYKYNPQLIQEYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_115938_115983_116101_129436
523984	contig_10042_pilon	+	2111	14	Intergenic	novelGene_79202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	86.20355708692	279	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	150	1115	1054190	1090129	FALSE	35	TTAAAATGAGGTATATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028995	1091125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1036430_1036485_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
523985	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
523986	contig_13894_pilon	-	2075	8	Intergenic	novelGene_62196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	222.231355821369	1233	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	117	1409	766610	750013	FALSE	20	TTGAGTAGCGGTGCCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQVSARLSSHTRQQLSQLRTHCLLLHPHTSRPCPPPPPHPVPLCLSKDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766726	749346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762382_763748_763958_766578
523987	contig_12414_pilon	+	2580	16	Intergenic	novelGene_59630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.552680851293	13	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1644	2240	684853	695975	FALSE	15	GTCTTTTGGATTTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEESQMEVDEGPGGINGHVDSPAPENGINGHVDDINQESVPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVEEEQDESALKRSELINWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIQRLTRYDHVLIELTQAGLKGSTGESESYEEDPYLVVNPNYLLED	652990	696315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653078_655641_655789_657540_657652_659047_659300_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_681236_681293_683109_683239_684738_684901_690260_690397_690966_691123_693031_693172_695858
523988	contig_14513_pilon	-	1107	3	Intergenic	novelGene_70379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	187	351	18880	12143	TRUE	30	AACATTAGAACTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19066	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11579_11670_12153_18725
523989	contig_14928_pilon	-	2866	10	Intergenic	novelGene_98790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_8	100.811154585635	813	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	33	1328	308373	278576	FALSE	30	AAAAAGTCTAGTCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARPGRLFPWLPRQLPLAALLLLLGSGGRWGFCPRAWAQEAAGADGSPATDREEAQDPHAKHLYTADMFEHGIQSAAHFVMFFAPWCGHCQRLQPTWNDLGDKYNNMKDARVYVAKVDCTADSDVCSAQGVRGYPTLKFFKPGQEAVKYQGPRDFQALETWMLQTLNEEPATPEPEVELPRAPEPKQGLYELSANNFELHVAQGNHFIKFFAPWCGHCKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKVDCTQHYELCSGNQVRGYPTLLWFRDGKKIDQYKGKRDLEALRDYVESQLQGPEREAAETIEPFEALELAVEPAADKGTVLALTESNFDNTVAEGITFIKFYAPWCGHCKNLAPTWEKLSKKEFPGLAAVKIAKVDCTAERNICSRYSVRGYPTLLLFRAGKKVSEYNGGRDLKSLYQFVLRQAKDEL	308405	277037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_278699_280380_280511_282073_282157_286607_286752_287421_287509_289948_290065_293589_293687_298585_298692_303504_303655_308113
523990	contig_3975_pilon	-	1998	14	Intergenic	novelGene_54824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	212.477106319855	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	113	1597	2066301	2056772	FALSE	15	TACATCTCTCTGCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRLSA	2079253	2056370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056784_2056893_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
523991	contig_6735_pilon	-	1659	10	Intergenic	novelGene_15690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	992.831951515773	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	325	1179	545923	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545943_554305_554374_564157_564232_564784_564869_568198
523992	contig_8317_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_20531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
523993	contig_15087_pilon	-	2371	25	Intergenic	novelGene_37178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	958.891793802733	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	87	1841	158925	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGGDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181126	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_144010_144105_145215_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149713_150476_150572_158907_158952_181066
523994	contig_8394_pilon	-	1995	4	Intergenic	novelGene_27303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.051863031078	48	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	459	1577	35322	32530	FALSE	15	CTTTTCATTCACCCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCPYCPLHQTRETQSYA	39012	32111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_32582_32643_33684_35295_35523_38754
523995	contig_15063_pilon	+	1439	4	Intergenic	novelGene_14124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	182	1354	34808	36661	FALSE	20	CTGTGGGTGAGAAGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34626	36746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
523997	contig_18145_pilon	+	2155	14	Intergenic	novelGene_37351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	321.087611778888	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	126	1658	86893	98924	TRUE	30	CATTCGAGCGGCAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGHP	86767	100922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_97173_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98443_98910_98983_100326_100482_100638
523998	contig_12624_pilon	-	2141	2	Intergenic	novelGene_61139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1617	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAATGTCAGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951394	947504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590
523999	contig_7898_pilon	-	1093	8	Intergenic	novelGene_47532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	38	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	71	1027	285587	282118	FALSE	25	TAAAAGCCCTCTGCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286096	282051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
524001	contig_7695_pilon	-	2674	19	Intergenic	novelGene_41604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	31.739487420694	5	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	133	2283	524436	504301	FALSE	15	CCACCATCTTTGCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525142	503909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514674_514736_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524442_525015
524002	contig_14638_pilon	-	2066	4	Intergenic	novelGene_71568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.984385550363	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277696	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254622_262339_262459_277509_277556_277660
524003	contig_1532_pilon	-	2004	8	Intergenic	novelGene_37410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1223.85184844358	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	70	885	32217	13487	FALSE	40	GTAATAATGAGTATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQKRPSPMRS	34930	12367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13514_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
524004	contig_15063_pilon	+	1305	4	Intergenic	novelGene_14268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	344	1165	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34815	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524005	contig_3077_pilon	+	1627	8	Intergenic	novelGene_26690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_7	3387.00750467647	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	563	1129	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10055	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
524007	contig_14621_pilon	+	2155	3	Intergenic	novelGene_105834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTTTACTTTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116085	126762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_120448_120584_124824
524008	contig_12352_pilon	+	2351	9	Intergenic	novelGene_57456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	233.305292213872	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	105	767	238274	284811	TRUE	55	AAAGAAAAAGGCTTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPPVGEGCWRPRADQCASVPSPRAFPRVPAQIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	230012	286464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742_286286_286354
524009	contig_16121_pilon	+	2202	6	Intergenic	novelGene_6854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	462.287096943014	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	115	1488	57746	63096	FALSE	25	TTCTATAATTTGTCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCFLRGHRADVEISLVVSH	33596	63810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565_62738_63040
524011	contig_1230_pilon	+	2198	9	Intergenic	novelGene_28831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1544.15769414105	3	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	225	1172	405421	407185	TRUE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINCPGSHLIWRQI	404450	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405266_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406903_407148_407352_407588_407788_408003_408241_408568
524014	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_8613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	236	1471	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26360	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524015	contig_5643_pilon	+	1764	14	Intergenic	novelGene_39026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	764.016914834905	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	651	1463	634983	641123	TRUE	10	GGTCATTGTGTGTGTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHEEYPCQGLPHLLQTQGGYV	631198	641593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638096_640685_640729_641102_641244_641412
524017	contig_9609_pilon	+	2045	9	Intergenic	novelGene_23060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	846.653965619957	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	124	1035	449884	454609	TRUE	65	AAAAAAATACCAAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	436479	456268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_436565_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
524019	contig_10235_pilon	+	2173	6	Intergenic	novelGene_46414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	231.674254072394	4	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	28	744	210483	212152	TRUE	35	AAAACGAATGTCCTTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSPLSIPQLCSPHIAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210455	213694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211796_211924_212047_212571_212683
524020	contig_854_pilon	-	2178	3	Intergenic	novelGene_36148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	143	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1191	1763	471014	470442	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	473840	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471882_471991_472061_473586
524021	contig_9345_pilon	-	1699	4	Intergenic	novelGene_24376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	562.665679304031	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	162	707	142974	142100	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPREGGVDTWQGAWHTADLQFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	143745	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_143681
524022	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_12847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524023	contig_14928_pilon	-	2466	7	Intergenic	novelGene_98789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	144.401831321105	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	10	453	308373	286747	TRUE	30	AAAAAGTCTAGTCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARPGRLFPWLPRQLPLAALLLLLGSGGRWGFCPRAWAQEAAGADGSPATDREEAQDPHAKHLYTADMFEHGIQSAAHFVMFFAPWCGHCQRLQPTWNDLGDKYNNMKDARVYVAKVDCTADSDVCSAQGVPRLPDSPLVPRRQED	308382	277037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_278699_280380_280511_282073_282157_286607_286752_287421_287464_303517_303655_308113
524024	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	6	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524025	contig_13863_pilon	+	1707	9	Intergenic	novelGene_42023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	718.749249999609	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	36	452	98341	110607	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAWRLAVGACDQGPYL	98305	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
524026	contig_15063_pilon	+	1444	4	Intergenic	novelGene_14175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	134	1306	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34674	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524027	contig_7457_pilon	-	1459	4	Intergenic	novelGene_31697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2104.51995054032	2175	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCTGGCTTGCCGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176983	1174114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175807_1175967_1176132_1176811
524028	contig_8616_pilon	+	1558	10	Intergenic	novelGene_72555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	884.20321947691	5407	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	22	882	425778	431241	TRUE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKR	425756	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431335_435675_435900_435993_436119_436357
524029	contig_10176_pilon	+	2361	6	Intergenic	novelGene_72738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGAAAATGGCTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264157	275055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_264393_267068_268676_270328_270452_271920_272050_273754_273858_274891
524031	contig_19579_pilon	-	2363	6	Intergenic	novelGene_59371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	499	junction_4	454.931643216868	97	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	106	327	13090	12869	TRUE	40	AAATCTATATGGGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGMGHSKGNVL	13195	7166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012
524032	contig_7816_pilon	+	1973	14	Intergenic	novelGene_66489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1036.95907835243	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	93	1343	170169	207888	TRUE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINCLLPK	170076	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207622_207862_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
524033	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_10634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524034	contig_3956_pilon	+	1755	13	Intergenic	novelGene_15107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1633.34982134535	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	742	1629	1286130	1290491	TRUE	15	CTCTCTGCAGGGACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281606	1290717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283946_1284804_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286112_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288067_1289844_1289892_1290297_1290570_1290669
524036	scaffold_16539_pilon	-	1928	12	Intergenic	novelGene_68347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	305.58679496372	1357	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	96	1616	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCESPPLWLTASPSPSSRAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502780	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500778_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
524037	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_10732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524039	contig_12250_pilon	+	2534	6	Intergenic	novelGene_80612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	44.7991071339597	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	451	2274	350196	354698	FALSE	50	AAGAAAAAGAATCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPFFLTWSVVNSVHWANGSTQALPATTILLLLTVWLLVGFPLTVIGGIFGKNNASPFDAPCRTKNIAREIPPQPWYKSTVIHMTVGGFLPFSAISVELYYIFATVWGREQYTLYGILFFVFAILLSVGACISIALTYFQLSGEDYRWWWRSVLSVGSTGLFIFLYSVFYYARRSNMSGTVQTVEFFGYSLLTGYVFFLMLGTISFFSSLKFIRYIYVNLKMD	349313	354958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_351968_352256_352443_353491_353766_354304
524040	contig_15063_pilon	+	1588	6	Intergenic	novelGene_10943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	233	1375	34808	39538	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27136	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
524041	SIRV2	-	614	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3846	216	2667	-216	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTAACGTATGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2065	1251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973
524042	contig_13863_pilon	+	1865	11	Intergenic	novelGene_42012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	845.94031113312	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	227	1051	99254	118962	TRUE	25	AGATATTTAGAGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPLFAWKPSGAASVRVVAAKPELCEPRAWGRALRWHYCCCWLEPEDPPAVLSTPSRRASTERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98268	120383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98452_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
524043	contig_1406_pilon	+	2712	4	Intergenic	novelGene_25576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	419.688773577119	4	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	74	448	2173822	2185207	FALSE	5	TTTTAGTTTGTGGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLVCWLCLSYFCRLSGEPAHLSSRETQSSSRRS	2173748	2187471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185111
524044	contig_5125_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_43482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTTATGGTGTAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145461	145111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_145100_145500
524045	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524047	contig_18231_pilon	+	1509	9	Intergenic	novelGene_105881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4151	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	1131	1508	258743	277178	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFSHKVFNSIRTCSSTPSSRNMSLTSLMTSSITDLYNLGTVFVFAEFAISTHNTNKRGGNPEKQDKNKTKREKTKPKHPEGDRSHRTIGEKFLKSDPEGVERRAVRGGGGNTPPGAKNLENRLS	232177	277179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_232441_238281_238367_246668_246987_249439_249577_250801_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_276922
524050	contig_9113_pilon	-	2340	4	Intergenic	novelGene_68580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_3	693.746831824598	1432	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	311	1555	348512	347268	FALSE	30	TGTGACTGGAAATGGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	362756	346482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_362682
524051	contig_14666_pilon	+	1653	4	Intergenic	novelGene_39615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3229	junction_3	238.484101496655	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	63	1418	477340	484940	FALSE	10	CTCTGTTAACTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477277	485175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861
524053	contig_11846_pilon	-	779	7	Intergenic	novelGene_105984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	140.746422887246	54	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCCCTCCACAGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557993	339687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_339944_348261_348324_352209_352232_356675_356764_467816_467906_476996_477072_557806
524054	contig_15063_pilon	+	1412	4	Intergenic	novelGene_14204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	104	1276	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34704	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524055	SIRV6	+	855	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	166	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	114	345	322	666	2002	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDASTNVVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1469	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2039_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524056	contig_11285_pilon	+	2069	13	Intergenic	novelGene_5610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	511.720212996212	5	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	94	1746	766124	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766127_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
524061	contig_1450_pilon	+	2280	17	Intergenic	novelGene_27373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	567.510021937939	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	63	2078	244426	355748	FALSE	65	AGAAAAAAAAAAAGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244363	355950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339519_347021_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
524062	contig_16098_pilon	-	1599	8	Intergenic	novelGene_46142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1051.44239121353	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	139	1035	458816	456727	TRUE	15	GAAGGGGGAGTCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGEACTLILATGRWMNCTCNPYTPIWSDFQSSF	460265	456071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
524063	contig_12074_pilon	-	2004	14	Intergenic	novelGene_53735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	443.62832943192	5	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	841	1749	34859	30226	FALSE	10	TTTAATGCCTGCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	43212	29970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34866_35922_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071
524065	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	202	1041	34808	36333	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36153_36266
524066	contig_9345_pilon	-	2168	20	Intergenic	novelGene_24547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	102.494807651743	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	702	2069	726614	723552	FALSE	10	TCCTGGAGTCTGTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730180	723452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727207_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
524067	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_13215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524068	contig_15021_pilon	-	2657	12	Intergenic	novelGene_26956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.783321292858	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	588	1094	261049	241314	FALSE	30	TTAAACAAGTGGTTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKGYSSMLLIHPPTYLFTK	279848	239750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241367_248127_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263374_267754_267864_269629_269660_279781
524070	contig_13894_pilon	+	1252	11	Intergenic	novelGene_62098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2428.40182836367	11489	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	27	1196	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522716_522757_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
524071	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10404	1	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11404	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
524076	contig_5549_pilon	+	721	4	Intergenic	novelGene_81597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_3	572.836800493823	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	79	552	86768	96749	FALSE	20	AAATTTTCTTGGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	86689	96918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_86819_91687_91835_93264_93412_96620
524077	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524078	SIRV6	+	626	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	836	-466	836	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11073	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
524079	contig_20819_pilon	-	2129	7	Intergenic	novelGene_55635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGAAGCCTCCTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43615	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_29853_29982_30150_30377_30640_40119_40521_40866_40931_41315_41399_42518
524080	contig_15063_pilon	+	1476	5	Intergenic	novelGene_11657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	20	CTAACCATGTCTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524081	contig_6227_pilon	-	1918	17	Intergenic	novelGene_49739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	317.105241796789	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	644	1618	1213164	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225075	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214185_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
524082	SIRV6	+	739	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	514	223	341	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524084	contig_10324_pilon	-	3430	22	Intergenic	novelGene_7716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	143	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCGGCGCGACCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80673	51812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_51869_66120_66168_67841_67917_68038_68126_68713_68793_68953_69072_69376_69438_69525_69654_69771_69856_69948_70060_72926_73061_73143_73241_73325_73422_73582_73666_74485_74750_74830_74925_75795_75901_76008_76078_76196_76267_76440_76527_78362_78451_79275
524085	SIRV6	+	1081	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	7	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	208	699	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1137	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524086	contig_3077_pilon	+	2273	8	Intergenic	novelGene_26741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3665.30222603311	5	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1165	1650	13867	17462	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGGWGTMTRKVSKARCST	10525	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16336_17014_17054_17449
524087	contig_2834_pilon	+	2276	5	Intergenic	novelGene_28008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_4	2511.2915999541	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	92	535	277870	289225	FALSE	70	AAAAATTTAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQRGLKNVFDEAILAALEPPETQPKRKCCIF	274803	290966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_289135
524088	contig_5649_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_82409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGGAAAAAAAAAAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278585	1280402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1278600_1280400
524090	contig_8978_pilon	-	2318	6	Intergenic	novelGene_49322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_1	730.496981513271	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	33	860	194082	192207	TRUE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKGKMDLIRDLNPRAQHSQPF	194114	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
524091	contig_5302_pilon	+	1867	9	Intergenic	novelGene_81483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	168.394440228886	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	163	1014	318287	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	308038	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_308198_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
524092	contig_854_pilon	+	1839	15	Intergenic	novelGene_36438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	445.117916044359	48	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	135	1346	1453661	1464275	TRUE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRS	1451196	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464269_1464349_1464541_1464823_1465336
524093	contig_3463_pilon	-	2640	16	Intergenic	novelGene_61996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	171.977853871428	9	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	27	1103	597436	522695	TRUE	15	CTCACTGCAGTGTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVRKGHDSMVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMTQEWYTLH	597462	507707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522722_522779_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_597388
524095	contig_15720_pilon	-	2177	7	Intergenic	novelGene_41891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1233.20144565093	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	104	712	283894	281376	TRUE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVSLEPGHEAFTSQKLLELHLDGHRLQL	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_281556_281786_281935_282577_282750_283785
524097	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524099	scaffold_19766_pilon	+	2646	13	Intergenic	novelGene_34429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	157.063681352501	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1431	2486	847654	851417	FALSE	20	CACCTTCTAATCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844634	851577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
524100	contig_11756_pilon	-	2512	6	Intergenic	novelGene_106032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	24.9639740426079	1148	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	64	657	143986	123559	FALSE	60	TGTTAATTAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGPAAWEVVSLESGHIGFPKMAAAKEDSGFGEVAAGNGRRLHLGIPEAVFMEDVDSFMKQPGNETADVVLKKLDEQYQKYKFMELNLAQKKRRLKGQIPEIKQTLEILKYMQKKKESTNSLETRFLLADNLYCKASVPPTDKVCLWLGANVMLEYDIDEAQALLEKNLSTATKNLDSLEEDLDFLRDQFTTTEVNMARVYNWDVKRRNKDDSTKNKA	144049	121703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_-_123630_125741_125881_134431_134531_135912_135980_138987_139113_143893
524101	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_8798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	30	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	244	1419	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524102	contig_15063_pilon	-	1455	5	Intergenic	novelGene_12226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	730	1053	35891	35108	TRUE	15	CAGTCCCCTGGTCCCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36729	27558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34926_35035_35380_35839_36156_36264
524104	contig_10904_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_22451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1848	2210	149507	149145	TRUE	5	GTGGGCGGGGCTGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDAAVGLELDVGGGVDDGSGEAEEGGVAGVGDGEVAPGQGESGLEPADLNDENDQGHRKAEAPGEHRPVTHGPCPGIHAGHQREGDAGGQQLQQTEESQGLSQCPRGPHNGGGTQARG	151354	143858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_143965_146146_146223_149094
524106	contig_15063_pilon	+	1437	4	Intergenic	novelGene_14184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	128	1300	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34680	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524107	SIRV4	-	1405	3	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACGCGAACTGGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3379	1137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1344_1675_1882_2386
524108	contig_5988_pilon	-	1599	4	Intergenic	novelGene_15973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	50	CGCAAAGTAAAAGTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
524109	contig_7410_pilon	+	2041	7	Intergenic	novelGene_106078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	324	junction_5	175.92959450366	1143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	186	584	405351	407259	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	405165	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
524110	contig_12090_pilon	-	2555	13	Intergenic	novelGene_80477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_12	149.919677568431	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	118	1398	67556	54207	TRUE	10	CGCCCATTCTGTTATTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAFWKVRDCRGYDPLFCGRLESASIRPSRPCTDPAKVAMPENVDPRSGAPAGTAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIMAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGVEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMRVIDPATADSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVANSGITRVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVVKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTMVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVLRCLVKKRSLMTMYT	67673	51588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_54363_54465_54577_54657_54755_55718_55859_57076_57210_57565_57688_58926_59070_59837_59947_60899_60990_64357_64411_67429
524111	contig_11318_pilon	-	1098	11	Intergenic	novelGene_48148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	482.946467012649	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	183	1055	49795	15029	FALSE	60	GAAGAGGAAGAAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRRTPRPRCRAPKDGTRG	58277	14985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17480_31139_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58143
524112	contig_18108_pilon	-	2235	17	Intergenic	novelGene_33516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	294.574162987863	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	155	1588	297156	271253	TRUE	20	GTTAGCCAAGTGTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEGTGVPAIAGGRRQ	335417	266700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271295_273859_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
524115	SIRV6	+	699	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	12	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10726
524116	contig_9516_pilon	-	2130	16	Intergenic	novelGene_106176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_14	86.7790041170994	626	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	102	1943	913190	877957	FALSE	35	TAAATTAAAATCTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWCRALAASALRQKLTPLVRTVCVRSPRQRNRLPGNLFQRWHVPLELQMTRQMASSGASGGKIDNSVLVLIVGLSTIGAGAYAYKTIKDDKKRYNERISGLGLTPEEKQKRATTPASEGEPVPQVRVPSHVPFLLIGGGTAAFAAARSIRARDPGARVLIVSEDPELPYMRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTGIRSESETESEASEITIPQSSAAVPQVPVEGEDYGKGVIFYLRDKVVVGIVLWNIFNRMPIARKIIKDGEQHEDLNEVAKLFNIHED	913291	877769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878565_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_898505_898631_899602_899703_905481_905625_913084
524117	contig_9345_pilon	-	1916	6	Intergenic	novelGene_24659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	4	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	269	850	955353	947957	FALSE	20	TTTCTAAACTTCCTGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001343	946890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
524118	contig_500_pilon	+	1597	10	Intergenic	novelGene_31007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	1164.75892699936	47	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	313	1182	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
524119	contig_19098_pilon	-	1845	3	Intergenic	novelGene_65783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_2	390	3472	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGAGCTGTCTGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53473	49397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_52524_52579_53352
524121	contig_15063_pilon	+	1438	5	Intergenic	novelGene_11476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGACCAGCCGCTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524122	contig_3386_pilon	-	1662	8	Intergenic	novelGene_34518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	810.004006036957	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	118	492	409604	406808	TRUE	25	GTTTAACTTCAAAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412211	404154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406464_406629_406842_407702_407838_409398_409607_412096
524124	SIRV6	+	500	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8784	18	7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAAGTCGTAGTCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
524125	SIRV6	-	1003	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8752	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	16	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11299	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
524126	contig_3627_pilon	+	2322	8	Intergenic	novelGene_78542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	220.041369023265	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	38	748	652971	676255	FALSE	20	ATACTGAGCTTGCTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDVVLNDGETRKMAEMKTEDGKVEKHYLFYDGESVSGKVTLAFKQPGKRLEHQGIRIEFVGQIELFNDKSNTHEFVNLVKELALPKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIQHMELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	652933	677829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_653049_660439_660516_661658_661723_667962_668023_670412_670520_672027_672097_673913_674057_676141
524128	contig_9345_pilon	-	1534	2	Intergenic	novelGene_24614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2016	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	38	460	949724	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKLLKQHRKFYNLTRALRDSSKLNCMYPQILCILLLSENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	949761	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475
524129	contig_15666_pilon	-	2037	4	Intergenic	novelGene_70208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	111.762645319842	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	736	1389	132068	129060	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHIRISSEHSSHLLSH	132803	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_130515_130795_131446_131711_132007
524130	contig_5643_pilon	+	1356	11	Intergenic	novelGene_38796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2017.95636474132	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	204	1151	236124	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVERQNLAEGQPPDAFTCSPQVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
524131	contig_5033_pilon	-	2494	13	Intergenic	novelGene_29065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_10	2924.35664814597	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	16	1695	566787	533242	FALSE	25	CTAAATGAAGGGGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNVGSSALLHSLPAGRAALGPILPADRAALGSHPACGQGSPGSRPACG	566802	532442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
524132	contig_8269_pilon	+	2784	1	Intergenic	novelGene_106219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAGCAAACATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258021	260805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_258000_260800
524133	contig_15047_pilon	+	1102	4	Intergenic	novelGene_52261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	334.225805240841	11	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3284	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4263_4552_4687_21013
524134	contig_11512_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_43311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	806	1138	383746	384078	NA	60	CTTTCAGAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNKYVRQSLTILASKEHSGCTSSKTDTFVLLAVHSIVTILGQHHNSRASILLWSPLFIVQLSHAYEAIENIMAWVRRTLVLKVTSLLVNTLKRSFAADFPNATRRLVS	382940	385823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_382900_385800
524137	contig_9839_pilon	+	3436	6	Intergenic	novelGene_88554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_5	285.6526562103	64	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	18	767	255906	264526	FALSE	65	AATGAATGTTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQI	255888	267195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_264520
524139	SIRV6	+	1486	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	52	-1	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5002	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
524140	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	14	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	11	1423	28164	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28153	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524141	contig_1225_pilon	+	2012	4	Intergenic	novelGene_44143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	150	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275159_276073
524142	contig_11396_pilon	-	2232	8	Intergenic	novelGene_71282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	732.26339077506	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	82	726	249053	232981	TRUE	40	TAATCTGTCAATAAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRRCSSGSSRSRPRPRRLLRPGRRLNMDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRKGGRQSRWSPLLTVTAQNRWRRRLVWTVYWEEPTGGQACQRTLQPSSRWKIMLGP	249134	230890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238455_238578_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
524146	contig_5643_pilon	+	1360	11	Intergenic	novelGene_38831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2017.95636474132	52	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	201	1148	236124	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVERQNLAEGQPPDAFTCSPQVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
524147	contig_5836_pilon	-	3658	2	Intergenic	novelGene_106274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	574	junction_1	0	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141218	45156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_48751_141154
524148	SIRV6	+	697	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	340	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033
524150	contig_14621_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_105841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124840	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_124800_126800
524151	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27547	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524152	contig_15047_pilon	+	1294	8	Intergenic	novelGene_52179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2664.19576255659	4	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	264	863	3246	21020	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKWGPTGASSAADHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSVSSPVSSDQTLFFRW	2174	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_2667_2826_3221_3286_3370_3498_4158_4434_4552_4664_20973_21062_21232
524153	contig_8772_pilon	+	1839	9	Intergenic	novelGene_21078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4485.0073700469	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	145	825	15355	19101	TRUE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKERKPKAPCNLSDRMLTTLLWHVSTLSVKWNPCKKRLPF	15210	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16571_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
524154	contig_7816_pilon	+	1875	13	Intergenic	novelGene_66493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1085.22174833329	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	307	1776	183050	211658	FALSE	40	GAGAAAAATGAATTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYQSLPESPPPPLRLCILVFPIHPPLPAAPWRVTTNPTSRSCRGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170079	211757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170209_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
524155	contig_5569_pilon	-	2724	18	Intergenic	novelGene_86748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	157.848598127433	9	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	39	1532	518064	467456	FALSE	40	AACAAAATTAATGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAWLQVLPVILLLGAQPSPLSFFSVGPAPVAAADRSKWHIPLPSGKNYFSFGKILFGNTTIFLKFDGEPCDRSLNVTWYLKSADCYNEIFNFKAEEVETYLENLKEKRGLSGKYQTSSKVFQNCSELFKTQSFSGDFVHRLPLLGEKQEAKDNGTNLTSVGDKTVMHEPLKTWQDAPYIFIVHIGIPSSKESVKEKSLSTLFTMTVEVKGPYEYLTLEEYPLMIFFMVMCIVYVLFGVLWLAWSACYWRDLLRIQFWIGAVIFLGMLEKAVFYAEFQNIRYKGESVQGALILAELLSAVKRSLARTLVIIVSLGYGIFISLTQTMKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	518102	466263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487367_493484_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517923
524156	contig_5967_pilon	-	2215	10	Intergenic	novelGene_44380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	428.665370656413	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	87	1214	488551	388566	FALSE	50	ACGTTAAGAACCAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488565_517539
524157	contig_15063_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_8600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	30	GTAGTAGTAGTAGCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	26355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26398_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
524159	contig_12919_pilon	-	1875	6	Intergenic	novelGene_75889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	479.421317840582	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	123	803	743613	720131	FALSE	20	CAGGCACTGTTCTAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGDSRTEFFTTPYGLYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743735	719058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_730980_731210_734916_735079_737596_737628_743565
524160	contig_16121_pilon	-	2188	4	Intergenic	novelGene_6864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTCAGTGCTTCGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64034	33609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_33706_57740_58200_60691_60854_62563
524161	contig_9290_pilon	-	1881	12	Intergenic	novelGene_77528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	345.289147007725	83	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	69	1526	496936	478940	FALSE	10	TTATTTGGGTGCCGTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497004	478584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
524162	contig_15021_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_26941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCCACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239745	241733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_239700_241700
524163	contig_610_pilon	-	1185	3	Intergenic	novelGene_76741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	904.5	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	466	501	214218	214183	FALSE	25	TATTGTCAAAGTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	235152	213498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998
524164	contig_15063_pilon	-	1488	4	Intergenic	novelGene_13909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	780	1103	35891	35108	TRUE	40	AGGACCCAAGAGTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36777	34610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36158_36264
524165	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	228	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524166	contig_7426_pilon	-	2254	15	Intergenic	novelGene_27467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	80.3152271632579	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	50	1636	668286	640574	TRUE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTLH	668335	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
524167	contig_7291_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_106310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGCAGGTTGTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200074	197991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_198000_200100
524168	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_8776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	244	1080	34808	36333	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27125	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36150_36266
524169	contig_4759_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_106327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAGCCTGACTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587985	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_586100_588000
524170	contig_19564_pilon	-	1861	5	Intergenic	novelGene_29602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	171	1001	15529	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15699	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12614_13117_13259_13554_13666_13945_14055_15472
524171	contig_12090_pilon	-	2652	1	Intergenic	novelGene_80499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246700	244048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_244000_246700
524172	contig_9345_pilon	-	3815	13	Intergenic	novelGene_24416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_6	52.1831044389742	7	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1203	1775	205737	196247	FALSE	35	CACACAAGAGTTTAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221110	194206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205734_205867_207634_207757_208548_209100_211740_211808_214946_215044_215211_215329_220991
524173	contig_14638_pilon	-	2085	6	Intergenic	novelGene_71562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	CTGAAGTGGTGTGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254036_254153_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
524174	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_12873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28165	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524175	contig_15459_pilon	+	2060	3	Intergenic	novelGene_106362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	397	junction_2	195.5	860	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9151	10958	FALSE	55	CTAAGGCAATAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKADTNKDRIENANARAKKLIES	8161	12646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892
524176	contig_11720_pilon	-	2134	11	Intergenic	novelGene_43903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.988350984596	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	87	1001	124674	118003	FALSE	25	TTAAAACCCTGTATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTFPGSTCSMPLWGPLFSPCSWLMTHSWFWGTGSIPSARRTTSLAPCRSTLTSSTSSPLCCSWWGIAIKEHIPVPPHPGLSLPRGLGPVTGISASDPFLPFK	134608	116869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_120231_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
524177	contig_6576_pilon	+	2181	4	Intergenic	novelGene_42420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3978.18275095552	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	264	1277	1301561	1302574	TRUE	20	ATTCAGTGCTACTTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295695	1303710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301397_1301547_1303392_1303623
524178	contig_15063_pilon	-	1700	6	Intergenic	novelGene_13708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.6	5	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	985	1308	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39090_39504
524179	SIRV4	+	1488	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	46	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1071_1145_1344_1677_1886_2389
524180	contig_12603_pilon	-	2715	17	Intergenic	novelGene_105809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_15	72.8227460602112	122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	182	2347	643013	618517	FALSE	20	CTTTGTGTTGACTGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVFTLKLRHKIIPRMVAIGRYDGTHPCLAAATQADKVFIHNPHTRSQHFSASRVIQSPLESDVSLLNINQAVSCLTAGVLNPQLGYDALLVGTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVDARSDRTGEVIFKDNFSSAIAGVVEGDYRMDGHIQLICCSVDGEIRGYLPGTAEMRGNLMDTSVEQDLIRELSQKKQNLLLELRNYEENTKAESSSPLSEADGHRGIIPANTKLHTALSVNLGSETQAAHAELCISTSNDTIIRAVLIFAEGIFIGESHVVHPSIHNVSNSICIPITPPKDVPVDLHLKTFVGYRSSTQFHVFELTRQLPRFSMYALTSPDSASEPLSYVNFVIAERAQRVVIWLNQNFLLPEDTNIQNAPFQVCFTSLRNGGQLYIKIKPSGEITVNTDDIDLAGDIIQSMASFFAIEDLQVEADFPAYFEELRKVLIKVDEYHSVHQKLSADMADNSNLIRSLLVRAEDARLMRDMKTMKNRYMELYDLNKDLLNGYKIRCNNHTELLGNLKAVNQAIQRAGRLRVGKPKNQVISACRDAIRSNNINTLFRIMRVGTASS	643194	618148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_618624_619319_619469_621985_622099_623815_623954_625011_625144_626303_626434_627093_627266_627356_627502_627692_627833_628017_628154_631065_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248_638477_642896
524182	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28169	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524184	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524185	contig_4103_pilon	-	2150	18	Intergenic	novelGene_51916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	470.09961397434	690	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	42	1244	91854	80996	TRUE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91895	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
524186	contig_16098_pilon	-	1458	10	Intergenic	novelGene_46153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1821.19562545401	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	130	1251	459176	456286	FALSE	30	AACTATTGAAGGGGGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGLCPEGLGWEKGEPEGCPGGVCQASPGQQPRLPRKVHPKRSGWGRSQPIPLHL	460264	456078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456538_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459035_459190_460148
524187	contig_13740_pilon	-	1742	11	Intergenic	novelGene_34615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	4393.43892184699	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	168	1073	165243	157474	TRUE	30	GTATATTCAGCGTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165410	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
524188	contig_6735_pilon	-	1987	14	Intergenic	novelGene_15791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	995.837847117431	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	682	1527	545923	542464	FALSE	20	GGGACTATGGTTCACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	542003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543283_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547286_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
524189	contig_7571_pilon	-	1867	4	Intergenic	novelGene_106396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	147.242053171715	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	970	1416	90055	84922	FALSE	35	TTCTATCAGCAATTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDRPWLWLIYLVTAGLPVVLITSFCWPRKVKKKYEDAEYKKTDIGKPQTKGALEQEVKEEKAALEKPVELEEEKKQSDGEILEKEEKGEPEEKSEEEIEVIEGQEEGNKSNKSGSEDEMKEADESTGSGDGPVKSVRKRRVRKD	91024	84470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_85003_86960_87062_89561_89722_89950
524190	contig_11258_pilon	+	1843	8	Intergenic	novelGene_67793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	176.601939111549	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	566	1024	285721	292582	FALSE	60	AAGAGAGAAGAAAAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279326	293401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_282663_282771_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
524191	contig_1516_pilon	+	1929	9	Intergenic	novelGene_49979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1206.77649131892	93	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	88	846	347241	359968	TRUE	5	GCACCTGTTTCCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADCP	335194	363730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_354977_359957_360125_362116_362299_362985
524192	contig_5779_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_106491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180983	181246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_181000_181200
524193	contig_12765_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_106542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	8467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_8200_8500
524194	contig_10135_pilon	-	2183	8	Intergenic	novelGene_106618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	40.7250612307078	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	490	1680	88066	84292	FALSE	5	ATCTCTGTTCTTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89154	83788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88142_88500_88681_88920
524195	contig_15063_pilon	+	932	4	Intergenic	novelGene_9692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	239	931	34808	36072	FALSE	25	GGGAGTCAGGGGAAACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMED	27130	36073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
524197	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	880	30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
524198	SIRV6	+	763	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	356	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	44	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	74	565	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1659	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
524199	contig_7816_pilon	+	1921	13	Intergenic	novelGene_66492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1147.60408629845	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	90	1841	170169	211658	FALSE	30	AGTGGTAAATATATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKKLCGAPGGGSSSAGALHGAQSLPALPPTPQIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170079	211738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181093_183045_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196654_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
524200	contig_10734_pilon	-	2006	5	Intergenic	novelGene_51008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	437.04597870247	14	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	93	611	320632	311551	FALSE	10	CAGCCTTAGTGTTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320724	310155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452_320480_320566
524201	contig_15063_pilon	+	1660	6	Intergenic	novelGene_13978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	197	1435	34808	39515	FALSE	45	CATGAAATAAATGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34611	39740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524202	contig_1230_pilon	+	2133	10	Intergenic	novelGene_28850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1358.93047088192	5	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	72	878	405241	406727	TRUE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAELLRLILSMKESTSIPLLREPDLKN	404454	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406545_406653_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408232_408568
524203	contig_177_pilon	+	2514	3	Intergenic	novelGene_41814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	5	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	83	1159	417672	418748	TRUE	20	ACCACTTTTAGTTGGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415648	420200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419080_419176
524204	contig_3233_pilon	+	2819	8	Intergenic	novelGene_56569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_5	303.32134236597	13	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2377	2691	746379	747909	FALSE	20	CACTCCCCAATGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738725	748037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_742836_743705_743819_745289_745346_746325_746424_746936_747016_747718
524207	contig_14621_pilon	+	1980	3	Intergenic	novelGene_105832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	74	1042	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116078	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824_124960_125015
524208	SIRV6	+	300	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	19	1270	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
524210	contig_10311_pilon	-	3163	10	Intergenic	novelGene_50449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_9	943.653668945117	2	153	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	36	1118	71526	67177	FALSE	25	CTTAAAAGTTGCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR	71561	65131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
524211	contig_12074_pilon	-	2248	15	Intergenic	novelGene_53750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	420.338930300931	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	119	1996	43217	30226	FALSE	20	ATATTTAATGCCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	29973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
524212	SIRV6	+	374	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	341	36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGTGCGTCTAGGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1732_1845_2027_2470
524213	SIRV6	+	839	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-3	119	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCGTTCACAAAGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	11087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2478_2621_2740_2815_3106_3165_10724_10819_11031
524215	contig_12644_pilon	+	1768	9	Intergenic	novelGene_44598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4384.03597584463	58	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	717	1688	2678073	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675471	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
524216	contig_15063_pilon	+	1624	6	Intergenic	novelGene_14177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	134	1369	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34674	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524217	contig_14895_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_106692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63476	63772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_63500_63800
524218	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_9734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	8	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524219	contig_12357_pilon	+	2116	12	Intergenic	novelGene_6076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	778.607784860021	5	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	117	1514	26079	53235	FALSE	40	TATATCGATTACATACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVTFENVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46580_51148_51239_52759_52844_53169
524220	contig_9014_pilon	-	3168	16	Intergenic	novelGene_106768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	37	junction_10	94.8126573828621	402	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	941	2826	9	2834	98081	88802	FALSE	20	TTTGGGGTTTCAAGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYLQWRRFVFFDKEVVKEPLGNDGAAPGAAPASGPAASKFLCLPPGITVCDSGRGSLVFGDMEGQIWFLPRSLQLTSFQAYKLRVTHLYQLKQHNILASVGEDEEGINPLVKIWNLEKRDGGNPLCTRIFPAIPGTEPTVVSCLTVHENLNFMAIGFTDGSVTLNKGDITRDRHSKTQILHKGNYPVTGLAFRQAGKTTHLFVVTTENVQSYIVSGKDYPRMELDTHGCGLRCSALSDPSQDLQFIVAGDECVYLYQPDERGPCFAFDGHKLIAHWFRGYLVIVSRDRKVSPKSEFTSRDSQSSDKQILNIYDLCNKFIAYSTVFEDVVDVLAEWGSLYVLTRDGRVHALQEKDTQTKLEMLFKKNLFEMAINLAKSQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYSKGNHDGAVQQYIRTIGKLEPSYVIRKFLDAQRIHNLTAYLQTLHRQSLANADHTTLLLNCYTKLKDSSKLEEFIKTKSESEVHFDVETAIKVLRQAGYYSHALYLAENHTHHEWYLKIQLEDIKNYQEALQYIGKLPFEQAESNMKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGQSEREALGCRANSEEFIPIFANNPRELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWAHEKDPQVKEKLHAEAISLLRSGRFSNVFDKALVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHEQYRQVIAVCERHGEQEPSLWEQALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSIIRDYLVQKLQKQSQQIAQDELCVWRYREETTRIRQEIQELKASPKIFQKTKCSICNSALELPSVHFLCGHSFHQHCFESYSESDADCPTCLPENRKVMDMIRAQEQKRDLHDQFQHQLKCSNDSFSVIADYFGRGVFNKLTLLTDPPTARLPPSLEAGLQRDLLMHSRRGT	98089	88467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_88967_89139_89363_89985_90158_90287_90491_90581_90722_90950_91113_91219_91409_91539_91687_92358_92546_93138_93291_93687_93890_94584_94833_96286_96451_96776_96913_97006_97152_97890
524222	contig_16492_pilon	+	3358	1	Intergenic	novelGene_100286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104691	108049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_104700_108000
524223	contig_15063_pilon	+	975	3	Intergenic	novelGene_13865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7060	junction_1	1101.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	199	975	34808	36156	FALSE	5	GGTGAGGCCCCTTTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPK	34609	36156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839
524224	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	5	1417	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524225	contig_10011_pilon	+	2670	9	Intergenic	novelGene_68092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98.3005595101066	9	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	60	983	322928	328997	TRUE	15	AGTGTGGCTGGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDTEATRCAPSRKSPWNSRSKFTGSWSI	322868	334179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326117_328478_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994
524226	contig_10235_pilon	-	2542	12	Intergenic	novelGene_46262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	400.728221414485	674	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1798	2346	17621	14151	FALSE	5	TGTGCGTCTGTGGTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	27180	13954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_18878_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_24573_24697_25124_25469_27131
524228	contig_16650_pilon	-	2025	5	Intergenic	novelGene_61961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCAGCCGGGTCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256001	244574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_244709_251254_251311_252974_253081_254184_254664_254751
524229	contig_9582_pilon	-	4416	19	Intergenic	novelGene_106830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	26.1850018328748	159	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	956	2871	106	2976	431196	367192	FALSE	25	AAGTATATGTATGCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGRPVPTCVHLASDVQLDGRCDPRKLQTQNQLQFNRNVPTHSSNLAIRYSCPHAIRIEKLKHSFNESYHCKDSNFRDGPDPSSSVSFSVISEEKLSYAVHLAKRDVKRRQFEEHMKEHHLRSQPQISQKCGHTTKSKIPEHRLEKKETKGHEVFPCSHQPSKVEISSSGAKVYLYTSHPGQPDLTVQNSPPTRDPGLQPHSRIGEHKSLLEVQRLQKELSSCIHKIEEVTKKDKIEEALDPDEERRVQIRRQEQAVRSARMLYVLQQQVKEIQEELDKLSPHKIKHTKKSWAVSRLAAAHRGAIRALQMFVTQFTDRGEHPVPTRGRELGSLIRQLSLCSAKLDSDPSVPDVVIDILQQIEDLESLLEKKLSPKKVKKYASEIRNKFPVGSQRVLERWPSTSSKSERRLFGAKEMFPQETRRPSVAKKLLVDKHQPDTELPVTKRLEDELDVLAVDILQEETPSILDQNASFKDETSALARTRVVKKKPVTVKAPCRKKDALAPARLQQGLHRAERCRPTQPHIKSRLHQTTVSSRLKMNQQPVKDQRAPWIPPNPTSPPASPKCAAWTKVKRSPREATKEQSLQQEDTQEGSHSRGAIEHEAARLAWLDAETSKRLKELEELKTKEMDKIQKRRLNWLDAETSRRTKELNELKSEEMDRLQKLSDSATQLADKVEHAVLERLKPLLAKAQRVNSSLDANSHLKDRPSVNTVATQPAEETAAVVSESSNIPLLDDFLEDTAHKLWAVTHSEILEDGKDTPTLETMMRRMEEMEKYQETVRQRYTKFVYADPHFWMQEGKKDQEVPAVSERPLPPHPIRITKTAAHKDPDVNIVLERPWNGNSLDESVGTEERVKKREAPLLTLPEDAQQKGGRALLFIPPAMLHSIGDYCSRFEQYLRMISHEAVGSFNPWLIAESFSEELVDEALGAVAAELQDMCEDYAEAVFTSEFLEAAA	436688	365751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_367310_373854_374080_374567_374689_378797_378880_380934_381097_384625_384710_385757_385837_389954_390045_390674_390765_393670_393791_395296_395464_397867_398101_418011_418223_420110_420327_420724_420788_422905_423013_425333_425944_431103_431267_436653
524230	contig_15063_pilon	+	1689	7	Intergenic	novelGene_12571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	6	1478	28164	39515	FALSE	25	TAGGCACTTGTGGCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28158	39726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524231	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524233	contig_15063_pilon	+	1373	4	Intergenic	novelGene_14229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	68	1240	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34740	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524235	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_13601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524236	contig_500_pilon	+	1905	9	Intergenic	novelGene_31066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_8	789.016308053896	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	216	1193	1492663	1498065	TRUE	10	GCGGGCATGTTTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1491860	1499582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882
524237	contig_7594_pilon	+	3008	6	Intergenic	novelGene_55431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	772.385758542971	61	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	39	395	539045	549242	TRUE	50	ATTTGGAAAAAAAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTGVAGGFVATMASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVGKL	539006	554867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_551292_552953_553000_554349
524238	contig_3975_pilon	+	2599	11	Intergenic	novelGene_54759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	98.7020263216516	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	18	1190	1961329	1984755	FALSE	40	AAAGATTCTAACAGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961311	1986164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1975982_1983163_1983261_1984722
524241	contig_10986_pilon	-	1958	12	Intergenic	novelGene_71452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_8	143.881551376284	1880	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	86	1303	80340	67011	FALSE	25	TGAACAATTTCCCCAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80425	66355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
524242	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	24	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524243	contig_11285_pilon	+	2386	11	Intergenic	novelGene_5576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	509.600470957396	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	903	2063	767746	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
524245	SIRV6	+	464	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1340	226	-2	137	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524246	contig_10324_pilon	+	2016	15	Intergenic	novelGene_7738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	914.967669775656	6	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	496	1479	69577	80230	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRLWCVRQQQGLW	66138	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_80193
524247	contig_12357_pilon	+	2108	13	Intergenic	novelGene_6107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	950.345931168692	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	117	887	26079	35090	TRUE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTFGLTRTFLLFQLVNWS	25962	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34311_35038_35192_42155_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169_53659_53709
524248	contig_13968_pilon	-	2374	3	Intergenic	novelGene_106872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.5	24	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	311	1009	45600	44902	TRUE	25	AGTTACATCTCCTATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVKNEVEYIKIDILGISELKWIGMGHFELDNHMVYYAGNDILKSNGIAFMVKKNISRSILKYKAVSDRIIVICLQGRPVNMTTIQIYAPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNAKVGNKEGSVVGKYGLGDRNDGGDCNLLKIIKNLLQQYINKELPEIQARFGRGRVKKDIIADVRWILAESKEYWKDVYLCFIDYAKAFHCVDHNKLWIIL	70272	43453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_44335_44417_45658_70019
524249	contig_15063_pilon	+	1508	4	Intergenic	novelGene_13974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3061.70544341258	9	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	197	1366	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36272
524250	contig_9345_pilon	-	1849	5	Intergenic	novelGene_24375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_4	509.609899825347	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	173	856	148904	142100	FALSE	10	AACTGCTTCCCTCGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAAAPPRPWSVCPSARPPRNGCAVPRAASPAAVVAAPASSWCVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176118	141106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_175989
524251	contig_8978_pilon	+	4015	12	Intergenic	novelGene_49480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	216.672354237704	36	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	113	2503	1721282	1770583	FALSE	35	ATACAAAATCAGGCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASSDPYLPYDGGGDNIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGICLGALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQVKHHVEPLVISSIRSPQ	1721169	1772095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1770477
524252	contig_1735_pilon	+	2145	7	Intergenic	novelGene_106882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	633.143480316008	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	106	1500	126256	139661	FALSE	25	CTAAATCTTTGGCAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGYDAFPRQ	126150	140306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136778_139653
524253	contig_15063_pilon	+	1577	7	Intergenic	novelGene_12242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3668.38635809019	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	442	1326	35271	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27558	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34804_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524254	SIRV6	+	936	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	45	454	-42	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTAATTGGCATCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	11372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524256	contig_11832_pilon	-	2619	14	Intergenic	novelGene_106926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_13	939.65603048206	170	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	662	1006	86997	85898	TRUE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTM	92493	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
524257	contig_10734_pilon	+	2733	9	Intergenic	novelGene_51229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	216.607940759336	9	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	177	1280	1243300	1333513	FALSE	30	GCCAGTGGTACTTAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198743	1334966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243385_1247255_1247552_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
524258	scaffold_8345_pilon	+	663	3	Intergenic	novelGene_107035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_2	134	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	62	424	796061	797810	FALSE	25	TCTAACTGCTCTAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQEEK	795999	798049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_796229_797376_797559_797797
524260	contig_9345_pilon	-	1869	13	Intergenic	novelGene_24511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	232.842623890043	227	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	501	1838	670952	667061	FALSE	50	AATTTGAAAAAAGTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671909	667029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671275_671731
524261	contig_3233_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_56608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAAAGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966500	969145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_966500_969100
524262	contig_13740_pilon	+	2635	7	Intergenic	novelGene_34737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	72.0015431933387	554	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	240	845	321880	356270	FALSE	10	CTTTGGTTTGTTGGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPEQQKEEFVSVWVRDPRIQKEDFWHSYIDYEICIHTNSMCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	273274	358060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_273491_321856_321904_342727_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
524263	contig_5649_pilon	+	2240	11	Intergenic	novelGene_82259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	154.504530677906	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	88	1380	12779	34768	TRUE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12691	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645_35556_35774
524264	contig_11338_pilon	+	1871	10	Intergenic	novelGene_6165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	435.808854917717	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	299	1324	6086	10018	TRUE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRP	745	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10022_13063
524265	contig_1443_pilon	+	2646	10	Intergenic	novelGene_28228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	53.5573996916243	362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1471	2046	538954	541250	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMVCTLGVLGQGENSLESRKKRIRWEELENLENSLEILRHTCV	535986	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028
524266	contig_9609_pilon	+	2096	17	Intergenic	novelGene_22985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	249.027287347692	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	155	1582	311574	332820	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309950	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_332755
524269	contig_10864_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_107101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGAGTACATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989124	991697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_989100_991700
524270	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524272	contig_5649_pilon	+	2398	10	Intergenic	novelGene_82245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	162.792983741793	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	120	1022	12779	29069	TRUE	35	AACCACTGTCTACTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGIPTLLSMGPGLPRPF	12659	35845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_29019_29095_33635_33787_34645
524273	contig_5918_pilon	+	2648	9	Intergenic	novelGene_99500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	41.2535983279035	197	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	154	891	258126	283157	FALSE	10	TTTTTCTGAGTTTTCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHPRTSLETKEYPDTEIQKNQVLSLEEWQEKWVNHNIPFHQEEGHQLLKKHLDTFLNGRSKLRVFFPLCGKAVEMRWFADLGHSVVGVEISELGIREFFTEQNLSYSEELITQIPGAKVFKSSSENISLYCCNMFDLPRANIGQFDRIWDRGALVAVNPADRQRYADIMLSLTRKRFRYFACVVSYDPTKHPGPPFYVPDAEIKRLFGTVCSIHCLDSVDVFEERHRSWGIDYIFEKLYLFTEK	251253	284914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_251359_258077_258266_259400_259494_264231_264365_268811_268865_269818_269894_277826_277913_282581_282627_283044
524274	contig_16594_pilon	-	2364	10	Intergenic	novelGene_53842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_8	2596.18762281148	26	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	255	1124	165546	121101	TRUE	30	ACATGGGTGAATTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335653	117328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_293805_293888_335583
524276	contig_3956_pilon	+	1852	8	Intergenic	novelGene_14970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1241.05838636518	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	81	878	1281682	1289548	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRM	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1289541_1289677_1289758_1289892_1290297
524277	contig_5954_pilon	-	2124	14	Intergenic	novelGene_28619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	409.724644149786	4	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	312	1763	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960572	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956270_956907_956942_959766_959941_960474
524278	contig_6102_pilon	-	1747	10	Intergenic	novelGene_32101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	350.41936075945	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	20	1549	822105	816763	FALSE	30	AAATATTTTATTTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817415_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
524279	contig_12622_pilon	-	1666	10	Intergenic	novelGene_5957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2239.33037830729	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	54	1586	1590968	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1591021	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583609_1586633_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
524280	contig_11720_pilon	+	1704	13	Intergenic	novelGene_43941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	322.880868983524	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	13	1452	262271	272210	FALSE	35	AATATTTATTGAGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265779_267780_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
524281	contig_15118_pilon	+	2621	8	Intergenic	novelGene_74579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.300796992894	403	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	627	1073	377560	378861	TRUE	30	TATTAACCATTTCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	371691	380642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_371770_376596_376650_376716_376995_377342_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151
524282	SIRV6	+	1075	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	13	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	202	693	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1143	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524284	contig_15063_pilon	-	1302	5	Intergenic	novelGene_11261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27174_34609_34918_35254_35380_35839_36156_36264
524285	contig_5799_pilon	+	2456	18	Intergenic	novelGene_50302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_9	230.587244895832	428	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	13	2220	561019	717769	FALSE	25	TATGGATATATTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGAVSAAPECRLLPYALHKWSSFSSTYLPENILVDKPNDQSSRWSSESNYPPQYLILKLERPAIVQNITFGKYEKTHVCNLKKFKVFGGMNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	561006	718005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
524286	contig_11285_pilon	-	3075	27	Intergenic	novelGene_5736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	142.782326985549	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	40	1440	1229333	1200229	TRUE	0	CTCTGCCTGGCTCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGREAKDLDEMDDDDDDDDIGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGGGHE	1230717	1192574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193415_1194307_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
524287	contig_15063_pilon	+	1365	6	Intergenic	novelGene_10301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3793.00870550016	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	249	1199	34808	36632	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSGESSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYPW	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27179_34605_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36431_36623
524288	SIRV6	+	459	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	350	8732	177	59	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTATCTTATTGCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	2599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
524289	contig_8122_pilon	+	2193	11	Intergenic	novelGene_40244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	851.828157552919	1110	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	59	526	720281	742086	TRUE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKQDPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGKMRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENVRGNIHEQS	720222	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737598_742060_742163_744037_744784_745062_745148_748083
524290	contig_5947_pilon	+	3316	13	Intergenic	novelGene_101519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_1	258.987920674991	1003	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	288	1757	509762	544234	FALSE	20	ATGTTTGGTCATGTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGAYPPRYFYPFPVPPLLYQVELSVGGQQFNGKGRTRQAAKHDAAAKALRILQNEPLPERLEVNGRESEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFEVARESGPPHMKSFVTKVSVGQFIGEGEGKSKKISKKNAAIAVLEELKKLPPLPTVERVKPRIKKKTKSIVKLHTGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPLSVCGRC	476380	545793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_476537_486781_486854_509702_509842_511128_511295_523233_523333_536193_536407_537648_537793_539875_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543545_543632_544218
524291	contig_15063_pilon	+	1666	6	Intergenic	novelGene_14111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3669.23014268661	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	188	1024	34808	36333	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	34620	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36277_36600_38975_39092_39506
524292	contig_9668_pilon	+	2094	11	Intergenic	novelGene_58104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	451.333623830532	23	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1002	1721	339365	359314	FALSE	20	TTTAAATGATGGTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214006	359687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_220571_220766_281470_281518_282642_282811_331983_332173_337928_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
524293	contig_5018_pilon	-	1873	10	Intergenic	novelGene_47023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	192.93643807172	2885	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	360	1226	1395701	1392342	FALSE	0	GCCCTGTGGTCTGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397353	1391694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1396391_1396439_1397191
524294	contig_18108_pilon	+	2697	19	Intergenic	novelGene_33520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1109	1423	276309	278088	TRUE	5	GACGGCGGGGCGGGGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVVQNDVAVTTVELPVCGRVHRHFVGSFNSPDLFLACAIVIHAVLGGHGSGGVQRGSVERHPLHISNVAGEVGQAWAIRLVWVPPVLEELLEQWGLTTLRKD	266709	335422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_267082_267669_267734_269578_269653_269897_270025_271249_271421_272030_272201_273829_273931_276279_276411_277875_278090_278279_278373_282720_282850_284890_284981_287435_287590_289293_289454_296016_296176_296964_297166_298757_298895_316667_316755_335359
524295	contig_11816_pilon	-	2215	14	Intergenic	novelGene_98513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_13	321.650679718408	1746	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	21	1226	1125299	989430	TRUE	35	TTGCCTTTTTCAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFPGSSGNPGASSSCRTPSRKQQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLSKTNLYIRGLPPNTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPNGRPWHREGEAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQVQSPSWMQPQPYILQHPSAVLTPSMEHTMSLQPASVISPLAQQMSHLSLGSTGTYMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEEASGQQQVAVETSNDHSPYTFQPNK	1125319	985327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986310_989422_989508_990796_990878_992054_992166_995414_995466_999066_999161_999284_999335_1000393_1000501_1015122_1015203_1017129_1017288_1027665_1027758_1033126_1033186_1086495_1086672_1125230
524296	contig_15063_pilon	-	1728	7	Intergenic	novelGene_10403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	981	1304	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39767	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36167_36276_36597_38967_39090_39504
524297	contig_15036_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_107160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTGCTTCAACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209757	211065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_209800_211100
524298	contig_6898_pilon	+	1883	8	Intergenic	novelGene_35722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1062.64396863749	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	104	883	59668	126706	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKP	59564	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117941_126699
524299	contig_15063_pilon	+	1124	5	Intergenic	novelGene_10474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	236	1021	34808	36700	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKVW	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36692
524301	contig_5092_pilon	-	1926	3	Intergenic	novelGene_62292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	904	junction_1	32	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447920	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835
524302	contig_8616_pilon	+	563	4	Intergenic	novelGene_72600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2010	junction_1	681.525902336482	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	184	489	435878	436516	FALSE	10	ACCTTTTCATGTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	431205	436590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_431238_435726_435900_435993_436119_436357
524303	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524304	contig_6975_pilon	-	2377	10	Intergenic	novelGene_74250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_7	385.673949161372	2026	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	177	1223	164514	159453	FALSE	25	GTATGGCATCTGTCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSMYDRMRRGGDGYDGGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169960	158298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163009_163195_163709_163849_164402_164538_169807
524308	contig_9345_pilon	+	2043	7	Intergenic	novelGene_24399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTGTGAATCATCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141131	175593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_142417_142570_142781_142955_143070_148861_148948_164409_164525_173640_173789_175508
524310	contig_9345_pilon	-	1939	6	Intergenic	novelGene_24642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1871.03184366274	6	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	527	865	952473	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001401	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952491_955170_955356_997013_997093_1001156
524311	contig_11337_pilon	+	2421	8	Intergenic	novelGene_107164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	204.635464837813	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	365	1531	159367	172617	FALSE	35	TAAAAAGTCTGGTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102503	173507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102763_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
524312	contig_16666_pilon	-	1382	4	Intergenic	novelGene_61752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	236	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	5	319	59688	56707	TRUE	10	TCATACCTTGTCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNGKTR	59692	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56708_58085_58264_59552
524314	contig_15063_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_9288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3372.67841139156	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1058	1483	36299	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36264_36600_38975_39092_39506
524315	contig_15063_pilon	+	1542	6	Intergenic	novelGene_14220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	86	1321	34808	39515	FALSE	35	TGGCCATGAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34722	39736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524316	contig_15063_pilon	+	1461	6	Intergenic	novelGene_12070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3599.786771463	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	498	1319	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35072_35142_35380_35839_36158_36266
524317	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	239	1084	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36268
524318	SIRV6	+	876	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	408	526	192	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	132	623	1733	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1495	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524319	contig_7412_pilon	-	1750	9	Intergenic	novelGene_76325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1533.51418317536	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	86	1615	377290	364334	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFKPQLRCYLDLPPAASRLWCHLSAT	377878	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364409_364516_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377817
524320	contig_4301_pilon	-	2296	6	Intergenic	novelGene_65115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	410.27239731671	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3	380	575648	546112	TRUE	10	CTATTGTTGTGACTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKEVGGAAAVCCAVSALWRLCLHLGVCVPRLPPRQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLDAASTERLSGAEGWGAC	575650	538013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_546046_546164_547299_547521_575543
524321	contig_15063_pilon	+	1669	7	Intergenic	novelGene_12570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3850.44710246601	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	6	1085	28164	36333	TRUE	15	TATCCCAAGTGCTGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	28158	39702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38971_39092_39504
524323	contig_11429_pilon	+	2055	5	Intergenic	novelGene_60458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	693.976359467669	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	210	767	46299	46856	TRUE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSLGPLDFKKQKGQCSGPSRSSCVPMLRRTQSISPQDRWEGFLFQTTPCSLTLLVLTDSHFPVSPLLSPVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	45419	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_47370_47457_47552_48443_48530_48899
524324	contig_12090_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_80480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGATGAGAGTGATTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59237	57640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_57600_59200
524326	contig_15063_pilon	-	1519	5	Intergenic	novelGene_11958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	785	1108	35891	35108	TRUE	20	CCCCAGTAGCTGAGGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36158_36264
524328	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524329	contig_5018_pilon	-	1882	9	Intergenic	novelGene_47087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	74	1324	1402792	1399645	FALSE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
524330	SIRV6	+	627	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	31	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_1845_2038_2497_2621_2740
524331	contig_18869_pilon	-	2602	3	Intergenic	novelGene_55970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	23	980	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	362	904	53041	52499	TRUE	25	TAACATTAGTCCAGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59878	49540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_49889_51148_53330_59805
524332	contig_12919_pilon	+	2592	8	Intergenic	novelGene_75913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	144.083309234623	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	62	1000	821938	840209	FALSE	15	AACTCTGTCCTGCCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYRARPGRGFPVLCWPKRGIMAANENQKHSVLDLCDRLLTDERNQTSIIDKIAKRNTELLEEIRKLEAELQINTRNFQIKEDIPETVIKFASVENPENDSQFLNVSCSFQVAVQVPYELQKGEVLITFEQEEVAQNVIRMGKHHVRIEDKDVEVVAQPVSLNSGVRFQVHVQVSKVKINVNGIPDGLPADQMRDKLELSFSKSRNGGGEVECVEYDNQSQSAVITFVEIGVADKILKKKDFPLYVNQNCHRVTVSPYIETHLEKFQVFSGICPRTVLLTGMEDIQMDEETVTDLVNIHFQRKKNGGGEVDVVKCSLSQPQIAYFEDETYGIV	807093	841801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_807149_821931_822013_822806_822906_825482_825646_828731_828839_829314_829502_839187_839295_840008
524334	contig_1244_pilon	-	1743	12	Intergenic	novelGene_38014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1010.40418228066	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	52	714	948448	924715	TRUE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEVM	948499	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924720_928754_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
524337	contig_8772_pilon	+	1632	10	Intergenic	novelGene_21098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4623.64837774107	11	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	378	1319	15814	23105	FALSE	20	AAACTCTTGCTGTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15220	23418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15343_15558_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
524340	contig_5480_pilon	+	3191	5	Intergenic	novelGene_107212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	112.295369450392	493	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	116	634	18176	27860	FALSE	30	AAGGCTCTGAATTATCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGPTAASVRRGFGGVRHRLPASLCSGVCPFPVPSGRDMSVPEPAPPGGVMTRLPDSLGAGEPTPGLSDTSPDEGLLDPLTVEDRAVEQLAEGLLSHYLPDLQRSKQALQELTQNQVVLLDTLEQEISKFKECHSMLDINALFTEAKHYHTKLVNIRKEMLMLHEKTAKLKKRALKLQQKRQKEELEREQQREKEFEREKQLTAKPAKRM	18060	30417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_18258_22479_22622_23941_24030_27236_27324_27740
524341	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524342	contig_11933_pilon	+	2967	4	Intergenic	novelGene_107241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_3	12.1928941054479	1059	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2527	2853	91153	91479	FALSE	10	CGTGGAGTTATGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQSAQRKDKNSFKIQSSQFGRVYDYARVCLCFCIVREVHSIFWLSDGLISSLPPPQLSFCNVFPTWRSLELSIWHSCLLCSLILQQTPSDLLTQNQTRPPTLWHIQ	82746	91593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_83058_85042_85091_85207_85325_89102
524343	contig_15063_pilon	-	1515	4	Intergenic	novelGene_13382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
524345	contig_14925_pilon	-	1655	5	Intergenic	novelGene_55344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	66	479	116065	114666	TRUE	5	GTGTGCACTTGCCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129452
524346	contig_3975_pilon	+	2585	12	Intergenic	novelGene_54754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	94.3190470935118	510	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	26	808	1961329	1975972	TRUE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPQTPSPSWPLQ	1961303	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1975682_1975932_1976095_1983156_1983261_1984722
524349	contig_11429_pilon	+	2175	5	Intergenic	novelGene_60463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_4	368.557576913025	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	67	513	46162	46856	TRUE	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	45425	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_47370_47457_47552_48443
524351	contig_13153_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_107282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATAAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114587	113726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13153_pilon_-_113700_114600
524352	contig_8394_pilon	-	2445	2	Intergenic	novelGene_27308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	162	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	856	2097	38778	32466	FALSE	20	TTAACCCTTTTCATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCFQELVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39633	32117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_38754
524353	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	20	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524355	contig_14925_pilon	-	2878	2	Intergenic	novelGene_55389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	0	208	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	56	574	276802	276095	FALSE	35	TGATTCACTTGCAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKTWRVLLIILWLLLSGISGKNEVEQSPPYLSVQEGELVTINCSYSTGMTTLQWLQKNPGGGIVSLFILSLEMKKKERLSATINTEERHSSLHITASQPRDSATYLCAVETQCFPGTCSPYLNSTAEASLLIPISRLVCLYPWTVKLTGFSDGLNGGREDKRKGVELRITS	276857	273790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_276562_276750
524356	contig_1443_pilon	-	1251	8	Intergenic	novelGene_28310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	561.553384890192	2	5	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	503	967	805384	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKGLCLFATENFTLAVFVETTFGKRKEINKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809522	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748875_766786_766826_767440_767556_776186_776283_805296_805718_808694_808741_809399
524357	contig_1244_pilon	-	2110	11	Intergenic	novelGene_37975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	753.329516214518	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	86	1333	946523	923211	FALSE	30	TTTAAATGATGGGCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCSGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	946608	922433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928878_931625_931688_933736_933856_934499_934566_946439
524360	contig_12512_pilon	-	3254	8	Intergenic	novelGene_24182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	382.413709087369	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	235	1332	599702	590797	TRUE	20	TAATTGTAAGTCTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQTPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLGLSLPERPEEHAVRIACIFSLQHHQAMQKW	599936	586593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_590862_591103_591267_591594_591852_592236_592340_593331_593480_595423_595506_599422
524361	contig_854_pilon	+	1498	7	Intergenic	novelGene_36229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2351.07715857127	9	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAGAAAATAAATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543484	563760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_556930_557065_557591_557752_562271_562405_563029
524362	contig_13158_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_107299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATAAAAAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176042	178724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_176000_178700
524363	contig_6846_pilon	-	3632	11	Intergenic	novelGene_107304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_10	52.1808393953183	262	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	83	1528	325558	309051	FALSE	20	GTGTCATTTGTGAGTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLCPPPSPAVAKTEIVLSGESPLLAATFAYWDNILGPRVRHIWAPKTEQVLLSDGEITFLANHTLNGEILRNAESGAIDVKFFVLSEKGVIIVSLIFDGNWNGDRSTYGLSIILPQTELSFYLPLHRVCVDRLTHIIRKGRIWMHKERQENVQKIVLEGTERMEDQGQSIIPMLTGEVIPVMELLSSMKSHSVSEEIDIADTVLNDDDIGDSCHEGFLLNAISSHLQTCGCSVVVGSSAEKVNKIVRTLCLFLTPAERKCSRLCETESSFKYESGLFVQGLLKDSTGSFVLPFRQVMYAPYPTTHIDVDVNTVKQMPPCHEHIYNQRRYMRSELTAFWRATSEEDMAQDTIIYTDESFTPDLNIFQDVLHRDTLVKAFLDQVFHLKPGLSLRSTFLAQFLLILHRKALTLIKYIEDDTQKGKKPFKSLRNLKIDLDLTAEGDLNIIMALAEKIKPGLHSFIFGRPFYTSVQERDVLMTF	331700	306946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_309238_309341_309452_310686_310745_313494_313731_315798_315916_318098_318172_319421_319487_320740_320837_323927_323988_325114_325603_331662
524365	contig_16411_pilon	-	2813	1	Intergenic	novelGene_77359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1902	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	269	580	301177	300866	NA	5	TCTGGTTTGGCAGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAILLGAGREGCVGCRCSARCDDFHKEAGDIFWVTISHPQVLGGLPEGSWPDFHSFQGFSGASLPPARSCLLLGISTGKDGAFGSPATTPGPPYSSLHTTGA	301445	298632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_298600_301400
524366	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524367	contig_9833_pilon	+	1797	12	Intergenic	novelGene_68537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	434.265581230337	1638	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	19	1401	230823	259941	FALSE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKERAPTSSCRMLTWTGPWSRPTSPCSSTRASAAVPAPEPSCRRMCMLSFWSEALPRPRHGWLATPLIARLSRGHRWTRLSLRRFLAISNLGSRRGAKLLCGGGAAADRGYFIQPTVFGDVQDSMTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	230804	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251857_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
524368	contig_4429_pilon	+	2634	11	Intergenic	novelGene_50790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	384.895946977881	32	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	14	1789	154531	198515	FALSE	20	TACCTAGTTTTGTTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154517	199360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_184287_184714_191596_191746_198438
524369	contig_2069_pilon	+	495	2	Intergenic	novelGene_23523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCAAGGCTCGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508369	1508994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941
524370	contig_12312_pilon	-	3395	19	Intergenic	novelGene_64025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	95.8007190879994	610	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	7	2349	583394	573769	FALSE	15	GTAGTCTCATCTTTAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPMHSSQPGYQLQQNGSFGPVRGPQPNYGSPYPGAPAFGSQPGSPQPLPPKRLDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGSEPFVTGVRGQVPPLVTTNFLVKDQGNASPRYIRCTAYSIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESGPLRCNRCKAYMCSFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSLGSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYDAIRSGLVRLLCEELKSLLEFLPREGGAEESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRTVITSLLDQIPEMFADTRETDTVFAPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGVYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNKYMDVATLSVVPQLTGGSVYKYACFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELAGLDVDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRNCETDTLINYMAKFAYRAVLNSPVKTVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECMKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLQGVVQNLFSVFSFSHITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLIVVKQEDKLEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS	583400	572722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_573910_574028_574119_574351_574412_574774_574955_575051_575171_575310_575450_575657_575804_575905_576003_576507_576679_576970_577088_577297_577392_577585_577778_577915_578041_578214_578331_578551_578691_579776_579905_580136_580249_582871_583009_583354
524371	contig_15063_pilon	+	2551	7	Intergenic	novelGene_13013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	1061	2296	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	29456	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524372	contig_8065_pilon	-	1511	1	Intergenic	novelGene_107340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225716	224205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_224200_225700
524373	contig_12357_pilon	-	2179	12	Intergenic	novelGene_6081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53908	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30321_30931_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42249_46434_46565_51127_51238_52758_52830_53169
524374	contig_5988_pilon	+	3203	17	Intergenic	novelGene_15874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCATTTCCTGGTCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387158	403608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_388062_388498_388671_390317_390432_390652_390806_391212_391456_392440_392621_393680_393827_394140_394364_394463_394613_394839_394950_395087_395223_395505_395645_395796_395862_395971_396067_397411_397523_397973_398183_403552
524375	contig_9708_pilon	+	2777	14	Intergenic	novelGene_67276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	105.685645294438	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	301	1458	782370	803598	FALSE	25	GTTACCTAAAGTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768133	804917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
524376	contig_8589_pilon	-	3616	17	Intergenic	novelGene_107359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	222.851819812516	206	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	46	2007	286339	160653	FALSE	30	ATATACTTGGAAATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIEIDFLQKKSIDSNPYDTDKMAAEFIQQFNNQAFSVGQQLVFSFNDKLFGLLVKDIEAMDPSILKGETSTGKRQKIEVGLVVGNSQVAFEKAENSSLNLIGKAKTKENRQSIINPDWNFEKMGIGGLDKEFSDIFRRAFASRVFPPEIVEQMGCKHVKGILLYGPPGCGKTLLARQIGKMLNAREPKVVNGPEILNKYVGESEANIRKLFADAEEEQRRLGANSGLHIIIFDEIDAICKQRGSMAGSTGVHDTVVNQLLSKIDGVEQLNNILVIGMTNRPDLIDEALLRPGRLEVKMEIGLPDEKGRLQILHIHTARMRGHHLLSADVDIKELAVETKNFSGAELEGLVRAAQSTAMNRHIKASTKVEVDMEKAESLQVTRGDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIKWGDPVTRVLEDGELLVQQTKNSDRTPLVSVLLEGPPHSGKTALAAKIAEESNFPFIKICSPDKMIGFSETAKCQAMKKIFDDAYKSQLSCVVVDDIERLLDYVPIGPRFSNLVLQALLVLLKKAPPQGRKLLIIGTTSRKDVLQEMEMLNAFSTTIHVPNIATGEQLLESLELLGNFKDKERTIIAQQVKGKKVWIGIKKLLMLIEMSLQMDPEYRVRKFLALLREEGASPLDFCNTP	286384	159043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_160684_161100_161157_164494_164609_165689_165825_188631_188712_191070_191138_203598_203733_205407_205565_218170_218267_227739_227928_228130_228206_229009_229176_246824_247025_279373_279530_282112_282189_282692_282801_286216
524379	contig_15063_pilon	+	1009	6	Intergenic	novelGene_8623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.5582294312618	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	230	754	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26366	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35127_36409_36600_38975_39092_39506
524381	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524382	scaffold_12124_pilon	+	2428	13	Intergenic	novelGene_21988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	156.355964069171	37	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	205	1266	799011	812968	TRUE	25	CACAAAGAGCTTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKSHLIHMQKLNNE	791831	815406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_812931_813765_813915_813998_815122
524383	contig_4232_pilon	-	2541	12	Intergenic	novelGene_63471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_11	374.781699545281	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	206	592	615916	614837	TRUE	5	TCTCTGCTGGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620506	607746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_616930_617058_620456
524384	contig_1443_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_28167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	212	613	343731	344592	FALSE	20	TTCTGTGCATTCTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343519	344883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343732_344191
524386	contig_5967_pilon	-	1987	10	Intergenic	novelGene_44385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	430.662280679421	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	111	1205	488569	388566	FALSE	35	AGAGCATCTTATGCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430759_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
524387	SIRV6	+	336	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-24	173	-11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGTGGTGTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	1947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
524388	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3607.56282766573	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	233	1462	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
524389	contig_5643_pilon	+	893	10	Intergenic	novelGene_38786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3092.30453437777	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	813	80	892	236108	238115	FALSE	30	ACCCCCTGAAGAAGGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSCWLFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGSPATALEEERGPLSCWGVLAPTPSNTLRIFHPLHSFHP	233606	238116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233626_236047_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237621_238002
524390	contig_5302_pilon	+	1858	9	Intergenic	novelGene_81460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.910488601448	10	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	154	1005	318287	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	209749	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_209900_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
524391	contig_5727_pilon	+	2401	2	Intergenic	novelGene_7934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	483	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	330	2333	129759	131762	FALSE	15	GTTCCAGTATTTTGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTTNSLPTDLLLKEGSLKQEVESFCYQIVSESNDQKVGILQSEDEQLQPSVSKKSESELPRVKFMSNSNKITFSKKPKRRKYDESYLSFGFTYFGNRDAPHAQCVLCKKILSNSSLAPSKLRRHLETKHAAYKDKDISFFKQHLDSPENSKPAAPKIVNTDNESATEASYNVSYHIALSGEAHTIGELLIKPCAKDVVMRMFDEQYSKKIDAVQLSNSTVARRIKDLAADIEEELVCRLKICDGFSLQLDESADVSGLAVLLVFVRYRFNRSIEEDLLLCESLQSNATGAEIFNCINSFMQKHEIEWEKCIDVCSDASRAMDGKIAEAVTLIKYVAPESTSSHCLLYRHALAVKIMPTSLKNVLDQAVQIINYIKARPHQSRLLKILCEEMGAQHTALLLNTEVRWLSRGKVLVRLLELRRELLVFMDSAFRLSDCLTNSSWLLRLAYLADIFTKLNEVNLSMQGKNVTVFTVFDKMSSLLRKLEFWASSVEEENFDCFPTLSDFLTEINSTVDKDICSAIVQHLRGLRSTLLKYFPVTNDSNAWVRNPFTVTVKPVSLIARDYESLIDLTSDSQVKQNFSELSLNDFWSSLIQEYPSIARRAVRVLLPFATMHLCETGFSYYAATKTKYRKRLDAAPHMRIRLSNITPNIKRICDKKTQKHCSH	128377	131830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_128456_129507
524392	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_12858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524394	contig_233_pilon	-	1853	9	Intergenic	novelGene_14502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1138.36571452236	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	76	1410	101691	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	101766	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673
524396	contig_5643_pilon	+	1137	10	Intergenic	novelGene_38871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	44	925	236108	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236064	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
524397	contig_2219_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_67205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTATCCCTCCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247419	245956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_246000_247400
524398	contig_7744_pilon	+	2117	18	Intergenic	novelGene_62541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	200.92671114761	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1105	1674	889342	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879798	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887438_889074_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
524399	contig_5643_pilon	+	2136	16	Intergenic	novelGene_39018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	751.474414438413	1	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	653	1933	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641235_641412
524400	contig_5084_pilon	-	2420	5	Intergenic	novelGene_64550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	349.886052880077	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	147	533	580023	533474	FALSE	20	TCACGTGTTGATTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRASTLLRDEELEEIKKETGSVKISSEFQNLLSTRWGTGSSMPFFQRVAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580169	531586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_533528_533674_533798_537729_537792_549014_549096_579956
524401	contig_12624_pilon	-	1976	15	Intergenic	novelGene_61071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	833.352927660794	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	143	1705	903621	862389	FALSE	45	ATGAAAATTCACTTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903763	862117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
524402	contig_12140_pilon	-	1464	11	Intergenic	novelGene_86521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	96.2501428570368	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	796	1464	43457	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84860	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_44267_44356_45850_46085_49424_49521_64263_64348_84713
524403	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_11624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	TAAGTGAGCGCTGCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524404	SIRV6	-	345	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTACTTAACTGCGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11725	11380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
524405	contig_4962_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_107383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	197	316	179766	179885	NA	85	AAAAAAAAAAACAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAKPLIHRAPAKIHCFWVKKTEKEKKKSPLSLRRFSKPSPRTQAKIYCCWRKGKCKHPLGEVYKMVLGPGFYIYTMRRTATAGEGARNSHPRATNYRYKAEFG	179569	181746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_179600_181700
524407	contig_15063_pilon	+	1352	5	Intergenic	novelGene_14367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	216	1100	35271	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35055	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524408	SIRV4	-	1564	3	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTCTCATTATAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3402	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1344_1675_1882_2385
524409	contig_9668_pilon	+	319	3	Intergenic	novelGene_58200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGAAGTGGTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511992	523478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_512102_522292_522402_523377
524410	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_13163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524411	contig_3095_pilon	+	810	4	Intergenic	novelGene_75109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1141.34929895375	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	82	807	147280	151151	FALSE	25	ACCTGAGGGTGAGTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147198	151154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996
524412	contig_15063_pilon	+	1168	4	Intergenic	novelGene_13119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	202	1167	34808	36454	FALSE	15	CTCAGGCCCAGGGCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPE	34606	36455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524413	contig_2770_pilon	-	1378	6	Intergenic	novelGene_107465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	11	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	35	484	750561	743833	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750595	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
524414	contig_1076_pilon	-	1861	14	Intergenic	novelGene_101099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_7	319.773847600875	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	1034	1861	61029	51354	FALSE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAIS	79721	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61227_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
524415	contig_854_pilon	-	2046	2	Intergenic	novelGene_36181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1104	1676	471014	470442	FALSE	35	TATTCTGGAAATCACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	473643	470071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586
524416	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524418	contig_1719_pilon	+	2399	8	Intergenic	novelGene_87297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	48.6142668233875	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	353	1063	415082	426233	FALSE	15	TGCTAACATCTTGTTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLEVSNRPDLYDVFVNLADSEITIAPLAKETMTMGKLHKEIGQLIVQSAEDPEKSESQVIKDISLKTRELLTNLASFAEVSDGGQRPALSLETLKQKRFPPATENFLYHLAAAEHMLKI	406729	427569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898_409116_415050_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422086_424045_424141_426056
524419	contig_2100_pilon	-	1048	9	Intergenic	novelGene_50756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	991.489275975792	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	16	810	1180199	1170170	FALSE	25	CTGTAGCCCATAAGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILSSRLRPGLRGLR	1180214	1169931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170207_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1176366_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189
524420	contig_12638_pilon	+	2037	9	Intergenic	novelGene_33378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	100.141150382847	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	617	1288	1530025	1538931	FALSE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515748	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524559_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
524421	contig_7457_pilon	-	2275	5	Intergenic	novelGene_31602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.579474460415	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	679	1200	958306	956489	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962728	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960360_960544_960896_962603
524422	contig_5434_pilon	-	3475	11	Intergenic	novelGene_74653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.378219611747	441	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	29	580	282075	275963	TRUE	25	AGGTATAATCTCAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAPTPQATSFPAEGRCGYYVEKKKRFCRMVVAAGKRFCGEHAGAAEEENARKRILCPLDPKHTVYEDQLAKHLKKCNSREKPKPDFFIQDINAGLKDETEIPEQLVPISFLSEEQLENLIKKLRKASVGLNSTLKDQIMSHPVLHDALNDPKNGDSATKHLKQQVCLGHSNSTKWPFIHL	282103	256511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_257654_258103_258804_259095_259529_262817_262893_273748_273822_275490_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
524423	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	4	1419	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGENNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34932_35037_35380_35839_36158_36266
524424	contig_12864_pilon	-	2042	8	Intergenic	novelGene_76434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_3	647.087761766958	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAGAGTTGCTGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252170	242236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245805_245915_246329_246348_248963_249843_251887_251999_252111
524425	contig_11720_pilon	-	2395	13	Intergenic	novelGene_43895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	171.296040039848	1305	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	224	1153	124674	118106	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134623	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_133014_133137_134558
524426	contig_12923_pilon	-	2806	17	Intergenic	novelGene_30147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_16	149.58096417576	54	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1376	2278	230738	225749	FALSE	25	AGCAAGGCTATATGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236111	225220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
524428	contig_20199_pilon	-	721	4	Intergenic	novelGene_82584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	83	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	160	495	43987	41055	TRUE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44146	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40657_40835_41250_42110_42171_43906
524431	contig_10986_pilon	-	2185	12	Intergenic	novelGene_71485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	170.137086195731	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	77	529	80340	74000	TRUE	40	AAACATGTAAAACTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTTWSLAHPAVSST	80416	66807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74259_74298_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
524434	contig_6735_pilon	-	1949	14	Intergenic	novelGene_15673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1053.96048228805	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	90	1154	564813	543101	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTPTLNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPGRL	568232	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542707_543028_543112_543182_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564792_564869_568198
524435	SIRV6	+	521	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	810	-335	810	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11047	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
524436	contig_13216_pilon	+	2001	7	Intergenic	novelGene_47478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	890.050123432508	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	397	1464	243939	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229620	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243114_243813_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
524438	contig_3588_pilon	+	2056	16	Intergenic	novelGene_72852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	609.073044333217	83	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	869	1540	127440	140944	FALSE	0	TTTGGTGGTTTTTTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQKRECKYVHQRPLPQPALPSMSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	84364	141460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112318_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
524440	contig_20614_pilon	-	3451	1	Intergenic	novelGene_107603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450738	447287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_447300_450700
524441	contig_13496_pilon	+	3259	17	Intergenic	novelGene_107625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	335.899910687693	298	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	149	2365	225105	515244	FALSE	15	CCCCGGGCAAGACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGKLNMHMNVQNGKWESDPSGTKTCIGTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHAHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLADESDSVDSADAEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSVIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFNLDDLQPWHPFGVDSVPANTENEVEPVDARPAADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPRGAPPLQDAAEWL	224956	516138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_225162_285095_285264_309234_309365_343908_344022_347585_347780_378499_378703_392486_392655_409208_409343_415282_415358_416490_416650_443901_444031_444828_444929_485013_485236_495910_495965_502185_502287_506201_506349_515181
524442	contig_15021_pilon	+	1878	2	Intergenic	novelGene_26952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCGTACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239749	241716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241412_241500
524443	contig_18194_pilon	-	2065	5	Intergenic	novelGene_55955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	337	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	128	454	18897	4965	FALSE	10	GCCCTAAGCTCTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQRVATKRRQTSGRTTVPKS	20413	3353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5022_5388_5501_7034_7162_18866_18976_20364
524444	contig_12074_pilon	-	1910	12	Intergenic	novelGene_53768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	279.525926886314	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1153	1761	33407	30226	FALSE	45	CCTTATTATCAAATAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45851	30076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_41067_41228_45769
524445	contig_2646_pilon	-	2190	11	Intergenic	novelGene_69665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	330.76402464597	389	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	414	1106	2178950	2174850	TRUE	30	AGAGTGGAATTGTTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2181068	2171587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180696
524446	contig_13946_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_107667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGCAGAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35153	35446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13946_pilon_+_35200_35400
524447	contig_10324_pilon	+	2122	16	Intergenic	novelGene_7714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1154.19589325209	20	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	762	1505	69971	80150	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLLPLYAS	51805	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69377_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74709_80128
524448	contig_2365_pilon	+	3470	1	Intergenic	novelGene_103740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGTTGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160069	163539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_160100_163500
524452	contig_14744_pilon	+	805	5	Intergenic	novelGene_66078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3123.47069579658	19	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	3	764	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIMRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384548_1385847_1386006_1386499
524454	contig_401_pilon	-	2623	16	Intergenic	novelGene_42785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.144294836779	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	63	2225	1129059	1114289	FALSE	30	GTGTGACTAGAGCGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVQLSESKRELTELRSALRVFQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDAATEDEEAAAGLSCPAVLTDSEDESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPTGPRESSPLVVISQPAPIAPHLSGPAEDSSSDSEAEDEKSVLMAAVQNGGEEANLLLPELGSAFYDMARGFAVGSLSEASTGGPVIPPWKECPICKERFSPATKPPGHPHSYIHSYTLPSDALKPIAGAPHPLLFGVCVCLPECSLEACVEAAAWT	1131679	1113890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114463_1114883_1114975_1115937_1116045_1116407_1116608_1116836_1116946_1117319_1117416_1117939_1118066_1118523_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
524456	contig_10311_pilon	-	1685	11	Intergenic	novelGene_50448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1065.01438487938	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	326	1117	68953	65773	TRUE	25	CTTAAAAGTTGCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65568_65640_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
524457	contig_8712_pilon	+	1614	5	Intergenic	novelGene_58786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	27	506	314974	321793	TRUE	20	TGGTGTGAAGAAGGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286994	323272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_322442_322812
524458	contig_12279_pilon	+	1076	5	Intergenic	novelGene_50118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3417	junction_2	1076.55570571151	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	79	573	68405	77128	FALSE	20	TGACTGAGATCTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	68326	77631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
524459	contig_2100_pilon	-	1575	10	Intergenic	novelGene_50755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	915.677095492661	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	214	1164	1176787	1171931	TRUE	25	TGTAGCCCATAAGAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILR	1185533	1169930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171926_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178820_1185420
524460	contig_14441_pilon	+	1857	2	Intergenic	novelGene_100703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1513	junction_1	0	303	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1204	1671	117143	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMVRRAVEGVTYVLGKLRDNFLWDHGGRLGKGKLGPPETKWMLSEHPMSSQPPPLLAPGNLKTFSSSGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	115804	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117097
524461	SIRV6	+	757	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1488	225	59	-90	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524462	contig_14209_pilon	+	2386	13	Intergenic	novelGene_88322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	53	junction_10	179.41494425555	714	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	65	883	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32301	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38286_38783_40142_40344_40418
524464	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7612	1	-219	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCGCCAACAGCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
524465	contig_13097_pilon	+	2212	19	Intergenic	novelGene_107696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_14	497.590319985437	964	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	239	2050	184733	264394	FALSE	40	AAAAATCTGTCTCTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184494	264556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
524466	contig_15063_pilon	+	1381	5	Intergenic	novelGene_14197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	117	1334	34808	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTDLLLTTGPQGPTRPHVVTSRYVCVHVCIQTNHVCG	34691	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_36649
524467	contig_14287_pilon	-	2319	3	Intergenic	novelGene_24049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_2	16	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	194	1006	22710	21898	FALSE	10	CTGAGCTCTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33879	20584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33780
524469	contig_15866_pilon	+	1787	13	Intergenic	novelGene_63632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_10	573.846790431809	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	220	879	601021	626230	TRUE	15	AGTGTGGCTTGGTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSEGIQEQIYK	458970	633806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581475_581685_581705_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_626203_626331_627916_627988_633069
524470	contig_15063_pilon	-	1112	3	Intergenic	novelGene_14376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	769	1092	35891	35108	FALSE	25	TTGGTATGGGATGTACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	35087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36142_36264
524471	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_12656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	177	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524473	SIRV6	+	1016	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	432	746	2021	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524475	contig_15047_pilon	+	1332	6	Intergenic	novelGene_52250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	230	505	3242	4178	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2616	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
524478	contig_20819_pilon	-	2133	7	Intergenic	novelGene_55676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	1657.90768406715	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1711	2091	66706	65441	FALSE	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWCHATSGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	70275	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_66682_68275_69625_69725_70232
524480	contig_18145_pilon	+	2461	12	Intergenic	novelGene_37361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	534.943744628681	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	593	1564	93431	98211	TRUE	75	CAAAAAATACAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANVRDSCASA	92838	100895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_97940_98182_98541_98826_98983_100326_100482_100638
524481	contig_15063_pilon	-	1487	4	Intergenic	novelGene_13799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	777	1100	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36260
524482	contig_15063_pilon	+	1480	4	Intergenic	novelGene_14126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	179	1351	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34629	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524483	contig_10311_pilon	-	1770	10	Intergenic	novelGene_50432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_9	1027.01694361346	17	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	331	1122	68953	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71561	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70496_71497
524484	contig_16775_pilon	+	2331	16	Intergenic	novelGene_107759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	182.591054910511	7	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	174	1658	130489	174136	FALSE	25	CGATGGTTTTGTAGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130315	174809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
524487	contig_15063_pilon	+	1778	7	Intergenic	novelGene_8464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	3	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	289	1524	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVGGPVTHITVAATTTTTSTAGARANWSPSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26305	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524488	contig_5153_pilon	+	2396	16	Intergenic	novelGene_74358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	296.062801145673	159	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	457	1677	1007835	1022174	FALSE	20	AGAATTTTTTCCTGGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956563	1022893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005403_1005581_1007792_1007907_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
524490	contig_6735_pilon	-	1496	13	Intergenic	novelGene_15753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	478	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	84	1379	564868	542104	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEHGHLSCGLASSSMNVSSNPPPTPAKSAVLSGIPGLLTWEGT	568281	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542228_543127_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
524492	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3757.05393227193	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	232	1392	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266
524493	contig_6958_pilon	-	2131	5	Intergenic	novelGene_69932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	9	junction_3	609.715661189706	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	156	581	190008	160965	TRUE	20	TAAACGGCATCCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLMTSCPCSCMCWPAATSRRCSLTWST	190163	148588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161042_183378_183418_189698
524495	contig_15063_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_13767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	805	1128	35891	35108	TRUE	50	ACCCAAGAGTGGACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36804	34607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
524497	contig_11720_pilon	+	1924	15	Intergenic	novelGene_43937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	400.638450934689	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	195	1352	264127	271346	TRUE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQKRIPRQTLQRLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGW	262258	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_262995_264109_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271410_271806_271961_272096
524498	contig_15732_pilon	+	2156	15	Intergenic	novelGene_88846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	269.342851081241	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	73	1905	53547	398220	TRUE	30	GCACTGGCACTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYNKLTIVHHPGASYSTPS	11225	398729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_393845_398197_398263_398520
524499	contig_3975_pilon	+	2767	10	Intergenic	novelGene_54769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	41.5285116992003	609	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	50	1249	1965812	1984755	FALSE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961632	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
524500	contig_15354_pilon	+	2649	10	Intergenic	novelGene_65758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	48.1550992133431	444	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	532	1260	642871	647109	FALSE	30	GCTGCCTCTGCTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	639076	648498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_639245_639415_639519_639699_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085
524501	contig_1443_pilon	-	1997	10	Intergenic	novelGene_28279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_8	362.275047272847	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	402	1325	776427	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809528	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805224_805505_805718_809399
524502	contig_15859_pilon	-	2279	2	Intergenic	novelGene_50216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379712	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_378542_378607
524503	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524504	contig_15720_pilon	-	1742	7	Intergenic	novelGene_41892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3875	junction_2	510.106987688748	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1395	1700	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_282750_283785
524506	contig_2204_pilon	+	1963	7	Intergenic	novelGene_71669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	2899	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	10	GGGCATCATGCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
524507	contig_6735_pilon	-	1701	11	Intergenic	novelGene_15720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	720.283423382768	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	86	676	564868	543845	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYILHRLGLQQRVVHLQSLSL	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543904_547276_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
524508	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_9516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
524509	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	9	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	230	1396	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35371_35839_36158_36266
524510	SIRV6	+	928	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	577	-14	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	41	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524512	contig_5643_pilon	+	1170	2	Intergenic	novelGene_38882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5483	junction_1	0	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236930	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_237819_237913
524513	contig_6191_pilon	+	3258	9	Intergenic	novelGene_107815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_3	51.8807225759241	244	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	127	2154	17002	43956	FALSE	35	TGAGTAACTGGCTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSKGAGAAASDEKPGRIASLSLLFQKSFAQILPQWKKGNTEGECLPHKCSGIDTLNENYSWQISVTDNDFKIFKNHESQLCEILQDKFDCISTVVSPALEGHIKSLQVFRKMLTSQVALSVWKDDLTRHVVDAVVNAANEHLQHMGGLALALVKAGGPEIEEDSRRFIGRYGKVPTSRIAITRAGRLPCKEIIHAVGPQWIARDGQRCVEELKMAIINILEYVNCTNLDIKAVAIPALSSGIFQFPLDLCTRIIVSTIKLYFIKKQVVGNLKEIHLVSNEDPTVAAFKTASENILGRNQLESLAFSAEMAENKSMLPSHNSFSVSQWTREEKRENGLKANSPAINLMGSNMEKMREAEAWIHRLLKLQGHHVIENNHIFYLGTKEHDILSRLQKTSSVSISEIIDSGKAKLEIKGARADLIEVVMKIEHVLCDIQEEMAKRREQDLWSLLGQWTGQQPKKQDEMKGNSNRVKFPVMFSTQALQDKKKQFEKCGFQVIKVEKINNEVLNTVFQAKKKMMAGRSRNVLVSHGLFHRVPHQFCNMVCRVGFQRMYQMPCESRYGAGIYFTKNLKNLADQIRKTPATDKLIYVFEADVLTGSFCQSCQLNIVPPPLSPGAIDGYDSVVDNVSSPETFVIFSSTQAVPQYLWTCSQDEVWSRDYSSGQMMLSSQSYWG	13013	45060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_13052_16913_17017_17825_17968_20223_20982_26888_26950_34944_35326_36068_36212_36849_37025_43603
524516	contig_1406_pilon	+	768	4	Intergenic	novelGene_25589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	1904	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	43	438	2173822	2185260	FALSE	30	AATAACCATTTGCATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173779	2185590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
524517	contig_13216_pilon	+	2012	7	Intergenic	novelGene_47482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	20	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	50	1477	229682	261012	FALSE	15	ACTTAGTTTTGTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229632	261547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
524518	contig_14727_pilon	-	2981	20	Intergenic	novelGene_56670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	107.035267442345	266	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	15	1553	414836	371686	TRUE	5	TTCACTGTGTTTTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVIGASVAPRTGAEPISPGPIPHPAQDKTTEAGGGNQSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYLDPEFPPDESSLFYSQKFPVQFVWKRPPEICKNPQFIIGGANRTDICQGDLGDCWFLAAIACLTLNERLLFRVIPHDQSFTNNYAGIFHFQFWRYGDWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRDEFWSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVTEFFDIKEAPRDMYKIMKKAIERGSLMGCSIDTIVPVQYETKMASGLVKGHAYSVTGLEETLFKDEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDNDEKARLQYQVTENGEFWMSYDDFIYHFTKLEICNLTADALESDKLQTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSQVVCSFLVALMQKNRRKERKLGANLFTIGFAIYEVPTDAWEQEAPAEGLLPVQCLQGQEQNLHQHAGSVPALPPASQRVRHRALHL	414850	362351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365112_365488_365567_370712_370750_371625_371843_372979_373152_376104_376266_377287_377366_378996_379083_380192_380277_385120_385290_386013_386148_388019_388139_390301_390372_414527
524519	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_10117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4010.99665762763	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	236	1069	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36144_36266
524520	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_14071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524521	contig_7176_pilon	+	1893	4	Intergenic	novelGene_107875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCTATGTCAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645769	662556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_+_646873_647943_648093_654519_654649_662044
524522	contig_3948_pilon	+	2248	4	Intergenic	novelGene_53393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.9976525433529	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1172	1642	1860968	1861438	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1813483	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813826_1814137_1814293_1814520_1860434
524523	contig_14687_pilon	-	1073	3	Intergenic	novelGene_107907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1405	junction_2	100.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	663	1073	433639	431203	FALSE	45	GGTAAATATAATTAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCVKGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNAQAGNFPIVNGVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKK	434301	431202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_431416_431602_431731_433569
524525	contig_3463_pilon	-	2700	15	Intergenic	novelGene_62001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	174.792413322495	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	101	1663	551994	508757	FALSE	30	AGAAAAGCTCTCCTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSSQPCPPTGLSLALGLSASRLCPCPAWVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	580065	507719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_579977
524526	SIRV6	+	1450	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	36	42	-1	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	222	713	1733	10736	TRUE	30	GCCTACTAAGCAGCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1123	11783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524527	contig_14925_pilon	-	1809	5	Intergenic	novelGene_55271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_4	793.415520077595	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	210	623	116065	114666	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121617	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
524529	contig_15120_pilon	-	2183	7	Intergenic	novelGene_107987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_4	224.840499020973	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	472	894	107933	92198	FALSE	30	GAAGTCGTGTGAAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDCIIRGDLANVRVGRHCVVKSRSVIRPPFKKFSKGVAFFPLHIGDHVFIEEDCVVNAAQIGSYVHVGKNCVIGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV	116159	90908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_92296_99853_99957_104333_104446_107823_107943_110684_110991_115269_115339_116072
524530	contig_9807_pilon	+	1964	14	Intergenic	novelGene_32864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	555.358725158314	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	105	1748	109130	158783	FALSE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGAENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_156624_156770_158676
524532	contig_9354_pilon	-	4012	9	Intergenic	novelGene_108055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	38.6652298583624	163	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	88	885	226067	213306	FALSE	65	GAGAAAGAAAAAGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKANASKKKSQQLKRNPKRKIGDEEVELSEKEVRKIAKNKQPKHPSSEVTGKTKHTNLKQIKIPSKKRKTWQPLSKKSREYLQTMMESVIISILSNTVKEKEQIQYHLNYLKKRLLQLCETLKVPPKKLRHLTNVSSLLKMEMAQHRANEEGLALLQEEVDKIVETTESMTENIQSLKNKIQILTTEMEKEEEKMLQMDRSGVLCLPELPQNSLRAPILQEEILTLIPNQNALLKDLDTLHNSSQMKNMLTFIQEAYNKLDTS	229850	210178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_213438_214198_214277_214423_214535_219693_219824_223361_223431_224006_224134_225187_225237_225965_226108_229803
524533	contig_15491_pilon	-	2382	7	Intergenic	novelGene_75973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	193.739300779854	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	48	881	91394	80831	TRUE	25	TTGTGTTCCCCCAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91441	79265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80214_80277_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
524534	contig_5018_pilon	-	1678	8	Intergenic	novelGene_47081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	719.64909249337	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	73	1119	1402792	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402864	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1402260_1402363_1402701
524535	contig_5643_pilon	+	1884	15	Intergenic	novelGene_39093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	881.30053480811	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	479	1192	634983	638095	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNVIPELA	631457	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635379_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637905_638078_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641154_641244_641412
524536	contig_4364_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTTTTCTACTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532883	1533231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533200
524537	contig_12624_pilon	-	1697	5	Intergenic	novelGene_61118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	378	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	229	534	952979	948779	TRUE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955867	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947964_948095_948842_950590_950768_952913_952985_955644
524538	contig_14519_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_66829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTGCTCTGCACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347238	347748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_347200_347700
524539	contig_14519_pilon	+	3242	10	Intergenic	novelGene_66831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	519	junction_4	204.86713550464	638	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	18	2027	353941	406074	FALSE	35	TGAAGATAACACTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKEKLEAVLNVALRVPSIMLLDVLYRWDVSSFFQQIQRSSLSNNPLFQYKYLALNMHYVGYILSVVLLTLPRQHLVQLYLYFLTALLLYAGHQISRDYVRSELESAYEGPMYLEPLSMNRFTTALIGQLVVCTLCSCVMKTKQIWLFSAHMLPLLARLCLVPLETIVIINKFAMIFTGLEVLYFLGSNLLVPYNLAKSAYRELVQVVEVYGLLALGMSLWNQLVVPVLFMVFWLVLFALQIYSYFSTRDQPASRERLLFLFLTSIAECCSTPYSLLGLVFTVSFVALGVLTLCKFYLQGYRAFMNDPAMNRGMTEGVTLLILAVQTGLIELQVVHRAFLLSIILFIVVASILQSMLEIADPIVLALGASRDKSLWKHFRAVSLCLFLLVFPAYMAYMICQFFHMDFWLLIIISSSILTSLQVLGTLFIYVLFMVEEFRKEPVENMDDVIYYVNGTYRLLEFLVALCVVAYGVSETVFGEWTVMGSMIIFIHSYYNVWLRAQLGWKSFLLRRDAVNKIKSLPVATKEQLEKHNDICAICYQDMKSAVITPCSHFFHAGCLKKWLYVQETCPLCHCQLKNSSQLPGLGTEPVPQPNAGAEQNIVHQEGTEPPDQERPEGTRIQEGPSDNNECFARADSQEGTFDPKEYPLSTKDEACLLPVSLEEKKQE	353923	407289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_354125_364472_364582_376998_377091_382891_383128_388119_388296_391320_391462_394196_394380_401744_401893_403076_403434_405690
524540	contig_15732_pilon	+	2274	16	Intergenic	novelGene_88843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	254.03983939532	2	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	49	2064	11208	398257	TRUE	20	TACAGCACTGGCACTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYNKLTIVHHPGGNETSQNENILYSTPFGNKLPTRPQVEKEFGFSSRKDY	11159	398725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_393845_395326_395383_398197_398263_398520
524541	contig_7376_pilon	-	3135	7	Intergenic	novelGene_108098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_6	43.4536790412759	274	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	7	1188	278914	257175	FALSE	40	AAAATGAACCTTATCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGMSGTPRRPPLPGVRQLSGLPGLALLLLALPLVAKADAQADAQAEAEADCPCEEPTLCRPISHHPDHEVFVFDVGYKTWKYYDWSQITTVATFGKYDSELMCYAHSKGARVVLKGDVSVKDIIDPTFRASWIAQKLILARKQYMDGINIDIEQEVNCSSPEYDALTALVKETADAFHREIEGSQVTFDVAWSPKNIDGRCYNYTGIADACDFVFVMSYDEQSQVWSDCIAAANAPYIQTLTGYDDYISMGINPRKLVMGVPWYGYDYTCLKLSADDVCTIAKVPFRGAPCSDAAGHQVPYKVIMKQVNSSISGSQWNEDQQAPYYKYKDPAGRFHQVWYDNPRSIALKAAYVNQHGLRGIGMWNANSLDYSGHPVAKWQTEEMWKVLKPKLSQR	278920	255227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_257376_259715_259878_260236_260335_262845_263018_275319_275529_276049_276189_278713
524542	contig_15304_pilon	-	639	2	Intergenic	novelGene_30661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10721	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	3	497	106206	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	106208	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040
524543	SIRV6	+	704	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8198	2	593	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTTGTGGTCGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
524545	contig_7396_pilon	-	2036	16	Intergenic	novelGene_79619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3485.43582098742	3	63	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	203	775	255163	249813	TRUE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELREAEHSDNNQAFPGMLSSFY	257471	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248606_248817_249062_249736_249870_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
524546	contig_9482_pilon	-	1963	11	Intergenic	novelGene_44322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_10	144.581603255739	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	296	1744	1244459	1236365	FALSE	20	TTAAACAGCCTTTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253543	1236145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253320
524547	contig_9345_pilon	-	1891	6	Intergenic	novelGene_24662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2250.54132154911	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	248	634	955353	949490	TRUE	20	GTTTTCTAAACTTCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLAQKNGPQKSSISVPMCPSSWLETRRIFGMMSTQGGS	1001315	946892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949470_949600_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001149
524548	contig_14711_pilon	+	2260	13	Intergenic	novelGene_68892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	359.071594145544	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	767	2017	86227	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70416	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_84866_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
524549	contig_12414_pilon	+	1481	3	Intergenic	novelGene_59553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1133	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	478	945	373587	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373155_373360
524550	contig_10246_pilon	+	2775	9	Intergenic	novelGene_46908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_5	203.59913893482	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	55	663	144696	175125	TRUE	10	TTTGTAGGAGTGCGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGLIWSQRFFTGECNCEVAGYPCL	140745	186396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
524551	contig_13740_pilon	+	1731	5	Intergenic	novelGene_34731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1125	junction_1	69.2364607703196	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	29	580	167703	176906	FALSE	15	CTTTATGTGGTTAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	167674	178057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
524553	contig_513_pilon	-	1930	9	Intergenic	novelGene_80171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	414.132659150422	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	134	1249	453421	449687	FALSE	40	CCAACCATGAAGCTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454705	449005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450669_450815_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
524554	contig_15063_pilon	-	1513	5	Intergenic	novelGene_12993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	TTGGCCCCAGTAGTCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
524555	contig_3584_pilon	+	1522	4	Intergenic	novelGene_108178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	1006.02231033357	123	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	683	1369	530695	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527068	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528877_529607_529683_530602
524556	contig_15063_pilon	+	1407	4	Intergenic	novelGene_14215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	93	1265	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34715	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524557	contig_16650_pilon	+	2100	4	Intergenic	novelGene_61973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	390	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	79	456	244670	254361	FALSE	35	CATCAAAGCTCCATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244591	256005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
524558	contig_1516_pilon	+	2065	10	Intergenic	novelGene_49980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	998.56038350526	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	381	1427	353572	363092	FALSE	5	GCACCTGTTTCCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRMRVVPVP	335194	363730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347364_352925_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362277_363068
524559	contig_4469_pilon	+	2583	3	Intergenic	novelGene_21947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	124.5	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	552	917	755476	755841	FALSE	35	GAAAAAGAGTCTCCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSDDESHFSSSDLIGSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	751633	757507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752189_755312
524560	contig_9471_pilon	+	1724	13	Intergenic	novelGene_21790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	770.129259533027	24	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	126	1508	410671	417296	FALSE	40	TTATCAAATTTATATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIGIVGSGGAAAVIKDGRDHIAVLGKTSAANIITLKHLIDYHSRRYIDEYRNDYNQGCEPGHRHRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHHRSHGKSHRRKRPRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406955	417512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411038_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
524562	contig_9839_pilon	-	1885	6	Intergenic	novelGene_88481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGTTTACAGATTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62457	45252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45422_49447_49613_54063_54121_57650_57850_59824_59926_61263
524563	SIRV6	+	926	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	14	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	380	30	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	392	724	2002	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524564	contig_9484_pilon	+	1184	9	Intergenic	novelGene_105634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	601.742768444291	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	28	513	95848	101217	TRUE	45	CAAGATCACAAAGTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVYLIRFVFIFTF	95820	104336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100531_101181_101369_101603_101756_101854_102056_103549_103641_104260
524565	contig_3153_pilon	-	2579	1	Intergenic	novelGene_104648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTATGAATAGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108814	106235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_106200_108800
524566	contig_15063_pilon	+	1463	4	Intergenic	novelGene_14156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	153	1325	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34655	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524567	contig_9014_pilon	-	2468	9	Intergenic	novelGene_106716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	81.255769025959	475	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	554	1906	44733	41867	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPFQGCLIFPRVLLLPLLYFCVAPSLKHSIPTKLIWERAKKPFWTHRDKSPSSYPQSLPQVALAQSSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51634	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_45016_46504_46693_51551
524569	contig_12414_pilon	+	1635	3	Intergenic	novelGene_59547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	408	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	TRUE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_374088_374135
524570	contig_960_pilon	-	2130	9	Intergenic	novelGene_108211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_8	41.017526741626	1034	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	213	1466	335554	292669	FALSE	40	AAAATAGGACTTCAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCRLLGAGPQLSTFCVLQKLSGTMFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRVNQKEEEPIPVIVSPHQTILASLGSRLTIPCKVFLGVGIKSTSTVWWTANDTIIDSAYPGGRVTEGLEKEYSENNENYIEVPLVFDPVIKEDLKTDFKCIVTNRMSLQTLRTTVKEASTFSWGIALAPLSLVFLVLGGIYMYRWCKHRPEKGYSLTTVKTDHEDF	335766	292004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_292818_294744_294888_296943_297080_304259_304323_306536_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_335540
524571	contig_4103_pilon	-	2308	5	Intergenic	novelGene_51879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	362	junction_4	189.349544493775	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	4	504	45573	41739	FALSE	90	AGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASGSGTKNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEVRLCFLPCPQPGIL	45576	39934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_41930_42374_42449_43898_44023_45129_45224_45555
524572	contig_9389_pilon	+	2875	3	Intergenic	novelGene_84115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_2	186.5	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	102	755	1408796	1423232	FALSE	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQRGARAPVDFLPPLGHCAWDASPGPEPWSPRMSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVGTPFPKNFLQAVKKILSRLFRVFVHVYIHHFDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVREFGLIDTKELEPLKEMTMRMCH	1408694	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1409217_1418063_1418267_1423202
524573	contig_12464_pilon	-	2972	9	Intergenic	novelGene_68695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_8	128.699686771181	353	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	369	2294	357758	337140	FALSE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	382206	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_378909_379024_381087_381156_382099
524574	contig_3095_pilon	-	1625	6	Intergenic	novelGene_75214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1193.29040891143	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	50	880	255481	247316	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGNKSALIQLGAGKEV	255530	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246708_246904_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
524575	contig_5954_pilon	-	2475	15	Intergenic	novelGene_28600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_8	393.825592031264	3	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	662	2113	956264	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960579	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
524576	contig_5538_pilon	+	2145	14	Intergenic	novelGene_23698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_11	247.397076800571	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	98	2143	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44763	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
524577	contig_4783_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_108371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155463	157642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_155500_157600
524578	contig_6048_pilon	-	2241	16	Intergenic	novelGene_73289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	96.9963573199186	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	53	1897	2006298	1978823	FALSE	25	CCTTGGAATAAAGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASCSGAQVNSPGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049054	1978478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980156_1980665_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
524579	contig_19851_pilon	+	1089	6	Intergenic	novelGene_29816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	220	735	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53417	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
524580	SIRV6	+	484	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAAGGTGAGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470
524582	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524583	contig_14530_pilon	+	3605	3	Intergenic	novelGene_108453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_2	9.5	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	109	474	59966	76215	FALSE	20	TCATTTCTGTGAGCCGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLWRRRYGKQSGPCVRVPAALRVLSPHFSAVNGGGMEHEGSGSSGGSAGLLQQILSLKLVPRVGNGTLCPNSTSLCSFPEMWYGVFLWALVSSLFFHVPTGLLALFTLRHHKYGGAIAGVYRAAGKEMIPFEALTLGTGQTFCVVVVSFLRILATL	59857	79346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_60099_72817_72920_76084
524585	contig_13863_pilon	+	2282	11	Intergenic	novelGene_42077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	368.56837900178	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	196	1392	474588	489696	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKVSVYRA	455732	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_489556
524586	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_14001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	196	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524589	contig_9609_pilon	+	1696	5	Intergenic	novelGene_23080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1087.37720571106	14	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	34	363	453647	454062	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGVGAGPLGRGGACPK	453109	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_453142_453645_453776_453861_454078_454307_454634_455282
524590	contig_11720_pilon	+	2147	16	Intergenic	novelGene_43979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	382.453738669427	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	524	1891	264322	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262282	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262828_263052_263872_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
524591	contig_10436_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_108477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	124	312	103480	103292	NA	30	TGGATTAAGGAGGATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVRRVARAAGADADATAWALGLGRATRGSGCRL	103603	101233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_101200_103600
524592	contig_13021_pilon	-	1939	10	Intergenic	novelGene_8236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.989365998033	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	116	1162	236115	210494	TRUE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236230	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_205646_205714_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
524593	contig_6576_pilon	+	2166	11	Intergenic	novelGene_42254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1586	1912	330902	337934	TRUE	55	CCACAGGAAACAGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCLEAFLVLLGPVADLAVPLEGYNLAEVEQAVVEMKLMLQSHHHHIHQNHLVASFFACVFCSRSRRLSSMSFSGIPSIPYISNSISVLPGIAFGTASIVSLFTCMQ	315251	339539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_315455_319393_319444_322201_323000_323861_324104_326529_326689_329123_329193_330837_330913_331027_331192_332093_332229_337917_338051_339401
524594	contig_11752_pilon	+	1377	7	Intergenic	novelGene_37600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1018.51440016002	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	115	1128	87165	105652	FALSE	40	AATATAAAGATGTCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTKFLGY	84087	105901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105633
524595	contig_233_pilon	-	1894	10	Intergenic	novelGene_14687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_7	1589.26438453475	10	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	341	1450	108522	98218	FALSE	35	TAGGCAAATAAATTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPVSGTHAVGAVKSLRTAFWKGLSTRFSNGTP	126988	97773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108684_108814_109914_109976_126898
524596	contig_12120_pilon	-	3509	6	Intergenic	novelGene_21405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	595.968321305755	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCCTGGTTTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119006	20868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_21473_21844_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559
524597	contig_2367_pilon	-	1558	3	Intergenic	novelGene_65325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACATAATTTAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213294	192229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193519_208552_208635_213107
524599	SIRV6	+	1033	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	207	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524600	contig_5084_pilon	-	2531	8	Intergenic	novelGene_64638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	59.6920669531794	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	145	537	1335788	1330743	TRUE	10	CGCACAGCGGCTGCTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLG	1337217	1327184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330841_1333776_1333874_1335200_1335338_1335727_1335822_1337106
524602	contig_19564_pilon	-	2028	5	Intergenic	novelGene_29582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	166	726	15529	12638	FALSE	25	AACCTTTGCAAGATGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVGPSPCLSSPSRSLMPRT	15694	11335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12692_13028_13259_13554_13666_13945_14055_15472
524604	contig_12624_pilon	-	1588	3	Intergenic	novelGene_61102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955778	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948826_950638_950768_955666
524606	contig_17144_pilon	-	158	1	Intergenic	novelGene_29540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTTTTTTCTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166249	166091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166100_166200
524607	contig_5947_pilon	+	2472	10	Intergenic	novelGene_101616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	176.395389206559	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	216	1013	995846	1005780	TRUE	35	ATACAAGGAAGGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	993771	1007414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737_1006143_1006317
524608	contig_5649_pilon	+	2381	9	Intergenic	novelGene_82250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	171.794890421689	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	104	1303	12779	34768	FALSE	30	ACCACTGTCTACTAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12675	35846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23243_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
524609	contig_15063_pilon	-	1621	6	Intergenic	novelGene_14171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	973	1296	35891	35108	TRUE	15	TCTGGTCGGAGCTCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36599_38977_39093_39511
524610	contig_7188_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_108520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41667	39070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_39100_41700
524611	contig_500_pilon	+	1917	9	Intergenic	novelGene_30999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1242.62162382601	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	313	1206	1492663	1498065	TRUE	10	TGCGGGCATGTTTGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSRECLPGCGEIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492751_1493615_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882
524612	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524613	contig_16666_pilon	-	1403	4	Intergenic	novelGene_61760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	267	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	25	339	59688	56740	TRUE	45	AATGCAAACATGGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNGKTR	59712	55131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56741_58085_58264_59552
524614	contig_14167_pilon	-	2114	5	Intergenic	novelGene_105532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	119.436960359848	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	111	740	64418	23033	FALSE	20	TCGTGTTCTGAAAGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTCVDIKDNVVDEGFSFTPKGDDLCLSCTCHGGEPEMCVAALCERPQGCQQYLKDPKECCKFMCLDPDGSSLFDSMASGMRLIISCISSFLILSLLLFMVHRLRQRRRERIESLIGANLHHFNLGRRIPGFDYGPDGFGTGLTPLHLSDDGEGGTFHFHDPPPPYTAYKYPDIDQPDDPPPPYEASINPDSMFYDPADDDAFEPAEASSHLLKVPFLAHPHNSWSEVPDGCSHTHPPAFLDSTRQ	64528	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_23147_24310_24343_26706_26944_28236_28390_64324
524615	contig_13863_pilon	-	3986	24	Intergenic	novelGene_42046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	88	junction_23	254.578928825404	387	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2889	144	3032	392389	277571	FALSE	20	ATAATCCCTGGTCATGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLRGVMGGQSAGPQHTEAETIQKLCDRVASSTLLDDRRNAVRALKSLSKKYRLEVGIQAMEHLIHVLQTDRSDSEIIGYALDTLYNIIANDEEEEVEENSTRQSDDLGSQFTEIFIKQQENVTLLLSLLEEFDFHVRWPGVKLLTSLLKQLGPQVQQIILVSPMGVSRLMDLLADSREVIRNDGVLLLQALTRSNGAIQKIVAFENAFERLLDIITEEGNSDGGIVVEDCLILLQNLLKNNNSNQNFFKEGSYIQRMKPWFEVGDENSGWSAQKVTNLHLMLQLVRVLVSPTNPPGATSTCQKAMFQCGLLQQLCTILMATGVPADILTETINTVSEVIRGCHVNQDYFASVNAPSNPPRPAIVVLLMSMVNERQPFVLRCAVLYCFQCFLYKNQKGQGEIVSTLLPSTIDATGNSVSAGQLLCGGLFSTDSLSNWCAAVALAHALQDNATQKEQLLRVQLATSIGNPPVSLLQQCTNILSQGSKIQTRVGLLMLLCTWLSNCPIAVTHFLHNSANVPFLTGQIAENLGEEEQLVQGLCALLLGISIYFNDNSLESYMKEKLKQLIEKRIGKENFIEKLGFISKHELYSRASQKPQPNFPSPEYMIFDHEFTKLVKELEGVITKAIYKSSEEDKKEEEVKKTLEQHDSIVTHYKNMIREQDLQLEELKQQVSTLKCQNEQLQTAVTQQVSQIQQHKDQYNLLKVQLGKDNQHQGSYSDGAQMNGIQPEDIGRLREEIGELKSNQELLQSQLAEKDSLIENLKSSQTSPGTNEQSATTASAKDSEQVAELKQELATLKSQLNSQSVEITKLRTEKQELLQKTEAFAKSVPVSGENETVTAAKTTDVEGRLSALLQETKDLKNEIKALSEERTAIKEQLDSSNSTIAILQNEKNKLEVEITDSKKEQDDLLVLLADQDQKIFSLKNKLKEFGHPIEEEDELESGDQADDDEDEDDVEDEDHI	392532	276616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_277658_278181_278398_279422_279531_282937_283037_301675_301766_302368_302533_307707_307847_310940_311063_311948_312131_312273_312393_312745_312857_323689_323902_324958_325114_325523_325613_329088_329230_333087_333267_336099_336221_340218_340275_340428_340532_340928_341030_356846_356924_367690_367756_367837_367925_392323
524617	contig_6494_pilon	+	836	7	Intergenic	novelGene_108549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	394	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAAGTGGCTCGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2102	8312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_2177_2630_2826_3294_3485_5563_5660_6395_6489_6750_6883_8256
524618	scaffold_12124_pilon	+	1987	12	Intergenic	novelGene_22058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	492.469338727577	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	93	1028	836073	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829652	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858330_858814
524619	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524620	contig_15063_pilon	+	1520	5	Intergenic	novelGene_9945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	238	1401	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
524621	contig_7580_pilon	+	1304	3	Intergenic	novelGene_108608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	707	junction_1	37.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	530	1075	106965	109647	FALSE	80	AAAAAAAAAAGGAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	106435	109876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_107190_108145_108248_109428
524622	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524623	contig_15063_pilon	+	1444	4	Intergenic	novelGene_14182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	25	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	130	1302	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34678	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524624	contig_12923_pilon	-	3213	16	Intergenic	novelGene_30153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	180.974718921978	30	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	2074	2991	230738	225749	FALSE	20	TAATGACCAGTCTGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTALCPQVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236109	225526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226494_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232837_233022_233074_234497_234618_235997
524625	contig_6735_pilon	-	1823	12	Intergenic	novelGene_15770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	906.995138806257	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	85	1347	564868	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568282	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547311_554267_554374_564157_564232_564784_564869_568198
524627	contig_13863_pilon	+	1954	11	Intergenic	novelGene_42017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_10	666.917806030098	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	62	1135	98341	118962	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98279	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
524628	contig_5280_pilon	+	1941	8	Intergenic	novelGene_52610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	698.077038026899	2	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	11	541	38343	47349	TRUE	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNQKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQGNILSRTTKN	38332	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_41732_41833_42902_42989_47317_47508_56218_56333_62043_62065_78042
524630	contig_16098_pilon	-	1522	10	Intergenic	novelGene_46091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1870.64435983638	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	305	1312	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460431	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456497_456583_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
524631	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524633	contig_5189_pilon	-	1970	8	Intergenic	novelGene_34857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.65900708742	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	111	845	244235	199237	FALSE	40	AAAACTGAATTACTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_218562_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
524635	contig_2341_pilon	+	2888	6	Intergenic	novelGene_84358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	44.3368920877411	307	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	148	624	129589	157640	FALSE	35	AGATGGTAGATATACGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEPQTTGYTNVQDTPAMPWWKDKFWIFLAGAIIVTSVSLGLILYCVCRRLFRQGKKLKTAKPLKQNEDEEMTYENVLNQSPGKLPPLPPRDLPSLEDASPADTQSEPPAAYSSIHKVKKAKRVSIPSYIEPEDDYDDVEIPTTTGKHHIKTKVSHF	129059	159904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129136_129517_129631_147326_147451_149686_149748_155756_155831_157464
524636	contig_11285_pilon	+	1892	11	Intergenic	novelGene_5578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	605.037519497758	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	824	1462	767584	769760	FALSE	15	CTTCAACTGTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQVRHLLYR	763520	770190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_769421_769657_769740
524637	contig_854_pilon	-	2247	10	Intergenic	novelGene_36137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.573885874493	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	121	1161	509201	471108	FALSE	0	GCCTGGGGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTKQRAWNTDVLAPLGATAISQSPPWMLGTGTTPTPPGWQKQSQCGTPTVVNWPASSSPGVSSPRKARIALGLPQGALGWRASTCLLSRGRV	509321	470021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471381_476715_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
524638	scaffold_16539_pilon	-	1976	11	Intergenic	novelGene_68345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	413	junction_1	196.306291289913	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	189	1664	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502329	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111
524640	SIRV6	+	555	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGTTGAAGCTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2022_2470
524643	contig_6410_pilon	-	4048	2	Intergenic	novelGene_108636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3407	3724	314495	312982	FALSE	20	GGAAGAGATTCCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFSAQRREWLRSCCEYGGVPEPWGPLELGSSLWLTSAVVSCSAFPGPVVNALSAASLSIFGDLGRDHGDGGHLAFFSQIQRWLMSHNAASNVFVRPMVTQLKF	317901	312657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_313242_314437
524646	contig_19825_pilon	-	2866	9	Intergenic	novelGene_59680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	214.901576308784	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	14	850	70053	17388	FALSE	20	CTGAATTTTGAGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCSFMGFPRPQPKERRRLTRLLLKFALYTIFTNLIAIRQADEEFQILANSWRYSSAFTNKIFFAMVDFDEGSDVFQMLNMNSAPTFINFPAKGKPKRGDTYELQVRGFSAEQIARWIADRTDVNIRVIRPPNYAGPLMLGLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFNGGVTLGMVLLCEAATSDMDIGKRKIMCVAGIGLVVLFFSWMLSIFRSKYHGYPYSFLMS	70066	15371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_23163_23239_36715_36780_37429_37520_38098_38240_38733_38875_42313_42495_70015
524647	contig_15063_pilon	+	1082	3	Intergenic	novelGene_13203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	254	961	34860	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWCAKSNTPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34888_35872_36158_36266
524648	contig_12671_pilon	+	1969	6	Intergenic	novelGene_19216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	551.71282384951	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	83	382	197316	207086	TRUE	20	CATGTTTCTTCGTGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSQGLHRKNGI	197233	212407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_207057_207206_210609_210724_211053
524651	contig_12357_pilon	+	2141	9	Intergenic	novelGene_6067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	589.681428824073	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	117	1298	26079	46603	FALSE	70	AGGGAAAAAAAACACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVTFEEFCLHGA	25962	47446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436
524652	scaffold_12124_pilon	+	1604	7	Intergenic	novelGene_22275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3896.12776783993	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	33	332	1473608	1508039	TRUE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGLFDPAVQRTLLEKA	1473575	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1507992_1509086_1509344
524653	contig_7025_pilon	-	2465	14	Intergenic	novelGene_104372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	768.660226874461	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	115	1929	95047	48194	FALSE	40	TATTGATGAAATCTGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPCGSDKEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVSGLLALFPPAHLPGLGFSPARAAFPVVSHSCAPRRDGRWNSLSVGVLQPLVSLPAGSRTVGCRSQRMTSNSSRK	95161	47657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_48421_65729_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_94786
524654	contig_11846_pilon	-	2064	13	Intergenic	novelGene_105935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_12	81.4784821628113	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	159	1421	260073	248626	FALSE	25	CTGTAGCCACAGAGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263833	247982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263714
524655	contig_19709_pilon	-	3444	12	Intergenic	novelGene_108662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_8	312.394881493713	367	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	61	768	85471	71938	TRUE	40	ATGTTCAAAGGAAGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNYNDELQFLDKINKNCWRIKKGFVPNMQVEGVFYVNDALEKLMFEELRNACRGGGIGGFLPAMKQIGNVAALPGIVHRSIGLPDVHSGYGFAIGNMAAFDMNDPDAVVSPGGVGFDINCGVRLLRTNLDESDVQPVKEQLAQAMFDHIPVGVGSKGVIPMNAKDLEEALEMGVDWSLREGYAWAEDKEHCEEYGRMLQADPNKVSPRAKKKRPSSVGDPGSRQPLRRNSGCG	85531	62797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19709_pilon_-_64771_67456_67577_68946_69058_69748_69938_70456_70633_71830_71991_73968_74127_78145_78303_80586_80687_81791_81860_83476_83556_85378
524656	contig_6898_pilon	+	2177	8	Intergenic	novelGene_35712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1205.44253877392	5	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	127	681	59668	115984	TRUE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLR	59541	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_116001_116690_116819_117865_117963_126441
524657	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	74	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524658	contig_10134_pilon	-	2110	5	Intergenic	novelGene_16225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	725.72928837136	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39688	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32860_32901_33731_34922_35178_38568_38825_39594
524660	contig_7286_pilon	-	2106	4	Intergenic	novelGene_108693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6547	junction_2	2752.06140919857	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	701	1129	291382	289158	TRUE	10	AATTGCCTTGTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGKQPLYSWVFSLCHHFKARYKSCFFVGCLF	292082	286881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_289422_290758_290857_291315
524661	contig_7426_pilon	-	1757	5	Intergenic	novelGene_27532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	91.9524333555127	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	67	570	1102797	1087105	FALSE	40	TATGTCAAAGATGCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAASGPAAGKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102863	1085917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1102705
524662	contig_10923_pilon	+	1769	10	Intergenic	novelGene_66201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	783.271502681912	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	47	1639	21667	46661	FALSE	25	ATACCACTACCCTGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVAHFSSWEPHLCLYGSSVSHQGSLLQPLLCAKLSA	13832	46791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_46557
524663	contig_6361_pilon	-	3223	1	Intergenic	novelGene_24018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	382	786	417498	417094	NA	50	AGGTTAAAAGCAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPLILSLQVFIMSLMESYKIGKKLPYLSHFSSLLGSQSPHWDLLNKSSIFACYLLGQKLQLAALSWPRCSGSPSVNLHVFHFSACSFSSLRSRSCSHSFSSSFPKTVLGFRFLGSVLLHQYNPVCFIFPKNS	417879	414656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_414700_417900
524667	contig_15063_pilon	+	1485	5	Intergenic	novelGene_12155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	232	1407	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27539	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524668	contig_20641_pilon	+	1644	7	Intergenic	novelGene_52857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1063.95796700601	9	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	36	1352	14659	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGKLVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14623	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14777_16790_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
524669	contig_1275_pilon	+	709	2	Intergenic	novelGene_108828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	112	573	747507	747968	FALSE	25	ATGGTAGCATAATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEATIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746561_747406
524670	contig_15063_pilon	+	1696	6	Intergenic	novelGene_13647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3846.59686476241	6	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	202	1443	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38972_39092_39506
524671	contig_11752_pilon	+	1869	6	Intergenic	novelGene_37589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1110.85930702317	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	117	986	87165	94417	TRUE	20	ACACAAGCTCCCTGCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84085	106468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94430_105597
524673	contig_18096_pilon	+	2247	11	Intergenic	novelGene_58030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	612.332948648037	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	74	1387	40382	78263	FALSE	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSGWSISTPDFLKLCLY	40308	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70616_78216
524674	SIRV6	+	731	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	39	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	168	488	2458	10736	TRUE	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2011_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
524675	contig_3627_pilon	+	2612	16	Intergenic	novelGene_78473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	161.851152469037	516	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	380	2389	437223	483447	FALSE	20	CTATGCGTTAAGGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD	432284	483670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_436894_437002_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
524676	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10463	19	1226	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11463	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
524677	contig_11396_pilon	-	2225	8	Intergenic	novelGene_71269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	705.585876113906	1050	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	119	781	249053	232299	FALSE	5	TCTTCGGCTTGTGTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMSSYSIRHSISMPAMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249171	230854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_234013_234056_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
524678	contig_8616_pilon	+	1398	10	Intergenic	novelGene_72581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	5259	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	10	1323	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425768	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
524679	contig_6047_pilon	+	1886	14	Intergenic	novelGene_24203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	653.993702808834	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	571	1728	115917	122696	TRUE	45	ACAAAGGTATAGCCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLILLSFCLKQQHCGQDIFYQTQKLMEIG	105133	123095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107316_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122473_122612_122741_122981
524680	contig_18108_pilon	-	2266	18	Intergenic	novelGene_33505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	336.261761605953	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	156	2054	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335418	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_269964_271371_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289405_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
524681	contig_16666_pilon	-	1255	4	Intergenic	novelGene_61732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	34	378	59586	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59619	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
524683	contig_8435_pilon	+	2270	6	Intergenic	novelGene_72012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	511	2199	94334	97944	FALSE	10	TGTGAGCTGCTTGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91115	98015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_93897_94013_95334_96398_96685_97030_97164_97674
524684	contig_2027_pilon	+	968	7	Intergenic	novelGene_39947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	105.450883774812	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	225	764	639829	642357	FALSE	25	TGTCACCTTCTCAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSLSPPRGTSEERPGDLLPKNQPLKTLWSMVVL	638048	642561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642260
524685	contig_15063_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_10247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524688	contig_7870_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_109039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGAAAGTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612501	611778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_611800_612500
524689	contig_10299_pilon	+	2407	21	Intergenic	novelGene_79688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	95.8475221380292	9	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	65	2245	320559	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320494	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336800_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
524690	contig_9180_pilon	+	4263	16	Intergenic	novelGene_109112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTCAGCCCCGCAGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383039	417383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_384978_387023_387177_396171_396216_396702_396842_398963_399112_400451_400625_401198_401349_401515_401793_402425_402546_404094_404243_406239_406432_406529_406705_410077_410328_410963_411048_416080_416242_417272
524691	SIRV7	+	1583	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	88	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACAGGTGTAAATACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	2591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1000_2600
524692	contig_3414_pilon	-	2916	14	Intergenic	novelGene_80965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	296.815305272129	9	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	16	1281	101974	79167	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPAGKSLYWLISKTGMIWGAGFEPFFKFHFIFQIVDILHILVPVWPLFMSEQAG	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65361_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
524693	contig_11518_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_109135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGAATTTAACAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426221	424628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_424600_426200
524694	contig_9482_pilon	-	2008	11	Intergenic	novelGene_44321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	144.737693777399	472	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	107	1567	1253164	1237352	TRUE	20	TAAACAGCCTTTCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKDPAWCCAHSAGAHCPCAPSARPWSSTPCGRSPTRWRSSPWPLLRTVA	1253270	1236144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237496_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
524695	contig_10437_pilon	+	1408	2	Intergenic	novelGene_38164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160772	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160844_162754
524696	contig_15063_pilon	-	1501	4	Intergenic	novelGene_13806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36795	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35378_35838_36172_36284
524697	contig_8420_pilon	+	1918	13	Intergenic	novelGene_69344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	267.096255537629	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	168	1331	14814	41829	TRUE	60	AAAAAATAAAGATATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLILPKLHILSAMIKAPLKSYLKTLEITREE	10949	58911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37122_41739_41918_51048_51183_58546
524699	contig_15063_pilon	-	989	4	Intergenic	novelGene_10597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	241	570	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVIPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36131	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27167_34606_34924_35035_35393_35846
524700	SIRV6	+	403	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-48	130	2	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
524701	contig_1725_pilon	+	1715	12	Intergenic	novelGene_24318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	706.916070392032	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	303	1574	247068	255543	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	245338	255684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_245391_246542_246748_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
524702	contig_6735_pilon	-	1922	12	Intergenic	novelGene_15793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1094.42544645638	4	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	626	1480	545923	542464	FALSE	60	TAAAGTTAAAAATAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568279	542021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_547243_547355_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564753_564869_568198
524703	contig_3095_pilon	+	1275	5	Intergenic	novelGene_75040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	54	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	64	504	147241	150489	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNGTSLCCSPRHGNLISRSDGAFEQPCGSWTAQHPHLFR	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149933_150413_150696_150996_151163_151848
524704	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	242	1480	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524705	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_8945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524706	contig_8447_pilon	+	1933	4	Intergenic	novelGene_69419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	488.879898907242	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70914	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_70938_71848_71963_82073_82241_82862
524707	contig_8377_pilon	-	2054	2	Intergenic	novelGene_35156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATATAAAGAACATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199764	197538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_197802_197973
524708	contig_14513_pilon	-	1203	2	Intergenic	novelGene_70284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	636	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	184	348	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
524710	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524712	contig_19957_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_57708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGAATTAAAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192932	190581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_190600_192900
524713	contig_5538_pilon	+	2175	14	Intergenic	novelGene_23695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_11	247.397076800571	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	128	2173	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44733	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
524714	contig_7396_pilon	-	2069	16	Intergenic	novelGene_79625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3162.73682890134	909	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	176	1564	255163	246442	FALSE	5	CTATTTTTGGTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257049	245936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_256986
524715	contig_5954_pilon	-	2462	15	Intergenic	novelGene_28671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	462.994165123898	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	822	2105	955906	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960582	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955927_956121_956288_956379_956500_956705_956942_959766_959938_960474
524716	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524718	contig_7452_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_109167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGCATCTAAGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390254	398101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_390756_396283
524719	SIRV6	+	476	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-438	621	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTATTGTATGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1847	3161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2627_2750_2829_3106
524720	contig_5019_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_109184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	421	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	FALSE	15	TTGTGAGTTTTTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
524722	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
524723	contig_10311_pilon	-	1926	12	Intergenic	novelGene_50409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1117.82856208583	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	32	1036	71526	66744	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66646_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67878_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
524724	SIRV6	+	778	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	100	441	1673	2560	TRUE	30	TATTTAGGTATAGTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1467	11068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524725	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524726	contig_19579_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_59366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	593.0468409456	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	106	948	13090	7943	FALSE	30	ATCTATATGGGATCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHIGATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012_12262_12900
524729	contig_3956_pilon	+	2019	9	Intergenic	novelGene_15040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1372.97758084391	1	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	81	782	1281682	1284356	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVRGCPRPRQTPGVSAFYCPAGAVLGERKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286447_1290681
524731	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	246	1418	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27123	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524733	contig_6424_pilon	-	1176	6	Intergenic	novelGene_109243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.293543869014	151	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	39	518	21039	6307	TRUE	10	TGGGGCCTGCCCTGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVTQVPWAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21077	5538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6079_6188_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_21012
524734	contig_15063_pilon	+	1280	4	Intergenic	novelGene_14286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524735	contig_3975_pilon	-	2783	8	Intergenic	novelGene_54874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_5	113.885728621603	12	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	2060	2713	2096423	2091957	FALSE	20	CATGGTTTCTGGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099458	2091886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473
524736	contig_20058_pilon	-	2919	10	Intergenic	novelGene_109277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_5	626.235805388527	274	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	14	1669	59150	30516	TRUE	40	TAGGCCCACATTAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59163	22628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_23874_30510_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
524737	contig_9133_pilon	+	2338	5	Intergenic	novelGene_109320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.22474487139159	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	458	1009	932063	932614	FALSE	20	GTTATATGCATTTGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGISEAERTEEKMQALSCDIEGFYEQNIEQSRKHPKKMKGNTESPYQKELVNVQPFQEVAYDQESMVLEEEVRAALKAVAKSKALRIDGIPIEKFQQTDAMLETLTFYAKKFGRPLPGQPTGRDPYLCPFQRKVIQQNAEIIEQYLISHASKILLKIIKKQLQQYIHRELPEIQAGFRRDIK	913704	933943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_913732_918968_919072_921845_921922_931685_931872_931997
524738	contig_3424_pilon	+	2732	4	Intergenic	novelGene_55522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	85.050311907456	330	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	173	634	235276	243935	FALSE	10	CTTTGATCTGACTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVMVSENFDIEAPNYLSKESEILLYAKQDSQCVDCFQAFLPVHYRYHRPHSKDGETFIVVNNPDLLMYCDQEFPILKCWAQSEVAAPCALRNKDICQWKNMKYKSVYKNVTLQVPVGLTLHTSLVCSVTLLITVLCSTLILIAVFKYGHFSL	235103	246033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_235279_237579_237794_241360_241462_243791
524739	contig_15063_pilon	+	1149	4	Intergenic	novelGene_12294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2720.81985193189	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	521	1009	36064	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28148	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34893_35880_36158_36266
524741	contig_4923_pilon	-	2326	1	Intergenic	novelGene_109328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCTATGTATATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418652	416326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_416300_418700
524742	contig_6233_pilon	-	1885	10	Intergenic	novelGene_74763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	290.742769514035	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	165	1004	149777	143464	TRUE	25	TGTGTACACATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250207	117773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118501_136760_136911_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
524743	contig_12638_pilon	+	2220	16	Intergenic	novelGene_33098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	566.067981783107	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	380	1774	173541	199604	FALSE	35	TTCAAGACAGCTAAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVAKRGKKAKAEVVVTNEREAKVRNGNEVEIENGKRAKAVKGSEVEAKKGDGAAQEVEIADSEAATEVLSMEPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170799	200050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171003_171675_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178285_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
524744	contig_11003_pilon	+	902	4	Intergenic	novelGene_105423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	280.014285349873	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCAGCGTCCTGGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55818	73040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_55962_64821_64966_66252_66366_72538
524746	contig_14513_pilon	-	1102	3	Intergenic	novelGene_70306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	187	351	18880	12143	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11872_11975_12153_18725
524747	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	25	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	2	1474	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524748	contig_12873_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_27145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	1257.82758048241	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	798	1163	17896	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15941	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19044_19169_19264_19611_19703_19851
524749	contig_18420_pilon	+	2207	15	Intergenic	novelGene_109341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	54.8445391027015	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	101	1612	92356	103753	FALSE	20	TACTGGTGTAAACCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSQAVPQLVKKEKKNKKKDKKDKKAKAALESGGEPGDADSDTTKKKKKKKAKVSSE	92255	104348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101756_103145_103296_103696
524750	contig_5988_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_15990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1476	1895	689940	689521	NA	10	GTTCAGTCTTGTGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	691415	689302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_689300_691400
524751	contig_3948_pilon	+	2237	4	Intergenic	novelGene_53384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.8954011539622	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	451	765	1814041	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRRIGLGPQKGLFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813331	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814080_1814381_1814520_1860434
524752	contig_5643_pilon	+	1145	10	Intergenic	novelGene_38870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	52	933	236108	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236056	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
524754	contig_2310_pilon	+	1901	13	Intergenic	novelGene_71597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	451	junction_11	159.842630942645	1380	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	43	1737	106097	134479	FALSE	20	AGCCAGATTTGTCGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGDDYESEAAYDPYAYPGDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106054	134643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
524757	contig_12414_pilon	+	2143	16	Intergenic	novelGene_59615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	88.4180976949855	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	63	749	527729	591484	TRUE	20	CTAATTATACTTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527666	607449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
524758	contig_11656_pilon	+	2313	18	Intergenic	novelGene_54028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	133.975621394445	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	401	2026	520424	536565	FALSE	40	TAACAAGAATATTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLQSCLLVCFREEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMRLWTGAGYKQKKKSRIAWSRPRDCVGGLDHLMWGSLA	489326	536852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527815_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536451
524759	contig_11292_pilon	+	1201	10	Intergenic	novelGene_109417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACACTTCACTCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161778	166453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_161952_162125_162209_163014_163159_163370_163470_164397_164551_164667_164807_165245_165383_165645_165712_165805_165909_166349
524760	contig_9345_pilon	-	1353	6	Intergenic	novelGene_24687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1871.03184366274	49	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	252	755	955353	947957	FALSE	20	CTAGATGTAGTATTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001326	947358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952553_955267_955356_997013_997093_1001156
524761	contig_8242_pilon	+	2804	4	Intergenic	novelGene_80187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_3	13.0213499897497	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	115	573	3532	29870	FALSE	70	AAAGAAGGAAGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGADPKSVVCAFFKQGQCTKGDKCKFSHDLTLERKCEKRSVYIDARDEELEKGIFFF	3417	32101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700
524763	contig_6862_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_63760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCAGCAACTAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150565	152672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_150600_152700
524764	contig_9848_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_79924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCCACGAGTGATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63733	64901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_63700_64900
524765	contig_7119_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_40965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1223	1969	139626	138880	TRUE	35	TGTTGAGAGAATGCAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140848	136975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_137096_138706
524766	contig_7963_pilon	-	2262	4	Intergenic	novelGene_58602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	567	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACGTTAAGATGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298889	293129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296366_296813_297937_298190
524767	contig_15063_pilon	-	1411	4	Intergenic	novelGene_14129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	723	1046	35891	35108	TRUE	20	TGGAGAAGATTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36101_36269
524768	contig_5515_pilon	-	2087	8	Intergenic	novelGene_52327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_7	465.055405959596	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	163	1149	76018	68158	FALSE	5	GCGGCTCTGTTCTATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99254	67219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_99118
524769	contig_500_pilon	+	1522	10	Intergenic	novelGene_30988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	1041.02824287775	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	220	1092	1492663	1498065	TRUE	15	GGAAGGAGGGGCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSRIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485731	1499604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
524770	contig_5210_pilon	+	2535	9	Intergenic	novelGene_65466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	131.304988481017	692	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	130	975	803815	812511	FALSE	15	GAGTGTATGTCTGGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKHQHFQEPEVGCCGKYFLFGFNIVFWVLGALFLAIGLWAWGEKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	803685	814071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807349_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474
524771	contig_14727_pilon	-	3430	19	Intergenic	novelGene_56675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	109.753497652301	222	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	21	1559	414836	371686	TRUE	10	GTATGGCTGGTTTCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVIGASVAPRTGAEPISPGPIPHPAQDKTTEAGGGNQSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYLDPEFPPDESSLFYSQKFPVQFVWKRPPEICKNPQFIIGGANRTDICQGDLGDCWFLAAIACLTLNERLLFRVIPHDQSFTNNYAGIFHFQFWRYGDWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRDEFWSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVTEFFDIKEAPRDMYKIMKKAIERGSLMGCSIDTIVPVQYETKMASGLVKGHAYSVTGLEETLFKDEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDNDEKARLQYQVTENGEFWMSYDDFIYHFTKLEICNLTADALESDKLQTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSQVVCSFLVALMQKNRRKERKLGANLFTIGFAIYEVPTDAWEQEAPAEGLLPVQCLQGQEQNLHQHAGSVPALPPASQRVRHRALHL	414856	362362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364971_365053_365112_365488_365567_370712_370750_371625_371843_372979_373152_376104_376266_377287_377366_378996_379083_380192_380277_385120_385290_386013_386148_388019_388139_390301_390372_414527
524772	contig_15063_pilon	+	1413	4	Intergenic	novelGene_14208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	101	1273	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34707	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524773	contig_12427_pilon	-	2170	7	Intergenic	novelGene_40530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	221	844	522337	506035	TRUE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578172	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505200_505234_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
524774	contig_11720_pilon	-	2222	14	Intergenic	novelGene_43983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	96	446	272327	271841	TRUE	0	TGCCTGGGCTCCCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272422	262294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_262356_262914_263051_263872_264424_265204_265317_265745_265811_266167_266238_266451_266608_267751_267908_269811_269906_270031_270154_270554_270697_271265_271340_271803_271958_272093
524775	contig_19790_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_109493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACAATTTTTTCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55976	58129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_56000_58100
524776	contig_17936_pilon	+	2177	11	Intergenic	novelGene_29939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	38	1321	50646	121021	TRUE	20	TTACCAGCCTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50608	126581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
524777	contig_15063_pilon	+	1677	6	Intergenic	novelGene_13602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524778	contig_5684_pilon	+	2553	4	Intergenic	novelGene_81043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.2815043060443	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1479	2042	443906	447039	FALSE	75	AATTAAAAAAAAAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403580	447550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441998_443223_443891_443949_446518
524779	contig_12873_pilon	-	1873	6	Intergenic	novelGene_27207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTTTTCTCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20435	16040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16416_16751_17021_17734_18009_18981_19261_19609_19700_19849
524782	contig_17108_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_109548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGGAAATACTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404450	401562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_401600_404400
524783	contig_6217_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_109650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGAGTCCCAGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735150	737294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_735200_737300
524784	contig_15859_pilon	-	3207	6	Intergenic	novelGene_50194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	148.074845939478	57	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	137	1276	349672	342417	FALSE	20	CTTCAGCGTTACATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTEIQPKIIGQAYPHKRRFILVLPGVIQSEKQRKCP	352740	340485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_342521_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352636
524787	contig_16098_pilon	-	1409	9	Intergenic	novelGene_46122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_8	1946.33707255449	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	108	1202	458816	456273	FALSE	5	GGAGTCTGTTGTCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	459986	456065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459900
524788	contig_11130_pilon	-	1910	6	Intergenic	novelGene_53084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATGGGTGTTTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55191_55841_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
524789	contig_17198_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_62375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCACAACATGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911058	912639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_911100_912600
524791	contig_3077_pilon	+	1426	8	Intergenic	novelGene_26754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_6	3263.35681062758	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	367	1050	13867	17590	FALSE	40	CTAATTATACTCTATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	11323	17966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
524792	contig_1225_pilon	+	2243	4	Intergenic	novelGene_44134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	TCCACTCTGGCCTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275642_276321
524793	contig_7321_pilon	+	2436	12	Intergenic	novelGene_53120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAAACGCAAACATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113474	207861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_114465_117015_117113_126175_126294_128643_128818_142773_142911_169474_169616_173560_173704_174647_174726_175744_175895_186238_186353_203989_204076_207653
524794	contig_8616_pilon	+	2335	21	Intergenic	novelGene_72413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	171.28765279494	607	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	109	1341	239674	248335	TRUE	10	TTTGTGCCCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEGKSYNEHDDRVNLPRRRKGRGPFRWNYGEGNRRSGRGGSGSRSARLGEDDGDVAMIDAQDGPRVRYNPYAARPNRRGDNWHDRGRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSLIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKIVDRENRRISIIINPSAPPQTVQNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYIRSVVLVYLLLEQPRRHGGSEASLTSVPFLTAPFANDSPSYYAWMAMSYLRQLPLMLKLPRCYLPAREAILEQRP	239565	251939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243885_244040_244576_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245980_247704_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
524795	scaffold_19766_pilon	+	2368	13	Intergenic	novelGene_34421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	160.744167856877	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1151	2206	847654	851417	FALSE	15	CCTTCTAATCTGGGCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	843802	851579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845663_845845_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
524796	contig_15304_pilon	-	1053	3	Intergenic	novelGene_30510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
524797	contig_5649_pilon	+	2214	9	Intergenic	novelGene_82256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.609935232389	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	362	1135	25982	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12685	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12786_23158_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
524798	SIRV6	+	968	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	38	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	100	303	424	726	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTSTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2483_2621_2746_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524800	contig_2100_pilon	-	1649	12	Intergenic	novelGene_50748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	856.899706755707	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	180	1307	1180199	1170268	FALSE	20	CCCATAAGAGTGCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPNPRVGVCGSHRCFPGQREPAARNSPCLFSRFTPERSSTPSTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1169925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176412_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180254_1182769_1182822_1185420
524801	contig_12427_pilon	-	2080	7	Intergenic	novelGene_40517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	184	807	522337	506035	TRUE	5	TCTGATTTTGCCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578135	504668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504923_505015_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
524802	contig_19769_pilon	+	1048	5	Intergenic	novelGene_102286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.194167841727	43	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	559	1014	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87001	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_88040_88841_88958_89163
524805	contig_5780_pilon	+	2280	7	Intergenic	novelGene_29782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	229.031111423754	13	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	281	763	107519	110295	TRUE	20	AGGAGTTTTGCATGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73990	113724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110608_111897_111993_112614
524806	contig_9014_pilon	-	3932	20	Intergenic	novelGene_106774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1803	2483	115412	113999	TRUE	15	TGCTCAGCACCTCCTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSNVAISTSVKIWSISGMSRAPLRNMLEWLRRLSRADSRSGHFLRSSTRKNSPWHSFLSSVNFSFNITVVAPKPSSSSQVEAALSFPEISSRCSSVDTSWYSGWYSLSWVSKMKASKLLAAFSRSCFCRSRSVKSRSLCMERDSSSSGKSGRSRTSSSTPISSTVLCFRAGFCFFSSSGAGETPAGPASPFSFGFWASDFSPFSFPAAFSPSAAASSLGSGGGG	118232	108016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_108057_108362_108545_108797_108914_110810_111001_111213_111353_111512_111595_111732_111867_112046_112235_112492_112632_113180_113243_113392_113472_113900_114088_114235_114409_114540_114629_114725_114850_115026_115162_115340_115424_115923_116160_116566_116621_116731
524807	contig_5988_pilon	+	1478	5	Intergenic	novelGene_16019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	155.77788674905	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	98	1360	779480	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGIEDEGEEY	779382	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838_786702_786788
524808	contig_9415_pilon	+	3075	15	Intergenic	novelGene_109845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	312.760944114295	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	124	1431	1956508	2013564	TRUE	10	CTGGTCTCCTTTTGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLDFERYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPENCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAFATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVLKAKAYILFYVERQAKAGSDKL	1953749	2017270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1953770_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077_2000159_2010366_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398_2013751_2015812
524809	contig_16724_pilon	-	1912	9	Intergenic	novelGene_105306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	791.202210247166	878	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	311	1186	569099	541872	FALSE	30	CCAAAGCAATGTTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIGTPSPQQARVCPPRTLPDDGANLSSVRGILSLIQSSTRRAYQQILDVLDENHRPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575965	541145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_553367_553527_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
524813	contig_10235_pilon	+	3205	8	Intergenic	novelGene_46377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_7	210.721210539966	2971	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	124	771	154773	158044	TRUE	15	GGCTAAGTCTGTGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSEEVSWISWFCGLRGNEFFCEVDEDYIQDKFNLTGLNEQVPHYRQALDMILDLEPDEELEDNPNQSDLIEQAAEMLYGLIHARYILTNRGIAQMLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153833	160761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_154761_154845_155532_155636_156206_156323_156763_156840_156980_157171_157953_159405_159687
524814	contig_7457_pilon	+	2079	12	Intergenic	novelGene_31325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	280.007142766037	338	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	470	1447	285416	290630	FALSE	15	CCAGAGGTGCACTGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280811	291262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285261_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
524817	contig_4103_pilon	-	1841	20	Intergenic	novelGene_51924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	488.353613765233	1333	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	68	1222	91854	80996	TRUE	10	ACTGTCTTATCTTCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91921	77532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82074_82121_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
524818	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_94120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653775	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
524820	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524821	contig_5020_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_27939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCTGTCTAACATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161901	162309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_161900_162300
524822	contig_12873_pilon	+	1848	6	Intergenic	novelGene_27174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1010.52164746729	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	384	1361	16357	19940	FALSE	40	AAGCCAAATTTGTAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRYT	15973	20427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19693_19929
524823	contig_3155_pilon	+	1597	5	Intergenic	novelGene_26408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	234	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	24	530	258156	261211	TRUE	30	TTACACCTCACTCCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGAAATMNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258132	262546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261830_262097
524825	contig_7457_pilon	-	2355	13	Intergenic	novelGene_31651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGCTTGACCACCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041116	1007151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1007254_1009677_1009738_1010208_1010407_1010899_1010979_1012249_1012388_1013166_1013234_1035305_1035460_1036571_1036726_1036920_1037064_1038840_1038954_1039309_1039394_1039679_1039757_1040130
524826	contig_11171_pilon	+	2783	5	Intergenic	novelGene_48564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	132.66192935428	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	56	808	70574	105888	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQSELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70518	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88457_90410_90474_105744
524828	contig_10733_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_109975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTGCATAGTTTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442970	442668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_442700_443000
524829	contig_5063_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_109985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	35	CAAATATATAATTTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
524830	contig_13740_pilon	+	2432	5	Intergenic	novelGene_34749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_4	52.1775813927783	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	49	642	342716	356270	FALSE	10	CTTTGGTTTGTTGGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQEFVSVWVRDPRIQKEDFWHSYIDYEICIHTNSMCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	342667	358060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
524831	contig_14513_pilon	-	1194	2	Intergenic	novelGene_70275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	262	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
524832	contig_10011_pilon	+	2847	10	Intergenic	novelGene_68100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.3738007508887	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	37	1899	322928	333199	FALSE	40	TGTACCTGAATTAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSQLWPLLASAMAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKLM	322891	334147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_328985_330864_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994_333045_333190
524833	contig_12638_pilon	+	1897	11	Intergenic	novelGene_33383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	109.991136006498	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	92	1453	1515842	1539233	FALSE	30	AAAGGATTTTGAGCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSESPGHDGGARRHLQETMSSGVLELLTQSVFRQ	1515750	1539677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1538897_1539135
524834	contig_4105_pilon	+	2539	11	Intergenic	novelGene_21459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.350760030087	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	89	1324	60529	73266	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58728	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61734_62296_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
524836	contig_15219_pilon	+	2296	8	Intergenic	novelGene_40810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	327.32583778497	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	126	956	19617	23972	TRUE	60	GCCTGACATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19491	25914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_24314_24453_25053_25514
524837	contig_12074_pilon	-	2092	15	Intergenic	novelGene_53770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	420.338930300931	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	119	1996	43217	30226	FALSE	30	CAGTTCAGTTCAGACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	30129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
524839	contig_6102_pilon	+	2366	19	Intergenic	novelGene_31912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	386.926062417328	4	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	5	1264	375264	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVMDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	375259	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376299_379340_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394724
524841	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10422	91	1185	45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAAGTTTGCGTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11422	11735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
524842	SIRV6	+	983	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	449	3	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGCATCGCGCGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524843	contig_9440_pilon	-	1930	6	Intergenic	novelGene_59090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.9542031573	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	52	735	1716626	1700693	TRUE	5	TTACTTTGTCTTTGGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716677	1698653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1698997_1699840_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
524844	SIRV6	+	941	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	177	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	43	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524845	SIRV6	+	615	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	275	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAATGCCCTGGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	2815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737
524846	contig_12357_pilon	+	1646	11	Intergenic	novelGene_6134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	882.397308472776	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	262	1212	30982	53235	FALSE	60	AGAAGAAAAAAAAGGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	27423	53669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_27531_29610_29655_30217_30290_30943_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
524847	contig_7051_pilon	+	2059	12	Intergenic	novelGene_64354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	457.160893608178	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1896	162	2057	331836	347604	FALSE	80	AAGAAAAGAGAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQD	321886	347606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334404_335959_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
524849	contig_13740_pilon	+	1906	6	Intergenic	novelGene_34724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	959	junction_1	125.450229174761	2110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	204	755	167703	176906	FALSE	15	CTTTATGTGGTTAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	166308	178057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_167674_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
524850	contig_11396_pilon	-	2904	3	Intergenic	novelGene_71366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	599	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2173	2511	815637	815299	TRUE	30	CCATTTTGCACTAGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGGIAPPITGPLLAFILGCSFAGLLAMAAQEVGFETGMLTFAPPLPDRTPVIAALLTTDPTVLTADVVTSPIFRPTMPCSRLFIPGALLSVSLWKPVCPSTIVPPRELGG	822074	807762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_807829_814971_816495_820759
524851	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_14075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524854	contig_14711_pilon	+	2391	14	Intergenic	novelGene_68900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	396.479149484978	8	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	516	1790	83997	89543	TRUE	20	GTCTTATCTCAGACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVRARAPYAAGRDGASVDAVAAVDKALGVYASVMMPAVSDTRAFSVEVLAAANVECVTVMPTARAEPVSAAGPWTAVSVLMEASAVGMDTANAIAASAWMATMVLYVISAQAARHPARDTGTVQSAGLSGLVPWPPIAAWLVLMPT	70424	90800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87877_88737_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
524856	contig_12301_pilon	-	1976	9	Intergenic	novelGene_110017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	241.669195389069	21	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	406	1101	129134	102891	FALSE	15	TTTGTGTCATTTCAGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLLVSTALQIPFIPCFLKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136805	102015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115908_116121_116180_129132_129265_130605_130737_136661
524857	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	26	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524859	contig_9471_pilon	-	2335	10	Intergenic	novelGene_21774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCGTGACGCTGCGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417507	406910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_407043_410632_410792_411000_411232_412752_412821_413710_413828_413916_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
524860	contig_8317_pilon	+	455	2	Intergenic	novelGene_19322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAATGGAAACAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	16724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
524862	contig_9609_pilon	+	2558	11	Intergenic	novelGene_23155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	115.689411788633	936	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	159	1313	796792	828402	FALSE	5	CCACTGGTTCCTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPYDSRPRALRGSRLLRPPPLPLARVAARCRATRWSWKRQAGATSECPAGAMDGEIAAEQGDPAPPPGAPGGPGSGGDPALGGRREPKKYAVTDDYQLSKQVLGLGVNGKVLECFHRRTGQKCALKLLYDSPKARQEVDHHWQASGGPHIVRILDVYENMHHGKRCLLIVMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAGIMRDIGTAIQFLHSRNIAHRDVKPENLLYTSKETDAVLKLTDFGFAKETTQNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSDDAKQLIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSALATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGGSLASQGCNNQ	796366	829647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_796473_796739_797017_821262_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825638_825715_826058_826184_827134_827221_827502_827584_828249
524863	contig_1532_pilon	-	1912	9	Intergenic	novelGene_37427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1285.74375363056	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	70	1263	32217	13113	TRUE	45	ATTTTATTAAAGGTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12492_12575_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
524864	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_14088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	190	1362	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524865	contig_3584_pilon	+	1951	4	Intergenic	novelGene_108170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	540.495040577514	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	897	1805	529553	531381	FALSE	10	TGACTCATTTCTGTGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPDLIALLAHVFSFVSGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527065	531527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_529683_530602
524866	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524867	contig_12050_pilon	-	2036	6	Intergenic	novelGene_62731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	90.6620096843215	860	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	333	884	697920	686686	FALSE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	698252	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
524868	contig_3956_pilon	-	1701	10	Intergenic	novelGene_15145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	600	1121	1286221	1284176	TRUE	25	CGGCGACGACGGCGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRMMTLTFSTMRWKVW	1291013	1281618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283976_1284058_1284221_1284743_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286589_1290595
524869	scaffold_16539_pilon	-	1808	12	Intergenic	novelGene_68348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	305.422049137212	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	99	1496	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502783	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498856_499018_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
524870	contig_13740_pilon	+	2513	7	Intergenic	novelGene_34742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	42	junction_1	88.0329799311346	376	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	132	737	321880	356270	FALSE	45	CATGAAAAAATCAACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPEQQKEEFVSVWVRDPRIQKEDFWHSYIDYEICIHTNSMCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	296454	358046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_296563_321856_321904_342727_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
524871	contig_9471_pilon	+	1738	12	Intergenic	novelGene_21772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_3	684.111561150061	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	741	1517	413930	417296	FALSE	40	AAATTTATATGAATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406890	417517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
524873	contig_15063_pilon	-	1444	5	Intergenic	novelGene_12363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	689	1012	35891	35108	TRUE	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36688	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28205_34613_34924_35035_35380_35839_36156_36264
524875	contig_6735_pilon	-	1787	11	Intergenic	novelGene_15776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	705.066273480728	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	635	1312	544935	542464	FALSE	30	CCTTATGCTGAGCTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568281	541988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545033_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
524876	contig_10923_pilon	+	1889	10	Intergenic	novelGene_66164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	470	junction_1	623.666399429838	3891	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	121	1773	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13758	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
524877	contig_13894_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_62121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2550.52162178835	12	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	612	1367	523580	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520691	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522981_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
524879	contig_7594_pilon	+	1687	9	Intergenic	novelGene_55426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	700.380510419158	424	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	826	1209	561547	566248	FALSE	20	GATCTTGAAGTTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	538991	566726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349_554553_556356_556518_561539_561752_566069
524880	contig_9594_pilon	+	1721	11	Intergenic	novelGene_73930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	465.969741506892	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	476	1291	315271	322451	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301191	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310542_310763_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
524881	SIRV6	+	809	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	533	2	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
524882	contig_9609_pilon	-	2390	6	Intergenic	novelGene_23134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	85.9302042357633	151	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	840	1400	523112	521807	TRUE	25	TTAACCTACCTCTATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523951	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
524885	contig_3956_pilon	+	1592	9	Intergenic	novelGene_14859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1383.85338367184	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	84	1397	1281682	1290816	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282743_1287424_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290390_1290531
524886	contig_9345_pilon	-	2132	6	Intergenic	novelGene_24348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	56	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	195	1133	176056	142100	FALSE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176250	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
524887	contig_12425_pilon	-	2057	10	Intergenic	novelGene_46696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	598.821641246115	2	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	127	1149	211174	204225	FALSE	50	GAACAGAATAACTGCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226618	203316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
524888	contig_16532_pilon	+	2576	13	Intergenic	novelGene_110037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_5	245.167332312715	343	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	105	1475	138093	185084	FALSE	10	CACTTTGTGTATTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIFPPPHVARRCRAVQFPHSSRASLLGSPRVAGTMSFAETNPAASSLPNGDCSRFRARPGGNRVTVVLGAQWGDEGKGKVVDLLSQDADIVCRCQGGNNAGHTVVVDSVEYDFHLLPSGIINPNVTAFIGNGVVIHLPGLFEEAEKNVQKGKGLEGWEKRLIISDRAHIVFDFHQAADGIQEQQRQEQAGKNLGTTKKGIGPVYSSKAARSGLRMCDLVSDFGGFSERFKVLANQYKSIYPTLEIDIEGELQKLKGYMEKIKPMVRDGVYFLYEALHGPPKKILVEGANAALLDIDFGTYPFVTSSNCTVGGVCTGLGMPPQNVGEVYGVVKAYTTRVGIGAFPTEQDNDIGELLQTRGREFGVTTGRKRRCGWLDLVLLRYAHMINGFTALALTKLDILDMFTEIKVGVAYKLDGEIIPHFPANQEVLNKVEVQYKTLPGWNTDISNARTFKELPVNAQNYVRFIEDELQIQVKWIGVGKSRESMIQLF	137988	186185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_138276_148401_148505_149545_149615_151217_151269_167915_167983_168227_168336_169389_169472_172265_172393_173580_173736_174902_175028_176253_176352_183467_183618_185031
524889	contig_21203_pilon	+	1198	8	Intergenic	novelGene_84480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	278.730723686017	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1140	57	1196	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKNWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53893	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106298_108286_108379_120210_120376_121973
524892	contig_2069_pilon	-	656	3	Intergenic	novelGene_23510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509796	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
524894	contig_5671_pilon	+	1219	7	Intergenic	novelGene_79417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	2387.69047524078	26766	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	124	537	370430	525570	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	368801	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205
524895	contig_5988_pilon	-	1556	4	Intergenic	novelGene_15975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	25	CTTAAATTTTTCCATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
524896	contig_1225_pilon	+	2702	4	Intergenic	novelGene_44137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	2	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275385_275607
524897	contig_5092_pilon	-	2636	6	Intergenic	novelGene_62272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	552.844860697827	75	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGATTGTTGCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259003	232280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_252780_258929
524898	SIRV6	+	639	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-436	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	74	225	153	377	2002	2794	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGEFWDTSWDVSLGLWD	1849	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2627_2750_2829_3106_3162_10721_10819_11031
524899	contig_7151_pilon	-	2159	11	Intergenic	novelGene_40656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	144.48532797485	68	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	57	2054	65162	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65218	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5218_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
524900	contig_9345_pilon	-	1306	2	Intergenic	novelGene_24645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTCCTGTATCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949582	946885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948107_949497
524901	SIRV6	+	903	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	527	164	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	25	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	TAACAATGTAATGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
524904	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	42	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524906	contig_5013_pilon	-	4499	3	Intergenic	novelGene_110086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	394	59	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGAATTTGAAATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180412	173830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174017_174599_174716_176215
524907	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524909	contig_7357_pilon	-	2319	9	Intergenic	novelGene_36825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2282.15631311705	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	469	1461	154994	136424	FALSE	35	TAATAAAAATTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167048	135565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159922_160031_166772
524910	SIRV6	+	987	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	383	0	210	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	114	605	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1513	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524911	contig_233_pilon	-	2349	15	Intergenic	novelGene_14670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1470.48360259821	2	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	5	1756	109972	92266	TRUE	35	GGAGCACCTGCAAACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	109976	78535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78984_79142_91473_91677_92138_92361_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
524913	contig_15039_pilon	-	1943	9	Intergenic	novelGene_110116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	526.235866793589	186	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	483	1169	202841	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260596	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202966_208401_208526_222093_222255_260523
524914	contig_14722_pilon	-	2464	23	Intergenic	novelGene_110207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_14	120.642083854243	541	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	114	1958	151970	37838	FALSE	30	GAATGACCAGTCCCCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEVGALHFTPVAAPRPGTASFGPSAGLGPAARQPSWIMGFPKGPEGQGLPEVETREDEEQNVKLTEILELLVAAGYFRARIKGLSPFDKVVGGMTWCITTCSFDVDVDLLFQENSTIGQKIALSEKIVSVLPRMKCPHQLEPHQIQGMDFIHIFPVIQWLVKRAIETKEEMGDYIRSYSVSQFQKTYSLPEDDDFIKRKEKAIQTVVDISDVYKPCRKYRRQRGAEELLDEESRIHATLLEYGRRYGFSRQSKTEKAEDKKTALSAGFSAGERAEAHEEDELRAAEESRLTASSVGQIVGLCSAEIKQIVSEYAEKQSELSAEDSPEKLGASQLHHRKIISLNKQILQKTKHLEELQASHANLQAKYSEAKKTLTELKSYSEKLDKEQAALEKIESKADPSILQNLRALVAMNENLKSQEQEFKAHCREEMTRLQQEIEALKAERAPGGDEKTPSSGEPHGALTSVMTCDEDLDRRYNMEKEKLYKIRLLQARRNREIAILHRKIDEVPSRAELIQYQKRFIELYRQISAVHKETKQFFTLYNTLDDKKVYLEKEISLLNSIHENFSQAMASPASRDQFLRQMEQIVEGIKQSRMKMEKKKQENKMRRDQLNDQYLELLEKQRLYFKTVKEFKEEGRKNEVLLSKVKAKAS	152083	37331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37892_45772_45887_47982_48068_49475_49514_51668_51752_58190_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_65720_65803_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93643_93737_96619_96657_105006_105108_120663_120721_127092_127192_136353_136466_140864_140960_142940_143055_151928
524915	contig_5423_pilon	+	2683	2	Intergenic	novelGene_85294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582223	586451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_584068_585612
524916	contig_2799_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_85470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATAAAGAATGCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416946	416667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_416700_416900
524917	contig_5050_pilon	-	2449	11	Intergenic	novelGene_110282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	239.965435010962	186	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	634	1407	671263	548291	FALSE	70	CTAAAAAAAAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGESCERQDGGAQAASGPAVRRHGARAHPGPGGSPRPDRALQGAAQSCTLRRLYSAGALVAQWLSTWLLTKRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPCILACDTWGLSLASPFFWCLFST	716409	547248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_703364_703439_716268
524918	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27530	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524919	contig_5718_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_110306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	695	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGATGTCTGTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188149	190652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_188100_190700
524920	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_10542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
524921	contig_17470_pilon	-	2165	13	Intergenic	novelGene_110521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	45.3108859865804	1018	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	407	1681	277215	270076	FALSE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302652	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302355
524923	SIRV7	+	2344	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	116	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTCCGTCTTCAATAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	147830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_42935_43083_114683_114993_147610
524924	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524925	contig_5954_pilon	-	1915	13	Intergenic	novelGene_28654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	290.346871096548	5	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	559	1698	956264	944942	FALSE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSRPPAFTMALFRPGS	959942	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944989_946246_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766
524926	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-179	954	-65	-77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAACGGTGTAGGTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8136	10912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
524927	contig_177_pilon	-	2496	2	Intergenic	novelGene_41808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1415	1738	418661	418338	TRUE	35	GCGCTGTGAAAACAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHNLEETMSKLLANEGIDDGVEAAVEEAQNLGNIQSPANVTAALTGLLDYPNPHEGICNQNQVVGQPAEQEDEHDGKDDPHGLVLLPHVGLEQCAQGESIAEQHD	420075	415638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_415705_417645
524928	contig_3233_pilon	+	2215	10	Intergenic	novelGene_56557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	315.281884456857	8	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	185	610	740857	743745	TRUE	20	CACTCCCCAATGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSGPHVCRVKLLQTVFKAVTFQKQISSLLDCTPSSEDSV	738716	748037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743202_743276_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
524929	contig_5499_pilon	+	2244	11	Intergenic	novelGene_57018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	299.368268191537	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	133	966	816576	839423	TRUE	40	CATCTGTAAAGAATTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKVVWSRKDQKSRVS	809530	841269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_827957_831323_831423_834837_834946_835345_835515_839385_839446_839911_840227_840328
524931	contig_13894_pilon	+	1294	10	Intergenic	novelGene_62099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2223.11118330445	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	27	1238	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
524932	contig_15720_pilon	-	996	8	Intergenic	novelGene_41893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	649	954	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282680_282750_283785
524933	contig_17144_pilon	-	2332	3	Intergenic	novelGene_29165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_1	148.5	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1975	2322	159487	157620	FALSE	10	AGTCATTTCTTTCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	161461	157609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469
524934	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_11407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2470.53398833127	59	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	231	722	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35844_36158_36266
524937	SIRV6	+	195	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	898	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11135	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11100_11300
524939	contig_14289_pilon	-	2261	6	Intergenic	novelGene_110550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_1	330.871818080658	3997	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	83	760	66533	51527	FALSE	20	ATGTTTTGTCCAAGGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66615	50025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
524940	contig_10549_pilon	-	4027	1	Intergenic	novelGene_110611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAATTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190006	185979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_186000_190000
524942	contig_6550_pilon	-	4073	20	Intergenic	novelGene_110655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_18	104.0819781314	292	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	343	3084	97436	16114	FALSE	25	CATGTGGATTTATTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESDTEEFYDAPEDVHLGGGYPLTSAGKVRLSTLKQETENTASKVRNESPVQELKQDVSKKIIESIIEESQKVLQLEDDSLDSKGKGLSEQATASSIAAGTDLSSIPGLLAIDQVLQEDSKKAESQNVFEETELESKKCSPSDDTYEKPADETTTLTEVSSTEQLNVPETEGEVVNKEATEVKRSDVLEPASSNSSSAKDFTAMEEVAPAKPPRQLTPEPDIVASTKKPVPARPPPPTNVPPPRPPPPSRPAPPPRKKKSESEFEALKTPDLEVAKENVVSDTLLTTNIVSESTAKDSQPSLDLASATSGDKVVTAQENGKAPDGQTVAGEVMGPQRPRSNSGRELTDEEILASVMIKNLDTGEEIPLSLAEEKLPTGINPLTLHIMRRTKEYVSNDAAQSDDEEKLQSQSTDTDGGRLKQKTTQLKKFLGKSVKRAKHLAEEYGERAVNKVKSVRDEVFHTDQDDPSSSDDEGMPYTRPVKFKAAHGFKGPYDFDQIKVVQDLSGEHMGAVWTMKFSHCGRLLASAGQDNVVRIWALKNAFDYFNNMRMKYNTEGRVSPSPSQESLNSSKSDTETGVCSGTDEDPDDKNAPFRQRPFCKYKGHTADLLDLSWSKNYFLLSSSMDKTVRLWHISRRECLCCFQHIDFVTAIAFHPRDDRYFLSGSLDGKLRLWNIPDKKVALWNEVDGQTKLITAANFCQNGKYAVIGTYDGRCIFYDTEHLKYHTQIHVRSTRGRNRVGRKITGIEPLPGENKILVTSNDSRIRLYDLRDLSLSMKYKGYVNSSSQIKASFSHDFTYLVSGSEDKYVYIWSTYHDLSKFTSVRRDRNDFWEGIKAHNAVVTSAIFAPNPSLMLSLDVQSEKSEGNDKDEDPEVLDPMPSGIMKTDNTEVLLSADFTGAIKVFINKRKNVS	97778	15124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_16209_22168_22304_22684_22813_23953_24070_24423_24526_24727_24920_26988_27112_30842_30957_43134_43200_44609_44749_46440_46593_47346_47454_51298_51383_52419_52557_53692_53789_54865_54997_55473_56111_60069_60148_66156_66191_97359
524944	contig_14871_pilon	+	2490	12	Intergenic	novelGene_63693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	744.698241621652	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	110	1537	201945	233218	TRUE	5	TGTCTGTGTGGCCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	193768	234217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_193813_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233248_233293
524945	contig_10734_pilon	-	2014	5	Intergenic	novelGene_51018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.108200715501	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	86	475	320632	315922	TRUE	35	TTTAAAAACAGCCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEEQARRND	320717	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311523_311572_311676_315844_315945_318838_319032_320458
524946	contig_18800_pilon	-	2243	2	Intergenic	novelGene_110665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2335	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAGTGCAGAGGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4157	774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_-_891_2030
524947	contig_12677_pilon	+	672	2	Intergenic	novelGene_110691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACTAGGGTAACTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_68_276
524948	contig_7426_pilon	-	1909	7	Intergenic	novelGene_27536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	192.218336505363	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	26	724	1102797	1087105	FALSE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYSGLVLSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIAKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102822	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091091_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094757_1102705
524949	contig_15123_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_110941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47459	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	105	515	690382	689972	NA	45	AAAAAACTCTTCACAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTKQTARKSTGGKAPGKQLATKAARKGAPSTGGVKKPHCYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFHRLVREIAQDFKTDLRFQRAAIGASQEASEAYLVGLFEDTNLCALHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	690486	689439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_689400_690500
524950	scaffold_6394_pilon	+	1128	8	Intergenic	novelGene_111016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	325.062568545484	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	117	968	402184	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398261	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
524952	contig_7179_pilon	-	1173	6	Intergenic	novelGene_78058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTCTTCCGGCTCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402587	392258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_392417_395398_395490_396248_396343_397028_397128_397713_397723_401865
524953	contig_11720_pilon	-	2080	3	Intergenic	novelGene_43753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	12.5	346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	137	1213	16869	15793	FALSE	20	CCTTTGTTGTGACATAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKHHLVKFICLGIWVLSLILSLPFFLFRQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18329	14925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16878_17281_17358_18277
524954	contig_15063_pilon	+	1600	6	Intergenic	novelGene_11639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3771.48376106805	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	228	1370	34808	39538	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27139	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
524955	contig_13894_pilon	-	1498	3	Intergenic	novelGene_62041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	362	1420	287445	286290	FALSE	10	TACTTCTGCAGGTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288212	286211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_287943
524956	contig_15063_pilon	+	1375	5	Intergenic	novelGene_14361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	236	1120	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35035	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524957	contig_5643_pilon	+	1135	10	Intergenic	novelGene_38872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	12	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	42	923	236108	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236066	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
524958	SIRV6	+	649	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	223	-441	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
524959	contig_8059_pilon	+	1839	17	Intergenic	novelGene_111087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	61.6846820531645	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	503	1351	266127	341600	FALSE	25	AAACCTTGTTGCTGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIN	90280	342088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_246324_246398_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_341596
524960	contig_15365_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_111135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGTTAGGTGCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132103	132502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_+_132100_132500
524963	contig_1406_pilon	-	1769	5	Intergenic	novelGene_25546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_4	527.122850956018	608	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2159618	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2159391
524964	contig_5727_pilon	+	2202	13	Intergenic	novelGene_7947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	837.912299010662	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	935	1462	173359	179344	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPKP	168148	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174860_179332
524965	contig_3767_pilon	+	4215	9	Intergenic	novelGene_111142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_8	89.8358746548393	223	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	129	1163	423881	456289	FALSE	25	TCTATATCTGAGAAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGPALPPGFNARGTAEDEERDPSPVAGPALPPNYKSSSSDSSDSDEDSSSLYEEGNQESEEDDTGPTARKQRRSQDDDDDDDDGFFGPALPPGFKKQDDSPPRPIIGPALPPGFIKSTQKSDKGRDDPGQQVSYFNSEETDSSEDDEDIVGPMPAKGPVNYSVTTEFEKRAQRMKEKLTRGDDDSPKPITRESWMTELPPEMKDFGLGPRTFKRRADDKSGDRSIWTDTPADRERKAKETQEARKSFSKKDEEHVLSGRDKRLAEQVSSYNDSKRTESLMDIHHKKLKNKAAEDKNKPQERIPFDRDKDLKVNLFDEAQKKALIKKSRELNTRFSHGKGSMFL	423752	460066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_+_423957_428990_429124_431527_431630_434975_435082_441704_441840_443194_443360_446258_446358_456070_456290_457014
524966	contig_6497_pilon	+	3772	11	Intergenic	novelGene_35606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	150.014799269939	9	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	1464	2360	515843	531005	FALSE	45	GACAGATATTTACAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRERQWVDDFPLHRSACEGDSELLSRLLSERFSVNQLDSDHWAPIHYACWYGKVEATRILLEKGKCNPNLLNGQLSSPLHFAAGGGHAEIVQILLNHPEIDRHITDQQGRSPLNICEENKQNNWEETVKLLKEAINKPYEKVRIYRMDGSYRSVELKHGNNTTVQQIMEGMRLSQETQQYFTIWICSENLSLQLKPYHKPLQHVRDWPEILAELTNLDPQRETPQLFLRRDVRLPLEVEKKIEDPLAILILFDEARYNLLKGFYTAPDAKLITLASLLLQIVYGNYEGKKHKQGFLK	498419	532417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_498661_505492_505597_506525_506686_511501_511595_513830_513961_515107_515995_518627_518785_519312_519421_524818_524976_527351_527504_530834
524968	contig_5941_pilon	-	2399	9	Intergenic	novelGene_84551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	588.229547030749	272	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	111	806	151020	145690	TRUE	25	TACTACTTTGCAATTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLGTEDLAGHEGVQFFGLLSLYLEQEQRFQPREKGLSLIETTPENDNTLCSRLRNAKVEDLRSLTNFFGSCTETFVLAVNILDRFLALMKVKPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELFLLEGAGF	152264	143152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527_145715_148066_148132_148227_148307_148486_148738_149827_149966_150882_151021_152010_152062_152205
524969	contig_5988_pilon	+	1929	3	Intergenic	novelGene_16024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_2	25	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	567	1811	783406	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	782839	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_783527_783653_783803_785838
524970	contig_11677_pilon	+	2182	13	Intergenic	novelGene_85973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	79.9435564771935	83	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	23	1741	727262	737173	FALSE	35	TGATATGAAGTATGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKDSLDFYPVSQCGILLLLPRRQH	727239	737614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531_736790_737104
524971	contig_11328_pilon	+	2123	9	Intergenic	novelGene_88438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_8	250.816634964669	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	154	1428	830591	853019	FALSE	75	GGAAATTAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLERVVVLTQRSVV	829298	853714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_852980
524972	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	4	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	238	1473	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524973	contig_5485_pilon	+	3285	5	Intergenic	novelGene_37717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.326857318737	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	271	621	202960	217366	FALSE	30	CGAGCAGAAACCATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEVCFESKGTGRIPDQLVILDMKHGVEAKNYEEIAKVEKLKPLEVELRRLEDLSESIVNDFAYMKRREEEMRDTNESTNTRVLYFSIFSMFCLIGLATWQVFYLRRFFKAKKLIE	180586	220030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_180773_202875_202988_208495_208570_216702_216830_217244
524974	contig_7286_pilon	+	617	5	Intergenic	novelGene_108714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	213	311	288412	288510	TRUE	30	CTTGCCATCAATCTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286900	291352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289424_290759_290857_291315
524975	contig_500_pilon	+	1594	11	Intergenic	novelGene_30955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	555.49649863883	2794	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	181	1293	1452302	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446832	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1447866_1447909_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
524978	contig_12050_pilon	-	2160	7	Intergenic	novelGene_62732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	147.965085971883	988	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	340	972	697920	687356	TRUE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGGSTMDSSAGGEARREAGEDKEGFLSKLKKMFTS	698259	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687342_687460_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
524980	contig_12532_pilon	-	4519	11	Intergenic	novelGene_111151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_8	82.7106401861332	158	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	909	2730	189	2918	134658	91072	FALSE	75	GTGAAGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRRKVTSDLDEKIHLGYHKDSLEGNGAVECDQVTCTPTERPIPEALRCYQDLPPSPDQRKLLSSLQYNKNLLKYLNDDRQKQPSFCDLLIIVEGKEFSAHKVVVAVGSSYFHACLSKNPSTDVVTLDHVTHSVFQHLLEFLYTSEFFVYKYEIPLVLEAAKFLDIIDAVKLLNNENVASFQSELTEKSSPEETLNELTGRLSNNHQCKFCSRHFCYKKSLENHLAKTHRSLLLGKKHGLKMLERSFSARRSKRNRKCPVKFDDTSDDEQESGDGSDTLNQENFDKEKSDRNDSEDPGSEYNAEEDGLEEEMSDEYSDIEEQSEKDQNDAEEKPEAGDSVGNIHEGLTPVVIQNSNKKILQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHNNETEFHKKEHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRFHLENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLGPFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDDKRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVWQKYKATFHQCDVCKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSDARPFNCQHCNATFKRKDKLKYHIDHVHGIKSPDDPLSTSEEKLVSLPIEYSSDDKIFRAETKQYMDQTKVYQSEAKTMLQNMSAEVCVPVTLVPVQMPDTQSDLVRHTTTLPPSSHEILPPQPQSTDYPRAADLAFLEKYTLTPQPANIVHPVRPEQMLDPREQSYLGTLLGLDNTTAVQNISNNEHHS	135468	89470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_91728_96178_96268_106097_106204_107672_107780_109425_109522_114414_114545_119470_119619_121562_121633_122668_122877_133538_134776_135397
524981	contig_14744_pilon	+	2761	1	Intergenic	novelGene_66039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGAATATCCACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308085	1310846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1308100_1310800
524982	contig_9332_pilon	+	2202	2	Intergenic	novelGene_60718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCCTCTCAGTCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81077	86307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_83109_86136
524983	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_11621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524984	contig_16303_pilon	-	1880	8	Intergenic	novelGene_34095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	85	1197	47976	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48060	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33318_35258_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
524985	contig_12873_pilon	-	1687	6	Intergenic	novelGene_27172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCATCCTACTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20176	15971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16416_16751_17021_17734_18012_18982_19265_19607_19700_19853
524986	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	203	1441	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524987	contig_12638_pilon	+	2503	15	Intergenic	novelGene_33130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	630.543825047968	1	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	601	1380	183468	198780	TRUE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQKKKLDGTQKLRMM	176721	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_176961_178085_178281_180794_180861_180954_181004_183013_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198147_198736_198843_199335_199415_199503
524989	contig_13740_pilon	-	1375	9	Intergenic	novelGene_34680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_3	4190.84221100008	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	72	857	161718	157474	TRUE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	161987	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919
524990	contig_15063_pilon	+	1371	5	Intergenic	novelGene_11229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1140	231	1370	34808	36625	FALSE	15	TGGTGATGTCTGACACGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVS	27138	36626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
524991	contig_20819_pilon	+	1827	5	Intergenic	novelGene_55643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	474.450735061081	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	15	767	30450	42557	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVPLQALPRGWHRPLPLSLSPPWPHQGTGLGRCLPVHFQGFKGKESTVRALSPAPC	30435	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_30643_40122_40517_41309_41400_41530_41569_42519
524992	contig_7171_pilon	-	2439	28	Intergenic	novelGene_101302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	109.084945694762	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	83	1252	1075756	1066585	TRUE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRSGTPPPLRTLTLEPIPPRT	1075838	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066633_1068440_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
524993	contig_3277_pilon	+	2628	8	Intergenic	novelGene_74722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	726.067040250951	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	403	1011	258281	263763	FALSE	75	AAAAGAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVGMILPVFLNIRINLKELKVFTEFIC	188801	265380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618
524995	contig_10629_pilon	-	2618	16	Intergenic	novelGene_52904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	370.966209901776	3	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	196	1281	256957	247368	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPGEKQTELMRGELERGLSRTERARGGGWTGGTPCPVCWSRRSIPMKCWW	267721	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247759_248077_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
524996	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
524997	contig_854_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_36308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_4	2469.91771117987	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	14	460	556108	562402	TRUE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	556094	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
524998	contig_5779_pilon	-	1889	2	Intergenic	novelGene_106436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	35	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	632	946	94626	94312	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPISDQNKGSVDLSAEEKALELPDREFKNLIFIPTGCSEKPSLHCSWVRLRARRSHLRRAPPLPPRTPAAFSPESPNSRFLCNPLHRITSVPHHVRRGRGHQL	95257	93296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94067_94138
524999	contig_14472_pilon	+	3985	25	Intergenic	novelGene_111171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_14	111.047255956892	529	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	902	2709	292	3000	348317	395316	FALSE	25	CTTACAACTTGGGTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRNHCPHLDSVGEITKEDLIQKSHGACQDCKVRGPNLWACLENRCSYVGCGESQVDHSTIHSQETKHYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGAQPSLPHVRQLHPTQENSVQDFKIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEVEEEDELKARGLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELWHKSRPGFVVPTNLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEELKEQVMEIEEDTHAVTTEESMEEDQSQSDIDFQSCESCGSSDKAENENGSRGFSEDNNETTMLIQENENNSEMSKDWQKEKMCNKINKINSEGELDRDSVSETVNLNNQETVKVQIHSRASEYITDVHLNDLSTSQILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLASTHKKAQSASSPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIIKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYVKSWFWGPIVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQKFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKASYIEDLVLMLPQNIWDNLYSRYGGGPAVNHLYICHTCQIEAEKTEKRRKTELEIFIRLNRAFQEEDSPATFYCISMQWFREWESFVKGKDGDPPGPIDNTKIAVTKCGNVMLRQGADSGQISEETWNFLQSIYGGGPEVILRPPVVHVDPDTLQAEEKIEVETRSL	317665	396301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_317800_346890_346997_348265_348398_348572_348627_349053_349117_350953_351107_356818_356922_359568_359639_362186_362301_364657_364737_368352_368765_369622_369764_375655_375772_377265_377439_377559_377631_378279_378314_379351_379398_379974_380156_380607_380735_381414_381585_382668_382751_383600_383710_393344_393448_394689_394759_395158
525000	contig_6361_pilon	-	2644	21	Intergenic	novelGene_23881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	319.093070278876	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	48	1898	109608	85504	TRUE	30	CAGGTCATATGCACACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVRIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRVSDHCSGDEELERDC	119032	75508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_75585_76275_76369_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86858_87042_87504_87581_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529_109610_118986
525001	contig_1532_pilon	-	1725	7	Intergenic	novelGene_37398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1234.38186285012	9	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	70	720	32217	13369	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTPYGHK	34930	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13387_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
525002	contig_1443_pilon	+	1787	7	Intergenic	novelGene_28304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTAGGAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748005	776685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748993_749234_749351_750370_750530_766776_766826_767479_767556_776186
525004	contig_12074_pilon	-	2110	13	Intergenic	novelGene_53758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	457.990803825676	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	123	1514	43217	32322	TRUE	25	TACATATTTAATGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETKLLGICILSLSFGLLSPGTALKRA	45857	29976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32395_33357_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_45769
525005	contig_5967_pilon	-	1909	6	Intergenic	novelGene_44354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	602.759189063095	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	390	890	430750	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWILMTSLAWDPTTITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517605	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_430708_430797_465406_465533_488455_488583_517515
525007	contig_14526_pilon	-	3403	14	Intergenic	novelGene_111222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_12	66.9981011830199	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	13	1824	456338	377158	FALSE	20	TAACCCTCGATTGTCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RISSMASAPTPKYNSHSLENESIKRTPRDGINRELSEAVPRLPGETRITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSALILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHDWRVTFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNRQISKLTIYDARPNVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHADADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLITILDHLYSCRFGTFLYNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQINNSAKISDPPTSPASPSQMMPHVQTHF	456350	375578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_377326_381447_381625_384951_385066_386093_386187_390941_391149_393457_393644_398981_399171_403582_403733_405946_406031_427855_427958_433561_433673_449990_450086_451807_451881_456275
525008	contig_12638_pilon	+	2713	17	Intergenic	novelGene_33106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	607.935080826892	2	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	741	1844	182987	199604	FALSE	40	AGGCATAAGAAATCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170806	200473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178097_178281_180957_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
525009	contig_11720_pilon	-	1952	13	Intergenic	novelGene_43888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.296040039848	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	61	990	124674	118106	TRUE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134582	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117786_118065_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
525010	contig_14513_pilon	-	1107	3	Intergenic	novelGene_70254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2196	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11947_12058_12129_18691
525011	contig_19564_pilon	-	2163	5	Intergenic	novelGene_29606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	148	942	15529	12566	FALSE	60	AAAAAAAGAAACCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNAVAGTSLWRLSSVGGCP	15676	11344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12616_12790_13259_13554_13666_13945_14055_15472
525012	contig_854_pilon	-	1796	8	Intergenic	novelGene_36160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.823104402639	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	88	750	509201	471073	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTGQDCTGPPPRSSRVESVHLFTEPGQGLSGRLPGNQEQK	509288	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471189_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
525013	contig_16310_pilon	-	2593	14	Intergenic	novelGene_70045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1094.69120230427	1098	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	221	2215	66135	56545	FALSE	25	AGTCCTAAACTCTGGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGDHKPQGKKTKFE	66355	56166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56592_57061_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
525015	contig_16775_pilon	+	1742	14	Intergenic	novelGene_107784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	218.280857026856	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	25	1209	144962	174136	TRUE	10	GTGTCTCTCTCTGATGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	144013	174767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984_174302_174399
525017	contig_18108_pilon	-	2122	16	Intergenic	novelGene_33494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	297.496397737295	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	270	1907	287542	266909	FALSE	20	AAGTGTGCCTCAGTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335416	266693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_297085_297166_316667_316759_335363
525018	contig_5954_pilon	-	1806	13	Intergenic	novelGene_28658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.919830352164	56	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	670	1683	956264	944848	FALSE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960587	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944976_946792_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
525019	SIRV6	-	790	7	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8793	511	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTTTACGCAAGGTATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11340	1847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2017_2452_2617_2737_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
525020	SIRV6	-	404	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTACTTAACTGCGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11784	11380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
525021	contig_15063_pilon	+	988	4	Intergenic	novelGene_10598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4177.08853948138	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	233	988	34808	36132	FALSE	40	AAACAGACCATGTCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPL	27136	36132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839
525022	contig_13707_pilon	-	2363	12	Intergenic	novelGene_43563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	724.353059889928	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	63	1196	275489	270861	FALSE	35	ATATTTACAAAAGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVS	275551	269693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270867_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
525023	SIRV6	+	653	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	8523	6	268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
525024	contig_12427_pilon	-	2192	6	Intergenic	novelGene_40547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	16	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	214	837	522337	506035	FALSE	40	AACAAAGATCATCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578165	504679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
525025	contig_7275_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_111255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTGGGGCTGAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417713	417964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_417700_418000
525026	contig_7744_pilon	+	899	5	Intergenic	novelGene_62579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	14.2016724367238	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	22	690	891597	892781	FALSE	35	AATAAAGAATGTCTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPQRLMSVGLALILVGHGNLLLGAVLHGTVLRHVANPRGAVTPEYTTANVISVGSGLLSVSVGLVALLASRNLLRPQLHWALLAISLVNLLLSAACSLGLLLAVSLTVANGGRRLIADCHPGLLEPLVPLDQGSGHVDCPFDPTRIYDTALALWIPSLVMSTVEAALSGYCCVAALTLRGVGPCRKEGLQQQLEELTELELPKCKRQENEQLLDQNQEIQTSQKSWV	891575	892990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_891756_891836_891897_892068_892276_892400_892536_892673
525030	contig_5698_pilon	+	2035	8	Intergenic	novelGene_55002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	25	TTTGTCATTCATACTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19620_19727
525031	contig_8435_pilon	+	2263	6	Intergenic	novelGene_72010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	1035	2195	94862	97944	FALSE	5	TGCTGTGAGCTGCTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91115	98012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_94484_94604_95334_96398_96685_97030_97164_97674
525033	contig_15063_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_14469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36391	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36511_36625
525034	contig_4759_pilon	-	2161	4	Intergenic	novelGene_106331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	527.810782593746	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	249	851	650121	587401	FALSE	20	TTGGAGCCTGACTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPKTDCRSPVGLDCCSCCLDLAHRSELQGDSSGENNNPGSPTVNNFRQLQEKLIFENLNTDKLNSIMRQDSLEPVLRDPCYLINEGICNRNIDQTMLSILLFFHSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	650603	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_649801_650228_650461
525036	contig_2444_pilon	+	2275	12	Intergenic	novelGene_83763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	296.705073813115	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	86	1807	231271	243030	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	229892	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_229976_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
525038	contig_9436_pilon	+	1738	10	Intergenic	novelGene_60931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	615	1076	442923	445033	TRUE	15	ATAGGTTTGGCTGTGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGDPDPDSVLRILLLGCGEAGGFLETTPLFRCLFTSCGLCFSSSLLMSLLTVDVRASIARSRSDSFFSPSGSSSFSVSWMIFSSSRSMPAFTSERSLSRSDGSSIPSSSFSNSPSNCCSSSSSSSSSSSSSFSTSLGCSASTPFFFVLGSL	441232	456799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_441822_442897_442975_443886_444071_444807_445088_445312_445400_446110_446165_446357_446452_446667_446779_446900_447109_456745
525039	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	221	1396	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525041	contig_11855_pilon	+	2233	2	Intergenic	novelGene_66938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	1301	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	449	1483	1003891	1004925	FALSE	10	GATGCTTATTGTGGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQPSQPPLPPPPPPPQQQQQQKTSALSPNAKEFIFPNMQGQGSSTNGMFPGDGSLNLSPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSNQQFQPVMAN	1001547	1005675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747
525042	contig_854_pilon	+	2050	15	Intergenic	novelGene_36435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_14	412.017788649065	1614	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	282	1925	1453661	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451049	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
525044	contig_4125_pilon	-	1852	6	Intergenic	novelGene_25140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.232334740715	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	186	647	856432	853458	TRUE	5	GGGACCTGGGTGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPGLLDVFLIGVSCLPGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	858298	851438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_851793_852324_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177
525045	contig_14528_pilon	-	2202	12	Intergenic	novelGene_111266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_6	97.4733699593877	532	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	25	1968	201850	190953	FALSE	5	TCTTTGCCTCCTGTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	201874	190718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
525046	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	8	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525047	scaffold_6394_pilon	+	1333	8	Intergenic	novelGene_110982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	932.594034214814	401	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	511	1173	403262	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398168	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402756_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
525048	contig_1225_pilon	+	1942	4	Intergenic	novelGene_44144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	131	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274831_275815
525051	contig_6589_pilon	+	1479	8	Intergenic	novelGene_26103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3295.73966180088	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	535	963	1879232	1880585	FALSE	20	CAAGATTGGTGTCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876576	1881101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878872_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
525052	contig_4125_pilon	-	2705	12	Intergenic	novelGene_25142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	515.911245490094	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	183	1205	875313	853458	TRUE	5	GGGACCTGGGTGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	935452	851438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_851787_852023_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177_858245_863756_863920_864951_865016_869024_869132_870351_870391_875256_875360_935316
525053	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_11489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	230	742	34808	35888	TRUE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27139	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
525054	contig_2933_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_111371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTCTGTTGCAGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963882	964385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_963900_964400
525055	contig_13707_pilon	-	2851	10	Intergenic	novelGene_43569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_9	568.197105428463	1	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1397	1825	272378	270728	FALSE	55	CTTGAAAAATATTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275551	269701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_273441_273706_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
525056	contig_12622_pilon	-	2110	12	Intergenic	novelGene_5939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2235.35628457932	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	30	1271	1590968	1586655	TRUE	40	AGAAGCGAATTTATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590997	1583548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587753_1588516_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
525058	contig_15063_pilon	+	1375	5	Intergenic	novelGene_14362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	236	1120	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35035	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525059	contig_7457_pilon	-	2667	6	Intergenic	novelGene_31515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	272.22593557558	628	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	14	508	678884	675675	FALSE	10	TTTGATGGTATGGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLIHKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSPDRNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRLGDLNYLIYVFPDRPKDEVFSKYYTPVLAKAVDGYVKPQIKQVVPEFVNASVDSVGGSATYMEQAPSPAVCAQAPYNMYPQK	678897	673515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_675679_676860_676969_677222_677275_677982_678139_678612_678744_678840
525060	contig_5643_pilon	+	1931	14	Intergenic	novelGene_39019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	772.896863837716	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	653	1663	634983	641161	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQVRAEQGLGGLKGGWVGHTWPSWNHHFPPRLCPQSQKGRERRRR	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635211_635651_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640654_641145_641244_641412
525062	SIRV6	+	735	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	118	357	93	449	1733	2643	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGECGSLI	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2648_3053_3165_10724_10819_11031
525063	contig_7119_pilon	+	1594	4	Intergenic	novelGene_40894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	218	1372	137033	139798	TRUE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127440	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139932_140858
525064	contig_1244_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_38044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	948291	947920	NA	30	AAGTTGTATCATGGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPASWDPELQGSAFFAPVCGTHDPEPSPYPSWGRRLWTCPPAWEGSGGGSGEALPRKPRRSRTRPSHPEEELGRTLRLLAKPGGRSRVADNYAPSAAGFTRRGGDGGIYCKKNSDQIEHKKR	948291	947800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_947800_948300
525065	contig_5643_pilon	+	2012	15	Intergenic	novelGene_39003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	744.816605286297	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	667	1701	634983	641123	TRUE	10	TGTGTAGCCTCTACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKVPEGQGVGVREHHIPPSHEEYPCQGLPHLLQTQGGYV	631182	641603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640636_640729_641102_641244_641412
525067	contig_14441_pilon	+	1608	5	Intergenic	novelGene_100518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	65	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1000	1428	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111133	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111384_112608_113209_116578_116963_117220_117344_117539
525068	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_14122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	184	1356	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34624	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525069	SIRV6	+	538	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	513	8198	340	593	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTTGTGGTCGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	3133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
525070	contig_854_pilon	+	1025	5	Intergenic	novelGene_36309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3264.24412192164	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	2	727	556108	563502	FALSE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSILMFSPSQGKEGEPQDPIRHPHVTAVIASCLVWQHLPIYSSPTQRLNLLWKLGARWLQATTCIPSGTGLSPPPEAVCFNVAGPASLNVILSTDLK	556106	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562396_563216
525071	contig_7293_pilon	+	2036	3	Intergenic	novelGene_54229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	718	junction_2	205.5	2277	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	80	382	220511	222009	FALSE	20	TCTAAATGCTTCTCCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSKLAFALLAAFMLSAALCKAAVLPRVVSELRCQCIKTHSTPFHPKFIKELRVIESGPHCTNSEIIVKIVTKDGEEGKEVCLDPKAKWVQIIVEKFLKR	220431	223663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220575_221496_221633_221906
525072	contig_10235_pilon	+	974	6	Intergenic	novelGene_46430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	13	732	210483	212152	FALSE	25	CAACTCTCAGATAGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210470	212394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
525073	contig_15087_pilon	-	2495	18	Intergenic	novelGene_37145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	438.06180537536	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	112	1797	72618	38999	TRUE	15	GCATTCCATGACTGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PERERERCRGPGVCPGRLFSRALPPPPPSGELLEESQMEASRLRQKAEELVKDSELLQQPSSSLASFDHLAELTGKDTNVPAPPADGAHPSDKPEPVPKPPSSGTSSEFEVVPAEEQNSPPESGGSTRNTMVRAGPPAPRDGNLMLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89775	33327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33384_33511_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69116_69205_71087_71174_72506_72642_89687
525074	contig_13760_pilon	-	2197	10	Intergenic	novelGene_61291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	217.509642187294	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	53	1333	194443	164456	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQVATRLLPQGSAQLARMTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRQLRRGHGRSGHGSDHPAGADMGDPAAATHRGRHPV	194495	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165381_169165_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
525076	contig_8045_pilon	+	1648	4	Intergenic	novelGene_35370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	179.872176836775	9201	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	26	517	116067	118287	FALSE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEVKKKNSFQHIFEHP	116041	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075
525077	contig_5954_pilon	-	1950	11	Intergenic	novelGene_28666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	501.013023782815	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	934	1593	946886	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956784	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947066_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948148_956185_956291_956379_956500_956705
525079	contig_15087_pilon	-	1749	18	Intergenic	novelGene_37208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	381.704826265615	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	85	1227	158925	113497	TRUE	30	CTGTAAAATGAGTGACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181124	110649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
525081	contig_4364_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	64	420	1530895	1531330	FALSE	10	CCCAGGTGACTGTCGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKM	1530461	1531331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
525082	SIRV5	-	458	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACTTCCACCTCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10960	8155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
525083	SIRV6	+	548	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8717	0	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGGTGAGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
525084	contig_14209_pilon	+	1869	13	Intergenic	novelGene_88309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	181.90244638267	672	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	87	905	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTGVYIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32279	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
525085	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525086	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_8632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26376	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525087	contig_14711_pilon	+	2703	15	Intergenic	novelGene_68883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	353.526959685524	1815	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	535	2460	83997	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70405	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
525088	contig_6102_pilon	+	2225	12	Intergenic	novelGene_31778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	197.843497711643	28	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	115	969	350018	355818	TRUE	60	GAAATTGAATAATAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRYCA	349903	357605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_356595_356746_356875_357038_357093_357307
525089	contig_20693_pilon	+	1895	11	Intergenic	novelGene_60253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	586.976013138527	58	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	26	994	14748	34261	FALSE	10	GGATTTTCTGAGTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14722	35162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_23969_27410_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
525091	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525092	scaffold_13505_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_111400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	460	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	229	633	219572	219168	NA	10	CTGACACCCTTCCTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVQGEEAHVHPSAGTQGQGSKIRDPEREALRPSVWGRPGQSLVCVQTAQGGDPGVRGPLVSVWRCLTPRRDLHACAPGLRRLRKHTWVGGRERMGRKLSWKWWRPQSPHPVAGAVKKPGYPVTVLTAAGVTVR	219800	218637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_218600_219800
525094	contig_5526_pilon	-	3712	1	Intergenic	novelGene_111684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	719	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTTTTTTCATTTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171922	168210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_168200_171900
525095	contig_3095_pilon	+	726	3	Intergenic	novelGene_75246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	390	698	247875	248690	FALSE	15	GTCTCTGTCTTGGCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKAQPKEDQPQHKASDTTQQLALGRFRLRAPLHCDGAPEAGVLYTAGVDISTLGSHFQHHKDLEGPVPIPNKGSGHNASCFLLVIPKPPDFDLAWIEICH	246376	248718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_246740_247848_247969_248475
525096	SIRV6	+	1375	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	55	164	-54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525097	SIRV2	-	448	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	24	-320	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5871	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4685_4801_5788
525098	contig_18822_pilon	+	2333	17	Intergenic	novelGene_111725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	58.8944699759663	16	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	594	2183	168231	246273	FALSE	20	TGAGGTTACCGTCTCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKFEKVPDGPIPPSTPKFAYGKVALKKLKTVGEALNILSPSGPTKSIYPLTFVQVKQYFGFVLYRTTLPKNCSDPTPLSAPINGVRDRAYVSVNGVPQGILERNQVFTVNITGEAGATLDVLVENMGRVNYGRYNNDFKGLISNLTLGCSILTDWLIFPLNAENAVRGHLGGWGGHGNSCHVEPEPHSSSNFTLPAFYVGNFSIPAGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQMTLFVPQHILVTSAPNTVTVLELERAPCSSVDPALCTVEFVDKPVISTAVTYSHLPTWPDHV	140636	246423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_143102_143221_165852_166023_168057_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191259_209335_209411_212481_212572_221549_221664_223825_223958_229459_229715_246024
525099	contig_14341_pilon	+	2756	4	Intergenic	novelGene_111835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3063	junction_3	1348.60158023866	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2068	2709	549806	551737	FALSE	5	CGCCTACCTGTGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGLHNQDPREAGQTTGGSGAPYTPISLWLRPNLPLTVVPTSLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_550151_550355_550485_551481_551581_551668
525100	SIRV6	-	754	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8739	-165	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	4	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGCGTATAGACGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11286	1709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1736_1848_2030_2470_2611_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
525101	contig_15063_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_11326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	231	815	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35160_36316
525103	contig_10629_pilon	-	1284	3	Intergenic	novelGene_52912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCTATTTGTTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247384	245856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246720_246786_247138_247314
525104	contig_17470_pilon	-	2127	13	Intergenic	novelGene_110516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_12	35.7432005966014	975	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	367	1641	277215	270076	FALSE	5	ACTCTTGTTGGCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302715	269589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302355
525105	contig_15118_pilon	+	2473	12	Intergenic	novelGene_74605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	246.902563844643	433	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	331	1848	392523	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391988	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392340_392461_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
525106	contig_13702_pilon	-	2535	8	Intergenic	novelGene_102613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	109.087682388891	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	287	1165	151513	144255	FALSE	20	TTTTTTTAATCATTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	159909	142884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151585_157337_157448_159804
525108	contig_5092_pilon	-	1806	4	Intergenic	novelGene_62305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	600.807419690832	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	86	319	451516	444668	FALSE	15	CATAATTTTGGCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKLINCS	451601	443180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444686_447862_447995_449415_449498_451514
525109	contig_12140_pilon	-	1368	10	Intergenic	novelGene_86522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	94.978880043518	336	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	700	1368	43457	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84860	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_44267_44356_45850_46085_64263_64348_84713
525112	contig_10299_pilon	+	2074	11	Intergenic	novelGene_79668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_8	58.9821159335607	1264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	24	1382	182394	186284	TRUE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQVSLGFAGRREPQLTVGGDELLSLTL	182370	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186528_187233
525113	contig_6898_pilon	+	1475	10	Intergenic	novelGene_35664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2010.25635611082	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	239	886	59668	124828	TRUE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLRRRARLWSGSRRPRWYKRTWRRPVPS	59429	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116687_124427_124464_124782_125008_125481_125529_127343
525114	contig_8487_pilon	+	3184	1	Intergenic	novelGene_111911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2025	2426	119636	120037	NA	65	AAAAAAAAAAAGACCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAILVRAQNEGKRAIEKTSIILENTWYEQQNVARNVDVKCASGEVLKGNEHVIGQWKKGDAFYAVAKNLSELCSDVWWKVELVCDELRYLAEEISKQDLRGAMWFLPTVYSKMQEEGDGPKNELCKMKTKL	117611	120795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_117600_120800
525118	contig_5467_pilon	-	2039	11	Intergenic	novelGene_111938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	464	790	15382	15056	TRUE	20	GTACTGCCTAGATGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYILLVDTVAAVGAAPGKPLGVEERRKQAGVRELGVHAMRGKGRQASSPPVQRDQRWKSDSHGSRPPSNVGWSHDLGQRDSRALVVVEAVHGLEAEDHVQAVGEDEEH	15845	8234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_8394_8663_8790_11137_11213_11425_11620_12037_12080_12957_13046_13437_13679_14370_14420_14507_14591_14646_14736_14952
525119	contig_5096_pilon	-	3129	7	Intergenic	novelGene_111978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	66.9164072224111	72	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	211	975	80190	65579	FALSE	45	TCTTTAAAAAAAAACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSSFATCVLVSEEDKNAIIIEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKTSTGEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMECGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVQIKKKGNIYSLNEGYAKDFDPAVTEYIQRKKFPPDNSSPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFLYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYIMEKAGGLATTGKEAILDIVPTDIHQRAPVILGSPDDVTEFLEIYGKHAAR	98366	63424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_-_65771_67647_67768_69426_69565_72970_73112_79489_79583_80109_80273_98238
525120	contig_11186_pilon	-	2578	7	Intergenic	novelGene_98871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	186.778835346335	353	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	153	653	285822	238580	TRUE	20	GTTAAGCTTATTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVDVGWLHRAFLFHLTFLLGFGPLPKAGTFRSPARSKSSVSAHLTVGRDDMSNKEGSGGFRKRKHDNFPHNQRREGKDVNSSSPVMLAFKSFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKENKTC	285974	234331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_238537_238586_239957_240086_266595_266727_280493_280609_285290_285396_285806
525121	contig_8394_pilon	-	1864	3	Intergenic	novelGene_27315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	253.5	51	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	288	1601	35493	32466	FALSE	55	GAATATAAAATTTATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTTQTQRQRPLVNCGKKPEGGGRTRGKLTSEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39012	32202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35397_35523_38754
525122	contig_6215_pilon	-	2796	9	Intergenic	novelGene_21185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_5	559.028048826711	4	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	92	1288	238624	228234	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	238715	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588
525123	contig_2438_pilon	+	1333	5	Intergenic	novelGene_112013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	FALSE	10	GATGGACTCTGGCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
525124	contig_11720_pilon	+	1669	13	Intergenic	novelGene_43946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	389.157093029994	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	13	630	262271	266608	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRHHHAPQHLPALRPG	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_266562_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270628_270700_271268_271343_271806_271961_272096
525125	contig_15063_pilon	-	1511	4	Intergenic	novelGene_13975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	35	GAGGACCCAAGAGTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
525126	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525128	contig_20693_pilon	+	1729	12	Intergenic	novelGene_60245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	496.179186508228	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	163	1218	21258	34261	FALSE	25	TTATGTATAGTCCTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILHDFSATCSSQHVIGPTFCTVAHCSNSRYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14710	34772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
525129	contig_1450_pilon	+	2968	22	Intergenic	novelGene_27349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	523.687617849072	1	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	213	2771	244426	355748	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243343	355945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347130_348135_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
525130	contig_5253_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_61609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTTTTTTTTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399406	398959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_399000_399400
525131	contig_5988_pilon	-	1752	5	Intergenic	novelGene_15995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	91.3318126394084	627	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	285	1016	691255	690042	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	693437	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_691009_691134_691358_691510_691606_693350
525132	contig_12622_pilon	-	1738	11	Intergenic	novelGene_5976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2420.81354094032	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	57	1550	1590968	1583745	FALSE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSESDWPPFSWPHGSPPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591024	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586626_1586671_1586707_1588831_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
525133	contig_5671_pilon	+	1359	7	Intergenic	novelGene_79449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	2326.29581571696	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	265	678	370430	525570	TRUE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	369008	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369248_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205
525134	contig_15405_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_112094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAGTAAAGAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33280	35552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_33300_35600
525135	contig_15063_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_14178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	133	1305	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34675	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525137	contig_5189_pilon	-	2139	10	Intergenic	novelGene_34829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1236.43113460366	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	123	692	230433	205038	TRUE	10	TCTAATGTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKI	247751	198095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205044_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235787_247730
525138	contig_11130_pilon	-	2090	6	Intergenic	novelGene_53085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	94	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATGGGTGTTTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55196_55666_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
525139	SIRV6	+	1312	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
525140	contig_3095_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_75001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	106	435	147280	149936	TRUE	15	GGTCTTAGGTGGAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNGTSLCCSPRHGNL	147174	152240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149963_150329_150696_150996_151163_151848
525141	contig_7870_pilon	+	1346	6	Intergenic	novelGene_108943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACGACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294580	497931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_295385_370811_370889_402900_403000_441669_441796_496464_496595_497821
525142	contig_3602_pilon	-	1273	7	Intergenic	novelGene_60640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	496	junction_1	138.534492295441	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	306	617	1110937	1106687	FALSE	15	ATGAGTCTCTTTTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELGWRRTCRTSLVSAGPPVSLQGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1112297	1106030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148
525143	contig_11396_pilon	-	2129	7	Intergenic	novelGene_71274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	724.368383873534	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	138	689	249053	232299	FALSE	5	ACCCTCTTCGGCTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249190	230858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245774_249034
525144	SIRV6	+	1253	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	6	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	202	543	1733	2742	TRUE	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGE	1143	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2627_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525145	contig_3679_pilon	+	3033	5	Intergenic	novelGene_112130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	70	junction_4	43.9566547862778	484	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	142	558	1079232	1092075	FALSE	20	ATTGGTGGTCAAGTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRVSGRRGGSLLGCFPGSFLPTQLHTLRSVWCCRCISPVAALTTAAMISLTDTQKIGMGLTGFGVFFLFFGMILFFDKALLAIGNVLFVAGLAFVIGLERTFRFFFQKHKMKATGFFLGGVFVVLVGWPLIGMIFEIYGFFLLFRGFFPVVVGFIRRVPVLGSLLNLPGIRSFVDKVGESNNMV	1079090	1094550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1079257_1084741_1084834_1086178_1086358_1089357_1089440_1092036
525146	contig_4315_pilon	+	1978	2	Intergenic	novelGene_46837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAATCATGAAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575432	581907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_580086
525147	contig_5350_pilon	+	2867	5	Intergenic	novelGene_99345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.287137516505	134	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	275	583	222805	223532	FALSE	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILGKYKEQGHVEAQPGTRRWSGFSNLAPLSCSDYTTET	142225	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_220454_220530_222758_222931_223349
525148	contig_7342_pilon	-	2547	22	Intergenic	novelGene_71115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	93.8654655535398	4	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	68	1075	86720	80506	TRUE	10	GCTAGTTTTCTCCTGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPVRYTVE	86787	76099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80527_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
525149	contig_7391_pilon	-	3116	13	Intergenic	novelGene_112141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	85.0297333616633	370	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1361	2146	331336	316481	FALSE	20	TGAATTGAGGGATTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYLPNGRFKEFLSKHVHLMCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKYDPQFGDAFWNSSKYGMVTYLLRMMTSWAIVCSVWYLPPMTRETDEDAVQFANRVKSAIARQGGLVDLLWDGGLKREKVKDTFKEEQQKLYSKMIVGNHEDRSRS	369634	315510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316590_322885_322966_323053_323183_326974_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206_330297_331310_331386_332480_332636_332814_332885_341539_342554_369562
525150	contig_3095_pilon	+	1244	5	Intergenic	novelGene_75057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
525151	contig_15063_pilon	+	1317	4	Intergenic	novelGene_14260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	3	1175	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34805	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525152	contig_5968_pilon	-	1238	8	Intergenic	novelGene_112187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_7	235.192322518038	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	14	1072	732362	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732375	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
525154	contig_1443_pilon	-	2904	8	Intergenic	novelGene_28382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	25.4101056547932	26	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	85	1440	1052337	1039061	TRUE	45	CATGTAAAATATTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQVLVCSENSPQLMDLSPSSTAIYVGKQDIIRQSVLLMGIEWDRYVYKGVGKPVEKRVWGHESESEEREDDQIPPHAVDLL	1052421	1036668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038033_1038153_1038263_1038441_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
525155	contig_11378_pilon	-	3498	1	Intergenic	novelGene_112255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1792	2124	380113	379781	NA	10	CGTGGTCGTGCCTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLFRSAVTVTMGALVAQWLSARLLPKRSAVRIHRQLLGNSTGQFYPVLQGRYEQAVGLGCVFVFVSLILFLFLYKTTIEKQLKFSQVRFRKGFMGCKTGITYKRPGHLL	381904	378406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_378400_381900
525156	contig_5020_pilon	+	1529	8	Intergenic	novelGene_27842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	929.199611691345	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	363	1214	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124285_124444_124547_124909_125091_125657
525157	contig_10324_pilon	-	178	2	Intergenic	novelGene_7891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4284	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCCTTTCCATGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579038	578762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_578840_578937
525158	contig_9389_pilon	+	1874	2	Intergenic	novelGene_84121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1423437	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1424509_1424549
525159	contig_16091_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_112353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38178	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_38200_40700
525160	contig_9436_pilon	-	2596	16	Intergenic	novelGene_60924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.2086919375485	19	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	22	2091	458965	441733	FALSE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTEEDPEHRVRVRVTRLHHGGPNQDLTVLEMKRENPQLKQIEGLVKELLEREGLTAEGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVQGAEEAQKERQRQKELESNYRRVWDPPRACWFFSHSLPRDTVRSFVWSRGGRTRSVGPFSRP	458986	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_441849_442180_442257_442544_442658_442804_442970_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
525162	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_14036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525163	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525164	contig_15063_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_12071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525165	contig_20641_pilon	-	3858	2	Intergenic	novelGene_52782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAGAAGAAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14052	9776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_11877_12294
525167	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAGATCAACCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30133	29845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
525168	contig_610_pilon	-	817	2	Intergenic	novelGene_76755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3263	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACACACTTATAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220667	213595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517
525169	SIRV6	+	746	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	93	587	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1842_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
525170	contig_5020_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_27945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGATTCACAGTGACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169469	170018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_169500_170000
525172	contig_20779_pilon	+	2007	5	Intergenic	novelGene_112358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	159.747456943765	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	41	1774	8301	76720	TRUE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENGAIHTEGCGL	8260	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_76688_76791_94359
525174	contig_3866_pilon	-	2368	12	Intergenic	novelGene_112426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.06141454619	1732	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	55	822	268685	242015	TRUE	55	AAATTTATTTTAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTKGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM	268739	239854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_240855_241468_242060_242535_242601_243133_243202_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253751_253854_257352_257477_265864_265948_268664
525175	contig_3077_pilon	+	2413	11	Intergenic	novelGene_26863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	76.3911644105521	14	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	133	1215	1337784	1346705	TRUE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336580	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611_1346967_1347333
525176	contig_9146_pilon	-	709	6	Intergenic	novelGene_79498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1491	junction_5	1262.74453473377	167	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	21	674	147490	142549	FALSE	25	CATGCTGACAATGTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147510	142513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
525177	contig_1861_pilon	-	2026	17	Intergenic	novelGene_77655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	118.032768225608	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	85	1788	112534	88651	TRUE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTGVNAVLILILTHCRSLVLT	115161	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_88604_88710_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
525178	contig_17427_pilon	-	1570	7	Intergenic	novelGene_30312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1075.50428740299	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179843	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177237_177325_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179689_179747
525179	contig_8210_pilon	-	3030	2	Intergenic	novelGene_30237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30150	24726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_25970_28363
525180	contig_11104_pilon	-	1640	8	Intergenic	novelGene_112469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_3	76.9059855423809	73	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	130	990	359149	336406	FALSE	45	GGGAAGAGGTTAGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELIPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNVSNPYSLQKHVKGETWKEFWFGIETSIMLV	359278	335755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_336589_336686_336794_337105_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
525181	contig_5092_pilon	-	2165	5	Intergenic	novelGene_62304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_4	284.380906532067	8	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	86	400	451516	444945	FALSE	15	ATAATTTTGGCTCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451601	443179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
525183	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525185	contig_12622_pilon	-	1691	10	Intergenic	novelGene_5962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2307.27886866278	67	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	70	1497	1590968	1583745	FALSE	35	TCAGAAGCGAATTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPTDDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591037	1583550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586605_1588841_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
525186	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525187	contig_15123_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_110906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGGCCTGTGCTAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202792	201335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_201300_202800
525188	contig_11396_pilon	-	2365	9	Intergenic	novelGene_71277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_7	698.806437792326	854	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	330	929	245798	232299	FALSE	20	GAAAACCCTCTTCGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMSSYSIRHSISMPAMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249159	230862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_234013_234056_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_247756_247917_249034
525189	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	196	1362	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35836_36158_36266
525190	contig_1516_pilon	+	2219	12	Intergenic	novelGene_49994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1064.99934427481	7	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	72	1667	347241	363092	TRUE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335210	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985_363145_363233
525191	contig_3095_pilon	+	1927	5	Intergenic	novelGene_74982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	69	833	147241	151151	TRUE	20	TAAATTTTGGTGTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	164895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_163812
525192	contig_12425_pilon	-	2072	10	Intergenic	novelGene_46692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	718.177391340119	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	143	862	211174	206598	TRUE	25	CCTTCAACTTGAAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLAADPTPSLHVSTMSMAPGPHAREKEKRLRNAARPVSLAIPHPTKKTSIMDIVLTVSLLLRRRSWLRSTKMVQ	226634	203286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207682_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
525194	contig_5499_pilon	+	2022	10	Intergenic	novelGene_57003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	275.528179643712	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	75	1112	803476	840364	FALSE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIFKIQVLVFSV	803401	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835454_840325
525195	contig_2100_pilon	-	1566	10	Intergenic	novelGene_50740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1021.03909793219	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	141	1034	1182812	1173349	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPGDGIYRRPL	1185551	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170170_1173063_1173374_1174200_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
525196	contig_4125_pilon	-	2678	19	Intergenic	novelGene_25074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_18	23.4674058174837	97	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	757	2472	461615	454981	FALSE	5	GGCTTTGCTACCTCTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTPPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPDAKKPRLLQGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDARKEQETVMRVYSHLKSILKDHCVQHLPDGSVTVESILIQAAAHSEDPGTKVLLVSWTYQDEELGSYLTSLLKKGLPQAPS	470010	454774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_467674_467809_467999_468247_469694
525197	contig_4812_pilon	-	550	4	Intergenic	novelGene_103673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	5768.8650145029	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	9	374	82334	79235	FALSE	30	AAAACATGTCTTGTAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQ	82342	79058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81179_81286_81547_81739_82268
525198	contig_16303_pilon	-	2096	8	Intergenic	novelGene_34052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	53	1165	47976	35759	TRUE	25	CCATTTTTATGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48028	32576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33162_35412_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
525199	contig_5485_pilon	-	2766	15	Intergenic	novelGene_37752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	99.3474884905892	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	691	1365	467063	459244	FALSE	40	TATTTAAAGAAACCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	478745	457842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469044_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
525200	contig_11720_pilon	+	2205	12	Intergenic	novelGene_43972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	351.853744972595	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	674	1915	264322	272176	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHRSFSPEIPSPASPHQVAHPTYAPGLPEAAVVSLCPRPPHPLLRHPAHRASGRLQGSEGSVRPQRPAQRAAEPAASLCCAAHPHVHQHACLHARVCQWLAEQGHHFLHHGANLCHQSLLRGQLPAQSPPPCLLWSCSPAGRSLPGTYHLPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	262268	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267962_270480_270700_271268_271343_271806_271961_272096
525202	contig_10235_pilon	-	3475	26	Intergenic	novelGene_46354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	153.067305457436	24	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	854	2137	137459	133469	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEEVEERAPAQNPELTPSGPAPAGPTAAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRLESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACAPPRHLHVVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPTTANAEAPLPGPGQSASLAPSSTTVESSTEGSPPPGPTPAPATSHPRVIRISHQSVEPVVMMHMNIQDSGMQPSGVPSAPTGPLGPPGHGQTLGSTLIQLPSLPPEFMHAVAHQITHQAMVAAVASAATGQQVPGFPTAPTRVVIARPTPPQARPSHPGGPPVSGALQGTGLGTNASLAQMVSGLVGQLLMQPVLVAQGTPGMAPPPAPATASASAGTTNTATTAGPAPGGPAQPPPPQPSGVPEAWVQRACHRSFLRQWCRVC	141071	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131511_131619_131765_131864_131925_132030_132178_132339_132465_132552_132656_132784_132839_133015_133186_133351_133541_134238_134373_134584_134673_134778_134892_135014_135123_135233_135312_135606_135860_136063_136262_136710_136841_137349_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_140917
525203	contig_1230_pilon	+	2264	9	Intergenic	novelGene_28825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1281.85543622321	2	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	353	2035	405761	408754	FALSE	35	AAATTGGCACCATATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404421	408983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405717_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
525204	contig_10324_pilon	+	1973	5	Intergenic	novelGene_7803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	86.7680096579379	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	159	680	133277	134610	FALSE	15	TACTTGGTGTCTTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS	133118	135903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_134560
525205	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	227	1399	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525206	contig_1146_pilon	+	2387	6	Intergenic	novelGene_84842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	164.952841745755	1138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	79	690	937672	944381	FALSE	35	TAAAAGGTTTAAATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	937593	946078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262
525207	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525210	contig_5954_pilon	-	1780	11	Intergenic	novelGene_28640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	450.540386646969	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	107	1420	959926	945083	FALSE	15	ACCATCCGTCCTTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEISEEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960566	944722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948141_959762_959941_960474
525211	contig_15453_pilon	+	2037	4	Intergenic	novelGene_112476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	226.133195754675	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	131	439	6981	17260	FALSE	25	TTACCAAATTCTACCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6850	18858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16235_17167
525212	contig_15063_pilon	-	1538	5	Intergenic	novelGene_9730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCACATTGCCATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36789	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36156_36264
525213	contig_4151_pilon	+	2688	24	Intergenic	novelGene_65289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	81.6986023485646	428	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	152	2368	723778	828280	FALSE	20	TTGATACCTTTTGCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPSPKLAGHFHPTLVTPPSNPWSRTLSSRGSACVCVCVCVSVFVSAAGIMASPLRFDGRVVLVTGAGGGLGRAYALAFAERGASVVVNDLGGDFKGDGKSSLAADKVVEEIRRKDGKAVANYDSVEAGEKIVKTALDAFGRIDIVVNNAGILRDRSFARISDEDWDLIHRVHLRGSFQVTRAAWDHMKKQNYGRIIMTSSASGIYGNFGQANYGAAKLGLLGLSNTLAVEGRKNNIHCNTIAPTAGSRMTKTILPEDVLEGLKPDYVAPLVLWLCHESCEENGSLFEVGAGWIGKLRWERTLGAIVRQKNQPMTPEAVKANWAKICDFDNTSTPQSIQESTGSIIGVLSKIDSGGVSTNHTSHTASTTTSGFDGAIGHQLPPFSSAYTELEAIMYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLKQFADNDASRFKAIKVRFVKPVYPGQTLQTEMWKEGNRIHFQTKNKETGDIVISNAYVDLVTTSEASDISAQTTSEGGELQSTLVFEEISRRLKDVGHEVVKKVKAVFEWHITKGGNVAAKWTIDLKNGSGKTYQGPAEGSADITIIISDEDFMQVVLGKLDPQKAFFNGRLKATGNILLSQKLQMILKDYAKL	723626	828600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_723836_726654_726709_740934_741043_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757522_760496_760598_763406_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940_793048_799587_799675_803058_803155_804394_804534_811593_811722_828190
525214	SIRV6	+	727	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-5	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
525215	contig_5153_pilon	+	2421	17	Intergenic	novelGene_74363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	299.63722205986	278	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	478	1698	1007835	1022174	FALSE	5	TTTTTTCCTGGTGCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956641	1022897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005133_1005347_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
525216	contig_10235_pilon	+	2400	6	Intergenic	novelGene_46417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	9	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	28	747	210483	212152	FALSE	10	CCCACACTGTCCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210455	213805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
525218	contig_9233_pilon	+	2353	5	Intergenic	novelGene_78244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6087792521477	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	63	371	582395	676460	TRUE	0	TTCTTGTGGTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLAREPAVAASQSCGTRRTMSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582332	679051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346_677038_677646
525221	contig_15063_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_11184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3696.57510030869	6	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	228	1493	34808	39538	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGDPGDCLLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKTGEVTHCGKNV	27137	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34617_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39502
525223	contig_15087_pilon	-	2136	2	Intergenic	novelGene_37285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGGAAGAGTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303739	301235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_301421_301788
525224	contig_4884_pilon	+	2460	12	Intergenic	novelGene_63812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	592.812138375184	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	201	2072	575052	593204	FALSE	55	AATAAATCTCTGAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNSRSHSSRSKSRSQSTSRSRSRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRIYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGYRPVWNRRHSRSPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSSRSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKSREQDHSRSSSSSASPSSPSSREEKESKKEREEEFKTHHELKEYSGFAGVSRPRGTFHDDRDDGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGDGIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE	563304	593592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576366_578184_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_586137_586319_592827_593041_593198
525226	contig_12864_pilon	-	1362	5	Intergenic	novelGene_76442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	541.059319760782	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	288	776	246028	242831	FALSE	20	CTTTGCCTGAAAGAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	246315	242244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246021
525227	scaffold_6394_pilon	+	1355	8	Intergenic	novelGene_110989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	932.594034214814	282	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	537	1199	403262	406119	FALSE	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398184	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402714_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
525228	contig_2444_pilon	-	2660	8	Intergenic	novelGene_83748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_7	113.117782214209	366	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	13	690	214022	183125	FALSE	40	AGAAAACATCACTTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTGTMVMAEGTVVLRRNRPGTKAQDFYNWPDESFDEMDSTLAVQQYIQQNIRADCSNIDKILEPPEGQDEGVWKYEHLRQFCLELNGLAVKLQSECHPDTCTQMTATEQWIFLCAAHKTPKECPAIDYTRHTLDGAACLLNSNKYFPSRVSIKESSVAKLGSVCRRIYRIFSHAYFHHRQIFDEYENETFLCHRFTKFVMKYNLMSKDNLIVPILEEEVQNSVSGESEA	214034	181154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_183257_183385_183498_184561_184642_190070_190158_190346_190390_193967_194069_209863_209927_213962
525229	contig_1230_pilon	+	2119	9	Intergenic	novelGene_28837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1463.47936759457	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	182	1228	405421	407259	TRUE	30	GCACTGTATTGTAAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLNARQPFWLCFFCSFSGIYSEHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGLSRQPSYLETNLKMFKICCSWMSLLFPLVLKLLVES	404453	408933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405306_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406928_407148_407356_407590_407788_408003_408237_408568
525230	contig_9807_pilon	+	1899	8	Intergenic	novelGene_32914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	444.25470723219	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	80	1078	140826	158783	FALSE	60	AGAAATTAAAAGTAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	140746	159604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
525231	contig_1331_pilon	-	1558	4	Intergenic	novelGene_37803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	271	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	19	495	169924	160009	FALSE	15	AGGCATTGTTCTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169942	158945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
525232	contig_15063_pilon	+	1345	4	Intergenic	novelGene_14245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	31	1203	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34777	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525233	contig_3817_pilon	+	2876	7	Intergenic	novelGene_78359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	116.56674292248	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	39	986	600174	638773	FALSE	30	TAAATGTTGGTGTGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDGAVPLPESRREIEELLAEAKYYLVQGLVEECQAALQNKDTYEPFCKVPVITSSKEEQKLIATSNKPAVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDNMLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNILLYEAQDGRGPDNALLEATGGAAGRSHHLDEDEERERERIERVRRIHIKRPDDRAHLHQ	600135	640663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547_612762_627206_627377_630762_630850_631177_631231_632474_632671_638548
525234	contig_233_pilon	+	1212	5	Intergenic	novelGene_14540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	339	848	78477	91651	TRUE	30	ATACATTCACCCAGCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78138	93883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764
525235	contig_10477_pilon	+	2441	4	Intergenic	novelGene_112487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	373.615072263181	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	265	2403	252809	260754	FALSE	45	ACAAAATTGTCCTAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHILDLADCNLVVVFNLLLLAVESALTQGEPVYNRTHVQQNPCTTEQNVALRHLHDCWNAGVHCCGHYRAMVKSLAANQKKEANKIYNCEYLGLSKIPDILPNTTEVLEFGFNFLPAIQNTTFSRLINLIFLDLTRCQINWLHEDTFQSHHQLNTIVLTGNPLIFMAETSLNGPKSLKHLFLTQTGISDLEFIPVHNLENLESLHLGSNHITSIEFPTNFPTQNLKILDFQNNAIHYLTRKDMDSLKPATNLSLNLNSNDIKGIEPGAFHSKIFQNLNFGGTFDLSVILKGLQNSTIQSLWLGTFEDKEDQDLSPAILQGLCEMSVESINLQQHHFSDFSSATFQCFTQLQELDLTATHLKELPSGIKGMNSLKKLVLNVNNFDQLCEISAASFPSLTHLYIKGNRKKLDLGAGCLERLENLQKLDLSHNGIEASDCCNLQLKNLPHLQCLNLSYNEPLGLQSQAFKESPRLELLDLAFTHLHVNVPQSPFQNLQLLQVLNLSYCLLDTSNHHLLAGLPNLRHLNLQGNRFQDGSIPKTNLLQTVGSLEILILASCDLLSIDQQAFHGLEKMCHVDLSHNSLTGDSISALSHLKGIYLNLAANNICIVSLHVLPTLSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWFKENLHKLEGLEETMCANPPPLKGVKLSDVKLSCGITAVGIFFLIVFLFLFTILLVFLIKFLLRWKYQHI	243057	260792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_243291_252777_253052_255104_255272_259025
525237	SIRV6	+	646	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-31	8524	12	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	32	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
525238	contig_6589_pilon	-	2668	3	Intergenic	novelGene_26301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	113	1006	2274715	2273749	FALSE	65	GAAACAAAAAAAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSAPP	2290210	2272086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273760_2273832_2274793_2290175
525239	contig_15063_pilon	-	1616	6	Intergenic	novelGene_14176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	972	1295	35891	35108	TRUE	5	TGGCTCTGGTCGGAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	34674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36153_36264_36597_38972_39090_39504
525240	contig_13740_pilon	-	1658	12	Intergenic	novelGene_34667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3842.87225353964	4234	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	169	1137	165243	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158689_158745_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
525241	contig_10372_pilon	+	3411	1	Intergenic	novelGene_112520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2068	2370	80713	81015	NA	25	ATCGTTGCTAAATTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRTLFFLYLKPISYCLVLHKGALVAEWLKSSAANQKVGSVNPPSAPWKPNEAVLLWSVGLLSWNRLDSSGFSFFFFKSLIVWFLKKYRTFYSLFKKFV	78645	82056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_78600_82100
525242	contig_11171_pilon	+	3322	9	Intergenic	novelGene_48560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	117.474930836328	671	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	78	1058	70574	93759	TRUE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVVRAFLCVWSPQAGSAGPSWGSRSGLCEEG	70496	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_91202_91285_93673_93804_104185_104253_105710
525244	contig_3948_pilon	-	1996	12	Intergenic	novelGene_53335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	473.648473061043	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	218	1267	1494311	1472006	TRUE	60	AATAATGAAATAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKTTYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGVPDCGKS	1510982	1467967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1472032_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
525245	contig_14363_pilon	-	3178	3	Intergenic	novelGene_112530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	4	563	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGGTAAAGTAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168324	147388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_150344_151901_152004_168203
525246	contig_2204_pilon	-	1736	5	Intergenic	novelGene_71662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51211	13174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_13280_25594_25713_38677_38843_48667_48715_49910
525247	contig_3077_pilon	+	1651	11	Intergenic	novelGene_26603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3234.84800415723	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	147	1298	9676	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17880_18024
525248	contig_4429_pilon	+	2542	11	Intergenic	novelGene_50786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_10	434.82094015813	154	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	484	2469	172238	207452	FALSE	10	TGTGTATTGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGDLSKEVWMNYQALHHIGEINHFCHAARLKMSHPRGGQGDVTTTKKEELGVEHILWTPDPCTENILDPGDSCNTRDGERRQEVAAEKWWQQNQENDRRRHGGLPSPWSEKAECLQEGGFLVEWGASRHLLAELGMWTHGVRELSAFRPRLTGILGCLWTLSSGTKELCNTCPSRAEARLAKEGLGAEGLRGQGPGVGLLVGVAEKLF	154496	207525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_206189_206255_206894
525249	contig_4093_pilon	-	1678	6	Intergenic	novelGene_27641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	96	833	69245	41737	FALSE	30	CTAACATGCATGTGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72519	40891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
525250	contig_15063_pilon	+	1504	5	Intergenic	novelGene_12999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	75	AAAAATTAGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28183	36772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525251	contig_16121_pilon	+	2283	3	Intergenic	novelGene_6885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	922	junction_2	135	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	404	1312	58910	62826	FALSE	45	CTAAAAAAGCAGCTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	58506	63797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_59396_60693_60856_62565
525252	contig_15063_pilon	+	1300	4	Intergenic	novelGene_14251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	21	1193	34808	36661	FALSE	65	TTATAAAAATTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34787	36768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525254	contig_5967_pilon	-	1999	2	Intergenic	novelGene_44346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1540	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389839	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224
525256	contig_1230_pilon	+	2198	9	Intergenic	novelGene_28838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1279.46040872705	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	73	1179	405241	407185	TRUE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELSSHLIWRQI	404453	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406890_407156_407352_407588_407788_408003_408237_408568
525257	contig_10297_pilon	-	4369	9	Intergenic	novelGene_112569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	52.331724364863	173	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	17	1216	985762	951063	FALSE	15	ACTATTTATTGCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRAFPNPYADYNKSLAEGYFDSAGRLTPEFSQRLNNKIRELLQQMERGLKSADPRDGTCYTGWSGIAVLYLHLYDVFGDPAYLQMAHGYIKQSLNCLSKRSITFLCGDAGPLAVAAVLYHKMKNAKQAEDYITRLIHLNKIDPHAPNEMLYGRMGYIYALLFVNKHFGEEKIPLSHIQQICETVLTSGESLARKRNFTAKTPLMYEWYQEYYVGAAHGLAGIYYFLMQPSLQVSQAKLHGLVKPSVDYVCQLKFPSGNYPPCVDDNRDLLVHWCHGAPGVIYMLIQAYKVFREEQYLSDAYRCADVIWQYGLLKKGYGLCHGTAGNAYAFLTLYNLTQDMKYLYRACKFAEWCLDYGEHGCRTPDTPFSLFEGMAGTIYFLSDLLVPMKAKFPAFEL	985778	947909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_951140_951713_951787_952220_952398_953511_953695_955692_955840_956376_956513_963942_964151_981850_981969_985681
525258	contig_5222_pilon	+	2391	2	Intergenic	novelGene_58996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	782	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGCAAAAATGATTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186283	190398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_186341_188064
525259	contig_8624_pilon	-	2067	2	Intergenic	novelGene_112575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTTTGTGATGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062093	1059927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1061794_1061892
525260	contig_6589_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_25957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83213	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296027	1297585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1297600
525261	contig_5954_pilon	-	1934	11	Intergenic	novelGene_28598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_4	484.558974738886	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	913	1572	946886	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956288	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947066_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955997_956121
525262	contig_1331_pilon	-	1090	4	Intergenic	novelGene_37843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	FALSE	30	TAGACTTGGCAGCAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	159412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
525264	contig_20493_pilon	-	2516	13	Intergenic	novelGene_86397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	70.3662541437458	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	423	1550	49056	37388	FALSE	35	TCTCAGAAAACCTGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55251	36421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50493_50565_54457_54665_55211
525265	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_9885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	577	1461	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34913_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525266	contig_10134_pilon	-	2128	4	Intergenic	novelGene_16252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	3	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTACCTAAGTGATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	32259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38817_39584
525267	contig_3986_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_52721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	491	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTCATGTCACCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103923	101968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_102000_103900
525268	contig_3077_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_26769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTATTCCTCTGCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18077	13528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13985_15135_15183_17640
525269	contig_854_pilon	-	2404	11	Intergenic	novelGene_36158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	228.560626530468	3	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	80	1306	509201	471125	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPGLHWASPKELSGGERPPVY	509280	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471186_474397_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
525271	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_12180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525272	contig_13004_pilon	+	2510	1	Intergenic	novelGene_112608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTAGATTCTCTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157959	160469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_158000_160500
525273	contig_10324_pilon	+	2268	8	Intergenic	novelGene_7797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	98.3172706816341	309	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	74	418	132046	133232	TRUE	15	AGCCCTCGATACTTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAE	131609	135894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_131657_132019_132220_132653_132822_133229_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_134560
525274	contig_5331_pilon	-	3313	19	Intergenic	novelGene_112838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	164.189752089946	6	61	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	195	1802	809743	789047	TRUE	20	TTGGCAGTCACGGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYTPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISDRQHQFHAPRSSSTSQPRSTYWQRPE	812529	778685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985_789127_791438_791551_792042_792142_797687_797854_798194_798311_799347_799444_799920_800042_802651_802874_804438_804630_805851_806098_806907_807044_809720_809827_812418
525275	contig_3975_pilon	+	1811	12	Intergenic	novelGene_54793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTACCCTCCCGCCCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2015532	2052448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2016161_2016419_2016471_2017581_2017700_2018280_2018427_2018507_2018610_2019773_2019868_2021000_2021137_2021593_2021739_2023262_2023338_2027088_2027211_2044821_2044930_2052362
525278	contig_6059_pilon	-	1906	16	Intergenic	novelGene_44853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5538.56842714994	2	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	708	1640	573432	569146	TRUE	40	GCTTTAATAAAAATTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584868	567818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_567966_568126_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575873_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580671_580941_580992_584752
525280	contig_8914_pilon	-	2064	4	Intergenic	novelGene_112870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_3	1985.3530892234	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	626	1156	267637	265586	TRUE	20	TGATGCTGTGCTTCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVTIFKALNNFSIIFMHENYFCRLDFFMVLNVNKTIGSCFVEIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKL	268965	264524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_265799_267319_268180_268882
525281	contig_14811_pilon	+	1636	2	Intergenic	novelGene_74478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	790	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATTGGTGGTTGAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356578	375701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_357607_375093
525282	contig_13894_pilon	-	1160	9	Intergenic	novelGene_62152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	454	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTCATCCTTGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528173	521684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_521769_522677_522844_523482_523623_524835_525023_525635_525797_526475_526577_526847_526946_527457_527578_528070
525283	contig_7963_pilon	+	2323	5	Intergenic	novelGene_58286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1530	1865	39310	40190	TRUE	35	ATGAACCAAAACTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEDTHSKGDESQHKPPNSGQHFVFGRIRLCLPLHGDRTIQAGVLHMAGIDIALLGGHFQHHQDLEGPVSIMDQIGGHNPSCFFMSIPEPPDLNAAWIEICHMADKQVVVL	37066	48932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284_39405_39949_40226_43586_43819_48741
525284	contig_10923_pilon	+	1789	9	Intergenic	novelGene_66212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_8	510.337128156477	4598	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	19	1671	21667	42718	FALSE	10	CTTGTAGGTAGCTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	21648	42836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
525285	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_9440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525286	contig_2100_pilon	-	1714	11	Intergenic	novelGene_50725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	920.212714539416	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	232	1131	1180199	1173168	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQA	1180708	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173167_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1180563
525287	contig_1076_pilon	-	2150	16	Intergenic	novelGene_101088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_13	331.181360184014	1700	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	422	1918	73886	50922	FALSE	10	GGCAGTTTTGTGACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMNSRVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	79708	50689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_73869_73997_75351_75429_79474
525288	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	10	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525291	contig_6361_pilon	-	608	4	Intergenic	novelGene_23990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	146	322	419537	415399	TRUE	15	ACTGTGCTTCTTTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	420962	410933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
525292	contig_16703_pilon	+	2595	6	Intergenic	novelGene_72767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_5	1288.40133498844	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	1582	2478	20022	33056	FALSE	60	AAAAAAAAAAGAGTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGKLLWLLSSILGK	18440	33173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822
525294	contig_14621_pilon	-	2221	17	Intergenic	novelGene_105859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.665831336995	29	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	35	1930	463759	396356	FALSE	25	TTTCTATTATGAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGPCGRHALESGPSPAEGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	463793	396064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405243_407293_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463704
525295	contig_8330_pilon	-	1971	12	Intergenic	novelGene_71790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	1654	1971	853109	837482	FALSE	30	GGGGAGGGAAGAAAGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTSPLQKGRSCSAVPWKLYLAIHSVPDGQAACIADIFSGGDPCACVTGRLTCHFGTIRLSGRCGPSHLTAGGISGLRDEVWVWKEEEEGRPDRGKGMDGRAARV	857807	837481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837559_837619_837681_852605_852685_853008_853124_853232_853347_853836_854058_854993_855090_855283_855329_856232_856271_856362_856558_856665_856755_856966
525296	contig_2367_pilon	-	1478	2	Intergenic	novelGene_65316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1347	junction_1	0	70	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTAAGTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208634	192222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552
525297	contig_4857_pilon	-	2675	6	Intergenic	novelGene_48635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	88.0272685024362	467	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	461	1075	448153	441598	FALSE	35	TTTATTGATGATTACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVNDPLLFIKDIKPGLKNLNVVFIVLEIGRVTKTKDGHEVRSCKVADKTGSITISVWDEIGGLIQPGDIIRLTRGYASMWKGCLTLYTGRGGELQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448613	439997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444997_445070_447620_447760_448062
525298	contig_2940_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_81996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTGGAAAGAAAAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151340	1149199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1149200_1151300
525299	contig_15063_pilon	+	1484	5	Intergenic	novelGene_12230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	40	TTGTATGTTTATAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525300	contig_13021_pilon	+	1639	8	Intergenic	novelGene_8165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2358.09600642345	45	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	169	1011	174676	180525	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQILCRQKGWIQYL	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177520_180486
525303	contig_15047_pilon	+	1678	6	Intergenic	novelGene_52167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	2	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	25	648	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2169	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
525304	contig_3948_pilon	-	1901	12	Intergenic	novelGene_53313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_5	439.725421463203	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	222	1580	1494311	1468245	FALSE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKTTYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510986	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
525306	contig_10354_pilon	+	1940	4	Intergenic	novelGene_50852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	385.836177095352	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	160	765	432370	475314	FALSE	30	TCCATTCATATAGTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432210	476489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_434101_434164_471873_472041_475056
525307	contig_6102_pilon	+	125	1	Intergenic	novelGene_32363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGTTTTTCTTTCCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714249	1714374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1714200_1714400
525308	contig_2933_pilon	-	3030	5	Intergenic	novelGene_111314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	465	947	336463	333419	TRUE	65	AAAAAAAAACCCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRGGWRSLESVWTQGAIASQLVLVHPDSLALLLADLLLDDTKQFLHAAPHVGLHCGIQTRQRLQLLLFQPAQAQELLLRLWPGKQLPEPLDVLLRHSDEEYDGVDLGLDQVSCAADPGLQQTVLVLGGHGLDVGGNDAFESVWVLLSGVDDGLSLLLP	336927	329524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_331403_332889_333068_333391_333519_334386_334503_336196
525312	contig_8447_pilon	+	2714	2	Intergenic	novelGene_69425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCAAAGTTAACTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81659	84432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82448_82506
525313	contig_10904_pilon	-	2765	10	Intergenic	novelGene_22523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	371.507439734089	37	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	201	995	354975	352112	TRUE	10	CCTCCAGCTGTGTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362580	347414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348254_348347_348716_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_354962_354999_362403
525314	contig_3077_pilon	-	1623	9	Intergenic	novelGene_26598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAGATCTGAGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18078	9529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9705_11258_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_17447_17632_17672
525315	contig_10940_pilon	-	2249	3	Intergenic	novelGene_49261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2181	junction_2	39	6	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1245	1625	875054	874674	FALSE	25	TTTTCTTTTTCCAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917130	874049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664
525316	contig_7202_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_17488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27944	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
525317	contig_16098_pilon	-	1588	9	Intergenic	novelGene_46144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_8	1942.84842435019	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	132	1388	459176	456273	FALSE	15	TGAAGGGGGAGTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	459307	456072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459035
525318	contig_13528_pilon	-	2715	12	Intergenic	novelGene_66874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	226.69716210351	250	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	219	980	67895	47592	TRUE	65	AAATAAAAAGTTTTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMM	68113	39861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43268_43404_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
525319	contig_500_pilon	+	1988	9	Intergenic	novelGene_31072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_7	904.238871924891	6	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	601	1578	1492663	1498065	TRUE	10	GGGCATGTTTGACTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1492062	1499584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
525322	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_14110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	188	1360	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34620	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525324	SIRV6	+	1050	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	413	727	2021	10736	TRUE	25	GTTAAGTAATTGGCATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525325	contig_1532_pilon	-	1980	8	Intergenic	novelGene_37423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1223.85184844358	5	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	70	879	32217	13471	FALSE	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQVQISMK	34930	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13474_15714_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
525327	contig_753_pilon	+	2827	1	Intergenic	novelGene_112988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	497	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTTATAGCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211523	1214350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1211500_1214400
525328	contig_9988_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_113060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGGACCATATACAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118899	119350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_118900_119400
525329	contig_8273_pilon	-	3372	15	Intergenic	novelGene_113075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_7	122.529296788273	733	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	124	1626	109068	74587	FALSE	15	AATGCTGCTACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSRQVTCVSWVRCGVAKETPDKVELSKEEVKRLITEAKEKLQEEGGSDEEETGDPSEVGMQSARTQARPREPLDDGDPEDNRTLDDDELAEYDLDKYDDDGDPDAETLGESLLGLTVYGSNDQDPYVTLKDTEQYEREDFLIKPNDNLIVCGRAEQDQCNLEVHVYNQEEDSFYVHHDILLSAYPLSVEWLNFDPSPDDSTGNYIAVGNMTPVIEVWDLDIVDSLEPVFTLGSKLSKKKKKKGKKSSSAEAHTDAVLDLSWNKLIRNVLASASADNTVILWDMSLGKPAASLAVHTDKVQTLQFHPFEAQTLISGSYDKSVALYDCRSPDESRRMWRFSGQIERVTWNHFSPCHFLASTDDGFVYNLDARSDKPIFTLNAHNDEISGLDLSSQIKGCLVTASADKYVKIWDILGDRPSLVHSRDMKMGVLFCSSCCPDLPFIYAFGGQKEGLRVWDISTVSSVNEAFGRRERLVLGNTRSSSISGPFGSRSSDTPMES	109191	72840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_74697_75644_75751_77137_77260_77351_77443_79141_79254_80551_80614_81309_81407_94043_94106_94894_95026_96088_96200_100983_101081_101570_101657_105590_105776_105910_105970_108996
525330	contig_1146_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_84849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	223.870855628865	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	53	577	939880	944381	TRUE	15	GTGTCCTACTTTCTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	939827	945958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262_945160_945364
525332	contig_7202_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_18674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
525333	contig_13097_pilon	+	2151	17	Intergenic	novelGene_107697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_7	521.322113566795	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	234	1931	184733	264394	FALSE	40	GAATATGAATGAGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184499	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
525334	contig_5643_pilon	+	1772	14	Intergenic	novelGene_39074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	725.496385874637	18	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	600	1043	634983	636453	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTVEPVARPR	631249	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636259_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640468_641433
525335	contig_12270_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_113216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14066	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
525336	contig_15063_pilon	+	1630	6	Intergenic	novelGene_14140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	171	1406	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34637	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525338	contig_11720_pilon	+	1708	13	Intergenic	novelGene_43947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	357.146211889006	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	13	1452	262271	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTLICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270121_271838_271961_272096
525339	contig_6677_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_114216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCAAGTCTTCCTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605868	603402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_603400_605900
525340	contig_12802_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_114262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGGAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266489	268526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_266500_268500
525341	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_9317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525342	contig_10734_pilon	-	2030	5	Intergenic	novelGene_51004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	95	700	320632	311551	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320726	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310840_310906_311676_315844_315953_318838_319032_320452
525343	contig_11832_pilon	-	2799	8	Intergenic	novelGene_106934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_7	932.603334538236	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	77	610	88105	86477	TRUE	10	GCATGAGTGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSGRKWGLGKGLGEGSYRRSGSVQGHVGPPALKEFTLFQNDLWGPRVYCYGEGCT	88181	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081
525344	contig_5799_pilon	+	3372	10	Intergenic	novelGene_50303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_9	211.559290349853	198	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	11	1321	561019	668285	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGAVSAAPECRLLPYALHKWSSFSSTYLPENILVDKPNDQSSRWSSESNYPPQYLILKLERPAIVQNITFGKYEKTHVCNLKKFKVFGGMNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQVWCTDKYVVEIISAQQLLVSGFISDVMLSCMLLVSTVNNLWQILE	561008	670336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934
525345	contig_10904_pilon	-	2555	9	Intergenic	novelGene_22519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	349.922290480329	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	530	850	354084	352112	TRUE	30	ACTCCCAGGAAGCCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362532	346222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_348863_349922_350113_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354657_354852_354962_354999_362403
525346	contig_7293_pilon	+	2311	2	Intergenic	novelGene_54230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1129	junction_1	0	65	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAATGCTTCTCCTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220431	223664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220575_221496
525347	contig_6589_pilon	-	2796	2	Intergenic	novelGene_26289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	0	530	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	154	1704	2274715	2273165	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290251	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274793_2290175
525348	SIRV6	+	484	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10333	9	1096	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11333	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
525349	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525352	contig_3077_pilon	+	1425	8	Intergenic	novelGene_26727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	3728.27117017624	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	214	927	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10114	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
525356	contig_6102_pilon	+	2600	19	Intergenic	novelGene_31868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	566.917713997759	23	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	44	2203	370803	394867	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQVGKLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYFLLCLYLVLLSCQLPRAFCTCAWPLAALAVASAYAKYSF	370759	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373488_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379711_394747
525357	contig_6101_pilon	+	1725	3	Intergenic	novelGene_114268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	3.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	248	721	67736	70669	FALSE	10	TCTTGTTTCCGTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLRCFGCAVIEDTWHYFLHRLLHHRRIYKYIHKIHHEFQAPFGMEAEYAHPLETLILGTGFFIGIVLLCDHVILLWAWVTVRLIETIDVHSGYDIPLNPLNLIPFYAGSRHHDFHHMNFIGNYASTFTWWDRIFGTDSQFNAYTEKMKKLEKKTE	67488	71673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_67859_68678_68834_70473
525360	contig_5485_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_37699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1391	1888	85988	85491	NA	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	87378	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_84700_87400
525362	contig_15063_pilon	+	1290	4	Intergenic	novelGene_14288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525364	contig_9843_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_114325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95658	97893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_95700_97900
525366	contig_8020_pilon	-	4082	1	Intergenic	novelGene_114433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCCAGGTTACGAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290370	286288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_286300_290400
525367	scaffold_12124_pilon	+	1884	11	Intergenic	novelGene_22036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	510.160572761165	14	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	188	1165	836073	857868	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVVLMLIFSRNSVRQTLFLPIPQVKSLLTPNAEIAWEGNHQPPDTQEPEFLIVEEMG	829557	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847611_854714_854804_857165_857236_857793_857936_858329
525369	contig_12115_pilon	+	1649	2	Intergenic	novelGene_114470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATTGATTCTGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46200	48290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12115_pilon_+_47029_47469
525371	contig_3077_pilon	+	1756	9	Intergenic	novelGene_26642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3881.37916854306	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	113	1138	9719	17462	FALSE	20	TAACAGTGTGCGGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEPLACSLHRSVTSSAKPQSTDSLASRSPTPPRATSGWGTMTRKVSKARCST	9606	18080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16349_16913_17054_17449
525372	contig_500_pilon	+	1500	10	Intergenic	novelGene_30993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	764.714148159338	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACTGCTTCAAAATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485750	1499544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492755_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
525373	contig_5499_pilon	+	2439	11	Intergenic	novelGene_57007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	270.650346388103	16	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	160	1197	816585	840037	FALSE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803402	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803473_809576_809635_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
525374	contig_10399_pilon	+	3497	11	Intergenic	novelGene_114491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	111.406507888902	582	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	59	1336	350005	370791	FALSE	55	AATTTAAATAAAACCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAEGSAGRQSELEPVVSLVDVLEEDEELENEACAVLGGSDSEKCSYSQGSVKRQALYACSTCTPEGKEPAGICLACSYECHGSHKLFELYTKRNFRCDCGNSKFKNLECKLFPDKAKVNSGNKYNDNFFGLYCICKRPYPDPEDEIPDEMIQCVVCEDWFHGRHLGASPPESGDFQEMVCQACMKRCSFLWAYAARLAVTKISAEDDGLVLNVDGKGDQEVIKTENGDHQDSILKEDVPERGKDAIKDIKAEQTSEPCTSSSSESDLQTAFKNQSLNTESQSGCKFQELKAKQFIKKDTATYWPLNWRSKLCTCKDCMKMYGDLDVLFLTDEYDTVLAYENKGRIDQASDRRDPLMDTLNSMNRVQQVELICEYNDLKTELKDYLKRFADEGTVVKREDIQQFFEEFQSKKRRRVDGMQYYCS	349946	372952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_350155_352534_352669_353146_353208_354087_354184_360424_360479_360706_360813_362055_362265_362422_362573_363084_363248_364274_364337_370698
525375	contig_10531_pilon	-	2480	5	Intergenic	novelGene_114514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	51.8579791353269	660	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	29	580	390805	381292	FALSE	45	AAATAAAGTTGGCATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEEGTALWRLQKLPADLGPQLLHKIIDGICGRAYPLYQNYHSVWDSTEWIHVLEDITTFFKVIVGKNLSDEEISQQLNQLNSFHQEAIMKCLKSRKDDIRQALLGEIVDISSAQLQNFDWQLKLALSSDKIATLQMPLLNLHLDVKENGEVKPYSVEMSKEELQNLINSLEAANKVVLQLK	390833	379391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_381313_382393_382550_386747_386901_388812_388969_390739
525376	contig_3095_pilon	-	1207	6	Intergenic	novelGene_75225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	1793	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	68	865	255481	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255548	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
525377	SIRV6	+	458	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10363	5	1126	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11363	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
525378	contig_14637_pilon	-	2484	8	Intergenic	novelGene_114552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	223.20513124085	468	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	80	700	391450	363936	TRUE	20	GATGCGTTTGTGTAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAVLAGKGLRGGAGRPAGSERSRVRMDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLAIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFLKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESENQTKGVKLSHREEGHDGGACGGYCSVV	391529	362095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_363385_363440_364112_369328_369396_369469_369589_371424_371498_377829_377892_389892_389949_391382
525379	contig_5338_pilon	+	2680	6	Intergenic	novelGene_114579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	102.17514374837	575	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	400	750	386732	387258	FALSE	15	CCCAATTTGTGGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLDPLFECVTTLAGAQQKLLNMKLQTVHQLLQENKQDKGVEVPEPEASTPFPEDLCIEETGDSQAWEEPINWSTETWNLATAWEVEQGLRRRSSMAVAKGPSHGSSWEGRRDSS	384897	389188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_385022_385110_385263_386519_386581_386669_386761_386856_386970_387049
525380	contig_6375_pilon	+	2413	7	Intergenic	novelGene_72929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.266574862278	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	163	975	22432	28930	FALSE	30	AAACTGCTGGCAGTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16552	30368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16580_19403_19435_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
525381	contig_15063_pilon	+	1609	6	Intergenic	novelGene_14194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	121	1356	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34687	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525383	contig_7569_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_114595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATAGGTCCCAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125690	128256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_127932_128194
525384	contig_19721_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_99155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	670	2013	73	2085	148734	146722	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRKLISATDTQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHRNILSASSTYFHQLFAVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDELIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGSTQDGNAETLPPGSNDKSLEIQKSKDEAQDNGTTIMPIITESFSLSAEDYETKKIIVTDSDDDDDDDVIFCSEILPAKETLPNNNAQVHANPGSVAISDVAPCASNNSSPLTNTTPTQKLPTSMSQVTLSQTQGSEKVLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLTTPPNVSSSLPNHMAPSINILVQNQQPPNSAVLTGNEANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAVSNTSLVPQADVPQNTTFDGSLIQKMPIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTNDPGVGSKHLTEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKDDPDEGEARLENDVPKTSGSEMTNKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCKRSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRYQCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYSYLSDRSSTMPVMKDDGIGYKVDAGKEPPVGTTSTQNKPMTWDDIFNQQENDSIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY	148806	146477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_146500_148800
525385	contig_6215_pilon	+	2855	10	Intergenic	novelGene_21218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACCCCGACAAAATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226761	243052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228367_229714_229951_230071_230215_231669_231760_231861_232035_233716_233854_234069_234147_235190_235361_238588_238755_242994
525386	contig_17936_pilon	-	2064	10	Intergenic	novelGene_29938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	486	785	126099	118792	TRUE	30	AACGGGAGCTACCGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVNFLLFVSFQSL	126584	50606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_50688_68289_68390_79102_79298_90971_91159_95140_95305_106374_106471_110996_111173_114805_114934_118639_118826_125833
525387	contig_9345_pilon	+	2890	23	Intergenic	novelGene_24545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	45	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1861	2700	727005	729870	TRUE	40	AAACTTTAAGGCCAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAHSGHVIRNSREDRDTSAVSSHGGSMWSPCMPGPWMHAHLGITKVEIDSFSMSNVKDSIGLWWEPGTHLSPRDLQVLLQQIHGVWGGHIAWRLVIFTWLVELECLSPELLHQGQSLASSHTVLHHILCFPPVCCFWPSLHSHLGFLVQIRLRLGTQKVEDLHIHFVLDHFAISPLEYSPCLSHQQPHVEMVPFHQELGLVPIYGSLHSLFNLLWSHHDVHTTFLLKVHGVNGVQGVTSHILKGSAQLGLGVDLLIGDVAHEKGQTPGILESGGQAI	723451	730180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_723603_723989_724118_724194_724264_724354_724480_724616_724708_724885_724994_725133_725276_725366_725456_725542_725682_725809_725905_726000_726131_726228_726338_726420_726492_726591_727215_727390_727483_727603_727671_728011_728072_728208_728267_728797_728864_729087_729162_729313_729427_729770_729921_730040
525388	contig_12301_pilon	+	2012	9	Intergenic	novelGene_110021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1587	1952	116142	136726	FALSE	10	TCGTCCCAATTCCCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFATLSRLKGTAFSKGYEMMLLEGRASLSTPFTITITVARGRRNKFPTASPGQERSSFTEKPMDKAATSGIRSPGIGQFPSRKTTDPGDLNILNSFPKTPATNKDRNTSTAMVPRRPQQR	102019	136786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114926_115788_115929_116083_116179_129131_129264_130604_130734_136658
525389	contig_12635_pilon	-	2418	11	Intergenic	novelGene_60806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_10	410.045168243695	858	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	148	1440	252849	180251	FALSE	50	CAAGAATATGAACAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLKFSAFVSNISFVAFPAPNTNSPTKILPKTLGPINVNVGPQMIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	252996	179272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_252818
525391	contig_12790_pilon	+	2005	9	Intergenic	novelGene_35236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	279.775803099553	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	206	937	307252	311960	TRUE	15	TAAGGGGTGTGGCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAPGAVRVAADKCGWEGVPAQ	305938	313342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311898_312035_312348
525393	contig_177_pilon	-	2520	3	Intergenic	novelGene_41807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1437	1760	418661	418338	TRUE	40	GCTGTGAAAACAGGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHNLEETMSKLLANEGIDDGVEAAVEEAQNLGNIQSPANVTAALTGLLDYPNPHEGICNQNQVVGQPAEQEDEHDGKDDPHGLVLLPHVGLEQCAQGESIAEQHD	420204	415636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_415705_417645_418790_418896
525395	contig_3095_pilon	+	1195	6	Intergenic	novelGene_74976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2979.94225447407	11	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	73	636	147241	151002	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNSSCPGKTTFSASSTISPSCPQWTSSMTARWITGVSTSRSSSTGS	147168	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150515_150566_150696_150996_151163_151848
525396	contig_987_pilon	+	2169	10	Intergenic	novelGene_72302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	412.661760277181	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	1172	1996	956443	967663	TRUE	40	AATTCACTTTTTAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD	950251	968496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_951407_956426_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_967656_967694_968353
525397	SIRV6	+	807	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	423	580	207	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	117	608	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1510	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525398	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_12247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	212	1384	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27559	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525400	SIRV4	+	1546	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	269	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
525401	contig_7457_pilon	-	2557	6	Intergenic	novelGene_31418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_5	151.760337374427	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAGCATTGCTCCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472768	468239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_472533_472730
525403	contig_7816_pilon	+	2106	14	Intergenic	novelGene_66480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1006.13863197154	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	924	2000	195803	211658	FALSE	35	ATGAATTGTCCCCAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170044	211764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194974_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
525405	SIRV6	+	549	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	222	106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	21	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGAGTCAATGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10726_10819_11031_11109_11205
525407	SIRV6	+	804	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	28	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	122	454	1673	2560	TRUE	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1165	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
525408	contig_6102_pilon	-	1843	8	Intergenic	novelGene_32114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	382.320305930159	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	745	1683	819997	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820391_820920_821216_822068
525410	contig_500_pilon	+	1535	10	Intergenic	novelGene_30967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	543.982865561675	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	160	1236	1452342	1480676	FALSE	0	TGTTTTTGGTTTTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTGTVPVKIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446851	1480975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452370_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
525412	contig_5189_pilon	-	1909	8	Intergenic	novelGene_34833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.65900708742	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	111	854	244235	199152	FALSE	10	CTCTAATGTTTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYATPKRIMKKLDLAFVVTIQCLESCRKIDFIVIGVREVRRENLSDCLFCLDDWF	247751	198096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199318_218623_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
525413	contig_18156_pilon	+	2491	17	Intergenic	novelGene_101441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	113.266399888714	731	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	90	2357	7355	64324	FALSE	45	GAAATTCTGAACAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAAISSCSGPGRARRFRCRPLRTSLGCRLMPSPRLALLRVAGNALLLSLTSPLLPRPQSQPPLLSRRPLSTPARPRTSFSAVPSRSSMDGVGAEEVLAPLRLAVRQQGDLVRKLKEDKAPQVDVDKAVAELKARKRVLEAKELALQPQDDIIDRAKMEDTLKRRFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHVDKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQLDNYGQQELGDLFVNYNVKSPTTGNDLSPPVPFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFSQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7265	64458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23501_23893_23971_29472_29619_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
525414	contig_12427_pilon	-	2079	7	Intergenic	novelGene_40526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	178	801	522337	506035	TRUE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578129	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505911_505993_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
525415	contig_854_pilon	+	1460	7	Intergenic	novelGene_36217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2810.57461503278	19	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	211	657	556108	562402	TRUE	10	CGGTGTCATCAGGGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPLLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543480	563830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543607_545929_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
525416	contig_1225_pilon	+	2197	4	Intergenic	novelGene_44193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	91	357	253442	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGFALAVPGWKDPGPGRGLRSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251438	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_275781_276325
525417	SIRV4	+	294	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	678	976	-46	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTAATTTGCACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
525418	contig_15063_pilon	-	1489	4	Intergenic	novelGene_13158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	775	1098	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36774	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34926_35035_35380_35839_36156_36264
525419	contig_6533_pilon	+	2502	1	Intergenic	novelGene_114647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAACCTTGTACATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147648	150150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_147600_150200
525420	contig_3956_pilon	+	1929	11	Intergenic	novelGene_15115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1539.09369760259	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	75	731	1281682	1284761	TRUE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVWPPRLGLHPEAVC	1281607	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284716_1284855_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287382_1290563
525421	scaffold_9100_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_83292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654263	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_654300_654800
525422	contig_15063_pilon	-	1497	4	Intergenic	novelGene_13184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36781	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
525423	contig_513_pilon	-	1947	9	Intergenic	novelGene_80167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	414.132659150422	235	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	144	1262	453421	449687	FALSE	35	CCATGAAGCTGCAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454715	449001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450850_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
525424	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525425	contig_10732_pilon	+	2189	6	Intergenic	novelGene_114714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.56279357253	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	687	1166	136273	140061	TRUE	25	TTCCTTGAGTTAATACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVCHGPRVPSVPCPLAPLEKSALCVVGPREAWRLLSSVLSACSAGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEEWIKCIKSGGTWRTGKNLA	134941	143554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_134975_135619_136486_138573_138646_139287_139443_140021_140146_142615
525427	contig_6710_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_98283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	15	AGGCATCCATGTCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
525429	contig_12644_pilon	+	1349	9	Intergenic	novelGene_44681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_8	3972.40007544243	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	272	1261	2678055	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677231	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
525430	contig_12790_pilon	+	2026	10	Intergenic	novelGene_35227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	270.231633608038	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	210	896	307252	311077	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMRESPSLAKMLRARPRGSHVGIPAPIPSPMDSAAPPCLMTTAATQLRATWGRTWRWNGPSLQRSHRVLSVALSLTGASQWKSCLTAPVICTTSRCRPCPPPLKLQQMRTRRGNYLRTS	305934	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309725_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
525431	contig_12951_pilon	+	2486	6	Intergenic	novelGene_68145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	250.27776569244	687	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	17	709	185318	198423	FALSE	35	CTGGTAAGCAGTAATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGSKMAAQQQAVEGDAQLAGPAAAAEVDPLGRFTCPVCLEVYEKPVQVPCGHVFCSACLQECLKPKKPVCGVCRSALAPGVRAVELERQIESTETSCHGCCKNFFLSKIRAHVATCSKYQNYIMEGVKATTKDASLQPRNIPNRYTFPCPYCPEKNFDQEGLVEHCRLFHSTDTKSVVCPICASMPWGDPNYRSANFIEHIQRRHQFSYDTFVDYDVDEEDMMNQVLQRSIMDQ	185301	200200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_185464_191449_191601_193116_193224_193596_193712_196924_197033_198357
525432	contig_16724_pilon	-	1805	9	Intergenic	novelGene_105295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	784.241831325007	1591	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	321	1070	569099	541872	FALSE	20	TGTTTGTGTACCGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575975	541136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
525433	contig_15087_pilon	+	2276	4	Intergenic	novelGene_37259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1353.78046800637	1	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCCGTCATCTCATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284567	303627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289418_301278_301421_301788
525434	contig_6735_pilon	-	1566	10	Intergenic	novelGene_15674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	988.917714935666	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	232	1086	545923	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568242	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546586_564157_564232_564784_564869_568198
525435	contig_2100_pilon	-	1698	12	Intergenic	novelGene_50738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	939.998918585627	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	118	741	1182812	1174387	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDPGAA	1185528	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171984_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175621_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
525436	contig_18592_pilon	-	1122	2	Intergenic	novelGene_114771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTGTATGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8217	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1661_7438
525439	contig_4812_pilon	+	3868	10	Intergenic	novelGene_103685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	50	junction_1	97.2478061576154	498	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	111	986	196969	211305	FALSE	15	TGTTTGGTGGTTATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALNWKPFVYGGLASITAECGTFPIDLTKTRLQIQGQTHDAKLKEMRYRGMLHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSLKRLFVERPEDETLLINVVCGILSGVISSAIANPTDVLKIRMQAQSSTIQGGMIGNFVNIYQQEGTRGLWKGVSLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYTHFLSSFTCGLAGALASNPVDVVRTRMMNQRVLRDGSRSGPTGTLDCLLQTWKNEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFVTYEQLKKLDL	187749	214187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_187804_196912_197033_198675_198824_202849_202945_203859_203946_205876_205973_206700_206826_208104_208244_210240_210322_211263
525440	contig_12950_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_114791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	875	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGTGGGTCTCATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106791	104398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_104621_104682
525441	contig_3627_pilon	+	2666	17	Intergenic	novelGene_78477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	170.318405860905	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	367	2451	437223	483447	FALSE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEPRNFIPRGVWLCLRGFPDYTPCVLYHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD	432297	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_436894_437002_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_447750_447826_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
525442	contig_6735_pilon	-	1683	13	Intergenic	novelGene_15721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	86	1477	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDLTGCHELPEVLGRLPSPIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542387_543104_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
525443	contig_16724_pilon	-	1947	10	Intergenic	novelGene_105294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	774.317046750805	1538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	304	1212	569099	541872	FALSE	20	TGTTTGTGTACCGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIGTPSPQQARVCPPRTLPDDGANLSSVRGILSLIQSSTRRAYQQILDVLDENHSVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575958	541136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_553367_553527_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
525444	SIRV4	+	434	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	67	449	67	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
525446	contig_5050_pilon	-	2319	11	Intergenic	novelGene_110281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	215.213289552481	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	25	831	716384	635997	TRUE	70	CTAAAAAAAAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIATQSWLPPLLWTTAGVC	716408	547248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636050_636104_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
525447	contig_11720_pilon	-	1989	2	Intergenic	novelGene_43763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	600	junction_1	0	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	67	1143	16869	15793	FALSE	25	ATATTGGCCCTTCTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKHHLVKFICLGIWVLSLILSLPFFLFRQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18335	14946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16878_18277
525448	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	17	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	884	1372	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35032_35392_35858_36158_36266
525449	SIRV4	+	1564	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	50	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTATATTGTAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
525451	contig_12414_pilon	+	2533	16	Intergenic	novelGene_59634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	363.060301082647	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	839	1894	661576	691069	TRUE	10	GTTTTATACTTGTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPARHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGVRGLRALGVRDLSYRLVFLACSVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDIRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPVGGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEDSIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKRLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEESLLKAGFL	655680	696304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_679840_679949_681136_681293_683109_683239_684738_684901_690260_690355_691040_691123_693031_693172_695858
525452	SIRV6	+	610	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	192	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2737_2829_3106
525453	contig_8045_pilon	+	1466	4	Intergenic	novelGene_35360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	541.917787942866	13	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117513_118075_118243_118527
525454	SIRV6	+	889	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	224	18	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
525455	contig_15063_pilon	+	1426	4	Intergenic	novelGene_14185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3061.70544341258	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	127	972	34808	36333	FALSE	45	AAATATCAGTTCACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34681	36787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36268
525456	SIRV6	+	1419	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	393	-2	177	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	217	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	147	638	1733	10736	TRUE	35	GAAGACCGGGAGTATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1480	11827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525457	contig_16036_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_114801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	423	824	12503	12102	NA	25	ACCACCACTGACTGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCWWECKMIQPFWKMIWLFLRKLEIDIPFDLAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	12925	11595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_-_11600_12900
525458	contig_5039_pilon	+	2458	11	Intergenic	novelGene_65005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	57.9869812975292	738	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	192	1880	1703196	1717980	FALSE	15	ATTTCCCAGGCAGTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPADSPRVKVRNLMESMQINRSVLENSSLENHVSVQPPRARVAVLISGTGSNLQALIDSTREPHSSARVVVVISNKAAVAGLDKAETAGIPTRVINHKLYKSRVEFDNAVDQVLEEFSTDIVCLAGFMRILSGPFVRKWNGRMLNIHPSLLPSFKGANAHEQALEAGVAVTGCTVHFVAEDVDAGQIILQEAVPVKRGDSVATLSERVKTAEHKIFPAALQLVASGAVQLGENGKICWVKKE	1703004	1718558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1703245_1703623_1703734_1704337_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710831_1712083_1712222_1713013_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
525459	contig_5302_pilon	+	1817	9	Intergenic	novelGene_81477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	241.632986158761	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	579	968	328325	337399	FALSE	5	CTCATCCTTCTTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306690	338248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_308086_308198_318283_318354_318938_318989_319808_319962_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
525460	contig_3975_pilon	-	2704	9	Intergenic	novelGene_54917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	313	junction_7	97.1014289287238	1804	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	129	1226	2262603	2243449	TRUE	20	TGTGATGAATTGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRDDPAARMSRSSGRSGSMDPSGAHPSVRQTPSRQPPLPHRSRGGGGGSRGGARASPATQPPPLLPPSATGPDATVGPAPTPLLPPSATASVKMEPENKYLPELMAEKDSLDPSFTHAMQLLTAEIEKIQKGDSKKDDEENYLDLFSHKNMKLKERVLIPVKQYPKFNFVGKILGPQGNTIKRLQEETGAKISVLGKGSMRDKAKEEELRKGGDPKYAHLNMDLHVFIEVFGPPCEAYALMAHAMEEVKKFLVPDMMDDICQEQFLELSYLNGVPEPTRGRGVPARRPRSCASSSTCSQGPRCWTTSGGFGAWYTRERNHHQRYHCDSRSATPTYCEGCSNTKSTDSRHPENTSASTPCTRNI	2262731	2237760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2239105_2241779_2241839_2242857_2242926_2243441_2243644_2244129_2244265_2249073_2249221_2250407_2250525_2251915_2252041_2262224
525461	contig_8050_pilon	+	2894	1	Intergenic	novelGene_114820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAATGGACTCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293937	296831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_293900_296800
525462	contig_5018_pilon	+	1797	10	Intergenic	novelGene_47066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1377	1718	1401408	1402786	FALSE	5	GACGCCGTCGGCGGCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLAEGLESRRQGVEAGVLARLQPFIFLLVTIELARTQNEFAKIRLVFGFDPAVGPPISVQKLLLEVHDGLSGGQAEKAEQQRHG	1399084	1402865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399842_1399928_1400029_1400626_1400763_1400850_1400972_1401057_1401262_1401349_1401445_1401872_1401927_1402013_1402077_1402259_1402363_1402701
525463	contig_15039_pilon	-	1999	10	Intergenic	novelGene_110130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_7	474.264811166832	1293	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	497	1225	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260912	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198673_200448_200620_201176_201237_208401_208526_222093_222255_260778
525464	SIRV6	+	481	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10326	19	1089	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11326	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
525465	contig_4754_pilon	+	1800	13	Intergenic	novelGene_35961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	169.573054561547	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	522	1478	409328	420496	FALSE	15	TAGCTGGTTGTCTGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAFGCHSPCMV	380134	420818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415840_420462
525466	contig_6375_pilon	+	2486	7	Intergenic	novelGene_72936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.266574862278	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	239	1051	22432	28930	FALSE	30	TGAAAACTGCTGGCAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16566	30365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20763_20879_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
525467	contig_12250_pilon	-	3007	1	Intergenic	novelGene_80524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1409	1723	70545	70231	NA	20	GTCTCCAATGACCAGTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFIVFGFIFRSLIHFELVFVYGVRYGSCFIFLQMDIQFCQHHLLKRLSFPHLMDFGTLSKISDRRWMDLHLGLNSVLLVNVSIVVPVPGCFDYCGCIVSSEVR	71953	68946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_68900_72000
525468	contig_15021_pilon	-	2200	13	Intergenic	novelGene_26950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	438.116827075458	26	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	92	1366	269638	240581	FALSE	25	ACAAGTGGTTCTGATGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRRALGGSGARSIGAWSSVLRPVEETSLEMSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQALEASVNPDLSPATVLPQRHGPGRLCEPGPVTSPQTQMLPGIPDPSFLPLLPLLMVLQREAKSSDHFITHRLFQQFSVAISFIL	279851	239746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_240835_243763_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
525469	contig_10940_pilon	-	2051	4	Intergenic	novelGene_49236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	904.326760020342	21	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	144	482	917000	875605	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQTSSRVS	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875626_893147_893306_916664_916748_916923
525470	contig_5018_pilon	-	2661	14	Intergenic	novelGene_46946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	79.3358526442673	165	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	688	2013	312555	301750	FALSE	15	GCTACTGTAGCTTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	316171	301101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312666_312747_313051_315476_315595_316015
525471	contig_1154_pilon	+	2456	3	Intergenic	novelGene_87158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_1	152.5	1829	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	27	752	896007	901120	FALSE	10	TATTGTCCTGTGTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLVLIRHGESTWNLENRFSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGMYIFQRGSQGAIKQLPLIRDLLSTKTFRKGLDHIDSLSHSLD	895980	902824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900253_900808
525473	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_10970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525474	contig_10437_pilon	+	2145	5	Intergenic	novelGene_38156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	253.375585840467	16	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159599	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_159766_159886_160203_160732_160844_161549_161639_162628
525475	contig_1938_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_114887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAAAAGTAGATATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234724	234899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_+_234700_234900
525476	contig_3095_pilon	-	1055	6	Intergenic	novelGene_75226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1206.16274192167	32	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	80	403	255481	248638	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQNRFLSRPSQSPVVSE	255560	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248684_253624_253806_255384
525478	contig_500_pilon	-	3410	1	Intergenic	novelGene_30942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATTAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226810	1223400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1223400_1226800
525479	contig_9482_pilon	-	1766	11	Intergenic	novelGene_44300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	143.515992140249	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	321	1538	1244341	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLGMEPQEWLSWPEPCWRRQNSCWTAGSTPSGSPMAMSRPPASPLSTWTSSATAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253189	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241191_1242473_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
525480	contig_854_pilon	+	1185	5	Intergenic	novelGene_36310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_4	2469.91771117987	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1	417	556138	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	556137	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
525484	contig_2161_pilon	-	2118	3	Intergenic	novelGene_114966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3550.5	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCTGCTGTGTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066379	1059515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1061384_1063660_1063751_1066219
525486	contig_14882_pilon	-	2195	16	Intergenic	novelGene_115014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	315.370258585048	854	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	620	2095	317300	295835	FALSE	65	AAAAGTCAAAAAAATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363666	295734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317321_320747_320816_321327_321410_321539_321739_363416
525487	contig_8045_pilon	+	1302	5	Intergenic	novelGene_35354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1318.0192288051	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	27	611	116067	118722	FALSE	25	TTGAACACTTGAGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116040	119413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117292_117450_117513_118075_118243_118527
525488	contig_5780_pilon	+	2563	2	Intergenic	novelGene_29794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1652	2044	112782	113174	FALSE	45	CTAATTGCAGCAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMHHVHIPDGSWLDLLEPGSACRSQGPEDWCLWAQQGEREAASSRFGLCSPRSHGRTRVLLISFGAVVWFMRSDLMLDIPGNPVKELFPLQAFTESSFLLWLAPLNLVWPSFQTCQRTYLTRDGRAPGS	111011	113693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_111757_111875
525489	contig_10496_pilon	-	2764	8	Intergenic	novelGene_59432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_7	60.374342435258	247	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	1524	2312	187240	110723	FALSE	45	TCACAAAGGAAAGGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGLRCFRLAHPAFCNSLAALTRPVSEVTLKTMSGKQNDHRQYMAYPALPVRHFATKKAKAKGKGQSQTRVNINTTLVEDIINLEELDEEMKSVMEALKDNFNKTLNIRTSPGSLDHITVVTADGKLALNQIGQISMKSPQLILVNMSSFPECTAAAIKAIRESGMNLNPEVEGTLIRVPIPKVTREHREMLVKLAKQNTNKAKDSLRKIRTNAMNKLKKSKDKTSEDTLRLIEKQISQMADDTVAELDRHLAVKTKELLG	195346	110270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_110801_124523_124684_154723_154816_163846_163966_168841_168998_187056_187269_187903_189354_195301
525491	contig_5485_pilon	-	2063	5	Intergenic	novelGene_37678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.080902468334	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	156	1298	87935	85491	TRUE	5	CCTTGTGCTCTTTTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88090	84676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85226_85274_86133_86257_86366_86774_87027_87794
525492	contig_15063_pilon	+	1378	6	Intergenic	novelGene_12060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	219	1067	34808	36494	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27150	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
525493	SIRV6	+	770	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-17	548	-11	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
525494	contig_11292_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_109465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTGGGAGTGGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449360	451005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_449400_451000
525495	contig_15063_pilon	+	1819	7	Intergenic	novelGene_12085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3850.6135766481	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	342	1175	34808	36333	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	27429	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36277_36600_38975_39092_39506
525496	contig_10627_pilon	+	1960	10	Intergenic	novelGene_59944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_9	261.514393060454	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	20	1084	163333	166905	FALSE	15	ATTGGTGGTGCCCAGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	163313	167781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166775_166851
525497	contig_753_pilon	+	2896	15	Intergenic	novelGene_112882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_14	51.5403547064367	615	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	25	1785	218165	243501	FALSE	20	CTTTTGATGGGTAGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGAFWVKMDGHDLFRRLGAGAKFDVKRFSSDAARFQLGKRKRDFNSSEVLQGLDFFGNKKSVPGKYGASRTHQELQDEEKQEEKLIERKRKQNKKKRKMMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSIANVIQQAGCPVPEYIKGFKKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKYFLEKAKDKRKKVTG	218140	244612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_218252_219571_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236184_236308_236440_236592_236763_236840_237845_237918_238494_238588_243482
525498	contig_11338_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_6213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	1124	1579	13152	13607	NA	30	AGCTGAATTTAACCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKFCSTRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLS	12028	13609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_12000_13600
525499	contig_16685_pilon	+	2935	2	Intergenic	novelGene_115064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	613275	619280	FALSE	30	TTAACTGTTACATGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPAAILDFASNRARLPTPSFRCRAAKGLFNGPSLLESRHRGRVPIYGGEASSGLGHLLPRQDGSRLSCVVLSLPFRAAVCRLLPKPLSSVAPLLARGSAWSTNSASR	613274	621888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_613598_619276
525500	contig_14768_pilon	+	4308	22	Intergenic	novelGene_115082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	220.338154876388	44	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1113	3342	325	3666	227589	260928	FALSE	50	ATGTTGTAATAAAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPFDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEESGGDVKVESASPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDNKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPYRVAGLQMTLAELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGILEQVEAYQTEAREALASLPSSPGLLQSLLERGQRLGVEVPEDQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKARAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASLPLSPLWLPGCICPAHSSCLSNSCDSG	227264	261570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_227739_231589_231668_233935_234059_234352_234524_235056_235192_235913_236038_236145_236328_237318_237478_239520_239641_239772_239932_240841_241024_241121_241285_248693_248814_248923_249119_254073_254256_254343_254469_254594_254743_255362_255469_256182_256542_257164_257304_257843_257976_260838
525501	contig_16098_pilon	-	1392	9	Intergenic	novelGene_46101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_8	1935.67891432825	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	90	1184	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGYRGELGTGTGSDPAGCGAGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	459009	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_458941
525502	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525506	contig_1230_pilon	+	1964	9	Intergenic	novelGene_28828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1279.46040872705	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1016	1729	407256	408754	FALSE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406645_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
525507	contig_7357_pilon	-	2303	9	Intergenic	novelGene_36828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1772.98191174501	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	598	1464	154876	136424	FALSE	25	GCATTGCCTGTAACAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAPRTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167052	135584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154713_154861_155072_159911_160034_166772
525508	contig_19769_pilon	+	730	5	Intergenic	novelGene_102318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	241	696	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87326	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
525509	contig_15063_pilon	+	1444	4	Intergenic	novelGene_14187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	127	1302	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34681	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525512	SIRV6	+	466	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	9	1114	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
525514	contig_12644_pilon	-	1284	9	Intergenic	novelGene_44684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTAACATTTTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680629	2677292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
525518	contig_13900_pilon	+	3490	27	Intergenic	novelGene_115090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_20	44.3912306761904	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	943	2832	53	2884	9522	37953	FALSE	15	GATGTCTTTCTGGACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRGGLDCLTCGIRHHNMGLTKQYLRYVASAVFGLIGSQKGNVVFVTLRGEKGRYVAVPACEHVFIWDLRKGEKILILQGIKQEVTCLCPSPDGLHLAVGYEDGSIRIFSLLSGEGNVTFNGHKAAITTLKYDQLGGRLASGSKDTDIIVWDVINESGLYRLKGHKDAITQALFLREKNLLVTSGKDTLVKWWDLDTQHCFKTMVGHRTEVWGLVLVSEEKRLITGASDSELRAWDITYLQEIEDLEEPEPKKIKGLSLGLQDTHEAKDGTLELDEAPEDRIVSCRKAGSIMRGGRDRVVNLAVDKTGRILACHGTDSALEVFCILSKEEIQKKVDKKMKKARKKAKLNSCKGEEKDLEINVETGLQDEIQRVTNIKTSAKIKSFDLIHSPQGDLKAVFLLQNNLVELYSLNLSASTPQAVRTSRITIGGHRSDVRTLSFSSDNIAVLSAAADSIKIWNRSTLQCIRTMTCEYALCSFFVPGDRQVVIGTKTGKLQLYDLASGNLLETVDAHDGALWSMSLSPDQRGFVTGSADKSVKFWDFELVKDENSTQKRLSVQQTRTLQLDEDVLCVSYSPNQKLLAVSLLDCTVKIFYVDTLKFFLSLYGHKLPVLCMDISYDGALIATGSADRNVKIWGLDFGDCHKSLFAHDDSVMYLQFVPKSRLFFTAGKDRKIKQWDADKFEHIQTLEGHHQEIWCLAVSPSGDYVVSASHDKSLRLWERTREPLILEEEREMQREAEYEESVAKEDQPAVPGETQGENYFTGKKTIETVKAAERIMEAIELYREETAKMKEHKAICKAAGKEVPRPINPILMAYGNISPSAYVLEIFKGIKSSELEESLLVLPFSYVPDVLKLFNEFIQQGFDVELLCRCLFFLLRIHFGQITSNQMLVPVIEKLKETTISKVSQVRDVIGFNMAGLDYLKRECEAKSEVMFFADAASNLEEKKRKRKKREKLILTLT	7555	38559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_+_7576_9489_9693_10805_11016_14101_14221_15914_15994_16882_16979_17882_17997_18193_18296_18749_18848_19734_19843_20370_20602_23462_23557_26304_26407_27699_27786_28458_28595_29340_29398_30464_30566_30797_30910_31040_31176_31449_31501_32035_32102_32603_32697_33190_33239_33947_33992_35828_35958_37442_37537_37797
525521	SIRV6	+	627	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8551	4	240	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATGGGACTAGTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
525522	contig_14526_pilon	+	3455	1	Intergenic	novelGene_111215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355538	358993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_355500_359000
525524	contig_8617_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_73426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62610	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
525525	contig_15063_pilon	+	1316	6	Intergenic	novelGene_13778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	3153.99135065396	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	593	1066	36142	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35220_36049_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525526	contig_11086_pilon	-	2204	11	Intergenic	novelGene_61193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	629	967	48795	47829	TRUE	30	CTGAATGAATCCAATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETGSEPELVPKEKKERCPLTRAPHSSILLVLTVVLPPGLRSTGPQGRLPASAPHLVQPDAPISWAKCSLLQGFQGRATVQLLTHHLGLCQAPGVVTHCAPGAVVPNLHSP	52230	35209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_-_35326_42516_42823_45320_45415_45486_45807_46366_46692_47752_48112_48739_48898_49316_49415_49650_49683_50824_50948_51957
525527	contig_12079_pilon	-	4103	6	Intergenic	novelGene_67473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1277	junction_5	673.591745792657	9	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	478	843	600738	598001	FALSE	45	AAAGAGGGGATACAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDK	638846	594740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
525528	contig_11548_pilon	+	2302	12	Intergenic	novelGene_66739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1152.11726044625	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	565	1509	101984	119638	TRUE	20	ACCATTACGCTGTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63642	120477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96200_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491_120305_120350
525529	contig_7457_pilon	-	2421	2	Intergenic	novelGene_31398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1788	2327	468247	467708	FALSE	25	CTCTCTCTGTAAACCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFSIAPSLSVKLERLQVFSEMSVIITQDYSLSLHTVLWFMPFCQLPCSEMESSRNSNKKANLNKAASQGPLCSHPPVLSEGLSGVWELDVVILISLYPNFLLWGGRQVNVTSLGEDPRGAGEGESPTYKELLLALGVSFKDCITQLCCLTRSKTTPFRGIVLGTAWQIRGSRQQFLR	470940	467613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289
525530	contig_854_pilon	+	1705	14	Intergenic	novelGene_36446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	469.219722442476	14	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	102	1580	1453661	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451229	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458453_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
525531	contig_3386_pilon	-	1872	8	Intergenic	novelGene_34516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_5	630.444708608332	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	464	1252	407739	404773	FALSE	25	TTAACTTCAAAGCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVAESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412206	404152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407838_408639_408687_409398_409607_412096
525532	scaffold_6394_pilon	+	1323	7	Intergenic	novelGene_110983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	341.871645829575	10640	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	48	767	398216	405283	TRUE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGASAFQEGGPVPGPGRAAGGGLPRLPG	398168	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405501_405717_405864_406086
525533	contig_5671_pilon	-	952	5	Intergenic	novelGene_79470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	357	941	531410	370440	FALSE	30	GCTAATGAATTCCTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGGQVQILQSLLMEDFKKHYKNFEKIVMTGYIGTEHLYRMEHLSADLRKLGAKILLRLRVHSLDSLPQKAFHKPHCQDPQAYLEEFLPVRLLLHSCPSDPSCQSQWRPQWCLLLLLSFVLLLSHLSPPPLQHLSPVLWSSQPLLSHHEPRLPWFWNLHREHPLLSFLLLLPRPVWFFQQQPRLPPWPLKVLS	531766	370428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_-_370548_376735_376778_392772_392917_521216_521301_531203
525534	contig_10134_pilon	-	1589	4	Intergenic	novelGene_16182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	505.345646287986	3307	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTTAGACTCTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39727	29372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30386_35002_35178_38558_38817_39584
525536	contig_5988_pilon	-	1608	4	Intergenic	novelGene_15953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	8	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	80	1435	655459	651962	FALSE	10	AGGTTTTTGACTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655538	651788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
525537	contig_9807_pilon	+	2102	14	Intergenic	novelGene_32846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.639390572692	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	139	1830	109130	158783	FALSE	25	CGTGTTGAACATTCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQVCVLGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108991	159055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149056_154120_154270_156624_156770_158676
525538	contig_1225_pilon	+	2158	4	Intergenic	novelGene_44124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	228	545	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250586	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274837_275610
525542	contig_11855_pilon	-	3843	1	Intergenic	novelGene_67034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	867	1196	1930366	1930037	NA	80	AGCAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPKLLLLFYVLHLVVQQIRTECLLCARLYFKFWGCSCEHVKLPAFLELIVQLGKEKHIAKLMYIHQLEINAMKGNKAGSAERVGYCIFSEKATLIWSHLCKDLKEARE	1931232	1927389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1927400_1931200
525543	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	39	516	2	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	219	710	1733	10736	TRUE	30	TGGAAATTGGCGATGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1126	11309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525545	contig_15063_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_11327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525547	contig_10986_pilon	-	1666	12	Intergenic	novelGene_71463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	183.058090405232	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	788	1447	73671	67011	FALSE	20	CCCCGTAAGCTCTCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80306	66791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73661_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
525548	contig_1443_pilon	-	3883	1	Intergenic	novelGene_28340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAGAGAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795425	791542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_791500_795400
525549	contig_3095_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_74987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	61	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
525550	contig_5698_pilon	-	1608	9	Intergenic	novelGene_55000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTTTTTTAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20732	4083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_4146_7815_8025_11129_11209_11790_11869_17145_17219_18788_18851_19227_19765_19851_20297_20669
525552	contig_3155_pilon	+	1789	5	Intergenic	novelGene_26378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	64	570	258156	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258092	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_262120_262221
525554	contig_15063_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_12065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525557	contig_414_pilon	-	2501	3	Intergenic	novelGene_115104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_1	20.5	309	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1275	2051	373842	373066	FALSE	10	TGATGGTGTTTTATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384204	372615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376161_376898_383938
525558	contig_15063_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_8765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	779	1102	35891	35108	TRUE	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36778	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27156_34599_34934_35042_35380_35839_36156_36264
525559	contig_10861_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_39385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1086	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1087	1512	1733322	1733747	NA	0	CGTGTCTTTGTTGTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGTGILCELMPSWGQLCLVICSTSWAHKSAPSPGKVSRSQIPLLQAGLIFCALKKYLWFSLLGYSQGSHQKPSLSSSMPRAKGPPGHLYQGRGGMLCGIWFRTSGAGDHVAILRSLLSCHLISSPRTEMLDFLALGSV	1732235	1734919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1732200_1734900
525560	contig_2161_pilon	-	2039	3	Intergenic	novelGene_114970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3550.5	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACCTGCTGTGTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066409	1059516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1061276_1063660_1063751_1066219
525561	contig_13787_pilon	-	2442	9	Intergenic	novelGene_40603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.379683521758	95	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	249	917	205032	131430	TRUE	10	TATGCTGTTTTTGGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	205280	129646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_130825_131082_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
525563	contig_10011_pilon	+	1783	7	Intergenic	novelGene_68104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.3879302008968	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	354	788	330847	333031	TRUE	10	TCTTATTAGTGTGGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	325936	334172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_326251_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
525564	contig_10011_pilon	+	2434	5	Intergenic	novelGene_68089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	122.989836978508	109	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	62	1705	322928	333451	FALSE	15	GTGTGGCTGGGCTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLLWPPGLGGGGGRQDRLGSGSVQSIHEQERECGSVS	322866	334180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_333343
525565	contig_8729_pilon	+	2187	7	Intergenic	novelGene_40104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	66.4697090577522	642	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGAACTATCTGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276499	323934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_292842_292938_293176_293233_306155_306214_322203
525566	contig_10986_pilon	-	1026	7	Intergenic	novelGene_71483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	196.221530135938	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	146	823	72941	67011	FALSE	40	AAACATGTAAAACTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGCSLLTGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	73086	66807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_72913
525567	contig_3817_pilon	+	1748	5	Intergenic	novelGene_78315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1083	junction_4	206.766172281638	4593	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	100	729	178717	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178617	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
525569	contig_5643_pilon	+	2048	15	Intergenic	novelGene_39024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	687.618546365732	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	651	1859	634983	641217	TRUE	30	TGTAAATAAAGTCTCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQPSTPPCRHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631198	641575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641082_641244_641412
525570	contig_13097_pilon	+	2094	19	Intergenic	novelGene_107714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	505.177844249911	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	168	1886	184733	264394	FALSE	55	ATATCCAAGAAAGAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184565	264602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254088_254153_254201_263407_263546_264246
525571	contig_5467_pilon	+	2373	2	Intergenic	novelGene_111975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	558	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTCAATTTGAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162243	164670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_162531_162584
525572	contig_15063_pilon	+	1642	6	Intergenic	novelGene_14139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3999.75902274125	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	174	962	34808	36299	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKRWPSMHQPST	34634	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36136_36266_36600_38975_39092_39506
525573	contig_1452_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_115146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
525574	scaffold_12124_pilon	+	1911	9	Intergenic	novelGene_22308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3130.97536470267	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1179	1829	1508755	1509405	FALSE	5	TTTTTTTTTTGTTAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473593	1509487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494300_1497040_1497122_1506629_1506687_1508010
525576	contig_5967_pilon	-	1764	7	Intergenic	novelGene_44362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	448.613419326707	19	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	143	646	488569	423960	TRUE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKG	517644	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388660_423954_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
525577	contig_15063_pilon	+	1458	6	Intergenic	novelGene_14313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	322	1206	35271	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34837	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525578	SIRV6	+	826	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	12	597	12	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGCGGTAAACGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012	11229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525579	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525580	contig_500_pilon	-	1429	9	Intergenic	novelGene_30977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTGAGCAACAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480977	1452270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1452366_1454482_1454585_1461319_1461548_1464029_1464117_1466064_1466283_1468833_1468908_1469129_1469324_1477837_1477924_1480632
525581	contig_10197_pilon	+	2835	17	Intergenic	novelGene_115302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	86.2595782725026	333	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	92	1942	1315291	1377360	FALSE	20	TATGAATCCTACTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQLSEGAIAAIMQQGDMSIKPVLQVINIRPITTGNSPPRYRLLMSDGVNTLSSFMLATQLNSLVEEEQLSSNCICQINRFIVNMLKDGRRVVILMELEVLKSAEAVGLKIGNPVPYNEGHGQQQVVPTPASAASPPTSKPQQQNGSSGMGSTVSKAFGAPKTFGKAGGTSLVNTAGGTQSKVVPIASLTPYQSKWTICARVTNKSQIRTWSNSRGEGKLFSIELVDESGEIRATAFNEQVDKFFPLIEVNKVYYFSKGTLKIANKQFTAVKNDYEMTFNNETSVIPCEDGHHLPTVQFDFTGIDDLENKSKDSLVDIIGICKSYEDATKIIVKSNNREVSKRNIYLMDMSGKVVSATLWGEDADKFDGTRQPVMAIKGARVSDFGGRSLSVLSSSTIIVNPDIPEAYKLRGWFDSEGQALDGVSISDLKSGGIGGSNTNWKTLYEVKSENLGQGDKADYFSCVATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDREFPNFKYRMILSANIADFLENQWVTCFQESAEAILGQSTAYLGELKEKNEQAFEEAFQNASFRSFTFRIRVKLETYNDESRIKASAVDVKPVDYREYGRRLIMNIRKNAMQ	1315199	1378253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1315324_1325302_1325354_1326427_1326507_1327173_1327283_1340587_1340677_1358223_1358317_1360518_1360652_1362645_1362749_1364050_1364120_1364266_1364460_1364616_1364757_1365191_1365341_1367602_1367736_1369928_1370106_1373651_1373760_1375656_1375744_1377255
525582	contig_3817_pilon	+	2702	8	Intergenic	novelGene_78361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	138.740103526452	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	35	982	600174	638773	TRUE	25	TGTTGGTGTGAAGAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDGAVPLPESRREIEELLAEAKYYLVQGLVEECQAALQNKDTYEPFCKVPVITSSKEEQKLIATSNKPAVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDNMLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNILLYEAQDGRGPDNALLEATGGAAGRSHHLDEDEERERERIERVRRIHIKRPDDRAHLHQ	600139	640667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547_612762_627206_627377_630762_630850_631177_631231_632474_632671_638548_638778_638951
525583	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525584	contig_5954_pilon	-	1789	9	Intergenic	novelGene_28592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	478.683872717684	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	713	1423	947127	945083	FALSE	5	CGTCCTTCTCTGAGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	955868	944716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_948007_948088_948197_955828
525585	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525587	contig_10377_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_115410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTTAATCCCTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251723	250977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_251000_251700
525588	contig_12570_pilon	-	2237	8	Intergenic	novelGene_79355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	232.344220359995	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	301	1221	211353	190389	FALSE	25	AGACTTTTGTATATTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228676	189372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211435_228457
525589	contig_5954_pilon	-	2707	8	Intergenic	novelGene_28770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	1	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	112	822	1462068	1392942	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462179	1390871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392210_1392394_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
525590	contig_15042_pilon	-	2108	7	Intergenic	novelGene_115421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	204	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	138	1091	35339	10047	FALSE	25	GCAAACCTTACATTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKRWLYWQPILTKTGFVSVLLVGAFVGWTLFFQQNVL	43086	9029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
525591	contig_15866_pilon	+	1841	14	Intergenic	novelGene_63645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	597.475052089895	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	193	1167	601021	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	505677	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_505748_519223_519277_581434_581475_581685_581705_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
525592	contig_1213_pilon	-	1094	11	Intergenic	novelGene_76478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	230.168307983528	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	14	778	101775	81179	TRUE	35	AGGTGCCATTTGAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKKMALTSFLPAPTQLSQDQLEAEEKARSQRSRQTSLVSSRREPPPYGYRKGWIPRLLEDFGDGGAFPEIHVAQYPLDMGRKKKMSNALAIQVDAEGKIKYDAIARQGQSKDKVIYSKYTDLVPKEVMNADDPDLQRPDEEAIKEITEKTRVALEKSVSQKVAAAMPVRAADKLAPAQYIRYTPSQQGVAFNSGAKQRVIRMVEMQKDPMEPPSTCHAFSQPKDDREGTTRVENSSLYFKLEKRKGLYNSIRQASGC	101788	75369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_75469_77898_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83429_84286_84386_85233_85341_85432_85529_92927_93090_96621_96776_101761
525594	contig_15063_pilon	-	1439	5	Intergenic	novelGene_13204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34777_34832_34924_35035_35380_35839_36156_36264
525597	contig_12638_pilon	-	2598	14	Intergenic	novelGene_33263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	773	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	983	1300	860948	859070	TRUE	25	TCTTACTTGTCATAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPKAQQVVEIVEQEARVLLAVFHPLQQPQVQGQPLFPSGQHQNHQAGVEAADVLLGQCLHVDDVDEAEEEGHLCGYLGYVGKQAALRQDLGHFHVYLVFKSVQ	862075	826312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_826364_830579_830788_836183_836370_845370_845536_850765_850901_852616_852677_854778_854878_855925_856010_857041_857134_858208_858353_858995_859105_859707_859820_860777_860988_861132
525598	contig_11052_pilon	-	771	3	Intergenic	novelGene_115461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	195	761	107604	102842	FALSE	25	AAGGTCAGCACGAGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRSDSALKGQGKSRQRCHLLCSPLCVLAARFCHGGCAQPRNSIYLERAEGFLLQVWLVMEGTGGQVGLGLGTYGSSNLHIQEVVHPRHDLLAGAHHLHHAAVELVVAGLVVLADGEVQGVLHALLVLFCVHDAAQQARGPGGCRRAQHPGQGQRGQQEQRGAQGRGHGGLGRWRRRADQQTGKRAA	107798	102831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_-_103134_106344_106459_107443
525599	SIRV6	+	543	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	-270	510	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
525600	contig_15304_pilon	-	1058	3	Intergenic	novelGene_30554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	199	1023	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54298	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
525601	SIRV6	+	1519	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	8	1	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525604	contig_15304_pilon	-	1235	2	Intergenic	novelGene_30453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	3085	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	189	383	54100	53906	TRUE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
525605	contig_10082_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_63886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACAAGCATAAAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366817	368452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_366800_368500
525608	contig_5711_pilon	-	3167	8	Intergenic	novelGene_80276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGCATATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122718	86013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_87547_101967_102090_105493_105638_107303_107417_108769_108937_113379_113567_121457_121635_121994
525609	contig_3948_pilon	+	2169	4	Intergenic	novelGene_53392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	70.9976525433529	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	288	989	1813956	1860572	TRUE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813427	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813826_1814520_1860434_1860575_1860866
525610	contig_18272_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_7095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTCTTCACTCCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541820	539893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_539900_541800
525611	contig_11115_pilon	+	2396	7	Intergenic	novelGene_102822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	691.479030773891	65	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	1335	2309	171704	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165374	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_169567_169646_171029_171981_172339_172595_172714_172964_173047
525612	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_9033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525614	contig_1435_pilon	+	2135	2	Intergenic	novelGene_115516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCGTAACAAAAAAATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569784	572330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_571248_571658
525615	contig_7293_pilon	+	2777	1	Intergenic	novelGene_54233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTGCTACTCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220455	223232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220500_223200
525618	contig_12919_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_75871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAACCTACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286795	286593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_286600_286800
525619	contig_15304_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_30511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	5	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	189	719	54100	53391	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
525620	contig_11978_pilon	-	2556	5	Intergenic	novelGene_63045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	6.60965203320114	360	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1468	1818	1800665	1797292	FALSE	15	CTCATCTCTTATCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGLPAGLQWMLSQTTAN	1802701	1796553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1802030_1802598
525621	contig_5671_pilon	+	1365	7	Intergenic	novelGene_79457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	2295.62843005764	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	277	690	370430	525570	TRUE	30	CATTGCATATATATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	369946	531791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205
525622	contig_10986_pilon	-	2156	12	Intergenic	novelGene_71474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	170.137086195731	46	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	86	961	80340	71463	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVCVAVLFL	80425	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71315_71407_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
525623	contig_12140_pilon	-	1376	10	Intergenic	novelGene_86523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	79.4384613131603	331	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	339	1376	46073	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRAWTWPDALNIENSDSESWTSHTVKKFTASFEGSLSGESELKTPSISLKKMVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84860	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_45850_46085_49424_49521_64263_64348_84713
525624	contig_2438_pilon	+	2088	4	Intergenic	novelGene_112060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2805.05650566972	10	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1054	1530	311851	312871	TRUE	10	TTTTGGATGGACTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	310797	313517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305_312409_312729_313020_313107
525625	contig_4364_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTTAAGGAGAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532834	1533283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
525627	contig_11171_pilon	+	3131	9	Intergenic	novelGene_48556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	144.228063756677	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	83	1261	70574	105888	TRUE	45	AGAGGAAGAGGCATCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70491	107792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710_107071_107104
525628	contig_3424_pilon	+	2209	3	Intergenic	novelGene_55502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.5	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	199	1953	163748	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQKCDGHNYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	163433	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_163566_163681_163775_168950
525629	contig_7396_pilon	-	1709	16	Intergenic	novelGene_79624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3164.03065303314	6	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	79	1200	255163	247733	TRUE	5	CTATTTTTGGTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAHMVILVDLLLLHK	255346	245936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246001_246214_246476_247186_247357_247718_247775_248205_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295
525630	contig_12638_pilon	-	1776	17	Intergenic	novelGene_33119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAATTATATGAACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199758	170898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_173507_173560_178085_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183508_185552_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191804_195500_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
525635	contig_7412_pilon	-	1760	8	Intergenic	novelGene_76327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1404.251489192	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	146	1426	377290	364533	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMDL	377905	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364541_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
525638	contig_11720_pilon	+	2095	15	Intergenic	novelGene_43933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	342.591720178252	5	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	13	1476	262271	271346	TRUE	35	AAAGCACTTTACCACAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGW	262258	272406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271347_271651_271961_272096
525640	contig_10801_pilon	+	2963	14	Intergenic	novelGene_74027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	432.275375195025	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	21	1472	235415	368988	TRUE	20	TTATCTTTGATATTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRAYSMEVCYQLPVLPLDRPVPQHVLSRRGAISFSSSSALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEFEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTTVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHMPLEDRQEMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDASHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLSVSPFCDRQSESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFSNTRLSQTMLGHVGLNKASWKGMQRAQSSSEDTDAALEELNSQLLPQENRSS	235394	370602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_235553_319908_319970_323393_323478_345671_345824_347622_347687_352563_352660_354573_354675_356986_357119_357317_357410_361966_362112_362717_362815_363829_363911_368779_370114_370236
525643	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525644	contig_7992_pilon	+	3122	11	Intergenic	novelGene_115533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	91.5264442661245	207	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	102	1070	606395	645332	FALSE	20	TTAAATTCTCTCTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCGGRSVSGGGGGSAEPDLGVRWRRPKEASRTMSGELPPNINIKEPRWDQSTFVGRASHFFTVTDPRNILLSKKQLENARKTIHDYRQGIVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRSTPAVLFWQWINQSFNAIVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVISRVLMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPVQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEADLQAKIRETHPELRRVYFNKGL	582310	647384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_582403_606385_606559_609963_610135_611209_611309_614478_614555_615800_615887_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235
525646	contig_7356_pilon	-	1797	5	Intergenic	novelGene_60385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	646.127889817488	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	76	465	457848	433924	TRUE	5	TTGCTTTTTCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457923	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_433822_433918_434073_435516_435623_437474_437529_457767
525647	contig_8885_pilon	-	2096	5	Intergenic	novelGene_115558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	123.384308159506	870	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	213	602	75477	49174	TRUE	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLPVSPLSRAAATSASKEQTGSEKNKHALGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75689	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
525648	contig_3307_pilon	-	2829	8	Intergenic	novelGene_86880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	543	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTTCCTTCTGCGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200184	118023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_118183_145185_145281_149325_149454_150094_150171_173045_173154_176208_176381_186328_186412_198176
525650	contig_9471_pilon	+	1836	8	Intergenic	novelGene_21811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	606.670740810122	6	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	768	1298	412726	414785	TRUE	15	GTAAATTTGTCCGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	411958	417377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414940_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417247
525651	contig_15063_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_8636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	5	TTTGCCCTGGCCCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	26382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26394_34605_34924_35035_35380_35839_36156_36264
525652	contig_6102_pilon	-	1697	10	Intergenic	novelGene_32124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	352.267575068221	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	291	1541	821069	816763	FALSE	10	CTCAGATCTGTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATQTPPCWGLWVVWPLRRPPGPCEDLAHQRRCPKHSSCCGPPRHCSSLAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821456_821978
525654	contig_8978_pilon	-	2139	9	Intergenic	novelGene_49411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1108	1605	345658	343422	TRUE	35	AAAATTCTTCAGGTCGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLFMPIAPPIAIWPIRISCSLASGKVPLNPSCCRRIISSCCRRISSSRRLRSSSLPELQLLSFLHLLVVQLFHPPKFFLAPHQICLYSPCLISMTWCSWRAASISISSFSRASLMLRSTWSCCCFSISMSAFQRMAYSYSKEPGCANLGGCSRSLREIAGSL	348141	340971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_341130_342364_342670_343350_343445_343634_343848_344173_344265_344695_344795_345355_345395_345625_345737_347112
525655	contig_4816_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_115610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAGGGCAAAGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665478	664839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_664800_665500
525657	SIRV6	+	1177	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	399	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	191	523	2002	10736	TRUE	5	GGGGTTTGCCGATGCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGQRRFHTTWLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1702	11700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1844_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525658	contig_15063_pilon	+	1504	5	Intergenic	novelGene_12043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27150	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525659	contig_9839_pilon	+	1589	6	Intergenic	novelGene_88569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	483	junction_5	231.379342206689	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	823	1551	261595	269866	FALSE	40	CAATAGAAATTAGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	259474	269904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
525660	contig_12425_pilon	-	1571	8	Intergenic	novelGene_46691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	764.875606799923	81	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	106	834	211174	204021	FALSE	25	TCAACTTGAAATTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGKMGPGLPKPCVYYQI	226597	203283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204047_207156_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
525661	contig_14322_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_115806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671648	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
525662	contig_1516_pilon	+	1848	11	Intergenic	novelGene_49985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1090.77871724745	91	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	88	1812	347241	363697	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNPGPGAWRQQEQGLRAGGSGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	335194	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362283_363445
525664	contig_15063_pilon	+	1423	6	Intergenic	novelGene_12852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	237	1250	34808	36632	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNW	28164	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36497_36626
525665	contig_7816_pilon	+	1896	14	Intergenic	novelGene_66490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1098.01817706255	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	93	863	170169	196748	TRUE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATR	170076	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183058_192965_193089_194850_194970_195755_195868_196741_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
525666	contig_13145_pilon	+	1900	9	Intergenic	novelGene_116625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1055.19760442061	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	50	910	35323	57392	TRUE	35	ATTTACCCAAGACTCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35273	66038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324_57542_65197
525667	contig_5954_pilon	+	1897	10	Intergenic	novelGene_28664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCTGACCGCGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944725	956150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947096_947204_947434_947714_947798_947935_948094_948197_955828_955933_956018
525668	contig_12923_pilon	-	2761	25	Intergenic	novelGene_30135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	213.854177829193	7	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	48	1712	201671	169321	TRUE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPASGPSLLLLLLTSLPLALGDPMYSMITPNVLRLENEETVVLEAHDVQEDIRVTVSVHDFPGKKQVLFSEDTQLTAANSHLSALPIKIPANKDLRSDRKNKFVVVQAAFRDVVVENVVLVSLQSGYLFIQTDKTIYTPGTTVLYRIYSVNHELLPVGRTVVTTIETPDGVPIKRDSLSSHNQFGILSLSWNIPELVNMGQWKIRAHYEDSPQQLFSAEFEVKEYVLPSFEVQVEPTEKFYYIYDPRGLEVTITARFLYGKNVDGMAFVIFGVQDGDQRISLTQSLSRVVIEDGYGEVVLSREVLLNGVKPSSPEALVGKSLYVSVTVILQSGSDMVEAERSGIPIVTSPYQIHFTKTPKYFKPAMPLDLMVLVTNPDGSPARQIPVVTKDNGVQSLTHNDGVAKLSINMPNSPTPQTITVRTKKDGIPEGQQASETMQVQAYSPPGNSNNYLHLSVPRLELKPGETINVNFHLRADPGLQARISYYTYLVMNKGKLLKVGRQGREPGQDLVVLPLTITADFIPSFRLVALSGQAPHPLGICQPPAIRRDQGK	201718	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169546_193529_193650_193750_193961_196212_196360_196443_196560_196840_196968_197385_197489_197641_197733_197817_197901_198012_198108_199515_199587_199678_199842_200279_200473_201597
525669	contig_15084_pilon	+	3169	1	Intergenic	novelGene_116706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241930	245099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_241900_245100
525670	contig_6735_pilon	-	1455	12	Intergenic	novelGene_15731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1027.20365013126	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	215	1249	554315	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDIMDTYLVVLPHPP	568285	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542231_543089_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554359_564784_564869_568198
525671	contig_9002_pilon	-	2446	11	Intergenic	novelGene_116721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_10	39.2567191700988	43	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	107	1294	331854	319614	TRUE	25	CATTGCTGTAGTCACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGIWALFGSDECLSVQCLSAMKIAHRGPDAFRFENVNGYTNCCFGFHRLAVVDPLFGMQPIRLKRYPYLWLCYNGEIYNHKEMQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKVNTLKWNDTGARLRKE	337858	316734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319052_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331605_331878_337775
525673	contig_10892_pilon	+	2994	2	Intergenic	novelGene_116755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATACTACTCCAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169038	174854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_170412_173233
525674	contig_9720_pilon	+	2041	2	Intergenic	novelGene_116783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1229	junction_1	0	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	113	517	391741	392457	FALSE	35	AACATGTCTGAAGTCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391628	393981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392089_392400
525675	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
525676	contig_7342_pilon	-	2348	19	Intergenic	novelGene_71120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	119.732327493094	2	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1234	2298	78723	76155	FALSE	20	CCAAAGCTAGTTTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	83978	76104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80527_80856_80983_81075_81234_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83591_83642_83789_83834_83913
525677	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	147	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
525678	contig_20641_pilon	+	1426	5	Intergenic	novelGene_52871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1294.59267242635	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	181	1131	41419	56882	FALSE	25	AGATCTCTGTGAAAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIYIRKYFTFVNRYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	38601	57177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_38710_41346_41619_45848_45965_54835_54968_56379
525679	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_9199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525680	contig_19476_pilon	+	2285	4	Intergenic	novelGene_116807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142558	160657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_+_142881_146517_146646_150618_150708_158911
525681	contig_3975_pilon	-	1995	14	Intergenic	novelGene_54783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	327.958144248162	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	526	1395	2021058	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052440	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021681_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
525682	contig_6898_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_35795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126489	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_126500_127700
525684	contig_9807_pilon	+	2063	8	Intergenic	novelGene_32835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	600.314305431848	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	178	918	109130	156718	TRUE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQPQTRRTMFSTDTMRRSSAWLGPRTTSTLPLVAWT	108952	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_156613_156770_158676
525686	contig_15063_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_8552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	249	1484	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26347	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525687	contig_13863_pilon	+	1738	11	Intergenic	novelGene_42080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	344.073378801674	16	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	174	1271	474588	489696	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKVSVYRA	455754	490595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489720_490151
525688	contig_21203_pilon	+	1370	9	Intergenic	novelGene_84469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	309.083220993958	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	255	1055	53950	120248	TRUE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSMPVFQRSQCI	52643	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_52693_53314_53505_53934_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_120210_120376_121973
525689	contig_7428_pilon	-	2360	13	Intergenic	novelGene_77741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	125.434218040994	448	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	9	1727	443863	438797	FALSE	30	TTCAGACTTTTTATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVWQKDGMGLRACLLGLLALTVAGKCSYSPEPDQRRTLPPGWVSLGRLDPEEELSLTFALRQQNLEKLSELVQAVSDPGSPRYGKYLTLKDVAELVQPSPLTLHTVQKWLLAAGARNCHSVTTQDFLTCWLSVRQAELLLAGAEFHRYVGGPAETHVVRSPHPYQLPQALAPHVDFVGGLHRFPATSSLRQRPKPQVAGTVGLHLGVTPSVIRERYNLTAQDVGSGTTNNSQACAQFLEQYFHDSDLAKFMRLFGGNFAHQASVARVVGKQGQGWAGIEASLDVEYLMSAGANISTWVYSSPGRHEAQEPFLQWLLLLSNESALPHVHTVSYGDDEDSLSSAYIHRVNTELMKAAARGLTLLFASGDSGAGCWSVSGRHQFRPSFPASSPYVTTVGGTSFQNPFRITNEIVDYISGGGFSNVFPRPSYQEEAVSQFLKSSPHLPPSSYFNASGRAYPDVAALSDGYWVVSNSVPIPWVSGTSASTPVFGGLLSLINEHRILNGHPPLGFLNPRLYQQHGAGLFDVTHGCHESCLNEEVQGQGFCSGPGWDPVTGWGTPNFPALLKTLLNT	443871	438163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440337_440577_440767_440915_441115_441303_441483_441615_441744_441950_442102_443218_443359_443641_443714_443819
525690	contig_12427_pilon	-	1956	8	Intergenic	novelGene_40546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1330.94217050347	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAGATCATCTGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578180	504678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504872_505022_506131_507799_507929_510397_510429_510529_510617_520312_520440_522284_522346_577960
525692	contig_11364_pilon	+	2691	17	Intergenic	novelGene_65153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	496	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATCGGGGATCTCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60418	97018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_61515_63980_64062_64315_64454_65141_65197_66990_67051_67662_67806_84028_84152_85518_85591_86484_86592_90472_90678_92018_92115_92229_92326_94547_94667_94954_95054_95295_95381_96227_96324_96998
525693	contig_5033_pilon	-	1824	13	Intergenic	novelGene_29020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3530.00560669999	14	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	16	1416	566787	531394	FALSE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEIL	566802	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531397_533827_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
525695	contig_5023_pilon	+	2922	1	Intergenic	novelGene_7119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1086	1535	136686	137135	NA	25	CCCAGGGCAACCAGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINISAQGTIVLEDPQLFPRQPGKLSERLPLKEQQAPGWVGTTNALWAARIRSSMHCLGRGTRRKRDTECGLTPELAGQGNRETTVSAKRCIPRLVTGTDADPQHGWGLRAVRSPLPSKNSSPLWGLQFKEQLLPMSHTCVHTNQVLCT	135600	138522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_135600_138500
525698	contig_10253_pilon	+	1273	8	Intergenic	novelGene_76870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_1	70.2017500799354	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1134	138	1271	46786	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRKRLMTPAFKDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	46648	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_46825_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
525699	contig_19342_pilon	+	966	6	Intergenic	novelGene_41120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.18747549010185	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	65	541	4349	6183	TRUE	20	AGAATCCTGTGTTTGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	4284	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
525702	contig_6735_pilon	+	1155	8	Intergenic	novelGene_15798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAGTATATACAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542061	551627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_542070_542272_542603_542792_542860_543008_543091_545891_545945_546577_546634_547243_547357_551181
525703	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525704	contig_1230_pilon	+	2182	9	Intergenic	novelGene_28832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1441.18750948653	3	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1226	1939	407256	408754	FALSE	15	TAGTTGTTTCATGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406284_406375_406735_407032_407352_407588_407788_408003_408237_408568
525705	contig_7165_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_116876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTCTGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657206	659701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_657200_659700
525706	SIRV6	+	380	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10393	53	1156	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11393	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
525707	contig_15063_pilon	-	1732	7	Intergenic	novelGene_8569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	30	GTAGTAGCAGCCACAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	26349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34613_34924_35035_35380_35839_36146_36251_36597_38972_39090_39504
525708	contig_12624_pilon	-	1784	5	Intergenic	novelGene_61098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	167	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	227	532	952979	948779	TRUE	20	CTTTTCTAATGCTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955865	947476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947976_948025_948842_950590_950768_952913_952985_955644
525709	contig_3948_pilon	+	2222	4	Intergenic	novelGene_53369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.963139588444	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	297	809	1813956	1860572	FALSE	30	AGTCTGTGTGAAGGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812653	1861985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812760_1813506_1813586_1813844_1814331_1860434
525710	contig_15063_pilon	+	1461	6	Intergenic	novelGene_14314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	322	1206	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34837	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525712	contig_4232_pilon	+	1318	3	Intergenic	novelGene_63203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	1762.5	161	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	78	392	146362	148542	TRUE	80	AAAAAAAAAAGACAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	146284	149672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148884_149087
525713	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_9938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525714	contig_15118_pilon	+	2817	3	Intergenic	novelGene_74545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	71	532	129085	129590	FALSE	15	TGAATCTTTTGCCTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDQDLELPGEGPQLVAIPGVGKMETNSSLPMNVSGGIQPESSSYAALNIFSQVVLGVTCVLGILGNGLVIWVAGFRMTHTVTTISYLNLAIADFSVTATLPFTMVSQAMRGQWPFGWFLCKLIYTVVDINLFGSVFLIAVIALDRCRSGQEGDHCTLDSCPPLHFASYHSCDYNK	125268	131875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_129073_129455_129498
525715	contig_3469_pilon	-	2282	17	Intergenic	novelGene_34157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	95.459088095372	621	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	376	1803	413507	380499	FALSE	15	CTATTTGCTTTATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427674	380019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427058_427196_427444
525716	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_12039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	220	1458	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27149	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525717	contig_3095_pilon	+	1129	5	Intergenic	novelGene_75041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	43	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	64	570	147241	151002	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDSLTNSPHQCSMLHGLKMENLSPQECQRQSSCPGKTTFSASSTISPSCPQWTSSMTARWITGVSTSRSSSTGS	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149856_150482_150696_150996_151163_151848
525718	contig_13149_pilon	+	3351	4	Intergenic	novelGene_116923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	29.5296461204668	411	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	46	606	27763	40997	FALSE	0	CCCTTCTTTTCCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASGLGRLDRKVAGSMEVHSKPQPSPSCSSSTAGCSGVSVSKELLTAESGGLGGIWDRLCINSKPNSRKSSNLQTVRIERSPLLDQVQTFLPQMAQANEKLRKEMAAAPPGRFDIENVDETLGKIIQMDVALFEMNQSDSKEEDSSEESSQDSSENSSESEDEEISIPGEITIDNIKLPNSEGGKGKIEVLDSPASKKKKQ	27717	43742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13149_pilon_+_27878_30623_30711_38702_38840_40775
525719	contig_16303_pilon	-	1694	8	Intergenic	novelGene_34101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	29	1120	45428	35759	TRUE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45456	33138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33307_35352_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
525720	contig_9389_pilon	+	1883	7	Intergenic	novelGene_83898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1736	junction_4	398.045502703174	3612	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	73	1002	159587	167516	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSPAPARGPSGPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159514	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167240
525721	SIRV6	+	810	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1848_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
525722	contig_9471_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_21729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1334	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATTTAAAGATTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197555	199357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_197600_199400
525724	contig_15185_pilon	+	1833	9	Intergenic	novelGene_99456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	194	817	429653	430486	TRUE	15	CAGCTGACGCTGCGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVITCFSDMSVAVNIGLRGLPALERTWSILGVGSRCLAPFETQEQSQRGSGKLGSCRDKMLLPPQGFVTAHTNTHSALVGSRVRALEDGDVVVDLGAVALGDALSNPHYVAALLLLELHKGVEDAKVKLIQEGQLVQLHLVLEESVLQSLVSGVAACTLEEQLGTHRVVVSHVLNLLIVVSPGQLGEALRVEPPTVWKELGTVFLG	429459	472485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_430069_430175_430252_430354_430541_430670_430751_434093_434172_435509_435689_444528_444701_451259_451514_472286
525725	contig_8140_pilon	+	2818	7	Intergenic	novelGene_86440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_6	226.524219946173	373	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	65	877	555480	738557	FALSE	80	AGCAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWRWLWLKQASGRICRGEGAMDDQGCPRCKTTKYRNPSLKLMVNVCGHTLCESCVDLLFVRGAGNCPECGTPLRKSNFRVQLFEDPAVDKEVEIRKKVLKIYNKREEDFSSLREYNDFLEEVEEIVFNLTNNVDLDNTKKKMEIYQKENKDVIQKNKLKLTREQEELEEALEVERQENEQRRLFIQKEEQLQQILKRKNKQAFLDELESSDLPVALLLAQHKDRSTQLEMQLEKPKPIKPVTFSTGIKMGQHISLAPIQKLEEALYEYQPLQIESCGPKVPELEMLGRLG	555415	740498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_555569_662788_662942_664649_664724_676299_676404_682875_683017_687699_687826_738431
525726	contig_15146_pilon	+	1088	5	Intergenic	novelGene_116972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	165.714174107105	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	142	759	615265	622018	TRUE	25	CCAAATCATGTTGATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTASAVASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPW	615123	629086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621875_622030_628768
525727	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	230	1465	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27541	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525728	contig_5317_pilon	+	2605	18	Intergenic	novelGene_76583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCTTTTCTCTTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355232	384213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355763_356222_356341_356923_356986_357962_358095_361104_361257_361766_361864_364144_364275_364799_364923_366580_366666_370358_370423_375288_375427_375693_375762_376057_376299_377191_377330_379072_379220_381030_381209_381934_382051_384127
525730	contig_12079_pilon	-	2412	6	Intergenic	novelGene_67529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.020903337642	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	494	1651	862522	861365	FALSE	40	AAGTACAAACGTTAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863555_871121_871171_871500_871555_871641_871725_872314
525732	contig_12019_pilon	-	2486	1	Intergenic	novelGene_87792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCGGAAAAGAGACTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767285	764799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_764800_767300
525733	contig_15063_pilon	-	1510	5	Intergenic	novelGene_10250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	759	1082	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36758	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34925_35033_35380_35839_36156_36264
525734	SIRV6	+	1438	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	34	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	160	654	1733	10736	TRUE	35	GAAGACCGGGAGTATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11207
525735	contig_5020_pilon	+	1527	9	Intergenic	novelGene_27876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	871.911943661744	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	353	1282	122915	125772	TRUE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118472	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125827_125895
525736	contig_233_pilon	-	1602	9	Intergenic	novelGene_14653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1277.3047796043	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	100	1167	126907	78602	FALSE	40	AGAAATAAACTTTCCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYESALTFLTRITPFSRVPPPRS	127006	78166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78665_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
525737	contig_2069_pilon	+	2130	12	Intergenic	novelGene_23273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	303.563491527604	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	149	991	333898	341321	TRUE	15	CTATGACTATCCCTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	332259	344274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519
525738	contig_11413_pilon	-	3935	1	Intergenic	novelGene_103196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	798	1097	595371	595072	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSYQGLHQTESGTATWCPANTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	596168	592233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_592200_596200
525739	contig_12638_pilon	+	1976	9	Intergenic	novelGene_33372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	116.579372103301	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	95	1135	1515842	1538839	FALSE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVRSSSPAGRSWMRRWLKPTWAS	1515747	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530588_1538797
525740	contig_3948_pilon	+	2113	4	Intergenic	novelGene_53379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.8954011539622	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1037	1507	1860968	1861438	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1813325	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814004_1814435_1814520_1860434
525741	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525742	contig_9708_pilon	-	2078	4	Intergenic	novelGene_67246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	15.1730755689881	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTGGCTAAATCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40180	18881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_24128_24246_24631_24943_40077
525743	contig_15063_pilon	+	1655	6	Intergenic	novelGene_13588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	35	TTGTGGCCATGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525745	contig_8075_pilon	+	2355	9	Intergenic	novelGene_42485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_7	146.435779439316	227	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	90	782	664009	689159	FALSE	25	TTATTTATGGTAAATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRESALSRSWQRPGAAVLSASDARSPSRCMCGNNMSAPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEALAGIRSSHIKYICPHAPIMPVTLNMNMAMPSWFDIIGLSPDSQEDEHGIKQAAENVKALIDQEVKNGIPSARIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVVGLSCWLPLRTSFPQGPISGANKDISILQCHGDFDPLVPLMFGSLTVEKLKTLVNPANVTFKTYEGMMHSSCQQEMMDVKQFIDKLLPPVD	663919	690732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_676735_676802_677759_677808_681283_681355_681594_681669_684219_684322_685194_685372_689105
525746	contig_15063_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_10639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525747	contig_15063_pilon	+	1297	4	Intergenic	novelGene_14299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525749	contig_6735_pilon	+	1569	11	Intergenic	novelGene_15797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAAAGAACTTCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542059	568275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_542603_542792_542860_543008_543291_543787_543896_544853_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547357_551184_551235_552840_552890_568254
525751	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	197	1372	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525752	contig_10496_pilon	-	2505	11	Intergenic	novelGene_59414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	107.762516674398	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	52	1743	64679	38747	FALSE	15	GTTGCATGCTATGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THKAHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64730	37984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47864_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
525753	contig_6047_pilon	+	2674	18	Intergenic	novelGene_24210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	655.494087135724	2	121	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	277	2415	107251	123624	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105195	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105261_106250_106370_107158_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115140_115892_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
525754	contig_18272_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_7090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539664	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539700_541800
525755	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_10381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TATTCTCCTTATACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525757	contig_15063_pilon	+	1675	7	Intergenic	novelGene_12969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	30	AGGCACTTGTGGCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28173	39727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525758	contig_6102_pilon	-	1711	9	Intergenic	novelGene_32144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	169	651	867239	839973	TRUE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867407	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839451_839535_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
525759	contig_12357_pilon	-	2181	12	Intergenic	novelGene_6082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53908	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30324_30936_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42249_46434_46558_51127_51238_52758_52839_53167
525760	contig_5643_pilon	+	1916	10	Intergenic	novelGene_39028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	804.173849516952	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	376	1128	631988	636350	TRUE	15	CATTGTGTGTGTAGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTVGSASHTGGEALGFPVSWGYLGPEIPGQSQS	631199	641596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631884_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636469_640757_641244_641412
525761	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
525762	contig_14415_pilon	+	1783	4	Intergenic	novelGene_77623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	227.216979021277	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	53	472	33410	38183	FALSE	10	GCCTTTTCTCTCAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTGGFSRDCTTASEAPARRPQARPQEVLLSLPAGRSRGSRWHLCQLARPCLHGVESGPHEAWSQPRSLLPVRAAWVPGV	33357	39494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36220_37971
525764	contig_15897_pilon	-	4025	2	Intergenic	novelGene_49558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	0	355	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	456	1307	699309	682019	FALSE	25	AAAGTAGGCCTGGCGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLPWDCWPSLEIRAVLCAMGCIQSIGGKARVFREGITVIDVKASIDPIPTSIDESSSVVLRYRTPHFRASAQVVMPPIPKKETWIVGWIQACSHMEFYNQYGEQGMSSWELPDLQEGKIEAISDSDGVNYPWYGNTTETCTIVGPTKRDSKFIISMNDNFYPSVTWAVPVSESNVAKLTNIYRDQSFTTWLVATNTSTNDMIILQTLHWRMQLSIEVNPNRPLGQRARLREPIAQDQPKILSKNEPIPPSALVKPNANDAQVLMWRPKYGPPLVVIPPKHR	699764	679300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_682548_698986
525765	contig_15063_pilon	-	1525	5	Intergenic	novelGene_12869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	779	1102	35891	35108	TRUE	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36172_36284
525766	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2382.00592988347	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	6	1421	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
525767	contig_11855_pilon	+	2130	3	Intergenic	novelGene_66937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	449	1387	1003891	1004925	FALSE	35	AATTAAAGATGCTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQPSQPPLPPPPPPPQQQQQQKTSALPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSNQQFQPVMAN	1001547	1005668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747_1004688_1004783
525768	contig_9415_pilon	-	697	6	Intergenic	novelGene_109940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	235.666713814234	35	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTCCTTCTGTCTCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2479356	2465575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2465660_2466910_2467173_2468096_2468220_2470587_2470634_2472695_2472746_2479224
525770	contig_15063_pilon	+	1505	5	Intergenic	novelGene_12101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	45	AAGTTGTATGTTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525771	contig_12644_pilon	+	1240	9	Intergenic	novelGene_44624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	4791.61524012258	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	163	1152	2678055	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCGSRRVERSVAFSPCHGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
525772	contig_5954_pilon	-	2166	12	Intergenic	novelGene_28610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	457.161219008447	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1095	1805	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956875	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947707_947842_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956500_956705
525773	contig_2100_pilon	-	1752	12	Intergenic	novelGene_50711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	847.64995504099	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	213	1406	1180240	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPWSSGTMIRPGIWGKVRVGPIGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180170_1180286_1182727_1182822_1185420
525774	SIRV6	-	782	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	27	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTGGTTTCACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11666	2738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
525776	contig_1516_pilon	+	1890	9	Intergenic	novelGene_49963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1093.90949551368	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	109	1251	347241	363092	FALSE	10	CACCTGTTTCCTCTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335173	363731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356422_362985
525777	SIRV6	+	896	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	160	654	1733	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525778	contig_8357_pilon	-	2304	17	Intergenic	novelGene_39738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	291.341663419	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	5	1651	818294	762891	FALSE	10	CTTTATCTTGATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPPVMERGLKSVVWQMVENIYKSREPVRQMKALYFVSPTSKSVDCFLRDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDSLFNKIKASCSKSIRRCKEINISFIPLESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPSNANGKDAVMETMAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818298	762237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_818245
525779	contig_12786_pilon	+	1651	11	Intergenic	novelGene_103420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTGACGAGCGGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590851	629490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_591049_592787_592933_593213_593424_600791_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614084_615627_615731_628319_628466_628732_628940_629304
525781	contig_4413_pilon	+	3640	4	Intergenic	novelGene_116990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	42.8978113919839	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3020	3361	139615	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	136595	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_139682_142574_142691_151580_151609_152230
525782	contig_12425_pilon	-	1592	6	Intergenic	novelGene_46693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	643.143840831893	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	259	669	211055	204225	FALSE	35	CAATAAAAGATTTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMFKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226631	203301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207234_211041_211200_226517
525783	contig_16740_pilon	+	3851	1	Intergenic	novelGene_116995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	318	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGCTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20649	24500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16740_pilon_+_20600_24500
525784	contig_4845_pilon	-	3036	2	Intergenic	novelGene_53722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	318	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	514	1608	1064773	1059594	FALSE	25	TATATTGTGTGTGGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRAPLKRSRILHMALMAASDPSGEAQASEEKPFLLRALQIALVVSLYWVTSISMVFLNKYLLDSPSLQLDTPIFVTFYQCLVTTLLCKGLSTLAACCPGYVDFPTLHLDLRVARSILPLSVVFVGMITFNNLCLKYVGVAFYNVGRSLTTVFNVLLSYLLLKQTTSFYALLTCGIIIGGFWLGVDQEGAEGTLSWVGTLFGVLASLCVSLNAIYTKKVLPVVDGSIWRLTFYNNANACVLFLPLLLLLGELQALRSFTHLGSAHFWGMMTLGGLFGFAIGYVTGVQIKFTSPLTHNVSGTAKACAQTVLAVLYYEETKSLLWWTSNMMVLGGSSAYTWVRGWEMKKVQEEPSPKEDEKSLLGV	1065286	1058165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1060154_1064238
525785	contig_12120_pilon	-	3789	7	Intergenic	novelGene_21403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_5	575.762513734806	1835	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2755	3093	21900	21562	FALSE	0	TCCTGGTTTGGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEFKK	156974	20865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_123278_123397_156911
525786	contig_2100_pilon	-	1620	12	Intergenic	novelGene_50719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	838.285706438941	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	113	1372	1182812	1170170	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRPGLRGLR	1185523	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170195_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
525787	contig_8020_pilon	-	2885	10	Intergenic	novelGene_114387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	63.7930682406447	5	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1290	1715	149892	148058	FALSE	35	ACCAGAATAAACCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	153220	146887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149988_150366_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151708_152036_152321_153168
525788	contig_593_pilon	-	2296	7	Intergenic	novelGene_101972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	118.129049019376	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	85	771	118610	110585	TRUE	20	ACTCATTGTGTTGCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSEIFVELQGFLAAEQDIREEIRKVVQSLEQTAREILTLLQGVHQGAGFQDIPKRCLKAREHFGTVKTHLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGIEPDREKGFHLDVEDYLSGVLILASELSRLSVNSVTAGDYSRPLHISTFINELDSGFRLLNLKNDSLRKRYDGLKYDVKKVEEVVYDLSIRGFNKETAAACVDK	118694	108814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_109154_109398_110819_113012_113093_113732_113849_116125_116223_117343_117438_118544
525790	contig_3424_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_55481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	106	1824	163695	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFGCSRGAWAPAEPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149898	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168783_169148
525791	contig_5988_pilon	-	1619	4	Intergenic	novelGene_15964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	4	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	30	AAGAAAGGTTTTTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
525793	contig_3077_pilon	+	1517	10	Intergenic	novelGene_26707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3688.4782000303	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	402	1085	13867	17590	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10101	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17754_17814
525794	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_11043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525795	SIRV4	+	506	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	11	433	11	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
525797	contig_1861_pilon	-	2054	17	Intergenic	novelGene_77660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_14	113.339075758319	1154	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	395	1945	104869	87440	FALSE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115247	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106035_106083_106881_106923_112515_112582_115124
525798	contig_10082_pilon	-	2690	16	Intergenic	novelGene_63846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_15	121.749469540254	876	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	96	1649	198528	128693	FALSE	0	TTGTGTCCCCTGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGCRRSPGGGNRFSSAFPSWRSQQDPGSLVTMGDPSKQDILTIFKRLRSVPTNKVCFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGSHRSLGVHLSFIRSTELDSNWSWFQLRCMQVGGNANASSFFHQHGCTTSDTNAKYNSRAAQLYREKLKSLASQATRKHGTDLWLDSCVVPSLSPPPKEEDFFASHVSPEVSGTAWASAQAEPSTLMPRAMGTTPENNEGGPEQGPSVEGLNTATKAALEVSSIIKKKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLASKNFNEIEKQAQAVDKVKEQEDRLARAAPKEESMVASLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKTVESERLGMGFGNCRSAISHSVTSDMQTIEQETPITAKPRKKYSEDNDDSYFTSNSRYFDEPMELRSSSFSSWDDSSDSYWKKEAIKDTDTILKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSDMYFGRQAQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEQRKQPSGNYNLTSVLPAAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVMTSIQDRYGS	198623	127651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_128711_131093_131216_142328_142420_145619_145744_152999_153132_160521_160645_161094_161224_167892_168036_168681_168729_170066_170127_174231_174320_178513_178598_178963_179096_182032_182106_188982_189102_198459
525799	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525800	contig_14405_pilon	+	2840	19	Intergenic	novelGene_85628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_18	273.678418117341	703	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	67	1614	351768	428649	TRUE	35	ATGTCAAGAAAATGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGVGTSGPASGPEAAVARRPGMAFMEKPPAGKVLLDDTVPLTAAIEASQSLQSHTEYIIRVQRGISVENSWQIVRRYSDFDLLNSSLQISGLSLPLPPKKLIGNMDREFIAERQKGLQNYLNVLTTNHILSNCELVKKFLDPNNYAVNYTEIALQQVSMFFRSEPTWEVVEPLKDIGWRIRKKYFLMKIKNQPKERLVLSWADLGPDKYLSDKDFQCLIKLLPSCLHPYIYRVTFATANESSALLIRTFNEKGTLKDLIYKAKPKDPFLKKYCNPKKIQGLELQQIKTYGRQILEVLKFLHDKGFPYGHLHASNVMLDGDTCRLLDLENSLLGLPSFYRSYFSQFRKITTLESVDVHCFGHLLYEMTYGRPPDSVPVDSFPPAPSMAVVAVLESTLSCGACKNGMPTVSRLLQMPLFSDVSLTTSEKPQFKIPTKLKEALRIAKECIEKRLIEEQKQIHQHRRLTRAQSHHGSEEERKKRKILARKKSKRSAIENSEEHSAKYSNSNNSAGSGASSPLTSPSSPTPPSTAVEHAPF	351701	434011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_351870_374857_374909_377440_377489_385722_385910_399701_399780_400567_400642_401404_401480_405954_406060_406590_406693_408162_408325_408731_408850_410043_410123_412693_412743_414456_414535_415065_415153_415607_415678_418804_418868_428629_428652_432787
525801	contig_1865_pilon	-	2101	11	Intergenic	novelGene_103235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	99.2411708919237	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	179	1390	87883	41886	FALSE	20	ATTTGGATTAATGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLQEAGVSIPKGHVAKSPDEAFAIAKKLGSKDVVIKAQVLAGGRGKGTFESGLKGGVKIVFSPEEAKAVSSQMIGKKLFTKQTGKKGRICNQVLVCERRYPRREYYFAITMERSFQGPVLIGSSQGGVNIEDVAAETPDAIVKEPIDIVEGIKKEQAVRLAQKMGFPHNIVDSAAENMVKLYRLFLKYDATMVEINPMVEDSDGAVLCMDAKINFDSNSAYRQKKIFDLQDWTQEDERDKAATEANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIKLHGGTPANFLDVGGGATVLQVTEAFKLITSDKKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGTRVDDAKALITDSGLKILACDDLDEAAKMVVKLSEIVTLAKQAQVDVKFQLPL	93257	41174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52489_52962_53084_56299_56443_56538_56701_68472_68612_72073_72203_76048_76212_76399_76500_87792_87958_93153
525802	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_9870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3765.54757712017	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	239	1045	34808	36299	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLPST	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36175_36287_36600_38975_39092_39506
525803	contig_12427_pilon	-	1983	6	Intergenic	novelGene_40529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1198.64616964307	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	218	622	522337	506035	FALSE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGANFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578169	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510449_520363_520440_522284_522346_577960
525804	contig_3975_pilon	-	1937	13	Intergenic	novelGene_54794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	332.639225237594	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	248	1339	2027160	2016131	FALSE	10	TACTCTCCCGAGCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLNSCAPSAQTTCPSTASRCKDKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052451	2015532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021665_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
525805	contig_990_pilon	-	2141	5	Intergenic	novelGene_76117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	138.121323480482	634	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACCTTTGTGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605906	1585412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605848
525807	contig_6048_pilon	-	2304	15	Intergenic	novelGene_73282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	88.0791909451433	12	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	14	1522	2006289	1979496	TRUE	20	TATTTGCCTGAGATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLCIFWPFCRTTRPCGPPSTTCVSCCLGSRPATTLLPRPPRSTPTLCTSVPWSWSTRPRLTESTRAWPPAGCGPRSLLRKTATRLWCPYLCASPSSACPSRPPRLSSWWAPALALPPS	2006302	1978453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980156_1980579_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110
525808	contig_12837_pilon	+	1713	8	Intergenic	novelGene_57298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2396.61311190673	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	378	821	129778	166049	FALSE	10	GTTGGGATTTGCTTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128548	166941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128795_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
525809	contig_13863_pilon	+	1758	10	Intergenic	novelGene_42027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	1019.0328869528	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	182	847	99254	116127	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVAAKPELCEPRAWGRALRWHYCCCWLEPEDPPAVLSTPSRRASTERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRFCQ	98313	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98452_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_116114_116144_118886_118965_119571
525811	contig_3269_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_116998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATAAAATGATTCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35922	34931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_34900_35900
525812	contig_8978_pilon	+	2334	11	Intergenic	novelGene_49400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	271.566363896562	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	74	1441	339807	347248	FALSE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAAQELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331589	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343803_344193_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
525813	contig_1225_pilon	+	2144	4	Intergenic	novelGene_44106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	542.098597018005	122	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	159	524	147032	148934	TRUE	20	TCTTGCATTGGCGCAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134365	150597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007_147173_148709_149555_149597
525816	contig_5643_pilon	+	1819	7	Intergenic	novelGene_38862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4812	junction_2	1753.86050376496	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1117	1419	237186	237679	TRUE	35	AAAGTATACTGTACCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVQRGQGAGFPCGPT	235775	238174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237819_237913
525817	contig_4469_pilon	-	1227	1	Intergenic	novelGene_21960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCACTTTTGAAGTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756622	755395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_755400_756600
525818	contig_8435_pilon	+	2201	4	Intergenic	novelGene_72014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	41.6839963961657	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	624	1961	94334	97774	FALSE	5	CTGTGAGCTGCTTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQWVSSTSPTQRTSLTRPHLETLWASC	91119	98014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_95334_96398_96659_97696
525819	contig_8538_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_4679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	133	366	842828	843061	NA	20	ATAGTGTTGTTTATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842695	843130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
525820	contig_3077_pilon	+	1340	7	Intergenic	novelGene_26698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_4	4366.14820395379	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	422	847	15160	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_16328_17449
525821	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525822	contig_12622_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_5978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGAGGCCCACACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583557	1588608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585706_1586269_1586406_1586527_1586838_1587626_1587784_1587863_1588042_1588434
525824	contig_20276_pilon	+	1441	1	Intergenic	novelGene_117050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTTATAAAAAGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11352	12793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20276_pilon_+_11400_12800
525825	contig_6576_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_42448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGTAGAGACTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305798	1303766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303800_1305800
525827	contig_1948_pilon	+	3544	2	Intergenic	novelGene_31148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1180	junction_1	0	22	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	2175	2948	122946	123719	FALSE	5	CGTGTTGTTGTTCTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSKKTYNSFQDELEDYIKVQKARGLEPKTCFRTMREDYLETFGYKEEVDSRPKYRMSDQRLPSETVQTYPGSYNIPQTLENQLPQRLPAHDSRLRLGSPSYCQFTTDYSSEKPVPLNLSQQEYNCGSYSGESAVYKHLSSENSTSAHQASHKQLHQKRKRHPEEGREKPEEERPKHKKKKSCEEMDLDKHQSIQRKKAEVEAVSVSTEKLKNRKEKKSREVSSKKEERKRRKEKKDQGQERTEEEMLWDQSILGF	117493	124315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_119646_122923
525828	contig_3975_pilon	-	1641	5	Intergenic	novelGene_54919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	207.539755227764	278	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2	400	2244180	2239007	FALSE	35	GTAAATGTGATGAATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPARRPRSCASSSTCSQVTRGVPPPPTVRGAPTPRARTAGIQRIPLPPPPAPETYEEYGYDDTYAEQSYEGYEGYYSQSQGDSEYYDYGHGEVQDSYEAYGQDDWNGTRPSLKAPPARPVKGAYREHPYGRY	2244181	2237765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2239105_2241779_2241839_2242857_2242926_2243441_2243565_2244129
525829	contig_8772_pilon	-	1378	9	Intergenic	novelGene_21114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	893	1222	19240	15784	FALSE	20	GGCGTCGGCCAGCGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23353	15627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19359_19989_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
525830	contig_9345_pilon	+	1866	5	Intergenic	novelGene_24344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGTGCCGCGGCCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141100	176097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_142417_142570_142781_148866_148948_173643_173789_175983
525832	contig_10058_pilon	+	3022	9	Intergenic	novelGene_67729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	131.449550683903	1	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	61	879	72602	99369	TRUE	30	TCACATTGAGTTTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72541	101638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532
525833	contig_9482_pilon	-	2327	8	Intergenic	novelGene_44287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	138.183994465823	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1583	2098	1238984	1236365	FALSE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253166	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1244342_1244471_1245325_1245387_1253059
525834	contig_2438_pilon	+	3123	1	Intergenic	novelGene_111993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	423	1272	142	1413	176662	177933	NA	70	TGTAATACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSKHWGEWFLNLRVLPAGVFGVAFLARVALVFYGVFQDRTLHVRFTDIDYQVFTDAAGFITKGRSPYLRATYRYTPLLGWLLTPNIYLSELFGKFVFISCDLLTAFLLYRLLLLKGLGRRQACGYCVFWLLNPLPMAVSSRGNADSIVASLVLMTLYLIEKRFVACAAVFYGFAVHMKMYPVTYILPIVLHLLPERDNEEGVRQSRYSLQGRLYEFLKRLCSWAVLLFVAVAGLTFFALSLGFYYKYGWEFLEHTYIYHLTRRDIRHNFSPYFYMLYLTAESKWSFSLGIAAFLPQFVLLSAVSFAYYRDLIFCCFLHTAIFVTFNKVCTSQYFLWYLCLLPLVMPLVRMPWKRAVALLMLWFMGQALWLAPAYLLEFQGKNTFLFIWLAGLFFLLINCSILIQIISHYKEEPLAERIKYD	176520	179643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_176500_179600
525836	contig_3975_pilon	+	2875	10	Intergenic	novelGene_54770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	94.3666346141212	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	400	1599	1965812	1984755	FALSE	10	GGGCTTTTCTCTTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1964333	1986031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1964712_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
525838	contig_5033_pilon	-	1659	11	Intergenic	novelGene_28988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3561.4652391958	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	24	980	566787	532034	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVF	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531163_531533_532039_535023_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
525839	contig_15434_pilon	+	2684	7	Intergenic	novelGene_56690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	419.613711247222	13	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1965	2507	31167	33302	FALSE	15	TGATTTGTTTGTGACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26573	33479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
525841	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10351	80	1114	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
525842	contig_2078_pilon	+	2601	13	Intergenic	novelGene_100188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1203	1622	529532	530319	TRUE	35	GCTCAGATGAGGTCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQREVEGHSSSRGGRVVPQDDILMIEPVQDRGRASLGLTVKLHHIPHHTLGPGSPEGEDRTRHWNSHDDCNPLAEDGAVNVVSCTVVSASIAFLHSEDWQLCPQGTLRLSSQTYSAFSVPGECDSACTLGYRADKD	505131	535450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_505666_505745_505778_508728_508798_514637_514725_515321_515345_521684_521793_522157_522433_529457_529735_530102_530387_531774_532061_532301_532572_533234_533481_535340
525843	contig_11285_pilon	-	2075	20	Intergenic	novelGene_5683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	379.537333153957	10	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1073	1885	787803	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796692	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_793775_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604
525845	contig_6048_pilon	-	2475	16	Intergenic	novelGene_73272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_14	100.361657131707	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	284	2104	1993762	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2006275	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2004860_2004942_2006110
525846	contig_7151_pilon	+	2415	6	Intergenic	novelGene_40756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.990784105557	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	187	528	504080	507901	TRUE	10	CCACTTGTGGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKISSHMRISQNSPATMMAQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	503145	509829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_503212_503293_503387_504052_504143_506568_506685_507738_509347_509387
525848	contig_5643_pilon	+	1311	12	Intergenic	novelGene_38825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2351.35752947206	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	102	1103	233973	237983	FALSE	10	GCCACCTCTTTGTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233694_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
525849	contig_11720_pilon	+	1965	14	Intergenic	novelGene_43996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_2	372.058546643102	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	142	1710	263896	272210	FALSE	30	ATTTATTGAGTACCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLHRAWLSHEHRFPGPRKHRVGSAGWCRGWIQRWPAWMEFQGEGVKFKMGQKRIPRQTLQRLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	263754	272465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
525850	contig_165_pilon	+	2157	14	Intergenic	novelGene_117055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	296.327221978014	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	178	1392	45144	71673	FALSE	10	CTACCTTGTGGAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLQQEEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	44732	72438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_44878_45111_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
525851	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525852	contig_9471_pilon	+	1704	11	Intergenic	novelGene_21794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_3	717.024797339674	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	893	1477	414749	417296	FALSE	25	ATATGAATCTGCATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCFFLLFAFLIIIYDFQKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	407007	417523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
525853	contig_12644_pilon	+	1476	9	Intergenic	novelGene_44625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5476.99057421135	7	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	417	1388	2678073	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675673_2677223_2677396_2678027_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
525855	contig_15087_pilon	+	2075	20	Intergenic	novelGene_37185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	299	607	110940	114589	TRUE	15	GCAGCCTCAGCGCAGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQSGLVMETGSQQGCASKLEILVLTTTDSQQGLQEVSGGVALNGLVERCVIFLNEFPPDIQQVDLTPGDHDPGESLLIRASALSWICKVCRQKKRGLFLTL	110641	181166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116908_118079_118173_136612_136665_138314_138374_139527_139650_141726_141787_143036_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149623_149716_150479_150574_158909_158954_164745_164866_181067
525856	contig_18272_pilon	-	2781	9	Intergenic	novelGene_6979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	547.020109319575	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	173	1315	184352	122209	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262841	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184437_262753
525857	contig_854_pilon	-	2095	5	Intergenic	novelGene_36132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	230.351226391352	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1102	1674	471014	470442	FALSE	0	CCTGGGGCTCTGTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	509319	470020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471802_493167_493197_495173_495239_497487_497571_509182
525859	contig_5935_pilon	+	2007	2	Intergenic	novelGene_102682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	0	827	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	402	986	775541	783172	FALSE	70	GTAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKAGPIPVHVMSSFEDVDTEETVTCLQMTLYHPGLLQTGIFQSIRFCHREKLSSSEVVKFGRNATICRYTFLDKQVSRVQFSLQPFKDFSSSVLSFEIKNMSKKTSLIVDSRELGYLNKTNLPYRCMVRFGDYQLLMEKEDGESLDFFETQFILSPRPLSQENICAATNPVPENGNCSTRSTSPTEMDENEA	775139	784193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_775553_782599
525860	SIRV4	+	1449	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	21	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	31	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1677_1886_2389_2950_3044
525862	contig_1639_pilon	+	2347	22	Intergenic	novelGene_74884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	259.88440653857	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1442	2227	312944	331594	FALSE	40	CTTTATACAGAAGCACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQQLRFLQHQMAVAAAAAQRAQLRRHRHPGSQSGSKVKRGAPATPQL	279872	331714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280008_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309215_312794_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
525864	contig_8823_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_53067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68869	66721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_66700_68900
525865	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_8927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525866	contig_4105_pilon	+	2086	11	Intergenic	novelGene_21454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	106.407894443974	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	94	1227	60529	73617	FALSE	30	TATCAGAACTGCCGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEAAVWA	58723	74476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72734_73600
525867	contig_500_pilon	+	2491	7	Intergenic	novelGene_31076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	702.940194231819	20	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	608	754	1496587	1496733	TRUE	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAPWPTTASWWSPSAATPGTRTAPVSACRAVGAGEIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMA	1492650	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492758_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1498078_1498882_1498974_1499277
525868	contig_9833_pilon	+	1780	11	Intergenic	novelGene_68528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	447.072074726212	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	40	1008	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATACALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230783	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250176_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
525869	contig_9345_pilon	-	1653	5	Intergenic	novelGene_24377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	589.702202386934	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	181	591	142974	142170	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLLCTCGFL	143764	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142194_142258_142414_142567_142781_142955_143072_143681
525870	SIRV6	+	1143	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	767	116	-431	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	43	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	148	480	2002	10736	TRUE	20	CGATGCGGTCTTCAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1854	11709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525871	contig_5019_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_109185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	FALSE	15	TTGTGAGTTTTTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
525872	contig_9233_pilon	+	2804	5	Intergenic	novelGene_78242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6087792521477	515	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	95	403	582395	676460	TRUE	0	TCTTGTGGTTCCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRPARLSSVHSLLAREPAVAASQSCGTRRTMSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582300	679052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346_677799_677989
525874	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_12066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
525875	contig_16098_pilon	-	1302	8	Intergenic	novelGene_46129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1994.26054016039	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	495	1097	457605	456273	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPLQRKKNPADSGAVPLKGLVPPPCYPPPPELNRLHSFWNAPPNPGVGDERCVRSRSPPAALRRCSPQVHPSSGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460379	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458508_460155
525876	contig_5018_pilon	-	1733	9	Intergenic	novelGene_47049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	680.831832668685	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	70	1173	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401437_1402011_1402078_1402260_1402363_1402701
525877	contig_13894_pilon	+	1350	3	Intergenic	novelGene_62029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCGAGGGAAAAAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286209	288251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_287123_287219_287537_288131
525878	contig_15063_pilon	+	1263	5	Intergenic	novelGene_14231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	62	1093	34808	36632	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34746	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
525881	contig_4732_pilon	+	1917	3	Intergenic	novelGene_75430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	506	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	626810	629551	FALSE	60	CTAAGAAAAGTAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHLRLHSRLEAVGLIALTIALFTIYVLWTLVSFRYHCQLYSEWRRTNPLTGSRVTRFPGFLHTVGYDETDGCSPKLHTERAPRSHPEVHSAPFPAGSHGWHVRGPGKFRQASCAFLPLADLLPWHP	626809	631087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_626900_629018_629068_629309
525882	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525885	contig_15063_pilon	+	1060	5	Intergenic	novelGene_9625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	240	860	34808	36603	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYGGPVPPGDREDRGQVHW	27129	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_35948_36550
525886	contig_12008_pilon	+	1691	7	Intergenic	novelGene_24994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_3	500.267150852644	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	30	TACACTGAAGGGTTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	39935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34714_39002
525887	contig_9290_pilon	-	1868	12	Intergenic	novelGene_77540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	366.982063200293	15	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	360	1529	489960	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497059	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487641_489959_490037_491390_491545_496930
525888	contig_15720_pilon	-	1333	7	Intergenic	novelGene_41876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1205.18209781298	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	982	1287	279842	278542	FALSE	15	TTGGAAGTGTCTTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283996	278495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281935_282577_282750_283785
525890	SIRV6	-	404	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACGATTAGGCGCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
525891	contig_5023_pilon	+	1632	7	Intergenic	novelGene_7347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2134.83804355792	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	151	630	611764	647201	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLLQASPLSPSPLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	609651	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618562_647062_647643_647740
525892	contig_10324_pilon	+	1288	7	Intergenic	novelGene_7717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1019.10299610327	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	23	571	51839	79563	FALSE	20	CTGTGTGGACAGACCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPTSLEASHWVLCPWVTTPSPTGLTRGPITALPPHPVTTPKKNQLPLSRFQLIATL	51816	80280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69017_79390
525893	contig_16492_pilon	+	2376	10	Intergenic	novelGene_100268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	92.1460193871059	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	108	1622	78509	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQEATNQLLDVNLFENQRFVKVTESGHRSESEHLEVTVGATVPTGFEQTAADEVREKLGSSCKISKDRGKIYFDISVESLAKVHCLRSVDNLFVVVQEFKDYQFKETKEEVLKDFEDLAGKLPWTDPLKVWKINTSFKKKKAKRKKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76784	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78764_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
525894	contig_5981_pilon	+	1850	10	Intergenic	novelGene_35487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	286.483447047292	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	87	1364	23508	37933	FALSE	15	TTTTTTGTGTCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSAVARLIVSHPAGVSDHPDELMDSCWSMCNF	23421	38419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612_37747_37836
525895	contig_3077_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_26622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_7	3271.29454497757	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	105	956	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9571	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_17449
525897	contig_11752_pilon	+	1439	7	Intergenic	novelGene_37596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1733.22974049413	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	294	1163	87165	94417	TRUE	60	GAGAAACAAATAAAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84087	105861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85214_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94430_105597
525898	contig_15063_pilon	+	1468	4	Intergenic	novelGene_14160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	840	1328	36064	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34659	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35384_35839_36158_36266
525899	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525900	contig_7182_pilon	-	2349	5	Intergenic	novelGene_117093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	399.409564232005	1408	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	430	651	102351	92559	FALSE	20	TTTTGGTGGTAATTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGAEPRSERAECLCAGGFLAERGASRQLPTELGLPTHRTKELSACAHKAFWQSEVPLGTYQWSYRALEHLPQQGRCGREAQGAERPHRKQKLKRQGTQEAELPQSQKINLRLILVSGKTKEFLFSPNDSASDIAKHVYDNWPMDWEEEQVSSPNILRLIYQGRFLHGNVTLGALKLPFGKTTVMHLVARETLPEPNSQGQRNREKTGESNCCVIL	190501	90860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347_102457_190177
525902	contig_546_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_117220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGATGCCACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131764	129666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_129700_131800
525903	contig_9848_pilon	-	2750	7	Intergenic	novelGene_79983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	491	junction_2	534.058595411902	1629	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	27	773	149215	130372	FALSE	35	CTTACATAATATTTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGMGGSRESRGGWDSRDDFNSGFRDDFLGGRGGSRPGDRRTGPPMGSRFRDGPPLRGSNMDFREPTEEERAQRPRLQLKPRTVATPLNQVANPNSAIFGGARPREEVVHKEQE	149241	128394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_130512_130796_130935_134184_134245_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
525904	contig_4223_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_117279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGACACCAGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273342	273794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_273300_273800
525906	contig_7342_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_71174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1174	1509	473910	473575	NA	30	CCACATATGCATGCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKQGDAHSEPQFPHRDGSLDGWGGLQTQVAESRTQSGEAGVHLSLGPREAQLPLCVSVCTLPRPPCCLPPRSKSQPQGAGPAARQLQCKQNCPRRPQGGVLSNAHHTQG	475083	473563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_473600_475100
525907	contig_3095_pilon	+	1182	6	Intergenic	novelGene_75003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2979.94225447407	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	66	638	147241	151002	TRUE	15	ATTGGATGGGTCTTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETISPSCPQWTSSMTARWITGVSTSRSSSTGS	147175	152232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150566_150608_150696_150996_151163_151848
525908	contig_9807_pilon	+	2011	9	Intergenic	novelGene_32871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	731.359820813257	17	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	104	790	109130	156718	TRUE	5	CTCTGGAGTTTTTTTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGWSQSSAWPTATQRTMFSTDTMRRSSAWLGPRTTSTLPLVAWT	109026	159634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_154234_154270_156624_156770_157171_157384_158676
525910	contig_12638_pilon	+	2035	10	Intergenic	novelGene_33394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	86.8802212215541	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	48	1346	1515842	1538931	FALSE	30	GGTTTATAATGTGTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515794	1539620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
525911	contig_5718_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_110451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGTTACAAAGAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624363	1623866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1623900_1624400
525912	contig_10011_pilon	+	3031	9	Intergenic	novelGene_68083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	96.2467531919908	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	71	1828	322928	332126	TRUE	10	TTATTAGTGTGGCTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCRPRQ	322857	334174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331016_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
525913	contig_7151_pilon	-	2312	7	Intergenic	novelGene_40664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	74.8479941095433	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	347	949	12708	5915	TRUE	25	AACCCAATGTTTTTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREG	13054	1820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_6259_6347_6390_12491
525915	SIRV6	+	1201	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	762	63	-436	-62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	153	485	2002	10736	TRUE	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
525916	contig_13216_pilon	+	2815	3	Intergenic	novelGene_47502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1286	junction_2	737.5	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1326	2297	256031	261012	FALSE	55	AATAAAATATTTTTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFLQFSQDENGVISLHIKRSHAFLLFFMQTVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	254705	261530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_256296_258447_258573_260430
525917	contig_10581_pilon	-	1097	3	Intergenic	novelGene_41403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	55.5	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCTTGTTTTGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613819	609101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_613632
525918	contig_19342_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_41057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	35	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	29	346	3263	5115	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWASTQRILP	3234	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3849_5087_5293_5413_5522_5960_5994_6139
525919	contig_15087_pilon	-	2590	20	Intergenic	novelGene_37154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.173645102207	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	605	1969	66689	38999	TRUE	30	AGATCAGCATTCCATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89776	33333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33555_33679_33972_34045_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
525920	contig_4392_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_117331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAGAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537673	539415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_537700_539400
525923	contig_2637_pilon	+	3153	6	Intergenic	novelGene_100023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	25.4275441205005	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	155	532	38745	46419	FALSE	25	ATACTGCTTGCTTAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNRNAKKCDKEEKAEKAKIKKAIQKGNTEVARIHAENAIRQKNQAINFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQVAVWILS	13323	49040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_13391_38657_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322
525924	contig_19990_pilon	+	3785	10	Intergenic	novelGene_30746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_2	108.263852362619	555	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	130	1113	12837	76077	TRUE	10	TGCCATCCTTTTTGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVSVFALAPPPGTVERGPPFAWEFCGRLGSAVTSQRAGPAAAMVAKDYPFYLTVKRANCSLEVPPASSAAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNATPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEDLLSQLRDIRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINIKTGNLNAAIIKNGSSTWRKARKTL	12707	84543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_12933_39525_39634_59204_59376_62749_62813_64728_64826_64991_65069_69960_70219_75963_76134_80027_80215_82114
525925	contig_4301_pilon	-	2030	5	Intergenic	novelGene_65081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_1	106.640459020017	549	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGTAAATTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426107	419742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_420175_421107_421196_422457_422553_424140_424210_424761
525926	contig_3095_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_75030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	27164	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
525928	contig_4315_pilon	+	2646	16	Intergenic	novelGene_46729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGGATGTAGATCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147234	162042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_148029_149223_149442_149668_149831_150079_150162_150417_150521_150634_150738_152921_153096_153950_154024_154208_154322_154978_155137_155369_155480_155797_155949_156694_156816_157325_157426_157842_157968_161983
525929	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_14003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	68	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525930	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_14004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525931	contig_8581_pilon	+	2075	12	Intergenic	novelGene_22815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1125	1439	329833	339429	TRUE	25	TACTTGTCAATCTGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTSLVLNFPLVSSSGVIRPSNKRPSLAILTRISRTSSPMYMPLTIFSNSCFPGLREPRSISRSNSVRMSSRDPSSPKAPHSVLMHILPSSPSTRSMYLSSSM	306339	366802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_306725_323386_323432_324016_324166_326006_326310_327805_328044_329828_329981_339262_339448_339552_339653_340260_340357_344624_344746_353025_353177_366652
525932	contig_15063_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_14101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	189	1361	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34619	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525935	contig_6497_pilon	-	1233	2	Intergenic	novelGene_35639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	182	1231	752012	750963	FALSE	50	TGAAATACTCAGACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKE	754452	750960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_752114_754372
525936	contig_6445_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_77022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACCAGTTACTGGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527038	529234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_527000_529200
525937	contig_13707_pilon	-	2040	10	Intergenic	novelGene_43544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	889.628525610688	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	144	1058	278215	270672	FALSE	30	TTACAAAAGTGGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEAIKSPLRAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQHPHHSQRQGGCRSFPGLLIRTSHGLFSLNSPRLLLKDFMCVFKCFS	278358	269689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270813_272429_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_278181
525939	contig_19098_pilon	-	1794	3	Intergenic	novelGene_65782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_2	303	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	117	302	52529	50887	FALSE	10	TGAGCTGTCTGCCTGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTAPVLLTSWPSPPTSCSSSCLDLLLATSLECIWLRTMKFQTWPKNLKKLRRTWRPRRSHLAHEVTPLSVDTPIGPSLKVFSPLNQRLLFPSQPRQIL	63975	49394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_52524_52579_63908
525941	contig_15063_pilon	+	1122	4	Intergenic	novelGene_11286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2640.18383198342	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	231	989	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34888_35873_36158_36266
525942	contig_2768_pilon	+	2356	8	Intergenic	novelGene_57486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	259.164276953788	12	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	17	892	656383	678767	TRUE	20	TATATTCTCGTGAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPAAAMAKGSVAERSQTGALHTTPAGDRAAGTRVPATLGSGHHLKEKAREEAGSARTSLLILVSIFLSAAFVMFLVYKNFPQLSEEERVTMKVPRDMDDAKALGKVLSKYKDTFYVQVLVAYFATYIFLQTFAIPGSIFLSILSGFLYPFPLALFLVCLCSGLGASFCYMLSYLVGRPVVYKYLTEKAVKWSQQVERHRDHLINYIIFLRITPFLPNWFINITSPVINVPLKVFFIGTFLGVAPPSFIAINAGTTLYQLTTAGEAVSWYSVFFLMILAVLSILPAIFHKKLKQKYE	656366	681054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656504_664570_664689_668729_668859_671910_672005_672644_672750_677124_677264_678597_679809_680631
525944	contig_12425_pilon	-	2039	10	Intergenic	novelGene_46687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	769.617573783592	5	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	319	1095	210324	204225	FALSE	20	ACTTGAAATTTGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGEYLLSPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226620	203280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207272_207634_207738_208645_208765_209381_209497_210319_210389_211048_211200_226517
525945	SIRV6	+	370	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	21	94	21	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
525946	contig_8978_pilon	+	2514	12	Intergenic	novelGene_49376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	329.771370838636	26	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	210	1628	339807	347248	FALSE	15	CTTTTAATTTCCTGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331565	348134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_333319_333432_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
525947	contig_15063_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_8851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_5	3576.20623566371	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	244	1386	34808	39538	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	27125	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_39506
525948	contig_20819_pilon	+	2447	5	Intergenic	novelGene_55618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	7.11951543294907	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	977	2254	23331	25305	FALSE	0	TTTCCTGTCTTTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPLGVWQKGDSLVSHSRVWAECSDFISSHIGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	22354	25498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_23643_23798_24004_24175_24654_24809_25033_25245
525949	contig_15459_pilon	+	1774	3	Intergenic	novelGene_106361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	198.5	709	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGGATAATGTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8161	12422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8295_9156_9268_10892
525950	contig_16594_pilon	-	4072	1	Intergenic	novelGene_53919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACCAAATGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288399	284327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_284300_288400
525952	contig_2100_pilon	-	1613	11	Intergenic	novelGene_50702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	923.006657614126	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	259	1266	1176787	1170268	FALSE	15	AAGAGTGCTCTCTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185488	1169920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170334_1171939_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178816_1182727_1182822_1185420
525953	contig_14513_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_70276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	175	390	18880	11918	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11989_18735
525957	contig_6102_pilon	+	2714	4	Intergenic	novelGene_31754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	176.115492409574	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	83	307	259998	261121	TRUE	60	AGGGAAAAAAAAAAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKELQRQASPSIVIALAGNKADLANKRMVEYEEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNDLFLAIAKKLPKSEPQNLGGAAGRSRGVDLHEQSQQNKSQCCSN	259915	263572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_260013_260573_260668_261005_263411_263454
525958	contig_3602_pilon	-	1673	11	Intergenic	novelGene_60642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	286.835510353931	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	12	875	1139393	1107817	TRUE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRSC	1139404	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108574_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
525959	contig_7356_pilon	-	3618	3	Intergenic	novelGene_60353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	2	191	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110657	101388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_104378_108410_108525_110142
525960	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_11856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	227	1402	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27142	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
525961	contig_3426_pilon	-	2753	20	Intergenic	novelGene_57915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_18	190.134388979417	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	462	2492	201351	145330	FALSE	30	TCAGTAAGTTAAATCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGTLKYYLTDNLMFTSIYALIQHYRESHLRCAEFQLRLTDPVPNPNPHESQPWYYERLSRGEAEDMLMRVPRDGAFLIRKREGADSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVNYYEKHALYRKMKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	206919	145068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196585_199924_200045_201190_201392_202899_203077_203772_203863_205426_205532_206870
525962	contig_8978_pilon	+	1908	8	Intergenic	novelGene_49401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	282.250503876921	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	71	1015	339807	347248	FALSE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331592	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342647_344765_344796_345356_345397_345627_345738_347113
525963	contig_15720_pilon	-	1485	8	Intergenic	novelGene_41913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	4	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1141	1446	279842	278542	FALSE	15	TGACTTTTTGGAAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282188_282750_283785
525964	contig_17518_pilon	+	2580	7	Intergenic	novelGene_117352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_4	10.4509436043939	85	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	91	966	7084	28350	FALSE	75	TTTAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCVAIQEANQLREEKTHLEKQSRELQAKCMELENEKFEAIVRARNSIQLLEEANLQKNQALLEEKQKEEDIEKMKETVSRLVQDAAIRTRKEVANTRKQYNVQISRLTEELSALQMECAEKQGQIERAIREKKAVEEELEKIYREGRGNESDYRKLEEMHQRCLVSERSKDDLQLRLKTAENRIKQLEITSSEEISRCQEMIQKLQNVLESERENCGFVSEQRLKLQQENEQLQKETEDLRKIALEAQKKAKLKISKMEHEFSIKERGFEVQLREMEDSNRNSTVELRHLLVTQQKATNRWKEEAKKLTESAEIRISNLK	6993	29964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_7174_9924_10024_14763_14836_19104_19180_21024_21171_22695_22889_28149
525966	contig_3948_pilon	+	2378	3	Intergenic	novelGene_53367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	79	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	210	911	1813956	1860572	FALSE	20	ACAAAGGGTCTGGGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812397	1862039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812478_1813826_1814520_1860434
525967	contig_2100_pilon	-	1691	12	Intergenic	novelGene_50757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	939.998918585627	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	123	1379	1182812	1170252	FALSE	35	TAAAGCATCTGTAGCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQVKNYMEEKFSPSRSRQVHLADLSAWPSTTRSSELKRSWAARLSLPARSSETPSPTKLWAV	1185533	1169939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1172008_1172317_1172451_1173171_1173374_1174204_1174386_1175647_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
525968	contig_12357_pilon	+	1817	13	Intergenic	novelGene_6070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	973.069124385998	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	117	884	26079	35079	TRUE	50	AAATAACCTAATGATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVSLASQGLSSYSSW	25962	53404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34319_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_51399_51524_52759_52844_53169
525970	contig_13740_pilon	-	1695	11	Intergenic	novelGene_34687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2028	junction_1	3526.39834533763	53	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	153	1178	165243	157474	TRUE	40	GAAATTGTGTAATTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165395	156803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
525974	contig_500_pilon	+	1787	9	Intergenic	novelGene_31005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	1087.93795778987	2253	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	656	1069	1496587	1498065	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLARRVDCPESAAGVPAGGAPWPTTASWWSPSAATPGTRTAPVSACRAVGAEIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492755_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882
525975	contig_3948_pilon	-	1888	9	Intergenic	novelGene_53334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	457.829321363322	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	609	1157	1485208	1472006	TRUE	60	TAATGAAATAAATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGVPDCGKS	1490819	1467965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1472032_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485988_1489829_1489929_1490738
525976	contig_12622_pilon	+	2877	18	Intergenic	novelGene_5867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	136.913935030501	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	331	1944	1193197	1212133	TRUE	35	ATGTACAAAACTACGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSSVTGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1185105	1213452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1185179_1185536_1185588_1189822_1190005_1193172_1193325_1195670_1195750_1199073_1199125_1203275_1203399_1203770_1203906_1205405_1205511_1205604_1205714_1206107_1206245_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932_1212958_1213343
525977	contig_500_pilon	+	1338	9	Intergenic	novelGene_31043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.30887492603	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	513	926	1496587	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAQSPPPGCPQEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485765	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1493641_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
525978	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
525980	contig_12790_pilon	+	2191	10	Intergenic	novelGene_35215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.930365880229	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	269	1324	307177	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGSAQGLLNRFQTGALCLLFTANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305931	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307115_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
525981	contig_6163_pilon	+	1262	6	Intergenic	novelGene_103783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	978	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	10	CGAGTCCTTCTGCTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
525983	contig_15063_pilon	+	1459	6	Intergenic	novelGene_14306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	331	1215	35271	39515	FALSE	15	TATTCTCCTTATACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34828	39759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
525984	contig_10235_pilon	+	2190	5	Intergenic	novelGene_46448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	210.23959546194	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	297	644	211007	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWRTGPIVGLPTLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210710	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211210_211285_211662_211704_211834_211924_212047
525985	contig_16098_pilon	+	2057	13	Intergenic	novelGene_46139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	833	1474	457627	462124	TRUE	10	TCGGTCTAGCCAGCCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPNFQHTAPFGKVSSVLLILGTALRQPIQPLGGGLAICSCQGYHTLVNLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASCGLICSQDALARSHNAMSDFKKLLLLLRGQCWVLVGHGVGGGRFLALQRKFLPWKSRLRHLVVKGNKSLGRDLQIYTVYWERERGGQGYLPEH	456069	468495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456666_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458621_458707_458842_461685_461768_462060_462469_466709_466867_468166_468204_468450
525987	contig_8394_pilon	-	1766	3	Intergenic	novelGene_27316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_1	170.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	262	1506	35322	32466	FALSE	50	TAAGAATATAAAATTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	38815	32205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35523_38754
525989	contig_3789_pilon	+	2136	6	Intergenic	novelGene_79842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	242.370790319296	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	192	551	445610	465911	TRUE	10	CAGTGTTTTCCATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETVADDSSDNVSTLCLGAAEQRHDCVILVWNTI	445418	473622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_465816_465913_467056_467110_468585_468697_472202
525990	contig_10042_pilon	+	1559	9	Intergenic	novelGene_79099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	304.23253852933	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	10	1065	6321	53598	FALSE	80	AAAAAAAAAAAACAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKR	6311	54092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_49649_53594
525991	contig_12873_pilon	+	1848	5	Intergenic	novelGene_27218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_1	1003.98369010657	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	970	1461	17896	19855	FALSE	30	ATTGTACTTTGCTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16448	20242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
525992	contig_4908_pilon	+	2477	8	Intergenic	novelGene_117368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.298642197926	593	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	58	504	43788	51485	TRUE	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRSLAVSFAVLVVLLWGAPRSHGRRSDVRVITDGNWKELLEGEWMIEFYAPWCPACQNLQPEWESFAEWGEDLEVNVAKVDVTEQPGLSGRFIITALPTIYHCKNGEFRRYQGPRTKKDFINFISEKEWKNIEPVSSWFGPGSIL	43730	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_43940_48113_48230_49589_49636_51352_51486_53578_53625_53724_53827_53950_54018_59872
525993	contig_10324_pilon	+	1944	16	Intergenic	novelGene_7745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1395.97596286214	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	135	1010	69577	74872	TRUE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQARWPLGPSF	69039	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69076_69478_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74650_74842_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78424_80282
525995	SIRV6	-	426	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTACTTAACTGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	11381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
525996	contig_15304_pilon	-	992	4	Intergenic	novelGene_30538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1490.4765084436	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	198	725	54100	53155	FALSE	20	CCAGAAGCAGCCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELPSSCPKTTT	54297	52887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53185_53251_53320_53491_53813_53991
525997	contig_15063_pilon	+	1628	7	Intergenic	novelGene_13902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3782.04149751016	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	199	1221	34808	36572	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGSPASWSTRPCPTR	34609	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36470_36530_36600_38975_39092_39506
525998	contig_12425_pilon	+	2101	10	Intergenic	novelGene_46673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1301	1963	207185	211162	TRUE	5	ATTTCTCCCGGCCCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVFFVGWGIARLTGLAAFRSLFSFSLAWGPGAIDMVLTWRDGVGSAAYMGVIEATGNQAFLSPEIPSSSRKAPIAAVPTLHVTAGEQVLCRHLHIDVLTGVNADPVRNGLHSPKCPTRATGTLVSDLFDGWTVWPVFPGIKVFRQIHFLSKVNSLGQLGSIQQGATQSLHVAHINIVEVVSSLPCSVMFVDMVDQLIRQGIEIQSALGTDQHHQAAEGS	203272	226618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204322_204828_204962_206555_206669_207179_207327_207650_207738_208645_208764_209380_209497_210302_210388_211047_211198_226515
525999	contig_10354_pilon	+	2057	5	Intergenic	novelGene_50846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	33	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	167	874	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432203	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
526000	contig_12873_pilon	+	1794	7	Intergenic	novelGene_27188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	1104.74563437321	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	366	1220	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15991	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19044_19169_19264_19611_19703_19851
526001	contig_7151_pilon	-	2089	14	Intergenic	novelGene_40659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	128.854396980863	137	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	278	1984	13837	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKARSTPIQFEETEAVTWRHEDQNDHEWALLSPGTCFSPFQCPGGCSRKQTAPPGGWGKTLYWEISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65221	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18206_40665_40716_65077
526002	contig_9797_pilon	+	1647	5	Intergenic	novelGene_65588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	336.717518849257	1461	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	240	866	183892	191368	FALSE	5	TGGAGTTCTGCGTTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172539	192149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191138
526004	contig_15304_pilon	-	913	3	Intergenic	novelGene_30499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	198	872	54100	52925	FALSE	20	AAGCAGCCCTGCTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53716_54044
526006	contig_5671_pilon	+	1309	8	Intergenic	novelGene_79424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	2298.71670498909	986	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	214	627	370430	525570	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	368831	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205
526007	contig_6958_pilon	+	2018	13	Intergenic	novelGene_69914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	46.3516150983137	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	110	1396	99742	138376	FALSE	0	TTTGCTTCTTGCTGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRAALLLGLALGTGAFLLDDPEDGGKHWVVITAGSNGWYNYRHQADACHAYQIVHRNGIPDEQIIVMMYDDIANCSDNPTPGVVINRPNGTDVYKGVLKDYTGEDVTPQNFLAVLRGDAEAVKGKGTGRVLKSGPRDHVFVYFTDHGAPGILAFPSDDLSVKDLNETIRYMYKHKKYQKMVFYIEACESGSMMKHLPNDINVYATTAANPRESSYACYYDEERGTYLGDWYSVNWLEDSDVEDLTKETLHKQYQLVKSRTNTSHVMQYGNKSISAMKLMQFQGIRHKVSSPISLPPVRHLDLTPSSEVPLAILKRKLMATNDLQESRVLLEKISGHLEARHVMEKSMQKIVSLLVMSNAEAEQFLSQRVELTKYACYQEAAMHFRTHCFNWHSSMLQNKIGHGQGVPWLLLKSCLGDAFPSVNTSA	89778	138998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_89859_99712_99880_121575_121674_122965_123048_124493_124580_126347_126424_127155_127219_127879_127947_129771_129891_129976_130067_132013_132215_135018_135190_138280
526009	contig_15063_pilon	+	1470	5	Intergenic	novelGene_10607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	14	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	35	TGCATTCAAACTAACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526010	contig_19564_pilon	+	2158	4	Intergenic	novelGene_29621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1172	1477	12568	12873	TRUE	30	GTGCGGGGCAAGAGAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRPRKTAATVRYRPWRGSQAAIMFLASKTCWVSSGTVRARYCWLPRLVSGAKPGMKKWRRGKGTMLTASLRRSALSWPGKRRQVVTPLMVAETRWFRSP	11396	15572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_13257_13552_13664_13942_14053_15495
526012	contig_9609_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_22965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAACCTTCATCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254796	254134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_254100_254800
526013	SIRV6	+	596	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	346	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	33	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGAGAGTTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2748_2829_3106_3162_10721
526014	contig_15304_pilon	-	2298	6	Intergenic	novelGene_30589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	202.155385780345	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	177	1412	66228	60534	TRUE	30	AGGAATACGCTTTATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPPEGGPGLPSPAAVQRLGLTGSYLQSWKFRTCVWRRTRARSWMSCGPAPLSSSLSFCSA	66404	59563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60711_64601_64892_64988_65310_65396_65721_66104
526016	contig_15063_pilon	+	1471	5	Intergenic	novelGene_9922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	238	789	34808	35938	TRUE	35	ATTCAAACTAACCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRKCTVSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27131	36729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35392_35858_36158_36266
526017	contig_9833_pilon	+	2018	8	Intergenic	novelGene_68559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_1	511.935742141172	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	641	1249	250070	254740	TRUE	15	TCACTCCTTGGGTAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	249429	260334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
526018	contig_6227_pilon	-	1997	18	Intergenic	novelGene_49720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	305.517984338607	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	72	1502	1224979	1203304	TRUE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATRSLKEIARPILLCLASSHHSSLEP	1225050	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203380_1203613_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
526020	contig_10431_pilon	+	3162	1	Intergenic	novelGene_117406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTACACTAAAGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251378	254540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_251400_254500
526021	contig_2219_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_67178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	304	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATACACAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115632	117927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_115600_117900
526022	contig_1230_pilon	+	2215	9	Intergenic	novelGene_28871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1052.5022268385	3	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	37	1977	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404489	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
526023	contig_5988_pilon	-	1618	4	Intergenic	novelGene_15958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	11	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	94	1449	655459	651962	FALSE	25	AGAAAGGTTTTTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655552	651792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
526024	contig_9345_pilon	-	1680	6	Intergenic	novelGene_24628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2365.33321119879	5	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	178	759	955353	947957	TRUE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001331	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947510_947662_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_1001156
526025	contig_8581_pilon	-	2965	16	Intergenic	novelGene_22845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.224200469066	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	13	2235	386058	314549	TRUE	15	TTTGTGAGCCATGTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQR	386070	306386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307117_314548_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
526026	contig_19579_pilon	-	1673	7	Intergenic	novelGene_59399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_6	583.798314679156	129	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	106	369	13090	12727	TRUE	30	GATTCCAGATTCTTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTVSSSVLLPLSLCADSGPIALQRGG	13195	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12801_12900
526027	contig_233_pilon	-	1563	9	Intergenic	novelGene_14520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1254.34240117083	59	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	87	989	126907	79043	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRP	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79050_104165_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
526028	contig_11386_pilon	+	2032	8	Intergenic	novelGene_82758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	458.244787983765	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	726	1430	17940	27749	TRUE	30	AAAGCCACTCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7881	32449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11416_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
526029	contig_5063_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_109986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	35	CAAATATATAATTTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
526030	contig_9646_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_117438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGATGTAACCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190242	187990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_188000_190200
526032	contig_10299_pilon	+	2319	21	Intergenic	novelGene_79716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.8056881776765	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	136	2157	334773	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320543	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320626_334719_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
526033	contig_15063_pilon	+	1096	4	Intergenic	novelGene_13117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	202	1095	34808	36382	FALSE	20	TTGTGCAGTGGCTGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDV	34606	36383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526035	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_11969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	223	1392	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKQVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27146	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36152_36266
526036	contig_11292_pilon	+	2100	2	Intergenic	novelGene_109470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457582	459720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_458378_458415
526037	contig_5696_pilon	-	2191	2	Intergenic	novelGene_117585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCCTGACCAACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739594	734223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_734592_737771
526039	contig_20641_pilon	+	1411	6	Intergenic	novelGene_52872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1461.35156618796	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	177	1115	40322	56882	FALSE	20	GATCTCTGTGAAAGCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYTYSVTQVRYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	38647	57178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_38690_40187_40354_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
526040	contig_15304_pilon	-	1095	3	Intergenic	novelGene_30668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_2	5148	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	357	953	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106931
526042	SIRV6	+	864	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	556	496	340	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	90	581	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1643	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526043	contig_14415_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_77628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38115	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_38100_39500
526044	contig_1244_pilon	-	2354	7	Intergenic	novelGene_37966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1056	junction_3	479.071816699287	9	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	672	1571	928860	923211	FALSE	15	TGATGGGCTAAGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	929531	922427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758
526045	contig_7548_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_117640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAATTGATTTTCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338258	339416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_338300_339400
526047	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526048	contig_5988_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_16117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225090	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1225100_1226900
526049	contig_13528_pilon	-	1873	12	Intergenic	novelGene_66866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	190.854667567318	859	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	258	1496	67895	40217	FALSE	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSAEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQIWQMAENIYNDEESDVTASELEGQGS	68152	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57192_61354_61498_66953_67099_67879
526050	contig_12357_pilon	+	2194	12	Intergenic	novelGene_6083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	563.361839303543	1	120	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	117	1520	26079	53235	FALSE	60	AATCTTAAGAATAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
526051	contig_17976_pilon	+	1544	3	Intergenic	novelGene_32467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	264	1280	41843	47385	FALSE	5	CCTCCCTGTGCTGCCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41579	47649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
526052	contig_15087_pilon	+	2328	4	Intergenic	novelGene_37271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	901.102657858693	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	36	527	284653	301885	FALSE	20	TGGGCTCATTTGAAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTSPCLNWSCLAGSAPGTTAARSS	284617	303686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289300_289451_301237_301421_301816
526053	contig_15087_pilon	+	2333	4	Intergenic	novelGene_37263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1121.44618932678	2	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	41	613	284653	301944	FALSE	35	AACTACAGACCAGCCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284612	303664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301412_301788
526054	contig_12414_pilon	+	1552	2	Intergenic	novelGene_59546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	152	1024	373182	374054	FALSE	25	TAAACTTAGTGTTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373137
526055	contig_2480_pilon	-	2172	2	Intergenic	novelGene_63558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1208	1582	364351	363977	TRUE	25	CGCCATAAAGACCGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPKAGDTQSTATALLCDTSLRGSQCPLALCPASPSLVPRQHRGALSHPALLWEQRTEPRPCSEPLLKRNFFLLILANLGPPSEDFSFPVITPHLVNFHLHGAQIDSPRTVCLTGQHSPGFSY	365558	344489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_344907_363803
526057	contig_5403_pilon	-	2526	19	Intergenic	novelGene_87969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	80.1855294663724	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	95	2143	458189	424565	FALSE	15	GTTTCAAGACTTCGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKASDPAGKMGGKEKPVGAGEEKRKEGGKKKNKEGSGDGGRTELNPWPEYINIRLEMYNKLKAEHDSILADNTVIAKVNKVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFTSLETLCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLEMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKTLKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNTLIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIYNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	458283	424181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434718_435798_435946_436744_436824_436907_436973_438891_439010_439918_440041_441204_441314_449956_450040_453795_453877_458132
526058	contig_15063_pilon	+	1652	6	Intergenic	novelGene_14114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3153.99135065396	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	187	1413	34808	39515	FALSE	25	GTATATATTCTCCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34621	39754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526059	contig_7963_pilon	-	987	6	Intergenic	novelGene_58333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATGTTGTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48807	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
526060	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_8918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526061	contig_9871_pilon	+	2618	6	Intergenic	novelGene_75620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	255.458333197412	669	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	182	994	331361	350078	TRUE	25	CACAGTCTCAATTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVLILNFTCTLKSMCVSTDSPC	331179	352712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350355_351364
526063	contig_7440_pilon	-	1402	11	Intergenic	novelGene_61167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	279.915058544552	61	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	75	956	74491	54265	FALSE	15	CCCCTGAATTATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
526064	contig_5018_pilon	+	1742	9	Intergenic	novelGene_47043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1377	1721	1401408	1402786	FALSE	5	CGGTGACGCGCGGGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLRKQLHITAPTVNVLLVLHSKLHHQRLVLVAEGLESRRQGVEAGVLARLQPFIFLLVTIELARTQNEFAKIRLVFGFDPAQRHG	1399084	1402807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399842_1399928_1400029_1400626_1400763_1400850_1400972_1401057_1401262_1401349_1401445_1401872_1402077_1402259_1402349_1402771
526065	contig_18194_pilon	-	2436	4	Intergenic	novelGene_55952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_3	51.6741930002029	15	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	130	1146	18897	4642	FALSE	10	CCTAAGCTCTTGCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20415	3351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866_18976_20364
526066	contig_6102_pilon	-	1547	9	Intergenic	novelGene_32110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	373.48508588028	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	14	1387	822105	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLRESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822118	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_822008
526068	contig_11720_pilon	+	1557	12	Intergenic	novelGene_43982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	315.9240676633	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	774	1301	270117	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262290	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265779_269803_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
526069	contig_7189_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_117645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTTCCGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292661	294719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_292700_294700
526070	contig_3469_pilon	-	2374	17	Intergenic	novelGene_34180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	27	368	480246	479905	TRUE	30	TCGAATAACTGCCACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSAECKAALTTISLLGRNSQQRWLQRCSHPGPYKIIKHRRSSFQHEVQNPIDSQTSQDRRQSTEGTLIGANPMPEFVFLLVADESRHHSVRGPALPAAGMSGLTEQHEAAHW	480272	437056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_437082_438408_438540_443464_443601_447275_447381_456226_456349_456834_456956_459872_459925_461690_461808_464112_464247_467208_467381_471276_471363_474166_474308_477208_477274_477998_478200_478863_478980_479534_479679_479766
526071	contig_5229_pilon	+	2763	9	Intergenic	novelGene_117695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	56.9197626049161	318	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	55	885	555782	596228	FALSE	25	TGCATGAACTCTTTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILFFKFDPCPVSKNAYRLVLAANRDEFYHRPSKLASFWGDNNEILSGLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPGIYGLSNALLDTPWRKLSFGKQLFQEVVEQSQALSKDALIAQLLDVLNNEEAQLPDPAIVDQGKEYVQPILSKYAAVCVRCPDYGTRTNTVILVDAEGHVTFTERSMLDKDPTCWETSTYEFKLQS	532726	598106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_532745_555745_555838_565421_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_591290_591445_593087_593193_596107
526073	contig_8640_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_117728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTACTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6508	7332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_6500_7300
526074	contig_18096_pilon	+	2120	10	Intergenic	novelGene_58048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	637.717360669102	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	9	1277	42483	78280	FALSE	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFMQLVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGTGGLRLVNFYPRFLKALFVLKVIER	42474	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70577_78200
526075	contig_15063_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_10611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	CTAACCATGTCTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526076	contig_1076_pilon	-	707	5	Intergenic	novelGene_101106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	470	junction_1	369.948982969274	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	260	706	54398	51378	FALSE	35	CATGCACCAGCACAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEE	59124	51376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874
526077	contig_19459_pilon	-	945	6	Intergenic	novelGene_59849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_5	8583.26608232554	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	23	610	16240	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16262	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_16203
526078	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526079	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526080	contig_6227_pilon	+	1941	15	Intergenic	novelGene_49732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAGGAAGAGGAAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202619	1225014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1203044_1203148_1203215_1203300_1203374_1203567_1203703_1204142_1204219_1204372_1204500_1205856_1206027_1211148_1211280_1213151_1213222_1214096_1214246_1214343_1214434_1222011_1222125_1223376_1223449_1223749_1223838_1224857
526081	contig_12644_pilon	+	1179	9	Intergenic	novelGene_44599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4320.73175949399	64	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	669	1091	2679895	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675471	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679126_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
526082	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_11842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	228	1355	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27141	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
526084	contig_14513_pilon	-	1147	2	Intergenic	novelGene_70353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19011	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
526085	contig_6513_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_117755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTTTCTTCAGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101134	103145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_101100_103100
526086	contig_5033_pilon	-	2285	6	Intergenic	novelGene_28957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1078.55707313058	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	139	846	477189	453092	TRUE	70	TAAGAAAGCAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDK	477327	451107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451498_452042_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
526087	contig_5092_pilon	-	2077	6	Intergenic	novelGene_62306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	47	361	451516	444945	TRUE	35	ATAAACATAATTTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451562	443185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_443331_443373_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
526088	contig_12923_pilon	-	2590	23	Intergenic	novelGene_30130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	127.407234118731	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	127	2544	183854	162599	FALSE	15	TGCCAGAGTCTGGAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLDEDIIPEEDIISRSQFPESWLWSIEELKEPEKNGISTKIMNVFLKDSITTWEILAVSLSDKKGICVADPYEVTVMQNFFIDLRLPYSVVRNEQVEIRAVLYNYQKDNIKVRVELLYNPTFCSLATAKKRHQQTLTIAGESSVSVPFVIVPLKIGLQEVEVKAAVYNQFISDGVKKTLKVVPEGMRVNKTVAVRTLDPEHKGQGGVQKEEITAADLSDQVPDTESETRILLQGTPVTQMVEDAIHGDRLKHLIVTPSGCGEQNMIGMTPTVIAVHYLDHTEQWEKFGLDKRQEALELIKKGYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQEAKDICEGQVNSLGGSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	184717	162552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164503_165718_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172032_172190_172858_172958_174586_174747_175257_175334_175991_176196_177926_178014_178118_178186_179551_179765_179853_179994_183784_183871_184607
526089	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	34	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526090	contig_14513_pilon	-	1166	3	Intergenic	novelGene_70307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2846	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11955_12004_12129_18691
526091	contig_15146_pilon	+	2473	10	Intergenic	novelGene_116968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_9	108.133776315483	656	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	231	2168	615265	628786	FALSE	10	TCATGTTGATTTTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTASAVASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSRRSPPIPLAKVDATAETDLAQRFGVSGYPTLKIFRRGKPFDYNGPREKYGIVDYMVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFSTEIAKFLKVAPGTLVVMQPERFQSRFEPKSHVMDIQGSTEASAIRDHVVQHALPLVGHRRVATEAKRYTRRPLVVVYLSVDFSFDYRVATQFWRSKVLEVAKDFPEYTFAIADEDDYASEVKDLGLGESGEDINAAVLDEGGRRFAMEPTEFDADALREFVTAFKKGKLQPVIKSQPAPKNNKGPVKVVVGKTFEDIVLDPSKDVLIEFYAPWCGHCKQLEPVYTALGKKYRGHKGLVIAKMDATANEATSDRYKVDGFPTIYFAPSGDKQNPIRFEGANRDLEHLSQFIEEHATQLGRAREEL	615034	629091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625893_626792_626950_627221_627456_628370
526092	contig_500_pilon	+	1604	10	Intergenic	novelGene_31008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1115.49152095986	4624	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	776	1189	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492755_1493615_1493788_1494191_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
526093	contig_8330_pilon	-	4035	12	Intergenic	novelGene_71764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2442	2753	647461	647150	FALSE	65	AAAAAAAAACGTAATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSASPLSNITFAVPSSLSPAPVLAPVPISGAAEGLAVCTGRQAKGPHPILPVKQRLLSATGNHQAGPAPTEKDGSVRPAPSSTPIQNPDAASRGRLGQRFT	658568	645867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_648363_649085_649304_651160_651257_651531_651595_653905_654027_654809_654977_656163_656257_656346_656478_656694_656777_657148_657227_657416_657506_658166
526095	contig_5018_pilon	-	1580	9	Intergenic	novelGene_47108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	701.09053445329	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	532	1419	1401907	1399645	FALSE	45	TTTTTTTTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402061_1402144_1402363_1402701
526096	contig_18055_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_117826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAGAAATTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51336	51726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_51300_51700
526097	contig_10016_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_117875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTAGCAATTAACAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432445	434020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_432400_434000
526099	SIRV6	+	638	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-36	8537	7	254	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTCTTCGGTCTTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	2794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
526100	contig_2380_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_117902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACAAGTCCTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496461	497876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_496500_497900
526101	contig_8617_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_73445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACAAACATAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62610	62044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
526102	contig_11560_pilon	-	2602	11	Intergenic	novelGene_117915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_2	69.3643280079898	156	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	123	1493	165836	128284	FALSE	25	TAGAATTTCTGTTGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRLQEIRERQKLRRQLLAQQLGAESADSIGAVLNSKDEQREIAETRETCRASYDTSAPNAKRKYLDEGETDEDKMEDYKDELEMQQEEENLPYEEEIYKDSSTFLKGTQSLNPHNDYCQHFVDTGHRPQNFIRDVGLADRFEEYPKLRELIRLKDELIAKSNTPPMYLQADIEAFDIRELTPKFDVILLEPPLEEYYRETGITANEKCWTWDDIMKLEIDEIAAPRSFIFLWCGSGEGLDLGRVCLRKWGYRRCEDICWIKTNKNNPGKTKTLDPKAVFQRTKEHCLMGIKGTVKRSTDGDFIHANVDIDLIITEEPEIGNIEKPVEIFHIIEHFCLGRRRLHLFGRDSTIRPGWLTVGPTLTNSNYNAETYASYFSAPNSYLTGCTEEIERLRPKSPPPKSKSDRGGGAPRGGGRGGTSAGRGRERNRSNFRGERGGFRGGRGGAHRGGFPPR	165958	127174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_128589_143668_143880_145639_145757_148488_148582_152403_152546_153573_153665_158049_158138_158739_158821_159950_160039_160753_160843_165770
526103	contig_11560_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_117913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGCCCTTTCTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127174	125239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_125200_127200
526104	contig_12622_pilon	-	1527	10	Intergenic	novelGene_5901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2239.33037830729	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	34	1485	1590968	1583572	FALSE	15	CATGTGTGTGTACGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPLAPSSHLPFLLEYF	1591001	1583529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583617_1586780_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
526106	contig_11422_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_99032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1200
526107	contig_2646_pilon	+	1984	8	Intergenic	novelGene_69509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_1	243.316204783414	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	321	887	566553	573396	FALSE	15	TCCTGCGAACATCCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	553998	574493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
526108	contig_1443_pilon	+	1881	6	Intergenic	novelGene_28301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTATCATTTCTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747996	776672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748993_749234_749349_750369_750530_766776_766826_767479_767556_776186
526109	contig_6533_pilon	+	829	3	Intergenic	novelGene_114612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	3694	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	25	CTATGTGCTGAAATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
526110	contig_11370_pilon	-	138	1	Intergenic	novelGene_98759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGGCCTGGCCGTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157734	157596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_157600_157700
526111	contig_11752_pilon	+	1475	9	Intergenic	novelGene_37609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1577.02535945843	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	107	817	84194	94236	TRUE	5	GCTCTCTTTCTTGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGNHLWSIWKLVISGTILSSDSV	84087	105922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_92938_93005_93060_94223_94410_96442_96572_105566
526112	contig_14287_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_24057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_2	16	95	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	195	1007	22710	21898	FALSE	80	ACAACAAAAAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33880	21338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33780
526114	contig_13021_pilon	-	2230	4	Intergenic	novelGene_8283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	615.807329175828	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	104	826	270418	258084	FALSE	70	CAACAAAAGAATAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTGMTSLWEMCLVMTLGLCGLTS	270521	256679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_258149_259754_260040_265837_266120_270327
526116	contig_7342_pilon	-	2622	17	Intergenic	novelGene_71109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_10	94.8899856412678	5	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1500	2564	78723	76155	FALSE	10	AGTTTTCTCCTGGCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	83622	76096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80983_81075_81178_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591
526117	contig_5643_pilon	+	1908	15	Intergenic	novelGene_39042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	833.842375478038	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1119	1895	636518	641217	FALSE	25	AGAGGTGGCCATGGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631208	641230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634987_635156_635274_635373_635488_635633_635696_636164_636259_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102
526118	contig_13863_pilon	+	1643	9	Intergenic	novelGene_42031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	918.824656830671	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	24	824	98341	118962	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLTGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98317	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110630_115341_115381_116114_116144_118886_118965_119571
526119	contig_854_pilon	-	2542	13	Intergenic	novelGene_36180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	214.8093954856	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	122	1528	493192	471073	FALSE	50	ACTCATAGACGAGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKHPTDRAPGDTRSLGPRVPVPPSSSTHCVPSATACFFSGSWQTTCLEYRCLGPSGCYGYFSKPTLDAGYRHHPHPPRVAEAVPVRDPNSGELASLLLSRRLFSTEGQDCTGPPPRSSRVESVHLFTEPGQGLSGRLPGNQEQK	497539	470058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471500_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483622_487021_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487
526120	contig_177_pilon	+	1715	3	Intergenic	novelGene_41802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	104	595	417672	419027	FALSE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTAPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIHSTLFSEIF	415627	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418133_418996
526121	contig_14215_pilon	+	2237	19	Intergenic	novelGene_59346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	119	junction_12	84.2530176768424	681	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	64	1899	5253	47528	FALSE	25	CAACATGAGTAGGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEVVDTCSFASPASVCRTKHLHLRCSIDFTRRALTGTVALTIESQEDNLRSLILDTKDLTIEKVVINGQEVKYALGERQSYKGSPMEIFLPIPLSKNQEVIIEVSFETSPKSTALQWLSPEQTSGKRHPYLFSQCQAIHCRAILPCQDTPSVKLTYSAEVSVPKELVALMSAIRDGEAPDPKDTSRKIYRFNQKVPIPCYLIALVVGALESRQIGPRTLVWSEKEQVEKSAYEFSETESMLQIAEDLGGPYVWGQYDLLVLPPSFPFGGMENPCLTFVTPTLLAGDKSLSNVIAHEISHSWTGNLVTNKTWDHFWLNEGHTVYLERHICGRLFGEKFRHFHALGGWRELQNTIKTFGETGPFTKLVIDLKDVDPDVAYSSVPYEKGFALLFYLEQLLGGPEVFLGFLKAYVKKFSYKSITTDDWKDFLYSHFKDKVDILNQVDWNAWLYSPGLPPVKPNYDMTLTNACIALSQRWIDAKEDDLNSFSAGDLKDLSSHQLNEFLAQMIQKAPLPLGHVKRMQEVYNLNAINNSEIRFRWLRLCIQSKWEDAIPLALKMATEQGRMKFTRPLFKDLAAFDKSHDLAIRAYQQHKASMHPVTAMLVGKDLKVD	5189	47866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_5412_22406_22538_26111_26233_28774_28844_30734_30840_32853_32907_35081_35155_35417_35559_36841_36866_37352_37424_38424_38537_39140_39286_40288_40393_40796_40868_41400_41456_43126_43223_45741_45825_46478_46584_47410
526122	contig_8822_pilon	+	3168	6	Intergenic	novelGene_117936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1939	2526	154744	155331	TRUE	30	TGAGTCGGAAGGAAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFIWFLSSVTSLMSSKVRTITECFPTEMAFIWLLSSVSSIVLYKVRKITEGFSTYMAFIRFLSSVSSIVLFKARTLNKGFPTKMTYIWFLSSMNSIVLYKISTISEGFPTQMTYIWFLSSVNSPMLSKVRICTEGFPTYMAFIWFLSSVSSIVLSKARKITEGFSTYMTFVWFLSSMSSNVLFKARALNKGFPT	152805	224919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_155539_156001_156084_156594_156691_177558_177686_179426_179515_224877
526123	contig_11855_pilon	-	2233	13	Intergenic	novelGene_67145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	165	junction_12	202.015865026047	19	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	42	1403	2723908	2710017	FALSE	25	TAACCCTGAATTTATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731330	2709186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
526124	contig_7229_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_39869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGGATAATTTAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506945	1506364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1506400_1506900
526125	contig_15304_pilon	-	1236	2	Intergenic	novelGene_30472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	197	727	54100	53391	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54296	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
526127	contig_11003_pilon	+	2167	9	Intergenic	novelGene_105420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	160.583311710775	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	458	997	56015	64513	TRUE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCTRWPWQAWPSPV	55557	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62820_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476
526128	contig_15304_pilon	-	985	3	Intergenic	novelGene_30518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	198	350	54100	53692	TRUE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADHSRLPLCMPPKPDTAPASPRRPAPGLGSQPHMHTEWPEGP	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_54068
526129	contig_10299_pilon	+	2210	20	Intergenic	novelGene_79696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.0305745982603	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	58	2040	320559	340377	FALSE	25	TCTCATGCAGTCCAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAPGERPFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320501	340547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_334988_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
526130	contig_5023_pilon	+	1668	12	Intergenic	novelGene_7206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	2128.4477640519	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	88	1494	607279	630353	FALSE	45	GTAACTTCATGATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKVNSDYSGVPIGR	580841	630527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199
526131	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27550	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526132	SIRV6	+	506	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8511	337	280	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
526134	contig_14704_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_82681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25451	25111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_25100_25500
526136	contig_12425_pilon	-	1983	11	Intergenic	novelGene_46695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	695.151559014291	3	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	104	1126	211174	204225	TRUE	35	CTGCCAATAAAAGATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226595	203305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_203395_203456_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
526137	contig_4754_pilon	-	1910	12	Intergenic	novelGene_35966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	861	1742	414941	407780	FALSE	15	GTGGCCAGCGACTCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKELSFSSKNSTPCCPASRGMYSMMASRTRHLASSASSTMAGSKDWDSCRMPITSFTQSRLEMMFSRTSGHSSFSCARKRGRRCSIVLSLPRMGERPMITEARADLTCWLASDTSSWIQGRIWVIITFSWQSAERFSQNSLTLWEAAALTSASQSFIRFWKAGTRSVLVISGPTAFWSSVNLSATMYRTRQDLSSAAWRRVGITRASKSSWGRSWAMFTHASTASSRTESCSSEARLENIGMISLLTLSSSSTLANSPSLEAAARRTMGVSSEHRFRKYCRSSALTALDTRG	420820	407611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_407822_409293_409439_409545_409703_410230_410346_410459_410530_411001_411138_414444_414618_414897_414960_415740_415898_416938_417079_420156_420249_420367
526139	contig_13863_pilon	+	1901	11	Intergenic	novelGene_42032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_10	666.917806030098	91	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	19	1092	98341	118962	TRUE	30	TTCTAAGATATTTAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98322	120378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
526140	contig_3018_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_78794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGCATGGTAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474519	474177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_474200_474500
526141	contig_10159_pilon	-	2630	7	Intergenic	novelGene_30781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	122.097524772436	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	30	488	352890	338306	TRUE	45	TTTAATAAAAACTGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKCMWQTKRVRDRKKNRLTHRQANWTFKPLTRKNSWEISAFVSDFTAKQVYY	352919	316431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_349371_349450_350261_350326_352585
526142	contig_5018_pilon	-	1461	9	Intergenic	novelGene_47061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	705.070519522693	31	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	73	1215	1402792	1399331	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKLSSFLIDIFSFFCPLCESLGSSPPQGQGV	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399421_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
526143	contig_8581_pilon	-	2821	18	Intergenic	novelGene_22823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	529.648829275532	49	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2490	55	2544	386058	306617	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAQVAEDEGWPRAPTVKMIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTGVCGRSVS	386112	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306644_309058_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
526147	contig_11978_pilon	-	3089	7	Intergenic	novelGene_62893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	21.8454165037479	211	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	163	852	760226	755796	FALSE	20	GTGCGTGATGCTGACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGPMRKNYRGDLEAFEEAHLTSLDPIKQFAAWFEEAVQCPDIGEANAMCLATCTRDGKPSARMLLLKGFGKDGFRFFTNVESRKGKELDSNPFASLVFYWEPLNRQVRVEGPVKKLPEEEAECYFHSRPKSSQIGALVSHQSSVIPDREYLRKKNEELERLYQEREVPKPEYWGGYVLYPRVMEFWQGQTNRLHDRIVFRRLPAGDSPLGTMTHRGEEDWFYERLAP	760388	753558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_755962_756175_756247_756550_756680_757157_757212_757922_758023_759049_759175_760181
526151	contig_3077_pilon	+	1699	10	Intergenic	novelGene_26616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3565.75657478427	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	125	667	9676	15163	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLEMKAEFAREAQSGRQKLLLNTWISSLS	9551	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13165_13863_13922_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
526152	contig_5434_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_74670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	453	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326040	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_323300_326000
526153	SIRV6	+	690	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	182	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723
526156	contig_15063_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_12502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	7	1419	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526157	contig_12079_pilon	-	2035	5	Intergenic	novelGene_67438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1509.82422404067	9	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	401	763	582115	580996	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAPPPPPPPVYEPVNYHVQDNLQEEGTEYTGYSAELSSEGIMDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLTNELSQARDDNKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM	638841	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582186_601782_601879_609185_609274_638695
526158	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526159	contig_14513_pilon	-	1216	2	Intergenic	novelGene_70251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	184	342	18880	18722	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19063	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12129_18691
526161	contig_19579_pilon	-	1756	7	Intergenic	novelGene_59375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_6	519.952775633412	1803	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	106	984	13090	7943	FALSE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12301_12900
526162	contig_6101_pilon	+	2031	6	Intergenic	novelGene_114265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	71	junction_2	26.4756491893967	658	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	146	1027	62190	70669	FALSE	10	TCTTGTTTCCGTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNENVSIFSSASLAVEYVDSLLPENPLQEPFKNAWNYMLNNYTKFQIATWGSLIVHEALYFLFCLPGFLFQFIPFMKKFKIQKDKPESLESQWKCFKVLLFNHFCIQLPLICGTYYFTEYFNIPYDWETMPRWYMLLLRCFGCAVIEDTWHYFLHRLLHHRRIYKYIHKIHHEFQAPFGMEAEYAHPLETLILGTGFFIGIVLLCDHVILLWAWVTVRLIETIDVHSGYDIPLNPLNLIPFYAGSRHHDFHHMNFIGNYASTFTWWDRIFGTDSQFNAYTEKMKKLEKKTE	57060	71673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_57176_62159_62445_66346_66496_67731_67859_68678_68834_70473
526163	contig_12923_pilon	-	2671	15	Intergenic	novelGene_30106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	273.553561520241	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	83	2089	93727	46004	FALSE	40	CACAAAAATTTTCTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTLEEMCPQAHYLLEATWKPCQ	101250	45421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46067_51210_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
526164	contig_4769_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_118038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATCAAAGAGCGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454478	1454054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1454100_1454500
526165	contig_4105_pilon	-	2014	15	Intergenic	novelGene_21504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_2	697.253332142395	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	20	1843	137447	100151	FALSE	35	TTAAAGTGTTGAACTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137466	99979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
526168	contig_18145_pilon	+	2791	15	Intergenic	novelGene_37332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	285.876498595074	1	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1389	2288	97864	100744	FALSE	45	ATAAACATTGGGTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86667	101247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96221_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
526169	contig_7321_pilon	-	2643	14	Intergenic	novelGene_53123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_10	148.911951269095	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	937	1758	173630	114374	FALSE	55	AATTTTTCAGAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	208390	113488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_173880_174031_174645_174728_175746_175895_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
526170	contig_233_pilon	-	1926	10	Intergenic	novelGene_14518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1196.81169037665	4	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	86	1483	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPVRLCGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126992	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92342_105452_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
526171	contig_3077_pilon	+	1504	8	Intergenic	novelGene_26614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1792.01159343917	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	139	1008	9676	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHLTCLSPIQEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9537	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11381_13839_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
526172	contig_15244_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_118065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	675	1013	663619	663281	NA	35	TATGGAGAAATCAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDAALEVLTHLCQEIWKTATWPPDWKRCIFVPIPKKGDPTECRNYRTISLIPHARKILLKIIQKWLQQYVDREQPEIQARMRRGCRTRDIIADVRWILAEGREYQKGV	664293	662039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_662000_664300
526173	contig_6445_pilon	-	3548	13	Intergenic	novelGene_77069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	149.860398000569	304	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	823	1899	687253	680231	FALSE	25	ATACGCATTCCCCACACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSCERCKKLRNGVKYCKVLRLPEILCIHLKRFRHEVMYSFKINSHVSFPLEGLDLRPFLAKECMSQITTYDLLSVICHHGTAGSGHYIAYCQNVINGQWYEFDDQYVTEVHETVVQNAEAYVLFYRKSSEEAVRERQQVVSLAAMREPSLLRFYVSREWLNKFNTFAEPGPITNHTFLCSHGGIPPNKYHYIDDLVVILPQNVWEHLYNRFGGGPTVNHLYVCSICQVEIEALAKRRRIEIDTFIKLNKAFQAEESPSVIYCISMQWFREWEAFVKGKDNEPPGPIDNSRIAQIKGSGHIQLKQGADYGQISEETWNYLNTLYGGGPEIAIRQSVAQLPDPESLHGEQKIEAETRAV	689758	678581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_680392_680854_680927_682276_682380_683406_683516_684735_684818_684908_685079_685522_685650_685732_685914_686965_687012_687227_687262_688012_688108_688778_688952_689212
526174	contig_3077_pilon	+	2639	11	Intergenic	novelGene_26871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	76.3911644105521	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	93	1175	1337784	1346705	TRUE	20	ACTTTTTGGATGACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336620	1348253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611_1346961_1347044
526175	contig_9345_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_24702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955951	958313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_956000_958300
526176	contig_5033_pilon	-	2376	15	Intergenic	novelGene_29002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3863.12809964745	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	235	1041	545288	534624	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IADCGVRLRHVRALASGQRRGPLGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTERKK	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531162_531527_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534636_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566751
526177	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	96	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526178	contig_10299_pilon	+	2556	23	Intergenic	novelGene_79699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	95.1897300697076	5	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	49	2394	320559	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGERPFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320510	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337775_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
526179	contig_12873_pilon	+	1847	7	Intergenic	novelGene_27131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1119.29572350951	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	293	1273	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15931	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_15981_16113_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
526180	SIRV6	+	779	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	371	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	216	548	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRHCKTSIRYGQRRFHTTCSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1674	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526181	contig_2278_pilon	-	2228	9	Intergenic	novelGene_118114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_8	126.307165275767	277	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	130	1140	999076	940418	FALSE	25	TTCTACTCTCAAGACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSMDRAAVARVGAVASASVCALVAAVVLAQYIFTSKRKTGRKTKIIEMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	999205	939329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_998923
526182	contig_4659_pilon	+	2598	10	Intergenic	novelGene_118198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	61.5222533261013	420	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	172	1416	191727	208048	FALSE	5	TTCTGAGTCTTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKQYKSQFEAQNIWYEHRLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	186959	209230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187040_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559_199738_201057_201210_204160_204302_205905_206069_207957
526183	contig_8330_pilon	+	2064	12	Intergenic	novelGene_71814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	599.252992283168	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	183	935	852673	856364	TRUE	5	GCCCAGCCTTGGCGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDAWWTICGRGDGRCWAETVSSSSH	845823	857815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_845938_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855495_856201_856271_856362_856560_856667_856755_856968
526184	contig_3018_pilon	-	1699	13	Intergenic	novelGene_78867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	434.747627940625	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	204	1208	600079	570116	TRUE	75	GAAGGAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVEV	624861	562939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570122_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
526186	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_11340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	586	1407	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34930_35037_35380_35839_36158_36266
526187	contig_15063_pilon	-	1543	5	Intergenic	novelGene_11759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27173_34614_34925_35033_35380_35839_36156_36264
526188	contig_11752_pilon	+	1440	8	Intergenic	novelGene_37584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	821.470806367631	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	118	1146	87165	105616	FALSE	10	ATGTCCAGTTGTGCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
526189	contig_3747_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_24884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201084	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202524_204883
526190	contig_20641_pilon	-	1653	7	Intergenic	novelGene_52858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	470	865	56705	54898	TRUE	30	AGCAACAAGCGGGGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57174	14624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45957_54832_54966_56377
526191	contig_4232_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_63208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	330	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	854	1243	148370	146289	FALSE	20	ACTGAACGCGGCCTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVFLSSLRQKSTAFLRFFTSSGVDDLRTFMSLNTLMTPSETATPEAWEMSHTHLMRSRFLGSPGGLSVFSLEEGVPTSLPRPLPRAQTTDPQPPPLGRRGLPLTMFAEAKGIWQKEAEKTRAAAAAAGI	149695	146286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146468_148159_148536_148803_148883_149086
526192	contig_8616_pilon	+	1788	13	Intergenic	novelGene_72466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	231	junction_9	557.983472475266	1508	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	387	1715	320431	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318022	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
526193	contig_8059_pilon	+	1883	18	Intergenic	novelGene_111081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	67.9727199502819	6	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	396	1445	246371	341600	FALSE	15	TCTTCAGTTTCCTGGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIN	62256	342038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_62352_90281_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_246324_246398_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_341596
526194	contig_5643_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_38873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4118	junction_1	0	38	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236105	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236510_236639
526196	contig_20984_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_42218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTATTACTGTGCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2192	2473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20984_pilon_+_2200_2500
526197	contig_10629_pilon	-	2125	11	Intergenic	novelGene_52918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470.70181644009	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGTGTTGGCTTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256193	245873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253859_254180_254228_254588_254689_255087_255140_256066
526198	contig_19342_pilon	+	918	6	Intergenic	novelGene_41096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.18747549010185	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	73	321	4349	6183	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTLLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3257	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3267_4285_4365_5016_5116_5464_5522_5960_5994_6139
526200	contig_3424_pilon	+	557	3	Intergenic	novelGene_55478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	154.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	116	556	163695	169034	FALSE	10	TGGTGGCCCTCATGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRFGCSRGAWAPAEPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTED	149888	169035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701
526201	contig_3424_pilon	+	1966	2	Intergenic	novelGene_55505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	95	1726	169047	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	168717	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_168809_169043
526202	contig_1331_pilon	-	1271	4	Intergenic	novelGene_37821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	43	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	33	509	169924	160009	FALSE	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQFFKRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169956	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
526203	contig_1443_pilon	-	1845	7	Intergenic	novelGene_28295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_6	254.169672113378	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	161	1069	776427	748763	FALSE	55	GAAAAAAAAAGAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQVKTTGKERKRWWRGDQGHMECL	809525	747986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_809399
526204	contig_14215_pilon	+	1951	18	Intergenic	novelGene_59348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	110.304328939072	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	43	1641	5253	46547	TRUE	15	TTTTTAAGCGGTATGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGCGSVCSGTSRAMPEVVDTCSFASPASVCRTKHLHLRCSIDFTRRALTGTVALTIESQEDNLRSLILDTKDLTIEKVVINGQEVKYALGERQSYKGSPMEIFLPIPLSKNQEVIIEVSFETSPKSTALQWLSPEQTSGKRHPYLFSQCQAIHCRAILPCQDTPSVKLTYSAEVSVPKELVALMSAIRDGEAPDPKDTSRKIYRFNQKVPIPCYLIALVVGALESRQIGPRTLVWSEKEQVEKSAYEFSETESMLQIAEDLGGPYVWGQYDLLVLPPSFPFGGMENPCLTFVTPTLLAGDKSLSNVIAHEISHSWTGNLVTNKTWDHFWLNEGHTVYLERHICGRLFGEKFRHFHALGGWRELQNTIKTFGETGPFTKLVIDLKDVDPDVAYSSVPYEKGFALLFYLEQLLGGPEVFLGFLKAYVKKFSYKSITTDDWKDFLYSHFKDKVDILNQVDWNAWLYSPGLPPVKPNYDMTLTNACIALSQRWIDAKEDDLNSFSAGDLKDLSSHQLNEFLAQMIQKMVTALHSVQVGGCNSFGLENGN	5210	47684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_5412_22406_22538_26111_26233_28774_28844_30734_30840_32853_32907_35081_35155_35417_35559_36841_36866_37352_37424_38424_38537_39140_39286_40288_40393_40796_40868_41400_41456_43126_43223_46478_46584_47410
526205	contig_16722_pilon	+	2978	1	Intergenic	novelGene_118289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCAAAAAGTTATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126790	129768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_126800_129800
526206	contig_5643_pilon	+	1751	5	Intergenic	novelGene_38867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4812	junction_1	1931.21158537846	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1028	1330	237186	237679	TRUE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVQRGQGAGFPCGPT	236039	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236300_236418_237281_237376_237456_237550_237819_237913
526207	contig_19604_pilon	-	2586	6	Intergenic	novelGene_77238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	1553	2584	274123	269721	FALSE	15	AGCCCGCGGAGGGCGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLWGRHVQESRGKWSRDSPAVPGGGKGSGAQQTHACTPRVPGQCSGQGQGLGQADPKPGLGTGIGVVTDSDEPQDAGELLLHRLVLDGDQPLLMGTWTEAECKFGLEVTFLALQVIIRDDHHHSATPLLDELAGNGPDTGARQDVAVRHAQLQPIVCLLQLPDHLLHKLDVAGAVADEGVKALGHLSQGVIKRCDACQPHRPWDAAVHGRHLYGLLRLFLLLLQNVFLAVLLDAGPQLFQGVVAAKFGKQLQQAAHGGVGAALPGVQQAASGVGVRLQVPDLQVLEAQLLGQRGPVGRHQRLHVEEQRQAAPHSHVERSQGHPGSGGRGRRGGRGGRGRRGGR	275811	269718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_270054_270730_270866_273136_273317_273482_273574_273830_275199_275334
526209	contig_1443_pilon	+	2526	9	Intergenic	novelGene_28391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	2155	2526	1041779	1052416	FALSE	20	TCTTCCAACGCGGACACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGNVRARSERWCSNFFSNSGSVASSGTAEAVLGLRPPEVGTVGTGLSLRKVGDSAASGFRRSKCPESCFRLRCNLSLSESSCFLWAWIELHVSDILVSRRGRVSNQARWTNTSQPSFQEIP	1036830	1052416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_1037061_1037688_1037795_1037962_1038031_1038151_1039084_1039305_1039516_1040150_1040331_1041267_1041671_1041753_1041972_1052237
526210	contig_8330_pilon	-	2125	8	Intergenic	novelGene_71857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	305.477144340269	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	13	648	916108	900688	TRUE	40	GTACATACAAATGTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFR	916120	894926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896321_899577_899661_900687_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
526211	contig_9345_pilon	-	1680	4	Intergenic	novelGene_24663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2263.52335972042	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	281	619	952473	947957	FALSE	20	GCAGTTTTCTAAACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001309	946895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_1001116
526212	SIRV6	+	914	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	19	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	367	678	2021	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1156	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526213	SIRV6	+	973	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	517	1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526218	contig_7457_pilon	-	1963	8	Intergenic	novelGene_31435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.636065089825	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAACAATAAATATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473218	468269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_472039_472730_472768_473151
526219	contig_5981_pilon	+	2200	8	Intergenic	novelGene_35481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_5	266.391073577237	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	857	1588	28523	37804	FALSE	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23415	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
526220	contig_10299_pilon	+	2500	20	Intergenic	novelGene_79694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	90.6415728947932	11	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	58	1290	320559	336895	TRUE	20	ACATGCTTGTCTCATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAPGERPFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320501	340538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338433_340025_340124_340232
526221	contig_5643_pilon	+	1282	12	Intergenic	novelGene_38774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2513.96587351999	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	589	1074	236928	237983	FALSE	10	GCCACCTCTTTGTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233604	238191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236758_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
526222	contig_3469_pilon	-	2153	16	Intergenic	novelGene_34156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	95.212884282188	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	73	1431	413507	380499	FALSE	25	ATTTTTTATTTTGACTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLFQTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427647	379776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385354_392603_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427583
526223	contig_5954_pilon	-	2021	13	Intergenic	novelGene_28597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	482.345369580299	3	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	659	1657	956264	945083	FALSE	5	TCCGTCCTTCTCTGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRCPALWTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960582	944718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946265_947159_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_956105_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959935_960474
526224	contig_9345_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_24400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.632176232533	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAATGTTCTGGCGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144554	141155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142008_142656_142781_142955_143072_144512
526225	contig_233_pilon	-	2094	11	Intergenic	novelGene_14566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1253.72858306732	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	87	1487	126907	79079	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQQSAWRGRKWPPSSGAQWQGSC	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79145_91489_91677_92138_92359_93764_93949_105470_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
526226	contig_500_pilon	+	1709	10	Intergenic	novelGene_30950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	556.713970046059	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	861	1409	1466134	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446814	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454628_1461225_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
526228	contig_18415_pilon	+	2234	8	Intergenic	novelGene_118309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_7	39.0509870789041	147	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	9	1211	280	38001	FALSE	15	CATTTTGTTTCATGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGMTPLMHAAYKGKLDMCKLLLRHGADVNCHQHEHGYTALMFAALSGYKDIVWVMLEAGAETDVVNSVGRTAAQMAAFVGQHDCVTVINNFFPRERLDYYTKPQGLDKESKLPPKLAGPLHKIITTTNLHPVKIVMLVNENPLLAEAAALSKCYKVMDLICEKCMKQRDMNEVLAMKTHYISCIFQKCINFLKDGENKLDTLIKSLLKGRATDGFPTYQEKIVRESIRKFPYCEATLLQQLVRSIAPVEIGSDPTAFSVLNQAITGQVGFIDVEFCTTCGEKGASKRCSVCKMVIYCDQTCQKIHWFTHKKICKNLKDIYEKQQLKAAKEKRKEENDGKLDVNSNCINEEQPEAETDPSQEDADQEDSSPKDPVEGDEESHKSDAGLEGVQDGPAGPQASEE	271	39024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_+_413_2117_2217_6425_6587_18367_18583_19426_19563_24154_24284_26318_26449_37801
526230	contig_16187_pilon	-	1979	7	Intergenic	novelGene_101068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	80.1907448247961	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	202	687	47874	41457	FALSE	65	GAGTAAAATTATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILRSVVQRPAGSLQTVTKGTESLICSDWIRHKFTRSRIPDKVFQPSPADHEKYGGDPQNPHKLHVVTRIKSTKRRPYWEKNIIKMLGLEKAHTPQVHKNIPSVNAKLKVVKHLIRIQPLKLPQGLPAKEDMSETCLRSTGELVLRWDLTPGPQEGIKS	53127	40164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_41962_42110_46088_46170_47823_47902_48721_48803_53034
526231	contig_5988_pilon	-	2345	3	Intergenic	novelGene_16109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1410	1793	1225528	1225145	TRUE	30	CCACATACAGGTTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLAIPIQPFNKCLTRISLPFVLKSSHPVDGKQAESLRIRQGGWGGRREHTQICIPFVMATCKRVFARPAAQRKQSIHKQRLFIFFQGLTEAQIIMSLSNNGTSKLLSNGKHTAQPHWNCAQTKQC	1226937	1222595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1222678_1223381_1223459_1224751
526233	contig_7457_pilon	-	1918	5	Intergenic	novelGene_31598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.0696848572564	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	96	1298	960838	956489	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962465	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955913_956367_956939_958234_958375_960225_960896_962427
526235	contig_5018_pilon	-	2075	9	Intergenic	novelGene_47024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	176.85335556613	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	393	1433	1395875	1392342	FALSE	10	GACTAGCCCTGTGGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYPSLQVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397348	1391699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1396111_1397191
526236	contig_5791_pilon	-	2264	9	Intergenic	novelGene_35856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	365.512995664997	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	240	1745	1088908	1079821	FALSE	20	TTATTGCTGTTTTTAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094428	1079301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1088992_1090648_1090729_1094352
526237	contig_19342_pilon	+	1223	6	Intergenic	novelGene_41062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.18747549010185	307	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	156	632	4349	6183	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3234	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
526238	contig_13457_pilon	+	1794	12	Intergenic	novelGene_118353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_8	56.0519239796297	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	101	844	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59310	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
526240	contig_18272_pilon	+	1808	2	Intergenic	novelGene_7096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539906	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_540219_540344
526242	contig_4857_pilon	-	3653	1	Intergenic	novelGene_48909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAGAAAAAAAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656533	1652880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1652900_1656500
526245	contig_3948_pilon	+	2466	4	Intergenic	novelGene_53382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.8954011539622	22	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	293	994	1813956	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813330	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813422_1813495_1813586_1813844_1814520_1860434
526246	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526248	contig_9363_pilon	-	2223	10	Intergenic	novelGene_6560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.81215433167	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	117	734	786587	777382	TRUE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	787882	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754122_773923_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
526251	contig_12873_pilon	+	1786	6	Intergenic	novelGene_27164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1130.31705286614	5	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	953	1300	19086	19940	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRWSYCEPPHHSSPFGTRSQHLRSSGYT	15961	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17250_17734_18028_19035_19264_19611_19703_19861
526252	contig_14638_pilon	-	2159	5	Intergenic	novelGene_71569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	168.028271430733	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	65	415	277527	254501	FALSE	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLDHAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262419_277509_277556_277660
526253	contig_1406_pilon	-	1772	6	Intergenic	novelGene_25541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	614.612918835912	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	125	787	2159494	2140979	TRUE	10	TTCTGGGGCTTCAGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYQRTARIRKFRTRLLDWIGNWRTIRIFVWQQ	2159618	2136623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141072_2143339_2143628_2147740_2147920_2159391
526255	contig_9609_pilon	-	2413	6	Intergenic	novelGene_23130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	86.5017918889545	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1178	1663	522751	521564	TRUE	25	ACCTACCTCTATTGAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGSGQKMVSSGGGYLGAGRASW	523928	520728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696
526256	contig_11285_pilon	+	1758	11	Intergenic	novelGene_5604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	486.706287199991	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	31	1440	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763527	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767121_768098_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
526257	contig_5988_pilon	-	1579	5	Intergenic	novelGene_15923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	91	885	655459	652482	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNPHPLPSGHIRPRHLC	655549	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652530_652570_652943_653272_653422_653549_653773_655456
526258	contig_11003_pilon	+	1865	9	Intergenic	novelGene_105429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	190.957415082526	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	146	1366	56015	72538	FALSE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW	55869	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64862_64966_66252_66425_70010_70127_72476
526259	contig_8412_pilon	+	1888	12	Intergenic	novelGene_118396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	22.401298663653	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	144	1454	696627	715040	FALSE	15	TGCCAGTGTGCTATTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	696483	715474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_696629_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
526260	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_11991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	222	1457	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27147	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526261	contig_15021_pilon	+	2413	5	Intergenic	novelGene_26953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTGCTCTGGGTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239749	251279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241882_243697_243801_248098_248163_249303_249381_251242
526262	contig_5033_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_29011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3595.72753589544	39	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	80	1555	566787	531284	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCGEPVRPGFCECVTVVQPHACFVCARPSPPRHFRQPQPHPL	566866	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531410_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
526264	scaffold_12124_pilon	+	2484	11	Intergenic	novelGene_22008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_10	177.734521126314	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	165	1109	799011	810473	TRUE	80	ATTAAAAAAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGGSGK	791871	812008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647
526265	contig_10711_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_118457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGGGGCGCTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867852	870358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_867900_870400
526267	contig_5041_pilon	-	2757	19	Intergenic	novelGene_27058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	641.849779067414	1	102	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	1248	2465	572892	521610	FALSE	30	TATATGGTGTCACATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDLSLKGC	636059	521317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_521630_525517_525652_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580866_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
526268	contig_7457_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_31513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACATCAGCTTACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671993	670198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_670200_672000
526269	contig_12279_pilon	+	953	5	Intergenic	novelGene_50119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3417	junction_2	1076.55570571151	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	94	447	69434	77128	FALSE	15	CTGAGATCTTCATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	68452	77634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
526271	contig_16907_pilon	-	2159	18	Intergenic	novelGene_87465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	83.6112275369894	408	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	206	2113	519112	480612	FALSE	30	CTCTACTACTGTTACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVHKGSKKLEMHVYSKRLEIMLQDIFGEDCVSVKDGSVLSVTVDGKTANINLDTRTVECEEGSEDDESLREMVELAAQRLYEALTPVH	524851	480565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_480714_482744_482842_485631_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502228_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519115_520240_520295_524702
526272	contig_12079_pilon	+	2354	14	Intergenic	novelGene_67395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	147.291965418766	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	567	2051	491184	578891	FALSE	35	TCAATAAACGTTCACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	478362	579194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_478403_490657_491294_494619_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545624_571799_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
526273	contig_20609_pilon	+	2120	13	Intergenic	novelGene_118474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	62.6832314100031	1044	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	25	1326	43732	58681	FALSE	10	CACCCCTTTTCCTGGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRTGADWTMAVNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKERAMSTTSIPSPQPGRLRSPFLQKQLTQPETPVTREPVPASLRPSTDFLEDPEPIVPQSPVQVEGEAVCKEPLEEENLYEEPPLVQQEDAASEHSICYKQGTGLLGKGLCARALYDYQAADDTEISFDPENLITGIEVIDEGWWRGYGPDGHFGMFPANYVELIE	43707	59475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56588_57337_57434_57554_57668_58017_58124_58541
526275	contig_7357_pilon	-	2355	9	Intergenic	novelGene_36812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2114.46594542806	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	258	1478	166808	136424	FALSE	15	TTGTTTTTCTGGACCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSCSGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167065	135546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166786
526276	SIRV6	+	498	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	0	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGTATGGCACTTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	2562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
526277	SIRV6	+	865	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	33	368	1673	2560	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1640	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2029_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526279	contig_9290_pilon	-	1959	12	Intergenic	novelGene_77542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	345.289147007725	1449	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	163	1620	496936	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497098	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
526280	contig_10923_pilon	+	1616	7	Intergenic	novelGene_66218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	770.031601083142	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	598	1500	32909	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	29346	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_29572_30133_30468_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
526282	contig_6735_pilon	-	1981	13	Intergenic	novelGene_15789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1088.14884538937	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	133	1317	564813	542855	TRUE	20	ACTATGGTTCACCCTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTPNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRGELGLGRRESAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENS	568275	542000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543017_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_547217_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564798_564869_568198
526283	contig_10311_pilon	-	1879	11	Intergenic	novelGene_50410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.59539802372	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	32	1231	71526	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65902_67188_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
526284	contig_14472_pilon	+	3658	1	Intergenic	novelGene_111197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATACAATTCTGTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551234	554892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_551200_554900
526285	contig_16622_pilon	-	1961	9	Intergenic	novelGene_48435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1187.69171478755	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121995	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115441_121468
526286	contig_16098_pilon	-	1469	9	Intergenic	novelGene_46099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	166	1260	458816	456273	FALSE	5	AGTCTGTTGTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460292	456063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
526289	contig_4686_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_118519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTGGAGAATTAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430313	430673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_430300_430700
526290	contig_3975_pilon	-	2492	13	Intergenic	novelGene_54803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	333.814777317535	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	1048	2004	2021058	2016034	FALSE	15	TGGTACATTTCTCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGRSSWPEQTSPALASCRVPHISPLTPQSLYFLFLCVFI	2052424	2015545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016149_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
526292	contig_15063_pilon	+	1710	6	Intergenic	novelGene_13038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3864.46096629271	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	436	1455	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVK	30081	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36497_39506
526293	contig_12873_pilon	+	2481	5	Intergenic	novelGene_27182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1440.10388080166	3	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1437	1907	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15981	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18009_19000_19264_19611_19703_19851
526294	SIRV6	+	1308	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3108	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
526296	contig_11855_pilon	-	1631	12	Intergenic	novelGene_66973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	2078.3147137974	486	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	113	1276	1102035	1080724	TRUE	55	AAAATGAGGTGAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKGQKIRLLD	1102147	1077674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1080623_1080750_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
526298	contig_1154_pilon	-	1389	4	Intergenic	novelGene_87153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCCCCGCCCCCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902824	895946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_896144_899975_900251_900806_900884_901984
526299	contig_1406_pilon	+	863	5	Intergenic	novelGene_25559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	26	352	2137376	2141072	TRUE	40	GGGTATAAGAATCACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFEKEKVMKYQKVCIQCLPSTLYYLIVFWYHQIPMLSWFLYLSLNLLNSSLRLHDVVSKQDHSTCWSTMEDETGSTTSLRRVLPLYCCQTNILIVLQFPIQSRSLVLNFRILAVL	2137350	2147790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2137453_2139835_2139992_2140978_2141115_2143208_2143630_2147742
526300	contig_5643_pilon	+	2111	16	Intergenic	novelGene_39048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	765.249890921623	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	581	1903	634927	641217	TRUE	10	GTCATTGTGTGTGTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPRLAQAPHSRSPTSRSCVRVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631212	641594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635170_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
526302	contig_10861_pilon	+	2606	11	Intergenic	novelGene_39396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	437.492399933987	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	349	1947	1910254	1934804	FALSE	45	CAAAACATTACCTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903787	1935463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1907039_1907172_1909506_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
526303	contig_12570_pilon	-	2274	8	Intergenic	novelGene_79345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	231.203947427639	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	19	1212	220118	190389	FALSE	15	TATAGGTTATTCCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLGSFQLCWRNTIPVLPLTSVGPSGSTSLFLSSAPPCENVAHICWGPGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	220136	189326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211479_219970
526304	contig_4315_pilon	-	2441	15	Intergenic	novelGene_46721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	187.380982634474	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	235	1764	157875	147905	FALSE	25	ACTTGTACTACTACCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARIFLIASKELEFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163693	147227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150714_154259_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
526305	contig_8138_pilon	+	2083	7	Intergenic	novelGene_52456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	384.470198238216	56	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	184	495	280295	305581	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGESES	280111	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364_306905_306958
526306	contig_15691_pilon	+	2279	13	Intergenic	novelGene_60753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCAAACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23146	114441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_24030_27939_28016_29700_29802_32386_32514_32812_32984_39822_39879_41356_41468_43424_43480_50441_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
526307	contig_15063_pilon	-	1488	4	Intergenic	novelGene_14020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	30	CTGAGGACCCAAGAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
526309	contig_5718_pilon	-	3754	1	Intergenic	novelGene_110456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	163	303	1753986	1753846	NA	15	GCCATCCACTTGCGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVSLTEVDSNERNNLQFGRRERKRTQGCEREVRNVCGLDQGLWISVDGRAPWIMGPCRGRTDSPRVHLGSILPTALPRTAEKVFHEKPTSAPTSTSVGY	1754148	1750394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1750400_1754100
526310	contig_1516_pilon	+	2044	10	Intergenic	novelGene_49977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1375.21455116225	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	945	1409	354977	363092	FALSE	15	GAAGCACCTGTTTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335194	363727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_350125_350235_352897_353030_353505_353693_354793_354986_359957_360125_362116_362299_362985
526312	contig_8045_pilon	+	1997	2	Intergenic	novelGene_35400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	9	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTTGAGTTCAGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116857	119417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117513_118075
526314	SIRV6	+	1365	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	188	66	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	340	672	2002	10736	TRUE	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1870_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526315	contig_14744_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_66079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
526316	contig_6735_pilon	-	1769	10	Intergenic	novelGene_15708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	854.196626394187	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	84	1289	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPDRSGRVVKRVGARSSLPLGGFGEVTPGGVLIHIVSSQDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568281	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543403_543824_543894_544851_544990_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
526317	contig_8452_pilon	-	1958	17	Intergenic	novelGene_47979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	326.626644417981	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	67	1905	145829	75102	FALSE	25	AAGACCTGTTTTTGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	145895	75048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104736_105998_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
526318	contig_10437_pilon	+	2412	3	Intergenic	novelGene_38137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	70.5	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3	410	156675	162086	FALSE	35	AAAGCGTTGCAGAGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGERAREPHAGRRRAEPASRSRRLDAREEQGSKSEEDNLVPDCSTLPPGPGSLSGSETSTFTDQLRAPRTLLFLNPSRSLLEPVTPGPLFSLSNSASGLGGWTPSTPSGCSPSWRWDQGSRTDHVTTGWPEELS	156672	164088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160030_161914
526320	contig_7410_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_106087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_6	233.542049509053	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	106	519	405351	407457	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405245	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_408214_408298_408410_410366_410421_411881
526321	contig_8978_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_49344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	949.214134019412	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	680	1378	193035	190773	FALSE	45	ATAAGAATAAGAATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTHAHISPVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194101	190476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193045_193215_193398_193613
526323	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526324	contig_8907_pilon	-	2557	3	Intergenic	novelGene_85842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1709	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1992	2369	641301	640213	TRUE	10	TGACTTCCGCTTCCGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKKIVLLKAADILSVVTIRRPLVVTIVSILVGVIRFLSVLLVTVTPGSSMPLVGSIVTWPPSSVIPTSKLSVILQPVASISLVSTSSAIPFLDNWWGLRRAFQVFLVFFVIFCESTGKHLFKI	643292	637940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_638094_640177_640358_641068
526325	contig_10689_pilon	+	1264	4	Intergenic	novelGene_118623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1784.12431056683	8514	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	96	479	57608	58411	TRUE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGKSEITFNYKVI	51266	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58475_60862
526326	contig_3986_pilon	-	2190	7	Intergenic	novelGene_52684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	107.831143718109	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	231	983	47670	35282	FALSE	25	GATATTTTCAATGTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153765	34074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46115_46299_47666_47820_153684
526327	scaffold_19766_pilon	+	2635	14	Intergenic	novelGene_34433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	153.179439966343	58	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	69	1637	844727	848686	TRUE	15	CCACCTTCTAATCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKAKKFLQEFYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLR	844658	851576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844731_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_849045_849980_850150_850925_851036_851215
526328	contig_15047_pilon	-	1664	6	Intergenic	novelGene_52104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGGCTACTGCAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21574	2113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2253_2563_2825_3220_3499_4155_4433_4551_4683_20996
526329	contig_1867_pilon	-	2564	10	Intergenic	novelGene_54598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	188.207988442521	301	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	466	1470	547888	517583	FALSE	10	TGTGTTTTTTTTTATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566935	516488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_566772
526330	contig_5189_pilon	-	1711	6	Intergenic	novelGene_34824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1525.10309159742	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	5	568	247733	199237	FALSE	10	TAATGTTTTTTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMLEIQNHSSSSLPGIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247737	198093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_244163_244290_247694
526331	contig_8145_pilon	-	3171	2	Intergenic	novelGene_118658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	924	1247	833859	833536	FALSE	20	TTTTTGAATAGTCTCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSKMKSFKTSIFSPFIMMLPIGPVVRIFVFLVLRCNPHRRLWSLIFVSKCFNPSSVSASKVVSSAYHRLLVSLPPILVPHSSYSPVSRIICSAYRLNKYGKRIQP	834837	831611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_834063_834117
526332	contig_8122_pilon	+	1847	12	Intergenic	novelGene_40247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	873.50464431299	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	465	1172	732332	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720415	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720656_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
526333	contig_16103_pilon	+	2728	20	Intergenic	novelGene_118912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	394.261931860188	57	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	129	2075	771073	791677	TRUE	15	GCTCCAGGGCTGTTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKVVASQAPGHWLVGEVPQSFSLKGLLTELQLS	766997	794270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767083_771029_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791065_791628_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208
526334	contig_15063_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_10400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	3	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	237	692	34808	35848	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVC	27132	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35843_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526335	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	202	1005	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKASMHQPST	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36273
526336	contig_11215_pilon	-	619	4	Intergenic	novelGene_118969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_3	247.132892725082	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGATGTGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6572	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_2048_4747_4994_5547_5569_6475
526339	contig_13894_pilon	-	1550	3	Intergenic	novelGene_62051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	417	1475	287445	286290	FALSE	20	AAGTACTTCTGCAGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288315	286214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_287991
526340	contig_12873_pilon	+	2195	5	Intergenic	novelGene_27193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1315.97537495958	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1297	2031	17632	19855	FALSE	55	CAATATAAGATAAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15999	20019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_18000_18991_19264_19611_19703_19851
526341	contig_9313_pilon	-	2005	4	Intergenic	novelGene_86482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGGATCACCTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463179	387542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_-_387702_432395_432583_457278_457360_461601
526342	contig_14441_pilon	+	1462	4	Intergenic	novelGene_100735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	652	junction_1	196.368700832558	2434	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	499	1011	121136	126062	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	120637	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126036_126283_126514
526343	contig_2892_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_119026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCTGTGAGAGGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278058	276086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_276100_278100
526344	contig_10311_pilon	-	1751	12	Intergenic	novelGene_50451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1087.84334372917	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	27	1166	71526	65773	TRUE	25	ACTTAAAAGTTGCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71552	65132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65541_65595_65881_67227_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
526345	contig_11720_pilon	+	1473	9	Intergenic	novelGene_43796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2565.92385591915	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	245	1189	68064	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67819	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78479_86255_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
526347	contig_5758_pilon	-	2436	15	Intergenic	novelGene_119050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	887.383326622349	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	1446	2153	36026	27444	FALSE	35	TTTGTGAAGATAAAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDFPGILRTRVFEGAEKKASEEEPPRDMKAVLPPEEGMAFLALKTLVQKRILMLLMKQPEEEISGVEVGVHHEEEGRAYFQLLMSSLALKEDGNQTPGMEIESQAQVMNISVMLPALIIPLTMVIPQPAENGPLLSKAWTWHHCHPESAPGMTGRGPLSTEKWKPLEGLQKIEVAKAEGAQDLPRECQNPGVPAPWMVIIMTTTTEMNLLGALRAVVPLLEGAGVAVTGVEGVT	179174	27160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_27621_29664_29881_30725_30819_30929_31094_35968_36213_48278_48349_48445_48601_49701_49829_91145_91244_92931_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
526349	contig_9363_pilon	+	1707	11	Intergenic	novelGene_6801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	244.418104894052	1304	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	265	1362	1622283	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622018	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
526351	contig_15442_pilon	+	3256	16	Intergenic	novelGene_119144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	95.4153493358846	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	89	1360	243902	274814	TRUE	15	TTTTTTTGTAGTTGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPGVGSQCRNHSHGPHLPGFGRHGICADENKELAKAKDALPLIEDSSNCDIVKATQYGIFERCKELVEAGYDVRQPDKENVSLLHWAAINNRLDLVKFYISKGAVVDQLGGDLNSTPLHWAIRQGHLPMVILLLQHGADPTLIDGEGFSSIHLAVLFQHMPIIAYLISKGQSVNMADLNGQTPLMLSAHKVLGPEPTGFLLKFNPSLSVVDKIHQNTPLHWAVAAGNVNAVDKLLEAGSSLDIQNVKGETPLDMALQNKNQLIIHMLKTEAKMRANKKFRLWRWLQKCELLLLLMLSMITMWTVGYILDFNSDSWLLKGTLLVILFFLTSLFPRLLIGYKSLIYLPTVFLLSSVFWIFMTWFVLFFPHLAGTPFYFTFILSVVAFLYFFYKTWATDPGYMKSSEEERNTVSFVVMLLMFFK	243813	288955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_243929_253373_253520_257494_257618_258867_258946_260670_260816_262452_262518_263193_263357_263597_263724_266844_266979_269355_269456_274649_275695_276550_276645_278459_278544_282672_282831_285869_285968_288373
526352	contig_10354_pilon	+	1806	3	Intergenic	novelGene_50849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	334	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	165	623	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLNGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432205	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432404_471873_472041_475056
526353	scaffold_16539_pilon	-	1905	12	Intergenic	novelGene_68351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_11	242.950731324768	1187	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	118	1593	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502802	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
526354	contig_10311_pilon	-	1682	12	Intergenic	novelGene_50401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.978539629779	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	21	1244	71526	65773	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71546	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65555_65764_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
526355	contig_9673_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_119165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACTGGATGGAGTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117997	116720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_116700_118000
526356	contig_4103_pilon	-	335	5	Intergenic	novelGene_51932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	731	junction_4	318.00972862477	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTACCGGGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91902	85763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
526357	contig_14811_pilon	-	1645	3	Intergenic	novelGene_74495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	130	909	375703	357434	FALSE	40	GCAGCACATAGACAACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386596	356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
526358	contig_3153_pilon	+	527	2	Intergenic	novelGene_104651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111291	209880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_111365_209426
526360	contig_12635_pilon	+	2389	10	Intergenic	novelGene_60805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAGAGAGAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179267	253010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_180435_180644_180751_189585_189751_192585_192742_197106_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227441_252813
526361	contig_6163_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_103778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	15	ACGTGACGAGTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
526362	contig_3018_pilon	+	2070	14	Intergenic	novelGene_78791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	658.875849166886	169	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	257	2023	478971	535107	FALSE	30	CATTGGACCTAAACGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVEQELANIDPSWIESPKTNGHIENGPFLLEQQLDDEEDDEEECPNPEEYNLDEPTAESDYTYSSSYEQFNGELPNGQHKIPESQLPEFPTSLFPGPLEPVACGSALSEGSPLNEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKTKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS	455281	535154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373_499857_517300_517402_517509_517618_522876_522947_523589_523683_534922
526363	contig_7357_pilon	-	2335	9	Intergenic	novelGene_36814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_8	2088.15874336699	2	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	213	1460	166824	136424	FALSE	10	CTTTGTTTTTCTGGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167036	135548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160031_166772
526364	contig_7744_pilon	+	1873	17	Intergenic	novelGene_62539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	197.54172818673	14	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	934	1680	887347	891030	FALSE	20	TAAAAGCGTCGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSWELPGSEHHPPPAPSLPPLCTLFTCFAQTWAWAFSAATF	879796	891223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890273_890911
526365	contig_5988_pilon	-	1436	3	Intergenic	novelGene_15977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	624	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	112	1362	653670	651962	FALSE	30	AGAGTGTCTTCACTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVQRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	653781	651887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549
526366	contig_7426_pilon	-	2353	16	Intergenic	novelGene_27468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	60.9256012599703	1068	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	75	2099	668286	637491	FALSE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	668360	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
526368	contig_6062_pilon	+	3189	12	Intergenic	novelGene_5263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_10	190.990155948995	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	720	2444	662655	744319	FALSE	30	AACCATTCTTAGATCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVVSNSYS	652633	745064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_652698_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245
526369	contig_15888_pilon	-	2477	9	Intergenic	novelGene_84392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	407.083817382858	2718	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	614	1069	38826	37821	FALSE	10	GTGCTCCGACTTCCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGSQAQLAMSHLNGHKLHGKPVRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	42547	36412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38722_38798_38892_39322_39357_40759_40831_41894_42056_42149_42261_42376
526370	SIRV6	+	393	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	357	69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCCGAAGGTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	2609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470
526372	SIRV6	+	274	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	92	1223	44	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGAAGTTTGCGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11700
526373	contig_11258_pilon	+	1716	8	Intergenic	novelGene_67785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	163.140355247266	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	28	813	279290	292582	FALSE	40	AAGAGCACAGAGAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279262	293485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_283824_283991_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
526374	SIRV6	+	1425	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	7	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1677	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGCTAGAAGACCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526375	contig_3077_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_26908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGCAAAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690194	1689204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1689200_1690200
526377	contig_18096_pilon	+	2136	13	Intergenic	novelGene_58024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	580.826183600185	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	79	1737	40382	78714	FALSE	35	TTAAAATCAATGAGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQIFIQQIFVVLLLQVRLCDHSFSSLHQSVSKRGNLNYEASENLGAF	40303	79113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75437_78571
526378	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_11096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526379	contig_7840_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_68972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153300	152469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_152500_153300
526380	contig_500_pilon	+	1641	11	Intergenic	novelGene_31025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1060.71540009561	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	311	1312	1492663	1498956	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGARSRCSAGVRPSAPSSAQPAWMVA	1485752	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498016_1498882_1498974_1499277
526381	contig_15063_pilon	+	1442	6	Intergenic	novelGene_9436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	241	1269	34808	36632	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27128	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
526382	contig_10058_pilon	+	2230	11	Intergenic	novelGene_67672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	346.83460035008	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	469	1620	39893	46630	FALSE	30	TTTACACGTAAATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMQHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDREDKSGKGTLRPAKSMDSLSAAAGASDEPEGLMGPSRPRPSPLLPESLENNSAEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAARAGGTSRSERCAGVHISDPYNISLPLHITSILNMPPNIISNVSLVRLTRGLECPKGNIAGAIKSIPTHSVPIGQSRTAPQGFQRVAGGFELPTFWLAAEPLTTVPTGT	31559	47240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_36964_37132_38857_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_41898_41977_42737_43068_46463
526385	contig_12570_pilon	-	2091	7	Intergenic	novelGene_79377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	43.2502408471136	13	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	573	1157	284104	280932	FALSE	25	TGAAGGGATTCTATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300330	279997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_284930_285147_286406_286481_300198
526386	contig_14209_pilon	+	2229	14	Intergenic	novelGene_88325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	201.763321418494	101	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	55	873	32366	37768	TRUE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32311	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38267_38394_38557_38783_40142_40344_40418
526387	contig_15063_pilon	+	1107	5	Intergenic	novelGene_14422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	46	852	35349	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35303	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526388	contig_5981_pilon	+	1868	10	Intergenic	novelGene_35479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	286.483447047292	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	93	932	23508	34697	TRUE	45	CGATAATAAAAAGCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRILFFCYRRRNMRCSREMGTICTCHTRSGSLRLCVGSSSHLSTSMPVRLW	23415	38390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30094_30142_30178_34582_34728_35629_35758_37612
526389	scaffold_12124_pilon	+	2435	10	Intergenic	novelGene_21997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	132.645726990691	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	222	941	800112	807554	TRUE	35	CTAGATCCTCCACAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791838	815396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
526390	contig_7467_pilon	-	1909	13	Intergenic	novelGene_69464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	191.456750990922	189	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	204	1487	92058	67563	FALSE	15	TTGCAGCATGGTTCTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTNLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133013	67140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86639_86680_86735_91949_92093_132844
526391	contig_14840_pilon	-	4337	8	Intergenic	novelGene_66233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_7	50.7796359633606	22	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	2943	3884	19511	11241	FALSE	10	CTGTGAGTTTGCATGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSTNLDIGAQLIVEECPSSYSLSGMTDIKTEHPLDSNSEEGSAQGVAMGMKFILPNRFDMNVCSRFVKSLNEEDSKNIQDQVNSDLEVASVLFKAECNIHTSPSPGIQVRHVYTPSTTKHFSPIKQSTTLTNKHRGNEVSTTPLLANSLSVHQLAAQGEMLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNGADPQLLGKGRESALSLACSKGYTDIVKMLLDCGVDINEYDWNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	22453	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13215_13342_13764_13863_15810_15877_18220_18380_19222
526392	contig_2455_pilon	-	2057	15	Intergenic	novelGene_119184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	63.2507562268255	14	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	991	1950	162921	142765	FALSE	20	TATCTTGTAAGATGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDIVKEFEDKGFVQVDDGRKIVFVPGCSIPLTIVKSDGGYTYDTSDLAAIKQRLFEEKADMIIYVVDSGQSMHLQAVFAAAQMIGWYDPKVTRVSHAGFGVVLGEDKKKFKTRSGETVRLIDLLEEGLKRSMDKLKEKERDKVLTPEELKAAQTSVAYGCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAYLLYAFTRIRSIARLANIDEEMLQKAAQETKIILDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDYIYELATTFTEFYDSCYCVEKDRQTGKVLKVNMWRMLLCEAVAAVMAKGFDILGIKPVQRM	177526	142657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142875_143681_143930_144362_144536_157119_157226_160387_160498_161079_161259_162887_162993_164823_164954_166684_166744_167936_168059_168494_168596_169668_169778_170985_171175_175412_175548_177452
526394	contig_1301_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_47272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	1075	1722	240053	239406	NA	30	AAGCCTCAAGTTGCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSITLSDIVPGDEPCRMEGTQNTTGEQLPPQSRVSLNEVDGVKLSRPSFAHAARLKMRRNNHKYPLIIGIWNVQSMNLGKLKVIKERMECIKIDILGISELKWIGIGHFESDNLMVHYAGNDSLKRNGIVFIIKRNISRSILKYTAAGDRIISIHLQGRPVNTTIIQFYAPTTNAKYENIEDFYQLLQSEIDQTCKHNALIITGDWNAKVGNN	241127	238711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_238700_241100
526395	contig_12837_pilon	+	2042	8	Intergenic	novelGene_57292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2751.66960819301	4	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	283	639	153893	166049	FALSE	50	ATGAATAAAAGTCAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128286	167452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128359_129646_129802_153837_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
526396	contig_15063_pilon	+	1421	4	Intergenic	novelGene_14206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	102	1277	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34706	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526397	contig_7963_pilon	+	647	3	Intergenic	novelGene_58384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1605	junction_2	1006	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	72	647	51450	57529	FALSE	10	TGGGGCCTGGAGGAGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEH	51378	57529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281
526398	SIRV6	+	670	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1614	-277	222	-134	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCTTGTTTAGAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526399	contig_1225_pilon	+	3340	2	Intergenic	novelGene_44108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	738	junction_1	0	20	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATTTCTAGTTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134406	150254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007
526400	contig_15087_pilon	+	2016	21	Intergenic	novelGene_37213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	240	548	110940	114589	TRUE	15	AGCTCGCTGAGTCGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQSGLVMETGSQQGCASKLEILVLTTTDSQQGLQEVSGGVALNGLVERCVIFLNEFPPDIQQVDLTPGDHDPGESLLIRASALSWICKVCRQKKRGLFLTL	110700	181125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116908_118079_118173_118902_118919_126034_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133538_144055_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149622_149716_150479_150574_158909_158954_176372_176507_181073
526401	contig_5988_pilon	-	589	6	Intergenic	novelGene_15880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	799	junction_1	70.5027659031899	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	57	587	398182	395594	FALSE	30	GCAAGAGGTGGAAGAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGELADKKDRDASPSKEERKRSRTPDRERERDRDRKSSPSKDRKRHRSRDRRRGGSRSRSRSRSKSIERERRHKERERDKERDRNKKDRDRDKDGHRRDKDRKRSSLSPGRGKDFKSRKDRDSRKDEDDEHGDKKPKAQPLSLEELLAKKKAEEEAEAKPKFLSKAEREAEALKRR	403608	395591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_395645_395796_395863_395972_396067_397411_397523_397973_398183_403552
526402	contig_5009_pilon	-	3276	13	Intergenic	novelGene_119247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_8	87.2614207743351	529	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	41	1915	40423	26082	FALSE	5	TTTTATTTGTTTCTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEKGDTENGKEKGGEKEKEQRGVKRPIVPALVPESLQEQIQSNFIVVIHPGSTTLRIGRATDTLPASIPHIIARRHKQPGQPLYKDNWLLREGLNKPESNEQRQNGLKMVDQAIWSKKMSNGTRRIPVTPEQARSYNKQMRPAILDHCSGNKWTNTSHHPEYLVGEEALYVNPLDCYNIHWPIRRGQLNIHPGPGGSLTAVLADIEVIWSHAIQKYLEIPLKDLKYYRCILLIPDIYNKQHVKELVNMILMKMGFSGIVVHQESVCATFGSGLSSTCIVDVGDQKTSVCCVEDGISHRNTRLCLAYGGSDVSRCFYWLMQRAGFPYRECQLTNKMDCLLLQHLKETFCHLDQDISGLQDHEFQIRHPDSPALLYQFRLGDEKLQAPMALFYPATFGIVGQKMTTLQHRSQGDPEDPHDEHYLLATQSKQEQSAKATADRKSASKPIGFEGDLRGQSSDLPERLHSQEVDLGSSQGDCLMAGNDSEEALTALMSRKTAISLFEGKALGLDKAILHSIDCCSSDDTKKKMYSSILVVGGGLMFHKAQEFLQHRILNKMPPSFRRIIENVDVITRPKDMDPRLIAWKGGAVLACLDTTQELWIYQREWQRFGVRMLRERAAFVW	40463	24720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_26226_27130_27295_28112_28378_29324_29466_29955_30052_30848_31003_32252_32386_32848_32943_33466_33641_33927_34033_34655_34767_36250_36422_40300
526404	contig_4315_pilon	-	2749	17	Intergenic	novelGene_46724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	179.553613163311	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	12	1340	163741	150695	TRUE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAFTTLLRTLM	163752	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150729_152981_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
526405	contig_401_pilon	+	1829	8	Intergenic	novelGene_42872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	201.64496987912	12	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	26	532	1749725	1767192	FALSE	15	AACTGCCTTTGTGCGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVIRAAVSQRTDQVVTASVKTPLFVFSHLPQNIACLL	1749699	1768489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764543_1764692_1764701_1767088
526406	contig_18145_pilon	+	2115	14	Intergenic	novelGene_37355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	511.299979111141	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	110	1930	90771	100744	FALSE	35	GCGGCAGAAAGTGAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAIRGTGGSVYTEDNDDDLYG	90469	100929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98437_100688
526407	contig_14333_pilon	-	1476	2	Intergenic	novelGene_49137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTAAAACGAGACACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425697	424114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_424376_424482
526408	contig_15185_pilon	-	1599	8	Intergenic	novelGene_99447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	332.885835673188	61	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	322	1146	444599	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSRVECRPVGVLRSRRLFRSHVVLPGALLQRGQWLLGGASARPESWGAQPGGLPQPGAVRDARGPHPHSWISDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472484	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444727_472290
526409	contig_10902_pilon	+	2355	6	Intergenic	novelGene_65661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	12	junction_5	502.319659181283	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	74	670	79192	110375	FALSE	15	TAACTCTGATGTTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPRGPRALRGHLRVFPSVCPSDMEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLSLSRTQVSSEKCS	79118	112060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102_100180_110327
526410	contig_14441_pilon	+	964	7	Intergenic	novelGene_100641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.342470313716	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111306	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_112099_112150_112454_112665_116555_116698_116853_116963_117220_117344_117539
526411	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	3	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721
526412	SIRV6	+	700	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	8167	0	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
526413	contig_6980_pilon	+	2016	9	Intergenic	novelGene_36043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	71	967	356720	372790	FALSE	30	TTCTATTATTTTAATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346112	373839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
526414	contig_13481_pilon	-	3239	12	Intergenic	novelGene_119430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_8	65.3403043450276	261	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	435	1568	933386	914822	FALSE	20	TGAAAGCCAGTGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THVETFVSSTRFVKCEKCHHFFVVLSEADSKKSIIKEPESAAEAVKLAFQQKPPPPPKKIYNYLDKYVVGQSFAKKVLSVAVYNHYKRIYNNIPANLRQQAEAEKQTSLTPRELEIRRREDEYRFTKLLQIAGISPHGNALGASMQQQVNQQVPQEKRGGEVLDSSHDDIKLEKSNILLLGPTGSGKTLLAQTLAKCLDVPFAICDCTTLTQAGYVGEDIESVIAKLLQDANYNVEKAQQGIVFLDEVDKIGSVPGIHQLRDVGGEGVQQGLLKLLEGTIVNVPEKNSRKLRGETVQVDTTNILFVASGAFNGLDRIISRRKNEKYLGFGTPSNLGKGRRAAAAADLANRSGESNTHQDIEEKDRLLRHVEARDLIEFGMIPEFVGRLPVVVPLHSLDEKTLVQILTEPRNAVIPQYQALFSMDKCELNVTEDALKAIARLALERKTGARGLRSIMEKLLLEPMFEVPNSDIVCVEVDKEVVEGKKEPGYIRAATKDSSEEEYDSGVEEEGWPRQADAANS	952476	913150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_914913_915785_915893_917846_917940_919681_919982_930689_930855_931825_931915_932722_932888_933262_933440_939754_939797_941217_941378_943010_943166_952452
526415	SIRV6	+	423	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10346	57	1109	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11346	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
526416	contig_11386_pilon	+	1909	8	Intergenic	novelGene_82755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	432.076193205196	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	788	1447	17940	31994	FALSE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7878	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11261_11370_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990
526417	contig_5331_pilon	-	1807	5	Intergenic	novelGene_112780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	259.898537895079	1094	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	24	815	253336	248930	FALSE	5	GCAGTGTCTTTGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253359	247937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253103
526418	contig_14441_pilon	+	1584	4	Intergenic	novelGene_100579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	461.283956895196	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	505	1398	111703	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111198	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112019_116578_116963_117220_117344_117539
526419	contig_5050_pilon	+	1998	13	Intergenic	novelGene_110276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	612	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCTGAGAGGAGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506903	716574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_507212_507713_507902_548361_548424_623122_623295_625244_625353_635963_636130_646841_646922_671148_671310_673586_673684_681394_681477_690380_690574_703364_703441_716269
526420	contig_14637_pilon	-	2460	6	Intergenic	novelGene_114553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	232.704619636139	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	74	310	391450	369538	TRUE	25	AGATGCGTTTGTGTAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLAGKGLRGGAGRPAGSERSRVRMDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLAIWFMMSQEETPFLNWTIG	391523	362096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_364112_369328_369396_369469_369589_377829_377892_389892_389949_391382
526423	contig_7816_pilon	+	1981	14	Intergenic	novelGene_66512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1042.95729402491	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	144	1874	181046	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170126	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170263_181038_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
526424	contig_15720_pilon	-	1156	8	Intergenic	novelGene_41910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1837.85530509041	338	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	104	964	283894	279091	TRUE	15	GACTTTTTGGAAGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWVSVGWGGQAEYLAARWNPCQTWRVRSS	283997	278501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279654_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
526425	SIRV6	+	1014	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	32	482	-5	12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	152	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	35	CAACTCACCATAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526426	contig_5018_pilon	-	1768	9	Intergenic	novelGene_47098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	680.831832668685	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	735	1217	1400899	1399645	FALSE	0	TGTGTCTTCCTCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402858	1399093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401973_1402078_1402260_1402363_1402701
526427	contig_5732_pilon	-	2156	2	Intergenic	novelGene_119582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150194	147852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_149147_149332
526429	contig_3410_pilon	+	2811	12	Intergenic	novelGene_58958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_7	70.2760789510006	305	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1418	2110	417402	420802	FALSE	10	TGCTTGATGGAGCCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGEELTSEESVFEVFAHYLSGEPNRNGCKVTCLPWNDEPLAAETNLMKEELLRVNRQGILTINSQPNINGKPSSDPIVGWGPSGGYVFQKAYLEFFTSRETVEALLQVLKRYELRVNYHIVDVKGENITNAPDLRPNAVTWGIFPGREIIQPTVVDPISFMFWKDEAFALWIEQWGKLYEEESPSRMIIQYIHDNYFLVNLVDNEFPLDNCLWQVVEDTFELLNRPAPE	407243	421503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_407389_409951_410201_411486_411727_412569_412681_415336_415532_416261_416513_417025_417161_417310_417492_417819_418003_419144_419247_420163_420284_420604
526430	contig_10106_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_73892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	524	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165529	162427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_162400_165500
526432	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3810.66217634445	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	238	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAYWGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKQVK	26747	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39503
526433	contig_9345_pilon	-	1605	6	Intergenic	novelGene_24675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	265	846	955353	947957	FALSE	20	GATGGCCATATGACCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001339	947197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
526434	contig_500_pilon	+	1536	10	Intergenic	novelGene_30964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	496.208463759107	133	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	123	1235	1452302	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446848	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
526435	contig_10050_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_119639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	418	1257	729	1985	299472	300728	NA	30	AAAAAAGTGTTTCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRGRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTQQDDLGDGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLPSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPMQTLQDSKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQSNSRVLGQNVMMGPNSVMPTYGSQVPHNKMMTPNSHTHPGHAQQTSAVNGRALPHAVSTMPHTSGLNRLTPGKTPLQVPLPPPMQMNALGGYSSVSSCHGYGRMGVLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDSVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG	298743	301319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_298700_301300
526437	contig_12786_pilon	+	1575	11	Intergenic	novelGene_103418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGAGCGGCGTAAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590850	629496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_591049_592787_592933_593213_593424_600791_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614084_615627_615731_628319_628380_628729_628940_629304
526439	contig_2783_pilon	+	1089	9	Intergenic	novelGene_119653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	48.8427003246135	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	68	583	736910	762052	TRUE	35	TAAGCCCTAAAAAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLGAPSQFVDVDTLPSWSDSCEDELNSSDAEAEKLQEDAIRSPFPYNKDINGKVVLWKGDVAILNCTAIVNTSNESLTDKNPVSESIFMLAGPDLKEDLQKLKGCRTGEAKLTKGFNLAARFIIHTRTVNVFCWILCHKFCKTRLSSRGCNTHSTSYCKEISRDSWGEH	736842	780853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_737086_738327_738468_756019_756088_756672_756762_762009_762087_764256_764417_767186_767344_779912_779990_780775
526440	contig_500_pilon	+	1645	12	Intergenic	novelGene_31009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1152.53913004331	5	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	341	835	1492663	1496605	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNHGAPRCPLGN	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1490762_1490903_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495424_1496572_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
526442	contig_11631_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_104193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	823	1194	123810	123439	NA	80	ATGAAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVIQKWLQQYIDRELPEIQVSFTRGCGTTDTIADVKWILAKSREYQKDIYQCFIDYAKAFHCVDHNKLWITLGRMGISEHLIVLMWNLYIDQEAVVEQNKGILHGLKSGKVCIRVVSFHHT	124632	122507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_122500_124600
526449	contig_15063_pilon	-	1489	4	Intergenic	novelGene_14130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	20	TGGAGAAGATTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36794	34630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34918_35025_35380_35839_36158_36264
526451	contig_6047_pilon	-	1876	12	Intergenic	novelGene_24215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAATAAGTTAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123868	107148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_107284_114988_115153_115884_116002_117938_118077_118158_118239_118356_118423_119278_119547_119760_119970_120536_120686_122584_122738_122978_123100_123592
526452	contig_14209_pilon	+	2291	11	Intergenic	novelGene_88344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	236.677185212263	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1553	1948	40155	40625	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32346	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34057_34106_35209_35355_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38783_40142_40344_40418_40857_40901
526453	contig_5690_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_119695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGGGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777058	779187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_777100_779200
526454	contig_8616_pilon	+	1909	12	Intergenic	novelGene_72470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	588.556842645461	30	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	371	1381	320431	330137	TRUE	15	CTATTTTCGTGCCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVRGRDPFSSLLVTLL	318038	331054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330271_330441_330546_330638_330720_330844
526456	contig_1450_pilon	+	3068	22	Intergenic	novelGene_27346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	522.955481254523	1	120	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	232	1731	244426	347055	TRUE	85	GCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALET	243324	355943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347049_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
526457	contig_15063_pilon	-	1327	4	Intergenic	novelGene_14242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	15	CTCGAATTTCTCGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
526458	contig_17427_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_30378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	984.505858349236	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	10	1434	188879	178046	FALSE	20	ATTTCAGCTGGTTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188888	177624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
526459	contig_6710_pilon	-	295	2	Intergenic	novelGene_98313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCCTGCGAGGTCACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657518	653633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
526461	contig_21422_pilon	+	1488	7	Intergenic	novelGene_79072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_3	79.0557117199988	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	190	1083	4766	12180	FALSE	75	AAAAGAAAAAGAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSPPGEGKATVPCLAERLTTELIVHIQKSLPLLEHQIIDSHQRATEELRRCGADVPDRETDKMFFLIEKIQTFNRDIEKLTEGVEAVKENEMRLYNQIRNEFKTWGLILAANTQKVRNIVHEEVSKYENQYRGKELPGFVNYKTFEAIVRHYIQQLVDPALDVLQKVTEIVRQAFTGMAKNNFGEFANLNQTAQTMIEDIKVKQAETAENVIQLQFRMEQLVFCQDQIYKMILNKIQEEMFNPLENTPQVFQMKKSNLFDTNVSDPSTSSITEIGVHLNAYFTETSSRLANQIPLIIQFFLLQENGDCLQRSMMQLLQEKERYVWLLQEEREMATKRRLLKERIYRLTQARHTLSQFST	1643	12585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_1728_4660_4784_5064_5207_6749_6909_7537_7615_9620_9888_11949
526462	SIRV6	+	850	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	37	747	0	122	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	52	6	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCACAAAGAAATTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	11090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
526463	contig_12638_pilon	+	1821	16	Intergenic	novelGene_33090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	559.890568672923	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	464	1669	173541	199604	FALSE	20	AATGCAGTGTGCTCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVAKRGKKAKAEVVVTNERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170775	199756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178124_182959_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
526464	contig_15063_pilon	+	1052	5	Intergenic	novelGene_12642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	171	914	35349	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34733_35343_35380_35839_36158_36266
526465	scaffold_6394_pilon	+	1396	7	Intergenic	novelGene_111001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	326.893458688505	88	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	11	1033	398216	405905	FALSE	10	ATTTTCCTGTACTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTVRARVCPWRLQGP	398205	406268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717
526468	contig_15304_pilon	-	1612	3	Intergenic	novelGene_30620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	252.5	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	177	308	66228	65813	TRUE	5	CCTGGAGCCCTGGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTGG	66404	64421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65821_66104
526470	contig_4604_pilon	+	2738	14	Intergenic	novelGene_19152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1143.90460768339	1	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	526	1875	365452	379856	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	363865	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_363937_364279_364409_364510_364626_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
526471	SIRV4	+	1566	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1677_1886_2389
526473	contig_1516_pilon	+	1927	10	Intergenic	novelGene_49965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1134.29718273715	18	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	561	1286	356057	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335173	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_352979_354973_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
526474	contig_12464_pilon	+	1111	3	Intergenic	novelGene_68736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	24.5	178	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	179	1111	421103	422035	FALSE	70	AATGAAAAAAGAACAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVIRLLGLPFIAGPVDIRHFFKGLTIPDGGVHIIGGEIGEAFIIFATDEDARRAISRSGGLIKDSYVELFLSSKAEMQKTIEMKRTDRTGRKRPGSGGSGAGSLSNFAGAVKEEASNSGYQDAEFHTNGTGRGDLKPRSTRPARAKNPYLFLRGLPYLVNEDDVRVFFAGLCVDGVIFLKLHDGRNNGDAIVKFASCVDASGGLKCHRSFMGSRFIEVMQSSEQQWIHCGGKQDEVPMRTEEHSPARGINDRHSRKRSHSKSSRRTRSRSPVGHYVHLKNLSLGISKRDLRNFFRDTDLTNEQITFLYK	416381	422035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_416483_420438_420487_421073
526475	contig_16098_pilon	+	2371	11	Intergenic	novelGene_46152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	814	1413	457627	461789	TRUE	40	GGCAGCAAAGCCGCGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPNFQHTAPFGKVSSVLLILGTALRQPIQPLGGGLAICSCQGYHTLVNLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASCGLICSQDALARSHNAMSDFKKLLLLLRGQCWVLVGHGVGGGRFLALQRKFLPWKSRLRHLVVKGNKSLGRDLWRGEEG	456076	468512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456663_456827_456982_457088_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458621_458707_458842_461685_462469_466709_466907_468430
526476	contig_12873_pilon	+	1753	6	Intergenic	novelGene_27208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	1104.4616788282	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	691	1182	17896	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16048	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
526478	contig_13894_pilon	-	1321	3	Intergenic	novelGene_62028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	183	1241	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288222	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
526480	contig_8059_pilon	+	3501	1	Intergenic	novelGene_111075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTATTCTTAAATTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22831	26332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_22800_26300
526481	contig_1244_pilon	-	1988	12	Intergenic	novelGene_38007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	914.872117694892	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	298	1566	946523	923211	FALSE	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIISVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947192	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924217_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_946991
526484	contig_5018_pilon	-	1623	8	Intergenic	novelGene_47088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	733.477709968345	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	74	1105	1402792	1399605	FALSE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYRTRNARRRRRQKTRRKRRTKMRMTRMKRTRRRMRRKMWARPRMSCRGHAACLQGWTEA	1402865	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399782_1400724_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
526485	contig_15087_pilon	+	2394	4	Intergenic	novelGene_37267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1353.78046800637	4	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTTTTAACTTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284614	303716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301235_301421_301788
526487	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526488	contig_9609_pilon	-	2336	7	Intergenic	novelGene_23132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	139.468534882325	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1397	1909	522064	521244	TRUE	25	TTAACCTACCTCTATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSATSRRSLLRQMWSSTWYYGVVTLVSILQAPVPPATLQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523939	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521750_521824_521862_522008_522081_522171_522309_522696
526490	contig_18108_pilon	+	2812	7	Intergenic	novelGene_33472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_3	116.683927294589	3	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	56	910	226815	260192	FALSE	35	ATAAAGTATGTACTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226759	262094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
526491	contig_755_pilon	+	2316	5	Intergenic	novelGene_119788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_3	18.952242611364	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	21	572	573406	581811	FALSE	55	AAAAAAATAAACGTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFSRWMESSGKLNIPADVLKIVYSVGAQTTGGWNYLLEQYGLSMSGAEKNKILYALSTSKHQENLVKLIKLGMEGKVIKTQDFAPLLHAIARNPKGQHLAWNFVRENWTHLLKKFDLGSFAMRVIISGTTSHFSSKDELQEVKLFFQSLKAQGSHLDIFQIVLETITNNIKWLEKNLNTLKTWLLVNV	573385	583555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_573429_576498_576661_577371_577513_580844_580927_581667
526493	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	102	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526494	contig_6410_pilon	+	2525	4	Intergenic	novelGene_108625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_2	122.835933939001	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGTGCATGGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299805	315179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_310261_310369_312966
526495	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526497	contig_8658_pilon	-	1514	7	Intergenic	novelGene_55808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1101.97621722673	6597	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	768	1163	13203	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55671	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_29919_30246_34540_34626_36521_36674_55528
526498	contig_12425_pilon	-	2026	11	Intergenic	novelGene_46686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	695.151559014291	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	110	1132	211174	204225	TRUE	20	ACTTGAAATTTGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226601	203280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_203592_203641_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
526499	contig_10940_pilon	+	1793	5	Intergenic	novelGene_49175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	750.102326352878	2382	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTTGTGTCGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172533	176228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172629_173150_173218_174001_174123_174639_174998_175076
526500	contig_6278_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_119811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366075	368858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_366100_368900
526501	contig_6958_pilon	-	2847	6	Intergenic	novelGene_69926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	332.122507517934	176	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1068	1814	183238	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190174	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_185332_185745_189698
526502	contig_19577_pilon	-	3921	7	Intergenic	novelGene_119837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	66.2797103192221	170	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	22	930	60130	40657	FALSE	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLSTLFCLGLCLRQAIQTRQVPLPKPSLQASPSALVPLKKSVVIQCQGPPGVDLYRLEKLKPRSYEDQAVLSIPVMKESFAGQYRCSYQNGTLWSPPSDLLDLVATGVFSKPSLSAWPSSAVSPGGDVTLSCQAQYGFDRFALHKEGDPGPSKSPERWYQAEFPIITVTAAHSGTYRCYSFSSSSPYLWSHPSDPLELVVTGTSVTPSWLSAEPSSFVSGTSKNTVFSTESGSPTGPPHQHYTEANLVRICLGAVILVLLVGILAEDWHSRKKLLVHRVRAVQRPLPPLLQTQKLHQSG	60151	37665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_40851_41350_41399_46577_46632_51818_52104_54854_55113_55259_55296_60096
526504	SIRV6	+	1509	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	1	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	435	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526505	contig_16098_pilon	-	1947	10	Intergenic	novelGene_46120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2200.86355666628	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1137	1739	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	468492	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458838_461682_461766_462058_462470_468450
526506	SIRV6	+	605	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	-345	523	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAATTAAAGTGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
526507	contig_15304_pilon	+	1232	2	Intergenic	novelGene_30512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTCTGGAGCAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52884	54288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493
526509	contig_3948_pilon	-	2024	6	Intergenic	novelGene_53193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	287.696367721249	11	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	83	655	866476	840505	FALSE	20	TCATGTCTTCTGAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGVGRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPDHVAAGEGVSREM	869650	839135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840546_847946_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
526510	scaffold_16539_pilon	-	2027	13	Intergenic	novelGene_68354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	312.762112297652	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	240	1715	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	508877	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_507853_507965_508811
526511	contig_7286_pilon	-	528	4	Intergenic	novelGene_108720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6547	junction_1	3606.66719038813	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	53	526	292049	289254	FALSE	25	TGGTAAGCAGCCATTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFD	292101	289251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_289422_290758_290857_291315_291497_292022
526512	SIRV6	+	853	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	41	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	160	483	160	642	1733	10740	TRUE	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSAYN	1467	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3152_10724_10819_11031_11109_11205
526513	contig_15063_pilon	+	1243	4	Intergenic	novelGene_14327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	285	1106	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34877	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526515	contig_5539_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_104756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	1166	1783	86344	86961	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDCSLQYGLHLNIKKTKILTTGPVSNIMINGEKIEVVKGFILLGPTINTHGSSSQEIKRCIALGKSVAKDLFKVVKSKDATSKTKVPLTQAMEFSVVSYACESWMMNKEDRRRIDAFELRCWRRILTISRTTNRTNKSVLEEVQPECSLEARIARLYLTYFGHVIRRDQSLEKNIMCGKVEDQRKRGRLSTRWIDTVAATEA	85178	87565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_85200_87600
526516	contig_19342_pilon	+	1045	4	Intergenic	novelGene_41054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	7	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTGTGTTTGCTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3233	6779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3795_4214_4365_6149
526519	contig_1813_pilon	+	2729	12	Intergenic	novelGene_105483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	368.667961878575	65	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	315	1079	128315	150078	TRUE	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSLWG	106521	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_106653_113656_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152229_154860
526521	contig_11292_pilon	-	693	6	Intergenic	novelGene_109420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	424	junction_5	206.256733223427	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	181	693	167479	165315	FALSE	30	ATGGAAGTGGATGAGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELNDPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKA	167659	165314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_165384_165646_165710_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
526522	contig_15135_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_119892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCACTCCTGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127601	129614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_127600_129600
526523	contig_8907_pilon	+	3346	2	Intergenic	novelGene_85843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	305	junction_1	0	166	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGTTGCAGTCCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637953	643383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_638096_640179
526525	contig_13894_pilon	+	1107	9	Intergenic	novelGene_62155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	89	1051	522731	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521733	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
526526	SIRV4	+	431	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	99	420	99	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACTTTCCACTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554	2351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
526527	contig_10923_pilon	+	1884	11	Intergenic	novelGene_66193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_3	774.652025105466	1635	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	50	1768	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13829	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
526529	contig_10861_pilon	-	1840	1	Intergenic	novelGene_39283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTTTGTTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354983	1353143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1353100_1355000
526530	contig_5643_pilon	+	1160	11	Intergenic	novelGene_38857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2465.96958821475	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	118	954	236108	237983	FALSE	15	CAGCCACCTCTTTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233975	238189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237619_237749_237819_237913
526531	contig_10968_pilon	+	1588	10	Intergenic	novelGene_84296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	249.014997812988	2583	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	269	1120	167443	177921	FALSE	30	TAATTATGACTCCACGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166048	178389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167330_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
526532	contig_5684_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_81075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGTATACAGAAGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450410	447892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_447900_450400
526534	contig_17936_pilon	+	2134	11	Intergenic	novelGene_29917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	802.318266026644	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	58	1275	50646	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKEVNESPDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50588	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114950_118717_118827_121017_121063_125766
526535	contig_5988_pilon	-	1296	3	Intergenic	novelGene_15965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1070.5	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	148	1128	653723	651962	FALSE	30	AAGAAAGGTTTTTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGSSTAWNTASSLMARGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652890_653670_653773_655456
526538	contig_18251_pilon	+	2540	4	Intergenic	novelGene_50161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1001	junction_1	922.016027819232	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1734	2105	48676	53991	TRUE	45	ATCAAGAATAGTGTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	46942	55317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48794_50696_50879_53919_54027_54917
526539	contig_14133_pilon	+	2776	5	Intergenic	novelGene_119917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.91230003857	530	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	304	645	143029	145887	TRUE	5	GAGCTTTTGTGTGTCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVCSTGLGGKPRGVRGVGRPVHVLNAAFTKPFCPGSWPGCLMPHLPQRSRQ	136627	148454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_146231_146666
526542	contig_14924_pilon	+	2646	17	Intergenic	novelGene_104156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	51.7166257116607	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	14	1576	44129	53716	TRUE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGLGAKKGLGAQKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPKYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISERATNRREVESWSSGLESNEARQKFAGAKAISSDMFFGREMDSEYEARSRLQQLSGSSAISSSDLFGEVDGAHGAGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQDRYGSY	44115	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_48758_48896_49018_49151_51163_51293_51371_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695_54048_54217
526543	contig_6445_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_77038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGGAGCTGGCACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564223	563098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_563100_564200
526544	contig_10159_pilon	-	2667	11	Intergenic	novelGene_30791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_8	124.026972872839	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	833	2092	353226	317967	FALSE	80	AGTGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642117	317391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_431854_431937_456756_456901_577727_577806_597817_597913_606778_606838_641956
526545	contig_854_pilon	-	2482	8	Intergenic	novelGene_36149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.268575359936	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1495	2067	471014	470442	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	483505	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471072_471214_471359_471762_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_479018_479205_483477
526546	contig_5643_pilon	+	1176	11	Intergenic	novelGene_38787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2615.06250212112	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	351	971	236700	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233606	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236304_236651_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
526547	contig_2798_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_119994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	295	888	497	1384	69370	68483	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELINTTTLSNTSSVDLDHCDLRCRRILIALYSVVLLGGTAGTVMMSRMMFKRKSQSMIATIIVNIIVLHSILLVTLPFRLSYYVSVVWKFGSFTCRVVSSIIYGHMYFTFVFYVVIVILRLLIYFKKLQMQRLQRYHAVVLSITVWMVGSLIFLPVFFLKYGIDPSHSEQHRCFEFYKDLNCRELIIINYSIIVFMMTIVVVLFLIKMAVIFQLAKTHWPDTWAHQEYRAQIKSLFFLLVIVVCFIPHHVFRIHFIQNFSEIEDSQLVLYNEICIALTTVCCLDMLCFIRGVIH	69866	67744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_67700_69900
526549	contig_11396_pilon	-	2104	7	Intergenic	novelGene_71271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	723.121109420053	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	70	663	249053	232299	FALSE	0	CCCTCTTCGGCTTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249122	230857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245816_249034
526551	contig_11417_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_103260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATACTAACCCTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269292	269894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_269300_269900
526552	contig_11328_pilon	+	553	4	Intergenic	novelGene_88428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_1	1460.55157008881	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	409	510	647217	647995	FALSE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	644907	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645017_645228_645376_647064_647223_647899
526553	contig_11130_pilon	-	1876	5	Intergenic	novelGene_53097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	729	junction_4	827.675170281192	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATGCACATACTTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	54588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
526555	contig_11752_pilon	+	1430	6	Intergenic	novelGene_37660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1100.71202410076	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	269	580	94265	105616	FALSE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	87188	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87332_92975_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
526556	contig_15063_pilon	+	1141	5	Intergenic	novelGene_12298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	15	1094	28164	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKDVVTSRYVCVHVCIQTNHVCG	28149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36691
526557	contig_14970_pilon	+	1479	7	Intergenic	novelGene_45038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_3	3776.56662488857	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	677	781	231446	231550	FALSE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	182399	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
526558	contig_14666_pilon	+	2556	14	Intergenic	novelGene_39518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.6093481398712	284	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1484	2122	446586	448893	FALSE	10	GGTATCGAGTCCGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFQNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429350	449327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440704_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446741_447493_447609_448003_448067_448153_448295_448638_448769_448858
526559	contig_9833_pilon	+	1856	12	Intergenic	novelGene_68540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	437.947976079427	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	18	1085	230823	254740	TRUE	15	ACTCCTTGGGTAACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRFPMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230805	260336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248824_250069_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
526560	contig_15063_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_14385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	131	1015	35271	39515	FALSE	30	AGGCACTTGTGGCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35140	39727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526561	contig_3095_pilon	+	1727	3	Intergenic	novelGene_75139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_1	574.5	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	44	406	149574	149936	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPIPLPLHHLLPTCMCLTSWVLLHLSLLIPTLTPFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNGTSLCCSPRHGNL	149530	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_150696_150996_151163_151848
526562	contig_2332_pilon	+	3379	12	Intergenic	novelGene_58648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	69.9025295419532	320	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	11	1708	250041	292483	FALSE	30	TCAACAACTATGTGGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPSSRAETFKYGLWPAARGVALGTLKEGRAVRGHLAEESAGAESAAQREVLSSSRARSGRRVRGWKWTIMFEIKKICCIGAGYVGGPTCSVIAQMCPEIRVTVVDVNESRINAWNSPTLPIYEPGLKEVVESCRGKNLFFSTDIDDAIKEADLVFISVNTPTKTYGMGKGRAADLKYIEACARRIVQNSHGYKIVTEKSTVPVRAAESIRRIFDANTKPSLNLQVLSNPEFLAEGTAIKDLKNPDRVLIGGDETPEGQRAVQALCAVYERWVPKEKILTTNTWSSELSKLAANAFLAQRISSINSISALCEATGADVEEVATAIGMDQRIGNKFLKASVGFGGSCFQKDVLNLVYLCEALNLPEVARYWQQVIDMNDYQRRRFASRIIDSLFNTVTDKKIAILGFAFKKDTGDTRESSSIYISKYLMDEGAHLHIYDPKVPREQIVVDLSHPGVSADDQVSRLVTISKDPYEACDGAHAVVICTEWDMFKELDYERIHKKMLKPAFIFDGRRVLDGLHNELQTIGFQIETIGKKVSSKRIPYAPSGEIPKFSLQDPPNKKPKV	250030	294154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_250247_258081_258251_267894_267997_280612_280814_280923_281122_282003_282152_283470_283566_285542_285674_287991_288126_288587_288680_288805_288917_292372
526563	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_9759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	5	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	239	1402	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35848_36158_36266
526564	contig_14526_pilon	+	3316	13	Intergenic	novelGene_111220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	803	1117	376378	376692	TRUE	60	AATAAGAAAGACAACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHSAVCHNLKTIRNFRQVHEKSRKQNWQSEKKHQIVFNWASSVFQYKNKLLLRRRGKHFIVQNFKIMSQTHLCSYFSLNHHFRWHKIWQLRQHLAFGEHLGS	375575	456350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_377326_381447_381625_384951_385070_390943_391149_393457_393643_398980_399168_403579_403732_405945_406031_427855_427957_433560_433675_449991_450086_451807_451881_456275
526565	contig_15063_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_13854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2273.14624254578	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	200	1441	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34608	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526566	contig_19342_pilon	+	922	5	Intergenic	novelGene_41124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	60	329	5208	6183	FALSE	20	AGAATCCTGTGTTTGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSGSADTWRTGRTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	4308	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4348_5187_5293_5413_5522_5960_5994_6139
526567	contig_12622_pilon	+	1144	8	Intergenic	novelGene_5920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGGGGAGAAAAGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583547	1589691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585705_1586273_1586406_1586527_1586594_1588934_1589010_1589098_1589228_1589523
526569	SIRV6	+	899	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	394	517	178	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	39	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	146	637	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1481	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526571	contig_11364_pilon	-	3657	1	Intergenic	novelGene_65169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	105	425	123723	123403	NA	70	GAAAGGAAAAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHIKPGKQLVSGQIPGKPTVRWRFVCRKCAGEKSHEITWGTKGSRIGQREMLDFDAAATKARANSTESSGAGMAQQRELSQIEMKGQGSYATVLTSQGALVVLNC	123827	120170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_120200_123800
526572	contig_9609_pilon	-	2189	8	Intergenic	novelGene_23113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	87.3708960088413	174	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	819	1754	523112	521244	TRUE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523930	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
526573	SIRV6	+	760	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	26	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1847_2026_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
526574	contig_17144_pilon	-	1748	9	Intergenic	novelGene_29527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2304.92938815379	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	553	1044	174965	173536	TRUE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	183242	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166170_172528_172740_173128_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176258_179691_179786_181794_181850_183158
526575	contig_15219_pilon	+	2445	8	Intergenic	novelGene_40833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	220.031166623536	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	15	1103	19617	24591	FALSE	70	AAAAAGAAAAGAAAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19602	25933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
526576	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526577	contig_3797_pilon	+	2446	3	Intergenic	novelGene_120078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	99.5	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	32	346	317790	331713	TRUE	35	TCAATGACATATTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWLHRPVALAMAPWAGAELSTLNPLSAVWLTLAAAFLVTLLLQLVPAGLFPGCPLFQDLIRYGKTKGARPPRPAACQAFDIPKSVCNREESIDASTVVPYPRNADVHLVICPSV	317758	334707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318011_331619_331755_332648
526579	contig_15545_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_120127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATGACACAGCTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12874	12185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_-_12200_12900
526580	contig_12638_pilon	+	1999	11	Intergenic	novelGene_33373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	109.991136006498	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	95	1393	1515842	1538931	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515747	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1538987_1539129
526583	contig_15304_pilon	-	1234	2	Intergenic	novelGene_30519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	7504	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	198	728	54100	53391	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
526584	contig_19459_pilon	-	1071	6	Intergenic	novelGene_59831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6441.90786646316	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	394	735	11335	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15687	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
526585	contig_8570_pilon	-	2431	1	Intergenic	novelGene_120167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	493	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392185	389754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_389800_392200
526586	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_14093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	537	1421	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34618	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35041_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526587	contig_20614_pilon	-	3201	6	Intergenic	novelGene_107560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_5	107.575833717429	330	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	212	718	243953	217319	FALSE	0	TGTGTTTGTGTCCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPNLYPVKLYVYDLSKGLARRLSPIMLGKQLEGIWHTSIVVHKDEFFFGSGGISSCPPGGTLLGPPDSVVDVGSTEVTEEIFLEYLSSLGESLFRGEAYNLFEHNCNTFSNEVAQFLTGRKIPSYITDLPSEVLSTPFGQALRPLLDSIQIQPPGGNTVGRPNGQS	244164	214835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_217413_219158_219282_219985_220096_222742_222813_223969_223992_243865
526588	contig_9233_pilon	+	2535	2	Intergenic	novelGene_78256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	186	575	676621	677010	TRUE	0	TTCTTGTGGTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSSLASEWARSPGPSSSTGQPTFDVYPTQRTGISSPTCGSVGKSKTKQSSPSFALHFPCWMLEREQTPDLVYVVLIGCCSGTIIPGSSQFGLKTPVAVELILTHGDPVCVRVELHSIGFSVTDFLEVDHQAFLPGSLSSKEPLGGFELPAFQLAAQCLTICATWGLPVWSRDAVIRICQHLHKVVVLKV	676435	679051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_677715_677795
526590	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_12812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2863.4034188163	19	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1	1476	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28163	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526591	contig_17976_pilon	+	1957	4	Intergenic	novelGene_32484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	225	1241	41843	47385	TRUE	50	GAAAAAAAAGTTGGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41618	48889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47805_48592
526592	contig_5918_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_99484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACTAACCACAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179033	178325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_178300_179000
526593	contig_13863_pilon	+	1854	12	Intergenic	novelGene_42028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	822.51740165972	92	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	28	1101	98341	118962	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98313	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571_119918_119983
526594	contig_6735_pilon	+	1835	13	Intergenic	novelGene_15800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	645	1028	543076	544921	TRUE	15	AACTTCTGAGCTGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVHVVNILIVSLCVVILLMPVHVVSILIVILGLKLGLGLGLGLGLCFINRLFLHLEDIRSPGGQSWGILSGIVCLEGREDTGRPLLVFTGSGSEDGQLSAGGQAFEEILLGNGAGATGSSTIISGC	542092	568283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_542603_542792_542860_543008_543285_543788_543896_544853_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547357_551181_551235_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
526595	scaffold_16539_pilon	-	2033	13	Intergenic	novelGene_68356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	312.762112297652	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	246	1721	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	516074	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_507853_507965_516002
526596	contig_20819_pilon	+	1375	7	Intergenic	novelGene_55638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	524.42561171459	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1362	12	1373	29817	43612	FALSE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAMKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFRLSDLLGTRRSGGLTGGAVLIGVGVGIKLCTSA	29805	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41309_41363_43513
526597	contig_12790_pilon	+	2170	8	Intergenic	novelGene_35259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_7	190.739912670931	26	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	545	1432	308748	312473	FALSE	25	CAGGGAGGGAAGTGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	308203	313211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
526598	contig_9463_pilon	+	1861	10	Intergenic	novelGene_83835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	244.07836223963	29	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	31	429	216051	219267	TRUE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVLIFLCSLLAPVVLASATEQEKEKDPFHYDYQTLRIGGLVFAVVLFSVGILLILSRRCKCGFSQKPRAPGDEEAQVENLITANGTVQNAWQTTSRLTCMWPHEVAVTLHSLHLRSSVPVTPTEPQKAEN	185952	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_218893_219005_219238_219290_221961_222135_222192
526599	contig_15304_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_30669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	20165	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
526600	contig_17427_pilon	-	2528	12	Intergenic	novelGene_30363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	984.505858349236	2	120	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	13	1437	188879	178046	FALSE	15	AACTTGCTTCGTTGTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188891	176954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
526601	contig_19579_pilon	-	1542	7	Intergenic	novelGene_59372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	659.008704208239	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	88	405	13090	8786	TRUE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTVRAPTDAVVLLNHTFSSGHCPAKLLTFWSQIHMVLNKDTLTF	13177	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012_12102_12900
526602	contig_10134_pilon	-	1859	5	Intergenic	novelGene_16239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	725.72928837136	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAAGTGTGTGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39654	32186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33345_33452_33731_34922_35074_38614_38817_39584
526604	contig_15047_pilon	+	1490	8	Intergenic	novelGene_52153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2664.19576255659	3	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	27	461	2194	3255	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGPHRPRTRAPRGKWGRWSQPLPARRLPLPAVFLHRRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLLQPERRRVSHFPEDVWL	2167	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2482_2826_3221_3312_3407_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
526606	contig_9014_pilon	-	1613	11	Intergenic	novelGene_106749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	67.4585057646551	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	576	1355	81764	78380	FALSE	5	TGTTTGTTTTTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83132	78121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82653
526607	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526608	contig_5003_pilon	-	2924	25	Intergenic	novelGene_120178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_19	232.975227432494	296	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	74	2497	81162	3627	FALSE	15	TGTGGCTTCATTAATTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGRKAAAGPGGSCGRDSQGRIGTMEGPRAAPQPYLGLVLEKLRRVVAALPEDMRPGPDPYGFPWELVTGAAIFGFFAVLLFLWRSFRSVRSRLYVGREKKLAVKLSTLIEEKCKLLEKFSLVQKEYEGLESSLKDGKESTEAQSLEFIEGSQISETTYEKLDRSKSELEDEILFLEKQLKEEKSKRSEKDELGMDISERIQSLEDESKSLKSQVAEAKMTFKIFQMNEERLKIAIKDALNANSQLQESEKQLLQEAEEWKEQLSELNKQKITFEDYKVHVEQVLSDKENQIKSLTEHLLKMKDWTAVLGEDVVDDDSLELEMKSESEYGTYLDDQPRGALKKLIHAAKLNASLKTLEGERNQIYIQLSEVDKTKEELTERIKDLQTEQSSLQSENAQFENENQKLQQKLKVMTELYQENEMKLHRKLTVEENYRLEKEEKLSKADEKLSHAAEELEIYRKRAKDLEEELERTILSYQGQITSHEKKAHDNWLAARTAERNLNDLRKENAHNRQKLTETEFKYELLEKDPYALDVPNTFGREHSPYGPSPLGRPSPETRAFLSPPTLLEGPLRLSPLLPGGGGRDSRGPGNLLDHQITNERGESSYDRLFGPHRAPSDTGSLSPPWEQDRKMMILPSGQLYPDPAFPPQRQDRYYSNSGRLSGPAELRSFNMPSLDKADGPMSSEMESSKNDPKDDLGNLNVPDSSLPAGNEATGPGFGPPPLPPVKGPLFPVDTRGPFMRRGPPFPPPPPGSMYGASRDYFPPRDFLGPPHPPLAMRNVYSPRGFPHYLPPRPGFYPQPQHPEGRSEFPPGLIPPSNEPATEHPEPQQET	81235	3199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_3794_5044_5280_5929_5989_10843_10967_26584_26744_30290_30420_32065_32146_33647_33716_38164_38201_39044_39106_40063_40166_43948_44088_46242_46334_47075_47123_48362_48484_50755_50879_56381_56487_60549_60622_61267_61379_61946_61974_63554_63618_66502_66592_66684_66707_71647_71780_81099
526611	SIRV6	+	847	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-438	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	32	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	155	490	2002	10736	TRUE	40	CATTCGCATGGAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526612	contig_12919_pilon	-	1932	6	Intergenic	novelGene_75886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	484.519143068672	1576	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	77	856	743659	720131	FALSE	15	CACTGTTCTAGGCACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743735	719054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_730980_731156_734916_735079_737596_737735_743565
526613	contig_10437_pilon	+	2098	3	Intergenic	novelGene_38166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	128.5	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGCAAAAGCGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161127	164080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_161639_161859_162105_162738
526614	contig_9463_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_83851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGGAATAAAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222899	223398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_222900_223400
526615	contig_9389_pilon	+	1779	8	Intergenic	novelGene_83909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	879.996405372992	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	39	968	159587	167516	TRUE	40	GTTTTTAGGGAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159548	168380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167240_167650_167702
526616	contig_12644_pilon	+	1329	9	Intergenic	novelGene_44626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5099.89329392047	69	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	270	1241	2678073	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677420_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
526618	contig_7378_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_120290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAGGAAAAAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604236	602126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_602100_604200
526619	contig_2646_pilon	+	2371	6	Intergenic	novelGene_69686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_5	173.601382482974	699	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	102	728	2313200	2333563	FALSE	20	CACCTCCTGGTATTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDIDIGKEYIIPSPGYRNVSQRTSTSGQQREREESKYKRSRPVECQDALETAARAEGLSLDVSVHSQLRILDEEHPRGKYHHGLSVLKPIRTTSKHQHPVDNAGLFSCMTFSWLTSLARVAYKKGELLMEDVWPLSKYESSDVNCRRLERLWQEELNEVGPDAASLRRVVWIFCRTRLILSIVCLMITQLAGFSGPNFQDGCVLRSE	2309602	2335206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2309649_2313144_2313329_2329777_2329936_2330114_2330271_2330951_2331100_2333527
526620	contig_12837_pilon	+	1967	6	Intergenic	novelGene_57321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3229.44633025539	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	191	493	153888	163972	FALSE	20	TTTTGTTTGACAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIFFSQNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDK	129669	167477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_153829_153894_159306_159400_161387_161494_163874_163973_166003
526622	contig_7457_pilon	+	1817	9	Intergenic	novelGene_31657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	225.309093247476	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	94	933	1033534	1040226	FALSE	10	GGTGTACTGGTGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1024051	1041110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1024124_1033512_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
526623	contig_6898_pilon	+	2198	9	Intergenic	novelGene_35685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2760.1444227386	8	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	553	990	124416	125646	TRUE	15	CTATGTTCTATTTCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114287_122997_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126055_126863
526624	contig_3153_pilon	+	2022	2	Intergenic	novelGene_104713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	0	51	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATATTGATATATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544703	548646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_546614_548534
526625	contig_9014_pilon	-	2738	9	Intergenic	novelGene_106725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	82.8046458539616	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	75	1298	46682	42748	FALSE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYVSQPSPRHPPPKFTHIFSYTFSTSQKL	51615	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
526626	contig_10581_pilon	-	2292	10	Intergenic	novelGene_41402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	98.2043724354069	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	201	668	633234	627471	TRUE	25	TCCTTGTTTTGGACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDELESKPELLVQFVQNTSIPLEQGLVESETKDITCLSLLPVTEASECSRLMLPDDTPNHTNSSKEVPSSAVLRSLQVNVGPDGEETRAQTVQKSPEFLSTPESPNLLQDLQPNDSTSFILLNLTRAGLGSSAEHLVFVQDEAEDSGNDFALQ	649696	609099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_619575_619758_620102_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
526627	contig_6807_pilon	-	2635	8	Intergenic	novelGene_84567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_7	237.262878405763	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	322	1791	121535	111018	FALSE	50	AATGTAAAGCACTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAIIANLQEEVTCPICLELLREPLSLNCGHSFCQACITVNNKTSMISSEGESTCPMCRISYQPDNIRPNRHLANIVEKLREVKVSLKEEQKRDVCNRHGEKLLLFCKEDGKVICWLCERSQEHHGHHTFLVEEVAQENQAKLKTALERLRMMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQDVNNIIKRSEICTVKRTKTIPKKQSRVFQAPDLKEMLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124745	110173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_113438_113462_117941_118173_120423_120520_121112_121693_124581
526628	contig_7440_pilon	-	1348	10	Intergenic	novelGene_61162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	413.084453147415	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	75	899	74491	54265	FALSE	15	CTGAATTATGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
526629	contig_13216_pilon	+	1872	7	Intergenic	novelGene_47489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	931.257155080641	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	908	1348	260572	261012	FALSE	35	ATATTTTTAAAACTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229649	261536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229755_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256214_256296_258447_258573_260430
526630	contig_4429_pilon	+	2897	11	Intergenic	novelGene_50789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	432.205379420479	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	611	2050	172238	198515	FALSE	25	CCTAGTTTTGTTAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	154513	199362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165431_166696_166771_168336_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
526631	contig_10235_pilon	-	1979	7	Intergenic	novelGene_46474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_6	835.914402848096	11419	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1014	1475	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224504	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_223780_224427
526635	contig_13481_pilon	+	2873	11	Intergenic	novelGene_119469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	44	junction_3	13.0552671362941	242	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	165	1253	1272222	1303211	FALSE	30	TCCTAATGACGTGCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQVLTPHVYWAQRHRELYLRVELSDVQNPAISITENVLHFKAQGHGAKGDNVYEFHLEFLDPVKPEPVYKLTQRQVNITVQKKVSQWWERPTKQEKRPLFLAPDFDRWLDESDAEMELRTKEEERLNKLRMESEGSPETLASMKKGYLFMYNLVQFLGFSWIFVNLTVRFFLLGKESFYDTFHTVADMMYFCQMLAAVETINAAVGVRNSPVLPSLLQLLGRNFILFIIFGTMEEMQNRAVVFFVFYLWSSVEIFRYPFYMLTCIDMDWKVLTWLRYSVWIPMYPLGCLAEAVAVIQSIPVFNETGRFSFTLPYPVKVKVRFSFFLQIYLVVLFLGLYINFRHLYKQRRRRYGQRKKKIH	1272057	1304831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1272309_1279079_1279123_1281187_1281262_1282680_1282846_1284353_1284406_1286782_1286894_1293751_1293880_1299338_1299452_1300668_1300776_1301307_1301440_1303134
526639	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	5	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526640	contig_1406_pilon	-	1857	7	Intergenic	novelGene_25536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	562.414857753796	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	97	552	2159494	2143381	TRUE	10	GCTTCAGTCTCATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKIPVVLVD	2159590	2136616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143405_2143477_2143628_2147740_2147920_2159391
526641	contig_15063_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_14317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	307	1191	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34852	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526642	contig_15498_pilon	+	2210	7	Intergenic	novelGene_42642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	191.713979667629	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	171	965	682266	686124	FALSE	30	CTACAGAATGCACATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQRAGGQPGPVRRSRQFLPRKTSCCLACWTVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675408	687369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675458_679261_679308_682190_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866
526644	contig_7412_pilon	-	1768	8	Intergenic	novelGene_76326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1404.251489192	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	129	1424	377290	364543	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMASLWPAP	377888	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364566_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
526647	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_10278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526648	SIRV6	+	386	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGTATCGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	1978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
526649	contig_9333_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_120338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGAGCATTTACTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444219	442690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_442700_444200
526650	contig_990_pilon	+	2559	17	Intergenic	novelGene_76166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	180.951305604574	636	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	429	2069	1911790	1932551	FALSE	20	GCTCATCTCAGATGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHFPPLLRDSENYVVLLDSTLPKSQYDYVLPQVSFTAVGYHKHITLIFNPTRKLPEQDIAQGSYIALPLTLLVLLAGYNHDKLIPLLLQLTSRLQGVRALGQTVSDNSGPEDAKRQAKKQKTRRT	1905046	1933041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911719_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919670_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769_1929890_1930456_1930550_1932419
526651	contig_14415_pilon	+	2419	5	Intergenic	novelGene_77597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	156.634925862657	37	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	530	895	33410	37984	FALSE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	24758	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_25210_33331_33446_35937_35993_36102_36199_37805
526652	contig_1443_pilon	+	718	2	Intergenic	novelGene_28183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	11	412	343663	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRSMNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343664_344191
526653	contig_11285_pilon	-	2241	19	Intergenic	novelGene_5664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	436.235314939082	4	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	30	2048	798530	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_798409
526654	contig_18869_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_56481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296614	297607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_296600_297600
526656	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_18423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGTAATTTGGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
526657	contig_854_pilon	+	2225	15	Intergenic	novelGene_36182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	120	503	470342	470725	TRUE	20	GTAGGGAGGAAGTCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPQFLAAPLWAKQGNRGGAHLPGWDLQNSSDVQQGFCWMLLQIPAPTLDGAVSLPDACPPPGTGIASCHKAATPFLSSPDPVEGCGVGGLPLELLLLLGNPPGFCSPTQAGSGAESAPFAVPPPGNFPPGTLRGLCEGVRSASEKQPVHGILLQAGSHLETELPA	470222	509321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_470783_471002_471283_471910_472061_473586_473746_474244_474311_474673_474755_476674_476788_483477_483629_486998_487109_488572_488654_491435_491558_493131_493199_495175_495241_497489_497571_509182
526658	contig_5084_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_64546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525465	524726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_524700_525500
526660	contig_14513_pilon	-	1206	2	Intergenic	novelGene_70308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	187	351	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
526661	contig_15063_pilon	-	1239	5	Intergenic	novelGene_11262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35345_36089_36156_36264
526662	contig_12622_pilon	-	1778	10	Intergenic	novelGene_5958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2307.27886866278	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	57	1583	1590968	1583745	FALSE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDRPTTGPTGPPSAGPTGPPTAGPSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591024	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586726_1588863_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
526663	contig_11086_pilon	+	2334	12	Intergenic	novelGene_61192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	61.9018150844044	4	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	125	2254	35087	52141	FALSE	15	GTTTCTCAACCCAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLQRIFYDLFPK	24485	52221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48872_52105
526665	SIRV6	+	337	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	336	94	170	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
526668	contig_15021_pilon	-	2107	13	Intergenic	novelGene_26949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	438.116827075458	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	50	1273	269638	240581	FALSE	25	ACAAGTGGTTCTGATGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMPQRHGPGRLCEPGPVTSPQTQMLPGIPDPSFLPLLPLLMVLQREAKSSDHFITHRLFQQFSVAISFIL	279809	239746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_240787_243766_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
526669	contig_9807_pilon	+	1925	8	Intergenic	novelGene_32857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	601.177857481902	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	110	787	109130	156718	TRUE	10	TCTCTTCGTTGTGGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGSSAWPTATQRTMFSTDTMRRSSAWLGPRTTSTLPLVAWT	109020	159763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_154243_154270_156624_156770_158676
526670	contig_17470_pilon	+	2716	10	Intergenic	novelGene_110523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1125	1502	271345	273587	TRUE	80	AAAAAAAAAAAATACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRVLVHSPQVLHELIWAQDPAHLPASGAKGLAGAANGQGAFPHSREAGNADVLVPVEDQPLVNLITDAHHVMLLAQAGHQLQFCLGEDLSQRVAGCVEDQGFGARCELVGQLCGVQLPVAAVI	269592	275132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_270141_270229_270521_270858_270939_271026_271219_271331_271414_271528_271609_272834_272958_273481_273609_273860_273952_274030
526672	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526673	contig_4093_pilon	-	1831	6	Intergenic	novelGene_27637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	159	896	69245	41737	FALSE	40	CAATCCAAGCATAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72582	40801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
526674	contig_1443_pilon	+	734	2	Intergenic	novelGene_28190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	132	437	344287	344592	FALSE	30	GCATTCTAATGAGTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343657	344889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343665_344162
526675	contig_8978_pilon	+	2403	11	Intergenic	novelGene_49381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_7	243.323262348671	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	96	1514	339807	347248	FALSE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331567	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
526678	SIRV6	+	784	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	183	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	30	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	81	410	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1486	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2023_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
526679	contig_9848_pilon	-	2166	3	Intergenic	novelGene_79980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	364	1526	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGCTTGTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130904	128383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_128881_128950_130512_130796
526680	SIRV6	+	675	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	548	-440	548	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	39	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10785	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
526681	contig_11285_pilon	+	1649	10	Intergenic	novelGene_5611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	469.740353812614	51	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	538	1326	767306	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLVTWLRPAASCPRAPTHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767361_768725_768857_769085_769320_769421_769653_769740
526682	contig_2770_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_107459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3001	junction_1	974.202693944586	5	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	62	403	746670	743833	FALSE	30	AAAGTCGTGTTAAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	746731	742937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600
526683	contig_10354_pilon	+	1995	4	Intergenic	novelGene_50847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	381.479866950916	250	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	330	812	432976	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMKRLIPVPLGTWPNIQDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432203	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_471873_472041_475056
526685	contig_5643_pilon	+	1610	13	Intergenic	novelGene_39051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	795.155889677545	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	636	1304	634983	641123	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQREEYPCQGLPHLLQTQGGYV	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637811_640689_640729_641102_641244_641412
526686	contig_19744_pilon	+	2982	4	Intergenic	novelGene_120409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	126.265153106029	300	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	398	1228	260398	271834	FALSE	10	TGCTGTTGTTTTATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPKSHFISALTVVFVNSKSLSSLKIDDTPVDDPSLKVLVANNSDTLKLLKMSSCPHVSPAGILCVADQCHGLRELALNYHLLSDELLLALSSEKHVRLEHLRIDVVSENPGQTHFHTIQKSSWDAFIRHSPKVNLVMYFFLYEEEFDPFFRYETPATHLYFGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	250867	273588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_251157_260289_260413_263501_263674_271190
526687	contig_9389_pilon	+	1942	6	Intergenic	novelGene_83918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1736	junction_3	434.966389506132	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	419	1066	164432	167516	FALSE	35	AAAAAGTGGCTGGAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159552	168392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164540_165815_165933_166074_166222_167240
526688	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_8605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26355	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526690	SIRV6	+	896	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	43	6	FALSE	0	NA	NA	C	coding	119	360	338	697	2021	10780	TRUE	40	AATTGTTGGTAACAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPEVRIIDERVEVEVVQQES	1467	11289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
526691	contig_1861_pilon	-	1990	16	Intergenic	novelGene_77650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	108.706005149465	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	141	1829	112534	87440	FALSE	25	GGCTGGAGTTGGCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115217	87278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103212_104797_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
526693	contig_5423_pilon	-	2022	8	Intergenic	novelGene_85275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	227.779969017722	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	72	764	573102	558837	FALSE	35	AAGCCTCATTGTAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAD	573173	557578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_558843_560675_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063
526694	contig_854_pilon	-	2629	1	Intergenic	novelGene_36141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	1640	2212	471014	470442	NA	0	CGTGCCTGGGGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	472653	470024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470000_472700
526695	contig_4754_pilon	+	1928	13	Intergenic	novelGene_35942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	173.910637173872	11	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	598	1497	410296	420387	FALSE	15	TAGCTGGTTGTCTGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380041	420818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407826_410282_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
526698	contig_7457_pilon	+	1949	11	Intergenic	novelGene_31333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_10	261.517896137148	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	111	1172	281205	290488	FALSE	10	GAGGTGCACTGTTGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKDGCGERQD	280836	291265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_290461
526703	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526704	contig_15063_pilon	+	1484	4	Intergenic	novelGene_14066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	191	1363	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34617	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526705	contig_12279_pilon	+	1346	7	Intergenic	novelGene_50079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2279.36085095995	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	241	843	68297	77128	FALSE	20	TGACTGAGATCTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57391	77631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57477_58288_58438_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
526706	contig_12425_pilon	-	2074	10	Intergenic	novelGene_46690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	687.426117242185	4	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	341	1132	209477	204225	FALSE	25	CAACTTGAAATTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226623	203282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210324_210389_211048_211200_226517
526707	contig_4114_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_15619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389074	389564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_389100_389600
526708	contig_13740_pilon	-	1813	9	Intergenic	novelGene_34647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	4929.64250573761	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	770	1492	161718	157474	TRUE	40	AATACTTTTGTATCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	164489	155111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_157452_157536_158270_158394_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162016_163819
526710	contig_14142_pilon	+	2340	12	Intergenic	novelGene_120476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	260.155484341687	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	303	1481	268562	274116	FALSE	40	TACAATAAAACTTTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLEDSVTLRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHFNFMCNSSCMGGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRICACPGRDRRTEEENFHKKGETSPEPPPGRSTKRALPTNTSSCTQPKKKPLDEEYFTLQIRGRERFKMFLELNEALELKDAQAGKEPEGSRAHSSPPKSKKGQSTSRHKKLMFKREGPDSD	261195	274975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_261367_265558_265662_268533_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_269877_269991_270242_270353_270673_270814_270915_270990_273349_273457_274034
526711	contig_401_pilon	-	4082	31	Intergenic	novelGene_42891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.179466805546	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1062	3189	15	3203	1831260	1808758	TRUE	10	CCTTCTACCCCACTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRTPRSPLHVVQPRWSPRRRTLLPPLPLLLPLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGADGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGISASQCTPIEFDSKGSRMLESSLSSPEGEEIVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDVRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDINGDGLDDLLVGAPLLMERTADGRAQEVGRVYVYLQHPAGMEPTPSFTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFIFPGGPGGLGSKPSQVLLPLWAAGHTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGAFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGSPVACINLSFCLNASGKHVPDTIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLTSRQASLTQTLLIQNGAREDCREMKIYLRNESEFRDKLSPIHITLNFSLDPQAPVDSHGLQPVLHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDNICVPDLQLEVFRTPPSREQNHYVYLGDKNSLNLTFHAQNVGEGGAYEAELRVTAPPEAEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFTVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWGGLRFTVPHLRDTKKTIQFDFQILSKNLNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVSLNGVSKPETVLFPVSDWHPRDQPQEEGDIGPAVHHVYELINLGPSSISQGTLELSCPQALEGQRLLYVTRVIGLSNCTTSHPLNPQGLELDPMGSQHHQLQRREAPGRTPASSGPRILKCPEAECFRLHCELGPLHRQESQSLQLHFRVWSKTILQREHQPFSLQCEAVFKALKMPYRILPRQLPQKELQVATAVQWTKAEGSHGVPLWIIILAILIGLLLLGLLIYVLYKLGFFKRSLPYGTTMEKAHLKPPATSDA	1831274	1807742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1808541_1808676_1808842_1809493_1809617_1810193_1810296_1811078_1811193_1811302_1811390_1812330_1812484_1812882_1812989_1813093_1813175_1813312_1813393_1813554_1813648_1813740_1813910_1814295_1814364_1814502_1814641_1814915_1815071_1815201_1815258_1815456_1815559_1815726_1815773_1816015_1816208_1816444_1816654_1816947_1817001_1817173_1817231_1820232_1820277_1820417_1820463_1820691_1820818_1821088_1821135_1821227_1821290_1821509_1821631_1821731_1821845_1823551_1823683_1831027
526713	contig_3469_pilon	-	2059	15	Intergenic	novelGene_34160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_14	86.9744273933905	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	231	1589	413331	380499	FALSE	30	ATTAGAGAACTATTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427672	380028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_427444
526714	SIRV6	+	1498	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	29	1	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526715	contig_7840_pilon	+	1497	10	Intergenic	novelGene_68957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_9	427.562803126376	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	226	1497	238014	304313	FALSE	15	CCACCCCTGCAGCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVV	130617	304313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299249_299535_301110_301261_304098
526716	contig_9463_pilon	+	2029	9	Intergenic	novelGene_83819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	233.877338310064	1979	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1260	1628	222660	223028	FALSE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185899	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_202568_202737_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961
526718	contig_10861_pilon	-	2297	7	Intergenic	novelGene_39337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	152.433227640462	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	887	1480	1491018	1490156	FALSE	5	CTTCCTCAGTTTGGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSPDAPEDEAGIKKAAENSKALASHQRPPCPSPRKVGQCLPGSLPWAPQQLFTHPVMPLPPPVKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493789	1489338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
526720	contig_14326_pilon	+	3083	6	Intergenic	novelGene_120643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.5873747719324	254	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	338	754	35571	48402	FALSE	15	TTTTGAGCTGTAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLLVTCLQWLETRPNRQVCPVCKAGISRDKVIPLYGRGSTGQQDPREKTPPRPQGQRPEPENRGGFQGFGFGDGGFQMSFGIGAFPFGIFATAFNINDGRPPPAVPGTPQYVDEQFLSRLFLFVALVIMFWLLIA	17880	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_48304
526721	contig_2854_pilon	-	2734	15	Intergenic	novelGene_120838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	138.814073273482	245	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	110	2281	356512	262691	TRUE	20	CAGAGAGCTCTTCCGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVNPIQIPSRLPLLLTHEGVLLPGSTMRTSVDSARNLQLVRSRLLKGTSLQSTILGVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGCREHILEDAKPESVDDTTDLALPPEMPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNVGGWCVLM	356621	257650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262717_264212_264421_274368_274512_300455_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773_348009_356279
526722	contig_9468_pilon	+	1944	11	Intergenic	novelGene_59498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_10	175.986050583562	1940	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	96	725	347212	354782	TRUE	35	GAGCAAAAACTTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGDSEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQ	345196	357240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_345271_347190_347278_350685_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
526723	SIRV6	+	899	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	224	8	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
526724	contig_5711_pilon	+	2442	12	Intergenic	novelGene_80262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	56.2895407397699	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	19	1935	52529	122172	FALSE	45	GCAGGCATTTGAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLERKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	52510	122679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_87430_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_108771_108937_113381_113568_121458_121637_121996
526725	contig_15063_pilon	+	1664	7	Intergenic	novelGene_8667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3437.5977763872	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	231	1067	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIRGGQACTSRLPDATHPGAAESA	26754	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35034_35380_35839_36144_36263_36551_38975_39092_39506
526726	contig_14513_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_70341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	55	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	189	605	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19068	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
526727	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
526728	contig_6102_pilon	-	1667	10	Intergenic	novelGene_32126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	374.542684112535	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	358	1512	820973	816763	FALSE	10	CCTCAGATCTGTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822121	816607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_820982_821314_821521_821978
526729	contig_7202_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_18069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCAGCTGTTGTCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
526730	contig_4857_pilon	+	4222	24	Intergenic	novelGene_48687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	203.670004417521	1	74	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	416	2332	1130199	1170732	FALSE	30	GATATATATGTGTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMIICKCLKEERKILENAQRFNQAQSGSIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKTLEDLQDEYDFKCKTLQNREHETSGVAKNEQKQEQMLLQKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEQDPITKNKQVLWDRTFTLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNLTVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHKKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTRTNEGPLIVTEELHSFSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLVSEPRWGQLSEVLSWQFSSVTKRGLSVDQLNMLGEKLLGPNASPEGLIPWTRFCKENINDKNFSFWLWIESILELIKKHLLSLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPRGTGYIKTELISVSEVHPSRLQSTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDTMMNAV	1123793	1172622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1123910_1127712_1127842_1128631_1128787_1130183_1130271_1133432_1133523_1136158_1136238_1137333_1137426_1137634_1137787_1139973_1140133_1141539_1141633_1143089_1143150_1145737_1145768_1145858_1145953_1147161_1147204_1151576_1151661_1152123_1152223_1152790_1152891_1155450_1155501_1156468_1156564_1157635_1157782_1160368_1160555_1161806_1161883_1162987_1163091_1170717
526732	contig_10159_pilon	-	2830	12	Intergenic	novelGene_30785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	131.544920524141	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	992	2251	353226	317967	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	629210	317387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_431854_431937_456756_456901_577727_577806_597817_597913_606778_606838_626384_626594_629099
526734	contig_4180_pilon	+	2096	2	Intergenic	novelGene_8418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888664	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_889140_889201
526735	contig_1244_pilon	-	1798	11	Intergenic	novelGene_38008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	971.656955926319	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	32	1084	947623	923601	TRUE	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWS	947654	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923605_924235_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578
526736	contig_10311_pilon	-	1688	10	Intergenic	novelGene_50421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	960.789734322889	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	33	1040	71526	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67533_68293_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
526737	contig_6576_pilon	-	2249	11	Intergenic	novelGene_42267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	79	junction_6	609.786224836213	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	123	1562	339439	322526	FALSE	20	GTGCAGTTTTGGTATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339561	321838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
526741	contig_4105_pilon	+	2570	11	Intergenic	novelGene_21469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.350760030087	3	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	549	1355	63728	73266	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58741	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62294_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
526742	contig_2087_pilon	+	2344	4	Intergenic	novelGene_65556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	441.504498529995	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	26	661	39353	70232	FALSE	25	TTTCAAAGTGTTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWRVCLPVARGSLAAWLLVGLWVWALGGLCGLGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDSIRHYA	39327	71915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994_70115_70209
526744	contig_5671_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_79453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	1748.54595593024	289	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	338	760	370430	531238	FALSE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	369885	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
526745	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526746	contig_10523_pilon	-	2245	8	Intergenic	novelGene_120938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	154	1137	39240	15001	TRUE	35	GCCAGCCCCAGAGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39393	12834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13223_14280_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
526747	contig_11548_pilon	+	2230	10	Intergenic	novelGene_66748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1061.96681029721	4	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	352	918	96101	117733	TRUE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGELCKR	63691	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_96046_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117718_117856_118975_119121_119346_119402_119491
526749	contig_11171_pilon	+	3215	10	Intergenic	novelGene_48566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	126.447275890969	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	50	1240	70574	105888	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70524	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86078_86152_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710
526751	contig_7963_pilon	-	2327	4	Intergenic	novelGene_58607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCAAAAAATACACGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298883	293139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296366_296813_298223_298395
526752	contig_10103_pilon	-	1855	16	Intergenic	novelGene_86163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	307.452587130656	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	68	1609	656948	638598	FALSE	15	TTGTGCTTATCTCTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLSSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657015	638351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645753_649864_649969_651346_651475_651637_651739_653443_653581_654456_654570_654694_654772_655131_655244_655980_656047_656148_656224_656945
526753	SIRV6	+	626	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	404	97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	69	210	183	392	2002	2780	TRUE	40	ACATATTTAGGTATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQRRFHTTCSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPSRKSGTRRGTYR	1707	11065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2616_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
526754	contig_15304_pilon	-	1521	3	Intergenic	novelGene_30621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	53.5	830	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	186	1031	66228	64912	FALSE	5	CCTGGAGCCCTGGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66413	64421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104
526755	contig_5302_pilon	+	1944	8	Intergenic	novelGene_81378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	476.390124814115	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	398	1132	111129	117238	FALSE	30	ACATAATTTCTCTGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL	92577	118050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92815_96449_96517_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046_115209_116464_116584_117165
526757	contig_10159_pilon	-	2786	10	Intergenic	novelGene_30899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	190.264143874889	371	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	96	938	1051078	1006290	TRUE	10	CTGCACTTACTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAEAFSRPLSRNEVVGLIFRLTIFGAVTYFTIKWMVDAIDPTRKQKVEAQKQAEKLMKQIGVKNVKLSEYEMSIAAHLVDPLNMHVTWSDIAGLDDVITDLKDTVILPIKKKHLFENSRLLQPPKGVLLYGPPGCGKTLIAKATAKEAGCRFINLQPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHEATAMMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVSM	1056759	1002457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006298_1012817_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1038415_1038537_1040930_1041030_1050916_1051092_1056677
526758	SIRV6	+	441	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	340	220	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTGGGACGTATCGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740
526759	contig_10082_pilon	-	2549	15	Intergenic	novelGene_63845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	140.604308001467	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	46	1434	198528	131150	TRUE	0	TTGTGTCCCCTGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSWRSQQDPGSLVTMGDPSKQDILTIFKRLRSVPTNKVCFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGSHRSLGVHLSFIRSTELDSNWSWFQLRCMQVGGNANASSFFHQHGCTTSDTNAKYNSRAAQLYREKLKSLASQATRKHGTDLWLDSCVVPSLSPPPKEEDFFASHVSPEVSGTAWASAQAEPSTLMPRAMGTTPENNEGGPEQGPSVEGLNTATKAALEVSSIIKKKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLASKNFNEIEKQAQAVDKVKEQEDRLARAAPKEESMVASLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKTVESERLGMGFGNCRSAISHSVTSDMQTIEQETPITAKPRKKYSEDNDDSYFTSNSRYFDEPMELRSSSFSSWDDSSDSYWKKEAIKDTDTILKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSDMYFGRQAQADVTTTSRACCPPLLTWRSLSRA	198573	127651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_128711_131093_131216_145619_145744_152999_153132_160521_160645_161094_161224_167892_168036_168681_168729_170066_170127_174231_174320_178513_178598_178963_179096_182032_182106_188982_189102_198459
526761	contig_10134_pilon	-	2031	4	Intergenic	novelGene_16254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTCTGGGATCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39722	32354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38831_39594
526763	contig_5499_pilon	+	2446	12	Intergenic	novelGene_57005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	226.261824493529	1	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	496	1311	818279	840037	TRUE	40	AAGAATTTGTAATGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803402	841277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818149_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840216_840320
526764	contig_11986_pilon	-	2740	5	Intergenic	novelGene_69258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.784902590047	488	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	254	574	845609	845289	TRUE	5	GGTTCCTCATTTTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHGLRHPAVDPGTPRDLRPSSSSPPSPPWILGAGRPQAPPRGPGLPGPHLAQQLGLGREEAEETWSEDRHQKWDKGVVGGHCSSQESLGAPDWVSSGCWGWVSMG	845862	839882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841373_841447_841746_841860_841950_842700_842855_845153
526765	contig_7138_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_120986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTCTCATGAAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162476	161932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_161900_162500
526766	SIRV6	+	1063	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	4	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
526767	contig_7594_pilon	+	2245	3	Intergenic	novelGene_55451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	327	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1388	1771	561547	566248	FALSE	25	TGTAGATCTTGAAGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	559836	566722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_561217_561539_561752_566069
526768	contig_11285_pilon	+	1723	10	Intergenic	novelGene_5605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	514.797694892534	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	95	1405	766124	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSVPWPAAWTQEEPATAAATPFWTNGPLCPQHGADVWAPPARPMPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763527	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766373_767733_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
526769	contig_4180_pilon	+	2112	8	Intergenic	novelGene_8337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2042.76702098913	18	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	72	773	865772	888134	TRUE	55	GAGAACTAAATAGATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNRSCVGNCCCSVLGSAGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865700	890028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866080_866126_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888858_889412
526770	contig_15063_pilon	+	1292	4	Intergenic	novelGene_14293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526774	contig_15063_pilon	+	1395	5	Intergenic	novelGene_13790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	201	1295	34808	39670	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQRECHLRALGPPGLRSLIIYAAPFMSSLALSSKKQVSF	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36467_39556
526776	contig_14415_pilon	+	2502	4	Intergenic	novelGene_77618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	227.216979021277	81	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	79	333	33410	38577	FALSE	20	ATTACAGCTTCTGCCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDPLGELEPCLCGSRGSLPDCIILQREEASLGTALVS	33331	40746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36159_38469
526778	contig_17936_pilon	+	2100	10	Intergenic	novelGene_29952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	731.199471188722	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	146	1240	79133	121021	TRUE	25	CAGCCTAGTGTCTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTVRSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	68274	126585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111144_114792_114934_118635_118827_121017_121063_125766
526782	contig_10986_pilon	-	889	7	Intergenic	novelGene_71467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_1	113.488619106352	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	9	671	73937	67011	FALSE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	73945	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924
526783	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_9089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2157.90683688306	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	243	797	34808	35938	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRKCTVSSPSPHPLLTSSSQNRPSYPAWSQT	27126	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35392_35858_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526784	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	199	1374	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526787	SIRV6	+	512	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1408	550	-21	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2495	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
526788	contig_12249_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_121008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	176	610	104537	104971	NA	25	AGATTGCAGCTGTGGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDRCAKEPVLLTSKQPGGIWVDQRPQKCPSQVRSVLPVYSCGFYTYYFLCVCDEKKDCQLCLCIVEKDKPIEQRSAMRCFSYQYTTAQQQLTTTGCHRADSDSRRPQATPCIQLMVNICGRGSGYFFLGKREGLQGKRKKKTS	104361	105006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_+_104400_105000
526789	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526791	contig_10629_pilon	-	2025	10	Intergenic	novelGene_52898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	525.354295502063	5	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	62	538	256132	248533	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVVRRGKTLQTVQKGQHYVTC	256193	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_248530_248592_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066
526792	contig_12790_pilon	+	2162	9	Intergenic	novelGene_35200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	285.919459813424	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	226	606	307252	309892	TRUE	45	ATAAAAAGTTTAATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKEKVQV	305918	313322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309875_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
526793	SIRV4	+	383	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	10	-923	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTACGGAACCAGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1800
526794	contig_9177_pilon	+	3054	19	Intergenic	novelGene_32649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_18	46.7631608199932	271	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1536	2966	105101	109340	FALSE	20	AGTCATGGTGTCATAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57885	109428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_99894_100009_100303_100440_100685_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
526795	contig_5967_pilon	-	2315	11	Intergenic	novelGene_44379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_10	481.583388417831	5	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	169	1314	488569	388566	FALSE	50	ACGTTAAGAACCAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517601	387564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_501673_501743_517515
526796	contig_9981_pilon	-	3183	3	Intergenic	novelGene_121051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_2	45.5	11	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGATTTTGTGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256376	249453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080_253186_254386
526797	contig_7357_pilon	+	2659	13	Intergenic	novelGene_36883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_7	79.5543140809403	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1325	2203	260068	273311	FALSE	40	TTTTAAAGATTGAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250829	273767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
526799	contig_6975_pilon	-	2234	10	Intergenic	novelGene_74253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	402.081804833019	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	146	1090	164514	159453	FALSE	35	GGAGATAATAGTATGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169929	158308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163185_163756_163849_164402_164538_169807
526800	contig_500_pilon	-	1502	9	Intergenic	novelGene_31077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGCCCAAGAGAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499570	1492652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1492735_1493505_1493718_1494241_1494465_1495350_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498076_1498880_1498972_1499275
526802	contig_4486_pilon	+	2115	13	Intergenic	novelGene_38581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1377.1618963974	7	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	137	1237	343083	412464	FALSE	35	TAGAAATGGGAATCATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311771	413342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_389998_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
526803	contig_7045_pilon	-	3302	18	Intergenic	novelGene_77476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_8	97.404233866329	566	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	126	2765	585475	524577	FALSE	25	CACTTGCTAATATTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKNYMDYLSRLYEREIRDFFEVAKIKMTGTTKESKKFGLHGSSGKLTGSTSSLNKLSVQSSGNRRSQSSSLLDMGNMSASDLDVADRTKFDKIFEQVLSELEPLCLAEQDFISKFFKLQQHQSMPGTMTEAEDLDGGAFSRQHNSGTPLPVSSEKDMIRQMMIKIFRCIEPELNNLIALGDKIDSFNSLYMLVKMSHHVWTAQNVDPASFLSTTLGNVLVTVKRNFDKCISNQIRQMEEVKISKKSKVGILPFVAEFEEFAGLAESIFKNAERRGDLDKAYTKLIRGVFVNVEKVANESQKTPRDVVMMENFHHIFATLSRLKISCLEAEKKEAKQKYTDHLQSYVIYSLGQPLEKLNHFFEGVEARVAQGIREEEVSYQLAFNKQELRKVIKEYPGKEVKKGLDNLYKKVDKHLCEEENLLQVVWHSMQDEFIRQYKHFEGLIARCYPGSGVTMEFTIQDILDYCSSIAQSH	591041	524039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_524730_526699_526895_529563_529764_533133_533318_536679_536909_537447_537525_538831_538940_539488_539653_546188_546295_552563_552714_568441_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585486_590926
526805	contig_6163_pilon	+	2649	14	Intergenic	novelGene_103851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_8	52.8180980279482	373	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	1566	2504	503044	507858	FALSE	35	TGAGGCAATTTAGAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLRGFQETCGKAICVGVIGFPNVGKSSIINSLKQERTCSVGVSMGLTRNMQVVPLDKQITIIDSPSIIVSPLNSATALAMRSPASIEVVKPVEAASAILSQADARQVVLKFTVPEYKNPLEFFTSLAQRRGLHQKGGSPNVEGAAKLLWSEWTGATLGYYCQPPTSWTCSSHFNESVVADMKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADEKSSDMSPVEETWQALPEESQAGEQFGSQEARSFVLDKTTKEEDDAYDFSTDYV	498896	508003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_498972_499595_499655_500280_500419_500538_500653_500876_500961_501720_502759_502986_503105_503528_503617_504844_505020_506718_506862_506943_507081_507166_507337_507598_507666_507760
526807	scaffold_12124_pilon	+	2331	12	Intergenic	novelGene_22054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	453.017376931231	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	115	1365	836073	857868	TRUE	25	TGGATCTCTATAAACTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRHSDIWSDWSETLHFGLPEQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVVLMLIFSRNSVRQTLFLPIPQVKSLLTPNAEIAWEGNHQPPDTQEPEFLIVEEMG	829630	858967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858240_858372
526808	contig_10311_pilon	-	1593	9	Intergenic	novelGene_50435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1006.56276971434	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	32	946	71526	65773	FALSE	10	AGTTGCTTTGGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKAPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_70224_70358_70446_70493_71497
526809	contig_15114_pilon	-	2424	1	Intergenic	novelGene_121105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54179	51755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_51800_54200
526810	contig_20969_pilon	+	3086	3	Intergenic	novelGene_121252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	144	junction_2	40	300	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	100	1287	15185	20846	FALSE	25	AGTATTTAAGGTATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLGKLGCAAPPQLSRAGLYPSAGPGVRGVIRAMPRYCAATCCKNRRGRNNKDRKLSFYPFPLRDKERLEKWLKNMKRDSWVPSKYQFLCSDHFTPDSLDIRWGIRYLKQTAVPTIFSIPEDSQGKDPSKKKSQKTKLEDENEVCLKAKSEESFASNEPKKNTVNTNVPSECAELLDSSGLVKPPAPKTESIQNNILTLNLVKQVIEKPESTLETSVNQGIGICGFHTSFENINSTTITLTTSDPEDIQRSLGTQEVFEITTNHIANPNFTNNSMEIKSAQENPVLFSTITQTVEQSNANKESVIAIFVPTENSRPTINSFIPAQQETMEMEDIDTEGSLYKDVDYGTEVLQIEHSYCKQDINKEHLWQKVSKLHSKITLLELQEQQTLGRLKSLEALIRQLKQENWLSEENVKIIENHFTTYEVTML	15085	22645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20969_pilon_+_15265_18830_19024_19931
526811	contig_2596_pilon	+	2816	16	Intergenic	novelGene_53509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	125.571334308432	518	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	170	1642	1027316	1046093	TRUE	15	TATTTTGGTTCAGTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDTEAIGLWLPLIKNVVGTDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVRGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKKKNCQKGAAYKIFSWIRCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDIKQTSLAGEKPALGPGPQQNPSVLEQAAVGGDAASKPASSTRPACPASTSPLTWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGNSQRTV	1027146	1049345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1027362_1030153_1030307_1030438_1030535_1030879_1031008_1032504_1032701_1033983_1034157_1034520_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046013_1046068_1046105_1046180_1046321_1047742_1047920_1047994_1048130_1048634
526812	contig_11115_pilon	+	2007	6	Intergenic	novelGene_102829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	549.668845760791	46	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	203	1924	165608	173241	FALSE	15	CTCCGGAGTCTGTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQGEQRWGCGSGRASPGGGGACLHSALLRTDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165405	173324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714
526813	contig_1225_pilon	+	2302	5	Intergenic	novelGene_44139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	2	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274470_274724_275807_276175
526814	contig_854_pilon	+	1633	7	Intergenic	novelGene_36260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	97	675	543600	562402	TRUE	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543503	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562679_563115
526815	contig_9177_pilon	+	2678	22	Intergenic	novelGene_32644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.3926241211612	1	38	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	1193	2413	105101	109164	FALSE	15	GTCATGGTGTCATAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGERKGPAGLL	57831	109429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_58434_58504_99894_100009_100303_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101464_101959_102091_102253_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109132
526816	contig_10299_pilon	+	2309	19	Intergenic	novelGene_79714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	91.742998521837	10	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	888	2147	337016	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320536	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
526817	contig_10523_pilon	-	2235	9	Intergenic	novelGene_120920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.127071818687	1499	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	169	1152	39240	15001	TRUE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	95306	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13158_14348_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
526819	contig_5280_pilon	+	2525	9	Intergenic	novelGene_52578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	487.431725988369	1	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	49	1119	38343	78098	FALSE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRCCLQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38294	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
526820	contig_6980_pilon	-	2029	9	Intergenic	novelGene_36019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1288	1605	370598	365020	TRUE	20	CCCTCAAGCTTGTCACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	373888	346078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_346157_356720_356772_361152_361226_362331_362434_364899_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734
526821	contig_5539_pilon	-	702	2	Intergenic	novelGene_104785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCATGGAATACTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302046	289885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_290521_301979
526822	contig_3386_pilon	+	1743	8	Intergenic	novelGene_34523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGGACTACCGCCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404158	412207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404940_405102_405188_405424_405466_406382_406607_406684_406844_407704_407838_409398_409609_412097
526823	contig_10354_pilon	+	2015	6	Intergenic	novelGene_50838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	439.365633612826	1209	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	174	881	432370	475314	TRUE	30	TCATATAGTTAATGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432196	476494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056_475614_475659
526824	contig_13528_pilon	-	2368	11	Intergenic	novelGene_66876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	194.962791321831	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	178	939	67895	47592	TRUE	20	TAGCAGGGTACTGCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMM	68072	39986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46597_46770_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
526825	contig_15063_pilon	+	1700	7	Intergenic	novelGene_9663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3416.29572376605	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	238	1059	34808	36333	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27129	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35049_35380_35839_36147_36266_36600_38975_39092_39506
526826	SIRV4	+	433	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	69	448	69	-448	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAAATTGCCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
526827	contig_1443_pilon	-	2872	8	Intergenic	novelGene_28384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	32.9365500095352	33	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	517	1404	1041520	1039061	TRUE	45	ATGAATGCATGTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQVLVCSENSPQLMDLSPSSTAIYVGKQDIIRQSVLLMGIEWDRYVYKGVGKPVEKRVWGHESESEEREDDQIPPHAVDLL	1052389	1036675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1039518_1040152_1040329_1041265_1041667_1041753_1041972_1052237
526828	SIRV6	+	976	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	8	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	35	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	20	AGCCTGCCTAATTGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11204
526829	contig_6164_pilon	-	2460	3	Intergenic	novelGene_121282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	238.5	464	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	350	877	569414	567664	FALSE	35	GTAAGAATGCCAAATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPSVPPTAPPPGPPAPFPPSGPSCPPPGGPYPAPTVPGPGPTGPYPTPNMPFPELPRPYGAPTDPAAAGPLGPWGSMSSGPWAPGMGGQYPTPNMPYPSPGPYSAPPPPQAPGAAPPVPWGTVPPGTWGPPAPYPAPAGSYPTPGLYPTPSNPFQVPSGPSGAPPMPGGPHSYH	580097	566080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_567676_568898_569629_579962
526832	contig_8978_pilon	-	2105	9	Intergenic	novelGene_49383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCGCCGGAAACGAGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348114	331577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339968_343330_343447_343638_343836_343968_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
526833	contig_7357_pilon	+	1876	9	Intergenic	novelGene_36829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1033	1410	139801	154908	TRUE	25	ATGTGACCGCCGCAGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135593	167068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_135601_135927_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_154860_155079_166772
526834	contig_14621_pilon	+	2023	2	Intergenic	novelGene_105837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	534	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTACTTTGTGGTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116086	126766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824
526835	contig_11978_pilon	+	2952	8	Intergenic	novelGene_62965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	497.532400749859	337	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	8	928	1153763	1166662	FALSE	15	GCATTCTTTATTTTATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPMQRGLSCLSRALGSWSRQPALVAQSIAVVPVRTKKRFTSPTYEPKYKSEKEFIEHARKAGLVIPPEHLERAIHLACTAGIFDAYVPPEGDARMSSLSREGLKQRTERLKKNVASQLSIRKIKEYDANFKTKEFPDKAKDIFIEAHLCLNSSDHDRLHTLVTEHCFPDMVWDIKYKTVRWSFVESLEPPQVVQVRYSSLVNQGNMYGQVTVRMHTRQILAIYDRFGRLMYGQEDVPKDVLEYVVFEKHLMNPYGSWRMHGKIVPQWAPPKQPILKTVMIPGPQLKPWEDYEEPQGEANKPQLA	1153755	1168686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1153829_1154719_1154898_1155328_1155447_1157415_1157515_1164227_1164277_1165165_1165316_1166233_1166408_1166575
526836	contig_7020_pilon	+	1806	3	Intergenic	novelGene_57067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	321	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	151	741	102160	103243	FALSE	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERMPWQLWQKTKLICNTDMWSSS	98727	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106_102685_103177
526837	contig_7695_pilon	+	2801	19	Intergenic	novelGene_41601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	594	941	506218	512081	TRUE	5	GCTTCCGGCTCCCCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRDSLRSSTVSLRVRKHSGGASVTAAYPSYKSRPPATSPVDFSTWSFRRNRSRAGLPTERILLRSRRTRASGRPSEPVVAVTVTSPSPASSKTFRITNRACMWACLQLEASGV	503906	525584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_504473_506190_506357_510465_510643_512049_512171_512294_512421_512505_512568_513891_513985_514281_514396_514584_514778_516930_516992_517069_517200_517278_517411_519632_519727_520312_520386_521063_521200_521994_522092_524168_524439_525012_525168_525549
526838	contig_4105_pilon	+	2515	11	Intergenic	novelGene_21457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	139.627397025082	3	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	491	1297	63728	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58726	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61792_62304_62413_62806_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
526839	contig_18822_pilon	+	2233	16	Intergenic	novelGene_111723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	50.9285338052801	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	449	2092	168177	246273	FALSE	25	CTTAACTGATGAGGTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLVILRPGPYICAEWDMGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKFEKVPDGPIPPSTPKFAYGKVALKKLKTVGEALNILSPSGPTKSIYPLTFVQVKQYFGFVLYRTTLPKNCSDPTPLSAPINGVRDRAYVSVNGVPQGILERNQVFTVNITGEAGATLDVLVENMGRVNYGRYNNDFKGLISNLTLGCSILTDWLIFPLNAENAVRGHLGGWGGHGNSCHVEPEPHSSSNFTLPAFYVGNFSIPAGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQMTLFVPQHILVTSAPNTVTVLELERAPCSSVDPALCTVEFVDKPVISTAVTYSHLPTWPDHV	140609	246414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_165852_166023_168057_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191259_209335_209411_212481_212572_221549_221664_223825_223958_229459_229715_246024
526840	contig_11512_pilon	-	2323	3	Intergenic	novelGene_43281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	416	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	381777	367967	FALSE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGKPFLLALVERTIFLEYVWPEFTTGEYVAQIASPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	381777	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368522_381673
526841	contig_8476_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_121326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAAGAGAGGTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65642	63002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_63000_65600
526842	contig_8476_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_121324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCAAAGGCTTCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60083	58939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_58900_60100
526843	contig_15047_pilon	+	1492	6	Intergenic	novelGene_52216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3086	4	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	431	475	3482	4197	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLDYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLTPKDRCDPPPHL	2179	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2615_2805_3312_3488_4158_4434_4552_4687_21007
526844	contig_9482_pilon	-	1636	9	Intergenic	novelGene_44296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	164.624145783661	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	4	411	1253080	1242438	TRUE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVSWPEPCWRRQNSCWTAGSTPSGSPMAMSRPPASPLSTWTSSATVSSWTWWTPSP	1253083	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237422_1238967_1239102_1239796_1239917_1240815_1241234_1242403_1242603_1244309_1244471_1245325_1245387_1253059
526845	contig_5967_pilon	-	2275	10	Intergenic	novelGene_44355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_4	268.047674034966	2	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	111	1256	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517612	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
526847	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_12968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	228	1400	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28173	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526848	contig_12357_pilon	+	1777	10	Intergenic	novelGene_6133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	783.700544347059	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	303	908	30278	51206	TRUE	40	GAAGAAATAGTATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVRTLQAI	27419	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42178_51182_51239_52759_52844_53169
526850	contig_1154_pilon	-	2298	9	Intergenic	novelGene_87083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCCGCGGCCCCGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446361	330751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_330872_331886_331963_389032_389097_389753_389834_434839_434972_438827_438937_439214_439503_442408_442504_445027
526851	contig_21203_pilon	+	1300	8	Intergenic	novelGene_84481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	279.032219630344	18	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1242	57	1298	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53893	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120255_120376_121973
526852	contig_15063_pilon	+	1359	4	Intergenic	novelGene_14232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	54	1226	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34754	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
526853	contig_9132_pilon	+	153	1	Intergenic	novelGene_121362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCGTAACCTGAGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36566	36719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_36600_36700
526855	contig_8658_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_55797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTACTGGTTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5697	30142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_6236_6700_6818_13111_13267_30045
526856	contig_6589_pilon	+	1026	6	Intergenic	novelGene_26128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_2	2598.31137472013	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	79	507	1879232	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878976	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
526857	contig_18420_pilon	-	1982	13	Intergenic	novelGene_109361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_11	358.678709525205	1830	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	264	1559	136423	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142900	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_136420_136498_142711
526858	contig_15047_pilon	+	1423	3	Intergenic	novelGene_52260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	354.5	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3248	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4687_21013
526859	contig_3386_pilon	-	2602	5	Intergenic	novelGene_34538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	954.867660987637	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	114	497	409604	406797	TRUE	50	AAAAAAAATCTGAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRSHHHVSSHHPLSLH	412207	404454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_405190_405426_406840_407702_407838_409398_409607_412096
526860	contig_14513_pilon	-	1300	4	Intergenic	novelGene_70255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	39	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
526861	contig_10058_pilon	+	2000	12	Intergenic	novelGene_67688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	121.525360411482	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	389	1321	50283	53244	FALSE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48217	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_48937_49125_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
526862	contig_13021_pilon	-	2569	10	Intergenic	novelGene_8227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	475.060230099534	20	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	147	1193	236115	210494	TRUE	30	GTAAGACAATTTTTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236261	202275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_203365_206000_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
526864	contig_2444_pilon	+	2078	11	Intergenic	novelGene_83771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	310.43717560885	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	8	1612	231301	243030	FALSE	35	AATAACTGTATTAACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVSKINAKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	231293	243496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240966_241551_241693_242125_242301_242567_242747_242877
526866	contig_15063_pilon	+	1687	7	Intergenic	novelGene_11626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	7	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	45	CCATGAAATAAATGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27139	39739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526867	contig_1516_pilon	+	1674	8	Intergenic	novelGene_49959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1257.75025910779	47	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	119	1033	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLEAEATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335163	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353626_359996_360125_362116_362299_362985
526869	SIRV6	+	633	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	968	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	40	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11205	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11200_11800
526871	contig_11429_pilon	+	1601	6	Intergenic	novelGene_60441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_3	549.388751249969	176	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	140	610	46162	48504	FALSE	20	CGATACTGACAGTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45352	49495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443
526872	contig_8386_pilon	+	3377	8	Intergenic	novelGene_82214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACCCAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17063	35414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_18829_19753_19900_20735_20858_21223_21318_21438_21528_21779_22023_31345_31423_34573
526873	contig_14638_pilon	-	2199	5	Intergenic	novelGene_71570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	1348	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
526874	contig_3386_pilon	-	3658	7	Intergenic	novelGene_34589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	93.5724615234395	4	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	47	1102	531475	518751	FALSE	60	AAAAAAAAAGTGGAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYLWSSRQFRIQSPRMNVHRASDGDRLLRQDASCLVDDTSTATQEREASSLASSGLQNLTYPSGPRSDDLSLDYASQPAHLQFPHIMPLPEDIKGSCFQTGNKRNHEPFIAPERFGNSSVGFGSNSHLQAPEKVTLLVDGTRFVVNPQIFTAHPDTMLGRMFGPGREYNFTRPNEKGEYEIAEGISATVFRTVLDYYKTGIINCPDGISIPDLRDTCDYLCINFDFNTIRCQDLSALLHELSNDGAHKQFDHYLEELILPIMVGCAKKGERECHIVVLTDEDSVDWDEDHPPPMGEEYSQILYSSKLYRFFKYIENRDVAKTVLKERGLKNIRIGIEAPLYPDVMGKGRRKESPCGFPVCSKQIPH	531521	516194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_518840_520332_520444_521996_522195_523515_523637_523989_524093_528528_528803_531315
526875	contig_5643_pilon	-	2127	10	Intergenic	novelGene_38713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_1	171.434110727672	1325	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	210	1571	48733	31788	FALSE	10	GGGAGTGGTCTGTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPTVPGLLPPLVLLALLVGIYPSGVIGLVPHLGDREKRDNLCPQGKYNHPQNNSICCTKCHKGTYRYNDCPGPGLDTDCRECETGTFTASENHVGQCFSCSKCRKEMDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	48942	31231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461_37616_48694
526876	scaffold_880_pilon	-	2684	2	Intergenic	novelGene_121442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428563	425692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_425947_426133
526878	contig_15063_pilon	-	1722	7	Intergenic	novelGene_10391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	972	1295	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36153_36264_36597_38972_39090_39504
526879	contig_11003_pilon	+	1783	8	Intergenic	novelGene_105427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	173.132012861721	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	151	1143	56015	70048	TRUE	5	GCCGCAGCGTCCTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRGMKHRPPCQAPT	55864	73038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_70010_70127_72476
526880	contig_7428_pilon	-	2150	2	Intergenic	novelGene_77749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	808	junction_1	0	88	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	460	828	515037	514339	FALSE	25	ATTCTTTGTATCAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSQLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515496	513016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956
526881	contig_15063_pilon	+	1517	6	Intergenic	novelGene_9155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3753.03088183404	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	243	1262	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVK	27126	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36497_39506
526882	contig_16303_pilon	-	1681	8	Intergenic	novelGene_34092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	460	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	53	1165	47976	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48028	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33264_35371_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
526883	contig_10937_pilon	+	2241	11	Intergenic	novelGene_67300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	60.0790312838015	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	124	2022	35798	45357	FALSE	10	CCGGGTGTTGTCACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33215	45576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33286_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
526885	contig_9363_pilon	-	1938	8	Intergenic	novelGene_6755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	309.616088808349	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	101	724	1510212	1506537	FALSE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1517904	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510134_1510216_1516338_1516415_1517883
526886	contig_10299_pilon	+	2334	20	Intergenic	novelGene_79698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	90.1226311348003	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	853	2172	336220	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320508	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335278_336194_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337775_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
526888	contig_4103_pilon	-	1656	17	Intergenic	novelGene_51921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	523.681901897516	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	15	977	91854	82202	TRUE	10	CTTATCTTCTCTGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMKYHF	91868	77527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_82002_82211_82369_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
526889	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_9655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	240	1478	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27129	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526890	contig_177_pilon	+	2126	4	Intergenic	novelGene_41799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	419.550023504018	11	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	129	1205	417672	418748	TRUE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQQIQQQQQVTPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	411721	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_411755_415635_415707_417647_419523_420000
526891	contig_6557_pilon	+	4169	22	Intergenic	novelGene_33011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_13	55.792375067264	200	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	32	2389	574083	588352	TRUE	20	ATTTCTCACTTGCATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAGTRALTSEQAWLEAAQAFIQETLCPAGKESSVQLTQLVIDCVKTVWLSQGKNQGFILPLSYSFVSVQDLRTYQHLPCCSHLSWSSSAYQAWAQEAGPNGVPLPQERLLLLGTLTDLSGDLEQECRNGSLYVRDNTGVLGCELIDLDLSWLGHLFLFPSWSYLPPARRNSSGEGHLELWGAPVPVFPLTVSPGPASPIPVLYPEIASRLLRQRSKVRVVYPNLAGKLVRLSALVNSHRKTYFVLSLGSSSPAVSHVPIVVQVPAQLVWHHALWPGRSYVLTELRVSRIREHPYRVWTTSPSSCLLPLKPECVRELELELEGPLLEADPKALPMPSNSQDRKGKKGLIRNSRLLSYTGTVTSVLNEPAGFYELDGQLGLCLAYQQFHSFQRVVRPGVSLELQDVHLLQSVGGGTKRPVLAPCLGGAVLVRGFSHQKPKTQSSHQAHGASLYEQLVWERQLGLPLYLWASKALEELACKLCPHVLRHHQFLQRSCPGNPSLGLQLLAPTLDILPLPGSPVRNAHKEILEEPHHCPLQKYTRLQTPCSFPTLAALKEEGQSRAWASFDPKALLPLPEASHLPSCQLNHRLAWSWICLLPSAFHPAQVLLGVLVASSHKGCLQLRDQSGSLPCLLLAKHSQPVTDPRLSGCLVRAEKFQLIVERDVRSNFPSWRELNMAAFIQKQQARVYVQFFLADALILPVPRPFHRSATSSRLPQTEPPQPRWTPHRTEPAILAIPQGGPDEAELLCPPRSQSGGAQAHSQFPCVRQLAWGHPEEGGDWMGPT	574051	592668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_574116_577649_577814_579497_579736_579881_580094_580436_580582_584021_584307_584406_584536_585119_585353_585487_585666_585781_585983_587113_587241_587823_587939_588054_588548_588800_588995_589705_589795_589884_590060_590509_590588_590988_591134_591221_591287_591573_591740_591842_591970_592122
526892	SIRV6	+	456	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	964	-33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCGTCGTAGATTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11201	11657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11200_11700
526893	contig_854_pilon	-	2561	14	Intergenic	novelGene_36170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	201.375506640098	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	53	1519	509201	471073	FALSE	10	CCAACTCGTGCCTGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCLGPSGCYGYFSKPTLDAGYRHHPHPPRVAEAVPVRDPNSGELASLLLSRRLFSTEGQDCTGPPPRSSRVESVHLFTEPGQGLSGRLPGNQEQK	509253	470030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471359_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
526894	contig_5690_pilon	-	2744	7	Intergenic	novelGene_119744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAGCAACACCAGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105972	1077691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1078719_1086390_1086568_1087638_1088344_1094153_1094269_1095253_1095334_1103513_1103632_1105450
526895	contig_12427_pilon	+	3169	7	Intergenic	novelGene_40498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_2	100.878915317105	49	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	7	927	401430	407354	FALSE	65	GAAAAAAAAAAAACCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEVRVEASGLTGSPSIGSDLAAGSMLYLGVPGSTC	401423	409596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156
526896	contig_15304_pilon	-	1430	4	Intergenic	novelGene_30597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
526900	contig_13707_pilon	-	1743	7	Intergenic	novelGene_43535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	564.487205838676	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	269	697	272378	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275548	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272379_274529_274587_275197_275274_275413
526901	contig_15063_pilon	+	1769	7	Intergenic	novelGene_12288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	46	1518	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28118	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526902	contig_12019_pilon	+	2803	11	Intergenic	novelGene_87745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_8	122.039706653204	697	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	2	994	623214	637915	TRUE	50	ATGCATAAAAATATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623212	643211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_638139_639665_639833_639942_640142_641782_641874_642082
526903	contig_18869_pilon	-	2043	3	Intergenic	novelGene_55981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	367	861	53041	52499	FALSE	15	TTGTTCTTTACTTGATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59465	51316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_52748_52795_53330_59387
526904	SIRV6	+	672	6	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	92	279	158	436	2002	2844	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPWYVWG	1844	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2865_10721_10819_11034_11109_11205
526906	scaffold_9100_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_83232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGTCACAAAGACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492383	492802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_492400_492800
526907	contig_5988_pilon	-	1331	5	Intergenic	novelGene_15926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	93	1157	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655551	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652312_652602_652943_653272_653422_653549_653773_655456
526908	contig_9177_pilon	+	1823	6	Intergenic	novelGene_32670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	735.495044170931	218	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	53	517	395377	415476	TRUE	25	TAATATCTTCCTCCAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGIELSLSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395324	416880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315_415549_415646
526911	contig_1008_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_121578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCTTTTAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670713	671362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_670700_671400
526912	contig_2310_pilon	+	1817	12	Intergenic	novelGene_71600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	239.085793239426	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	867	1652	126512	134479	FALSE	15	GCCAGATTTGTCGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106063	134644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118162_122876_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
526913	contig_15118_pilon	+	2402	13	Intergenic	novelGene_74610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	252.412195954686	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	47	1777	392042	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391995	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392337_392423_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393461_393559_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
526914	contig_9345_pilon	-	1698	15	Intergenic	novelGene_24492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	298.655798059046	11	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	39	1655	671829	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVAPKIPPDIKSHSPKCPSTVTGCYMLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671867	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668614_668687_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
526915	contig_7334_pilon	+	2158	3	Intergenic	novelGene_50564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	254.5	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	322	933	120109	121279	FALSE	10	ACTCACTGTTCTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFHTSRDGRQLCSPSQYLT	116719	122504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097_120666_121224
526916	contig_6677_pilon	-	2689	1	Intergenic	novelGene_114158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	855	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACATGGTTGTTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390084	387395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_387400_390100
526917	contig_15304_pilon	+	1961	6	Intergenic	novelGene_30649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1302	1679	103122	105670	TRUE	15	CTTGCTGGGAGTGTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQHGQRAVRGQRAGRGSVGGWSHLKPMAGSSFYVFVSEQPLGSLPYHIPVVGDDRPLQLHHRREDPLHHLEEGDGGTVAHAEQEERDEDGDGGPQPIQLPILGLRTALIWVQLWAGDKEMDFSV	101820	106953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_103330_103546_103688_105641_105718_106199_106374_106483_106523_106931
526918	contig_3424_pilon	+	2200	4	Intergenic	novelGene_55488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	192.804449003532	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	409	1953	163748	170678	FALSE	30	TTACTCAAATACAGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQKCDGHSSCPRGLQVGGWSRRLPRAAPCFRAQRSLALFPDTHPGCQPLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149960	170925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150303_163681_163803_168701_168796_169282
526919	contig_12605_pilon	+	840	5	Intergenic	novelGene_64166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	119	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	385	738	4816	5980	TRUE	15	CTGCAGTTGTGATCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGLRGTGPSRSGQPSWCPLERSKDTHAVCSTRG	3867	6202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5882_6005_6124
526920	contig_10734_pilon	-	1700	5	Intergenic	novelGene_50996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	82	687	320632	311551	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320713	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310507_310890_311676_315844_315953_318838_319032_320452
526922	contig_854_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_36355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGTGTTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976323	974687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976300
526923	contig_17976_pilon	+	1488	3	Intergenic	novelGene_32493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	212	1228	41843	47385	FALSE	5	AGTCCCTCCCTGTGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41631	47645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
526925	contig_11285_pilon	+	2051	12	Intergenic	novelGene_5626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	509.706121778533	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	153	1733	766314	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYHVDPGELGGLGGRAGGWNTVPRWSVLFRGLLPGPRRSQLQLLQPHFGQMALSAHNMEQTSGPPLPDRCPLAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766050	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766380_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
526926	contig_7230_pilon	+	3461	1	Intergenic	novelGene_52513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2640	6101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_2600_6100
526927	contig_2114_pilon	-	2174	13	Intergenic	novelGene_104312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_5	59.2018088124566	1408	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	35	1393	1169443	1139050	FALSE	10	TTCGTCCAGTAGTCTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGRCSYPVPRLLLLLLLLLSLNGGAVLSWPTEEGKEVWDYVTVRKDAHMFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169477	1138268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
526928	contig_11003_pilon	+	2130	9	Intergenic	novelGene_105416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	190.957415082526	14	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	494	1303	56015	66274	TRUE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAAGRDLPECSHDFPAAACPEPQELRGSHLPRLPGNKSHVGTSY	55521	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64558_64855_64966_66252_66425_70010_70127_72476
526929	contig_9290_pilon	-	2586	12	Intergenic	novelGene_77573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	20.9982289690038	13	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	5	1198	516542	504291	FALSE	25	TGACAGGCCTCTGCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAASMCDVFSFCVGVPGRAQVAVEVRFVSSSKGKGLFAKQLIRKGETIFVERPLVAAQFLWNALYRYRACDHCLRALETAEENAQRLTGKPGQVLPHPELCIVRKDLHQNCPHCQVMYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516546	502902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510196_510337_511094_511204_516446
526930	contig_6958_pilon	-	2065	5	Intergenic	novelGene_69923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	496.818062775499	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	19	1032	189786	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	189804	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
526933	contig_4114_pilon	-	2312	11	Intergenic	novelGene_15638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	114.598472939215	361	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	334	1296	592330	573446	TRUE	10	TTTTTGTGTGTGTCCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLFKEVFCSRFAQCNTSFDFLTAASICVDCGSR	594237	566502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_574099_574192_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127_592346_593919
526934	contig_5988_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_16023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	138.420329070552	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	259	1416	783406	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	782391	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_782548_783303_783527_783653_783803_785838_786232_786318
526935	contig_15063_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_13801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
526936	contig_14357_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_121712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	864	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTGCTTAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878092	880893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_878100_880900
526937	contig_11720_pilon	-	2158	12	Intergenic	novelGene_43892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	171.854733966734	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	89	916	124674	118106	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134610	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124574_124711_134558
526938	contig_6871_pilon	+	1659	4	Intergenic	novelGene_21557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	73	1209	121971	135017	TRUE	25	ATAAACGAGTGTGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121898	136050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135296_135878
526939	contig_15063_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_11190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	232	1470	34808	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526940	contig_1009_pilon	-	2492	9	Intergenic	novelGene_121772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	67.5905642453146	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	979	1374	305255	301449	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356440	300330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_313131_313179_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_356347
526942	contig_1244_pilon	-	1835	10	Intergenic	novelGene_37971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1002.67188729925	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	203	1183	928860	923081	FALSE	20	ATGATGGGCTAAGCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTVCYPPQFHKPGHSIRHTTLLTWPFALLSAQFLIKCCQRLL	947638	922428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923211_923259_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928875_946491_946620_947578
526944	contig_7898_pilon	-	1577	6	Intergenic	novelGene_47522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_5	2008.45626290442	28	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	478	1086	284247	282538	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKRSHQDHSGPNSCGGVACGETNGNLLLCFYNHILHSR	286099	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284598_285533_285636_286074
526945	contig_5033_pilon	-	1534	9	Intergenic	novelGene_29013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3180.03329139413	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	138	419	545288	534319	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESTEGWWLL	547652	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534346_542774_542865_544559_544686_545249_545325_547551
526946	contig_15732_pilon	+	2561	17	Intergenic	novelGene_88842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_10	242.306486899856	465	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	51	1997	11208	380841	TRUE	30	GCACTGGCACTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKECSNKRQPENNLVVTSSMVLLGNKKELQWRVKSFPL	11157	398729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349157_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_393845_395326_395383_398197_398263_398520
526947	contig_1435_pilon	+	3390	21	Intergenic	novelGene_115473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	162.433986591477	166	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	99	2288	338670	393309	FALSE	55	AGAAAATAAATTGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPGREEAAGARWRWRGEDRACVTRGSPNQAEMQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLKKLNHKNIVKLFAIEEESTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVVGGMNHLRENGIIHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYLHPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITGKPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFAETSDILHRMIIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATVFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLVLEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSLEPLSTIGLMFEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAVTGVVCYACRITSTLLLYQELTRKGVRWLIELIKDDYNEAVHKKTEVVITLEFCIRNIEKTVKIYEKLMQINLEATELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETNLQDIGSKLSPGGLLADTWAHQEGTHPRDRNVERLQVLLNCITEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTHFADECVKKYDAFLNKSEEWMRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQDYTNELQETLPQKMFAASSGIKHTMTPVYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMDGGLRNVDCI	333036	394411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_333104_338638_338757_345580_345722_348686_348817_350410_350593_357555_357717_361448_361560_364179_364360_365987_366185_366906_366966_367368_367461_370112_370215_371099_371179_386167_386290_386388_386466_388127_388168_388713_388816_388937_389035_389548_389656_390213_390286_393257
526949	contig_7457_pilon	+	1760	8	Intergenic	novelGene_31342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	301.483948873852	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	120	1127	281350	290630	FALSE	15	CAGAGGTGCACTGTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	281230	291263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281356_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
526950	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	624	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
526951	contig_12586_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_121798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGCACTTGAAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38456	40623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_38500_40600
526952	contig_12837_pilon	+	1671	8	Intergenic	novelGene_57318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	2739.66355747622	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	129442	129750	TRUE	25	ACCAATGAGTTAGCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGREVRLVATPLLFPSPSPPLRAKHGIEAVGGFAILPSPDRDRFKGLGFIRVSPGPVRVLICSVFAKGACIWQSRCETKRQSFTAVRIIKSFGRTFERTPR	129440	166864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_136752_136828_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
526953	contig_1719_pilon	+	2600	7	Intergenic	novelGene_87266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1692	2120	355220	355708	TRUE	10	CGTGCTCCTGATATTCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRGPLSSSVPRLGTLSSSVFLQGPRSSSNPRLGPRSSSTLRLGPRSSSTLRLGPRSSSTLRLGPRSSSTLLLGPRSSSTLLLGPRSSSPLRQDVRSSSTPPRRGPRSSSIPRLGPLSSSAARQVPLSSSSPRLSGRSSSA	349844	358537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_351057_352093_352278_353051_353247_355119_355484_355543_355990_356640_356723_358420
526955	contig_3095_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_75073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	61	825	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147180	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
526956	contig_854_pilon	-	2788	14	Intergenic	novelGene_36176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.375506640098	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	44	1228	509201	471988	TRUE	40	ATAAAGCTCATGATCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	509244	470044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470619_471001_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
526957	contig_6047_pilon	+	1437	9	Intergenic	novelGene_24194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_7	511.345758147068	135	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	153	1178	105237	123624	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105084	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115056_122981_123102_123594
526958	contig_13863_pilon	+	1845	11	Intergenic	novelGene_42033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	651.131446022998	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	10	426	98341	104542	TRUE	30	CTAAGATATTTAGAGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLKIPKATFSMAGIWIMVFKVSYAT	98331	120380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99347_104467_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
526959	contig_15063_pilon	-	1481	5	Intergenic	novelGene_13800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	747	1094	35813	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRESLGRCGFPRAQWWTLLQESCNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35737_36157_36264_36511_36625
526961	contig_15063_pilon	-	1682	6	Intergenic	novelGene_14042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	979	1302	35891	35108	TRUE	30	CTGAGGACCCAAGAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39769	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34912_35025_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
526962	contig_5018_pilon	-	1436	7	Intergenic	novelGene_47062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	548.620517500232	45	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	73	876	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1399996_1401214_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
526963	contig_6102_pilon	-	1717	10	Intergenic	novelGene_32103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	304.713344345505	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	274	1524	821069	816763	FALSE	25	TGCTTAAATATTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822042	816569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
526964	contig_8581_pilon	-	2374	16	Intergenic	novelGene_22821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	562.690971039068	18	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	53	2056	386058	319205	TRUE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREVTIKKRNLTWMWWLWSTTRWAP	386110	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306537_314663_314737_319156_319259_321751_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
526965	contig_16098_pilon	-	2864	21	Intergenic	novelGene_45852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_20	513.839106627746	1	91	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	54	2795	230275	201500	FALSE	25	AGGTCTATTTAGAGTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230498	201430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230455
526967	contig_12624_pilon	-	1840	12	Intergenic	novelGene_61052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	960.718223066593	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	151	828	903621	878866	TRUE	35	ACAAGGCACCCAGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQVR	903771	862028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874142_878861_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
526968	contig_18420_pilon	+	2131	15	Intergenic	novelGene_109347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	63.7769150865671	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	82	1542	92356	103753	FALSE	20	GTTGTCTACTGGTGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSPVVPQLVKKEKKKNKKDKKDSDTTKKKKKKKAKVSSE	92274	104342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101756_102633_102733_103696
526969	contig_11186_pilon	-	2565	7	Intergenic	novelGene_98873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	162.055974554747	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	86	481	285822	238580	TRUE	40	TAAGAAGTTAAGCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPKAGTFRSPARSKSSVSAHLTVGRDDMSNKEAFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKENKTC	285907	234337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_237099_237265_238537_238586_239957_240086_266595_266727_280493_280609_285806
526972	contig_7839_pilon	+	3445	3	Intergenic	novelGene_45695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_2	1	183	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	6	827	206859	209923	FALSE	50	GAAAACAAAAAGGTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALEPEVLSADAVPDLEWYEKAEETHVPQIELLETTSAQGPLNPSEHFCPRDCMVPVVFPGPVSQEGCCRFTCELLKHIMYQRQQLPLPYEQLKHFYRKPSPQAEEVVRNKPRTATETSSKKCQQALAEMESVFSHLEGLFARTLVPRVLILLGGSALSPKEFYELDLSRLVPDSREQSLNTAACLRRLFRAIFMADAFSELQAPPLMGTIIMAQGHRDCGEDWFRPKLNYRVPSRGHKLTVTLSCGRPPIPTTAWEDYIWFQAPVTLKGFH	206853	212541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_206905_207420_207687_209413
526973	contig_7457_pilon	-	1923	4	Intergenic	novelGene_31600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.7817459305202	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	87	896	962606	956489	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSRVPPRRRAVPESGSLQRRRRRSPFLIMNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962692	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956441_956488_956666_960265_960896_962603
526974	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_13005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCCTTGGCCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	28189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28197_34603_34924_35035_35379_35840_36156_36264
526975	contig_12119_pilon	+	3391	6	Intergenic	novelGene_88660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	770	junction_1	163.711453478368	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	219	1286	319835	348999	FALSE	30	TTCAAAGCTTCTTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKRKCLISF	306528	351104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682
526976	contig_17470_pilon	-	2014	13	Intergenic	novelGene_110527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	58.5910379001962	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	56	1195	277215	270503	TRUE	15	TTCAAACTCTTGTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKPSSAL	302595	269594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270521_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
526977	contig_3424_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_55506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	547	1644	297	1940	169035	170678	NA	30	CGCCAAGCCTGATGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	168738	170760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_168700_170800
526978	contig_9505_pilon	+	3003	14	Intergenic	novelGene_121869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	176.201135741761	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	167	1162	652560	675956	TRUE	25	AAATTTTTAGTGTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECNTDKDQSPKDVFDELFKLAPEKVSAVKQAIVTFVNQKLDRLGLSVQSLDTQFADGVILLLLIGQLGGFFLHLKEFYLTPSSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLNYPINPEDIVNKDEKSTLRVLYNLFHRHKLKESADGMPRGAPN	650627	678071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017_659074_663426_663450_666184_666244_666444_666514_669223_669326_675220_675294_675846_676222_676495
526979	contig_12644_pilon	+	1278	10	Intergenic	novelGene_44616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	5371.99571853887	134	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	456	1229	2678073	2680576	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLLDLFIPYT	2675473	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677679_2677937_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680540
526980	contig_5967_pilon	-	2103	8	Intergenic	novelGene_44372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	461.072042712881	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	511	1092	430750	388566	FALSE	35	CCAACAAATGTTTTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWILMTSLAWDPTTITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517645	387554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
526981	contig_9656_pilon	+	1457	11	Intergenic	novelGene_121930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	49	351	430484	432171	TRUE	10	AGCTTCCGGGTCACCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKNSGIRKTQKAVFHFVQVLFPGIKCVIQLLPLLFSKCPMCAMTDNYFSLGLINFAVDHFSSYRINNKCFNIISSNLEFLLHCVKRNFFIFHCHSHKSK	430435	446681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_430617_431077_431139_432062_432206_436343_436427_436929_437028_438024_438111_440922_441016_441181_441307_442127_442426_443221_443384_446554
526982	SIRV6	+	718	7	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	19	1008	19	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
526983	contig_12079_pilon	+	2408	14	Intergenic	novelGene_67403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	149.086647297358	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	858	2099	535255	578891	FALSE	25	AACGTTCACTGGTAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	490862	579200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494839_510897_510963_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
526984	contig_8631_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_121964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTCAAGTCGATTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755804	753863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_753900_755800
526986	contig_7229_pilon	-	1997	4	Intergenic	novelGene_39805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1889.53509861259	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	877462	875811	FALSE	35	GTATATAAAACTTCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTY	877464	874139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875814_875887_875960_876729_876867_877350
526987	contig_9752_pilon	+	2037	4	Intergenic	novelGene_122050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	49.0872239544625	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATTGTCATTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341836	349791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_342042_344486_345031_346964_347013_348551
526989	contig_16098_pilon	-	684	4	Intergenic	novelGene_46046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1914.94653247087	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAATGGCTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349706	348312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349331_349493_349604
526990	contig_10286_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_98423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCAAAAATATTCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431649	430352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_430400_431600
526991	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_12861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
526993	contig_3956_pilon	+	2313	11	Intergenic	novelGene_14901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1527.89969893315	1	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	553	1617	1284132	1290315	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAASRLT	1281599	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287455_1290297
526994	contig_11396_pilon	-	2219	8	Intergenic	novelGene_71278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	705.585876113906	612	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	121	783	249053	232299	FALSE	20	GAAAACCCTCTTCGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMSSYSIRHSISMPAMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249173	230862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_234013_234056_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
526995	contig_12938_pilon	+	1442	9	Intergenic	novelGene_99708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	805.208474557987	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	117	764	78117	85540	TRUE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51946	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468_85555_85654
526996	contig_15021_pilon	-	1927	2	Intergenic	novelGene_26942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1495	1800	240178	239873	FALSE	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYYKKYCGALLICPFPVESLPAVKAVQAHWTVLPRFHDTVQRKSENVFADSVNRVYVQVLLRASCHPVLVMWGLEGLHCYTFKSLLFAAQFSIYTFAHR	241733	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241122_241182
526998	contig_5280_pilon	+	2257	9	Intergenic	novelGene_52623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	566.12012859463	3	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	884	1201	47432	78098	FALSE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38736	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38946_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
526999	contig_5189_pilon	-	2496	11	Intergenic	novelGene_34835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	945.664866641455	5	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	254	1357	244235	199237	FALSE	10	TCTCTAATGTTTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	252438	198097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_252238
527001	contig_5954_pilon	-	2077	15	Intergenic	novelGene_28709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	194.161422953339	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	95	1726	975610	962496	TRUE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975704	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962265_962318_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
527003	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527004	contig_5575_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_122061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGACAACCCTGAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246011	245764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_-_245800_246000
527006	contig_10082_pilon	-	3061	8	Intergenic	novelGene_63865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_1	185.009541949179	805	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	43	1242	230553	212085	FALSE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSNLSVPSNPAQSAQSQPSYNPFEDEDDTGSTVSEKEDIKAKNVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	230595	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_212198_214733_214928_215484_215608_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358
527008	contig_854_pilon	+	1739	15	Intergenic	novelGene_36453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	454.094141996919	6	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	910	1614	1460156	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451241	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458450_1459120_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
527009	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_9529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527012	contig_15732_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_88914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACTGTGGCAAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356274	355973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_356000_356300
527013	contig_18168_pilon	-	1687	6	Intergenic	novelGene_122077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_3	71.4154045007098	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	27	1310	27110	23837	FALSE	35	GAAGAAATATGTGGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRNCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNGERRRPGSHVTGPLVPTDESPRVSGSGVLPKATGPAREHRGYSIPFRFQFRSKRALPSPGRSVVVGAGLTAGAGLTAGAGPVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27136	23459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26754_27040
527015	contig_5092_pilon	-	2069	6	Intergenic	novelGene_62307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	4	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	65	379	451516	444945	TRUE	35	ATAAACATAATTTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451580	443185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444211_444279_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
527016	contig_3386_pilon	-	1678	8	Intergenic	novelGene_34527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	810.004006036957	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	113	487	409604	406808	TRUE	35	AATTGTTGTTTAACTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412206	404161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406572_406709_406842_407702_407838_409398_409607_412096
527019	contig_8581_pilon	-	2094	12	Intergenic	novelGene_22842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.167966894938	30	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	67	1800	386058	306646	FALSE	40	TACCAACTCAAAGACTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHPRVKCIITSRHCRDSASQGTT	386124	306351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306712_324067_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
527022	contig_14621_pilon	+	1979	3	Intergenic	novelGene_105839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	179	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116093	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824_126259_126300
527023	contig_10134_pilon	-	1755	4	Intergenic	novelGene_16177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	470.944441167604	3422	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCTTGGCTTTAAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	29363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30462_34922_35178_38558_38817_39584
527024	contig_9609_pilon	+	2098	10	Intergenic	novelGene_23041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	799.528194207892	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	173	1084	449884	454609	TRUE	45	AAATACCAAGAACTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELPAEGQRRERSGSGGAEPGRGPCGNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435494	456272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435574_435670_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
527025	contig_3095_pilon	-	1235	6	Intergenic	novelGene_75229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	96	893	255481	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255576	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
527027	contig_1225_pilon	+	1239	2	Intergenic	novelGene_44208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274996	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_275207_275768
527028	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527029	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_12990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28180	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527030	contig_13894_pilon	-	1857	8	Intergenic	novelGene_62192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	216.037600657754	349	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	105	1187	766610	750013	FALSE	25	GTAGCGGTGCCACGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGRTLADKGVSRGQRQPREWELEPKCPAPRDRPMLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766714	749342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762224_763800_763958_766578
527032	contig_500_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_31010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1104.18376087397	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	201	1094	1492663	1498956	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSRIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKARSRCSAGVRPSAPSSAQPAWMVA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498013_1498882_1498974_1499277
527033	contig_8712_pilon	+	2271	6	Intergenic	novelGene_58727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_1	32.7377457990009	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	362	988	2416	8519	FALSE	25	CACCTGGGGTGCTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYAIRPDLAEVCLFTKDEPNLTPEKTEHFYRNLLNKHNIKTVSQIIPLRTLKKEYKPYEAKLRLLGSFDFFLTDARIRRLLPSIIGKHFYLRKKVPVCVNLLAKDLSKEINDCIGGTIMNISKNGSCSTIRVGHTGMMVQHIIENVIAVTKGLSEKLPEKWESVKLLYLKTEKSVALPIFSSFVSSFYEGKGGPLTGQKKKEAKKKQKEKLQKKKEKKRRKREMQQAAKTKKTKLAQTKDKVAAEVSGAPAKSPGPQKGETLGEKEEIHRGKAQRKVGDGSEDEIPLLVPMEETPAKKKKVEVFLLMFSIHNGLTWCCVSSRHCSE	960	9802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1100_2104_2254_2342_2445_5372_5467_5547_5674_8141
527034	contig_9014_pilon	+	2984	9	Intergenic	novelGene_106731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCGGACCATCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41329	51587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_42960_43053_43200_43281_43397_43480_43559_44086_44240_44420_45022_46508_46692_50553_50597_51552
527035	contig_5711_pilon	+	3408	7	Intergenic	novelGene_80297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	621	junction_4	197.467859550752	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	2281	3090	237892	249320	FALSE	30	AAAATGGAACTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFIFLLAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDNNDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKPKATPEKPSHDKKSQDFGNLFSFPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKPTDKVPSKTVAAKKGKPSSDITPKPKRTPKQKKVEAVNSDSDSEFGVPKKTAASKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKTSKTTTSKKPKKSSFDQDSDVDIFPSDFASEPPSLPRTGRARKEVKYFAESDEEEDVDFAMFN	235377	249638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_235574_235807_238122_240295_240376_241604_241716_246411_246535_248135_248234_249152
527037	contig_5643_pilon	+	1531	12	Intergenic	novelGene_39046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	761.81926665143	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	543	1319	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631210	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634851_636481_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
527038	contig_1443_pilon	-	1504	8	Intergenic	novelGene_28281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	489.826124918895	64	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	218	832	767487	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809547	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767511_808694_808741_809399
527039	contig_5988_pilon	-	1564	5	Intergenic	novelGene_15993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.641695452624	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	86	922	693353	690042	TRUE	10	AGTTCAGTCTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	693438	689303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_689553_689648_690504_690859_691009_691134_691358_693350
527040	contig_12151_pilon	+	2821	1	Intergenic	novelGene_54990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017216	1020037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_1017200_1020000
527044	contig_12340_pilon	+	3058	1	Intergenic	novelGene_122110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAACAAAATAAATACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64843	67901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_64800_67900
527045	contig_12340_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_122111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67901	69531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_67900_69500
527046	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527048	contig_15120_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_107991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_2	264.724460524524	729	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	94	642	116120	92198	FALSE	30	GAAGTCGTGTGAAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGELLYNKSEYIETASGNKVSRQSVLCGSQNIVLNGKTIVMNDCIIRGDLANVRVGRHCVVKSRSVIRPPFKKFSKGVAFFPLHIGDHVFIEEDCVVNAAQIGSYVHVGKNCVIGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV	116213	90908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_92296_99853_99957_104333_104446_107823_107943_115269_115339_116072
527050	contig_17936_pilon	+	1956	9	Intergenic	novelGene_29953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	461.35561121547	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	146	340	79133	91012	TRUE	25	GCCTAGTGTCTTGAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSRRIHRCPV	68274	126587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68391_79103_79300_90984_91134_95142_95305_106374_106472_110997_111167_118642_118827_121000_121063_125766
527051	contig_14513_pilon	-	1289	4	Intergenic	novelGene_70368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	20	CATTAGAACTCTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
527052	contig_5643_pilon	+	1348	10	Intergenic	novelGene_38852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2591.16375018001	8	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	522	1175	236700	238020	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWTMNLATATGWWTLWSTWPLRSKIPLDHQPQQQH	233951	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237917
527053	contig_4951_pilon	-	3356	1	Intergenic	novelGene_122120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTTTATTTCTGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27022	23666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_23700_27000
527054	contig_5033_pilon	-	1698	15	Intergenic	novelGene_29019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3691.98854181011	62	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	14	1417	566787	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566800	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531132_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542728_544593_544686_545249_545325_547551_547686_566747
527055	contig_12773_pilon	+	1619	2	Intergenic	novelGene_122133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGGAGCTCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7727	9477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12773_pilon_+_8941_9071
527056	contig_11422_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_99088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGGTGTTAGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538	747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1500
527058	contig_5671_pilon	+	1318	8	Intergenic	novelGene_79442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2301.52482728565	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	223	636	370430	525570	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	368856	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369592_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205
527060	contig_5917_pilon	-	2473	13	Intergenic	novelGene_122164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	219.458550882748	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	568	1710	737125	699492	FALSE	65	ATGAAAAAAAAAAAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	793018	698728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737176_757567_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_792827
527061	contig_17493_pilon	+	2383	10	Intergenic	novelGene_122183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	388.972149817096	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	190	1071	92103	156476	FALSE	30	ACAGAAAAGTGGGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLRILKRQAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADEDAFAEECRRRGQNALPSQPAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGFKEGGKRKKQKQREEQKKKKSTKGNH	49973	157788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94787_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119116_119188_146410_146618_156393
527063	contig_2596_pilon	-	2787	14	Intergenic	novelGene_53474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	103.074569433519	434	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	83	1285	722501	669421	TRUE	25	AACACTGAGTACTTTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEIAGAKPHITAAEGKLHNMIVDLDSVVQKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSNSVQLTGCRPMT	722583	662383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664345_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
527065	contig_1244_pilon	-	2060	8	Intergenic	novelGene_37980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	169	junction_7	757.493880893989	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	395	1294	928860	923211	FALSE	50	AGAGAATCACATTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	929725	922444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_929364
527066	contig_50_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_122235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATATACATTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135598	137808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_135600_137800
527067	contig_6710_pilon	-	1241	2	Intergenic	novelGene_93399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	241	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658185	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
527068	contig_4392_pilon	+	4071	21	Intergenic	novelGene_117306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_18	123.299635035956	202	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	998	2997	167	3163	307347	655344	FALSE	5	GTCCTGCCTTCAGCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAEAESPLNPSCKIMTFRPSMEEFRDFNKCLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDDLLIPAPIQQIVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCEAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVKKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPESTPEVKAWLQRRRKVRKVPKSFQRTRSHPKRPKTEEDEEASAVADGDEFPTPELATDQLKVSEKPEAAVKLGNIGAASEEETFADRMQPDQNLLHNINLSGNSCSSTSIMEEMKTEEDEACATVAPSNPEEADGAVTLSSGCVKSEEADPAKLSWPRSPESCSSVADTNGVWTEGEESDLESCGSGLEPGEVPEVPSGERNGFKVPHRIEAETKTAKSWRHPLSKPPARSPMTLVKQQAASDEELPEVPSTEEEVEETESWAKPLVHIWQTKSPNFVAEQEYNAAVARMAPHCAICTLLMPYYKPDSSNEENESRWETKLDEVITSGEKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEVCDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTQNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCMFCRHRIKKVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVSRDCVKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYLGSNIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGEKKRQRVLSSRFKNEYVDDPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ	273704	656252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_307329_307491_308176_308353_313024_313140_343418_343613_368063_368114_378934_379039_384173_384312_464336_464531_468579_468819_471078_471399_474144_474254_488930_489113_490691_490906_492144_492222_516721_516778_518997_519107_581318_581505_645308_645429_649029_649123_655167
527070	contig_1443_pilon	+	2319	9	Intergenic	novelGene_28327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCGAGTCTCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748385	809528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748995_749233_749349_750369_750530_766776_766826_767479_767556_804483_805720_808696_808744_809402
527072	contig_15063_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_14297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527074	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527075	contig_13740_pilon	-	1631	11	Intergenic	novelGene_34668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_10	4541.26570902871	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	169	1110	165243	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
527076	contig_5018_pilon	-	1872	9	Intergenic	novelGene_47050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	810.073299152614	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	830	1312	1400899	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401348_1401469_1401906_1402078_1402260_1402363_1402701
527077	contig_5671_pilon	+	1292	7	Intergenic	novelGene_79428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2369.10508185874	350	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	87	401	370430	506820	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNE	368838	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_506811_507035_521218_521303_531205
527078	contig_15063_pilon	+	1639	5	Intergenic	novelGene_13052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	331	1503	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30186	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527079	contig_6735_pilon	-	1614	13	Intergenic	novelGene_15741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	800.223766448416	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	85	891	564868	544941	TRUE	35	TATGCTGAGCTAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAVVPVDSRQNLSPWLRRRGSRRKRRRQSRWPSSKRSERL	568282	541985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542381_543157_543292_543788_543894_544851_545057_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
527081	contig_500_pilon	+	1506	11	Intergenic	novelGene_31054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1101.86207848351	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	685	1098	1496587	1498065	TRUE	10	GCGGGCATGTTTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485779	1499582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1491933_1492682_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
527082	contig_5643_pilon	+	1069	9	Intergenic	novelGene_38875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_2	1709.31550170675	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	243	863	236700	237983	FALSE	15	CAGCCACCTCTTTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236208	238189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
527083	contig_3414_pilon	-	2222	16	Intergenic	novelGene_80966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	340.244905260249	151	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	16	1830	101974	67173	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65392_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95112_95212_95426_95642_98057_98187_101892
527084	contig_3095_pilon	+	1241	5	Intergenic	novelGene_74979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	69	833	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
527085	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_18811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTACAGTCAGGACTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30095	29878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
527086	contig_14513_pilon	-	999	2	Intergenic	novelGene_70330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	132	455	18880	11833	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19011	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12012_18735
527087	contig_10940_pilon	-	1621	5	Intergenic	novelGene_49231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	142	570	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917141	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874444_874920_875675_893147_893306_916664_916748_916923
527088	contig_14970_pilon	+	1844	9	Intergenic	novelGene_44944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	133	1221	136145	231550	FALSE	20	TTTTTTTAATTACTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
527090	contig_10689_pilon	+	1241	5	Intergenic	novelGene_118622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1892.23307232487	8532	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	96	542	57608	59355	TRUE	30	ATGAAAAGCTTTCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGKSEITFNYKSVLILHHVCLCAFILIPPSPTSF	51266	61577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58403_59283_59393_60915
527091	contig_8729_pilon	-	2471	4	Intergenic	novelGene_40156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_3	159.250327053563	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1372	1806	768761	765591	FALSE	25	TACACAGTAGTTTATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770749	764925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438
527092	contig_3095_pilon	+	1109	5	Intergenic	novelGene_75027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	118	702	149748	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147280_149732_149896_150413_150696_150996_151163_151848
527094	contig_5302_pilon	+	3024	1	Intergenic	novelGene_81550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	459	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTTCTGTATTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656275	1659299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1656300_1659300
527095	contig_9233_pilon	+	2961	5	Intergenic	novelGene_78240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6087792521477	600	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	112	420	582395	676460	TRUE	5	CTGCATTTCTTCTTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582283	679042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346_677765_677805
527096	contig_3745_pilon	+	2323	3	Intergenic	novelGene_85074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	43.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	38	304	364213	370795	FALSE	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCWQCRNSLGTMAWGHSQDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364175	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364234_369179_369268_370637
527097	contig_9389_pilon	+	1821	8	Intergenic	novelGene_83924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1084.2267064689	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	284	1024	164237	167516	TRUE	30	ACCTCTGTTTTTAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159559	168374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163809_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167240_167553_167613
527098	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_12747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3806.5278761914	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	2	1081	28164	36333	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	28162	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38975_39092_39506
527099	contig_15498_pilon	+	2371	8	Intergenic	novelGene_42646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	178.672657022128	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	238	1362	679496	686124	TRUE	30	CTACAGAATGCACATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	679258	687369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866_686499_686734
527100	contig_8616_pilon	+	1798	11	Intergenic	novelGene_72481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	617.702808800478	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	304	1374	320431	330241	TRUE	15	CCAGCCACTTCCTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYPAIWSLPPHSCPFHRAQVPAVQLPDDLCLHWRRQQLHLPQRHRALQLHAVGVGGHLAPKPALFAGRKGQGPLFFPPCDPSLTVKWIGPCWGLEDEDPAHWEGSQPSLLSDFSSTG	318277	331065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328404_328459_329944_330292_330467_330546_330638_330720_330850
527101	contig_8075_pilon	+	2946	7	Intergenic	novelGene_42489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_6	120.857239014559	150	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	66	536	664009	684330	FALSE	65	TCTGTTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWQRPGAAVLSASDARSPSRCMCGNNMSAPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEALAGIRSSHIKYICPHAPIMPVTLNMNMAMPSWFDIIGLSPDSQEDEHGIKQAAENVKALIDQEVKNGIPSARIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVVGLSCWLPLRTSFPQVS	663943	686740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_676735_676802_677759_677808_681283_681355_681594_681669_684219
527103	contig_1244_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_37922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAAGTTGGCAAGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296748	297498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_296700_297500
527104	contig_4486_pilon	-	1768	11	Intergenic	novelGene_38577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	901	1329	399315	377416	TRUE	20	GCACTGACCGACATCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVLINIFLRIVKSQCSPFSTSATPQGYCLPLTLLPLTSMIVLLPTTARGKRSFIFLTSLFSSSSSVSGNSYILILCSWISFIICFLNCWHSSGVSVSALAISGMIFTFSCKRFINSISNGLSPCPEGAMKYKQHCTLLSGI	413389	311767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_311821_342989_343091_360533_360641_376090_376193_377339_377475_385368_385486_389956_390050_391118_391216_392816_392869_399304_399390_412563
527106	contig_12414_pilon	-	1967	11	Intergenic	novelGene_59648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_9	489.701184397179	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	264	1457	782107	756525	FALSE	45	CCAAAAATCAGAATGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	795105	756014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_787129_787233_794945
527107	contig_10163_pilon	+	2360	11	Intergenic	novelGene_82634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	146.193570310052	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	54	1208	123564	183894	TRUE	5	TTTCTGTTTTACGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLSRATVHDPETGKLTTAQYRVSKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANYGVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYDDFVLFSTGNCCFLV	123510	186596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146_152324_155412_155484_165096_165197_175174_175229_181219_181286_183846_183969_185518
527108	contig_13702_pilon	-	2478	8	Intergenic	novelGene_102610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	109.087682388891	488	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	218	1096	151513	144255	FALSE	10	TTGGCATGTAGGTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	159876	142872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151549_157337_157448_159804
527109	contig_20819_pilon	+	2555	8	Intergenic	novelGene_55605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	36.2429444224412	380	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	147	2366	22116	25305	FALSE	0	TTGTTTTCCTGTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	21075	25494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22066_22323_22476_23309_23427_23643_23798_24004_24175_24654_24809_25033_25245
527111	contig_10246_pilon	+	2245	8	Intergenic	novelGene_46907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	238.079047068534	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	504	923	175160	184738	FALSE	50	AGAAGACATATGAATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140740	186060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_169672_169783_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
527112	contig_6163_pilon	+	1127	6	Intergenic	novelGene_103784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.9855789771407	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	89	988	10301	16461	FALSE	10	CGAGTCCTTCTGCTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9590_10271_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
527113	contig_17311_pilon	-	2096	5	Intergenic	novelGene_57853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7709.72717983587	321	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	40	486	126865	121474	TRUE	20	AACTTATATGTGTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126904	118802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_119996_121056_121642_123344_123555_123642_123709_126862
527114	contig_15327_pilon	-	2003	9	Intergenic	novelGene_70726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	305.050303228828	7	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	32	481	967479	963529	TRUE	25	TGATCTGTTTGCTGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGSVFTPKTSTWAASWSAEAGFGAESWGMLALRMAAPITLQTVNQQKN	967510	959518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963496_963671_963787_963928_965036_965146_967420
527116	contig_12677_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_110837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGTCAAGGCCAGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	3078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2800_3100
527119	contig_8658_pilon	-	1282	7	Intergenic	novelGene_55802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1117.15751649741	3213	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	19	723	55624	6722	TRUE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLGHQSGCINWKCSEVAHV	55642	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6776_13146_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
527120	contig_12624_pilon	-	2105	15	Intergenic	novelGene_61033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	833.352927660794	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	179	1741	903621	862389	FALSE	20	GGCACCCAGAGTCCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903799	862024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
527121	contig_19851_pilon	+	943	7	Intergenic	novelGene_29843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3181.21203317226	52	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	77	592	53637	56177	FALSE	25	TAATTGTTCCGTGTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEPPPPAVQVQGLGPQREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53471_53567_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
527122	contig_21203_pilon	-	1214	8	Intergenic	novelGene_84487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGATGGCGGCCCCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122161	54024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_-_54128_93209_93352_102794_102896_105780_105964_106204_106364_108205_108377_120208_120372_121969
527123	contig_15087_pilon	-	2310	17	Intergenic	novelGene_37143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	393.261919717636	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	230	1594	66689	38999	TRUE	15	GCATTCCATGACTGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	72527	33327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33647_33756_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506
527127	contig_15063_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_8585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2923.18574313862	6	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	244	1449	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26352	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36569_38977_39092_39506
527128	contig_1406_pilon	-	2835	3	Intergenic	novelGene_25542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	362.5	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142831	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978
527129	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_8726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	245	1048	34808	36299	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGDMHQPST	27124	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36162_36277
527131	contig_1331_pilon	-	1331	4	Intergenic	novelGene_37830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	17316	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	95	571	169924	160009	FALSE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	170018	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
527132	contig_14744_pilon	+	882	7	Intergenic	novelGene_66056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4845.68525139175	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	20	841	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382037	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1385964_1386499
527133	contig_4232_pilon	-	2189	12	Intergenic	novelGene_63486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	343.913692805584	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	19	465	620488	614837	TRUE	15	CACGGAGATCTCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620506	607754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_607827_608043_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
527135	contig_5954_pilon	-	1873	10	Intergenic	novelGene_28649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	460.825346525123	40	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	127	1749	959926	944848	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEIKRKQDWSDHAIWWEQKKNVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTEWGRGWGRGLTPPGQGRAAPASHLSLSNRPPGRPPALRWPSSLTSTSTWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960586	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947885_956887_956942_959766_959941_960474
527136	contig_10437_pilon	+	1760	8	Intergenic	novelGene_38250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_7	151.728140341298	1472	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	185	1174	397110	407700	FALSE	25	TATTTGGTGTCAGATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396419	408286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397108_397230_398632_398756_398840_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
527138	SIRV6	+	746	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	840	0	-315	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	32	364	2002	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1970	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
527141	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_9510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527143	contig_12638_pilon	-	1989	11	Intergenic	novelGene_33397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCGGCACGGAGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539673	1515832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1515869_1521144_1521332_1522652_1522730_1524396_1524551_1529415_1529525_1529953_1530041_1530100_1530162_1530252_1530341_1530440_1530556_1534858_1535058_1538797
527144	contig_6304_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_122247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTATCAAGTCAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75677	75373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_75400_75700
527145	contig_15039_pilon	-	2054	11	Intergenic	novelGene_110124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_10	455.753891919751	895	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	552	1280	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260906	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198673_200448_200620_201176_201237_202795_202857_208401_208526_222093_222255_260778
527146	contig_4486_pilon	+	2138	15	Intergenic	novelGene_38583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1457.91007113272	4	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	137	1084	343083	411172	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKLL	311771	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407660_411163_411218_411258_411318_412424_412875_412977
527147	contig_1406_pilon	+	1689	4	Intergenic	novelGene_25587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	382.780470882318	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAATAAAGATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173774	2187445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2185820_2186338_2186412
527148	contig_3469_pilon	-	2263	16	Intergenic	novelGene_34155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_15	80.6165133345658	453	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	97	1524	413507	380499	FALSE	40	ACATACTATAAATCCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427671	379759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427583
527150	contig_12279_pilon	+	1394	7	Intergenic	novelGene_50093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	2268.71420388045	134	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	282	884	68297	77128	FALSE	10	GATCTTCATTTCCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57534	77638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_57717_57931_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
527151	contig_12624_pilon	-	2083	15	Intergenic	novelGene_61060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	833.352927660794	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	167	1729	903621	862389	FALSE	55	AAACAAACAAGGCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSEAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903787	862034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
527153	contig_9594_pilon	+	1763	11	Intergenic	novelGene_73931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	466.393664193672	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	753	1328	319403	322451	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301196	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316255_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
527154	contig_15063_pilon	+	1690	7	Intergenic	novelGene_10531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	5	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	235	1437	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27134	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
527155	contig_854_pilon	+	1010	6	Intergenic	novelGene_36214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2575.34918797432	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	120	548	543600	562402	TRUE	30	TGATCTAAAATGAGCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543480	563489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545957_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
527156	contig_18869_pilon	-	2058	2	Intergenic	novelGene_55977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	319	861	53041	52499	FALSE	25	TCATCTATGGTCGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59417	51301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_53330_59387
527157	contig_14441_pilon	+	1273	6	Intergenic	novelGene_100648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	381.223608922637	576	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	659	1087	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111478	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111624_111740_112040_113143_113209_116578_116963_117220_117344_117539
527158	contig_5018_pilon	-	1877	9	Intergenic	novelGene_47086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	69	1319	1402792	1399645	FALSE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402860	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
527159	contig_1406_pilon	+	1720	2	Intergenic	novelGene_25583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTAGTTTGTGGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173763	2187471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2185825
527160	contig_11328_pilon	+	1686	8	Intergenic	novelGene_88441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	277.890229392537	666	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	224	1435	830839	857309	FALSE	30	TCTTGAATCAGAGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAREHRAGRCLGCQSWGCGVAGLFPLFCCRSSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829332	857560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
527161	contig_4105_pilon	-	2605	11	Intergenic	novelGene_21472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.6	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1363	1995	72750	63749	TRUE	20	CACACTAGCTCTTCGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLYLFAIIFLLFLFLFLFPLLVQVHDIPDIPDSPSSRGQDHCVTTVIAVTLTVQNVVPGEHDSTAHNVPFVTAGPKRVPHTTAMEDLAIICMIGHRPSTPSRMPVLGIILPGQAQGDVAFLSRVHNLHLEVVAAGAQWVPGLGQPHINDALALAQVLQQLPADSDIMQPAPLVLVTVHHHDTVILMAQLSIEVQPHLLTQGVHAHCWE	74475	58754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_58819_60483_60655_61697_61774_62285_62411_62725_62862_63710_63897_71020_71171_71622_71680_72378_72501_72594_72768_73130
527164	contig_10689_pilon	+	1019	3	Intergenic	novelGene_118636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_2	116	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	18	536	57608	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	57590	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_57792_58211_58374_60928
527165	contig_2100_pilon	-	1465	9	Intergenic	novelGene_50728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1019.92768585572	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	641	1222	1175737	1170166	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPLGSLAPSQLVRPLFLMQMAAPGSDQDCGAFGS	1185488	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170267_1173265_1173374_1174204_1174403_1175562_1175950_1176724_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
527166	contig_854_pilon	+	1129	5	Intergenic	novelGene_36312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2878.59258145365	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	556182	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	556180	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556188_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
527168	contig_9014_pilon	-	1399	8	Intergenic	novelGene_106754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	43.3307168231517	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	124	531	81764	79637	TRUE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	81887	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726
527170	contig_4426_pilon	-	171	1	Intergenic	novelGene_15449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAAGGACTAATGGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861491	861320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_861300_861500
527172	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
527173	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527174	contig_6227_pilon	-	1698	17	Intergenic	novelGene_49714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	311.190832729693	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	44	1396	1224979	1202920	FALSE	15	TTATGGCTTCAGCCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225022	1202617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204155_1205977_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
527175	contig_7202_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_18704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCTACGTCTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
527176	contig_11574_pilon	-	2329	9	Intergenic	novelGene_64088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	264.422483915419	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	50	1837	456525	449890	FALSE	35	TTTCCCACATGAATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	462686	449397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651
527178	contig_4232_pilon	+	1177	4	Intergenic	novelGene_63198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2220.22025934365	21900	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	79	393	146362	148542	TRUE	30	AAGATTCATTAATGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	146283	149694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148604_148767_148884_149087
527179	contig_4407_pilon	+	2991	1	Intergenic	novelGene_122267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACGTCCAACTGCATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14137	17128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_+_14100_17100
527180	contig_12873_pilon	+	2011	6	Intergenic	novelGene_27216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1310.88199316338	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	944	1435	17896	19855	FALSE	30	CAAATTTGTAGTATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16363	20431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16604_16714_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
527181	contig_4429_pilon	+	3013	11	Intergenic	novelGene_50794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	384.226612821132	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	267	2177	165292	198515	FALSE	25	TTGGACACATACCTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	157358	199351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_157544_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
527182	contig_10793_pilon	+	1026	9	Intergenic	novelGene_83362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4067.25867254285	5	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	333	557	160548	162693	TRUE	25	TCAGCAACATTTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAILNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTG	130870	165010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130886_159151_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162701_163176_163295_163944_164068_164789
527183	contig_14925_pilon	-	1871	7	Intergenic	novelGene_55277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	901.65101650004	7	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	41	592	322420	115968	TRUE	10	TGCCTTTGGCTTGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQNLLSAVIQAHLWERNSCDCGTKKSASNQTICFRNEKWDEGCLSGEGFLSQGYKYNPQLIQEYNRI	322460	112092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113055_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129503_321808_322113_322371
527185	contig_6102_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_32192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894889	897358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888
527187	contig_9839_pilon	+	1769	7	Intergenic	novelGene_88552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_2	240.203906435067	77	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	28	1158	255906	267720	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STFQRTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGYVYI	255878	268331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523
527188	contig_6795_pilon	-	2357	5	Intergenic	novelGene_27759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	741.177610293241	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	74	967	396012	373705	FALSE	30	TATTTTGAAACAATTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSDYEEQQLQREEEARKVKSGIRQMRLFSQDECAKIEARIDEVVSRAEKGLYNEHTVDRAPLRNKYFFGEGYTYGAQLQKRGPGQERLYPPGDVDEIPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHIFERPIVSVSFFSDSALCFGCKFQFKPIRVSEPVLSLPVRRGSVTVLSGYAADEITHCIRPQDIKERRAVIILRKTRLDAPRLETKSLSSSVLPPSYASDRLSGNNRDPALKSKRSHRKADPDAAHRPRILEMDKEENRRSVLLPTPAPSFSFCFVLMVFVFGFFGSYIFFPWFVVFQG	396085	372314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_373806_373973_374033_374891_375048_387155_387237_395515
527189	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	220	1395	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527190	contig_12790_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_35268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCTCCTTAGCCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314569	314223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_314200_314600
527191	contig_12790_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_35267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCTAAATAAAAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313616	313369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_313400_313600
527192	contig_10861_pilon	+	1061	3	Intergenic	novelGene_39344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	324	461	1489678	1489815	TRUE	25	CTCAATGCCACGATGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNPGHNKKNTQKPHGDRRRDTTPPPPPPWPKSGDEVWVGQLVETLSLSPARQAPGLQGRSRKGRWAQPPRGREHLREGPSEGSTPSPALLPRDRWPTAARGRAVDTFMIERRLEKRQETRLSGQNWWGSVRGAWEGPMGQTLRSQEGGPKRG	1489354	1490606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1490213_1490299_1490471_1490574
527193	SIRV6	+	1308	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	556	52	340	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	90	581	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1643	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527195	contig_16286_pilon	-	3452	1	Intergenic	novelGene_75270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1277	1768	9141	8650	NA	40	GTCTTAAAATCACTGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAVSLAMSPHGSIYLTAKLTKAINSVLQCFLFRFILQSNSSAIWKAATWPIDWKRSTCMPIPKKDDPMKCGSYRTVSLISHASKILLKIIQKQLQQYIHCQKKFKLDSSWIQGGCGMKDIAADVRWILAESGEYQKHVYLCFIDHAKAFNCMNPNKLWITL	10417	6965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16286_pilon_-_7000_10400
527196	SIRV6	+	1469	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	51	8	1	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	207	698	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1138	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527197	contig_18162_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_122340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	16223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_16200_16600
527198	contig_1225_pilon	+	2302	4	Intergenic	novelGene_44178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251369	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_275033_275542
527200	contig_1244_pilon	-	1578	10	Intergenic	novelGene_37986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	955.301749238828	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	117	839	933762	923794	TRUE	30	TATCCAGACTCTTCAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRRQCIPREDKGCI	934522	922777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923529_923707_923827_924210_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499
527202	contig_19352_pilon	-	1788	6	Intergenic	novelGene_122358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	581.814953400134	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	277	702	122805	103962	FALSE	45	CAAAAAGGATGTATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAIKDTVV	123081	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103979_105931_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
527203	SIRV6	+	1280	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	584	52	368	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	62	553	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1671	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527204	contig_6215_pilon	-	2225	7	Intergenic	novelGene_21200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	989.993672819287	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	82	750	238624	228202	FALSE	20	AGTGTGTAGTGTGTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPVQL	238705	226726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228213_231669_231761_231862_232033_233741_233853_234066_234147_235190_235361_238588
527208	contig_15629_pilon	+	2575	11	Intergenic	novelGene_122472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_8	90.0413238463318	202	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	415	1605	180200	202417	TRUE	40	CCCAAGTATCACAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLCWIFLWLVSRERINGFNISDCSTKKLIWTYHATSEEEFILFCDLPELQKSHFFRRSQLSPTQVPELVPCRGSKDLSNVQWYLQPQNGDPLREITRDHPSIKSALHFSTIQMNDAGSYICRPRIRSPQDDACCIKMVLEVKPKKNTSFPCFEHKHKQFLLLGSIDPIYCPSLHCQSDTQCPEVTWYQNGKLLSEKRGNPLRIGEVYNYHRGTYVCDYNQSYNTSSWIVRAVVQVETIVKNTNFKPDILEPDKDTLEVELGKPLTLNCKVRFGFEKDLKPVVRWYIKDTDQRQEVPAPEGNSSTSMLKDGVIQHILSLKEVTQRDLQRKFICFAKNSVGSTTRSIQLKKKERSGFHIHTAWHHHDPGRHAAGECSPLHVLDRNRAAVPNLSEQG	176355	208436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_176670_180099_180270_180739_181053_181149_181337_192027_192179_195237_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
527210	contig_2204_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_71660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	165.946143218153	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	30	803	13204	50577	FALSE	40	TAAATTTTTAAAGGGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSQGQHGGVDASEWTRKCELAGIFLFL	13174	51207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912_49981_50498
527211	contig_3948_pilon	-	1714	8	Intergenic	novelGene_53210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.416155143367	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	106	912	866476	840803	TRUE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLKSSRGRAGGVGRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869673	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_839327_840186_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
527213	contig_3948_pilon	-	2046	12	Intergenic	novelGene_53321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	422.406192823374	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	870	1727	1485208	1468245	FALSE	25	GACTTCATCAACAGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511002	1467925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510921
527215	contig_20610_pilon	+	2748	3	Intergenic	novelGene_67650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	210	54	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	49835	50282	TRUE	30	TTTACCTAACTTCAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLLLLCRSHGGRDGVAEVARQRQHASSVHQPACLLRGEAGKEWKFIAFEACVLAPFSWRGNAVFSDPLRSKFQHFAPRSVYIYIKETRHDSHVYLLNFYFSQT	49833	53232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_49962_50094_52513_53030
527216	contig_5023_pilon	+	2054	13	Intergenic	novelGene_7185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2428.97153590202	1	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	772	1566	618569	647811	FALSE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTHTHTHIQPDVTGKMNTSWMRLG	580773	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611781_616461_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631552_647737
527217	contig_9177_pilon	+	1831	14	Intergenic	novelGene_32615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	408	836	2759	3724	TRUE	10	TGAGTTCCTTCTTGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	2028	7620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2205_2377_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589
527218	SIRV6	+	659	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	271	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	5	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2028_2470_2621_2740
527220	contig_9014_pilon	-	2304	12	Intergenic	novelGene_106724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	80.0231371500696	438	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	53	802	50592	43800	TRUE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTMKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51601	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_43743_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51551
527222	contig_16310_pilon	+	1381	5	Intergenic	novelGene_70069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	17413	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	342	674	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285634	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
527223	contig_11986_pilon	-	2802	4	Intergenic	novelGene_69262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	25.7725090401036	120	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	254	574	845609	845289	TRUE	10	AGTTTTGATCCTCGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHGLRHPAVDPGTPRDLRPSSSSPPSPPWILGAGRPQAPPRGPGLPGPHLAQQLGLGREEAEETWSEDRHQKWDKGVVGGHCSSQESLGAPDWVSSGCWGWVSMG	845862	839895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841746_841860_841950_842700_842855_845153
527224	contig_3818_pilon	+	2283	6	Intergenic	novelGene_99262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	152.140724331127	706	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	31	477	519853	528488	TRUE	40	GATTGATACAAAAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRDYVYVRRYSVDQENNVMVLVSRAVEHPSVPESPEFVRVRSYESQMVIRPHKSFDENGFDYLLTYSDNPQTVFPRYCVSWMMSSGMPDFLEKLHMATLKAKNMEIKVKDYISAKPLDMGSEAKATTQSSERKNEGSRGPAQIEYA	519743	530469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_519768_519846_519930_520393_520494_527216_527302_528303_528809_528983
527225	contig_2257_pilon	-	1153	2	Intergenic	novelGene_122501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	795	1097	305427	304610	FALSE	60	ATAGCAAAAAGATGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFNKGPKSIKWGKESLFNKWCWQNWMSICKKMKQDPYLTPYTKTHSKWIEDLNIQPKTIKIIEEKIGPTLEILIHSINRIQTITNNIQTPEDKLDNLEK	306221	304553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_304622_305136
527227	contig_15434_pilon	+	2724	4	Intergenic	novelGene_56705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_2	273.203627761826	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1405	1707	31167	32387	TRUE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIGMNYLERSCL	29269	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_30590_31082_31265_32182_33064_33141
527228	contig_15185_pilon	+	2995	6	Intergenic	novelGene_99381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	387	junction_5	212.692830156543	745	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	257	820	64414	120566	FALSE	35	GTGAAAACAAAGGTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVVPDQRSKFENEEFFRKLSRECEIKYTGFRDRPHEERQARFQNACRDGRSEIAFVATGTNLSLQFFPASWQGEQRQTPSREYVDLEREAGKVYLKAPMILNGVCVIWKGWIDLQRLDGMGCLEFDEERAQQEDALAQQAFEEARRRTREFEDRDRSHREEMEARRQQDPSPGSNLGGGDDLKLG	64157	122741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_64492_64731_64819_70100_70218_89657_89775_107652_107749_120497
527229	contig_11816_pilon	-	1958	2	Intergenic	novelGene_98546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTCTCGTAACTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085246	1082988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1083507_1083806
527230	contig_9668_pilon	-	1888	16	Intergenic	novelGene_58196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	884.350146843558	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	272	1786	605373	506987	FALSE	20	CCAGCTGCCTGTTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKPHHAVCFQLLLF	669996	506884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_507026_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610423_610514_662727_662779_669866
527232	SIRV6	+	305	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	12	168	12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGTTTATAGTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	1952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
527234	contig_177_pilon	+	2330	3	Intergenic	novelGene_41806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	527	931	418344	418748	FALSE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415634	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_417956_418197
527235	SIRV6	+	1502	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	3	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527236	contig_14890_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_122514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368674	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_366300_368700
527237	contig_500_pilon	+	1573	11	Intergenic	novelGene_30972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	554.857143776666	49	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	725	1273	1466134	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446875	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1453131_1453197_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
527238	contig_15866_pilon	+	1811	11	Intergenic	novelGene_63628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	587.837426504982	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	603	1139	620763	633133	FALSE	15	AAGTGTGGCTTGGTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458883	633805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
527241	contig_5954_pilon	-	2373	16	Intergenic	novelGene_28683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	430.997169364255	1	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	660	1694	956264	946279	TRUE	10	TGCTGGACCATCCGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLGGPTAHPTDPGGPPERGPALSV	960581	944728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945131_945196_945263_945384_945527_946209_946348_946712_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956934_959762_959941_960474
527242	contig_4105_pilon	+	2576	12	Intergenic	novelGene_21461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.185882143353	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	43	1065	58775	72509	TRUE	25	TCAGAACTGCCGTGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRTRRPRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTRNSDQCWEPNGLELLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGE	58732	74478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60554_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_67340_67380_71022_71173_71624_71683_72381_72511_72602_72766_73131
527243	contig_7171_pilon	-	2492	29	Intergenic	novelGene_101300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	110.708219879915	5	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	78	1370	1075756	1066155	TRUE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKVGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPFPSPAPFCWIRSSGSAVLAHHPPRDAPSS	1075833	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066248_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072516_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
527244	contig_6595_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_122541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTATTCATAAATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576515	575459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_575500_576500
527245	scaffold_15568_pilon	+	4143	5	Intergenic	novelGene_122575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	15.0727402949829	118	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	895	2688	344	3031	77744	94531	FALSE	45	TAATAAACCATAACTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIMKKLTQGHKAKGLYSKDTDWPQEKKKPKILEPITFEDVTVVFTEAEWKRLSCEQKNLYKEVMVEIYRNLLSLAEPKLELYPCSSCLLAVSCQQFLSQHVLQIFPGLCAENHFHPEDSSPGRQKQSEQQGSLPRCWNENTKGQEREVVSKPLCGRTGERETSRTFSSLAQGWSASPREGNTVVGTEPNSAQRVNSVETDNGLKELETSRFGAVSYREDQPHCGLKSKFITNQRALLREKPYVYSECGRGFSHKSDLVIYHRIHSDEKPYVCSECGRGFNRKSNLIAHQRTHSGEKPYKCLECGRGFSQKSGLLLHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLIRHQRTHSGKKPYMCLECGRDFSQKSGLLFHQMTHSGEKSYVCSLCGRGFKWKTLLLMHQRRHSGEKPYVCSECGREFSYKSDFIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFSLKSNLITHQRTHSDEKPYVCSECGRGFNQKSHLLVHQRTHSGEKPYVCSECGRGFNRKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRDFNQESSLLMHQRTHSGEKPYVCSECGRGFIQKSGLLHHQRTHSGEKPYVCSECGRGFKQKSGLFYHQRTHSGEKPHVCKECGRSFSQKSVLIRHQRRHSGEKPYVCLECGRGFSQKSDLLLHQGTHSGEKPYVCSECGRGYNCKSILLIHQRTHSGEKPYVCKECGRGFTQKSHLITHQRTHTGEKPYVCLECGRGFSQKSGLLLHQGTHSGEKPHVCKKCGRSFNRKSILLMHEKTHSGEKPYVCSECGRGFNRKSHLFMHQRTHSGEKPYVCGECGRGFNHKSNLIPHQRTHSGEKPYVCLECGRGFIQKSHLFTHQRTHSGEKPYKCLECGRGFNQESSRLMHQKTHSGEATCVQGVWARL	57815	95643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_57935_77519_77787_77969_78026_81493_81621_92069
527246	scaffold_12124_pilon	+	2373	12	Intergenic	novelGene_22030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	492.469338727577	3	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	202	1032	836073	852375	TRUE	30	AACTGGCGTCTTCTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEL	829543	858979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847691_852368_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858258_858358
527247	contig_10940_pilon	-	1787	5	Intergenic	novelGene_49272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	135	563	917000	875564	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917134	874222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874549_874665_875675_893147_893306_916664_916748_916923
527248	contig_3077_pilon	+	1648	10	Intergenic	novelGene_26618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_2	3320.00410902616	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	472	1155	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9557	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
527250	contig_12638_pilon	-	1812	15	Intergenic	novelGene_33117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATTATATGAACCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199758	170897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_173507_173559_178083_178281_182936_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191804_195500_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
527253	contig_11316_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_122696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTCCTCGTAGTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139845	140522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139800_140500
527254	contig_12079_pilon	+	2040	15	Intergenic	novelGene_67411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	135.398146823601	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	436	1716	535255	578891	FALSE	10	CCTGTGTCTCCCAGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRILLWNLQSKCSVMKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	494662	579215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_542339_542379_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
527255	contig_5403_pilon	-	2393	17	Intergenic	novelGene_87973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	93.1782565838189	14	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	71	925	458189	433410	TRUE	35	ACATAAGTTTCAAGACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKASDPAGKMGGKEKPVGAGEEKRKEGGKKKNKEGSGDGGRTELNPWPEYINIRLEMYNKLKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYHIACGISQGLADNTVIAKVNKVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFTSLETLCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLEMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKTLKIHKVILTE	458259	424187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431852_431998_432084_432248_433247_433424_436740_436824_436907_436973_438891_439010_439918_440041_441204_441329_449848_450040_453795_453877_458132
527256	contig_12622_pilon	-	2077	12	Intergenic	novelGene_5977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2232.8115101077	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	162	1889	1590968	1583745	FALSE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591129	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586661_1587977_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
527261	contig_15063_pilon	+	1612	6	Intergenic	novelGene_14191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	124	1359	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34684	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527262	contig_16846_pilon	-	1209	4	Intergenic	novelGene_82945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	320	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	61	579	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558710	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
527263	contig_10082_pilon	-	2993	12	Intergenic	novelGene_63872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	224.182960993917	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	200	1657	260762	212085	TRUE	30	TAAACAGTTGATCTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAYDDSVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRLLVDKGPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSNLSVPSNPAQSAQSQPSYNPFEDEDDTGSTVSEKEDIKAKNVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	329410	210281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210911_211377_212198_214733_214928_215484_215608_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358_230595_232483_232641_260702_260842_329290
527264	contig_7202_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_18692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTACGTCTACCTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
527265	contig_10940_pilon	+	2384	3	Intergenic	novelGene_49173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1651	junction_1	147.5	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGCTGTTGAAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172524	176214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172629_173150_173218_174001
527268	contig_10064_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_122705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTCCACCTTGGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264328	262688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_262700_264300
527269	contig_10235_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_46471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_6	880.598405074872	11002	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	608	1069	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224484	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_223370_223755_223780_224427
527270	contig_11752_pilon	-	2494	3	Intergenic	novelGene_37669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGATTTGTGAGTCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105909	91088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_93056_94218_94433_105596
527273	contig_15047_pilon	+	1284	7	Intergenic	novelGene_52132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	106	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	140	415	3242	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRLPLPAVFLHRRSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2588_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
527274	SIRV4	+	446	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	4	500	4	-500	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGGTTACAACGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	2271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
527276	contig_9708_pilon	-	2120	4	Intergenic	novelGene_67249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	7.36357401145817	54	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAATACGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40214	18904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_24128_24246_24631_24974_40077
527278	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_9344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527280	contig_5671_pilon	+	1399	6	Intergenic	novelGene_79443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	1821.29448470037	271	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	417	839	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368856	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369248_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
527283	contig_3986_pilon	-	2126	12	Intergenic	novelGene_52665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.568829849013	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	114	1262	60653	34935	FALSE	15	TTTTCAATGTCTTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAAKMTVYKIFVQKFIFYINIPVVKQ	108508	34070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35005_41432_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396
527284	contig_13894_pilon	-	1160	9	Intergenic	novelGene_62153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	452	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTCATCCTTGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528173	521684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_521769_522677_522844_523482_523623_524835_525023_525635_525797_526475_526577_526847_526946_527457_527578_528070
527285	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAGATCAACCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
527286	contig_15063_pilon	+	1094	4	Intergenic	novelGene_13116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	202	1092	34808	36379	FALSE	15	GTTTGTGCAGTGGCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPD	34606	36381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527287	contig_7202_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_17528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27950	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_28000
527290	contig_12427_pilon	+	1488	5	Intergenic	novelGene_40462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	337	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	975	1421	314492	325869	FALSE	15	TATTTTCAGAGTCCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFTTPIALHFGAVFLNVSKFATRIALLLISMVTVTSKMAWFATVVAALLSLSLGLLAVLGNVTTSTAVIAGFILLKVTILGKMTRLTTAITDVWKRRGNKLETSATASHSTTTASSSRTFPSPVARSPTLEALIAAHGCSYVFFGV	313517	325936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_314509_315363_315568_315748_315840_315956_316079_325856
527291	contig_3449_pilon	-	1991	14	Intergenic	novelGene_73707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	162.133446388676	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	320	1468	328842	299208	FALSE	10	AGGTGTATTGTGGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLSVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVLEDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGSLLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLITLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAMLLQPNKKTIKKLREVLYELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK	347008	298684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_299304_305148_305276_306287_306386_307835_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_318314_318407_322018_322114_324625_324712_327360_327429_328710_328880_332071_332212_346866
527292	contig_15063_pilon	+	1560	6	Intergenic	novelGene_13775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	35	TTTGAGCTCTAAGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527294	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTACCCAGCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
527295	contig_11258_pilon	+	2692	6	Intergenic	novelGene_67813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAGAGAAGCAGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325993	360535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_327650_328686_328769_330516_330663_336874_337092_354744_355093_360292
527296	SIRV4	+	1019	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	929	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2384	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_3400
527297	contig_11832_pilon	-	2096	14	Intergenic	novelGene_106942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_12	925.239396496065	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	996	1652	86997	84249	FALSE	20	ATAGGCATGAGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92437	83804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88802_89418_89450_92387
527298	contig_7963_pilon	-	1335	6	Intergenic	novelGene_58316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1352.39926057359	14	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	302	607	48600	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCRPILFPRDAGTLSREEEMLLRARPLSAAPLPAENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48901	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43854_48526
527299	contig_10235_pilon	+	3836	28	Intergenic	novelGene_46548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_7	35.9261932025186	180	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1246	3741	45	3785	418425	429472	FALSE	20	CATGTGAGCTCAAGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCSFRLRGSCSGTKMLETERLVLPPPGPLDLPLRAVELGCTGRWELLNVPGAPESTLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQRKMDPWSLLSAPGAPVPSDLQAQRHSTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPLSQALWGNPTQYPFWPGGMDEPTITDLSIREEAEEEIDFEKDLLTVPPGFKKGVDFAPKNHPAPAPGLLSLSYLLEPLDLGGGDEDGSEAVGQPGDTRGDTVSAFPCSAPLVRASSLEDLVLKEASTAVSTPEVPKPPPQEQWAIPVDVTSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDAERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVARPVPLEHYLFTGNSPKTQGELFLLLDSRGVFHMKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHHGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLQRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDTMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQSLAELTKRLGALEEPDVTGQLVDLPEYYSWGEELTEARSLIQRSIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPMSEDPQDKGPATPDVPFPDDLVGFKLFLPEGPCDHVMAKLQPGDVAAITTKVLRVNGEKILEDFNRRQQPKFKKDPPCAAVTTAVQELLRLAQAYPAGPPTLDPVNDLQLKDVSVVEGGLRARKLEELIRGAQCVHSPRFPAQYLKLRERVQIQKEMERLRFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLQTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSALRPEEIAALLSGLVCQSSGDSGDQLPSTLKQGVERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ	418380	429523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_418447_418525_418630_419184_419295_419375_419494_419592_419708_419822_419898_420192_420247_420345_420537_420700_420830_421033_421180_421549_421697_421835_421921_422113_422221_422554_422702_422777_422875_423052_423266_423346_423458_425691_425923_426544_426683_426838_426977_427079_427185_427441_427590_427680_427808_428049_428261_428418_428530_428609_428829_429038_429180_429271
527302	contig_13865_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_122743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGTAAACATGGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46105	46863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_46100_46900
527304	SIRV6	+	305	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	10	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGTTTATAGTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	1952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
527305	contig_9345_pilon	-	1615	4	Intergenic	novelGene_24356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	562.211308633645	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	75	620	142974	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144586	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_142975_144512
527307	contig_5189_pilon	-	1958	8	Intergenic	novelGene_34851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1066.17295759656	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	111	824	244235	199237	FALSE	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220337_244172_244289_247694
527310	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	47	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	199	1371	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527311	contig_12864_pilon	-	1652	7	Intergenic	novelGene_76383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	486.298490869777	244	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	101	643	223293	217842	TRUE	30	CTCCATAGAGGTTTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223393	214800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215792_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
527312	contig_854_pilon	+	1998	4	Intergenic	novelGene_36751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	32.2593655651606	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	629	1432	1745134	1745937	FALSE	70	CAACAAAAATAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722258	1746503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722669_1737993_1738042_1743412_1743540_1745090
527313	contig_15063_pilon	-	1511	5	Intergenic	novelGene_12221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTCCCAGTAGTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36781	27551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34924_35035_35378_35838_36156_36264
527314	contig_5020_pilon	+	1270	8	Intergenic	novelGene_27840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1135.93947453019	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	293	901	122915	125717	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVHALLSSLGFLECGDVRHL	118462	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119588_122874_122918_123188_123364_124167_124363_124444_124547_124909_124984_125657
527318	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527319	contig_5350_pilon	+	2981	6	Intergenic	novelGene_99339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	54.1575479504012	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	243	698	184722	223532	FALSE	20	ACTTTATGTATGCTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPGLCWRTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILGKYKEQGHVEAQPGTRRWSGFSNLAPLSCSDYTTET	142193	225815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_220454_220530_222758_222931_223349
527320	contig_5063_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_110001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCACACATCACCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25329	24948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_24900_25300
527322	contig_3975_pilon	+	2260	11	Intergenic	novelGene_54755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	116.383160293919	6	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	23	952	1961329	1984894	TRUE	25	AGAAGCTGGAAGGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPICSWKMWSGRTGNEGSQSEQLSHPQHLLPLTLASAWPRKTLTENVPQMASVKQSSGHRF	1961306	1986269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1975682_1984707_1985398_1985464
527323	contig_15063_pilon	+	1466	6	Intergenic	novelGene_14301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	332	1216	35271	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34827	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527325	contig_9049_pilon	+	1618	8	Intergenic	novelGene_83151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_7	1530.52222646856	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	191	778	90226	112652	TRUE	45	TTTGAAAAGAAATAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	89352	113712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113028
527326	contig_14101_pilon	+	2498	4	Intergenic	novelGene_122757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	43.6882898116494	338	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	179	1333	260068	273778	FALSE	5	TCCCCTGTGTGAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257121	274943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264833_273610
527327	contig_1275_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_108862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	332	1021	747279	747968	NA	25	AATTGCATTTTAGATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746947	748665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746900_748700
527328	contig_5727_pilon	+	2592	3	Intergenic	novelGene_7930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	46	510	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	525	2528	129759	131762	FALSE	20	TTCAGTTCCAGTATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTTNSLPTDLLLKEGSLKQEVESFCYQIVSESNDQKVGILQSEDEQLQPSVSKKSESELPRVKFMSNSNKITFSKKPKRRKYDESYLSFGFTYFGNRDAPHAQCVLCKKILSNSSLAPSKLRRHLETKHAAYKDKDISFFKQHLDSPENSKPAAPKIVNTDNESATEASYNVSYHIALSGEAHTIGELLIKPCAKDVVMRMFDEQYSKKIDAVQLSNSTVARRIKDLAADIEEELVCRLKICDGFSLQLDESADVSGLAVLLVFVRYRFNRSIEEDLLLCESLQSNATGAEIFNCINSFMQKHEIEWEKCIDVCSDASRAMDGKIAEAVTLIKYVAPESTSSHCLLYRHALAVKIMPTSLKNVLDQAVQIINYIKARPHQSRLLKILCEEMGAQHTALLLNTEVRWLSRGKVLVRLLELRRELLVFMDSAFRLSDCLTNSSWLLRLAYLADIFTKLNEVNLSMQGKNVTVFTVFDKMSSLLRKLEFWASSVEEENFDCFPTLSDFLTEINSTVDKDICSAIVQHLRGLRSTLLKYFPVTNDSNAWVRNPFTVTVKPVSLIARDYESLIDLTSDSQVKQNFSELSLNDFWSSLIQEYPSIARRAVRVLLPFATMHLCETGFSYYAATKTKYRKRLDAAPHMRIRLSNITPNIKRICDKKTQKHCSH	126500	131826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_126690_128339_128456_129539
527329	contig_13244_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_87007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATATGACGGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480109	478647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_478600_480100
527331	contig_8138_pilon	+	2814	4	Intergenic	novelGene_52448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.483862700683	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	198	581	280295	305213	TRUE	0	GTGGTGGTGTCTTCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGERPGLWGSWPCFCLGLQSQSQLWSMRTEAALALLLGA	280097	307945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_306859_307357
527332	contig_8317_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_19393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
527333	contig_9871_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_75673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	135.366990888555	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	141	569	492195	501371	FALSE	50	AAAGGTAATTAACTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKGACYGDDACFVARHRSADVLGVADGVGGWRDYGVDPSQFSGTLMRTCERLVKEGRFVPSNPIGILTTSYCELLQNKVPLLGSSTACIVVLDRTSHRLHTANLGDSGFLVVRGGEVVHRSDEQQHYFNTPFQLSIAPPEAEGVVLSDSPDAADSTSFDVQLGDIILTATDGLFDNMPDYMILQELKK	467334	501373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_467407_492126_492307_497440_497640_501253
527334	contig_2114_pilon	-	1840	12	Intergenic	novelGene_104319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	86.6565368099881	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	684	1304	1147929	1139050	FALSE	30	TTTAATGACTACTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169447	1138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149506_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
527335	contig_12977_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_122816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTCATCCTTGACGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81787	82272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_81800_82300
527336	contig_12697_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_122836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCGGATGGCTTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307546	307123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_-_307100_307500
527337	contig_10765_pilon	+	2138	6	Intergenic	novelGene_122846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	190.107758915832	781	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	212	1972	18249	34929	FALSE	25	TGTATTTTAAATGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15607	35095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18196_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
527338	contig_15063_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_12854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2114.29006340715	3	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	598	1485	35271	39515	FALSE	25	ATATATTCTCCTTATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28164	39756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34936_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527339	contig_15063_pilon	-	1496	4	Intergenic	novelGene_13910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	785	1108	35891	35108	TRUE	40	AGGACCCAAGAGTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36158_36264
527340	contig_11422_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_99033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1300
527342	contig_7179_pilon	-	2237	11	Intergenic	novelGene_78165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	129.114522808242	801	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	746	1468	1061981	1058069	FALSE	10	GCCCCCTGAGTGTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKWLGESEKLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTEFLVQMQGVGNNNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEEFGQES	1071737	1057299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058171_1058816_1058958_1060225_1060446_1060733_1060816_1061212_1061362_1061952_1062110_1062591_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
527343	contig_12638_pilon	+	2975	18	Intergenic	novelGene_33253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_13	213.558222007141	77	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	125	2200	803891	861300	FALSE	20	TGACTGATGTGGACCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKQSKWSGIPQLLLRLYATSHLHSDFVECQNILKEISPLLSMEAMAFVTEERKLTQETTYPNTYIFDLFGGVDLLVEILMRPTISIRGQKLKISDEMSKDCLSILYNTCVCTEGVTKRLAEKNDFVIFLFTLMTSKKTFLQTATLIEDILGVKKEMIRLDEVPNLSSLVSNFDQQQLANFCRILAVTISEMDTGNDDKHTLLAKNAQQKKSLSLGPSAAEINQAALLSIPGFVERLCKLATRKVSESTGTASFLQELEEWYTWLDNALVLDALMRVANEESEHNQASIVFPPPGASEENGLPHTSTRTQLPQSMKIMHEIMYKLEVLYVLCVLLMGRQRNQVHRMIAEFKLIPGLNNLFDKLIWRKHSASALVLHGHNQNCDCSPDITLKIQFLRLLQSFSDHHENKYLLLNNQELNELSAISLKANIPEVEAVLNTDRSLVCDGKRGLLTRLLQVMKKEPAESSFRFWQARAVESFLRGTTSYADQMFLLKRGLLEHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	800851	862075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_800955_803869_803987_812884_812943_815113_815170_826236_826366_830581_830790_836185_836372_845372_845540_850769_850902_852617_852677_854778_854881_855928_856013_857044_857136_858213_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162
527344	contig_3818_pilon	+	2619	9	Intergenic	novelGene_99258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	133.520539150349	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	37	924	497371	528488	TRUE	55	AAAGATTGATACAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRGRPGPVCSLMAALAGVFVWDEERIQEEELQRSIDEMKRLEEMSGVFQSSGVEHHSPEPKSQTEGNEESGDRAQPWEMVMDKKHFKLWRRPITGTPLYQYRVFGTYTDVTPRQFFNVQLDTEYRKKWDALVIKLEVIERDVVSGSEVLHWVTHFPYPMYSRDYVYVRRYSVDQENNVMVLVSRAVEHPSVPESPEFVRVRSYESQMVIRPHKSFDENGFDYLLTYSDNPQTVFPRYCVSWMMSSGMPDFLEKLHMATLKAKNMEIKVKDYISAKPLDMGSEAKATTQSSERKNEGSRGPAQIEYA	497334	530466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_497436_516071_516281_516627_516678_519656_519768_519846_519930_520393_520494_527216_527302_528303_528763_529045
527346	SIRV4	+	400	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	130	420	130	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACTTTCCACTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585	2351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
527348	contig_15087_pilon	+	2262	21	Intergenic	novelGene_37200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAGAGCAGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110647	150576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113491_114528_114591_116811_116908_118079_118175_126040_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133527_134810_134896_136587_136666_139484_139650_141726_141768_143029_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149104_150435
527349	contig_10011_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_68054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCCACATCTTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208336	208863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_208300_208900
527350	contig_7816_pilon	-	1812	14	Intergenic	novelGene_66514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	76	423	211694	209366	TRUE	10	TGGTGGCCTGGATGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFLKTYIYHSSQYIFEHLCQQLSGMCRIPTLHPIAPLGLGDQAPHGLHNGVLVNAKHLQQLIWLPASWYLADGQAGDSDARLAHDSTAHCLTYATFVIMVLHREDPALGGAGAVENEFSIQGLDGERIQHADVNLVFLQ	211769	170259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_170275_181010_181128_182011_182126_182984_183083_192894_193088_194849_194972_195756_195860_196775_196909_207502_207660_207802_207973_209064_209149_209282_209377_210625_210749_211480
527351	contig_17936_pilon	+	2185	11	Intergenic	novelGene_29897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	913.334796227539	3	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	70	1329	50646	121021	TRUE	20	TTACCAGCCTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50576	126581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68387_79117_79300_90973_91161_95142_95299_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
527354	contig_7428_pilon	+	2384	6	Intergenic	novelGene_77682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	300.208194425136	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	193	1341	221272	223939	TRUE	10	GCCCTCTGTGACTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALALPDCLVLWVPAEAHPLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTRSVLSPSEACGLLLGSTCGHWDVFSSWNISLPAVPKPPPRPPSPPAPGAPVSRILFLTDLHWDHDYLEGADPDCVDPLCCRQGSGLPPTSRPGAGYWGEYSKCDLPLRTLESLLSGLGPAGPFDMVYWTGDIPAHNVWQQSRQDQLRALTTITALVRKFLGPVPVYPAVGNHESTPVNGFPPPFIEGNHSSSWLYEAMAKAWEPWLPAEALQTLRIGGVLCPVPTPPASASSLSI	221079	225742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221584_222563_223337_223875_224050_224356_224434_224643_224794_225036
527355	contig_5023_pilon	+	2137	14	Intergenic	novelGene_7210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2222.73147968198	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	88	1536	607279	646990	FALSE	10	ATCCTACTCTGCTTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	647591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614464_622545_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631497_639106_639197_643413_643539_646857
527360	contig_5780_pilon	-	1861	5	Intergenic	novelGene_29801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	42.7697322881498	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	683	1387	119675	117335	FALSE	10	CGTTTCTTTCCACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELTYISLCFPEAIKARGMDSTEDIPYYFYRDDGLLVWEAIKKFTAEVIGIYYESDQVVEEDQELQDFVKDVYVYGLRGRKASGFPSSIKTREMLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFSQYDWCSWIPNAPSTMRAPPPTAKGVVTIEQIVETLPDRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLDTIVSVIAERNKEKKLPYYYLSPDRIPNSVAI	120357	116860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_117515_118059_118231_118619_118721_119105_119228_119544
527361	contig_18715_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_122999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328015	329499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18715_pilon_+_328000_329500
527362	contig_19744_pilon	+	3450	6	Intergenic	novelGene_120407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	119.216441819071	299	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	296	745	256567	258076	TRUE	15	ATGCTGTTGTTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGGRDTDQNSSEEGTAEKFKKLRTTNAHSQTCDWGNLLQDIILQVFKYLPLLDRAHASQVCRNWNQVFHMPDLWRCFEFELNQPATSYLKATHPELIKQIIKRHSNHLQYVSFKGRVGNHGSDDENIDEMKKWNGFLRSSEWFKKSQ	250862	273587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_251157_256565_256915_257974_258090_260289_260413_263501_263674_271190
527364	contig_15449_pilon	+	2719	2	Intergenic	novelGene_33645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2114	2425	129919	130303	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMISHFLLDNQPASSSATTSWVAKANHFIFFVILPLPMASLSSANCFTPLEPLKTKLLTVAIQCLKDHTCENAIVIILKYAYPFLISLLTDFVFLGEMRRFK	127805	130597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_130218_130290
527365	contig_15047_pilon	+	1097	5	Intergenic	novelGene_52263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3251.26752205967	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	489	599	4573	20995	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRRLHRPEREPAHLDGGGHGCSDHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGKL	3304	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4434_4552_4676_20987_21062_21232
527366	contig_13558_pilon	+	2475	2	Intergenic	novelGene_123003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTGAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36703	39219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_38797_38837
527368	contig_14513_pilon	-	1084	3	Intergenic	novelGene_70261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1467.5	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19077	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18914
527369	contig_2069_pilon	-	2584	9	Intergenic	novelGene_23402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	230.672793150818	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	217	894	1247872	1236774	TRUE	25	AACTCATTGTCCATCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVASGLMEDDGKPRATQTPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVSGLASSGARVRGPSIRALVPPSKGTT	1249830	1233912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234882_1235178_1235318_1236191_1237020_1245605_1245765_1246182_1246273_1246482_1246609_1247815_1247947_1249409_1249513_1249791
527370	contig_17274_pilon	+	2045	17	Intergenic	novelGene_26502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	150.805130880882	167	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	153	1790	87831	124532	FALSE	10	CTTCATCTCACTCTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRRRKRGRPRKHLTQRNKAPLKRGRPRGSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNALFWAGLPIHCCSEC	87678	124787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_113142_113218_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349_124432_124479
527372	contig_12635_pilon	+	1845	7	Intergenic	novelGene_60792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	113	junction_6	26.170381901854	362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	163	1002	118817	154217	FALSE	25	GTTGGAACGCATTCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLECAPQRGGVFGCSAVRRSRRAAPPEPGRRASPLLAASTPAAGVHLTVHTHTMTKKDKKSFNQSLAEWKLFIYNPTTREFLGRTAKSWGLILLFYLVFYGFLAALFSFTMWAMLQTLNDEVPKYRDQIPTPGLMVFPKPVTALEYSFSLSDSRSYEGYVRDLDNFLKSYDLEEQKNLTACPDGALFEQKGPVYSACQFPRHLLKECSGQNDTEYGYSRGSPCILVKMNRIIGLKPKGQPRITCTPKDERAALITTYPSGGHIDLKYFPYYGKKLHVGYRQPVVAVQASFNLNNTRKEATFDCIIDGSPNLKNKDDRDKFLGRVTFKITVNA	118654	155060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_118926_137419_137549_142097_142206_143686_143872_146769_146821_151190_151278_154046
527373	contig_5727_pilon	+	2770	3	Intergenic	novelGene_7928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_1	70.5	492	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	707	2710	129759	131762	FALSE	20	TTACTTCAGTTCCAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTTNSLPTDLLLKEGSLKQEVESFCYQIVSESNDQKVGILQSEDEQLQPSVSKKSESELPRVKFMSNSNKITFSKKPKRRKYDESYLSFGFTYFGNRDAPHAQCVLCKKILSNSSLAPSKLRRHLETKHAAYKDKDISFFKQHLDSPENSKPAAPKIVNTDNESATEASYNVSYHIALSGEAHTIGELLIKPCAKDVVMRMFDEQYSKKIDAVQLSNSTVARRIKDLAADIEEELVCRLKICDGFSLQLDESADVSGLAVLLVFVRYRFNRSIEEDLLLCESLQSNATGAEIFNCINSFMQKHEIEWEKCIDVCSDASRAMDGKIAEAVTLIKYVAPESTSSHCLLYRHALAVKIMPTSLKNVLDQAVQIINYIKARPHQSRLLKILCEEMGAQHTALLLNTEVRWLSRGKVLVRLLELRRELLVFMDSAFRLSDCLTNSSWLLRLAYLADIFTKLNEVNLSMQGKNVTVFTVFDKMSSLLRKLEFWASSVEEENFDCFPTLSDFLTEINSTVDKDICSAIVQHLRGLRSTLLKYFPVTNDSNAWVRNPFTVTVKPVSLIARDYESLIDLTSDSQVKQNFSELSLNDFWSSLIQEYPSIARRAVRVLLPFATMHLCETGFSYYAATKTKYRKRLDAAPHMRIRLSNITPNIKRICDKKTQKHCSH	126496	131822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_126868_128339_128456_129539
527375	contig_5153_pilon	+	841	4	Intergenic	novelGene_74404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	323.85902282732	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGAATTTTTTCCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011767	1022891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1022287
527376	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	242	1414	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26354	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527377	contig_9468_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_59506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGATGCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353453	353232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_353200_353500
527378	contig_9468_pilon	-	945	5	Intergenic	novelGene_59501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCATTCAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352288	346905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_347276_350683_350787_350869_351048_351908_352017_352102
527379	contig_12414_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_59597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	873	173	1045	373182	374054	NA	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373009	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373000_374600
527380	contig_9807_pilon	+	2339	12	Intergenic	novelGene_32891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	469.860415354768	2	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	777	1484	147193	158783	FALSE	5	GGAGTTTTTTTGCGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109054	159638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109121_128563_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145205_147118_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
527381	contig_13740_pilon	+	1610	5	Intergenic	novelGene_34732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	531.738187456948	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	11	454	167703	176906	FALSE	10	TGTGGTTAGACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	167692	178062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_167727_170859_170921_173094_173232_176358_176454_176779
527384	contig_6589_pilon	+	2036	8	Intergenic	novelGene_26033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_7	786.44093671348	152	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	103	909	1725483	1730190	TRUE	35	AAATAGCTTTATATTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVIWLRPHSLLAP	1725380	1731818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730906_1731406
527385	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_8617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26366	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527387	contig_13216_pilon	+	1737	7	Intergenic	novelGene_47494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	980.235005836185	4	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	757	1197	260572	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229677	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243845_243952_245961_246135_256211_256296_258447_258554_260494
527388	contig_7151_pilon	-	2121	12	Intergenic	novelGene_40649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	149.911048005307	8	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	778	2016	12708	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	18279	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13373_13676_13782_13974_18093
527389	contig_15407_pilon	+	1619	9	Intergenic	novelGene_123066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	569.241985011647	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	330	1076	449761	468221	TRUE	30	TTATGCACAGTGTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDNQNFLMLALKQI	449431	470714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468182_468308_470257
527390	contig_6050_pilon	-	2888	8	Intergenic	novelGene_123120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	54.557215800647	598	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	300	1844	394250	377305	FALSE	5	CATTGTTGTTGTTTCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGAAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSGLIAQLEEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSSP	394549	376260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377904_379934_379962_381537_381571_381701_381818_382659_382683_389461_389693_392504_392601_393830
527391	contig_1735_pilon	+	1746	9	Intergenic	novelGene_106884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	648.593622771609	960	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	95	1507	126256	137692	TRUE	10	CAACCTGTCCGGCTCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGKQRSYVGNSSHSV	126161	139775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137649_137778_139169_139202_139653
527392	contig_13211_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_123139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157984	156813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_156800_158000
527393	contig_13481_pilon	+	1830	6	Intergenic	novelGene_119558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	526.909631720659	1563	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	92	742	1568681	1586220	TRUE	40	AATAAACAGTTTTAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGARVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568589	1587809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080_1586383_1586883
527394	contig_2069_pilon	+	687	3	Intergenic	novelGene_23476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACAGACCGACAGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508362	1509823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
527395	contig_2940_pilon	-	2797	1	Intergenic	novelGene_82010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359423	1356626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1356600_1359400
527396	contig_2834_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_28010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTAATACATAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282349	282905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_282300_282900
527397	contig_4426_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_15339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	518	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	252	584	6677	7009	NA	40	CTGTACTAACAAGAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRVNYIPHRSEYKSEPSHLEVSSLSSLPHVSIAEQRGRARQQELGFSYHMPWSLIFEENLSRPHLPQKINSVFSAAQAPNCWLKVSFRSSTFYSLQGNVIFSILVYHF	6425	8132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_6400_8100
527398	contig_15063_pilon	+	949	4	Intergenic	novelGene_8757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	244	948	34808	36084	FALSE	30	AAACGTTCACATGCACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESG	27125	36085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
527400	contig_5499_pilon	+	1948	12	Intergenic	novelGene_56999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	285.551546923516	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	137	667	816585	834902	TRUE	15	TTTCTTATCATTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKSHCPKSHG	803388	841027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803448_809594_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831347_834874_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
527401	contig_11989_pilon	+	2660	21	Intergenic	novelGene_68435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	483	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1578	1931	56477	71242	TRUE	15	GCCTAAGGTTCAGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNRSGCAKKSAYISKRDLLSRINVGRTTLVRSIPSLTWDNRCMITLLCSSTDPASPSSSLSSWESKRSASLVPLDMEELSDSVVSGRFRLFPELLCVKTEADPEESIKCFGDEPL	45611	107183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_46312_46598_46734_48158_48243_49058_49146_53542_53683_53801_53869_54143_54253_54940_55028_56308_56480_59328_59412_65758_65881_65998_66112_71209_71369_74968_75075_76359_76451_80408_80447_90225_90278_91047_91080_92005_92052_92290_92386_107040
527402	contig_15304_pilon	-	992	4	Intergenic	novelGene_30549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1490.4765084436	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	198	821	54100	53061	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPG	54297	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53066_53130_53320_53491_53813_53991
527404	contig_4232_pilon	+	1061	4	Intergenic	novelGene_63188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	411	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	82	582	146362	149200	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146280	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
527405	contig_3956_pilon	+	1483	10	Intergenic	novelGene_14860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1346.98289283133	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	84	1481	1281682	1291009	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKAGSCVWCHREHLQLCQCHWNNKFGMVV	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286574_1290925
527406	contig_16148_pilon	-	2820	12	Intergenic	novelGene_50351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	382.745540483923	2	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1292	2434	89222	59018	FALSE	20	GTTTTGCTTGCAGAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALILVLGVLMEVNQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153100	58631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_88919_89181_89311_111370_111491_150789_151734_152961
527407	contig_15047_pilon	+	1342	6	Intergenic	novelGene_52201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3018.18760185645	20	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	196	471	3242	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2727_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21168
527408	contig_7179_pilon	+	2186	7	Intergenic	novelGene_78059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	281.051843774221	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	903	1646	396316	402057	FALSE	15	TAAGTCTGTGTTCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGMFKKVNARERIVGWYHTGPKLHKNDIAINELMKRYCPNSVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392258	402597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_393004_395399_395492_396250_396344_397029_397128_397713_397795_400662_400755_401612
527410	contig_6710_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_94244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653644	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
527413	contig_12352_pilon	+	2512	7	Intergenic	novelGene_57457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	224.922764521513	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	102	452	238274	268138	TRUE	20	AGTTGCTTGTTTAGAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVGEGCWRPRADQCASVPSPRAFPRVPAQIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLIW	230015	286650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_238264_238420_245181_245240_247436_247575_268129_268198_277208_277302_284742
527414	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_9932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527416	contig_15087_pilon	-	2611	19	Intergenic	novelGene_37147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.591174736168	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	561	1925	66689	38999	TRUE	20	CAGCATTCCATGACTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89775	33329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33785_33922_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_75535_75668_89687
527417	contig_8558_pilon	+	3742	11	Intergenic	novelGene_123171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_7	13.1030530793399	217	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	247	1485	1140028	1149980	FALSE	35	AGATATAATTTGTAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAARFVMRSVGSLSGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFVFLRQELPVRLANILKEIDILPDQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPEDQKTLSDFVDAVVKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQTGNPTHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLTSPELKLTQVNGKFPGQPIHIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENWPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNARNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAVIYLKALSSESIEKLPVFNKSAYKHYQMSTEADDWCIPSKEPKNLAKAKVAV	1139781	1152237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_1140158_1141186_1141329_1142713_1142786_1143530_1143716_1143882_1143970_1144391_1144470_1145995_1146073_1147860_1147960_1148156_1148268_1148579_1148694_1149836
527418	contig_15720_pilon	-	1515	7	Intergenic	novelGene_41894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1222.71111560426	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	104	787	283894	280223	TRUE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKVFRCQESPQYSRKNT	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
527419	SIRV6	+	514	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737
527420	contig_5954_pilon	-	1783	10	Intergenic	novelGene_28692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	467.515893966303	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	767	1477	947127	945083	FALSE	15	TTTGGCTTTTTATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960574	944776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948137_959810_959941_960474
527421	contig_20641_pilon	+	1591	7	Intergenic	novelGene_52841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.95796700601	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	58	1302	14599	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAAQKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14541	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14633_16778_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
527424	contig_2646_pilon	+	1917	9	Intergenic	novelGene_69516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.855919421648	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	351	917	566553	573396	FALSE	30	AGAAAACTCGCTGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554004	574396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554137_565301_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
527425	contig_18637_pilon	+	2248	8	Intergenic	novelGene_81843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	102.379844955251	732	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	252	1046	148247	177073	FALSE	60	AAAAAAAAAAGAACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGLPSSQLWRPPGSRHGWPFSRGPGPCVPSLPPCLRPLERRDQGCVSGLPRRPGIWGATENIKTPRSERLIRRKTLPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDFCTEWPAALDSDEKCEKHFPIEVDTADYVLAGPSIRNPKARVVTLRVKLSSLNLDDHAKKKLIKLVGERYCKTTDVLTIKTDRCPLKRQNYDYAVYLLTVLYHESWKTEEWEKNKTEADMEEYVWKNSSSEKNILETLRKIKAAEKNMEVNKEEFLGTKEVEDYKKSVVSLKNEGENENTISQYKESVKRLLNLA	141634	178275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141809_147071_147125_148222_148391_149544_149606_153201_153342_160263_160374_161804_161875_176803
527426	contig_3077_pilon	+	1185	7	Intergenic	novelGene_26758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	25	junction_6	3845.37595330056	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	106	687	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	11409	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16196_17449
527427	SIRV6	+	823	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	7	258	0	105	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATAGTAGATTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	11073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
527428	contig_5643_pilon	+	1754	13	Intergenic	novelGene_38998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	803.962525902517	26	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1156	1542	640257	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631118	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636243_640236_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
527430	contig_5041_pilon	+	3422	1	Intergenic	novelGene_27083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAACCACTGCATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533926	537348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_533900_537300
527432	contig_13894_pilon	-	1756	3	Intergenic	novelGene_62040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	5147	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	618	1676	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288657	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
527435	contig_13097_pilon	+	2094	17	Intergenic	novelGene_107702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_11	512.822825155043	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	205	1251	184733	227141	TRUE	40	GAATATGAATGAGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQELLPPTFHLLHFFHLLQLSVLLHL	184528	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_227066_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
527438	contig_7057_pilon	+	3164	3	Intergenic	novelGene_123398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	437	1495	1277966	1279199	FALSE	20	ACATTTGGAGTTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENLQPESDFQHVQIHTVEKLYLYNACGKTFSLKQNLIDHEKMHTGEKSHECTECGKVFSRISSLTQHLRSHRGKKTYKCNKCGKAFSQKGNFLSHQKHHIAEKSYECGKASIQMASLIRHQRNYTGKPCVCKECGKTFNGKSYLSEHEKIHTGEKPFECNQCGRAFSQKQYLIKHQNIHSGKKPFECNECGKAFIQKSSLIRHQRSHTGEKPYTCRECGKAFSGKSNLTEHEKIHIGEKPYKCNECGTIFRQKQYLIKHHNIHTGEKPYECNKCGKAFSRITSLIVHVRIHTGDKPYECKICGKAFCQSSSLTVHMRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHMRIHTAL	1277529	1280868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1278540_1278623_1279101_1279191
527439	contig_5862_pilon	-	4181	5	Intergenic	novelGene_54959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	96.2418827746008	304	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	181	1254	221542	202458	FALSE	50	CATCTTAGACATAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFRRRTCIILSLFILFIFLLMMGLKALRPNTATFGDPFGLDLLPEFRQQIFHLEKKTDSKKSDKINSETNPKNLKSVEITMKPAKPSELNLEELPPLNYYLHVFYYSWYGNPQFDGKYIHWNHPVLEHWDPRIAKNYPQGRHNPPEDIGSSFYPELGSYSSRDPSVIETHMRQMCSASIGVLALSWYPPDSKDENGEPTDDLVPTILDKAHKYNLKVTFHIEPYSNRDDENMYKNVKYIIDNVGPGYIDTSIRPWNTHNTRNRVNGKYYETALSAALQTRPSLISVTSFNEWHEGTQIEKAVPKRTSSTVYLDYRPHKPGLYLELTRKWSEKYSKERATYASDHQSPGLNALIKV	235295	199530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_202801_203982_204060_215899_216010_220998_221578_235150
527441	contig_8978_pilon	-	1535	8	Intergenic	novelGene_49326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	878.855494146698	347	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	27	560	194082	192962	TRUE	45	AAGCAAAAGAATGTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGQGNDHTRTHISSNPLGSGKFNTSPPE	194108	190422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193045_193215_193398_193613_193768_193967
527442	contig_12074_pilon	-	1929	14	Intergenic	novelGene_53741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	465.24196160733	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	740	1273	34934	32681	TRUE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKACWRVPGSDLHQSHVHL	45838	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32732_33151_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36005_36099_36287_36721_36736_39998_40171_41067_41228_45769
527443	contig_5954_pilon	-	2018	14	Intergenic	novelGene_28711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	198.831765585676	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	102	1613	975610	962496	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSRPLLVGSRRRRVRLGTRSGRVRFNGVPGRAMEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975711	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963128_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
527444	contig_13457_pilon	+	1835	12	Intergenic	novelGene_118346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_8	56.0519239796297	85	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	142	885	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59269	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
527445	contig_3463_pilon	-	2565	15	Intergenic	novelGene_62000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	194.546725933459	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	112	1041	565112	522688	TRUE	10	GCTCTCCTCACTGCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEVARVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSRNDWPLNIYQGSRDRPRNGTPCIRK	597462	507713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522765_524044_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_565091_565150_597388
527446	contig_1719_pilon	-	2459	9	Intergenic	novelGene_87298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	433	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGGGCTTGCCGCCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427575	406736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_406829_408913_409114_411264_411349_415050_415197_416226_416338_417985_418095_421982_422083_424042_424138_426053
527447	contig_11176_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_123441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATATTTTTTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58795	57940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_57900_58800
527448	contig_3095_pilon	-	1306	6	Intergenic	novelGene_75224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1340.26764491276	8	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255546	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247693_247970_248476_248759_253535_253694_253733_253806_255384
527449	contig_12671_pilon	+	1750	8	Intergenic	novelGene_19220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	471.910316626767	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	65	823	197316	214433	FALSE	15	AAATGTGCTTTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDDVPTNFGHRRSVKEEFPWPNMFGKLTFLMELDYVHQHTKA	197251	215360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_214310
527450	contig_5988_pilon	-	1560	5	Intergenic	novelGene_15934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	96	866	655459	652482	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLHPLPSGHIRPRHLC	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652528_652592_652943_653272_653422_653549_653773_655456
527451	SIRV2	+	469	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-109	163	-109	-163	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCTATAAATACCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
527453	contig_854_pilon	-	2712	13	Intergenic	novelGene_36177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.262643982787	1	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	53	1063	509201	471696	FALSE	45	GAATAAAGCTCATGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQFPHL	509253	470046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471711_473702_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
527454	contig_4908_pilon	+	2354	9	Intergenic	novelGene_117371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	104.427008000804	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	17	853	43788	60051	TRUE	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRSLAVSFAVLVVLLWGAPRSHGRRSDVRVITDGNWKELLEGEWMIEFYAPWCPACQNLQPEWESFAEWGEDLEVNVAKVDVTEQPGLSGRFIITALPTIYHCKNGEFRRYQGPRTKKDFINFISEKEWKNIEPVSSWFGPGSILMSSMSALFQLSMWIRTCHNYFIEDLGLPVWGSYTVFALATLLSGLLLGLCMIFVADCLCPSKRRRPQPYPSKKLLPESSQPLKKVEEEQETDEGDVSEEEAESEAGTKSGFSENALRQRSVGPSPRMEES	43771	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_43940_48113_48230_49589_49636_51352_51482_53578_53625_53724_53827_53950_54018_59872_60588_60665
527455	contig_10235_pilon	+	2167	6	Intergenic	novelGene_46420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.674254072394	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	26	547	210483	211834	TRUE	45	GTACATGAGTGAATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPHHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSLSPSLSSVPPT	210457	213679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211797_211924_212047_212317_212417
527456	SIRV6	+	945	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	418	729	2021	10736	TRUE	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527457	contig_8317_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_19864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACCCATTAAAACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
527459	contig_5485_pilon	-	2807	17	Intergenic	novelGene_37762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	70.1763125545223	447	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	140	2383	586595	527702	TRUE	30	ATGAAATTCATGGGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPQLTTAPVPPASSSQSSQVPEKPRPALLPTPVSFGSAPPSTYRPPMQSAIGPSEQVNSKAPLNKSTPSYSSFSSEQGLGESSAAVKDMPVRSGGLLPDPPRSSYLEGPRGPREQKEQLQKMKDFGSEPQMPDHPPPQESSRLQNTASRPGMYPPPGPYRPPPPMGKPPGSIVRPSAPPARSSVPVSRPPVPIPPPPPPPPPPPPPPVIKPQTSGVEQERWDEDSFYGLWDTNDDQGLNSEFKSENAAIPSGPVLPLPPVHPSIPPPGPMPMGMPPMSKPPPVQQTVDYGHGRDISTNKVEQIPYGERITLRPDPIPERPTFETEHTGQRDRYDRDRDREPYFDRQSNIMTDHRDFKRDRETHRDRDRDRGVIDYDRDRFDRDRRPRDDRTQSYRDKKDHSSSRRGGFDRPSYDRKSDRPAYEGPSMFGGERRTYPEERMSLPAPSLSHQPPPASRVEKKPESKNVDDILKPPGRESRPERIVVIMRGLPGSGKTHVAKLIRDKEVEFGGPAPRVLSLDDYFITEVEKEEKDPDSGKKVKKKVMEYEYEAEMEETYRTSMFKTFKKTLDDGFFPFIILDAINDRVRHFDQFWSAAKTKGFEVYLAEMSTDNQTCGKRNIHGRKLKEINKMADHWETAPRHMMRLDIRSLLQDAAIEEVEMEDFDANIEEQKEEKKDAEEEESELGYIPKSKWEMDTSEAKLDKLDGLRTGTKRKRDWEAIASRMEDYLQLPDDYDTRASEPGKKRVRWADLEEKKDADRKRAIGFVVGQTDWEKITDESGHLAEKALNRTKYI	586734	526959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_527348_527665_527849_538950_539082_544036_544089_547271_547353_549453_549538_549824_549909_549995_550173_550407_550528_550816_550880_551430_551586_552478_552598_553081_553278_553493_553587_553698_554117_557588_557713_586395
527460	contig_15720_pilon	-	1501	7	Intergenic	novelGene_41872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1103.38398675267	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	104	1075	283894	278921	FALSE	15	TGGAAGTGTCTTTCTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQVSGSSQVDSASTISALGVIYQSQNHCL	283997	278494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
527462	contig_1719_pilon	+	2412	10	Intergenic	novelGene_87299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	48.438072975504	185	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	376	1116	415052	426233	TRUE	5	CATCTTGTTCTCCGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAAAPEDGCDRGGGHSADARSRAHRDHLSTIEKDTNGEVLWVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRILCRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLEVSNRPDLYDVFVNLADSEITIAPLAKETMTMGKLHKEIGQLIVQSAEDPEKSESQVIKDISLKTRELLTNLASFAEVSDGGQRPALSLETLKQKRFPPATENFLYHLAAAEHMLKI	406756	427575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898_409116_411266_411347_415050_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422086_424045_424141_426056_426574_426619
527463	contig_15434_pilon	+	1918	7	Intergenic	novelGene_56696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	303.496110170936	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	56	901	26904	32387	TRUE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSVAHLARANPFNAPHLQLVHDGLSDPRSSPAGPPGLPRRSRNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIGMNYLERSCL	26609	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_33064_33141
527464	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
527466	contig_5153_pilon	+	1756	13	Intergenic	novelGene_74401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	285.700929003273	39	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	155	1036	1011783	1022174	FALSE	15	GAATTTTTTCCTGGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	1005555	1022894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1005581_1007792_1007844_1011704_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
527467	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	69	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527469	SIRV6	-	438	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1542_1647_1736_1847
527470	contig_13894_pilon	-	1656	4	Intergenic	novelGene_62058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	593	1588	287445	286290	FALSE	30	GTAGTGAAAGTACTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDRGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288632	286221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286631_286693_287123_287219_287538_288132
527472	contig_10023_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_123491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCTGCAGTACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214431	213345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_213300_214400
527473	contig_11338_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_6205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	124	423	8916	12052	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRDRLAAATAAFAHAENDPSSPTSLLPPPSHLCHSAPRRGVWGATAVVWHRTTEQQPGQVEPLPAASLCSTLAALASSQDGDMSWPRAPAWVQVLGTD	8792	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8924_11760
527474	contig_13740_pilon	-	1676	10	Intergenic	novelGene_34679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_3	4007.63692572008	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	251	1156	165243	157474	TRUE	30	ATTGTGTAATTATAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165493	156800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
527475	contig_12301_pilon	-	1913	8	Intergenic	novelGene_110019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	256.061615671713	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	41	1039	136698	102891	FALSE	15	ATTTGTGTCATTTCAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNELSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136738	102016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_115790_115929_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
527476	contig_19899_pilon	-	2287	7	Intergenic	novelGene_102515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	8	junction_5	78.8234666129883	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	812	1234	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156649	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_144792_145008_145554_156555
527478	contig_10011_pilon	+	2977	10	Intergenic	novelGene_68088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	113.706683517475	3	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	62	1999	322928	333006	TRUE	15	ATTAGTGTGGCTGGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQCLVSRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFKAYVRKWRCSRFQQ	322866	334176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_332098_332225_332413_332447_332994_333045_333190_333519_333564
527479	contig_6102_pilon	+	1800	11	Intergenic	novelGene_32279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	58.7996598629618	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	17	931	1445549	1447881	TRUE	20	TTTAGAAGGGGAGTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSDFPEVMWNTAEGDTKSPRGVQASQLPLLSLFLALFSSA	1445532	1449214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447573_1447778_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
527480	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
527482	contig_15304_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_30550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
527483	contig_6418_pilon	+	2001	12	Intergenic	novelGene_81213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_10	219.310602789441	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	328	1548	1375762	1441289	TRUE	15	GTCTGTCACTTTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNST	1341103	1444785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441348_1441958_1442066_1444497
527485	contig_16098_pilon	-	2778	15	Intergenic	novelGene_46178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_8	39.3912867191179	282	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	1304	2731	580184	571362	FALSE	5	CCTTTTTTTGTTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCGRRSCLLEWRNCSTRDKTPWPTGVRRQQLRSLSRQPPRNKTRVVSYRVPHNAAVQVYDYREKRARVVFGPELVSLGPEEQFTVLSLSAGRPKRPHSRRALCLLLGPDFFTDVITIETADHARLQLQLAYNWHFELSDRKDPQETAKLFSVPDFVGDACKAIASRVRGAVASVTFDDFHKNSARIIRTAVFGFETLDGKDLPQPRDRAVFPQNGLVVSSVDVQSVEPVDQRTRDALQRSVQLAIEITTNSQEAAAKHEAQRLEQEARGRLERQKILDQSEAERARRELLELEALSTAVESTGTAKAEAESRAEAARIEGEGSVLQAKLKAEALAIETEAELQRVRKVRELELVYAQAQLELEVSRAQQLGELEIKKFQQMTEALGPSTIRDLAVAGPEMQVKLLQSLGLKSTLITDGSTPINLFNTALGLLGAGPEVHPPAKKVAGGPSSQEGLLLQCPPNPQALGSAHIVP	604716	571314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_571581_572284_572474_576722_576850_577020_577138_577955_578328_579649_579848_579978_580225_581314_581597_582984_583222_583531_583627_584653_584786_584897_585022_590355_590552_590792_590931_604657
527488	contig_19459_pilon	-	1027	7	Intergenic	novelGene_59865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_5	8098.19448498656	1047	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	106	693	16240	7003	FALSE	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19069	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_16203_16265_18988
527490	contig_18272_pilon	-	2168	4	Intergenic	novelGene_6987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	310.582606653295	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	182	706	262678	122209	FALSE	30	GAAATGATGACACTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262859	120746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122434_172725_172796_184338_184551_262660
527491	contig_1450_pilon	+	2190	3	Intergenic	novelGene_27430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	117	1244	419840	424140	FALSE	35	GAAACCATGATGGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISEGEARWTMRDLILVLKFPSLYVTSFKRQQKNERKAKRKG	419723	425086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423245_424020
527492	contig_7898_pilon	-	1098	8	Intergenic	novelGene_47520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	71	1027	285587	282118	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286096	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
527493	contig_10323_pilon	+	2831	1	Intergenic	novelGene_123640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	763	1077	523882	524196	NA	35	TATGTATATTTTCACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTNRSLFSHGLEVQIQGARSRGRLSLLALEEGPCHQSFPGLRASLRRNPRSKGHALLLELLSWWYEVLLSLCLLLSFISQKTSAQDTVQSCRLSPTSLTSQR	523119	525950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_523100_526000
527494	contig_14513_pilon	-	1300	4	Intergenic	novelGene_70256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	121	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
527497	SIRV6	-	1019	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8770	451	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGCTTGATGGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11317	1093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
527498	contig_10734_pilon	-	2208	13	Intergenic	novelGene_51509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	646.759932063066	1	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	146	928	2305085	2274490	TRUE	50	AAAGGAAGCAACACTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQPFSLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQVGWNYGY	2305230	2265314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270952_2271048_2274372_2274510_2275750_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285197_2286277_2286447_2304960
527501	contig_1244_pilon	-	1814	12	Intergenic	novelGene_38025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1175.42552871448	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	76	1428	948448	923211	FALSE	20	ATTGTCTTCCCTCTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVRDDVEISRPRESCLWGVELVVERKEPGMAHHSCQEETKKLAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948523	922824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924712_927036_927227_928758_928894_931617_931653_933736_933856_946434_946620_947578_947655_948440
527502	contig_15897_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_49532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTAACTCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560560	559426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_559400_560600
527503	contig_4519_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_123645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTATGGAGTCCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6096	6851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_6100_6900
527504	contig_14441_pilon	+	1917	7	Intergenic	novelGene_100461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	353.610268830279	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1307	1735	116728	117610	FALSE	15	CTGCCTACGAGTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	85402	117792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_87050_87795_92403_92708_113670_113711_116578_116963_117220_117344_117539
527506	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	10	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
527507	contig_20614_pilon	+	2239	13	Intergenic	novelGene_107575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_12	49.382576774495	319	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	188	2026	245101	286402	FALSE	15	CTACATGCGGTTCTTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGWESYYKNEGDEEEEEQHEGPEAGGEYKYSGRDSLIFLVDASRAMFESQNEGDENELTPFEMSIECILSVYTNKIISSDRDLLAVVFYGTKKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRVLELDRFKGQLGKKHFQDLIGCGSDYSLSEALWVCANLFSDVQFKMSHKRIMLFTNEDDPHGNDSAKASRARTKAADLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISVAEDEDIGVHFEESSKLEDLLRKVRAKESKKRALGRLKFKLSKDVALTVGIYNLVQKAFRPPPVRLYRETNEPVKTKTRTFNVNDGSLLLPSDTKRSQSYGSRQIVLEKEETVQLKRFDEPGLILVGFKPLIMLKKHHYLRPPLFVYPEESVVNGSTALFSALLTKCLEKEVMAVCRYTPRHNSPPYFVTLVPQEEELDDQKVQVTPPGFQLIFLPYADDKRKVPFTEKVLANPEQVDKMKAIVQKLRFSYRSDSFENPVLQQHFRNLEALALDLMEPEQAVDLTLPKVEAMDKRLGSLVDEFKELVYPPDYNPQGKTTKRKQDDEDSRNKRPKVEVSEEELKAHVNKGTLGKLTVPMLKEACRVYGLKGGMKKQELLDALTRHFQEG	244293	286615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_244466_245085_245180_251570_251693_255565_255705_255999_256255_256970_257155_264970_265158_275659_275829_276570_276733_278158_278289_281316_281418_284640_284755_286205
527508	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_12966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28172	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527509	contig_9727_pilon	+	2523	4	Intergenic	novelGene_86306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	159.41629639267	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACACCAGACTGACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308419	314655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_311014_312912_312991_314078
527511	contig_12140_pilon	-	1212	9	Intergenic	novelGene_86519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_6	53.1105862799499	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	4	1212	84789	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMEATGTDDVDKLKTKFISAWNNMKYSWVLKTKTYFSRNSPVLLLGKCYHFKYEDENEMLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRAWTWPDALNIENSDSESWTSHTVKKFTASFEGSLSGESELKTPSISLKKMVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84792	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_45850_46085_64263_64348_84713
527512	contig_10246_pilon	+	2147	9	Intergenic	novelGene_46892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	175.556926308819	5	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	92	640	144696	171249	TRUE	40	CTCCCAAAAGAAATTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGIY	140708	185770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169787_171242_171293_175054_175149_183514_183619_184504
527513	contig_16650_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_61970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.76438020109	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	82	459	244670	254361	TRUE	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244588	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186_255350_255901
527516	SIRV4	+	486	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	27	437	27	-437	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCCAATTGCTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	2334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
527517	contig_5549_pilon	+	1061	5	Intergenic	novelGene_81575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1335.25334674735	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	62	499	82155	91873	TRUE	20	AATTTTCTTGGGATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVSLRNVLYGLRD	82093	96919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91950_93224_93412_96620
527518	contig_6829_pilon	+	2284	7	Intergenic	novelGene_123759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	61.970423052722	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	840	1502	54432	59222	FALSE	15	TGTCATCTATTTTTACTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLFAMYCLLLFYKVLKEELSPIQPVGKFLCVKLVVFVSFWQAVVIALLVKVGVISEKHTWEWQTVEAVATGLQDFIICIEMFLAAIAHHYTFSYKPYVQEAEEGSCFDSFLAMWDVSDIRDDISEQVRHVGRTVMGHPRKKFFPEDQDQNEHTSLLSSSSQDAISVASSMPPSPMGHYQGFGHTVTPQTTPTAATIPDEMFNDTTGEKKELSDKFVAS	18185	60004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18868_52898_52974_54349_54444_56463_56577_57944_58045_58565_58738_58956
527519	contig_10042_pilon	+	1883	11	Intergenic	novelGene_79204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	80.7093550959243	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	96	878	1054190	1090129	FALSE	15	GGTATATTCTTTTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028995	1091134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
527520	contig_3721_pilon	+	3341	11	Intergenic	novelGene_123794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_1	197.917760698731	51	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	230	1669	63865	102235	FALSE	35	GGAGACTTTCACAAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSPWRQSRREVRFSEEPPEVYGDFEPRVAKERSPAGRRTSPGEFRLDSATEEVKASAYYLRSRQRRQPRPQEATEMKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSDSSYKTNGNSKMSELEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTAGKFRSGDSVESGDQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63635	103907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81608_81696_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
527521	contig_3721_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_123810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTTGATTTTCATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103856	104584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_103900_104600
527522	contig_3602_pilon	-	1563	11	Intergenic	novelGene_60641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	288.596413699131	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	136	765	1123679	1107817	TRUE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKAGSDPCLPFPCRSC	1139378	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107862_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
527523	contig_18184_pilon	-	3579	5	Intergenic	novelGene_123887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	6.51920240520265	126	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	282	2267	633712	608277	FALSE	25	TCACATCCATCTATTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQDDKPSGPLKACAQDSFHPQEIIIKVEGEDTGSLAISSQERVNFKIVTVVYTQEEQGTLNSAQKILDRDVMLENHRDLVSWDLATAHDRRESVSKLSTFDEEPSHGVKIERLARGDPWLSSCGEIRDCKDQLEKQQEKQERLLKELAFTQRKAVIYEKVCKSDELEDKSGLNSSLLSSQAIPTRNHFHKHASHVKKLNRNSVVNNHHKVDDSEKLCENNECRNLPQSTHLIQLTRTQTEDKFYEFGDNIQSTPLNIHEKIHVEGKTFDFKECGEVLNHSISHNEQQRISFEESQYKRSKTSQSSSPAQNMRNHSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECNECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECNECGKSFNRSSHLVMHQRTHTGEKPYKCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPYECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCNQCGKAFINSSKLIRHQATHTEEKPYECN	638063	606964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_610010_611335_611463_619541_619617_633661_633752_637821
527524	contig_1516_pilon	+	2144	10	Intergenic	novelGene_50008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1136.95064335797	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	54	1508	347304	363092	FALSE	15	AAGCACCTGTTTCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVIFLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	347250	363728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356163_356439_356526_359957_360125_362116_362299_362985
527525	contig_14513_pilon	-	2674	3	Intergenic	novelGene_70327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1467.5	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15789	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_14504_15400
527526	contig_15384_pilon	+	2757	10	Intergenic	novelGene_85124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_1	28.1955254308372	240	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	650	1210	83786	84679	FALSE	30	CGCGTAAAAGATGCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYILSPAVLQRIQLQPTSIEKEVFPVMAKEGQLYAMELQGFWMDIGQPKDFLTGMCLFLQSLRQKQPERLCSGPGIVGNVLVDPSARIGQNCSIGPNVSLGPGVVVEDGVCIRRCTVLRDAHIRSHSWLESCIVGWRCRVGQWVRMENVTVLGEDVIVNDELYLNGASVLPHKSIGESVPEPRIIM	82476	86226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_82598_82707_82842_82959_83041_83130_83180_83318_83463_83665_83825_83909_83989_84061_84190_84280_84464_84547
527527	contig_11681_pilon	+	2872	4	Intergenic	novelGene_102965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	40.4722126896961	489	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	331	2697	163570	165936	FALSE	30	TGAAATGATATGTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	111109	166111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_111175_114794_114910_161361_161445_163502
527528	contig_10937_pilon	+	3275	4	Intergenic	novelGene_67336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	15.8394724940223	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1953	2387	183633	184067	TRUE	50	ACTCGATCGAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCSRPGKALLGTISNRPRWEEKECGHPCPGRPLLLPVSLGWEGQHHILLNGCGFQLTQISVSSKQVQLLSALGLGGPPVGRRVPVSSCFCTSDECPLFQTVFQGCLYCNLRACLSPEQKADTLFVCCGRFRFPVQEPWWHKG	180603	185944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181497_181654_181931_184669_185657
527529	contig_15063_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_10251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	45	GTATGTTTATAAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527531	contig_5018_pilon	-	1581	8	Intergenic	novelGene_47074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	575.486803692743	33	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	67	720	1402792	1400631	TRUE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKITKASGSTRRSTTLSTPLMLTSTPMTALQCWA	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400730_1401199_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
527532	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	108	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527534	contig_854_pilon	+	1785	15	Intergenic	novelGene_36451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	454.094141996919	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	956	1660	1460156	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451234	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458453_1459084_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
527535	contig_5033_pilon	-	2160	14	Intergenic	novelGene_29034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4115.03344439881	3	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	785	1399	535015	532125	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531172_531549_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536595_540597_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545271_545312_566747
527536	contig_12644_pilon	+	1787	8	Intergenic	novelGene_44664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	5201.47719206687	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1215	1643	2679113	2680331	FALSE	40	GAAGCCAGCACCTGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPESPEEEPTEKPENHVEAQPICKDHAPEHHSSTGQESQTQGG	2675486	2680475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678194_2678720_2679204_2679507_2679665_2679878_2679937_2680125_2680229_2680311
527537	contig_10609_pilon	+	2662	10	Intergenic	novelGene_123898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	366	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	2334	2660	154009	162134	FALSE	25	AATCAGCGCGGATGGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKRPKAAKESANKACICASSLPTWRISFSGMNRLGPCPSGRGILIPSTSSWSRPPPHCLQPSSSETASEAVYASFAAVARRMSARRRLRTLTGGRRWQPAAAPSCSV	141826	162136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_143017_143667_143817_145175_145364_147953_148068_150758_150900_151552_151802_153081_153265_153889_154094_154882_154943_161952
527538	contig_3386_pilon	-	1738	8	Intergenic	novelGene_34519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	810.004006036957	45	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	422	1120	407739	404773	FALSE	25	GTTTAACTTCAAAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVAESPSCLFSPPSESALASQLAPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412211	404154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406692_406781_406842_407702_407838_409398_409607_412096
527541	contig_14341_pilon	+	2383	8	Intergenic	novelGene_111769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	49.7618819776662	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	87	1973	299952	328668	FALSE	15	AGAATCTGTGTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSEERIVSGLPKAWSGEPVTFEDVTLGFTPEEWELLDPMQKTLYREVMLENYRNLVSVEHQLSKPDVVSQLEEAEELWLKEREIPQDTFPECPVAQLDPQEDPFPDGKRGSRPLRKMEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	299410	329078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_299457_299911_300006_300969_301097_301864_301961_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327865
527542	contig_5686_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_45496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCAAACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265852	263758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_263800_265900
527543	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
527544	contig_10135_pilon	-	2160	9	Intergenic	novelGene_106612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	39.4873397432645	605	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	466	1656	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89576	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88142_88500_88681_88920_89057_89502
527545	contig_3386_pilon	+	2350	11	Intergenic	novelGene_34567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	720.10319399375	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	217	1260	488148	508362	FALSE	35	CCCCCAACTTTAACTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVVLTRNGCLVPIPDPVTRSFFSCRPLQPPGLRLFSRRDRWRDRRLGCPQPCLPGDLVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEQERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470131	509452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506629_507645_507741_508231
527548	contig_15063_pilon	+	1455	4	Intergenic	novelGene_14166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	141	1313	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34667	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527550	contig_5033_pilon	-	2149	14	Intergenic	novelGene_29036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3822.89359876202	5	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	67	1470	545288	532045	TRUE	15	AGACCTGGGCCTGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSCRALQTSCVELEGMFHPGETAASFPTSVAGGMNAHIC	547581	530986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531163_531541_532161_533423_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
527551	SIRV6	+	401	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8803	164	-12	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
527552	contig_5690_pilon	+	2089	10	Intergenic	novelGene_119719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_1	396.317493375646	2710	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	49	726	1044729	1087811	TRUE	20	GAAATTTCACGTGTTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEISFVV	1044680	1105968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
527553	contig_10058_pilon	+	1790	11	Intergenic	novelGene_67685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_1	84.1370310861989	1063	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	356	1111	51319	53244	FALSE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48209	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
527554	contig_15304_pilon	-	1305	5	Intergenic	novelGene_30422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	1542.3119820581	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	198	1121	54100	49917	TRUE	30	GCCAAACTTTCTCAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGLPVLQIGKSLAHGWCWTCHRTAWRRRHKGLACGQPLSLCSHSSCSASSTAQH	54297	49408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50078_52986_53320_53491_53813_53991
527555	SIRV6	+	642	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-11	276	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGCCCTGGTACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	2816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2627_2743
527556	contig_5649_pilon	-	1573	3	Intergenic	novelGene_82363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	26.5	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	305	643	1057385	1056259	FALSE	15	CTTCATGCGTCATCGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFFYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN	1057689	1055328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266
527557	contig_14101_pilon	+	2303	5	Intergenic	novelGene_122764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	46.6442654567526	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	73	1227	260068	273778	TRUE	20	AAATCCCCTGTGTGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257227	274940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264833_273610_273840_273925
527558	contig_10904_pilon	+	2546	7	Intergenic	novelGene_22517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCACCTCAGAATCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346014	354772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_347435_348716_348866_349530_349624_349922_350113_351954_352142_353959_354254_354559
527561	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_12389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	106	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527562	contig_3382_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_124051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGCCACTCACAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223393	224406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_223400_224400
527563	contig_8772_pilon	-	1130	8	Intergenic	novelGene_21125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAACAGTTGCACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23397	16549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
527564	contig_15063_pilon	+	1509	4	Intergenic	novelGene_13874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	199	1374	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34609	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527565	contig_4364_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_2706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAAATAAAGTGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532957	1533290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
527566	contig_7356_pilon	-	1769	5	Intergenic	novelGene_60387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	776.30032043018	23	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	68	385	457848	433924	TRUE	20	AAAATTGCTTTTTCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457915	432498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_433570_433610_434048_435563_435623_437474_437529_457767
527568	contig_10923_pilon	-	1453	7	Intergenic	novelGene_66217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGAGTAGAGACGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42820	29346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_29572_30133_30317_32868_33050_36531_36697_37269_37539_38577_38741_42553
527569	contig_1230_pilon	+	2222	9	Intergenic	novelGene_28844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1368.4473809303	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	73	1215	405241	407185	TRUE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGSHLIWRQI	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406926_407156_407352_407603_407788_408003_408237_408568
527571	contig_1443_pilon	-	1849	9	Intergenic	novelGene_28325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	593.075235003958	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	896	1570	804494	748649	FALSE	30	TTTTATCAACTGTCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVFIFVFPDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809519	748369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767584_804491_805224_808694_808741_809399
527572	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527573	contig_9243_pilon	-	2075	9	Intergenic	novelGene_60312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	257.642406010734	47	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	14	604	64617	27300	TRUE	40	TGAATTGTATAGATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQV	64630	18775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21238_27290_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
527575	contig_8357_pilon	-	2294	16	Intergenic	novelGene_39744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_15	298.779442993583	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	394	1644	795947	762891	FALSE	25	AAACTTTATCTTGATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818368	762240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_818245
527576	contig_3130_pilon	-	3675	14	Intergenic	novelGene_103583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	309.611801221499	554	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	63	1577	202529	175763	FALSE	5	GTTTTGTGTCTCGATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWWRRLRRRQQERILGLSLTMPTVEELYRNYGILADATEQVGQHKDSYQVILDGVKGGTKEKRLAAQFIPKFFKHFPELADSAINAQLDLCEDEDVSIRRQAIKELPQFATGENLPRVADILTQLLQTDDSAEFNLVNNALLSIFKMDAKGTLGGLFSQILQGEDIVRERAIKFLSTKLKTLPDEVLTKEVEELILTESKKVLEDVTGEEFVLFMKILSGLKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFSKNVHSTRFVTYFCEQVLPNLSSLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDMEKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSFHQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIRLQYFARGLQVYIRQLRLALQGKTGEALKTEENKIKVVALKITNNINVLIKDLFHIPPSYKSTVTLSWKPVQKVELGQKRANEDTTSGSPPKKSTAGPKRDARQIYNPPSGKYSSNLGTFNYERSLQGK	202591	173664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_175786_179023_179161_179661_179739_181844_181902_182722_182817_185026_185209_186380_186471_187649_187755_188282_188490_189699_189852_190418_190485_191011_191106_192189_192352_202460
527577	contig_1406_pilon	+	738	3	Intergenic	novelGene_25601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	433.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGCAGTCACTTGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2183711	2186679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2183885_2185143_2185423_2186393
527578	contig_16310_pilon	-	2447	14	Intergenic	novelGene_70038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	1120.55271653436	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	151	2055	66135	56545	FALSE	10	GTGCCAGACTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGRGGFGGRGGHGRGGRGGFGGRGRGGFGGRGGFRGGRGGGGDHKPQGKKTKFE	66285	56152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56622_56971_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62127_63139_63538_64831_64955_66117
527579	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
527581	contig_18272_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_7092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4384	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539799	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539800_541800
527582	contig_10009_pilon	-	2100	2	Intergenic	novelGene_82720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCAGGTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43884	41538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_43216_43461
527583	SIRV6	-	444	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTTCCCCATAGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11784	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11800
527584	contig_6980_pilon	+	1921	10	Intergenic	novelGene_36004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	125	1021	356720	372790	TRUE	20	TTCAGACTGTTACTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346058	373879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_372927_373115
527585	contig_15063_pilon	-	1252	5	Intergenic	novelGene_14294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.3923048454133	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	758	1081	35891	35108	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36801	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_35935_35978_36156_36264
527587	scaffold_16539_pilon	-	1874	12	Intergenic	novelGene_68349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	294.86416539325	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	142	1014	502141	491915	TRUE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQVLLHHCVRVAAPQT	502785	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494622_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502245_502747
527588	contig_13894_pilon	-	1403	9	Intergenic	novelGene_62100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	719	1105	523608	522754	TRUE	20	AGCGACGAACGTGCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMTWQYFFMLLKSFSSCFLPSSSCHFLQYLVKAFFLDLCLQEQSRVGEGTGHRPSSPFQGRVSGRRTGTRRGWGSLPASKEPFPPASGAWMELIGQSRAELSRRLHSSLICSAKTVLKVRRPRGVST	528173	520686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_520715_521574_521769_522677_522832_523299_523623_524835_525023_525635_525797_526475_526609_527457_527578_528070
527590	contig_15047_pilon	+	1322	7	Intergenic	novelGene_52230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	7	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2213	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2605_3257_3498_4158_4434_4552_4624_19403_19514_21104
527591	contig_9363_pilon	+	2174	9	Intergenic	novelGene_6817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	259.731080879821	100	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1254	1829	1624307	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTLSASVSSEIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622239	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
527592	contig_9482_pilon	-	1845	11	Intergenic	novelGene_44304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	144.503460166184	1353	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	40	1617	1253164	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253203	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242568_1244318_1244471_1245325_1245387_1253059
527593	contig_15063_pilon	+	1479	5	Intergenic	novelGene_12229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	213	1385	34808	36661	FALSE	40	AGAAGTTGTATGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527594	contig_17008_pilon	-	2539	1	Intergenic	novelGene_124237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1030	1494	61668	61204	NA	70	TTGTTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMVIPSETEASQLLVFLVSSASTSCGLSVLGPQARICPAGASVPKLGSSTNKCLEAPHSARKPPAHKHSAPLFCGSASLVPLISAWRQPAPPGRLAHRHSALSLHGSTPVPSCASLLVLLLLVLCHCRSSNHSQCQNRFYILGIC	62697	60158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17008_pilon_-_60200_62700
527595	contig_13760_pilon	-	2337	10	Intergenic	novelGene_61289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	193.468917974496	42	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	5	1189	192135	167445	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPKAYWGVGQGPSCQPLP	192139	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165389_167277_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857
527597	contig_17769_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_124255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86678	85363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_85400_86700
527598	contig_14925_pilon	-	991	5	Intergenic	novelGene_55088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	1556.62927105332	1197	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	196	453	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGAGTRLAVHPYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	34456	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_34413
527599	contig_1532_pilon	-	1982	8	Intergenic	novelGene_37387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1541.11503497319	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	469	1233	27321	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34923	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27369_28825_28964_29438_29505_32049_32214_34870
527600	contig_14925_pilon	-	1903	8	Intergenic	novelGene_55321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	976.753619216771	8	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	488	901	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322461	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113037_113217_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129485_321798_322113_322371
527601	contig_10861_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_39419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTTCACTACATACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2200341	2201023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2200300_2201000
527602	contig_18145_pilon	+	2093	12	Intergenic	novelGene_37350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	304.20241195299	5	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	132	1568	86893	100744	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86761	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96240_98826_98983_100326_100482_100638
527603	contig_15063_pilon	+	1521	4	Intergenic	novelGene_13580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	6	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527605	contig_11720_pilon	-	2180	13	Intergenic	novelGene_43890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.296040039848	159	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	88	1017	124674	118106	TRUE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134609	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117414_117492_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
527606	contig_11720_pilon	+	2026	14	Intergenic	novelGene_43989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	341.592961694602	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	180	938	263924	269680	TRUE	40	AAAATATTTATTGAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAI	262923	272460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269674_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
527607	contig_14441_pilon	+	1728	9	Intergenic	novelGene_100355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	319.033207519217	14	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1115	1543	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23048	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_23565_23796_26652_26781_26886_26996_27093_27189_112106_112154_116578_116963_117220_117344_117539
527608	contig_10855_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_124350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	306	728	571648	571226	NA	35	ATTGTGACCAGAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLRSREVAGFICSQQPGPGLGAEPPAPSCPGPAPCLPSSPISWGRWPCVPAWPFHPGRAGCGLPRDALGLVSFPTPSKPLPGSAFSLLTPRRKQPLPIWLCGHARWEWLSYSPQPQLGGFPEADHSPHFHPGASGQTA	571953	571151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_571200_572000
527609	contig_12279_pilon	+	1275	6	Intergenic	novelGene_50114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2028.94469121265	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	175	777	68297	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	64457	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_64626_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
527610	contig_233_pilon	-	1477	8	Intergenic	novelGene_14633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1374.70130336353	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	196	879	108727	79079	TRUE	15	GGTGTCCTAGAAGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHARPACPAAHSGGTALPRVCCAGAATTTHRPVCLLVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPYLIQVMDTRAWRGRKWPPSSGAQWQGSC	109976	78147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79138_91473_91502_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108861_109914
527611	contig_7426_pilon	-	2118	8	Intergenic	novelGene_27548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	302.373198250784	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	37	648	1102797	1091093	TRUE	20	GAAGGGGTTGAGTTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIALASWPLRENTGQIQWTGWDVMLGLSWRKLTFNERLLWART	1102833	1086770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1088070_1090921_1091100_1092305_1092422_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
527612	scaffold_13609_pilon	+	2342	5	Intergenic	novelGene_124424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	61.7636624561724	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	25	516	779035	794554	FALSE	40	ACATGCAAGTTATGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACEEALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGRVDVAVNCAGIAVAIKTYNLKRSQAHTLEDFQRVLNVNLIGTFNVIRLVAGEMGQNERDQGGQRGVIINTASVAAFEGQM	779010	796380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780437_780559_780689_794548
527614	contig_6227_pilon	-	1651	15	Intergenic	novelGene_49736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	275.421800820754	58	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	473	1351	1211228	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225026	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1222062_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
527615	contig_5033_pilon	-	1906	12	Intergenic	novelGene_28984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4028.13123416671	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	390	1136	536585	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566808	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531538_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_544617_544686_545249_545325_547551_547686_566747
527616	contig_13528_pilon	-	1962	12	Intergenic	novelGene_66867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_6	135.333258695307	1468	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	323	1585	67880	40217	FALSE	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSAEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQIWQMAENIYNDEESDVTASELEGQGS	68202	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
527617	contig_5018_pilon	-	1555	7	Intergenic	novelGene_47080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	550.485063880534	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	70	996	1402792	1399645	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
527620	contig_17427_pilon	-	4018	5	Intergenic	novelGene_30383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	770	junction_4	1090.45162662082	62	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAACGGTTAGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204695	182702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_182800_184281_184368_184468_188140_188767_188890_204653
527621	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	247	1419	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27122	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527622	contig_9345_pilon	-	2319	23	Intergenic	novelGene_24548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	174.220204775641	1	42	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	275	2221	729379	723552	FALSE	10	CTCCTGGAGTCTGTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	729997	723453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726284_726434_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770
527623	SIRV6	+	949	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	549	-7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	42	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527624	contig_16411_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_77341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208749	208189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_208200_208700
527625	contig_17108_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_109514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTGAATTATGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44307	44056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_44100_44300
527626	contig_15286_pilon	+	1814	8	Intergenic	novelGene_124436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_5	65.0942801336834	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	115	885	8542	25108	FALSE	40	AAAAAACTCTGGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFKLVKTWLGPEAISLLKFTSKNEIQEYVSVEYLPPHMGGTDPFKYSYPPLVDDDFQTPLCENGPITSEDETSSKEDIESDGKETLETISNEEQTAPVKKINPAEPNSKAEENEKVDSKMKAFKKPLSVFKGPLLHISPAEELYFGTAESGEKKTLIVLTNVTKNIVAFKVRTTAPEKYRVKPSNSSCEPGASVDIVVSPHGGLTVSAQDRFLIMAAEMEQSSGTGPAELTQFWKEVPKNKVMEHRLRCHIIESSKPTTLTLKDSAFNMLDKTSEDICLQFTNSRCETDRSPP	8427	26037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_8554_10756_10934_11419_11533_15377_15475_16537_16635_17061_17192_22665_22769_25066
527627	contig_15666_pilon	-	1792	6	Intergenic	novelGene_70169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	642.644847485763	28	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	92	1126	110619	107816	FALSE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110710	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108859_109098_109378_109948_110246_110558
527629	contig_3077_pilon	+	1586	9	Intergenic	novelGene_26607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3659.26411446004	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	614	1180	13867	17590	TRUE	25	GATTAACAGTGTGCGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9532	18077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11480_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449_17699_17779
527630	contig_12074_pilon	-	2016	15	Intergenic	novelGene_53763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	414.923400848191	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	24	1565	45831	31029	TRUE	45	AAAATACATATTTAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFPCGSGSFLKNRPRPRPLVMMRPCS	45854	29980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32256_32301_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
527631	contig_7744_pilon	+	2160	18	Intergenic	novelGene_62561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	227.880910439116	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1148	1717	889342	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879825	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_881536_881629_882666_882899_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886935_887367_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
527632	contig_3986_pilon	-	2536	11	Intergenic	novelGene_52690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	117.773723724777	3	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	132	1355	60653	35282	FALSE	35	TTTTCATAATAAAGTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQVCMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153814	34100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_44829_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
527633	contig_7708_pilon	+	3948	5	Intergenic	novelGene_61531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	248	junction_1	51.4508260380725	56	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	127	729	250654	255022	TRUE	30	TTGATTAAAAGACTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAVSLNQRVMCRRFSYIIC	249572	266042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_256787_257187_257288_264687
527634	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527635	contig_8772_pilon	-	1750	9	Intergenic	novelGene_21099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	941	1270	19240	15784	TRUE	30	GAGAGTGGCAGAGGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23421	15222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15384_15464_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20701_21944_22051_23061
527637	contig_5758_pilon	-	3572	1	Intergenic	novelGene_119092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGACCTTTTGGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179142	175570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_175600_179100
527638	scaffold_9100_pilon	+	950	3	Intergenic	novelGene_83291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	955	junction_2	42	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	197	406	653404	654304	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	651951	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_652069_653324_653449_654139
527639	contig_8122_pilon	+	2206	3	Intergenic	novelGene_40264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2109	junction_2	43.5	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGAGTAATGTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743418	748839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_744784_745062_745148_748083
527640	contig_15219_pilon	+	2432	8	Intergenic	novelGene_40831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	220.031166623536	2	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	31	1119	19617	24591	FALSE	20	TGGAGCTCTAGCCTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSLTTTVTKMNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19586	25904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
527642	contig_3469_pilon	+	2738	9	Intergenic	novelGene_34187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	61.3604870824866	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	1201	2379	464141	479914	FALSE	5	TCAGCCTCTGCCTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	462940	480273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
527643	contig_1443_pilon	-	1947	10	Intergenic	novelGene_28282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	31	junction_8	363.255581215142	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	391	1275	776427	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809565	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_805197_805224_805553_805718_809399
527645	contig_990_pilon	-	2132	5	Intergenic	novelGene_76119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	100.579570490234	693	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	22	546	1605903	1586999	FALSE	25	CTCACCTTTGTGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1605924	1585412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
527648	contig_3095_pilon	-	2560	3	Intergenic	novelGene_75201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	987	12	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	676	1215	248927	248388	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIQLISGGAQILIQDLESRNLSPLVPMRVLSPGETGYVVSRLTHCAFFCLLLPSVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	249602	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246708_246904_247387_247858
527650	contig_11720_pilon	+	3997	1	Intergenic	novelGene_44022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCTCAAGTCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324876	328873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_324900_328900
527651	contig_12977_pilon	-	2024	8	Intergenic	novelGene_122811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	429.312977503664	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	511	1212	87513	68817	FALSE	40	AACAAGTAGTTTTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAGILCYVGAYVFITYDDYDHFFEDVYTLIPAVVIIAVGALLFIIGLIGCCATIRESRCGLATFVIILLLVFVTEVVVVVLGYVYRAKVENEVDRSIQKVYKTYNGTNPDAASRAIDYVQRQLHCCGIHNYSDWENTDWFKETKNQSVPLSCCRETASSCNGSLAHPSDLYAEGCEALVVKKLQEIMMHVIWAALAFAAIQLLGMLCACIVLCRRSRDPAYELLITGGTYA	93937	68004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_68910_76187_76272_76557_76711_77707_77810_79526_79602_79843_80036_87510_87874_93787
527652	contig_6898_pilon	+	2225	9	Intergenic	novelGene_35696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1520.0434152928	2	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	134	1057	59668	126535	FALSE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERASLLGICPPQSSPNLLQLE	59534	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104609_113038_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_126474
527656	SIRV6	+	427	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10342	57	1105	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11342	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
527657	contig_11224_pilon	+	2199	3	Intergenic	novelGene_124446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	92.5	255	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	151	456	19401	20398	FALSE	25	TATTAAACTTGATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPEC	11243	22141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211
527659	contig_10990_pilon	+	2325	3	Intergenic	novelGene_7407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	1155	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	115	603	119582	121424	TRUE	40	AGGTAAAATTCCCACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119467	123584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121878_122315
527660	contig_10496_pilon	-	2650	11	Intergenic	novelGene_59415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_10	97.1547734287925	487	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	86	1888	64679	38747	FALSE	15	GTTGCATGCTATGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64764	37984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
527662	contig_20819_pilon	+	2524	6	Intergenic	novelGene_55615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	32.3691210878516	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	143	2212	22495	25167	FALSE	25	AAAATTCTTTTCTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKVRKGGCFTSNSSFSFVIFSVSASLNVVPTTSSLPCFSTPIFCLC	22198	25479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_22323_22476_23309_23427_23643_23798_24004_24175_24654_24809
527663	contig_15897_pilon	+	3016	18	Intergenic	novelGene_49502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	83.0517410744756	216	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	29	1675	42395	95331	FALSE	5	TTTTTAGTCTGTTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELVQGQSAPVGMKAEGFVDALHRVRQIAAKIDSIPHLNNSTPLVDPSVYGYGVQKRPLDDGVGNQLGALVHQRAVITEEFKVPDKMVGFIIGRGGEQISRIQAESGCKIQIASESSGIPERPCVLTGTPESIEQAKRLLGQIVDRCRNGPGFHNDIDGNSTIQEILIPASKVGLVIGKGGETIKQLQERTGVKMVMIQDGPLPTGADKPLRITGDPFKVQQAREMVLEIIREKDQADFRGVRSDFSSRMGGGSIEVSVPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGISPERAAQVMGPPDRCQHAAHFINELILTAQERDGFGGLSVARGRGRGRGDWSMGTPGGVQEVTYTVPADKCGLVIGKGGENIKSINQQSGAHVELQRNPPPNTDPNLRIFTIRGVPQQIEVARHLIDEKVGGTSLGAPGAFGQNPFSQPPATPHQNTFPPRSSGCFPNIAAKVNGNPHSTPVSGPPAFLTQGWGSTYQAWQQPTQQVPSHAASAAPQASSPPDYTMAWAEYYRQQVAFYGQTLGQAQAHSQEQ	42366	96672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_42479_55974_56081_68438_68473_70925_70976_71383_71456_72738_72797_74873_75037_78114_78214_79705_79811_80242_80346_81355_81457_83615_83758_87940_88102_88857_88932_89261_89343_89579_89657_94120_94249_95322
527664	contig_10299_pilon	+	2144	17	Intergenic	novelGene_79704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90.3275074036143	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	723	1982	337016	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320522	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
527665	contig_9807_pilon	+	1820	13	Intergenic	novelGene_32888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	626.198362253439	4	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	85	690	109130	140728	TRUE	40	CGTGTGGAGCATAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGHPGRKQGSRRRDLCY	109045	159010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_140338_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_154180_154270_156624_156770_158676
527666	SIRV6	+	963	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-8	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	407	721	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527667	contig_5988_pilon	-	1601	5	Intergenic	novelGene_15996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.641695452624	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	91	939	693353	689968	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLALLMLALSQPTRW	693443	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690008_690069_690504_690859_691009_691134_691358_693350
527668	contig_7293_pilon	+	1837	4	Intergenic	novelGene_54226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_3	221.734074963683	2791	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	87	407	220511	222466	FALSE	25	AGTTGGAATCGACTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSKLAFALLAAFMLSAALCKAAVLPRVVSELRCQCIKTHSTPFHPKFIKELRVIESGPHCTNSEIIVKIVTKDGEEGKEVCLDPKAKWVQIIVEKFLKRAEKGGQ	220424	223896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220575_221496_221633_221906_222006_222444
527669	scaffold_19766_pilon	+	4181	12	Intergenic	novelGene_34262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGGCGGCTACCGGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172649	181469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_175182_175388_175556_176228_176358_176763_176849_176955_177110_177689_177804_177937_178052_178719_179024_179455_179590_180016_180151_180387_180609_181376
527670	contig_17274_pilon	+	1964	17	Intergenic	novelGene_26462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_16	462.57809729142	573	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	64	1707	7027	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6963	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
527672	contig_10064_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_122704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTAGAAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261893	260435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_260400_261900
527673	contig_2892_pilon	+	2796	2	Intergenic	novelGene_119035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	820	1125	325625	325930	TRUE	25	CATTATGTACTGTAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCLLWGKTAVFYLWESHLSRSKYKGSFATLHRACLICFFLCAFTVAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRVSCTTEKIDFAER	324805	331232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_325991_329621
527674	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	242	1369	34808	38994	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
527675	contig_15063_pilon	+	1461	6	Intergenic	novelGene_14278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	339	1217	35271	39515	FALSE	15	TATTCTCCTTATACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34820	39759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38981_39092_39506
527676	contig_11130_pilon	-	2334	6	Intergenic	novelGene_53086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	2116	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATGGGTGTTTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55275_55501_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
527677	contig_3307_pilon	+	2044	9	Intergenic	novelGene_86882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	239.281084710012	387	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	217	1089	127358	198323	FALSE	25	TTACAGAGTGTCTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKNEQICLEGSTTRMLLRGRLYAMQTGMKIDSKTPDCRKFLSKLMDQLEALKKQLGDNEAITQEIVGSAHLENYALKMFLYADNEDRAGRFHKNMIKSFYTASLLIDVITVFGELTDENVKHRKYARWKATYIHNCLKNGETPQAGPVGIDEDNDVEENEDAGATSLPTPPPQPSSSTYDPSNMPSSSYTGIQIPPGAHAPANTPAEVPHSTGVTSNTIQPTPQTIPAIDPALFNIVSQGDIRLTPEDFARAQKYCKYAGSALQYEDVSTAVQNLQKALKLLTTGRE	118046	199278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_118183_127277_127422_145185_145281_149325_149454_150094_150171_173045_173155_176209_176384_186331_186413_198177
527679	contig_15304_pilon	-	1525	3	Intergenic	novelGene_30612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	53.5	880	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	186	1031	66228	64912	FALSE	10	GAGCCCTGGGCTGTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66413	64417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104
527680	contig_233_pilon	-	1785	10	Intergenic	novelGene_14606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1189.84870912956	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	91	1347	126907	78579	FALSE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126997	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91592_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
527682	contig_15888_pilon	-	1590	8	Intergenic	novelGene_84430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_7	1285.85843636356	3338	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	71	880	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRFLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259796	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
527683	contig_16411_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_77385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCATGGTGTCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368836	369797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_368800_369800
527684	contig_9535_pilon	+	3611	2	Intergenic	novelGene_124485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	106	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1033	1680	374783	375430	FALSE	30	GCTGAACAGAGTATGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRNPSPDPLSESESEEEENANYLNESSGEEWDSSEEDPVVPNLTPLESLAWQVKCLLKYSTTWKPLNPNSWLYHAKLLDLSTPVHILREIGLRLSHCSHCVPKLEPIPEWPPLASCGVPPFQKPLISPSRLSRDHATLNGALQFATKQLSRTLSRATPIPEYLKQIPNSCVSGCCCGWLTKTVKETTRSEPINTTYSYTDFQKAVNKLLTASL	366176	377361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_366248_373821
527688	contig_15459_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_106371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	469	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2020	2388	16644	17012	NA	10	CTATTTGTCTTAGTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYNKLPRGKVILVQYTHIWLILRTHLQNGEEQILLTLVMNVHVDYFTILFSGGGLEILLCTNTYLIIAFQFSKFFYLKKIAFHSKETDLGITKDALWKHAELKTVLFQTKNFETRTARYLH	14624	17112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_14600_17100
527689	contig_5280_pilon	+	2198	9	Intergenic	novelGene_52595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	509.987928778711	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	29	1150	38343	78098	FALSE	25	ACATTGTCTCACGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38314	79146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
527691	SIRV6	+	595	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	384	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2825_3106_3165_10724
527692	contig_10235_pilon	+	2008	4	Intergenic	novelGene_46436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	237.8963359673	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	10	432	210483	212121	FALSE	25	ACGAATGTCCTTGGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPGAEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210473	213697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_210912_211834_211924_212047
527693	contig_4891_pilon	+	1269	7	Intergenic	novelGene_124553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_4	477.85585925279	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	137	952	701017	756631	FALSE	55	AAGAACCAAATGTCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700880	756948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
527695	contig_14133_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_119938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	461	772	208493	208182	NA	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	208953	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206600_209000
527696	contig_13519_pilon	+	1832	14	Intergenic	novelGene_124633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	390.330234939202	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	100	1776	66179	120612	FALSE	15	GACTTGTACTGTTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGSRALPWQARCRGISDPRERLERGRPGTAAMSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTMEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57060	120668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100608_102238_102373_115513_115645_116672_116756_120484
527698	contig_9463_pilon	+	1678	9	Intergenic	novelGene_83831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGGCTCTGAAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185943	223426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222533_222668
527700	contig_6710_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_89091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653563	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
527701	contig_11285_pilon	-	2346	7	Intergenic	novelGene_5644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	876	1217	769124	768472	TRUE	30	GTGGACAGCAAAGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSTWANGQQPQAPVERRQHV	770196	767063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_767176_767265_767836_768024_768531_768612_768855_769083_769295_769404_769647_769733
527702	contig_5033_pilon	-	1985	15	Intergenic	novelGene_29003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	15	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531134_531892_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
527703	contig_10923_pilon	+	1521	10	Intergenic	novelGene_66207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	790.903764962653	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	35	1405	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13844	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36659_37513_37540_38578_38742_42554
527704	contig_6102_pilon	-	1646	10	Intergenic	novelGene_32109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	352.267575068221	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	236	1486	821069	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822089	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821436_821978
527705	contig_5649_pilon	-	1802	9	Intergenic	novelGene_82458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	123.935467078637	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	294	1202	1570696	1564135	FALSE	15	GTGGAGACTCCTGTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVAGVCGAACVPSLSAAELTAQPTWSPSPSLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573883	1563534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654_1573730_1573785
527706	contig_9668_pilon	+	1929	10	Intergenic	novelGene_58110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	419.536722741163	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	462	1550	282781	359314	FALSE	15	TGATGGTGCTGGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214037	359693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_281470_281586_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
527707	SIRV6	+	1458	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	52	18	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1065	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527708	contig_9995_pilon	+	1267	2	Intergenic	novelGene_47669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	47	301	183725	189931	FALSE	15	CTTTGTTCTTCTGTGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENICAGPWRLRRERKMDIYREMGFGHYEEEESCWEKQKSEKRDRPQNQSRSRSRERDGHYSNSHKSKYQTDPYERERSKKRDRSRSPKKSKDKEKSKYR	183678	190897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_183728_189679
527709	contig_4659_pilon	+	2605	10	Intergenic	novelGene_118199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	63.6758767819542	47	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	182	1426	191727	208048	FALSE	10	CTATTCTGAGTCTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKQYKSQFEAQNIWYEHRLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	186963	209227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187054_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559_199738_201057_201210_204160_204302_205905_206069_207957
527710	contig_14184_pilon	-	2737	6	Intergenic	novelGene_66592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	275.457002089255	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1082	1474	90204	89812	FALSE	25	TGAACCAAGTGTGTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKKWPPSPSFLLALSPRDSPWAVIEQVCLGFLGPATSHHSHPPVSQSAHYTATKPNTAHLAEGPSCKSGPGPGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126323	88548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90772_91298_91348_91951_92050_105799_105915_109168_109327_126229
527711	contig_6898_pilon	+	2498	3	Intergenic	novelGene_35775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3477	2	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	35	313	124416	125516	FALSE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKR	124381	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124464_124782_125008_125510
527712	contig_8658_pilon	-	1333	7	Intergenic	novelGene_55828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	30	1019	55624	6049	FALSE	30	TGATTCATTTTTACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55653	5734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
527713	contig_13055_pilon	-	2972	17	Intergenic	novelGene_104951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	46.3087464740733	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	191	2071	143110	88287	FALSE	20	TATCTTTATATTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDAAIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVTGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHSGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAVISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD	159207	87385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88371_89894_90042_98669_98832_103038_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115979_116548_116625_119247_119368_138770_138846_139427_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_156219_156335_159175
527714	contig_16907_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_87447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCAATGTCTTCACATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418080	417882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_417900_418100
527715	contig_10235_pilon	+	1898	7	Intergenic	novelGene_46416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	206.674462218566	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	28	747	210483	212152	TRUE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210455	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047_212511_212905
527716	contig_14807_pilon	-	1822	4	Intergenic	novelGene_124694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13282	junction_2	4585.71145576731	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1152	1640	38669	37336	FALSE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKVSSAPALPSPPHPAPPCPWIPDSVLCLPRSTSPRSGVLPSLMLMNLKTW	39907	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37649_38298_38438_38632_38741_38827
527718	contig_15112_pilon	+	2265	3	Intergenic	novelGene_124772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAAAAAAAGTACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72103	77994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_74207_75804_75867_77894
527719	contig_7342_pilon	-	2368	20	Intergenic	novelGene_71102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_11	101.858763767448	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	756	2309	81141	76155	FALSE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86791	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_86703
527720	contig_6980_pilon	+	1798	7	Intergenic	novelGene_36065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	787.079923232422	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	123	602	362370	370545	TRUE	20	CTTAGAATGTCTTCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRPLNGLLPCIRIVLDMLVLSLKMEK	361141	373744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368376_370468_370641_371430_371523_372735
527722	contig_14513_pilon	-	1379	5	Intergenic	novelGene_70343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1352.67944743017	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	198	686	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESENNLQEMWILMFIRKNAGPFPLRKDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_13381_13454_14952_15001_18735
527723	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1403	691	948	-59	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGACTAGCCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2403	2712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
527725	contig_12644_pilon	+	1232	10	Intergenic	novelGene_44627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4922.28687692676	4	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	53	1144	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678756_2679163_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
527726	contig_15720_pilon	+	1241	8	Intergenic	novelGene_41870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	533	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	278497	279803	TRUE	40	CTGCCGAGAAAAAGATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278494	283984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281929_282569_282887_283778
527727	contig_7744_pilon	-	1882	16	Intergenic	novelGene_62569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGTGTGCTGGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891228	881596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_881627_882664_882892_883077_883204_883414_883522_884859_884901_885272_885368_886855_886941_887132_887189_887341_887445_889020_889155_889339_889454_889839_889875_890087_890144_890223_890288_890539_890599_890678
527728	contig_15063_pilon	+	1407	5	Intergenic	novelGene_13972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3429.81277732473	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	523	1266	35349	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35159_35261_35380_35839_36158_36266
527730	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2988.60773396242	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35836_36158_36266
527731	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_9418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527732	contig_16148_pilon	+	2082	12	Intergenic	novelGene_50352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	714	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTCCAGAATTAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58681	150978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_59177_63746_63847_74693_74884_75357_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89048_89182_89311_111367_111496_147635_147699_150782
527735	contig_4213_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_124819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	631	942	56455	56144	NA	30	CATGGCACAGGACCGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTCLPGRLINMTIIQITHQPLRPKMKKLKIFTNFCSLKLIKHALIITGDWNMKVGNKEEGFVIGKYGLGNRNDAGDCMTEFCKTKDFFIANTFFKQHKWQL	57085	55707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_55700_57100
527736	contig_8616_pilon	-	2204	3	Intergenic	novelGene_72516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	36.5	440	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	296	1015	347284	346380	FALSE	20	GCGTTCCCAATCCTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALLRTFPVAALAAGMRRALGSLAGSCLADRCLWDRLHAQPRLGGAPTFDWFFGYEEAQGFLLPLLQEASTACPLQVLDVGCGTSGLCTGLYTKCPHPVDVLGVDFSPVAVAHMNSLLEGGQGQNRLCPGHPASCLRFMQADAQNLGPVAPSGSFQLVLDKGTWDAVARGGLPGAYQLLSECLRVLSPRGTLIQFSDEDPDVRLPCLEQGSQGCTVTVQELGPFRGLTYFAYLVQSAH	347850	345190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_347036_347220_347559_347829
527737	contig_7887_pilon	+	2599	6	Intergenic	novelGene_124934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_5	274.177023107335	1614	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	185	1576	583225	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLFSGGVSESESGPLEEVELQVIPGTGSDTELQDAVGDGQDGLRELQASAPLGSVPSLQNMALLLDKLAKENQDIRLLQAQLQAQKEELQSLMLQPKRLEEENARLRGALQQGEASQQALESELQQLRTRLQGMKADCIVWGPDGVCLTWGSGLQGDKATEGQGPREQEPGSGFLEQKEQLEAEAQGLRQELERQRRLLGSVQQDLEQSLREAGQGDPAHSGLAKLSHRLAQKLQDLESWGQDPGTPANASGAWGQELHFQSSRERSGKEKWWGGQGNRKAEHWKHKKEGSGGERKSWESEKDREQTRKRKEGKLRVQEWEDKDGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	582322	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_582340_582478_582503_583003_583087_583164_583294_583892_585122_585612
527738	contig_13021_pilon	-	1570	8	Intergenic	novelGene_8135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCGGCCGCCTCCCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181112	174505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177510_180505
527739	contig_14871_pilon	+	2286	4	Intergenic	novelGene_63698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_1	765.081840212027	198	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	128	763	201945	215078	FALSE	70	GCACAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRSAHPSPTGSAPPAVRVEHIRGSSLRPPDPWESGGGCQKLGSTSHPVSNSPWYLACPLTLWPLFTRL	194862	216601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767
527740	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
527741	contig_1244_pilon	-	1507	8	Intergenic	novelGene_38019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	90	junction_7	780.071686920307	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	189	1088	928860	923211	FALSE	25	ATATTTATGCTTTTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	931255	922791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931100
527742	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	27	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	228	1394	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRAVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34913_35030_35380_35839_36158_36266
527745	contig_5020_pilon	+	1521	8	Intergenic	novelGene_27820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	930.938959835056	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	364	1206	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124477_124926_125091_125657
527746	SIRV6	+	1049	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	32	7	25	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	40	ACTATGGGGAAAGAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
527747	contig_12644_pilon	+	1995	8	Intergenic	novelGene_44658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4682.63692500589	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1221	1907	2679113	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675480	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2678194_2678720_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
527749	contig_9233_pilon	+	2143	2	Intergenic	novelGene_78257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTGTGGTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676777	679051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_677393_677523
527750	SIRV6	+	391	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	527	-62	354	62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTTATTGCCCGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	2602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
527751	contig_10948_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_124968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116907	117453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_116900_117500
527753	contig_5302_pilon	+	1959	3	Intergenic	novelGene_81503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	191	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	54	578	342399	355674	FALSE	25	CATGATTTTATTAAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSMVFVPKQWNIIVSTRMLMRQCLL	342345	357055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353739_355602
527756	contig_16303_pilon	-	1818	8	Intergenic	novelGene_34097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	93	1205	47976	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48068	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33275_35285_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
527757	contig_10861_pilon	-	2423	3	Intergenic	novelGene_39282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1334	junction_2	248	1530	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	394	816	1355171	1354749	FALSE	15	GTGGTTTGTTTTTATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERYNIPVPQSRNVSKNQQQLNRQKTKDQNSQMKIVHKKKERGHGYNSPAVAWQAMQNGGKNKVHFPNNQNWNSSLSSPSLLFKSQTNQNYAGAKFSEPPSPSVLPKPPSHWVPVSFNPSDKEIMTFQLKTLLKVQV	1356818	1353141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355190_1355520_1355727_1356649
527758	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527759	contig_7357_pilon	+	2620	16	Intergenic	novelGene_36880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	114.934648097662	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	1240	2247	257391	273311	FALSE	45	AGACATTATGAATTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250826	273684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_251492_252250_253750_253841_256778_256948_257240_257396_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
527760	contig_11720_pilon	-	1786	3	Intergenic	novelGene_43757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	300	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	53	934	16869	15793	FALSE	20	GCCCTTCTGGAAGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSCGWTHLASASDQTMADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18321	14940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16321_16515_16878_18277
527761	contig_9177_pilon	-	1880	9	Intergenic	novelGene_32604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.53153354305	17	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	710	1441	7310	2159	FALSE	15	TACCTGTAACCTCTGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAGSDSAATVQVPAFRASR	9056	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2219_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8789_8903
527762	contig_12427_pilon	+	2489	19	Intergenic	novelGene_40494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.529169161986	8	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	391	2118	403591	419950	FALSE	25	TGACAGCTGCTTCTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397736	420321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399301_399632_399672_399853_399895_403488_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_414116_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
527764	contig_4103_pilon	-	3286	4	Intergenic	novelGene_51880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	362	junction_3	148.43404820548	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTTGATGCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45580	39949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_44023_45129_45224_45555
527766	contig_3948_pilon	-	2225	8	Intergenic	novelGene_53218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.416155143367	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	62	868	866476	840803	TRUE	80	AAAAAACAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869629	839329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840655_840770_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
527767	contig_4429_pilon	+	2754	12	Intergenic	novelGene_50783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_11	376.501687461234	172	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	873	2622	62	2683	154531	207452	FALSE	15	CATGTGTATTGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APHLPRGEGVYGEEAAEAAAMAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGDLSKEVWMNYQALHHIGEINHFCHAARLKMSHPRGGQGDVTTTKKEELGVEHILWTPDPCTENILDPGDSCNTRDGERRQEVAAEKWWQQNQENDRRRHGGLPSPWSEKAECLQEGGFLVEWGASRHLLAELGMWTHGVRELSAFRPRLTGILGCLWTLSSGTKELCNTCPSRAEARLAKEGLGAEGLRGQGPGVGLLVGVAEKLF	154469	207523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_206189_206255_206894
527768	contig_12919_pilon	-	1587	5	Intergenic	novelGene_75892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	492.373080092728	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	80	526	743659	720289	FALSE	10	TTGATTTTGTTGTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHDTVEMSFQKTSLVQEMS	743738	719227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_734916_735079_737596_737735_743565
527770	SIRV6	-	710	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8561	-126	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTGGTTTCGACTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2609_2733_2822_3095_3161_10721_10818_11034
527771	contig_15185_pilon	-	1783	6	Intergenic	novelGene_99458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_5	261.469998278961	102	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	66	1115	472420	430130	FALSE	10	CTGAGCCCATCTGTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPVSALAGRTLGGHLGTTPTHPTAPTCSCFPPLSLGPGVQAALRGCRQQPRRQDSGGPILRARGECRVLQGLPIIGRGW	472485	429461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
527772	contig_6102_pilon	-	1735	10	Intergenic	novelGene_32118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	352.267575068221	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	325	1575	821069	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVATQTPPCWGLWVVWPLRRPPGPCEDLAHQRRCPKHSSCCGPPRHCSSLAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822131	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821483_821978
527773	contig_1143_pilon	-	2032	24	Intergenic	novelGene_86567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	248.311675300895	31	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	17	1213	201052	135973	TRUE	30	TTTTTAAAATTGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGQWMVGVKMAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVRQENWMYILNMKKK	201068	85734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_85934_88855_88925_91081_91148_93804_93839_96112_96166_99347_99402_112824_112901_114899_114963_119308_119389_121382_121454_135918_136016_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
527775	contig_4659_pilon	+	2683	10	Intergenic	novelGene_118202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	60.7217901783959	383	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	257	1501	191727	208048	FALSE	5	TTCTGAGTCTTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKQYKSQFEAQNIWYEHRLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	187753	209230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187919_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559_199738_201057_201210_204160_204302_205905_206069_207957
527776	contig_11720_pilon	-	2074	11	Intergenic	novelGene_43908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.597456748555	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	177	854	133018	118106	FALSE	40	GATTTATGTTTAGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSRTCNTRRGRQGPERPSPSERAEAPSPEATEKGHTCLRAREWKLIQLTGKKTSAKNMGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134616	116885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_133014_133137_134558
527777	contig_8210_pilon	-	2974	4	Intergenic	novelGene_30238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1485.72548683201	269	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	277	612	37758	29712	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILE	53106	24727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_25979_28600_29926_37636_37803_52874
527778	contig_9807_pilon	+	1885	10	Intergenic	novelGene_32859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	534.390295247136	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	108	1172	109130	158906	FALSE	25	GTATAAAGCACCGTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNERVLSLDVSVTRPTPAPPQGGGP	109022	159619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145159_158835
527779	contig_15063_pilon	+	1192	3	Intergenic	novelGene_14344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
527780	contig_6063_pilon	-	2162	17	Intergenic	novelGene_27576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	550.801560795719	4	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1161	1730	26509	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDQKLSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70264	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_26493_26558_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45813_48191_48356_48688_48772_52947_53066_70135
527781	contig_4364_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_2678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532946	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
527782	contig_5967_pilon	-	2044	9	Intergenic	novelGene_44369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	496.716075212993	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	109	642	488569	403442	TRUE	35	CAACAAATGTTTTACTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDAHPDSHFHDHKICPGPT	517610	387553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388878_403363_403471_412498_412523_423982_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
527784	contig_7594_pilon	+	2957	3	Intergenic	novelGene_55448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	327	163	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2096	2479	561547	566248	FALSE	20	GATCTTGAAGTTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	559128	566726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_561217_561539_561752_566069
527785	contig_6960_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_60232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAATAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223161	220858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_-_220900_223200
527787	contig_15063_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_10689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36794	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36158_36264
527788	contig_16303_pilon	-	2100	7	Intergenic	novelGene_34045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_5	506.445373822949	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	153	1079	40611	33093	FALSE	25	AGTCTTCAGACATGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKAALED	47930	32071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
527789	contig_4469_pilon	+	2509	6	Intergenic	novelGene_21953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	300.342071644983	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	183	1421	751887	755841	TRUE	20	ATACGGAGTGTCCTTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIPSAQPPPACLPKAPGLEPGDLPGMDFAHMYQVYKSRRGIKRSDDSKETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELTLKHVKALTNLIDQQQQKILALQSGLQAGELSGRNVDAGQEMFCSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTFPHSSGEQSGSDTDTDSGYGGELEKGDLRSEQPYFKSDHGRRFATGERIGTIKQESEEPPTKKGRMQLSDDESHFSSSDLIGSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	751704	757046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752204_752461_752570_753495_753620_754984_756002_756118
527792	contig_5643_pilon	+	2002	16	Intergenic	novelGene_39079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	866.643322762536	1	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	492	1793	634927	641217	TRUE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELCTCPRLAGSTSSLKRFPLGEPPGWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERQRHCYRPRVSPGRFSCVRASANPEILCCPCSMTSPRLAQAPHSRSPTSRSCVRVDDTRWAVQRPLTASRTWWSISRKRALRRPQVPVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631261	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631344_631438_631559_631850_632046_634832_634992_635156_635256_635390_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
527793	contig_9014_pilon	-	2876	15	Intergenic	novelGene_106769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	102.505375667895	352	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	1349	2542	91348	88802	FALSE	20	TTTGGGGTTTCAAGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGQSEREALGCRANSEEFIPIFANNPRELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWAHEKDPQVKEKLHAEAISLLRSGRFSNVFDKALVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHEQYRQVIAVCERHGEQEPSLWEQALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSIIRDYLVQKLQKQSQQIAQDELCVWRYREETTRIRQEIQELKASPKIFQKTKCSICNSALELPSVHFLCGHSFHQHCFESYSESDADCPTCLPENRKVMDMIRAQEQKRDLHDQFQHQLKCSNDSFSVIADYFGRGVFNKLTLLTDPPTARLPPSLEAGLQRDLLMHSRRGT	98093	88467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_88967_89139_89363_89985_90158_90287_90491_90581_90722_90950_91113_91219_91409_91539_91687_92358_92411_93696_93890_94584_94833_96286_96451_96776_96913_97006_97152_97890
527794	contig_8452_pilon	+	1841	3	Intergenic	novelGene_48041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	62	1147	432928	434013	TRUE	10	CACGTATGCTTGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423968	434980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_434360_434632
527795	contig_12079_pilon	+	2159	14	Intergenic	novelGene_67405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	147.560598323248	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	225	1835	491184	578891	FALSE	10	CCTGTGTCTCCCAGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	490959	579215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
527796	contig_11258_pilon	+	1897	9	Intergenic	novelGene_67774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	186.032927193011	29	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	9	1142	278958	292582	TRUE	50	CTTTCACGGGAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278949	296548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450_293033_296243
527797	contig_14273_pilon	-	2417	4	Intergenic	novelGene_21160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTAAAGTAGATGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151390	138187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_139183_147780_148027_148889_149548_150872
527798	contig_755_pilon	+	2418	5	Intergenic	novelGene_119787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_3	18.952242611364	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	112	663	573406	581811	FALSE	15	CGTGTTGTACTTATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEGSIFDRLLRSALLKLACDLNHPPCTQKAAELFSRWMESSGKLNIPADVLKIVYSVGAQTTGGWNYLLEQYGLSMSGAEKNKILYALSTSKHQENLVKLIKLGMEGKVIKTQDFAPLLHAIARNPKGQHLAWNFVRENWTHLLKKFDLGSFAMRVIISGTTSHFSSKDELQEVKLFFQSLKAQGSHLDIFQIVLETITNNIKWLEKNLNTLKTWLLVNV	573294	583566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_573429_576498_576661_577371_577513_580844_580927_581667
527799	contig_14553_pilon	+	1921	6	Intergenic	novelGene_124998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	147.197010839215	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	43	360	5787	12174	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHNPREFIS	5744	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_6138_6387_12152_12270_13796_13937_14294_14424_22455
527800	contig_15888_pilon	-	1451	7	Intergenic	novelGene_84435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1739	junction_6	902.918493306874	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	100	744	254586	252475	TRUE	10	ACATTTCGGCTCCTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	254685	251599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527
527802	contig_12951_pilon	-	2028	5	Intergenic	novelGene_68168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	338.110189139576	1072	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	162	650	307101	296988	FALSE	10	CAGGTTTTATTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDDNWASKSKRRATAINVNVLKFTVPSFKKILALSWKSSPMVYFLKWTWGTGNGGGEETFFFLPYPFLYFTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	326227	295609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_303434_303506_306956_307220_326184
527804	contig_9848_pilon	-	1513	11	Intergenic	novelGene_79942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	453.961727461688	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2	598	110488	104044	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPACVCGAPAQVRAGRKGHRGGGDPVSPCVYRQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	110489	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107414_110408
527805	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_14029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527807	contig_13707_pilon	-	2044	9	Intergenic	novelGene_43571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	761.444351216817	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	155	1021	273826	270728	FALSE	50	AACCTTGAAAAATATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAIEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	274220	269704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273970_274040_274147
527809	contig_10235_pilon	-	2131	10	Intergenic	novelGene_46282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	357.031277808168	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	176	1009	25335	19534	TRUE	55	TTTTAACAAAACTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27173	13980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15088_18953_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
527810	contig_8658_pilon	-	1350	6	Intergenic	novelGene_55795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	47	junction_4	1044.66806211351	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	380	997	30206	6049	FALSE	20	AGTGTGATGTCTGTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55716	5695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_36521_36674_55528
527811	contig_8248_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_125013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTGACCTGAGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42990	40872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_40900_43000
527812	contig_11396_pilon	-	477	2	Intergenic	novelGene_71270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCTTCGGCTTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231478	230857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_231231_231374
527813	contig_14441_pilon	+	1602	9	Intergenic	novelGene_100596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.584899987623	6	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	996	1424	116728	117610	FALSE	10	GGCGCTGCCTACGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111201	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111994_112040_112454_112665_113843_114048_114138_114161_114556_114732_116578_116963_117220_117344_117539
527814	contig_10013_pilon	+	2283	7	Intergenic	novelGene_125086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	67.9936680058437	372	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	26	625	508654	511412	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAEIYMNQEVKMQAAASKDKKRGGPAKNKGAEDPDYENITLTFRNQHRPKGGHSPPVSQVPAQSRPLSAPAQIPHWLYRAIMSLYILLALTFVFFIILSAMVLLKNSEMSQELLVLKTELLNVSNSMRESQEEQKKSQSHVQQAISQIKMTINTVDTNVQKENVKLDTLKKELNQVKVELEKKMETILKELEKKQNP	508628	513070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_508748_509047_509138_510330_510469_510656_510708_510804_510952_511216_511295_511410
527815	contig_15063_pilon	+	1598	7	Intergenic	novelGene_9844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	35	TTTGAGCTCTAAGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
527816	contig_8453_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_125151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	363	680	340542	340225	NA	25	TGTATTAAGGCAATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIPRNAKRTNKSVLEEVQAECFLEARMVRLRLTYFGYIIRRDQSLQKDIMLGKVEGQRKRGRPSMRWIDTVPLTMDSSITIVRMAQDWAVFLSVVRRFAMNWN	340904	339240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_339200_340900
527818	contig_8453_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_125150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	721	1077	337772	337416	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSVIAEVITVYSVVWRWRKTSSTWTVAVAGPKWGKGRRSPGKGTPANRGSTENDQAGTGSQREPLRIERANLRIVAPKRLKTKTGYVFRINIIIILGSRENWEKERVRMIVGLWTL	338492	336826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_336800_338500
527819	contig_5711_pilon	+	2322	11	Intergenic	novelGene_80264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	55.5489873895105	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	6	1724	52529	122172	FALSE	45	ACGTTGAAAATAACTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLERKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	52523	122770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_108771_108937_113381_113568_121458_121637_121996
527822	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527823	contig_7816_pilon	+	1650	11	Intergenic	novelGene_66481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1184.14254209533	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	109	1539	170169	211658	FALSE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170060	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181093_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
527824	contig_8452_pilon	-	735	5	Intergenic	novelGene_48080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.280247918297	163	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	36	359	991128	962980	FALSE	5	GTGGTTGAGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRRYTQLLPHPLFRK	991163	962603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963021_968709_968752_972861_972933_981637_981738_991058
527825	contig_9727_pilon	-	1763	6	Intergenic	novelGene_86319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1226	1609	310354	309329	TRUE	25	CCTTACGGAAGCCCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLQHPCAATNIFRRVYILPICSRPPNLNFRSTLNHAHMISTSLSCPILSGEVAGEWPRSPGLLEVIPLLCWQPSLPATSLHHPVPRGYGAIRSHLTLSIPETMPKSSGGKESSDNSTSNAALEPTL	314654	308448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_308465_309190_309345_309986_310816_310903_311013_312911_312991_314078
527826	contig_9609_pilon	+	1957	10	Intergenic	novelGene_23040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	963.991009639959	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	119	898	449884	454554	TRUE	70	GAAAGAAAAAAAATACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCRPESFPRRASGGSGVGRAGPSRAGGRVGAGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSNAVCV	435483	456262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435579_449860_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454462_454538_454634_455282
527827	contig_21203_pilon	+	2417	8	Intergenic	novelGene_84474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	78	1370	53950	122165	FALSE	80	AAACAAACAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIFR	53872	123212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
527828	contig_15063_pilon	+	1484	4	Intergenic	novelGene_14144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	167	1342	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34641	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527829	contig_2367_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_65306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGACCCATGCAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132245	131843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_131800_132200
527831	contig_15063_pilon	+	3236	4	Intergenic	novelGene_13069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	37	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	1922	3094	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	32886	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527833	contig_7119_pilon	-	199	2	Intergenic	novelGene_40876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTATTCGGCCTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124098	120920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_120937_123915
527834	contig_1275_pilon	+	840	2	Intergenic	novelGene_108832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	9	698	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746557_747277
527835	contig_6215_pilon	-	1841	4	Intergenic	novelGene_21195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	926.75347315238	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	888	1193	227679	227374	FALSE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSAGFACRLRHIAFKERLAMVHTELSTQLDCNLPWVGMASFHTYTVNFVLVYKHMQNNGFSGDVRNAEGLDKGFEKENHGLRKKFFKKTLEISFEKERW	243078	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228194_235237_235361_238588_238751_242990
527836	contig_11429_pilon	-	2743	2	Intergenic	novelGene_60471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATGGGGGCAGGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49487	46659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_-_47364_47448
527837	contig_2770_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_107474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3001	junction_1	974.202693944586	4	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	76	417	746670	743833	FALSE	55	ATAAAAGACCATTAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	746745	742955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600
527838	contig_5643_pilon	+	3090	10	Intergenic	novelGene_38939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	103.62515543779	786	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	135	1535	481872	501081	FALSE	25	GGATGCTCCATGTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462243	502636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
527839	contig_15087_pilon	+	2372	5	Intergenic	novelGene_37261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1175.97417063471	2	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	61	600	284653	301944	FALSE	30	AAACTTTTTAACTTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVACTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284592	303716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301267_301308_301421_301788
527840	contig_6215_pilon	-	1858	11	Intergenic	novelGene_21189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	766.672426789956	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	43	1404	243029	228234	TRUE	15	GTGTGTAGTGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243071	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_227063_228116_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
527841	contig_12786_pilon	-	1825	9	Intergenic	novelGene_103401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	986	junction_7	401.030995529024	2228	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	547	1539	614067	592872	TRUE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGEMDGGVFTEVLLIQGASTNPRNHGSVFLLWCFHDMVLLPSVTMVGHNGLFMSGQELGGPHLPLSRVWCEVGAHVMCVLRVPRSQVSVSSCVLQVKAAWMVLSAHTRKRTSRST	629526	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
527842	contig_15063_pilon	-	1519	5	Intergenic	novelGene_11060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	779	1102	35891	35108	TRUE	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36778	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
527843	contig_2069_pilon	-	2136	8	Intergenic	novelGene_23220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	75.0749285578027	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	50	847	218720	185953	FALSE	25	GTGAATGCTGAGAGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAGARCRANRSQLLVMSYGPLHMYRNPGPSGPQLRDFNSIIQTCSGNIQRISQATAQIKNLMSQLGTKQDSSKLQENLQQLQHSTNQLAKETNELLKELGSLPLPLSTSEQRQQKLQKERLMNDFSAALNNFQAVQRRVSEKEKESIARARAGSRLSAEERQREEQLVSFDSHEDWNQMQSQEDEVAITEQDLELIKERETAIRQLEADILDVNQIFKDLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVERATDQLQRAAYHQVKAGVNERHSVLQTLWASTVH	218769	184663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_186102_186863_186937_190692_190799_192108_192153_196226_196365_201208_201309_202852_202923_218602
527844	contig_11224_pilon	+	2188	3	Intergenic	novelGene_124441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	92.5	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	152	457	19401	20398	FALSE	35	TTTGAATCATCTTATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPEC	11242	22129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211
527845	contig_19677_pilon	+	1579	10	Intergenic	novelGene_125155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_7	116.439779380683	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1413	166	1578	101414	125369	FALSE	10	GTGAGTCCGCGGCAGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVHKSSPLQKQNPLSFQHHLPKEMSLPKRPQPSFGTAQKQRKFPQNQQAGDLDMHFTSLTLNQQITSTPPGENRSQPRAKWTESILCSQYEEKVRPCIDLIDSLRALGVEQDLALPAIAVIGDQSSGKSSVLEALSGVALPRGSGITTRCPLVLKLKKQPCEYEWTGKLSYRDKEFQLQDPSEVEQYICKAQNAIAGHGVGISQELINLEITSPEVPDLTLIDLPGITRVALGNQPQDIGLQIKSLIKKYIQRQQTINLVVVPCNVDIATTEALTMAKEVDPDGDRTIGILTKPDLVDKGAEKGVLNVVQNLTYHLKKGYMIVRCRGQQEVTDKLSLAEATRREIHFFQTHPNFRVLLGEGKATVPCLAERLTTELIVHIQKSLPLLEHQIIDSHQRATEELRRCGADVPDRETDKMFFLIEKIQTFNRDIEKLTEGVEAVKENEMRLYNQIRNEFKTWGLILAANTQK	93363	125370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19677_pilon_+_93459_101343_101660_103033_103227_104223_104362_111002_111158_115809_115949_120162_120362_121840_121920_124823_124947_125228
527846	contig_1532_pilon	-	1942	9	Intergenic	novelGene_37428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1451.43004912397	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	74	706	32217	15878	TRUE	45	ATTTTATTAAAGGTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFNHK	34934	12379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13149_13195_13518_15732_15889_17982_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
527847	scaffold_6394_pilon	+	1331	9	Intergenic	novelGene_111004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1224.09624187602	225	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	251	1171	399145	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398209	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_398997_399149_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
527848	contig_8801_pilon	-	2637	2	Intergenic	novelGene_66299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	162	junction_1	0	639	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1216	1953	548049	545797	FALSE	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRWANRSHSQILLGQTLSAGAPRWGFTLISPRSLTSLHTCLGAMVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549264	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738
527849	contig_1719_pilon	-	1567	7	Intergenic	novelGene_87322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	60.4032743777649	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	13	792	467734	458348	FALSE	30	ATATTTGGCATTTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRAMKMAAAAGKLLRASVACHMSAIPWGVSASAALRPAASGRKCLTNALWSGSHPAKRAFSTSSSYLAPAVTQHAPYFKGTAVVHGEFKELSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVDETLRLVKAFQFVEAHGEVCPANWTPHSPTIKPSPTASKEYFEKINQ	467746	457572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_458761_458928_461153_461258_462091_462228_463065_463208_466480_466617_467692
527850	contig_1230_pilon	+	1571	8	Intergenic	novelGene_28839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1360.5938679376	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	362	1336	405792	408754	FALSE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGHKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405805_406790_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
527852	contig_7083_pilon	+	2088	8	Intergenic	novelGene_125159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	658.718855515951	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	255	704	161470	182245	FALSE	20	GAAATTGTTGAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYIERPQLIRAKVPIVKFRDKVNCVEFDLNVNNIVGIRNTFLLRTYAYLENRVRPLVLVIKKWASHHEINDASRGTLSSYSLVLMVLHYLQTLPEPILPSLQKTYPESFSPAIQLQLVHQAPCNIPPYLSKNESNLGDLLLGFLKYYATEFDWDSQMISVHEAKAIPRPDGIEWRNKYICIEEPFDGKNTARAVHEKQKFDMIKDQFLKSWQRLQNKRDLNSILPLRAAILKR	156657	183629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_156728_159880_159958_161362_161492_169672_169717_174263_174401_178715_178808_180833_180914_182170
527853	contig_9333_pilon	-	2460	26	Intergenic	novelGene_120314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_8	138.766889422513	362	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	38	2260	142532	96148	FALSE	20	CATGTTTATGAAGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GESEQTAEDSAKMAAFSEMGVMPEIAQAVEEMDWLLPTDIQAESIPLILGGGDVLMAAETGSGKTGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGKKGKTTIKTGASVLNKWQMNPYDRGSAFAIGSDGLCCQSREVKEWHGCRATRGLMKGKHYYEVSCHDQGLCRVGWSTMQASLDLGTDKFGFGFGGTGKKSHNKQFDNYGEEFTMHDTIGCYLDIDKGHIKFSKNGKDLGLAFEIPSHIKNQALFPACVLKNAELKFNFGEEEFKFPPKDGFVALAKAPESYVTKSQHTGSAQVAQTKFLPNAPKALIVEPSRELAEQTLNNVKQFKKYIDNPKLRELLIIGGVAARDQLSVLDNGVDIVVGTPGRLDDLVSTGKLNLSQVRFLVLDEADGLLSQGYSDFINRIHNQIPQITSDGKRLQVIVCSATLHSFDVKKLSEKIMHFPTWVDLKGEDSVPDTVHHVVVPVNPKTDRLWERLGKNHIRTDEVHAKDNTRPGANSLEMWSEAIKILKGEYAVRAIKEHKMDQAIIFCRTKIDCDNLEQYFMQQGGGPDKKGHQFSCVCLHGDRKPHERKQNLERFKKGDVRFLICTDVAARGIDIHGVPYVINVTLPDEKQNYVHRIGRVGRAERMGLAISLVATEKEKVWYHVCSSRGKGCYNTRLKEDGGCTIWYNEMQLLSEIEEHLNCTISQVEPDIKVPVDEFDGKVTYGQKRAIGGGNYKGHVDVLAPTVQELAALEKEAQTSFLHLGYLPNQLFRTF	142569	95947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_96279_96949_97071_97374_97471_106477_106521_106609_106683_106810_106884_108397_108490_112879_113027_114559_114612_115519_115709_116456_116547_117376_117476_120058_120120_125727_125867_126620_126736_126871_126949_128788_128862_131045_131123_131655_131740_131961_132046_133811_133860_136925_137023_137591_137622_138606_138671_139421_139474_142516
527854	contig_15063_pilon	-	1502	4	Intergenic	novelGene_13216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	790	1113	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36788	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36157_36264
527857	contig_8269_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_106259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAACTCTCTGATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380267	382129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_380300_382100
527858	scaffold_6394_pilon	+	1367	8	Intergenic	novelGene_111015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	932.594034214814	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	546	1208	403262	406119	FALSE	10	ACTGTGTTTTGATTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398254	406278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402476_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
527861	contig_5954_pilon	-	2000	12	Intergenic	novelGene_28690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	458.476222154423	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	671	1684	956264	945083	FALSE	20	TATTATTATTTTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRRLLTRVVPQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960588	944766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946363_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
527862	contig_12414_pilon	+	1518	3	Intergenic	novelGene_59544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	93	824	370898	373887	FALSE	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTVA	370805	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373714_373873
527863	SIRV6	+	1026	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	500	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
527864	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527865	contig_15063_pilon	-	1317	4	Intergenic	novelGene_14246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	777	1100	35891	35108	TRUE	15	AGGTCTCGAATTTCTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36776	34778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
527866	contig_9982_pilon	-	3203	16	Intergenic	novelGene_55733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1169	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2244	2615	322769	316112	TRUE	25	GCGGCATTATAGGAAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVRGPGGSRVISKGSVRARSGGSIFTIVPDIFTSFSSSLSTGVCDKFCITALKKHVFPKLLSPFTVIWEVEFMEGFSLAMFSFFSLSCSFLFSFSNFLFSSSMFPLPFADCRDVMPACFLI	338633	307549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_307689_311156_311257_313034_313215_315166_315271_316046_316151_317258_317443_318514_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325074_326515_326998_327935_328112_330450_331131_333520_333607_337962_338121_338218
527869	contig_7173_pilon	+	2751	3	Intergenic	novelGene_37532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	107	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2150	2584	225253	225687	FALSE	35	TACCAATTTTTATTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHCLKTGTFKDSLIRPSCRRLPSKPGVLHVEALGDFERSTYTVQRLLVLCLPTLFSPLDPDLCRKHALPDPLSGQEAPEHKLVTPFLVSSLVQIVLECGCLWPPGSLFLHSHKSFWRVATRPLKSFFSFLVFKMLWIRDWLNP	213023	225854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_213250_220273_220563_223618
527870	contig_3410_pilon	-	2199	8	Intergenic	novelGene_58920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	571.251365380407	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	77	928	57649	15127	TRUE	15	TTTACACGTTGAGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLGVGPSKKAGWTMAELALDLLDSPG	57725	13693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14380_14541_15207_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
527871	contig_11855_pilon	+	2489	10	Intergenic	novelGene_67067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	85.5089339062169	437	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	224	1348	2086282	2105965	FALSE	5	CTGTGTGGTATCTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSGANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVKVPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNRVEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVENAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINYHASDVLETSGWKSMVVSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS	2034382	2107106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2034540_2086215_2086360_2086951_2087074_2089215_2089368_2089903_2090032_2097169_2097348_2100083_2100140_2100603_2100727_2104362_2104506_2105820
527872	contig_7707_pilon	-	2543	8	Intergenic	novelGene_72162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGCAAAAGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280998	252812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_254475_256569_256654_269220_269324_270098_270235_270865_270961_272828_272984_278603_278690_280776
527874	contig_5302_pilon	+	1744	10	Intergenic	novelGene_81471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	172.462413153177	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	91	942	318287	337399	TRUE	5	CTCATCCTTCTTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFGLPLARFLCAAAPAVAAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306658	338248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307_337897_337943
527875	contig_5836_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_106287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	491	1087	122619	123215	NA	20	TTCAGCCTGCGAGTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFGKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	122128	123913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_122100_123900
527876	contig_19769_pilon	+	1099	5	Intergenic	novelGene_102252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.194167841727	152	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	610	1065	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86950	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_88040_88841_88958_89163
527877	contig_7179_pilon	-	2229	17	Intergenic	novelGene_78181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_16	60.3551662556736	431	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	49	2109	1222971	1181125	FALSE	20	TGGATAGTGATTTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFRVHRVRFFNYVPSGIRCVAYNNQSNRLAVSRTDGTVEIYNLSANYFQEKFFPGHESRTTEALCWAKGQRLFSAGLNGEIIEYDLQALNIKYSMDAFGGPIWSMTASPSGSQLLIGCEDGSVKLFQITSDKIQFERNFDRQKSRILSLSWHPSGTHIAAGSIDYISVFDVKSGSATHKMIVDRRYMGVSKRKCIIWGVTFLSDGTVISVDSAGKVQFWDSATGTLVKSHLIANADVQSIAVSDQEDSFVVGTAEGTVFHFQLVSVTSNSNEKQWVRTKPFQHHTHDVRAVAHSPTALISGGTDTHLVIRPLMEKVEVKNYDAALRKITFPHRRLISCSKKRHLLLFQFAHHLELWRLGSTVATGKNGDILPLSKNADHLLQLKTKGPENIICSSISPCGSWIACSTASRFFLYRLSYERDSISLQRVPKMPAFLRSALQILFSEDSTKLFVASNQGSLHIIQLSEGCFKHLHTFQPQSETVEAMCLLAVSPDGNWLAASGTSAGVRIYGLKELKPHCTVPAYNFPVTALGIAPNTNNLVIAHSDQQVFEYSIPDKQYTEWSRAIQKQGFHHLWLQRDTPITHISFHPKRPMHILLHDAYMFCIIDKSLPLPNDKTLLYNPLSLTNESDVIRRRTAHAFKISKKYKPLLFMELLDERTLVAVERPLDDIIAQLPPPIKKKKFGT	1224312	1181004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1181242_1182103_1182215_1183677_1183864_1185474_1185571_1194851_1194959_1196691_1196849_1198794_1198918_1200012_1200078_1200814_1200912_1206351_1206444_1206550_1206723_1209852_1210065_1215621_1215712_1217115_1217201_1218689_1218882_1222812_1222974_1224266
527878	contig_17796_pilon	+	2016	8	Intergenic	novelGene_33808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_6	244.357382970609	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	111	1082	53527	110323	FALSE	15	ACAGGGTTGACTTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53416	111257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_99617_99648_110237
527879	contig_5698_pilon	+	2137	7	Intergenic	novelGene_55001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	730	junction_1	590.437314388431	7	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	FALSE	25	GTATTATTTGTCATTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
527881	contig_5485_pilon	-	2409	16	Intergenic	novelGene_37751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.480230740355	5	23	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	5	1333	478711	458904	FALSE	45	GTTTTAAATGGAAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHHQLSTEMILLLPGAIM	478715	457827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_458954_459332_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
527884	contig_15087_pilon	+	2490	18	Intergenic	novelGene_37160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1389	2102	52951	72512	TRUE	20	GGAGGGAGATGGGCCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLLVHFKQLSALLLQHLHLLLGCTQDAHLWQLACYHSSLLLAGRHLLPCAFHLWGVWLPGGTLFVAAAHQQLLELHIFLPKPLSGLIPLFQALVQLGLQDLILLPKLLTQGLQDGGALLVLVHLGGQPVELEGHAAQMGEELAVVWLLGTHAQSGLQPLQVQHQVAVSRGRGPSSCIVFLVLPPLSGGEFCSSAGTTSNSEEVPYWMEVLGPALACHWGVHRQREVLGHLCPFL	33353	89775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_33759_33806_33955_40432_40648_41127_41194_41710_41831_42908_43046_49136_49266_52531_52669_52919_52986_54480_54568_58874_58999_60951_61054_66539_66728_69120_69207_71087_71173_72505_72641_73968_74144_89690
527887	contig_11656_pilon	-	2416	2	Intergenic	novelGene_53988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATTTTTCACATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375936	372205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_373142_374456
527888	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_10685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527889	contig_7426_pilon	-	2424	17	Intergenic	novelGene_27477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	94.1939488502314	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	1118	2233	649816	637491	FALSE	20	CTGGCATTGCAAGCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	668311	637299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_651600_651784_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
527890	contig_10506_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_125174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAAACACTGCCCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28086	28687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_+_28100_28700
527893	contig_1867_pilon	-	2790	12	Intergenic	novelGene_54597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_11	178.710717812774	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	113	1696	551098	517583	FALSE	10	TGTGTTTTTTTTTATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVAAPGPRASDNCDSGGGADAAPACGEPVQATLSSLKMVDVGKWPIFSLCSEEELQLIRQACVFGNAGNEVLYTTVNDEIFVLGTNSCGCLGLGDVQSTLEPRRLDSLSGKKIACLSYGSGPHIVLATTEGEVFAWGHNAYSQLGNGTTNHGLVPCHISTNLSNKQVIEVACGSYHSLVLTSDGEVFAWGYNNSGQVGSGSTANQPIPRRVTGCLQNKVVVNIACGQMCSMAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566854	516488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972_551129_566772
527895	contig_10311_pilon	-	1526	11	Intergenic	novelGene_50411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1065.01438487938	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	324	1007	68953	65644	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKE	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65649_65885_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
527896	contig_7870_pilon	-	1147	8	Intergenic	novelGene_108885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	515	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	25	TACCTATATGTGTTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
527897	contig_7457_pilon	-	1808	7	Intergenic	novelGene_31417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.403999051324	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	311	403	471189	471097	TRUE	20	TTTAGCATTGCTCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRWVQDDGASSLARRPLGQGKPRGRARQRGWSTPTATTAWTPESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEVSASYPFSLVWWI	473210	468238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471292_471559_471641_472730_472768_473120
527899	contig_12977_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_122803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGCCGACATTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52786	53572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_52800_53600
527900	contig_12638_pilon	-	1454	8	Intergenic	novelGene_33400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	814	1185	1529501	1521279	FALSE	35	TTACTCATTCAACAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTFRIPLAIILYRLWTPVVVSSEMPRMPEQELRVLGVNKVGEVTAIVQNHVEGPILEVQSLLDAPQVLLVCFALPGIHWNASLGNGSCGMVLGGEDVAAGPLHLAPRAMRVSMRTAVSTVM	1540157	1521009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1521332_1522652_1522730_1524396_1524543_1529405_1529525_1529953_1530162_1530252_1530341_1530440_1530558_1539780
527901	contig_11850_pilon	-	1906	6	Intergenic	novelGene_125225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	948.167622311583	39	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	106	678	286397	284179	TRUE	10	TGATTGTTCTTCTGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKVKPFELY	286502	281442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_284335_285098_285261_285361_285531_286311
527902	SIRV6	+	612	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	343	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2492_2621_2740_2829_3106_3165_10724
527903	contig_15185_pilon	-	1615	8	Intergenic	novelGene_99457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	324.778982933167	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	83	1165	472420	429911	FALSE	10	TGAGCCCATCTGTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKVAQHSTSGEAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472502	429460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434064_434172_435509_435689_444528_444701_472290
527904	contig_6027_pilon	-	2836	18	Intergenic	novelGene_74440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.391057973797	38	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	838	2559	283869	263119	TRUE	10	CACTCTGTCTGTTCTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNVSRTDLDMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	290908	262064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262191_262967_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265867_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_289209_289339_290862
527906	contig_9482_pilon	-	2226	8	Intergenic	novelGene_44317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	160.5400325178	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1490	2005	1238984	1236365	FALSE	20	AAACAGCCTTTCTCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1244385	1236143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1240966_1241040_1241101_1242539_1242603_1244305
527908	contig_7457_pilon	-	1945	5	Intergenic	novelGene_31606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	134	1396	962606	956489	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962739	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955902_956427_956939_958234_958375_960225_960896_962603
527911	contig_3077_pilon	-	1742	9	Intergenic	novelGene_26608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1026	1364	15161	11465	TRUE	20	GTTTACCAGATCTGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKSRCLGYLGNVVATVKGDLPRGHCCTEQELLSSRLGFPCKLSLHFHLDQGGEMLLVSPSRVDPGQVQPVKAVGPQKWRHRLDESPALRAKAPSSNRQQGLQVGVPVLE	18084	9532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9705_11258_11476_12010_12069_13050_13174_13863_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17037_17442
527913	SIRV6	+	696	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	378	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	74	225	209	433	2002	2794	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHCKTSIRYGQRRFHTTCSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGEFWDTSWDVSLGLWD	1681	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2627_2750_2829_3106_3162_10721_10819_11031
527915	contig_18096_pilon	+	3173	15	Intergenic	novelGene_58035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	794.134444100067	2	79	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	847	1731	66667	76634	TRUE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40311	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53720_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62851_62899_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77060_78102
527916	contig_12864_pilon	-	1278	7	Intergenic	novelGene_76427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	1880	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	172	681	251873	242831	FALSE	10	AGAGTTGCTGCCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252157	242233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
527917	contig_7440_pilon	-	1410	11	Intergenic	novelGene_61157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	279.915058544552	3187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	75	956	74491	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
527918	contig_15063_pilon	+	1719	5	Intergenic	novelGene_13048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	6	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	170	1582	30275	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30105	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527919	contig_11752_pilon	+	1261	7	Intergenic	novelGene_37611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1506.40897501309	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	107	946	84194	105616	FALSE	5	CTTGACTCTTGTCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASLTEVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84087	105931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_94208_94410_96442_96572_100956_100976_105597
527920	contig_13464_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_125248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGTTCATTTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444079	444368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_444100_444400
527921	contig_10339_pilon	-	2162	2	Intergenic	novelGene_125273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCCCTGCTGAACGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330627	322330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_322602_328736
527922	contig_9682_pilon	+	2719	2	Intergenic	novelGene_125299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCCTATTGCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27107	30201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_27199_27573
527923	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCAGGACTCGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
527924	contig_6735_pilon	-	1718	13	Intergenic	novelGene_15722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	86	1318	564868	542384	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDSPCPKWLYPTPIPASSV	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542438_543120_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
527925	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
527926	contig_7396_pilon	-	853	7	Intergenic	novelGene_79647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_6	4768.42789140777	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGCATTGTAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257477	252160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257142_257294_257381
527927	contig_12950_pilon	+	4171	2	Intergenic	novelGene_114789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	10	2163	102511	104664	TRUE	5	CTCTGTCTGGCTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFRAALFFWVVASWAKGDEPPGETDKAGFQKCKNALNLRVLEVLPGGGWDNLRNVDMGRVMGLTYTSCRTTEDGQYIIPDEIFTIPQKQSNLEMNSEILESWVDYQSSTSYSINTELNTFSEVNGKFSAEFQRMKTLQVKEHSITTRVQVRNLVYTVKINPTLELSWGFRKDLMAISDCLENNQTRMATYLAELLVLNYGTHVITSVDAGAALIQEDSIRTSFLQDSQNSRIAVTLSAGITFQNIINFKFEDNYILQNALTKSYLSNRTNSRVQSIGGVPFYPGITLQTWQEGIANHLVALDRVGLPLHFFINPNMLPGLPGPFVKKLSKIVELAVRRYYDFNTYPGCTDFNSPNFNFQANTDDGSCEGRVTNFTFGGVYQECTQLSGNEAVLLCQNLEQKNPLTGDFSCPSGYSPIRLLSQIHEEGYNHLECQRRCTLLVFCKKVCEVVFQVAKAEFRAFWCVAHNQVPEYSGLLFGGLFSSKSINPLTNSQSCPAGYLPLRLFESLKVCASQDYELGYRFSVPFGGFFSCAVGNPLADSAISRDSGAPAVKKCPGGFSQHLALISDGCQVSYCVKSGIFTGGSLPPVRLPPYTRPPLMSQTATNTVMVTNMETSNSWIKDYETHQWKLGEPLELRKALKVTHEDEHGLSGGTAAGVIVGVITVLVAAITLAIYGTRKYKKRQYRAIEDEKQSLTQGTAATGDAPHQEPEQNPV	102501	106791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_104767_104885
527928	contig_11429_pilon	+	1681	7	Intergenic	novelGene_60453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	955.991588177776	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45399	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_46765_47370_47457_47552_48443_48530_48899
527929	contig_5050_pilon	-	2538	10	Intergenic	novelGene_110283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_9	174.019014144865	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	189	1496	716384	548291	FALSE	70	CTAAAAAAAAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPCILACDTWGLSLASPFFWCLFST	716572	547248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
527930	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_13917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	111	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
527931	contig_1406_pilon	-	1474	5	Intergenic	novelGene_25543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	572.217834395259	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2147784	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143516_2147740
527932	contig_16121_pilon	+	2221	6	Intergenic	novelGene_6847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	522.51736813239	80	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	185	1711	51510	62826	FALSE	20	TTCTGTAGTTAAATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLQAILSYKYIFNGCNILLYIVLTAKYALNLISLVVDIMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33591	63336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_51442_51628_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
527933	contig_9363_pilon	-	2036	12	Intergenic	novelGene_6760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	441.687335656501	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	161	1393	1548961	1505966	FALSE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLVALLSLL	1549121	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505989_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
527934	scaffold_6394_pilon	+	1361	8	Intergenic	novelGene_110988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	932.594034214814	121	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	543	1205	403262	406119	FALSE	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398178	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402714_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
527935	contig_9727_pilon	+	2510	6	Intergenic	novelGene_86334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	276.505045161928	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACTTTTTGGGCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425209	432835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426079_426135_428941_429016_429240_429323_430794
527936	contig_15063_pilon	+	983	4	Intergenic	novelGene_11228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	231	983	34808	36132	FALSE	40	AAACAGACCATGTCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPL	27138	36132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
527939	contig_4469_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_21959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	122	487	755476	755841	NA	15	GATGTAGCAGTCTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLRSEQPYFKSDHGRRFATGERIGTIKQESEEPPTKKGRMQLSDDESHFSSSDLIGSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	755354	756622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755400_756600
527940	contig_19769_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_102279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.49824211698	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	171	509	87859	89339	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRSWAALAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGEWQVATHWQALHHPQGCPCRPQSGSYCCSPDRTTPGNQDCAGERELGLGTQ	86998	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87497_87609_87820_88058_89199
527942	contig_5344_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_125327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1147	1449	10939	10637	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNGLLQLRPQVLRSPISSGKPSLMCTLPSLSSDWESSFLSAAHNILSILLLSNYRILPCTVTDFIFLGSTINTHGSSSKKSNDVLHWANLLQKISLKC	12085	9197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_9200_12100
527943	contig_8317_pilon	+	411	2	Intergenic	novelGene_19376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16267	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
527944	contig_5018_pilon	-	1602	8	Intergenic	novelGene_47097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	719.94302495661	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	241	1050	1402284	1399645	FALSE	0	GTGTCTTCCTCCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTRRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402863	1399092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401388_1402270_1402363_1402701
527945	SIRV6	+	832	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	33	223	26	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	182	673	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1163	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
527946	contig_10082_pilon	-	2595	17	Intergenic	novelGene_63849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	142.929123606772	18	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	588	1604	174259	128693	TRUE	15	CAGCAGATTGTGTCCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTPENNEGGPEQGPSVEGLNTATKAALEVSSIIKKKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLASKNFNEIEKQAQAVDKVKEQEDRLARAAPKEESMVASLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKTVESERLGMGFGNCRSAISHSVTSDMQTIEQETPITAKPRKKYSEDNDDSYFTSNSRYFDEPMELRSSSFSSWDDSSDSYWKKEAIKDTDTILKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSDMYFGRQAQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEQRKQPSGNYNLTSVLPAAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVMTSIQDRYGS	198582	127658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_128326_128368_128711_131093_131216_142328_142420_145619_145744_152999_153132_160521_160645_161094_161224_167892_168036_168681_168729_170066_170127_174231_174316_178513_178598_178963_179096_182032_182106_188982_189102_198459
527947	contig_3745_pilon	+	2474	3	Intergenic	novelGene_85085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	386	1015	434035	487098	FALSE	50	AAAAGTTAAGTGAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKSLPIHLDNEKKNQVFQNTKPLFCEHCAIEYLTD	393627	488557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393747_433768_434558_486991
527948	contig_10311_pilon	-	1999	9	Intergenic	novelGene_50437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_8	1003.5813370126	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	777	1352	68387	65773	FALSE	10	AGTTGCTTTGGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
527949	contig_14209_pilon	+	2096	15	Intergenic	novelGene_88346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	228.452201047102	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	15	779	32366	37623	TRUE	20	ACTTAGGGGAGCCTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAP	32351	41008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37621_37812_37909_38078_38271_38394_38557_38783_40142_40344_40418_40725_40901
527950	contig_12837_pilon	+	1625	8	Intergenic	novelGene_57302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	2218.19382307649	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	367	810	129778	166049	FALSE	25	ACCAATGAGTTAGCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128644	166864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
527951	contig_5039_pilon	-	2069	10	Intergenic	novelGene_64966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_5	637.438818172835	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	389	688	1663533	1657729	TRUE	25	TCTGGAATAAATGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEGNKDDDDNVFSSSLPSEPVDISTAMSERALAQKRLNENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVLTQEQLANTGAQAWIKKGQILVAVFLPRSVPALLFTTLLLPRPRISS	1673075	1653723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654782_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1658438_1658519_1662234_1662352_1663443_1663555_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047
527953	contig_1244_pilon	-	1548	13	Intergenic	novelGene_38029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1014.23497099483	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	27	1424	948448	923211	FALSE	40	CTCTGAAAGAGTCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948474	923086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923775_924216_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
527954	contig_6048_pilon	-	2091	14	Intergenic	novelGene_73284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	103.949236586818	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	55	1725	2006298	1978823	FALSE	15	CTGTATTTGCCTGAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPASCSGAQVNSPGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049056	1978456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984467_1987459_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
527955	contig_4232_pilon	-	2396	11	Intergenic	novelGene_63473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	360.522468093183	646	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	35	481	620488	614837	TRUE	5	TCTCTGCTGGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620522	607746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611753_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
527956	contig_9415_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_109925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCAAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2219103	2220259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2219100_2220300
527957	contig_15063_pilon	+	1155	3	Intergenic	novelGene_14372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	190	1011	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35081	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
527958	contig_10009_pilon	-	2499	2	Intergenic	novelGene_82744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCTCATAGATTATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77278	74565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_75995_76208
527959	contig_10163_pilon	+	2431	12	Intergenic	novelGene_82633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	150.888881450737	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	135	1424	123564	185589	FALSE	5	TTTCTGTTTTACGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLRRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPDVGASVWPKKGTAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE	122494	186596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146_152324_154314_154386_165096_165197_181219_181286_183288_183358_183871_183969_185518
527962	contig_12425_pilon	-	1392	4	Intergenic	novelGene_46676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_1	421.111492230845	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	143	445	206628	204225	FALSE	20	TGAAATTTGCTTTCTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	207281	203277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180
527964	contig_12873_pilon	+	1627	6	Intergenic	novelGene_27148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1310.88199316338	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	560	1051	17896	19855	FALSE	30	CAAATTTGTAGTATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15946	20431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16281_17192_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
527965	contig_500_pilon	+	3276	7	Intergenic	novelGene_30949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	281.174125567928	11	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2656	3078	1466134	1469327	FALSE	25	CAGGTGGTGGCAGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSIT	1446811	1469525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1466283_1468833_1468910_1469129
527966	contig_9940_pilon	+	2732	1	Intergenic	novelGene_125349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAAATATTATTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201582	204314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_201600_204300
527967	contig_9940_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_125350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204916	206237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_204900_206200
527968	contig_2646_pilon	-	2542	16	Intergenic	novelGene_69632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	364.087901474355	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	1176	2390	2073197	2069499	FALSE	10	AAGGTCCCTCTCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078687	2069346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073224_2074878_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
527969	contig_8464_pilon	+	2255	17	Intergenic	novelGene_125394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	256.575281350328	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	9	2171	857221	892583	FALSE	40	TAAAGAAGCATTTTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDPVEGGDLWHTRLPNHAVFLRLREGLKNQSPAETEKSASSSLPSPPPLLTRNLLFGLGGEIFLWDREGSSFLVVRLRSLSGSSEEPSLSQYQRLLCINPPLFEIYQVLLSPTQHHVALIGLKGLMVLELPKRWGKNSEFEGGKSTVNCSTTPIAERFFTSSTCLTLKHAAWYPSEMLDPHIVLLTSDNVIRIYSLREPQTPAKVIVLSEAEEESLILNKGRAYTASLGETAVAFDFGPLAAVSKNIFGQKGKDEVVAYPLYILYENGETFLTYVSLFHSPGNIGKLLGPLPMHPAAEDNYGYDACAILCLPCIPNILVIATESGMLYHCVVLEGEEEDDQTSEKSWDSRADLIPSLYVFECVELELALKLASGEDEPFDSDFSCPIKLHKDPKCPSRYHCTHEAGVHSVGLTWIHKLHKFLGSDEEDKDSLQELATEQKCFVEHILCTKPLPCRQPAPIRGFWIVPDILGPTMICITSTYECLIRPLLSTVHPASPSLLCTREDVEVAESPLRILAETPDSFEKHIRSILQRSVANPAFLKSSERDTAPPEECLQLISRATQVFREQYILKQDLAKEEIQRRVKLLCDQKKKQLEDLNYCREERKSLREMAERLADKYEEAKERQEDIMNSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQRKMEKVLSPQKPTITLSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF	857212	892667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_857512_858662_858833_859757_859884_864979_865067_867920_868098_869665_869853_870352_870501_872708_872808_884660_884752_887827_887930_889834_889994_890865_890989_891109_891176_891319_891401_891748_891822_891981_892101_892519
527972	contig_5222_pilon	+	2668	10	Intergenic	novelGene_59009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_9	349.602631569043	1225	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	162	1085	368441	373255	FALSE	10	AGTGTTTCTTTCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQFPQFHVKSSLQIKKNAITDDYKVTAQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKNRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTIMEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH	320069	374838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_320231_368440_368581_368774_368840_369127_369208_369626_369754_370977_371054_371430_371556_371926_372013_372146_372228_373111
527973	contig_10940_pilon	-	1694	3	Intergenic	novelGene_49243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	713	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	676	1056	875054	874674	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917148	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875434_916676_916748_916923
527974	contig_233_pilon	-	2153	13	Intergenic	novelGene_14616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1453.14755119897	2	90	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	82	1224	126907	98408	TRUE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNVKTLLQSLPGAQHPP	126988	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91665_98336_98452_99775_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
527977	contig_5084_pilon	-	2458	6	Intergenic	novelGene_64556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	225.356606293226	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	271	576	544719	533474	FALSE	30	CAAAATCACGTGTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRAKMLMDQNHLTAEATNCILLFDCMIWIKMTRSPVMSCYRYVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580132	531591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_533528_533674_533798_537725_537792_544656_544785_570252_570287_579961
527978	contig_12250_pilon	+	837	4	Intergenic	novelGene_80565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.7954243967663	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	187	696	298747	304188	FALSE	25	TGGTGGCCTAATAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVQPVSGSSPIPSVPTCFYPGSGTQRCCHQRSHQVRGSWPGGFSPSGLPDPEKRHPTERVVMPVAYQEYRSHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFRNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQTFVPVRPGPRQLIASLDSPQISQVHGVIQVDVAPASGGRGFSDTGGDSHSGETIPMASRGGA	289954	304329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_290127_298732_298894_299252_299390_303962
527980	contig_15449_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_33624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	807	junction_3	584.983380580641	2012	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	146	520	84815	88945	FALSE	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	62208	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000_86181_88888
527982	contig_12790_pilon	+	2085	9	Intergenic	novelGene_35238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	285.919459813424	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	204	1157	307252	312473	FALSE	25	CAGATTCTGATGGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKESFFLSLQSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305940	313401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_310009_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
527983	contig_401_pilon	-	1809	4	Intergenic	novelGene_42864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_3	52.6561170868748	1334	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	422	1543	1724288	1721973	FALSE	10	TATACTTCTGTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728785	1721706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
527984	contig_12622_pilon	-	1651	8	Intergenic	novelGene_5968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2505.30311009853	22	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	30	1154	1590968	1585550	TRUE	35	CCTTCAGAAGCGAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVAGPTGPPTAGPSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSGRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWR	1590997	1583553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585705_1586266_1586407_1586528_1586692_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
527985	contig_11281_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_125462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCTCCTTGAAAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834455	834257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_834300_834500
527986	contig_7979_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_125534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAGGTAGCAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045919	1046384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1045900_1046400
527987	contig_2027_pilon	+	2463	15	Intergenic	novelGene_39945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	59	junction_6	85.8958790677197	382	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	235	2019	639829	648974	FALSE	5	GGCTTTTGCTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLTAQSFSTDGEPPPACTLSPTPAPLASTYVFSTTSAAGTRGGGDGAHRRNPSPASMSSGRKSPHSKSPSEQRERKSLADEKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVAQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRTQADELPACLLSAARLVP	638038	649418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643195_643448_643533_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505_648641_648839
527988	SIRV6	+	391	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	5	1193	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
527989	contig_7165_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_116867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	174	473	409087	409386	NA	35	AAATTTTTGAAATGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHSYQGLHQTKSSTARWCPAITTHCSDKDRNRGFWTDLEKDVKQNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHLFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	408913	409630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_408900_409600
527990	contig_11003_pilon	+	1999	10	Intergenic	novelGene_105434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	204.223612617683	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	108	1394	56015	70523	TRUE	15	ACATGCCGCAGCGTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQDSCCKSVLSNRNIL	55907	73034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_70479_70571_72476
527992	contig_10135_pilon	-	2355	8	Intergenic	novelGene_106625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	43.5847754733373	8	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	545	1237	88066	86195	TRUE	15	AGGACTTTGTCTCATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYR	89404	83801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89057_89340
527995	contig_15063_pilon	-	1425	6	Intergenic	novelGene_14312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	944	1267	35891	35108	TRUE	35	GGAAGGTAAGAGTACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39739	34837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39509
527996	contig_15063_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_13803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	790	1113	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36789	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36156_36264
527997	contig_9516_pilon	-	2123	17	Intergenic	novelGene_106170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	101.455328069796	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	244	1926	905571	877957	FALSE	20	TCTGTTCTCTTTTAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSGASGGKIDNSVLVLIVGLSTIGAGAYAYKTIKDDKKRYNERISGLGLTPEEKQKRATTPASEGEPVPQVRVPSHVPFLLIGGGTAAFAAARSIRARDPGARVLIVSEDPELPYMRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTGIRSESETESEASEITIPQSSAAVPQVPVEGEDYGKGVIFYLRDKVVVGIVLWNIFNRMPIARKIIKDGEQHEDLNEVAKLFNIHED	913210	877759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878565_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_898505_898631_899602_899703_905481_905625_909712_909777_913084
527998	contig_11590_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_125581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGATACTTCTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465958	464883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_464900_466000
528000	contig_11338_pilon	-	1729	11	Intergenic	novelGene_6178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	163	546	13454	8840	TRUE	40	GGGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHVHRGARALDGPHQQEGEDAQQQADQRESQPHLGDQGQRGVLHIVVGHEDGKAAQVAAPAGGTAIPAA	13616	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_893_2631_2779_4517_4665_6081_6129_6246_6327_7358_7534_7613_7733_7963_8187_8741_8921_9811_9935_13274
528001	contig_20314_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_125626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	404.363344389318	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	374	1129	8313	24277	FALSE	10	AGCCCCAGTGCCCTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_7989_8316_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
528004	contig_10436_pilon	-	1611	3	Intergenic	novelGene_108478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3501	junction_1	1278.5	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGATGGAATGGAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103587	101404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788
528005	contig_17936_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_29951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	976.672155843505	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	451	1326	91140	119731	FALSE	40	CAAAATTTGAACATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKNYQSLLIPESEKRKAFPLGPVQYQESIQRSPCVL	68274	120003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68391_79103_79277_90978_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_119628
528006	contig_12644_pilon	+	1350	9	Intergenic	novelGene_44680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4922.93451453247	16	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	838	1260	2679895	2680545	FALSE	15	TGTGTTGGAGTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677227	2680635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678841_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
528007	contig_8284_pilon	+	2052	5	Intergenic	novelGene_125700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	982	junction_1	213.778360691628	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTTACAAGAGAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425053	440192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444
528008	SIRV6	+	403	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
528011	contig_1532_pilon	-	1806	7	Intergenic	novelGene_37378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1352.43020974179	2	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	95	1057	29441	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32184	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29446_32094
528012	contig_11338_pilon	-	1929	2	Intergenic	novelGene_6210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	163	579	13454	13038	TRUE	10	CTCCCTCACCTGTGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGAVSTQAGTALEGSLPRDLAPDTSACSP	13616	11548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_11685_11823
528013	contig_8600_pilon	+	2388	6	Intergenic	novelGene_125733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	148.016215327916	47	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	94	945	102400	114451	FALSE	25	CTTTAATTGAATTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETIVFLRRALSGRLTPSLKLPDPGASITSVTMGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSFYIPGGHFTTAWFAIGMGGAFFFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNKMEEGNPRCWYAALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQVWLFSASFICEWFLINVDVTPR	102306	115894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109465_110132_110271_114212
528014	SIRV4	+	248	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1517	638	1062	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2517	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
528015	contig_16303_pilon	-	2027	5	Intergenic	novelGene_34098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	469.341227147158	10	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	93	722	47976	34567	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDVVGRSQFIWGCYTEGLSSFWAISQRLPSVPCCMGLSKHDCLLHQSLQAEKAVDRVS	48068	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33394_33520_34737_38771_38856_40433_40731_47897
528017	contig_12622_pilon	-	1544	8	Intergenic	novelGene_5946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2674.02120181481	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	14	859	1590968	1588627	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSER	1590981	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583622_1587620_1588042_1588434_1588632_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
528018	contig_1244_pilon	-	1724	10	Intergenic	novelGene_38012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	766.803176252623	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	275	1303	933762	923211	FALSE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	934680	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499
528019	contig_4429_pilon	-	2015	2	Intergenic	novelGene_50781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGGTGTTACCGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130453	124252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_125944_130129
528020	contig_10523_pilon	-	2142	7	Intergenic	novelGene_120936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.382466606375	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	306	1073	26656	15001	TRUE	50	AGCAGCAATAAAACAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39421	12759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13044_14215_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_39162
528021	contig_13093_pilon	-	2859	5	Intergenic	novelGene_105222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	87.591380854511	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	232	2658	80341	57754	FALSE	25	TCCAAGAATGGTTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHSGEKPYVCRECGRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCKKCGRGFNRKSDLLMHCRTLLGEKPHVCKECGQGFTNKSNLLRHHRTHSGRELCGAGSVGGTSF	80572	57552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57801_58609_60773_77589_77717_80070_80127_80307
528023	contig_4659_pilon	-	2870	15	Intergenic	novelGene_118181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_10	200.280734093371	258	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	600	2084	130326	126705	TRUE	50	GGAAAAAATGGAAGATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSCIKNPKILLLKCSIEYLYREETKFTCIDPIVLQEREFLKNYVQRIVDVRPTLVLVEKTVSRIAQDMLLEHGITLVINVKSQVLDRISRMTQGDLVMSMDQLLTKPRLGTCHKFYMQMFQLSNEQTKTLMFFEGCPQHLGCTVKLRGGSDYELARVKEILIFMICVAYHSQLEISFLMDEFAMPPTLTQNSSFHSLIEGCGEEGAAQEQFSGSTLPRDPDFPPDRPIMISEALPSDDGSSLESRIVFEKGDQENKSVLQDVVSLKHQECAATACVSGIPCALFPSLPESLLPLHMDDQQDVIGSEQPETLQQTDELHDPKSQMRAFRDPLQDDTGLYVAMEVTSSEDKRKTYSLAFKQELKDVILCMSPVITFREPFLLTEKGMKCSTRDYFAEQVYWSPLLNKEFKEMESRRKKQLLRDLTGLQGMNGSIQAKSIQVLPSHELVSTRIAEHLGDSQSLGRMLADFRARGGRIQQKKFRSFCSFKGCIRHFW	136513	118409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_118485_118913_119028_120654_120834_122174_122347_123004_123077_124458_124560_126631_127814_128062_128190_128865_129007_130218_130327_131975_132127_133348_133424_134065_134247_134673_134804_136451
528024	contig_2100_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_50620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51093	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTTTTTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820061	822094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_820100_822100
528025	contig_11720_pilon	+	1837	14	Intergenic	novelGene_43975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	337.608593092915	4	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	77	1615	262352	272244	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVLEPPSWLTAPTNTSCMGSLMRSRRREGQLDEPPHGGRHLAC	262275	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271966_272120
528026	contig_848_pilon	+	2152	8	Intergenic	novelGene_83347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_6	48.8751011273029	396	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	234	1412	783225	792105	FALSE	10	CTTTGTCTCACGTACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSTANVEFCLDVFKELNSNNIGDNIFFSPLSLLYALSMILLGARRNSAEQMEKVLHFNHVVESLKPGFKDSSKCSQAGRIHSELGALLSQIKQPDSNYTLSIANRLYGTKLMAFHQQYLTCSEKLYQAQLKTVDFEHSPEETRKTINAWVESKTNGKVTNLFGKGTIDPSSVMVLVNVIYFKGQWQNKFQEGETSKTPFQLGEGKSVTVDMMYQTGIFKLAFIKKPRIQVLELPFVNNRLSMIILLPVGKAKLEQIEKELNLKTFQEWTSSSNMMEKEVEVYIPRFKLEIKYELNSLLKSLGMTDIFDQTKADLSRMSPAKNLYLSKVIHKSYVDVNEEGTEAAAATGNIVVVKNVPMRAQFMANRPFLFFIKHTRTNMILFFGKLASP	739873	792845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_740088_783205_783393_784636_784697_785878_786008_787957_788076_789566_789710_790763_790920_791700
528028	contig_1225_pilon	+	2271	5	Intergenic	novelGene_44186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	265.823249547514	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251382	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274370_274798_276477_276576
528029	scaffold_19766_pilon	+	2276	14	Intergenic	novelGene_34417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	164.749406262679	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1061	2116	847654	851417	FALSE	20	CACCTTCTAATCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	843767	851577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845611_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
528030	contig_9290_pilon	-	1958	12	Intergenic	novelGene_77546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	283.139366437178	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	653	1621	487534	478940	FALSE	30	TAGAGTTATCTTTGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497001	478602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486230_487529_487663_489929_490037_491390_491545_491926_492119_496930
528031	contig_14273_pilon	-	2393	6	Intergenic	novelGene_21130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	20.4117613154769	510	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	388	2316	24983	20187	FALSE	30	CTTAGTGGTTTTAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGICCSVNFSVEHFSKDLKEDLLYNLKQRGPNSSKQLLKSDVNYQCLFSGHVLHLRGVLTPQPVEDERGNVFLWNGEVFNGIMVEAEENDTQIVFNYLSSCKNESDILSLFSKIQGPWSFIYYQASTHYLWFGRDFFGRRSLLWHFNNLGKSFCLSSVGTQTSGVANQWQEVPACGIFRIDLKSAAISKCVILKSYPWKYISRENVIKECVDSLTQISADLPKIVSVEANEAKLYLEQSVVPLNMVLPPAAFETHCTDISRVPPIRETLQVCLTDRHMKEVVQQFIDVLSISVKRRVLYLPRDESLTSNVLKTCDKRASIAILFSGGIDSMVIATLADRHIPIDEPIDLLNVAFMTKEKTIPTSSNKKRSKQKNHCEIPSEEFSKNLAATADDNPDKQLSVPDRITGRAGLKELQAVNPSRIWNFVEINVSLEELQKFRRTRICQLIQPLDTVLDDSIGCAVWFASRGIGCVVTQDEVKSYQSNAKVVLTGIGADEQLAGYSRHRVCFQTHGLEGLNKEIEMELGRISSRNLGRDDRVIGDHGKEARFPFLDENVVSFLNSLPIWEKANLTLPRGIGEKLLLRLAAVELGLTSSALLPKRAMQFGSRIAKMEKNNEKASDKCGRLQVISSENLSIEKEIKM	29345	20109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_20473_23046_23229_23522_25076_25991_26068_27254_27309_29180
528032	contig_8045_pilon	+	1279	5	Intergenic	novelGene_35387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	44	583	116169	118722	FALSE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116125	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
528034	contig_3948_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_53406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	643	1092	1861398	1860949	NA	30	GTCAGGAACCAGCGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQADLPVGCEAADTINSSGAPVLGPAGPSVMVMGARGEEGTGVVLNCKGHPSFGRGASCSNSPPSWVGLASSRRPLEDPGWDWRALARPEVGRRSWSLPLCKQPESLISHKWPLSGSRRWRWKEGKPRSRREWEMINSEATNIKTKAI	1862040	1860517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1860500_1862000
528035	contig_16492_pilon	+	2375	10	Intergenic	novelGene_100269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	92.1460193871059	1037	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	107	1621	78509	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQEATNQLLDVNLFENQRFVKVTESGHRSESEHLEVTVGATVPTGFEQTAADEVREKLGSSCKISKDRGKIYFDISVESLAKVHCLRSVDNLFVVVQEFKDYQFKETKEEVLKDFEDLAGKLPWTDPLKVWKINTSFKKKKAKRKKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76785	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78764_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
528036	contig_13300_pilon	-	2335	3	Intergenic	novelGene_125814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	29.5	17	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	250776	248617	TRUE	25	AAAAGAGGGTTTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250778	244177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_248782_250575
528037	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27135	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528038	contig_11115_pilon	+	1838	7	Intergenic	novelGene_102830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	437.142488847236	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	195	1715	165608	173204	FALSE	15	CGGAGTCTGTGGCTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLCPGQPGSHDELFARSLQAQCARRDPIPRQVIPQWHLPLSGRQLAGHDHRGGGDGSSGLERPLRHHHHGGVSGLGPGDYYSSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	165413	173327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172794_172964_173047
528039	contig_12873_pilon	+	1642	5	Intergenic	novelGene_27190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	1289.63742482141	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	359	1072	16357	19855	FALSE	35	TTAAGCCAAATTTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15998	20425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
528040	contig_2987_pilon	-	2704	13	Intergenic	novelGene_125852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	60.3316643415564	230	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	106	2619	522271	507993	FALSE	30	TGATTCTTCCAAAGGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSHLYRDGEGRMDEDEDEHENFEITDWDLQNEFNPNRQRHWQTKEEATYGIWAERDSDEERPSFGGKRTRDYSAPVSFISAGLKKGAAEEAELEDSDDEEKPVKQDDFPKDFGPKKLKTGGNFKPSQKGFAGGTKSFMDFGSWERHTKGIGQKLLQKMGYVPGRGLGKNAQGIINPIEAKQRKGKGAVGAYGSERTTQSLQDFPVVDSEEEAEEEFQKELSQWRKDPSGSKKKPKYSYKTVEELKAKGRISKKLTAPQKELSQVKVIDMTGREQKVYYSYSQISHKHNVPDDGLPLQSQQLPLPGKEAKAPGFALPELEHNLQLLIDLTEQEIIQSDRQLQYERDMVVNLSHELEKMSEVLDHEERVISNLSKVLEMVEECERRMQPNCSNPLTLDECARVFETLQDKYYEEYRMSDRVDLAVAIVYPLMKEYFKEWDPLKDCTYGTEIISKWKSLLENDHLLSHGGQDLSADAFHRLIWEVWMPFVRNIVTQWQPRNCDPMVDFLDSWVRIIPMWISDNILDQLIFPKLQKEVENWNPLTDTVPIHSWIHPWLPLMQARLEPLYSPIRSKLSSALQKWHPSDSSAKLILQPWKDVFTPGSWEAFMVKNIVPKLGMCLGELVINPHQQHMDAFYWVIDWEGMISVSSLVGLLEKHFFPKWLQVLCSWLSNSPNYEEITKWYLGWKSMFSDQVLAHPSVKDKFNEALDIMNRAVSSNVGAYMQPGARENIAYLTHTERRKDFQYEAMQERREAENMAQRGIGVAASSVPMNFKDLIQTKAEEHNIVFMPVIGKRHEGKQLYTFGRIVIYIDRGVVFVQGEKTWVPTSLQSLIDMAK	524074	507907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_508349_510118_510285_510773_510917_511458_511703_512416_512586_513337_513445_513566_514095_515391_515545_517516_517645_519400_519558_519837_519992_522062_522321_524018
528042	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
528043	contig_9995_pilon	-	2461	5	Intergenic	novelGene_47694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	759.838593057763	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	74	772	321559	297327	FALSE	15	AATTTGCCTTTTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPAVSPGVVSPTFELTNLLNHPDHYVETENIQHLADPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKRNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARGPHFNPSAIHNFYDNIGFVGPVPPKPKVKSIT	321632	295637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297344_299626_299708_300994_301061_301720_301790_321093
528044	contig_19564_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_29610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	135	554	15529	12334	FALSE	50	TGAAAAAAAGAAACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQPLVHR	15663	11346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12351_13132_13259_13554_13666_13945_14055_15472
528045	contig_1076_pilon	-	2100	16	Intergenic	novelGene_101089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_12	334.749431996863	1598	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	561	1871	65958	50922	FALSE	20	TAAGGCAGTTTTGTGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	79708	50692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_65952_66033_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
528046	contig_9272_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_125878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTCTTGCTCCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214374	214828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_214400_214800
528048	contig_16303_pilon	-	1828	8	Intergenic	novelGene_34100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	126	1217	45428	35759	TRUE	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45553	33136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33275_35285_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
528050	contig_1725_pilon	+	1770	15	Intergenic	novelGene_24300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	613.736469571128	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	131	1207	236065	248899	TRUE	20	GTGAGTACGTTGCCGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQALRKTLRSYLCPEQL	218482	252778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711
528051	contig_9982_pilon	-	1771	14	Intergenic	novelGene_55759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	231.076564580281	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	70	1083	353538	344025	TRUE	25	GAGCCTCAACTGTCCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLV	353607	339712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344273_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
528052	contig_10011_pilon	+	2687	8	Intergenic	novelGene_68098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	100.360574420233	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	46	1977	322928	333031	FALSE	30	GAATGCCCAACACGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKVDAPCLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322882	333741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328548_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994
528055	contig_5485_pilon	-	2061	5	Intergenic	novelGene_37687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.080902468334	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	154	1296	87935	85491	TRUE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85008_85052_86133_86257_86366_86774_87027_87794
528058	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_9871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	239	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27130	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528059	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_10118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	238	750	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
528060	contig_6795_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_27675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAACATGGTTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59160	58606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_58600_59200
528061	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528064	contig_14744_pilon	+	2531	5	Intergenic	novelGene_66053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	3641.44195340253	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	20	427	1382976	1383476	TRUE	20	TACATTTAACTTGTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMVRFGGCSRLDVFSLSANTLKICMY	1382037	1386684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1384574_1385183_1386006_1386499
528065	contig_3122_pilon	-	3199	20	Intergenic	novelGene_64384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	111.439013543786	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	970	2913	48	2960	276393	250499	FALSE	15	CTACCAGCTTTATTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELKEPGEWLSSCTRMSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQEREGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQLKIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEKKENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRLMQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKEHLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENSVTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG	277533	250259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256546_257951_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270053_270181_270292_270461_276264_276420_277512
528067	contig_10581_pilon	-	2380	11	Intergenic	novelGene_41407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_5	78.3545786792323	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	203	670	633234	627471	TRUE	15	TGGCTCCTTGTTTTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDELESKPELLVQFVQNTSIPLEQGLVESETKDITCLSLLPVTEASECSRLMLPDDTPNHTNSSKEVPSSAVLRSLQVNVGPDGEETRAQTVQKSPEFLSTPESPNLLQDLQPNDSTSFILLNLTRAGLGSSAEHLVFVQDEAEDSGNDFALQ	649698	609103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620102_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
528069	contig_15063_pilon	-	1670	7	Intergenic	novelGene_9649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	927	1250	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39748	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36566_38972_39090_39504
528070	contig_4678_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_126039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	86	352	496751	497017	NA	20	TTATTACTCATTTTGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASLGLCQSVTRDWADHGTLSPLARLSQMGLPLPSGSQGASSLMLGPVLKILLSEMPQPRPGGCPWPTLKHSASPCNNRHTCPAIICPSCVCLWGVCVCVCVCVCVCMYAREKGVG	496665	497130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_496700_497100
528071	contig_15063_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_13961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	12	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	198	1433	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528072	contig_9049_pilon	+	1609	8	Intergenic	novelGene_83121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1673.78312788237	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	256	756	95983	112652	TRUE	50	GAAAAGAAATAGTTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88248	113715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95970_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113018
528073	contig_9848_pilon	-	2673	6	Intergenic	novelGene_79984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_2	564.946227529665	107	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	149215	130372	FALSE	40	ACCTTACATAATATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGFRDDFLGGRGGSRPGDRRTGPPMGSRFRDGPPLRGSNMDFREPTEEERAQRPRLQLKPRTVATPLNQVANPNSAIFGGARPREEVVHKEQE	149226	128396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_130512_130796_130935_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
528075	contig_366_pilon	-	2827	15	Intergenic	novelGene_51636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	182.623623212064	1215	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	662	2020	1420753	1406847	FALSE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVMALLLLLLVLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNTYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGLSPDPGQDPDGVTGYKNIHLEKKCVHRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSSNDSFSEQGLDKEDRRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTSGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWDLEPTRRPTFKQICFLLREQAKVDRKEQDYANLTSSSSSGSSSGGSGSSEPEESSSEHLACCEQGDSSQSMLQPNNYQFC	1441005	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1407006_1407102_1407212_1408086_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420765_1435758_1435983_1436405_1436664_1440837
528076	contig_10436_pilon	-	902	4	Intergenic	novelGene_108494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	27	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	116	469	103480	102032	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103595	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
528077	SIRV4	+	243	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1488	672	1033	-40	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTGCACATGCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2488	2731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
528079	contig_14441_pilon	+	1396	7	Intergenic	novelGene_100668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	364.58077141957	171	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	782	1210	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112132	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_112401_112665_113048_113209_113879_114048_116558_116963_117220_117344_117539
528080	contig_383_pilon	+	2053	7	Intergenic	novelGene_126079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_5	44.1314324867586	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	67	1368	21066	42668	FALSE	40	CTGATTCTGTAAAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSETIRSLGQAEGRKPAESTEEMASCLKADWNRRFQTLVFRAAHLLCFSTLICELMDQREVAAWTYHHSTTAYPWNVSRAFCQKYYTDLVAIQNKNEIAYLNDVIPYYNSYYWIGIRKINKVWTWVGTKKTLTEDAENWADNEPNNKRNNQDCVEIYIKSSSAPGKWNDEPCWKKKRALCYTASCQDMSCSKQGECIETIGNYTCSCYPGFYGPECEHVRECGEVDLPQHLLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCPKGYTLKGPSKLECLASGNWTSKPPQCVATQCPPLEIPEQGSMACLPPEKELQHQSSCSFRCEEGFALVGPEEVRCTASGVWTAPAPVCKAVQCRLLEAPSKGTMDCAHPLAAFAYGSSCKFECQPGYRVRGSDTLRCIGPGQWTAPMPACEGRISLYQPPTHLGSRQGTVERPRALNVKVTSSMLWHWSKMFNLQEAWFSTL	20999	43353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_21069_34860_34952_37371_37759_39957_40066_40538_40725_41553_41740_42327
528081	contig_383_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_126085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTGTGCATATGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43905	45909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_43900_45900
528083	scaffold_12124_pilon	+	1799	7	Intergenic	novelGene_22067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	532.401608019944	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	10	945	836073	858123	FALSE	30	TAAACTGGCGTCTTCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGMVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTHDPMCYGIEPSLLGFSWL	836063	858977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847748_858068
528084	contig_5280_pilon	+	2162	8	Intergenic	novelGene_52591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	715.370718792797	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	32	532	38343	41734	TRUE	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEF	38311	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41069_41732_41814_47249_47508_56218_56384_62043_62065_78042
528085	contig_14513_pilon	-	1077	2	Intergenic	novelGene_70395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	10	CATGCCCGCTTAGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12129_18691
528086	SIRV6	+	819	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	342	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	19	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	266	577	2021	10736	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1645	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528087	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10419	82	1182	54	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGTTTGGTCGCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11419	11744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
528088	contig_19579_pilon	-	1468	6	Intergenic	novelGene_59376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	562.77647427731	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	106	696	13090	7943	FALSE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12900
528091	SIRV6	+	649	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	14	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACGTTTGGGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1542_1645_1728_1852_2027_2470_2621_2740
528092	contig_5718_pilon	+	1825	12	Intergenic	novelGene_110437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	260.542250820879	797	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	21	1091	1617860	1629221	TRUE	25	TTCAAACTTCTTGAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIVIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKLWQVYYLCHSV	1617839	1631590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1622890_1622963_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477_1625616_1628604_1628635_1629215_1629346_1630980
528093	contig_1309_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_73987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATCTCTGTGTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336345	334411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_334400_336300
528094	contig_14986_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_59735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	658	1098	151613	152053	FALSE	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150294	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150638_151298
528096	contig_9389_pilon	+	2395	4	Intergenic	novelGene_84116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	459.426454034448	872	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	102	755	1408796	1423232	TRUE	0	TTTGGCTGCTGGTTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQRGARAPVDFLPPLGHCAWDASPGPEPWSPRMSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVGTPFPKNFLQAVKKILSRLFRVFVHVYIHHFDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVREFGLIDTKELEPLKEMTMRMCH	1408694	1425354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1409217_1418063_1418267_1423202_1423526_1424007
528097	contig_14744_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_66146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2022	2321	1650313	1650014	NA	80	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYYPNHSFLSSCHYPHQFYLQLLTGLTLPSVLFFYGLVSAWGRFSRKLSSASQNPEPFIKLFYFEIDFDLIVRLSRECLTKTEKIGRDVNVKPGSIRD	1652334	1649564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1649600_1652300
528098	contig_8153_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_34801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTTCAACAGTACTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41415	39910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_39900_41400
528100	contig_12948_pilon	+	3010	1	Intergenic	novelGene_126200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233592	236602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_233600_236600
528101	contig_8671_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_126234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	584	895	18113	17802	NA	25	TTACACTTATTCATGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIRVGPNTLTQVTSLIPCIGSFLGMWPASPFILQEIKRERSKQRDRDFIPPRKKCWEWSMSFVPGVPALRSSKTRGRLMTRTFPQTRKPSLSDGTLNSDF	18696	17086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_17100_18700
528102	contig_9345_pilon	-	690	2	Intergenic	novelGene_24587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	640	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	42	479	945468	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945509	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
528103	contig_12622_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_5906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2239.33037830729	64	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	61	1635	1590968	1583538	FALSE	20	TATGTACATGTGTGTGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPPPPTFLFCWNISNKFGFSNLQKRI	1591028	1583535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583609_1586683_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
528104	scaffold_12124_pilon	-	2147	9	Intergenic	novelGene_22002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	8.26797284707685	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGAGCCAGGCTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810709	791850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_791951_800002_800146_802988_803111_803837_803971_804058_804234_807297_807499_807578_808462_809815_809951_810454
528105	contig_10311_pilon	-	1794	12	Intergenic	novelGene_50439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	992.978539629779	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	459	1148	68736	65773	FALSE	15	AAGTTGCTTTGGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_68905_69013_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
528106	contig_401_pilon	+	1945	9	Intergenic	novelGene_42871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	186.123572862225	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	26	424	1749725	1764546	TRUE	15	TTTCCAAACTGCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGG	1749699	1768483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764582_1764692_1764745_1765957_1765997_1767088
528108	contig_5936_pilon	-	673	3	Intergenic	novelGene_53602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	52	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGCTTCCGTAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560522	555392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_555488_555609_555898_560232
528109	contig_8616_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_72438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	29	349	255468	255148	NA	15	CATCTTGGTACTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQVRLRGGDSLGLGRTGGGLANPEPESRAAFWSFPGRPRPARCFSVVYRGDAAMLIELCSPARPGYTSKSFPCKKG	255496	253303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253300_255500
528110	contig_19402_pilon	+	1870	13	Intergenic	novelGene_80775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_11	1718.73163020486	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1245	624	1868	29462	101188	FALSE	45	GATAAGAATGAGGAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKVEKTHIKVTVPTSNGDQTQKPAEKTED	23464	101190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_100931_100989_101164
528111	contig_11422_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_99046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1910	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1900
528112	contig_3193_pilon	-	3186	11	Intergenic	novelGene_126302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	72.7137538571624	325	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	82	2481	98257	47316	FALSE	10	GGCGTCACTTTGTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRGLQGFVGSTCPHICTVVNLRDLAERHRSKHPGCSPTVVVDAMCCIRYWYTPESWVCGGQWREYFSALRNFVNAFAEVGIKLVFVFDGIVEQDKRDEWVKRRRKNSREISRIFQYIKSHGEQPGRHMFFIPPGLAVFTQLALKALGQEAHCSLQEADYEVASLGLQDGCLGVLGEDTDYLIYNTCPYLSIRELCLDTLDTVMLCREKLCESLCLSVTDLPLLACLLGNDVIPQGMFESFRYKCLSAYTSVKENLNKRGNVILAVADHIAKVLRLHQGEKKLEEMLPLGPNKALFYRGVASYLLPGQKSPWFFKKSKAVTTLDKQILSMSSDSESKQEVAMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVPMCTDPESRQEVPMCTDPESRQEVPMYTDPEFKLEVPMCTDPDIKQVTMSSDPEIKQQVTPCSDPEIKHEVTMVSDPEILEVARAHHVWGESYLVYNVMSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVDTLGLEDLQALIAQALCLQGKSTAQLVDLQLDHINPRAVQLGSLFVRGLTTLVFVNSACGFPLDMSDFMPWNIFDGKLFHQKYLQSEKGYSVEALLEQNRSLLMRFHSLKSVVVKACLRENRRIKSRQRWGSHHTGRWSRQGSGSQQPSSGYGRPGQGQPWRYPGPGRRQCEHDQWRRYSSSSGWSR	113236	46610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47329_50395_50448_61027_61121_62913_63023_64886_65094_79015_79109_80133_80307_81725_81831_94139_94321_96883_98270_113167
528115	contig_6418_pilon	-	1511	13	Intergenic	novelGene_81116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	400.113386707096	95	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	66	1118	106563	69523	TRUE	35	TATGTTAGAAGCAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQVCPEVLSALPCHPEVPGSLERWPVRVVTAG	118013	68222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69429_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
528117	contig_5780_pilon	+	1821	6	Intergenic	novelGene_29784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	249.342014109135	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	281	649	107519	112556	FALSE	10	GTTTTGCATGGGACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGHIQPMPVFTVPQIAVTCAPLQPSDARQLQAVHSGRPNTIPSLQASLRQSPAYRQCRPCRFLC	73990	113728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_112042_112145_112467
528119	contig_16685_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_115069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTCTTTTATATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629510	628898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_628900_629500
528120	contig_5302_pilon	+	2173	3	Intergenic	novelGene_81498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	29	820	342315	355700	FALSE	25	TCCATGATTTTATTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342286	357053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
528122	contig_15629_pilon	+	602	3	Intergenic	novelGene_122450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	3.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGTATGTGCTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97403	102828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_97711_102174_102322_102680
528125	contig_15063_pilon	+	1642	6	Intergenic	novelGene_14157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	152	1387	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34656	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528126	contig_3077_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_26689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	3891.34313415755	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	461	1027	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10042	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
528131	contig_4857_pilon	+	2912	4	Intergenic	novelGene_48831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	50.0754985552371	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAACTGTTAATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1339922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335192_1335517_1336704_1338119_1338905
528135	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	12	1487	28164	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28152	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528136	contig_5643_pilon	+	1174	10	Intergenic	novelGene_38865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	87	968	236108	237983	FALSE	15	CAGCCACCTCTTTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236021	238189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
528138	contig_5954_pilon	-	2586	14	Intergenic	novelGene_28639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_7	401.663375795729	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1515	2225	947127	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
528140	contig_12873_pilon	+	1228	4	Intergenic	novelGene_27227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2397	junction_1	433.996159737234	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	163	654	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	17733	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_18014_18984_19264_19611_19703_19851
528141	contig_15047_pilon	+	2176	4	Intergenic	novelGene_52245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3636.88587790281	2	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1097	1636	4112	21099	FALSE	30	TGGAAGACCGGAGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNAEFLNFLTFFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSSSGGDSAQGSDVSLTASKGETLEGLMWRTG	2597	21639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2812_3229_4434_4552_4676_21004
528142	contig_2100_pilon	-	1328	10	Intergenic	novelGene_50691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.92640773758	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	182	1081	1182812	1170166	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLVRPLFLMQMAAPGSDQDCGAFGS	1185523	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170241_1174244_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1184432_1184502_1185420
528143	contig_10629_pilon	-	1952	10	Intergenic	novelGene_52900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.072727832975	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	80	355	256132	253155	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPGRDRMEEAEGISEKGRGGGER	256211	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246562_246613_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_254584_254689_255094_255140_256066
528144	contig_9594_pilon	+	1705	11	Intergenic	novelGene_73950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	520.029191488324	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	91	1275	301335	322451	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSGFLMKKELNYFAKALERAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301244	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316234_316286_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
528145	contig_12566_pilon	+	2497	20	Intergenic	novelGene_86002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	78.6337630923317	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	165	2369	47610	86354	FALSE	30	CTAACTCTTTAGATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44358	86482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44421_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
528147	SIRV4	+	380	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	928	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCGTCTTCTTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
528148	contig_11720_pilon	-	1987	4	Intergenic	novelGene_43755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12.2836838484589	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	152	1201	16869	15725	FALSE	20	CCTTCTGGAAGAACCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKHHLVKFICLGIWVLSLILSLPFFLFRQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHDNHHPRG	18344	14938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_15749_15843_16878_17281_17358_18277
528149	contig_10793_pilon	+	1207	13	Intergenic	novelGene_83416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3604.22757173973	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	156	896	152887	163940	TRUE	35	CTGTAATCATGAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130963	165208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146996_151423_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161423_162562_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054
528150	contig_1225_pilon	-	2104	2	Intergenic	novelGene_44205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACGGAAGCCATCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276692	274545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_276202_276244
528152	contig_20819_pilon	+	1927	6	Intergenic	novelGene_55627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	488.49835209548	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	27	902	29817	42592	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLPTSPLPRIQRKRKYSEGIITSTLLKHHHLWPELLQ	29790	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40419_41530_41569_42519
528153	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_9711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528154	contig_8581_pilon	-	2282	16	Intergenic	novelGene_22824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.224200469066	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	57	2261	386058	306361	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGQSCGKVSCLHLGKRNRPTNNAVTGISHCFCEPCCMT	386114	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306472_314677_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
528155	contig_14925_pilon	-	1166	3	Intergenic	novelGene_55291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	336	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	78	557	116065	112704	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSVQSGTNRFPNPFSMRKISPGRKRVHVLLPKHEMFCPTQHHICPKLTFLSPHLVHVPPTTLELVMGGGIVPNFQPFWFS	129478	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112940_115821_116101_129436
528156	contig_11115_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_102834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	583.695982511444	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	658	1632	171704	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWATCPALSQPAHHQGNFSLKTGHHGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165534	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165611_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
528157	SIRV6	+	487	2	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	826	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGACTTGCGTCGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11063	11651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_11114_11214
528158	contig_5643_pilon	+	1142	10	Intergenic	novelGene_39100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.086210791432	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	547	933	640257	641217	TRUE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	635195	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_635251_636184_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638171_640242_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
528159	contig_4151_pilon	+	1834	3	Intergenic	novelGene_65233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	102.5	249	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	123	689	528988	663644	TRUE	15	GGTGTGTCCTCTTGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528865	667423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078_664642_667275
528160	contig_854_pilon	+	1958	15	Intergenic	novelGene_36502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2473	junction_1	1868.29856570417	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1785	174	1958	1649514	1689395	FALSE	20	ATTGCCACGCTGCTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDN	1612772	1689395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338
528161	contig_4754_pilon	+	2117	15	Intergenic	novelGene_35948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	234.510573714009	2	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	66	866	380119	410309	TRUE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAADGPGPRLPEPNEGL	380053	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409655_410265_410352_410471_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414952_415742_415898_416938_417082_420211_420252_420370
528162	contig_15304_pilon	-	1244	2	Intergenic	novelGene_30477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	198	392	54100	53906	TRUE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
528163	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
528164	contig_6199_pilon	+	1787	4	Intergenic	novelGene_126384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	147.691119119149	1734	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	31	495	461129	513685	FALSE	30	AAGATTTGAATGTTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWDSSSTRSKMAASRRLMKELEEIRKCGMKNFRNIQVDEANLLTWQGLIVPDNPPYDKGAFRIEINFPAEYPFKPPKITFKTKIYHPNIDEKGQVCLPVISAENWKPATKTDQVIQSLIALVNDPQPEHPLRADLAEEYSKDRKKFCKNAEEFTKKYGEKRPVD	461098	514977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_461156_478402_478499_501226_501414_513530
528165	contig_12873_pilon	+	1429	4	Intergenic	novelGene_27134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	1435.61090364578	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	421	855	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15936	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_18984_19264_19611_19703_19851
528166	contig_4759_pilon	-	2180	4	Intergenic	novelGene_106332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	528.669609071257	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	268	870	650121	587401	FALSE	20	TTGGAGCCTGACTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPKTDCRSPVGLDCCSCCLDLAHRSELQGDSSGENNNPGSPTVNNFRQLQEKLIFENLNTDKLNSIMRQDSLEPVLRDPCYLINEGICNRNIDQTMLSILLFFHSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	650937	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_649801_650228_650776
528168	contig_12638_pilon	+	1946	12	Intergenic	novelGene_33137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	561.354751493913	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	557	1072	191339	199604	FALSE	40	TAAGAAATCTCATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	182978	200478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191262_191319_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
528170	contig_5549_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_81582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1408.35702149704	85	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	379	852	86768	96749	FALSE	0	TTTGGCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	97029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82313_86608_86819_91687_91835_93264_93412_96620
528171	contig_6356_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_126434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAGAGACTTTTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100378	101736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_+_100400_101700
528172	contig_6795_pilon	+	963	6	Intergenic	novelGene_27733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	273.129566323384	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	28	846	320577	324643	FALSE	15	GCCCTCTTACCCTCACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRCESGAMEGTGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRSVVPVLGHVPYPWPCLSVTARFGPAPSKILPCSLNFPVALALPPLDLATLHPSWVGLYPAGSACWLGWPVPSLNIILPPS	320549	324760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237
528173	contig_6795_pilon	+	1476	8	Intergenic	novelGene_27746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	308.928893476298	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	240	497	331921	332306	TRUE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTRCLGGVSVVDR	331607	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_331693_331766_331990_332117_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
528176	contig_6227_pilon	-	1832	19	Intergenic	novelGene_49759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.073657263785	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	132	1751	1223803	1202706	FALSE	30	AAAGAGGTTATGGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSLLLVPIAIVCTAWSCPTLPRAPSGCRLGPQVSWGTRVWNPSTRLSPGPPALLRN	1224954	1202624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202870_1202972_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
528177	contig_7066_pilon	-	2230	18	Intergenic	novelGene_42209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	105.74281655316	2	28	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	103	1827	1128537	1078816	FALSE	50	AAATAAATCTTTTTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARDAAAASAGSSASSGNPPPQEPGLGELLEEFSRTQYRAKDGSGMGGTKVERIEKRCLELFGRDYCYSVIQNVNGEICGHYPRHIVFLEYESSEKEKDTFESTVQVSKLQDLINRSKMARCRGRFVCPVILFKGKHICRSATLAGWGELYGRTGYNYIFSGGADDAWADAEDVTEEDCALRSADTHLFDKVRGHDIKLLRYLSVKYICDLMVENKKVKFGMNVTSSEKVDKAQRYADFTLLSIPWKQDYVDAPLSIPDSLKRSLNIDWSQYQSWDLVQQTQNYLKLLLSIVNGDDDSGLLVHCISGWDRTPLFISLLRLSLWADGLIHTSLKPAEILYLTVAYDWFLFGHMLVDRLSKGEEIFFFCFNFLKHITSEEFCALKTHRRKSLSARDAGFTLEDLYMLRRRDRGSTTSLGSDFSLVMESSPGAAGSFTYETVELVPAGAQTQAAWRKSHSSSPQSVLWSRPQPSEDRLPSHHGLVEAKSSSSSSSNHSDNFFRMGSSPLEVPKPRLATLSDRETRLQEVRSAFLAAYSSTVGLQAAAPSPSGAIGGLLEQFARGVGLRGTSSSIL	1128639	1078412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1079000_1089724_1089905_1090595_1090735_1090905_1090965_1091742_1091814_1094005_1094043_1094323_1094401_1094718_1094805_1095968_1096036_1101150_1101226_1101847_1101858_1109278_1109345_1110615_1110739_1112265_1112327_1112639_1112716_1118699_1118809_1126358_1126508_1128381
528178	contig_8823_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_53064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	784	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTGAGCATCTACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66714	69164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_66700_69200
528179	contig_11285_pilon	+	2084	5	Intergenic	novelGene_5648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_4	521.153288390278	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1264	1761	769191	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	767654	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_767836_768024_768527_768610_769320_769421_769653_769740
528181	contig_7004_pilon	+	1777	3	Intergenic	novelGene_126467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_1	94	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	820	1707	394844	395731	FALSE	10	TTTCTTGTCACCTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	392052	395801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394514_394759
528182	contig_1107_pilon	-	2535	2	Intergenic	novelGene_126537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	430	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	362	703	126174	124671	FALSE	65	AAAAAAAAAACCAGACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDDLVLALQLQEEWDLQALRRDHAQEPLSLVDASWELVDPTPDLQALFVQFNDRFFWGQLEAVEVKWSVRMTLCAGICSYEGRGGMCSIRLSEPLLKLRPRKDLVEVFFAQT	126535	122838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_124792_125953
528183	scaffold_9100_pilon	+	1570	7	Intergenic	novelGene_83248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	386.78392618561	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	545	1024	651131	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644811	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647254_650383_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
528184	contig_6735_pilon	-	1483	13	Intergenic	novelGene_15681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1012.36769711734	249	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	669	1277	545923	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDTYLVVLPHPP	568267	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542222_543080_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552901_554235_554374_564157_564232_564784_564869_568198
528186	contig_5780_pilon	+	3015	3	Intergenic	novelGene_29785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	193	1788	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1156	1545	111869	112258	FALSE	10	GTTTTGCATGGGACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	73990	113728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104924_110810
528187	contig_4531_pilon	-	2658	1	Intergenic	novelGene_47894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	489	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAATGAATGACTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331133	328475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_328500_331100
528189	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
528190	contig_10629_pilon	-	2374	15	Intergenic	novelGene_52902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	428.026343839264	3	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	130	1023	256957	247382	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERNSLPALYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267655	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248421_253133_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
528192	contig_5280_pilon	+	1934	10	Intergenic	novelGene_52605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	623.484255842881	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	20	1090	38343	78098	TRUE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38323	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042_78479_78690
528193	SIRV6	+	398	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-10	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_1845
528194	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	3	1412	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528195	contig_14924_pilon	+	2618	17	Intergenic	novelGene_104151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	58.1463670404265	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	45	1553	44129	53716	TRUE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPKYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISERATNRREVESWSSGLESNEARQKFAGAKAISSDMFFGREMDSEYEARSRLQQLSGSSAISSSDLFGEVDGAHGAGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQDRYGSY	44084	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48249_48788_48896_49018_49151_51163_51293_51371_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695_53823_53997
528196	contig_15063_pilon	+	1460	4	Intergenic	novelGene_14163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	146	1318	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34662	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528197	contig_9471_pilon	-	2151	6	Intergenic	novelGene_21831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	983	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATTAAATTTCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417524	412524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412823_413708_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
528198	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
528199	contig_7396_pilon	-	1982	16	Intergenic	novelGene_79638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3183.74859699834	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	204	1298	255163	247765	TRUE	25	ATTTAGTGAACCTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWRLFLCRGSWLIW	257472	245947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248227_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
528201	contig_2438_pilon	+	1123	5	Intergenic	novelGene_112040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	63	662	310588	312871	FALSE	20	GGACTGCGTTCACCGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305103	313332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
528202	contig_10599_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_49904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACACCACACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326465	325210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_325200_326500
528205	contig_7428_pilon	-	1908	3	Intergenic	novelGene_77745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	808	junction_1	48.5	3680	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	151	528	515358	514339	FALSE	20	CCTGGCAGAATGTGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYAEKLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515508	512958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515026_515337
528209	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_10306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	237	734	34808	35888	TRUE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVPANNHQYLRHPPILC	27132	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35369_35839_36158_36266
528210	contig_5231_pilon	-	2503	8	Intergenic	novelGene_65893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	135.094524730815	560	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	25	720	222876	212509	TRUE	35	TAGAATGTGGAAAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDNVSAMEGSWKIGEEFHIDKDMGFALPNPLEELPHTYAPWISIARNLPVLIENGQLRAEVEKLSQLSIDELRGHKLQRLAHLVLGYITMAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHSKYLCGTTF	222900	208842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283_219380_222777
528211	contig_3975_pilon	+	2445	8	Intergenic	novelGene_54763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	109.449084239277	83	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	7	927	1961329	1984755	FALSE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATATVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961322	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965885_1973395_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
528213	contig_8138_pilon	+	1839	6	Intergenic	novelGene_52409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	119	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	227	709	280295	306552	TRUE	10	CTTCTTAGTAGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280068	307935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306936_307188
528215	contig_3948_pilon	-	2072	12	Intergenic	novelGene_53322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	422.406192823374	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	898	1755	1485208	1468245	FALSE	35	AAGACTTCATCAACAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510934	1467927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510825
528217	contig_9014_pilon	-	1928	13	Intergenic	novelGene_106751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	67.5721836261046	17	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	510	1058	82349	79637	TRUE	5	TGTTTGTTTTTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	83402	78121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82743_82813_83146_83319
528219	contig_4486_pilon	+	2221	14	Intergenic	novelGene_38572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1496.46615289006	5	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	143	1372	343083	412567	TRUE	25	GTAATAGAGTGTGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAERRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRKGRSFKPSIDHQLRISCQYASLDISVFWIRLTNLHQFYP	311765	413473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411183_411318_412446_413211_413267
528220	contig_7457_pilon	-	1821	4	Intergenic	novelGene_31613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.042345358545	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	59	868	960838	956817	TRUE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDDDWGPGGAERAGAAVVAK	960896	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956002_956448_956874_958234_958375_960225
528223	contig_6063_pilon	-	1880	15	Intergenic	novelGene_27579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	479.524855179264	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	17	1450	70243	17150	FALSE	45	AAGCTTTAGTAACAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRGKMAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70259	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36247_44470_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
528227	contig_9471_pilon	+	1837	9	Intergenic	novelGene_21812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_4	512.963921124088	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	648	1220	412726	414935	TRUE	35	TCAAATTTATATGAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMILKLWTLEVQRMMMNIIVHWYLQDITELLKLF	412078	417515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414836_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
528228	contig_16385_pilon	+	1915	17	Intergenic	novelGene_86186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	204.410700245853	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	49	1734	3004	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRGSLSLDDFRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_6716_6744_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
528230	contig_12019_pilon	+	2137	3	Intergenic	novelGene_87790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2345	junction_1	447.5	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1738	2106	766615	767304	FALSE	15	CACCTCTGTGTCTGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYSLSSPAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764793	767335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_766813_767133
528232	contig_5033_pilon	+	2325	13	Intergenic	novelGene_29066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1634	1975	542138	544599	TRUE	25	CTAACTCCGCAGTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQGLDKGGVGPYSNLDVSHQLNAVLTNVPISLWLGLAVGPLLRVEEKGDIGHEGSHHLGHVQFGNLIGLELFLVIQLSQVLLKRLAESESGAYLLRPALISPLIMSKMTGK	532617	566795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_533498_533797_533878_534199_534356_534446_534633_534969_535069_536506_536637_540604_540662_542092_542236_542662_542868_544560_544687_545244_545325_547551_547680_566740
528233	contig_10134_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_16253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAATGTCTACCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33639	32266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32300_33600
528234	contig_3900_pilon	-	2357	2	Intergenic	novelGene_84195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGTGTGTAATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534531	531984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_532813_533002
528238	SIRV4	+	391	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	126	433	126	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
528239	contig_5136_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_126640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293433	291457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_291500_293400
528241	contig_14443_pilon	+	958	4	Intergenic	novelGene_126675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGGCGACTACGCGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29102	39494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_+_29709_37689_37859_38984_39045_39371
528243	contig_5728_pilon	+	4851	12	Intergenic	novelGene_126688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	63.897774764343	273	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	302	1885	248720	278500	FALSE	10	TTGTCTGTTTTGTAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFDESGPESAKKVCLAIAHYSQPTDLQLLFAFEYVGKKYHNAANNINGVPSGGGGGGGGGAGGGSSQKTPLFETYSDWDREIKRTGASGWRVCSINEGYMISTCLPEYFVVPSSLADQDLKIFSHSFVGRRMPLWCWSHNNGSALVRMALIKDALQQRKIDQRICNAITKSHPQRSDVYKSDLDKTLPNIQEVQAAFVKLKQLCVNEPFEETEEKWLSSLESTRWLEYVRTFLKHSAELVYILERKHLSVILQEEEGRDLSCFVASLIQVMLDPYFRTVTGFQSLIQKEWVMAGYQFLDRCNHLKRSEKESPLFLLFLDATWQLLEQYPAAFEFSETYLAVLYDSTRISLFGTFLFNCPHQRVKQSTEFAISKNIQLGDEKGLKFPSVWDWSLQFTAKDCTLFHNPLYIGKSSPCIHNGSVKSFKRTKKSYSSTLRGLPSSLRNGVISDQELLPRRNSLVLKLKPEPPQQGESQSSGLEQYFRDWFSKPADLHGVLLPRLSGIHVKLWKLCYFRWVPEAQISSGGSITAFHKASVLVDEVDTLSRMLRQHRRVPLPACSSEPDQSRMYFQASGPHATLGTPDFLSSSFPFSPLGNLCRRSISGTPLSKFLSGAKIWLSTETLANED	235418	281466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_235459_241981_242073_248549_248734_250707_250796_250876_250966_253530_253662_254882_254953_255612_255684_269590_269761_270825_270997_277138_277322_277903
528244	contig_9389_pilon	+	1874	6	Intergenic	novelGene_83937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1736	junction_3	401.396263061828	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	253	993	164237	167516	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	163493	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167240
528245	contig_5954_pilon	-	2046	14	Intergenic	novelGene_28706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	200.311148499073	788	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	82	1641	975610	962496	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHLKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975691	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967351_968032_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
528246	contig_12622_pilon	-	1540	9	Intergenic	novelGene_5950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2636.49511662738	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	18	1274	1590968	1587731	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVGEILSHSNPRVPSPLIPVTSHPHPVFFLPQWFLPALEMQMAQPATFPSPSRAAHTPPAPPTAAPTACSGAAPRPTTTPTTSLASAPVRDSTPRTAMRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGATRRGRCAPSPSFSWARSTRPVSGRAAEMGVSGVPPPRTSTETRSGASARTKDTACSLWRRTSSVTRWA	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583615_1586740_1586840_1587628_1587785_1587864_1588023_1588493_1588609_1588835_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
528247	contig_854_pilon	+	1505	7	Intergenic	novelGene_36272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3203.65309278157	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	161	739	549318	562402	TRUE	35	AATATAACTTCAGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRHGRQDPTLRVPETQWLSSAPLPSLYRILRWKPRFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543526	563793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_549265_549425_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
528248	contig_19564_pilon	-	1642	2	Intergenic	novelGene_29597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	159	782	15529	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15687	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12801_15505
528249	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_14023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528250	contig_5954_pilon	-	2990	21	Intergenic	novelGene_28405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	114.86578036996	315	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1634	2209	21271	16787	FALSE	10	CCATCTGGCTCTGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQVQANLPDEQVLSEQEIDESFKALFRQLAGEDLEISVRELQTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRDGNGKLGLVEFNILWNRIRHYLAIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFQLNKKLYELIITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDQDGVVTFDLFKWLQLTMFA	41639	16005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16814_17205_17265_17557_17675_18560_18640_18849_18919_19369_19435_20250_20309_20391_20458_21235_21276_21425_21647_24546_24725_35373_35535_35645_35721_36230_36317_36623_36708_38029_38200_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_41576
528251	contig_15866_pilon	-	2895	5	Intergenic	novelGene_63679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633772	621418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_623331_624422_624505_626203_626331_627916_627992_633073
528252	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	287	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528253	contig_11104_pilon	-	1224	5	Intergenic	novelGene_112463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	44.342417615642	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	419	865	334667	327498	FALSE	40	TACTAGGCATTCCAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP	335085	327138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_327579_329045_329133_331188_331285_334327_334409_334565
528254	contig_15063_pilon	+	1001	4	Intergenic	novelGene_12517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3744.3799961483	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	996	6	1001	28164	36138	FALSE	35	ACCATGTCTAAGCCAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQ	28158	36138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839
528255	contig_12638_pilon	+	2019	10	Intergenic	novelGene_33379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	125.187858836231	18	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	94	942	1515842	1530459	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCTLSR	1515748	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530321_1530442_1530534_1534937_1535060_1538799
528257	contig_6227_pilon	-	1808	17	Intergenic	novelGene_49725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.991240285198	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	129	1508	1223803	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLKEIARPILLCLARVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224951	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203331_1203371_1203583_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223388_1223446_1223746_1223838_1224857
528258	contig_2646_pilon	+	1981	9	Intergenic	novelGene_69517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.855919421648	1645	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	657	980	569631	573396	FALSE	25	GAAAACTCGCTGGTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554004	574397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554174_565275_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
528259	contig_16541_pilon	+	4070	2	Intergenic	novelGene_126742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	162	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	2618	3613	357745	358740	FALSE	25	CTGCTGGATTTGATAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLILLTRNLYMAQEAVVRTEQGDTAWFKVRKGIRQGCILSPYLFNLYAEQIIQECGLYDEEQGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNVKKTKILTTGPIRNIMINGEKIEVVKDFILFGSTINTHGSGSQEIKRHIALGKSAAKDLFKVLKCKDITLRTKVRLTQAMVFSIASYACESWTMNKEDRRRIDAIELCWQRISNIPWTTKRTNVSVLEEVQPGCSLEAGMVRLRLTYFGHVIRRDQSLEKDILLGKVEGHQGKGRPSTRWTDTVAATVGSSIATIVRMAQDWAVFCSVVHRVAMSRN	353374	359197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_355673_357425
528261	contig_18156_pilon	+	2576	18	Intergenic	novelGene_101443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	123.313200139805	268	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	540	2426	19365	64324	FALSE	15	CTTGTAATCCATTTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDTLKRRFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHVDKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQLDNYGQQELGDLFVNYNVKSPTTGNDLSPPVPFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFSQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7312	64474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_11750_11867_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23501_23893_23971_29472_29619_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
528262	contig_18108_pilon	+	2063	15	Intergenic	novelGene_33518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCGGACGGCGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266703	335417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_267082_267669_267734_269578_269653_269897_270025_276336_276411_277875_278090_278279_278373_282720_282850_284890_284983_287436_287590_289293_289454_296016_296176_296964_297166_316667_316755_335359
528265	contig_16110_pilon	+	2803	1	Intergenic	novelGene_126795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92512	95315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_92500_95300
528266	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	241	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528267	contig_7412_pilon	+	1830	8	Intergenic	novelGene_76330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	510	809	365790	370299	TRUE	15	TGCTTCCAACTCCTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSMSWLLFTLTRGIIRRVGWNLIISSFLKTALKTVGLRAFSMSSRRCFTCWGTRITKLRLWESCSRPTLAFKVGSVKWATGYFLLVIMGTFISEDLK	364200	377818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_364699_365778_365997_370206_370349_370542_370749_373395_373528_375276_375803_377240_377313_377782
528268	contig_9471_pilon	+	1684	13	Intergenic	novelGene_21785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	766.064926897337	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	97	1443	410634	417283	FALSE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSRRTYCPDWDEKDWDCGKWRSSSSYKRRKRSHSSARENKRCKYNHSKTSDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYNQGCEPGHRHRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHHRSHGKSHRRKRPRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKRSLKASFLFPP	406947	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417247
528269	contig_3588_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_72880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCATTTAACCTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103929	102601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_102600_103900
528270	contig_4125_pilon	-	3349	8	Intergenic	novelGene_25126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.279026542451	2	96	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	94	378	815566	813780	TRUE	65	TGTAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCIMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	816003	808969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_810195_810280_811038_812049_812137_812627_813016_813265_813879_815228_815315_815466_815568_815911
528271	contig_19564_pilon	-	1662	4	Intergenic	novelGene_29637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	150	1484	15529	12201	FALSE	10	TTGAATGTCTCCTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15678	12022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
528272	contig_15063_pilon	+	1457	6	Intergenic	novelGene_14226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	78	1202	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34730	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36497_38983_39092_39506
528276	SIRV6	+	510	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1383	577	-2	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528277	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528278	contig_16303_pilon	-	1659	8	Intergenic	novelGene_34062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_7	689.978349261033	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	431	1345	40611	35759	TRUE	20	TATATGCATCACTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	59310	32965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35588_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_58999
528279	contig_854_pilon	-	1408	2	Intergenic	novelGene_36344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTGTTGGAGTAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976143	974684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975864_975914
528281	contig_6102_pilon	+	2215	14	Intergenic	novelGene_32332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1055	1402	1688502	1689481	TRUE	10	ATGAGGGGCTGGGGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSRTKLGTVFLSRWHSDSNWQPNTWSRSRPRSCRLCKGGLFAISLFSLLRTRFCSVPSGHRPGASTTAEPEQRLEQGLCLLFFLILPGTQLPQFRRPRARQTQLQGVLSILVGR	1685168	1691365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1685652_1687189_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688581_1688896_1689007_1689103_1689252_1689470_1689567_1689732_1689827_1690052_1690144_1690265_1690336_1690557_1690713_1690855_1690968_1691159
528282	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_8668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4009.12378207508	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	230	1075	34808	36333	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	26755	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36268
528283	contig_3270_pilon	-	1764	9	Intergenic	novelGene_104503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_6	180.478833592751	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	1	1482	386296	362548	FALSE	15	TTCTAGTCAGGCATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHREFLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVIIEQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLANTSEDKCEKDNIVGSNKNNTICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVVELFEFIRVVSLY	386296	362265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_362733_365983_366143_367848_367891_369375_369479_370452_370585_375431_375549_376972_377090_380092_380171_385747
528285	contig_11253_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_126836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	822	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGACAAAACAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182000	183799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_182000_183800
528286	contig_610_pilon	-	1320	5	Intergenic	novelGene_76751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1326.68277576066	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	106	837	252557	214183	TRUE	35	ATATCATATTGTCAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252662	213504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_213632_213826_214263_220517_220785_234998_235302_252475
528288	contig_9668_pilon	-	160	1	Intergenic	novelGene_58214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATAGAAAAAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539578	539418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_539400_539600
528292	contig_10354_pilon	+	1731	3	Intergenic	novelGene_50836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432181	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432332_471900_472041_475056
528294	contig_12528_pilon	-	1661	11	Intergenic	novelGene_81332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	502.310113376189	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	926	1462	959940	933323	FALSE	20	TGATATTAATTTGTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968106	933123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956166_959917_960131_963878_964021_964909_964971_966191_966274_967656
528295	contig_20844_pilon	-	2094	9	Intergenic	novelGene_78600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_8	228.165201937105	271	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1457	1984	206752	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209171	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
528297	contig_5698_pilon	+	2067	7	Intergenic	novelGene_55022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1011.5752841759	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	20	616	4103	19438	FALSE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSNEVQTAKEFIKIIEHAECLKAECKILQYIGGKRKRIQHVVI	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17208_18789_18839_19361
528298	contig_9345_pilon	-	1646	5	Intergenic	novelGene_24633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2625.99527560504	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	193	606	955353	947923	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKNLGALFCETSLQAQPSCG	1001346	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947984_949530_949607_952439_952561_955197_955356_1001156
528300	contig_1452_pilon	-	2065	3	Intergenic	novelGene_115137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	51	665	715391	699652	FALSE	50	TTAGGAAAATAACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715441	698251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
528301	contig_3956_pilon	+	1479	8	Intergenic	novelGene_14960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	10	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	81	725	1281682	1286416	TRUE	15	TGACTGTGTGGAGCCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIIACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1291007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284220_1286150_1286224_1286409_1286606_1287276_1287712_1290877
528302	contig_854_pilon	+	1980	15	Intergenic	novelGene_36439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	434.77247157659	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	652	1425	1457358	1464213	TRUE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRVRRSPATLLITPVPVPTAHTVTQSSFSL	1451196	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456389_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460955_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
528303	contig_8045_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_35408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118095	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_118100_119400
528304	contig_6102_pilon	+	2807	2	Intergenic	novelGene_32074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCCTGGTGTCTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778500	781351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_781059_781102
528306	contig_15087_pilon	-	2195	13	Intergenic	novelGene_37134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	390.377906293661	3	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	233	1366	71161	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSARGAAAPEFAPGGSSPELSHLHHPLGSFWRNHRWKRPDSGRRQRSWSRTVSCSSNPLPPWPRLITWLSSQERTQMSQHLPLTVHTPVTSQSRSQNLHPVALPLNLKSSLLRSRILHQRVVAAPGTQWSWAPCPARRQPDAAPAAAGDHSERVCRGARPQPALHPSGPHGPRVQPAGLQGAQERATHLHPADLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89772	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52616_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_89687
528307	contig_14925_pilon	+	1384	2	Intergenic	novelGene_55224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCCCACAGTGATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28498	42970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_29830_42917
528309	contig_8153_pilon	-	3162	6	Intergenic	novelGene_34798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	26581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_27259_29108_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001
528310	contig_19342_pilon	+	1184	6	Intergenic	novelGene_41058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	114	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	29	388	3263	5268	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSESGQPWWCPLERSKDTPVMCSTRG	3234	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3846_5195_5293_5413_5522_5960_5994_6139
528311	contig_9982_pilon	-	1815	15	Intergenic	novelGene_55764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	196.280996512237	22	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	34	1680	353538	339852	FALSE	25	ATCAGAGCCTCAACTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353571	339716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
528313	contig_13592_pilon	+	3868	4	Intergenic	novelGene_33728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1562	junction_3	138.817225956371	87	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1527	1901	266585	267518	TRUE	20	TTTCAAGAAGTCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGNNGFLLR	265058	269607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_266685_267159_267282_267365_267704_267825
528314	contig_6980_pilon	+	1845	7	Intergenic	novelGene_36066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	915.407680884437	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	142	492	362399	370498	TRUE	20	AGACTGTTACTGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKYGHSPWSTTRPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGENYHA	361151	373882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_361226_362331_362433_364879_365032_368206_368358_370484_370641_371430_371495_372735
528316	contig_1532_pilon	-	1907	8	Intergenic	novelGene_37408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1373.99858895451	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	70	1161	32217	13113	FALSE	45	TAATAATGAGTATGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29446_32092_32227_34870
528317	contig_18511_pilon	+	1669	9	Intergenic	novelGene_126858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	281.50832580938	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1455	214	1668	47371	59244	FALSE	40	AGATTGAAGGTGAGGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEK	35358	59245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151
528318	contig_15666_pilon	-	1973	6	Intergenic	novelGene_70133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	697.404158289869	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	120	914	110619	107816	FALSE	10	CTACGTGTTTACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110738	106756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108859_109098_109138_109948_110246_110558
528320	contig_15021_pilon	+	1879	2	Intergenic	novelGene_26951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCCACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239748	241733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241378_241483
528323	contig_7963_pilon	-	2347	5	Intergenic	novelGene_58278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1667.96492768883	6	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	57	353	48841	43622	TRUE	15	TTGTTTTGTGTAGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48897	36935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38494_39327_39403_39945_40232_43546_43819_48741
528324	contig_5643_pilon	+	1527	12	Intergenic	novelGene_39020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	775.605250196407	40	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	653	1315	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635443_638159_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
528325	contig_5988_pilon	-	1093	2	Intergenic	novelGene_15968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	75	929	786071	651962	FALSE	40	TAAGAAGAAAGGTTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQSECSRVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786145	651797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652790_786044
528326	contig_3077_pilon	+	1612	9	Intergenic	novelGene_26696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3609.10722166854	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	724	1146	16163	17590	FALSE	50	GCTGCTCAATAAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15192_15262_16144_16328_16936_17054_17449
528327	contig_5928_pilon	-	2875	7	Intergenic	novelGene_40369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_5	22.5807194059199	150	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	23	625	251809	217526	FALSE	65	GAAAAGAAAAAAAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RATPWQDMACGFRRSIAYQLSRVLDLPPENLIKSISAVPISKKEEVADFQLSVDSLLENNSDHLRPDIQDQAKRLAEKLKCDTVVSEISTGQGTVNFKINRELLTKTVLQQVIEDGSKYGLKSELFSDLPQKKIVVEFSSPNVAKKFHVGHLRSTIIGNFIANLKEALGHQVTRINYLGDWGMQFGKYVCDFVFCFFFHFLIKFNFF	251831	215275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_217678_220326_220383_221490_221589_229383_229468_230831_230935_249346_249421_251773
528328	contig_610_pilon	-	1401	4	Intergenic	novelGene_76745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	812.289904460771	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	683	718	214218	214183	FALSE	30	ATATTGTCAAAGTGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252543	213499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235302_252475
528329	contig_13740_pilon	-	1609	12	Intergenic	novelGene_34625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	4301.23528479978	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	24	1133	162217	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFNIWFKFDVSFFFPPQKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	162240	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127
528330	contig_8616_pilon	-	1272	10	Intergenic	novelGene_72567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	728	1270	430553	425763	FALSE	5	AGGGGGTGGGGTCCTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRNQRLVLGKACDVSQGHTFAHQESPCFHVSIQQPQNSPHLLLGILCGLLVVVHDAQGGEHPGTSWRDYVAVSKAHPLHHLGCCLWSTSPQLLIAHIVGNGIALKHTESIVTLKCWNLAGRKFAEKFRGAVGLAKVEVGWCGEHADLSPAVLSSNEGLEGPPVFRICVQGLSRHGDSAE	436591	425760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_425788_426885_427045_427754_427820_427981_428124_428647_428759_430512_430628_431118_431243_435729_435897_435990_436118_436356
528331	contig_16622_pilon	+	1881	8	Intergenic	novelGene_48431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGACTGGGGCTGTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108205	121883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_108469_110033_110147_110891_111033_112144_113041_113602_113741_115155_115292_115417_115484_121755
528332	SIRV4	+	416	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	11	-889	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTTATCATCTTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	1882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
528333	contig_7457_pilon	-	1904	5	Intergenic	novelGene_31599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.4106257185226	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	152	829	960661	956489	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGERVPAKAATAEPFPHHEVSPERATRSCLRSSSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962662	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956642_958285_958375_960225_960710_960846_960891_962603
528334	contig_3789_pilon	+	2965	7	Intergenic	novelGene_79846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	277.065224972188	763	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	546	887	465838	472341	FALSE	20	TGAAGGTTGTCTGTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	445432	474419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465799_465913_467056_467110_468585_468661_472202
528335	SIRV6	+	541	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9679	217	529	-70	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCGACAGTTAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
528336	contig_15063_pilon	+	1017	3	Intergenic	novelGene_14395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	72	893	35271	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35199	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
528337	contig_11115_pilon	+	1890	8	Intergenic	novelGene_102812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	586.314013519189	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	163	1800	165608	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165327	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165436_165553_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
528340	SIRV5	+	467	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	17	7399	-2	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGTCGTAAGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
528344	contig_17470_pilon	-	1908	13	Intergenic	novelGene_110533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	45.3108859865804	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	173	1447	277215	270076	FALSE	50	CACAATAAAGTTTCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302418	269614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302355
528346	contig_11989_pilon	-	3054	21	Intergenic	novelGene_68438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	367.242137424343	12	61	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	597	1670	76387	54047	TRUE	10	TCCAACCTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGESGGMVWIAMLTGEFYVILIYAEHLASKRK	226875	45617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90209_90278_91983_92052_92290_92387_135427_135511_166966_167018_191091_191143_226759
528348	contig_10674_pilon	+	2524	1	Intergenic	novelGene_6461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1335	1685	347267	347617	NA	65	AAAAAAAAAAAACCGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWQAWWQWLQSVLSFEEGFRATSRKLGHNVLCPPLPPAAGLCIQLPHRASLLGGHSLGADAQAAPSQRAPILVFQLVCGLRPCSSKLLSGGKGGKKKTLERVFGRNVCEFNDIRK	345932	348456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_345900_348500
528349	contig_15063_pilon	+	661	2	Intergenic	novelGene_13112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7060	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	202	660	34808	35378	FALSE	25	GTAAGTGCACAGGTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRL	34606	35379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037
528351	contig_15434_pilon	+	1905	5	Intergenic	novelGene_56691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	333.003284518336	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	508	810	31167	32387	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIGMNYLERSCL	26578	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_30409_30590_31082_31265_32182
528352	contig_8357_pilon	-	2536	19	Intergenic	novelGene_39741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_10	267.61503237964	832	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	105	1883	818294	762891	FALSE	10	CTTTATCTTGATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPVMERGLKSVVWQKIKATVFDDCKKEGEWKIMLLDDFTTKLLASCCKMADLLAEGITVVENIYKSREPVRQMKALYFVSPTSKSVDCFLRDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDSLFNKIKASCSKSIRRCKEINISFIPLESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPSNANGKDAVMETMAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818398	762237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808821_818245
528353	contig_10511_pilon	-	2186	3	Intergenic	novelGene_126903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.5	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCAATAAAGTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596280	574391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_575605_595170_596094_596230
528355	contig_9901_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_126943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTCCACACAGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224848	225912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_224800_225900
528357	contig_14441_pilon	+	836	5	Intergenic	novelGene_100446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	334	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	223	651	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCTSVPAVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112104_112154_116578_116963_117220_117344_117539
528359	contig_9345_pilon	-	1912	7	Intergenic	novelGene_24366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	59	997	176056	142100	TRUE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176114	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141740_141819_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
528360	contig_6980_pilon	+	1642	6	Intergenic	novelGene_36006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	837.929973207785	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	248	550	361220	372790	FALSE	20	AGACTGTTACTGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346059	373882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_370490_370641_371430_371523_372735
528361	contig_8820_pilon	-	2330	1	Intergenic	novelGene_79309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246162	243832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_243800_246200
528362	contig_2768_pilon	+	2650	8	Intergenic	novelGene_57485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	259.164276953788	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	141	1016	656383	678767	TRUE	30	CAGGAGAAACCTCACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGSVAERSQTGALHTTPAGDRAAGTRVPATLGSGHHLKEKAREEAGSARTSLLILVSIFLSAAFVMFLVYKNFPQLSEEERVTMKVPRDMDDAKALGKVLSKYKDTFYVQVLVAYFATYIFLQTFAIPGSIFLSILSGFLYPFPLALFLVCLCSGLGASFCYMLSYLVGRPVVYKYLTEKAVKWSQQVERHRDHLINYIIFLRITPFLPNWFINITSPVINVPLKVFFIGTFLGVAPPSFIAINAGTTLYQLTTAGEAVSWYSVFFLMILAVLSILPAIFHKKLKQKYE	656242	680444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656504_664570_664689_668729_668859_671910_672005_672644_672750_677124_677264_678597_679922_679964
528363	contig_11337_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_107192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTAACAATGATAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206184	206743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_206200_206700
528364	contig_12079_pilon	-	1999	3	Intergenic	novelGene_67420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1849	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584786	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582022_584328
528365	contig_3095_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_75043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	103	828	147280	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151990
528366	contig_5649_pilon	+	2447	10	Intergenic	novelGene_82249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	162.792983741793	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	104	967	12779	28964	TRUE	35	CAACCACTGTCTACTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLLWSA	12675	35844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28446_28948_29095_33635_33787_34645
528368	contig_3270_pilon	-	3451	11	Intergenic	novelGene_104461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	235.29405007352	146	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	141	2510	117490	96160	FALSE	50	GAAATAAACTAAATCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEFESLIAKHGTLKFAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAEEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSTMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTGNSSTGFRSKQLVKNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGQTSTGNSNNNASLHEVKAGAVTSQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKTREALDSRAHHKIRTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQDNLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGRTPGDFCDRRTTKPEQFVRPGSRMTEDTHFTGPPGKSTAGTQGRIKSVKETSLPRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDGRPPASVDSAAATADSGVHAAPSEYCLHPWSPRVLPSPAPAVGSPAPSELPADMSASCPESLCAQARSSRTERSQFLNPAFATVGVSGDSFGMSAKDSMGSSTMTHSSQPFLSLNTELVSNISGLPPRAVTKVPDQASTSWGKAAQKGNEQLSDNQTPSNSNPQSPLAGNSLITAACLSPGDTDAALLVSEDNQTVWYEYGCV	117858	95218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_97168_97364_97634_99787_99869_100976_101049_101651_101856_106359_106575_106714_106808_110361_110508_115231_115419_117395_117540_117767
528369	contig_11720_pilon	+	2446	1	Intergenic	novelGene_44013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1779	2120	271835	272176	NA	35	GACCCAGCTTTAAAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVLWGQGVPWALGKQGEEATDGGDVGATNPGFPKYPLLHSWPPPPPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	270056	272502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_270100_272500
528370	contig_10324_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_7770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCCTATTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78463	80744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_78500_80700
528371	contig_2438_pilon	+	1285	5	Intergenic	novelGene_112024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2518.41959371349	10846	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	81	548	310588	312791	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGGTGTGDSFLVIPTGFLRNQRRTLGTSQTTSCKRART	305085	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312099_312373_312409_312729
528372	contig_10968_pilon	+	1896	8	Intergenic	novelGene_84289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	368	junction_5	149.268556772069	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1213	1602	172393	177921	FALSE	15	CAATTGTGTGCATGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166016	178215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_172482_173419_173571_176189_176248_177829
528374	contig_10923_pilon	+	1445	7	Intergenic	novelGene_66211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	856.030503090995	126	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	435	881	29315	37418	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYFHPVSTLAGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLWCSGVCAAP	21648	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_29202_29572_30133_30289_37383_37540_38578_38742_42554
528377	contig_8156_pilon	-	1651	6	Intergenic	novelGene_98935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	97.948966303887	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	370	1230	441382	395622	FALSE	25	TGTGAGTCCCTTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDNPQTTKAFLPRMLELQNGHIVCLNSVLALSAIPGAIDYCTSKASAFAFMESLTLGLLDCPGVSATTVLPFHTSTEMFQGMRVRFPNLFPPLKPETVARRTVEAVQLNQALLLLPWTMHALIILKSILPQAALEEIHRFSGTYTCMNTFKGRT	441751	395200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403539_403939_404004_404665_404810_441187
528378	contig_15063_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_9290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	240	1475	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528379	contig_7898_pilon	-	1098	8	Intergenic	novelGene_47521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	33644	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	71	1027	285587	282118	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286096	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
528380	contig_15047_pilon	+	1407	8	Intergenic	novelGene_52186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	243.658928564885	3	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	20	352	2194	3255	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLLQPERRRVSHFPEDVWL	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2584_2826_3221_3363_3431_3498_4158_4434_4554_4676_20997_21062_21232
528381	contig_4754_pilon	+	2095	10	Intergenic	novelGene_35969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	176.089693755522	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	743	1675	410506	420397	FALSE	15	ATAGCTGGTTGTCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTGKVLRPQGTQEEGDLQGQALGLGAKEEECAFDSCLFLFPQFCLWPEAG	408983	420817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_409442_409548_409705_410232_410317_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159
528382	contig_15152_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_126964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCTGTTCTATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203855	202600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_202600_203900
528383	contig_854_pilon	+	2126	16	Intergenic	novelGene_36517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2656.53487753418	3	34	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	167	2071	1649514	1716307	FALSE	10	GGTGTTTTCCACTGAGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRELPPPFFI	1612779	1716362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1681780_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692742_1716279
528384	contig_12250_pilon	-	1667	9	Intergenic	novelGene_80643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_5	136.455979623467	1562	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	134	1405	379717	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380655	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
528387	contig_9515_pilon	+	1445	9	Intergenic	novelGene_73808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	291.210592827596	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	591	1322	66468	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57242	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
528388	contig_3986_pilon	-	2608	11	Intergenic	novelGene_52689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.125563413395	3	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	436	1269	55958	44795	TRUE	35	AATAAAGTCACGTGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQVCELSSAERTRE	153862	34093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35282_44643_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56055_57911_57964_60545_60655_153684
528389	contig_5092_pilon	-	2056	4	Intergenic	novelGene_62302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	904	junction_1	253.551222087811	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATTTTGGCTCCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449474	443178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835_447995_449415
528390	SIRV6	+	1260	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-441	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	44	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	102	309	177	485	2021	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTSTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2483_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528391	contig_7202_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_18647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
528392	contig_13707_pilon	+	1936	8	Intergenic	novelGene_43570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTTTGACTGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269703	273985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_270898_271536_271626_271738_271898_272366_272462_272854_272980_273329_273441_273706_273839_273954
528393	contig_6199_pilon	+	2556	21	Intergenic	novelGene_126401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	207.172729865685	102	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	380	1099	574926	592948	TRUE	15	TTTCAATTTGTGATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559467	606175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559590_564006_564057_565838_565885_568957_569021_570040_570093_574879_574932_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754_604021_605252_605725_605828
528394	contig_11677_pilon	+	1903	12	Intergenic	novelGene_85971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	83.3953047809296	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	23	1402	727262	736807	FALSE	20	CTAGCTACACACCTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHRAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKPEKID	727239	737308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736025_736636
528396	contig_14744_pilon	-	3452	1	Intergenic	novelGene_65936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183393	179941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_179900_183400
528397	contig_5780_pilon	+	2127	6	Intergenic	novelGene_29780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	250.760762480895	5	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	281	685	107519	112278	FALSE	35	AAAAAGGAGTTTTGCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLKPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEVDARQLQAVHSGEWNPTSVLPRPLRNCPGTALLLHIVPVSLQQQGSSQVKVQCDF	73990	113720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109539_110188_110292_112112
528398	contig_19267_pilon	+	2862	2	Intergenic	novelGene_126973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19154	22698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19267_pilon_+_20777_21458
528400	contig_5499_pilon	+	2803	15	Intergenic	novelGene_56985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_9	176.346496235944	664	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	52	1731	776530	795406	FALSE	20	ACACTTAGTTGGCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVAKATAGMVLGELYVSDREGNDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWDVISKSQMKNIRKMWHREQMKNECREKKEAEDNLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIHALEAHRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLSDELCQCYNGVVLSTESSVAVYGMLNLTPEGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGENMSKILKARSLITRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGSTLFKLDYFGEEAFLTQSSQLYLETCLPSLGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHIEAECAFLTFEDLLTRVEDLICDVVDRVLKSPIASIVYDLNPNFKPPKRPFKRMNYLDAIVWLKEHNVKKEDGTFYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIWDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCAHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP	776478	796478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_776573_777638_777722_780037_780104_780189_780283_780368_780459_782346_782426_783301_783373_787847_787935_789167_789390_790465_790666_791050_791187_791872_791987_794159_794292_794615_794748_795274
528401	contig_12622_pilon	-	1512	9	Intergenic	novelGene_5985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2307.67419440007	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	16	1071	1590968	1585587	TRUE	30	ATTCTCTAACCTTCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGGSRHRRPSSGRG	1590983	1583562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585628_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
528403	contig_12624_pilon	-	1851	4	Intergenic	novelGene_61135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	258	563	952979	948779	FALSE	20	TGTTGAAGATTTTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955896	947490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955644
528405	contig_15354_pilon	+	2633	10	Intergenic	novelGene_65751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	47.7364162050186	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	526	1254	642871	647109	FALSE	35	AAGAATCAAAGCTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	638975	648488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_639245_639308_639519_639699_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085
528406	contig_19564_pilon	-	1628	5	Intergenic	novelGene_29631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	807	1445	12839	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15700	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12973_13033_13259_13554_13666_13945_14055_15472
528407	contig_2100_pilon	-	1354	10	Intergenic	novelGene_50663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	896.27646748804	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	169	1005	1180199	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1182809	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173275_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727
528408	contig_19851_pilon	+	1028	6	Intergenic	novelGene_29857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	111	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	161	676	53637	56177	FALSE	25	AATTGTTCCGTGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53476	56529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
528409	contig_15063_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_14368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	204	1025	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35067	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
528410	contig_13740_pilon	-	1660	13	Intergenic	novelGene_34669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4260.35936391782	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	169	1230	165243	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156986_157076_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
528411	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_97061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
528412	contig_10902_pilon	+	1996	3	Intergenic	novelGene_65666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	151	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTCTGATGTTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79150	112060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94005_110206
528414	contig_9440_pilon	-	2056	6	Intergenic	novelGene_59100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.9542031573	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	95	778	1716626	1700693	TRUE	30	AGAACTGTGGACATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRSARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716720	1698666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699023_1699770_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
528415	contig_2236_pilon	+	2699	15	Intergenic	novelGene_98681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_14	54.0275817692846	189	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	65	1618	41032	69291	TRUE	40	AGCATAAAATGGTCAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPQFLAASHGVPVALSPGKMAAPEQPLPKSRGCQSSASFSPPRGDRTLLVRHLPAELTAEEKEDLLKYFGAQSVRVLSDKGRLKHTAFATFPNEKAAIKALTRLHQLKLLGHTLVVEFAKEQDQVHSLLSSSNTEKKKRSDDPVEDDKEKKEFGCLTIENGIAPNHGLSFPLNSCLKYMYPPPSSTILANIVNALASVPKFYVQVLHLMNKMNLPTPFGPITARPPLYEDYMPLHAPLPPASPQPPEEPPLPDEDEELSSKESEYESSDDEDRQRMTKLMELANLQPKRPKTIKQRHVRKKRKIKDMLNIPSSASHSNLHPVLLPSDVFDQPQPVGNKKIEFHISTGMPATFKKDLEKEQNCEEQNYDLPDAEVDTSNVGFGKIFPAPNLNITEEMKEDSDEMPSEFISRKELKKGRISREEMETLSIFRSYEPGEPNCRIYVKNLAKHVQEKDLKFIFGRYVDFSSETERIMFDIRLMKEGRMKGQAFIGLPNETAAAKALKEANGYVLFGKPMVVQFARSARPKQDSKEGKRKC	40967	71492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_41224_43195_43244_49203_49323_50578_50663_52493_52606_53481_53551_54643_54787_57723_57850_61109_61262_63781_63944_64983_65079_65166_65226_67930_68064_69231_69304_70423
528416	contig_8019_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_126989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGTAAATATCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150084	151932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_150100_151900
528418	contig_10986_pilon	-	1970	12	Intergenic	novelGene_71453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_8	143.881551376284	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	102	1319	80340	67011	FALSE	35	CAGATGAACAATTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80441	66359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
528419	contig_11656_pilon	+	2370	18	Intergenic	novelGene_54017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_9	156.535855472294	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	970	2058	521815	528195	FALSE	15	TATTGGAGTTTGTCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLRYKPQFPAPGWNVEKQKAVCEATFLTLLRFA	465042	528507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521707_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001
528421	contig_11328_pilon	+	1667	10	Intergenic	novelGene_88450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	262.538227669142	747	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	573	1409	836590	857309	FALSE	25	TCAGAGTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829361	857567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836533_836584_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
528422	contig_3077_pilon	-	1387	8	Intergenic	novelGene_26747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGGAGAAGTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17881	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13162_13855_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17048_17444
528423	contig_14925_pilon	-	1092	5	Intergenic	novelGene_55097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	1545.88849856644	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	51	554	51337	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKVLCRVSTKCGLFSMVFCWASNHCVINTARNKLTFGEGTMVLVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	51387	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_51243
528424	contig_5210_pilon	-	2344	6	Intergenic	novelGene_65410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	186.253161047001	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	348	956	439927	431502	FALSE	10	TGTGGACAGCTGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444369	430113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_439777_439957_443013_443119_444156
528425	contig_19579_pilon	-	1490	4	Intergenic	novelGene_59388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	607.149807616612	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	88	852	13090	7816	FALSE	65	TTAAATAAAAAAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHMWICCPPIPSGMPLNSLVCMSPSPCPEPRAGTGCVDARVRMPFKEDDAPRGILLIFPQHQPSAWSFQR	13177	7177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8022_8704_8825_12012_12262_12900
528426	contig_14215_pilon	+	1195	6	Intergenic	novelGene_59355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_5	29.3734574063048	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	588	1037	41408	47528	FALSE	15	TTTAAGCGGTATGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTNACIALSQRWIDAKEDDLNSFSAGDLKDLSSHQLNEFLAQMIQKAPLPLGHVKRMQEVYNLNAINNSEIRFRWLRLCIQSKWEDAIPLALKMATEQGRMKFTRPLFKDLAAFDKSHDLAIRAYQQHKASMHPVTAMLVGKDLKVD	40287	47686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_40868_41400_41456_43126_43223_45741_45825_46478_46584_47410
528428	SIRV4	+	274	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	707	967	-75	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGACAGCGAGTCAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
528429	contig_177_pilon	+	1611	2	Intergenic	novelGene_41850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	90	500	417873	419027	FALSE	15	TGTTGTTATACTAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIVSEIF	417783	420138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_418267_419010
528430	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_14080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	190	1365	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528434	contig_7025_pilon	-	2374	4	Intergenic	novelGene_104406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGGACGCCCGTAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396594	344053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_344311_353922_354090_362626_362754_394771
528435	contig_3095_pilon	-	1194	5	Intergenic	novelGene_75215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1495.41975712507	9	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	50	763	255481	247815	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGKELWREPGKIACS	255530	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247739_247970_248476_248669_253535_253806_255384
528436	contig_1244_pilon	-	1778	11	Intergenic	novelGene_37989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	859.697016395893	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	453	1352	928860	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	946604	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931618_931684_933732_933856_934499_934566_946439
528437	contig_5485_pilon	-	2747	14	Intergenic	novelGene_37747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	113.735289054591	319	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	35	1006	478711	460624	TRUE	0	CGGGGTTCCTGTTTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISPKE	478745	457791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_459379_460469_460638_461257_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
528440	contig_6635_pilon	-	3860	1	Intergenic	novelGene_127003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAAGTTGGGTTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321751	317891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_317900_321800
528441	contig_5539_pilon	-	788	3	Intergenic	novelGene_104786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	19.5	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTGCATCCACACCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302066	289896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_290521_297220_297298_301979
528442	contig_854_pilon	+	1367	8	Intergenic	novelGene_36222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3390.64257349908	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	593	925	556108	563353	FALSE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITASCGSIYPFTLVPPSA	543481	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_549265_549425_550481_550665_556082_556201_557001_557065_557591_557716_563300
528443	contig_6084_pilon	-	2649	1	Intergenic	novelGene_127045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGAATTAGAAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339500	336851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_336900_339500
528451	contig_6137_pilon	+	2932	4	Intergenic	novelGene_59320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	47.8817989080054	285	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	116	475	1686492	1693045	FALSE	5	GCAGTCCCCCTCCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTNLAAGIPSSKVKYSRLSSTDDGYIDLQFKKSPPKIPYKAIALATVLFLIGAFLIIIGSLLLAGYISKMGADRAVPVLIIGILVFLPGFYHLRIAYYASKGYRGYSYDDIPDFDD	1684012	1695502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684103_1686466_1686588_1688000_1688124_1692904
528452	contig_202_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_127073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTAAAACTCAGGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270374	268874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_-_268900_270400
528453	contig_13592_pilon	+	2516	15	Intergenic	novelGene_33707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	522.164724967131	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	514	1380	256608	266507	TRUE	20	ATACTTATTGTGTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHILQMLQYKALSMSGKSLLRKRLQIILTCVWLCWMVYSV	249304	269472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261369_266140_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
528456	contig_91_pilon	+	2509	11	Intergenic	novelGene_127093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.3	1214	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCCCGAGCCCAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309864	446562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_311013_314485_314627_317393_317460_318497_318621_321981_322129_325296_325482_334661_334821_335110_335223_344031_344085_380722_380957_446421
528457	contig_11250_pilon	+	4010	14	Intergenic	novelGene_127157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	84.8529532110642	318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	197	1819	180215	244882	FALSE	40	AAAATATAGCTGTCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFATNPFDQDVEKATSEMNTAEDWGLILDICDKVGQSRTGPKDCLRSIMRRVNHKDPHVAMQALTLLGACVSNCGKIFHLEVCSRDFASEVSNVLNKGHPKVCEKLKALMVEWTDEFKNDPQLSLISAMIKNLKEQGVTFPAVGSQAAEQAKASPALVAKDPETVANKKEEEDLAKAIELSLKEQRQQPTTLSSLYPSTSSLLSNHQHEGRKVRAIYDFEAAEDNELTFKAGEIITVLDDSDPNWWKGETHQGMGLFPSNFVTADLTAEPEMIKTEKKTVQFSDDVQVETIEPEPEPAFIDEDKMDQLLQMLQSTDPSDDQPDLPELLHLEAMCHQMGPLIDEKLEDIDRKHSELSELNVKVMEALSLYTKLMNEDPMYSMYAKLQNQQYYMQSSGVPGSQVYPGPPQSGAYLVAGNAQMSHLQSYGLPPEQLSSLSQGAVPPPANPPLPSQQAQTSYPNTMVGSVQGNTYPSQASVYSPPPPAAAAAAAADVTLYQNAGTNISQVPNYSLTSSTLPQPVGSQQPPQPQQPYSQKALL	180018	247073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_180255_191177_191263_210812_210889_210983_211080_214408_214556_221029_221121_223005_223199_224312_224408_227899_227989_232300_232389_232834_232890_233380_233535_235543_235720_244644
528458	contig_15063_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_14261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	1	1164	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34807	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35839_36158_36266
528459	contig_4845_pilon	+	2896	14	Intergenic	novelGene_53620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	329.095694793112	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	77	1396	205637	221846	TRUE	35	TGGAGATGGAAAACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGSSGRARFLFSFCRVRLWGTGLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	202027	223421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657_221918_221992
528460	contig_5711_pilon	+	2358	11	Intergenic	novelGene_80261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	55.4126339384801	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	21	1820	52529	122172	FALSE	15	TGCCTTATATCTTTTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	52508	122710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_113381_113568_121458_121637_121996
528462	contig_3077_pilon	+	1214	9	Intergenic	novelGene_26636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3324.50708517443	4	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	76	927	9676	17801	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPAR	9600	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16272_17787
528464	contig_14638_pilon	-	1934	4	Intergenic	novelGene_71565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.020068753696	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	86	373	262373	254501	TRUE	10	GTTCTGAAGTGGTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	262458	252755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253983_254166_254614_258223_258365_262339
528465	contig_9354_pilon	-	3108	9	Intergenic	novelGene_108057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	45.3884277652355	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	500	880	219744	213306	FALSE	35	GAGAAAACTGCCTAATCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMAQHRANEEGLALLQEEVDKIVETTESMTENIQSLKNKIQILTTEMEKEEEKVKQMLQMDRSGVLCLPELPQNSLRAPILQEEILTLIPNQNALLKDLDTLHNSSQMKNMLTFIQEAYNKLDTS	229865	211077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_213438_214198_214277_214414_214535_219693_219795_223361_223431_224006_224134_225187_225237_225965_226108_229803
528466	contig_3975_pilon	-	1903	12	Intergenic	novelGene_54792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	399.88756684311	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	95	1402	2027179	2016034	FALSE	10	TACTCTCCCGAGCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKGSRRRSSWPEQTSPALASCRVPHISPLTPQSLYFLFLCVFI	2052430	2015532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2052363
528467	contig_1715_pilon	+	1792	5	Intergenic	novelGene_127185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251390	269324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_251524_252370_252480_256575_256701_262484_262583_267997
528468	contig_6199_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_126415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAAAATGAGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715294	712709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_712700_715300
528469	contig_7396_pilon	-	1530	15	Intergenic	novelGene_79607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3183.73189521546	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1407	124	1530	255163	245934	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITINSPRPWHSIQSSVQNVMLFCKKRFMIFKINLVNL	257477	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246037_247237_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
528470	contig_10324_pilon	-	1918	6	Intergenic	novelGene_7766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAGGAGGGAGGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80766	75795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_75901_76008_76081_76196_76270_76439_76527_78362_78451_79273
528471	contig_11285_pilon	+	1349	8	Intergenic	novelGene_5643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_6	530.083666865478	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	166	1041	767140	769878	FALSE	20	TACACTTCAACTGTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766547	770186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_769421_769653_769740
528472	contig_14815_pilon	-	1508	7	Intergenic	novelGene_127205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	686	junction_1	102.115403125853	1691	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	72	860	22749	17106	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23306	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702_22765_23250
528473	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	7452	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
528474	contig_11720_pilon	+	1466	12	Intergenic	novelGene_43998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	341.02446532531	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	305	1225	266455	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWHVLIRERFFGTCSCPRVRAAARRSCCRPWASWAPSSCPTATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	264369	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266581_267819_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
528475	contig_1535_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_127232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGTTTTCAGTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59364	60403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_59400_60400
528477	contig_3095_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_75078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	98	823	147280	151151	TRUE	25	ACTTATAGCTTAAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
528478	contig_4754_pilon	+	2075	14	Intergenic	novelGene_35957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	169.928213175847	21	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	32	1483	380119	416949	TRUE	10	TTTGTGTGTGTCAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLVSEEASEEAGGEVWEGMGPCHHHPQGPGHVWGPQLPAPYDYALLHQRAV	380087	420738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414637_415774_415898_416938_417082_420159_420252_420370
528480	contig_10801_pilon	+	3031	7	Intergenic	novelGene_74070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	19.1463660607786	197	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	244	1092	456112	499596	FALSE	25	CTGAATGGATATTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSSSTVNEEPDALSVVNQLRDLAADPLNRRAIVQDQGCLPGLILFLDHPNPSVVHSALLALRYLAECRANREKMKGELGMMLSLQNVIQKTTTPGETKLLASEIYDILQSSNMADGDSFNEMNSRRRKAQFFLGTTNKRAKTVVLHIDGLDDTSRRNLCEEALLKIKGVISFTFQMAVQRCVVRIRSDLKAEALASAIASTKVMKAQQVVKSESGEEMLVPFQDTPVEVEQNTDLPDYLPEDESPTKEQDKAVSRVGSNPEGGASWLSTAANFLSRSFYW	451860	501535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_452066_456073_456295_460545_460638_488575_488766_497846_497964_498050_498126_499404
528481	contig_10331_pilon	+	2253	9	Intergenic	novelGene_54046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	1097	junction_3	1031.64346281794	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	82	2019	6092	28575	FALSE	65	AATGAAAAAAAAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESLSIVYTTYCPAQYTIYEPVIRLKGQMKTQLSQRPFSSKEVQSISLEPHHLKNLQPTECKTIQGVLHETGGTGIFVFLFARVVELSSCEETQALALRVILSLTKYNQQRIHELENCNGLSMIHQVLIKQKCIVGFHILKTLLEGCCDEDVIHLTENGKFKLDVESNAIIQDVKLLEELLFDWKIWNKAEQGVWETLLAALEILIRADHHQQMFNIKQLLKAQVVHHFLQTCQVLQEHKEGQLTSMPREVCRSFVKIIAEVLGSPPDLELLTIIFNFLLAVHPPTNTYVCHNPTNFYFSLHIDGKIFQEKVRSIMYLRHCSSGGKFVTSPRFMVISPSGFTASPPEGNNSSNLIPQRMIAHMLRSRSLPAFPTSSPLMQPRKLTTSLGSSIDKLQNIADSYVATQPEKWDPLGSSEILKKGKEDALISSCESAKTVCETEAVLSAQTSVSGVPKGKVVFPVVEVDHKEVGSELRSDDDSPGDESCPRRPDFLKGLASFQRSHSTIASLGLAFPSQNGSAAVGRWPSLVDRNADDWENFAFSLGYEQNYNRTANAHSITEDCLVPICCGLYDLLSGVLLILPDIMLEDVMDKLIQADTLLVLVNHPSPAIQQGVIKLLDAYFNRASKEQKDKFLKNRGFSLLANQLYLHRGTQELLECFIEMFFGRRIGLDEE	6010	28809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_6257_9049_9224_10156_10307_14107_14246_18845_19045_22017_22150_25154_25783_26519_26698_28401
528483	contig_8658_pilon	-	1276	7	Intergenic	novelGene_55827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	138	947	36589	6049	FALSE	40	CAATAAATTTACAGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55581	5719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
528484	contig_12638_pilon	+	1816	11	Intergenic	novelGene_33386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	109.991136006498	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	90	1388	1515842	1538931	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515752	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1539012_1539332
528485	contig_5210_pilon	+	2347	10	Intergenic	novelGene_65472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	141.64117417694	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	11	856	803815	812511	TRUE	15	GAGTGTATGTCTGGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKHQHFQEPEVGCCGKYFLFGFNIVFWVLGALFLAIGLWAWGEKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	803804	814071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807349_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474_812538_812606
528486	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_9371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528488	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	226	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528489	contig_5988_pilon	-	1356	4	Intergenic	novelGene_15967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1034.91395240807	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	294	1190	652858	651962	FALSE	35	AGAAGAAAGGTTTTTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655543	651795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653365_653742_653773_655456
528490	contig_9727_pilon	+	2108	14	Intergenic	novelGene_86248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.326535736817	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	405	1511	8228	20134	TRUE	10	GACTGTTGTTACGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISTPVDINNRDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACSIALDAVKTVQFEESGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIASRPEELREEDVGIGAGLLEIKKIGDEYFTFITECKDPKACTILLRGGQQRDSFGSRTQPPGCYASVSQRPSGPSAGARGWGL	4699	21383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_4872_7376_7469_8087_8234_8327_8391_8706_8804_12793_12912_14765_14953_15673_15824_17193_17327_17519_17602_19150_19333_20045_20292_20547_20680_21075
528491	contig_16103_pilon	-	2074	8	Intergenic	novelGene_118839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4259.24686261958	4	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	69	533	743628	735009	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAEPLPRDG	743696	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723647_733297_733356_733542_733606_734953_735030_735672_735733_735856_735975_737495_737630_743496
528492	contig_7457_pilon	-	2948	11	Intergenic	novelGene_31519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	113.030128726813	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	80	1180	694599	675289	FALSE	30	ATAAATTTGATGGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQLLEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQSTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLVREANNCSSPAGSLVDAMSQKHLQVLKTQTKFAATVRLLVGGKLNVHMNPPQVKATIISEQQAKSLLKSENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMSLKRIKRADRRGAESVTEEKFTVLFESQFSVGSNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDHNATATVLWDNAFAEPQAPSPAVCAQAPYNMYPQNSDPVLDQDGEIDLDETMDVARHVEELLRRPMDSLGPPLPPPDGFFTSARGSLS	695477	673520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_675452_676860_676917_680452_680546_681158_681282_681381_681470_683262_683412_689276_689331_692716_692807_693980_694138_694471_694610_695408
528493	contig_9014_pilon	-	2306	9	Intergenic	novelGene_106728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	73.1928104392774	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	931	1752	43493	41867	FALSE	10	GGTTGTTACTCATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51583	41312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_43743_43829_44086_44240_44420_45016_51551
528494	scaffold_12124_pilon	+	2371	12	Intergenic	novelGene_22000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	167.421524727703	9	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	217	936	800112	807554	TRUE	20	CAAAGAGCTTGTTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791843	815408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808331_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647_810745_813915_813998_815122
528495	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	5	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528496	SIRV4	+	281	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	93	-942	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAGACTACAACGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548	1829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1800
528497	contig_18869_pilon	-	2733	3	Intergenic	novelGene_55972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24	895	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	496	1038	53041	52499	TRUE	35	TAATAACATTAGTCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59594	49543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_49889_51148_53330_59387
528498	contig_5643_pilon	+	1483	12	Intergenic	novelGene_39029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	830.497311930609	38	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	650	1177	634983	641123	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENANHIPPSHEEYPCQGLPHLLQTQGGYV	631199	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636462_640669_640729_641102_641244_641412
528500	contig_13707_pilon	-	2200	12	Intergenic	novelGene_43549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	827.849139848021	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	188	901	274534	271743	TRUE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLPPAEGQDKETWSQG	275545	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271789_272373_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275230_275442
528502	contig_16098_pilon	-	2494	13	Intergenic	novelGene_45873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	44.24450687813	45	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	619	1527	253301	247493	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	254104	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563
528503	contig_3414_pilon	-	2261	16	Intergenic	novelGene_80967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	298.207504190548	206	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	16	1869	101974	67173	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65392_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
528505	contig_11285_pilon	-	1939	16	Intergenic	novelGene_5666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	465.572603241309	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	583	1746	789442	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798604	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_798422
528506	contig_8357_pilon	-	2321	18	Intergenic	novelGene_39745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	283.919843457006	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	422	1672	795947	762891	FALSE	30	AAAACTTTATCTTGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	808820	762241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800672_802131_802215_806917_806995_808080_808163_808770
528507	contig_15063_pilon	+	1501	5	Intergenic	novelGene_9928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	35	GAGAAGTTGTATGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528509	contig_5020_pilon	+	1335	6	Intergenic	novelGene_27893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1231.947628757	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	365	1024	122915	125772	FALSE	0	CTTGGTGTCTCCTCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	119437	126083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119607_122719_123041_123152_123364_124167_124308_125022_125091_125657
528510	contig_10134_pilon	-	1305	3	Intergenic	novelGene_16179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	514.5	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	356	610	34974	30068	FALSE	15	TCTATTTAGACTCTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSDWLLLQTPHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQGNTTESLTEQRKSGVQNSNSCKKTRLNGLTKTTGTPEDMTPGLSVNPELKPFPKPTLQTKLRLDYGT	38710	29372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30271_34922_35178_38558
528511	contig_17274_pilon	+	1913	16	Intergenic	novelGene_26457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	425.953706404816	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	72	1661	7027	80052	FALSE	30	AGAAACTTCATCTCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEGKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6955	80304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
528512	contig_7593_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_127257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3532	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3500
528513	contig_5515_pilon	-	1717	10	Intergenic	novelGene_52330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	447.150346191038	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	113	1309	99142	67635	FALSE	5	CCCCTGAGCGGCTCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHREVGNPLPSTPRMSEPSLLNFSLLKCTFIL	99254	67226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_67724_68180_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
528515	contig_6047_pilon	+	1473	9	Intergenic	novelGene_24199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	676.329061921784	269	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	113	958	105237	122634	TRUE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYV	105124	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114750_122628_122741_122981_123102_123594
528516	contig_8060_pilon	+	2747	6	Intergenic	novelGene_104827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	122.068177671333	428	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	51	413	158272	215146	TRUE	15	GTCAGCGTGTGGTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARTRRPRGGGRKDAVMAPRGLPGSAVLAAAVFVGGTASSALEAPELNDSINENSDTVGQIVHYIMKNEANADVLKAMVADNSMGDPESPVTPSTPGSPPVSPGPLSPGGTPGEARLWTPSAHSGWCCGEGRVSSV	158221	243769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_158360_203636_203709_212184_212243_215001_215240_219456_219596_241667
528517	contig_9345_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_24611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948034	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_946900_948000
528518	contig_4364_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_2744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCTTCAGGACTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533295	1532973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
528520	contig_15063_pilon	+	1908	6	Intergenic	novelGene_8436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3599.786771463	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	597	1769	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	3105	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_3456_27122_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528522	contig_1331_pilon	-	1617	4	Intergenic	novelGene_37800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3512.24043722649	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	170	553	166527	160009	FALSE	15	GGCATTGTTCTGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMKRPFLLTTSVSVSGSVPESSLLKKILARIFVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	170023	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166429_166534_169860
528524	contig_5684_pilon	+	2135	4	Intergenic	novelGene_81040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.8090105744597	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1048	1611	443906	447039	FALSE	35	AAATAGGGCTAAATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403575	447563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441996_442785_443891_443949_446518
528525	contig_3077_pilon	+	1099	5	Intergenic	novelGene_26774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_3	1018.6545047267	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	64	606	15160	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13944	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
528531	contig_15063_pilon	+	1299	4	Intergenic	novelGene_14262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	351	1172	35271	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34808	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528532	contig_9647_pilon	+	2647	22	Intergenic	novelGene_127379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	24.6439498262464	290	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	1050	2450	89977	138145	FALSE	10	CTTTTTTTTTTAGTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVEAVIALLEATPEIPACVVSLSGNHAVRLPLMECVQMTQDVQKAMDERKFKKAVQLRGRNFESNLNTYKRLCIKLPDSQIVKSNCNVAIINVGAPAAGMNAAVRSAVRTGISDGHRMLAVYDGFDGFSKGQIKEISWTDVGGWTGQGGSILGTKRILPGKYLEEIAEQMRAHSINALLIIGGFEAYLGLLELSAAREKHEEFCVPMIMVPATVSNNVPGSDFSIGADTALNTITDTCDRLKQSASGTKRRVFIIETMGGYCGYLANMGGLAAGADAAYIFEEPFDIRDLQSNVEHLTQKMKTSIQRGLVLRNENCSENYTTDFICQLYSEEGKGVFDCRKNVLGHMQQGGAPSPFDRNFGTKMSAKAMQWITVKLKDSQRTGRKFVTDDSVCVLGISKRNLVFQSVADLKKDTDFVHRIPKEQWWLKLRPVMKILAKYKASYDVSDSGQLEHVHLHPQEESAGI	38798	138342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_38987_61547_61622_73368_73447_76389_76580_78017_78184_79765_79811_80055_80166_86753_86850_88304_88398_89967_90094_91814_91880_92675_92746_93150_93298_103545_103617_105707_105796_106525_106679_115839_116005_118298_118361_118846_118959_121139_121240_137548_137652_137997
528533	contig_9594_pilon	+	1744	10	Intergenic	novelGene_73933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.318553906022	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	241	1314	310498	322451	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301201	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301389_310444_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
528534	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_96798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653853	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
528535	contig_12951_pilon	-	1879	6	Intergenic	novelGene_68163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.635667596719	579	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	22	465	326206	296988	TRUE	20	TATTTAAGAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTGSGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	326227	295358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_296231_296293_296415_296566_297135_298383_298510_307070_307220_326184
528536	contig_10135_pilon	-	2200	9	Intergenic	novelGene_106609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	41.7071261896573	579	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	506	1696	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89570	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88963_89057_89502
528538	contig_5499_pilon	+	2823	15	Intergenic	novelGene_56983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_9	176.346496235944	935	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	77	1756	776530	795406	FALSE	40	AAAAAACACTTAGTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVAKATAGMVLGELYVSDREGNDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWDVISKSQMKNIRKMWHREQMKNECREKKEAEDNLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIHALEAHRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLSDELCQCYNGVVLSTESSVAVYGMLNLTPEGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGENMSKILKARSLITRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGSTLFKLDYFGEEAFLTQSSQLYLETCLPSLGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHIEAECAFLTFEDLLTRVEDLICDVVDRVLKSPIASIVYDLNPNFKPPKRPFKRMNYLDAIVWLKEHNVKKEDGTFYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIWDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCAHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP	776453	796473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_776573_777638_777722_780037_780104_780189_780283_780368_780459_782346_782426_783301_783373_787847_787935_789167_789390_790465_790666_791050_791187_791872_791987_794159_794292_794615_794748_795274
528539	contig_6494_pilon	-	758	7	Intergenic	novelGene_108547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	990.353935048812	80	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	16	747	8286	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8301	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2111_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
528540	contig_5041_pilon	-	2169	8	Intergenic	novelGene_27101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	692.43524710154	14	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	9	1073	616721	576390	TRUE	35	CTTCATTAAAACCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKVSTIVKCI	616729	575193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_575266_575365_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559
528541	contig_9345_pilon	-	2119	5	Intergenic	novelGene_24393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_4	500.404336511985	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	449	1132	148904	142100	FALSE	15	ATTTGGAACTGCTTCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	151852	141112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_151447
528542	contig_11285_pilon	+	2174	13	Intergenic	novelGene_5559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	522.927948085478	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	65	1858	766060	769878	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEVRAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763493	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766450_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
528544	contig_15087_pilon	+	2366	4	Intergenic	novelGene_37280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	901.102657858693	3	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	25	462	284653	301814	FALSE	30	ACTTTTTAACTTGCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCVDSPFTMTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTTAQV	284628	303718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289300_289451_301237_301421_301799
528546	contig_14744_pilon	+	1019	6	Intergenic	novelGene_66050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	4102.12815011916	84	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	445	978	1383399	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382035	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
528547	contig_12227_pilon	-	2924	6	Intergenic	novelGene_127392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	31.4668079092875	120	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	164	547	73693	66609	TRUE	25	TTCAAAAGTTGGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDAILTEGEGPRRLKNLYFLYLIELRALSKVLPFFERPDFQLFTGNKVQDAENKMLLLDILHEVKSFPLHFDENSFFAGDKKEANKLKEDFRLHFRNISRIMDCVGCFKCRLWGKLQTQGLGTALKILFSEKLIANMPESGPSYEFHLTRQEIVSLFNAFGRISTSVGELENFRNLLQNIH	73856	62609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_-_64977_66598_66670_68247_68382_68468_68556_73123_73194_73661
528548	contig_1337_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_84228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCAGATACTCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108141	107924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_107900_108100
528549	contig_3132_pilon	-	2308	2	Intergenic	novelGene_127436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCGTTCTGTGTAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240954	238146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_239791_240290
528550	contig_11933_pilon	+	2806	3	Intergenic	novelGene_107242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	101.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	228	557	83002	89328	FALSE	15	ACTTGGTTCTACCTTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVESDAACHSPAVLKIPRKMSSTLSVAMMPGRNQFLGYAWPRIWLVILKLSGLAGRAPATAVQDTGQTQAFLTLSCAELMSKLRGPQSQRHPSTPPDGAIKTLFLGGE	82774	91577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_83058_85042_85091_89102
528551	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	235	1407	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27134	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528556	contig_14326_pilon	+	3147	7	Intergenic	novelGene_120648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6.09416843292741	240	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	150	605	35413	45955	TRUE	15	TTTTGAGCTGTAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKGPSASTSPENSSAGGPSGSSNGAGESAGQDSTFECNICLDTAKDAVISLCGHLFWSPACSGWRLDLTDRCVLFAKPASAEIRSSRSTAGAALGSRTPERRPLPVLRDRGQSQRTEGDFKDSDLEMVASRCLLELGHFPLGYLPQHLT	17910	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_47357_47452_48304
528557	contig_3004_pilon	+	2760	12	Intergenic	novelGene_127486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_10	190.911688294019	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	137	916	277854	281328	TRUE	15	TGTAGTTTTGGCTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275496	287263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_284415_285297_286451_286738_286875_287113
528558	contig_12624_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_61095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	1953	2264	903464	903775	NA	35	GCTAAAGACAACTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIVCMQPMLKQILECGSWTAVKASRAPFQSFLSAASTPSFQRLMASARDMVRWKPGGREAASRQLRLGGREWVRRGVSPSRAAQLPQVLIFLAWCSECGPA	901511	903777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_901500_903800
528560	contig_15063_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_12093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3269.02335377097	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	238	1401	34808	36661	FALSE	25	GTGAGAAGTTGTATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35371_35839_36158_36266
528561	contig_17753_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_105036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1151	1480	28767	29096	NA	35	CAAACAAGATACGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGHLFNSVLKLLLKFTIQPKIRQAYKTNNNRCSSSMCMRVGPAHRTSQWTHQPKGKMQREEVTGKLDERKWGTWEREGESVDTSQGLQPLSQNSMCINCLMRNEFAL	27616	29712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_27600_29700
528562	contig_13760_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_61328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTACTAGCATGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255265	254833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_254800_255300
528564	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528565	contig_1532_pilon	-	2033	8	Intergenic	novelGene_37446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_2	253.030045808067	935	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	190	1437	51365	41713	FALSE	20	AACCATTTGTTTGTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLHVANAIFALNFFKHLANTSPTQNLFFCPWSISSTMAMVYLGARGNTADQMAQVLQFNKVGGHKIIPVTPRKFTSCEIRQWIQKATYPDAILQAQAGNTIHSSFQSLISAINSSSGGYLLESINQLFGEKSTRFNEEYVKLCKKYYSTEAQAVDFLEHAEEARKKINSWVKTQTKGKIPNLLPEGSVDRETRMVLVNAVYFKGKWKTPFQKKLNGLYPFRVNATERKPVQMMYLHERLNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDGVADVSTGLELLEGEITYDKLNKWTSKDTMVEDDVEVYLPQFKLEKRYELKPILRSMGISDAFSKGQANFLGMSERNDLFLSEVFHQAAVDVNEEGTEATAGTGAIMTGRSGHGGPQFVADHPLLFFIMHRMTRSILFLGRFSSP	55625	41116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_42118_42429_42595_43684_43828_44479_44598_45389_45519_47118_47239_51197_51375_55445
528567	SIRV6	+	1021	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	349	0	176	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	148	639	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1479	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
528568	contig_21027_pilon	+	2368	3	Intergenic	novelGene_127569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_2	409	12	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1345	1671	6371	8128	FALSE	25	ATACTATGCTTGCCTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1733	8825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_6482_7912
528569	contig_500_pilon	+	1339	9	Intergenic	novelGene_31082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1136.23676422434	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	560	1066	1496587	1499316	FALSE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK	1493675	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1493792_1494196_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498000_1498048_1498078_1498882_1498974_1499277
528570	contig_15114_pilon	-	3744	11	Intergenic	novelGene_121178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCCCTTACGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678016	656465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_658802_662557_662666_662750_662861_665288_665485_667325_667475_668356_668479_669732_669812_670208_670274_675198_675348_676587_676739_677737
528571	contig_5499_pilon	+	1847	12	Intergenic	novelGene_57000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	258.854150197327	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	137	1174	816585	840037	TRUE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803388	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803441_809587_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840133_840696
528572	contig_4213_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_124830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAACAAAATGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178992	176513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_176500_179000
528573	contig_19579_pilon	-	1710	7	Intergenic	novelGene_59391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	106	945	13090	7943	FALSE	65	TTAAATAAAAAAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
528574	contig_5018_pilon	-	1968	8	Intergenic	novelGene_47051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_5	466.00963465559	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	70	903	1402792	1400834	TRUE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKVGLGF	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
528576	contig_14575_pilon	+	2559	25	Intergenic	novelGene_101870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_18	113.444545618357	67	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	145	690	17236	26356	TRUE	55	ATTGAAGAGAAAGATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17091	63900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
528577	contig_15518_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_127631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAACTTTTTTCCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39346	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_39300_40600
528579	contig_14353_pilon	-	2147	8	Intergenic	novelGene_82147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_5	179.928103555225	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	524	1174	407973	402843	FALSE	65	GACTTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASASCPRNQTVPHRWPAFPPRVNEKEIVRSRTIGELLAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420344	401869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_414146_414413_415277_415447_420261
528580	contig_14711_pilon	+	2485	14	Intergenic	novelGene_68885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	295.578281864651	19	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	526	2106	83997	90138	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRGSRPHPGHCAGLHRRHCGSGAGPGPGLPYLSGNL	70414	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_90032_90194_90489
528582	contig_6217_pilon	-	2878	4	Intergenic	novelGene_109682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	232	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGGAAGGGGCGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018887	877363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_877541_981693_981754_1008901_1009382_1016726
528583	contig_5988_pilon	-	1592	5	Intergenic	novelGene_16001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.641695452624	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	245	889	693353	690013	FALSE	25	TAAATGAGTTCAGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICL	693597	689309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690018_690238_690504_690859_691009_691134_691358_693350
528584	contig_11978_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_62876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1105	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	127	450	651501	651178	NA	15	GGTGCAATGTTTTCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQQDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTLADQQARRQERKPKDRRK	651627	649390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_649400_651600
528585	contig_1143_pilon	-	2103	25	Intergenic	novelGene_86566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	234.476007864107	41	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	7	1914	201037	85910	FALSE	15	CATTTTATCTCGTTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVSSLPELLEKKRLIDLHTNVATAVLEHIKARKLDVYFEYEEKIMSKTTLDKSLLDIISDPDAGTPEDKMRLFLIYYISTQQAPSEADLEQYKKALTDAGCNLNPLQYIKQWKAFAKMASAPASYGNTTAKSMGLLSRVMNTGSQFVMEGVKNLVLKQQNLPVTRILDNLMEMKSNPETDDYRYFDPKMLRGNDSSVPRNKNPFQEAIVFVVGGGNYIEYQNLVDYIKGKQGKHILYGCSELFNATQFIKQLSQLGQK	201043	85720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_85934_88855_88925_91081_91148_93804_93839_96112_96166_99347_99402_112824_112901_114899_114963_119308_119389_121382_121454_135918_136016_147612_147695_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
528586	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_13721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
528587	contig_10135_pilon	-	2098	9	Intergenic	novelGene_106615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	38.698958319314	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	404	1594	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89577	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88920_89057_89502
528588	contig_3424_pilon	+	2299	2	Intergenic	novelGene_55485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	405	2048	169035	170678	FALSE	25	TCAAATACAGCTTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149940	170929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149995_168684
528589	contig_12427_pilon	-	2452	4	Intergenic	novelGene_40430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	321.90302197332	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	8	646	264797	229966	TRUE	30	GAGCCAATGACGCCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVMAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTLEIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPNWIEDVRKYAGSNIVQLLIGNKSDLSEHREVPLAEAQSLAEHYDILCAIETSAKDSSNVEEAFLRVATELIMRHGGPMFSEKSTDHIQLDSKDISESWGCGC	264804	227582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_227785_228361_230217_230601_230786_264593
528590	contig_12950_pilon	+	2962	2	Intergenic	novelGene_114788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	16	2169	102511	104664	TRUE	20	AAACTCTGTCTGGCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFRAALFFWVVASWAKGDEPPGETDKAGFQKCKNALNLRVLEVLPGGGWDNLRNVDMGRVMGLTYTSCRTTEDGQYIIPDEIFTIPQKQSNLEMNSEILESWVDYQSSTSYSINTELNTFSEVNGKFSAEFQRMKTLQVKEHSITTRVQVRNLVYTVKINPTLELSWGFRKDLMAISDCLENNQTRMATYLAELLVLNYGTHVITSVDAGAALIQEDSIRTSFLQDSQNSRIAVTLSAGITFQNIINFKFEDNYILQNALTKSYLSNRTNSRVQSIGGVPFYPGITLQTWQEGIANHLVALDRVGLPLHFFINPNMLPGLPGPFVKKLSKIVELAVRRYYDFNTYPGCTDFNSPNFNFQANTDDGSCEGRVTNFTFGGVYQECTQLSGNEAVLLCQNLEQKNPLTGDFSCPSGYSPIRLLSQIHEEGYNHLECQRRCTLLVFCKKVCEVVFQVAKAEFRAFWCVAHNQVPEYSGLLFGGLFSSKSINPLTNSQSCPAGYLPLRLFESLKVCASQDYELGYRFSVPFGGFFSCAVGNPLADSAISRDSGAPAVKKCPGGFSQHLALISDGCQVSYCVKSGIFTGGSLPPVRLPPYTRPPLMSQTATNTVMVTNMETSNSWIKDYETHQWKLGEPLELRKALKVTHEDEHGLSGGTAAGVIVGVITVLVAAITLAIYGTRKYKKRQYRAIEDEKQSLTQGTAATGDAPHQEPEQNPV	102495	106788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_104694_106024
528593	contig_15063_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_13709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528594	contig_3077_pilon	+	1202	7	Intergenic	novelGene_26765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2722.37698936467	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	342	764	16163	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13073	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13171_13863_13958_15129_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17658_17717
528595	contig_11720_pilon	-	1419	2	Intergenic	novelGene_43875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	134	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	50	307	109749	109492	TRUE	15	CATGTATGTGTGGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLVSATTGKVSRSWTMVLEPSTHLCLFPFLSYSSSCLFLLRFFCIREPKSSPSSHLLLLLIGGGRFQTRDCGLPAQPGGGGGERVQLSGILGLLQCVSGS	109798	107778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866
528597	contig_15063_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_10119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528598	contig_15063_pilon	+	1220	4	Intergenic	novelGene_14333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	256	1077	35271	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34903	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528601	contig_15304_pilon	+	1005	3	Intergenic	novelGene_30545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCACGCTGGAGACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52889	54245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493_53813_53991
528602	contig_19342_pilon	+	1264	7	Intergenic	novelGene_41079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.1446603773522	7	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	200	676	4349	6183	FALSE	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3241	6771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3810_3892_4315_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
528603	contig_20889_pilon	+	2843	4	Intergenic	novelGene_127638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	47.3168985552613	120	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	338	1948	60728	63349	FALSE	10	TGTTTGGATTGAGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNDTCFSMVGDICKSHGVEDKDNNQKTHVRKHMIENLCERNEDNQCGQTFSQILSHSVLKRTPMEGHPSEFLECGKSLMDHSSLKHHIRSHSGCVASQCKECGQACSCLSYLSTPVRTLTGEKPYESKEYGKAFRHFSVLKTHMRNHSGVRPYECKECGKTFRQSSVLMTHMRTHSGERPYKCKECGKAFSYSSNFTVHIRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDVTRHMSIHSGERPYECKECGKAFRLSSHLSTHMRIHGGERPYECKECGKTFRWPPDLTAHTRTHSGERPYKCKECGKAFRRSSHLTTHTRIHSGERPYECKECGKAFRCSSNFTTHMTTHSGERPYECKECGKAFSCPSHLTTHIRTHSGEKPYECKECGKAFSYSSNFTAHIRTHSGERPYECKECGKAFRRSSYLTRHMSTHSGERPYDCKECGKAFRRSSHLSKHMRIHSGEGPYECKECGKTFCWPSDLTAHMRTHSGERPFECKECGKAFRRSSHLTNHMRIHSGERLMNVRNVGKPLAGHHTSLHI	20036	64244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_39283_39526_60671_60820_61830
528604	contig_15185_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_99450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	332.885835673188	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	250	1074	444599	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472502	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444689_472342
528605	contig_10531_pilon	-	2531	4	Intergenic	novelGene_114516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_3	56.7861485458088	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	270	608	386852	382316	FALSE	10	TTTTTGTATGTTGCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPEEGTALWRLQKLPADLGPQLLHKIIDGICGRAYPLYQNYHSVWDSTEWIHVLEDITTFFKVIVGKNLSDEEISQQLNQLNSFHQEAIMKCLKSRKDDIRQALLGEIVDISSAQLQNFDWQLKLALSSDKIATLQMPLLNLHLDVKENGEVKPYSVEMSKEELQNLINSLEAANKVFVLILLYGLNFTVLKPLEQYKKSS	390804	380392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_382550_386747_386901_388812_388969_390739
528606	contig_7057_pilon	-	3579	3	Intergenic	novelGene_123396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	198	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAACTCGGGAGTCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280870	1268691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1268712_1272740_1272940_1277510
528607	contig_8138_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_52487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTCCATGGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307351	307827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_307400_307800
528608	contig_13528_pilon	-	1777	12	Intergenic	novelGene_66864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	168.816737644971	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	516	1400	57141	40217	FALSE	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSAEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQIWQMAENIYNDEESDVTASELEGQGS	68111	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61412_66961_67099_67879
528610	contig_11512_pilon	-	2302	8	Intergenic	novelGene_43273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	441.251605766865	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	166	996	396169	367967	TRUE	30	ACCCTTGGAACCTAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396334	366009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366471_367121_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
528612	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
528613	contig_5954_pilon	-	2363	13	Intergenic	novelGene_28688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	422.862237876855	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1311	2021	947127	945083	FALSE	25	TAAATGTTTTATTGCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960576	944740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956278_956762_956942_959766_959941_960474
528615	contig_14925_pilon	-	1410	7	Intergenic	novelGene_55162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1778.00819426933	207	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	72	410	276802	83767	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKTWRVLLIILWLLLSGISGKNEVEQSPPYLSVQEGELVTINCSYSTGMTTLQWLQKNPGGGIVSLFILSLEMKKKERLSATINTEERHSSLHITASQPRDSATYLCAAAV	276873	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_83712_83779_276286_276562_276750
528616	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_8898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36765	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27175_34612_34925_35033_35378_35838_36156_36264
528617	contig_11832_pilon	-	1783	15	Intergenic	novelGene_106923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	988.118096408005	8	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	493	1332	88105	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92444	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_88081_88281_88490_88536_88646_88715_89418_89450_91996_92113_92387
528618	SIRV6	+	1028	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1386	56	1	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	96	305	2569	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2473	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528619	contig_2204_pilon	+	2093	8	Intergenic	novelGene_71654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.646305480464	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	170	679	14806	47843	TRUE	35	GTTAAATTTTTAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAEASHSPTTPKRRESHRKVNTWK	13174	51205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14738_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_47775_47918_48669_48717_49912
528620	contig_8616_pilon	+	1507	12	Intergenic	novelGene_72489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	643.727677138438	1	39	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	627	1436	327034	330999	FALSE	15	CACTTCCTTGACTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	320442	331070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_320473_321092_321208_322267_322585_323789_323876_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
528621	contig_1443_pilon	-	1934	10	Intergenic	novelGene_28296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	492.643687130096	2	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	349	1272	776427	748649	FALSE	55	GAAAAAAAAAGAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	747986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_789176_789314_808690_808741_809399
528622	contig_2537_pilon	+	2225	19	Intergenic	novelGene_33427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	31	junction_2	165.241321843068	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	139	1719	239886	297712	FALSE	10	GGTCTCATCTATGTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRMHNNSSPSVSPNTSFTSDGSPSPVGGIKRKAEDSDSEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVLRYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIASLPSDFEKGTKPFKPLEQLMGVFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALLPFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFVLELYKTGSTEPMDVPPELCHGIQGKFSLDEEAVLPDQIVCSPVPLLRDLSQNTAISINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAPVLKPGDWEKSSNGRQWKPQLGFSRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGVYSNAAPPPATYQGSLYRPLLRGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFERGVGAEPLLPWNRMLQTQNAAFQPNQYQLLAGPGGYPPRRDDRGGRQGYPREGRKYPLPPPSGRYNWN	235203	298218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_235245_235342_235401_239846_239892_241320_241453_245173_245293_249123_249260_250522_250631_250723_250814_251426_251500_258097_258182_259021_259120_259201_259282_266057_266115_278243_278313_278407_278540_280631_280760_290367_290432_295098_295238_297646
528623	contig_15866_pilon	+	1741	13	Intergenic	novelGene_63647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	534.45429073859	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	96	1070	601021	633133	FALSE	15	TAAGTGTGGCTTGGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	519250	633804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_519277_581434_581475_581685_581705_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
528625	contig_14513_pilon	-	1048	2	Intergenic	novelGene_70372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	185	424	18880	11918	FALSE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTCSSPTPLRITPTSSSFSRVPSTWPSWDSVCSEERQSMAVERVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19064	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12113_18835
528626	contig_16775_pilon	+	2000	16	Intergenic	novelGene_107770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	294.663800891042	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	737	1492	158999	174222	FALSE	40	GATCAATAATAGTACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130369	174730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152245_156913_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984_174133_174218
528627	contig_8978_pilon	+	1913	10	Intergenic	novelGene_49382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	297.980403697381	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	87	1040	339807	343977	TRUE	20	CCCAGAAATTGCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGK	331576	347878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_343969_344028_344175_344261_344692_344757_347204
528628	contig_3975_pilon	-	1844	15	Intergenic	novelGene_54836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.026700608983	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	257	1777	2066301	2056443	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGHFV	2079238	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056453_2056855_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
528629	contig_12790_pilon	+	2332	6	Intergenic	novelGene_35203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	514	junction_4	123.222725176811	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1205	1528	309644	310194	TRUE	55	AAAAAAAAAAGTTTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	305928	311534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_309756_309873_309924_310032_310494_311029
528630	contig_16098_pilon	-	1785	6	Intergenic	novelGene_46127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_4	988.626643379593	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460262	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458838_460148
528631	contig_15063_pilon	+	1836	7	Intergenic	novelGene_8455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	5	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	346	1581	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPQSLKGRKSWGRAGQFVCGRASHTHHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26250	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528632	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528633	contig_15063_pilon	+	1117	5	Intergenic	novelGene_9958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	238	1068	34808	36740	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLPLCVCPCVHSN	27131	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36175_36704
528634	contig_7151_pilon	-	2028	10	Intergenic	novelGene_40650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	132.337764642665	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	737	1552	12708	4371	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWTTSSPYLWSSASFWGPFSSWSLSSWELSCTDGEQSSESYLVLKVLSMRLCTRILMITFYNQRRRTCWTTQENCLMSH	18279	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5259_5934_6259_6347_6390_12491_12807_13356_13876_18160
528635	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10499	2	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11499	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
528636	SIRV6	+	495	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10271	60	1034	-58	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTAGTCGATTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11271	11766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
528637	contig_9482_pilon	-	1657	10	Intergenic	novelGene_44303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	125.064427840658	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	38	1429	1253164	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253201	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239842_1241049_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
528638	SIRV6	+	756	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-149	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	47	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	15	GGTGGTCGATTTATTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSKKCV	1640	11121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11031
528640	contig_9345_pilon	-	2144	21	Intergenic	novelGene_24540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	179.368468522202	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	22	2043	730155	723552	FALSE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDSLSLFTSLGLSEHKARETLKNTALSAQLREAATQAQRTLGSTIDKATGTLLYGLASRLKDPRRLPFLVGYIANKKIHTETQLSAALEYVRSHPLDPIDTMDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730176	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724098_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
528643	contig_15063_pilon	+	914	4	Intergenic	novelGene_11472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4177.08853948138	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	230	913	34808	36060	FALSE	30	GCATGGAAGACTGGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTV	27139	36061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839
528645	contig_7357_pilon	+	1953	9	Intergenic	novelGene_36820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1346	1723	139801	154908	TRUE	20	CAAGCTGTTCCATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135552	159972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136445_136489_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139052_139777_139973_154561_154720_154860_155083_159916
528646	SIRV6	+	347	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10460	19	1223	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
528647	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_10665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528649	contig_5549_pilon	+	1088	5	Intergenic	novelGene_81563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1408.35702149704	20	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	447	920	86768	96749	FALSE	25	AAAATTTTCTTGGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82049	96917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82313_86584_86819_91687_91835_93264_93412_96620
528650	contig_9482_pilon	+	2225	15	Intergenic	novelGene_44227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	122.869268504607	2	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1488	2003	230471	235868	FALSE	50	AAAACATAAATGAACGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDKLRFADGSIRTSELRLNMQKSMQSHAAVFRVGSVLQEGCEKITQLYRDLQHLKTFDRGMVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKVRIDEYDYSKPIQGQQKKPFTEHWRKHTLSYVDVKTGKVTLEYRPVIDRTLNEADCATVPPAIRSY	212083	236090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216625_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230543_232975_233088_233345_233477_234032_234147_235781
528651	contig_7176_pilon	-	2242	9	Intergenic	novelGene_107874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	15.15286689046	226	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	118	1230	676513	646777	FALSE	5	CCCTTGTCACTGGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRSKPVEVRPQKNAAAVRFRALPTRSVLLADLLPVCRTMDAPKQVVNFGPGPAKLPHSVLLEIQKELLDYRGVGISVLEMSHRSSDFAKIINTTENLVRELLAVPDNYKVIFVQGGGSGQFSAVPLNLIGLKAGRCADYVVTGAWSAKAAEEAKKFGTVNIVHPKLGSYTKIPDPSTWNLNLDASYVYYCANETVHGVEFDFIPDVKGAVLVCDMSSNFLSKPVDVSKFGVIFAGAQKNAGSAGVTVVIIRDDLLGFALRECPSILEYKVQAGNNSLYNTPPCFSIYVMGVVLEWVKNNGGATAMEKLNSIKSQMIYDVIDNSQGFYVCPVEPQSRSKMNIPFRIGNAKGDDALEKRFVDKALELNMISLKGHRSVGGIRASLYNAVTIEDAQKLADFMKNFLEMHQL	676630	645764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_646883_647954_648093_654519_654649_662044_662215_665198_665372_666207_666414_669908_669979_673814_673876_676453
528654	SIRV6	+	345	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	94	162	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
528656	contig_15063_pilon	+	1081	5	Intergenic	novelGene_9265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	356.90851418816	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	242	829	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27127	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_38975_39092_39506
528657	contig_3956_pilon	+	3132	15	Intergenic	novelGene_15155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1479.90012762859	1	174	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	1237	2112	1286460	1289507	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATRGAV	1281637	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283978_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286214_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289224_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
528658	contig_15063_pilon	+	1470	4	Intergenic	novelGene_13713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	201	1373	34808	36661	FALSE	40	AGTTGTATGTTTATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528659	contig_5643_pilon	+	1175	12	Intergenic	novelGene_38772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2515.80120816575	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1059	116	1174	233973	238192	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTNSTRGRERPSQLLGSPCPNSIQHTENLPSSTQLPSVPPEEGVRGLESPTLSCTINKVYCTQ	233559	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237762_238008
528660	contig_17106_pilon	-	2389	11	Intergenic	novelGene_127673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_10	43.712812766968	613	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	88	1446	109585	88603	FALSE	15	TGTCCTTTATGTAGGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCGSPRPSSRQQRPGVQIFARSLCARLVPMASYLRVLRPLCRAPGSGPAWTPAALTAPNLQEQPRRHYADKRIQVAKPVVEMDGDEMTRIIWQFIKEKLILPHVDVQLKYFDLGLPNRDQTNDQVTIDSALATQKYSVAVKCATITPDEARVEEFKLKKMWKSPNGTIRNILGGTVFREPIICKNIPRLVPGWTKPITIGRHAHGDQYKATDFVVDRAGTFKVVFTPKDGSGAKEWEVYNFPAGGVGMGMYNTDESISGFAHSCFQYAIQKKWPLYMSTKNTILKAYDGRFKDIFQEIFEKHYKTDFDKNKIWYEHRLIDDMVAQVLKSAGGFVWACKNYDGDVQSDILAQGFGSLGLMTSVLVCPDGKTIEAEAAHGTVTRHYREHQKGRPTSTNPIASIFAWTRGLEHRGKLDGNQDLIRFAQTLEKVCVQTVESGAMTKDLAGCIHGLSNVKLNEHFLNTTDFLDTIKSNLDKALGKQ	109672	87659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_88691_89398_89492_89583_89682_89863_89977_91552_91705_91873_92011_93376_93521_93604_93766_95773_95940_96841_96934_109470
528661	contig_9708_pilon	+	2595	13	Intergenic	novelGene_67269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	147.736721531544	4	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	20	1276	768056	803598	FALSE	25	GTTACCTAAAGTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768036	804917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782316_783240_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797355_797397_797867_797973_798891_799022_803458
528662	contig_5467_pilon	+	1947	12	Intergenic	novelGene_111932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	369.259544995452	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	14	988	8246	14522	TRUE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8232	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956_15257_15301_15647_15748
528663	contig_10103_pilon	-	1790	15	Intergenic	novelGene_86159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	315.441834607283	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	68	1543	656948	638598	FALSE	15	TGTGCTTATCTCTCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLSSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657015	638350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645747_651368_651475_651637_651739_653443_653647_654456_654570_654694_654772_655131_655244_655980_656047_656148_656224_656945
528664	scaffold_12124_pilon	+	1945	9	Intergenic	novelGene_22236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3433.84283411093	2	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1243	1833	1508755	1510483	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPGSPFSQRLDSPIKQNETQGAHQARDKDEKAGGDRKAGNREPKVKKGEC	1473570	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1496970_1497122_1506629_1506687_1508010_1509200_1510337
528665	contig_8317_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_20667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16483	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
528666	contig_14441_pilon	+	1498	3	Intergenic	novelGene_100534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	200.5	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	990	508	1497	111703	117792	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLA	111195	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117523
528667	contig_9839_pilon	+	3871	17	Intergenic	novelGene_88592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_4	103.799517550661	278	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	100	2190	472175	491118	FALSE	35	TTGAAAAAAATGTGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDDWQEAHERLAELEEKLPVAVHEQTDNGERDEMDLLGDHEENLAERLSKMVIENELEDPAVMRAVQTRPVLQPQSGSLNSSIWDGSEVLRRIRGPLLTQEMPTVSVLEYALPQRPPQGPEDDRDLSERALPRRSTSPIIGSPPVRAVPIGTPPKQMAVPSFNQQILCPKPVHVRPPMPPRYPAPYGERMSPNQLCSVPNSSLLGHPFPPSVPPVLSPLQRAQLLGGAQLQPGRMSPSQFARVPGFVGSPLAAMNSKLLQGRVGQMLPPAPGFRAFFSAPPPATPPPPQQHPPGPGPHLQNLRSQAPMFRPDTTHLHPQHRRLLHQRQQQNRNQHRNLNGAGDRGSHRSSHQDHLRKDPYANLMLQREKDWVSKIQMMQLQSTDPYLDDFYYQNYFEKLEKLSAAEEVQGDGPKKERTKLITPQVAKLEHAYKPVQFEGSLGKLTVSSVNNPRKMIDAVVTSRSEDDETKEKQVRDKRRKTLVIIEKTYSLLLDVEDYERRYLLSLEEERPALVDGRKHNICSMYDNLRGKLPGQERPSDDHFVQIMCIRKGKRMVARILPFLSTEQAADILMATARNLPFLIKKDAQDEVLPCLLSPFSLLLYHLPSVTVTSLLQQLMNLPQSAAAPAPSNPHLTAVLQNKFGLSLLLVVLSRGEDLQSSDPATESTQNNQWTEVMYMATRELLRIPQAALAKPISIPTNLVSLFSRYVDQQKLNLLETKLQLIQGIR	472075	492799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_472295_472592_472674_473276_473472_474393_474496_475168_475259_475921_476143_476958_477049_479622_479804_480230_480355_480695_480794_481360_481421_482564_482714_484613_484774_489433_489590_490447_490540_490634_490785_491096
528668	contig_5954_pilon	-	1581	9	Intergenic	novelGene_28602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	466.72040613198	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	125	1219	959926	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960584	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_959794_959941_960474
528669	contig_9848_pilon	-	2075	3	Intergenic	novelGene_79986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	396.5	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATGGGATTCCAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149237	128492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_130299_136653_136842_149156
528670	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_12559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528671	contig_5033_pilon	-	2275	14	Intergenic	novelGene_29056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3665.85096879889	1	98	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	24	635	566787	542197	TRUE	20	TTTGTTTGTTTTGCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKVRQFVRTAFSW	566810	531040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531136_531483_532161_533382_533491_533794_533859_534322_534630_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542225_542655_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
528672	contig_5023_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_7303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTCATTCACGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582925	585597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_582900_585600
528673	contig_10058_pilon	+	2027	10	Intergenic	novelGene_67684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	118	junction_4	91.0418435882678	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	48	725	48251	51887	TRUE	0	TTTTTTTTCCTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTSAPHQYGRGLEVRMSGCPWRYPGPERGKHCRGKAAKAALPELSTHRAVRQDIRRPQRRTSSSDVPPHREMKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGEISCEDAGWRG	48203	53873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
528675	contig_11328_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_88468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	844	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	313	942	272	1213	902278	901337	NA	20	CTCTCCCATTTGTATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECACFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAQIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDVHRFEKISNIIKQFKLSCSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLERVDGPKHSLLMR	902549	900152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_900200_902500
528677	contig_11855_pilon	+	2086	3	Intergenic	novelGene_66935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	450	1436	1003891	1004925	FALSE	65	AAAAAAAACGGTATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQQQQKTSALSPNAKEFIFPNMQGQGSSTNGMFPGDGSLNLSPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSNQQFQPVMAN	1001546	1005575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747_1004611_1004658
528678	scaffold_12124_pilon	+	2534	11	Intergenic	novelGene_21993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	141.321760532481	33	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	143	1030	799011	807554	TRUE	25	CACAAAGAGCTTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791833	815406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798987_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
528679	contig_18108_pilon	-	2148	16	Intergenic	novelGene_33496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	384.455921472873	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	83	1933	297156	266909	FALSE	20	AAGTGTGCCTCAGTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335436	266693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_269964_271371_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_296016_296172_296960_297166_335363
528680	contig_14871_pilon	+	2246	11	Intergenic	novelGene_63701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	684.100285045987	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	126	1037	201945	227246	TRUE	65	AAAAAAAAAGAATTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGVGLRHTNRHEDGTGLGSVSFGYV	194864	233722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227172_227475_227652_227827_230158_230300_233056
528681	contig_8377_pilon	-	1873	3	Intergenic	novelGene_35151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGTTCCGGTATCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199243	194367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_194521_196079_196217_197660
528682	contig_7816_pilon	+	1824	14	Intergenic	novelGene_66510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	931.988400516994	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	53	1225	170169	207920	TRUE	30	GAATTGTCCCCAAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSFSKRSTRTASSSATLPSRTWLALPWAVPHATGRCPSAALLQPFSRGPLTTFAWRPSPRATSTSVVLTAACPLGKTGPLRWPWRIWPCSGQSPHQLSFTQVMEFLQRKQWN	170116	211766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195845_196847_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
528683	contig_15063_pilon	-	1555	5	Intergenic	novelGene_8601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	30	GTAGTAGTAGTAGCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	26355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_26399_34610_34924_35035_35380_35839_36156_36264
528684	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1389	683	934	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTATGTTAATTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2389	2720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
528685	contig_14513_pilon	-	1069	2	Intergenic	novelGene_70351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	189	527	18880	11833	FALSE	15	TTAGAACTCTGCTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19068	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12134_18842
528686	contig_8600_pilon	-	3846	1	Intergenic	novelGene_125745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGTGTGTGTGGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128530	124684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_124700_128500
528687	contig_16098_pilon	-	1308	8	Intergenic	novelGene_46087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2498.66730192603	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	131	691	459176	456936	TRUE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGVTTTSTWKAPC	460265	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_456971_457866_457907_458405_458618_458704_458838_459035_459190_460148
528688	contig_15087_pilon	-	2745	19	Intergenic	novelGene_37133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.495115311729	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	598	1962	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89769	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33935_33980_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
528689	SIRV6	-	862	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8548	438	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	6	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCCCGACATTTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11095	1106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1540_1647_1736_1847_2030_2470_2618_2733_2826_3114_3163_10722_10825_11040
528690	SIRV6	+	631	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
528691	contig_1076_pilon	-	1752	14	Intergenic	novelGene_101098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	296.090282889023	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1551	202	1752	79519	51354	FALSE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAIS	79720	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
528693	contig_19342_pilon	+	1234	4	Intergenic	novelGene_41114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	6	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	233	364	4154	4285	TRUE	35	GACCTGAGAACCTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLHRRRLRGRHAVRAVRQRRRESEVGAAGAVGGAGGAGVSGRADTIAKGAAQTLRVDLPTLRGCYNQSDAGSRTFQGMFGCEVGPNGRLLCGYYQSAYDGFDYIALEEDLRTWMAAERTA	3679	6760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4365_5016_5151_6103
528694	scaffold_2602_pilon	+	2650	14	Intergenic	novelGene_127692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_3	456.445878759669	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	1046	1954	47545	68818	FALSE	20	TGTGTGGCAGCGGAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYADQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDSFTNLIPNRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	37357	69514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_37632_37742_38152_44015_44106_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_56687_56771_57959_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
528695	contig_16187_pilon	-	1904	6	Intergenic	novelGene_101069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	52.8983931703034	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	204	614	47874	41457	FALSE	65	AAGAGTAAAATTATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILRSVVQRPAGSLQVKVFQPSPADHEKYGGDPQNPHKLHVVTRIKSTKRRPYWEKNIIKMLGLEKAHTPQVHKNIPSVNAKLKVVKHLIRIQPLKLPQGLPAKEDMSETCLRSTGELVLRWDLTPGPQEGIKS	53096	40166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_41962_42112_47819_47902_48721_48836_53034
528696	SIRV6	-	418	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCATCGCCAATTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11745	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11300_11700
528697	contig_5019_pilon	+	2043	2	Intergenic	novelGene_109179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	FALSE	35	TTTTTAGATTAAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
528698	contig_12000_pilon	+	2535	9	Intergenic	novelGene_43175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_7	632.268126964344	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	152	499	488478	490720	TRUE	20	TATATCACATGTTGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGKVADEQSWY	449742	669835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_491785_492310_492414_494931_495057_558472_558606_669224
528699	contig_10496_pilon	-	2551	11	Intergenic	novelGene_59408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	111.796958813735	151	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	44	1783	64679	38747	FALSE	10	TGCTATGTATCTCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64722	37978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50723_52526_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
528702	contig_5643_pilon	+	3054	10	Intergenic	novelGene_38935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	121.541132599545	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	975	1526	498119	501081	FALSE	55	AAAAATGCAATAAACTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462242	502609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495111_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
528703	contig_2367_pilon	-	1491	4	Intergenic	novelGene_65315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	681.660880171039	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	101	307	213194	193580	TRUE	10	TTTAAGTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	213294	192219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193234_193409_193619_208552_208634_213107
528704	contig_3155_pilon	+	1607	5	Intergenic	novelGene_26354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	40	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	82	588	258156	261211	TRUE	35	ATTACACCTCACTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258074	262545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261959_262273
528706	contig_13041_pilon	+	2439	3	Intergenic	novelGene_127728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	2	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	720	1247	275096	288695	FALSE	10	TTCAGTTAGCTCCTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNRKRSLEDSESVGVKKARIEDMKNSSSVSNTLTNGCIINGHLDFPSTTQLSGMEDRNDQCLTGSNGISDGLVPGPPCGGVNSPEEPERTVSGNSDLCGSLHLNGSPSSCIASRPSWADDIEENLHYGHYHGFGDTAESIPELNSVIEHSNSVRVEERYDSAILGTMHLYHGS	268084	289887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_268638_274929_275166_288237
528708	contig_10923_pilon	+	1717	10	Intergenic	novelGene_66208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	862.341128685291	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	60	1601	20101	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	20041	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_20104_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42554
528709	contig_567_pilon	-	2048	12	Intergenic	novelGene_33961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_11	930.125513613287	429	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	304	1302	331097	308820	FALSE	10	GGGAGTACTGTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338320	308073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331171_338090
528712	contig_854_pilon	+	1346	6	Intergenic	novelGene_36199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2575.34918797432	14	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	169	621	543631	562402	TRUE	45	CCTGCTTAAGGAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPLPPVPLLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMELWARPAFSSVTPPTPSRETSPHRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543462	563752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545974_556963_557065_557591_557752_562271_562405_563029
528713	contig_5988_pilon	+	1169	2	Intergenic	novelGene_15950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	737	1168	786367	786798	FALSE	30	GTGAAGAGTATTAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDE	651787	786799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652486_786328
528714	contig_15092_pilon	+	2028	3	Intergenic	novelGene_57808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	5	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	28	594	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325131	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
528715	contig_9345_pilon	-	1787	12	Intergenic	novelGene_24512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	237.132142259463	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	39	890	671829	669257	TRUE	55	AAATTTGAAAAAAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLVSCCTGGVLA	671867	667030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
528716	contig_10063_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_127737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	380	1143	333	1475	373580	374722	NA	30	GAAATTGTTCAGTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLQNQPQQLELVTTQLAGNAWQLVASTPPASKENNVSQPASSSSSSSSSNNGSASPTKTKSGNSSTPGQFQVIQVQNPSGNVQYQVIPQLQTVEGQQIQINPTSSSSLQDMQGQIQLISAGNNQAILTAANRTASGNILAQNLANQTVPVQIRPGVSIPLQLQTLPGTQAQVVTTLPINIGGVTLALPVINNVAAGGGTGQVGQPVTTADNGTSNGNQLVSTPTTTTASASTMPESPSSSTTCTTTASASLTSSDTLASSADTGQYASTSASSSERTLEESQTPAATESEAQSSSQLQPNGLQNTQDQSNSLQQVQIVGQPILQQIQIQQPQQQIIQAIPPQSFQLQSGQTIQTIQQQPLQNVQLQAVNPTQVLIRAPTLTPSGQISWQTVQVQNIQSLSNLQVQNAGLSQQLTITPVSSSGGTTLAQIAPVAVAGAPITLNTAQLASVPNLQTVSVANLGAAGVQVQGVPVTITSVAGKLLHLFSLSTL	373247	375248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_373200_375200
528719	contig_6270_pilon	+	3624	3	Intergenic	novelGene_99864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	101	junction_1	42.5	298	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	130	957	1032332	1035699	FALSE	35	ATAAAATGATTTAGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFENLNTALTPKLQSSCSFPHLSRSAAPSSVALGPVEPGGPGLWVGSSQHLKNLGKAMGAKMNDFLRRKEPSSLGGVGVMEINKTAGAELASGVDVASGACLEDERSALQEAFPRLDPPPPVTKKRTPRALKTTQDMLISSQPVLSNLEYGTELSLGLPQDSPSSTLAPREFAPADTSQLEVTMEMAEKGEALPNGEVSLSVPDLIHKDSQGESKLKMTEWRRASSPDLMERNGLKLSLSPISLAEPPEDGSPPSQARTSSLDNEGPHPDLLSFE	1027843	1038366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1027962_1032320_1032649_1035188
528721	contig_12125_pilon	-	3400	9	Intergenic	novelGene_76203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	41.7784334316164	235	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	43	1095	121190	108963	FALSE	20	GTTTTATATGTTCTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRTQRWSWYPAASTMSHQTGIQASEDVKDIFARARNGKYRLLKISIENEQLVIGSCSQPSDSWDKDYDFFVLPLLEEKQPCYILFRLDSQNAQGYEWIFIAWSPDHSHVRQKMLYAATRATLKKEFGGGHIKDEVFGTVKEDVSLHGYKKYLLSQSSPAPLTAAEEELRQIKINEVQTDVSVDTKHQTLQGVAFPISREAFQALEKLSNRQLNYVQLEIDIKNEIIILADTTNTELKDLPKRIPKDSARYHFFLYKHSHEGDYLESIVFIYSMPGYTCSIRERMLYSSCKSPLLEIVERQLQMDVIRKIEIDNGDELTADFLYEEVHPKQHAHKQRFAKPKGPAGKRGIRRLIRGPAETEATTD	121232	106657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_109134_111345_111468_111631_111783_112015_112142_113742_113848_115204_115301_117355_117535_119460_119539_121165
528722	contig_6589_pilon	+	596	4	Intergenic	novelGene_25788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1889.73937062466	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	220	504	671073	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASGEGGGGLQRVEGGRRRAGQGGPSEGLDSDSDFPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668438	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668542_670013_670104_671046_671188_672584
528723	contig_18108_pilon	-	2151	15	Intergenic	novelGene_33521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	279.46626425589	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	160	1488	297156	276273	TRUE	20	TTGGAGTGTGTTAGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNW	335422	266709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270026_276245_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
528725	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
528726	SIRV6	+	852	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	580	162	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528728	contig_10937_pilon	+	2521	10	Intergenic	novelGene_67301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	62.8156228110157	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	1398	2324	40796	45357	FALSE	20	TGGTGCTCAGCACCAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33220	45554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33286_35744_36212_38929_39254_40254_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
528729	contig_9609_pilon	-	1207	2	Intergenic	novelGene_23084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	377	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTGGGACACAAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456275	454419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_454633_455281
528730	contig_16666_pilon	-	1945	3	Intergenic	novelGene_61766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	434.5	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAAATAGACTCGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58649	55368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_57307_58098
528731	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTTGAKESRSLSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28161	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28200_34617_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528732	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_10151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	37	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528733	contig_10134_pilon	-	2133	3	Intergenic	novelGene_16193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	838	3	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38719	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35327_38540
528734	contig_5023_pilon	+	1930	16	Intergenic	novelGene_7237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2049.62895720719	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	86	1903	607279	648178	FALSE	20	TCCCCATCTGCTCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKSGPMTHISGASECKVVGFVFV	580843	648205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_648111
528735	contig_12644_pilon	+	1213	11	Intergenic	novelGene_44635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5125.36058146156	59	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	300	1139	2678073	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677364_2677605_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311_2680337_2680468
528737	contig_3975_pilon	-	1714	14	Intergenic	novelGene_54837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.477106319855	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	103	1572	2066301	2056518	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLLLSRTTRERTEACD	2079243	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056564_2056942_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
528738	contig_5954_pilon	-	2017	13	Intergenic	novelGene_28705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	207.567793476948	697	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	74	1612	975610	962496	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975683	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963434_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
528740	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528742	contig_15354_pilon	+	2415	8	Intergenic	novelGene_65748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	48.4826920516119	463	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	298	1026	642871	647109	FALSE	30	GCTGCCTCTGCTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	638962	648498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085
528743	contig_12873_pilon	+	1999	7	Intergenic	novelGene_27210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	1190.17049432237	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	934	1425	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16050	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_16999_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
528744	contig_5429_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_127813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGACTAAGACAGACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458029	456935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_456900_458000
528746	contig_1443_pilon	+	2442	8	Intergenic	novelGene_28308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAAGGAGAAGGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748364	805719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748993_749234_749349_750369_750528_766772_766826_767479_767557_776185_776462_804484
528747	contig_12644_pilon	+	1293	9	Intergenic	novelGene_44607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4593.83709271182	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	857	1291	2679113	2680210	FALSE	30	TCGACAGGCCAGGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTI	2675473	2680212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678384_2678691_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107
528748	contig_10299_pilon	+	2628	8	Intergenic	novelGene_79671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_6	49.7721338313162	30	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	495	1016	184255	185364	TRUE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	182545	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_186528_187233
528749	contig_1443_pilon	+	991	2	Intergenic	novelGene_28168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	1043	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	221	685	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343528	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
528752	contig_6829_pilon	+	2261	9	Intergenic	novelGene_123761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	55.2963606397383	242	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	332	457	18531	18656	TRUE	20	ATTTTCTGTAACCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFGLVFRGVGCPVGANEGILGSVGLRPCLLSISIIGRRNTCERGREEAQPSKKASGQSAVGQNWTVWRVPRGRSWSAPHSSKVWFRQSSGRSSGEDSSSAREFHHRGTGSMQSGEEKMSAQLPGSTLTGRSCGSSRSRKLSAHRGGSLSRW	18199	59689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18868_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898_52974_54349_54444_56463_56581_58537_58738_58956
528753	contig_5686_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_45335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCTATAGGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116182	114530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_114500_116200
528754	SIRV4	+	363	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	67	-886	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCATCTTTTATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
528755	contig_3095_pilon	+	1252	5	Intergenic	novelGene_74980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	69	833	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151172_151848
528756	contig_3018_pilon	-	3765	1	Intergenic	novelGene_78793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464600	460835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_460800_464600
528757	contig_5686_pilon	+	2121	2	Intergenic	novelGene_45331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACCTTCAGCCTATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110673	116159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_111378_114742
528758	contig_12923_pilon	-	2234	13	Intergenic	novelGene_30103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	288.003182852783	18	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	45	1811	93727	45797	FALSE	40	ACAGTCCTTTGATGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSDFEISSGFECGVAVYDVNLLCLRILTHGNRACFPGWP	101212	45373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45910_53911_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
528759	contig_14441_pilon	+	1474	5	Intergenic	novelGene_100631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	8	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	374	1288	111703	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111277	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_111423_112040_116578_116963_117220_117344_117539
528760	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCTCCTACGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
528762	contig_7457_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_31695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	145	486	1176842	1174926	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176986	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
528763	contig_7342_pilon	-	2559	22	Intergenic	novelGene_71108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	94.8977251112613	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	105	1463	86720	77874	TRUE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSVRQVASSLTPSWLLRRPRVA	86824	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77924_78698_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
528765	contig_5480_pilon	+	1643	5	Intergenic	novelGene_107230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	120.561965395393	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	905	1387	96175	103586	FALSE	30	GATACTTGTGAAGAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKYDGYTSCPLVTGYNRVILAEFDYNGQPLETFPFDQSKERLSMYLMKADFMPFLYWNMMLRGYWGGPAFLRKLFHLGMS	94736	103842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_95635_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
528766	SIRV6	+	308	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	222	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2818_3106_3165_10724_10819_11031
528768	contig_14287_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_24048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGCTCTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21396	20584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_20600_21400
528769	contig_15047_pilon	-	1045	5	Intergenic	novelGene_52265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGTTCAGGGCGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21658	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_3493_4152_4433_4551_4683_21007_21070_21243
528770	contig_990_pilon	-	1980	4	Intergenic	novelGene_76123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	113.193050434497	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	18	332	1605903	1587072	FALSE	40	AATTTAAACAACTCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTI	1605920	1585423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
528772	contig_4131_pilon	-	2765	2	Intergenic	novelGene_127862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	3	536	163333	162755	FALSE	20	CTACATATTTTATCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKAAKKPAGARRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEVKPKVKKAGAAKAKKPAGAAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPAAAAVAKKAAKSAAKAVKPKAAKPKVAKPKKAAPKKK	163335	160525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_162845_162889
528773	contig_19342_pilon	+	1444	7	Intergenic	novelGene_41066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	2	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	29	847	3263	6183	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3234	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3619_3892_4133_4310_5170_5293_5413_5522_5960_5994_6139
528774	contig_5649_pilon	-	2370	7	Intergenic	novelGene_82466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	84.611694752492	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	87	647	1573807	1567380	TRUE	30	ATGAATGACCCTGGTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQ	1573893	1563547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
528775	contig_18055_pilon	+	1981	9	Intergenic	novelGene_117808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	242.610670622708	196	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	626	1030	77213	78314	FALSE	75	TATTAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVAE	40647	79265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932
528777	contig_9389_pilon	+	2201	5	Intergenic	novelGene_84101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	104.538270504156	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCTCATATTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390440	1425343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1398390_1398531_1408698_1408915_1423431_1423621_1423732
528778	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_9538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	14	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528779	contig_15087_pilon	-	2027	23	Intergenic	novelGene_37186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1053.22331008628	1	38	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	127	1716	158925	118167	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQGLCRK	181166	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110714_110767_110956_118115_118185_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
528780	contig_3469_pilon	+	2694	9	Intergenic	novelGene_34188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.794544970047	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1394	2341	467316	479914	FALSE	10	CTTTTATCAGCCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	462977	480267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_464248_467192_467382_471277_471365_474168_474292_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
528781	contig_10011_pilon	+	2384	5	Intergenic	novelGene_68096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	122.989836978508	82	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	60	1628	322928	333471	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKAGFWECAKHPRAGKGVWLCLLRMATGW	322868	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329012_333387
528783	contig_10159_pilon	-	2840	10	Intergenic	novelGene_30898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_9	158.532467368286	406	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	141	1226	1051078	1004067	FALSE	5	CTTACTTTTTGGTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAEAFSRPLSRNEVVGLIFRLTIFGAVTYFTIKWMVDAIDPTRKQKVEAQKQAEKLMKQIGVKNVKLSEYEMSIAAHLVDPLNMHVTWSDIAGLDDVITDLKDTVILPIKKKHLFENSRLLQPPKGVLLYGPPGCGKTLIAKATAKEAGCRFINLQPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHEATAMMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1056804	1002452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1038415_1038537_1040930_1041030_1050916_1051092_1056677
528784	contig_8020_pilon	-	1252	3	Intergenic	novelGene_114397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	10	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	135	548	152275	151533	FALSE	20	TGCTCTTCCCTAGAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQVPQGHSGCHDMAAGV	153257	150828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_151708_152036_152321_153168
528785	contig_8020_pilon	-	2134	6	Intergenic	novelGene_114379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	56.5734920258596	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	528	953	149892	148058	FALSE	0	CCCTGTCTCTCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	150828	146876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149962_150255_150433_150547
528786	contig_7457_pilon	-	2697	4	Intergenic	novelGene_31574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	2.05480466765633	374	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	759	1283	923530	922396	FALSE	0	GTTTCCCTTCCCTCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPISLPTLPHFAPGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVTIVVLGNKCDLQEQRRVDPDVAQHWAKSEKVKLWEVSVADRRSLLEPFIYLASKMTQPQSKSAFPLSRKNKGSGSLDG	925124	920981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_922636_923245_924016_924302_924384_924932
528787	contig_5005_pilon	-	2227	6	Intergenic	novelGene_84309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	446.203361708538	24	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	93	812	539718	512817	TRUE	10	GACCCTGGTTTTATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539810	511357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_511709_511752_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649
528790	contig_2100_pilon	-	1706	12	Intergenic	novelGene_50666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	837.172543606511	3	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	782	1357	1174340	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185471	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174395_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
528791	contig_15087_pilon	-	1870	19	Intergenic	novelGene_37188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1033.32442200459	36	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	135	1340	158925	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCCCCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181174	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133469_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
528793	contig_5033_pilon	-	2173	15	Intergenic	novelGene_29051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3694.170759039	2	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	158	1522	545288	532125	TRUE	35	TCTGTGGTTTAACAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547672	531017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531165_531541_531853_531931_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
528794	contig_5153_pilon	+	2305	18	Intergenic	novelGene_74366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	306.629889725963	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	466	1773	1007835	1022174	FALSE	75	TTAGAGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMKVTLAQRKEGACSTSAAGKLHQAEGMLRLAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956653	1022706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005133_1005347_1005517_1005581_1007792_1007907_1009183_1009271_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
528797	contig_15327_pilon	-	2065	9	Intergenic	novelGene_70727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	299.685851142492	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	165	494	965138	963579	TRUE	25	TTGATCTGTTTGCTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGDLYLLPRPPRGLPAGQQRQVLVPRAGECWH	966475	959519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963496_963671_963791_963928_965036_965146_966318
528798	contig_6007_pilon	+	1555	11	Intergenic	novelGene_87906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	68.1692012568726	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	187	1269	58259	80410	FALSE	30	AAAGTGTTTCTAAAGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGLSGLRGRDFELSDVFYFSKKGLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	34840	80696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_35001_58232_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
528799	SIRV6	+	818	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	768	0	-387	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	104	436	2002	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1898	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
528800	contig_1443_pilon	+	688	2	Intergenic	novelGene_28191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	77	382	344287	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKDRRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343662	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343681_344228
528802	contig_10940_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_49241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	147	575	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917146	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
528803	contig_14790_pilon	+	4217	1	Intergenic	novelGene_127916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186741	190958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_186700_191000
528804	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528807	contig_3410_pilon	-	2330	7	Intergenic	novelGene_58916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.859235912831	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	122	895	57649	15127	FALSE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGPSKKAGWTMAELALDLLDSPG	57770	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15194_30420_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
528808	contig_12279_pilon	-	1290	6	Intergenic	novelGene_50083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3515	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	442	744	77185	75050	TRUE	55	AAGTTAGTGAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77626	57513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57597_68290_68472_69357_69537_71625_71709_75029_75094_76926
528809	contig_15063_pilon	+	1230	5	Intergenic	novelGene_8526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4112.63591720687	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	251	1093	34808	36333	FALSE	25	TCTACTTCACCTACAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	26345	36470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
528810	contig_4442_pilon	+	2489	14	Intergenic	novelGene_127931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	188.591383841287	192	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	365	1561	295974	391178	FALSE	35	TAAATAAATGGTAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAMIDIFCSAEFRDWNCKSIFMRVEDELDIPPAPQSQHFQN	151274	392106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_151381_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_391058
528811	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_9349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528812	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	215	1387	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528813	contig_11429_pilon	+	1843	6	Intergenic	novelGene_60450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_4	620.845359167643	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	106	552	46162	46856	TRUE	20	ATACTGACAGTGCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	45386	49497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_47370_47457_47552_48443_48530_48899
528814	contig_10765_pilon	+	2190	7	Intergenic	novelGene_122861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	215.855211246387	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	400	2046	18249	34929	FALSE	60	TGTAAATAAAAATTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKESDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15654	35073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_17961_18782_18895_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
528815	contig_15491_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_75974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTGTGTTCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80248	79269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_79300_80200
528816	contig_6208_pilon	-	2993	7	Intergenic	novelGene_52979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_6	310.457413433075	772	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	207	578	383584	365189	TRUE	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGDYDYLIKFLALGDSGVGKTSVLYQYTDGKFNSKFITTVGIDFREKRVVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISQLQMHCIL	453983	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_383431_383607_420587_420701_453912
528817	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_11640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.54078115961	2	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	230	694	34808	35851	TRUE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLQ	27139	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35846_36158_36266_36600_38975_39092_39506
528818	contig_15063_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_10194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3679.89894184911	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	238	1365	34808	38994	TRUE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	27131	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
528819	contig_3948_pilon	-	2279	13	Intergenic	novelGene_53316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	443.580413604268	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	984	1958	1485672	1468245	FALSE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGASTSPPGAPSAPCRIWGSVSEGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQVEIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511002	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473360_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485264_1485616_1485988_1489829_1489929_1490738_1490839_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
528822	contig_6227_pilon	-	1732	16	Intergenic	novelGene_49744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	311.978731468812	1	28	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	43	1077	1224979	1203660	TRUE	15	AGGTTATGGCTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQP	1225021	1202620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203667_1205891_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
528823	contig_10940_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_49218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	42	422	875054	874674	NA	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKNTHISRLGPPRMCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	875095	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874000_875100
528825	contig_5153_pilon	+	2133	16	Intergenic	novelGene_74370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	286.955250092337	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	228	1598	1007835	1022174	FALSE	85	GAGAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGTPGGSYPPGPPGGFGQPPSAQQPIPPYGMYPPPGGNPPSGMPSYPPYPGAPVPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956678	1022709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010207_1010254_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
528826	contig_5988_pilon	-	1457	4	Intergenic	novelGene_15929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.91395240807	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	147	1283	653723	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGSSTAWNTASSLMARCQVSKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655553	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653365_653659_653773_655456
528827	contig_14871_pilon	+	2007	12	Intergenic	novelGene_63700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_11	680.568916118549	92	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	128	1555	201945	233218	TRUE	5	TCTGTGTGGCCGAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	194862	234219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233610_234158
528829	contig_513_pilon	-	1805	8	Intergenic	novelGene_80161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	442.333100082473	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	144	539	453421	451062	TRUE	20	AACGATGCTTGCTCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPTTKGTPALS	454715	448988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451096_452218_452365_453009_453117_453312_453443_454593
528832	contig_19352_pilon	-	1574	7	Intergenic	novelGene_122365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	581.975371758405	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	269	955	122805	103758	FALSE	10	TTGTGTGTGTTATTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLLVTTKLVCILVIKQYMGLVLGRILQRLNFVANYCLPSGILLFSNILGFKEILLNFEKKVSSF	123073	103138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103948_104045_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
528833	contig_11115_pilon	-	2473	1	Intergenic	novelGene_102851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1933	2412	171469	170990	NA	0	CGCCTGTGTGTTTGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPEASAIQYPAAKGPSSPGVPHPKREHLSPLSLPSPRAPQRITKGSELPGGRAVLEQSQPLVPQVQFRAAGEAGAVVLPARRHCGRDLSGLPHCGLPAQFLLPAEQHHGEVGPGRSAPHLAAQSEVVAHGLPGGQGRQLHALREPCEGRDGTYQPAL	173401	170928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_170900_173400
528834	contig_7202_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_18332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27935	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
528835	contig_3095_pilon	-	1350	5	Intergenic	novelGene_75227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1322.24288615973	82	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	91	894	255481	247815	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGKELWREPGKIACS	255571	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247714_247970_248476_248759_253535_253806_255384
528838	contig_5715_pilon	-	2303	14	Intergenic	novelGene_127964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_5	101.778329728714	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	670	1488	630764	555553	FALSE	20	CTGTGCACTAGCATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKDMALVAPEAPSEQARRVFQTYDPEDNGFIPDSLLEDVMKALDLVSDPEYINLMKNKLDPEGLGIILLGPFLQEFFPDQGSSGPESFTVYHYNGLKQSNYNEKVMYVEGTAVVMGFEDPMLQTDDTPIKRCLQTKWPYIELLWTTDRSPSLN	659646	554737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_555703_559544_559617_564060_564149_566702_566776_576738_576812_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
528840	contig_3077_pilon	+	1707	9	Intergenic	novelGene_26695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3434.4256411189	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	526	1209	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10095	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13860_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
528843	SIRV6	+	1463	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	65	0	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	452	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	AATTATGGATTTAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528844	contig_1225_pilon	+	1933	3	Intergenic	novelGene_44198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	319	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCACTCTGGCCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253415	276793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_253520_274222_275005_275746
528845	contig_16724_pilon	-	1685	8	Intergenic	novelGene_105307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	824.102084027191	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	210	959	569099	541872	FALSE	30	CCAAAGCAATGTTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSFWSFSRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575975	541145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575806
528846	contig_10141_pilon	-	2759	8	Intergenic	novelGene_84622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	73.3415270623453	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	55	2286	418688	395735	FALSE	15	CTGGCGTGTCATCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQLAGSEDSSAASPHATMKLKETKSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFKKIYKTLKKDEDIPVFPVQTKYMDTVKEEKLMSKKSVGGKNR	421143	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_399918_400108_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835_409370_417973_418694_421094
528847	contig_12179_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_128008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTAACATGCTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528793	530060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_528800_530100
528848	contig_1867_pilon	-	3364	1	Intergenic	novelGene_54561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	756	1715	449145	448186	NA	20	TCTTCTGTTGACCCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449900	446536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_446500_449900
528850	contig_9995_pilon	+	2169	13	Intergenic	novelGene_47663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	109	junction_2	99.4399595512566	460	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	29	1507	158431	189931	FALSE	5	TCTTTATCCGTTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACCRGGAGAMAVLLETTLGDVVIDLYTEERPRACLNFLKLCKIKYYNYCLIHNVQRDFIIQTGDPTGTGRGGESVFGQLYGDQASFFEAEKVPRIKHKKKGTVSMVNNGSDQHGSQFLITTGENLDYLDGVHTVFGEVTEGMDIIKKINETFVDKDFVPYQDIRINHTVILDDPFDDPPDLLIPDRSPEPTREQLDSGRIGADEEIDDFKGRSAEEVEEIKAEKEAKTQAILLEMVGDLPDADIKPPENVLFVCKLNPVTTDEDLEIIFSRFGPIRSCEVIRDWKTGESLCYAFIEFEKEEDCEKAFFKMDNVLIDDRRIHVDFSQSVAKVKWKGKGGKYTKSDFKEYEKEQNKPSNLVLKDKVKPKQDAKYDLILDEEAEDSKSSHSHTSKKHKKKTRHCSEEKEDEDYVPIKNPNQDIYREMGFGHYEEEESCWEKQKSEKRDRPQNQSRSRSRERDGHYSNSHKSKYQTDPYERERSKKRDRSRSPKKSKDKEKSKYR	158402	190593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_158501_162342_162411_162497_162563_163986_164105_165053_165197_165736_165834_166586_166704_171011_171137_172569_172637_176756_176869_178602_178700_182787_182936_189679
528851	contig_11924_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_128025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCTCAGAAAATATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53595	54472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_53600_54500
528853	contig_15039_pilon	-	1905	9	Intergenic	novelGene_110137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_7	526.928585649896	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	512	1135	200602	185257	FALSE	25	AGAATGCTCCTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260918	184486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_201176_201237_202795_202966_208401_208526_260778
528854	contig_13740_pilon	+	3378	1	Intergenic	novelGene_34764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGCTGAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695040	698418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_695000_698400
528855	contig_10354_pilon	+	1987	6	Intergenic	novelGene_50854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	439.365633612826	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	146	853	432370	475314	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432224	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056_475429_475477
528856	contig_17427_pilon	+	3127	1	Intergenic	novelGene_30409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366681	369808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_366700_369800
528857	contig_3077_pilon	+	1496	9	Intergenic	novelGene_26734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	3516.32495476456	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	378	1061	13867	17590	FALSE	10	TCCCATCCCACTTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGCTGRWSDLGFPCRLCSPGAAPVLFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10125	18025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
528858	contig_13097_pilon	+	1980	17	Intergenic	novelGene_107713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_11	530.951018809645	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	176	1198	184733	227141	TRUE	35	GTTAAAAATCTGTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQELLPPTFHLLHFFHLLQLSVLLHL	184557	264553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215273_215382_225265_225360_227066_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
528859	contig_14575_pilon	+	2580	9	Intergenic	novelGene_101881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_5	68.4432931338053	201	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	12	506	19976	26356	TRUE	75	GGGAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	19964	32318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473
528861	contig_20641_pilon	-	1466	6	Intergenic	novelGene_52867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	467	796	56705	56376	TRUE	25	CAGTTTCTGAAGGTGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTA	57171	16810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54962_56375
528862	contig_15991_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_70870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1097	1558	101926	103698	FALSE	45	TACAAAGTAGAAGTCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPTASTPSSNNVHRDTQLVPQLAATSRGSRYLVVARDGNVHVAQRRVRVTQSNGGQVHVRRLCERLVVSPGVGHHQKTRLPEGCLDLVSEGSRSEAPGNGSGSSSSSKLQHRPTWPVFLEDMTLTSAGFSMATMARAANRSFSHVLFRFMM	100375	104220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100543_100885_101049_101159_102271_103581
528864	contig_14711_pilon	+	1867	12	Intergenic	novelGene_68884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	447.868763983453	1	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1034	1627	89183	90570	FALSE	20	AGACCTCAGTTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70414	90810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82138_84855_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86255_88223_88280_88639_88853_89160_89326_89463_89673_90032_90194_90489
528866	contig_1244_pilon	-	1411	9	Intergenic	novelGene_38003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	986.29420053045	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	19	861	947623	923434	TRUE	20	ATGCTTTTTATCCAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRTPGGGLSVQVSRQASPCPASPLRFPSMMGTDMKCCQPT	947641	922785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_927116_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578
528867	contig_6001_pilon	-	1388	13	Intergenic	novelGene_128044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	85.3378905033137	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1350	37	1386	712446	667617	FALSE	15	GCTGTCTGAGGGAGTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDAFRAVKKRIVGNKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVEGVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNLIQSWADAFRSSPDLTGVVAVYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETPSGQYAVGTDTSQQVDSNQHTAPLSTPAVPPSDTPIAPTPEQIAKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRILELIPRIADEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFERFRTGQTAKAPSEAESATDLIDMGPDSAAPSHLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLNASGQLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAMEGSSEKSLSDWMVRQGMVRRGEALSTGRAGCCYLHKNRAEE	712482	667614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_667743_670983_671060_673821_673943_675050_675145_675511_675546_677380_677515_680179_680297_684568_684716_684905_685041_685405_685556_686461_686541_692449_692535_712394
528868	contig_15063_pilon	+	1199	3	Intergenic	novelGene_14350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
528869	contig_5988_pilon	-	1589	4	Intergenic	novelGene_15917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	18	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	60	1415	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655518	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
528870	contig_11752_pilon	+	1456	8	Intergenic	novelGene_37654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1098.84685382598	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	141	1169	87165	105616	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85556	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85692_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
528871	contig_11017_pilon	+	2376	10	Intergenic	novelGene_128070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_6	580.397947771852	3041	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	244	888	233889	294618	FALSE	65	ACAACAAAAGACAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPKPVKPGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233645	296106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
528872	contig_6710_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_98262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	10	CCCAGCCTCACCCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
528873	contig_14133_pilon	+	2433	6	Intergenic	novelGene_119912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.780123649964	586	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	920	1435	146942	147457	FALSE	5	AGCTTTTGTGTGTCCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQARALCPATYLACMVAQLPPQWAGGAKETQPHAQTAPGRCGYSQVPPNTLSGGLCRRSPLSYHHSRERVLGQTRLQAAQFMGQSSLDCSPGVCTGPRPWCTVPPQAGPSARVVGPIHVLWAACARRHDCPMSVHVYVCMRPFGHRHDLCFPHAWAVPVIPQGLPLLSL	136617	148455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143093_145655_145735_146042_146231_146666
528874	SIRV6	-	1312	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1087	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACGAGCAGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	3105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3163_7102_7451_7808_7923_10723_10825_11035_11109_11205
528875	contig_13571_pilon	+	2783	13	Intergenic	novelGene_128106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_7	101.794011775415	444	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	41	1513	71861	116333	FALSE	20	GTCTACCTTTTCCAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAADREDDPNFFKMVEGFFDRGASIVEDKLVEDLRTRESEEQKRNRVRGILRIIKPCNHVLSLSFPIRRDDGSWEVIEGYRAQHSQHRTPCKGGIRYSTDVSVDEVKALASLMTYKCAVVDVPFGGAKAGVKINPKNYTDNELEKITRRFTMELAKKGFIGPGIDVPAPDMSTGEREMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGRISATGRGLFHGIENFINEASYMSVLGMTPGFGDKTFVVQGFGNVGLHSMRYLHRFGAKCVGVAESEGSIWNPDGIDPKELEDFKLQHGSIMGFPKAKPYEGSILEADCDILIPAASEKQLTKSNAPRVKAKIIAEGANGPTTPEADKIFLERNIMVIPDLYLNAGGVTVSYFEWLKNLNHVSYGRLTFKYERDSNYHLLMSVQESLERKFGKHGGTIPIVPTAEFQDRISGASEKDIVHSGLAYTMERSARQIMRTAMKYNLGLDLRTAAYVNAIEKVFKVYNEAGVTFT	71820	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_72102_88382_88464_92165_92222_93420_93485_98158_98254_102369_102550_103316_103455_103655_103794_104488_104570_107836_107961_108769_108862_115192_115256_116213
528876	contig_15304_pilon	-	1232	2	Intergenic	novelGene_30513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	2434	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	189	383	54100	53906	TRUE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
528879	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_14081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	190	1362	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528881	contig_15087_pilon	-	2384	26	Intergenic	novelGene_37192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	995.794062243795	2	74	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	208	1983	150508	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181184	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110868_110996_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_181040
528884	contig_15866_pilon	+	1918	12	Intergenic	novelGene_63625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	586.986364181943	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	708	1244	620763	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458822	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581479_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
528886	contig_9471_pilon	+	1985	9	Intergenic	novelGene_21779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_2	851.111919784936	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1296	1880	414749	417296	FALSE	15	CTACCATGTTTATTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCFFLLFAFLIIIYDFQKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406925	417401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_412753_412821_413710_413828_413916_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
528887	contig_14513_pilon	-	1221	2	Intergenic	novelGene_70241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	10	CTGCTTTTGTCCATGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12129_18691
528888	contig_11115_pilon	+	1840	4	Intergenic	novelGene_102850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_1	505.476013278573	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	776	1750	171704	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	170928	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171981_172339_172595_172714_172964_173047
528889	contig_15063_pilon	+	1240	4	Intergenic	novelGene_14328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	282	1103	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34877	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528891	SIRV6	-	831	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGACTTTCGGCTCCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11732	2754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11104_11201
528893	contig_11829_pilon	+	1442	2	Intergenic	novelGene_128150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGACCTTTCATCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249715	253638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_251072_253552
528894	contig_1861_pilon	-	1901	13	Intergenic	novelGene_77666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_7	91.8577931732886	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	76	1800	105785	87440	FALSE	20	CTACCTCATCATGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVDSLALLDFFLLCGDQPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	105860	87338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620
528895	contig_10904_pilon	+	2620	3	Intergenic	novelGene_22458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	919.5	3	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	146	1114	149100	150068	FALSE	30	TAAAGAAGGACTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143902	151574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146147_146226_149097
528896	contig_3975_pilon	-	1797	13	Intergenic	novelGene_54789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	330.662077841143	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	65	1483	2052412	2015845	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKVWVERMISSSHQSRD	2052476	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2015892_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
528897	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528898	contig_3588_pilon	+	2265	3	Intergenic	novelGene_72851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1546	junction_2	41	385	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84364	98075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163
528900	contig_2100_pilon	-	1414	9	Intergenic	novelGene_50742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	720.319015697212	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	258	1070	1175737	1170268	FALSE	20	CATAAGAGTGCTCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185525	1169923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176294_1182727_1182822_1185420
528901	contig_15063_pilon	+	991	5	Intergenic	novelGene_10357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	237	944	34808	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETVCIQTNHVCG	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36055_36723
528902	contig_233_pilon	-	2729	16	Intergenic	novelGene_14599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1709.32376492382	3	128	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	776	2290	105485	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNVTTTTVMNPKFAES	126993	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78620_78970_79142_91473_91623_92138_92353_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105694_107300_107472_108401_108564_108724_108791_109902_109976_126898
528904	contig_12873_pilon	+	1645	6	Intergenic	novelGene_27141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1260.0543797789	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15941	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19044_19609_19703_19851
528905	contig_5515_pilon	-	2118	9	Intergenic	novelGene_52329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	504.862047989349	9	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	140	1186	99142	68158	FALSE	10	CCCTGAGCGGCTCTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGHSKRRRQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFAGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99281	67225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68283_68671_68786_68873_68989_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
528907	SIRV6	+	841	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	589	164	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528908	contig_5210_pilon	-	2604	10	Intergenic	novelGene_65411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	172.196557227453	515	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	383	1219	439927	431502	FALSE	25	AAATGTGGACAGCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444363	430116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777_439957_442673_442763_443013_443048_443095_443119_444156
528910	contig_14441_pilon	+	862	5	Intergenic	novelGene_100452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416.76214739345	99	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	249	677	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82333	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82375_114102_114161_116578_116963_117220_117344_117539
528911	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	125	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	568	1389	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35033_35380_35839_36158_36266
528912	contig_10129_pilon	+	3005	21	Intergenic	novelGene_128167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_5	149.575365618808	425	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	761	2602	608285	650130	FALSE	20	GTATTTCTGAGGTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLKKCWASLHESSLNTLVQMLRTAIISQLSYWTDTSQSQCNAKALLGMMKEVYKVNKANSRLPENAFNINELSNSLNFYIERCRVISRNKNPVPADNLSPLIFTDFPFAFNFLSKMKLLEADSFIKMQGSIEKAYQEHMQMFIQRKSEFPSPPKFILKVRRSHLVEDALRQISQVEVNDLRKALVIEFTEEIVSEAGGVRSEFFHCVFEEMTRPEYGMFMYPEDGSYMWFPAKPKVEKNRYFLFGVLCGLSLFHLNVVNLPFPLALFKKLLGQKPSLEDLKELSPLLGKSLQEVLNDEADDLGELYIFFSIYWDKNHVDLIPNGVSIPVDQTNKNDYASKCVDYIFNTSIKEVYEEFQRGFYRVCDEEIIQYFQPEELMSAIVGNTDYDWENFEKNAMYDQGYHKSHPTILMFWKAFHKLTLDEKRKFLFFLTGSDRLNVEGIRKSGIVFRCPETFSENDGPRSVTCYNILDLPKYSTMERVEEALQIVINNCRGFGSPKITFQ	588251	650533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_588284_589293_589371_592929_593158_595360_595456_596710_596839_598697_598766_607103_607226_608274_608335_608643_608738_611511_611702_614301_614457_620225_620340_620664_620773_626277_626449_626856_627001_637583_637751_639693_639758_640707_640779_647340_647525_647610_647714_649903
528913	contig_10923_pilon	+	1748	11	Intergenic	novelGene_66179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	892.509165219047	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	258	1184	23028	37418	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSWCSGVCAAP	13827	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21838_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36687_37387_37540_38578_38742_42554
528914	contig_7657_pilon	-	2742	4	Intergenic	novelGene_30052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405210	375521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_377943_397496_397620_400620_400759_405150
528916	contig_9708_pilon	+	2545	11	Intergenic	novelGene_67281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	95.2021533369913	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	65	1222	782370	803598	FALSE	25	CCTAAAGTGATTGTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	782305	804921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
528917	contig_12414_pilon	+	1627	2	Intergenic	novelGene_59541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	FALSE	40	TAGAATCTACAATGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
528918	contig_14925_pilon	-	1540	4	Intergenic	novelGene_55285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	954.787701824628	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	70	357	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129470	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114758_115869_116101_129436
528919	contig_11752_pilon	+	1515	9	Intergenic	novelGene_37581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	110	1228	84194	105616	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
528920	contig_2069_pilon	-	3118	21	Intergenic	novelGene_23405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_20	245.438643045467	189	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	42	2189	1257919	1234847	FALSE	25	GTTGAAACTCATTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLLPWCHGPAGRMEQDPKPPRLRLWALLPWLPRKQRPRISQTSLPAPGPGSGPRRDLDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVASGLMEDDGKPRATQTPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWITQKDKLPPEPAVPPGPAACKGSHGSHVLRTQ	1257960	1233917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234882_1235178_1235318_1236191_1236310_1236576_1236654_1236857_1237020_1245605_1245765_1246182_1246273_1246482_1246609_1247815_1247947_1249409_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1257784
528921	contig_3077_pilon	+	1483	10	Intergenic	novelGene_26735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3403.5418480035	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	203	1033	12050	17590	TRUE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10125	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17953_17998
528922	SIRV6	+	502	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	1	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACACGAACTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2473	11254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
528923	contig_15063_pilon	+	1311	4	Intergenic	novelGene_14005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3104.78956166472	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	196	750	34808	36133	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLPREKPPSAWKTGSQGKRSHAPSPTLTSLRR	34612	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_36038_36158_36266
528924	contig_11003_pilon	+	1885	9	Intergenic	novelGene_105422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.35858845372	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	406	1401	60927	72538	FALSE	15	TGTTGATTGTGCACATGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW	55769	73022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60164_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476
528925	SIRV6	+	689	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	22	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	40	6	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCGAAGTTGTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	10751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1527_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
528926	contig_15029_pilon	-	2232	6	Intergenic	novelGene_128192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	75	650	172327	163104	FALSE	30	GCATTTAGCTAGTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172401	161521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
528928	contig_13894_pilon	+	1143	9	Intergenic	novelGene_62154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	37	1092	521729	528117	FALSE	20	AGTGACACCTGCGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521692	528168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
528929	contig_12624_pilon	-	1520	2	Intergenic	novelGene_61109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955854	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948792_955644
528930	contig_6063_pilon	-	2957	14	Intergenic	novelGene_27583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	435.733076102179	4	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	12	530	70243	45532	TRUE	25	TCCTTGTGAAGCTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKVSLIC	70254	16727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26042_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
528932	contig_6227_pilon	-	1601	16	Intergenic	novelGene_49726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	405.410025639338	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	199	1242	1223803	1202979	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKASSGTSTASTSGEWSWGSSWLRKLNLSLKAAPQ	1224955	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203186_1204465_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224020_1224087_1224857
528934	contig_15744_pilon	+	420	2	Intergenic	novelGene_83614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4201	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152632	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152706_153245
528936	contig_5526_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_111686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTAGGTGCCGGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182774	183980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_182800_184000
528937	contig_5526_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_111687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAGAAATAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185468	186083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_185500_186100
528938	contig_15063_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_11103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGGTAGTCACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36800	27137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34925_35033_35369_35835_36156_36264
528940	SIRV6	+	994	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1458	18	29	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
528941	contig_10134_pilon	+	2122	4	Intergenic	novelGene_16246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1563	1982	34954	38820	TRUE	50	GAAATAAGGAAGGAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILPYHSRAVIISTVIVVCLWDGEVGIFTKKLLGFSILVERDLVQKPVLPAVAPQHNGLPLLKHQVRGLEPVLPAAAGSGVKAVAGLDLSWDGDPSVEPLDGVVPRGVGPVALQSHIVPLEHIDPWGFKVHHCLREIC	32200	39724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_33734_34924_35167_38613_38835_39598
528942	contig_6048_pilon	-	3381	11	Intergenic	novelGene_73216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_5	28.7888867447145	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	361	2235	1645874	1609163	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGMTSILMSAIGLPVCLSRAPQPASPPASCLASKSHSSVKRLRKMSMKGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661984	1608016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1627230_1627372_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
528943	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528944	contig_6159_pilon	-	2983	2	Intergenic	novelGene_128265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	103	477	314676	314042	FALSE	20	GAAATATGCCTGTGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLELDTNLPADRVPAGLEKRLCAATAAILSKPEERVNVMVRPGLAMVVNGSAEPCAQLLVSSIGVVGTAEENRGHSAHFFEFLTKELALGQDRCVVAGGSPFPGIAGAAVRPGQWSHLRAFS	314778	311535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_314309_314568
528946	contig_15063_pilon	+	1474	5	Intergenic	novelGene_13521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	202	1332	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34838_34879_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528947	contig_8156_pilon	+	1708	6	Intergenic	novelGene_98932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395198	441756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398544_403289_403537_403887_404006_404667_404810_441187
528948	contig_11752_pilon	+	1409	9	Intergenic	novelGene_37562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1396.19536039016	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	157	786	84194	94221	TRUE	50	GAAAAATATTACTGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMA	84037	105884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_92922_94219_94410_96442_96572_100956_100976_105597
528949	contig_5317_pilon	+	1043	4	Intergenic	novelGene_76502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	46203	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	115	525	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33674	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
528951	contig_11677_pilon	+	2234	13	Intergenic	novelGene_85974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	79.9435564771935	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	23	1690	727262	736807	TRUE	35	TGATATGAAGTATGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKPEKID	727239	737614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531_737018_737280
528952	contig_14441_pilon	+	1673	5	Intergenic	novelGene_100557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.563872498141	142	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1083	1436	116876	117560	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111196	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112618_113209_116578_116963_117097_117344_117539
528954	contig_7697_pilon	-	1109	2	Intergenic	novelGene_128292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCCAGATTCGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399650	396970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_397428_398998
528955	contig_14925_pilon	-	1005	5	Intergenic	novelGene_55127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	1557.05892630947	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	210	467	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTKTLTFGKGTQLIVSLDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	100512	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_100455
528957	contig_3986_pilon	-	2560	9	Intergenic	novelGene_52678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	121.822552817613	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	374	1351	48331	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153885	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_153684
528958	contig_12644_pilon	-	1874	11	Intergenic	novelGene_44489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	436.834625459109	4	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	539	1186	1056052	1034210	TRUE	55	AAAACACTTGTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKG	1123679	1025908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027282_1030066_1030210_1034209_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063342_1123335
528959	contig_15063_pilon	+	1902	7	Intergenic	novelGene_13034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3810.76338225762	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	194	1651	30275	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30081	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30314_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38984_39092_39506
528960	contig_10958_pilon	-	1302	2	Intergenic	novelGene_5482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCTACATTTGCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901696	895792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
528961	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
528962	contig_12352_pilon	+	2048	4	Intergenic	novelGene_57466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	253.9216852146	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTGCTTGTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252279	286648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_252322_268129_268198_277269_277302_284742
528963	contig_366_pilon	-	3229	16	Intergenic	novelGene_51644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	277.928256130167	9	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	154	1389	1440886	1423794	TRUE	45	GACATTAAACTAACAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWALLVLLMATAWHGQGIPVIEPQGPELVVEPGTPVTLRCVGNGTVEWDSPISPGWTLGHEAPSSILTTTNATFRNTGTYHCTESGELSRGDANIHLFVKDPFRPWNILAEEVTVLEDQDALLPCLLTNPELEADVSLVRERGRPVRHDTSYSFLKWRGFTIHKTKYLDSSVYHCSTLVGGRKVLSIGIQLKVQRVSGPPALKLEPAELVRIQGEAAQIVCSASSVNPAFDVFLQRGDTKLTVYAATDFHDKHYHNVLTHNLHHVGFQDAGNYSCVATSAQGGSSTSMVFRVVESAYLNLTSEQNLLQEVSLGEKFNLKVKVEAYPALQGFNWTYLGPFSDQQHSLNFDIIEDTYRYTSTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNAGGWKTLTFEIILRYPPRGKGHADPHQWL	1441039	1406065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1407006_1407102_1407212_1408086_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1414858_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
528964	contig_12622_pilon	-	2036	14	Intergenic	novelGene_6022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_13	343.271486741132	1876	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	567	1643	1690387	1685486	FALSE	25	CCAGGGGTTAAAGGGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691527	1685092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1691276_1691482
528966	contig_11846_pilon	-	2686	12	Intergenic	novelGene_105936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_6	73.3639179897715	101	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	9	1106	263830	253072	TRUE	15	CTCACAGCTTACTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQTLGLPITDEQIQEMKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRSVEPAKLGKARMRRSLEVGGYI	263838	248389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263659
528967	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTTCTTTCATTTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27935	27673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
528968	contig_1861_pilon	-	1917	16	Intergenic	novelGene_77659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	123.697588227634	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	153	1808	112534	87440	FALSE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWDPEVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVCGSCSWRFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115229	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97643_97664_99795_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
528969	contig_20641_pilon	+	1524	7	Intergenic	novelGene_52836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1604.25160814076	4	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	59	1234	14599	56882	FALSE	50	AAAAAAGATCTCTGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14540	57172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14653_14736_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_56379
528971	contig_21203_pilon	+	1288	9	Intergenic	novelGene_84479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	261.601796629916	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	70	1287	53950	122160	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPGSLLSMEAKTSVPIGTLFS	53880	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973_122031_122100
528972	contig_8631_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_121948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATTATTTTTAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684028	683084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_683100_684000
528974	contig_7898_pilon	-	558	6	Intergenic	novelGene_47541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3684.52218883263	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATCCAGCAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286095	283767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284068_284262_284318_284421_284598_285533_285636_286074
528977	contig_15063_pilon	+	1200	3	Intergenic	novelGene_14353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
528978	contig_15063_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_13774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528979	contig_6975_pilon	-	1492	9	Intergenic	novelGene_74267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_6	361.478366399706	1721	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	197	1030	164514	159839	TRUE	20	CCACTGATGTTGATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMGM	169980	159232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_163849_164402_164538_169807
528980	contig_312_pilon	+	676	8	Intergenic	novelGene_128324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_7	57.6353774577202	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	85	675	572892	588856	FALSE	30	TAAGCATACGTTGATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVSSLNEVKIYSLSCGKSLPEWLSDRKKRALQKKDVDVRRRIELIQDFEMPTVCTTIKVSKDGQYILATGTYKPRVRCYDTYQLSLKFERCLDSEVVTFEILSDDYSKIVFLHNDRYIEFHSQQGFYYKTRIPKFGRDFSYHYPSCDLYFVGASSEVYRLNLEQGRYLNPLQTDAAENNVCDINSVHGLFATGTVE	572807	588857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_572958_575400_575447_577846_577946_582291_582370_583777_583816_585377_585515_587220_587287_588795
528982	contig_15063_pilon	+	1403	4	Intergenic	novelGene_14218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	89	1261	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34719	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
528983	contig_15304_pilon	-	1543	3	Intergenic	novelGene_30438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	674	1498	54100	52925	FALSE	15	AGCCCTGCTTTTCCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54773	52879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
528984	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
528985	contig_13863_pilon	+	1607	7	Intergenic	novelGene_42016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1026.31925940334	18	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	63	737	98341	118909	TRUE	15	TATTTAGAGGTGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMFSAAQFILQ	98278	120386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110618_118879_118965_119571
528986	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	240	1415	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
528987	contig_1406_pilon	+	1835	3	Intergenic	novelGene_25571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	406	1691	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTAGTTTGTGGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173729	2187471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2185820
528988	contig_6557_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_33039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAACCAGGTGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658332	660480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_658300_660500
528989	contig_15063_pilon	+	955	3	Intergenic	novelGene_13522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	202	813	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVHHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34885_36017_36158_36266
528990	contig_5954_pilon	-	1610	10	Intergenic	novelGene_28626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	451.216900567814	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	125	1249	959926	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960584	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947922_959890_959941_960474
528991	contig_13740_pilon	-	1567	11	Intergenic	novelGene_34614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3231.95297614306	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	167	898	165243	157474	TRUE	30	GTATATTCAGCGTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165409	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160700_161220_161270_161574_161722_161919_162031_165237
528992	contig_14722_pilon	-	2544	24	Intergenic	novelGene_110208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_17	114.272714626583	551	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	143	2038	151970	37838	FALSE	30	GAATGACCAGTCCCCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRCSGPAAAEEVGALHFTPVAAPRPGTASFGPSAGLGPAARQPSWIMGFPKGPEGQGLPEVETREDEEQNVKLTEILELLVAAGYFRARIKGLSPFDKVVGGMTWCITTCSFDVDVDLLFQENSTIGQKIALSEKIVSVLPRMKCPHQLEPHQIQGMDFIHIFPVIQWLVKRAIETKEEMGDYIRSYSVSQFQKTYSLPEDDDFIKRKEKAIQTVVDISDVYKPCRKYRRQRGAEELLDEESRIHATLLEYGRRYGFSRQSKTEKAEDKKTALSAGFSAGERAEAHEEDELRAAEEQRIQSLMTKLTATAAEESRLTASSVGQIVGLCSAEIKQIVSEYAEKQSELSAEDSPEKLGASQLHHRKIISLNKQILQKTKHLEELQASHANLQAKYSEAKKTLTELKSYSEKLDKEQAALEKIESKADPSILQNLRALVAMNENLKSQEQEFKAHCREEMTRLQQEIEALKAERAPGGDEKTPSSGEPHGALTSVMTCDEDLDRRYNMEKEKLYKIRLLQARRNREIAILHRKIDEVPSRAELIQYQKRFIELYRQISAVHKETKQFFTLYNTLDDKKVYLEKEISLLNSIHENFSQAMASPASRDQFLRQMEQIVEGIKQSRMKMEKKKQENKMRRDQLNDQYLELLEKQRLYFKTVKEFKEEGRKNEVLLSKVKAKAS	152112	37331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37892_45772_45887_47982_48068_49475_49514_51668_51752_58190_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_65720_65803_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93304_93356_93643_93737_96619_96657_105006_105108_120663_120721_127092_127192_136353_136466_140864_140960_142940_143055_151928
528993	contig_6048_pilon	-	2436	16	Intergenic	novelGene_73277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_15	81.4967211337705	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	20	2065	2006298	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049021	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
528995	contig_15063_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_14429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	226	714	36064	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35838	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
528996	SIRV6	+	779	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	513	2	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
528997	contig_11328_pilon	+	1886	7	Intergenic	novelGene_88443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	260.824334243056	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	212	1309	830839	849070	FALSE	15	GATCAGTTTTATGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRAGRCLGCQSWGCGVAGLFPLFCCRSSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLVGPFYP	829344	849647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758
528998	contig_9706_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_20989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGTGGTGCTGGAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424177	424488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_424200_424500
528999	contig_15744_pilon	+	1070	5	Intergenic	novelGene_83593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	24	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	53	418	149562	152709	TRUE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDW	149509	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152712_152942
529000	contig_11307_pilon	+	2164	7	Intergenic	novelGene_105234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.590690893237	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	687	1406	76402	87762	FALSE	30	ACATATCCATTCTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEVPTWIMILVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDNFAHRTEVRKALAKNKEWQEQFLIPNLPLIDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEGVYELVSFQMKPGGPALWGDAFQRAVNSHVNLNYAKLVGVFHTEYGVLNRVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	74017	88520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_75898_76438_76748_76960_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
529001	contig_8153_pilon	+	1332	7	Intergenic	novelGene_34804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	227.968321386011	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	108	1331	138411	167674	FALSE	25	ATGATATTCTTTTGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAGQMQNLESAGAGQSVSTQTGSMSGHIPRLSKVNLFTLLSLWMELFPVAETQRHKSQKKEEGKHGSLGDNEDRTRVPTDKKQVKRTGLVVVKNMKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTEDHKTGVGAVIWAEGKSRNCDGTGALYFVGCGYNAFPVGSEYADFPHMDDKQKDREIRKFRYIIHAEQNALTFR	138303	167675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680_148756_153002_153181_158353_158924_164642_164693_167503
529002	contig_12923_pilon	-	2112	12	Intergenic	novelGene_30073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.138882718155	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	58	1455	93727	45997	FALSE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFTTCWKQLGNPANRF	101225	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46041_57236_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
529003	contig_7202_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_18715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAACCTGGAGCTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30138	29840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
529004	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
529007	contig_10940_pilon	-	1739	3	Intergenic	novelGene_49249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	588	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	724	1104	875054	874674	FALSE	30	CAAGAACAGTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	916943	874038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_916664_916748_916923
529009	contig_10235_pilon	-	2094	19	Intergenic	novelGene_46396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	99.6324108106926	14	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	31	1341	192397	178857	TRUE	10	TCTACTGGCTGGCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLLSCVLGPRLYKIYRERDSERTPSGVPEPPTTVTTPSSSSWDTYYQPRALEKHADSILALASVFWSISYYSSPFAFFYLYRKGYLSLSKVVPFSHYAGTLLLLLAGVACLRGIGRWTNPQYLQFITILEATHRNQSAENKRQLSKYNFDFRSWPVDFHWEEPSSRKESRGGPSRRGVALLRPEPLHRGTADTFLNQVKKLPCQITSYLVAHTLGRRMLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTT	192427	177637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_190402_190470_191199_191257_192265
529010	contig_5020_pilon	+	1501	9	Intergenic	novelGene_27843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	871.911943661744	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1137	363	1499	122915	126085	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVAMASAQPGPASLFLLPFPLYLSSFPSSCHHIPSLPHILTPPLYLISPFSLSPGGIDPTLAPARIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPPIKQAQP	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125698_125803
529011	contig_11720_pilon	+	1398	6	Intergenic	novelGene_44004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_2	325.623954892757	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	347	1099	269766	272210	FALSE	45	CTTTAAAACTGACACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECALHISLLLSRRPQFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	269419	272509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
529012	contig_18145_pilon	+	2253	1	Intergenic	novelGene_37315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAAATTGCTCTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76034	78287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_76000_78300
529013	contig_7182_pilon	-	2249	2	Intergenic	novelGene_117160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	99	317	889318	889100	FALSE	65	GAAAAGCAAGAAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKVRGLIAYQQCNRKDNKIHERPV	891358	887167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_889333_891274
529014	contig_9839_pilon	+	1564	4	Intergenic	novelGene_88500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	2129.35530149386	72	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	119	463	49467	61360	FALSE	40	TAAAATATTTATTTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45322	62461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_59824_59927_61264
529015	contig_10437_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_38167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162313	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_162300_164100
529017	contig_7775_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_37527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAAGGAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473272	473498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473300_473500
529018	contig_8122_pilon	+	833	2	Intergenic	novelGene_40266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2109	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745074	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_745148_748083
529019	contig_9708_pilon	-	2334	3	Intergenic	novelGene_67244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	8	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGAACAACGTCAGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40214	18573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_24631_24974_40077
529020	contig_5967_pilon	-	2065	8	Intergenic	novelGene_44383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	470.389938112574	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	110	1093	488569	388566	FALSE	40	GAGTTTGAATGTTAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517611	387593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_488455_488583_517515
529021	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_2921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGGAGAAATAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533020	1533286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
529023	contig_12080_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_128369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCAGCAATAGAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123140	123492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_123100_123500
529024	contig_10434_pilon	-	2278	14	Intergenic	novelGene_82059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	247.038266925276	42	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	339	1787	178895	164413	FALSE	35	TCTAAAGGAAAATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFAPEFQVGDGIGMDLKLSNHVFNALKQHAYSEERRSARLHEKKEHSTAEKAVDPKTRLLMYKMVNSGMLETITGCISTGKESVVFHAYGGSMEDEKEDSKVVPTECAIKVFKTTLNEFKNRDKYIKDDFRFKDRFSKLNPRKIIRMWAEKEMHNLIRMQRAGIPCPTVVMLKKHILVMSFIGHDQVPAPKLKEVKLSSEEMKEAYYQTLHMMQQLYNECTLVHADLSEYNMLWHAGKVWLIDVSQSVEPTHPHGLEFLFRDCRNVSQFFQKGGVKEALNERELFNAVSGLNISADNEADFLAEIEALEKMNEDHVQKNGRKAASFLKDDGGPPVLHNE	192017	163921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167670_167762_167844_169239_169400_170625_170824_174791_174920_175623_175768_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_181744_181869_191854
529025	contig_10904_pilon	-	1746	5	Intergenic	novelGene_22757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_4	280.360816627431	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	763	1509	661760	652201	FALSE	10	GTGTTTTCCATCTCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662743	651963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_662445_662665
529026	contig_17964_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_33854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135060	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135100
529028	contig_11855_pilon	+	2605	9	Intergenic	novelGene_67027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATATCGTAGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1909419	1922423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1911115_1911747_1911856_1912484_1912630_1914056_1914152_1915279_1915422_1915657_1915747_1917913_1918106_1919632_1919700_1922351
529029	contig_16098_pilon	-	1626	10	Intergenic	novelGene_46151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	38	junction_1	1862.66430711163	7	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	390	1484	458816	456273	TRUE	20	ATTGAAGGGGGAGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460516	456074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456180_456235_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
529030	contig_7932_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_128432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251772	254149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_251800_254100
529032	contig_11338_pilon	+	1729	11	Intergenic	novelGene_6152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	447	1727	6086	13613	FALSE	30	ATTTAACCTCTAGTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLSKA	744	13615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9936_13275
529033	contig_854_pilon	+	1519	8	Intergenic	novelGene_36195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	2955.8248960868	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	294	878	543412	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLQTAVGVQIGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543118	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543453_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563624_563738
529034	contig_9463_pilon	+	1944	8	Intergenic	novelGene_83832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	189.817097786909	79	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1175	1543	222660	223028	FALSE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185943	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217492_218523_218671_219238_219290_221961
529035	contig_7744_pilon	+	963	7	Intergenic	novelGene_62577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_6	89.7819890376436	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	251	520	890099	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	889391	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
529037	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_10671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	787	1110	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36786	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27163_34599_34924_35035_35380_35839_36156_36264
529038	contig_8357_pilon	-	1905	11	Intergenic	novelGene_39695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_6	60.9133811243474	762	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	76	1620	333125	312261	FALSE	10	GTCTTCCTGAGGCCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLDLFRVDKGGDPALIRETQEKRFKDPGLVDQLVKADSEWRRCRFRADNLNKLKNLCSKTIGEKMKKKEPVGDDESISENMLNLDDLTADTLTSLKVSQIKKVRLLIDEAILKCDAERIKLEGERFENLREIGNLLHPSVPISNDEDADNKVERIWGDCTVRKKYSHVDLVVMVDGFEGEKGAVVAGSRGYFLKGVLVFLEQALIQYALRTLGSRGYTPIYTPFFMRKEVMQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333200	311975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318125_318967_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332989
529039	contig_1154_pilon	-	1664	5	Intergenic	novelGene_87150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCCGCCCCCCCGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902819	895938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_896144_899975_900251_900806_900847_900888_900989_901775
529040	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	240	1082	34808	36333	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27129	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
529041	contig_21394_pilon	+	191	3	Intergenic	novelGene_128436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_2	13.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAGGAAAACATGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15733	18486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21394_pilon_+_15823_18292_18372_18463
529042	contig_6980_pilon	-	2791	22	Intergenic	novelGene_36076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	97.5887060860813	406	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	31	2208	402649	375176	FALSE	10	GCAGTTTTCGTTTTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFQSVSEKLHMECKAEMVAPLVTNPGHVCITDANLYFQPLNGHPKPVVQLTLQDIRRIYKRRHSLMPLGLEVFCTEDDLCSDIYLKFYEPQDRDDLYYCIATYLENHVAKHTAESYMLQWQRGHLSNYQYLLHLNNLADRSCNDLSQYPVFPWIINDYYSSTLDLSNPETFRDLSKPVGALNKERLERLLTRYREMPEPKFMYGSHYSSPGYVLFYLVRIAPEYMLCLQNGRFDNADRMFNSIAETWKNCLDGATDFKELIPEFYGDDVSFLVNSLKLDLGKRQGGKMVDDVELPPWAASPEDFLRKSKDALESNYVSEHLHEWIDLIFGYKQKGSDAVGAHNVFHPLTYEGGVDLNSIEDPDEKVAMLTQILEFGQTPKQLFVTPHPRRITTKFKSLSQTSSDNASMADSPVSAGEESFEDLTEESKTLAWTNITKLQLHEHYKIHKEAVTGIAVSCNGCSIFTTSQDSTLKMFSKESKMLQRSISFSNMALSSCLLLPGDATVLSSSWDNNVYFYSIAFGRHQDTLMGHDDAVSKICWHDNRLYSASWDSTVKVWSGIPAETPCTRRHHFHLLAELEHDVGVDTISLNAASTLLVSGTKEGTVSIWDLTTATMLHQIPCHSGTVYDTAFSPDSRHVLSTGEDGCLNIIDVQTGMLISSLTSEEPQRCFIWDGNSVLSGSQSGELLVWDLLGAKLSERIQGHTGAVTCIWMNEQCSSIITGGDDRQIMFWKLQY	402679	374592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544_376648_377062_377214_378717_378802_380128_380253_380644_380713_382286_382355_386816_386876_388604_388714_390148_390313_390609_390653_391458_391591_391912_392034_392130_392183_393104_393169_393261_393353_394801_394882_396147_396325_398490_398600_400114_400187_402547
529044	contig_4125_pilon	+	2819	2	Intergenic	novelGene_25049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTTCGTACCCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212629	221803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_215433_221787
529045	SIRV2	+	492	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	13	18	13	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTCTTCCTACTAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1600
529046	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	10	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529047	SIRV6	-	189	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACCAATAAATCGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11331	11142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11100_11300
529049	contig_12790_pilon	+	2332	8	Intergenic	novelGene_35249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_7	218.024713072175	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	109	579	307252	309980	TRUE	10	GGGTCTCTCTGTCACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKVSLVLSSWAFGSPMGQGG	306035	312788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_310166_310370_310494_311029_312035_312348
529050	contig_4754_pilon	+	1852	10	Intergenic	novelGene_35970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_9	99.1737470239248	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	68	1429	409328	420397	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLPNPIPTPRYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTGKVLRPQGTQEEGDLQGQALGLGAKEEECAFDSCLFLFPQFCLWPEAG	409260	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159
529052	contig_6710_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_96784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653673	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
529053	contig_5485_pilon	-	2005	4	Intergenic	novelGene_37692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	550.638417354498	10	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	497	1195	86314	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPHLQQAAENLRQSLQRRRSERAVLALLPSSAHSSHLSPPSAPHPALPTRHHDVLGLQRRLRGIFVPLQQCLPCRGQPLLLPLARRLLLQHGFSRQCAVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88090	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_86924_87794
529055	contig_7025_pilon	+	2355	5	Intergenic	novelGene_104410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	126.579026698739	144	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAGAAAGAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344183	396605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_344312_353923_354090_354968_355035_362592_362755_394772
529057	contig_4857_pilon	-	2353	6	Intergenic	novelGene_48637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_3	87.7701543806321	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	457	762	443315	441598	FALSE	35	TTAAATTCATTTATTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	447893	440006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444432_444537_444997_445070_447620
529058	contig_15063_pilon	-	1479	5	Intergenic	novelGene_10439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	730	1056	35891	35108	TRUE	25	AGGTAGTCACATTGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36730	27133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35836_36155_36264
529060	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
529061	contig_13894_pilon	+	1259	10	Intergenic	novelGene_62101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2509.7943745393	10679	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	27	827	520713	525785	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGPLAHQEATPQDPPRAAQGCLYWGLASCPCGLLCGTCWAEGLPSPH	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525000_525647_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
529062	contig_9199_pilon	+	2105	12	Intergenic	novelGene_65619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	91.5376452388184	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	46	1176	42527	57407	TRUE	20	CACATCAGCTGGACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42481	59154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304_58059_58876
529063	contig_16775_pilon	+	1820	16	Intergenic	novelGene_107766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	182.591054910511	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	127	1611	130489	174136	FALSE	40	CATGTATAAGGTAGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAIAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130362	174345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
529064	contig_14215_pilon	+	3853	1	Intergenic	novelGene_59357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCTTATACTGATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176877	180730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_176900_180700
529065	contig_8616_pilon	+	1190	9	Intergenic	novelGene_72574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	937.063623440266	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	583	1110	431167	436516	FALSE	10	TCATGTCCTGCCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428799_431128_431238_435726_435900_435993_436119_436357
529066	contig_8377_pilon	-	2375	8	Intergenic	novelGene_35140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTGTGCCTACAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199112	185676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_185823_189183_189270_191115_191254_192217_192348_193989_194115_194344_194521_196079_196192_197650
529067	contig_15063_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_14267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	344	1156	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34815	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35371_35839_36158_36266
529068	contig_14871_pilon	-	1951	4	Intergenic	novelGene_63729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	206.707522843268	1264	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	483	965	299879	288466	FALSE	15	TTTCCTTGATTTTGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKKLPPGGIPGIDLSDPKQLAEFARMKPRKIKEDDAPRTIACPHKGCTKMFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	300361	287479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_289618_291318_291380_299799
529069	contig_9471_pilon	+	2045	7	Intergenic	novelGene_21836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	576.871928786817	13	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1149	1808	413930	417283	FALSE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKVTSFLFPP	412781	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417032_417260
529070	contig_13409_pilon	+	3514	1	Intergenic	novelGene_128454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	216	677	97884	98345	NA	45	ATTCCCAGGAAATGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHVIVRSHQVGSGSCTTERNTAWSNTIFTTAAMLEATVIVNVLIHLVDGLPLFLLTLYFTKHDVLLQGMIPPDNIPKYMRPSLTIFTSKEHSGCAISKTDLFLRLAICGIFNILRQHHKSKALVLLWSSLFIVQLLHAHEANENTMAWVRHT	97668	101182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_97700_101200
529071	contig_15063_pilon	+	1565	5	Intergenic	novelGene_8591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2428.32271074089	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	243	1421	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26353	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
529072	contig_6807_pilon	-	2129	7	Intergenic	novelGene_84563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	318.23261932115	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	172	1227	124590	111018	FALSE	40	CTAAAAAATATATGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVAKLKTALERLRMMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQDVNNIIKRSEICTVKRTKTIPKKQSRVFQAPDLKEMLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124761	110115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_113438_113462_117941_118173_120423_120520_124581
529074	contig_9471_pilon	+	1805	11	Intergenic	novelGene_21799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_2	371.193749947383	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	808	1584	413930	417296	FALSE	40	AAATTTATATGAATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	410713	417517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
529076	contig_14980_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_78233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTGCCACCACATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527458	528202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_527500_528200
529077	contig_7179_pilon	-	1994	15	Intergenic	novelGene_78182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	66.8617596086072	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	238	1068	1218752	1198866	TRUE	30	TTTAGGACTAGTCGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIRCVAYNNQSNRLAVSRTDGTVEIYNLSANYFQEKFFPGHESRTTEALCWAKGQRLFSAGLNGEIIEYDLQALNIKYSMDAFGGPIWSMTASPSGSQLLIGCEDGSVKLFQITSDKIQFERNFDRQKSRILSLSWHPSGTHIAAGSIDYISVFDVKSGSATHKMIVDRRYMGVSKRKCIIWGVTFLSDGTVISVDSAGKVQFWDSATGTLVKSHLIANADVQSIAVSDQEDSFVVGTAEGTVFHFQLVSVTSNSNEKQWVRTKPFQHHTHDVRAVAHSPTALISGGTDTHLVIRPLMEKVEVKNYDAALRKITFPHFAHHLELWRLGSTVATGKMGEGVLRTLFAAVSPHVEVG	1222920	1181043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1181242_1182103_1182215_1183677_1183864_1185474_1185571_1194851_1194959_1196691_1196849_1198794_1198918_1200798_1200864_1206351_1206444_1206550_1206723_1209852_1210065_1215621_1215712_1217115_1217201_1218689_1218882_1222812
529078	contig_9515_pilon	+	1777	8	Intergenic	novelGene_73814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	299.285748380496	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	544	1056	66468	68511	TRUE	0	TTTCCTTGGCTCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVEGTLGWVAGSLCLEVARRGGDHLGGMWVAGGGWQEGSGVLMRSVAGSQGAYV	57289	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68824_69343_69477_71788_71878_72464
529079	contig_10311_pilon	-	1828	11	Intergenic	novelGene_50463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1071.74559014721	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	33	1202	71526	65773	FALSE	40	TAAATTGTATATTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNSREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71558	65146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65871_67190_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70496_71497
529080	contig_2069_pilon	-	2391	14	Intergenic	novelGene_23399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	161.184961196683	878	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	35	829	1257919	1245701	TRUE	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPWCHGPAGRMEQDPKPPRLRLWALLPWLPRKQRPRISQTSLPAPGPGSGPRRDLDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMGSC	1257953	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234882_1235178_1235318_1236191_1236310_1236576_1236654_1236857_1237020_1245605_1245713_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1257784
529081	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	16	1425	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28148	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529083	contig_13571_pilon	+	2548	13	Intergenic	novelGene_128109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	155.508551926324	488	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	95	1270	88439	116333	FALSE	20	TTTCCAAAGTGTATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYKCAVVDVPFGGAKAGVKINPKNYTDNELEKITRRFTMELAKKGFIGPGIDVPAPDMSTGEREMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGRISATGRGLFHGIENFINEASYMSVLGMTPGFGDKTFVVQGFGNVGLHSMRYLHRFGAKCVGVAESEGSIWNPDGIDPKELEDFKLQHGSIMGFPKAKPYEGSILEADCDILIPAASEKQLTKSNAPRVKAKIIAEGANGPTTPEADKIFLERNIMVIPDLYLNAGGVTVSYFEWLKNLNHVSYGRLTFKYERDSNYHLLMSVQESLERKFGKHGGTIPIVPTAEFQDRISGASEKDIVHSGLAYTMERSARQIMRTAMKYNLGLDLRTAAYVNAIEKVFKVYNEAGVTFT	85654	117611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_85693_88382_88464_92165_92222_93420_93485_98158_98254_102369_102550_103316_103455_103655_103794_104488_104570_107836_107961_108769_108862_115192_115256_116213
529084	contig_8045_pilon	+	1282	5	Intergenic	novelGene_35347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1292.62571922425	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	29	586	116067	118722	FALSE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116038	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116160_117307_117349_117450_117513_118075_118243_118527
529085	contig_10129_pilon	+	3110	21	Intergenic	novelGene_128166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	144.803798292724	365	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	686	2770	598159	650130	FALSE	45	TATGAAAGACATGTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKNFDVSCLISADDLVNVQVKHIFAGTYANFVTTYQDTSSTSVSRKTLPEISRINQSLTEKWIAVRRGSTEHEEAKSEIGMIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLKKCWASLHESSLNTLVQMLRTAIISQLSYWTDTSQSQCNAKALLGMMKEVYKVNKANSRLPENAFNINELSNSLNFYIERCRVISRNKNPVPADNLSPLIFTDFPFAFNFLSKMKLLEADSFIKMQGSIEKAYQEHMQMFIQRKSEFPSPPKFILKVRRSHLVEDALRQISQVEVNDLRKALVIEFTEEIVSEAGGVRSEFFHCVFEEMTRPEYGMFMYPEDGSYMWFPAKPKVEKNRYFLFGVLCGLSLFHLNVVNLPFPLALFKKLLGQKPSLEDLKELSPLLGKSLQEVLNDEADDLGELYIFFSIYWDKNHVDLIPNGVSIPVDQTNKNDYASKCVDYIFNTSIKEVYEEFQRGFYRVCDEEIIQYFQPEELMSAIVGNTDYDWENFEKNAMYDQGYHKSHPTILMFWKAFHKLTLDEKRKFLFFLTGSDRLNVEGIRKSGIVFRCPETFSENDGPRSVTCYNILDLPKYSTMERVEEALQIVINNCRGFGSPKITFQ	588143	650470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_588284_592929_593158_595360_595456_596710_596839_598064_598202_598697_598766_607103_607226_608274_608335_608643_608738_611511_611702_614301_614457_620225_620340_620664_620773_626277_626449_626856_627001_637583_637751_639693_639758_640707_640779_647340_647525_647610_647714_649903
529086	contig_5643_pilon	+	1277	11	Intergenic	novelGene_39103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	925	junction_10	523.909190604631	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	312	1088	636518	641217	TRUE	30	TGTAAATAAAGTCTCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	635440	641575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
529087	contig_12528_pilon	+	3294	1	Intergenic	novelGene_81339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTTCTTTGTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942574	945868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_942600_945900
529088	contig_7963_pilon	-	1860	6	Intergenic	novelGene_58293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1178.15812181557	7	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAATAAAAAATTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48902	37937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38917_39293_39405_39949_40227_43546_43819_48526_48587_48741
529089	contig_7396_pilon	-	2013	16	Intergenic	novelGene_79623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3363.95623171421	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	374	1507	252437	246442	FALSE	5	TATTTTTGGTGGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFQSQTAVAPSEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257453	245935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251483_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255323_255381_257381
529090	contig_3588_pilon	+	968	4	Intergenic	novelGene_72898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_3	223.387555606842	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	237	455	138833	140944	FALSE	5	TTATTTGGTGGTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	136018	141457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_136117_137170_137249_138772_138929_140821
529091	contig_18081_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_23825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATGAAGGGAGACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199432	199786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_199400_199800
529092	contig_5092_pilon	-	2096	5	Intergenic	novelGene_62297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	526.205758235312	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451614	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447921_447995_449415_449498_451514
529093	contig_2251_pilon	-	3091	11	Intergenic	novelGene_128464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	98.2912000130225	24	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	40	696	138003	78752	TRUE	25	GAAGGTAACTTGTATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLSMDSIHF	138042	56174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_56568_66235_66359_70007_70067_76931_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988
529094	contig_17790_pilon	-	2089	6	Intergenic	novelGene_128492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1379	1861	125673	123888	TRUE	30	GGGAATTCCATCAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILVFGLGIFIAEYELITASTAGFLTVTIMSATVQLPILPEIDHVDQEFAAGTADKASWVPQFIVASPLGIDGRVTFFHTQFAAIAEILSSFVLSRLVLHGPHCCCGASIPTRDVRSVGALSIHLLGKFDISYPQSLILIFLHKLLHLLHLSGSQLVAL	131127	122775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_-_122886_123769_124107_124999_125214_125623_125783_129800_130490_130547
529096	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
529097	contig_14744_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_66055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	3308.80670937424	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	20	592	1382976	1385279	TRUE	10	TTTAACTTGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGKKILGFYILSNLNF	1382037	1386688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1386006_1386499
529098	contig_10159_pilon	-	2666	11	Intergenic	novelGene_30792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	123.526070122869	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	757	1419	353226	349428	TRUE	80	AAAAGTGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKIGLSSH	642119	317394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_349371_349450_352585_353440_431854_431937_456756_456901_597817_597913_606778_606838_641956
529099	contig_19604_pilon	+	2476	6	Intergenic	novelGene_77241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	276.989097258358	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	360	719	273206	273988	TRUE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEIRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	269898	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273577_273833_275206_275279
529100	contig_5780_pilon	-	2587	14	Intergenic	novelGene_29800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	35.2045586074526	297	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	88	2112	183256	117335	FALSE	10	GTTTCTTTCCACATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSYTVTVATGSQWFAGTDDYIYFTLVGTAGCSEKHLLDKPFYNDFERGAVDSYNVIVDEELGEIQLVKIEKRKYWLRDDWYLKYITLKTPYGDYIEFPCYRWITGEGEIVLRDGRAKLARDDQIHILKQHRRKELETRQKQYRWIEWSPGFPLSIDAKCHKDLPHDIQFDSEKGVDFVLNYSKAIENLFINCFMHMFQSSWSDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDSMFGYQFLNGCNPVLIQRCRKLPEKLPVTTEMVECSLERQLTLQEEIEQGNIFIVDFELLDGINANKTDPCTHQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQVPGDKNPIFLPSDAKYDWLLAKIWVRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQLICEYGLFDKANATGGGGHVQLVHRAMQELTYISLCFPEAIKARGMDSTEDIPYYFYRDDGLLVWEAIKKFTAEVIGIYYESDQVVEEDQELQDFVKDVYVYGLRGRKASGFPSSIKTREMLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFSQYDWCSWIPNAPSTMRAPPPTAKGVVTIEQIVETLPDRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLDTIVSVIAERNKEKKLPYYYLSPDRIPNSVAI	183343	116859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_117515_118059_118231_118619_118721_119105_119228_119544_119724_121292_121380_122016_122221_128336_128484_134216_134390_135378_135486_144378_144502_165648_165731_175445_175645_183106
529101	contig_10930_pilon	+	2123	2	Intergenic	novelGene_37117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1195	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTTTGTGTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339628	342107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_340639_340994
529102	contig_15087_pilon	+	2392	4	Intergenic	novelGene_37268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	1	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	39	620	284653	301944	FALSE	30	AAACTTTTTAACTTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284614	303716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
529103	contig_14441_pilon	+	896	3	Intergenic	novelGene_100696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	389	895	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARNLAPAVSSFFLSLFLSPKPQSHLPEAGSPGGAVGKSAAVNQKVGSSNPPATPWKPYGTARLCPVGSLGVRLCFTATDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	114492	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114732_116578_116963_117523
529104	contig_13744_pilon	+	3041	20	Intergenic	novelGene_77182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	16	junction_19	60.4029406192866	209	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	932	2799	13	2811	718904	760922	FALSE	15	GTGGAATTTTTCTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPDSDSDEDLVSYGTGLEPLEEGERPKKPIPLQDQTVRDEKGRYKRFHGAFSGGFSAGYFNTVGSKEGWTPSTFISSRQNRADKSVLGPEDFMDEEDLSEFGIAPKTIVTTDDFASKTKDRIREKARQLAAAAAPIPGATLLDDLIAPAKLSVGFELLRKMGWKEGQGVGPRVKRRPRRQKPDPGVKIYGCALPPGDSEGSEDDDDDYLPENVTFAPKDVTPVDFTPKDNVHGLAYKGLDPHQALFGTSGEHFNLFSAGLERASNLLGDVGLSKGRKLGISGQAFGVGALEEEDDDIYATETLSKYDTVLKDEEPGDGLYGWTAPKQYKSQKESEKDLRYIGKILDGFSLASKSLSSKKIYPPPELPREYRPVHYFRPVVAATSENSQLLQVLSESSGKALCDPGTHSRHQLNASKRGDLLGETPIQGSATSVLEFLSQKDKERIKEMKQAAELKAAQLKAKSLAQHALSGRPQPSSPDLGHCSRHMASSGRTATVRASNFKPFAKDPEKQKRYEAFLVNMKQGHKDALERCLDPNMTEWERGRERDEFARASQLYVSSHSTLSSRFTHAKEEDDPDQVEVPRDQENDISDKQSAVKMKMFGKLTRDTFEWHPDKLLCKRFNVPDPYPDSTLVGLPRVKRDKYSVFNFLTLPETASLPAAQASSEKVQQHRGPDKSRKPSRWDTSKEEKKEDSISEFLSLARSKVGTPKQEPSPLVNKEEEHATESLSNKMVNKGADSQSEGEVSRPSMDLFKAIFASSSDEKSSSSEDEQGDSEDDQAGVGEADFKHSEETDLVETSSVAPTSEPAPQAPAPSFSIQKMHIDEREEFGPRLPPVFCPNARRTLEIPQKEKHKKNKEKPKTKKEHRRRKEKKKKHRKHKHKGKQKNKKSEKSSSSEGTESSDSGSDEEGTADVSPQELLRRLKRLPLKRQ	718891	761152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_718977_726876_727012_728358_728445_729891_730053_730689_730788_731378_731438_731809_732053_733057_733206_735926_736007_739294_739500_741273_741571_742564_742744_743023_743152_743963_744101_744461_744629_749301_749519_751190_751299_753453_753552_757762_757912_760891
529105	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_18524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTTCAAAATAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
529106	contig_9656_pilon	-	741	7	Intergenic	novelGene_121931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_1	120.784472879956	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	115	687	438091	430496	FALSE	50	CATTATAAACTGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	441017	430441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922
529107	contig_6958_pilon	-	2351	6	Intergenic	novelGene_69933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	345.555205430334	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	687	1322	183127	149618	FALSE	20	TAAACGGCATCCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190171	148588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189694_189749_189829
529108	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529109	contig_15047_pilon	+	1209	5	Intergenic	novelGene_52120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3251.26752205967	54	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2164	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_3433_3498_4158_4434_4552_4676_20987
529110	contig_17274_pilon	+	2240	11	Intergenic	novelGene_26554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	272.654011523762	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	213	740	195747	213142	TRUE	25	CTAAATAGGGCTTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYGSMELHILQDKGYSAEIPGKPTMSSGN	182426	216902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_182470_184627_184721_186547_186623_195745_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208203_208237_209285_209328_213058_213180_215439
529112	contig_6975_pilon	-	2120	9	Intergenic	novelGene_74258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_7	353.229741103435	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	878	1732	163813	159453	FALSE	40	CAGGAATAGAGCTTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169960	159064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_164538_169807
529113	SIRV6	+	514	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	8503	337	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740
529114	contig_18145_pilon	+	2146	12	Intergenic	novelGene_37344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	568.235357477519	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	200	1621	95966	100744	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFIFINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86678	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86791_94934_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_97964_98334_98541_98826_98983_100326_100482_100638
529115	contig_4759_pilon	-	1856	4	Intergenic	novelGene_106337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.297723388781	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	231	773	589639	587182	FALSE	45	AAATAAAATTGGAGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEMYQTPMEVAVYQLRNFSISFFSSLLGGDVVSVKLDNSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPLNLFYLVLSSLFLAPQASSHVENFTPSIAGAKRCPKDMATWVHSSDRPLTKSRSLEAELHGA	589869	586098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587376_587456_587632_588757_588810_589517
529116	contig_7334_pilon	-	2044	3	Intergenic	novelGene_50574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1191	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1012	1347	121494	121159	TRUE	30	CTACAAAAATTTTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMCTDLKSCLGPSPWLTVFAQSFGMSRFAHSSPFHQGEVHGKDPIKPQRQFSLDKFEAPSQSQGAASSCLCQVRYWLGEQSCLPSRLVWLQITLAGSWLHLQGAESELHR	122505	116788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_-_117030_120097_120163_120767
529117	contig_3588_pilon	+	2319	19	Intergenic	novelGene_72869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	578.500029343662	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	319	1008	105570	125597	TRUE	5	ATTTGGTGGTTTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPHFTSSEGPVTPPRPHGWILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKL	84474	141459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_105494_105629_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131552_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
529121	contig_366_pilon	-	3841	21	Intergenic	novelGene_51642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	212.232914506681	1270	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	1554	3038	1423458	1406847	FALSE	15	CAAAGCTGGCTCTCTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYECRAHNWAGNATQAFWPISVEATVHRLKEPLFTPVLVACMSVMALLLLLLVLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNTYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGLSPDPGQDPDGVTGYKNIHLEKKCVHRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSSNDSFSEQGLDKEDRRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTSGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWDLEPTRRPTFKQICFLLREQAKVDRKEQDYANLTSSSSSGSSSGGSGSSEPEESSSEHLACCEQGDSSQSMLQPNNYQFC	1441010	1406043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1407006_1407102_1407212_1408086_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
529122	contig_13740_pilon	-	1351	8	Intergenic	novelGene_34670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4473.99561639372	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	169	846	165243	157458	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGADIELLPI	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157484_160654_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
529123	contig_15893_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_128515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAAAATAGAGGTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85710	86269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_85700_86300
529125	contig_3281_pilon	+	2809	2	Intergenic	novelGene_128519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	269	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1404	1721	13834	14151	FALSE	30	TTTTTAAAAAATTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFLKFLLDPFRKREKEDVDIPKYFSLFNPEDKSFLFSSAGDQCCMNAQQRVTSNIYRLCSTSGTDKVAIKSNVLFPPPRMSGATFVWHLRSLMLLQNHILESG	10013	15239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_10395_12811
529126	SIRV6	+	808	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	525	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	39	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
529127	contig_14638_pilon	-	2208	5	Intergenic	novelGene_71557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	10	GTGGTGTGTTCTTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
529128	contig_15720_pilon	-	1023	8	Intergenic	novelGene_41884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	28	981	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283921	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
529130	contig_18156_pilon	+	2204	16	Intergenic	novelGene_101442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	124.774391959604	17	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2160	43	2202	7355	64303	FALSE	15	TTCTGACCACTTGTGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCRPLRTSLGCRLMPSPRLALLRVAGNALLLSLTSPLLPRPQSQPPLLSRRPLSTPARPRTSFSAVPSRSSMDGVGAEEVLAPLRLAVRQQGDLVRKLKEDKAPQVDVDKAVAELKARKRVLEAKELALQPQDDIIDRAKMEDTLKRRFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQLDNYGQQELGDLFVNYNVKSPTTGNDLSPPVPFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFSQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLG	7312	64305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23891_23971_29472_29619_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
529136	contig_2733_pilon	+	1882	9	Intergenic	novelGene_128543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	492.428928882128	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	225	767	550569	614101	FALSE	50	AAGTAGAAAAGCTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISTNLGGVEFGARMITIDGKQIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGSQGGQQAGGGCC	504753	615216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_504816_544501_544574_550478_550591_560425_560494_570777_570861_571294_571388_578069_578182_611519_611589_614005
529137	contig_5779_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_106429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAATATTAGATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93291	94524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_94087_94133
529138	contig_3095_pilon	-	1438	6	Intergenic	novelGene_75249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1187.07347708556	1745	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	71	808	255481	248388	TRUE	20	TTATCTGTACTCTGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	255551	246376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248245_248759_253535_253806_255384
529140	contig_6710_pilon	-	423	2	Intergenic	novelGene_98227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
529143	contig_12427_pilon	-	1565	7	Intergenic	novelGene_40542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	231	854	522337	506035	TRUE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578182	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504823_505470_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
529144	contig_3942_pilon	-	3158	19	Intergenic	novelGene_128849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	124.088230259315	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	16	1821	1408388	1385047	FALSE	40	TACAGTAAGAATCCAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQAAAAAQAAAQAAQAEAAESWYLALLGFAEHFRTSSPPKIRLCVHCLQAVFPFKPPQRIEARTHLQLGSVLYHHTKNSEQARSHLEKAWLISQQVPQFEDVKFEAASLLSELYCQENSVDAAKPLLRKAIQISQQTPYWHCRLLFQLAQLHTLEKDLVSACDLLGVGAEYARVVGSEYTRALFLLSKGMLLLMERKLQEVHPLLTLCGQIVENWQGNPIQKESLRVFFLVLQVTHYLDAGQVKSVKPCLKQLQQCIQTISTLHDDEILPSNPADLFHWLPKEHMCVLVYLVTVMHSMQAGYLEKAQKYTDKALMQLEKLKMLDCSPILSSFQVILLEHIIMCRLVTGHKATALQESPRLFSNHAAQLHTLLGLYCVSVNCMDNAEAQFTTALRLTNHQELWAFIVTNLASVYIREGNRHQELYSLLERINPDHSFPVSSHCLRAAAFYVRGLFSFFQGRYNEAKRFLRETLKMSNAEDLNRLTACSLVLLGHIFYVLGNHRESNNMVVPAMQLASKIPDMSVQLWSSALLRDLNKACGNAMDAHEAAQMHQNFSQQLLQDHIEACSLPEHNLITWTDGPPPVQFQAQNGPNTSLASLL	1408403	1383709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1385122_1385238_1385367_1385623_1385715_1388826_1388939_1389099_1389178_1389313_1389364_1390253_1390338_1391677_1391744_1391823_1391872_1392123_1392228_1392969_1393061_1393127_1393275_1394291_1394448_1394721_1394750_1396341_1396437_1397738_1397835_1398385_1398452_1398757_1398776_1408115
529145	contig_15899_pilon	+	2307	6	Intergenic	novelGene_128904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	103.617373060699	1160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	15	794	13746	33720	FALSE	10	TACCTTTATGTCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WYFAMISVSGVFSVTFSVIFAYVADVTQEHERSTAYGWVIGFGSVKIAAFIAMVGILSIVAQTVFLSILMRSLGNKNTVLLGLGFQMFQLAWYGFGSQAWMMWAAGTVAAMSSITFPAVSALVSRNAESDQQGVTQGIITGIRGLCNGLGPALYGFIFYMFHVELTEMEPELNSNQAALQGAVIPGPPFLFGACIVLMSFVVALFIPEYSKASGIHKHSSSISGSLTNTPERGIEEDFEPLLQDSSIWELSSFEEPGNQCTEL	13731	35233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_13848_27640_27713_29168_29282_30855_30954_32683_32827_33468
529146	SIRV6	+	927	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	175	507	1673	2560	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1110	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529147	contig_10331_pilon	-	2794	4	Intergenic	novelGene_54119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	74.5534856477028	319	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	227	1126	402040	397038	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKDQEIAQRILLEPYKYLLQLPGKQVRTKLSQAFNHWLKVPEDKLQIIIEVTEMLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYICPTEEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSTEYSENKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENVDIKKYCVHYLENVGSFEYTRNTLKELESKAYKQIDACGGNPELIALVEHLSKMFKENE	409107	395369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_397797_398048_398120_401970_402064_408904
529148	contig_6807_pilon	-	2508	7	Intergenic	novelGene_84560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	321.218340420067	565	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	360	1598	121535	111018	FALSE	35	TATATGCTGTGTCAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAIIANLQEEVTCPICLELLREPLSLNCGHSFCQACITVNNKTSMISSEGESTCPMCRISYQPDNIRPNRHLANIVEKLREVKVSLKEEQKRDVCNRHGEKLLLFCKEDGKVICWLCERSQEHHGHHTFLVEEVAQENQAKLKTALERLRMMQKEAEKLGADIREERASWKDVNNIIKRSEICTVKRTKTIPKKQSRVFQAPDLKEMLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124783	110107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_113438_113462_120423_120520_121112_121693_124581
529150	contig_12427_pilon	-	1610	5	Intergenic	novelGene_40454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2184	junction_3	1899.97781237045	14	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	134	646	316061	314393	FALSE	30	GAAAGCTGACAGTTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325972	313428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_325856
529151	contig_3975_pilon	-	2157	9	Intergenic	novelGene_54868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_6	131.573114179911	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1124	1585	2096423	2093304	TRUE	15	GGTTTCTGGTCAGATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVRELHPGFLLKPQKASRI	2099390	2091883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097367_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364
529152	contig_11720_pilon	+	2339	15	Intergenic	novelGene_43921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_12	366.309678567527	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	613	1671	264322	270732	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLVSRASLPPRC	262245	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270803_271268_271343_271806_271961_272096
529153	contig_8330_pilon	+	1758	10	Intergenic	novelGene_71791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	541.202775717609	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	252	854	852673	856687	TRUE	15	GGACACCGCTGCCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837499	857805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853084_855315_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
529154	contig_17470_pilon	+	2086	14	Intergenic	novelGene_110472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_11	196.680469545381	772	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	20	1771	78219	89971	FALSE	10	GGCTTTACTTTTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHEENISSKMKGLNGKVSDLEKAAAQRKAKLDENSAFLQFNWKADVVESWIGEKENSLKTDDYGRDLSSVQTLLTKQETFDAGLQAFQQEGIANITALKDQLLAAKHIQSKAIEARHASLMKRWSQLLANSATRKKKLLEAQSHFRKVEDLFLTFAKKASAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSLEEIKALREAHDAFRSSLSSAQADFNQLAELDRQIKSFRVASNPYTWFTMEALEETWRNLQKIIKERELELQKEQRRQEENDKLRQEFAQHANAFHQWIQETRTYLLDGSCMVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAFDYIEFTRSLFVN	78199	90286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_78270_79627_79727_81385_81546_82226_82304_82984_83195_83604_83902_84382_84496_84990_85009_87600_87656_88113_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88983_89845
529155	contig_6980_pilon	+	1895	8	Intergenic	novelGene_36060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	871.520299621909	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	178	759	362386	372755	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKYQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTTL	356711	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_356762_361152_361226_362331_362401_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371480_372747
529156	contig_11285_pilon	+	1631	9	Intergenic	novelGene_5621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	516.051338894688	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	12	1313	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766048	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766141_767364_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
529157	contig_7695_pilon	-	2860	20	Intergenic	novelGene_41600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_18	31.8870930566132	571	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	253	2466	524436	504301	FALSE	10	CCATCTTTGCCATGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525583	503906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524442_524575_524637_525015_525168_525549
529158	contig_3975_pilon	-	1658	15	Intergenic	novelGene_54800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	316.076359929246	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	36	1484	2052412	2016131	TRUE	10	CTCTACTCTCCCGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052447	2015535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2015616_2016036_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
529160	contig_17470_pilon	-	1920	14	Intergenic	novelGene_110519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	65.2173425949565	39	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	92	1231	277215	270503	TRUE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKPSSAL	302631	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270450_270521_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
529163	contig_12638_pilon	+	2740	17	Intergenic	novelGene_33107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	503.150632111051	8	104	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	827	1870	183468	199604	FALSE	35	GGCATAAGAAATCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170806	200474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183041_183443_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
529164	contig_5981_pilon	+	1891	10	Intergenic	novelGene_35489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	286.483447047292	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	83	1276	23508	37804	FALSE	15	TTTTTTGTGTCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23425	38419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25472_25516_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
529166	contig_15744_pilon	+	2508	4	Intergenic	novelGene_83608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_2	603.484879678025	107	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1839	2294	152116	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINCNFLLQLFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	150277	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152177_152263_152353_152532_152706_153245
529167	contig_4315_pilon	-	2277	15	Intergenic	novelGene_46731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.432683922892	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	9	1607	163741	147905	FALSE	35	CCATACAACTTGTACTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRAVSY	163749	147234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_147922_150135_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
529168	contig_7457_pilon	-	2756	4	Intergenic	novelGene_31575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	8.52447456836295	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	163	648	924001	923096	FALSE	25	CAAAAAGTTTCCCTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCKVVVCGQASVGKTSILEQLLYGNHVVGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVCGLGLWWEPQWGECALGWLWEAWNDFIFHSFARSWVTRVEATGGCLHP	924999	920987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_923488_923907_924016_924302_924384_924932
529170	contig_6489_pilon	-	3224	2	Intergenic	novelGene_128955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	0	315	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGTAGTTTGAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391600	387838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538
529171	contig_9468_pilon	+	1147	3	Intergenic	novelGene_59481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	39.5	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	447	1145	263891	264589	FALSE	40	TTTACAGTTTCTAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILLVFDFDNTVIDDNSDTWIIQCAPEKKLPVKLQESYQKGFWTEFMGRVFKYLGDKGISEDEMKRAMTSVPFTPGMVELLNFIRTNRNKFDCIIISDSNSVFIDWVLKAASFHDVFDKVFTNPAAFNNSGHLTVENYHTHSCTRCPKNLCKKAVLVEFIDNQLQQGVNYTQIVYIGDGGNDFCPVTFLKKNDFAMPRKGYSLQKTLSRMSQNFDPVESSVVVWSSGVEIIS	258087	264591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_258330_261374_261553_263864
529172	contig_15063_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_13581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529173	contig_13894_pilon	-	1900	8	Intergenic	novelGene_62194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_4	147.225496904495	1075	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	75	1232	766610	750013	FALSE	25	GAGTAGCGGTGCCACGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRGQRQPREWELEPKCPAPRDRPMLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766684	749344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762299_763800_763958_766578
529174	contig_11752_pilon	+	1145	7	Intergenic	novelGene_37640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1534.6126185096	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	52	981	84194	105747	FALSE	5	TGTCCAGTTGTGCTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGDIEDEVYFLQYI	84142	105911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94350_105709
529175	contig_7357_pilon	+	2634	12	Intergenic	novelGene_36888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	122.893019390346	42	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1724	2176	270199	273311	FALSE	40	TTAAAGATTGAATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250842	273769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263634_268156_268233_270133_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
529176	contig_16650_pilon	+	1998	4	Intergenic	novelGene_61971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1101.12709933454	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGCTCCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244588	256007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253046_254256
529177	contig_11396_pilon	+	1391	6	Intergenic	novelGene_71432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	464	junction_3	355.999213482277	68	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	122	889	1782334	1789378	FALSE	35	TTAAAAGAGAGCGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGESAAAAHECALLRRNAGGVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKVIAVFPGFLLPVDSSQWSGWGSTSLGGNLSSVPTKCV	1782212	1789880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201
529179	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_10580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2482.69658503276	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	234	1076	34808	36333	TRUE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGQACTSRLPDATHPGAAESA	27135	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36271_36600_38975_39092_39506
529180	contig_11846_pilon	-	1898	12	Intergenic	novelGene_105934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_11	82.5055971054025	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	337	1251	254938	248626	FALSE	35	AGCCACAGAGTGTTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263867	247978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_263714
529181	contig_10689_pilon	+	1318	4	Intergenic	novelGene_118613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1733.91759383836	30	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAAGCTTTCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51214	61577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_58374_60928_61027_61270
529182	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_11112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	232	1410	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
529183	contig_12270_pilon	+	579	2	Intergenic	novelGene_113638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAAGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13850	14652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
529186	contig_15500_pilon	-	1958	2	Intergenic	novelGene_128980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGACGGACTAGGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202860	197729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_199550_202722
529188	contig_567_pilon	-	2043	8	Intergenic	novelGene_33958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	632.000645827621	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	141	824	338200	308820	FALSE	30	AGGGGACCCTAACTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRKVSELRAFVKMCKQDPSVLHMEEMRFLREWVESMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEHASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338340	307600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315121_329305_329358_331040_331099_338090
529189	contig_11752_pilon	+	1605	7	Intergenic	novelGene_37616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.710122894549	2	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	232	1257	84322	105578	FALSE	5	TCTTTCTTGACTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESQDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFEVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGT	84090	105926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84341_87159_87547_88667_88776_92870_93060_94223_94410_96442_96576_105574
529190	contig_934_pilon	+	420	2	Intergenic	novelGene_129015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGCTCAGTGGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146440	200219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_+_146805_200163
529191	contig_8658_pilon	-	1277	6	Intergenic	novelGene_55801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1324.05972674951	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	531	926	13203	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55586	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_29919_30246_34540_34626_55528
529192	contig_9995_pilon	+	800	7	Intergenic	novelGene_47664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	109	junction_2	80.0909205563	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	158431	166712	FALSE	50	CATTAAAAACTAAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGAGAMAVLLETTLGDVVIDLYTEERPRACLNFLKLCKIKYYNYCLIHNVQRDFIIQTGDPTGTGRGGESVFGQLYGDQASFFEAEKVPRIKHKKKGTVSMVNNGSDQHGSQFLITTGENLDYLDGVHTVFGEVTEGMDIIKKINETFVDKDFVPYQDIRINHTVILDDPFDDPPDLLIPDRSPEPTREQLDSGRIGADEEIDDFKGRSAEEVEEIKAEKEAKTQAILLEMVR	158411	166806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_158501_162342_162411_162497_162563_163986_164105_165053_165197_165736_165834_166586
529193	contig_16121_pilon	+	1807	6	Intergenic	novelGene_6849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	497.170634691954	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	180	1355	51510	62826	FALSE	25	GAATGAGATTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLQAILSYKYIFNGCNILLYIVLTAKYALNLISLVVDIMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	63278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_51442_51628_57743_58202_59218_59396_60693_60856_62565
529194	contig_7396_pilon	-	1769	14	Intergenic	novelGene_79641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3263.77284313686	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	699	1364	248983	246442	FALSE	20	CAATAGTCCACGTCCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257472	246036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249876_250890_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
529197	contig_11285_pilon	-	2056	19	Intergenic	novelGene_5693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	436.235314939082	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	55	1866	798505	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791176_798497
529198	SIRV6	+	1175	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	380	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	55	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	127	384	50	433	1733	2794	TRUE	35	AAGTGGTATCTAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGEFWDTSWDVSLGLWD	1683	11684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2627_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529199	contig_5881_pilon	-	3455	13	Intergenic	novelGene_129065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	111.772431256052	279	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	39	1532	755253	722141	FALSE	15	GTGTTAATATCTGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYQEGRLQKLLKMNDSEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAKYDKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEDMVKHDWEKMTEAVQNYIGSLNWGYRVALREKKVTYENAYGQFVGPHRVKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYSPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGVKFIRQFVPIKIEQIEAGTPGRLKVVAKSTNSEETIEGEYNTVLLAIGRDACTRKLGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKLELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSNVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVVKFGEDNIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIVCNIKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKQQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGGSILQSGC	755291	720217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_722204_728543_728679_729732_729829_732845_732954_737069_737227_738424_738502_739101_739195_741825_742052_743360_743477_744092_744236_752280_752401_753461_753535_755166
529200	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_11409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	2740.89176865851	9	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266
529202	contig_13097_pilon	+	1821	16	Intergenic	novelGene_107705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	525.115538609256	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	196	1119	184733	245509	TRUE	30	TCTGTCTCTTAATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASNCQYCSTSDSTTRFSSSTRRSTSISYTNNRKWTFLWL	184537	264561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215309_227110_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
529203	contig_7816_pilon	+	1889	14	Intergenic	novelGene_66513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1037.21828142084	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	127	1293	181046	207920	TRUE	40	AATGAATTGTCCCCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEPFSRGPLTTFAWRPSPRATSTSVVLTAACPLGKTGPLRWPWRIWPCSGQSPHQLSFTQVMEFLQRKQWN	170183	211763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196901_207567_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
529205	contig_14208_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_129095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCATTAAAATGCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195836	196280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_195800_196300
529206	contig_14441_pilon	+	1349	6	Intergenic	novelGene_100387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	613.29516547907	1910	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	404	871	113653	117123	TRUE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	47065	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47160_47267_47571_113646_113711_116578_116963_117097_117344_117539
529207	contig_18163_pilon	-	1012	4	Intergenic	novelGene_35311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2802.64387082388	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	6	635	11553	9125	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTQTAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWEPPPQSIMGIVAGLVVFGPAGCWRCGGCSCDLRKKSLGREGWGLSFLIQLEGFDPQVGVFASSASL	11558	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9325_9444_9721_10375_10466_11489
529208	contig_1230_pilon	+	1485	6	Intergenic	novelGene_28878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1535.92096150811	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	57	1250	405332	408754	FALSE	25	GCACCATATAGTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRATEPPQAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	405275	408989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_405358_406584_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
529209	contig_10134_pilon	-	1088	2	Intergenic	novelGene_16271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2647	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCTTGACATATGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39687	38168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_39164_39594
529210	contig_13490_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_129120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40354	38076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_38100_40400
529211	contig_15063_pilon	+	1703	7	Intergenic	novelGene_11950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	3	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	577	1461	35271	39515	FALSE	20	TATATTCTCCTTATACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27144	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34921_35031_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529212	contig_7457_pilon	+	2236	12	Intergenic	novelGene_31641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	177.411414281481	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	133	1110	1005828	1039330	TRUE	10	CTGGTGTCTCATGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYANQILS	1001546	1041116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014454_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
529214	contig_12074_pilon	-	2138	15	Intergenic	novelGene_53736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	454.356328743628	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	558	1883	36661	30226	FALSE	10	TTTAATGCCTGCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45851	29970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36738_40004_40151_41154_41228_43071_43252_45769
529217	contig_4469_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_21958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1477	1785	756037	755729	NA	30	CCACTCGAGTGAGGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTNTQAHNAHMHTHADTHTLNLLPTPQISSAYTLEQSHCTPKNFFFFLKEGRKESKAAGSPKEFSLWFPSLKGGSASELGVERKSRWTDGLAREKGVSGA	757513	755297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_755300_757500
529218	contig_15304_pilon	-	1234	6	Intergenic	novelGene_30421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1516.50448070555	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	197	433	54100	53632	TRUE	30	GCCAAACTTTCTCAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDQGT	54296	49408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53643_53695_53813_53991
529221	contig_9516_pilon	-	3199	7	Intergenic	novelGene_106175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	98.9215457937361	185	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	360	953	884684	880016	FALSE	35	TAAATTAAAATCTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGKEAQPLLLEEC	889990	877769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790
529222	contig_4103_pilon	-	2088	19	Intergenic	novelGene_51914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	500.182994290867	133	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	378	1460	87845	80996	TRUE	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91926	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91653
529224	contig_7334_pilon	+	2708	2	Intergenic	novelGene_50565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	509	junction_1	0	2	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	316	1383	120109	121176	FALSE	10	TGTACTCACTGTTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116725	122501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097
529226	SIRV2	-	377	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3303	0	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
529227	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_9842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	239	1414	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
529230	contig_13592_pilon	+	2367	5	Intergenic	novelGene_33715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1087	junction_1	139.0773166264	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1613	2056	257730	259489	FALSE	30	GCCCAGCAATGGCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKVRRILYKQNYTP	249327	259800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_257885_258019_258096_259276
529231	contig_15219_pilon	+	2116	5	Intergenic	novelGene_40836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_4	217.113449606421	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	107	784	23353	24591	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	23164	25923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
529232	contig_18096_pilon	+	2100	13	Intergenic	novelGene_58031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	750.444701493721	11	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	946	1629	69419	78661	FALSE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNKYLLCYCYKSGSVIIVSVLYTKV	40308	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44252_53712_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62892_66666_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75462_78585
529234	SIRV6	+	1465	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	52	11	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529235	contig_13863_pilon	+	1840	12	Intergenic	novelGene_42086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	435.998294029569	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	486	1349	478688	490095	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMTNYVSRGSTFKCGREKNKSCKRARNQRWW	455960	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_476611_476659_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_490006
529236	contig_9609_pilon	+	1649	6	Intergenic	novelGene_23071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1010.41207435383	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	34	648	450196	454609	TRUE	65	GTAGAAAGAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVPGSCLQRIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	450162	456259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450226_453031_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
529237	contig_6217_pilon	-	1940	3	Intergenic	novelGene_109657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	162	599	739532	739095	TRUE	40	TATATAAACGTATATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797230	737699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_738671_738724_739620_797156
529242	contig_12864_pilon	-	1273	7	Intergenic	novelGene_76414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	497	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	166	675	251873	242831	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252151	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
529243	contig_11720_pilon	+	1951	15	Intergenic	novelGene_43971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	373.864136896203	12	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	570	1307	265261	270649	TRUE	35	AATATTTATTGAGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEWPSSGI	262268	272462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264436_265167_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270628_270700_271268_271343_271806_271961_272096
529245	contig_15687_pilon	+	1528	6	Intergenic	novelGene_129140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_5	54.046646519465	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	945	1526	160209	164840	FALSE	30	GGTATAGGGTTTAATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLASCTSELISEEMEQLDGGDSSSEEGKDELHETPVEIELMTQIDQEGITVQSGGDELNEDLIQEESSEDEGESEEVVKDEELVGEMKDEEEEILNYPDTTIDLSHLQSQRSLQKLASKEESSNLSDSKLQSRRHLSAKERREMKKKKLPNDSGDLEEIEGKDKEKESALHSETHQNTSKNFPAGQPVKRGQ	158571	164842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_159306_159998_160267_161641_161922_162636_162680_162851_162902_164689
529246	contig_11338_pilon	+	1957	12	Intergenic	novelGene_6166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	526.803302009644	66	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1512	446	1957	6086	13607	FALSE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLS	745	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10574_13174
529247	contig_2892_pilon	+	1927	8	Intergenic	novelGene_119010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	454	junction_1	998.249754033815	2849	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	222	887	265084	331810	TRUE	10	GTTTTTGCTGTAGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAAAALAAVEPACGSRYQQLQNEEELGEPEQAGSDAPPPYSSISTESAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRFSTYFPGYFDGQYWLWWVFLVLGFLLFLRGFINYAKVRKMPETFSNLPRTRVLFIY	264862	339507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265147_305212_305301_318539_318671_324764_324853_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
529249	contig_3410_pilon	-	2288	7	Intergenic	novelGene_58905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	615.244237861861	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	43	630	34242	15425	TRUE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPSQGHQRHCSRTPRRSRCLWVCRMPG	34284	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14391_14467_15507_30363_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217
529251	SIRV6	+	936	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	29	56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529252	contig_12790_pilon	-	1910	9	Intergenic	novelGene_35245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	1544	1909	308833	305957	FALSE	10	CTCGGCGATGGAGTGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLLNRQASLLMSQPCLAACFHGIWKIISSLLIQTSPGIWLELICISSQGLMRIRVMGMLALQRPRVPARRGLLCGRGECDRCGKWRKRRMPESRSRGAGLALAWHGSGWTQLGTALVHVL	313321	305955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306137_307244_307339_308741_308840_309576_309752_309871_309930_310347_310492_311027_311078_311896_312033_312347
529254	contig_15545_pilon	+	893	2	Intergenic	novelGene_120120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATAACATACAACTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9188	27814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
529255	contig_5467_pilon	+	1992	9	Intergenic	novelGene_111937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	397.726959577799	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	12	899	8246	14522	TRUE	15	CGGGTCACCATGAGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8234	15832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11581_12966_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956
529256	contig_5020_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_27873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	828.976797390762	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	356	1174	122915	125094	TRUE	35	AAAGCAAGCTCAACCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKG	118469	126069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125123_125955
529258	contig_10838_pilon	-	1331	3	Intergenic	novelGene_129164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74047	53400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_54231_69929_70081_73697
529260	contig_10311_pilon	-	1744	10	Intergenic	novelGene_50430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1133.75620651111	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	777	1217	68387	66744	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71559	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65537_66628_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
529261	contig_10299_pilon	+	3127	21	Intergenic	novelGene_79690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	85.9706926807037	4	77	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	61	1293	320559	336895	TRUE	30	AAGTTGGAATGCTTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320498	340522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
529262	contig_15063_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_10197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	123	junction_2	3570.3112570506	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	238	1461	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35049_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529263	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	24	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529266	contig_1230_pilon	+	2251	9	Intergenic	novelGene_28845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1052.5022268385	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	73	2013	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
529269	contig_10940_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_49219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	71	451	875054	874674	NA	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGALLVHFSLCKNTHISRLGPPRMCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	875124	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874000_875100
529271	contig_20371_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_129179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTTTGAAAAACAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38500	39271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_38500_39300
529274	contig_3627_pilon	+	2177	10	Intergenic	novelGene_78580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_4	35.2055691441771	785	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	122	1870	1315436	1343837	FALSE	20	GTCATTCTCTTAACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKREYASDLSPPRKKPAKSHFRNKQHDSKGSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313532	1344144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323504_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
529279	contig_4232_pilon	-	2433	11	Intergenic	novelGene_63477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_7	311.965462832026	677	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	40	486	620488	614837	TRUE	10	GATCTCTGCTGGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620527	607748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
529281	contig_12622_pilon	-	1451	8	Intergenic	novelGene_5951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2704.12454428793	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	18	836	1590968	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585681_1586587_1586840_1589131_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
529282	contig_2114_pilon	-	1939	12	Intergenic	novelGene_104315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_11	86.4720850194056	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	264	1214	1157893	1139050	FALSE	30	TTTAGTCAAAGGATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSWGGVLTPSRACCCCCCCCSALTEGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169447	1138324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1169367
529283	contig_9937_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_129200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTAGTTTCTCATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52023	49993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_50000_52000
529284	scaffold_19766_pilon	+	2258	14	Intergenic	novelGene_34425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_7	155.130485255546	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1044	2099	847654	851417	FALSE	15	CCACCTTCTAATCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844381	851576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844446_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
529286	contig_7230_pilon	-	2161	10	Intergenic	novelGene_52519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	69.6419413859206	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	96	1235	67689	20327	TRUE	15	CTGTTAATCCTTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLDLSCAQQQGGPGSSLGPSTLSLAVAPPSMFFRAGLSAKSQLLRVFQPASVATMSTGTFVVSQPLNYRGGSRVEPADASGTEKAFEPATGRVIATFTCSGEKEVNLAIQSAKSAFKIWSQKSGMERCRILLEAARIIRERRDEIATVETINNGKSIFEARMDIDTSWQCLEYYAGLAGSMAGEHILLSGGSFGYTRREPLGVCVGIGAWNYPFQIACWKSAPALACGNAMIFKPSPFTPVSALLLAEIYTEAGVPSGLFSVVQGGAATGQFLCQHPDVAKVSFTGSVPTGTKIMEMAAKGIKPVTLELGGKSPLIIFSDCVMENAVKGALMANFLTQGEVCCNGTRVFVQKEILDKFTEEVVKQTQKIKIGDPLLEDTRMGPLINRPHLERVLGFVKLAEEQLIAEMT	67784	14533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_15226_17154_17268_20205_20348_23458_23648_28168_28310_28991_29189_32632_32768_43473_43604_65630_65777_67508
529288	contig_6364_pilon	-	2248	11	Intergenic	novelGene_51730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_9	1100.33787992598	22	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	496	1440	472628	444615	FALSE	60	CTCTCAGTAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGKFIFAIFNIIFKCEFSIFVHSVVFTDYLYTKQCV	521182	443806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_486627_486719_490716_490802_521045
529290	contig_1735_pilon	+	2079	7	Intergenic	novelGene_106886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	633.143480316008	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	89	1504	126256	139198	FALSE	10	TGCAACCTGTCCGGCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGYDAFPQCTYILKSA	126167	139773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136778_139169
529291	contig_12125_pilon	+	2672	12	Intergenic	novelGene_76190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	144.833503726358	129	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	655	1548	67320	82984	FALSE	35	CTAAATTTGTGATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56154	84108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_65031_65169_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_82650_82810_82939
529292	contig_15021_pilon	-	2117	10	Intergenic	novelGene_26964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	491.646440261925	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	263	802	261049	243699	TRUE	25	GTGTCTTCTGAGAATGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKNPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQRQAGDGDGSAHGHHA	262475	240567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251295_251339_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373
529294	contig_5799_pilon	+	2301	16	Intergenic	novelGene_50299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	228.089007967406	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	251	2080	599871	717769	FALSE	30	TACTTTCCATTTAAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLQDGLQRATILPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	560995	717990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561223_599847_599918_612830_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
529295	contig_19342_pilon	+	1259	7	Intergenic	novelGene_41112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.68178700572909	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	430	837	5070	6183	TRUE	15	TCCAGAATCCTGTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3653	6773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4310_5054_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
529296	SIRV6	+	375	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10394	57	1157	-55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
529298	contig_19342_pilon	+	1161	6	Intergenic	novelGene_41064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	29	364	3263	5272	TRUE	15	CAGAATCCTGTGTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFNGYYPDLAAGRGGPDPGRGTCGDQACGGRDLPEVGSHGGALWRGAKIHLSCAVREAN	3234	6775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3721_5098_5293_5413_5522_5960_5994_6139
529299	contig_1867_pilon	-	3076	13	Intergenic	novelGene_54602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_12	182.033479063605	320	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	987	1991	547888	517583	FALSE	30	TACAACAAATGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566848	516497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885_551129_553162_553377_566772
529301	contig_7079_pilon	+	997	4	Intergenic	novelGene_129241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	626.400830139935	85	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	98	307	342598	350380	FALSE	5	GCTGGTTATGTTGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELAGYAP	342500	351070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344745_350361
529303	contig_12773_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_122130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGGAAGAGAGAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9458	7720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12773_pilon_-_7700_9500
529304	contig_15087_pilon	-	2627	17	Intergenic	novelGene_37137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	410.752848247885	2	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	611	1798	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89785	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41143_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
529306	contig_1331_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_37840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	69	545	169924	160009	FALSE	35	GCATATACCTGTGTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169992	159251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
529307	contig_2078_pilon	-	2479	13	Intergenic	novelGene_100173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_11	65.1306379517351	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	34	1941	535379	505518	FALSE	30	TATAGGATGACGTTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTFGETDRQVSMRLCLLLLLILAPGGEQSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535412	504979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_534554_534576_535345
529309	contig_12638_pilon	+	2414	6	Intergenic	novelGene_33275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	235.048420543513	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	906	1643	857106	861300	FALSE	30	TAAATGACTGATGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLKRGLLEHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	856200	862071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_857136_858213_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162
529310	contig_7457_pilon	-	1978	6	Intergenic	novelGene_31621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.6602345232675	13	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	538	1125	958306	956270	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYCFFCFCFCFLKLTSCNFLKTCKITDLLFLSTLFLSNTQALNTRRGE	962730	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956410_956562_956939_958234_958375_960225_960445_960772_960896_962603
529311	contig_12654_pilon	-	2413	9	Intergenic	novelGene_129320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	168.46939633061	455	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	186	794	827177	812546	TRUE	10	CAGAGTCCTTGGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILCLEFLKSRWKRGGLLQQKRPLPPLRALSESSFCLRWCNFLPARAQSGGFRAVLESFASTMAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKVIMTFFCRLICVIPCFSASNMPV	827362	808407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_811074_811629_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
529313	contig_11832_pilon	-	1799	16	Intergenic	novelGene_106921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_15	928.825509267842	61	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	692	1348	86997	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92407	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_91996_92113_92387
529314	contig_14970_pilon	+	2107	10	Intergenic	novelGene_44946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1140	junction_5	5247.33635662001	2	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	133	1428	136145	231550	FALSE	10	GTCTGTACTTCTGCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
529315	contig_7446_pilon	-	1921	11	Intergenic	novelGene_101939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	179.208705145704	307	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	80	1519	260350	156374	FALSE	20	TCCTGAATTTGACTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTSQSDVSSLPPVPSSTDLEVGETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTVSAQALLASSSAESPPSTSLLSSSDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDDSNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSTASSSRGNGSHCKSEGQEEDFAPLSSMQPPKGDSETKAPEASSEDVTRYQEGTSAENTVENRIDVDKFTSEPLDSSSGEKNDLNLDRPCGVPEESILSEKGKEPETSDQLSTKSATNQNTTNPEPQSQTEAIESSVHEETSARYSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE	260429	155971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_156439_163488_163595_165971_166061_166683_166841_168390_168530_185009_185329_185568_185656_186937_187054_193589_193708_206814_206875_260166
529318	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_11822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	5	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	226	1398	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529319	contig_9345_pilon	-	1577	14	Intergenic	novelGene_24505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	267.304360798276	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	31	1536	671829	667061	FALSE	25	AAGTAATGCCTGGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671859	667019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667692_667815_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
529320	contig_4364_pilon	+	2502	2	Intergenic	novelGene_4564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	242	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAACATGTCTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534993	1538340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1535360_1536204
529322	SIRV6	+	347	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10398	81	1161	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11700
529324	contig_9727_pilon	-	3165	15	Intergenic	novelGene_86278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	259.409818784164	619	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	101	2383	163331	137693	FALSE	5	TGACTTGTGCTGTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQIIKEVLAVSNSILELPCPHLSALASYRWSHGIAAVPEASSTVYNGSLLLLLRDGVGGLYQCWATESGFSYPVVSYWVDSQDQPLALDPELAGIPRERVETPLTRVGGGAALAAQWSYWPQFLTVTVILALVLSGALIVLLASPLGALRARGKVQGCGTLLPGEKSSLSKEQSFRPPKEHRTSASDMDTDNNQLGTEVA	165714	136910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_138286_138719_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_165643
529327	contig_9727_pilon	+	2933	14	Intergenic	novelGene_86331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	64.0924812583048	555	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	52	1848	409270	422683	FALSE	35	AATGTACAAACATTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVRGERDASWSRRAPQQMGPTSSSPPFSSSHRRPQVGRSPAVGGSPGGSTAAPSGALDAAAAVAAKINAMLMAKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTSNKSKDDLVVAEVEINDVPLTCRNLLTRGQTQDEISRLSGAAVSTRGRFMTAEEKAKVGPGDRPLYLHVQGQTRELVDRAVNRIKEIITNGVVKAATGTSPTFNGATVTVYHQPAPITQLSPAVSQKPPFQSGMHYVQDKLFVGLEHAVPTFNVKEKVEGPGCSYLQHIQIETGAKVFLRGKGSGCIEPASGREAFEPMYIYISHPKPEGLAAAKKLCENLLQTVHAEYSRFVNQVNTAVPLPGYTQPSAISSVPPQPPYYPSNGYQSGYPVVPPPQQPAQPPYGVPSLVPPAVSLAPGVLPALPTGVPPVPTQYPITQVQPPASTGQSPLSGPFIPAAPVKTALPAGHQPPPPPQPPLPPQPQAQKRRFMEELPDERESGLLGYQHGPIHMTNLGTGFSSQSEIEGAGSKPASSSGKERERDRQLMPPPAFPVTGIKTESDERNGSGTLTGSHDYPAKKMKTTEKGFGLVAYAADSSDEEEEHGGHKNASSFPQGWSLGYQYPSSQPRAKQQMPFWMAP	408725	423768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_408765_409257_409477_412065_412195_412558_412639_413802_413856_414118_414283_415004_415217_415795_415857_416895_416954_417192_417447_419228_419403_420560_420674_421280_421373_422483
529328	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
529330	contig_12427_pilon	-	1861	7	Intergenic	novelGene_40561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1411.8212135001	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	280	903	522337	506035	FALSE	0	TTCTCGTTTTCCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578121	505076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_564267_564378_577960
529331	contig_11994_pilon	+	2244	11	Intergenic	novelGene_129347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	67.1297251595744	309	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	454	1695	95169	108340	FALSE	5	GGCTTTGTCTTAGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93707	108889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93947_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
529332	contig_5988_pilon	-	3864	1	Intergenic	novelGene_15865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	27	338	295500	295189	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGERKNNNKRWYFTREQLENSPSRRFGLDPDKELSYRQQAANLLQDMGQRLNVYPCGLGLRPWSQSRHAPASRPQALIRDGKGKRGWLGAGCLDGRAHDGAD	295526	291662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_291700_295500
529333	contig_12790_pilon	+	1958	9	Intergenic	novelGene_35205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	271.865200972835	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	368	982	309644	312363	FALSE	15	TTATAAGGGGTGTGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGMLG	305928	313339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312031_312348
529335	contig_6795_pilon	+	2825	21	Intergenic	novelGene_27737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_20	366.487980703324	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	823	2472	30	2501	322269	333435	FALSE	45	GACAGCACTAATTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPSLVMPPKPTDRATEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAALA	322239	333759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327094_327243_327430_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331291_333423
529336	contig_567_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_33975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGATATGCCCTCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342803	342074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_342100_342800
529337	contig_8658_pilon	+	1323	7	Intergenic	novelGene_55820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGAGAAAGAGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5702	55663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_6236_6700_6818_13111_13225_30057_30245_34539_34626_36521_36672_55526
529338	contig_5033_pilon	+	2416	14	Intergenic	novelGene_28979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	106	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1872	2213	542138	544599	TRUE	15	ACGGCCCCACAGTCGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQGLDKGGVGPYSNLDVSHQLNAVLTNVPISLWLGLAVGPLLRVEEKGDIGHEGSHHLGHVQFGNLIGLELFLVIQLSQVLLKRLAESESGAYLLRPALISPLIMSKMTGK	530983	547591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_531379_531512_532146_533367_533481_533789_533867_534191_534356_534446_534640_534975_535069_536506_536637_540604_540662_542121_542236_542662_542868_544560_544683_545244_545325_547551
529339	contig_5302_pilon	+	1740	9	Intergenic	novelGene_81469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	220.001704538851	63	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	67	585	318287	333952	TRUE	15	CTCGACATTTTGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRTRTRPRAHAAARGPEEPRRKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFERTMGQSLAAPFTRR	306461	338297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306525_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328338_333908_334060_336232_336291_337307
529340	contig_7457_pilon	-	1747	9	Intergenic	novelGene_31409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.238104082643	85	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	57	791	473193	469327	TRUE	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473249	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
529341	contig_12919_pilon	-	1594	6	Intergenic	novelGene_75895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	445.359809592199	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	77	790	743659	720131	FALSE	25	CATATGTTGTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743735	719326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_731100_731210_734916_735079_737596_737735_743565
529342	contig_9272_pilon	-	3661	1	Intergenic	novelGene_125884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCACAACAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223278	219617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_219600_223300
529343	contig_9381_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_129362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGAAATAGAATGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13719	15032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9381_pilon_+_13700_15000
529344	contig_9363_pilon	-	2240	12	Intergenic	novelGene_6567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1003.24775085059	9	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	118	1320	786587	754313	FALSE	25	TGATTTTTATATATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKAHPSNGSFPTEQLLQGADLWSGHRAGPQAAGQTYPLGDWSCDV	787883	753392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754442_773662_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
529345	contig_10311_pilon	-	1630	10	Intergenic	novelGene_50457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	886.846779255889	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	359	712	68709	67548	TRUE	25	TTCACTTAAAAGTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALM	71559	65135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67554_67823_67962_68264_68409_68643_68745_68955_69038_70224_70358_70446_70493_71497
529346	contig_5981_pilon	+	2351	10	Intergenic	novelGene_35494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	286.483447047292	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	65	1303	23508	37804	TRUE	30	TGAAGGCCTGTGAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23443	39174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612_38104_38425
529347	contig_1230_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_28846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	736.047444123	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	73	1269	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406853_408598
529348	contig_10589_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_129372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	530	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	408	707	76863	77162	NA	85	AAAGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEPSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNPNTHKEDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSCPRFTVRLRIGQPHITKRD	76455	79183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_76500_79200
529349	contig_3095_pilon	-	1078	6	Intergenic	novelGene_75259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	7	762	255439	246716	FALSE	50	TCACAATTAAACATAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255445	246399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
529351	contig_6710_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_94729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGGAAGCACAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653358	653883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
529353	contig_7202_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_18675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
529354	contig_8045_pilon	+	1894	3	Intergenic	novelGene_35394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2698	junction_1	435.5	2	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATGTCATTGAACACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116161	119404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_118243_118527
529356	contig_10734_pilon	+	1993	10	Intergenic	novelGene_51190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	348.545230605409	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	437	1180	1129441	1142903	FALSE	10	GTCCTTCGTATGCACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123709	1143716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1124903_1124984_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131233_1139048_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
529359	contig_14755_pilon	-	3338	14	Intergenic	novelGene_129398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	98.0603002504433	375	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	25	1887	1047882	972909	FALSE	20	TCTTCTCTTGGAATTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEENTTKVTEKPPFDRSNSQYSLDELSMEDYWTELENIKKSSENRQEDQEVVVVKEPDEGELEEEWLKEAGLSNLFGESAGDSQESMVFLSTLTRTQAAAVQKRVETVSQTLRKKNKQYQIPDVRDIFAQQIESKEKAPDGTESQSVRTNENKHQGEDDQASSFLVDKKELSPLVPEEPTASETDINLEVSFAEQAVNQKESSKDRTQKSKGNDAQLPNFRLPKDKTGTTRIGDLAPQDMKKVCHLALIELTALYDVLGVELKQQKAVKIKTKDSGLFGVPLTVLLEQDQRKVPGTRIPLIFQKLISQIEEGGLETEGLLRIPGAAVRIKNLCQELEAKFYEGIFNWESVKQHDAASLLKLFIRELPQPLLSAEYLKAFQAVQDLPTKKQQLQALNLLVILLPDANRDTLKALLEFLQRVIDNKEKNKMTIMNVAMVMAPNLFMCHALGLKSSEQREFVMAAGTANIMHLLIKYQKLLWTIPKFIVNQVRKQNTENHKKDKKAMKKLLKKMAYDREKYEKQDKNPNDADVPQGVIRVQAPHLSKVSMAIQLTEELKASDVLARFLSQESGVAQTLKKGEVFLYEIGGNIGERCLDDDTYMKDLYQLNPNAEWVIKSKPS	1047906	971457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_973001_974423_974486_978243_978369_990236_990378_991781_991989_996958_997042_998652_998813_1003320_1003399_1009356_1009449_1011606_1011773_1030734_1030914_1037715_1037780_1044547_1044784_1047704
529361	contig_7412_pilon	-	1689	9	Intergenic	novelGene_76309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1533.51418317536	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	97	1512	377290	364334	FALSE	25	AGAGGACGAGGTCTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQLRCYLDLPPAASRLWCHLSAT	377889	364156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364400_364621_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377817
529362	contig_7718_pilon	+	2098	10	Intergenic	novelGene_129407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.4662033826445	1858	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	132	833	257538	284723	FALSE	50	TTAAGAGAACAAAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252821	285988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_252880_254870_254936_254984_254989_257533_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
529365	contig_7004_pilon	+	1473	4	Intergenic	novelGene_126469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	178.408395417804	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	105	1406	393880	395731	FALSE	5	CGGTTTCTTGTCACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARALRRPRTTLALQGLTGLRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRNGPYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	393002	395798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_393065_393837_394061_394364_394514_394759
529366	contig_5280_pilon	+	2169	9	Intergenic	novelGene_52615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	618.062484199615	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	1	1113	38343	78098	FALSE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCESEYGFKEYLWVFEGKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38342	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41117_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
529368	contig_7009_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_23682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGCTTAGTTTCAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540495	538372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_538400_540500
529369	contig_299_pilon	-	3682	1	Intergenic	novelGene_129494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1525	1917	1595539	1595147	NA	50	AAAAAAGGCTCTAATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPRTFLPCFQGHRWLRFTGFGFSIALPILKPEDHKALLSPGVFVEQQIRTKSLVERGFISRTSQISQRQSPGKRLQGQLEEFCSERVFAFCLSNSLQFQRGNQKKRLVIALPVSLSNPSILRTLFLALL	1597063	1593381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1593400_1597100
529370	contig_15449_pilon	-	2129	5	Intergenic	novelGene_33662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	131.317125691968	34	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	116	652	196078	193019	TRUE	15	GAGATGTGGCAGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGSRTESEFIICNTTTCYGVQGASGYTSSSHWTAGCLMT	196193	190966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_193136_195024_195209_195339_195567_196069
529371	contig_14133_pilon	+	2384	7	Intergenic	novelGene_119921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.682975050633	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	295	693	143029	146688	TRUE	15	TACAGAGCTTTTGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136636	148450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666_147363_147433
529374	contig_9484_pilon	+	1538	11	Intergenic	novelGene_105635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_10	433.793914203507	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1515	22	1536	95848	104346	FALSE	10	GTTTGAGACCGCTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKIT	95826	104348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260
529375	contig_15063_pilon	+	1660	7	Intergenic	novelGene_10377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	237	1472	34808	39515	FALSE	15	ATCCCAAGTGCTGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529376	contig_9415_pilon	+	3036	1	Intergenic	novelGene_109865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATTATTTCTCAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2014248	2017284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2014200_2017300
529377	contig_15063_pilon	-	836	2	Intergenic	novelGene_14448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTAGCGGGGCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36796	35851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36156_36264
529380	contig_14638_pilon	-	2039	4	Intergenic	novelGene_71577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.984385550363	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	42	299	277550	254501	FALSE	10	CCCCTGTTCTGAAGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTFSEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254620_262360_262459_277509_277556_277660
529383	contig_5515_pilon	-	1112	3	Intergenic	novelGene_52332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	124	660	99142	67684	FALSE	10	AGTTTCCCCTGAGCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRRQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVGDPTFFGFLPSCLLSFSLLPLLFLPPTSLWLAHPCAPSHRCHHHHHLSLRQLTCPVAPCTASSLHSTGDSGKGAEGRREAHRQTTWQPGSPRGETFRQRKVFLLLIPPKIRKTCPLPQNDAREVGERSGKSPSQYPKNV	99265	67231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68099_89040_89139_99118
529384	contig_7816_pilon	+	1984	13	Intergenic	novelGene_66484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1085.25913444158	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	404	1873	183050	211658	FALSE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170071	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182968_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
529385	contig_9668_pilon	+	1928	8	Intergenic	novelGene_58107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	339.664119809135	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	106	1281	214129	359314	FALSE	45	TTTCATTGATAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214023	359961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
529388	contig_2770_pilon	+	1457	6	Intergenic	novelGene_107441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGCTAAGACGCCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742934	750670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744574_744674_746594_746748_747768_747796_750557
529389	contig_2892_pilon	+	1981	9	Intergenic	novelGene_119011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	1208.50480320725	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	193	609	265084	325258	TRUE	15	AGCAGTTTTTGCTGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAAAALAAVEPACGSRYQQLQNEEELGEPEQAGSDAPPPYSSISTESAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFNFCFLIDQSQPDYSP	264891	339503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265147_305212_305301_318539_318671_324764_324853_325211_325299_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
529390	contig_3426_pilon	-	2525	21	Intergenic	novelGene_57918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	152.515073025587	5	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	662	2281	196454	145330	FALSE	55	TAAAAGCAATGAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	241103	145085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196598_214111_214199_217057_217131_217970_218015_229166_229251_230844_230930_240192_240241_241006
529391	contig_4812_pilon	-	1103	5	Intergenic	novelGene_103639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	5092.905868706	163	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	171	572	82626	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQ	82796	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
529392	contig_15384_pilon	-	2852	19	Intergenic	novelGene_85139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	40.9881042664579	24	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	22	1203	127943	121695	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRDRKGSDPY	127964	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121724_123188_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
529393	contig_5954_pilon	-	2099	13	Intergenic	novelGene_28629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	419.414100263689	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	287	1738	956264	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960588	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_959794_959941_960474
529394	contig_12873_pilon	-	1919	6	Intergenic	novelGene_27217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAAGTTGCAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20339	16379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16416_16751_17019_17254_18012_18982_19262_19609_19700_19849
529396	contig_4891_pilon	-	2096	14	Intergenic	novelGene_124511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	344.164127627448	844	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	68026	30210	TRUE	20	GGTTAGATTTAAGTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92826	28969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_29132_29668_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
529398	contig_9646_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_117455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTAGTGCAAGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293610	292660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_292700_293600
529400	contig_567_pilon	+	3351	12	Intergenic	novelGene_33956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGCTGCCGCGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306669	338292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_308951_309473_309604_312029_312080_313587_313705_315084_315189_317467_317579_317714_317795_322249_322322_326925_327000_329285_329357_331039_331099_338090
529402	contig_233_pilon	-	1556	9	Intergenic	novelGene_14603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1254.34240117083	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	111	986	126907	79043	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNASGRP	127017	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79060_104202_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
529403	contig_13958_pilon	-	3114	1	Intergenic	novelGene_129531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCATCATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124905	121791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_121800_124900
529404	contig_6710_pilon	+	583	2	Intergenic	novelGene_89088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653353	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
529406	contig_2646_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_69668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	247	744	1556	2299	2183426	2182683	NA	25	TTACTGCTACTACTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLGPGFGINQEPGILAFIHSANTSWGSGGRGLCWKCDSVLLTLWEPWGSLPTQSMASCWCHCRAVSCTSLPSLTLPCPPLENSSAIAHACSVGAPRSSIFGLLLFPLYKTPKMVSFIIMSLTATDMLVIPKYISPAPTSPLIFRSVFLLPTGLSTDITMWTQHIISPTKCVPPEFQSWLLSSQSTQTHKLETFMGFSSFLSYLISQHIISIPLQQSVLNLALPLPSAFTYLVRWSTGFGVRLFWV	2184981	2182470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2182500_2185000
529410	contig_15888_pilon	-	1578	8	Intergenic	novelGene_84419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_7	1285.85843636356	3143	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	59	868	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259784	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
529411	contig_1154_pilon	-	2256	9	Intergenic	novelGene_87087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1778	2089	434921	331945	TRUE	5	CAGGCCCTGCCTCCGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFACSCLSRASCPAPEAGSSRSTKCPFTLSLLKQQNRQFSSKVQSETLSGSQSLNKLRSFNNPGPNSPSKILSNPPHEIAAEWTPESRICIIPSNETLSEGG	446370	330762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_330872_331886_331961_332259_332329_389031_389097_389753_389834_434839_434973_439214_439503_442408_442504_445027
529412	contig_7912_pilon	-	3019	1	Intergenic	novelGene_129556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTGTGAGTTCTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44697	41678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_41700_44700
529413	contig_12605_pilon	+	858	5	Intergenic	novelGene_64195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2964.38926045484	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	214	858	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPDPGRGRSIGSEQTRIAKGNAQTYRVSLGNLRGYYNQSDAGSHTLQEMYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4427_4535_4795_5072_5728_6005_6124
529414	contig_11720_pilon	+	1497	11	Intergenic	novelGene_43961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	351.547493235267	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	9	1241	262271	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264365_267784_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
529415	contig_12624_pilon	-	1788	5	Intergenic	novelGene_61105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	8	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	244	549	952979	948779	TRUE	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955881	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948162_948222_948842_950590_950768_952913_952985_955643
529416	contig_6163_pilon	+	1257	6	Intergenic	novelGene_103779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	15	CGTGACGAGTCCTTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
529419	contig_12250_pilon	-	1216	7	Intergenic	novelGene_80653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_5	142.851224083738	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	441	959	377548	375947	FALSE	30	AGGAATCAGTATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	379060	375689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009
529420	contig_1715_pilon	-	1172	9	Intergenic	novelGene_127192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	255.898783701682	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	290	313	284588	284565	TRUE	70	GAAATCTAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGFLRTELGLDLGLEPKRYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKLFILLEMCQQSSH	312213	252432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269631_271063_271241_271925_272011_284541_284607_311942
529421	contig_12733_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_129588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCGCCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282752	283617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_282800_283600
529422	contig_5549_pilon	+	1012	5	Intergenic	novelGene_81571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	65	739	82155	96749	FALSE	15	GCTCAAATTTGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82090	97022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
529423	contig_5189_pilon	-	1911	11	Intergenic	novelGene_34870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_10	569.896657298497	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	111	1214	244235	199237	FALSE	10	TTGCAGTTCCGTGGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
529424	contig_253_pilon	-	2984	19	Intergenic	novelGene_129741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_10	144.65869793721	525	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	190	1338	679264	674518	TRUE	10	CTCCTTGGCTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVAFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMAVELPDSFSPELRSLLGGLLQRDVNRRLGCLGRGAQEVKESPFFRSLDWQMVFLQKVTEQVAGPGGQPVASPQPDANPYSRSTLPR	680681	672151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_673304_673391_673506_673757_673895_674060_674224_674437_674678_675192_675294_675610_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641
529425	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_12170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2583.02558785235	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	231	1400	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27540	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35371_35836_36158_36266
529426	contig_12644_pilon	+	1309	10	Intergenic	novelGene_44601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5188.68344347034	4	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	352	1110	2678137	2680429	FALSE	30	AGAAATATGTGTTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALPWLPQPCQHWSCLKVCHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNRPNQMRRGFQERSPWEERKEERKLLV	2675472	2680628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677627_2678054_2678198_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680348
529427	SIRV6	+	484	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10262	80	1025	56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11262	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11700
529428	contig_14353_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_82114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGTAAGTTGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84286	83905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_83900_84300
529429	contig_16098_pilon	-	1703	9	Intergenic	novelGene_45938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1353.88122055629	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	125	622	352350	350466	TRUE	20	CTCTGAAGACTGGTTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGAVAGWWDEAGGLVR	354113	348282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349566_349951_350076_350236_350643_350765_350889_352152_352352_353990
529430	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_13623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529431	contig_11752_pilon	+	1835	9	Intergenic	novelGene_37646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1102.2025675891	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	499	996	92915	105616	FALSE	40	ATTGCATTTAACCACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85033	106455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_87159_87279_87399_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
529433	contig_11338_pilon	-	1587	6	Intergenic	novelGene_6381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	286.276509689496	174	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	152	793	319426	304448	FALSE	25	CTTAAGTTATGTCTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPPWSCNSHPSDWAGLCDKVILAHQRDRSILPSRWV	321460	303653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_304553_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311
529434	contig_6980_pilon	+	1687	10	Intergenic	novelGene_36046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.415640473861	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	217	942	362370	372790	TRUE	45	TTAATGTAAAAAATTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346118	373624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361236_362357_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_372846_372934
529435	contig_12079_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_67394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTATTGTACGAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478168	477309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_477300_478200
529436	contig_2087_pilon	+	2393	4	Intergenic	novelGene_65557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	441.504498529995	2766	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	31	669	39358	70191	FALSE	25	TTTCAAAGTGTTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRRGGGSDAMAGLPPRGPGIPGGLAAGRPLGLGGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39327	71915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39430_39475_39637_69054_69264_69994
529440	contig_4759_pilon	-	2089	4	Intergenic	novelGene_106336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	527.525038900209	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	178	780	650121	587401	FALSE	20	ATTGGAGCCTGACTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPQLSDHPFLRAKNFSGTLLLFPQCSSGNLESPQASLEGARLPAAPDLTGQAILEPEEMAQPKTDCRSPVGLDCCSCCLDLAHRSELQGDSSGENNNPGSPTVNNFRQLQEKLIFENLNTDKLNSIMRQDSLEPVLRDPCYLINEGICNRNIDQTMLSILLFFHSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	651790	586091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_649801_650214_651705
529441	contig_8435_pilon	+	2113	5	Intergenic	novelGene_72015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	94.2533155915483	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	536	1651	94334	97041	TRUE	5	CTGTGAGCTGCTTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFCSPLWSKRSSTRSARLPFTLGGPCPSTCSSPAPRRTPGATNAATACRSIPWPAKCCPRAGRRRRLSPGPGTH	91119	98014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93845_95231_96476_96685_97030_97164_97674
529442	SIRV6	+	1408	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	8	19	8	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1594	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529443	contig_5827_pilon	-	2132	4	Intergenic	novelGene_129793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_3	32.8261413442938	996	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	157	1038	461149	454141	FALSE	35	TTACTAAAACATCTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRVVPSAGLDPGQSGSAIRDRRSELTAPDHGSAPATRGINENTHSSVKTFTMKSEAKDGEEESLQTAFKKLRVDASGSIVSLSVGEGTSVRTSVRTTTDDAKPKTTCASKDSWHGSTRKSSRGAVRTQRRRRSKSPVLHPPKFIHCSTIAASSSNQLKHKSQTDSPDGSSGLGISTPKEFNAGECATSPPDVNHTGAVVEPLRTSVLGLPSESKKEDSSDATQVSQASLKARDLSDFQSVSRLNQGKACACIGKECQCKRWHDMEVYSFSGLQNVPPLAPEQRSTLEDYSQSLHTRTLSGSPRSCSEQARVYVDDVTIEDLSGYMEYYLYIPKKMSHMAEMMYT	464854	453046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_454832_458199_458314_461072_461190_464738
529444	contig_15063_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_8788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	33	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	244	759	34808	35888	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27125	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35384_35839_36158_36266
529446	contig_15063_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_11450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	229	1464	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529447	SIRV6	+	372	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1618	114	226	-105	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAATGGACGAAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	11165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
529452	contig_10135_pilon	+	2135	12	Intergenic	novelGene_106637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	68.1072319311416	14	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	15	1361	106830	115289	FALSE	25	CAAACTTCTGGTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIILQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGTTYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLVRSNPNDSTSSEWIQ	106815	116063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113076_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114015_114473_114604_114885_114982_115157
529453	contig_3948_pilon	-	1851	11	Intergenic	novelGene_53325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	437.660827582273	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	461	1537	1485911	1468245	FALSE	40	CCAAAGACTTCATCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510989	1467930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489869_1494190_1494313_1510766
529454	contig_6975_pilon	-	2453	8	Intergenic	novelGene_74269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_7	344.360157926766	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1696	2235	162477	159453	FALSE	30	AACCACTGATGTTGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169948	159234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_164538_169807
529455	contig_3095_pilon	-	1177	5	Intergenic	novelGene_75126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTGTCTTCAGGGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152253	147244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995_151162_151847
529456	contig_12951_pilon	-	1995	3	Intergenic	novelGene_68165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	567	junction_2	122.5	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	52	369	307115	296988	FALSE	30	TAATATTTAAGAGGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	307166	295361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_307070
529457	contig_12869_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_75348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	824	1147	83802	83479	NA	35	ATATTATGGTGAGTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSNDCLPLITQLAATHYTQLEHIFLPLTTSIVPWTLCGSYLLDPGSSGATVPLSFTLNSQNTENWTQSFTTTSQLSKLLPHMCKMSFEVSDMKSLKNIRDFQLPA	84625	82565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_82600_84600
529458	contig_13216_pilon	-	1785	5	Intergenic	novelGene_47500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTGCAGAATAGAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261487	243697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_243950_245959_246135_256120_256296_258447_258569_260425
529459	contig_15354_pilon	+	2354	8	Intergenic	novelGene_65749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	47.9238341282396	2	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	289	975	642871	647109	FALSE	35	AAGAATCAAAGCTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHIIAPSCPQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	638971	648488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644330_644998_645174_646352_646510_647085
529460	contig_13216_pilon	+	1836	7	Intergenic	novelGene_47473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	892.133289119712	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	71	895	229682	260611	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRT	229611	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258545_260604
529461	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_12393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	4	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	10	1482	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28154	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529463	contig_12019_pilon	+	1857	3	Intergenic	novelGene_87683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAACATGAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5191	8651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_6434_7726_8013_8322
529464	contig_12080_pilon	-	2262	14	Intergenic	novelGene_128380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_13	211.647608205648	421	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	57	803	177526	171125	TRUE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	177582	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
529466	contig_6227_pilon	-	1369	11	Intergenic	novelGene_49717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	239.051960878801	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	190	1068	1211228	1202920	FALSE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224995	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211280_1224857
529467	contig_12570_pilon	-	2871	2	Intergenic	novelGene_79374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1351	2049	283103	280817	FALSE	20	AGGGATTCTATTTTAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGGCGPRRGKDLPKISKQGHGRSGREPRHPPSSPGLCPLLQFLDAGFLQKARRSFSLCLLWGLSHTLTSCLPPGQLWCPFSPLGRMNYLTRLVTLLAPGCAGSRTICRVSWVSPSHSSTAVVSSSTALASYPTAGPSPPWWGSLSRCGRYCDPLRRRWTICTSATSRSCATSLRPTSSSSTSPLTSTWSSAEHQKAGHSHGRHCGAQLEVLCSEQASWRCWLNVFPEPS	284453	279994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674
529468	contig_12279_pilon	+	1053	7	Intergenic	novelGene_50101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1868.87993788318	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	59	730	68297	77256	FALSE	55	AGACACTGTAAAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKGPFQSCLSPIPSHCSQLGSVPMLPILSY	57544	77579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928_77109_77167
529469	contig_11285_pilon	-	1664	10	Intergenic	novelGene_5640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	1291	1662	767307	766311	FALSE	35	CTGGGAAGCGACGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVHLVFAARSLGHGATAPGAIKHSAARGGVGAFELAIGAPDSTQGVGILSAKARPPISIAVEAPGAAVASIPARHGLSGNGQQREVPETVRRQEEPAEQWASVWQGGPRRLLHVVGREGHL	770201	766308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_766444_766551_766637_767063_767176_767265_767402_767722_767836_768024_768147_768426_768531_768612_768772_769413_769643_769732
529470	contig_1443_pilon	-	1657	8	Intergenic	novelGene_28294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	398.723473303573	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	477	995	750529	748649	FALSE	55	GAAAAAAAAAGAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809520	747986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_776181_776462_805197_805224_809399
529471	contig_3745_pilon	+	2383	6	Intergenic	novelGene_85070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	15.9674669249697	9	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364155	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_368691_368991_369179_369328_370637_370912_371191_371378_371554
529472	contig_7963_pilon	-	1421	5	Intergenic	novelGene_58337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1386.97746917533	32	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATGTTGTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48911	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
529473	contig_5671_pilon	+	897	5	Intergenic	novelGene_79473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_4	418.042088192086	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	212	337	392910	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370515	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
529474	contig_15666_pilon	-	1684	6	Intergenic	novelGene_70210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	133.561371661121	1208	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	247	1008	131534	129088	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLLSHSLTRVVLCYFPNKPLDCFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132920	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130018_130298_130515_130795_131446_131711_132850
529475	contig_6102_pilon	-	3047	23	Intergenic	novelGene_32250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.101937371669	166	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	1266	2834	1308338	1301592	TRUE	30	TTACTGTACAGATGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGPGTGAESSGEIINNTVPLENSIPGNCCCALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSTSFTLGPNKLPIQLQVLSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSETERVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPEPQMPAMVPTYDHGMAPDSSMSMQLGSDMVPQVYPPHSHSIPSYQALSPEESVNVLPAFQEPHLQMPPNLSQMSLSYDQPHPQGLLPCQPQEHAVPTPEPLLCSDVAMAEEGCLSQQVGGFPQGTWVSEDMFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGEPGGGPLGVQPLLQPSLYGQSGISLSHLDLRANPSW	1315136	1300875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1301055_1301557_1301782_1301869_1301999_1302084_1302151_1303242_1303336_1303530_1303642_1303754_1303819_1304033_1304181_1304506_1304644_1304739_1304835_1306035_1306243_1306604_1306698_1307617_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507_1311645_1314868
529476	contig_8616_pilon	+	2172	21	Intergenic	novelGene_72417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.066334637698	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	674	1888	245168	251655	FALSE	10	TTTGTGCCCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTMLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTSTLLCFSVSGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASPEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNDWDYTRSAQVFTQLKAEGKIPEVAFMK	239593	251939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243620_243885_244040_244576_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245973_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
529478	contig_7410_pilon	-	3443	3	Intergenic	novelGene_106072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	23	junction_2	305.5	232	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	70	573	365811	361340	FALSE	10	TTTTGACATTTGTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEWMKKSPLEWQDYIYKEVKVTASEKKEYKGWVLTTDPVSANIVLVNFLEDGSMSVTGVMGHAVQTVETVNDGDHRVREKLIHLFMSGDCQAYSPEDLEKRKNSLKTWLEKNHIPITEQGESQRTICVARVLTIEPPYGPENCISSNEIILSRVQDLIQGHLTASQ	366511	358469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_361716_365683_365825_366455
529479	contig_12357_pilon	+	2124	12	Intergenic	novelGene_6125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1036.87979172098	4	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	497	1402	30982	53198	FALSE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKVHGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKQLNPHLCAA	25970	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27518_29541_29655_30217_30323_30967_31066_34131_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52839_53169
529480	contig_3747_pilon	+	1471	2	Intergenic	novelGene_24807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200983	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201415_204164
529481	contig_4891_pilon	+	1456	7	Intergenic	novelGene_124546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	544.777222561867	4812	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	143	751	701017	754769	TRUE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFG	700874	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754787_755745_756027_756579
529483	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529484	contig_2646_pilon	+	2681	8	Intergenic	novelGene_69532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	158.724122107434	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1974	2297	569631	573396	FALSE	10	TTGATTTGTACTTTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	560527	573780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_560613_565255_565390_566422_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
529485	contig_7457_pilon	-	2201	5	Intergenic	novelGene_31622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	125	1129	962606	956489	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962730	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956612_956869_956939_958234_958375_960225_960896_962603
529486	contig_15063_pilon	+	1290	4	Intergenic	novelGene_14289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529487	contig_5280_pilon	+	1917	7	Intergenic	novelGene_52619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	681.018212352324	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	549	866	47432	78098	FALSE	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38412	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
529488	contig_13894_pilon	-	1506	2	Intergenic	novelGene_62031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_1	0	5321	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	632	1426	287084	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287538_288132
529489	contig_14208_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_129106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTCTAAACCGCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297252	296988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_297000_297300
529491	contig_7870_pilon	-	1144	8	Intergenic	novelGene_108890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	25	ATTTACCTATATGTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
529492	contig_13216_pilon	+	2054	7	Intergenic	novelGene_47467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	87	1514	229682	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229595	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
529493	contig_7708_pilon	+	2834	7	Intergenic	novelGene_61533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	116.58425660821	34	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	112	957	250654	264717	TRUE	30	AACAGTAGTACTTGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMGVPEKPHSD	249587	266668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187_257288_264687_265843_265916
529494	contig_6873_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_129827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAACCAGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466231	468422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_466200_468400
529496	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
529498	contig_6102_pilon	+	2198	19	Intergenic	novelGene_31850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	497.309675735599	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	70	2100	370803	395166	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQEHLDSGALGTSGPIFCSSA	370733	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379651_395106
529501	contig_7202_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_18693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTACGTCTACCTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
529502	contig_10904_pilon	-	1045	4	Intergenic	novelGene_22680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGGAACTGACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563550	541578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_541867_556192_556371_562437_562694_563227
529503	contig_11720_pilon	+	1837	10	Intergenic	novelGene_43997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	372.90802493608	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	545	1585	266216	272210	FALSE	35	AATATTTATTGAGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	263926	272462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_264427_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
529505	contig_5549_pilon	-	2415	4	Intergenic	novelGene_81644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	364.49691356718	9	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAGTGCTTATTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445635	441965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442128_442504_443683_443958_445003_445604
529507	contig_9609_pilon	+	2223	10	Intergenic	novelGene_23049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_4	892.672572104495	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	12	1217	435608	454609	TRUE	75	AAGAAAAAAAATACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYSATLDSVQGQPGSALGCWGWPPGDKAAPSPRPIPQAGGKLSQGFLIYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435596	456264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_452724_452863_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
529508	contig_15063_pilon	+	870	3	Intergenic	novelGene_14426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	246	734	36064	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35358	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
529511	contig_211_pilon	-	2577	11	Intergenic	novelGene_129856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	158.023922239641	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	51	1481	98758	78556	FALSE	30	GTGCAAATGTGTGAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGLYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYIGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDSEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSVVDILATDDPNFNQEDQQDTQIYDKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKLVKPVLTQESAAYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRNEDESETEDEEEKSQEDHEQKKKRKKTRHSEAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKMTEPQETKESQKVELSESRLKAFKVALLEVFREAHAQSVGMNHLTESINRDTEEPFSPVEIQAALSKMQDDNQVMVSEGIIFLI	98808	77459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_78755_79997_80068_80522_80609_81082_81187_82164_82306_86086_86238_87063_87191_87563_87739_96887_97075_97505_97619_98680
529512	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	202	1044	34808	36333	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36268
529513	contig_2768_pilon	+	2462	7	Intergenic	novelGene_57480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	261.565426274617	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	390	1010	668746	678767	FALSE	20	ACTATTCTTATGTCACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVPRDMDDAKALGKVLSKYKDTFYVQVLVAYFATYIFLQTFAIPGSIFLSILSGFLYPFPLALFLVCLCSGLGASFCYMLSYLVGRPVVYKYLTEKAVKWSQQVERHRDHLINYIIFLRITPFLPNWFINITSPVINVPLKVFFIGTFLGVAPPSFIAINAGTTLYQLTTAGEAVSWYSVFFLMILAVLSILPAIFHKKLKQKYE	656163	680219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656419_664570_664689_668729_668859_671910_672005_672644_672750_677124_677264_678597
529515	contig_11832_pilon	-	1405	9	Intergenic	novelGene_106917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_3	771.881133578869	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	49	954	87391	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREEGRKKGQWWCQGPCVRHGLFSPPPPCKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	87439	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233
529516	contig_5019_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_109213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234893	236507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_234900_236500
529517	contig_11715_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_129898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATGCTGCCCGGGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143592	143910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11715_pilon_+_143600_143900
529518	contig_15039_pilon	-	1894	10	Intergenic	novelGene_110117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	507.46496564593	117	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	497	1120	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260596	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_201176_201237_202795_202857_208401_208526_222093_222255_260523
529519	contig_19579_pilon	+	2249	6	Intergenic	novelGene_59362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	696	1103	7859	8761	TRUE	35	GAAAACTCGACTAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMPRGASSSLKGIRTLASTQPVPALGSGQGEGDIHTRLLRGIPEGIGGQQIHTPHKGFLLQHGIGHFFGVFCCEDLRIHLFILLRLEVLKGSILIIFLDIQKWAGAVNHFIFRTYCVWPDTNGKEKRGGGREE	7163	13737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_+_8092_8175_8227_8442_8483_8677_8825_12012_12262_12903
529522	contig_17005_pilon	-	2974	3	Intergenic	novelGene_129900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	15	125	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	1278	2099	21134	19387	FALSE	15	TCTTATATTTGGGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDTWPSMVGGICKLHGIEDQDNNQKTCVSMLPIFNRRHMVENLCENNEDSPCGQTFSQIPNLSVLKRTPMEAYPSECLECGKSLMDHSSLKHHISSHSGCSASQHKECGEDCSCPSYLSTPMRTLTGEKRHECKECGKAFSQSSHLTSHIRSHSGERPYECKECGKAFGHSSNLTIHMRTHSGERPYECKECGKAFHKSSNLTIHMRIHSGERPYVCKECGKTFNRSSHLTTHIRSHSGERPYECKECGSTFHHSSSFTRHMRYSQWRETL	38453	18511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_-_20117_21042_22325_38366
529525	contig_10324_pilon	+	3464	21	Intergenic	novelGene_7718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1275.60397067428	1	177	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	721	2052	69971	79348	FALSE	20	TACAGACTCCAGGCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCWRTWSGMMARPRGLTSCLPTSRSF	51819	80760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69112_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78426_79273
529526	contig_8673_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_129939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43856	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAACTGTAAAATTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436252	435186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_435200_436300
529528	contig_10235_pilon	+	2063	20	Intergenic	novelGene_46393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	40	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	316	741	177952	179564	TRUE	0	GGCTCCGTCGGCTGCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSLKQSQLPPSLCTHDLLTHTPGEVRPMFCLVGAENRQTPVLLYLPPAVNRGFLQLRGGLQPLPHHSQALLGHHAGISMLQELQQEVVASVGHDVLRNRGGDDLILGSPDQQHRALVPAQLLCIVQIEVLPHGPAHQPP	177636	192415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_177967_178123_178160_178240_178351_178434_178512_178652_178715_178859_178916_179494_179566_179772_179876_180343_180465_180842_180896_181309_181374_182321_182425_182534_182648_184875_184998_185213_185291_186964_187052_190072_190156_190400_190499_191069_191231_192279
529529	SIRV6	+	1128	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-348	-51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	105	318	84	401	2021	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1937	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529531	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_10494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	5	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	236	1474	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529532	contig_4364_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_1404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532906	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
529533	contig_15063_pilon	+	1442	4	Intergenic	novelGene_14181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	130	1302	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34678	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529535	contig_3111_pilon	+	2301	4	Intergenic	novelGene_129983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	13.4742552876052	420	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	511	1017	160650	162091	FALSE	20	CCTAAATTCTTCCCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDKQKEVFLPSTPGLGMHVEVKDPEGKVVLSRQYGSEGRFTFTSHTPGDHKICLHSNSTRMALFAGGKLRVHLDIQVGEHANNYPEIAAKDKLTELQLRARQLLDQVEQIQKEQDYQRYREERFRLTSESTNQRVLWWSIAQTVILILTGIWQMRHLKSFFEAKKLV	160139	163375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_160734_160956_161083_161357_161505_161941
529537	contig_5988_pilon	+	1782	2	Intergenic	novelGene_16115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTTTTTTCTTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224950	1226931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1225030_1225228
529538	contig_3233_pilon	-	3452	13	Intergenic	novelGene_56527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_4	48.0962576506738	133	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	190	1869	376824	342065	FALSE	10	CTTGGGAGCATCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETVPEAASSPPPQGQHYFDRFSEEDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNFSTMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDIYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMKWGLLPVSHSALLVGDMAYYDFNGEMEQEVDRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKYRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPVVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGTPVPVLRHHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLDMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPVQQKPPLSGGDMCLPSGSAVPGAEQQNP	386167	340481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_342242_343121_343242_344438_344697_349376_349554_354682_354782_356914_357059_358494_358645_367017_367099_367532_367685_374732_374872_376641_376859_382207_382325_386129
529539	contig_953_pilon	-	2847	7	Intergenic	novelGene_130001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_6	66.7817756244588	362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	61	867	285390	275969	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLIWKPEVEVVAASSVTAMQREEKQLEASLDALLSQAADLKNSLGSFIYKLENEYDRLTWPSVLDSFALLSGQMNTLNKVLKHEKTPLFRNQVIIPLVLSPDRDEDLMRQTEGRVPVFSHEVVPDHLRTKPDPEVEEQEKQLTTDAARIGADVAQKQIQSLNKMCSNLLEKISKEERESESGGLRQNKQTFNPADTNALVAAVAFGKGLSNWRPSGSSGPGQPGQPGAGTILAGASGLQQVQMAGAPSQQQSLLSGVQMAQASQPGKMPSGIKTNIKSASMHPYQR	285450	273988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_276034_276945_277195_277575_277658_278241_278383_278901_279047_279726_279846_285384
529541	contig_17936_pilon	+	2153	11	Intergenic	novelGene_29931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	812.683800749098	4	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	44	1324	50646	121021	TRUE	45	CAGAAGGGAGAATAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVVSCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50602	126554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50680_68282_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
529544	contig_11932_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_85426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCAGGGATTTTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426866	425824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_425800_426900
529547	contig_7963_pilon	-	2193	5	Intergenic	novelGene_58283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1667.96492768883	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	51	302	48841	40217	TRUE	20	CTCCAGAATCCATGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTESSLK	48891	37066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39271_39405_39954_40232_43681_43819_48741
529548	contig_11328_pilon	+	1710	6	Intergenic	novelGene_88439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	293.267522920626	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	142	573	830591	836570	TRUE	15	GATCAGTTTTATGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQSCCQCQRCCEWGKRCCNNYCDWGKRCCNNYCDWCQGFCGQHNHQSGGQDQRSGDWQCGEDQVCGQRQH	829310	849647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_836364_836684_839250_839386_848758
529549	contig_11285_pilon	+	2106	14	Intergenic	novelGene_5562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	514.487025500434	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	53	1783	766060	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763505	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768669_768725_768857_769085_769320_769421_769653_769740
529550	contig_7184_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_130026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAGTCCCTGTGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59686	58780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7184_pilon_-_58800_59700
529551	contig_11386_pilon	+	1812	7	Intergenic	novelGene_82749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	465.049609062183	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	918	1748	17940	23363	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTSQSPVRKTEATPAVWKKGIQHRALFAQVMEELRSQPGRGEAPQRRPRKPLSPCLGWAP	7858	23427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_23188
529552	contig_4180_pilon	+	2494	15	Intergenic	novelGene_8426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	80.3277724103449	4	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	411	1940	1078119	1155294	TRUE	15	GGGATGTGTCTGTGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKASLAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDITEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDSQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRSITIANQTNCPLYITKVMSKSAAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSIKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG	1072473	1157753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1072734_1076123_1076213_1078057_1078243_1125305_1125471_1127668_1127731_1128287_1128369_1128940_1129010_1136507_1136629_1144951_1145109_1145581_1145724_1147773_1147945_1152735_1152916_1153722_1153889_1155202_1155472_1157376
529554	contig_16846_pilon	-	1342	4	Intergenic	novelGene_82972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3759.16217024781	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	196	714	555239	551492	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555388_558688
529555	contig_16999_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_84989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAAAATAAACCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120303	121271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_120300_121300
529556	contig_16999_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_84990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATGAAACAGGGGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121222	121468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_121200_121500
529557	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
529561	contig_5472_pilon	-	3148	10	Intergenic	novelGene_130029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_9	60.6831479444207	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	412	2361	449344	402325	FALSE	25	GGCTAATGTGTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKVAAVSTVVNKGVTPKAFVFRNYGHFPGINSHYLGGCQYKLWQAIRASSAAPGYFAEYALGNDLHHDGGLLLNNPSALAMHECKCLWPDVPLQCIVSLGTGRYESDVRNTVMHTSLKTKLSHVINSATDTEEVHIMLDGLLPPNTYFRFNPVMCENIPLDESRNEKLDQLQLEGLKYIERNEEKMKKAAKILSQEKTTLQKINDWIKLKSDMYEGLPFFSKL	456312	401537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_421983_422179_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449664_456220
529562	contig_5467_pilon	+	2058	11	Intergenic	novelGene_111926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	356.454990146021	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	26	1000	8246	14522	TRUE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8220	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956_15257_15304
529563	contig_6227_pilon	-	2802	17	Intergenic	novelGene_49701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_16	81.6760942687639	364	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	50	1966	1162315	1119927	FALSE	10	AGTGTTGCTTTTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSRGLPRELAEAVAGGRVLVVGAGGIGCELLKNLVLTGFSHIDLIDLDTIDVSNLNRQFLFQKKHVGRSKAQVAKESVLQFYPKANIIAYHDSIMSPDYNVEFFRQFILVMNALDNRAARNHVNRMCLAADVPLIESGTAGYLGQVTTIKKGVTECYECHPKPTQRTFPGCTIRNTPSEPIHCIVWAKYLFNQLFGEEDADQEVSPDRADPEAAWEPMEAEARASNEDGDIKRVSTKEWAKSTGYDPVKLFTKLFKDDIRYLLTMDKLWRKRKPPVPLDWAEVQSQGEETNASDQQNEPQLGLKDQQVLDVKSYASLFSKSIETLRVHLAEKGDGAELIWDKDDPSAMDFVTSAANLRMHIFSMNMKSRFDIKSMAGNIIPAIATTNAVIAGLIVLEGLKILSGKIDQCRTIFLNKQPNPRKKLLVPCALDPPNPNCYVCASKPEVTVRLNVHKVTVLTLQDKIVKEKFAMVAPDVQIEDGKGTILISSEEGETEANNHKKLSEFGIRNGSRLQADDFLQDYTLLINILHSEDLGKDVEFEVVGDTPEKVGPKQPEDAAQSITNGSDDGAQPSTSTAQEQDDVLIVDSDEEGSSNNAAISEEERSRKRKLDEKENVSVKKPRTEPADELDDVIALD	1162364	1119090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1120109_1121578_1121716_1123851_1123958_1126098_1126196_1127823_1127980_1133189_1133303_1133400_1133495_1135488_1135656_1136609_1136710_1140820_1140937_1141581_1141650_1148716_1148839_1150537_1150639_1152278_1152344_1154293_1154365_1155674_1155759_1162177
529564	contig_13760_pilon	-	612	2	Intergenic	novelGene_61305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	182	550	167362	161507	FALSE	10	TTTATGACTCTTTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRRSSEPQLCPGSAPKPTGELDKGPHASPSHSLCKASPSPSLSSYSDPDSGHYCQLQPPMCGSREWAAAEASSRQARSYGEKLKHPRDTVIIRECSGFNSRISLAPPRPCMDAGLCPICYKLSESLFRKNQNSCSSHQLLLLIFLPRFPVVEPWEAPHTSSHLPRHLLPHPTTTTKASILL	167543	161444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161801_167287
529567	contig_10904_pilon	-	1590	6	Intergenic	novelGene_22740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_5	281.496287719749	17	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	356	1339	662171	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662747	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662445_662665
529568	contig_20857_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_130044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	205	516	1686	1997	NA	30	TTCATGAGAAACTATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANNIQKTATVAILISDKIDFKVKSTAKDKKGHYIMIKGSVHQEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALERDRQLHNNSRRHKHSTIGEGQNIQIEAK	1481	2998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20857_pilon_+_1500_3000
529570	SIRV6	+	825	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	177	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	305	625	2458	10736	TRUE	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1480	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2000_2456_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529571	contig_10940_pilon	+	2015	3	Intergenic	novelGene_49181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1459	junction_2	243.5	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGAAATTTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172903	176219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_173218_174001_174123_174639
529572	contig_6735_pilon	-	1539	13	Intergenic	novelGene_15702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	83	1333	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDTYLVVLPHPP	568280	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542222_543080_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
529573	contig_14133_pilon	+	2146	7	Intergenic	novelGene_119915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.682975050633	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	309	707	143029	146688	TRUE	15	GTACAGAGCTTTTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136622	148449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666_147063_147384
529574	contig_7412_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_76340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4570	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	80	547	377290	375384	FALSE	15	CTCCTTGAAGCTCTACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTD	377369	375381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_375801_377239
529575	contig_13954_pilon	+	2008	9	Intergenic	novelGene_130048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	85.7962703152066	638	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	169	1509	60851	89637	FALSE	20	ATTCATCCCATTCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRVKRFLSKNGLVILGFTFILSLIALLAVGLTQNKNTPENFKFGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKINDNAEAGWTLGYMLNLTNMIPAELPQPKPFSRPTYISLMVAFSLVLAIVFILGSIIFHKSSYFQK	35391	90136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_35521_60811_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_89436
529577	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
529578	contig_15045_pilon	-	2664	3	Intergenic	novelGene_130062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	374	junction_2	4	523	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	178	1233	166837	157201	FALSE	10	GCTACTTGTCAGCTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNAVVILAFVVDKKLRHRSNYFLLNLAISDFFVGVISIPLYIPYTLYNWDLGDKLCTFWLIIDYLLCTASVYNIVLISYDRYQLVLNAVSYRAKQTEILKIVALMVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKECEPGFFLVWYIIAITSFFEFLVPVISVAYFNMYMYWSLWKRGSLGRRQSHPGLNSPDSSNDCGHSFKCRPFSRTSLPELKETEVPLRSEKQRRKSSFLHSFRTQVNTCTIASKMCSFSHSHSVTHQREHLELLRAKKLAKSLAILVGVFAICWTPYSVSAIVLSDKHPKPYWYEIAFWLQWLNSFVNPFLYPLCHKRFQKAFLKIFCMKKKTILSQS	167014	155769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157987_164354_164519_166731
529580	contig_15063_pilon	+	1418	4	Intergenic	novelGene_14207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	102	1274	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34706	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529581	contig_6735_pilon	-	1279	11	Intergenic	novelGene_15803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	687.502589086034	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	86	715	564868	543176	TRUE	25	CTACCCTGGATAAGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRARARA	568283	542272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543194_546586_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
529582	contig_2069_pilon	-	1182	3	Intergenic	novelGene_23481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	26	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509865	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509537_1509727
529583	contig_10058_pilon	+	1877	12	Intergenic	novelGene_67690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	119.950334074683	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	445	1200	51319	53244	FALSE	10	CAGTTGTTTCTCGTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48241	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_49003_49125_50196_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
529584	contig_6975_pilon	-	2171	9	Intergenic	novelGene_74255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_7	394.240389071186	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	496	1035	162477	159453	FALSE	35	TCAATGTGGGAGATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169956	158316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_164402_164538_169807
529585	contig_15063_pilon	-	1142	5	Intergenic	novelGene_12362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	385	708	35891	35108	TRUE	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36384	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
529586	contig_10235_pilon	+	1879	3	Intergenic	novelGene_46454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	249	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	180	329	211879	212152	FALSE	15	TGTCCTTGGATGCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGLWPRGLSKKRLVALEDSYTFLSGALPRTSLDHCPDLLCSPHIAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	211587	213702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211704_211815_211924_212047
529587	contig_10235_pilon	+	2176	5	Intergenic	novelGene_46451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_3	71.2618411213182	3	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	486	635	211879	212152	FALSE	35	GAAAACGAATGTCCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210736	213693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
529589	contig_6589_pilon	+	1421	8	Intergenic	novelGene_26036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	855.401779330411	396	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	99	590	1725483	1728348	TRUE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQVREPPPNPRGGLFL	1725384	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728415_1728963_1729234_1730067_1730152_1731406
529590	contig_2087_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_65561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	118	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	67	435	69092	70191	FALSE	50	CAATAAACAAATTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39607	71894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994
529595	contig_5280_pilon	+	1096	7	Intergenic	novelGene_52658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	189.971415978533	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	921	175	1095	316066	329252	FALSE	15	GAGTTGGGGGTACTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAWLRHERTREGAMPGPKQMDTAVAQLFQGDKANFSSGEEVFYSCEPGYDLRGAAFLRCTPQGDWSPAAPRCEVKSCDNILDQLPNGRVLSPPSLQLGAKVSFVCDEGFRLKGRSFSHCVLVGMKSLWSNPVPVCEQIFCPNPPAILNGKHTGNALGNIPYGKEISYTCDPDPDRGMHFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVPAGHCKTPKQFPFATPTTPIDESEFPVGTYLDYECLPGYSGSSFSITCLENLVWSSAEDACKRKSCGYPPKPSNGMVLINTDVQFGSTINYSCNEG	315891	329253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_316158_317877_318009_318096_318200_319522_319609_324496_324725_327093_327274_329151
529597	contig_19579_pilon	-	1696	7	Intergenic	novelGene_59393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	183	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	106	945	13090	7943	FALSE	50	ATAAAATATTATTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
529598	contig_960_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_108294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAGGACACAGCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037436	1036978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1037000_1037400
529599	contig_14711_pilon	+	2208	7	Intergenic	novelGene_68921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_3	226.542674419928	17	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	217	1020	86227	89329	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLWYSPCPQLPPPVQDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHR	85867	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_90194_90489
529601	contig_15063_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_10944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	233	1468	34808	39515	FALSE	20	TGTGTATATATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529602	scaffold_6394_pilon	+	954	7	Intergenic	novelGene_110984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1318.56644588819	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	492	806	405365	406119	FALSE	10	CATTTTCCTGTACTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398173	406267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403255_403314_405302_405501_405717_405864_406086
529603	SIRV6	+	898	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1502	70	73	65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529604	contig_9471_pilon	+	1560	7	Intergenic	novelGene_21833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_6	370.249015303665	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	758	1342	414749	417296	FALSE	40	ATCAAATTTATATGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCFFLLFAFLIIIYDFQKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	412551	417514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
529606	contig_9609_pilon	-	2216	8	Intergenic	novelGene_23120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	140.407570003493	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	729	1289	523112	521807	TRUE	25	ACCTCTATTGAGTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523895	520724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521577_521646_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523742_523796
529607	contig_15063_pilon	-	1493	4	Intergenic	novelGene_14027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	788	1111	35891	35108	TRUE	30	CTGAGGACCCAAGAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36797	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36264
529608	contig_15047_pilon	+	1273	8	Intergenic	novelGene_52222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2653.98825797504	7	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2183	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2588_2796_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
529609	contig_15327_pilon	-	2047	9	Intergenic	novelGene_70729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	290.480636187681	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	323	1051	965138	960518	FALSE	20	CCTTGATCTGTTTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967456	959521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_966318_966598_967420
529610	contig_1225_pilon	+	1801	4	Intergenic	novelGene_44130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	198	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	225	542	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250589	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274952_276079
529611	contig_11677_pilon	+	2230	11	Intergenic	novelGene_85981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	86.7989055230537	49	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	6	887	727781	735135	TRUE	40	AAATGATATGAAGTATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYTPSTVPAGVALWYTVLTPKPTMPRGCR	727775	737611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734255_734318_734354_735086_735188_735996_736208_736531
529612	contig_6557_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_32937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTAAAACAAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300369	300793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_300400_300800
529613	contig_10658_pilon	-	808	8	Intergenic	novelGene_130089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_7	220.798828006354	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	230	808	454573	362428	FALSE	35	AGACAGGTGAGCTCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRTVSEIRSRAEGYEKTDDVSEKTSLADQEEVRTIFINQPQRTKFCNNHVSTAKYNIITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLLFILAVAAIKEIIEDIKRHKADNAVNKKQTQVLRNGAWEIVHWEKVNVGDIVIIKGKEYIPADTVLLSSSEPQAMCYIETSNLDGETNLKI	454802	362427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_362492_367052_367127_372555_372597_391332_391379_405629_405729_406810_406911_408203_408319_454533
529615	contig_4812_pilon	-	944	5	Intergenic	novelGene_103636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	7541.09469838431	520	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	93	413	82626	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82718	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81615_82598
529616	contig_12786_pilon	+	2272	9	Intergenic	novelGene_103432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGTCCCTCCGGGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591773	629467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_592933_593213_593424_600791_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614084_615627_615731_628731_628911_629303
529617	contig_9345_pilon	-	1832	6	Intergenic	novelGene_24402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	498.769686328269	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	91	915	173741	142100	FALSE	10	AGCTTTGTTTCTGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLACGCSCKDPAGTHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	175238	141182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175195
529618	contig_12644_pilon	+	1564	10	Intergenic	novelGene_44640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4390.15570465458	4	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	798	1484	2679113	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675475	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678327_2678691_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
529619	contig_6710_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_92995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
529621	contig_15304_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_30598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	193.325861924598	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	186	1004	66228	64723	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVAVQQGARAFGPGLHH	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_64988_65310_65396_65721_66104
529623	contig_12127_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_130101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTTTTTGCTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37092	34991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_35000_37100
529624	contig_15304_pilon	-	1094	4	Intergenic	novelGene_30689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	16	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	397	993	106308	105631	FALSE	50	CCTAAAAATAAAGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107223	105529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
529626	contig_15666_pilon	-	2619	3	Intergenic	novelGene_70109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2189	2581	58020	55114	FALSE	30	AAACCATCCCTTGGAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRISKKGTMITRMLRVNSASSFMWVSLQANLITGAMSQKYWLTLGVCSVQLKRMTAIMVALATRIVKYSRRKMTKSSSWSSPRLEKPTRMNCVTTVVLLKTCMWKSSFFKKAVLGAEHIRWTGVPAQRSS	60208	55075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_55182_57353_57548_57889
529627	SIRV6	+	632	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1896	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7449_7805_7924_10721_10819_11036
529628	contig_10324_pilon	+	2011	11	Intergenic	novelGene_7758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1340.30974405172	1	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	4	528	73354	74940	TRUE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKGEAH	73350	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74943_75862_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80204_80570
529629	contig_12790_pilon	+	1939	10	Intergenic	novelGene_35204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	304.961199717822	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	216	1163	307252	312473	TRUE	40	TATAAAAAGTTTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKGIQGLWSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305928	313321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309773_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_313157_313228
529632	contig_500_pilon	+	1753	10	Intergenic	novelGene_31069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1236.4271106701	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	379	957	1492663	1496612	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRLHQGGGGATGTHTMGLQDALWGTDV	1491960	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492389_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496533_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498968_1499277
529634	contig_9463_pilon	+	1763	9	Intergenic	novelGene_83824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	1943	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	994	1362	222660	223028	FALSE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185911	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222232_222317
529635	contig_15063_pilon	+	1418	6	Intergenic	novelGene_14329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	282	1166	35271	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34877	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529636	contig_15063_pilon	+	1291	4	Intergenic	novelGene_14290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529640	contig_9471_pilon	+	2180	8	Intergenic	novelGene_21820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_7	361.069838911295	13	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	287	1108	412726	416327	TRUE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRYVLFKLVLSLVPLGHVF	412439	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_417028_417152
529641	contig_8772_pilon	-	1600	7	Intergenic	novelGene_21103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGAGCGAGAGTGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23399	15229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15766_19112_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
529642	contig_16666_pilon	-	1256	5	Intergenic	novelGene_61735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	669.189995442251	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	TRUE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55784_55879_56041_56584_56664_58098_58264_59552
529643	contig_10135_pilon	-	2126	9	Intergenic	novelGene_106616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	41.0120028162488	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	432	1622	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89582	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88920_89080_89502
529644	contig_15498_pilon	-	2337	9	Intergenic	novelGene_42675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_7	53.8678939629164	3	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	10	981	697708	689466	TRUE	55	TTTCTAAAATAAAGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVVRASWRGRA	697717	688017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
529646	contig_6102_pilon	-	4113	23	Intergenic	novelGene_32052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	56.3429030781404	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	222	2429	571141	561531	TRUE	45	ACAAAAATATTATTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFEGLDPGLAEYAPAMHSGLDSVLDAHLNPSLLQNVELDPEGVALEALPVQESVHIMEGVYSELHSVVAEVGVPVSVSHFDLHEEMLWVGSHGGHATSFFGPALERYSSFQVNGSDDIRQIQSLENGILFLTKNNLKYMARGGLIIFDYLLDESEDMHSLLLTDSSTLLIGGLQNHILEIDLNTVQETQKYAVETPGVTIMRQTNRFFFCGHTSGKVSLRDLRTFKVEHEFDAFSGSLSDFDVHGNLLAACGFSSRLTGLACDRFLKVYDLRMMRAITPLQVHVDPTFLRFIPTYTSRLAIISQSGQCQFCEPTGLANPADIFHVNPVGPLLMTFDVSASKQALAFGDSEGCVHLWTDSPEPSFNPYSRETEFALPCLVDSLPPLDWSQDLLPLSLIPVPLTTDTLLSDWPAANSAPAPRRAPPVDAEILRTMKKVGFIGYAPNPRTRLRNQIPYRLKELDSEFDSFSQVTESPIGREEEPHLHMVSKKYRKVTIKYSKLGLEDFDFKHYNKTLFAGLEPHIPNAYCNCMIQVLYFLEPVRCLIQNHLCQKEFCLACELGFLFHMLDLSRGDPCQGSNFLRAFRTIPEASALGLILADSDEASGKGSLARLIQRWNRFILTQLHQDLQELEAPQAYRGAGGSSFCSSGDSVIGQLFSCEMENCSLCRCGSETVRASSTLLFTLSYPEDKTGKNYDFAQVLKRSICLEQNTQAWCDNCEKYQPGQRRSTVSVCMT	572007	557380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_558048_558363_558562_558801_558896_559566_559747_559874_560019_560117_560276_560923_561015_561244_561305_561438_561573_562641_562743_562867_563005_563112_563313_563441_563571_563836_563957_564175_564296_565168_565266_565451_565795_566167_566436_566815_566894_567061_567183_567290_567461_570859_571264_571908
529647	contig_9668_pilon	-	107	1	Intergenic	novelGene_58199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGGCAAAGAGTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512098	511991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_512000_512100
529648	contig_13021_pilon	-	1688	10	Intergenic	novelGene_8252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	619.498562658383	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	107	1024	236115	212848	TRUE	25	CAGGGCATCAGCTCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADILCVCHGFKPVHSGPLPC	236221	209329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_209717_210465_210559_211873_211940_212067_212125_212786_212907_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
529649	contig_14441_pilon	+	1620	4	Intergenic	novelGene_100503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	682.232772267322	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	479	946	113653	117123	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	95993	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_96466_113646_113711_116578_116963_117097
529650	contig_15063_pilon	+	1526	5	Intergenic	novelGene_9941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529651	SIRV6	+	1030	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	0	167	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
529652	contig_5643_pilon	+	2032	6	Intergenic	novelGene_38937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	136.924212614132	20	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	135	761	481872	501364	FALSE	30	AGGATGCTCCATGTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTISWSPHLQFASSVSPFRSQALWLGPNPVGWVLLPAFQRLNHAISSPISFSLKP	462243	502635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495577_501196
529653	contig_1719_pilon	+	2132	7	Intergenic	novelGene_87300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	49.8745648825353	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	373	588	415052	424090	TRUE	45	TGCACTTAATGAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAPEDGCDRGGGHSADARSRAHRDHLSTIEKDTNGEVLWVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRILCRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKS	406759	427550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898_409116_411266_411347_415050_415200_416229_416294_424086_424141_426056
529654	contig_8177_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_86492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35959	35672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_35700_36000
529655	contig_15063_pilon	-	1688	6	Intergenic	novelGene_13862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36154_36264_36597_38972_39090_39504
529656	contig_7440_pilon	-	1410	11	Intergenic	novelGene_61158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	279.915058544552	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	75	956	74491	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
529659	contig_8060_pilon	+	2719	6	Intergenic	novelGene_104829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	122.068177671333	295	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	27	389	158272	215146	TRUE	10	CCCAGTCAGCGTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRKDAVMAPRGLPGSAVLAAAVFVGGTASSALEAPELNDSINENSDTVGQIVHYIMKNEANADVLKAMVADNSMGDPESPVTPSTPGSPPVSPGPLSPGGTPGEARLWTPSAHSGWCCGEGRVSSV	158245	243765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_158360_203636_203709_212184_212243_215001_215240_219456_219596_241667
529660	contig_854_pilon	-	3106	13	Intergenic	novelGene_36161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	208.738722250249	2	117	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	88	1266	509201	474385	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	509288	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471500_471991_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
529663	contig_6589_pilon	+	1037	8	Intergenic	novelGene_26095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_4	2382.70637584017	138	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	26	637	1876599	1880585	FALSE	25	GGTGTGGGTATTTATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876573	1880985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
529664	contig_7078_pilon	-	2462	9	Intergenic	novelGene_130186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_5	269.838724982164	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	468	947	795828	777331	TRUE	60	GCAGAACAATGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDGKLTSFSLIIFK	796295	773216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702
529666	contig_14030_pilon	-	2296	7	Intergenic	novelGene_62225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	543.355930000462	35	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	321	653	344359	337410	FALSE	20	TAAACTTGTTCACCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394467	335766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350861_394246
529667	contig_13984_pilon	+	2985	2	Intergenic	novelGene_130234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	244	471	24684	24911	FALSE	10	TTTAACTTCTGCTTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQRLAARQAEEAQRLRERQEALHQQRLQGHLLWQRQQQQQQQNQQQQNQQQQQQLRERELSRQRQAKREEGQQQRQERLRLMIKTMMEKSETFERTTAPKAERNTMRRRTRRKKMGLLLVRNHIEELKCSCAQSHRQCSAKGFFSSCSKLNLPTEL	8041	27425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_8281_24679
529668	contig_9440_pilon	-	2716	5	Intergenic	novelGene_59102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	356.431181997311	17	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	65	748	1716626	1700693	FALSE	30	GGATTACCACTAGGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716690	1698724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
529670	contig_11328_pilon	+	1861	8	Intergenic	novelGene_88444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	271.1851540094	13	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	98	1282	830591	849070	FALSE	10	TCAGTTTTATGCTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVWVVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLVGPFYP	829354	849649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838070_839280_839386_848758
529671	contig_10674_pilon	-	2187	11	Intergenic	novelGene_6451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	704.902149237751	115	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	260	1318	355630	305906	TRUE	10	ATGTGCTTGCTTTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKSTTGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTLTEEKVSLDPELEEALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTQFCNIVGSSNGVDQKQFSNVVKGEKILPVFDEPPNPTNVEESLKRMKENDARLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKYFSLAATRSNDPVAVAFADMLRVNRTLKSLNVESNFITGAGILALLDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ	395395	302849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_303143_305329_305941_313927_314073_315665_315810_318345_318454_320217_320349_326400_326491_327662_327786_353817_353975_355504_355707_395212
529672	contig_5643_pilon	+	1298	10	Intergenic	novelGene_38803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2748.36124910019	5	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	468	1088	236700	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236192_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
529673	contig_628_pilon	+	2916	7	Intergenic	novelGene_130248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	41.479579982873	277	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	233	1006	259926	275604	FALSE	25	TTAAACAACTTGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNEWRDYFLFNPATDIEEIIRFWKHSTGIDIGDSLTIPDEFTEDEKISGQWWRQLLAGGVAGAVSRTSTAPLDRLKVMMQVHGSKSNKMNLVGGFQQMVKEGGIRSLWRGNGTNVIKIAPETAVKFWAYEQYKKLLTEEGQKVGTFERFISGSMAGATAQTFIYPMEVIKTRLAVGKTGQYSGMFNCAKKILKHEGLGAFYKGYIPNLLGIIPYAGIDLAVYELLKSHWLDNFAKDTVNPGVMVLLGCGALSSTCGQLASYPLALVRTRMQAQAMLEGTPQLNMVGLFRRIISKEGVRGLYRGITPNFMKVLPAVGISYVVYENMKQTLGVAQK	257512	277514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_257595_259775_259935_262611_262765_268412_268521_270026_270195_273172_273324_275419
529674	contig_16098_pilon	-	2615	15	Intergenic	novelGene_45876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_14	49.8835889745274	725	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	862	1770	253301	247493	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	255225	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_254292_255169
529675	contig_14621_pilon	+	2002	3	Intergenic	novelGene_105831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTACTTTGTGGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116061	126765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824_125975_126019
529676	contig_13004_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_112675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTAAACCCTCACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664456	666206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_664500_666200
529677	contig_7202_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_18206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27915	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
529678	contig_12080_pilon	-	2896	17	Intergenic	novelGene_128395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_14	87.3047822286958	311	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	289	2340	206402	194427	FALSE	25	GGCTATCATTCATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFSFELILTGGRIQHFGTDGADSLEAWTSALGKWFSPLSCHQLLGPGLLRLGRLWLRSPSHTALASGLWLSGFGLLRGDHLFLCPAPGPGPLAPEDMVHLRRLQEISVVSAADTPDKKEHLVLVETGRTLYLQGEGRLDFSAWNAAIEGAAGGGGTGLQEQQMSRCDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFVEDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKEVIGCLPWVNRRTLATLIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQHDDQQPVVLRRRSSSDLARQKFGTMPLLPIRGDDSGATLLSANQTLPMKSSQGSVEEQEELEEPVYEEPVYEEVGAFPDLTEDTSISSTTREWTAKPETLLTSQSSFDQFLLSKAGTLGQEERPPEPPPGPPSKSSPQAHGSLEEKLLQELSSLILRKAETTTGLASPSQPSSSHPPSPTGLPTQTSSFPMQPPCTSSLPSSQPLT	208567	193870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195651_195790_195898_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200886_200956_201268_201417_202856_202963_203237_203451_204722_204887_205119_205184_206371_206592_208468
529680	contig_7119_pilon	+	1457	3	Intergenic	novelGene_40975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	8	1162	137033	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLMVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137025	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707_139904_140759
529681	contig_401_pilon	-	3434	1	Intergenic	novelGene_42802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	688	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGGATCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678181	1674747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1674700_1678200
529682	contig_17427_pilon	+	2038	7	Intergenic	novelGene_30289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.723150806133	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTTGGTGTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	176877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148065_151312_151423_155674_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
529683	contig_15063_pilon	+	1486	5	Intergenic	novelGene_12627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	4	1413	28164	36661	FALSE	25	AACTAACCATGTCTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529684	SIRV2	+	441	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	156	-74	-156	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACCACTCCCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
529685	contig_414_pilon	-	2176	3	Intergenic	novelGene_115107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	21	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	952	1728	373842	373066	FALSE	15	CATGATGGTGTTTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384212	372617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376492_376898_383938
529686	contig_9091_pilon	-	3610	17	Intergenic	novelGene_32446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_9	76.0238192525869	172	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1096	3291	83	3373	235987	182034	FALSE	35	TCAATGTAAAAACTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEADLVSKMLRAVLQSHKNGIALPRLQGEYRSLTGDWIPFKQLGYPTLEAYLRSVPAVVRIETSRSGEITCYAVACTETARIAQLVARQRSSKRKAGRQVNCQMRVKKTMPFFLEGKPKATLRQPGFSSDFSIKKPPPALLRDKGNSLGVKSGAEMPPYTIHTTLGSEVFKNVPTQRHVTLSTNSRFSPKASLPPAFQMHLSRTCSKEMSDNLNQTVEKPNVTPPASNTYKMDEVQNRIKEILNKHNNGIWISKLPHFYKELYKEELNQEILQQFEHWPHICTVEKPCSGGQDLLLYPPKRTQLSRSELDNEKVPPSQLPAPKQLPTLKGCPAVTPEDFKEKVAELLEKYSNGLWASALPKAFEDMYKVKFPKDALKNLASLSDVCTVDYISANPQKAILYAKLPVPTDKILSDTVQAQGDYDIKSMIEQEYLQIEENLAESADSFIEYVTVPPLIIPTEASPSVLVVELNNTNEVVIRYVGKDYSAAQELMEDEMKEYYSKNPKVAPVQAVHVGHLLAVNAEEDAWLRAQIISADDNKIKVCYVDYGFSENVEKSKAYKLNPKFCSLPFQATKCKLAGLEVLSDDPDLVKVVETLTCGKIFAVEILDKADIPLVVLYDTSGEDDININATCLKAICDKSLEVHLQVDAMYTNVKVTNICSDGTLYCQVPCKGLNKLNDLLHKIEDYFHCKHMTSEYFISLPFCGKICLFHCKGKWSRVEITNVHSSRALDVQFLDSGTVTSVKVSELREIPPRFLQEMIAIPPQAIKCCLADLPQSIGMWTPDAVLWLRDSVLNCSDCSIKVTKVDETKGIIHIYLFTPKNFPDPHRSINRQITNADLWKHQQDVFLSAISSGVGSPNSKNGNTPVSGSTGEGFRKSLTDIKKSMVDHTGSFSMEELPPPVHLSKPGEHMDVYVPVACHPGYFVIQAWQEIHKLEVLMEEMILYYSVSEERHVALEKDQVYAAKVENKWHRVLLKGILTNGLVSVYELDYGKHELVNIRKVQPLVDMFRKLPFQAVTAQLAGVKCNQWSEEASMVFRNHVEKKPLVALVQTVIENTNPWDRKVVVYLVDTSLPDTDIWIHDFMSEYLVELSKVN	245444	181796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_182255_182607_182769_186874_187375_189806_189918_192871_193007_194280_194368_196325_196461_200602_200806_202624_202737_207702_207890_212140_212728_223511_223730_226048_226123_232757_232969_233912_234055_235780_235994_245368
529688	contig_10372_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_112515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52571	49583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_49600_52600
529690	SIRV4	+	500	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	448	2	-448	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAAATTGCCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	2323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
529691	contig_16303_pilon	-	1637	7	Intergenic	novelGene_34059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	717.881760613976	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	23	856	40530	35759	TRUE	35	AACATTTGCCATTTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	40552	32593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33101_35484_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433
529692	contig_18822_pilon	-	2068	16	Intergenic	novelGene_111729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	178	507	246246	229607	TRUE	40	CATCACAAATCATCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGHGCADHRLVHKLHGAQRRVHAAAGCTLQFQHCDGIWGRGHEDVLRHKQGHLGAPCGPIAAKVKTINPHLALGPARKLDKGVLGQVWDPSRNGEVPHIKGWQCEVR	246423	143168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_143215_165845_166027_168086_168209_169637_169676_170796_170892_175765_175949_181157_181219_182823_182947_183091_183132_191144_191257_209333_209409_212479_212569_221546_221662_223823_223956_229457_229713_246022
529694	contig_1861_pilon	-	1972	16	Intergenic	novelGene_77656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_13	109.703843749129	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	139	1734	112534	88651	TRUE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTGVNAVLILILTHCRSLVLT	115215	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_88604_88710_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_106881_106923_112515_112582_115124
529695	contig_11978_pilon	-	3263	1	Intergenic	novelGene_62814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCAGAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398920	395657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_395700_398900
529698	contig_8954_pilon	-	3827	1	Intergenic	novelGene_130279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACCAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129484	125657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_125700_129500
529700	contig_14528_pilon	-	2086	13	Intergenic	novelGene_111265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.326409282155	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	8	1852	201850	190953	FALSE	5	TCTTTGCCTCCTGTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	201857	190718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191057_191155_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
529701	contig_3986_pilon	-	2866	13	Intergenic	novelGene_52688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.9771297938176	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	698	1678	48331	35282	FALSE	35	AATAAAGTCACGTGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153859	34093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46115_46299_47666_47820_48252_48400_52852_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
529703	contig_8978_pilon	-	1684	7	Intergenic	novelGene_49320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	856.301932731674	847	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	3	542	194082	193127	TRUE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGIWKEGVKSPGILWGTGVYGVVLFHHKAT	194084	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193398_193613_193768_193967
529704	contig_3602_pilon	-	1426	12	Intergenic	novelGene_60660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.510225395575	43	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	67	954	1139393	1106687	TRUE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139459	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106445_1106625_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
529707	contig_17470_pilon	-	2038	14	Intergenic	novelGene_110506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	59.9979289583394	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	172	1551	279765	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRNVAAIFSHLAGPLQGKKAGASSLAGCLHQTVAMAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302411	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_279666_279881_302355
529708	contig_9017_pilon	-	2519	6	Intergenic	novelGene_130329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.8095211115606	265	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	453	794	218109	217768	FALSE	20	GTGGAGCATCAGTCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	224307	216042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218123_218614_218722_219573_219605_219825_219969_220072_220192_224268
529709	contig_4105_pilon	+	2314	10	Intergenic	novelGene_21477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	118.852019205127	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	335	1141	63728	73266	TRUE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	61717	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_74076_74117
529710	contig_7173_pilon	+	2841	3	Intergenic	novelGene_37529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	107	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2244	2678	225253	225687	FALSE	35	TATATACCAATTTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHCLKTGTFKDSLIRPSCRRLPSKPGVLHVEALGDFERSTYTVQRLLVLCLPTLFSPLDPDLCRKHALPDPLSGQEAPEHKLVTPFLVSSLVQIVLECGCLWPPGSLFLHSHKSFWRVATRPLKSFFSFLVFKMLWIRDWLNP	212929	225850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_213250_220273_220563_223618
529711	contig_9468_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_59469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAGAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181175	178897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_178900_181200
529712	contig_12837_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_57266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	106	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTAGCTTGATATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60661	29150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_31213_60477
529713	contig_6735_pilon	-	1386	12	Intergenic	novelGene_15723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	919.639059631549	538	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	86	1180	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542327_543838_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
529715	contig_12638_pilon	+	2389	4	Intergenic	novelGene_33079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	987	junction_2	409.788021081903	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170765	178518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_173560_178085
529716	contig_2114_pilon	-	2041	12	Intergenic	novelGene_104314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	82.0075586115176	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	643	1263	1147929	1139050	FALSE	20	TAATTCGTCCAGTAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169462	1138271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1152985_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
529717	contig_7594_pilon	+	1303	6	Intergenic	novelGene_55416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	996.347650170361	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	84	473	539045	552997	TRUE	20	ATAGTGTTTTGTGATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVDYLLFCGFCAYQDS	538961	555177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_552953_553000_554349
529718	contig_3602_pilon	-	1972	6	Intergenic	novelGene_60489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	1624	1971	168786	161606	FALSE	20	ACGGTCTCTCAACGGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNSGKSMVPFPSASTSLIMSCSSASVGFCPRDLITVPNSLVVIVPSPSLSKREKASLNSGGPSASLTMARPGVSGARGSRLLSRRQKLQQLELRRAFAPPHSLPAARAAAAARP	171128	161604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_161769_168464_168612_168748_168853_169141_169280_169420_169641_169929
529719	contig_4103_pilon	+	2420	4	Intergenic	novelGene_51959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1556	1858	161672	161974	TRUE	20	CGCAAGCGCAGCCCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGYHTWQWTGVASGSNGPAWDDPGLADPRPLYSCPHKILGGLCSKGQHRRCNTSEENQVMEPAPRRVQPWYIARENTEDQSQLQTPQSGLEEKDACGP	159870	164200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_161123_161368_162402_162987_163087_164164
529720	contig_11056_pilon	+	1971	10	Intergenic	novelGene_130364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_9	52.6455653930657	685	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	172	1179	340996	369990	FALSE	10	TGTAGAGTCTGGGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEGGFGGTSSSDAQQSLQSFWPRVMEEIRNLTVKDFRVQELPLARIKKIMKLDEDVKMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPVQLNAGQLQYIRLAQPVSGTQVVQGQIQTLATNAQQITQTEVQQGQQQFSQFTDGQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294529	370782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_340987_341101_347924_347997_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_365410_365519_368561_368622_369870
529721	contig_12790_pilon	+	1865	11	Intergenic	novelGene_35241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	295.625793867856	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	495	1430	309644	312898	FALSE	25	AATTGTTTATAAGGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSCRLLRAWQARAWAHLWGKAGPASQEVGVLKLVCQMEGSDRSQPLAFPSEPSCLDRVSLSLSWPEEHRPVTSEKYSTNPRAGSALRDNCTK	305945	313333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309534_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312410_312627
529722	contig_11656_pilon	+	2443	12	Intergenic	novelGene_54000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	182.812915253466	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	172	1341	465719	536764	FALSE	40	CATTAATATTCCAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPSVTMLDTLSAHLEGLHRRDPAHFDAK	464933	537866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522814_536680
529723	contig_9609_pilon	+	1570	6	Intergenic	novelGene_23076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1034.8302276219	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	204	554	453647	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	450567	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450641_453012_453142_453645_453776_453861_453973_454498_454634_455282
529724	contig_13905_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_130436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	372	683	228815	229126	NA	25	TGATGATTCAATGACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRHSSTSKTSVSNHVYLWPPRMSLYLVFCDCPAAEIISLILTLWSLYYEINRRFECAFSNYVHPPLAIPTTPHLENQHSEPVFSTLTTHRSHWKCSIILFRV	228443	229553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_228400_229600
529725	contig_12425_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_46680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATGGTGCTCACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203279	207285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204322_204828_204964_206555_206673_207181
529727	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_12106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	16	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529728	contig_8258_pilon	+	2479	5	Intergenic	novelGene_130439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	37.3965239026303	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1791	2126	25390	51135	FALSE	30	TCAGTTTAAAATGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNKEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK	3052	51488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_+_4778_25324_25494_32383_32475_38822_38949_51120
529729	contig_5084_pilon	-	2931	11	Intergenic	novelGene_64635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	51.0628044666565	348	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	4	897	1344218	1330743	TRUE	30	GTAAACCCATCTGCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMATAAWRQGWRVGRWGLRRPQLPPLAGLVSQRAHSVLPVDDAINGLSEEQKQLRQTMVKFLQEHLAPKAQEIDQSNEFKKLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLG	1344221	1327144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330841_1333776_1333874_1335200_1335338_1335727_1335822_1337106_1337277_1340930_1340983_1341204_1341295_1344062
529730	contig_19974_pilon	+	3910	1	Intergenic	novelGene_130457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCACCCTCAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103878	107788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_103900_107800
529733	contig_16776_pilon	-	1276	7	Intergenic	novelGene_130515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	361.376842398932	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	377	904	43087	35073	FALSE	0	GTTCCTCTTTTGCCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	57768	34700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43228_44262_44437_57706
529735	contig_15063_pilon	+	1290	4	Intergenic	novelGene_14308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	327	1148	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34832	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529738	contig_11978_pilon	-	2534	6	Intergenic	novelGene_62895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	32.3382126902524	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	66	311	760226	756658	TRUE	10	CTTCGTTTGACTGGATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGRRAEWPGYQRHLCGRSAIMDLGPMRKNYRGDLEAFEEAHLTSLDPIKQFAAWFEEAVQCPDIGEANAMCLATCTRTLIPLLPLSSTGSLLTVRCEWRDL	760291	753916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_755962_756175_756247_756550_756680_757157_757212_759049_759175_760181
529740	contig_12427_pilon	-	1993	7	Intergenic	novelGene_40528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1402.75186884764	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	276	827	520420	506035	TRUE	15	GATCATCTGATTTTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578157	504673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505288_505482_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520438_522284_522346_577960
529744	contig_8616_pilon	-	2063	11	Intergenic	novelGene_72372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	58.4452735471398	29	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	140	2011	195406	178743	FALSE	10	GAGGTATTGTCTTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPEPPQPSAGVVAAPCPSPGPHSGPPDQCPSAGGDSGREGVSPAEKRRPSAKFQRPRDQAGSAGTMSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLVKIKVPDNEAEEAKFTGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGLTEYLDYVSTLKVKGIVLGPVHNNQKDDLAETNLQQIDPAFGSNKDFESLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	195545	178690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184266_184441_184901_185334_185997_186070_195294
529746	contig_14441_pilon	+	1282	7	Intergenic	novelGene_100561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.833603520047	286	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	666	1094	116728	117610	FALSE	15	ACGAGTGTCTCATTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112107_112154_112454_112665_113143_113209_116578_116963_117220_117344_117539
529749	contig_4364_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	61	423	1530895	1531336	FALSE	10	GTGACTGTCGGGCTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQ	1530464	1531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
529750	contig_11986_pilon	-	1850	9	Intergenic	novelGene_69197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1096.3697768089	4823	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	122	1105	792566	734724	FALSE	5	GGTGTTTGTCTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQGRRGAGGPGAPAPQRRLRSVEACLLPL	794706	733978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734808_751610_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
529751	contig_1225_pilon	+	2134	4	Intergenic	novelGene_44136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	223	825	250814	275486	FALSE	10	CCACTCTGGCCTGGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETALELLTPELPLVAFQPSWEWPEQILPSMEAPTWTLWYKSPSFNCSPQDCCFQSLTGGIQWAGSSPRLALPSPHQPPPQPFFSFQQPDHSEWALSLFFLWELE	250591	276795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274387_275176
529752	contig_14441_pilon	+	1628	5	Intergenic	novelGene_100562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	613.289644050835	8	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1036	1389	116876	117560	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111196	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_112109_112665_116578_116963_117097_117344_117539
529753	contig_3745_pilon	+	2391	3	Intergenic	novelGene_85076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	167	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAATGTGTAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364176	372808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369227_370659
529756	contig_1516_pilon	-	1956	10	Intergenic	novelGene_49970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCAGCCTCAAGGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363733	335181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_335267_347225_347394_347974_348066_352895_353028_353503_353691_354791_355063_356020_356171_356369_356523_359953_360082_363142
529757	contig_9463_pilon	+	1561	3	Intergenic	novelGene_83845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	375	junction_2	69	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	797	1165	222660	223028	FALSE	15	TCCTATTGGCTCTGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	218623	223424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_218671_219238_219290_221961
529758	contig_10299_pilon	+	1934	12	Intergenic	novelGene_79662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	74.0668672649673	164	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	571	1869	184255	187611	FALSE	40	ACAAAACTTGATACATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182364	187676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183758_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
529759	contig_12977_pilon	+	1715	16	Intergenic	novelGene_122783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	802.884455503336	17	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	230	1204	37078	57283	TRUE	0	CTTGGCCCTGTTCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10706	58802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10924_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_57866_57977_58495
529760	contig_9720_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_116768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTGGTAGCCGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197183	195860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_195900_197200
529761	scaffold_13505_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_111579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTAATGACTGTCGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623209	622760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_622800_623200
529763	contig_854_pilon	+	2628	13	Intergenic	novelGene_36476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2473	junction_1	2014.36047888378	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	180	1820	1649514	1685335	FALSE	40	GAAGGTCTAGGAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPVRAKRAVVPALASCPSLLGVPPLSTSAV	1612766	1686143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074
529764	contig_6048_pilon	+	2417	18	Intergenic	novelGene_73116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	347.148981310494	25	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	64	1590	909094	1358561	FALSE	20	GGTTGCAGCCATACTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVAIEVLTRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDASKPLEVLLLEKNRSLQSENATLRISNSDLSGRCAELQVQVTEAAATVAEQRELIAHLEQDLSTIQTIQRPDAEGAAEHSLEKIPEPIKEATALFYGPSAPASGSVRRPPAQVPRERQRGSGR	909030	1359388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258627_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1350868_1350997_1351717_1351785_1352522_1352549_1358504
529766	contig_4659_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_118174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATACAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91477	94026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_91500_94000
529767	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_9642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	23	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529770	contig_11068_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_130551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAATAAAGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289750	288788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_288800_289800
529771	SIRV6	+	553	5	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-8	70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCGAAGGTGAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1541_1645_1736_1845_2027_2470
529773	contig_3975_pilon	-	2356	9	Intergenic	novelGene_54886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_8	129.836194876467	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1647	2300	2096423	2091957	FALSE	30	TTAGTCTGGAAATACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099590	2091900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097939_2099364_2099458_2099552
529774	contig_7396_pilon	-	1766	15	Intergenic	novelGene_79610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3553.40010570503	3	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	844	1449	248983	246251	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQM	257480	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246257_247218_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249868_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253927_253977_254602_254701_255105_255191_257381
529775	contig_2596_pilon	-	2320	14	Intergenic	novelGene_53468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.447954498583	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	119	1321	722501	669421	TRUE	10	TGAGTACTTTGTCCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEIAGAKPHITAAEGKLHNMIVDLDSVVQKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSNSVQLTGCRPMT	722619	662378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_662973_664472_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
529776	contig_9807_pilon	-	1238	3	Intergenic	novelGene_32926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGGATGGAGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159629	154129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_154270_156624_156768_158674
529777	contig_5643_pilon	+	1771	15	Intergenic	novelGene_39021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	764.021987208991	3	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	653	1753	634983	641580	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKWMTHSLNLGAPLLLL	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640517_641443_641475_641563
529778	contig_3424_pilon	+	2310	4	Intergenic	novelGene_55480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	985	2067	169596	170678	FALSE	30	TTTTTTACTCAAATACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149891	170921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_169247_169376
529779	contig_8284_pilon	-	3324	12	Intergenic	novelGene_125679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	39.6257283479741	219	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	43	1179	389183	336801	FALSE	10	AGCTTTTATTCCTCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATATAVVAEEDTELRDLLVQTLENSGVLNRIKAELRAAVFLALEEQEKVENKTPLVNESLKRFLNTKEGRLVASLVAEFLQFFNLDFTLAVFQPESSTLQGLEGRENLARDLGIIEAEGTVSGPLLLEVIRRCQQKEKGPASGEGALDLSDVHSPPELPEGNTRSHTIPSKKSSETSQSDTSISLSEPKSKSSRHLPAQETKIGSFLSNKSLDVKDKAGICPDEDDMEGDSFFDDPIPKPEKTYGWRSEPSKQGGSLASLSDAPPLKSGLSSLAGAPSLKDSESKRGDAVLTDLKLVGDKIGSLGLGTGEEDDYVDDFNSSSRRSGNSQLSIGEETEEGLSVEADDISASDKLDDLTQDLTVSQLSDVADYLEDVA	389225	334655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_336876_340850_340948_347191_347232_352660_352730_354347_354461_359450_359675_371059_371141_378229_378368_378811_378901_379280_379336_387208_387263_389081
529781	contig_12638_pilon	+	1955	10	Intergenic	novelGene_33374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	130.156695686771	13	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	967	1482	1530272	1538931	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515747	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529957_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1539145_1539420
529784	contig_6494_pilon	-	835	7	Intergenic	novelGene_108564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	44	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	28	759	8286	2635	TRUE	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8313	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
529785	contig_15410_pilon	+	2027	6	Intergenic	novelGene_130622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	934.952704686178	200	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	309	662	146836	148093	TRUE	10	GTATGGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145501	152311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146738_146980_147081_147178_147750_147842_148070_148202_151054
529789	contig_15327_pilon	+	2592	9	Intergenic	novelGene_70413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	173.056665214028	22	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	34	549	28761	32076	TRUE	10	CGCCCCCTGCTTCTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSQSYDLTGKVMLLGDSGVGKSCFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKFRGQTHLEASAQLIGLLKLWKWPLPRKEIQGCPAARPHEVIVSRVTGQRLRLERVSPNY	25311	34381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_28869_29900_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31758_31896_32409_32488_32566_32747
529791	contig_6842_pilon	-	1201	4	Intergenic	novelGene_130717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_3	147.443397802532	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	83	646	433953	429481	FALSE	40	ACTAACCAGGACTATCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	434035	428925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547_432658_433818
529792	contig_2444_pilon	+	2247	12	Intergenic	novelGene_83768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_1	244.147868756174	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	58	1779	231271	243030	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	230305	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230361_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
529793	contig_7334_pilon	+	2832	2	Intergenic	novelGene_50573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	436	1503	120109	121176	FALSE	5	CTCACTGTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116767	122505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117192_120097
529794	contig_11224_pilon	+	2123	4	Intergenic	novelGene_124443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	187.261552083947	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	152	457	19401	20398	TRUE	25	CTTGATTTTCTTTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPEC	11242	22148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211_20821_20904
529795	contig_19769_pilon	+	978	4	Intergenic	novelGene_102304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	10	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	489	944	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87236	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87375_87508_88040_88841_88958_89163
529796	contig_1443_pilon	+	1960	10	Intergenic	novelGene_28302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAAATGGCCCCCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747996	809519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748993_749234_749348_750368_750530_766776_766833_767448_767562_776188_776462_787303_787357_805196_805226_808694_808744_809402
529797	contig_16045_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_130855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12649	14080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_12600_14100
529800	contig_12644_pilon	-	1184	9	Intergenic	novelGene_44687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	229	567	2680391	2679609	TRUE	15	AGCATAGGGCTGCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFPGTPFSSDLAASAAAALSTLSFIPGLSKNGVPAHGLCIWVELQHDSQVFQWVLLQDSAMDLLAWCSEGSLDLGAFQDSAKVCIHHLVHGKAEVALEGGGFPPSAIQLI	2680619	2677379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678843_2679071_2679203_2679506_2679659_2679872_2679961_2680105_2680230_2680314
529801	contig_7342_pilon	-	2412	22	Intergenic	novelGene_71118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	93.8654655535398	3	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	106	1230	86720	79011	TRUE	10	GCTAGTTTTCTCCTGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGKPSWLRSPEHPCRPSTGGLCICSCSNSSSKAGWRSSTRGMASQISLSRKSLAARRPQAPSAPTSSGQTT	86825	76099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80426_80928_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
529802	contig_15304_pilon	-	1060	3	Intergenic	novelGene_30536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	20	CAGAAGCAGCCCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
529803	contig_10235_pilon	-	2571	18	Intergenic	novelGene_46569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_17	54.4888166679045	432	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	29	2140	546922	537592	FALSE	20	GTTGAAGGAATGGTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLNPEDWGLRNCTLYTGLDEVAEEQTQLFRCLEQDVPFDSSSLDVGMDASPPEPPWDPLPLFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSDVQTKIEPVSPSSSINSEASLLSADSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNETLSGRGATGDYEEMMQIECEVMDTRVIHIKTSTVPPSLRKQPSPTPSNTTRGPLPAPAGSQAHQASHQPLYLSHP	546950	537160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811_545904_546165_546245_546384_546465_546831
529804	contig_13201_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_130889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTCTACATTCTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453964	452870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_452900_454000
529805	contig_8978_pilon	-	1469	9	Intergenic	novelGene_49323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	828.424096930431	328	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	34	1071	194082	190819	FALSE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKQPA	194115	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190832_190869_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
529807	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	225	1397	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27144	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529809	contig_8050_pilon	-	1405	3	Intergenic	novelGene_114812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	17.5	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATCAACCCAGCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253963	244480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_245669_245780_245843_253808
529810	contig_8050_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_114810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCTGTCAAATCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243571	241781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_241800_243600
529811	contig_2646_pilon	-	2032	15	Intergenic	novelGene_69622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	131.483936320009	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	104	1189	2075196	2070812	TRUE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGLEWLCWASPLSPWGRRLVQRWRCEPLATC	2075299	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071658_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143
529814	contig_14209_pilon	+	2598	12	Intergenic	novelGene_88320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_8	152.156889453828	159	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	68	886	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32298	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38783_40142_40344_40418
529816	contig_5280_pilon	+	2101	9	Intergenic	novelGene_52604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	548.081526212114	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38322	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38453_39288_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
529817	contig_12425_pilon	-	2103	10	Intergenic	novelGene_46683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	608.443145847166	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	259	1158	211055	204225	FALSE	15	CTTGAAATTTGCTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226631	203279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211052_211200_226517
529818	contig_11978_pilon	+	457	5	Intergenic	novelGene_63058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4785.56655475608	452	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	31	390	1827946	1830788	TRUE	15	ATGAGCTTTTACCTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHM	1827915	1831950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830791_1831885
529819	SIRV6	+	456	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10333	37	1096	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11333	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
529821	contig_14513_pilon	-	1226	4	Intergenic	novelGene_70329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	117	533	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	18996	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
529822	contig_10299_pilon	-	3365	1	Intergenic	novelGene_79769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595792	592427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_592400_595800
529823	contig_10765_pilon	+	1910	6	Intergenic	novelGene_122851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	198.652460342176	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	151	882	18249	19074	TRUE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKQYLHFVIFRLLPSGPNGSRCLLL	15616	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_18903_18996_19517_28914_29040_32032_32122_34727
529825	contig_15087_pilon	-	1538	15	Intergenic	novelGene_37205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	296.137559390282	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	284	1015	134824	113497	TRUE	30	TGTAAAATGAGTGACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181165	110648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134878_150484_150572_158907_158952_181066
529826	contig_10134_pilon	-	1863	3	Intergenic	novelGene_16245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	838	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATATGTTTAAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38799	32194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35080_38629
529828	contig_5485_pilon	-	2101	4	Intergenic	novelGene_37683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	149	1291	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88083	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
529829	contig_1964_pilon	-	3063	1	Intergenic	novelGene_130906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTGATAAACTATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134939	131876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_131900_134900
529830	contig_9883_pilon	+	2199	4	Intergenic	novelGene_87587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.981044694859	17	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	528	1022	91562	96211	FALSE	15	GCCTACCCCACCCCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDDIEEGDLPEHKRPSAPIDFSQIDPGKPESILKMTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPGKGGGSKEKNKTKQEKSKKKKEGDPKSRTSKEDNRAGNKREDL	83818	97388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84049_91264_91565_94067_94301_95952
529831	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_1935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532917	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
529832	contig_13528_pilon	-	1805	13	Intergenic	novelGene_66869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	185.0472161969	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	155	1432	67895	40217	FALSE	25	TAAATTGTCTTATTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGTCEREEAGKKDAASGEHPGGSPELRLRELQVRDAPGKGRSVCGRTRRKMASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSAEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQIWQMAENIYNDEESDVTASELEGQGS	68099	39843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879_67908_67957
529833	contig_15304_pilon	-	1417	4	Intergenic	novelGene_30625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	5	GTGCCTGCCTGGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
529835	contig_10235_pilon	-	1759	6	Intergenic	novelGene_46524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	32.3765347126588	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	169	1230	331785	328214	FALSE	10	TGTAGAGGCTCTGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	331953	327684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328943_329127_329952_330027_331063_331257_331623
529837	scaffold_6394_pilon	+	1224	8	Intergenic	novelGene_111009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1013.95449320259	93	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	551	1069	405059	406119	FALSE	10	CTGTACTGTGTTTTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398216	406274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402962_403172_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
529840	contig_17066_pilon	-	1657	7	Intergenic	novelGene_130958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	53.8134638254117	433	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	75	911	402983	276065	FALSE	15	ACTTGATTTGTCTGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSPESRVNAIHFLVHKLPEKNKEMLDILVKHLTNVSNHSKQNLMTVANLGVVFGPTLMRPQEETVAAIMDLKFQNIVVEILIENHEKIFRTLPDAVFPEPTSLSTSPPNAPPRQSKRPGQRNKRPMAVYNLCLELEDGNGPNPPKEDTPTSSLDSLSSPSPTTATVHGPPGPDKNHLLTDRESFGEWATTVPSLTRSPMVQWLNLQSPTTPSSNPAAPPSSPKLSAFPLSPPTTTVDKPPESITNRKARAVYPCEAEHSSELSFEIGAVFEDVQTSREPGWLEGTLNGKRGLIPQNYVKLL	403057	275318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_276154_286931_287024_288165_288319_321887_322048_351964_352116_400641_400802_402951
529841	contig_4742_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_130986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTATAAATGAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198836	196739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_196700_198800
529843	contig_10299_pilon	+	2484	19	Intergenic	novelGene_79692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	97.7606045524941	2	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	61	864	320559	336816	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTEREPEGRRVPSGDPGAGAADPGCAAVH	320498	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335222_336733_337087_337216_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338806_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
529844	SIRV6	+	581	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1446	3	60	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
529845	contig_15063_pilon	+	1194	3	Intergenic	novelGene_14345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
529846	contig_21203_pilon	+	1172	7	Intergenic	novelGene_84484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	202.331960456627	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1146	25	1170	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53925	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
529849	contig_14513_pilon	-	1732	3	Intergenic	novelGene_70347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGAACTCTGCTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15782	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12163_14025_14278_15174
529850	contig_1154_pilon	-	1639	5	Intergenic	novelGene_87156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGCGGCCCGCTCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902824	895955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_896144_899975_900251_900806_900989_901775_902543_902597
529852	contig_9807_pilon	+	1846	13	Intergenic	novelGene_32856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	562.188481640178	30	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	110	1399	109130	156656	TRUE	40	CGTGTGGAGCATAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQV	109020	159010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149053_156654_156770_158676
529853	contig_13097_pilon	+	1895	17	Intergenic	novelGene_107719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	582.206363757732	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	158	1108	184791	243874	TRUE	30	TCTGTCTCTTAATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKSGSMAMKMKLKGQKKKMPGYANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPTVSTAPPLIPPPGK	184633	264561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186169_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227048_227110_227161_243873_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
529854	contig_14353_pilon	-	2007	11	Intergenic	novelGene_82094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.859981148771	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	53	1060	104372	80022	FALSE	35	TAATCAAAGTATGGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQPPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLECSPPHPAPPLDSSPAPKPPAVHSR	104424	79074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80097_80514_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
529855	contig_8122_pilon	+	1828	12	Intergenic	novelGene_40239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	824	junction_1	733.018473603925	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	182	1153	720281	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKQDPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGKMRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720099	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
529857	contig_12605_pilon	+	613	3	Intergenic	novelGene_64222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4099	junction_2	2135	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	209	613	5056	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	4847	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_5072_5728_6005_6124
529858	contig_18108_pilon	-	1944	14	Intergenic	novelGene_33503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	314.127400378635	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	95	1732	287542	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTSSRRRKRLSSRWEEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335405	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_335356
529859	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_12214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3772.59616253258	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	223	1458	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27548	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
529860	contig_13787_pilon	-	2117	9	Intergenic	novelGene_40621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	723.143992836143	9	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	306	1022	205032	159290	TRUE	15	TTCTTATACATGTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205337	157982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_158545_158756_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
529861	contig_3975_pilon	-	1788	5	Intergenic	novelGene_54779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	625	junction_1	243.854849244381	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	362	904	2018377	2016415	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKG	2018738	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280
529863	contig_4469_pilon	+	2816	6	Intergenic	novelGene_21946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	300.342071644983	6	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	257	1144	751887	755841	FALSE	15	GAGTCTCCTGCATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIPSAQPPPACLPKAPGLEPGDLPGMDFAHMYQVYKSRRGIKRSDDSKETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELTLKHVKALTNLIDQQQQKILALQSGLQAGELSGRNVDAGQEMFCSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	751630	757513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752204_752461_752570_753495_753620_754984_755281_755631
529864	contig_500_pilon	+	1619	11	Intergenic	novelGene_31056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1202.3700927751	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	384	1346	1492663	1499316	FALSE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK	1486432	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1486669_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498000_1498048_1498078_1498882_1498974_1499277
529865	contig_1532_pilon	-	2085	8	Intergenic	novelGene_37400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_7	1182.69652118559	2	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	143	1336	32217	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	35473	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
529866	contig_9471_pilon	+	1509	10	Intergenic	novelGene_21782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	574.36167467314	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	271	978	410671	416200	TRUE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIGIVGSGGAAAVIKDGRDHIAVLGKTSAANIITLKHLIDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILDT	406947	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407181_410633_410795_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_416192_416273_416936_417028_417152
529868	contig_11071_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_131023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAACCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88512	89206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_88500_89200
529869	contig_14415_pilon	+	1623	5	Intergenic	novelGene_77613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	198.39024043536	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	TRUE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805_38060_38404
529873	contig_5643_pilon	+	1924	15	Intergenic	novelGene_39056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	845.620313311899	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	969	1913	636518	641584	FALSE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631217	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632083_635173_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636259_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
529874	contig_15760_pilon	+	3537	3	Intergenic	novelGene_131061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	399	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	13	393	425012	478123	TRUE	10	CTGCTGAGTTTTCTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQGVMLGRHVFRVRALYRRLLLLHRVLPPDLKSLGDQYVKDEFRRHKTVGSDEAQRFLQEWEEYAAVLWQQAKESRQQNSPEKSHFGTPLPEEKLNDFRDEQIGQLQELMREATKPNRQFNITESTKPKC	424999	482461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_425186_477916_480228_481421
529875	contig_10940_pilon	-	2079	4	Intergenic	novelGene_49228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	123	551	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917122	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
529876	contig_15063_pilon	+	1334	4	Intergenic	novelGene_14252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	20	1192	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34788	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529877	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
529879	SIRV6	+	662	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	514	513	341	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	37	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
529880	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_19567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAATGGAAACAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16399	16724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
529881	contig_3588_pilon	+	2353	18	Intergenic	novelGene_72868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	639.08855406023	445	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	111	416	84577	112819	TRUE	5	CTTATTTGGTGGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETGMLKLG	84466	141456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112799_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122372_125563_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
529883	contig_16310_pilon	+	1458	4	Intergenic	novelGene_70087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_3	1768.95907873026	132	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	160	300	285976	288728	TRUE	20	AAAGCTGCCTCGAGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNAVSVPPCS	285816	290631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_289061_289558_289633_289879
529884	contig_9414_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_131073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	687	1112	306725	306300	NA	30	GGCCAGCTACTACCAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIIDDVKWILAESREYQKDVYLCFIDCAEAFDCVDHNKLWITLQRVGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQGIPRGLKSGKVCVRVVSFHHIYSICILSKQFEKLYYMKRSGASGLEEDSLTVCDMQMTQSCLLKVKRI	307411	306020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_306000_307400
529885	contig_14925_pilon	-	950	4	Intergenic	novelGene_55083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	155	412	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29829	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
529886	contig_15063_pilon	-	1489	4	Intergenic	novelGene_13090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	50	CCAAGAGTGGACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34918_35036_35380_35839_36156_36264
529887	contig_5549_pilon	-	2672	1	Intergenic	novelGene_81667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAAACGTGCAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525843	523171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_523200_525800
529888	contig_15063_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_9741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529890	contig_10982_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_87871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTAGATGGCCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117261	116426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_116400_117300
529891	contig_12624_pilon	-	1458	2	Intergenic	novelGene_61126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTTTACTTTTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955847	947485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948823_955726
529892	contig_15629_pilon	+	3095	11	Intergenic	novelGene_122433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_8	90.7491597757246	108	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	184	1851	89415	107009	FALSE	35	TTTTAAAATATTCATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWVLAILTLLQDSITAHLSKTHWGLENEALIVPCPKNPNSEHPVDWYSKTNRSITTQKKYRVFASKNFLKFLPTKVDDSGIYTCIIRSPTSNWTRSVNLTIYKKQPDCIIPDYLMYSTVTGTPKRSQIFCPTTQYYNWTAPLEWFKNCKPLQGLRYYRSESYLLIDNANSNDAGDYTCKWVHNEKGVSYTVTATRTLRFGEGKAFPVVPVITAPPPNDTKEVEIGKTVNITCLACMGKGLQILASIKWQVNGSSISDLGEARIHQEQVQSQSSRDELTCLKRILRITDVKEEDFSLKYECLALNLRGVTTRAVRLRRKNPIDHQSIYCTVAGFSVLLILTSVLAILLKVFWIDFILLWRDIVRPYKTRNDGKIYDAYVIYSRDYRNQPEGASSVENFVHQILPDVLENKCGYNLCIYGRDLLPGEDVATAVETNIQKSRRHIFILTPHTAHSKEFAYEQEIALHNALLQNKSKVILIEMEAPNEQAGLQLGKFQESLKHLMKVQGTIKWREDRVADKLSLNSKFWKHVRYQMPVPNKLPKKTLNLVSLSAQRR	69473	108253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_69559_89316_89476_89952_90161_91520_91696_91787_91951_93239_93312_95352_95495_95589_95736_102174_102322_103346_103515_106623
529894	contig_11832_pilon	-	2001	14	Intergenic	novelGene_106915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	963.026030849984	45	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	917	1366	86997	84828	TRUE	5	GTGTGTGTGTTTTCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKGCLRGAAFCSYAPQAP	92452	83794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84993_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
529895	contig_6488_pilon	-	2478	8	Intergenic	novelGene_44715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	787.000816844739	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	275	1051	54113	31233	TRUE	20	TGTAACCACAGGTGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFKGMSVSRPNAVVGKCRMIRHSRDRKNEPNPQRFDRIAHTKETMRLDGLNTLTYKVLDTQRYPLYTKITVDIGKPS	91405	28393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_28918_30329_31366_31558_31664_34242_34366_36841_37030_53885_54122_90850_90974_91262
529897	contig_8772_pilon	+	1458	10	Intergenic	novelGene_21082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4623.64837774107	9	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	317	1141	16563	23105	FALSE	5	TCTTGCTGTGTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15211	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15428_15830_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
529898	contig_15063_pilon	+	1437	4	Intergenic	novelGene_13964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	35	ATTCAAACTAACCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529899	contig_14970_pilon	-	1894	10	Intergenic	novelGene_45104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	128.108846467408	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	341	1198	312002	264487	TRUE	10	TCTCGATAGCTGCCTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQAKLMVEFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPPGYCLPNLWEDHCNQGLGVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315778	254888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_255535_264436_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291011_291104_291170_311919_312047_315339_315469_315611
529900	contig_3018_pilon	-	2106	7	Intergenic	novelGene_78890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_6	489.623239508366	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	413	997	600079	577746	FALSE	60	TGAGAAAGAAAGAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSGRLKRSVLN	624997	576636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
529901	contig_10011_pilon	+	2154	17	Intergenic	novelGene_68015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	53.2703892889849	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	343	2037	9017	35455	FALSE	15	GATCATGCTTTTGTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPVLCPWRTTVQSESPWRNLATASVPVGQTYSTQAAEDQKEEPLHSIISSTETVQGSVSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNSSDALEKLRHKLVCEGQTLPEMEIHLQTDADKGTITVQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDALQNQAEAGSKVIGQFGVGFYSAFMVADRVEVFSRSAAPGSPGFQWLSDGSGVFQVAEASGVRPGTKIIIHLKSDCREFAGEARVRDVITKYSNFISFPVYLNGRRMNTLQAIWTVDAKDVSESQHEEFYRYVAQAYDRPRYTLHYRTDAPLNIRSIFYVPETKPSMFDVSRELGSSVALYSRKVLIQTKAADILPKWLRFVRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFVDQSKRDPEKYARFFEDYGLFMREGIVTTTEQEVKEDIAKLLRYESSALPAGQLTSLMDYANRMKAGTRNIYYLCAPSRHLAEHSPYYEAMKQKNMEVLFCYEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDGSPADGRLSEKETEDLMAWMRNALGSRVTNVKVTLRLDTHPAMITVLEMGAARHFLRMQQLAKTHEERAQILQPTLEINPRHALIKKLSQLRAGEPELAQLLVDQIYENAMIVAGLVDDPRPMVGHLNKLLTKALEKH	6595	35572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_6765_7613_7697_8926_9068_12225_12298_16750_16912_18943_19054_19731_19806_20597_20754_22295_22417_23020_23091_26651_26800_28398_28585_29042_29182_29913_30000_31694_31841_35156_35230_35353
529902	contig_5189_pilon	-	1997	8	Intergenic	novelGene_34858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1087.14629246688	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	53	874	230433	199237	FALSE	35	TTAAAACTGAATTACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPPLNTPENREYTAEIMFDLAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	230485	198113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228234_230425
529903	contig_7179_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_78095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTAACTCTCTAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601979	603576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_602000_603600
529904	contig_7119_pilon	-	2123	2	Intergenic	novelGene_40867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCAGTGGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63748	56765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_57730_62589
529905	contig_12464_pilon	+	2932	5	Intergenic	novelGene_68642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2506	2814	96842	98480	TRUE	25	CTAGTGAGTTGTAAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPTPHLPHVSGGFFLYVRVTLPNNAGTFRVSCRVMVESEADQLPGLLQGLREKSPGGARCQGQPVVQSTSRTKQMTPGWLARNVVRWKPQILHGTTHLSR	93013	101840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_94386_95479_95559_95787_96911_98240_98519_101760
529908	contig_13740_pilon	-	1413	9	Intergenic	novelGene_34689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3312.57295910218	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	165	632	165243	160666	TRUE	40	GGAAATTGTGTAATTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165407	156804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_165237
529910	contig_19851_pilon	+	972	7	Intergenic	novelGene_29853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3181.21203317226	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	169	618	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53468	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006_56052_56117
529911	contig_9243_pilon	-	1660	8	Intergenic	novelGene_60318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	222.091909637723	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	51	767	64589	20056	FALSE	30	TTACCAGTGAGTCATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSPEERWRIWRISCLMRRSAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64639	19162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_64578
529912	contig_11386_pilon	+	1868	8	Intergenic	novelGene_82748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	445.829380744129	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	798	1559	17940	24897	FALSE	5	CTTTCACTGTTGCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	7854	25206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11339_11462_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_24791
529913	contig_9014_pilon	-	1759	13	Intergenic	novelGene_106752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_4	53.8115926172047	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	581	1501	82349	78380	FALSE	5	TGTTTGTTTTTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83402	78121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_83146_83319
529915	contig_10134_pilon	-	2076	4	Intergenic	novelGene_16212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	790.073976845769	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39729	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35108_38620_38817_39584
529916	contig_3095_pilon	-	1131	6	Intergenic	novelGene_75247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	37	792	255439	246716	FALSE	20	TTATCTGTACTCTGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255475	246376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
529917	contig_1090_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_131129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGGGCAATAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441344	441042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_441000_441300
529918	contig_12977_pilon	+	1685	15	Intergenic	novelGene_122776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	668.597698659711	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	636	1292	48712	57283	TRUE	5	TATTTCTCCTTGGCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10666	58794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48647_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
529919	contig_17796_pilon	+	1773	12	Intergenic	novelGene_33768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_4	210.864180171358	34	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	382	1704	12080	42369	FALSE	35	TATGTGCTTATTATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8157	42438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
529921	contig_14176_pilon	-	2514	16	Intergenic	novelGene_74830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	151.256015491028	509	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	282	2093	230248	223438	FALSE	10	ACCACGTCGTTGTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGLELGDGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSLMEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRDKSKKKKKVKVKTEKKSTPSRGSSSKSSSRQLSESFKSKEFVSSDESSSGENKGKKKRRRSEDSEEEELASTPPSSEDSASGSDE	231899	223016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_223762_223950_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_229930_230220_230314_231182_231305_231805
529922	SIRV6	-	480	5	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8613	-151	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTAGCAACTGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11160	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2621_2739_2828_3105_3164_10723_10818_11031
529924	contig_5981_pilon	+	1784	9	Intergenic	novelGene_35482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	291.264806490589	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	93	1172	23508	37804	FALSE	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23415	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30094_34657_34728_35629_35758_37612
529925	contig_15063_pilon	-	1321	4	Intergenic	novelGene_14248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	20	GAAGGTCTCGAATTTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
529926	contig_9696_pilon	-	2732	17	Intergenic	novelGene_68839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCGAACCTTCCGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626986	577969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_578171_583864_584001_593184_593295_596921_597016_597960_598044_602197_602303_603099_603167_603245_603304_606702_606856_607977_608127_608413_608511_609022_609116_613857_613932_614133_614242_618817_618989_624290_624388_626050
529927	contig_3747_pilon	+	1662	3	Intergenic	novelGene_24761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4993	8	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	333	647	201313	204183	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYERYYRLW	200980	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202176_204161
529928	contig_15063_pilon	+	1690	7	Intergenic	novelGene_10162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2981.86036262972	2	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	238	741	34808	35888	TRUE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	27131	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35844_36158_36266_36600_38975_39092_39516
529929	contig_12873_pilon	+	1306	5	Intergenic	novelGene_27223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_1	767.731235524516	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	315	806	17896	19855	FALSE	25	TATATGTTTCTCTACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16867	20355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
529930	contig_10354_pilon	+	2467	5	Intergenic	novelGene_50837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	547.309498821279	26	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	178	531	432370	454358	TRUE	25	ATTTAGGATTGTTATGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKAGQGIRKTEEESTPLNCGVGEEY	432192	457326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_454287_454818_455849
529931	contig_6027_pilon	-	1358	2	Intergenic	novelGene_74435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	55	378	263442	263119	TRUE	5	CTCTGTCTGTTCTCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	263496	262062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262790_262865
529933	contig_1331_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_37804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	7	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	65	541	169924	160009	TRUE	15	GAGGCATTGTTCTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169988	158946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159830_159905_160214_160867_160949_166406_166534_169860
529934	contig_16303_pilon	-	1924	8	Intergenic	novelGene_34090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	93	1184	45428	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45520	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33350_35233_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
529935	contig_9609_pilon	-	2154	7	Intergenic	novelGene_23125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.379320764678	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	819	1328	523112	521979	TRUE	25	TACCTCTATTGAGTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLL	523930	520725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521978_522081_522171_522309_522696_522806_522950
529936	contig_9014_pilon	-	2477	8	Intergenic	novelGene_106722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_7	78.5701298593966	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	7	708	46682	43800	TRUE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	46688	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43397_43480_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504
529937	contig_7963_pilon	+	2206	11	Intergenic	novelGene_58589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	185.542474921512	3	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1040	1981	265492	269915	FALSE	30	TTTAAAATGTTTTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	259820	270140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
529938	contig_20641_pilon	+	1567	9	Intergenic	novelGene_52833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1436.51381389112	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	137	1294	14767	56882	FALSE	80	ATATTAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14540	57155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14587_14676_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379_56539_56604
529939	contig_10011_pilon	-	1800	5	Intergenic	novelGene_68047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_4	181.05454979094	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	139	819	194838	188024	FALSE	20	GGAGGTTGTTGGGGGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTNNTAINFYENRDFKQHHYLPYYYSIRGVLKDGFTYVLYINGGHPPWTILYPLPRGRRAVAPPRRGGGALSDGAGRPVGALVSFR	212638	187042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_212506
529940	contig_5018_pilon	+	1701	10	Intergenic	novelGene_47102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1197	1625	1401408	1402786	FALSE	10	ACCGACGCCGTCGGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLRKQLHITAPTVNVLLVLHSKLHHQRLVLVAEGLESRRQGVEAGVLARLQPFIFLLVTIELARTQNEFAKIRLVFGFDPAVGPPISVQKLLLEVHDGLSGGQAEKAEQQRHG	1399131	1402862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399697_1399797_1399842_1399928_1400009_1400626_1400763_1400850_1400972_1401057_1401245_1401344_1401445_1401872_1402077_1402259_1402363_1402701
529941	contig_14513_pilon	-	1097	2	Intergenic	novelGene_70328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18958	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
529943	contig_12622_pilon	-	1398	10	Intergenic	novelGene_5922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2350.5772340711	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1284	114	1397	1590194	1583549	FALSE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAGWLLCRPPTSSTHLCGLPRRPANKSYRLAAGRAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPGPLLPPSFFVGIFLINLDSLTF	1590938	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583614_1586791_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590200_1590830
529945	contig_10940_pilon	+	862	2	Intergenic	novelGene_49203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCACAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466646	469021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_467056_468568
529946	contig_14871_pilon	-	1828	5	Intergenic	novelGene_63725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_4	359.50799712941	1303	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	353	835	299879	288466	FALSE	30	GATTTTGCACTCAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKKLPPGGIPGIDLSDPKQLAEFARMKPRKIKEDDAPRTIACPHKGCTKMFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	300357	287472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_289618_291318_291380_299799_299963_300088
529947	contig_12837_pilon	+	2111	8	Intergenic	novelGene_57310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_3	2626.59109408187	3	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	353	685	154005	166049	FALSE	20	GATTTTGTTTGACAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128786	167475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153964_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
529948	contig_6735_pilon	-	1256	7	Intergenic	novelGene_15699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	802.518483691601	75	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	81	776	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568278	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_554324_554374_564157_564232_564784_564869_568198
529949	contig_11720_pilon	+	2149	13	Intergenic	novelGene_43942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	451.829452522372	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	749	1483	266216	270732	TRUE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEQGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLVSRASLPPRC	262258	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270546_270803_271268_271343_271806_271961_272096
529950	contig_9482_pilon	-	1694	11	Intergenic	novelGene_44306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	143.515992140249	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	57	1466	1253164	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLILIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253220	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241095_1242480_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
529951	contig_3095_pilon	+	1104	5	Intergenic	novelGene_75095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	38	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	56	688	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147185	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149835_150484_150696_150996_151163_151848
529952	contig_854_pilon	+	2034	8	Intergenic	novelGene_36117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_4	181.575531031546	1134	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	352	1161	286655	306557	FALSE	5	TCTTCTTGGTCAGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDIFIAIKTTRAFHHSRLELLLDTWVSRTREQTFVFTDSSDEGLQERLGRHLVVTNCSAEHSHPALSCKMAAEFDAFLASGLRWFCHVDDDNYVNPRALLQLLATFAPARDVYVGRPSLNRPIHASEPQPRNHTRLVQFWFATGGAGFCINRKLALKMVPWASGPRFVDTSTLIRLPDDCTVGYIIECKLGGRLQPSPLFHSHLETLQLLGAAQLPEQVTLSYGVFEGKLNVIKLQGPFSPEEDPSRFRSLHCLLFPDTPWCPQLVAR	286303	307430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_286754_295356_295406_295734_295838_296314_296469_299517_299604_302162_302329_304379_304466_306490
529953	contig_15063_pilon	+	1401	4	Intergenic	novelGene_14169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	138	1310	34808	36661	FALSE	25	GTGAGAAGTTGTATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34670	36752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
529954	contig_14970_pilon	+	2321	10	Intergenic	novelGene_44991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	6046.03576479132	1	111	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	122	937	136145	224337	TRUE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPAWL	136023	232854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224326_224375_231345_232625_232786
529955	SIRV6	+	684	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1386	400	1	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	96	305	2569	10736	TRUE	25	AGAGACCTATTCGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2473	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
529956	contig_7045_pilon	+	2403	7	Intergenic	novelGene_77449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	318.200888678136	251	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAGCTTGTATTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323236	365722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_333548_333641_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111
529958	contig_10019_pilon	-	2003	3	Intergenic	novelGene_86687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	1.5	648	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	188	403	261562	261071	TRUE	15	CTGAATTTGGTCTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRTAGSEPGRCEWQAQSPFPGARGAADCAGGRIRSSFRRGHHGSVDRLFQVLELRWVGESEMEVGAEAVVGEDGLRERRGLSEAGRQEQNRDVQPQSGSNMIPKHSYWLDVWLFILFDLVVFFFVYFMPCWV	261749	258358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_260964_261081_261356
529960	contig_5189_pilon	-	1738	10	Intergenic	novelGene_34871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	967.412445395537	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	111	1043	244235	199237	FALSE	10	TATTGCAGTTCCGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQVSKFQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220328_230376_230485_235736_235848_244163_244289_247694
529962	contig_15108_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_131181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	504	803	98138	97839	NA	20	AGTACAGTGACTCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPHCSHDGDSPEGFSFHRQGACLGKLRHGNAASSSGLSLRGVLIRQLQSVPGQTRLELCLGWIHRGKTRPLVLTRDSGNSVASSFFSSHSTYPGNPA	98641	97417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_97400_98600
529963	contig_13608_pilon	-	2413	16	Intergenic	novelGene_52373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	126.468898240722	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	100	1836	470234	369353	FALSE	40	CATAACAGCAAAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470333	368775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_466411_466478_470191
529964	contig_19342_pilon	+	1518	7	Intergenic	novelGene_41076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.91070819942883	5	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	514	921	5070	6183	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3237	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4262_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
529965	contig_6823_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_131253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATTTTTTTTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458907	459823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_458900_459800
529966	contig_2069_pilon	-	1327	6	Intergenic	novelGene_23425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	899.078995416977	8289	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	167	487	1331269	1327936	FALSE	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRKAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAVSVFDIFFFILAFSQKKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1331435	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329517_1329827_1329892_1330155_1330201_1331254
529967	contig_14326_pilon	-	3017	6	Intergenic	novelGene_120716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	37.5265239530655	5	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	241	1185	447468	443443	TRUE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQSEARRGPELRAAAKWLQFPQLALRRRLGQLSCMSRPALKLRSWPLTVLYYLLPFGALRPLSRVGWRPVSRVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPGALSPAGAWRGPAEVGRGGKAGKAVGNKGQSLLRTKLLGPLLGVQVQTAHSFEQVLTIAGWTGAHLRACPKLALVSVPSHLLPLLQEPAGHQGRERALPLCHLPGPRRLPLLPLPH	451604	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443932_444094_444332_445734_445901_447415_447627_451522
529968	contig_9955_pilon	-	1405	4	Intergenic	novelGene_21289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_1	518.409747850739	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	262	1050	49317	45240	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49891	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47737_48794_49380_49692
529970	SIRV6	+	1030	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	0	167	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
529972	contig_615_pilon	+	2226	4	Intergenic	novelGene_80038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	136.933885101128	255	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGAACTAAAAGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8774	27182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_8965_10614_10900_22345_22407_25492
529973	contig_9955_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_21317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_2	524	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	211	903	49296	47546	FALSE	60	TTGAAGAAATAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49819	46296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794_49380_49692
529975	contig_3307_pilon	+	2155	3	Intergenic	novelGene_86896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_2	86.5	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	899	1213	176296	198323	FALSE	35	CTAGTTCAACTTATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSSYTGIQIPPGAHAPANTPAEVPHSTGVTSNTIQPTPQTIPAIDPALFNIVSQGDIRLTPEDFARAQKYCKYAGSALQYEDVSTAVQNLQKALKLLTTGRE	175397	199265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_176384_186331_186413_198177
529976	contig_15063_pilon	+	1091	4	Intergenic	novelGene_13524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	202	1044	34808	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKDVVTSRYVCVHVCIQTNHVCG	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36691
529977	contig_3077_pilon	+	1384	7	Intergenic	novelGene_26711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3412.4886324597	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	500	886	16199	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10105	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11477_12013_12071_13019_13160_16195_16328_16936_17054_17449
529979	contig_14322_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_115967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
529980	contig_12837_pilon	+	1348	7	Intergenic	novelGene_57322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3248	junction_2	1928.19212966159	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	90	533	129778	166049	FALSE	25	ACCAATGAGTTAGCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	129688	166864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
529981	contig_6589_pilon	-	2037	3	Intergenic	novelGene_26292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	718	948	2273395	2273165	FALSE	40	AAATTGTGAATGTGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYSLHGGGKGRRRRPRLKKDGWSGQRRNPHKVADGDGLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290255	2272075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274002_2274761_2274793_2290175
529982	contig_10126_pilon	+	886	2	Intergenic	novelGene_105770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTGGGTGTTACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185767	186779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_185817_185942
529983	contig_10159_pilon	+	2720	9	Intergenic	novelGene_30881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	129.946563536709	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	516	1493	978504	996587	FALSE	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKKKTPGFLTLYEVWLVSRFLLMFYLVPVYSLIAQSLC	975076	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994648_996472
529984	contig_8558_pilon	+	3101	18	Intergenic	novelGene_123153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_9	285.370189979121	525	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	124	2151	390433	612149	FALSE	35	ACCATTAAATTGTTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTGYLNIFGESQPNPKTVELLSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCTPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKRVFGQTTIHQQIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTAIDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTLAGNRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGTLPFNLAEAQRQKTSGDTARPILLQVAESAYRFGLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASLANEDGQISPGSLLLAGAVAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRITLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSASTSTAISGGP	390309	613099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_390448_426563_426618_435133_435277_481552_481669_507338_507479_527471_527619_529415_529555_530297_530392_530592_530678_544235_544321_544814_544974_558872_558926_560307_560389_582513_582655_598745_598885_611350_611510_611603_611695_611962
529986	contig_15087_pilon	+	2396	4	Intergenic	novelGene_37279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1217.16647268244	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	29	601	284653	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVSLGWVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTVTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284624	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289466_301261_301425_301792
529987	contig_7157_pilon	+	862	8	Intergenic	novelGene_131315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCCGCTTCCTTCTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997263	1019979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_997363_999519_999648_1003372_1003445_1004295_1004391_1004588_1004794_1010535_1010643_1011511_1011620_1019931
529989	contig_5472_pilon	-	2731	10	Intergenic	novelGene_130034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	63.6770400701757	157	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	209	2521	449707	402325	FALSE	20	CCCTGAGCTTTAGGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINLTIDIYIYLLSNARSLCGKQRSKQLHFLCSPKYYWRVSHISPQRGFHTSKVRCKWTKSEARSCSKHCCWPSNHGLHSGILKLSTSAPKGLTKVSIRISRIKSTLHSISKAVFGSQNEMISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKVAAVSTVVNKGVTPKAFVFRNYGHFPGINSHYLGGCQYKLWQAIRASSAAPGYFAEYALGNDLHHDGGLLLNNPSALAMHECKCLWPDVPLQCIVSLGTGRYESDVRNTVMHTSLKTKLSHVINSATDTEEVHIMLDGLLPPNTYFRFNPVMCENIPLDESRNEKLDQLQLEGLKYIERNEEKMKKAAKILSQEKTTLQKINDWIKLKSDMYEGLPFFSKL	456335	402114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_421983_422179_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449801_456220
529990	contig_10581_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_41433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730201	729648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_729600_730200
529991	contig_15063_pilon	+	1468	5	Intergenic	novelGene_9500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	375.855025242446	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	593	1075	35271	36333	FALSE	35	TGCATTCAAACTAACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27129	36726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34928_35037_35384_35852_36158_36268
529992	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCATTTGTACCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27935	27668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
529993	contig_15063_pilon	-	1468	4	Intergenic	novelGene_14155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	801	1124	35891	35108	TRUE	40	ACAGGAGATGAGGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36153_36264
529994	contig_10986_pilon	-	2294	13	Intergenic	novelGene_71477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	217.726303086135	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	102	479	80340	74330	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQACLLLATT	80441	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71317_71376_71629_72178_72321_72913_73007_73924_74006_74224_74358_74989_75049_75476_75544_76171_76245_80189
529995	contig_15185_pilon	-	1561	8	Intergenic	novelGene_99442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_3	304.914842578202	154	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	102	947	472420	430069	FALSE	5	CATCTGTGTGCTGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILESYPRKTVPSSFHTVGGSTLRASPSWPGLTTMSRLRTWLTTTRSTSCSSRVQAATPETRLWRTDSSSTR	472521	429454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430489_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
529996	contig_9345_pilon	-	2489	22	Intergenic	novelGene_24542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_19	176.935798085043	1	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	722	2389	727643	723552	FALSE	10	CCTGGAGTCTGTGTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730161	723451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_729088_729165_729316_729427_729770
529997	contig_15304_pilon	-	1058	3	Intergenic	novelGene_30558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	201	1025	54100	52925	FALSE	25	TCCACCAGAAGCAGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54300	52891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
529998	contig_4754_pilon	+	2278	15	Intergenic	novelGene_35943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_14	113.994472655118	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	76	1845	380119	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380043	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
529999	contig_2444_pilon	-	3151	3	Intergenic	novelGene_83743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.5	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	42	1493	52642	49496	TRUE	60	GTAGGAAAAAAAATATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRISAFRLLGCIRYSRISLPQESGPRHYGSCPLGAHDEVRDGRAYFTTPIFYVNAAPHIGHLYSALLADALCRHRRLRVPVAAATRFSTGTDEHGLKIQQAAATAGLAPAELCDRVSAQFQQLFREAGIASTDFIRTTEARHRLAVQHFWEVLKARGLLYKGLYEGWYCASDECFLPEAKITWQQGPSGDACPVSLESGHPVSWTKEENYIFRLSHFREPLRQWLRDDPQAVIPQPFYHAVLQWLEEELPDLSVSRKSSHLHWGIPVPGDDSQTIYVWLDALVNYLTVIGYPDAEFKSWWPVTSHIIGKDILKFHAIYWPALLLGAGMSLPHRIYVHSHWTVCGQKMSKSLGNVVDPRTCLERYTVDGFRYFLLRQGVPNWDCDYYDEKVVKLLDSELADALGGLLNRCTAKRINPSGTYPAFCTACFPSKSGLVGPLVRAQAEDYALKVMVKGGNDQCSRDLKLDLVISPRLHKRTSQRRC	52683	46017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_47675_49494_49601_51295
530000	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	30	TTCTTTAACTTTAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530003	contig_3077_pilon	+	2752	10	Intergenic	novelGene_26867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	68.6666666666667	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	105	1187	1337784	1346705	FALSE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336608	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
530004	contig_10109_pilon	+	2696	1	Intergenic	novelGene_131321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTAGTTCCTTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88350	91046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_88400_91000
530005	contig_7457_pilon	-	2049	3	Intergenic	novelGene_31612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.5	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	138	857	962606	956608	FALSE	10	TAGCTGTGTGCAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKRWVSSTGASSTPWAMGAGC	962743	955415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956669_960239_960896_962603
530006	contig_9609_pilon	-	2542	5	Intergenic	novelGene_23028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTAATGCATTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325179	321000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321038_321844_322351_322601_322762_323260_324327_324406
530007	contig_5145_pilon	-	2138	13	Intergenic	novelGene_131437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.487002152833	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	700	1374	925621	916397	TRUE	5	GATTCCGTCCTGCCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947092	915556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915885_915960_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
530008	contig_9014_pilon	-	2183	8	Intergenic	novelGene_106709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	87.142622950505	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	314	1621	44733	41867	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPFQGCLIFPRVLLLPLLYFCVAPSLKHSIPTKLIWERAKKPFWTHRDKSPSSYPQSLPQVALAQSSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHGDSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	46535	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43348_43476_43559_44086_44240_44420_45016_46504
530010	contig_14513_pilon	-	1194	2	Intergenic	novelGene_70277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
530012	contig_3382_pilon	+	2395	10	Intergenic	novelGene_124049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGAGGAACCTCGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217575	344779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_218778_224726_225047_229629_229762_231318_231470_234091_234178_254698_254817_272862_272957_306322_306379_309847_309939_344634
530013	contig_9389_pilon	+	2322	4	Intergenic	novelGene_84102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	104.550891382565	892	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390440	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1398390_1398531_1408698_1408915_1423431
530014	contig_1244_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_37915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1096	1437	265804	265463	NA	60	AAAAAAAAACCCAGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLYLNIKKAKILTTGPISNIMINGEKAEVVKDFILLGFTINAYGSSGQEIKQNTALGKSVAKDPSKVLKSKDVTLRTKTRLTQPTEFSIASYACKSWTINKED	266899	264587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_264600_266900
530015	contig_8452_pilon	+	1784	3	Intergenic	novelGene_48036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	557.5	41	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	72	1157	432928	434013	TRUE	5	TATGCTTGGTTTTCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423958	434984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_434284_434627
530016	contig_10134_pilon	-	2174	5	Intergenic	novelGene_16244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	719.424075215724	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGTTTAAGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39625	32191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38817_39063_39155_39594
530017	contig_1244_pilon	-	1722	12	Intergenic	novelGene_37992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	960.922138038198	2	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	706	1296	927144	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANTCCQRSGTVQGKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947638	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924657_927103_927227_928758_928894_931617_931681_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578
530021	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	9	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530023	contig_4103_pilon	-	2691	18	Intergenic	novelGene_51919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	487.112649768012	16	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	536	1270	85413	80996	TRUE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91911	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85631_85815_86833_86889_87789_87883_91263_91331_91838
530024	contig_6230_pilon	-	2490	13	Intergenic	novelGene_102092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_5	49.9418411755113	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1151	1714	136521	118618	FALSE	20	GTAAAGTTTCCTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVSNLTRSMSLVLDEFYSSLRVVGVSAVLGTGLDELFVQVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATDSLSPVLDPSDLILTRGTLDEEDEEVDSDTDDIDHRVTEESHEEPAFQNFMQESMAQYWKRSNK	157545	117841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128222_132861_132953_133621_133662_134932_135016_135714_135862_136512_137240_137622_137702_147637_147676_148371_148439_149453_149494_156635_156730_157431
530025	contig_13542_pilon	+	1730	10	Intergenic	novelGene_131495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	1057.34343323372	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	228	1010	417080	505589	FALSE	80	AAAAAACAACCAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346560	506309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_357755_357870_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
530026	contig_7816_pilon	+	1707	12	Intergenic	novelGene_66482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1193.60662567678	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	932	1600	207600	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170070	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170262_181907_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195835_207567_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
530027	contig_3463_pilon	-	2408	12	Intergenic	novelGene_61989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	182.235657078256	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	97	1308	597436	508757	FALSE	70	TGAAAAATAAAGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQNGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597532	507656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_542246_542314_551883_552007_597388
530028	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_12703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2382.00592988347	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	2	1417	28164	36661	FALSE	50	TAAAAATATCAGTTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
530029	contig_1596_pilon	+	3208	1	Intergenic	novelGene_131591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2129	2488	103131	103490	NA	75	AGGGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLCLAYFGHVIRRDQSLEEDIMLGKIEGQRKRGRPSMKWVDTVAAAMGLGIRTIVRMVQEHAVFCFVVHRVAMSWNRLDGTWQQHRIIVEFWSLANRIHKEKKRGGSHQENNARKFL	101002	104210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_101000_104200
530031	contig_20314_pilon	+	870	7	Intergenic	novelGene_125631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	26	802	1482	24277	FALSE	5	GCCCCAGTGCCCTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1456	24345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
530033	contig_513_pilon	-	2006	9	Intergenic	novelGene_80169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_8	424.902029149073	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	146	1321	453421	449687	FALSE	35	CCATGAAGCTGCAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454748	449001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454624
530035	contig_5549_pilon	-	823	5	Intergenic	novelGene_81594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	80	556	96842	91727	TRUE	35	CCCAAGAAGCAGACCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLQENMIGSWHPLAHCAKRAAPAPTSQRHSRLGSVAEVLLARWELFGENSFREKLFSFLFRDGWKDHHTVSILPINRGGNPLFCCQLERDNYSENLIKVPSSGSWIEDRQLQFLIRTKNKHHTSRHRHALFILLRWVQHAQEDGKVSILIIDDGKR	96921	82178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_82250_86661_86817_91685_91834_93263_93410_96618
530037	contig_12790_pilon	+	2151	10	Intergenic	novelGene_35211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.930365880229	3	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	305	1285	307252	312473	FALSE	15	TTATAAGGGGTGTGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARHSIAEVGRAPERCRAESSRSRAKPRPALPRGSATQASSAFSTSHTDRTPRARTAVPAAPAPSGAGEVSPPSPLGEPATAQGLLNRFQTGALCLLFTANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305930	313339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306174_307190_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
530041	contig_8801_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_66286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTATAACATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453016	455381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_453000_455400
530042	contig_12057_pilon	+	2415	20	Intergenic	novelGene_131625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	38.1344029320063	62	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	130	2001	121149	161653	FALSE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99434	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
530044	contig_14925_pilon	+	1001	5	Intergenic	novelGene_55093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1024	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATTTCCCACAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25789	42967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_42916
530045	contig_16121_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_6887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTAAGACAGAAACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60770	62084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_60800_62100
530046	contig_13437_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_131645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	654	1154	79149	78649	NA	25	CACTCACCATAATGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILEHLIVLMRNLYTNQESVPIRTEQEDTAWFKIRKGMCQGYILSPYLFNLYTEQIIREAGLYEEKYAIRIGGRLINNLRYADNTTFPAESEEDMKHLLMKIKDHSLQFGLHLNIKQTKILTTGPISNTMINGDKTEVVKDFILLGSRISTWKQQSRNQKMHCIG	79802	77619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13437_pilon_-_77600_79800
530047	contig_13457_pilon	+	1803	13	Intergenic	novelGene_118342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	76.7790390232473	5	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	167	910	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59244	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69134_69210_69321_69439_70250_70416_70761_70893_70952_71059_71202
530049	contig_9471_pilon	+	1871	12	Intergenic	novelGene_21777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_4	709.081643296105	249	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	123	1106	410634	414785	TRUE	40	TATCAAATTTATATGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSRRTYCPDWDEKDWDCGKWRSSSSYKRRKRSHSSARENKRCKYNHSKTSDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYNQGCEPGHRHRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHHRSHGKSHRRKRPRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	406921	417513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
530050	scaffold_880_pilon	-	2748	20	Intergenic	novelGene_121432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAAACAGTGGAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492757	408722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_408780_420187_420364_424872_424946_433473_433596_437560_437774_439123_439212_441361_441427_443430_443581_447598_447680_450969_451131_453829_453965_455113_455210_456015_456178_479494_479614_482288_482360_484796_484938_485540_485641_488539_488633_490474_490712_492349
530051	contig_6361_pilon	-	2172	13	Intergenic	novelGene_23886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_6	82.131500250107	140	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	107	1687	109608	90660	FALSE	25	TCTGTAAGCCTTCACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVVRRPLKIPAF	119091	90174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529_109610_118986
530054	SIRV4	+	400	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	34	-882	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTTTATAGGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
530055	contig_15449_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_33593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGAGTAGTTCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32357	33202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_32400_33200
530056	contig_15063_pilon	+	1346	4	Intergenic	novelGene_14243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	33	1205	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34775	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530057	contig_12790_pilon	+	1712	11	Intergenic	novelGene_35209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	286.274501134837	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	115	999	307252	312627	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGVGMGSPSLG	305928	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_305945_306045_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312598
530058	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_18672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
530059	contig_20199_pilon	-	524	3	Intergenic	novelGene_82594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1345	362	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCAAAGAGTGGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42173	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41065_41198_41250_42110
530060	contig_3410_pilon	-	2070	6	Intergenic	novelGene_58919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.272087415293	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	126	926	57649	14837	FALSE	15	TTACACGTTGAGCCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTRTQDSHPASKDRASACMLRLRDSPSEQTGWGWPSSRWFCVGRGRQPLQRIQVPHLTQDP	57774	13692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15016_30902_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
530062	contig_9345_pilon	-	2058	7	Intergenic	novelGene_24361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	571.518639727136	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	308	1063	164438	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPIVAATVVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	175845	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_164409_164528_173643_173789_175772
530064	contig_12638_pilon	-	1781	17	Intergenic	novelGene_33118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAATTATATGAACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199733	170898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_171970_172044_173507_173560_178085_178281_180794_180859_180952_180989_183497_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191355_191725_191804_195518_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
530065	contig_14711_pilon	+	2538	15	Intergenic	novelGene_68893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	368.686589151827	1874	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	370	2295	83997	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70416	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82049_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
530066	contig_15063_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_8701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	248	1420	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27121	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530067	contig_610_pilon	-	1436	4	Intergenic	novelGene_76739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1496.06572939382	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	93	482	252557	220706	TRUE	25	TTGTCAAAGTGGATTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLPETIM	252649	213496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220723_235010_235302_252475
530068	contig_18272_pilon	+	2267	4	Intergenic	novelGene_7085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539169	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539413_539520_540494_540548_541430_541670
530069	contig_10452_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_131646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	561	1064	3437	3940	NA	70	GAAAAAAAAAAATAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRTGSFGFGDSPGGGGNFGPGSGSNFRGGSDGYGSARGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYDPGGSGGSGGYGGRSRY	2876	4463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10452_pilon_+_2900_4500
530070	contig_12964_pilon	-	4625	1	Intergenic	novelGene_131710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	892	1197	569791	569486	NA	45	ATTAGCCCCAGAATATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFKYRAVFTVSSKFHLRGSCLNMCSYLFLVIAARWVSGSFINKHELLSSELLHCYRVTLSIDRPSEWQYNFKIPELSCLRVFQLFLLGAVESIPTHSSPM	570682	566057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_566100_570700
530071	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	13	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530072	contig_10904_pilon	+	2351	6	Intergenic	novelGene_22528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	417	740	350991	351314	TRUE	35	ACACTTACATACCCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEDTRGIHIEKASHVICRPRQAPVFLQCPENSAEDNKHQLLPLPCLTHNCSSHKKGISTIMISEETRLTNHLMKANRMKGRGQKEEFTSKGIICITIKCDFDKYI	350574	362556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_352142_352532_352697_353957_354254_354559_354695_354963_355001_362404
530073	contig_11572_pilon	-	3065	1	Intergenic	novelGene_100044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211799	208734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_208700_211800
530074	contig_17427_pilon	-	1945	8	Intergenic	novelGene_30300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTCTCAACCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176864	151372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_151414_152119_152248_152572_152598_155683_155794_171333_171428_172209_172304_173590_173647_175467
530077	contig_10923_pilon	+	1494	9	Intergenic	novelGene_66181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	639.893545833993	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	51	1391	21667	42718	FALSE	35	GAGCAAACTGCAACACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPYAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29463_32888_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
530078	contig_17311_pilon	-	1628	5	Intergenic	novelGene_57840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7709.72717983587	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	37	483	126865	121474	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126901	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_119617_121148_121642_123344_123555_123642_123709_126862
530081	contig_17274_pilon	+	2260	16	Intergenic	novelGene_26505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	156.970004211704	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	147	1709	87831	124532	FALSE	25	TTTGATGTGTTGGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRSSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNALFWAGLPIHCCSEC	87684	125083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349_124432_124479
530082	contig_2100_pilon	-	1314	8	Intergenic	novelGene_50698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	859.600524211386	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	141	965	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGKTLELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185551	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1180183_1180286_1182727_1182822_1185420
530083	contig_7202_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_18207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27915	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
530085	contig_8978_pilon	+	2012	11	Intergenic	novelGene_49397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	349.042132127341	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	74	751	339807	343826	TRUE	10	GCCTTTTAATTTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRHSLRWRSNSRTKWTATLRKLGRSWRWRWRLLAMSTRSC	331589	348132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342577_343708_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113_347474_347578
530087	contig_17075_pilon	-	2807	3	Intergenic	novelGene_131755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_2	1678	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTGTTTAAAAAACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91174	88006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_90723_90984_91038_91136
530091	contig_14441_pilon	+	1237	4	Intergenic	novelGene_100395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.83725334431	11	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	426	827	125667	126326	FALSE	5	TGCAGCCTGGCCGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGKGDGGWGDYWREG	47341	126736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47557_122126_122188_125517_125902_126159
530092	contig_6102_pilon	-	1558	10	Intergenic	novelGene_32123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	350.41936075945	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	21	1148	822105	817425	TRUE	10	TCAGATCTGTCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPGHG	822125	816605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817436_818212_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
530093	contig_6102_pilon	+	2084	11	Intergenic	novelGene_32274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	48.4195208567784	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	50	1189	1444370	1448190	TRUE	20	AGTATCTGTTACTGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQVGSCPLEGGGGFGPGRLGPGTLLTEVGAGGEKESGGGG	1444320	1449384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
530094	contig_15063_pilon	+	1330	5	Intergenic	novelGene_14062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	192	1250	34808	36603	FALSE	15	TCGGCCCCATGTGGTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIW	34616	36683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36542_36597
530095	contig_5698_pilon	+	2175	7	Intergenic	novelGene_55011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	836.726491885026	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACCAATACAAATATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4135_7821_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
530096	contig_10734_pilon	+	1843	8	Intergenic	novelGene_51176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	307.423725399936	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	518	1030	1139110	1142903	FALSE	10	GTCCTTCGTATGCACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123671	1143716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131229_1139055_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
530097	contig_15063_pilon	+	1387	5	Intergenic	novelGene_14070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3429.81277732473	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	191	1219	34808	36632	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34617	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
530098	contig_2257_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_122506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTGAAGGATGAGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319007	318413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_318400_319000
530101	contig_6227_pilon	-	1743	16	Intergenic	novelGene_49772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	314.993728332627	1	33	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	146	1456	1222052	1202920	FALSE	40	ATGCCACAAAAGAGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCHGRTHPRSAVPEAAAVAPRAWLRAQPHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224990	1202632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222110_1224902
530102	contig_7816_pilon	+	1794	14	Intergenic	novelGene_66498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	931.988400516994	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	89	1204	170169	207920	TRUE	40	GAGAAAAATGAATTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKRSTRTASSSATLPSRTWLALPWAVPHATGRCPSAALLQPFSRGPLTTFAWRPSPRATSTSVVLTAACPLGKTGPLRWPWRIWPCSGQSPHQLSFTQVMEFLQRKQWN	170080	211757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195797_196856_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
530104	contig_8263_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_83102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151104	148789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_148800_151100
530105	contig_15063_pilon	-	1520	4	Intergenic	novelGene_13085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	45	AGAGTGGACACAAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	34602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36256
530106	contig_11171_pilon	+	2166	3	Intergenic	novelGene_48582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	140.5	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104187	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_104253_105710_105975_106026
530107	contig_11253_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_126829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGGCACCATTTAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152803	153903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_152800_153900
530108	contig_10904_pilon	-	1600	4	Intergenic	novelGene_22651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	535193	533796	TRUE	50	GTACATATATAGGTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIRFLLSGWKTRQCPQPRRGWTGLILLLIITGSGPALALLGVLPLHTAWAASSIWGAEGEVNVLLGVQADNEGRNVHHLLADPDVALPDQHPGVVDGLGQAQLEHLGLQAPLQEILDLQAQDVI	535194	529961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_530998_531232_531360_533734_533921_534943
530109	contig_14219_pilon	-	2663	12	Intergenic	novelGene_54369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	900.059474618894	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	103	1245	1084399	1047195	FALSE	25	ACAAGCTGTATTCCGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQPGGGGGGSLSVSSREERTQGGAPAGTGGGPTMAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLLNLNHLGLILLVLHYFVEFLFHISRLFYFSDEKYQKGFSLWAVLFVLGRLLTLILSVLTVGFGLARAENQKFDLSAGNFNVLAVRIAVLASICITQAFMMWKFINFQLRRWREHSAAQAPAVKKKPTVTKGRSSRKGTENGVNGTVTSNGADSPRNRKKSAFSYIFQQ	1084501	1045776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047228_1047276_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
530110	contig_18511_pilon	+	2048	11	Intergenic	novelGene_126869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	315.762331509001	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	176	1810	47371	61308	FALSE	30	ATTAATTTGAATGTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35396	61546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59218_59857_59948_61191
530113	contig_5968_pilon	-	1251	8	Intergenic	novelGene_112180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_7	235.192322518038	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	15	1073	732362	622680	FALSE	15	TGCTCACTGGTTTCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGKMASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732376	622501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
530114	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_12830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	237	1412	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28164	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
530115	contig_6059_pilon	-	2284	16	Intergenic	novelGene_44862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5433.39749900762	4	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	74	1096	584374	573368	TRUE	75	TTAAAAACAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPQHSLSSYGKVAACGPAGSRAEMNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKQQRVWFCMFLLPRRSH	584447	568042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569142_569239_569552_569668_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573419_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
530117	contig_10013_pilon	+	3163	22	Intergenic	novelGene_125039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	153.759965479077	256	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1668	1495	3162	250665	270588	FALSE	25	AGGTCTGCAGCAACGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDTDSGFSKFKQAADDSVSLPSSNAESVFVEDPYTASLRSEIESDAHEFEAESWSLSVDLAYVRKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALREELQFSSKAIGHLFPCADDLLDMHSQFLARLKERRQESLEEGSDRNYIIQRIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGIFCSGHNKAVSHYKSLLQHNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTKDYDDLTQALNLIKDIISQVDARVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGALCWKSTSGRLKDVLAVLLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKLPVVSLQKLIVREVANEEKAMFLISASLKGPEMYEIYAGSKEERNTWMAHIRRAVESCSDEEEGAFSEAEEERKMVEARAMRLRDFQERLSMKDQLIAQSLSEKQQIFLEMSEMSGLEDCTQGPQPRLLFRGGDPSENLQGELILRSAMTEIEDIQNLLCRRLGSASGQAEDSSSLPHRAETFGGHDSTVSLSKNGSFKK	161522	270589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_161800_188439_188577_203147_203411_204114_204266_205150_205266_206160_206230_207531_207610_209961_210065_210250_210393_249259_249403_250648_250762_250921_251063_256720_256972_257948_258075_260053_260172_261230_261480_263048_263126_264692_264872_266100_266193_268077_268270_270017_270147_270571
530118	contig_14890_pilon	-	1852	9	Intergenic	novelGene_122516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_8	1192.27660381306	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	493	1308	370199	366814	FALSE	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371213	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370322_370689_371106
530119	contig_14513_pilon	-	1194	5	Intergenic	novelGene_70257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11870_11975_12158_13087_13136_14952_15001_18735
530120	contig_16622_pilon	-	2621	9	Intergenic	novelGene_48448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1213.07883090919	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	736	1170	115540	113120	TRUE	35	TTCTGAACTTACTGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	121971	108241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121326
530122	SIRV2	-	405	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	63	2968	47	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAACGACAACGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5848	4003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
530124	contig_14441_pilon	+	1376	6	Intergenic	novelGene_100602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	380.294096719894	33	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	762	1190	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111202	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112401_112665_113048_113209_116578_116963_117220_117344_117539
530125	contig_9468_pilon	+	2429	12	Intergenic	novelGene_59449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	240.790022033189	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1154	2209	206034	207089	FALSE	30	AACACTTTGTGTAATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	150431	207309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177204_177296_189671_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201457_205979
530126	contig_3529_pilon	-	2478	8	Intergenic	novelGene_105337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	512.419590506348	1314	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	57	437	550554	538872	TRUE	15	CTTCCCTTCTACTGATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDCSFYVFFLFTGSNDFGWQ	571160	524332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538929_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_571131
530127	contig_5643_pilon	+	1244	12	Intergenic	novelGene_38832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2804.74352917746	3	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	58	1032	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGMVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233629_233933_233989_236030_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
530128	contig_8823_pilon	-	2697	2	Intergenic	novelGene_53065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70290	66714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_68016_68894
530129	contig_10523_pilon	-	1912	9	Intergenic	novelGene_120929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	539.934486766682	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	143	1126	39240	15001	TRUE	5	TTGCCAGGTTGTGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	43080	12732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13065_14546_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_42952
530130	contig_5686_pilon	+	1900	3	Intergenic	novelGene_45220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3078	junction_1	853.5	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCCTAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93777	172697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_171800_172507
530131	contig_14513_pilon	-	980	4	Intergenic	novelGene_70230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1144.57017648062	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	187	390	18880	11982	TRUE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTAVYGGGKSP	19066	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11663_11774_12016_14975_15001_18735
530132	contig_3602_pilon	+	1853	7	Intergenic	novelGene_60512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	62	511	161745	169451	TRUE	15	TACCTGACTTGGCTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161683	171125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170652_170983
530133	contig_7083_pilon	+	1911	7	Intergenic	novelGene_125161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_4	800.430647977838	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	252	347	161470	178745	TRUE	30	TTTTGTATGATGTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIERPQLIRAKVPIVKFRDKVNCVEFDLNVNNIVGIRNTFLLRTYAYLENRVRPLVLVIKKWASHHEINDASRGTLSSYSLVLMVLHYLQTLPEPILPSLQKTYPLGQSDDFSS	156660	183592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_156728_159880_159958_161362_161492_169672_169717_178715_178808_180833_180914_182170
530137	contig_14575_pilon	+	2433	23	Intergenic	novelGene_101862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	17	junction_7	118.966564161657	26	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	146	982	17236	27783	TRUE	60	GAAGAGAAAGATCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENKILAVEEAVNWVKFVGDITLLSKLQSLENCWPMLSIFFTEYKYHITNYVMENYNLLEEFKTADCTDCTEQGEIMKIKGNEEFSKERFALAIIYYTRAIEYR	17090	63903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_24256_24378_26341_26428_27684_27857_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
530138	contig_3077_pilon	+	1469	10	Intergenic	novelGene_26733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	3688.4782000303	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	379	1062	13867	17590	TRUE	25	GATTAACAGTGTGCGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGCTGRWSDLGFPCRLCSPGAAPVLFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10124	18077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17708_17787
530139	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530140	contig_15063_pilon	+	1132	3	Intergenic	novelGene_14381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	167	988	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35104	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
530142	contig_10500_pilon	+	1075	2	Intergenic	novelGene_41204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438667	1447140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1439194_1446591
530144	contig_8772_pilon	+	1457	9	Intergenic	novelGene_21122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4484.74574948235	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	317	1141	16563	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	16036	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_16340_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
530145	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530146	contig_18108_pilon	-	2051	14	Intergenic	novelGene_33501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	287.864674814256	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	60	1388	297156	276273	TRUE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTSPGSSSLTPQGFEPSSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNW	316717	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_276255_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667
530147	contig_8978_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_49417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGAAATCCAGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374645	375956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_374600_376000
530148	contig_5023_pilon	+	2744	15	Intergenic	novelGene_7140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	217.674396420762	11	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1778	2335	387262	405576	FALSE	5	TCTGTTGCTCAGGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	323699	405985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_368505_368590_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
530149	contig_10197_pilon	-	2808	18	Intergenic	novelGene_115279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	537.261600788351	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	63	1184	1197388	1190477	TRUE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSFSCVASPLC	1197640	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168127_1187900_1188044_1188181_1188370_1188646_1188840_1188960_1189088_1189239_1189404_1189522_1189730_1189856_1190054_1190437_1190507_1193347_1193448_1193543_1193670_1193759_1193973_1194097_1194317_1194408_1194574_1196589_1196759_1197288_1197400_1197589
530150	contig_14925_pilon	-	1666	5	Intergenic	novelGene_55349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	10	CTGCATTGTGTGCACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
530151	contig_15286_pilon	+	1812	8	Intergenic	novelGene_124433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_5	65.0942801336834	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	115	885	8542	25108	FALSE	35	GGAAAAAACTCTGGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFKLVKTWLGPEAISLLKFTSKNEIQEYVSVEYLPPHMGGTDPFKYSYPPLVDDDFQTPLCENGPITSEDETSSKEDIESDGKETLETISNEEQTAPVKKINPAEPNSKAEENEKVDSKMKAFKKPLSVFKGPLLHISPAEELYFGTAESGEKKTLIVLTNVTKNIVAFKVRTTAPEKYRVKPSNSSCEPGASVDIVVSPHGGLTVSAQDRFLIMAAEMEQSSGTGPAELTQFWKEVPKNKVMEHRLRCHIIESSKPTTLTLKDSAFNMLDKTSEDICLQFTNSRCETDRSPP	8427	26035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_8554_10756_10934_11419_11533_15377_15475_16537_16635_17061_17192_22665_22769_25066
530152	contig_1150_pilon	-	3336	3	Intergenic	novelGene_61460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	139.5	194	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGATGACTGAGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349763	341936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_345121_346557_346616_349669
530153	contig_5023_pilon	+	2082	12	Intergenic	novelGene_7254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2448.7137794266	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	82	1260	607279	647115	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGSVSP	580847	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625834_647099_647374_647737
530154	contig_15063_pilon	+	1335	5	Intergenic	novelGene_14369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	202	1086	35271	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35069	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530155	contig_7091_pilon	+	2257	16	Intergenic	novelGene_131770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	338.874109695949	561	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	901	1581	415587	435147	FALSE	15	CACGTGGCCTTGGACTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349687	435823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406380_415528_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
530156	contig_4105_pilon	+	2153	6	Intergenic	novelGene_21481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	156.004358913461	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	579	935	72453	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	70429	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_70533_70826_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
530157	contig_19342_pilon	+	1528	7	Intergenic	novelGene_41052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.91070819942883	5	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	527	934	5070	6183	FALSE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3227	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3911_4278_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
530158	contig_4151_pilon	+	2583	24	Intergenic	novelGene_65293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	111.78180541879	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	1072	2256	763470	828280	FALSE	10	CTTTTGCACTCACTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLKQFADNDASRFKAIKVRFVKPVYPGQTLQTEMWKEGNRIHFQTKNKETGDIVISNAYVDLVTTSEASDISAQTTSEGGELQSTLVFEEISRRLKDVGHEVVKKVKAVFEWHITKGGNVAAKWTIDLKNGSGKTYQGPAEGSADITIIISDEDFMQVVLGKLDPQKAFFNGRLKATGNILLSQKLQMILKDYAKL	723709	828607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_723836_726654_726709_740934_741043_742323_742441_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757522_763451_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940_793048_799587_799675_803058_803155_804394_804534_811593_811722_828190
530159	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_8610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3359.99437313517	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26357	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530160	contig_9516_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_106185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGAAGCACTGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889844	889071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_889100_889800
530163	contig_2036_pilon	+	4184	1	Intergenic	novelGene_131850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGCCAAACACTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636300	640484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_636300_640500
530164	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
530167	contig_1996_pilon	-	1667	8	Intergenic	novelGene_131940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_5	229.547914165995	1942	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	399	1172	509912	508483	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511086	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732
530170	SIRV6	+	1284	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	13	14	13	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGATAGTTACGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3118	11810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
530171	contig_12128_pilon	-	1970	7	Intergenic	novelGene_131983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	107.837326046638	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	163	696	410049	393439	FALSE	25	TACTCTTTCTCATTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLAPSKSTVYVSNLPFSLTNNDLYRIFSKYGKVVKVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNMLGEREPPKKKEKKKKKKISEPEEQIKPKLKKKKKNGNPVQGTHQHQMIQDAHG	411654	392164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_393527_394488_394602_396936_397045_397580_397693_404592_404622_409965_410052_411494
530172	contig_19680_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_132009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCTAAGATACTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157486	157117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_157100_157500
530173	contig_19680_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_132008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATAGCACATACCACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155859	155538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_155500_155900
530174	contig_10196_pilon	+	1303	10	Intergenic	novelGene_132135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	520.131559805952	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	304	1116	1038364	1050606	FALSE	10	TAACCCCTGCCTGTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWRPRSPVLTCRDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034550	1050793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1034995_1035140_1038292_1038469_1039041_1039107_1043788_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
530175	contig_1406_pilon	-	1774	5	Intergenic	novelGene_25547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	616.588750708282	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	178	792	2159494	2139992	TRUE	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGHFFFMSF	2159671	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2140014_2143316_2143628_2147740_2147920_2159391
530176	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_11849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	3	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	228	1463	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27141	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530177	SIRV5	-	406	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCCACCTCCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10906	8153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
530179	SIRV4	+	1513	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	46	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	53	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1677_1876_2385
530180	contig_6557_pilon	+	2482	8	Intergenic	novelGene_32955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1635	1967	356233	359494	TRUE	45	AACAAAGTCGCAGTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSADILAEGVSGLVPKPFGIAFGEGKLFSVPLPTGVAGKESEAWTAESIFSQSRVGELGADFLVTSCCLSRTASSCLKSLASSFNLCTDTNKDSFSSSSLSKNAFRSMA	350560	395129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_352166_356203_356297_356839_357014_359399_359536_361479_361629_362506_362662_364233_364334_395059
530181	contig_5549_pilon	+	818	5	Intergenic	novelGene_81576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1258.3603170396	13	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	319	648	91781	96749	FALSE	20	AATTTTCTTGGGATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	96919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86790_91746_91835_93264_93412_96620
530182	contig_5941_pilon	-	2605	8	Intergenic	novelGene_84550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_1	444.026061011224	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	262	1296	151020	144460	FALSE	20	CTACTTTGCAATTGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLGTEDLAGHEGVQFFGLLSLYLEQEQRFQPREKGLSLIETTPENDNTLCSRLRNAKVEDLRSLTNFFGSCTETFVLAVNILDRFLALMKVKPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELLEILLLVKKHSKVNDTEFFYWRELVSKCLVEYSSPECCKPDHKKLVWIVSRRTAQNLHNSYYSVPELPTIPEGGCFDESESEDSCEDTSCGEESLSSSPLSDQECTFFFSFKVAPALCFPS	152271	143150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527_145734_148032_148132_148227_148307_148486_148738_149827_149966_150882_151021_152010
530183	contig_4732_pilon	+	2365	3	Intergenic	novelGene_75428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	257	1502	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	242	559	622645	629290	FALSE	45	GTAAGATGAAACATTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSRLSSGPWTQQGLLPLPLPAVLRMEKDQPESLPEAPGCRGLRGCPALPPCSWTPEEGGRGDARVTAQLVESCSGEGRGSWGCLGVQKDGNARPIPHSQNAS	616878	631096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_616927_622451_622691_629018
530184	contig_9290_pilon	-	2822	14	Intergenic	novelGene_77575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	24.6814018571299	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	534	971	509725	506742	TRUE	20	ACGTGAGTGGTGACAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTRFP	516523	502912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507089_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510098_510337_511094_511204_515706_515813_516446
530186	contig_9014_pilon	-	1706	13	Intergenic	novelGene_106764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_12	67.6873429001973	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	131	844	85778	79637	TRUE	10	GAAGGTTTTGTTTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNGDAAETTEENSPKMRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	85908	78129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_85745
530187	contig_14711_pilon	+	2229	11	Intergenic	novelGene_68940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	65.5591336123351	50	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	124	1026	122204	135577	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFLLALIPPLTESLSVFPSCVLKNNFSFLESKVALTMLVCINPLSPLLNIRYCYC	121073	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133498_133699_133925_133978_134106_134197_135227_135313_135413
530188	contig_14970_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_44937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCTAAACTGTTGGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136012	136360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136000_136400
530189	contig_1443_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_28176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	481	945	344128	344592	NA	30	ATTTTCACATACCGATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343647	345190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343600_345200
530192	SIRV6	+	966	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
530195	contig_10958_pilon	+	1367	3	Intergenic	novelGene_5457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTATACAGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893871	901630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_893946_895734_895855_900457
530197	contig_11720_pilon	+	2161	15	Intergenic	novelGene_43932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_3	325.455160082752	1	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	600	1967	264322	272210	FALSE	35	GTAAAGCACTTTACCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
530199	contig_15047_pilon	+	1178	7	Intergenic	novelGene_52240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	259.724052281134	8	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	174	449	3242	4178	TRUE	45	GGAAATAAATGGAAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFYTAVSRPGRGEPRGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2570	21630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2618_2719_2826_3221_3498_4158_4329_4558_4676_20997_21062_21232
530200	contig_7870_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_108998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAATATCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469678	467523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_467500_469700
530205	contig_3077_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_26750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACTTGTAGGCGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18088	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16267_17782
530207	contig_5954_pilon	-	2421	15	Intergenic	novelGene_28655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.784725716014	2	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	646	1818	956264	945474	TRUE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLNSPHGSWRPTRTWPSSLCLRPSCASSRPGSRCLTLASPTSWSGSRAAGKTRSWALPTTG	960563	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945248_945393_945527_946209_946335_946683_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
530208	contig_6364_pilon	-	2225	10	Intergenic	novelGene_51728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_8	909.757449699617	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	252	1412	490750	444615	FALSE	75	AGTAAAAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSTSAPGVYANGNDNKKFKGDRPPCSPSRVLHLRKIPNDVTEAEVISLGLPFGRVTNLLILKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGKFIFAIFNIIFKCEFSIFVHSVVFTDYLYTKQCV	521245	443801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_490716_490802_521045
530209	contig_8044_pilon	+	2721	3	Intergenic	novelGene_132378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAGTGTTTCTCGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377474	387494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_379303_381976_382051_386675
530213	scaffold_16539_pilon	-	1665	11	Intergenic	novelGene_68341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	298.336471119439	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	143	802	502141	491915	TRUE	10	TGGGCCTGAGTGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRALRPTGSWARQAAPSRQPGPGPMIPATIKRHQWRSASMEPLLWPTWQVLLHHCVRVAAPQT	502786	489780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494707_499026_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502245_502747
530215	contig_15063_pilon	+	1060	5	Intergenic	novelGene_9497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	240	1058	34808	36343	FALSE	20	CACCTGCCTCGTAAAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAPTREQLSLRESAS	27129	36345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36302
530217	contig_16098_pilon	-	1559	10	Intergenic	novelGene_46143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2128.53439405302	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	264	1358	458816	456273	FALSE	15	GAAGGGGGAGTCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	466869	456071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_461682_461766_466710
530218	contig_16907_pilon	+	2262	6	Intergenic	novelGene_87420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	899.711509318404	1177	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	220	957	327210	363082	FALSE	25	GCTAATTATGTGATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTELIQKAKLAEQAERYDDMATCMKAVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGGRRSAWRVISSIEQKTDTSDKKLQLIKDYREKVESELRSICTTVLELLDKYLIANATNPESKVFYLKMKGDYFRYLAEVACGDDRKQTIDNSQGAYQEAFDISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNNPELACTLAKTAFDEAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDSAGEECDAAEGAEN	326435	364387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_326528_327082_327504_358180_358305_359987_360152_361003_361100_363022
530219	contig_5033_pilon	-	1610	11	Intergenic	novelGene_29016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4070.52887104366	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	148	1164	545288	531619	TRUE	10	GACCTGGGCCTGAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKGEPSEGTEAHAS	547662	530985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531359_531545_531647_534436_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542095_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
530220	contig_4105_pilon	+	2143	6	Intergenic	novelGene_21483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	156.004358913461	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	633	989	72453	73266	TRUE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	70669	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73572_73635
530221	contig_6735_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_15824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCCCACCCCTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640838	644239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_640800_644200
530222	contig_16103_pilon	+	3332	26	Intergenic	novelGene_118913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	364.168202895311	1	128	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	111	3017	771073	799889	FALSE	30	TGTAGTCTTCAATAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	767015	800204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767083_771029_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_793989_794030_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
530225	SIRV6	+	408	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1193	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11400_11800
530226	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
530227	contig_5018_pilon	-	1162	7	Intergenic	novelGene_47075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	763.063489422007	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	67	612	1402792	1401297	TRUE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKVCLGVVAEGFQGDFEAS	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399179_1400664_1400764_1400851_1400966_1401052_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
530228	contig_7622_pilon	-	2065	14	Intergenic	novelGene_132415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	197.114330203559	459	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	207	1658	297961	269279	FALSE	25	TAGGAAATGTTATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKEKGYATDESTVSSVQGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD	306643	268871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_274472_274674_276552_276757_280542_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
530229	contig_11896_pilon	+	2118	2	Intergenic	novelGene_88009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAATGGAAGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131995	134292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_133034_133212
530230	contig_2367_pilon	-	1543	3	Intergenic	novelGene_65320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	764	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATAATTTAAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213294	192226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193502_208552_208634_213107
530232	contig_15991_pilon	-	1817	3	Intergenic	novelGene_70922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7128	junction_1	621.5	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1052	1438	101267	100770	FALSE	30	ACATCGATTTCTAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTGVYLCGSLVVCVCVVPFWCVSVWFPSGVCQDSSVPSL	103631	100390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_101049_101159_102271_103583
530233	contig_14925_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_55181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	1558.77756591503	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	19	471	75465	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSNAGSMLTFGGGTRLMVKPHIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	75483	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_75422
530234	contig_3956_pilon	+	1558	7	Intergenic	novelGene_14943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1142.60001993504	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	81	1088	1281682	1290491	FALSE	15	CTCCAGCTGTGTCAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQKDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283850_1289004_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
530235	contig_15123_pilon	-	2991	11	Intergenic	novelGene_110912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_1	161.997067874699	408	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	196	2391	227392	217804	FALSE	10	TTTAGTGCTGAGCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFFQKEQALSALQLEHTSTQALVSELLPVKHLCQQLQAEQAAAEKRHREELEQSKQAAGGLRAELMRAQRELGELVPLRQKVAEQERAAQQLRAEKASYAEQLSMLKKAHGLLAEENRGLGERANLGRQFLEVELDQAREKYVQELAAVRADAETRLAEVRQEAQNAARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEELSKKLADHDQASKMQQQKLKAQGSESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHYKLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRGLEQLQKENKELRAEAERLGQELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLAITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPVSQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKVEALRVGDGGSVTRRKLHGRGWAFPRLPRAAASKAGPS	227587	217203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219374_220063_220293_221228_221476_222752_222911_223020_223240_223326_223438_224870_224940_226981
530236	contig_9345_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_24418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	1542	2162	195186	194566	NA	50	TTAAAAACACACAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPCVCRAPVFFWAQRGRLGSGVQLRYTAGQTDPATCRPAGYGAGSEGGWTCSRVPGCLQVDLGEARPQDLEAYFVPGTFPGLFLTVQPTLPSPPGLCSLQVPALLRGVRVPGPGWWSLCLVCSSSCGQTRVERCPGPGQGRPLGLLLEPQAPLSMEGAALRVSEGPLLTPGPENHAPAFGTWELWPLLLCPLDFGDFWSAGHAHL	196727	194213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_194200_196700
530237	contig_9505_pilon	+	2829	13	Intergenic	novelGene_121873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	206.546941126924	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	38	964	652560	675956	TRUE	15	TTTTTAGTGTCAGCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGGSSRGSKEKMEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECNTDKDQSPKDVFDELFKLAPEKVSAVKQFADGVILLLLIGQLGGFFLHLKEFYLTPSSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLNYPINPEDIVNKDEKSTLRVLYNLFHRHKLKESADGMPRGAPN	650756	678074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017_659074_663426_663450_666184_666244_669223_669326_675220_675294_675846_676256_676508
530238	contig_14513_pilon	-	1022	3	Intergenic	novelGene_70373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	187	351	18880	12143	TRUE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19066	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11455_11632_12153_18725
530239	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
530240	contig_5770_pilon	-	2296	4	Intergenic	novelGene_74191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_2	1528.37655336926	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1047	1529	264028	262675	FALSE	50	AAGTAAAAGAAGAATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKVNYLIAVSLLYNTRKICGCCDDCLRTPLE	265779	261907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_262957_263576_263676_263926_264062_264766
530241	contig_14142_pilon	-	2491	22	Intergenic	novelGene_120597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	130.927426193694	482	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	176	1867	598441	586374	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFNQARLDDSPRAPGQGSGHLAIGSAATLGCGGMARGREPGGVGHVAAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVVINQIYEARVDAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEVRGRRGSRGPPRGQPPVPPKPCIRPRPGSFSRKPEPPL	598616	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586388_587233_587404_587508_587604_587720_587791_588403_588616_588714_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
530242	contig_6137_pilon	+	2545	5	Intergenic	novelGene_59315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	72.3787779670257	201	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	160	519	1686492	1693045	TRUE	25	TGTAACCTCTATTGTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTNLAAGIPSSKVKYSRLSSTDDGYIDLQFKKSPPKIPYKAIALATVLFLIGAFLIIIGSLLLAGYISKMGADRAVPVLIIGILVFLPGFYHLRIAYYASKGYRGYSYDDIPDFDD	1683968	1695170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684103_1686466_1686588_1688000_1688124_1692904_1694903_1695001
530245	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36161_36266
530246	contig_12964_pilon	-	2006	3	Intergenic	novelGene_131698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558580	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556773_557457_557510
530248	contig_3948_pilon	+	1911	13	Intergenic	novelGene_53326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1296	1667	1485692	1491198	TRUE	25	GCGGAGCAAGGGGGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHRVPVLGVVVTHGQRVAAFGGLTVSDHEGAQHIARGQEVTFRILPADALEEPLFCLQRVNMGDIVARDIAFFLGGQGSSPPPFPRLFQDHHLVPLLEAEVFAVNGLIIIQGDHDDVLRNCL	1467936	1510994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468447_1471755_1471876_1473189_1473354_1482576_1482656_1483426_1483605_1485096_1485250_1485600_1485750_1485882_1485986_1489827_1489927_1490736_1490842_1491191_1491234_1494195_1494272_1510861
530249	contig_13744_pilon	-	4255	28	Intergenic	novelGene_77164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_11	66.9635570278467	163	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	956	2871	135	3005	375026	312331	FALSE	15	TATGATTCTTGAGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYDEDLLKNPFYLALQKWRPDLCSKVAQAHGIVLVPCKGSLSSNVQSTCQFESYILIPVEEHFQTLNGKDVFIQGNRIKLGTGFAYLLSVPILFEETFYNEREESFSILCIAHPLEKRESSEEPSTSPDPLSLKTIEDVRDFLGRHAEKFDRSIASFHRTFRECERKSLRHHIDSVNALYTKCLQQLLRDSRLKVLAKQEAQMNLMKQAVEMYIHHDIYDLIFKYVGTMEASEDAAFNKITRSLQDLQQKDIGVKPEFSFNIPRAKRELAQLNRCTSPQQKLICLRKAVQLLTQSPSQRVNLETMCADDLLSVLLYLLVKTEIPNWMANLSYIKNFRFSSSAKDELGYCLTSIEAAIKYIRQGNLSVKPPESEGFGDRMFLKQRMNLLSQMTSTPIDCLFKHIASGNQKEVERLLSQDGHDKDVVQKMCHPLCFCDGCEKLVSGRLNDPSVVTPFSRDDRGQTPLHVAAVCGQASLIDLLVSRGAVVNATDYHGSTPLHLACQKGYQSATLLLLHYKASADVQDNNGNTPLHLACAHGHEDCVKALVYYDVHLCRLDIGNEKGDTPLHIAARWGYQGIIETLLQNGASTEIQNRLKETPLKCALNSKILSIMEAGHLAFERRQKSSEIPAQSPQRSVDSISQRSSTSSFSSVSVSSRQEEAKKDYREVEKLLRAVADGDLEMVRYLLEWTEDELDEVEDAAGAVGLEFCHPLCQCPKCAPAQKKLFKIPANGLGVNVTNQEGSSPLHVAALHGRADLIPLLLKHGANVGARNADQAVPLHLACQKGHFQVVKYLLDSNAKPNKKDISGNTPLIYACSSGHHEVATLLLQRGASINASNSKGNTALHEAVIEKHVFVVELLLLHGASVRVLNKRQCTAIDCAEQNSKIMELLQVIPSCVATLDDVDEMDNKDYITVKIRKKWNSKMCDLPDEPFTRQFHFVRPAGQFKQGGKEPH	385590	311080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_312356_315279_315359_316196_316309_317864_318027_319182_319303_320116_320315_326095_326219_328624_328670_329775_329896_330007_330068_331568_331767_333079_333173_333619_333736_334781_334865_335634_335763_336874_336968_350806_350940_351450_351530_353414_353537_354206_354284_354366_354433_354529_354584_354669_354730_355177_355333_356183_356341_358131_358243_374924_375057_385486
530251	contig_500_pilon	+	725	5	Intergenic	novelGene_31065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1070.06974071787	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATGTTTGACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491859	1499585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1491933_1496851_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
530252	contig_500_pilon	+	1337	10	Intergenic	novelGene_31071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.73633036433	3	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	33	1010	1492663	1498065	TRUE	30	GTTGGTTGTAAAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1492029	1499501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492052_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
530253	contig_5210_pilon	+	1003	8	Intergenic	novelGene_65468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	137.814427134936	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	50	862	803815	811897	FALSE	10	TGGGGCACTGTCCGCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLAPGSGFRAGGRPLTMPGKHQHFQEPEVGCCGKYFLFGFNIVFWVLGALFLAIGLWAWGEKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANW	803765	812038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807349_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831
530254	contig_10629_pilon	-	2702	15	Intergenic	novelGene_52909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.958497623979	3	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	400	933	256957	253815	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRVCGRQPSEQDFRGLNYRVIQVPCGPAP	267925	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253898_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
530255	contig_1154_pilon	-	1969	13	Intergenic	novelGene_87246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_12	19.3754928252734	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	51	1460	1875601	1858385	FALSE	30	CCCAGCACCTCCAGGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPLQRAGWVVFGHDPMKCVLVATEGAEVLFYWTDEEFEESLRLKFGQPENEEEELPALEDRLSTLLAPVIISSMTMLEKLSDAYTCFSTENGNYLYVLHLFGECLFIAINGDHTESEGDLRRKLYVLKYLVEVHFGLITVDGQLIRKELRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETETDSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSGSIVWLDEGTPPTDTYQIQVAEDTLQMLVPHSPTASSPRRIFLDASIKESYCPLVPHTFYCLPLWPGINMVLLTKSPSAPLALVLYQLLDGFSLLEKKLKEGHEAGGTLRSHPLVADLRQRMDKFVKNRGGQEIQSTWLELKTKAFSRSEPGSSWE	1880512	1857875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1858451_1859840_1860021_1860112_1860281_1861540_1861597_1864160_1864231_1864370_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1869642_1869786_1870002_1870141_1875484_1875602_1880462
530256	contig_10793_pilon	+	1499	13	Intergenic	novelGene_83358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3517.9833267797	19	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	225	1151	146975	163940	TRUE	25	TCAGCAACATTTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130861	165010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_140211_140296_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789
530257	contig_5690_pilon	+	1505	11	Intergenic	novelGene_119729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	470.275196028878	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	48	1028	1044729	1105490	FALSE	25	AGAAATTTCACGTGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVIKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087758_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
530259	contig_11285_pilon	-	2856	26	Intergenic	novelGene_5662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.131215364252	1	104	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	26	1903	798530	787791	TRUE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLARTARIQTVRWCC	798555	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787140_787291_787431_787533_787625_787750_787832_789970_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
530260	contig_6047_pilon	+	1348	9	Intergenic	novelGene_24197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	676.329061921784	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	116	889	105237	122687	TRUE	15	ATACCCAGTGTCTTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASD	105121	123880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114682_122685_122741_122981_123102_123594
530261	contig_10134_pilon	-	2205	4	Intergenic	novelGene_16237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	3	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTGTGTGTCTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	32184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38831_39594
530262	contig_5005_pilon	-	1725	6	Intergenic	novelGene_84321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	526.639535166132	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	41	637	540029	512878	FALSE	50	TGTAAAAACAAAGGATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNIYLVRQRISRLGQRMSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQKCLVCVQGDQLT	540069	511789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512918_515637_515745_520412_520621_521921_522041_539649_539722_539978
530263	contig_12427_pilon	-	1306	7	Intergenic	novelGene_40538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1107.81105488857	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	133	756	522337	506035	TRUE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578084	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504743_505551_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
530264	contig_5039_pilon	+	3045	1	Intergenic	novelGene_64860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350128	353173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_350100_353200
530265	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530266	contig_19342_pilon	+	1161	7	Intergenic	novelGene_41070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.33749739908346	20	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	28	738	3263	6183	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCACWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3235	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3867_5074_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
530269	contig_6497_pilon	-	2313	7	Intergenic	novelGene_35640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	505.888876686922	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2100	213	2312	790005	750981	FALSE	55	ATGAACTTCAAAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEERQKKLEAGKAKLAQFRQRKAQSDGQNPSKKQKKKRKTSSSKQDVSAYHAMNIDQSQTDEMYINSSQRVGSAVTPESTVMRTLHSGEIVKRDQVFSVEPESEISTTADDYSSEEEFGVDDSYSEHGAQYSETHLEMMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQI	790217	750979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_752208_754320_754519_755398_755555_756694_756863_764427_764473_767272_767531_789957
530270	contig_17427_pilon	-	1805	6	Intergenic	novelGene_30345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_5	801.027340357369	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	116	712	179819	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	181362	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270
530271	contig_5018_pilon	-	1687	9	Intergenic	novelGene_47025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	175.07850917517	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	453	1046	1394992	1392342	FALSE	15	AGACTAGCCCTGTGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397347	1391700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395464_1395757_1395852_1397191
530274	contig_1154_pilon	-	1624	5	Intergenic	novelGene_87157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	813	1136	901992	900842	TRUE	10	GATTCCGGAGTCGCGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLGLALGSHSFHGFTHGLFVPQELHGLDGLQVLVQFIDHGNTSGQVQLHDSLFRETLQMFDNAPKAVAMGCNQHPFPLLDLRNYFFIPKGQGSGNSVLQTLTGG	902804	895965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_896144_899975_900251_900806_900989_901775_901949_901988
530276	contig_817_pilon	+	3442	2	Intergenic	novelGene_132479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATTGAGAAGTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721689	726371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_723640_724879
530277	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_89066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530278	contig_8729_pilon	+	1837	13	Intergenic	novelGene_40061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.426354752522	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	1	1509	33998	43845	FALSE	50	AAATTTTAACAGCTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAELADVLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVNKIIELKKKVCGDSNKGFVVINQKGIDPFSLDALAKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSLDDLNPDCLGYAGLVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAIRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAIAAALMKYKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKVQAEHSESGELVGVDLNTGEPMVAAEAGIWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG	33997	44173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34112_36789_36925_37784_37959_38491_38596_39239_39351_40001_40162_40269_40353_40956_41054_41327_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
530279	contig_15304_pilon	-	2291	6	Intergenic	novelGene_30584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	28	junction_2	196.457221806682	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	186	1490	66228	60349	FALSE	30	GTCACCTCATGACAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSELEVQDLCMEEDESKELDELWTSTFVFITLFLLSVSYSAMVTLFKVQWIFSALLQGKLQDSHEYSNIM	66413	59547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104
530282	contig_11846_pilon	-	2057	8	Intergenic	novelGene_105943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	107.632215797832	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	23	742	263830	254013	TRUE	40	CCCAAAGTAAGAGGCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVSVFGMAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQTLGLPITDEQIQEMKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKGFHHHRANIHTESGY	263852	252087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_253290_253421_253492_253969_254061_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263659
530283	contig_19564_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_29629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	215	1333	13615	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSCRRVRTSLLQPPGHVPSPQPAIRRDKIIYRSLAPHTDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15687	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_13993_15570
530284	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530287	contig_5727_pilon	-	3752	6	Intergenic	novelGene_7984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGCCGCTCGGTCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497420	454016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_454084_461717_461918_466848_466956_480142_480328_485110_485220_494336
530288	contig_7428_pilon	-	1849	3	Intergenic	novelGene_77748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	808	junction_1	48.5	3555	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	149	526	515358	514339	FALSE	20	TTCTTTGTATCAGAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYAEKLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515506	513015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515026_515337
530289	contig_3095_pilon	+	1215	5	Intergenic	novelGene_75064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	63	827	147241	151865	FALSE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147178	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151148_151861
530291	contig_10726_pilon	-	2918	14	Intergenic	novelGene_132497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	65.8286281493369	226	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	510	2273	106060	8017	TRUE	5	CTCTTTGTGTATTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNAVHWFRKGLRLHDNPALKECIQGADTIRCVYILDPWFAGSSNVGINRWRFLLQCLEDLDANLRKLNSRLFVIRGQPADVFPRLFKEWDITKLSIEYDSEPFGKERDAAIKKLATEAGVEVIVRISHTLYDLDKIIELNGGQPPLTYKRFQTLISKMEPLEIPEETITSEVIEKCTTPLSDDHDEKYGVPSLEELGFDTDGLPSAVWPGGETEALTRLERHLERKAWVANFERPRMNANSLLASPTGLSPYLRFGCLSCRLFYFKLTDLYKKVKKNSSPPLSLYGQLLWREFFYTAATNNPRFDKMEGNPICVQIPWDKNPEALAKWAEGRTGFPWIDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGMKVFEELLLDADWSINAGSWMWLSCSSFFQQFFHCYCPVGFGRRTDPNGDYIRRYLPVLRGFPAKYIYDPWNAPEGIQKVAKCSIGVNYPKPMVNHAEASRLNIERMKQIYQQLSRYRGLGLLASVPSNPNGNGGLMGYSPGENIPGCSSNGSCPQGNGILHYAHRDSQQAHLLKQGRSPTGTGVSSGKRPSQEEETQSIGPKVQRQSAN	106636	6593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_-_7239_8016_8121_8193_8266_16825_16922_17027_17231_17454_17607_18963_19276_19354_19496_20455_20545_20935_21121_23463_23607_30914_31024_105902_106219_106285
530292	contig_15063_pilon	+	1233	6	Intergenic	novelGene_12113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3779.64481929189	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	237	1130	34808	36700	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPD	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36380_36697
530294	contig_14184_pilon	-	2500	8	Intergenic	novelGene_66590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	428.553523435498	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	763	1236	90689	89812	FALSE	25	GAACCAAGTGTGTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPAQLVGKRSTTNGTTQFIYEAYSAAQERRRDRQHGWILPTACCRICGLSASDFPSSERLFQNQCLMMSTALLFPTPLRSFCCLQFDAVRLNRGAFPDQGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126333	88547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89982_90385_90772_91298_91348_91951_92112_103407_103502_105799_105915_109168_109327_126229
530295	contig_3009_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_132517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAACTAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70616	71764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_70600_71800
530296	contig_16934_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_132539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACTAATCTAGGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254379	252675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_252700_254400
530297	contig_5791_pilon	-	2054	10	Intergenic	novelGene_35869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	400.412565015413	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	310	1083	1088908	1087956	TRUE	30	TAATTTTAACTTTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSSLQVLVFIIWVIAMMSNAFAVTVD	1094428	1079766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1080455_1080711_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1088141_1088210_1089142_1094352
530298	contig_8541_pilon	-	1789	5	Intergenic	novelGene_105581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	410.000304877935	2347	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	235	888	577314	564912	TRUE	25	TTCCTATGTTTAAGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKARERKLARMAAEEHTLQDTGQDRGRTCKT	577548	547838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_564935_565360_565419_567245_567472_576967
530299	contig_11285_pilon	-	2598	22	Intergenic	novelGene_5734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	100.643597843321	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	1036	2277	1199468	1192895	FALSE	0	TCTGCCTGGCTCTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM	1215748	1192573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1195547_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728
530300	contig_6710_pilon	-	423	2	Intergenic	novelGene_98228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
530301	contig_11590_pilon	+	2400	3	Intergenic	novelGene_125565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.5	40	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTCATCCGCCTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60614	68924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_61169_61766_63460_68771
530302	contig_5050_pilon	-	2464	9	Intergenic	novelGene_110284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	237.018459196747	202	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	196	1422	716384	548291	FALSE	70	CTAAAAAAAAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPCILACDTWGLSLASPFFWCLFST	716579	547248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
530303	contig_9345_pilon	-	1836	6	Intergenic	novelGene_24606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2434.42538599974	4	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	190	675	955353	948037	FALSE	5	TATCCTGGTGTTTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQAKAETWQTGLVLLGTWSVQQRPKME	1001301	946875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948112_949472_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997098_1001198
530305	contig_7816_pilon	+	1572	10	Intergenic	novelGene_66523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1096.04409886951	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	78	1310	192958	211491	FALSE	40	TTTTGAGAAAAATGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVDSYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKAMPLLLPSQTRLTSACWILSPSSPWIENSFSTAPAPPRAGSSRWRTIITKVA	192880	211753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210601_210751_211482
530307	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
530308	contig_15063_pilon	+	1313	4	Intergenic	novelGene_14263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	350	1171	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34809	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530310	contig_5690_pilon	+	1441	10	Intergenic	novelGene_119742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	468.008072105125	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	50	994	1073823	1105525	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVDVTHHVCCK	1073773	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103590_1105497
530311	contig_5686_pilon	+	3030	13	Intergenic	novelGene_45231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1600.13324748979	1	147	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	527	1918	176692	211288	FALSE	25	CATCTCAAATCAGGTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKVR	93785	212400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172609_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208726_211283
530314	contig_18328_pilon	+	2046	7	Intergenic	novelGene_132550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	212.298270260395	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	79	1008	15119	39001	FALSE	40	TACTCATGAAATGTAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSAQDCSADDDNFLVPIAVGAALAAVLILVLLAYFIGLKRHHAGYEQF	15040	40039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_38861
530315	contig_5797_pilon	+	2702	9	Intergenic	novelGene_56953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	244.825830949269	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	15	1088	370215	418675	FALSE	50	AGAGTGACTTAAATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEEESPLSVSSPEGTGTWLHYTSGVGTGRRRRRSGEQITSSPVSPKSLAFTSSIFGSWQQVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGSHCAGLFSTSVLGGSSSAPNLQDYARTHRKKLTSSGCIDGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	370200	420289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_370257_370344_370462_398470_398642_400828_401003_402272_402343_403978_404099_408614_408756_412625_412752_418562
530319	contig_3424_pilon	+	2046	4	Intergenic	novelGene_55483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	72	1655	163695	170524	FALSE	40	AAATATTTTTTTACTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHFPATPADAAHPRLSDGHLQSLLQGHPRGGHAQRCASGL	149932	170915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_170063_170409
530320	contig_12624_pilon	-	1779	13	Intergenic	novelGene_61070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1339.39002493258	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	101	1180	903621	864568	TRUE	15	ACTTATGATTGGGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPERKPLQSLTSLLLPVPVLQENPSCHQVSGPGATSQEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVDSHL	903721	862092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_864537_864583_867656_867769_867898_868051_874029_874133_877426_877462_878874_878935_882980_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
530321	contig_7045_pilon	+	3185	18	Intergenic	novelGene_77477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGATTGCCGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524042	585458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_524728_526697_526895_529563_529764_533133_533318_536679_536908_537446_537525_538831_538940_539488_539651_546186_546295_552563_552718_567410_567463_568441_568551_569433_569568_569765_569988_572067_572247_577204_577364_581398_581538_585371
530322	contig_9981_pilon	-	2193	3	Intergenic	novelGene_121048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTGTGAATGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254218	249449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080_253171_253207
530323	contig_151_pilon	-	2608	5	Intergenic	novelGene_132563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	77.2863991915783	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	81	869	203676	169769	FALSE	20	TGCATTTTGAAGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFGWKRKIGEKVSKVTSQQFEAEAADEKDVVENNEGNWLHAIKRRKEILLEGCAEKSKQLKDEGADLAENKRYREAIQKWDEALQLTPNDATLYEMKSQVLMSLHEMFPAVHAAEMAVQRNPHSWESWQTLGRAQLGLGEIVLAIRSFQVALHIYPMNPEIWNEDLSWARTLQEQQKVAQRIEKSKAPAEATHFSPKSIPDYDFESDEIVAVCAAIAEKQKTVSANKTMVIVSASGAVETVTEKEDHATTPDGSVFIKAR	208545	168029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_170123_172696_172829_174441_174524_203455_203678_208466
530324	contig_8616_pilon	+	1791	11	Intergenic	novelGene_72405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	109.492282833084	469	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	136	1203	215071	237101	FALSE	15	CTAGCCATGTCGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRKRYGSKNTDQGVYLGLSKTQVLSPATAGSGSRDIAPLPPPVALVPPPPDTMSCRDRTQEFLSACKSLQSRQNGIQANKPALHAVRQRSEFTLMAKRIGKDLSNTFAKLEKLTILAKRKSLFDDKAVEIEELTYIIKQDINSLNKQIAQLQDFVRAKGSQSGRHLQTHSNTIVVSLQSKLASMSNDFKSVLEVRTENLKQQKSRREQFSRAPVSALPLAPNHLGGGAVVLGAESCASGDVAINMIDSRTSQQLQLIDEQDSYIQSRADTMQNIESTIVELGSIFQQLAHMVKEQEETIQRIDENVLGAQLDVEAAHSEILKYFQSVTSNRWLMVKIFLILIVFFIIFVVFLA	214270	237689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_214387_215051_215296_216320_216392_216556_216613_216728_216800_219806_219924_220007_220065_220243_220326_221061_221169_221372_221495_236941
530325	contig_1275_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_108821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	116	577	747507	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746555_747398
530326	contig_14925_pilon	-	1628	4	Intergenic	novelGene_55308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	885.050281057523	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	84	389	116065	115146	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKG	129484	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113306_115117_115208_115821_116101_129436
530331	contig_6785_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_132581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	21.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	213	142	354	536145	544192	FALSE	25	GAGGGTCTACACTCAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSLFPHENSTASYGINQFSYLFPEEFKAIYLRSKPSRFPRYPADIQMSISNISLPVRFDWRDKHVVTQVRNQQMCGGCWAFSVVGAVESACAIKGKPLEDLSVQQVIDCSYSNYGCN	535040	544193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_535126_536088_536229_544063
530332	contig_6785_pilon	+	2315	3	Intergenic	novelGene_132585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_2	127	422	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTTGAGAAGCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554733	560357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_554858_555392_555486_558259
530333	contig_15219_pilon	-	2301	5	Intergenic	novelGene_40829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1839	2141	23225	19680	FALSE	20	TCAAGATAGGTCGGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTLSNIWRLLLQGYQNITGLVVKSFGRIIIANVFNGFTNYFLVVNSSSGRNFSSKKDHSSFSNSFTSHFGIRVLLKVGIKDSITDLVTNLIWMAFPHRL	25263	19519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_19705_22614_22695_22780_22903_23149_23491_23690
530334	contig_12079_pilon	-	1522	4	Intergenic	novelGene_67429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.535243298843	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	124	333	638707	580913	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLGVTVRHLK	638830	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580939_601790_601879_609189_609274_638695
530335	contig_11896_pilon	-	2158	2	Intergenic	novelGene_87999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAACACATGTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134280	131984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_132318_132455
530337	contig_7915_pilon	-	2144	7	Intergenic	novelGene_42991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_5	296.612214103795	94	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	340	705	151603	143602	FALSE	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKT	167287	142162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_143637_143972_144061_147960_148028_151427_151606_154716_154771_155911_155971_167063
530338	contig_5302_pilon	+	1717	9	Intergenic	novelGene_81472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	182.923780233736	805	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	66	680	318287	334021	TRUE	5	CTCATCCTTCTTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLCAAAPAVAAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVSWRLLSISPGQQEIVTLALE	306683	338248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333957_334060_336232_336291_337307
530339	contig_614_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_132661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTATGTTTGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125429	1125097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1125100_1125400
530341	contig_9345_pilon	-	2641	7	Intergenic	novelGene_24421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	67.0563610372316	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	201743	196498	TRUE	35	ATTCCTTGCAATAAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQVTKTLRQKVGAASLWLTPELSAVEDTTRVCFSLARWCRLLLRTGREPV	204507	194234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_196481_196645_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464
530342	contig_15063_pilon	+	1362	4	Intergenic	novelGene_14228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	70	1242	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34738	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530343	contig_12414_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_59600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	873	172	1044	373182	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373010	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373000_374600
530345	contig_8729_pilon	+	1835	6	Intergenic	novelGene_40098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	71.0042252263906	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAATCTAACTTAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276489	323918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_306155_306214_322203_322528_322722
530346	contig_401_pilon	-	1809	4	Intergenic	novelGene_42772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	939	junction_1	366.764532394045	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGGGTGTGTGTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086606	1078895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1082383_1083688_1083759_1086575
530347	SIRV6	+	1004	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1386	80	1	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	96	305	2569	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2473	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
530348	contig_16724_pilon	-	1925	9	Intergenic	novelGene_105304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	796.195474977722	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	403	1197	570116	541872	FALSE	30	AAAGCAATGTTTGTGTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTSSDTPLGRVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575958	541143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568918_569140_570078_570256_571072_571184_575806
530349	contig_15063_pilon	+	1563	5	Intergenic	novelGene_8687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	249	1421	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27120	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530350	contig_10904_pilon	+	1801	3	Intergenic	novelGene_22473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	280	744	149604	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRVSAGLSPRAPPRWPAGRALAPCSLNAAHDIFALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	145857	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_145963_149429_151066_151524
530351	contig_3077_pilon	+	1185	5	Intergenic	novelGene_26772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_3	1018.6545047267	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	4	687	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13863	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
530352	contig_10923_pilon	+	1706	11	Intergenic	novelGene_66196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	772.624747209148	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	49	1590	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13830	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32918_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42554
530354	contig_7744_pilon	+	2043	18	Intergenic	novelGene_62552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	203.847048978303	2	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	122	736	882687	885326	TRUE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGESQIVLSSGSDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQRNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFHKYWADTKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHSCDPPHHPWEPDL	879806	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889084_889395_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
530358	contig_9345_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_24703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTACCCATAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955955	958205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_956000_958200
530359	contig_9014_pilon	-	1495	14	Intergenic	novelGene_106748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_13	71.1061378520637	32	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	151	1236	85778	78380	FALSE	5	GTTTGTTTTTGGTGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNGDAAETTEENSPKMRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	85928	78120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_85745
530360	contig_10940_pilon	-	1954	5	Intergenic	novelGene_49237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	5	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874543_874688_875675_893147_893306_916664_916748_916923
530362	contig_13894_pilon	+	1209	9	Intergenic	novelGene_62142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	98	1153	521729	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521631	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
530363	contig_3986_pilon	+	2204	14	Intergenic	novelGene_52696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1004	1444	46192	52882	TRUE	30	AACAGGCAGAGGTGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGFHHVGLTEEGFRRHSSFLQGLDGHFHIIFVITHPDFSKLPRPEFPDQFERLPGNFPFILNPGVLKSQAYTGQSQSLAQTIPFLRIVLHQVLERGKSNPGGDVIASFIQHKDLIVFDHLPLGGYILHRQGKGTFICVTLSNKE	34917	153860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_35487_39677_39808_41343_41498_44833_44910_46117_46297_47664_47820_48252_48398_52846_52951_54767_54869_55923_56018_57911_57962_59788_59954_60548_60657_153686
530364	contig_12624_pilon	-	2071	15	Intergenic	novelGene_61065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1030.15919118536	3	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	397	1167	900272	871253	TRUE	50	CTTTCAAAAACAAACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPG	903903	862041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871254_874052_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900322_903556
530365	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTACCCAGCTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
530366	contig_12227_pilon	+	1949	15	Intergenic	novelGene_127396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_13	91.2722994838041	1005	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	4	1080	114799	141029	TRUE	30	TTGCTAATAAATCTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMADPRDKALQDYRKKLLEHKEIDGRLKELREQLKELTKQYEKSENDLKALQSVGQIVGEVLKQLTEEKFIVKATNGPRYVVGCRRQLDKSKLKPGTRVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNPELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIREMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSDGFNGADLRNVCTEAAHEFLKIV	114795	143358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_114884_115858_115939_116032_116073_116307_116361_118433_118502_118963_119079_123311_123400_124702_124765_124848_124973_125339_125402_127297_127419_127993_128075_132517_132590_141003_141072_142531
530367	contig_15047_pilon	+	1667	5	Intergenic	novelGene_52172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	296.677750261121	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	260	535	3242	4178	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2170	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2667_2826_3221_3498_4158_4681_21013
530369	contig_4125_pilon	+	2009	8	Intergenic	novelGene_25218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	33.0361582981744	1045	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	214	1095	1702282	1711283	FALSE	20	CTCAGTGGCATTGAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1702068	1712197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
530370	contig_1516_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_50035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTCTCTGCCTGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615725	614550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_614600_615700
530371	contig_12864_pilon	+	1158	8	Intergenic	novelGene_76440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGCAGGAAGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242239	252163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242449_242566_242888_243778_243824_244597_244767_245704_245913_246327_246348_251864_251999_252111
530372	contig_2161_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_114965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCTGCTGTGTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061743	1059515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1059500_1061700
530373	scaffold_16539_pilon	-	1574	12	Intergenic	novelGene_68346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	300.630879351797	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	91	1548	502141	489810	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGSLLLSHLYLRPYWPDAVALGPSRAGGGINPQRSGDACWAWPPGPPPFQGTEDPRL	502775	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_489980_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
530375	contig_2636_pilon	-	1653	2	Intergenic	novelGene_52099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	758	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTATTTTAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85677	79688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_81216_85551
530377	contig_15304_pilon	-	835	3	Intergenic	novelGene_30580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	198	833	54100	53114	FALSE	10	TGCCGTGACCAGTGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVT	54297	53111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
530378	contig_18735_pilon	-	2492	12	Intergenic	novelGene_132674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_3	183.874148480255	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	387	1535	86559	59686	FALSE	35	GTTAATAAAGAGGATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTKEKDQLSKSIIMYRSLFEASKQLLDEMKCQVEEAKLKEAQLRNELKAHNIDIPATQQMTHIEALLKRKVTEQEELKKKPRRSCTLPNYTKGSADVLGKIAHLAQIEDDRAAMVISWHLASDMDCVVTLTTDAARRIYDETQGRQQVLPLDSIYKKTLPDWKRPLPHLRNGKLCFKPIGDPIFARDLLTFPDNKEHCETVFGMLLGDTIILDNLDAANHYRREVVKITHCPTLLTRDGDRIRSNGKFGGLQNKAPPMDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRIITKTDV	92136	58728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_59711_65767_65880_67037_67197_71407_71580_77769_77841_78099_78210_81403_81595_84587_84711_85317_85404_86459_86580_86748_86876_91897
530380	contig_18328_pilon	+	2211	8	Intergenic	novelGene_132551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_7	146.810859855218	427	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	79	1173	15119	39001	FALSE	40	TACTCATGAAATGTAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYSTAQDCSADDDNFLVPIAVGAALAAVLILVLLAYFIGLKRHHAGYEQF	15040	40039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291_28457_38861
530381	SIRV6	+	1435	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	75	18	25	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
530382	contig_9345_pilon	-	1432	3	Intergenic	novelGene_24666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2740.5	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCAGTTTTCTAAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952508	946897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948125_949470_949607_952439
530383	contig_17274_pilon	+	2022	15	Intergenic	novelGene_26486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_14	479.044350552137	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	452	1765	31273	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHDIQIDDGEETQEMASTQSIHEQDKVTTWTLESFNLEFKTWLLQSSVGERDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	30821	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_31349_36255_36337_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
530384	contig_10734_pilon	+	2572	16	Intergenic	novelGene_51282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	249.871220164841	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	125	1408	1339960	1369504	TRUE	35	GAGAACAAGAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSEDRRGPARDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESESAFKECYLESDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNSYVEDCIAQKHPLIKVLRLICLQSVCNSGLKQKVLDYYRREILQTYGYEHILTLYSLEKAGLLRPQAGGRNNYPTIRKTLRLWMDDVNEQVQTACACRC	1336787	1389466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438_1339505_1339941_1340070_1341846_1342034_1346894_1347012_1347328_1347504_1352397_1352592_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
530385	contig_10235_pilon	-	1717	11	Intergenic	novelGene_46272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_5	287.410873141571	1108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	241	1527	25335	14151	FALSE	20	AAACAGTGTGCGTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	27238	13960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
530387	contig_4232_pilon	-	2181	12	Intergenic	novelGene_63472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	343.913692805584	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	31	477	620488	614837	TRUE	5	TCTCTGCTGGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620518	607746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_608215_608459_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
530388	contig_6065_pilon	-	1999	5	Intergenic	novelGene_132696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_1	146.72657393942	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1485	1838	499520	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	501004	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497
530390	contig_4884_pilon	+	2184	11	Intergenic	novelGene_63815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_6	449.321443957441	37	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	193	1599	575052	580349	TRUE	65	CACTGAAAAAAAAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNSRSHSSRSKSRSQSTSRSRSRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRIYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGYRPVWNRRHSRSPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSSRSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSATSGDIWPGLSAYDNSPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTVHSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTITPQNAPRDEARGRSSFYPDGGDQETAKTGKFLKSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKGPGICFEMAKSMFQSKIAVERYRQS	563312	585220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576827_578420_578568_578703_578874_580272_580500_581256_581363_582400_582486_584843_585020_585152
530392	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
530393	contig_14322_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_116520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGATCACAATCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674841	672825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
530396	contig_7412_pilon	-	1679	8	Intergenic	novelGene_76321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1453.41434742682	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	137	1663	377290	364215	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEGGQCWERNGGGPAVEWGLLGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAPLLPGLAPSCLPPLVSSVRHVKGSLRSGEGTCFCHSLAKAMSRSPNHSAAFSGSGSPNYK	377426	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364400_364629_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
530397	contig_10135_pilon	+	890	2	Intergenic	novelGene_106686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	70	339	319329	319753	FALSE	20	AAGGCTGTCGTGTCAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KISLAEWVLARSACALAAASLLEMGCGARRGPGPMRGSGFFSPAAGEAERVAAGPVSGGQVPKHTRARSECRSRRTNREGFPHVADGAHTHTPTETKTGGGFTRKAGVHRLA	319259	320304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_319471_319625
530398	contig_6589_pilon	-	2687	3	Intergenic	novelGene_26294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	576	1601	2274190	2273165	FALSE	45	AAAAAATTGTGAATGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290255	2272078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274398_2274504_2274793_2290175
530400	contig_5836_pilon	-	2844	1	Intergenic	novelGene_106285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120727	117883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_117900_120700
530401	contig_14925_pilon	-	1080	7	Intergenic	novelGene_55194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1792.8439620397	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	94272	29629	TRUE	25	AGCAAAGGCTGTGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESGLKLVFGQGTRLTVNPRPFCTEQSCSCFCKASSGCENTGSIIYKLTLGKGTLVTVNPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTALE	94273	25795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29638_29681_29828_93556_93680_94214
530402	contig_7045_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_77493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTATGACATTGCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585287	582516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_582500_585300
530406	contig_12019_pilon	+	2220	2	Intergenic	novelGene_87789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3240	junction_1	0	28	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1822	2190	766615	767304	FALSE	15	TCACCTCTGTGTCTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYSLSSPAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764793	767334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_766813_767133
530407	contig_9727_pilon	+	1890	14	Intergenic	novelGene_86251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	133.236942475564	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	102	1295	4844	20134	TRUE	15	GAGACTGTTGTTACGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISTPVDINNRDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACSIALDAVKTVQFEESGRKEIDIKKYARVEKINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIASRPEELREEDVGIGAGLLEIKKIGDEYFTFITECKDPKACTILLRGGQQRDSFGSRTQPPGCYASVSQRPSGPSAGARGWGL	4742	21381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_4872_7376_7439_8182_8234_8327_8391_8706_8804_12793_12912_14765_14953_15721_15824_17193_17327_17519_17602_19150_19333_20045_20292_20547_20680_21075
530409	contig_14925_pilon	-	993	5	Intergenic	novelGene_55205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_4	1519.6860489917	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	209	466	29675	27020	TRUE	30	GGAAGAGCAAAGGCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQGGKLIFGQGTELSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	57694	25800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_57638
530410	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
530412	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_12114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	22	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530413	contig_15063_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_10481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	236	1474	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27133	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530414	contig_5799_pilon	+	2504	19	Intergenic	novelGene_50307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	258.245194044175	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	682	2268	619664	717769	FALSE	25	TATGGATATATTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	561091	718005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_609572_609706_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
530416	contig_8420_pilon	+	2036	12	Intergenic	novelGene_69349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	267.693330152741	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	197	1321	29058	41921	TRUE	50	TAAACAAACAGATCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKL	21371	59212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41922_51133_51183_58546
530418	contig_2069_pilon	-	2562	7	Intergenic	novelGene_23192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	238.57895269002	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	20	1894	114391	82208	FALSE	25	ATTTCGGGTCAAAACGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIESSQVLGLEQQPLLPEPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPVLNKVPGTEEDARTFLTAHQSPGSSTVTSPSPCHQNHLTTF	114410	81539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_82333_97870_98025_102635_102921_103028_103694_109097_109509_111852_111994_114297
530419	contig_15063_pilon	+	1873	7	Intergenic	novelGene_8454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3753.83337403247	12	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	393	1628	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26203	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530420	contig_7202_pilon	-	263	2	Intergenic	novelGene_18615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTTCTTCACCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30013	28586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
530421	contig_1435_pilon	+	3102	21	Intergenic	novelGene_115476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	180.634845752418	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	976	1563	366172	388171	TRUE	50	GCTTTAAAAACTGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAVTGVVCYACRITSTLLLYQELTRKGVRWLIELIKDDYNEAVHKKTEVVITLEFCIRNIEKTVKIYEKLMQINLEATELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETNLQDIGSKLSPGGLLADTWAHQEGTHPRDRNVERLQVLLNCITEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDK	333059	394423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_333104_338638_338757_345580_345638_348729_348817_350410_350593_357555_357717_361448_361560_364328_364360_365987_366185_366906_366966_367368_367461_370112_370215_371099_371179_386167_386290_386388_386466_388127_388172_388718_388816_388937_389035_389548_389656_390213_390286_393257
530422	contig_4364_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATCTGTTTTTGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241216	1243020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1241200_1243000
530423	contig_8576_pilon	+	1828	10	Intergenic	novelGene_88796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_3	647.8499102206	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	606	1625	909976	915551	FALSE	20	TGAAGTTAGTTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893614	915754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893685_893754_893804_902715_902845_907364_907607_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
530424	contig_7202_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_18687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCTACCTGTCCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
530425	contig_11285_pilon	+	1938	9	Intergenic	novelGene_5582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	552.564702093791	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	37	684	766060	767445	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAGKGVGKEPWWHSG	763521	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768527_768610_768686_769909
530426	contig_7963_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_58407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54838	54372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_54400_54800
530427	contig_11088_pilon	+	683	2	Intergenic	novelGene_85050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGGTCACTGAGGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
530428	contig_8412_pilon	+	2752	19	Intergenic	novelGene_118389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_15	27.2978541190727	301	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	14	2320	684930	715040	FALSE	15	GATGCCAGTGTGCTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLESPQKLSGAPPPPEGVGGSRCSEISTELIRSLTELQELEAVYERLCGEEKVVERELDALLEQQNTIESKMISLHRMGPNLQLIEGDAKQLAGMITFTCNLAENVSSKVRQLDLAKNRLYQAIQRADDILDLKFCMDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEGIARIVETHQPIVETYYGPGRLYTLIKYLQVECDRQVEKVVDKFIKQRDYHQQFRHVQNNLMRNSVTEKIEPRELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	684916	715472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711_686795_687497_687613_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694544_694703_695820_695880_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709922_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
530429	contig_1331_pilon	-	1138	5	Intergenic	novelGene_37842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	33	509	169924	160009	TRUE	35	ACAAGCATATACCTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQFFKRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169956	159255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159608_159731_160214_160867_160949_166406_166534_169860
530430	contig_10235_pilon	-	2334	11	Intergenic	novelGene_46276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	382.033885931602	37	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	50	883	25335	19534	TRUE	20	TGAAACAGTGTGCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27178	13962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17681_18878_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25338_27131
530431	contig_15918_pilon	+	2080	13	Intergenic	novelGene_132719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	101	junction_1	48.0933698364153	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1968	113	2080	195890	257009	FALSE	25	GTAAGTTTCCTCCCAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTAESLDPGSRPDPVRSFNRWKKKHSHKQNRKKQLRKQLKKPEWQVEREVISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSADGLGILIISPTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETICFHATNLQMLVLDEADRILDMGFAETMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFMRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRLRPGISILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAILFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEGGEALLILLPSEEKGMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKMESFLAQDKDLKERAQRCFVSYIRSVYLMKDKEVFDVSKLPLSEYALSLGLAVAPRVRFLQKMQKQPTEDLLMSQVKKVIEPRAPSLTNDEVEVFRAYFSEKMSILQKGGKRSEETEYRLANGSSDEEEEEEKEDEEEIGEKVGKSKGSQTVSDTSETQKIKEVPMRFMDRVEEDDEPDADFFKVKRHNVFGLDLKENKALQ	195777	257009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_196076_208109_208171_208520_208652_210044_210204_211291_211413_213016_213207_214818_214946_219352_219516_226449_226535_248772_248875_250556_250645_253441_253531_256543
530433	contig_7275_pilon	+	2632	3	Intergenic	novelGene_111242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	12	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	209	1267	408481	409539	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCPSPTYSLEWTTGPLSPRVFATLRGNPAGTEPRVEAVPPSSAFIVLCIYPKAVENEQIPEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	401663	410904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_405425_405485_408457
530434	contig_5643_pilon	+	1676	14	Intergenic	novelGene_39084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	815.977643561942	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1079	1540	636523	641217	TRUE	25	CGCCACTGTATATAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEHPRHCHRSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631279	641522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636553_640211_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
530437	contig_6842_pilon	-	987	3	Intergenic	novelGene_130716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_2	123	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	142	432	431836	429481	FALSE	40	ACTAACCAGGACTATCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	432660	428925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547
530441	contig_1443_pilon	-	1591	10	Intergenic	novelGene_28286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	563.807777417573	76	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	308	922	767487	748649	FALSE	30	AAAGAACCTGGTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809522	747979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767566_776427_776462_805197_805224_808694_808741_809399
530442	contig_511_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_132726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCCTAATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42298	40213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_-_40200_42300
530443	contig_401_pilon	+	2317	19	Intergenic	novelGene_42917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	470.659613969822	2	32	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	92	1735	1940664	1964540	TRUE	30	TAAGTGGTCTACAAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLVSLSWHLLQGSAVKLTQPWWLLLPI	1940572	1973156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1955908_1964463_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1972807
530444	contig_13457_pilon	+	1702	13	Intergenic	novelGene_118343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_9	53.6834212976616	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1536	167	1702	60777	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59244	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
530446	contig_11115_pilon	+	1865	7	Intergenic	novelGene_102827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	620.168167157551	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	803	1777	171704	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165385	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171112_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
530447	contig_9354_pilon	-	3162	9	Intergenic	novelGene_108056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	32.7392635072935	95	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	117	923	226067	213306	FALSE	30	CTAATCGCTTGTGACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKANASKKKSQQLKRNPKRKIGDEEVELSEKEVRKIAKNKQPKHPSSEVTGKTKHTNLKQIKIPSKKRKTWQPLSKKSREYLQTMMESVIISILSNTVKEKEQIQYHLNYLKKRLLQLCETLKVPPKKLRHLTNVSSLLKMEMAQHRANEEGLALLQEEVDKIVETTESMTENIQSLKNKIQILTTEMEKEEEKVKQMLQMDRSGVLCLPELPQNSLRAPILQEEILTLIPNQNALLKDLDTLHNSSQMKNMLTFIQEAYNKLDTS	229879	211066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_213438_214198_214277_214414_214535_219693_219824_223361_223431_224006_224134_225187_225237_225965_226108_229803
530448	contig_3386_pilon	-	1687	7	Intergenic	novelGene_34507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	801.848489429269	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	116	916	409604	404773	FALSE	25	TCAGTTGAATCCACTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYLTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412209	404001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406578_407730_407838_409398_409607_412096
530449	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	19	1158	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
530450	contig_12357_pilon	+	1836	10	Intergenic	novelGene_6136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1272	junction_9	508.370259739547	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	111	1154	30278	53235	FALSE	50	GAATAGAAGAAATAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	29604	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
530453	contig_11328_pilon	+	2062	9	Intergenic	novelGene_88448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.206422490142	507	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	434	1804	830591	857309	FALSE	25	TCAGAGTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829358	857567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830225_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
530456	contig_18055_pilon	+	2090	9	Intergenic	novelGene_117816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	279.678833664616	164	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	727	1131	77213	78314	FALSE	65	AAAAAAAAATTATTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVAE	40672	79273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40863_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932
530457	contig_14680_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_132732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5095	4256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_5100
530458	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	181	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
530459	contig_2078_pilon	-	2213	11	Intergenic	novelGene_100175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	64.4072200921605	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	92	1699	535379	505518	FALSE	15	GTATCTGAGGTGCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535470	505003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532049_535345
530460	contig_2342_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_132755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204879	206932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_204900_206900
530463	contig_5092_pilon	-	2415	7	Intergenic	novelGene_62275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	631.014791163144	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAATGATTGTTGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259003	232281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_251143_252780_258929
530465	contig_14441_pilon	+	834	6	Intergenic	novelGene_100429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	442.851487521494	94	11	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	246	794	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81885	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_82331_82376_121648_121691_125517_125902_126159_126283_126514
530466	contig_11422_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_99094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAGTGAGGTGTTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632	749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1600
530467	contig_6048_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_73306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTTGATTATATCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2025618	2026626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2025600_2026600
530468	contig_15039_pilon	-	1926	9	Intergenic	novelGene_110118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_8	506.449266338693	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	529	1152	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260810	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_222093_222255_244329_244524_260778
530469	contig_9313_pilon	+	1916	5	Intergenic	novelGene_86471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1052.16978192685	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	127	450	387329	461613	TRUE	70	AAATAAACTAAATGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387202	463667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601_462554_463141
530470	contig_6048_pilon	-	2407	16	Intergenic	novelGene_73292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	110.825909525806	3	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	143	1702	2006289	1979379	TRUE	30	CCTCTGACCCTTGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEDYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGK	2049135	1978486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979153_1979236_1979383_1979455_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985783_1987376_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
530472	contig_4180_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_8414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAACAGAGTTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890365	888304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_888300_890400
530474	contig_6102_pilon	+	2453	9	Intergenic	novelGene_32273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	64.0229451056416	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1254	1640	1447451	1448190	TRUE	20	TAGAAGGGGAGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQVGSCPLEGGGGFGPGRLGPGTLLTEVGAGGEKESGGGG	1444320	1449216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447304_1447414_1447555_1447907_1448581_1448676_1448785_1448901
530477	contig_12869_pilon	+	2016	9	Intergenic	novelGene_75338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	309.004019998122	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	48	1022	67502	97384	TRUE	20	TTTTAAACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67454	98478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97551_97650
530478	contig_3602_pilon	+	1477	7	Intergenic	novelGene_60499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	6822	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	121	570	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161624	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170094_170867
530480	contig_14575_pilon	+	2700	26	Intergenic	novelGene_101864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_18	117.121133874293	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	1966	2700	51080	63919	FALSE	70	AAAGAAGAAGCAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEKKLKRKIQ	17090	63919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
530482	contig_7707_pilon	-	381	3	Intergenic	novelGene_72181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	62	364	575766	542852	FALSE	60	CCAAAAAGAAAAACAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLGINQHPEWCCLAYSVVQMYYSCICSTIWSPFHRSCITYCVSFAKSSSYNIVHVSIFTELQFCEIYFYFAVLYKHTLFNHLSCYWLLTFHQRVPADKFIPALSWQQYVIQFINKMFLK	575827	542834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_542967_553913_554056_575720
530484	contig_9848_pilon	-	1869	12	Intergenic	novelGene_79968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_2	458.660518329603	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	250	966	113970	104044	TRUE	25	AGTTTAAGAGCAGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	114219	98505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
530486	contig_14711_pilon	+	1828	9	Intergenic	novelGene_68920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_3	332.735231640715	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	341	1591	86227	90570	FALSE	20	CTCAGACCTCAGTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85743	90807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
530487	contig_7031_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_132808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGGATAAAGAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369174	371777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_369200_371800
530488	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_14011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530489	contig_13894_pilon	+	1194	9	Intergenic	novelGene_62089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2272.41905452648	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	27	1193	520713	527579	FALSE	20	TGAGCTGATATAGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFM	520686	527580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459
530491	contig_5954_pilon	+	2450	14	Intergenic	novelGene_28681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1962	2312	956720	959897	TRUE	10	CTCTGCTTTCTCTTTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAWKRGWEKLARRRRARRLGSRRITGWCWGPKKRRASARIPYLSSVQWVCSSHRFFSAPTKWRGRTSPACLISSTIFSSTPPMCDSPVTRRVTDSASGSSSPTNTRSSQDESM	944728	960563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_945259_945380_945530_946212_946337_946675_946907_947096_947204_947434_947644_947798_947935_948094_948197_955828_955927_956116_956290_956412_956505_956709_956939_959765_959943_960470
530493	contig_859_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_132817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAAAAAACTGATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72014	73764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_72000_73800
530494	contig_5988_pilon	+	1408	5	Intergenic	novelGene_16020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	155.77788674905	1092	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	96	593	779480	786116	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKP	779384	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838_785953_786107
530495	contig_9363_pilon	+	1588	12	Intergenic	novelGene_6811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	266.584209014465	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	205	1302	1622283	1625624	TRUE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622078	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537_1625690_1625748
530496	contig_3601_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_132948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1132	1470	449656	449318	NA	50	TTTAAAGCCTCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEKRTVEIGRRKEPKGVTKTLMLGERPKVKKKREEKKGKDKKKKKMNAVNQEKEIHRKNKSPQRSMNEKRRQRVRGRGSVVNRNHMKSRNKCKYKSETNTIPERVCLNLQ	450787	449208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_449200_450800
530497	contig_14219_pilon	-	3757	1	Intergenic	novelGene_54349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAAGTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847099	843342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_843300_847100
530499	contig_8712_pilon	+	2761	4	Intergenic	novelGene_58744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	56.4977875673021	300	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1538	2041	93606	103433	FALSE	10	TCTAACTTTTTTTTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKENGIQDMEQFYELWLKSQKNEKSDDVASQSNKENGKQIHMPTDYAEVTVDFHCWMCRKNCNSEKQWQGHISSEKHKEKVFHTEDDQYCWQHRFPTGYFRTCDGFLNGTCTEGNSCKFAHGNAELQEWEERRDALKMKLNKARKDHLIAPNDNDFGKYSFLFKDLN	92068	104153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_93622_99333_99468_101391_101556_103243
530500	contig_12622_pilon	-	2034	11	Intergenic	novelGene_5970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	73	junction_6	2217.6976439542	2	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	20	1201	1590968	1586655	TRUE	35	ACCTTCAGAAGCGAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590987	1583554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
530501	contig_4151_pilon	+	2548	24	Intergenic	novelGene_65286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	102.302028836039	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	84	2297	707721	828280	FALSE	25	GTTCAGTATCCTTAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPQFYISKIPICIRNGCGSRHRHFLMANKQRSLPLPRTREISAGIMASPLRFDGRVVLVTGAGGGLGRAYALAFAERGASVVVNDLGGDFKGDGKSSLAADKVVEEIRRKDGKAVANYDSVEAGEKIVKTALDAFGRIDIVVNNAGILRDRSFARISDEDWDLIHRVHLRGSFQVTRAAWDHMKKQNYGRIIMTSSASGIYGNFGQANYGAAKLGLLGLSNTLAVEGRKNNIHCNTIAPTAGSRMTKTILPEDVLEGLKPDYVAPLVLWLCHESCEENGSLFEVGAGWIGKLRWERTLGAIVRQKNQPMTPEAVKANWAKICDFDNTSTPQSIQDTELEAIMYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLKQFADNDASRFKAIKVRFVKPVYPGQTLQTEMWKEGNRIHFQTKNKETGDIVISNAYVDLVTTSEASDISAQTTSEGGELQSTLVFEEISRRLKDVGHEVVKKVKAVFEWHITKGGNVAAKWTIDLKNGSGKTYQGPAEGSADITIIISDEDFMQVVLGKLDPQKAFFNGRLKATGNILLSQKLQMILKDYAKL	707637	828531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_707854_723769_723836_726654_726709_740934_741043_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757522_763449_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940_793048_799587_799675_803058_803155_804394_804534_811593_811722_828190
530502	contig_12570_pilon	-	2030	6	Intergenic	novelGene_79352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	217.631431553441	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	304	975	198025	190389	FALSE	20	AGTTCTGTATAGGTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	205008	189333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_201210_201386_204946
530503	contig_15063_pilon	-	1203	3	Intergenic	novelGene_14338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	FALSE	20	AGCGGGGGGTGGAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	35033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36156_36264
530504	contig_1532_pilon	-	2083	8	Intergenic	novelGene_37417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1414.4017124147	1	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	146	793	32217	15878	TRUE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTVDHK	35476	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13514_15732_15889_17967_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
530505	contig_15063_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_13342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530507	contig_8658_pilon	-	1383	7	Intergenic	novelGene_55821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	5820	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	48	1037	55624	6049	FALSE	20	CTGAAGCAGTGTGATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55671	5702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
530508	contig_2596_pilon	-	2684	15	Intergenic	novelGene_53475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	100.703064217814	437	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	98	1300	722501	669421	TRUE	25	AACACTGAGTACTTTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEIAGAKPHITAAEGKLHNMIVDLDSVVQKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSNSVQLTGCRPMT	722598	662383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669296_669340_669458_674929_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
530510	contig_5602_pilon	-	2396	11	Intergenic	novelGene_133013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.438407495284	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	492	1346	508819	488176	TRUE	80	TAGAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516417	486689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_487405_487840_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_508816_509066_511996_512153_516328
530511	contig_14871_pilon	+	2005	12	Intergenic	novelGene_63689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	744.698241621652	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	132	1559	201945	233218	TRUE	5	TGCCCTGTCTGTGTGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	193746	234212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_193813_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233610_234157
530513	contig_6735_pilon	-	1421	12	Intergenic	novelGene_15724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	919.639059631549	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	86	1102	564868	542303	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEST	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542312_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
530514	contig_1443_pilon	+	2104	11	Intergenic	novelGene_28229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	53.5855390940504	39	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1154	1972	538444	541708	FALSE	40	AGAATGGAAATGAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535988	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536604_537644_537727_537987_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
530519	contig_4103_pilon	-	1448	4	Intergenic	novelGene_51876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	310.071317961243	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44023	39933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_42069_42354_42449_43898
530520	contig_5499_pilon	+	2074	9	Intergenic	novelGene_57022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	200.302895635585	2	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	72	935	818231	840037	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	818159	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
530525	contig_1267_pilon	-	3587	1	Intergenic	novelGene_74465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATCTTAGTCACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37331	33744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1267_pilon_-_33700_37300
530526	contig_16148_pilon	-	3441	7	Intergenic	novelGene_50377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	531.810325418962	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1077	1562	111433	85700	FALSE	75	AAAAAAGAAAAGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWGK	153081	83820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151167_151211_151734_152961
530527	contig_15087_pilon	-	1698	17	Intergenic	novelGene_37171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	321.431733615398	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	127	693	143049	127673	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHDATRSLRCQAVEEGHGGGRHR	144053	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132660_133442_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010
530528	contig_16724_pilon	-	1714	8	Intergenic	novelGene_105293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	851.408389022541	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	187	660	569099	557742	TRUE	20	TGTTTGTGTACCGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMVSQIRFCPKK	575952	541136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_557699_557776_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575806
530529	contig_19721_pilon	+	1336	5	Intergenic	novelGene_99159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4.96865172858795	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCTGGGGATAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160321	166124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_160441_162252_162324_164314_164627_164967_165610_165932
530530	contig_5526_pilon	+	3296	7	Intergenic	novelGene_111705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	58.6799227447799	576	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	141	881	361707	384508	FALSE	55	AACTTAATATAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLRGVWGVLSALGKSGAELCAGCGSRLRFPLSFVCVPRWFSSTLGSYPKKPLSSYLRFSTEQLPIFKAQNPDAKNSELIKKIAQLWRELPDSEKKVYEDAYKADWQAYKEEINRIQEQLTPSQIVSMEKEIMQKRLKRKALIKKRELTMLGKPKRPRSAYNIFIAESFQEAKDASSQAKLKTVNENWKNLSTSQKQVYIQLAKDDKIRYDNEMKSWEAQMIEVGRNDLIRRKMKQRTKDGTEEC	361566	386923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_361808_362365_362485_370349_370421_373841_373992_376247_376344_383831_383889_384361
530531	contig_3320_pilon	-	2821	11	Intergenic	novelGene_133055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	15	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGCGCCTGCGCGGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177776	103713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_103779_113121_113281_125920_126021_127201_127282_129180_129261_154065_154147_169045_169153_170842_170969_174495_174582_175790_176252_176300
530533	contig_3986_pilon	-	2261	7	Intergenic	novelGene_52673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	155.835828857024	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	207	1052	47670	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESHQDLKSCDEKPLKHCQEKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPVLPKGRSDSTHFLGGPSELPQLLTQALSPSCPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153741	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35584_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_153684
530535	contig_9981_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_121033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATTCCAGGGACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101997	100606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_100600_102000
530536	contig_9981_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_121032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAATCTGCTTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100656	99149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_99100_100700
530537	contig_7356_pilon	-	1884	4	Intergenic	novelGene_60381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	9514	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	66	455	457848	433924	FALSE	5	TTGCTTTTTCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457913	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
530538	contig_2463_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_43033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	601	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTCATAGTAGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522961	525700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_523000_525700
530539	contig_4315_pilon	-	2160	12	Intergenic	novelGene_46726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	203.996191829631	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	331	1485	155000	147905	FALSE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARIFLIASKELEFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163757	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155125_161983_162089_163656
530540	contig_18168_pilon	-	1359	7	Intergenic	novelGene_122073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	164.736911467952	21	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	46	978	27110	23837	FALSE	25	AAATATGTGGTGATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGDYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27155	23455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26642_27036
530541	contig_12074_pilon	-	1804	12	Intergenic	novelGene_53749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	342.055889300212	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	487	1551	36661	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	46710	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33417_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_41067_41228_46464
530542	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	59	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530543	contig_15039_pilon	-	1889	9	Intergenic	novelGene_110125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_8	510.192059424684	1034	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	429	1115	202841	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260906	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202857_208401_208526_222093_222255_260778
530544	contig_10011_pilon	+	2666	1	Intergenic	novelGene_68120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	524	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1488	1931	333300	333743	NA	80	AAAAAACAAAAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCILVVGSPTFLSGRQDWEVEVGGKTGWVLGVCKASTSRKGSVALSPENGYWVVMTTMRNEYQASAFPPTHLWSKEPPWRVGIFLDYEAGDISFYNVTAKSHIYTFTCCSSSGPLQPVFSPGTQDGRKNTDPLIICPVCVQGPH	331812	334478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_331800_334500
530545	contig_7593_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_127339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAATCTGTATGTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588604	589799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_588600_589800
530546	contig_10642_pilon	-	2143	2	Intergenic	novelGene_78663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATAAACTGTGTCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171466	169172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170409_170559
530547	contig_11285_pilon	-	2051	11	Intergenic	novelGene_5550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	317.347900576008	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	978	1736	743612	741540	FALSE	35	ATGATAAACTTTTGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745251	741224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744486
530548	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530549	contig_17796_pilon	+	2085	13	Intergenic	novelGene_33811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_12	319.774519084238	25	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	105	1310	53527	120497	FALSE	15	CTACTTCAGCTCTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53422	121272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
530552	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	223	1395	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28178	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530555	contig_10042_pilon	+	2531	9	Intergenic	novelGene_79106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	291.165733517871	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	10	1038	6321	71641	TRUE	80	AAAGAGAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTAEKTALAKWRGTFGNQQRCGETHVRLCTTDK	6311	78294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_71545_72869_78028
530556	contig_8617_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_73425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62517	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
530557	contig_6217_pilon	-	2138	3	Intergenic	novelGene_109658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.5	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	112	744	739958	739095	FALSE	45	ATATATAAACGTATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRESRHRFSCGRSVGAGRRPAGGGFSARALRAAPGKMKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797226	737700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739435_739665_739964_797120
530558	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_12375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	13	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	10	1419	28164	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28154	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530559	contig_4105_pilon	+	2428	13	Intergenic	novelGene_21464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	139.443810866201	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	563	1474	63728	73476	TRUE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSALYSPFAGPCTQFLTCPRICLPSRPQGMHRHSDPCKTRPLPSSSVTTCLSWCCPCISPGA	58733	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61792_62304_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73190_73294_73510_73560
530560	contig_17106_pilon	-	2243	10	Intergenic	novelGene_127676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_9	45.7869462231807	587	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	809	1513	93400	88603	FALSE	5	GCACTGGCTTTGCGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMYNTDESISGFAHSCFQYAIQKKWPLYMSTKNTILKAYDGRFKDIFQEIFEKHYKTDFDKNKIWYEHRLIDDMVAQVLKSAGGFVWACKNYDGDVQSDILAQGFGSLGLMTSVLVCPDGKTIEAEAAHGTVTRHYREHQKGRPTSTNPIASIFAWTRGLEHRGKLDGNQDLIRFAQTLEKVCVQTVESGAMTKDLAGCIHGLSNVKLNEHFLNTTDFLDTIKSNLDKALGKQ	109655	87872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_88691_89398_89492_89583_89682_89863_89977_91552_91705_91873_92011_93376_93766_95773_95940_96841_96934_109470
530561	contig_3817_pilon	-	2436	18	Intergenic	novelGene_78289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTGAGAGATATGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130887	82160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_82200_84235_84349_84972_85080_86587_86675_86779_86914_89564_89659_94131_94179_95297_95350_99004_99095_99341_99432_100442_100565_110570_110710_113089_113240_117076_117328_123626_123708_124543_124732_129751_129819_130302
530562	scaffold_8345_pilon	+	813	5	Intergenic	novelGene_107034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_4	114.494541354599	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	3	572	790638	797810	FALSE	25	TAACTGCTCTAGAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQEEK	790635	798051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_790675_792008_792117_795998_796229_797376_797559_797797
530564	contig_500_pilon	+	1444	11	Intergenic	novelGene_30986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1158.56584189247	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	235	1197	1492663	1499316	FALSE	45	AGGTAATAAACATGCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK	1485716	1499563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498000_1498048_1498078_1498882_1498974_1499277
530565	contig_8772_pilon	+	1680	8	Intergenic	novelGene_21121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5805	junction_1	2932.96317392357	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	510	1364	16533	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNCFRLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	16023	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
530567	contig_10923_pilon	+	1565	9	Intergenic	novelGene_66182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	908.728060257853	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	51	1451	21667	42718	FALSE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42554
530571	contig_14101_pilon	+	2398	4	Intergenic	novelGene_122762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	43.6882898116494	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	82	1236	260068	273778	FALSE	20	AAATCCCCTGTGTGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257218	274940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264833_273610
530573	contig_14925_pilon	-	1692	6	Intergenic	novelGene_55186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1755.56071954233	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94840	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_93556_93680_94214
530574	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	436	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
530581	SIRV6	+	482	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1409	139	23	-78	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTATTGTAAGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	11192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
530583	contig_6710_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_98202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530586	contig_9727_pilon	+	1880	5	Intergenic	novelGene_86314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	138.131051903618	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	40	315	309192	310109	TRUE	15	CAGACTGACTTGTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPYPLGTG	308426	314661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_311014_312912_312991_314078
530588	contig_5988_pilon	-	1607	4	Intergenic	novelGene_15969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	89	1444	655459	651962	FALSE	40	TTAAGAAGAAAGGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655547	651798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
530593	contig_16098_pilon	-	1442	8	Intergenic	novelGene_46117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1994.26054016039	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	632	1234	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460448	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_460197
530594	contig_13216_pilon	+	1988	7	Intergenic	novelGene_47464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	883.174466846098	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	503	1453	246066	261012	FALSE	15	ACTTAGTTTTGTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229595	261547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243845_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
530595	contig_14441_pilon	+	1321	7	Intergenic	novelGene_100601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.262980125825	223	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	711	1139	116728	117610	FALSE	15	CTGCCTACGAGTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111202	117792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112109_112154_112401_112665_113143_113209_116578_116963_117220_117344_117539
530596	contig_11285_pilon	-	1957	12	Intergenic	novelGene_5536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_11	307.507091902362	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	555	1634	744458	741540	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745293	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744754
530597	contig_15304_pilon	+	1308	5	Intergenic	novelGene_30419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	311	685	50040	53495	TRUE	40	GAGCAAAGAAGACAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAFANLQDRKAGQAVDGLLGEVQGQGLMAHQAGEIITLLPGLGLHAQHTGHGKGDSFLAWLLPWGPGQVVVLGQLLGPVPPAHQHVLGAESTHHACQCHQFVQRQLLRRWWQQVDLGWEAVP	49405	54297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_49526_49849_50077_52985_53322_53493_53813_53991
530598	contig_7057_pilon	-	2808	5	Intergenic	novelGene_123379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	72.3550274687254	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	128	1786	1194054	1173144	FALSE	20	CTGTGAACATATTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSVSFKDVTVDFTQEEWQQLEPAQKALYRDVMLENYCHLISVGFHMTKPDMILKLEQGEELWTTGRVYPSHTYLEEDGKAGDVLVKFREYQDKHSRSGVFINHRKLIKERSNVYGKTFTLGKNRITSKTTLCEYKTDGKVLKNISELVIRNINPIREKFGESNGWEKSLLNTKHEKIHPAVNLHKQTERSLSCKQELIQHQKVQTPEKLFEHNECEKSFLMKGTLFTHTRVHRGGIPLEYNKDGIAYIRKSNIDVHPQALMEKKPYAYSKYGKFFCRKSVFIMHERSQTEERPFQCPYCGNGFRRKSYLIEHQRIHTGEKPYVCSQCGKAFRQKTALTLHEKTHIEGKPYICIDCGKSFRQKATLTRHHKIHTGEKAYACTQCGSAFRKKSYLIDHQRTHTGEKPYQCNECGKAFIQKTTLTVHQRTHTGEKPYICTECGKSFCQKTTLTLHQRIHTGEKPYICNECGKSFRQKAILTVHQRIHTGEKSNGCPQCGKAFSRKSNLIRHQKTHTGEKPYECKECGKFFSCKSNLIVHQKTHKEKLLEFSK	1197066	1172121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1174571_1191057_1191154_1191418_1191546_1194045_1194109_1196993
530599	contig_14273_pilon	+	2907	8	Intergenic	novelGene_21155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.144043780437	1	149	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	237	1835	135370	151187	FALSE	65	AAAAGAAAAGAAACAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKEPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	128109	152259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128269_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148903_149549_150873
530600	contig_3866_pilon	-	2427	12	Intergenic	novelGene_112425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.06141454619	1872	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	49	816	268685	242015	TRUE	20	ACTTATCTGACTGTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTKGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM	268733	239701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_240568_241269_242060_242535_242601_243133_243202_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253751_253854_257352_257477_265864_265948_268664
530601	contig_7457_pilon	-	1184	4	Intergenic	novelGene_31689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	31	372	1176842	1174926	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176872	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
530602	contig_5210_pilon	-	2538	9	Intergenic	novelGene_65417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.478082160423	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	313	1167	442701	431502	FALSE	25	CTTACTACTTTCTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQPEVPALEPSEPLGKMSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGKAASLMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444302	430130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431657_431804_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777_439957_442673_442763_443013_443119_444156
530604	contig_10923_pilon	+	1362	8	Intergenic	novelGene_66198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	791.447988415756	149	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	48	821	21667	37441	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCSLVLWSLCGSLRERKAKS	13831	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_37379_37540_38578_38742_42554
530608	contig_3948_pilon	+	2359	5	Intergenic	novelGene_53370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.5307643771954	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	265	897	1813956	1860572	FALSE	30	ATTGAACAAAGGGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSHAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812672	1862034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812745_1813504_1813586_1813844_1814033_1814101_1814520_1860434
530609	contig_10311_pilon	-	1872	8	Intergenic	novelGene_50476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	585.57367650215	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	32	322	71526	68955	TRUE	40	TATACTTGTGGACTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKDPEGNSGTWRLYGSNLPCLHWWNQCSK	71557	65457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66642_66754_67180_67217_67708_67962_68264_69038_70224_70358_70446_70493_71497
530610	contig_15221_pilon	-	2683	6	Intergenic	novelGene_133069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	69.5281238061261	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	255	407	182332	154058	TRUE	15	GATGTCACCTTTTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEHFSPLGLSFVHVT	190693	139939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_140527_141050_141158_149435_150948_153987_154103_182224_182420_190526
530611	SIRV4	+	384	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	126	440	126	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
530612	contig_5472_pilon	-	2792	10	Intergenic	novelGene_130031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	63.6770400701757	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	144	2456	449707	402325	FALSE	10	TTTGGTATTTTTGCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINLTIDIYIYLLSNARSLCGKQRSKQLHFLCSPKYYWRVSHISPQRGFHTSKVRCKWTKSEARSCSKHCCWPSNHGLHSGILKLSTSAPKGLTKVSIRISRIKSTLHSISKAVFGSQNEMISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKVAAVSTVVNKGVTPKAFVFRNYGHFPGINSHYLGGCQYKLWQAIRASSAAPGYFAEYALGNDLHHDGGLLLNNPSALAMHECKCLWPDVPLQCIVSLGTGRYESDVRNTVMHTSLKTKLSHVINSATDTEEVHIMLDGLLPPNTYFRFNPVMCENIPLDESRNEKLDQLQLEGLKYIERNEEKMKKAAKILSQEKTTLQKINDWIKLKSDMYEGLPFFSKL	456270	401988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_421983_422179_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449801_456220
530613	SIRV6	+	694	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8192	18	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
530615	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_17486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27935	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
530616	contig_12414_pilon	+	1185	2	Intergenic	novelGene_59539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	FALSE	50	TAAAGAACATTTAAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
530617	contig_14300_pilon	-	1775	8	Intergenic	novelGene_133093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	104.325628369514	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	838	1617	180329	148003	FALSE	10	TGCTGCAACCTCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIMTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPEIFNPEKEREAGISTSNKKSLRSRQH	185609	147844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_184804
530618	contig_13457_pilon	+	2621	15	Intergenic	novelGene_118316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_2	190.98423911893	504	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	370	2340	52406	57730	FALSE	20	TTCCCGATGGCCTCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDGSDPEPPDAGEDSKSENGENAPIYCICRKPDINCFMIGCDNCNEWFHGDCIRITEKMAKAIREWYCRECREKDPKLEIRYRHKKSRERDGSERDSSEPRDEGGGRKRPAPDPDLQRRVGSGTGVGTILARGSASPHKASPQPLVPTSSQHHQQQQQQIKRSARMCGECEACRRTEDCGHCDFCRDMKKFGGPNKIRQKCRLRQCQLRARESYKYFPSSLSPVTPSEPLPRPRRPLPTQQQPQPSQKLGRIREDEGAVVSSAVKEPPEATATPEPLSDEDLPLDPDLYQDFCAGAFDDHGLPWMSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52036	58011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53413_53513_53615_53935_54172_54259_54440_54805_54833_54909_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
530622	contig_3956_pilon	+	1516	10	Intergenic	novelGene_14949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1595.19187282004	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	496	1335	1284132	1290816	FALSE	10	GGTATGGTGGTGACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1290997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282795_1282856_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286138_1290563
530623	contig_5018_pilon	-	1846	9	Intergenic	novelGene_47101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	74	1324	1402792	1399645	FALSE	50	ACAAGCAAAATTTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
530624	contig_5945_pilon	-	1282	7	Intergenic	novelGene_104526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	791.77388747602	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	687	1280	32224	2616	FALSE	15	GAGTCTTTGGGGACCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILPGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKLAEDYNSSNTLNVKAVSETPAVPPVSEDEDDDDDATPPPVIAPRPEHTKS	55410	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_2733_12606_12645_16208_16357_16847_16949_32034_32246_34108_34321_54957
530628	contig_5031_pilon	-	1577	9	Intergenic	novelGene_133217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	520.324763368994	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	928	1359	103742	98495	FALSE	50	AAAAGCTAGTTATATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMYTLLRNQPEPTMKEIEDAFQGNLCRCTGYRPILQGFWTFARDGGCCGGNGANPNCCMNQKKNPTEVTLSPSLVNPEDFMPLDPTQEPIFPPELLVGDASGRGPTTCLYQEPLRPALFSYPPGTLCPLCHLGFSLDFPSSF	116957	98276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_98726_99042_99112_102699_102762_103672_103800_105631_105780_105906_106016_107368_107466_110278_110337_116499
530629	contig_9955_pilon	+	2193	5	Intergenic	novelGene_21310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTTAGGACTAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44980	49754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_45362_45924_46814_47459_47737_48794_49384_49697
530631	contig_10163_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_82635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127489	127297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_127300_127500
530632	contig_11908_pilon	+	2046	15	Intergenic	novelGene_133224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	108.136558601254	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	212	1597	692429	836723	TRUE	5	TATTTCCTTTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVAAGAASVELVIGWCIFGLLLLAILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSHGLAALSFSISSLTLIGMLAAITYTAYGMSALPLNLIKGTRSAAYERLENTEDIEEVEQQIQTIKSKSKDGRPLPARDKRALKQLEERLRTLKKRERHLEFIENSCWTKFCGALRPLKIIWGIFFILVALLFVISLFLSNLDKALHSAGIDSGFIIFGTNLSNPLNMLLPVLQTVFPLDYILITVIIMYFIFTSMAGIRNIGIWFFWIRLYKIRRGRTRPQALLFLCMILLLIVLHTSYMIYSLAPQYVMYGRSMYCYPDIPIPSQVLVL	692217	837353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_698010_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752803_752878_783983_784110_788412_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810413_836668_836761_836941
530633	contig_7420_pilon	+	3013	8	Intergenic	novelGene_85861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	44.6011805462865	133	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	311	1075	271163	308979	FALSE	70	GCATTAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYTGLSCLVILGDDLSRVNKEACLAGLRALQLEDGSFCAVPEGSENDMRFVYCASCICYMLNNWSGMDMKKAIDYIRRSMSYDNGLAQGAGLESHGGSTFCGIASLCLMGKLEEVFSEKELNRIKRWCIMRQQNGYHGRPNKPVDTCYSFWVGATLKLLKIFQYTNFEKNRNYILSTQDRLVGGFAKWPDSHPDALHAYFGICGLSLMEESGICKVHPALNVSTRTSERLQGLHQSWKTQDSRQCSENVHIST	226828	310917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_+_226974_244417_244541_271120_271273_272818_272952_278440_278487_297734_297920_304868_304978_308797
530634	contig_8616_pilon	+	1933	12	Intergenic	novelGene_72467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_3	536.433585577504	1361	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	384	1394	320431	330137	TRUE	15	CACTTCCTTGACTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVRGRDPFSSLLVTLL	318025	331070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330292_330467_330546_330638_330720_330844
530636	contig_9945_pilon	+	2247	2	Intergenic	novelGene_104801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAAACCCAAGCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28297	30651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_28482_28588
530638	contig_6101_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_114271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAACTCACAGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162075	162741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_162100_162700
530639	contig_3602_pilon	+	1620	7	Intergenic	novelGene_60505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	550	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	106	555	161745	169451	TRUE	10	GACTTGGCTCCACCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161639	171130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170149_170762
530641	contig_12624_pilon	-	1937	15	Intergenic	novelGene_61073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1092.02639993879	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	314	1405	903590	867935	TRUE	25	CTCTCCCGTTAAAATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVCWRPTRRTGRALWTPSPPSRIHTPEFASTLAACTRSWKTCRMRRRPLPEASTETSTWRWLTSNEGCSTTGQRTIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSETKRRAKGNKAQCAHALHTQGALQVHCGHGDSARAPLQPGIGQCV	903903	862277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874064_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888794_900249_900333_903447
530643	contig_9363_pilon	+	1643	11	Intergenic	novelGene_6815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	302.887041650844	26	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	47	583	1622283	1623633	TRUE	10	CTGGGGCCACGCGAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKWRATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGSGGHPGGWAFGDGLQALGLGSDQFLDAGSGP	1622236	1625964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623738_1624051_1624128_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
530644	contig_12644_pilon	+	1457	10	Intergenic	novelGene_44630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5194.95779043915	4	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	396	1367	2678073	2680545	FALSE	15	TGTGTTGGAGTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677225_2677499_2677643_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
530645	contig_13952_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_133268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGAACAGCTGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205194	204868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_204900_205200
530646	contig_12837_pilon	+	2287	7	Intergenic	novelGene_57313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2844.97026444136	4	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	246	578	154005	166049	FALSE	45	ATAAACATTTTAATATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128812	167758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
530647	contig_5434_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_74684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358252	359927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_358300_359900
530648	contig_11924_pilon	-	2264	9	Intergenic	novelGene_128016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCGCAGCGCCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72562	11001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_11128_38812_38977_42069_42207_50560_50655_58636_58761_61407_61472_64459_64572_71053_72193_72258
530649	contig_10106_pilon	-	3150	2	Intergenic	novelGene_73894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1680	2039	163968	163539	FALSE	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFHLTSGTDSRASRKWSWVMVWMKQGKGHFATGEWVQNIPLITRSTLALTPPSNHCLKKTIFYQTVFAAENTIMYNLVRDDTVRRLRAAFRARFLGSNPISITVIYTYLSVPQFAHL	165647	162427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_163773_163842
530650	contig_1154_pilon	+	2895	6	Intergenic	novelGene_87199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_5	70.5311278798234	506	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	188	664	1091545	1096644	FALSE	40	ATCAATGCAGATGTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQLFVEGYKDADYWLRRFEAEPLPENTNRQLLLQFERLVVLDYIIRNTDRGNDNWLIKYDCPMDSSSSRDTDWVVIKEPIIKVAAIDNGLAFPLKHPDSWRAYPFYWAWLPQAKVPFSQEIKDLILPKISDPNFVKDLEEDLYELFKKDPGFDRGQFHKQIAVMRGQILNLTQALKDNKSPLHLVQMPPVIVETARSHQRSASESYTQSFQSRKPFFSWW	1086785	1098875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1086932_1091503_1091566_1093478_1093579_1094316_1094451_1094926_1094987_1096482
530651	contig_15063_pilon	+	1371	5	Intergenic	novelGene_14339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	238	1122	35271	39515	FALSE	10	TCCTTATACTGCGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35033	39764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530652	contig_5988_pilon	-	1521	3	Intergenic	novelGene_15997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	105.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	887	1306	689940	689521	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	693450	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_691134_691358_693350
530655	contig_3822_pilon	-	3184	2	Intergenic	novelGene_133295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTACAGAAAGAGAACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272759	269499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_269909_269984
530656	contig_12402_pilon	+	919	2	Intergenic	novelGene_133384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTGTAACGAAAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641196	653884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_641258_653026
530657	contig_9609_pilon	+	1613	17	Intergenic	novelGene_22979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	249.425809360218	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	172	1467	311574	325242	TRUE	40	TACGATCCAACAACAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPVILSS	309933	325979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325254_325631_325717_325929
530658	contig_11370_pilon	-	743	3	Intergenic	novelGene_98737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGGGGGAGGCGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148548	145755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
530659	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
530661	contig_14441_pilon	+	1386	6	Intergenic	novelGene_100350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	382.969450478756	1499	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	170	1150	13117	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLREMPPVLPSLTSMDPTLLRLVVLCVLGTGSMDTEVTQTPRQLVKARQQIARMDCVPIKQHVHVYWYRQKLREELKFLAYLKNEETIDGSGLPDKRFSAHCSKNSSCSMEIQSTELGDSAVYFCASSLSTGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAAQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	12947	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_13214_30842_31145_113661_113711_116578_116963_117215_117344_117539
530663	contig_12427_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_40558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1494.14411620834	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	131	682	520420	506035	FALSE	20	GACTCTCCAGTATTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	555731	504881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520438_522284_522346_555679
530665	contig_12624_pilon	-	1975	15	Intergenic	novelGene_61069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1076.8559204784	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	500	1675	884793	862389	FALSE	10	ATGATTGGGTGTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903777	862088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884804_888732_888805_900245_900333_903447
530666	contig_4065_pilon	+	2590	17	Intergenic	novelGene_133406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_13	109.686039876322	293	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	12	1781	819064	880934	FALSE	20	TAAGCTACTAGTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVSVKRDLLFQALGRTYTDEEFDELCFEFGLELDEITSEKELISKEQGNEKAAGASDVVLYKIDVPANRYDLLCLEGLVRGLQVFKERIKAPVYKRVMPNGEIQKLTITEETAKVRPYAVAAVLRNIKFTKDRYDSFIELQEKLHQNICRKRALVAIGTHDLDTLSGPFTYTAKRPSDIKFKPLSKTKEYTACELMNIYKTDNHLKQYLHIIENKPLYPVIYDSNGVVLSMPPIINGDHSKITVKTRNVFIECTGTDFTKAKIVLDIIVTMFSEYCENQFTVEAAEVVFPNGKSHTFPELAYRKEMVRADLINKKIGIRETPENLAKLLTRMYLKSEVIGNGNQIEIEIPPTRADIIHACDIVEDAAIAYGYNNIQMSLPKTYTIASQFPLNKLTELLRHDMAAAGFTEGLTFALCSQEDIADKLGLDISATKAVHISNPKTAEFQVARTTLLPGLLKTIAANRKMPLPLKLFEISDIVVKDSSRDVGARNYRHLCAVYYSKSPGFEIIHGLLDRIMQLLDVPPGEKKGGYAIKASEGSAFFPGRCAEIFARGQSIGKLGVLHPDVITKFELTMPCSSLEINIEPFL	819052	881743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_819122_823798_823855_826627_826783_828131_828202_828780_828897_831595_831747_832759_832869_833859_833931_835627_835690_836993_837046_837986_838049_838329_838538_839034_839116_842867_842961_847364_847483_863327_863484_880782
530667	contig_10749_pilon	-	1647	13	Intergenic	novelGene_133450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_3	1212.47188684476	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	315	1271	155250	136250	FALSE	35	AGAAACTGGATGCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157783	135873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
530669	contig_5499_pilon	+	1920	8	Intergenic	novelGene_57019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	308.329534817566	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	25	426	816576	825237	TRUE	10	GGATTTCATGCTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGKGNHF	816551	841126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_816674_818145_818295_825082_825400_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840207_840422
530670	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_98027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
530671	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_10454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27133	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530674	SIRV6	+	791	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-422	41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	39	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	139	468	2002	10736	TRUE	25	AAGTAATTGGCATCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1863	11372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
530676	contig_16666_pilon	+	2084	2	Intergenic	novelGene_61782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	7	1140	106098	117928	FALSE	30	GTACTCACTGTCACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMRTGWLIGTSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106091	118872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851
530677	contig_10437_pilon	+	1729	8	Intergenic	novelGene_38251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	174.478581809356	1379	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	154	1143	397110	407700	FALSE	25	TATTTGGTGTCAGATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396425	408286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396578_397108_397230_398632_398756_398840_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
530678	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_14090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	190	1362	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34618	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530679	contig_8576_pilon	+	1920	9	Intergenic	novelGene_88779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	619.888888733296	1110	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	689	1708	909976	915551	FALSE	25	TTTTTTTTGTAATATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893583	915763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_907382_907607_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
530681	contig_15063_pilon	+	1335	5	Intergenic	novelGene_11623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	448	1191	35349	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35248_35380_35839_36158_36266
530682	contig_5514_pilon	+	1552	6	Intergenic	novelGene_75273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	265.785326908767	1150	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	120	1361	65296	68726	FALSE	15	TGTATGTGTCAGCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGLGALGTSEPLPQFVDPALVSSAPESGVFFPSGPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61038	68917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
530683	contig_6710_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_92632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCACAGTGACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
530684	contig_15063_pilon	+	1417	4	Intergenic	novelGene_14205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	102	1277	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34706	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
530685	contig_15118_pilon	+	2174	9	Intergenic	novelGene_74616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	273.122196781953	13	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	12	1334	392042	395136	TRUE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEIKDSFQQLSPRGHFWELASQPSFSSASY	392030	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394700_395049_395141_395233_395346_398644
530686	SIRV6	+	1188	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	81	-441	54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	25	TGCGTTTGGTCGCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
530687	contig_14744_pilon	-	2287	2	Intergenic	novelGene_66031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	358	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACGGTATCTGTCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301572	1299212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1300599_1300671
530689	contig_15063_pilon	+	1529	5	Intergenic	novelGene_9954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	236	1408	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530690	SIRV4	+	1565	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	50	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
530693	contig_9797_pilon	+	1489	6	Intergenic	novelGene_65589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	397.415953378824	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	240	866	183892	191368	TRUE	10	GAGTTCTGCGTTTTCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172539	192151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191138_191531_191690
530694	contig_8616_pilon	+	1716	13	Intergenic	novelGene_72474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	585.09635365088	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	357	1643	320431	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318052	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330045_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
530695	contig_10589_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_129374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCATAATGTTTTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125912	126197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_125900_126200
530696	contig_10848_pilon	-	2226	9	Intergenic	novelGene_133536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	189.413197467864	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	104	1189	863774	830918	TRUE	35	TGATAAAAGGTGTTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLPSALALSLLLVSGSLLPGPGAAQNAGFVKSPMSETKLTGDAFELYCDVVGSPTPEIQWWYAEVNRAESFRQLWDGARKRRVTVNTAYGSNGVSVLRITRLTLEDSGTYECRASNDPKRNDLRQNPSITWIRAQATISVLQKPRIVTSEEVIIRESPVLPITLQCNLTSSSHTLTYSYWTKNGVELTAHQKNVSSMEHRISKPRAEDSGEYHCVFHFLSAPKANATIEVKAAPDITGHKRSENKNEGQDAMMYCKSVGYPHPEWVWQKKGDDGFSDISNASGRFFIINKENYTELNIVDLQITEDPGEYQCNATNAIGSTSVVTVLRVRSHLAPLWPFLGILAEIIILVVIIVVYEKRKRPDEVPDDDEPAGPMKTNSTNNHKDKNLRQRNTN	907349	829336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_830360_830903_830979_831835_831858_838740_839015_843675_843810_855199_855295_858376_858549_863446_863795_907266
530697	contig_4232_pilon	+	1906	3	Intergenic	novelGene_63220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	835	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	904	1428	148204	149200	FALSE	75	AAAAGACAACAATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCVWLISQASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	147300	149678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_148539_148806_148884_149087
530698	SIRV6	-	790	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8561	541	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	6	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTCACTCCCTCTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1524_1636_1741_2480_2603_2733_2828_3105_3172_10728_10825_11035
530700	contig_1443_pilon	-	1886	11	Intergenic	novelGene_28287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	579	junction_5	449.839982660501	46	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	294	1217	776427	748649	FALSE	30	AAAGAACCTGGTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809532	747979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_787303_787358_805197_805224_808694_808741_809399
530702	SIRV2	-	392	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4438	77	3263	-42	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATTGTGAAGATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	1077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
530703	contig_18055_pilon	-	3526	3	Intergenic	novelGene_117792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_2	53	68	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	19	438	39456	39037	TRUE	35	TAGAAATGCTTGAACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVESGSVLALRRHRLGTPAPLSRPVYSAFSQGDSWGEGEVDEEERCDQVARDLRAEFSVRGSSEPRKDSLLPLDRDGSPVLPNKRNGIFLATAASRAPARRWPVQVLSVLCSLIFAALLAFLLAIVYLIVKGTEAGL	39474	4335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_5353_21760_21894_37098
530704	contig_14101_pilon	+	2159	5	Intergenic	novelGene_122760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	46.6442654567526	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	91	1140	260068	273924	FALSE	5	TCCCCTGTGTGAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAK	257209	274943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264833_273610_273667_273917
530709	contig_20693_pilon	+	1836	14	Intergenic	novelGene_60242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	787	junction_8	447.428471027929	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	53	1459	14718	34261	FALSE	30	CCAGCTGATAATTTGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEQEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14665	34638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
530710	contig_11017_pilon	+	1529	11	Intergenic	novelGene_128072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	688.434049128891	3135	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	557	1072	268852	294618	FALSE	0	TTCTCTTTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233661	295075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_263721_263922_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
530712	contig_9484_pilon	+	2142	8	Intergenic	novelGene_105625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	608	junction_7	429.794920246142	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	50	571	95848	100602	TRUE	25	GGAGTGTTAATGCAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKVSREFTQCGCSF	95798	104113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100823_101219_101369_101603_102080_103265_103374_103495
530713	contig_10134_pilon	-	2032	5	Intergenic	novelGene_16215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTGTGTCTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39729	32182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33353_33526_33731_34922_35178_38558_38817_39584
530714	contig_401_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_42860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	272	819	1122	1940	1722791	1721973	NA	10	ATACTTCTGTGTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1723912	1721705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1721700_1723900
530715	contig_15063_pilon	+	1362	4	Intergenic	novelGene_14235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	4	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	51	1223	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34757	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530717	contig_13740_pilon	-	1360	9	Intergenic	novelGene_34665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3583.7261138897	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	227	574	161718	160666	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165407	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_161973_165237
530718	contig_7695_pilon	-	2273	17	Intergenic	novelGene_41609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.9373913041834	10	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	195	1898	524436	504301	FALSE	55	TAAATATTAGAAATAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVLATADARFWKGPTEVPAGQA	526030	503925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504364_512107_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524445_525015_525168_525996
530719	contig_9471_pilon	-	3483	9	Intergenic	novelGene_21786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGCTGACGGTCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417515	406949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_407043_410632_412818_413708_413828_413916_414084_414633_414934_415628_415729_416213_416271_416934_417034_417152
530720	contig_14133_pilon	+	2557	7	Intergenic	novelGene_119911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	110.566345090478	592	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	394	792	143029	146688	FALSE	10	AGAGCTTTTGTGTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136614	148453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_141578_141677_142282_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666
530721	contig_7467_pilon	-	1621	13	Intergenic	novelGene_69467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	224.541755582342	1074	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	630	1574	77603	67563	FALSE	20	GAGTAAACGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133017	67515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_83911_83953_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132844
530722	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530723	contig_11832_pilon	-	1770	15	Intergenic	novelGene_106924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	970.747978496531	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	474	1319	88105	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92454	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85011_85914_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88802_89418_89450_92387
530724	contig_3077_pilon	+	1395	8	Intergenic	novelGene_26714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_6	3933.47032737334	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	397	897	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10106	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16936_17054_17449
530727	contig_14441_pilon	+	1180	5	Intergenic	novelGene_100546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5.62916512459885	55	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	680	1180	116728	117789	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACL	111196	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112108_112154_112401_112669_116555_116963_117523
530728	contig_19342_pilon	+	1696	5	Intergenic	novelGene_41101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.03108891324554	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	566	937	5070	6001	FALSE	35	GACCTGAGAACCTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSK	3618	6760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4132_4377_5021_5293_5413_5522_5960
530729	contig_12622_pilon	-	1633	10	Intergenic	novelGene_5947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2239.33037830729	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	17	1549	1590968	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590984	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583615_1586635_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
530730	contig_4301_pilon	-	3247	4	Intergenic	novelGene_65126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	167.145312693942	23	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	180	674	551260	543583	FALSE	70	AACCACTGAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAVSKGIRLTLVPFLGQWGSVSIFSSIEPTRSVLCSLSGR	575650	541009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_543840_547294_547521_551248_551329_575539
530731	contig_8616_pilon	-	2284	2	Intergenic	novelGene_72517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	103	junction_1	0	398	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	450	1196	347126	346380	FALSE	65	AAAAAAAAAACTTATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRFCSSEIRTRATLEFGRWVTDILHPMSTGSLAGSCLADRCLWDRLHAQPRLGGAPTFDWFFGYEEAQGFLLPLLQEASTACPLQVLDVGCGTSGLCTGLYTKCPHPVDVLGVDFSPVAVAHMNSLLEGGQGQNRLCPGHPASCLRFMQADAQNLGPVAPSGSFQLVLDKGTWDAVARGGLPGAYQLLSECLRVLSPRGTLIQFSDEDPDVRLPCLEQGSQGCTVTVQELGPFRGLTYFAYLVQSAH	347846	345291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_347559_347829
530732	contig_15063_pilon	+	924	4	Intergenic	novelGene_8885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	243	923	34808	36060	FALSE	30	GCATGGAAGACTGGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTV	27126	36061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
530735	contig_13894_pilon	+	1223	10	Intergenic	novelGene_62102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2509.51212611358	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	130	1167	521676	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPSLSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521698_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
530737	contig_1867_pilon	+	2647	11	Intergenic	novelGene_54601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTCCTTCAAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516497	550954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_517717_531506_531646_532496_532633_537547_537677_538245_538442_546228_546402_547622_547727_547862_548021_548574_548748_550593_550747_550887
530738	contig_2100_pilon	-	1246	7	Intergenic	novelGene_50703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	787.270971986986	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	156	998	1175737	1170170	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGTGSVWSPEVLPAHSTVTTLSRWILSLELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRPGLRGLR	1176390	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170195_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175487_1175786_1176283
530739	contig_15146_pilon	-	2332	4	Intergenic	novelGene_116937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.8872154908264	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGAGAGTGGCCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112852	106233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_108069_108967_109084_111059_111224_112635
530741	contig_1262_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_133559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAGTTTTTTTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294198	295585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_294200_295600
530745	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_97995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	658195	653562	FALSE	30	TTCTTTAACTTTAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWWTFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658196	653415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
530746	contig_12948_pilon	+	2632	2	Intergenic	novelGene_126202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233597	236604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_234739_235113
530748	contig_6691_pilon	+	2970	1	Intergenic	novelGene_60169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407954	410924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_408000_410900
530749	contig_16098_pilon	-	2486	17	Intergenic	novelGene_45877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	53.1095565788305	702	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	862	1983	253301	244693	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWQQEEAPPTPCPTTSGTRCCTRPVSLPPALLFAAVASATHGFWPCCSASTWAS	255225	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247189_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_254292_255169
530750	contig_1516_pilon	+	2266	12	Intergenic	novelGene_49989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1064.99934427481	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	87	1682	347241	363092	TRUE	10	ACCTGTTTCCTCTCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335195	363732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985_363469_363524
530751	contig_10951_pilon	-	2740	1	Intergenic	novelGene_61639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTTTCCTGACGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287266	284526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_284500_287300
530753	contig_5479_pilon	+	2206	14	Intergenic	novelGene_133590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_13	275.418412193426	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	80	1708	258380	453205	FALSE	10	CTCTCTGGTTTACATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIEREVLTVVVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFKFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKAGVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEGNEELRQKFERAKISQGTKTPEEKTTNTISKCDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVELTPTDKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV	258300	453703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_258393_261201_261331_318101_318259_319625_319761_334184_334282_344547_344695_375219_375394_395880_395973_398958_399022_403751_403891_409404_409486_409800_409909_415695_415837_453052
530754	contig_6215_pilon	-	2736	11	Intergenic	novelGene_21204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	880.704746211805	2	144	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	465	1358	233835	228234	TRUE	30	AGACAAAGTGTGTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243033	226732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_227912_228034_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234121_235172_235361_238588_238751_242990
530755	contig_3747_pilon	+	1343	7	Intergenic	novelGene_24777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4669.29232384904	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	380	721	201481	203804	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201208_201327_201563_202132_202206_202309_202399_203588_203651_203768_203850_204629
530756	contig_11855_pilon	+	2378	9	Intergenic	novelGene_67066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	103.417539614903	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	461	1237	2089364	2105965	FALSE	5	CTGTGTGGTATCTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVKVPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNRVEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVENAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINYHASDVLETSGWKSMVVSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS	2034371	2107106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2034540_2086215_2086360_2089215_2089368_2089903_2090032_2097169_2097348_2100083_2100140_2100603_2100727_2104362_2104506_2105820
530759	contig_5967_pilon	-	2083	8	Intergenic	novelGene_44378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	577.099503322169	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	111	533	488569	424051	TRUE	45	TTAAGAACCAACAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYS	517612	387561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_423963_424055_430698_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
530760	contig_7630_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_133642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCCTGAATGTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425313	424200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_424200_425300
530761	contig_5889_pilon	+	2513	14	Intergenic	novelGene_133678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_13	117.215676395691	272	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	33	1352	20445	322986	FALSE	45	AAAATTCAGATTTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVRKLKLVPER	20412	324147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_288483_288513_322982
530762	contig_233_pilon	-	1469	9	Intergenic	novelGene_14545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1574.21661073056	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	667	1029	91606	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	99815	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92192_92285_92359_93764_94024_94879_94914_98310_98452_99779
530766	contig_10235_pilon	-	981	7	Intergenic	novelGene_46279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	431.978394521454	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	246	794	17621	14151	FALSE	25	ATGAAACAGTGTGCGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	20917	13963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17681_19632_19752_20850
530768	contig_3602_pilon	-	1599	9	Intergenic	novelGene_60664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	366.319170089418	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	252	803	1113579	1107817	TRUE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRSC	1139529	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108574_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1139295
530769	contig_15118_pilon	+	3717	1	Intergenic	novelGene_74549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	612	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	929	1978	129085	130134	NA	15	ACTGAATCTTTTGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METNSSLPMNVSGGIQPESSSYAALNIFSQVVLGVTCVLGILGNGLVIWVAGFRMTHTVTTISYLNLAIADFSVTATLPFTMVSQAMRGQWPFGWFLCKLIYTVVDINLFGSVFLIAVIALDRCICVLHPVWAQNHRTVGLAKRVIIVPWILALLFTLPVIIRVTTISNEAGTFCKLDFSPWTTNRDEKKKVDIIMYTVRGIIRFIIGFSMPMSTVAICYGLVAAKIHRQGLIKSSRPLRVLSSVVVAFFICWFPYQLVALIATIRIRQRLLNMIQGLRIAINITVALAFFNSCLNPMLYVFMGHDFRERLIHSLPASLERALTEDSGQTSDTPANSTSPPSNAELKEM	128156	131873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_128200_131900
530771	contig_6102_pilon	+	2758	17	Intergenic	novelGene_32359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	96.4565154616317	288	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	425	2260	1701947	1714324	TRUE	10	GCTGAGACCCTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGTESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEVWNSRGVSSQTEAWCLRQEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQVRKLKTILFLTQQQPQCHLLSVSK	1700824	1714926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1700907_1701244_1701318_1701572_1701803_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714599_1714702
530773	SIRV6	-	834	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8272	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10819	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723
530774	contig_20493_pilon	-	2604	12	Intergenic	novelGene_86393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.3134799335747	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1663	2196	43387	36826	FALSE	45	AGAAAACCTGATTATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPGQQI	55240	36417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36844_37471_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_47119_48978_49107_49197_49252_54457_54665_55211
530775	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_12900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	235	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28166	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
530777	contig_7963_pilon	+	1783	6	Intergenic	novelGene_58604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	93.1141235259185	264	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	81	836	293211	297210	TRUE	35	AAAACCTATTGCCATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWSESQLLCSLGLTQDHTESIWGLCYLCTLLGHNTNSFP	293130	298885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815_297280_297580_297939_298192_298225_298397
530778	contig_6710_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_95987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653662	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
530780	contig_11171_pilon	+	1896	10	Intergenic	novelGene_48531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	31	1023	31058	65045	TRUE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	31027	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_65493_65532
530781	contig_3077_pilon	+	1315	10	Intergenic	novelGene_26645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3612.98180263516	7	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	70	942	9676	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9606	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16172_17455_17742_17866
530782	SIRV4	+	403	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	27	-886	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCATCTTTTATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
530783	contig_15063_pilon	+	1729	7	Intergenic	novelGene_12749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2	1477	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28162	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530784	contig_2444_pilon	+	2658	8	Intergenic	novelGene_83749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	371	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTGGAGTCGGTACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181159	214036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_183259_183386_183497_184560_184642_190070_190160_190348_190389_193966_194069_209863_209926_213961
530785	scaffold_12124_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_22409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	132	635	1508902	1509405	NA	40	TATATATATATGTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508770	1510591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508800_1510600
530787	contig_9017_pilon	-	2400	5	Intergenic	novelGene_130328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13.4420050587701	293	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	334	675	218109	217768	FALSE	20	GTGGAGCATCAGTCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	224295	216042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218123_219573_219605_219825_219969_220072_220192_224268
530789	contig_7963_pilon	-	2322	3	Intergenic	novelGene_58379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGGCAAGAGCTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59197	51374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_51531_56716_56970_57284
530790	contig_20602_pilon	-	1677	11	Intergenic	novelGene_133727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	304.234136809136	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1020	1511	19264	10026	FALSE	55	TACAATAAATGTAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29539	9859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19866_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26558_28884_28949_29483
530791	contig_7457_pilon	-	2951	2	Intergenic	novelGene_31293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_1	0	51	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161051	157856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_160767_161010
530792	contig_10990_pilon	+	2141	2	Intergenic	novelGene_7453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	50	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708553	716580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_714557
530794	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	202	666	34808	35851	TRUE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLQ	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35846_36158_36266
530795	contig_14513_pilon	-	868	5	Intergenic	novelGene_70374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	187	663	18880	11499	FALSE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSPQGFHGCFSEVDHKAFLPRHF	19066	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11563_11985_12158_13087_13136_14952_15001_18735
530796	contig_13542_pilon	+	2461	15	Intergenic	novelGene_131574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	176.691663293861	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	10	2130	732625	753556	FALSE	40	TTGAAAAAGAAGGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LECMLNRLAGIKDFKQGRHLLTVLLKLFSYCVKVKVNRQQLVKLEMNTLNVMLGTLNLALLAEQESKDSGGAAVAEQVLSIMEIILDESNAEPLSEDKSNLLLTGDKDQLVMLLDQINSTFVRSNPSVLQGLLRIIPYLSFGEVEKMQILVERFKPYCNFDKYDEDHSGDDKVFLDCFCKIAAGIKNNSNGHQLKDLILQKGITQNALDYMKKHIPSAKNLDADIWKKFLSRPALPFILRLLRGLAMQHPATQVLIGTDSITNLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKRMAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVALEEMENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVSHLSLLSSQSRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFATCLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDMKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTTRATSREEKNLQGFLEQPKEKWVESAFEVDGPHYFTVLALHILPPEKWRPIRVEILQRLLVTSQARAVAPGGATRLTDKTMKDYSAYRSSLLFWALVDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPISEAADKALKTFQEEFMPVETFSEFLDAAGLLSEINDPESFLKDLLNSIP	732615	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_732682_733588_733697_734108_734229_734972_735164_735629_735804_736742_736843_738267_738487_739643_739758_740763_740907_741347_741504_742661_742857_745740_745966_749174_749266_749994_750158_753491
530799	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530800	contig_7356_pilon	-	1900	4	Intergenic	novelGene_60371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	743.886341378096	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	480	1019	408223	407684	FALSE	35	GAAGTGTGTAATATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGWIPNLGHLQNRLPDHWLMLILLLLQHQSSIQHQLFHQQLLHWHQKSQLESQILNLDHFQNWLLDHLVMSVLVLHQHQSSIEYHVSHHQLQHWHQMEILQESWNFILGNFQNRLWDHFLSQILLLQQHWSWIQQVLHHQVEQWHLRESLLEDRILFLGQHYNQVLDHLVRSIMLLD	457913	406802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_408397_435516_435623_437474_437529_457767
530801	contig_3745_pilon	+	2276	4	Intergenic	novelGene_85066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	141.98826242569	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	69	569	363058	370795	FALSE	20	TGAACTGCTGCAGCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSWWGADRCCPCSGSDREVDGMASGQQRARGPGHSHSLCCTLRRWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGYRMERPDNCSEEMYSLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	362989	372502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_363264_364271_364372_369179_369232_370652
530802	contig_14638_pilon	-	2426	6	Intergenic	novelGene_71571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	162.737334376596	8	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTGAAGTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277696	252756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_271738_271966_277509_277556_277660
530803	contig_19459_pilon	-	1199	9	Intergenic	novelGene_59843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7109.10526960848	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	174	914	16240	6952	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNN	19137	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6955_7050_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
530805	contig_14483_pilon	+	1633	3	Intergenic	novelGene_133756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGCTTTGGTCCCACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60979	96478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_62425_87781_87830_96338
530806	contig_8581_pilon	-	2337	13	Intergenic	novelGene_22822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.297063195096	13	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	991	1863	329921	306814	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPSDIHF	386110	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306835_323362_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339262_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
530810	contig_5092_pilon	-	2060	6	Intergenic	novelGene_62298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.403393368753	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	100	414	451516	444945	TRUE	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451615	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444804_444926_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
530814	contig_18869_pilon	-	990	3	Intergenic	novelGene_56416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_2	34.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	28	405	79419	75455	TRUE	20	TGATTTGCTTTTACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWGEFSSSFLNC	79446	73726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73786_74928_75766_79352
530815	contig_7963_pilon	-	978	5	Intergenic	novelGene_58331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	191	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48912	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38542_39363_39405_39949_40232_43546_43819_48741
530817	SIRV6	+	699	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	547	164	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
530818	contig_4754_pilon	+	2007	14	Intergenic	novelGene_35958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	169.13255891521	4	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	23	1576	380119	420387	FALSE	15	TAGCTGGTTGTCTGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380096	420818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410290_411091_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
530819	contig_6735_pilon	-	1396	13	Intergenic	novelGene_15750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1012.36769711734	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	80	1279	564868	542104	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNHGHLSCGLASSSMNVSSNPPPTPAKSAVLSGIPGLLTWEGT	568277	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542231_543088_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552875_554304_554374_564157_564232_564784_564869_568198
530820	contig_16525_pilon	-	386	4	Intergenic	novelGene_133854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	961.527950711783	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	9	329	181180	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181188	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150
530822	contig_10737_pilon	+	3770	1	Intergenic	novelGene_133896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAATTACTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282924	286694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_282900_286700
530823	contig_10235_pilon	-	1920	11	Intergenic	novelGene_46258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	351.34057551043	1048	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	420	1706	25335	14151	FALSE	25	GTAAATGCTCCATCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	26911	13936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_26625
530824	contig_8394_pilon	-	1794	3	Intergenic	novelGene_27313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_1	170.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	277	1521	35322	32466	FALSE	30	TTTATGCAAAGTGTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	38830	32192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35523_38754
530825	contig_18420_pilon	+	2346	7	Intergenic	novelGene_109363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	714	1016	110996	112657	TRUE	60	AAGAAAAAGAAAGTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLMHCFKFGTKHIALVAAKLQKLIGRDILCHLLSRDEVVVLPIFLTLLGWPCRIYGAGYTNFSGFWLSRAFLMWLRPTPLAPISTRVFLLNAGSRTTSS	108949	120901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_109549_110723_110799_110956_111162_112317_112401_112603_112683_118233_118344_119706
530826	contig_4857_pilon	-	613	7	Intergenic	novelGene_48775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1918	junction_1	1478.10419118545	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	38	613	1226315	1213436	FALSE	40	GTAAGCAAAATTCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQR	1226440	1213435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
530827	contig_3747_pilon	+	1357	7	Intergenic	novelGene_24798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5418.81696805985	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	379	909	202422	204750	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLLSRHKNNDQKKLLLLILCSSVQNYIILIL	200983	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201227_202182_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203275_204661
530829	contig_12873_pilon	+	1877	6	Intergenic	novelGene_27170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1225.12944622191	2	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	443	1303	16409	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15966	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16821_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
530830	contig_5280_pilon	+	4111	20	Intergenic	novelGene_52644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	63.1099379331653	164	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1099	3300	59	3358	201083	234466	TRUE	40	AAACACTTGCCTTACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRGSRISEGVVPLELRRGMGAAHLLWVFLALVAPGVFGDREGERGGISCDPPPVVENARRFYFSGPVSVGNVIRYSCLPNFRLIGEKNVYCIRKDHVTAVWDKAAPRCEYYNKHSICSEPEVPGGYRNKQSRPPYRHGDSVTFTCNTNFTMKGNKSVWCQGNGTWGPTPLPTCESDFPLECPSLPSIPNGHHTGENGSSLVPGLSVTYSCDRGYLLHGKKTIICLSSGAWSATSPTCKEAQCESPGRFPNGQVQQPPSLRVGVTANYSCNEGYRLRGQPSSQCVIAGQRAVWTKTPVCEVILCSPPPTIHNGRHTSSSSGPVRYGSTVTYTCDPDPEKGVSFILIGENTIYCTSDRQKTGIWSGPSPRCELSTFAVQCTHPQVLNRYTLFVQKEEYPYNATVVFACASGFTMKGRRQIRCNAQGTWEPSVPVCEKECQAPPKILNGQIKGGHVSHFDPGTSIQYGCDPGYVLVGEEYIHCTSEGVWTPGAPQCKAAECEPIGTELFKKPQDHFIRQDANSSCDEGYRLGESVYQLCQGTVLWFLEIRLCKEITCPPPPVIYNGIHSWSSSEDVPHGTTVTYTCNPGPERGVKFNLIGKNTIRCISNERETGSWSGPAPVCELSIPHVQCSHAYIANGNKISGKEAPYFYNDSVTFKCHDGFTLKGSSQIRCKANNTWDPEIPVCEKDCQPPSEIHHGQHTGGDRVRFASGTTVDYTCDSGYLLVGNKTIHCMPSGMWSPSPRCEEGSCKPVKDMQEIPSGTRVVTFNMSCQVGYQVSRFSYQKCQDADGVWFRKIPLCKVIHCPPPPIIENGRLTGMTTKHFLYGNEVSYECGQGFDLLGEKTIRCLSDAEGHGVWNGPPPTCFQSRPVTHCPSPEVKHGYKLNKTLSSYSHNDTVYVACNTGFIMNGSHLIRCHTNNTWVPGVPTCIKKAFLGCEPPSEIPNGWHTGEDTARFSPGMSVLYSCDPGYLLVGEELLLCTHEGTWSQSVPYCKEVNCSFPEYISGMQKGLEPGKMYHYGSTVTVECEDGYTLEGSPQSQCQEDHRWNPPLAVCKSRSLAPLLSGISVGLVLLIILVAVSLCMLLKDKGSYYTNAAPKDGARPLEAQEVYSVDPYSPAS	201024	244095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_201165_215478_215869_217602_217792_217876_217977_218197_218281_218796_219205_219824_220002_220081_220173_220467_220545_221460_221869_222446_222621_222695_222781_223093_223174_223652_224046_226241_226428_227610_227797_228460_228485_229154_229228_234372_234482_243357
530831	contig_10167_pilon	-	329	3	Intergenic	novelGene_133898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	34	327	17172	16723	FALSE	25	ATCCACAGTGCTGCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPPALPSLTSMGPTLLCLAVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVKAREQTARMECVPIKGHEYVYWYRQKLGEELKFLIYFNNEEVFDESGMSDKRFSAQCPKTVYFCASS	17205	16720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10167_pilon_-_16746_16793_17016_17123
530833	contig_9463_pilon	+	1688	9	Intergenic	novelGene_83833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1047	1577	222660	223314	FALSE	15	CCTATTGGCTCTGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMGPILCGVSNLGMGDSKSSEVLFSLSMPCGSSSPAAPVPTALSVGSAVWGQPVEAVQGSTQPHCRGNDKRPKVTKSLESQIESHP	185944	223425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222935_223058
530834	contig_13740_pilon	-	1554	10	Intergenic	novelGene_34664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3884.18368690002	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	162	1214	165243	157140	FALSE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGNRTASGYRNNNVKETLISVMHKYAVIWQKTPEQMQRAIL	165404	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157262_158303_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
530838	contig_9345_pilon	-	1621	4	Intergenic	novelGene_24656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1568.08276425562	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001351	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_955251_955356_997013_997093_1001156
530839	contig_13760_pilon	-	2161	9	Intergenic	novelGene_61294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	236.398200870903	12	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	67	1812	194443	161782	FALSE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPGTTRSTAWRWCWPIWRLPAWWHTTEACTTPMLRSSCRGFKPGRSSWRCSARSSRCASSGAARVPAAARPDAMRSSTRSSLPCPTNWSLPSAPASCDLQGPSPSAAAGSIGAERGTDFHSTPGTL	194509	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163373_167499_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
530841	contig_14341_pilon	+	610	5	Intergenic	novelGene_111851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	2137.68687779572	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	64	609	548758	551580	FALSE	15	TGGGCAGGGTGGGGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAK	547752	551581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481
530847	contig_5549_pilon	+	861	5	Intergenic	novelGene_81590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	15	689	82155	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82140	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
530849	contig_15063_pilon	+	942	4	Intergenic	novelGene_12016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	220	804	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35160_36316
530854	contig_10437_pilon	+	2291	5	Intergenic	novelGene_38150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	217.134031188112	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAAAAGCGTTGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159565	164083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160203_160732_160844_161549_161639_161859_161955_162724
530855	contig_12977_pilon	+	1976	14	Intergenic	novelGene_122773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	649	junction_12	505.916439530267	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	323	1315	10887	57020	TRUE	0	CTCCTTGGCCCTGTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAGNCV	10564	58799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57378_58495
530856	contig_6227_pilon	-	1654	15	Intergenic	novelGene_49738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	430.628142297709	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	60	890	1224979	1204205	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMPSTSLSTKVGAPG	1225038	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203371_1203561_1203700_1204139_1204217_1204364_1204399_1211229_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
530858	contig_7182_pilon	-	2112	3	Intergenic	novelGene_117159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_2	157.5	54	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	128	427	889318	888811	FALSE	35	TGAGGAGGACGAAGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCVWLPLSQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPP	891387	887125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888961_889168_889333_891274
530859	contig_15063_pilon	+	1191	3	Intergenic	novelGene_14366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	228	1049	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35043	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
530860	contig_5981_pilon	+	2082	5	Intergenic	novelGene_35478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	209.868411153275	163	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	94	522	23508	37614	FALSE	30	TGAAGGCCTGTGAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASACAAAACGSGFAPSAPPPSFLRAARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVL	23414	39174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28186_37612
530861	contig_3948_pilon	-	2083	8	Intergenic	novelGene_53219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	355.36597978962	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	48	758	866476	840803	TRUE	80	AAAAAAACAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKVMDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869615	839330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840599_840745_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852626_856561_856680_866413_866480_869571
530862	contig_7396_pilon	-	2050	14	Intergenic	novelGene_79597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2743.8018542498	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	322	1542	252437	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFQSQTAVAPSGMSQQFMPHCLIRKREIILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	255380	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252348_252442_254553_254701_255105_255191_255295
530864	contig_11429_pilon	+	1269	6	Intergenic	novelGene_60452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_3	812.792716502799	4590	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	93	461	46162	47422	TRUE	30	AATCGATACTGACAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGKCIGKLDHGTRGVAFV	45399	49492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47552_48443_48530_48899
530866	contig_3081_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_133928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	507	1453	1959	183966	183460	NA	20	CCCCTTCTAGCCAGGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHRSAILDSCGGSADREYKKAASQSSQQETEQPVTGDIHFLTTYTLHPHSASSASCIHSLLAKKHQLHPRATRIPPTCAGRLPECHLLAAGVPFFHFFRLLPYLSPHPLPFSQIPGSVCHLCFVLKGCETLLNRETASWTVLPRWWDPEGFVCSNLICLFSFSFLGLG	185418	183458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_183500_185400
530867	contig_17144_pilon	-	2020	12	Intergenic	novelGene_29488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1818.15618163744	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	212	1735	179764	166363	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183293	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166552_170886_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
530868	contig_12864_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_76411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	725.875994356938	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252143	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244635_244767_245704_245915_246329_246348_249519_249843_251887_251999_252111
530869	contig_6795_pilon	-	2165	5	Intergenic	novelGene_27757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	741.177610293241	1223	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACAATTGTCTGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396994	372308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_374033_374891_375048_387155_387237_395515_395653_396927
530870	contig_15063_pilon	+	1370	4	Intergenic	novelGene_14212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	96	1268	34808	36661	FALSE	50	TATGTTTATAAAAATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34712	36763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530873	contig_18096_pilon	+	1965	7	Intergenic	novelGene_58028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	935.442616566558	21	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	378	698	72061	76634	TRUE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40308	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44252_72003_72130_75381_75507_76507_77352_78569
530874	contig_10734_pilon	+	2141	4	Intergenic	novelGene_51012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	438	767	310594	310923	TRUE	10	GCCCCTTCCGGCTGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPRGTKTKTLVLILTFSTLIKQWPKMPLSKNKIVAVYHRNEIQEALTLWHQKSRFFRICERTLPTCQKNVDMPAEKEKKELPSAETRRESALTEASYKIRQKPKSGY	310156	320727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_311676_315794_315953_318838_319033_320457
530875	contig_11328_pilon	+	1796	8	Intergenic	novelGene_88449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	277.017497421284	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	91	1101	830591	853019	FALSE	75	GGAAATTAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWVVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLERVVVLTQRSVV	829361	853714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830725_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_852980
530876	contig_3584_pilon	+	2312	5	Intergenic	novelGene_108180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	917.231806851463	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	27	1070	527096	531381	FALSE	60	CACCAAAAAATTGAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527069	532623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602
530877	contig_614_pilon	+	2384	5	Intergenic	novelGene_132623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	11.27774356864	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	340	657	619179	619496	TRUE	20	GTATCTGTTAATTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHHKATVSPMCQVSMLHSAAGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSR	588647	641288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_619971_621721_621753_634039_634064_640090
530878	contig_14441_pilon	+	842	5	Intergenic	novelGene_100442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	148	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	228	656	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLCTSVPAVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82323	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112104_112154_116578_116963_117220_117344_117539
530879	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	599	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
530880	contig_15666_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_70192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	335.352113456886	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	154	1323	110619	107848	FALSE	25	TTCACTGGTCCCATGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQRLWPSSPLFPTAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110772	107239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
530881	contig_9653_pilon	+	2148	5	Intergenic	novelGene_48176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	71.7717736996934	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAAGTAAAAGTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162336	175190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_162604_163226_163321_171528_171609_172716_174330_175096
530882	contig_6365_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_134011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	563	1183	111672	112292	NA	5	GGTTGTTGTCTGAGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFFITVLSFLELWYVSTTVLTLLHTLLHGHSPISSALCFIQLYVFHSLGVTECYLLGVMALDRYFAICLLLHYHALMSREVQLWLAGATWVAGFLAAIVPASLTASLPFCLKEVTHYFCDLAPLMWLTCVDTGWHVHVHGTVIGVVTGCNFVLILGLCGGILKVVLKLPSAASRAKAFSTCSSHMTVVALFYGSAFTVYVGSPGS	111109	113277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_111100_113300
530883	contig_12638_pilon	+	2081	12	Intergenic	novelGene_33159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	202.095550594881	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	104	919	269238	271285	TRUE	30	GGAAAGACCACTGCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDS	235649	274455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235753_269237_269367_269457_269602_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271746_273449_273584_273761_273999_274124
530884	contig_9482_pilon	-	1773	11	Intergenic	novelGene_44310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_6	116.172285851661	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	6	1547	1253080	1236365	FALSE	0	GCCTTTCTCTTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253085	1236138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
530885	contig_13608_pilon	-	2713	18	Intergenic	novelGene_52362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	204.077975463312	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	120	2123	470234	369353	FALSE	15	TGTGTTTTGTTTCTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKIKARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470353	368762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382481_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
530886	contig_11338_pilon	+	1827	12	Intergenic	novelGene_6147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	526.803302009644	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	447	1622	6086	13398	FALSE	45	ATCAAAAGCTGAATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	744	13603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10522_13249
530887	contig_9527_pilon	+	2112	6	Intergenic	novelGene_134060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_5	194.881502457262	1362	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	60	785	473904	482156	FALSE	20	TATTGGATTCTGACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGSRFPARRGARGARSLAMSRSNRQKEYKCGDLVFAKMKGYPHWPARIDEMPEAAVKSTANKYQVFFFGTHETAFLGPKDLFPYEESKEKFGKPNKRKGFSEGLWEIENNPTVKASGYQSSQKKRRVEEPEPEPEPEATEGDGDKKGNAEGSSDEEGKLVIDEPTKEKNEKGTLKRRTGDLLEDSPKRPKEAEDPEEEEKESGTLEGERPLPVEMEKNSTPSEPGSGRGPPQEEEEEEEEEEAAKEDAEAPGIRDHESL	473844	483483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_473991_480170_480248_480411_480551_481218_481411_481734_481959_482149
530890	contig_15304_pilon	-	888	4	Intergenic	novelGene_30683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	163	759	106308	105631	FALSE	15	TGGGGTCCTGCAAGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	106989	105501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
530891	contig_9727_pilon	-	2940	14	Intergenic	novelGene_86283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	252.482608224054	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	89	2194	163331	137693	FALSE	30	ACAGACAGTTTATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDFKEVLAVSNSILELPCPHLSALASYRWSHGIAAVPEASSTVYNGSLLLLLRDGVGGLYQCWATESGFSYPVVSYWVDSQDQPLALDPELAGIPRERVETPLTRVGGGAALAAQWSYWPQFLTVTVILALVLSGALIVLLASPLGALRARGKVQGCGTLLPGEKSSLSKEQSFRPPKEHRTSASDMDTDNNQLGTEVA	169712	136946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_138286_139175_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_169653
530892	contig_10058_pilon	+	2036	2	Intergenic	novelGene_67679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	494	1099	45626	46308	FALSE	30	ACGTAAATAGTGTGGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGGEQSKDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGSLT	45132	47245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_46218_46294
530893	contig_11056_pilon	-	1074	5	Intergenic	novelGene_130398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	154.497572796468	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	166	558	679018	645634	FALSE	30	AGACCGCAGAGCCTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAPTVCIYLNKNGNTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTVFSFLKQGHGGEVISAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHY	684604	645117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645644_667893_668060_670511_670713_679002_679045_684465
530894	SIRV4	+	1561	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	49	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATATTGTAACCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1678_1886_2389
530895	contig_3476_pilon	-	1906	5	Intergenic	novelGene_134102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	205.492548526704	52	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	394	705	87600	72084	FALSE	10	TCTCTATTCCCTGGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEQMQPLELSEDRLDKLDPRCSHLDDLSDQFIKDCDLKKKPRKGKNVQTTLNVESDQKKPRRKDTPALHIPPFIPGVRLLRDERPKVIMEDDEKDGDKIAI	115160	70882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3476_pilon_-_72164_83403_83557_87521_87640_94131_94378_115052
530896	contig_8541_pilon	+	1781	4	Intergenic	novelGene_105579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1202	1621	567442	577357	FALSE	25	CTAAAATGGCAGCTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSISCCRIFRCRSNSAFFSSSSRFCFSSRLLRLLTVRPKMSMRSGGDEARSRSRSRRDTAVLVERERDRDSRRRFRLLSRDLERFRTRSLSRDRDRDRLRFLLCLLLLVCLERDELRLRDRPILPGDAETNRWLRP	547599	577517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_+_548548_564879_564935_567243_567472_576967
530897	contig_5832_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_134160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATATAGGACCGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452856	451534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_451500_452900
530898	contig_12919_pilon	-	1910	5	Intergenic	novelGene_75887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	493.263114372036	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	77	676	743659	720289	FALSE	15	CACTGTTCTAGGCACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDMS	743735	719054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720297_731011_731210_734916_735079_737596_737735_743565
530899	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
530902	contig_2455_pilon	-	2139	15	Intergenic	novelGene_119183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	51.9383956122589	1305	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	48	2030	177497	142765	FALSE	15	TCTTGTAAGATGTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQVAQCSARLLLQEKEIKFLTAEIDRLKNCGYLEASPDLEQLRAENLKLKYRLNILRRSLQAERNKPTKNMININSRLQEVFGCAIKAAYPNLENPPLIVTPSQQPKFGDYQCNSAMGISQMLKTKEQKVNPREIAENITKHLPPNECIEKVEIAGPGFINVHLRKDFVSEQLTSLLVNGVQLPALGENKKVIVDFSSPNIAKEMHVGHLRSTIIGESMSRLFEFAGYNVLRLNHVGDWGTQFGMLIAHLQDKFPDYLTVSPPIGDLQAFYKESKKRFDTEEEFKRRAYHCVVLLQSRNPDIIKAWKLICDVSRQEFNKIYDALDISLIERGESFYQERMNDIVKEFEDKGFVQVDDGRKIVFVPGCSIPLTIVKSDGGYTYDTSDLAAIKQRLFEEKADMIIYVVDSGQSMHLQAVFAAAQMIGWYDPKVTRVSHAGFGVVLGEDKKKFKTRSGETVRLIDLLEEGLKRSMDKLKEKERDKVLTPEELKAAQTSVAYGCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAYLLYAFTRIRSIARLANIDEEMLQKAAQETKIILDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDYIYELATTFTEFYDSCYCVEKDRQTGKVLKVNMWRMLLCEAVAAVMAKGFDILGIKPVQRM	177544	142655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142875_143681_143930_144362_144536_157119_157226_160387_160498_161079_161259_162887_162993_164823_164954_166622_166744_167936_168059_168494_168596_169668_169778_170985_171175_175412_175548_177452
530904	contig_1146_pilon	-	3651	31	Intergenic	novelGene_84785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_30	63.4185742157261	138	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	6	2897	248184	106770	FALSE	15	GCTACTTTTCTGTCACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFPWHSRNRNYKAEFASCRLEAVPLEFGDYHPLKPITVTESKTKKVSRKGSTSSTSSSSSSSVMDPLSSVLDGTDPLSMFAATADPTATAAAMDSSRKKRDRDDNSTVGLDFEPWSSKRGEILTRYTTTEKLSINLFMGSEKGRAGTATSAMSEKVRTRLEELDDFEEGSQKELLNLTQQDYVNRIEELNQSLKDAWASDQKVKALKIVIQCSKLLSDTSVIQFYPSKFVLITDILDTFGKLVYERIFSMCVDNRSVLPDHFSPENVNDTAKETCLNWFFKIASIRELIPRFYVEASILKCNKFLSKTGISECLPRLTCMIRGIGDPLVSVYARAYLCRVGMEVAPHLKESLNKNFFDFLLTFKQIHGDTVQNQLVLQGVELPSYLPLYSPAMDWIFQCISYHAPEALLTEMMERCKKLGNNALLLNSVMSAFRAEFIATRSMDFIGMIKECDESGFPKHLLFRSLGLNLALADPPESDQLQILNEAWKVITKLKNPQDYINCAEVWVEYTCKHFTKREVNTVLADVIKHMTPDRAFEDSYPQLQSIIKKVITHFHDFSVLFSVEKFLPFLDMFQKESVRVEVCKCIMEAFIKHQHEPTKDPVILNALLHVCKTMHDSVNALTLEDEKRMLAYLINGFIKMVSFGRDFEQQLSFYVEARSMFCNLEPVLVQLIHSVNRLAMETRQVMKGNHSRKTAAFVRACVAYCFITIPSLVGIFTRLNLYLHSGQVALANHCLSQADAFFTAAISLIPEVPKTINIDGKMRPSELFLLEFLCNFFSTLLIVPDHPEHGVLFLVRELLNVIQDYTWEESSDDKIRIYTCVLHLLSAMSQETYLYHVDKVDSNDSLYGGDSKFLAENNKLCETVMVQILEHLKALAKDEALKRQSSLSLSFFNSILAHGDLRNNKLNQLSVNLWHLAQRHGCADTRTMVKTLEYIKKRSKQPDMSHLTELALRLPLQSRT	248189	106015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_106869_107357_107505_114326_114446_126288_126455_134238_134379_148530_148646_149682_149761_151418_151518_153756_153821_155803_155885_157561_157648_158866_158930_161837_161919_164531_164586_171004_171122_171644_171757_172528_172576_187636_187760_188221_188300_192746_192841_194256_194305_194998_195096_202551_202612_204205_204291_213188_213318_216576_216654_220315_220341_224136_224260_229522_229691_232543_232644_248167
530906	contig_16045_pilon	+	1514	2	Intergenic	novelGene_130853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7282	14080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_7368_12651
530907	contig_177_pilon	-	1787	3	Intergenic	novelGene_41837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAGATGTGGCCAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420151	415666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_415705_417645_418235_418991
530908	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	834	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
530909	contig_1154_pilon	-	2908	20	Intergenic	novelGene_87241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	20	junction_2	29.6835572903115	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	173	1870	1875601	1856525	TRUE	10	CACACCTGCCTGTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCVLVATEGAEVLFYWTDEEFEESLRLKFGQPENEEEELPALEDRLSTLLAPVIISSMTMLEKLSDAYTCFSTENGNYLYVLHLFGECLFIAINGDHTESEGDLRRKLYVLKYLVEVHFGLITVDGQLIRKELRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETETDSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSGSIVWLDEGTPPTDTYQIQVAEDTLQMLVPHSPTASSPRRIFLDASIKESYCPLVPHTFYCLPLWPGINMVLLTKSPSAPLALVLYQLLDGFSLLEKKLKEGHEAGGTLRSHPLVADLRQRMDKFVKNRGGQEIQSTWLELKTKAFSRSEPGSSWELLQACGKVKQQLCAIYRLSLLSTAPSRGRPPPAPAPPGPSPKAHARKAGRLEGLFVSEEPAEHHHGVIPRRLPRFGAFHLRGPHDWADGGSFPQHP	1880517	1850287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840_1860021_1860112_1860281_1861540_1861597_1864160_1864231_1864370_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1869642_1869786_1870002_1870141_1875484_1875602_1878694_1878812_1880462
530910	contig_9471_pilon	-	1478	8	Intergenic	novelGene_21829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACAATCCCCCCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417420	412498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414728_414804_414934_415628_415714_416192_416271_416934
530911	contig_8122_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_40245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	911.658006594389	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	371	892	742073	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720245	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
530913	contig_14681_pilon	+	3164	9	Intergenic	novelGene_134195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_4	184.011378724252	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2252	2668	60259	71147	TRUE	35	TCTACCCTATCAAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYLDGQNLVSQHSSLLKSGRRETTSSSERLTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	23088	72938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_50350_50634_56129_56208_58505_60349_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
530914	contig_5551_pilon	+	2419	6	Intergenic	novelGene_134265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_5	232.76374288106	893	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	192	734	623518	635049	FALSE	30	GAAAAATCCGTCTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASALEELQKDLEEVKVLLEKATRKRVRDALTAEKSKIETEIKNKMQQKSQGKADPLDNEKPAAVVAPMTMGYTVKISNYGWDQSDKFVKIYITLTGVHQVPAENIQVHFTERSFDLLVKNLNGKNYSMIVNNLLKPISVEGSSKKVKTDTVLILCRKKAENMRWDYLTQVEKECKEKES	623326	636734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_623539_626683_626904_629801_629899_630168_630269_633422_633521_635042
530915	SIRV6	+	1008	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	4	423	4	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	36	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTCGCATGGAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
530916	contig_11780_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_134301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32238	31835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_-_31800_32200
530920	SIRV6	+	314	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGCTATTGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845
530921	contig_7416_pilon	-	3170	1	Intergenic	novelGene_134334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAACCAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869797	866627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_866600_869800
530922	contig_859_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_132830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAGAAACATTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131142	130572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_-_130600_131100
530924	contig_6208_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_53017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGCTGGAGTAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477963	478537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_478000_478500
530925	contig_16098_pilon	-	1589	9	Intergenic	novelGene_46115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	287	1381	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460413	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
530927	contig_7815_pilon	+	1705	11	Intergenic	novelGene_134408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	62	junction_10	57.0915930763891	235	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1683	21	1703	879707	933798	FALSE	25	GTAAGTACTCTTTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADWVGPLSPGRKARAPGAYSKAAGTKHTRASKQEDASKRKAELEAAVRKKIEFERKALCIVEQLLEENITEEFLKDCGMFITSAHYSDVVDERTISKLCGYPICQKKLGIVPKQKYRISTKTNKVYDITERKSFCSNFCYKASKFFQAQIPKTPVWIREEERYPDFQLLKEGQSGHSGEEVQLRSQAIKMSDIENPGHSEKQYESSSSSTRSDSSSDNEQDFVSSILPGNKPNAAGISPQLHKKSIMRKKAGHKVNPKHNDKEQAIVDVAERLDNCRLDSQEKAAACVLPSQNVNAQISSNNPLQEKLKASENKYSSSEVTLVGISKKSAEHFKRKFAKSNQVSRSASSSVQVSPEVAKTNLLKVLKETLIEWKTEETLRFLYGQNYASVCLKPPSVCLIEAEELDEDDLNSDPVSHPLVLRESQNSLDEALPFRGSDTAINPLPSYENLKKETETLNLRIREFYRGRYVLNEESSMSQDSEERNLTFPLMDSSSQNQIRKRIVLEKLSKVLPGLLGPLQITLGDIYTQLKNLVRTFRLTNRNIIHKSAEWTLIAMVLLS	879686	933800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_879780_880670_880717_890607_890723_891955_892055_892263_892330_893856_893946_909891_909928_911918_912847_914980_915064_918056_918138_933731
530928	contig_13740_pilon	+	2557	8	Intergenic	novelGene_34739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	105.193504882135	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	170	775	321880	356270	FALSE	30	AAAATCAACTTTGGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPEQQKEEFVSVWVRDPRIQKEDFWHSYIDYEICIHTNSMCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	273463	358052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_273491_275892_276012_321856_321904_342727_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
530932	contig_3975_pilon	-	2239	4	Intergenic	novelGene_54804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1074	junction_1	73.440830302738	44	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	331	846	2018377	2016940	FALSE	20	ATGGTACATTTCTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKGGLGWART	2018707	2015546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280
530933	SIRV6	+	1073	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	13	2	6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	202	693	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1143	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
530936	contig_10354_pilon	+	1897	6	Intergenic	novelGene_50841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	439.365633612826	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	174	881	432370	475314	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432196	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056_475346_475512
530938	contig_10904_pilon	-	2107	8	Intergenic	novelGene_22619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	336.410220912941	1175	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	396	1427	510205	499813	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	515806	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514118_514793_514925_515034_515114_515739
530939	SIRV6	+	341	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	51	0	-51	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTCATTGTATATGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
530940	contig_3077_pilon	+	1397	8	Intergenic	novelGene_26628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3373.14561602946	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	342	908	13867	17590	FALSE	20	TTAACAGTGTGCGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9600	18079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
530943	contig_19342_pilon	+	1060	4	Intergenic	novelGene_41125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	56	463	5070	6183	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	5014	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_5960_5994_6139
530944	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_10120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	18	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
530946	contig_6533_pilon	+	760	3	Intergenic	novelGene_114613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	986	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTGCTGAAATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10484	25827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13552_25250
530948	contig_7457_pilon	-	1818	4	Intergenic	novelGene_31615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.0416305603426	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	79	828	960838	956489	TRUE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGCSPKNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962448	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956156_956237_956666_960265_960896_962427
530949	contig_15063_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_9171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	777	1097	35891	35108	TRUE	20	TCACATTGCCATGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAVHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36776	27127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27156_34595_34928_35042_35374_35836_36156_36264
530951	contig_11832_pilon	-	2584	12	Intergenic	novelGene_106941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1075.9095479509	4	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	655	999	86997	85898	TRUE	10	GGCATGAGTGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTM	92486	83801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84494_85004_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
530952	contig_14184_pilon	-	2756	8	Intergenic	novelGene_66591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.710025208515	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	959	1426	90482	89879	FALSE	25	TGAACCAAGTGTGTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTALLFPTPLRSFCCLQFDAVRLNRGAFPDQGLHLGCSGVAWFQAGREGVRPTGHPASLWAQVPCSGASQGLWAGPHNELENHGSSLILEPACLPRSGPRHPASCWHCHRGSQLQEWPRPRQPGGPGKTHYRTLSFLGSRGQLWFHLHLSLDGR	126322	88548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90013_90148_90772_91298_91348_91951_92112_103407_103502_105799_105915_109168_109327_126229
530953	contig_5981_pilon	+	2476	10	Intergenic	novelGene_35495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.52331166425	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	281	1174	25607	37804	FALSE	30	TAAGTATAGGACTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23447	39106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25025_25070_25399_25467_25575_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
530954	contig_9121_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_134435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAAGTAAGAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60745	61349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_60700_61300
530955	contig_5643_pilon	+	1987	6	Intergenic	novelGene_38948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	98.2392996717709	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	223	669	481872	501321	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISAEVTKPSLHWAPNPHIETPVQEAEGKEDADLEDWSCSSPSIGTVSFKRARAPLCIPHSAPLSVQTSPTLSAGMAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICFSFPFPSPLVRPQPSWLGLAPSLPKA	462255	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_462492_462593_481851_481957_482082_482251_494961_495073_501238
530956	contig_3233_pilon	+	2021	9	Intergenic	novelGene_56563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	223.621331719494	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1298	1885	742817	747909	FALSE	20	AATGGGATTGTGTTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738720	748045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
530957	contig_7396_pilon	-	1572	16	Intergenic	novelGene_79635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3354.66114864411	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	182	1528	255163	245987	FALSE	15	GTGAACCTATTTTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITIHVPGILFRAVCKM	257083	245942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246031_247238_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
530958	contig_12977_pilon	+	1974	16	Intergenic	novelGene_122772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	781.479724625022	18	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	812	1468	48712	57283	TRUE	0	TTCTCCTTGGCCCTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10490	58797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48647_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_57866_57977_58495
530960	contig_12427_pilon	-	1526	6	Intergenic	novelGene_40563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	145	768	522337	506035	FALSE	25	CCAGCTAGAGGCAGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578096	505276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
530961	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	201	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34607	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
530962	SIRV4	+	332	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	646	970	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTTAACCGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
530963	contig_9753_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_41316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAAATCTGTTGTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70510	69102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_69100_70500
530965	contig_2987_pilon	-	2643	13	Intergenic	novelGene_125851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	64.1383054205692	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	81	2555	522232	507993	FALSE	25	TTCTTCCAAAGGGCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDEDEHENFEITDWDLQNEFNPNRQRHWQTKEEATYGIWAERDSDEERPSFGGKRTRDYSAPVSFISAGLKKGAAEEAELEDSDDEEKPVKQDDFPKDFGPKKLKTGGNFKPSQKGFAGGTKSFMDFGSWERHTKGIGQKLLQKMGYVPGRGLGKNAQGIINPIEAKQRKGKGAVGAYGSERTTQSLQDFPVVDSEEEAEEEFQKELSQWRKDPSGSKKKPKYSYKTVEELKAKGRISKKLTAPQKELSQVKVIDMTGREQKVYYSYSQISHKHNVPDDGLPLQSQQLPLPGKEAKAPGFALPELEHNLQLLIDLTEQEIIQSDRQLQYERDMVVNLSHELEKMSEVLDHEERVISNLSKVLEMVEECERRMQPNCSNPLTLDECARVFETLQDKYYEEYRMSDRVDLAVAIVYPLMKEYFKEWDPLKDCTYGTEIISKWKSLLENDHLLSHGGQDLSADAFHRLIWEVWMPFVRNIVTQWQPRNCDPMVDFLDSWVRIIPMWISDNILDQLIFPKLQKEVENWNPLTDTVPIHSWIHPWLPLMQARLEPLYSPIRSKLSSALQKWHPSDSSAKLILQPWKDVFTPGSWEAFMVKNIVPKLGMCLGELVINPHQQHMDAFYWVIDWEGMISVSSLVGLLEKHFFPKWLQVLCSWLSNSPNYEEITKWYLGWKSMFSDQVLAHPSVKDKFNEALDIMNRAVSSNVGAYMQPGARENIAYLTHTERRKDFQYEAMQERREAENMAQRGIGVAASSVPMNFKDLIQTKAEEHNIVFMPVIGKRHEGKQLYTFGRIVIYIDRGVVFVQGEKTWVPTSLQSLIDMAK	524093	507904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_508349_510118_510285_510773_510917_511458_511703_512416_512586_513337_513445_513566_514095_515391_515545_517516_517645_519400_519558_519837_519992_522062_522238_524018
530966	contig_11752_pilon	+	1172	9	Intergenic	novelGene_37582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1375.71288338083	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	127	885	85049	105616	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDIAEEMSESSEGLVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85073_87458_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
530967	contig_1435_pilon	+	2785	22	Intergenic	novelGene_115474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	135.082892162931	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	1114	2127	366172	393309	TRUE	25	GTAAAGAGTTTGTGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAVTGVVCYACRITSTLLLYQELTRKGVRWLIELIKDDYNEAVHKKTEVVITLEFCIRNIEKTVKIYEKLMQINLEATELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETNLQDIGSKLSPGGLLADTWAHQEGTHPRDRNVERLQVLLNCITEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTHFADECVKKYDAFLNKSEEWMRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQDYTNELQETLPQKMFAASSGIKHTMTPVYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMDGGLRNVDCI	333043	394018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_333104_338638_338757_345580_345722_348686_348817_350410_350593_357555_357717_361448_361560_364179_364321_366102_366185_366906_366966_367368_367461_370112_370215_371099_371179_386167_386290_386388_386466_388127_388168_388713_388816_388937_389035_389548_389656_390213_390286_393257_393524_393574
530968	contig_7151_pilon	+	2961	4	Intergenic	novelGene_40731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	119.192654508946	24	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTACAGTAGAGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502248	507766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_506685_507738
530970	contig_8907_pilon	-	3192	8	Intergenic	novelGene_85847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_7	114.925708035004	390	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	76	1512	717655	662717	FALSE	10	TACCTTGTCATTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGPAAPGEQASGAEAEPGPAGSPPSLLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKNTVDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTSNTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPTASKTVFLFCSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT	717730	661036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_662876_663386_663534_675067_675156_681230_681424_684575_684774_692187_692294_700073_700231_717266
530972	contig_16122_pilon	+	1814	2	Intergenic	novelGene_134506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	645	1340	134090	137601	FALSE	10	AGCAGTCTTGCTTGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133445	138075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134161_136976
530974	contig_14811_pilon	-	1718	4	Intergenic	novelGene_74481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	421.842255930921	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	130	804	375703	357493	FALSE	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLATRR	386596	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357507_357552_357613_375102_375765_386528
530975	contig_15063_pilon	+	1198	3	Intergenic	novelGene_14349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
530976	contig_8663_pilon	-	2224	6	Intergenic	novelGene_57992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	250	junction_5	134.18405270374	1213	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	86	562	71195	53470	FALSE	15	TTGTTGTCTATGAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQSSLKKLAVNNIAGIEEVNMIKDDGTVIHFNNPKVQASLSANTFAITGHAEAKPITEMLPGILSQLGADSLTSLRKLAEQFPRQVLDSKTPKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN	74415	51807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54145_54985_55188_67192_67307_71141_71209_74343
530977	contig_5954_pilon	-	1731	9	Intergenic	novelGene_28653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	492.588570715968	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	663	1373	947127	945083	FALSE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956277	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948146_956160
530978	contig_13894_pilon	+	1103	8	Intergenic	novelGene_62158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2599.26044426927	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	181	624	523580	525849	TRUE	50	CAATAAAAAATATTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKVREVCRLRTVALVTES	522757	528150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525933_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
530979	contig_19721_pilon	+	1975	3	Intergenic	novelGene_99160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	2	53	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGTCCTCTTGTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160334	166112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_160441_162252_162324_164314
530981	contig_14357_pilon	-	2902	1	Intergenic	novelGene_121679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558427	555525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_555500_558400
530983	contig_10058_pilon	+	1968	10	Intergenic	novelGene_67687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_1	86.741136096768	1083	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	348	1037	51319	52990	FALSE	10	CAGTTGTTTCTCGTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVRPQPST	48217	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837
530985	contig_17427_pilon	+	2026	2	Intergenic	novelGene_30389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTGTGGCCATCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193225	203310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_194867_202925
530986	contig_17427_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_30392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAATATAAGGACGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203612	204216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_203600_204200
530989	contig_9345_pilon	+	818	2	Intergenic	novelGene_24589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	861	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAGCTGCACACATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944543	945638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_945114_945390
530991	contig_15063_pilon	+	1107	4	Intergenic	novelGene_14282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2815.71352709516	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	652	1107	36064	36628	FALSE	25	GTGATGTCTGACACGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSL	34827	36628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34936_35049_35369_35839_36158_36266
530992	contig_11115_pilon	+	2342	5	Intergenic	novelGene_102831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	582	junction_2	316.293672873803	7	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	136	828	165608	171373	TRUE	20	AGTCTGTGGCTTAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFGDALGCPWRGQA	165472	173330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171981_172339_172964_173047
530993	scaffold_19766_pilon	+	2144	15	Intergenic	novelGene_34434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	157.477176836803	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	421	1488	845894	849034	TRUE	15	TCTAATCTGGGCCCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGWPSTSPTCTSTAGSPQHSLNLWT	844662	851582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844793_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848406_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
530994	contig_14925_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_55379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130942	128583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128600_130900
530997	contig_6846_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_107305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACGTAAGTAAAATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310361	309345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_309300_310400
530998	contig_12570_pilon	-	2014	7	Intergenic	novelGene_79368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	46.3884564184765	667	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	492	1076	284104	280932	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300286	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_286406_286481_293908_294088_300198
530999	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_18424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGTAATTTGGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
531001	contig_1379_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_134589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCATGATGTAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435513	434887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_434900_435500
531002	contig_1379_pilon	-	2733	2	Intergenic	novelGene_134588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGAAAACTTGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434578	431743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_433161_433262
531004	contig_10297_pilon	+	2227	8	Intergenic	novelGene_112541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	93.2963240520904	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	543854	557159	TRUE	45	AAAAAATTCATATGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTMASGCKIGPSILNSDLANLGTECLRMLDSGADYLHLDVMDGHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEAGANMIVSGSAIMRSEDPRSVINLLRNVCSEAAQKRSLDR	543842	561564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543976_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554385_554473_557036_557305_558563_558617_560233
531005	contig_5954_pilon	-	2264	15	Intergenic	novelGene_28672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	417.595870698562	1	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	670	2142	956264	944848	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTDHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	960587	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945038_945373_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
531006	contig_20697_pilon	+	1794	2	Intergenic	novelGene_134605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	61	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACTAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3753	6129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_4000_4581
531007	contig_7357_pilon	-	2869	3	Intergenic	novelGene_36857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.5	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGACATTAATAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200583	195832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_196950_196987_197437_199280
531009	contig_3602_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_60497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	5296	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	121	570	161745	169451	TRUE	10	CTGACTTGGCTCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161624	171128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170245_170789
531010	contig_5894_pilon	-	3499	1	Intergenic	novelGene_83010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGCATGATCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258211	254712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_254700_258200
531011	contig_1443_pilon	-	4211	26	Intergenic	novelGene_28350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	253.116934241864	1	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	29	2719	937429	898928	TRUE	50	AAAGATAAATAAACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGGAASGAMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEG	937457	895945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898931_899649_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125_909222_909341_909408_910547_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913985_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
531013	contig_348_pilon	+	2858	9	Intergenic	novelGene_67596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	10.5356537528527	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	568	1425	320222	344260	FALSE	35	AAAAACTGTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKANRDQLLCLGWPLETVTLTLQTKVPHPMRCFGCT	314460	345693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319670_319792_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_344155
531015	contig_9471_pilon	+	1289	10	Intergenic	novelGene_21798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	510.099869185643	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	287	1063	413930	417296	FALSE	25	TATATGAATCTGCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	410661	417522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_410743_412745_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
531017	SIRV4	+	313	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	201	436	201	-436	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCAATTGCTCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	2335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
531018	contig_5317_pilon	+	2316	11	Intergenic	novelGene_76634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	133.461192861446	91	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	25	1236	896836	922667	TRUE	10	TTGGGATGTTGTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMEEDSYDSFGEPSYPEVFEPPPAWLPGGGAGGRGGKGREARPRGLHLLQRAGGQGGGHGQWGLEHHAGMLRGHPYSVNRSP	896811	924984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_918631_918735_921985_922105_922647_923014_924250
531019	contig_14289_pilon	-	2270	6	Intergenic	novelGene_110548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_1	330.871818080658	3980	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	91	768	66533	51527	FALSE	15	TGTTTTGTCCAAGGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66623	50024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
531021	contig_15453_pilon	+	2015	5	Intergenic	novelGene_112484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	299.615899945247	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	24	401	6981	17249	FALSE	20	AAATTCTACCCTTCGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGRRRKMAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLLGA	6957	18863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103_17161_17233
531025	SIRV2	-	503	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4366	38	3191	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1541	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
531026	contig_13894_pilon	+	1190	10	Intergenic	novelGene_62116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2555.40902478461	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	463	1134	524877	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520687	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523531_524846_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
531027	contig_16622_pilon	+	2555	9	Intergenic	novelGene_48437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTCAGTCCCCCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108206	120312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_108469_110031_110145_110891_111029_112144_113041_113602_113741_115155_115292_115417_115561_118813_119325_120093
531032	contig_9833_pilon	+	1912	13	Intergenic	novelGene_68536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	446.433707906958	751	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	535	1143	250070	254740	TRUE	15	TCACTCCTTGGGTAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230804	260334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244863_244944_246609_246710_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
531033	contig_7165_pilon	+	2509	16	Intergenic	novelGene_116887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	375.916917534831	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	51	1583	909633	1063359	FALSE	55	AGAATATTTAATAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVPSKSAGLRRVFVVGVGMTEFVKPVDNSRDYPDLAEEAGQKALADAQIPYSAVEQACVGYVYGDSTCGQRAVYHSLGLTGIPIINVNNNCSTGSTALFMGRQLIQGGVADCVLALGFEKMDKGPLGVKFPDRTIPLDKHLEVMVNKYGMSAHPVASQMFGRAGEEHMEKYGTKIEHFAKIGWKNHKHSVNNPYSQSQKEYSLDEVMESREVFNFLTVLQCCPTSDGAAAAVLASEAFVQKYGLQSKAVEILAQEMVTDLPSSFEEKSVIKMVGFDMTKEAARKCYEKSGLRPSDIDVIELHDCFSSNELLSYEALGLCPEGQGGKLVDRGDNTYGGKWVINPSGGLIAKGHPLGATGLGQCAELCWQLRGEAGKRTHQIEAVPTSSAFDGFKANLVFKEIEKKLEEEGEEFVKKIGGIFAFKVKDGPGGKEATWVVDVKNGKGSVHPNSDKKADCTITMADSDLLALMTGKMNPQSAFFQGKLKITGNMGMAMKLQNLQLQPGKAKL	909582	1064285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_909702_929448_929504_940162_940235_944647_944780_945963_946029_951357_951485_960814_960879_965882_965970_967104_967256_968383_968532_973684_973793_1016715_1016771_1043582_1043677_1053994_1054125_1060246_1060327_1063263
531034	contig_12019_pilon	+	2101	3	Intergenic	novelGene_87786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1842	junction_1	251.5	45	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1292	1627	766528	766863	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPQCSSGRAMSTHVWKVVRHWPVPKHLMTYSLSSPAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVRGVGTGRALKFTYRL	764790	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_764823_765184_765260_765343
531035	contig_6048_pilon	-	2519	15	Intergenic	novelGene_73290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_14	81.5164000026237	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	53	1753	2006298	1979428	TRUE	25	CCTTGGAATAAAGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASCSGAQVNSPGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKCMAQAGGA	2049054	1978478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
531036	contig_7091_pilon	+	2197	16	Intergenic	novelGene_131767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_1	331.77542605403	600	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	124	1479	349798	431560	TRUE	50	TTGATTCAGAATAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKDYHEEKKVLNGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDESAYF	349674	435684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431547_431687_435092
531037	contig_10531_pilon	-	2477	4	Intergenic	novelGene_114517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	53.6304225437598	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	11	391	390805	382483	FALSE	10	TTTATTTTTGTATGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGMEPEEGTALWRLQKLPADLGPQLLHKIIDGICGRAYPLYQNYHSVWDSTEWIHVLEDITTFFKVIVGKNLSDEEISQQLNQLNSFHQEAIMKCLKSRKDDIRQALLGEIVDISSAQLQNFDWQLKM	390815	380396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_382489_386747_386901_388812_388969_390739
531038	contig_14513_pilon	-	1071	3	Intergenic	novelGene_70354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19011	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11995_12070_12153_18725
531039	contig_15063_pilon	+	1207	5	Intergenic	novelGene_10495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	972	235	1206	34808	36457	FALSE	15	AGGCCCAGGGCTTCTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEP	27134	36458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531040	contig_15304_pilon	+	1257	5	Intergenic	novelGene_30678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3715	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTTGCTTCCTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105488	112607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_105962_106042_106374_106483_106523_106931_107223_112484
531041	contig_7594_pilon	+	1419	7	Intergenic	novelGene_55418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	715.466456236769	3749	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	79	795	539045	554556	FALSE	15	GTGTTTTGTGATTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	538966	555180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
531043	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
531044	scaffold_12124_pilon	-	2208	9	Intergenic	novelGene_22070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1224	1571	857198	847657	TRUE	35	GCCGAGATGTTGAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIFFGCRVDNLRYDLHTQISSVGFPTG	858979	837309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846898_847601_847734_852323_852461_854702_854801_857162_857231_857788
531045	contig_15991_pilon	-	1672	5	Intergenic	novelGene_70923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3372.78730243993	90	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1250	1618	101267	100445	FALSE	30	ACATCGATTTCTAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	103924	100390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101821_101915_102271_103583
531046	contig_10182_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_134635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	765	1100	405469	405134	NA	15	TCTCAGCTGAAGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLGQCLLCQVAAFSVMQASLSLASLPAGCALSGSLPSASLPLASLLLIGPAHSQCSSLLGFLSCCSSVSSSPPSNLSAISPLHHQASLPSGFFTVCLSAANWPSSQPV	406233	405028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_405000_406200
531048	contig_15063_pilon	+	1713	7	Intergenic	novelGene_11902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3695.17550327451	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	225	1343	34808	38987	TRUE	10	CTGCGTTCTTGTGAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSGK	27142	39772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36595_38977_39092_39506
531049	contig_15063_pilon	+	1767	7	Intergenic	novelGene_13062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	37	1512	30275	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSFKGLASDQTTEKSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30238	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531053	contig_15063_pilon	-	1379	5	Intergenic	novelGene_14363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	984	1307	35891	35108	FALSE	25	ACAGCGGGGGGTGGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	35035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36156_36264_36597_38967_39089_39504
531057	contig_17144_pilon	-	1474	10	Intergenic	novelGene_29511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1628.41864517409	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	323	1450	179764	166106	FALSE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQLFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVLSLWTGPPRQPAHFKNVQPHPLAFCTCFL	183404	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166199_166386_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168196_176105_176271_179700_179786_181794_181850_183158
531059	contig_10299_pilon	+	2249	11	Intergenic	novelGene_79665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_7	44.538634913971	1230	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	28	1047	182394	185364	TRUE	40	ACAAAACTTGATACATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	182366	187676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185864_186084_186207_186389_186528_187233
531061	contig_10246_pilon	+	2871	10	Intergenic	novelGene_46906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.762937847536	3	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	63	1220	144696	184738	FALSE	20	TCATAGGTTTGTAGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGMIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140737	186389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144780_148218_148337_168075_168275_169672_169787_171174_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
531062	contig_233_pilon	+	2622	15	Intergenic	novelGene_14578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	145	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	1898	2620	105585	127000	FALSE	10	TACTGGCCCTGATGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGLAWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCEVLFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRPEEEQSHQSEQQGMLAWHDLTHVLEPWCCVSWVGWGRSSYDLVQAGSLSLLGK	78138	127002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91467_91677_93787_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107471_108400_108584_108726_108818_109917_109978_126900
531063	contig_8059_pilon	+	1738	17	Intergenic	novelGene_111086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_14	69.0514979924404	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	430	1293	266127	340344	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKPSCIPNGKENFSGSTALWQNI	90280	342012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336472_338661_338891_340277_340374_341596
531064	contig_15063_pilon	+	1559	6	Intergenic	novelGene_14094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2273.14624254578	4	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	419	1306	35271	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLQVSSPSSPVRAPTRARWPLAASLVTFCLAPSHFPGTIRTTALSTPRNSRPSHLSYWRANNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34618	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34804_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531065	contig_6980_pilon	-	3450	1	Intergenic	novelGene_36055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACTCATTGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354575	351125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_351100_354600
531066	contig_9516_pilon	+	2628	16	Intergenic	novelGene_106151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	39.1643829121421	217	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	809	2491	702153	710833	FALSE	35	ATTTTTAATCTATTAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAKARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKDFETLRKVDPTAALEELEKIEKARMMERMSLKHQNSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQAASESEEEGGGVEENELLVPDVVNEVHINANEPNPWMRRSCTSDAKEVEIQKDPEQPPEPMAHEDSESEGEESPVAEEETLLKEFEERRSLRKRPELNQDAEPVGGREAQDASSQEVLSELRALSRKLNKENQEKQSRKQKGNSVRAVLPVQREEPAQEEEEPLLLQRPERVQTLEELEELGKEGYLQNTELPRPVSQGQQTERNPDNQPGAPKKKKRKEEMIDLQNLLTTKSPSVKSLAVPTTIEALEDEEERDQKQMIKEAFAGDDVIRDFLKEKKEAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLQPSAKKRRRFLIKAPEGPPRKDKNLPNVIINEKRNIHAAAHQVHVLPYPFTHHHQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTPKVVTKPGHIIKPIKAEDVGYRSSSRSDLSMVQRNPKQLSVRHKKQLKKNSVD	690578	710970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_690684_691718_691795_692663_692735_694231_694297_695915_696059_696331_696488_698029_698117_702047_702168_702265_702361_702961_703086_703168_703247_703704_704096_706498_706912_707643_707838_707971_708072_710560
531067	contig_7151_pilon	-	2479	13	Intergenic	novelGene_40654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	144.185933202006	3	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	38	952	65162	13468	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQI	65199	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5710_5943_6286_12491_12807_13360_13469_18273_18479_18570_18880_40400_40716_65077
531068	contig_12270_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_113190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14417	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14209
531069	contig_18156_pilon	+	2393	16	Intergenic	novelGene_101444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	124.576509289138	973	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	841	2256	29578	64324	FALSE	45	ATTCTGAACAAAACTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFSQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7325	64461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23537_29472_29619_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
531072	contig_8710_pilon	-	2040	12	Intergenic	novelGene_73535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_1	66.8312294001876	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	26	1525	495594	459003	FALSE	15	CTTTTCATTTTGATTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	495619	458487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459117_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500
531073	contig_3747_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_24827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	329	1516	201313	203972	FALSE	10	TGTGGACTCGTTGGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVKIVICPKPRPSPGP	200984	203976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203677_203950
531074	contig_1532_pilon	-	938	5	Intergenic	novelGene_37442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	1323.10298163068	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	133	594	32217	28430	FALSE	25	TACATTATGTTCCCAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKETASKKYRVNQQQQQQPLGVELLPAQCVE	35463	28085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_28520_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
531075	contig_3414_pilon	-	2230	16	Intergenic	novelGene_80968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	288.913704917037	158	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	16	1869	101974	67173	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65361_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
531078	contig_8476_pilon	-	2255	9	Intergenic	novelGene_121333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	236.331202975824	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	758	1669	209623	104729	FALSE	50	GAAAAAAATGTTTTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGTSRARSPRSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRGAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYSFVQQLTERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRTLDVSVSFNGGKSVFSSSLIVTATECSNGIAAIIAILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPRPPPPPPKEKEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVTIPEETEEPIRPRPPKPKPTYQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEVCMWACAGKKNESWSIY	210380	104142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_104864_106930_107099_113163_113257_114099_114145_130076_130173_144931_145011_206168_206241_208667_208740_209471
531079	contig_17198_pilon	-	2353	12	Intergenic	novelGene_62412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	237.329390656576	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	113	1408	1150359	1105667	FALSE	30	GATACTAGAGTGTCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTPKDAASVRATHPIPAACGIYYFEVKIVSKGRDGYMGIGLSAQGVNMNRLPGWDKHSYGYHGDDGHSFCSSGTGQPYGPTFTTGDVIGCCVNLINNTCFYTKNGHSLGIAFTDLPPNLYPTVGLQTPGEVVDANFGQHPFVFDIEDYMREWRTKIQAQIDRFPVGDREGEWQTMIQKMVSSYLVHHGYCATAEAFARSTDQTVLEELASIKNRQRIQKLVLAGRMGEAIETTQQLYPSLLERNPNLLFTLKVRQFIEMVNGTDSEVRCLGGRSPKSQDSYPVSPRPFSSPSVSPSHGMNIHNLASGKGSTAHFSGFESCSNGVISNKAHQSYCHSKHQSSNLNVPELNSINMSRSQQVNNFTSNDVDMETDHYSNGVGETSSNGFLNGSSKHDHEMEDCDTEMEVDPGQLRRQLCGGSQAAVERMIHFGRELQAMSEQLRRECGKGTANKKMLKKPTICQSNLHLP	1200098	1104721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1105706_1117273_1117426_1119094_1119217_1122034_1122180_1124906_1125098_1126926_1127036_1128153_1128267_1131162_1131348_1144509_1144533_1148908_1149077_1150310_1150364_1199990
531080	contig_6735_pilon	-	1663	11	Intergenic	novelGene_15667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	821.185508883346	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	842	1183	543144	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	554373	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543876_544847_545064_545913_545945_546577_546634_547243_547355_551180_551235_552840_552887_554280
531081	contig_9708_pilon	-	1990	3	Intergenic	novelGene_67247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	14	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAAAAATGTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40219	18891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_24631_24943_40077
531082	contig_12414_pilon	+	1679	2	Intergenic	novelGene_59568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	87	1145	370898	374054	FALSE	15	TAGTGTTATGTTCTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370811	374588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
531083	contig_5515_pilon	-	3082	10	Intergenic	novelGene_52355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_8	152.437074651789	714	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	375	1781	169061	160151	FALSE	20	GCAAAGAGTCTCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVGVSAGGHTLGRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPTSAQPLPAPETVHATGPAGSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTAGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQSVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDVEEEGRPGTFHVGGAPAPNASHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEESVVGGLSGGTLSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES	172749	158849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_160589_161061_161210_165496_165573_165751_165809_166171_166290_167741_167847_167931_168178_168842_169082_170133_170248_172509
531084	contig_6710_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_98226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531085	contig_11512_pilon	-	2949	16	Intergenic	novelGene_43368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1170.86648636336	1	123	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	126	1064	609650	556848	FALSE	5	TGCAGTGGCCTGTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYT	622326	554962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556853_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576904_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
531086	contig_6958_pilon	-	2458	5	Intergenic	novelGene_69948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	496.818062775499	9	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	946	2181	190008	149618	FALSE	30	AAGACGCTTCCTGAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190953	149340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
531087	contig_3095_pilon	+	1197	5	Intergenic	novelGene_75102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	89	814	147280	151151	TRUE	45	ATACAATAAACTATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147191	152220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
531088	contig_5280_pilon	-	1998	8	Intergenic	novelGene_52588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGCGCCTAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79149	38309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_38472_39266_39371_40905_41072_41733_41837_42906_42988_47317_47506_56216_56289_78027
531089	contig_15063_pilon	+	1196	3	Intergenic	novelGene_14335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	238	1059	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35033	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
531090	contig_12635_pilon	+	1471	11	Intergenic	novelGene_60816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCTAGTCCTGCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180242	253034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_180435_180644_180751_189585_189751_192585_192742_197106_197174_201014_201145_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227436_252806
531091	contig_15063_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_11295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531092	contig_7045_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_77456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACACATGCTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359485	358502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_358500_359500
531094	contig_8541_pilon	-	1701	4	Intergenic	novelGene_105580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_2	373.026361892382	2283	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	205	1026	577314	548514	FALSE	25	TTCCTATGTTTAAGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKAREEEERAKREELERILEENNRKIAEAQAKLAEEQLRIVEEQRKIHEERMKLEQERQRQQKEEQKIILGKGKSRPKLSFSLKTQD	577518	547838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_564935_567245_567472_576967
531097	contig_14397_pilon	-	1974	8	Intergenic	novelGene_134640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	428.202364900198	58	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	35	829	126676	8434	FALSE	15	TCATTCCTCTTTCATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFKEAEAQHSIMTEPRRADMKAPPAALVFALALALIRTGRGNHEDPELSTYTTPEEEGTDEETISSTFAAVTTETLTADTNSTLLDTGEANQLQFTLMVLIPLILLVLLLLSVVLFGTYYKRKRTKKEPSSQGSQSALQTNELGSENVKVPIFEEDTPSVMEIEMEELDKWMNSMNRNADYECLPTLKEEKESNHNPSCPSSPCKNRIFINYVSVVSQIYMTVEHKKQPDSEEDVEKGISFLISDGSWLKAENTRKMLLWIELCPPKVCVNWARP	126710	7288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_8584_13818_13904_91746_91805_93971_94058_95353_95382_102475_102515_102603_102865_126588
531098	contig_6589_pilon	+	1420	8	Intergenic	novelGene_26031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	10	junction_6	853.492130207731	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	106	1233	1725483	1731819	FALSE	65	AAAAAAAAAAAGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPAEQPHLHSGHLSGRRSTRARLHDALDIPVQELGPRLRPDQSIPIGSAPSQSPAPSQSPSPPRPTPDPFRCPGHSPMSCKYLFIPQYTLPGTEHTASSLPWEPRCLPALAPKGPGASEHQLSVPKDKLRSLSHLVAYHLPARLFSAQTSNKFPAFW	1725377	1732006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729208_1730094_1730152_1731406
531099	contig_9848_pilon	-	1782	12	Intergenic	novelGene_79963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	476.817549180619	2	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	96	512	110549	105907	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGRRAPGVGRGGVTAQLRPNSLLLQEAGTDQMQPT	113915	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104611_104841_104905_105852_105909_106409_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
531100	contig_233_pilon	+	2076	12	Intergenic	novelGene_14521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	342	851	78477	91651	TRUE	25	GGGAAAAGGTACTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78135	126993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92347_93759_93892_101691_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107436_108720_108818_109917_109978_126901
531102	contig_11338_pilon	+	1725	10	Intergenic	novelGene_6162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	435.808854917717	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	299	1357	6086	13234	FALSE	45	TATCAAAAGCTGAATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRAALHRLHKDHHL	745	13602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10013_13195
531103	contig_2069_pilon	-	731	3	Intergenic	novelGene_23520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	72	353	1509802	1508747	FALSE	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509873	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
531104	contig_6375_pilon	+	2219	6	Intergenic	novelGene_72931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	282.567797174413	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCAGTGATGATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16552	30374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_20907_20997_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
531105	contig_10299_pilon	+	2337	19	Intergenic	novelGene_79697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	87.6684445672416	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1322	2179	337976	340377	FALSE	15	TTGACATGCTTGTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320508	340535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335155_336796_337087_337220_337257_337431_337537_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
531107	contig_7887_pilon	+	2265	3	Intergenic	novelGene_124931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.5	1621	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	70	1242	584043	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAATKAWGLRSYGLLSGLRLQGMKADCIVWGPDGVCLTWGSGLQGDKATEGQGPREQEPGSGFLEQKEQLEAEAQGLRQELERQRRLLGSVQQDLEQSLREAGQGDPAHSGLAKLSHRLAQKLQDLESWGQDPGTPANASGAWGQELHFQSSRERSGKEKWWGGQGNRKAEHWKHKKEGSGGERKSWESEKDREQTRKRKEGKLRVQEWEDKDGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	577970	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_578027_584029_585122_585612
531108	contig_1867_pilon	-	1274	4	Intergenic	novelGene_54546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	24.7161665492222	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGTATAAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449907	387699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_387747_426593_426680_429532_429984_449217
531109	contig_15063_pilon	-	1548	5	Intergenic	novelGene_10330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	803	1126	35891	35108	TRUE	20	GGTAGTCACATTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27173_34613_34924_35035_35380_35839_36156_36264
531110	contig_3004_pilon	+	3758	4	Intergenic	novelGene_127496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	14.3372087784044	51	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGCTCGAAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281709	287267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_284415_285297_285751_286379_286451_286738
531112	contig_9436_pilon	+	2853	8	Intergenic	novelGene_60888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	145.505452594375	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	338	697	349921	350577	TRUE	10	TTTGCTCTTTTTTTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFCCFRAQHVGQSSSSTELAAYKEETNTIAKSDLLQCLQYQFYQIPGTCLLPEVTEEDQGRICVVIDLDETLVHSSFKPISNADFIVPVEIEGITHQVYVLKRPYVDEFLRRMGELFECVLFTASLAKYADPVTDLLDRRGVFRARLFRESCVFHQGCYVKDLSRLGRDLRKTLILDNSPASYIFHPENAVPVQSWFDDMADTELLNLIPIFEELSGAEDVYTSLGQLRAP	344101	353877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_344196_346361_346401_346873_346976_347550_347608_349875_349969_350106_350293_350451_351804_352947
531115	contig_15063_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_11410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	583	993	36142	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35213_36082_36158_36266
531119	contig_10904_pilon	-	2498	3	Intergenic	novelGene_22480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2015	2377	149507	149145	TRUE	35	AGCTGGTCAGAAGACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDAAVGLELDVGGGVDDGSGEAEEGGVAGVGDGEVAPGQGESGLEPADLNDENDQGHRKAEAPGEHRPVTHGPCPGIHAGHQREGDAGGQQLQQTEESQGLSQCPRGPHNGGGTQARG	151582	146151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_146223_149094_150363_150423
531120	contig_6589_pilon	+	1281	8	Intergenic	novelGene_26029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_7	637.63149104114	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	106	951	1725483	1731484	FALSE	35	GGTAAAATAGCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725377	1731814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
531121	contig_5549_pilon	+	1067	5	Intergenic	novelGene_81579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1335.25334674735	376	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	62	508	82155	93153	TRUE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVSLRNRRKLYSSHSD	82093	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91850_93120_93412_96620
531123	contig_12873_pilon	+	1948	6	Intergenic	novelGene_27137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1225.79205414295	6	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	416	1384	16357	19855	FALSE	30	TTGACTTTAAGCCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPAIAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15941	20419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16400_16747_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
531124	contig_11293_pilon	+	1014	8	Intergenic	novelGene_134666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_6	241.734041745832	80	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	242	1012	33857	47466	FALSE	25	TAAGTCCATTTTTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHSEIRPTHIIFGSDSESETKETYIQEQSHPREELVKESICKAPGKLFDSSSNEESDSEDDSNRFKIKPQFEGRAGQKLMDLQSRFGTDDRFHMDCRFLESDSEEEQKEVDEKKTAEEEELAAEKKKALDVVQHVLHINLSNSTSKGSITAKKFKDIIHYDPTRHDHATFERQRDDKQKESKAKRKKKRAECEKLPEVSKEMYYSIATDLKERLQTTKDSSEKKENIPWNVDCDGDKTEINDPTPLKNGDEEPAGFTFSFFDSDAKDVKEETYRVETVKPGKIAWQEDPCFQDSSSKEEDATEVIDHRRPNSGEVSLPEKETSRFFFFCKNDERLH	32912	47468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_33028_33474_33598_33853_33945_37293_37433_38394_38473_44666_44936_46672_46800_47396
531125	contig_1154_pilon	-	3612	19	Intergenic	novelGene_87239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	36.4573148005875	7	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	559	1284	1870016	1864829	TRUE	15	CACCTGCCTGTGCTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTWLRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQVSGRVPGWWRPERDSSEASLDSGGQAPGGAMVSTSQFWACGGAQLFPCAFRCKGDSECIWRSALKVQIWGVRRSWFETQPPHLASSVIWTSSFPSEPQFPYLFNGDNDGISP	1880501	1850285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840_1860021_1860112_1860281_1861540_1861597_1864158_1864231_1864370_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1870002_1870141_1871457_1871619_1875484_1875602_1878694_1878812_1880462
531127	contig_935_pilon	-	2697	7	Intergenic	novelGene_45579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_6	200.566420142777	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	874	2622	74	2695	630665	618204	FALSE	25	AATAGGTATGTGGTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTIDIKSLSVEKYDVSSQVISQLKQKLENLQNSNLPKSFRVPYDPGLKAGALVIEKCKVMASKKKPLWLEFKCADPTALSKETIGIIFKHGDDLRQDMLILQILRIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGD	633028	618201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_618288_619758_619906_621790_621895_623339_623566_623677_623744_628670_630678_632967
531128	contig_18081_pilon	+	2284	9	Intergenic	novelGene_23838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	14	358	427182	427526	TRUE	0	CTCCGCCCGCTCGGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLYMFIKPSFYIIYPPTVCKQIQYTCKQKASRSEVVEKRKFPLHTGASPSTLLELMPQGHIKAKRPMKNQKELILTPPPRMDFRTGICSTLQQAGVQQGNRVVFTFTDWLKQYKLSF	427168	485280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_427632_429298_430105_434817_434927_435608_435844_448204_448317_454648_454788_456512_456655_465890_466072_485183
531129	contig_15039_pilon	-	1709	8	Intergenic	novelGene_110139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	525.854367982743	121	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	273	941	200602	185257	FALSE	25	CCAGAATGCTCCTTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260909	184488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_260778
531130	contig_14513_pilon	-	1305	4	Intergenic	novelGene_70231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
531133	contig_6418_pilon	-	2018	13	Intergenic	novelGene_81209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1155	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCAGAATGGAACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444785	1341084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1341236_1341714_1341864_1375715_1375862_1383106_1383284_1388795_1388881_1390222_1390360_1409653_1409795_1410275_1410421_1428927_1429128_1429224_1429367_1441131_1441282_1441958_1442064_1444495
531134	contig_6710_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_97897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653408	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
531135	contig_8420_pilon	+	1646	9	Intergenic	novelGene_69338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	309.226833206628	37	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	441	860	37098	51079	TRUE	0	TTTTTGTGTTCGTGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10924	59229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14800_35372_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
531136	contig_9482_pilon	-	1835	11	Intergenic	novelGene_44284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	145.096381760539	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	82	1401	1253164	1237334	TRUE	5	TCTCTTCTGCTTTTCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADK	1253245	1236133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237337_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
531138	contig_15063_pilon	+	1257	4	Intergenic	novelGene_14319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	299	1120	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34860	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531140	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_97024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531141	contig_15063_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_14030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	15	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	195	1367	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531143	contig_5033_pilon	-	1657	13	Intergenic	novelGene_28989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3530.00560669999	32	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	24	1595	566787	531046	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLCGSGCCLGPQPLHCCLSCLAAASVLFLVVSQHHTKPGRHVVTSKWT	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531187_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
531145	contig_9199_pilon	+	2427	12	Intergenic	novelGene_65606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	91.5376452388184	13	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	78	1208	42527	57407	TRUE	30	AGACACATCAGCTGGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42449	59151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304_57419_57943
531148	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	229	1404	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531149	contig_12414_pilon	+	1258	3	Intergenic	novelGene_59558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	57	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	91	726	370898	374054	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370807	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373076_373498
531151	contig_15146_pilon	+	2249	11	Intergenic	novelGene_116974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.538050818361	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	59	1951	615265	628786	FALSE	25	TGCCAAATCATGTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSRRSPPIPLAKVDATAETDLAQRFGVSGYPTLKIFRRGKPFDYNGPREKYGIVDYMVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFSTEIAKFLKVAPGTLVVMQPERFQSRFEPKSHVMDIQGSTEASAIRDHVVQHALPLVGHRRVATEAKRYTRRPLVVVYLSVDFSFDYRVATQFWRSKVLEVAKDFPEYTFAIADEDDYASEVKDLGLGESGEDINAAVLDEGGRRFAMEPTEFDADALREFVTAFKKGKLQPVIKSQPAPKNNKGPVKVVVGKTFEDIVLDPSKDVLIEFYAPWCGHCKQLEPVYTALGKKYRGHKGLVIAKMDATANEATSDRYKVDGFPTIYFAPSGDKQNPIRFEGANRDLEHLSQFIEEHATQLGRAREEL	615206	629084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620684_620728_620792_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625893_626792_626950_627221_627456_628370
531152	contig_15135_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_119849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23080	25455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_23100_25500
531153	contig_5020_pilon	+	1664	8	Intergenic	novelGene_27810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	930.02863682046	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	365	1057	122915	124913	TRUE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTGVRVKNPDCLACPSLLSGR	118460	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124854_125091_125657
531154	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531156	contig_16091_pilon	+	3212	1	Intergenic	novelGene_112352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1143	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGTGATGATTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37498	40710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_37500_40700
531157	contig_14851_pilon	+	3595	1	Intergenic	novelGene_134691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAACAAACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361945	365540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14851_pilon_+_361900_365500
531159	contig_9091_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_32444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATTTTCAATTAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78493	76980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_77000_78500
531160	contig_5023_pilon	+	2640	13	Intergenic	novelGene_7133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	216.696199910279	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	984	2231	359358	405576	FALSE	5	TCTGTTGCTCAGGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	323617	405985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
531162	contig_6316_pilon	+	1938	14	Intergenic	novelGene_134699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	185.935695443981	163	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	181	1629	140480	157164	FALSE	20	CTCTTTAAAGTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSKRTHCPDWDSRESWGHESYSGSHKRKRRSHSSTQENRHCKKPHPQFKESDCHYLEARSLNERDYRDRRYIDEYRNDFCEGYVPRHYHRDIESGYRVHCSKSSGLSRKSSLKRKHNRHCSSHHSRSKSHRRKRPRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136276	157473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_139488_139564_140479_140644_145291_145515_146617_146709_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
531163	contig_6102_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_32197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1381.2103387971	3	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	40	546	905250	896086	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKVSKVFLGVVLNQNFSTLALLTFWGNNFSPLRIAADLSDFLQ	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
531166	contig_6418_pilon	-	4372	16	Intergenic	novelGene_81132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	35	junction_15	69.9979682244817	156	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	981	2946	183	3128	191747	137771	FALSE	20	TTGTGTATTTTAATGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMGEPGLNWDISPKNGLKTFFCRENYKDHSMAPSLKELCILSNRRIGEILNASASSVENEPAVGSAAQAKEKVKTTVGMVLLPKPRVPYPRFSRFSQREQRTYVDLLVRYAKVPANSKDVGINKNDYLQYLDMKKHVNEEVTEFLKFLQNSAKTCAQDYNMLSADARLFTEQILKACIEQVKKYPEFYTLHEVTSLMGFFPFRTEMGLKLEKTLLALGSVKYVKTVFPSMPAKLQLTKDNIATIGTLEQTAAAMHDDISKDPNAEKLVSRYHPQIALTSQSLFTLLNNHGPGYKEQWEIPVCVQLIPVAGSKPIKVIYVNSPLPRKKMTMRERNQIFHEVPLKFMMSKNSSVPVSAVFMDKPEECVSEVDMSYEVNESRKIETLENLDLDFDDDVTELETFGVTTAKSSKSPSPTSPSTVPSVARTPAAPKVTATAVATTAPDVSANSRSLSQILLEQLQKEKQLVTGADGDADKGKKNGDQAIESRGDRIPNSDKPRMQGSELKTSAALPLESSRTKEIETSHKNDTALDKVNADERLKVLENTDNSEEVTAASEADRTADVIHCDSDTDEDCLIIDTECKTTGNGKTAALSSDLSPNPANPNPSSGQPSAGNQSNTTCSPEESCILKKPIKRVYKKFDPVGEILKMQDELLKPISRKVPEPPVMNLENPKQLPVSEQPSAPSDEVSGWPQSLWPSAFPKPKGRLPYELQDYVEDTSEYLAPKEGNFVYKLFSLQDLLLLARCSVQRIETRPRSKKRKKIRRQFPVYVLPKVEYQACYGVEALTESELCRLWTESLLHSNCSFYVGHIDAFTSKLFLLEEITSEELKEKLSALKISSLFNILQHILKKLTSLQEGSYLLSHAAEDSSLLIYKTSDGKVTRTAYNLHKTHCSLPAVPSSLSVPWVPLDPSLLLPYHIHHGRIPCTFPPKSLGPPAQQKVGGTRMPTRSRRNPVSMETESSCLPAQQIENEGAAPNKRKMT	192807	136526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_137900_142445_142705_145503_145555_146868_146954_159806_159937_164830_165007_165926_166930_172563_172746_173714_173875_174049_174167_175213_175352_181479_181600_182765_183028_189611_189717_191718_191853_192730
531167	contig_5690_pilon	+	1630	11	Intergenic	novelGene_119730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_1	379.517707096784	3057	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	48	1148	1044729	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
531168	SIRV6	+	922	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	4	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	359	691	2002	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1141	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1849_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531170	contig_20344_pilon	+	3322	1	Intergenic	novelGene_134725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAAAAAAACTAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4	3326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20344_pilon_+_0_3300
531171	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531172	contig_7412_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_76290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCAAACCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276035	277845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_276000_277800
531173	contig_6215_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_21182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2011	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGCCACCAGTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226725	228262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_226700_228300
531175	contig_12113_pilon	-	1669	8	Intergenic	novelGene_134735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	203.201418121357	1099	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	154	837	259537	217850	TRUE	15	GGCATTGGTGGTGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSSGDGSSSGYSGDASGAVTVWEVVSLLGKLLGTVAVLKVVLYLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRWK	259690	210365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217812_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_233167_233273_259482
531176	contig_756_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_134776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCTTCAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180654	178367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_-_178400_180700
531178	contig_15063_pilon	+	1273	4	Intergenic	novelGene_14276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	340	1164	35271	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34819	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
531179	contig_6677_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_114168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTGAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418326	416502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_416500_418300
531182	contig_12414_pilon	-	808	8	Intergenic	novelGene_59674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_1	308.83626201386	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	104	808	917567	902587	FALSE	35	CTAACAAGAGGTGATAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKIQIQLTQSYEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDKKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEEREEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRVNKDASGRSANSHQSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISV	917670	902586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_902756_903001_903040_905263_905360_905446_905556_909063_909205_909286_909347_916187_916267_917554
531183	contig_10940_pilon	+	2047	5	Intergenic	novelGene_49170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	749.681057183653	4629	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTTGTGTCGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172068	176228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172110_172399_172629_173150_173218_174001_174123_174639
531184	contig_12622_pilon	-	1763	15	Intergenic	novelGene_6035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	391.537602124689	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	47	1390	1691275	1685486	FALSE	15	ACCCTGTCTTCTCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLNLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691528	1685112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687835_1688012_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
531185	contig_16831_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_134797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGTGAGGTTCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409196	408551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_408600_409200
531186	contig_12873_pilon	+	1515	6	Intergenic	novelGene_27213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_1	1219.83451336646	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	171	941	16409	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16238	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16911_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
531187	contig_12019_pilon	+	2230	9	Intergenic	novelGene_87740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	149.836369083077	643	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	4	1314	623205	642306	FALSE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQEALQLEVKARRDEEAVRLAQTRLLEEEEEKLRQLLQLKEDQERYIEQAQQEKQELQQEMAQQSRSLQQAQQQLEEVRQNRQQADQEVEAAQRKLRQASTNVKHWNVQMNRLMHPIEPGDKRPTTSSSFIGFQAPLLARRDSSLKRLTRWGSQGNRTPSPISSERQKSLNGGDEAPIPASTPQEDKLDPAPEN	623201	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636117_639767_639833_639942_640142_641782_641874_642082
531189	contig_15063_pilon	+	1715	7	Intergenic	novelGene_11892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	227	1465	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531190	contig_10958_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_5474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAGCTCTTTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901686	895402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900462
531194	contig_15063_pilon	+	1507	4	Intergenic	novelGene_13091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	25	CAGTTCACAAGATGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531195	contig_19564_pilon	-	2346	4	Intergenic	novelGene_29613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	2	115	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	163	1497	15529	12201	FALSE	65	GGAAATGAAAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15691	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
531196	contig_401_pilon	-	3474	13	Intergenic	novelGene_42746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	69.2208121400878	168	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	407	1843	929845	906879	FALSE	50	TTAAAGAAATTTATCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHGIGPVCDLRFRSIIECVDDFRVVSLKLLQTHFKKSLDDQKVSRVEFLPVHWHSSLGGDATGVDRNIKKITLPSIGRFRHFTNETLLDILFYNSPTYCQRIVEKVGMEINRLYALFMGRNPDFKGGVSVAGHSLGSLILFDILSNQKDLSLSKSPGPLTIANGVVKQSHFPEKQMTEEPKLTLDESCDLDVENEEVLTLQETLEALSLSEYVSTFEKEKIDMESLLMCTIDDLKEMEIPLGPRKKIANFVKHKAAILEQKKTSSEKKAVLAASTKGREESAPKARETASLPSESNGSKRKLPVGPYVSSVHVDYESFEVGTGQVSVVYNSLDFAPEIFFALGSPIGMFLTVRGVDKIDENYRLPTCKGFFNIYHPLDPVAYRLEPMIIPDLDLKAVLIPHHKGRKRLHLELKESLSRMGSDLKQGFISSLKSAWQTLNEFARAHTSSTQLQEELEKVANQIKEEEEKQVVEGKFDI	939674	905247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_907082_918591_918695_919074_919231_920654_920853_924790_924887_926174_926328_926757_926877_927265_927475_928712_928855_929787_929878_933256_933380_934910_935001_939513
531197	contig_12624_pilon	-	1831	4	Intergenic	novelGene_61131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	838.628642487245	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	72	464	955789	950573	TRUE	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQAGPDEGETGNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKVSYEL	955860	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950559_950768_952913_952989_955666
531199	contig_12644_pilon	+	1274	10	Intergenic	novelGene_44637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4894.06488123404	4	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	206	1186	2677375	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVNWQVIRPVLSRGVLAELWLEFPESEALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677655_2678153_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
531200	contig_9931_pilon	+	2840	1	Intergenic	novelGene_134822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	600	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATTCCTACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303374	306214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_303400_306200
531201	contig_19640_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_134868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	739	1212	88017	88490	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKGTRERLVQRTNGPQLPQPPPESSTNRRPATTTYCSDRDHNKGSWTELEKNVEQNSNTHTHKKEQTYWSDRLQKPQKNGPRHRFSSVMKSLLRFTLQPKIKKGPQNKTRLNGHTSLGARMRWQEGELKAAKGRVSTCCGVGNQCHKTIFVLTV	87278	89742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_87300_89700
531203	contig_501_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_134890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCACAGCTTAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723852	722891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_722900_723900
531205	contig_16846_pilon	-	1207	4	Intergenic	novelGene_82971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	61	579	555239	551492	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558710	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
531206	contig_5758_pilon	-	1794	4	Intergenic	novelGene_119095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	103.781822428914	1238	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	16	402	231423	214843	TRUE	20	ATGTCCATGAGTACCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSAAMAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPRLVVDIGFMCIG	231438	212663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_213875_214661_214976_220514_220696_231350
531208	contig_6436_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_134911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGCTCTCTCTCTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610931	611295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_610900_611300
531209	SIRV4	+	439	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	22	489	22	-489	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCAAAGGCGGAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	2282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
531210	contig_15063_pilon	+	1307	4	Intergenic	novelGene_14269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	344	1165	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34815	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531211	contig_3602_pilon	-	1126	5	Intergenic	novelGene_60673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	670	junction_1	78.7480158480199	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	74	670	1112298	1108562	FALSE	25	TGGTGGTTCGAACTAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLHASPPRGAEGQNPPASRDLRVMVELGWRRTCRTSLVSAGPPVSLQGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRLVI	1112371	1108105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148
531212	contig_602_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_134949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTGGCTGGACCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483175	481145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_481100_483200
531213	contig_19098_pilon	+	2949	2	Intergenic	novelGene_65866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	428	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAAGTAAACAACTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485676	503008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_488492_502874
531214	scaffold_12124_pilon	+	2155	8	Intergenic	novelGene_22035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	480.842670183697	4	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	189	941	836073	857209	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMGKSRR	829556	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846903_857196_857236_857793
531215	contig_14528_pilon	-	2148	11	Intergenic	novelGene_111269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	129.899538105414	2	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	749	1480	197232	191389	FALSE	0	GTTCTTTGCCTCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVRPHHSFPDPQVSCHRWL	201873	190720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191441_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197899_198048_198159_198459_198588_200925_201104_201663
531216	contig_16098_pilon	-	2448	14	Intergenic	novelGene_45889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	51.2075484450435	140	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1728	2189	247373	244355	FALSE	10	GTTTACTTTCTTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYTALFLFLIWSLLQFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	255211	244095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_255169
531217	contig_14638_pilon	-	2109	6	Intergenic	novelGene_71574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	CCTGTTCTGAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253078_253165_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
531218	contig_15063_pilon	+	962	3	Intergenic	novelGene_14414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	8	829	35271	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35263	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
531219	contig_5018_pilon	-	1659	7	Intergenic	novelGene_47089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	548.620517500232	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	74	922	1402792	1399824	FALSE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGAWARAVHCGGSSLVPSLTTSSSPTTRLMLRSLAMRHGVSRRLQKSS	1402865	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1401017_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
531220	contig_6871_pilon	+	1902	4	Intergenic	novelGene_21556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	31.1126983722081	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	505	960	134562	135017	TRUE	30	AGGATAAACGAGTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121898	136047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_133940_134218_134416_135791_135878
531221	SIRV6	+	1033	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
531224	contig_12790_pilon	-	1790	9	Intergenic	novelGene_35257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGCGCATCCGAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313308	307276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_307339_308741_308840_309576_309754_309871_309922_310030_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312033_312347
531225	contig_12113_pilon	-	1516	7	Intergenic	novelGene_134734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_4	179.562817853685	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	151	732	259537	211148	FALSE	20	CATTGGTGGTGTTTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSGDGSSSGYSGDASGAVTVWEVVSLLGKLLGTVAVLKVVLYLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	259687	210363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_231872_231905_233167_233273_259482
531226	contig_6102_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_32307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAACGTTTGGTTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1549880	1547275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1547300_1549900
531227	contig_7839_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_45759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTATTTTTCTTGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1542992	1541642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1541600_1543000
531228	SIRV6	+	970	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	544	14	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	20	GCCTGCCTAATTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531229	SIRV6	+	506	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10243	1	1093	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
531230	contig_12057_pilon	-	2317	20	Intergenic	novelGene_131637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAAGAGAACAGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162068	114851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_114940_121137_121269_135368_135431_136620_136726_140421_140510_140827_140974_142174_142274_143969_144052_145734_145944_147493_147584_148241_148293_149410_149470_149668_149749_151783_151856_152877_152937_154466_154537_155465_155569_156318_156395_157620_157722_161522
531231	contig_14133_pilon	+	2890	6	Intergenic	novelGene_119913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.064210946896	616	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	314	712	143029	146688	FALSE	45	ATCGTTACACAAATAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136617	148866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666
531233	contig_12864_pilon	-	3257	6	Intergenic	novelGene_76377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	147.030064952716	58	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	96	869	208748	203029	FALSE	55	TAAAAAATGTACACATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQCDEPPASPDDSDNSVSESLDEFDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMAVDLDDQDWLDMNNIEQALFSRLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSTDRDAGEKHSFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDVLLEAIQGAREYISKIRELQHFDFPM	213570	200640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
531234	contig_19469_pilon	-	2784	14	Intergenic	novelGene_134997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	43.6375604999928	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	335	1564	155587	137139	TRUE	25	AATCTGAGTCTGTTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGKLISSYYNVTYWPLWYIELALASLFSLNALFDFWRYFKYTVAPTSLVVSPGQQTLLGLKTAVVQTTPPHDLAATQIPSSPPSPSIQGQSVLSYSPSRSPSTSPKFTTSCMAGYSPQLQGLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPDVTNENVFCIYQSAINAPHYELIYQSHVYSLPKGRNNMFHTLLMFLYIIKTKESGMLGACSVSQHLSNPSVYKLEVKIPL	157243	133478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_137109_137209_139384_139459_141415_141514_141610_141726_142377_142476_144912_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488_155731_156187_156320_157184
531235	contig_15063_pilon	+	980	5	Intergenic	novelGene_10404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2922.06967533288	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	237	728	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35345_39033_39092_39506
531236	contig_15063_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_12019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	220	1392	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531237	contig_18108_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_33441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAATAGAGAGTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49062	48550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_48600_49100
531239	SIRV6	+	656	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	8503	-14	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
531243	contig_6735_pilon	-	1199	9	Intergenic	novelGene_15758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	807.318090965389	13	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	399	1010	564309	542177	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVISCVAPGMAHLFPSLTAKCCLLQNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIHECFL	568226	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542193_546596_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564623_564811_564869_568198
531245	contig_14563_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_135055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCATAGGGTTTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140819	142581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_140800_142600
531246	contig_3986_pilon	-	2634	7	Intergenic	novelGene_52693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	86.4150192707006	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	505	1485	48331	35282	FALSE	15	CTGACCTAGGCTGCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	48835	34132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46115_46299_47666_47820_48252
531247	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	14	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	201	1040	34808	36333	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34607	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36153_36266
531248	contig_12873_pilon	+	1656	5	Intergenic	novelGene_27186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	1289.63742482141	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	372	1085	16357	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15985	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
531250	contig_13457_pilon	+	1792	14	Intergenic	novelGene_118336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	60.653443733117	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	182	1792	60777	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRHLAHRLRRRHQRCQRRPPLAVAPPAGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59229	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
531251	contig_9463_pilon	+	1749	7	Intergenic	novelGene_83840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	375	junction_6	96.0028934749133	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	983	1351	222660	223028	FALSE	15	CTATTGGCTCTGAAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	216076	223426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961
531253	contig_5093_pilon	+	3146	1	Intergenic	novelGene_135101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638360	641506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_638400_641500
531255	contig_6102_pilon	+	2685	19	Intergenic	novelGene_31831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	497.309675735599	1	86	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	96	2294	370803	394867	FALSE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVRNEAFCTCAWPLAALAVASAYAKYSF	370707	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379806_394794
531259	contig_8412_pilon	-	2008	6	Intergenic	novelGene_118408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	111.399102330315	61	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	30	833	817194	814504	TRUE	10	TTGTGTAGCCTGCTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGQKISEQMVIGTPGTVLDWCAKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSVRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	817223	813276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_813379_813430_814566_814977_815170_815695_815859_816409_816648_817045
531260	contig_12938_pilon	+	1776	3	Intergenic	novelGene_99752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1210	829	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83323	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_83470_84550_85847_85987
531261	contig_9297_pilon	+	2456	9	Intergenic	novelGene_69870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	382.303033436827	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	589	2112	910129	912790	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909634_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
531262	contig_3525_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_135127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTAATATGCTGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53735	53985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_53700_54000
531264	contig_9797_pilon	+	1562	6	Intergenic	novelGene_65578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	397.415953378824	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	246	872	183892	191368	TRUE	45	AAAAGAATGACACTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172533	192134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191138_191983_192058
531268	contig_9482_pilon	+	1296	7	Intergenic	novelGene_44292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	340	768	1236476	1239008	TRUE	15	GGCCATCTGCTGGTGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLHIIGALVQTVDAQRWVRLLHLAGAHLSHRLDGVHATVLSKGHGDDLQRVGERPHGVLLQGRALVCLLADCQGTGNLRSSSSIHDSVVTNEVPDDTQGVVQGSLGLLDDHFVPPADEDGDGPGVPALLDDQHPVLRRPE	1236136	1241205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240971_1241045
531269	contig_14711_pilon	+	1635	9	Intergenic	novelGene_68922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_3	332.735231640715	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	146	1396	86227	90570	FALSE	20	CAGACCTCAGTTGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85938	90809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
531271	contig_854_pilon	+	1604	15	Intergenic	novelGene_36447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	448.378581157504	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	102	1364	1453661	1464721	TRUE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRAHP	1451229	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464252_1464710_1464823_1465336
531272	contig_6062_pilon	+	3387	12	Intergenic	novelGene_5268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	193.936728201376	95	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	893	2617	662655	744319	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVVSNSYS	660784	745089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245
531273	contig_5643_pilon	+	1844	16	Intergenic	novelGene_39085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	815.662059651885	1	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	856	1632	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631287	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631522_631962_631987_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636176_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
531274	contig_11328_pilon	+	1814	7	Intergenic	novelGene_88456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_6	306.758862952646	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	27	659	830591	839255	TRUE	75	GGAAATTAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELD	830564	853714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_839250_839386_848758_849050_852980
531275	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_96983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657493	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657494	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531277	SIRV6	+	1081	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	38	44	-6	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGAAGTGACTTGCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	11646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
531279	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531282	contig_15063_pilon	-	1499	5	Intergenic	novelGene_12985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	767	1090	35891	35108	TRUE	20	GGCCCCAGTAGTCCATACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36766	28179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264
531283	contig_10311_pilon	-	1519	11	Intergenic	novelGene_50477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_10	906.337045474806	10	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	23	1246	71526	65773	FALSE	35	ATGTAGAAATGGTTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71548	65499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
531284	contig_3386_pilon	-	1952	6	Intergenic	novelGene_34502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	854.146732125107	10	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	118	699	409604	404773	FALSE	5	GTCTTGTGGTTTAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412211	403519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404888_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
531287	contig_6654_pilon	-	2096	2	Intergenic	novelGene_85690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTTTCTGAGCCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94942	92784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_93667_93728
531288	contig_7426_pilon	-	2002	8	Intergenic	novelGene_27535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_3	189.424692914399	8	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	60	521	1102748	1091093	TRUE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTASRRGPPTVATGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIALASWPLRENTGQIQWTGWDVMLGLSWRKLTFNERLLWART	1102807	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1092305_1092422_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1102705
531290	contig_5954_pilon	-	1812	9	Intergenic	novelGene_28661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	473.546443735987	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	744	1454	947127	945083	FALSE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960620	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947634_956793_956942_959766_959941_960474
531291	contig_5649_pilon	-	1863	8	Intergenic	novelGene_82463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	98.6099303688373	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	85	1266	1573807	1564135	FALSE	15	CTGGTGGAGACTCCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573891	1563537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
531292	contig_14925_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_55198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	1552.3328211115	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	204	461	29675	27020	TRUE	20	GAGCAAAGGCTGTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNKFIFGAGTRLQVFPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	69603	25796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_69552
531293	contig_15047_pilon	+	1433	3	Intergenic	novelGene_52226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	211	609	4112	4510	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNAEFLNFLTFFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWGKRGWGRSLFSESMSLSGDFQQGWG	2183	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2328_4045_4687_21013
531295	contig_3386_pilon	-	1387	7	Intergenic	novelGene_34510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	779.628276808891	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	295	624	407739	404773	FALSE	35	TAATATAGTCAGTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVADLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412208	404009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409442_409565_409607_412096
531296	contig_6227_pilon	-	1371	11	Intergenic	novelGene_49733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	339.095340575479	99	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	42	707	1224979	1203668	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITN	1225020	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203673_1213193_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
531297	contig_2867_pilon	-	1861	5	Intergenic	novelGene_135256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.747234239876	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	137	664	1305476	1286221	FALSE	15	CTATATTCCTATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCELSAKLLRRADLNQGIGEPQSPSRRVFNPYTEFKEFSRKQIKDMEKMFKQYDAGRDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQRKAAFKELQSTSWLKGTCSLLVCLPSPPSFLPFPSLSLVTSFQS	1305612	1285023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286658_1286781_1288013_1288149_1289316_1289465_1305456
531300	contig_11292_pilon	-	2335	13	Intergenic	novelGene_109451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_5	70.1717634728449	705	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	91	1002	386035	370188	FALSE	10	TGCCATGTTTATGCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAASHMLLGSGITILSQPFMYVKVLIQVGYEPLPPTIGRNIFGRQVCQLPGLFCYAQHIASIDGKRGLFTGLTPRLCSGILGTVVHGKVLQHYQDSEKPEELGPGNVQKDVSSSFDRVIKETTREMMARSAATLVTHPFQVIALRSMVQFIGRETKYCGLCDSIVTIYREEGILGFFAGLIPRLLGDIISLWLCNSLAYLVNTYALDSGVSTMSEMKSYSQAVTGFFASMLTYPFVLVSNLMAVNNCGLAGGSPPYSPVYTSWVDCWCVLQKEGNMSRGNSLFFRKVPFGKTYCCDLRMLI	386125	368854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_370275_372198_372275_373463_373532_374255_374304_375253_375348_376421_376482_376910_376963_377213_377272_378608_378672_378865_378893_382730_382838_383199_383285_385948
531301	contig_5236_pilon	-	2647	15	Intergenic	novelGene_100966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	184.658938233132	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	116	2032	1011714	1006770	TRUE	60	ATAGAAGAAAATAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011829	1005895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006125_1006383_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
531303	contig_9833_pilon	+	1696	11	Intergenic	novelGene_68543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	447.072074726212	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	13	924	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230810	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250139_252292_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
531304	contig_405_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_135322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGGACTTTTATTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507342	509383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_507300_509400
531306	contig_13894_pilon	+	1172	9	Intergenic	novelGene_62088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2272.41905452648	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1146	27	1172	520713	527558	FALSE	45	GAGGAGAAGAAAGCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTM	520686	527558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459
531307	contig_8772_pilon	+	1378	10	Intergenic	novelGene_21096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4623.64837774107	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	121	1062	15814	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLRDPRARDAGVLPPHTPTELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15217	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15276_15751_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
531308	contig_18299_pilon	+	3393	6	Intergenic	novelGene_135344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	100.23652029076	641	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	82	1167	47477	63896	FALSE	5	AGCCTTCTTGGTTGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSARPLPRRLVSRPAELRVLPGAALRMGGAVSAGEDNDELIDNLKEAQYIRTELVEQAFRAIDRADYYLEEFKENAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALDLQPGLSFLNLGSGTGYLSSMVGLILGPFGVNHGVELHSDVIEYARQKLDFFIKTSDSFDKFEFCEPSFVTGNCLEISPDCTQYDRVYCGAGVQKEHEDYMKNLLKVGGILVMPLEEKLTKITRTGPSAWETKKILAVSFAPLIQPCPSESGRSRPVQLPLLVVRSLQDLARIAIRSTIKKIIPQETASKNENGLKNTPRLKQRRIRRRRMQTVVFLDKEVFASRVSNPSDDNACEDCDEEQQEDEGKAPSEVKPHAPVNFLREKVLSLPLPDPLKYYLLYYREK	43773	66122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_43832_47453_47784_54382_54486_55448_55621_60635_60760_63516
531310	contig_12357_pilon	-	2141	12	Intergenic	novelGene_6087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53913	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29655_30218_30321_30931_31060_34118_34317_35056_35190_42109_42258_46484_46565_51127_51238_52758_52839_53167
531311	contig_5954_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_28792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGGGGGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401273	1401714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1401300_1401700
531312	SIRV7	-	319	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33179	14857	-40	-14851	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGTTATTGTATCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114778	70888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680
531317	contig_5092_pilon	-	1842	3	Intergenic	novelGene_62308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	904	junction_1	32	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGTTTATAAACATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447854	443193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835
531318	contig_11752_pilon	+	1298	8	Intergenic	novelGene_37605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1094.78045511324	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	443	991	88745	105602	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTHSA	84087	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87296_87426_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105589
531319	SIRV6	+	523	5	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	9057	3	229	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATCGTTAGGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740
531321	contig_2730_pilon	+	2630	8	Intergenic	novelGene_135395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	56.6838709377703	1796	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	151	885	430881	451321	FALSE	25	CCATGTAATCTGTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRRKLTALDYHNPAGFNCKDETEFRNFIVWLEDQKIRHYKIEDRGNLRNIHSSDWPKFFEKYLRDVNCPFKIQDRQEAIDWLLGLAVRLEYGDNAEKYKDSVPDNTKNADNAAKNAEPLINLDVNNPDFKAGVMALANLLQIQRHDDYLVMLKAIRILVQERLTQDAVAKANQTKEGLPVALDKHSLGFDTGDAVLNEAAQILRLLHIEELRELQTKINEAIVAVQAIIADPKTDHRLGKVGR	430730	453066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_430942_432136_432262_434910_435011_439839_439927_445378_445468_448469_448539_450989_451039_451166
531322	contig_4125_pilon	-	2762	19	Intergenic	novelGene_25072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	26.0730810522185	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	1521	2549	457148	454981	FALSE	10	CTACCTCTGCGCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPDAKKPRLLQGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDARKEQETVMRVYSHLKSILKDHCVQHLPDGSVTVESILIQAAAHSEDPGTKVLLVSWTYQDEELGSYLTSLLKKGLPQAPS	469990	454767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458183_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_467581_467809_467999_468247_469694
531323	contig_8978_pilon	-	1052	4	Intergenic	novelGene_49350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	175.328897282286	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAAAGTTTCTGTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192685	190493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265
531324	contig_8907_pilon	-	453	4	Intergenic	novelGene_85804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1806.20861352047	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	170	406	178678	173397	FALSE	5	CCTTGCCTGTGTCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179544	173349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391
531325	contig_5018_pilon	+	763	5	Intergenic	novelGene_47162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_2	246.180827848149	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1	510	1498296	1500271	FALSE	5	ATCTGTGTCGGTGTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498295	1500524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
531327	SIRV6	+	704	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	194	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	34	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10723
531328	contig_5445_pilon	+	1451	3	Intergenic	novelGene_135404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	1436.5	187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCCTACTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51574	53972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52273_52635_53127
531329	contig_15063_pilon	+	1201	3	Intergenic	novelGene_14354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
531333	contig_9345_pilon	-	1681	5	Intergenic	novelGene_24378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	85	732	144517	142100	TRUE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144601	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141589_141631_142414_142567_142781_142955_143072_144512
531334	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGAGGCCGCCGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
531338	contig_4442_pilon	-	2427	14	Intergenic	novelGene_127948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	711	1037	391310	390218	TRUE	20	TTAGTGAGGAAGTGCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSLGWLPSSGLSNWVDGRAITGGGREYRRRSSFGGGRRRVMSSVLKMLRLRCRWNVQFIFNTHENTLAIPVPELCRAENVNHSFCEDPHEFWELMCQEGQHGCEGT	392020	255626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_255643_274935_275094_295227_295290_295934_296046_297220_297296_301537_301798_303923_304032_338421_338535_358119_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387439_390150_390293_391058
531341	contig_14326_pilon	-	2378	6	Intergenic	novelGene_120678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	136.502014637147	763	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	117	905	126344	116744	FALSE	30	AGGACTCCACATTGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAWVQTVLVSNMLLAEAYGARGCFWDNGHLYWADQTSPAPGLRCLNWLDAQSSLALAPEAGASNHSYCRNPDQDPRGPWCYVSGKAGAPEKRRCEDLRCPEIPSQAPPAPITETEEAFEVPGEDEAQVFPPANALPARREAAAVQPVIGISQRVRMNSKEKDLGTLGYVLGITMMVVIIAIGIGIILGYTYKRGKDLKAQHEQKACEREMQRITLPLSAFTNPTCEIVDEKTVAVHTSQTPVSLQEGCTPLMDQAGTPGA	126460	115270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_116949_123741_123821_123921_124120_125082_125203_125290_125408_126274
531342	contig_15063_pilon	+	1682	6	Intergenic	novelGene_14050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	194	1432	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34614	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531344	contig_12624_pilon	-	1532	10	Intergenic	novelGene_61041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1068.46800445461	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	130	492	903621	875157	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKIQGACSLQLP	903750	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_888727_888805_900249_900333_903447
531345	contig_854_pilon	+	1452	6	Intergenic	novelGene_36212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1321.10447732191	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543476	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556241_557591_557752_562271_562405_563029
531346	contig_10581_pilon	-	2709	6	Intergenic	novelGene_41365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.6460857724864	66	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	142	696	447439	324758	FALSE	15	AAGTCTCACTGTTTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDLEASLLSFEKLDRASPDLWPEQLPGVAEFAASFKSPITSSPPKWMAEIERDDIDMLKELGSLTTANLMEKVRGLQNLAYQLGLDESREMTRGEVPQHSRETQEVAAACGRDVLGTVTMLPSRCSSDHAHLTASSGEAGGVYLQDRPPPRSWHSAPLRTLGSKRRICSTQGSLQLFNQLPESSQNMQLLFQFYTSHDSPIPQCILHFPAPAIDSDSREGNPGVGSPSWD	457386	322744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_324907_325219_325502_445557_445642_447399_447467_455780_455819_457310
531347	contig_10861_pilon	-	1790	8	Intergenic	novelGene_39339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	238.765105302689	104	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	122	349	1492200	1491104	TRUE	5	CTTCCTCAGTTTGGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRGRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSW	1493820	1489338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
531348	contig_5039_pilon	-	2418	11	Intergenic	novelGene_64959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_5	621.013043341281	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	197	973	1673164	1657729	TRUE	5	TGTGGTGTTTTATTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRRRSFSISPVRLRRSRTPLRRRFSRSPVRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAKANAAAMCAKAGVPLPPNLKPAPPPSIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEGNKDDDDNVFSSSLPSEPVDISTAMSERALAQKRLNENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVLTQEQLANTGAQAWIKKGQILVAVFLPRSVPALLFTTLLLPRPRISS	1674774	1653712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654835_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1658438_1658519_1662234_1662352_1663443_1663555_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047_1673209_1674622
531349	contig_12886_pilon	+	2567	2	Intergenic	novelGene_135448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGCCAACAGAACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228591	231254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_230638_230733
531350	contig_12624_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_61012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803511	803313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_803300_803500
531352	contig_7457_pilon	-	864	3	Intergenic	novelGene_31362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1.5	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATATTAAAAATTTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319082	316944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317653_318285_318385_319025
531354	contig_6048_pilon	+	2263	9	Intergenic	novelGene_73236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCTAAAAAAATTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1896668	1911022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1896993_1898637_1898822_1899062_1899215_1899573_1899675_1900951_1901029_1905861_1905992_1907589_1907698_1908240_1908325_1909919
531355	contig_9423_pilon	-	2555	9	Intergenic	novelGene_99176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.3739352563293	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	634	1476	61277	59746	TRUE	35	TGAGATCAACAGTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEVTLKRNPAQVMMKMTKMRKRVVRMKMEMILLLVTL	74915	38380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_38792_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60540_61292_73820_74027_74502
531356	contig_4857_pilon	-	1787	6	Intergenic	novelGene_48849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATTCAGCCAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411067	1331410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1335234_1335516_1336703_1336825_1405450_1405553_1407010_1407073_1409985
531357	contig_6902_pilon	+	3176	9	Intergenic	novelGene_135552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	21.9655269684112	216	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	300	1970	282413	310685	FALSE	20	CAGTAGCTTCATTGTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRVAVIGAGVSGLSSIKCCLDEDLEPICFERSNDIGGLWKFTETSKDGMTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFNHENYGLSITKGKKSKIIVNDELPTCILCGSVTMKTSVKEFTETSALFEDGTVEENIDVVIFTTGYTFSFPFLEEPLKSLCSKKLFLYKKVFPSNLEKATLAIIGLISLKGSILSGTELQARWATRVFKGLCKLPPSQKLMADATKKEQLIKRNVIKDNSEDKLDYIPYLDDLAACIGTKPNVPLLFLKDPRLAWEVFFGPCTPYQYRLMGPGKWNGARNAILTQWDRTLKPLKTRVVHDSSKPASMSHYLKVWGTLVLLASLLLLCKSSLCFKLLWDKLQDRISPYQISIW	278390	311891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_282377_282545_283762_283952_284527_284691_294102_294246_295100_295301_297370_297724_298673_298744_310264
531359	contig_16045_pilon	+	1514	2	Intergenic	novelGene_130854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	399	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7282	14080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_7368_12651
531360	contig_4754_pilon	+	2053	13	Intergenic	novelGene_35947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.089911211102	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	139	1242	380189	415758	TRUE	30	AGGTCTAGAAATAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPTYPPSLLYSLCHP	380050	420807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380195_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_415710_415898_416938_417082_420159_420252_420370
531362	contig_5999_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_45617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTGCCAAATGCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114811	114155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_114200_114800
531363	contig_10437_pilon	-	2416	15	Intergenic	novelGene_38447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	23.9237735061907	893	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	409	1896	1029286	951463	FALSE	20	TACAAGTGATTGGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENVDYLIQELRRPKYSVYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVTEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLVLDRCDDTVTPLLDQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKQKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNVKRLLQNPRVTELDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMVDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGKLKETQYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHGRSKEGSQVTARSASRR	1030270	950942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_951551_986392_986525_1006041_1006164_1007555_1007664_1007873_1008033_1017987_1018156_1018559_1018674_1019086_1019222_1021496_1021608_1022051_1022190_1022311_1022381_1023404_1023485_1027648_1027710_1029283_1029518_1030093
531364	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
531365	contig_12638_pilon	-	2029	12	Intergenic	novelGene_33128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCAGGGTTGATAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200485	173508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_173561_178095_178193_182929_183048_183450_183559_188440_188508_191148_191356_191725_191806_195501_195552_198066_198149_198734_198846_199336_199415_199506
531367	contig_854_pilon	+	1643	8	Intergenic	novelGene_36201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	2962.79003230236	89	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	429	875	556108	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543462	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_549265_549425_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
531368	contig_1725_pilon	+	2171	15	Intergenic	novelGene_24312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	733.740778894185	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	919	2040	247068	255543	FALSE	55	GTATGAGGGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNFSGIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	235837	255674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247024_247187_247639_247755_248345_248439_248844_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
531369	contig_20951_pilon	+	2152	3	Intergenic	novelGene_43128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4	42	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCACTTGTTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286836	302751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286955_289624_289758_300850
531370	contig_9345_pilon	-	1733	7	Intergenic	novelGene_24385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	45	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	104	1033	176056	141808	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSQSQTHAAGKWVKLGSCSVGF	176159	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141871_142171_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
531371	contig_4103_pilon	-	2582	8	Intergenic	novelGene_51995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_5	228.5750892564	18	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1469	2317	221097	215783	FALSE	75	GAGAAAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKVSGKKYFPYWKLLKICWNRFITCMTNNLNKIYFKGNG	223755	215517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221703_222231_222378_222871_222984_223150
531374	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531375	contig_7452_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_109153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACCTTAAGATGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150366	151683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_150400_151700
531376	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_8907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	243	1418	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531378	contig_15063_pilon	+	1474	5	Intergenic	novelGene_12592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	5	1414	28164	36661	FALSE	35	ATGTGTGCATTCAAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28159	36721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531379	contig_12057_pilon	+	2315	20	Intergenic	novelGene_131632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	42.5020775115498	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	956	1900	147511	161653	FALSE	5	GCCCTGTTCAGTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99500	162068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142239_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
531380	contig_6589_pilon	+	2252	13	Intergenic	novelGene_25936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_12	245.715734584137	84	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	68	1453	1228758	1257861	FALSE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTEEELRRFEEELAAREAELNAKAQRLSQETEALGRSQDHLEAQKRELQQAVLQMEQRKQQQQALNALAPAPGREGQLKFHPGTDGVPVPGAADDQKDRDTSEKKVPEQPPKLPQLDSQKL	1228279	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228890_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256925_1257394_1257498_1257748
531381	contig_2550_pilon	-	2474	10	Intergenic	novelGene_135641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	148.001835157124	338	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	103	1044	522468	481148	FALSE	20	GGTTACTTCTGTGAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQPSPMPHGGNPNNLCHSPGPAHPPDSQRHPTALSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCIYPDPNQRPDIGYVHQVAKQMHVWTSST	570373	479717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_481259_484475_484590_491769_491865_499889_499998_501113_501223_505600_505712_509763_509827_511179_511321_522378_522498_570300
531382	contig_14575_pilon	+	2394	23	Intergenic	novelGene_101863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_10	109.914805475923	121	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1047	1348	2394	32830	63904	FALSE	65	AAGAGAAAGATCCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLRHRSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEKKL	17090	63904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_32691_32850_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
531383	contig_3426_pilon	-	2506	18	Intergenic	novelGene_57914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	195.108380847201	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	625	2244	196454	145330	FALSE	30	CAGTAAGTTAAATCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	205487	145067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196614_201254_201392_202899_203077_203772_203863_205426
531384	contig_1244_pilon	-	1917	12	Intergenic	novelGene_38013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	920.75614811823	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	597	1496	928860	923211	FALSE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947711	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931698_933751_933856_934499_934566_946439_946620_947578
531385	contig_1154_pilon	+	1843	4	Intergenic	novelGene_87154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	417.027577025789	19	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	163	960	896110	901946	FALSE	20	TCCTGTGTGATGTCTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKRSAAGRRCEVWSRPGCGGCEGPGSSGFEGSSVLGSARAKLLAFALLPEKRDLGPDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895947	902829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896277_899972_900253_900808_900990_901776
531387	contig_7020_pilon	-	2556	19	Intergenic	novelGene_57044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	179.78412981499	397	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	149	2128	63145	39469	FALSE	15	TGAAGTTCTCTGCTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVILESIFLKRSQQKKKTSPLNFKKRLFLLTVQKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVEKITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESGEMEQISIIERFPYPFQVVYDEGPLYVFSPTEDLRKRWIHQLKNVIRYNSDLVQKYHPCFWIDGQYLCCSQTAKNAMGCQILENRNGSLKPGSSHRKTKKPLPPTPEEDQILKKPLPPEPTAAPVCTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGEEYFILEESNLPWWRARDKNGEEGYIPSNYVTEAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAEQLLKQEGKEGGFIVRDSSKAGKYTVSVFAKSAGDPQGVIRHYVVCSTPQSQYYLAEKHLFSTIPELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQGVVKVSDFGLSRYVLDDEYTSSVGSKFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYSLGKMPYERFTNSETAEHIAQGLRLYRPHLASERVYTIMYSCWHEKADERPTFKILLSNILDVVDEES	74745	39040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_39541_42143_42302_43260_43380_44004_44070_45083_45301_45811_45984_46835_46911_47791_47920_48094_48175_48471_48527_49076_49140_49542_49731_51550_51619_51944_52074_58674_58757_60332_60402_62374_62474_63004_63176_74627
531388	contig_9290_pilon	-	1676	11	Intergenic	novelGene_77533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	365.819367994643	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	44	1336	496936	478940	FALSE	30	AGTTATCTTTGCAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	496979	478599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
531389	contig_16098_pilon	-	2606	8	Intergenic	novelGene_45761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	295.289135373091	6	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	464	877	35038	31519	FALSE	10	CTGACTTGACTTGGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36309	29789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35100_35907
531390	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_13185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	17	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531392	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	198	1436	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34610	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531393	contig_8823_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_53070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68250	66723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_66700_68200
531394	contig_5217_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_135750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTTGGCCGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555129	556110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_555100_556100
531396	contig_1867_pilon	+	1584	7	Intergenic	novelGene_54508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5845.42914497207	201	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	156	578	194973	215806	TRUE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQVSGKVPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISRSRL	194817	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213660_215603_215751_215791_215811_218786_218898_219457_219609_220857
531398	contig_10923_pilon	+	1622	10	Intergenic	novelGene_66177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	790.903764962653	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	52	1143	21667	37486	TRUE	50	TAAAGAGCAAACTGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGDAMSSTCASY	13827	42817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36702_37455_37540_38578_38742_42554
531400	contig_12279_pilon	+	1146	6	Intergenic	novelGene_50078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2372.42851104095	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	295	648	69434	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57384	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57477_68290_68436_69376_69447_71633_71711_75031_75096_76928
531403	contig_3077_pilon	+	1684	10	Intergenic	novelGene_26688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3405.09325845349	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	506	1189	13867	17590	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTREGKASIHLEVGRLPLGACFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9929	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9992_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
531404	contig_9243_pilon	-	1587	9	Intergenic	novelGene_60321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	249.934460159058	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	23	463	64617	27363	TRUE	20	TGACCATGTCTCAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVSHQ	64639	19264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27365_34490_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
531405	contig_6048_pilon	+	3656	1	Intergenic	novelGene_73123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912655	916311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_912700_916300
531408	contig_12837_pilon	-	1126	4	Intergenic	novelGene_57335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGATATGGGCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166872	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_159398_161385_161492_163872_163967_166001
531409	contig_10263_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_135814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCCGAGGGTATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37409	38822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_37400_38800
531410	contig_13592_pilon	+	2764	15	Intergenic	novelGene_33714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	615.538228889555	1	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	768	2057	257869	267873	TRUE	30	ACATTAAATGACTCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLLSKLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIQVDTSLQSVSLVVICT	249315	269649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257889_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267823_268000_269068
531412	contig_9516_pilon	+	2793	8	Intergenic	novelGene_106141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_3	125.425479948885	702	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	144	719	568150	581954	TRUE	10	TTACTGTCTCCAGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRKPSNASEKEPTQKKKLSLQRSSSFKDFAKSKPSSPVVSEKEFNLDDNIPEDDSSVPTPEDAGKSSKKLGKKWRAVISRTMNRKMGKMMVKALSEEMGDPLEEGSASPTSPDYSLDSPGPEKMALAFSEQEERDHPTLSRQASTGSELCSPSSGSGSFGGGPTCPPVHRALLWPGTRPHRLHPQPLRP	568006	584843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_568207_577370_577467_578019_578167_579830_579973_581820_581971_582111_582322_582477_582629_583146
531416	contig_7728_pilon	-	1613	9	Intergenic	novelGene_64702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	320.771896173901	2155	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	36	908	752150	715993	TRUE	25	TTTTTCTAACTGATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEGNIWVYSFIVLVSF	752185	713429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_714107_715964_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
531417	contig_15063_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_10152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	135	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531418	contig_5964_pilon	-	2934	7	Intergenic	novelGene_80369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	81.2540597276359	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	351	2186	128960	115131	FALSE	50	AACAGACAAAAATGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNCEAMKSLAQMLDEPAPLSLDFALSQEDLERTKSQASVTFMDVAVRFTRREWEQLAPTQRVLYRDVMLETYGNLLSVGCQYTKPDVIFKLEQGEEPWTEEGAPPRRSCREKFWKGDDLIDWQQENHVSFSTQVASTYRKTQTKVIHKKCIGKQFGLSSELISSSNKPHNCDSLGKNLKDNSDLVVHEKHCAIKKSSNCDGDAESFCHITSNTGVKTCECNHCVKAFIQKSNITVHHGIQSENKPSESNGYEEKFHANSFFTQEEEAYNSDKSYDCSQCGKTFSQKSYLIRHHKTHTGEKPYECKQCGKTFSQSTYLIAHKRAHTGEKPYECNQCGKNFSYQSSLIRHHKFHTGEKPYECLDCGKSYFEKSHLIVHQRIHTGEKPYECNECGKAFTSISVFVQHVRTHTGEKPYECDKCGKRFTTSSYLFLHARTHSDEKCYKCNECGKGFLQKVQLTVHKRIHSGEKPYKCNKCEKAYRDHSSLNHHIKIHSGEKPFVCNECGKSFTYQSFLIKHERYHTGEKPYECTECGKAFFYNRELTVHQRRHTGEKPYQCTECGKAFTASSCLRLHVRTHTGEKPYQCNQCGKSFSQNGQLTAHWRTHAQERSL	129634	114382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_116633_122054_122151_122590_122718_128252_128312_128908_129150_129352_129482_129602
531420	contig_10431_pilon	-	2335	5	Intergenic	novelGene_117404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_4	535.608299039513	800	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	128	679	262758	252991	FALSE	30	TTCATATTTGAAGGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFEAALLSPGSPKRRRCAPLPGSTPGLRPPDAEPPPPLFQTQTPPPTLQQSTPPGSERRLPTPEQIFQNIKQEYSRYQRWRHLEVVLNQSEACTSESQPHSSALTAPSSPGSSWMKKDQPTFTLRQVGIICERLLKDYEDKIREEYEQILNTKLAEQYESFVKFTHDQIMRRYGTRPTSYVS	262885	251334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_253002_253850_253923_255271_255407_258059_258201_262565
531423	contig_13542_pilon	+	1403	8	Intergenic	novelGene_131483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1114.07164610408	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	101	682	346638	505589	FALSE	80	AAAAACAACCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVETNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346537	506310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464702_487967_488024_499871_499938_500886_500964_505501
531424	contig_3975_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_54695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109129	1109726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1109100_1109700
531425	contig_13108_pilon	-	3431	18	Intergenic	novelGene_135868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_17	30.9196973086882	564	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	194	2581	58096	16573	FALSE	25	GAAAAAGCCTGTGTGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSQVYRSGFQTFNQHLLPWVRSTAVSRSHRVQPSAISHVRSWSNIPFITVPLSRTHGKSFAHRSELKHAKRIVVKLGSAVVTRGDECGLALGRLASIVEQVSVLQNQGREMMLVTSGAVAFGKQRLRHEILLSQSVRQALHSGQNQLKEMAIPVLEARACAAAGQSGLMALYEAMFTQYSICAAQILVTNLDFHDEQKRRNLNGTLHELLRMNIVPIVNTNDAVVPPAEPNSDLQGVNVISVKDNDSLAARLAVEMKTDLLIVLSDVEGLFDSPPGSDDAKLIDIFYPGDQQSVTFGTKSRVGMGGMEAKVKAALWALQGGTSVVIANGTHPKVSGHVITDIVEGKKVGTFFSEVKPAGPTIEQQGEMARSGGRMLATLEPEQRAEIIHHLADLLMDQRDEILLANKKDLEEAEGRLAAPLLKRLSLSTSKLNSLAIGLRQIAASSQDSVGRILRRTRIAKNLELEQVTVPIGVLLVIFESRPDCLPQVAALAIASGNGLLLKGGKEASHSNRFLHLLTQEALSIHGVKEAVQLVNTREEVEDLCRLDKMIDLIIPRGSSQLVRDIQKAAKGIPVMGHSEGICHMYVDSEASVDKVTRLVRDSKCEYPAACNALETLLIHRDLLRTPLFDQIIDMLRVEQVKIHAGPKFASYLTFSPSEVKSLRTEYGDLELCIEVVDSVQEAIDHIHKYGSSHTDVIVTENEKTAEFFLQHVDSACVFWNASTRFSDGYRFGLGAEVGISTSRIHARGPVGLEGLLTTKWLLRGQDHVVSDFSEHGNLKYLHENLPVPQRNTN	61582	15722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_16755_19805_19902_21384_21572_23336_23459_23559_23756_26112_26251_28849_29071_36579_36674_37853_37928_38650_38796_39650_39776_45624_45716_46145_46305_49169_49275_49371_49522_53870_54086_58008_58125_61417
531426	SIRV4	+	389	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	128	433	128	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
531427	contig_12157_pilon	-	3826	1	Intergenic	novelGene_135917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATTTAAAGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205713	201887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_201900_205700
531430	contig_15047_pilon	+	1290	7	Intergenic	novelGene_52108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	99	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	392	427	3482	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLAVRSERTCQNSVSPESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRLPLPAVFLHRRVPARPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2125	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2605_3265_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
531432	contig_15021_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_26940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240276	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_239938_240170
531433	contig_2078_pilon	-	2751	14	Intergenic	novelGene_100178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_7	58.4091870864051	31	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	89	2239	535379	505518	FALSE	15	CTGTATCTGAGGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535467	505005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
531434	contig_12566_pilon	+	2460	20	Intergenic	novelGene_86008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	97.7479091316648	2	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	85	2337	47511	86354	FALSE	30	TATATCTAACTCTTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQDSSSCWCALLRPGEPVLPAERWNTQTMATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44377	86477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59136_63049_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75410_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
531438	contig_9535_pilon	-	1702	12	Intergenic	novelGene_124495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	124.21701883637	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	53	1360	635440	608023	FALSE	5	TCTGGTGTGGCTCTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLSVKRFWNRSFSAAEMTKGLVLGIYSKGKEDDVPQFTSAGESFDKSVSGKLRELLTISGPPLKVGKTRTFHGLHQDFPSVVVVGLGKKAAGVNDQENWHEGKENIRAAVAAGCRQVQDLEIPSVEVDPCGDAQAAAEGAILGLYEYDELKQKKKMMVSAQLHGRPKSWIEEQEMGSFLSVAKGSDEPPVFLEIHYKGSPNACEPPLVFVGKGITFDSGGISIKASANMDLMRADMGGAATICSAIVSAAKLNLPINIIGLTPLCENMPSGKANKPGDVIRAKNGKTIQIDNTDAEGRLVLADALCYAHTFNPKLIINAATLTGAMDIALGSGATGIFTNSTWLWTKLFEASIETGDRVWRMPLFEHYTKQVVDCQLADVNNIGKYRSAGACTAAAFLKEFVTHSKWAHLDIAGVMTNKDEVPYLRKGMTGRPTRTLIEFLLRFSQDEANA	635492	607680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_608219_608698_608809_611070_611151_617377_617481_618568_618658_620163_620289_623284_623444_628751_628912_630186_630293_630765_630821_632053_632170_635431
531439	contig_401_pilon	-	2601	12	Intergenic	novelGene_42790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	109.2397469516	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	75	1292	1129059	1116557	TRUE	40	ACTATTCTAATAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEKT	1131691	1113921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407_1116566_1118574_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
531440	contig_14219_pilon	-	969	2	Intergenic	novelGene_54366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCTGTATTCCGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047185	1045775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1046681_1047121
531442	contig_7932_pilon	+	3292	1	Intergenic	novelGene_128431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGCCAGGCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250847	254139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_250800_254100
531443	contig_12622_pilon	-	1388	9	Intergenic	novelGene_5992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2394.90946788704	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	2	997	1590968	1585459	TRUE	20	ATTTGGATTCTCTAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVGTICISSRTGGTGDSLRAGAAGHRAPSLSRTRGPSFLQSWTLPLRTRSPRRFSSSLGARCGCTQARRRWARGGWTSWAWVRRWITSPASFLGARVRRCYSAGNDSGGST	1590969	1583568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586556_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
531444	contig_12638_pilon	+	2091	9	Intergenic	novelGene_33399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	122.738479601957	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	213	1391	1521202	1538931	FALSE	50	TGTTAAGGAGAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1520989	1539631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529491_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
531445	contig_9363_pilon	+	1786	10	Intergenic	novelGene_6803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	254.654013647275	1365	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	869	1441	1623705	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622022	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
531446	contig_15063_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_10887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	233	1408	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531447	contig_15459_pilon	+	2308	6	Intergenic	novelGene_106384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	88.8130621023732	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	23	394	20684	50975	TRUE	15	ATTTTGTAGTCCTCGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGWCVRTMAAANPWDPASASNAAGLLLGHFVASGLVTQEMLNISKKSASCFVNFSRLQQITNIQAEIYQKNLEIELLRLEKDTADVVHPFFLAQKCHTLQSMSNHLEAVLKEKRSLRQRLNTWYICWSWQ	20661	55006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_20777_43413_43507_43874_43945_49451_49536_50943_51053_53169
531448	contig_10074_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_57096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187352	186059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_186100_187400
531451	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	15	AGGCTGTGCTCCTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
531452	contig_16831_pilon	+	4133	1	Intergenic	novelGene_134798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1816	2118	436768	437070	NA	70	AAGAAAGAAAAAAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVATPPLCGKSNPTSLTPDCKDQSYTILIYYQFCSPLLHFCFDTSCTCSTSSSDPDHWELRHTSQVKGRSLPDCQLCPRPHMPPSLECPRHHCHLRIPF	434952	439085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_435000_439100
531453	contig_15410_pilon	-	2056	10	Intergenic	novelGene_130578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	81.333029750496	2031	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1142	1897	56347	54277	FALSE	25	AAGCAATTCTTCCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59306	54117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56657_57021_57564_57669_57870_59216
531454	contig_8820_pilon	-	1726	9	Intergenic	novelGene_79298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1165.18944275169	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	33	878	170675	168126	TRUE	25	CCTCTGTTAATATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKIKKTTRSFMSSSLKTLSLEYMKILKIGRSFQSC	170707	166401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168349_169172_169338_169664_169799_170135_170503_170600
531456	contig_5231_pilon	-	2190	7	Intergenic	novelGene_65889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	133.365933514606	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	297	746	219086	211512	TRUE	30	GAATGTGGAAAACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSG	219501	208840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_211568_212537_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283
531457	SIRV6	+	1078	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	4	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
531460	contig_7728_pilon	-	1473	9	Intergenic	novelGene_64704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	320.771896173901	27	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	43	912	752150	713991	FALSE	25	TTTTTCTAACTGATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEGLVLGKYSCSISR	752192	713429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_714032_716036_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
531462	contig_10225_pilon	+	1970	12	Intergenic	novelGene_86775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	555.521376726405	5	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1155	1829	42707	47611	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEPEEPPATALVPRASEDLWLGQCGDGEAACRMAGL	20657	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35604_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46618_47504
531463	contig_762_pilon	-	2012	5	Intergenic	novelGene_135944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	36.2904946232481	135	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	82	522	266669	257494	TRUE	5	ACCTGGGTGCGTCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVRSWRK	266750	255239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_257668_259724_259837_263903_264056_266666
531464	contig_15063_pilon	+	1669	7	Intergenic	novelGene_8456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3810.76338225762	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	346	1473	34808	38994	TRUE	15	TCATTTATGCTGCACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATELEGKEKLGQSRTVCVWEGQSHTSLWLLLLLLLQQLGPGQTGHHLPRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	26252	39605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
531467	contig_10940_pilon	-	1884	4	Intergenic	novelGene_49269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	3	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	98	526	917000	875564	FALSE	15	GATGAGATTGGCTTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917097	874205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
531468	contig_4754_pilon	+	1998	11	Intergenic	novelGene_35968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	171.515130527892	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	762	1565	410506	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	408964	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_409442_409548_409705_410232_410317_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
531470	contig_8864_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_136004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAATCACAAAGTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726914	727909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_726900_727900
531471	contig_7058_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_136026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182906	180789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_180800_182900
531473	contig_9375_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_136043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGGACTGCAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144234	143668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_143700_144200
531474	contig_846_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_136093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATATATAGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89596	90930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_89600_90900
531475	contig_10159_pilon	-	2259	7	Intergenic	novelGene_30901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	242.605074601135	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	162	419	1027025	1006290	TRUE	15	TGATTTTTCTGCACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHEATAMMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVVPDLQQSATTTPLWIGM	1029215	1002465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1010082_1010124_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101
531478	contig_8712_pilon	+	1681	3	Intergenic	novelGene_58819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	380.5	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	318066	321937	FALSE	10	GAAGGGTCTCGTGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADRVCAAARLVFRPPDPDVLSLLQQDDRDEAHLQCWCPHLALLRKPVPAGVRGGLLLHPLLRGRPAGCGPLLSQLQSSPGHLQAFVGLGQRGGGRELKEVLSSSHPAPP	318064	323281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_318222_321684_321864_321936
531480	contig_19459_pilon	-	1383	9	Intergenic	novelGene_59858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8476.98851947878	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	171	677	16240	11276	TRUE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGSPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVNYRALLTLLLTDQISK	19134	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6750_6788_7120_7789_7946_10268_10323_11192_11426_12584_12704_15503_15702_16200_16265_18988
531481	contig_14925_pilon	-	1496	8	Intergenic	novelGene_55208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1430.5044493436	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	146	559	116065	114666	TRUE	30	TGGAAGAGCAAAGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTGWQIGKQGFCNDAWSSALTTQLIFGTGTQIIVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121553	25801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
531482	contig_12074_pilon	+	1800	12	Intergenic	novelGene_53752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	328	972	30302	33631	TRUE	20	CGGATCTTATAGTATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNRSTSLMLLESVRNMVTRSMPMPQPAVGGSPYSRAVQKFSSMNMASSSPAALALGLFFKKLPLPHGVIQLSVGITHFLLHDKELKALSQALFRAVPLGQRAHYLRVITDERGIDASHFQELSNKLIKESGCGPRWRAFNSFCYTDIIKDFASFFSFEEVCFWQLHTQDFPKLFHHADSLKGWSEVNFTGLALGAIWMVGDLVTSCDVLHHP	29974	40153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_30324_30920_31066_32216_32344_32646_32734_33106_33195_33342_33514_33626_33791_34829_34950_35882_36002_36092_36286_36646_36740_40009
531484	contig_15063_pilon	+	994	3	Intergenic	novelGene_14405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	32	853	35271	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35239	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
531486	contig_15063_pilon	+	1747	7	Intergenic	novelGene_8468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3412.75016177081	6	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	269	1105	34808	36333	TRUE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHCGCYYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKACTSRLPDATHPGAAESA	26327	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36277_36600_38975_39092_39506
531488	contig_5988_pilon	-	2152	10	Intergenic	novelGene_15871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	162.392148444878	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	19	1467	394505	387838	FALSE	20	AGGCTGTGTCTAGTTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRRTLEEKEQEEARLRKLRKKEAKQRWDDRHWSQKKLDEMTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQNRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	394523	387152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388593_388637_388674_390323_390433_390653_390806_391212_391456_392440_392619_393678_393825_394138_394365_394464
531489	scaffold_16539_pilon	-	1846	12	Intergenic	novelGene_68360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	305.58679496372	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	629	1537	498849	490096	FALSE	15	ACAGCCTGGGCCTGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502814	489786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500665_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
531490	contig_13760_pilon	-	2994	4	Intergenic	novelGene_61283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.684198393627	90	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	47	463	159222	158170	TRUE	30	CAGACGAATGTTGGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAGDIPRESSGFTWMAAATRDCWPWGSFLGLLGLVSAAAAAWDLASLRCNFGDFCECDFRPDFQGLECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVHDPAPKKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLFRGGLRSPHVHHFSPRHPLPPPQPHRAL	159268	154567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_155345_155672_157426_158168_158436_159071
531491	contig_1715_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_127184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251452	249183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_249200_251500
531492	contig_12250_pilon	+	2190	6	Intergenic	novelGene_80615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	43.4667689160352	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	197	1195	350196	352343	TRUE	35	TTCTTTTTATAAATGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEDSPPGPGYPRLAGPQELGRASGCRKLHRRALGRAECGVSCEVAAAAAIRHSSRQPSGGPAALRMTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGCSTCIVMGPLTQQPSCCMP	349567	354926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_351937_352283_352443_353491_353766_354304
531493	contig_7357_pilon	+	1990	7	Intergenic	novelGene_36823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1373	1750	139801	154908	TRUE	25	CATTGCCATTTTTCACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135564	159982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136567_137568_137784_138923_139045_139766_139973_154561_154720_154860_155083_159916
531494	contig_567_pilon	-	1829	11	Intergenic	novelGene_33959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	981.821984883207	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	83	715	338200	313645	TRUE	10	GGGAGTACTGTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHAVSSQARNRAAVFSAAPSTSRRVRTMDPRKVSELRAFVKMCKQDPSVLHMEEMRFLREWVESMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRKLQNIGESMSENVKRER	338282	308073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313700_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338090
531495	contig_8065_pilon	-	2531	13	Intergenic	novelGene_107315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_12	27.1153656725399	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	325	1782	112224	90599	FALSE	20	GAAGTATTTGCGTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTPTHTPVSRNVPSRFSGSTRWRGVSFTDSVESTPLPSIEDRLAVLCPSQELLEYFQKKMAECETENEDLLKKLELYKEACEGQHKLEWDLQQKEEEIAELQKALSDMQICLFQEREHVLRLYSENDRLRIREVEDKKKIQSLLALVGTDTGEVTYFYKEPPHKVTIPQKTIQAVNVPEQNASSTLKADPKVNKRRSAMREKGESPKQYQRNIQTLILQVEALQAQLEEQTKLSREQVEGLMEDRRIRIEEIQVQHQRNQEKIKELTKNLHHTQELLYESTKDFLQLRFENQHKEKSWMLEKDCLMSKIKQCRLQCKKKEDKTGKVWPVVHQSHHNQNEYIKTLKDKLVQEKKLSNMYQEQCIALEEEVARIREEECVRREIFKDRTNKMGKRLQVMTKRYEALENRRMLEVEGFKTDIKALRQKLKDLEQMLYKTTLNARADQDLAILCEVRDSNRRAHKIQGELKNLKSKVFGLENELRLC	117737	89849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_90746_91506_91660_91761_91888_93586_93807_97690_97840_98991_99084_99661_99735_101337_101435_106932_107076_110200_110421_112186_112241_114885_114941_117484
531496	contig_9389_pilon	+	1648	6	Intergenic	novelGene_83904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1021.28840197077	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	42	767	159587	167516	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159545	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164243_165824_165933_166074_166222_167240
531497	contig_12414_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_59603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	108	581	373581	374054	NA	25	TAAACTTAGTGTTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373473	374582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373500_374600
531499	contig_7695_pilon	-	2578	21	Intergenic	novelGene_41662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	312.204003818016	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1151	1879	906566	901615	TRUE	10	CACTCCTGGTCCTCCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQPENPLGGTGAI	912808	896338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901639_903724_903809_903914_904005_904635_904786_905766_905995_906230_906312_906494_906597_907259_907434_907871_907957_908116_908214_908578_908680_908992_909111_910317_910369_910586_910836_912102_912181_912460_912508_912688
531501	contig_5954_pilon	-	2080	15	Intergenic	novelGene_28700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	194.161422953339	731	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	84	1535	975610	963070	TRUE	5	GTTATGGTTTTCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSRS	975693	962084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963080_963125_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
531502	contig_17769_pilon	+	2419	16	Intergenic	novelGene_124260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	101.862652625975	469	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	1128	2339	110839	116765	FALSE	25	TATAGCATGTCTGATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKNAPCILFIDEIDAIGRKRGRGHLGGQSEQENTLNQMLVEMDGFNSTTNVVVLAGTNRPDILDPALMRPGRFDRQIYIGPPDIKGRSSIFKVHLRPLKLDESLSKDALARKLAALTPGFTGADISNVCNEAALIAARHLSPSVREKHFEQAIERVLGGLEKKTQVLQPSEKTTVAYHEAGHAVVGWFLEHTDPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPREQYLYTREQLFDRMCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	97607	116845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_97780_102105_102194_104163_104259_104700_104851_106410_106480_106928_107054_108444_108716_110387_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_113608_114697_114814_115333_115535_116111_116307_116546
531504	contig_1867_pilon	+	442	4	Intergenic	novelGene_54496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGATAATAGTTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6656	14404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_6778_10433_10524_12026_12083_14229
531505	contig_10734_pilon	+	1879	6	Intergenic	novelGene_51300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	298.053283826902	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	974	1324	1378305	1388936	FALSE	30	TTAAAAAAGTGTGGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368635	1389491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369296_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
531510	contig_10299_pilon	+	2247	19	Intergenic	novelGene_79715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	92.0175104109116	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	17	1225	320559	337973	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQYPCLSGLCCGGFIPWPSRYVSTCVFLKCRASAGSWLTGPATRCNRKTCLTRMLLGLLTRNLGTHLVSPTLTLLHGPMAVGARSWLLSCWSMSHARGSRYPFS	320542	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335835_337417_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
531511	contig_10063_pilon	-	3128	4	Intergenic	novelGene_127767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_1	78.7414898399962	167	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	352	1122	784060	780656	FALSE	10	TTCATTTGCCGTATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWQMTQLLLLLALVVSAWGARPRNPQGRTDLLNVCMDAKHHKTKPGPEDKLHDQCSPWRKNACCSVNTSQELHKDTSRLYNFNWDHCGKMELDCKRHFIQDTCFYECSPNLGPWIQQVDQSWRKERILNVPLCKEDCQRWWEDCRTSYTCKTNWHKGWNWSSGINECPVKAACHTFEFYFPTPADLCEGLWSHSYKVSNYSQGSGRCIQMWFDPAHGNPNEEVARFYAEAMSRAGPHATGPLLLSLVLTLLWLLG	784411	778649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_780937_781042_781179_781338_781528_783895
531512	contig_2892_pilon	+	1878	8	Intergenic	novelGene_119014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_1	998.249754033815	2652	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	173	838	265084	331810	TRUE	10	GTTTTTGCTGTAGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAAVIAAGGQRLAREQRRPSRPTEARPPRLPGPPRPQRPLTSLAPSPSSASGCAMALAAAALAAVEPACGSRYQQLQNEEELGEPEQAGSDAPPPYSSISTESAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRFSTYFPGYFDGQYWLWWVFLVLGFLLFLRGFINYAKVRKMPETFSNLPRTRVLFIY	264911	339507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265147_305212_305301_318539_318671_324764_324853_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
531514	contig_16148_pilon	-	1691	6	Intergenic	novelGene_50360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	585	junction_1	307.790578153393	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	390	1370	78645	59018	FALSE	25	GTAATGTTTTGCAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCNSFLCFIYAEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	79034	58696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423
531515	contig_14441_pilon	+	1708	8	Intergenic	novelGene_100550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.9103594183	16	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1095	1523	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112105_112154_112454_112665_113843_114161_114556_114732_116578_116963_117220_117344_117539
531517	contig_11720_pilon	+	2261	8	Intergenic	novelGene_43973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_3	335.579243356064	6	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1345	1812	266216	268041	FALSE	60	AACAAATACACAAGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTGVGREM	262271	268490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_265206_265816_266171_266240_266453_266610_267753
531521	contig_8065_pilon	-	2733	13	Intergenic	novelGene_107313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_12	26.0516314268416	323	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	521	1978	112224	90599	FALSE	15	TTTGCGTTTTCTATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTPTHTPVSRNVPSRFSGSTRWRGVSFTDSVESTPLPSIEDRLAVLCPSQELLEYFQKKMAECETENEDLLKKLELYKEACEGQHKLEWDLQQKEEEIAELQKALSDMQICLFQEREHVLRLYSENDRLRIREVEDKKKIQSLLALVGTDTGEVTYFYKEPPHKVTIPQKTIQAVNVPEQNASSTLKADPKVNKRRSAMREKGESPKQYQRNIQTLILQVEALQAQLEEQTKLSREQVEGLMEDRRIRIEEIQVQHQRNQEKIKELTKNLHHTQELLYESTKDFLQLRFENQHKEKSWMLEKDCLMSKIKQCRLQCKKKEDKTGKVWPVVHQSHHNQNEYIKTLKDKLVQEKKLSNMYQEQCIALEEEVARIREEECVRREIFKDRTNKMGKRLQVMTKRYEALENRRMLEVEGFKTDIKALRQKLKDLEQMLYKTTLNARADQDLAILCEVRDSNRRAHKIQGELKNLKSKVFGLENELRLC	117757	89843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_90746_91506_91660_91761_91888_93586_93807_97690_97840_98991_99084_99661_99735_101337_101435_106932_107076_110200_110421_112186_112241_114885_114941_117308
531524	contig_9609_pilon	+	1476	4	Intergenic	novelGene_23081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_3	614.524748620157	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	113	460	453773	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	453660	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_453776_453861_454016_454418_454634_455282
531525	contig_13787_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_40632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATAAATCTAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191710	190864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_190900_191700
531526	contig_8075_pilon	+	1920	3	Intergenic	novelGene_42493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	138	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGTGACTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664033	690839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664085_685236_685372_689105
531528	contig_1867_pilon	+	1849	2	Intergenic	novelGene_54569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAAAAAGAAAGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448000	449930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_448256_448336
531529	contig_2646_pilon	+	2014	9	Intergenic	novelGene_69515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_7	154.371912924599	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	450	1016	566553	573396	FALSE	35	ATAGAAAACTCGCTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554003	574394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
531531	contig_11986_pilon	+	1843	6	Intergenic	novelGene_69199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3172	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	129	551	734107	734529	TRUE	15	CAGAGGGGCGCGGCGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGRKENADISNRVGGKPKDLLVPGEGTAASQSGRYGKDRQCELENHSGGPSPFTESMRGFTQQETLSASVPGCAFSSERLITLFGDKTAPLFNQLKKNQISRLGLGEVAAIQSSTNISGQMWTVRRSVFFAAVSKIAI	733978	794764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_735162_756604_756741_757968_758101_758220_758370_792502_792595_794613
531532	contig_7202_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_18721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGAAGAACGTCTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29845	30099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
531534	contig_18194_pilon	-	1157	5	Intergenic	novelGene_55959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	128	928	18897	4046	FALSE	15	ACTTTCCCAGGTGGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALK	20413	3816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_4049_4860_5501_7034_7162_18866_18976_20364
531537	contig_1948_pilon	-	1256	4	Intergenic	novelGene_31173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	286.591850702159	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	245	454	546798	544410	FALSE	20	GAAGTGTATTCTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552027	543607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551992
531538	contig_11978_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_63120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATTTGCTTTCAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1893883	1891474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1891500_1893900
531539	contig_15063_pilon	+	1358	5	Intergenic	novelGene_13385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	3425.34177126896	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	202	1050	34808	36494	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
531541	contig_10674_pilon	+	2170	12	Intergenic	novelGene_6431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_3	203.583353489871	89	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	29	2038	198581	251342	FALSE	30	CAACTTTCTGTGTTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKGTPDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLNSDEEGEPSGKRKAEDDDKANKKHKKYVISDEEEEDDD	198552	251474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782_211897_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_241065_241253_243633_243732_251237
531542	contig_5643_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_38879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236540	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236500_238200
531543	contig_13558_pilon	+	1348	2	Intergenic	novelGene_123018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	130	927	40701	41660	FALSE	75	ATTTAAAAGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	40571	42081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_40832_40993
531545	contig_4232_pilon	+	1524	2	Intergenic	novelGene_63184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5349	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	85	399	146362	148542	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	146277	149667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230
531547	contig_14925_pilon	+	1008	5	Intergenic	novelGene_55176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACCTTGCATCGTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25794	43952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_43889
531548	contig_5145_pilon	-	539	4	Intergenic	novelGene_131462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	202.559182023976	506	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	30	365	956111	949748	FALSE	10	GTCCTTTCACTCAGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTYRFRGCVMEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVEDFNRHLDTLTEHYDIPKVSWTK	956140	949573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949817_952957_953012_955790_955930_956037
531549	contig_18194_pilon	+	2217	2	Intergenic	novelGene_55941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1648	1995	4994	5341	TRUE	40	ACCCTTGGGGAGAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDAWLQLSVVETSDGRTAFTACSQSPVDISLLALAFADDLAEWSTMLVETLVIAAATPSPTPVAHNGRLTPAVTGARAKPRMVRMPETVLVELATMWEMVQSLCILPTLSARA	3346	18972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_+_5470_18878
531550	contig_2596_pilon	-	2323	11	Intergenic	novelGene_53473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	106.12487926966	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	138	1328	722501	664369	TRUE	15	CACTGAGTACTTTGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAELEEKRAFDSAVAKALEHHRREIVAEQDRKVEEVRDAMEIEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKYEFEKDMSEKLAEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSEQMGSYRLLIQCDFG	722638	662381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664345_664549_665480_665613_669223_669311_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
531551	contig_9482_pilon	-	1393	8	Intergenic	novelGene_44294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	26	junction_6	135.041187972335	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	14	1165	1242459	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1242472	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403
531552	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
531553	contig_7963_pilon	-	1742	4	Intergenic	novelGene_58287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1355.14041912842	202	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGATCTGACTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	37077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39363_48737
531555	contig_14925_pilon	-	962	5	Intergenic	novelGene_55149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	10	426	32665	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAMTDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	32674	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_32658
531557	contig_17470_pilon	-	1992	13	Intergenic	novelGene_110526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	55.660366409941	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	301	1347	277215	270870	TRUE	15	TTCAAACTCTTGTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDVSSSG	302546	269594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270890_271041_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302355
531559	contig_500_pilon	+	1207	7	Intergenic	novelGene_31084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_5	984.654832359487	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	379	792	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1494261	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
531560	contig_12279_pilon	+	1239	7	Intergenic	novelGene_50094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2302.91045925223	24	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	68	463	68297	73208	TRUE	20	TTCTGACTGAGATCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKEKDHSLCVTHIKLNHPVT	57535	77628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_73151_73221_75031_75096_76928
531561	contig_12951_pilon	-	1689	4	Intergenic	novelGene_68161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.074828367065	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	43	360	307115	296988	TRUE	20	TATTTAAGAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	307157	295358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_295540_295839_297135_298383_298510_307070
531563	contig_6316_pilon	+	1861	7	Intergenic	novelGene_134721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_6	93.6507993677695	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	527	826	147168	149021	TRUE	60	AAAGAAATGAAATGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINCKYN	146641	157154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_147170_148632_148750_148840_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
531564	contig_5643_pilon	+	1239	10	Intergenic	novelGene_38809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2776.85941707934	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	542	1027	236928	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236115_236450_236510_236639_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
531565	contig_9995_pilon	+	2466	13	Intergenic	novelGene_47662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_11	115.174113362721	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	40	1128	158431	178709	TRUE	10	TCCGTTTTTCTGTTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPGACCRGGAGAMAVLLETTLGDVVIDLYTEERPRACLNFLKLCKIKYYNYCLIHNVQRDFIIQTGDPTGTGRGGESVFGQLYGDQASFFEAEKVPRIKHKKKGTVSMVNNGSDQHGSQFLITTGENLDYLDGVHTVFGEVTEGMDIIKKINETFVDKDFVPYQDIRINHTVILDDPFDDPPDLLIPDRSPEPTREQLDSGRIGADEEIDDFKGRSAEEVEEIKAEKEAKTQAILLEMVGDLPDADIKPPENVLFVCKLNPVTTDEDLEIIFSRFGPIRSCEVIRDWKTGESLCYAFIEFEKEEDCEKAFFKMDNVLIDDRRIHVDFSQSVAKVKWKGKGGKYTKSDFKEYEKEQNKPSNLVLKDKVKPKQEYP	158391	190599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_158501_162342_162411_162497_162563_163986_164105_165053_165197_165736_165834_166586_166704_171011_171137_172569_172637_176756_176869_178602_178980_182787_182936_189679
531566	contig_9345_pilon	-	1851	6	Intergenic	novelGene_24651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	3	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	201	782	955353	947957	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001275	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
531568	contig_14158_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_136125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26476	24561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_24600_26500
531571	contig_9389_pilon	+	1909	8	Intergenic	novelGene_83930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1115.23882314644	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	320	1060	164237	167516	FALSE	35	GCAATAAAAACCTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159573	168365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_159799_159917_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167240
531572	contig_7202_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_18648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
531575	contig_9406_pilon	+	2900	1	Intergenic	novelGene_136179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2561	2884	153361	153684	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEIKSADRTYMPSKCVKIGRTINTKLNIKGADINILFRLLKMQSVPFVTTVTAKHLQFPWEPPYLKVNLPFLSSSTWVSFCPETPTLNLCNSETTKFRKKGCLKLN	150800	153700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_150800_153700
531576	contig_366_pilon	-	2570	14	Intergenic	novelGene_51637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	288.287147285377	14	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	120	1355	1440886	1423794	TRUE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWALLVLLMATAWHGQGIPVIEPQGPELVVEPGTPVTLRCVGNGTVEWDSPISPGWTLGHEAPSSILTTTNATFRNTGTYHCTESGELSRGDANIHLFVKDPFRPWNILAEEVTVLEDQDALLPCLLTNPELEADVSLVRERGRPVRHDTSYSFLKWRGFTIHKTKYLDSSVYHCSTLVGGRKVLSIGIQLKVQRVSGPPALKLEPAELVRIQGEAAQIVCSASSVNPAFDVFLQRGDTKLTVYAATDFHDKHYHNVLTHNLHHVGFQDAGNYSCVATSAQGGSSTSMVFRVVESAYLNLTSEQNLLQEVSLGEKFNLKVKVEAYPALQGFNWTYLGPFSDQQHSLNFDIIEDTYRYTSTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNAGGWKTLTFEIILRYPPRGKGHADPHQWL	1441005	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406558_1413984_1414071_1414568_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
531577	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531581	contig_8045_pilon	+	1420	5	Intergenic	novelGene_35361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	1187.08516438375	77	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
531582	contig_12958_pilon	-	4069	10	Intergenic	novelGene_136189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	208.487913022657	582	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	10	1890	70628	39829	FALSE	35	AGATGCCATCCAATAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVTMASRPIMTAPICLVENQKEQLTVNPKALKILNEIYQPVVVVAVVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGRNPKIQNSNLPRECIRHFFPKRRCFVFDRPTSDKNLLAHVEELPEEQLDCNFQMQAKNFCSYIFTHAKTKTLRQGIIVTGNRLGTLVETYVDAINSGAVPCLENAVTTLAQRENSAAVQKATDHYSKQMAQCLRLPTDTLQELLEVHAVCEREAITIFMEHSFKDENQEFQKQLMCTIEKKKEDFVLQNEEASEKYCQAELKQISEPLMETISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKVEQDYERLPRKGVKANEVLKSFLQSQVAVEESILQSDRALTDGEKAIAAERAKTEAAEKEKELLKQKQEEQQQKMEAQERSFKKNMEQLKEKMERERENLLQEQTMMLEHKLKVQEELLREGFEKKSEELNKEINQLKEEIETINKKRSGFSQFLDEAGNVLLVALPGAGKLFGAGMKLLSSHIK	70637	37649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_40048_40927_41122_41468_41572_50899_51113_52404_52686_61224_61471_63129_63327_63529_63640_65624_65753_70438
531583	SIRV2	+	455	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-44	112	-44	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
531584	contig_7119_pilon	+	1481	4	Intergenic	novelGene_40963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	104	1258	137033	139798	TRUE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127554	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139932_140858
531587	contig_5423_pilon	-	2692	16	Intergenic	novelGene_85238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_3	198.776993973984	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	497	2386	532780	497362	FALSE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWAQEDQNLQELMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534579	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
531588	contig_5954_pilon	-	2999	21	Intergenic	novelGene_28402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	124.748657307404	304	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1641	2216	21271	16787	FALSE	10	ATCTGGCTCTGGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQVQANLPDEQVLSEQEIDESFKALFRQLAGEDLEISVRELQTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRDGNGKLGLVEFNILWNRIRHYLAIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFQLNKKLYELIITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDQDGVVTFDLFKWLQLTMFA	42834	16003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16814_17205_17265_17557_17675_18560_18640_18849_18919_19369_19435_20250_20309_20391_20458_21235_21276_21425_21647_24546_24725_35373_35535_35645_35721_36230_36317_36623_36708_38029_38200_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_42764
531591	contig_12429_pilon	+	3367	17	Intergenic	novelGene_136210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	80.0667446181622	186	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2589	127	2715	229965	249136	FALSE	25	TACTCTGTTATCTGACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPASTPSRRGSRRARGTHTPTRQSEDARLSPSQRRKGEDSTSGELQPMPTSPGADLRSPVAQDALFSSPQQLHASTIPLDFDISSPLTYGTPSSRVEGTPQSGVRGTPMRQRPDLGSARKGRQVDLQSDGPTTDDLVASEPSLGQKLVIWGTDVNVATCKENFQRFLRRFVDLLAKDEENVALDIKEPLYMQRLEEINVIGEPFLNVNCEHIESFDKTLYRQLLCYPQEVIPTFDMAVNEIFFDHYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTARVEIDRGRIAEPSVCEHCHTTHSMTLIHNRSAFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSILAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLMLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSKEQAEEEFMDMAVLRDYIAYAHSTVTPQLSEEAGQALIEAYVDMRKIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRFSDKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL	229652	249788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_229767_229952_230035_230341_230504_231361_231526_231615_231718_231940_232037_232121_232218_234344_234484_237653_237875_240469_240591_242083_242344_243088_243455_244364_244493_245262_245471_247375_247605_247966_248101_249043
531592	contig_1076_pilon	-	1919	15	Intergenic	novelGene_101097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	206.944930069892	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	193	1425	79519	54509	TRUE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKHFFQTPAGSVLLRVHLEVVATEELARDPPQGRGRSAAIAAVPTTSLIMHKIIG	79711	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51497_51835_51974_53850_53913_54272_54408_54492_54671_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
531594	contig_13295_pilon	+	2344	2	Intergenic	novelGene_31203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTAAACTTTTCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16748	19204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_18894_19005
531595	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCTCCTACGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
531596	contig_6710_pilon	-	412	2	Intergenic	novelGene_98239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531597	contig_6595_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_122544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTACTTCAGGTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610854	610278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_610300_610900
531598	contig_3077_pilon	+	1399	8	Intergenic	novelGene_26724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3458.03238261062	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	373	903	15160	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10113	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13055_13171_15137_15262_16144_16323_16943_17054_17449
531599	contig_6589_pilon	-	2306	3	Intergenic	novelGene_26290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	158	661	2274715	2273718	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTEPDQ	2290255	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273732_2274225_2274793_2290175
531601	contig_15474_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_136231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCTCATTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63243	62985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_63000_63200
531602	contig_9571_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_136263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTTTATGCTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377265	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_374600_377300
531603	contig_1406_pilon	+	1712	4	Intergenic	novelGene_25575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	382.780470882318	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTCTACTAGGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2173746	2187413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2185820_2187293_2187340
531605	contig_9471_pilon	+	2802	4	Intergenic	novelGene_21837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	466.04530061167	3	161	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTTTGTGCTTATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413349	417501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414073_414633_416273_416936_417028_417152
531606	contig_5317_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_76617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACTCTGCATACGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766750	767127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_766800_767100
531607	contig_675_pilon	+	2942	16	Intergenic	novelGene_136341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_12	36.1493199567203	275	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	81	2225	95121	169941	FALSE	15	TTTGAAAGGCTTTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQELYHAEFARAGKEAGLQVWRIEKLELVPVPKSAYGSFYVGDAYLVLHTTKASRGFTYRLHFWLGKECTQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQSRELQGHESTDFVSYFKEGLKYKAGGVASGLNHVLTNNLTAERLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGSSCNKYERLKASQVAIGIRDNERKGRSQLIVVEEGSEPRELITVLGKKPELPDGNDDDDTIADIANRKMAKLYMVSDASGSMNVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFIWKGKNANPQERKAAMKTAEEFLEQMNYSTNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGEVEIWRVESNGRIPINKNSYGEFYGGDCYIVLYTYPRGQIIYTWQGRNATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPTHLLSLFKDKPLIIYKDGTSKEGGQAPAPPIRLFQVRRNLASITRIMEVDVDGSSLNSNDVFVLKLQQKNGYIWIGRGASQEEEKGAEYLASVLKCKPTRIQEGEEPEEFWSSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFIIEEVPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEAERTESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSN	95040	170658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_95320_100498_100654_104953_105116_117932_118083_135058_135152_145323_145457_145861_145951_146769_146986_150571_150694_155237_155329_159364_159536_163073_163252_163527_163650_167494_167573_169105_169167_169816
531608	contig_4531_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_47841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTGAGAAATTAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58211	57817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_57800_58200
531609	contig_4350_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_136393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAGCGAATAAATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329695	330198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_329700_330200
531610	contig_414_pilon	-	2185	3	Intergenic	novelGene_115106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	23	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	961	1737	373842	373066	FALSE	15	CATGATGGTGTTTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384192	372617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376463_376898_383938
531612	contig_6496_pilon	-	2104	13	Intergenic	novelGene_103485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	870	1211	463343	461100	TRUE	15	CCGTACCACGTGCCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTLNLLGLTCPPLSEESRFSLPTRRRHLRCHGGRGTGTSIGASGCPSAAVQEGLGTHVLGVFIRIKVDVIVECQLLVCHRRHSLVNARYEDFPLPVNQRAHQGDEVSHGLMH	468169	450255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_450278_451305_451436_452588_452684_453532_453679_455570_455735_457423_457512_459852_460054_461052_461139_461415_461571_462830_462953_463317_463418_463634_463783_467522
531615	contig_2069_pilon	-	1492	6	Intergenic	novelGene_23562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_5	81.0693530256656	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCCATCTAATGGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2271784	2263005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2263066_2263256_2263305_2267609_2267810_2268667_2268824_2269898_2269954_2270811
531617	contig_8160_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_136407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGGCAATAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190286	192588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_190300_192600
531618	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531619	contig_15839_pilon	-	2405	14	Intergenic	novelGene_136411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	85.474381088635	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	127	1218	106014	48146	FALSE	0	TTGGTCTGGTCTTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALEKSLHLGPGRKRDFSPVSWSQYFESMEDVEVENETGKDTFRVYKSGSEGPVLLLLHGGGHSALSWAVFTAAIISRVQCRIVALDLRSHGETKVKNPEDLSAETMAKDVGNVVEAMYGDLPPPIMLIGHSMGGAIAVHTASSNLVPSLLGLCMIDVVEGTAMDALNSMQNFLRGRPKTFKSLENAIEWSVKSGQIRNLESARVSMVGQVKQCEGITSPEGSKSIVEGIIEEEEEDEEGSELVNKRKKEDDMETKKDHPYTWRIELAKTEKYWDGWFRGLSNLFLSCPIPKLLLLAGVDRLDKDLTIGQMQGKFQMQVLPQCGHAVHEDAPDKVAEAVATFLIRHRFAEPIGGFHCVFPGC	106140	46958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_48165_48620_48689_49307_49373_52016_52062_52575_52706_54667_54792_56097_56164_62193_62285_65861_66017_70879_70932_71327_71386_88688_88781_89326_89422_105982
531620	contig_9177_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_32783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATACACATATTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413174	1414203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1413200_1414200
531621	contig_5209_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_136426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGAAACTGAGCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62013	61210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5209_pilon_-_61200_62000
531625	contig_15063_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_12735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	2	1414	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531627	contig_15182_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_136466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCTGGGTTTAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603254	602487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_602500_603300
531629	SIRV6	+	1292	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	138	164	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	34	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	25	TGGTATCTAAAATGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531630	contig_18328_pilon	+	2568	9	Intergenic	novelGene_132547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	201.528185063529	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	79	1173	15119	31074	TRUE	25	AGCTACATTGAGCTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYSTAQECSLDDDTILIPIIVGAGLSGLIIVIVIAYLIGRRKSYAGYQTL	15040	32937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291_28457_30934_32062_32529
531632	contig_6735_pilon	-	1774	11	Intergenic	novelGene_15691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	800.840489735628	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	530	1294	545022	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545035_551184_551235_552840_552952_554243_554374_564168_564232_564784_564869_568198
531633	contig_7171_pilon	-	2275	26	Intergenic	novelGene_101301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	116.553507025743	17	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	80	1237	1075756	1068324	TRUE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDM	1075835	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068215_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
531634	contig_8020_pilon	+	3004	9	Intergenic	novelGene_114439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	7.71261142545117	150	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	521	1546	321966	331625	FALSE	5	CCTGGCCTAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNPALAGALGAQQLSTWLLTERLIYNGTSRATQFPDGVDVRVPGFGQTFSLEFLDPSKSSVGSYFHTMVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317269	333083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_320934_321051_321514_321672_321945_321991_322110_322157_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
531635	contig_1443_pilon	+	715	2	Intergenic	novelGene_28177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	112	417	344287	344592	FALSE	30	CATTCTAATGAGTGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343649	344890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343660_344185
531636	contig_5423_pilon	+	3161	1	Intergenic	novelGene_85306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATTCAAAAACTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721887	725048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_721900_725000
531637	contig_9333_pilon	+	2212	12	Intergenic	novelGene_120323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	93.2541182925044	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	27	1052	173519	267422	FALSE	80	AAAATAAAAAAATAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLQSWANMAAPESGPALISGTPSPEGEEETILYDLLVNTEWPPETEVQPRGNRKHGASFLITKAIRDRLLFLRQYIWYSPTPFLLPDGLVRLVNKQINWHLVLASNGKLLAAVQDQCVEIRSAKDDFTSIIGKCQVPKDSKPQWRRVAWSYDCTLLAYAESTGTVRVFDLMGSELFVISPASNFAGDLSYAIAGLIFLEYKASAQWSAELLVINYRGELRSYLVSVGTNQSYQESHCFSFSSYYPHGISTAIYHPGHRLLLVGGCETAEAGISKASSCGLSAWRVLSGSPYYKHVTNGGDRVTAVPKTLGLLRILSVKFYSRQEQEQIIREAGLYEEEQGDQDWRKTD	173492	268582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_173642_175873_175929_177757_177795_189151_189230_190553_190602_196269_196314_211326_211461_213691_213826_214945_215045_254366_254506_266273_266343_267356
531639	contig_4924_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_84769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCCTGAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239022	239963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_239000_240000
531640	contig_1532_pilon	-	1752	7	Intergenic	novelGene_37381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1425.56870717931	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32224	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13430_15840_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28962_29438_29505_32049
531641	SIRV6	+	1331	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	585	0	369	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	321	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531643	contig_10246_pilon	+	1962	2	Intergenic	novelGene_46918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	105	308	184535	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	183544	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_183619_184504
531645	contig_9921_pilon	+	2064	3	Intergenic	novelGene_23751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274.5	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	124	996	321085	325518	FALSE	45	AAAAAAACATCTTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEVFPWGFESQKAVYEPEFDGGTLIIRLLKF	299192	326586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_321868_325428
531646	contig_15063_pilon	+	1320	5	Intergenic	novelGene_14377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	181	1065	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35090	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531647	contig_9982_pilon	-	1755	15	Intergenic	novelGene_55763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	242.964430083324	15	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	45	1619	353538	339852	FALSE	25	TCAGAGCCTCAACTGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353582	339715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343165_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
531650	contig_4131_pilon	-	2698	3	Intergenic	novelGene_127863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	3	584	163435	162646	FALSE	25	TTCTTACTACATATTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRCYLSPSLTSSLCRRLLQLPLLPPPPVEKTPVKKKAAKKPAGARRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEVKPKVKSAKKTPKKAKKPAAAAVAKKVAKSPKKAKAAKHKKGSFQSHHRFQKKSLTFITLLDRAL	163437	160531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_162720_162843_162950_163033
531651	contig_8660_pilon	-	911	3	Intergenic	novelGene_136503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	1224	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	15	TGAAGGCTTAGTTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
531652	contig_4884_pilon	+	2533	12	Intergenic	novelGene_63813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	592.812138375184	25	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1115	2125	578494	593204	FALSE	25	TTGCTTGTAGAGACCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKSREQDHSRSSSSSASPSSPSSREEKESKKEREEEFKTHHELKEYSGFAGVSRPRGTFHDDRDDGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGDGIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE	563304	593612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576355_578120_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_586137_586319_592827_593041_593198
531653	contig_2161_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_114903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTAATAAGATGTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757428	756408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_756400_757400
531655	contig_15327_pilon	-	2449	8	Intergenic	novelGene_70721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	303.516465612591	7	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	48	359	967479	963784	TRUE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGG	967526	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963186_963928_965036_965146_967420
531658	contig_6898_pilon	+	2275	8	Intergenic	novelGene_35728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	787.951205367957	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	87	872	59668	125892	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDSPHPLPWAEKWPIVVPMGLPFPSLSPLVC	59581	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_125804_125919_126324
531659	contig_13753_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_136519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTCTTTTTAATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272259	273182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_272300_273200
531660	scaffold_16539_pilon	-	1803	12	Intergenic	novelGene_68364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	305.620220221543	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	109	1500	502141	490096	FALSE	10	GTCTCTACAGCCTGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502793	489792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490440_491000_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
531664	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531665	contig_18272_pilon	-	2115	4	Intergenic	novelGene_6982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	310.582606653295	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	182	649	262678	122209	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262859	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122382_172730_172796_184338_184551_262660
531666	contig_15304_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_30670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
531668	contig_6048_pilon	-	1321	9	Intergenic	novelGene_73240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	220.80729013101	1670	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	118	1134	1916833	1896861	FALSE	20	GGTCCTCTCTGTAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1916950	1896673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
531669	contig_6065_pilon	-	2047	5	Intergenic	novelGene_132704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	227.476372399421	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	14	493	507473	498657	FALSE	30	TTTCCTGGAGAAAAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVKMAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSVSIIRCI	507486	497102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_498763_499497_499621_501763_501897_503182_503260_507432
531670	contig_14441_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_100377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.824776566424	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	583	1011	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	30629	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_30708_30849_31145_112604_112665_116578_116963_117220_117344_117539
531671	contig_2703_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_101755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	134	406	567424	567696	NA	85	AAAAAAAAAAAAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHSPTPTEVRPLGIDYQISSDCFYFFNSVSELRLFLYSFFPFFMFSRQPPNLHRSSFDFFYPKSLIRRAGRSSSLQVRTVWLGIAVLGPRLLLLFLPLLLSPHNLSGSCGGQMLSLTPRRAPHLLIPAVSSSN	567290	569875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_567300_569900
531672	contig_3584_pilon	+	1355	5	Intergenic	novelGene_108185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	1419.56278480383	5130	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	387	1208	530275	531381	FALSE	10	GACTCATTTCTGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYSKALQRTSRNLCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	528391	531528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_528477_528774_528877_529607_529683_530150_530318_530602
531673	contig_13592_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_33742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATGCTGCCTACGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301683	302120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_301700_302100
531678	contig_6710_pilon	-	420	2	Intergenic	novelGene_98237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	AGGCCTCTGGCCCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531679	contig_3602_pilon	-	1457	10	Intergenic	novelGene_60661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	283.559299870785	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	229	804	1113579	1106687	FALSE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139470	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119196_1139295
531680	contig_11594_pilon	-	2238	10	Intergenic	novelGene_80931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTCATTCGTAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568810	540513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_540564_543388_543491_548947_549014_552855_552960_560271_561100_563010_563102_563558_563656_566671_566776_567338_567455_568130
531681	contig_12279_pilon	+	1084	5	Intergenic	novelGene_50097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2265.21422827952	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	63	581	68297	77128	FALSE	20	TGACTGAGATCTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVAGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57540	77631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_71633_71711_75031_75096_76928
531682	contig_10496_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_59420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.601055923321	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	44	1687	64679	38323	FALSE	25	CTTTCCAAAGTTGCATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEMLNL	64722	37993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_38339_38921_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
531685	contig_11279_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_136523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGTTAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5617	6894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11279_pilon_+_5600_6900
531686	contig_14890_pilon	-	1666	9	Intergenic	novelGene_122522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_8	1190.62031495141	192	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	309	1124	370199	366814	FALSE	0	TGCTTTTGTCTGTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371217	366271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370322_370376_370981
531687	contig_5643_pilon	+	908	7	Intergenic	novelGene_39135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGATGTCATAGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646257	650529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490
531689	contig_9180_pilon	-	2235	2	Intergenic	novelGene_109120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCTACTAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491033	485389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_485968_489376
531690	contig_20602_pilon	-	1716	11	Intergenic	novelGene_133711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	298.580374438777	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	371	1366	24969	10026	FALSE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEQDGWGRGWSHSGAATSFSPGSRHLGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29563	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_29483
531691	contig_19342_pilon	+	1128	5	Intergenic	novelGene_41118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.08220700148449	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	65	541	4349	6183	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	4284	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
531692	contig_7457_pilon	-	2409	5	Intergenic	novelGene_31571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	15.5463018110418	391	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	522	995	923479	922396	FALSE	0	GTTTCCCTTCCCTCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVTIVVLGNKCDLQEQRRVDPDVAQHWAKSEKVKLWEVSVADRRSLLEPFIYLASKMTQPQSKSAFPLSRKNKGSGSLDG	925110	920981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_922636_923245_923488_923761_924016_924302_924384_924932
531693	contig_2988_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_136548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAATGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95406	95810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_95400_95800
531694	contig_6102_pilon	+	505	6	Intergenic	novelGene_31956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1222.8278047215	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	42	368	413086	416047	FALSE	25	ATAAACTTGTTCTCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414272_414650_414788_414877_414956_416018
531698	SIRV6	+	274	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	819	0	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11056	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11100_11300
531699	contig_14483_pilon	-	1474	4	Intergenic	novelGene_133739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	22.8958996814325	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	277	1473	14197	11524	FALSE	25	GTTTGTAATACTTGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPFGDAFRSHTFSEQTLMSTDLLANSSDPDFMYELDREMNYQQNPRDSFLSLEDCKDIENLESFTDVLDNEGALTSNWEQWDTYCEDLTKYTKLASCDIWGTKEVDYLGLDDFSSPYQDEEVISKTPTLAQLNSEDSQSVSDSLYYPESLFSVKQNPFPSSFPGKKITSRAAAPVCSSKTLQAEVPLSDCVQKASKPTSSTQIMVKTNVYHNEKVNFHVECKDYVKKAKVKINPVQQTRPLLSQVHTDAAKENTCYCGAVAKRQEKKGMEPLQGHATPALPFKETQELLLSPVPQDGPGSIAAGESSSLSASTLVSDSSQKKEEHNYSLFVSDNMGEQPTKCSPEEDEEDEEDVDDEDHDEGFGSEHELSENEEEEEEEEDYEDDKDDDISDTFSEP	39234	11522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_12610_14086_14213_16422_16616_39166
531700	contig_6735_pilon	-	2049	10	Intergenic	novelGene_15666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	676.611984654261	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	960	1856	545229	542177	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFHQYFSTYRPPSSPLPSSLLLDISLIPIAPSSLSLSPPSPKTTLILFAVSEASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVILHECFL	552862	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542198_542559_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840
531701	contig_15991_pilon	-	1145	7	Intergenic	novelGene_70895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3245.72818828414	308	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	708	1076	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106358	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103841_105001_105142_106315
531702	contig_17274_pilon	-	2089	16	Intergenic	novelGene_26485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	843	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80309	30815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_31346_36252_36336_41795_41856_42654_42711_47231_47294_51701_51784_54320_54383_69749_69855_73732_73876_74917_74966_76378_76418_77044_77166_77891_78000_78278_78360_78575_78718_79942
531703	contig_9345_pilon	-	1543	4	Intergenic	novelGene_24670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1568.08276425562	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCAACTACTAATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001326	946919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_955272_955356_997013_997093_1001156
531704	contig_6576_pilon	-	1895	12	Intergenic	novelGene_42228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	75.3999802705106	890	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	29	1282	261331	229661	TRUE	80	AAAAGAAAAAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGRCESGKMAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKVRSPKDVLGVGWGKGCVEGLAFAPHGPCWKALKPLSGEWGPWAQSWSFIVAVLFLVHSP	261359	228758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_229239_229527_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
531706	contig_5538_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_23708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255245	254856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_-_254900_255200
531707	contig_5337_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_136556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	0	336	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	233	1576	322179	320836	FALSE	15	CATTTGTGTGTGTATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	330306	319671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_322308_330202
531708	contig_8138_pilon	+	2018	5	Intergenic	novelGene_52419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	219	674	280295	306552	TRUE	10	CTTCTTAGTAGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306902_306940
531709	contig_2069_pilon	-	3271	9	Intergenic	novelGene_23227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_8	78.4183492557705	729	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	199	1122	260390	236896	FALSE	20	ACTCTCAAGTGTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALYACTKCHQRFPFEALSQGQQLCKECRIAHPVVKCTYCRTEYQQESKTNTICKKCAQNVQLYGTPKPCQYCNIIAAFIGNKCQRCTNSEKKYGPPYSCEQCKQQCAFDRKDDRKKVDGKLLCWLCTLSYKRVLQKTKEQRKHLSSSSRAGQQEKEQYSRLSGGSHYNSQKTLSTSSIQNEIPKKKSKFESITTNGDSFSPDLALDSPGTDHFVIIAQLKEEVATLKKMLHQKDQMILEKEKKITELKADFQYQESQMRAKMNQMEKTHKEVTEQLQAKNRELLKQAAALSKSKKSEKSGAITSP	260588	234746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_236983_237518_237621_241276_241413_246539_246627_249487_249646_253829_253983_254717_254773_258947_259013_260309
531711	contig_14925_pilon	-	1001	5	Intergenic	novelGene_55111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	1552.3328211115	69	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	206	463	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STNKFIFGAGTRLQVFPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	69605	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_69552
531714	contig_2341_pilon	+	2755	4	Intergenic	novelGene_84356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	55.5397755366968	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGAAAAAAAAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129057	159591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129631_147326_147451_149686_149728_157574
531717	contig_7151_pilon	+	3096	5	Intergenic	novelGene_40643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1950	2345	5845	6240	TRUE	50	AAAATCTTGTCAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHRVAGRPRKCFWRQTHISFSISPLSCPSTHQSTSLQHPPRAYSCSAPRAAQHRPTGKTPCLCTAPRPARCSHFLGQMQPPAGLPGQSHSPAADTPPRPLPGSRSRHTLCPRSRCAKSPLALSMWCLLP	1818	13178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2089_3098_3248_4314_6262_6348_6388_12487
531718	contig_3818_pilon	+	2216	14	Intergenic	novelGene_99239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	393.994112832597	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	724	1845	451626	455535	FALSE	0	CCGTTTTCTTCTGTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	424891	455906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_425010_425468_425633_427646_427819_428719_428913_429408_429483_451623_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
531719	contig_6710_pilon	-	414	2	Intergenic	novelGene_98242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531721	contig_17936_pilon	+	1641	9	Intergenic	novelGene_29919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	812.612521054777	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	56	1339	50646	118830	FALSE	45	GCAAAGCTATACTAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKK	50590	119132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635
531722	contig_17470_pilon	-	2066	12	Intergenic	novelGene_110522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_11	55.6304215484019	15	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	365	1582	277306	270076	FALSE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPETSHFLQRDQAAIPERTLTALLLSPGRHGQAAAGPKAGWARQKPMGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302701	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_277162_277325_302355
531723	contig_7963_pilon	-	1600	6	Intergenic	novelGene_58275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1488.61178283661	103	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATACTTATACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48924	35261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_35990_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
531724	contig_11548_pilon	+	1412	5	Intergenic	novelGene_66774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	219	809	112832	119638	FALSE	20	GGCTAATGGCTCCATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112613	120241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
531725	contig_9609_pilon	-	3241	4	Intergenic	novelGene_23106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	44.1008944227766	224	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1882	2451	507907	506367	FALSE	15	ATACTGCTGCTTTTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNKDGSYTGFIKVQLKLVRPVSVPSSKKPPSLQDARRSPVRGTAVRRRTSFYLPKDAVKHLHVLSRTQAREVIEALLRKFLVVDDPRKFALFERAERHGQVYLRKLSDDEQPLRLRLLAGPSEKALSFVLKENDSGEVNWDAFSMPELHNFLRILQREEEEHLRQILQKYSCCRQKIQEALHACPLG	509788	505576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_506514_507150_507267_507390_507689_507898
531726	contig_2087_pilon	-	1790	2	Intergenic	novelGene_65564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTTCAATCTGAAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71631	69110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_69262_69992
531729	contig_7839_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_45715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCAAGAAAAAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936172	935822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_935800_936200
531730	SIRV6	+	1049	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	39	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
531731	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	584	14	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	35	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531734	scaffold_7386_pilon	-	2167	11	Intergenic	novelGene_136585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	59.5049577766424	372	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	53	1345	309042	297334	FALSE	5	GGGAGCCTCTCTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHAAAAAAGWLVSKEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKRIWAALSAPWRIGSLMGQTRSLPCLPTFTLSSWGAGQEEASRDPPRPLEAPNPAPLAPSVRTPAAGHTPRLRERAPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEIQPGPSESSTAYLLMYRRESLGPTR	309094	296511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_297890_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308577_308800_308864
531737	contig_2733_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_128560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTCCACTGGTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573803	574961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_573800_575000
531738	contig_12638_pilon	+	1927	11	Intergenic	novelGene_33243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.2	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	596	1876	746493	764546	FALSE	5	TTGTCCATTGTGTCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737315	764597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739572_745083_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_762088_762211_764045
531744	SIRV6	+	991	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	437	751	2021	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1642_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
531749	contig_15063_pilon	+	1309	4	Intergenic	novelGene_14264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	346	1167	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34813	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531753	contig_8729_pilon	+	1902	4	Intergenic	novelGene_40103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	20.5480466765633	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGACGTTTTATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276499	323858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_322203
531754	contig_854_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_36252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1415.22162575337	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	102	734	543600	563353	FALSE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTVCRPTRYPGRPVPPAHEAAETLLQHPLGVALQPSQPDGSDPPGLLRKARWCPSWPRSPLPVVFFSSWLQSLVDVFFVLEAGVNLQALRPNPLCSRLPRGKKGSPRIQYATLMLLQSLLAASCGSIYPFTLVPPSA	543498	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556217_562336_562405_563029
531755	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_18712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGGAGCTCCACGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
531756	contig_21388_pilon	-	785	5	Intergenic	novelGene_136635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	233	583	26799	21603	FALSE	20	TTAATAACCTGCGTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28419	21400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
531757	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531759	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_89064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531760	contig_15063_pilon	+	1430	4	Intergenic	novelGene_14186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	127	1299	34808	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34681	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531761	contig_14441_pilon	+	1121	5	Intergenic	novelGene_100597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.649295973133	10235	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	389	649	116728	117123	TRUE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	111201	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113661_113711_116578_116963_117097_117344_117539
531762	contig_15063_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_11159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	232	1410	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
531763	contig_8978_pilon	-	1444	8	Intergenic	novelGene_49334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	792.846486414872	3252	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	20	1141	194082	190773	FALSE	25	TAAGAATGTCTGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194101	190469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
531764	contig_3077_pilon	-	1450	7	Intergenic	novelGene_26709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAAAGGTTGACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18083	10104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_10203_11274_11476_12010_12071_13020_13169_15135_15262_16144_16332_17453
531765	contig_4857_pilon	+	2460	23	Intergenic	novelGene_48657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	113.512914763836	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	64	1161	1015035	1084195	TRUE	15	AGACCCCTTCGTATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWNQVQQLEIKFLEQVDQFYDDNFPMEIRHLLAQWIENQDWEAASNNETMATILLQNLLIQLDEQLGRVSKEKNLLLIHNLKRIRKVLQGKFHGNPMHVAVVISNCLREERRILAAANMPVQGPLEKSLQSSSVSERQRNVEHKVAAIKNSVQMTEQDTKYLEDLQDEFDYRYKTIQTMDQVDKNSVLMNQEILTLQEMLNSLDFKRKETLSKMTQIINETDLLMNSMLIEELQDWKRRQQIACIGGPLHNGLDQLQNCFTLLAESLFQLRRQLEKLEEQSTKMTYEGDPIPLQRTHLLERVTFLIYNLFKNSFVVERQPCMPTHPQRPMVLKTLIQFTVKLRLLIKLPELNYQVKVKASIDN	1012030	1109807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039_1077126_1077750_1077903_1079777_1079937_1080626_1080720_1083743_1083804_1084191_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107876_1107986_1109630
531766	contig_4305_pilon	+	1784	9	Intergenic	novelGene_136657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	383.636363468063	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	492	1361	498575	504013	FALSE	20	CATACTTTTTGGTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRQRAQERKNEEMEVMEVEDEGRSGEESESESEYEEYTDSEDEMEPRLKPVFIRKKDRVTVQEREAEALKQKELEQEAKRMAEERRKYTLKIVEEETKKELEENKRSLAALDALNTDDENDEEEYEAWKVRELKRIKRDREDREALEKEKAEIERMRNLTEEERRAELRANGKVITNKAVKGKYKFLQKYYHRGAFFMDEDEEVYKRDFSAPTLEDHFNKTILPKVMQVKNFGRSGRTKYTHLVDQDTTSFDSAWGQESAQNTKFFKQKAAGVRDVFERPSAKKRKTT	490453	504436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_490619_496273_496494_498155_498225_498537_498742_499264_499374_499476_499638_501232_501393_503641_503732_503830
531767	contig_6215_pilon	+	3167	7	Intergenic	novelGene_21233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	312	junction_1	172.928694360807	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2516	2959	592959	600051	FALSE	30	TACCTGTTAGTAGAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCPGRPVNSLFVAPAVTPVRSVLQKETNNPGVRLFQYDPRDYQLLDMLQYYLNLTEANMKGESNWKLEYILTQAYDIKDLQPESLYGLAKQFAVLDSKQFIKYYNYFFVSYASSAICDEKCKAFQICAVMNLDHVSYADCLKQFYI	571268	600259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571455_582748_582963_584025_584171_588153_588251_590620_590791_591255_593097_599745
531768	contig_3095_pilon	+	1246	5	Intergenic	novelGene_74997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	7	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
531775	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
531776	contig_9471_pilon	-	2201	7	Intergenic	novelGene_21830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTCTAAAGAAAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417514	412516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414084_414633_415714_416192_416271_416934_417026_417150
531777	contig_12993_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_136726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCAGGCAACCACTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77249	77480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_77200_77500
531778	contig_5696_pilon	-	2261	5	Intergenic	novelGene_117583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTCTTCAAGCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739592	732031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_732064_732416_732505_732629_732787_734428_734592_737771
531780	contig_3161_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_84532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGGTTGTTTAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484090	483378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_483400_484100
531781	contig_9527_pilon	+	2165	8	Intergenic	novelGene_134059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.39122950009	1416	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	239	838	480444	482156	FALSE	20	TATTGGATTCTGACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPRRSLASPTRGKGSARGCGRSRTTLPSRLLATSPPPSCTEPCLPGQWVCPRANPTESSQKKRRVEEPEPEPEPEATEGDGDKKGNAEGSSDEEGKLVIDEPTKEKNEKGTLKRRTGDLLEDSPKRPKEAEDPEEEEKESGTLEGERPLPVEMEKNSTPSEPGSGRGPPQEEEEEEEEEEAAKEDAEAPGIRDHESL	473659	483483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_473679_473880_473991_480170_480248_480411_480551_480996_481067_481218_481411_481734_481959_482149
531782	contig_4868_pilon	+	3627	12	Intergenic	novelGene_136751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	222	junction_5	84.5985170727542	526	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	178	1608	16777	33051	FALSE	50	AGGTGAATAAGTGACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIKFLEVIKPFCVILPEIQKPERKIQFKEKVLWTAITLFIFLVCCQIPLFGIMSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKLFGMIITIGQSIVYVMTGMYGDPSEMGAGICLLITIQLFVAGLIVLLLDELLQKGYGLGSGISLFIATNICETIVWKAFSPTTVNTGRGMEFEGAIIALFHLLATRTDKVRALREAFYRQNLPNLMNLIATIFVFAVVIYFQGFRVDLPIKSARYRGQYNTYPIKLFYTSNIPIILQSALVSNLYVISQMLSARFSGNLLVSLLGTWSDTSSGGPARAYPVGGLCYYLSPPESFGSVLEDPVHAVVYIVFMLGSCAFFSKTWIEVSGSSAKDVAKQLKEQQMVMRGHRETSMVHELNRYIPTAAAFGGLCIGALSVLADFLGAIGSGTGILLAVTIIYQYFEIFVKEQSEVGSMGALLF	16599	35070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_16784_17048_17117_18910_18977_19068_19148_20572_20705_22651_22762_23065_23220_28720_28882_30280_30479_30718_30911_31262_31340_32864
531783	contig_3948_pilon	+	2036	4	Intergenic	novelGene_53386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	100.963139588444	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	356	868	1813956	1860868	FALSE	25	TGAACAAAGGGTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813341	1862036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814331_1860434_1860571_1860866
531784	scaffold_12124_pilon	-	1121	4	Intergenic	novelGene_22347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACACAGATACACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508739	1483744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1483964_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
531786	contig_8069_pilon	+	1866	12	Intergenic	novelGene_136774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	87.2613628964472	479	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	687	1757	429472	513395	FALSE	15	TGAGCTTTTTATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRTRDFPWTTTFSMLYVDNPVGTGFSFTDDPRGYAVNEDDVARNLYSALIQFFQLFPEYKENDFYATGESYAGKYVPAIAHYIHTLNPMAELKINLKGIAIGDAYSDPESIIGGYAAFLYQIGLLDEGQQKYFQNQCDECLKHIKQGNWTKAFEILDRLLDGDLTDEPSYYENVTGCTNYYNFLQCTEPEDHTYYGKFLSLPEVKQILHVGNRTFNDGSEVEKYLREDTMKSVKPWLAEIMNNYKVLIYNGQLDIIVAAPLTERSLMAMDWKGSQEYRTVEKKVWKVFKSDDEVAGYVRQVGDFHQVIVRGGGHILPYDQPLRSFDMINRFVFERGWDPYDEQITLLKDHFRGF	411123	513504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_411583_411726_411846_429363_429479_430568_430628_432622_432703_440137_440205_455951_456075_456429_456562_465445_465545_467101_467276_486785_486969_513248
531788	contig_14513_pilon	-	1208	2	Intergenic	novelGene_70315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	189	353	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19068	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
531791	contig_4780_pilon	-	1883	11	Intergenic	novelGene_65398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	111.635343865641	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	313	1077	419817	322013	FALSE	75	TTTAAAAAAAAAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLGQGPPTDAPAVDTAEQVYISSLALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKHVQSKGE	428891	321206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_322037_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_419799_419852_422134_422262_428740
531792	contig_11396_pilon	-	1991	8	Intergenic	novelGene_71276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	699.236814283244	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	70	690	249053	232299	TRUE	20	GAAAACCCTCTTCGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249122	230862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_231981_232115_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
531793	contig_7272_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_25297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCAACTCATTACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348341	349720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_348300_349700
531794	contig_11088_pilon	+	833	5	Intergenic	novelGene_85028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.331791652406	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12334	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_12445_13625_13696_14663_14937_16250_16348_17119
531796	contig_5229_pilon	-	2767	10	Intergenic	novelGene_117712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	25.7854394744183	230	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1432	2283	655675	652839	FALSE	20	AAGGATTGTTTCTGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGCFLIPSRQTPRTSHWFRATLGSHRSTPYSAYNPETYAGYWKQLTVRTSRRGQAMAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657588	652354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655474_656307_656546_657083_657324
531797	contig_3081_pilon	+	2683	8	Intergenic	novelGene_133938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.0639841599416	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	458	1219	240012	252540	FALSE	5	GCTTTCTGTGGCTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPSNMWVEAWETAKPIPARRQRRLFDDTREAEKVLHYLAVQKPADLARHLLPCVIHAAVLKVKEEESLENISSVKKIIKQIISHSSKVLHFPNPEDKKLEEIILQITIVEATIARARSLKAKFGTEKCEQEEEREDLERFVSCLLEQPEVLVVGAGQGHAGRIVHKLFVNAQRAATMAPPEEDLKRMGSPEERRQNSSSDFPPPAGRELILRTTVPRPAPYSKALPQRMYSVLTKEDFRLAGAFSSDTSFF	226007	254004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_226244_236013_236152_239928_240117_246409_246507_246603_246708_246840_246957_248590_248694_252303
531799	contig_5485_pilon	-	2786	14	Intergenic	novelGene_37745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	109.019514023269	328	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	474	1334	469101	459244	FALSE	0	CGGGGTTCCTGTTTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVRDAIPVSLRVPGVQPFALRLPEGELPSRETFPACVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	478726	457791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_477655_477690_478648
531800	contig_854_pilon	+	1294	6	Intergenic	novelGene_36297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	8	junction_1	3056.5713732874	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	89	535	556108	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPAFSSVTPPTPSRESTSPLFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	545923	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_545987_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
531801	contig_10235_pilon	-	2101	19	Intergenic	novelGene_46398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	98.7449014154936	20	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	31	1806	192397	177938	FALSE	5	TTTTTTCTACTGGCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLLSCVLGPRLYKIYRERDSERTPSGVPEPPTTVTTPSSSSWDTYYQPRALEKHADSILALASVFWSISYYSSPFAFFYLYRKGYLSLSKVVPFSHYAGTLLLLLAGVACLRGIGRWTNPQYLQFITILEATHRNQSAENKRQLSKYNFDFRSWPVDFHWEEPSSRKESRGGPSRRGVALLRPEPLHRGTADTFLNQVKKLPCQITSYLVAHTLGRRMLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLVSSGIGSRKKVLEWQLPWSGWWAQRAGAGQDVHAAAPHSTLHLTHSTRPLSSGSEASAQL	192427	177642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_190402_190470_191199_191257_192265
531802	contig_19579_pilon	-	1641	8	Intergenic	novelGene_59383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	654.794187948724	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	86	874	13090	7943	FALSE	65	AAATAAAAAAAATCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13175	7175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12152_12202_12262_12900
531804	contig_8156_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_98923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGGTATAAAAAGAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264771	266273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_264800_266300
531807	contig_8772_pilon	+	1820	8	Intergenic	novelGene_21100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4118.83932531424	6	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	132	1382	15355	21966	TRUE	35	AAAAAACTCTTGCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESSLLCFFI	15223	23415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21944_22053_23063
531808	contig_7932_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_128429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215844	216708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_215800_216700
531809	contig_5019_pilon	+	2056	2	Intergenic	novelGene_109182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	FALSE	15	ATTGTGAGTTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
531810	contig_6589_pilon	+	1764	4	Intergenic	novelGene_25762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	1807.89865743508	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCTGACTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668287	672845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_671188_672584
531811	contig_5210_pilon	+	2040	5	Intergenic	novelGene_65476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	126.662938541627	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2	484	808847	812511	FALSE	20	CTTAGAGTGTATGTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	808845	814067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_808988_810095_810222_811638_811756_811831_811894_812474
531813	contig_14618_pilon	+	2672	7	Intergenic	novelGene_136792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	70.1128059312673	24	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAAGCCCTCTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296048	312420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_301268_301362_308232_308497_308603_310212_311984
531814	contig_18916_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_136874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAACAATACACTCTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20721	21311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_20700_21300
531815	contig_11285_pilon	+	2105	12	Intergenic	novelGene_5630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_1	459.873590248738	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	427	1782	767140	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766065	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
531816	contig_2100_pilon	-	826	8	Intergenic	novelGene_50770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	902.263321897115	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	290	826	1180199	1174362	FALSE	20	TCTGACAAGGTGGTGATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGY	1185525	1174361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182723_1182822_1185420
531817	contig_15304_pilon	-	1550	6	Intergenic	novelGene_30424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	37	junction_5	1510.34949597767	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	465	1424	54100	49864	TRUE	40	CAAAAGCCAAACTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	57774	49413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991_54295_57504
531819	contig_14326_pilon	-	2756	1	Intergenic	novelGene_120775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGACAAGCAATTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819727	816971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_817000_819700
531820	contig_5020_pilon	-	1510	9	Intergenic	novelGene_27867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	540	887	124926	123330	TRUE	15	GCTTGCAGAGGGGTCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126087	118467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118568_119477_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656_125712_125766
531821	contig_13123_pilon	-	2072	5	Intergenic	novelGene_136893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGAGCGCGCGCCGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446115	434381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443548_444544
531822	SIRV4	+	1503	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	7	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGTCGTCGCTCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1864_2371
531823	contig_21422_pilon	+	1492	7	Intergenic	novelGene_79073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_3	79.0557117199988	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	190	1083	4766	12180	FALSE	55	GAAAAAGAAAAAATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSPPGEGKATVPCLAERLTTELIVHIQKSLPLLEHQIIDSHQRATEELRRCGADVPDRETDKMFFLIEKIQTFNRDIEKLTEGVEAVKENEMRLYNQIRNEFKTWGLILAANTQKVRNIVHEEVSKYENQYRGKELPGFVNYKTFEAIVRHYIQQLVDPALDVLQKVTEIVRQAFTGMAKNNFGEFANLNQTAQTMIEDIKVKQAETAENVIQLQFRMEQLVFCQDQIYKMILNKIQEEMFNPLENTPQVFQMKKSNLFDTNVSDPSTSSITEIGVHLNAYFTETSSRLANQIPLIIQFFLLQENGDCLQRSMMQLLQEKERYVWLLQEEREMATKRRLLKERIYRLTQARHTLSQFST	1643	12589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_1728_4660_4784_5064_5207_6749_6909_7537_7615_9620_9888_11949
531824	contig_18194_pilon	-	1636	5	Intergenic	novelGene_55944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	19	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	128	1147	18897	3836	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSIPMI	20413	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_3849_4651_5501_7034_7162_18866_18976_20364
531825	SIRV6	+	823	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	271	585	2021	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
531826	contig_15063_pilon	+	1315	4	Intergenic	novelGene_14257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	8	1180	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34800	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531827	contig_16098_pilon	-	1434	8	Intergenic	novelGene_46124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2095.81098228571	6	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	209	1228	458816	456273	FALSE	5	GGGAGTCTGTTGTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQVGMVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460335	456066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457548_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
531828	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531833	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27135	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531834	SIRV4	+	452	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	22	476	22	-476	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCACTCCAACTGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	2295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
531839	contig_14219_pilon	-	2113	12	Intergenic	novelGene_54371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	987.985026821328	4	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	101	700	1084399	1057776	TRUE	30	AGACAGTGCTTTATGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPGGGGGGSLSVSSREERTQGGAPAGTGGGPTMAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTGFMLFPNSTSRKPKKRIFLVSLSTLVFTFFTLPELIF	1084499	1046292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1046671_1046711_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068432_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
531840	contig_12057_pilon	+	2391	21	Intergenic	novelGene_131631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	47.784516320666	269	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	64	1977	121149	161653	FALSE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKEIQDRKLSVLAGQLQCDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99500	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_160908_160951_161524
531841	contig_7202_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_18563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTCTATAAATTGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
531843	contig_15063_pilon	+	1428	4	Intergenic	novelGene_14199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	114	1286	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34694	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531844	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
531845	contig_7035_pilon	+	3814	1	Intergenic	novelGene_83525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCATTCTGCACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300269	304083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_300300_304100
531846	contig_9727_pilon	+	1975	14	Intergenic	novelGene_86249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_11	114.763610916233	1115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	137	1378	4844	20134	TRUE	10	GACTGTTGTTACGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISTPVDINNRDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACSIALDAVKTVQFEESGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIASRPEELREEDVGIGAGLLEIKKIGDEYFTFITECKDPKACTILLRGGQQRDSFGSRTQPPGCYASVSQRPSGPSAGARGWGL	4707	21383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_4872_7376_7439_8182_8234_8327_8391_8706_8804_12793_12912_14765_14953_15673_15824_17193_17327_17519_17602_19150_19333_20045_20292_20547_20680_21075
531847	contig_8412_pilon	+	2816	19	Intergenic	novelGene_118385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_9	22.3029782653836	320	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	27	2384	684930	715040	FALSE	15	GATGCCAGTGTGCTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLESPQKLSGAPPPPEGVGGSRCSEISTELIRSLTELQELEAVYERLCGEEKVVERELDALLEQQNTIESKMISLHRMGPNLQLIEGDAKQLAGMITFTCNLAENVSSKVRQLDLAKNRLYQAIQRADDILDLKFCMDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEGIARIVETHQPIVETYYGPGRLYTLIKYLQVECDRQVEKVVDKFIKQRDYHQQFRHVQNNLMRNSVTEKIEPRELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	684903	715472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711_686795_687497_687613_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694544_694703_695820_695880_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
531849	contig_14528_pilon	-	2272	11	Intergenic	novelGene_111271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_5	92.510593987932	489	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	14	973	201850	196884	TRUE	0	TGGTTCTTTGCCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQVPKVSSQPPSPWTSLPLCPPVSPALVSPGQ	201863	190722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
531850	contig_12079_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_67413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGACCTTGAATTTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541001	539968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_540000_541000
531852	contig_1331_pilon	-	1106	4	Intergenic	novelGene_37827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3563.14505271209	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	360	404	160053	160009	TRUE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	166524	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159381_159438_160214_160867_160949_166406
531853	contig_12624_pilon	-	1756	5	Intergenic	novelGene_61104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	214	519	952979	948779	TRUE	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955852	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947583_947645_948842_950590_950768_952913_952985_955644
531854	scaffold_12124_pilon	+	1994	10	Intergenic	novelGene_21986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	194.844350669077	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	435	1277	803880	810992	FALSE	15	TAATTTGTTGCTGTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGECAQSALKKEKPAPSTSMYWWSWGPSSAPCSLGFFLKGLKTDTRELKTDTWAPRFMAALFIIDRRWKQPSVSQQTNGYTRWGPSTQRNMPQP	791828	811709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_803856_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809967_810647_810745_810825
531855	contig_10734_pilon	-	2531	13	Intergenic	novelGene_50977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	38.0397270407312	137	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	245	1051	278533	266433	FALSE	35	TATAATAATTTCAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGNSHLFMNRSNRLAVIASHIHESRFLYPGKNGRLGDFFGEAGNPPSEFNPSGSKDGKYELLTAANEVIAEEIKDLMTTSDIKGQHMETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPIHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKVSA	281265	264952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_266503_266582_266620_266733_266870_267699_267769_270919_270974_271980_272056_273753_273783_273933_273964_275096_275160_276523_276691_278456_278564_279918_279999_281131
531856	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
531857	contig_1141_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_136913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAATATAAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340957	338085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_-_338100_341000
531858	contig_6710_pilon	-	439	2	Intergenic	novelGene_98230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531859	contig_9345_pilon	-	1596	15	Intergenic	novelGene_24499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	263.594888619113	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	48	1553	671829	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671876	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669383_669421_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
531860	contig_8914_pilon	+	905	6	Intergenic	novelGene_112876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	307	627	265577	267418	TRUE	25	GACGGAAGTGCAACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264566	268967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264951_265501_265799_267319_267508_268075_268179_268881
531861	contig_4125_pilon	-	2354	17	Intergenic	novelGene_25071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_10	23.0419963056589	101	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	336	2138	469722	454981	FALSE	5	CCTCTGCGCTTTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIRVTPLGAGQDVGRSCILVSIAGKNVMLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTPPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPDAKKPRLLQGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDARKEQETVMRVYSHLKSILKDHCVQHLPDGSVTVESILIQAAAHSEDPGTKVLLVSWTYQDEELGSYLTSLLKKGLPQAPS	470057	454764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_469694
531862	contig_7119_pilon	+	2415	3	Intergenic	novelGene_40959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	112	1266	137033	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127546	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
531863	contig_12873_pilon	+	1202	5	Intergenic	novelGene_27211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1321.15259811272	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	137	628	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16094	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16177_17841_18014_18984_19264_19611_19703_19851
531864	contig_15063_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_10987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	7	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531868	contig_3602_pilon	-	1454	10	Intergenic	novelGene_60644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	292.469857051886	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	48	641	1139393	1108699	TRUE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEHWLSRSMRSCSPPSPTPASAS	1139440	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1111740_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
531870	contig_3181_pilon	-	3113	8	Intergenic	novelGene_136936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_4	82.5533840886598	14	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	92	628	322396	316329	TRUE	25	CATTGTGAAGTTGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPSPQTKPSNPSNPRVFFDVDLGGERVGRIVLELFADIVPKTAENFRALCTGEKGIGPTTGKPLHFKGCPFHRIIKKFMIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFYYKHDQEGLLSMANAGPNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGMGVARILENVEVKGENPAKNAEN	322487	310256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_310504_311292_313332_315990_316098_316236_316344_317405_317595_319464_319572_320966_321108_322311
531871	contig_15063_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_11469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
531872	contig_3602_pilon	+	2253	6	Intergenic	novelGene_60494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1292	junction_1	440.7209548002	16	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	125	574	161745	169451	FALSE	10	GACTTGGCTCCACCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161620	171130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422
531873	contig_9127_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_103007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151172	153226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_151200_153200
531874	contig_21203_pilon	-	1085	7	Intergenic	novelGene_84491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATGATCAACCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122161	93224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_-_93351_102795_102887_105780_105964_106204_106364_108205_108377_120208_120372_121969
531875	contig_7135_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_136950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTATATCCTCTATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253734	253374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_253400_253700
531879	contig_177_pilon	+	2098	3	Intergenic	novelGene_41804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	101	1177	417672	418748	TRUE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPPPFHWPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415630	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419523_420000
531880	contig_5758_pilon	-	1694	2	Intergenic	novelGene_119098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	238	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATAAAGTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215598	212919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_213895_214879
531881	contig_15384_pilon	+	2897	8	Intergenic	novelGene_85126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	30.7743598550773	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	720	1346	83878	84679	FALSE	30	TAAAAGATGCTTCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLTSAHSYSCSPRPLRRRSSLSWPKRGSYMPWNCRVRQGGHRVGVVCGWAEPPDASFSAGFWMDIGQPKDFLTGMCLFLQSLRQKQPERLCSGPGIVGNVLVDPSARIGQNCSIGPNVSLGPGVVVEDGVCIRRCTVLRDAHIRSHSWLESCIVGWRCRVGQWVRMENVTVLGEDVIVNDELYLNGASVLPHKSIGESVPEPRIIM	82498	86230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_82598_82707_82842_82959_83041_83130_83180_83318_83463_83665_84190_84280_84464_84547
531882	contig_11720_pilon	+	1861	15	Intergenic	novelGene_43931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	334.153430786102	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	13	1668	262271	272210	FALSE	35	TGTAAAGCACTTTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINNSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267855_269830_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
531883	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531884	contig_11832_pilon	-	1801	15	Intergenic	novelGene_106943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	744.484563510972	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	50	481	92410	87289	TRUE	20	ATAGGCATGAGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPNAQPTPAPDPPAGPAAEEAGPACPPLFFSQYPRICLALSPCSQAQRTRGRPAG	92459	83804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86774_86930_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
531885	contig_7202_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_18333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27935	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
531886	contig_15063_pilon	+	1313	4	Intergenic	novelGene_14259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	4	1176	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34804	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531887	contig_12279_pilon	+	1153	6	Intergenic	novelGene_50084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1613.69823696997	2198	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	86	655	68297	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKLDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57517	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75063_76928
531888	contig_233_pilon	-	1736	8	Intergenic	novelGene_14546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1060.46807147233	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	415	1296	93993	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	99848	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779
531890	contig_14353_pilon	-	2254	9	Intergenic	novelGene_82144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	188.332111906069	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	739	1278	405634	402843	FALSE	70	TTGTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420309	401866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_406851_407028_407877_407979_409840_409973_414146_414413_420261
531891	contig_15063_pilon	+	1793	6	Intergenic	novelGene_11632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2309.86541599289	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1030	1437	36064	38994	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQSEC	27139	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_35384_35839_36158_36266_36569_38982_39092_39506
531892	contig_7411_pilon	-	2765	4	Intergenic	novelGene_136966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	3.29983164553722	122	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	379	1998	97344	86221	FALSE	20	GTTAATTTTGTACTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVWRDAPPGAPGRSGSPTLCVVGVSVTRISSEGEHSASCTAKMTCSLMFPFSPCQLCHFRFCCSPRSLLRAMFQGSVTFRDVAIDFSQEEWEWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKGDVRRDLFSVSESNSEINEISPKNDIYENDSYQYLIMERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	97722	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_87390_94994_95091_95331_95459_97116
531893	contig_16156_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_137080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	227	358	246974	247105	NA	45	GAATTCTCAAAACTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGESESLSPPTSNKDSPLLRCHWRSSGEPGLLLPLGGIPPPCFIDCAKAFYCVHHNKLWVTLGRVGIPEHLTVLMRKLYLDQEAVVLTEQGDTVWCKSQERCVSGLYPFTLLCMLSR	246747	248980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_246700_249000
531894	contig_5649_pilon	+	2415	7	Intergenic	novelGene_82390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	23.6690139681023	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	749	1438	1086750	1096594	FALSE	20	GTATCTGTCCTTGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARILRPGGCLFLKEPVETAVVNNSKVKTASKLCSALTLSGLVEVKELQRESLSPEGIQSVQEHLGYQSDGLVSVQITGKKPNFEVGSSSQLKFSIAKKSPSVKPAVDPAAATLWTLSVNDMEDDSLDLIDSDELLEPEDLKKPDPASLRAASCGEGKKRKACKNCTCGLAEELEKEKSKEQKSSQPKSACGNCYLGDAFRCASCPYLGMPAFKPGEKVLLSNSNLHDA	1086001	1097571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1086814_1088284_1088362_1089885_1090052_1091407_1091482_1092355_1092472_1095901_1095984_1096483
531895	contig_15063_pilon	+	1089	4	Intergenic	novelGene_14398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_3	3794.36345122604	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	66	857	35271	39538	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	35205	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_39506
531898	contig_9927_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_137101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACTCATCAAAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13663	12664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9927_pilon_-_12700_13700
531900	contig_13412_pilon	+	2575	5	Intergenic	novelGene_80027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	234.769035436959	584	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1	816	735153	739967	FALSE	10	TACTTACTGGGTCCGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQLDSDSDRVGDTCDSNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDNDGVPDDRDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDQDNVPDIDDICPENVDISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAIGFDEFNAVDFSGTFFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEQQGAPARPSLSSGLGSSPGL	735152	741726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_735216_736837_737073_737246_737475_737657_737883_739902
531901	contig_20600_pilon	+	2991	5	Intergenic	novelGene_137113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	55.8457697592217	207	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1119	1619	112379	117548	FALSE	10	GGCCTAATTTTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMSTALCSRGRVIGLKEEPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111260	118920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_112446_114085_114161_114959_115049_116223_116332_117386
531903	contig_9014_pilon	-	2217	10	Intergenic	novelGene_106717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	84.638811399155	463	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	834	1655	43493	41867	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51634	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44535_44785_45016_46504_46693_51551
531904	contig_9727_pilon	-	2718	2	Intergenic	novelGene_86344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGATCTTTCAGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432838	428848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_429431_430702
531906	contig_16098_pilon	-	1495	8	Intergenic	novelGene_46154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2386.72264404389	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	701	1303	457605	456273	FALSE	35	ACAACTATTGAAGGGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460420	456080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_458405_458618_458704_458823_460163
531908	contig_2069_pilon	+	1822	13	Intergenic	novelGene_23243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	107	junction_12	294.470805947815	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	199	1041	333898	341321	TRUE	30	ATACACATTTACTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323988	347544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_347279
531909	contig_2419_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_137136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181674	179588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_179600_181700
531910	contig_9014_pilon	+	3092	7	Intergenic	novelGene_106718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTAGCTATTTTGGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41305	50626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_43200_43281_43395_43479_43559_44086_44240_44420_45022_46508_46686_50551
531911	contig_6576_pilon	-	2871	12	Intergenic	novelGene_42259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	777.384542728197	1	103	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	35	871	339439	324049	TRUE	30	AAACCTGAAGTTTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIANGWNDATWTRNTTSDAWYATSPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSSGSCPRTCWYRFQAFK	339473	320996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322021_322060_322687_322835_322996_323858_324102_326539_326665_329121_329188_330287_330336_330837_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339404
531912	contig_19579_pilon	-	1348	5	Intergenic	novelGene_59377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	720.123774083317	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	106	576	13090	7943	FALSE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_12900
531913	contig_15304_pilon	-	1418	4	Intergenic	novelGene_30615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	177	1283	66228	64554	FALSE	10	GGAGCCCTGGGCTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66404	64418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
531914	contig_11115_pilon	+	2352	6	Intergenic	novelGene_102814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	582	junction_2	484.47728532925	385	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	1291	2265	171704	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165340	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171981_172339_172595_172714_172964_173047
531917	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_97023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531919	contig_3846_pilon	+	4129	10	Intergenic	novelGene_137145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	60.1738222891723	307	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	78	1829	160547	222044	FALSE	40	TCTACGTATTAAAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAANCSLRVKRPLLDPRFEGYKLSLEPLPCYQLELDAAVAEVKLRDDQYTLEHMHAFGMYNYLHCDSWYQDSVYYIDNLGRIMNLTVMLDTALGKPREVFRLPADLTVYDNRLCASIHFTSSTWVTLSDGTGRLYLIATDERGNNSSKKWEIMFNEELGSPFIIIHSISLLKDEEHSIAALLLRIEKEELDMKGSGFYVSLEWVTISKKNKDNKKYEIIKHEILRGKSVPHYAALEPDGNGLMIVSYKSFQFIQTGQDLEENKNENMSEKIKEPLYYWQQTEDDLTITTQLPEDTTKEDIQVQFLPDHISIVLNGQLFLEGKLYSSVDHESSTYIIKENNSLEISLIKKNEGLTWPELIVGDKQGEFIRDSAQCAAIAERLMHLTSEELNPNPDKEKPPCNAQELEECDIFFEESSSLCRFDGNTLKTTHVVNLGSNEYLFSVIVDPKEMPCFSLRHDVDALLWQPHSSKQDDMWEHIATFNALGYVQASKRDKKFFACAPNYSYAALCECLRRVFIYRQPTPMSTVLYNRKEGRQVGQVAKQQVASLETNDAILGFQATNERLFVLTAKNLFLIKINTEN	160469	224344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_+_160665_173034_173190_184817_185004_189190_189372_192969_193153_196727_196933_202502_202648_206148_206275_219293_219454_221751
531920	contig_2890_pilon	-	3035	7	Intergenic	novelGene_60279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	99.1715685063012	14	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	87	683	316048	307251	FALSE	10	CTTGCTATCTCTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIFEWIYNGFSSVLQFLGLYKKSGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHEQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTGKGNVTLKELNARPMEVFMCSVLKRQGYGEGFRWLSQYID	320490	304898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_307368_308618_308751_312123_312228_315241_315308_315746_315867_315990_316065_320420
531922	contig_10354_pilon	+	2080	5	Intergenic	novelGene_50845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	487.515320272092	2	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	169	627	432370	472049	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVQ	432201	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472062_475056
531923	contig_9239_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_137209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACTTCTATTAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273521	273959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_273500_274000
531924	contig_14513_pilon	-	1293	4	Intergenic	novelGene_70337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
531926	contig_5643_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_38749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156722	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_156700_157300
531927	contig_11512_pilon	-	2403	9	Intergenic	novelGene_43297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.354362607068	2	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	144	503	396169	374638	TRUE	30	CCTAATACGTACGGAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESVFTRCR	409417	366024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367462_367961_368181_368470_368604_374526_374659_378207_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
531929	contig_7151_pilon	-	2304	11	Intergenic	novelGene_40680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	113.285303548166	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	980	2218	12708	1924	FALSE	30	AATACTCTGAGTTTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65207	1837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_13471_40628_40716_65077
531930	contig_15977_pilon	+	2218	4	Intergenic	novelGene_137219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.868355901622	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	122	352	78688	78918	TRUE	35	ATTTTAAGGTATCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSTFPQTTFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV	78566	91722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_79651_79771_80519_83878_84001_91457
531931	contig_8898_pilon	-	3306	11	Intergenic	novelGene_137228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_10	51.1180007433781	365	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	560	2536	216812	202709	FALSE	20	GAAAACTTGTTCCCGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILGFIIAFILAFSVGANDVANSFGTAVGSGVVTLKQACILASIFETVGSVLLGAKVSETIRKGLIDVEMYNSTQQLLMAGSVSAMFGSAVWQLVASFLKLPISGTHCIVGATIGFSLVAKGQEGVKWSELIKIVMSWFVSPLLSGVMSGILFFLVRAFILRKADPVPNGLRALPVFYACTVGINLFSIMYTGAPLLGFDRLPLWGTILISVGCAVFCALIVWFFVCPRMKRKIEREIKSSPSESPLMEKKNSLKEDREETKLSLGDVESRNPVVPDVGCAAAPLRAVVEERTVSFKLGDLEEAPEQEKLPSMDLKEETSIDSAMNGAVQLPNGNLVQFNQAVSNQINSSGHYQYHTVHKDSGLYKELLHKLHLAKVGDCMGDSGDKPLRRNNSYTSYTMAICGMPLDSFRAKEGEQKGEEMEKLTWASADTKKRIRMDSYTSYCNAVSDIHSASEVDISVKGEMGLGDRKGSNGSLEEEWYDQDKPEVSLLFQFLQILTACFGSFAHGGNDVSNAIGPLVALYLVYDTGDVSSKVATPIWLLLYGGVGICIGLWVWGRRVIQTMGKDLTPITPSSGFSIELASALTVVIASNIGLPISTTHCKVGSVVSVGWLRSKKAVDWRLFRNIFMAWFVTVPISGVISAAIMAVFKYVVLRV	217760	201938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_202871_203878_203964_204522_204709_205342_205905_206009_206283_208466_208587_210933_211031_215999_216086_216263_216405_216547_217160_217548
531932	contig_3130_pilon	-	3555	14	Intergenic	novelGene_103564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_11	89.488817852903	31	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	10	2193	129947	73733	FALSE	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECAMRALHFSSRHNKDIALVNLANVLHRAHFSADAAVVVHAALDDSDFFTSYYTLGNIYAMLGEYNHSVLCYDHALQAKPGFEQAIKRKHAVLCQQKLEQKLEAQHRSLQRTLNELKEYQKQHDHYLRQQEILEKHKLIQEEQILRNIIHETQMAKEAQLGNHQICRLVNQQHSLHCQWDQPVRYHRGDIFENVDYVQFGEDSSTSSMVSVKFDVQANQSDISDSVKSSPVAHSILWIWGRDSDAYRDKQHVLWPKRADCAESYPRVPVGGELPTYFLPPENKGLRIHELNSDDYSSEEEAQTPDCSINDFRKSQTLSYLVKELEVRMDLKAKMPDDHARKILLSRINNYTIPEEEIGSFLFHAINKPNAPVWLILNEAGLYWRAVGNSTFAIACLQRALNLAPLQYQDIPLVNLANLLIHYGLHLDATKLLLQALVINSSEPLTFLSLGNAYLALKNISGALEAFRQALKLTTKCPECESSLKLIRCMQFYPFLYNITSSVCSGNCHEKTLDNSHDKQKYFDNSLSLDAAEEEPSERGTEEDPVLSVENSGRDSDALRLESTVVEESNGSDEMENSDETKMSEEILALVDEFQQAWPLEGFGGALEMKGRRLDLQGIRVLKKGPQDGVARSSCYGDCRSEDDEATEWITFQVKRVKKPKGDHKKTPGKKTESNQVENTHRYQSNLEITGPKVASPGPQGELECLYAISSFRLECLSSYKGYAYDLKYFS	129956	72370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_73982_74793_75054_86945_87117_102962_103150_115882_116108_116475_116554_117895_118062_118217_118334_119670_119818_124093_124207_126473_126635_128372_128513_128962_129108_129921
531933	contig_5020_pilon	+	1408	7	Intergenic	novelGene_27819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1002.87032506147	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	364	876	122915	124987	TRUE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIALST	118461	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124330_124973_125091_125657
531935	contig_13216_pilon	+	1991	7	Intergenic	novelGene_47492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	37	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	27	1454	229682	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229655	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
531938	contig_10003_pilon	+	3016	1	Intergenic	novelGene_88244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCCTGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685261	688277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_685300_688300
531940	contig_12790_pilon	+	1681	8	Intergenic	novelGene_35237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.782371869223	5	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	164	814	309722	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305940	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306087_309704_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
531941	contig_2278_pilon	-	2274	10	Intergenic	novelGene_118117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_9	121.385621618882	264	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	302	1195	956893	940418	FALSE	20	TCCTTTTAATTCTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	999205	939338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_956857_956913_998923
531942	contig_14953_pilon	+	2855	6	Intergenic	novelGene_137268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	35.5527776692624	553	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	98	1921	44858	87422	FALSE	0	TTTTTGTTGTTGGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INNSWPASADCVSRRRRIRRAAWDGRDPSQPTMAGLYSLGVSVFSDQGGRKYMEDVTQIVVEPEPTAEEKPSPRRSPSQPSPPQPLPPPSALPGSEVSEKGPAVAAREARDPPPDTGASPDPSRCCRRRSSVAFFAVCDGHGGREAAQFAREHLWGFIKKQKGFTSPEPAKVCAAIRKGFLACHLAMWKKLAEWPKTMTGLPSTSGTTASVVIIRGMKMYVAHVGDSGVVLGVQDDPKDDFVRAVEVTQDHKPELPKERERIEGLGGSVMNKSGVNRVVWKRPRLTHNGPVRRSTIIDQIPFLAVARALGDLWSYDFFSGEFVVSPEPDTSVHTLDPQKHKYIILGSDGLWNMIPPQDAISMCQDQEEKKCLMGEHGQSCAKMLVNRALGRWRQRMLRADNTSAIVICISPGVDLQGNFSNEDELYLNLTDSPSYNSQETCVMTPSPCSTPPVKSLEEDPWPRLNSKDHIPALVRSNAFSENYLEIPAEITRGNVQAIVIPSKDPEPLEENCTKALTLRIHDSLNNSLSVGLVPTNSTNTIMDQKNLKMSTSGQMKAQEVERTPPANFKRTLEESNSGPLLKKHRRNGLSRSSGAQPASLPTTSQRKNSVKLTMRRRLRGQKKIGNPLLHQHRKTVCVC	44760	88356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_45336_62172_62402_68835_68961_75795_75987_81223_81467_86864
531943	contig_11720_pilon	-	2030	10	Intergenic	novelGene_43887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.915940961301	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	39	647	124674	118722	TRUE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIARYIQGQLYPSTLGNLCALLKS	124712	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117511_117596_118253_118641_118747_120438_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472
531944	contig_4812_pilon	+	4460	23	Intergenic	novelGene_103693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	51.7013235759408	110	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	672	2486	267652	325806	FALSE	10	GTTTGTCCTCACGTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKLDDCITYISSHPSFKDYPVYLLKFKQCLSKALHLMKSYTVNTLQNLTNQLLKRDPSSVPNADNAFTLFYVKFRAAGPKVRTLIEQIEQRSEKMPEYQQVLNDIHQCYLDQRELLLGPSITCTVTELTSQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEEIAQSLKEEQKKVPSEASFSDVQLEEAESNSLTKSGSTESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKTQVDGQLFLIKHLLILREQIAPFHTEFTIKEISLDLKKTRDAAFKILNPMTVPRFFRLNSNNALIEFLLEGTPEIREYYLDSKKDVDRHLKSACEQFIQQQTKLFVEQLEEFLTKVSALKTMASQGGPKYTLSQQPWAQPAKVSDLVSSAYKTIKAKLPLTLRSMSLYLSNKDTEFILFKPVRNNIQQVFQKIHALLKEEFSPEDTQIIACPSMEQLNLLLSGSK	247720	327780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_248015_262508_262656_264352_264415_265705_265751_266428_266504_267603_267697_268733_268860_270334_270416_274401_274446_274901_275029_276398_276491_277571_277712_279166_279328_287773_287880_296906_297032_299606_299697_302680_302802_305704_305794_305902_306038_312841_312918_317651_317780_319039_319139_325776
531946	contig_1948_pilon	+	1680	3	Intergenic	novelGene_31139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	494.5	1667	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	311	1084	122946	123719	FALSE	5	CGTGTTGTTGTTCTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSKKTYNSFQDELEDYIKVQKARGLEPKTCFRTMREDYLETFGYKEEVDSRPKYRMSDQRLPSETVQTYPGSYNIPQTLENQLPQRLPAHDSRLRLGSPSYCQFTTDYSSEKPVPLNLSQQEYNCGSYSGESAVYKHLSSENSTSAHQASHKQLHQKRKRHPEEGREKPEEERPKHKKKKSCEEMDLDKHQSIQRKKAEVEAVSVSTEKLKNRKEKKSREVSSKKEERKRRKEKKDQGQERTEEEMLWDQSILGF	103592	124315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_103771_119535_119646_122923
531950	contig_8377_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_34890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46485	45820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_45800_46500
531951	contig_12113_pilon	-	1835	9	Intergenic	novelGene_134732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	245.798412067694	1058	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	552	1049	231875	211148	FALSE	15	TTGGTGGTGTTTGAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	259675	210361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_232488_232713_233167_233273_259482
531952	contig_5967_pilon	-	2176	10	Intergenic	novelGene_44371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	545.647627442229	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	202	837	482536	388894	FALSE	35	CCAACAAATGTTTTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRHLMTFQQDLVIDFQLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPLCRPLAN	517612	387554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388917_389233_389306_403376_403471_412498_412588_423970_424055_430708_430797_465406_465533_482476_482550_488455_488583_517551
531953	contig_10667_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_137314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCATAGTTGCTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61314	60368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_60400_61300
531954	contig_13145_pilon	+	748	3	Intergenic	novelGene_116626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	586.5	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	32	388	35323	41191	FALSE	15	TACGTGCTGTGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCEWTSAGRTMRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEGNTEVLVLSKIPEFKVTNSHFGKYW	35291	41551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026
531955	contig_11735_pilon	+	1470	2	Intergenic	novelGene_137328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	0	123	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	127	501	9695	11504	FALSE	45	TTCGAAGACTTAACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRRKKIHLSKPVFLTLKHTQPVGARTKRLCASWKRWKEGGSWSTEGCSSTGSSDSHTTCRCFHLPSFAVLMALTPKVPEFIVRSLNLTVSSELRSHPHILEKDSKIRTPVQVAFLEGDSRKHQ	9568	12473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11735_pilon_+_9758_11192
531956	contig_14526_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_111208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAAAGACTTGAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323823	322115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_322100_323800
531957	SIRV4	+	303	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	254	393	254	-393	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAGCTAGAAGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	2378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
531958	contig_7695_pilon	-	2045	4	Intergenic	novelGene_41633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_3	92.7014323274218	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	22	552	720233	716614	FALSE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSSSGMSRDATATPPSSPSMSSALAVMGSPNSPYGDVIGLQVDYWLGHPSERRRDGDKRDASSKNTLKSVFRSVQVSRLPHGGEAQLSGTMAMTVVTKEKNKKVPTIFLSKKPREKEVDSKSQVIEGISRLICSAKQQQTMLRVSIDGVEWSDIKFFQLAAQWPTHVKHFPVGLFSGSKAT	720254	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716730_716884_717005_718112_718340_720165
531961	contig_5732_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_119598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACGTGCTGCAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314773	313344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_313300_314800
531962	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
531964	contig_11224_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_124444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	187.261552083947	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	151	606	19401	20631	FALSE	25	CAGGGATGCTACTGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPDCYLARLMLVRRGMDSSLSVPGIWHSTHVHNKNSLYPNHPSQLQRKSLGVSA	11243	21097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211_20392_20474
531966	contig_10477_pilon	+	2091	4	Intergenic	novelGene_112488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	331.512024249834	14	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	635	2044	259345	260754	FALSE	35	TCCTAAGTGAAGAAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLKPATNLSLNLNSNDIKGIEPGAFHSKIFQNLNFGGTFDLSVILKGLQNSTIQSLWLGTFEDKEDQDLSPAILQGLCEMSVESINLQQHHFSDFSSATFQCFTQLQELDLTATHLKELPSGIKGMNSLKKLVLNVNNFDQLCEISAASFPSLTHLYIKGNRKKLDLGAGCLERLENLQKLDLSHNGIEASDCCNLQLKNLPHLQCLNLSYNEPLGLQSQAFKESPRLELLDLAFTHLHVNVPQSPFQNLQLLQVLNLSYCLLDTSNHHLLAGLPNLRHLNLQGNRFQDGSIPKTNLLQTVGSLEILILASCDLLSIDQQAFHGLEKMCHVDLSHNSLTGDSISALSHLKGIYLNLAANNICIVSLHVLPTLSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWFKENLHKLEGLEETMCANPPPLKGVKLSDVKLSCGITAVGIFFLIVFLFLFTILLVFLIKFLLRWKYQHI	243068	260801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_243291_255104_255272_259025_259206_259279
531967	contig_10225_pilon	+	2482	14	Intergenic	novelGene_86824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	569.31904720885	3	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	482	2224	39882	47494	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPGRRSTDYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVRAALS	20845	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39880_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41533_42618_42726_44018_44073_45216_45259_46110_47263_47480
531969	contig_15003_pilon	-	3387	24	Intergenic	novelGene_137334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_22	48.5107124762432	4	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	1109	1996	239085	216108	FALSE	65	AAAAAAAAAGATCAGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLILVKRKKSQWYLWHLWVQFFTARITELMQVLKDLNHGRYERTMVSQQERGAEGPQVIPLVLGAGEIINADNIIKFDHVPLATPNGDILIRDLNFEVPSGANVLICGPNGCGKSSLFRVLGELWPLFGGRLTKPERGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQVIYPDGREDQKKKGISDLVLKDYLDNVQLGHILEREGGWDSVQDWMDVLSGGEKQRMAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEDYIYSHCRKVGITLFTVSHRKSLWKHHEYYLHMDGRGNYEFKQITEDTVEFGS	313525	214716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_216186_219570_219628_224440_224546_225456_225577_226789_226880_226979_227046_227150_227229_237550_237615_237741_237815_237894_237987_239020_239126_239529_239622_239917_240016_240106_240177_242386_242457_245915_246059_248538_248596_252630_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265957_273246_273284_313505
531971	contig_3410_pilon	-	1955	8	Intergenic	novelGene_58904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	136.89069078827	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	132	824	31547	14821	FALSE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKAMSRQAGGGHLADGSVWVGGGSPCRGYKSPTLLRTPEKYLL	32180	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14943_19485_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120
531972	contig_9463_pilon	+	1801	9	Intergenic	novelGene_83827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	1942	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1035	1403	222660	223028	FALSE	15	CTATTGGCTCTGAAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185917	223426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222489_222527
531974	contig_5686_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_45446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATACTGTTTAAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220218	218313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_218300_220200
531975	contig_10299_pilon	+	1875	9	Intergenic	novelGene_79669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	69.8941163475153	3	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1256	1804	186186	187611	FALSE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEVSGQEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182370	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_184692_184854_184935_185088_185253_185864_186084_186207_186389_186540_187233
531977	contig_15063_pilon	+	1377	4	Intergenic	novelGene_14217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	91	1263	34808	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34717	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
531980	contig_16703_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_72794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTTTGATTTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43026	44887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_43597_43650
531984	contig_9955_pilon	-	1593	6	Intergenic	novelGene_21286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	724.827317366005	2553	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	262	918	49296	46990	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEKS	49870	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_46876_46999_47590_47737_48794_49380_49692
531985	contig_10434_pilon	-	2142	20	Intergenic	novelGene_82037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	375	junction_19	168.3184226778	450	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	82	2055	153372	132856	FALSE	35	TGTTATAATAAAGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCPLLAPRAGRPPSSTLAAAAGPPAPAMGEEDYYLELSERPVQFEKANPVNCVFFDEANKQVFAVRSGGATGVVVKGPDDRNPISFRMEDKGEVKCIKFSLENKILAVQRTSKTVDFSNFIPDNSQQEYTQECKTKNANILGFCWTSSTEIVFITDQGIEFYQVLPEKRNLKLLKSQNINVNWYMYCPESSVILLSTTVLGNVLQPFYFRAVTMSKLPKFEIELPAAPKSTKLSLSERDIAMATIYGQLYVLFLRHHSRTSNSTGAEVVLYHLPREGACKKMHILKLNRTGKFALNVVDNLVVVHHQDTETSVIFDIKLRGEFDGAVTVHHPVLPPRSIQPYQIPAAGPASVTSQSPVPCKLYSSSWIVFQPDIIISASQGYLWNLQVKLQPIVNLLPDKGRLMDFLLQRKECKMVILSVCSQMLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	153453	132768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139146_139201_139465_139511_142485_142598_143308_143415_143506_143597_144855_144960_145447_145589_148181_148269_149454_149512_150355_150441_152569_152647_153270
531986	contig_7202_pilon	-	310	2	Intergenic	novelGene_18607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTGAGAAACTGATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30037	28550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28621_29797
531987	contig_12837_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_57402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAATCAAAATCATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451572	453507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_451600_453500
531988	contig_6233_pilon	-	1752	12	Intergenic	novelGene_74800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	289.253099156951	669	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	501	1388	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
531989	contig_6361_pilon	+	1778	5	Intergenic	novelGene_23995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	442	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	359	661	415471	421015	TRUE	40	TTGACTTGTGAAACTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQTVITDGSRDAIFGPVVGPHCDTCSTQTAFIHVTSNLTCKALNAKCSTKTDFAIGEAITQASVPVGGLDWRTTPRLRHNDHLGRLHFQCRLLKGYGL	410934	428205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411212_415389_415503_419464_419589_420868_421638_427710
531990	contig_12603_pilon	-	2371	8	Intergenic	novelGene_105790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	231.876638560688	204	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	118	801	590934	577174	TRUE	50	ATATAAAACAGAATGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVPPNRSQTGWPRGVNQFGNKYIQQTKPLTLERTINLYPLTNYTFGTKEPLYEKDSSVAARFQRMREEFDKIGMRRTVEGVLIVHEHRLPHVLLLQLGTTFFKLPGGELNPGEDEVEGLKRLMTEILGRQDGVLQDWVIDDCIGNWWRPNFEPPQYPYIPAHITKPKEHKKLFLVQLQEKALFAVPKNYKLVAAPLFELYDNAPGYGPIISSLPQLLSRFNFIYN	591051	573401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_574935_577136_577196_578477_578593_579305_579382_582716_582807_586750_586815_587666_587868_590818
531991	contig_6710_pilon	-	443	2	Intergenic	novelGene_98232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
531992	contig_8020_pilon	+	2987	11	Intergenic	novelGene_114383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1086	1565	147966	149853	TRUE	45	AAGCATTCCCCCCAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGKVATTVSPGAMWREDFESDHLDDNLSVQCVGVTIGFWSGTRSCLWCRRGRTERQELPSCSSGNSSSKGLCHLFSSPYLFHLSEDPQQIFTKDTLKFPLTPATSQKLLYQHRVCGHILQPLRELAGPVVITTNPDELGSNDCPDVVEVVCHSGHVG	146880	153627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_148204_148296_148436_149106_149185_149828_149917_150258_150433_150547_150621_150904_151044_151127_151231_151580_151708_152036_152320_153167
531993	contig_14744_pilon	+	1935	5	Intergenic	novelGene_66080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6142	junction_4	2944.32649344464	7	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1349	1894	1384415	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLQPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
531995	contig_13295_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_31207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCAATAATTATCCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52879	52004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_52000_52900
531997	contig_8354_pilon	+	2286	18	Intergenic	novelGene_24109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAAGAAATTAGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231423	320942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_231461_232861_232957_240651_240819_256649_256769_259836_259952_296383_296454_297455_297549_299401_299599_300178_300291_302292_302472_305550_305630_306067_306154_307295_307429_308576_308636_312425_312653_315101_315246_317291_317497_320773
531998	contig_12638_pilon	+	1895	9	Intergenic	novelGene_33375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	113.648581161403	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	95	805	1515842	1530546	TRUE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARRRPPSTSPQREARPPSPWIFTPCRSAASMSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMMLSCVTSDTLMWRLMSSGSTRTLWRR	1515747	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530025_1530462_1530561_1534864_1535060_1538799
532000	contig_15449_pilon	-	2098	6	Intergenic	novelGene_33678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_2	64.5024030560102	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	687	1841	195566	191270	FALSE	20	TCAGTGTATAAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196252	191012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339
532001	contig_7179_pilon	+	1725	8	Intergenic	novelGene_78057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	318.286034880577	1649	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	467	1210	396316	402057	FALSE	45	AAAGACAATTAAATGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGMFKKVNARERIVGWYHTGPKLHKNDIAINELMKRYCPNSVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392258	402572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_392418_392853_393004_395399_395492_396250_396344_397029_397128_397713_397795_400662_400755_401612
532004	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532018	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532043	contig_7898_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_47635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720746	718032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_718000_720700
532054	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
532071	contig_2550_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_135672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCATGTATTCAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246766	1247088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1246800_1247100
532076	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532078	SIRV6	+	734	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	587	-14	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
532099	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
532104	SIRV4	+	298	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	641	1009	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
532109	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532122	contig_3975_pilon	+	2457	10	Intergenic	novelGene_54758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	100.162090854996	10	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	19	1026	1961329	1984842	FALSE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGACLSLAPEDTD	1961310	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1975910_1984805
532149	contig_6589_pilon	+	2251	14	Intergenic	novelGene_25933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	296.897248777015	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	91	1506	1228758	1257861	TRUE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPVSGPALLSSQDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTEEELRRFEEELAAREAELNAKAQRLSQETEALGRSQDHLEAQKRELQQAVLQMEQRKQQQQALNALAPAPGREGQLKFHPGTDGVPVPGAADDQKDRDTSEKKVPEQPPKLPQLDSQKL	1228256	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228920_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256925_1257394_1257498_1257748_1257919_1257972
532150	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
532152	contig_233_pilon	+	1670	8	Intergenic	novelGene_14551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	339	848	78477	91651	TRUE	30	CTAGGAAGAGAGCGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78138	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92345_93756_94007_94722_94818_101680_101764_104145
532157	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
532166	contig_20602_pilon	-	1502	9	Intergenic	novelGene_133704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_7	259.436287939833	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	12	1085	29552	10026	FALSE	45	ACACAAATTCTCCTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29563	9608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_28884_28949_29483
532175	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_18156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532183	contig_14882_pilon	-	2038	16	Intergenic	novelGene_115016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	325.070139440022	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	283	1950	320807	295835	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLYLGASKNEYRSPGGAVVKCSAANQKIGDLNSLAAPWEKDMAVCFCKDYSLGNPIGATGSGEMVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	321728	295746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317321_317537_317672_320769_320816_321323_321410_321540
532191	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532193	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
532207	contig_10196_pilon	+	1211	10	Intergenic	novelGene_132148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	458.623786755307	7741	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	8	1021	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQGPEGRGTATRGQRRGLPWHPGLDSLCHRKVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034558	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044036_1044124_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
532213	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532216	contig_15063_pilon	-	1116	5	Intergenic	novelGene_11652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36383	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838_36150_36264
532217	contig_5019_pilon	-	2129	3	Intergenic	novelGene_109183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAGCAAAAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173474	105659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_105735_134383_134457_171493
532237	contig_7057_pilon	+	3323	3	Intergenic	novelGene_123397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	503	1642	1277966	1279189	FALSE	15	ATTTGGAGTTTGTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENLQPESDFQHVQIHTVEKLYLYNACGKTFSLKQNLIDHEKMHTGEKSHECTECGKVFSRISSLTQHLRSHRGKKTYKCNKCGKAFSQKGNFLSHQKHHIAEKSYECGKASIQMASLIRHQRNYTGKPCVCKECGKTFNGKSYLSEHEKIHTGEKPFECNECGKAFSQKENLIIHQRIHTGEKPFECKGCGKAFIQKSSLIRHQRSHTGEKPYTCRECGKAFSGKSNLTEHEKIHIGEKPYKCNECGTIFRQKQYLIKHHNIHTGEKPYECNKCGKAFSRITSLIVHVRIHTGDKPYECKICGKAFCQSSSLTVHMRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHMRIHTGEKPYQCNECGKAFSQKSHHIRHQRIHTH	1272887	1280870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1272943_1277518_1278434_1278517
532260	contig_6533_pilon	+	829	3	Intergenic	novelGene_114614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	25	CTATGTGCTGAAATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
532267	SIRV4	+	184	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1583	636	1128	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
532270	contig_7202_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_17582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27794	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
532272	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
532283	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532285	contig_10734_pilon	-	2205	7	Intergenic	novelGene_51406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	146.732182336846	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1134	1454	2075693	2073385	FALSE	15	CGTGTTCATTTGTGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLYKENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCGKRMSECPICRQYVVRAVHVFKS	2091273	2072633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2073576_2075563_2075766_2076034_2076122_2077859_2078270_2079518_2079735_2090570_2090857_2091211
532297	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532302	contig_5649_pilon	+	1982	11	Intergenic	novelGene_82268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	149.581449384608	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	70	594	21124	28325	TRUE	35	CAACCACTGTCTACTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEGNSSSGEEKESFCIF	12820	35844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26052_26873_26895_28299_28451_28928_29031_33713_33787_34645_35015_35125
532322	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532323	contig_8538_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_4900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
532330	contig_6710_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_94906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGCACACTACAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
532353	contig_12270_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_113586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14429	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14400
532359	contig_9345_pilon	-	1650	12	Intergenic	novelGene_24502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	281.592050038044	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	919	1608	669169	667061	FALSE	20	AGTAATGCCTGGTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671875	667018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669490_670140_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
532366	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
532391	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
532429	contig_15304_pilon	-	1287	5	Intergenic	novelGene_30412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1562.72556371872	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	196	1155	54100	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54295	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49517_49845_50061_52986_53320_53491_53813_53991
532434	contig_19342_pilon	+	817	3	Intergenic	novelGene_41116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3873	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3883_4177_4365_6149
532442	contig_854_pilon	+	1111	4	Intergenic	novelGene_36313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_3	2427.75209241434	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	557005	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	557003	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_557065_557591_557752_562271_562405_563029
532456	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_94276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532459	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532460	contig_20165_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_54488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACGGCCTCAGAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128069	127564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_127600_128100
532496	contig_6589_pilon	-	1991	2	Intergenic	novelGene_26296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	679	909	2273395	2273165	FALSE	55	CAAAAAAAAATTGTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHGGGKGRRRRPRLKKDGWSGQRRLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290246	2272082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274003_2290175
532501	contig_5485_pilon	-	1942	4	Intergenic	novelGene_37688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.876506766504	5	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	434	1132	86314	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86356_86928_87027_87794
532503	SIRV7	-	354	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
532508	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532509	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_17726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532513	SIRV4	+	280	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1480	643	1025	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2480	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
532517	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4412	34	3237	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
532528	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_89541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532529	contig_7594_pilon	+	1372	7	Intergenic	novelGene_55425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	739.527946282852	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	517	900	561547	566248	FALSE	20	TGTGTAGATCTTGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	538991	566720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_561539_561752_566069
532556	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_95849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532568	contig_3948_pilon	-	1508	7	Intergenic	novelGene_53211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	374.339752096942	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	11	712	866419	840803	TRUE	25	AAGAGTGTCATGTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	866429	839142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_839521_840384_840860_842501_842655_847881_848004_852475_852636_856565_856712_866355
532600	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532610	contig_12079_pilon	+	3794	1	Intergenic	novelGene_67471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	2728	3207	597383	597862	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGGEGGPALPHPTQHDFTLLHGQASIHTVKIIHVVHPSSEGLAEVFVHEGCCLQNLEVPGLAELVQASSPEGLDLCRSHVPIGTGTWASLGGKGASSHSCSPHSASCTCVRLYAAPDAFTLWGPWLLLPTRLHDLLNRLWGQKTNAHLGPTSQRAPP	594655	598449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_594700_598400
532622	contig_11677_pilon	+	2269	13	Intergenic	novelGene_85979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	89.848483570954	53	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	8	2134	727262	737475	FALSE	40	GAAATGATATGAAGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVTITLQTPEPKLQGQTFPETVPPVASGVLRGPACGRGRHHGGEGAVSSCRSSASTTVLFPPVLMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDYLPLGQGQLGLLPCISMWHPSLVTEKAALRKALAGSLCLPWFSLTPQGEPQHCFAGRCQAQVTSGTPPLQLSFLASYTPVGYSQTGVQKAAAQDLVLRVWQRLGQCGTVGKIPDLESNRPEFCASALNI	727254	737610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734546_735086_735188_735996_736208_736531_736679_737079
532642	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532663	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
532686	contig_3825_pilon	-	1770	9	Intergenic	novelGene_78014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	883.216555763647	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	33	737	1470962	1464170	TRUE	15	GATTTGCATTTCTTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGDQGPPGIPGKAGPKGERGPHGEKGEPGHSEYCRTAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQAQCLWQIPANMPTVRARPPLHSVSLPSVLEKTSKSRFSSSSSNGPGQP	1470994	1461794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1464316_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
532694	contig_16907_pilon	-	2229	18	Intergenic	novelGene_87464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	99	junction_7	64.2274289517943	458	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	87	2141	524752	480612	FALSE	20	GCCTACTTACTTTTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIPAEESDQLLIRPLGAGQEVGRSCIILEFKGRKIMLDCGIHPGLEGMDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVHKGSKKLEMHVYSKRLEIMLQDIFGEDCVSVKDGSVLSVTVDGKTANINLDTRTVECEEGSEDDESLREMVELAAQRLYEALTPVH	524838	480523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_480714_482744_482842_485631_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502228_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520295_524702
532695	contig_15063_pilon	+	1471	5	Intergenic	novelGene_10609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	35	ATTCAAACTAACCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
532706	contig_5649_pilon	+	2050	9	Intergenic	novelGene_82386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	27.0944528455549	398	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	122	1057	1086027	1096594	FALSE	5	CTTGGTTTGATCCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCAAGASCCRERREARSRRLRRNRELAGHPAFRSISTAGMADFGISAGQCVIVVWDRSSPVKALKDLVGKLQALTGSEGRVSVENINQLLQSAHEESSFDIILSGVIPGSTTLHSAEILAEMARILRPGGCLFLKEPVETAVVNNSKVKTASKLCSALTLSGLVEVKELQRESLSPEGIQSVQEHLGYQSDGLVSVQITGKKPNFEVGSSSQLKFSIAKKSPSVKPAVDPAAATLWTLSVNDMEDDSLDLIDSDELLEPEDLKKPDPASLRAASCGEGKKRKACKNCTCGLAEELEKEKSKEQKSSQPKSACGNCYLGDAFRCASCPYLGMPAFKPGEKVLLSNSNLHDA	1082063	1097587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1082159_1086000_1086184_1086660_1086814_1088284_1088362_1089885_1090052_1091407_1091482_1092355_1092472_1095901_1095984_1096483
532719	contig_18145_pilon	-	2285	15	Intergenic	novelGene_37323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	518	832	97865	97184	TRUE	40	GAGACTGAACCGAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLRNLSGCSTGYWTSSWSSRLTSSRPPMSSQVTCGTSTTVSRSADGLLWLRAHRKSSIVTAREFMTSASMVSSSRSMRSIFLRMACRAASEHRAAKSAPTCP	100929	86639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_86910_90460_90570_90761_90934_92015_92161_92690_92824_93350_93473_94901_95004_95949_96087_96162_96299_96653_96772_97174_97334_97425_97548_97822_97993_100382_100480_100636
532722	contig_5020_pilon	+	1425	7	Intergenic	novelGene_27835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1200.78469714137	17	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	318	1070	121762	125717	FALSE	20	GCAAGCTCAACCTTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLHELCPGPVQQRWPLCPYHAPEGGAPGLLQRVHALLSSLGFLECGDVRHL	118462	126072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123324_125000_125091_125657
532743	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532755	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532762	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532766	contig_9290_pilon	-	2473	15	Intergenic	novelGene_77571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.1391701999614	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	411	1319	509725	504291	TRUE	25	ACAGGCCTCTGCAGGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516498	502900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_503954_504189_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510196_510337_511094_511204_515706_515813_516446
532767	contig_10848_pilon	-	2033	8	Intergenic	novelGene_133532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_7	113.250309726116	555	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	126	974	907357	830918	TRUE	10	TACCCTTTATTCTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSSLPSALALSLLLVSGSLLPGPGAAQNEPRIVTSEEVIIRESPVLPITLQCNLTSSSHTLTYSYWTKNGVELTAHQKNVSSMEHRISKPRAEDSGEYHCVFHFLSAPKANATIEVKAAPDITGHKRSENKNEGQDAMMYCKSVGYPHPEWVWQKKGDDGFSDISNASGRFFIINKENYTELNIVDLQITEDPGEYQCNATNAIGSTSVVTVLRVRSHLAPLWPFLGILAEIIILVVIIVVYEKRKRPDEVPDDDEPAGPMKTNSTNNHKDKNLRQRNTN	907482	829314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_830360_830903_830979_831835_831858_838740_839015_843675_843810_855199_855295_858376_858549_907266
532776	SIRV4	+	304	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	632	1012	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
532785	contig_10135_pilon	-	2255	9	Intergenic	novelGene_106617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	37.9662679229866	618	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	561	1751	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89582	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89057_89502
532786	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532788	contig_7457_pilon	+	2107	12	Intergenic	novelGene_31323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_10	241.741546298131	1692	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	136	1482	281205	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280811	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
532789	contig_4125_pilon	+	2064	8	Intergenic	novelGene_25215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	33.0361582981744	1241	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	274	1155	1702282	1711283	FALSE	25	TACGACTCAGTGGCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1702008	1712192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
532799	contig_14925_pilon	-	991	5	Intergenic	novelGene_55098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_4	1550.18466641881	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	196	453	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFFFGSGTKLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	54545	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_54502
532811	contig_11386_pilon	+	2419	4	Intergenic	novelGene_82788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	515.69844763087	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	98	820	17940	21088	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRYGLQASVPLAGPRALCSPSAC	17842	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_22318_23050
532829	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
532846	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
532860	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
532863	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
532868	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
532869	contig_15135_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_119893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131958	129538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_129500_132000
532877	contig_16411_pilon	+	2512	8	Intergenic	novelGene_77374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1477	1794	326028	327994	FALSE	20	CATCTTAGATGGCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFLCSPFMSFPQFPKVSPATFTFSKQRSGAGRAPGAPQLLALLLVGEAHAVVAVGLAALTGRAIHLVEVGGAVGRLARAELRKVALPCLLTTHGAGGQQLSEE	318163	328712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_319015_319330_319414_320725_320868_322115_322228_322352_322435_323336_323540_326024_326138_327786
532881	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_16607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27846	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
532891	contig_12050_pilon	+	1791	7	Intergenic	novelGene_62640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	177.184461320211	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	686	1279	359783	363452	FALSE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	359097	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
532902	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
532914	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
532932	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
532956	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
532962	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
532970	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
532975	contig_3077_pilon	+	1672	9	Intergenic	novelGene_26719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_8	3519.32393853919	4	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	508	1185	13867	17590	FALSE	25	GATTAACAGTGTGCGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIEGEEGQGALVGGLTLDFPAGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10110	18077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17455
533000	SIRV2	-	259	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4614	34	3439	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
533006	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
533016	contig_12864_pilon	-	2087	9	Intergenic	novelGene_76431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	622.416410050378	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGAGTTGCTGCCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252159	242235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_248963_249279_249324_249843_251887_251999_252111
533025	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10428	1	1191	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11428	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
533029	contig_3077_pilon	+	1265	6	Intergenic	novelGene_26626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3402.90413617545	17	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	77	394	9676	12074	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQR	9599	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12230_16971_17054_17449
533040	SIRV4	+	319	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1452	632	997	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2452	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
533047	contig_7202_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_18685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTACCTGTCCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
533049	SIRV5	-	258	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10985	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
533063	contig_14322_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_116595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCGGCGGCCACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674881	674695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
533073	contig_5643_pilon	+	2004	16	Intergenic	novelGene_39088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_15	733.805169419422	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	546	1994	634983	641584	FALSE	10	GTCATTGTGTGTGTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631303	641594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
533088	SIRV7	-	341	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33228	0	9	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114729	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
533091	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
533120	contig_5539_pilon	-	2079	4	Intergenic	novelGene_104783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2593655651606	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTCACGTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302051	282434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_284258_287813_287921_297220_297298_301979
533130	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
533132	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
533134	contig_11720_pilon	+	1928	15	Intergenic	novelGene_43981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	349.844783366823	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	69	1688	262352	272210	FALSE	55	AAATCATTCAAAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262283	272450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266604_267753_267913_269816_269907_270032_270140_270557_270700_271268_271343_271806_271961_272096
533148	contig_1230_pilon	+	1880	9	Intergenic	novelGene_28872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1435.39985173993	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1170	710	1879	406520	408691	FALSE	10	GTGGTGGAGCTCCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFP	404495	408692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405439_405707_405914_406126_406298_406415_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
533157	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
533167	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
533179	contig_10235_pilon	-	1252	6	Intergenic	novelGene_46467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	925.820587371009	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	231	689	222843	219464	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRWAHFCSFKHPSHTHPLPPGGPRQCRSCAQEGSSHSCCMAPKCTQTPTRSRNFWRQCCALPGTPSWQLRTLSPTQLGWMYLPSFLPTSRIQTQHSMTIWRRGS	223073	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220494_220634_220788_222804
533181	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
533189	SIRV4	+	318	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1453	632	998	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2453	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
533194	contig_12626_pilon	+	3331	1	Intergenic	novelGene_80439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGATGCTTTGTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136432	139763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_136400_139800
533220	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
533224	SIRV4	+	311	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	206	433	206	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
533230	contig_12427_pilon	-	1362	6	Intergenic	novelGene_40532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1495.35595762347	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	99	650	520420	506035	TRUE	20	AGATCATCTGATTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLDFFSAPSFFACPPPRELSQRARPGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578061	504674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504823_505470_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_577982
533231	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10395	2	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11395	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
533254	contig_17470_pilon	-	2036	12	Intergenic	novelGene_110509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	60.3942967040777	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	270	1211	277165	270503	TRUE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKPSSAL	302568	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270521_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_277162_277222_302355
533267	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
533281	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533285	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
533291	contig_14441_pilon	+	1373	6	Intergenic	novelGene_100375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	586.709672666132	82	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	31	477	30634	112144	TRUE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGDHITWRLLMRMSSLRERPPALPSLPSMVPTLLCLAVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVKARQQIARMDCVPIKQHVHVYWYRQKLREELKFLAYLKNEETIDGSGLPDKRFSAHCSKNSSCSMEIQSTELGDSAVYFCASSLSTVLHMISPSARGPS	30603	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_30737_30842_31154_112111_112154_116578_116963_117097_117344_117539
533298	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
533329	contig_10629_pilon	-	2469	15	Intergenic	novelGene_52901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	445.169430024762	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	190	723	256957	253815	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRVCGRQPSEQDFRGLNYRVIQVPCGPAP	257146	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246968_247062_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253898_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939
533331	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533334	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
533337	SIRV4	+	177	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1116	23	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
533341	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
533342	contig_5020_pilon	+	1457	7	Intergenic	novelGene_27907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_1	861.481862838679	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	214	1143	122915	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	121854	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
533344	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657820	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAPSWSSKVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657789
533353	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
533365	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
533387	contig_14445_pilon	+	2941	2	Intergenic	novelGene_137348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACAATGAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243603	247126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_244416_244997
533399	contig_6102_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_32224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895330	897369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_896706_896888
533408	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533416	contig_9468_pilon	+	2052	10	Intergenic	novelGene_59502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_9	180.885135096186	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	307	936	347212	354782	TRUE	40	TATCACATGATTCAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGDSEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQ	346905	357137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_347278_350685_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
533429	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	633	1013	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTTATATGTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
533434	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533463	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_91281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657161	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657161	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
533483	contig_11067_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_137395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAAGGTCATGGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22400	23185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11067_pilon_+_22400_23200
533498	contig_12090_pilon	-	2363	14	Intergenic	novelGene_80473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	233	junction_13	144.055626994016	1295	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	130	1749	67556	51792	FALSE	30	GGGATTGTTAACTAACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPAGAAFWKVRDCRGYDPLFCGRLESASIRPSRPCTDPAKVAMPENVDPRSGAPAGTAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIMAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGVEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMRVIDPATADSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVANSGITRVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVVKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTMVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVLRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTTGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR	67685	51177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_53617_54231_54363_54465_54577_54657_54755_55718_55859_57076_57210_57565_57688_58926_59070_59837_59947_60899_60990_64357_64411_67429
533512	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533514	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
533518	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
533520	contig_3122_pilon	+	2790	2	Intergenic	novelGene_64397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	758	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	8	487	409328	412387	FALSE	40	AGTACGTTTCAAGAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMAALSVFGITRRGLMWIVSGAPRRQFWFPSRKEKEPVLAETVEEVKKEPILACPPLRSQTYIPPDDLQSRLESCVKEVFGPSVPRNWQDISLDDGYLKFSLLAHLADDLGHAVPNSRLHQMCRVRDVLDFYNVPVQDRSKFDELMANNLPPNLKISWGY	409320	414690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_409420_411999
533533	contig_1443_pilon	-	1888	10	Intergenic	novelGene_28303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	573.554952860332	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	850	1236	750277	748649	FALSE	60	GGAATTTGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHNQNNELKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809524	747996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750249_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_805197_805224_808694_808741_809399
533537	contig_854_pilon	+	1388	7	Intergenic	novelGene_36231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2351.07715857127	6	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	116	442	543600	557691	TRUE	40	TCAAGTTTGGAAATATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPRSVPRTSSSSASPSSVQPLMRTCAPSGSLRCGTTAPAHLSSWWAPSWTCGMTRTPSRS	543484	563782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556126_556987_557065_557591_557752_562271_562405_563029
533556	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
533565	SIRV4	+	191	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	643	1114	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
533567	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
533569	contig_12427_pilon	-	1862	8	Intergenic	novelGene_40553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1330.94217050347	5	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	158	781	522337	506035	TRUE	55	TAACAAGAACAAAGATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578109	504686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504806_505019_505771_505823_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
533574	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533609	contig_9471_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_21683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	870	1280	46574	46164	NA	60	TTCCAAGAAAAGAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLLISFSLVLTHGKAALWKTNSLVHLAQAAAQGGQLTNCWVCHHHPQSKDSSLPVAIAMSNFSSVPNATLNNTWLIPVFLVKLNAALQYSFNFTFYYNQTVTGVMFNWRAVLYWANCHLPLWMLPLTSTYAIYT	47443	45159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_45200_47400
533612	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533630	contig_15063_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_12510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2204.14960295853	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	920	1471	36064	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28157	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28201_34613_34926_35034_35380_35844_36158_36266_36600_38975_39092_39506
533648	contig_9345_pilon	-	1932	7	Intergenic	novelGene_24392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	67	1005	176056	142100	TRUE	10	TTTGGAACTGCTTCCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176122	141111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141724_141784_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
533658	contig_14924_pilon	+	2825	16	Intergenic	novelGene_104153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_13	44.702672055358	9	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	23	1585	44129	53716	FALSE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGLGAKKGLGAQKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPKYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISERATNRREVESWSSGLESNEARQKFAGAKAISSDMFFGREMDSEYEARSRLQQLSGSSAISSSDLFGEVDGAHGAGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQDRYGSY	44106	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_48758_48896_49018_49151_51163_51293_51371_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695
533668	contig_7020_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_57076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	422	1269	64	1332	102241	103509	NA	40	AAATAATCTTACATAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	102177	104305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_102200_104300
533671	contig_12125_pilon	+	2413	11	Intergenic	novelGene_76196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	125.183065947436	523	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	333	1289	67320	82984	FALSE	35	CTAAATTTGTGATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWLRREAPRPHPGPHAPNRRFEALLQAGKSPTCELLFDWGTTNCTVGDLVDLLVQNEFLAPASLLLPDAVPKTVNTLPSQEAITVQQKQLPVYGKDRTSVTPVQNLELNYMPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56169	84108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
533691	contig_14322_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_116480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCTCACTCCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
533694	SIRV7	+	344	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACTTAATCCTATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78951_114674
533699	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
533700	contig_5302_pilon	+	1807	9	Intergenic	novelGene_81470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_1	108.472850866012	2532	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	103	954	318287	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRRPAFGLPLARFLCAAAPAVAAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306646	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
533727	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
533732	SIRV4	+	257	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1514	632	1059	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
533739	contig_15063_pilon	-	1721	7	Intergenic	novelGene_12893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	35891	35108	TRUE	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
533742	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533744	contig_14441_pilon	+	1327	6	Intergenic	novelGene_100342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	380.425761483105	39	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	713	1141	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	6221	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6425_6604_6913_113156_113209_116578_116963_117220_117344_117539
533783	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_95862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
533813	contig_9014_pilon	-	2396	10	Intergenic	novelGene_106712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	82.0096350858457	463	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	275	1834	46682	41867	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51543	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51279
533823	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533826	contig_7963_pilon	+	1158	5	Intergenic	novelGene_58397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	5503	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	61	825	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51389	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
533831	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	356	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
533843	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533850	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_18728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGCCAGATCAACCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
533854	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
533880	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533905	contig_3862_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_137428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620706	618342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_618300_620700
533908	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
533912	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
533915	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
533927	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGACTCGGAGGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
533945	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
533952	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533957	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533964	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_16422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
533970	contig_15063_pilon	+	1348	5	Intergenic	novelGene_8659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	3424.52894570918	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	238	1347	34808	36598	FALSE	30	GTAAACCCTCCCTGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAYWGQGTQISVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKST	26747	36599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26791_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
533982	contig_16846_pilon	+	2623	16	Intergenic	novelGene_82894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_13	206.856429008678	373	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	83	1207	401088	451845	FALSE	10	CCTGATTGCTGATTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELQDVQLTEIKPLLNDKNGTRNFQDFDCQEHDIETAHGVVHVTIRGILKGNRPVILTYHDIGLNHKSCFNAFFNFEDMQEITQYFAVCHVDAPGQQEGAAPFPSGYQYPTMDELAEMLPSVLTHLSLKGIIGIGVGAGAYVLSRFALNHPELVEGLVLINVDPCAKGWIDWAASKLSCLTTNVVDIILAHHFGQEELQANMDLIQTYRLHIAQDINQENLQLFLSSYNGRRDLEIERPLLGQNGNTKTLKCSTLLVVGDSSPAVEAVVECNSRLDPINTTLLKMADCGGLPQVVQPGKLTEAFKYFLQGMGYIPSASMTRLARSRTHSTSSSLSSGESPYSRSLISNQSDGTQGVPESSEDPDKQETMEVSC	375890	453261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_375928_401042_401145_411066_411103_423148_423255_424312_424434_426259_426323_427772_427834_430939_431027_434887_434945_442194_442299_443342_443406_443528_443581_446845_446894_449079_449116_449200_449253_451663
533987	contig_13481_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_119509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCTTATGTGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413965	1411856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1411900_1414000
534008	SIRV4	-	226	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAAAAGATTATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
534019	contig_15039_pilon	-	1679	7	Intergenic	novelGene_110131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_6	480.886218928715	389	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	282	905	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260918	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_260778
534020	contig_12312_pilon	-	2411	11	Intergenic	novelGene_63987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_10	30.4460178020049	321	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	153	1457	440934	436461	FALSE	10	ACTTTGGCTCTCCTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVPLACLLLCALLVRDSDGSGELPRGSGASNCGCLNGGTCVSYKYFSNIQRCNCPKKFHGEHCEIDTSKTCYEGNGHSYRGKANMDTRGRPCLAWNSVSVLLKTYHAHRPDALQLGLGKHNYCRNPDHQKRPWCYVQVGLKQLVQECQVYDCSLGESPISPPEKSEFQCGQKAVKPRFKIVGGEFTTIENQPWFAAIYRKHRGGSVTYLCGGSLITPCWVVSATHCFINYQKKEDYIIYLGRSRLNSNTPGEMKFEVKELILHEDYSSETLAHHNDIALLKIRSNTGQCAQPSRTIQTICLPPQNDDARFGASCEITGFGKENPTDYIYPEQLKMTVVKLVSHKVCQQPSYYGSEVTHKMLCAADPQWETDSCQGDSGGPLVCSNEGRLTLTGIVSWGRGCALKDKPGVYTRVSRFLPWIHTHIGEEENGLSL	441361	435506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_436641_437328_437478_437806_437948_438602_438752_438972_439193_439378_439471_439630_439806_440124_440233_440379_440414_440877_440966_441240
534029	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
534031	contig_8616_pilon	+	951	8	Intergenic	novelGene_72577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1166.70309952832	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	15	407	425778	428579	TRUE	15	TTGAACCTTTTCATGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGITMAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQDSVK	425763	436586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428564_428655_435784_435900_435993_436119_436357
534046	contig_12270_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_113127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
534062	contig_15123_pilon	+	3200	10	Intergenic	novelGene_110904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	78.9478652789217	181	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	528	1049	191749	210300	FALSE	25	GCTCTGCAAACAGCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVMFTLFGLNLLFKIKPEDAMDFGISLLFYGLYYGVLERDFAEMCADYMASTIGFYSKSGMPTKHLSDSVCAVCGQQIFVDVSEEGIIENTYRLSCNHVFHEFCIRGWCIVGKKQTCPYCKEKVDLKRMFSNPWERPHVMYGQLLDWLRYLVAWQPVIIGLVQGINYILGLE	143393	212451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_143458_170796_170835_172408_172519_173805_173948_188374_188484_191684_191793_194840_194962_207393_207528_208391_208494_210179
534094	SIRV4	+	326	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	656	966	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAGTCAATAACTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
534106	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTACCCAGCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534107	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	62	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
534113	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534122	contig_19899_pilon	-	1929	7	Intergenic	novelGene_102519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	3	junction_5	80.0950823847646	490	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	457	879	144526	140028	FALSE	30	CAAGATTGTGGTACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156639	138977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_144939_145500_145554_156555
534154	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534165	SIRV4	+	398	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	918	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
534204	contig_3601_pilon	-	1728	5	Intergenic	novelGene_132869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_4	46.7406407743839	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAACTAACTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188352	144040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_169011_169200_170691_170868_187636
534205	contig_14666_pilon	+	2237	15	Intergenic	novelGene_39513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.1936644492086	479	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	475	1803	443672	448893	FALSE	10	GGTATCGAGTCCGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429316	449327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440704_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446215_446600_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
534210	contig_6361_pilon	-	1161	4	Intergenic	novelGene_24019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_3	3496.27080695354	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	89	427	420979	415399	FALSE	35	CTCTGTATAGGTTAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436353	414664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_415504_419465_419591_420870_421003_436288
534213	contig_7571_pilon	+	2016	4	Intergenic	novelGene_106390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	23.2808934536456	603	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	143	391	74286	76427	FALSE	25	AGAGATTGTGTGTTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRSCRCQLVQVSGPEASSQSLLLRAPLTADHSSIILYPRPKSLLPRMMNADMDAVDAENQVELEEKTRLINQVLELQHTLEDLSARVDAVKEENLKLKSENQVLGQYIENLMSASSVFQTTDTKSKRK	68229	78052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_68322_74235_74308_74647_74732_76284
534218	contig_14514_pilon	+	1693	4	Intergenic	novelGene_137451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	39.6344406910062	1478	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGTTACTGTGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8386	36322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_8430_24699_24764_30105_30203_34833
534221	SIRV4	+	398	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	918	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
534255	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534269	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534279	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534286	scaffold_6394_pilon	+	1226	8	Intergenic	novelGene_110980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	325.062568545484	11892	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	53	1066	398216	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398163	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
534312	contig_9127_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_102997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACTTTTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49151	51239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_49200_51200
534318	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	643	971	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
534331	contig_9594_pilon	+	1648	11	Intergenic	novelGene_73942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_10	395.189182544259	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	115	1368	301335	322451	FALSE	10	GCTGTGTTAGCTTAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301220	322731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
534337	contig_12301_pilon	-	1915	9	Intergenic	novelGene_110025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	241.825059443805	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	77	1051	136698	102891	FALSE	30	ATGATTCCAAATTTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136774	102026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116180_129132_129240_130658_130737_136661
534344	contig_7202_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_17699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGCAGGTTGGTCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
534350	contig_13707_pilon	-	2442	12	Intergenic	novelGene_43539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	791.34991894539	5	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	968	1396	272378	270728	FALSE	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	278365	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273714_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_278181
534351	contig_4857_pilon	-	2396	7	Intergenic	novelGene_48645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_3	80.1782735880211	110	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	874	1179	443315	441598	FALSE	25	CAGACCTATAATTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448613	440380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444432_444537_444997_445070_447620_447760_448062
534352	SIRV2	+	301	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	296	-74	-296	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATGCTAAACCATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
534355	contig_5954_pilon	-	2089	3	Intergenic	novelGene_28783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1625	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGATGTGGTATTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394751	1390890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391992_1392060_1392988_1394690
534356	contig_15063_pilon	-	1138	4	Intergenic	novelGene_12657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGTAATCACAATGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	28160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34888_35872_36172_36284
534370	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	51	523	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
534381	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534382	contig_15063_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_13966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	197	1369	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34611	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
534383	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
534386	SIRV6	+	555	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9659	223	509	-76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTTGCGACAGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
534399	contig_5423_pilon	-	2443	4	Intergenic	novelGene_85257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTACCGTGGGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546514	534778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_535033_541107_542349_544404_544523_545684
534406	contig_4105_pilon	+	2579	11	Intergenic	novelGene_21465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.47338895089	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	78	1364	60529	73266	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58733	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58792_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
534416	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_16628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27851	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534419	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
534421	contig_9206_pilon	+	3222	3	Intergenic	novelGene_137492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	481	189	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	365	2284	318283	320202	FALSE	40	AACCAAATGAATCATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEFESQWGYDQRNYKGMTTTQNKNLSGTKEQHNKSWNNLHLEQSISVRKSMYQYLKHDKSFIRNLLKLKYNIGYAANKSIKYFENRLGLNFPSYLDELQRFQTEEKIYECSQVEKSIKNCSSISSLQRFPPIVKTNICNKNGKDFLSPLPTQLQTTHIREKPYKCNECGKTFSQCSVLTKHERIHSEHRPYKCNECGKAFKQFSNLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFNQNSHLVSHCRIHTGEKPHKCNVCGKVFNQNSHLASHCRIHTGEKPYKCMKCGKAFNKRSYLWDHERIHTGEKPYNCTECGKAFRQWSSLRIHRRIHTGEKPYKCNECGKAFKQCSHLTKHQNIHPGEKQHKCNVCGKTFIHGSGLVKHQRIHTGEKPHKCNECGKAYIQSSSLVEHRRIHTGETPYKCNECGKTFTVRSSLTKHKRNHTGEKPYKCNECGKAYTKFAHLTRHQKIHSEKKHCESDVGGSAFIHSSTLGGCQRAHSREKPYKCNECGKSFNWSSRLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKAFSQNSNLTTHQIIHTGEKPYKCNECDKDFKQYSSLIRHQNIHPGEKPYKCSMCNKAFIRHSHLWGHEKIHTGERTYKCIECGKTFRQWSDFRIHQRIHTGEKP	305275	321140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_305433_307266_307334_318142
534422	contig_8616_pilon	+	1537	9	Intergenic	novelGene_72580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	913.280548010851	4	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	533	1462	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425767	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_428126_428649_428794_430515_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
534442	contig_21027_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_127574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_1	0	7	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1183	1509	6371	8128	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	5188	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_6482_7912
534447	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCATCCCCCTCGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
534452	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
534455	contig_10246_pilon	+	2461	7	Intergenic	novelGene_46900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	263.782107050497	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	403	822	175160	184738	FALSE	20	ACTCGGTGAGCCTCATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140729	186377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_148218_148337_169672_169783_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
534461	contig_20614_pilon	-	2113	8	Intergenic	novelGene_107555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	178.648669009247	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	89	1138	164772	157951	FALSE	10	TACCTCCCTCTGTCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGPRETRGRFQLPEPEGSGVPSPQPDATMLSRLLKEHQAKQNERKELQEKRRREAITAATCLTEALVDHLNVGVAQAYMNQRKLDHEVKTLQVQAAQFAKQTGQWIGMVENFNQALKEIGDVENWARSIELDMRTIATALDCDWCGNLARLGAESQSKRGNCKHCSTRQLPPEELRPPPAGHLGSSMWLPLLLGALVWGVLWLLRDQQTLPRSDAFIFITGCDSGFGRLLALRLDQQGFRVLASCLTPAGAEDLQRMASSRLHTILLDVTDPQSVQWAAKWVKTQVGEAGLFGLVNNAGVAGIIGPTPWLTWDDFHRVLSVNTLGPIGVTLALLPLLQEAHGRVVNVTSVLGRLAANGGGYCVSKFGLEAFSDSLRY	164860	156975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_157958_158378_158638_158839_159186_159734_159835_160658_160730_160918_161052_163291_163365_164711
534462	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_19070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCATGACGACCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
534467	contig_5539_pilon	-	2243	4	Intergenic	novelGene_104780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2593655651606	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACGTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302033	282431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_284340_287716_287921_297220_297298_301979
534470	contig_7202_pilon	-	404	2	Intergenic	novelGene_18594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGCTGCAGAACCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	28536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
534472	contig_6975_pilon	-	2062	8	Intergenic	novelGene_74251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	445.951219076614	29	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	188	910	164514	159453	FALSE	20	TAGTATGGCATCTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169971	158300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_164402_164538_169807
534478	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
534493	contig_17274_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_26561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201888	197635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_198009_200353
534510	SIRV5	-	469	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACGGGTGACTACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
534513	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10520	2	1283	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
534524	contig_10926_pilon	+	2673	5	Intergenic	novelGene_137509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	77.7122094654373	722	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	101	583	289095	293073	FALSE	15	TCACTGTGTGAATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLAGIFVVHFATVAMLFVSTIANVWVVSNNGSESVGLWKNCTQGNCNQDLSYAYEDALKSVQAFMILSIIFSVISLVVFVFQLFTLEKGNRFFLSGATMLVCWLCIVIGASIYTHHYANGKRNNFIGSHHGYSFILTWICFCFSFIIGILYLVLRKK	271494	295163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_271554_289053_289173_291524_291622_291732_291874_292906
534538	contig_5033_pilon	+	2338	7	Intergenic	novelGene_28940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1173	1490	453045	453362	TRUE	25	TGTCAGCTGAACTCCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGCGKFSPEGLQRPYLSIRTSSWAPRDRQTEDSVTEGKAFPTTSPPLLADAPGELEGAQAGPRSGLDSLSVHPGGRPDRSTPCSTCLSSRWGLEGWPVLTIDK	450248	465131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_451948_452642_452803_452905_453461_456495_456602_462970_463033_464549
534540	contig_9345_pilon	-	1882	6	Intergenic	novelGene_24403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	565.083569040899	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	76	654	176056	142579	TRUE	30	ACCAGAAATGTCTTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRRKHAHLTRPTASPHVQCRPLWLPPHAPSARDAGSTLPDAVPTTLPSPAHGPTCLP	176131	141196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142686_142895_143072_148863_148948_173643_173789_175989
534543	SIRV6	+	648	7	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-283	32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGCAGTTAAGTAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002	11363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2625_2740_2829_3106_3163_10724_10819_11034_11109_11205
534547	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	635	1120	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
534553	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
534563	contig_12427_pilon	+	2996	23	Intergenic	novelGene_40488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	172.194969258735	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	127	2637	397813	419950	FALSE	30	GTATTTATTGAATGACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKLDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNYRGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397686	420309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399632_399672_399853_399934_401068_401145_401423_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
534568	SIRV7	-	331	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	11	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
534594	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534597	contig_6589_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_26291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1	507	2290262	2273718	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQRLLTPWRRKREAAAASAEERRLERTAQKSPQGCRRRRICFGSLSSCCHREPEPCTLCLHCHHTSLVCHSQPLTLPPSNLSCSPRDWGTGLQFKGPWNGFQRVYGDVHCCCRHHHCHRLCLESETTGSIRAPQYCAHCRNRSVWPRCSLGGPYQPRPDLCPAGEPDQ	2290262	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274058_2274712_2274793_2290175
534626	contig_10904_pilon	+	1736	4	Intergenic	novelGene_22657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	681	junction_1	1004.33073348485	131	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	53	571	530908	534035	FALSE	25	GAATTGGTGTTTATTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRYCLCRAAWVPLSYPLLSVGRSHCCPYFLCSLRRWHV	530610	535200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530638_530882_531005_531238_531362_533736
534627	contig_18113_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_137545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTGGAATATGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230620	230262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_230300_230600
534637	contig_15063_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_10599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	233	1132	34808	36388	FALSE	30	CAGTGGCTGCACAAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFV	27136	36388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
534644	contig_8317_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_20018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAACTTGACCAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16416	16733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
534670	scaffold_12124_pilon	+	2517	12	Intergenic	novelGene_22007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	158.649100817126	6	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	172	1059	799011	807554	TRUE	30	CTACAGAGATGCTTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791864	815329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816_809950_810456_810488_810647_810745_813915_813998_815122
534675	contig_10058_pilon	+	2964	9	Intergenic	novelGene_67696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	95.6529370955226	14	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1895	2338	52117	53244	FALSE	0	TTTTTTTTTTTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	49113	53870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
534708	contig_7202_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_18065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28073	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
534712	contig_4065_pilon	-	2979	15	Intergenic	novelGene_133398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_14	76.1180608244421	206	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	252	2411	575637	532915	FALSE	35	GAATTGAGACCTTGCGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNHVSSKPSTMKLKQTINPILLYFIHFIVSLYTILTYIPFYFLSESRQKSNQIKAKPVNSEPQSAYRAVNSLGGLASVLYPGCDTLDKVFTYAKNKFKKKRLLGTREILTEEDEVQPNGKIFKKVILGQYNWLSYEDVFIQALNFGNGLQVLGQKPKTNIAIFCETRAEWMIAAQACFMYNFQLVTLYATLGGPAVVHGLNETEVTNIITSKELLQTKLKDIVSLVPRLRHIITVDGKPPSWSEFPKGVIVHTMAAVQALGANANVENKPHSKPLPSDIAVIMYTSGSTGLPKGVMISHSNIIAGVTGMAERIPRLGQEDVYVGYLPLAHVLELSAELVCLSHGCCIGYSSPQTLADQSSKIKKGSKGDTSVLKPTLMAAVPEIMDRIYKNVMNKVNEMSSFQRNLFILAYNYKMEQISKGHSTPLCDRFVFRKVRSLIGGNIRLLLCGGAPLSATTQRFMNICFCCPVGQGYGLTESAGAGTITDVWDYNTGRVGAPLVCCEIKLKNWEEGGYFNTDKPHPRGEILIGGQNVTMGYYKNEAKTKIDFFEDENGQRWLCTGDIGEFDPDGCLKIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNLPLIDNICAYANSYHSYVIGFVVPNQKELTELARKKGLKGTWEELCNSCEMENEVLKVLSEAAISASLEKFEIPAKICLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELKTHYQADIERMYGGK	606978	532346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_533073_537024_537183_539173_539289_540798_540991_542038_542114_554280_554454_556053_556194_557839_557912_558147_558272_559953_560105_562271_562411_563238_563349_565931_566110_575262_575673_606762
534733	contig_12031_pilon	+	3380	1	Intergenic	novelGene_137563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	753	2627	3379	279617	280369	NA	10	TAGCGGCGTGGGGCCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPAYDQDGHLLGPVDERQAEAHTLVWLGRARGQHNQLLAVQAGRRLGKERGRVPVIPHAQQHQVKAAVGHLGGNLLGVELAALVFFSTEPLVQAHGHGVDVEVGDVDVLQQVGLQAPEVGLWVCGQDAALVHQPQMCVGPREAKVPQGQLLQQGHGARATRKRQVELAKALHCPRGHGLDVAGQLSNQLLGPGQDQWALTVCGLEGPEVTGHWGSARPGHQLLQLLLGKGQLAATELEVQQVPILGSSR	276990	280370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_277000_280400
534735	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534737	contig_6227_pilon	-	1488	11	Intergenic	novelGene_49633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	289.653327272448	19	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	206	1486	395173	345863	FALSE	30	ACAAGATTGTTACTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPDSVTQERRPPKLAFMSRGVGDKGSSSHNKPKPTGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQK	406547	345860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_345879_349057_349118_353017_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_359403_359521_361757_361857_392432_392539_395032_395336_406504
534754	contig_16869_pilon	-	2418	12	Intergenic	novelGene_137586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_11	71.3295228250286	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	537	1871	79386	35850	FALSE	35	TAAAGAATCTGCTGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRAYKRLDGSMECCNNHSLTDVCFAYRNNFNKRLHTCLPARKAVEATQVCRTNKDCKKGSSSSFCIIPSLETHTRLIKVKHPPQIDMLYVGHPLHLHYTVSITSFIPRFNFLSIDLPVVVETFVKYLISLSGALAIVNAVPCFALDGQWILNSFLDATLTSVIGDNDVKDLIGFFILLGGSVLLAANVTLGLWMVTAR	84046	35302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_36073_37295_37372_39061_39258_39616_39712_51938_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_82132_82316_83855
534762	contig_15063_pilon	+	1489	4	Intergenic	novelGene_13169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
534774	contig_14353_pilon	-	2337	9	Intergenic	novelGene_82079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	526.80018745251	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	463	957	83931	80452	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104407	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83980_87291_87455_88664_88750_90961_91054_104333
534775	contig_177_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_41824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	165	395	419983	419753	TRUE	25	TGGCCAATGAAAGGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNRNLLSHSSGGWESKIRVSAVLTPSETLRENLFHVSVLASGSSRCFFAPSCSVMWHPSLCLSVCVYLLLFYKYTSHIRLGPTLHQYDLMLTKLITFSKNLFPNMLTFSDTRVRTSTYLFGGHNSIYNNI	420147	415658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_415705_417645_417772_418401_418956_419370
534795	contig_4315_pilon	+	549	4	Intergenic	novelGene_46848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1267.17033845757	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	15	371	575508	580260	TRUE	45	TCACTTAAAAGTAAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAAMASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575493	580847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086_580341_580749
534796	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534799	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
534805	contig_3068_pilon	+	2809	1	Intergenic	novelGene_137622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAAGACTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232754	235563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_232800_235600
534826	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
534846	contig_3334_pilon	-	2577	8	Intergenic	novelGene_137672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	166.155570082341	124	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	3	1154	778618	727584	FALSE	20	CTGTGTATTTGAGCCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHARIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQIAMQNQINTNPESPDTVTIHAATPQFIIGPGGVVNLTDETGVSAVQFGNSSTSVLATLAALAEASAPLSNSSETPVVATEEVVTAESVDGAIQQVVSSGGQQVITIVTDGIQLGNLHSIPTSGIGQPIIVTMPDGQQVLTVPATDIAEETVISEEPPAKRQCIEIIENRVESAEIEEREALQKQLDEANREAQKYRQQLLKKEQEAEAYRQKLEAMTRLQTNKEAV	778620	726160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_727737_733508_733625_738712_738899_756283_756398_756777_756890_761716_761912_763122_763291_778510
534848	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534864	contig_11386_pilon	+	2304	4	Intergenic	novelGene_82773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	509.059481353167	88	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	1419	2249	17940	23363	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTSQSPVRKTEATPAVWKKGIQHRALFAQVMEELRSQPGRGEAPQRRPRKPLSPCLGWAP	16521	23418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_21022_23188
534868	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534869	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534872	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
534879	contig_854_pilon	+	1674	16	Intergenic	novelGene_36551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2575.0463348582	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	77	1459	1649736	1704954	TRUE	30	AGTAGAGAGTAGGCCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGTMRARECARSWPTRSPSCRLSWTMSQVFSVSLTASPAS	1649659	1715533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685184_1704633_1704689_1704893_1704999_1705285_1705370_1715446
534881	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
534885	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534886	contig_17440_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_7561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAATAGTGAGAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420	1700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_1700
534897	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
534902	contig_9609_pilon	+	2264	12	Intergenic	novelGene_23157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	151.040906286677	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	100	1107	796792	828402	TRUE	5	CCACTGGTTCCTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLPLARVAARCRATRWSWKRQAGATSECPAGAMDGEIAAEQGDPAPPPGAPGGPGSGGDPALGGRREPKKYAVTDDYQLSKQVLGLDVYENMHHGKRCLLIVMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAGIMRDIGTAIQFLHSRNIAHRDVKPENLLYTSKETDAVLKLTDFGFAKETTQNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSDDAKQLIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSALATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGGSLASQGCNNQ	796425	829647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_796473_796739_796955_821347_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825638_825715_826058_826184_827134_827221_827502_827584_828249_829010_829097
534918	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
534931	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	29	373	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14437	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
534950	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_17645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
534951	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_18819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCCAGAACTACAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
534956	contig_7342_pilon	-	2166	15	Intergenic	novelGene_71212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.130374854034	19	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2067	99	2165	716514	679929	FALSE	35	CATAACCCTTTACTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVPSEAAPFCARSRDSTGPVLCEVGGGARAPGMAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPVEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSGEDDSDTKRLSKEEKGRSSCGRNFWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGRMISVEKAKNEPAGKKTSDKRESEGKKDKSSNSDRSAHLKRDDKADRKDDAKKGEDGSGEKGKDPDGQKSGPSERSRTTKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSGSKERASKSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPRKSRDSEPASLAATNAFQPCVPALWPPESVLLGILLNCVKINFFFICCHTVAQYNVNLGFCFLFWFFVINVFLF	716612	679927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_680130_688393_688493_690313_690403_690585_690726_691085_691169_691266_691417_693321_693417_694223_694274_694924_695445_696385_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
534964	SIRV4	+	221	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1550	632	1095	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2550	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
534990	contig_15120_pilon	+	2727	17	Intergenic	novelGene_108027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_16	40.2173295203697	157	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	159	2471	261742	358260	FALSE	0	GGCGGCTGGTTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKFLADDFDVKEWINAAFRAGPKEAAAGKADSHAATLVMKLQLFIQEVNHAVEETSHQALQNMPKVLRDIEALKQEASFLKEQMILVKEDIKKFEQDTAQSMQVLVEIDQVKSRMQLAAESLQEADKWSTLSADIEETFKTQDIAMISAKLTGMQNSLMMLVDTPDYSEKCVHLEALKNRLEALVSPQIVAVFGSQSIDQAKAFVKVFTEIDRMPQLLAYYYKCHKVQLLAVWQELCQSDLPLDRQLTGLYDAMLGAWHAQIQWAAQVFKNPHEVVTVLLIQTLGALVPSLPICLSSAVERAGPEMELTKLLEFYDTTAHFAKGLEMALLSHLHEHNLVKVMELVDAVYGPYKPYQLKYGDMEGNNLLIQISAVPLEHGEVIDCVQELSHSVNKLFSLASTAIDRCVRFTNGLGTCGLLTALKSLFAKYVSDFTNTLQSIRKKCKLDEIPPNSLFHEDWTAFQNSIRIIATCGELLRQCGDFEQQLANRILSIAGKYLSDSYCPRSLTGFQDSILTDKKSTAKNPWQEYNYLQKDNPAEYASLMEILYTLKEKGSSNHNLLSASRAALTRLNQQAHQLAFDSVFLRIKQQLLLVSKMDSWNTAGIGETLTDDLPTFSLTPLEYISNIGQYIMSLPLNLEPFVTQEDSALELALHAGKLPFPPEQGDELPELDNMADHWLGSIARATMQTYCDVILQIPELTPHSTKQLATDIDYLTNVMDALGLQPSRTLQNIVTLLKTKPEDYRQATKSLPRRLAATIAAMRGVAY	261583	358516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_261911_263575_263725_265286_265404_269577_269747_289890_289974_290722_290846_307854_308054_315608_315737_316727_316883_325603_325721_329339_329406_333057_333245_336571_336713_341951_342036_348615_348731_352737_352882_358093
534999	contig_14925_pilon	-	995	5	Intergenic	novelGene_55159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	1552.7624576863	159	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	202	459	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYKYVFGAGTRLKVLTNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	77400	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_77351
535000	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
535002	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGATCAACCTGGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
535014	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_16608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27846	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
535029	contig_14814_pilon	+	2661	2	Intergenic	novelGene_137716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1173	junction_1	0	66	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATACATCTTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280697	283780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_282992_283413
535047	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535056	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
535092	contig_15185_pilon	-	1909	8	Intergenic	novelGene_99439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	329.51987335937	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	522	1451	450401	429911	FALSE	0	TCTGTGTGCTGTCTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	450922	429452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_450397
535104	contig_15185_pilon	-	1379	9	Intergenic	novelGene_99445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	329.864366065812	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	11	1174	472420	429663	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQDPGGEEASCPCSCPASRTLSETALGSQKGRGICSPLQGWTKSSPEQEGPLALCLQPLTCLRSM	472430	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_429853_429992_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
535115	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
535132	contig_1090_pilon	+	695	8	Intergenic	novelGene_131098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	118.690473802359	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	21	596	148314	208273	TRUE	20	AGGTTCTGTGGAATGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPTEDMDEDGLPLMGSGIDLTKVPAIQQKRTVAFLNQFVVHTVQFLNHFSTICEEKLADLSLRIQQIETTLNILDAKLSSIPGLDDVTFEVSPVSVTNGPQSEAASEQSQQNSIQDSGPQESEVAAENILTVAKDPRYARYLKMVQVGVPLLAIRNKMISEGLDPDLLERPDAPVPNGEGEKNTEESSDSESSFSD	148293	214055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_148365_148927_149027_157265_157332_172355_172455_176731_176843_197723_197789_208188_208306_213988
535134	contig_7091_pilon	+	2218	17	Intergenic	novelGene_131769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	335.964417526246	601	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	439	1746	368213	435147	FALSE	40	CTTACTAAGTGATCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKDYHEEKKVLNGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349678	435619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_361875_361940_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
535146	contig_14871_pilon	+	2297	12	Intergenic	novelGene_63692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	817.235118964807	3	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	193	1428	213505	233350	FALSE	5	TCTGTGTGGCCGAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAELSVSLCAL	193765	234219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_193813_201879_201992_213471_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233134_233322
535153	contig_3426_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_57931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAATTTTTTTTGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272955	274694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_273000_274700
535164	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535167	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33226	0	7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
535168	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGCCGCCGTCAACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
535176	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535181	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_16476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
535182	contig_15063_pilon	+	1201	3	Intergenic	novelGene_14355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
535183	contig_1274_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_137794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCATTTTGAGTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121678	122631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_121700_122600
535184	contig_1274_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_137795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCAGCTGTGGTCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122883	125269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_122900_125300
535190	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
535201	contig_9482_pilon	-	2573	16	Intergenic	novelGene_44256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_8	58.3511972646853	1436	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	48	1841	773701	738770	FALSE	0	TGTGGCCGCTCTTGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKVTFLSSASTALSMRHNSVFGDLKADETELLYSAYGDETGVQCALSLQEFVKDAGRYSQKLVDDLLDQITGGDHSRMLVRLKQRRSIPMKPPDEVKVGDSLGDGGGSVLDFMSMKPYSDVSLDISMLSSLGKVKKELDHDEGHLGLDETTKLLQDLHEAQTERGGSRPSSNLSSLSNTSERDAHHLGSPSHLSVGEQPDVAHDPYEFLQSPEPAASTSS	773748	738037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738871_740661_740830_742838_742942_744776_744816_747459_747572_748086_748220_749002_749099_751176_751253_754752_754886_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
535222	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_16460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
535233	SIRV4	+	1545	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGCTAGAAACAGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1685_1886_2389
535276	contig_18420_pilon	-	1698	11	Intergenic	novelGene_109358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	353.311533918722	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	7	1275	142774	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIARPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142780	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111154_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
535297	contig_7898_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_47636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	706	1131	718842	719267	NA	5	AGTGTGCGGCCTCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKAPHYPCVRALDPTTEGRDCVPCRKVASHQTRQISELGLTSHLGALRVAVPVCCWGSGVAVLPSSSSVDRQQHCLLPLCFSSWSLSWDLYVPKSLLSATEAQSGEVLLFNIKIFNRHVVSALPRVCLGNVPQGRLSLEP	718136	720791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_718100_720800
535309	SIRV6	+	661	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-364	486	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAATGGGGTTTGCCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
535319	SIRV2	+	267	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	330	-74	-330	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGACCACCAGCACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
535326	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	19	357	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14427	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
535334	contig_15570_pilon	+	1770	13	Intergenic	novelGene_137851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_3	370.818941668303	740	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	528	1565	692194	740309	FALSE	40	TAAAAACCAGAGGCCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPIFEEASNVIKEEYPNENQVVFARVDCDQHSDIAQRYRISKYPTLKLFRNGMMMKREYRGQRSVKALADYIRQQKSDPVQELHSLEEITTLDRSKINIIGYFEQKDSDKYRVFERVASILHDDCAFLSAFGSVSKPERFSGDNIIYKPPMLSAPDMVYLGSMTNFDATFSWIQDKCVPLVREITFENGEELTEEGLPFLILFHMKEDTESLEIFQNEVARQLISEKGTINFLHADCDKFRHPLLHIQKTPADCPVIAIDSFRHMYVFGDFKDVLVPGKLKQFVFDLHSGKLHREFHHGPDPTLDIAPGQESQDVASSPPESSFQKLAPSEYRYTLLRDRDEL	655860	740514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_656127_686130_686204_687918_687959_691013_691146_692177_692294_709097_709283_710296_710413_713399_713458_715164_715282_723505_723618_724579_724722_737313_737420_740207
535344	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_94390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657167	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657169	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
535352	contig_11088_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_85030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	57.9271573232759	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13623	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_16250_16348_17119
535404	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
535405	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535409	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535461	contig_14811_pilon	-	1438	4	Intergenic	novelGene_74487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	108	junction_1	269.422839912778	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACCCCAAAGTGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386628	356580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375281_375519_375695_375765_386528
535466	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
535476	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
535483	SIRV7	-	261	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69024	1	35805	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78933	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
535489	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
535504	contig_15354_pilon	+	2587	5	Intergenic	novelGene_65760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	35.7866944547831	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	470	1198	642871	647109	FALSE	30	GCTGCCTCTGCTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	642401	648498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085
535508	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	643	1115	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
535527	contig_7171_pilon	-	2169	26	Intergenic	novelGene_101303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	115.648086884306	39	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	86	2011	1075756	1057779	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRERRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLASYGWGSTPGLLEAWSAGVGSRLRPAAAGAERPHPHLPSSWLPQACGGGDASSR	1075841	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
535528	contig_5988_pilon	-	1594	4	Intergenic	novelGene_15972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	89	1444	655459	651962	FALSE	60	CAAAGTAAAAGTATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655547	651811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
535531	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535542	SIRV4	+	505	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	445	0	-445	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATTGCCATTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
535544	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
535570	SIRV4	+	286	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1485	632	1030	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
535572	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
535587	contig_11548_pilon	+	2005	11	Intergenic	novelGene_66733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	726.118723074953	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	206	1543	63836	119638	FALSE	20	TTTTCCCTGTAACTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63630	120100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
535618	contig_12873_pilon	+	1388	5	Intergenic	novelGene_27225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_1	1003.98369010657	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	323	814	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	17095	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
535621	contig_16098_pilon	-	2210	17	Intergenic	novelGene_45845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	375.326274726404	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	192	2126	228571	201500	FALSE	25	TGCTACAGTTCCTAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIPRGLFEVLRTRGEAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230493	201415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201739_201783_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214576_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215649_228516_228592_230174_230286_230433
535627	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
535648	contig_14711_pilon	+	1678	10	Intergenic	novelGene_68914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.486100879242	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	842	1435	89183	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKFISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85450	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85593_85912_86009_86151_86166_87770_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
535654	contig_14744_pilon	+	1035	7	Intergenic	novelGene_66049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4041.81979091377	14729	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	29	601	1382976	1385279	TRUE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGKKILGFYILSNLNF	1382028	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385335_1385820_1386006_1386499
535688	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535700	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	636	972	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
535706	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
535722	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
535738	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
535744	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
535758	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535769	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535774	contig_4125_pilon	-	863	2	Intergenic	novelGene_25086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	543	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGATAGCCCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535988	534779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_534869_535214
535777	contig_13740_pilon	+	1149	3	Intergenic	novelGene_34717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTACACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160701	162226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_160798_160975_161719_161916
535796	SIRV7	-	354	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-8	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114746	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
535799	contig_15449_pilon	-	2823	1	Intergenic	novelGene_33572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTAGATAGCTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22077	19254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_19300_22100
535821	contig_4105_pilon	-	2365	9	Intergenic	novelGene_21476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.661437827766148	2	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1359	1718	72750	71145	TRUE	45	AAAGAAGGAATGGGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLYLFAIIFLLFLFLFLFPLLVQVHDIPDIPDSPSSRGQDHCVTTVIAVTLTVQNVVPGEHDSTAHNVPFVTAGPKRVPHTTAMEDLAIICMIGHRPSTPSRMPVLGIILQARPKAM	74475	61697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_61774_62285_62411_62725_62862_63710_63897_71020_71167_71619_71680_72378_72501_72594_72770_73136
535829	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535836	contig_7695_pilon	-	2702	4	Intergenic	novelGene_41575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	94.3197870132361	312	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	383	2038	391241	388811	FALSE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	397120	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793_391259_396703_396825_396876
535838	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_19093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
535852	contig_15498_pilon	+	2587	9	Intergenic	novelGene_42631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.75466993323	4	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	518	1312	682266	686124	FALSE	25	TATCTGGCTTTAAGAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675012	687399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675042_679269_679456_679523_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866
535853	contig_5210_pilon	-	2163	5	Intergenic	novelGene_65409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	195.474263011784	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGACAGCTGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444367	430113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_443013_443119_444156
535856	SIRV4	+	279	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1492	632	1037	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2492	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
535860	contig_6227_pilon	-	1471	13	Intergenic	novelGene_49719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	348.256640281273	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	42	911	1224979	1203369	TRUE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDGAPGHGKECRGLGEAVATQGL	1225020	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203629_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
535886	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
535893	SIRV4	+	288	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1483	632	1028	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2483	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
535903	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
535929	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
535940	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
535947	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
535948	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_115741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
535962	contig_6102_pilon	-	1771	10	Intergenic	novelGene_32125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	304.713344345505	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	29	1615	822105	816763	FALSE	10	CTCAGATCTGTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822133	816606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
535972	contig_11003_pilon	+	1098	5	Intergenic	novelGene_105435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	141.263052494274	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	49	750	56015	72689	FALSE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLAQESAHCWPPAPSMGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHPRAPLGLCPSSRCPCNRHCLTLCHLLCTCPGSPQLPPLPGS	55966	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62895_72563
535973	contig_18794_pilon	-	2697	8	Intergenic	novelGene_54655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	80.3718399258175	692	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	117	959	353203	325647	FALSE	30	CTTGCATAATTACATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPLLLTVTRSKAGWPRTLAAASPCRCVKLLLLLPFGFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404658	323908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330139_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145_353212_404550
535975	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_89089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
536015	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_95856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536028	contig_1532_pilon	-	2040	9	Intergenic	novelGene_37445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	371.713914691124	908	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	196	1443	51365	41713	FALSE	15	ACCATTTGTTTGTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLHVANAIFALNFFKHLANTSPTQNLFFCPWSISSTMAMVYLGARGNTADQMAQVLQFNKVGGHKIIPVTPRKFTSCEIRQWIQKATYPDAILQAQAGNTIHSSFQSLISAINSSSGGYLLESINQLFGEKSTRFNEEYVKLCKKYYSTEAQAVDFLEHAEEARKKINSWVKTQTKGKIPNLLPEGSVDRETRMVLVNAVYFKGKWKTPFQKKLNGLYPFRVNATERKPVQMMYLHERLNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDGVADVSTGLELLEGEITYDKLNKWTSKDTMVEDDVEVYLPQFKLEKRYELKPILRSMGISDAFSKGQANFLGMSERNDLFLSEVFHQAAVDVNEEGTEATAGTGAIMTGRSGHGGPQFVADHPLLFFIMHRMTRSILFLGRFSSP	55488	41115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_42118_42429_42595_43684_43828_44479_44598_45389_45519_47118_47239_51197_51375_51466_51610_55445
536041	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	29	364	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14437	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
536050	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
536056	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536065	contig_10235_pilon	+	2171	6	Intergenic	novelGene_46413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	225.922995730846	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	28	618	210483	211768	TRUE	20	CCTATCTCTGCATACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFGETNSTPFFYSHIPHPSVPES	210455	213519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211924_212047_212147_212220
536074	contig_8616_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_72440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1169	junction_1	0	164	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	26	346	255468	255148	TRUE	15	TCATCTTGGTACTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPGGKGTMALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQVRLRGGDSLGLGRTGGGLANPEPESRAAFWSFPGRPRPARCFSVVYRGDAAMLIELCSPARPGYTSKSFPCKKG	255493	253304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_254223_254302
536077	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_19069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCATGACGACCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	29917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
536082	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536083	contig_4876_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_137904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434289	436209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_434300_436200
536104	contig_20641_pilon	+	1618	7	Intergenic	novelGene_52859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	32	1363	14659	56882	FALSE	35	GTAATTCTACCAGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14627	57137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
536116	contig_5033_pilon	-	1491	10	Intergenic	novelGene_28978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4067.5864928165	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	216	920	540619	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLAVEHCKRHVWN	542692	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531175_531744_532161_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663
536117	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536121	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
536135	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
536139	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
536142	contig_10734_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_51523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGGTTCCCTTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2276962	2276672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2276700_2277000
536171	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536175	contig_8729_pilon	+	2086	3	Intergenic	novelGene_40145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	285	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTGGCGTGTCTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675429	679822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_675539_676852_677498_678490
536189	contig_12675_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_137925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGCACAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30276	32023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12675_pilon_+_30300_32000
536190	contig_3956_pilon	+	1529	8	Intergenic	novelGene_15191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1527.98592257646	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	9	1067	1282731	1290491	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282722	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285096_1289810_1289892_1290297_1290661_1290717
536204	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
536216	contig_5643_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_38878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5483	junction_5	1693.3774062506	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	584	1009	237186	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236509	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
536220	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536221	contig_5003_pilon	+	3485	2	Intergenic	novelGene_120195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_1	0	78	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	285	368	81843	81926	TRUE	70	AAAGAAAAAAAATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRHSTWRSRPPLEAEELGTQRVWAAQPEDQRSWPRRPRLWWLRRLRGFSEGPLDAATRGERSAPPHPPVQGPAPCPVPTPALHLAAPRACHLHPMQNVGGGVPRGTPPGQGSRQPPSFLSK	81558	87868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_82693_85517
536222	contig_6215_pilon	+	1128	4	Intergenic	novelGene_21175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	3.09120616516523	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	70	528	161679	191404	FALSE	35	TTTGTAAAGATTTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATAAATSSFGCRIWNPCASLTMKQSSNVPAFLSKLWTLVEEAHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIIKQERDGPVEFQHPYFKQGQDDLLENIKRKVSSTKPEENKIRQEDLTKIMSSAQKVQIKQETIESRLSELKR	161609	192004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_161772_190232_190342_190495_190624_191275
536223	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
536228	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536231	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
536232	SIRV6	+	250	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8467	-1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
536244	contig_5136_pilon	-	1952	12	Intergenic	novelGene_126614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	314.610135231023	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	65	1219	207337	190837	TRUE	20	CCACCTTTTACACATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTCDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCISGVNTWRDQLKPTQLLHSVARFKGYLPPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANRILHQHLGAPDERLALHILRTQGLVPEHVETRTLRSTFQPNISQGRLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDIILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSVDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHHTIIPAKSSEKCHLDMVPDLKAMDPLKAKTASLFEQKSMRGWWPCYADKDGSRVLAGESGDDVGNPQRKGGRREASREGTG	211376	187749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_188302_190270_190419_190803_190915_193021_193213_195453_195554_197575_197718_201574_201671_201758_201848_204075_204216_206291_206441_207167_207339_211313
536245	contig_987_pilon	+	1883	10	Intergenic	novelGene_72299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	431.982509934012	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	354	713	956443	962510	TRUE	35	TTCACTTTTTAAAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHR	945375	968498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945476_946227_946465_956426_956462_957008_957141_962301_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_967656_967694_968353
536251	contig_10235_pilon	+	1830	3	Intergenic	novelGene_46455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_1	96	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAAAACGAATGTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211606	213691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211704_211834_211924_212047
536254	contig_10134_pilon	-	1820	4	Intergenic	novelGene_16257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAGCATTTGAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39673	32509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38814_39584
536259	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
536272	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536289	contig_8661_pilon	-	1335	11	Intergenic	novelGene_137930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	595.794629045949	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	377	1021	312756	301399	FALSE	20	AGTAGCACTGTTTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRANSVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316087	301084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312738_312903_313805_313886_315937
536294	contig_7391_pilon	-	1731	4	Intergenic	novelGene_112163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	130.907940511219	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	58	483	457964	439954	FALSE	25	AAATTGTCTGTGTGTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARQRLEGRGGGAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKIPPQAGTLMYPLAERRVSPTSSPEHHSFVSAARAMVPFTPRTNFLKFCAWGDL	458238	438705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_451552_451706_457853_457987_458203
536297	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
536306	contig_8978_pilon	-	1580	8	Intergenic	novelGene_49325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	792.846486414872	3751	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	107	1228	194082	190773	FALSE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194188	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
536307	contig_15063_pilon	-	1496	5	Intergenic	novelGene_11993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCCCAGTAGCTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36766	27148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35379_35840_36156_36264
536335	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	636	971	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
536339	contig_15449_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_33625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	856.838520375922	3148	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	195	569	84815	88945	FALSE	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	62214	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_67996_68052_84788_84953_86000_86181_88888
536375	contig_610_pilon	-	2675	6	Intergenic	novelGene_76817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	67.7152863096657	105	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	49	1491	343470	332842	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSGAAGHLAHSWDSLKEGASPSPLSLSPAEPPEGGSQNPLGCVLREDSDPPLPGALRGA	343518	331657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_333015_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338808_343421
536388	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536392	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCAGGACTCGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
536425	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536440	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
536484	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_95887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
536487	SIRV6	-	292	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAACTTTGACGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
536492	contig_10135_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_106676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACCCAGCAGATGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237381	239473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_237400_239500
536500	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_17493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
536502	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536508	contig_15063_pilon	-	1729	8	Intergenic	novelGene_8443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	978	1301	35891	35108	TRUE	25	ACCCCAGCATTCAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39765	24222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_24231_27140_27170_34608_34918_35025_35380_35839_36158_36264_36597_38972_39091_39504
536522	contig_14711_pilon	+	1758	12	Intergenic	novelGene_68898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	359.961131969725	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	48	1379	82000	90138	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAAAGGRAALHAPAMVALLTVLGFLLALSRGERELDTKIPSPGGGHGMGGILTCLYWGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHSGGGGRRQGRAKSETSRKGSRPHPGHCAGLHRRHCGSGAGPGPGLPYLSGNL	70419	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82130_85518_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89621_89673_90032_90194_90489
536532	contig_3627_pilon	+	1122	3	Intergenic	novelGene_78492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5605.5	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	206	454	634068	634316	FALSE	45	GTATAACCAAAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNREVGVQAAGATVCWSPWRSSSSATNWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621257	634984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621343_630880_631000_634066
536541	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	226	-4	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
536544	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
536566	contig_401_pilon	+	2061	8	Intergenic	novelGene_42875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_1	147.91392974377	1823	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	23	421	1749725	1764546	TRUE	5	CTGCCTTTGTGCGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGG	1749702	1768491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764745_1765957_1765997_1767088
536578	contig_9919_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_137973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599320	601037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_599300_601000
536579	contig_3818_pilon	+	2125	13	Intergenic	novelGene_99299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	135.694586602905	440	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1355	1957	982979	990624	FALSE	20	CATGCTACGTGCCAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKEGRKKSVRVLVAVGNGRGAAGFAVGKAAERMDAFRKAKNKAVNFLHYIERYGDHTIFHDVSLTFKRTHIKMKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961579	990792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_966726_967375_968211_968350_973411_973538_976245_976480_978585_978621_982960_983052_986166_986214_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
536586	contig_15063_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_10178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3857.41256111745	6	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	236	1477	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEAPFLHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27131	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36175_36277_36600_38975_39092_39506
536588	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
536590	SIRV6	+	391	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10434	1	1197	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11434	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
536612	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
536643	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_95026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536661	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536667	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_95845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536672	contig_11720_pilon	-	1847	2	Intergenic	novelGene_43759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1317	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	11	778	16869	16013	FALSE	20	TTGGCCCTTCTGGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQTMADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKHHLVKFICLGIWVLSLILSLPFFLFRQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYALLAALQPGSGHRHPDEDWGDQGDL	16879	14943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16090_16178
536673	contig_8317_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_20633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
536678	contig_11338_pilon	-	1832	11	Intergenic	novelGene_6225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	99.7310884328453	8	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	113	739	17283	14153	TRUE	25	AAACCTGACTCCCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLGSPP	21394	12415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12882_13032_13118_13458_13760_13880_13964_14167_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
536680	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
536682	contig_3077_pilon	+	1798	10	Intergenic	novelGene_26605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	17	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	147	1298	9676	17590	FALSE	15	CGGCACTTGCTTCAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
536689	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
536695	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536730	contig_15384_pilon	-	2497	20	Intergenic	novelGene_85142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	64.7060260415843	87	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	47	886	127943	125570	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLRSRPSPGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRR	127989	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_120043_120301_120383_120461_120546_121025_121165_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
536738	contig_12622_pilon	-	1871	15	Intergenic	novelGene_6027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	355.946797216915	1880	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	67	1497	1691275	1685486	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691477	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691411
536743	contig_2027_pilon	+	2351	17	Intergenic	novelGene_39907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	325.234909094565	10	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	723	2156	129185	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	125999	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_128959_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
536750	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
536764	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
536790	contig_16098_pilon	-	1655	11	Intergenic	novelGene_45942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1452.82655881561	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	226	1152	352350	349356	TRUE	30	AGACTCTGAAGACTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKLQGVPAWHGLHAQTWPGGEQV	354214	348285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348506_348845_349062_349172_349231_349346_349422_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
536793	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_18159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536797	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536800	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
536801	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
536812	contig_233_pilon	+	2286	9	Intergenic	novelGene_14579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	339	848	78477	91651	TRUE	5	TGGCCCTGATGCTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78138	127005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92380_93793_94007_94722_94914_98310_98454_109458_109978_126899
536818	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	45	3412	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
536823	SIRV4	+	300	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	635	1013	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
536832	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
536835	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_115858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
536854	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536864	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
536873	contig_10235_pilon	+	1448	4	Intergenic	novelGene_46429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	237.8963359673	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTCCCTGTAGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210468	213158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_210865_211813_211924_212047
536887	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
536905	contig_3960_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_138034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACAAATGCTGTTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570700	570875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_570700_570900
536929	contig_5964_pilon	-	2572	4	Intergenic	novelGene_80368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	106.396532942677	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	700	1206	116254	115748	FALSE	45	ACAGACAAAAATGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFRVRTNPLKVMDMRKNSMLTHSLLKKRKLTIVISPMTVVNVEKRSARSHISLDIIKLIQARSLMNVSSVGKPFLRVHTLLHTRELILEKNLMSVTSVEKTSAISPPSLDIINFILERNPMNAWIVGNPTLRNHTSLSIRESIQEKNLMNVMNVGKLLLQSQSLCNM	129477	114381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_116633_128252_128312_128908_129150_129456
536933	contig_4364_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_3604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533050	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
536937	contig_14300_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_133134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGCATTGAGTATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406127	403309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_403300_406100
536948	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_94278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
536956	contig_11003_pilon	+	1844	10	Intergenic	novelGene_105432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	183.070990750367	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	124	1428	56015	72538	TRUE	5	CCGCAGCGTCCTGGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW	55891	73039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476_72597_72681
536981	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_16575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
536986	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537000	contig_3700_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_138089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAAAGATCATAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282654	284624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_282700_284600
537007	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537015	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_18711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGAGCTCCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
537022	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
537032	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10519	2	1282	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11519	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
537042	contig_7202_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_16451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27811	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
537048	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_17646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
537053	contig_2069_pilon	-	595	4	Intergenic	novelGene_23505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	891.083734686153	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	65	346	1509802	1508747	TRUE	5	GCATTGTGTCTGTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509866	1508365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508599_1508730_1508813_1508942_1509111_1509754
537059	contig_12270_pilon	+	605	2	Intergenic	novelGene_113187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	747	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	13836	14364	FALSE	20	AAGCCTTTTGTATTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13835	14663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
537089	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
537090	contig_11126_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_138111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCTTTTGATACAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130952	131891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_131000_131900
537098	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
537114	contig_9706_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_20797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCTCTGGCTATAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2063	1764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1800_2100
537122	contig_4659_pilon	+	2739	10	Intergenic	novelGene_118201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	59.6609763477387	376	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	312	1556	191727	208048	FALSE	5	TCTGAGTCTTGTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKQYKSQFEAQNIWYEHRLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	187743	209231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187964_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559_199738_201057_201210_204160_204302_205905_206069_207957
537138	contig_14925_pilon	-	996	5	Intergenic	novelGene_55158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	1560.06656508625	158	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	203	460	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKLIFGTGTRLTVFSYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	72483	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_72433
537148	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537168	contig_1948_pilon	+	1700	3	Intergenic	novelGene_31140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	588.5	309	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	337	1110	122946	123719	FALSE	5	TTTCCACGTGTTGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSKKTYNSFQDELEDYIKVQKARGLEPKTCFRTMREDYLETFGYKEEVDSRPKYRMSDQRLPSETVQTYPGSYNIPQTLENQLPQRLPAHDSRLRLGSPSYCQFTTDYSSEKPVPLNLSQQEYNCGSYSGESAVYKHLSSENSTSAHQASHKQLHQKRKRHPEEGREKPEEERPKHKKKKSCEEMDLDKHQSIQRKKAEVEAVSVSTEKLKNRKEKKSREVSSKKEERKRRKEKKDQGQERTEEEMLWDQSILGF	103627	124309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_103771_119474_119646_122923
537193	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1582	632	1127	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
537206	contig_12623_pilon	-	2822	8	Intergenic	novelGene_138163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	177.046978661205	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	12	1133	177710	51811	FALSE	5	GTACCTTGTTTCCCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGSPTPPLPSVMSPSRVAASRLAQQGSDLIVPAGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177721	50121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_141648_141745_147430_147540_177617
537207	contig_12638_pilon	+	1619	11	Intergenic	novelGene_33136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	598.166105693059	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	312	1139	185550	199604	FALSE	15	CTTGCATTCTGATTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	182932	200084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_183050_183452_183591_185493_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
537212	contig_20748_pilon	+	2107	5	Intergenic	novelGene_138177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	231.867419013539	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	73	684	149380	185931	FALSE	25	CAATATGTAGTCTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIARVADGLPLAASMQEDEQSGRDLQQYQSQAKQLFRKLNEQSPTRCTLEAGAMTFHYIIEQGVCYLVLCEAAFPKKLAFAYLEDLHSEFDEQHGKKVPTVSRPYSFIEFDTYIQKTKKLYIDSRARRNLGSINTELQDVQRIMVANIEEVLQRGEALSGLLDHNYYSLHQTESSTTRWCPATTIDCSDRDHNRGSWTELDKM	149307	187354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_149440_158593_158704_161658_161820_164010_164158_185797
537213	contig_1275_pilon	+	916	2	Intergenic	novelGene_108830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	18364	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	88	777	747279	747968	FALSE	20	GTAGCATAATTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
537224	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
537239	contig_14815_pilon	-	2038	3	Intergenic	novelGene_127209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	686	junction_1	108.5	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1007	1630	20027	17106	FALSE	35	TGATCTACTTAATATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSNFVCTCSGFIQEAKFCDLMLSDLPFRLSAYTTCVFHISEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	21033	16697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747
537249	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537256	contig_10323_pilon	-	2160	13	Intergenic	novelGene_123565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	1123.82177808089	114	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	45	794	531203	452590	TRUE	25	GAATTTAGCAATGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPAVHNTELDCLSPEAQRLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLVWFGPRVLA	531247	446287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_447164_448195_448301_449824_449905_450804_450923_452277_452328_452452_452619_463310_463453_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208_474245_513276_513364_531137
537272	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
537276	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
537283	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537284	contig_18184_pilon	+	3028	5	Intergenic	novelGene_123852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.3739406695128	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	494	2008	48717	61937	FALSE	25	TGTGTAAACCTTCTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGDSPSLVAGGLFIIHTGGKTYQCKEYIETFSEVPSFDIYHRLYSKEKSVTCSECGKGFRYISGLRNHHRVHMGKNYYMLDGCGKEVSQSSHLQTYLNAHTLEKPHKCEECGKRFRHRATLNVHYKGHTGVKPYNCEECGRGFMYPSHLREHQRIHTGERPFRCDTCGKNFHRRAALNTHCMVHTGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQREIV	37561	62957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37997_48658_48732_55969_56097_60466_61824_61921
537288	contig_10626_pilon	-	1933	12	Intergenic	novelGene_138188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	123.191982136866	573	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	137	1519	197995	10495	FALSE	5	CCAGCCTTGGTGTGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKGGDGIKAPPIIGRFGTSLKIGIVGLPNVGKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKCTWQLTEGLKFESTQQLYRTKTWRSTSIKITAKKPSQAFYSVTRGCYESGLTQRHSTTTTDWSARLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSALPKIIKAGFAALQLEYFFTAGPDEVRAWTIRKGTKAPQAAGKIHTDFEKGFIMAEVMKYEDFKEEGSENAVKAAGKYRQQGRNYIVEDGDIIFFKFNTPQQPKKK	199465	10080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_10597_13875_13999_16072_16170_16855_16997_52819_53012_59101_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
537289	contig_12425_pilon	-	2049	10	Intergenic	novelGene_46697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	598.821641246115	4	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	129	1151	211174	204225	FALSE	50	GTTTAACAAGGAACAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226620	203326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
537308	contig_19342_pilon	+	1081	5	Intergenic	novelGene_41073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	150	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	26	490	3263	6183	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3237	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_5076_5293_5413_5522_5960_5994_6139
537311	SIRV2	+	655	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-71	141	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGCCTACGTGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
537331	SIRV4	+	305	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	196	449	196	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
537348	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	-1	2974	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
537370	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537372	contig_9955_pilon	-	1499	5	Intergenic	novelGene_21291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	502	junction_2	551.70933243874	1796	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	797	1144	47731	45240	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFELSEKLTKDGTKSPSEKSFQQRSIAFSSNLNSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49898	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_47590_47737_48794_49380_49692
537386	contig_401_pilon	-	2441	15	Intergenic	novelGene_42787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.607831205939	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	88	1686	1129059	1116037	TRUE	30	GTGTGACTAGAGCGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVQLSESKRELTELRSALRVFQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDAATEDEEAAAGLRG	1131704	1113890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114441_1114868_1114975_1115937_1116045_1116836_1116946_1117319_1117416_1117939_1118066_1118523_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
537387	contig_6710_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_89700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCACTATGCACACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
537398	contig_11752_pilon	+	1276	9	Intergenic	novelGene_37583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1350.74997108088	77	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	414	983	88745	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84084	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87325_88690_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
537399	contig_11337_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_107190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199616	202390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_199600_202400
537411	contig_19342_pilon	+	1282	6	Intergenic	novelGene_41104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	242	697	4218	6183	FALSE	25	AACCTTCCAGAATCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRAQVRGATRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGASGSDSAQGSYVSLTA	3618	6768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3655_3770_3892_4133_4377_5165_5293_5413_5534_6133
537412	contig_14467_pilon	-	2925	19	Intergenic	novelGene_138216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_5	129.316150061261	487	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	202	2580	90158	57859	FALSE	25	GTGACTGTGTCAGATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVIKRDGRQERVMFDKITSRIQKLCYGLNMDFVDPAQITMKVIQGLYSGVTTVELDTLAAETAATLTTKHPDYAILAARIAVSNLHKETKKVFSDVMEDLHNYINPHNGRHSPMVAKSTLDIVLASKDRLNSAIIYDRDFSYNYFGFKTLERSYLLKINGKVAERPQHMLMRVSVGIHKEDIDAAIETYNLLSEKWFTHASPTLFNAGTNRPQLSSCFLLSMKDDSIEGIYDTLKQCALISKSAGGIGVAVSCIRATGSYIAGTNGNSNGLVPMLRVYNNTARYVDQGGNKRPGAFAIYLEPWHLDIFEFLDLKKNTGKEEQRARDLFFALWIPDLFMKRVETNQDWSLMCPNECPGLDEVWGEEFEKLYESYEKQGRVRKVVKAQQLWYAIIESQTETGTPYMLYKDSCNRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIVEYTSKDEVAVCNLASLALNMYVTSEHTYDFKKLAEVTKVIVRNLNKIIDINYYPVPEAFLSNKCHRPIGIGVQGLADAFILMRYPFESPDAQLLNKQIFETIYYGALEASCELAKEHGPYETYEGSPVSKGILQYDMWNVTPTDLWDWKLLKEKIAKYGVRNSLLIAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYTRRVLSGEFQIVNPHLLKDLTERGLWNEEMKNQIIACNGSIQSIPEIPDDLKQLYKTVWEISQKTILKMAAERGAFIDQSQSLNIHIAEPNYGKLTSMHFYGWKQGLKTGMYYLRTRPAANPIQFTLNKEKLKDKERVSKEEEEKERNTAAMVCSLENRDECLMCGS	90359	57513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_58048_58732_58922_60040_60137_61333_61470_63038_63116_64970_65193_65403_65554_68553_68756_69423_69504_69857_70020_71055_71140_72944_73087_79002_79166_79571_79612_80437_80498_82590_82692_83781_83960_85605_85695_90139
537414	contig_6102_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_32304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532761	1534866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1532800_1534900
537419	contig_6871_pilon	+	2048	10	Intergenic	novelGene_21519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	347.806282111958	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	93	920	54514	69012	TRUE	15	AATGGTGTTATGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRPSYAPPPTPAPATQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTASSGITIPKPPKPPDKPLMPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRVSK	52485	72217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54467_54521_54695_54740_57960_58066_63387_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69868_71944
537453	contig_15063_pilon	-	1530	5	Intergenic	novelGene_11663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36776	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34599_34925_35033_35383_35840_36156_36264
537459	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
537461	contig_14322_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_116118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	54	249	302	671606	671659	NA	10	CTGTGGGGAGATGCGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQC	671357	671661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
537462	contig_14322_pilon	+	172	1	Intergenic	novelGene_116605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAAAATGGCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674715	674887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_674700_674900
537470	contig_5671_pilon	+	1158	7	Intergenic	novelGene_79426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2117.7829405615	13	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	176	598	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368836	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369659_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
537476	contig_9752_pilon	+	1617	3	Intergenic	novelGene_122048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	42	1295	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	155	412	341951	348670	FALSE	50	TAAAATTTAAAAGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGAAIAVLLPRPNVSAAGSAPPSWPTWKTARIPASSPLTPGAQAPRRGGDKMFSLKKWNAVAMWSWDVECDTCAICRVQVMDACLRCQAENKQEDCVVVWGECNHSFHNCCMSLWVKQNNRCPLCQQDWVVQRIGK	341796	349875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_342042_346964_347013_348551
537477	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
537485	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
537488	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
537495	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
537512	contig_15304_pilon	-	2340	7	Intergenic	novelGene_30588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_6	196.51689212098	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	247	1551	66228	60349	FALSE	20	ATACGCTTTATTGTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSELEVQDLCMEEDESKELDELWTSTFVFITLFLLSVSYSAMVTLFKVQWIFSALLQGKLQDSHEYSNIM	71754	59559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104_66402_71681
537514	contig_10451_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_138305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGGAGTGGCTGGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127206	126926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_126900_127200
537517	contig_10339_pilon	+	1777	2	Intergenic	novelGene_125264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	66	1139	328740	329813	FALSE	15	TAATTTGTTTCTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRALRTKRKDCEVAAAVTKRMAGCGEIDHSINMLPTNRKTNESCSNTAPSLTVPECAICLQTCVHPVSLPCKHVFCYLCVKGASWLGKRCALCRQEIPEDFLDKPTLLSPEELKAASRGNGEYAWYYEGRNGWWQYDERTSRELEDAFSKGKKSTEMLIAGFLYVADLENMVQYRRNEHGRRRKIKRDIIDIPKKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292270	330451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292335_328738
537546	contig_14441_pilon	+	1085	2	Intergenic	novelGene_100713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1513	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	152	412	116728	117123	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	116576	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117097
537556	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
537565	contig_6445_pilon	-	1555	14	Intergenic	novelGene_76958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	814.632853738746	2	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	687	1337	73974	43105	FALSE	60	AATTAAAAAAGATACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	90107	42886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73965_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88194_88465_88594_89993
537572	contig_9133_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_109321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	55	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	439	990	932063	932614	FALSE	20	GTTATATGCATTTGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGISEAERTEEKMQALSCDIEGFYEQNIEQSRKHPKKMKGNTESPYQKELVNVQPFQEVAYDQESMVLEEEVRAALKAVAKSKALRIDGIPIEKFQQTDAMLETLTFYAKKFGRPLPGQPTGRDPYLCPFQRKVIQQNAEIIEQYLISHASKILLKIIKKQLQQYIHRELPEIQAGFRRDIK	921860	933943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_921922_931685
537574	contig_16385_pilon	+	1915	17	Intergenic	novelGene_86187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	204.410700245853	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	49	1734	3004	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRGSLSLDDFRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_6716_6744_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
537583	contig_8045_pilon	+	1258	6	Intergenic	novelGene_35368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1183.94678934486	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	26	739	116067	118897	FALSE	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTSQNSTRTCAESHRSLQNPMLHEMGKGAHKRRTLRFSPPVRRKGCDLPKNQKTDLELSLGVQEPSLITINSKLDSDSESQ	116041	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527_118554_118656
537594	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537601	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
537608	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
537610	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_17715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537616	contig_3077_pilon	+	1044	7	Intergenic	novelGene_26753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3805.4329327365	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	374	757	13867	17801	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPASGPAR	11316	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16264_17779
537630	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
537632	contig_1996_pilon	-	1744	7	Intergenic	novelGene_131944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_4	228.652331912204	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	399	1253	509912	508483	FALSE	15	GACAGTGCGGACCCGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYRWAGVPAGVPQASVAAGASCHFSPTLPSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511086	507991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732
537635	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_16632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27854	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537652	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537662	contig_5485_pilon	+	2549	16	Intergenic	novelGene_37749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1982	2422	469064	474622	TRUE	20	AGGGCGGGCGGACACCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEGGGTAAAIGSALGAAAAGASAGLALAGAASVFLSVKRGVPPSTFPPSGTKRASITPFAGDGTCTDVLSVSISQTTSSSATESPTAFLPPDVSLCDRLCKRRGFDCNHIILACGRSSEEANTEDTAAVNDSLPAVRVTWSLT	457803	478733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_458082_458366_459378_460467_460637_460842_460937_461241_461309_462744_462876_466980_467078_468571_468650_469007_469164_470642_470757_471272_471329_471548_471623_471751_471808_474581_474634_477658_477692_478650
537684	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
537694	contig_11720_pilon	+	2034	13	Intergenic	novelGene_43957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	397.219808656226	3	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	770	1780	266455	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWHVLIRERFFGTCSCPRVRAAARRSCCRPWASWAPSSCPTTSTCTPPWSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264427_266171_266240_266453_266605_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
537699	contig_17198_pilon	+	1983	2	Intergenic	novelGene_62428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	77	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195171	1204227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1195915_1202987
537726	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
537743	contig_4103_pilon	-	1543	17	Intergenic	novelGene_51918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	482.367108480408	857	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	56	1381	91854	77689	FALSE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMKYLGDFFGMSNSYAECYPATMDDMAVDSDEEVDYSKMDQGNKKGPLGRWDFDTQEEYSEYMNNKEALPKAAFQYGIKMSEGRKTRRFKETNDKAELDRQWKKISAIIEKRKKMEADGVEVKRPKY	91909	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80624_82369_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
537762	contig_19564_pilon	-	1993	4	Intergenic	novelGene_29625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	846.389324654375	3	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	137	1405	14035	12201	FALSE	40	CTCACCCCCCCAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTASTPPAPTTGTVTCSWTASQCTTMKPQVRAGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15589	11612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13935_14055_15472
537767	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537772	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
537773	contig_6361_pilon	-	2702	2	Intergenic	novelGene_23991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	0	140	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	318	722	417498	417094	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPLILSLQVFIMSLMESYKIGKKLPYLSHFSSLLGSQSPHWDLLNKSSIFACYLLGQKLQLAALSWPRCSGSPSVNLHVFHFSACSFSSLRSRSCSHSFSSSFPKTVLGFRFLGSVLLHQYNPVCFIFPKNS	417815	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388
537774	contig_8772_pilon	+	1499	10	Intergenic	novelGene_21109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5865.11856468203	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	340	483	15814	19030	TRUE	25	TGCTTTTTTCCAGCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAAAQPTATLCSHVLQVRVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEGC	15314	23361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15372_15531_15918_16549_16582_19022_19119_19210_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
537780	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537781	contig_14807_pilon	-	1427	6	Intergenic	novelGene_124695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4812.91800885907	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	40	372	39773	38295	TRUE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPSARLKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADR	39917	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
537785	contig_9696_pilon	+	2483	15	Intergenic	novelGene_68837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	611.538224479877	35	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	237	1580	593219	626143	FALSE	20	CAAGGTTGATCTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDPRVLHHMGGMAGLQSMMRQFQQGAAGNMKGMMGFNNM	577967	627046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614244_624292_624389_626051
537792	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537799	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
537800	contig_17066_pilon	+	3501	1	Intergenic	novelGene_130948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111523	115024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_111500_115000
537802	contig_5954_pilon	-	2443	15	Intergenic	novelGene_28675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	434.48461728013	1	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	131	2086	959926	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGVLLKIVEEITQAGLVRPRHLVGAEKKRWLLQTHWTLDKYGILADARLFFGPQHQPVILRLPNRRALRLRASFSQPLFQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960590	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947831_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956940_959766_959941_960474
537818	contig_12340_pilon	-	2094	5	Intergenic	novelGene_122094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	85.5248501898717	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	407	961	12693	3862	FALSE	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVLHVRWVSVRRTLWRTPREHCPAWCGSRPSAREVFSRQVGVRQEDARPCPAWCGGRPSAREAFFTSAFRMENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	14349	2728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_12388_12590_12686_12960_14209
537842	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537845	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
537860	SIRV4	+	157	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	31	1128	31	-1128	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCAGGTCGTCAACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
537873	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
537878	contig_13004_pilon	+	2765	6	Intergenic	novelGene_112684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_5	144.701624040644	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	41	535	684510	690483	FALSE	30	TTAAATGCCTATGTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTARNGGFLLSTNMKWIQFSNLYVDIPKDLTKPTITISDEPDTLYKRLSVLVKGHDKAVLDSYEYFAVLAAKELGISIKVHEPPRKIERFTLLKSVHIFKKHRVQYEMRTLYRCLELEHLTGSTADVYLEYIQRNLPEGVAMEVTKTKLERLPEHIKEPIWETVPAEKEDSKSQNLS	684375	692713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_684406_684499_684573_686880_687018_687982_688092_689798_689889_690387
537884	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_90885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
537890	contig_4931_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_138357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	250	753	273	1025	228316	229068	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSVSWFTKVNENSVLSIKKNRGLERLSGLKLPVAIKLILIHDNSICV	228043	230293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_228000_230300
537918	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
537921	contig_14273_pilon	+	3145	9	Intergenic	novelGene_21143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	532.80595670469	5	126	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	313	1818	128229	151187	FALSE	10	TTTGTTTTTTCCTGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127916	152514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149047_149271_149549_150873
537943	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
537944	contig_6807_pilon	-	2583	4	Intergenic	novelGene_84569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_3	92.4097156989218	72	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	346	1191	121535	117846	FALSE	20	GAACTTCTTCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAIIANLQEEVTCPICLELLREPLSLNCGHSFCQACITVNNKTSMISSEGESTCPMCRISYQPDNIRPNRHLANIVEKLREVKVSLKEEQKRDVCNRHGEKLLLFCKEDGKVICWLCERSQEHHGHHTFLVEEVAQENQAKLKTALERLRMMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQVRVGKVPLPHLRFRENEDLSFLLFSVIGSFW	124769	116453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_118173_120423_120520_121112_121693_124581
537959	contig_401_pilon	-	1814	4	Intergenic	novelGene_42855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	141.98826242569	1288	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	424	1545	1724288	1721973	FALSE	5	ACTTCTGTGTCTTTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728695	1721703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174_1724438_1727923_1728018_1728515
537965	contig_1624_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_138384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224795	222164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_222200_224800
537971	contig_20641_pilon	+	1573	8	Intergenic	novelGene_52811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1499.28342067476	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	114	629	14767	45947	TRUE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTLSSPAPGAFSAAFLGRTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSATKDFTFASILGLEKCSWYQLC	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14590_14707_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41594_45879_45965_54835_54968_56379
537986	contig_16666_pilon	-	1186	3	Intergenic	novelGene_61744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	889.5	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	47	358	59688	55925	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSPWSAEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGWHGRSIVRTKISLNTFKVVEFNCGVFILQLTFASFSY	59734	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_58203_58264_59552
538012	SIRV6	+	700	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	39	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	93	587	1733	10736	TRUE	30	GTCACATATTTAGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1640	11062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
538014	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538028	contig_383_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_126158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460299	460665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_460300_460700
538029	contig_15031_pilon	-	2129	8	Intergenic	novelGene_138395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	210.553982607399	177	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	208	1470	129549	68789	FALSE	65	AAGAAAATAAAGGAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQPVWKPYPNQDSDLLVLSGTDSELHIPRVCEFCQAVFPPSITSRGDFLRHLNSHFNGKT	161734	68129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68966_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_161576
538030	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_19084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGCCATGACGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
538044	SIRV5	+	344	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-23	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8458_8586_10858
538052	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538055	contig_12270_pilon	+	357	2	Intergenic	novelGene_113642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13851	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
538063	contig_7202_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_16576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGACGCCGGGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
538094	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
538095	contig_7760_pilon	-	2353	7	Intergenic	novelGene_138441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	14.8061548763419	118	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	92	910	265537	257665	FALSE	25	CGTCGTAGTGTTATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSASTPAVAVQTSNASDHQTASPPSGCPVHEGKMRGCPLSTKPSDSTCESKTYSLPAHQERAYEYVECPMKAAASENKENLDPSNLMPPPNQMPAPDQPFPLSTAREESSIPRADSQKKWVYPSEQMFWNAMLRKGWKWRDEDISQKDMYNIIRIHNQNNEQAWKEILKWEALHATECPCGPSLIRFGGKAKEYSPRARLRSWMGYELPFDRHDWIINRCGTEVRYVIDYYDGGEVNKEYQFTILDVRPALDSLSAVWDRMKVAWWRWTS	266290	256221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_257864_258608_258696_260544_260665_261241_261391_262297_262450_265425_265570_266231
538096	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_19107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTTATCTCTTTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71404	71161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_71200_71400
538100	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
538116	SIRV4	-	206	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAGAATCTAGATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
538136	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538139	contig_2100_pilon	-	1398	9	Intergenic	novelGene_50768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	845	junction_2	536.798248297254	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	116	1186	1182812	1173168	FALSE	25	TTCACGTAACAGCGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQA	1185526	1172955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
538144	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
538161	contig_18195_pilon	-	2368	3	Intergenic	novelGene_138443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	1.5	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGAGCTCTTGCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12951	2046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18195_pilon_-_4187_6865_6993_12850
538167	contig_10861_pilon	+	1925	8	Intergenic	novelGene_39267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	322.940381178815	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	220	762	1339531	1348775	TRUE	30	ATAAAATGTTTTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRFKHRNRSFSRSKSNSRSRSKSQPKKEMKAKSRSRPNCSWNTQYSSAYYTSRKI	1337595	1350032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1345204_1345307_1348714_1348903_1348996
538179	contig_10082_pilon	-	2124	5	Intergenic	novelGene_63863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.587078863296	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	24	455	230442	212085	TRUE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	230465	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214813_228798_228955_230358
538182	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
538201	contig_5881_pilon	-	3463	13	Intergenic	novelGene_129064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	111.772431256052	297	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	39	1532	755253	722141	FALSE	5	ATCTGTCTTGTGTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYQEGRLQKLLKMNDSEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAKYDKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEDMVKHDWEKMTEAVQNYIGSLNWGYRVALREKKVTYENAYGQFVGPHRVKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYSPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGVKFIRQFVPIKIEQIEAGTPGRLKVVAKSTNSEETIEGEYNTVLLAIGRDACTRKLGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKLELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSNVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVVKFGEDNIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIVCNIKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKQQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGGSILQSGC	755291	720209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_722204_728543_728679_729732_729829_732845_732954_737069_737227_738424_738502_739101_739195_741825_742052_743360_743477_744092_744236_752280_752401_753461_753535_755166
538203	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
538207	contig_11386_pilon	+	1983	7	Intergenic	novelGene_82750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	455.827970717999	789	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	912	1673	17940	24897	FALSE	5	TTTCACTGTTGCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	7864	25207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_24791
538224	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
538227	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
538229	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538232	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538244	contig_18096_pilon	+	1758	2	Intergenic	novelGene_58054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	641	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	562	915	77927	78280	FALSE	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRNSLQITVSVTRSSFLFLRTALFLGSRSSFICPTLWGHRYLKLLNLGNEEDKEESRGKDKSQGLKEREGEKRIEGKGENAKKTKGKVLGTGGLRLVNFYPRFLKALFVLKVIER	77317	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_77555_77602
538245	contig_2646_pilon	-	3541	21	Intergenic	novelGene_69592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.077351843771	94	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	122	1732	1508494	1462718	TRUE	10	GAGTCTTGTCTGTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEPDQENVEQSRAAKTAEEELNKPFSLEASLSKFSYIDLDKELEFKNDLIDDKEFDIPQVDTPPTLESILNETDDEDESFVLEDPMLLNIDTIDSHSYDTSSVASSDSGDRTNLKRKKKLPDNFSLHGSVMRHSLLKGISAQIVSAADKVDAGLPTAIAVSSLIAVGTSHGLALIFDQNQALRLCLGGTSVGEQYGAISALSINNDCSRLLCGFAKGQITMWDLASGKLLRSITDAHPPGTAILHIKFTDDPTLAICNDSGGSVFELTFKRVMGVRTCESRCLFSGSKGEVCCIEPLHSKPELKDHPITQFSLLAMASLTKILVIGLKPSLKVWMTFPYGRMDPSSVPLLAWHFVAVHNYVNPMLAFCRGDVVHFLLVKRDESGAIHVTKQKHLHLCYDLINFTWINSRTVVLLDSVEKLHVVDRQTQEELETVEISEVQLVYNSSHFKSLATGGNVSQALALVGEKACYQSISSYGGQIFYLGTKSVYVMMLRSWRESGSPPETRLPHRSLGSCVVFPRRKSKSRSGIIRGCQ	1520147	1450540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1452235_1461397_1461488_1462692_1462740_1463164_1463254_1464121_1464158_1465150_1465226_1467346_1467518_1471527_1471609_1474912_1475021_1476564_1476625_1476727_1476882_1478147_1478216_1481740_1481828_1482718_1482844_1492432_1492488_1493624_1493658_1498154_1498249_1500041_1500173_1506882_1506952_1508341_1508593_1520124
538268	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
538272	contig_10235_pilon	-	1394	9	Intergenic	novelGene_46476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	898.016207746275	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	430	891	222843	219405	TRUE	25	ATTTAGTGGTGTTATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224453	217919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222884_223231_223370_223554_223780_224427
538274	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
538282	contig_6589_pilon	+	2143	13	Intergenic	novelGene_25940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	285.986547857684	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	14	1399	1228758	1257861	TRUE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHAAMPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTEEELRRFEEELAAREAELNAKAQRLSQETEALGRSQDHLEAQKRELQQAVLQMEQRKQQQQALNALAPAPGREGQLKFHPGTDGVPVPGAADDQKDRDTSEKKVPEQPPKLPQLDSQKL	1228744	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228890_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256925_1257394_1257498_1257748_1257911_1257965
538293	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
538308	SIRV6	-	325	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGACCATTTCTGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
538316	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
538320	contig_10627_pilon	-	2116	8	Intergenic	novelGene_60010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	148.965822679333	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	209	1237	402038	373138	TRUE	10	TTGGCTCAATTTCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVYDIAFSRAGGGRDMFASVGADGSVRMFDLRHLEHSTIIYEDPQHHPLLRLCWNKQDPNYLATMAMDGMEVVILDVRVPCTPVARLNNHRACVNGIAWAPHSSCHICTAADDHQALIWDIQQMPRAIEDPILAYTAEGEINNVQWASTQPDWIAICYNNCLEILRV	402246	368370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_369184_373071_373311_375715_375834_376928_377139_380441_380561_380960_381073_381786_381946_401900
538323	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
538367	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_17608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
538374	contig_11429_pilon	+	2187	4	Intergenic	novelGene_60457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	360.292473785766	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	77	523	46162	46856	TRUE	45	GGAAGAAAAAATATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	45415	49412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_47552_48443
538396	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538413	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	58	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
538424	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
538427	contig_5643_pilon	+	1902	15	Intergenic	novelGene_39091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	832.561954549489	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	440	1690	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKIDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631455	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631554_631850_632046_634836_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635701_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
538460	contig_13905_pilon	+	1436	2	Intergenic	novelGene_130418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	101	556	218514	228676	FALSE	25	TGATTCAATGACTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVSLGFPWLMSPWELDGITNDDRFSGGWIWDYSFPATATVYLKFWNILTKKKKGVDIWQKWLFSFGSLLKSGPACPKKQGQEG	218413	229556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218737_228443
538464	contig_10331_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_54150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCTGCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435128	432999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_433000_435100
538473	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538481	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
538482	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
538496	contig_11850_pilon	-	3037	6	Intergenic	novelGene_125189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1304.69352723159	84	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1124	1582	184660	181211	TRUE	15	TGTATTGGCTCTTTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	189233	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180314_180391_181279_182664_182765_183240_183373_184501_185191_188640
538497	contig_3627_pilon	+	2028	4	Intergenic	novelGene_78535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	335.780020582259	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCTTGCTTTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642240	677832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653009_673913_674057_676141
538513	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	641	1117	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
538540	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
538569	contig_10341_pilon	+	2539	9	Intergenic	novelGene_47224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	161.853280396166	21	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	12	1151	67374	120280	TRUE	30	CTGTTAATGATAGTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQAMEGNRDEAEKCVEIAREALNAGNREKAQRFLQKAEKLYPLPSARALLEIIMKNGSTAGNSAHCRKPSGRGVQNKTNCTKDSTSSSGESGKGYSRDQVDGVLSINKCKNYYEVLGVTKDAGDEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATDAFKKIGNAYAVLSNPEKRKQYDLTGNEEQGCNHQNNGRFNFHRGCEADITPEDLFNIFFGGGFPPGSVHSFSNGRAGYNHQHQHRHSGHEREEERGDGGFSVFIQLMPIIVLILVSLLSQLMVSNPPYSLYPRSGSGQTIKMKTENLGVIYYVNKDFKNEYKGILLQKVEKNVEEDYVTNIRNNCWKERQQKTDMQYAAKVYRDDRLRRKAEALSMDNCKELERLTSIYRGE	67362	230418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_67507_87472_87645_94305_94452_105635_105822_111077_111173_111962_112073_113062_113236_120155_121652_230401
538578	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538625	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
538627	contig_12079_pilon	-	1618	4	Intergenic	novelGene_67431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.535243298843	61	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	130	327	638707	581015	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVQDAAADPARQHQAED	638836	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581066_601827_601879_609189_609274_638695
538633	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538640	contig_8772_pilon	+	1393	9	Intergenic	novelGene_21124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5467.79836720183	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	277	1077	16563	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	16076	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_16340_16549_16611_19022_19119_19225_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
538641	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
538646	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_18530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
538652	contig_12644_pilon	+	1126	8	Intergenic	novelGene_44691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_7	3944.58169842002	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	63	1052	2678055	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677630	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
538670	contig_15063_pilon	+	1281	4	Intergenic	novelGene_14281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	333	1154	35271	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34826	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
538679	contig_12119_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_88652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTTTGTTGTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227725	229786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_227700_229800
538684	contig_5549_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_81629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414147	415654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_414100_415700
538685	contig_10225_pilon	+	2183	14	Intergenic	novelGene_86806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	1115	2065	42707	47636	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFEREQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20689	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46791_47480
538686	SIRV5	-	316	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATATACAGATTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
538694	contig_10734_pilon	-	1880	4	Intergenic	novelGene_50997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	4	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	178	483	318911	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320717	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319012_320640
538702	contig_10765_pilon	+	2624	1	Intergenic	novelGene_122909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1298	1747	123824	124273	NA	75	AGAAATAAAAAAAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNVNKTKILTTGPISNILINGENTEVVKDFILLGSIVNTHGSSSQEIKICTALGTSAAKDLFKVLKSKGVTQKTKVHTTQAMVFLIASYAYENWTMNKEDRRTDAFDLCWQRILNIPWMAKRKNKSVLKMYNQNAP	122526	125150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_122500_125200
538721	contig_7202_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_18538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27943	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
538789	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538794	SIRV6	+	328	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	1	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
538799	SIRV6	+	663	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	529	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	35	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11037_11109_11205
538801	contig_854_pilon	-	2567	14	Intergenic	novelGene_36091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_8	95.0128611661719	433	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	116	1858	27895	4416	TRUE	15	TGTTCCAACAGCTCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPDLLNFKKGWMSILDEPGEWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDYNKENTLHSYGTQKGSLKAGEQRAGSEVIGRGGLRKAEGQRQSPDYVELSPLTQSSPQRARPLVRAPDRPAKQEELERDLAQRSEERRKWFEATDSRAVETQSGEAPRRGLGAPLTEDQQSRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRSEQRGSSSDSHEALEKEVQCLRAQLEAWRLRGEAPQDAPRFQEDGHIPTGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELNKTRSLQQGPDGLRKQHESDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALTRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHAHLSEEIDRLRSFIASQGTGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELNHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE	28010	2952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_3660_4413_4578_5405_5493_6730_6845_6912_7073_7674_7778_9768_9917_15721_15833_16546_17073_18611_18722_19090_19181_19324_19394_22409_22467_27889
538805	contig_8377_pilon	+	1824	17	Intergenic	novelGene_34986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4600.06128865421	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	189	1493	136354	177309	TRUE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGRKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERGKYANFLLMNIHTLTFEHTTGVQQIFYQGRSKVF	68112	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68320_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173730_177253_177345_177430_177531_179567_179659_180405
538806	contig_7151_pilon	-	1638	10	Intergenic	novelGene_40647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	140.722562178823	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	58	1533	18221	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	18278	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2016_4657_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
538810	contig_15304_pilon	-	1116	4	Intergenic	novelGene_30665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	378	974	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107195	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
538816	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538819	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	632	1112	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
538825	contig_14441_pilon	+	1192	6	Intergenic	novelGene_100337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.745719354084	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	577	1005	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	5970	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_30842_31134_111974_112040_116578_116963_117220_117344_117539
538859	contig_7391_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_112161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	136.957511659638	826	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTGTGTCATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458236	438702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_443033_443094_444144_444247_451552_451706_457816_457987_458203
538864	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
538865	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
538877	contig_3095_pilon	-	1490	5	Intergenic	novelGene_75207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	409.110315196281	608	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254252	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535
538886	contig_6710_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_97885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
538891	contig_13740_pilon	-	1657	9	Intergenic	novelGene_34663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4138.17682530604	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	404	760	160838	158585	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNKFTCNLYVEIGLELMT	165318	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161248_161962_162031_165237
538905	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	29	355	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14437	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
538920	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
538949	contig_5467_pilon	+	1959	11	Intergenic	novelGene_111940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	356.454990146021	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	2	976	8246	14522	TRUE	40	CTTACTAATAAAAACGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8244	15818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956_15649_15744
538950	contig_16920_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_138452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTAGATTCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15816	15012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_15000_15800
538951	contig_9852_pilon	+	2049	9	Intergenic	novelGene_138456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	366.128371442313	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	37	495	21374	33429	TRUE	45	AACTTATAATCGAATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAGRGGGAVGTMAYPGHPGAGGGFYPGGYGGAPGGPAFPGQTQDPLYSYFAAVAGQDGQIDADELQRCLTQSGIAGGYKPFNLETCRLMVSMLDRDMSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIARCCELPI	21337	37028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_24546_24617_30839_30884_31683_31832_32069_32106_33403_33434_35430_36567_36614
538957	contig_13894_pilon	-	1643	7	Intergenic	novelGene_62191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	201.973595634017	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	425	973	753211	750013	FALSE	25	GTAGCGGTGCCACGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766702	749342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_763800_763958_766578
538981	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
539000	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
539009	contig_7020_pilon	+	2139	2	Intergenic	novelGene_57074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	54	1403	102160	103509	TRUE	45	GAAAATAATCTTACATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	102106	104303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_103906_103963
539014	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
539031	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539034	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
539076	contig_7815_pilon	+	2821	4	Intergenic	novelGene_134350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	224	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2316	2672	50717	52001	FALSE	15	CCTGCGCACACCCCTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISTSNTGPTIINAGGYISWKIIYYLFRKVSCGDAQLLGAAAEAPHHQAATEVRQVPHDAASLGCGLRLGPRVRRSRRRGAARIPRTSRGTAAELQWAGAQRAGLGLLHAVAAPSRR	41866	52150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_44022_45255_45358_50658_50812_51739
539085	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539094	contig_17493_pilon	+	2493	10	Intergenic	novelGene_122192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	445.480265182047	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	117	1019	92066	156476	FALSE	25	GTTCAGCTCACTTGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGFKEGGKRKKQKQREEQKKKKSTKGNH	50009	157950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119116_119188_146482_146618_156393
539100	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
539101	contig_15063_pilon	+	1324	4	Intergenic	novelGene_14249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	28	1203	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34780	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
539130	contig_12923_pilon	-	2203	18	Intergenic	novelGene_30146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_17	147.645793291975	547	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	26	1669	236117	225749	FALSE	20	GCTATATGGGTCCCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEEAAAPEMAVSERRGLARGSPVEWGPRLLLLLLLAGCSGRIHRLTLTGEKRADIQLNSFGFYTNGTLEVDLSLLQLGPQKTEEKTPLVGFSLTRVRSGSVLSYSPQEPYDCPLQKNSSNLLVLFLINTKDLQVQVRKYGDQKKLFIFPGLLPEVPSNPGPPKPGPSATPKVDSVAPSMINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVMIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236142	225214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
539137	contig_12000_pilon	+	2329	10	Intergenic	novelGene_43148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	554.833909081508	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	131	862	417192	584749	TRUE	70	AAAAAAAAAAAACCTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416823	588454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_584748_585374_587611
539140	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539163	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_116092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539186	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539200	contig_6102_pilon	+	2226	11	Intergenic	novelGene_32266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_6	48.4195208567784	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	1008	2039	1446602	1449029	FALSE	20	TAGAAGGGGAGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444298	1449216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
539202	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_97357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
539210	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539218	SIRV5	+	429	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7460	2	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
539237	contig_1516_pilon	+	2545	3	Intergenic	novelGene_50019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	924	junction_1	151	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2112	2507	363302	363697	FALSE	5	TGTTTCCTCTCTTCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLHPSKGRVRGAGLEAPSIFNARGHHLPLLCVLHSVPVENGCPENAQPGPGAWRQQEQGLRAGGSGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	358511	363735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_360125_362116_362299_362985
539243	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
539254	contig_11428_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_138501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197517	196889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_196900_197500
539260	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
539266	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
539297	contig_10968_pilon	+	1427	9	Intergenic	novelGene_84290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	368	junction_6	146.236965231093	1790	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	749	1138	172393	177921	FALSE	15	CTGTGCAATTGTGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166018	178210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
539306	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_116074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539333	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539338	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539356	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
539365	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1110	23	-1110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCCACCGTAACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
539373	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
539389	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	632	988	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
539391	contig_5429_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_127788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147418	149582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_147400_149600
539404	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539414	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539422	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539435	contig_14556_pilon	-	2575	1	Intergenic	novelGene_138508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1166	1504	40510	40172	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPEQGDTAWLKFRKGVHQGCILSPHLLNLYVEQIIQEEEGGIRTGGRLINSLQYADDTTLLAESGEDLKHLLMKIKDYSLQHGLHFNTKKIKILTTGPISNIMINRENIE	41675	39100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_39100_41700
539462	contig_11986_pilon	-	2558	3	Intergenic	novelGene_69257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	20.5	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3	437	845757	845323	TRUE	5	GGTTCCTCATTTTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAASTATDHTWGVGTRGGQAHKTGQGPATPETEGLPHGSRDPRDLKPPPNGSWPETPRRGSWDPPRPETLFLFPSLSSVDPGSWETASPAAGPGTSRTAPRTAAGAGAGGGRGNLVRRQTPEVGQGSCRGALQQSGKPWRSRLG	845759	839882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841746_841860_841950_845153
539477	contig_8045_pilon	+	1220	4	Intergenic	novelGene_35403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	583.850627776965	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	431	526	118627	118722	FALSE	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	117246	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075_118243_118527
539479	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539484	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539491	contig_12873_pilon	+	1930	6	Intergenic	novelGene_27180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1450.64377432918	3	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1027	1350	19035	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15978	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17014_17734_18028_19000_19264_19611_19703_19851
539515	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
539517	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
539552	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539554	contig_19890_pilon	-	1500	7	Intergenic	novelGene_138543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_4	97.15051323705	631	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	31	1392	107277	95869	FALSE	20	TTCAATTTGAACTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETVEVLELGEMAESAALVWIRGPGSGCKAVRCASARCSVWDFIHRYCQDQDVPVEYFFVKCNGALINTSDAVQHGAVYSLEPRLFGGKGGFGSMLRALGAQIEKTTNREACRDLSGRRLRDVNHEKAMAEWVKQQAEREAEKEQKRLERLQRKLAEPKHCFSSPDYQQQCHEMAERLEDSVLKGMQAASSKMVSAEISERRKRPNKSRTSGGASAEKRKCFWLGMDGLASAEGSSSESSDDDSDPAPSTSGTCCQSPRNGSDGVEMAAEFPIGCHRPEVLSADSGSPEKLQKNSVIDSGKDTSKDSRAKLEETWTEEQTERKMPIETEEAQENKEAESKAARAGPNGEEETKEMTDGERAAKVARGQDRENIPVAKLEESESGDTVSHFRHIGQGTVDLLAFSSAAELELLGLDQLKSELMALGLKCGGTLQERAARLFSVRGLAREQIDPALFAKPLKGKKK	107307	95760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_-_96091_98236_98742_101036_101152_101934_102105_102422_102535_103342_103461_107157
539557	contig_20527_pilon	-	2316	5	Intergenic	novelGene_138573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	146	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGAGAGGTGGCCGCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28522	12882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25008_25443_25613_26237_26346_27308
539559	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539571	SIRV7	-	365	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	3	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78816_78964_114680
539572	SIRV4	+	185	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	1118	13	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
539578	contig_10404_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_138650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTATGAGTTTTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778708	776524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_776500_778700
539580	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
539587	contig_2537_pilon	-	2315	20	Intergenic	novelGene_33426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	456	764	297743	280751	TRUE	55	ACAAAGAAGCACATGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFGKASQKPNSNCIFLRVVAKDISFLLWDIPVSLLDHHVWVDTHRARLVAGTGLAGRLHFGFGASGSMAAEAQPQHLFQIFVAGKGEEDLARNPGASYLT	298198	235202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_-_235243_235340_235398_235478_235587_239844_239889_241315_241453_245173_245291_249121_249258_250520_250631_250723_250814_251426_251498_258095_258182_259021_259118_259199_259282_266057_266112_278240_278311_278405_278538_280629_280760_290367_290430_295096_295235_297643
539605	contig_11396_pilon	-	2174	8	Intergenic	novelGene_71281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	728.245529351474	105	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	118	753	249053	232299	FALSE	35	AAGCATTCCTTTGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMSSYSIRHSISMPAMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249170	230877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_234013_234056_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245816_249034
539608	contig_11677_pilon	-	447	6	Intergenic	novelGene_85924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	16962.3656769921	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	12	323	598052	595231	TRUE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFILDQT	598063	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595724_595803_595892_597212_597397_598027
539615	contig_10940_pilon	+	2049	4	Intergenic	novelGene_49266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	735	1229	874821	875315	TRUE	15	ACTGCTCCGGCTCAGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENQDDSKGLIGMGVRDPGAHSRRSRPGYVCGLTKAKVDQQCSWDSCLLNSKQEGIPENEDSGTGLIGIGVRDPGAHSRRSKPGYVCVLTKAKVDQQCSWDSCLLMSKQEGMEENQDGSTGSISNVRSWWLRPGKRNVRKSGHYRRYLKSDDMCDLGIKTIFL	874086	917143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_875675_893147_893308_916666_916747_916922
539616	contig_7707_pilon	+	4252	20	Intergenic	novelGene_72178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	390.646406560266	8	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	75	2771	531589	655929	FALSE	60	TTAGCATTAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKGGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFNIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGSSTPNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNISDLCTALSALSGVPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEQVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMALPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCYKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEETCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN	531514	657410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531644_542837_542969_553915_554043_575679_575826_583133_583196_612136_612282_635116_635291_637314_637474_637552_637778_639965_640050_640139_640235_640333_640526_641469_641586_641976_642250_642627_642699_643075_643192_644060_644211_645498_645603_652216_652306_655746
539619	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1555	646	1100	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTTAACCGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2555	2757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
539631	contig_9848_pilon	+	1510	11	Intergenic	novelGene_79955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGCCAGAGACACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98498	113906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_99394_104028_104150_104468_104539_104843_104912_105859_105909_106409_106440_106510_106557_107108_107190_107354_107401_110005_110042_113838
539641	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
539644	contig_4364_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_3022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
539647	contig_19579_pilon	-	1675	7	Intergenic	novelGene_59364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	58	897	13090	7943	FALSE	30	ATCTATATGGGATCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13147	7164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
539685	SIRV4	+	217	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1554	632	1099	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2554	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
539702	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539705	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
539728	contig_10074_pilon	-	2745	2	Intergenic	novelGene_57097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	108	482	190420	190046	TRUE	75	GAAAAAAAAAAAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIDKLDFNTTNHFCVRDTIKRVKRQPTEWEIISANHSFHKGSISRIYKEILQLNNNKANNPIKKRANDLKRHFSKDIQMSHKHTKACLTSLVFRQMQVKTTVMYHFTPTGMAVTNKTENKCW	190527	186059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_186547_188269
539751	contig_14322_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_116498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAATAAACGCTCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
539754	contig_5945_pilon	+	4339	1	Intergenic	novelGene_104524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCACCAAAGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	4339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_0_4300
539761	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539783	contig_6710_pilon	+	537	2	Intergenic	novelGene_97277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
539786	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
539792	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
539796	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
539821	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
539836	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
539859	contig_4301_pilon	-	2219	6	Intergenic	novelGene_65114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	338.192489567702	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTGTGACTGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575650	538012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543849_547349_547521_551248_551329_575543
539875	contig_4131_pilon	-	2638	2	Intergenic	novelGene_127858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	555	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	2	610	163432	162549	FALSE	15	TATTTTATCTCCTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCYLSPSLTSSLCRRLLQLPLLPPPPVEKTPVKKKAAKKPAGARRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEVKPKVKKAGAAKAKKPAGAAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPARLPDVAKSSFTFLFPRLVGRLGWWGEED	163433	160520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_162639_162913
539887	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
539894	contig_13894_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_62032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	271	1218	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286524_286634_287123_287219_287538_288132
539903	contig_19744_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_120375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140977	143100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_141000_143100
539920	contig_5050_pilon	-	1946	12	Intergenic	novelGene_110269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_11	170.30847074239	697	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	194	1621	716384	507209	FALSE	15	CTTGGATGTTTGCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716577	506883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
539954	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_95094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
539955	contig_3095_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_75116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	36	383	147241	150324	TRUE	45	TGAATACAATAAACTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNEFQLFF	147205	152217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150304_150696_150996_151163_151848
539960	contig_6902_pilon	+	2845	2	Intergenic	novelGene_135557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278411	284979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_282377
539961	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
539966	contig_14467_pilon	-	2507	1	Intergenic	novelGene_138235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGCTTCTAATGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220020	217513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_217500_220000
539967	contig_5715_pilon	-	2371	15	Intergenic	novelGene_127965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	107.793855604679	531	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	740	1558	630764	555553	FALSE	25	AACTGTGCACTAGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKDMALVAPEAPSEQARRVFQTYDPEDNGFIPDSLLEDVMKALDLVSDPEYINLMKNKLDPEGLGIILLGPFLQEFFPDQGSSGPESFTVYHYNGLKQSNYNEKVMYVEGTAVVMGFEDPMLQTDDTPIKRCLQTKWPYIELLWTTDRSPSLN	659651	554739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_555703_559544_559617_564060_564149_566702_566776_576738_576812_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631783_635172_635331_637616_637678_645335_645416_659347
539968	contig_5758_pilon	-	2309	7	Intergenic	novelGene_119070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_1	903.143399466552	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	194	952	113963	91111	FALSE	30	CCAGCCTAATGCCACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEIGSPPRFFHMPRFQHQAPRQLFYKRPDFAQQQAMQQLTFDGKRMRKAVNRKTIDYNPSVIKYLENRIWQRDQRDMRAIQPDAGYYNDLVPPIGMLNNPMNAVTTKFVRTSTNKVKCPVFVVRWTPEGRRLVTGASSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSPVRAMTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRGTCTNSTDWNI	179184	89753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_91244_92931_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
539969	contig_11292_pilon	-	2684	3	Intergenic	novelGene_109467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	307	junction_2	25	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1152	1748	455078	450308	FALSE	20	TATACTTCTGATTGGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQQAAGISNQAAGIGHLAITVSHPAAGMGHQARGMSLQSNYLGLATASAIMSYAECSVPIGVTAPTLQPVQARGAVPTTAIIEPPPPPPPPPPPPPPAPKIPPPEKTKKGKKDKAKKSKTKMPSLVKKWQSIQRELDEEENSSSSEEDRESTAQKRIEEWKQQQLVSGMAERNANFEALPEDWRARLKRRKMAPNT	456229	449371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_450399_452333_452492_454730
539971	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
539984	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_11907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	224	1399	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
539993	SIRV6	+	589	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	523	577	350	-34	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGAAGTTGTTCAACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	10754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
540006	contig_12786_pilon	-	1729	10	Intergenic	novelGene_103386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	986	junction_8	378.327345359695	3522	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	607	1542	614067	590909	FALSE	30	TAGGTTTTCTTCAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629586	590721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
540014	contig_7202_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_17293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGCTCATGCAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
540016	contig_20493_pilon	-	2037	11	Intergenic	novelGene_86402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_10	48.6	397	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	39	1052	54655	43349	TRUE	10	TGCCTGAGCCTCCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRSRGGQKPCRMSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGEGPSPGLH	55240	37322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38264_38354_38489_43050_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
540025	contig_13110_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_138747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTCACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759315	759055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_-_759100_759300
540034	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540035	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
540038	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
540047	contig_3155_pilon	-	2388	7	Intergenic	novelGene_26447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.8236353376241	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	198	761	357605	353200	TRUE	25	TAAAGTACGTTTGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRLLVASSPSPSPTLSTSVWQCGGQLEIIPCSVVGHVFRTKSPHTFPKGINVIARNQVRLAEVWMDGYKEIFYRRNLQAAKMAEEKSFGDISERLKLKEQLHCRNFSWFLHNVYPEMFVPDLKPTFYGAIKSLGTNHCLDVGENNHGGKPLIMYVCHGLGGNQYFEYTTQRDLRHNIAKQLCLHANDGTLGLRNCHFTGKNSQVPKDEEWELTQDQLIRNSGSGTCLTSKDKQPAMARCNPSDPHQHWLFI	359184	351409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_351809_351971_353314_354399_354553_356069_356172_356842_356975_357542_357744_359125
540052	SIRV6	-	870	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8794	-106	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	4	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCTACTCTTTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11341	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1732_1846_2030_2470_2615_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
540056	contig_5769_pilon	-	2842	4	Intergenic	novelGene_138754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	23.4710223230453	264	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	87	977	126343	118756	FALSE	15	TTTGTTGTTGTTACTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPVTVATDGGDRPGSPAASSLSASQRRAELRRRKLLMNSEQRINRIMGFHRPGSGAEEESQTKSKQLDSDKLNSLTVPSVSKRVVLGDSVTTGTTDQQGGVVEVKGTQLGDKLDSFMKPSECSNDVNIELQQRNREDLTADTVQGASRHGLEQYLSRFEEAMKLRKQLISEKPSQEDGSTAEEFDSFRIFRLVGCALLALGVRAFVCKYLSIFAPFLTLQLAYMGLYKYFPKGEKKIKTTVLTAALLLSGIPAEVINRSMDTYSKMAEVFTDLCVYFFTFIFCHELLDYWGSEVP	126429	116890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_118948_121723_121790_123996_124458_126171
540057	contig_804_pilon	+	3943	1	Intergenic	novelGene_138783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAGAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30037	33980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_+_30000_34000
540058	contig_9098_pilon	+	2115	9	Intergenic	novelGene_75811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	55.9933031710043	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	208	1458	302742	332191	FALSE	20	AAGCCAGCTTTTTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHRSTRKRCGDSHPESPMGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLEPLMQGYWEWLVGRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTVLLVYYCPTATEQAPLWAYIACACGLFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAVQLGTNPDWMFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGIIDVTEVQIFIIIMHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTAHSNHH	295457	332848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_295592_302668_303081_309869_310018_311367_311510_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488_331615_332071
540059	contig_602_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_134945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTCCACTGGTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380042	381395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_380000_381400
540062	contig_11752_pilon	+	1275	7	Intergenic	novelGene_37618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1534.6126185096	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	99	1016	84194	105652	FALSE	5	TGTCCAGTTGTGCTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKEKFLGY	84095	105911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94357_105633
540071	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540074	contig_848_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_83348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAAATGTCTCTCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739903	756432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_740088_756268
540076	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_96658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540078	contig_9002_pilon	-	1972	12	Intergenic	novelGene_116724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_11	38.766092366337	372	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	149	1834	331854	316878	FALSE	35	GAAAACATTGCTGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGIWALFGSDECLSVQCLSAMKIAHRGPDAFRFENVNGYTNCCFGFHRLAVVDPLFGMQPIRLKRYPYLWLCYNGEIYNHKEMQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKAPSPEKAEQESERLLKELYLFDVLRADRTTAAHGLELRVPFLDHRFSSYYLSLPPEMRIPKHGIEKHLLRETFEDSNLIPKEILWRPKEAFSDGITSVKNSWFRILQDYVEHQVDDTMMAAASEKFPFNTPKTKEGYYYRQIFERHYPGRADWLTHYWMPKWINATDPSARTLTHYKSAAKA	337900	316739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319052_319154_319664_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331605_331878_337775
540090	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540100	contig_9482_pilon	-	1670	11	Intergenic	novelGene_44302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	156.611270347954	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	33	1442	1253164	1236365	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253196	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239842_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244355_1245350_1245387_1253059
540105	contig_6102_pilon	-	1526	9	Intergenic	novelGene_32168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	261	743	867239	839973	TRUE	10	TTTGGTTGTCCTTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867499	839081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839489_839596_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
540108	contig_10324_pilon	+	1815	2	Intergenic	novelGene_7769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2444	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78128	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_78451_79273
540109	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGGACTCGGAGGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
540111	contig_1594_pilon	-	2281	17	Intergenic	novelGene_138816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	67.6269350462521	267	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	752	2047	747636	503479	FALSE	20	TTGATCCCCCTCCATGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKVSYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKAKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETV	777976	503244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762742_771341_771460_777250_777306_777805
540116	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540133	contig_10135_pilon	-	2153	8	Intergenic	novelGene_106622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	40.9205302497214	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	461	1651	88066	84292	FALSE	5	CATCTCTGTTCTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89183	83789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88495_88681_88920
540159	contig_6710_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_90410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCCAAAGATGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
540171	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
540181	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540220	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
540224	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_18341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
540226	contig_1380_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_138879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	736	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTGTTTTGACTGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107063	109479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_107100_109500
540237	SIRV4	+	147	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1167	2	-1167	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTGGTTCGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
540247	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540251	contig_7091_pilon	+	2228	15	Intergenic	novelGene_131771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_11	318.857526881489	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	107	1555	349798	435147	FALSE	25	ACACACGTGGCCTTGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349691	435820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420877_420945_421228_421316_431521_431687_435092
540258	contig_1532_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_37418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	42	395	13466	13113	NA	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	13507	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12400_13500
540263	contig_15449_pilon	-	2502	6	Intergenic	novelGene_33673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.519436787308	24	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	117	932	196078	192849	TRUE	35	GTAAACTTAAGAGATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPVNMQGGGAAGPRAKH	196194	190976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_192250_192551_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
540289	contig_6496_pilon	+	2355	13	Intergenic	novelGene_103486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	74.9226916375955	472	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	354	1781	452626	467595	FALSE	25	TGAAGGAAGGGCGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTELFNYIDENQDRYVKKLAEWVAIQSVSAWPEKRSEIRRMMEVAAADITKLGGSVELVDIGKQKLPDGSEIPLPPVLLGKLGTDPKKKTVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLEERDGKLYGRGSTDDKGPVAGWMNALEAFQKTNQEIPVNVRFCLEGMEESGSEGLDKLIFAQKDTFFKDVDYICISDNYWLGKRKPCVTYGLRGICYFFIEVECSDKDLHSGVYGGSVHEAMTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDVGAKTLLHSCKKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	450272	468169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_450461_451306_451439_452592_452686_453536_453681_455572_455736_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461578_462836_463002_463278_463421_463637_463786_467525
540291	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540296	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
540298	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
540307	contig_14925_pilon	-	942	4	Intergenic	novelGene_55191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	25	AGCAAAGGCTGTGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
540310	contig_5145_pilon	-	1998	13	Intergenic	novelGene_131430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.487002152833	22	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	701	1375	925621	916397	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947093	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915676_915894_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
540339	contig_11631_pilon	-	1183	7	Intergenic	novelGene_104209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAAAGTATTTCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283575	260117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_260570_261557_261689_262604_262672_264549_264629_273511_273612_281407_281537_283350
540357	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
540380	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540382	SIRV4	+	228	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1543	632	1088	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
540389	contig_6069_pilon	-	2746	13	Intergenic	novelGene_8065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_4	48.1003002993629	299	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	120	2108	515909	498920	FALSE	25	CAGACGTCTAACATGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPSLQPPPHRDFISVTLSLGESYDNSKGWRRRSCWRKWKQLSRLQRNVLLTLLAFLIICGLLSYMNTTHHWKALSGRSSEKQKARPDIPGLKPVNPPVLPAPQTAGAAQGLPEIPPQKPRKHSRRGPPSLQIRAPDKDVKDRIQDRVEQEQEEPGNAHKENSQRTVISWRGAVIEHEQGTESPSRRADVPTNRPGPESRTQKASAPLNKRQKAVVEAFRHAWKGYRKYAWGHDELRPLSKSFGEWFGLGLTLVDALDTMWILGLTKEFEEARKWVSQKLQFQKDVDVNLFESTIRILGALLSTYHLTGDSLFLEKAKDFGNRLLPAFKTPSKIPFSDVNIGTGIAHPPRWTSDSTVAEVTSIQLEFRELSRLTGNEKFQEAVVEVTRRVHSLSGKKDGLVPMFINTHSGHFTHLGVYTLGARADSYYEYLLKQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	516028	498281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501622_505367_505557_505922_506072_506906_507093_508364_508475_509812_509965_514285_514420_515227_515337_515795
540399	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
540416	contig_15666_pilon	-	2336	7	Intergenic	novelGene_70216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	134.088797278354	1432	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	686	1684	132068	129088	FALSE	45	TAAAAATGATCTGAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132793	128435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130018_130298_130515_130795_131446_131711_132007_132222_132261
540435	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540436	contig_15063_pilon	+	1583	5	Intergenic	novelGene_13063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3966.53629600184	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	275	1450	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30242	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
540463	contig_11989_pilon	-	2710	21	Intergenic	novelGene_68434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_16	351.040207811014	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	99	2087	107068	46235	FALSE	10	CTTTTTTTTTTTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRIRSRGGEKGVLGSSPRLPPLEAQRGRGPWRMAFLLATCGGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKGRKYTRSYLNQRMKLIFLTFFLKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	107166	45611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80517_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_107041
540477	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
540496	scaffold_15568_pilon	-	3775	3	Intergenic	novelGene_122577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGAAGTCTCCTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95639	57856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_57934_81492_81620_92068
540508	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
540521	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_18709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCTCCTACGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
540527	contig_5317_pilon	+	1015	4	Intergenic	novelGene_76529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	39726	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	87	497	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33702	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
540534	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540539	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540540	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
540554	contig_9183_pilon	-	2339	7	Intergenic	novelGene_40296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	2	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	165	2048	323783	312131	FALSE	20	TCCATGTTGTGCTTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325982	311839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
540572	contig_10299_pilon	+	2072	17	Intergenic	novelGene_79725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	92.85607142239	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1053	1910	337976	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	333993	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335189_335969_336034_336187_336265_336733_336981_337908_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
540581	SIRV4	+	174	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1119	23	-1119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCAACGACGAGCCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
540589	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
540594	contig_8317_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_20233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
540601	contig_9833_pilon	+	1655	11	Intergenic	novelGene_68523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	447.072074726212	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	68	883	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYRVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230755	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250160_252409_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
540608	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540628	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
540648	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
540653	contig_5018_pilon	-	1711	9	Intergenic	novelGene_47095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	659.935981743684	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	67	801	1402792	1400687	TRUE	0	GTGTCTTCCTCCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGRVEAPADRQPRLQRQVDPPGDRQP	1402858	1399092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1401048_1401263_1401350_1401446_1401873_1401968_1402015_1402078_1402260_1402363_1402701
540678	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
540697	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
540704	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1434	632	979	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2434	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
540707	contig_7202_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_18815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCGCTGCTGGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29881	30110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
540719	contig_17427_pilon	+	2002	7	Intergenic	novelGene_30294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	201.703922178579	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAGTTTCTTATCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147958	176866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
540726	contig_15063_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_13224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
540732	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	232	1404	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
540733	SIRV5	-	418	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACTTCGCACGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10864
540744	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540754	contig_5331_pilon	-	1933	5	Intergenic	novelGene_112772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	259.898537895079	1196	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	14	805	253336	248930	FALSE	15	CCCCTACATTACTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLTMVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253349	247801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253103
540765	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
540769	contig_7057_pilon	+	1121	10	Intergenic	novelGene_123329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	661.517242200379	2470	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	162	632	938907	943233	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	937155	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
540770	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
540782	contig_10134_pilon	-	2284	4	Intergenic	novelGene_16189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	790.073976845769	2	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	50	550	39679	35039	TRUE	30	AGTAATGAGTGACTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFETQVFQDIYPGNLCLLQPLTVLLLLALSSSADLPKAVVNLEPPWINVFQGDYVTLKCHGAHTPGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSGQLAAAPDPSPGVSGGGDHCAEVPQLEELASVQGHVLPEWKIQEVFW	39728	32112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38554_38832_39594
540786	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671621	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
540807	contig_5063_pilon	+	884	5	Intergenic	novelGene_109997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	15	TAATTTCTCTTGACTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
540814	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	287	6	56	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
540866	contig_10311_pilon	-	1673	9	Intergenic	novelGene_50442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	998.815798833799	5	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	32	928	71526	65874	FALSE	25	AAAAGTTGCTTTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHAVWL	71557	65128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65886_67847_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
540870	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
540871	SIRV4	+	248	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	257	445	257	-445	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATTGCCATTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	2326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
540877	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
540880	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_115753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
540881	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
540890	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
540896	contig_19098_pilon	+	2455	14	Intergenic	novelGene_65852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	11	junction_7	67.9088320283571	343	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	332	1315	448586	464455	TRUE	10	CTCGTGGTGACCCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRDYWSYLERRLFSRLEDIYRPTINKLKTSLFRFYLVYTIQTNRSDKAQEFFAKQAAELQNQAEWKDWFALPFLPSPDTNPTFATYFSRQWADTFIVSLHNFLSVLLQCMPVPVILSFDAECQRTNQVQEENEVLRQKLFALQAEIHRLKKEEQQAEEDEALVQHKLPSYVSSMDRLGDSELAMVCSQRSAALSQSPRVGFLSSLLPQSKKSPSRLSAAQAPPQAQSTAKREATVSQAAKGKDPASGAKDGKGLFSGLAAGESSWPQYRQRRLQDHGKERKELLSTTTSQAAWQSAEKKPEMGGTETEPGPEPVEVPMRGPEGSRPEQPFIVLGQEEYGEHHSSIMHCRPKHPPSPSLRCCLWNGPPSETDCFYWAVVWVRCAFTTQKPRRISVRSTSTTTCPESCLSPAAPMGPLSSARLRPRVSPPRWTCRLQT	447719	478039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_447847_448381_448589_450244_450329_451485_451617_452513_452680_459110_459270_460418_460595_461694_461764_464097_464193_464354_464524_468886_468996_470207_470321_472101_472300_477387
540921	contig_4315_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_46770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273007	275479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_273000_275500
540922	contig_9752_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_122052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGAATTGTCATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347082	349789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_347100_349800
540933	contig_5222_pilon	+	2448	6	Intergenic	novelGene_58984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	283.096449995404	97	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	368	1165	155317	188217	TRUE	20	TGATTTGTATTGGAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDSSMSSGYCSLEEELEDCFFTAKTTFFRNVQSKHPCKNVCKPAEEPRQPPTLQEIKQKIHSYNSREKNCLGMKLSEDGTYTGFIKVHLKLRRPVTVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSEVIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSVADCPLYLRLLAGPDTDVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYDKFRQKLEEALRESQGKPG	154949	190408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_155437_183985_184097_185448_185747_186224_186341_188064_188818_189725
540939	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540953	contig_1624_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_138371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCTGCAAAGGAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86399	88493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_86400_88500
540956	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
540958	contig_20029_pilon	+	1812	4	Intergenic	novelGene_138900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGCGAAGCGCGTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5000	11658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_+_5561_7095_7492_9500_10227_11528
540961	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
540964	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
540971	contig_3627_pilon	+	2069	7	Intergenic	novelGene_78538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	262.67153125783	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	54	608	642322	668026	TRUE	20	TTACGGTTTTTGTACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLGGFFGPICEIDVVLNDGETRKMAEMKTEDGKVEKHYLFYDGESVSGKVTLAFKQPGKRLEHQGIRIEFVGQIELFNDKSNTHEFVNLVKELALPGELTQSRSYDFEFMQVEKPYESYIGANVRLRYFLKVTIVRRLTDLVKEYDLIVHQLATYPDVNNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSK	642268	677438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_660439_660516_661658_661816_667857_668048_673913_674057_676141
540973	contig_5549_pilon	+	896	5	Intergenic	novelGene_81574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	62	736	82155	96749	FALSE	25	GTGGCACTAAAATTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	96909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
540976	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
540993	contig_5727_pilon	+	2457	3	Intergenic	novelGene_7931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	46	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1956	500	2455	129759	131714	FALSE	45	TAAGCGGATATGTGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTTNSLPTDLLLKEGSLKQEVESFCYQIVSESNDQKVGILQSEDEQLQPSVSKKSESELPRVKFMSNSNKITFSKKPKRRKYDESYLSFGFTYFGNRDAPHAQCVLCKKILSNSSLAPSKLRRHLETKHAAYKDKDISFFKQHLDSPENSKPAAPKIVNTDNESATEASYNVSYHIALSGEAHTIGELLIKPCAKDVVMRMFDEQYSKKIDAVQLSNSTVARRIKDLAADIEEELVCRLKICDGFSLQLDESADVSGLAVLLVFVRYRFNRSIEEDLLLCESLQSNATGAEIFNCINSFMQKHEIEWEKCIDVCSDASRAMDGKIAEAVTLIKYVAPESTSSHCLLYRHALAVKIMPTSLKNVLDQAVQIINYIKARPHQSRLLKILCEEMGAQHTALLLNTEVRWLSRGKVLVRLLELRRELLVFMDSAFRLSDCLTNSSWLLRLAYLADIFTKLNEVNLSMQGKNVTVFTVFDKMSSLLRKLEFWASSVEEENFDCFPTLSDFLTEINSTVDKDICSAIVQHLRGLRSTLLKYFPVTNDSNAWVRNPFTVTVKPVSLIARDYESLIDLTSDSQVKQNFSELSLNDFWSSLIQEYPSIARRAVRVLLPFATMHLCETGFSYYAATKTKYRKRLDAAPHMRIRLSNITPN	126525	131716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_126690_128339_128456_129539
541009	contig_10299_pilon	+	2640	22	Intergenic	novelGene_79700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	108.04712585671	2	90	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	48	1169	320559	336791	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERPFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSATPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYERARRQTSTFGRSRSWGS	320511	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335026_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336737_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338397_338987_339077_339158_339256_340019_340124_340232
541016	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
541026	contig_5236_pilon	-	1836	10	Intergenic	novelGene_100967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_9	56.493417075262	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	19	1152	1010200	1007644	TRUE	15	CCCAGACCCCACTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYGRVCGRRGLLWAPLPPQVPL	1010218	1006735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127
541028	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
541041	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541044	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_17630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
541052	contig_9706_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_20863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATCCCCCCACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2455	2716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
541063	contig_3584_pilon	+	1365	6	Intergenic	novelGene_108168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_4	1273.43733257668	5806	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	528	1214	530695	531381	FALSE	10	CATTTCTGTGCTCTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527064	531532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530178_530318_530602
541072	contig_15063_pilon	+	1333	5	Intergenic	novelGene_12138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	233	1333	34808	36589	FALSE	30	AAGTCCACTGGTAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVD	27538	36589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
541086	contig_7440_pilon	-	1326	10	Intergenic	novelGene_61159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	415.104211220315	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	75	872	74491	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQPDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56398_58982_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
541091	contig_12638_pilon	-	3092	1	Intergenic	novelGene_33149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTATCCCCCTCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200857	197765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_197800_200900
541096	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
541115	contig_13048_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_138940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516747	513981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_514000_516700
541116	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
541119	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541131	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541145	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
541172	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541182	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
541185	SIRV7	-	251	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69035	0	35816	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78922	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
541188	contig_7202_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_17518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACCTGCTCATGCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
541228	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541239	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_116093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
541244	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
541253	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
541261	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
541271	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
541288	SIRV4	+	168	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1603	632	1148	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2603	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
541295	contig_10082_pilon	-	2841	11	Intergenic	novelGene_63892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	39.636346955793	123	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	422	1693	430676	404694	FALSE	5	TTTGCCTGTTGTGTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVKWVTDIEKSVLINNFEKRGWIQVTENEDWNFYWMSVQTIRNVFSVETGYRLSDDQIVNHFPNHYELTRKDLMVKNIKRYRKELEKEGSPLAEKDENGKYLYLDFVPVTYMLPADYNLFVEEFRKSPSSTWIMKPCGKAQGKGIFLINKLSQIKKWSRDSKTSSFVSQSSKEAYVISLYINNPLLIGGRKFDLRLYVLVSTYRPLRCYMYKLGFCRFCTVKYTPSTSELDNMFVHLTNVAIQKHGDDYNHIHGGKWTVSNLRLYLESTRGKEVTSKLFDEIHWIIVQSLKAVAPVMNNDKHCFECYGYDIIIDDRLKPWLIEVNASPSLTSSTANDRILKYNLINDTLNIAVPNGEIPDCKWNKSPPKEVLGNYEILYDEELAQGDGADRELRSRPGQSLGPKGSRSRDSGRTVLTTWK	440773	403545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_404824_408234_408399_413696_413784_417888_418033_421696_421806_422060_422196_423662_423844_424711_424921_430563_430681_434677_434752_440430
541299	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
541308	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
541337	contig_11708_pilon	-	4149	14	Intergenic	novelGene_138952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	139.136559712107	341	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	4	1077	239003	229304	TRUE	40	AAATATTTTGACTATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMAVLLVSNVNESKGHTPPHTTYKDKRKWKPKFWRKPISENNFSSDEEQSTGPIKYAFQPESRINVPALDTVVTPDDVRYFTNETDDIANLEASVLENPSHVQLWLKLAYKYLNQNEGLCSESLDSALNVLARALENNKDNPEIWCHYLRLFSKRGTKEEVQEMCETAVEYAPDYRSFWTFLHLESTFEEKDYVCERMMEFLMGATKQETSDTLSFQLLEALLFRVQLNIFTGRCQNALAILQNALKSANDRIVAEYLKTSDRCLAWLAYIHLIEFNILPPKLYDPSNANPSRIVNTEPFVMPWHAVQDVKTNPDMLLAVFEDGVKACTDESLTVEERTEVCLPLYTNMIALHQLLER	239006	219258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_221553_223217_223319_224497_224664_224798_224904_225167_225279_228362_228458_229025_229225_229302_229414_232871_233110_233696_233886_235390_235578_236881_237066_238640_238761_238957
541368	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_18833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCCCTCGCAGGTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
541405	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1433	632	978	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2433	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
541416	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	635	1126	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
541423	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541436	contig_14322_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_115695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671431	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
541462	contig_19825_pilon	-	2254	7	Intergenic	novelGene_59688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_6	188.459249942498	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	96	983	46721	36552	FALSE	35	TCATTGGAACATCTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWFWCVSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCKQADEEFQILANSWRYSSAFTNKIFFAMVDFDEGSDVFQMLNMNSAPTFINFPAKGKPKRGDTYELQVRGFSAEQIARWIADRTDVNIRVIRPPNYAGPLMLGLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFSILFVILVLRYNLSIFSHSSIVSIVFVWGSCLIQTGHNILWESYYCVICLSSIN	70110	35280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_36780_37429_37520_38098_38240_38733_38875_42313_42432_46551_46722_70015
541464	contig_15118_pilon	+	2510	7	Intergenic	novelGene_74582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	264.0267768407	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	516	962	377560	378861	TRUE	30	TATTAACCATTTCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	376597	380642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376658_376756_376995_377342_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151
541467	contig_1813_pilon	+	2860	10	Intergenic	novelGene_105515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	57.2921902332979	353	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	13	2391	423524	442898	FALSE	15	TGCAGCCCTTCTTGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATSREAAPAKSSASGPSAPPALFELCGRAVSAHMGVLESGVWALPGPILQSILPLLNIYYLERIEETALKKGLSTQAIWRRLWDELMKTRPSSLESVTCWRAKFMEAFFSHVLRGTIDVSSDRRLCDQRFSPLLHSSRHVRQLTICNMLQGATELVAEPNRRVLETLASSLHTLKFRHLLFSDVAAQQSLRQLLHQLIHHGAVNQVSLYSWPVPESALFILILTMSAGFWQPGPGGPPCRLCGEVSRGRAPSRDEGSLLLGSRRPRRDAAERCAAALMATRRKNEAKQVPRAVPATRVTRRSTQESLTAGGTDPKRELHPPATSQEAPGTRRPPSAPAATSSASASSSTSSSKRAPASSAPQPKPLKRFKRAVGKKGARTRQGSGAESEDLYDFVFIVAGEKEDGEEMEIGEVACGALDGSDPSCLGLPALDASQRFRSISTLELFTVPLSTEAALTLCHLLSSWVSLESLTLSYNGLGSNIFRLLDSLRALSGQAGCRLRALHLSDLFSPLPILELTRAIVRALPLLRVLSIRVDHPSQRDNPAVPGNAGPPSHIIGDEEIPENCLEQLEMGFPRGAQPAPLLCSVLKASGSLQQLSLDSATFASPQDFGLVLQTLKEYNLALKRLSFHDMNLADCQSEVLFLLQNLTLQEITFSFCRLFEKRPAQFLPEMVAAMKGNSTLKGLRLPGNRLGNAGLLALADVFSEDSSSSLCQLDISSNCIKPDGLLEFAKRLERWGRGAFGHLRLFQNWLDQDAVTAREAIRRLRATCHVVSDSWDSSQAFADYVSTM	423511	443367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_423657_427785_427873_429345_429417_436814_437959_440465_440727_441230_441396_441490_441590_442159_442283_442510_442587_442678
541479	contig_5457_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_138996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGTATGTTGCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26575	26221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_26200_26600
541485	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541558	contig_18869_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_56106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCCAAGCACTACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
541560	contig_2552_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_139014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACTAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218164	220464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_+_218200_220500
541580	contig_7887_pilon	+	2360	2	Intergenic	novelGene_124936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	52	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	597	923	584832	585287	FALSE	25	CAAAATGCCTGTCTCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSVQQDLEQSLREAGQGDPAHSGLAKLSHRLAQKLQDLESWGQDPGTPANASGAWGQELHFQSSRERSGKEKWWGGQGNRKAEHWKHKKEGSGGERKSWESEKDREQTRKRKEGKLRVQEWEDKDGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKSPQQLPLEKASR	584235	586724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_585122_585250
541591	contig_4364_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_1150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532894	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
541594	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4147	-1	2968	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
541611	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
541620	contig_500_pilon	+	1346	9	Intergenic	novelGene_31026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	1191.61854215181	10	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	62	931	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485752	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
541621	contig_5445_pilon	-	2225	1	Intergenic	novelGene_135421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACCAGCTCTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53916	51691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_51700_53900
541627	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2128	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
541634	contig_10923_pilon	+	1810	10	Intergenic	novelGene_66199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	797.863273041901	4	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	48	1694	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13831	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38584_38742_42554
541657	contig_6975_pilon	-	1942	7	Intergenic	novelGene_74254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	459.286765902669	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	259	798	162477	159453	FALSE	35	GGAGATAATAGTATGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169994	158308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_169807
541683	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGCCATGACGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
541704	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
541719	SIRV4	-	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAACGATTGCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
541745	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
541753	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	658186	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658188	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
541759	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
541802	contig_7753_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_41514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGATAGCAAGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244046	1246683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1244000_1246700
541806	contig_5551_pilon	-	2167	3	Intergenic	novelGene_134262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGTCACATGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615361	607163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_607238_612219_612416_613464
541809	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	444	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
541821	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
541837	contig_13740_pilon	-	1697	11	Intergenic	novelGene_34694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3987.53262181013	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	165	1187	165243	157474	TRUE	40	TCTAAAGGAAATTGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165407	156810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161719_161919_162031_165237
541839	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
541850	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
541852	SIRV4	+	395	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	6	-915	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAGTGTGAAGTTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
541857	contig_12074_pilon	-	2093	14	Intergenic	novelGene_53764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	429.441952459869	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	867	1850	34934	30226	FALSE	50	TAAAAATACATATTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45897	29982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35892_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
541862	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
541863	contig_2062_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_139049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATTGATACCAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312586	1311971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1312000_1312600
541883	contig_6589_pilon	-	1201	10	Intergenic	novelGene_25904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	166.41410493401	6686	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	241	1053	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178548	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178132_1178424
541888	contig_6589_pilon	+	1504	8	Intergenic	novelGene_26004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_7	637.63149104114	3058	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	137	982	1725483	1731484	FALSE	65	AAAAAAAAAAAGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725346	1732006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
541890	contig_10437_pilon	-	2337	15	Intergenic	novelGene_38449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	18.9080751564629	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	109	1821	1030186	951463	FALSE	30	GAGATACAAGTGATTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERLDSQNREVMKHLKAICFLRPTKENVDYLIQELRRPKYSVYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVTEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLVLDRCDDTVTPLLDQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKQKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNVKRLLQNPRVTELDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMVDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGKLKETQYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHGRSKEGSQVTARSASRR	1030294	950946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_951551_986392_986525_1006041_1006164_1007555_1007664_1007873_1008033_1017987_1018156_1018559_1018674_1019086_1019222_1021496_1021608_1022051_1022190_1022311_1022381_1023404_1023485_1027648_1027710_1029382_1029518_1030093
541892	contig_10235_pilon	-	1344	9	Intergenic	novelGene_46469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	895.224962998128	1256	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	379	840	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224470	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223231_223370_223694_223780_224427
541895	contig_5196_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_38654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTTGAGTGTCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10285	8428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_8400_10300
541898	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_11320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	231	1409	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
541914	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
541917	contig_1813_pilon	+	2243	9	Intergenic	novelGene_105480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	191.000286321775	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102763	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_113656_113794_141568_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
541923	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTTTTTCATTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5790
541925	contig_8729_pilon	+	1919	2	Intergenic	novelGene_40110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCTGAACTATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306022	323931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_306214_322203
541948	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	632	1112	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
541949	contig_16510_pilon	+	2234	5	Intergenic	novelGene_139087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.8488958605955	257	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	59	565	289339	292515	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAELRAESDSLLLQLLRDLEELEGWFSLSKARYAMGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPALRRRKGLSRTSKPEPSAAPEDPLNWFGILVPHSLRQAQASFQEGLQLAADMASLQIRINWGRSQLRGLQEKLRQLEPGAA	289280	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289414_289529_289634_289736_289820_291155_291288_292402
541966	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
541981	contig_6102_pilon	+	2097	18	Intergenic	novelGene_31735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	137.928169460759	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	243	1442	216236	228032	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPGSEQPVPRRHCSAEYP	210253	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220750_227977_228161_228274_228396_228586_228648_228903
541986	contig_15063_pilon	-	924	4	Intergenic	novelGene_12516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	171	494	35891	35108	TRUE	45	AGTAATCACAATGGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36061	28158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35380_35839
541994	contig_7202_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_18828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGCAGGTGCGCCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
541996	contig_9345_pilon	-	3391	1	Intergenic	novelGene_24704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	983	1330	963666	963319	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAPEIPRCLLIGSVGLQGQLHVMPQLFHLDTVKWWHQTLSNLGAEQNYHQHQSKTDSYEVEVRHTDTLQLFFLFKPILTPAIPPMALSVSLLGWIICCSAHTELTKHIHDYRVY	964648	961257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_961300_964600
542000	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542012	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_89065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
542024	contig_14322_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_116579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCCACAGCAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
542032	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542059	contig_3463_pilon	-	2579	14	Intergenic	novelGene_61994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	166.980706110071	11	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	27	1172	597436	519627	TRUE	20	CACTGCAGTGTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVRKGHDSMVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMTSMFHLST	597462	507705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_522710_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_597388
542068	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_16572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
542074	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_90546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653843	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
542091	contig_5467_pilon	+	2276	11	Intergenic	novelGene_111943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	673.219882356426	1584	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	124	1467	16679	21610	FALSE	15	AGCCTGGCTCTTTAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESSSITPLEELYKRFQFPEGPSESMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVVEGSFVYKGGKIYKVPSTETEALASNLMGMFEKRRFRKFLVFVANFDENDPKTFEGVDPQTTSMRDVYRKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQPCLETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPVDDIIMENGKVVGVKSEGEVARCKQLICDPSYIPERVRKAGQVIRIICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISYAHNVAAQGKYIAIASTTVETSEPEKEIEPALELLEPIDQKFVAISDLYEPIDDGSESQVFCSCSYDATTHFETTCNDIKDIYKRMVGSAFDFENMKRKQNDVFGEADQ	16555	22419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_16724_17777_17886_18032_18133_18264_18400_18888_19088_19304_19437_20039_20140_20623_20796_21032_21178_21312_21368_21457
542107	SIRV5	+	458	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	878	-17	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
542108	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
542125	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542126	contig_20199_pilon	-	1004	4	Intergenic	novelGene_82513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.07816092788	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	154	549	43987	41171	TRUE	15	CTCCTCACTAGGCATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44140	27456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_27538_40796_41250_42110_42347_43906
542133	contig_3627_pilon	+	2147	10	Intergenic	novelGene_78571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	36.2525435463534	754	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	25	1836	1313510	1343837	FALSE	15	TTCTCTTAACTGGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPPLSKAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKRSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313485	1344148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323423_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
542137	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
542161	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542162	contig_10141_pilon	-	2731	8	Intergenic	novelGene_84621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_4	115.791508623853	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	8	2473	418577	395520	FALSE	15	CTGGCGTGTCATCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFKKIYKTLKKDEDIPVFPVQTKYMDTVKERICLARQIEKAEYRNFQACLHNSWIEQAAAALEIELEEGMYKGGKADEQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPLFKDDLKTKYPTQSGKPIVVSAPGNGKSALSCISKQKKKKKKKLKEQQQPQPSTSAD	418584	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397364_399918_400108_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835_409370_417973
542168	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542172	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
542173	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
542183	SIRV4	+	300	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	198	452	198	-452	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTCTTCAAATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	2319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
542222	contig_10923_pilon	+	1582	10	Intergenic	novelGene_66197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	908.625267392015	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	49	1569	21667	53256	FALSE	25	ATAAAATGTTTTGGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVVLEPPSSMAAERTQSAAFPPGGLQGCLSVVIRK	13830	53269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36601_36698_37270_37540_38578_38742_53155
542229	contig_8377_pilon	+	2164	6	Intergenic	novelGene_35120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6579	junction_3	857.0395556799	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1319	1699	176610	177627	FALSE	75	AAAAAAAAAACAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDVSENASFLSLMIFILLLSMHSIHFHICLWKMFEILLEIL	168149	178092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430
542242	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
542244	SIRV1	-	256	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	5	3569	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
542252	contig_12312_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_63971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218303	217425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_217400_218300
542262	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
542266	contig_10674_pilon	+	2096	12	Intergenic	novelGene_6434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	214.778263516909	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	23	1936	198581	251317	FALSE	20	CTTTCTGTGTTCAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPQESAAMADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLNSDEEVRNQ	198558	251477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782_211888_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_241065_241253_243633_243732_251299
542269	contig_13863_pilon	-	1213	6	Intergenic	novelGene_42043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCACTCAGGGTCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120388	113961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_114121_114261_114323_115311_115379_116112_116144_118886_118963_119569
542270	contig_11677_pilon	+	2198	13	Intergenic	novelGene_85976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	79.9435564771935	8	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	17	2059	727262	737475	FALSE	35	TGATATGAAGTATGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAAATDIEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETLNLKVPDYLPLGQGQLGLLPCISMWHPSLVTEKAALRKALAGSLCLPWFSLTPQGEPQHCFAGRCQAQVTSGTPPLQLSFLASYTPVGYSQTGVQKAAAQDLVLRVWQRLGQCGTVGKIPDLESNRPEFCASALNI	727245	737614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727296_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531_736771_737063
542279	contig_4469_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_21961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCACTTTTGAAGTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757130	755395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_755400_757100
542300	SIRV4	+	170	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1601	632	1146	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2601	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
542312	contig_18869_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_56368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
542318	SIRV5	+	302	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	10	893	10	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8325	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
542353	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542359	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
542360	contig_12074_pilon	+	2099	3	Intergenic	novelGene_53777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	126.5	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	44	829	46021	52368	FALSE	30	CAAGTGTTTTATTTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWPLCKLRFYRPSAMAEAMDLGKDPNGPTHSSTLFVREDGSSISFYVRPSPAKRRLSTLILHGGGTLCRVQEPGAVLLAQPGEALAEAAGDFISTQYVLDCVERNERLELEDYRLGSAADQASETKPGAQAEGAAAAVEPDPEPLTGRIAFTEADDVAILTYVKENARSPSSVTGNALWKAMEKSALTQHSWQALKDRYLKHLRGQEHKYLLGDAPVSPSSQKLKRKAEEDPEAADSGEPQNKRTPDLPEEEPEEEKIKENEEPVKKMLIEAPWF	45977	53638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_46694_50487_50589_52356
542368	contig_4364_pilon	+	334	3	Intergenic	novelGene_579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	261	72	332	1530895	1531234	FALSE	25	CACTTTCTATAACGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWH	1530453	1531236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
542370	contig_10734_pilon	+	2368	6	Intergenic	novelGene_51292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	289.583148680996	154	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	20	544	1368595	1380475	FALSE	60	ATTAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGK	1368575	1382299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1380467
542373	contig_14682_pilon	+	164	1	Intergenic	novelGene_139104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAATAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91512	91676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_91500_91700
542396	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542409	contig_500_pilon	+	1642	10	Intergenic	novelGene_30970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	557.993915626813	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	229	1341	1452302	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446858	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452157_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
542413	contig_4857_pilon	-	3506	6	Intergenic	novelGene_48647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	62.3204621292236	3	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1985	2290	443315	441598	FALSE	30	ACAGACCTATAATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448614	440381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_444537_444997_445070_447620_447760_448062
542421	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
542429	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
542444	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542447	contig_15087_pilon	-	2752	19	Intergenic	novelGene_37149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.939709610745	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1134	1991	52941	38999	TRUE	20	CAGCATTCCATGACTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89806	33329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33736_33798_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54564_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
542465	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542474	SIRV7	-	349	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
542512	contig_8616_pilon	+	2545	16	Intergenic	novelGene_72536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	233.240324319979	864	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	369	1889	404449	407881	FALSE	5	GCTCCTTCTGGCTCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSLNSLADSNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLAEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYFLVSPPATPISTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGAARGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLTQNRGLGGIMVKRAYETMAGVGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPPLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED	401833	408537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_401873_403509_403628_403740_403805_403990_404109_404419_404523_404702_404803_404971_405161_405259_405335_405458_405518_405660_405792_405913_406054_406291_406521_406653_406744_407135_407255_407360_407510_407715
542520	contig_11088_pilon	+	1307	4	Intergenic	novelGene_85027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	92.782900723499	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	682	1110	17314	17742	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	10801	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_10919_14663_14937_16250_16348_17119
542573	contig_16930_pilon	-	3121	1	Intergenic	novelGene_139161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	2348	2776	130158	129730	NA	20	GCAATTTAATTTTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHNYHSFHQTESSTTRWCPATTTDCSNKDHNRGSRTELEKNVEQNSDSQKKTRLTGFTEPGETLRIWPPDTFFKSVLKSLLRFTRQPKIRQAHKANNNTCSSPLYTRLNGHTSPGARMRRQEGTGKLDKRKRVTQSQRGDS	132505	129384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_129400_132500
542601	contig_8045_pilon	+	1250	5	Intergenic	novelGene_35393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	17	556	116169	118722	FALSE	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116152	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
542627	contig_11285_pilon	-	3214	28	Intergenic	novelGene_5738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	141.724389111881	351	24	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	1375	2901	1200236	1192895	FALSE	5	TTCTGACCTCTGCCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM	1230742	1192581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207816_1209748_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
542632	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542637	contig_6233_pilon	-	1830	12	Intergenic	novelGene_74799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_9	296.313130107966	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	627	1466	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250339	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_177116_177257_199837_199941_200462_200546_250135
542638	contig_15407_pilon	+	1678	7	Intergenic	novelGene_123061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	751.627733655431	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	472	1125	465994	470398	FALSE	40	GTCAAGTCCTCTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIRRVVEVFKPGKFVTTLFVNQSSKCRTVLSSPQKIEGFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449426	470951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468308_470257
542642	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542673	contig_11413_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_103147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	220	573	139964	140317	NA	30	ACCCCATTTCCTCTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQAQPGRHGSVMLESYWLTSITTGAPTKIEWRSGERSVFLPICINVKKVVQAYLLLLIEYFKSSIITHKYFTHDPTSSQASCSHCILSDCIYRRHYFNIFFFFGIFKMFKFGKFP	139744	141407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_139700_141400
542685	contig_1009_pilon	-	2230	8	Intergenic	novelGene_121774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_7	33.555923471125	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1011	1406	305255	301449	FALSE	50	CTAAGAGAAAGCCATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356423	300624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_356347
542693	contig_6001_pilon	-	2326	15	Intergenic	novelGene_128041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	87.794083060353	384	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	67	1545	712446	665184	FALSE	30	GCTCAGTCTCCACGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDAFRAVKKRIVGNKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVEGVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNLIQSWADAFRSSPDLTGVVAVYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETPSGQYAVGTDTSQQVDSNQHTAPLSTPAVPPSDTPIAPTPEQIAKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRILELIPRIADEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFERFRTGQTAKAPSEAESATDLIDMGPDSAAPSHLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLNASGQLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDIEHWLSTDVGNDAEEAKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPPGAAPRKKTQEKDEDMLFAL	712512	664402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_665339_665419_665460_666180_666241_670983_671060_673821_673943_675050_675145_675511_675546_677380_677515_680179_680297_684568_684716_684905_685041_685405_685556_686461_686541_692449_692535_712394
542703	contig_9345_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_24349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	46	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	75	722	144517	142100	TRUE	10	TGCTTCCCTCGTTCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144591	141103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141715_141893_142414_142567_142781_142955_143072_144512
542705	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542708	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
542709	contig_9848_pilon	-	2088	8	Intergenic	novelGene_79981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	743.084470711268	1541	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	23	511	149215	130914	TRUE	15	TTTAATGCTTGTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGMGGSRESRGGWDSRDDFNSGIRMTS	149237	128383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_129475_129672_130112_130866_130928_134178_134245_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
542726	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_89063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
542740	contig_4364_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_2790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
542741	contig_12923_pilon	-	2176	15	Intergenic	novelGene_30084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.553561520241	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	58	2163	93727	45355	FALSE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTLLIQSFDE	101225	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45386_51079_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
542744	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
542746	contig_9995_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_47703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATAAAATAGAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301519	300540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_300500_301500
542749	contig_3151_pilon	+	2767	8	Intergenic	novelGene_139192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_3	34.7128159594801	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	739	2574	201092	246022	FALSE	30	CCAAATTTGTGTGTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTTELQKTTGTMIHKLTARALVRDFEYGILHENETHHQMKKQILKSLIIKISKENSLLTQFTSFVAVEKRDENESPFPNIPNILELIAKEDVDFLPYITWQEEQSGASMTQIISASSEWNEDLQHKSLTERKVKSPKPEVSEDVEVFNLATQLPVQPLILNSECGLVAKPLDLSWMNSLKKKKIKAQFRKSSLHTKNDVFKPSLSLGAAPILPGASHVDSGFLSPPVSPQNSLFGSPGSLKQFGPSKYDQDLETGSCTDVSLKLDFPSRLPPQNPPFRSPACSPFSAASFGSKQIDRSKIYQDREICGTGISLGTYSTPRPRLFLSLPRLPPPVSAVGFSVPSPLHFQNSLDPLSANYKQPIDLLGFASSESGVSFPLNISAGTALSDPPLHDLQTASSHESSSEMKSNERSVLQASRFSKRVAKSDETRSDFTSSFQAQNDEDDKVCKQSWRNFVPWTKLFSLQTEGGFWKLTPELGFILNLNTNFLNSFLEQKGIQSLGIKGQECLLNLIATLLVLQFLCTKFKEEGIVFKSLMKLDDTSISRNIPWAIEGIKKASEWVRRTEGQYPSICQRLELGKDWDSATKQILGIQPIDTTSPLYGVLNYSQG	200353	246215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_201131_202469_202551_203650_203747_206056_206180_222022_223091_224785_224886_234561_234695_245826
542752	contig_16385_pilon	+	1891	16	Intergenic	novelGene_86191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_8	143.183735885827	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	49	1707	3004	36650	FALSE	10	TTGGGTTTCTTAGCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
542756	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
542792	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_18254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
542793	contig_4686_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_118593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846457	844812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_844800_846500
542797	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_16609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27846	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
542807	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
542820	contig_16461_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_139199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	360	231	590	718	359	NA	20	TACTCCCACAGTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAYEKACVYMYEWYLSTLIAGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQNSYGS	948	356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_400_900
542831	contig_15449_pilon	-	2162	6	Intergenic	novelGene_33676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_5	96.7334481965778	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	58	873	196078	192849	TRUE	50	AATACTAGGTAAACTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPVNMQGGGAAGPRAKH	196135	190984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
542849	contig_3410_pilon	+	1814	3	Intergenic	novelGene_58895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATGCAGGTGACGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13681	15645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_15155_15245_15524_15582
542859	contig_1725_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_24302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTAACCAATGTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222420	224197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_222400_224200
542861	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_97517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
542881	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	668	969	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
542882	contig_8710_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_73504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCTATGTATATACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271651	269704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_269700_271700
542897	contig_15063_pilon	+	1080	4	Intergenic	novelGene_13911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	138	959	35271	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34747_35269_35380_35839_36158_36266
542900	contig_12951_pilon	-	1856	4	Intergenic	novelGene_68160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	340.074828367065	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	9	326	307115	296988	TRUE	20	TATTTAAGAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	307123	295358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_296412_296510_297135_298383_298510_307070
542915	contig_1986_pilon	-	2010	5	Intergenic	novelGene_64151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	616.885473568636	219	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	124	585	410391	388414	FALSE	20	GTCTCATGTGAATGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPNRSPPLSNTAAAPHRGDRGFPLAAAAAGRVPPRPRPAAAMQFMLLFSRQGKLRLQKWYVPLSDKEKKKITRELVQTVLARKPKMCSFLEWRDLKIVYKRYASLYFCCAIEDQDNELITLEIIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLLGGEVQETSKKNVLKAIEQADLLQEPRHEYFNVPVY	412789	386988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_388450_402862_403001_403608_403718_410212_410392_412666
542918	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
542922	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
542928	contig_12270_pilon	-	333	2	Intergenic	novelGene_113869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	4	333	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14412	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
542940	contig_12644_pilon	+	1120	9	Intergenic	novelGene_44615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5692.98840680358	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	53	607	2675526	2679592	TRUE	30	CAGTGAGAAATATGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKLD	2675473	2680623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679583_2679665_2679878_2679963_2680107_2680220_2680378
542957	contig_10235_pilon	+	2284	5	Intergenic	novelGene_46438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	230.946287045278	1	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	7	498	210483	211761	TRUE	30	ATGCCTCAGTACATGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSS	210476	213671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211754_211924_212047
542974	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
542998	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543004	contig_11752_pilon	-	1302	7	Intergenic	novelGene_37563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATCCAAGTCTCACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105909	84049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_84195_85032_85115_87157_87455_88706_88775_92872_93056_94218_94433_105596
543018	contig_19342_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_41121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4284	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4377_5957_5994_6139
543030	contig_6735_pilon	-	1538	9	Intergenic	novelGene_15761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1034.03142330154	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	208	1062	545923	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568267	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547301_568194
543080	contig_5794_pilon	-	1491	9	Intergenic	novelGene_69801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3397.25572153466	459	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	40	1011	749501	743712	FALSE	15	TATTTGTGTAGTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749540	743231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749495
543082	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
543091	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543099	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543106	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543129	contig_7202_pilon	+	173	1	Intergenic	novelGene_17583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTCTCCCAGGGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
543139	scaffold_17542_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_139244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474583	476487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_474600_476500
543154	contig_9797_pilon	+	1599	6	Intergenic	novelGene_65593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	397.415953378824	1620	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	188	814	183892	191368	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172546	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183804_183848_183989_188577_188734_189277_189422_191138
543158	contig_14621_pilon	+	2030	2	Intergenic	novelGene_105833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	1099	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116084	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824
543167	SIRV4	+	330	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	632	986	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543176	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543194	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543216	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
543231	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_90566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653856	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
543233	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543238	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543253	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543266	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
543270	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
543283	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
543298	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543302	contig_11720_pilon	-	1735	3	Intergenic	novelGene_43761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300	1246	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	485	886	16194	15793	FALSE	20	TTGGCCCTTCTGGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18335	14943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16341_16597_16878_18277
543306	contig_14287_pilon	-	2307	3	Intergenic	novelGene_24050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	137.5	1	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	182	994	22710	21898	FALSE	10	CTGAGCTCTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33912	20584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33825
543312	contig_7457_pilon	-	1870	8	Intergenic	novelGene_31426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.210112565976	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	23	493	473193	471097	TRUE	50	TAACAATAAATATTGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEVSASYPFSLVWWI	473215	468266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468348_468483_469384_470289_470492_470902_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
543319	SIRV6	-	286	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTCACCGCGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
543338	contig_12427_pilon	+	3095	24	Intergenic	novelGene_40490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	184.969143699653	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	533	2728	401454	419950	FALSE	25	TGAATGACAGCTGCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397711	420317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_399599_399672_399853_399934_401068_401145_401421_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
543344	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543348	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	636	975	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543356	contig_9871_pilon	+	1876	8	Intergenic	novelGene_75647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	185.431102778231	69	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	397	1206	391952	419187	FALSE	0	CCCTCCTCCTGTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384493	419857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384781_384900_384991_391932_391973_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
543362	SIRV4	+	300	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	632	1016	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
543364	SIRV6	+	467	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1340	223	-2	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
543379	SIRV2	-	647	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	-1	2971	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
543392	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
543393	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
543402	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	29	355	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14437	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
543404	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCATGACGACCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543414	contig_14882_pilon	-	3009	3	Intergenic	novelGene_114979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	101.5	1126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	687	1214	66629	39935	FALSE	25	TTGTTTTTATATTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGNDDDLTIPRAAINKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLISSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALKRRKANSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKARQQQAELAQQEWLQMQQAAQQAQLAASASASNQAGSSQDEEDDDDI	67315	38139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_40079_57893_58058_66409
543433	contig_6445_pilon	+	2535	6	Intergenic	novelGene_77087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	5.49181208709839	197	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	160	1425	917053	921649	FALSE	15	TTTCTCTTGCCCTTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLHGFRRIIFEYQPLVDAILGSLGIQDPERQEPLDGPSYVASEDSRILVLTELLERKAHSPFYQEGVSNALLKMAELGLTRAADVLLQNGANLNFEDPVTYYTALHIAVLRNQPNMVELLVRHGADINRRDRIHESSPLDLASEEPERLPCLQRLLDLGADVNAADKHGKTALLHALASSDGVQIHNTENIRLLLEGGADVKATTKDGDTVFTYIIFLLGETVGGDKEEAQLINRFCFQVTQLLLAHGADPSECPAHESLTHICLKSFKLHFPLLRFLLESGAAYNCSLHGASCWSGFHIIFERLCSHPGCAEDDSHVDLLRKAETILDLMVTNSQKLQLPENFDIHPVGSLAGKIQALHFSLRQLESYPPPLKHLCRVYIRLYLQPWPVDVKVKALPLPDRLKWYLLSEHSGTLQDDI	916893	922759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_917166_918711_918894_919925_920033_920135_920245_920763_920851_920981
543435	contig_14528_pilon	-	2028	10	Intergenic	novelGene_111275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	119.784786436878	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	10	1404	201850	191351	FALSE	0	TCCTTGGTTCTTTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRVSLGDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSCPLLPGSPYLPLTLGGEASEKQRPSLFSAAHQSSVPSFPAWWQPPQWPGKRAPSSTPCFLSPMALATSCASTQSHCW	201859	190726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192731_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197802_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
543446	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_18804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCAGGACTCGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543448	contig_14361_pilon	+	2986	9	Intergenic	novelGene_139253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	55.2108175541714	116	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1	756	3976	26294	TRUE	25	ATCAGATAATTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCLEKISPHWFLYSRSLSGAEAVNALRPFYFAVHPDFFGQHPREREVNENSLKRLSVYLENLQKPGFKSLKPTQLTFYVRETDQNSSDGQEPFSTSGFRAVEFTLHTRDLLSTVLDILNSCSLSTEHLQSLNTHVHSQPLRQARRPPDRPIKWDKSYYSFTGFRDPDEDLEQVSRVETTLISWLDHNEKSAVKKLKNSLPLRRELDRLKDELSHQLQLSDIRWQRSWGIAHRCSQLHSLGRLAQQNLDVH	3975	35825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_+_4114_7563_7718_13454_13708_21706_21830_25747_25824_26282_26375_30828_31062_31717_31850_34040
543465	contig_4364_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_2204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532923	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
543476	contig_7457_pilon	-	2618	2	Intergenic	novelGene_31514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	611	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGATGGTATGGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676671	673515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_675869_676406
543477	contig_5018_pilon	-	1538	6	Intergenic	novelGene_47063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	598.339502289461	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	73	513	1402792	1401830	TRUE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGEGPCPALTSVPFL	1402864	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1401799_1402078_1402260_1402363_1402701
543478	contig_8050_pilon	-	3057	4	Intergenic	novelGene_114838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACGTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351622	340010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_341572_341710_341853_343856_344232_350643
543481	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_94272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
543484	contig_2100_pilon	-	1453	11	Intergenic	novelGene_50668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1028.60482693793	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	245	1135	1180199	1170237	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLPPVS	1185488	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170252_1172365_1172451_1173171_1173374_1174204_1174383_1175647_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180282_1182727_1182822_1185420
543515	contig_10225_pilon	+	2136	6	Intergenic	novelGene_86789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	561.195723433456	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	713	2020	38722	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALVSMWCPQDTHTLGTESSCAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVNLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20679	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35619_35785_37031_37145_38521_38787_46216_47328_47504
543523	contig_10431_pilon	-	2020	4	Intergenic	novelGene_117407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	425.269326427383	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	105	515	262758	252991	FALSE	20	TACCTTGCCTTTTTACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFEAALLSPGSPKRRRCAPLPGSTPGLRPPDAEPPPPLFQTQTPPPTLQQSTPPGSERRLPTPGSSWMKKDQPTFTLRQVGIICERLLKDYEDKIREEYEQILNTKLAEQYESFVKFTHDQIMRRYGTRPTSYVS	262862	251485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_253002_253850_253923_255271_255407_262565
543531	contig_14925_pilon	-	1147	6	Intergenic	novelGene_55099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1753.86943641766	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	106	609	51337	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDANRFFFGSGTKLSVKPSVGKVLCRVSTKCGLFSMVFCWASNHCVINTARNKLTFGEGTMVLVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	54557	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_51243_51388_54502
543547	contig_15063_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_13229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
543548	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
543551	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543570	contig_987_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_72325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGCTTTTCTCAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065744	1066750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1065700_1066800
543577	contig_3122_pilon	-	1382	7	Intergenic	novelGene_64392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	132.694720651912	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	624	1091	261599	258561	TRUE	50	AACGAGAACGGAGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAVPHNIAVAVFKAL	262595	258150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258329_258447_258602_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262059
543580	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_17628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543581	SIRV2	+	646	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTCGTTCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1651_1727
543604	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_89071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	TGGTTTTGCTCTCCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
543617	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_18273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543632	contig_9014_pilon	-	2331	11	Intergenic	novelGene_106711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	90.803964671153	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	253	1095	50583	43180	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVRTGPLNVTIVTTAART	51527	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43315_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51286
543633	contig_5797_pilon	+	2284	6	Intergenic	novelGene_56959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	210.183158221585	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	312	674	408632	418675	FALSE	40	TATCAGAGTGACTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	398595	420285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_398646_400828_401003_402272_402343_408614_408756_412625_412752_418562
543635	contig_6069_pilon	+	1999	9	Intergenic	novelGene_8071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	75.9489960433974	539	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	87	1550	560908	566386	FALSE	25	GAGCAGTGTAGAGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELEAATMTVCNQTWNELQTRAPEEMSRLPHYCAGAMFVWQLMSYGYGFDEPAFRGVTFRKKAGDTAIGWALGYMLNLTNMIPADPPGLRKGSEFGSWVVLLLLFAAMLLAALVLLLRQVCSAK	560821	566835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564695_564775_564896_565907_566043_566197
543636	contig_5196_pilon	+	2896	1	Intergenic	novelGene_38671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	358	1077	115	1191	26386	27462	NA	75	ACAAAAACAAAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPDATSAYLDYSYATSQIPDNEETYVSYTSVFLPVFYTVVFLTGVLGNLVLMGVLHFKQGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCSVLLLTCMSVDRYLAIMCPTVSRKFRRRDCAYGVCAGIWFVSCLLGLPTLLSRELTLIDDKPYCAEKRSTSVKLAWSLVVLIFTFFAPLLSIVTCYCCITRKLCTHYHQSGKHNKKLRKSMKVIFIVVTAFVCSWLPFNTFKLLAIVSGLQQELYVSSAILQLGMEVSGPLAFTNSCVNPFIYYVFDSYIRRAIVRCLCPCLKNNDFGSSTETSDSHLTKVLSNFVHAEDFARRRKRSVSL	26271	29167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_26300_29200
543648	contig_1813_pilon	+	2529	12	Intergenic	novelGene_105479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	371.84303095449	192	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	70	834	128315	150078	TRUE	10	AGCCGTGGTATTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSGGARERSPGESAVVKERRKEMGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSLWG	102763	156300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
543649	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
543661	contig_12270_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_113128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
543672	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_95101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
543674	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_16633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27854	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543677	contig_8885_pilon	-	1819	6	Intergenic	novelGene_115556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.586157515486	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	110	499	75477	49174	TRUE	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75586	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_46945_47118_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
543683	contig_14322_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_116587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGCCACAGCAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
543689	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_96630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
543690	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543709	contig_7202_pilon	-	159	1	Intergenic	novelGene_16433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27781	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543721	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_96880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
543734	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	41	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	234	1406	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27537	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
543747	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543764	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
543767	contig_12622_pilon	-	1371	9	Intergenic	novelGene_6004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2434.09538830651	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1350	20	1369	1590968	1586268	FALSE	10	TTAGTTCCCACTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFS	1590987	1586265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1586407_1586528_1586661_1587977_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
543783	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
543794	contig_12032_pilon	-	2072	9	Intergenic	novelGene_139265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_8	117.366879378298	476	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	209	1765	122805	96750	FALSE	15	CTTGGCAGTCTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRVRLQKRTWPLEMPEAEPTLGQLRAHLGQALLPTCGYSSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	123013	96442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122683
543823	contig_10299_pilon	+	1929	12	Intergenic	novelGene_79660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_8	57.8986004484072	981	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	72	1868	182394	187611	FALSE	45	ATTCACAAAACTTGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182322	187672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
543825	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
543828	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543835	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
543846	contig_5780_pilon	+	2521	6	Intergenic	novelGene_29778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	19	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	281	763	107519	110295	TRUE	35	TAAAAAGGAGTTTTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73990	113719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110359_112024
543852	contig_10437_pilon	+	2284	3	Intergenic	novelGene_38139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.5	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156673	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160844_162858
543858	contig_15219_pilon	+	2540	8	Intergenic	novelGene_40828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	220.031166623536	4	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	108	1196	19617	24591	FALSE	60	AAAGAAAAGAAAAGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19509	25935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
543867	contig_7410_pilon	-	2048	6	Intergenic	novelGene_106083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAAGAGCCCGAGTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412183	405243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_405377_406600_406782_407067_408410_410366_410419_411207_411244_411879
543868	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543871	contig_1516_pilon	+	1857	7	Intergenic	novelGene_50000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1476.61475642393	28	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	377	1282	347241	363153	FALSE	15	AAGCACCTGTTTCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRCRDGPWSPSSKPCPVPSPPPLH	336187	363728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_363083
543876	contig_8978_pilon	+	181	1	Intergenic	novelGene_49307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAATGTTTTGTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111819	112000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_111800_112000
543903	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_16616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27848	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
543911	contig_19769_pilon	+	836	6	Intergenic	novelGene_102283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	241.073432795901	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	31	804	87249	89322	FALSE	15	CACTTAGCTGTGTACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86999	89354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
543918	contig_12638_pilon	+	2606	3	Intergenic	novelGene_33088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1605	junction_2	188	163	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170775	178520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_173560_178085
543933	contig_1443_pilon	+	1781	9	Intergenic	novelGene_28300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACGGGAAACAGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747995	804636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748995_749241_749349_750369_750531_764859_764929_766777_766826_767479_767556_776186_776462_804491
543948	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
543950	contig_11292_pilon	-	1604	12	Intergenic	novelGene_109408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_5	273.233651110498	1011	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	221	1531	167479	161842	FALSE	5	CTGCCACCTGTCTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELNDPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167699	161768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
543960	contig_5988_pilon	-	1367	4	Intergenic	novelGene_15935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	874.727513127501	8	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	96	1193	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652697_653284_653422_653549_653773_655456
543962	SIRV6	+	266	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10558	2	1321	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11558	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
543967	contig_12079_pilon	+	1931	13	Intergenic	novelGene_67412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	153.06704685638	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	98	1669	529222	578891	FALSE	10	TTGGTGATCTGTTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLRCPLFSCPFAPSWTFSLRCRCSCLISSVTSRFYQFTTQQPLGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	529124	579153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_529358_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
543981	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
544000	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
544013	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
544028	contig_8486_pilon	-	2638	13	Intergenic	novelGene_139293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_10	19.5794322355544	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	194	2248	60945	55211	FALSE	25	TTGCAAAGTGGGTTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILSEEAGSPKLPRWHFLLDKERVRLLRAEHCNPDPLSREEGRQRGGWGWGLRQGSTLARGTGAMAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHDWIPTDWPVPPDWQNLRPSPNLRPSPISRASQNPGASQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPDSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAETRAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGAASANFAANFGAIGFFWVE	61639	54820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58865_59479_59738_60034_60203_60900_60975_61475
544048	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
544068	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_91282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657161	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657161	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
544073	contig_11720_pilon	-	1774	13	Intergenic	novelGene_43896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.296040039848	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	105	1004	124674	117634	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFT	134626	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117642_118143_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
544074	contig_8631_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_121969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATATATAAAACTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774463	774095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_774100_774500
544107	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1457	636	1002	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2457	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
544120	contig_12624_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_61136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	13	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	239	544	952979	948779	TRUE	20	GTGTTGAAGATTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955877	947491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948188_948487_948842_950590_950768_952913_952985_955644
544134	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544141	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544147	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_115742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
544160	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
544184	contig_9363_pilon	-	1776	11	Intergenic	novelGene_6549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1035.11508538906	10	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	126	1097	786587	754063	FALSE	30	TATATGTGTCAGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQ	787891	753383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754066_773920_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
544191	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_93389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
544226	contig_19564_pilon	-	1623	4	Intergenic	novelGene_29636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	915.548044737261	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	169	1443	15529	12201	FALSE	10	GAATGTCTCCTCTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15697	12020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13199_13554_13666_13945_14055_15472
544234	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544236	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
544244	contig_14322_pilon	-	320	2	Intergenic	novelGene_116393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671840	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
544250	contig_7202_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_18301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27940	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544251	contig_12948_pilon	+	2305	2	Intergenic	novelGene_126204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	238	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233602	236606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_233879_234577
544266	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
544267	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658083	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658043
544279	SIRV3	-	266	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTTACCCTTGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7822	7556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_7600_7800
544288	contig_14322_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_116580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCCACAGCAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
544291	contig_2892_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_119037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCATTGAGTCGATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326493	326177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_326200_326500
544312	SIRV4	+	226	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1545	632	1090	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
544314	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_16416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544316	SIRV6	+	382	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1623	99	231	-90	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTGACATCTGAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	11180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
544337	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
544339	contig_15063_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_14272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	343	1164	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34816	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
544341	contig_5988_pilon	-	1616	4	Intergenic	novelGene_15962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	4	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	93	1448	655459	651962	FALSE	30	AAGAAAGGTTTTTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655551	651793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
544342	contig_6175_pilon	+	2854	15	Intergenic	novelGene_16321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	241.830149957716	8	53	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	586	1608	1495446	1520939	TRUE	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1484529	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1484586_1488389_1488468_1489986_1490062_1491423_1491516_1493861_1494032_1495331_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518667_1518761_1520852_1521739_1522605
544364	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544366	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
544369	contig_3948_pilon	+	2207	4	Intergenic	novelGene_53383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.8954011539622	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	367	735	1813956	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSLNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813330	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814026_1814358_1814520_1860434
544394	contig_6048_pilon	-	3206	10	Intergenic	novelGene_73215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	36.8842031829948	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	330	2060	1645874	1609163	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661953	1608016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624239_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
544395	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
544401	contig_4891_pilon	+	1320	7	Intergenic	novelGene_124540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_4	477.85585925279	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	150	965	701017	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700867	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
544413	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544443	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544450	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
544453	contig_500_pilon	+	1681	11	Intergenic	novelGene_30947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	83	junction_1	546.762334108706	264	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	269	1381	1452302	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446805	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1447805_1447909_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
544461	SIRV4	+	307	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	632	1009	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
544465	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
544467	contig_15687_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_129141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACACAACCTTAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183368	184126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_183400_184100
544481	contig_5881_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_129055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGGATTTGTTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517445	517939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_517400_517900
544518	contig_3975_pilon	+	2703	11	Intergenic	novelGene_54766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	90.1330128199429	14	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	85	1284	1965812	1984755	TRUE	20	GAAGCTGGAAGGTGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961597	1986270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722_1985939_1986034
544519	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	130	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
544523	SIRV4	+	340	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	437	173	-437	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCCAATTGCTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
544529	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
544532	contig_6102_pilon	+	1643	2	Intergenic	novelGene_32232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	191	586	924848	925243	FALSE	85	GAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVLQTEQEDTVWFKVRKSVCQGCIFHHTYSICMLETGLYEEELGIRIGGRLINNLRYADDTILLVESEENLKHLLMKIKDHSLQYGIQLNIKKTKTLTTGPISHNMINGGKI	906219	926300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_906291_924728
544535	contig_15304_pilon	-	1228	2	Intergenic	novelGene_30454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	119	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	189	719	54100	53391	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
544555	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
544645	contig_7357_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_36822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATTCTCTTTCTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137281	135559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_135600_137300
544648	contig_10496_pilon	-	1889	4	Intergenic	novelGene_59417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	33.436506994601	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	180	1130	50648	38747	FALSE	30	AAAGTTGCATGCTATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	50827	37987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488
544653	contig_14727_pilon	-	2671	18	Intergenic	novelGene_56669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	118.168608645461	245	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	535	1242	380246	371686	TRUE	5	TCACTGTGTTTTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGLVKGHAYSVTGLEETLFKDEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDNDEKARLQYQVTENGEFWMSYDDFIYHFTKLEICNLTADALESDKLQTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSQVVCSFLVALMQKNRRKERKLGANLFTIGFAIYEVPTDAWEQEAPAEGLLPVQCLQGQEQNLHQHAGSVPALPPASQRVRHRALHL	414837	362350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365112_365488_365567_370712_370750_371625_371843_372979_373152_376104_376266_377287_377366_378996_379083_380192_380277_388014_388139_390301_390372_414527
544662	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
544664	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
544665	contig_7202_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_17692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTCCGCAGGTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
544701	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_16658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544702	contig_6059_pilon	-	2095	14	Intergenic	novelGene_44867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4908.30687615725	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	176	1771	584374	570712	TRUE	85	ATATAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQAFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQPNTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQVRNL	584549	568141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569786_569957_570660_570727_571300_571456_571545_571651_572881_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
544718	SIRV6	+	352	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10472	2	1235	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11472	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
544720	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
544731	contig_14441_pilon	+	1750	8	Intergenic	novelGene_100356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	332.240446492769	17	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	515	1486	26678	117335	TRUE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTGAMLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	23048	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_25816_25950_26652_26781_26886_27189_113646_113711_116578_116963_117216_117344_117539
544749	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
544757	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
544758	contig_500_pilon	+	1431	10	Intergenic	novelGene_30957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	523.83488586989	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	600	1130	1466152	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446835	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461479_1464077_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
544762	contig_5018_pilon	+	2431	13	Intergenic	novelGene_46947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	485	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	716	1027	301817	302817	TRUE	5	GTCCCCCGCCCGAGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSTRGWAWSPSSMWGWTELLLAGSGTFSQTQWGSTLCQRWTPHLPEVARTRPIRGTPHRSRTPGRTFHFSVLSGRCSWMLGPGGPCPAMVDAVIHSSQVPQ	301101	316175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_301854_301968_302061_302233_302328_302728_302851_305679_305848_305918_306014_308067_308256_308355_308540_309844_309923_310012_310173_312507_312672_315420_315594_316014
544769	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_18706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCCTCCTACGTCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30091	29823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
544777	contig_11104_pilon	-	1832	14	Intergenic	novelGene_112460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_9	64.2670095827561	704	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	166	1455	359149	327498	FALSE	10	TACTTCTGTATTGTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELIPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP	359314	327120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_327579_329045_329133_331188_331285_334327_334409_334565_334681_335041_335104_336498_336589_336686_336794_337105_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
544780	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_93648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
544812	contig_20951_pilon	-	144	1	Intergenic	novelGene_43098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTGAACCCTAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28868	28724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
544816	contig_5684_pilon	-	601	2	Intergenic	novelGene_81020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6312	junction_1	0	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361476	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361315
544818	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
544830	contig_20614_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_107592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAACCAGTGTGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293202	292140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292100_293200
544836	contig_6871_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_21680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1667	2050	1062116	1062499	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQSRCAWGHHESGADLTAANNNRRANRGAAALSQWHGRKKNPCSSSSSLNPEIFTILSPRHSQPKSFVILKQTKTSLLLRSHALNFSSNVTFPKSLRVGCSHNNEYFFFHPVDHPLIVSISFPTSL	1060449	1062655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_1060400_1062700
544839	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
544845	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544846	contig_10000_pilon	-	2503	14	Intergenic	novelGene_139298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	364.524883283082	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	103	1302	310672	163749	TRUE	20	GCAAATGTGGCCTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDDSSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQEMEEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPDLRRLHCLAVSV	310774	158918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_273298_273441_280591_280703_281388_281456_283019_283184_284782_284931_285837_285939_286746_286805_287001_287133_291412_291467_306629_306801_310657
544869	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
544874	SIRV2	-	357	4	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1535	2339	360	304	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTCTTGCTCAGCGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4372	3339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3375_3665_3826_3966_4095_4338
544891	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
544892	contig_10106_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_73847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	855	1211	19402	19046	NA	20	GTACATTTCAGTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATGICSSFSYLHPTPVHSLHYSQITLHCSQSMTYQDFPLIKTLEKLSTDRTETWRLSPSFKNHPESRLSEHCSKIVPTPLPFSLFCQAELHGLCCSDLAQANDPCTVFSTISIVSK	20256	19044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_19000_20300
544895	contig_14322_pilon	-	1310	5	Intergenic	novelGene_115688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_3	3142.30451858186	709	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	524	853	672553	671886	TRUE	20	TTTATTGCTGGTGTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWPGGPPRHPWSSGCFTGFPRRSLCSGGGAGFSPACWVLCYLLQDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674887	671272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672714_672787_672934_674670
544899	contig_8658_pilon	-	1322	7	Intergenic	novelGene_55813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	1203.3555053359	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	356	973	30206	6049	FALSE	25	AAGCAGTGTGATGTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55653	5699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_32581_32688_34540_34626_55528
544910	contig_7744_pilon	+	1618	15	Intergenic	novelGene_62540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	194.909083986376	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	932	1597	887347	891205	FALSE	10	AAGCGTCGTGTGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLLLLFLPSALCLLVLHRRGPGPSQQPPSSWGLVAELLAPAQPVWKGGPRPLGELNSTIPLGQTGGREGWCCSGGPRGPLDSPQLLL	879798	891226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889753_890940
544928	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
544933	contig_12425_pilon	-	1882	8	Intergenic	novelGene_46669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	833.297555694561	2563	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	9	410	211174	207357	TRUE	10	TTTGCTTTCTGGTAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMEC	211182	203272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207362_208655_208765_209381_209497_210341_210389_211048
544934	contig_12425_pilon	-	1780	8	Intergenic	novelGene_46684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	539.356608395974	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	45	836	209477	204225	FALSE	20	ACTTGAAATTTGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	210327	203280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302
544935	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
544949	contig_14513_pilon	-	1257	4	Intergenic	novelGene_70382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	157	573	18880	11982	FALSE	45	AAAAACATTAGAACTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19036	11297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
544955	contig_4924_pilon	+	2969	1	Intergenic	novelGene_84715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98166	101135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_98200_101100
544957	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4130	21	2951	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCTAAGGAGACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781	1056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
544969	contig_15063_pilon	+	825	4	Intergenic	novelGene_9691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	239	823	34808	35964	FALSE	20	GGCCCGCCAGAATGGCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHIS	27130	35966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
544976	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
544983	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_18427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545004	SIRV4	+	260	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1511	632	1056	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2511	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545005	contig_15087_pilon	-	2027	20	Intergenic	novelGene_37175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1063.23052383498	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	69	968	150508	138311	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDE	150576	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_138291_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480
545010	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545013	contig_14711_pilon	+	2053	12	Intergenic	novelGene_68886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	308.357016438376	18	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1091	1810	88246	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGTCNAGCAAVLPGVGAGSVSALRLSCPPRIWSLGAGLPMGQAPYAAGRDGASVDAVAAVDKALGVYASVMMPAVSDTRAFSVEVLAAANVECVTVMPTARAEPVSAAGPWTAVSVLMEASAVGMDTANAIAASAWMATMVLYVISAQAARHPARDTEEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70414	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_84866_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_90032_90194_90489
545016	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	632	1085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545035	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
545044	SIRV6	+	846	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	16	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	41	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	105	318	370	687	2021	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCSELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1153	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3103_3165_10724_10819_11031
545057	SIRV4	+	256	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1515	632	1060	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2515	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545081	SIRV4	+	205	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1566	632	1111	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
545114	SIRV4	+	287	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	200	463	200	-463	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGGAAGAGTACCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
545125	contig_4659_pilon	+	2520	11	Intergenic	novelGene_118194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	87.4588474655366	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	679	1338	199577	208048	FALSE	5	TTCTGAGTCTTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	186942	209230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187040_188123_188199_191710_191849_195021_195231_195277_195314_198152_198259_199559_199738_201105_201210_204160_204302_205905_206069_207957
545127	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545135	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
545145	contig_13481_pilon	-	2032	8	Intergenic	novelGene_119389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_7	434.339188437153	823	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	252	866	556920	527468	TRUE	40	AAAAATCATCCAGAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLKSEGEHSTGTSTGSGGSLEEEVRTLFVSGLPVDIKPRELYLLFRPFKGYEGSLIKLTSRQPVGFVIFDSRAGAEAAKNALNGIRFDPENPQTLRLEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	557171	526084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767_536919_537232_537296_538013_538053_538608_538687_556845
545146	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
545150	contig_12414_pilon	+	1453	2	Intergenic	novelGene_59601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	450	917	373587	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373039	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373345_373442
545161	contig_3975_pilon	-	1971	11	Intergenic	novelGene_54881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	178.681952082464	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1251	1904	2096423	2091957	FALSE	25	ATACATGGTTTCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099590	2091889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097367_2097473_2097540_2097850_2097939_2099342_2099458_2099552
545164	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545171	contig_7202_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_18665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCATGGTGAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
545179	contig_3077_pilon	+	1677	9	Intergenic	novelGene_26674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3746.37269360311	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	500	1183	13867	17590	FALSE	15	AGTGTGCGGCACTTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGSAGRGHLLCCRRNVAEGGSDRSLGWPRCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9628	18084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9721_11276_11479_12013_12071_13019_13165_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
545193	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545203	contig_4180_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_8326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGCATGATCATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799098	796530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_796500_799100
545228	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545250	contig_20314_pilon	+	868	7	Intergenic	novelGene_125625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	10	CCAGCCCCAGTGCCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
545252	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545253	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545256	SIRV4	+	317	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1454	632	999	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2454	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545260	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545266	contig_6929_pilon	+	1199	7	Intergenic	novelGene_139391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_5	4216.04002260679	407	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	421	801	127176	130939	TRUE	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	102608	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
545302	contig_10444_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_139454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690779	692533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_690800_692500
545315	contig_11427_pilon	-	2325	17	Intergenic	novelGene_78979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_12	54.9896297041542	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	40	2166	138608	106977	FALSE	20	TTTTCTTTTCTTATAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVFATLLSLGALGLCLATPENTVRWCTISGDEATKCSEFQKNMARVGAAPLTCVNRTSYRECVKAIVKNQADAVSLDSGLVFKAGQAPYKLKPVVAEVYGSKEQPQTHYYAVAVVKKDTNFQLNELRGKKSCHTGFRRSAGWYIPIGTLRPFLEWTGPPASLESAVSSFFSGSCVPCVDARQFPKLCSLCAGQGANKCACSSQEPYFGYSGAFRCLQDGAGDVAFVKDSTVFENLPNKNDRDQYQLLCPNNTRKPVDAFKSCHLGRVPSHAVVARSVNGKEDLIWELLRQAQARFGKTKAPEFQLFASPPGKKDLLFKDSALGFLRIPSKIDSALYLGFKYLSALQNLKKKKSSLDARRKQIVWCAVGREEQSKCNQWRRWSRRQVSCALASTSEDCIALIMKGEADAMSLDGGLVYTAGKCGLVPVLAENARSQESNGSDCVTRPSKGYLAVAVVRKSDADLTWNSLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLFNQTGSCRFGEFFRQSCAPGADPGSNLCALCIGDDSGQNKCVPNSKERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLDNTDGKNTQEWAKNLKPEDFELLCLDGSRKSVSEAWKCHLAVAPSHAVVSREEKAEYLENVLLQQQEQFGQNGSKCPKQFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYEKYLGAAYVTAVANLKKCSSSGLLEACAFLNS	138647	106817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_107012_108713_108904_110424_110610_111779_111848_115228_115371_116173_116330_117356_117405_118609_118701_120840_120996_121855_122031_123102_123282_127146_127203_128162_128311_128662_128846_129192_129302_131655_131820_138565
545334	SIRV7	-	336	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33223	10	4	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
545338	contig_11986_pilon	-	2518	15	Intergenic	novelGene_69203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1212.51969056177	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1040	1993	744270	734510	FALSE	25	GAAAAAGGTGTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	794701	733984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744293_751609_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
545342	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545346	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545358	SIRV5	+	381	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7587	2	-194	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCACCCCCGCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
545361	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
545383	SIRV4	+	288	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	673	987	-41	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTGCACATGCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
545415	contig_14322_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_115696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671431	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
545418	SIRV4	+	225	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	643	1080	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545431	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545439	contig_15063_pilon	-	1252	4	Intergenic	novelGene_14284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	783	1097	35891	35108	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGATEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34907_35031_35369_35837_36156_36264
545440	scaffold_8345_pilon	+	1994	9	Intergenic	novelGene_107031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	238.22753697883	47	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	85	1041	785045	795711	TRUE	25	TAACTGCTCTAGAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRREEENTEARCQGPGRARIPEGEEGKMKTLIPLLLLGLLLTGEKGQVLGEETISANELQEMSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCYQSPRR	779485	798051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_795685_796229_797376_797559_797797
545444	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
545451	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545459	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
545478	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
545481	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545485	contig_15063_pilon	+	1074	6	Intergenic	novelGene_12458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2316.07162238131	11	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	396	821	36299	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28156	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34889_36119_36158_36266_36600_38975_39092_39506
545489	contig_5302_pilon	+	1845	9	Intergenic	novelGene_81462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.910488601448	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	145	996	318287	337399	FALSE	5	CTCATCCTTCTTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	218470	338248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_218612_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
545512	contig_2646_pilon	-	1969	11	Intergenic	novelGene_69663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	343.760905281563	1342	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	2178950	2174850	TRUE	30	AATTGTTGGCTAAACGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2179514	2171580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2179370
545517	SIRV7	-	286	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91625	15	-91619	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACTAGTAGAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
545523	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545525	SIRV7	-	394	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33169	6	-50	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114788	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
545537	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
545543	contig_3077_pilon	+	1487	8	Intergenic	novelGene_26623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4081.53027524666	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	131	991	9719	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9588	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16196_17449
545546	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545553	contig_7202_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_18302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27941	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545556	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
545563	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
545596	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545606	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
545617	contig_8317_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_20155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAGTTTAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
545621	contig_12079_pilon	-	2111	7	Intergenic	novelGene_67556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	353.699220933393	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	167	655	871668	864689	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKGGR	872424	863232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_864701_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
545626	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545627	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
545628	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
545640	SIRV5	-	348	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
545649	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
545650	SIRV6	+	871	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	1	-441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
545662	contig_6735_pilon	-	1318	13	Intergenic	novelGene_15703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1236	83	1318	564868	541984	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHSRDISESSLCPVLKLKIKWDYGSPL	568280	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542057_543136_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
545667	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10486	1	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11486	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
545668	contig_7202_pilon	-	172	1	Intergenic	novelGene_19083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGCCATGACGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30091	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
545680	SIRV4	+	321	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	456	173	-456	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTACCTCTTCAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
545687	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
545694	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545698	contig_9014_pilon	-	2653	9	Intergenic	novelGene_106705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	82.110348769202	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	738	2090	44733	41867	FALSE	10	TCATTTCTTCTTCCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPFQGCLIFPRVLLLPLLYFCVAPSLKHSIPTKLIWERAKKPFWTHRDKSPSSYPQSLPQVALAQSSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51553	41303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_45016_46504_46693_51286
545738	contig_6710_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_90332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTGCCCAACTGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
545760	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545767	contig_9345_pilon	-	2559	5	Intergenic	novelGene_24420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_4	31.8541598539343	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	140	547	201743	196247	FALSE	35	ATTCCTTGCAATAAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	201882	194234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653
545775	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAGATCAACCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
545777	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
545782	SIRV4	+	336	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	632	980	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
545795	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_95873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545816	contig_10940_pilon	-	1717	2	Intergenic	novelGene_49223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	699	1079	875054	874674	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	893237	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875669_893153
545822	contig_15456_pilon	+	2365	5	Intergenic	novelGene_139506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	751	junction_1	348.198488652665	3070	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	63	368	131507	142382	FALSE	50	ATAAAAGAATCTCAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCEKCEKKLGTVITPDTWKDGARNTTESGGRKLNENKALTSKKARFDPYGKNKFSTCRICKSSVHQPGSHYCQGCAYKKGICAMCGKKVLDTKNYKQTSV	131444	144379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_137564_137620_141935_142040_142317
545832	contig_5258_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_100249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTACCAGAACCTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334811	334579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_334600_334800
545835	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
545843	contig_5084_pilon	-	1920	8	Intergenic	novelGene_64555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	278.046758657604	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	49	618	580023	533494	TRUE	30	CAAAATCACGTGTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVASAAAAPRGTPDSGMGSRASTLLRDEELEEIKKETGFSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVFWKKWTWNRK	580071	531591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_532872_533471_533528_533672_533798_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579956
545844	contig_9609_pilon	-	2078	8	Intergenic	novelGene_23136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_3	82.1529186384533	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1208	1957	522751	520853	FALSE	25	TTAACCTACCTCTATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523958	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696
545859	contig_11429_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_60472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATAATAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50793	52951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_50800_53000
545869	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
545877	contig_5643_pilon	+	1100	11	Intergenic	novelGene_38833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3053.87199469788	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	359	913	236700	237822	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236304_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237823_238008
545887	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545936	SIRV4	+	290	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1481	632	1026	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
545947	contig_18096_pilon	+	2408	9	Intergenic	novelGene_58051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	751.850176231941	2071	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	219	1205	62926	77920	FALSE	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGFWLKVYCYHDHNHPEVDILETKISSLFTDIEFTPKRMF	59565	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_76591_77801
545951	contig_10861_pilon	-	1824	8	Intergenic	novelGene_39332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	203.924255646101	845	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	407	1000	1491018	1490156	FALSE	10	AGTTTGGGCTTGGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSPDAPEDEAGIKKAAENSKALASHQRPPCPSPRKVGQCLPGSLPWAPQQLFTHPVMPLPPPVKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493792	1489331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
545954	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
545974	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
545985	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	648	973	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
545992	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
546008	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
546013	contig_5018_pilon	-	1366	9	Intergenic	novelGene_47052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	705.070519522693	68	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	70	1227	1402792	1399224	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGGVKPRPEIPSALLPGAQGGRRRGVASRSPSTEKEWGC	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399340_1399940_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
546015	contig_7202_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_18000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCAGGTAATGAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
546047	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546078	contig_15304_pilon	-	1430	4	Intergenic	novelGene_30599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	525	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
546081	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
546106	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
546107	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
546111	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546113	contig_1516_pilon	+	1754	10	Intergenic	novelGene_50002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1230.70910002685	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	267	1730	347241	363697	FALSE	25	ACAGCTGAAGCACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFNGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	336297	363721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360083_363498
546116	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
546120	contig_8978_pilon	-	2380	11	Intergenic	novelGene_49389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCGCGCGACCGCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348138	331586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339964_340939_341130_342364_342670_343350_343443_343636_343848_344189_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
546121	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
546123	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
546135	contig_15596_pilon	-	2380	15	Intergenic	novelGene_139541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_12	97.2788176703795	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1777	2367	188296	182796	FALSE	5	TTGTGTGTGTGTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQKDPVKAKTKRRLVLGLREVLKHLKLRKLKCVIISPNCEKIQSKGGLDDTLHTIIDYACEQNIPFVFALNRKALGRSLNKAVPVSVVGIFSYDGAQDQFHKMVELTMAARQEYKTMLESVRRELAEEPGARSPPSPPPQGPSCSAEDAHPASTEKEEPHYIEIWRKHLEAYNRCAQELEETLGASTSQMMNLKL	217206	182782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_182900_183272_183466_183854_184010_188157_188379_190879_191004_191819_191987_194743_194877_196626_196717_198011_198135_199636_199846_201847_201930_204476_204710_206575_206826_215682_215829_217069
546141	contig_7202_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_16644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTCCGCAGGTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
546143	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546148	contig_13633_pilon	+	1720	14	Intergenic	novelGene_15297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.613818111224	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	460	1416	28347	49142	FALSE	30	GATTCTGTGTGATAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5006	49446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22063_22119_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
546166	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1110	0	-1110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCCACCGTAACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
546215	contig_7527_pilon	+	3555	2	Intergenic	novelGene_139570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	902	junction_1	0	314	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1618	2013	89903	94676	FALSE	50	AAAAAAGACTCATTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKVILRVLFPLLSNSHTSFGKALAVCFWGI	88285	96218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_90038_94415
546222	contig_9955_pilon	-	1481	6	Intergenic	novelGene_21295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_2	719.622400985406	80	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49838	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_46954_46999_47590_47737_48794_49380_49692
546242	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
546262	contig_14322_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_116182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	82	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
546268	contig_6842_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_130721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACACCTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432480	433121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_432500_433100
546270	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
546271	contig_15063_pilon	+	1375	5	Intergenic	novelGene_14364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	236	1120	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35035	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
546274	contig_9848_pilon	-	1580	13	Intergenic	novelGene_79957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	471.256447052864	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113915	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110516_110570_113840
546282	contig_15859_pilon	-	208	2	Intergenic	novelGene_50204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAAGCTCCTGGAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352707	350238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_350376_352636
546287	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_12008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	221	1393	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27148	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
546289	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546295	contig_9345_pilon	-	2254	6	Intergenic	novelGene_24720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	24.9559612117025	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	505	1053	1013764	1012336	FALSE	5	TGACTCTGCTGGCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAYRGPGAWASTPGGKRKGKAGLGCGYMGTLEGLLFFLPKGLGRQHLGSLLIGRLSGSKLGSCCVLVCVYQMLCDMARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEGLPDPGRVSSEVQQMWALTEMIRASQTSTRIGRFDVDGCYDLNLLSYT	1015316	1011134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012975_1013434_1013977_1014872_1015007_1015158
546309	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
546316	contig_13863_pilon	+	1926	11	Intergenic	novelGene_42018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	828.552979597563	3	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	62	1015	98341	116127	TRUE	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPRIMTTGSQCLKKTTEGHLPSKPLMPLARQTSVWRHYSRFCQ	98279	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114109_114277_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
546317	contig_12671_pilon	+	2037	7	Intergenic	novelGene_19226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	423.77329500047	201	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	43	744	197316	211199	FALSE	10	TTTGGGATATTGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDVSMLFNTFDIYIKTNKPVLEEVQPECSP	197273	212492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200256_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053
546321	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546322	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
546327	contig_18822_pilon	-	2136	16	Intergenic	novelGene_111726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	169	498	246246	229607	TRUE	20	CAGCTGACTGAGGACCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGHGCADHRLVHKLHGAQRRVHAAAGCTLQFQHCDGIWGRGHEDVLRHKQGHLGAPCGPIAAKVKTINPHLALGPARKLDKGVLGQVWDPSRNGEVPHIKGWQCEVR	246414	140638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_140769_165852_166027_168086_168209_169637_169676_170796_170892_175765_175949_181157_181219_182823_182947_183091_183132_191144_191257_209333_209409_212479_212569_221546_221662_223823_223956_229457_229713_246022
546333	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546340	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546342	SIRV4	+	213	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1558	632	1103	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
546359	contig_15354_pilon	-	2158	3	Intergenic	novelGene_65717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	322	1464	224900	223758	FALSE	65	GGAAAAAAAGTCAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227765	223063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224922_227372_227506_227598
546383	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
546388	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_115878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
546391	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1475	632	1020	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
546397	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_16467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27821	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
546400	contig_4769_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_117978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	25	1407	437809	439191	NA	20	TTATCAGTGTGGATTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANEEVLALRAEVTQREEELSSLKQRLAAALLAEEESEPERLVPVSPLPPKAALSRDEILRYSRQLVLPELGVHGQLRLATASVLVVGCGGLGCPLAQYLAAAGVGRIGLVDYDVIEMSNLARQVLHDEALAGRAKALSAAASLRRLNSAVECVPYAQALTPATALDLVRRYDVVADCSDNVPTRYLVNDACVLAGRPLVSASALRFEGQITVYHYDGGPCYRCVFPQPPPAETVTNCADGGVLGVVTGVLGCLQALEVLKIAAGLGPSYSGSLLLFDALRGHFRCIQLRKRRPDCAVCGERPTVTDLQDYEAFCGSSATDKCRSLHLLSPKERVSVTDYKRLLDSGASHLLLDVRPQVEVDICRLPHALHIPLKHLEQRDAESLKLLGEAVRERKQGTQEGAALPVYVICKLGNDSQKAVKILQSLTAAQELDSVTVQDVMGGLMAWAAKIDETFPLY	437784	440110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_437800_440100
546405	SIRV4	+	265	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	668	1015	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
546413	contig_10058_pilon	+	1787	11	Intergenic	novelGene_67695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	134.212369027597	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	172	735	50283	52191	TRUE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRLTGGDGGACRAPGSRPCLFGAVGARELSTHRAVRQDIRRPQRRTSSSDVPPHREMKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSP	48583	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48669_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52192_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
546415	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
546442	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_19067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
546446	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	38	3249	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
546456	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_93643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
546460	contig_9415_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_109795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCGAAAGAAAGAGGCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697575	1697943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1697600_1697900
546464	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546468	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
546482	SIRV4	+	353	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	182	415	182	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTCCACTCTTAGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637	2356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
546486	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
546495	SIRV4	+	164	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1607	632	1152	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2607	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
546504	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
546515	contig_12644_pilon	+	1404	10	Intergenic	novelGene_44647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	11	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	49	1320	2675526	2680545	FALSE	25	GAAATATGTGTTGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
546517	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
546519	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
546523	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_95081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
546524	contig_2069_pilon	-	725	3	Intergenic	novelGene_23511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	64	345	1509802	1508747	FALSE	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509865	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
546537	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1117	2	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
546544	contig_10629_pilon	-	2161	11	Intergenic	novelGene_52899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	450.425754148228	3	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	62	595	256132	252415	TRUE	15	TCTATTTGTTCTTTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWRQNGGSGRHLRKRKRRRRKMMTLKRRGRLSGSVRKRNSVRLLPTWER	256193	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253777_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066
546557	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_10888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2322.79361706976	85	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	233	1411	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
546558	contig_9753_pilon	-	1784	7	Intergenic	novelGene_41318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	372.2323050044	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGATAAATCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93357	69106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_70667_70838_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93282
546563	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
546582	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
546616	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1461	632	1006	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2461	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
546623	contig_16461_pilon	-	326	2	Intergenic	novelGene_139209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	21	326	919	395	FALSE	20	GTTGCAGTTTATTATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAED	939	394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
546631	contig_7356_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_60350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	530	844	90210	90524	NA	90	AAAAAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQLRPGPSVVIPVRAVSGGSRTPSSCTGLSLVEAVVVVVHYSFGLIFPLYLVFFILPKERNFSSVYKHPWSTFFLVLNSFWVSKLQIGLLHFHKIIFCCCCS	89680	91998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_89700_92000
546632	contig_9633_pilon	+	1428	5	Intergenic	novelGene_139584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.5291908605377	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	71	544	7299	131868	TRUE	15	GATCTGTGTGTTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCFDAKINFDDNAEFRQKDIFAMDDKSENEPIENEAAKYDLKYIGLDGNIACFVNGAGLAMATCDIISLNGGKPANFLDLGGGVKEAQVYQAFKLLTADPKVEAILVNIFGGIVNCAIIANGIIKACRELELKVPLVVRLEGTNVHEAQNLLNNSGLPITSAIDLEDAARKAVASVAKK	7228	132867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_7393_9721_9865_107131_107253_131752_132088_132202
546641	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_96874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
546648	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
546659	contig_6233_pilon	-	1626	11	Intergenic	novelGene_74787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	277.590705896289	809	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	496	1335	149777	143464	TRUE	30	GCCACAAAGCTTTGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250348	136683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
546699	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
546724	SIRV4	+	299	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	205	446	205	-446	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAATTGCCATTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	2325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
546730	SIRV4	+	228	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1543	632	1088	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
546738	contig_4364_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTACAGGGTATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533247	1532795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533200
546746	contig_4364_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_2781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
546747	contig_12277_pilon	-	3582	1	Intergenic	novelGene_139685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTAAACAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226169	222587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_222600_226200
546752	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	636	966	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
546767	contig_4678_pilon	-	2297	14	Intergenic	novelGene_126059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	62.7291538725187	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	611	1405	575142	572868	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKGQGGACIGTDPAATAAPS	578131	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
546771	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
546772	contig_3861_pilon	+	2140	12	Intergenic	novelGene_57889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	817.138506523206	1212	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	120	1952	141869	176828	FALSE	20	TAGTTTGATTTTTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEDDYTHSACRNTYQGFNGMDRDYGPGSYGGMDRDYGHGSYGGQRSMDSYLNQSYGMDNHGGGGGGNRFGPYESYDSRSSLGGRDLYRSGYGYNEPEQSRFGGSYGGRYESSYRNSLDSFGGRNQGGSSWEAPYSRSKLRPGFMEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQLIEGDEEEEEKIDEAIEEEDDEDEEEEEEVEEVEEVEEVEEVEGVEGGRDIEGVGEVEGAGEVGGAREDGGAEELGGTGEVGEGEEVEEAAGEVGGAGEVGEVEAVREEAEEEAKEEPVNFSVDQPEEN	141749	177016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_147877_150018_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171890_176396
546773	contig_17936_pilon	+	1715	10	Intergenic	novelGene_29929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	833.088690015714	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	105	1214	79133	121021	TRUE	30	GCCTCAGAAGAAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50600	126226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
546775	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	4	1253	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
546791	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
546822	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546860	contig_15063_pilon	+	857	2	Intergenic	novelGene_14442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
546869	contig_15304_pilon	-	1009	4	Intergenic	novelGene_30479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1490.4765084436	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	198	830	54100	53061	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCWDPICHHFQKLREQLPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53529_53584_53813_53991
546872	contig_18613_pilon	+	1261	6	Intergenic	novelGene_80217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_1	1665.47970266827	866	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	219	839	23921	31105	FALSE	10	TTCTCATGTTTGATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAILRPRVCAPNLSWSARDPLSTNPSPPRCPISAPTRYKKALNAGVGGGRERGREVPERSQTGRDRAEERKAMRRTGAPTQSDSRGRGRARGGCPGVEATPSLPPPRGGTRGQEPQMKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23702	31527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_24053_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
546875	contig_5981_pilon	+	1810	9	Intergenic	novelGene_35500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_6	259.197198094424	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	209	1198	25511	37804	FALSE	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23548	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
546929	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
546933	SIRV4	+	328	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	449	173	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
546942	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546952	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546957	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
546963	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3208	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
546970	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
546988	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
546992	contig_8106_pilon	-	1955	4	Intergenic	novelGene_139743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	125.867655363348	642	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	112	708	134968	128810	FALSE	30	AGGTAAAATGTTTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCSQVKPPPQGTFQVLRGNGTSVGTVLLFHCPSGHQMGGSGLVTCAWKGSVAEWSSGTPTCKSVPPHETFGFRVAVIASIVSCAIILLMSVAFLTCCLMKCVKRTEKRHSDRTAQLWYQLRGKDLETLQAASLGLKGLNNNNNSHPSCQPRLGEAALQAHDNHCFTSDHGKGTTELASMGPSVNKHPWTPLPDALSPSVSRVMVHIESPAQTLPASGPTPEMPGMPGQVSANLG	135079	127562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_129015_131522_131688_132743_132892_134889
547028	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGGTACCCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547041	contig_16322_pilon	-	1366	7	Intergenic	novelGene_87499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	479.834693757479	24	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	247	660	37060	32956	TRUE	10	TTGTGCAGTGTGTACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57674	31681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32186_32242_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
547044	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
547071	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
547076	contig_11396_pilon	+	2352	8	Intergenic	novelGene_71280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	528	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAACGCGACGGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230865	249191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_232395_232978_233030_238733_238834_242979_243040_243744_243890_245692_245843_247756_247915_249032
547079	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
547096	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
547101	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	66	3365	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
547109	contig_5023_pilon	+	2507	13	Intergenic	novelGene_7131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	226.96847248021	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	992	1762	359358	402057	TRUE	25	AAAATCTGTTGCTCAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPRNAGAAFSYQEVVADLQVCQKHIKGV	323609	405981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
547166	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_16693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTTGGTCACGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
547170	contig_9594_pilon	+	1730	12	Intergenic	novelGene_73938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	446.317327721873	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	129	1382	301335	322451	TRUE	25	TCGATTTAAACTGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301206	322870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410_322617_322687
547171	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
547172	contig_19941_pilon	-	3177	22	Intergenic	novelGene_139749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	59.7371794801604	217	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	950	2853	14	2866	40346	8281	FALSE	20	AGACTTCAGCTTTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTGKHKLLSTGPTEPWSIREKLCLASSVMRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQEKYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAMKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTSATLDEATSGVTPGTLPSTPVISFPGIPDTLPPGSAPLEAPMTPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPPSPRLVSENEMAVTPGHLNSTGVLLEVGGVLPVIHGGEMQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVQPPVESVSQATIVMMPALPAPSSAPAVSTPESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSNEISMIINSIKEECFRSGVAEAPGGSKAPSIDGKEDLDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKAVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSIEIKVEPTEPEQGISGAEIAAVVPALSMEPPELRSHSLDEDPRSTATGEIAEADVSSGKGDETQLTTVKTEASPESLLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQDSSEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK	40359	7969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_8341_9972_10018_10605_10711_11965_12144_12519_12589_12784_12878_13071_13287_14070_14118_14325_14420_14709_15160_15533_15815_16208_16419_17307_17453_17844_18064_18602_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_40327
547175	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_97353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
547180	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
547189	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
547199	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
547200	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
547205	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1115	0	-1115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGACGAGCCACCGTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
547209	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_17605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27824	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
547215	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_17597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27821	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
547219	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
547220	contig_14925_pilon	-	898	4	Intergenic	novelGene_55068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	103	360	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29777	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
547237	contig_5649_pilon	-	1698	7	Intergenic	novelGene_82366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	49.1720336053827	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	432	770	1057385	1056259	FALSE	10	TCCTTCATGCGTCATCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFFYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN	1061837	1055330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1059557_1059703_1061783
547243	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
547246	contig_14176_pilon	+	2667	9	Intergenic	novelGene_74842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	120.331767937648	176	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	138	848	246102	271823	TRUE	15	CTTGGAAAGTCTGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGVGVHPRHGPTLTGILTGRCVNYSSALRTCEIQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRFAKYYKMENGSEYRTLLKAFGIRFDVLVYGNAGKFNIIPTIISAVAAFTSVGVGTVLCDIILLNFLKGADQYKAKKFEEVNETMLKVAASANPVYPSDQTTEEKQSTDSGAYSIGH	245964	273768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_270173_270268_270557_270624_271207_271286_271709_272693_272818
547256	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	219	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
547261	SIRV7	-	429	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	80	-15	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114836	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56110_70893_70988_78841_78964_114680
547267	contig_7357_pilon	+	1770	15	Intergenic	novelGene_36881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	113.71814422743	9	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	388	1395	257391	273311	FALSE	50	ACATTATGAATTTATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250826	273686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257240_257396_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
547273	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547287	contig_18081_pilon	-	2326	2	Intergenic	novelGene_23809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_1	0	416	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	24	437	205697	145983	FALSE	35	GGAGAAATGTCTATCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGWGRAMSHGAGLVRTTCSSSSNAPGPWAGTGQSSASPSEGMLDPDYPCTRTALLKVAQMVALLIAFTCVRTAVWTDYSAYSFFEVVTICDLIMILAFYLVHLFRLYRVLTCINWSLSVRERPGPVHSPPGPSAEGLRRTSEY	205720	144093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_146235_205535
547291	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547297	contig_9290_pilon	-	2719	13	Intergenic	novelGene_77572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	20.6092953677596	207	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	421	1329	509725	504291	FALSE	25	ACAGGCCTCTGCAGGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516516	502900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510098_510337_511094_511204_516446
547301	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
547306	contig_18420_pilon	-	1863	12	Intergenic	novelGene_109371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_11	300.046663037602	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	62	1456	142813	109372	FALSE	25	TGCTGTTAAAATGCCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142874	108964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
547310	contig_7202_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_18623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATATTTTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
547344	contig_10324_pilon	-	3431	5	Intergenic	novelGene_7898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_4	146.305331413452	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	141	800	761911	755303	FALSE	40	TTCTAAAAATAGTGCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGEPPTGQRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFKVKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDVANQESFAAVQDWATQIKTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPTEDGRRLADDLGFEFFEASAKENVNVKQVFERLVDVICEKMNESLEPSSSQGSNGKGPALGDAPPPQSSGCSC	763773	752671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_755491_760887_761013_761092_761212_761683_761971_763692
547352	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
547360	contig_7202_pilon	-	156	1	Intergenic	novelGene_17581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27782	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
547368	contig_15304_pilon	-	657	3	Intergenic	novelGene_30581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	198	656	54100	53291	FALSE	20	TGCCACCACCGGCGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHL	54297	53289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
547371	contig_9014_pilon	-	1799	12	Intergenic	novelGene_106760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_11	70.6512795764176	30	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	124	837	85778	79637	TRUE	0	GGTTTTGTTTGTTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNGDAAETTEENSPKMRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	85901	78126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_85745
547372	contig_5278_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_139775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATTTTCCCATCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207490	205455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_-_205500_207500
547377	contig_8286_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_139803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	231.5	46	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	59	373	189967	189653	TRUE	60	AAAAGAAAAATATCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGERLQGERGAAAGSAGVMQAAQPRRPNSPPILAEGVASPLLPKRERPREDATAGEGRGVGGGGVLMKPNALVFLSTLSFSSPPQRQGILLCTWGKERSKTLSSSSESSWPSHKSESPDRHE	190025	181020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_182907_184959_185119_189628
547378	contig_9955_pilon	-	1905	5	Intergenic	novelGene_21281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	229	921	49296	46433	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46434_47546_47737_48794_49380_49692
547387	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547389	contig_6202_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_139822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448146	448423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_448100_448400
547399	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547405	contig_6589_pilon	+	1232	3	Intergenic	novelGene_25956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	19460	junction_2	1386.5	105593	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296020	1297585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1297096_1297265
547418	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
547434	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1480	632	1025	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2480	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
547444	contig_11292_pilon	-	2193	11	Intergenic	novelGene_109411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_5	250.268256077354	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	964	2121	166472	161842	FALSE	5	CCTGCCACCTGTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167655	161769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165909_166349_167194_167413
547451	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
547454	SIRV6	+	766	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1683	141	-253	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	31	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGGTATCTAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2770	11684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
547458	contig_11338_pilon	-	1570	10	Intergenic	novelGene_6217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_9	85.0926873009589	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	54	1208	17283	12948	TRUE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGALVTLSAVQGFPAAHPGGHQSVWPRDGH	21335	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
547462	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547468	contig_3588_pilon	+	2101	18	Intergenic	novelGene_72854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	621.330050087607	4	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	186	803	84577	125597	TRUE	5	TTCTTTCTTATTTGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQHRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKL	84391	141450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120041_122325_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
547480	contig_19769_pilon	+	1269	4	Intergenic	novelGene_102275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3673	junction_3	102.84076148212	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	781	1236	87859	89322	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_88040_88841_88958_89163
547483	contig_19579_pilon	-	1659	7	Intergenic	novelGene_59392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	64	903	13090	7943	FALSE	55	ATATTATTTTTAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13153	7186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
547488	contig_1639_pilon	+	2251	14	Intergenic	novelGene_74877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	245.448870294801	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	157	1308	283593	309304	FALSE	25	GTCAGATATTTTGATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSQ	279672	310247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145
547490	contig_7359_pilon	+	2640	9	Intergenic	novelGene_139873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_8	19.1180542943052	198	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	201	1697	414164	424725	FALSE	5	CTGTGTGGTTTCTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKSQPSAPKTKSPGSVSNGTAASQGQWGRAWEVDWFSLASVVFLLLFAPFIVYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQGLYLVYHPVQLSNLHAAGVLLLGLLGYYIFRMTNHQKDLFRRTNGRCLIWGQKPKVIECSYTSADGQKHHSKLLVSGFWGVARHFNYTGDLLGSLAYCLACGGGHLLPYFYIIYMTILLTHRCLRDDTAVPTSMAATGSATWPPCLTASCPAFSEGPSRGGAAEAAVESMWSRADGG	402198	425668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_403997_404119_414157_414262_415308_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_424191
547496	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547498	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547514	contig_6403_pilon	-	2103	7	Intergenic	novelGene_139884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	71.1260617964095	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	487	852	959426	956210	FALSE	0	TGTTTGGTTCCCTTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQTMAANAQKNKFLIDGFPRNQDNLQGWNKTMDGKADVSFVLFFDCNNEICIERCLERGKSSGRTDDNRESLEKRIQTYLQSTKPIIDLYEEMGKVRKIDASKSVDEVFDEVVKIFDKEG	997100	954958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_956252_957200_957298_957531_957609_959276_959430_962222_962370_995626_995727_996864
547537	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
547539	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
547579	contig_10930_pilon	+	1699	3	Intergenic	novelGene_37101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_2	7913.5	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCATCAGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339420	342167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_340055_340994
547590	contig_15384_pilon	-	2468	19	Intergenic	novelGene_85148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_17	57.0374849669761	7	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	1116	2318	124750	118939	FALSE	25	AGGACACAGAGCCTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	127951	118788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125666_125761_126225_126313_126390_126488_126583_127723_127857_127931
547600	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
547609	contig_10813_pilon	+	1977	11	Intergenic	novelGene_87021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.4595509902401	634	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	49	1392	55960	85000	FALSE	20	CTTTGACCCATTTCTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKLSWTYREVRLLSREKVYLESPVPRNYDPTLHPFEVPREYVRALNATKLERVFAKPFLASLDGHRDGVNCLAKHPKSLATVLSGACDGEVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55911	85585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_56036_62537_62738_63303_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
547621	contig_6954_pilon	-	2395	2	Intergenic	novelGene_64431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	641	988	239808	239461	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDITTDPTEIKRIMTEYYEKVYSNEFENLEEMDKFLETHLPTPKLTQTEVEQLNKPITKGEIEKVIKKLPTKKKAWLGWLHWRIVPNFQRRLNTTTTKGISEHRKGWNTPKLIL	241638	238053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_240360_241549
547622	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1111	2	-1111	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGCCACCGTAACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
547623	SIRV4	+	354	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	155	441	155	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1610	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
547630	SIRV5	-	384	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTCAGTAGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10992	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
547655	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
547660	contig_5727_pilon	-	3435	1	Intergenic	novelGene_7993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	310	645	543776	543441	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVNSQLSLPSLPASADKQWKARHERRLELKLPWAFVEWALSARPALLVSVGVREETSSEWELWAGGRCCQGCPEDSRCAVGLKGPLSLCSTPSGVTWSILRYGMNSPLII	544085	540650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_540600_544100
547662	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547667	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
547689	contig_7718_pilon	+	2095	10	Intergenic	novelGene_129403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94.1107831556663	2051	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	125	826	257538	284723	FALSE	45	GAGAACAAAACTCATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252804	285992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_252859_254873_254936_254984_254989_257533_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
547692	scaffold_8345_pilon	+	1912	8	Intergenic	novelGene_107030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_1	191.520127359172	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	85	1431	785045	797562	FALSE	20	GTGTGATCTAACTGCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRREEENTEARCQGPGRARIPEGEEGKMKTLIPLLLLGLLLTGEKGQVLGEETISANELQEMSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQ	779485	798043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_795998_796229_797376
547696	SIRV2	+	303	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	293	-73	-293	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAAACCATACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
547700	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547708	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
547732	contig_14744_pilon	+	1076	7	Intergenic	novelGene_66057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4841.85562453992	223	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	20	427	1382976	1383476	TRUE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMVRFGGCSRLDVFSLSANTLKICMY	1382037	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383559_1384434_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
547735	contig_1996_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_131863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGCTTCCATGTGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76498	74612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_74600_76500
547737	contig_776_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_139954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	98	403	1098796	1099101	NA	30	ATGTGTTTTGAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYSYVQNLTSSYHLQCYLPVQAIIILCLDIHNSLSTKKKKANQQTKKTVAVKLIPTHGSPMCVRVKLCSMVFPMADFSEVDHQGFLPRHVWIDSNLQPFS	1098698	1100844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1098700_1100800
547748	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_16420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547768	contig_13894_pilon	-	1352	3	Intergenic	novelGene_62033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.5	180	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	274	1272	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKGDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287059_287215_287538_288132
547800	contig_14976_pilon	-	627	2	Intergenic	novelGene_139963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	58	384	28307	27981	TRUE	45	GTAATTTTAGAAATACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLLLQQITVLCCFKIFPTMSALASEAASPLRSGPCRSTTLITLISSIITASISSKGGRLPVPIPRLSHTEMLLLTSCLIWRIILTNPLLRGAATRVPLRHRLLPGAQGVVDMVAGEAPKAEITAED	28364	2772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_2855_27819
547865	contig_15063_pilon	+	1461	6	Intergenic	novelGene_10938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3554.36664400284	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1227	233	1459	34808	39091	FALSE	20	AGCCCAGTCAGGGGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFK	27136	39093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975
547881	contig_5189_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_34873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTAAGTATTGATGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199662	200352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_199700_200400
547883	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547890	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_114011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	31	354	14409	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
547892	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_94711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
547901	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_17719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
547907	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
547912	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
547913	contig_1093_pilon	-	1102	3	Intergenic	novelGene_139984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGTTTTGTGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476073	471157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_471649_473955_474441_475947
547916	SIRV4	+	304	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1447	652	992	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
547923	contig_6215_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_21239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGCTGCTTGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574527	573449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_573400_574500
547933	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
547938	contig_15185_pilon	-	1738	7	Intergenic	novelGene_99453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_6	241.767105565115	2066	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	124	1230	472420	429966	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPVSALAGRTLGGHLGTTPTHPTAPTCSCFPPLSLGPGVQAALRGCRQQPRRQDSGGPILRARGEAEQVGLPESVSLWRLLRLCEAQGAGVPQHSVDC	472543	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
547954	SIRV6	+	241	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10583	2	1346	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11583	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
547964	contig_3604_pilon	+	2040	6	Intergenic	novelGene_139988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	805.296814845309	2487	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACCCATATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45336	52805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47666_47849_47925_48032_48132_51168
547965	contig_11171_pilon	+	2791	7	Intergenic	novelGene_48568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	161.997342227855	1	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	156	821	88418	105888	FALSE	15	TCCTACCTTTGAGCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSCFSALSAVQDGGHIPGRTHPEARGGGKGANLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVVSVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70534	107858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_88360_88457_90410_90591_91202_91285_93683_93804_104185_104253_105710
547969	contig_3386_pilon	-	1277	5	Intergenic	novelGene_34526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	880.673428405785	52	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	118	525	409604	404912	FALSE	25	TTGTTGTTTAACTTCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSSRSRSNERK	412211	404159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
547975	contig_7202_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_18705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCTACGTCTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
547981	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
547985	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
547989	contig_3588_pilon	+	2192	18	Intergenic	novelGene_72866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	618.865291590139	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	241	888	90170	125597	TRUE	5	CTTATTTGGTGGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGFWILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKL	84460	141456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
547995	contig_7428_pilon	-	1963	11	Intergenic	novelGene_77739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	160.232986616364	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	9	1322	443836	438797	FALSE	40	TTTTATTAAAGCCCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRACLLGLLALTVAGKCSYSPEPDQRRTLPPGWVSLGRLDPEEELSLTFALRQQNLEKLSELVQAVSDPGSPRYGKYLTLKDVAELVQPSPLTLHTVQKWLLAAGARNCHSVTTQDFLTCWLSVRQAELLLAGAEFHRYVGGPAETHVVRSPHPYQLPQALAPHVDFGRHEAQEPFLQWLLLLSNESALPHVHTVSYGDDEDSLSSAYIHRVNTELMKAAARGLTLLFASGDSGAGCWSVSGRHQFRPSFPASSPYVTTVGGTSFQNPFRITNEIVDYISGGGFSNVFPRPSYQEEAVSQFLKSSPHLPPSSYFNASGRAYPDVAALSDGYWVVSNSVPIPWVSGTSASTPVFGGLLSLINEHRILNGHPPLGFLNPRLYQQHGAGLFDVTHGCHESCLNEEVQGQGFCSGPGWDPVTGWGTPNFPALLKTLLNT	443844	438155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440337_440577_440767_441615_441744_441950_442102_443218_443359_443641_443714_443819
547998	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548011	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	3	344	14425	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14427	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
548013	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
548023	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548027	contig_13216_pilon	+	2055	7	Intergenic	novelGene_47461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	97	1524	229682	261012	FALSE	25	TAAAACTTAGTTTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229585	261543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
548037	contig_8866_pilon	-	2102	14	Intergenic	novelGene_77871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	93.5741961093698	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	503	955	931899	926869	TRUE	15	TAATGTTTTTTGTATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDYVPAQPPLSQNPDPSPTRSSEPSGPESPEAKALFDKVASQGEVVRKLKAEKASKDEVDGAVQGLLQLKAEYKSLTGVEYKPISATGAEDKDKKKKEKENKSEKQNKLLKQNDGQRKDSPKTPGSGQSSGGPGEGQGPKKQTRLGLEAKKEENLADWYSQVITKSEMIEYYDVSGCYILRPWAYSVWEIIKDFFDAEIKKLGVENCYFPIFVSQGALEKEKTHIADFAPEVAWVTRSGKTELAEPIAVRPTSETVMYPAYAKWVQSHRDLPIRLNQWCNVVRWEFKHPQPFLRTREFLWQEGHSAFATFEEAAEEV	936376	912477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_912841_912937_913003_917539_917619_920825_920987_924675_924850_925525_925724_926761_926870_928901_929009_929261_929342_931270_931344_931707_931918_932407_932460_934654_934918_936207
548046	contig_8317_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_20229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
548051	contig_14890_pilon	-	1636	8	Intergenic	novelGene_122519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_7	1102.14695860731	2257	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	277	1092	370199	366814	FALSE	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371238	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370981
548056	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
548089	contig_8594_pilon	-	1854	7	Intergenic	novelGene_140055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	226.893085443832	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	222	1031	496028	463861	TRUE	40	CAAACATTGATGTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREGFFLFQTQQEDLPP	525442	460908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463905_466604_466740_475734_476005_487004_487311_495973_496043_525235
548103	contig_14666_pilon	-	2248	15	Intergenic	novelGene_39515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	785	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	488	844	448746	447597	TRUE	20	CTAGCAAGCGCGGCGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAFRFNGACDAVVFQDGEEELHEVRGVRGGDDIQHLSDKVANEGNVSVQLLQALPDVADHRKDITAAQQVNHPVQQGLLQLQLLHHVQLRVLGLKELDQQLQDLGVQELVAGADLIQ	449323	429334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_429427_440670_440822_441062_441178_441958_442065_443648_443757_444228_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446218_446601_446740_447492_447607_447968_448065_448151_448293_448636_448767_448856
548110	contig_14322_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_115752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
548115	contig_5958_pilon	+	2927	9	Intergenic	novelGene_140084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	70.4427959411039	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	227	652	154917	182843	TRUE	20	TTAAGCACTTTGGCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFKRHLNDDDVTGSVKSERRNLLEDDSDEEEDFFLRGPSGPRFGPRNDKIKHVQNQVDEVIDVMQENITKVIERGERLDELQDKSESLSDNATAFSNRSKQLRRQMWWRGCKVKAIMALVAVILLLVIIILIVVKYHA	151759	187324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_151932_154862_154983_160822_160870_167909_167961_176696_176798_177740_177821_181665_181718_182814_182967_185172
548121	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
548127	contig_10299_pilon	+	2694	17	Intergenic	novelGene_79709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	85.4323334209595	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1675	2532	337976	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320529	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335216_336796_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
548145	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548147	contig_10324_pilon	+	2237	8	Intergenic	novelGene_7760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1266.85142404792	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	122	526	74608	76226	TRUE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRDLSQMLLLVPGEVHQISQQERLHHDRHLRHQLLHLSQERLLPAHEKHHQSGCPGQSD	74486	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_74751_74831_74919_75827_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
548151	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548180	contig_9982_pilon	+	1924	2	Intergenic	novelGene_55710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1240	1563	198674	198997	FALSE	15	ACGCGGCGTCCACTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPFPSLAYSVIFSGLGQTWLWQHACPFSHFCSFEYMPNKTFFLLYYKLYDVFPLQQSYTSHKVRNIWGYQKLKEAHENPSIKDLEEALPCQQLHFGLPASRTVRE	197342	199358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_198261_198352
548186	contig_9753_pilon	-	1577	5	Intergenic	novelGene_41312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	386.565647723643	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTTGTCTGCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93372	69096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_85980_86095_86172_86247_93282
548190	contig_6233_pilon	-	1573	11	Intergenic	novelGene_74778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_7	263.55191139508	762	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	495	1334	149777	143464	TRUE	15	GCTTTGGAGTGATTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250347	136675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
548191	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_115794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
548204	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	632	974	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
548215	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
548218	contig_15063_pilon	+	1694	7	Intergenic	novelGene_12244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3871.2650566564	2	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	213	1019	34808	36299	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	27558	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266_36600_38980_39092_39506
548225	SIRV6	+	903	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	66	559	16	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	512	27	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	192	683	1733	10736	TRUE	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1153	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
548230	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1110	2	-1110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCCACCGTAACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
548257	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
548268	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
548271	contig_10339_pilon	+	1891	4	Intergenic	novelGene_125266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	97.3869715219763	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	462	1103	329038	329813	FALSE	40	AAGCAGAATCTACAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENMHGITKEEMGGGSMMSALVESWKMRFPKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292278	330601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292335_308602_308709_328738_329131_329264
548276	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
548285	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548287	contig_14322_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_116338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671853	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
548289	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_16617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27848	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
548307	contig_12638_pilon	+	1931	11	Intergenic	novelGene_33231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_8	29.6755791855863	550	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	91	1887	737245	764546	FALSE	5	TCTGCTTTTGTCCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQVVCGVLMPDCCPPDNHFSLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737154	764590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759206_759412_762088_762211_764045
548310	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
548331	contig_15063_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_14236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	50	1222	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34758	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
548332	contig_8412_pilon	+	2805	19	Intergenic	novelGene_118384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	25.537010179128	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	236	2374	686772	715040	FALSE	20	AGATGCCAGTGTGCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLHRMGPNLQLIEGDAKQLAGMITFTCNLAENVSSKVRQLDLAKNRLYQAIQRADDILDLKFCMDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEGIARIVETHQPIVETYYGPGRLYTLIKYLQVECDRQVEKVVDKFIKQRDYHQQFRHVQNNLMRNSVTEKIEPRELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	683991	715471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_684167_686711_686795_687497_687613_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694544_694703_695820_695880_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
548334	contig_15029_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_128216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGAGCTCTAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252120	253433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_252100_253400
548347	SIRV7	-	345	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33223	1	4	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
548355	contig_13051_pilon	+	1899	16	Intergenic	novelGene_140090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	103.30141442508	760	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	101	1792	60194	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGELLSYQPNRGTKRPRDDEEEELKMRRRQGGTRERGRYREEETTVVEEADDDKKRLLQIIDREGEEEEEEEEPLDESSVKKMILTFEKRSYKNQELRIKFPDNPEKFMESELDLNDIIQEMHVVATMPDLYHLLVELNAVQSLLGLLGHDNTDVSIAVVDLLQELTDIDTLHESEEGAEVLIDALVDGQVVALLVQNLERLDESVKEEANGVHNTLAIVENMAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60093	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
548370	contig_10196_pilon	+	1233	10	Intergenic	novelGene_132144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	459.167550580584	267	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	261	1043	1038364	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034554	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1034995_1035101_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
548383	contig_10011_pilon	+	2155	17	Intergenic	novelGene_68013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	53.2703892889849	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	344	2038	9017	35455	FALSE	15	GATCATGCTTTTGTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPVLCPWRTTVQSESPWRNLATASVPVGQTYSTQAAEDQKEEPLHSIISSTETVQGSVSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNSSDALEKLRHKLVCEGQTLPEMEIHLQTDADKGTITVQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDALQNQAEAGSKVIGQFGVGFYSAFMVADRVEVFSRSAAPGSPGFQWLSDGSGVFQVAEASGVRPGTKIIIHLKSDCREFAGEARVRDVITKYSNFISFPVYLNGRRMNTLQAIWTVDAKDVSESQHEEFYRYVAQAYDRPRYTLHYRTDAPLNIRSIFYVPETKPSMFDVSRELGSSVALYSRKVLIQTKAADILPKWLRFVRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFVDQSKRDPEKYARFFEDYGLFMREGIVTTTEQEVKEDIAKLLRYESSALPAGQLTSLMDYANRMKAGTRNIYYLCAPSRHLAEHSPYYEAMKQKNMEVLFCYEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDGSPADGRLSEKETEDLMAWMRNALGSRVTNVKVTLRLDTHPAMITVLEMGAARHFLRMQQLAKTHEERAQILQPTLEINPRHALIKKLSQLRAGEPELAQLLVDQIYENAMIVAGLVDDPRPMVGHLNKLLTKALEKH	6594	35572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_6765_7613_7697_8926_9068_12225_12298_16750_16912_18943_19054_19731_19806_20597_20754_22295_22417_23020_23091_26651_26800_28398_28585_29042_29182_29913_30000_31694_31841_35156_35230_35353
548385	contig_13542_pilon	+	1751	10	Intergenic	novelGene_131485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	1057.84110454696	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	100	933	346638	502491	TRUE	80	AAAAAACAACCAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSIDAIPDNQKFKQLQRELSQVLTQRQIYIQPDN	346538	506309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_502388_502502_505501
548400	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
548415	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548417	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_16411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548423	contig_5200_pilon	+	1941	17	Intergenic	novelGene_140157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_13	59.5991492703545	367	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1875	67	1941	187531	480959	FALSE	30	TAAGGAAATAGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPGPSEVTGADASGPDPQLAVTMGFTGFGKKARTFDLEAMFEQTRRTAVERSRKTLEAREKEEEMNREKELRRQNEDTEPTSSGLNVVRDNSKSSSRDTSSRESEESSDSSDDELIGPPLPLEMTKEPDNLMEEGILGSLPRPRHEEVEDDDDDDDSEEEENPVQKIPDSHEITLKHGTKTVSALGLDPSGARLVTGGYDYDVKFWDFAGMDASFKAFRSLQPCECHQIKSLQYSNTGDMILVVSGSSQAKVIDRDGFEVMECIKGDQYIVDMANTKGHTAMLHTGSWHPKIKGEFVTCSNDATVRTWDVDNPKKQKSVFKPRTMQGKKVIPTTCTYSRDGNLVAAACQNGSIQIWDRSLTVHPKFHYKQAHEPGTDTSCVAFSYDGNVLASRGGDDTLKLWDVRLFNKPLFSASGLPTMFPMTDCCFSPDDKLIVTGTSVQRGCGSGKLVFFERRTFQRVYEIDITDASVVRCLWHPKLNQIMVGTGNGLAKVYYDPNKSQRGAKLCVVKTQRKAKQAETLTQDYIITPHALPMFREPRQRSTRKQLEKDRLDPLKSHKPEPPVAGPGRGGRVGTHGGTLSSYIVKNIALDKTDDSNPREAILRHAKAAEDNPYWVSPAYSK	187464	480959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_187556_187662_187729_189054_189139_194501_194623_202480_202674_248426_248487_262831_262966_294935_295090_314553_314631_388264_388440_444645_444746_447912_447998_449683_449823_474225_474327_476123_476204_478133_478251_480795
548427	contig_12923_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_30160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTTCTGGCAAAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280318	278068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_278100_280300
548440	SIRV4	-	307	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTATGTTCGTGAACGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
548443	contig_10299_pilon	+	2074	12	Intergenic	novelGene_79667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	65.157279519484	1277	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	28	1047	182394	185364	TRUE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	182366	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185534_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
548450	contig_5791_pilon	+	2819	11	Intergenic	novelGene_35819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	47.5542847701445	157	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	148	1350	751375	761894	TRUE	30	CTGCTTAACTGTTCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPVPAEPPEEKNTKIVQNYLEKFYQLPRTQFKSERKNSASVVVEKLKVMQLFFGLNATGKPDAETLEIMQKPRCGVPDGGGFMVTPGNPKWKHMNVTYRIRNYPSDLAKAEVEKAIKKAFKVWSRVSPLSFTKISERKADIEISFLVRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQPGPGIGGDAHFDAEEKWTNTYENYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPTYAYRDPNTYLLSQDDINGIQAIYGSSSDPIQPTGPSTPIACDPRLAFDAITTLRGEIFFFKDKYFWRRHPQLRIVRLNFISLFWPSLSNGIQAAYEDYDRDMIFLFKGRRYWAVSGYTIQQGYPRDISNYGFPRSVQAIDAAVSYSGKTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSIASTFQGIQSRVDAVFHQDHFFLFFSGPIYYAFNLNARRVTRIDRSNKWLNCR	748941	763567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_748996_751281_751527_752586_752736_752822_752949_755401_755564_758438_758557_759546_759681_760646_760801_761524_761629_761790_762536_762739
548459	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
548473	contig_1575_pilon	+	1674	18	Intergenic	novelGene_45171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	431.54234537036	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	25	1590	82695	190698	FALSE	40	GTAATAGAAATTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AINPSAVSMENEGKIIMPTSKGFLRIKCSNGSKAHSIPAGTQELKSVARFQKLPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVTSILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWRKYISQFKNPLIMLLLASAVISVIMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVDSCFISELSSFIPGCVELLPFLRCYVLVG	82670	190782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_82708_104379_104481_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167818_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_185018_185124_190388_190431_190605
548499	scaffold_6394_pilon	+	1245	7	Intergenic	novelGene_110990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1041.72085192403	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	31	519	398216	405113	TRUE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKPWPVLRRA	398185	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405085_405501_405717_405864_406086
548508	contig_14811_pilon	-	1604	4	Intergenic	novelGene_74488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	321.969287700275	6	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	155	586	375672	357600	FALSE	30	TGACAACCCCAAAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVPGIRRTAFVAGWTRNLTAKEWRKLRIVGSSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGKYLG	386590	356581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375134_375456_375574_375765_386528
548515	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548539	contig_11072_pilon	+	1728	3	Intergenic	novelGene_140177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	26	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAAGTGATTTTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64996	69408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11072_pilon_+_65056_66272_66402_67868
548546	contig_9471_pilon	-	1741	7	Intergenic	novelGene_21815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGGGAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417524	412431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412822_413708_414083_414632_414728_414804_414934_415628_415714_416192_416271_416934
548550	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
548562	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91680	4	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
548582	contig_9389_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_83934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCCCTCCCTTCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163189	162480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_162500_163200
548583	contig_9389_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_83933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTAGCTTTGCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162328	162032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_162000_162300
548589	contig_1996_pilon	-	1435	8	Intergenic	novelGene_131932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	369.068269775528	1572	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	164	937	509912	508483	FALSE	5	CGGACCCGGGGGCGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	510535	507984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510416
548607	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
548609	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548627	SIRV7	-	246	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69039	1	35820	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78918	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
548631	contig_8801_pilon	+	2487	9	Intergenic	novelGene_66331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	143.84100380281	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1350	1667	938911	940089	TRUE	20	TTAGTTACAGATTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGPTKQLV	937140	944236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_938481_938901_939100_939696_939803_940066_940189_940884_940938_941018_941130_941760_941871_942886_943037_943939
548646	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
548664	contig_16098_pilon	-	2179	15	Intergenic	novelGene_45842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	314.718573668992	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	275	2095	215535	201500	FALSE	25	TGCTACAGTTCCTAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	228598	201415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215638_228287_228387_228525
548671	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
548713	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
548730	contig_6842_pilon	-	1155	4	Intergenic	novelGene_130718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_3	147.443397802532	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	47	610	433953	429481	FALSE	35	CAATGAGTGGACTAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	433999	428935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547_432658_433818
548733	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
548735	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
548748	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548755	SIRV7	-	292	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91634	0	-91628	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAGTATAAAACTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
548774	SIRV4	+	272	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1490	641	1035	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2490	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
548791	SIRV4	+	158	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1613	632	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2613	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
548794	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548803	SIRV4	+	285	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1486	632	1031	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2486	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
548817	contig_12157_pilon	+	2700	1	Intergenic	novelGene_135899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2097	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTCATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118336	121036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_118300_121000
548835	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	1116	13	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
548851	contig_10986_pilon	-	541	4	Intergenic	novelGene_71459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	162.583995385633	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	4	321	74003	67011	FALSE	25	CCCGTAAGCTCTCATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	74006	66790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67291_72178_72321_73924
548859	contig_16098_pilon	-	1003	8	Intergenic	novelGene_46162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1389.16824328922	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	104	1003	458816	456559	FALSE	15	TCCTATGGCCGAGCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTF	460230	456558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
548866	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
548872	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
548921	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
548935	contig_17042_pilon	+	1678	3	Intergenic	novelGene_140179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	25	junction_1	293.5	1335	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	201	1064	4885	10091	FALSE	20	TCACGTCCAGCATTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPDSNLIWIITVMVLTQLVAFYLVKDLDWKWVIFWAYAFGSCINHSMTLAIHEVSHNSAFGHCKAMWNRWFGIFANLPVGVPYSISFKRYHMDHHRYLGSDGIDVDIPTDFEGWFFCTTFRKLIWVILQPLFYAFRPLFINPKPISYLEIINTIAQISFDIIIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKNLPLVRKIAAEYYDSLPQYTSWIKVLYDFVMDDTISPYSRMKRHQKGQVELE	2033	10705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_2208_4858_5602_9944
548955	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1118	0	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
548958	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
548963	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
548985	contig_16666_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_61795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGCAGAGCGGCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121904	122701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_121900_122700
548989	contig_9415_pilon	+	1788	4	Intergenic	novelGene_109709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGTAGAAGTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425077	436235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_425946_426279_426364_427731_427856_435523
549000	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
549010	contig_12624_pilon	-	1619	9	Intergenic	novelGene_61055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1102.47108096993	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	286	645	903621	874110	TRUE	40	AAACAAGGCACCCAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKIPGGNLSRV	903906	862030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874136_888727_888805_900249_900333_903447
549023	contig_13300_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_125784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAACCTTCCCAAAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152319	151463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_151500_152300
549028	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549044	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
549052	contig_7744_pilon	+	2094	17	Intergenic	novelGene_62562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	208.094170013843	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1130	1660	889381	890785	FALSE	20	TTGCTAAAAGCGTCGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879828	891219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889163_889351_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
549053	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
549057	contig_12786_pilon	-	1735	9	Intergenic	novelGene_103398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	750.140778454284	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	897	1673	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629491	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628319_628911_629303
549079	contig_7253_pilon	+	2618	7	Intergenic	novelGene_140204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	44.6081706516742	187	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	251	814	201514	215768	FALSE	40	GAATTGCACACAATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANEDQEMELEALRSIYEGDESFRELSPVSFQYRIGENGDPKAFLIEISWTETYPQTPPIISMNAFFNNTISSAVKQSILAKLQEAVEVNLGTAMTYTLFEYAKDNKERFMENHHPINSTTSISNIISVETPNIGPSSKKKDKKEQLSKAQKRKLADKTDHKGELPRGWNWVDVVKLSKTGSKDDE	201263	217572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_201538_204133_204215_207379_207490_207570_207719_209612_209731_212355_212406_215735
549083	contig_13894_pilon	+	1188	9	Intergenic	novelGene_62148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	77	1132	521729	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521652	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
549104	contig_8538_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_4702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
549123	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549130	SIRV5	+	386	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	53	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8254	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
549132	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
549133	contig_13740_pilon	-	1529	12	Intergenic	novelGene_34631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3407.61059496858	40	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	165	668	165243	160666	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165407	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
549137	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
549140	contig_7202_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_16670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCAGGTTGGTCACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
549147	contig_11560_pilon	+	3336	19	Intergenic	novelGene_117909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	32.5885782460476	122	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	192	2600	29366	114904	FALSE	20	TCTTGGCCAAAAGTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLPPPPSALNGPGPSPLSPPAHRPDGLPGPAPPNAQYQPPPLPGQTLGAGYPPQQAASCGPQMAGAPLSYPGGFPGGPAQMAGPPQPQKKLDPDSIPSPIQVIENDRATRGGQVYATNTRGQIPPLVTTDCVIQDEGNASPRYIRCTAYCFPCTSDMAKQAQIPLAAVIKPFATIPSNESPLYVVNHGEDGPVRCNRCKAYMCPFMQFIEGGRRYQCGFCSCVNDVPPFYFQHLDHTGRRLDRYEKPELSLGSYEYVATLDYCRKNKPPNPPAFIFMIDVSYSNVKNGLVKLICEELKTVLEKLPKEEQEETSGIRVGFITYNKALHFFNVKSNLAQPQMMVVTDVGEVFVPLLDGFLVNYQESQSVIHNLLDQIPEMFADSNENETVFAPVIQAGMEALKAADCPGKLFIFHSSLPTAEAPGKLRNRDDKKLVNTDKEKILFQPQTSIYESLAKDCVAHGCSVTLFLFPSQYVDVASLGLIPLLTGGTLYKYNSFQMYLDSQQFLNDLRNDIQKKIGFDAIMRVRTSTGFRATDFFGGVFMNNTTDVEMAAIDCDKAVTVEFKHDDKLSEDSGALIQCAVLYTTIGGQRRLRIHNLGLNCSSQLADLYKSCETDALINFFAKSAFKAVLHQPLKVIREILVNQTAHMLACYRKNCASPSAASQLILPDSMKVLPVYMNCLLKSCVLLSRPEISTDERTFQRQLVMTMGVADSQLFFYPQLLPIHTLDVKSSTLPAAIRCSESRLSEEGIFLLANGLNMFLWLGVSSPPEVIQGIFNVPSFAHINTDTTLLPEVESPYSQKLRLIMSIIQQKRPYSVKLTIVKQREQPEMVFRQFLVEDKGLYGGSSYVDFLCCVHKEICQLLN	28844	115640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_+_29016_29345_29477_36636_36749_37658_37787_63152_63292_66970_67087_75487_75613_81149_81342_82104_82199_88736_88854_89699_89871_93360_93458_93577_93724_94700_94840_95617_95737_102951_103132_105839_106032_109113_109204_114763
549153	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_92014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
549154	SIRV6	+	332	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	188	25	1	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAACAAGAGAGTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2473	10763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
549204	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549213	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_19057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
549215	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549236	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
549240	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
549243	contig_1443_pilon	-	1303	9	Intergenic	novelGene_28323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	251.931538319441	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	140	1024	776427	748649	FALSE	30	TTTTATCAACTGTCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	789227	748369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_787303_787358_789176
549245	SIRV6	+	606	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10219	1	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11219	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11800
549247	contig_6795_pilon	+	1617	9	Intergenic	novelGene_27744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	300.006562428224	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	231	1340	331565	333435	FALSE	30	TAAATGCTTTTATTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTRCIQISTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGLGAQKPYDDNAEYMKYTRLFRCSNEKGFFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHLRSKEQEQPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHAWSTFRKALA	331334	333712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
549267	contig_7202_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_18638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACGTCTGGCGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29797	30105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
549275	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549280	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
549303	contig_15720_pilon	+	1367	8	Intergenic	novelGene_41888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCGAGAAAAAGATCGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278499	283986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278611_279006_279115_279712_279852_280265_280373_281446_281555_281785_282086_282456_282750_283785
549310	contig_14101_pilon	+	2320	5	Intergenic	novelGene_122763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	46.6442654567526	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	82	1236	260068	273778	TRUE	5	TCCCCTGTGTGAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257218	274943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264833_273610_274623_274703
549321	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549337	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549338	contig_15134_pilon	-	2132	16	Intergenic	novelGene_140213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	100.021908711153	4	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	80	913	216759	199503	TRUE	30	GTAAGAATTGGTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSCWSDPVVVVVVVVVVWLTAGEAIMTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQI	221853	184233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_205922_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216766_221780
549343	contig_13547_pilon	-	2290	14	Intergenic	novelGene_104862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_3	298.464908783508	242	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2247	44	2290	163431	52973	FALSE	35	TGCTCAGATGAAGATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLRLHRWSVIWKNWIFSQDCEHVFQVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRDSPLHFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADAGLKRGDQIMEVNGQNFENITFVKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKAGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDIEQTSQEKGNKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIKVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETL	163474	52972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_53010_54264_54506_63546_63705_75687_75929_84852_84962_88970_89175_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206
549353	contig_2924_pilon	+	2325	17	Intergenic	novelGene_140241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	420.032955366302	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	119	1993	17893	303804	FALSE	20	GATTCTTCGTTTACAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSAAKAASATDLAEIEIKKEMKKDPLTSKAPEKPMHEVSGGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPETLPNRTEEKEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSVSRPIAMPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEDDKEEHVSLAHRGADASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGAMAAGGGPAPLSAAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	17774	304136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_17944_66034_66159_125503_125608_135679_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847_221956_236286_236339_239711_239793_242630_242782_259354_259441_287622_287733_293259_293389_297301_297568_302765_302830_303762
549357	contig_3601_pilon	-	2527	13	Intergenic	novelGene_132962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	154.038595452208	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	42	1205	1194492	1127225	FALSE	15	TGATCCGTCTACTTGCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDPPSGRKPPRATMETATEQWVLVEMVQAVYEAPAYHLILEGILILWIIRLLFSKTYKLQEHSDLTVKEKEELIEEWQPEPLVPPISKDHPALNYNIVSGPPSHNIVVNGKECINFAACFAIQKGLQASRSDIKLFKHNDMADLERLLKEQEIEDQKNPRKARVTRRFIVAEGLYMNTGAICPLPELVKLKYKYKARIFLEESLSFGVLGEHGRGVTEHYGINIDDIDLISANMENSLASVGGFCCGRSFVIDHQRLSGQGYCFSASLPPLLAAAAIEALNIMEENPGIFAVLKEKCEQIHKALQGISGLKVVGKSFSPAFHLQLEKSTGSRERDVKLLQEIVSQCMNRSIALTQARYLEKEEKCLPPPSIRVVVTVEQTEEELEKAASTIKEVAQAILL	1194533	1125902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1127319_1129305_1129380_1132667_1132786_1139478_1139534_1141955_1142053_1142353_1142450_1147057_1147166_1152465_1152556_1157632_1157755_1184400_1184451_1188426_1188522_1191165_1191274_1194435
549363	contig_13674_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_140307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCTGCACTGATTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11091	12941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_11100_12900
549367	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549378	contig_3571_pilon	-	2635	11	Intergenic	novelGene_88703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_7	58.0017241123055	223	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	690	1982	41961	30354	FALSE	65	AAGAAGGAAAATGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAANFYAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWTVVTPMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFNSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	100114	29700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_31449_31562_33384_33490_36653_36892_38625_38763_40254_40416_41808_42008_42749_42976_45517_45659_49302_49434_99969
549387	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
549388	contig_12148_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_140318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5435	7781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_5400_7800
549409	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_115828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
549413	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
549422	contig_12943_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_140365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCACAGCAATATGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97310	96664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_96700_97300
549448	contig_5954_pilon	-	1554	9	Intergenic	novelGene_28609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	470.108215600408	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	42	1193	956216	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956257	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947494_948088_948197_955828_955932_956121
549450	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
549462	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549473	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_90842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
549474	contig_11316_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_122670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139380	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
549485	contig_10523_pilon	-	2426	8	Intergenic	novelGene_120942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	489	junction_7	360.473271674665	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	124	1107	39240	15001	FALSE	25	ATAGAAGGAGTGTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	95261	13681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
549490	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549509	contig_10861_pilon	-	2583	19	Intergenic	novelGene_39417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_7	123.062828979929	477	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	18	2270	2249263	2191815	FALSE	5	GTCCTATCTTTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESLANLSEDEYYSEEERNAKAEKEKKLPPPPPQAPPEEENESEPEEPSGQAGGLQDDSSGGYGDGQASGVEGAAFQSRLPHDRMTSQEAACFPDIISGPQQTQKVFLFIRNRTLQLWLDNPKIQLTFEATLQQLEAPYNSDTVLVHRVHSYLERHGLINFGIYKRIKPLPTKKTGKVIIIGSGVSGLAAARQLQSFGMDVTLLEARDRVGGRVATFRKGNYVADLGAMVVTGLGGNPMAVVSKQVNMELAKIKQKCPLYEANGQAVPKEKDEMVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNVLNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVNLKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAETQGKLEEKLQELEANPPSDVYLSSRDRQILDWHFANLEFANATPLSTLSLKHWDQDDDFEFTGSHLTVRNGYSCVPVALAEGLDIKLNTAVRQVRYTASGCEVIAVNTRSTSQTFIYKCDAVLCTLPLGVLKQQPPAVQFVPPLPEWKTSAVQRMGFGNLNKVVLCFDRVFWDPSVNLFGHVGSTTASRGELFLFWNLYKAPILLALVAGEAAGIMENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSRWRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAGEHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSPSM	2249280	2191501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2192001_2192692_2192840_2193530_2193659_2195435_2195551_2195962_2196151_2197701_2197835_2200721_2200834_2202114_2202189_2202978_2203114_2208661_2208753_2209068_2209212_2218122_2218218_2219415_2219498_2222263_2222371_2223158_2223252_2223883_2223963_2226676_2226811_2231842_2231903_2249112
549522	contig_12871_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_140368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAAGACTTTTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13371	13081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_13100_13400
549545	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1116	0	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
549563	contig_1867_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_54555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGGGCACCATCTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427857	425729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_425700_427900
549584	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
549594	SIRV4	+	314	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	668	966	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
549595	contig_17768_pilon	+	662	8	Intergenic	novelGene_140386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	458	junction_7	121.108822712367	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	90	662	21888	78798	FALSE	20	CTCTCCCCAGCAATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVKSKKATDTYKIYVEKYALAKADFEQKMTETAQKFQDIEETHLIRMKEIIESLSNAIKEIHLQIGQVHEEFLNNMANTTVESLIQKYVESKGTGKERPGLIEFEECDPTSAVEGIKPRKRKTFALPGIIKKEKDAESVECPDADSLNIPDVDEEGYSIKPEANQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELKVSIGNIM	21798	78798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_21906_39953_40053_40789_40887_58293_58339_60536_60610_66601_66627_78293_78352_78640
549611	contig_5643_pilon	+	1618	12	Intergenic	novelGene_39047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	845.128001454795	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	276	1406	631988	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631210	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635703_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
549616	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
549630	SIRV4	-	250	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCATCGTATGTTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2719	2469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2700
549637	contig_15273_pilon	+	2085	4	Intergenic	novelGene_140429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	210.555350337045	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATACAAAAGCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95932	147744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_95994_144775_144950_145197_145339_146035
549644	contig_8020_pilon	-	2657	4	Intergenic	novelGene_114378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	31.6333157709821	253	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	197	523	150417	149105	TRUE	0	CCCTGTCTCTCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQ	150613	146876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_149185_149828_149914_150255
549653	scaffold_8345_pilon	+	1714	10	Intergenic	novelGene_107028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	228.685130449902	1439	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	185	880	785045	790617	TRUE	15	CTGCTCTAGAGTGACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGLSHAGLQPAPEGVCARQSAINTGALSVLTTQPRREEENTEARCQGPGRARIPEGEEGKMKTLIPLLLLGLLLTGEKGQVLGEETISANELQEMSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSPLT	779385	798054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790537_790606_790675_792008_792117_795998_796229_797376_797559_797797
549659	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549662	contig_9471_pilon	+	1616	11	Intergenic	novelGene_21796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_4	735.412809243897	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	1064	1615	414749	417263	FALSE	15	CTTTCTTTTCCCCCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCFFLLFAFLIIIYDFQKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKH	407016	417264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412821_413710_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
549678	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549711	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1121	0	-1121	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTCAACGACGAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
549732	contig_14322_pilon	-	266	2	Intergenic	novelGene_116531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTGGTGCTCCTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674891	672888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
549735	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549739	contig_13216_pilon	+	2051	7	Intergenic	novelGene_47466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	87	1514	229682	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229595	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
549742	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
549746	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
549747	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	52	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
549767	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
549777	SIRV4	+	232	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1539	632	1084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
549808	contig_18869_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_56165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73600	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
549814	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
549818	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
549829	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
549830	contig_8848_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_140458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1532	1900	60087	59719	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLIYCQLSIQSTLFHCSLPGPSHQHGLSGRLRQLSNWLLSSTLALLQPIPHAADSLFVLQPAKHISTSFLCHSLCWNAFPLDIHIFCSLTSLTALLKCLLIREKLPQPLYLNSTLLHFFP	61618	58746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_58700_61600
549839	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
549852	contig_9981_pilon	-	2045	5	Intergenic	novelGene_121046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	78.5409924816334	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	446	808	255931	250527	FALSE	35	TCATAATACTTTGTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKQLVTGSVQAKVLKWGGETEDFPSPPDYILMADCIYYEESLEPLLKTLKDLSGSETCIICCYEQRTMGKNPEIEKKYFELLQLDFDFEKIPLEKHDEEYRSEDIHILYIRKKKSKFPS	256376	249289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080_253186_254386_254507_255642_255716_255881
549853	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
549854	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30103	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
549869	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27843	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
549875	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
549879	SIRV6	-	230	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	87	429	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAAACCCAATTTCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733	1115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640
549889	SIRV4	+	1563	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATATTGTAACCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
549892	contig_18869_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_56184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73697	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
549898	contig_4232_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_63222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	820	1158	148204	148542	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCVWLISQASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	147384	149669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_147400_149700
549899	contig_4429_pilon	+	2337	10	Intergenic	novelGene_50791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	580	junction_1	237.723981453333	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	3	2021	154531	191765	FALSE	45	ACCCATTAACAATTTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFPEEVDVFTAPHWRMKQLVGLYCDKLSKTNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGNAFQQ	154528	192081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_154615_165210_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596
549904	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
549907	contig_12864_pilon	-	1271	7	Intergenic	novelGene_76421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	713.143198959523	30	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	164	673	251873	242831	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252184	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251964_252111
549908	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
549909	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
549920	contig_15491_pilon	-	2346	5	Intergenic	novelGene_75975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	183.664095565791	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	46	750	91394	80881	FALSE	25	AGCTGCTGTGATGGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGTILKSPPWLHHQLRNLTLHRNSSRKPVPIPVSHSGWGCLSENPTTRGSGKMVLLGCLICLDSRVLPRSTLQVPVRTYKGELFMQTTAF	91439	79284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81409_85961_86213_87650_87753_91306
549925	SIRV6	+	849	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	23	-441	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
549943	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_93621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
549947	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
549957	contig_5827_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_129794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455499	453249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_453200_455500
549962	contig_12786_pilon	-	1510	9	Intergenic	novelGene_103387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_8	654.670515889482	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	509	1444	614067	590909	FALSE	20	CTTTTGTATGATTTCGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629621	590842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_628731_628911_629303
549963	contig_17753_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_105084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1343	1663	75255	74935	NA	30	AGGGTTGGGGAAAGTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVLTPEKATHPTLLPTRVGTGQLPFTSAACVIIHLGPQMQISWPGSLKHLLITALGDASHFLLALSFQKGRVPRWHPLEGKRRKVHVSFDSQFVHGLLKTIQGN	76597	74288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_74300_76600
549966	contig_15047_pilon	+	1661	6	Intergenic	novelGene_52231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	4	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	422	697	3242	4178	TRUE	45	GGAAATAAATGGAAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPAPPAAPSPATSPPPLPAPIDPGPGRRAGSGVGGLSRSPPAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2424	21630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21516_21557
549968	contig_6364_pilon	-	2417	4	Intergenic	novelGene_51771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_2	40.9579730401244	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1505	1819	929835	902980	FALSE	35	AGTGATGTGACTAAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANASGQGFQNKNRVAILAELDKEKRKLLMQNQSSTNHPGASIALSRPSLNKDFRDHAEQQHIAAQQKAALQHAHAHSSGYFITQDSAFGNLILPVLPRLDPE	931339	902381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_903076_904266_904358_906457_906561_929810
549978	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550013	contig_7887_pilon	+	1622	2	Intergenic	novelGene_124937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	221	604	584832	585706	FALSE	25	CAAAATGCCTGTCTCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	584611	586724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_585122_585612
550015	SIRV6	+	1056	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	26	-1	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
550019	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550042	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550053	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
550058	contig_2204_pilon	+	1784	6	Intergenic	novelGene_71655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_4	171.316082140586	24	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	30	800	13204	50221	FALSE	35	GTTAAATTTTTAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_48669_48717_49912
550071	contig_2100_pilon	-	1447	10	Intergenic	novelGene_50706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	915.921757939327	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	166	1101	1180199	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPGECKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1182806	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1174200_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727
550072	SIRV6	+	932	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	544	0	371	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	59	550	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1674	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
550078	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
550089	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550098	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550100	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550102	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550103	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550111	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
550117	contig_11622_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_140476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCAACCCTATAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31957	30733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11622_pilon_-_30700_32000
550122	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550123	contig_12340_pilon	-	2035	6	Intergenic	novelGene_122096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_5	21.0104735786702	302	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	57	902	42866	3862	FALSE	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIPALPLPESPPTVQSGKMAGAPEGLVFVSPPDEEMATGADDPASVPAAPREDFRVLCTSKRAVTEVLELCGRFVQQLGDALPEKIREPALRDAQWTFESAVQENVSINGGAWQEASENCSMDSDIKVLEDQFDEIIVDIAMKRKQYPRKILECVIKTIKAKQEILKQYQPVVHPLDLKYDPNPAFRMENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	42922	2728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_23812_23868_26700_26832_32416_32496_42632
550133	contig_1450_pilon	+	1987	4	Intergenic	novelGene_27422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	835.328810841708	35	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	20	CCATGATGGTGAAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423383_424022_424565_424929
550158	scaffold_16539_pilon	-	1713	12	Intergenic	novelGene_68369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	323.924820376887	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	153	1595	502141	490096	FALSE	5	TCCCTGCTGCTCTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502795	489977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501960_502111_502246_502747
550172	SIRV7	-	284	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	1	35782	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
550182	contig_6233_pilon	-	1619	10	Intergenic	novelGene_74803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	243.809782159255	706	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	416	1255	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250355	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
550183	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
550186	contig_4678_pilon	-	3393	11	Intergenic	novelGene_126053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_3	52.8962191465515	9	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	348	776	577200	574996	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSVR	578004	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_573021_573153_573226_573495_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
550191	contig_12427_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_40437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACTTCAGAGTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249156	251849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_249200_251800
550193	contig_14322_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_116504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGCAAATAAACGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671902	671386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671657_671823
550201	contig_5210_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_65463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGGAGGTTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660294	657609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_657600_660300
550205	contig_14322_pilon	-	744	2	Intergenic	novelGene_116513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCCGAGGGGGAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674745	672264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
550208	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550226	SIRV4	+	278	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1482	643	1027	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2482	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
550227	contig_1443_pilon	-	2161	16	Intergenic	novelGene_28256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	50.1560232341707	391	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	109	975	560906	554728	TRUE	15	AGCACTGTTATCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYALTHPDTVEGLVLINIDPNAKGWMDWAAHKLTGLTSSAPEMILGHLFSQEELSGNSELVQKYRNIVVHAPNLENIELYWNSYNNRRDLNLERRGDITLRCPVLLVVGDQAPHEDAVVECNSKLDPTQTSFLKIQLLGLQGPAWEQVG	562617	553135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554776_554842_554891_555155_555208_555499_555545_556763_556868_557043_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
550234	contig_6418_pilon	+	2100	3	Intergenic	novelGene_81200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	150	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAATTGCGAGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341067	1362979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1361198
550235	contig_13244_pilon	-	2592	3	Intergenic	novelGene_86962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3934	junction_1	484	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299439	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_299281_299397
550237	contig_6589_pilon	-	1881	2	Intergenic	novelGene_26298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	522	845	2274190	2273122	FALSE	70	AAACAAAAAAAAATTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSPCCSGGWRKPARCARDAARSRSAASGSPSTDGHLWATGAGNVQL	2274711	2272085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273257_2274001
550246	contig_17440_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_7689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3786	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3800_4000
550250	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_17720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550252	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550255	SIRV4	+	218	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1553	632	1098	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2553	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
550269	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
550285	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550289	contig_5033_pilon	-	2096	15	Intergenic	novelGene_29059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	31	1605	566787	532125	TRUE	40	AGTAAATGGACTTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566817	531060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531157_531729_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
550290	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
550310	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
550322	contig_7356_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_60335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25147	27248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_25100_27200
550349	contig_6001_pilon	+	1938	10	Intergenic	novelGene_128050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAGAAAAGCGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725376	763653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_725546_725641_725807_728557_728667_729840_729902_730966_731051_755883_756836_757401_757517_757623_757700_757971_758122_763596
550371	contig_1301_pilon	+	2816	15	Intergenic	novelGene_47404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1942	2343	815000	822605	TRUE	0	CTCCCTCCTCTGCCCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLNTLLLRNLNKILTRISNRCGTVSSTLGIGWHHSGRSCYWLYRGGYRINGESSGSWTWCGWFYGCHLSSLLSLSILSCTLTITCFRGCLIVGFSNRRLRLGSGSYSSSSCCWLLVVLLTIISYSRGCGSYI	795676	852530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_795946_798098_798253_799194_799398_800425_800589_804161_804310_805024_805141_805932_806133_810302_810594_811764_811961_814798_815041_819977_820203_822469_822614_824144_824429_852066_852167_852449
550376	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
550392	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
550395	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550404	contig_1225_pilon	+	1683	4	Intergenic	novelGene_44133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	5	GCTTTCCACTCTGGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274914_276149
550405	contig_1450_pilon	+	1490	9	Intergenic	novelGene_27403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_3	209.102808147093	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	188	1294	347091	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	346444	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
550412	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
550426	contig_7202_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_16376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27785	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
550434	scaffold_12124_pilon	-	1686	4	Intergenic	novelGene_22431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	22.6274169979695	75	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	60	1364	1676771	1672300	FALSE	25	CATTTTACATTTGGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGEWALLDLAQKKLYRDVMMETFRSLAAIVSQNLYDGESLSSEHVMVQFMKNNTWSSMLGEIFESHGTKGHNKQGRYLRSHTVENLCESNEGNKCGKIFSRMPDLNVLKRTASEINPFECCESGKAFMDHSSHNPRNVSHTGCSTCQCKECGEACSCPSHLTTPMRTVNRKKPRKCKVCGKDLICTSTLQNPVTTLTGEKRYECNECGKYFCNFSSFWTHLKGHNRACEQYCKTYSDQFLILRKKLHHRGKLYECKECGKAFTRSAHLTLHIKTHSGERPYECKQCGKAFSQLSNLTSHIKTHSGERPYECKECGKAFSQSYHLTSHIRTHSGEKPYVCKECRKAFSCSSGLTRHIRTHSGERPYECKQCGKAFSRSSSLNTHIRTHSGEKPYECKECGKAFSHFSSLYAHMRTHSGEKAYERKECGKAFRQAAHLMQHVRTHSGETTLCQK	1676830	1671977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1672896_1673735_1674263_1675032_1675181_1676737
550435	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	3	356	14437	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
550436	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_89243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
550454	SIRV3	+	147	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4675	2173	2616	48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGGTGGACGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6619	6766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6600_6800
550480	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_90411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550486	contig_14711_pilon	+	1040	6	Intergenic	novelGene_68917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	454.980702887496	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	208	801	89183	90570	FALSE	20	CAGACCTCAGTTGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85498	90809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85593_85912_85986_89142_89326_89463_89673_90032_90194_90489
550488	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCAGTATATTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
550499	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
550500	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550505	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
550509	contig_15042_pilon	-	2118	7	Intergenic	novelGene_115420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	138	1091	35339	10047	FALSE	15	CATTGTCCCTTTAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKRWLYWQPILTKTGFVSVLLVGAFVGWTLFFQQNVL	43086	9019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
550531	SIRV4	+	185	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1586	632	1131	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
550550	contig_11386_pilon	+	1351	5	Intergenic	novelGene_82774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	340.679009479598	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	414	1043	17940	20925	TRUE	35	CAGGAAGTACTTCCAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	16540	23400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_16859_17844_18037_19625_20050_20816_21022_23188
550551	contig_3004_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_127560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTTTTGAAATAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857173	859192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_857200_859200
550570	contig_9871_pilon	+	2466	11	Intergenic	novelGene_75718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_10	92.6295849067672	272	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	88	1785	598042	616625	FALSE	20	TGCTGTTGGGTTGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAILESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGLIECYLASNSIREAMVMANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLSREQKYEDGIALLRSALANQSDCVLHRILGDFLVAVNEYQEAMDQYSIALSLDPNDQKSLEGMQKMEKEESPTDATQEEDVDDMEGSGEEGDLEGSDSEAAQWADQEQWFGMQ	597954	617306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_614614_614766_616435
550592	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-21	928	-21	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGACTAGGTGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
550647	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91666	4	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
550649	contig_6102_pilon	+	2724	21	Intergenic	novelGene_32357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.8871456700012	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	2	2647	1699217	1714849	FALSE	10	GCTGAGACCCTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1699215	1714926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699301_1700367_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
550652	contig_1867_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_54591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500358	502670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_500400_502700
550653	contig_12625_pilon	+	1860	10	Intergenic	novelGene_140477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	349.341320236658	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	345	1502	15248	32535	FALSE	5	GTTTGGTGACCTGGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQTNTTGSNVTTSSAPNSNSTSGSATSSPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTSNFSELQSQMQRQLMSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALSTGGSSGTNGSSSAPSENTSPSAGTTETGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGERKRCLQFSFFNHGF	7474	32893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_7629_9288_9405_15173_15437_15913_16073_16678_16914_23321_23465_28478_28595_28844_29011_30470_30574_32488
550656	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
550662	contig_2367_pilon	+	1424	2	Intergenic	novelGene_65313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	319	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAAGGCATACACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192219	208577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_+_193618_208551
550673	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550678	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550679	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	229	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
550680	contig_17274_pilon	+	2102	19	Intergenic	novelGene_26460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_18	441.53703198858	1532	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	67	1845	7027	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEDDGEETQEMASTQSIHEQDKVTTWTLESFNLEFKTWLLQSSVGERDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6960	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_31294_31349_36255_36337_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
550681	contig_5226_pilon	-	1944	6	Intergenic	novelGene_140498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_4	115.203472169896	41	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	224	673	18164	9316	FALSE	30	TTGTGGATATAGACACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVIMPPSALDQLSRLNITYPMLFKLTNKNSDRMTHCGVLEFVADEGICYLPHWMMQNLLLEEGGLVQVESVNLQVATYSKFQPQSPDFLDITNPKAVLENALRNFACLTTGDVIAINYNEKVRGSALGRTGPHKNTTRHPEQKQLKEI	28429	8044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_9473_11337_11469_15533_15656_17708_17742_18157_18265_28306
550685	contig_14322_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_116499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAATAAACGCTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
550700	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550706	contig_1372_pilon	+	2679	12	Intergenic	novelGene_140515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	32.8719026445242	186	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	1340	2503	457535	484809	FALSE	20	CTATACCGCTTTACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQGMKFDPEITVLQTMLAECQEKLKKLSWLESRVECLEEKMKGKVMVNEKTWTNLLSRVTLLETEMLLLKKNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451683	484985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_453613_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_470835_471043_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
550707	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
550713	contig_7202_pilon	-	159	1	Intergenic	novelGene_18690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTACGTCTACCTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29976	29817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30000
550717	contig_6589_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_26204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	62.8051733212987	1323	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	221	715	2032681	2030536	TRUE	15	TCATTGCATGTATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033664	2027927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
550718	contig_990_pilon	-	2060	22	Intergenic	novelGene_76028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	157.306336320925	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	7	1896	865835	725789	FALSE	5	CGTCCTATCTTCTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWKYPKGIHVETLETEKKERYIVISKVDEEERKRREQQKHAKELGKLVIGHNMLLDVMHTVHQFYCPLPADLNEFKEMTTCVFPRLLDTKLMASTQPFKDIINNTSLAELEKRLKETPFNPPKVESAEGFPSYDTASEQLHEAGYDAYITGLCFVSMANYLGSFLSPPKIHVSARSKLIEPFFNKLFLMRVMDIPYLNLEGPDLQPKRDHVLHVTFPKEWKTSDLYQLFSAFGNIQISWIDDTSAFVSLSQPEQVQIAVNTSKYAESYRIQTYAEYVGKKNEEKQIKRKWTEDSWKEVERKRLNTQCISCALQNHCYRTNSFTATGTVVKRNLSPSLEEAGLEDSASGEVSDAELEKTDSCAETLSEGRKKAKKLKRMKKELSPAGQHWILLKFWSCIVFKCSRNSYLGEKL	865841	725624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_726066_746125_746316_803705_803781_808861_808949_811850_811907_829146_829217_829886_829998_833877_833954_834528_834572_835681_835726_840429_840508_848178_848260_849297_849341_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
550720	contig_3942_pilon	+	1241	6	Intergenic	novelGene_128691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	476.657696885302	15	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	54	530	426591	428427	TRUE	30	GTTATGAGTCATTTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEVSGYRGGHWNWLCPLPCGPPFNPATIHPVSSKCW	426537	430169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428587_429453_429670_429749_429853_429936
550723	contig_3588_pilon	+	2192	19	Intergenic	novelGene_72861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	579.203137673958	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	167	985	84577	125597	TRUE	0	TTTGGTGGTTTTTTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKL	84410	141460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127480_131417_131462_134092_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
550744	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550754	contig_12790_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_35277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTAGTTCTTCTGGTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391670	390795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_390800_391700
550768	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
550771	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550786	contig_13004_pilon	+	2723	1	Intergenic	novelGene_112694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTCATCTAAAGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837700	840423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837700_840400
550788	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550798	contig_7151_pilon	-	2652	6	Intergenic	novelGene_40641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	65.8683535546472	3	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	266	868	12708	5915	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREG	12973	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_6259_6347_6390_12491
550806	contig_14441_pilon	+	1069	5	Intergenic	novelGene_100558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.858083365687	18141	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	454	882	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATVIQPYGRPLQKPLSGPRRLCSGNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111431_112594_112665_116578_116963_117220_117344_117539
550809	contig_1154_pilon	+	2831	12	Intergenic	novelGene_87206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	73.7839150201619	278	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	172	1014	1152989	1167582	TRUE	35	TAAAAAGCCCTCAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTSEREGSGLEVSPSVILEAPPESPPAPTKSPAFDLFNLVLSYKRLEIYLEPLKDAGDGVRYLLRWQTPLCSLLTCLGLNILLLTLNEGAWYSVGALLISVPALLGYLQEVCRARLPESELMRRKYHSVRQEDLQRVRLSRPEAVAEVKSFLIQLEALLSRLCCTCEAAYRVLHWENPIVSSQFYGALLGTVCMLYLLPLCWVLALLNSTLFLGNVEFFRVVSEYRASLQRQMHPKQEESTLESLPPDAGGEGSSAGQHACPHSHRGPHARQCGGGRGG	1151302	1177155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1151473_1152987_1153186_1156378_1156450_1158091_1158279_1163577_1163674_1165445_1165559_1166585_1166724_1167541_1167614_1169233_1169379_1173544_1173592_1173964_1174047_1175643
550810	contig_13760_pilon	-	2380	8	Intergenic	novelGene_61287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	81.0854928014694	726	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	793	1383	167362	164589	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGSREWAAAEASSRQARSYGEKLKELSENGVSEGDWGRAFTVPVVEATSSFNPATFQSLLIPKDNRPLEVGLLQKVKELLAEVDARTLARHVTKVDCLVARILGVTKEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLERFHTMSIMLAVDILGCAGSAEERAALLHKTIQLAAELRGDHGQHVQLRRGHGRSGHGSV	171278	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164594_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851
550814	scaffold_12124_pilon	+	1071	10	Intergenic	novelGene_22212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3082.6448881071	6389	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	291	668	1490385	1508039	FALSE	15	CACGCCATTGGTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473548	1508442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473740_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
550820	contig_9858_pilon	-	3229	19	Intergenic	novelGene_140529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	21	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTCAAATTGAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250417	213537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_213557_215385_215559_216738_216875_223896_223967_224091_224277_227121_227294_230609_230711_232241_232359_233478_233639_234945_235079_236229_236317_237119_237278_237838_237963_239516_239621_240325_240470_242084_242236_246860_246983_248358_248544_249529
550821	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1117	2	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
550822	contig_2455_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_119196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	65	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1621	1920	174001	173702	FALSE	70	AGTCAAAAAAGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNCHGLHQTESSTTRWCPATTTNCSDRGHNRGSRTELEKNVEQNSDSIKKDQPYWPDRDWRNPESMAPRHPFSSLMKSLLRFTPHPTIRQAHKTKRD	177526	173423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_175548_177452
550830	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_96618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550841	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550850	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_17680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
550854	contig_10674_pilon	+	2078	13	Intergenic	novelGene_6436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	207.651199932322	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	800	1945	211824	251342	FALSE	30	AACTTTCTGTGTTCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLNSDEEGEPSGKRKAEDDDKANKKHKKYVISDEEEEDDD	198568	251475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209140_209207_209364_211782_211888_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_241065_241253_243633_243732_251237
550856	contig_15063_pilon	+	1452	4	Intergenic	novelGene_13134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	ACCATGTCTGTGGGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
550859	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550863	contig_3077_pilon	+	1671	10	Intergenic	novelGene_26613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3755.81496145528	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	590	1273	13867	17590	TRUE	40	TGCAGCTGCTCAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9537	18052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_11263_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17648_17711
550870	contig_16113_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_140543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10806	12914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_10800_12900
550875	contig_20819_pilon	-	2396	6	Intergenic	novelGene_55617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGCCCGAACTACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25491	22281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_23307_23423_23641_23796_24001_24172_24651_24806_25031_25243
550879	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
550910	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_17642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
550914	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550920	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
550925	contig_14441_pilon	+	1682	8	Intergenic	novelGene_100366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333.128215801762	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1102	1530	116728	117610	FALSE	55	ACCAAACCAATAAACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23066	117762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_25816_25950_26652_26781_26886_27189_112102_112154_116578_116963_117220_117344_117539
550936	contig_20719_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_140567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATCCAATATGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26506	28332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_26500_28300
550942	contig_4059_pilon	-	1094	4	Intergenic	novelGene_140599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1206.65736644666	43	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	547	849	411176	398089	FALSE	35	TCCCAGGAAAATATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	436406	397843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411263_422301_422662_436306
550954	contig_7815_pilon	+	1743	12	Intergenic	novelGene_134410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_8	66.9763742729016	235	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1737	5	1741	879707	933798	FALSE	25	GTAAGTACTCTTTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMADWVGPLSPGRKARAPGAYSKAAGTKHTRASKQEDASKRKAELEAAVRKKIEFERKALCIVEQLLEENITEEFLKDCGMFITSAHYSDVVDERTISKLCGYPICQKKLGIVPKQKYRISTKTNKVYDITERKSFCSNFCYKASKFFQAQIPKTPVWIREEERYPDFQLLKEGQRMKFPGYRSPPLLHGIEHNGHSGEEVQLRSQAIKMSDIENPGHSEKQYESSSSSTRSDSSSDNEQDFVSSILPGNKPNAAGISPQLHKKSIMRKKAGHKVNPKHNDKEQAIVDVAERLDNCRLDSQEKAAACVLPSQNVNAQISSNNPLQEKLKASENKYSSSEVTLVGISKKSAEHFKRKFAKSNQVSRSASSSVQVSPEVAKTNLLKVLKETLIEWKTEETLRFLYGQNYASVCLKPPSVCLIEAEELDEDDLNSDPVSHPLVLRESQNSLDEALPFRGSDTAINPLPSYENLKKETETLNLRIREFYRGRYVLNEESSMSQDSEERNLTFPLMDSSSQNQIRKRIVLEKLSKVLPGLLGPLQITLGDIYTQLKNLVRTFRLTNRNIIHKSAEWTLIAMVLLS	879702	933800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_879780_880670_880717_890607_890723_891955_892055_892263_892330_893856_893946_909891_909928_910437_910492_911918_912847_914980_915064_918056_918138_933731
550960	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
550970	contig_12566_pilon	+	2265	16	Intergenic	novelGene_86013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	95.5976289803605	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	10	1902	52316	86354	FALSE	35	AATCAAACTTCATTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	52306	86717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
550975	contig_7202_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_17298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCTCATGCAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
550991	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_17222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
550994	contig_15063_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_9527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	35891	35108	TRUE	25	AGTCACATTGCCATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34926_35036_35380_35839_36146_36264
551000	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551010	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551011	contig_1719_pilon	-	2101	9	Intergenic	novelGene_87270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	434.191777904649	11	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	109	1086	382036	353170	TRUE	35	CTCAATTTAAAATTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSRERKSQRKQLGSTPRIKTIRRL	382144	350343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_351057_352093_352276_353049_353233_371636_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
551012	contig_18794_pilon	+	3180	12	Intergenic	novelGene_54645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.628786023258	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	327	1208	145406	166900	TRUE	25	GACAATATATTTGGGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEEDCHSESVRAEDDEKESPAETDLQAQLQMFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISVLPMEVLMYIFRWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRGCIKLVPYTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYNCSKLSE	145079	172948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145409_152183_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_168038_168360_168455_169970_170123_172359
551014	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551026	contig_7286_pilon	-	1068	7	Intergenic	novelGene_108680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4984.33013442016	7362	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	19	585	293122	288662	TRUE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGKQPLYSWCKS	293140	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288674_289226_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
551027	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
551031	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_97465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551082	contig_9098_pilon	+	2172	10	Intergenic	novelGene_75810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	67.3538655897087	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	929	1513	324266	332191	FALSE	10	GCCAGCTTTTTTCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTAHSNHH	295430	332850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_295479_302668_303081_309869_310018_311367_311510_322434_322576_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488_331615_332071
551089	contig_11104_pilon	-	1774	14	Intergenic	novelGene_112461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	76.8100708387157	259	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	161	805	359149	336575	TRUE	30	CAGAAATACTTCTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDMFHRHCEIPSCWGLYYYAVQRTLPRNEYRIDSSIYDCIKRSCP	359309	327126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_327579_329045_329133_331188_331285_334327_334409_334565_334681_335041_335104_336498_336589_336686_336804_337162_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
551102	contig_262_pilon	+	2698	1	Intergenic	novelGene_140608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1938	4636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_+_1900_4600
551118	contig_6726_pilon	+	1433	13	Intergenic	novelGene_86225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	628.771288572668	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	14	1300	287836	333034	FALSE	15	CTTTATTTTATCTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287822	333167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322673_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
551121	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	276	-74	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
551124	contig_7571_pilon	-	2271	15	Intergenic	novelGene_106395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	74.6041594835362	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	96	1817	136475	84922	FALSE	35	TATCAGCAATTGAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWSGETRGPSGSDSDIRAATAENGPAGQIINMHFQGFRLCLGLLLISVNAEFMDDGVEMEDFDENSEEIDVDEDELSSEIKYKTPQPIGEVYFTETFDTGRLAGWVLSKAKKDDTDAEISIYDGRWEIEELKENRLPGDRGLVLKSRAKHHAISAILSKPFIFADKPLIVQYEVNFQDGIDCGGAYIKLLADTDDLNLENFYDKTSYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKHPKTGVFEEKHAKPPDVDLKNFFTDRKTHLYTLVMNPDDTFEILIDQIVVNKGSLLEDVVPPINPPKEIEDPSDRKPDDWDERAKIPDPSAVKPDDWDESEPAQIEDSSIVKPDGWLDDEPKFIPDPTAEKPNDWNEDMDGEWEAPHIPNPACRVGCGEWKPPMIDNPKFKGVWRPPMIDNPNYQGIWSPRKIPNPDYFEDDHPFLLTSFRAIGLELWSMTSDIYFDNFIICSKKEVADHWAADGWSMKIMVANANEPGVLKQLMAAAEDRPWLWLIYLVTAGLPVVLITSFCWPRKVKKKYEDAEYKKTDIGKPQTKGALEQESEEEIEVIEGQEEGNKSNKSGSEDEMKEADESTGSGDGPVKSVRKRRVRKD	148960	84467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_85003_86960_87036_89646_89722_89950_90077_91174_91391_92649_92801_92927_93042_115798_115989_119617_119811_121249_121332_125250_125393_128759_128819_129467_129542_136331_136485_148874
551130	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551138	contig_15304_pilon	-	1430	4	Intergenic	novelGene_30600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	13	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
551144	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551151	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551152	contig_5727_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_7966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATACTTGTATCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177863	180045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_177900_180000
551176	contig_19564_pilon	-	1494	4	Intergenic	novelGene_29642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1329	164	1492	15529	12207	FALSE	30	CTAAGGCAGAGTCCCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEE	15692	12204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
551177	contig_10904_pilon	-	1729	10	Intergenic	novelGene_22786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_6	234.008441337666	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	34	552	773328	759958	TRUE	10	TGCACTTGGTGCTGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTGFPGSFSSSPTTPHSSLVEYQRPQPGGL	773361	757093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759452_759496_759593_759723_759930_759966_768446_768525_769599_769885_772375_772412_773216
551185	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551187	contig_5643_pilon	+	1071	10	Intergenic	novelGene_38869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2549.4558509224	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	63	878	236108	237822	TRUE	15	CAGCCACCTCTTTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	236045	238189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237841_238014
551194	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_16468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551197	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_92015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551204	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
551214	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
551221	SIRV6	+	387	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10438	1	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11438	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
551223	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
551224	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
551231	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551240	contig_1406_pilon	+	2617	4	Intergenic	novelGene_25580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	419.688773577119	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	69	356	2173822	2185207	FALSE	10	CTATTTTAGTTTGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPRETQSSSRRS	2173753	2187468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183859_2185172
551272	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551283	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551287	contig_2596_pilon	-	2657	14	Intergenic	novelGene_53471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	103.680722931953	449	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	111	1226	722501	669421	TRUE	15	CACTGAGTACTTTGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSNSVQLTGCRPMT	722611	662381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675563_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
551290	contig_12864_pilon	-	1420	8	Intergenic	novelGene_76386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	532.63856106622	2221	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	62	604	223293	217842	TRUE	30	ATAATGTATTTGCACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223354	214846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215607_215753_215792_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
551291	contig_11656_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_53963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTTATACTCTGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147699	147984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_147700_148000
551296	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551304	contig_9839_pilon	+	1654	5	Intergenic	novelGene_88499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	1747.00035775612	217	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAAATATTTATTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45322	62459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
551318	contig_4125_pilon	+	1717	8	Intergenic	novelGene_25201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	229.981809396007	72	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	187	807	1507592	1518074	FALSE	5	TCCTGTGTTAGTCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEARRAASSVLLPAALTETVARPRRRCELAQVILLENGRDGISEQQLDSNAHVLNQAALPLMVLCPHWSYRMSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505624	1518984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1507492_1507615_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984
551324	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551325	contig_3602_pilon	-	2249	5	Intergenic	novelGene_60480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	1903	2247	168786	161595	FALSE	10	CGGCCGCAACGCGCGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNSGKSMVPLSASTSLIMSCSSASVGFCPRDLITVPNSLVVIVPSPSLSKREKASLNSGLTHHGEARGVRCAGIKAPLAAAEAAAARAPPSVRASTLTARSARRRRRPPQRSL	171118	161592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_161758_168464_168612_168751_168853_169141_169280_169420
551345	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_91310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
551346	contig_4924_pilon	-	1547	11	Intergenic	novelGene_84692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1199.11779654878	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	22	876	252576	82377	TRUE	10	GTGCCACTGTATTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGNGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252597	65292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69153_74641_74822_82347_82480_127716_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
551369	contig_7356_pilon	-	1832	3	Intergenic	novelGene_60382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	470.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	68	403	457848	433924	FALSE	5	TTGCTTTTTCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457915	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_457767
551378	contig_4103_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_52000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAATTATCATTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223747	223089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_223100_223700
551409	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
551417	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551418	contig_1301_pilon	-	1285	10	Intergenic	novelGene_47337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	928	junction_8	327.286185033191	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	83	1285	322831	279347	FALSE	45	AGGTAATAATGTAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHK	322913	279346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
551420	contig_1996_pilon	-	1791	7	Intergenic	novelGene_131941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_4	240.180082900773	1610	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	399	1358	509912	508421	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRCVMVAVAGSLEPGVGGAGRGPFCLVSRMCLLKALCVPTSVQGPGDLYVTTKSRDPSFIRLQLTPGPTA	511086	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732
551428	SIRV5	+	318	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	880	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
551430	contig_10930_pilon	+	2006	4	Intergenic	novelGene_37089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_3	4888.12993098815	133	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTGTGTTTTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339417	342109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_341625_342020
551439	contig_16103_pilon	-	2496	14	Intergenic	novelGene_118785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	90.1651344993725	15	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	449	2212	570242	563539	FALSE	15	GAGCCCCGGAGGCAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPLRRYSRHIDSSPYSPAYISPPPESSWRRTMPWGSFPAEKGQLCRLPSALNRTSSDSALHTSVMNPNPQDTYPGPTPPSVPPSRRGANSTTSLTDFLDGEADSKVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLPTSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPASVPALPLVMNSGGSLPDLTSLHFPPPLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISGGLGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSNSQPQLQGSHSHPSLPASSWARHALPATSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAHPYPPSTHGASPRHRRVPLSPLTLPAGPADARRSQQQPPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLPTDQRLPPYPYSAPSLVLPTQQPTPKPLQQPGLPSEVCSVQPPGGQPPGRQPHYGTLCPPGSSGHWQQPYHRPANDFSPGTLEQFRMEDPSTSLVLDPSEFSEGPGVLGGEGPVGGLQDPHALNHQNLAHCSRHGSGPNIILPGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSKGLELGLGLEDELHMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEDSFRSDRLQ	573879	563254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_563757_563872_564060_564489_564760_566654_567062_567516_567762_567884_567935_568053_568119_568287_568342_568417_568522_568688_568758_569387_569448_570207_570329_570408_570511_573619
551457	contig_10968_pilon	+	1305	10	Intergenic	novelGene_84294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	368	junction_7	138.73084341119	2223	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	129	1013	166381	177921	FALSE	15	TGCAATTGTGTGCATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTSPSSHGSCSPTLSKSSGLSCEPSGAAAPSGEHQITRGLAMATSGQSCVRPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166045	178213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
551484	contig_12327_pilon	+	1871	6	Intergenic	novelGene_140624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	774.105264159856	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	111	656	168930	171003	TRUE	20	ATTTCATGAGCTTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148614	172351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841_171097_171229
551489	contig_1154_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_87105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381392	379307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_379300_381400
551490	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
551500	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551508	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	6	344	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14414	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
551542	contig_4364_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_3341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGGGTCCTAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
551553	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551556	SIRV2	+	434	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGCTTCTTTGAGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1741	2981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877
551559	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551564	contig_2069_pilon	-	1278	3	Intergenic	novelGene_23485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	7	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509871	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509599_1509699
551570	SIRV7	-	350	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
551576	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_114028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	31	351	14409	13866	FALSE	20	TACTGTCAGTATGGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14439	13865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
551614	contig_6361_pilon	-	735	5	Intergenic	novelGene_24001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	310	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	112	450	420979	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436376	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
551617	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	632	974	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
551648	contig_12624_pilon	-	1587	5	Intergenic	novelGene_61121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	250	555	952979	948779	TRUE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955888	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947954_948216_948842_950590_950768_952913_952985_955644
551655	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551658	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551669	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
551671	contig_17936_pilon	+	2095	9	Intergenic	novelGene_29915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	880.596237997302	3	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	63	698	50646	114818	TRUE	35	AGAAATGCTAAATGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELQFTGDI	50583	130799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95230_114797_114934_118635_118827_121017_121063_129753
551675	contig_15039_pilon	-	1922	9	Intergenic	novelGene_110138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_8	479.916122228666	15	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	426	1154	200602	185257	FALSE	25	CCAGAATGCTCCTTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260901	184488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198673_200448_200620_208401_208526_222093_222255_260778
551685	SIRV7	-	287	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35774	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78840
551686	contig_9332_pilon	-	2353	3	Intergenic	novelGene_60716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86304	80510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_82357_82733_83110_86173
551693	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551698	contig_18272_pilon	-	2914	9	Intergenic	novelGene_6991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	553.30456124995	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	163	1455	262678	122209	FALSE	35	TCAGAAATGATGACACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262840	120749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168621_172662_172796_184338_184551_262660
551699	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_19071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCATGACGACCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
551700	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551712	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551731	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551738	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551748	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
551768	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_90323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551793	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_18932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
551802	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_97016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551807	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551812	contig_10732_pilon	-	2146	13	Intergenic	novelGene_114669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	679	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1292	1630	131217	126744	TRUE	10	CCGCTCGGAACCCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVIPIIFWDLKGFVFYALIQIPQELLGQVPPVVDAAVHGDEPLYRGLVFDIGVMQAGVQHDDGKGQDVTSLPVDWNTPLLHWQYRWANASIIRSIFCASPGNRKLHRNCL	143556	47521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_47621_118289_118375_120068_120134_125783_125851_126162_126285_126665_126747_128086_128207_130564_130711_131147_131262_136406_136485_138572_138646_139287_139443_142615
551813	contig_15063_pilon	+	743	3	Intergenic	novelGene_14258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7060	junction_1	1101.5	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	4	741	34808	36117	FALSE	25	CCCTTCGCCGCTGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHAD	34804	36119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839
551818	contig_5059_pilon	+	2510	1	Intergenic	novelGene_140769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAATGACCCTCTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560815	563325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_560800_563300
551862	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
551868	SIRV4	+	261	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1510	632	1055	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
551877	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_93657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
551895	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
551907	contig_7744_pilon	+	1949	15	Intergenic	novelGene_62531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	83.9307598498881	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	54	1097	825487	829783	TRUE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSEGSFRVTRMRCWRVTSSVSWSRKGKPAGRWVWLTLNFRNGLQGSGREAGRSE	825433	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829581_829622_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
551910	SIRV5	+	258	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	151	145	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
551921	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_16471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551948	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
551959	contig_5711_pilon	+	2298	10	Intergenic	novelGene_80271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	69.115755470956	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	473	1753	87410	122172	FALSE	15	TATCTTTTTAGTGGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	65571	122717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_65771_69855_70102_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_113381_113568_121458_121637_121996
551969	contig_6589_pilon	+	474	5	Intergenic	novelGene_26150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	22	474	1885124	1887805	FALSE	40	AAGAAGCAGTTTCAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGT	1885102	1887805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
551972	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
551980	contig_7293_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_54268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTCTCATTATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336407	338016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_336400_338000
551986	contig_12735_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_140772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAAAGCTTTTAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20294	19472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_19500_20300
552000	contig_7202_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_18710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAACGTCTGGCGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29826	30103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
552006	contig_4103_pilon	-	1987	19	Intergenic	novelGene_51920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	460.779680086098	1899	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	160	1362	91854	80996	TRUE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	92013	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
552030	contig_15063_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_14095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	832	1155	35891	35108	TRUE	25	GCTCTCTGAGGACCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36155_36264_36567_39504
552038	contig_10861_pilon	+	2255	9	Intergenic	novelGene_39393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	385.804354563294	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	114	1136	1907049	1930717	FALSE	40	CTTATTAAACTATGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQVNGNAVQLKEEEEPMDTSSVTHTEHYKTLIEAGLPQKVAERLDEIFQTGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKG	1903774	1931836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1907039_1907206_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1930711
552045	contig_2817_pilon	+	2141	2	Intergenic	novelGene_104351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATACAGTGATTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420835	424229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_421054_422306
552051	contig_1244_pilon	-	1935	7	Intergenic	novelGene_38027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	861.066973779237	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1364	1798	924306	923211	FALSE	45	AAATAGTTTATATGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	929704	923073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924529_924715_927036_927227_928758
552068	contig_15031_pilon	-	2105	8	Intergenic	novelGene_138390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_5	188.574891743091	252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	618	1421	78772	68789	FALSE	30	TTTTGGGAGAGTTCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQPVWKPYPNQDSDLLVLSGTDSELHIPRVCEFCQAVFPPSITSRGDFLRHLNSHFNGKT	161630	68104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68966_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101917_102970_103080_129450_129599_161576
552084	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552088	contig_10235_pilon	+	1546	6	Intergenic	novelGene_46431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.674254072394	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	13	681	210483	212152	TRUE	20	AGTGCTCCTGACAGCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210470	213196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211844_211924_212047_212199_212377
552093	contig_6710_pilon	-	573	3	Intergenic	novelGene_95675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4151.5	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	686967	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IADTAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	686969	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142_657180_686955
552099	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
552101	contig_6227_pilon	+	1546	14	Intergenic	novelGene_49734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGGAAGGACGGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202619	1225020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1203044_1203146_1203215_1203300_1203374_1203567_1203700_1204139_1204219_1204372_1204500_1205856_1206010_1206141_1206185_1206577_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213220_1223785_1223838_1224857
552115	contig_4402_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_140844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGAAGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592653	592368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_592400_592700
552128	contig_776_pilon	-	462	5	Intergenic	novelGene_139936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	125.278689329032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	122	433	911734	834774	FALSE	25	TCCAGGTACTATGGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSGGLATTLQTECILEQTYGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRCQWVMFG	932095	834744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_834799_861796_861886_863749_863884_911670_911784_932023
552144	contig_7695_pilon	-	2308	14	Intergenic	novelGene_41606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	27.8429662433938	16	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	719	1918	514753	504301	FALSE	20	ACCACCATCTTTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525580	503910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_521058_521203_521999_522090_524166_524442_525015_525168_525549
552155	contig_7562_pilon	-	2229	12	Intergenic	novelGene_140881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	108.958176827261	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	82	1122	143632	129780	TRUE	15	TGGAGAATTTCTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGACEGEQVTLSPPIHLLERPASRHIMKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIKISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVYLYWVVFAIKTKTFFHSTFGT	143713	125585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_125802_126240_126320_128841_129030_129155_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_141978_142093_142214_143084_143180_143566
552158	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
552167	scaffold_9100_pilon	-	1740	11	Intergenic	novelGene_83297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	331.861657923901	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	473	1492	784035	746337	FALSE	25	ATAAATTTCCTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPNVSASYPPYQATGPPNTSYMPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	796528	746088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274_749478_768983_769076_774460_774528_777866_777994_781780_781945_783998_784065_786207_786293_789318_789594_796445
552181	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
552183	contig_4301_pilon	-	2187	5	Intergenic	novelGene_65112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	398.221044145083	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	441	698	543732	539500	FALSE	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKEVGGAAAVCCAVSALWRLCLHLGVCVPRLPPRQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNEMD	575650	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_547294_547521_575543
552187	contig_12427_pilon	-	1590	5	Intergenic	novelGene_40535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1368.05290467876	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	211	597	522337	505932	TRUE	20	AGATCATCTGATTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQVTRKQRWSCTMNSPNPSSWTRMTGPRPRRKAAVAEGAVRVEHRVLHKPRTHLGLQTQAPLASSKQNIN	578162	504674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505039_505302_506135_520308_520440_522284_522346_577960
552210	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552213	contig_13217_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_140896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAGATCACTCAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26865	26251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_26300_26900
552217	contig_11498_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_65489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTGTTTTTGCTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16525	17778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_16500_17800
552218	contig_13740_pilon	+	1782	6	Intergenic	novelGene_34729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	959	junction_1	125.450229174761	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	80	631	167703	176906	FALSE	15	CTTTATGTGGTTAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	166432	178057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_167674_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
552237	contig_14322_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_116458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671372	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
552244	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
552250	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552260	contig_7202_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_16417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTGATGGATTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27621	27892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
552261	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
552262	contig_3122_pilon	-	2367	12	Intergenic	novelGene_64387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_11	148.500994793117	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	583	2040	276393	258279	FALSE	45	GTAAGAGCAATATTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQADTSAQWQCPSAVSVEY	277563	257951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258329_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277007
552267	contig_5084_pilon	-	2534	8	Intergenic	novelGene_64554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258.102890415463	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	108	695	580023	533474	TRUE	30	AAAATCACGTGTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPFLTPTLSFSFSFLPSFAVASAAAAPRGTPDSGMGSRASTLLRDEELEEIKKETGFSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580130	531590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_532832_532875_533528_533674_533798_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579956
552291	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
552297	contig_14890_pilon	-	1881	9	Intergenic	novelGene_122523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_8	1192.27660381306	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	524	1339	370199	366814	FALSE	0	TGCTTTTGTCTGTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371244	366271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370322_370689_371106
552316	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
552319	contig_12357_pilon	+	1751	10	Intergenic	novelGene_6120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	777.330045733471	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	456	1190	34261	53235	FALSE	30	AGCTTGGAATTGATCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25964	53796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29637_34201_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
552326	contig_7202_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_18654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGAGGCCTGGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
552339	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
552371	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
552375	contig_14536_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_69298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTATACATACATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98677	97895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_97900_98700
552376	contig_1230_pilon	+	1338	8	Intergenic	novelGene_28870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1360.5938679376	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	326	1318	405792	408754	FALSE	20	CTTAGCATTGTTCCACGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGPRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404489	408774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405809_406776_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
552399	contig_165_pilon	+	2483	13	Intergenic	novelGene_117059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	311.457148827179	836	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	870	1715	60284	71673	FALSE	5	CCTTGTGGAGTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVFFSEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	44806	72441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60140_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
552416	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
552424	contig_9150_pilon	-	1966	4	Intergenic	novelGene_140903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_3	80.6570242170857	405	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	433	1302	47776	46907	FALSE	15	TCATTTGCAGTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRKQGSQTRGQQSAEEDNFKKPTRSNMQRSKMRGAASGKKTAGPQQKNLEPALPGRWGGVALQRTPPSGSVRKTRKNKQKTPGNGDGGSTSEAPQPPRKKRARADPTVESEEAFKNRVEVKVKIPEELKPWLVEDWDLVTRQKQLFQLPAKKNVDAILEEYANCKRSQGNVDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILMAHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLGYLHDFLKYLAKNSAALFTASDYKVASAEYHRKAL	59321	46242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47801_49153_49253_57679_57770_59102
552425	contig_11505_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_140938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305423	305648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_305400_305600
552435	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552437	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
552439	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
552447	contig_8829_pilon	+	3050	1	Intergenic	novelGene_140944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGGGTGCCTTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7815	10865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_7800_10900
552467	contig_11752_pilon	+	1384	9	Intergenic	novelGene_37575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1350.74997108088	4	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	601	1098	92915	105616	FALSE	35	ATATAAAGATGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84083	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87480_88731_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
552474	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
552484	contig_15031_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_138404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTATGTGTATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86561	83473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_83500_86600
552485	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552495	contig_5643_pilon	-	2245	7	Intergenic	novelGene_39169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	59.9295883145843	27	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	62	1393	784100	772569	FALSE	15	TTGTGCGTACCTGTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPRNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVENNMQQQSVCHGDSGSVYVVWDDCAHHWVATGIVSWGIGCGKGYDFYTKVLNYVDWIKRVMEGKD	784161	771716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_773090_773140_773342_775224_775288_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
552500	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552505	contig_7051_pilon	+	2033	12	Intergenic	novelGene_64282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	154.12230841255	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	134	985	184159	206198	FALSE	25	ATTTGGAGTCATAGGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAAAERSRADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184025	207246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
552509	contig_5967_pilon	+	1893	7	Intergenic	novelGene_44349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACAGGCATTCTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387546	465494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_388933_389231_389308_403378_403477_412505_412604_423962_424057_430709_430760_465403
552517	SIRV6	+	1079	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3327	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
552522	contig_12894_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_140956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATTAGAATCAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101352	101048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12894_pilon_-_101000_101400
552526	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	211	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
552537	contig_8773_pilon	+	3197	1	Intergenic	novelGene_74506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6891	10088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_6900_10100
552544	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552545	contig_12327_pilon	+	2038	5	Intergenic	novelGene_140618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	620.554993534014	2651	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	142	687	168930	171003	FALSE	15	TCATGAGCTTTTCAGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148583	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841
552553	contig_7202_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_18642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
552566	contig_15120_pilon	-	1814	5	Intergenic	novelGene_107990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	294.098941684597	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCGTGTGAAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116208	90908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_92296_99853_99957_107823_107943_115269_115339_116072
552571	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552577	contig_9833_pilon	+	1851	12	Intergenic	novelGene_68527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	449.135790911486	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	48	692	230823	250134	TRUE	10	TGCTCTTCACTCCTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAATACALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPVIPAPDASMEIGPSLGNWQRGCDEGS	230775	260328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249501_250057_250151_251791_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
552587	contig_14925_pilon	-	943	4	Intergenic	novelGene_55170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
552590	contig_8538_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_4964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842805	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
552596	contig_16098_pilon	-	1494	5	Intergenic	novelGene_46073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_3	58.3282735900867	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	817	1167	446699	445488	FALSE	15	AAATGGTTTTCGGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	448382	445160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668_447062_447714_447817_448030
552601	contig_1107_pilon	-	3726	5	Intergenic	novelGene_126528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	401	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	3279	3725	96101	35615	FALSE	15	GGGTACATGTTGGACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHITCSIAWITSNHGLRPAIDFVVAQLPVTVADQVVHAAHEQPNGFAAGLFALDPGDLISTDVLGRVALLADQLPVRELARVVQGPHLLADLLAGLLAQKVVHHTDAVLVHARHDVLQRQLQRRQRLRLPVGPQAAAVAQPLAGGVAR	106664	35613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_36012_96051_96172_99803_99947_102539_102604_103663
552619	contig_14341_pilon	+	891	6	Intergenic	novelGene_111837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2244.17040351218	284	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	226	840	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547956_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
552633	contig_10197_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_115191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAGAACTGCTGGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517827	517578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_517600_517800
552634	contig_10197_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_115190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTCAAATGGTCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517275	515699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_515700_517300
552647	contig_6546_pilon	+	451	4	Intergenic	novelGene_140988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	65	409	597703	599657	FALSE	15	GCTGTTGATTTTACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597638	599699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
552652	contig_3700_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_138067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	515	961	146485	146931	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLYRVPFLVLEWPNLKLKKPPWVHMPSAMVVYALVVVSYFITGGIIYDVIVEPPSAGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSDAPNIPKLNRFLLLFIGFVCALLNFFMARVFMRMKLPGYLMG	145970	148230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_146000_148200
552668	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552679	contig_4364_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
552685	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552687	contig_15304_pilon	-	983	4	Intergenic	novelGene_30450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1616.44610179245	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	179	940	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEATTFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISTPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54278	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53308_53500_53687_53728_53813_53991
552688	contig_8330_pilon	+	2677	1	Intergenic	novelGene_71888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGAGACTCCATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063427	1066104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1063400_1066100
552693	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
552700	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
552703	contig_18420_pilon	+	1772	15	Intergenic	novelGene_109345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	52.221857961773	499	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1686	86	1771	92356	103385	FALSE	15	CTCTTAGGAGGAGCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSPVVPQLVKKEKKKNKKDKKAKAALESGGELGDARKRESDSESDKETSQAVPQLVKKEKKNKKKDKKDKKAKAALESGGEPGDAVCISPSTFRVLWARLVLGQGNNCPDGDGFL	92270	103386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101756_102633_102775_103145
552704	contig_6533_pilon	+	832	3	Intergenic	novelGene_114617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	30	TGTGCTGAAATTTGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
552710	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_18485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552715	SIRV6	-	429	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGCGCGCGATGCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
552738	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
552752	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
552758	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	493	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
552759	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_16423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552791	contig_16622_pilon	-	1757	10	Intergenic	novelGene_48419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	505	junction_4	1037.8358894032	1404	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	725	1588	115540	108374	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	121964	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
552794	contig_9471_pilon	-	1965	6	Intergenic	novelGene_21816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417221	412437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412830_413721_413828_413916_414934_415628_415714_416192_416271_416934
552797	SIRV4	+	326	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1445	632	990	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2445	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
552798	contig_15859_pilon	-	2176	7	Intergenic	novelGene_50199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	152.690318400786	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	186	1325	349672	342417	TRUE	30	AAGCTCAGATCTGCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRPGRPVAVLASAVLSRIDHLSGGQQLPGVRAAAYEIKPGEVNEPLERATDGEIVFLSSEMYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTEIQPKIIGQAYPHKRRFILVLPGVIQSEKQRKCP	352969	340501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_342354_342521_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352816
552832	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_18425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
552833	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
552837	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
552855	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552868	contig_2209_pilon	-	1869	10	Intergenic	novelGene_141024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_6	227.252673862768	592	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	320	1372	275996	258117	FALSE	15	GCAGTGATTTATTTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRQTPLTCSGHTRPVVDLAFSGITPYGYFLISACKDGKPMLRQGDTGDWIGTFLGHKGAVWGATLNKDATKAATAAADFTAKVWDAVSGDELMTLAHKHIVKTVDFTQDSNYLLTGGQDKLLRIYDLNKPEAEPKEISGHTSGIKKALWCSEDKQILSADDKTVRLWDQATMTEVKSLNFNMSVSSMEYIPEGEILVITYGRSIAFHSAVSLDPIKSFEAPATINSASLHPEKEFLVAGGEDFKLYKYDYNSGEELESYKGHFGPIHCVRFSPDGELYASGSEDGTLRLWQTVVGKTYGLWKCVLPEEDSGELAKPKISFPETTEEELEEIASENSDSIYSSTPEVKA	276315	257619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_258179_262341_262408_262852_263003_265205_265343_265496_265635_266280_266378_268909_268983_270026_270109_275103_275240_275884
552874	SIRV4	+	411	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-905	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTGACGGACGCGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
552918	contig_11601_pilon	+	1878	5	Intergenic	novelGene_141029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	291.740038390345	3107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	66	392	92987	98821	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALETVPKDLRHLRACLLCSLVKTIDQFEYDGCDNCDAYLQMKGNREMVYDCTSSSFDGIIAMMSPEDSWVSKWQRVSNFKPGVYAVSVTGRLPQELFLLLPQESCGS	92921	100307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_93056_93789_93897_97845_97902_98165_98220_98780
552926	contig_3817_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_78323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1083	junction_4	206.766172281638	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	38	667	178717	204532	FALSE	35	GGGGCAAACCAAGCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWGITAGLDPEMALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178679	205418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
552949	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552964	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
552965	contig_15087_pilon	+	2351	4	Intergenic	novelGene_37283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	1081.0698404821	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	2	556	284677	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLIALGLLLVGPAAPARVLLIQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284675	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289300_289451_301237_301421_301788
552966	contig_6735_pilon	-	1587	11	Intergenic	novelGene_15659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1160.72958091021	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	278	1225	554315	542464	TRUE	30	TGAGCTAAATAGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568265	541980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542290_542410_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_554243_554364_564153_564232_564784_564869_568198
552976	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
552997	contig_11285_pilon	-	1541	12	Intergenic	novelGene_5543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_11	294.66122864982	1055	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	139	1218	744458	741540	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745460	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
553001	contig_16846_pilon	-	1247	4	Intergenic	novelGene_82959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	99	617	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558748	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
553007	contig_4213_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_124833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGCAAATAGCACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185356	182895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_182900_185400
553018	contig_7695_pilon	-	3312	2	Intergenic	novelGene_41578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	0	102	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	840	2654	391400	388811	FALSE	20	TGGAAACCTGGTTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYSSGEGVGGLVIAGNSLVLSCVQFGSHQVACPAPLIANPLSAALSDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	392239	388152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793
553027	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
553041	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553044	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553060	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
553073	contig_8558_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_123168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTGTGACTGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563032	562242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_562200_563000
553081	contig_11378_pilon	+	3560	1	Intergenic	novelGene_112240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341311	344871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_341300_344900
553090	contig_11328_pilon	-	924	6	Intergenic	novelGene_88386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28648	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCCGCTCAGCCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648038	643638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_643687_644248_644381_644803_645014_645225_645462_647063_647221_647897
553104	contig_10299_pilon	+	2139	18	Intergenic	novelGene_79703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	103.427857946048	11	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	39	1379	320559	337096	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYP	320520	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337097_338728_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
553106	SIRV5	+	330	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
553143	contig_1275_pilon	+	918	2	Intergenic	novelGene_108859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	87	776	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746775	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746856_747272
553148	contig_14322_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_115982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATCTCAAAGCCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671357	671618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
553153	contig_14273_pilon	+	2073	8	Intergenic	novelGene_21147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_1	471.402380224827	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	311	2041	128229	151187	FALSE	30	ATTATGTAGAGCACATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127918	151219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
553174	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
553200	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
553213	contig_12873_pilon	+	1679	5	Intergenic	novelGene_27154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1313.55954851693	5	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	407	1108	16357	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVELKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15950	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_18984_19264_19611_19703_19851
553226	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553234	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_18103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
553235	contig_15991_pilon	-	2906	3	Intergenic	novelGene_70951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	44	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	102	824	182356	169604	FALSE	75	AGAAAAAAACAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYTLQPNVTETDYYYPDVFSSPCDGELIQRGSNFLLAIFYCFLFVFSLLGNSLVILVLITRKKLKSITDVYLLNLALSDLLFVLSFPFLTHYRLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFFSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYAMKVRTASVGTALSLVVWLTAITATSPLLVFYQVASEDGSLQCYSSYNQQTLKWKIFTYFEINILGLLIPFTILIFCYISILHQLRGCQNRNKTKAIRSLL	183492	167521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_169617_181646_182371_183405
553244	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
553252	SIRV4	+	304	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	194	452	194	-452	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTCTTCAAATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	2319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
553262	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
553272	SIRV4	+	332	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	917	-67	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGTCAGGTTAAGACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2372	2704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
553274	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553298	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
553301	contig_2078_pilon	-	2354	11	Intergenic	novelGene_100177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	79.4647091481495	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	72	1532	535379	521750	TRUE	15	CTGTATCTGAGGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTGNAFQEHRRSRWGAA	535450	505005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_521684_521793_529451_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
553307	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
553315	contig_12050_pilon	-	1608	6	Intergenic	novelGene_62690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	78.3464102559907	1530	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	139	1089	619215	615621	FALSE	5	GCTTCCGCCCTCTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659702	615101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617366_617771_617890_619129_619256_659604
553323	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
553329	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
553336	SIRV6	+	391	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10434	1	1197	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11434	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
553358	contig_15063_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_14059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	193	1368	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34615	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
553368	contig_6929_pilon	+	1310	9	Intergenic	novelGene_139378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5622.67398574735	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	531	911	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101622	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101669_101861_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
553370	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_94888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
553374	contig_15410_pilon	+	1769	3	Intergenic	novelGene_130605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	271.5	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	167	703	145617	147258	TRUE	40	GATAAATTTCAAGCATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPALPASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSVRRGLTLARLGEAPGNWDCQVGFGCLCPSSRTSQDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVKAGRQLQGTGRGVHRSRGHISLYFW	145450	148553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_147842_148070
553375	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553395	contig_9955_pilon	+	2121	8	Intergenic	novelGene_21378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	58.5149553533112	415	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	632	1219	574800	580436	FALSE	15	GATTGCATTTGCTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAASASLTPDFLSPGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDLNRSLLKEEDPAVLISEVLRRKFALKEEDITRKGN	567654	581338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_567673_570756_570897_571397_571503_571634_571841_574376_574487_574747_574960_576188_576511_580330
553437	contig_12638_pilon	-	2308	13	Intergenic	novelGene_33060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_12	39.9057918380556	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	437	1624	77522	19895	TRUE	45	AGCTTCATATATTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPSIAPTAVDSNSKTLQPITLELRRRKISKGSEVPLKRPRLDKNSSQEKSKNYSENTDKDLSRRRSSRLSTNGTHEILDPDLVVSDLVNAVDADPLQDTSSSAKESEEGHLKSPLKAGQVSSALTCHSLGDGLGATGLELNCKSMGENAMKTEPASTLAELQDISTVTVTNTFKKTGDFVTSKAPAVDLDHKFRCKVVDCLKFFRKAKLLHYHMKYFHGMEKSPEPEESPGNRHVQTRGSSSSDKASQDSLARKRVSASSPTAKDKEKNKEKKFKEFVKVKPKKKKKKKKKAKPECPCSEEVSDTSQEPSPPKTFAITRCGTSHKPGVHMSPPLHGSESGNHKGKGKVSEEDNLSESSSESFLWSDEEYGQDVDVTTNPDEELDGDDRYDFEVVRCICEVQEENDFMIQCEECQCWQHGVCMGLLEENVPEKYTCYVCQDPPGQRPGFKYWYDREWLSRGHMHGLAFLEENYSHQNAKKIVATHQLLGDVQRVIEVLHGLQLKMSILQSREHPDLQLWCQPWKQRSGGGTISFQTHPCC	83571	13109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_13305_17613_17798_19589_19992_23907_24104_26723_26824_38673_38853_39796_39962_40654_40754_51872_52152_77449_77630_78343_78533_79439_79554_83545
553442	contig_7202_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_17721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTCACGTAGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
553455	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
553458	SIRV4	+	164	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1129	23	-1129	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGCAGGTCGTCAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
553465	contig_12773_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_122132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGTCCACACAGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7720	9466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12773_pilon_+_7700_9500
553469	contig_7457_pilon	-	2021	5	Intergenic	novelGene_31616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	82.8986580108508	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	43	1305	962606	956489	TRUE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLQRRRRRSPFLIMNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962648	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955911_956266_956939_958234_958375_960225_960896_962603
553477	contig_5643_pilon	+	1759	5	Intergenic	novelGene_38729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	266.426701927566	529	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1066	1398	156118	156948	FALSE	5	CTGCAGCTGTCCGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYP	152153	157309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823
553487	contig_9548_pilon	-	2832	14	Intergenic	novelGene_141063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_11	67.2544404728313	59	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	140	2143	163089	142966	FALSE	30	CCAGTAATTGTTTATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSHMDEYKNSSNGSTGNSSEVAVEHSADFSTEIMNVTEMEQSPDGSPNVNATTEENEMANAVDLPVTETEANFPPEYEKFWKTVENNPQDFTGWVYLLQYVEQENHLMAARKAFDKFFIHYPYCYGYWKKYADLEKRHDNIKQSDEVYRRGLQAIPLSVDLWIHYINFLKETLDPGDPETNSTIRGTFEHAVLAAGTDFRSDRLWEMYINWENEQGNLREVTAIYDRILGIPTQLYSHHFQRFKEHVQNNLPRDLLTGEQFIQLRRELASVNGHSGDDGPPGDDLPSGVEDITDPAKLITEIENMRHRIIEIHQEMFNYNEHEVSKRWTFEEGIKRPYFHVKPLEKAQLKNWKEYLEFEIENGTHERVVVLFERCVISCALYEEFWIKYAKYMENHSTEGVRHVFSRACTIHLPKKPMVHMLWAAFEEQQGNINEARNILRTFEECVLGLAMVRLRRVSLERRHGNMEEAEHLLQDAIKNAKSNNESSFYAIKLARHLFKIQKNLPKSRKVLLEAIERDKENTKLYLNLLEMEYSGDLKQNEENILNCFDKAIHGSLPIKMRITFSQRKVEFLEDFGSDVNKLLNAYDEHQTLLKEQDSLKRKAENGSEEPEEKKAHTEDTTSSSTQMIDGDLQANQAAYNYSAWYQYNYQNPWNYGQYYPPPPT	181127	142276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_143023_143282_143404_143639_143715_146521_146707_147553_147823_148184_148312_148621_148787_149467_149576_150055_150222_156088_156257_161422_161542_162194_162321_162771_163123_181021
553493	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553494	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553500	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
553504	contig_7412_pilon	-	1796	7	Intergenic	novelGene_76318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1280.84066360947	7	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	250	1452	375758	364543	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMASLWPAP	377131	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364566_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_376924
553507	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
553513	contig_5988_pilon	-	1589	5	Intergenic	novelGene_15936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.537526451696	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	96	1415	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFMFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653580_653615_653773_655456
553517	SIRV4	+	173	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1587	643	1132	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
553525	contig_21013_pilon	+	2379	10	Intergenic	novelGene_38514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	465.69297892204	36	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	123	1682	19282	85337	FALSE	15	TTCAGGACTGCTGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPELMNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEHGKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSNGELFSSASQPAVELFSGSQPALGPPSAASNSSDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSQSNMLPVRPQTNPLMGGPMPVSMPNVMTGTMGMAPLGNTPVMNQSMMGMNMNIGMSSPGMGLSGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFTNFNK	19159	86034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_19323_55721_55827_56372_56470_58356_58466_59403_59569_62439_62618_69125_69279_82017_82232_83994_84146_84990
553532	contig_6823_pilon	-	2974	3	Intergenic	novelGene_131233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	26.5	12	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCTACTATATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325541	316679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_319408_320648_320750_325396
553538	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
553559	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553579	contig_15304_pilon	-	709	3	Intergenic	novelGene_30481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	259	666	54039	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSITQAHRRPRCPAKFQAAPLYATELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53258_53785_53813_53991
553584	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
553592	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553596	SIRV4	+	366	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	153	431	153	-431	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGCTCGTCATGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608	2340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
553604	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553617	contig_10058_pilon	+	1920	13	Intergenic	novelGene_67691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.476583680325	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	309	1241	50283	53244	FALSE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48241	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_48937_48994_49049_49125_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
553642	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553647	SIRV6	+	419	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10329	2	1179	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11416	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
553657	contig_3575_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_141110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACATTGGTTACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421220	420391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_420400_421200
553658	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
553660	contig_5954_pilon	-	1728	13	Intergenic	novelGene_28697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	326.973357307425	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	950	1366	948112	947124	TRUE	10	GGCATCTCCTACTTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKEAVRWSPMSMSQARSSASNSWCHHLRA	960581	946232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_946335_946673_946908_947097_947207_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_949407_949467_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
553662	contig_16303_pilon	-	1540	8	Intergenic	novelGene_34104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	126	1217	45428	35759	TRUE	30	AAAGCCATCCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45553	33141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33205_35498_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
553664	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
553667	contig_15063_pilon	+	1673	7	Intergenic	novelGene_11887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	227	1462	34808	39515	FALSE	25	TAGGCACTTGTGGCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27142	39726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
553680	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
553690	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657510	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVSAEGPKWTSNAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653874_657471
553691	SIRV4	+	359	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	156	435	156	-435	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCAATTGCTCGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1611	2336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
553700	contig_13592_pilon	-	370	3	Intergenic	novelGene_33688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAAACCAGCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246763	221701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_221794_234296_234406_246594
553703	contig_7202_pilon	-	158	1	Intergenic	novelGene_16431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27780	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
553726	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553753	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
553754	contig_19685_pilon	-	2528	6	Intergenic	novelGene_141135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	61.699270660195	142	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	163	840	133618	122061	FALSE	20	ATCTTGGTTAAGAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGETESPGPEKCGPYISSVTSRSVNLMIRGVVLFSIGVFLALVLNLLQIQRNVTLFPPDVIASIFSSAWWVPPCCGTASAVIGLLYPCIDKHLGEPHKFKREWSSVMRCVAVFVGINHASAKVDFDNNIQLSLTLAALSIGLWWTFDRSRSGFGLGVGIAFLATLVTQLLVYNGVYQYTSPDFLYVRSWLPCIFFAGGITMGNIGRQLALYECKVIAEKSHQE	143937	120372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19685_pilon_-_122103_124014_124115_124291_124459_127587_127713_133374_133751_143907
553756	contig_15063_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_9235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27127	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
553781	contig_17144_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_29110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	479	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	38	1096	5087	10337	FALSE	55	TATAAAAGCAAAAACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKSIKFL	5049	11208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_10321
553782	contig_16098_pilon	-	1583	8	Intergenic	novelGene_46112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2109.44832714574	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	773	1375	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460274	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_456992_457089_457182_457557_457907_458405_458618_458704_458838_460148
553789	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553800	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	636	973	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
553822	SIRV7	-	298	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91628	0	-91622	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAAACTAGTAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
553828	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553833	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553842	contig_3602_pilon	-	1490	9	Intergenic	novelGene_60652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	293.834881353457	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	260	835	1113579	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139537	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1139295
553845	contig_5549_pilon	+	1574	7	Intergenic	novelGene_81645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAATGGCGCCCACGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441965	445635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_442534_442878_442938_443120_443682_443957_443989_444483_444755_444949_445002_445603
553882	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
553887	contig_15063_pilon	+	1500	4	Intergenic	novelGene_13912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	34808	36661	FALSE	40	AATATCAGTTCACAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
553888	contig_6980_pilon	+	1848	9	Intergenic	novelGene_36008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	119	1015	356720	372790	FALSE	45	TTTAATGTAAAAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346064	373623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
553890	contig_5317_pilon	+	640	3	Intergenic	novelGene_76521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	330.5	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33690	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35395_43259
553903	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
553927	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
553939	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
553955	SIRV4	+	245	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	6	-1065	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATTTCCAGTACCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
553958	contig_3132_pilon	+	2666	15	Intergenic	novelGene_127408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_7	41.9759406307558	340	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	404	1525	13928	23874	FALSE	15	TTGACTTTGACCCCTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVYKSPEYESLGFELTVERLVSIGYPQELLGFAYDSTFPTRGLVFDTLYGNLLKVDAYGNLLVCAHGFNFIRGPETREQYPNKFIQRDDTERFYILNTLFNLPETYLLACLVDFFTNCPRYASCDTGFKDGDLFMSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMPHESTVEHTHVDINEMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	7465	25015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_7589_8405_8502_12587_12680_12806_12865_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953_23131_23628
553960	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
553964	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_17722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
553965	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
553974	contig_11292_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_109454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATTCAGGATTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383200	384407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_383200_384400
553996	SIRV4	+	180	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1591	632	1136	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2591	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
554004	contig_8616_pilon	+	1678	12	Intergenic	novelGene_72480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	600.008236858062	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	327	1592	320431	330805	FALSE	0	CCTGCCTCTGCGCCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGAGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGEGHLELLPGWSGEEAEPQRKQHWAVVF	318082	330891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330461_330546_330638
554009	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
554030	contig_8772_pilon	+	1508	8	Intergenic	novelGene_21084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4888.68059074914	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	143	772	15355	19024	TRUE	55	GGTAACTTTTAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQV	15212	22055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16615_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966
554039	contig_17158_pilon	+	2618	1	Intergenic	novelGene_141159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACCTTAGCAGTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191787	194405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_191800_194400
554057	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
554059	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554083	SIRV4	+	300	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	199	451	199	-451	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTCAAATTGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
554087	contig_2892_pilon	+	1816	7	Intergenic	novelGene_119013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	1245.45034246876	17	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	180	854	265084	338543	FALSE	10	CAGTTTTTGCTGTAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVAAAAAAVIAAGGQRLAREQRRPSRPTEARPPRLPGPPRPQRPLTSLAPSPSSASGCAMALAAAALAAVEPACGSRYQQLQNEEELGEPEQAGSDAPPPYSSISTESAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRAFSCFSEDLSIMQKFGRCQKLSQISPGPEFSLFIKDVFWQRPSCIYEFSLKKQENTCRK	264904	339505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265147_305212_305301_318539_318671_324764_324853_325763_325889_331706_331813_338469
554088	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
554089	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV705	2462	5	0	146677	0	-91645	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTGAATTAGCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147925	147682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
554096	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
554115	SIRV6	+	261	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	20	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11028_11109_11205
554119	contig_14925_pilon	-	1033	5	Intergenic	novelGene_55203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCAAAGGCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46441	25800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29861_46378
554159	contig_6063_pilon	-	2081	16	Intergenic	novelGene_27585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	507.373480671673	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	71	1087	70243	26550	TRUE	30	GAAATTATGATTTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAGNSTEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKAK	70313	16765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_26493_26558_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48353_52941_53066_70135
554167	contig_13850_pilon	+	2884	4	Intergenic	novelGene_141167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	55.7275116576683	288	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	106	708	43241	49064	FALSE	45	AACACAAAAGACATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAAELGRAEGGSGENSPSPSSSLPSPLSDPRREPMNIYNLIAIIRDQIKHLQAAVDRTTELSRQRIASQELGPAVDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQITTLRTVLKANKQTAEVALANLKSKYENEKAMVTETMMKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFATRCDEYITQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNSLLRMAIQQKLALTQRLELLELDHEQARRGRTKATPKAKPSTPSL	43135	51240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_+_43475_44313_44466_46851_47063_49058
554176	SIRV2	+	617	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	-21	-73	21	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTAACCTGGAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
554188	contig_11386_pilon	+	1836	6	Intergenic	novelGene_82770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	317.487007608185	50	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	645	1274	17940	20925	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	11059	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_11416_13558_13752_17844_18037_19625_20050_20816_21022_31990
554195	contig_14441_pilon	+	867	6	Intergenic	novelGene_100422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.906497713021	194	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	9	680	81887	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLCTSVPAALFWCVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81878	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_82331_82353_112089_112154_116578_116963_117220_117344_117539
554197	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
554207	SIRV6	-	201	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGACCATTCATGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3163_10722_10825_11035
554209	SIRV2	-	622	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	34	3076	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
554216	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554219	contig_14322_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_116453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
554226	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
554237	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
554244	contig_3077_pilon	+	1337	9	Intergenic	novelGene_26612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3324.50708517443	115	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	141	1055	9676	17801	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTEVGWGYGTARASGPAR	9535	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16298_17750
554254	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
554259	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
554270	contig_14322_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_116185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
554293	contig_10197_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_115197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGCTAGAAAATGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557744	558892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_557700_558900
554294	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554326	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
554328	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
554330	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554333	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554341	contig_4125_pilon	-	2417	16	Intergenic	novelGene_25070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	23.505649439136	38	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	326	1936	469722	455361	TRUE	5	CCTCTGCGCTTTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIRVTPLGAGQDVGRSCILVSIAGKNVMLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTPPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPDAKKPRLLQGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDARKEQETVMRVYSHLKR	470047	454764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_469694
554342	SIRV5	+	380	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	878	-53	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
554345	contig_1516_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_50022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1226	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	796	1191	363302	363697	FALSE	30	CAACAGCTGAAGCACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLHPSKGRVRGAGLEAPSIFNARGHHLPLLCVLHSVPVENGCPENAQPGPGAWRQQEQGLRAGGSGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	361819	363719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_362299_362985
554353	SIRV4	+	259	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	635	1054	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
554354	contig_16098_pilon	-	2067	19	Intergenic	novelGene_45881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	54.2281417533802	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	487	1803	253301	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	255478	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169_255281_255428
554357	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
554361	contig_14871_pilon	+	1640	4	Intergenic	novelGene_63722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1075	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCATGTACTCTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287301	299872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_288651_289460_289617_291317_291380_299799
554362	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
554379	contig_14341_pilon	+	675	6	Intergenic	novelGene_111830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2244.17040351218	15	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	10	624	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547737	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547746_548756_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
554395	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554397	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
554399	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTCAACCGCCAGATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554409	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
554415	contig_7202_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_17723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTCACGTAGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
554425	SIRV4	+	207	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1564	632	1109	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
554487	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
554491	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554504	contig_8712_pilon	-	1854	3	Intergenic	novelGene_58808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1220	1768	321940	315053	FALSE	55	TAAAAACAGAAGACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVWRFVTFDDGPLEREDHLNRTSTRVGLGESWKGLLSAHGRLHVGRVLQTLVGAQESFAVGTVVVHILQGVHAEGDEAAARHAPQQAQASAGEPGEGTSIVGEPRHDHLVAGGTAHLDRAVEKRDGLLHIHGLHGNWHWRWGRAPAACSTRVDSCPSRRDPTRAPWSAQARVLVAWGSNC	323159	314966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_315186_318061_318221_321683
554512	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
554519	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
554532	contig_9014_pilon	-	2239	11	Intergenic	novelGene_106726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	85.5268378931432	446	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	73	1680	50592	41867	FALSE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTMKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51621	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51551
554538	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
554540	contig_2062_pilon	-	3355	2	Intergenic	novelGene_139029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	196	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	94	1209	1183461	1174155	FALSE	60	AAAAAAAAAGTCAATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LICSFGRPVDLEKDDYQKVVCNNEHCPYSTWMHLQCFYEWESSILVQFNCIGRARSWNEKQCRQNMWTKKGYDLAFRFCSCRCGQGHLKKDTDWYQVKRMQDEKKKKSGLEKNTGKPLAEAVEEVKKCRPQNKPQKGLNHDLPRRHSMDRQNSQEKAVSAVAYGARSPCASPGQSPPTGYSILSPAHFSGPRSSRYLGEFLKNAIHLEPHKKAMAGGHVFRNAHFDYSPAGLSVHRAGHFDAPVQFLRRLDLSELLTHIPRHKLNTFHVRMEDDAQVGQGEDLRKFILAALSASHRNVVNCALCHRALPVFEQFPLVDGTLFLSPSRHDEIEYDVPCHLQGRLMHLYAVCVDCLEGVHKIICIKCKSRWDGSWHQLGTMYTYDILAASPCCQVGIDPREVGI	1183554	1172008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1174343_1182533
554545	contig_14441_pilon	+	819	5	Intergenic	novelGene_100444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	223	651	116728	117610	FALSE	5	CAGCCTGCTTGGCGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCTSVPAVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112104_112154_116578_116963_117220_117344_117539
554556	contig_7426_pilon	-	1553	4	Intergenic	novelGene_27527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	47.4201082523719	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	65	364	1091096	1087105	FALSE	35	TGTCAAAGATGCAAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1093433	1085915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372
554571	SIRV4	+	213	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1558	632	1103	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
554573	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
554588	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_19025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554596	contig_2069_pilon	+	2099	12	Intergenic	novelGene_23254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_1	282.568765857121	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	187	1029	333898	341321	TRUE	15	TCCACTTAGGCCTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324000	344205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519
554599	SIRV6	+	1081	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	4	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
554608	contig_14711_pilon	+	1963	6	Intergenic	novelGene_68943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	48.8	1327	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	84	584	132483	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCASVTGCGCTWMPPGVGVSCCHRHTSVSWLESRGLTLWPGIPTSSSQQACSAQLFFSKILRYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	132399	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_132521_132596_132662_132953_133036_133925_133978_134106_134197_135227
554609	contig_1154_pilon	+	1635	4	Intergenic	novelGene_87152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	413.667606767667	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	226	762	900067	901946	FALSE	20	TGCAATATTGTCCTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895944	902819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896081_899977_900253_900808_900990_901776
554617	contig_5467_pilon	+	1860	11	Intergenic	novelGene_111933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	356.454990146021	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	14	988	8246	14522	TRUE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8232	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956_15392_15625
554630	contig_15063_pilon	+	1134	3	Intergenic	novelGene_14380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	171	992	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35100	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
554638	contig_18272_pilon	-	2234	6	Intergenic	novelGene_6997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	570.490315430508	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	167	832	262678	122690	FALSE	70	GTAAATAAAAAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPAGTAVDAGARSAVAGVGHQGVRPTGDRHLLLPEHGRQGAVQNEQRGLPPSHLPLQHRSAVVTPSISDPGPDQQSPSQPRKRADPAVAIPPRAPF	262844	121287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_168478_168656_172633_172796_184338_184551_262660
554660	contig_10861_pilon	-	2571	20	Intergenic	novelGene_39418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	128.84081526702	457	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	828	2258	2209190	2191815	FALSE	5	GTCCTATCTTTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNVLNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVNLKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAETQGKLEEKLQELEANPPSDVYLSSRDRQILDWHFANLEFANATPLSTLSLKHWDQDDDFEFTGSHLTVRNGYSCVPVALAEGLDIKLNTAVRQVRYTASGCEVIAVNTRSTSQTFIYKCDAVLCTLPLGVLKQQPPAVQFVPPLPEWKTSAVQRMGFGNLNKVVLCFDRVFWDPSVNLFGHVGSTTASRGELFLFWNLYKAPILLALVAGEAAGIMENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSRWRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAGEHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSPSM	2255150	2191501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2192001_2192692_2192840_2193530_2193659_2195435_2195551_2195962_2196151_2197701_2197835_2200721_2200834_2202114_2202189_2202978_2203114_2208661_2208753_2209068_2209212_2218122_2218200_2219438_2219498_2222263_2222371_2223158_2223252_2223883_2223963_2226676_2226811_2231842_2231903_2249112_2249279_2255119
554672	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554674	contig_15304_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_30601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	193.325861924598	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	186	1004	66228	64723	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVAVQQGARAFGPGLHH	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_64988_65310_65396_65721_66104
554684	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554687	contig_5815_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_141179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCATCGGTGGCTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145250	144054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_144100_145200
554698	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
554699	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554723	contig_15286_pilon	+	1708	8	Intergenic	novelGene_124435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	80.0084179244629	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	115	780	8542	25108	FALSE	40	GAAAAAACTCTGGTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFKLVKTWLGPEAISLLKFTSKNEIQEYVSVEYLPPHMGGTDPFKYSYPPLVDDDFQTPLCENGPITSEDETSSKEENEKVDSKMKAFKKPLSVFKGPLLHISPAEELYFGTAESGEKKTLIVLTNVTKNIVAFKVRTTAPEKYRVKPSNSSCEPGASVDIVVSPHGGLTVSAQDRFLIMAAEMEQSSGTGPAELTQFWKEVPKNKVMEHRLRCHIIESSKPTTLTLKDSAFNMLDKTSEDICLQFTNSRCETDRSPP	8427	26036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_8554_10756_10860_11450_11533_15377_15475_16537_16635_17061_17192_22665_22769_25066
554729	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
554743	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554762	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_18894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30103	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554770	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
554775	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_16477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
554791	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27909	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554805	contig_7202_pilon	-	148	1	Intergenic	novelGene_19008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30062	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
554826	contig_1076_pilon	-	2829	8	Intergenic	novelGene_101149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_4	37.9962404155238	195	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	95	1486	1054783	1039797	FALSE	0	TTTGTTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNSLLYNIGEQLDSDKLASLKFLSLDHIPQRKQEHIKDPLAFFRALQEKRLLEENNQSFLKELLFRIQSLDLLTKYLGISKQEMERELQKPGKAQVSAYRVMLFQIFEDVNKEELKSFKFLLKKEIPKCKLDDDLTLLDIFIEMEKRVILGESNLDTLKRICDQINKSLLLKINDYEDLSRGEELFRELAISDSPRELESESQISDKVYRMKSKPRGYCLIFNNYNFSVARKAVDKLCNIKDRNGTELDAEALKKTFSDLHFEVVHFQDLTAKKICEVLESYQNKDHSNNDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEASICELTSYFTGLKCPSLAGKPKIFFIQACQGSNYQKGIAVETDAEQQEACSEMASSQKSYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRSPVEGTWYIQSLCESLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDRKNMGKQMPQPMFTLRKKLYFPLN	1071899	1038453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1039933_1041752_1042252_1043959_1044102_1046009_1046075_1048145_1048285_1049024_1049131_1054478_1054815_1071836
554833	contig_4364_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_1528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532909	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
554841	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
554857	contig_6710_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_98118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCCCTGAGGAAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653437	653875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
554860	contig_5515_pilon	-	2234	6	Intergenic	novelGene_52354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	204	junction_1	90.0657537580184	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	41	928	167792	160151	FALSE	5	GAGTCTCCTGTCCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEIISLESSYNDEMLSYLPGGTAGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQSVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDVEEEGRPGTFHVGGAPAPNASHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEESVVGGLSGGTLSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES	167832	158844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_160589_161061_161210_165496_165573_165751_165809_166171_166290_167741
554879	contig_7839_pilon	-	1612	7	Intergenic	novelGene_45738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	72	431	956514	955729	TRUE	30	CCCCAGCAGAAGACTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSMLAVQPYVLVTMQQGEDTSLLEIVTFSTFLSKISFMSLQRFSNLALLSSIFFFSSSSSGSSRPSLVTETKLFPSNSFSCCTQYSSIGSVIYTTSKPLFLTRSTKAELATCSLLSP	956585	953726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_953753_953916_954052_954238_954543_954894_955466_955583_955732_955881_956151_956426
554880	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
554884	contig_7898_pilon	-	1015	7	Intergenic	novelGene_47517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3129.24945296614	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	51	944	285587	282118	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	285637	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284535_285533
554901	SIRV6	+	1466	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	36	-11	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
554905	SIRV4	+	289	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1473	641	1018	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2473	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
554912	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
554924	contig_11285_pilon	+	1987	14	Intergenic	novelGene_5592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	538.824668764004	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	564	1805	767344	769878	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767162_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740_769962_770097
554925	contig_9233_pilon	+	2670	6	Intergenic	novelGene_78243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	82.1841833931566	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	66	374	582395	676460	TRUE	0	TTCTTGTGGTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSLLAREPAVAASQSCGTRRTMSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582329	679051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346_676710_676942_677360_677421
554943	contig_11171_pilon	+	1936	9	Intergenic	novelGene_48532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_8	997.420415058264	1349	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	31	1023	31058	65045	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	31027	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785
554970	contig_12622_pilon	+	1668	10	Intergenic	novelGene_6000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGAAGAAATGGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583665	1589224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583865_1585363_1585475_1585559_1585706_1586269_1586396_1586535_1586838_1587626_1587784_1587863_1588042_1588434_1588580_1588831_1589010_1589098
554975	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
554985	contig_10861_pilon	-	1721	9	Intergenic	novelGene_39327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	223.568781362694	963	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	435	896	1491018	1490156	FALSE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493820	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
554989	contig_5125_pilon	+	2248	12	Intergenic	novelGene_43506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_8	477.895213107166	332	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	23	1543	1087611	1127980	FALSE	0	TTCTGTCTGGTGTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFNFGAPSGTSGTAAAPAAPAGGFGGFGTTSTTAGSAFSFSAPTNTGTTGLFGGTQNKGFGFGTGFGTTTGTSTGLGTGLGTGLGFGGFNTQQQQTTLGGLFSQPTQAPAQSNQLIHTASALSAPTLLGDERDAILAKWNQLQAFWGTGKGYFNNNNAPVEFTQENPFCRFKAVGYSCMPNNKDEDGLVVLVFNKKETDIRGQQQQLVESLHKVLGGNQTLAVNVEGIKTLPDDQTEVVIYVVERSPNGTSRRVPATTLYAHFEQANIKTQLQQLGVTLSMTRTELSPAQIKQLLQNPPAGVDPIIWEQAKVDNPDSEKLIPVPMVGFKELLRRLKVQDQMTKQHQTRLDIISEDISELQKNQTTTMAKIAQYKRKLMDLSHRTLQVLIKQEIQRKSGYAIQADEEQLRVQLDTIQCELNAPTQFKGRLNELMSQIRMQNHFGAVKSEERYYIDADLLREIKQHLKQQQEGLSHLISIIKDDLEDIKLVEHGLNETIHTRGGVFS	1087588	1128685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1087678_1091825_1091910_1092002_1092144_1098902_1099130_1100702_1100891_1101756_1101954_1103604_1103660_1104087_1104182_1119633_1119742_1125790_1125911_1126191_1126303_1127851
554991	SIRV7	-	359	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33208	2	-11	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114749	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
554996	contig_2924_pilon	-	3007	1	Intergenic	novelGene_140250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2409	2723	31160	30846	NA	70	AAAAAAAAACACAACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKTCFCLCISISGCLTPGRLKNSWQRVPQTSAVPTRKPLTSLSSQKTQALYTATWGCGSCCPHWGPWNHLQMSAILCCFKHQISEQWHLIVPRLGRKQGSEE	33568	30561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_30600_33600
555006	contig_13457_pilon	+	1291	10	Intergenic	novelGene_118344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	62.92225263405	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	167	1291	60777	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLQKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59244	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68905_70754_71059_71202
555018	contig_10404_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_138716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266120	1268108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1266100_1268100
555028	contig_4315_pilon	+	1920	10	Intergenic	novelGene_46746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	183.146436721959	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	611	1312	223162	225537	FALSE	10	GAGCTTCTTGTCTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	207445	226145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_207575_214651_214842_214960_215057_216250_216296_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
555030	contig_5791_pilon	-	2202	9	Intergenic	novelGene_35860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	365.512995664997	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	180	1685	1088908	1079821	FALSE	30	AATTATTGCTGTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094419	1079303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1088950_1090657_1090729_1094352
555041	contig_8616_pilon	-	1748	4	Intergenic	novelGene_72442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	489	junction_1	279.733603431709	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	35	355	255468	255148	TRUE	15	TCATCTTGGTACTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQVRLRGGDSLGLGRTGGGLANPEPESRAAFWSFPGRPRPARCFSVVYRGDAAMLIELCSPARPGYTSKSFPCKKG	255502	253304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302
555050	contig_14326_pilon	-	2530	6	Intergenic	novelGene_120732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_5	58.6808316232822	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1021	1398	443129	442066	FALSE	35	AAAACCTTATGTCAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	486180	440933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443932_444094_444332_473560_473737_486102
555060	SIRV6	-	474	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTTGATTGCTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
555079	contig_5643_pilon	+	1439	11	Intergenic	novelGene_39037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	803.654334897784	33	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	647	1075	634983	640691	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTPQP	631202	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_640679_640729_641102_641244_641412
555086	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
555101	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	636	972	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
555103	contig_20694_pilon	+	3123	2	Intergenic	novelGene_141250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59943	65173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_+_60823_62929
555104	contig_10217_pilon	-	1037	9	Intergenic	novelGene_87418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	643	junction_3	420.18967071431	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	134	1036	130155	110900	FALSE	40	AGACCGAGAGCCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVF	130288	110898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
555107	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
555138	SIRV4	+	329	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	652	967	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
555139	contig_7286_pilon	-	1033	7	Intergenic	novelGene_108695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4992.98722932697	7314	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	293122	290708	TRUE	10	AATTGCCTTGTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKVSVKQAGSLLSKISWF	293142	286881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289526_290707_290857_291315_291497_292022_292101_293119
555140	contig_3077_pilon	+	1313	6	Intergenic	novelGene_26757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4461.42145061414	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	317	820	13747	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKQMGKANEVPQTSASIHKSRFHMVWVRGTWPSLLTCLSPIQEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	11373	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13743_13986_15137_15262_17449
555152	contig_10058_pilon	+	1996	10	Intergenic	novelGene_67689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_4	94.3716058992322	1048	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	198	1064	50283	52990	FALSE	10	AGTTGTTTCTCGTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVRPQPST	48221	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837
555164	SIRV7	-	342	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	2	6	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
555173	contig_10404_pilon	+	2198	4	Intergenic	novelGene_138725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	109.044333491781	615	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	120	560	1373396	1376032	FALSE	40	CAAAGTAAAGAGCAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSREQKRSGTGAGEAHPGRLRVERRSRLAAGYCGVPVTMRSLPLLRTLSLCSLLWAFCALHVGAEEPGASFSNAGSAGLDKNTVHNQEHIMEHLEGVINKPEAEMSPQELQLHYFKMHDYDGNNLLDGLELSTAITHVHKEEGSEHIPPMNEDELISLIDGVLRDDDKNNDGYIDYAEFAKSLL	1367548	1377670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1367656_1373383_1373545_1374312_1374473_1375900
555176	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
555178	contig_7744_pilon	+	2064	18	Intergenic	novelGene_62554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	204.147310948428	2	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1169	1621	889355	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWRRSPKIWIPVLYWLKSLQDQEENQFRLCTLSHQLWNWINSLKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879808	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889635_889837_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
555188	contig_7165_pilon	+	3173	1	Intergenic	novelGene_116884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAAGAGTGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739658	742831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_739700_742800
555200	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
555208	contig_7202_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_18649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
555215	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
555232	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555244	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
555250	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555260	contig_7963_pilon	-	1015	5	Intergenic	novelGene_58341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	5903	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCAATGTTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48903	38333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38552_39323_39405_39949_40232_43546_43819_48741
555295	contig_7411_pilon	-	2376	5	Intergenic	novelGene_136967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	4.27200187265877	176	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	209	1609	97125	86221	FALSE	20	GTTAATTTTGTACTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQGSVTFRDVAIDFSQEEWEWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKGDVRRDLFSVSESNSEINEISPKNDIYENDSYQYLIMERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	97741	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_87390_94994_95091_95331_95459_97116_97174_97581
555298	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
555300	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_98028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
555305	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555308	contig_1867_pilon	-	2479	11	Intergenic	novelGene_54610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	188.66555064452	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	901	1647	546242	517583	FALSE	40	CATAAAACAGGTCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	551130	516750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546400_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972
555312	contig_13550_pilon	-	2976	5	Intergenic	novelGene_141252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	27.1788060812097	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	152	700	57682	23578	FALSE	0	TTTTGCCTCTCGGGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQPGSAHASTTCPPSSRRGATPRVGARRVWEADTSLGLVALEKPPPGAGAMAEEQRCYGTESDPNCKTATTAEPTMSPTQTSEVAAGSLELEDYDLKCLFCRIARGQEPSTELLPCENEDLVCFKDIKPAAPHHYLVVPKKHVGNCNDLKKDHVELVENMVAVGKTILKRNNFTDFKNVRMGFHMPPFCSISHLHLHVLAPVNQLGFISKLIYRANSYWFITVDYLIEKLRT	57833	21301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13550_pilon_-_23611_25336_25464_27473_27544_55134_55253_57481
555321	contig_3233_pilon	+	2045	9	Intergenic	novelGene_56559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	226.856748577158	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	1136	1909	741808	747909	FALSE	20	AATGGGATTGTGTTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738716	748045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
555335	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_94877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
555345	SIRV2	-	396	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4477	34	3302	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
555349	SIRV5	+	413	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
555353	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
555359	SIRV4	+	281	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1490	632	1035	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2490	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
555380	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
555385	contig_5258_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_100252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACACATCCTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334812	334590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_334600_334800
555391	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555395	contig_8375_pilon	+	2647	10	Intergenic	novelGene_141268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	114.585242408339	4	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	100	1611	19906	64643	FALSE	25	TAGATCTGTGCAATGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCLLPQRHGSKAELTILAVEALTVQLRWPHRDKMWLGVLLTLLFCSSLEGQENSFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	19806	65679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_19940_20025_20053_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37267_51082_51140_59731_59755_64613
555396	contig_15459_pilon	-	1755	5	Intergenic	novelGene_106373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	143.635606657959	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	312	866	19967	16392	FALSE	30	CTTTGGCTGGAAACAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIGKFTLLKSLSLNNNKLTVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQISQISVKISCCPRLKVLRLEENCLELSMLPQSILSDSQICLLAVEGNLFEIKKLRELEGYDKYMERFTATKKKFA	20528	15502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_19068_19338_19909_20261_20510
555400	contig_12464_pilon	+	2755	2	Intergenic	novelGene_68716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374809	379209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_376347_377991
555405	contig_10722_pilon	+	2022	2	Intergenic	novelGene_70992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	1098	1952	31560	32414	FALSE	40	ATAAAAAAATGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKGRDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNVPISGPILQAKAKEMAKLLKVDGFSASNGWLQSFKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30297	32484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_30911_31075
555406	contig_12414_pilon	-	2129	13	Intergenic	novelGene_59646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	439.120609539364	1694	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	169	960	795027	765827	TRUE	30	ATCAGAATGATCCTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYPRGPLTRVRERVRSPRPDQPRLRGPRGPTKEGGWSLFRDRDNDTPSECLGPKGEMLWFQGSIPAAIALAKRNGSVFVVFVAGNDEQSTQMAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKQRKK	795195	756008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765843_766786_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129_787233_794945
555417	contig_13067_pilon	-	3096	5	Intergenic	novelGene_141335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.775466367045	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	215	571	75166	36326	TRUE	25	TTGAATTGTGCTACAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDKEFMWALKNGDLDEVKDYVAKGEDVNRTLEGGRKPLHYAADCGQLEILEFLLLKGADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVKLLLSKGADKTVKGPDGLTALEATDNQAIKALLQ	75380	33258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_34412_34953_36413_52559_52644_53605_53720_75094
555422	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
555424	contig_7744_pilon	+	2010	14	Intergenic	novelGene_62528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	85.6570843227491	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	113	1450	825487	830740	FALSE	15	GGTAGTCCCCCAGCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825374	831300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
555433	contig_6163_pilon	+	1898	5	Intergenic	novelGene_103781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	45.2575960475145	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	176	817	9706	13058	TRUE	15	GACGAGTCCTTCTGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVMACL	9530	16598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13842_16300
555445	contig_3151_pilon	-	1400	4	Intergenic	novelGene_139194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCCAGAAGAGAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245924	222021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_223089_224783_224882_234557_234693_245824
555464	contig_6227_pilon	-	1607	9	Intergenic	novelGene_49752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	134.337203986833	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	552	1310	1206145	1202920	FALSE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1207089	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579
555468	contig_7594_pilon	+	1527	8	Intergenic	novelGene_55421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	987.368487755329	3633	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	337	903	544633	554556	FALSE	15	GTGTTTTGTGATTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	538977	555180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_540866_540986_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
555472	SIRV4	+	302	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	199	449	199	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
555479	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_16485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27827	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
555483	SIRV5	+	309	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	906	-10	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCTCAGTGGTGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
555487	contig_15063_pilon	+	2275	3	Intergenic	novelGene_13068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3530	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	1816	2274	34808	35378	FALSE	25	GTAAGTGCACAGGTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRL	32790	35379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_32841_33042_34926_35037
555504	contig_10058_pilon	+	2018	10	Intergenic	novelGene_67697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	90.1997782702374	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	441	1373	50283	53244	FALSE	50	TTTTTTTAAAAACATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	49842	53889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
555530	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
555539	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555546	contig_10019_pilon	-	2275	19	Intergenic	novelGene_86693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_11	165.4504140405	367	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2265	9	2273	490043	346063	FALSE	65	GAAGAAAAACAAAATCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REMVNAWFAERVHTIPVCKEGLRGHTEFCSCLSQQTSHADSSAPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEGTVSFLSDSEKKKQMPLTPTRFDNEEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLISADRYSLFLVREDSSNDKFLISRLFDVAEGSTPEEASNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPLNIKDAYEDPRFNAEVDQITGYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDEKDFAAYLAFCGIVLHNAQLYETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIISFMQVQKCTIFIVDEDCSDSFSSVFHMECEELEKSSDTLIRERDANKINYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTSENIGHVNQQHIGSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKKEENTGKIKAFNRNDEQFLEAFVIFCGLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETRELQSLAAAVVPSAQTLKITDFNFSDFEMSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFQMKHEVLCSWILSVKKNYRKSVAYHNWRHAFNTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGVNNSYIQRSEHPLAQLYCHSIMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAILATDLALYIKRRGEFFELIRKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAELVATEFFDQGDRERKELNIEPTDLMNR	490051	346060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_346078_346820_346896_353291_353356_356540_356619_358653_358755_363543_363632_372728_372824_375233_375360_381408_381556_398218_398279_400566_400743_411377_411466_412900_413010_422404_422473_424571_424710_432453_432544_434548_434621_473610_473701_489458
555547	SIRV5	-	304	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACCAAAGTACATATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
555556	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
555569	SIRV6	+	649	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	216	-320	-15	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
555574	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
555578	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555583	contig_12603_pilon	-	2443	15	Intergenic	novelGene_105808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_14	75.8142534119288	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	316	831	635920	627660	TRUE	20	CTTTGTGTTGACTGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVDARSDRTGEVIFKDNFSSAIAGVVEGDYRMDGHIQLICCSVDGEIRGYLPGTAEMRGNLMDTSVEQDLIRELSQKKQNLLLELRNYEENTKVGPNVKGKWS	638311	618148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_618624_619319_619469_621985_622099_623815_623954_625011_625144_626303_626434_627093_627266_627356_627833_628017_628154_631065_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248
555585	SIRV7	-	336	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	7	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
555597	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
555604	contig_5643_pilon	+	2005	15	Intergenic	novelGene_39052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.225641933048	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	128	952	631341	636453	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSESTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTVEPVARPR	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631850_632046_634804_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636259_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
555605	contig_6062_pilon	+	2739	6	Intergenic	novelGene_5290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	488.124983994878	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	291	1010	758838	766005	FALSE	30	TACATTATGAATCCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLHGDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIVYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIYAYTHNLVYPKHFIMAPNPDDMEEDP	756143	767734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_756365_758768_758931_759167_759267_761712_761981_764681_764768_765831
555614	contig_5765_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_141398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACTAAAAAAAAAAATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700532	702849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_700500_702800
555647	contig_6735_pilon	-	1573	13	Intergenic	novelGene_15747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1093.03152274865	8	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	682	1518	545923	542042	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGCPFWDSWFAYLGRYLESLVCQVVLFAHFPFLQRYL	568272	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542150_542779_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547260_547388_552836_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
555658	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
555668	contig_6102_pilon	-	2446	23	Intergenic	novelGene_31990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.780983920497	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	800	2403	5	2407	438578	417032	FALSE	15	TCAGTTTCATCTTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPCKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGTDEARAEFQALHPSSSQPRPPAPLSLTSWCSSSASWHLSSVQSFL	438582	416992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_417149_421835_421868_422138_422301_422537_422797_423161_423225_423318_423439_424435_424590_425298_425413_429166_429239_429548_429680_429962_430001_430140_430201_431438_431564_431940_432057_432161_432294_432427_432504_433389_433460_433715_433786_434353_434447_434547_434630_435076_435163_436270_436391_438467
555703	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_96893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
555710	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
555716	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
555725	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
555758	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
555759	contig_11752_pilon	+	1178	8	Intergenic	novelGene_37644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1130.47308139341	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	83	469	87309	92993	TRUE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVHSVPSIALREQT	85033	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85104_87296_87547_88667_88776_92952_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
555794	contig_12624_pilon	-	1702	4	Intergenic	novelGene_61099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	7	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	83	400	955789	948779	FALSE	20	CTTTTCTAATGCTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGSCWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSRNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955871	947476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955782
555798	contig_12605_pilon	+	858	5	Intergenic	novelGene_64185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2172.25700597328	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	26	721	3897	5980	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGPGPAAGSPASSPSATWTTRSSCGSTATPRIRGWSRGRRGSSGRGRSIGSEQTRIAKGNAQTYRVSLGNLRGYYNQSDAGSHTLQEMYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLESGTRRTRPRTWSLWRPGLRGTGPSRSGQPSWCPLERSKDTHAVCSTRG	3871	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4297_4535_4795_5044_5833_6005_6124
555810	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_18064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27939	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555818	contig_12852_pilon	-	1783	8	Intergenic	novelGene_141451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGTCAGGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573125	558408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_558965_560763_560916_561118_561411_562499_562639_563419_563663_563830_563922_565487_565632_572959
555822	contig_233_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_14682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAACTCAGGTGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96263	97862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_96300_97900
555828	SIRV7	-	345	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33218	6	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
555830	contig_5023_pilon	-	1959	9	Intergenic	novelGene_7199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1509	1844	609714	607291	TRUE	15	AACCCTGGCTGTGTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGANTGLLRGATNRTNPFLLVDCFSKGLGNICAFQPTKNLDKLIKADPPIFVQITCSHQVFCNFSHSITRQRQAGSLEQVIQLIAADVSIAISIYFGKSFSELHHFFIGH	623501	580825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580903_607252_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525
555833	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
555841	contig_4364_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_3725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
555864	contig_18419_pilon	-	1747	2	Intergenic	novelGene_141457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCCTAGTTGGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30426	28633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_30271_30316
555872	contig_8801_pilon	+	2065	10	Intergenic	novelGene_66325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	126.849867516245	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	396	1271	938911	944080	FALSE	25	TTCTTAAGATGGAGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGEIDTRFSFCAVATLSLLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSESHAGQIYCCTGFLAITSQLHQVNSDLLGWWLCERQLPSGGLNGRPEKLPDVCYSWWVLASLKIIGRLHWIDREKLRSFILACQDEETGGFADRPGDMVDPFHTLFGIAGLSLLGEEQIKPVNPVFCMPEEVLRRMNVQPELVS	935723	944874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_935742_936730_936839_938220_938481_938901_939100_939696_939803_940884_940938_941018_941130_941744_941871_942886_943037_943939
555887	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555948	contig_6361_pilon	+	1778	11	Intergenic	novelGene_23931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	241.307355876277	398	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	339	1406	306021	345856	FALSE	25	TAGTACTTTGTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDSTAKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDDPVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQQRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAMEAQMAQ	284741	346228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_284860_289860_290002_305941_306022_308749_308902_309697_309802_317331_317486_317640_317792_325203_325375_341173_341290_341875_341961_345722
555952	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
555957	contig_9389_pilon	+	1620	7	Intergenic	novelGene_83910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	121	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	39	971	159587	167739	FALSE	45	GGAAAAAAAGTGGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQALGRPLSSPPTTRRGQTTEVPHVASPHIIASSGFWGFVLFFYMLERCQRRVCGRLGGEWPGVWVPPSLGFLPELSHQARGRGKGHISLHWGS	159548	168388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167460
555960	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
555963	contig_16775_pilon	-	2082	21	Intergenic	novelGene_107789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	69.3476026982909	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1299	1976	188403	177291	FALSE	10	GTTGTTGTACAGTTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEELTRLWNLCPDNMEACKSETREYMPTLEEFFEEAIEQADPENMVENEYKVVNNSNYGWRALRLLARRSPHFFQPTNQQFKSLPEYLENMVIKLAKELPPPSEEIKTGEDEDEEDNDALLKENESPDVRRDKPVTGEQIEVFANKLGEQWKVLAPYLEMKDSEIRQIEGDSEDMKMRAKQLLVAWQDQEGIHATPENLINALNKSGLSDLAESLTNDNETNS	235743	177184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_177587_178278_178355_179106_179255_181579_181664_187782_187849_188395_188492_189711_189783_189871_189922_190118_190186_191684_191786_209277_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219486_227461_227558_227944_227994_228445_228565_231987_232055_233245_233307_233399_233474_235686
555967	contig_13528_pilon	-	1847	12	Intergenic	novelGene_66865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	192.435241871258	15	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	224	1108	67895	46581	TRUE	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSVI	68118	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46589_46747_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
555968	contig_500_pilon	+	1392	9	Intergenic	novelGene_31075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1152.02311174733	3	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3	449	1492652	1495407	TRUE	10	GGCATGTTTGACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAPWPTTASWWSPSAATPGTRTAPVSACRAVGAEIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVGVQTHQEAHSLHGAQP	1492649	1499585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492755_1493615_1493721_1494244_1494430_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
555969	contig_12672_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_141477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAAGACCCCAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88594	88139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_-_88100_88600
555974	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	635	971	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
555979	contig_4385_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_141505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCACAGGACCATTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327599	326997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_327000_327600
555982	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
556004	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556033	contig_8729_pilon	+	1919	2	Intergenic	novelGene_40112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	318271	322350	FALSE	35	TTAAAGGCTGAACTATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVCGHGAGALAVFPLGTQRANAGLRGVSGIQKPFFVSPSHVLLPDEKKEVWGILSGCSHLLYKIVEESEERLTEEQIEALLHTVTSILPAEPETEQQKRANDAAVDEEYPE	318269	323929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_318463_322203
556036	SIRV4	+	495	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	19	-440	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1886_2247
556045	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
556056	contig_12622_pilon	-	1074	11	Intergenic	novelGene_6025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.389359729867	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	195	881	1690387	1685305	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSQRGTAPHVDNPG	1691115	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685344_1687839_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093
556064	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
556065	contig_18637_pilon	+	2240	9	Intergenic	novelGene_81846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	119.055659252301	720	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	9	437	141663	149860	TRUE	80	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMAAAGLSAWLALQPGARTLRAFSTAVSPATRTPRPRLRATENIKTPRSERLIRRKTLPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDHSTRCCNKQN	141654	178266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141775_147071_147125_148222_148391_149544_149606_149825_149881_153201_153342_160263_160374_161804_161875_176803
556085	contig_15063_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_13526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	3428.5933340074	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	202	1086	34808	36504	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRPGLLLHLQHPERV	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36460
556087	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
556098	contig_9609_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_23083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAGAAAGAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454329	456258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_454300_456300
556100	contig_3602_pilon	+	1534	7	Intergenic	novelGene_60482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	149	598	161745	169451	TRUE	10	TGACTTGGCTCCACCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161596	171129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170101_170842
556105	contig_14925_pilon	-	1006	5	Intergenic	novelGene_55116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	1543.31088896567	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	211	468	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSNTRLIFGQGTTLQVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	73140	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_73082
556106	contig_16103_pilon	+	2283	7	Intergenic	novelGene_118932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_6	118.292598622606	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1400	1939	794268	799889	FALSE	15	TTAGCTAACTCTGGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	792779	800233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
556112	contig_7202_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_18397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556125	contig_11281_pilon	+	2653	11	Intergenic	novelGene_125425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	256.749683544109	526	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	378	1325	215142	237909	FALSE	20	CAAGCTCTGTGTTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLHSKWKRNRKGEKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVAEFSAADNHILPNESAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEVERQRRLERIKQKQSQLQELILQQIAFKNLVQRNRQAEQQANRPPPSNSVIHLPFIIVNTSKKTVIDCSISNDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGSISGVFVTSSGSTSNGTRLSASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETPVSYVGEDDDDDDDFNENDDED	124497	239237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_124648_126602_126679_178695_178763_215057_215165_224868_225035_227028_227173_228437_228507_230872_231025_231738_231906_233428_233508_237761
556127	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556138	contig_20314_pilon	+	1097	8	Intergenic	novelGene_125624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408.436641103511	10	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	297	1034	9165	24277	FALSE	10	TTCCAGCCCCAGTGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1510_7989_8217_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
556143	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
556151	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556155	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556161	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	1555.7699661261	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSAGKLTFGDGTTLTVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	61677	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_61622
556175	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
556180	contig_10437_pilon	+	1795	3	Intergenic	novelGene_38136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.5	41	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGCGTTGCAGAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156667	164086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160185_162689
556196	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
556232	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556236	SIRV4	+	212	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1559	632	1104	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2559	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
556245	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68995	0	35776	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
556260	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
556270	contig_2367_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_65307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136479	134339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_134300_136500
556282	contig_8138_pilon	+	1890	5	Intergenic	novelGene_52406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	230	685	280295	306552	TRUE	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280065	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_307019_307195
556295	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
556303	SIRV6	+	183	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	897	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11134	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11100_11300
556315	contig_14322_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_115839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
556320	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556336	contig_7119_pilon	+	2363	3	Intergenic	novelGene_40962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	110	1264	137033	139798	FALSE	15	CCCAGCCCAGGGCCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127548	140897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
556339	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
556343	contig_5039_pilon	-	2088	10	Intergenic	novelGene_64967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	604	junction_1	472.816619373257	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	61	1140	1673164	1654775	FALSE	25	TTTAGGGTCTGATGATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTDLDKAQLLEIAKANAAAMCAKAGVPLPPNLKPAPPPSIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEGNKDDDDNVFSSSLPSEPVDISTAMSERALAQKRLNENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVLTQEQLANTGAQAWIKKDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLRNGSPYQPNCMFFLNRY	1674638	1653826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654835_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1662234_1662352_1663443_1663555_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047_1673209_1674622
556345	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_17839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556353	contig_4759_pilon	-	2369	3	Intergenic	novelGene_106338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	514	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	471	1073	650121	587401	FALSE	50	TTCTAAAAATAAAATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPKTDCRSPVGLDCCSCCLDLAHRSELQGDSSGENNNPGSPTVNNFRQLQEKLIFENLNTDKLNSIMRQDSLEPVLRDPCYLINEGICNRNIDQTMLSILLFFHSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	650591	586104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_649801
556374	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
556377	contig_13894_pilon	-	1337	3	Intergenic	novelGene_62056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	210	1268	287445	286290	FALSE	30	TAGTGAAAGTACTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288249	286220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
556378	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
556382	SIRV4	+	312	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1459	632	1004	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2459	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
556387	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
556390	contig_12864_pilon	-	1585	8	Intergenic	novelGene_76416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	617.12529736923	328	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252164	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_249519_249843_251887_251999_252111
556391	contig_18869_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_56037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAGAATTTTCTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
556398	SIRV4	+	408	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	101	441	101	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
556421	contig_10629_pilon	+	1459	3	Intergenic	novelGene_52895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1745	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTTCCCCTCCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245853	247911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_247140_247316_247396_247817
556442	contig_9797_pilon	+	1388	4	Intergenic	novelGene_65601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_1	151.28853962618	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	224	607	188724	191368	FALSE	5	TGGAGTTCTGCGTTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	183911	192149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_183989_188577_188734_189277_189422_191138
556446	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
556453	contig_14441_pilon	+	1276	5	Intergenic	novelGene_100554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	416.76214739345	163	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	662	1090	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113843_114161_116578_116963_117220_117344_117539
556463	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
556484	contig_5499_pilon	+	2416	11	Intergenic	novelGene_57002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	233.279746227571	2	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	137	1174	816585	840037	FALSE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803388	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803448_809594_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
556508	contig_13702_pilon	-	2410	7	Intergenic	novelGene_102611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_6	70.9587125650465	477	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	153	1031	151513	144255	FALSE	15	TCATTGGCATGTAGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAAAAGESARQPARPRFAGPAFQEQIKHCLACPLTESAERSFSGFFRMPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	159885	142875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151585_159804
556514	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
556517	contig_15236_pilon	+	2798	2	Intergenic	novelGene_141624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTTCTGCGGTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617768	624859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_618975_623267
556524	contig_14322_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_115718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTTATATTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
556533	SIRV4	+	298	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1473	632	1018	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2473	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
556546	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
556550	contig_14322_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_116583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGCCACAGCAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
556554	contig_6735_pilon	-	1721	13	Intergenic	novelGene_15733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	974.369208342847	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	647	1162	544935	542812	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALADQATQLGLSESQL	568286	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542195_542273_542601_542790_542853_543005_543292_543788_543894_544851_544999_547318_547355_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568194
556556	SIRV7	-	342	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	2	6	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
556586	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTACGTCTACCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
556590	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556602	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
556607	contig_14925_pilon	-	1005	5	Intergenic	novelGene_55096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_4	1552.7624576863	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	39	467	45828	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGYNKLTFGKGTMLLVSPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	45866	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_45809
556613	contig_8415_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_141681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	1.5	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTAGAAATGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24163	59049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_24230_25361_25635_58957
556620	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
556621	contig_5084_pilon	-	2747	4	Intergenic	novelGene_64624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGAGGGGCGGAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197317	1187447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1187512_1188634_1188883_1191507_1191667_1195041
556634	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
556638	contig_10581_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_41356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	418.197986073051	2066	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	18	416	74587	85242	TRUE	10	TTCCGCCTTTGGGCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSVSDIVVDPGGL	74569	87907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85268_86992
556654	contig_3233_pilon	-	1902	10	Intergenic	novelGene_56571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	96	572	747951	745312	TRUE	10	GCTGAAGCCGCCGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLGRGGARTRPLGKGVGVEGNGIDVVVHGEEVPDVLSPKAGPTQGRGVPQLHQGEAGERVLSLHLSAMCQRQNETFLQQLPALPHRAHTQDGEANLPLEQDRVNLRQHGYNVSAQHLPSFPEDVPGEGVSLLSYLLQFSGKTQQTCIYQSPYTGG	748046	738728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_738774_740576_740663_740816_740913_741755_742609_742720_742834_743703_743816_745286_745381_746327_746423_746935_747014_747716
556662	contig_17102_pilon	-	3429	4	Intergenic	novelGene_141700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	61.0791835789139	198	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	68	463	30631	20431	FALSE	10	TGTTTTTGGTAGTGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVAAATVPPPFAFIGLCSARIMAPSLWKGVVGIGLFALAHAAFSAAQHRSYMRLTEKEDESLPIDIVLQTLLAFAVTCYGIVHIAGEFKDMDATSELKNKTFDTLRNHPSFYVFNHRGRVLFRPSDTTNTSNQDALSSNTSLKLRKLESLRR	30698	17464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17102_pilon_-_20591_22373_22478_25604_25658_30552
556663	contig_5643_pilon	-	2088	17	Intergenic	novelGene_39031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	92	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	268	621	640702	638136	TRUE	10	CTGCCACTGTACTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILHGWGVCDVPVLRLPALLGLHDLQLLLGCFNELGNGHVDELVLRLCLHHARALRPHHLDCLLDVDVTVPLTLGGDALHKHVNDDDGACAANARAAMHNDGPRVRQTFLPLVDLV	641595	631200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_631347_631433_631558_631850_632054_634807_634988_635154_635261_635356_635486_635631_635729_636168_636254_636429_636540_637703_637901_638045_638197_640212_640296_640393_640536_640634_640729_641098_641255_641421_641477_641565
556670	contig_5791_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_35853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	227.968321386011	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTATACAAGAATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080160	1073155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1073872_1074274_1074421_1079961_1080015_1080126
556675	contig_14441_pilon	+	1599	7	Intergenic	novelGene_100368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.382477250214	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	987	1415	116728	117610	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23153	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_25816_25950_26652_26781_26886_27207_116573_116963_117220_117344_117539
556694	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
556700	contig_9437_pilon	+	3241	8	Intergenic	novelGene_141742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	78.179020099215	127	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	152	739	527782	558005	FALSE	20	TGTGGCATAATTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCVLLLRQCPAPALWTWARGGRPAASRAKWLKEIQGPTRGSAPWLRGQERMDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQVKMVLSKLYENKKIANATHNIYAYRIYCEDKQTFLQDCEDDGETAAGGRLLHLMEILNVRNVLVIVSRWYGGILIGPDRFKHINNCARNILLEKNYITLPEESSKAVGKNKKVKKDKKRSEH	524067	560507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_524191_527753_527817_535608_535695_549658_549757_551903_551978_554779_554871_557035_557171_557936
556719	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556720	contig_15666_pilon	-	1442	5	Intergenic	novelGene_70211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	141.856221224168	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	284	766	131534	129088	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGYLDQELYPDLFLLLLSHSLTRVVLCYFPNKPLDCFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132957	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130515_130795_131446_131711_132850
556723	contig_12090_pilon	-	3062	1	Intergenic	novelGene_80472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCAGGTGAGCTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51226	48164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_48200_51200
556724	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTACCTGTCCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30061	29813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
556733	contig_7202_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_17703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGTTGGTCACGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
556744	contig_4315_pilon	+	1541	2	Intergenic	novelGene_46844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGAATCACTTTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575448	581578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_580178
556750	contig_5981_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_35480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	319.46671124209	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	93	1127	23508	37804	FALSE	30	AAATTATTTTTTGTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKVAGSGPAGSSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23415	38413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23613_25570_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
556762	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556768	SIRV4	+	1542	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	15	10	15	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAACAGGTTATATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
556774	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556775	contig_6616_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_141759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTCCGCACATCACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320617	320051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_320100_320600
556794	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
556800	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
556802	SIRV7	-	323	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	3	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
556816	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
556819	contig_6227_pilon	-	1203	8	Intergenic	novelGene_49722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	218.706400902942	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	37	903	1206145	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQVPAARPGFGTSRACGSLGAHELSYSSSLFPFLSPFQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1206181	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204519_1205767_1206011_1206142
556825	SIRV4	+	277	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1494	632	1039	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2494	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
556830	contig_6418_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_81186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTTTATAAAGGTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156965	1157811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1157000_1157800
556839	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
556840	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_115756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671648	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
556843	contig_1154_pilon	+	1701	4	Intergenic	novelGene_87155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	191.809511987516	2598	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	55	819	896007	901946	FALSE	20	GTCCTGTGTGATGTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLVLIRHGESTWNLENRFSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895952	902828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900253_900808_900990_901776
556858	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556883	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
556905	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
556911	contig_13894_pilon	+	1190	9	Intergenic	novelGene_62103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1630.25971378029	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	27	989	520713	527479	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDCPTVLAGTD	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526562_527449_527580_528072
556947	contig_3469_pilon	+	2356	7	Intergenic	novelGene_34189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	70.6674528258157	15	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	173	1063	464141	478983	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDV	463968	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864
556961	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1114	0	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
556965	contig_14322_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_115978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671598	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
556966	contig_14441_pilon	+	813	4	Intergenic	novelGene_100650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	403.5693524318	19	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	199	627	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111990	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117220_117344_117539
556970	SIRV4	+	225	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1546	632	1091	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2546	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
556984	contig_9233_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_78248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAACAACCCCACATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607054	606245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_606200_607100
556985	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
556991	contig_7202_pilon	-	153	1	Intergenic	novelGene_18874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30060	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
556996	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
556997	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557005	contig_8729_pilon	+	2929	8	Intergenic	novelGene_40070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	25.7388771300997	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	5	391	45249	51033	TRUE	5	TGTGTCTCGGACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQW	45244	57034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_51027_52603_54672_54758_54932_55078_56295
557006	contig_2204_pilon	+	2113	3	Intergenic	novelGene_71680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	397	junction_2	46	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	717	1121	38796	50221	FALSE	25	TTTAAAGGGCATCATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	38079	51213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_38845_48669_48717_49912
557062	SIRV4	+	223	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1548	632	1093	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2548	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
557078	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
557085	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_16634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27854	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557101	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_96745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
557107	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
557110	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
557114	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
557134	contig_14483_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_133766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCATCATGAGTTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133193	134386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_133200_134400
557158	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
557176	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_115859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
557180	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
557184	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557185	contig_9014_pilon	-	1988	12	Intergenic	novelGene_106761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	46.7120597803781	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	577	1125	82349	79637	TRUE	10	AAGGTTTTGTTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	83398	78128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_83146_83319
557202	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
557214	contig_2834_pilon	+	2954	1	Intergenic	novelGene_28016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATAGTTGAAGCAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303070	306024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_303100_306000
557220	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557221	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	1115	6	-1115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGACGAGCCACCGTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
557224	contig_10734_pilon	-	2088	4	Intergenic	novelGene_51019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	96	701	320632	311551	FALSE	35	TTTAAAAACAGCCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320727	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
557236	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1433	632	978	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2433	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
557260	contig_19342_pilon	+	1433	6	Intergenic	novelGene_41091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.2	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	424	858	4218	5544	TRUE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRAQDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGGV	3255	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4134_4365_5135_5293_5413_5566_6223
557261	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
557280	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557296	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
557299	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
557313	SIRV4	+	188	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1583	632	1128	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
557319	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557334	contig_7410_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_106088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_4	263.554904147125	105	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	106	504	405351	407259	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	405245	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_408410_410366_410421_411881
557335	contig_15720_pilon	-	867	7	Intergenic	novelGene_41881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1201.78692186076	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	520	825	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	282729	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577
557342	contig_10940_pilon	-	2057	4	Intergenic	novelGene_49265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1047.00238777187	4	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1078	1458	875054	874674	FALSE	40	TTTACAGAAATAAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917143	874074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916744_916923
557343	contig_854_pilon	+	1230	7	Intergenic	novelGene_36264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2542.75417717788	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	156	467	556108	562402	TRUE	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543510	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543569_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557726_557752_562271_562405_563029
557363	SIRV4	+	318	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1453	632	998	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2453	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
557364	contig_9833_pilon	+	1525	10	Intergenic	novelGene_68535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	463.674641143449	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	20	754	230823	254740	TRUE	15	ACTCCTTGGGTAACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230803	260336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250127_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
557367	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557368	SIRV5	+	390	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-60	875	54	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8255	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
557374	SIRV4	+	350	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	189	411	189	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
557376	contig_8069_pilon	+	1861	14	Intergenic	novelGene_136771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_10	70.0619337173405	583	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	292	1752	394109	513395	FALSE	15	TGAGCTTTTTATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKVIILLVLSTLNPSDGLFHSLYQNVQVSTPKRGDPGKPLFLTPYIEAGNTVKGKELSLVSPFLGTNLKSYCGYITVDKTYNSNLFFWFFPAQVQPEDAPVVLWLQGGPGGSSMFGLFVEHGPYVVTSNMTLRTRDFPWTTTFSMLYVDNPVGTGFSFTDDPRGYAVNEDDVARNLYSALIQFFQLFPEYKENDFYATGESYAGKYVPAIAHYIHTLNPMAELKINLKGIAIGDAYSDPESIIGGYAAFLYQIGLLDEGQQKYFQNQCDECLKHIKQGNWTKAFEILDRLLDGDLTDEPSYYENVTGCTNYYNFLQCTEPEDHTYYGKFLSLPEVKQILHVGNRTFNDGSEVEKYLREDTMKSVKPWLAEIMNNYKVLIYNGQLDIIVAAPLTERSLMAMDWKGSQEYRTVEKKVWKVFKSDDEVAGYVRQVGDFHQVIVRGGGHILPYDQPLRSFDMINRFVFERGWDPYDEQITLLKDHFRGF	380924	513504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_381068_388703_388829_394085_394272_411726_411846_429363_429479_430568_430628_432622_432703_440137_440205_455951_456075_456429_456562_465445_465545_467101_467276_486785_486969_513248
557382	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557390	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
557394	contig_6735_pilon	-	1329	13	Intergenic	novelGene_15781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	70	1281	564868	542042	FALSE	20	TTCACCCTTATGCTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYERYL	568267	541993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542054_543099_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
557403	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557412	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCAACCGCCAGATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
557422	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
557432	contig_1107_pilon	+	1270	4	Intergenic	novelGene_126573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTATGAAGACTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544194	672284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_544244_631483_632124_653413_653771_672060
557456	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73601	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
557472	contig_1618_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_141795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGATGAAAACTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317382	316585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_316600_317400
557491	contig_3602_pilon	+	1552	7	Intergenic	novelGene_60508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	4632	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	99	548	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161646	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170164_170840
557496	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557504	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
557511	contig_10575_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_141822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGACAGAGACTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504265	518512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_504590_518477
557533	contig_3233_pilon	+	1917	7	Intergenic	novelGene_56564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	335.873694845084	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1480	1794	746379	747909	FALSE	25	TTACCCACTCCCCAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738721	748032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_742698_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
557538	contig_15691_pilon	-	1705	14	Intergenic	novelGene_60750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	589.845933148709	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	872	1498	32979	22953	FALSE	35	AGAGCCAGAACTCGACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYAGYRQASALNIPVAMDTDGPLFEDVQMLGKTGSQDARQEMAFPTGPDRLRC	114445	22745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_22995_23915_24033_27942_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51928_69380_69581_114283
557543	contig_233_pilon	-	1787	12	Intergenic	novelGene_14646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1582.19200389526	3	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	95	1300	109972	78640	FALSE	20	CATGGGGTGTCCTAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKEVRGGAESGRHRRGHSGRDRPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	126994	78152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79050_79085_79142_99789_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126903
557544	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1118	0	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
557549	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
557550	contig_9727_pilon	-	2384	14	Intergenic	novelGene_86280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	294.941755357315	9	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	70	771	163331	156376	TRUE	10	TATGACTTGTGCTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHRDGQRD	169693	136912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_137777_139182_139258_139381_139501_141241_141423_154837_154993_156041_156215_156329_156396_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_169653
557554	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
557558	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557566	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
557568	contig_12786_pilon	-	1489	9	Intergenic	novelGene_103406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	531.98471253881	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	651	1427	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629630	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
557581	contig_14322_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_116188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671893	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
557582	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
557588	contig_18822_pilon	+	2035	14	Intergenic	novelGene_111724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	91.7425649567967	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	64	1173	140694	221587	TRUE	20	TGAGGTTACCGTCTCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLVHTLSLLLMPLLLGSARGLHNASQRMFKIDYSQNCFLKDGQPFRYISGSIHYHRVPSFYWKDRLLKMKMAGLNAIQMYIPWNFHEPLPGQYQFSDDHDVEHFIQLAHEMGLLVILRPGPYICAEWDMGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKVVFWVCAVPDDTP	140630	246423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_165852_166023_168082_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191263_221549_221664_223825_223958_229459_229715_246024
557609	contig_15866_pilon	+	1942	12	Intergenic	novelGene_63627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	646.076384195302	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	299	1273	601021	633133	FALSE	15	TCTAAGTGTGGCTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458878	633802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519226_519326_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
557626	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557633	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
557634	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_95708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
557640	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_95968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
557641	contig_10986_pilon	-	1258	9	Intergenic	novelGene_71475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	188.353681607236	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	486	1040	72225	67011	FALSE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80425	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_76171_76245_80189
557647	contig_4114_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_15573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAACACTAGGTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50799	48863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_48900_50800
557652	contig_4125_pilon	-	2493	16	Intergenic	novelGene_25068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	23.1253588560745	249	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	297	1391	469722	456504	TRUE	5	TCTGCGCTTTTTATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIRVTPLGAGQDVGRSCILVSIAGKNVMLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTPPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVRFQEGGFLHSSHCGVW	470018	454762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455508_455618_455681_455778_455887_456022_456186_456291_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388_460618_461229_461304_461576_461675_469694
557664	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_18698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTACGTCTACCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
557666	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
557672	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_18419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGTAATTTGGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
557685	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
557708	contig_5643_pilon	-	1924	12	Intergenic	novelGene_39150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	71.8205983482973	373	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	673	1512	662051	658287	TRUE	10	CTGCTAGTATTCCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVQGQLTDMPGKTPNSIIPALKRLSLGLVYLVGYTLLSPHITEDYLLTEDYENRPFWFRCMYMLIWGKFVLYKYVTCWLVTEGVCILTGLGFNGFDENREAKWDACANMKVWLFETTPRFTGTINSFNINTNAWVARYFFKRLKFLGNKELSHGLSLLFLALWHGLHSGYLICFQMEFLIVIVERQAASLIRESPVLSNLASTTALQPFFYLVQQTIHWLFMGYSMTAFCLFTWDKWLKVYKSIYFLGHIFFLSLLVILPYLHKAMVPRKEKLKKME	708353	657022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_657423_658274_658404_658503_658663_658740_658889_659576_659744_659840_659928_660723_660833_661998_662178_662798_662893_663452_663560_664488_664597_708116
557734	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557740	contig_6494_pilon	-	1004	8	Intergenic	novelGene_108546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1059.53409090785	28287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	15	692	8286	2953	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQATCVPFSDDTMTSQKGHFLLLVLVSAMFCGPGHRFLLQRCPVHWLI	8300	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_2912_3093_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
557742	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
557748	contig_10531_pilon	-	1967	2	Intergenic	novelGene_114533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488517	472711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_473316_487154
557757	contig_7530_pilon	-	2647	11	Intergenic	novelGene_141836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_7	62.1816693246491	293	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	549	2378	192909	171432	FALSE	20	ATTCATTTTCCGTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSVAKEVLIKLMEEFSPVVERLGFDENFVDITEMVEKRLQQLQSDECSSVTVSGHVYNDQSINLHDISHIRLLVGSQIAAEMREAIYNQLGLTGCAGVASNKLLAKLVSGIFKPNQQTVLLPESCQDLIHSLNHIKKMPGIGYKTTKRLEALGINSVRDLQTFSSKILEKEFGISVAQRIQKLSFGEDNSPVTPSGPPQSFSEEDSFKKCSSEVEAKKKIAELLASLLNRVCQDGRKPHTVRLIIRRYSSEKHYSRESRQCPIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTLLSVCFCNLKALNTAKKGPIDYYLTPSLSTTKCSGKRSLKMKDTHMEDFSKDKETNCDFLPSGRIESTRNGKSPVNNTDFSKEKGINDFPLYSFPEGIDQEVFKHLPVDIQEEILSSKSREKFQGKGSLSSPLHASGGVFSFFSTKQMQDSPSNPTDQLSSSKQVSSVSPCEPGTSGLNSSSSSYVSIQKDYEDERMSQGPKESQGFHFSNTTPTISVFHSFPDLQSEQLFSKNHTTDSHKQPSAIASHHEGFTENRQQNSAEEKITFPSDIDPEVFYELPEEVQKELLAEWKTTGSYFQLVHK	198249	171162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_172230_179259_179466_182112_182244_185539_185632_186434_186614_189495_189733_191528_191682_192875_193057_193856_194022_196662_196789_198139
557781	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557789	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557798	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
557809	contig_10159_pilon	+	2636	1	Intergenic	novelGene_30859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGATTTGGGATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800647	803283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_800600_803300
557823	contig_7428_pilon	-	2996	12	Intergenic	novelGene_77737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	171.873151379991	485	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	720	1682	441072	438797	FALSE	10	TTCCGTGCCTTCACCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFGGNFAHQASVARVVGKQGQGWAGIEASLDVEYLMSAGANISTWVYSSPGRHEAQEPFLQWLLLLSNESALPHVHTVSYGDDEDSLSSAYIHRVNTELMKAAARGLTLLFASGDSGAGCWSVSGRHQFRPSFPASSPYVTTVGGTSFQNPFRITNEIVDYISGGGFSNVFPRPSYQEEAVSQFLKSSPHLPPSSYFNASGRAYPDVAALSDGYWVVSNSVPIPWVSGTSASTPVFGGLLSLINEHRILNGHPPLGFLNPRLYQQHGAGLFDVTHGCHESCLNEEVQGQGFCSGPGWDPVTGWGTPNFPALLKTLLNT	443682	437482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440337_440577_440767_440915_441115_441303_441483_441615_441744_441950_442102_443214_443393_443641
557841	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7456	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
557847	SIRV5	-	237	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAACTGCTCTAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
557871	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557877	contig_4232_pilon	+	1110	4	Intergenic	novelGene_63218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1426.88129226724	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	170	619	148279	149200	FALSE	45	AAAAAGATTCATTAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRRAPPRGSERVCSREARARQEHAVSEPGRGRRGKSAQAASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146672	149691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146794_148230_148539_148806_148884_149087
557879	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
557893	contig_15063_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_9464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	2	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	241	1479	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
557912	contig_15720_pilon	-	1322	8	Intergenic	novelGene_41903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2124.11755506966	6	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	325	903	282638	279316	TRUE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLPSPAPGMEHCASGISQRKGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWVKMHL	283998	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279330_279709_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282573_282750_283785
557930	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	0	2967	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
557934	contig_10437_pilon	+	1247	8	Intergenic	novelGene_38308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	959.911879459011	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	472	915	443902	451175	FALSE	40	CTTTGCACAGCTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431120	451507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441768_443802_443977_445309_445476_446951_447055_451075
557975	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
557983	contig_1516_pilon	+	1592	10	Intergenic	novelGene_49991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1082.91124540846	37	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	84	1592	347241	363726	FALSE	15	TGAAGCACCTGTTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKTGPGPYLLPRPLSLSHSHLVVCALGTCVSCTPLSCRCRQTLHPPPSIFPTTAATSRPVAIEPTCMSINNS	335198	363726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360117_363516
558002	contig_8712_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_58797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAACCAAAAGGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304162	304950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_304200_305000
558012	contig_14807_pilon	-	765	6	Intergenic	novelGene_124667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	154	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	24	668	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
558024	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
558048	SIRV4	+	222	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	647	1079	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACTTTAACCGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
558058	contig_6795_pilon	+	2060	10	Intergenic	novelGene_27743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_4	304.497764998183	26	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	6	881	330553	332103	TRUE	40	AAATCAGTATTTTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVCLPTCRAFSLGAFPILCGGCRTQTRGRWGDGVKVLP	330547	333737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
558059	contig_3916_pilon	-	1267	15	Intergenic	novelGene_141851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_12	110.978417648088	478	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	155	1261	86319	6128	FALSE	20	TTCAACCCCATATTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLNKITVPASQKLRQLQKMVHDIKNNEGGIMNKIKKLKVKAPPSVPQRDYASGSAADEEEQWSDDFDGDYENPDEHSDSEMYVMPAEENGDDSYEPPPVEQETRTVQPALPFARGEYVDNRSSQRQSPPVSKTLPSKPSWPSSKAKLSSTLPSLASLQKPQVPPKPKELLEDEADYVVPVEDEDENYIHPTESSSLPSEKAPTVNRSTKPSNSSKPASPPGTASGQNRRTWESKLPSSPAAPSPLPRAGKKPATQLKITTTASQQNASSVCEEKPIPAERHRGSSHRQEAVQSPVLPPAQKQIHQKPIPLPRFPETGSPVVDGPLPSFSSNCSLSEQEADVYCKPWYAGACDRKSAEEALYKSNKV	86473	6121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_6218_7006_7084_10238_10271_10714_10800_13236_13280_14263_14292_14631_14705_23333_23406_24718_24801_32100_32265_33309_33467_37152_37194_50126_50177_62072_62139_86272
558094	contig_3975_pilon	-	2851	4	Intergenic	novelGene_54901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	20.0665559243899	22	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGAGGCTGTGTGTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117385	2112049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2113039_2113492_2116039_2117344
558103	scaffold_16539_pilon	-	1793	11	Intergenic	novelGene_68366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	413	junction_1	196.306291289913	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	26	1501	502141	490096	FALSE	35	GTAAATAACTTGTCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIPRLPGMMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502166	489803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111
558105	SIRV4	+	414	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	105	431	105	-431	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGCTCGTCATGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560	2340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
558137	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	277	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
558141	contig_3469_pilon	+	2270	17	Intergenic	novelGene_34182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	137.014925623999	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	433	1908	456854	479914	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	438520	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_438540_443464_443604_445564_445685_447278_447326_456260_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
558145	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
558150	contig_15449_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_33621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	807	junction_3	584.983380580641	3725	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	168	542	84815	88945	FALSE	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	62186	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000_86181_88888
558155	contig_12357_pilon	-	2799	7	Intergenic	novelGene_6068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48365	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29636_34133_34313_35036_35190_42109_42249_46434
558167	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
558169	contig_10500_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_41138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAATTTTTGTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11636	12697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_11600_12700
558172	SIRV7	-	351	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33218	0	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
558178	contig_3077_pilon	+	1627	9	Intergenic	novelGene_26739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	447	1130	13867	17590	FALSE	10	GTGCGGCACTTGCTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10183	18087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10332_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
558179	contig_3866_pilon	+	2765	19	Intergenic	novelGene_112401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1180	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1505	1834	183346	200506	TRUE	45	ACCAAATAACAAGCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINQPEEFEEIEIFIAQNRWFVDWNTSVFHKLIKLLEEVVPLFRIKFFLRLLLLLLPFWPLFPSLHHFLQPGHLHHHYWMTQGFHLYPFSNCQGQLLFLRRRLLFEALV	171797	223794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_172418_174189_174272_177419_177620_180389_180645_182063_182292_183051_183153_183327_183419_184713_184793_199818_199987_200496_200575_201701_201787_205906_206037_209029_209129_209213_209292_217713_217803_218724_218789_220618_220733_222500_222559_223648
558218	contig_12644_pilon	+	1325	9	Intergenic	novelGene_44633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5099.89329392047	7	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	282	1253	2678073	2680545	FALSE	45	AAGAGGCAGTGAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677425_2678046_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
558225	SIRV5	-	401	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTAATTTCGCACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
558237	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	289	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
558239	contig_7963_pilon	+	1567	4	Intergenic	novelGene_58510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	194.826988776082	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	16	936	145910	149613	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWGAHVIPLGGRLLNHASKLTCSPFSPVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSGGTSGHWEGVDEPWVLDTMLHV	145894	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149344
558250	contig_14925_pilon	-	963	4	Intergenic	novelGene_55175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	26.3986531642978	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	212	394	29675	27054	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTGFQKLVFGTGTQLLVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGQYEPKLSKPVCDRAPHTSPESGCI	42396	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26329_27018_27127_29565_29828_42337
558255	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
558270	contig_15134_pilon	-	2426	18	Intergenic	novelGene_140211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_16	100.972263141298	393	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	208	2205	216759	184453	FALSE	30	AAGAATTGGTATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKIVHVLFNHIDKSGLKDKSVEELKKRYGG	221859	184231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216789_218006_218106_221780
558282	contig_11171_pilon	+	2842	6	Intergenic	novelGene_48559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.480524780226	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	78	599	70574	93749	TRUE	35	ACCATTTCTGAATAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQKWSL	70496	107832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88415_93731_93804_104185_104253_105710
558303	contig_9515_pilon	-	1918	9	Intergenic	novelGene_73823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	2	808	72653	66703	TRUE	25	GTAGTTAAATTCCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEWKRARVGHLGQVHLSSGIRDLIQSRGLGVCLVSRKVFLGVALLQRWLGAQDLDHLGRLLPISDNLHLGLALPLTVPNGQGQVPCLVALQDVGLATTPGKDGLTQVQDEAVPSVEAVPAQRSLRGSDVLLPLHVVEFLDGSWGGPWGGLVEC	72654	65135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_65901_66072_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68347_68727_68822_69341_69476_71787_71873_72459
558306	contig_11285_pilon	-	1472	13	Intergenic	novelGene_5679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	369.610117406016	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	62	1282	796157	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVSARRPAPRHPEVPNRSSQLDNSCVGAGMTPSHAHPAQVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSPQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796218	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787171_793832_793961_794413_794467_794607_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126
558317	contig_5153_pilon	+	1335	10	Intergenic	novelGene_74405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	286.663092139643	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	212	802	1015039	1022174	FALSE	80	TAGAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	1012104	1022707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1012131_1012820_1012937_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
558334	contig_753_pilon	+	1333	5	Intergenic	novelGene_112971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	889	1212	1187040	1192781	FALSE	50	AATGTACAAGGGTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSFIKMNSQARQNFFLSYIYCLSMPFSSLIPSCELWLSTTQKMCNKVCFTAHMYMSFMWTAPQAFVKCSTVALLFAAIKFTNQDIVCSEDFIFAISAKPVLSKIGF	1183687	1192902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1184293_1185654_1185851_1186952_1187127_1188198_1188412_1192757
558338	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
558343	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
558346	contig_2636_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_52040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAGGAAAAAAAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15791	17311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_15800_17300
558354	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
558355	contig_14209_pilon	+	1766	11	Intergenic	novelGene_88312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	173.582285962595	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	81	899	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32285	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37846_40148_40344_40418
558359	contig_14744_pilon	+	1532	6	Intergenic	novelGene_66062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	3452.52825622036	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	18	542	1382976	1384621	TRUE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKVSGHSGRIPLFAYVG	1382039	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1384429_1385233_1385820_1386006_1386499
558362	SIRV4	+	307	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	668	973	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
558374	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
558379	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
558409	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
558416	contig_16126_pilon	-	2961	18	Intergenic	novelGene_141878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_17	45.318557195674	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	950	2853	8	2860	106789	47184	FALSE	30	TGTAGTAAAATGCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKTKIAKCPLKTKQTGHILKSTQNTCVRSEKHLQKKRIGSETSLAKGEKNKTTFSPTKDLCKQYEDNDCLHIQKGISPATPNMPKTRNTITTSAAKQKPCRNHIAAENMKSNLVCLTQDQLQQILMTVNQGNRPISLTENGTEETSQYSLHFNNIPNQPEDENVMGLLQKTEAVSSVSDENKSVLNKKQETSKQLEQKIATETVWKPADIFSTLGERERDRSLLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEASEKWNNNPWKKSESDKTVWEKPQILDQSREAVPLEPPVSAVKQEQQKKWIGELNKQIEEDRQRKRMEKMIYSKGEERDRWAMHFDSFKGYPGSQSQLSSRSTHKQEYLCVSPDTQELADISSVCTPTNGSQVGPSGERPTARPVRDVAVTDSQKMNFLRSMTALLDPAQIEEQDRRRQKQLEHQKAITAQVEETRRRKQLEEEQRKREEREEERRLAREREAVQRQYEEDILKQKQKEEIMTLKTNELLQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLLKNLGGDTIQMEYNASTNNISNLRHSSDEAGGKMNTCVNYTTSPKKDTGVQTDDLNTGMFSTESHCGSVLEREIIDCPSPEISAEFNGQFNTKKNKQELSQDKGANLENSWHSGHCNQLTRTEKQIRHMKKCLKRPDWNIHKPLRGYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLHLVERNNLGHLSPNSSSSPEALPTSHQETESRFRWHLVKKEEEPLKINSFSKESRPQSPIPAVKNRTQQTQTNTLHLPLKNSSYERENLISEASQTESSLGISEPSDFIPYVRTNEIYYLNPDAPLSGPSTQDPQYQNSHDGDQEQQQLSESDLVRDPLLNPNLVRNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELETNLMPSAANQEENFSSLF	106796	47082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_47271_48546_48675_48939_49200_50842_50884_51363_51849_54828_54970_60298_60444_63164_63327_64113_64199_64397_64646_65261_65394_79850_79976_81806_81911_82095_82262_95666_96109_103829_103856_104569_104635_106778
558435	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_18727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCAGATCAACCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
558449	contig_12873_pilon	+	1956	6	Intergenic	novelGene_27160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1148.66332752465	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	400	1320	16357	19650	TRUE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYTITTPWPGSSWQ	15957	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19260_19611_19703_19851
558452	contig_10235_pilon	+	2180	7	Intergenic	novelGene_46419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	229.476215179991	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	26	733	210483	212121	TRUE	25	GCCATGCCTCAGTACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFALFPPHSSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPGAEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210457	213668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211815_211924_212047_212319_212418
558453	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
558455	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16430	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
558456	contig_12864_pilon	-	455	4	Intergenic	novelGene_76454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	261.626111506903	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGTAGGATCTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252159	248850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_248979_249536_249681_251863_251999_252111
558475	contig_13707_pilon	-	2307	12	Intergenic	novelGene_43541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	810.931828054656	1	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	839	1267	272378	270728	FALSE	30	ACAAAAGTGGTGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275526	269687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273740_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274555_275197_275274_275413
558478	SIRV4	+	390	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	887	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGCACATGCTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2342	2732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2700
558498	contig_1225_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_44206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTCTGGCCTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274779	276794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_274800_276800
558507	contig_7045_pilon	+	2391	6	Intergenic	novelGene_77442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	184.396312327552	269	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	165	977	323324	364311	FALSE	20	AAGCTTGTATTGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFSEAALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEVRNLFLL	323159	365725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111
558536	contig_10940_pilon	-	3043	18	Intergenic	novelGene_49192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_14	63.9416364505345	296	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	536	2371	421751	400258	FALSE	20	ACAAGTCGTGTGCGGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQALIASARRLPAVNMFEQGHGKLDLLRAYQILNSYKPQASLSPSYIDLTECPYMWPYCSQPIYYGGMPTIVNVTILNGMGVTGRIVDKPDWQPYLPQNGDNIEVAFSFSSVLWPWSGYLAISISVTKKAASWEGIAQGHVMITVSSPAEMESKNSAEQTSTVKLPIKVKIIPTPPRSKRILWDQYHNLRYPPGYFPRDNLRMKNDPLDWNGDHIHTNFRDMYQHLRSMGYFVEVLGSPFTCFDANQYGTLLMVDNEEEYFPEEIAKLRRDVDSGLSLIVFSDWYNTSVMRKVKFYDENTRQWWMPDTGGANVPALNELLSVWNMAFSDGLYEGDFTLANHDMYYASGCSIAKFPEEGIVITQTFKDQGLEVLKQETAIIENVPILGLYQIPAEGGGRIVLYGDSNCLDDSHRQKDCFWLLDALLQYTSYGVTPPSLSHSGNRQRPPSGVGSITPERMEGNHLHRYSKVLEAHLGDPKPRALPACPHLSWAKPQPLNETAPSNLWKHQKLLSIDLDKVALPNFRSNRPQVRPLSPGESGAWDIPGGIMPGRYNQEVGQTIPVFAFLGAMVVLAFFVVQINKAKSRPKRRKPRVKRPQLMQQVHPAKTPSV	431938	399585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_400455_401669_401801_405355_405483_406695_406828_408819_408961_411133_411212_411884_412010_412777_412935_413529_413646_414423_414597_415145_415335_418409_418555_421626_421789_423983_424137_426124_426228_428768_428837_429970_430088_431881
558542	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
558552	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	6	1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
558560	SIRV7	-	224	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69035	21	35816	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78922	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
558565	contig_14711_pilon	+	2611	16	Intergenic	novelGene_68887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	375.313770952608	1	98	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	526	2367	83997	90570	FALSE	10	CTCAGTTGTCATTTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70414	90814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_84889_84972_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
558567	contig_15559_pilon	-	2684	1	Intergenic	novelGene_141895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGGAAAAATAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159636	156952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_157000_159600
558602	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
558603	contig_12790_pilon	+	1854	10	Intergenic	novelGene_35247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	268.623238839168	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	331	1059	309644	312473	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305965	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_313157_313228
558609	contig_9415_pilon	-	2696	15	Intergenic	novelGene_109869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	106.314128306406	47	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1125	2108	2033980	2027180	TRUE	5	TCCGAGCCTGGGCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQELETGIVDLLIPSPNATAEVGYNRDRFLFNPSACLDEHLMQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPLVWKQLCCVPLSLEDLEEVDLLYVQTLNSILHIEDSGITEESFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLTFSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREGMSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVEVLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWRTLEEFSNEERVLFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQPVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY	2049483	2026548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2027001_2027043_2027366_2029894_2030201_2031414_2031568_2032050_2032304_2033088_2033166_2033971_2034007_2034397_2034556_2035744_2035915_2037808_2037948_2044478_2044649_2046276_2046380_2047124_2047248_2048593_2048750_2049404
558618	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
558619	contig_9363_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_6780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCATACAGTGCATGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511919	1511322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1511300_1511900
558627	contig_6283_pilon	-	3637	4	Intergenic	novelGene_100223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_1	124.354332453679	74	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	643	1551	641423	626349	FALSE	20	TACCTCCAGGGCTCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCPTDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQVRALEPWGLIAP	642065	624262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_626508_628015_628334_629452_629674_641212
558628	contig_12414_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_59623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598144	600682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_598100_600700
558634	contig_1532_pilon	-	1820	7	Intergenic	novelGene_37414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1619.98927465585	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	540	1076	15864	13113	FALSE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34884	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15879_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29481_34800
558643	contig_7171_pilon	-	1878	13	Intergenic	novelGene_101381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	114	junction_12	914.196581096697	675	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	209	1579	1372066	1363653	FALSE	15	CTAGAGCGCTTGCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRKLPSVCSLFDPGRPAGLAAELENYDDPHKTPASPVVHIRGLIDGVVEADLVEALQEFGPISYVVVMPKKRQALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQKISRPGDSDDSRSVNSVLLFTILNPIYSITTDVLYTICNPCGPVQRIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKPTRLNVFKNDQDTWDYTNPNLSGQGDPGSNPNKRQRQPPLLGDHPAEYGGPHGGYHSHYHDEGYGPPPPHYEGRRMGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1377129	1363353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233_1367306_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690_1372810_1377053
558651	contig_12414_pilon	+	1633	2	Intergenic	novelGene_59574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	43	1101	370898	374054	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFGSHRGVEEQAVTMDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370855	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
558652	contig_5643_pilon	-	1908	9	Intergenic	novelGene_38721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	438	junction_1	154.218189588647	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	26	1144	48733	32155	FALSE	40	TATGTTGCACTAATAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPPWPDMGLPTVPGLLPPLVLLALLVGIYPSGVIGLVPHLGDREKRDNLCPQGKYNHPQNNSICCTKCHKGTYRYNDCPGPGLDTDCRECETGTFTASENHVGQCFSCSKCRKEMDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADGEFLAGSQLRAQGRSF	48758	31390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461_37616_48694
558664	SIRV6	+	388	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10437	1	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11437	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
558665	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
558672	contig_9548_pilon	+	2615	3	Intergenic	novelGene_141064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTACCTTCTCTATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142289	145400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_143023_143282_143404_143639
558686	contig_8394_pilon	-	1930	3	Intergenic	novelGene_27314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	253.5	61	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	689	1657	33434	32466	FALSE	30	TTTATGCAAAGTGTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39014	32192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35343_35523_38754
558691	contig_990_pilon	-	2053	6	Intergenic	novelGene_76118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	125.705369813704	65	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	18	542	1605903	1586999	TRUE	25	CTCACCTTTGTGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1605920	1585412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1586358_1586432_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
558700	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
558713	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
558728	contig_8317_pilon	+	449	2	Intergenic	novelGene_19359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
558729	contig_19769_pilon	+	699	5	Intergenic	novelGene_102320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	210	665	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87357	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
558752	contig_2100_pilon	-	1352	10	Intergenic	novelGene_50688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	833.95707027504	283	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	108	1157	1182812	1170114	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTAQTRTAGPSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185518	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170201_1173275_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
558768	SIRV2	-	423	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	53	3256	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
558780	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
558781	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91678	4	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
558788	contig_10311_pilon	-	2151	6	Intergenic	novelGene_50479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_5	1064.20381506552	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	179	580	70287	68584	TRUE	55	GTAAAAAAAGACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLRSLQLFSRELLFLVLKIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVSFFSPCCTAGDVVKCRYC	71559	66781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
558796	contig_5967_pilon	-	1735	10	Intergenic	novelGene_44389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_4	268.047674034966	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	101	1246	488569	388566	FALSE	40	CTATCAGCCCTACAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517602	388076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
558798	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
558809	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
558810	SIRV5	-	368	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAAGATGCGTAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
558816	contig_8710_pilon	+	2471	17	Intergenic	novelGene_73536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	519	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGGACTAGGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458487	521032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_459119_460706_460828_462651_462796_480217_480363_481184_481318_481629_481745_482104_482252_483151_483280_483791_483890_483993_484154_484362_484461_495500_495617_497794_497862_502009_502097_516296_516415_518639_518755_520984
558836	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
558841	contig_2204_pilon	+	1531	7	Intergenic	novelGene_71649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	176.575526805576	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	30	917	13204	50221	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	50835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38727_38845_48669_48717_49912
558844	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
558845	contig_14925_pilon	-	1000	5	Intergenic	novelGene_55115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	1543.31088896567	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	205	462	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTRLIFGQGTTLQVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	73134	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_73082
558859	contig_10793_pilon	-	1187	12	Intergenic	novelGene_83422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	167250	163989	TRUE	35	TGGAGAGAAATGTCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCKNKNKRTNKQQKKLEIGLSNDVNSSFPGEQKLSSRPHTSCFTVACTLLGFDPSSRHSLDHFPHLLLLPLHSLTSSSSSSIASPVKYNTDLGIIRSRKK	167251	146951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_146992_151413_151496_152862_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161459_163105_163288_163929_164078_165325_165375_166399_166466_167148
558860	contig_9345_pilon	-	1961	6	Intergenic	novelGene_24343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	4	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	24	962	176056	142100	FALSE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176079	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
558863	SIRV4	+	250	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	644	1054	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
558865	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
558872	SIRV7	-	288	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68998	0	35779	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78959	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
558877	contig_8636_pilon	-	2902	1	Intergenic	novelGene_141926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAACCAGAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391131	388229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_388200_391100
558885	SIRV2	-	198	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	461	2958	-461	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCTGTGGGAGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
558886	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	34	3407	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
558908	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
558919	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	118	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
558945	SIRV4	-	346	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACGATTGCCACAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
558952	contig_5954_pilon	-	1670	10	Intergenic	novelGene_28665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	494.345533177796	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	860	1555	947127	944841	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQAFTELSTSTCLHHGFVQTRVLTGLDSATTGLGRGRAPLPLPEWPRPIPRPICSP	956473	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945006_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948088_948197_956121_956291_956379
558966	contig_18869_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_56003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTAAAAATGTGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
558987	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
559016	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
559033	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
559043	contig_13481_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_119489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAATGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322416	1324109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1322400_1324100
559052	contig_5671_pilon	+	1057	6	Intergenic	novelGene_79435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_5	728.393684761201	39	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	81	503	370430	531238	FALSE	35	ATTGCATATATATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368844	531792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
559072	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
559080	contig_7321_pilon	-	2378	12	Intergenic	novelGene_53124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	168.235372308762	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	761	1579	173627	114374	FALSE	30	AAATAGACCTTTTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	207800	113574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655
559104	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
559105	contig_12414_pilon	+	1324	3	Intergenic	novelGene_59564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	90	662	370898	373924	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVTESHPLCLPWGQV	370808	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373528_373883
559131	contig_10734_pilon	+	1963	5	Intergenic	novelGene_51305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	370	junction_4	219.318261893532	26	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1050	1400	1378305	1388936	FALSE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368738	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
559132	contig_10311_pilon	+	2741	6	Intergenic	novelGene_50492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	47.0089353208515	19	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1462	2211	245829	251428	TRUE	45	TAATGAAATTGTGTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVMSQVYKQTLAKSSDTLVGAHVKIHRCNEAFIYLLSPLRSVTIEKCRNSTFVLGPVQTALHLHGCDNVKVIAVCHRLSISSTTGCVFHILTPTRPLIFSGNQTVTFAPFHTHYPMLEDHMARTGLATVPNYWDNPMVVCRESSDTSVFRLLPPCEFYVFIIPFEMEGDTTEIPGGLPSVYQKALAQREQKIQIWQKTVKEARLTKDQRKQFQVLVENKFYEWLINTGHRQQLDSLVLPAAGSKQAAG	237723	254786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_238753_242425_242793_245763_245951_246100_246599_251298_251451_254278
559149	contig_11338_pilon	-	1794	10	Intergenic	novelGene_6228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_9	82.8506018217262	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	627	1667	16734	12549	FALSE	30	TTATGGAAACCTGACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21359	12421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_17288_21286
559185	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
559189	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	19	351	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14427	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
559211	contig_4301_pilon	-	2162	6	Intergenic	novelGene_65111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	181.141933300934	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	518	673	543732	539500	FALSE	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVGGAAAVCCAVSALWRLCLHLGVCVPRLPPRQAVDLTRVPCEPEVTWSFPVLTVSWILRVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKEMD	575646	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542304_542416_543699_543840_547294_547521_551247_551329_575543
559212	SIRV6	-	325	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTCTGGTTGGTTAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
559221	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33222	0	3	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
559227	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_16626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27850	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
559231	contig_12622_pilon	-	1760	11	Intergenic	novelGene_5995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1735.34383048432	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	237	1376	1588902	1585459	TRUE	30	CTAATAAATTTGGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDSGPTGPPTAGPSEAPTASPSEAPTVPLDPADDACNVYIFDAIAEIRDHLHFFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFFSDRCDPFLLQGARCGCTQARRRWARGGWTSWAWVRRWITSPASFLGARVRRCYSAGNDSGGST	1589227	1583575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585731_1586266_1586407_1586528_1586692_1586764_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098
559263	contig_5988_pilon	-	2388	9	Intergenic	novelGene_15857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_8	37.920146360477	122	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	52	1788	295500	270782	FALSE	30	TAGGTGGGAAGGTGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGERKNNNKRWYFTREQLENSPSRRFGLDPDKELSYRQQAANLLQDMGQRLNVSQLTINTAIVYMHRFYMIQSFTQFHRNSVAPAALFLAAKVEEQPKKLEHVIKVAHACLHPQESLPDTRSEAYLQQVQDLVILESIILQTLGFELTIDHPHTHVVKCTQLVRASKDLAQTSYFMATNSLHLTTFSLQYTPPVVACVCIHLACKWSNWEIPVSTDGKHWWEYVDATVTLELLDELTHEFLQILEKTPNRLKRIRNWRACQAAKKTKADDRGADENTSEQTILNMISQSSSDTTIAGLMSMSAASTTNAVPSIPATEESSSNLSSVEMLQNEHWLSSQPPFKLEHAQGHRTSENVALTGVDHSLQHDGSNAFVSQKQSSKSVPSAKVSLKEYRAKHAEELAAQKRQLENMEANVKSQYAYAAQNLLSHRDSHSSVILKMPIEGSENPERPFLEKADKTALKMRIPVAGGDKIASSKPEEIKMRIKVHAAAEKHNSIDDSGTKSREHKEKHKTHPSNHHHHHNHHSHKHSHSQLPTGTGNKRPGDPKHSSQTSTLPHKTYSLSSSFASASSTRKRGPP	295551	270181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_271742_272716_272788_272950_273115_274272_274319_277641_277705_279115_279177_281078_281208_293531_293614_295339
559268	contig_14322_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_115805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559284	contig_9516_pilon	+	3823	4	Intergenic	novelGene_106189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	874	1266	945649	946041	TRUE	60	AAAATAAAAATACATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSWSESNHKLKIKSQSPQWGDVLNLVGFEVISGQISTSLTGGQSCRKVLSPRYDFLRPQTRGDLTVKLFTFLGKREQASVVSIEGGHCPGVPWIFFEISVLLPHLKNRKNRTMTDKEWEKRQLSDLKM	944775	952621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_946501_946627_946665_946817_946936_950678
559323	contig_20951_pilon	-	147	1	Intergenic	novelGene_43101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGAGGCCCCCCTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28881	28734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
559340	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
559346	contig_10299_pilon	+	2150	18	Intergenic	novelGene_79683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	84.0518870887703	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	729	1988	337016	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320488	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_334994_336952_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
559350	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559354	contig_1076_pilon	+	2621	4	Intergenic	novelGene_101128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	119.444082686791	10	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	454	759	973982	982645	FALSE	40	AATTGCAAAATTATTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMTFILIR	945658	984507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980865_982625
559370	contig_11702_pilon	-	2294	8	Intergenic	novelGene_141962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	152.048595883698	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1526	1975	313781	289501	FALSE	20	TTGTTACGACGCAATCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321141	289181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_319430_319753_319887_321065
559383	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
559406	contig_6576_pilon	+	1758	2	Intergenic	novelGene_42382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	376	1179	1282674	1289135	FALSE	35	ATATTAATACTTGTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWTMASHSWCMKITSILKDMKLTGHYLHLAWLMTTVFFLSPGTKANYAHLWANNTIWDPVIQNKTGKNQDENINTNPITPEVNYKGNSTSKPEIATSSHIISLTPKSEQIYTLSVLRNSSPPVQNTENTSKSHSEILKKDVCDENNNKTAMLICFIIIAVLFLVCTLLFLSTVILANKVSSLRRSKQAGKRQPRSNGDFLASSGLWPAESDTWKRAKQLTGPNLMMQSTGALTATRERKDEEGTETLTNRCFNEEKCKVAMRKTME	1282298	1289714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1282713_1288370
559408	contig_10331_pilon	-	2910	15	Intergenic	novelGene_54102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	244.879739330746	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1965	2750	318178	304759	FALSE	25	AATGATTTTCTGATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	371625	304598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312126_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_320196_321424_321525_325324_325414_332861_333045_355498_355627_371587
559410	contig_10016_pilon	+	2695	11	Intergenic	novelGene_117853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	231	707	298367	305683	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDNGSVVQQILQEAANQESKDFSRAGEVFMFPAMFQEQFFQKNFVLFISFAPFYLLVQLCNQFILKHMEIAISTEIELTLHHIKENGDCGFSELYFGGQSDLQNGTHHGWDEFDFVGTQVIPHVPDSKADFLSHVPVFLKFCCAWLERRFQAEGTHG	294331	313240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_294385_296529_296621_297237_297279_298321_298481_300561_300649_301512_301666_302033_302094_305620_305723_306643_306720_308027_308123_311462
559412	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559437	contig_12638_pilon	-	1450	12	Intergenic	novelGene_33201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	260.950519358975	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	276	1307	333134	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNLLTEVLLSQVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333547	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332789_333007_333274_333411
559439	contig_10904_pilon	+	1887	5	Intergenic	novelGene_22649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	1321.05816961253	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1070	1498	530908	534035	TRUE	30	CGGATCAGAACTTTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHISLRRWHV	529838	535185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531005_531238_531362_533736_533924_534013_534186_534946
559447	contig_12622_pilon	+	2569	8	Intergenic	novelGene_5858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	94.5858858176967	205	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	531	2159	1107540	1111730	FALSE	5	CAGCTTGGTTTTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISHGLVSFKDLIVDFTQEEWQQLDPAQRLLYRDVMLENYSNLVSVGCHVSKPDVIFKLEQGEEPWMEEEFSSQNYSEVDGALKKNEDVQNKHLMQIVFFSNNTLIAERADIFGNTFNLGMNIVPSIKIPYKDDSCGNSSKTNSEVIVKKSYFKRIPNEYSGCGKLLFHTKHEITHSGMKKYKYNQIRKARIQSEDLILHQNIQTLKQAYDYNKCGKTFKRTVLITQKKVNSERKPNECNECKKTFSKKSNLIVHQRIHTGEKPYVCNDCRKTFRVKTHLTRHQRIHTGERPYECSECGKTFTDKSALIVHQKIHRGEKSHECDECGKTFFRKSSLTEHFRSHTGEKPYECEECGNAFSKKSYLAVHQRTHRGEKPNECNECGKTFFCHSALTAHQRIHTGERPYECNECRKTFFCQSALNVHQRTHTGERPYECNECGKTFCQKFSFIEHQRTHTGEKPYECNECGKAFCHKSTLRVHRRIHTGEKPYECNECGKTYRQLWTFTEHQKIHTGEKPYECNICEKTFRHKSNFLLHQKTHKE	1098399	1112140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098707_1099890_1100008_1103000_1103062_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986_1109080_1109919_1110974_1111390
559448	contig_7839_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_45752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTATCAATATGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099129	1098911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1098900_1099100
559454	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
559459	contig_9955_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_21251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAATATTATCAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12697	12312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_12300_12700
559468	contig_4531_pilon	-	2511	9	Intergenic	novelGene_47918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_8	37.180093800312	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	689	1888	422163	413360	FALSE	15	TATACGCATTCTGCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRERCSKIQCAWLLVFLAGSSVLLYYTFHSQSLYYSLIFFNPTLEHLSFWEILWIVGITDFVLKFIFMGLKCLILLVPSFIMPFKSKGFWYMLLEELCQYYRTFVPIPVWFRYLISYGEFGNVTRWSLGILLALLYLILKLLDFFRHLRTFRQVLRIFFTRPSYGVAASKRQCSDVDDICSICQAEFQKPILLICQHIFCEECITLWFNREKTCPLCRTVISDHINKWKDGATSSHLQIY	423485	412736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_419856_419958_421469_421547_421757_422218_422851
559469	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
559487	contig_9797_pilon	-	1658	4	Intergenic	novelGene_65575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1940	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	720	1106	191434	189331	TRUE	20	CGGCGGCCATGTTATAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSLLQLRVADGARVVPVILLEEVFPLLDEFP	192153	172226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_172567_188574_188734_189277_189420_191136
559522	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
559557	contig_7202_pilon	-	250	2	Intergenic	novelGene_18629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATTTTGCCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30013	28599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
559578	contig_16303_pilon	-	1503	8	Intergenic	novelGene_34096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	727.191241724497	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	88	630	47976	37644	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIALMERLL	48063	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33221_35375_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37667_38711_38856_40433_40731_47897
559628	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
559633	contig_14322_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_116454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559637	contig_12603_pilon	-	2515	17	Intergenic	novelGene_105812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_15	77.421507630309	71	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	598	2166	635920	618517	FALSE	45	AAAATTTAAAGGTGTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEPAVRSYLSPAQFCSRHEAAGATVATDLVLSLRSSPRQVFIHNPHTRSQHFSASRVIQSPLESDVSLLNINQAVSCLTAGVLNPQLGYDALLVGTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVDARSDRTGEVIFKDNFSSAIAGVVEGDYRMDGHIQLICCSVDGEIRGYLPGTAEMRGNLMDTSVEQDLIRELSQKKQNLLLELRNYEENTKAESSSPLSEADGHRGIIPANTKLHTALSVNLGSETQAAHAELCISTSNDTIIRAVLIFAEGIFIGESHVVHPSIHNVSNSICIPITPPKDVPVDLHLKTFVGYRSSTQFHVFELTRQLPRFSMYALTSPDSASEPLSYVNFVIAERAQRVVIWLNQNFLLPEDTNIQNAPFQVCFTSLRNGGQLYIKIKPSGEITVNTDDIDLAGDIIQSMASFFAIEDLQVEADFPAYFEELRKVLIKVDEYHSVHQKLSADMADNSNLIRSLLVRAEDARLMRDMKTMKNRYMELYDLNKDLLNGYKIRCNNHTELLGNLKAVNQAIQRAGRLRVGKPKNQVISACRDAIRSNNINTLFRIMRVGTASS	643194	618167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_618624_619319_619469_621985_622099_623815_623954_625011_625144_626303_626434_627093_627266_627356_627502_627692_627833_628017_628154_631065_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248_638477_643077
559653	contig_11386_pilon	+	1591	6	Intergenic	novelGene_82754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	299.026018934808	78	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	898	1344	17940	24960	FALSE	5	TTTCACTGTTGCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVH	7878	25207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19974_24958
559654	contig_7202_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_17522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
559656	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
559660	contig_16907_pilon	+	2239	6	Intergenic	novelGene_87423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	928.731952718329	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	307	1044	327210	363082	TRUE	45	ACTAGAAAAGCTAATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRGRGDKRRASRSRGVGLRCWAGCGTYCLIVRSLLLLLLFVLFSYLATLGAPSRRPSRRLSRRALPDPGWFSLPSVPLPVSSPRPLPDRRRHPSPARRLSTMEKTELIQKAKLAEQAERYDDMATCMKAVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGGRRSAWRVISSIEQKTDTSDKKLQLIKDYREKVESELRSICTTVLELLDKYLIANATNPESKVFYLKMKGDYFRYLAEVACGDDRKQTIDNSQGAYQEAFDISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNNPELACTLAKTAFDEAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDSAGEECDAAEGAEN	326903	364378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_327504_358180_358305_359987_360152_361003_361100_363022_363133_363233
559661	contig_5954_pilon	-	2464	15	Intergenic	novelGene_28641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	394.861768631164	1	100	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	653	2104	956264	945083	FALSE	15	ACCATCCGTCCTTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960574	944722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956709_956942_959766_959941_960474
559683	scaffold_13505_pilon	-	667	3	Intergenic	novelGene_111446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535623	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531057_532853_532999_535516
559686	contig_1516_pilon	+	2310	11	Intergenic	novelGene_49986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1089.74450675376	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	88	1356	347241	360102	TRUE	5	TGTTTCCTCTCTTCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLRLPSTTCNCLRSSAAWRPLPATPQKPPPWAPWRPRSSAAVGP	335194	363735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359973_360125_362116_362299_362985
559694	contig_14322_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_115764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
559697	contig_5988_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_16148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACCAAGCATGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1902627	1901304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1901300_1902600
559708	contig_11396_pilon	-	2133	8	Intergenic	novelGene_71272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	699.236814283244	1001	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	111	731	249053	232299	TRUE	0	CCCTCTTCGGCTTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLVRVYAASDSRRCSSGSSRSRPRPRRLLRPGRRLNMDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249163	230857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_231273_231311_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
559709	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559710	contig_7202_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_19074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
559723	SIRV7	-	256	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69030	0	35811	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78927	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
559739	SIRV7	-	348	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	0	2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
559750	contig_4759_pilon	-	1775	3	Intergenic	novelGene_106335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	598	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGAGCCTGACTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641684	586091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_641501
559764	contig_19851_pilon	+	1020	7	Intergenic	novelGene_29817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3181.21203317226	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	153	668	53637	56177	FALSE	25	AATTGTTCCGTGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53419	56529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53513_53577_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
559784	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
559799	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_16511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
559808	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	19	348	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14427	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
559813	contig_3774_pilon	-	1421	11	Intergenic	novelGene_142031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	166	junction_9	116.585762424063	2258	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	215	1219	210407	144743	FALSE	10	TTGGACCTCTGCTGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210621	144540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
559823	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
559836	contig_1337_pilon	+	2690	8	Intergenic	novelGene_84258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAAGCACAGATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547130	565390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_549095_550765_550943_552351_552395_554071_554172_555742_555806_563521_563661_564516_564628_565297
559848	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
559851	contig_5020_pilon	+	1687	8	Intergenic	novelGene_27794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	929.199611691345	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	455	1378	122915	125772	FALSE	5	ACCTTGGTGTCTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEALLPIGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118370	126081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124341_124428_124547_124909_125091_125657
559856	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
559900	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
559917	SIRV7	-	910	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	21	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147611
559977	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
559981	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
559985	SIRV5	-	395	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGAATTTACGGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
559995	contig_15304_pilon	-	1197	4	Intergenic	novelGene_30622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	214.044128368168	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	175	1185	66228	64436	FALSE	5	TGCCTGGAGCCCTGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPASWRSASLTGSSRRPSPAMWSMRHCLKQEFRRNRCRKAPVIDIPLSYPLPGPVSWGGGLGKWRTGQTLHMLCNDPGKPPQ	66402	64423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64678_64988_65310_65396_65721_66104
560001	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_116249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
560004	contig_20493_pilon	-	2435	12	Intergenic	novelGene_86398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_10	64.9056530793189	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	190	1473	54509	37388	FALSE	35	ACCCTCTCAGAAAACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPAAPTAELVLGAPGPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55245	36425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_54457_54665_55211
560021	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
560026	contig_5947_pilon	+	2281	10	Intergenic	novelGene_101615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	176.395389206559	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	240	1037	995846	1005780	TRUE	15	GGAAGGAGGCTGTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	993747	1007420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737_1006001_1006396
560028	contig_16846_pilon	-	1123	4	Intergenic	novelGene_82955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	3741.8489487893	97	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	92	493	555122	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPDLRAGSATHRAPSPHQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558746	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555156_558688
560032	contig_3193_pilon	-	2744	9	Intergenic	novelGene_126300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	67.5536823570707	257	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	60	2039	98257	47316	FALSE	10	GGCGTCACTTTGTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRGLQGFVGSTCPHICTVVNLRDLAERHRSKHPGCSPTVVVDAMCCIRYWYTPESWVCGGQWREYFSALRNFVNAFAEVGIKLVFVFDGIVEQDKRDEWVKRRRKNSREISRIFQYIKSHGEQPGRHMFFIPPGLAVFTQLALKALGQEAHCSLQEADYEVASLGLQDGCLGVLGEDTDYLIYNTCPYLSIRELCLDTLDTVMLCREKLCESLCLSVTDLPLLACLLGNDVIPQGMFESFRYKCLSAYTSVKENLNKRGNVILAVADHIAKVLRLHQGEKKLEEMLPLGPNKALFYRGVASYLLPGQKSPWFFKKSKAVTTLDKQILSMSSDSESKQEVAMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVPMCTDPESRQEVPMCTDPESRQEVPMYTDPEFKLEVPMCTDPDIKQVTMSSDPEIKQQVTPCSDPEIKHEVTMVSDPEILEVARAHHVWGESYLVYNVMSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVDTLGLEDLQALIAQALQGQPWRYPGPGRRQCEHDQWRRYSSSSGWSR	113214	46610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47329_50395_50448_61027_61060_79058_79109_80133_80307_81725_81831_94139_94321_96883_98270_113167
560035	contig_7202_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_18335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27943	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560061	contig_11082_pilon	+	2173	6	Intergenic	novelGene_142057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	42.2582536316871	865	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGAACATTTGTGCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137134	144311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_+_137180_138136_138265_138498_138570_140169_140241_141637_141781_142596
560065	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
560095	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
560101	contig_15063_pilon	+	800	3	Intergenic	novelGene_13527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3530	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	202	501	34808	36504	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICLQQLCHQHPDARASGPGLLLHLQHPERV	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35131_36415
560103	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
560104	contig_3721_pilon	+	2999	10	Intergenic	novelGene_123797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	212.068006795398	2	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	589	1443	91265	102235	FALSE	20	CTCTTTGTGTTGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63811	103791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73150_81605_81660_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
560121	contig_7594_pilon	+	741	4	Intergenic	novelGene_55397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	20	430	369120	370420	TRUE	30	AAAGTTACGCTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLNSEMWKILVEMILPTIRTLFGLSSTFTPQVLLDPCVLDGLSSVSTSSDEGNCQLSAKVNVQPLGVEALLLVTSSVPESVPAVGSGDADGCVQASTPSPELFDGDGNSAGGAQLMESLFCKKCFKRVFLGMLCLLIALRS	369100	372631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_369149_370038_370539_371639_371784_372582
560132	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
560139	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
560164	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
560167	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
560179	SIRV4	+	314	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	668	966	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
560191	contig_4105_pilon	+	2512	12	Intergenic	novelGene_21471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	117.824494780364	1	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	26	1354	58775	73266	TRUE	30	TATCAGAACTGCCGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAELRGLWMRRTRRPRFVLMNKMDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58749	74476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_74190_74241
560201	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842770	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
560206	contig_14666_pilon	-	2626	6	Intergenic	novelGene_39670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	101.298766033945	656	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	88	672	502764	495281	FALSE	15	GTTTTTCCTGATTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIWTSEHVFDHPWETVTTAAMQKYPNPMNPNVVGVDVLHRHVDPSGKLHSHRLLSTEWGLPSIVKSLIGAARPKTYVQEHSVVDPVEKTMELKSTNISFTNMVSVDERLIYKPHPQDPEKTVLTQEAIISVKGVSLSSYLEGLMASTMSSNANKGREAMEWVIRKLNAEIEELTASARGSMRTPMAAAAFVEK	502851	493326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_495401_496716_496820_496942_497014_497456_497547_498683_498853_502732
560230	contig_6544_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_142095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99782	98436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_98400_99800
560233	contig_7202_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_17933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGGATTTCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
560239	contig_11171_pilon	+	2445	9	Intergenic	novelGene_48574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.957072762808	7	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	286	1338	86114	106753	FALSE	15	CTACCTTTGAGCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARWRTYPWTNSSGSAGWRQRGVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTCPVPAVLAFWVSLLGGAALLPVPVWHGIHHTLGLVQMLAESTLHLLDFSDASRSLALWVWGII	70568	107860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85892_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710_105858_106560
560240	contig_10609_pilon	+	2658	6	Intergenic	novelGene_123919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_5	183.191266167359	267	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	186	803	386471	391134	FALSE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQV	361235	392989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915
560254	contig_7022_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_142141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTATTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114185	112318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_112300_114200
560262	contig_10354_pilon	-	1609	2	Intergenic	novelGene_50871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTACAAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476497	471873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_472043_475057
560277	contig_2069_pilon	-	413	3	Intergenic	novelGene_23547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	67	348	1509802	1508747	FALSE	30	CACCAGGCCATGAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509868	1508681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
560290	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560293	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560296	contig_13041_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_127726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAATGACTTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259771	258073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_258100_259800
560297	contig_13041_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_127725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAAAAGAACATTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257209	256541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_256500_257200
560322	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	639	1120	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTCTTCTTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
560330	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
560351	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_17656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
560355	contig_11285_pilon	+	1545	11	Intergenic	novelGene_5593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	524.063965561457	46	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	35	1081	766060	769732	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWML	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768713_769726
560365	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
560372	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-85	887	29	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8230	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
560434	contig_401_pilon	-	3602	14	Intergenic	novelGene_42784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_13	96.530707626086	528	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	79	1494	1129059	1117910	TRUE	10	GGACCCAGCCGTCTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVAELEPLKEQLRGAQELAASSQQKAALLGEELASAAGARDRTMSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVRYPATHES	1131695	1113872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407_1116608_1116836_1116946_1117319_1118066_1118523_1118779_1119020_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
560440	contig_854_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_36385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCCTCAAACAGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974756	976282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974800_976300
560449	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560460	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560465	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560492	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
560499	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
560500	contig_11752_pilon	+	1248	7	Intergenic	novelGene_37613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_4	1174.99399525652	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	113	955	87165	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQESDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84089	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_96442_96572_100956_100976_105597
560508	contig_8658_pilon	-	1361	7	Intergenic	novelGene_55812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	1203.3555053359	428	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	393	1010	30206	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55690	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_32581_32688_34540_34626_55528
560512	contig_7963_pilon	-	1086	6	Intergenic	novelGene_58320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	14981	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48902	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
560521	SIRV7	-	352	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
560523	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	29	367	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14437	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
560529	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560531	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
560532	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560553	contig_10511_pilon	-	2735	2	Intergenic	novelGene_126906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	83	junction_1	0	160	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1967	2431	594204	593740	FALSE	35	TAAAATTAGTGCATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKIEVVKDFILLGSTVNTYGSSSQEIKRQIALGKSVAKYLFKVLKSKDVTLRTKVHLTQAMVFSVASYACESWRINKKDRRRIDTFELWCWRRVLNIPWTAKRTNRSVWEEIQSSLDARMARLCLTYFGHVVRTGQSLEKDIMLGKVQGQ	596307	593435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_596094_596230
560560	SIRV4	+	314	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1457	632	1002	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2457	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
560564	contig_2636_pilon	-	1518	3	Intergenic	novelGene_52075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_2	110.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	123	299	85555	62451	TRUE	35	GTCAAGAAGTCATGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMRKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_62624_85551
560567	contig_610_pilon	-	1839	7	Intergenic	novelGene_76682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	307.70480984216	46	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	54	890	68933	37693	TRUE	35	AATCCCCACATTCCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEECLSCPQKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGRILPDGKMWKCPFLLPGTEVVYPR	68986	32814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37890_38285_38538_44935_45278_68887
560577	contig_3281_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_128531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACATTACTGCTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148903	147441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_147400_148900
560578	contig_3410_pilon	-	2095	6	Intergenic	novelGene_58924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.272087415293	21	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	129	833	57649	14962	FALSE	15	GTTTGTTTTACACGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPAGEEGLRTAIQQAKTELQPAC	57777	13699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15029_30886_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
560589	SIRV4	+	159	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1612	632	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2612	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
560609	SIRV4	-	321	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2700
560617	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	-1	2962	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
560619	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
560626	contig_4364_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_2791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
560638	contig_10404_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_138702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACCAAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1198508	1199743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1198500_1199700
560656	contig_3627_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_78528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGGGAAGACACTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634372	634181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_634200_634400
560659	contig_10437_pilon	+	2629	8	Intergenic	novelGene_38253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	195.177470262218	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1614	2060	401482	407700	FALSE	40	GCTATTTAATTAACATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396440	408269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396578_397108_397230_398632_398756_398840_398997_400405_401557_405379_405546_405816_405923_407600
560675	SIRV4	+	307	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	205	-436	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCAATTGCTCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	2335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1884_2251
560685	contig_2940_pilon	-	2792	15	Intergenic	novelGene_81892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	114.347126357082	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	322	1518	483505	459143	TRUE	20	GGTTTAATGGCTGTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHIQGAWKTISNGFGFKDAVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDSSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTVGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRVIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPRTPVPAQRERAPGSGTQEKNKIRSRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLR	550741	452223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453209_454290_454356_455835_455883_458238_458416_459142_459232_466868_466987_467360_467489_467597_467626_470951_471106_472710_472810_474434_474593_474886_474990_477286_477400_483298_483532_550446
560690	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560714	SIRV4	+	330	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	447	173	-447	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
560717	contig_7202_pilon	-	181	1	Intergenic	novelGene_18526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCTTTCAAAATAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27800
560718	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560730	contig_3956_pilon	+	1413	8	Intergenic	novelGene_14895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1813.6383884561	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	83	712	1281682	1285075	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMLCQVF	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285057_1285173_1285712_1285827_1287276_1287406_1290649
560757	contig_4364_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_2685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532949	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
560758	contig_5302_pilon	+	2047	4	Intergenic	novelGene_81495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	473.765999436665	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCCATGATTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342277	357049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353435_353565_353862_355568
560762	contig_10813_pilon	+	2030	11	Intergenic	novelGene_87018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_3	48.9919381123058	653	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	67	1404	55923	85000	FALSE	40	TAAATCCTAAATAGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKMLSRNPDNYVRETKLDIQRVPRNYDPTLHPFEVPREYVRALNATKLERVFAKPFLASLDGHRDGVNCLAKHPKSLATVLSGACDGEVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55856	85626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_62537_62738_63303_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
560766	contig_13863_pilon	+	1849	12	Intergenic	novelGene_42024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.772350830716	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	282	1100	99260	118962	TRUE	30	TTCTAAGATATTTAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98309	120378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98542_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571_119781_119840
560772	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_18812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTACAGTCAGGACTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560779	contig_14744_pilon	+	787	6	Intergenic	novelGene_66092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	67	750	1383156	1386652	FALSE	10	TTAACTTGTGTCCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1383089	1386689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
560785	SIRV7	-	249	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69037	0	35818	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78920	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
560788	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
560794	contig_14711_pilon	+	2145	12	Intergenic	novelGene_68905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	410.109298070205	3	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	448	1902	83997	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHCVTVMPTARAEPVSAAGPWTAVSVLMEASAVGMDTANAIAASAWMATMVLYVISAQAARHPARDTECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	82025	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87847_89129_89326_89474_89673_90032_90194_90489
560797	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560798	contig_15063_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_14406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	10	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	27	911	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35244	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
560824	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560827	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
560838	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_97955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
560846	contig_17440_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_7640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3499	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
560856	contig_14322_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_116400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671888	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
560860	contig_5684_pilon	+	2125	3	Intergenic	novelGene_81038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	43	510	403611	441865	TRUE	80	GTAAGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPPTAVARPPGSWRMELRCGGVGSQAVGRGMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403568	443567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_443377_443463
560876	contig_5201_pilon	+	3236	2	Intergenic	novelGene_82166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	859	1182	203413	203995	FALSE	40	TTATGAAAGAATTTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYIIILIPVLFRFFRHLNENNKLKIDPLATIIWCQAINCSRIVSLTIQHGALLRINLRIKKCKQKGKEEQKENTLKWLTRKLKIYLQKMEKLRTRRSDVLECLIGF	202554	206049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_203577_203835
560880	contig_16510_pilon	+	2189	5	Intergenic	novelGene_139085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.8658193207029	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	107	520	289563	292515	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPAFLSPALRRRKGLSRTSKPEPSAAPEDPLNWFGILVPHSLRQAQASFQEGLQLAADMASLQIRINWGRSQLRGLQEKLRQLEPGAA	288046	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_288120_289529_289634_289736_289820_291140_291288_292402
560885	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560889	contig_233_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_14684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTCAGGTGACCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96263	97864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_96300_97900
560893	contig_19769_pilon	-	579	4	Intergenic	novelGene_102326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	493	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	89175	88018	TRUE	20	TAAAGAGCTCTGTCCGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTNHGSVG	89356	87557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87608_87819_88039_88840_88958_89163
560897	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_93502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
560898	contig_7426_pilon	-	2745	4	Intergenic	novelGene_27559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.9386377963656	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	23	424	1185828	1161950	TRUE	5	TTGTCAGCGCCTTGTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLRAGRRRQTAGRKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185850	1158909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1159075_1159793_1162053_1163424_1163680_1185784
560900	contig_2100_pilon	-	1434	10	Intergenic	novelGene_50726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1018.94452774294	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	570	1025	1175737	1170332	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQN	1185441	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1173296_1173374_1174204_1174403_1175562_1175896_1176346_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
560941	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-15	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8300	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
560943	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCCCTCGCAGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560948	contig_18869_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_56299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73548	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
560952	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560953	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560962	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGGACTCGGAGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560964	contig_14322_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_116126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	249	305	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671357	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
560980	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
560984	contig_6048_pilon	-	2479	14	Intergenic	novelGene_73271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	69.3570642895437	8	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	26	1864	2006232	1979067	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCG	2006257	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110
560989	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
560990	contig_233_pilon	-	1634	8	Intergenic	novelGene_14651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1141.47992017524	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	35	1213	101691	78579	FALSE	10	CTTTCCATGGGGTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIQPIFAVTKRMVPTYESFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	101725	78157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98386_101673
560996	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561005	SIRV2	-	593	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4280	34	3105	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1627	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
561008	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
561020	contig_9706_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_20792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCCCCTAATCAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1744	2057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1700_2100
561055	contig_15866_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_63641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCCCATCCTGCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481522	480245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_480200_481500
561074	contig_20951_pilon	+	2328	5	Intergenic	novelGene_43127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.81909084849293	39	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	212	301	287236	289668	TRUE	25	AACTTAATTTCACTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEVAAANPTATRVADPVCSGTLCCGCREAVLSAASCVDSAGAARVHLVEGFGSTGLGQRHTIHIQQGTRRMMVTASAQLSFSLRKGLLSVFAKAEDRTS	286832	302745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286998_287189_287282_289624_289758_298111_298155_300850
561081	SIRV4	+	397	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	919	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
561083	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_96496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
561118	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
561131	contig_11055_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_142178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACCACTGAGCTAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277164	279059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_+_277200_279100
561150	contig_18869_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_56167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73602	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
561153	contig_4364_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_2768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGACAGAAATGACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
561154	contig_8674_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_102882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCCTACTTCGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30186	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_29900_30200
561180	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
561205	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561210	contig_4180_pilon	+	1063	6	Intergenic	novelGene_8374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	146	682	875200	888134	FALSE	20	CTACGTCCCTCTGCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874279	888515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
561220	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
561228	contig_9653_pilon	-	2161	8	Intergenic	novelGene_48202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_7	343.96796243789	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	154	1167	196924	182544	FALSE	40	ATGAATTCAGCAAGGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEVTIGYCL	200987	181549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200896
561232	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
561241	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561266	contig_5947_pilon	+	2085	4	Intergenic	novelGene_101619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	438	junction_2	66.8946103127067	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	310	753	1001214	1005780	FALSE	15	GAGGGGATCTTGCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAGGRGPYPHCLGMCASQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	1000904	1007112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737
561273	contig_9848_pilon	-	1710	11	Intergenic	novelGene_79958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_4	557.26834649027	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	115	771	113970	104073	TRUE	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKETPLPWTITTGGSSGSPWKMRTTPVPTRTCSSAGQEPPSQSLSWVKHLLPWQEAPTRTTVSQTM	114084	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104841_104905_105852_105909_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
561306	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561307	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561309	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_93569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
561312	contig_12919_pilon	-	2233	5	Intergenic	novelGene_75899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	952	junction_2	149.563531651269	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	77	757	743659	728815	FALSE	60	TGGAAAAAAAAATACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNAVT	743735	727338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_728873_730980_731210_734916_735079_737596_737735_743565
561316	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561333	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_96083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
561334	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_18694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTACGTCTACCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
561336	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
561353	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_16478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
561358	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
561379	contig_14811_pilon	-	1513	3	Intergenic	novelGene_74489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	469.5	206	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	188	661	375397	357434	FALSE	30	TGACAACCCCAAAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGEAGPVAARRRCCCCWLLCRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386594	356581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375519_386528
561380	contig_16122_pilon	-	2074	7	Intergenic	novelGene_134492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	191.592811857741	80	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCTGTGTGTGACAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110616	104297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_104996_105116_105255_105407_108757_110059_110332_110368_110497
561386	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561393	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561395	contig_10427_pilon	+	3278	3	Intergenic	novelGene_142181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTTAAAGTTCACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50968	57580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_+_51676_53329_53503_55182
561399	contig_6102_pilon	-	1990	3	Intergenic	novelGene_32221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4508	junction_1	143.5	75	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATCATTAATAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897369	894927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_896359_896627_896706_896888
561402	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
561412	SIRV7	-	253	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69033	0	35814	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78924	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
561413	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561415	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
561424	contig_11752_pilon	+	1498	8	Intergenic	novelGene_37578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1664.96767143953	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	110	1075	84194	96466	TRUE	40	CTGTGAAATATAAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQRVSQ	84084	105895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96452_96592_105597
561425	contig_5145_pilon	-	1406	4	Intergenic	novelGene_131459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	202.559182023976	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	23	358	956111	949748	FALSE	15	TTAAATGTGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRFRGCVMEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVEDFNRHLDTLTEHYDIPKVSWTK	956133	948699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949817_952957_953012_955790_955930_956037
561426	contig_2444_pilon	+	1754	9	Intergenic	novelGene_83767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	352.980501409072	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	59	652	231271	241565	TRUE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKLERKR	230304	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230361_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235570_241547_241693_242125_242301_242567_242747_242877
561431	contig_2332_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_58646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTAGCAGCTGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230417	231282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_230400_231300
561436	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561442	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_94795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653719	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
561447	contig_2100_pilon	-	1692	12	Intergenic	novelGene_50733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	940.527133716087	5	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	772	1347	1174340	1170268	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185494	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175777_1176279_1176418_1176765_1176815_1178782_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
561455	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
561458	contig_4103_pilon	+	1815	19	Intergenic	novelGene_51911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.559959812873	9	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	876	1319	82208	85369	TRUE	40	AACACAGCAACGACAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISASGGFFSSSFPIVFLLELLVAGTLPQVGEDLGELADDNVICRQCGLGLHSGAISLAADKSGGNVRVSIFIIQVHHIGHAAWQEQLIPLVCFALEKHAVNIAAQTCFKFNLIFRILIFLGFLLGLFHQFLLLFLFAGNLSSLTF	77523	91898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_77716_77800_77837_79071_79180_79380_79470_80265_80324_80569_80652_80932_81017_81981_82211_82373_82417_82719_82825_83660_83826_84687_84735_84825_84894_85356_85477_85645_85808_86824_86863_87820_87883_91263_91330_91837
561473	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
561476	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	632	974	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
561479	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
561489	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_91290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
561490	contig_8676_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_142200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTATTTCTTAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225664	224611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_224600_225700
561509	SIRV4	+	213	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1558	632	1103	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
561513	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561530	contig_6364_pilon	+	1816	11	Intergenic	novelGene_51744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.680832392703	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	414	1307	656052	694889	FALSE	10	CCACTGTTTTTCATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGNRAAPRTGKQRLSATPAGRRKLAGCTLFITGASRGIGKAIALKAAKDGANIVIAAKTAQAHPKLPGTIYTAAEEIEAAGGKALPCVVDVRDEQQISDSVEKAVEKFGGIDILVNNASAIALSSTLDTPTKKVDLMMNVNTRGTYLTSKACIPYLKKSKIAHILNLSPPLNLNPLWFKQHCAYTIAKYGMSMCVLGMAEEFKGEIAVNALWPKTAIHTAAMDMLGGAGIESQCRKVDIIADAAYSIFKKPKNFTGNFIIDENILKEEGIQNFDVYAVKPGHSLMPDFFLDELPGAVNMKMESPDAAPAIKEGKQAPQPKGGSPVEETFRIVKETLSEDAVKATQAVYQFELSGDDGGTWFLDLKSKGGNVGRGEPLDRADVVMSMSTEDFVKMFSGKLKPTMAFMSGKLKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARL	521112	695398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_521183_647333_647498_648683_648783_655971_656087_660441_660546_661701_661801_674476_674672_676819_676892_682957_683105_685567_685697_694776
561533	SIRV4	+	301	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	862	-153	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGATGTGTTTGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2317	2618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2600
561537	contig_14142_pilon	-	1334	4	Intergenic	novelGene_120541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	901	junction_2	136.367966261224	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	845	1192	350417	349539	FALSE	45	TGAGGCAAAAGAAGGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	351261	349396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384
561553	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
561556	contig_14925_pilon	-	1676	5	Intergenic	novelGene_55335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
561567	contig_18081_pilon	-	2079	2	Intergenic	novelGene_23845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTGCTAGCCTTCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429478	427269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_427937_428066
561568	contig_1076_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_101118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	903	1205	132735	132433	NA	70	TTTACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRTFLGSSGKNFILILKRFVSSVKPSLELVITLTICHHDSNLIFLFFWSRPSDFKSSFKLRKGHFSTVQFSEKLPSPTESHSPGVKQSHARTSIGKSL	133637	130932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_130900_133600
561573	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_18684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTACCTGTCCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30109	29813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
561575	contig_990_pilon	+	2321	8	Intergenic	novelGene_76044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	58.0246253142331	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	232	1023	880846	890739	TRUE	25	CTTTTGTTCCAGGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQKSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870382	895958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893303_893438_894961
561577	contig_9839_pilon	+	1718	5	Intergenic	novelGene_88507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	1851.46433600542	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	93	635	49467	61360	FALSE	30	AAGTAATTTGCTTCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45348	62443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_57651_57850_59824_59927_61264
561591	contig_15063_pilon	-	1201	3	Intergenic	novelGene_14356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	FALSE	25	ACAGCGGGGGGTGGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	35035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36156_36264
561598	contig_3386_pilon	-	1296	7	Intergenic	novelGene_34508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	779.879834048525	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	114	608	409604	404912	TRUE	35	TAATATAGTCAGTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	412207	404009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404441_404654_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
561602	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
561606	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
561611	contig_12790_pilon	+	1935	10	Intergenic	novelGene_35199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.623238839168	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	340	1068	309644	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305911	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_305988_306032_306139_307246_307339_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
561615	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
561618	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
561630	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
561631	contig_15629_pilon	-	3536	2	Intergenic	novelGene_122478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATTTTGTAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184245	180612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_181050_181146
561634	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1460	632	1005	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2460	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
561639	contig_602_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_134978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATAAAATAGCCTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597498	597095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_597100_597500
561640	contig_602_pilon	-	2912	1	Intergenic	novelGene_134976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596477	593565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_593600_596500
561641	contig_8538_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_4902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
561650	contig_14925_pilon	-	2066	7	Intergenic	novelGene_55316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	968.284049233488	4	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	470	883	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	276843	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129503_276286_276562_276750
561662	contig_2078_pilon	-	2218	13	Intergenic	novelGene_100179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.9804828211797	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	96	1706	535379	505518	FALSE	15	CTGTATCTGAGGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSAANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535474	505005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505779_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_529455_529735_530102_530388_531775_531931_532441_532569_533231_533475_534554_534576_535345
561665	contig_9199_pilon	-	2714	11	Intergenic	novelGene_65609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTCTCGCTGCCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58915	42454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_42575_49937_50003_51095_51170_51970_52097_53097_53225_54455_54673_55404_55496_56067_56243_56342_56406_57086_57127_57299
561667	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561671	contig_16103_pilon	-	1973	2	Intergenic	novelGene_118689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1038	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180358	178299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_180184_180269
561683	contig_14441_pilon	+	1271	6	Intergenic	novelGene_100547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	391.932341099838	10	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	664	1092	116728	117610	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_112109_112154_112401_112669_116558_116963_117220_117344_117539
561695	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561699	contig_7202_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_18230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGTTGGTCACGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
561707	SIRV4	+	1221	4	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389_3007_3350
561712	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
561719	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_18734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACCGCCAGATCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
561720	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561732	contig_5921_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_142251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATCACTGACCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392168	393352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_392200_393400
561733	contig_6102_pilon	-	1057	7	Intergenic	novelGene_32195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1365.88453229237	17	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	537	947	896355	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906113	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896706_896888_896975_905180_905253_906085
561735	contig_9363_pilon	+	1641	11	Intergenic	novelGene_6806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	276.698048421018	712	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	724	1296	1623705	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622043	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622114_1622237_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
561740	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_16488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
561741	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_18321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
561762	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	632	1116	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
561770	contig_9833_pilon	+	1855	12	Intergenic	novelGene_68545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	434.077134479214	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	296	700	246676	251182	TRUE	15	CACTCCTTGGGTAACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPVSASLSEACWLSPWCGQHCSWIWPNGRCCHRFPQGCGQGGIHWLH	230824	260335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249522_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
561776	SIRV6	+	628	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1442	506	13	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2529	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
561793	contig_8616_pilon	+	1140	8	Intergenic	novelGene_72578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	968.058292223592	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	13	1068	425778	436516	FALSE	15	GAACCTTTTCATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425765	436588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_428700_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
561802	contig_5125_pilon	-	1480	3	Intergenic	novelGene_43458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCCATTTCCAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	54473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_54522_58446_59382_59493
561810	contig_3147_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_142276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAAGCTTTTCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110534	110351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_110400_110500
561812	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
561820	contig_3602_pilon	+	1878	3	Intergenic	novelGene_60607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	34	1089	902032	913188	TRUE	30	TTAATTGTGTGTATAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	914936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_913841_914799
561821	SIRV6	-	639	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8646	422	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGATCGGTCTAGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11193	1936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2020_2466_2614_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11037
561824	SIRV7	-	365	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-22	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114760	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
561844	contig_9345_pilon	-	1966	7	Intergenic	novelGene_24396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	91	1029	176056	142100	TRUE	30	CAAACATTTGGAACTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176146	141117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141258_141302_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
561864	contig_10163_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_82629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACATTACTATTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96505	96171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_96200_96500
561867	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_115970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
561868	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
561899	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
561919	SIRV4	-	218	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAATGTCCAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
561936	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
561957	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
561958	contig_987_pilon	+	1730	12	Intergenic	novelGene_72286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGGCGGAGGGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916153	945201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_916797_920067_920169_921709_921813_922618_922690_927661_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933247_936244_936427_937202_937323_937404_937454_945028
561959	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
561963	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
561997	contig_4103_pilon	-	721	9	Intergenic	novelGene_51922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	407.927517305464	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	207	560	87793	77689	FALSE	10	CTTATCTTCTCTGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSYAECYPATMDDMAVDSDEEVDYSKMDQGNKKGPLGRWDFDTQEEYSEYMNNKEALPKAAFQYGIKMSEGRKTRRFKETNDKAELDRQWKKISAIIEKRKKMEADGVEVKRPKY	91888	77527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80602_87789_87883_91263_91331_91838
562014	contig_11563_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_142306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCATTAAACAATTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219303	220233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_219300_220200
562016	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562024	contig_10599_pilon	+	2789	9	Intergenic	novelGene_49865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	745.547407949354	1	150	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	109	1092	123528	163915	FALSE	30	ATATGAAGCCTGACTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123204	165612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
562041	contig_14711_pilon	+	2378	14	Intergenic	novelGene_68894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	308.785174552906	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	524	1999	83997	90138	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRGSRPHPGHCAGLHRRHCGSGAGPGPGLPYLSGNL	70416	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89210_89326_90032_90194_90489
562053	contig_7202_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_16436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27786	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562055	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
562121	contig_2596_pilon	-	2389	13	Intergenic	novelGene_53469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	95.3808156811421	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	127	2022	722501	662746	FALSE	10	TGAGTACTTTGTCCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEKRAFDSAVAKALEHHRREIVAEQDRKVEEVRDAMEIEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKYEFEKDMSEKLAEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	722627	662378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669302_675560_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
562127	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
562133	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33216	10	-3	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
562135	contig_6191_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_107868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACTAGTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527258	528790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_527300_528800
562140	contig_19604_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_77257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	59	424	275139	275661	FALSE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQTVATKASPAPEHTGSRMPRNVHTFPHTHRSRYTHVFLGTAPRNGCVKKARCRGGQTISLDKDGLLLFSFMLSEWGHLCVCFPYSLKPDFGKEPIKCLSSVLCIQGLAQGAPLRISAQRVQEHLMSGKRLAAIPHPLR	275080	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_275372_275528
562147	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_17589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562149	contig_10594_pilon	+	3062	11	Intergenic	novelGene_142322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_7	241.881458570102	267	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	142	1302	362257	480232	FALSE	15	ACACTGGTGGTATGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVETRVCETDGCSSEAKLQCPTCIKLGIQGSYFCSQECFKGSWATHKLLHKKAKDEKAKREVSAWTVEGDINTDPWAGYRYTGKLRPHYPLMPTRPVPSYIQRPDYADHPLGMSESEQALKGTSQIKLLSSEDIEGMRLVCRLAREVLDIASGMIKAGVTTEEIDHAVHLACIARNCYPSPLNYYNFPKSCCTSVNEVICHGIPDRRPLQEGDIVNVDITLYRNGYHGDLNETFFVGDVDEGARKLVQTTYECLMQAIDAVKPGVRYRELGNIIQKHAQANGFSVVRSYCGHGIHKLFHTAPNVPHYAKNKAVGVMKAGHVFTIEPMICEGGWQDETWPDGWTAVTRDGKRSAQFEHTLLVTDTGCEILTRRLESARPHFMSQF	362115	481992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_+_362371_426557_426610_432399_432513_433104_433166_446442_446535_447486_447571_449959_450099_468485_468618_471544_471689_475973_476040_480068
562155	contig_2227_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_142349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267203	268672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_267200_268700
562163	contig_9706_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_20791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCCCCTAATCAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1744	2056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1700_2100
562180	contig_14405_pilon	+	2762	17	Intergenic	novelGene_85627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_13	270.080514615549	167	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	78	1733	351768	432993	FALSE	30	ATGTGTTGTAATGAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRAAGVGTSGPASGPEAAVARRPGMAFMEKPPAGKVLLDDTVPLTAAIEASQSLQSHTEYIIRVQRGISVENSWQIVRRYSDFDLLNSSLQISGLSLPLPPKKLIGNMDREFIAERQKGLQNYLNVLTTNHILSNCELVKKFLDPNNYAVNYTEIALQQVSMFFRSEPTWEVVEPLKDIGWRIRKKYFLMKIKNQPKERLVLSWADLGPDKYLSDKDFQCLIKLLPSCLHPYIYRVTFATANESSALLIRTFNEKGTLKDLIYKAKPKDPFLKKYCNPKKIQGLELQQIKTYGRQILEVLKFLHDKGFPYGHLHASNVMLDGDTCRLLDLENSLLGLPSFYRSYFSQFRKITTLESVDVHCFGHLLYEMTYGRPPDSVPVDSFPPAPSMAVVAVLESTLSCGACKNGMPTVSRLLQMPLFSDVSLTTSEKPQFKIHQHRRLTRAQSHHGSEEERKKRKILARKKSKRSAIENSEEHSAKYSNSNNSAGSGASSPLTSPSSPTPPSTAGTSALPPPPPPPPPAAPLPPASTEAPAQLPPQAVNGVSRGALLSSIQNFQKGTLRKAETCDHSAPKIG	351690	434022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_351870_374857_374909_377440_377489_385722_385910_399701_399780_400567_400642_401404_401480_405954_406060_406590_406693_408162_408325_408731_408850_410043_410123_412693_412743_415065_415153_415607_415678_418804_418868_432787
562192	contig_18869_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_55996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
562195	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562199	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1112	2	-1112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAGCCACCGTAACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
562224	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562227	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_16418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562231	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562235	contig_15549_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_142354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24874	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	264	795	24	818	83681	82887	NA	45	TTTCTAGCATCAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSLSSSMAVGKNKHLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGHVFEVSLADLQNDEVALRKFKLITEDVQGENCLTNFHGMDLTRDKMCSVVKKWQTMTEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIQKMSYAQHQQVCQIRKKMMEIMTQEVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDAFVRKIKVLKKPRFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	83704	82833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15549_pilon_-_82800_83700
562238	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
562248	contig_6677_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_114220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCCTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630951	628652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_628700_631000
562251	contig_2069_pilon	-	2392	2	Intergenic	novelGene_23232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	24	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1180	1590	258037	257627	FALSE	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGKFFNSKVVYWYSKFTFCGTTIVGDPALSQLTHRPRSFILISFIFILEIFFSISLFVMDHNYHSLHQTESSTTRWCPATTTDCSGRYHNRESQTVQQKNTEQKSNSHTHTKDQACWSDRETGETPRVWLQTPF	260513	256824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_259013_260309
562283	contig_14322_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_115829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671658	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
562286	contig_20493_pilon	-	2352	12	Intergenic	novelGene_86416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_11	49.9186114449815	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	40	690	54655	46993	TRUE	5	GCGCCGAGGGCGGGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRSRGGQKPCRMSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQE	55241	37443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
562290	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562297	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	643	967	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
562299	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
562303	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
562312	contig_7457_pilon	-	2379	9	Intergenic	novelGene_31455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	34.171442755611	225	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	93	1019	477748	476183	TRUE	20	TTCCAGGTGAATGTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFRSGLLVLTTPLASLTTRLAPILTSAAQLVNHTLYVHLQPGLSLEGPAQPESSPVQATFEVLDLITHLYAGASVHGHLDVRVLLTNIRAKSAFLPPQFSSVQNLAHPPEVVLTDFQTLDGSQYNPVKQQLERYATSCYSCCPQLASVLLYPEYGSRAVSLEPQDAPSSSTIKPASPVARSPKQPVRGYHRGAVGGTFDRLHNAHKVLLSVSCILAQERLVVGVADKDLLKSKLLPELLQSYEVRVERLSEFLVDIKPSLTFDLIPLLDPYGPAGSDPSLEFLVVSEETYRGGDGRQPLPPRECNP	478232	474162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475766_476410_477048_477761_478152
562329	SIRV2	-	358	3	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	656	403	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAACGTTCTAGCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3326_3665_3826_3963
562332	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
562333	contig_15691_pilon	-	1576	12	Intergenic	novelGene_60759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_7	472.835354777192	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	69	1418	114377	27919	FALSE	20	CCCTCCTCTTGTACAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVALLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRVT	114445	27760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
562338	contig_6735_pilon	-	1362	8	Intergenic	novelGene_15657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	783.815914456387	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	321	878	554290	542464	FALSE	30	GAGCTAAATAGTACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEAGLGGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543835_554267_554374_564157_564232_564784_564869_568198
562345	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
562364	SIRV7	+	346	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTTGCGTTTTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56048	114756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56103_70889_70987_78840_78954_114674
562396	contig_16685_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_115054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525969	528154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_526000_528200
562404	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562405	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
562408	contig_13894_pilon	-	1531	3	Intergenic	novelGene_62038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814	5209	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	393	1451	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288315	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288015
562412	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562423	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562437	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_17614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562474	contig_7057_pilon	-	3296	4	Intergenic	novelGene_123416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	36.8057966449127	113	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	139	1884	1503103	1493046	FALSE	15	TTCTGCGATGCATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLWPGPTYGSPSPDFPETARRRRFPQDTVTFKDVAVDFTQEEWQQMKPAQRNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVGEEETLGRHCPEIWEVDEQIEKQQETLVRKVTSISKETLIKDKVNECKKVAKIIHLNSDIATSRQSFCECDSLDKDLEHNLDLLYFEKSCVKEKNYEYNEYGKLFYHFSSHVTPFKCNQCGQEFNHKFDLIRHERIHAGEKPYQCKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECNQCGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECNECRKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKTFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFICNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGEKRRVY	1526260	1491633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1494626_1502639_1502736_1503033_1503161_1526179
562491	contig_15304_pilon	-	1421	4	Intergenic	novelGene_30594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	177	1283	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66404	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
562499	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
562500	contig_9345_pilon	-	1600	13	Intergenic	novelGene_24490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	283.742645523878	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	49	1554	671829	667061	FALSE	15	ATGCCTGGTTTTTGAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYKPPQDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671877	667014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671023_671731
562507	SIRV2	-	624	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	34	3074	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
562517	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_16462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27818	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562524	contig_1948_pilon	+	1113	2	Intergenic	novelGene_31172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAAAATGGACCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543607	546899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_544575_546753
562535	contig_14618_pilon	+	2949	11	Intergenic	novelGene_136790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_9	45.3073945399644	32	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	161	1015	298711	308709	TRUE	10	TGCCTGCCAAGCCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFGTTSGFGTGGTSMFGSTTTDNHNPMKDIEVTSSPDDSIGCLSFSPPTLPGNFLIAGSWANDVRCWEVQDSGQTIPKAQQMHTGPVLDVCWSDDGSKVFTASCDKTAKMWDLNSNQAIQIAQHDAPVKTIHWIKAPNYSCVMTGSWDKTLKFWDTRSSNPMMVLQLPERCYCADVIYPMAVVATAERGLIVYQLENQPSEFRRIESPLKHQHRCVAIFKDKQNKPTGFALGSIEGRVAIHYINPPNPAKDNFTFKCHRSNGTNTSAPQDIYAVCFICFIVP	295964	312416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_301268_301362_305016_305104_306087_306175_306283_306356_307516_307625_308389_308497_308603_310212_311984
562538	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
562566	contig_14513_pilon	-	1316	4	Intergenic	novelGene_70233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	101	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
562576	contig_14322_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_115825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTCTTGAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671881	671353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
562583	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562586	contig_15063_pilon	+	1456	4	Intergenic	novelGene_14165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	144	1316	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34664	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
562604	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562613	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562626	SIRV4	+	316	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	661	971	-29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAACATAAGTCAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
562632	contig_5093_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_135081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544123	541789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_541800_544100
562635	contig_15063_pilon	+	1241	5	Intergenic	novelGene_10602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1008	233	1240	34808	36496	FALSE	25	TGTCTGAGGAAGACTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILN	27136	36497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
562638	contig_8581_pilon	-	2087	12	Intergenic	novelGene_22829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.167966894938	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	127	2061	386058	306366	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMPAAVWHRESLSGHTSATKLCVCGTSHSNIVSVLHSVCLVGGGGNPVGKCLVSIWVKGTDRPTMPSLESPIAFVSHVV	386184	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306602_324036_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
562643	contig_5231_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_65882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTGAGTCAATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119213	118775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_118800_119200
562646	contig_6137_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_59224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312487	1312230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1312200_1312500
562653	contig_19179_pilon	+	1453	2	Intergenic	novelGene_142379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3067	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGTTAGCACTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34771	36293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_35585_35653
562685	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
562700	SIRV4	+	364	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	413	173	-413	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCACTCTTAGACGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
562708	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
562716	SIRV4	+	179	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1592	632	1137	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2592	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
562718	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_4	1560.49623517649	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGYGKLTFGQGTILTVYPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	90384	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_90329
562719	contig_15691_pilon	-	2225	13	Intergenic	novelGene_60754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	69	junction_12	583.476238447919	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	239	1504	69449	23868	FALSE	25	ATCCCTGCAGACTTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYAGYRQASALNIPVAMDTDGPLFEDVQMLGKTGSQDARQVKHRAELRPALCSFA	120101	23146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_24033_27942_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_119994
562722	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
562723	contig_18869_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_56324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73748	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
562731	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
562751	SIRV4	+	215	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1556	632	1101	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2556	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
562753	contig_6356_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_126425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTCCTCTGGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34929	32963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_33000_34900
562765	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
562767	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562769	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562772	contig_3386_pilon	-	1436	4	Intergenic	novelGene_34532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1012.57570361705	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	116	505	409604	405095	FALSE	30	TAAATTGTTGTTTAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYREERDLCLGREITSRLDPSLDLVGK	412209	404163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_405172_407730_407838_409398_409607_412096
562780	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562781	contig_11720_pilon	+	1875	14	Intergenic	novelGene_43955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	345.555551327503	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	9	1634	262271	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGSLPSPQLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_264285_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
562791	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
562807	contig_14882_pilon	+	2120	4	Intergenic	novelGene_115011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGGAATCCTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294893	298732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_296195_297684_297788_297899_297953_298069
562808	contig_15442_pilon	-	2850	6	Intergenic	novelGene_119150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288937	271345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_-_272987_276339_276642_278456_278544_282672_282822_285860_285968_288373
562813	contig_7202_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_16672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGGTTGGTCACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
562815	contig_9471_pilon	+	3689	13	Intergenic	novelGene_21736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	196.114107232385	93	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	448	1524	259445	297729	FALSE	65	CTAAATACGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSERGVVEEWLSEFKALPDTQVTNYAATLHRKKTLVPALYKVIQDSNNELLEPVCHQLFELYRSSEVRLKRFTLQFLPELIWVYLRLTVSRDRQSNGCTEALLLGIYNLEIADKDGNNKVLSFTIPSLSKPSIYHEPSTIGSMALTEGALCQHDLIKVVYSDLHPQRETFTAQNRFEVLSFLMLCYNSAIVYMPASSYQSLCRMGSRVCVSGFPRQHEKQWKELCGRIVLDPEFMVQLLTGVYYAMYNGQWDLGQEVLDDIIYRAQLELFSQPLLVANAMKNSLPFDAPDSSQEGQKVLKVEVTPTVPRISRTAITTASIRRHRWRREGEYRVPIVHSCILVNLSLFLQVTLTITL	210890	299894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_211097_211704_211740_242821_242898_248960_249061_259414_259496_260221_260324_271741_271922_275967_276049_278277_278394_289122_289219_293218_293336_293894_293983_297483
562817	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562831	contig_15063_pilon	+	1199	3	Intergenic	novelGene_14351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
562834	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_16448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27809	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562845	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_94999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562846	contig_10734_pilon	+	2400	17	Intergenic	novelGene_51418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_16	77.4461254276158	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2247	93	2339	2116886	2156078	FALSE	30	TATTTTGTTGCTAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVHESLYFNPMMTNGVVHANVFGIKDWVTPYKIAVLVLLNEMGRTGEGAVSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEGPALPHAGEDPGEEPLCDALPAAAPGAALSRGALDQPSLARVTRAGTCCVVDTMVDLFNPPSL	2116793	2156139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155887
562854	SIRV7	-	1272	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33103	707	-82	-705	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAGGTGGACAACGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114820	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
562858	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
562867	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1480	632	1025	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2480	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
562873	contig_10765_pilon	+	1978	7	Intergenic	novelGene_122847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	177.730523233599	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	155	1834	18249	34929	FALSE	60	TGTAAATAAAAATTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPIDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15612	35073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19229_19309_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
562877	SIRV4	+	300	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	927	-89	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCATGCCAGTCGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2382	2682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
562881	SIRV2	-	366	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-679	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCTGTCACATCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
562904	contig_10235_pilon	+	2105	6	Intergenic	novelGene_46435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	190.386344048096	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	410	559	211879	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSQPWPWFCSCCCSQELKGTRGPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210470	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210879_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
562910	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
562949	contig_14508_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_79068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCATTTTCTACTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163501	162924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_162900_163500
562950	SIRV6	+	1079	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
562958	contig_7202_pilon	+	179	1	Intergenic	novelGene_16443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTCCCAGGGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
562960	contig_14441_pilon	+	2564	2	Intergenic	novelGene_100459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	45	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	24	506	85423	87484	FALSE	55	GATTTAAAGAAATAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALPLACALLCLLQPGLMGAQVIQTPRYSVRRSEKRVLLECTRQNVLVSTRPSFGAAADPCSYDVDSTEKGDALDGYSVSRKTKGGFSLTLGLASPNQSSVYLCASSESTARCSHIFSEQKAGAGSHITLHQLETVTLRYPACRHTSWQAKHGMPFRPC	85399	89542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_87050
562961	contig_14441_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_100479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTAGAGAGACCGCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89542	90540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_89500_90500
562973	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
562983	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
562989	contig_12786_pilon	-	1328	7	Intergenic	novelGene_103407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	569.839158593604	28	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	622	1266	602829	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629639	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602909_628731_628938_629303
562997	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
563006	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1561	632	1106	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
563007	contig_9955_pilon	-	1488	7	Intergenic	novelGene_21296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	731.896338288422	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49838	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_46876_46999_47590_47737_48794_49235_49305_49380_49692
563017	contig_614_pilon	+	2358	5	Intergenic	novelGene_132621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_2	24.8746859276655	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAATACATGTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588633	642225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_621721_621753_634039_634064_640090
563032	contig_15063_pilon	+	1113	6	Intergenic	novelGene_14391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3818.57823803572	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	94	711	35271	36572	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDTCLRKTGAPGTHSPASWSTRPCPTR	35177	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36380_36494_36600_38975_39092_39506
563040	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	643	1118	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
563046	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
563069	contig_5125_pilon	+	1207	3	Intergenic	novelGene_43495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_2	25	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	300	806	977418	1022328	FALSE	60	AATAACAACAACAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCCFYIVGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQAIETNIVLRNGTETFDSWEKPPLPVYTQFYFFNVTNPEEILEGETPLVTEVGPYTYRELRDKANVQFGDNGTTISAVSNKAYVFERNLSIGDPKIDLIRTLNIPVVVSRHFSIIIVDFRRKEKAKLRLLWFYT	977118	1022729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_977535_1000321_1000480_1022096
563073	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
563074	contig_15063_pilon	+	1525	5	Intergenic	novelGene_8761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	244	1416	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27125	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
563084	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_94302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
563096	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
563100	contig_7202_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_17786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTAGTCACCCAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
563112	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563128	contig_3602_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_60680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGGTAAAAAATAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234649	1234214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1234200_1234600
563132	contig_5480_pilon	+	1333	7	Intergenic	novelGene_107229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.683650426734	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	594	908	95632	101919	TRUE	35	AGTGATACTTGTGAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKWLHILPTGDWLQPCDSCGV	91499	103839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_91725_92258_92469_95473_95635_96168_96353_101482_101551_101859_102034_103528
563138	contig_14322_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_116494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
563145	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_17494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563146	contig_8486_pilon	-	2819	13	Intergenic	novelGene_139291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	25.1009074647821	40	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	154	1518	60945	58064	TRUE	25	AAAGTGGGTTAGATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWHFLLDKERVRLLRAEHCNPDPLSREEGRQRGGWGWGLRQGSTLARGTGAMAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQVVAAATRPKTALKAQNATTKGPNGAYDFSQALNAKEMPNTQPKATFKPQNTTTKGPNAAYDFSQAATTSELATNKSEMVFKAQNATTTVGPNATYNFSQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHLTCLTEPGCLAAPRCGPSSGKSK	61599	54816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58264_58343_58865_59479_60203_60900_60975_61475
563154	contig_10940_pilon	+	1865	4	Intergenic	novelGene_49180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	799.856792737856	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTTGTGTCGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172654	176228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172743_173150_173218_174001_174123_174639
563171	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_95889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
563172	contig_7744_pilon	+	1833	15	Intergenic	novelGene_62545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	194.909083986376	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	931	1635	887347	891030	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVGAMWSVLPCEALSLLQEGSGELPGSEHHPPPAPSLPPLCTLFTCFAQTWAWAFSAATF	879799	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889892_890865
563175	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563180	contig_10861_pilon	-	1170	11	Intergenic	novelGene_39321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	276.868289986412	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	85	825	1492200	1489676	FALSE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQALGQDRPRPGPACPPGLSHLALSAAGAASQS	1493783	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489693_1489941_1490021_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
563184	contig_7357_pilon	+	460	4	Intergenic	novelGene_36879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.891499354659	286	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGATTAACCTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250826	257346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250940_253743_253841_256778_256853_257170
563185	contig_7457_pilon	-	1131	3	Intergenic	novelGene_31693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_2	2016	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	1176982	1174926	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLSRRRGLSSLPLEPPRFPTFRPPCPPSPAAAFRRPFPPRKRNRIVCPLSRTSTLSKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1176811
563192	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563205	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
563209	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_18100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563215	contig_11752_pilon	+	1231	7	Intergenic	novelGene_37663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_4	786.834374778666	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	54	938	87309	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	87255	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
563216	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
563237	contig_4924_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_84736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGAGGTGGCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136917	136326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_136300_136900
563239	contig_14322_pilon	+	202	2	Intergenic	novelGene_116528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCATCCGGCCGCTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672861	674811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_672915_674662
563244	SIRV6	+	599	4	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	17	1005	17	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3122	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724
563255	contig_14208_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_129113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTTCCATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332543	335061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_332500_335100
563261	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1115	2	-1115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGACGAGCCACCGTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
563265	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_95837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
563277	contig_10235_pilon	-	1864	6	Intergenic	novelGene_46527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_3	21.9034243898072	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	95	1345	331785	328214	FALSE	35	AACGAACATTTGTAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVVSDAETGVVFLFYSLCAHKFGCQVASTMLVWSKDDGLSWSKPQNLSLDIGTEMFAPGPGSGIQKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	331879	327694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328943_329127_329763_330027_331063_331257_331623
563286	contig_10196_pilon	+	1173	9	Intergenic	novelGene_132158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	455.102993151001	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	415	990	1039045	1050606	FALSE	10	CCCGTAACCCCTGCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034589	1050789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038650_1039036_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047005_1050152_1050212_1050506
563302	SIRV4	+	319	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	652	977	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
563304	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
563305	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
563315	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
563348	contig_5935_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_102688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAACACTGTTCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801475	799777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_799800_801500
563377	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_17631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563393	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
563405	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCATCCCCCTCGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
563417	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
563426	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563435	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_16479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563449	contig_7202_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_17992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATGCAGGTAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
563458	SIRV7	-	287	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35776	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70875_70988_78841
563459	SIRV6	+	227	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	37	31	-37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
563462	SIRV2	+	295	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-67	295	-67	-295	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGCTAAACCATACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
563464	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
563472	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563476	SIRV4	+	242	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1529	632	1074	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2529	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
563491	contig_4125_pilon	+	2118	8	Intergenic	novelGene_25217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	59.1811470255968	1198	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	638	1213	1708054	1711283	FALSE	25	ATTGTACGACTCAGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1702036	1712188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1707965_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
563512	contig_11708_pilon	+	2588	7	Intergenic	novelGene_138978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	44.7437146423942	305	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	471	1373	310423	324718	FALSE	25	AATGTTTCTCATATGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASTYYGNLRPISPWRWLFSVVVPVLMVSNAFKKKSLDRSGALGGLVVGFILTIANLSFFTSLLVFFLSSSKLTKWKGETKKRLDSEYKEGGQRNWVQVFCNGAVPTELALLYMIENGPGEIPIDFSKQYTASWMCLSLLAALACSAGDTWASEVGTVLSKSLPRLITTWEKVPVGTNGGVTLVGLTASLLGGTFVGVTYFLTQLAFVNDLDISAPQWPIIAFGGLAGLLGSILDSYLGATMQFSGLDESTGMVVNSATNEAKYIAGKPILDNNAVNLFSSVLIALLLPTAACVLWPRE	309730	325933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_310100_310321_310445_312582_312697_321493_321632_322014_322270_323060_323271_324554
563514	SIRV4	+	1491	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	2	74	2	-74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	44	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCCACCTGGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
563529	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
563530	contig_17158_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_141142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	110495	110821	NA	70	AAAAGAAAAAAACTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVDSCLLVDSCLLVDSCLLVESCLLVDSCLFVDSCLLVDSCLLVDSCLLVDSCLLVDSCLLVDSCLWWTLVCWWTFAYWWTLVCWWTLVCGRLLSVVDSCLLVDSCL	110493	112531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_110500_112500
563535	contig_11422_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_99090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGAGGTGTTAGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538	748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1500
563542	contig_3975_pilon	+	2419	11	Intergenic	novelGene_54768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	90.1330128199429	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	50	841	1965812	1976049	TRUE	70	AAGGAGAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQTYGCLS	1961632	1986151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1975803_1976028_1976095_1983156_1983261_1984722
563552	contig_2798_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_120066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATCAACCACTGGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188864	189374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_188900_189400
563569	contig_7202_pilon	-	172	1	Intergenic	novelGene_18216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27806	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
563574	SIRV6	+	830	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	14	244	7	119	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	50	6	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	45	GCGTTCACAAAGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
563575	SIRV6	+	223	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10551	52	1314	-50	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTATTGCCTACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11551	11774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
563600	contig_3009_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_132519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACACATGATATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77308	75201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_75200_77300
563603	contig_4315_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_46792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAAAACATCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329011	327076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327100_329000
563608	SIRV4	+	306	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1465	632	1010	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2465	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
563615	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	318	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
563617	contig_11328_pilon	+	742	5	Intergenic	novelGene_88423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_2	1841.34819833186	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	43	699	644338	647995	FALSE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	644295	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
563618	contig_10855_pilon	+	2759	7	Intergenic	novelGene_124380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	29.3371209675842	295	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	559	1482	832604	835148	FALSE	15	TCCACATTTGTGTGTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETFWNLASVDWCIQVKTNGSSLQQDIFGNEISNDEKIKSFIRNDSLIDLEEKGKLHHNEGQPQIKKKHSREHVSGHRGQKIPACEVCGKTFSYSSSLKVHLRRHRGEKPYECKECGKAFSCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFSFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTFYSSLHRHWKTHSEPKPYECKQCGKGFRCPKYFQQHVNMHSREKPYECKECGKVYSMPANLRQHMITHSSERPYECKQCGKSFRWTTSLRLHRRTHSSEKPYECKQCGKVYKCLISLEGHLRKHTGENP	793027	836425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_793119_806095_806223_808283_808465_826613_826680_832510_832638_833903_834085_834439
563640	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91622	2	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
563641	contig_16310_pilon	+	1121	5	Intergenic	novelGene_70093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_1	3678.80329557045	324	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287620	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_287747_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
563642	contig_6898_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_35797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126628	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_126600_127700
563650	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
563653	SIRV4	+	299	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	635	1014	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
563655	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563659	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_95728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
563666	contig_11815_pilon	-	3100	1	Intergenic	novelGene_50910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGGAAATGCATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156956	153856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153900_157000
563675	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_93007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
563688	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
563721	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563735	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
563738	contig_11328_pilon	+	1623	9	Intergenic	novelGene_88446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	275.169237697458	209	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	154	1365	830839	857309	FALSE	25	TCAGAGTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSGLSELGVRSRRTLSSFLLSVVSFFIKEEKWDLLQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829356	857567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830607_830796_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
563742	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
563743	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
563747	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
563755	contig_9706_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_20814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2700
563785	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
563786	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
563787	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	66	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
563789	contig_17964_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_33848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCTGGTGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134938	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_134900
563792	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1465	635	1010	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2465	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
563799	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_115853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
563810	contig_3410_pilon	+	2857	12	Intergenic	novelGene_58961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	75.2515341267522	283	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1486	2178	417402	420802	FALSE	30	TTAAAGATAGTCTGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGEELTSEESVFEVFAHYLSGEPNRNGCKVTCLPWNDEPLAAETNLMKEELLRVNRQGILTINSQPNINGKPSSDPIVGWGPSGGYVFQKAYLEFFTSRETVEALLQVLKRYELRVNYHIVDVKGENITNAPDLRPNAVTWGIFPGREIIQPTVVDPISFMFWKDEAFALWIEQWGKLYEEESPSRMIIQYIHDNYFLVNLVDNEFPLDNCLWQVVEDTFELLNRPAPE	407637	421481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_407851_409951_410201_411486_411727_412569_412681_415336_415532_416261_416513_417025_417161_417310_417492_417819_418003_419144_419247_420163_420284_420604
563811	contig_1143_pilon	-	2211	22	Intergenic	novelGene_86571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	222.68451800209	51	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	29	1807	201052	93790	FALSE	80	AGTAAAAAAGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRSPAGQWMVGVKMAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVSSLPELLEKKRLIDLHTNVATAVLEHIKARKLDVYFEYEEKIMSKTTLDKSLLDIISDPDAGTPEDKMRLFLIYYISTQQAPSEADLEQYKKALTDAGCNLNPLQYIKQWKAFAKMASAPASYGNTTAKSMGLLSRVMNTGSQFVMEGVKNLVLKQQNLPVTRILDNLMEMKSNPETDDYRYFDPKMLRGNDSSVPRNKNPFQEVSAI	201080	93385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_93839_96112_96166_99347_99402_112824_112901_114899_114963_119308_119389_121382_121454_135918_136016_147612_147695_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
563814	SIRV2	-	617	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	35	3080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
563822	SIRV4	+	182	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1589	632	1134	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
563825	contig_6445_pilon	+	2564	2	Intergenic	novelGene_76971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	697	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	93	398	76151	76456	TRUE	30	ACACACACCCATTTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFYEFNAVPLGLGYLQVVKAEIFKAPLMFVSTGSDLAGSEFGQSLTSAQLCWSFAGCRNTASFLEYIHIPQSSERERERLRERDSLSNFPVQKVIWDRS	76058	81203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_77922_80502
563843	SIRV7	-	348	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78836_78964_114680
563844	contig_8978_pilon	-	1186	7	Intergenic	novelGene_49333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	516.479643570027	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	150	800	193675	190856	FALSE	25	TAAGAATGTCTGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLAWMDRNSTRSVFRAAITHSVAVLNIGVNGATRSTGGAIHGGAIHQRRILCCLHWKLCLFPLALWVWLLASSLCIAGWKGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRLGVACLRDWRRVCSQTTVNDSATSVKFSQKGEP	194024	190469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192403_193215_193398_193613_193768_193967
563846	contig_8576_pilon	+	1794	8	Intergenic	novelGene_88805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	520.597302163974	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	356	1612	902723	915551	FALSE	60	AAACGTTACAAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893765	915733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902405_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
563850	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563889	contig_18145_pilon	+	1757	5	Intergenic	novelGene_37368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	173.300858336016	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	63	836	97990	100853	FALSE	30	AAAACATCCTCCCCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKQTTLRKPCVLPAVLSVTMTSGSMRCLLRPFSRVGALAASDSLQGTKAELAPVRAAEAAQVAAYTQKTMMMTCTVKCWWPTSWPAEPCSLGWGRSPRRDQGCAHGLLHSSV	97927	101774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_98038_98231_98541_98826_98912_100364_100482_100638
563892	contig_10431_pilon	-	2349	5	Intergenic	novelGene_117405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_4	535.608299039513	785	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	150	701	262758	252991	FALSE	25	GCTTTTACTTCATATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFEAALLSPGSPKRRRCAPLPGSTPGLRPPDAEPPPPLFQTQTPPPTLQQSTPPGSERRLPTPEQIFQNIKQEYSRYQRWRHLEVVLNQSEACTSESQPHSSALTAPSSPGSSWMKKDQPTFTLRQVGIICERLLKDYEDKIREEYEQILNTKLAEQYESFVKFTHDQIMRRYGTRPTSYVS	262907	251342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_253002_253850_253923_255271_255407_258059_258201_262565
563908	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_18404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563910	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
563924	contig_1331_pilon	-	1675	5	Intergenic	novelGene_37812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3740.43617109021	10	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	74	631	170785	160009	FALSE	35	AGTAAAAGTTAGTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGSQVSYTAHVRGSSACQKCVLMPSSWFRLIATRVQENKTLPDPAPFLQPLCLSPFVAATVSVHLVEGLPPQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	194030	158964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_170640_170786_193957
563927	contig_12951_pilon	+	3517	1	Intergenic	novelGene_68194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	144	488	755258	755602	NA	70	AAAAAAAAAGACAGACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQVRERPGVRQSLRLGHGNPPQNTGPCSSSGSRPPSRPYCLRVRSDSGRGRPHLSLSPGWACVSLGPRNLLRSPTYLISSSPGDLLSLEAAHLDS	755114	758631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755100_758600
563942	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
563972	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	18	1109	18	-1109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACCGTAACGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
563998	contig_11896_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_88007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	34	633	141903	133107	FALSE	40	GAAACATGAACACATGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSADQIAEVKTMESHPPIPPVFVEHVVPQDTNQKGLCTKERMICLEFTSREFHAGQIEDELNLNDINGCSSGCCLNESKFPLDNCHASKALIQPGQAPEMANEFPDLTVEDLETDALKADMNVHLLPMEELTSRLKDLPMSPDPESPSPQPSCQAEVSDFSTDRIDFFSALEKFVELSQETRSQPPSFSGTQPWLSCESSPSHAMVSPHE	141936	131988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_133188_141384
564009	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
564013	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	24	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
564017	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	9	356	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14417	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
564020	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
564032	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564038	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
564048	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564054	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564057	SIRV4	+	306	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	660	982	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
564069	contig_1637_pilon	-	2471	13	Intergenic	novelGene_142384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_6	45.7750386855835	221	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	90	1010	688291	495287	FALSE	25	GAGATGATGTATTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFGVSAFLATGGDVTRNKVRKTFVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADMWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPTLETGVEDKEMMKKYGKSFRKLLSLCLQKDPSKRPTAAELLKCKFFQKAKNREYLIEKLLTRTPDIAQRAKKVRRVPGSSGHLHKTEDGDWEWSDDEMDEKSEEGKAAFSQEKSRRVKEENPEIAMNASSIPEQIQSLSVQDSQGQPNASEDYREASCVVNLVLRLRNSRKELNDIRFEFTPGRDTADGVSQELFSAGLVDGHDVVIVAANLQKIVDDPKALKTLTFKLASGCDGSEIPDEVKLIGFAQLSVS	688380	493825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_495362_507769_507835_549867_549937_554903_554957_613865_613934_615898_615962_625272_625303_625405_625529_677028_677095_677195_677245_685621_685756_687904_688007_688267
564078	contig_5018_pilon	-	2577	14	Intergenic	novelGene_46948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	74.6361588844023	242	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	103	1929	316115	301750	FALSE	15	GCTACTGTAGCTTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAQAAPFRLRPLSNPWLLSLLFLLLNRIRPQGSPGPMQCYRIGLLGDLNCSWEPLGDSRTPSTLHFQSQKYISPYSHLNRTQVVAVPTGQSWVTIPREQFTEFDTLLVWGAEADGPLWPPISVDLETRVKLDAPRLCPDINFSEDDPLETTVHWAPPTLRPHQKDMVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	316217	301101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312666_312747_312921_315476_315595_316015
564083	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_96889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
564085	SIRV7	-	286	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68994	0	35775	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
564089	SIRV6	+	184	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	246	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727
564101	SIRV6	+	297	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10528	1	1291	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11528	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
564111	SIRV5	-	398	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTTACGGTGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
564126	contig_1443_pilon	+	1065	2	Intergenic	novelGene_28171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	535	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	274	759	343817	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSEEKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343543	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343833_344122
564133	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_17701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564139	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
564145	contig_8671_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_126267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	194	595	525848	525447	NA	25	GGCAATTTTTTTTTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGERIDIVKDFILLGSAINALGSGSQEIKQCIAPGKSAAKDLFKVFKSKDVTLRTKVHLIQAMVFSITSYAFESWTMNKQDRRIDAFELRCWRRILNILWTVRRTNKSVWEEIQPECSLEARMVRFHLLWT	526041	523779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_523800_526000
564163	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	3	362	14437	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
564168	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_18814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTACAGTCAGGACTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
564178	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
564182	contig_5954_pilon	-	1832	5	Intergenic	novelGene_28412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.44948974278318	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTCCAGCAACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97317	93369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_94754_94886_95012_95847_95999_96555_96646_97235
564185	contig_3233_pilon	+	2035	8	Intergenic	novelGene_56561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	310.888785154264	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	184	693	740857	745484	TRUE	15	CCCAATGGGATTGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGTGGGARFYLAWFPRDLPNWRVEWGLDEDWKPSSL	738717	748042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
564208	scaffold_19766_pilon	-	1696	8	Intergenic	novelGene_34325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	138	junction_2	424.11097893002	1701	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	624	1472	622205	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623673	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622736_623580
564228	contig_12624_pilon	-	1615	4	Intergenic	novelGene_61148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	19	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	209	514	952979	948779	FALSE	30	ACCCGAATGCGCATGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955847	947677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955644
564230	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564246	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564250	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_115855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
564270	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
564281	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564291	contig_12570_pilon	-	2581	5	Intergenic	novelGene_79348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	213.386240184319	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	854	1525	198025	190389	FALSE	15	GTTCTGTATAGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	198938	189332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198698_198757
564336	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	34	3384	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
564357	contig_9706_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_20801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATATGAATTCCGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
564361	SIRV4	+	175	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	654	1119	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAATAACTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2700
564371	contig_15720_pilon	+	837	7	Intergenic	novelGene_41904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	580	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	20	ATCGAGCAGCCCACCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	283998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281845_283790
564377	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564393	contig_9258_pilon	+	605	3	Intergenic	novelGene_104614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	69	461	97238	99582	FALSE	15	CAACCAGTGCTTGGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96752	99726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
564398	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564402	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564409	contig_5302_pilon	-	2777	19	Intergenic	novelGene_81513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_9	236.324609356822	457	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	217	2739	1451551	1383630	FALSE	15	GCTTTAAGTTGTCAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCGRRASRPEESSRLRPLFQGARCSRRDQHVPPLVPLSQSTRLALRAPAPPGSVSCLAGRTRARARAVAGAMSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNAKNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVRYMEEERNFTTEQVTAMLLSKLKETAENVLKKPVVDCVISVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRAKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVLVNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDVDVSGTMNRGKFLEMCDDLLARVEPPLRSVLEQAKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKERISKFFGKELSTTLNADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVFPKNHAAPFSRVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKVKARVNVHGIFSVSSASLVEVHKSEENEEPMETDQNAKEEEKMQVDQEEPHVEEQQQQTPAENKAESEEMETSQAGSKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIENQLLWQIDREMLNLYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFSLKLEDTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKMRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKVISAFKNKEDQYDHLDAADMMKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVIKAKEIEAKIKELINICSPIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID	1451767	1383591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1383834_1384039_1384202_1386779_1386900_1388513_1388622_1389782_1389909_1390986_1391140_1392888_1392979_1393944_1394127_1396453_1396588_1404554_1404662_1405185_1405338_1407805_1407883_1410583_1410829_1418836_1418971_1419563_1419664_1428240_1428364_1430204_1430346_1436323_1436382_1451444
564412	contig_1532_pilon	-	1994	8	Intergenic	novelGene_37424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1373.99858895451	2	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	290	1252	29441	13113	FALSE	40	AAGGTAATAATGAGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32056_32227_34870
564427	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
564445	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564468	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
564483	contig_9848_pilon	-	1775	12	Intergenic	novelGene_79965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_11	372.931407514497	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	13	579	113970	105907	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGRRAPGVGRGGVTAQLRPNSLLLQEAGTDQMQPT	113982	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
564487	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_94670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
564496	contig_6001_pilon	-	2128	10	Intergenic	novelGene_128052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	15.7158408722215	706	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	575	2128	756765	725388	FALSE	70	TATTAAAAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKPKKKNMSAYQVFCKEYRVTIVADHPGIDFGELSKKLAEVWKQLPEKDKLIWKQKAQYLQHKQNKAEATTVKRKASSSEGSMKIKASSIGVLSPQKKSPPSTILLPTSPAKAPETEPIDVAAHLQLLGESLSLIGHRLQETEVSTTVSSMSPVSYVTCIQSLTQLYSLNNFIPVMPGAQDTVIKKNDGNRNIWRFGIYLLAVKVYTNSILLKHWHQKKLESTLYF	763660	725387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_725807_728557_728664_729837_729903_730968_731051_755883_756834_757399_757515_757621_757701_757972_758122_758775_758875_763596
564497	contig_9752_pilon	+	1668	4	Intergenic	novelGene_122049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.6051072639367	1276	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTTGTCAAATCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341815	349845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_342042_344930_345031_346964_347013_348551
564498	SIRV5	-	400	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTACGGTGGTAATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
564501	contig_13894_pilon	+	1187	9	Intergenic	novelGene_62146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	78	1133	521729	528117	FALSE	15	GACACCTGCGTCTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521651	528171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
564503	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564508	contig_5549_pilon	+	1038	5	Intergenic	novelGene_81584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1432.76679452729	14	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	59	367	82155	86899	TRUE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKVEYQWHVVRAGNQFLLVQTPAENLHF	82096	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86685_86976_91687_91835_93264_93412_96620
564510	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
564522	contig_8581_pilon	+	1931	11	Intergenic	novelGene_22838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1017	1322	329833	339651	TRUE	5	CGGGGCCAGCCTTCGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTSLVLNFPLVSSSGVIRPSNKRPSLAILTRISRTSSPMYMPLTIFSNSCFPGLREPRSISRSNSVRMSSRDPSSPKAPHSVLMHILTVSFTTATMLAS	306344	386074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_306864_326054_326310_327805_328044_329828_329981_339262_339381_339611_339653_340260_340357_344624_344746_353025_353177_366652_366814_385995
564525	contig_5954_pilon	-	2866	7	Intergenic	novelGene_28769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	1	165	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	83	793	1462068	1392942	FALSE	80	AAAAAAAAAACACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462150	1390868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
564534	contig_18850_pilon	+	864	3	Intergenic	novelGene_142444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	102.5	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	144	863	186691	190240	FALSE	20	GCAGGAATTGGGTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLTSPRVPLSAYERVSGRASPPLLDRARSRTPPGGSRTPPSAPSQSRMPCERAPSPASRMGQPSSQAALPPAQERPRSPGPPAFSDQSSRSLPAQTAPVAGSQAFSSGTVAKTTSSAGDHNSMLSGPAPGVFHPEGGELPASAGAQQAPALASLQPTKERRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSDSEGSSLPPQPEVALKRVPSPAPAPKEAVREGRPQEPTPAKRKRRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPQLFFMFLKGILVFLKSVQQEQLFLSNKNEK	186547	190241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_187173_187888_188029_190142
564547	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91670	0	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
564568	contig_8673_pilon	-	2228	6	Intergenic	novelGene_129928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_5	181.175495031751	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	94	759	338208	324321	FALSE	25	AGGCCTCTCACTTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	352516	322851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_352443
564571	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	GTGGAGTTTTCAGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
564589	contig_20175_pilon	+	2852	16	Intergenic	novelGene_142459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_14	16.6805275695944	166	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	29	2368	77985	123392	FALSE	30	AAGAGGTGAGTGTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFVTEVLAHSGRLEKEDLGTRISRLTRQVEEIKGEVCSMISKKYSEFLPSMQSAQDLVTQVDKLSDDIDQLKSRIESEVRRDLHVSTAEFTELKQQLERDSVVLSLLKQLQEFSTAIEEYNCALAEKKYVTAAQRLEEAQKCLKLLKSRRCFDLKMLKSLSMELTIQKQNILYHLGEEWQKLIVWKFPPSKDTNSLESCLQTELHLCSEQSHKEEKTPVPPISSVFLAFSILGELHTKLKSFGKMLLKYILRPLASCPSLYAVIESQPNIVIFRFESVMTDLEHPSPSEVFAKIRLVLEVLQKHLLDLPLEADLENEKTSKIILAEMLGNIIWEDLSECLIKNCLVYSIPTNSSKLQQYEEIIQSTEEFENALKEMRFLKGDTTDLLKYARNINSHFANKKCQDVIVAARNLMTSEIHNTVKITSDSKISVPALPSPDKDDKLDIQKVAKAQYNEVGNLEPENTLDQHSFSLPTCRISESVKKLMELAYQTLLEATTSSDQCAVQLFYSVRNIFHLFHDVVPTYHKENLQKLPQLAAIHHNNCMFLAHHLLTLGHQFASRLAPILCDGTTTFVDLVPGFRRLGTECFLAQMRAQKGELLERLSSARNFLNMDDEENYSAASKAIRQVLHQLKRLGIVWQDVLPVNIYCKAMGTLLNTAISEIIGRITALEDISTEDGDRLYSLCKTVMDEGPQVFAPLSEESKNKKYQEEVPVFVPKWMSFKELMMMLQASLQEIGDRWADGKGPLAAAFSSSEVKALIRSLFQNTERRAAALAKIK	77956	123876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_+_78090_79911_80047_83322_83425_83620_83699_83851_84012_85782_85936_86356_86549_104396_104561_107787_107971_113608_113848_116006_116079_118197_118368_119171_119303_119841_119974_120775_120979_123271
564616	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
564619	SIRV6	+	1082	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
564640	contig_6275_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_142476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATAGAAATGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235670	237886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_235700_237900
564642	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564663	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
564690	contig_6576_pilon	+	1663	2	Intergenic	novelGene_42340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677267	680659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_677770_679498
564697	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
564702	contig_15063_pilon	-	1168	4	Intergenic	novelGene_14283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	36676	36368	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAQWSVAGVGRVRHHQGHVVQGGFTSGLVHGPLGHLVGQGLVDHDAGECVPGAPVFLRHVQDAVGEVEALGLRLGHRGAGDIIVGGHRLSLVQPLHKHIRG	36677	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35378_35838_36156_36264
564712	contig_19730_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_142491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGCTAGAGAGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128073	130220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_128100_130200
564713	contig_19730_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_142492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACTCCTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130477	131470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_130500_131500
564714	contig_14362_pilon	+	1951	9	Intergenic	novelGene_142528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	334.420557644114	953	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	52	492	52448	59576	TRUE	20	CTCTAGACGTGTGATACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAFRKAAKSRQLEHRERSQPGFRKHLGLLEKKKDYKLRADDYRKKQEYLRALRKKALEKNPDEFYYKMTRVKLQDGVHVIKEAKEEATPEQLKLMRTQDVKYIEMKRVAEAKKIERLKSELHLLDFQGKQQNNHVFFFDTKKRS	52396	65026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_52511_56788_56851_58276_58380_58783_58898_59376_59472_59572_59704_61578_61690_62348_63313_64769
564722	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_18653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGAGGCCTGGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30086	29799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
564741	contig_6048_pilon	-	3218	10	Intergenic	novelGene_73214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	37.54536350853	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	333	2066	1645874	1609163	FALSE	70	AAAAAAAAAATTATAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661028	1608010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1660951
564746	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564748	contig_9345_pilon	-	1631	14	Intergenic	novelGene_24493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	223.726296222196	2695	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	44	1588	671829	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671872	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
564757	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_94112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653698	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
564762	contig_7202_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_16434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27784	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
564779	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
564780	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	234	-4	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
564784	contig_14415_pilon	+	1097	2	Intergenic	novelGene_77608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGGTGTTTATATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33331	39505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33373_38449
564804	contig_16703_pilon	+	977	8	Intergenic	novelGene_72744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1204.36823984314	163	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	207	605	6490	33001	TRUE	25	TGCACTTTGAGTTGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASPAL	5730	40745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_9981_32987_33016_38544_38758_40600
564805	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
564819	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
564823	contig_9014_pilon	-	2621	5	Intergenic	novelGene_106708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	50.1273378507177	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	404	748	44144	43272	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHGECPAGPASLPTLHGPPALQAQLSLCSSVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYR	44981	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42961_43054_43559_44086_44240_44420_44533_44785
564824	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564831	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
564832	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564836	contig_7202_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_16441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27798	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
564847	contig_14322_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_116119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671661	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
564848	contig_11248_pilon	+	2739	8	Intergenic	novelGene_142556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_3	45.7803094648112	254	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	169	975	351981	410462	FALSE	25	TTAATTTCTTTGTTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IETRWTSKGESLNGLILSSPPSQQDAKRLTGEPSILQKNVFSSLLPRRQPVPRVRKMEPSLLVCGLLTFTMVTGYMAEFCFDAPPKIRYATFKAHTYKNGTILNCECKQGFRRISNGSPYMLCKGNSSHTSWENKCQCISNSPRNTGEPVTPKPEEQEERKTTEMRSQMQPPDQENLLGHCREPPPWKHEAMGRKYHFVVGQTVQYQCTNGYWAQRRGPAESTCRVICGKTRWTQPRLTCTNEVITGKEEAESSTDTLPESETSCPSITTVSQKYTEVVATMETFVFTTEYQVAVAGCVFLLISILLLSGFTWRRKWRKSRRTI	351812	412226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_352045_391015_391208_392098_392210_398645_398850_404085_404158_404624_404697_405590_405658_410437
564854	contig_18869_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_56250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73582	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
564855	contig_1406_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_25493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAATTGTACTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352974	1351914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1351900_1353000
564859	contig_11115_pilon	+	2603	14	Intergenic	novelGene_102792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_4	138.423541795017	440	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	7	1878	150114	157736	FALSE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIMRGPRASPRPLNLSQLSFHRVCRDEITQLSHLGQGTRTNVYEGLLRVEGEGPEEDKEDSGDPPVPSRGRGQELRVVLKVLDPSHHDIALAFYEVASLMSQVSHVHLAFVHGVCVHGSENILVTEYVEHGPLDVWLRREKGHVPVAWKVAVAQQLASALSYLEDKNLVHGNVCGRNILLARPGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGTLSREERVERIPWMAPECLPGGANSLSTAADKWGFGATLLEICFDGEAPLQGRGPSEKERFYQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	150107	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_150198_150303_150487_150567_150656_151655_151784_152659_152796_152878_153034_153729_153881_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601
564865	contig_10734_pilon	-	1042	9	Intergenic	novelGene_51518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	625.556302422092	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	744	298	1041	2286346	2269344	FALSE	40	GAACGAGTACTACTACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRPLCSSTSSSTHTRASAVGGTSTPTASAAG	2305230	2269342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2269432_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286432_2305018
564871	contig_14142_pilon	+	3593	8	Intergenic	novelGene_120494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_4	31.4571298819228	107	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTCTGTGTGGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307869	318476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308281_308382_308467_308566_308669_309006_310041_311187_312815_313548_313645_318077
564876	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564877	contig_5039_pilon	+	1732	5	Intergenic	novelGene_65020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	374.190041957292	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	111	494	1773369	1781518	FALSE	30	CAATCATTTTATTAATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFLDNFRWPECECIDWSERRNAVASVVAGILFFTGWWIMIDAAVVYPKPEQLNHAFHTCGVFSTLAFFMINAVSNAQVRGDSYESGCLGRTGARVWLFIGFMLMFGSLIASMWILFGAYVTQSKY	1756801	1782756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1756871_1773327_1773468_1775230_1775344_1776931_1777000_1781414
564878	contig_5039_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_65028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	138	329	1783883	1784074	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTQCFFYQHCGFIKAHYPQKVSFQFFFSCEDTGHSCQDGFSDKHVMNFNHPSCICQILKTPELMKGNKLTECAVIKNRICLSNVCVCVLAVGSKGTGSVPALLVPLWF	1783745	1785754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1783700_1785800
564892	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
564916	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27843	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
564925	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
564928	contig_20779_pilon	+	2012	5	Intergenic	novelGene_112362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	159.747456943765	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	41	1774	8301	76720	TRUE	25	TGAGTGCTATTCTAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENGAIHTEGCGL	8260	94523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_76688_76795_94359
564933	contig_9843_pilon	-	2473	10	Intergenic	novelGene_114339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	28.7006688957196	117	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	437	1576	302693	259346	FALSE	30	TAAACAGTGTTGCATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQDQK	305690	258448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_259358_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_304403_304509_305367
564936	contig_7202_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_17496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCCGGGGCTCCCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
564946	SIRV4	+	207	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1564	632	1109	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
564951	contig_10526_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_142578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTTTAAGTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300958	302218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_301000_302200
564957	SIRV4	+	320	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	652	976	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
564962	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
564963	contig_9706_pilon	+	149	1	Intergenic	novelGene_20785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761	910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_800_900
564972	contig_9609_pilon	+	1119	6	Intergenic	novelGene_23077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	965.375450278284	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	169	642	453647	454609	TRUE	65	GTAGAAAGAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	450602	456259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454623_455795
564994	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
564995	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
565002	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565004	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_16387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
565014	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565024	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	203	1375	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34605	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
565034	contig_12938_pilon	-	1438	9	Intergenic	novelGene_99695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGGAGAAGTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86316	51944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52043_78097_78190_79052_79229_80719_80795_81369_81459_83391_83468_84548_84632_85465_86005_86106
565046	SIRV2	+	476	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	118	-71	-118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTGCAACTTGGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
565060	scaffold_13505_pilon	-	1026	5	Intergenic	novelGene_111456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	321.267411979491	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	214	621	532892	531050	FALSE	30	GCAGACCTTAGCAGGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAHPPWELHPVVVHIPGLGLGPYGQADHRECEQEPRGHIPVPVRGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535623	530644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532466_532756_532999_535516
565064	contig_16492_pilon	+	2178	11	Intergenic	novelGene_100274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	101.619879944822	37	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	740	1462	86032	100411	FALSE	60	CAAGCCAAATTAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76793	101127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78571_78830_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
565080	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_94969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565092	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565093	SIRV6	+	1067	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	20	1	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	195	686	1733	10736	TRUE	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1150	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
565123	contig_1786_pilon	-	2748	21	Intergenic	novelGene_142594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_17	281.088438040415	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	87	2717	68236	41015	FALSE	25	AATCGTTATTATGTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTAMALRNKSFGSAQEFAWAHDSSEYAIRESNSVVKIFKNFKEKKSFKPDFGAESIYGGFLLGVRSVNGLAFYDWDNTELIRRIEIQPKHIFWSDSGELVCIATEESFFILKYLSEKVLAAQETHEGVTEDGIEDAFEVLGEIQEIVKTGLWVGDCFIYTSSVNRLNYYVGGEIVTIAHLDRTMYLLGYIPKDNRLYLGDKELNIVSYSLLVSVLEYQTAVMRRDFSMADKVLPTIPKEQRTRVAHFLEKQGFKQQALTVSTDPEHRFELALQLGELKIAYQLAVEAESEQKWKQLAELAISKCQFGLAQECLHHAQDYGGLLLLATASGNASMVNKLAEGAERDGKNNVAFMSYFLQGKLDACLELLIRTGRLPEAAFLARTYLPSQVSRVVKLWRENLSVVSQKAAESLADPTEYENLFPGLKEAFVVEEWVKETHADLWPAKQYPLITPNEERNVMEEAKGFQPSRAAAQQELDGKPVSPTSVIMASHTTSKEKSLLELEVDLDNLELEDIDTTDINLDEDILDD	68322	40983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_41111_41550_41620_41783_41853_42041_42223_42309_42403_43584_43800_44712_44824_48995_49204_49487_49619_50251_50396_52199_52307_52383_52473_54358_54470_55558_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_68182
565128	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565133	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
565134	contig_20550_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_142629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGTGCGTGCGCACACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22097	22808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_22100_22800
565142	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
565151	contig_10197_pilon	+	2452	13	Intergenic	novelGene_115276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	274	627	1167872	1168480	TRUE	30	GACCTCTGCCCACAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFGVCQLQLILHVGIMPYTHKVVVPRGLGRDHKEAKEAIRQQHLDPLIVRGQVTLGVVALVCVLAAPFIATRGQLVGCEGAGTWREAASDDNGLLAIPRWVVSHDLGMGSDILG	1167598	1187317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1167934_1168095_1168302_1168394_1168535_1168687_1168830_1170017_1170159_1170249_1170493_1171235_1171422_1175371_1175546_1175651_1175784_1175985_1176164_1176279_1176530_1186804_1186917_1187104
565153	SIRV4	+	191	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	639	1118	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTCTTCTTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
565154	contig_10424_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_56806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACTGCATCTAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301334	303763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_301300_303800
565158	contig_6445_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_77049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCAGACAGCAGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651976	649446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_649400_652000
565171	contig_8866_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_77828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTATTATTTTTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576361	575094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_575100_576400
565178	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
565184	SIRV6	+	871	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	32	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
565204	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_18491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565224	SIRV4	+	252	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1519	632	1064	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2519	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
565233	contig_18869_pilon	-	2616	3	Intergenic	novelGene_55974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	49.5	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	386	928	53041	52499	TRUE	35	TAGGCTCTAATAACATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59869	49550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_49889_51148_53330_59772
565239	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
565240	contig_6589_pilon	+	1926	2	Intergenic	novelGene_26160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	17655	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1437	1802	1886541	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGLLGSPVQQLPIPSIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885104	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886783_1887705
565250	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
565260	SIRV2	+	596	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	-18	-55	18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACATGGTAACCTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1600
565264	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
565277	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
565284	contig_6735_pilon	-	1591	16	Intergenic	novelGene_15777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1008.00885357664	7	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	88	1404	564868	542177	FALSE	30	CCCTTATGCTGAGCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDLILHECFL	568285	541989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542204_542565_542601_542790_542857_543005_543139_543240_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554246_554374_564157_564232_564784_564869_568198
565287	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
565293	contig_16666_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_61736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56652_58193_58264_59552
565303	contig_17470_pilon	-	1896	12	Intergenic	novelGene_110520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_10	48.0829173631214	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	336	1412	277165	270076	FALSE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302634	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_277162_277222_302355
565318	contig_17493_pilon	-	2697	10	Intergenic	novelGene_122181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	404	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTCTCCAACAACAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158036	49967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_50099_92038_92130_94727_94841_103475_103529_104358_104471_116051_116188_118449_118588_119114_119187_146409_146616_156391
565332	contig_10042_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_79153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGACTTGAAAGAATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647936	648881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_647900_648900
565338	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_94669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
565352	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565378	contig_14807_pilon	-	895	6	Intergenic	novelGene_124668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_5	7414.58644564887	1684	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	307	798	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39620
565391	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
565414	contig_13707_pilon	-	1926	2	Intergenic	novelGene_43579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2455	junction_1	0	1940	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTAATTAAATGCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275539	273505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_274040_274147
565417	scaffold_2602_pilon	+	2462	9	Intergenic	novelGene_127681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	510.439210386506	646	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	380	1717	25608	47598	FALSE	65	AAAAAAAAAAATGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICR	25228	48343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476
565432	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
565433	contig_15039_pilon	-	1961	11	Intergenic	novelGene_110145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_10	502.4814424434	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	537	1205	200602	185257	FALSE	60	TAAAAAGGAAAACCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260891	184500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_201176_201237_202795_202857_208401_208526_222093_222255_260778
565436	contig_16496_pilon	-	1053	3	Intergenic	novelGene_5202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	3582	762	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVIKKSSLAPA	3583	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_787_1250_1354_3413
565438	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	84	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
565442	contig_12671_pilon	-	2809	1	Intergenic	novelGene_19229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATTTTCAGGCAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201049	198240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_198200_201000
565451	contig_4232_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_63261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3181	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGTGGTTCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463014	460878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_460900_463000
565452	contig_3956_pilon	+	1272	8	Intergenic	novelGene_15041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1451.1488481861	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	81	1073	1281682	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDKTSKKI	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285789_1290796
565480	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
565481	contig_12250_pilon	-	2501	8	Intergenic	novelGene_80650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_4	145.509660244569	65	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	38	1087	379717	377252	TRUE	25	GGAATCAGTATCTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECWDSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRGEAVPTEPLPLTSGYPVDPTW	380559	375688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
565483	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565494	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
565513	contig_7963_pilon	+	2632	11	Intergenic	novelGene_58586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	163.457027992069	7	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	119	1660	260459	268067	TRUE	35	TATATATTTTAAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKVPERGHSERTWTPTPCHSCLMRHCSL	259777	270133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464_265594_267797_268345_268536_268697_269102_269240_269735
565519	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565533	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565545	contig_10477_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_112492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGCTACCAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261083	261417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_261100_261400
565546	contig_5690_pilon	+	1584	11	Intergenic	novelGene_119716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	473.95227607851	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	76	1110	1044729	1105490	FALSE	35	AAGAGAAATTTCACGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRHLPAARSLPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044653	1105964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073877_1077697_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
565547	contig_7293_pilon	+	1555	3	Intergenic	novelGene_54236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	646	junction_1	44	4776	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	163	519	329270	330139	FALSE	30	TAATAATCTGTACCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRHNTTSCTSVSPFGVLQVWLLLSLLLTALVPGTSQETNCVEAELYTELRCMCVKTTSGVHPSYINTLKVIRAGAHCNKVEVIATLKDGKKICLDPEAPIIKKIVQKILQSDGSAA	329107	331175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329388_329744_329881_330036
565549	contig_6202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_139821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTGCCACCACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440591	440278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_440300_440600
565550	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
565583	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
565588	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_16469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
565589	contig_14513_pilon	-	1203	5	Intergenic	novelGene_70221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	TRUE	25	TAATTATCTCTTCTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	4231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_4252_11412_12158_13087_13136_14952_15001_18735
565592	contig_16492_pilon	+	2127	10	Intergenic	novelGene_100272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	96.2877631546882	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	649	1371	86032	100411	FALSE	15	CAATGGTGTGTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76789	101167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78830_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
565598	contig_14322_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_116482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCTCACTCCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
565602	contig_9354_pilon	+	1906	9	Intergenic	novelGene_108043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_7	90.2039356125884	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	24	1130	96289	116167	TRUE	15	ATTTATTAGCTTTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAFATNMRFKFPLMAIGLEVAMIVLFGVFVQYENVQNSGQPSNTSSPAVMNSFFRLYPLFQHVNVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGFNFFIAALGLQWGTIIQGLLNDHGEKFHISIHSLISADFSTTTVLVSFGAVLGKISPIQVLIMTILEIAVFNGNEYLFAEIFQATDIGGSMVIHAFGAYFGLAVAGILYRSNQIWEHHNKQSDIHSDLFAMIGTLFLWIFWPSFNSTLAVPEEKQNRAIINTYFSLAACVLTSYAFSSLVERRGKLSMAHIQNATLAGGVAVGTCADMEINPYGSMIIGSIAGIVSVIGFKFLTPFFATTLRIQDTCGVHNLHGLPGIVGGLASIVVIAMGASDVFNSKVTHLGTAT	96265	117871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_96446_104932_105117_105984_106136_108697_108846_109396_109564_111077_111216_111996_112119_116127_116202_117129
565618	contig_10627_pilon	+	1865	4	Intergenic	novelGene_59909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	48.1271464167804	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	67	960	29148	31949	TRUE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFSVARSTGSQLVWWLPVTTQIMRGNAIINSKNAGNTGLQLLAATPDLHPPSLRRRPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGEWEPRGLERAFTPSPLGEEPCPVFCWLGDRDQDLHI	29081	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30300_31515_32538_32744
565626	SIRV4	+	352	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	151	447	151	-447	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
565631	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
565635	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_95696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565639	contig_18869_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_56092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
565641	contig_14322_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_116404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAAATTAGCAGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671886	671367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
565650	contig_15859_pilon	-	2101	7	Intergenic	novelGene_50197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	148.012856048235	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	104	1243	349672	342417	TRUE	25	GATCTGCAACTTCAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTEIQPKIIGQAYPHKRRFILVLPGVIQSEKQRKCP	352707	340494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_342354_342521_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352636
565651	contig_14326_pilon	-	2279	4	Intergenic	novelGene_120676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	172.677605831085	822	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	485	802	123955	116744	FALSE	20	CTCCACATTGCCAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKEKDLGTLGYVLGITMMVVIIAIGIGIILGYTYKRGKDLKAQHEQKACEREMQRITLPLSAFTNPTCEIVDEKTVAVHTSQTPVSLQEGCTPLMDQAGTPGA	124826	115266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_116949_123741_123821_123921_124120_124506
565657	contig_6740_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_142681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCCTTCAAGATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617141	618931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_617100_618900
565660	contig_10404_pilon	-	3139	16	Intergenic	novelGene_138648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_15	92.4356833455325	296	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	308	2866	827022	764956	FALSE	20	TGGCATTTGAGATGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFESFVKGLLLVRQYRVEVYKNKAGNKASKENDWYLAFKASPGNLSQFEDILYGNNDMSSSIGVVGIRTSTVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLVQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQVILRGGILITDRKRTEFSTKDIYQDLNRLLKAKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDFNQYMKLDIAAVRALNLFQGSLEDTSGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQNCYQVYQGINQLPNVIQALEKYEGKHQSLLLAIFVTPLIDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLTELREVMDDLEKKMQSALISAARDLGLEPGKQIKLDSSTQFGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFTTVDIQKNGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKTDYEEAQNAIVKEIINISSGYVEPMQILNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPVILKKGQGRILLKASRHACVEVQDEVAFIPNDVHFEKDKQMFHIVTGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATRIGAFCMFATHFHELTALASQVPTVSNLHVTALTTEETLTMLYQVKKGACDQSFGIHVAELANFPRHVIECAKQKALELEEFQNIGESRDYGETEPAAKRCYLERERGEKIIQEFLSKVKQLPFTEMSEEAITVKLKQLKAEVIAKNNSFVNEIISRIKVTA	840992	764682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_765127_768245_768422_770987_771236_773776_773982_775077_775324_780376_780475_782856_783008_783781_783906_795991_796102_810864_811065_818548_818683_819141_819292_821791_821939_823569_823849_826902_827058_840720
565663	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	646	1011	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTTAACCGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
565664	contig_15039_pilon	-	1591	7	Intergenic	novelGene_110115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_6	568.163611021411	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	149	817	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	222224	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_222093
565676	contig_15744_pilon	+	438	2	Intergenic	novelGene_83613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4201	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGACAGTTGTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152608	153586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152706_153245
565697	contig_11017_pilon	+	1432	11	Intergenic	novelGene_128078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.955762278836	2410	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	290	976	259431	294618	FALSE	5	ATTCTCTTTGTCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTHGDPICVRGELCIIGFSVEVDHQAFLPRCLQVDLNLQPPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233694	295074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_259416_259554_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
565701	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_116094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
565711	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565712	contig_10197_pilon	+	2397	2	Intergenic	novelGene_115227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920482	923615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_921059_921794
565716	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565717	contig_5018_pilon	-	1865	9	Intergenic	novelGene_47076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	748.627567202144	1	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	67	786	1402792	1400937	TRUE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGFAVTLTCFSDRLDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGLGQARAHP	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401048_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402398_1402751
565721	contig_12312_pilon	+	3428	6	Intergenic	novelGene_64011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_5	58.0468776076715	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525319	535962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
565724	contig_9653_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_48204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190717	192785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_190700_192800
565727	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_96913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
565730	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_17617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
565740	contig_1107_pilon	-	1873	4	Intergenic	novelGene_126538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.1837661840736	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	250	309	124791	124732	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPETSGPNTGNSVQRQLGATGRVGLTGPATRPCPGTPVAGGRVLGVGGPHPGPSGPVRAVQRPVLLGPAGGRGGEVERAHDPMCWDMQLRREGWNVFHPTQ	126414	122842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_124212_124536_124792_125953_126145_126356
565749	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
565775	contig_13097_pilon	+	2197	18	Intergenic	novelGene_107699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_13	500.706504311865	946	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	223	1989	184733	264394	FALSE	55	ATATCCAAGAAAGAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184510	264602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
565778	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_93989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
565783	contig_14322_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_115981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671615	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
565788	SIRV4	+	348	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	181	421	181	-421	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGACTTTCCACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636	2350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
565814	SIRV4	+	331	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	919	-66	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCAGGTTAAGACTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374	2705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
565820	contig_14513_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_70400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	151	315	18880	12143	FALSE	50	CAGCCAAATAAACACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19030	11692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
565838	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
565844	contig_1856_pilon	-	3475	2	Intergenic	novelGene_84881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	837	junction_1	0	95	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	303	752	260083	259331	FALSE	70	AAAAAAAAAATAGAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLTFLFVILHVYKALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSGKGKFHFPFPPPTTFDSTKPK	260385	256607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_259735_260037
565845	contig_15304_pilon	-	1468	2	Intergenic	novelGene_30534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	487	834	54039	53692	TRUE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSITQAHRRPRCPAKVRGQGWTGPGDLGATLPMLGRRGSGRESKEGRRSLGTGVRKKEQGGTVGREDWPTLASLSSRLPLCMPPKPDTAPASPRRPAPGLGSQPHMHTEWPEGP	54525	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
565853	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565873	contig_7333_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_142761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACTTAACTATTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147357	146155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_146200_147400
565894	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565897	contig_5715_pilon	-	2409	16	Intergenic	novelGene_127963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	109.892472697431	544	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	183	1421	659441	559568	TRUE	20	CTGTGCACTAGCATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSTLAVEELGFERFHALIHKRSFRSLSELKDSVLDQYSMWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKDMALVAPEAPSEQARRVFQTYDPEDNGFIPDSLLEDVMKALDLVSDPEYINLMKNKLDPEGLGIILLGPFLQEFFPDQVKFRSMLTKKRKILFIYSPPHFPSLRAPVVQSLLLSTTTMD	659623	554737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_555703_559544_559617_563698_563776_564060_564149_566702_566776_576738_576812_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631757_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
565904	contig_11429_pilon	-	1441	6	Intergenic	novelGene_60451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	578	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	605	967	48520	46538	TRUE	30	CGCTTGATAAAGCGTACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMPHLSCRNCLCNSLQSSGHNHPGFCRYSLWTFHIHIHILQADCHTCCSHSPGPHHLQQSSCGHAHGHQRHPLWFPGPTCPRDPPGSGGHPGTTPFMARMASEACSGLVKVIKPKPRDR	49494	45393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_-_45473_46142_46617_47259_47364_47448_47550_48441_48528_48897
565914	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
565919	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91623	6	-91617	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAGTAGAGTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
565954	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
565967	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_96620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
565971	contig_2637_pilon	+	2665	6	Intergenic	novelGene_100026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	25.772853935876	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	346	744	38745	47120	FALSE	25	TACTGCTTGCTTAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQDELSQRLARLRDQV	38399	49041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322_46396_47075
565975	SIRV4	+	323	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1448	632	993	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2448	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
565979	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
565983	contig_18869_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_56079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73582	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
565989	contig_14704_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_82686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAACTAGATTTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68274	66298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_66300_68300
566001	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
566014	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566042	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
566046	SIRV4	+	188	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	639	1121	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTCTTCTTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
566048	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
566049	contig_7151_pilon	-	1868	13	Intergenic	novelGene_40672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	138.774672481048	1	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	59	1771	18221	1924	FALSE	20	TTTCTCAACCCAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	18279	1826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4350_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13464_13511_13676_13782_13876_18160
566052	contig_10241_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_142835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAATTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104538	102478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_102500_104500
566055	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566057	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_114058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	AGTTTATTACTGTCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566061	contig_7165_pilon	+	1577	6	Intergenic	novelGene_116890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	497.616880742605	922	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	73	540	1016847	1063285	FALSE	5	TCTTCTTTGTTTTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGAKVALQHNIGLGGAVVVTVYKMGFPEAARTHQIEAVPTSSAFDGFKANLVFKEIEKKLEEEGEEFVKKIGGIFAFKVKDGPGGKEATWVVDVKNGKGSVHPNSDKKADCTITMADSDLLALMTGKMNPQSSLFQKPGQSRGHQCRSWLWSSFPPTAVRFAVHSMSSVGRRPSFKAN	1016774	1064322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582_1043677_1053994_1054125_1060246_1060327_1061700_1061820_1063263
566077	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566097	contig_4924_pilon	-	3787	9	Intergenic	novelGene_84697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_5	1182.06048914597	55	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	20	925	252576	82377	TRUE	20	TTCCCCAGCTAAATCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252595	71976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
566111	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	4	875	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
566121	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566122	contig_2892_pilon	+	1581	6	Intergenic	novelGene_119016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_1	1473.27043002974	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	357	401	324837	328181	TRUE	10	CAGTTTTTGCTGTAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPSASRPSSATAPAHLARSFALLRVRLRHGVGGGGAGRSRAGLRQPVPAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFIFHLFPWIL	264993	339505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265147_318539_318671_324764_324853_328152_328220_331706_331813_338469
566143	contig_13894_pilon	+	1096	9	Intergenic	novelGene_62156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	78	1040	522731	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521744	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
566144	contig_15063_pilon	+	1493	4	Intergenic	novelGene_13180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
566148	SIRV5	+	399	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7490	2	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
566151	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566175	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
566186	contig_4114_pilon	-	2234	10	Intergenic	novelGene_15644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_9	97.7386285261505	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	351	1625	592330	567115	FALSE	10	TAATTTTTGTGTGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLMRNEFTITHVLIPKQSAGSDYCNTENEEELFLIQDQQGLITLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQMMLPESIAIVCSPKFQETGFFKLTDHGLEEISSCRQKGFHPHSKDPPLFCSCSHVTVVDRAVTITDLR	594254	566505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127_592346_593919
566195	contig_13740_pilon	-	1558	10	Intergenic	novelGene_34676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4788.52248147125	9	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	201	1037	165243	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKLKVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165443	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161728_162127_162164_165237
566216	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566218	contig_15063_pilon	+	857	2	Intergenic	novelGene_14443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
566238	contig_3077_pilon	+	1583	9	Intergenic	novelGene_26625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	126	1235	9719	17590	FALSE	40	AGACATCTTACAAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9593	17938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
566242	contig_3825_pilon	+	1572	7	Intergenic	novelGene_77930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	1238.03734686084	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATGTTTGTGGGGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12212	15686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13772_13904_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
566245	contig_3382_pilon	-	2249	15	Intergenic	novelGene_124026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	389.315097187303	81	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	95	1090	344734	224870	TRUE	10	TTTGGCGTTCATTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDCLFLPPCAARGSSKASLSLEDPVLWSGGPMEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344828	176647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_185100_185283_186028_186176_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
566255	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
566261	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_97754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566266	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566275	contig_4093_pilon	+	1481	6	Intergenic	novelGene_27640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGGGCGGCGGCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40890	72479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_41797_45447_45543_45618_45782_46295_46373_69060_69257_72435
566284	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566286	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566289	scaffold_6394_pilon	+	1394	7	Intergenic	novelGene_111007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	326.893458688505	316	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1	1023	398216	405905	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTVRARVCPWRLQGP	398215	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717
566292	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	116	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
566299	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566301	SIRV5	-	423	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTCCTGCCAGTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10966	8196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
566311	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
566315	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566344	contig_9014_pilon	+	2665	10	Intergenic	novelGene_106727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1811	2278	44184	46572	TRUE	0	TCCCTCCGCCCGCGGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVLSKLTAVLEGAGTLFPAAQHHVVILANGLVFTAQAVCFHMPIEPLRIVEGALTMLPQTQKVVRDIRDDIPALEVQDAGAEVSLALQGLQPPLFQLGVVAVEVDMADEVSRTIQRTKATFLPQAGEFFLCSRSSSSSSSSSSEPWRCCCRC	41310	51553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_42287_42831_42960_43053_43200_43281_43397_43480_43829_44086_44240_44420_44535_44787_45022_46508_46692_51285
566350	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566355	contig_21412_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_142847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAAGGGCTCCTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18024	17474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_17500_18000
566359	contig_14322_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_116566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACAGCAGCGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
566366	contig_5954_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_28693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	485.418163430696	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	602	1723	948112	945083	FALSE	10	ACTGGAGTGTCTTTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	959799	944789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948134_956446_956500_956705_956942_959508
566371	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	150	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
566391	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566396	contig_9848_pilon	-	1398	10	Intergenic	novelGene_79941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	551.070226978131	1851	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	342	503	104554	104073	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPGYLVEWALRNHRGRPSATPMLAPIQMTTPRTTRIRHPSNSGGSPGGLWSLSWVKHLLPWQEAPTRTTVSQTM	107189	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_98988_99036_99394_104028_104148_104467_104611_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128
566400	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566409	contig_2204_pilon	+	1264	6	Intergenic	novelGene_71663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	164.84659535459	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	30	602	13204	50549	FALSE	25	TTTTTAAAGGGCATCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPRPAWWSGCLRMDEKM	13174	51211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38787_50498
566412	contig_15236_pilon	+	1927	4	Intergenic	novelGene_141531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	246	junction_1	44.4996878890428	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	42	1244	55474	110193	FALSE	25	GCTATAAAGTGGGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVVEKSLEGPLAPSTDEAAQKTGDLVEILNEDKVKFDDTGLSLILQNGLETLRMENALTDVILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFCNDLKEKREKRIVIKGVDAEIMHTLLDYTYTSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISERTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTRDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELDSENKKWVEFACVTLKNEVYISGKQDRETPRVPLVARCIFLSEAIVLKEAL	55432	110876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_82174_82341_100925_101376_109866
566426	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566443	contig_500_pilon	+	3299	13	Intergenic	novelGene_30919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	59.6188705211884	849	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	55	2628	1063342	1089765	FALSE	35	ATAAAAGGATTTATCGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVHASASAIIQYGKIARKQGLVNVALDILSRIHTIPTVPIVDCFQKIRQQVKCYLQLAGVMGKNECMQGLEVIESTNLKYFTKEMTAEFYALKGMFLAQINKSEEANKAFSAAVQMHDVLVKAWAMWGDYLENIFVKERQLHLGVSAITCYLHACRHQNESKSRKYLAKVLWLLSFDDDKNTLADAVDKYCIGVPPIQWLAWIPQLLTCLVGSEGKLLLNLISQVGRVYPQAVYFPIRTLYLTLKIEQRERYKSDSGQQQPSSVGNQSHSASDPGPIRATAPMWRCSRIMHMQRELHPTLLSSLEGIVDQMVWFRENWHEEVLRQLQQGLAKCYSVAFEKSGAVSDAKITPHTLNFVKKLVSTFGVGLENVSNVSTMFSSAASESLARRAQATAQDPVFQKLKGQFTTDFDFSVPGSMKLHNLISKLKKWIKILEAKTKQLPKFFLIEEKCRFLSNFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQVLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPALRCRAAGEHGQPAAGLPGPEGGDRHCDAPAQPGAVRGWGEQGEHPGGRGQQPGQPVPHGPRLAPVAVTPCAAHPGM	1063287	1090436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1063552_1064169_1064271_1069626_1069829_1071515_1071681_1073181_1073273_1074575_1074776_1075645_1075908_1079806_1080033_1081309_1081528_1083490_1083676_1086058_1086263_1086347_1086543_1089450
566446	contig_7426_pilon	-	2681	3	Intergenic	novelGene_27556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.5	55	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	1163648	1161950	TRUE	10	AGCGCCTTGTCCGTCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPSSDFLPFRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1163649	1158904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1159075_1159793_1162080_1163424
566449	contig_10134_pilon	-	1557	4	Intergenic	novelGene_16178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	495.521498580592	951	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGACTCTTGGCTTTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	29366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30271_34922_35178_38558_38817_39584
566452	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566462	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
566469	contig_12270_pilon	-	320	2	Intergenic	novelGene_114036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	2	319	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14410	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566474	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	650	987	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATAACTTTAACCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
566483	contig_854_pilon	+	1920	8	Intergenic	novelGene_36460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	291.204255407346	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	838	1365	1459076	1464213	TRUE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRVRRSPATLLITPVPVPTAHTVTQSSFSL	1457686	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460955_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
566486	contig_14925_pilon	-	990	5	Intergenic	novelGene_55143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_4	1519.6860489917	64	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	196	453	29675	27020	TRUE	15	AGGCTGTGCTCCTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGQGTELSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	57681	25790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_57638
566488	contig_20719_pilon	+	4439	1	Intergenic	novelGene_140574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65185	69624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_65200_69600
566500	contig_11978_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_62874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGCTCTGCCTTAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647942	649294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_647900_649300
566515	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
566517	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566533	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	69	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
566534	contig_3975_pilon	+	2561	10	Intergenic	novelGene_54757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103.880748344162	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	19	1152	1961329	1984755	FALSE	40	AAAGATTCTAACAGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961310	1986164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1968057_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
566535	contig_7202_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_17336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGCAGGTAATGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
566546	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1582	635	1127	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
566554	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
566556	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_115991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
566564	SIRV6	-	246	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTTTCTAAACAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
566567	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
566570	contig_3095_pilon	-	1175	5	Intergenic	novelGene_75230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1322.24288615973	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	96	851	255481	246698	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIILRIF	255576	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246712_247876_247970_248476_248759_253535_253806_255384
566585	contig_6589_pilon	+	2147	16	Intergenic	novelGene_25727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_8	59.3248683100098	397	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1128	1784	479605	507033	TRUE	25	ATCTGGAGGAGTCTACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451707	509758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_477749_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
566587	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
566599	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGCCAGATCAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30086	29848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
566611	contig_6795_pilon	-	1743	10	Intergenic	novelGene_27662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	101.964045950848	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	263	1024	129029	46282	FALSE	30	CATGCTGTGGATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPRGGYQHNST	134362	45562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
566627	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
566642	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566652	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
566666	contig_15063_pilon	+	1080	3	Intergenic	novelGene_14388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	117	938	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35154	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
566678	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566688	contig_11115_pilon	+	1798	7	Intergenic	novelGene_102825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	620.168167157551	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	234	1709	165608	173241	FALSE	20	AGTCTGTGGCTTAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165374	173330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166489_171160_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
566695	contig_10235_pilon	-	1598	5	Intergenic	novelGene_46486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	794	junction_4	784.198635550968	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	41	439	222843	220073	TRUE	45	TACAGAATGAAAATTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSDGRFLVAVSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDSESCG	222883	217931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_220197_220354_220481_220677_220788_222804
566698	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566710	contig_14637_pilon	+	2625	7	Intergenic	novelGene_114549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	560	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1642	1944	363652	363954	TRUE	5	TGCGCACTGCGCCGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLKNYMINVNHKIKCTYKGTPILCHIKKRQTANCMLTMLPGKADEWDFLQIFTVMIQNKRVQTARSLTEQLKSLYTERCHYLIACAKGDLSQVYTTEQ	362010	391529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_364112_369328_369395_369468_369589_371424_371497_377828_377890_389890_389949_391382
566713	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
566729	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
566738	contig_2793_pilon	-	1252	8	Intergenic	novelGene_142867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_4	411.7412502323	3120	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	167	847	118367	79566	FALSE	10	TCCTAGACTGTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118533	79160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
566755	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_97507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566766	contig_13718_pilon	+	2297	11	Intergenic	novelGene_142893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_5	155.214979947169	353	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	6	1415	226308	273278	FALSE	30	TCCTTTAAGTGTCAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAMETEAAPLTLESLPTDPLLLILSFLDYRDLINCCYVSRRLSQLSSHDPLWRRHCKKYWLISEEEKTQKNQCWKSLFIDTYSDVGRYIDHYAAIKKAWDDLKKYLEPRCPRMVLSLKEGAREEDLDAVEAQIGCKLPDDYRCSYRIHNGQKLVVPGLLGSMALSNHYRSEDLLDVDTAAGGFQQRQGLKYCLPLTFCIHTGLSQYIAVEAAEGRNKNEVFYQCPDQMARNPAAIDMFIIGATFTDWFTSYVNNVVSGGFPIIRDQIFRYVHDPECVATTGDITVSVSTSFLPELSSVHPPHYFFTYRIRIEMSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLEMGPDEYEEMEEEEEEEEEEDDDSADMDESDEEDEEERRRRVFDVPIRRRRCSRLF	226302	274160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_226412_230712_230803_236273_236438_252116_252232_253824_254030_255157_255204_256435_256521_257368_257492_262552_262669_263921_264113_273107
566767	contig_15063_pilon	+	1150	3	Intergenic	novelGene_14373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	189	1010	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35082	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
566771	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	0	2960	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
566773	contig_8729_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_40113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCAGTGGTTCTCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324657	325144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_324700_325100
566800	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
566801	contig_9177_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_32550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13962	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1986_13890
566811	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	19	351	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14427	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566816	contig_8978_pilon	-	1444	9	Intergenic	novelGene_49330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	828.424096930431	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	30	1151	194082	190773	TRUE	65	AAAAAGTGAAGCAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194111	190430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190542_190590_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
566822	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
566837	contig_8386_pilon	-	2830	2	Intergenic	novelGene_82243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	115	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	975	1298	92821	90003	FALSE	10	CACTATTGTGTTTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRCSASCCEDSQASMQQVHQCIERCHAPLAQAQALVTSELEKFQDRLARCTMHCNDKAKDSMDAGSKELQVKQQLESCVTKCVDDHMHLIPSMTKKMKESLSSIAK	93795	88470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_90192_92686
566843	SIRV2	+	658	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
566846	contig_15720_pilon	+	997	7	Intergenic	novelGene_41922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCGAGCAGCCCACCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279004	283997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281929_282569_282750_283785
566854	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
566863	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566880	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566881	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
566887	SIRV7	-	255	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69031	0	35812	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78926	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
566896	contig_18869_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_56093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
566908	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
566910	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
566914	contig_5247_pilon	+	2573	17	Intergenic	novelGene_81804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	198.512908900152	4	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2541	33	2573	145538	161554	FALSE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLNGEGFHVPFCFCKKKSGKPGETERIHFISGFLQIKMAIIME	145505	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_161433
566935	contig_15118_pilon	+	1494	6	Intergenic	novelGene_74629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	88.5519056824866	2063	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	33	800	438502	458938	FALSE	30	GGAGGAAATGGACTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVPGSDSRKMAELRALVGVKRVIDFAVKIRVKPDKTGVVTDGVKHSMNPFCEIAVEEAVRLKEKKLLKEVIAVSCGPAQCQETIRTALAMGADRGIHVEVPAAEADRLGPLQVARILAKLAEKEKVNLLLLGKQAIDDDCNQTGQMTAGFLDWPQGTFASQVTLEGDKLKVEREIDGGLETVRLKLPAVVTADLRLNEPRYATLPNIMKAKKKKIEVIKAGDLGVDLTSKLSVVSVEDPPQRSAGLKVETTEDLVAKLREIGRI	438469	459632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_438559_448781_448941_449190_449350_451928_451992_457612_457772_458767
566945	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
566949	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	9	368	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14417	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
566954	contig_6870_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_103951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTTTTTCAATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258955	1259611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1259000_1259600
566955	contig_10196_pilon	+	1158	9	Intergenic	novelGene_132131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	620	junction_4	223.494267264286	394	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	42	968	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPEPVPRTAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034524	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
566956	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
566959	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1462	632	1007	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2462	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
566960	contig_15063_pilon	+	1130	4	Intergenic	novelGene_11837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2640.18383198342	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	228	986	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34888_35873_36158_36266
566964	contig_14618_pilon	+	2295	11	Intergenic	novelGene_136793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	46.7641957056892	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	75	815	298711	307723	TRUE	15	TGCCAAGCCCTCTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFGTTSGFGTGGTSMFGSTTTDNHNPMKDIEVTSSPDDSIGCLSFSPPTLPGNFLIAGSWANDVRCWEVQDSGQTIPKAQQMHTGPVLDVCWSDDGSKVFTASCDKTAKMWDLNSNQAIQIAQHDAPVKTIHWIKAPNYSCVMTGSWDKTLKFWDTRSSNPMMVLQLPERCYCADVIYPMAVVATAERGLIVYQLENQPSEFRRIESPLKHQVSQTSSQEACSWHLLDARQRLHVEHNCTFKNQ	296050	312420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_301268_301362_305016_305104_306087_306175_306283_306356_307516_308497_308603_308680_310016_310212_311984
566969	contig_7202_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_18531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
566974	SIRV4	+	304	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	152	494	152	-494	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAACGGCAAAGGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607	2277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
566976	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
566978	contig_3601_pilon	-	2781	15	Intergenic	novelGene_132961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_14	126.03052756198	357	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	35	1456	1194492	1127225	FALSE	20	TCCGTCTACTTGCGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSGRKPPRATMETATEQWVLVEMVQAVYEAPAYHLILEGILILWIIRLLFSKTYKLQEHSDLTVKEKEELIEEWQPEPLVPPISKDHPALNYNIVSGPPSHNIVVNGKECINFASFNFLGLLDNPRLKAAALASLKKYGVGTCGPRGFYGTFDVHLDLEDRLAKFMKTEEAIIYSYGFATIASAIPAYSKRGDIVFVDKAACFAIQKGLQASRSDIKLFKHNDMADLERLLKEQEIEDQKNPRKARVTRRFIVAEGLYMNTGAICPLPELVKLKYKYKARIFLEESLSFGVLGEHGRGVTEHYGINIDDIDLISANMENSLASVGGFCCGRSFVIDHQRLSGQGYCFSASLPPLLAAAAIEALNIMEENPGIFAVLKEKCEQIHKALQGISGLKVVGKSFSPAFHLQLEKSTGSRERDVKLLQEIVSQCMNRSIALTQARYLEKEEKCLPPPSIRVVVTVEQTEEELEKAASTIKEVAQAILL	1194526	1125899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1127319_1129305_1129380_1132667_1132786_1139478_1139534_1141955_1142053_1142353_1142450_1147057_1147166_1152465_1152556_1157632_1157763_1171169_1171303_1183726_1183800_1184356_1184451_1188426_1188522_1191165_1191274_1194435
566982	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1561	632	1106	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
566985	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
566986	contig_5217_pilon	-	2902	15	Intergenic	novelGene_135744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	109.94404885009	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	1129	2655	532133	529231	FALSE	35	TCCTCCTGGGAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLLTLERTQLPYPASIVPGQAGALWPLVTGSCFVWTHSGGRDGGTAELVLSLPLFPLLLAPFQDHLWHPQLCSSRSATETGPRPRGRCVVAGLCHVYTAVWEPPPFETADLKETYRCIKQVHYKLPASLSLPARQLLAAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDQLPVTSCMTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533748	528983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766_532033_532108_532777_532869_533000_533128_533246_533343_533452_533618
567034	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567039	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
567061	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567062	SIRV4	-	285	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGTGAACGTCGAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	2457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2700
567075	contig_14925_pilon	-	1832	4	Intergenic	novelGene_55173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30716	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
567082	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567091	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
567093	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567100	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_97916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
567104	contig_8616_pilon	+	2616	2	Intergenic	novelGene_72391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_1	0	113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTGTAGTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196155	199039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479
567105	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567111	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567121	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567133	contig_1443_pilon	+	1872	11	Intergenic	novelGene_28240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	45.3705851846766	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	749	1567	538016	541541	FALSE	30	GAAATGAATTTTGTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535997	541846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
567140	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGATCAACCTGGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30086	29844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
567146	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567148	contig_7202_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_18963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
567170	contig_8617_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_73454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTGCATCCCCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62338	62057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62300
567175	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
567179	SIRV6	+	484	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10264	2	1114	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
567187	contig_9290_pilon	-	2156	11	Intergenic	novelGene_77544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.292401947756	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	802	1872	486324	478887	FALSE	30	TAGAGTTATCTTTGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGFQGLVLVPPLCAREQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLGMEWTSTTRTLLTTLRPLCGSQLWCGSMP	496990	478602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478978_479899_480088_480840_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
567191	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_9177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2780.31575320142	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	242	1084	34808	36333	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGEACTSRLPDATHPGAAESA	27127	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36164_36277
567216	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
567225	contig_5033_pilon	-	2196	8	Intergenic	novelGene_28920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1082.02057772126	4	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	90	1028	477189	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477278	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_449869_449944_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
567228	contig_5317_pilon	+	866	4	Intergenic	novelGene_76525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	140	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	94	504	35282	43326	FALSE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33695	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
567231	contig_8658_pilon	-	1440	7	Intergenic	novelGene_55815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	475	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	102	1091	55624	6049	FALSE	25	AAGCAGTGTGATGTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55725	5699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
567232	contig_5718_pilon	-	1540	2	Intergenic	novelGene_110457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_1	0	2132	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	10	354	1766376	1755405	FALSE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGMGMTVPVSFAVFPNEDGSLQKKLKVWFRIPNQFQSNPPVPSDEDIKIEEREGITVYSMQFGGYAKEADYVARAAQLRTALEGTATYRNDVYFCTGYDPPMKPYGRRNEIWLMKT	1766385	1754218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1755577_1766203
567251	contig_13292_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_142930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTCCCTTCACCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98354	96774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_96800_98400
567254	contig_5153_pilon	+	2565	2	Intergenic	novelGene_74340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	661	1251	671136	672531	FALSE	55	TTCTAAATAAATTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSLCPGSRVSNQTARWGLRKGKRGVGPSGCMGSAARIQGQHHISLQTLSVSVFKAGPQFSPVHVGRDGPSCIGWYFWGCRHGYAQLPTSLSLCVPLRHKLMPHSCSLMQSSLMSVHASPSSCMLSGRPACCASVLFQARPRSSCATWPVVMLDHPVIWVMSVKSLRPSLLLPGALHPEEAWARYLRVLPGSLPK	670475	673845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_671670_672474
567256	contig_9436_pilon	-	2376	12	Intergenic	novelGene_60920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.760011080205	2	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	502	1302	457264	442592	TRUE	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKVKLRSKLSDRGLKGLRRTRAG	458953	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442211_442500_442658_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458097_458392_458803
567259	contig_14970_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_45050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTCCAAGAAAGGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191489	191996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_191500_192000
567261	contig_13894_pilon	-	1234	4	Intergenic	novelGene_62053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	679.409711113666	98	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	368	1162	287084	286290	FALSE	25	TGAAAGTACTTCTGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287274_287443_287538_288132
567268	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTCTTGAAGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567272	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
567275	contig_3588_pilon	+	1622	10	Intergenic	novelGene_72864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	670.869106476585	6	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	511	1110	131456	140944	FALSE	5	CTTATTTGGTGGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	84458	141456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_125538_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
567323	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532900	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
567326	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
567331	contig_11328_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_88453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_5	279.338305445009	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	85	717	830591	839255	TRUE	15	GATCAGTTTTATGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELD	829367	849647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_839250_839386_848758
567332	contig_8820_pilon	-	1833	8	Intergenic	novelGene_79296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1386.48474899065	22	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	50	898	170762	167581	TRUE	30	ACTAGGCCTCTAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGAAALRSVCRLFAKMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKKKNKV	171322	166002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167527_167598_169168_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170763_171273
567335	contig_7119_pilon	+	1470	4	Intergenic	novelGene_40947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	144	1238	137044	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127525	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_139947_140865
567375	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567382	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
567384	contig_9839_pilon	+	2743	2	Intergenic	novelGene_88585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	84	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331269	334371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331425_331783
567397	contig_15063_pilon	-	1415	6	Intergenic	novelGene_11263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	785	1165	35891	34829	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGLADELGGALTSAGEGILVWDVHTHIGGQLCRVIWKGHSQVLVLVGVLDFAHQVLIGALVDLDGR	36782	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34609_34924_35035_35141_35250_35380_35839_36158_36264
567402	contig_8914_pilon	-	848	6	Intergenic	novelGene_112861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_5	2044.36752077507	24978	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	10	804	268944	264566	FALSE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRMAVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268953	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075_268180_268882
567409	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567412	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567424	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
567429	contig_7119_pilon	+	1429	4	Intergenic	novelGene_40884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	246	1358	137033	140877	FALSE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDDEV	127412	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139745_140865
567443	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567450	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567466	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567472	contig_8538_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_4966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842805	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
567483	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
567493	contig_5515_pilon	+	2088	10	Intergenic	novelGene_52333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1122	1478	68936	75509	TRUE	15	CGGCCCGGAGCAGCAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSACSSGCSGDEAELRCRGDRLVHSSRPLEAAAVAELHVALAFRGCRWGRGPDGPVSPDPAATAGRIPEPPAPQWPHWWPPSLWPASCLPASAVQSMTPLMFLWHSSSGTALQTLV	67272	99274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_67990_68050_68278_68669_68782_68870_69081_71006_71208_75498_75648_75735_75896_75982_76047_89046_89139_99118
567499	contig_5247_pilon	-	1644	7	Intergenic	novelGene_81826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	204.806751733324	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	342	992	376451	342767	FALSE	35	ATAAATCTGTATTTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPNSS	416601	342114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_409244_409395_416448
567510	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567522	contig_10569_pilon	-	2334	4	Intergenic	novelGene_44093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.369522511198	6	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTGTGGGATGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448371	406699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_407460_411051_411148_429525_430834_448201
567524	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
567528	SIRV4	+	300	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	200	-447	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1879_2247
567548	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
567552	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567572	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567615	contig_12901_pilon	+	541	4	Intergenic	novelGene_142984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	145.373847563981	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	165	539	129813	152244	FALSE	45	TAACAGCACATTAAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVVRSAGSGQGAVVSAVQLLVALSFFPGVVEAQVTGVLDDCLCDIDSIDNFNTYKIFPKMKKLQERDYFRYYKVNLKRPCPFWAEDGHCSIKDCHVEPCPEYLKMANDTKELEDCEQANKLGA	129648	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_+_129918_141277_141398_149141_149226_152178
567618	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567628	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567640	contig_10848_pilon	-	2044	8	Intergenic	novelGene_133533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_7	113.250309726116	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	147	995	907357	830918	TRUE	30	TTTGGAATAATACCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSSLPSALALSLLLVSGSLLPGPGAAQNEPRIVTSEEVIIRESPVLPITLQCNLTSSSHTLTYSYWTKNGVELTAHQKNVSSMEHRISKPRAEDSGEYHCVFHFLSAPKANATIEVKAAPDITGHKRSENKNEGQDAMMYCKSVGYPHPEWVWQKKGDDGFSDISNASGRFFIINKENYTELNIVDLQITEDPGEYQCNATNAIGSTSVVTVLRVRSHLAPLWPFLGILAEIIILVVIIVVYEKRKRPDEVPDDDEPAGPMKTNSTNNHKDKNLRQRNTN	907503	829324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_830360_830903_830979_831835_831858_838740_839015_843675_843810_855199_855295_858376_858549_907266
567651	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	925	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
567652	contig_7410_pilon	+	1830	8	Intergenic	novelGene_106080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_3	187.483985710671	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	158	571	405351	407457	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405193	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
567654	contig_14925_pilon	-	1029	6	Intergenic	novelGene_55189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1757.49708392361	40	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	239	496	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSATYLCAVETHTNKFIFGAGTRLQVFPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	276311	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_69552_69603_276275
567699	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567705	contig_12864_pilon	-	1283	7	Intergenic	novelGene_76432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	13	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	179	688	251873	242831	FALSE	20	AAAGAGTTGCTGCCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252164	242235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
567706	contig_6546_pilon	+	3977	1	Intergenic	novelGene_140959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	242	729	298	1026	424353	425081	NA	15	GTATCCCTGGACATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSDGVSLQLGNTKDFIISFDLKFLTNGSVSVVLETTEKNQLFTVHYVSNTQLIAFKERDIYYGIGPRTSWSTVTRDLVTDLRKGVGLSNTKAVKPTKIMPKKVVRLIAKGRGFLDNITISTTAHMAAFFAASDWLVRNQDEKGGWPIMVTRKLGEGFRSLEPGWYSAMAQGQAISTLVRAYLLTKDQVFLSSALRATAPYKYLSEQHGVKAVFMNKHDWYEEYPTTPSSFVLNGFMYSLIGLYDLKETAGEKLGKEARALYERGMESLKAMLPLYDTGSGTIYDLRHFMLGIAPNLARWDYHTTHINQLQLLSTIDESPVFKEFVKRWKSYLKGNRAKHN	424055	428032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_424100_428000
567717	SIRV7	-	343	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
567720	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567733	contig_6418_pilon	+	2182	13	Intergenic	novelGene_81206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	251.350629378343	13	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	705	1745	1388801	1441289	TRUE	45	AAATACATTAAATTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNST	1341081	1444769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1383109_1383285_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441348_1441958_1442066_1444497
567734	contig_5981_pilon	+	2116	5	Intergenic	novelGene_35486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	211.472811491217	148	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	90	746	23508	37804	FALSE	30	TGAAGGCCTGTGAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACAAAACGSGFAPSAPPPSFLRAARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGDLCVLMKELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23418	39174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_37590
567740	contig_5928_pilon	+	2913	7	Intergenic	novelGene_40359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_5	58.5531572353039	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1437	1937	171977	180521	TRUE	15	TTCTATTTGATCACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCCETHSLGKFKTSLRENVLGSPKELMKLSVPSLVYAVQNNMAFLALSNLDAAVYQVTYQLKIPCTALCTVLMLNRTLSKLQWVSVFMLCGGVTLVQWKPAQATKVVVEQNPLLGFGAIAIAVLCSGFAGVYFEKVLKSSDTSLWFLQALEASTLLLWSSTQITS	170540	183581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_171988_172170_172331_172519_172673_177706_177774_179822_179870_180458_180594_182677
567749	contig_14326_pilon	+	1739	2	Intergenic	novelGene_120773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_1	0	877	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	195	935	804038	818924	FALSE	20	GGGGAGATTATGTGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDREQLLQRARLAEQAERYDDMASAMKAVTELNEPLSNEDRNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTMADGNEKKLEKVKAYREKIEKELETVCNDVLALLDKFLIKNCNDVQYESKVFYLKMKGDYYRYLAEVASGEKKNSVVEASEAAYKEAFEISKEHMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEIQNAPEQACLLAKQAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDQQDEEAGEGN	803843	819728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_804125_818270
567753	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
567766	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_94123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
567775	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
567776	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	117	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
567798	contig_10609_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_123944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATGAGAATAGCAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427819	429695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_427800_429700
567833	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
567837	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_16622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
567842	contig_3948_pilon	+	2323	4	Intergenic	novelGene_53391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.8954011539622	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	272	904	1813956	1860572	FALSE	30	TGTGAAGGTGAAAGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSHAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813425	1861991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814033_1814101_1814520_1860434
567843	contig_12357_pilon	-	1950	12	Intergenic	novelGene_6072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53665	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26136_27420_27530_29522_29657_30221_30321_30931_31049_34113_34314_35031_35175_42094_42249_46434_46565_51127_51238_52758_52842_53167
567848	contig_1948_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_31170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	286.591850702159	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	31	501	552044	544410	FALSE	20	TTCTAGTCTTTTATGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552074	543599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551992
567852	contig_4315_pilon	-	1927	9	Intergenic	novelGene_46786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	314.975569489127	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	451	999	335762	327997	FALSE	10	ACATCCTGTGTCTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPPRLSREAVAHPCVIELCPPQRGRAQTQPPLEQKRLPQGEMCLPTSAPGRGTNRRGHPPRPPTGLWYLATAPPAPAPPAFAYVSSVPVMPYPAATVYYVSPGPTSAQAATEWPPKASSQPAAAHRHSIQLDLAGLEELNKALSRAVQAAKSVRSTTKQMSRSLSADLRQARGLRGSCLF	340993	327068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334053_335721_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339019_339082_339142_340931
567854	SIRV6	+	316	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	196	33	9	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	FALSE	40	CGAAGTTGTTCAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
567855	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
567860	contig_12079_pilon	-	2234	8	Intergenic	novelGene_67554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_7	210.044893160622	166	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	171	1037	871668	864421	FALSE	45	AAAAAAAAACCCTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVCSSLFTRSSQFRISPSVCISQAMKCF	872428	863223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
567872	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
567880	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_97082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
567889	contig_5389_pilon	-	624	7	Intergenic	novelGene_142989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	98.2479855603496	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	88	624	15088	4677	FALSE	15	GTGAGCTTCCATGCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METILEQQRRYHEDGLRKEELNAISGPNEFAEFYNRLKQIKEFHRKHPNEICVPMSVEFEELLKARENPSEEAQNLVEFTDEEGYGRYLDLHDCYLKYINLKASEKLDYITYLSIFDQLFDIPKERKNAEYKRYLEMLLEYLQDYTDRVKPLQDQNELFGKIQTEFEKKWENGTFPGWP	15175	4676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_4816_5512_5596_6493_6586_6996_7070_8644_8751_8855_8861_15049
567890	contig_1861_pilon	-	1767	15	Intergenic	novelGene_77658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.063986888971	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	151	1608	112534	87490	FALSE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWDPEVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKIKSPASCLTP	115227	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
567901	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
567908	contig_5814_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_143052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	262	363	322949	322848	NA	20	TTTCACATACTTTCTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYFYFKLVQTWIAPHPYLPCLPKEEKIRTNPWAGRTSEAVQPFPGGQKPISILGPEPVWGLTLLALQGSSGPVRKNPTVLNGLFSSGMLKSFGFETTKFSSVNPFFANTSSHLPWFCKGG	323210	322449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_322400_323200
567911	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
567914	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
567916	contig_6735_pilon	-	1500	11	Intergenic	novelGene_15655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1069.51540428364	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	109	1014	554315	542464	FALSE	30	GCTAAATAGTACTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVVRSWDSESQTHDWSIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568248	541977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542828_543848_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_568198
567919	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
567925	contig_15063_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_13648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
567930	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
567934	contig_9363_pilon	+	1907	8	Intergenic	novelGene_6814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	305.661277113295	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	987	1562	1624307	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTLSASVSSEIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622232	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622754_1623562_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
567935	contig_6842_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_130743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGGAATGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266292	1265968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1266000_1266300
567937	contig_12414_pilon	+	1600	3	Intergenic	novelGene_59596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	236	838	372984	373819	FALSE	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALFSTSWLASSSRGSSSCPAIALSSPGNHQARL	372748	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373490_373595_373664_373790
567939	contig_11752_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_37657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1397.94856396793	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	360	1052	87165	94236	TRUE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQGSDSV	86805	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667_88776_92873_93060_94219_94430_105597
567940	contig_5585_pilon	-	2526	16	Intergenic	novelGene_143069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	38.0029238641216	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	65	1969	497788	390145	FALSE	30	TTTATACAAGTATCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLSGHPTLPCNVLKFKSTTIMLDCGLDMTSTLNFLPLPLVQSPRLSNLPSWSLKDGNAFLDKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPTQSHRMDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKHGFSDIKVEDTAKGHIVLLQEAETLIQIEEDSTHIICDSDEMLRVRLRDLVLKFLQKF	497852	389587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_390322_392713_392852_394330_394430_402731_402900_405339_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_467045_467107_497723
567971	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_115987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671624	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
567999	contig_5968_pilon	-	1370	9	Intergenic	novelGene_112185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	513.289331176871	2489	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	446	1204	638341	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732372	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_663792_663928_700585_700743_732230
568001	contig_15629_pilon	+	2373	9	Intergenic	novelGene_122476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_6	90.9669411104935	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1307	1960	202323	208025	FALSE	40	CAAGTATCACAAATAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAGMLLVSALLYTYWIEIVLLYRTYQSKDETLGDKKEYDAFVSYAKLSSLESEVTSSLSEENLALNLLPEVLENKYGYTLCLLERDVTPGGVYAEDIVSIIKKSRRGIFILSPNYVNGPSVFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCSFKEPASLPHLVKKALGVLPTITWRGLKSVPPNSRFWTQVRYHMPVKNSKRLTWNHLRIISRIFSLERTQ	180086	208438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_180270_180739_181337_192027_192179_195237_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
568004	contig_18392_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_143097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGTGTGGAATGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136632	138856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_136600_138900
568025	contig_15021_pilon	+	2992	4	Intergenic	novelGene_26999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	10.8012344973464	169	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	16	1089	483495	487607	FALSE	15	GATTTTTGATTCCATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVDVMAALSRQVFDWHRLIPLTGASVARQTSRLGEQRRTIASLLPPLTTVSRGGSLEELSRVKSRKYVQESECRTDLTRCLLEQPRTPVDGGALGLETITTSLRDMGFSDAHVGELLSIQPGPSPQQLLDITSELILLGLNPEPVCVALKKSPQLLKLPMKQMKKRSSYLRKLGLGEGKLKRVLYCCPEIFTMRQRDIDDIVGVLREKCLFTVRQVTEILHRCPYVLREEPGELEYKFQYAYFRMGIKHRDVVKTDFLQYSITKIKQRHIYLERLGRYQTPDKKGQTQVLNPSLKDIFRVSEAEFLVKTACSSPEEFEVFKKLLAREEEEGPGGCTSDDSASSDGDVEDRDAEEEFTDGRD	483479	489510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_483516_484302_484802_486390_486576_487238
568032	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_97072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568035	contig_7898_pilon	+	2740	2	Intergenic	novelGene_47654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2224	2556	864336	868522	FALSE	30	GACGTCACTGAATTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPPVSVRPLSLVFLLECEFCTSPFSCSIRDSVVFPVRAVIGGSWARLEMDVEQNSNTQKKTRFTVLTETGETPSVWPRHPFSSAVKSLPRFTVQPRTGQPHKRKWD	862112	868706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_864484_868337
568038	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	635	1118	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
568054	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
568057	contig_3155_pilon	-	1509	4	Intergenic	novelGene_26384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTTCGGAGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262159	258099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_258167_259207_259324_259727_259977_261082
568086	contig_7229_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_39862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGAAATAAAAAGGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461441	1463584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1461400_1463600
568099	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568115	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_17657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
568141	contig_9609_pilon	-	1849	10	Intergenic	novelGene_23138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_9	87.8331752054238	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	768	1733	523112	520853	FALSE	25	TCATTTTAACCTACCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523964	520736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523120_523204
568152	contig_10299_pilon	+	2200	17	Intergenic	novelGene_79722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	101.750134367233	2	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	784	2043	337016	340377	FALSE	15	TTTGACATGCTTGTCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320911	340534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_321113_333955_334014_335361_335435_335741_335841_336194_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
568159	contig_7457_pilon	-	3929	21	Intergenic	novelGene_31468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	194.893714624151	252	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	613	2631	531341	498985	FALSE	15	TGTGTTTGACTCCACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGTPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNVRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVRPMFVSNWTEETLRGNPVLQLDPAVPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIFHMMFGVTLSLFNHTYFRKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSEKAPSLLIHFINMFLFSYSDTGNAVLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKPLVLRHQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDTEEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLALFFIFAAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE	551383	497686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_499079_505780_505953_506246_506365_512195_512304_516988_517097_517489_517707_518245_518365_520402_520494_520938_521094_521407_521548_522385_522537_525700_525914_528051_528146_528943_529027_530848_530976_531312_531412_537254_537384_537938_538037_539131_539211_549279_549443_551310
568167	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568177	contig_8102_pilon	-	2584	2	Intergenic	novelGene_85335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158185	152290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_153656_156966
568202	contig_3602_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_60676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131703	1130853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1130900_1131700
568207	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568208	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
568224	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
568225	contig_11186_pilon	+	2345	6	Intergenic	novelGene_98876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACTAAGTTTCACAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234347	280547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_236218_238539_238586_239957_240085_266594_266727_266923_267039_280492
568237	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
568238	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
568239	contig_10205_pilon	-	1903	15	Intergenic	novelGene_143110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_12	67.7025306252375	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	496	1809	237302	220058	FALSE	20	TACTCTCGGATCCATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDLPESAVRDLIIATIAVKYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	256346	219963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_242569_242647_255694_255822_256230
568247	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568251	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568254	contig_14209_pilon	+	1949	13	Intergenic	novelGene_88315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	204.758733364145	26	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	72	848	32366	37631	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPCEIK	32294	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37425_37621_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
568266	contig_15063_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_13992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34612	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
568276	contig_9482_pilon	-	1903	11	Intergenic	novelGene_44313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	122.186906008786	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	53	856	1253164	1240884	TRUE	0	GCCTTTCTCTTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRGLGRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKWRMPRSRFSPVRLSHLNQRRSISWT	1253216	1236138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241041_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
568277	contig_4125_pilon	+	1869	8	Intergenic	novelGene_25212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	61.408302303815	1130	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	135	959	1684872	1711283	FALSE	25	ACGACTCAGTGGCATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCQALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1684737	1712193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1684884_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
568278	contig_16964_pilon	-	2070	10	Intergenic	novelGene_143123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	25.1474663083261	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	24	2069	152656	130994	FALSE	45	TAAATAACTGATGAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSKIKLMQTKIDELHMLDSGSQISDIDLLSLRDLSNCSQEDNLLNTQLHLLGDDYLVSKQIKESCIQELSRESSFHSSIEAIWEECKEIVKVSSQKSHHILELEQEVEKLQVEVKGYKDENDRLKTEERENKNQDDLLKEKESLVQQLKEELQEKTISLSVEVQHVVEGKRALSELTQDVICYKAKIQELETIFEAQKDKYSCSAKLEQEILEKESVILKLERNLEEFQASLQDSIKNTKDLSEREVKLKEEITQLTNNLQDVKHSLQLKEEENETNRQETEKLKEELSASSALTQNLKADLQRKEDDYAELKEKLADAKKQIEQVQKEVCVMRDEEKLLRIKINELEKKKNQCSQEIDMKQRTIQQLKEQLNNHKMEEAIQQYEKVCKDLNVKEKIIEDMRMTLEEQEQTQVEQDQVLEAKLEETERLATELEKWKEKFKDLETRSNQSSNKEFVDNTDILSEKLSKLQDELQESEQKYKADRKKWLEEKMILITQAKEAENLRNKEMKKYAEDRERCLKQQNEVEKLTEQLAEKDTDLQRWREERDQLVAALEIQLRALISSNVQKDNEIEQLKKTTSEASKMEKPSVEIIPRHINSTDPGGVETETQPTSYEISTNEVEDGSVVLDSCEVSTENIQMTRFPKPELEIQFTPLRPNKMAVKHPGCTSPVTVKISKPRKRKSNDMEE	152679	130992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_131192_134021_134133_135109_135287_136584_136741_138364_138493_139515_139642_148206_148268_150612_150733_151255_151395_151826
568294	contig_4845_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_53637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279091	280898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_279100_280900
568301	contig_13366_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_99792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAGGAATGAGCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161863	164303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_161900_164300
568302	contig_13366_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_99794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAGATTGCCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164250	165076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_164200_165100
568319	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568322	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
568326	SIRV6	-	964	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8807	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11354	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
568345	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_98036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	10	TTCTCCTCTTCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
568363	contig_14353_pilon	-	1578	7	Intergenic	novelGene_82076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.058981710932	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	222	635	88616	80015	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVPCNPQPPSHQLCTPGRR	91049	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80061_83897_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961
568395	contig_3861_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_57878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	852	2559	5	2563	56145	58703	NA	20	ACTATATCACCTGTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLAEVASLNDIQPTYRILKPWWDVFMDYLAVVMLMVAIFAGTMQLTKDQVVCLPMLPTPVNSKAHDVTTDIPKTEAATDQDQDGRATNDISFGTSAVTPDVPLRATYPRTDPTVPSQEARKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSSNFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVSTSSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVEDSDLIYKLYVVQTVIKTAKFIFILCYTANFVNAISFEHVCELKVEHLTGYEVFQCTHNMAYMLKKLLISYISIICVYGFICLYTLFWLFRIPLKEYSFEKVREESSFSDIPDVKNDFAFLLHMVDQYDQLYSKRFGVFLSEVSENKLREISLNHEWTFEKLRQHVSRNAQDKQELHLFMLSGVPDAVFDLTDLDVLKLELIPEAKIPAKISQMTNLQELHLCHCPAKVEQTAFSFLRDHLRCLHVKFTDVAEIPAWVYLLKNLRELYLIGNLNSENNKMIGLESLRELRHLKVLHVKSNLTKVPSNITDVAPHLTKLVIHNDGTKLLVLNSLKKMMNVAELELQNCELERIPHAIFSLSNLQELDLKSNSIRTIEEIISFQHLKRLTCLKLWHNKIVAIPPSITHVKNLESLYFSNNKLESLPVAVFSLQKLRCLDVSYNNISMIPVEIGLLQNLQHLHITGNKVDILPKQLFKCVKLRTLNLGQNCITSLPEKVGQLSQLTQLELKGNCLDRLPAQLGQCRLLKKSGLVVEDHLFDTLPLEVKEALNQDINVPFANGI	56140	59051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_56100_59100
568398	contig_15063_pilon	+	1151	3	Intergenic	novelGene_14374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	188	1009	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35083	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
568399	contig_1331_pilon	-	1443	3	Intergenic	novelGene_37809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3121	8	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTCTTGAGGCATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166524	158954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160191_160859_160949_166406
568415	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
568423	contig_8044_pilon	+	2089	16	Intergenic	novelGene_132367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	174.65618289148	674	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	383	1561	364438	386963	FALSE	20	CCACCAGAGTGTTTCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIDRNTGIIEMFMEKLQDEDEGTYTFQLQDGKATGHSTLVLIDDAYKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFAEYLSWEVTSDCNVLLKCKVANIKKETNIVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAFKELMTEVCKTIALSATDLKIQSTAEGIRLYSFVPYYLDDLKVSWSQNGTAVKYTDRVKSGVTGEQIWLQINEPTPNDKGKYVMELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	351414	387491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_351581_353078_353186_353303_353349_362064_362120_364428_364574_365301_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
568435	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568450	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1433	632	978	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2433	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
568451	contig_2027_pilon	-	2022	14	Intergenic	novelGene_39912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.266469355010597	168	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1085	1480	131643	129211	TRUE	30	GAGGTACAGGAGTGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEYWVCQWWQAQVTQSAQVCGRCSTRLRCTASRTSSGWVPASRSVRSTNLGSVRYWLTFSAGCLKRPSNSSRAHCRVCSMALGKFFNVQIGMDFSGGSWLELYDSVKNGITTCTLPLVPSVPDSSRGLR	136684	126590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_126697_126784_126864_127215_127378_128870_129038_129182_129374_131165_131237_131481_131662_132654_132803_134361_134456_134742_134836_134958_135157_135871_135969_136071_136175_136351
568469	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
568478	contig_15937_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_143130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGTATTTGTGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30540	28029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28000_30500
568489	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568496	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
568498	contig_15063_pilon	+	1544	5	Intergenic	novelGene_11831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	29	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27141	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266
568519	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
568521	contig_11872_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_143154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	839	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGCCTCTTTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92324	94600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_+_92300_94600
568523	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568537	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
568541	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
568566	contig_12951_pilon	+	2004	5	Intergenic	novelGene_68152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	277.443124802184	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	30	365	193177	198423	TRUE	35	TCCAACTGGTAAGCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSKYQNYIMEGVKATTKDASLQPRNIPNRYTFPCPYCPEKNFDQEGLVEHCRLFHSTDTKSVVCPICASMPWGDPNYRSANFIEHIQRRHQFSYDTFVDYDVDEEDMMNQVLQRSIMDQ	193147	200195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_193224_193596_193712_196924_197033_198357_198509_198641
568570	contig_610_pilon	-	1475	4	Intergenic	novelGene_76731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1334.73950850177	36	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	77	781	252557	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWRPGLLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQGTFHKLSADVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252633	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235252_252452
568576	contig_12301_pilon	-	1698	6	Intergenic	novelGene_110023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	297.247102593112	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	115	558	136698	110740	TRUE	25	CAAATTTGTGTCATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGAGNWDERVTFSSFGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIILLIYIHWSWQVWMKLGNVMGKILNNSEVLLGSLLRLCKSLQMTCTIFMVEMQW	136812	102019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113716_129150_129265_130605_130737_136661
568584	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568589	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_17322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATGCAGGTAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
568611	contig_11708_pilon	+	2521	6	Intergenic	novelGene_138979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_4	45.1371244099577	276	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	404	1306	310423	324718	FALSE	25	AATGTTTCTCATATGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASTYYGNLRPISPWRWLFSVVVPVLMVSNAFKKKSLDRSGALGGLVVGFILTIANLSFFTSLLVFFLSSSKLTKWKGETKKRLDSEYKEGGQRNWVQVFCNGAVPTELALLYMIENGPGEIPIDFSKQYTASWMCLSLLAALACSAGDTWASEVGTVLSKSLPRLITTWEKVPVGTNGGVTLVGLTASLLGGTFVGVTYFLTQLAFVNDLDISAPQWPIIAFGGLAGLLGSILDSYLGATMQFSGLDESTGMVVNSATNEAKYIAGKPILDNNAVNLFSSVLIALLLPTAACVLWPRE	310019	325933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_310445_312582_312697_321493_321632_322014_322270_323060_323271_324554
568612	SIRV5	-	261	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
568619	contig_13138_pilon	-	1864	4	Intergenic	novelGene_143158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.446825855364	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	509	901	201199	200723	FALSE	35	TCCAAGCAATATTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSCGDTSVGFSVGIFLFLLLLFFGIGCVWHWKHPNTTRFTLPKFLRRKESKRNDYAKTNIHGNYENVEARPPKAREETDKEIYENTRQSNFEEHIYGNETLSDDCYFLKPSTSAAPQEEDIYILPDSY	204482	199759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_-_200937_201020_201601_202073_202139_204440
568625	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
568629	contig_2480_pilon	-	2229	7	Intergenic	novelGene_63548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	631.193776374049	1257	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	141	719	309164	285063	FALSE	35	TATGACTGGTAATACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDGKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASFENVRAKWYPEVRHHCPNTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLTPITYPQGLAMAKEIGAVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPPPVKKRKRKCLLL	309356	283552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_285194_285508_285669_286715_286779_295351_295470_298956_299029_309129_309237_309288
568637	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
568639	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568647	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
568658	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1572	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
568682	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	635	1008	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
568696	contig_7816_pilon	+	2038	14	Intergenic	novelGene_66499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_7	853.910177779827	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	87	1958	170169	211658	FALSE	30	AGTGGTAAATATATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170082	211738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
568703	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568704	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
568708	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568709	contig_8020_pilon	-	2327	10	Intergenic	novelGene_114386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	59.2133618554311	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	546	1154	150417	148058	FALSE	30	AGAATAAACCCTGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGDQQIQEPLTPLSTWLRCHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQFWSAYVPCQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTPWAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	154115	146884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151258_151580_151708_154054
568727	contig_6633_pilon	+	2355	7	Intergenic	novelGene_143165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	61.4367334924491	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	31	1257	73802	105616	FALSE	65	GAAACAAAAATGTAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCWAADLLTKMVLMNAIYFKGKWKEQSEKSTRGMSFEINQNCTMDALTEANGTFAIRLLKILCEENPSHNVFFSPLSISSALAMVFLGAKRNTAAQMAQALSLDMEKDIHQGFQSLLTEVNKPGTQYLLRTANRLFGEETYDFLSTFKESCLRFYHAELEQLSFAKAAERSRKHINTWVSKKTEGKIRELLPGNSVDPQTRLIFVSAVYFKGRWNEEFNKTYTRKMPFKINQKEQKPVQMMFQEATFKISYVKEVQAQVLELPYAGEELSMVILLPDDNVDLSMVEKNLTFEKFVAWTKPDCMSSTEVEVLLPRFTLEEDYDMEYVLQNLGVVDAFQQGKADFSAMSAKTDLFLSKFVHKSFVEVNEEGTEATAASAAVVVECCLEAGPRFCADHPFLFFIRHNTANSILFCGRFSSP	73771	106714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_73892_89340_89518_99627_99766_100129_100248_101916_102060_103843_104000_105211
568759	contig_4364_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_3543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAAGAAAGGAAACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
568764	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
568766	contig_2078_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_100166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTCATTTGTGCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503823	504460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_503800_504500
568773	contig_14575_pilon	+	2709	10	Intergenic	novelGene_101859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	157.655351563286	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	159	935	17236	30544	FALSE	75	GGGAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIDKYHITNYVMENYNLLEEFKTADCTDCTEVKLECSSREIKDLRITFFMETELFVFFALDSSEHVLVVENLENTRLEKEENKSHQ	17077	32318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20117_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22699_26341_26428_27822_27857_28958_29022_30473
568780	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568782	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_97071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
568783	contig_19459_pilon	-	1235	8	Intergenic	novelGene_59833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_7	7322.9125130285	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	114	899	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16761	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_16672
568786	SIRV3	-	178	1	FSM	SIRV3D	SIRV311	161	1	-5	-12	-5	12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGACTTTTACTATCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4767	4589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_4600_4800
568800	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
568807	contig_15888_pilon	-	2621	4	Intergenic	novelGene_84459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31.0161248385416	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	94	1926	529617	524404	FALSE	15	TATTGCAGGTATGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVAVEDVTVDFTREEWALLDLSQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQNINVGEKLSTENRIVQFMKNDTCSSMVGEICELHGIEDQDNNQKTHVSMLPIFDRQRMIENLCVSNEDNQCGQTFSKIPNLSVLKRTIEAYPSEFLECGQCLMDHSSLKHHMRSHPGFHASQCKECGEACSCPSHLSTPVRTHSGERPYECKECGKSFSCSSNLTKHMRIHSGERPYECKECGKAFCHFSDLTTHMRIHSGERPYECKECGKAFSWPSHLTKHMRIHSGQRPYECKQCGKACRNSSHLTRHMSTHSGERPYECKECGKAFSWPSILATHIRTHSGEKPYECKECGRAFSCSSSFTKHMRIHSGEKPYECKECGKSFSSSSNLTKHKRIHNGERPYECKECGKAFRHLSDLTAHMRIHGGERPYECKECGKAFSWPSHLTAHIRTHSGERPYECKECGKSFSCSSNLTKHMRIHNGERPYECKECGKAFCHSSDLTTHMRIHSGETPYECKECGKAFSWPSHLTKHIRIHSGERLYECKECGKSFSCSSHLTTHICTHSGEGPYQCKECGKAFSCFSNFNSHISTHSGERPYECKKCGKAFRCSSYLISHMSTHRGERPYECKECGKAFRRSSHLTRHMRTHSGERA	529710	523708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_525773_527116_527396_528425_528577_529583
568829	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGTCAACCGCCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
568833	contig_9515_pilon	+	1293	10	Intergenic	novelGene_73819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	275.536558484947	3677	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	121	1170	65880	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57520	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57628_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
568837	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
568894	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_90580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
568900	contig_1154_pilon	+	4215	1	Intergenic	novelGene_87177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAATGGTTAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932334	936549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_932300_936500
568905	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
568927	contig_13740_pilon	-	1787	12	Intergenic	novelGene_34606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3434.07950061278	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	132	1115	165243	157474	TRUE	30	TATTCAGCGTTTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCNINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165374	154897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160888_161054_161270_161604_161722_161919_162031_165237
568928	SIRV4	+	335	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	442	173	-442	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGCCATTCCAATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
568937	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
568940	contig_6227_pilon	-	1851	17	Intergenic	novelGene_49715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	381.643644115489	1	56	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	133	738	1223803	1211239	TRUE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSANCEALCCLVYQHDQSEGVWN	1224955	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1205981_1206575_1206634_1211210_1211265_1212591_1212627_1213153_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
568956	contig_7202_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_18201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCATCTTCCGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27630	27855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
568962	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
568980	contig_10734_pilon	-	2083	4	Intergenic	novelGene_50993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	3	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	81	686	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320712	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
568997	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	639	1114	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTCTTCTTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
569004	contig_8045_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_35350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	27	668	116067	118722	FALSE	20	GGGTGTTAAAGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116040	119186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
569009	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
569019	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569021	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
569027	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
569045	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
569052	contig_6735_pilon	-	1976	14	Intergenic	novelGene_15774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1071.45784665556	2	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	271	1116	554315	543218	TRUE	30	CCTTATGCTGAGCTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEVSIPDSGCPPSGGRADL	568273	541988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542827_543005_543260_543776_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564832_568182
569055	contig_8978_pilon	+	2018	8	Intergenic	novelGene_49410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	384.400248465591	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	653	1141	343379	347264	FALSE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMLHSIVQLLELNSLQTSVADTNKFAV	339830	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_339964_340939_341134_342372_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344754_347186
569061	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_18639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
569083	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_91651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
569092	contig_6489_pilon	-	427	4	Intergenic	novelGene_128943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	89.8443097808648	18	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	18	425	279258	270719	FALSE	45	TAAGCCCAGAATAAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAEQMRLAQVIFDKNDSDFEAKVKQLMEVTGKNQDECIVALHDCNGDVNKAINILLEGNSDTTSWETVGGKKKNFGKESSENKENREKRSERETNRGRGSNNNRKGRGGNRGREFRGEENGIDCNQGDKSSDRGKRAHGR	279275	270716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_270796_272185_272343_277001_277113_279195
569098	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_16577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
569111	contig_8616_pilon	-	1865	9	Intergenic	novelGene_72371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_6	54.4929754647331	655	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	140	1813	185319	178743	FALSE	10	GAGGTATTGTCTTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLVKIKVPDNEAEEAKFTGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGLTEYLDYVSTLKVKGIVLGPVHNNQKDDLAETNLQQIDPAFGSNKDFESLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	185458	178690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184266_184441_184901
569115	contig_14322_pilon	-	324	2	Intergenic	novelGene_116335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671843	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
569118	contig_14925_pilon	-	1967	6	Intergenic	novelGene_55318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	909.532715189509	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	371	784	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322092	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129503_321823
569123	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_116075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
569130	contig_8729_pilon	+	1914	7	Intergenic	novelGene_40095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	63.7166034527544	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	122	565	276603	322350	TRUE	55	GAAATAAAGTGAAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKDANSALLSNYEVFQLLTDLKEQRKESGKNKHSSGQQNLNTITYETLKYISKTPCRHQSPEIVREFLTAMKSHKLTKAEKLQLLNHRPMTAVEIQLIVEESEERLTEEQIEALLHTVTSILPAEPETEQQKRANDAAVDEEYPE	276481	323909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_292842_292938_306155_306214_322203_322484_322693
569146	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
569157	contig_14513_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_70352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1467.5	32	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGAACTCTGCTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19077	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18943
569161	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_95863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569162	contig_6589_pilon	+	1528	9	Intergenic	novelGene_26007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	898.320481509801	3026	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	133	1191	1725483	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGRPQEALLWSPLPPLSEPQCLPVANGVAHTDHNNYSNNNSSHFSSTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725350	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725850_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
569172	contig_11978_pilon	-	2247	7	Intergenic	novelGene_62864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	46.8167230330739	159	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	174	986	603912	600051	FALSE	20	AGATTGTTGTTGCAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENQEQEEVITVRVQDPRVQNEGSWNSYVDYKIFLHTNSKAFTAKTSCVRRRYREFVWLRKQLQRNAGLVPVPELPGKSTFFGSSDEFIEKRRQGLQHFLEKVLQSVVLLSDSQLHLFLQSQLSVPEIEACVQGRSPMTVSDAILHYAMSNCGWVQEERQGSSHLAKGDQPKSCCFLPRSGRRNSPSPPPSEEKDHLEVWAPVVDFEAPSLESPTLPALSSPSHCDFARPDEGTSAGQPARRVMGGDQLASLSHAVPLDPGQLETVLEK	607142	598789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600343_601085_601299_601508_601605_602843_602945_603271_603359_603888_603944_607000
569185	contig_1450_pilon	+	1862	3	Intergenic	novelGene_27414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	147	1163	419840	423253	TRUE	20	CATGATGGTGAAGCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419693	425091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423770_424908
569202	contig_5711_pilon	+	2518	11	Intergenic	novelGene_80270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	53.4715812371394	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	531	1976	87410	122172	FALSE	20	TTATATCTTTTTAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLERKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	65513	122714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_65771_69855_70102_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_108771_108937_113381_113568_121458_121637_121996
569206	contig_10990_pilon	+	3782	2	Intergenic	novelGene_7468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	168	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1823	2893	710426	712742	FALSE	65	CTGAAAAAAAAAAAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICTLNVPVSSLSPGRRCSTLTGTGILGCVPTNSNTDEEDVVEAKMVAEGVDKEAKLPARKKRKKGLRIKGKRRRKKLLLAKKFSKDLVAGRPIADAPALLASSATEQDEENLFESNIEKQIYLPSTRAKTSIVWHFFHVDPQYTWRAICNLCEKSVSRGKPGSHLGTSTLQRHLQARHSPHWTRANKFGVTSGEEDFTLDVPLSPSSPGSNGSFEYIPTDPLDGNRMGKKLHKSASYALRAERGRFLIKSNIVKHALIPGTRAKTSAVWNFFYTDPQHISRAVCNICKRSVSRGRPGSHLGTSTLQRHLQATHPIHWAVANKDNGAVGNGLDEAETERNDVLSDPLRGEKSTVC	708603	713631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_711489_712734
569209	contig_12250_pilon	-	1942	7	Intergenic	novelGene_80709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_4	178.800090106863	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401310	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528
569223	contig_18869_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_56163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73599	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
569225	SIRV5	+	282	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-283	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAACTGGCAAAAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
569238	contig_500_pilon	-	1402	9	Intergenic	novelGene_30997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCCCCGCGCGCTGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499580	1485750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485802_1491926_1492059_1494240_1494465_1495350_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498076_1498880_1498972_1499275
569242	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_90389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569249	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_96276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
569262	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569274	contig_8538_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_4935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTCTGGATGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843082	842792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
569303	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
569325	contig_8914_pilon	-	756	5	Intergenic	novelGene_112862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	2992.569213903	227	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	245	712	267346	264566	FALSE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268965	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268882
569327	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_98083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569337	contig_17875_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_143180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTTTACCACATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61078	63378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_61100_63400
569364	contig_4156_pilon	+	2635	1	Intergenic	novelGene_88090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTGGGTATGTGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240603	243238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_240600_243200
569372	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73573	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
569379	contig_7378_pilon	-	3155	23	Intergenic	novelGene_120233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	53.5825037744953	208	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	964	2895	38	2932	202749	87604	FALSE	20	ACGAAGTTGTTTCAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLKKRVYEEFTKVVQQQQEEITAKKLRLTKPSKSAALHIDLCKATSPADALQYLLQFARKPVEAESVEGVVRILLEHYYKENDASVRLKIASLLGLLSKTSGFSPDCIMDDAINILQNEKSHQVLAQLLDTLLAIGTKLPENQAIQMRLVDVACKHLTDTSHGVRNKCLQLLGNLGSLEKSGTKDTEGLATRDVQKIIGDYFSDQDPRVRTAAIKAMLQLHERGLKLQQTIYNQACKLLSDDYEQVRSAAVQLIWVVSQLYPESIVPIPSSNEEIRLVDDAFGKICHMVSDGSWVVRVQAAKLLGSMEQVSSHFLEQTLDKKLMSDLRRKRTAHERAKELYSSGEFSSGRKWGDDAPKEEIDTGAVNLIESGACGAFVHGLEDEMYEVRIAAVEALCMLAQSSPSFAEKCLDFLVDMFNDEIEEVRLQSIHTMRKISNNITLREDQLDTVLAVLEDSSRDIREALHELLCCTNVSTKEGIHLALVELLKNLTKYPTDRDSIWKCLKFLGSRHPTLVLPLVPELLSTHPFFDTAEPDMDDPAYIAVLVLIFNAAKTCPTMPALFSDHTFRHYAYLRDSLSHLVPALRLPGRKLVSSAVSPNIMPHEDPSQQFLQQSLERVYSLQHLDPQGTQELLEFTIRDLQRLGELQSELAGVADFSATYLQCQLLLIKALQEKLWNVAAPLYLKQSDLASAAAKQIMEETYKMEFMYSGVENKQVVIIHHMRLQAKALQLIVTARTTRGVDPLFGMCEKFLQEVDFFQRCFIADLPHLQDSFVDKLLDLMPRLMTSKPAEVVKILQTMLRQSTFLHLPLPEQIHKASATIIEPAGESDNPLRFTSGLVVALDVDATLEHVQDPQSTVKIQVLYPDGQAQMIHPKPADFRNPGPGRHRLITQVYLSHTAWTEPCQVEVRLLLAYNSNARIPKSPWIEGGEVSPQVETSIEGTIPFSKPVKVYIMPKPARR	202786	87380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_87783_90750_90872_93778_93923_94142_94303_96077_96138_113839_113971_115565_115647_124228_124323_131868_132027_133188_133323_135026_135143_138200_138344_144028_144235_150287_150463_152257_152330_164642_164764_165856_165946_167054_167106_168745_168932_185007_185115_192263_192382_198296_198492_202695
569382	scaffold_12124_pilon	+	2040	12	Intergenic	novelGene_22001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	144.02909485687	366	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	188	1372	799011	815200	FALSE	15	CACCCAGCCACTTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKRFLVMHALFPPIPKIKDKLNDNQETGLQVSWNELMPGTGKAENEEVITVEEVA	791848	815868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
569397	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569398	contig_14553_pilon	+	1804	5	Intergenic	novelGene_124999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_4	137.486362960113	360	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	43	483	5787	14299	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLS	5744	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_6138_6387_13796_13937_14294_14424_22455
569415	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569419	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_94134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569422	contig_13464_pilon	+	3163	24	Intergenic	novelGene_125243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_23	249.748554079198	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	130	2700	440611	562095	FALSE	50	ACATCAAAACCAACTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQALLRQLFQSVKEKITGAPSLECAEEILLHLEETDENFHNYEFVKYLRQYVCNTLGSMIEEEMEKCISDQNQSEDSGYDTVVQHVTKRTQESKEYKEMMHSLKNIMIVVVESMINKFEDDEIRIQERQKKLQNEKSNSYCTDNCSDSDSSFNQSYKFCQGKLQLILDQLDPGQPKEVRYEALQTLCSAPPSDVLNCENWATLCEKLTVSLADPDLVFSDRILKFYAQTFTLSPLHMTKEIYTSLAKHLELYFLSRENRIPTLSTGVDITNANVIRLLKKVRLLNEYQKEVPSFWIRHPEKYMEEIVESTLSLLSVKYDQSHLVSQKILDPIYFLALVDAKAVWFKKWMHAYYSRTALLRLLEKKYKSLITAAVQQCVQYFELCETMKADEILRHSKLCGNKQKNFYYSGQELQYIYFIHSLCLLGRLLIYTQGRKLFPMKLKNRKDLVSLTDLLVLFTQLIYYSPGCPKTTSAAHSENYSPASMVTEVLWILCDQKECAIECLYNNTVIEALLQPIHNLMKGTEAASHCSETALIHVADILAKIASAEEGLILLLYGENVNSSEEENPTGAHVIAQFSKKLLDEDSPIFSGSEMLPVVKGAFISVCRQIYSTCEGLQVLIPYSLHESIAKAWKKTSLLSERVPTPVEGSDFVSSVSQQSQNIMVWEDNLLDDLLNFAATPKGLLLLQRTGAINECVTLMFNRYAKKLQICRHKKFGYGVVVTQVASTAAGAIALQSSGFINALITDLWANLECGRDDVRVAHPRSTPVDPIDRSCQKSFLALVNLLSYPAVYELVGNQELPNKAEYSLREVPTCVTDIIDRLIILNSEAKIRSLFNYEQSHTFGLRCCQVGSNS	440307	562558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_440404_440577_440736_460269_460432_472016_472195_480736_480806_483023_483150_486001_486081_486227_486332_486429_486492_487258_487404_489849_489910_496632_496724_500020_500162_500627_500721_502933_503077_506774_506903_510219_510422_511000_511084_513198_513338_516242_516331_520634_520754_526915_527033_550943_551033_562067
569450	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_18282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCATGCAGGTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
569468	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
569491	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_17716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569497	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
569501	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
569503	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_17586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
569505	contig_4103_pilon	-	2282	4	Intergenic	novelGene_51958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.6653333119993	382	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	757	1731	161777	160803	TRUE	5	CATGGTTGTCCTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEDGGLPGLGRPRQARWTLMLLLSTAMYGTHAPLLALCHVDGQVPFRPSSAVLLTELTKLLLCAFSLLVGWQTWPQGAPPWRQAIPFALSALLYGANNNLVIYLQRYMDPSTYQVLSNLKIGSTALFYCFCLRHRLSTRQGLALLLLMAAGACYAAGGLQDPRNTFPGPPTAAAAGPMPLHITPLGLLLLILYCVISGLSSVYTEMLMKRQRLPLALQNLFLYSFGVLLNLGLHAGSGPGPGLLEGFSGWAALAVLSQALNGLLMSAVMKHGSSITRLFVVSCSLVVNAVLSAALLRLQLTAAFFLATLLIGLAVHLYYGSH	164197	159870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_160334_160714_162403_162988_163088_164165
569514	contig_9345_pilon	-	1886	7	Intergenic	novelGene_24669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1920.52253450866	2	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATAAAGGCAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001393	946905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_946990_947159_948131_949476_949717_952439_952561_955197_955348_997009_997093_1001156
569521	SIRV4	+	207	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1564	632	1109	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
569522	SIRV5	-	246	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTAACAATTTAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
569538	scaffold_9100_pilon	+	1438	8	Intergenic	novelGene_83252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	443.726887871817	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	500	892	651131	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGIQKELQF	644841	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139_654190_654276
569540	contig_14925_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_55372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129484	128116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
569546	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	882	-18	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
569565	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
569580	contig_15063_pilon	+	1120	4	Intergenic	novelGene_13905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	921	198	1118	34808	36409	FALSE	25	TGTGGCCTCCAACAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQ	34610	36411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
569582	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
569618	SIRV5	-	369	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAGATGCGTAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
569621	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569622	contig_854_pilon	+	1320	6	Intergenic	novelGene_36225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2575.34918797432	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	131	586	543614	562402	TRUE	50	GGAGAAAATAAATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGGRWSCGQDLPSHQLHHQRLPGRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543483	563761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545974_556977_557065_557591_557752_562271_562405_563029
569640	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
569649	contig_8798_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_143188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCCACCCAACAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24918	25758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_24900_25800
569650	contig_10434_pilon	-	2189	20	Intergenic	novelGene_82038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_19	213.817251816862	157	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	309	2102	150439	132856	FALSE	35	TGTTATAATAAAGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKGEVKCIKFSLENKILAVQRTSKTVDFSNFIPDNSQQEYTQECKTKNANILGFCWTSSTEIVFITDQGIEFYQVLPEKRNLKLLKSQNINVNWYMYCPESSVILLSTTVLGNVLQPFYFRAVTMSKLPKFEIELPAAPKSTKLSLSERDIAMATIYGQLYVLFLRHHSRTSNSTGAEVVLYHLPREGACKKMHILKLNRTGKFALNVVDNLVVVHHQDTETSVIFDIKLRGEFDGAVTVHHPVLPPRSIQPYQIPAAGPASVTSQSPVPCKLYSSSWIVFQPDIIISASQGYLWNLQVKLQPIVNLLPDKGRLMDFLLQRKECKMVILSVCSQMLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	160646	132768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139146_139201_139465_139511_142485_142598_143308_143415_143506_143597_144855_144960_145447_145589_148181_148269_149454_149512_150355_150441_152569_152647_160416
569651	contig_8263_pilon	+	2066	8	Intergenic	novelGene_83091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	210.288140513954	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1587	2012	192474	192899	FALSE	85	CGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139588	192953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_139714_140073_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188852_188939_189005_189258_189386_192402
569690	contig_14208_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_129105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAGCTTTAAAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292868	293625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_292900_293600
569703	contig_11335_pilon	-	1870	8	Intergenic	novelGene_104930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	73.704041370102	514	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	144	1001	459255	418179	FALSE	35	AACCAGCCATGTACAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRRRGFSLVLNPPVRLRSLREGDVYEIGEDGELAAILLAVSLPLEFEMLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVLRAAKRGIPYRVIHNASIMNAVGCCGLQLYKFGETVSIVFWTDTWRPESFFDRVKKNRQNGMHTLCLLDIKVKEQSLENLIKGRKIYEPPQYMSVNQAAQQLLEIVQNQRMRGEEPAITEETLCVGLARVGAEDQKIAAGTLQQMCTVDLGGPLHSLIITGGSMHPLEIEMLSLFSVLEDTSESQSIDGL	459633	417309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_420501_420606_422034_422075_427382_427504_442122_442232_451414_451540_459120_459279_459513
569727	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569731	contig_11978_pilon	+	877	6	Intergenic	novelGene_63064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4015.20198246614	80	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	471	797	1830693	1831883	FALSE	5	TGCCTGCCTCTCAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827918	1831963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830191_1830552_1830785_1831161_1831273_1831759
569733	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569740	contig_8942_pilon	-	1167	3	Intergenic	novelGene_143202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_1	9	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	16	441	514015	392186	FALSE	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCTLTMETEAIDGYITCDNELSPEREHSNMAIDLTSSTPNGQHASPSHMTSTNSVKLEMQSDEECDRKPLSREDEIRGHDEGSSLEEPLIDSSEVADNRKVQELQGEGGIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGKQLKE	514030	391459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_392473_513043_513149_513981
569755	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569758	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
569763	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_16410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569780	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
569786	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569792	contig_6710_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_93415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653686	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
569807	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569808	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_114019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	31	351	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14439	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
569820	contig_15491_pilon	-	1638	6	Intergenic	novelGene_75979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_4	89.824272888791	23	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	49	882	91394	80831	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91442	80074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
569828	contig_10892_pilon	-	3007	1	Intergenic	novelGene_116736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGACCCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68975	65968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_66000_69000
569829	contig_5551_pilon	+	2599	6	Intergenic	novelGene_134264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_2	160.37082028848	1070	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	212	904	623518	635173	FALSE	55	AAAATCAGAAGCAAGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASALEELQKDLEEVKVLLEKATRKRVRDALTAEKSKIETEIKNKMQQKSQGKADPLDNEKPAAVVAPMTMGYTVKISNYGWDQSDKFVKIYITLTGVHQVPAENIQVHFTERSFDLLVKNLNGKNYSMIVNNLLKPISVEGSSKKVKTDTVLILCRKKAENMRWDYLTQVEKECKEKEKPSYDTETDPSEGLMNVLKKIYEDGDDDMKRTINKAWVESREKQAKGDTEF	623306	636868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_623539_626683_626904_629801_629899_630168_630269_633422_633521_635016
569832	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_95099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
569835	contig_19640_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_134869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGAGGAGCTCTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94866	96539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_94900_96500
569870	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
569871	SIRV5	+	379	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2084_3280_3405_3483
569884	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
569885	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
569886	contig_12250_pilon	+	2133	6	Intergenic	novelGene_80621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	52.9603625365235	268	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	101	1357	350196	353654	TRUE	10	TCCTGTAGTTGGAGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSGAASHHHPAASDGLAAGGLSPHCHWRHLREEQR	349792	354969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349876_350178_350544_351345_351968_352256_352443_353553_353766_354304
569899	contig_15063_pilon	+	1354	4	Intergenic	novelGene_14241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	38	1210	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34770	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
569902	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
569908	contig_14882_pilon	-	2876	4	Intergenic	novelGene_114981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	258.983911984252	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	588	1115	66629	39935	FALSE	40	CTTCAAGCAATAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGNDDDLTIPRAAINKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLISSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALKRRKANSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKARQQQAELAQQEWLQMQQAAQQAQLAASASASNQAGSSQDEEDDDDI	67336	38173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_40079_57893_58058_66409_67058_67177
569926	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
569932	SIRV4	+	492	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	11	-440	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1874_2246
569956	SIRV6	+	401	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10424	1	1187	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11424	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
569962	contig_6807_pilon	-	2175	7	Intergenic	novelGene_84565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	352.225977021697	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	366	1322	121535	111018	FALSE	35	CACTTATATAAGTTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQDVNNIIKRSEICTVKRTKTIPKKQSRVFQAPDLKEMLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124796	110164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_113438_113462_117941_118169_121525_121693_124588
569967	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
569974	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
569991	contig_9272_pilon	+	3587	4	Intergenic	novelGene_125920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	110.55315463613	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	580	1038	323246	324168	TRUE	40	ATGTAAAATACCACTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLSLFPVRAALTTRFLLPLIYSGSGHCISLSSVTDPPGQMSQEGRHSRQQTSLLGCQPCPGSERCLHQHNKTDSGEVRISHPCICLSLFRREQLMALHHMDFSFILSLIFLIQHFLLSLYPSPAGGTCALCLEQHFPWTTTADSVLISTP	322402	328390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322478_322741_323416_323879_325529_327201
570001	SIRV4	+	372	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	918	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATAAGTCAATAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373	2745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
570014	contig_8210_pilon	+	2482	2	Intergenic	novelGene_30231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGTATATATACACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21189	24418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_21872_22618
570020	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
570033	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	-1	2964	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
570034	contig_4364_pilon	+	1773	6	Intergenic	novelGene_167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	376	junction_1	670.514906620278	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	120	734	1268714	1270037	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1266986	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837
570052	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570057	contig_12638_pilon	+	1921	11	Intergenic	novelGene_33235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.910192493739	589	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	141	1868	737303	764546	FALSE	5	GTCCATTGTGTCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRALMEPRRTLPTTAGFFFWPPVLFLVPRTRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737162	764599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737527_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_762088_762211_764045
570077	contig_7202_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_18070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCAGCTGTTGTCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27936	27627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570078	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	20	GTTCACAAGATGCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
570112	contig_7753_pilon	-	2171	4	Intergenic	novelGene_41467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_3	16.391054470859	654	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAAAAAAAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576948	563318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_565139_567959_568101_572765_572882_576854
570115	contig_8322_pilon	+	2925	1	Intergenic	novelGene_143261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAGAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402900	405825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_402900_405800
570130	scaffold_12124_pilon	+	1493	8	Intergenic	novelGene_22060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	506.002379602374	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	90	896	836073	858374	FALSE	20	TCTCTATAAACTGGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHMVFNG	829655	858971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847658_858358
570132	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570133	contig_11292_pilon	-	2392	4	Intergenic	novelGene_109441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	56.1802654160891	272	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	27	1631	329190	325468	FALSE	15	TATGTGTGTCTGTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRVPASGMKGGNADSWQREKSAIMESPEEPGASMDENYFVNYTFRDRSHSGRVAQGIMKLCLEEELFADVTISVEGREFQLHRLVLSAQSCFFRSMFTSNLKEAHNRVIVLQDVSESVFQLLVDYIYHGTVKLRADELQEIYEVSDMYQLTSLFEECSRFLARTVQVGNCLQVMWLADRHSDPELYTAAKHCAKTHLAQLQGTEEFLHLSHHLLTDIISDGVPSSQNPTEAIEAWINFNKEEREAFAESLRTSLKEIGENVHIYLIGKESSRTHSLAVSLHCAEDDSITVSGQNSLCHQITAACKHGGDLYVVGGSIPRRMWKCNNATVDWEWCAPLPRDRLQHTLVSVPGKDAIYSLGGKTLQDTLSNAVIYYRVGDNVWTETTQLEVAVSGAAGANLNGIIYLLGGEENDLDFFTKPSRLIQCFDTETDKCHVKPYVLPFAGRMHAAVHKDLVFIVAEGDSLVCYNPLLDSFTRLCLPEAWSSAPSLWKIASCNGSIYVFRDRYKKGDANTYKLDPATSAVTVTRGIKVLLTNLQFVLA	329216	324706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_326329_326793_326901_327643_328262_329171
570145	SIRV4	+	333	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	640	975	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCGTCTTCTTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
570146	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_18895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30103	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
570151	contig_11850_pilon	-	1702	7	Intergenic	novelGene_125227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1170.80766282654	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	105	839	286397	282879	TRUE	25	TAAATGCTTCCTTATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	281458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281651_282207_282950_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
570157	SIRV4	+	329	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	644	975	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
570160	contig_11978_pilon	-	1662	12	Intergenic	novelGene_62786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	927	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGCGCGCGGAGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589574	299568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_299806_335600_335720_379900_380024_539031_539114_540005_540089_542949_543073_545619_545685_547580_547774_556589_556642_564819_564921_587275_587385_589199
570165	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	635	1115	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
570171	contig_3426_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_57975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTCACACTCACCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572870	572084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_572100_572900
570180	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
570183	contig_19744_pilon	+	2452	3	Intergenic	novelGene_120401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_1	127.5	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTGTGTAAGGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217114	225793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_218568_219217_219384_224960
570188	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
570191	contig_19459_pilon	-	987	6	Intergenic	novelGene_59889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6441.90786646316	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	409	750	11335	7003	FALSE	45	CATAACTGCAATTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15702	6765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
570193	SIRV5	-	341	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGACCTGGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
570202	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
570205	contig_14925_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_55081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
570226	SIRV4	+	211	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1560	632	1105	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2560	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
570227	contig_14925_pilon	-	1541	6	Intergenic	novelGene_55276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	803.217778687698	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	42	437	322420	129449	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQCCDTSSSLGKELM	322461	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112879_115181_115208_115821_116101_129436_129492_321808_322113_322371
570231	SIRV6	+	489	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470
570242	contig_12624_pilon	-	1495	4	Intergenic	novelGene_61146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	757.822465283848	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	200	337	950665	948779	TRUE	20	AACACTTTGCTGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQAGPDEGEDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955763	947572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948238_948285_948842_950590_950768_955666
570251	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
570256	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1462	632	1007	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2462	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
570265	contig_15093_pilon	+	2908	15	Intergenic	novelGene_143310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	86	junction_6	57.0944437769918	359	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	38	2755	196770	215346	FALSE	35	GTAAGGAGTGGGCATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAWVALQSLPEEMVISPCLLDFLEKALETIPITPIERNYTAVSSQDEDMGHFEIPDPMEESTTSLVSSSTSSYSSFPVDVVVYVRVQPSQIKFSCLPVSRVECMLKLPSLDLVFSSNRGELETLGTVYPAETLSPGSNIPQSGTKTSANKTGIPGSSGLGSPLGRSRHSSSQSDLTSSSSSSSGLSFTACMSDFSLYVFHPYGAGKQKTAISGLTPVSGGLGNVDEEPTSVTGRKDSLSINLEFVKVSLSRIRRSGGASFFESQSVSKSASKMDTTLINISAVCDIGSASFKYDMRRLSEILAFPRAWYRRSIARRLFLGDQTINLPTSGPGTPDSIEGVSQHLSPESSRKAYCRTWEQPSQSASFTHMPQSPNVFNEHVTNSTMSPGTAAHSLKSPASIRSRSVSDSSVPLRDSLSKTSTPFNKSNKAASQQGTPWETLVVFAINLKQLNVQMNMSNVMGNTTWTTSGLKSQGRLSVGSNRDREISMSVGLGRSQLDSKGGVVGGTIDVNALEMVAHISEHPNQQPSHKIQITMGSTEARVDYMGSSILMGIFSNADLKLQDEWKVNLYNALDSSMTDKSEIFVHGDLKWDIFQVMISRSTTPDLIKIGMKLQEFFTQQFDTSKRALSTWGPVPYLPPKTVTNNLEKSSQEQLLDAAHHRHWPGVLKVVSGCHISLFQIPLPEDGMQFGGSMSLHGNHMTLACFHGPNFRSKSWALFHLEEPNIAFWTEAQKIWEDGASDHSTYIVQTLDFHLGHNTMVTKPCGALESPMATITKITRRRHENPPHGVASVKEWFNYVTATRNEELNLLRNVDANNTESSTTVKNSSLLSGFRGGSSYNHETETIFALPRMQLDFKSIHVQEPQEPSLQDASLKPKVECSVVTEFTDHICVTMDAELIMFLHDLVSAYLKEKEKGE	196732	215499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_196855_197974_198115_199212_199415_202071_202273_203032_203213_205260_205399_206351_206610_207496_207648_208013_208172_208303_208497_208698_208917_211965_212218_212886_213091_214562_214758_215203
570267	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
570278	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
570279	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
570283	contig_9515_pilon	+	1297	10	Intergenic	novelGene_73804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	25	junction_1	273.040493537334	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	80	1174	49238	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVWRNGFISRSRNNMYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	49158	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_49270_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
570296	contig_7919_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_28118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTCCCCAGCACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417487	1417688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1417500_1417700
570309	contig_5019_pilon	+	2051	2	Intergenic	novelGene_109180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	FALSE	25	TTAAAATTGTGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
570313	contig_14441_pilon	+	1161	6	Intergenic	novelGene_100502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	382.969450478756	16	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	553	981	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	95927	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_95977_96144_96448_113659_113711_116578_116963_117220_117344_117539
570314	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
570321	contig_9038_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_143330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1753	2076	421896	421573	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHTSLSSLALTFLDFFTFCPFETFLKLNLSLVSTMMFEIKRKKLKLFVSISESIQFPLCLVTKHFTRGFIMFSIEIMISRFKNLQCNFFICLSCVFFRTCSVLLLS	423648	421076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_421100_423600
570324	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
570333	contig_3270_pilon	-	2328	15	Intergenic	novelGene_104454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	84.3245673161815	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1959	370	2328	68067	50439	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQL	78138	50438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68088_70709_70822_77499_77647_78048
570334	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
570343	SIRV4	+	270	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1501	632	1046	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
570351	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
570354	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
570357	contig_10019_pilon	+	1606	2	Intergenic	novelGene_86677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	550	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACATCTCGGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258353	261463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_259851_261354
570371	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
570376	contig_6494_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_108561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1265	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2788	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631
570397	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
570400	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
570406	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1118	0	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
570410	contig_15118_pilon	+	2621	3	Intergenic	novelGene_74547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.5	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	99	869	129247	130123	FALSE	15	TGAATCTTTTGCCTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSWWQFQVVLGVTCVLGILGNGLVIWVAGFRMTHTVTTISYLNLAIADFSVTATLPFTMVSQAMRGQWPFGWFLCKLIYTVVDINLFGSVFLIAVIALDRCICVLHPVWAQNHRTVGLAKRVIIVPWILALLFTLPVIIRVTTISNEAGTFCKLDFSPWTTNRDEKKKVDIIMYTVRGIIRFIIGFSMPMSTVAICYGLVAAKIHRQGLIKSSRPLRVLSSVVVAFFICWFPYQLVALIATIRIRQRLLNMIQGLRIAINITVALAFFNSCLNPMLYVFMGHDFRES	125301	131875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_129174_130014_130119
570428	contig_2646_pilon	+	2929	20	Intergenic	novelGene_69637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	242	439	2069598	2069901	TRUE	0	GCCGCTCTGCTTCTCGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFNEVISLSNKRTGGNNSPKGLEQCPPCSRKHSLLTQLQVGAPDGHLEVIVRVLPKDNKTFQNGSDRKKLLSSQFCPLPMGQQHRGCMCLEPRDGLRLAGLAHHIHCLAHADGHWQWPQLLIERDQHPGLHGGHQPIQYIVRFA	2069356	2078576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2069684_2069789_2069907_2070139_2070266_2070458_2070553_2070644_2070819_2071047_2071130_2071329_2071486_2071670_2071764_2071889_2072050_2073166_2073259_2073435_2073564_2073761_2073871_2074039_2074185_2074613_2074676_2074853_2075303_2075590_2075818_2075987_2076109_2077145_2077310_2078031_2078093_2078534
570437	SIRV5	-	386	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAAGCACTTTCAGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8577_10842
570445	contig_1301_pilon	-	2662	4	Intergenic	novelGene_47361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_3	422.131364493198	600	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	457	1167	618035	551789	FALSE	25	TCAGCGCAAGCATGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVLLLGLKDREGYTSFWNDCISSGLRGCMLIELALRGRLQLEACGMRRKSLLTRKVICKSDAPTGDVLLDEALKHVKETQPPETVQNWIELLSGETWNPLKLHYQLRNVRERLAKNLVEKGVLTTEKQNFLLFDMTTHPLTNNNIKQRLIKKVQEAVLDKWVNDPHRMDKRLLALIYLAHASDVLENAFAPLLDEQYDLATKRVRQLLDLDPEVECLKANTNEVLWAVVAAFTK	618491	550293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_552214_558856_558972_567267_567400_617996
570454	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
570460	SIRV4	+	289	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	206	455	206	-455	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTACCTCTTCAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	2316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
570462	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
570482	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_89618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
570483	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	583	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
570489	contig_6954_pilon	+	2527	8	Intergenic	novelGene_64445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	121.178566165635	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	41	997	503473	538707	FALSE	35	TACATAGTTGTCAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGVRPEPGYRPVMETRYNLKSPAVKRLMKEAAELKDPTDHYHAQPLEDNLFEWHFTVRGPPDSDFDGGVYHGRIVLPPEYPMKPPSIILLTANGRFEVGKKVCLSISGHHPETWQPSWSIRTALLAIIGFMPTKGEGAIGSLDYTPEERRALAKKSQDFCCEGCGSTMKDVLLPLKSGSDSSQADREAKELARQISFKAEVNSPGKTITESDLNHSFSLNDLQDDIPTTFQGATASTSYGIQNPLAASLQQHTQPVAKNTSMSPRQRRAQQQSQRRSSTSPDVIQGQQPRDNHTDHGGSAVLIVILTLALAALIFRRIYLANEYIFDFEL	503432	540237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_503504_522187_522262_523165_523298_526001_526087_526368_526475_530986_531117_532197_532318_538428
570490	contig_14925_pilon	-	998	5	Intergenic	novelGene_55178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	1552.3328211115	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTNKFIFGAGTRLQVFPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	69607	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_69552
570496	contig_19098_pilon	-	2877	2	Intergenic	novelGene_65872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	110	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	168	476	502790	502482	TRUE	25	CCCAGCATTTCTGACGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRRRGRSRSLILLVLCESPGSSPSFCKYLPCQQQFPRCPRSWKEQLSRLIYSLAMTIGEIIGPAVPVTFPSSLVGRIICPPPLFSISLPPPSLASPCAPLAQNWGRHCQFSWAEMPGTLGTAGSCTLAQEMSVAGGLEPSSGTAARERPPNSRARL	502957	499849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_500371_500601
570503	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
570506	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
570540	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_95864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
570560	contig_13481_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_119419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTATACACCCTTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745429	742993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_743000_745400
570563	SIRV1	-	269	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3835	0	3561	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6805	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
570564	contig_18168_pilon	-	1558	7	Intergenic	novelGene_122069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	156.30916657559	1846	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	494	1174	26220	23837	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27127	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26277_26403_26754_27040
570578	contig_2770_pilon	-	1401	6	Intergenic	novelGene_107440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1807.35818254158	45	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	162	503	746670	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPVSPFCSPPPDAAVQADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	749844	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_749788
570588	contig_9858_pilon	+	3469	20	Intergenic	novelGene_140528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_19	36.5073513638159	174	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	889	2670	23	2692	213461	249645	FALSE	15	CTTGTTGGCTTTGGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNPFINIAEPLDPAQPGKKFFNLNKLEDSRYGHLPFSIRVLLEAAIRNCDEFLVKKNDIENILNWNVMQHKNIEVPFKPARVILQDFTGVPAVVDFAAMRDAVKKLGGDPEKINPVCPADLVIDHSIQVDFSRRADSLQKNQDLEFERNRERFEFLKWGSQAFRNMRIIPPGSGIIHQVNLEYLARVVFDQDGYYYPDSVVGTDSHTTMIDGLGVLGWGVGGIEAEAVMLGQPISMVLPQVIGYRLTGSPHPLVTSTDIVLTITKHLRQVGVVGKFVEFFGPGVAQLSIADRATIANMCPEYGATAAFFPVDEVSIKYLVQTGRDESKIKHIKKYLQAVGMFRDFSDSSQDPDFAQVVELDLKTVIPCCSGPKRPQDKVAVSDMKKDFESCLGAKQGFKGFQIAPDHHNDHKTFIYNNGEFTLAHGSVVIAAITSCTNTSNPSVMLGAGLLAKKAVEAGLSVKPYVKTSLSPGSGVVTYYLRESGVMPYLSQLGFDVVGYGCMTCIGNSGPLPEPVVEAITQGDLVAVGVLSGNRNFEGRVHPNTRANYLASPPLVIAYAIAGTISINFEKEPLGVNAKGQQVFLKDIWPTRDEIQAVERRYVIPGMFKEVYQKIETVNESWNALTVSSDKLYCWNPKSTYIKSPPFFENLTLDLQSPKSVVDAYVLLNLGDSVTTDHISPAGNIARNSPAARYLTNRSLTPREFNSYGSRRGNDAIMVRGTFANIRLLNKFLNKQAPQTIHLPSGEILDVFDAAERYQQAGLPLIILAGKEYGSGSSRDWAAKGPFLLGIKAVLAESYERIHRSNLVGMGVIPLEYLPGENANTLGLTGLERYTIIIPENLKPRMKVQVKLDTGKTFQAVMRFDTDVELTYFHNGGILNYMIRKMAK	213438	250422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_+_213558_215389_215559_216738_216877_223898_223969_224093_224278_224818_224959_227122_227295_230611_230713_232243_232361_233480_233641_234947_235084_236233_236319_237121_237279_237839_237965_239518_239624_240329_240473_242087_242236_246860_246984_248359_248546_249531
570589	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570592	contig_13145_pilon	+	2539	7	Intergenic	novelGene_116620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	679.940356861459	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	69	875	35323	48908	FALSE	60	GAGTAAAAAAGTAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQISKYS	35254	50572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800
570604	SIRV4	+	317	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	648	983	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
570608	SIRV6	+	558	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	374	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTTCAACAAGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	10758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2481_2621_2740_2829_3106_3165_10724
570610	contig_253_pilon	+	1417	7	Intergenic	novelGene_129729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	349	junction_3	109.310973323308	1899	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	84	1076	582199	585056	FALSE	5	GCCACGGCCTCTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGRKEAAGGRAAGAGPELQGRTGGAAMSDTEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK	582115	585397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_582254_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
570612	SIRV4	-	299	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGACGACCTGCTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2320	1660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
570614	contig_5643_pilon	+	1328	7	Intergenic	novelGene_38965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_3	538.363389253847	4426	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	385	888	551251	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549526	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
570615	contig_4315_pilon	-	2732	17	Intergenic	novelGene_46723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	182.417008098889	28	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	9	2057	163741	147905	FALSE	25	CAACTTGTACTACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARIFLIASKELEFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163749	147229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154012_154276_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
570623	SIRV4	+	301	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	200	449	200	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
570632	contig_11370_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_98778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACAGTTTGACACTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293752	294472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_293800_294500
570633	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
570649	contig_9463_pilon	-	1713	6	Intergenic	novelGene_83841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAACAATAAACAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223421	216586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_216626_216768_216845_217424_217460_218618_218675_219242_219288_221959
570654	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
570687	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
570692	contig_7919_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_28105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGTGCTTTCAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380457	1379691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1379700_1380500
570694	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
570705	contig_6726_pilon	+	1605	14	Intergenic	novelGene_86235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	680.916368280067	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	281	1471	295727	333034	FALSE	20	TTTATTTTATCTTATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287841	333168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_288814_288954_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
570714	contig_3602_pilon	+	1889	8	Intergenic	novelGene_60507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	970.262388243931	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	100	549	161745	169451	TRUE	20	GACTACCTGACTTGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161645	171122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170245_170381_170750_170943
570722	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570732	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570749	contig_4364_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_1628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532911	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
570770	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1433	632	978	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2433	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
570772	SIRV4	+	307	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	632	1009	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
570779	SIRV4	+	308	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	201	441	201	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
570781	contig_7963_pilon	-	904	6	Intergenic	novelGene_58336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	49	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATGTTGTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40163_43654_43819_48741
570792	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570795	contig_11082_pilon	+	2135	6	Intergenic	novelGene_142055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	37.5872318746672	784	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAACATTTGTGCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137129	144312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_+_137180_138136_138265_138498_138570_140169_140241_141681_141781_142596
570799	contig_19469_pilon	-	2815	15	Intergenic	novelGene_134996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	42.0469247097932	5	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	25	1509	157514	141453	TRUE	20	TGAGTCTGTTTTCAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEPNPSASLIDRTIKMRKETEARKVVLAWGLLNVSMAGMIYTEMTGKLISSYYNVTYWPLWYIELALASLFSLNALFDFWRYFKYTVAPTSLVVSPGQQTLLGLKTAVVQTTPPHDLAATQIPSSPPSPSIQGQSVLSYSPSRSPSTSPKFTTSCMAGYSPQLQGLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPECHQRSPL	158442	133474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_139384_139459_141415_141479_141610_141726_142377_142476_144912_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488_155731_156187_156320_157184_157244_157377_157515_158418
570804	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27916	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570816	contig_5727_pilon	-	1948	13	Intergenic	novelGene_7945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1468	1935	171302	168162	FALSE	30	CTGAAGCCGAACTATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFFVCGVVCCGVVISSSASCRNPFLSVLPWGFPQELAVASGLGIVLRCTPTSSSVRRSTETRSTPFCNRTLHFGGLTTKNLHRELSSCHRSCLLRIRSSGTGKGKGRGTENKKRGREGGGRSRGRLETLSSEESLLQPPPGTRCHLHRAPTRC	175508	168148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_168379_169877_169946_170281_170348_171185_171328_171890_171992_172571_172710_172797_172864_173289_173443_173717_173827_174028_174120_174208_174300_174718_174862_174958
570817	contig_6325_pilon	-	1987	7	Intergenic	novelGene_143342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_5	125.451185725763	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	1531	1986	127684	115254	FALSE	30	TAAGTATAAGGTGTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKP	131411	115252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_115280_116468_116635_118233_118341_125704_125793_127615_127704_128782_128892_130009
570822	contig_7285_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_143401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGCCTCCAGCAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277427	277732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_277400_277700
570835	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570838	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570851	contig_6589_pilon	+	1295	5	Intergenic	novelGene_25787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	118	junction_1	1816.43971824005	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	716	1207	669670	672754	FALSE	10	ACGGGCCCTGACTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668388	672842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669121_669748_670000_670104_671046_671188_672584
570882	contig_16920_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_138448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGAGGGGCAGGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7757	5796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_5800_7800
570883	contig_16920_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_138447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAAATAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5846	5272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_5300_5800
570911	contig_17936_pilon	+	660	5	Intergenic	novelGene_29941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	877.291000751746	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	23	658	50646	95250	FALSE	30	CCAATTCCCTACAGATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQI	50623	95252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142
570917	contig_5018_pilon	-	1870	9	Intergenic	novelGene_47045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	60	1310	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402851	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
570945	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570946	contig_10722_pilon	+	1753	3	Intergenic	novelGene_70988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.5	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	887	1507	31560	32236	FALSE	40	TCATAAAAAAATGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKGRDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNVPISGPILQAKAKEMAKLLKVDGFSASNGWLQSFKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDIRPTIRGA	30267	32482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31137_31542_32156_32211
570952	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
570962	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_17625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
570981	contig_9375_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_136065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGCAATCAAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371125	369230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_369200_371100
570988	contig_19579_pilon	-	1755	7	Intergenic	novelGene_59379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_6	519.952775633412	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	106	984	13090	7943	FALSE	55	AAAAAAAATCTATATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12301_12900
570996	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571000	contig_15039_pilon	-	2396	2	Intergenic	novelGene_110114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1283	junction_1	0	346	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189227	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754
571001	contig_15859_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_50223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGTAGGGTTTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377421	379363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_377400_379400
571014	contig_7202_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_18688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTCTACCTGTCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29965	29815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30000
571030	contig_6710_pilon	-	591	2	Intergenic	novelGene_92636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1	384	657522	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVQQKPVSAEGPKWTSNVSTSGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653886_657462
571032	contig_13760_pilon	-	2249	10	Intergenic	novelGene_61292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	217.509642187294	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	57	1385	194443	164456	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPQVATRLLPQGSAQLARMTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDHGQHVQLRRGHGRSGHGSDHPAGADMGDPAAATHRGRHPV	194499	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165394_169130_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
571039	contig_13428_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_143453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	525	926	152370	151969	NA	25	AAGTTTTGGATTAACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILDFVPGDTDDTPGKSPSTRRMLEGHSGEMLVFIAIVLPEAHCQGASPVHFPRPRSSPLISGCVISPPAPEPLCSCRWPWRCLHTCSGSPGWATSLQASGSCRDCCCPNFTCSFPSNCQKSWAVLPVRAGS	152894	150849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_150800_152900
571040	contig_9389_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_84108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395241	1397915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1395200_1397900
571047	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
571069	contig_13608_pilon	-	2769	18	Intergenic	novelGene_52364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	186.226319875932	1	109	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	125	2179	470234	369353	FALSE	15	TGTGTTTTGTTTCTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470358	368762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466472_470191
571086	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
571087	contig_14441_pilon	+	1816	8	Intergenic	novelGene_100364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	332.536510194362	5	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1213	1641	116728	117610	FALSE	10	CTTGGCGCTGCCTACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23054	117785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_23565_23796_26652_26781_26886_27189_113657_113711_116578_116963_117220_117344_117539
571096	contig_9471_pilon	+	1999	2	Intergenic	novelGene_21789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3271	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAACAGTAAATCAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406951	412540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633
571101	contig_10674_pilon	+	2016	13	Intergenic	novelGene_6437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	207.651199932322	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	739	1884	211824	251342	FALSE	30	CAACTTTCTGTGTTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLNSDEEGEPSGKRKAEDDDKANKKHKKYVISDEEEEDDD	198570	251474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209047_209173_209364_211782_211888_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_241065_241253_243633_243732_251237
571111	contig_5643_pilon	-	1635	9	Intergenic	novelGene_39133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	216.670256380519	550	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	640	1302	650407	647313	TRUE	40	TAAATTTTTATTACTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPGLLGLDEAPVVPRGLNQLLLASLSDLQMVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	651543	646216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344_649587_650379_650571_650870_650956_651152
571115	contig_15146_pilon	-	2163	4	Intergenic	novelGene_116934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	36.8872154908264	23	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	177	305	111094	108990	TRUE	20	CTGGAGAGTGGCCTACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPRTCAHPALRCLLLRSRGPAWASSAGHDGALLRPPGHHLHHVLGPHRHRRALVCATMLVTTAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLWE	112826	106232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_108069_108967_109084_111059_111098_112653
571147	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
571162	contig_11096_pilon	+	2755	20	Intergenic	novelGene_143466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_18	172.982874274431	214	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2688	66	2753	198818	275727	FALSE	5	ATGCCTCTTTTCCTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGVGAAGRWERKRLRGGEGARMATPSRRTSTPSSQASKRVLPRDPSSEVPSKRKSSAPSTLPPTPLLPPPLQSSGPFVEGSIVRIAMENFLTYDICEVSPGPNLNMIIGANGTGKSSIVCAICLGLAGKPAFMGRADKVGFFVKRGCSKGMVEIELFRASGNLVITREIDVAKNQSFWYINKKSTTQKVVEEQVAALNIQVGNLCQFLPQDKVGEFAKLTKIELLEATEKSIGPPEMHRYHCELKNFREKEKQLETSCKEKTEYLEKMIQRNERYKQDVERFYERKRHLDLIEMLEAKRPWVEYENVRQEYEEVKQARDQVKEEVRKLKEGQIPITRRIEEIERQHHNLEARIKEKATGIKEKSQKCKEKQDVLERKDKHIEELQQALIVKQNEEHDRQRRISNTRKMIEDLQNELKTTENCENLQPQIDAITNDLRRVQDEKALCESEIIDKRRERETLEKEKKSVCDLIKRFDNLMNQKEDKLRQRYRDTYDAVLWLRNNREKFKQRVCEPIMLTINMKDNKNAKYIENHIPSNDLRAFVFEAQEDMEVFLKEVRDNKKLRVNAVIAPSSSYADKAPSRSLSELKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCFQYHIHEVPVGTERTRERIERVIQETQLKQIYTAEEKYVVKTSFYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEINRKLDAVGSGLIALCETNQHLEHKDNELRQKKKDLLERKTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIKEINVQKAELVTELTNLIKICTSLNIQKVDLILQNTTVNSEKNKLESDYMAASSRLRLTEQNFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTVPQEYQTQVPTIPNGHNSSPPMAFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPT	198752	275729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_199027_204496_204639_211137_211191_220210_220374_221956_222092_226127_226269_227806_227969_231688_231761_237416_237673_239714_239870_243982_244097_252250_252346_252997_253131_254419_254594_254699_254870_256761_256886_257320_257444_272466_272593_275158_275204_275631
571170	contig_21203_pilon	+	1290	8	Intergenic	novelGene_84477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	70	1290	53950	122093	FALSE	20	AGGCCCTCCTGGATCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRP	53880	122093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
571173	contig_7202_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_17559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27624	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
571190	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
571210	contig_16594_pilon	-	1204	2	Intergenic	novelGene_53915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAAGTGAGTAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293871	272668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_273670_293668
571216	contig_10299_pilon	+	2811	23	Intergenic	novelGene_79708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	92.6085246776732	1	103	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	33	1265	320559	336895	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320526	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337216_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
571224	contig_9797_pilon	+	1393	4	Intergenic	novelGene_65600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_1	151.28853962618	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	225	608	188724	191368	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	183910	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_183989_188577_188734_189277_189422_191138
571229	contig_9988_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_113055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCAGATCCTGCACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101459	100801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_100800_101500
571240	contig_10311_pilon	-	1679	11	Intergenic	novelGene_50470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	926.115700115272	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	36	953	71526	67247	TRUE	15	GTGAACTGGACCCTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTVKPCSHNYRLVGSWD	71561	65257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67527_67863_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
571248	contig_10323_pilon	-	1931	10	Intergenic	novelGene_123549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_9	256.619668616783	1793	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	121	678	305132	268465	FALSE	0	GCTGCCTGCCTGGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVPPKVKCLTRIWHPNITETGDICLSLLREHSIDGTGWAPTRTLKDVVWGLNSLFTDLLNFDDPLNIEAAEHHLRDKEDFRNKVEDYIKRYAR	309163	267211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_277887_277921_278700_278759_279648_279720_285482_285551_292633_292700_295187_295218_305014_305149_309059
571255	contig_18869_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_56337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
571259	contig_10299_pilon	+	2302	18	Intergenic	novelGene_79723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98.5142920795995	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	881	2140	337016	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320911	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_321113_333955_334035_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
571261	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
571263	contig_8712_pilon	+	1377	5	Intergenic	novelGene_58768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	61	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	53	532	314974	321793	TRUE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASSDLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286968	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_322238_322865
571267	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_116078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571269	contig_10311_pilon	+	1888	11	Intergenic	novelGene_50459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCGGGCTCGCCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65139	71559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65920_67182_67260_67490_67585_67826_67961_68263_68407_68641_68756_68872_69038_69807_69947_70223_70360_70448_70493_71497
571271	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571274	SIRV7	-	340	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33229	0	10	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
571291	contig_7202_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_18633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAAGAATTTTGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
571297	contig_5586_pilon	-	2069	7	Intergenic	novelGene_143574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431554	390959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_391238_392797_392875_392971_393126_416879_417011_429952_430020_430124_430231_430298
571307	contig_8658_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1001.50499249879	61	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	257	652	13203	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55662	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_36612_36674_55528
571311	contig_3627_pilon	+	2132	10	Intergenic	novelGene_78575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	36.2525435463534	782	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	14	1825	1313510	1343837	FALSE	20	GTCATTCTCTTAACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPPLSKAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKRSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313496	1344144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323423_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
571324	contig_6975_pilon	-	1327	10	Intergenic	novelGene_74268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	403.262191460752	34	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	106	1107	164514	159453	FALSE	20	CCACTGATGTTGATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169980	159232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_163849_164402_164538_169898
571325	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
571341	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
571344	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571368	contig_4364_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_1269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532901	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
571379	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	632	988	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
571383	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_93018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
571384	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674881	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
571390	contig_15034_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_143625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAGAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2258	2585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_2300_2600
571394	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571427	contig_11292_pilon	+	2287	13	Intergenic	novelGene_109450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCACGGCCCCCGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368854	386102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_370268_372195_372275_373463_373532_374255_374302_375251_375347_376420_376486_376913_376963_377213_377272_378608_378671_378864_378893_382730_382838_383199_383283_385968
571433	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_95102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
571468	contig_13760_pilon	-	2020	8	Intergenic	novelGene_61298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	251.429870126516	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	137	1513	194443	161940	FALSE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQPGCQQQPGPTL	194579	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161976_167525_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
571482	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
571488	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571496	contig_6375_pilon	-	2536	16	Intergenic	novelGene_73008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_10	37.9973098462977	15	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	7	1581	334545	329515	TRUE	15	GCTCCAACCCCACTGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGGAGGSRVSSGRDLNCVPEIADTLGAVARQGFDFLCMPVFHPRFKREFTQEPAKNRPGPQTRSDLLLSGRDWNTLIVGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVTLENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKDDGVSIPGEYTSFLAPISSSKLYNEVRACREKDRDPEVKSHSLLEGSSSLYSFFYISFNCFLLLEKMKR	334551	327216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328788_328997_329115_329275_329724_330332_330509_330594_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302_333389_333701_333821_334444
571500	SIRV4	+	244	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-1072	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGCCCAATTTCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
571505	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
571521	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571525	contig_9345_pilon	-	2131	15	Intergenic	novelGene_24489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	263.298852474305	214	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	75	1619	671829	667061	TRUE	35	AGTCTGGCAAACAAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671903	666456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_666926_667017_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
571530	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571546	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
571557	contig_7165_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_116846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284847	283130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_283100_284800
571562	contig_3382_pilon	+	1223	7	Intergenic	novelGene_124054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCGTCTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224544	273420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_225049_229633_229762_231318_231466_234088_234178_254698_254821_272866_272957_273277
571565	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_18487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571578	contig_11171_pilon	+	1518	6	Intergenic	novelGene_48598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	84	359	212165	235078	TRUE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGAVEWEQVLGLPVPRTLPFCKMRLLLVSAVNVARNMESCTPSTRHSTQKAGELETASKSDLLFFSFLPLQEDSR	212081	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_234857_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
571587	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1118	0	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
571594	contig_7412_pilon	-	2011	8	Intergenic	novelGene_76313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1250.18654934504	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	229	1755	377290	364445	FALSE	15	ATTTGCCTTTCCATACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377988	364188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
571611	contig_12427_pilon	-	1966	6	Intergenic	novelGene_40551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1469.01022460703	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	301	615	520335	506035	FALSE	50	CAAGAACAAAGATCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578095	504683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507857_510397_510553_520328_520440_522284_522346_577960
571621	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571629	contig_13021_pilon	+	2259	13	Intergenic	novelGene_8144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3465.48800074872	7	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	550	1956	176681	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174506	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176416_176502_176595_176690_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179997_180211_180440
571637	contig_4105_pilon	+	2400	12	Intergenic	novelGene_21475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	117.824494780364	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	16	1344	58775	73266	TRUE	40	GACGTTTATACAGCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGLWMRRTRRPRFVLMNKMDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58759	74438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131_73357_73472
571644	contig_1406_pilon	-	1866	7	Intergenic	novelGene_25537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	562.414857753796	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	3	1055	2159596	2137428	FALSE	10	GCTTCAGTCTCATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSASGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159598	2136616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391_2159423_2159494
571649	contig_10011_pilon	+	2236	10	Intergenic	novelGene_68106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.5998378179815	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	548	1243	328404	333031	TRUE	15	ATTCTTATTAGTGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	325976	334170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_326287_326351_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
571656	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_94132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571669	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	99	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
571690	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
571691	contig_2027_pilon	+	2044	15	Intergenic	novelGene_39911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	204.21073798947	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	434	1867	129185	136487	FALSE	50	TAAAGAATTATTAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	126590	136664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_126698_126785_126867_127222_127379_128871_128959_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
571705	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_91288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657164	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657165	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
571728	contig_9017_pilon	-	2445	2	Intergenic	novelGene_130332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	63	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	386	727	218109	217768	FALSE	25	ATTCCTAGTGGAGCATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	219942	216049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218126_219573
571733	contig_854_pilon	-	1900	2	Intergenic	novelGene_36343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	427	756	1001288	1000959	TRUE	20	ATGTGTTGGAGTAGTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGLIVSDTQVRESVCVCVCARVCLCVSVCLCKCRVQREREAEGEPRTLFSSDAELRAALEAPLGSQERAQSFVQRHTGHQPLPRFLSFFLFLNCDLDESLQSTLVSH	1001714	974682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975748_1000879
571734	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
571735	contig_6735_pilon	-	1437	8	Intergenic	novelGene_15669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	802.107708172789	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	280	957	544935	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	564845	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_544948_554241_554374_564157_564232_564784
571749	contig_9609_pilon	+	2066	9	Intergenic	novelGene_23161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_3	78.7555553596062	827	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	23	820	821395	828402	FALSE	5	CACTGGTTCCTGGGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRCLLIVMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAGIMRDIGTAIQFLHSRNIAHRDVKPENLLYTSKETDAVLKLTDFGFAKETTQNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSDDAKQLIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSALATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGGSLASQGCNNQ	821372	829648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825638_825715_826058_826184_827134_827221_827502_827584_828249
571755	contig_18869_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_55990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTTTCTTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
571765	contig_15063_pilon	-	1429	6	Intergenic	novelGene_11346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	688	1011	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35380_35839_36156_36264_36511_36625
571783	contig_4812_pilon	-	988	5	Intergenic	novelGene_103630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8027.60102318868	52	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTCTGAGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82740	78698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_82258_82343_82598
571791	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571794	contig_11493_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_143675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTTCTACATTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160790	159340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_159300_160800
571804	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_18832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCGCAGGTGCGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
571806	contig_8486_pilon	-	2906	12	Intergenic	novelGene_139288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_11	18.7047525670628	408	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	155	2506	60945	55211	FALSE	10	GGTTAGATGTGCTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWHFLLDKERVRLLRAEHCNPDPLSREEGRQRGGWGWGLRQGSTLARGTGAMAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQVVAAATRPKTALKAQNATTKGPNGAYDFSQALNAKEMPNTQPKATFKPQNTTTKGPNAAYDFSQAATTSELATNKSEMVFKAQNATTTVGPNATYNFSQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHDWIPTDWPVPPDWQNLRPSPNLRPSPISRASQNPGASQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPDSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAETRAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGAASANFAANFGAIGFFWVE	61600	54810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58865_59479_60203_60900_60975_61475
571812	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-144	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8171	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
571818	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571821	contig_2637_pilon	+	2505	7	Intergenic	novelGene_100021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	28.5929284186765	215	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	186	584	38745	47120	FALSE	25	TACTGCTTGCTTAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLFNLKFAARELNRNAKKCDKEEKAEKAKIKKAIQKGNTEVARIHAENAIRQKNQAINFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQDELSQRLARLRDQV	13292	49041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_13391_38657_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322_46396_47075
571827	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571841	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
571849	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
571851	contig_9183_pilon	-	2248	7	Intergenic	novelGene_40339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	584.884152821926	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	153	1196	323783	322740	TRUE	45	ACTGTGGTACCATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSRGILLHPCLLPRTRSCPADYGLHRGRARQKTHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLK	325980	311886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312293_314766_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320719_322739_323834_325878
571853	contig_10225_pilon	+	2268	14	Intergenic	novelGene_86830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	587.230084036601	9	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1069	1614	42707	46881	TRUE	20	ATCCTAGACTTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTITRTCHPLMKRCLRSRCCRQEEGS	21315	47751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21494_34904_34930_35637_35789_37035_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46521_46806_47268_47483
571858	SIRV7	-	248	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69038	0	35819	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78919	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
571860	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_97846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571874	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_93608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
571878	contig_18869_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_56186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73699	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
571895	contig_12279_pilon	+	1102	7	Intergenic	novelGene_50098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1868.87993788318	92	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	62	664	68297	77128	TRUE	30	AAGCTGTATATTCTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57541	77618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928_77491_77542
571896	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571899	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
571900	contig_19778_pilon	-	2407	6	Intergenic	novelGene_143746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAAAATACAAAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15817	5642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_-_5891_9525_9636_10478_10654_12473_12708_13557_13704_14323
571901	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571907	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
571912	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
571916	contig_7202_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_17309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTCATGCAGGTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
571923	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571942	contig_12128_pilon	-	2682	8	Intergenic	novelGene_131982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_7	58.7036834362171	2129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	177	830	410049	393395	FALSE	25	TTGACTGGAAGTACTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLAPSKSTVYVSNLPFSLTNNDLYRIFSKYGKVVKVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNMLGEREPPKKKEKKKKKKISEPEEQIEEVEESDNEGEDPALDSLSQAIAFQQAKIEEEEKKWKPSSGNPSTSDDSRRPRIKKSTYFSDEEELSD	411668	391542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_393527_394327_394404_394488_394602_396936_397045_397580_397693_404592_404622_409965_410052_411494
571945	contig_7119_pilon	+	2128	3	Intergenic	novelGene_40958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	2	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	112	1266	137033	139798	FALSE	10	TGAGCCCATGTCCTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127546	140660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
571947	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
571948	contig_11429_pilon	+	2167	5	Intergenic	novelGene_60443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_3	607.932716260607	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	118	690	46162	47714	FALSE	25	ATTAGCCAGACTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRWVLKGLGYSGAISLSLRAQVCFNSSISQLCNFGKSFGLQMGITIPALWGGCEY	45374	49191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457
571967	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
571969	contig_10331_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_54151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGTAGGATATAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438841	436631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_436600_438800
571974	contig_7202_pilon	-	163	1	Intergenic	novelGene_16435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27785	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
571975	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
571989	contig_7744_pilon	+	2367	11	Intergenic	novelGene_62524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_10	77.989486470934	260	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	122	793	825487	828757	TRUE	15	CCTGTGCACCCCCAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKRSGLGLEQGEGAGLNYWATY	825365	830800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_829676_829810_830176_830326_830402_830494_830537_830626
571991	contig_6215_pilon	+	2441	13	Intergenic	novelGene_21173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_11	14.759883694212	146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	80	1690	161679	210628	FALSE	20	GTACTAGTGTTCATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAAATAAATSSFGCRIWNPCASLTMKQSSNVPAFLSKLWTLVEEAHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIIKQERDGPVEFQHPYFKQGQDDLLENIKRKVSSTKPEENKIRQEDLTKIMSSAQKVQIKQETIESRLSELKSENESLWKEVSELRAKHAQQQQVIRKIVQFIVTLVQNNQLVSLKRKRPLLLNTNGAQKKNLFQHIVKEPADNHHHKVPHSRTEGLKQRERISDDIIIYDVTDDNADEENIPVIPETNEDVISDPSNSCSQYPDIVIVEDDNEDEYVPVIQSGDQSEPARESLSSSTDGTSPLMSSAVQLNGSSSLTTEDPVTMMDSILNDNINLLGKVELLDYLDSIDCSLEDFQAMLSGRQFSIDPDLLVDLFTSSVQMNPTDYINNTKSENKGLETTKNNVVQPVSEEGKKSKPKPDKQLIQYTAFPLLAFLDGNPTSAVEQGCTTSSEVMSSVDKPIEVDELLDSSLDPEPTQSKLVRLEPLTEAEASEATLFYLCELAPAPLDSDMPLLDS	161599	211379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_161772_190232_190342_190495_190624_191275_191401_196036_196113_198910_198973_199892_199981_201233_201383_201778_202022_202665_202772_206988_207043_209829_209915_210335
572032	SIRV5	-	436	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTAGAGATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8468_8590_10863
572056	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	379	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572059	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572061	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572067	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
572072	contig_15063_pilon	-	988	4	Intergenic	novelGene_11536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTGAGGTAGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36798	27139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35155_36274
572074	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_93598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572077	contig_14925_pilon	-	1715	5	Intergenic	novelGene_55131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_4	1475.88894822747	766	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	539	1177	103374	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	103912	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_103145
572091	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572096	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_17606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27824	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
572112	scaffold_19766_pilon	+	2251	14	Intergenic	novelGene_34418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	155.580227216031	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	531	2090	846528	851417	FALSE	20	ACCTTCTAATCTGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	843771	851578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845663_845845_845975_846497_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
572122	SIRV4	+	397	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	92	461	92	-461	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGAAGAGTACCTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547	2310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
572125	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
572128	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	67	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572129	SIRV2	-	603	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4270	34	3095	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
572136	contig_5317_pilon	-	2920	14	Intergenic	novelGene_76576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_8	64.1162959650979	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	23	1549	308205	234483	FALSE	65	GGAAAAAAAAAAAAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELDQLPDESSSAKALVSLKEGSLSNTWNEKYSSLQKTPVWKGRNTGSAAEMPFRNSKRSRLFSDEDDRQINTRSPKRNQRVAMVPQKFTATMSTPDKKASQKIGFRLRNLLKLPKAHKWCIYEWFYSNIDKPLFEGDNDFCVCLKESFPNLKTRKLTRVEWGKIRRLMGKPRRCSSAFFEEERSALKQKRQKIRLLQQRKVADVSQFKDLPDEIPLPLVIGTKVTARLRGVHDGLFTGQIDAVDTLNATYRVTFDRTGLGTHTIPDYEVLSNEPHETMPIAAFGQKQRPSRFFMTPPRLHYTPPLQSPITDNDPLLGQSPWRNKISGSDTETLGGFPVEFLIQVTKLSKILMIKKEHIKKLREMNTEAEKLKSYSMPIGIEFQRRYATIVLELEQLNKDLNKVLHKVQQYCYELAPDQGLQPADQPTDMRRRCEEEAQEIVRHANSSTGQPCVENENLTDLISRLTAILLQIKCLAEGGDLNSFEFKSLTDSLNDIKSTIDASNIR	308227	233111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_234585_234740_234921_241677_241804_246223_246305_250417_250520_250795_250916_253010_253145_267415_267574_273634_273761_275004_275139_297457_297563_299180_299276_300751_300785_308174
572142	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
572151	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_17323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATGCAGGTAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
572157	contig_9807_pilon	+	1829	14	Intergenic	novelGene_32845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	649.142693624746	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	909	1613	140826	158783	FALSE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATAPSPPGAVFRPVSGLGLASLSCSAVRANRPRALGERGGNKWRGCRSKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108990	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109140_109558_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128705_139428_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151766_156690_156770_158676
572165	contig_10581_pilon	+	1132	3	Intergenic	novelGene_41401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAAGTTAAGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609094	613812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_609919_612472_612601_613632
572180	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1120	0	-1120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCAACGACGAGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
572190	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572194	contig_10496_pilon	+	2561	6	Intergenic	novelGene_59438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	17.6906755099968	393	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	138	710	199627	219320	FALSE	0	TCTGTGTGGTTGTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METETKTLPLENASILSEGSLQEGHRLWIGNLDPKITEYHLLKLLQKFGKVKQFDFLFHKSGALEGQPRGYCFVNFETKQEAEQAIQCLNGKLALSKKLVVRWAHAQVKRYDHNKNDKILPISLEPSSSTEPTQSNLSVTAKIKAIEAKLKMMAENPDAEYPAAPVYSYFKPSDKKRTAPYSRTAWKSRR	195406	221171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_195528_199610_199740_209283_209411_214098_214186_216071_216158_219160
572198	contig_13481_pilon	+	2799	1	Intergenic	novelGene_119349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGATACAATAATAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386806	389605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_386800_389600
572205	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572208	SIRV6	-	336	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAGCCGAATTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
572214	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572217	contig_3627_pilon	+	2410	15	Intergenic	novelGene_78478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	165.996757406245	346	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	1011	2195	444132	483447	FALSE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD	432304	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444121_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
572230	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572246	contig_15042_pilon	-	986	7	Intergenic	novelGene_115425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	723	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	138	986	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
572265	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572279	SIRV5	+	592	7	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	12	1996	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	36	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGGCGTAAAAGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068	5594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2064_2270_2316_3298_3405_3483_3641_5376_5451_5543
572282	SIRV7	-	227	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91674	-7	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
572286	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_97560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572290	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572293	contig_12622_pilon	-	1820	15	Intergenic	novelGene_6051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	397.490424733857	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	46	1206	1691275	1686312	TRUE	15	GCTGAATTCTGGAGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQGL	1691527	1685204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686321_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
572304	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1433	632	978	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2433	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
572314	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572321	contig_5643_pilon	+	1860	15	Intergenic	novelGene_39090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	793.358994968835	1	52	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	499	1668	634983	640732	TRUE	15	CCTAGGAGCCCCCCTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSK	631433	641463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631559_631854_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640733_641102_641244_641412
572345	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_17622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
572352	contig_12923_pilon	+	2407	5	Intergenic	novelGene_30183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	36.609425015971	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	312	1901	382062	398812	FALSE	25	AAAGCCGCCCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVAVEDVAVDFTQEEWALLDLSQRQLYRDVMMETFRNLASVGEICELHGSEDQDTNRNTHVSMLPIFNRRYMVENLCVSNEDHQCGETFSRIPNVSVLKRTSMDGYPTECLECGKSWMDHSSLKHHIRSHSGCNAYQCKECGGACSCSSYLNTPVRTLTGEKPYECKECGKAFSWPSHLTSHVRTHSGERPYICKECGKAFRHSSSLTKHLRTHSGERPCECKECGKAFNRSSYLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRHSSSLTKHIRTHSGEKPYECEECGKTFNLSSHLTSHVRTHSGERPYICKECGKAFRHSSSLTRHIRTHSGLRPYECKECGKAFSQSSHLTIHTRTHSGERPYICEECGKAFRHSLSLTIHIRTHSGERPYECKECGKAFHQSSNLIEHVRTHSGERPYECKECGKAFSHATSLTEHVRTHSGERPYECKECGKVFSQASHLTIHVRTHSGERPYICKECGKAFHHSSSLTRHIRTHSGEKPYEGKERDKAFSCSSDFTAHIRTHGGERP	367688	399318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_367755_381816_382065_391929_392057_393141_393203_397413
572365	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572366	contig_7457_pilon	-	3753	20	Intergenic	novelGene_31466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_19	192.049148257055	363	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	134	2449	539147	498985	FALSE	20	TGACTCCACTGGGAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGGGCGVSLPRLPWRQWGRQRELNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNVRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVRPMFVSNWTEETLRGNPVLQLDPAVPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIFHMMFGVTLSLFNHTYFRKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSEKAPSLLIHFINMFLFSYSDTGNAVLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKPLVLRHQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDTEEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLALFFIFAAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE	551380	497680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_499079_505780_505953_506246_506365_512195_512304_516988_517097_517489_517707_518245_518365_520402_520494_520938_521094_521407_521548_522385_522537_525700_525914_528051_528146_528943_529027_530848_530976_531312_531396_537254_537384_537938_538037_539131_539211_551310
572385	contig_1225_pilon	+	1834	4	Intergenic	novelGene_44181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	4	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	374	724	274362	275688	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKTVKKQRKKIRSSRVTADCRLPQVALDSSLTTLSGLSACSSCGSWSRGQGNIFLSLLVGEFNAGPWSWQSLTGMERVTRSSSSRGIKFEMNSCHEIHDFSPKLFLDADGREVW	251372	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274454_275429
572396	contig_10937_pilon	+	2322	11	Intergenic	novelGene_67288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	58.9386121316069	499	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1092	2102	40405	45357	FALSE	10	CGGGTGTTGTCACAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33171	45577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40162_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
572402	contig_18194_pilon	-	1911	5	Intergenic	novelGene_55945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	128	616	18897	4642	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20413	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_4902_5429_5501_7034_7162_18866_18976_20364
572408	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCAGATCAACCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	29846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
572417	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572425	contig_3789_pilon	-	2180	7	Intergenic	novelGene_79852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTCGGACAAGTGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473621	445457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_445761_457259_457371_464032_464101_465797_465911_467054_467110_468585_468701_472206
572437	contig_5917_pilon	-	2657	14	Intergenic	novelGene_122165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	237.996394980404	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	713	1924	737194	699492	FALSE	25	TAGCAGCTTCAGACATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	793016	698758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739291_759667_759813_760815_760867_781978_782066_792827
572448	contig_7202_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_16618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGGGGCTCCCATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
572461	contig_14322_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_116189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671893	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
572479	contig_7202_pilon	-	389	2	Intergenic	novelGene_18598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTGATGAAGCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30097	28544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
572483	contig_8864_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_135972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTGAAGTAGAACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90923	91483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_90900_91500
572484	contig_8864_pilon	+	2288	5	Intergenic	novelGene_135973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	84.8027122207775	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	62	715	91545	109422	FALSE	35	ACTTAAAACTATTTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSLQELLDYPGEDVEEIFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGEKVTVCKDNRQEYVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVRLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA	91483	110995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_91620_92113_92197_106899_107084_107307_107411_109213
572507	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572520	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572524	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572533	contig_16496_pilon	+	1447	2	Intergenic	novelGene_5217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTAAAAAACAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64	3594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1307_3389
572541	contig_5671_pilon	+	1184	9	Intergenic	novelGene_79436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2256.37157567188	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	201	614	370430	525570	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	368844	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531205_531493_531604
572543	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
572546	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572547	contig_4105_pilon	+	2148	11	Intergenic	novelGene_21473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	126.947272518948	3	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	647	1249	63839	73585	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVTLPHWPHMSREK	58757	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62860_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72773_73547
572548	contig_3004_pilon	+	3005	12	Intergenic	novelGene_127485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_9	193.591330657613	16	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	139	918	277854	281328	TRUE	25	CAAAGTCAGCCTGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275494	287252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_285751_286379_286451_286738_286875_287113
572554	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572558	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
572561	contig_8317_pilon	+	529	2	Intergenic	novelGene_19327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
572580	contig_3604_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_139995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAAGTTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50768	53090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_50800_53100
572581	contig_12148_pilon	-	3050	1	Intergenic	novelGene_140323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATCTAAAAAATATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47294	44244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_44200_47300
572584	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_19007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
572605	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572619	SIRV3	+	252	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4570	2173	2511	48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGGTGGACGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6514	6766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6800
572635	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
572653	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
572663	contig_3975_pilon	-	2172	9	Intergenic	novelGene_54875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	194.756739292893	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1323	1898	2096423	2092161	FALSE	20	CATGGTTTCTGGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKR	2099567	2091886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097367_2097473_2097540_2097850_2097939_2099342
572670	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572681	contig_2770_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_107463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3001	junction_1	974.202693944586	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	67	408	746670	743833	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	746736	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600
572684	contig_10958_pilon	+	1303	2	Intergenic	novelGene_5483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895816	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895885_900451
572700	contig_4114_pilon	-	2016	10	Intergenic	novelGene_15645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_9	96.2889170961828	438	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	133	1407	592330	567115	FALSE	10	TAATTTTTGTGTGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLMRNEFTITHVLIPKQSAGSDYCNTENEEELFLIQDQQGLITLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQMMLPESIAIVCSPKFQETGFFKLTDHGLEEISSCRQKGFHPHSKDPPLFCSCSHVTVVDRAVTITDLR	594259	566505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127_592346_594142
572713	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1561	632	1106	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
572716	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572719	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572727	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572730	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_13003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	215	1384	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRPAVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28186	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34913_35027_35380_35839_36158_36266
572733	contig_12050_pilon	-	2203	4	Intergenic	novelGene_62696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_3	80.9293244476658	36	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	117	1112	619215	616574	FALSE	5	GCCTCTGCCTGCCAGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQVRRGGRCCEVVGAAGGWDCRAPACLCIWDGSRGQIQSFLKGNQRHQALGDTGPLARSCSLLKRRWRKLNWPPEGVSPGDGAYHRGLCRGLLGRGRPPGL	659680	615482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_617366_617771_617890_619129_619256_659604
572740	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572741	contig_12605_pilon	+	968	6	Intergenic	novelGene_64196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2654.62030429966	3	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	564	968	5056	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_4909_4962_5072_5728_6005_6124
572757	contig_1076_pilon	-	1934	10	Intergenic	novelGene_101111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_5	147.920399013944	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	169	1266	79519	58848	FALSE	10	TTCTTCACTCTCCTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKVSYSFFLR	79687	58179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
572758	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572775	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
572777	contig_9424_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_143779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2258.26465455225	2060	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	371	706	279584	277512	FALSE	20	AAACACCTGTTCGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280482	277213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552_279766_279978_280144_280458
572778	contig_14322_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_116591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGGCGGCCACAGCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
572781	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
572784	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
572789	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_17618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
572814	contig_1865_pilon	-	2124	12	Intergenic	novelGene_103232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_10	110.376291022278	531	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	201	1412	87883	41886	FALSE	15	TTTGGATTAATGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLQEAGVSIPKGHVAKSPDEAFAIAKKLGSKDVVIKAQVLAGGRGKGTFESGLKGGVKIVFSPEEAKAVSSQMIGKKLFTKQTGKKGRICNQVLVCERRYPRREYYFAITMERSFQGPVLIGSSQGGVNIEDVAAETPDAIVKEPIDIVEGIKKEQAVRLAQKMGFPHNIVDSAAENMVKLYRLFLKYDATMVEINPMVEDSDGAVLCMDAKINFDSNSAYRQKKIFDLQDWTQEDERDKAATEANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIKLHGGTPANFLDVGGGATVLQVTEAFKLITSDKKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGTRVDDAKALITDSGLKILACDDLDEAAKMVVKLSEIVTLAKQAQVDVKFQLPL	93213	41173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52489_52962_53084_56299_56443_56538_56701_68472_68612_72073_72203_76048_76212_76399_76500_87792_87974_91438_91474_93138
572824	contig_15304_pilon	-	1838	5	Intergenic	novelGene_30651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4461.03616747275	95	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112620	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103117_106297_106371_106480_106523_106931_107223_112484
572825	contig_14575_pilon	+	2429	23	Intergenic	novelGene_101888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106.689283931354	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	922	1656	32830	50408	TRUE	65	AAAAAATTGAAGAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLRHRSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQDFVTLMKMLKGLIQDGYTALLDKRCCCVYRPLHTC	20925	63895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_21036_21521_21604_22645_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_32691_32850_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51064_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
572835	contig_16303_pilon	-	1816	8	Intergenic	novelGene_34110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.581097514345	2	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	53	1054	47976	37221	TRUE	35	AAATAAATTTCTCTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILSRLFSPPSQSRNNFLAWVLELWSLQL	48028	33160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33320_35259_35764_35980_36029_37169_37302_37431_37701_38579_38856_40433_40731_47897
572836	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	149	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572855	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
572860	contig_2646_pilon	+	2381	2	Intergenic	novelGene_69669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	496	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGATGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2182470	2184984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2184255_2184387
572865	SIRV4	+	313	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1458	632	1003	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2458	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
572894	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572903	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_18124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
572905	contig_15244_pilon	+	2431	2	Intergenic	novelGene_118075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1338	1679	791436	791777	FALSE	90	AAAAAACAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNGCKYPLVIGTWNVLSMNLGKLEVVKNEIKCLKIDILGISELKWTGTGHFESDSHMVYYARNDKLKRNAVAFVVKNNISRSILKYSAVRDRIISIRLQYKEDELIRLLFK	787230	792529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_787292_790159
572913	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
572920	contig_9753_pilon	-	1474	4	Intergenic	novelGene_41314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_3	337.979618057394	404	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	159	362	73274	70212	FALSE	15	AAATCTGTTGTCTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAAGRVVPAGVSASVWTCEYVRRWQSRCPSPCCLYVWVTREDFATFDYILCMDESNLRDLNRKRNQVKNCKARIELLGSYDPQKQLIIEDPYYGNDSDFETVYQQCVRCCRAFLEKAT	93367	69099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_93251
572924	SIRV2	-	639	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4152	5	2973	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1759	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
572954	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
572968	contig_15063_pilon	+	1244	4	Intergenic	novelGene_14326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	283	1104	35271	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34876	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
572970	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_17619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
572972	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_97682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
572980	contig_8270_pilon	-	2756	5	Intergenic	novelGene_143803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_3	54.22349582976	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2212	2616	409509	380364	FALSE	25	CTTTTCACATTAAACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRVQPDVVKDKETERNLQRIATRGVVQLFNAVQKHQKNVDEKVKEAGGSIRKRAKLISTVSKKDFISVLRGTDGSTNEKSSAGKKSKAKQTEVKSEESPGWNIFRDDFMMGASMRDWDKESDGSADSQPGATS	429498	380223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_380496_406158_406361_409438_409537_410968_413006_429351
572985	contig_21388_pilon	-	2262	3	Intergenic	novelGene_136627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	101	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1703	2053	26799	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28501	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756
572989	contig_13608_pilon	-	2827	6	Intergenic	novelGene_52392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_5	336.001547615483	127	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	453	2105	453349	450109	FALSE	20	TTCAAGCATGGTTGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGVLFSSSEVSADNVQSHCPSSANHLGSSSTLFDFSGPVVKCGLYHNSPVVPSHGLLHKKKKLDRPKSEKKLESCKLTEELSLADLINDMPRDSFYESYKSQPSVRLSSTDSLESLLSKSLDAELLRPHASECISKGDTQFKGVSDLKSLMIKSTPDKSLFIQNKSLPDFQNIPVQNSLRNLNNPSHLTSSLENMTLDNLNASKKTEFESVPLAEQSTKNSIFKKDNLQFSQCESPSLAELCQEHKENNPNQCFTSSSDLCNPSSASFTDLSLGSFPLSQLANRHQSSTGVSELTGSLSSLAFCKASPTRDLNNLSLSDLIAETIDVDKSQIKNDSYKFSSSEMRTSGIDSNIDLSVLIKTPDFVPKPVVDQSAAPAPGTKVLNSKLGKNSNSAKDNKKNSKGSLTRKPPFSLSWTKALAARPSAFASTLCLRYPPKSCKRHTLDLYKTFLYSRQVQDVKDKEKSPLIAITPFDFKSASPDDIVKANQKKAFTRE	470353	449386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_451593_453180_453376_456289_456419_466411_466478_468884_468954_470191
572992	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
572998	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
572999	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657496	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657496	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573000	SIRV4	+	245	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-1071	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGCCCAATTTCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
573002	contig_2646_pilon	-	2113	16	Intergenic	novelGene_69629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	362.384780156243	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	661	1959	2073458	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2078698	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073543_2075750_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
573004	contig_9732_pilon	+	1217	12	Intergenic	novelGene_98354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	76.2317042133568	418	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	164	1216	221707	285420	FALSE	40	GTATGAATATATTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLFSRWRTKPSTIEVLESIDKEIQALEEFSEKNQRLQKLWVGRLILYSSVLYLFTCLIVYLWYLPDEFTARLAMTVPVFAFPLIIWSIRTVLIFFFSKRTERNNEALDDLKSQKKKILEEVMEKETYKTAKLILERFDPDSKKAKEHEPPSAGAAVIARPGQEIRQRTAAQRNLSPAPATANQGPPPQVPVSPGPPKDTSAPGGPPERTVTPALLSNVLPRRLGSPATSVPGMGLHPPGPPLARPILPRERGALDRIVEYLVGDGPQNRYALICQQCFSHNGMALKEEFEYIAFRCAYCFFLNPARKTRPQAPRLPEFSFEKRQAVEGSSSAGTSPSGSALPSENQFSE	204991	285421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_+_205093_221644_221734_224507_224550_225346_225535_236232_236292_244065_244107_252362_252447_252528_252581_273059_273273_282539_282646_284045_284117_285250
573020	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573023	contig_10299_pilon	+	2151	9	Intergenic	novelGene_79727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_3	61.9797093813774	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1023	1748	337976	340136	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGYVD	336704	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019
573034	contig_401_pilon	-	1714	3	Intergenic	novelGene_42861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_1	281.5	1263	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	326	1447	1724288	1721973	FALSE	10	ATACTTCTGTGTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728783	1721705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174_1724346_1728515
573043	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
573053	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573059	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573068	contig_9668_pilon	-	1396	4	Intergenic	novelGene_58240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1160	junction_3	312.91780958513	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	169	660	605373	585665	FALSE	30	TTCAGATGTTGTACATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQVSEWRHRWQDH	610512	584928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_585997_598962_599051_605301_605374_610344
573074	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
573080	contig_5799_pilon	+	2443	12	Intergenic	novelGene_50305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_9	221.94054002319	37	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	8	1549	561019	675080	FALSE	85	ATTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGAVSAAPECRLLPYALHKWSSFSSTYLPENILVDKPNDQSSRWSSESNYPPQYLILKLERPAIVQNITFGKYEKTHVCNLKKFKVFGGMNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMGKGIQ	561011	675974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933
573082	SIRV6	+	446	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	40	-1	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGGTCGTTGAAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
573103	SIRV4	+	295	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1476	632	1021	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
573106	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_93483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
573114	contig_10299_pilon	+	2300	22	Intergenic	novelGene_79687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	91.7961608532312	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	66	2165	320559	340402	FALSE	20	GACATGCTTGTCTCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMGPPLTRFNGPGHKLRRSEKPTLHVP	320493	340537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_338922_340321
573119	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
573130	contig_6958_pilon	-	2795	17	Intergenic	novelGene_69976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_16	147.30490275276	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	237	2585	710143	685179	TRUE	20	ATCATGTTGCCCTGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSIIKLTTLSGVQEESALCYLLQVDEFRFLLDCGWDEHFSMDIIDSLRKHVHQIDAVLLSHPDPLHLGALPYAVGKLGLNCAIYATIPVYKMGQMFMYDLYQSRHNTEDFTLFTLDDVDAAFDKIQQLKFSQIVNLKGKGHGLSITPLPAGHMIGGTIWKIVKDGEEEIVYAVDFNHKREIHLNGCSLEMLSRPSLLITDSFNATYVQPRRKQRDEQLLTNVLETLRGDGNVLIAVDTAGRVLELAQLLDQIWRTKDAGLGVYSLALLNNVSYNVVEFSKSQVEWMSDKLMRCFEDKRNNPFQFRHLSLCHGLSDLARVPSPKVVLASQPDLECGFSRDLFIQWCQDPKNSIILTYRTTPGTLARFLIDNPSEKVTEIELRKRVKLEGKELEEYLEKEKLKKEAAKKLEQSKEADIDSSDESDVEEDIDQPSAHKTKHDLMMKGEGSRKGSFFKQAKKSYPMFPAPEERIKWDEYGEIIKPEDFLVPELQATEEEKSKLESGLTNGDEPMDQDLSDVPTKCISTTESIEIKARVTYIDYEGRSDGDSIKKIINQMRPRQLIIVHGPPEASQDLAECCRAFGGKDIKVYMPKLHETVDATSETHIYQVRLKDSLVSSLQFCKAKDAELAWIDGVLDMRVSKVDTGVILEEGELKDDGEDSEMQVDASSDSSTIAQQKAMKSLFGDDEKETGEESEIIPTLEPLPPHEVPGHQSVFMNEPRLSDFKQVLLREGIQAEFVGGVLVCNNQVAVRRTETGRIGLEGCLCQDFYRIRDLLYEQYAIV	718212	684070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_684263_685160_685272_685648_685784_686965_687266_688393_688620_689379_689533_693317_693519_693876_693978_703239_703531_704194_704383_706661_706778_707488_707619_708640_708747_708826_708987_709994_710177_714420_714480_718068
573144	contig_12050_pilon	-	1689	7	Intergenic	novelGene_62691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_6	91.0044260217906	1537	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	220	1170	619215	615621	FALSE	5	GCTTCCGCCCTCTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659702	615101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617366_617771_617890_619129_619256_619530_619612_659604
573147	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573152	contig_7915_pilon	+	2426	8	Intergenic	novelGene_42974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_7	197.654408769758	40	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	791	1966	126154	137758	TRUE	15	CTTGGGTCTATCATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQKLQKERESEEEKLEASKMTLKEQQQQLEKELTDQKSELEQVLTKVSVAEEHVKTLQEEKRWNETLEKTLSQTKQQLSEREQELMEKSSELLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	125363	138425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_126380_128202_128409_129868_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137785_137991
573159	contig_2403_pilon	+	2456	19	Intergenic	novelGene_70997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	255.967228805217	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	224	2323	109605	171239	FALSE	10	CCAATCTGGTGGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPRAKKLEKLGVYSACKAEESCKCNGWKNPNPSPTPPRADLQQIIVSLTESCRSCSHALAAHVSHLENVSEEEMNRLLGIVLDVEYLFTCVHKEEDADTKQVYFYLFKLLRKSILQRGKPVVEGSLEKKPPFEKPSIEQGVNNFVQYKFSHLPSKERQTIVELAKMFLNRINYWHLEAPSQRRLRSPNDDISGYKENYTRWLCYCNVPQFCDSLPRYETTQVFGRTLLRSVFTVMRRQLLEQARQEKDKLPLEKRTLILTHFPKFLSMLEEEVYSQNSPIWDQDFLSASCRTSQLGIQTVISPPPVAGTISYNSDSSSLEQLNGRSTSPACKASSGLEVNPGEKRKMNDTHPLEEAKKPRVTGDIPMELINEVMSTITDPAAMLGPETNFLSAHSARDEAARLEERRGVIEFHVVGNSLNQKPNKKILMWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYITRLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPSQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHDILNFLTYADEYAIGYFKKQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGIRETGWKPSGREKSKEPKDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLVLSLKSDCLFYIESIFMFSNLKINIFL	60737	171372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_60793_93877_94005_109563_109710_114589_114683_116065_116248_123831_124024_128861_128969_133770_133897_135756_135894_138651_138861_139830_139958_148218_148330_151046_151191_161000_161116_163533_163571_163812_163877_163974_164060_169314_169496_171154
573185	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_115867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573199	contig_12503_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_143826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATCTGCTGATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130246	129970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_130000_130200
573212	contig_16098_pilon	-	1358	9	Intergenic	novelGene_46140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1954.21614720583	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	62	1156	458816	456273	FALSE	15	AAGGGGGAGTCTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRCSPQVHPSSVLGERPTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460195	456070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458821_460138
573239	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_115946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573243	contig_18869_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_56236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
573244	contig_12773_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_122131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCGTCCACACAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7720	9464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12773_pilon_+_7700_9500
573254	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573263	contig_6445_pilon	+	1865	9	Intergenic	novelGene_77128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	224.85981744189	840	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	67	1167	1470295	1488667	FALSE	10	GCTGCCTGGCCTACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS	1470228	1489365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559
573270	contig_5457_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_138997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTCTAACCCCCAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28290	26785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_26800_28300
573274	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	411	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573280	contig_9609_pilon	+	1949	9	Intergenic	novelGene_23050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	781.712503098166	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	49	1212	435659	455537	FALSE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLLPSFLSLFLALPAIPPQLQRLGGGVATGLPNRSPPLSEVPGTASVTPFLGVCSGF	435610	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454586_455366
573318	SIRV7	+	363	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAACTTGCGTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56034	114754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
573345	contig_6137_pilon	+	2129	6	Intergenic	novelGene_59310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	145.542296257823	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	168	836	1677350	1682139	FALSE	35	GTTCTTAAAAGATTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEARLVQGSILKKVLEALKDLINEACWDISSSGVNLQSMDSSHVSLVQLTLRSEGFDTYRCDRNLAMGVNLTSMSKILKCAGNEDIITLRAEDNADTLALVFEAPNQEKVSDYEMKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVISCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTITLSMSSDVPLVVEYKIADMGHLKYYLAPKIEDEEGS	1677182	1683432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1677571_1678870_1678969_1679085_1679154_1679889_1680059_1681939_1681973_1682059
573365	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573367	contig_6710_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_89230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
573391	contig_8138_pilon	-	1904	4	Intergenic	novelGene_52403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCCTTCGACTGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307937	280001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280099_288505_288614_304971_305096_306362
573407	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573408	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573413	contig_614_pilon	+	2105	6	Intergenic	novelGene_132628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	25.206348406701	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	39	380	588714	619496	TRUE	25	AGGTATCTGTTAATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGVSVLLLLDVGKAQVLATGESAVTETGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSR	588675	641286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619242_619971_621721_621753_634039_634064_640090
573419	contig_5302_pilon	+	1752	8	Intergenic	novelGene_81375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	412.729837020958	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	338	1072	111129	117238	FALSE	55	TAAGAACTGAAAAGGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL	92480	117918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92668_92757_92815_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046_115209_116464_116584_117165
573426	contig_6847_pilon	-	2242	11	Intergenic	novelGene_143893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	249.745970938472	37	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	149	1684	266491	232193	TRUE	30	TGAAATGTTTATTAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPSWQEAKRQRLLSGGQQVRSGRCSPSPDPSPIPSGAGVRVRPTTAFTMVLLAAAVCTKAGKAIVSRQFVEMTRTRIEGLLAAFPKLMNTGKQHTFVETESVRYVYQPMEKLYMVLITTKNSNILEDLETLRLFSRVIPEYCRALEENEISEHCFDLIFAFDEIVALGYRENVNLAQIRTFTEMDSHEEKVFRAVRETQEREAKAEMRRKAKELQQARRDAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTSAMITETIIETDKLKVAPAPTRPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIMSSNMGKRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	266639	230339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_230700_231994_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024_245190_246080_246287_246422_246603_247231_247496_266488
573431	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_96948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
573441	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
573448	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_94304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
573462	contig_938_pilon	+	3577	14	Intergenic	novelGene_143908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	184.782360386643	616	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	783	3155	82318	127395	FALSE	30	ATAAATCTTACTTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKNHFLQSFKLGDDKGIAHPISFPSLAKKLLIDLCKDVPFQVKCVACRQTLRSHMELTAHFRVRCRNAGPVAVAEKSIAQVAEKFVLRGYCPNCNQVFVDEASTRNHKQNSGHKVQIITSMEESVLLYCHSNQGNKPPSDLHLLLDKSKFSSLKRTMSIKESSTQDYNTIPKKKMNLENESCGAVVCVQRDKSTIKTWFCECHQRFPSEDAVEKHVFSANTMCYKCMVCGKVCEDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELIRKETIMAHVTEFHNGHRYFYETEEVEGETLPLSSTTLGTNSTKKPSSTITIIDHSPASNPPRGKWQCRICEDMFDSQECVKQHCMSLASHQFHRYSCARCKKTFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLVFNVEEAFLIHYKERHSIDYVFVSEKIETSIKTEDDFPVLETSNLLTCGCRESYICKINRKEDYSRCLQIMLDKGKLWYRCNLCSVTAQNLADMKTHIHQVHREEKKDEEEQHYVIKCGTCTKAFHDPESAQQHFHRKHCFLQKPSVANFGSEKGSLYKFTASASPTERKLKQAVSYPKNSDVEKGAENDLSCQNIDEEAVELPDLDYLRTMTHIVFVDFDNWSNFFGHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIFNYLNRIGCFFLHPRCSKRKDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHILNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKESDSDDNLGIKSTSIGEEFRSTEDVELEEAIRRSLEDM	24226	127817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_24344_24837_24922_32069_32151_64172_64299_68841_68954_74981_75133_82206_82361_82853_83002_91965_93570_95206_95351_96634_96766_97701_97889_104593_104663_127348
573465	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
573474	SIRV2	-	261	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	665	22	665	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4067	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
573482	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
573486	contig_14519_pilon	-	1995	11	Intergenic	novelGene_66822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	182.744521121702	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	53	352	283786	282104	TRUE	15	TGTTCTGTTCCAGCTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRRVPASAVRGSPRSRMAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLVNVYFCYHLSLENFSQS	287163	269771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272070_272275_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282125_282680_282806_283632_283788_287112
573490	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573496	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
573508	contig_1813_pilon	-	2418	10	Intergenic	novelGene_105488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1783	2157	149942	136541	TRUE	30	TTCAATAGTCTCTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSAEPHWSGQLWCGYGGAGVVQFYPTAQVKVADFHWRHLFCRLTQYIFWLQITVSNAFGMQEVKGSSNIPHHSAGFSLIEVLPPLDVGQDGASLQFLKDQVKPCVIFKELNQLQNVLVSLTLI	156296	113729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_113844_130951_131040_136481_136564_138158_138231_141496_141602_144963_145020_147587_147685_149920_150117_152057_152222_154852
573515	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573527	contig_5605_pilon	-	3304	1	Intergenic	novelGene_143947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAACAGTTTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419567	416263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_416300_419600
573530	contig_7457_pilon	-	1630	8	Intergenic	novelGene_31424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.247220165422	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	57	701	473193	469327	TRUE	35	ATAAATATTGCCGAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473249	468261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
573538	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	59	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
573544	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573547	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
573570	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
573575	contig_6102_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_32119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816603	819674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_816600_819700
573577	SIRV7	-	359	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-13	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114751	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78843_78964_114680
573607	contig_14441_pilon	+	1561	7	Intergenic	novelGene_100370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	348.491032883201	7	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	347	1375	26678	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	25628	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_25950_26652_26781_26886_27189_112107_112154_116578_116963_117220_117344_117539
573616	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573644	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
573655	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
573661	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
573668	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
573673	contig_15456_pilon	+	2016	4	Intergenic	novelGene_139510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1502	junction_2	35.4400902933387	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGTCATGAGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136269	143944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_136500_137564_137620_141935_142040_142317
573686	contig_7695_pilon	-	2679	19	Intergenic	novelGene_41637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.113816836843	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	225	2273	863143	715527	FALSE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSRLFSLTLKKLVMLKEMDKDLNSVVIAVKLQGSKRILRSNEIILPMSGLVETELQLTFSLQYPHFLKRDANKLQIMLQRRKRYKNRTILGYKTLAVGLINMAEVMQHPNEGALVLGLHSNVKDVSVPVAEIKIYSLSSQPIDHEGIKSKLSDRSPDIDNYSEEEEESFSSEQEGSDDPLHGQDLFYEDEDLRKVKKTRRKLASTSAITRQPNIKQKFVALLKRFKVSDEVGFGLEHVSREQIREVEEDLDELYDSLEMYNPSDSGPEMEETESILSTPKPKLKPFFEGMSQSSSQTEIGSLNSKGSLGKDTTSPMELAALEKVKSTWIKNPDDSLTETDTLEITDQDMFGDISTSLIVPEKVKTPLKSSKPDLQGSASPSKVDVVHTPRQKRSTPLKERQLSKPLSERTNSSDSERSPDLGHSTQIPRKVVYDQLNQILVSDAALPENVILVNTADWQGQYVAELLQDQRKPVVCTCSTVEVQAVLSALLTRIQRYCNCNSTMPRPVKVAAVGGQSYLSSILRFFVKSLASKTSDWLSYMRFLIVPLGSHPVAKYLGSVDSRYSSTFLDAGWRDLFSRSEPPVAEQLDVVGRVMQYVLAVLCDLPCPVASSLVDNPPPPPPLRPAQLCLFLQLWTGRWRQTPHIVCPPATWPVISLDHRVDVSPSLVCSPTSSPHGPLA	863367	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_715779_725317_725353_726130_726242_726427_726583_727247_727355_727942_728048_739669_739806_739990_740107_743270_743352_748526_748621_748969_749131_750021_750082_753251_753333_753419_753512_753758_753904_758792_758919_759647_759738_791350_791439_863129
573692	contig_9177_pilon	+	2504	17	Intergenic	novelGene_32662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	51.8772589869588	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1120	1755	105101	106963	TRUE	55	AAACAAAAAAAGTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPQW	99940	109418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_100009_100303_100440_100685_101146_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
573710	contig_5095_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_74951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTCAGAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231949	229356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_229400_231900
573714	contig_8616_pilon	+	1508	11	Intergenic	novelGene_72485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	575.179937063177	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	252	1436	320431	330999	FALSE	15	ACTTCCTTGACTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318329	331071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
573725	SIRV2	+	324	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	273	-74	-273	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTGATGTTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
573731	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	631	970	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTATATGTTGTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
573733	SIRV6	+	334	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10488	4	1251	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11488	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
573744	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671627	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573759	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573764	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573770	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_16999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573771	SIRV5	-	326	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	12	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8457_8590_10863
573779	contig_10940_pilon	+	1918	4	Intergenic	novelGene_49217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	738	1232	874821	875315	TRUE	15	GTCCCAATGCGGACCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENQDDSKGLIGMGVRDPGAHSRRSRPGYVCGLTKAKVDQQCSWDSCLLNSKQEGIPENEDSGTGLIGIGVRDPGAHSRRSKPGYVCVLTKAKVDQQCSWDSCLLMSKQEGMEENQDGSTGSISNVRSWWLRPGKRNVRKSGHYRRYLKSDDMCDLGIKTIFL	874032	917167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_874176_874226_875675_916664_916747_916922
573802	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573804	contig_13224_pilon	+	2251	2	Intergenic	novelGene_104099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTTCTCTCTGGTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256421	258709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_256629_256665
573811	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573812	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573822	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_17681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
573830	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573831	contig_7870_pilon	-	906	7	Intergenic	novelGene_108936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	544.14287849996	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	240	731	496465	292663	FALSE	10	CTCATGAGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKHLYPVPKMCWDSSQRRL	497931	292487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_292719_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
573833	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_90327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573835	contig_12057_pilon	+	2104	18	Intergenic	novelGene_131638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	41.7233432294467	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	82	1689	136654	161653	FALSE	5	GCCCTGTTCAGTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDAEVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	135382	162068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157706_161559
573844	contig_2100_pilon	-	1453	12	Intergenic	novelGene_50700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	869.976317717	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	116	1105	1182812	1170268	FALSE	10	AGAGTGCTCTCTCTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185526	1169919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173201_1174346_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
573848	contig_15031_pilon	-	2127	8	Intergenic	novelGene_138392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_7	245.483446384842	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	183	1445	129549	68789	FALSE	20	CCTTTTGGGAGAGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQPVWKPYPNQDSDLLVLSGTDSELHIPRVCEFCQAVFPPSITSRGDFLRHLNSHFNGKT	178301	68106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68966_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_178168
573851	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_115990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671627	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
573853	contig_12427_pilon	-	2598	10	Intergenic	novelGene_40503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1305	1646	414213	412571	TRUE	35	TTTTTAACATGAAATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSVKVCFVQRMTYSVSDSVRATGSGEDLKRGPSPRNSGTAANCSWKISCRVAATFSGCLTVVIGVLSVLCSAMGAVARGTDLRSKGFSDGSRVYCCRALSKPGMDTVRPFRM	420290	409631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_410412_411279_411368_412486_412584_413034_413160_413424_413495_414079_414708_415806_415907_417570_417709_417959_418060_419818
573854	contig_4364_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_3324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
573885	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_17689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573887	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
573896	contig_12624_pilon	-	1798	4	Intergenic	novelGene_61108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	838.628642487245	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955847	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950603_950768_952913_952985_955644
573909	contig_15787_pilon	+	2455	3	Intergenic	novelGene_143966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1725	junction_1	83.5	106	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56155	86428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150
573910	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCCGCCATGACGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
573919	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
573963	contig_15459_pilon	+	1994	7	Intergenic	novelGene_106382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	94.7200553678517	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	187	690	43417	53703	FALSE	15	TTTTGTAGTCCTCGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNISKKSASCFVNFSRLQQITNIQAEIYQKNLEIELLRLEKDTADVVHPFFLAQKCHTLQSMSNHLEAVLKEKRSLRQRLMKPICQENLPIEAIYHRYMVHLLELAVNFIEKLETHLETIRNIPHLDANLKNMSKALAKMDILVTETEELAENILKWWEQQREVSS	20634	55007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_20818_43413_43507_43874_43945_49451_49585_50943_51053_53169_53270_53701
573968	contig_16103_pilon	-	1788	14	Intergenic	novelGene_118744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_13	90.1583747878071	1092	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	51	1223	321023	314512	FALSE	30	CAACACTGCTACTGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGDRGRGRGGRFGSRGGPGGGFRPFVPHIPFDFYLCEMAFPRVKPAADETSFSEALLKRNQDLAPNSAEQASILSLVTKINNVIDNLIVAPGTFEVQIEEVRQVGSYKKGTMTTGHNVADLVVILKILPTLEAVAALGNKVVESLRAQDPSEVLTMLTNETGFEISSSDATVKILITTVPPNLRKLDPELHLDIKVLQSALAAIRHARWFEENASQSTVKVLIRLLKDLRIRFPGFEPLTPWILDLLGHYAVMNNPTRQPLALNVAYRRCLQILAAGLFLPGSVGITDPCESGNFRVHTVMTLEQQDMVCYTAQTLVRILSHGGFRKILGQEGDASYLASEISTWDGVIVTPSEKAYEKPPEKKEGEEEEENTEEPPQGEEEESMETQE	321073	313946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314673_314804_314896_315104_315220_315294_315357_315757_315846_316318_316398_316881_316999_317322_317389_318032_318136_318474_318553_319100_319206_319791_319835_320330_320391_321018
573971	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
573979	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
573981	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
573982	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574001	contig_13702_pilon	-	2361	7	Intergenic	novelGene_102612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_6	92.2955698948883	438	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	108	986	151513	144255	FALSE	25	TTAATCATTGGCATGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAGESARQPARPRFAGPAFQESAERSFSGFFRMPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	159876	142879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151549_159804
574017	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	19	348	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14427	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
574019	contig_12414_pilon	+	1275	3	Intergenic	novelGene_59579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	18.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370904	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_371097_373010_373381_373868
574025	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574037	contig_14322_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_115757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
574040	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
574053	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
574056	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574058	SIRV4	+	478	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	449	23	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
574074	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574078	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
574079	contig_5302_pilon	+	1636	6	Intergenic	novelGene_81487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_2	103.683364142952	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	397	786	328325	337399	FALSE	5	TCATCCTTCTTCTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEVKHWHADYDFLSPLKEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	319757	338249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
574094	contig_1225_pilon	+	1644	4	Intergenic	novelGene_44191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	102	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	121	387	253442	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKSRRLCRGPRGFALAVPGWKDPGPGRGLRSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251408	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274942_276071
574096	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCAGGACTCGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
574099	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_16415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574107	contig_4531_pilon	-	2047	9	Intergenic	novelGene_47920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	50.1695562567579	287	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	225	1424	422163	413360	FALSE	15	TATACGCATTCTGCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRERCSKIQCAWLLVFLAGSSVLLYYTFHSQSLYYSLIFFNPTLEHLSFWEILWIVGITDFVLKFIFMGLKCLILLVPSFIMPFKSKGFWYMLLEELCQYYRTFVPIPVWFRYLISYGEFGNVTRWSLGILLALLYLILKLLDFFRHLRTFRQVLRIFFTRPSYGVAASKRQCSDVDDICSICQAEFQKPILLICQHIFCEECITLWFNREKTCPLCRTVISDHINKWKDGATSSHLQIY	423633	412736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_419856_419958_421469_421547_421757_422218_423463
574116	contig_4754_pilon	+	2250	15	Intergenic	novelGene_35951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	159.360520550744	1	87	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	55	1839	380119	420397	FALSE	25	GGTCTAGAAATAGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTGKFCLWPEAG	380064	420808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420257_420370
574118	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
574123	contig_13044_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_100006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTATATGTGGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244274	243630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_243600_244300
574126	contig_15087_pilon	+	1908	18	Intergenic	novelGene_37173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1235	1609	134823	147977	TRUE	30	GCCTAGAAGAGGGAGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRSALASTSGLKSPAGQHKLLKVPGQLPSDAGFDRLPCGLQIFVKHQPKMLLAAISQDVNELGLICSPFQFSCLVQVLDILLYQVLAHDIVLLPGALGSRTTSIFWKWPEVSPMMSASRSRS	110641	149714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116909_118083_118173_126037_126092_126680_126764_127609_127687_132603_132723_133431_133527_134810_134876_143042_143133_144010_144104_145208_145275_146902_146975_147976_148069_148981_149099_149623
574129	contig_2444_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_83742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAAGCTGACCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46017	48298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_46000_48300
574138	contig_2069_pilon	-	899	2	Intergenic	novelGene_23492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2176	junction_1	0	28160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	104	385	1509802	1508877	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEGNRSRARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGVWAWGLEAGGSVVEVSRQGQT	1509905	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1509111_1509754
574140	contig_10324_pilon	+	2039	7	Intergenic	novelGene_7763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1084.13033503049	4	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75620	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_75813_75869_75906_76006_76084_76199_76267_76440_76530_78365_78451_79273
574144	contig_10627_pilon	+	2072	3	Intergenic	novelGene_59910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	23	182	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	67	960	29148	31949	FALSE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFSVARSTGSQLVWWLPVTTQIMRGNAIINSKNAGNTGLQLLAATPDLHPPSLRRRPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGEWEPRGLERAFTPSPLGEEPCPVFCWLGDRDQDLHI	29081	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30300_31515
574148	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574149	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	31	345	14409	13872	FALSE	20	TTTATTACTGTCAGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14439	13870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
574154	SIRV4	+	298	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	641	1009	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
574159	contig_7202_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_18465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGGATTTCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27644	27896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
574162	contig_15304_pilon	-	1002	4	Intergenic	novelGene_30544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1490.4765084436	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	198	830	54100	53061	FALSE	25	ACCAGAAGCAGCCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCWDPICHHFQKLREQLPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54297	52888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53529_53584_53813_53991
574167	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574178	contig_5649_pilon	-	1975	8	Intergenic	novelGene_82456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	98.6099303688373	1235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	99	1280	1573807	1564135	FALSE	25	ACTGTTTGTACCATTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEDVHCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573905	1563439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
574190	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
574205	SIRV5	-	357	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTCTCTGCAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10855
574209	contig_6842_pilon	-	255	2	Intergenic	novelGene_130651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACAGCACCAGGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215280	210316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_210498_215206
574227	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_89607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653776	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574233	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
574234	contig_3077_pilon	+	1322	8	Intergenic	novelGene_26737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_6	3773.28366713305	12	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	177	824	12050	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10151	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16936_17054_17449
574244	contig_15042_pilon	-	986	7	Intergenic	novelGene_115426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	1035	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	138	986	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
574249	contig_10904_pilon	-	1842	10	Intergenic	novelGene_22499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	354.042684181191	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	202	879	336807	310785	TRUE	45	TTTTAAAAATATGTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRRTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLAEDPKVNTRAPCEAAYVPTKEPLGACELQP	337008	309744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_310485_310561_310878_315357_315390_315486_315525_315742_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
574253	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574270	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_96846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
574271	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574272	contig_19577_pilon	-	2904	6	Intergenic	novelGene_119839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	43.5862363596583	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	38	661	60130	40657	FALSE	25	CTTATTTTAATGAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLSTLFCLGLCLRQAIQTRQVPLPKPSLQASPSALVPLKKSVVIQCQGPPGVDLYRLEKLKPRSYEDQAVLSIPVMKESFAGQYRCSYQNGTLWSPPSDLLDLVATGTSVTPSWLSAEPSSFVSGTSKNTVFSTESGSPTGPPHQHYTEANLVRICLGAVILVLLVGILAEDWHSRKKLLVHRVRAVQRPLPPLLQTQKLHQSG	60167	38413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_40851_41350_41399_46577_46632_54854_55113_55259_55296_60096
574275	contig_5643_pilon	+	1299	6	Intergenic	novelGene_38970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_2	488.370924605468	784	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	356	859	551324	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVIRVDIRDTLCQDRCLTKPVLLQLIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549628	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551535_551805_551892_552142_552231_552357
574278	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
574285	contig_19647_pilon	-	1962	9	Intergenic	novelGene_144006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_4	245.858063727835	1816	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	234	1349	137920	73991	FALSE	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTIASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAGGKKGARKSKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQKLNLIHSEITNLAGFEVEAIINPTNADIDLKDDLGNTLEKKGGKEFVEAVLELRKKNGPLEVAGAAVSAGHGLPAKFVIHCNSPIWGADKCEELLEKTVKNCLALADDKKLKSIAFPSIGSGRNGFPKQTAAQLILKAISSYFVSTMASSIKTVYFVLFDSESIGIYVQEMAKLDAN	146605	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_94938_95039_102559_102668_112495_112694_113103_113211_137748_137954_146405
574288	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1465	636	1010	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2465	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
574289	contig_3463_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_62014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCACTTCTGTATCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565746	567150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_565700_567200
574290	contig_3463_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_62016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACGACTAGACTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567150	569258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_567200_569300
574304	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	632	1116	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
574308	contig_14041_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_144039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACATATTGTATGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110292	109073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_109100_110300
574332	contig_15970_pilon	-	2185	19	Intergenic	novelGene_144046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_3	102.918657200723	120	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2013	172	2184	220872	147712	FALSE	30	TAGTCAGTCACTGGCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKEIDWQPYFTTRIVDDFGTHLRVFRKAQQKVTEKDDQVKGTAEDLIDTFFEVEVEMEKKICRDLVCTSPKDEEGFLRDLCEVLLYLLLPPGDFQNKIMRYFVREILARGILLPLINQLSDPDYINQYVIWMIRDSNCNYEAFMNIIKLSDNIGELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDISTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKEINTVKLAANFGKLCTVPLDSILVDNVALQFFMDYMQQTGGQAHLFFWMTVEGYRVTAQQQLEVLLSRQKDGKHQTNQTKGLLRAAAVGIYEQYLSEKASPRVTVDDYLVAKLADTLNHEDPTPEIFDDIQRKVYELMLRDERFYPSFRQNALYVRMLAELDMLKDPSFRGSDDGDGESFNGSPTGSINLSLDDLSNVSSDDSIQLHAYISDTGVCNDHGKTYALYAITVHRRNLNSEEMWKTYRRYSDFHDFHMRITEQFENLSSILKLPGKKTFNNMDRDFLEKRKKDLNAYLQLLLTPEMMKASPALAHCVYDFLENKAYSKGKGDFARKMDTFVNPLRNSMRNVSNAVKSLPDSLAEGMTKMSDNMGKMSERLGQDIKQSFFKVPPLLPKTDSDPEHCRVSAQLDDNVDDNIPLRVMLLLMDEVFDLKERNQWLRRNIKNLLQQLIRATYGDTINRKIVDYVDWMTSPEQVADSVKRFRYILRHSHFFQVVQSLALLSLINFHCFFVSSLSIKFA	221134	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_147890_148142_148289_150990_151063_152505_152668_160545_160657_162284_162393_167394_167535_172368_172439_178244_178283_183964_184098_185045_185151_190522_190717_201786_201887_206505_206595_206961_207101_211533_211618_219477_219567_220817_220920_221010
574352	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574365	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
574380	SIRV4	+	319	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1449	635	994	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2449	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
574384	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78839_78966_114680
574413	contig_8616_pilon	+	1191	9	Intergenic	novelGene_72565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	913.157434400005	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	18	1118	425778	436516	FALSE	15	AACCTTTTCATGTCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427790_428688_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
574415	contig_14924_pilon	+	2352	8	Intergenic	novelGene_104163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	896	1210	54486	54800	TRUE	55	TGCAAACAAAAAGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLCPFFPWSVATVGLMCLHPDSGRCEHTADHGSRGREGQEQAPGLAFLPLPHPGLGGLDSTPPVRAGGAYRAAGLSLWQLGHALCHPWCHLPCHAGSLGPTPL	53590	206767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_55167_57470_57538_60524_60631_61256_61459_63184_63265_79035_79122_163115_163247_206663
574444	SIRV2	-	637	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4143	16	2964	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
574461	contig_8330_pilon	-	1893	10	Intergenic	novelGene_71981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	353.097755149134	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	196	1239	2066429	2038853	FALSE	40	ACTAGCAATCATTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLTHPEVSYSTGPTQSTNNPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2116557	2038198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2057892_2058041_2066340_2066434_2111907_2112004_2116462
574477	contig_7151_pilon	-	1941	12	Intergenic	novelGene_40682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.506873469576	3	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	59	1720	18221	2067	FALSE	40	TCACAATAAATACTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMNSPFCFRCLYPAS	18279	1845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2109_3119_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
574479	contig_7202_pilon	-	158	2	Intergenic	novelGene_18611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAATCTCACGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29897	28575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
574484	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
574486	contig_8617_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_73461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCAACATGAACCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
574487	contig_10436_pilon	-	763	4	Intergenic	novelGene_108502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	250	333	102553	102032	FALSE	25	CAAGCTGAACTGATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103459	101601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
574499	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
574504	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_89260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653730	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
574510	contig_5337_pilon	-	2743	2	Intergenic	novelGene_136557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	290	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	236	1579	322179	320836	FALSE	15	CATTTGTGTGTGTATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	330812	319671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_322308_330705
574516	contig_14925_pilon	-	1179	5	Intergenic	novelGene_55185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	1557.48858342525	93	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94450	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_94214
574522	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574524	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
574534	contig_12919_pilon	-	1986	6	Intergenic	novelGene_75888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	952	junction_3	145.099414195923	1679	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	77	910	743659	720131	FALSE	15	CACTGTTCTAGGCACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743735	719054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_730980_731210_734916_735079_737596_737735_743565
574535	contig_11601_pilon	+	1863	5	Intergenic	novelGene_141031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	608	junction_4	55.8183437590189	3119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	63	416	92987	98871	FALSE	45	AAAAAACCAAACCCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALETVPKDLRHLRACLLCSLVKTIDQFEYDGCDNCDAYLQMKGNREMVYDCTSSSFDGIIAMMSPEDSWVSKWQRVSNFKPGVYAVSVTGRLPQGIVRELKSRGVAYKSRDTAIKT	92924	100318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_93056_93789_93897_97845_97902_98165_98220_98803
574536	contig_1107_pilon	+	3357	2	Intergenic	novelGene_126580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_1	0	583	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	181	513	673204	677490	FALSE	15	CGCTGGTTGTGTATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSTTQALKSSQGSKPPGPDALGPVRKEEEATFWKINAERSRGEGPETEFQSLTPSQIKSMEKGEKVVPVCHRQEPAPKDKETQAERPSGPRQELCDLSGVWAERERPLLMQVSASPPREAGPAEPEGKPSAPDAIQEDAEDVLFSEPVPAQVSSSSVVLKTGFDFLDNW	673023	680334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_673480_677433
574541	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
574582	contig_10627_pilon	+	2039	4	Intergenic	novelGene_59904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	45.1072795307661	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	170	931	29280	31949	FALSE	15	TAAACCTGTGCCCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGEWEPRGLERAFTPSPLGEEPCPVFCWLGDRDQDLHI	24172	33057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515
574586	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACATCCACTTCAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
574589	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	69	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574596	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
574599	contig_11832_pilon	-	1856	15	Intergenic	novelGene_106932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_13	921.835261855392	1826	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	507	1406	88105	84249	FALSE	10	ATGAGTGTGTGTGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92487	83798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88802_89418_89450_92387
574609	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_16461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
574618	contig_13894_pilon	-	1774	7	Intergenic	novelGene_62200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	235.131169066686	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	174	1112	762268	750013	FALSE	20	TCTATTGAGTAGCGGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766721	749350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762299_766578
574621	contig_18251_pilon	+	2358	3	Intergenic	novelGene_50162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	1582	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46947	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48794_53919_54027_54917
574631	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_18714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAACCTGGAGCTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
574659	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
574660	contig_3130_pilon	-	2776	19	Intergenic	novelGene_103554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_4	123.716471951389	211	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	62	2740	128512	32257	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALDDSDFFTSYYTLGNIYAMLGEYNHSVLCYDHALQAKPGFEQAIKRKHAVLCQQKLEQKLEAQHRSLQRTLNELKEYQKQHDHYLRQQEILEKHKLIQEEQILRNIIHETQMAKEAQLGNHQICRLVNQQHSLHCQWDQPVRYHRGDIFENVDYVQFGEDSSTSSMVSVKFDVQANQSDISDSVKSSPVAHSILWIWGRDSDAYRDKQHVLWPKRADCAESYPRVPVGGELPTYFLPPENKGLRIHELNSDDYSSEEEAQTPDCSINDFRKSQTLSYLVKELEVRMDLKAKMPDDHARKILLSRINNYTIPEEEIGSFLFHAINKPNAPVWLILNEAGLYWRAVGNSTFAIACLQRALNLAPLQYQDIPLVNLANLLIHYGLHLDATKLLLQALVINSSEPLTFLSLGNAYLALKNISGALEAFRQALKLTTKCPECESSLKLIRCMQFYPFLYNITSSVCSGNCHEKTLDNSHDKQKYFDNSLSLDAAEEEPSERGTEEDPVLSVENSGRDSDALRLESTVVEESNGSDEMENSDETKMSEEILALVDEFQQAWPLEGFGGALEMKGRRLDLQGIRVLKKGPQDGVARSSCYGDCRSEDDEATEWITFQVKRVKKPKGDHKKTPGKKTESNQVENTHRYQSNLEITGPKVASPGPQGKKRDYQSLGWPSPDECLKLRWVELTAIVSTWLAVSSKNIDITEHIDFATPIQQPAMEPLCNGNLPTSMHTLDHLHGVSNRASLHYTGESQLTEVLQNLGKDQYPQQSLEQIGTRIAKVLEKNQTSWVLSSMAALYWRVKGQGKKAVDCLRQALHYAPHQMKDVPLISLANILHNAKLWNDAVIVATMAVEIAPHFAVNHFTLGNVYVAMEEFEKALVWYESTLKLQPEFVPAKNRIQTIQCHLMLKKGRRSP	129023	32220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_32389_34072_34217_35870_35991_62840_62925_63990_64151_68857_68979_73827_73982_74793_75054_86945_87117_102962_103150_115882_116108_116475_116554_117895_118062_118217_118334_119670_119818_124093_124207_126473_126635_128372_128513_128962
574666	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574691	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_89057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGCTCTCCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653300_653800
574692	contig_7151_pilon	-	1800	8	Intergenic	novelGene_40674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	107.046623449022	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	554	1708	12708	1924	FALSE	25	CTGAGTTTCTCAACCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	13261	1831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491
574698	contig_7870_pilon	+	1148	8	Intergenic	novelGene_108886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	615	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACGACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143113	497931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_143480_217275_217381_295249_295385_370811_370889_402900_403000_441669_441796_496464_496595_497821
574716	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574721	contig_19899_pilon	-	1795	8	Intergenic	novelGene_102512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	85.4734712394102	530	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	320	742	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156599	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_144792_145008_145059_145500_145554_156555
574744	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_89078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
574752	contig_3386_pilon	-	2706	6	Intergenic	novelGene_34533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	682.785354265892	1	150	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	99	464	409604	406808	TRUE	30	TATAAATTGTTGTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGSGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412192	404165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_406842_407702_407829_409398_409607_412096
574766	contig_3174_pilon	+	1559	2	Intergenic	novelGene_144068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	55	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGAGTTCTGTGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3174_pilon_+_1500_9848
574774	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
574777	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574784	contig_753_pilon	-	2131	12	Intergenic	novelGene_112940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	91.5467635547831	384	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	174	1874	841832	731406	FALSE	20	CCAACGCCGACTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQPLALQLEQLLNPRPREADPEADPEEATAARVIDRFDEGDDEEGDFLAVGSIRKLASASLLDTDKRYSGKTTSRKAWKEDHWEQALPGSSDEEIPDKEGSGDGDSEGLGLEESDEDHMSAAEEQESGDDGENGLARRKRSRHRSAKTPGFSVQSISDFEKFTEGMDDIGSSEEEEGEEEESGMEEGDGEIDFEGESEEDRAENRNSEDDGVVMTFSGVKVSEEVEKGRAVKNQIALWDQLLEGRIKLQKALLTTNQLPQPDVFPIFKDKGGPEFASALKNSHKALKALLRSLVDLQEELLFQYPDTRYLVDGTKPKAESEEEISSEDDELVEEKQRRRAPPKRKLETDDYPSFMAKRFADFTVYRNRTLQKWHDKTKLASGKLGKGFGAFERSILTQIDHILMDKERLLRRTQTKRSVYRVLGRPEPTAEPVPESLPGQPEILPQAPANAHLKDLDEEIFDDDDFYHQLLRELIERKTSSLDPNDQVAMGRQWLAIQKLRSKIHKKVDRKASKGRKLRFHVLSKLLSFMAPIDHTTMNDDARTELYQSLFGKLNPPGDSHRN	842005	731148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_731470_754678_754751_764070_764152_766291_766360_800800_800885_802202_802368_802884_803084_804441_804557_837241_837380_837855_838288_840540_840733_841741
574785	contig_10904_pilon	-	1797	7	Intergenic	novelGene_22783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	189	junction_5	196.138910525735	102	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	40	648	773328	759449	TRUE	10	GCGTCAGTGGTTTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGIPRSKGEEQNPQER	773367	756998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759496_759593_759723_769599_769885_772375_772412_773216
574789	SIRV7	+	367	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTTGCGTTTTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78966_114683
574799	contig_8616_pilon	+	2247	21	Intergenic	novelGene_72412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_18	151.892025794641	612	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	110	1963	239674	251655	FALSE	10	TTTGTGCCCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEGKSYNEHDDRVNLPRRRKGRGPFRWNYGEGNRRSGRGGSGSRSARLGEDDGDVAMIDAQDGPRVRYNPYAARPNRRGDNWHDRGRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSLIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKIVDRENRRISIIINPSAPPQTVQNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTMLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTSTLLCFSVSGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASPEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNDWDYTRSAQVFTQLKAEGKIPEVAFMK	239564	251939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243885_244040_244576_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245973_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
574815	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574819	contig_8377_pilon	+	2920	1	Intergenic	novelGene_35118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165033	167953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_165000_168000
574820	contig_4884_pilon	+	2087	9	Intergenic	novelGene_63816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	624.803969257558	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	189	1889	575052	585023	FALSE	70	ACTGAAAAAAAAAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNSRSHSSRSKSRSQSTSRSRSRSHSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSRDRIYSRDYRRDYRNNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGYRPVWNRRHSRSPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSSRSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGSQEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSATSGDIWPGLSAYDNSPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTVHSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTITPQNAPRDEARGRSSFYPDGGDQETAKTGKFLKSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDR	563316	585221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576827_578420_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843
574825	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574830	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_95835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574856	contig_13608_pilon	-	2553	17	Intergenic	novelGene_52375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	181.719865108358	2	114	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	116	922	470234	400675	TRUE	40	CATAACAGCAAAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERESNNGCWYDKV	470349	368775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400706_410883_411050_411536_411800_416269_416379_456289_456419_466411_466478_470191
574863	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_94119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
574879	contig_12074_pilon	-	1973	13	Intergenic	novelGene_53738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	445.898250725432	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	52	1512	45831	31029	TRUE	10	TTTAATGCCTGCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWPRPLVMMRPCS	45882	29970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
574906	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
574921	contig_19311_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_144073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATCTCTAGCACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93003	91371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_91400_93000
574924	contig_1154_pilon	+	1415	2	Intergenic	novelGene_87163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGTGAAATGCCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900482	902684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_900990_901776
574927	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
574940	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
574960	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
574978	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
574980	SIRV4	+	251	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1520	632	1065	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
574993	contig_990_pilon	+	3745	18	Intergenic	novelGene_76055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_13	52.5015735470233	156	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	36	2012	1031707	1057355	FALSE	25	CATAAATGTTCTTCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPMLHTRLPGVVAASPSTVKTLGTASTGISDMLALENEFFNSPPRKTVRFGGTVTEVLLKYKKGETNDFELLKNQLSDPDIKDDQIINWLLEFRSSIMYLTKDFEQLVSILLRLQWLNRSQEVVEEYLAFLGNLVSAQTVFLRPCLSMIASHFVPPRVIIKEGDVDVSDSDDEDDNLPANFDTCHRALQIIARYVPSTPWFLMPILVEKFPFVRKSERTLECYVHNLLRISVYFPTLRHEILELIIEKLLKLDVNASRQDIEDAEETAAQTSGGTDATEGLFNMDEDEETKGETEADPAQLDRMVHPVAERLDVLLSLLLSYVKDVCYVDGKVDNNKTKDLYRDLITIFDKLLLPTHASCHVQFFMFYLCSFKLGFAEAFLEHLWKKLQDPNNPAIIRQAAGNYIGSFLARAKFVPLITVKSCLDLLVNWLHIYLNNQDSGTKAFCDVALHGPFYSACQAVFYTFVFRHKQLLSGNLKEGLRYLQSLNFERIVMSQLNPLKICLPSVVNFFASITSKYQLVFCYTIIERNNRQMLPVIRNTAGGDSVQTCTNPLDTFFPFDPCVLKRSKKFIDPIYQIWEDMSAEELQEVKKPIKKEMVEDEDDDFLKGEVPQNDPVIGITPSSFDLHFRSPSSSVGSPPVLYMPDQSPLTSRICD	1031671	1059088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1031796_1033291_1033398_1034351_1034409_1037973_1038064_1038161_1038292_1038700_1038761_1039106_1039171_1039890_1039961_1043115_1043215_1044923_1045017_1045967_1046107_1047459_1047591_1048714_1048846_1049770_1049956_1052509_1052619_1055097_1055251_1056206_1056295_1057172
574997	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575018	contig_9345_pilon	-	2699	12	Intergenic	novelGene_24515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	241.211816658861	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	81	707	671829	669559	TRUE	25	CTCCTCGGTTTTTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGE	671909	667049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_669025_669114_669206_669289_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
575032	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_19026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
575049	contig_6735_pilon	-	1293	12	Intergenic	novelGene_15732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	919.639059631549	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	88	1041	564868	542236	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSGCRVD	568285	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542259_543865_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
575054	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
575056	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575066	contig_12790_pilon	-	1184	11	Intergenic	novelGene_35251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTCGCGGAGCCGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	306043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306137_307244_307339_308741_308840_309576_309754_309871_309922_310030_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312033_312347_312387_312708
575069	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575071	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
575090	contig_9345_pilon	-	1542	3	Intergenic	novelGene_24404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	183.5	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	99	644	142974	142100	FALSE	30	GTTTCACCAGAAATGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	143072	141201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955
575109	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_95011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
575119	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575130	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
575142	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_17662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
575149	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
575153	contig_3986_pilon	-	1926	14	Intergenic	novelGene_52695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.518848730845	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	178	1659	60653	35282	TRUE	35	AGGATTAGATTAGTTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPVRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153860	34393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_34628_35248_35467_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
575155	contig_3948_pilon	+	2021	9	Intergenic	novelGene_53230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_7	48.2953155078213	568	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	84	686	933984	966763	FALSE	80	ATGCAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLYCTQDPVPEAVGGDMQQLNQLGAQQFSALTEVIFHFLAEPKEVERFLAQLSEFATTNQISLGPLRSTVKSLLLVPNGALKKSLTAEQVRADFITLGLSEDKATYFSEKWKQNSQTLAQWAIGQTLMINQLIDMEWKFGVTSGSSELDKVGSIFLQLKLVVKKGNQTENLYIELTLPQFYSFLHEMERVRASMECFS	933900	968098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_934068_940742_940797_940893_940997_964583_964641_964723_964762_965227_965319_965633_965684_966104_966154_966686
575220	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
575228	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
575230	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_90585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575245	contig_7080_pilon	+	2232	10	Intergenic	novelGene_100099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	1020	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	49	861	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460833	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_541058_541299
575251	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575255	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
575259	contig_10042_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_79239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGTTGAAGCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193724	1192918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1192900_1193700
575266	contig_5961_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_144175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277981	275890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_275900_278000
575267	contig_13664_pilon	+	2292	3	Intergenic	novelGene_144190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	22.5	252	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	286	681	16686	35042	FALSE	35	CAAAGTGTCATCATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKLSFLLLVFGLIWGLMLLHYTFQQPRHQSSVKLREQILDLSKRYVKALAEENKNTVDVENGASMAGYADLKRTIAVLLDDILQRLVKLENKVNYIVVNGSAANTTNGTSGNLVPVTTNKRINASGTIR	6442	36653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_6558_16515_16897_34857
575272	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575283	contig_383_pilon	+	2548	4	Intergenic	novelGene_126134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1294	junction_3	39.8580815728337	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1756	2265	157256	169172	FALSE	30	TATTCATGTGGTTAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	155500	169455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_157284_159221_159374_164402_164586_169025
575304	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	643	1122	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
575327	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
575328	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
575333	SIRV4	+	208	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1563	632	1108	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2563	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
575355	contig_5515_pilon	-	1537	10	Intergenic	novelGene_52335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	447.150346191038	51	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	36	1208	99142	67947	FALSE	35	TTACCTAGACAACAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPAPPLIAATTTTTCLSAS	99177	67617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68002_68170_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
575358	SIRV4	+	464	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	-1	487	-1	-487	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAGGCGGAGACCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454	2284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
575360	contig_6215_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_21219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	660	965	227679	227374	NA	25	TCCAAGATTTTGAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSAGFACRLRHIAFKERLAMVHTELSTQLDCNLPWVGMASFHTYTVNFVLVYKHMQNNGFSGDVRNAEGLDKGFEKENHGLRKKFFKKTLEISFEKERW	228338	226778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_226800_228300
575365	contig_10000_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_139354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAACCAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358433	358951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_358400_359000
575409	contig_6735_pilon	-	1496	10	Intergenic	novelGene_15745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	866.956632403914	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	569	1099	545022	542384	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDTPIPASSV	568267	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542411_543063_543292_543788_543894_544851_545064_551175_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
575413	contig_4857_pilon	+	2946	22	Intergenic	novelGene_48661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_4	99.7312033677027	235	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	50	1147	1015035	1083807	TRUE	15	AGACCCCTTCGTATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWNQVQQLEIKFLEQVDQFYDDNFPMEIRHLLAQWIENQDWEAASNNETMATILLQNLLIQLDEQLGRVSKEKNLLLIHNLKRIRKVLQGKFHGNPMHVAVVISNCLREERRILAAANMPVQGPLEKSLQSSSVSERQRNVEHKVAAIKNSVQMTEQDTKYLEDLQDEFDYRYKTIQTMDQVDKNSVLMNQEILTLQEMLNSLDFKRKETLSKMTQIINETDLLMNSMLIEELQDWKRRQQIACIGGPLHNGLDQLQNCFTLLAESLFQLRRQLEKLEEQSTKMTYEGDPIPLQRTHLLERVTFLIYNLFKNSFVVERQPCMPTHPQRPMVLKTLIQFTVKLRLLIKLPELNYQVKVKASIDK	1012044	1109807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039_1077126_1077750_1077903_1079777_1079937_1080626_1080720_1083743_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107876_1107986_1109518
575421	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575426	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575427	contig_7202_pilon	+	180	1	Intergenic	novelGene_18339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTCAAAGAGATACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27638	27818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
575434	contig_11512_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_43241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	11	355	4011	4578	FALSE	20	GCTGGTACCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYS	4000	4578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
575435	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_90561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575436	contig_15410_pilon	+	1869	3	Intergenic	novelGene_130611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	421.5	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	147	581	145617	147258	FALSE	40	CAATGTGGATAAATTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVKAGRQLQGTGRGVHRSRGHISLYFW	145470	148546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081
575437	contig_7066_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_42213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCCACCTCTTAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113894	1115944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1113900_1115900
575442	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
575503	contig_15410_pilon	+	1260	4	Intergenic	novelGene_130617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	344.347047161565	42	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	136	606	145617	147867	FALSE	50	TATGAAAATAAATTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTGKCVCGGC	145481	148521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750
575520	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_17682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
575521	contig_1076_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_101094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAGAGAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53857	50969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51000_53900
575524	contig_6557_pilon	+	2974	1	Intergenic	novelGene_32957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTATAATATGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355905	358879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_355900_358900
575531	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	51	529	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
575544	SIRV4	+	504	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	440	6	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
575546	contig_14333_pilon	-	1683	5	Intergenic	novelGene_49153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	140.703589151095	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	54	518	446908	444070	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKVYHGKAPKEGKVCFLLPYPEVLEDCQYSDTSVPKGRRRSKHLYFPLHNL	446961	440790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441821_443131_443248_444050_444220_445731_445820_446681
575550	contig_6735_pilon	-	959	8	Intergenic	novelGene_15775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	886.986988837687	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	81	719	564868	542464	TRUE	30	CCTTATGCTGAGCTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568278	541988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542030_542264_542601_542790_542857_543005_543178_554267_554374_564157_564232_564784_564869_568198
575556	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
575558	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
575559	contig_15063_pilon	-	1275	4	Intergenic	novelGene_14310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	791	1114	35891	35108	TRUE	35	AGGTAAGAGTACCTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36788	34834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36158_36264
575561	contig_10135_pilon	-	2161	9	Intergenic	novelGene_106613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.3215706504	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	555	1433	88066	84516	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRIPGRKMG	89576	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84541_84700_84806_85945_86069_86261_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89057_89502
575576	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575577	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575578	contig_8636_pilon	+	4383	4	Intergenic	novelGene_141908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	14.6969384566991	212	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	304	1002	326354	332612	FALSE	10	GAATTGTGGGCTGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSASLMPPIWDKTIPYDGESFHLEYMDLDEFLLENGIPASPTHLVQNLLLPVAELEGKESANSSTASPPSSSTTVFQPSETVSSTESSLEKERETPSPIDPNCVEVDVNFNPDPADLVLSSVPGGELFNPRKHKFAEEDLKPQPMIKKAKKVFVPDEQKDEKYWTRRKKNNVAAKRSRDARRLKENQITIRAAFLEKENTALRTEVAELRKEVGKCKTIVSKYETKYGPL	322049	335993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_322297_326297_326616_331014_331236_332396
575583	contig_20029_pilon	-	1829	6	Intergenic	novelGene_138895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	394.495424561553	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	860	1669	9595	5156	FALSE	5	GCATTGTCTTTTTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAELASVDFQLASEEARKQINQWVKGQTEGKIPELLASGTVNSMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTDAPFRLNKKDTKTVKMMYQKKKFPYGYIQALKCRVLELPYQDKDLSMVILLPDDIEDDSTGLQKIEEQLTLENLSEWTKPENLHTMEVNVSLPRFKLEETYDLNSYLARLGVQDLFNSSKADLSSMSGARDLFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIANFCMLVPEETFNADHPFFFFIRHNPSKSILFCGRFSSP	12755	4995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_-_5561_7095_7264_7349_7493_9501_10227_11528_11731_12729
575584	contig_7457_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_31537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755938	753695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_753700_755900
575588	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575607	contig_567_pilon	-	256	4	Intergenic	novelGene_33965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1990	junction_3	461.151457404904	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGCCCTAAATGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331099	322271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_322322_326925_326997_329281_329358_331040
575612	contig_3155_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_26371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	72	578	258156	261211	TRUE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258084	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261824_262207
575616	contig_1443_pilon	-	1268	6	Intergenic	novelGene_28297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	579	junction_5	54.7042959921796	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	90	608	750529	748649	FALSE	60	GAGAAAAAAAAAGAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	767480	747988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440
575619	contig_11720_pilon	-	1687	5	Intergenic	novelGene_43905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.882908351288	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	158	403	124506	118158	FALSE	40	GAAATTAAAACCCTGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAADLH	124663	116873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118173_121892_121930_122145_122211_123024_123120_124472
575622	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575624	contig_5018_pilon	-	2119	10	Intergenic	novelGene_47118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_6	39.6338177087805	170	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	746	1618	1433423	1429090	FALSE	20	CCCCACGACCTTTACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPIYAYGSEKQRQKYLPRLAKGELLGCFGLTEPNHGSDPGSMEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAGAFGCLNNARYGITWGVLGAAEFCLHTARQYTMDRIQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGKAITGIQAFKAGK	1434632	1428588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1431777_1432207_1432425_1432505_1432636_1433362_1433868_1434048_1434193_1434388_1434425_1434511
575627	contig_12270_pilon	-	295	2	Intergenic	novelGene_114117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTTCACTTTCACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
575649	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657496	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657496	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
575650	contig_15087_pilon	+	2161	18	Intergenic	novelGene_37144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	24	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1251	1961	52951	72512	TRUE	5	TCGCGCTCCCGCTCGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLLVHFKQLSALLLQHLHLLLGCTQDAHLWQLACYHSSLLLAGRHLLPCAFHLWGVWLPGGTLFVAAAHQQLLELHIFLPKPLSGLIPLFQALVQLGLQDLILLPKLLTQGLQDGGALLVLVHLGGQPVELEGHAAQMGEELAVVWLLGTHAQSGLQPLQVQHQVAVSRGRGPSSIVFLVLPPLSGGEFCSSAGTTSNSEEVPYWMEVLGPALACHWGVHRQREVLGHLCPFL	33327	89758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_33559_34003_34121_38965_39059_40458_40648_41127_41194_41710_41831_42908_43046_49136_49266_52531_52669_52919_52986_54480_54568_58874_58999_60951_61054_66539_66724_69119_69207_71087_71173_72505_72645_89690
575653	contig_7202_pilon	-	149	1	Intergenic	novelGene_16429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27771	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
575668	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575671	contig_7202_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_17288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACCTGCTCATGCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
575674	contig_2596_pilon	+	2673	24	Intergenic	novelGene_53460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_3	47.6855246669251	258	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	10	2088	627602	656411	FALSE	20	CATGTGTATGAGTTTCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAAVRWFSGRCRPYLPTGRGAAPGGRASSCRFYSGSAAIPEVEGADVTSVEEVIIPRKKTWDKVAVLQALASTVNRDPTAAPYAFQDDPYLIPASVMESRSFLLAKKSGETAAKFVINSHPKYFQRDIAEPHIPCLMPEYFEPQIDDISEAALKERIKLKKVKASVDMFDQLLQAGTAVSLETTNGLLDLLCYYGDQEPPADYHFQQTEKSKELEEATEEENEKSGKSGHQHGSTWRGKNNVERIFALMPEKNARSYCTVIRGMVKHRANEQALNLYTELLNNRLTADVYTFNALIEATALTGNDKFEEKWNKIQELLKHMVAQKVKPNLQTFNTILKCLRRFHIIGRVPALHTLREMKAIGIEPSLATYHYLIQLFYPTESSSKMSSLIIYDIMNELTGKKFSAKDLEDDMFFQSAMRVCSSLRDLELAYQVHDLLNTGDNRTFLGPAQRRHFYYYKFFNLLCLMEQIDVTLKWYKDLIPSVFFPRSQTLIDLLQALDVANRLEMIPQIWKDSKEYGHTFCSDLREEILMLMARDKHPLELQVVFADCAADIKSTYESQDARQTHSDWSARTLNCIAVLFLRAGRTQEAWKMLGLFRKHNKIPRNELVNEFMDSAKASNSPGQAIEVVRLASTFSLLVCEDLTQRVMADFALSQEQKDTLRKLTALTSDSDSSSDSDSSSDTDISEVK	627592	656996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_627703_629245_629299_629409_629447_633487_633534_635397_635467_635920_636026_637149_637274_640892_641009_642805_642874_644570_644659_645004_645066_645334_645421_646135_646281_647122_647174_649069_649160_649452_649482_650907_651015_651657_651737_651829_651921_652861_652948_653620_653770_655372_655415_655821_655981_656314
575679	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1582	632	1127	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
575684	contig_15063_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_9099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	243	1481	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
575687	contig_9014_pilon	-	2078	11	Intergenic	novelGene_106729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.5315146598024	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	67	1524	46682	41867	FALSE	10	GGTTGTTACTCATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51607	41312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42035_42136_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
575688	SIRV5	-	330	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCTCAATGTATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
575693	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91671	1	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
575703	contig_1331_pilon	-	1295	2	Intergenic	novelGene_37805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8404	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGGCATTGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160898	158949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867
575714	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_18893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
575729	SIRV7	-	340	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33228	1	9	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114729	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
575731	contig_3602_pilon	+	1810	6	Intergenic	novelGene_60503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	794.172424603121	404	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	114	419	161745	168877	TRUE	15	TACCTGACTTGGCTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKVSSPGD	161631	171125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_169282_169422_170110_170825
575736	contig_9609_pilon	+	1785	8	Intergenic	novelGene_23068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	890.471922576989	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	31	801	449884	454475	TRUE	30	CCTTAGCGCTAACCTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTASTMRRPAISRASLRT	449853	456108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454425_454634_455282
575765	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575766	contig_9463_pilon	-	1081	4	Intergenic	novelGene_83815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	235.491448299555	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	70	690	44553	40046	FALSE	15	GGGCTGCGTTGATAATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRLLLPLVALLSLRLGSDAQGTELPSPLSVWFEAEFFHHMLHWTPILNQSQSTYYEVEFLCYGEESWKAIPTCNQTLAQSCDITAVTLGLYHNNGYRAKVRAVDGSRRSNWTISDTRFTRDEVTLKVDSVKLEIHNGCIFGTIQPLRPKIAPAGDMYEHIFKNFREYEIDIRKVPGEYTVWRSSGFPVTWAGGLCWQSQERSQG	44622	39654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_40294_41370_41556_42167_42289_44486
575789	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_115879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
575806	contig_14474_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_144207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAGAGAGTTCATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42810	43466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_42800_43500
575833	contig_14441_pilon	+	1297	6	Intergenic	novelGene_100417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	611.577174197991	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	714	1067	116876	117560	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	81872	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82360_114102_114161_116578_116963_117097_117344_117539
575849	contig_15063_pilon	-	1402	4	Intergenic	novelGene_13125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	690	1013	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36689	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
575850	contig_10722_pilon	+	1698	3	Intergenic	novelGene_70990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.5	299	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	867	1619	31560	32414	FALSE	5	TGGTTTTGTTTCTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKGRDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30287	32493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31137_31542_31827_31928
575854	contig_7810_pilon	-	3260	18	Intergenic	novelGene_144217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_9	138.887921257683	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2250	137	2386	444542	301295	FALSE	45	ATATATGCTTAATTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIDPYQHIIVEHQYSHKFTVVVLRATKVTKGAFGDMLDTPDPYVELFISTTPDSRKRTRHFNNDINPVWNETFEFILDPNQDNVLEITLMDANYVMDETLGTATFPISSMKVGEKKEVPFIFNQVTEMILEMSLEVCSSPDLRFSMALCDQEKTFRQQRKERIKENMKKLLGPENSEGLYHTRDVPVVAILGSGGGFRAMVGFSGVMKALYESGILDCATYIAGLSGSTWYMSTLYSDPDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKIKRYVESLWKKKSSGQPVTFTDIFGMLIGETLIHSRMNATLSSLKEKIDTAQCPLPLFTCLHVKPDVSELMFADWVEFSPYEIGMAKYGTFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFSILFNRVLGVSASQNKGSTMEEELENITAKHIVSNDSSDSDDESQEPKGTENEDAEREYQNDNQASWVHRMLMALVSDSALFNTREGRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLSPLRDFTTQESLDEDELDAAVADPDEFERIYEPLDVKSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKELLLAEKWAKMNNLPFPKIDPYVFDREGLKECYVFKPKNPDVEKDCPTIIHFVLANINFRKYKTPGVPRETKEEKEIADFDIFDDPESPFSTFNFQYPNQAFKRLHDLMHFNTLNNIDVIKNAIFESIEYRRQNPSRCSVSLSNVEARRFFNKEFLSKTTA	471288	300420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_301427_309294_309453_311489_311686_320908_321094_327946_328190_331461_331534_346492_346586_346667_346806_354889_355005_355986_356210_364954_365092_379607_379750_383669_383708_393302_393417_394196_394346_424913_424996_444509_444613_471222
575865	SIRV4	+	326	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1445	632	990	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2445	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
575868	contig_5280_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_52587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	785.083262078018	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGTCTCACGTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38309	79147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38466_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42913_42989_47317_47508_56218_56282_56332_56384_62043_62065_78042
575876	contig_13894_pilon	-	2340	8	Intergenic	novelGene_62197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_6	178.893195818634	47	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	737	1675	762268	750013	FALSE	20	ATTGAGTAGCGGTGCCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766709	749347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762717_763800_763958_766578
575883	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
575924	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
575931	contig_12624_pilon	-	1791	13	Intergenic	novelGene_61038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1101.58825679108	7	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	131	550	884793	875430	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATWHLWWIKTVSLGLPLCNHRQLSLHPDPKPQRSSGLWKGRLTVCGFSLYLRHQRSSRSCQGTSSLS	888804	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_873928_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878931_882974_883083_884679_884815_888695
575960	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575962	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_94881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
575981	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_93709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
575985	contig_13760_pilon	-	2154	6	Intergenic	novelGene_61309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	245.083169556785	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	92	988	191898	168840	FALSE	15	TTTGGGGAGGGGGTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDTTLQCPTRIYTKNLPVELLMSTYLWLVHSTMIC	191989	167673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_168946_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857
575986	contig_15063_pilon	+	1018	6	Intergenic	novelGene_9107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2788.32411315471	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	245	766	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35133_36415_36600_38975_39092_39506
575988	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
576000	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
576007	contig_233_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_14690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCCTCTAGGTCAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111922	111581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_111600_111900
576042	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
576044	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
576062	contig_14322_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_116396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671878	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
576065	SIRV7	-	1478	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112259	179	112081	-174	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATGGTGGATCAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2657	1179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1200_2700
576070	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
576082	SIRV4	+	219	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1549	635	1094	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2549	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
576094	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
576107	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
576111	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
576121	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576124	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576133	contig_9720_pilon	+	1564	5	Intergenic	novelGene_116780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	516.77291918211	1813	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	419	823	391741	392457	TRUE	20	GTCAATGCCTGCATTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	388989	393993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_389044_390104_390159_391430_392089_392400_392465_393259
576135	contig_7321_pilon	-	2162	10	Intergenic	novelGene_53122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	113.034682757872	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	72	1268	208319	114374	FALSE	85	GAAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	208390	113479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_203985_204078_207655_207860_208311
576140	contig_10904_pilon	-	1491	6	Intergenic	novelGene_22746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	429.718698685547	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	255	1169	662171	652272	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSEPQTPKITQ	682225	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652301_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662409_682208
576141	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576157	contig_12654_pilon	-	2087	9	Intergenic	novelGene_129302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	583	junction_3	349.308244964244	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	905	1612	764461	759069	FALSE	10	TAGTCTTTGCTTTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	766315	758593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434
576158	contig_19342_pilon	+	1244	6	Intergenic	novelGene_41069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	28	657	3263	6183	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3235	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3882_5170_5293_5413_5522_5960_5994_6139
576180	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
576193	contig_7202_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_18326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27637	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
576194	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
576208	contig_5485_pilon	-	1741	5	Intergenic	novelGene_37689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.080902468334	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	154	1032	87935	85390	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPESVHYREEKHVFPGGFP	88088	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85445_85809_86133_86257_86366_86774_87027_87794
576220	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
576233	contig_3410_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_58901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1348	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	207	338	14968	14837	NA	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNGRAGPGFARQPRLNPCLSLNCPQLDSRAWPLEPLVFFYLTPASQEACRGRGTQDSHPASKDRASACMLRLRDSPSEQTGWGWPSSRWFCVGRGRQPLQRIQVPHLTQDP	15174	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_13700_15200
576236	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
576244	contig_13740_pilon	-	1437	9	Intergenic	novelGene_34666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4653.43295320777	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165407	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_158343_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161272_161574_161722_161919_162031_165237
576247	contig_5671_pilon	+	1217	7	Intergenic	novelGene_79437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2117.7829405615	1462	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	235	657	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368844	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369592_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
576252	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
576255	contig_19342_pilon	+	1224	7	Intergenic	novelGene_41099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.41565025531987	2	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	329	805	4349	6183	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3614	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3880_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
576258	contig_3602_pilon	-	1538	12	Intergenic	novelGene_60658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.510225395575	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	58	945	1139393	1106687	TRUE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139450	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106566_1106625_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
576274	contig_10629_pilon	-	2573	14	Intergenic	novelGene_52924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.942939750793	1	97	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	591	1367	256125	247382	TRUE	45	AATTATATATATATATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTLPIPSWSTWNFLEAGSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267838	245994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247130_247310_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254675_256066_256223_256591_256667_256939_257145_267625
576281	contig_4678_pilon	-	2152	16	Intergenic	novelGene_126051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	54.0187621726624	321	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	416	1906	577200	571931	FALSE	5	TAGCCTGCCTTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGQRWWGAGVKAGLTRVYLQRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	578072	571684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
576284	contig_16622_pilon	-	2072	16	Intergenic	novelGene_48439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	952.665117796735	112	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	308	1906	128619	108374	FALSE	15	TGACCAGTCTCTTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	132421	108207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128337_128679_132173
576297	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
576303	contig_16907_pilon	-	2542	16	Intergenic	novelGene_87473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_5	58.7898706316733	103	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	108	1967	524752	485628	FALSE	20	CTGCTTTGTGGGAGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGRSSFFRPRWLWFQFKKTPAACFSSRLLPQPSEMSAIPAEESDQLLIRPLGAGQEVGRSCIILEFKGRKIMLDCGIHPGLEGMDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVHKGSKKLEMHVYSKRLEIMLQ	524859	485052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502228_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520295_524702
576307	contig_16666_pilon	-	1263	5	Intergenic	novelGene_61737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	669.189995442251	181	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	TRUE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55544_55632_56041_56584_56664_58098_58264_59552
576308	contig_17106_pilon	-	2296	12	Intergenic	novelGene_127674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	70.2473787046608	117	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	156	1358	96892	88603	FALSE	20	AGGACTGTCCTTTATGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSLLVRCALAWSPWPATCESYARSAAPNLQEQPRRHYADKRIQVAKPVVEMDGDEMTRIIWQFIKEKLILPHVDVQLKYFDLGLPNRDQTNDQVTIDSALATQKYSVAVKCATITPDEARVEEFKLKKMWKSPNGTIRNILGGTVFREPIICKNIPRLVPGWTKPITIGRHAHGDQYKATDFVVDRAGTFKVVFTPKDGSGAKEWEVYNFPAGGVGMGMYNTDESISGFAHSCFQYAIQKKWPLYMSTKNTILKAYDGRFKDIFQEIFEKHYKTDFDKNKIWYEHRLIDDMVAQVLKSAGGFVWACKNYDGDVQSDILAQGFGSLGLMTSVLVCPDGKTIEAEAAHGTVTRHYREHQKGRPTSTNPIASIFAWTRGLEHRGKLDGNQDLIRFAQTLEKVCVQTVESGAMTKDLAGCIHGLSNVKLNEHFLNTTDFLDTIKSNLDKALGKQ	109628	87664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_88691_89398_89492_89583_89682_89863_89977_91552_91705_91873_92011_93376_93521_93604_93766_95773_95940_96841_96934_109470_109504_109547
576309	contig_9955_pilon	-	1411	4	Intergenic	novelGene_21290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_1	518.409747850739	1502	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	268	1056	49317	45240	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49897	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47737_48794_49380_49692
576322	SIRV4	+	307	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	632	1009	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
576330	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	652	974	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
576335	contig_7004_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_126472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	352	1059	186	1244	394673	395731	NA	5	CGGTTTCTTGTCACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFYGAQRQSSSDPSPIPTLLFLVLVFQSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	394487	395798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_394500_395800
576336	contig_6595_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_122559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACTTGGTATTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713432	713086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_713100_713400
576348	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
576358	contig_15304_pilon	-	2147	7	Intergenic	novelGene_30585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	205.996494037048	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	256	1245	66228	60534	TRUE	30	GTCACCTCATGACAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPASWRSASLTGSSRRPSPAMWSMRHCLKQEFRRNRCRKAPSWKFRTCVWRRTRARSWMSCGPAPLSSSLSFCSA	71729	59547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_64678_64988_65310_65396_65721_66104_66402_71647
576359	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
576400	contig_776_pilon	+	3033	10	Intergenic	novelGene_139945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	39.5137107006332	146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	20	1294	932295	1212931	FALSE	40	TCAAGTTATTATTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVETCGTGAGGTGFMAAATSKNNVTGFQRKGPRAGGTDSSGSRLVSIAGTRPSVRNGQLLVSTGLPALDQLLGGGLAVGTVLLIEEDKYNIYSPLLFKYFLAEGIISRHTLLVASAKEDPADILQELPAPFLDDNCKKEFDEDTCNHKTPEPNIEMKIAWRYQLLPKMEAGPVSSSRFGHYYDVSKRIPQELLEASKWHGFFLPEKLSLSLKVEHCSLTHGYLKLLNFIQSIIYEEGFDGSNPQKKQKNILRIGIQNLGSPLWGDDICCTENCNNSHSLTKFLYVLRGLLRTSLSACVITVPSHLIQNKAVIARVTNLSDTVVGLESFIGSEKETNPLYKDYHGLIHIRQIPRLNNLTCDVSDVKDLGFKLKRKQFTIERLHLPPDLSDTVSRSSKQDLAESAKLLGPGCGMMAGGKKHLDF	932275	1214670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_932518_953027_953064_974918_975041_1016455_1016588_1022960_1023101_1036269_1036355_1040814_1041004_1070131_1070241_1072800_1072908_1212799
576408	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
576442	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
576453	contig_7202_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_18691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29817	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
576471	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
576477	contig_9424_pilon	-	347	5	Intergenic	novelGene_143786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1699.04487874806	56	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	23	346	280461	277471	FALSE	10	TGGTCTGAGTGTAGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSSL	280483	277469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277477_278586_278762_279552_279629_280079_280144_280458
576485	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
576486	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
576499	contig_10902_pilon	-	1404	8	Intergenic	novelGene_65685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAACACTAGGTAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218579	160632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_160841_178809_178883_189007_189180_196148_196298_196626_196759_201872_202058_209424_209781_218450
576505	contig_3627_pilon	+	2462	15	Intergenic	novelGene_78549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	53.6319657956152	189	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	61	2424	681063	720753	FALSE	15	ATCCTTTTTCCTCGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVHRRVPGLLLAPVGPAASMSLPRCALWWARHPAGRQAGHRATVCSALRAHVRPLPGAVGRVPAVAAASSSASGGSKAPNTSLFVPLTVKPLGPSADGDVGAELTRPLDKNEVKKILDKFYKRKEIQKLGADYGLDARLFHQAFISFRNYILQSYSLDVDIHIVLNDICFSAAHVDDLFPFFLRHAKQIFPVLECKDDLRKISDLRIPPNWYPEARAIRRKIIFHSGPTNSGKTYHAIQKYLSAKSGVYCGPLKLLAHEIFEKSNTAGVPCDLVTGEERVTVEPDGKQAAHVACTVEMCSVTTPYEVAVIDEIQMIKDPARGWAWTRALLGLCAEEVHLCGESAAIDLVTELMYSTGEEVEVRNYNRLTPISVLDHALESLDNLRPGDCIVCFSKNDIYSVSRQIEIRGLESAVIYGSLPPGTKLAQAKKFNDPDDPCKILVATDAIGMGLNLSIRRIIFYSILKPSINEKGEKEIEPITTSQALQIAGRAGRYSSKFKEGEVTTMNREDLSLLKEILNRPVEPIQSAGLHPTAEQIEMFAYHLPETTLSNLIDIFVDFSQVDGQYFVCNMDDFKFSAELIQHIPLSLRVRYVFCTAPINKKQPFVCSSLLQFARQYSRNEPLTFAWLRRYIKWPLLPPKNIKDLMDLEAVHDVLDLYLWLSYRFMDMFPDASLIRDLQKQLDGIIQEGVHNITKLIKISETHKLLHLESMPAGSQSGLSGTLKSQSRRTRGTKTLGSKAAEPHSPEAGEKSLASRLVQQGLLTPDLLKQLEKEWLTQRTEHGKGRTESGSNSKGTRRKKKELDSD	681002	720791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_681337_698032_698111_698811_698920_700357_700473_701597_701767_703597_703710_707156_707235_708348_708441_709420_709602_710377_710472_713209_713430_714898_714980_716412_716590_719359_719509_720317
576507	contig_5988_pilon	-	1591	4	Intergenic	novelGene_16003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.7803399242762	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	968	1387	689940	689521	FALSE	25	CCTGTCTTAAATGAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	693449	689316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690523_690945_691009_691134_691358_693350
576510	contig_5758_pilon	-	1599	4	Intergenic	novelGene_119094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_3	13.8884444373331	1278	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	16	444	231423	213816	FALSE	15	TCCATGAGTACCTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSAAMAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY	231438	212660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_213895_214879_214976_220514_220696_231350
576525	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576533	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
576534	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576535	contig_18299_pilon	+	1909	5	Intergenic	novelGene_135346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	136.927900736117	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	164	475	55567	64695	FALSE	5	TTGGTTGTCTCCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWHWLPQLHGWAHSRFEFCEPSFVTGNCLEISPDCTQYDRVYCGAGVQKEHEDYMKNLLKVGGILVMPLEEKLTKITRTGPSAWETKKILAVSFAPLIQPCPSESGRSRPVQLPLLVVRSLQDLARIAIRSTIKKIIPQETASKNENGLMCGWPVFS	47738	66129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_47784_55448_55621_60635_60760_63516_63618_64662
576553	contig_7202_pilon	-	154	1	Intergenic	novelGene_17580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27780	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
576566	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
576582	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
576594	contig_9345_pilon	-	2196	21	Intergenic	novelGene_24551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	187.60956132351	1	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	566	2104	729104	723552	FALSE	20	TAAATGCTCCTGGAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730161	723459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724919_725590_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729154_729301_729427_729770
576596	contig_5799_pilon	+	2334	17	Intergenic	novelGene_50301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	248.728069070923	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	881	2098	667965	717769	FALSE	25	TATGGATATATTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	560998	718005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_650924_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
576613	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576617	contig_1225_pilon	+	2102	4	Intergenic	novelGene_44145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	2	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274828_275652
576619	contig_854_pilon	+	1216	5	Intergenic	novelGene_36223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1398.44645946851	26	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	150	443	543631	562402	TRUE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMELWARPAFSSVTPPTPSRESTSPLCECPGAGGLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543481	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_546012_557687_557752_562271_562405_563029
576624	contig_14882_pilon	-	2161	16	Intergenic	novelGene_115019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	312.67900473169	746	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	650	2077	317252	295835	FALSE	70	TTTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363670	295750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317321_320769_320816_321327_321410_321539_321739_363416
576626	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
576645	SIRV4	-	183	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTTGGTAAATAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
576654	contig_12270_pilon	+	367	2	Intergenic	novelGene_113565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13849	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
576657	contig_4103_pilon	-	1817	19	Intergenic	novelGene_51923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	528.156811263426	861	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	65	820	91854	82801	TRUE	5	TGTCTTATCTTCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGEYRVSALDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEANHTDDK	91918	77530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82821_83658_83735_84665_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
576662	contig_16098_pilon	+	2106	11	Intergenic	novelGene_45853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	1736	2104	215342	226774	FALSE	30	ACCAGAAGGAGCTTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTAWVISVPLANIFGFSLTRGIPPRTRSHSPPSLSSSSSSKRLDFLSCFFLALSSRFFSAAFLSSSVVGAFLRNLEAGAACFPSSSSESESEDVEPVSQSSSSSESSESSSSSSIFLRNLRL	202030	226776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_202182_202273_202427_204666_205033_212685_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215394_215519_215680_226248_226377_226745
576688	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
576710	contig_8710_pilon	+	2955	18	Intergenic	novelGene_73511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	62.3175260134973	110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	27	2063	347357	443681	FALSE	40	ACACCAAAATGTATGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKVQTTKRGDPHELRNIFLQYASTEVDGEHYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTTIHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKNKSGLISGLDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTLAGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNATGRLTLADIERIAPLAEGALPYNLAELQRQQSHGLGRPVWLQIAESAYRFTLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRGSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFTKRDGSIPLFAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVLRDLGLFGLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVYAHCKLLLADENGHVGGLNLLAAGALAGVPAASLVTPADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPSAFWKGTAARVFRSSPQFGVTLVTYELLQRWFYVDFGGLKPSGSEPTPKSRIADLPPANPDHIGGYRLATATFAGIENKFGLYLPKFKSPSIAVVQPKAAAATAQ	347330	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_347369_348358_348413_368559_368703_378227_378344_386208_386349_398322_398470_401126_401266_401941_402036_403627_403713_416879_416962_418229_418389_421453_421507_421746_421828_436144_436286_438049_438189_441520_441680_441813_441905_443479
576732	contig_9578_pilon	+	2407	3	Intergenic	novelGene_68012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	81.5	270	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	1324880	1326867	TRUE	35	CATAGAGTGTGAAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSNLQHHFSLSSVYSHYFPDTGIPEVTTCHSRSALTVDYIFYSADKEEAAQESGAAVGLVGGLKLLARLSLLTEQDLWTVNGLPNEHSSSDHLPLLAKFRLEL	1324878	1329320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1325043_1326715_1327065_1327426
576734	SIRV4	+	178	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	36	1102	36	-1102	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAACGAGTGTGGTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	1669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
576737	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_94391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	128	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
576745	contig_7202_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_18184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
576766	contig_5300_pilon	+	2870	1	Intergenic	novelGene_144234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	8	313	8601	8906	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEMFIRTLKNSNIFLGIQKAICMSKIQEEVTLVDSVYRNQSYPNTKARQRDHNKRKLQSNIPYECRSKNPQKILVNIIQQHIKRITQHDQVEFIPGTQVWFNI	8593	11463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_+_8600_11500
576778	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
576787	contig_16666_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_61755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	669.189995442251	225	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	TRUE	10	TCATACCTTGTCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55202_55342_56041_56584_56664_58098_58264_59552
576809	contig_8978_pilon	-	1379	7	Intergenic	novelGene_49336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	853.314859826079	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	52	993	194082	190856	FALSE	25	TAAGAATGTCTGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRLGVACLRDWRRVCSQTTVNDSATSVKFSQKGEP	194133	190469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
576820	contig_9233_pilon	+	2103	5	Intergenic	novelGene_78238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6087792521477	617	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	121	429	582395	676460	TRUE	0	TTCTTGTGGTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582274	679051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346_676901_677817
576824	contig_15063_pilon	+	1398	6	Intergenic	novelGene_9437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3554.36664400284	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1158	241	1398	34808	39022	FALSE	15	ATGGCCTCCACCTTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWA	27128	39022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975
576825	contig_3077_pilon	+	1643	9	Intergenic	novelGene_26731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_2	3254.25158206538	2	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	467	1150	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10122	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11565_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
576853	SIRV4	+	181	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1590	632	1135	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
576856	contig_4364_pilon	+	2235	7	Intergenic	novelGene_63	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	15.7550697307953	398	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	87	665	703017	707465	FALSE	20	TATTAGTGTGATTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFAPRGCRSIGCGPAAGSLSPPSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPESPRDVSQSSDSDPDAGGHS	701273	709035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_701336_702992_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347
576861	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_93698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
576868	contig_8616_pilon	+	2529	18	Intergenic	novelGene_72534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	238.723841843164	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	213	1493	400633	406383	TRUE	15	GGTTGAACCTGATTGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLADSNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLAEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGAARGTTRQPGQAAG	400420	408256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_400661_401368_401437_401778_401873_403509_403628_403740_403805_403990_404109_404419_404523_404702_404803_404971_405161_405259_405335_405458_405518_405693_405792_405913_406054_406356_406521_406653_406744_407135_407255_407360_407510_407715
576887	contig_9656_pilon	-	1109	8	Intergenic	novelGene_121892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.698466034141	3	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	260	1069	97308	79853	FALSE	10	TTCCCTGCCAGCTGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNFSQIPWTLSLSG	101196	79812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_79894_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_101023
576906	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
576913	SIRV4	+	483	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	24	443	24	-443	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGCCATTCCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	2328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
576944	contig_5832_pilon	-	3334	13	Intergenic	novelGene_134153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	382	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCGGCAGCACCACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449443	422369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_422559_424490_424556_426512_426619_434493_434620_436682_436823_437056_437130_437856_437966_440844_440946_441236_441341_443495_443790_445143_445298_446709_446873_447733
576976	contig_7202_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_18829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCGCTGCTGGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29895	30110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
576977	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
577001	SIRV3	+	200	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4610	2185	2551	36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTCTTTTCAAGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6554	6754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6600_6800
577011	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577021	contig_10793_pilon	+	1945	11	Intergenic	novelGene_83393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3882.0082380129	2	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	131	865	146975	163295	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEGK	130871	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163311_163944_164090_165325_165377_166401
577028	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	632	1085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
577031	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
577032	contig_6163_pilon	+	1891	15	Intergenic	novelGene_103849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_9	52.544490380893	608	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	89	1738	498959	507858	FALSE	30	TTTAGAAGGCATCTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRPKLKKASKRMTCHKRYKIQKKVREHHRKLRKEAKKRGRKKPRKDPGVPNSAPFKEALLREAELRKQRLEELKQQQKLDRQKEQEKKRKLETNPGVEPSSGEAVKEEFEQGKAKNKAKSGKQNPKKLYCEELKKVIEASDVVLEVLDARDPLGCRCPQVEEAIVKGGQKRLVLVLNKSDLVPKENLESWLNYLEKELPTVVFRASTNWKDKGKLIKVKKKAAPFKSEVCFGKDGLMKLLRGFQETCGKAICVGVIGFPNVGKSSIINSLKQERTCSVGVSMGLTRNMQVVPLDKQITIIDSPSIIVSPLNSATALAMRSPASIEVVKPVEAASAILSQADARQVVLKFTVPEYKNPLEFFTSLAQRRGLHQKGGSPNVEGAAKLLWSEWTGATLGYYCQPPTSWTCSSHFNESVVADMKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADEKSSDMSPVEETWQALPEESQAGEQFGSQEARSFVLDKTTKEEDDAYDFSTDYV	498870	508011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_498972_499595_499655_500280_500419_500538_500653_500876_500961_501720_501854_502645_502759_502986_503105_503528_503617_504844_505020_506718_506862_506943_507081_507166_507337_507598_507666_507760
577034	contig_8452_pilon	+	1563	3	Intergenic	novelGene_48045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	350	1063	433300	434013	FALSE	20	CTTTGAGTATGTCTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423988	434513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_433073_433136
577040	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
577047	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
577062	scaffold_6394_pilon	+	1112	8	Intergenic	novelGene_110987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1013.95449320259	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	437	955	405059	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398174	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402889_403255_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
577082	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
577094	contig_5403_pilon	-	2046	18	Intergenic	novelGene_87976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	79.4294969309196	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	45	1883	458189	428446	TRUE	45	GGAGGAAAACTTACCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKASDPAGKMGGKEKPVGAGEEKRKEGGKKKNKEGSGDGGRTELNPWPEYINIRLEMYNKLKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYHIACGISQGLADNTVIAKVNKVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFTSLETLCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLEMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKTLKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNTLIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIYNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKW	458233	425185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_425305_428401_428450_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434718_435798_435946_436744_436824_436907_436973_438891_439010_439918_440041_441204_441329_449848_450040_453795_453877_458132
577102	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577104	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
577117	SIRV5	+	323	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	7	875	7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
577124	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
577136	contig_12270_pilon	-	320	2	Intergenic	novelGene_114085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	23	319	14409	13890	FALSE	25	AGGCTGAAGATGCCGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSF	14431	13888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
577146	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_3463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533039	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
577147	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_18876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
577158	contig_4931_pilon	+	2406	3	Intergenic	novelGene_138343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	79.5	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	102	1178	212295	229068	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSVSWFTKVNENSVLSIKKNRGLERLSGLKLPVAIKLILIHDNSICV	123202	230296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123286_212276_212521_228217
577161	contig_6589_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_26011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1273	1725	1726632	1727084	NA	30	CAACAGGGACCCCGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLVSGPPLALPGASSP	1725359	1727454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725400_1727500
577174	contig_14225_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_52762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAACACAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474606	476188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_474600_476200
577223	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
577231	contig_2214_pilon	-	3238	14	Intergenic	novelGene_144244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	48	junction_3	27.4887820045682	208	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	162	1526	268492	231326	FALSE	45	GGATGAAAAACAGATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTYIVEEGVGQYLANIDLQGKAFVSGLLIGQCSSQKDYVILATRTPPKEEQNESLKHPKDKMDNLDEEWVTEHANQVSRMLPGGLLVLGVFIITTLELANDFQNALRRLVFAVEKSMNKKKLWSFTEEEVSERVTLHICSSTKKIFCRTYDIRDPKSSARPADWKYQNGLSTSWLSLECTVHINIHIPLSTTAVSYALEKNTKNGLTRWAKQIENGVFLINGQVKDEDCDLLQGQKKSSRGNPQVTYQSFDVRVLTQLLLSSDHRSTATVQICSGSVNLKGAVKCRAYIHNSKPKVKDAVQAIKRDILNTVADRCEILFEDLLLNEIPEKKDSEKELHILPHRVFVPISGSTVMLCDYKFGDEAAEEIRDHFIEMLDQMIQIEDLEIAEEINTACMSSSMDSEASLDFTDDEQAKQPLKTTIVLKIQQNIGVITAFAVAVLAAGISFHYFSD	277157	229613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_231394_232734_232846_243949_244136_249120_249212_250377_250507_254150_254220_255796_255893_256703_256845_257771_257809_259060_259168_261250_261347_265712_265848_268393_268515_277018
577236	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33226	0	7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
577249	contig_11898_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_144297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAATAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253450	253196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_253200_253400
577257	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577267	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577269	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577270	contig_7202_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_17704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGTTGGTCACGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
577282	contig_9594_pilon	+	1727	11	Intergenic	novelGene_73943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	466.393664193672	5	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	724	1299	319403	322451	FALSE	10	ACTGGGATTTTTTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301225	322879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316255_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
577283	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
577285	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
577296	contig_1008_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_121582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAATCTTTATGGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684613	685513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_684600_685500
577324	contig_12528_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_81346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTTCCCACCAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968117	965457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_965500_968100
577327	SIRV7	-	350	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
577329	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577333	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_17626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
577337	SIRV4	+	333	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	444	173	-444	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATTGCCATTCCAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
577342	contig_7412_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_76273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2101	2454	243387	243034	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISKSLYSRLNNDLGCLVSSKTCQNNVFYNQCSFCKRNVVVRGLSGIGQYSGFQQTIRVTLRALKKTWISSPPLQKLRDGGYGGRFGGLCIYTVLTLLTGSSAPVCHIFLLQSGRWV	245487	242999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_243000_245500
577355	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577356	contig_7202_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_17752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
577357	contig_1443_pilon	-	2140	8	Intergenic	novelGene_28269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_7	236.611107783491	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	155	1078	776427	748649	FALSE	40	AGAATGAAATATTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809519	747586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_809399
577359	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
577393	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
577407	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577412	contig_14925_pilon	-	1249	4	Intergenic	novelGene_55350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	885.050281057523	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	84	506	116065	112852	FALSE	10	CTGCATTGTGTGCACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHESSVLFLLTFFDSRSTKWNEQVPQSILHEENKPWEEESTCPFT	129484	112108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112981_115157_115208_115821_116101_129436
577421	contig_1331_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_37874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCAGGTATGGTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341937	339402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_339400_341900
577422	contig_5988_pilon	-	1612	4	Intergenic	novelGene_15920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	6	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	83	1438	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655541	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
577435	contig_5968_pilon	-	1251	8	Intergenic	novelGene_112190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_7	235.192322518038	2546	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	27	1085	732362	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732388	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
577436	contig_12000_pilon	+	2434	9	Intergenic	novelGene_43168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	580.017672144565	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	121	972	417072	584749	TRUE	70	TCTAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTFQGWGRLGSGSRRVFPFCPRTLLAIAHVLGCCRLVQTMSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416951	588449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_584748_585374_587611
577451	contig_9177_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_32773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365526	1363207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1363200_1365500
577459	contig_15063_pilon	+	1357	4	Intergenic	novelGene_14239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	43	1215	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34765	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
577465	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
577472	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577497	contig_3382_pilon	-	1500	3	Intergenic	novelGene_124200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_2	21.5	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	552	944	1382427	1379406	FALSE	60	TATTAAAGAAAAATCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYTKPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLDSYFEELLKSLYPERRFPTAEFGDEPEDNLSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLR	1382978	1378849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1379613_1380458_1380609_1382391
577517	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_16452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27812	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
577524	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577525	contig_17796_pilon	+	1985	12	Intergenic	novelGene_33762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_4	210.864180171358	17	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	387	1709	12080	42369	FALSE	50	AACTCTATGTAACAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8152	42645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
577528	SIRV4	+	336	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	632	980	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
577531	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577551	contig_16492_pilon	+	2112	10	Intergenic	novelGene_100276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	96.2877631546882	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	636	1358	86032	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76802	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78830_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
577553	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577591	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
577595	contig_11285_pilon	+	1668	11	Intergenic	novelGene_5616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	479.497455676253	5	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1656	12	1667	766060	770193	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHHLSPTKFSLTPFALSPFPHRRWGFHLRPSHWKGGTCGKSHIKSCHPLLQFLWTLWPGALPIHRCACACVCVCSNKVCTL	766048	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769956
577603	contig_3602_pilon	+	2078	7	Intergenic	novelGene_60484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	148	597	161745	169451	TRUE	10	TGACTTGGCTCCACCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161597	171129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170691_170887
577604	contig_15304_pilon	-	1237	2	Intergenic	novelGene_30484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	198	728	54100	53391	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
577609	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
577616	contig_205_pilon	+	2908	5	Intergenic	novelGene_144310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	222.982062058812	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	266	2098	292858	296995	FALSE	60	ATAGTAAAACACACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDSNDKGSGDQSAAQRRSQMDRLDREEAFYQFVNNLSEEDYRLMRDNNLLGTPGESTEEELLRRLQQIKEGPPPQNSDENRGGGSSDDVSNGDSIIDWLNSVRQTGNTTRSGQRGNQSWRAVSRTNPNSGDFRFSLEINVNRNNGSQNPENENEPSARRSSGENTENNSQGQVENPRSESTSARPSRLERNSTEALTGEAPPTRGQRRARSRSPDHRRTRARAERSRSPLHPMSEISRRSHHSISSQTFEHPLVNETEGSSRTRHHVTLRQQITGPELLSRGLFAASGTRNASQGAGSSDATGNTESTGSGQRPPTIVLDLQVRRVRPGEYRQRDSIASRTRSRSQTPNNTVTYESERGGFRRTFSRSERAGVRTYVSTIRIPIRRILNTGLSETTSVAIQTMLRQIMTGFGELSYFMYSDSDSEPSGSVPSRNMERSELRNGRGSSAGNSSSGSSSSSSSSPSSSSSGESSESSSEMFESSNEGSSSSGARREGRHRAPVTFDESGSLPFLSLAQFFLLNEEDDDQPRGLTKEQIDNLAMRSFGENDALKTCSVCITEYTEGNKLRKLPCSHEYHVHCIDRWLSENSTCPICRRAVLASGNRESVV	273759	297805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_273937_275870_275935_292833_293027_293874_293959_295415
577625	contig_8616_pilon	+	2128	21	Intergenic	novelGene_72419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183.238717251568	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	634	1848	245168	251655	FALSE	10	TGTATTTGTGCCCTGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTMLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTSTLLCFSVSGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASPEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNDWDYTRSAQVFTQLKAEGKIPEVAFMK	239618	251935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243880_244040_244576_244661_244837_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245973_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
577631	contig_8177_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_86506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	5	334	63978	63649	NA	25	TGCTTTTACTTGAACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMCLGAELVLVNELGIYPDTLQVCPSTVFLERSFMFIIILGSMCMQVHVYVWGGRKQRQQAKAEDTASTQGFTGFAKHLLRGSDGWYECEEIYLLIIQQVIEVKNRMKCA	63982	61094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_61100_64000
577646	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_17609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
577657	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577662	SIRV5	+	309	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	21	875	21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8336	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
577663	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGGACTCGGAGGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
577673	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
577676	SIRV7	-	354	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
577680	contig_8538_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_5058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842830	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
577694	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
577698	SIRV2	-	635	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4145	16	2966	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
577713	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
577722	contig_11816_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_98531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAAAACCGTAACCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026465	1027743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1026500_1027700
577723	contig_11816_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_98532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTCAAGTACCAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027694	1028795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1027700_1028800
577724	contig_11816_pilon	+	1672	1	Intergenic	novelGene_98533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028846	1030518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1028800_1030500
577746	contig_15886_pilon	+	3761	13	Intergenic	novelGene_144333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_6	95.453740977851	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	387	1835	39186	57304	FALSE	20	TTGAATTTTCTTTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEQVKVLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHHIASVEKLALTTSGCPLVIQCKNFRIVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANREYKICETYPRELYVPQIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQNKEAAICRCSQPLAGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVSGTKGLSVSDFYSGVESSGWLRHIKAIMDAAIFLARAIMVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGHLDGDPKEISPVFIQFLECVWHLTEQFPQAFEFNEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLNDQEKYLNPLYSSKSQRLTVLEPSTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNMNEQNKQLEKEVKDLESKIKQRKNKETDGVPTKELLHSVHPESPSLKTSLCFKELPVNDALRTIEGSNSADNRYSDYAEAFSKSEPAVVSLEYGVARMTC	31593	59230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_31713_37261_37425_39081_39240_39413_39543_42099_42235_47133_47267_48006_48117_49435_49562_51964_52015_52461_52663_54529_54662_54741_54869_57052
577754	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
577756	contig_1443_pilon	+	1897	4	Intergenic	novelGene_28334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	500	823	776387	804740	TRUE	30	GTTCTACGTGAAGAAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGSVLLVTLLAMVSDKVRHTAEKHHPGRVCICSEGPPGSRSSWLLLLQAGHPCCCSLWFVRGSVQEKQDGVLRETGGRWLFGKMPSPSKVLSSTTHILLQHSLKI	775887	809448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_776462_804491_805720_808696_808740_809396
577757	contig_11720_pilon	+	1621	13	Intergenic	novelGene_43984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	351.027657979634	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	159	1367	265261	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262302	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_264378_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
577760	contig_14322_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_116584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGCCACAGCAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
577776	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
577779	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	8	1115	8	-1115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGACGAGCCACCGTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
577783	contig_9852_pilon	+	2080	6	Intergenic	novelGene_138455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	376.445799551542	63	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1022	1363	31690	35457	FALSE	50	AAAATATTAATTATGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIAKRYSTNGKITFDDYIACCVKLRALTDSFRRRDTGQQGVVNFPYDDFIQCVMSV	21337	36174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_30839_31832_32069_32184_33374_33434_35430
577789	contig_14711_pilon	+	1894	11	Intergenic	novelGene_68897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	382.62676330858	5	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	50	1654	82000	90570	FALSE	20	AGACCTCAGTTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALLTVLGFLLALSRGERELDTKIPSPGGGHGMGGILTCLYWGPASQLPPVESASSHTPADYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70417	90810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82183_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
577800	contig_6175_pilon	+	2104	9	Intergenic	novelGene_16303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	230.71407493909	1043	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	65	1066	1466806	1522014	FALSE	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYKMAKYYVSREFTEEKKCNVCLRITLASPNQRRAQDLPPRKEQNLRSGQEDY	1444488	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1444540_1466792_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490027_1521856
577811	SIRV4	+	274	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1485	644	1030	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
577829	contig_14322_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_116433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671368	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
577831	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
577837	scaffold_6394_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_110979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	111	440	385289	384960	NA	20	GGCAGGCAGTGGGCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGHRVPSIFGSVGPGSALHVGTAPFQAQVLVPAPPTMVQVASGWDHPGDSSYIELQGTTRSPGAHLSATTQAPGPLTLTVPCPPRNRPAGEWAGCPGRSRLAGTRRSGTRHPSSPVSRARAGHLFLLECCPLGPGRNLAESMVSG	385399	383455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_383500_385400
577866	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_94282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
577870	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
577880	contig_7744_pilon	+	1723	13	Intergenic	novelGene_62526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_9	97.8324460493552	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	122	1333	825487	830740	FALSE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825365	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
577889	contig_5260_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_144415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511058	508281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_508300_511100
577898	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91628	4	-91622	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAAACTAGTAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
577907	contig_12250_pilon	+	2315	5	Intergenic	novelGene_80610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	52.8417448614256	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	495	1751	350196	354405	FALSE	10	TCCTGTAGTTGGAGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPSLWSCTTSLPQSGVGSSIRCTASSSLSSPSC	349269	354969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_351968_352256_352443_354304
577917	contig_5482_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_144461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATCAACTCCCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321385	321782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_321400_321800
577929	SIRV4	+	473	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	36	441	36	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
577938	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
577943	contig_11285_pilon	+	2139	5	Intergenic	novelGene_5647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_4	495.147452785531	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	976	1386	768710	769349	TRUE	15	CTTCAACTGTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHVSAHLPDPG	767461	770190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_767836_768024_768527_768610_768857_769085_769653_769740
577965	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
577990	contig_2646_pilon	-	1810	10	Intergenic	novelGene_69667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	354.675751763338	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	592	1347	2175082	2172056	FALSE	20	TCTGTAGAGTGGAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC	2181033	2171592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175166_2176971_2177024_2178876_2178992_2180692
577995	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
577999	SIRV4	+	312	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1459	632	1004	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2459	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
578011	SIRV4	+	333	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	632	983	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
578015	contig_6589_pilon	+	1358	6	Intergenic	novelGene_25770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2070.18153793333	125	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	777	1268	669670	672754	FALSE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668289	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669121_669421_669458_669748_670000_670104_671046_671188_672584
578016	contig_11259_pilon	-	2125	10	Intergenic	novelGene_144523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	167.17241783246	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	25	528	159043	143744	TRUE	15	AATTTTTTTTTTTGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLKSCNWSKSSGSYP	159067	127885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_128399_131174_131914_133312_133442_139870_139990_143646_143786_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_159031
578018	contig_10235_pilon	-	1512	8	Intergenic	novelGene_46280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	400.217236928514	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	785	1333	17621	14151	FALSE	55	AACTAAAAATGAAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	23776	13971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17798_19381_19752_20850_21035_23722
578019	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_18699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCTACGTCTACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
578033	contig_5419_pilon	+	2519	8	Intergenic	novelGene_15472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	887	1204	69530	69847	TRUE	5	GCGCCCCACTGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQENKYFSSIQLGKYSPLNPLHLRGTHWSKMLHYSTNRKESCRCSQHNSLIVARTCKHTRGGWGCTQQWIFTEQDKPKGYTAETQGTGLSPYVPLSKFLICKH	68643	79718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_70369_70693_70797_72459_72644_72723_72830_73651_73739_74410_74512_74669_74771_79606
578034	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
578044	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
578054	contig_3602_pilon	+	2264	5	Intergenic	novelGene_60490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1011.15561982318	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	244	585	168543	169451	FALSE	10	GACTTGGCTCCACCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161604	171130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161774_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422
578055	contig_14322_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_116238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
578060	contig_17737_pilon	-	1848	7	Intergenic	novelGene_72911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	122.465868260871	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	114	971	94041	53442	FALSE	45	AAAAATCATGTTTAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAPRRSALGPLPSSLPSPAPAPGTCWVCSCFGEKEKMGKLIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYAHKLELMRILTRVNWKVATEFESYSPDSTFHAKKQIPCIVSMLTKELYFNQ	94154	52564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_53672_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_94032
578062	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
578066	SIRV7	-	280	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69006	0	35787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78951	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
578083	contig_11258_pilon	+	3123	14	Intergenic	novelGene_67756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_13	35.2176663575064	165	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	276	1481	70004	95823	TRUE	35	TACTAAATATGCAGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARVEYIVPWWVVWLHSVPHLGLRLQPVNSTFNPRDESYQESLLFLGLVAAVGLALNLIFLAVYLVCLCCCRRDDGVQTKQRNSCCVTWTAMLAGLVCCAAVGVGFYGNSETNDGVYQLIYSLDNANHTFSGIDSLVSGTTQKMQLDLEQHLARLSEIFAARGDYIQTLKLMQQMAGNIMGQLSGLPAWRDVTAELTKVADQTGYVEYYRWLSYLLLFVLDVVICLTACLGLAKHSKCLLASMLCCGVLTLLLSWASLAVDTAAAVGTSDFCVAPDAFILNVTQGRISTEVTRYYLYCSQSVSSPFQQVLTVFQRSLTTMQIQAAGLLQFAVPLFPTAEKDLLGIQLLLNSSEASLHQLTALLDCRGLHKDYLDALTGVCYDGIEGLLYLGLFSLLAALAFSTMICVGPRAWKHFATRDRDYDDIDDDDPFNPQARRIAAHNPPRGAASQLLQLQQRPGQPDQPAAPGPDHLQRPSLRVHEPSGTLRWEPPL	58479	102211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_58605_69853_70027_74243_74356_80362_80584_85695_85792_86388_86462_91419_91490_91737_91794_92498_92592_92790_92884_94256_94400_95062_95250_95784_95864_100609
578108	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578111	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
578119	SIRV4	-	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGATTGCCACAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	2424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
578124	contig_5671_pilon	-	1031	7	Intergenic	novelGene_79412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	351	893	531368	370440	TRUE	15	TGCGCTCACCACCCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFKKHYKNFEKIVMTGYIGTEHLYRMEHLSADLRKLGAKILLRLRVHSLDSLPQKAFHKPHCQDPQAYLEEFLPVRLLLHSCPSDPSCQSQWRPQWCLLLLLSFVLLLSHLSPPPLQHLSPVLWSSQPLLSHHEPRLPWFWNLHREHPLLSFLLLLPRPVWFFQQQPRLPPWPLKVLS	531798	368796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_-_368898_370402_370548_376735_376778_392772_392917_521216_521301_531203_531369_531448
578125	contig_8729_pilon	-	1640	5	Intergenic	novelGene_40153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_3	150.47653471555	1546	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	214	966	770511	765591	FALSE	20	GTTTATGTTTCTAGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFTPTNQIRLTNVAVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770724	764916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438_769569_770383
578147	SIRV4	+	335	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	639	974	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTCTTCTTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
578181	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
578182	contig_14441_pilon	+	1445	7	Intergenic	novelGene_100373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	443.955484505172	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	428	997	27079	126062	TRUE	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDFQLNAPKTRPVAWRSSPWSPGTQPCISVPAVKPQCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	25842	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_25950_26652_26781_26886_27189_121188_121239_125517_125902_126036_126283_126514
578204	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
578207	contig_5063_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_110000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	331	471	35566	57319	FALSE	20	TATAATTTCTCTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9463	57619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
578223	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
578231	contig_2455_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_119198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799446	800129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_799400_800100
578234	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_17658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
578235	contig_15304_pilon	-	1293	5	Intergenic	novelGene_30418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	1538.77857406451	8	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	198	1157	54100	49864	TRUE	25	ACTTTCTCAGAGACCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54297	49403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991
578254	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
578261	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	886	-17	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
578265	contig_9727_pilon	+	1064	6	Intergenic	novelGene_86311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	160.403989975312	6379	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	44	595	309192	314189	FALSE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308422	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078
578266	contig_2365_pilon	+	2034	12	Intergenic	novelGene_103742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	367.659247556823	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	108	1868	179760	319997	FALSE	20	AATTGGCACTTGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRELASVETNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEGMQPLMYSVQEALNARPWWIRVGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVSFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICQFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCAGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESNCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYETSAQEELLSDSELSRTYLP	179652	320163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_179788_193762_193972_195604_195783_248941_249030_254096_254242_256889_257044_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_319819
578270	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_10889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
578271	SIRV5	+	308	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	19	878	19	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8334	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
578286	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578294	contig_14666_pilon	-	1579	6	Intergenic	novelGene_39531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_5	786.922003758949	2867	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	109	1023	458977	449808	FALSE	15	TCACTAATCTGCTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCGAQRRVLLLLLVLLAGAARAGLYFRPGHSCYHARRGDPLAAQGRRTYPRPHEYLSPSDLPQSWDWRNVKGVNYASITRNQHIPQYCGSCWAHGSTSAMADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	459085	449251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_458831
578320	contig_12644_pilon	+	2246	3	Intergenic	novelGene_44699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	68.5	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTGGGGTCTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2681901	2685554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2682052_2683290_2683381_2683548
578330	contig_6742_pilon	+	2280	7	Intergenic	novelGene_144550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	12.2304265393049	159	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	131	1474	25724	47227	FALSE	20	TCTCATTTGTGTCTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAVPRVECPCESSAKTCFSPENLERHSIPEALRLKWKNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEQWRHLDSTQKEYYWDLMLEAYGKMVSGDISSPKSDLANSAEHGQELARLHLDAGENIPMPTCTGDRQENDKEKVNLEHYRDQEPPNVSCDISGEAPSQAPVSGFFTGDEPRHFGEVAQGNLQVEGRGEQHSPQERSSGKQPGQHVLNPHPGDLSVLWLKEKPEAPPERSAETSHDPEAPYLHRVWENLLQEFSACVSPENSHWREVFSVPHLQKKPFCGVQTL	18173	48033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_18199_25618_26114_26786_26974_27402_27495_41061_41147_41800_41909_46745
578332	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_116351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671894	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
578348	SIRV6	+	237	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9642	558	492	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
578349	contig_8772_pilon	+	1343	9	Intergenic	novelGene_21106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5385.12502176133	7	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	656	1027	20497	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHRALARLSSQSQSAPSQPPSPLPPSAAILYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15266	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15357_15506_15667_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
578354	contig_9389_pilon	-	1886	9	Intergenic	novelGene_83877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	519.010702563059	2769	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	542	1015	38910	36552	FALSE	0	CCTCGGGCTGGGCGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGRARHGGGDLAAARTGGQQPPMRSCRRPGLHPTRVLPAHQPAPPSHPQAEPNPHGDAGDLGRAAAEVLLGVPPGRLHSHAGQQLREAPASRRLPVHGPHLSQCRPGGQTADESQQSTPGLPAAGAAPVCLPGAAQLMAASWSPAWRRDLQYHLLK	45863	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38692_38850_38975_39409_39535_40050_40206_45142_45230_45753
578368	contig_15410_pilon	+	1012	5	Intergenic	novelGene_130621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	302.224254486631	47	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	117	584	145617	148093	FALSE	50	TATGAAAATAAATTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145500	148521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
578382	contig_4125_pilon	+	1628	7	Intergenic	novelGene_25199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	208.611614143498	1595	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	127	717	1510873	1518074	FALSE	5	CCTGTGTTAGTCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505592	1518985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984
578403	contig_854_pilon	+	1766	2	Intergenic	novelGene_36373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGGGCTGGGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974697	977693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976141_977370
578424	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
578428	contig_12427_pilon	+	2041	15	Intergenic	novelGene_40489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	239.541963006101	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	249	1736	399297	419950	FALSE	25	CTGAAATTTGTCTATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPHPHQDPLSHKPDIWPASRQPQWPWTEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397692	420255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_407751_407796_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
578435	contig_6735_pilon	-	1118	10	Intergenic	novelGene_15725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.835290761347	717	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	86	775	564868	542327	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTQFH	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542338_545886_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
578436	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
578445	contig_10197_pilon	+	3466	1	Intergenic	novelGene_115256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1376	1720	1050105	1050449	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQYEPQRFTPFLFSSAKSCILGTEQVSVSSLGPGEEAREDQASRTPCQQEGITLQSLPRHAYCVPLTTALLRSSGSSGAATQAGRASRSNVTTQWSAREALKFAGSGFKSQL	1048729	1052195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1048700_1052200
578452	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
578454	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
578471	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
578474	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	6	2969	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
578477	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
578480	contig_12414_pilon	+	2165	16	Intergenic	novelGene_59614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	88.4180976949855	18	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	82	768	527729	591484	TRUE	15	ATTATACTTTGTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527647	607452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
578488	contig_12977_pilon	+	1506	14	Intergenic	novelGene_122779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	702.899800951398	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	213	1109	10909	57283	TRUE	0	TCTCCTTGGCCCTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10696	58798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
578492	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
578509	contig_10246_pilon	+	1401	8	Intergenic	novelGene_46903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	198.995231201193	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	69	1181	144696	176585	FALSE	20	ATATTTTATTATTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQVGTPGVRSGVVKVHVRKVCAFLRASLCKPFLDRKTVCVHIQAGFYSRVLGPCHCAYATFLILRRAYYTTPWV	140731	176805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294
578510	contig_8452_pilon	-	2042	17	Intergenic	novelGene_47977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.311786628448	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1914	128	2041	145829	74489	FALSE	25	AAATGTCTTCCTTGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVQLHYSHGIGCFNYVPLSLSIYKFVILINIV	145956	74487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_74577_78943_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
578513	contig_14513_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_70238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	187	621	18880	11833	FALSE	10	TGCTTTTGTCCATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12151_18763
578519	contig_10058_pilon	+	1722	9	Intergenic	novelGene_67699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	138.539649108116	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	418	795	52117	52990	FALSE	10	GCCACAGTTGTTTCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVRPQPST	50272	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_50306_50698_50738_50884_51001_51315_51418_51739_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837
578520	SIRV5	+	238	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	279	151	165	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8480	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
578526	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_96655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
578539	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
578553	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
578559	SIRV5	-	380	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCACTTTCAGTAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
578584	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_98153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
578590	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
578601	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91669	0	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
578605	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
578607	SIRV5	+	488	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	64	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
578622	SIRV5	+	259	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	258	151	144	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8459	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
578630	contig_7963_pilon	-	3029	1	Intergenic	novelGene_58611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGGACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299107	296078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_296100_299100
578635	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
578649	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578654	contig_13718_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_142911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	531	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269442	267818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_267800_269400
578660	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578666	SIRV4	+	311	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	204	435	204	-435	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCAATTGCTCGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	2336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
578678	contig_15063_pilon	+	1402	6	Intergenic	novelGene_9064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	3596.95567946006	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	243	1091	34808	36494	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	27126	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36330_36486
578707	contig_5481_pilon	-	2912	6	Intergenic	novelGene_144560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_2	27.8596482389854	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	302	1729	70084	49411	FALSE	35	TTCATTTCACGTAGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEIAQGSVMFSDVSVDFSQEEWECLDSSQRDLYRDVMLENYSNLVSMGLHIPKPQVISLLEQGKEPWMVGKELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIESCQREIMGLTRQSLEYSNFRDILVYRIDFERQLGYFSQEILTHECMPTFIQHTFLTLHQIINNEEKPYECKKCGRAFSQSSQFIQHQRVHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFVCKECGKAFSCNSYLLQHQRIHTGKKPYECKECGKTFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYKCKVCGKAFTKSSQLFQHVRIHTGEKPYACKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLHQHQRIHAGEKPFECLQCGKAFTQNSQLFQHQRVHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKTFSSGSDLVRHQGIHTDG	81431	48227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_50595_58314_58411_58716_58844_70063_70295_79983_80053_81409
578712	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	632	1123	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
578718	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
578746	contig_16122_pilon	+	2429	22	Intergenic	novelGene_134521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	46.4476883719959	159	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	357	1787	142082	159039	TRUE	15	TGTAGTATGTTTGTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDVDLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGSFPNCYGIGRCAKMSHELWRKLEEEEDGETKGRRPEIGHVFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGLVDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDRSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGFLSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLHIGACESIMKKKTKQDFQELIKTEHALLEGFNIRESTGYIEEHIDRQVSLIESLRLMCLLSITENGLIPKDYRSLKTQYLQSYGPEHLLTFSNLRRAGLLTEQAPGDTLTAVESKVSKLVTDKAADPTCGWRV	141725	160286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154264_154339_154658_154746_154915_155007_155255_155331_155590_155656_155789_155845_157040_157088_157684_157818_159013_159116_159311_159388_159494_159612_159913
578748	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578755	contig_11171_pilon	+	1378	7	Intergenic	novelGene_48597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	589.074886769265	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	87	896	212165	251467	FALSE	15	GTGCAGATGGCTCCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKAASAMNTETNVALFTRLHVGNGKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212078	251949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_237729_237796_239236_239336_249980_250068_251407
578762	SIRV5	+	306	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	24	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8339	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
578770	contig_3975_pilon	-	2085	14	Intergenic	novelGene_54786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_13	243.420983376391	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	37	1485	2052412	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052448	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
578771	contig_9345_pilon	-	1866	6	Intergenic	novelGene_24622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	211	792	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001285	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
578774	contig_14322_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_116485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCTCACTCCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671888	671376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
578782	contig_14513_pilon	-	1130	5	Intergenic	novelGene_70333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	150	578	18880	11841	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAILDFLSGFGLFQFPCVFFLSCYY	19029	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11910_12038_12158_13087_13136_14952_15001_18735
578786	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578790	contig_3386_pilon	-	1758	7	Intergenic	novelGene_34534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	623.759680396937	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	526	1152	406716	404773	FALSE	30	TTATAAATTGTTGTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412207	404166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407784_409398_409607_412096
578808	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
578809	contig_13457_pilon	+	2009	11	Intergenic	novelGene_118341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_8	58.3737098358499	102	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	172	915	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59239	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761
578833	contig_14322_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_116120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671661	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
578849	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
578863	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
578875	contig_3077_pilon	+	1561	9	Intergenic	novelGene_26676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	388	1071	13867	17590	FALSE	20	TAACAGTGTGCGGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9631	18080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9721_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
578885	contig_14173_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_144573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTCCGAATCCACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14173_pilon_+_2800_4100
578918	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
578919	contig_7066_pilon	-	2363	18	Intergenic	novelGene_42208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	96.2035040258473	320	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	144	1937	1128537	1078816	FALSE	5	CTGTCTTGTACCCTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARDAAAASAGSSASSGNPPPQEPGLGELLEEFSRTQYRAKDGSGMGGTKVERIEKRCLELFGRDYCYSVIQNVNGEICGHYPRHIVFLEYESSEKEKDTFESTVQVSKLQDLINRSKMARCRGRFVCPVILFKGKHICRSATLAGWGELYGRTGYNYIFSGGADDAWADAEDVTEEDCALRSADTHLFDKVRGHDIKLLRYLSVKYICDLMVENKKVKFGMNVTSSEKVDKAQRYADFTLLSIPYPGCEFFKEYKDRDYMAEGLIFNWKQDYVDAPLSIPDSLKRSLNIDWSQYQSWDLVQQTQNYLKLLLSIVNGDDDSGLLVHCISGWDRTPLFISLLRLSLWADGLIHTSLKPAEILYLTVAYDWFLFGHMLVDRLSKGEEIFFFCFNFLKHITSEEFCALKTHRRKSLSARDAGFTLEDLYMLRRRDRGSTTSLGSDFSLVMESSPGAAGSFTYETVELVPAGAQTQAAWRKSHSSSPQSVLWSRPQPSEDRLPSHHGLVEAKSSSSSSSNHSDNFFRMGSSPLEVPKPRLATLSDRETRLQEVRSAFLAAYSSTVGLQAAAPSPSGAIGGLLEQFARGVGLRGTSSSIL	1128680	1078389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1079000_1089724_1089905_1090595_1090735_1090905_1090965_1091742_1091814_1094005_1094043_1094323_1094401_1094718_1094805_1095968_1096036_1101150_1101226_1101847_1101919_1109270_1109345_1110615_1110739_1112265_1112327_1112639_1112716_1118699_1118809_1126358_1126508_1128381
578926	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
578928	contig_5832_pilon	+	2889	9	Intergenic	novelGene_134145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_2	315.645741892711	124	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	18	1295	334930	347511	FALSE	20	CAGCAGACTGTGAGCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLDDCSKFGQYETDLTFVGCVGMLDPPRPEVAACIARCRQAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDMEDMVGKAYTGREFDDLSPAQQRHACQTARCFARVEPAHKSRIVEYLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKSASEMVLSDDNFASIVSAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAILGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRNPREALISGWLFFRYLAIGVYVGLATVAAATWWFLYDAEGPHVTFYQLRNFLKCSKENPLFADDVDCKVFESRFPTTMALSVLVTIEMCNALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLAAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISLPVILLDEALKYLSRNHMDEEKGQK	334912	349105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_334969_335082_335419_336792_337014_337928_338132_338702_338789_343171_343309_343766_343885_344414_344533_347491
578930	contig_19744_pilon	+	3335	5	Intergenic	novelGene_120408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	103.197323124197	307	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	296	1582	256567	271834	FALSE	15	ATGCTGTTGTTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGGRDTDQNSSEEGTAEKFKKLRTTNAHSQTCDWGNLLQDIILQVFKYLPLLDRAHASQVCRNWNQVFHMPDLWRCFEFELNQPATSYLKATHPELIKQIIKRHSNHLQYVSFKVDSSKESAEAACDILSQLVNCSLKTLGLISTARPSFMDLPKSHFISALTVVFVNSKSLSSLKIDDTPVDDPSLKVLVANNSDTLKLLKMSSCPHVSPAGILCVADQCHGLRELALNYHLLSDELLLALSSEKHVRLEHLRIDVVSENPGQTHFHTIQKSSWDAFIRHSPKVNLVMYFFLYEEEFDPFFRYETPATHLYFGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	250862	273587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_251157_256565_256915_260289_260413_263501_263674_271190
578940	contig_14158_pilon	+	1823	4	Intergenic	novelGene_136124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	116.219141663019	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	254	514	21251	25162	FALSE	10	CCACTGTTCCTGTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAQRPKAKKLFALIIVPSLILLVSRDAKCGRSAARGSRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	18094	26471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18216_21118_21301_24096_24236_25090
578948	contig_19564_pilon	-	1635	4	Intergenic	novelGene_29626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	16	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	118	1452	15529	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15646	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
578973	contig_1154_pilon	+	2096	7	Intergenic	novelGene_87089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	232.592395022327	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	11	1738	330777	445998	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVCRRQQCSVERRGFRQELDSWRHKLIHCVGFESIFEGLFGPGLLKDLSLFKDCEPESVSDWTFDENCLFCCLRRDKVKGHLVDLDEPASGAGQEALLKQEQAKIIRFERQAEEFLNAVFYRKDSPWVSDPNIPLVAREIMQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	330766	446356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330874_389032_389099_389755_389836_434841_434975_439216_439505_442410_442505_445028
578991	contig_15720_pilon	-	1040	9	Intergenic	novelGene_41895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1722.95711913414	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	258	998	282704	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282631_282689_282750_283785
578993	contig_4232_pilon	+	1013	5	Intergenic	novelGene_63199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1981.19854822781	87	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	79	579	146362	149200	TRUE	30	AAGATTCATTAATGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146283	149694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087_149468_149527
578999	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_96659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
579011	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579013	contig_12644_pilon	+	2432	2	Intergenic	novelGene_44697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	138	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTATCAAAGTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2681865	2685536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2682052_2683290
579024	SIRV4	+	388	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	928	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
579035	contig_2204_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_71648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	50831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
579063	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
579111	contig_10765_pilon	+	2036	7	Intergenic	novelGene_122839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	177.730523233599	811	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	195	1868	18249	34929	FALSE	35	TATTTTAAATGTTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15572	35097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_18684_18770_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
579115	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
579116	contig_7275_pilon	+	2773	5	Intergenic	novelGene_111245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	21.7873242964803	169	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	350	1408	408481	409539	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	401683	410904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_402438_402473_405425_405485_406427_406555_408457
579117	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579124	SIRV4	+	382	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	918	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
579126	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_95850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579129	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579155	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_95114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
579156	contig_11285_pilon	+	2384	13	Intergenic	novelGene_5579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	541.599861264958	1	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	985	2031	767746	769760	TRUE	10	GCGTGTGTGTGTGCTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQVRHLLYR	763521	770158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769657_769740_769819_769863
579177	contig_3233_pilon	+	1672	5	Intergenic	novelGene_56581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_2	114.200207968287	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1067	1540	743801	747909	FALSE	15	CCCCAATGGGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	742734	748041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
579203	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
579213	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_91270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653885	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
579241	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579260	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	0	35775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
579297	contig_10331_pilon	+	1503	12	Intergenic	novelGene_54194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	73.8303841235755	982	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	4	1434	604724	620153	FALSE	15	TGTGTTCAGTTTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKEATKKRKQDEVEEITPQIQKPHLQEPAKKKVKKKLSDADKKLANSLGSTGEVISQDLLRTDYVSGTALLRKFPCFSRESALACADLEEEEIHQEHGQKRRSSQSGGGVRAADTKVPNNVDHIVVNQRKKIQVNQEEERLKNERTVFVGNLPVTCNKKKLKSFFKQYGQIESVRFRSLIPAEGTLSKKLAAIKRKIHPDQKNINAYVVFKDESAATKALKRNGTQIADGFRIRVDLASESSSRDKRSVFVGNLPYKIEESAVEEHFLDCGSIVAVRIVRDQVTGVGKGFGYVLFENTDAVHLALKLNNSELMGRKLRVMRSVNKEKLKQQNSNPGLKNVSKPKQGLNFASKHAEGQSKSLFIGEKAVLTKKKKKGQKRSGRPKKQKKQK	604720	620222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605105_605366_605501_607901_607998_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_617716_617757_618144_618264_619868
579301	contig_20819_pilon	+	2059	7	Intergenic	novelGene_55637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	576.961413113756	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	16	1002	29817	42557	FALSE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRSAMKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVESTVRALSPAPC	29801	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30478_40308_40522_40867_41210_41309_41400_42519
579305	SIRV6	+	395	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10430	1	1193	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11430	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
579306	contig_5063_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_109993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	25	TATATAATTTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
579309	contig_10013_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_125042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAATATTGCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168117	170213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_168100_170200
579310	contig_10019_pilon	-	1800	3	Intergenic	novelGene_86686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	167	373	261562	259852	TRUE	15	CTGAATTTGGTCTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGRCEWQAQSPFPGARGAADCAGGRIRSSFRRGHHGSVDRLFQVLELRWVGESEMEVGAEAVVGEDGLRERRGLSEAGRQEQNRDVQPQSGSNMIPKHSYWLDVWLFILFDLVVFFFVYFMP	261728	258358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259188_259253_259853_261356
579316	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
579317	contig_13216_pilon	+	1963	7	Intergenic	novelGene_47493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	828.506437311544	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	125	1423	243033	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229661	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229748_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
579318	contig_10176_pilon	+	2074	9	Intergenic	novelGene_72705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	352	junction_2	208.531734695226	663	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	168	1361	244610	254018	FALSE	0	CCTGGGTTTTTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQAIKEGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGRMQRERRGKNVVHQLSVTLEDLYNGATRKLALQKNVICDKCEGRGGKKGAVECCPNCRGTGMQIRIHQIGPGMVQQIQSVCMECQGHGERISPKDRCKSCNGRKIVREKKILEVHIDKGMKDGQKITFHGEGDQEPGLEPGDIIIVLDQKDHAVFTRRGEDLFMCMDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIVITSHPGQIVKHEDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVNFPENGFLSPDKLSLLEKLLPARKEVEETDEMDQVELVDFDPNQERRRHYNGEAYEDDDHHPRGGVQCQTS	243324	254731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_243482_244599_244742_245088_245267_247647_247753_248407_248636_250956_251072_252581_252698_253015_253117_253799
579319	contig_15498_pilon	-	2258	3	Intergenic	novelGene_42624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	184	942	537695	534858	FALSE	20	AAGTGTTAGCCTGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	543928	533541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535588_537666_537788_543837
579338	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579354	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
579357	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
579358	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_19027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
579363	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
579376	contig_15047_pilon	+	1424	8	Intergenic	novelGene_52209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2653.98825797504	3	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	20	550	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2636_2728_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
579414	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579429	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1472	635	1017	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2472	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
579434	SIRV2	+	460	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	137	-74	-137	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCGAATGACTCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
579442	contig_5096_pilon	-	3210	6	Intergenic	novelGene_111979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	73.8067747567931	9	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	178	1056	98361	65579	FALSE	45	TCTTTAAAAAAAAACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVDPASNGFRTHPTGQAKASSSPSGEDALRPWVGLPATFRCSRPRRPRLPHSAQQPGPSMTDQAPFDTNVNTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGIAHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINMLKSSFATCVLVSEEDKNAIIIEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKTSTGEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMECGVNCFMLDPDNSSPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFLYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYIMEKAGGLATTGKEAILDIVPTDIHQRAPVILGSPDDVTEFLEIYGKHAAR	98538	63424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_-_65771_67647_67768_72970_73112_79489_79583_80109_80273_98191
579447	contig_7870_pilon	-	1483	6	Intergenic	novelGene_108942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_1	354.065304710868	319	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	240	734	496465	295191	FALSE	35	GGAAAAAGTTTCCTGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAISKYLTYRSSWWNDLALWNY	497931	294441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
579455	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579462	contig_12923_pilon	-	2335	16	Intergenic	novelGene_30098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.440205381523	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	63	2219	93727	45465	FALSE	25	GAATTTTTATGAGGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKHIP	101230	45348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45475_49021_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
579464	contig_5515_pilon	+	2017	4	Intergenic	novelGene_52338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	544	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	823	1245	68936	71284	FALSE	55	TTTACCATCAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSACSSGCSGDEAELRCRGDRLVHSSRPLEAAAVAELHVALAFRGCRWGRGPDGPVSPDPAATAGRIPEPPAPQWPHWWPPSLWPASCLPASAVQSMTPLMFLWHSSSGTALQTAKGRRTEMWGENLNFIQETTVSER	67632	72056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_68278_68669_68782_68870_69081_71006
579467	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1462	632	1007	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2462	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
579471	contig_3382_pilon	-	1181	4	Intergenic	novelGene_124004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGTTATTTATCACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118130	108082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_108856_116175_116386_117740_117868_118059
579472	contig_3382_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_124001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACTGCCATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108132	106459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_106500_108100
579481	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579484	contig_12644_pilon	+	1001	8	Intergenic	novelGene_44609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5447.13960136278	10	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	474	962	2679113	2680576	FALSE	50	CAAAGAGGCAGTGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLLDLFIPYT	2675473	2680615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2678638_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680540
579495	contig_12050_pilon	+	2301	16	Intergenic	novelGene_62618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	356.805642705755	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	207	1529	334091	355996	FALSE	10	CAGTTGTGTGGCGTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQISWRP	321302	356768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351558_355978
579501	SIRV7	-	230	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35832	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78906	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78844
579507	contig_14925_pilon	-	1413	7	Intergenic	novelGene_55140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1771.60357366489	81	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	52	408	322420	321805	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQ	322471	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_83708_83763_321801_322113_322371
579514	SIRV7	-	245	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69041	0	35822	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78916	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
579516	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
579531	contig_14322_pilon	-	154	1	Intergenic	novelGene_116554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674840	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674800
579540	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
579558	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
579563	contig_12123_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_144601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAACAATTCAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122202	122456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_122200_122500
579573	contig_14925_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_55183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_4	1525.69908156884	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	197	454	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLYFGTATSLTVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	86526	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_86482
579584	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	26	373	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14434	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
579586	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1118	0	-1118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGACGAGCCACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
579587	SIRV4	+	352	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	144	454	144	-454	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACCTCTTCAAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599	2317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
579590	contig_10541_pilon	-	2606	12	Intergenic	novelGene_144645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	177	junction_11	185.793807332148	47	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	329	1588	312553	234166	FALSE	70	GTAGGAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEIVNVHKEIQLSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQDIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSKTYEKKSDIVLLLSQKQTLEELKQSIQQLRCTESKFAAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMVSERVIQ	394507	233147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_234380_243494_243618_259379_259500_260014_260153_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_374167_374310_394487
579597	contig_18869_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_56212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73743	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
579605	contig_9332_pilon	-	2106	10	Intergenic	novelGene_60704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	428.619518172032	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	501	1676	69447	41510	FALSE	30	TCGGCATAATTGTATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNCLKKSEILLSFLTPGGNRLRNQICEVLDTDLIRQQAEHSAVDIQGLANYVISTMGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRQIFHVLDLMRMDMVNFTIRSLRPHLQRQLVDYERTKFQEILEETPSALDQTTEWIKESINEELLSLSEATLTPGAEGSSKPTLSPTLVLNNSYLKLLQWNYRKKELPETLMTDGARLQELTEKLNQLKIIACLSLITNNMVGAITEGLPELANRLKRISAVLLEGMSKETFNLKEVLNSIGVQTCVEVNKTLEERGLSTLNAEVQANLVGQFSSIEEEANPIWSLIDKRIQLYMKSLLCLPSPPKCMPPIPGGLAVIQQELEVLGSHYANIVNLNKQVYGPFYANILRKLLFSEEAVGKTETLSPTN	86307	41079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66121_68156_68378_69417_69537_73800_73890_76408_76601_86177
579607	contig_6958_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_69987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGCCGGCGGAAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719230	718496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_718500_719200
579616	contig_3818_pilon	+	2224	14	Intergenic	novelGene_99238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	393.994112832597	738	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	728	1849	451626	455535	FALSE	10	TTTCTTCTGTCTTTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	424836	455910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_425010_425468_425633_427646_427819_428719_428913_429408_429426_451617_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
579632	contig_14322_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_116596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCGGCGGCCACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
579635	contig_14322_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_116483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCTCACTCCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
579636	contig_11115_pilon	+	1977	8	Intergenic	novelGene_102804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	586.314013519189	45	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	298	1887	165608	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165310	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172432_172479_172595_172714_172964_173047
579639	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_93613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579641	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579670	contig_5434_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_74668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAGGAAAGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291979	292800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_292000_292800
579688	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
579709	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
579714	SIRV5	-	305	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTACATATACAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10979	8327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
579716	contig_10235_pilon	-	1607	11	Intergenic	novelGene_46265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	353.936491478344	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	170	1414	25335	14151	FALSE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	27167	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21014_23743_23816_24175_24304_25124_25469_27131
579735	contig_5779_pilon	+	2717	3	Intergenic	novelGene_106487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	103	420	162901	163218	TRUE	50	AAAAATCTCCATTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLGHREREGNRKTGTQPPTIKYLQARYAGTLCEDMVQWHYPRGHTHMPGGEGTSAQWQHCRHESTAAKGKCRQVGTSCIRNDVQLPKPRSTQRTQLPLKLEVSFYGTFNVQFGFLLNAYHLIRTSQDFCTLSTMPRCEK	162798	166290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_165044_165624_165809_166002
579742	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
579761	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
579765	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
579770	SIRV7	-	351	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33218	0	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
579771	contig_7202_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_18249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTCACCCAATTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
579773	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_92119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTGTACTCCAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
579774	contig_14556_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_138511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACACCCTAAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55136	52591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_52600_55100
579775	contig_15087_pilon	-	1867	11	Intergenic	novelGene_37132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_6	393.148063711371	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	118	1038	74105	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRGPYRIYDPGGGAPPGEASAAFERLVEENSRLKEKMQGIKMLGELLEESQMEASRLRQKAEELVKDSELLQQPSSSLASFDHLAELTGKDTNVPAPPADGAHPSDKPEPVPKPPSSGTSSEFEVVPAEEQNSPPESGGSTRNTMQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89768	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_42954_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
579798	contig_15839_pilon	-	2453	14	Intergenic	novelGene_136410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	41	junction_12	78.3459933535609	561	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	196	1266	105924	48146	FALSE	0	TTGGTCTGGTCTTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMGPGRKRDFSPVSWSQYFESMEDVEVENETGKDTFRVYKSGSEGPVLLLLHGGGHSALSWAVFTAAIISRVQCRIVALDLRSHGETKVKNPEDLSAETMAKDVGNVVEAMYGDLPPPIMLIGHSMGGAIAVHTASSNLVPSLLGLCMIDVVEGTAMDALNSMQNFLRGRPKTFKSLENAIEWSVKSGQIRNLESARVSMVGQVKQCEGITSPEGSKSIVEGIIEEEEEDEEGSELVNKRKKEDDMETKKDHPYTWRIELAKTEKYWDGWFRGLSNLFLSCPIPKLLLLAGVDRLDKDLTIGQMQGKFQMQVLPQCGHAVHEDAPDKVAEAVATFLIRHRFAEPIGGFHCVFPGC	106119	46958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_48165_48620_48689_49307_49373_52016_52062_52575_52706_54667_54792_56097_56164_62193_62285_65861_66017_70879_70932_71327_71386_88688_88781_89326_89422_105913
579802	contig_18869_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_55997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
579824	SIRV5	-	295	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTACCAAAGTACATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10976	8334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
579825	contig_9594_pilon	+	1574	11	Intergenic	novelGene_73937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	310.366493036861	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	131	1141	301335	322451	FALSE	15	GATTTTTTTTCCTGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301204	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319785_321604_321659_321936_322036_322410
579828	contig_9014_pilon	-	2139	7	Intergenic	novelGene_106733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	80.6689049276251	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	13	357	46598	44765	TRUE	20	AGTGAACCCACCTTCGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCEVSRQCQ	46610	41550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43397_43480_43559_44086_44240_44420_45016_46504
579834	SIRV5	-	314	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAGTACATATACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
579838	contig_15063_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_8954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	7	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	243	1415	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27126	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
579855	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579859	contig_8616_pilon	-	1919	2	Intergenic	novelGene_72518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	527	904	346757	346380	FALSE	15	CCTAAGAGCCTTGGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLLEGGQGQNRLCPGHPASCLRFMQADAQNLGPVAPSGSFQLVLDKGTWDAVARGGLPGAYQLLSECLRVLSPRGTLIQFSDEDPDVRLPCLEQGSQGCTVTVQELGPFRGLTYFAYLVQSAH	347563	345364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_347036_347315
579863	contig_15720_pilon	+	1238	7	Intergenic	novelGene_41889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	25	AGATCGAGCAGCCCACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	283996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281902_282643_282747_283778
579864	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
579865	contig_13894_pilon	+	2425	5	Intergenic	novelGene_62162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2999	junction_1	1864.74198952563	8	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1309	1620	525098	525409	TRUE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLWNERWAQRPSQSVEIFLAAFLLRTALWAEMTGSVGSAVHLNPYHLQPPQKNLKVKFSCYRETKLMDFDARVLHLVQNCFPEALLLPGFGAYDVCLGRCLI	523789	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
579868	contig_7410_pilon	+	1701	8	Intergenic	novelGene_106089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	218.527166386652	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	106	504	405351	407259	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	405245	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407879_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
579871	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
579884	contig_10426_pilon	+	3453	5	Intergenic	novelGene_144675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	21	junction_3	42.7931069215592	189	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	96	764	105791	119386	FALSE	50	AAAAAGACACGAGTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCCSAIGCASRCLPNSKLKGLTFHVFPTDENMKRKWVLAMKRLDVNAAGIWEPKKGDVLCSRHFKKTDFDRSAPNIKLKPGVIPSIFDSPSHLQGKTEKLHCRKNFTLKTLPVTSHNHQLVGASSCIEEFQTQFIFEHSYSVMDSPKKLKHKLDHVISELEDAKESLRNVLDREKQFQKSLRKTIRELKDECLISQETANRLEAFCWGCCQESIEQDCIS	104749	122075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_+_104822_105767_105871_107219_107428_111425_111552_119131
579885	SIRV4	-	218	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAATGTCCAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
579887	contig_953_pilon	-	2573	6	Intergenic	novelGene_130003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_5	72.7939557930465	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	24	494	285390	278182	TRUE	20	TGATGGGCAGTGACTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASSVTAMQREEKQLEASLDALLSQAADLKNSLGSFIYKLENEYDRLTWPSVLDSFALLSGQMNTLNKVLKHEKTPLFRNQVIIPLVLSPDRDEDLMRQTEGRVPVFSHEVVPDHLRTKPDPEVEEQEKQLTTDAARIGADVAQVALSHCPGAPQPLSPSVRS	285413	274809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_276034_276945_277195_277575_278383_278901_279047_279726_279846_285384
579890	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579894	contig_9177_pilon	+	1828	4	Intergenic	novelGene_32684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1412	junction_1	340.389319586982	8	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	309	455	415330	415476	FALSE	60	TAATAAAACAATAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	405440	416849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_405553_405912_406017_407998_408077_415315
579912	contig_9895_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_144700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTTTAAAATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352535	350599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_350600_352500
579915	SIRV4	+	188	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1583	632	1128	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
579916	contig_17337_pilon	+	2436	8	Intergenic	novelGene_144718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	482.85828402232	263	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	117	755	1643	30455	TRUE	10	CCCTAATGTTTTTCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSSLEKILRCENIYNEGQRIGCSFNLKDPSLEQGSIQIMVKDNAGKIRPSFNVVPLNSHVKPDPPDIKNLSFKNDGLYVEWKNPENFQSTCLLYEVEVNNSHIVSEIFPVEEIKCQSSEGRICLLFPSVLPDTLNTVRIRVKTNKYCYEDNNLWSNWSQAMSIGEKTSSTFYITILLIIPVIVAGAIIVLLLYLKRLKIIIFPPIPDPGKIFKEMFGDQNDDTLHWKKYDIYEKQTKEETDSVVLIENLK	1526	32855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_1707_3641_3791_7380_7411_7694_7828_11171_11269_13308_13394_30374_31772_32490
579920	contig_3410_pilon	-	1651	6	Intergenic	novelGene_58930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	146.718233359048	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	49	495	29768	15414	TRUE	30	CCCATTAGGGAGTCAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	29816	14169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15123_15210_15514_15606_15695_19446_19655_29162_29198_29752
579935	contig_11832_pilon	-	2206	12	Intergenic	novelGene_106922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_11	978.662639515513	35	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	905	1333	86997	84964	TRUE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG	92440	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
579942	contig_4654_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_103063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAACAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446251	448337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_446300_448300
579944	contig_13740_pilon	-	1487	11	Intergenic	novelGene_34633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4451.61018509033	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	169	1074	165243	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
579945	contig_9363_pilon	-	1641	6	Intergenic	novelGene_6548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1395.35079460328	26	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	64	681	786587	777382	TRUE	30	TATATGTGTCAGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	786650	753383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754154_777191_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541
579951	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579962	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
579968	contig_5988_pilon	-	1565	5	Intergenic	novelGene_15937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.537526451696	6	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	96	1391	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653683_653742_653773_655456
579975	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_95019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
579983	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
579995	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
580006	SIRV5	+	293	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	886	26	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
580032	contig_9471_pilon	+	1538	12	Intergenic	novelGene_21781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	780.595672102904	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	968	1498	414726	417296	FALSE	40	ATCAGTCTAATTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406947	417336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414595_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
580055	contig_1372_pilon	+	2440	11	Intergenic	novelGene_140518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	33.8845097352758	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	1309	2265	457535	484809	FALSE	25	ACTATACCGCTTTACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451714	484984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_453613_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
580057	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_16573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
580059	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
580076	contig_9354_pilon	+	1943	10	Intergenic	novelGene_108044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.23239930057	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	500	1252	108719	117180	FALSE	15	ATTTATTAGCTTTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHAFGAYFGLAVAGILYRSNQIWEHHNKQSDIHSDLFAMIGTLFLWIFWPSFNSTLAVPEEKQNRAIINTYFSLAACVLTSYAFSSLVERRGKLSMAHIQNATLAGGVAVGTCADMEINPYGSMIIGSIAGIVSVIGFKFLTPFFATTLRIQDTCGVHNLHGLPGIVGGLASIVVIAMGASDVSTTAMQAATLVTSIGTAVAGGLITGLILKLPIWEQPPDEDCYDDCVYWEVPTVDDSLSLSRFQPM	96267	117871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_96446_104932_105069_105971_106136_108697_108846_109396_109564_111077_111216_111996_112119_115831_115906_116127_116202_117129
580103	contig_16185_pilon	-	2135	13	Intergenic	novelGene_144731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.916988416509	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	193	1500	127403	82386	TRUE	5	TCCTGCTTCTTCTGTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPQEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134361	81703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_81942_81988_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111499_127364_127464_129327_129422_134323
580107	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580124	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
580143	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_17623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
580144	SIRV6	-	345	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCGAATTTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
580148	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580149	contig_10197_pilon	+	2141	10	Intergenic	novelGene_115308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	111.685183649908	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	225	1244	1364339	1377360	FALSE	20	AATCCTACTTCCTTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNNETSVIPCEDGHHLPTVQFDFTGIDDLENKSKDSLVDIIGICKSYEDATKIIVKSNNREVSKRNIYLMDMSGKVVSATLWGEDADKFDGTRQPVMAIKGARVSDFGGRSLSVLSSSTIIVNPDIPEAYKLRGWFDSEGQALDGVSISDLKSGGIGGSNTNWKTLYEVKSENLGQGDKADYFSCVATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDREFPNFKYRMILSANIADFLENQWVTCFQESAEAILGQSTAYLGELKEKNEQAFEEAFQNASFRSFTFRIRVKLETYNDESRIKASAVDVKPVDYREYGRRLIMNIRKNAMQ	1362667	1378257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1362749_1364050_1364120_1364264_1364460_1364616_1364757_1365191_1365341_1367602_1367736_1369928_1370106_1373651_1373760_1375656_1375744_1377255
580155	contig_6710_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_93430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
580173	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_93699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
580203	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580204	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_116079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
580211	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1584	632	1129	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
580214	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
580220	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580236	SIRV6	+	633	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	730	223	-425	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	142	474	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1860	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
580246	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580249	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	491	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
580263	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580276	contig_5039_pilon	-	2069	5	Intergenic	novelGene_64963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_4	371.247895616931	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	708	1166	1657705	1654623	FALSE	30	GAATAAATGTGGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSFASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR	1659109	1653719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654782_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1658438
580278	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	878	0	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
580297	contig_5463_pilon	-	2824	2	Intergenic	novelGene_144770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15852	11974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_13763_14816
580306	SIRV4	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTGGCTACATGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
580311	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
580315	contig_4838_pilon	+	1861	13	Intergenic	novelGene_144783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	33	junction_1	228.441944971194	256	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	265	1644	217868	279206	FALSE	40	AAGCAGTACATCTACCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWLIGGGREPQGLAEKSPLQTIGEEQTQNPYTELIVLKAHHDIVRFLVQLDDYRFASAGDDGIVIVWNAQTGEKLLELSGHTQKITAIIAFPSLESCEEKNQVILTASADRTVIVWDCDTGRQVQRVSCFQSTVKCLTVLQRLDVCLSGGNDLCVWNRELDLLCKTSHLSDTGVSALIEIPKNCVVAAIGKELIIFRVVAPTEESLEWDILEVKRLLDHQDNILSLVNVNDLSFVTGSHVGELIIWDILDWTMQAYERNFWDPSLQLDAQQEIKLCQKPNDISIHHFTCDEENVFAAVGRGLYVYNLQMKRVIACQKTAHDSNVLHIAKLPNRQLISCSEDGSVRIWELREKQHLPAEPVPTGFFNMWGFGRVNKQASQPVKKQQENATSCSLELIGDLIGHSSSVEMFLYFEDHGLVTCSADHLIILWKNGERESGLRSLKLFQKLEKNGDLYLAV	217603	279423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_217919_222263_222380_239648_239698_241062_241195_244326_244390_248316_248429_251007_251071_255283_255395_268199_268385_273286_273409_274222_274312_275548_275683_279053
580331	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
580333	contig_12352_pilon	+	2282	5	Intergenic	novelGene_57463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.792757081071	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTGCTTGTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238262	286648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_238420_247436_247575_252230_252267_277256_277302_284742
580335	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580337	contig_9297_pilon	-	2219	2	Intergenic	novelGene_69863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	903	junction_1	0	777	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAAAGAGCTACCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908642	904798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_906634_908258
580339	contig_6589_pilon	+	1249	8	Intergenic	novelGene_26001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	855.848451204167	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	139	912	1725483	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725344	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729201_1730106_1730152_1731406
580347	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
580364	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
580367	contig_2027_pilon	+	2024	15	Intergenic	novelGene_39894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	238.655716504776	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	949	1830	132640	136487	FALSE	15	AGATGTGGCATGCCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117789	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124686_131596_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
580377	contig_15063_pilon	-	926	4	Intergenic	novelGene_9920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36069	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35378_35838
580387	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580395	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
580402	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580406	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
580408	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580414	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
580429	contig_11056_pilon	-	1683	4	Intergenic	novelGene_130396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	111.092554005908	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	238	645	655706	645779	FALSE	20	TATAGATGCCAGTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHSHDRYLPGDTFVLGNSLSRSLEPHSDPMDSALNPNNLVVSTSQNLRAPAYRPLLPSCGLPQSTASAVRRLCSRGSDRYLESRDGSRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQLGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF	668045	644740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645905_647059_647203_655567_655766_667867
580452	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_97787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580461	contig_7744_pilon	-	1920	9	Intergenic	novelGene_62511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_8	305.731065439873	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	636	1886	823397	820619	FALSE	30	TAAACTCAGCAACTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKSLGRRDRRKKGDRGKEILEKDGYLGQSILTVHFLSSFIPQVLNSRPLVLFPCFVKVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQYMSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	824292	820584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823501_823760
580514	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
580519	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
580526	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_18703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCTACGTCTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
580533	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
580534	contig_12019_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_87629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.4313863316944	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	460	783	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_5400_6114_6226_8298
580543	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
580547	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580548	contig_5569_pilon	-	2657	18	Intergenic	novelGene_86743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	160.171879997297	13	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	472	1458	503063	467456	FALSE	15	TTAATGTTGTTCTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEPLKTWQDAPYIFIVHIGIPSSKESVKEKSLSTLFTMTVEVKGPYEYLTLEEYPLMIFFMVMCIVYVLFGVLWLAWSACYWRDLLRIQFWIGAVIFLGMLEKAVFYAEFQNIRYKGESVQGALILAELLSAVKRSLARTLVIIVSLGYGIVNLTQTMKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	517666	466256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487359_493479_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517558
580549	contig_8538_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_5059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842831	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
580567	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_95095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
580583	contig_13894_pilon	+	1261	10	Intergenic	novelGene_62118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2275.14669178403	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	22	975	520713	526879	TRUE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPL	520691	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526876_526948_527459_527580_528072
580595	contig_10793_pilon	+	1287	12	Intergenic	novelGene_83365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3970.36719787357	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	237	1037	152890	163940	TRUE	25	CGAGTTGTGTTGAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	165147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_131015_151413_151491_152874_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054
580617	contig_17440_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_7661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3570	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
580620	SIRV4	+	482	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	27	441	27	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
580621	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
580628	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
580634	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_93444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
580639	contig_19564_pilon	-	2283	4	Intergenic	novelGene_29619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	846.389324654375	3	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	166	1458	15529	12201	FALSE	45	TGCCCCAAGAGCCAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGFSPLFPVGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15694	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13688_14009_14055_15472
580640	contig_7396_pilon	-	1945	15	Intergenic	novelGene_79598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3108.17224081476	7	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	115	1494	255163	246385	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELREVKAPNTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	255382	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250228_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254683_255105_255191_255295
580659	contig_10734_pilon	-	1895	7	Intergenic	novelGene_51408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	119.662952588603	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	871	1191	2075693	2073385	TRUE	20	AGACGTGTTCATTTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLYKENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCGKRMSECPICRQYVVRAVHVFKS	2091296	2072636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2073063_2073106_2073576_2075563_2075766_2076034_2076122_2077859_2078270_2079518_2079735_2091211
580667	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	1545.02928774829	88	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	210	467	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNYQLIWGSGTKLFIKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	68920	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_68863
580687	SIRV7	-	329	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33227	13	8	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114730	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
580697	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_94319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
580725	contig_6710_pilon	+	555	2	Intergenic	novelGene_95781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653361	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
580747	contig_4732_pilon	-	3191	26	Intergenic	novelGene_75474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	360.019101715451	24	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	984	2955	127	3081	747726	700718	FALSE	50	GATGAAAGCAAGAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPELGEGAEAGPCPSHPPWPPEPAPQPGPTWLSPRGPDASLAMGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIVGNLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGGEPDGGKISNFLLEKSRVVSQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSDTYKVDGTDDRSDFNETLSAMQVIGILPSIQQMVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESIDVTLNVEQAAYTRDALAKGLYARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEEGRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFPKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLQAVNMDPDQYQMGGTKVFIKNPESLFLLEEMRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEASNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSITKYDRRFKPIKRDLILTSKYVYVIGREKVKKGPEKGQVREVLKKKLELQALRGVSLSTRQDDFFILQEDAADSFLESIFKTEFVSLLCKRFEEAARRPLPLTFNDTLQFRVKKEGWGGGGTRSVTFSRGLGDVALLKAGGRALTVSVGDGLPKSSKPTRKGMAQGKPRRPAQAPVRAALQSPTPPWGLASPMSHPLPKPLLPYVSNGANSRTYLPDI	747852	700607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_700840_703062_703129_703544_703694_703910_704058_704407_704554_706204_706375_706555_706671_712566_712712_712811_712911_713353_713461_715492_715575_720150_720237_721485_721654_722527_722612_723828_723916_724035_724117_727095_727293_727793_727927_728152_728288_728409_728542_729165_729256_729369_729458_730958_731054_731135_731226_732091_732230_747723
580749	contig_15882_pilon	+	994	7	Intergenic	novelGene_144819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	390	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAAGCAAGGTCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575449	579218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_575666_576002_576129_576573_576796_576942_576998_577909_578017_578364_578582_579167
580753	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
580754	contig_6735_pilon	-	1551	11	Intergenic	novelGene_15700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	687.502589086034	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	81	698	564868	543176	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKARA	568278	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543187_546591_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
580765	SIRV6	+	450	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	166	34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCGTGCGTCTAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2027_2470
580767	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_115750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
580791	contig_12402_pilon	-	2458	4	Intergenic	novelGene_133380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTCACACCCGGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662489	636406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_636475_658759_658879_659864_659992_660345
580796	contig_3942_pilon	-	418	4	Intergenic	novelGene_128760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	261	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGACGGCAGAACCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795506	792275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_792302_793507_793623_793793_793885_795320
580805	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580811	contig_14322_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_116225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
580824	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_116211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
580826	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
580828	contig_15063_pilon	+	1732	5	Intergenic	novelGene_13046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3399.75038605778	17	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	422	1594	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30095	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
580832	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTCAGGACTCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
580838	contig_5690_pilon	+	1417	11	Intergenic	novelGene_119727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	546.555660477503	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	48	1004	1044729	1105490	TRUE	25	GAGAAATTTCACGTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVTLLDIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1088244_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450_1105558_1105620
580841	contig_10225_pilon	+	2138	14	Intergenic	novelGene_86829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	564.301002393027	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	1072	2022	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFEREQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21312	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21494_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46791_47480
580848	contig_14621_pilon	+	1744	2	Intergenic	novelGene_105843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2	418	124931	125445	FALSE	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLPLDRFLQRCPVALAKALPSRDHVLPPVAAARPPHPQASQSRPVVQPLHVHGLLPAQLPPGAEALHYLCLGFPGSPVPHLPLSFPREAEDGRGGIDIGHKALEFKIPQPCGCHIPDGAFLACDVYPYNVNNGTDQCF	124929	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_125171_125268
580853	contig_20670_pilon	+	2588	6	Intergenic	novelGene_144824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	43.9790859386595	297	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	101	769	21913	26534	FALSE	20	AATGCTAATTTGTCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGGGDCAASAPDADRPHQRPFLIGVSGGTASGKSTVCEKIMELLGQNEVDHRQRKLVILSQDRFYKVLTAEQKAKALKGQYNFDHPDAFDNDLMHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMGKNQA	21812	28353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_22021_22403_22564_23577_23675_23884_24028_24115_24211_26468
580856	contig_9098_pilon	+	2079	9	Intergenic	novelGene_75806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	57.5537791982421	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	168	1418	302742	332191	FALSE	15	CAGCTTTTTTCTCAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHRSTRKRCGDSHPESPMGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLEPLMQGYWEWLVGRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTVLLVYYCPTATEQAPLWAYIACACGLFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAVQLGTNPDWMFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGIIDVTEVQIFIIIMHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTAHSNHH	294675	332852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_294770_302668_303081_309869_310018_311367_311510_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488_331615_332071
580875	contig_5189_pilon	-	1930	8	Intergenic	novelGene_34861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1305.34119396159	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATCATGAAGAAAAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247751	198142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220380_244201_244287_247694
580884	contig_14322_pilon	-	152	1	Intergenic	novelGene_115689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671426	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
580886	contig_4305_pilon	-	952	4	Intergenic	novelGene_136670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	228.085266707188	188	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	50	589	514655	512533	FALSE	25	GGCCACTTCTTACAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKEGSQPKQARAAAVAMTRGNQRELARQKNMKKQSDSVKGKRRDDGLSAAARKQSAPSSLPPGTRRSCSRSRKKQTRRRRNPSSFVASCPTLLPFACVPGASPATLAFPPVVLTGPSTDGIPFALSLQRVPFVLPSPQTLNTIPRMELRAQEGRLQDLSMLLFLILPQSVCLLESWPKNPAALECSHSLLLCHSS	514704	512169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_512707_513070_513321_513934_514044_514648
580887	contig_9594_pilon	-	2873	7	Intergenic	novelGene_73957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	11.6963907063485	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	30	785	335282	328011	FALSE	15	TGTCTTTGGTGGAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDDDCLDNMESSKMATPKNAPRDALVMAQILKDMGITEYEPRVINQMLEFAFRYVTTILDDAKIYSSHAKKPNVDADDVRLAIQCRADQSFTSPPPRDFLLDIARQKNQTPLPLIKPYAGPRLPPDRYCLTAPNYRLKSLIKKGPNQGRLVPRLSVGAVSSRPTTPTIAAPQTVSVPNKVATPVSVTSQRFTVQIPPSQSTPIKPVPATTGVQNVLINPSMIGPKNILITTNMVSSQNTTNESNPLKRKHEDVDDNDTM	335311	325922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_328175_329047_329159_331888_331965_333847_333983_334061_334199_334501_334584_335231
580895	contig_13894_pilon	-	1165	4	Intergenic	novelGene_62027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	131	814	287445	286561	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEPALSSCPCWLCSPQTL	288170	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286615_286718_287123_287219_287538_288132
580896	contig_11752_pilon	+	1355	7	Intergenic	novelGene_37610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1844.85107047215	2	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	107	691	84194	92886	TRUE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFV	84087	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92881_93045_94247_94423_105597
580904	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
580905	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
580908	contig_17440_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_7675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3702	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
580922	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	442	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
580938	SIRV7	-	339	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	10	1	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
580945	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
580998	contig_1154_pilon	+	3029	3	Intergenic	novelGene_87037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37244	44003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_39133_39652_39798_43007
581010	contig_12622_pilon	+	2006	2	Intergenic	novelGene_5758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	377	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACTATGAATTGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74689	76767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_76388_76459
581016	SIRV7	-	360	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-17	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114755	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
581022	contig_14322_pilon	+	367	2	Intergenic	novelGene_116486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	138	230	367	671606	671899	FALSE	20	GAAGCTGAAGCCGGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVELLLGKLKDNC	671376	671899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
581025	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
581046	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
581051	contig_7356_pilon	-	2162	6	Intergenic	novelGene_60372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	734.628994799416	313	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	306	914	435519	408051	FALSE	35	GAAGTGTGTAATATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCVSDQDLDEACMVRTVKTGSAEKLVPAEHLVPAFLKGDLSYIKIFLGTYRTYATTQQVLDLLFQRYGCNFPYSARAGRPQDQLKGPEPRPVPVVKVAQDISLPQELAPGTSHGVHSAPAPALELHSTPPITSPAPAPAPVGEHAGGVDSQPGSPPEPAPGPLADVDPAPAPTPELHTAPAIPSTAPALASEEPAGESDT	457915	406802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_408397_409733_409794_410435_410636_435516_435623_437474_437529_457767
581084	contig_14273_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_21161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAGAAAAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150686	152254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_150700_152300
581087	contig_7876_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_144850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAATTAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481639	479380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_-_479400_481600
581095	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581107	SIRV4	-	328	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAGTGGCTACATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
581122	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
581126	contig_6047_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_24229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATCCTTAAGTTGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171883	174378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_171900_174400
581129	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_17624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
581135	contig_12125_pilon	+	2358	10	Intergenic	novelGene_76194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	121.891572947253	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	65	1231	64006	82984	FALSE	35	AATTTGTGATAATTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPITPSTYVRCLNVGLIRKLSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQAGKSPTCELLFDWGTTNCTVGDLVDLLVQNEFLAPASLLLPDAVPKTVNTLPSQEAITVQQKQLPVYGKDRTSVTPVQNLELNYMPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMANANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56163	84111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_64005_64167_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
581149	contig_6497_pilon	-	2609	4	Intergenic	novelGene_35645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	777.884738677053	21	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	214	606	790005	764386	TRUE	20	CTCTTCCCTAGCAATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEERQKKLEAGKAKLAQFRQRKAQSDGQNPSKKQKKKRKTSSSKQDVSAYHAMNIDQSQTDEMYINSSQRVGSAVTPESTVMRTLHSGEIVKRDQVFSVEPESEISTTADDYSSEVRINKIMILNVVD	790218	760231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_761395_763545_764473_767272_767531_789957
581153	contig_2940_pilon	+	2921	8	Intergenic	novelGene_81882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	30.1350700841991	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	120	1370	413437	450766	FALSE	45	AATTCATCAAGAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKQITCRYFMHGVCREGNQCLFSHDLANSKPSTICKYYQKGYCAYGTRCRYDHTRPSAAVGGAAGTVPHGVPSPGFHSSHSPSELSASIMKTSLHEPGKREKRTLVLRDRNLCGLAEDKALPCVVSNPGGCSDPQNSLEMKPHSYLEAIRSGLDDLEASSSYTSEQQLCPYAAAGECHFGDACVYLHGEVCEICRLQVLHPFDPEQRKAHEKICMSTFEHEMEKAFALQASQDKVCSICMEVILEKASASERRFGILSNCNHTYCLSCIRQWRCAKQFENPIIKSCPECRVISEFVIPSVYWVEDQNKKNELIEAFKQGMGKKACKYFEQGKGTCPFGSKCLYRHAYPDGRLAEPEKPRKQLSSEGTVRFFNSVRLWDFIENRESQHIPNTEDVDMTELGDLFMHLSGVESSDP	413317	452317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_413463_429119_429249_430380_430563_432292_432598_433827_434043_439373_439485_450304_450450_450628
581157	contig_5538_pilon	+	2146	14	Intergenic	novelGene_23697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_11	247.397076800571	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2046	99	2144	47801	258996	FALSE	20	GTAAGGGCTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRPKRKMF	44762	258998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
581176	contig_1275_pilon	+	2039	3	Intergenic	novelGene_108841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	6	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	85	735	747279	747968	FALSE	30	AGTAGATTTCCAAGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746552	749272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747354_747392
581179	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581188	contig_17493_pilon	+	1523	8	Intergenic	novelGene_122182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	492.419350073218	1394	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	158	853	92066	119222	FALSE	15	TTCTTTTGTGAATGGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRVEVEEDGQLKSLTINGKEQLLRLDNK	49968	119892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119140
581199	contig_3787_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_102442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTAAATCTCTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728990	729327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_729000_729300
581201	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
581202	contig_5945_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_104541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACCCTGAAATATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195105	195394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_195100_195400
581231	contig_5549_pilon	+	2153	11	Intergenic	novelGene_81605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.9784219198065	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	110	1885	334039	369342	FALSE	80	AAGAAAAAAGAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW	303568	369610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
581240	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_93433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
581248	contig_1939_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_144891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTTAATAACCCCACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983107	981602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_981600_983100
581249	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
581267	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
581269	contig_1861_pilon	-	2657	6	Intergenic	novelGene_77665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	78.7568409727053	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1633	2556	97127	87440	FALSE	20	CTACCTCATCATGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCFLLSPLSHPRFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	98759	87338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914
581272	contig_6233_pilon	-	1525	10	Intergenic	novelGene_74777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	261.805601237839	955	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	387	1226	149777	143464	TRUE	15	GCTTTGGAGTGATTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250326	136675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
581285	contig_14744_pilon	+	1017	6	Intergenic	novelGene_66058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	4102.12815011916	11	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	443	976	1383399	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382037	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
581287	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
581326	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
581338	SIRV6	+	751	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	340	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	268	579	2021	10736	TRUE	30	ATTGTATATGCGGTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1643	11224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
581357	contig_1331_pilon	-	1353	5	Intergenic	novelGene_37806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	21	497	169924	160009	TRUE	10	CTTGAGGCATTGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169944	158949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159661_159863_160214_160867_160949_166406_166534_169860
581368	contig_6710_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_95042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCAAAGATGGTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
581378	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73578	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
581387	contig_10907_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_144909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAATAATGAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24416	22264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_22300_24400
581398	contig_1694_pilon	+	686	1	Intergenic	novelGene_144979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCCTTAACGAGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1621160	1621846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1621200_1621800
581409	contig_12886_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_135481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAAAAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325574	327305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_325600_327300
581432	contig_5715_pilon	-	2202	11	Intergenic	novelGene_127975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	108.120719568453	370	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	200	1120	659441	602242	FALSE	45	AAAAATTTTTTAAGTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSTLAVEELGFERFHALIHKRSFRSLSELKDSVLDQYSMWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKLPIVMTGECTHTR	659640	601159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_602284_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631757_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
581433	contig_14322_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_115702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671493	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671500
581437	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_95027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
581438	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
581442	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581450	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27909	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581455	contig_18108_pilon	-	1607	12	Intergenic	novelGene_33504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	338.120766727751	13	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	313	1395	296996	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGICSTTSTTGWAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335415	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_277918_296960_297166_316667_316759_335363
581486	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
581488	contig_4754_pilon	+	2225	15	Intergenic	novelGene_35950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	161.029912292907	2	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	125	1813	380189	420387	FALSE	55	AGAAATAAAGGTCTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380064	420799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380193_399464_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
581492	contig_12120_pilon	-	1803	5	Intergenic	novelGene_21409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_4	301.94742919919	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATATTATACCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156974	22562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_156911
581499	contig_11285_pilon	-	1931	12	Intergenic	novelGene_5535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	325.602784929305	93	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	549	1553	744458	741595	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGELSPADHQGRPLLCHHDQHL	745287	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741733_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744754
581501	contig_302_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_145003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAAAAATTGTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11718	8884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_8900_11700
581514	contig_20646_pilon	+	1585	11	Intergenic	novelGene_145016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_6	201.66182087842	950	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	45	1367	25749	40819	FALSE	0	CCCTTCTGTCCTGCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	25704	41037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_25752_31252_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_38470_39122_39278_40684
581544	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
581551	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
581561	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
581569	contig_6270_pilon	+	2015	11	Intergenic	novelGene_99895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	166.416976297492	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	106	1623	1195735	1222846	TRUE	5	CTTTTCTTCTTGTCTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLNDLKCRLSKAGQEHLLQFWNELEEAQQIKLYEELQAMNFEELNFFFQKAIEGFNQSSDQEKVDARMEPVPREVLGSATRDQDQLQAWESEGLFQISQNKVAVLLLAGGQGTRLGVAYPKGMYDVGLPSHKTLFQIQAERILKLQQLAEKYHGNKCIIPWYIMTSGRTMESTKEFFAKHKYFGLKKENVIFFQQGMLPAMRFDGKIILEERSSVSMAPDGNGGLYRALAAQNIVEDMEQRGIWSIHVYCVDNILVKVADPRFIGFCIQKGADCGAKVVEKTNPTEPVGVVCRVDGVYQVVEYSEISLATAQKRSSDGRLLFNAGNIANHFFTVPFLRDVVNIYEPQLQHHVAQKKIPYVDSQGQLIKPDKPNGIKMEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRLKDANDVPIQCEISPLISYAGEGLENYVADKEFHAPLIIDENGIHELVKNGL	1187527	1223300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1187584_1195685_1196015_1205315_1205521_1208027_1208204_1209532_1209706_1214260_1214455_1215539_1215681_1216884_1217074_1221864_1221932_1222753_1222944_1223005
581575	contig_12622_pilon	+	2805	16	Intergenic	novelGene_5871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	138.619799772215	9	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1273	1890	1207624	1212133	TRUE	35	ATGTACAAAACTACGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1191719	1213452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1191970_1193172_1193323_1195670_1195750_1199073_1199125_1203275_1203399_1203770_1203906_1205405_1205511_1205604_1205714_1206107_1206249_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932_1212940_1213343
581581	contig_15491_pilon	-	2127	3	Intergenic	novelGene_75981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	67	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1481	1795	80724	80410	FALSE	80	GAATTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALSRLQNSLAQTWVPAACHLCVKSLSNLSQASLPAFNSSSLFKCYYSASLGTLLHSVLSTSEPPHPHPPKTTQTREQGELAQLLAEREKNRKRGNMRGQQCT	82790	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674
581599	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581617	contig_10904_pilon	-	1375	6	Intergenic	novelGene_22741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	369.399729290643	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	42	1124	662714	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662755	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662665
581624	contig_14322_pilon	+	181	1	Intergenic	novelGene_116603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAAAATGGCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674706	674887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_674700_674900
581625	contig_11978_pilon	+	1502	14	Intergenic	novelGene_62790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	68.099909200645	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	142	1122	299759	587379	TRUE	10	GCCATGTCTGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEDIYEVLPDEEHNLDEDESGTRRKGVEYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299617	589574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547621_547737_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587387_589201
581627	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
581630	contig_10937_pilon	+	2229	11	Intergenic	novelGene_67289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_8	55.5572677513933	507	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	111	2009	35798	45357	FALSE	10	CGGGTGTTGTCACAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33172	45577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
581631	contig_5671_pilon	+	1064	6	Intergenic	novelGene_79407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2084.04545056004	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367652	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_367707_369626_369747_370404_370525_392825_392919_521218_521303_531205
581635	contig_1406_pilon	-	2732	4	Intergenic	novelGene_25448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	86.0322936783366	227	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	80	721	586425	585784	TRUE	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPYIAAYQKELAHSQPAVQPRLKLLLMGHKAAGKTLLRHCLTEDRVEGNQGGGDKEKSSPPSPPPVSKGIEVTSWPADASRGLRFIVYDLAGDESYEVIQPFFLSPGALYVLVVNLATYEPCRFPTAVGSFLHRVGARVPHAVVCIVGTHADLCGEWELEEKCLDIHRQIALQEKHDAEGLSHLAQVVDEALARDFELRSASPHAAYYGVSDKNLRRRKAHFQYLLHHRLQILSPRAAC	586504	484189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484848_491812_491924_498646_498774_584668
581636	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
581642	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
581654	contig_9633_pilon	-	2666	5	Intergenic	novelGene_139654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	74.7876159534451	158	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	112	726	1196788	1188558	FALSE	20	CATTTGCTGACTCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRDHLFKVLVVGDAAVGKTSLVQRYSQDSFSKHYKSTVGVDFALKVLQWSDSEMVRLQLWDIAGQERFTSMTRLYYRDASACVIMFDVTNSTTFSNSQRWKQDLDSKLTLPSGEPVPCLLLANKCDLSPWAVSRDQIDRFSKENGFIGWTETSVKENKNINEAMRVLIEKMMSNSREDIISLSTQGDYINLKNKSSSSWSCC	1196899	1186617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1188673_1189101_1189224_1189537_1189720_1190872_1190945_1196664
581655	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	234	11	-64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCCCAGCGGTGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
581664	contig_4891_pilon	+	1193	7	Intergenic	novelGene_124541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	523.341082745172	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	149	838	701017	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLAATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700868	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708964_733856_733930_754711_754766_755867_756027_756579
581667	contig_13093_pilon	-	2302	3	Intergenic	novelGene_105227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.5	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	188	2131	77623	57754	FALSE	50	AGAAAATTAAAAGGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRMGGALTISYTSSCTRKHSGRELCGAGSVGGTSF	77810	57582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57857_58965_60773_77589
581680	contig_2892_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_119042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	484	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACCAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339496	337889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_337900_339500
581698	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91668	2	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
581706	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_94840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
581708	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
581711	contig_7357_pilon	-	2292	9	Intergenic	novelGene_36804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1892.45148137938	4	118	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	482	1114	154994	137724	TRUE	15	TTTTTCTGGACCTAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAAHL	167076	135543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137825_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154698_154895_155061_159922_160034_166772
581733	contig_854_pilon	-	1800	15	Intergenic	novelGene_36455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACTGGGAGAACACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465451	1451255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1451323_1453650_1453782_1454085_1454134_1454899_1455034_1455688_1455776_1456385_1456459_1457301_1457424_1458361_1458468_1459019_1459169_1460074_1460206_1460533_1460620_1460744_1460875_1464208_1464346_1464538_1464821_1465334
581736	contig_6576_pilon	-	2173	8	Intergenic	novelGene_42282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_6	407.130626382707	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	1212	2171	337927	323808	FALSE	25	AACTTGTCCCTTGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVV	339138	323805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331197_332093_332233_337921
581752	contig_7202_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_16822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACGTAGTCACCCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
581753	contig_7202_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_18677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29810	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
581755	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_18751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGGCCGCCGTCAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
581759	contig_8330_pilon	+	1974	8	Intergenic	novelGene_71975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	715	1059	2038893	2040639	TRUE	30	TATTTCGGATACCTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFSLSWGLAKIILCSLFIYESMVSTVGVSPLPEARACWQSCWSTPAAGSPSAAVGLCCGSAPGLHPPPASPLLCACSPRAFAGLHSSLQTPCWTSEADGALLPGLCCGSGILL	2038178	2116716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2038995_2039683_2039897_2040609_2040688_2052210_2052370_2055973_2056187_2057892_2058039_2066338_2066434_2116462
581761	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
581770	contig_10019_pilon	+	1739	2	Intergenic	novelGene_86678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	650	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAAGTCTGTCCACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258353	261597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_259855_261359
581773	contig_12689_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_145039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3891	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGTGACACACGCGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70228	71664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_70200_71700
581774	contig_5954_pilon	-	956	3	Intergenic	novelGene_28715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	12.5	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	179	568	963529	962496	FALSE	15	CCAGGTGGGCGTGGTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLELHFEFLSVVKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	963707	962107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385
581782	contig_12340_pilon	-	2217	5	Intergenic	novelGene_122093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	86.9381964386195	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	746	1084	5507	3862	FALSE	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	14334	2728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_7311_7438_12473_12960_14209
581827	contig_9833_pilon	+	1531	9	Intergenic	novelGene_68533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	511.519733245942	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	28	759	230823	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230795	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_250072_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
581830	contig_546_pilon	+	2444	9	Intergenic	novelGene_117174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	997.825604752654	42	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	127	1707	119834	165964	FALSE	50	ATATTTCAGAAGGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPRVSSWEPDTDHLNLPSIRRL	61157	166701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_152871_165903
581839	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_95829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
581845	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
581849	contig_2100_pilon	-	1534	11	Intergenic	novelGene_50720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	874.215311007534	2	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	613	1188	1174340	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185523	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1176289_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
581852	contig_5988_pilon	-	1549	4	Intergenic	novelGene_15924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	874.727513127501	12	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	626	1375	652711	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655549	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653343_653422_653549_653773_655456
581853	contig_12279_pilon	+	1434	7	Intergenic	novelGene_50111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2499.33240530791	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	87	389	68297	70784	TRUE	20	TGACTGAGATCTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLETLKKKKSLC	57850	77631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57931_68290_68475_69362_69447_70743_70815_71462_71711_75031_75096_76928
581858	contig_14322_pilon	-	324	2	Intergenic	novelGene_116222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671838	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
581881	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
581886	contig_990_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_76088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCATCTTCTAGATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140257	1139718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1139700_1140300
581911	contig_15134_pilon	-	3052	16	Intergenic	novelGene_140212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_15	88.2917889727012	311	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	1448	2833	207183	184453	FALSE	30	GTAAGAATTGGTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNIKYLSKILYLLTYSDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKIVHVLFNHIDKSGLKDKSVEELKKRYGG	221841	184233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216766_221780
581918	contig_5247_pilon	-	1443	5	Intergenic	novelGene_81821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	165.315418216209	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	54	782	416518	342760	FALSE	15	ATATCAGTGGTTTGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGCSRPAACSEAARRDMAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKAPVDG	416571	342098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_353558_353640_367107_367372_376192_376490_416448
581919	contig_12079_pilon	-	1356	3	Intergenic	novelGene_67445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	638.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGCGGAGGCTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638772	579724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580936_609205_609274_638695
581923	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
581930	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1475	632	1020	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
581946	contig_7342_pilon	-	2321	20	Intergenic	novelGene_71111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	112.382976993874	2	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1200	2264	78723	76155	FALSE	10	TAGTTTTCTCCTGGCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86812	76097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80979_81078_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83789_83834_83913_83979_86703
581951	contig_7285_pilon	-	1541	7	Intergenic	novelGene_143418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_6	48.6326936215638	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	396	809	370123	356156	FALSE	45	TAATAAATTTAAGTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATGHKVALVDQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	380004	355423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
581954	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_19098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
581965	contig_10734_pilon	-	942	8	Intergenic	novelGene_51171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTGGGGGGGAAAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141372	1123639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1123794_1127586_1127743_1128558_1128603_1129366_1129453_1131069_1131223_1139049_1139114_1140653_1140891_1141324
581989	contig_744_pilon	-	3843	5	Intergenic	novelGene_145077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	90	junction_4	12.7573508221731	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	10	1413	214364	201221	FALSE	25	TTGCAGTTTGTTTTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESLELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTPEELEAEIGRYPFKVLNKNGMVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKQMAEEYLGMAVANAVISVPAEFDLKQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKVDVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQGGMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYTQIYQTYGFLPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNLTLHHSAQMSVLLTVEEKNRKEPQSSDNELPKDTLSAADGHHVNSVFGADLSEKKSGENQVLFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTDIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQEFFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN	214373	198790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_-_201889_202813_202982_205296_205511_208782_209124_214351
582010	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
582017	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
582034	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
582040	SIRV4	+	448	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	489	13	-489	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCAAAGGCGGAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
582049	SIRV6	+	987	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1389	94	4	41	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	42	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	93	302	2569	10736	TRUE	20	AATTCTTGAAGTTTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2476	11731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
582075	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
582087	SIRV4	+	300	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	201	449	201	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
582102	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
582116	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582118	contig_9389_pilon	-	3105	15	Intergenic	novelGene_83862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_11	20.6842146259866	229	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2490	137	2626	31262	14071	FALSE	5	GCCTGTGTTGGTTTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAYVCEWEKWPRSTLCPSVPLACAWSCRNLIAFTTDLRNDDQDLTRMIHILDTEHPWDVHSIDSEHREAITCLEWDQSGSRLLSADADGQIKCWSMADHLANSWESPVGSLVEGDPIVALSWLHNGVKLALHVEKSGASSFGEKFSRVKFSPSLTLFGGKPMEGWIAVTVSGLVTVSLLKPSGQVLTSTESLCRLRGRVALADIAFTGGGNIVVATADGSSASPVQFYKVCVSVVSEKCRIDTEILPSLFMRCTTDLNRKDKFPAITHLKFLARDMSEQVLLCASSQTNSLVECWSLRKEGLPVNNIFQQISPMVGDKQPMILKWRILSATNDLDRVSAVALPKLPISLTNTDLKVASDTQFYPGLGLALAFHDGSVHIVHRLSLQTMAVFYSSAAPRSVDEPAIKRPRTSGPAIHFKAMQLSWTSLALVGIDNHGKLNMLRISPSMGHTLDMSLALRHLLFLLEYCMVTGYDWWDILLHVQPSMVQSLVEKLHEEYTRQNAALQQVLSTRILAMKASLCKLSPCTVTRVCDYHAKLFLIAISSTLRSLLRPHFLNTPDKSPGDRLTEICSKITDVDIDKVMINLKTEEFVLDMNTLQALQQLLQWVGDFVLYLLASLPNQGSPLRPGHSFLRDGTSLGILRELMVVIRIWGLLKPSCLPVYTATSDTQDSMSLLFRLLTKLWICCRDEGPTSEPDEALVDECCLLPSQLLIPSLDWLPVSDGLISRLQPKQPLRLQFGRAPTLPGSAAASQLDSLARAPGQPKIDHLRRLHLGAYPTEECKTCTRCGCVTMLRSPNKTTAVKQWEQRWIKNCLCGGLWRRMPLSCP	32306	13591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_14198_14693_14778_15075_15293_15628_15822_16490_16625_16809_17021_17150_17358_18728_18941_20236_20393_21665_21772_22947_23380_29794_29965_30244_30353_31129_31300_32207
582122	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
582126	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
582162	contig_6410_pilon	+	2202	6	Intergenic	novelGene_108619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	92.9873109623028	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	132	629	300693	313081	FALSE	20	TAAATTGCTGTTGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299800	314654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310261_310369_312966
582166	contig_3095_pilon	-	1008	6	Intergenic	novelGene_75210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1206.16274192167	1431	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255483	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248761_253671_253806_255384
582177	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
582185	SIRV4	+	274	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	660	1014	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
582191	contig_12270_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_113129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
582204	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_18489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582205	contig_5018_pilon	-	1212	9	Intergenic	novelGene_47099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	705.070519522693	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	70	1173	1402792	1399136	FALSE	0	TTTTGTGTCTTCCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKDWATSVWGSRFQLGSY	1402861	1399096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399187_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
582210	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582214	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_17659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
582219	SIRV4	-	493	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCCTTAAATTAAAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2313	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
582243	contig_10197_pilon	+	1776	9	Intergenic	novelGene_115288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	77.0274910340458	562	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	392	1648	1255988	1263353	FALSE	5	CTTTTGTTACCTTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALILLLWTGAFLGHGSSQNTGGSLEEGSPAPDTTGIPVEEEDPFFKVPVNKLAGAISNFGYDLYRVRSSMSPAANVLMSPLSVATALSALSLGAGQRTESTIHRALYYDLINNANIHSTYKELLATVTAPQKNLDSAFRIMFERKLRIKTSFVSPLEKSYGTRPRFLTGNPHVDLREINNWVQAQTKGKIASSTREMPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1253793	1263481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1253969_1254274_1254484_1255980_1256072_1257966_1258166_1258884_1259041_1259455_1259660_1260794_1260938_1261911_1262123_1263093
582244	contig_6102_pilon	-	788	8	Intergenic	novelGene_32196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1290.43035061793	34	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	31	678	905250	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906113	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
582253	contig_5231_pilon	-	1904	6	Intergenic	novelGene_65888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	121.78604189315	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	847	1617	213462	209128	FALSE	30	GAATGTGGAAAACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	217272	208840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430
582254	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_96910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
582268	contig_6496_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_103519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	756	1100	888056	887712	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSITSYACESWTINKEERRRTDAFELWCWRRILTISWTARRTNKSVLEDVQPECSLETRMATLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIILGKAEGQQKRRRPSTRWTDALAAKNRLKH	888811	886768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_886800_888800
582272	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
582300	contig_2100_pilon	-	1306	11	Intergenic	novelGene_50735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	876.208200144235	3	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	109	786	1182812	1172388	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANCQGCEREVMQLSPAQSEPDRFRDRVSSGVQAGPVQRVGRHGVSSFWGD	1185519	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173261_1175703_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
582304	contig_6710_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_94770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653610	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
582330	SIRV4	+	404	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	912	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
582331	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	878	13	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
582349	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
582354	contig_15273_pilon	+	2146	4	Intergenic	novelGene_140431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_1	88.6002257333467	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	9	467	95964	146076	FALSE	20	GCTTTTGATGACTGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMAGLPRRIIKETQRLLAEPVPGIKAEPDESNARYFHVVIAGPQDSPFEGGTFKLELFLPEEYPMAAPKVRFMTKIYHPNVDKLGRICLDILKDKWSPALQIRTVLLSIQALLSAPNPDDPLANDVAEQWKTNEAQAIETARAWTRLYAMNNI	95955	147755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_95994_144775_145023_145197_145339_146035
582359	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
582375	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91669	4	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
582377	contig_13525_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_145085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCTTAATACCCTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50898	51444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_50900_51400
582414	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
582419	contig_15545_pilon	+	861	2	Intergenic	novelGene_120125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAAAGCCTGTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9190	27784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
582421	contig_11378_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_112250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGATATCTTTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356541	356886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_356500_356900
582431	contig_2890_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_60284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTTGACTCCAACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313268	314838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_313300_314800
582457	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
582467	contig_7202_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_17294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGCTCATGCAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
582474	contig_16846_pilon	-	1161	5	Intergenic	novelGene_82956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	97	654	555239	551369	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAYTISLSTAPQDPHRGSFL	558746	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551426_551509_551665_552661_552824_555055_555278_558688
582499	contig_2537_pilon	+	1244	14	Intergenic	novelGene_33420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	230.7809996999	4	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	20	961	205895	235157	TRUE	55	AGAAAAAGAATGAAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEVFGKRTHHGQPAIHI	205875	239876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_234991_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846
582503	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
582505	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582527	contig_10968_pilon	+	1428	9	Intergenic	novelGene_84297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	263.904812385072	1206	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	109	960	167443	177921	FALSE	30	TAATTATGACTCCACGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166049	178389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_167440_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
582530	contig_12128_pilon	-	1769	9	Intergenic	novelGene_131984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	114.614298846174	2025	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	322	924	405828	393395	FALSE	10	CTATATTTGTTGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNFGNLKFEIFSKYGKVVKVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNMLGEREPPKKKEKKKKKKISEPEEQIEEVEESDNEGEDPALDSLSQAIAFQQAKIEEEEKKWKPSSGNPSTSDDSRRPRIKKSTYFSDEEELSD	411677	392549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_393527_394327_394404_394488_394602_396936_397045_397580_397693_404592_404622_405795_405881_409965_410052_411494
582543	contig_5643_pilon	+	2007	16	Intergenic	novelGene_39067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	935.388152349363	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	115	1248	631341	637860	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTTCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEQMCPILARAGHATRLWALLRDQLCGARCS	631226	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632036_634812_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636570_637768_637901_638045_638201_640216_640298_640411_640538_640650_640729_641102_641196_641412
582554	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_90569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
582559	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
582587	contig_14322_pilon	-	161	1	Intergenic	novelGene_115712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTTTTATTGCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671439	671278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
582594	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-10	-61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1166_1456_1535_1640_1736_1845
582619	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582637	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	642	1113	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
582648	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_116414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
582664	contig_12270_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_113824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13854	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
582671	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_89195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
582687	contig_15063_pilon	+	818	4	Intergenic	novelGene_10595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	233	817	34808	35964	FALSE	20	GGGCCCGCCAGAATGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHIS	27136	35965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
582697	contig_4845_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_53677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGTTTCTTTGTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770636	786335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_770644_784139
582722	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
582726	contig_14925_pilon	+	1015	5	Intergenic	novelGene_55110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	685	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACCTTAACAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25789	68930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_68865
582737	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
582748	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTACCCAGCTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582756	SIRV4	+	320	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1451	632	996	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2451	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
582764	contig_3095_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_74965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3462.13128000658	82	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	81	662	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147160	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149796_150496_150696_150996_151167_151848
582767	contig_14441_pilon	+	1221	4	Intergenic	novelGene_100512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	606	1034	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	108182	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108639_116578_116963_117220_117344_117539
582781	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
582784	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
582794	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_18285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCAGGTAATGAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
582802	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
582803	contig_12074_pilon	-	2631	13	Intergenic	novelGene_53760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	459.218440819714	4	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1505	2383	33790	30226	FALSE	30	ATACATATTTAATGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45857	29977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_34524_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36738_41067_41228_45769
582804	contig_1996_pilon	-	1749	7	Intergenic	novelGene_131943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	692	junction_1	172.641648766712	1964	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	526	1254	509679	508483	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTCSSSFARRVSPTCWRHCPRPRPQGSAPAGEWGARSAHSWGDSAELADTSLCRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511098	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509712_509829_509957_510732
582824	contig_5210_pilon	-	1874	6	Intergenic	novelGene_65404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	35.5302687859239	479	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	72	1127	242656	233076	FALSE	45	AAAAAGATTTTAAAGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPAAALGASALGQSGPGSMAPWCSVTSGPSRYVLGMQELFRGHSKTREFPAHSAKVHSVAWSCDGRRLASGSFDKTASVFLLEKDRLVKENNYRGHGDSVDQLCWHPSNPDLFVTASGDKTIRIWDVRTTKCIATVNTKGENINICWSPDGQTIAVGNKDDVVTFIDAKTHRSKAEEQFKFEVNEISWNNDNNMFFLTNGNGCINILSYPELKPVQSINAHPSNCICIKFDPMGKYFATGSADALVSLWDVDELVCVRCFSRLDWPVRTLSFSHDGKMLASASEDHFIDIAEVETGDKLWEVQCESPTFTVAWHPKRPLLAFACDDKDGKYDSSREAGTVKLFGLPNDS	242727	232328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_233240_235392_235494_235623_235786_240055_240261_241604_241762_242389
582831	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582842	contig_11285_pilon	+	1554	12	Intergenic	novelGene_5614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	499.956378262433	2	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	29	676	766060	768758	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTSACQTPRP	763529	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767732_768723_768857_769085_769320_769421_769657_769749_769979_770114
582851	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
582882	contig_15063_pilon	+	1004	4	Intergenic	novelGene_9693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3553.87266075881	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	239	1003	34808	36144	FALSE	30	CTAAGCCAAAGGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTM	27130	36145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839
582894	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
582899	SIRV6	+	412	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10413	1	1176	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
582913	contig_4754_pilon	-	2427	2	Intergenic	novelGene_35887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAATGGCAAATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76476	73869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_75694_75873
582938	contig_17074_pilon	+	1956	12	Intergenic	novelGene_145207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	217.920070266126	1079	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	64	1467	841610	861409	TRUE	10	CTTACCCAGCTGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQAWRESWGGSLGSGRPRATMDRRKKALDVTTSSLVDLKAELFRKQEEFKQEKLLKDSGVSGKPKTTHKKPSIWSKQNAGVSNRAEKDAEQKIEEQKTLDKAREKLEEKAKLYEKMTKGDFIDEEVEDMYLVDFTQKIIDKRKEMDTFSANRDSRKAEEREDEEENLSERDVPPPQDSSEEWVDYVDSLGRSRRCMKKDLPDLLEMDKNLQGRLFISPANEKTLLSEDMRKELQRQQWEEEEREALKRPMGPIHYEDIRENEARQLGVGYFAFARDKELRNKQMKTLEMLREQTTDQRTKRENIKEKRKAMLEARLAKLRQKKMKKSKEDGAEKENGDEDVIGHLPPEPEALPTPPTAAQSSKVEVIVQERKDTKPGVPHVREWDRGKEFSFGNWSKRQSALRAERDPEFAPPSDYFTGQKRTGPFGGQRWSRPGPAQSGLGPVSGQSHQPPSSHASSTPASDGPPQAPTITFETLDDMISYYKQVT	841546	862936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_841652_843132_843238_843963_844065_849757_849817_851928_852107_855183_855280_856366_856510_856977_857073_857795_857929_859871_860025_861110_861628_862665
582939	contig_14925_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_55165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	1555.7699661261	26	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	206	463	29675	27020	TRUE	20	CAAAGGCTGTGCTCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGKLTFGDGTTLTVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	61675	25793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_61622
582953	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
582958	contig_15744_pilon	+	947	4	Intergenic	novelGene_83578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3310	junction_2	365.30748083711	21204	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152706_153245
582959	contig_5967_pilon	+	1660	10	Intergenic	novelGene_44390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCGCACCGAACCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388172	517598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_388933_403378_403477_412505_412603_420335_420431_423959_424057_430700_430794_465403_465532_482467_482550_488455_488581_517513
582960	contig_3095_pilon	-	1305	5	Intergenic	novelGene_75244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	665.353806256491	53	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTACTCTGAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255559	246375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247749_247970_248476_248759_253535_253806_255380
582965	contig_3132_pilon	-	4458	10	Intergenic	novelGene_127462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_6	25.703436864876	100	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	104	1141	522800	461147	FALSE	0	CTGGGCTGTGTGCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGTDGPSGFGFELTFRLKRETGESAPPTWPAELMQGLARYVFQSENTFCSGDHVSWHSPLDNSESRIQHMLLTEDPQMQPVQTPFGVVTFLQIVGVCTEELHAAQQWNGQGILELLRTVPIAGGPWLITDMRRGETIFEIDPHLQQERVDKGIETDGSNLSGVSAKCAWDDLSRPPEDDEDSRSICIGTQPRRLSGKDTEQIRETLRRGLEINSKPVLPPINPQRQNGLTHDRAPSRKDSLESDSSTAIIPHELIRTRQLESVHLKFNQESGALIPLCLRGRLLHGRHFTYKSITGDMAITFVSTGVEGAFATEEHPYAAHGPWLQILLTEEFVEKMLEDLEDLTSPEEFKLPKEYSWPEKKLKVSILPDVVFDSPLH	522903	457829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_461237_463741_463811_472969_473109_474931_475067_490202_490315_492332_492490_495265_495339_495616_495703_496627_496771_522766
582967	SIRV6	+	866	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	6	-441	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
582968	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
582981	contig_11720_pilon	-	1716	11	Intergenic	novelGene_43878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	81.0811938737954	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	541	1251	110844	108246	FALSE	20	GACATGTATGTGTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASLLLVTWMGPWPSMTCLRRPSGTSVSTSRASCSCCGRRAQLWFTPAAWMALCAFGMLAPAACLPTTGATRPRSWTLLSAKTPPWW	113368	107780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109022_109209_109289_109573_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112683_113170
582999	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583009	contig_4531_pilon	-	2510	8	Intergenic	novelGene_47919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	58.0699788959803	265	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	789	1286	422163	418573	TRUE	15	TATACGCATTCTGCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRLNFF	423585	412736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_421469_421547_421757_422218_422851
583014	SIRV5	+	376	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAGAGGTCGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3280_3405_3483
583030	SIRV4	+	253	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1518	632	1063	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2518	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
583036	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_93313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657829	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSAVAPSWSSKVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657789
583043	contig_3077_pilon	+	1667	9	Intergenic	novelGene_26596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	3423.49873804198	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	148	720	9676	15245	TRUE	20	TAACAGTGTGCGGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKTPGFHHSHDLPVSWGLASDHRTSQPPVQRPEGRKF	9528	18080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
583051	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583053	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583059	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
583060	contig_12622_pilon	-	1812	14	Intergenic	novelGene_6036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	360.330617414277	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	368	1444	1690387	1685486	FALSE	25	TTAAAACCCTGTCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEARQLPSRTRSSSSPGSPSSRVSANTPATSTAPAPSACITGWRPYIPGRVWGALRCTTEGDDRFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691221	1685117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691026
583067	contig_13528_pilon	-	1797	13	Intergenic	novelGene_66871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	185.0472161969	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	201	1478	67895	40217	TRUE	30	AATAAATTGTCTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSAEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQIWQMAENIYNDEESDVTASELEGQGS	68095	39845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40070_40121_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
583070	contig_1076_pilon	-	1971	15	Intergenic	novelGene_101091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	328.930487042661	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	210	1616	79519	51437	TRUE	20	TTGTATTTTAAGGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKG	79728	50700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51438_51835_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
583073	contig_7887_pilon	+	1877	5	Intergenic	novelGene_124928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.458146988521	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	269	862	580030	585706	FALSE	30	AAGCAAAATGCCTGTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKNWLGRWMEKSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	577202	586721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_577295_577973_578059_579938_580066_584657_585122_585612
583087	contig_15029_pilon	+	443	2	Intergenic	novelGene_128187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAGAAAATTACAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160723	163149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_161067_163049
583089	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
583090	contig_7202_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_16640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATCTTCCGCAGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
583095	contig_7342_pilon	-	2156	20	Intergenic	novelGene_71107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	120.476638808588	1	54	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	1090	2097	78723	76155	FALSE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSDSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86823	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76336_76392_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80953_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
583096	contig_6048_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_73343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACATTCTACCTTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2907823	2908174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2907800_2908200
583105	contig_6898_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_35753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAGGGCTGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119545	118671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_118700_119500
583106	contig_6488_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_44756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	412.869094131407	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	127	735	193038	183543	TRUE	45	ATCCATCAGCAAGGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHQAETPAHHKPPRSQRPSVPSKASGHDRSTRGPAAGARRPRMKKKIQFRVARSEEMAQREEVARTEEMAQSEEMARSEEMTRSEEVSQSEEMAATGLNVTVSHNNEKHNLYVTLQQGTSEPVVQDLAQLVEEATGVPVAFQKLIFKGKSLKEMEQPLSALGIQNGCRVMLIGKKNSLEEQVELKKLKDLEKAVEKIANQLEELNKDFAGIQQGFLAKDLQAEALCRLDRRLHRFCQKISKTVD	193164	181526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_182487_183513_183585_184465_184520_186801_186916_189040_189124_190955_191085_192851
583107	contig_10197_pilon	+	3117	2	Intergenic	novelGene_115242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	650	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAATCAAACTCTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981548	996027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_984177_995538
583116	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_94970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
583117	contig_8616_pilon	+	1287	10	Intergenic	novelGene_72568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	884.20321947691	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	18	878	425778	431241	TRUE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKR	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431253_435860_435900_435993_436119_436357
583145	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583149	contig_12624_pilon	-	1613	4	Intergenic	novelGene_61120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	757.822465283848	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	92	454	955789	948779	TRUE	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQPVGSCWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQAGPDEGEDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955880	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947976_948111_948842_950590_950768_955666
583167	SIRV7	-	394	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-41	3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCTAAGAGATCGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114779	56034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70877_70988_78841_78964_114680
583168	contig_6576_pilon	-	1681	13	Intergenic	novelGene_42227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	94.2577361988571	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	370	1344	252452	229096	FALSE	80	AAAAGAAAAAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	260475	228758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_260309
583173	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
583183	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
583186	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
583187	contig_17281_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_105189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGACTGAGATTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3000
583200	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
583204	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_91311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
583209	contig_14322_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_116491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671620	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
583216	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	635	1116	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
583221	contig_9363_pilon	-	1675	9	Intergenic	novelGene_6568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1130.8300878116	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	176	1177	786587	753891	FALSE	25	TGATTTTTATATATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGNLLWVKIKRSTTDPLLSENFLHGRVHSPAGACAAGTELPWRSHWWSQVLVSQHEPVPAHRTLQLMGSINMSNEQ	787941	753392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754113_776028_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
583228	SIRV4	+	254	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1517	632	1062	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2517	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
583229	contig_15449_pilon	+	1407	4	Intergenic	novelGene_33628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	870.173545909091	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	181	453	84917	88945	FALSE	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGGAALPVEIRGGRQDSLAAVPAAVHWVRGRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	62243	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62336_84828_84953_86000_86181_88888
583233	contig_15245_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_145229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGAGCACTTAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121683	121974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_121700_122000
583242	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_90919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
583243	SIRV7	-	289	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91631	6	-91625	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTATAAAACTAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
583248	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
583266	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
583279	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583280	contig_5472_pilon	+	4452	1	Intergenic	novelGene_130042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTACAACTCCTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450273	454725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_450300_454700
583282	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583297	contig_11338_pilon	-	1593	12	Intergenic	novelGene_6221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	95.7431135991142	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	789	1457	13877	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21394	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14105_14167_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
583298	contig_14322_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_116108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	17	51	249	299	671606	671656	NA	10	GCGGCTGTGGGGAGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQ	671357	671657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
583302	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583306	contig_3410_pilon	-	2013	4	Intergenic	novelGene_58899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	776.922275534832	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	128	574	57649	15127	FALSE	5	CGTTGAGCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLFCLGVGPSKKAGWTMAELALDLLDSPG	57776	13687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15210_32168_32250_34217_34324_57472
583314	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	83	503	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
583316	contig_8284_pilon	-	3204	12	Intergenic	novelGene_125678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	41.6224669147098	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	607	1059	359509	336801	FALSE	10	AGCTTTTATTCCTCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDSFFDDPIPKPEKTYGWRSEPSKQGGSLASLSDAPPLKSGLSSLAGAPSLKDSESKRGDAVLTDLKLVGDKIGSLGLGTGEEDDYVDDFNSSSRRSGNSQLSIGEETEEGLSVEADDISASDKLDDLTQDLTVSQLSDVADYLEDVA	389194	334655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_336876_340850_340948_347191_347232_352660_352730_354347_354461_359450_359675_371059_371141_378229_378287_378819_378901_379280_379336_387208_387263_389081
583328	SIRV4	+	394	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	11	-911	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTGAAGTTGACGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	1860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
583337	contig_15185_pilon	-	1480	8	Intergenic	novelGene_99455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_7	330.131080954588	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	205	1029	444599	429911	FALSE	10	GAGCCCATCTGTGTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	446389	429459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_446286
583342	contig_15236_pilon	+	2954	1	Intergenic	novelGene_141653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692014	694968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_692000_695000
583344	contig_9345_pilon	-	1715	7	Intergenic	novelGene_24672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1956.1874200143	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	278	859	955353	947957	TRUE	10	CACCAGTCCTCTTGGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001352	946995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947055_947159_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
583351	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_96636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
583364	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
583376	contig_7202_pilon	+	184	1	Intergenic	novelGene_16446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGGGTGTGCTTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
583401	contig_12427_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_40478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2469.20669193569	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	132	569	316061	315376	TRUE	65	ACTACAAAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDVLVCFFSLLLKPAITAVEVVTLPRTARSPRESESSAATTVANQAILLVTVTMLMSRSAILVANLDTFKKTAPK	325970	314223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315597_315748_315842_315937_316079_325856
583403	contig_9807_pilon	+	2246	16	Intergenic	novelGene_32873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	638.866252739092	1	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	820	1716	140826	157176	TRUE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	109028	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128613_139399_139478_140300_140386_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_157171_157384_158676
583404	contig_11631_pilon	+	2264	7	Intergenic	novelGene_104205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_1	452.209298887141	6	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	131	538	257411	260601	TRUE	40	GCTTTAAAATGAAAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVKISCLKIQ	257280	283579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257554_260336_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390_281540_283353
583407	contig_12638_pilon	+	2949	2	Intergenic	novelGene_33193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_1	0	7	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGCTGCTCTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271320	274395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_273999_274124
583419	contig_5947_pilon	+	2628	1	Intergenic	novelGene_101475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	557	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACTTTGGTGGTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91864	94492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_91900_94500
583432	SIRV6	+	317	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10508	1	1271	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11508	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
583439	contig_13823_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_145281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATGAAAGAAATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340716	341339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_340700_341300
583445	contig_7202_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_17554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATTCTTTGATGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27624	27889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
583471	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTAATTTGGTACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583475	SIRV4	+	218	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	643	1087	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
583493	contig_3700_pilon	-	3464	3	Intergenic	novelGene_138070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	12.5	79	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	268	567	177307	177008	FALSE	60	GAGTGAAGGAAAAAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSYPHQFPSNPSQGPLNRRQHDGVFPTLQLQKLEQGPEKPRKQHMSKAFRATLRKLLIGLLSVVPVDIVRRDLPISVGFHHTWMPFLLGLLKSHIHL	266439	174110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_177317_264736_264850_266294
583503	contig_14513_pilon	-	767	5	Intergenic	novelGene_70319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1206.69393385398	83	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	198	641	18880	11414	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIWTRVSNPLISRGALNHLHHPGTSAMPA	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11498_12038_12158_13087_13136_14952_15001_18735
583505	contig_14441_pilon	+	1333	7	Intergenic	novelGene_100535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	366.194127327144	4	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	722	1150	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113670_113711_114537_114732_115468_115611_116578_116963_117220_117344_117539
583506	contig_8616_pilon	+	1368	10	Intergenic	novelGene_72556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	872.4412888379	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	20	1312	425778	436535	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRWTTSHIHGGNWILAVRRPRRWFESTFPGRGPSSMWAEPSTRARSSSEHLAVA	425758	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436097_436375
583520	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_17727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTCACGTAGTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
583527	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583565	contig_504_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_54417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGAAAGAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142273	141585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_141600_142300
583567	contig_5758_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_119141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	847	1248	667401	667802	NA	20	CTGTGTACTCAGTTACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCACFSALWECWLGSEPAEGCGCCRRGLGRPVFWCDVALSAHHIESHGMVFLHGVIMLHFKLNLQMLSCLLSVPALAGPMHRVNCLRRAKVLSVLRNSSMDGAEFTLLPLSHRVVAFAEAMAESTASPGCWD	666554	669295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_666600_669300
583576	SIRV4	+	314	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	652	982	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
583577	contig_7571_pilon	+	2055	4	Intergenic	novelGene_106391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.783429475148	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTGTGTGTTTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74231	78053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_74308_74425_74552_74647_74732_76284
583585	contig_11171_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_48583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCTTTGAGCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105916	107860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_105900_107900
583587	contig_15087_pilon	-	1775	21	Intergenic	novelGene_37217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	526	junction_4	969.706883547807	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	126	1769	158925	118850	FALSE	15	CTCTGGGCTGAGCAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILVSALFFMWIVTLPLRGV	181165	118843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
583594	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
583595	contig_8762_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_145289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAGTCAAAATAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90526	90130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_90100_90500
583597	contig_253_pilon	-	3016	21	Intergenic	novelGene_129743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_11	144.9998620689	326	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	15	2042	691384	673139	FALSE	20	AAATGGTGCCTGACTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSYLMAMEKSKATPAARASKKILLPEPSIRSVMQKYLEDRGEVAFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMAVELPDSFSPELRSLLGGLLQRDVNRRLGCLGRGAQEVKESPFFRSLDWQMVFLQKYPPPLIPPRGEVNAADAFDIGSFDEEDTKGIKLLDSDQELYRNFPLTISERWQQEVAETVFDTINMETDRLEARKKAKNKQLGHEEDYALGKDCIMHGYMSKMGNPFLTQWQRRYFYLFPNRLEWRGEGEAPQSLLTMEEIQSVEETQIKERKCLLLKIRGGKQFILQCDSDPELVQWKKELRDAYREAQQLVQRVPKMKNKPRSPVVELSKVPLIQRGSANGL	691398	672164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_673304_673391_673506_673757_673895_674060_674224_674437_674534_674610_674678_675192_675294_675610_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641_680719_691313
583611	contig_13481_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_119396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTAGTAGGAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526365	537294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_527242_527458_527529_536155_536304_536767_536918_537231
583650	SIRV7	-	349	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	1	0	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
583665	contig_10341_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_47236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128419	126326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_126300_128400
583667	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
583671	SIRV6	+	289	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1143	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7856	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7924_10724_10814_11031_11109_11205
583683	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
583690	contig_9594_pilon	-	1766	11	Intergenic	novelGene_73948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	512	1216	321995	315301	TRUE	40	AAAATCGAACGCAGCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFILCVPFGTASGSVSTTYDGDAAPGSGFYHFIHESFGSPGKSFPFKYSHRSVPHNLLSPSDSLSILLAALRTTVQAHPASGYARGHGGLASLGILIKLVSGDKVNRQGNLHTILLSFGHQVFDNLGSFFIKQRSANLHAVEHFKKGKSHSTTNNHLIDFVQHIIDQLDLVCNFSSAQDGQEGSLWALQGFGKVIQLLLHQETTSLLWQIHSHHGTVGSVSSAKSIIDVDIT	322881	301241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_301398_307476_307539_310448_310582_310702_310849_315247_315352_316196_316318_319364_319479_319721_319903_321479_321657_321934_322034_322408
583694	contig_14209_pilon	+	2303	13	Intergenic	novelGene_88335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	186.72238751687	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	35	853	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32331	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_38078_38273_38394_38557_38783_40142_40344_40418
583702	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
583711	contig_19564_pilon	+	1167	4	Intergenic	novelGene_29572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_3	197.26293789424	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	276	767	7599	9682	FALSE	35	AATGAATGTTACAGTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRLQEPPTPQSWLFMSPWEQGPLLSSSLYFPSFPRSQLIMQAEAEAESVRMRGEAEAFAVEARARAEAEQMVKKAEAFQLYQEAALLDMLLEKLPQVAEEISGPLTSANKITLVSSGSGTIGAAKVTGEVLDILSRLPESIERLTGVSISQVNHNKPLQTA	7323	10082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_7755_7878_8017_8469_8635_9649
583716	contig_11752_pilon	+	1194	7	Intergenic	novelGene_37597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1201.34794663698	10	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	115	501	87165	88665	TRUE	50	ATATTACTGTGAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTA	84087	105889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88660_88721_94211_94410_96442_96572_100956_100976_105597
583719	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
583724	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583732	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1584	632	1129	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
583736	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
583744	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	20	GCTGGTACCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
583745	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
583752	contig_16999_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_84977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAGAGAAGATATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_73600_74000
583769	contig_15165_pilon	-	2836	5	Intergenic	novelGene_145319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	28.252212302756	217	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	817	1881	224352	219132	TRUE	35	AAAATTTCACTTTTCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLEAKKPSVCESKPLTRERLRTTLSVLKGIVASCYGPSGRLKQLHNGAGGHVCTTSQSSALLRGLSVTHPVLKILTTSMQNHVSCFSDCGLFMAILCCNLIEYVEGIDLAPTTVIELNKQLLSLCTSYLKSEACACRIPVDFSSTQILLCLVRSILTSKPACMLTGKEVDHISALVLRAFLLTIPEKAEDHIILGKSIIVPLKGQRVIDSTVLPGMLIETSEVQLMRTLPIKKSSALKVALFCVSLSGDFSDTGEGTLAVSYGVSLESAVLDQLLNLGRQLVWDHIDLVICQKVIHPSLKQFLSTHHVIAIDRVGVALMEPLSKMTAHMSNSTACLAVNNQGTFCVFGRWLY	246833	216326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_217251_219100_219212_223367_224773_246278_246461_246619
583782	contig_12250_pilon	+	2575	6	Intergenic	novelGene_80614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	51.3941630927093	343	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	405	1595	350196	353450	TRUE	10	TCCTGTAGTTGGAGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSCPLPVQSEWVPPGI	349359	354969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_351968_352256_352433_353405_353766_354304
583806	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_113837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	16	345	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14424	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
583808	contig_2278_pilon	-	1138	10	Intergenic	novelGene_118120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	151.524842114347	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	274	681	956893	942172	TRUE	35	AGCATTCATCAGGAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKGRI	999177	940414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942184_943395_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_956857_956913_998923
583809	contig_5549_pilon	+	2428	12	Intergenic	novelGene_81606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	35.9742791495615	4	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	120	1868	304420	367494	TRUE	75	AGAAAAAAGAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAEEEAADGRRGREGCGREGSVRAGSALECGEGYFSWCMEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWR	303568	369611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367701_369257
583812	contig_1337_pilon	-	2523	12	Intergenic	novelGene_84243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	45.8180014426464	476	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	229	1581	450056	428635	FALSE	30	GCAACACCTGCAGTCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKKRNTPHRGGSGGGGTGAAAATAVAAGSQHRNVQPFSDEDASIETMSHCSGYSDPSSFAEDGPEVLDEEGTQEDLEYKLKGLIDLTLDKSAKTRQAALEGIKNAMSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGKSDEQCAAAALACVLCIQLGPGIESEEILKTLGPILKKIICDGTTSIQARQTCATCFGVCCFIATDDITELYSTLECLENIFTKSYLKEKDPNGICSTPTTVLHISSLLAWTLLLTICPINEVKKKLEMHLHKLPSLLSCDDVNMRIAAGISLALLFELARGMDNDFFYEDMESLTQMLRALATDGNKHRAKVDKRKQRSVFRDILRAVEERDFPTETVKFGPERMYIDCWVKKHTYDIFKEVLGSGMQYHLQSNEFLRNVFELGPPVMLDAATLKTMKISRFERHLYNSAAFKARTKARSKCRDKRADVGEFF	450284	427692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_428725_431514_431611_432042_432172_434959_435095_439321_439431_439518_439698_439779_439831_442539_442698_444397_444523_445308_445394_445524_445630_449965
583819	contig_13138_pilon	-	2159	3	Intergenic	novelGene_143156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_2	231	723	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	511	987	201199	200723	FALSE	10	CTGCTCTGAATTGCTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSCGDTSVGFSVGIFLFLLLLFFGIGCVWHWKHPNTTRFTLPKFLRRKESKRNDYAKTPSFSPQVIGLKHKISVQTQGHRSAMGKTNIHGNYENVEARPPKAREETDKEIYENTRQSNFEEHIYGNETLSDDCYFLKPSTSAAPQEEDIYILPDSY	204484	199550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_-_201601_202073_202139_204440
583825	contig_15304_pilon	-	1187	4	Intergenic	novelGene_30602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	216.813796199002	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	186	1049	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_65112_65310_65396_65721_66104
583829	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
583830	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7024	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
583849	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_116097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671648	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
583855	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	172	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
583862	contig_6365_pilon	-	2355	4	Intergenic	novelGene_133994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_3	49.9688792038494	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	266	766	12349	11849	TRUE	45	AAATAGTATGAGTCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKGNRGTPSLQPTTSLNRALLWSYLIYPFPTLRLSSHNNGETSNVNQFTIYVFPFSVMSIDVFWKVYFGFIKEQKAEKK	17706	9468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_10535_11092_12368_17459
583867	SIRV5	-	479	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTACAGTAAGGACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
583881	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_97377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583889	contig_13051_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_140116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTCAGCAAATATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234446	235334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_234400_235300
583892	contig_5423_pilon	-	2749	1	Intergenic	novelGene_85185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAACCAAAATCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188775	186026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_186000_188800
583903	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583905	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
583910	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_95071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583914	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
583915	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
583925	contig_8617_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_73405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62339	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
583955	contig_3627_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_78465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACACACCTTGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326314	324491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_324500_326300
583956	contig_15047_pilon	+	1057	6	Intergenic	novelGene_52128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	5	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	464	661	4573	21265	FALSE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSREGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGNPVLQVVTVPRALMCLSQLLKCEITALCDTE	2164	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_3416_3498_4158_4434_4552_4676_20999_21062_21232
583966	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
583973	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_95096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
583983	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
583994	contig_11752_pilon	+	1379	8	Intergenic	novelGene_37617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1094.78045511324	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	513	1076	88745	105606	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDNLSFFIQHE	84092	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87274_87329_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_105574
584002	SIRV4	-	319	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGATTGCCACAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2700
584012	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	641	980	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
584022	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584033	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
584039	contig_15459_pilon	+	1441	3	Intergenic	novelGene_106359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	198.5	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTGTTCTTTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8161	12167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8217_9156_9268_10892
584053	SIRV5	-	344	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACCTGGCTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
584058	contig_7202_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_18303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	45	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28079	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
584075	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584087	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
584096	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
584097	contig_6069_pilon	-	2708	13	Intergenic	novelGene_8062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	54.6836863749652	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	275	2065	515252	498920	FALSE	15	GTCTAACATGTGCGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLTEAQWLLASVREAVSFRVRPRDAASGRGPPGCRRRCHVSAVAAAAAASGLHLGDAEPRRELRQQLSRLQRNVLLTLLAFLIICGLLSYMNTTHHWKALSGRSSEKQKARPDIPGLKPVNPPVLPAPQTAGAAQGLPEIPPQKPRKHSRRGPPSLQIRAPDKDVKDRIQDRVEQEQEEPGNAHKENSQRTVISWRGAVIEHEQGTESPSRRADVPTNRPGPESRTQKASAPLNKRQKAVVEAFRHAWKGYRKYAWGHDELRPLSKSFGEWFGLGLTLVDALDTMWILGLTKEFEEARKWVSQKLQFQKDVDVNLFESTIRILGALLSTYHLTGDSLFLEKAKDFGNRLLPAFKTPSKIPFSDVNIGTGIAHPPRWTSDSTVAEVTSIQLEFRELSRLTGNEKFQEAVVEVTRRVHSLSGKKDGLVPMFINTHSGHFTHLGVYTLGARADSYYEYLLKQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	516028	498276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501622_505367_505557_505922_506072_506906_507093_508364_508475_509812_509965_514285_514420_515227_515325_515826
584108	contig_18794_pilon	+	2144	13	Intergenic	novelGene_54642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	378.002966993059	770	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	355	1659	145406	172468	FALSE	15	TATATTTGGGTGGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEEDCHSESVRAEDDEKESPAETDLQAQLQMFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISVLPMEVLMYIFRWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRGCIKLVPYTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYIRFFPDGHVMMLTTPEEPQSIVPRLRTKNTRTDAILLGHYRLSQDTDNQTKVFAVITKKKEEKPLDYKYRYFRRVPVQEADQSFHVGLQLCSSSHQRFNKLIWMHHSCHITYKSTGETAVTAFEIDKMYTPLFFARVRSYTAFSERPL	145051	172953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145409_152183_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_166873_167941_168038_168360_168455_169970_170123_172359
584113	contig_8617_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_73479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGAATTCCGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
584118	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
584119	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_96623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
584128	SIRV4	+	271	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	661	1016	-29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAACATAAGTCAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
584142	contig_12951_pilon	+	2482	6	Intergenic	novelGene_68146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	250.27776569244	678	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	13	705	185318	198423	FALSE	35	CTGGTAAGCAGTAATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSKMAAQQQAVEGDAQLAGPAAAAEVDPLGRFTCPVCLEVYEKPVQVPCGHVFCSACLQECLKPKKPVCGVCRSALAPGVRAVELERQIESTETSCHGCCKNFFLSKIRAHVATCSKYQNYIMEGVKATTKDASLQPRNIPNRYTFPCPYCPEKNFDQEGLVEHCRLFHSTDTKSVVCPICASMPWGDPNYRSANFIEHIQRRHQFSYDTFVDYDVDEEDMMNQVLQRSIMDQ	185305	200200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_185464_191449_191601_193116_193224_193596_193712_196924_197033_198357
584143	contig_15063_pilon	+	1111	3	Intergenic	novelGene_14383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	146	967	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35125	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
584146	SIRV7	-	296	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91630	0	-91624	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTATAAAACTAGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
584166	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
584167	contig_5698_pilon	+	2106	8	Intergenic	novelGene_55023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	1	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	20	655	4103	19438	FALSE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTICKILQYIGGKRKRIQHVVI	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19259_19377
584186	contig_14322_pilon	-	154	1	Intergenic	novelGene_115690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671428	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
584190	SIRV6	+	641	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCGGTCTTACAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2616_2740
584198	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
584204	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_115804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
584223	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
584249	contig_11416_pilon	+	2691	1	Intergenic	novelGene_145366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	694	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	588	1232	567917	568561	NA	15	TCTCAGCCCCAACTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVYALESRGHRHQKTAIFISVSVFILVGVVHYPVFQMEEQDTCFEALPTDNRIARYYYSRFVVGFAIPLFIIAFTNHGIIRRVRLSVGLSASQKAKVRHFAVAVVLIFLVCFAPYHLVLLIKAVAFSYHQDNKAALCAFEASLYMASVTFLCFSTVNSVADPIIYVLATDNSRQKISRIHKEWKVWTTKTDVIKFTCSKDLEEAKSATHELL	567329	570020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_567300_570000
584287	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
584290	contig_11720_pilon	+	1706	13	Intergenic	novelGene_43966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	396.743016111605	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	938	1465	270117	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262264	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265755_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267865_270045_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
584292	contig_1275_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_108864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	629	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	401	811	747710	747300	NA	60	CTAAAATTTAAAAACGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGFHLQGDGLSR	748110	747272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_747300_748100
584299	contig_14158_pilon	+	1930	4	Intergenic	novelGene_136114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_2	57.7831194111991	986	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	150	620	18010	25162	FALSE	10	CACTGTTCCTGTCTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	17860	26472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21301_24096_24236_25090
584300	contig_5033_pilon	-	2260	15	Intergenic	novelGene_28982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	2	111	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	3	1577	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566789	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531135_531592_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
584304	contig_14822_pilon	+	1154	5	Intergenic	novelGene_145417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_4	414.334707694154	3857	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	40	426	183396	186229	TRUE	20	AGACTTTGATGTTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCLVSLRSGDNKMSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFR	181679	190343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181708_183384_183502_185583_185738_186102_186594_189979
584305	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
584328	contig_7202_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_18617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATTTTCTTCACCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30101	28587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
584335	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
584342	contig_17274_pilon	+	2149	14	Intergenic	novelGene_26530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_1	310.335092798873	145	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	65	1411	131715	186645	FALSE	40	TGCAAAATTCTTAAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGKEN	131650	187383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547
584358	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGAGGCCGCCGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
584360	contig_9177_pilon	-	1880	9	Intergenic	novelGene_32628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_1	1649.95798715452	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	331	1485	26442	22687	FALSE	10	GTTACTGGTGCTCGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLVSLGAQRRKSFGIFRE	26772	22291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312
584361	contig_10437_pilon	+	1360	2	Intergenic	novelGene_38160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160058	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160131_162803
584365	contig_1521_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_145447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	81.5	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	21	737	191760	163608	FALSE	55	CTATAAAAAAGAAGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREGMHCSSSDFLKVLLFKHFFN	191780	163336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_163981_179059_179258_191614
584378	SIRV7	-	298	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91622	6	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
584391	contig_10159_pilon	-	2580	8	Intergenic	novelGene_30903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_6	214.3059990399	5	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	524	979	1027025	1004067	FALSE	15	TGATTTTTCTGCACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1056777	1002465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1050916_1051092_1056677
584396	contig_1836_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_71050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828964	826743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_826700_829000
584408	contig_11816_pilon	+	2499	8	Intergenic	novelGene_98452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	624	junction_5	521.851570108292	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	157	2313	420896	445813	FALSE	40	AAAAAAGCCCTCGGGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSGRGAGAIVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSSAATGGSTSDSAHGGINTGITGILPGSLFRFAVPPALGSHLTDNVMITVDIIPSGWNSSDGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQECMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLQLNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGSTNEPSTRVRVSNIEVGRREGVIQQVFALGGRMPYIFTSDFLWGSITLKCFFKMKIL	400512	445999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433939_437138_437309_442782_442893_445555
584415	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
584421	contig_4009_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_145457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTCAATTTTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519283	519084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4009_pilon_-_519100_519300
584423	contig_10196_pilon	+	1275	10	Intergenic	novelGene_132136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	460.104818975464	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	303	1085	1038364	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034551	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1034995_1035140_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
584424	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
584428	contig_2867_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_135235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTAAGTGTACAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224756	1225054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1224800_1225100
584440	SIRV7	-	336	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	7	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
584443	contig_5020_pilon	+	1425	9	Intergenic	novelGene_27799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	871.911943661744	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	370	1425	122915	126094	FALSE	5	CTCCCTCTCTTGTAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTHILTPPLYLISPFSLSPGGIDPTLAPARIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPPIKQAQPWCL	118455	126094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125711_125906
584453	contig_5954_pilon	-	2391	15	Intergenic	novelGene_28676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	406.094766259889	3	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	650	2035	956264	945083	FALSE	10	CTGGACCATCCGTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQVPGRPGPGNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960567	944726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947842_948065_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
584455	contig_10958_pilon	+	1260	2	Intergenic	novelGene_5481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCTTGATTGCACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895721	901584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
584484	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_90328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
584485	contig_5481_pilon	-	2890	2	Intergenic	novelGene_144561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	0	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	489	1709	58351	49411	FALSE	35	TATTCATTTCACGTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIESCQREIMGLTRQSLEYSNFRDILVYRIDFERQLGYFSQEILTHECMPTFIQHTFLTLHQIINNEEKPYECKKCGRAFSQSSQFIQHQRVHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFVCKECGKAFSCNSYLLQHQRIHTGKKPYECKECGKTFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYKCKVCGKAFTKSSQLFQHVRIHTGEKPYACKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLHQHQRIHAGEKPFECLQCGKAFTQNSQLFQHQRVHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKTFSSGSDLVRHQGIHTDG	58839	48229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_50595_58314
584492	contig_16310_pilon	+	1955	3	Intergenic	novelGene_70085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_2	1696	29	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	170	310	285976	288728	TRUE	25	GTTGTTCTAACAAAGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNAVSVPPCS	285806	290620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_289633_289879
584504	SIRV4	+	383	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	933	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2388	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
584507	SIRV7	-	341	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33215	13	-4	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114742	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
584558	SIRV6	+	387	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	137	11	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCGTGCCGCTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
584572	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
584576	contig_6098_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_145470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCAGCAAATCCTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48786	49504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_48800_49500
584580	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
584581	contig_7202_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_17683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCATCTTCCGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
584592	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
584597	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_16512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
584600	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584608	contig_18869_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_56155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTACCTTCCCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
584616	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584618	contig_3602_pilon	-	1586	11	Intergenic	novelGene_60667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_10	198.705712046735	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	51	938	1139393	1106687	FALSE	15	ACTTTTGCATGAGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139443	1106038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
584623	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
584630	contig_7202_pilon	-	401	2	Intergenic	novelGene_18600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAACTGATGAAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
584654	scaffold_21177_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_145487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184642	186652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_184600_186700
584670	contig_11677_pilon	+	1640	9	Intergenic	novelGene_85970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.3211642841497	74	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	239	1216	723423	725272	FALSE	30	TCCACATCAAATTGCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRLSQIGVENTEENRRLYRQVLFSADDRVKKCIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVHMIQDKGIVVGIKVDKGVVPLAGTDGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKITERTPSALAILENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALNDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIKYTPEEIAMATITALRRTVPPAVPGVTFLSGGQSEEEASLNLNAINRCPLPRPWALTFSYGRALQASALNAWRGQQDNAEAATEEFIKRAEVNGLAAQGKYEGSGEDGGAAAQSLYIANHAY	721803	725696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_721917_723207_723328_723417_723630_723740_723796_723891_724053_724168_724253_724501_724677_724804_725005_725176
584671	contig_12427_pilon	-	2611	4	Intergenic	novelGene_40428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	321.90302197332	1190	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	95	733	264797	229966	TRUE	25	GCCAATGACGCCAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTLEIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPNWIEDVRKYAGSNIVQLLIGNKSDLSEHREVPLAEAQSLAEHYDILCAIETSAKDSSNVEEAFLRVATELIMRHGGPMFSEKSTDHIQLDSKDISESWGCGC	264891	227580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_227785_228291_230217_230601_230786_264593
584674	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
584691	contig_6589_pilon	+	2568	6	Intergenic	novelGene_26181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.0984573286766	11	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1675	1998	1903744	1911490	TRUE	15	TTGATTGTGTTCTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901824	1913577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1903026_1903069_1903448_1903648_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
584695	contig_13894_pilon	+	1200	9	Intergenic	novelGene_62143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	91	1146	521729	528117	FALSE	15	GACACCTGCGTCTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521638	528171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
584697	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
584701	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584705	contig_14925_pilon	-	1087	6	Intergenic	novelGene_55139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1757.73938910181	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	292	549	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERHSSLHITASQPRDSATYLCARLYYCDNNNNAPHFGAGTRLRVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	276352	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_80667_80741_276286
584708	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_17955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584711	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_93693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
584731	SIRV4	+	156	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1158	2	-1158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGTTAACTTCGCGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
584746	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_9345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	241	1416	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
584759	contig_5799_pilon	+	2254	17	Intergenic	novelGene_50296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	228.857616420669	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	446	2032	619664	717769	FALSE	35	ACTTTCCATTTAAATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	560976	717991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605485_612830_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
584760	contig_14513_pilon	-	1301	4	Intergenic	novelGene_70243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	10	TCTGCTTTTGTCCATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
584772	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_94859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
584787	contig_5454_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_145497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATGGGGGAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100597	100917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_+_100600_100900
584788	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	23	346	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14431	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
584802	contig_16046_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_145510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACTTACCAGACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122109	123591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_122100_123600
584815	contig_14176_pilon	+	2658	9	Intergenic	novelGene_74845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	120.331767937648	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	77	787	246102	271823	TRUE	25	CTTAACTTGGAAAGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVNYSSALRTCEIQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRFAKYYKMENGSEYRTLLKAFGIRFDVLVYGNAGKFNIIPTIISAVAAFTSVGVGTVLCDIILLNFLKGADQYKAKKFEEVNETMLKVAASANPVYPSDQTTEEKQSTDSGAYSIGH	246025	273763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_270173_270268_270557_270624_271207_271286_271709_273113_273181
584829	contig_5585_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_143079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGTACAACAGAACGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425004	424117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_424100_425000
584832	SIRV4	+	281	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	652	1015	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
584841	contig_3948_pilon	-	1968	13	Intergenic	novelGene_53302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	484.369406777743	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	493	924	1489878	1483572	TRUE	20	CATCAACAGGTTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEPPTTSTPRWP	1510947	1467920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473192_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485106_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489876_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
584843	contig_10904_pilon	-	2045	8	Intergenic	novelGene_22495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	595	junction_6	221.996690543451	932	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	99	617	336807	315739	TRUE	25	TGTATATAGGCTAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRR	336905	309733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_310878_315357_315390_315486_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
584849	SIRV4	-	222	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTCCAAAAAGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
584859	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
584860	contig_5954_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_28772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	136	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393560	1390872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390900_1393600
584871	SIRV4	+	330	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	173	-445	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATTGCCATTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1891_2258
584880	contig_12250_pilon	-	843	2	Intergenic	novelGene_80726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	797	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATGAGAAGATTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401303	399821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_400562_401200
584886	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
584920	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
584923	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584926	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584935	contig_10734_pilon	-	2415	13	Intergenic	novelGene_50974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	38.4588524703134	181	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	20	640	282131	267738	TRUE	15	TTTTTGTAATTTTTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAEAAMVSDEDELNLLVIIVDTNPIWWGKQALKGSQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNRLAVIASHIHESRFLYPGKNGRLGDFFGEAGNPPSEFNPSGSKDGKYELLTAANEVIAEEIKDLMTTSDIKGQHMETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQTLIQDSSNRLVTSQGDYT	282150	264938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_266503_266582_266620_266733_266870_267699_267769_270919_270946_271980_272056_273753_273783_273933_273964_275096_275160_276523_276691_278456_278564_279918_279999_282118
584939	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
584950	contig_11498_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_65545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGATAAGTTCCTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338676	337262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_337300_338700
584979	contig_10299_pilon	+	1832	13	Intergenic	novelGene_79663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	71.33659455162	27	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	670	1761	184802	187611	FALSE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182364	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184228_184292_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
584985	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
584986	contig_2455_pilon	+	2701	1	Intergenic	novelGene_119208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAAAAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336266	1338967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1336300_1339000
585000	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_97875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585013	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
585029	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585030	contig_10863_pilon	-	2513	17	Intergenic	novelGene_59337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_6	157.275422726343	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	176	1558	111386	92616	TRUE	25	ATTATAGTTTGTTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKLTRIAIVNHDKCKPKKCRQECKKSCPVVRMGKLCIEVTSQSKISWISETLCIGCGICIKKCPFGALSIVNLPSNLEKETTHRYCANAFKLHRLPIPRPGEVLGLVGTNGIGKSTALKILAGKQKPNLGKYDDPPDWQEILTYFRGSELQNYFTKILEDDLKAIIKPQYVDQIPKAAKGTVGSILDRKDETKTQAIVCQQLDLTHLKERNVEDLSGGELQRFACAVVCIQKADIFMFDEPSSYLDVKQRLKAAITIRSLINPDRYIIVVEHDLSVLDYLSDFICCLYGVPSAYGVVTMPFSVREGINIFLDGYVPTENLRFRDASLVFKVAETANEEEVKKMCMYKYPGMKKKMGEFELAIVAGEFTDSEIMVMLGENGTGKTTFIRMLAGRLKPDEGGEVPVLNVSYKPQKISPKSTGSVRQLLHEKIRDAYTHPQFVTDVMKPLQIENIIDQEVL	119241	88552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_89066_90223_90336_92156_92280_92408_92736_94860_94920_95018_95079_96699_96922_98844_98967_103048_103139_105476_105574_105833_105904_106048_106187_106639_106758_107764_107863_110316_110403_111283_111415_119094
585033	contig_3956_pilon	+	1495	3	Intergenic	novelGene_15216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1522.5	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1283572	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284054_1284467_1290335
585037	contig_14322_pilon	-	155	1	Intergenic	novelGene_115692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671429	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
585045	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
585047	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
585057	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGTAATTTGGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585058	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
585061	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
585066	contig_5189_pilon	-	1992	11	Intergenic	novelGene_34869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1337.80368141219	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATACTTGTTTCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247751	198433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220399_228136_228245_230388_230485_235736_235844_244163_244268_247690
585072	contig_14441_pilon	+	1354	7	Intergenic	novelGene_100639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.194127327144	13	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	743	1171	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111303	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111383_111988_112040_112454_112665_115357_115611_116578_116963_117220_117344_117539
585084	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585086	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585096	contig_9463_pilon	+	1492	9	Intergenic	novelGene_83826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	23	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	723	1091	222660	223028	FALSE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185914	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222071_222424
585100	contig_15063_pilon	+	1199	3	Intergenic	novelGene_14352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
585103	SIRV6	+	323	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10502	1	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11502	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
585104	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	188	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585114	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_93019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
585115	contig_5020_pilon	+	1235	7	Intergenic	novelGene_27844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	887.656355554082	55	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	363	1118	122915	125970	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALPCFPFSPSLPSLSLFLPLLLPPHPFPPPYSHPSSLPYLPLFSQSWWY	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124524_125825
585146	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585147	contig_6710_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_89384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATCCACCTTCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
585149	contig_567_pilon	-	1899	11	Intergenic	novelGene_33960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_8	629.160583635053	829	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	371	1153	322309	308820	FALSE	10	GGGAGTACTGTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338314	308073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_329281_329358_331040_331099_338090
585159	SIRV4	+	451	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	46	453	46	-453	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTCTTCAAATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	2318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
585179	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585184	contig_9354_pilon	+	1913	9	Intergenic	novelGene_108047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.7852864143879	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	844	1221	111159	117180	FALSE	10	TTTATTAGCTTTTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIGSIAGIVSVIGFKFLTPFFATTLRIQDTCGVHNLHGLPGIVGGLASIVVIAMGASDVSTTAMQAATLVTSIGTAVAGGLITGLILKLPIWEQPPDEDCYDDCVYWEVPTVDDSLSLSRFQPM	105052	117872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_105117_105712_106136_108697_108846_109396_109568_111121_111216_111996_112119_115831_115906_116127_116202_117129
585197	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
585206	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
585217	contig_10082_pilon	-	2347	7	Intergenic	novelGene_63873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.847102700348	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	370	696	232564	212085	TRUE	40	AATAAACAGTTGATCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHALRRPTPSSSPSGPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	377267	210283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733_214894_232510_232641_260702_260842_329290_329409_377231
585222	contig_12113_pilon	-	1877	8	Intergenic	novelGene_134731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	164.377986509689	1026	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	159	845	259537	211148	FALSE	25	TAATTGGCTTAATGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGSSGDGSSSGYSGDASGAVTVWEVVSLLGKLLGTVAVLKVVLYLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	259695	210115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_233167_233273_259482
585228	contig_10437_pilon	+	2745	4	Intergenic	novelGene_38158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_3	125.881778753806	2	124	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAGCGTTGCAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159883	164085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160203_160732_160844_161549_161639_161859
585271	contig_14441_pilon	+	1277	6	Intergenic	novelGene_100599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	596.48718343314	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	705	1058	116876	117560	FALSE	10	AGCCTGCTTGGCGCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111202	117779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111378_112608_112665_113032_113209_116578_116963_117097_117344_117539
585279	contig_15666_pilon	+	3053	2	Intergenic	novelGene_70103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	139	1161	20804	58318	FALSE	25	CAAGAGTCATTCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKITENNFKRRNYWEEKKEKEDFHMQVFNRTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANATIMAVIRFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSATKTISFVACATQLFFFLGFACTNCFLIAVMGYDRYVAICYPLRYTLPMSKRLGLGLVSLSGVTGLLIALVATNLICDMPFCGPNRVNQYFCDMAPVIKLACKDTHMKELALFTLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGKRKAFATCASHLTVVFVHYGCASILYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVCSLRNQEVKTALKRFLGMPVATKVI	20665	60210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_20864_57355
585282	contig_20819_pilon	+	2209	14	Intergenic	novelGene_55668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_6	22.6159078955683	369	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	27	1532	54837	61455	TRUE	15	TAGTGTGTCTGGATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHQLVGLMETAPKPGGDVPHKKNKLQSKRKKPRRYWEEEETSPTAAGASPGPSRSKKRKQELRPRRPKNTHIQKKSRISKKPQVPRKSGERRNLVPQRTLSGAQDPFPGPAPVPVEAALKFRRIDKSKKLLHSKSKTRSRLEVADAEEEETSVRAARSELLLAEEPGFLEGDDGEDTAKIRQADIVEAVDIASAAKHFDLNLRQFGPYRLNYSRTGRHLAFGGRRGHVAALDWVTKKLMCEINVIEAVRDIRFLHSEALLSVAQNRWLHIYDNQGIELHCIRRCDRITRLEFLPFHFLLATASETGFLTYLDVSVGKIVTALNARAGRLDVMTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGEWVREWGTKLMNCG	54810	62600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_56288_56394_56486_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61652_61826_61923_62105_62220_62329
585292	contig_12624_pilon	-	1403	11	Intergenic	novelGene_61053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1373.53523434967	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	190	1044	903465	862389	FALSE	40	AACAAGGCACCCAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTENSAIKDLKEALTKLRGNQLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQLLLLGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903700	862029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871272_878874_878935_882974_883042_888747_888799_900249_900333_903447_903473_903518
585313	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585314	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585333	contig_7202_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_18636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
585360	scaffold_16539_pilon	-	1886	12	Intergenic	novelGene_68350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	357.576530559	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	153	1574	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQEVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502796	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490439_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501987_502111_502245_502747
585365	contig_6163_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_103782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	64.4316692318304	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	176	1054	9706	16461	FALSE	15	GACGAGTCCTTCTGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHLKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13811_16338
585371	contig_17311_pilon	-	440	5	Intergenic	novelGene_57849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7709.72717983587	538	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	40	438	126865	118803	FALSE	10	CTTATATGTGTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKNYK	126904	118800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118812_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
585379	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585389	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
585402	SIRV2	+	428	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	159	-64	-159	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAATACCACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
585409	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585411	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	9	341	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14417	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
585412	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585418	contig_3627_pilon	+	3269	3	Intergenic	novelGene_78410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	35.5	500	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	66	425	4272	11645	FALSE	15	GAAGCTCTCCCAGTCGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARPSCNHKTGQQVSSEVTGSSPWKSHLCNLAVKQEVAQELSFSCPEPQSVLASLDTLHSTYQKFLEFVKLFGLRVPVHWQCLKRCLELILTHGSPMCGRMPLIGDDLKNWDIQVKRR	4206	14489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_4305_10561_10786_11542
585432	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-4	-72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGGTCGCCCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1837
585453	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
585457	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
585462	contig_4952_pilon	+	2086	11	Intergenic	novelGene_145521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	166.886308605589	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	71	1192	355970	442892	TRUE	30	GTCCGTAACCAGTAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHHVTQNGGLYKRPFNEAFEETPMLVAVLTYVGYGVLTLFGYLRDFLRHWRIEKCHYATEREEQKDFVSLYQDFENFYTRNLYMRVRDNWNRPICSVPGAKVDIMERQSHDYNWSFKYTGNIIKGVINMGSYNYLGFARNTGSCQEAAARVLEEYGVGVCSTRQEIGNLDKHEELEKLVATFLGVEASMAYGMGFATNSMNIPALVGKGCLILSDELNHASLVLGARLSGATIRIFKHNNMQSLEKLLKDAIVYGQPRTRRPWKKILILVEGIYSMEGSIVRLPEVIALKKKYKAYLYLDEAHSIGALGPTGRGVVDYFGLNPEDVDVLMGTFTKSFGASGGYIGGKKELIDYLRTHSHSAVYATSMSPPVVEQIITSMKCIMGLDGTSLDISGDA	355899	454722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_356096_381347_381503_384289_384439_386788_386914_398188_398283_399566_399673_400398_400619_407004_407132_442872_442972_445583_445714_454037
585480	contig_854_pilon	+	2643	16	Intergenic	novelGene_36145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	88	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	318	704	470342	471131	TRUE	20	GTAGGGAGGAAGTCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQIPAPTLDGAVSLPDACPPPGTGIASCHKAATPFLSSPDPVEGCGVGGLPLELLLLLGNPPGFCSPTQAGSGAESAPFAVPPPGNFPPGTLRGLPLSFKWTSLKVELTSALDSLATFHSDPAPAQ	470024	509321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_470632_471034_471652_471761_471882_471991_472061_473586_473746_474244_474311_474673_474755_476674_476788_483477_483629_486998_487109_488572_488655_491438_491558_493131_493199_495178_495241_497489_497571_509182
585490	contig_2894_pilon	-	2089	2	Intergenic	novelGene_86551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314099	311905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_313891_313995
585505	contig_7563_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_145554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGATAACAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100956	99520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_-_99500_101000
585512	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585514	contig_5217_pilon	+	635	5	Intergenic	novelGene_135724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	44.6038114963284	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	11	442	306725	324774	FALSE	40	AATACAGTACATTCTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDTRVQYFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLPARIYIYPDKLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYARCLRRKTWQSTSERSQSLKTPWSTVLL	306714	324967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_306846_306944_307020_307141_307224_307332_307405_324692
585538	contig_8551_pilon	+	1434	12	Intergenic	novelGene_145556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	32.1484161531641	229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	35	1432	2202	16100	FALSE	55	AATGAAAAAAATACTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASTVSQQTYYMKIQSKLQTLEEKAKEAERTAELAEADAREKDKELIEALKRLKVYESGVYGLEDAVVEIKNYKNQIKIRDQEIEVLTKEINKLELKINDFLDENEALRERAGLEVKTMIDLTEFRNSKSLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMAQETGKRAATLGLVEDLNPTDNFSQENRTGERKFDFVSLRNISEAQSKNEFLSRELIEKERDLERSRIVIAKFQNKLRELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNAIESKNAEGIFDASLHLKAQVDQLTGRNEELRQELREARKEAINFSQQLAKANLKIDHLDKETNLLRQSEGSNVVFKGVDLPDGIAPSSANIINSQNEYLVYLLQEIENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVIRHQQSLLYKEYLSEKETWKTESETMKQEKKKLEDQIQQDAVKVKEYNNLLNSLQVDSD	2167	16102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8551_pilon_+_2343_3063_3227_4879_4981_5052_5141_6346_6457_8016_8102_8648_8792_10422_10588_11009_11160_14397_14514_15877_15981_16067
585543	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
585578	contig_14970_pilon	+	1895	12	Intergenic	novelGene_44945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	6348.84150296352	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	133	1524	136145	231550	TRUE	30	TAATTACTTTGTCAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231687_231944
585585	SIRV5	+	305	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	13	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
585589	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
585597	contig_7457_pilon	-	1743	9	Intergenic	novelGene_31403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	161.345126979404	74	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473214	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473120
585598	contig_8978_pilon	-	1337	7	Intergenic	novelGene_49321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	514.612934371283	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	30	902	194082	190856	FALSE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVSLCLAWMDRNSTRSVFRAAITHSVAVLNIGVNGATRSTGGAIHGGAIHQRRILCCLHWKLCLFPLALWVWLLASSLCIAGWKGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRLGVACLRDWRRVCSQTTVNDSATSVKFSQKGEP	194111	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192418_193215_193398_193613_193768_193967
585599	contig_8710_pilon	-	3237	1	Intergenic	novelGene_73541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAATAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504335	501098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_501100_504300
585605	SIRV4	+	335	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1436	632	981	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2436	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
585612	contig_15691_pilon	+	1742	14	Intergenic	novelGene_60752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGCTCTCTGCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22776	114455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_22994_23914_24030_27939_28016_29700_29802_32386_32514_32812_32984_39822_39879_41356_41468_43424_43480_50441_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
585622	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585633	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_17705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585645	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585657	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585660	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10542	4	1305	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11542	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
585665	contig_14273_pilon	+	2245	8	Intergenic	novelGene_21153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	545.963555635019	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	288	2039	128229	151187	FALSE	55	CGAAAAAGAAAAACTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWPLVFLFKGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127941	151393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135339_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
585676	contig_10159_pilon	-	2380	6	Intergenic	novelGene_30788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	91.5051911095759	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	544	1803	353226	317967	FALSE	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	419336	317389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_419006
585695	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585697	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585702	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585703	contig_6418_pilon	-	1326	13	Intergenic	novelGene_81106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	359	junction_12	319.32037204037	83	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	56	1075	106563	68463	FALSE	20	CAACTACTTTGTTCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118003	68211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
585721	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	203	1441	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
585733	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
585736	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_17647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
585737	SIRV6	+	855	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-14	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033
585742	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1114	2	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
585749	contig_5643_pilon	+	1037	8	Intergenic	novelGene_38874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2802.49179940179	6	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	7	825	236199	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQETWVCNCFSTLPQAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236192	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236300_236602_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
585751	SIRV6	+	672	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	815	-491	815	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	51	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11052	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
585764	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	45	TACTAATATTTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
585765	contig_9799_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_145575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTTTTATGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129718	1128766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_1128800_1129700
585766	contig_14513_pilon	-	1182	5	Intergenic	novelGene_70340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	187	630	18880	11841	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSPCVFFLSCYY	19066	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11872_11985_12158_13087_13136_14952_15001_18735
585768	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
585778	contig_6175_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_16280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565930	568048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_565900_568000
585781	contig_11752_pilon	+	1439	8	Intergenic	novelGene_37570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1685.89804083214	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	113	910	84194	94343	TRUE	5	TGTCCAGTTGTGCTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTWTVVMPWLTSALTPHAPSAAQRELS	84081	105911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93015_94266_94410_96442_96592_105597
585782	contig_5728_pilon	-	2145	11	Intergenic	novelGene_126699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	372.669344057168	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	29	2059	371325	344906	FALSE	25	TGCATTGATGTCAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRGWRPRTLKRCLREVSKATEQPECFLTIQDGLASNFTSLTKVLYDFHKILEYRSIRASPLKKLVINNFDDEQIWQQLELQNEPILQYFQNTVSKTIKDEGISLLPETEEQECKEDGSEMEADGQEDLEQDLEEGEVSDLSGDDLKGHESTKHLSKSDLRESPDFSDEDSDRDFDIDKLEQQSKVQNKVPRKPREKSIVDDKFFKLSEMETFLENIEKEEEQKDGEEEEDIDFFEDTDSDEDEGGLSGSQKLKSGKNSRNLKYKDFFDPIETDEDIASDRDELGSNEEEEIAEEEEESVFEMDEDNDLEESEDSKQHKECLKRVTFALPNDEETEDTNTSNVKKNSDEVKSSFEKRQEKMNEKIASLEKELLEKKPWQLLGEVTAQKRPENSLLEETLHFDHAIRMAPVITEETTLQLEDIIKQRIRDQAWDDVVRKEKPKEEAYEYKKRLTLDHEKSKLSLAEIYEQEYIKLNQQKATEEENPEHVEIQKMMDSLFLKLDALSNFHFIPKPPAPEIKVVSNLPAIAMEEVAPVSVSDAALLAPEEIKEKNKAGDTKTAAEKTATDKKRERRKKKYQKRLKIKAQEKWRKLLEKSHPDQEGKYTKAVASEKLKKLTKAGKAALLKDEGKDKALKSSQAFFSKLQDQVKMQINDAKKTEKKKKKTQDISSHKLKL	371353	344819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_345056_345507_345739_346761_346870_350345_350457_353444_353583_354444_354513_355358_355501_367726_367899_368202_368349_368941_369618_371236
585785	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585786	contig_16098_pilon	-	1151	7	Intergenic	novelGene_46111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2262.50139349251	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	138	536	458816	456936	TRUE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTSTWKAPC	460264	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_456961_457856_457907_458405_458618_458704_458838_460148
585787	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585788	contig_13519_pilon	+	1695	14	Intergenic	novelGene_124635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	418.347184601385	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	76	1179	66179	102254	TRUE	15	GACTTGTACTGTTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWQARCRGISDPRERLERGRPGTAAMSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIGGTK	57084	120668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72556_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100609_102238_102373_115513_115645_116672_116756_120484
585789	contig_14322_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_116466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTACGGAGCAATGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671373	671643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
585796	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585799	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585800	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91679	6	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
585813	contig_18735_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_132687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAGACAAAGATCGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93815	93455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_93500_93800
585814	contig_6217_pilon	-	2036	2	Intergenic	novelGene_109655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	202	639	739532	739095	FALSE	40	TATAAACGTATATATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWLKPPRRWQQSVGSRVTGFLAVEASARDGARQEGGEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797258	737697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739628_797152
585821	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585826	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
585849	contig_8435_pilon	+	2393	5	Intergenic	novelGene_72009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	64.5387480510739	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	635	2323	94334	97944	FALSE	5	CTGTGAGCTGCTTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91108	98014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_95334_96398_96685_97030_97164_97674
585853	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
585875	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
585884	contig_6361_pilon	-	2222	6	Intergenic	novelGene_23882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_5	412.95210376023	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	111	938	87009	79135	FALSE	70	AAAATCATGAAAAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHVSDLAQMKWGHLCISIRWL	87582	77850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504
585887	contig_7356_pilon	-	2035	5	Intergenic	novelGene_60375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	734.732051499048	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	243	791	435519	408051	FALSE	30	CTTTGAAGTGTGTAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCVSDQDLDEACMVRTVKTGSAEKLVPAEHLVPAFLKGDLSYIKIFLGTYRTYATTQQVLDLLFQSPEPRPVPVVKVAQDISLPQELAPGTSHGVHSAPAPALELHSTPPITSPAPAPAPVGEHAGGVDSQPGSPPEPAPGPLADVDPAPAPTPELHTAPAIPSTAPALASEEPAGESDT	457852	406806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_408397_410435_410636_435516_435623_437474_437529_457767
585891	SIRV7	+	301	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147656	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
585898	contig_7467_pilon	-	1990	12	Intergenic	novelGene_69461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_11	146.046579233425	1218	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	238	1563	92058	67563	FALSE	25	GCATGGTTCTCTAGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133047	67135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132844
585904	contig_12873_pilon	+	1961	6	Intergenic	novelGene_27142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1010.52164746729	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	416	1396	16357	19706	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRW	15941	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19707_19864
585912	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
585929	scaffold_9100_pilon	+	1602	8	Intergenic	novelGene_83256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	379.856686186799	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	241	1056	649053	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_649035_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
585932	SIRV4	-	382	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCCACGATCCTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1848	1466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1500_1800
585933	contig_8156_pilon	-	2654	7	Intergenic	novelGene_98911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	37	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGCATGATAGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154470	138010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_138188_143079_143326_145525_145720_146023_146151_147747_147891_152477_152609_152834
585936	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
585946	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
585947	contig_10734_pilon	+	1654	9	Intergenic	novelGene_51200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	351.358412984519	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	494	1186	1131100	1142903	FALSE	35	TCAAAACTGGTGTTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKINPLRNTSLRNIMTKNILLIREESDLIHLKMVRTGTRAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1125365	1143371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1125570_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131089_1131219_1139045_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
585957	contig_12624_pilon	-	1702	5	Intergenic	novelGene_61096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	220	525	952979	948779	TRUE	20	TTTTCTAATGCTCTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955858	947475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948596_948721_948842_950590_950768_952913_952985_955644
585959	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586001	contig_14322_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_116478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671894	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
586002	contig_19006_pilon	+	2795	19	Intergenic	novelGene_145579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	409.158731159376	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	9	2312	22205	91868	TRUE	10	AGGGTCATGTGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALRESVLHLALQMSTYKRATLDEEDLVDSLSEGDVYPNGLQVNFCSPRNGQRCWAARTQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGVQYQTRAPPVCLSEACISVTSSILSSMDPTVDPCQDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENSTASVSEAERKAQVYYHACMNETRIEELKAKPLMELIEKLGGWNITGPWDKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKQQTECMVEQYSNYSVNGEPVNGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEQTLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSVSNSKEFSEHFHCPPGSPMNPHHKCEVW	22196	94321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_22334_30891_31034_41862_42076_55695_55818_56975_57123_58689_58756_59858_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80534_83349_83454_86755_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691_92264_94233
586015	contig_3602_pilon	-	1750	11	Intergenic	novelGene_60653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_10	198.705712046735	2394	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	208	1095	1139393	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139600	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
586034	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586073	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586077	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586090	contig_13894_pilon	+	1073	10	Intergenic	novelGene_62104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2509.7943745393	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	27	641	520713	525785	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWAQGLPSPH	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_524929_525762_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
586091	contig_9571_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_136296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGGCTGCATATTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527504	526942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_526900_527500
586096	contig_18869_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_56090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
586103	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
586111	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586112	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
586113	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
586119	contig_5988_pilon	-	1672	4	Intergenic	novelGene_15992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	28.5929284186765	18	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	97	933	693353	690042	FALSE	10	GTTCAGTCTTGTGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	693449	689302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_691009_691134_691358_693350
586122	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586123	contig_10103_pilon	-	1773	16	Intergenic	novelGene_86161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	307.452587130656	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	648	1526	651658	638598	FALSE	15	TGTGCTTATCTCTCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657023	638350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645753_649864_649969_651346_651475_651637_651739_653443_653546_654512_654570_654694_654772_655131_655244_655980_656047_656148_656224_656945
586130	contig_5643_pilon	+	1130	11	Intergenic	novelGene_38844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2975.38213344101	16	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	418	918	236731	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPSRLSVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233620	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236306_236473_236510_236639_236756_237135_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
586131	contig_5317_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_76501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	117	506	35282	43305	FALSE	30	TACGTGGAGAACGTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARR	33672	43306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
586166	contig_14322_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_116507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCATGTTGTAATTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
586179	contig_14638_pilon	-	2110	6	Intergenic	novelGene_71564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	TTCTGAAGTGGTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253362_253452_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
586189	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586190	contig_6691_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_60187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGGGAGGAGGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508360	506816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_506800_508400
586191	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
586198	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586206	contig_15629_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_122481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGCTCATAAAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194594	195899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_194600_195900
586207	contig_15629_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_122483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1568	1930	197917	198279	NA	60	AAAAAATTCACTGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVFWVLVIMLYEKVDLRLFLSRAQNLIQWAEFTGERFWFNRNKKSRRLKLHNTSQSWTSVPERNKGFESNLSGTLLKDPKKHHCRRVDADSNQPYRTELNFPIRVQVAAGRFELPTFG	196349	198405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_196300_198400
586208	contig_15691_pilon	-	1749	14	Intergenic	novelGene_60751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	585.34018834749	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	297	1556	69449	22953	FALSE	30	CAGTGAAACCTCTGAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IASRKNSLVAIQSATSNKIKVSVPQPIVKKDKRQNSTRFNTSNNRELQKLPSLKDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYAGYRQASALNIPVAMDTDGPLFEDVQMLGKTGSQDARQEMAFPTGPDRLRC	148529	22759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_22995_23915_24033_27942_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_148364
586212	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
586216	contig_14618_pilon	-	2486	10	Intergenic	novelGene_136788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACGACACCGCGCATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312407	295956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_296116_298701_298799_299301_299409_301268_301362_305016_305109_306090_306167_306273_306355_307515_308679_310015_310209_311982
586230	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
586248	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586250	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_92003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657493	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657493	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
586261	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586294	contig_2646_pilon	-	2483	16	Intergenic	novelGene_69673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	91	junction_6	69.5446778856745	403	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	29	1567	2215518	2209692	TRUE	10	TTTCTTTCCAGGTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVAGRVNKRGGGGPGGGGGGGGGPRGTEEEPPPPLQAVLVADSFNRRFFPISKDQPRVLLPLANVALIDYTLEFLTATGVQETFVFCCWKAAQIKEHLLKSKWCRPTSLNVVRIITSDLYRSLGDVLRDVDAKALVRSDFLLVSGDVVSNISITKALEEHRLRRKLEKNVSVMTMIFKESSPSHPTRRHEDNVVVAVDSATNRVLHFQKTRGLRRFSFPLGLFQGSGDGVEIRYDLLDCHISICSPQVAQLFTDNFDYQTRDDFVRGLLVNEEILGNQIHMHVTTREYGARVSNLHMYTAVCADVIRRWVYPLTPEVNFTDSTIQSCTHSRHNIYRGSEVSLGHGSILEENVLLGSGTVIGSNCSITNSVIGPGCHIGDNVVLNQAHLWRGVRVAAGAQVCQSVLCDNAEVKERATLKPRCVLTSQVVVGPDITLPEGSVISLHPPDAEEDEDDSQFSDDSGAGREEEKAKLKGYNPAEVGVAGPGLPLESCRCECGGRGGATAKSVGT	2215546	2207235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2207599_2207748_2207860_2208216_2208343_2208912_2209037_2209331_2209423_2209590_2209699_2209859_2209963_2210068_2210211_2210454_2210601_2211490_2211804_2212072_2212151_2212425_2212507_2212592_2212771_2212859_2213046_2213913_2214039_2215338
586295	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
586307	contig_513_pilon	+	2123	9	Intergenic	novelGene_80150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAGCCCGCCAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445775	453373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_447023_447829_447916_450624_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451777_452200_452344_453000_453100_453303
586322	contig_14219_pilon	+	1763	10	Intergenic	novelGene_54372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGATCGCAGCAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046753	1084590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1047336_1055720_1055882_1056614_1056761_1057564_1057669_1057774_1057843_1068381_1068472_1070549_1070608_1071991_1072110_1072229_1072352_1084276
586324	SIRV5	-	343	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTCTGCAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10866
586325	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
586333	contig_10011_pilon	+	1834	10	Intergenic	novelGene_68087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	91.212951213826	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	62	1336	322928	333031	TRUE	50	CACAGGATGGAAGAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322866	333675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_325672_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190
586343	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCGGAGGCCGCCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
586345	contig_10953_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_42561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2965.18880792888	206	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	113	547	422508	425337	FALSE	15	GCGTACTCTGTTTCGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIGKCLPLANTYFALKH	420003	426295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420054_422445_422657_423202_423365_425213
586347	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_93510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586355	contig_17440_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_7634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTGCCCGTAGGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	3461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3500_3800
586365	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1447	648	992	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
586372	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586396	SIRV4	+	298	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	673	977	-41	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTGCACATGCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
586417	contig_7695_pilon	-	1037	7	Intergenic	novelGene_41622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	333	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	36	656	687243	680696	FALSE	0	GTTGCTGGTGGCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNPSTLSQRQHVWLILPLLAPGA	687278	680314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680763_681605_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
586428	contig_6470_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_145608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAGAGAGGGGAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027646	1026311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_1026300_1027600
586440	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_17497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27855	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586460	contig_5643_pilon	+	1118	10	Intergenic	novelGene_38841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2547.90207575847	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	286	906	236700	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGCGWSLPFVQCQYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233614	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_236207_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
586474	contig_8616_pilon	+	1655	11	Intergenic	novelGene_72491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	589.347478148503	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	401	1582	322373	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	321589	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_321885_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
586486	SIRV4	+	295	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1476	632	1021	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
586491	contig_1867_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_54575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCATTTGTAGCTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451504	451900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_451500_451900
586501	contig_9706_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_20838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGAAATATGTCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
586511	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586528	contig_2770_pilon	+	1162	3	Intergenic	novelGene_107437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCATTACCTCAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742934	744671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744574
586531	contig_17198_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_62426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174615	1178086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1174600_1178100
586533	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586536	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
586542	SIRV4	-	218	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAATGTCCAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
586548	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
586551	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_114035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	31	348	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14439	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
586558	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1114	2	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
586563	SIRV4	+	259	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1512	632	1057	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2512	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
586566	contig_15063_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_12232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	213	1388	34808	36661	FALSE	55	AAAAATATCAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27558	36785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
586572	contig_4891_pilon	+	1259	7	Intergenic	novelGene_124549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.572985425359	4711	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	353	904	707907	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFWPQVETGPEQAEQGSAESFVLGGPHRLTTHSPFFPPPAEAAGDHGRLGSAVRVGGAGHHLRSGRAHLLPPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700876	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701094_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
586573	scaffold_8345_pilon	+	1672	9	Intergenic	novelGene_107027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	234.399998666809	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	232	1428	786752	797810	FALSE	15	CTGCTCTAGAGTGACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQEEK	779367	798054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785044_786721_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_795998_796229_797376_797559_797797
586574	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	546	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	96	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
586607	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586616	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
586626	contig_3077_pilon	+	2609	9	Intergenic	novelGene_26829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	119.963536126608	27	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	362	1045	496936	521016	FALSE	20	TGCCTAGGAGAGTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPDLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQCFGGDSMQLQDTMGIPC	490563	522580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_490635_492485_492726_496885_497036_498360_498579_503787_503938_507593_507709_517678_517726_520774_520806_520993
586643	contig_5988_pilon	-	2289	3	Intergenic	novelGene_16110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1409	1792	1225528	1225145	TRUE	35	TTTTCAATAATAAGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLAIPIQPFNKCLTRISLPFVLKSSHPVDGKQAESLRIRQGGWGGRREHTQICIPFVMATCKRVFARPAAQRKQSIHKQRLFIFFQGLTEAQIIMSLSNNGTSKLLSNGKHTAQPHWNCAQTKQC	1226936	1222650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1222678_1223381_1223459_1224751
586652	contig_20693_pilon	+	1781	14	Intergenic	novelGene_60256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	606.106792394692	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	661	1272	27396	34261	FALSE	25	TATTATGTATAGTCCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	19358	34770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_25869_25914_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32931_33015_34254
586659	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586681	contig_7457_pilon	-	2237	4	Intergenic	novelGene_31609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.4791284279777	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	60	1262	960838	956489	TRUE	10	TAGCTGTGTGCAGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	960897	955415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956329_956426_956939_958234_958375_960225
586699	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_17223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586705	contig_14553_pilon	+	2073	3	Intergenic	novelGene_125001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_2	164.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	101	943	6238	22522	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQESVSHENMTSHMKLLSTRLLTT	6137	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_6387_13796_14424_22455
586715	contig_6069_pilon	+	1878	9	Intergenic	novelGene_8074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	87.903000517616	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	61	1203	560908	566005	TRUE	25	GAGCAGTGTAGAGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPDSLLSAVPRHPRPARPLMAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELGHVRVAADELWLRL	560847	566835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564695_564775_564853_565959_566043_566197
586716	contig_2438_pilon	+	1240	5	Intergenic	novelGene_112035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2388.18372408825	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	75	536	310588	312412	FALSE	35	GGACAGAGAAGGGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	305091	313433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312413_312729
586727	contig_15498_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_42717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGTCATGGATCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004339	1004985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1004300_1005000
586734	contig_6829_pilon	+	2234	10	Intergenic	novelGene_123763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.876872270244	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	529	1767	18735	59222	FALSE	20	ATTTTCTGTAACCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKHALHLYLEELEAVGIHTKAWFIAGIFLLLTIPISLWVILQHLVHYTQPELQKPIIRILWMVPIYSLDSWIALKYPSIAIYVDTCRECYEAYVIYNFMGFLTNYLTTRYPNLVLILEAKDQQKHFPPLCCCPPWPMGEVLLFRCKLGVLQYTVVRPFTTIVALICELLGIYDEGNFSFSNAWTYLVIINNMSQLFAMYCLLLFYKVLKEELSPIQPVGKFLCVKLVVFVSFWQAVVIALLVKVGVISEKHTWEWQTVEAVATGLQDFIICIEMFLAAIAHHYTFSYKPYVQEAEEGSCFDSFLAMWDVSDIRDDISEQVRHVGRTVMGHPRKKFFPEDQDQNEHTSLLSSSSQDAISVASSMPPSPMGHYQGFGHTVTPQTTPTAATIPDEMFNDTTGEKKELSDKFVAS	18206	59689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18780_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898_52974_54349_54444_56463_56577_57944_58045_58565_58738_58956
586735	contig_7513_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_89020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	347	junction_2	43	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	153	252	404	682658	682810	FALSE	25	GTAACCAGCCGGACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVPKTTSETLKHKINPSAGETFPQAIDVLLYTPGHLDPAEKITDAHPKLWCALSEGKVVVFDASSWTIYQHCFKVGTAKLNCMVMAEQNQVWIGSEDSVIYIINVHSMSCHKQLTDHRASVVDLIVQGGEKAP	677524	682812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_677630_680394_680535_682651
586748	SIRV4	+	300	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	632	1016	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
586768	contig_6710_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_89054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	875	1261	602577	602191	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMNKPVSTTPVGQRTEKKLLIFSSPRHEGNEGSQDQQKRLPQAALDNHKSKASPSHMAMKRDSDSLLLLATLVFPSVSVWVLSVLKHARGLRAFSNAVPSSWTGRLQALQEPGSSPSFSYHMMSHLL	603451	601256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_601300_603500
586781	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586782	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1120	2	-1120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCAACGACGAGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
586798	contig_6509_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_145658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207827	204976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_205000_207800
586825	contig_15063_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_14298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	332	1153	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
586828	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586830	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
586831	contig_12411_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_145687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAATAAAGGACACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440413	440768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_440400_440800
586846	contig_8658_pilon	-	1425	7	Intergenic	novelGene_55809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1158.76668152921	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	265	1074	36589	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55678	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36704_55528
586847	contig_14322_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_116462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
586874	scaffold_12124_pilon	+	2331	9	Intergenic	novelGene_22015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_6	150.712837459189	9	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	76	597	803880	807554	TRUE	25	TCCTCCACAAAGAGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	803077	815401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816_809950_810647_810745_813529_813765_813915_813998_815122
586892	contig_5690_pilon	+	2030	5	Intergenic	novelGene_119722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	365	junction_1	404.575394704127	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	48	587	1044729	1086602	FALSE	60	TTCATGGAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVSKYTVPTLYVE	1044681	1088045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391
586926	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586933	contig_11752_pilon	+	1294	8	Intergenic	novelGene_37572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1664.96767143953	14	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	613	951	92915	94417	TRUE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84081	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87282_87402_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94430_105597
586936	contig_3426_pilon	-	2497	9	Intergenic	novelGene_57917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_8	136.99977189762	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	199	1002	179690	175577	TRUE	45	GCAATGAAAATCTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVTPGSPLCGRAHPGDPKLVVLSSYFSSQHLPGSASGSVLHSTPEASGRKREGRGPLPNPPWSLSLVVLGVRSDCLPLGQDSLPGSAGSLWDLVMSASGHKKAENKHEGRIYPSSGQF	186459	145080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428
586939	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586940	contig_10511_pilon	-	2759	2	Intergenic	novelGene_126908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	83	junction_1	0	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1991	2455	594204	593740	FALSE	35	TAAAATTAGTGCATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKIEVVKDFILLGSTVNTYGSSSQEIKRQIALGKSVAKYLFKVLKSKDVTLRTKVHLTQAMVFSVASYACESWRINKKDRRRIDTFELWCWRRVLNIPWTAKRTNRSVWEEIQSSLDARMARLCLTYFGHVVRTGQSLEKDIMLGKVQGQ	596331	593435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_596094_596230
586941	contig_11815_pilon	-	1640	3	Intergenic	novelGene_50934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGGTAAGTAGGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323103	299105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_300146_300257_300649_322894
586959	contig_10732_pilon	+	2513	13	Intergenic	novelGene_114696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	414.574907787081	45	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	450	1352	95430	138578	TRUE	25	TTCCTTGAGTTAATACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLQAQEEEVPSDLTPEERQELQNIRRRKQELLADIQRLKDEIAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKHVAMGRKKFNMDPKKGIQFLMENDLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGEWQGEDVEAALVHFDRQLPLLLRVHDG	94980	143554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_95458_118293_118377_120070_120136_125785_125853_126167_126287_126667_126749_128089_128203_130562_130712_131148_131265_136408_136486_138573_138646_139287_139443_142615
586961	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
586962	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_91867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGATGGCTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
586966	contig_10299_pilon	+	1841	17	Intergenic	novelGene_79726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.3597628719787	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	342	1679	336845	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	334748	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_334789_334912_334975_335199_335254_335378_335435_336715_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
586970	SIRV7	-	266	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91658	2	-91652	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCGATTTCTTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
586988	contig_12869_pilon	+	2026	7	Intergenic	novelGene_75326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	411.751813056792	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	100	1047	67431	97384	TRUE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVWWTTVLVQCIALTLHSQAAFRWMIIGGFKCWQTLWPLCLGDESSLQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67331	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_81595_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917_97745_97866
586992	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
586995	contig_3380_pilon	-	2338	3	Intergenic	novelGene_60079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	30	junction_1	113.5	893	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325092	59115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_61224_226563_226680_324978
586996	contig_14441_pilon	+	824	5	Intergenic	novelGene_100421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	16	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	9	638	81887	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81878	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_112110_112154_116578_116963_117220_117344_117539
587010	contig_11104_pilon	-	1750	14	Intergenic	novelGene_112462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.7329763322677	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	161	1381	359149	329034	TRUE	30	CAGAAATACTTCTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELIPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLVSR	359309	327126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_327484_329021_329133_331188_331285_334327_334409_334565_334681_335041_335104_336498_336589_336686_336794_337105_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
587016	contig_10990_pilon	+	1826	3	Intergenic	novelGene_7405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	33	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	127	615	119582	121424	TRUE	35	GAAGCTATGTGGTATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119455	123564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121519_122447
587035	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587061	contig_15459_pilon	-	1699	6	Intergenic	novelGene_106374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	134.05909144851	518	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	91	810	20238	16392	FALSE	30	CTTTGGCTGGAAACAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSALRAHVETAQKTGVFQLKDRGLTEFPSELQKLTSNLRTIDLSNNKIESLPPMLIGKFTLLKSLSLNNNKLTVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQISQISVKISCCPRLKVLRLEENCLELSMLPQSILSDSQICLLAVEGNLFEIKKLRELEGYDKYMERFTATKKKFA	20578	15502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_19068_19338_19909_20049_20154_20261_20510
587062	contig_9345_pilon	-	1372	5	Intergenic	novelGene_24685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2086.74153885909	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	190	585	955353	948024	FALSE	25	CTTTTAAAAATTCCCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDKAGASQDEAGAGKTRRRQRHGKQDWCFWVHGVFSKDQRWSEGGF	1001343	947236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949503_952454_952561_955197_955356_1001156
587071	contig_11215_pilon	-	1189	3	Intergenic	novelGene_118971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	275	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	640	1188	5042	1794	FALSE	25	GTGAGAGATGTGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLLISLTPHSLVSSVNPPKAVVSLDPPWYRLLEKDNVSLKCLPEGNSTQWWHNGSLISSQSSSYFIKSARVNDSGEYQCQTSSTLHSDPVQLEVHIGWVLLQAVRQVFLKGETIELRCHAWKSKPLHKVSYFQDDRRKKFSHHNTIFHIPKATGQHNGSYFCRGLIGNRNESSGSLNIYIQ	6588	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_2048_4747_5569_6475
587073	contig_2069_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_23506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTGTGTCTGTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509877	1508365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508400_1509900
587075	contig_11215_pilon	-	623	4	Intergenic	novelGene_118970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_3	247.132892725082	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGATGTGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6576	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_2048_4747_4994_5547_5569_6475
587078	scaffold_12124_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_22025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	669.096545724158	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	372	812	846536	858257	FALSE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFNAVIRAVRLCPWSTHCCQVDSDSRRPHVLRNRTEPPRVFLAVIFIKGALVAQWPSAQLVTKRSAVQTHQQFHRRKTWQRAPVKITA	829491	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846784_857993
587084	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	29	370	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14437	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
587095	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGATCAACCTGGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
587103	contig_854_pilon	-	2489	4	Intergenic	novelGene_36130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	185.38308684691	1	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1496	2068	471014	470442	FALSE	0	CCTGGGGCTCTGTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	474642	470020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471656_471762_472061_473586_473742_474241
587148	contig_16622_pilon	+	1872	10	Intergenic	novelGene_48443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCCTGCGCTGTTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108210	121592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_108469_110033_110147_110891_111030_112156_112706_112975_113041_113602_113741_115155_115292_115417_115561_118814_118889_121334
587154	contig_5988_pilon	+	2294	16	Intergenic	novelGene_15879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCATTTCCTGGTCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387903	403608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_388062_388498_388611_390641_390806_391212_391456_392440_392621_393680_393830_394141_394364_394463_394610_394839_394950_395087_395223_395505_395645_395796_395862_395971_396067_397411_397523_397973_398183_403552
587182	contig_11677_pilon	-	451	4	Intergenic	novelGene_85932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	196	408	595842	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597358	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
587194	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	635	976	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
587196	contig_5643_pilon	+	3007	11	Intergenic	novelGene_38945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.028792594841	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	124	1524	481872	501081	TRUE	50	AATGCAATAAACTTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462250	502612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481855_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050_501351_501398
587218	contig_10235_pilon	-	2027	10	Intergenic	novelGene_46285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	357.031277808168	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	172	1005	25335	19534	TRUE	30	TGTCAGAATTTTTTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27169	13992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15055_19008_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
587236	contig_12810_pilon	+	2590	11	Intergenic	novelGene_145703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_2	11.824127874816	191	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	89	1822	492427	623125	FALSE	20	TGTATACAAGTCTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPAFDLSQDPDFLTIAIRVPYARVSEFDVYFEGVDFKFYAKPYFLRLTLPGRIVENGSEQGSYDADKGVFTIRLPKETPGQHFEGLNMLTALLAPRKSRTAKPLVEEIGASEISEEGVEDDDEEFDWEIEQSPYEEVSESALNPQCHYGFGNLRSGVFQRLQDELSEVIDIKDPDSIPAAERRQKRLAAELAKFDPDHYLADFFEDEAIEQVLKYKPWWADTYSKVMASLGKSQEQENHAALVSFSEDEKYQLRKFVNKSYLLDKRAHRQVYYSLIDILLAYCYETRVTEGEKNVESAWNIRKLSPTLCWLETCTNVHEILVSFGRRVLCYPLYRHFKLVLKACRDTIKILQLGKSAVLKCLLDIHKIFQENDPAYILNDLYISDYCVWIQKAKSKKLAALAEALKKDSLTKAQLGFELEELETAALLVQEEETALKAACSASRQQTPCCSPEASDLEESDSTSSSTTQDSDSEQDERQENGSKTAGSLQGPLLEESSALLTDGVEVCRNMALLRSEGSQGKPLALSCAPGRSGPLIEELEDQLKTIVQISEAEGSVAGNHSSVQERDDRQTPIH	492338	623893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_492570_496557_496623_498310_498434_499170_499332_510384_510498_519836_519965_530618_530774_533251_533306_535654_535779_561661_561783_622578
587252	contig_10923_pilon	+	1417	9	Intergenic	novelGene_66170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	767.24155868605	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	73	855	21667	37418	TRUE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLWCSGVCAAP	13806	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30289_37383_37540_38578_38742_42554
587284	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	14	893	14	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8329	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
587289	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
587299	contig_7457_pilon	-	3009	8	Intergenic	novelGene_31453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	33.0281265417393	8	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1985	2707	475867	474462	FALSE	20	CAGGTGAATGTATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEEDKVSSSNFRQQMLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVEKAWNLLQKRIPKMPSGP	478243	474159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_477761_478152
587318	contig_7202_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_17489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28061	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
587324	contig_12125_pilon	+	1562	2	Intergenic	novelGene_76230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	582	junction_1	0	274	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	169	540	384800	385171	TRUE	55	AAACGAACCAAAAAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLDVVELAEPEEVEVLEPEEDFEQFLLPVIHEMREDIAALTRERGRAYLRTRGKLWEMDNMLLQIKTQVEASEESALNHLQNADDGAAARGEKAEEKAREMAKMAEMLVELVRRIERSESS	384631	386712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_385184_385702
587325	contig_13863_pilon	+	1969	8	Intergenic	novelGene_42021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1247	junction_1	632.616045658415	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	55	558	98341	104580	TRUE	45	GTAAGTTACATATTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQV	98286	116143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114
587326	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587339	SIRV4	+	466	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	36	448	36	-448	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAAATTGCCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	2323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
587345	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
587347	contig_12113_pilon	-	1637	6	Intergenic	novelGene_134737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	244.561321553511	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	466	858	222752	211148	FALSE	15	AGAGGCATTGGTGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	232840	210368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_232477
587349	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587358	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTTCATTTGTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27950	27670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_28000
587361	contig_10011_pilon	-	1960	5	Intergenic	novelGene_68067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.2411819273161	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	341	1495	242740	236529	TRUE	30	TTAAGTGAGAATGTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKMEITLSLQPHSPDSPKQERHIIAKLEERQEPALHNNRRDPELSRQRFRQLCYQELSGPKEALCRLGQLCREWLQPELHTKEQILELLVLEQFLTILPPEIQTWVRKRCPVNSKEIVNLVEEFHRASKRPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGAQLGEQELPDFLEESSQAEPQDQLSHHHGEKYHLLQEPTLKLAGTEATRMRSDNKENPQQEGTKGAKPCAVSADRSKGNGLQSPEHTAVNMSEPWLSPRQVSPPNAQKPFTHHQRHCRQLEYISSPLKSHLLRDVEKSNHLERLGHPKKSYKCDHCGKSFSFNSELERHKRVHTGERPYTCEVCGNCFGRQSTLQLHQRIHTGEKPYHCNLCGKSFRQNSNLRKHQSLHHGE	243568	236017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_236278_236323_237092_241170_241355_242332_243019_243506
587368	SIRV4	+	324	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1447	632	992	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
587374	contig_15888_pilon	-	2716	2	Intergenic	novelGene_84400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	220	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTCTGTGCATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87161	84222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_86818_87040
587382	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
587387	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
587392	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_89226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653720	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
587399	scaffold_19766_pilon	+	2154	15	Intergenic	novelGene_34436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	155.918558673352	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	392	2023	846171	851417	FALSE	30	TTTTGCTAATAAAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844762	851548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844793_845085_845163_845497_845663_845845_845914_846119_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
587413	contig_15087_pilon	-	1945	8	Intergenic	novelGene_37124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	392.351518775848	215	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	727	1116	41785	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	52946	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532
587426	contig_5423_pilon	+	1996	3	Intergenic	novelGene_85289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACTAGGTCAAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581352	586101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_582162_583127_583959_585745
587428	contig_8317_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_19442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
587429	contig_4151_pilon	+	2552	24	Intergenic	novelGene_65291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	93.57756100896	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	1070	2254	763470	828280	FALSE	55	AATTAAATGAGTAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLKQFADNDASRFKAIKVRFVKPVYPGQTLQTEMWKEGNRIHFQTKNKETGDIVISNAYVDLVTTSEASDISAQTTSEGGELQSTLVFEEISRRLKDVGHEVVKKVKAVFEWHITKGGNVAAKWTIDLKNGSGKTYQGPAEGSADITIIISDEDFMQVVLGKLDPQKAFFNGRLKATGNILLSQKLQMILKDYAKL	723652	828578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_723836_726654_726709_740934_741043_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757434_760496_760598_763406_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940_793048_799587_799675_803058_803155_804394_804534_811593_811722_828190
587436	contig_5878_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_145728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCATAGCTTTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273268	274286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_273300_274300
587439	SIRV6	+	382	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	4	1203	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
587446	contig_18794_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_54634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAGCTGAGGAGTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110351	109450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_109400_110400
587468	contig_10235_pilon	-	2688	11	Intergenic	novelGene_46394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	32.1714158842908	11	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	813	1571	182616	180007	TRUE	10	TCTACTGGCTGGCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTGTILPPIHHCRPFLPTLLPQERWGNAQGGAELKEDREEGGTSKWAWKRVSYLYMLHISFHPYTQLLKGGEINQSPGAGRSEKVNISSTCCLRCTSKNGLFMLQPLDDAPAE	183428	177637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178918_179496_179561_179767_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532
587477	contig_15092_pilon	+	1925	3	Intergenic	novelGene_57813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	160	360	348159	351034	FALSE	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REIWTCRSPRCAPGTTSSRALTASLGRTSETSPNGTTACFSFFPHSRFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLL	325150	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325267_348115_348358_351032
587479	contig_19769_pilon	+	986	6	Intergenic	novelGene_102251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1486.43016653996	177	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	497	952	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86944	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87702_87820_88040_88841_88958_89163
587483	contig_8616_pilon	+	1323	9	Intergenic	novelGene_72587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	940.463175448672	5	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	350	1249	428108	436516	FALSE	10	ACCTTTTCATGTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426886	436590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428764_430515_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
587485	SIRV7	-	347	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56096_70877_70988_78841_78964_114680
587503	SIRV4	-	314	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGTGAACGTCGAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
587504	SIRV4	-	304	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAAAGCAGAAGGTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2310	1645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
587508	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_96071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
587533	contig_10904_pilon	+	1662	5	Intergenic	novelGene_22449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	775.643120255701	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	213	1181	149100	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143833	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150135_150203_150559_151524
587541	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
587547	contig_20602_pilon	-	1509	10	Intergenic	novelGene_133722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	495	junction_1	198.379546436734	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	271	1266	24969	10026	FALSE	35	CTAATTTATACATCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	26537	9782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429
587552	contig_6503_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_145804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAAAATCTTCGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430181	1429654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_1429700_1430200
587567	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587597	contig_7202_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_17172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTGATGGATTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
587617	contig_5643_pilon	+	1300	9	Intergenic	novelGene_39134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAGGAGAAAGGGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646231	651393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650570_650869_650958_651155
587621	contig_9345_pilon	+	1684	5	Intergenic	novelGene_24618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1049	1513	947931	955231	TRUE	30	CCTTGAACTTCTCAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVLAARFHKTRHPDFFFPRLACRAALVAISKTSLTPSLVFAEHSMYPKAPILFAMSLPSSGFTGSCFILASSRLVCSSFRRSFLFPTRMMGTLGQKCLTSGVHFSGMAVNGETHQYNIRVWVGEGPQTIIIFLPSCVPQSQLHLPSTSISAT	946882	997067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474_949602_952451_952563_955203_955346_997010
587631	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
587639	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
587661	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
587675	contig_15063_pilon	+	1514	5	Intergenic	novelGene_12012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	3	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	220	1395	34808	36661	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
587695	contig_3077_pilon	+	1462	8	Intergenic	novelGene_26703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_4	3913.60726654256	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	422	964	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
587736	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_18931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30103	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
587764	contig_14322_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_116281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGTACGGAGCAATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
587768	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
587771	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_115751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
587774	contig_19352_pilon	+	1645	7	Intergenic	novelGene_122371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1155	1574	112873	123043	FALSE	20	AGAATCGCGTCACCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLYSTVSTLKPIVGMVVTISPNFSLYRMVVLPAASNPTIKMRICFLPKRREKREEMVRPMAAAALAMGRSRRGFGRPRAFSFHTPGKLSQREEEELRKNESGRDCSPAGVSDEASGPGQKLAGRRPTRRLARQLRLQC	103142	123114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_103245_103309_104089_105885_106011_108444_108516_112795_112905_113279_113363_122738
587778	contig_3571_pilon	-	2399	10	Intergenic	novelGene_88700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	24.589970855344	216	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	20	1744	100098	30354	FALSE	60	GAAGGAAAATGAAACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWTVVTPMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFNSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	100117	29698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_31449_31562_33384_33490_36653_36877_38625_38763_40254_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_99969
587795	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587802	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587803	contig_960_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_108263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	619	978	626813	627172	NA	35	CTCACGTGATGACTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDGSLLTTCRKYVRRSLAILASKEHSAHTSSKTDLFVLLAVHGLVNILRQHHNSKASLLWSSLFIIQLSHAYEATDNTMAWLRHTSVFKVTALLFNTLKRSFAADLPNAMHPLIS	626194	628620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_626200_628600
587810	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
587813	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
587822	contig_7182_pilon	-	389	3	Intergenic	novelGene_117163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_2	157.5	1218	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	94	387	889318	888817	FALSE	20	GTAAGTATCTTGCCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRP	891353	888814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888961_889168_889333_891274
587846	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
587855	contig_17440_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_7593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACCCCATATCCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	3319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3000_3300
587856	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
587859	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
587881	contig_11855_pilon	+	2006	6	Intergenic	novelGene_67046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	121.6	950	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	528	989	2002362	2007496	FALSE	30	CAGCATGAGGTTCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVPCSVAPEKSVCRPQPPQVRRTFSLDTILSSYLLGQWPRDADGAFTCCTNDKATQITKLKQQLQRTKLSRSGKEKERGSPLQGDHAVRGALRTSPPSFPSGSTVLRLSPCLHRSLEGLNQELEEVFVKEQGEEELLRILDIPDGHRAPAPPQSSSCDPSLLPLEPGNLASSPSMPLASPQPSGCASHEEHRGAVEELASIPSDKASSPGHPAFLEEGSPSPVLAFAASPRPNHSYVFKREPPEGCERVRVFEEATSPGPDLTFLTSCPDKNKVHFNPTGSAFCPVNLMKPLFPSMGFIFRNCPSSPGSPLPPDQPQATSSEGSRGL	1986605	2008513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1986779_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253_2002456_2004013_2004165_2007279
587890	contig_14415_pilon	+	1965	4	Intergenic	novelGene_77609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	862	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	30	CAATGGTGTTTATATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
587893	contig_13718_pilon	+	2279	11	Intergenic	novelGene_142894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	199.475336821372	363	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	118	1368	230721	273278	FALSE	30	AAAACCATTTTGGTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEDLASYQVMIRCGEDIAKNTGLYLNTYSDVGRYIDHYAAIKKAWDDLKKYLEPRCPRMVLSLKEGAREEDLDAVEAQIGCKLPDDYRCSYRIHNGQKLVVPGLLGSMALSNHYRSEDLLDVDTAAGGFQQRQGLKYCLPLTFCIHTGLSQYIAVEAAEGRNKNEVFYQCPDQMARNPAAIDMFIIGATFTDWFTSYVNNVVSGGFPIIRDQIFRYVHDPECVATTGDITVSVSTSFLPELSSVHPPHYFFTYRIRIEMSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLEMGPDEYEEMEEEEEEEEEEDDDSADMDESDEEDEEERRRRVFDVPIRRRRCSRLF	226302	274189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_226412_230712_230803_236320_236438_252116_252232_253824_254030_255157_255204_256435_256521_257368_257492_262552_262669_263921_264113_273107
587907	contig_12080_pilon	-	2296	11	Intergenic	novelGene_128385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	242.01702419458	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	8	457	177526	172543	TRUE	40	CTTATCCAATAAATCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKVAITLSPVPPFPWVPELRALALTLDSQL	177533	166345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_171262_172266_172712_175881_176025_177280_177364_177471
587918	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
587922	SIRV5	-	454	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGTTCTCCACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
587929	contig_7202_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_17487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27939	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587930	contig_11130_pilon	-	1729	6	Intergenic	novelGene_53082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	89	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGGGTGTTTGCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55191_56024_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
587949	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
587951	contig_8330_pilon	+	931	5	Intergenic	novelGene_71988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	95	475	2052244	2057934	TRUE	40	TTCGGATACCTTCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYFTALIVDFVTFFYAQQTTNAFGSGSDTLPMRFAFLTILCFPTEDLVSLSLLILLQFLHVTFLISICFIKIALLFFRRQFTPLIAQHPCDFWKWDLWSLCSKLFSTLVHESNISCKGGFGCIAISKRFLPLSSLGPTSSFTSLLIFMPLFIAFCCI	2052149	2116719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2052370_2055973_2056187_2057892_2058039_2066338_2066434_2116462
587960	SIRV5	+	399	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-69	875	45	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8246	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
587962	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
587966	contig_2646_pilon	-	2840	21	Intergenic	novelGene_69628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	320.090518447517	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	28	2538	2078663	2069647	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQVRGSGCGGPGRQA	2078690	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069780_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070762_2071064_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
587988	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
587989	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588022	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
588059	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
588060	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91672	4	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
588073	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588098	contig_5643_pilon	-	2205	10	Intergenic	novelGene_38712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	272.336393291663	1348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	612	1649	36806	31788	FALSE	10	GGGAGTGGTCTGTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	48927	31231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37304_37461_37616_48694
588102	contig_15087_pilon	-	2121	16	Intergenic	novelGene_37131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	429.749518776797	20	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	508	1995	66689	33451	FALSE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLEELREDRVCLQEQKRITGCFGAGALSTSTHSHLCQCHPQPGMKATPATSAKAQTEITRP	89763	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33631_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
588121	contig_15063_pilon	-	1499	5	Intergenic	novelGene_12231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	35891	35108	TRUE	15	CAGTCCCCTGGTCCCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	27558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34925_35033_35380_35839_36146_36264
588128	contig_12626_pilon	-	2429	12	Intergenic	novelGene_80446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1316	1729	164938	158023	TRUE	40	TCTAATATACACTGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFSGLHSSEPSPWSGSMPPLLPSSSSDMEFFKGSLNTLPCARYSSSSDWSSSTWSCNILHCCSYSFLICASLSSCRKNSALLGSRSPNFSANTFSKFRCSLFVRFSYFANFSAFSRSSFSRRLFSFKERVRRSRM	173588	156170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_156448_156971_157109_157455_157599_157879_158055_160815_160927_161300_161392_162653_162793_164897_165021_166205_166710_171111_171242_171349_171419_173058
588141	contig_12624_pilon	-	1568	5	Intergenic	novelGene_61116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	850.929785587507	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955672	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950666_950731_950768_952913_952985_955644
588173	contig_11269_pilon	-	2287	8	Intergenic	novelGene_145807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_4	176.201762830256	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	75	1025	299711	257055	FALSE	25	CAGTTTGAATGACTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFFFCTCQSSSLQPLGPEHLGCVTMEELDALLEELENSTLQDSDEYSNPASLPLDQHSRKETNLTETSKVLSVQDDTTPLQAQLVYTTNIQEPNTCSKLQEPKKSPLPKTSAAAQLDELMAHLCEIQAKVAVKTDVGKKHLPDKQDHNASLDSMLGDLEQDLQDLGIATVPKGHCASCQKPIAGKMIHALGQAWHPEHFVCTHCKGELGSSPFFERGGLAYCPKDYHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMDQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDFLAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDAVWHPECFVCGVCIGILIYLLDLGKARGSPL	299785	255792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_257267_271445_271528_271645_271820_272865_273034_276695_276793_286864_286912_294698_294857_299698
588178	contig_10629_pilon	-	1365	10	Intergenic	novelGene_52927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.743124337483	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	464	901	252400	247024	FALSE	35	AGCAGCCAGGCAGGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAQNGEGQRGRMDRGNSLPCVLEQKIYPYEMLVVTSKGRTKLPPGVDRMRLEVSEDFSRVFSMSPEEFGKLALWKRNELKKKASLF	254686	246559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247125_247310_247396_247692_247764_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588
588179	contig_7254_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_145860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTAATAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270382	270826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_270400_270800
588190	contig_13740_pilon	-	1888	13	Intergenic	novelGene_34761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	287.843164761646	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	149	1258	873748	687167	FALSE	40	AATATGTTTTTCTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEPRPGSVRTHSPAVLTGTASPSLGCRHSFTPSVPLSAQILSARPALSNMPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYERKMPVLAASALDLTV	873896	686536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687630_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
588201	contig_9177_pilon	+	1703	5	Intergenic	novelGene_32672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	868.185572040909	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAATATCTTCCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395329	416877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_407998_408077_415315_415943_416048
588206	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1464	648	1009	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
588207	contig_17440_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_7688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3749	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
588208	contig_7179_pilon	+	1507	6	Intergenic	novelGene_78056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	235.146252362227	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	302	964	396299	402057	FALSE	5	GTCTGTGTTCTAGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIWKTCMECLRRSMVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392256	402600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_392418_395399_395492_396250_396344_397713_397795_400662_400755_401612
588213	SIRV4	-	332	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGGCTACATGAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
588227	contig_9468_pilon	+	1754	10	Intergenic	novelGene_59458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	145.108984160012	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	383	958	172913	189961	TRUE	65	GTACAATTTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKGKKQHSTYF	150676	190806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150989_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_190525_190573
588238	contig_5189_pilon	+	2460	2	Intergenic	novelGene_34819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAACAAAGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196342	218671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_198717_218585
588247	contig_9098_pilon	-	1508	12	Intergenic	novelGene_75790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	453.957110145044	1227	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	454	1254	288130	264388	FALSE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295266	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_290715_290841_292835_292905_294101_294181_295200
588248	contig_20157_pilon	+	556	4	Intergenic	novelGene_145865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	146.647726049726	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	10	555	40965	49576	FALSE	20	AGCACTCTGTGCTGATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPTSPASASPASPAPAPAAAPAPASAPTPAPAPSPTPATAPAPASSSDPAAAAATTAASAQSPASVQAPAQTSAPPPPGPALPGPFPGGRVVRLHPVILASIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDMEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDIT	40955	49577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_41335_48495_48567_48788_48869_49551
588254	contig_3095_pilon	-	1313	5	Intergenic	novelGene_75235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1495.41975712507	10	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	48	542	255481	253408	TRUE	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRGERRASARAGPTLGRGLSLQESLGAARGSERGGVGPRGWGWG	255528	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247858_247970_248476_248759_253384_253806_255384
588255	contig_14687_pilon	+	2557	3	Intergenic	novelGene_107924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAACCCAGTACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458226	528055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_460086_523427_523544_527473
588258	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
588270	contig_15063_pilon	-	1126	5	Intergenic	novelGene_12142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	785	1126	35891	27539	FALSE	35	TTGAACAAATTGTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEMRGKRLGEDWLSEDPVTTVPWSQ	36783	27538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27566_34602_34651_35164_35380_35839_36157_36264
588273	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588285	contig_5643_pilon	+	1529	9	Intergenic	novelGene_39120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	886	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGCACCGGAAGTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646192	651403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649706_650486_650570_650869_650958_651155
588286	contig_13215_pilon	+	1896	8	Intergenic	novelGene_145883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	336.693041332358	1025	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	136	690	103354	180409	FALSE	35	AGTATTGTTACTTATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRESRRHRALYVAPSRRRHRPQQQQQHEPPPRVVRFGPGWEAEKMPQSKSRKIAILGYRSVGKSSLTIQFVEGQFVDSYDPTIENTFTKLITVNGQEYHLQLVDTAGQDEYSIFPQTYSIDINGYILVYSVTSIKSFEVIKVIHGKLLDMVGKVQIPIMLVGNKKDLHMERVISYEEGKALAESWNAAFLESSAKENQTAVDVFRRIILEAEKIDGAASQGKSSCSVM	103218	181615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_103406_142187_142260_156089_156158_169217_169301_173174_173232_173352_173401_174186_174269_180316
588289	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
588290	contig_5671_pilon	+	957	5	Intergenic	novelGene_79445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1916.44089068774	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368861	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368934_376715_376781_392775_392919_521218_521303_531205
588307	contig_15087_pilon	-	2004	16	Intergenic	novelGene_37135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	399.311351648755	35	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	601	1878	66689	33451	FALSE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKRVCLQEQKRITGCFGAGALSTSTHSHLCQCHPQPGMKATPATSAKAQTEITRP	89772	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33613_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
588322	contig_11512_pilon	+	1842	9	Intergenic	novelGene_43263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	13.4791505667086	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	421	1704	358048	471553	FALSE	10	TTGGTGACTCTGACTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEGSSDVSGNWGLMDQVAALSWVQTHIREFGGDPQRVSLAADRGGADVASIQLLTTRAVNARLFRRAVLMGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357627	471691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_358061_358498_358702_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
588331	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588348	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91678	0	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
588362	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588371	contig_18822_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_111734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1693	1992	204972	205271	NA	70	GAAAATGAAGGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSVLKEVQLECSLQARMVRLCLTYFGHVIRRDQSLDGMLGKVEGQRKRGRPSTKWIDTVAATMGSSIKMIVRLAQDRAVFPSVVRRVAMSQNNLDNT	203279	205404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_203300_205400
588372	contig_5727_pilon	+	1778	3	Intergenic	novelGene_7996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCAGATTTACTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675987	686280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_677429_684708_684826_686060
588388	contig_4065_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_133402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGGCAGTCCTACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585897	587208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_585900_587200
588402	SIRV6	+	944	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	340	86	167	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
588409	SIRV5	-	229	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCACCCATAAACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
588412	contig_6735_pilon	-	1190	10	Intergenic	novelGene_15726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.835290761347	862	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	86	790	564868	542384	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSV	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542398_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
588439	SIRV4	+	185	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1586	632	1131	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
588440	contig_5302_pilon	+	1708	7	Intergenic	novelGene_81380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	438.891184944768	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	287	1021	111129	117238	FALSE	45	TGAAAAGGTCAAATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL	93073	117925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_93267_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046_115209_116464_116584_117165
588443	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_96838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588453	contig_10531_pilon	+	2191	2	Intergenic	novelGene_114535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486583	488851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_487251_487327
588454	contig_10861_pilon	-	1846	10	Intergenic	novelGene_39328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_6	245.34817789228	973	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	122	1021	1492200	1490156	FALSE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRGRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493820	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
588461	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_97066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588476	contig_6048_pilon	-	2033	8	Intergenic	novelGene_73238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	236.035365734779	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1151	1846	1907696	1896861	FALSE	20	GGTCCTCTCTGTAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1910986	1896673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922
588478	contig_14925_pilon	-	1665	5	Intergenic	novelGene_55332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	3	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	73	486	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116093_129436
588490	contig_19769_pilon	+	679	5	Intergenic	novelGene_102280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1575.13920019787	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	32	679	87249	89356	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRATLASPPPSAGMPLPAAKWVLLLLAGPDDSGEPRLCRRKRTRVGDSIKLVLLP	86998	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88032_89199
588491	SIRV5	+	211	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	303	154	189	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8504	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
588494	contig_4114_pilon	+	2017	2	Intergenic	novelGene_15597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTGATTAAAATGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251453	253531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_252031_252091
588496	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
588504	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_95857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588505	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588517	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588533	contig_1699_pilon	+	3327	2	Intergenic	novelGene_72812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	130	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	38	1312	47445	48719	FALSE	30	TTGTGATACCTTTGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESDVLHFQFEQQGDVVLQKMNLLRQQNLFCDVSIYINDTEFQGHKVILAACSTFMRDQFLLTQSKHIRITILQSAEVGRKLLLSCYTGALEVKRKELLKYLTAASYLQMVHIVEKCTEALSKYLEIDLSMKNNNQHTDLCQSSNLDVKNEEENSDKDCEIIEISEDSPVSMDFHIKEEESNALQSTVESLTSERREMKSPEMSTVDIGFKDNEICILHVESISTAGVENGQFSQPCTSSKASMYFSETQHSLINSTVENRVTEIPGNQGQGIFCENTEGSHGTVNEIQNLEESYSLRHQCPRCPRGFLHIENYLRHLKMHKLFLCLQCGKTFTQKKNLNRHIRGHMGIRPFQCTVCLKTFTAKSTLQDHLNIHSGDRPYKCHCCDMDFKHKSALKKHLTSVHGRSSGEKLPRPDLKRQNLL	46200	50734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_46229_47435
588554	contig_414_pilon	-	2051	3	Intergenic	novelGene_115101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	20	123	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	748	1524	373842	373066	FALSE	20	GGTTACGTGGGTTATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384192	372538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376676_376898_383938
588555	scaffold_6394_pilon	+	884	7	Intergenic	novelGene_111006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1287.82690563945	8	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	351	770	405059	406159	FALSE	10	CCTGTACTGTGTTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASTCSALRMGSRAGARPDRRPTRL	398215	406273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_403280_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405725_406086
588577	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588580	contig_8452_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_47990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGCCTGGCAATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131264	132892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_131300_132900
588590	contig_5485_pilon	+	1912	5	Intergenic	novelGene_37711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGCAGATGCGGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84794	88072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_85681_85740_86135_86258_86366_86774_87016_87788
588601	contig_8317_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_19678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAACAGCAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
588602	contig_9146_pilon	-	715	6	Intergenic	novelGene_79496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1491	junction_5	1262.74453473377	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	21	674	147490	142549	FALSE	25	GACAATGTTTGCACCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147510	142507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
588603	contig_10674_pilon	+	2192	12	Intergenic	novelGene_6428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_9	198.325469205388	423	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	57	2057	198581	251342	FALSE	20	CTTTCTGTGTTCAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLNSDEEGEPSGKRKAEDDDKANKKHKKYVISDEEEEDDD	198524	251477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782_211888_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_241065_241253_243633_243732_251237
588607	contig_6946_pilon	+	1640	3	Intergenic	novelGene_59793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTGTTTGTCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452357	454077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_452670_452707_453218_453259
588610	contig_5549_pilon	+	2085	12	Intergenic	novelGene_81608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	36.5373125258491	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	121	1404	304435	353176	TRUE	60	AACTCAAGAAAACATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVER	303582	369414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353225_365224_365385_366192_366402_367383_367491_369257
588612	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588619	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588623	contig_7056_pilon	+	2498	9	Intergenic	novelGene_43651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACACACCTTTGAAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722480	730140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723720_723824_724509_724599_724691_724746_725182_725319_725471_725604_725658_725733_725812_725989_728557
588653	SIRV5	+	236	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	151	167	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
588664	contig_5549_pilon	-	2709	3	Intergenic	novelGene_81643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_2	104	23	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAGTGCTTATTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445621	441965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_445003_445604
588670	contig_8210_pilon	-	2796	3	Intergenic	novelGene_30239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1802.5	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	43	378	37758	29712	TRUE	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILE	37800	24731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_26016_28577_29926_37636
588686	contig_15047_pilon	+	1079	7	Intergenic	novelGene_52111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	7	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGAGGCAGGGCTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2148	21456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2605_3257_3498_4158_4434_4552_4687_21007_21062_21232
588705	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588737	SIRV4	-	485	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCCACTGACTGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2325	1479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
588747	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588758	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	187	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
588760	contig_7202_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_16444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27802	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
588765	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588780	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
588789	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588794	contig_6589_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_25842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCACTATAAACTTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920689	922571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_920700_922600
588809	contig_5643_pilon	+	1036	7	Intergenic	novelGene_38919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.4952207818777	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	121	441	386563	389878	TRUE	25	TCTAGGGAGGAGGTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELKPGIFPHSQRPRRISFDTYQLSPWLPKSSVSHMQCCWRPLPCITCGSWKTW	385950	391463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_386028_386519_386725_388568_388658_389808_390012_390678_390785_390942_391095_391259
588818	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588830	contig_15899_pilon	+	2935	2	Intergenic	novelGene_128909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	0	1148	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1106	1420	32764	33720	FALSE	5	CCTTTATGTCTTTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHVELTEMEPELNSNQAALQGAVIPGPPFLFGACIVLMSFVVALFIPEYSKASGIHKHSSSISGSLTNTPERGIEEDFEPLLQDSSIWELSSFEEPGNQCTEL	31658	35235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_32827_33468
588834	contig_7202_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_17289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588836	contig_6418_pilon	-	803	2	Intergenic	novelGene_81234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTTGGTTTTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416439	1415495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1416167_1416307
588841	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91678	6	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
588845	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588846	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
588850	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_97501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588857	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
588859	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
588862	contig_16187_pilon	+	2306	5	Intergenic	novelGene_101076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	155.298704115649	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	32	688	53333	63290	FALSE	25	ACTACTTTATGGATTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWGGGGGLGTMAGSRLGQDPESTAAVTVLKRAVELDSESRYPQALVCYQEGIDLLLQVLKGTKDDTKKCSLRKKISDYMDRAENIKKYLDQEKEDGKYHKQIKIEENATGFSYESLFQEYLNETVTEVWIEDPYIRHTHQLYNFLRFCEMLVKNPCKVKIIHLLTSLDEGSGKEQQSNGLQEIKESLRSHGVLLELEYSSSIHDREIRLVFRNIFIFMPLKYSYFYVS	53301	64908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_53484_59847_59950_62054_62192_62316_62404_63110
588870	contig_12638_pilon	+	2032	10	Intergenic	novelGene_33391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	118.82012549321	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	69	1016	1515842	1534883	TRUE	50	AGAGAAAGAAAGTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSAGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWTAIG	1515773	1539639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529410_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530515_1534864_1535060_1538799
588872	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_96110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
588875	contig_6325_pilon	-	3157	1	Intergenic	novelGene_143345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGATTCTTACTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118476	115319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_115300_118500
588876	contig_6325_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_143341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCCGCCCAGGCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115217	114834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_114800_115200
588877	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
588895	contig_12079_pilon	-	1268	4	Intergenic	novelGene_67458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1131.37084989848	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTGAAAAGCCACGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598149	580168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581137_582055_582094_591597_591715_598004
588897	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588900	contig_14094_pilon	+	354	2	Intergenic	novelGene_145912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTATGTGTATATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300991	301458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_301046_301158
588901	contig_14094_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_145913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCCCACAAATAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301557	304452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_301600_304500
588902	contig_12079_pilon	-	1349	6	Intergenic	novelGene_67443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	810.653415461873	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	140	412	638707	600804	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQELRKESPPPVQIPRQVLPGRCA	638846	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580400_599482_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
588907	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	510	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
588911	contig_11338_pilon	+	1838	10	Intergenic	novelGene_6188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	562.037584965259	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	299	1633	6086	13398	FALSE	45	ATCAAAAGCTGAATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMRSLGRLPSRAVPACVLTAPPGPCPGGWQWLGSSVPRGAGPRPCSAAPTSQRSPPVRQQQSGHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	2631	13603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_2781_4519_4667_6083_6131_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10580_13070
588914	contig_11720_pilon	+	2447	11	Intergenic	novelGene_43943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	417.607040170541	45	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1774	2193	268923	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263020_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_268930_270628_270700_271268_271343_271806_271961_272096
588915	contig_8538_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_5049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842826	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
588920	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588926	contig_7202_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_18066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	140	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28093	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
588933	contig_7234_pilon	-	1574	15	Intergenic	novelGene_145927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_14	186.206559103221	471	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	252	1001	510034	411977	FALSE	20	TCTGATGCAAGTTATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	411403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_524420_524532_587318
588934	contig_14986_pilon	+	1814	2	Intergenic	novelGene_59723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	334	1383	151004	152053	FALSE	35	AGTTGTTTCTTACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150250	152484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150537_150956
588935	contig_1225_pilon	+	1802	4	Intergenic	novelGene_44175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	7	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATGCTTTCCACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251344	276784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_275037_276058
588937	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_93616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
588939	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588945	contig_15982_pilon	+	1229	2	Intergenic	novelGene_145973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	951	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAAGTTGGTAGTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66243	68992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_66453_67972
588952	contig_7279_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_145992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149566	150322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_149600_150300
588967	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
588987	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
588993	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
588994	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589001	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
589003	contig_15596_pilon	-	2563	17	Intergenic	novelGene_139542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	120.208396519336	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	833	2502	62	2563	217105	182796	FALSE	15	AATGGGAGCTCTTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQPSVRLLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKKKTYSEPKFDNKRADGTISSDIKSAKGSHLSVHAENSLKSVTDVCHKRTDRKSRITEKSGSTSRPEFEFTRLDFPELQSPENSGILEIPEQPKWGPLHSAATSVSLLRERKPPAVLAEGEIAVKSKNPAASVADSAASSSSSCTRELSWTPMGYVVRQTLSTEQSPAPKNVTSMINLKTVASSANPKTVNVASSEVLSSDPSSNKEKHTVHPTKKSKVLQGGNPEQNEVSRKNKKKKEKSKPKYEVLTVQEPPRIEDAEEFPNLAVASERRNRVESTKFQSKQQQQNNFKSSRKKSEIPVQLDLGGMLTALEKKQHSQNAKQSSKPVVVSVGAVPVLSREATSGMKNHHLNQVLTPHNPLDSSAPLRKKGKQREVPKAKKPTSLKKIILKERQERKQQRLQENIASDAVQDVESSGDDQSLPQADPSEESGSEEPLRAEPQSDIEACHLGLDSASFPKIHSRRFRDYCSQMLSKEVDACVTDLLKELVRFQDRMYQKDPVKAKTKRRLVLGLREVLKHLKLRKLKCVIISPNCEKIQSKGGLDDTLHTIIDYACEQNIPFVFALNRKALGRSLNKAVPVSVVGIFSYDGAQDQFHKMVELTMAARQEYKTMLESVRRELAEEPGARSPPSPPPQGPSCSAEDAHPASTEKEEPHYIEIWRKHLEAYNRCAQELEETLGASTSQMMNLKL	217166	182795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_182900_183272_183466_183854_184010_188157_188379_189071_189187_190879_191004_191819_191987_194743_194877_196626_196717_198011_198135_199636_199846_201847_201930_204476_204710_206206_206328_206575_206826_215682_215829_217069
589029	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589033	SIRV6	-	228	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTAAAACCAGGACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
589040	contig_10940_pilon	-	1764	5	Intergenic	novelGene_49263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	175	603	917000	875564	TRUE	20	TTTTTTCTTTTTCCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917174	874051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875002_875352_875675_893147_893306_916664_916748_916923
589062	contig_10103_pilon	-	1891	16	Intergenic	novelGene_86160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	307.461173700572	52	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	220	1644	655204	638598	FALSE	15	TGTGCTTATCTCTCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657015	638350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645753_649864_649969_651346_651475_651637_651739_653443_653647_654456_654570_654694_654772_655131_655207_655974_656047_656148_656224_656945
589085	contig_10986_pilon	-	1577	12	Intergenic	novelGene_71465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_10	180.842472887317	1812	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	519	1358	74333	67011	FALSE	20	CCCCGTAAGCTCTCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80425	66791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76116_76245_80189
589092	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589093	contig_10437_pilon	+	2545	1	Intergenic	novelGene_38236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTACAGGAGCATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333693	336238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_333700_336200
589098	contig_6375_pilon	+	2424	3	Intergenic	novelGene_72980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	479	junction_2	128.5	186	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTTCTCCCACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241671	244535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241865_241940_244006_244369
589099	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
589105	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1113	2	-1113	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGAGCCACCGTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
589122	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_93654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
589132	contig_5671_pilon	+	1131	6	Intergenic	novelGene_79450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2306.78481007657	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	251	637	370430	531225	FALSE	10	TACTTTTTTGTGATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNGRLSRL	369022	531719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369248_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521280_531205
589133	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
589137	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589153	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_93633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
589157	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589172	contig_18168_pilon	-	1265	7	Intergenic	novelGene_122068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	156.30916657559	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	441	881	25980	23837	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27126	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26065_26483_26754_27040
589174	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCATTCTTTCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
589178	contig_18869_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_56141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
589181	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
589182	contig_6740_pilon	+	3008	2	Intergenic	novelGene_142694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTACAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632134	636632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_632729_634218
589191	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589197	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
589221	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
589224	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589229	SIRV4	+	318	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	663	967	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTAACATAAGTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
589233	contig_11396_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_71263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	374	781	150901	150494	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFNKTNDFFIENTFFLQCKRQLYTWTLLDGIYRNQINYICGKRQWRSPISSVRTKLGTTCGTDHQLLMCKFKLKLKKIRTSPREPKCDLKYIPPEFRDRLKNRCDALNTNDQRPDEFRNDIKDIVDEESKKGH	151274	148456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_148500_151300
589246	contig_17440_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_7609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAATTCCGCTACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
589248	contig_7744_pilon	-	2360	8	Intergenic	novelGene_62515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_7	76.0861488105182	163	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1065	2012	823397	821469	FALSE	20	TAAGGTGCTATTGGGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKSLGRRDRRKKGDRGKEILEKDGYLGQSILTVHFLSSFIPQVLNSRPLVLFPCFVKVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQYMSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVRAGERDSKVGSKRAQKYNLTFPRL	825078	821120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823501_823760_824670_825026
589261	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_18830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCGCAGGTGCGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
589269	contig_1694_pilon	-	2921	1	Intergenic	novelGene_144957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCTAATTATTACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1530151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1530200_1533100
589287	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
589289	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
589306	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589317	contig_9389_pilon	-	1798	8	Intergenic	novelGene_83872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_5	437.438275529199	2815	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	49	867	45836	36611	FALSE	0	CTCGGGCTGGGCGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGPSKALPGGGGHRGMVALENPEGGSEEAATVAEVSPGGRRMLPLPGCLPALAGSQVKRFSASKRKQHFINQAVRNSDLVPKAKGRKSLQRLENTQYLLTLLESNGGTPGLEDGDLAPPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45884	35679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38975_39409_39535_40050_40206_45753
589326	SIRV4	+	263	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	670	1015	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCACATGCTAACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
589354	contig_12950_pilon	+	421	2	Intergenic	novelGene_114794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTCTGGCTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105269	106791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_105360_106460
589372	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
589386	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_96100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653855	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589401	contig_6929_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_139435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTACTTTTGCTTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202665	204692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_202700_204700
589402	contig_15118_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_74548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCTCAGTTTCCTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125350	127477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125400_127500
589409	contig_11498_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_65513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATACATGCGCGTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173215	172647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_172600_173200
589422	contig_3747_pilon	-	2629	1	Intergenic	novelGene_24976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	513	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCATTTCTCATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257166	254537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_254500_257200
589446	contig_6048_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_73231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATAAGTATATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775485	1773324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1773300_1775500
589458	contig_12079_pilon	+	2089	13	Intergenic	novelGene_67399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.627795257286	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	610	1851	535255	578891	FALSE	20	GCTATTGTATTAGTAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	490655	579129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491103_531271_531298_532323_532394_535188_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
589459	SIRV4	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCTACATGAACAACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	2436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
589461	SIRV6	+	954	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	22	552	-15	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	236	727	1733	10736	TRUE	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1109	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
589469	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589482	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589489	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
589490	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
589502	SIRV7	-	274	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35782	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70877_70981_78841
589517	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22671	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
589529	contig_10235_pilon	-	1564	11	Intergenic	novelGene_46268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_10	340.952621342028	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	85	1371	25335	14151	FALSE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	27213	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25338_27131
589542	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
589543	SIRV7	-	188	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69098	0	35879	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78859	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
589545	contig_9848_pilon	-	1696	3	Intergenic	novelGene_79985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	396.5	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTACATAATATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149232	128396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_129829_136653_136842_149156
589549	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589557	contig_9345_pilon	-	1195	4	Intergenic	novelGene_24676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2138.49173224703	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATGGCCATATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955250	947200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952479_952561_955197
589559	contig_16103_pilon	-	2533	12	Intergenic	novelGene_118748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_11	92.6911694421965	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1487	2191	316990	314512	FALSE	10	TCCTAGTAGGTGCTCGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNETGFEISSSDATVKILITTVPPNLRKLDPELHLDIKVLQSALAAIRHARWFEENASQSTVKVLIRLLKDLRIRFPGFEPLTPWILDLLGHYAVMNNPTRQPLALNVAYRRCLQILAAGLFLPGSVGITDPCESGNFRVHTVMTLEQQDMVCYTAQTLVRILSHGGFRKILGQEGDASYLASEISTWDGVIVTPSEKAYEKPPEKKEGEEEEENTEEPPQGEEEESMETQE	321073	314169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314673_314804_314896_315104_315220_315294_315357_315757_315846_316318_316398_316881_318136_318474_318553_319100_319206_319791_319835_320330_320391_321018
589564	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589567	contig_14322_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_115977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671589	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
589578	contig_7202_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_17685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27856	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589584	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
589597	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
589598	contig_15236_pilon	-	1037	6	Intergenic	novelGene_141543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	12.1095004025765	101	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGATTCCTGACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114069	106397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_106611_110951_111177_111381_111509_111610_111686_113397_113603_113877
589608	contig_19825_pilon	+	2264	4	Intergenic	novelGene_59679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGGGGAAAAAAGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15369	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_+_17404_19816_19903_23159_23239_36715
589615	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_16574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
589617	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589621	contig_8658_pilon	-	1267	6	Intergenic	novelGene_55805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1060.5690170847	57	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	299	916	30206	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55659	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30230_36529_36674_55528
589627	contig_13265_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_146010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAACCCACTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115089	115947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_115100_115900
589661	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
589667	contig_5988_pilon	+	1570	4	Intergenic	novelGene_16015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_3	73.1452132557027	111	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	103	1452	779480	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779377	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838
589669	contig_17440_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_7686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3743	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
589672	contig_10923_pilon	+	1411	8	Intergenic	novelGene_66186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	593.349674925919	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	51	1295	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
589681	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589690	SIRV7	-	251	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69035	0	35816	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78922	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
589692	contig_15777_pilon	-	3199	16	Intergenic	novelGene_75734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_15	37.1433260043667	154	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	228	2216	141177	88613	FALSE	20	CTTTCTACTCGTTAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTGMAGVSLKRGSLAVKDNDSQAPGEEVKRQKVSECCLSEGQDGLESDSLPSDENVPAVPEAVSAGEGKNNSDAPLEDEEEEEEDGLSEEGEEEEEVESFADMMKHGLTELDVGITKFVSSHQGFSGILKERYSDFVVHEIGKDGRISHLDDLSVPVDEEDPSEDVFTVLTAEEKQHLEELQLFKNKETSVAIEVIEDTKEKRTVIHQAIKSLFPGLETKTEDREGKKYIVAYHAAGKKALANPRKHSWPKSRGSYCHFVLYKENKDTMDAINVLSKYLRVKPNIFSYMGTKDKRAITVQEIAVLKVTAQRLAHLNKCLMNFRLGNFSYQKNPLKLGELQGNHFTVVLRNITGTDEQVQQAMHSLKEIGFINYYGMQRFGTTAVPTYQVGRAILQNSWAEVMDLILKPRSGAEKGYLVKCREEWAKTKDPAAALKKLPIKRCVEGQLLRGLSKYGMKNIVSAFGIIPRNNRLMYIHSYQSYVWNNMVSKRIEEYGLKPVPGDLVLKGATATYIEEDDVNNYSIHDVVMPLPGFDVIYPKHKISEAYREMLTADSLDIDNMRHKIRDYSLSGAYRKIIIRPQNVSWEVVAYDDPKIPLFNTDVDNLEGKPPPVFASEGKYKALKMDFSLPPSTYATMAIREVLKMDTSIKNQTQLNTTWLR	152486	87629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_88750_96014_96107_97082_97213_99693_99796_101518_101646_102629_102791_103665_103728_110781_110908_111303_111433_125163_125242_127325_127438_133496_133642_136261_136364_139709_139795_140776_141210_152291
589697	contig_1331_pilon	-	853	4	Intergenic	novelGene_37845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	FALSE	20	ACTTGGAGAGCCACTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	159649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
589704	contig_6929_pilon	+	804	4	Intergenic	novelGene_139412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_2	1547.29556179663	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	22	402	127176	130939	TRUE	5	TTTGTGTATCTTTCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127154	132319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130971_131948
589707	SIRV7	-	238	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69048	0	35829	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78909	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
589718	contig_11512_pilon	-	2096	9	Intergenic	novelGene_43275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	413.661697525889	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	120	950	396169	367967	TRUE	35	AACCCTTGGAACCTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409393	366010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366087_366896_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
589727	contig_14855_pilon	+	2124	6	Intergenic	novelGene_146034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	24.273442277518	218	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	279	917	650839	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648561	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340
589729	SIRV7	-	244	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69041	1	35822	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78916	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
589730	contig_15063_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_14279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	338	1162	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34821	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
589750	contig_13097_pilon	+	2562	16	Intergenic	novelGene_107704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	531.275881461056	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	762	1823	196348	263558	FALSE	70	CAAGCACAAAAAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRRFAL	184537	264297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190521_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407
589752	SIRV4	+	355	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	154	441	154	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
589755	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_96689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
589758	contig_13740_pilon	-	1341	10	Intergenic	novelGene_34640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3457.93995977838	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	195	662	165243	160666	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165437	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_157452_157536_158315_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_165237
589759	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
589774	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_90547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653843	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
589776	contig_854_pilon	+	1431	7	Intergenic	novelGene_36209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2803.75791968961	8	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	124	675	543600	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543476	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545962_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
589786	contig_8576_pilon	+	1920	6	Intergenic	novelGene_88792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	455.568480033463	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	13	966	893619	916102	FALSE	70	AAACAGCAACAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTCPCVGVVSC	893606	917056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913395_916068
589789	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	0	35782	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
589798	contig_11752_pilon	+	1830	6	Intergenic	novelGene_37662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1294.33000428793	2	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	12	980	87210	105616	FALSE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKAFSMNDPY	87198	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88670_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_105590
589803	contig_1154_pilon	+	2012	4	Intergenic	novelGene_87120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_3	261.677069856892	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	716	2011	439267	445992	FALSE	35	AGTAGGAATACTGTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKN	434309	445993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_434975_439216_439505_442410_442505_445028
589804	contig_8920_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_146055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAATATGCTGTCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43778	44685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_43800_44700
589826	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
589830	SIRV6	+	260	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2049	568	31	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
589838	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589847	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589865	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_18486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589868	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
589884	contig_7119_pilon	-	2213	6	Intergenic	novelGene_41004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	372.49558386644	33	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGCCTTGTCTTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196805	188201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_195119_196379_196690
589899	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_89077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	TGTGGTTTTGCTCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
589900	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
589914	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	660	966	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
589917	contig_4339_pilon	-	2420	11	Intergenic	novelGene_146099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_2	102.870598326247	297	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	248	1861	1231218	1205601	FALSE	20	TTACACCAATTGTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHSDWRVQVAVKHLHIHTPLLDSERNDVLREAEILHKARFSYVLPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNQLLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMNPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMMSLSQSRSSISAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASVKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEEVTNPLQIMYSVSQGHRPDTNEESLPFDIPHRALMISLIKSGWAQNPDERPSFLKCLIELEPILRTYDEITFLEAVIQLKKTKSSASTILLCDKEKMKLSLNIPVNHGPQEESCGSSQLHESSGSPGTSRSLSTPQDGDFSSRKTQDNSSILYHHPVNHSWESNISEVQRTKFCDHKITPCSSTIVNLLSIEGNSERLQPGVAQQWIQSKREDIVSQMTEACLNQSLDALLSRDLIMKEDYELVSTKPTRTSKVRQLLDTSDIQGEEFAKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEVLGISRLPYSNLFQNKSL	1231465	1205041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1205939_1206549_1206709_1208537_1208632_1209681_1209766_1212608_1212695_1215396_1215559_1219287_1219338_1221086_1221245_1223050_1223207_1225856_1226011_1231045
589918	contig_10496_pilon	+	2543	6	Intergenic	novelGene_59440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	17.6906755099968	4	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	126	698	199627	219320	FALSE	10	ACAGTGTCTGTGTGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METETKTLPLENASILSEGSLQEGHRLWIGNLDPKITEYHLLKLLQKFGKVKQFDFLFHKSGALEGQPRGYCFVNFETKQEAEQAIQCLNGKLALSKKLVVRWAHAQVKRYDHNKNDKILPISLEPSSSTEPTQSNLSVTAKIKAIEAKLKMMAENPDAEYPAAPVYSYFKPSDKKRTAPYSRTAWKSRR	195418	221165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_195528_199610_199740_209283_209411_214098_214186_216071_216158_219160
589919	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91677	2	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
589922	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
589924	SIRV7	-	347	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-4	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114742	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
589935	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589960	contig_10235_pilon	-	2073	19	Intergenic	novelGene_46390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	75.2311663811065	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	226	1827	191197	177880	FALSE	10	CTGGCTGGCTGATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALASGAHCIFSDPAALLNLVLPRLEEGSTQGWGMLWTLQQNSSTHAHALQCTYLVLPFGYLSLSKVVPFSHYAGTLLLLLAGVACLRGIGRWTNPQYLQFITILEATHRNQSAENKRQLSKYNFDFRSWPVDFHWEEPSSRKESRGGPSRRGVALLRPEPLHRGTADTFLNQVKKLPCQITSYLVAHTLGRRMLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192431	177633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_191016_191257_192265
589963	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
589965	contig_9471_pilon	-	1915	3	Intergenic	novelGene_21730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	37	2190	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1481	1795	204981	197680	FALSE	15	TTTATGCCAATGTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGHGHEHGHGHEHGHHKMELPDYKQWKIEGTPLQTVQEKLAARGLRDPWGRNEAWRYMGGFANNVSFVGAILKGFKWGFAAFVVAVGAEYLLESQSKDKKHH	209169	197559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_197837_204823_205000_207707
589972	contig_6488_pilon	+	2193	7	Intergenic	novelGene_44760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	411	junction_1	335.41139747414	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1052	1558	194710	203836	FALSE	45	TACAATTTTAATAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGPAKNMVKQKALRVLKQKRMYEQQRDNLSQQSFNMEQANYTIQSLKDTKTTVDAMKLGVKEMKKAYKQVKIDQIEDLQDQLEDMMEDANEIQEALSRSYGTPELDEDDLEAELDALGDELLADEDSSYLDEAASAPAIPEGVPTDTKNKDGVLVDEFGLPQIPAS	193658	204471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_194731_196117_196165_197384_197479_197611_197684_199944_200054_201539_201653_203785
589980	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
589994	contig_1717_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_146111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTATCTGATTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95211	96058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_95200_96100
589995	contig_20646_pilon	+	1385	8	Intergenic	novelGene_145022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_3	163.487626692764	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	67	1170	33838	40819	FALSE	10	AGACCCTTCTGTCCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	33771	41034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_38470_39122_39278_40684
589996	contig_854_pilon	+	1827	15	Intergenic	novelGene_36441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	401.701845214806	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	119	1702	1453661	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451212	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1454977_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
590002	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590006	SIRV3	-	431	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTCCACCAAACCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7212	6781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6800_7200
590010	contig_1150_pilon	-	204	3	Intergenic	novelGene_61449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36526	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTTGAGTAAAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309854	309082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309190_309329_309385_309812
590011	contig_19769_pilon	+	1336	3	Intergenic	novelGene_102276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	312.5	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	642	974	87859	88993	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNVSSSEIEVQGP	86998	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_88040_88841
590022	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590026	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
590027	contig_6217_pilon	-	2802	1	Intergenic	novelGene_109606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCCAGCATACGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401336	398534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_398500_401300
590043	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91668	-15	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
590056	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	632	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
590062	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_17661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
590065	contig_8978_pilon	+	2147	10	Intergenic	novelGene_49385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	270.2142268554	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	79	1257	339807	347248	FALSE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331584	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343404_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
590074	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590075	contig_12270_pilon	-	385	2	Intergenic	novelGene_113136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	27	383	14409	13830	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14435	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590097	contig_12270_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_113105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	ACAGTGCTTCAGCCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590101	contig_14638_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_71578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	25	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	10	TTTCCCCCTGTTCTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253336_253613_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
590110	contig_10424_pilon	+	2262	16	Intergenic	novelGene_56812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1040	1453	317607	319652	TRUE	35	AGCAGCACAGGAGAGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALGFFNRSLGCALKGSPDGGGGSVCSIIEGGMYIGCGGIGTALPQPNFISKDIIIFPFKFFKALSASLLFINATKPQFLSLALSSSVLGHIIFTLANGPNLPNSWHSISSFICGLIFPRYKLVVLGSPTSCEPGA	311642	347222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_312428_312505_312572_313426_313533_316593_316641_317571_317781_317959_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323828_324272_324387_327209_327310_329327_329460_341003_341049_347147
590115	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_17498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590118	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
590122	contig_11328_pilon	+	239	2	Intergenic	novelGene_88431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3456	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATCTTTACACAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647120	648036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_647223_647899
590123	contig_3525_pilon	-	3506	6	Intergenic	novelGene_135136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	85.0750257126027	12	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	350	946	608593	592708	FALSE	55	AAAATACAATTAAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVWVADRGNKRIQVFDKDTGEWLGAWDNCFTEEGPSSVRSLLLSVLKCLFYSVYMT	609796	590147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_592876_602693_602786_605990_606192_608457_608602_608885_609006_609575
590142	contig_6230_pilon	-	1763	11	Intergenic	novelGene_102093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_9	80.6727339316079	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	361	987	137170	118618	FALSE	20	GTAAAGTTTCCTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNMLYACSILYKTKLPFIVVMNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVSNLTRSMSLVLDEFYSSLRVVGVSAVLGTGLDELFVQVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATDSLSPVLDPSDLILTRGTLDEEDEEVDSDTDDIDHRVTEESHEEPAFQNFMQESMAQYWKRSNK	157549	117841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128222_132861_132953_133621_133662_134932_135016_135714_135862_136512_136559_137144_137240_137622_137702_156635_156730_157431
590176	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	878	-22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
590197	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590201	contig_14322_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_116463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
590215	contig_5415_pilon	-	276	3	Intergenic	novelGene_146140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	496	junction_2	17.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTAATGTCAGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200594	191707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_191802_194535_194623_200499
590219	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1582	632	1127	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
590222	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
590237	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
590241	contig_17074_pilon	+	1773	4	Intergenic	novelGene_145133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	247.631895271097	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	216950	223655	FALSE	20	GTCTTTAACATATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	216948	225055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_216959_217651_217694_220892_221011_223452
590265	contig_13645_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_146163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCAGATCTTATAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18135	19908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_18100_19900
590283	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
590284	SIRV7	+	234	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTCTTCTCAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147689	147923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
590291	contig_15063_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_11792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTGAGGTAGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39767	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035_35385_35845_36158_36264_36597_38972_39090_39504
590294	contig_14322_pilon	-	323	2	Intergenic	novelGene_115778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671850	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671640_671817
590301	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590306	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590314	contig_10793_pilon	+	1272	12	Intergenic	novelGene_83370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3457.92970116251	7	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	132	950	146975	163192	TRUE	45	AATGTCAAATACAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGWKVPDRLEKRKECHIENH	130870	167256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162683_163136_163288_163929_164068_167167
590326	contig_2793_pilon	+	971	4	Intergenic	novelGene_142876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	8.9566858950296	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	831	140	970	286544	301428	FALSE	25	GATGGTAGCCACCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLEWRVSKQEPLLLLSGAWASVGLDHPRLAPFSSHTAKFAEEACAVLTSSKFEACHHAVSLQPYLQNCHYDVCSCSDGRDCLCNAVASYASACAQKGVSIAWREPSFCALSCPQGQVYLQCGIPCNLTCRSLSYPDEECNEVCIEGCFCPPGLYLDDRGDCVPKAQCPCYYDGEIFQPEDVFSDHHTMCYCEDGFMHCTMSGMPGSLLPDVVLSSPLSHRSKRSLSCRPPMVKLVCPADNPRAEGLECAKTCQNYDLECMSTGCVSGCLCPHGMV	286404	301429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_286875_291609_291851_299208_299304_301264
590327	contig_2793_pilon	+	3345	23	Intergenic	novelGene_142877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_15	22.762381972409	90	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1057	3174	53	3226	330013	416823	FALSE	35	GCAAAAGACTGATGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITTIDVPWNVAQEHAHLMSLVDLMQRKSGPSQTGDALGFAVRYITSEVHGARPGAAKVVVILVMDVSVDSVDAAADAARSNRVAVFPIGIGDRYDVSQLRILAGPDASSNVVELQRIEDLPTMVTLDNSFFHKLCSGFVRVCVDEDGNEKRPGDSWTLPDQCHTVTCLPDGQTLLKSHRVNCDRGPKPSCTNSQSPVRVEETCGCHWTCPCVCTGSSTRHIVTFDGENFKLTGSCSYVLFQNKEQDVEVILHNGACSPQQTCMKSIEVKHDGLSIELYSDMEVTVNGRLVSVPYTGGNMEVSVYGTIMHEIRFNHLGHIFTFTPQNNEFQLQLSPKTFSSKMYGLCGICDENGANDFMLRDGTVTTDQRTFIQEWTMQQPGQICQPIPEEHCPVSSSSHCQVLLSALFAECHEVLAADTFYAICQQDSCHREQVCEVIASYAHLCRTNGVCVDWRTTDFCGMSCPPSLVYNHCAHGCSQHCEGNTSSCGDHPSEGCFCPPHQVLLEGNCVPEEACTQCISEDGVRHQFLETWVPDHQPCQICMCLSEQKVNCTSQPCPTARVPTCGPCEVARLHQNPNQCCPEYECVCDLVSCDLTPVPHCEGGLQPTLTNPGECRPNFICACRKEECRRESPPSCPPHRTLTLRKTQCCDEYECACNCVNSTVSCPLGYLASVIINDCGCTTTTCLPDKVCVHRGTIYPVGQFWEEGCDVCTCTDMEDAVMGLRVAQCSQKPCEDSCTLGSTYVLHEGECCGRCLPSACEVAIGSPRGDSQTSWKSVGSHWASPENPCLLNECVRVKEEVFVQQRNVSCPQLDIPTCPMGFQLSCKTSGCCPTCRCEPVEACVLNGTIIGPGKSLMIDECTTCHCTVQVGVVSGFKLECRKITCKACPLGYKEEKIQGECCGRCLAMACTIQLRGGQIITLQRDETIQDGCDSHFCKVNERGEYIWEKRVTGCLPFDEHKCLAEGGKIMKIPGTCCDTCGEPECKDITARLQYVKVGDCKSEEEVDIHYCQGKCTSKAMYSIDTEDMQDQCSCCSPTRIEPMRVPLHCINGSVVYHEVLNAKQCKCSPRKCTK	329960	416942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_330062_330355_330500_333393_333559_334464_334509_334818_334997_352412_352628_353753_353947_354131_354474_356224_356425_364504_364608_365077_365153_366370_366476_367707_367914_373121_373272_377963_378075_380511_380693_381757_381799_382281_382399_412461_412561_413436_413566_414101_414142_415825_415924_416634
590329	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590337	contig_11338_pilon	+	3729	10	Intergenic	novelGene_6327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	52.0315668668289	917	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	955	2478	277296	287319	FALSE	35	ATTTTATACATTTCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGLFDLGVSGCSALPAQDPAWLQQESTEVMTPGLLTTCSQEPVTFEDVAVVFTQEEWVFLDSAQRSLYREVMLENCRNLAAVGYQLCKPSVFSPWGQIEELWTTERGLFQGICPEPQLQLQESIPNQDIFGEIPSIVMKRELPQPGGKLYKCNEFEKCFNSIELHFQYQRIHTEEAPYECKENGQSFQSCHLIVPEKICSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLTRHEKTHTSEKFFECQECRKAFKYSSNLRRHMRIHTGEKPFECNQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFDCNQCGKAFREHSSLKTHMRTHTKEKPYECNQCGKPFRTSTHLSVHKRIHTGEKLYECSTCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYACQECGRAFSEPSSLRKHTRTHTGKKPYMCQECGRAFGQSSHLIVHVRTHTAGKPYACNQCDKAFRHSSSLTVHKRIHSGRENVRNIGLPVSVPHLYGGPFAS	264862	288570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_264932_271840_271919_274838_274960_275068_275186_276726_277342_283213_283297_283878_284006_284430_284527_285052_285130_286224
590349	contig_10427_pilon	-	3204	1	Intergenic	novelGene_142187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGAAGGAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82580	79376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_79400_82600
590356	contig_10437_pilon	+	2097	4	Intergenic	novelGene_38153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	246.561689373403	3	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCGTTGCAGAGTGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159582	164089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160203_160732_160844_161549_161597_162770
590359	contig_1275_pilon	+	921	2	Intergenic	novelGene_108822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	99	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	90	779	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
590374	SIRV4	+	318	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	660	970	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
590384	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
590387	contig_4469_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_21963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	755550	755921	NA	15	GAGTCTCCTGCATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APASFLPTLLSDPTISNCLPAHAGEVLVSHLRSSVIPRSQRFCCSPHQLHEPRQDLGSLAHAPETPFSLANPSVHRLFRSTPSSEADPPFKLGNQRLNSLGDPAALLSFLPSFKKKKKFLGVQ	755549	757513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755500_757500
590388	scaffold_19766_pilon	-	1562	2	Intergenic	novelGene_34364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	461	junction_1	0	56	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	233	796	678108	677545	TRUE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGRSDEERGPGREGKDSGTRDGREGLMDPSCPSGASLSVADLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHW	678340	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394
590389	contig_12951_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_68213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCGACTCAATGCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781350	779661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_779700_781400
590400	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_96792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590401	contig_854_pilon	+	1287	7	Intergenic	novelGene_36247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3461.30772091834	40	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	108	515	543600	560658	TRUE	10	GCTGGGCCCAGCTGACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDGETEAQRGD	543492	563606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_556082_556201_557001_557065_557591_557752_560626_560721_562271_562405_563029
590405	SIRV4	+	280	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	688	980	-56	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACTAGCCTATGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
590410	contig_7202_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_17300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCTCATGCAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
590414	SIRV6	+	294	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	1	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
590415	contig_9440_pilon	-	4022	1	Intergenic	novelGene_59040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACTAGAAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320793	316771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_316800_320800
590429	contig_14441_pilon	+	1237	4	Intergenic	novelGene_100695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	613.586723020199	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	648	1001	116876	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	114381	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114732_116578_116963_117097_117344_117539
590437	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_94298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
590439	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590441	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	21	91670	-11	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147936	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
590460	contig_6710_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_90194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAGCACTTGCTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
590464	contig_6710_pilon	-	408	2	Intergenic	novelGene_98251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	CTCCTTAGGCCTCTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
590470	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	638	1123	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
590474	contig_3103_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_146175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTTCTGGACAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1849	2135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_1800_2100
590478	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	213	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
590479	contig_7165_pilon	+	2363	5	Intergenic	novelGene_116905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_4	27.6891224129621	152	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	110	2086	1198317	1220946	FALSE	10	GATGTTTCCTCTTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRLLLRVWPRGLAVGPGAPCRPLSARSGPSQYLQSSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLDDGHFRKTEQFCKSFENGSGKELHEQLVAQDKKNKHTSYISGPWFDMYLAARDSIVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTFRAGLLEPEVFHLNPAKSDTDTFKRLIRLVPPSLSWYGAYLVSAYPLDMSQYFRLFNSTRIPKPGRDELFTDDKARHLLVLRKGHFYVFDILDKDGNIVSASEIKAHLKYILSDNSPAPEFPLTYLTSENRDIWAELRQKLVSDSNAETLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGTAAVHFEHAWGDGVAVLRLFNEVFQDSTQNPAVTPQSRPATTDSSVAVQKLSFKLSDALKTGITTAKRKFDETMETLTIDCIQFQRGGKEFLKKQKLSPDSVAQLAFQMAFLRQYGKTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASIFTMRCSEAFVREPSKHSAGELQQLMAECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRYLAAAKGIPLPELYLDPAYGKINHNILSTSTLSSPAVNLGGFAPVVPDGFGIGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAHEFLHCVEKALDDMFDALEGKSIKT	1198207	1221223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1210507_1210589_1211668_1211776_1216675_1217981_1220614
590501	contig_11378_pilon	-	2959	1	Intergenic	novelGene_112222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	1536	2036	277237	276737	NA	85	AATAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVITTFIRHCSGYSSQSNKARKRNKRYPNQKGRVKLSLLADDMILYIQNRKDSTRKLLELIEEFSNIAGYKINTQKSLGLLFTNKEFSEREIKKTIPFTIALKPIKYLGLTLSRNIKDLHSKNYKLTATPHTTEQTAAWSSVISMTCSGSNHHHPPGFHWLTVCK	278772	275813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_275800_278800
590502	contig_6397_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_146241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAGTAATTAGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340368	341268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_340400_341300
590503	contig_6397_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_146240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGGCAGTCTGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330862	331912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_330900_331900
590519	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
590521	contig_3900_pilon	-	2663	1	Intergenic	novelGene_84164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47193	44530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_44500_47200
590530	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
590542	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590559	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590572	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590573	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_93641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590588	contig_233_pilon	-	1767	13	Intergenic	novelGene_14668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1484.83636163496	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	73	1632	126907	78579	FALSE	25	CAAAATTTCTCTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126979	78443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91655_98397_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
590611	contig_6063_pilon	-	1597	15	Intergenic	novelGene_27589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	398.949647735866	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	9	1568	70243	17150	FALSE	20	ATGTTTGTTCTAATTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70251	17120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
590618	contig_10134_pilon	-	1688	4	Intergenic	novelGene_16186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	470.944441167604	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAATAAAATATCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39682	29384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30462_34922_35178_38558_38817_39584
590620	contig_13026_pilon	-	1406	13	Intergenic	novelGene_146292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	101.307973800464	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	664	1089	14211	6422	FALSE	10	GGACCAGGCCTGTGCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLAARAIP	28156	6104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6443_6499_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
590623	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590624	contig_13172_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_146320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17826	19006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_17800_19000
590647	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590657	SIRV4	+	292	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1479	632	1024	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2479	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
590662	contig_11292_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_109466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTGGTTATCTGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450990	449363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_449400_451000
590669	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
590678	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590685	contig_7057_pilon	-	498	5	Intergenic	novelGene_123426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	14.0956553590104	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGATGCTGGAGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605815	1579063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1579155_1581496_1581543_1603515_1603657_1604832_1604949_1605711
590686	contig_8772_pilon	-	1852	9	Intergenic	novelGene_21093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	328	861	23090	19333	TRUE	30	CAGAGGACCGGACCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRSFVDNLSSLVSTVLISSVLFEWVSTRGSESRLVSPQIQGRKVWKRQRNPALLAFQQLPVGGNLNVKGHLNIQQILVFTKVTSHFFLHVLNLILQTANSVLVVSSFNSKVLLHFTHLALQRFVSSFKSIHFTGEGLDLSPVLVRLLLRLAQGIIVPVSSLRKISKLDLYHSSAS	23417	15214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19361_19994_20123_20475_20695_21476_21523_21965_22048_23059
590687	contig_3948_pilon	-	1709	13	Intergenic	novelGene_53409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	213.174599148731	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	92	1366	1975758	1933521	FALSE	10	CTGGCTTTGTCAGGTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYESSAEILPHTPRLTHFPTVSGSPASLADSMQQKLAGPRRRRPQNPSAIYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975849	1933177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1934532_1934680_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
590688	contig_6102_pilon	+	2176	10	Intergenic	novelGene_32269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	60.3639169465982	41	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	65	784	1444370	1447422	TRUE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMSV	1444305	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447301_1447414_1447555_1447907_1448581_1448676_1448785_1448901
590696	SIRV7	-	230	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91696	0	-91690	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTGTATTGACGGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
590715	contig_5018_pilon	+	2298	3	Intergenic	novelGene_47148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	627.5	6	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	79	402	1498209	1498621	FALSE	10	GGTGCGAATCTGTGTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWYDGGREEGGVQLGPHLRARAV	1497682	1500517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497752_1498199_1498312_1498400
590731	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_94793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653716	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
590751	contig_14048_pilon	-	1278	3	Intergenic	novelGene_146336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCACGGGTCGCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529992	525017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_525161_526964_527081_528973
590753	contig_3975_pilon	-	1951	14	Intergenic	novelGene_54798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	325.564034912339	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	82	1356	2044892	2016131	FALSE	10	CTCTACTCTCCCGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052406	2015535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2017052_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
590758	contig_15459_pilon	+	2387	6	Intergenic	novelGene_106381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_5	47.2584383999302	342	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	57	764	20684	53379	FALSE	20	TGAAATTTTGTAGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLHSVLLPRHRGWCVRTMAAANPWDPASASNAAGLLLGHFVASGLVTQEMLNISKKSASCFVNFSRLQQITNIQAEIYQKNLEIELLRLEKDTADVVHPFFLAQKCHTLQSMSNHLEAVLKEKRSLRQRLMKPICQENLPIEAIYHRYMVHLLELAVNFIEKLETHLETIRNIPHLDANLKNMSKALAKMDILVTETEELAENILKWWEQQREVSSCIPKILTEENYLHKHDIIMPPLSFNSKVPVQTINAK	20627	55002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_20777_43413_43507_43874_43945_49451_49585_50943_51053_53169
590762	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	16	363	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14424	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590767	contig_12270_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_113897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	4	330	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14412	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590774	SIRV4	+	367	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	103	480	103	-480	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGAGACCACTCCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1558	2291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
590781	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_96032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590790	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	2	1	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
590791	contig_16951_pilon	+	2564	6	Intergenic	novelGene_98649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	286.614444855803	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	233	580	91217	106694	TRUE	30	TAACAATTTGCTTTGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLMLVPSSLKPFSRWTGRQAAQEQEPLHLDSGGCGLVRERCRPSGFGASRGALQKA	85840	111514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91172_91399_103934_104099_106692_108229_110476_110582_111169
590794	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590797	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
590798	contig_12644_pilon	+	430	2	Intergenic	novelGene_44695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4495	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	57	356	2680163	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2680106	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2680229_2680311
590809	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
590811	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590816	contig_5033_pilon	-	1713	5	Intergenic	novelGene_29103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	66.8370219264743	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	62	586	859134	789799	FALSE	25	ATTTCCACAGTAACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGVDGSIFQKPKKLHLTIGMLVLLSEQEIQQTCEMLQQCKQEFIDDICGGQPLEAEMAGIEYMNDDPGMVDVLYAKVHMKDGSNRLQELVDRVLERFQSSGLIVKEWNSVKLHATVMNTLFRKDPNAEGRYNLYTPDGKYIFKERESFDGRNILKLFENFYFGALKLNSIHISQRFTVDSFGNYASCGQIDFS	859195	788671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_789916_812829_812916_825673_825799_846033_846154_859057
590821	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_16453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27812	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
590832	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
590857	contig_7202_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_17290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590859	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_95115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
590862	contig_9678_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_146366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACAAATGGAAGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229844	231919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_229800_231900
590865	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
590867	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
590869	contig_15063_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_14430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	226	714	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35838	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
590880	contig_2890_pilon	+	1358	12	Intergenic	novelGene_60292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	681	1067	344459	355662	TRUE	10	GACTGGCGCGGCCAGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFIVRARSGILCNGSRLMKAQDFIIGCIRIIHINGNDFPVSFSFINHSQYAQNFHTDYLTSCTYLASNFTHVNWVIVTTTASVFVIVSWVFPSLRDGTIVPDVSFIREQIGNITEFSFFHILFNWV	336422	370960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_336685_337287_337330_338549_338620_341426_341515_341987_342115_344367_344534_351455_351576_352501_352592_355560_355681_356537_356591_368253_368316_370802
590883	contig_3241_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_146407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCACATAGCAGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865428	864765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_864800_865400
590884	contig_10003_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_88175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423500	423700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_423500_423700
590890	SIRV4	+	352	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	180	418	180	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTTTCCACTCTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635	2353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
590893	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1117	0	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
590910	contig_20493_pilon	-	2176	13	Intergenic	novelGene_86395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.7362093097186	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	39	1052	54655	43349	TRUE	35	TCAGAAAACCTGATTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRSRGGQKPCRMSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGEGPSPGLH	55240	36419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36790_37391_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
590914	contig_4103_pilon	-	2767	7	Intergenic	novelGene_51904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	30.0762918813695	256	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	79	1221	74485	69847	FALSE	20	CATTCTAAGTTTCCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSCEKSAEHGSYGEDPDSAEAPTRFRDTPEDIVLQAPASGLALHPARDLLAAGDVDGDVFVFSYSCQEGETKELWSSGHHLKSCRAVVFSEDGQKLVTVSKDKAIHILDVEQGRLERRISKAHGAPINTLLLVDENVLATGDDTGGVRLWDQRKEGPLMEMRQHEEYIADMALDPAKKLLLTASGDGCLGVFNIKRRRFELLSEPQSGDLTSVTLMKCGKKVACGSSEGTIYLFNWNGFGATSDRFALRAESIDCMVPVTESLLCTGSTDGVIRAVNILPNRVVGSVGQHAGEPVEELALSHCGHFLASSGHDQRLKFWDMAQLQAVVVDDYRRRKKKGGPLRALSSKAWSTDDFFAGLREEEEDSTTRGEESEEDSD	74563	68300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_70163_70249_70420_70505_70606_70699_70880_70997_71086_71171_71273_74297
590919	contig_15744_pilon	+	1077	5	Intergenic	novelGene_83572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	38	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	60	425	149562	152709	TRUE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDW	149502	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152768_152998
590923	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_93488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
590925	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590943	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_115854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
590956	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
590958	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
590959	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_17315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
590978	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
590980	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
590986	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
591009	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591014	contig_205_pilon	+	2820	4	Intergenic	novelGene_144309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	136.179619946925	355	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	211	2043	292858	296995	FALSE	45	TAGAAATGAGAAAACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDSNDKGSGDQSAAQRRSQMDRLDREEAFYQFVNNLSEEDYRLMRDNNLLGTPGESTEEELLRRLQQIKEGPPPQNSDENRGGGSSDDVSNGDSIIDWLNSVRQTGNTTRSGQRGNQSWRAVSRTNPNSGDFRFSLEINVNRNNGSQNPENENEPSARRSSGENTENNSQGQVENPRSESTSARPSRLERNSTEALTGEAPPTRGQRRARSRSPDHRRTRARAERSRSPLHPMSEISRRSHHSISSQTFEHPLVNETEGSSRTRHHVTLRQQITGPELLSRGLFAASGTRNASQGAGSSDATGNTESTGSGQRPPTIVLDLQVRRVRPGEYRQRDSIASRTRSRSQTPNNTVTYESERGGFRRTFSRSERAGVRTYVSTIRIPIRRILNTGLSETTSVAIQTMLRQIMTGFGELSYFMYSDSDSEPSGSVPSRNMERSELRNGRGSSAGNSSSGSSSSSSSSPSSSSSGESSESSSEMFESSNEGSSSSGARREGRHRAPVTFDESGSLPFLSLAQFFLLNEEDDDQPRGLTKEQIDNLAMRSFGENDALKTCSVCITEYTEGNKLRKLPCSHEYHVHCIDRWLSENSTCPICRRAVLASGNRESVV	273750	297772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_273937_292833_293027_293874_293959_295415
591019	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1585	632	1130	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
591025	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91627	2	-91621	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAACTAGTAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
591032	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591036	SIRV6	-	152	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	107	17	107	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGTTCCCAAATTAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	1561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1600_1700
591067	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591090	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
591093	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_96624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591100	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591102	contig_4364_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_2062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532920	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
591117	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591119	contig_12079_pilon	-	3195	1	Intergenic	novelGene_67483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1464	1799	616171	615836	NA	80	GCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVACHFSLFVLSIELMNLLCVALLMVLQLSHVCRVKSVADLILDFLFPSCAFVSLKFILLKSMCDWRRNLTLSLKRSRRKCTLLGGKIAEVDLFTKMRERTGRSFDIAKIQ	617634	614439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_614400_617600
591168	SIRV4	+	306	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	195	449	195	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
591170	contig_12938_pilon	+	1402	7	Intergenic	novelGene_99714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	812.162271689319	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	113	580	78117	85499	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITP	51950	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83439_85492
591175	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1114	0	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
591178	contig_9927_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_137099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9927_pilon_-_0_800
591187	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
591188	contig_13293_pilon	-	2023	2	Intergenic	novelGene_146434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	442	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTTTTATTCCCCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160936	155995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_-_157795_160712
591193	contig_14925_pilon	-	1600	5	Intergenic	novelGene_55354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	65	478	116065	114666	TRUE	10	GTTTTCTGCTGTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121485	112155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116079_121434
591194	contig_18168_pilon	-	1494	7	Intergenic	novelGene_122075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_3	72.7774385064187	2332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	74	1114	27110	23837	FALSE	25	GAAATATGTGGTGATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSDFWRSQSPSPRVPVTRNCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27183	23456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26754_27040
591199	contig_8712_pilon	+	2608	5	Intergenic	novelGene_58780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	2	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	37	516	314974	321793	TRUE	20	GACTCTTTGGGCTCAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286984	324470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_322121_322705
591205	contig_9049_pilon	+	1528	7	Intergenic	novelGene_83153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1722.72240138167	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	95	595	95983	112652	TRUE	50	AAGAAATAGTTGAGTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	90174	113718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_90257_95970_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112853_112985
591215	contig_8156_pilon	+	2216	5	Intergenic	novelGene_98937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1095	1478	403758	404803	TRUE	30	GTGGGGAAAAAGTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSALVSLSLLSLPLVQAHWRHMGGNVSLSHPGLALTQDSPYPELAQGVDVLGLEKGIIITVHQALPVDHGSVVHQDGDVAHLLPDSFGRLVYLLSVAHVTDEVVALCAHLPDLLCCLLQAFLSPAP	395203	441919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398542_403288_404006_404667_404810_441187
591217	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_95038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591218	contig_5485_pilon	-	2482	16	Intergenic	novelGene_37748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.480230740355	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	23	1390	478711	459244	TRUE	15	TCAAACGGGGTTCCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	478733	457796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_457911_458265_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
591224	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591227	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591235	contig_13664_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_144198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGTCATCATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34329	36653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_34300_36700
591238	contig_11779_pilon	-	2866	1	Intergenic	novelGene_146446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	696	1007	51501	51190	NA	60	AAAAAAAGTATTCTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWYCPFLIGQSYGLLRGNDKLKKNCVTFFIKKNISRSTLKYDTASDRIISIHLQGRPVNVTIIQMYTSTINTKDEETEDFYQLLQSEIDQTCSQDALIITGD	52196	49330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_49300_52200
591244	contig_16532_pilon	+	2875	2	Intergenic	novelGene_110067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1234	1593	583696	584055	FALSE	35	ATCATGTTCAGATGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKSLQVQYHPSQKKAFLEKEKLYFFFFESLTQSTENTMFQHNLIYFVFPLASILSNRHCCPGFLVREGEFEAEERQRCTKGQYSTAMGKLLKNKENPTSLSCDQKQNSTPSTSESAF	582247	585337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_582752_582966
591250	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
591253	contig_15230_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_146449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	531	878	119263	119610	NA	25	AGTGGTGATTTAGTAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPILKQMHLFDSNLTKLQGILPKGNVISKSASVSPFDPQANRDFCHKTPLPLRLLLCSFFLSQFLELDVQGWIRRVLSQITVIVDEHISCSGALRNCKAQAGDHLPKWTLSFAE	118732	119693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15230_pilon_+_118700_119700
591261	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
591268	contig_10958_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_5321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATTAAGTCCCAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13580	11696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_11700_13600
591271	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
591276	contig_12139_pilon	-	2028	7	Intergenic	novelGene_146482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	19.0671328614335	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	83	1117	313853	297991	FALSE	35	AAACGTGATTAATATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTHPHANKLPLKDLFTYEDYRWAVSSVMTRQNQIPTEDGSRVTLALIPLWDMCNHTNGLITTGYNLEDDRCECVALQDFRAGEQIYIFYGTRSNAEFVIHSGFFFDNNSHDRVKIKLGVSKSDRLYAMKAEVLARAGIPTSSVFALHFTEPPISAQLLAFLRVFCMTEEELKEHLLGDSAIDRIFTLGNSEFPVSWDNEVKLWTFLEDRASLLLKTYKTTIEEDKAFLKGRDLSRRAVMAIKLRLGEKEILEKAVKSAAVNREYYRRQLEERAPLPKYEESALGLLESSVADSRLPLVLRNLEEEGGEQEAFKLKEAVGRAKVAEHRLINGVNSVPNGTRSENGNLNQEESPRGVDDAKESPSESIEEAKE	314781	297079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_298441_300080_300242_303504_303591_304479_304647_305833_305909_313757_313873_314718
591278	contig_14322_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_116251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
591296	contig_12638_pilon	+	1803	10	Intergenic	novelGene_33239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_9	31.214115198966	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	63	1205	737245	764074	FALSE	35	ACCAATTACGAATCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPDQRSSRPQA	737182	764672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_764045
591299	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591320	contig_10299_pilon	-	2182	4	Intergenic	novelGene_79757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	28.7556757682529	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	150	1613	593453	580210	FALSE	0	TGTGGGCTTCTTCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622534	579640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580419_591057_592259_593399_593495_622426
591324	contig_7202_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_17939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGGATTTCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
591356	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
591376	contig_7202_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_16587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27843	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
591378	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591380	contig_8581_pilon	-	2310	12	Intergenic	novelGene_22827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	554.381361713105	12	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	86	1795	386058	306855	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKVRYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPHPPCHSA	386143	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306883_324050_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366805_385989
591385	contig_10135_pilon	+	1288	6	Intergenic	novelGene_106668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	328	junction_1	88.0931325359701	4131	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	24	533	222438	270079	FALSE	30	CTCTCCTTGAAATCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSPESKMAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMEQFWSKNTGSNRPLSPHITIYSWSLPMVMSVCHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGNFESHLELVKSLCLGPAVIYTAKFALVSPLMYHTWNGIRHLMWDLGKGLKIPQLYQSGVAVFILTVLSSLGLAAM	222414	270834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222458_227989_228047_233654_233757_246597_246660_265108_265273_269974
591392	contig_14326_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_120776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCACCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822007	820086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_820100_822000
591397	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	29	370	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14437	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
591410	contig_16575_pilon	-	1352	13	Intergenic	novelGene_146491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_12	72.0952302321188	497	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1266	86	1351	26213	2061	FALSE	25	TAAGTAATTCTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRDNLVELSKAKYSRNVVKKFLMYGSKPQIAEIIRSFRGHVRKMLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQKEAVIKHSLVHKVFLDFFTYAPPKLRSEMIEAIREAVVYLAHTHDGARVAMHCLWHGTPKDRKVIVKTMKTYVEKVANGQYSHLVLLAAFDCIDDTKLVKQIIVS	28119	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_2142_7368_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13320_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_28044
591427	contig_9345_pilon	+	1884	20	Intergenic	novelGene_24550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1022	1696	727167	729870	TRUE	40	GAAAACTTTAAGGCCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNVKDSIGLWWAHTHLSPRDLQVLLQQIHGVWGGHIAWRLVIFTWLVELECLSPELLHQGQSLASSHTVLHHILCFPPVCCFWPSLHSHLGFLVQIRLRLGTQKVEDLHIHFVLDHFAISPLEYSPCLSHQQPHVEMVPFHQELGLVPIYGSLHSLFNLLWSHHDVHTTFLLKVHGVNGVQGVTSHILKGSAQLGLGVDLLIGDVAHEKGQTPGILESGGQAI	723457	730178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_723603_723989_724118_724194_724261_724352_724364_725550_725682_725809_725893_725993_726131_726228_726338_726419_726492_726591_726701_727136_727204_727382_727483_727603_727671_728011_728072_728208_728267_728797_728864_729087_729162_729313_729427_729770_729921_730040
591429	contig_16461_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_139203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	30	359	919	371	FALSE	20	GTTATGGTAGCTATACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQN	948	369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
591434	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591435	contig_12312_pilon	-	2619	12	Intergenic	novelGene_64031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	94.3116865233362	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	58	1635	577677	573769	FALSE	20	TTGGTTTATTTTTCAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRTVITSLLDQIPEMFADTRETDTVFAPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGVYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNKYMDVATLSVVPQLTGGSVYKYACFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELAGLDVDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRNCETDTLINYMAKFAYRAVLNSPVKTVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECMKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLTKSPIANTTEPPAVRASEERLCNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQNLFSVFSFSHITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLIVVKQEDKLEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS	577734	572784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_573910_574028_574119_574351_574544_574774_574955_575051_575171_575310_575450_575657_575804_575905_576003_576507_576679_576970_577088_577297_577392_577585
591438	contig_15063_pilon	+	1677	6	Intergenic	novelGene_14116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	187	1422	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34621	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
591440	contig_9833_pilon	+	1455	10	Intergenic	novelGene_68530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	463.674641143449	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	32	1060	230823	259941	FALSE	15	ACTCCTTGGGTAACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKGAAADRGYFIQPTVFGDVQDSMTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	230791	260336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250127_254726_254811_256795_256954_258491_258607_259908
591447	contig_7202_pilon	+	144	1	Intergenic	novelGene_18083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGCTAAAGCTTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
591452	SIRV5	+	319	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-8	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10866
591472	contig_8588_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_146501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTAACAAACACAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323572	323833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_323600_323800
591479	SIRV4	+	307	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	206	437	206	-437	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCCAATTGCTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	2334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
591486	contig_3077_pilon	+	1370	7	Intergenic	novelGene_26712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3254.0025950956	13	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	330	872	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10105	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
591503	contig_9561_pilon	+	2183	1	Intergenic	novelGene_100859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCCATTGCTGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229906	232089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_229900_232100
591505	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCAGTATATTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
591513	contig_12080_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_128416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	84.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCGGTTAGTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531745	538951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_531851_537435_537612_538789
591518	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_16413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591543	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591547	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
591566	contig_3787_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_102381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTACATAATATGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415743	416753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_415700_416800
591567	contig_11720_pilon	+	1987	16	Intergenic	novelGene_43978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	382.978293553738	1	61	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	383	1750	264322	272210	FALSE	65	AAAAAATCATTCAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262282	272447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262969_263052_263872_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
591572	SIRV4	-	431	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGGCAATTTGAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2300_2800
591580	contig_7775_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_37521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAGAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473092	473494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_473100_473500
591583	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGGACTCGGAGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
591594	contig_14925_pilon	-	994	5	Intergenic	novelGene_55121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_4	1543.31088896567	231	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	199	456	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKFIFGSGTILRVIPYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	83758	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_83712
591596	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_17602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
591598	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1101	23	-1101	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACGAGTGTGGTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
591615	contig_6960_pilon	+	1875	4	Intergenic	novelGene_60237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	71.2101740546173	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATATAAGGAAAGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271820	282630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_271840_273209_273331_275959_276015_280950
591619	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91674	2	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
591630	contig_3414_pilon	-	2047	15	Intergenic	novelGene_80971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	343.299090162095	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	683	1687	89815	67173	TRUE	10	ACATTTCCTTCCTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	101989	64959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65361_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89935_95089_95212_95426_95642_98057_98187_101892
591635	contig_6980_pilon	+	2032	9	Intergenic	novelGene_36048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	663.31421664246	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	60	941	356720	372790	FALSE	20	CAGACTGTTACTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRIMKSLMDHTVPEV	346123	373881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372747
591643	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_3188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAAGGCTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
591654	contig_9871_pilon	+	2299	10	Intergenic	novelGene_75724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	105.724776637559	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	75	1460	598042	616464	FALSE	15	TGATGCTGTTGGGTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGLIECYLASNSIREAMVMANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLIWTPMTRSL	597967	617303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_616435
591661	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591667	contig_14925_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_55147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
591696	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591700	contig_14322_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_116348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	24	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671893	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
591721	SIRV4	+	385	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	923	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCGTCTTCTTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2378	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
591727	contig_16098_pilon	-	1835	10	Intergenic	novelGene_46133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2286.01495950086	10	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	380	1630	459176	456273	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKPEGSSFYMTHLSLALAFSFTPDARSQPHPQLGNTQQHTELGKEPATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460514	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_456994_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_459035_459190_460148
591735	contig_10011_pilon	+	1722	3	Intergenic	novelGene_68118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_2	55	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	842	1285	333300	333743	FALSE	15	GTGTGGCTGGGCTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCILVVGSPTFLSGRQDWEVEVGGKTGWVLGVCKASTSRKGSVALSPENGYWVVMTTMRNEYQASAFPPTHLWSKEPPWRVGIFLDYEAGDISFYNVTAKSHIYTFTCCSSSGPLQPVFSPGTQDGRKNTDPLIICPVCVQGPH	331725	334180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_332229_332413_332447_332994
591736	contig_10904_pilon	-	1974	9	Intergenic	novelGene_22621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	328.826607043895	284	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	481	1443	510205	499664	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSLWPHPRKAPGGVSCSSVPLPASLPNHHAFTWKFCEPACCRLPQKRVLERVLFPLATYLAPQ	515977	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499852_500069_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515888
591738	contig_8617_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_73449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62546	62046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
591747	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_90390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591751	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
591755	contig_9345_pilon	+	1330	2	Intergenic	novelGene_24612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGACAGAAATGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946882	949557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474
591756	contig_4654_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_103039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATACAGTGAAACCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355970	356517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_356000_356500
591760	contig_15063_pilon	+	1683	6	Intergenic	novelGene_13604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
591776	contig_1532_pilon	-	1913	8	Intergenic	novelGene_37394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_6	1358.17408940933	4	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	202	1164	29441	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32144_32227_34870
591783	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591812	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
591823	contig_4924_pilon	-	3146	1	Intergenic	novelGene_84714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAATTTACTCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101137	97991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_98000_101100
591837	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591839	contig_9363_pilon	+	1553	10	Intergenic	novelGene_6821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	254.654013647275	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	643	1215	1623705	1625624	FALSE	10	CCCTGGGGCCACGCGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622248	1625962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
591842	SIRV4	+	211	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1103	2	-1103	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTAACGAGTGTGGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
591854	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591855	contig_4857_pilon	-	1706	8	Intergenic	novelGene_48707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1104.53576913838	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	42	764	1216861	1178809	TRUE	20	CTGTGTGAGTAGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1216902	1176233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1176653_1178285_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723
591900	contig_14322_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_115728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671591	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
591901	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	193	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
591908	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
591915	contig_12622_pilon	-	1792	14	Intergenic	novelGene_6041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_11	417.218657641318	1577	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	46	1425	1691275	1685486	FALSE	20	CTTAAAACCCTGTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691527	1685118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
591918	contig_3975_pilon	-	2068	14	Intergenic	novelGene_54799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_13	243.420983376391	1	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	25	1473	2052412	2016131	FALSE	10	CTCTACTCTCCCGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052436	2015535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
591921	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
591928	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
591933	SIRV4	+	184	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	18	1114	18	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
591945	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
591949	contig_5247_pilon	-	1560	6	Intergenic	novelGene_81820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	282	junction_5	73.9443033640861	1517	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	131	889	416518	342767	FALSE	5	TCAGTGGTTTGGCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPNSS	416648	342095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_416448
591954	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_96102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
591959	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
591969	contig_3975_pilon	-	2490	10	Intergenic	novelGene_54876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_9	121.812647075968	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1587	2420	2097890	2091957	FALSE	20	CATGGTTTCTGGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHTGAVWCVDADWDTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099571	2091886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473_2097540_2097850_2099458_2099552
591983	contig_7202_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_18182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCATGCAGGTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
591997	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_17728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592007	contig_15293_pilon	-	1873	2	Intergenic	novelGene_146520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1206	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCCAGAGCTGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94159	92216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_92727_92796
592013	contig_14322_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_115705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
592016	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
592022	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592035	contig_13894_pilon	+	1123	10	Intergenic	novelGene_62105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2509.7943745393	38	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	27	1067	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_524949_525732_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
592047	contig_18869_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_56214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73744	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
592051	contig_7202_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_18488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTTGGTCACGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27647	27868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
592054	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
592059	contig_11590_pilon	+	2267	6	Intergenic	novelGene_125587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	246.446261890904	276	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	63	1070	721633	737277	TRUE	20	TCTATGCATGTTGTACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAFLDKPKTEKHNAHGAGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVVGIPHGLEDWSFFAVYDGHAGSRVANYCSTHLLEHITNNEDFRAAGKSGSALEPSVENVKNGIRTGFLKIDEYMRNFSDLRNGMDRSGSTAVGVMISPKHIYFINCGDSRAVLYRNGQVCFSTQDHKPCNPREKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDYDYKCVDGKGPTEQLVSPEPEVYEILRAEEDEFIILACDGIWDVMSNEELCEFVKSRLEVSDDLENVCNWVVDTCLHKGSRDNMSIVLVCFSNAPKVSDEAMKKDSELDKHLESRVEGVFFLTYRNYGEVW	670746	749559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_670795_721618_722479_730017_730136_737233_737368_737762_737821_748510
592061	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
592068	contig_7707_pilon	+	3245	4	Intergenic	novelGene_72193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_2	231.456739418454	75	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1045	1461	644170	655929	FALSE	15	TTATTTAGTCTTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN	643125	657713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_644211_645498_645603_652216_652306_655746
592075	contig_4519_pilon	+	2949	10	Intergenic	novelGene_123689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_3	107.273275122724	638	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	225	1991	520840	744048	FALSE	20	TTAGTGCATTTTGTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCRLNKLEKRDEKRPGNIYSTLRRPQVETKIDMSYEYRFLEFTTLSAAELPRSSAVRLASLRDLPAQLLELYQQGFSLAALHPFVQPTHEREKTPLERIFRAILVKKTERSQKTDLHNEGYILELDCCSSLDHLTDQKIIPEFIKKIQEAASRGLKFVGVIPQYCSPVNSAGSSPLVPAANSTADPRDARNVPGQCGDHASLDNENPRAVDVCSTRAGTDRSPEPGQDPRGQVLATEQAGLHSEGDGGEFLSQQMSKTLNGRDGDPSEGHEEPLLRKMEIFALFNKPKSQHKCQQYYPVTIPLRVSKNGQTVSSLDANWLEHMSDHFRKGNVLVNAVFYLGMVNDSLHGLTDGVFIFEAVSTEDSKTIQGYDAIVVEQWTVLEGVEVQTDYVPLLNSLAAYGWQLSCVLPTPVIKTTREGNVSTKQIVFLQRPCLPQKIKKKESKFQWRFSRGEMHNRQMRKSKGKLGARDKQQAEENEKNLEDQFSKSGDLGNCVLGRHQEDGVPGEEEGVASEGMGVSVQEVKGDKLCLDSGLGSGGMEGTVQNGPAGASRAQVGGCAGPCDPGEHGRDGSPEEVAGEPAAPEDN	496157	745006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_496374_520831_520985_602022_602210_633041_633151_673878_674270_686906_687111_698727_698844_731096_731201_732861_732944_743619
592095	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592104	contig_6847_pilon	-	2173	11	Intergenic	novelGene_143892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	249.745970938472	43	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	101	1636	266491	232193	TRUE	20	TGTTTATTAGACTCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQVRSGRCSPSPDPSPIPSGAGVRVRPTTAFTMVLLAAAVCTKAGKAIVSRQFVEMTRTRIEGLLAAFPKLMNTGKQHTFVETESVRYVYQPMEKLYMVLITTKNSNILEDLETLRLFSRVIPEYCRALEENEISEHCFDLIFAFDEIVALGYRENVNLAQIRTFTEMDSHEEKVFRAVRETQEREAKAEMRRKAKELQQARRDAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTSAMITETIIETDKLKVAPAPTRPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIMSSNMGKRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	266591	230334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_230681_232001_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024_245190_246080_246287_246422_246603_247231_247496_266488
592122	contig_9345_pilon	-	1646	4	Intergenic	novelGene_24355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.632176232533	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	66	482	144517	142269	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPEPGLHGFPKGSPPEHAPASLAATVIMPCIYEWLC	144582	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142373_142588_142781_142955_143072_144512
592125	contig_12414_pilon	+	1678	2	Intergenic	novelGene_59566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	4	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	88	1146	370898	374054	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370810	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
592135	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
592146	contig_11086_pilon	+	2024	6	Intergenic	novelGene_61196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	152.925341261676	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	177	1088	45601	48131	TRUE	25	CTGAATCTGTCCTAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREG	45424	49722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48900_49318_49418_49653
592152	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592172	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_94497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657493	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657495	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592181	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592190	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_94701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
592192	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
592222	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_93020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
592228	contig_7119_pilon	+	1388	5	Intergenic	novelGene_40918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	314.467307521784	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	190	1164	137044	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127479	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_139217_139336_139932_140858
592236	contig_1443_pilon	+	1965	12	Intergenic	novelGene_28224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_5	48.1816466549262	383	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	931	1656	538444	541541	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535984	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
592250	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_17620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
592251	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
592253	contig_4232_pilon	+	1346	3	Intergenic	novelGene_63191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	1762.5	21514	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	82	396	146362	148542	TRUE	20	GATTCATTAATGGGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	146280	149696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148884_149087
592268	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592287	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592291	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
592307	contig_12080_pilon	-	2807	17	Intergenic	novelGene_128396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	93.8368764132737	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	106	1356	206402	196337	TRUE	40	TGGAACCAAAAGGCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALASGLWLSGFGLLRGDHLFLCPAPGPGPLAPEDMVHLRRLQEISVVSAADTPDKKEHLVLVETGRTLYLQGEGRLDFSAWNAAIEGAAGGGGTGLQEQQMSRCDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFVEDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKEVIGCLPWVNRRTLATLIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKK	206507	193881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195407_195447_195651_195790_195898_196008_196103_196140_196235_196340_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200886_200956_201268_201417_202856_202963_203237_203451_204722_204887_205119_205184_206371
592309	contig_16098_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_45928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	144	junction_2	35	2185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	40	300	345494	346145	FALSE	5	GCCTAGGGCCTGGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVPLGCRPLWAAAMELSVECLREKLQRELEAEHVEVEDTTLNRCASSFRVLVVSSKFEGKPLLQRHRLVNACLAEELPHIHAFEQKTLTPEQWTRERQK	345454	346246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_345557_345646_345745_346045
592310	contig_19777_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_29710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGAATGTGTGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20749	20996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_20700_21000
592312	contig_12638_pilon	-	1369	13	Intergenic	novelGene_33204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	252.415043463472	1793	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	75	1226	333499	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGSGPEAAGCGAGRLASLFRLVPMEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333573	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332789_333007_333096_333202_333274_333411
592323	contig_5020_pilon	+	1588	8	Intergenic	novelGene_27811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	930.938959835056	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	365	1273	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118460	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124536_124919_125091_125657
592326	contig_11851_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_146552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCACTTCGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29738	29273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_29300_29700
592332	SIRV4	+	270	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1491	642	1036	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2491	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
592334	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592347	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592348	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
592355	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
592359	contig_11720_pilon	+	1399	11	Intergenic	novelGene_43948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	431.23201411769	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	13	1143	262271	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_266171_266240_266453_266610_267753_267841_267882_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
592369	contig_8138_pilon	+	1385	6	Intergenic	novelGene_52459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	249	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	175	657	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280120	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306974_307631
592379	contig_10940_pilon	-	1986	6	Intergenic	novelGene_49259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1001.13203924358	3	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	145	573	917000	875564	TRUE	30	TTTTTCCAAGAACAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917144	874044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874387_874451_874543_874583_875675_893147_893306_916664_916748_916923
592382	contig_14882_pilon	-	2805	4	Intergenic	novelGene_114980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	197.518494211442	2	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1	492	67206	66659	TRUE	40	AGCAATAAAATTCTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFVPRRPSQFQQRPRPTCCGAPARVSEGWFRRGGGNGCWRGWRRLAPGFCLCSGAVADRLGDSSRPAEETRRWFPSPSNFRTTPSFSLLDPAVLSAEHSALRLSYQPRPESHTRGCSPPCRTSSSPLPHFLYPLLGAPLSVTLRGQPFEKSPGSSGPELGSL	67206	38168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_40079_57893_58048_66409_67014_67069
592399	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_97118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592417	contig_10937_pilon	+	2336	11	Intergenic	novelGene_67290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	65.5054196231121	489	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	100	1065	35798	40676	TRUE	10	CGGGTGTTGTCACAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYDTKLLDLEEKVACGKEVG	33183	45577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40620_40892_41611_41728_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
592443	contig_11088_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_85052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14665	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
592444	contig_9678_pilon	-	3167	22	Intergenic	novelGene_146363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	86.6165998764074	139	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	746	2752	249450	213699	FALSE	35	TTATTCCAAACACAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQERERGITIQSAAVTFDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWKQADKYNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGLVDVISKEKLLWNPSSDDGKDFERKPLLELIDPELLKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLGEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTVAQTAVPVLCGSALKNKGIQPLLDAITMYLPSPEERNYEFLQWYKSDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIYSGTVKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAAHRAKREGEKKHGKNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSVAKQPELDHALKCLQREDPSLKVKLDPDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYGLETYLGPLQVAYRETILNTVRATDTLDRTLGDKRHLVTIELEASPTETSSVMPVIENAENVSEDRLKVFQEAIENGIHSACLQGPLLGSPVQDVAITLHSLIVLPGTSTTMISACVSRCVQKALKKADKQVLEPLMNLEVTVTREYLSPVLADLAQRRGNIQEIQTRQDNKVVVGFVPLAEIMGYSTVLRTITSGSATFALELSSYQAMNPQDQRTLLSQRSGFAKGF	259727	213283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_213837_214520_214704_219463_219580_222918_223099_225922_226062_227788_227866_232115_232306_236789_236890_236971_237113_238584_238734_240385_240467_243469_243650_243886_243948_244723_244813_249161_249251_249356_249483_250119_250325_251679_251778_252229_252288_255072_255158_257586_257674_259547
592445	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_4123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
592454	contig_18420_pilon	-	1957	12	Intergenic	novelGene_109354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	335.920125295452	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	95	1351	142813	109372	FALSE	5	GGTGTCTCCGTGTTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVCRLRRPQVPPRLARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142907	108765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119760_124356_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
592455	contig_14357_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_121662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479362	478765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_478800_479400
592456	contig_15063_pilon	+	819	4	Intergenic	novelGene_11696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	229	525	34808	36504	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLILQQLCHQHPDARASGPGLLLHLQHPERV	27140	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35129_36416
592463	contig_19938_pilon	+	1486	8	Intergenic	novelGene_146562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	129.414537239754	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	264	1124	8802	19091	FALSE	40	TATCACAAGTGGCAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5737	19453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_6386_6566_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18535_18953
592464	contig_7457_pilon	-	2121	10	Intergenic	novelGene_31447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	35.4926526912505	242	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	115	1032	477748	475920	TRUE	5	TGTATTGTGTCTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFRSGLLVLTTPLASLTTRLAPILTSAAQLVNHTLYVHLQPGLSLEGPAQPESSPVQATFEVLDLITHLYAGASVHGHLDVRVLLTNIRAKSAFLPPQFSSVQNLAHPPEVVLTDFQTLDGSQYNPVKQQLERYATSCYSCCPQLASVLLYPEYGSRAVSLEPQDAPSSSTIKPASPVARSPKQPVRGYHRGAVGGTFDRLHNAHKVLLSVSCILAQERLVVGVADKDLLKSKLLPELLQSYEVRVERLSEFLVDIKPSLTFDLIPLLDPYGPAGSDPSLEFLVVSEETYRGGDGRQPLPPRE	478254	474151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475062_475152_475329_475395_475478_475669_475789_475922_476193_476410_477048_477761_478152
592465	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
592466	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592480	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
592501	scaffold_12124_pilon	+	1720	9	Intergenic	novelGene_22044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	488.239551219481	19	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	143	1120	836073	858374	FALSE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRVFNG	829602	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852418_858358
592516	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
592542	contig_9400_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_146599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGTCGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151429	151712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_+_151400_151700
592555	contig_13461_pilon	+	2736	17	Intergenic	novelGene_146602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	96	junction_7	78.4414341642859	249	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	221	1912	45659	76242	FALSE	30	AGAGAGAATGCCTGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYRRLLMSRVVPGQFDDADSSDSENIDFKTIKEEDGVPLEDLLNKGEDEIEEEEEEDYDDDDDWDWDDGVGKLTKGYASNRGNNPQANRQTSNYSSAKMSTPADKVLRKFENKINLDKLNVTDSVINKVTEKSRQKEADMYRIKDKADRATVEQVLDPRTRMILFKMLTRGIISEINGCISTGKEANVYHASTTNGENRAIKIYKTSILVFKDRDKYVSGEFRFRHGYCKGNPRKMVKTWAEKEMRNLIRLNTAEVPCPEPIMLRSHVLIMGFIGKDDMPAPLLKNVQLSESKARELYLQVIQYMRRMYQDARLVHADLSEFNMLYHNGGVYIIDVSQSVEHDHPHALEFLRKDCANVNDFFLKHNVAVMTVRELFEFVTDPSITRENMDAYLSKAMEIASQRTNEERSSQDHVDEEVFKRAYIPRTLNEVKNYERDLDIMMKLKEEDMAMNAQQDNILYQTVTGLKKDLSGVQKVPALLENQITETTCSDSEDAGSSECSDADSEEQGDHACSKKHTTDPELDKKERKKMVKEAQREKRKNKIPKHVKKRKEKTAKMKKGR	45438	77066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_45730_49600_49791_51555_51647_52550_52621_53692_53736_56514_56608_58241_58355_58455_58537_59587_59675_60083_60222_60592_60697_60915_61023_71063_71130_72357_72478_73479_73534_74876_75030_76131
592557	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
592558	contig_3077_pilon	+	1584	8	Intergenic	novelGene_26800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	57	junction_7	768.669430820266	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	205	1284	473998	482090	FALSE	25	AGATTTAACGTGTGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGTLQKFCFWKKMSFPYPHPFFVTWLTVGHPFL	467406	482390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481198_481989
592562	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
592566	contig_10103_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_86153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471593	469493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_469500_471600
592603	SIRV4	+	486	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	10	454	10	-454	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACCTCTTCAAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
592608	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592609	contig_8538_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_4655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	533	1602	214	1815	841460	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	841246	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841200_843100
592614	SIRV4	+	147	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1624	632	1169	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2624	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
592617	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592629	contig_14353_pilon	-	2372	12	Intergenic	novelGene_82101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	502.490968629008	1	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	680	1174	83931	80452	TRUE	30	CTCTCAATTTTTACATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104423	79090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80203_80365_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86226_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
592650	contig_14925_pilon	-	901	4	Intergenic	novelGene_55171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	1722.10536521111	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29827	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611
592655	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
592662	contig_12227_pilon	+	2257	14	Intergenic	novelGene_127395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	48.8586900933	1034	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	6	1175	114799	142650	FALSE	35	AACGACTTCAGTTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMADPRDKALQDYRKKLLEHKEIDGRLKELREQLKELTKQYEKSENDLKALQSVGQIVGEVLKQLTEEKFIVKATNGPRYVVGCRRQLDKSKLKPGTRVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNPELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIREMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSDGFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV	114793	143732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_114884_115858_115939_116032_116073_116307_116361_118433_118502_118963_119079_123311_123400_124702_124765_124848_124973_125339_125402_127297_127419_127993_128075_132517_132590_142531
592666	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	615	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592667	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
592690	contig_3602_pilon	-	1757	6	Intergenic	novelGene_60510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGCCTCCACACTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171132	161657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_161769_168464_168612_168748_168853_169141_169280_169420_170169_170623
592696	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592705	contig_14790_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_127903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCCAGCTGTTCATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139661	137126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_137100_139700
592708	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_92012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657500	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
592709	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
592717	contig_14443_pilon	-	1187	4	Intergenic	novelGene_126672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	943.141912262766	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCACTGCAGTGTGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39501	29096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_37689_37932_38841_39045_39371
592723	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
592724	contig_500_pilon	-	2852	1	Intergenic	novelGene_30940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222308	1219456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1219500_1222300
592746	contig_13267_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_146617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	305	682	236478	236855	NA	55	ATTTCCTAAAGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTGDVNNQSALQKMVVWIKFQNVDQVLSIVSTIQQSFAMLGLLLLLLGAVKSVPTHSDPVQNKTKCRLVLCHPCASKLVSSAYCRLLMSLPPILIQHSSSYSPASQIICSAYRLNKCGERLQP	236173	237830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_236200_237800
592751	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592790	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592802	contig_11429_pilon	+	3438	2	Intergenic	novelGene_60449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2282	junction_1	0	18	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	243	800	46299	46856	FALSE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSLGPLDFKKQKGQCSGPSRSSCVPMLRRTQSISPQDRWEGFLFQTTPCSLTLLVLTDSHFPVSPLLSPVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	45386	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144
592809	SIRV4	+	303	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	210	437	210	-437	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCCAATTGCTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1665	2334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
592815	contig_19459_pilon	-	1226	8	Intergenic	novelGene_59855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	2	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	106	891	16240	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19095	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16277_19026
592816	contig_12270_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_113117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	23	382	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14431	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
592817	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592818	contig_5033_pilon	-	2236	15	Intergenic	novelGene_29047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4252.03162545595	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	635	1117	542139	534347	TRUE	25	AAGTTCTGTCCACCAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRSVTCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQHT	566800	531000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531537_532161_533382_533491_533803_533876_534197_534356_534465_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542118_542237_542679_542833_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566751
592832	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_16465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27819	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
592836	contig_12000_pilon	+	1385	9	Intergenic	novelGene_43159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	524.127593601978	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	97	618	417192	490667	TRUE	20	TATCACATGTTGCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRSSTFRGTA	416857	669837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490628_490689_558472_558606_669224
592842	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
592845	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
592871	SIRV5	+	383	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-53	875	-53	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8262	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
592874	SIRV5	+	372	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7489	2	-96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
592877	contig_13901_pilon	-	3254	16	Intergenic	novelGene_146620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGTCCCGCCCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153776	2212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_2701_64382_64658_65110_65262_90150_90246_93293_93424_104845_105098_107188_107321_119253_119369_120599_120748_120858_121005_135109_135188_138179_138338_140172_140303_150065_150170_151686_151877_153114
592892	SIRV5	+	345	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
592906	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_19072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCATGACGACCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
592924	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	635	1114	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
592926	scaffold_17542_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_139243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCTATAACAAAGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473341	473869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_473300_473900
592947	contig_8589_pilon	-	2764	6	Intergenic	novelGene_107355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_2	68.4210493927125	416	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	61	699	16686	2831	FALSE	5	GTTTGTGGGTCTTTACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAVRTCSGEARAVAGAAGAMEPLYQQTHKQVHEIQSHMGRLETADKQSLHLVENEIQARIDQIFSHLERLEILSSKEPPNKRQSAKLRVDQLKYDVQHLQTALRNFQHQRCAREEQERQREELLSRTFTPNDSDTTIPMDESLQFNSSLYKVHHGMDDLIGGGHSILERLRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKRAFQDKYFMIGGMLLTCVVMFLVVHYLT	16746	765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_2993_6084_6226_8839_8973_9819_9929_11589_11655_16657
592949	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
592957	scaffold_13505_pilon	-	1145	5	Intergenic	novelGene_111454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	271.365989025891	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	118	738	536526	531050	FALSE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGPSDALDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	536643	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_536498
592961	contig_9696_pilon	-	1299	6	Intergenic	novelGene_68765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	525	junction_2	212.235718011837	61	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	64	924	150836	136106	FALSE	10	TGACTTCTGTCTGTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAAQVTKKKKKKRYRIPTNDELLYDPEKDNRDQAWVDAQRRSYHGFGIQSPRQQQPVPNSDAVLNCPACMTTLCLDCQRHESYKTQYRAMFVMNCSVNKEEILRYKTPENRKKRWGHKKMRSSQEDTAKWAETEAEEIYHPVVCTECSTEVAVYDKDEVFHFFNVLASHS	150899	135730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_137980_138092_139913_140032_140957_141057_146412_146595_150762
592989	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_96780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657815	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657816	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
592992	contig_14326_pilon	-	2666	3	Intergenic	novelGene_120677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	161.5	814	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	872	1189	123955	116744	FALSE	20	CTCCACATTGCCAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKEKDLGTLGYVLGITMMVVIIAIGIGIILGYTYKRGKDLKAQHEQKACEREMQRITLPLSAFTNPTCEIVDEKTVAVHTSQTPVSLQEGCTPLMDQAGTPGA	124826	115266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_116949_123741_123821_123921
592997	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593000	SIRV4	+	223	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1548	632	1093	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2548	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
593005	SIRV7	-	346	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33223	0	4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
593023	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
593024	contig_7457_pilon	-	2074	10	Intergenic	novelGene_31448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	34.3866899314901	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	50	967	477748	475920	TRUE	10	ATGTATTGTGTCTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRSRGSQSPVASARGSMAVFRSGLLVLTTPLASLTTRLAPILTSAAQLVNHTLYVHLQPGLSLEGPAQPESSPVQATFEVLDLITHLYAGASVHGHLDVRVLLTNIRAKSAFLPPQFSSVQNLAHPPEVVLTDFQTLDGSQYNPVKQQLERYATSCYSCCPQLASVLLYPEYGSRAVSLEPQDAPSSSTIKPASPVARSPKQPVRGYHRGAVGGTFDRLHNAHKVLLSVSCILAQERLVVGVADKDLLKSKLLPELLQSYEVRVERLSEFLVDIKPSLTFDLIPLLDPYGPAGSDPSLEFLVVSEETYRGGDGRQPLPPRE	478189	474152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475766_475922_476193_476410_477048_477761_478152
593025	contig_10629_pilon	+	1905	5	Intergenic	novelGene_52951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	192.679786173849	857	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	94	1347	447968	452372	FALSE	5	TTTTTGTGTGGCTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATVVAQKKFSVTIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGRDKVTFTFEAGRRCFSGEGNFEFETQQGNEIFLALEEAISAQKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447874	452930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_450546_450732_451751
593036	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
593050	contig_18794_pilon	+	2473	11	Intergenic	novelGene_54643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	180.045994123724	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	341	742	145406	161049	TRUE	60	CTAAGAAAAAAGAAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEEDCHSESVRAEDDEKESPAETDLQAQLQMFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNS	145065	168437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145409_152183_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_161048_161086_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_168038_168360
593052	contig_14441_pilon	+	1293	6	Intergenic	novelGene_100414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	371.762074450851	332	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	678	1106	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81756	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82373_112112_112154_116578_116963_117220_117344_117539
593066	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
593078	contig_4364_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_3669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
593080	contig_15629_pilon	+	1506	7	Intergenic	novelGene_122482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.8460567209174	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	494	1147	202323	208025	FALSE	35	TGTACATATAACTTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAGMLLVSALLYTYWIEIVLLYRTYQSKDETLGDKKEYDAFVSYAKLSSLESEVTSSLSEENLALNLLPEVLENKYGYTLCLLERDVTPGGVYAEDIVSIIKKSRRGIFILSPNYVNGPSVFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCSFKEPASLPHLVKKALGVLPTITWRGLKSVPPNSRFWTQVRYHMPVKNSKRLTWNHLRIISRIFSLERTQ	194630	208384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_194749_195237_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
593085	contig_7775_pilon	+	2800	1	Intergenic	novelGene_37478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	722	1072	125311	125661	NA	60	AAAAAAGTCCCAAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENKKQKTKPVAFESILTHSDPIGQGRTAPQSFQGAPGGFKLPIFWLAAIALNHYTTRVSRKSPINLTVNPVPRKQPRAGSRAKNALGKDTKEDGYLLASEVVDRHRGHRRYSIT	124589	127389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_124600_127400
593097	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
593107	contig_15384_pilon	-	2279	21	Intergenic	novelGene_85146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_19	55.208694967369	1	23	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	229	2124	126551	118939	FALSE	15	ACAGAGCCTGGTTCTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	127995	118783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127723_127857_127931
593114	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_17643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
593116	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593121	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_19028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
593126	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
593127	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	114	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
593132	contig_12119_pilon	+	831	4	Intergenic	novelGene_88625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	129.646527999103	342	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	294	473	70066	193636	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKCVSAKETLEADLYKRFILVLNEKKAKIRSLHKLLSEVQELEKNAEHDRETATCSQVSADRDAVYDESTTLREDDSIFSSPDVTDIAPSRKRRQQMQKNLGTEPKMASQEHQLQEKEKLDPSLPQTLKKEHSSAENMSLETLRNTSPEDLFDEI	22110	193994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_22265_23943_24003_69985_70134_193524
593153	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
593164	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
593165	contig_20844_pilon	-	1260	11	Intergenic	novelGene_78599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	363.070571652399	417	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	25	651	209140	205871	TRUE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGGAGASGPQRN	209164	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205893_206582_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
593174	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_95103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
593178	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCGCCGTCAACCGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
593183	contig_10949_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_146684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30121	27808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_27800_30100
593198	contig_4759_pilon	+	1780	3	Intergenic	novelGene_106328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2359	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGACGGCGGATCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586090	589325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_587631_588756_588810_589138
593213	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4268	34	3093	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
593219	contig_11285_pilon	+	2110	12	Intergenic	novelGene_5622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.647996650245	3	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	551	1792	767344	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766048	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767275_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
593225	contig_13453_pilon	-	2321	20	Intergenic	novelGene_146700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_5	178.42656411298	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2184	136	2319	112783	37776	FALSE	50	AAAAACACAGGTATGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLQSESTNSGKKRDADFESTDEPIFGKKIRIEESITEDLSLADLMPRVKVQAVETVEGCTHEVALPADEDYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYAIALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGLMTGDVTINPTASCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIILLPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGGDGLHLVVDENGDFREDNFNTAMQVLRDAGDLAKGDQKGRKGGTKGPSNVFKIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKKMVEEVFSNAIDCLSDEDKKLPQVEHVLPLLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETFAMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSPTIGKQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVEKVKKSEEQYNKIVIPNEESVVIYYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRLVKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSKESLKNSATEAAKPAKPDEKGEMQVVPVLVHLLTAISSVRLYIPKDLRPVDNRQSVLKSIQEVQKRFPDGVPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPLHNDPNLETVYTLCE	115002	37773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_37953_38993_39105_44871_45001_49649_49719_50311_50485_54077_54229_55371_55498_62180_62283_63740_63852_65543_65624_66901_67034_68747_68851_69339_69439_70543_70669_75262_75354_76817_76993_102399_102513_103445_103509_112729_112797_114880
593253	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	632	1123	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
593261	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_19094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
593263	contig_3727_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_146753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGCTCCTCGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339094	338066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_338100_339100
593268	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
593275	contig_4857_pilon	-	2074	7	Intergenic	novelGene_48640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	115.60336884749	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	235	849	448153	441598	FALSE	15	TAATTTTTGCTGTATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVNDPLLFIKDIKPGLKNLNVVFIVLEIGRVTKTKDGHEVRSCKVADKTGSITISVWDEIGGLIQPGDIIRLTRGYASMWKGCLTLYTGRGGELQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448601	440372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444997_445070_447620_447760_448062_448329_448542
593300	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
593315	contig_14322_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_116460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671895	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
593349	SIRV4	+	254	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1517	632	1062	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2517	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
593350	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
593353	SIRV5	+	351	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	4	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAACACACTGAAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8205	10899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8451_8586_10858
593356	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
593364	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
593398	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
593407	contig_5780_pilon	+	1698	6	Intergenic	novelGene_29779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	281	1153	107519	113174	FALSE	35	TAAAAAGGAGTTTTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCSPDPPLLAPGLSGRMAMHHVHIPDGSWLDLLEPGSACRSQGPEDWCLWAQQGEREAASSRFGLCSPRSHGRTRVLLISFGAVVWFMRSDLMLDIPGNPVKELFPLQAFTESSFLLWLAPLNLVWPSFQTCQRTYLTRDGRAPGS	73990	113719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110249_112737
593433	contig_9706_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_20827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2183	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
593435	contig_9609_pilon	-	2187	8	Intergenic	novelGene_23141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	110.563491778641	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1068	1787	522751	521244	TRUE	40	TCAGTTCTGTAAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523985	520758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_523144_523310
593447	contig_2770_pilon	-	1208	4	Intergenic	novelGene_107462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1722.17930412473	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746731	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744656_746665
593476	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1585	632	1130	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
593484	contig_8486_pilon	-	2586	14	Intergenic	novelGene_139292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	24.9047891119371	4	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	221	1288	60945	58064	TRUE	25	TGCAAAGTGGGTTAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAQRSEAVGGILSEEAGSPKLPRWHFLLDKERVRLLRAEHCNPDPLSREEGRQRGGWGWGLRQGSTLARGTGAMAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHLTCLTEPGCLAAPRCGPSSGKSK	61666	54819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58264_58343_58865_59479_59738_60034_60203_60900_60975_61475
593494	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
593496	SIRV7	-	250	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69034	2	35815	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78923	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
593500	contig_5643_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_38959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500816	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_500800_502600
593507	contig_10011_pilon	-	2363	7	Intergenic	novelGene_68045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	260.927618741716	913	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	117	845	194838	186602	TRUE	20	CACATCCTATCTTTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTNNTAINFYENRDFKQHHYLPYYYSIRGVLKDGFTYVLYINGGHPPWTILDYIQHLGSALASLSPCSIPQRLYRQAHSLLCSFLPWSSISAKGGIEYSRTM	212616	184608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_185927_186401_186759_188132_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_212506
593513	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_115795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
593520	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
593521	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
593529	contig_5935_pilon	+	1833	2	Intergenic	novelGene_102679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	337	885	782624	783172	FALSE	35	TTTTGTTTTCAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFEDVDTEETVTCLQMTLYHPGLLQTGIFQSIRFCHREKLSSSEVVKFGRNATICRYTFLDKQVSRVQFSLQPFKDFSSSVLSFEIKNMSKKTSLIVDSRELGYLNKTNLPYRCMVRFGDYQLLMEKEDGESLDFFETQFILSPRPLSQENICAATNPVPENGNCSTRSTSPTEMDENEA	775109	784120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_775422_782599
593536	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_89074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	68	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	GTGGTTTTGCTCTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
593538	contig_13894_pilon	+	1050	10	Intergenic	novelGene_62106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2555.40902478461	43	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	428	994	524982	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523519_524975_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
593546	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593548	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
593558	contig_10437_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_38187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCAATTTTACCAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224281	224640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_224300_224600
593576	contig_7457_pilon	+	2285	16	Intergenic	novelGene_31654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	185.267686215259	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	83	1939	1019853	1040226	FALSE	80	TTAAAAAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1019770	1040572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1019863_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
593582	contig_9463_pilon	-	2728	7	Intergenic	novelGene_83811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.516221520522	4	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	37	1476	42232	32636	FALSE	45	GAATCATGAGACACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVWFEAEFFHHMLHWTPILNQSQSTYYEVEFLCYGEESWKAIPTCNQTLAQSCDITAVTLGLYHNNGYRAKVRAVDGSRRSNWTISDTRFTRDEVTLKVDSVKLEIHNGCIFGTIQPLRPKIAPAGDMYEHIFKNFREYEIDIRKVPGEYTFTNKKVNHENFSLPASGEVGEFCIRVKPSVGSRTNKGVWSKEECITLTRQYFTPTILSICFTFVLPLCGALVYCLALQLYVRRGRKLPSVLVFKKPSPFSLVSQLPCPEAPDSIYHLDVEAFPKVSPELRNSELHGSTDSGFGSAKPSLQTEEPQFFLPEPHPEATGTRGQGEPPVLENSCSGDSSNSTDSGICLQEPSLSPSTGPGWELQVGSDSRDQDDSGIGLAQNSVRQPGGTQGSSALGEVSPPRPELPGEEDPAAVAFQGYLKQTRCAEEKTAKVGCLEVESSSTDGLGPKFRMCLGAEADWPPPDLAKGYMIPSLRLGWPHREGREVVTERW	42268	31383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_32702_33476_34158_37753_37876_39339_39491_40123_40294_41370_41556_42167
593584	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593586	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
593589	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	632	1112	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
593595	contig_6233_pilon	-	1619	12	Intergenic	novelGene_74789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	288.824376847172	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	504	1391	149777	143464	TRUE	35	TAAGCCACAAAGCTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250356	136686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
593599	contig_4114_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_15607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	802	1176	319220	319594	NA	15	TTCCATAGGGTTTCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGHLQAFKTPGTMQQTRRQNISTKHMITSHETMTLNLQTKEPNLQTKESNPMRCLVVHKQPQQPFFLVIVVNISITQLLPTQLFTDVQLFDSNCKNWLSNPTLNQCDFSITVNPLFPPSSHPW	318418	319669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_318400_319700
593608	contig_6898_pilon	+	2339	5	Intergenic	novelGene_35709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	712.952312570764	1	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	131	640	59668	125987	FALSE	45	AAAAGTTTAGGAATACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEITSPDQRHFPLDLENTPTLTIVLWESRVG	59537	127686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114480_125897
593611	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
593615	contig_15888_pilon	-	1516	9	Intergenic	novelGene_84420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1502.6340570395	99	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	59	721	259726	252829	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTQPSGRPLALPGHRGRGPRASHHHLHLREAVEARGGPGR	259784	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253517_253578_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
593619	contig_11978_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_63109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2699.5	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1830701	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830781_1831161_1831273_1831759
593621	contig_4315_pilon	+	2093	9	Intergenic	novelGene_46748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	209.213967925184	563	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	630	1487	222198	225537	FALSE	20	AAGAGCTTCTTGTCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	221319	226143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_221808_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
593623	contig_17440_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_7665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3599	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
593626	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_18112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27855	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593632	contig_5084_pilon	-	3057	11	Intergenic	novelGene_64631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	66.7833062973076	19	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1252	1893	1330509	1328304	FALSE	15	CCCATCTGCTTCTAAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHHTGPAAGTPGLRRKEHTYWAVGAATGSGDKFRMLLFSSLEHQFLTFPSLPQTFPVGLCCLYRQWWDNTVPPQCLSSSGRLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGGNGYINDFPMGRILRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH	1344179	1327139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330841_1333776_1333874_1335200_1335506_1335727_1335822_1337106_1337272_1340930_1340983_1341204_1341295_1344062
593633	contig_13305_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_146768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	174	560	57198	57584	NA	60	AACAAAAGGATTAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVIKDFILLGSTINTCGNSSQEIKRGIALGKSAAKYLFKVLKREDVTLKTKVHLTQAMMFSVVSYACESWTINKANQRRIDSLSCGVGEEY	57024	59089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_57000_59100
593646	contig_5247_pilon	+	2421	16	Intergenic	novelGene_81793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	241.788576147748	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	236	1507	130402	156413	TRUE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAQRSGGRRRTRGSSSGGSGCGGISLSHRLRSFPPRGSPSSLRSALPAPLARPGAAAFLSLLFSSDRTRRRAQTTATMGKGVGRDKYEPAAVSEHGDKKKAKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRGLTTARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASMSKLRVTS	130166	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_130414_141035_141141_141772_141833_144123_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148064_156385_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
593647	contig_5018_pilon	-	1361	8	Intergenic	novelGene_47028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_5	113.862968124865	335	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	71	1240	1397263	1392342	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAACTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERVRGLAEVDPTGWWGLSHHPRHVPVFLQLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397333	1392220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
593666	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
593680	contig_8617_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_73480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATATGAATTCCGCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
593698	contig_14691_pilon	-	3941	1	Intergenic	novelGene_146792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACAGCAGTGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26893	22952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_23000_26900
593699	contig_14925_pilon	-	1022	6	Intergenic	novelGene_55222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1753.86943641766	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	171	599	51262	27020	TRUE	50	TCCAAAGAAGTCAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	64440	25904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_51243_51388_64395
593701	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	23	364	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14431	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
593714	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
593724	SIRV7	-	226	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35836	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56095_70883_70988_78841
593727	contig_1532_pilon	-	1491	9	Intergenic	novelGene_37437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1650.5439254985	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	647	1411	27321	13113	FALSE	20	ACATTTCATCATCTGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34945	13032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28291_28520_28825_28964_29438_29505_32144_32227_34870
593728	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593738	contig_12864_pilon	-	2064	3	Intergenic	novelGene_76445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	922	junction_2	50.5	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1094	1486	244887	242831	FALSE	35	TAAAGTATCTTTGCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKGVLRGESLSFVLFSCLVPSYFSFLNDFFSSFYTLAAVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	245980	242252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598
593740	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
593758	SIRV5	-	175	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAGCAATGCTTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
593771	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
593776	contig_15063_pilon	-	1201	3	Intergenic	novelGene_14357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	806	1129	35891	35108	FALSE	25	ACAGCGGGGGGTGGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36805	35035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36156_36264
593795	contig_12638_pilon	+	2000	7	Intergenic	novelGene_33276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	285.706969152351	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	549	1286	857106	861300	TRUE	30	TTTTAAATGACTGATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLKRGLLEHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	856557	862068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_857136_858213_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162_861823_861876
593802	contig_12671_pilon	+	1884	3	Intergenic	novelGene_19233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_1	284	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	339	728	207076	211199	FALSE	35	TGTGTGGAAGAACTGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDVSMLFNTFDIYIKTNKPVLEEVQPECSP	206737	212355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_207206_210609_210724_211053
593810	contig_3155_pilon	+	1374	5	Intergenic	novelGene_26383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	95	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	59	565	258156	261211	TRUE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258097	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261806_262313
593815	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGGCCGCCGTCAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
593816	contig_13901_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_146679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATAACTGTGCGCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324282	323249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_323200_324300
593835	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
593836	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
593854	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593862	contig_4891_pilon	-	2262	14	Intergenic	novelGene_124512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	344.164127627448	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	257	1432	68026	30210	TRUE	20	GGTTAGATTTAAGTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92865	28969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_29781_30190_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
593872	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
593875	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593878	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
593882	contig_10437_pilon	+	2923	9	Intergenic	novelGene_38181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_7	138.837078530917	38	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	495	1520	201902	205555	TRUE	5	GGTCTGTTGTTTGCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHHKPEQPTSGEARTTEAVTSENHEVLSGPEEHPQDKDAGDANGAAGEQEPVDQASLPAQDQENLESPPPEASSSQVEPAHGTQTEVETVGACPRPQGLPLSPRARQPELDFYCVKWISWKEERTPIITQSTNGPCPLLAIMNVLFLQWKVKLPPQKEVITSDELMAHLGDCLLSIKPQEKSEGLQLNFQQNVDDAMSVLPKLATGLDVNVRFTGVSDFEYTPECSVFDLLGIPLYHGWLVDPQSPEAVNAVGKLSYNQLVEKIITCKHSSDTNFVTEGDVPPFLRNSCPCCMWREGPGWHKRFALDCQRLAVQTHPVALQKKGLAICFLKDDSQETPME	198726	208944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_198867_201547_202355_202737_202796_204217_204283_204597_204757_205264_206106_206907_207100_207432_207577_208427
593891	contig_6576_pilon	-	1652	13	Intergenic	novelGene_42230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	74.5648021671232	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	51	1319	261331	229096	FALSE	90	AAAAAAAAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGVGGRGRGRCESGKMAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261381	228762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
593896	SIRV7	-	346	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	6	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
593916	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
593921	contig_12352_pilon	+	2629	8	Intergenic	novelGene_57462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	199.055422494565	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	133	795	238274	284811	FALSE	25	CAATGAGTTGCTTGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	237959	286645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_238083_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
593924	contig_4891_pilon	-	2500	14	Intergenic	novelGene_124515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	344.164127627448	11	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	165	1340	68026	30210	TRUE	30	GTAAATAAACGTTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92773	28998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_29915_29965_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
593925	contig_18145_pilon	+	1517	6	Intergenic	novelGene_37341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	226.717798154446	749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	219	992	86893	100744	FALSE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86674	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90553_98292_98541_98826_98983_100326_100482_100638
593928	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	5	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	238	1410	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
593929	contig_3825_pilon	+	1544	6	Intergenic	novelGene_77941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	1293.67764145478	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCATTTGGCATTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12762	15656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_13904_14198_14390_14471_14780_15302_15498
593945	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	225	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
593972	contig_6445_pilon	-	1092	10	Intergenic	novelGene_76922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	681.671927897835	2595	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	49	864	88578	43105	FALSE	20	GATACATTAGCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_88146_88216_88473_88594_96306
593975	contig_9243_pilon	-	2172	10	Intergenic	novelGene_60309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_5	128.232235310937	35	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	28	888	64617	20056	FALSE	45	TTGTATAGATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64644	18771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
593991	contig_18303_pilon	-	2036	2	Intergenic	novelGene_146807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAAGTGAAAGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68317	58524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_60260_68016
593999	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
594010	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594016	contig_5941_pilon	-	3005	4	Intergenic	novelGene_84553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	976	junction_1	210.888596182914	14	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	143	637	148593	145524	FALSE	25	TTATACTACTTTGCAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPKHLSCIGVCCFLLAARIVEEECNIPSTHDVIRISQCKCTASDIKRMEKIISEKLDYELEATTALNFLHLYHTIILRHISERKEILSLDKLEAQLKACNCRLVFSKAKPSVLALCLLNLEIETLKSIELLEILLLVKKHSKVNDTEFFYWRELVSKCLVEYSSPECCKPDHKKLVWIVSRRTAQNLHNSYYSVPELPTIPEGGCFDESER	148735	143155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_145734_148032_148132_148227_148307_148486
594045	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
594054	contig_14666_pilon	+	2036	14	Intergenic	novelGene_39512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.4122383209812	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	27	1613	429343	448893	FALSE	25	CTGGGTTGAAAGGTATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAPGAIMDEDYFGSAAEWGDEADGGQQQEDDYGEGEDDAEVQQECLHKFSTRDYIMEPSIFNTLKRADSIFTEEGETPAWLEQMIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429316	449316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440704_440824_442035_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446215_446600_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
594061	contig_15063_pilon	-	681	3	Intergenic	novelGene_11977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCCAGTAGCTGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35379	27147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34924_35035
594077	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
594084	contig_4604_pilon	+	2625	5	Intergenic	novelGene_19124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	54.6688896905726	334	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	37	660	300691	306332	FALSE	25	GATTAGCTGATTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCTIEKILTDAKTLLERLREHDAAAESLVDQSAALHRRVAAMREAGAALPDQYQEDASDVKDMSKYKPHILLSQENTQIRDLQQENRELWVSLEEHQDALELIMSKYRKQMLQLMVAKKAVDAEPVLKAHQSHSAEIESQIDRICEMGEVMRKAVQVDDDQFCKVQEKLAQLELENKELRELLSISSESLQVRKEDSMDTASQAIK	300654	308297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_300850_301077_301184_302068_302212_303264_303379_306230
594091	contig_9609_pilon	-	2024	8	Intergenic	novelGene_23114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_3	88.9491943958655	125	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	828	1388	523112	521807	TRUE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523939	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
594107	SIRV5	-	324	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTCAATGTATTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
594108	SIRV7	-	1367	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112544	5	112366	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2372	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2400
594111	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
594115	contig_6589_pilon	+	1528	8	Intergenic	novelGene_26051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_2	815.106077984545	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	256	1191	1725832	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNSLGRPQEALLWSPLPPLSEPQCLPVANGVAHTDHNNYSNNNSSHFSSTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725470	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
594122	contig_5145_pilon	-	1921	13	Intergenic	novelGene_131438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.487002152833	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	712	1386	925621	916397	TRUE	5	GATTCCGTCCTGCCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947104	915556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915666_915970_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
594124	contig_14322_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_116176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671847	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
594137	contig_1719_pilon	+	1962	9	Intergenic	novelGene_87302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	45.7759489251725	7	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	20	922	406779	426535	FALSE	5	CATCTTGTTCTCCGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRKMAATEAADTQLMLGVGLIEKDTNGEVLWVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRILCRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLEVSNRPDLYDVFVNLADSEITIAPLAKETMTMGKLHKEIGQLIVQSAEDPEKSESQPSSF	406759	427575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408918_409116_411266_411347_415050_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422086_424045_424132_426520
594142	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_94817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
594146	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594149	SIRV4	+	173	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1598	632	1143	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2598	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
594151	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594160	contig_6497_pilon	+	3431	15	Intergenic	novelGene_35604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.811155250963	518	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	1730	3103	515843	543016	FALSE	40	AAATATAGCTTTTGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRERQWVDDFPLHRSACEGDSELLSRLLSERFSVNQLDSDHWAPIHYACWYGKVEATRILLEKGKCNPNLLNGQLSSPLHFAAGGGHAEIVQILLNHPEIDRHITDQQGRSPLNICEENKQNNWEETVKLLKEAINKPYEKVRIYRMDGSYRSVELKHGNNTTVQQIMEGMRLSQETQQYFTIWICSENLSLQLKPYHKPLQHVRDWPEILAELTNLDPQRETPQLFLRRDVRLPLEVEKKIEDPLAILILFDEARYNLLKGFYTAPDAKLITLASLLLQIVYGNYEGKKHKQGFLNEENLKSIVPITKLKSKAPHWTNRILHEYKNLSTSEGVSKEMHHLQRMFLQNCWEIPTYGAAFFTGQIFTKASPSNHKVIPVYVGVNIKGLHLLNMETKALLISLKYGCFMWHLGDTDTCFQIHSVENKMSFIVHTKQAGLVVKLLTKLNGQLMPTERNL	498153	543344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_498661_505492_505597_506525_506686_511501_511595_513830_513961_515107_515995_518627_518785_519312_519421_524818_524976_527351_527504_530834_531002_531626_531715_532311_532519_542305_542423_542947
594171	contig_3588_pilon	+	2271	18	Intergenic	novelGene_72855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	614.953949382872	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	186	1166	84577	131459	TRUE	5	TTTCTTATTTGGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTQPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGWPLGEHLPKIQKPPLPPATERHERSPLPGKKPPVPKHGWGPDRRENVSTCIKDLCPSQHCPP	84391	141453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122106_122180_122283_122372_125606_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
594178	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
594184	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
594204	contig_1443_pilon	+	808	3	Intergenic	novelGene_28184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	344128	344592	TRUE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344738_344796
594209	SIRV7	-	355	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33214	0	-5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114743	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
594221	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
594241	contig_3095_pilon	-	2034	4	Intergenic	novelGene_75205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	832.737386908715	10	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253853	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246708_246904_247387_247858_248759_253535
594242	contig_1719_pilon	+	2289	8	Intergenic	novelGene_87301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	60.0781803577808	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	323	952	415082	426233	FALSE	15	GCTAACATCTTGTTCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLETMTMGKLHKEIGQLIVQSAEDPEKSESQVIKDISLKTRELLTNLASFAEVSDGGQRPALSLETLKQKRFPPATENFLYHLAAAEHMLKI	406759	427570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898_409116_415050_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422007_424047_424141_426056
594243	contig_6270_pilon	+	1293	8	Intergenic	novelGene_99822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	140.393034305954	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	447	842	39429	45668	TRUE	25	TACAATTGCTGGGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37422	47671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
594246	contig_10581_pilon	-	3057	6	Intergenic	novelGene_41364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.4354332453679	111	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	4	594	465246	325206	FALSE	5	GTCTCACTGTTTCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGWKMASPIDGTDLEASLLSFEKLDRASPDLWPEQLPGVAEFAASFKSPITSSPPKWMAEIERDDIDMLKELGSLTTANLMEKVRGLQNLAYQLGLDESREMTRGEVPQHSRETQEVAAACGRDVLGTVTMLPSRCSSDHAHLTASSGEAGGVYLQDRPPPRSWHSAPLRTLGSKRRICSTQGSLQLFNQLPDWRS	465249	322742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_325502_445557_445642_447399_447467_455780_455819_457310_457386_465215
594249	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_94801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
594253	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
594269	contig_6710_pilon	+	549	2	Intergenic	novelGene_96168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
594283	contig_14158_pilon	+	1796	5	Intergenic	novelGene_136117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	117.559293550106	674	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	75	545	18010	25162	TRUE	10	CACTGTTCCTGTCTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPPPLPPQPHCSRSRGVPVHLRTMSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	17935	26472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21301_24096_24236_25090_25498_25556
594295	contig_10923_pilon	+	1676	9	Intergenic	novelGene_66209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	770.201069526653	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	19	888	21667	36602	TRUE	55	AATAAAGAGCAAACTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKICG	21648	42815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33020_36593_36698_37270_37540_38578_38742_42554
594300	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
594307	contig_6710_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_94309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGCCCCTGAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
594313	contig_4364_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_4580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAATACACCGGCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1963853	1963514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1963500_1963900
594318	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594323	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
594335	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
594336	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
594337	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
594355	contig_3754_pilon	-	2502	14	Intergenic	novelGene_146815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	118.652593186253	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	634	1776	197806	40551	FALSE	10	TTGCCTTTGCTGATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELARLLEIDPYLKPFAPDLQRRYRQFNKTLNDIGENEGGIDKFSKGYESFGVHRCADGGLYCKEWAPGAEGVFLTGDFNGWNPFSYPYKKRDFGKWELYIPPKQNKSTVVPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVTREGCNVNYDWIHWDPEHPYKFKHSRPKKPRSLRIYESHVGISSHEGKVASYKHFTCNVLPRIKDLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQITSFFAASSRYGTPEELKELVDTAHSMGITVLLDVVHSHASKNSEDGLNMFDGTDSCYFHSGPRGNHDLWGSRLFAYSSWEVLRFLLSNIRWWLEEYAFDGFRFDGVTSMLYHHHGVGQVFSGDYHAYFGLQVDEDALIYLMLANHLAHTLYPDSITIAEDVSGMPALCSPVSQGGGGFDYRLAMAVPDKWIQLLKEFKDEDWNMGNIVYTLTNRRHLEKYIAYAESHDQALVGDKTLAFWLMDAEMYTNMSVLAPFTPVIDRGIQLHKMIRLITHALGGEGYLNFMGHISKCLIQLLKSCDFLNSCTFKIVLDSDAAEYGGHQRLDHNTEFFSETFEHNGRPYSLLVYIPNRVALILQNVDLPN	358513	39824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_40608_48489_48669_126848_127021_131262_131374_135593_135693_140691_140820_146139_146256_195328_195539_197735_197827_200348_200485_201192_201319_250723_250840_294903_295074_358448
594356	contig_9609_pilon	-	1922	9	Intergenic	novelGene_23128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	110.872040546749	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	860	1795	523112	520853	FALSE	25	TACCTCTATTGAGTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523971	520725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521693_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
594357	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_91993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657184	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
594375	contig_14322_pilon	-	223	2	Intergenic	novelGene_116525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCAGGTGGGCGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674811	672851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
594384	contig_1948_pilon	+	2240	3	Intergenic	novelGene_31168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_2	78	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1476	2003	478740	485694	FALSE	10	CTTTTAGTTTTGTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIVGSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKEITPPEDINDTQSDIIFFMKNVEGHDEKTQFESSSYPGYFLASEKDADLYRLILKEKNQIGDNSVMFTVDLQELGVKYS	477264	485931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_478891_480516_480654_485454
594393	contig_12786_pilon	-	1633	8	Intergenic	novelGene_103392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1418	junction_3	272.85048608185	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	636	1571	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	616248	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624
594394	contig_6494_pilon	-	1284	6	Intergenic	novelGene_108574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1673	junction_5	473.442287929585	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	30	761	8286	2635	FALSE	40	TAAAAGACACATGGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8315	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
594398	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
594404	SIRV4	+	271	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	158	-887	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTATCATCTTTTATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613	1884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1600_1900
594409	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594415	SIRV6	+	1078	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	3	7	3	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	212	703	1733	10736	TRUE	40	ACTATGGGGAAAGAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1133	11324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
594422	contig_12638_pilon	+	1723	11	Intergenic	novelGene_33377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.52980940599	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	235	1146	1522697	1539011	FALSE	30	ATCACATCCCTGGGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLPLPRLAFQWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDAPILLLKNKWH	1515748	1539588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521263_1521337_1522656_1522733_1524407_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1534964_1538826_1538899_1538975
594428	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
594436	contig_15118_pilon	+	2144	4	Intergenic	novelGene_74585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.4918492362511	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1197	1496	379462	379761	TRUE	30	TATTAACCATTTCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGGQRDRRASQPCPSGCLCFLSPRAFGQCHLIASPGGSVLKPVCDADSNTPTKLSWSWGSLTLSPSQALNPEVLELPQLLSGDGGKFTCQAHHLLGP	376598	380642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376995_378661_379782_379884_380022_380151
594460	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
594475	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
594500	contig_614_pilon	+	2400	4	Intergenic	novelGene_132618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	29.9369708257569	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	377	694	619179	619496	TRUE	15	TCTGTTAATTGATTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHHKATVSPMCQVSMLHSAAGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSR	588610	641291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_619971_621721_621753_640090
594506	contig_6958_pilon	-	1753	3	Intergenic	novelGene_69921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	331.5	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	142	720	161022	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	161163	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928
594510	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACTCCAAATTAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671661	671371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
594511	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCAACCGCCAGATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
594536	contig_9848_pilon	-	1438	9	Intergenic	novelGene_79956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	573.935046412048	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	89	373	110549	106830	TRUE	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGE	113908	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104841_104879_106815_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
594539	SIRV4	-	216	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGATCAATGTCCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
594557	SIRV4	+	259	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1512	632	1057	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2512	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
594579	contig_14322_pilon	-	392	2	Intergenic	novelGene_115788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671897	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
594580	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594584	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
594585	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	21	359	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14429	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
594586	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
594594	contig_10426_pilon	-	2554	6	Intergenic	novelGene_144666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_5	51.7702617339337	13	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	93	713	104586	73619	TRUE	40	CAACATTTCATAGAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGKHKCIENVSRQNCPICLEVSLKTNFVGFLKSPHLNLKYLDIHIVFIGAVAFISFVGYSHISCCCSCLAVWTSFT	104678	68369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_69031_72438_73835_76253_76333_96657_96774_97008_97129_104496
594598	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
594601	contig_17212_pilon	-	1506	2	Intergenic	novelGene_88607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGGTACTTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67262	65597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_66985_67143
594604	SIRV7	-	1206	2	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	112442	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2296	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1304_1388
594612	contig_7202_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_18643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
594618	contig_4339_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_146081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTTAGGTGCCGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037944	1039061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037900_1039100
594627	SIRV4	+	296	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	207	447	207	-447	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
594658	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594668	contig_13900_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_115094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAACTGGCTTTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38553	36277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_-_36300_38600
594675	SIRV5	-	357	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCAATCTCTCTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
594678	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
594688	SIRV7	-	350	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33217	2	-2	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
594718	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594722	contig_5247_pilon	+	2245	15	Intergenic	novelGene_81801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	229.982752237055	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	113	1984	144244	161215	FALSE	40	AGTGGAAAACCCGGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	144131	161476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_155607_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
594731	contig_12357_pilon	+	1247	5	Intergenic	novelGene_6117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	792.410050100325	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	116	562	26079	53235	FALSE	45	TAGAAGAAATAGTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25963	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
594732	SIRV4	-	322	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCGAGTCAAAGTGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
594745	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
594748	SIRV4	-	327	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAAAGTGGCTACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
594757	contig_15304_pilon	-	2331	5	Intergenic	novelGene_30590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	214.856929141231	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	162	1007	66228	64912	TRUE	45	TGGTCAAATAAAAACTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66389	59580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_65310_65396_65721_66104
594764	contig_18869_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_56257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73549	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
594767	contig_8823_pilon	-	2169	2	Intergenic	novelGene_53071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70290	66723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_67519_68916
594769	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	1	2	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
594794	contig_11416_pilon	+	2878	1	Intergenic	novelGene_145376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAATAAGAGTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751153	754031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_751200_754000
594800	contig_4469_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_21955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAGAAACACAGACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757493	754983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_755000_757500
594804	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
594840	SIRV4	+	477	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	450	23	-450	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCAAATTGCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
594855	contig_12724_pilon	-	1642	7	Intergenic	novelGene_146870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	61.3487299515374	755	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	94	1110	541481	441312	TRUE	30	TAAGTACTTTGATTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSGPPGLSRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQVFVGKVLKKLFPDVPSGQEKLAPATLASEKPPEKVRPKKANLRGVQPLTDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKDTDEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDYKLAVLPYEVQA	541574	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_441286_441353_445761_445867_448443_449011_497701_497837_522974_523122_541459
594857	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
594859	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
594860	contig_8712_pilon	+	1745	2	Intergenic	novelGene_58827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	7	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGGGTCTCGTGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320154	323281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_320303_321684
594875	contig_9471_pilon	+	1577	10	Intergenic	novelGene_21773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_2	823.792644412205	244	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	769	1353	414749	417296	FALSE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCFFLLFAFLIIIYDFQKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406902	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
594891	contig_854_pilon	+	1641	13	Intergenic	novelGene_36440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	453.545814174881	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	131	1516	1453661	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYVTSGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451200	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460636_1464541_1464823_1465336
594905	contig_18055_pilon	+	2002	10	Intergenic	novelGene_117821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	309.790610287372	2	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	374	1060	73614	78314	FALSE	60	AGCCACATATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVAE	40697	79256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_43421_43502_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932
594906	contig_15859_pilon	-	2005	7	Intergenic	novelGene_50193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	148.165073107291	469	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	87	1460	349672	341031	FALSE	20	CTTCAGCGTTACATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTEIQPKIIGQAYPHKRRFILVLPGVIQSAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352690	340485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_342442_342521_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352636
594928	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1117	0	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
594933	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91629	0	-91623	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAAACTAGTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
594934	contig_8795_pilon	-	1447	3	Intergenic	novelGene_146891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	18	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	62	850	201513	177423	FALSE	10	TGGCTATCAGCTGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRLPFGLGGGPGRHPPRAMLLLSWWPVLLWMLGPPARALEEDGGHVWSEERPAHSLQAGAVYLSEEEPPHGPMGQDMPAEEADAVAGQDNDGDHMVMLSVIPGKAEDKLSSEPSSGTCGAGVEEDSRCNLRESLFSLNNAGTNFPDREEEYYTEPEVAESEHAPAEESNNTESLKSPKVNCEERNMTGLENFTLKILNMSQDLMDFLNPNGSDCTLVLFYTPWCRFSASLAPHFNSLPRAFPTLHFLALDASQHSRYLPLGGLRLILLDGGCGYLEVRTT	201574	176825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_177663_180241_180724_201446
594935	contig_8795_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_146890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTGGTGTTTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176400	173004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_173759_175266
594944	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
594945	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
594947	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
594956	SIRV6	-	1256	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	34	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGCCGCGCCTTGCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	7099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7806_7923_10723_10825_11035_11109_11205
594962	contig_14322_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_115911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGAGCAATGCGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671355	671646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
594979	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
594991	contig_5947_pilon	+	2748	3	Intergenic	novelGene_101565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	472	junction_1	129	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	269	529	873725	873985	FALSE	5	TGATTTCTTTTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLNEILGTERDYVGTLRFLQSAFLHRIRQNVADSAEKGITEENVKILFSNIEDILEVHKDFLAALEYCLHPEPQSQHELGNVFLKFVSTMPQSLSDSAAFGKQASSSGPCSARLRPASSAGLSGRWRGCGRQAGPASASQEQWRRARPSQTWVFLAAILSHCHVESGPPFLRAPH	783690	876204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_783755_868789_868862_873592
594992	SIRV4	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTGGCTACATGAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
594994	contig_16761_pilon	+	2204	10	Intergenic	novelGene_146896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	58.4670425259256	961	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	35	1102	17825	63217	FALSE	55	TTAAGAACTGAAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPSACADLLAMALRLLRLAPVSASARGLAAGAQRMGGIHTSAQCKLRYGPLAFILGDKASKKLTEHSRVITVDGNICSGKSKLAKEIAEKLGLRHFPEAGIHYADTTTGDGKLLDVEFSGNCSLEKFYADPKSNDGNSYRLQSWLYASRLLQYADALEHLLSTGQGVVLERSIFSDFVFLEAMYNQGYIRKQCVNHYREVKKITASEYLPPHVVIYVDVPVPEIQSRIQKKGDPHEMKITSAYLQDVENAYKKTFLPEMSENCEVLQYSAWEAQDAEKVVEDIGYVKLEKGPWLKQDDRTFYHLRMLVQNKLKVLNYTTIPVYLPEVTIGAHQSDRVFHRFRELPGRRYEPGYNADVGDTWIWLK	17790	64319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_17900_22928_23098_24266_24483_25683_25771_26902_27025_30882_30963_38402_38458_39772_39859_47080_47190_63148
594996	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595018	SIRV5	-	299	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTATTTGACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10957	8306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
595029	SIRV4	-	279	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAACCATCGTATGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2751	2472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
595035	contig_13216_pilon	+	1940	7	Intergenic	novelGene_47468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_4	839.887823197572	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	976	1416	260572	261012	FALSE	35	ATATTTTTAAAACTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229599	261536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256214_256296_258447_258573_260430
595048	contig_12786_pilon	-	2090	5	Intergenic	novelGene_103422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1418	junction_3	69.4095634621051	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1390	2034	602829	590909	FALSE	20	CCAGAATCTCCTTTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	604218	590852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796
595051	contig_4891_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_124580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCCCACTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756353	756982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_756400_757000
595054	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
595056	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595057	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595058	contig_6397_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_146249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTATATAGGCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439681	441957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_439700_442000
595059	contig_20615_pilon	-	2708	4	Intergenic	novelGene_146917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	30.2691628926573	2	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	233	2425	211769	195461	FALSE	25	ATACGATGATCTTGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMENFRNLASIVSRKLNDGNKLSSELIMLRFMKNNTWSSMLGEISESHGTRDQHKNQGRHLRSHTVENLWESNEGNQCGKTFSWIPNLTVLKRNSPELNPFECCECGKAFIDHPSHKHHTISHTGCSTCQCKECAETCGCPSHLFTPMRTLIAKKLYKCKLCGKDLSCMSVLKNSVITLSGEKRYECNECGKHFCSFSSFWTHVRGHKHECKECCKTYSRPSSLILHEKFHIRNMPYECKECGKAFSQSSTLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASSLTQHIRIHSGERPYECKQCGKAFSQASSLTRHVSTHTGEKPYECKECGKAFSRASSLTTHIRNHSGEKPYECEECGKAFSQASSLFKHRRTHTGEKPYECKECGKAFSDSSALTTHVRTHTGERPYECKECGKVFTCFSHLTTHIRTHSGVRAYECKECGKAFSQSAHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASALTRHITTHSGERAYECKECGKAFSRALSLTTHLRTHSGEKPYECKDCGKAFSQASHLTTHARIHNGERPYECKKCGKAFSCSSALTTHIRTHTGERPYECNECGKAFSCSSAFTTHIRTHSGEKPYECTECGKAFSDSSHLTTHVRTHSGERPYECKQCGKAFTQASHLTRHRRTHRGKTTLCEKWDVSFLLL	212001	195177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_197367_197722_197874_198848_198976_211760
595070	contig_6230_pilon	-	2079	11	Intergenic	novelGene_102111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	32.0001562496185	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	2	1336	181201	166056	FALSE	65	AAAGAATAAAGTAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTIENFLRRSISFMGGNNGLKLSLTPNPRLVVFGRNHQLMQQGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	181202	165312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179885_180772_180857_181156
595077	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
595086	contig_16928_pilon	-	3822	1	Intergenic	novelGene_146920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1154	2191	36180	35143	NA	45	ATATATATAACAAATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADPSECLKCGQSLMNHSSLKHHIKSHSGCSAYQCKECGEACSCPSYLSTDVRTLTGEKSYECKECGKGFRRSSKLTIHMGIHSGEKLYVCKECGKAFSCSSNLTAHIRIHSGERPYECKECGKAFSRSSYLTSHRRTHTGERPYECKECGKVFSWSSALTAHMRTHSGERPYECKECGKSFCHSLDLSIHTRTHSGERPYECKECGKAFSQSSHLTSHLRTHSGERPYECKECGKAFSQSSHLTSHLRTHSGERPYECKKCGKAFNRSSYLTQHVKAHSGERPYECKECGKTFIQSSHLTAHKRSHCGERPYECMECGRAFFHFSGFTIHMRTHSGERPYECN	37333	33511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16928_pilon_-_33500_37300
595093	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	266	-74	-266	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTATCACTGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
595096	contig_6364_pilon	+	2369	5	Intergenic	novelGene_51768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTCCGCCTCCCGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902341	931337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_903076_904266_904362_906461_906559_929808_931128_931213
595107	contig_12622_pilon	+	2414	16	Intergenic	novelGene_5808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	147.907839173212	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	88	1422	358539	419730	TRUE	45	TCTCCAAAATACCAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGNHKLTQIAKVVIKICEHEMNEIEVCPECYLAACQKRDNWFCEPCSNPHPLVWAKLKGFPFWPAKALRDKDGQVDARFFGQHDRAWVPINNCYLMSKEIPFSVKKTKSIFNSAMQEMEVYVENIRRKFGVFNYSPFRTPYTPNSQYQMLLDPTNPSAGTAKIDKQEKVKLNFDMTASPKILMSKPMLSGGTGRRISLSDMPRSPHEHKLFSAHGL	349713	463657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_454905_463584
595117	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
595119	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_115992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
595120	contig_2646_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_69714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAGATACACCAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571459	2571997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2571500_2572000
595121	contig_15118_pilon	+	2615	10	Intergenic	novelGene_74615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_6	211.339525554801	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	36	1166	392042	394049	TRUE	55	AATCGAAAGAAGACGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTGMKEGQRTTPWDRVSGTLV	392006	399279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
595129	SIRV6	+	858	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	14	-441	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
595133	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
595136	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595157	contig_4486_pilon	+	2149	12	Intergenic	novelGene_38600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1624.60282240876	2	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	808	1242	399314	412464	FALSE	45	GAAAAAAAGTCACCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	342997	413371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343081_360535_360647_376092_376202_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391184_392782_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
595168	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
595169	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
595171	contig_13258_pilon	+	1011	8	Intergenic	novelGene_146930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	18.0430324615394	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	64	639	122754	135070	FALSE	35	GCAGTGATATGACAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSRIPSSRLHQIRKEEGVDMMNRETSREREVQTAMQISQSWDESLSLSDSDFDKSEKLYSPKRIDFTPVSPAPSPTRGFGKQCFSPSLQMFVSSSGLSPSPVPSPRRFSRRSQSPVKCIRPSVLGPLKRKGEMETESQPKRLFQGTTNMLSTDAAQLSDLSSCSDILDGSSSSSGLSSESLAKGSTPAESPVACSNSCSSFILMDDLSPK	122393	135442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_+_122442_122738_122783_122867_122923_123171_123274_123602_123689_124251_124314_126667_126765_134925
595194	SIRV4	+	299	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1472	632	1017	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2472	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
595209	contig_4315_pilon	-	1977	7	Intergenic	novelGene_46785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_5	116.206353813665	37	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	38	841	339053	328205	FALSE	10	ACATCCTGTGTCTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	339090	327068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
595213	contig_10414_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_146945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTTTTTCCCCACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171751	171248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_171200_171800
595222	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
595231	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595236	contig_3627_pilon	+	2315	15	Intergenic	novelGene_78474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	33	junction_11	164.596910229636	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	72	1748	432362	461592	TRUE	10	GGTATGTGTCTGCTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAISSETDRRERGSGCLGCSISPHLWCIKF	432290	483536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461510_461621_476760_476896_478112_478158_483177
595237	contig_7334_pilon	+	2210	3	Intergenic	novelGene_50577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	118	960	120286	121176	TRUE	10	ACTCACTGTTCTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	120168	122504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_121053_121100_121316_121393
595252	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
595261	SIRV7	+	271	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCTAATTTGGCACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147671	147942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
595264	contig_7457_pilon	+	2046	12	Intergenic	novelGene_31326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	256.73583555125	2	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	612	1421	285745	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280821	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285533_285744_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
595265	contig_2100_pilon	-	1409	10	Intergenic	novelGene_50692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	861.714713181561	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	113	1060	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSLELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185523	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
595276	contig_16122_pilon	+	1546	2	Intergenic	novelGene_134512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	373	1068	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133717	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134161_136976
595280	scaffold_19766_pilon	-	1602	6	Intergenic	novelGene_34329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	450.076704573787	30	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	715	1215	621659	596963	TRUE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKASTP	622373	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596977_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454
595292	contig_14926_pilon	-	1703	3	Intergenic	novelGene_146948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_2	6	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	5	340	13823	11770	FALSE	25	ACTAAAACTCTCCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMSKESVSDAILQTDLALTAKEKELKEARLKAEAAQAEAQRLEEIERQNQLMMEQRERLHQEQVRQMERDRANWLAEQQRAQERKIQEEARRLKERLIAENRRFQNRLRRLF	13827	10406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14926_pilon_-_11848_13292_13475_13747
595301	contig_13428_pilon	-	2303	2	Intergenic	novelGene_143440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTCATCTATCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60413	57596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_59829_60342
595306	contig_5696_pilon	+	2063	18	Intergenic	novelGene_117533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_17	54.3689815903292	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	63	1364	635115	656904	FALSE	20	CCCTGGAGAGTCTATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSATLRLPLPYLFIFALGKKHTYLLSRDTHNCIGKICCKRPL	632374	657603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638565_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840_652953_655515_655562_656828
595316	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
595321	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGGACTCGGAGGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
595329	contig_15732_pilon	+	2148	16	Intergenic	novelGene_88845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	251.295098771677	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	48	818	11208	153780	TRUE	25	ATACAGCACTGGCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNKILYNSKGDSISSGRSRTWNMSE	11160	398724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110708_126419_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_393845_395326_395390_398197_398263_398520
595330	contig_6842_pilon	-	1337	4	Intergenic	novelGene_130713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	307.21111091018	2941	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	460	780	432427	429481	FALSE	40	TAACCAGGACTATCGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	434047	428923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432425_432658_433818
595334	contig_16650_pilon	-	2268	2	Intergenic	novelGene_61957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	118	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	740	1126	242153	241767	FALSE	15	CTGATGTTACTTGTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLCCSRLHRQLLNHSKPVGSPGSDCWDYQKQSQERKESPFLCLQELGLCSSISCFWLNTLFRAGTIWKRLPNQEEALPGNTVHCFQAKESWLLNPGLMTHSHTVTLGSLCIPSRVLSLHLGTTYHC	244327	240624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_242784_244218
595346	contig_7359_pilon	+	2706	10	Intergenic	novelGene_139878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	21.2904661906987	165	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	267	1763	414164	424725	FALSE	5	CTGTGTGGTTTCTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKSQPSAPKTKSPGSVSNGTAASQGQWGRAWEVDWFSLASVVFLLLFAPFIVYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQGLYLVYHPVQLSNLHAAGVLLLGLLGYYIFRMTNHQKDLFRRTNGRCLIWGQKPKVIECSYTSADGQKHHSKLLVSGFWGVARHFNYTGDLLGSLAYCLACGGGHLLPYFYIIYMTILLTHRCLRDDTAVPTSMAATGSATWPPCLTASCPAFSEGPSRGGAAEAAVESMWSRADGG	402238	425668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_403997_404119_411146_411253_414157_414262_415308_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_424191
595348	contig_5302_pilon	+	1644	9	Intergenic	novelGene_81478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	182.923780233736	7	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	59	583	318287	334001	TRUE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAAPAVAAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYHLPEGEQEVGDCCQSRLDSRK	306690	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328321_333934_334060_336232_336291_337307
595352	contig_5331_pilon	-	1683	4	Intergenic	novelGene_112776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	298.898347640502	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	26	688	253336	248930	FALSE	0	GTGTCTTTGTTCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEEGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253361	247934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_251700_251798_253103
595359	contig_21203_pilon	+	1294	8	Intergenic	novelGene_84486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1284	11	1294	53950	122156	FALSE	10	TTCAGGTGAGTTTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNII	53939	122156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
595364	contig_14341_pilon	+	1654	5	Intergenic	novelGene_111853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1893	junction_1	1721.05047863216	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1003	1617	548758	551737	FALSE	5	GGGGTGGCCCCGCCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547755	551774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
595370	contig_10134_pilon	-	1714	4	Intergenic	novelGene_16184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.7245549721023	18	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTATTTAGACTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	29374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30462_34922_35152_38558_38817_39584
595374	contig_10196_pilon	+	1130	9	Intergenic	novelGene_132139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_4	223.494267264286	7743	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	14	940	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034552	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
595388	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_93390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
595393	contig_9883_pilon	-	806	3	Intergenic	novelGene_87594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	96100	94134	TRUE	55	AAATGTGAAATGAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASSSFARVYLSLQSYISTPVLTDQEVFDLPGIAAITKHEDSTVGSHNKPLDIVVGIEKTALPQASDFLHLLLSGASGDSDEHHQSLPFFRHFQYAFRLAWIDL	96101	87562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_87985_94065_94299_95950
595394	contig_12425_pilon	+	1656	9	Intergenic	novelGene_46636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	226.413304324194	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	83	1171	167145	193565	TRUE	65	TTGAAAAGAATATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEECVFCSKKERHTLSGLRIC	167062	198546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_193508_193683_198178
595397	contig_5899_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_146981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTAGACACGAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188358	189710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_188400_189700
595404	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
595439	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_16513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
595444	contig_6217_pilon	-	1949	3	Intergenic	novelGene_109659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	177	1040	739958	739095	TRUE	15	CCTTTTTACTTGTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGAGGREEPSLAKAAQTLAAERRESRHRFSCGRSVGAGRRPAGGGFSARALRAAPGKMKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797291	738133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_738669_738720_739964_797120
595445	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91679	0	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
595447	contig_11656_pilon	+	2572	16	Intergenic	novelGene_54022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	154.040629561021	11	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	164	1780	468970	536565	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRVSIRPETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLA	468806	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_468997_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_536558
595455	contig_12624_pilon	+	1254	8	Intergenic	novelGene_61035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTATTGAACATTCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862027	877458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_862484_863770_863948_867655_867765_867898_868053_874027_874139_875121_875186_875385_875527_877416
595458	contig_11248_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_142539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156912	157941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_156900_157900
595462	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595463	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	23	364	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14431	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
595465	SIRV6	+	404	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	120	11	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTATTGTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
595470	contig_9668_pilon	-	2128	12	Intergenic	novelGene_58088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_6	162.755406404978	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	11	1384	176820	121609	FALSE	25	TACATTTATTCCTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNEMMLKFYSFYKQATEGPCKNSRPGFWDPIGRYKWDAWSSLGDMTKEEAMVAYVEEMKKILETMPMTEKVEELLHVISPFYEIVEDKKSGRSSDFTSDLGNVLTTPNAKTMNGKAESSDSGAESEEEEAREEVKGAEQSDNDKKMMKKSADHNNLEIIVTNGYDKDSFVQDIQNDFHASSSLNGESTEEVKPVEQNFEQTGKTTVCIHEDVSGIQHLTSDSDGEVYCDSMEQFGQEEIYLEKTGEKGQSLDSFSSNSGPFQYYLNGDPNQRLENSGFPEDVQVSPANGSIGDMQGVAVEGKGEVKRGGEDGRSNSGTPPNEKRGGENLEFCNVRRGRGHRMQPLGEGAKGRQVGSGGDGERWGSDRGSRGSLNEQIAIVLMRLQEDMQNVLQRLHKLETLTASQAKSSTLQTSSQPSSLRPSWWPFEMSPAVLTFAIMWPFIAQWLVHIYYQRRRRKLN	176830	120864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_121622_123176_123287_123619_123665_129339_129540_134528_134797_141248_141282_145066_145150_145973_146178_147289_147422_164932_165048_174462_174536_176722
595474	contig_10864_pilon	+	1940	4	Intergenic	novelGene_107134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13.6707311029399	70	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCTCGATTTATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533814	1548442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1534009_1536545_1536655_1542273_1542382_1546913
595480	SIRV2	+	377	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	212	-66	-212	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCTTCTTGGCTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
595491	SIRV7	-	352	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-1	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
595496	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
595502	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595516	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
595520	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595523	contig_9363_pilon	+	1765	11	Intergenic	novelGene_6824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	275.005254495255	14	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	32	670	1622283	1624132	TRUE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKSPFPLFLSLPLSWWLPQLRIFPGLHC	1622251	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624051_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
595532	contig_17753_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_105078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACTCGACAGCAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63183	64798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_63200_64800
595543	SIRV5	-	322	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGATTTCTCAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8453_8590_10863
595546	contig_18869_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_56046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73560	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
595550	contig_9678_pilon	-	2967	21	Intergenic	novelGene_146360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_16	77.7161501877184	137	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	200	2542	257649	213699	FALSE	40	CACAGTCTCACAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFNWRLFAVNHQKISSLHINNICCCKRRASLERLKPHLPLGRNYSSLPGVIGNDIKSLHSIISPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWKQADKYNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGLVDVISKEKLLWNPSSDDGKDFERKPLLELIDPELLKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLGEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTVAQTAVPVLCGSALKNKGIQPLLDAITMYLPSPEERNYEFLQWYKSDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIYSGTVKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAAHRAKREGEKKHGKNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSVAKQPELDHALKCLQREDPSLKVKLDPDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYGLETYLGPLQVAYRETILNTVRATDTLDRTLGDKRHLVTIELEASPTETSSVMPVIENAENVSEDRLKVFQEAIENGIHSACLQGPLLGSPVQDVAITLHSLIVLPGTSTTMISACVSRCVQKALKKADKQVLEPLMNLEVTVTREYLSPVLADLAQRRGNIQEIQTRQDNKVVVGFVPLAEIMGYSTVLRTITSGSATFALELSSYQAMNPQDQRTLLSQRSGFAKGF	259722	213273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_213837_214520_214704_219463_219580_222918_223099_225922_226062_227788_227866_232115_232306_236789_236890_236971_237113_238584_238734_240385_240467_243469_243650_243886_243948_244723_244813_249161_249251_249356_249483_251679_251778_252229_252288_255072_255158_257586_257674_259547
595563	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_17612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
595570	contig_16098_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_45825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAATTCTAGTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192622	193409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_192600_193400
595574	SIRV4	+	301	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	201	-443	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGCCATTCCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	2328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1881_2251
595575	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
595576	SIRV6	-	269	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACGTCACCGCGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
595578	contig_6589_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_26282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	60	1610	2274715	2273165	TRUE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2274774	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272446_2273155
595595	contig_14711_pilon	+	1802	12	Intergenic	novelGene_68896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	408.021126498888	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	322	1572	86227	90570	FALSE	20	GTCTTATCTCAGACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70417	90800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82068_85561_85593_85910_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
595602	contig_8268_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_146998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTCTCAACCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67142	69091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_+_67100_69100
595613	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
595616	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595617	contig_11978_pilon	+	460	4	Intergenic	novelGene_63107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_3	2164.46180120807	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	8	373	1830113	1831883	FALSE	20	CTCTCAGCTTTTTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1830105	1831970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
595634	contig_9345_pilon	-	1392	6	Intergenic	novelGene_24681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2365.33321119879	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	174	662	955353	947957	FALSE	5	TTCCCGTTTTGTCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECLVL	1001327	947226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947973_948065_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_1001156
595648	contig_14682_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_139097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTACCAAGTAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82484	83560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_82500_83600
595652	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
595657	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
595660	contig_6102_pilon	+	1921	12	Intergenic	novelGene_32263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	58.7691941566173	593	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	92	1570	1444370	1449029	FALSE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444278	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448274_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
595668	contig_7457_pilon	-	1290	4	Intergenic	novelGene_31703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	67	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	141	482	1176842	1174926	FALSE	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176982	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
595675	contig_6593_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_49851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTGGGTCAGGCACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235765	1234097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1234100_1235800
595688	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595699	contig_12125_pilon	+	1424	3	Intergenic	novelGene_76231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291	4914	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	73	399	384800	385171	TRUE	45	CGAACCAAAAAGTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGAAVSTRVSPEVVGPAAPKQQKMRPLDVVELAEPEEVEVLEPEEDIAALTRERGRAYLRTRGKLWEMDNMLLQIKTQVEASEESALNHLQNADDGAAARGEKAEEKAREMAKMAEMLVELVRRIERSESS	384727	386715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_384866_384910_385184_385702
595704	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
595716	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595717	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
595721	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
595736	contig_12464_pilon	-	1999	2	Intergenic	novelGene_68691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	566	1321	337895	337140	FALSE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	338701	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_338197_338437
595743	contig_14744_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_66149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650424	1652335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1650400_1652300
595749	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	641	966	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
595753	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
595763	contig_9440_pilon	-	1614	7	Intergenic	novelGene_59095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.864180271787	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	82	765	1716626	1700693	TRUE	15	CTGTGGACATTACTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716707	1698662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699090_1699739_1699814_1700344_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
595766	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	668	983	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
595770	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595780	contig_6876_pilon	+	2505	3	Intergenic	novelGene_147021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_2	2	653	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	123	1232	133885	141512	FALSE	10	TCTTGGGTGACTAGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTITVLTAFLLSQFPYNCILLVQTINAYTMIISNCTISTNIDICFQVTQTVAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSFTRREGSLKLSSGLLETTSGALSL	126391	142785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_133860_133906_140423
595786	contig_7051_pilon	-	3203	1	Intergenic	novelGene_64304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201347	198144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_198100_201300
595793	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	25	357	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14433	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
595802	SIRV7	-	345	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56094_70877_70988_78841_78964_114686
595815	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
595820	contig_9345_pilon	+	2169	6	Intergenic	novelGene_24390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1438	2043	142760	151834	FALSE	35	TAGGCTAGAAGTCCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWWSRPTGSAAHLVQTAAGAGEADDDGDNGEHKDGQANGHGRPEPDMGSLSKSEGILIDEASSLILLMLLSTLLRLRQLSFLCPLSLQLLLLFPVASWPSGLNARICPAGASVPNLCSSTGKCPEAPHSARKPPAHRHSLSSLAPWVSSSTISRWSSGSAAVCWFSSAAASLLLQVLCCYWSSATAAPLSIYSFKTTYTF	141109	151960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_142417_142570_142614_142672_142779_142954_143071_148863_148948_151447
595835	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	140	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
595858	contig_4364_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCGGCGACGGAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533260	1532847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
595860	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595868	contig_11115_pilon	+	1651	7	Intergenic	novelGene_102826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	620.168167157551	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	587	1561	171704	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165374	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166383_171202_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
595871	contig_9848_pilon	-	1420	7	Intergenic	novelGene_79940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	623.271320444707	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106398	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105944_106131_106263_106351
595874	SIRV4	+	304	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	632	1012	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
595885	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
595892	contig_14322_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_116186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	54	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
595908	contig_17274_pilon	+	1852	5	Intergenic	novelGene_26472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	215.389617902071	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	13	507	7027	30219	TRUE	30	GCACATAGTAAGTGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEGN	7014	36471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_31349_36255
595909	SIRV6	+	192	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	72	519	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
595913	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595923	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
595924	contig_20890_pilon	-	1679	6	Intergenic	novelGene_147040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	921.322006683874	782	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	162	812	42692	21744	FALSE	20	TTAGTCTGTATGTATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPFTDVVTTNLKLRNPSDRKVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDPGLTVTVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQTIFAPPNTSDMEAVWKEAKPDELMDSKLRCVFEMPNENDKLGITPPGTTAAVTSLSSINNTVATPASYNMKNDPRGLSVFKQEKQKNDMEPSKAAPLNASKQDGPMPKPHSVSLNDTETRKLMEECKRLQGEMMKLSEENRHLRDEGLRLRKVAHSDKPGSTSAASFRDNVTSPLPSLLVVIAAIFIGFFLGKFIL	45633	20876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_21903_29614_29789_33954_34090_42125_42207_42590_42695_45474
595925	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
595932	contig_3627_pilon	+	169	1	Intergenic	novelGene_78533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAACCAAAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634815	634984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_634800_635000
595933	contig_6735_pilon	-	1175	10	Intergenic	novelGene_15677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	961.781795534841	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	559	1140	544974	542019	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGCAVCPLSFPAEISLNLLCAQS	568256	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542087_543005_543292_543788_543894_544851_544992_546595_546634_547243_547388_554230_554374_564157_564232_564784_564869_568198
595937	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595940	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
595942	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
595944	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595946	contig_10734_pilon	-	2009	12	Intergenic	novelGene_51450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_11	73.6173937405898	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	125	1291	2234466	2216993	FALSE	10	CTTAATCCGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRAVVAGFLFEYDTPRIVLIRSRKVGLMNRAVQLLILAYVIGWVFVWEKGYQEVDSVVSSVTTKAKGVAVTNTSELGFRIWDVADYVIPAQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234590	2216274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2229766_2229915_2234332
595952	contig_10163_pilon	-	2953	9	Intergenic	novelGene_82616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	8.36286434183886	224	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	64	1128	61076	48912	FALSE	20	ACCTTTATTCAGATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLILEASEGVPRHIKFRDVTMSLYCGIACRRKSFWYYRLLSTYVNNARYIFELKEDDDACKKAQRTGAFYLFHSLAPLIQKSEHHHQYLAPRYSLLELERLLDKFGQDTQKIEDSVLIGCSEQQEAWFAVDLGLNSSSSTSASLQKPEMEAELQGSFTELRKALFQLSMKDASLLSTAQALLRWHDAHQFCSRSGQLTKKNVAGSKRVCPSNKIIYYPQMAPVVITLVSDGTRCLLARQSSFPKGMYSALSGFCDIGESLEEAVRREVAEEVGLELDRLQYSASQHWPVPNSSLMIACHATVKPGQTEIQMNLRELEAAAWFSHDEVATALKRKGPYTQQQDGTFPFWLPPKLAIAHQLIKEWLEKQSCSSLPA	65297	47086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_49113_49579_49735_50467_50580_50741_50868_51728_51836_53290_53426_56473_56620_60993_61086_65243
595956	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
595961	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
595963	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_89570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653770	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
595964	contig_16187_pilon	-	1997	4	Intergenic	novelGene_101065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	35.8143360495021	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	255	299	41980	41936	TRUE	70	AAATTATAAAGAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILRSVVQRPAGSLQTVTKGTESLICSDWIRHKFTRSRIPDKVFQPSPADHEKYGGDPQNPHKLHVVTRIKSTKRRPYWEKNIIKMLGLEKVCCCFSDL	47867	40159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_42110_46088_46170_47823
595976	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
595982	contig_12886_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_135467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAGGAAATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286430	285520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_285500_286400
596008	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_114075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	31	339	14409	13878	FALSE	20	CGCAGTTTATTACTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14439	13875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
596014	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
596016	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
596032	contig_6589_pilon	+	1814	15	Intergenic	novelGene_25716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	62.8490254498827	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	124	1323	460735	506905	TRUE	25	ATCTGGAGGAGTCTACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGSWTTQSPLWRSVAGGTHLQGPCRST	451667	509758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_505399_505459_506884_507045_509406
596046	contig_15063_pilon	-	1722	7	Intergenic	novelGene_12391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACAATGGTAGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39752	28154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28195_34599_34926_35036_35378_35838_36153_36264_36597_38967_39089_39504
596052	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
596055	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596061	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	654	969	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAATAACTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
596077	contig_2069_pilon	-	3217	9	Intergenic	novelGene_23445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_8	37.3745819374612	139	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	110	1111	1360978	1334659	FALSE	20	AAGAACGTCTTGTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIKEGELSLWERFCANIIKAGPMPKHIAFIMDGNRRYAKKCQVERQEGHSQGFNKLAETLRWCLNLGILEVTVYAFSIENFKRSKSEVDGLMDLARQKFTRLMEEQEKLQKHGVCIRVLGDLHLLPLDLQELIAQAVQATRNYNKCFLNVCFAYTSRHEISNAVREMAWGVEQGLLDPSDISESLLDKCLYTNHSPHPDILIRTSGEVRLSDFLLWQTSHSCLVFQPVLWPEYTFWNLCEAILQFQMNHSVLQKARDMYAEERKRQQLERDQAAVTEQLLREGLQASGDTQLRRTCLHKLSARREERIQGFLQALELKRADWLARLGTASA	1361618	1332552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1334896_1343023_1343132_1345524_1345640_1350401_1350504_1351478_1351596_1354912_1355056_1359034_1359152_1360915_1361030_1361560
596086	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	144	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
596090	contig_11720_pilon	-	1775	11	Intergenic	novelGene_43880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	76.593015347354	932	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	524	1369	110844	108190	FALSE	30	AGAGACATGTATGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASQPSLGEGEESESNSVESLGFCSVMPLAAVGYLDGTLAIYDLSTQTLRHQCQHQSGIVQLLWEAGTAVVYTCSLDGIVRLWDARTGRLLTDYRGHTAEILDFALSKDASLVVTTSGDHKAKVFCVQRPDR	113351	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109022_109209_109301_109506_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112683_113170
596093	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596094	SIRV5	+	349	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	886	-30	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
596096	contig_10196_pilon	+	2048	11	Intergenic	novelGene_132300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	240.021686520198	117	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1256	1843	2368768	2374406	FALSE	20	AGCCCACCTGCCCACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2348153	2374611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348832_2352497_2352597_2363547_2363643_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365564_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
596115	SIRV7	+	207	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATCATCTATTACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	78878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
596125	contig_20819_pilon	+	2579	5	Intergenic	novelGene_55604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	53.5467085823209	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	165	1424	22116	23648	TRUE	40	AACAATAAAATTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEV	21057	25473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22066_22323_22476_23309_23427_24722_25391
596133	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
596137	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596143	contig_7202_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_16588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27843	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
596150	contig_11285_pilon	-	1463	12	Intergenic	novelGene_5546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	335.059955162832	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	383	1141	743612	741540	FALSE	25	ACTTTTGTCAAGTGTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745450	741217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744486_744520_745337
596152	contig_16622_pilon	-	2523	16	Intergenic	novelGene_48428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	936.199456431279	21	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	254	1471	128619	112684	TRUE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	132367	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128337_128679_132173
596154	contig_8848_pilon	+	2023	2	Intergenic	novelGene_140453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATGTCTTCTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49865	58640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_50093_56844
596164	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	386	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
596170	contig_10523_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_120966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	892	1227	87162	87497	NA	25	CCCATAGGATTTCCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNVLVKNIEYAMDCQKNERICPGKSTARMLLRSGDDFLLYFGHFIRRDQSLEKDIKLDKVEGQGKRGPSVSWIDTVAATMGSSIIMIVSMAQDRAEFCSVVHRVAISQN	86270	89033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_86300_89000
596185	contig_4780_pilon	-	2004	12	Intergenic	novelGene_65399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	156.212135908061	329	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	524	1198	361784	322013	FALSE	75	TTTAAAAAAAAAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKHVQSKGE	428908	321206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_322037_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_418007_418114_419799_419852_422134_422260_428740
596196	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596198	contig_8254_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_48388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAAGTGAGGAGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80636	81632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_80600_81600
596210	contig_4232_pilon	+	2279	11	Intergenic	novelGene_63491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	580	1005	608360	608785	TRUE	30	ATTAATTCTAGATGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGRARGDQGRPGLDKGSSVAGTEGHGGPLWREVAVRPSITKGMKLASTALASQSRPPGTPGRGPGQARLRGRENPGHQSGGRAQREVSCSPTLSLAGHCVNPVTTRAWAQGKPSECTSWRAVRSWARRCTSGSALLLSP	607780	616675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_609046_610285_610365_611351_611461_611653_611697_611951_612075_613618_613697_613872_613971_614818_614983_615283_615392_615782_615949_616629
596223	contig_205_pilon	+	2812	1	Intergenic	novelGene_144318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCCAGAATAGAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283684	286496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_283700_286500
596226	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596254	contig_8538_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_5087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842860	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
596264	SIRV7	-	323	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	27	0	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
596283	contig_12638_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_33401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTACAAGGGCTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538051	1540171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1538100_1540200
596285	contig_5549_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_81561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1408.35702149704	140	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	372	845	86768	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82044	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82265_86616_86819_91687_91835_93264_93412_96620
596292	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596295	contig_12948_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_126206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	417	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	498	318	815	236292	235795	NA	30	CACTGTAACAGATGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPA	236609	235792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_235800_236600
596299	contig_14711_pilon	+	2003	6	Intergenic	novelGene_68939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	29.0613144919496	372	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	232	624	120484	135401	FALSE	20	TTTTGTTGGAATGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGMYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	119790	136780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_119897_119981_120073_120449_120561_133925_133978_134106_134197_135227
596301	contig_4364_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_4378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAGTAACAACCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
596307	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596318	contig_1150_pilon	-	4212	3	Intergenic	novelGene_61465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_2	3.5	250	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1049	3150	216	3365	418312	385721	FALSE	35	CTCAAGGAGGATGTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRMCAQNRLFLILLNVILISKLLGAIWFPKTLPCDVTVDVPKAHVIVDCTDKHLMEIPGGIPTNATNLTLTINHIPAISPASFRRLEHLIEIDFRCNCVPIRLGPKDNICSERLQIKPRSFSRLTSLQALYLDGNQLLEIPQGLPASLKLLSLEANTIFSIMKENITELANIEILYLGQNCYYRNPCNVSFSIEKDAFLSLKNLKVLSLKDNNISAVPTVLPSSLTELYLYNNIITKIQEHDFDNLNQLQLLDLSGNCPRCYNVPFPCTPCENNSPLQIHVNAFDALIELRVLRLHSNSLRHVPKRLFQNIKKLEELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPNLVQLDLSFNYELQVYHAYMNLSNEFASLKNLRILRIKGYVFKELNSLNLSPLRNLSNLEVLDLGTNFIKVADLSIFKQFEKLKVIDLSLNKISPSGDSSDVGFCPNSRTSVDSYGPQVLEAGHYFRYDEYARSCRFKHNQTPFLPFNGNCKMYGQTLDLSKNNIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNSISQTLNGTEFQPLVELKYLDFSNNRLDLLYSTAFEELRNLEILDISSNGHYFQSEGLTHMLNFTKNLSFLKKLMMNDNGISTSSSRTMESSSLKILEFRGNHLDVFWKDGDNRYLQFFKNLQNLEELDISENSLSFLPPEVFDGMPPNLKTLSLVKNGLKSFSWERLQLLKNLETLDLSQNQLKTVPERLSNCSSSLKRLILNNNQIRQLTKYFLQDAFQLRHLDLSSNKIQIIQKTSFPENVLNNLETLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVVSLDLYTCELDLTNLILYSFSISMALFLMVVTTASHLYFWDVWYSYYFCKAKIMGYQRLISLDSCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLDELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTNKYAKTENFKIAFYLSHQRLIDEKVDVIILIFLEKPLQRSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV	418881	384873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_388868_418309_418414_418767
596323	contig_7457_pilon	-	1227	5	Intergenic	novelGene_31694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1881.64507479493	34	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	143	484	1176842	1174926	TRUE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176984	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174832_1174900_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
596337	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_19095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
596350	contig_57_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_44904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAAAAAAGTCTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115480	117719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_115500_117700
596354	SIRV7	-	287	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68993	0	35774	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
596363	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
596366	SIRV6	+	371	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-394	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1891	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2625_2746
596369	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
596371	contig_91_pilon	-	2296	11	Intergenic	novelGene_127094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	333.866140840906	1093	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	41	793	446461	322104	TRUE	15	CTTACTTTGCATACTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSPVQSGLPGMQNLKADPEELFTKLEKIGKGSFGEVFKGIDNRTQKVVAIKIIDLEEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGGSALDLLEPGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGTPFWMAPEVIKQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPHSELHPMKVLFLIPKNNPPTLEGNYSKPLKDY	446501	309961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_311017_314489_314627_317393_317460_318497_318622_321982_322111_325333_325483_334662_334821_335110_335220_344028_344086_380723_380955_446419
596395	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596398	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_93138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATACACAGTGGTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
596402	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596404	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596405	contig_16098_pilon	-	1340	8	Intergenic	novelGene_46131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1595.92812226258	18	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	327	1295	458816	456113	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIQAVRLGPQPANPSSSLTMPTKWRCSKAGPSTLQAPALSHTHSGGEGIIRGSRPLFPVTLATLVTLVRGVVCKC	460453	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456335_456876_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
596421	contig_6227_pilon	-	1416	8	Intergenic	novelGene_49745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	244.401225822772	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	654	1118	1204208	1202920	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1206517	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204210_1204376_1204501_1205857_1206011_1206142
596455	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596462	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596467	contig_14322_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_115681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTGGTGTAAGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671885	671269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
596482	SIRV5	-	349	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10987	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8460_8590_10863
596488	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
596493	SIRV7	-	362	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-19	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114757	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
596501	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
596502	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
596510	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_93695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
596519	contig_14133_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_119981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGAATAACTGTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280010	279447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_279400_280000
596524	contig_6062_pilon	-	2506	10	Intergenic	novelGene_5279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1844	2173	735035	726092	TRUE	50	AAATATATTTCAAATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCTTLISGILLLVDGLIVLTASSSLSTSRSDGSRKNILSSGGDGSSMSSKPRLLSLFMSLLSMSIGISVSVPRLEGSPLKVTSPRQSLGTLDAQRLWQLNLQSLHCIP	749923	715123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_715282_725916_726107_729313_729395_732298_732483_734985_735111_738367_738445_739516_739795_744243_744298_746919_747022_748666
596526	contig_14986_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_59737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	594	1643	151004	152053	FALSE	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150357	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150505_150557
596527	contig_7025_pilon	+	3552	1	Intergenic	novelGene_104399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATGCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86125	89677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_86100_89700
596537	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
596538	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_95828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596546	contig_4305_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_136719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCTTCACGATCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820165	820414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_820200_820400
596554	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596560	SIRV6	+	923	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	542	11	369	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	61	552	1733	10736	TRUE	35	GATGACTATGGGGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1672	11320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
596562	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596564	contig_18869_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_56164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73599	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
596567	contig_4496_pilon	+	2003	5	Intergenic	novelGene_66692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.011428198275	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	214	1983	952477	998163	FALSE	35	TGTAAATAATACTGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	947488	998183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_947546_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
596578	contig_5200_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_140151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATGTAGAGCATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149720	150469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_149700_150500
596580	contig_2332_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_58715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAAAACATACTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813603	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_813600_815400
596592	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	637	970	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTCTTTATATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
596594	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
596607	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596610	SIRV2	+	284	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-47	286	-47	-286	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATACTTATTTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061	1345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
596617	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-2	876	-2	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8313	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
596619	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_96892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596625	contig_9482_pilon	+	2232	14	Intergenic	novelGene_44228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	136.044588931404	2	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	54	1442	212145	230430	TRUE	10	CCTGGCATCTCCTCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVRVLSQLLRGRRLAQMRVQCPAASQTKARCFHFNVDGNKRSSAKVSDSISTQYPVVDHEFDAVVVGAGGAGLRAAFGLSEAGFNTACVTKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMEEDNWRWHFYDTVKGSDWLGDQDAIHYMTEQAPASVVELENYGMPFSRTEDGKIYQRAFGGQSLKFGKGGQAHRCCCVADRTGHSLLHTLYGRSLRYDTSYFVEYFALDLLMENGECRGVIALCIEDGSIHRIRAKNTVVATGGYGRTYFSCTSAHTTTGDGSAMVTRAGLPCQDLEFVQFHPTGIYGAGCLITEGCRGEGGILINSQGERFMERYAPVAKDLASRDVVSRSMTLEIREGRGCGPEKDHVYLQLHHLPPRTAGHAPAGHLGDGHDLCGCGRHQGAHPCAPHSALQHGWHPHQLPGPGSEARERPGPGRAGPVRLRGGCLRLGAWRQPPWGKLTPGPGRLWPGLCPEYRRVLQTRR	212091	236255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216622_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230515_233358_233477_234032_234147_235781
596629	contig_6710_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_93420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653695	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
596630	contig_1867_pilon	-	1761	3	Intergenic	novelGene_54562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1155	1574	448605	448186	FALSE	20	TACATTCCATTTTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449907	447998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448707_448791_449020_449082
596634	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671651	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
596640	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
596662	contig_6888_pilon	+	3174	16	Intergenic	novelGene_147063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	75.9328358192657	40	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	211	1029	33833	56270	TRUE	25	GAAAGATTGCACTTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNITSIAPLLEKLAKTSDVYWVLQDPVYEDLLSENRKMITNEKIDAYNEAAVSILNSSTRNSKSNVKMFSVSKLIAQETIMESLDGLHLPESSRETSAMILMNVYCNKILKPIDGSCCQPRPPLTLMQKLAACFFTLSIIGYLIFYIIHRNAHRKNKPCTDLEGGEEKKNIMNIPVSPLEILLQSFCKLGLIMAYFYMCDRADLFMKENKFYTHSSFFIPIIYILVLGVFYNENTKETKVLNREQTDEWKGWMQLVILIYHISGASTVHLSH	27313	73691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_27361_28380_28448_33314_33360_33781_33906_43521_43737_45982_46406_47403_47494_56252_56289_58955_59076_60099_60257_61662_61743_63995_64098_65627_65769_66328_66407_70369_70463_72335
596663	contig_4202_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_147076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACACCCTTAATCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228233	227799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_227800_228200
596666	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
596674	contig_9886_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_147089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246972	249325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_+_247000_249300
596688	SIRV7	-	350	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
596691	contig_6496_pilon	+	2046	12	Intergenic	novelGene_103484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	77.4670284435112	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	57	1484	452626	467595	FALSE	45	AAATGAAGCGTCTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTELFNYIDENQDRYVKKLAEWVAIQSVSAWPEKRSEIRRMMEVAAADITKLGGSVELVDIGKQKLPDGSEIPLPPVLLGKLGTDPKKKTVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLEERDGKLYGRGSTDDKGPVAGWMNALEAFQKTNQEIPVNVRFCLEGMEESGSEGLDKLIFAQKDTFFKDVDYICISDNYWLGKRKPCVTYGLRGICYFFIEVECSDKDLHSGVYGGSVHEAMTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDVGAKTLLHSCKKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	450255	468157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_450279_452592_452686_453536_453681_455572_455736_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461578_462836_463002_463278_463421_463637_463786_467525
596694	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91673	6	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
596703	contig_19769_pilon	+	1049	5	Intergenic	novelGene_102256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.444799541576	37374	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	36	686	87249	88993	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNVSSSEIEVQGP	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841
596708	contig_14441_pilon	+	735	3	Intergenic	novelGene_100786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	152	700	125667	126705	FALSE	0	GCCTGGCCGTGTGTCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125515	126740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
596723	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
596728	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_16455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
596731	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
596734	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596765	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
596766	contig_5727_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_7951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1114.6101585557	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	354	977	177195	179323	FALSE	15	CTTGATGTAGTTGTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168158	180079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169857_177097_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
596768	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
596783	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGCCAGATCAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
596811	contig_14322_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_116442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
596814	contig_8617_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_73402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62337	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
596855	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
596860	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
596868	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-9	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114747	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114684
596871	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596876	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	21	91654	-11	-91648	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTTCTTGAATTAGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147936	147685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
596879	contig_3233_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_56535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGTGATTACATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728722	729410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_728700_729400
596891	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
596895	contig_5018_pilon	-	1500	7	Intergenic	novelGene_47067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	661.066226300781	9	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	74	940	1402792	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDSQDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402865	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400971_1401957_1402078_1402260_1402363_1402701
596901	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
596906	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596913	contig_3103_pilon	-	3103	1	Intergenic	novelGene_146197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCATCATTCAGTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79490	76387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_76400_79500
596935	contig_10990_pilon	+	2716	1	Intergenic	novelGene_7478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713864	716580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_713900_716600
596936	contig_15039_pilon	-	2073	11	Intergenic	novelGene_110141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	526.644291718803	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	571	1077	202841	187835	TRUE	25	ACCAGAATGCTCCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPCGFSTRYSTAAT	260850	184489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191223_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202857_208397_208526_222093_222255_244329_244524_260778
596937	contig_14322_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_116359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671624	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
596941	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2118_2157_2270_2316_3298
596944	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
596947	contig_15063_pilon	+	1761	5	Intergenic	novelGene_13029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2445.80000971052	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	444	1622	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	30073	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35836_36158_36266
596954	contig_11259_pilon	-	1781	6	Intergenic	novelGene_144525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	101.963522889316	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	130	489	147832	131887	FALSE	25	TTCAGACTCATGGCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLAVVIMGVVLQGANLYGYIRCKVGSRKNLTSMATSYLGKQFLRQNAGDDQTS	159059	130594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_144321_144454_147760_147851_155716_155800_159031
596965	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
596967	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657167	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657168	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
596970	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
596987	contig_5988_pilon	-	1498	3	Intergenic	novelGene_15930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1070.5	4	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	95	1324	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIGKLNSGALADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655553	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653526_653773_655456
596990	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
597000	contig_9436_pilon	-	2743	13	Intergenic	novelGene_60929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	101.733413881576	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	12	1097	458965	445349	TRUE	20	CAATTTATCAGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEVRAKHRGSTPLLSSQIFRTMCKSKSFGVLPT	458976	441230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442658_443880_444071_444807_445087_445310_445435_446347_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
597003	contig_19769_pilon	+	839	6	Intergenic	novelGene_102281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	241.073432795901	8	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	32	805	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
597014	contig_6102_pilon	-	1556	9	Intergenic	novelGene_32162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	299	781	867239	839973	TRUE	40	TGGAAAAGAAAGTGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867537	838887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839612_839921_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
597034	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597041	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597053	contig_15354_pilon	+	3492	10	Intergenic	novelGene_65737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	96.2958404547616	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	105	1520	591728	607044	TRUE	20	TCTTTTATACTGCATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTEPPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQVIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVLNGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRECVRVPRGGIPPRAHSRDSSDSADGRATPSENLVPSSARVDKPPSVLPYFNRPPSALPLMGLPPPPIPPPPPLSSSFGVPPPPPGIHYQHLMPPPPRLPPHLAVPPPGAIPPALHLNPAFFPPPNASVGPPPDTYMKASAPYNHHGSRDSGPPPSTVSEAEFEEIMKRNRAISSSAISKAVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIKQSRVANDERCRVLISSLKDCLHGIEAKSYSVGASGSSSRKRHRSRERSPSRSRESSRRHRDLLHNEDRHDDYFQERNREHERHRDRERDRHH	591002	613448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_591056_591676_591782_598174_598394_599232_599337_599700_599874_602548_602964_603669_603789_606055_606225_606881_607050_611481
597063	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
597067	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-411	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGGTTGTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4336_4480_4687_4801_5788
597073	contig_15063_pilon	+	1459	4	Intergenic	novelGene_13908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	198	1028	34808	36333	FALSE	55	ATGTTTATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTIGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34610	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36144_36266
597077	contig_10437_pilon	-	2289	16	Intergenic	novelGene_38406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	334.875831051186	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	435	2081	786446	774056	FALSE	30	AAATTTGGGATGATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESAD	792998	773847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779203_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428_786576_788620_788732_789486_789628_792945
597087	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_18262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597091	contig_15063_pilon	-	1134	3	Intergenic	novelGene_14371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	FALSE	30	GGATGTACACACTCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	35079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36156_36264
597093	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
597111	contig_10523_pilon	-	2127	9	Intergenic	novelGene_120940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.934486766682	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	368	1351	39240	15001	TRUE	65	GAAAGACAAAAGAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	43305	13020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13144_14347_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_42952
597118	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597148	contig_14666_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_39504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGTCTTGTTTTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319894	320799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_319900_320800
597149	contig_14666_pilon	+	2140	3	Intergenic	novelGene_39505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2982	junction_1	538.5	1841	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTGACTCTTGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320850	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_322434_322677_322746_323028
597154	contig_14322_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_116598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCGCGGCGGCCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
597156	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
597158	contig_11171_pilon	+	1275	7	Intergenic	novelGene_48588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	466.229438033345	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	116	859	212165	251467	TRUE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFQEQKRKEGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212049	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407_251622_251690
597159	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
597172	contig_9505_pilon	+	1668	15	Intergenic	novelGene_121822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	40.1027379593555	27	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	94	1503	404142	447348	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVTGQFPWSSLRETDRGLSAEYSFPVWKTSHTVKWEGVWRELGCLARTASFAVRKESGHSLKSSLSHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404048	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419604_422552_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
597178	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
597197	contig_8978_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_49473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	690	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695229	1693061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1693100_1695200
597205	contig_500_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_30953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_9	348.560850737237	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	245	1234	1452302	1480644	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITP	1446829	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1447805_1447909_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1480637
597224	SIRV7	-	169	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76969	2	43750	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
597227	SIRV4	+	336	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	632	980	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
597231	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
597270	contig_16098_pilon	-	1252	7	Intergenic	novelGene_45998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1211	junction_1	1235.11605392638	12	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	152	748	350353	349122	TRUE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKVMLPCPFLALGWALAS	350595	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512
597274	SIRV6	+	762	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-51	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	20	TCGTCATTGTATATGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029
597276	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	643	966	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
597287	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
597291	contig_6102_pilon	-	2230	5	Intergenic	novelGene_32368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	151.497524732254	95	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1511	2017	1715667	1715078	FALSE	15	GACCCGTATTCTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAESLSFSFGTLSSWELEAWYEDLQEVLSSDESGGTHVSPPANEKEESKTFTTLDPACLAWLTEEPGPAEVTSSSQSPQSPDSSRSSLAQEEEEEDQRRPRKRKQSGQSQARAGKQRLKEKEQENERKVAQLAEENERLKQEIERLTREVEATRRALIDRMVNLHQA	1719037	1714864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1715447_1715529_1715688_1716395_1716444_1717438_1718785_1718941
597305	contig_6496_pilon	+	2001	9	Intergenic	novelGene_103492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_3	72.0979151917724	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	423	1430	457478	467595	FALSE	20	GTCTGAAGGAAGGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALEAFQKTNQEIPVNVRFCLEGMEESGSEGLDKLIFAQKDTFFKDVDYICISDNYWLGKRKPCVTYGLRGICYFFIEVECSDKDLHSGVYGGSVHEAMTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDVGAKTLLHSCKKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	455366	468166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_455736_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461578_462836_463002_463278_463421_463637_463786_467525
597306	contig_5445_pilon	+	1535	3	Intergenic	novelGene_135417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1483	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51685	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_52635_53127_53244_53448
597317	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597318	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
597338	contig_10479_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_147094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAGTGTGTTCTGGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17235	20190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_17200_20200
597339	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597346	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
597349	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
597366	contig_10861_pilon	-	1997	4	Intergenic	novelGene_39363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3034	junction_1	749.130310575018	68	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	19	420	1585418	1582703	FALSE	15	TGTACATTACTGTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVV	1585436	1581125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1582841_1583241_1583349_1584525_1584677_1585412
597373	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597380	contig_4845_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_53625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAATGGAGATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221512	223414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_221500_223400
597383	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597384	SIRV5	-	394	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACGAATTTACGGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
597388	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
597395	contig_6102_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_32365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTATTCTTTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716844	1714862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1714900_1716800
597397	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597403	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
597410	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
597419	contig_5690_pilon	+	1603	11	Intergenic	novelGene_119731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	481.136997122441	14	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	48	1121	1044729	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077713_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
597428	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_96202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
597431	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597432	SIRV5	+	406	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2126_2157_2270_2316_3298_3405_3483
597436	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597438	contig_5690_pilon	+	1470	10	Intergenic	novelGene_119737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	500.133315560295	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	44	988	1044729	1105483	FALSE	30	AGAGAAATTTCACGTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVGILHRVEED	1044685	1105965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095303_1105450
597453	contig_10968_pilon	+	1265	9	Intergenic	novelGene_84298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	260.906802086492	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	580	969	172393	177921	FALSE	10	ATTGTGTGCATGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166052	178217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_171657_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
597455	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597479	contig_14322_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_116495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
597482	SIRV4	+	315	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	658	975	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATAAGTCAATAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
597483	contig_11752_pilon	+	1213	6	Intergenic	novelGene_37568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_3	1161.53061087515	157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	113	1072	84194	94417	FALSE	15	AGTTCTTGACTGTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84081	94558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223
597487	SIRV4	+	950	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	255463	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
597493	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
597504	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671651	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
597505	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_97054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597515	contig_3745_pilon	+	2051	5	Intergenic	novelGene_85079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	136.911239494791	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	90	485	364282	370795	TRUE	20	TAAACTTATTTTCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRTLPSTWIENKLYGMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364192	372818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369328_370637_370912_371191_371378_371554
597522	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
597543	contig_13481_pilon	-	1704	3	Intergenic	novelGene_119390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1260	junction_2	5	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	30	323	536852	527468	FALSE	50	AAAAAAATCATCCAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536881	526086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527531_536157_536304_536767
597548	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597558	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_90541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653837	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
597567	contig_4429_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_50826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCGTTCCCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234971	236980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_235000_237000
597580	contig_3424_pilon	+	2118	4	Intergenic	novelGene_55474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	301	1878	169101	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149875	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168744_169078
597584	contig_9807_pilon	+	1732	8	Intergenic	novelGene_32917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	487.128277955277	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	191	925	147193	156903	TRUE	35	TAAACCACGTGTGGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQGDSVPRLSLPRQGSWAPSIPLSFCTVVLVEAGLPLLSGQHQVLC	140926	159003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_157384_158676
597592	contig_2027_pilon	-	2545	8	Intergenic	novelGene_39949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1983	2309	641291	639847	TRUE	5	TCTTGCCTCCTCGCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVGAHVDTDCWHLGGTMLMELIATGLAAEAMEQKLKTEVTERQAEECLPYKIVHGQWDIFKDLDNELLTIQGGNGSVPGSDRLSPLDESVDHAAVLIETPHLKGLV	645028	638054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_638099_639489_639644_639808_639913_640831_640937_641024_641180_641290_641387_642948_643101_643293
597613	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	31	384	14409	13833	FALSE	20	GTACCACAGTGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSC	14439	13830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
597614	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597619	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
597623	SIRV5	-	288	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTACCTTAGAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10864
597624	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597628	SIRV7	-	238	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69046	2	35827	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78911	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
597629	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
597638	contig_15045_pilon	-	2511	4	Intergenic	novelGene_130063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.220836791512	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	139	576	166837	157727	FALSE	35	TGCACTTAATTTTTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNAVVILAFVVDKKLRHRSNYFLLNLAISDFFVGVISIPLYIPYTLYNWDLGDKLCTFWLIIDYLLCTASVYNIVLISYDRYQLVLNAVSYRAKQTEILKIVALMVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKEYVYVLEPMEAG	166975	155791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157762_157853_157987_164354_164519_166731
597645	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597654	contig_15304_pilon	-	914	3	Intergenic	novelGene_30500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1714.5	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	198	737	54100	53061	FALSE	20	AAGCAGCCCTGCTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54297	52883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53300_53620_53813_53991
597655	contig_12393_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_147120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23287	21600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12393_pilon_-_21600_23300
597659	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
597660	contig_3155_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_26345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCCAGATCTACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141466	140816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_140800_141500
597661	contig_6885_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_83666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGGCAGTTGTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198748	201641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_198700_201600
597671	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
597674	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	632	1112	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
597676	contig_5988_pilon	-	1987	16	Intergenic	novelGene_16054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.6805491326409	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	221	1540	1050018	1042451	FALSE	35	AGCACTGAGTTCCAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLKDMRDEVLEHELTVADRRQKREIRQLEQELHKWQVLVDSITGMSSPDFDNQTLAVLRGRMVRYLMRSREITLGRATKDNQIDVDLSLEGPAWKISRKQGVIKLKNNGDFFIANEGRRPIYIDGRPVLCGSKWRLSNNSVVEAPNLS	1052645	1042003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042469_1042547_1042676_1042844_1042933_1043068_1043152_1043345_1043439_1043557_1043587_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1051477_1051541_1052598
597695	contig_15063_pilon	+	1435	4	Intergenic	novelGene_14196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	118	1293	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34690	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
597697	contig_7457_pilon	+	2512	6	Intergenic	novelGene_31660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_1	205.583073233182	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	992	1624	1036606	1040226	FALSE	10	TACTGGTGTCTCATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1035614	1041114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
597699	contig_15063_pilon	-	1731	7	Intergenic	novelGene_11451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	984	1310	35891	35108	TRUE	25	AGCTGAGGTAGTCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39768	27138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35836_36155_36264_36597_38972_39081_39488
597700	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597701	contig_1274_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_137771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33540	36028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_33500_36000
597717	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
597722	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
597739	contig_500_pilon	+	1293	9	Intergenic	novelGene_31011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1105.02621575237	12	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	201	878	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSRECLPGCGGRWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492755_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
597746	contig_10377_pilon	-	2996	6	Intergenic	novelGene_115345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	28.7986110776197	49	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	403	2673	131197	113448	FALSE	15	TATTTGGTTTATGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFPSTSRRWSKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDIAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSQNFIDGEKLSSEHIMMRLTKDNTWSSVLGNIFKSHGSKNEPKIQGKLLRSVTVENLCESNDGNQYLTSFSQIPNLTGLKKNLAAVNAFECCECGKTFMDLSSHNHHTGSHTGCNTCQCKECGEACSCPSQLTTPMRTLNGKNPQNCKVCGKVFICISNLKNPVTTLTGEKYYKCNECGKDFFSFSSFWTHERGHKCECKERCKTDSLSCLILHKFLNTDKPYVCKECGKAFRCSSNLTKHTVTHSGERAYECKECGKDFRHASSLTTHIRTHSGEKPYVCRECGKAFSCSSHLTSHIKTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHIRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSVLTTHKRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDLTTHKRTHSGERPYECKECGKTFSQSSHLTTHIKTHNGQRPYECQECGKAFSWPSDLTTHVRTHSGVRPYECKECGKAFSQASSLTTHLRTHSGVRPYNCKECGKAFSQASSLTTHMRTHSGVRPYSCKECGKSFRCSSHLSNHTRTHSGERPYECKECGKAFSDFSAFTKHIRIHSGEKPYECKECGKTFSQASNLTSHTRTHSGARPYKCKECGKAFSDSSSLTSHMRTHSGERPYECKECGKTFSRSSHLISHRRIHSGERPYECKRCGKAFSQASALTTHIRTHSGERPYECKQCGKAFSQASALTTHKRTHSGETTL	133776	113124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_115399_118831_118983_119952_120080_131155_131395_131539_131576_133607
597748	contig_5063_pilon	+	882	5	Intergenic	novelGene_109995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	20	TATAATTTCTCTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
597765	contig_4659_pilon	+	2607	11	Intergenic	novelGene_118197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	62.7637634308205	2	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	717	1424	199577	208048	FALSE	5	TCTGAGTCTTGTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKQYKSQFEAQNIWYEHRLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	186954	209231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187105_188123_188199_191710_191849_195021_195210_195271_195314_198152_198259_199559_199738_201057_201210_204160_204302_205905_206069_207957
597768	contig_6710_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_95804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653699	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
597771	SIRV7	-	344	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	0	6	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
597783	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
597816	contig_7356_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_60398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454192	452093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_452100_454200
597824	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597829	contig_5643_pilon	+	861	7	Intergenic	novelGene_38881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5483	junction_6	1546.62468513427	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	31	651	236700	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236669	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
597840	contig_500_pilon	+	1371	10	Intergenic	novelGene_30968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	604.3444157428	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	269	1090	1454573	1480676	FALSE	55	AAATAAAAATACTGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISQVKENGCERTTFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAADRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446856	1480957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454613_1461451_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469165_1469324_1477837_1477929_1480637
597844	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597850	contig_19402_pilon	+	1347	2	Intergenic	novelGene_80748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	10	453	23458	29340	FALSE	40	TGAAACATGATTCACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNIMTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSRF	23448	30234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23889_29327
597865	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
597869	SIRV4	+	365	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	921	-30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTAACATAAGTCAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2376	2741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
597871	contig_17198_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_62355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCACTCGTACCTAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709779	711979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_709800_712000
597872	contig_9199_pilon	+	2825	11	Intergenic	novelGene_65611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	95.0202609973262	1	142	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	603	1208	54541	57407	FALSE	10	CCCGCGGACTGCAGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42460	59024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54444_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304
597876	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_11760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	229	681	34808	35836	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSV	27140	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35371_35834_36158_36266
597887	contig_9720_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_116784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	614.5	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	113	517	391741	392457	TRUE	20	CAATGCCTGCATTCTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391628	393995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392089_392400_392479_393340
597889	SIRV7	-	366	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-23	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114761	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
597903	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
597911	contig_7733_pilon	+	2063	7	Intergenic	novelGene_147138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.1824903526199	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	415	717	100960	107305	FALSE	70	AAAACCAACAAATCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	88553	108651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_88661_91178_91225_92135_92193_93204_93373_100923_101033_106056_106176_107194
597912	contig_10753_pilon	+	3008	1	Intergenic	novelGene_105148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	2693	3007	356296	356610	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTENVLHKYLLSERMHDCWARKRLGSVALAQSYAFSPEPWEWVGREGGCCEHTLLVHLQGDAGTERKDPPIYHCLTLHIHGQGSSCIKKYHLQITAVLFTTAK	353603	356611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_353600_356600
597913	contig_5549_pilon	-	2539	4	Intergenic	novelGene_81655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_3	218.721029827698	32	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTGTTTTTGAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445621	442009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_443683_443958_444755_444949_445003_445604
597917	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGTCAACCGCCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
597918	contig_7051_pilon	+	2001	7	Intergenic	novelGene_64373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	26.2196914974647	153	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	142	1161	365021	384724	FALSE	25	TGTTGGACAGTTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARSANSENNLSWILQIKPWVSTEYRTMKLQSYRMTFASMNKMKSYRYPVTRPYSTSQTTVDSNEVKTFRALAHKWWDEQGAYAPLHSMNDLRVPFIRDNLLKTVADHQPGKPLSGMKILDVGCGGGLLTEPLGRLGASVIGIDPVDENIKTAQHHKSFDPVLAKRIEYRACSLEEIVEETVETFDAIVASEVVEHVVDLETFIQCCCRVLKPGGSLFITTINKTQLSYALGIIFAEQIAGLVPKGTHTWEKFVSPEKLESILESNGLSVQTVTGMLYNPFSGFWHWSENTSLNYAAHAVKSKVEEPPAPAEPVLNEETEELRANISANPGVHEELKK	364879	385564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_365037_368164_368292_371433_371587_374005_374106_376003_376247_378973_379134_384503
597922	contig_8729_pilon	+	1648	3	Intergenic	novelGene_40075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	177	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTGACGCATGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69484	73531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_70630_71386_71638_73279
597924	contig_3077_pilon	+	1581	10	Intergenic	novelGene_26647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3648.12341409175	5	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	420	1004	13867	17511	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKEIPEEQAAGRCHGVGPGLG	9609	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17040_17455
597928	contig_7196_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_147159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGATGGTAATTAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3234	2630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7196_pilon_-_2600_3200
597931	contig_3602_pilon	+	937	3	Intergenic	novelGene_60517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1010	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	425	784	169723	170976	FALSE	10	TGACTTGGCTCCACCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPPHPPVPSGEPLPPPPARGGLSSLFVCFLSFVILFWVLGRLPALSWDLLGRDTALAQAEEHALCYCMPRQPVNPYAKPSNLAFPGTCPALRIFSSTLRHPASKGGEGWAIVGDPAKS	169157	171129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_169282_169422_169972_170865
597934	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597938	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
597945	contig_5013_pilon	-	1476	4	Intergenic	novelGene_110083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_2	351.015036081869	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	34	354	216357	174688	FALSE	15	ATGATTTTTCTACTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPARDLQKKLAMALRPGEYFWPAFGLRLLLMTMFQAVSAFGAEFSSEACRELGFSSNLLCSSCDLLGQFSLLQLDPDCRGCCQEEAQFETKKLSSGVINPNYSEDYKSSMFVVQTLY	216390	173565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_205757_205926_216282
597954	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597957	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597964	SIRV5	+	462	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	878	-21	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
597968	contig_11630_pilon	+	2295	5	Intergenic	novelGene_147165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_1	167.201039171412	232	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGAATGAATGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77614	146265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_97081_97254_131895_132058_144489
597971	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27916	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
597974	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	13	354	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14421	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
597979	contig_12427_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_40484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTCTTTTTTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320597	318675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_318700_320600
597981	contig_6102_pilon	+	1922	12	Intergenic	novelGene_32271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	46.5053093920779	30	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	61	1575	1444370	1449029	FALSE	20	CCACCCTGAGTATCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444309	1449376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
597990	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
597994	contig_12270_pilon	+	381	2	Intergenic	novelGene_113182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	13836	14364	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13835	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
598006	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598013	contig_8452_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_48060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGCCAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460638	461432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_460600_461400
598020	contig_848_pilon	+	1961	8	Intergenic	novelGene_83349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_6	48.8751011273029	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	203	1381	783225	792105	FALSE	35	AAAAAAATCGTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSTANVEFCLDVFKELNSNNIGDNIFFSPLSLLYALSMILLGARRNSAEQMEKVLHFNHVVESLKPGFKDSSKCSQAGRIHSELGALLSQIKQPDSNYTLSIANRLYGTKLMAFHQQYLTCSEKLYQAQLKTVDFEHSPEETRKTINAWVESKTNGKVTNLFGKGTIDPSSVMVLVNVIYFKGQWQNKFQEGETSKTPFQLGEGKSVTVDMMYQTGIFKLAFIKKPRIQVLELPFVNNRLSMIILLPVGKAKLEQIEKELNLKTFQEWTSSSNMMEKEVEVYIPRFKLEIKYELNSLLKSLGMTDIFDQTKADLSRMSPAKNLYLSKVIHKSYVDVNEEGTEAAAATGNIVVVKNVPMRAQFMANRPFLFFIKHTRTNMILFFGKLASP	739904	792685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_740088_783205_783393_784636_784697_785878_786008_787957_788076_789566_789710_790763_790920_791700
598022	contig_8330_pilon	-	2285	11	Intergenic	novelGene_71744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	35.861399861132	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1035	2177	526197	515388	FALSE	10	TCAGCTCTCTGCTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSDWHLAVKLADQPLAPKSILRLPETELGEYSLGGYSISFLKQLIAGKLQESVPDPELIDLIYCGRKLKDDQTLDFYGIQPGSTVHVLRKSWPEPDQKPEPVDKVAAMREFRVLHTALHSSSSYREAVFKMLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGVLQDKDLFSVFADPNMLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	527579	515279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520379_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_526574
598038	contig_854_pilon	+	1850	8	Intergenic	novelGene_36116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	193.039384793965	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	117	980	286420	306557	FALSE	5	GCCTCTTCTTGGTCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQRRPREQVEAGGWRAAWLSLGVRNTSPLAAPPSLPLMPASLWLLPGPPPEQPPSLAVWNFGADAAPAPPGPGWSPPHPPVHGASVPETFVFTDSSDEGLQERLGRHLVVTNCSAEHSHPALSCKMAAEFDAFLASGLRWFCHVDDDNYVNPRALLQLLATFAPARDVYVGRPSLNRPIHASEPQPRNHTRLVQFWFATGGAGFCINRKLALKMVPWASGPRFVDTSTLIRLPDDCTVGYIIECKLGGRLQPSPLFHSHLETLQLLGAAQLPEQVTLSYGVFEGKLNVIKLQGPFSPEEDPSRFRSLHCLLFPDTPWCPQLVAR	286303	307427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_286573_295356_295406_295734_295838_296314_296469_299517_299604_302162_302329_304379_304466_306490
598048	contig_15063_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_13538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
598049	contig_6958_pilon	-	2161	6	Intergenic	novelGene_69940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	550.592916772455	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	86	1138	189959	149618	FALSE	20	CTTTTGTAAACGGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190044	148594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698_189823_189956
598070	contig_7202_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_17988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCTCATGCAGGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
598076	contig_5988_pilon	+	1568	4	Intergenic	novelGene_16017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_3	73.1452132557027	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	101	1450	779480	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779379	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838
598104	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	632	970	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
598105	contig_15613_pilon	+	2426	2	Intergenic	novelGene_147186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30672	39987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_32046_38934
598111	contig_11338_pilon	-	1519	11	Intergenic	novelGene_6224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_10	80.7468265630297	699	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	102	1385	17283	12549	FALSE	20	AACCTGACTCCCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21383	12414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
598114	contig_12414_pilon	+	1283	3	Intergenic	novelGene_59569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	184	747	373093	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISTDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370811	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373106_373503
598116	contig_9807_pilon	+	2336	1	Intergenic	novelGene_32928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	449	754	157878	158183	NA	15	TCTTCGTTGTGGATCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPRISTHLPPPVGLLASGCGLCWGLGTESGQMSCSLRALARVQLGARGREAEREQGPPPSWEAPKGAGHRGKSKCTGSVSVVCWNCEWSPRCSPHRGKC	157429	159765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_157400_159800
598117	contig_10319_pilon	+	2659	2	Intergenic	novelGene_147234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCCTCCTCCACCTCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31749	36399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_33626_35616
598121	SIRV6	+	338	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10487	1	1250	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11487	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
598122	contig_3095_pilon	+	1076	5	Intergenic	novelGene_75021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	196	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	103	672	147280	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149805_149896_150413_150696_150996_151163_151848
598134	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
598142	contig_990_pilon	-	2225	5	Intergenic	novelGene_76114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	67	junction_4	117.854518369047	590	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGTGTAAAGTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605894	1585408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605756
598160	contig_15449_pilon	+	1383	4	Intergenic	novelGene_33623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	964.303317887525	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	146	568	84815	89082	FALSE	15	GAGCTGATGGTTGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVDVAQFPHCEGSIRKLNCKSSLLSLCYTYALPKFC	62208	89897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000_86178_88974
598164	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_18413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598168	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
598169	contig_18364_pilon	+	1926	2	Intergenic	novelGene_102572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCAAACCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128420	131321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_130233_131207
598172	contig_2168_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_147264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGTTACACAAGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247906	248653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_+_247900_248700
598173	contig_15459_pilon	-	1706	6	Intergenic	novelGene_106375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	134.05909144851	505	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	98	817	20238	16392	FALSE	30	CTTTGGCTGGAAACAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSALRAHVETAQKTGVFQLKDRGLTEFPSELQKLTSNLRTIDLSNNKIESLPPMLIGKFTLLKSLSLNNNKLTVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQISQISVKISCCPRLKVLRLEENCLELSMLPQSILSDSQICLLAVEGNLFEIKKLRELEGYDKYMERFTATKKKFA	20585	15502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_19068_19338_19909_20049_20154_20261_20510
598176	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
598180	contig_12485_pilon	-	2638	4	Intergenic	novelGene_147274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	41.2337510083939	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	24	719	129265	60767	FALSE	5	CGGTCTCCTGTTTGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPATPPRPVTHLLFDMDGLLLDTERLYSMVFQEICDRYGKKYSWDVKSLVMGKKALDAAEIIIQVLQLPMSKEELVEESQMKLRQVFSQASLLPGVEKLIHHLRKHDIPCAVATSSGTASFEEKTSQHKEFFSLFHHVVLGDDPEVRSGKPSPDIFLACAKRFSPTPPLDKCLVFEDAPNGVEAALAAGMQVVMVPDANLNRDLTRNATMLLSSLQDFQPELFGLPPYE	129288	58847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_60944_76718_76949_91598_91818_129195
598186	contig_9937_pilon	+	2474	11	Intergenic	novelGene_129206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	778.619939379926	624	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	285	1388	145949	177905	FALSE	55	TAAATAAAATTTAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPQVVVAPVLMSKLSVNAPEFYPSGYSSNYTESYEDGCEDYPTLSEYVQDFLNHLTEQPGSFETEIEQFADTLNGWVTTDDALQDLVELIYQQATSIPNFSYMGARLCNYLSHHLTINPQSGNFRQLLLKRCQTEYEAKDQAAKGDEATRKRFHAFVLFLGELYLNLEIKGTNGQVTRADILQLGLRELLNALFSNPVDDNLICAVKLLKLTGSVLEDAWKEKGKTDMEEIIQRIENVVLDANCSRDVKQMLLKLVELRSSNWGRVHATSTYREATPENDPNYFMNEPTFYTSDGVPFTAADPDYQEKYQELLEREDFFPDYEENGTDLSGAGDPYLDDIDDEMDPEIEEAYEKFCLESERKRKQ	144353	178991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_144567_145877_146048_155159_155346_158849_158963_162842_162955_164231_164358_167964_168072_168570_168689_169460_169516_175554_175649_177811
598188	contig_9797_pilon	+	1456	5	Intergenic	novelGene_65590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	464.857168923961	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	292	675	188724	191368	FALSE	5	TGGAGTTCTGCGTTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172542	192149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_175069_175188_188577_188734_189277_189422_191138
598191	contig_5485_pilon	-	2090	4	Intergenic	novelGene_37680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	3	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	138	1280	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88072	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
598197	contig_14522_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_147339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTAAGCATACTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168876	170433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_168900_170400
598198	contig_14522_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_147340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTACCACCAGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171426	173564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_171400_173600
598199	contig_854_pilon	+	1299	8	Intergenic	novelGene_36238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2969.37535518836	4	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	170	418	556108	562280	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLSPAGALQALHTPGAHRETPRLAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTCRPSPIRRAWRWPRRLTR	543488	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543561_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557627_557702_557752_562271_562405_563029
598207	contig_12479_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_56839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAGCTGTTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140519	138950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_139000_140500
598213	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
598223	contig_5201_pilon	+	2760	5	Intergenic	novelGene_82172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	99	junction_1	26.8828476914184	207	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	96	458	250608	268923	FALSE	85	TACAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEVEGRRPSQASARPIHFACQLPPPAPRATMAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHNRSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPILDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKGTLI	250512	271225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_250657_250797_250857_251002_251033_251196_251257_268758
598241	contig_20614_pilon	-	1286	4	Intergenic	novelGene_107588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	331.71708159548	44	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCAGTGTGGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302081	292137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292539_292713_293369_295570_295693_301973
598245	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_18540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
598251	contig_5033_pilon	-	2107	16	Intergenic	novelGene_29063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3570.95613464455	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	29	1603	566787	532125	TRUE	35	TTGTCAGTCAACATCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	531104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531157_531618_532064_532117_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
598279	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
598282	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10507	4	1270	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11507	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
598295	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
598313	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598314	contig_15498_pilon	+	1855	5	Intergenic	novelGene_42649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	204.181904193295	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	32	607	682266	686124	FALSE	30	CAGAATGCACATGTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKAAFLLQSWRAAP	682234	687372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_686085
598315	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
598316	contig_19342_pilon	+	823	2	Intergenic	novelGene_41129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAATCTGAGAGAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5088	6733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5350_6171
598327	contig_9633_pilon	+	1543	4	Intergenic	novelGene_139585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	34.9380403953437	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	71	544	7299	131868	FALSE	15	GATCTGTGTGTTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCFDAKINFDDNAEFRQKDIFAMDDKSENEPIENEAAKYDLKYIGLDGNIACFVNGAGLAMATCDIISLNGGKPANFLDLGGGVKEAQVYQAFKLLTADPKVEAILVNIFGGIVNCAIIANGIIKACRELELKVPLVVRLEGTNVHEAQNLLNNSGLPITSAIDLEDAARKAVASVAKK	7228	132867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_7393_9721_9865_107131_107253_131752
598330	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
598331	contig_10658_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_130071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCCCATTTTAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170887	170388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_170400_170900
598334	contig_8978_pilon	-	1357	8	Intergenic	novelGene_49341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	885.620847605952	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	143	1057	193675	190773	FALSE	35	GAATAAGAATGTCTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194109	190472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193731_194022
598343	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
598375	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
598377	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598416	contig_6710_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_90850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
598418	contig_14322_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_116213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	54	248	301	671606	671659	NA	10	GCTGTGGGGAGATGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQC	671358	671660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
598431	contig_2100_pilon	+	1392	10	Intergenic	novelGene_50693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCCTAGCCACCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1185523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170178_1174204_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1180284_1180561_1180721_1182728_1182824_1185422
598432	contig_11493_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_143677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	880	1308	164857	164429	NA	70	AGAAAAAAAAAAAATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSVTEQACCGLLSAGFLLSLSAGAPQVRSGTAWLYPLLLSLSVAFLGQVWCLMLAGPAFNQQLWDNSRLVPRLGQHYNSSQGKTFTGNPCIVCAQASSGLLSALSGYRSLHSQGVCHCERQASSTPTCLLCSVIHLHGWN	165736	163134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_163100_165700
598434	contig_17171_pilon	-	1576	4	Intergenic	novelGene_147369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.6761895045715	48	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGGGTTGTGACATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269399	264891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_265471_265621_266527_268720_268752_269338
598447	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_16594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
598452	contig_8631_pilon	+	3041	1	Intergenic	novelGene_121978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814835	817876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_814800_817900
598461	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
598465	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91669	2	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
598485	contig_1225_pilon	+	1535	4	Intergenic	novelGene_44166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	196	513	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250618	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274722_276086
598488	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
598496	contig_10904_pilon	-	1441	7	Intergenic	novelGene_22751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	327.466240838485	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	161	1123	662171	652272	FALSE	15	TCTCTACTGTTGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSDFPGAIMTLLRSHAQREKQLIPPVYQNTSQTSRVPQTPKITQ	662420	651953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_659254_659305_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310
598501	contig_20614_pilon	-	1384	4	Intergenic	novelGene_107589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.71708159548	1263	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCAGTGTGGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302081	292137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292326_292402_293369_295570_295693_301973
598505	contig_1406_pilon	+	1017	3	Intergenic	novelGene_25557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTTAAAATAAAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2136698	2141118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2137461_2139855_2139950_2140957
598529	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
598533	contig_10813_pilon	+	1777	10	Intergenic	novelGene_87017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	59.7626994613997	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	106	1206	55960	85000	FALSE	30	TCTCAGTATTGAAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKLSWTYREVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55854	85571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_63303_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
598537	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
598542	contig_5988_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_15852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATCAGATTTGTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247878	246655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_246700_247900
598543	contig_5690_pilon	+	1380	9	Intergenic	novelGene_119720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	486.296141769601	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	49	891	1044729	1105483	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDRLCPFILGIVGILHRVEED	1044680	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077721_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1103602_1103632_1105450
598545	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
598555	SIRV4	-	496	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGATCCTTAAATTAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2318	1461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
598563	contig_7979_pilon	+	948	4	Intergenic	novelGene_125546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	43	318	1077470	1078319	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VERTQGIGYGKKECMGTAIRVTKQSMYKFFYGKKENCQPLMKNIKGIYFQINFNSSCSFLVYCVVVMKHTSSCNSVYFLLSSVTSSPACIFLYKSSSVSSNSFCI	1077427	1081158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1077742_1078315_1078484_1080366_1080441_1080766
598570	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
598575	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTGGCTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	73353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
598585	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_116183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
598588	contig_12644_pilon	+	671	4	Intergenic	novelGene_44693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4495	junction_3	4472.19232840251	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	166	597	2679886	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2679506	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
598590	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598595	contig_18869_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_56190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAGCAAATCAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73700
598600	contig_11285_pilon	+	1654	12	Intergenic	novelGene_5598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	580.969110571308	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	35	1213	766060	769760	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAERLQPRKLWGSCVLSYRVTMNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPCSDYPGHLLYR	763523	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767527_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768709_769726
598606	contig_14513_pilon	-	1023	2	Intergenic	novelGene_70267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	187	477	18880	11833	FALSE	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11979_18735
598616	contig_9727_pilon	+	2583	4	Intergenic	novelGene_86302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	40.2685430026411	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	91	879	275239	277981	FALSE	10	ATGGCGTGGTCTTCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEVLASIIIIVFRPRAEQPTPETQHCPEFCFLSLSHLGPRDTLKPLEKLARFPVGGAREAEDVGEFLGQRAQLPLLPFPWQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGMARTPAPSAGSSAGSVPEAPNSSPSTPATSSPAGAPSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNNMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS	275148	279685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_275572_275748_275865_276091_276279_277828
598622	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
598626	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1547	632	1092	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
598633	SIRV4	+	182	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1589	632	1134	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
598638	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1043	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
598646	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598652	contig_3380_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_60131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGGTAGGTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502395	501032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_501000_502400
598654	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
598658	SIRV6	+	231	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	51	501	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
598665	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598666	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
598675	contig_9981_pilon	-	2830	3	Intergenic	novelGene_121038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	16	62	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	268	669	182344	172636	FALSE	25	CTGGCAGGTGTACAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKPNLSTWRQRSHVEEHISDSTWHNAGLTCSCGRAGPGGGAHSRVTSTVFKCLCHEDPAEDHLPTSFSKCSPQATSGRIMRWEWGLLKMLILSPLYSYPRISGRTMVKHSAANQKVSSLNSLATRGRKDLAI	198544	170474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_172973_182279_182417_198349
598687	contig_11978_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_63100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGCATAAAGACTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831965	1829876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1829900_1832000
598688	contig_9290_pilon	-	1848	12	Intergenic	novelGene_77548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	345.289147007725	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	55	1512	496936	478940	FALSE	30	CTAGAGTTATCTTTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	496990	478603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
598700	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
598704	contig_6710_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_96191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
598708	contig_4364_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_3273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTCCTAAGGCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
598713	contig_15691_pilon	-	1662	14	Intergenic	novelGene_60762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_13	568.179903170522	29	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	380	1504	69449	27919	FALSE	20	CCCTCCTCTTGTACAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKNKKEKESPKAGKSGKSSKEGQDSDQEIASRKNSLVAIQSATSNKIKVSVPQPIVKKDKRQNSTRFNTSNNRELQKLPSLKDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRVT	187694	27760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_148364_148528_186770_186834_187672
598724	contig_8520_pilon	-	1144	4	Intergenic	novelGene_85440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	38.3086877294897	348	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	387839	215717	FALSE	25	CTGGGGTCTGTAATTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLVSGHLDSWDVGQGAMDDGGGAFISWEALSLIKDLGLRPKRTLRLVLWTAEEQGGIGAFQYYQLHKANISNYSLVMESDLGTFLPSGLQFTGSDKARAIMEEVMRLLQPINITQVFRNAEGTDINYWIQAGVPGASLLDDLFKYFSFHHSHGDTMTVMDPKEMNIAAALWAVVSYVVADMEEMLPRS	387892	215144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_292468_292671_321751_321844_387778
598733	contig_10437_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_38174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACATTTGGAAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164086	162990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_163000_164100
598749	contig_4103_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_51881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGTTTGATGCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42330	39951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40000_42300
598757	contig_4531_pilon	+	1874	2	Intergenic	novelGene_47892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_1	0	916	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	224	643	328636	330172	FALSE	10	TCCCTGAATGTCTGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEKEFTESCGCADCCILFLLSNPCFLSPGGKFIFFNVLSAFLPQCIFFLGLLYPVSSAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	328412	331403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_328912_330028
598761	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	11	370	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14419	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
598766	contig_12835_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_147391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCCTCCAGGCACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537	2853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12835_pilon_+_1500_2900
598777	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91674	2	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
598780	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_97836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
598782	contig_14322_pilon	-	326	2	Intergenic	novelGene_116175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671839	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
598789	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
598801	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842772	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
598802	SIRV6	+	421	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	15	1153	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
598812	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
598813	contig_17274_pilon	-	2594	16	Intergenic	novelGene_26549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTGCACAAAGGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216892	179109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_179188_181177_181241_182425_182468_184625_184719_186545_186630_195739_195815_202341_202395_203685_203789_205826_205970_208195_208236_209283_209323_211484_211608_213057_213177_213464_213543_213700_213734_215464
598819	contig_8045_pilon	+	1338	5	Intergenic	novelGene_35382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	37	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2	643	116067	118722	FALSE	20	ACACTTGAGTTCAGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116065	119417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
598821	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
598827	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
598834	contig_7733_pilon	+	1823	4	Intergenic	novelGene_147137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	59.8163857149527	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	111	455	88279	107305	FALSE	15	AACTTTCTTGCCCTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	88168	108673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_88285_100923_101033_106056_106176_107194
598851	contig_12427_pilon	-	1391	5	Intergenic	novelGene_40562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1196.91465339012	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	133	537	522337	505937	FALSE	20	TTAAAATTCTCGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQT	578084	505082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505943_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
598863	contig_9706_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_20844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2279	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
598866	contig_3818_pilon	-	2315	13	Intergenic	novelGene_99243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	79	447	455828	455460	TRUE	45	ACGAGAAACAGCACAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDQLPDTCRHWAQAGGAAGGAVTSPDAAPFWRHSSIHCLGGAVFALGPSLDCKMAKGTRGSGGLGLHRPRRADLNSPTRPHATVPVLLRGQLCSPTTQSESLSVSASFTSTLNLYSWSQPM	455906	440560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_440758_441156_441316_446513_446722_446983_447140_451526_451658_451748_451915_452135_452256_452457_452603_452697_452875_453174_453337_453425_453509_454981_455076_455389
598872	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598904	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
598905	SIRV5	+	382	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7586	2	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
598915	contig_14322_pilon	-	156	1	Intergenic	novelGene_115694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671430	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
598917	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
598929	contig_5467_pilon	+	1906	8	Intergenic	novelGene_111934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	423.573138999196	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	595	1227	13537	15166	FALSE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPRILLWAQNFSVTYNGQTEDLTSLTFGAQELNLTGSFWNSSAAGLALTYEQLFGTMVTFKFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCQYVSSLTKNGNLLVPHTQPSAWDVTLRDFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTSLLMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPAISLTQIV	8232	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11561_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956
598931	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
598960	contig_299_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_129426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCACAACCTCCTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858568	858297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_858300_858600
598973	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
598987	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
598990	contig_16724_pilon	-	1776	6	Intergenic	novelGene_105288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	747.73390989041	193	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	438	767	560992	541872	FALSE	20	TACTTTGAGTTGTGTATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	568157	540862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_567926
598992	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
599000	contig_7202_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_18859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30086	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
599006	scaffold_6394_pilon	-	1050	6	Intergenic	novelGene_111028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTCCATCAGCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406271	402759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_402971_403237_403372_405024_405198_405299_405498_405714_405870_406092
599007	scaffold_6394_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_111026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGAAAACCAAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402711	402378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_402400_402700
599009	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
599013	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_97864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
599015	contig_14133_pilon	+	2233	3	Intergenic	novelGene_119927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	271	786	146942	147457	FALSE	20	CTTCACAATCTCCTCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQARALCPATYLACMVAQLPPQWAGGAKETQPHAQTAPGRCGYSQVPPNTLSGGLCRRSPLSYHHSRERVLGQTRLQAAQFMGQSSLDCSPGVCTGPRPWCTVPPQAGPSARVVGPIHVLWAACARRHDCPMSVHVYVCMRPFGHRHDLCFPHAWAVPVIPQGLPLLSL	146181	148904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_146231_146671_146714_146762
599029	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
599034	contig_9656_pilon	-	1322	12	Intergenic	novelGene_121927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	422.42354680174	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	90	1253	446594	430496	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRCHRAALFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKRVGYILEEKVICFHDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	446683	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440269_440309_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
599036	contig_12638_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_33360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCAGTCCTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440875	1438794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1438800_1440900
599038	SIRV4	+	922	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1481	0	1026	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_3400
599043	contig_13740_pilon	-	1363	10	Intergenic	novelGene_34653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	4277.35965056095	8	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	167	1072	165243	157474	TRUE	15	TGTTATTGGATATGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165409	155819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
599054	contig_12622_pilon	+	1348	7	Intergenic	novelGene_5917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCAGCTGGAGAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583547	1588034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585705_1586269_1586406_1586527_1586838_1587626_1587784_1587863
599061	contig_5210_pilon	-	2476	9	Intergenic	novelGene_65467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	404	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1418	2143	812652	807528	TRUE	20	TCATGGCCGCGGCCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTQAKENRWAEWVGSGVAARELRRGHTADGTSEMVGVSQWFSKFCLFEQFVAIITFDPVGLHCRDVTHEVLGQADAKDLEEGDSHKDPSHDDQVVLQPLLKLAHAAFGVDEALLLQLLGFEPDVVATLGVENILRRVSDAAGEGHSAALPARVQVSAVEIDIEVPVVGPSGSTARPVFLSKVNEVLEVNVIPVGLNVAVDEEVELVSNPVLEDKGQDQTLAGRCSPGGPRCIQQSPTPT	814069	803698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_803901_807296_807347_807446_807596_808863_808988_810095_810221_811046_811093_811632_811754_811829_811891_812471
599074	contig_4364_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532852	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
599081	contig_6424_pilon	+	2200	2	Intergenic	novelGene_109242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	817	1173	6027	6383	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEIMVPSLGTGEVMERREGLENLGQIRAWGGGARGLLASPGSCCRQPLRWGMGGHVPSEVREREVMGIPRMASKARGRRYSPSGISRGRPGFSTRGPPDPCSLGLQRSCWAHLVSQ	5210	8830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_6421_7840
599085	contig_12709_pilon	-	2043	9	Intergenic	novelGene_147418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	43.914690025093	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	21	890	110619	73650	FALSE	30	ATACTGTAACTCTAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGFRAMGRLVALSLLGISLALLGERFLALRNRLKASGEVESVDLPNCHLIKGIEAGSEDIAILPNGLAFFSVGRKHPGLHSFAPDKPGGILMMDLKEKKLRALELRISRGFNLASFNPHGISTFIDDDDTVYLFVVNHPESKNTVEIFKYEVKVVAEGFDVANGISISPDEKYIYVADMLAHEIHVLEKHTNMNLTQSKVLKLDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPSSEILRIQNILTEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASIYDGKLLIGTLYHRALYCEL	110639	72496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_73809_74443_74573_75355_75438_86035_86097_87763_87836_88734_88901_94625_94682_102694_102766_110545
599094	contig_3018_pilon	+	2164	14	Intergenic	novelGene_78945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_8	32.0720343074053	236	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	101	1408	1350624	1438845	FALSE	5	CCTTGGTTCTGATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLENTVLCRESQVSTLQSLFGERHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKLSHLCSSEDGCCTQITCDTLNDFVRLFKQVTKAEGLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANVLPGFLRLQELTDRNVTVIFLSEIIWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILCHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQQDDTDPGQLKGLSAYTHVELPYYSKFILIAAYLASYNPARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKTSNHLLGPKSFPLDRLLAILYSIVDSRVAPTANIFSQITSLVTLQLLTLVGHDDQLDGPKYKCTVSLDFIRAIARTVNFDIIKYLYDFL	1350523	1439601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1350696_1354411_1354505_1356662_1356864_1362065_1362141_1365533_1365646_1368023_1368155_1384570_1384620_1384708_1384800_1388934_1388988_1389909_1390023_1395834_1395883_1399266_1399378_1429642_1429756_1438799
599099	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
599103	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
599105	contig_9727_pilon	-	2758	15	Intergenic	novelGene_86279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	245.539815550163	507	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	82	1977	163331	137693	FALSE	10	ATGACTTGTGCTGTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQIMLSGALIVLLASPLGALRARGKVQGCGTLLPGEKSSLSKEQSFRPPKEHRTSASDMDTDNNQLGTEVA	169705	136911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_137899_138719_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_169653
599109	contig_9482_pilon	+	1575	6	Intergenic	novelGene_44236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	167.799165671347	70	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	50	430	263283	285606	TRUE	10	GACTCGGGGTTTGCTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRFFSPSRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGNSLVLTA	263233	290386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_278052_278098_285421_285815_288534_288944_289858
599121	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599128	SIRV4	-	303	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCGTATGTTCGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
599131	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
599135	contig_14322_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_116585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGCCACAGCAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
599140	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	216	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
599141	contig_15063_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_14446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_2	2946	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	225	683	36064	39538	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGEVTHCGKNV	35839	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266_36600_39506
599151	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
599160	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599161	SIRV4	+	1546	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	9	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATATTGTAACCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1858_2371
599167	contig_9335_pilon	-	1256	4	Intergenic	novelGene_147461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.7515902921777	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	206	1012	737423	642197	FALSE	40	TGAATAAAGTCTCCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGFQKQYGEASVHVRVLYLAPPGLELTSLRVKPGGVVVKCYGCNPKEKEREWKGPFYFIQGADPQFGLMKAWSVGDCDGGGDEWGQEIRLTEQAVQAINKLNPKPKFFVLCGDLVHAMPGMPWRKEQTEDLQRVLKDVDREIPLVFVSGNHDIGNVPTAESIAEFCQTWGDDYFSFWVGGVLFLVLNSQFFYDASRCPALKQAQDQWLDEQLSIAGERKCQHAIVFQHIPLFLQSLDEEDDYFNLSKSVRQEMADKLTEAGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758377	641952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_671128_671552_737269_737489_758237
599179	contig_12079_pilon	+	2191	9	Intergenic	novelGene_67550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACTAAAAGAGAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861265	871551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_861981_862022_862630_863468_863581_864501_864700_866538_866665_867261_867410_868245_868415_871105_871170_871499
599180	contig_13707_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_43578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2013	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCGAGCAATTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275545	273061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_273100_275500
599182	contig_4364_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_4147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
599222	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
599254	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
599256	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_91293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657167	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657169	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
599267	contig_14322_pilon	-	401	2	Intergenic	novelGene_115790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
599268	contig_15384_pilon	-	748	10	Intergenic	novelGene_85131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_1	68.9155862246804	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	70	747	110663	103712	FALSE	10	GGGGCCTGGGCATGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKGAGMSFSRKSYRLTSDAEKAKVTGIVDEKLLNDYLHRVFSPPDHTSPAATSRKPLSFQNLPEHLDQLLQVDSEDEESQGQDEGRLGPSTVVLDHTGGFEGLLLVDDDLLGVIGHSNFGTIRSTTCVYKGKWVYEVLISSQGLMQIGWCTINCRFNQEEGVGDTHNSYAYDGNRVRKWNVTTTNYGKAWAAGDVVSCLIDLDDGTLSFCLNGVSLGTAFENLS	112274	103710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_103752_103909_103978_104206_104294_104571_104658_104777_104833_105145_105241_105381_105462_110227_110313_110581_110690_112231
599284	contig_15498_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_42650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	20	385	684456	684821	NA	65	AAAAAAAAAAAATTGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHPLLSEQVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKVRLVPHLPGSAGCVDGKLSSQVKARCGQALQG	684436	686732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_684400_686700
599304	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599313	contig_16098_pilon	-	1385	9	Intergenic	novelGene_46147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1537.56418057101	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	147	971	458816	456579	TRUE	15	TTGAAGGGGGAGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTAPSTSAPC	460273	456073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456605_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
599322	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
599333	contig_6871_pilon	-	2884	3	Intergenic	novelGene_21530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	614	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCCAAAATGTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72219	66579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_68218_68896_69866_71942
599336	SIRV4	+	261	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1510	632	1055	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
599337	contig_10042_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_79217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_4	50.7709316440028	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	299	532	1082817	1090129	FALSE	20	GAGGTATATTCTTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLSQLSSLTFWKYLPVSWHILRGILTLYFVWLQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1076157	1091132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
599353	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_16659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599368	contig_6327_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_147483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTATATGAAAATGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35732	33240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_33200_35700
599370	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_97607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
599395	contig_15063_pilon	+	1245	4	Intergenic	novelGene_14324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	287	1108	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34872	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
599397	contig_3233_pilon	+	1315	10	Intergenic	novelGene_56566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	275.447156097988	275	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	706	1179	743801	747909	FALSE	20	AATGGGATTGTGTTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738721	748045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743587_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
599407	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1588	632	1133	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2588	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
599417	contig_3469_pilon	-	1990	16	Intergenic	novelGene_34158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	86.8204788949909	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	219	1514	413507	380499	FALSE	20	GAACTATTTGCTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPEAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427654	380022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393236_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444
599418	contig_3948_pilon	-	1744	13	Intergenic	novelGene_53410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	212.273212315324	912	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	73	1257	1975758	1934529	TRUE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYESSAEILPHTPRLTHFPTVSGSPASLADSMQQKLAGPRRRRPQNPSAM	1975830	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1934475_1934680_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
599427	contig_6710_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_96587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653697	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
599441	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
599442	contig_610_pilon	-	2292	7	Intergenic	novelGene_76816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.0836330929711	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	45	1487	343470	332842	TRUE	60	AAAAAAAAAAATTGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSGAAGHLAHSWDSLKEGASPSPLSLSPAEPPEGGSQNPLGCVLREDSDPPLPGALRGA	343514	331648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_332393_332780_333015_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338808_343421
599443	SIRV1	-	208	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	4008	5570	3588	-121	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAAAGATGTCGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
599444	contig_9833_pilon	+	2283	10	Intergenic	novelGene_68521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	173.075449186507	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	85	1197	230823	252564	FALSE	25	TTATGTTATGTGAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQNGSAS	230738	253650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_252546
599450	SIRV7	-	350	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
599453	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_97876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
599456	SIRV6	+	319	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10429	2	1279	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
599457	contig_10093_pilon	+	1925	14	Intergenic	novelGene_147504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	118.178232659641	498	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	158	1222	90937	125260	FALSE	25	AGCTGTGTAGACATGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFDTGTLLLSTHRLIWRDQKNHECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKSAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEFYRRLSEEMTQRRWETMPVSQSLQTNRRPQSGRIRAVGIVGIERKLEEKRKETDKNISEAFEDLSKLMIKAKEMVELSKSIANKIKEKQGDITEDETIRFKSYLLSMGIANPVTRETYGSGTQYHMQLAKQLVGILQVPLEERGGIMSLTEVYCLVNRARGMELLSPEDLVNACKMLDALKLPLRLRVFDSGVMVIELQSHKEEEMLASALETVSEKGSLTSEEFAKLVGMSVLLAKERLLLAEKMGHLCRDDSVEGLRFYPNLFMTQS	73158	125963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90910_91006_93068_93140_101699_101815_102834_102925_103664_103752_108824_108858_108972_109051_109680_109816_118733_118800_122855_122921_123505_123591_124997_125075_125166
599461	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
599463	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599473	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
599476	contig_8616_pilon	+	1245	10	Intergenic	novelGene_72559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	886.870750670616	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	19	1170	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425759	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428089_428774_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
599498	contig_8357_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_39717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCCAAAGCGTCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477262	476036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_476000_477300
599504	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599507	contig_15837_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_147519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCAATAAAAAGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5024	4745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_4700_5000
599508	contig_15837_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_147518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTCAACAGAGCCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4343	2964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_3000_4300
599510	contig_15063_pilon	-	1311	5	Intergenic	novelGene_8773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTGCCATGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	27125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34606_34926_35264_35380_35839_36155_36264
599525	contig_4364_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_3800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533061	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
599527	contig_7426_pilon	-	1969	9	Intergenic	novelGene_27537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.720577921324	2176	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	29	820	1102797	1087105	TRUE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102825	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1086276_1086311_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
599530	contig_6102_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_32087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGTAGGGATGGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791172	789443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_789400_791200
599533	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599534	contig_12790_pilon	+	1968	11	Intergenic	novelGene_35243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	291.210302015571	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	194	1168	307252	312473	TRUE	15	TTATAAGGGGTGTGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKESKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305950	313339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309879_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312980_313045
599539	contig_5020_pilon	+	893	5	Intergenic	novelGene_27858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1020.48040157565	15	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	64	549	122915	125701	FALSE	30	CAGCCTAGCCAGCATACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQGSCPPFFAWVPGMW	118466	126045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118474_122858_123041_123152_123364_124167_124273_125657
599542	contig_14563_pilon	-	2056	4	Intergenic	novelGene_135063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	562	junction_3	116.851282501401	629	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTCAGTTTGGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174353	161670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_162039_166787_166855_172198_172279_172812
599546	contig_5059_pilon	-	2624	5	Intergenic	novelGene_140717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.146327643514	72	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	43	336	231713	214097	TRUE	85	ATGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTVRTEQPLREDSLTLSHEG	231755	211094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_212472_213185_214187_214730_214789_226820_226893_231639
599557	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599561	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCATCCCCCTCGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	29904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
599563	contig_13542_pilon	+	3386	19	Intergenic	novelGene_131548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	74.048386749793	7	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	5	2164	571860	597427	FALSE	20	TAAGAAGTCCTTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMAAALVSRFWLWALLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKLKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAALNSRTGEILWRHVDKGTPEGAVDAMLLHGQDAITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQALGLVGLQESVRYVAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFSHVNIVKFNMEDGEIVQQVRVSTPWLQSLTGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALETEWELRQIPLQSLDLEFESGFQPRILATQPNPVDPSRAQFFLQLSPSHYALLHYHQGVLSLLKNLPQTALVSFATTGEKTVAAVMTCRNEVQKPSSSEDGSMGSISEKASPKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTMITFSLEQNGTRPERLFIQVFLKKDDSVGYRALVQMEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCLEMVDLPLTGAQAELEGEFGKKADGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTAHLWKMFYDARRPRSQIKNEINIDTLARDEFNLQKMMVVATASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAERFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGLVFATMITKRLAQVKLLNHAWR	571855	598649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_571955_576437_576563_577298_577365_577608_577703_578443_578573_579453_579581_580091_580242_580561_580730_581236_581309_581707_581771_582584_582708_583740_583838_584087_584211_585902_586103_586262_586331_594558_594624_595741_595827_596937_597068_597247
599566	contig_17440_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_7680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCTGCATCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3710	3982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
599578	SIRV6	-	195	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGACTTCGACTCGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11262	10759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
599580	contig_8616_pilon	-	1685	8	Intergenic	novelGene_72374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	61.1027906106437	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	136	1635	185319	178743	FALSE	10	GTGAGGTATTGTCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLVKIKVPDNEAEEAKFTGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	185454	178692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184901
599585	contig_8801_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_66333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTGTATTTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943088	944352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_943100_944400
599586	contig_3243_pilon	-	1688	5	Intergenic	novelGene_147524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1132	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCCCGCGCTCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34126	17421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_-_17829_20569_20811_28042_28140_28537_28694_33339
599610	contig_18869_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_56169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73603	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
599619	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_16514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
599633	contig_4059_pilon	-	886	4	Intergenic	novelGene_140595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1023	junction_3	771.694239968137	142	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	45	563	422646	398089	FALSE	30	GATTATGCTGACTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	436335	397765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411209_422462_422662_436306
599636	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
599641	SIRV4	-	293	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTCGAGTCAAAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2700
599673	contig_9656_pilon	-	1715	10	Intergenic	novelGene_121926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_2	180.303447924141	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	61	1068	446594	431074	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVR	446654	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
599681	contig_21203_pilon	+	1305	8	Intergenic	novelGene_84485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	19	1305	53950	122159	FALSE	10	AGGTGAGTTTTTGTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53931	122159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
599699	contig_6898_pilon	+	1585	11	Intergenic	novelGene_35671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1625.53575475903	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	166	1323	59668	127431	FALSE	30	TAGGAATACTTTACTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQHHLGLDLVSPGPWYCLPCSLLPA	59502	127693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122739_126689_126734_127403
599713	contig_7391_pilon	-	1933	6	Intergenic	novelGene_112164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	128.821737296157	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	99	509	457964	443049	TRUE	25	CAAATTGTCTGTGTGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWVGHRFDVGGRLVGRGKEAFCGRTAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKVLKKVSKYIQEQNEKIYAPQGLLLTDPIERGLRVIEITIYEDRGMSGR	458330	438706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_443033_443094_444144_444247_451552_451706_457853_457987_458254
599729	contig_13004_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_112754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGAAGAACCCCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004113	1005040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_1004100_1005000
599730	contig_8978_pilon	+	2355	11	Intergenic	novelGene_49407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	271.566363896562	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	52	1104	339807	344719	TRUE	15	TAATTTCCTGTGCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRFDEAPRRTSADGRAAQPRGAKTKATGAQAGGGAQAP	331611	348138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343831_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
599742	contig_6001_pilon	-	2025	11	Intergenic	novelGene_128053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	16.5713608373	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	575	1897	756765	725516	FALSE	70	TATTAAAAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKPKKKNMSAYQVFCKEYRVTIVADHPGIDFGELSKKLAEVWKQLPEKDKLIWKQKAQYLQHKQNKAEATTVKRKASSSEGSMKIKASSIGVLSPQKKSPPSTILLPTSPAKAPETEPIDVAAHLQLLGESLSLIGHRLQETEVLKIQ	763660	725387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_725534_725636_725807_728557_728664_729837_729903_730968_731051_755883_756834_757399_757515_757621_757701_757972_758122_758775_758875_763596
599743	contig_13300_pilon	-	2264	6	Intergenic	novelGene_125786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	24.2123935206745	418	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	173	1699	167148	157619	FALSE	30	CACATGCGTCCCTGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTRQTTLHARRVFGPEDRLTAGSRSEKARGSRAATGVTWAGNHLSPLARRIKAPGTAMAIPQLLWIWLLVAGTHGLEDGSMRLMDGNMANEGRVEIFYRGQWGTVCDDSWDLTDASVVCRALGFENATQALGSAAFGPGAGPIMLDDLECTGTEPSLADCRSRGWLNSNCQHEEDASVTCTSKTISYPAVHILDFSSELSTALSGVFDSQQSCDLSIQVWARGEEALSVCAHTLILSTNPEARDLLRESGSNVTMEVDAECVPVVRDFIRYLYSRRLNISMSSVKCFHQLASTYGAERLQDYCARLFTIVLLQDPSFRTPLDLHAYALATGDALLEALCVQFLAWNFEALTRAKAWPSTPLALLRTLLSRSELAVSSELALLKAVGAWGWENRASHEVIAGLLEEIRFPMMLPMDLFELQFNMSLFRDHEPLFRKKVLQALEFHTVPLRLLAQYRGLNFSEDTYRPRLYMAPTWSASVSGNIQNSWLAEKSRRVASIPSTHTTLLTPRPPLTIDITPIDLSRHPSTPASSSTTCSSPGLSPTSPPSRAAGTTGSRVPPTRSLPWA	169264	157053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_158508_161631_161894_164504_164637_166209_166402_167096_167171_169114
599746	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599758	SIRV5	+	297	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	33	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8348	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
599762	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
599783	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_18228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599785	contig_9471_pilon	+	1806	12	Intergenic	novelGene_21791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	505.017027779368	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	806	1582	413930	417296	FALSE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406962	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407181_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
599826	contig_14514_pilon	+	1809	4	Intergenic	novelGene_137449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	47.4411916657525	1468	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGGTTACTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8382	36321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_8430_24699_24764_30105_30344_34861
599835	contig_7202_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_18686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCTACCTGTCCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29964	29814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30000
599840	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599842	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
599844	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
599846	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
599852	contig_9014_pilon	+	2484	10	Intergenic	novelGene_106778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	10.962337319485	165	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	760	1956	141549	145866	FALSE	40	AAACACTGTCAGTAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWKDYEYDLCMTEERCLSGLITSSQSAAYAISKFVSGVLSDQMSARWLFSSGLLLVGLVNVVFSWSSTVPVFAALWFLNGLAQGLGWPPCGKILRKWFEPSQFGTWWAILSTSMNLAGGLGPILATILAQSYSWRSTLALSGALCVVVSFLCLLLIHNEPADVGLRNVDPTPSKGKKGSVKKDSTLQELLLSPYLWVLSTGYLVVFGVKTCCTDWGQFFLIQEKGQSALVGSSYMSALEVGGLVGSIAAGYLSDRAMAKAGPSIYGNPRHGLLLFMMAGMTVSMYLFRVTVTTDSPKLWILVLGAVFGFSSYGPIALFGVIANESAPPNLCGTSHAIVGLMANVGGFLAGWPFSTIAKRYSWSTAFWVAEVICAASTAVFFLLRNIRTKMGRVSKAE	140071	146394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_140496_141213_141558_141727_141777_142401_142635_142956_143201_143667_143827_144071_144158_144683_144798_145428_145568_145702
599853	contig_5988_pilon	-	2175	15	Intergenic	novelGene_16050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_5	68.477763409976	270	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	429	1817	1050018	1042346	FALSE	20	GGTAGTTTCTTTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLKDMRDEVLEHELTVADRRQKREIRQLEQELHKWQVLVDSITGMSSPDFDNQTLAVLRGRMVRYLMRSREITLGRATKDNQIDVDLSLEGPAWKISRKQGVIKLKNNGDFFIANEGRRPIYIDGRPVLCGSKWRLSNNSVVEIASLRFVFLINQDLIALIRAEAAKITPQ	1052916	1041987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042433_1042547_1042676_1042844_1042933_1043068_1043152_1043345_1043439_1043557_1043587_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1052598
599856	contig_9290_pilon	-	2441	14	Intergenic	novelGene_77569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19.816017667862	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	25	1281	516542	504291	TRUE	15	CTCTGCAGGAATGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASMCDVFSFCVGVPGRAQVAVEVRFVSSSKGKGLFAKQLIRKGETIFVERPLVAAQFLWNALYRYRACDHCLRALETAEENAQRLTGKPGQVLPHPELCIVRKDLHQNCPHCQVMYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516566	502894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_503951_504186_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510196_510337_511094_511204_516446
599858	contig_2069_pilon	+	1681	6	Intergenic	novelGene_23459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	351.414057772309	567	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	140	1612	1432950	1439381	FALSE	10	GTTGAGGCCTCTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGEPALEPDCCHKPKHLRDTGSSLSPSLDFQFCQGDQVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432103	1439450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432232_1432938_1433064_1433701_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
599859	contig_3948_pilon	+	2073	5	Intergenic	novelGene_53223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCAGCCCCTGAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839418	856701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_840859_842500_842658_847880_848025_852439_852636_856565
599878	contig_10299_pilon	+	2320	19	Intergenic	novelGene_79684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	100.113762451018	8	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	71	1303	320559	336895	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320488	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337228_338349_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
599879	contig_3181_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_136939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCCTTGAAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317368	316599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_316600_317400
599896	contig_12638_pilon	+	2139	20	Intergenic	novelGene_33096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	632.275909302865	54	52	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	909	2012	182987	199604	FALSE	60	TTGAAAAAATAAAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170790	199731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_173706_173729_176888_176961_178085_178281_180794_180861_180954_180986_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
599898	SIRV4	+	298	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	201	451	201	-451	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTCAAATTGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	2320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
599903	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
599907	contig_11285_pilon	-	2186	5	Intergenic	novelGene_5501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	64.4457135890355	414	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	37	624	539296	519894	FALSE	25	TAACCATCACTCATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAGRGCSPKMAAPPGEYFSVGSQVSCRTCQEQRLQGEVVAFDYQSKMLALKCPSSSGKPNHADILLINLQYVSEVEIINDRTETPPPLASLNVSKLASKARTEKEEKLSQAYAISAGVSLEGQQLFQTIHKTIKDCKWQEKNIVVMEEVVITPPYQVENCKGKEGSALSHVRKIVEKHFRDVESQKILQRSQAQQPQKEAALSS	539332	518331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_519987_520827_520955_522390_522501_537224_537359_539172
599911	contig_12644_pilon	+	1119	8	Intergenic	novelGene_44617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4580.48473506498	52	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	617	1039	2679895	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678861_2679891_2679963_2680107_2680229_2680311
599912	contig_1532_pilon	-	1860	9	Intergenic	novelGene_37448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	319.896443204672	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	60	668	51365	43714	TRUE	15	TGCAACCATTTGTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPEQRFLSDSTSENSKIETMQDLHVANAIFALNFFKHLANTSPTQNLFFCPWSISSTMAMVYLGARGNTADQMAQVLQFNKVGGHKIIPVTPRKFTSCEIRQWIQKATYPDAILQAQAGNTIHSSFQSLISAINSSSGGYLLESINQLFGEKSTRFNEEYVKLCKKYYSTEAQAVDFLEHAEEARKKINSWVKTQTKGKIPNLLPEGSVDRESGKLHFRRN	55495	41119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_42118_42429_42595_43684_43747_43786_43828_44479_44598_45389_45519_47118_47239_51197_51375_55445
599919	contig_7202_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_19043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29915	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
599920	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
599922	contig_14441_pilon	+	1028	6	Intergenic	novelGene_100391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	439.269120244071	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	495	1028	125667	126745	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREDPAPSPESKPDEPIKMVCSL	47264	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47571_122148_122188_125517_125902_126159_126283_126514_126630_126684
599928	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_93701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
599930	contig_5643_pilon	+	1937	16	Intergenic	novelGene_39033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.34797987431	1	75	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	964	1740	636518	641217	TRUE	15	AAGTCTCTCCGGTCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631202	641583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631955_634838_634992_635156_635211_635368_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
599942	contig_7733_pilon	+	2097	11	Intergenic	novelGene_147132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	56.6505957603272	35	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	400	1203	92170	107305	FALSE	30	AATTAGTATTTGCAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKGCKVVGAAGSDDKVAYLKKVGFDVAFNYKTVESLEETLKKASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86749	108199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_88498_88661_91178_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_97575_97732_100923_101033_106056_106176_107194
599964	contig_10434_pilon	-	2237	18	Intergenic	novelGene_82036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_17	216.566826433364	270	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	272	1867	150439	133988	TRUE	35	TGTTATAATAAAGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKGEVKCIKFSLENKILAVQRTSKTVDFSNFIPDNSQQEYTQECKTKNANILGFCWTSSTEIVFITDQGIEFYQVLPEKRNLKLLKSQNINVNWYMYCPESSVILLSTTVLGNVLQPFYFRAVTMSKLPKFEIELPAAPKSTKLSLSERDIAMATIYGQLYVLFLRHHSRTSNSTGAEVVLYHLPREGACKKMHILKLNRTGKFALNVVDNLVVVHHQDTETSVIFDIKLRGEFDGAVTVHHPVLPPRSIQPYQIPAAGPASVTSQSPVPCKLYSSSWIVFQPDIIISASQGYLWNLQVKLQPIVNLLPDKGRLMDFLLQRKECKMVILSVCSQMLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKVILVHESLDYQSVCSCWLAFTWHSLCLLETFNSKR	151627	132768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139146_139201_139465_139511_142485_142598_143308_143415_143506_143597_144855_144960_145447_145589_148181_148269_149454_149512_150355_150441_151357
599972	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
599979	contig_9653_pilon	-	2028	4	Intergenic	novelGene_48206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_3	460.478736389279	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	161	691	196924	192055	FALSE	20	TTCCCAGCTTTACCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQVSLFLFCLFSFKMLIDFFDVMFVVSSYVY	200994	190717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_192240_194047_194351_196881_196987_200896
599980	contig_7963_pilon	+	2221	4	Intergenic	novelGene_58366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1605	junction_2	854.026281146481	80	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	89	853	51450	57937	FALSE	30	TCCTCCAGCAGTACCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51361	59305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782
599987	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1432	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
599990	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91674	2	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
600004	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
600014	contig_12270_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_113143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	27	383	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14435	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600026	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27898	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600034	contig_10940_pilon	+	1928	3	Intergenic	novelGene_49176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1459	junction_2	96	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGTACTGAGTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172538	175505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172629_173150_174123_174639
600045	contig_5467_pilon	+	1927	11	Intergenic	novelGene_111930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	356.454990146021	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	14	988	8246	14522	TRUE	5	TGAGTTGGGCCTCCGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8232	15842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956_15107_15270
600046	contig_5988_pilon	+	1395	3	Intergenic	novelGene_16018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	214	1039	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	534	1277	786070	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779379	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_785862
600061	contig_8317_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_19436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16397	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
600068	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600073	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
600095	contig_14441_pilon	+	1447	5	Intergenic	novelGene_100669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	400.567332042941	261	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	833	1261	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112157	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_113032_113209_116578_116963_117220_117344_117539
600097	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
600098	contig_15459_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_106368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGACTGCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11245	9563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_9600_11200
600103	contig_14322_pilon	-	338	2	Intergenic	novelGene_115777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671843	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
600134	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
600142	SIRV6	+	873	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	183	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	305	637	2002	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1486	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
600152	contig_3233_pilon	+	1482	4	Intergenic	novelGene_56583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_1	131.524395709186	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	879	1352	745272	747909	FALSE	15	CTCCCCAATGGGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLSQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	744393	748039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_745378_746325_746424_746936_747016_747718
600157	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
600158	contig_7362_pilon	+	2166	5	Intergenic	novelGene_147551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	35.2091962418911	137	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	763	1185	424037	424882	FALSE	50	TGATAGGCAAAAAAGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVIHIPDKTYKLSCRILYQYLLLAQGQFHDLKQLFMSANNNSTPSSSTSPEEKSTDRSLLEKAGLSESEVESPEETSKDCVVCQNGPVNWVLLPCRHTCLCDGCVRYFQQCPMCRQFVQESFALCSQKEQEKDKLKTP	373659	425863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_373793_401898_402039_410771_411255_424030_424139_424561
600161	contig_14326_pilon	-	2708	4	Intergenic	novelGene_120689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	77.9928771676548	227	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	18	1628	177636	161220	FALSE	10	CCTATTCCTGGAGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRELEMHTISSKVFGDILDFAYTSRIVVRLESFPELMTAAKFLLMRSVIEICQEVIKQSNVQILVPPARADIMLFRPPGTSDLGFPLDMTNGAALAANSNGIAGSMQPEEEAARAAGTAIASQASLPVLPGVDRLPMVAGPLSPQLLTSPFPNVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSMFGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPISEDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMSYHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQTCNASFATRDRLRSHLACHEDKVPCQVCGKYLRAAYMADHLKKHSEGPSNFCSICNREGQKCSHQDPIESSDSYGDLSDASDLKTPEKQSANGSFSCDMAVPKNKMESDGEKKYPCPECGSFFRSKSYLNKHIQKVHVRALGGPLGDLGPALGSPFSPQQNMSLLESFGFQIVQSAFASSLVDPEVDQQPMGPEGK	177653	160139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_161639_169072_169245_175279_175344_176680
600164	contig_13894_pilon	+	2933	7	Intergenic	novelGene_62206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTCTTCAGAGCCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749817	766705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_750039_750736_750866_751115_751376_753094_753242_761486_761600_762021_763960_766580
600190	contig_9594_pilon	+	1599	10	Intergenic	novelGene_73939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	531.319740520401	3	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	351	1166	315271	322451	FALSE	15	GATTTTTTTTCCTGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301211	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301374_307478_307530_310433_310542_315241_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
600203	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
600207	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
600215	contig_18869_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_56295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73539	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
600224	SIRV7	-	337	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	6	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
600231	SIRV4	-	189	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAATAAACCTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
600235	contig_9290_pilon	-	1830	12	Intergenic	novelGene_77531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.159533974499	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	659	1489	486192	478940	FALSE	25	GTTATCTTTGCAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497063	478598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483227_486126_486278_486627_486679_487536_487663_489929_490039_491390_491545_496930
600237	contig_15063_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_12967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3625.33315327326	6	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	229	1467	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28172	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
600239	contig_2917_pilon	-	1673	8	Intergenic	novelGene_147589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	224.199528481727	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	188	1369	123157	93080	FALSE	30	TTTCAACTGGAATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSHHSKPQSLSCLCPGLPSPTTSRPKSTSESRLTSQKCCAKPDRNKLPVWELPPVPLRSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	123344	92775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_122196_122375_123156
600241	contig_14322_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_116232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671597	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
600243	contig_7202_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_19088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCCGCCATGACGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
600258	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
600262	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
600270	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600277	contig_2894_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_86555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	694	1104	314187	314597	NA	80	GTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETLEVMTIPFETEAAWLLVFLASSASAFCGLPHARICPAGASVPKLGSSTDKCPKAPHSTRKRPVHRQSAISLCGSAPAPSRAGLLVLLLLVLCRCPFCAAAGSLPLLVLCRCHTSIHSQFQNHFPILGIC	313493	315240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_313500_315200
600278	contig_5889_pilon	+	1540	13	Intergenic	novelGene_133674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	128.117432025813	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	33	827	20445	201118	TRUE	30	AATTTCCCATCCATGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGSC	20412	323233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_196998_201110_201208_255473_255555_256682_256759_273382_273599_322982
600279	contig_12074_pilon	-	1744	12	Intergenic	novelGene_53746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	434.459120370061	15	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	166	1491	36661	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45854	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_45769
600284	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
600290	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600308	contig_10311_pilon	-	1336	6	Intergenic	novelGene_50458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1033.71349996022	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	18	515	68736	67221	TRUE	30	ATTCACTTAAAAGTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGLMYNKCLWL	68753	65136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67254_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643
600312	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600324	contig_312_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_128326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGTTTAAGAGAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589566	587435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_587400_589600
600326	contig_13992_pilon	-	2627	15	Intergenic	novelGene_147651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_11	163.291463465842	531	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	456	2441	666315	655415	FALSE	15	GCTCTGAAGTTGCATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSILKTWRPLLGLPPWTRQRVPTKPQRTPPDGGVSAVPTEAALPPTVSPEGPCGEALLADLPGVAPACPKDTCTPQEKEQKPLASTAGDIEASGAPVPRDEAEALLPTHASGLEDTAPASPLRAGRAVTPSPQKEEGPRQMADSAKSEPIKLEFDFSDSVVSKRAPPPRKLGKRPGIKPPSKRQEARQAPTETDERPVPATRGSYNLDWDKLDGPNFNPFGNGSQCGGGEARPPERPEARPARPMAEPLSAEPEAAEASPPSQQVGSALPGGSPEVQVTAPEVPAEAPGAAGEGGTSCSSDTSVPTSSPGSEPTAPPAELPPSLDLAKESFKDPAEVLGTGAEVDYLEQFGASSFKESALRKQSLYLKFDPLLRDSPNRLVPVAAETSREAAQAAAVPSPLSVSTQVASNPSSGSVPEARLVEFDFLGSLDVPVPSPAPCVLGPGGPPLQVSPIVDVLQYSQKDLDAAVRALQLENLELKGRCEELYAKNQEMGKIMDEFEGIAHQVTEEAKKEKELAEAKIQKILKERDQLTADLNSMEKSFSDLFKRLEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYILRIEKESQRYQALKAHAEEKLSLANEEITQVRSKAQAEALAFQASLRKEQMRVHSLEKTIEQKTKENDELTRICDDLISKMEKI	670066	655228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656275_658801_658963_659896_659941_660024_660102_660361_660467_660821_660955_662112_662217_663349_663403_664196_664327_664510_664602_665521_666583_669720_669864_670021
600331	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600332	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_94979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600343	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
600345	contig_546_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_117231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAGTAGAACTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149320	151274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_149300_151300
600358	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600359	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
600372	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600375	SIRV7	+	291	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147666	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
600384	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	35	3076	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
600385	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600387	contig_4103_pilon	-	1420	5	Intergenic	novelGene_51875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	263.046098621515	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	59	529	45186	40734	FALSE	5	GGGCCTGTTTCACGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRPAVGRKTWTFAESGTKMNMRSSLRRGSRKREKRRMENQCSPSSGSFCGTGTTRWTWNPSLERQLSLPKPPRNLRWEDQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	45576	39842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_41930_43898_44023_45129_45224_45555
600391	contig_6710_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_97991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	TTCTTTAACTTTAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
600402	contig_401_pilon	-	2132	3	Intergenic	novelGene_42858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	165.5	1229	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	743	1864	1724288	1721973	FALSE	5	TACTTCTGTGTCTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728515	1721704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174_1724346_1727830
600403	contig_14142_pilon	+	2421	6	Intergenic	novelGene_120499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.5307115277357	48	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAATTCTGTGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308391	318474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_310042_311187_311231_311321_311387_312644_312815_313548_313645_318077
600427	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600431	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600448	contig_20211_pilon	+	2968	1	Intergenic	novelGene_147665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1893	2201	23836	24144	NA	40	AAAACATACCTTACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDIWLMRFLSKILKRPQGFSFLLIVKCKRKEMDLKTNCKTKAKLTDLENSVIQTKDRCPRIFTKDVATQSFIKQKPGTNRSNQLSQQKTHQLRLKGTEKN	21943	24911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20211_pilon_+_21900_24900
600449	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600458	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
600471	contig_5954_pilon	-	2214	15	Intergenic	novelGene_28714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	201.935848067385	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	532	1821	971201	962496	FALSE	10	TGGGCGTGGTTACATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975647	962102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_972433_972586_975601
600479	contig_8616_pilon	+	1394	10	Intergenic	novelGene_72583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	6	1319	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425772	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
600486	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
600501	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
600503	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600504	contig_5210_pilon	+	2197	10	Intergenic	novelGene_65465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	141.64117417694	588	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	149	994	803815	812511	TRUE	15	GAGTGTATGTCTGGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKHQHFQEPEVGCCGKYFLFGFNIVFWVLGALFLAIGLWAWGEKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	803666	814071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807349_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474_813069_813425
600505	contig_11422_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_99105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACAACAACTAACCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303	906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_900_1300
600506	contig_7870_pilon	-	2863	1	Intergenic	novelGene_109020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGAAAGAATGGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549452	546589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_546600_549500
600512	contig_11720_pilon	+	1812	13	Intergenic	novelGene_43958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	356.038884814566	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	518	1558	266216	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
600516	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600517	contig_16907_pilon	-	740	3	Intergenic	novelGene_87457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	27	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	146	520	467716	449131	FALSE	20	ATTTTTCAGGGAAGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGCKLNRLNLVVGEYASACLKVAQDCGTDVLDLWTLMQKDNQDFSSYLSDGLHLSPKGNEFLFSHLWPLLEKKTSSLPLLLPYWRDVAEA	467861	448910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_459295_459418_467610
600519	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600522	contig_15304_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_30680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	20	CAAGACTGGCATGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
600527	contig_9014_pilon	-	1957	11	Intergenic	novelGene_106767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	68.1883421121235	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	131	778	85778	80035	TRUE	20	TCAGTAGGTGGGGACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNGDAAETTLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQVGAAPSSPQLVFIFFPALFSSWEPWWPSG	85908	78210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_85745
600528	contig_7457_pilon	+	1702	14	Intergenic	novelGene_31483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	70	junction_6	297.351484485018	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	177	1508	641631	658632	FALSE	20	TGCTGGGTAGTTATCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPNRILDEHPSLVFLLPVCWERPRGLREPRGPHPGPSAASACRASAGETVGTPDSSRMAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGNGGRANCDVSFVRDDSHPRGLSSR	612238	658826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_612392_641607_641759_642572_642718_643349_643449_648697_648794_648955_649038_649226_649322_649492_649645_651964_652124_652278_652372_653188_653249_658208_658239_658337_658432_658533
600531	contig_2940_pilon	-	2957	1	Intergenic	novelGene_81941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATGCAAGTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720656	717699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717700_720700
600534	contig_3155_pilon	+	1835	4	Intergenic	novelGene_26412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	563.986012434903	3	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	188	514	259780	261211	FALSE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258144	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259325_259731_259978_261082
600545	contig_16210_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_147676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTAATTTAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63805	64476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_+_63800_64500
600555	contig_1594_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_138831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTCCCAGCATTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612986	610905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_610900_613000
600568	contig_14925_pilon	-	1079	5	Intergenic	novelGene_55125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_4	1525.69908156884	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	284	541	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGPQVSALALSSAWFLLSFLSQWNTGNEKLYFGTATSLTVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	86613	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_86482
600575	contig_15410_pilon	+	1603	4	Intergenic	novelGene_130619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	348.886801126096	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	123	557	145617	147258	TRUE	25	TTAATCCTTTGATCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVKAGRQLQGTGRGVHRSRGHISLYFW	145494	148533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147842_148070
600576	contig_7202_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_17710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTTGGTCACGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
600585	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
600597	SIRV2	-	607	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4262	38	3087	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
600598	contig_12943_pilon	+	1528	14	Intergenic	novelGene_140354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	282.034220929213	46	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1434	93	1526	30166	82156	FALSE	50	AGTCACTAAGGTAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGVEDNEKNFYESDDEEKEKTEKRKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLFWHLSPKSEASIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNISEITDACLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRRMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDHAKKILLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNTKATGYLELSNWPEVAPDPAVRNVEVIELAKEWTPAGKTKKENPSKKFYSESEEEDGSSDSNSDSESESGSESGEQSEEGDSSDDSSEDSSSDSGSGSESELENKRTAKKNAKNKGRSDSEDGEKENEKSKTSESSSAESSSVEESSSDSESESESASKPESR	30073	82158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_30232_34949_35048_36609_36665_36751_36824_43126_43190_45748_45882_50600_50711_57186_57364_67008_67076_67135_67196_68162_68294_75000_75110_78701_78859_82020
600602	contig_15628_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_147693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGAAGGAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102076	101200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_101200_102100
600605	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600612	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600619	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
600628	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
600630	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600631	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600680	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600684	contig_5686_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_45405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	904	1218	174091	173777	NA	30	CCTTCTGCAAAAGGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGVWVEKLLTLKAEETKGTLSSSTITTSSIGRNFREHWSPWVVQRVNGSAANQKVGGSNPPAAPWEKDVAVLFHKGYSLGNPMGQFYSVLQGHYESELTLQQ	174994	172431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_172400_175000
600690	contig_12654_pilon	-	1620	13	Intergenic	novelGene_129301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	459.964914120873	1030	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	43	1143	788119	759069	FALSE	10	GTCTTTGCTTTCTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRASLAAALVAAAMLGRDRLLSVLLAAAASCAMAQHVPPWTEDCRRSMYPPSGPTYRGPVPWYTVNLDLPPYKRWHELMADKAPAPGLLGPLPSPFEEEMKGIAAVTEIPLGEIILFNIFYEFFTICTSIVTEDKEGHLLHGRNMDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788161	758591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_768979_769059_771768_771860_775941_775989_788041
600699	contig_15236_pilon	+	2520	19	Intergenic	novelGene_141592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_11	21.3104622772275	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	108	2285	456726	511415	FALSE	20	AAGCTAACGTGTGTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVAGGGQDACGGKGLRRETQLLGEGVGEQLDSRNMAAASAVSMLLVAAERNQWQRLPSLRLPPRRWTGKQRSMKYTTTTGRSITKVLIANRGEIACRVMRTARKMGIQSVAVYSEADRNSIHVDMADEAYCIGPAPSQQSYLAMEKIIQVAKVSAAQAVHPGYGFLSENPEFAELCKQEGIIFIGPPSSAIRDMGVKSTSKSIMAAAGIPVIEGYHGEDQSDQCMKEHAGRIGYPVMVKAVCGGGGKGMRIVRSEKEFQEQLESARREAKKCFNDDAVLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNTVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPGPGIEAEVRRKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHNFYFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQEEITLQGHAFEARIYAEDPNNNFMPVAGQIVHLSTPQTDLCTRIETGVREGDEVLVHYDPMVAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLHTNIDFLLSLSGHPDFEAGNVHTDFIPQHHTELFPAQRATAKELLCQAALGLILKERAATDAFRLKAQDRFSPFASSSGRRLNICYTRNMTLRDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIDDKTFRVLGDLHSEGDCTYLKCSVDGVASKAKLIILENTTYLFPQEGSVQIDFPVPKYMSSVSAEGTQGGTVAPMTGIIEKVFVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKAPKDGTIKNVFHQEGSQANRHAPLVEFEEEESDKRESE	456618	511650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_456815_460858_460906_462590_462728_465310_465407_472155_472278_472737_472886_472958_473081_482969_483082_488131_488214_489403_489532_492971_493156_495822_495933_497260_497478_499243_499331_503696_503747_505706_505845_507515_507624_509859_509932_511286
600703	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	3	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	34808	36661	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
600710	SIRV2	-	255	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	650	43	650	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACAAGACATTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4082	3686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
600713	contig_14441_pilon	+	1323	5	Intergenic	novelGene_100734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	422.027842683395	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	360	872	121136	126062	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	120623	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120819_120971_121239_125517_125902_126036_126283_126514
600717	contig_12624_pilon	-	1399	5	Intergenic	novelGene_61140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	196	501	952979	948779	TRUE	60	AAAGTTCGAAAAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955834	947514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947575_947940_948842_950590_950768_952913_952985_955644
600720	contig_12279_pilon	+	1032	6	Intergenic	novelGene_50087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2486.82938699059	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	71	589	68297	77128	TRUE	45	AAACAAAAGCTGTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVAGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57532	77612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_71633_71711_75031_75096_76928_77494_77534
600741	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1544	635	1089	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2544	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
600743	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_96111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
600764	contig_7202_pilon	-	158	1	Intergenic	novelGene_16432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27780	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600781	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
600782	contig_11171_pilon	+	1389	7	Intergenic	novelGene_48605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	584.391706534809	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	23	904	212165	251467	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKVTPTQGGVSPCWCSPTVVITLPCQAASAMNTETNVALFTRLHVGNGKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212142	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_237657_237796_239236_239336_249980_250068_251407
600787	contig_10734_pilon	-	1694	4	Intergenic	novelGene_51024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	117	596	320506	311551	FALSE	15	CTTGTACATTTTTTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320622	310452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
600803	contig_10627_pilon	+	2258	3	Intergenic	novelGene_59915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.5	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	29301	30355	TRUE	20	ACTTAAACCTGTGCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYREWLRHGVLLSHRQNLVY	29299	33054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30711_31515
600814	contig_6576_pilon	-	2054	11	Intergenic	novelGene_42269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	546.842902486628	3	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	145	954	339439	324053	TRUE	25	TTATGCCTTTTTATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPVQRQVFSIDHLHQQQQFLLHSLQLLSLFSPVPDRLRQLSKDLLVQISSL	339583	321940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326629_329133_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
600821	contig_15047_pilon	+	1175	6	Intergenic	novelGene_52239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3018.18760185645	62	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	160	435	3242	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPCGISTPPCPGPAAGSPTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2558	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2616_2743_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21302
600822	contig_14513_pilon	-	1074	3	Intergenic	novelGene_70289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	184	348	18880	12143	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11910_12038_12153_18725
600832	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_18108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600846	contig_4891_pilon	+	1042	6	Intergenic	novelGene_124574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_3	452.46100384453	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	136	687	707907	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	707771	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
600851	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
600852	contig_16121_pilon	+	2106	5	Intergenic	novelGene_6865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	595	junction_1	263.684470532491	4	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	97	1503	57746	62826	FALSE	25	TTAGAGTAAGCATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33614	63429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
600861	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
600862	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_97242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
600865	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
600876	contig_10855_pilon	+	2449	5	Intergenic	novelGene_124387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	23.4773827331754	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	245	1168	832604	835148	FALSE	10	CATTTGTGTGTTGCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETFWNLASVDWCIQVKTNGSSLQQDIFGNEISNDEKIKSFIRNDSLIDLEEKGKLHHNEGQPQIKKKHSREHVSGHRGQKIPACEVCGKTFSYSSSLKVHLRRHRGEKPYECKECGKAFSCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFSFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTFYSSLHRHWKTHSEPKPYECKQCGKGFRCPKYFQQHVNMHSREKPYECKECGKVYSMPANLRQHMITHSSERPYECKQCGKSFRWTTSLRLHRRTHSSEKPYECKQCGKVYKCLISLEGHLRKHTGENP	819266	836429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_819352_826613_826680_832510_832638_833903_834085_834439
600878	contig_14322_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_116555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
600883	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600889	SIRV6	+	341	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	133	11	37	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
600891	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_17663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600894	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_16619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27848	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
600908	contig_11429_pilon	+	1538	6	Intergenic	novelGene_60459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	845.287548707539	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	73	429	46162	47494	TRUE	20	CGATACTGACAGTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGKWWGPGLWEQQV	45419	49495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47374_47457_47552_48443
600910	contig_5280_pilon	+	1727	8	Intergenic	novelGene_52629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	722.162003420059	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41004	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_41075_41732_41833_42902_42989_47278_47508_56218_56282_56332_56384_62043_62065_78042
600913	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
600922	contig_11429_pilon	+	1506	6	Intergenic	novelGene_60467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	804.609818483468	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	412	882	46162	48504	TRUE	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45750	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899
600931	SIRV4	+	147	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1167	2	-1167	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTGGTTCGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
600934	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	2	361	14434	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
600938	SIRV4	-	190	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTATTAAAGAATCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	2570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
600944	contig_2125_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_147734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTCAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635279	636255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_635300_636300
600950	contig_14925_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_55249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCACCAGGGCTCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109327	108490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_108500_109300
600961	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	643	966	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
600969	contig_14209_pilon	+	2307	13	Intergenic	novelGene_88333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	229.50313178691	2	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1524	1919	40155	40625	FALSE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32327	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35617_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38271_38783_40142_40344_40418
600972	SIRV2	-	267	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	53	3412	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
600988	SIRV4	+	181	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	1122	13	-1122	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTCAACGACGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
600992	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
600997	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91679	0	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
601004	contig_15666_pilon	-	1746	7	Intergenic	novelGene_70214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	134.088797278354	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	153	1151	132068	129088	TRUE	40	ATACAACTGCCAAGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132220	128417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_128784_128858_129110_129280_129375_130018_130298_130515_130795_131446_131711_132007
601005	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601012	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601014	contig_6589_pilon	+	1083	8	Intergenic	novelGene_26107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3182.61701453764	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	22	564	1876599	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876577	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879284_1879546_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
601030	contig_10109_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_131326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCGATACATAGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153228	154028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_153200_154000
601031	contig_10109_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_131327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154587	155452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_154600_155500
601038	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601045	SIRV5	-	402	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1102	1175	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTGCGATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3508	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2199_3299_3403_3481
601048	contig_1406_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_25600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAATGACATGAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2182938	2183645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2182900_2183600
601058	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
601082	contig_15304_pilon	-	1293	5	Intergenic	novelGene_30413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	1538.77857406451	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	197	1156	54100	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54296	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991
601088	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601090	contig_8576_pilon	+	1617	9	Intergenic	novelGene_88786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	519.968688961172	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	15	1409	893619	915551	FALSE	20	TTAGTTTTTTTTGTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893604	915759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910630_910683_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
601093	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
601094	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_94853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601114	contig_4402_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_140794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2033	2395	209903	209541	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWWFLKKRKIELPYDPAIPLLGIYPKDLKTETQTPMFTAALFTIVKRCKQPNCPSTDEWINKMWYIHATEHYSASRRNEVLIHAPVWMELEDIILSKISQSQKNIHCMTSLI	211935	209146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_209100_211900
601124	contig_19459_pilon	-	529	4	Intergenic	novelGene_59823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5957.3493732998	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	49	327	11335	6868	FALSE	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQNRFISMLARQQSYKFNL	11383	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6922_7789_7946_10268_10332_11329
601132	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601134	contig_14513_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_70396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GTGTCAGTGTAGAGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
601143	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601145	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_90562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
601165	contig_19775_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_147749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCTCTTGTTTCTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200720	199947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_-_199900_200700
601172	contig_6795_pilon	-	2566	4	Intergenic	novelGene_27756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	304	junction_3	734.668632786238	1326	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	105	1016	396012	373855	FALSE	25	CAATTGTCTGATGCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKFQEDSDPERSDYEEQQLQREEEARKVKSGIRQMRLFSQDECAKIEARIDEVVSRAEKGLYNEHTVDRAPLRNKYFFGEGYTYGAQLQKRGPGQERLYPPGDVDEIPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHIFERPIVSVSFFSDSALCFGCKFQFKPIRVSEPVLSLPVRRGSVTVLSGYAADEITHCIRPQDIKERRAVIILRKTRLDAPRLETKSLSSSVLPPSYASDRLSGNNRDPALKSKRSHRKADPDAAHRPRILEMDKEENRRSVLLPTHRRRGSFSSENYWRKSYESAEDCAEAAGSPARKVKMRRH	396116	372304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_374033_374891_375048_387155_387237_395515
601175	contig_709_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_57647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCTACCCAGATGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3084879	3083571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3083600_3084900
601188	contig_9243_pilon	+	2122	4	Intergenic	novelGene_60305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18489	27585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_20197_21196_21260_25151_25222_27303
601189	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
601192	contig_15063_pilon	+	1328	4	Intergenic	novelGene_14254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	15	1190	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34793	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
601200	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
601206	SIRV6	+	900	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	46	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	406	741	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1849_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
601209	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
601236	contig_2069_pilon	+	1781	13	Intergenic	novelGene_23252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	304.133970845452	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	188	1030	333898	341321	TRUE	20	GTGTCTGCTGAATGCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323999	345517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_345282
601237	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	GGTCTTAGGTGGAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
601251	contig_7744_pilon	+	2549	15	Intergenic	novelGene_62455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	124.136281265916	9	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	35	1072	399829	405773	TRUE	5	GATTTCCTCTCTGCGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARTLGGGRWEVVKKGRRPAAGGNNKGGGRGDRRALGEANGVWKFDLTPAIQTTSTLYELGFEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALKALDVAALQKELDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKAAGSLELFFDHCLFTMLQELDKTPGESLHGYRICIQAILQEKPKIATTNLGKFLELLRSHQSRPAKCLTIMWAIGQAGFASLTEGLKVWLGIMMPVLGIKSLSPFAIAYLDRLLLMHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLDFAYMPNNSLTPSPSGLPTRTC	399794	408606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_399977_400930_401131_401634_401786_402086_402222_402436_402520_402945_403052_403158_403241_404091_404194_405742_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652_407931_407996
601255	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
601260	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_19097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601264	contig_2854_pilon	-	2616	5	Intergenic	novelGene_120836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	56.5862174031804	8	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1736	2422	274434	257841	FALSE	15	GAGCTCTTCCGTGACTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	277204	257646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368_274512_275546
601284	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_96502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601315	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601316	contig_13093_pilon	-	2583	3	Intergenic	novelGene_105224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.5	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	95	2386	77623	57754	FALSE	35	GTAATCCAAGAATGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHSGEKPYVCRECGRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCKKCGRGFNRKSDLLMHCRTLLGEKPHVCKECGQGFTNKSNLLRHHRTHSGALTISYTSSCTRKHSGRELCGAGSVGGTSF	77717	57556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57849_58609_60773_77589
601317	contig_14711_pilon	+	2130	12	Intergenic	novelGene_68904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	363.099990781858	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	642	1892	86227	90570	FALSE	20	TCAGACCTCAGTTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	82016	90808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_82134_84855_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
601330	contig_8330_pilon	+	2998	1	Intergenic	novelGene_71945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCCAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390966	1393964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1391000_1394000
601341	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
601353	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601361	contig_5954_pilon	+	349	5	Intergenic	novelGene_28435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2084.67359555399	41	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	236	310	98909	98983	FALSE	20	GCCCAGCCATCTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQQGSHFSRRHAALCSRPGATHPRGDRPGDGRPDQGSCSVSGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97547	99022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98039_98637_98694_98857
601362	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
601367	contig_12301_pilon	-	1883	9	Intergenic	novelGene_110024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	280.159775842286	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	224	709	129204	110775	TRUE	25	CCAAATTTGTGTCATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRVCR	136745	102020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113634_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116180_129132_129213_130605_130737_136661
601368	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGTCAACCGCCAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601373	contig_3825_pilon	+	1498	6	Intergenic	novelGene_77923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	994.303897206483	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	20	595	12232	14551	TRUE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIEVRAACPYLWLLTSGRVLMSLLEGWMA	12212	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_15302_15498
601378	contig_7083_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_125166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTACCTTATTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187725	185903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_185900_187700
601379	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601388	contig_7860_pilon	+	1731	6	Intergenic	novelGene_147754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_5	114.983477073882	130	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	103	411	24619	29844	FALSE	15	ATATTTGTCCTTTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSASDKPVCGELVSVAHALSLPAESYGNDPDIEMAWAMRAMQHAEVYYKLISSVDPQFLKLTKVDDQIYFEFRENFEKLRIDVLDPEELKSESAKEKWRPFCLKFDGIIEDFNYGTLLRLDCSQGYTEENTIFAW	22815	31164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7860_pilon_+_22840_22927_22994_24606_24667_25168_25310_26911_27024_29836
601394	contig_14925_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_55202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	1539.44460358273	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	212	469	29675	27020	TRUE	30	GAAGAGCAAAGGCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTGFQKLVFGTGTQLLVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	42396	25799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_42337
601416	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	1	1308	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
601418	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601425	contig_11590_pilon	+	2505	6	Intergenic	novelGene_125586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_5	144.811601745164	294	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	431	1765	721738	748816	FALSE	25	TAATCTATGCATGTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDAHTAVVGIPHGLEDWSFFAVYDGHAGSRVANYCSTHLLEHITNNEDFRAAGKSGSALEPSVENVKNGIRTGFLKIDEYMRNFSDLRNGMDRSGSTAVGVMISPKHIYFINCGDSRAVLYRNGQVCFSTQDHKPCNPREKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDYDYKCVDGKGPTEQLVSPEPEVYEILRAEEDEFIILACDGIWDVMSNEELCEFVKSRLEVSDDLENVCNWVVDTCLHKGSRDNMSIVLVCFSNAPKVSDEAMKKDSELDKHLESRVEEIMEKSGEEGMPDLAHVMRILSAENIPNLPPGGGLAGKRNVIEAVYSRLNPHRENDGASDEAEEGGSQGKLVEALRQMRINHRGNYRQLLEEMLTSYRLAKVEGEESPAEPAATASSSNSDAGSPVTMQESHTESKRDLAELESSNEDAGTKMSDEKI	670483	749556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_670795_721618_722479_730017_730136_737255_737368_737762_737821_748510
601445	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601447	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	0	35782	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
601449	contig_10437_pilon	+	2257	3	Intergenic	novelGene_38265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_2	158	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1315	1674	405392	407700	FALSE	35	ATATATTTGGTGTCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	404077	408283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_405546_405816_405923_407600
601453	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_18671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30081	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
601462	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_89566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653768	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601465	contig_7202_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_17686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCATCTTCCGCAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
601471	SIRV2	+	650	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGTTCTAGGCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1734
601508	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601509	contig_17440_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_7591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTTAAGTCTTACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3320	3020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3000_3300
601512	contig_13894_pilon	+	1249	10	Intergenic	novelGene_62125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2658.61893972541	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	996	253	1248	522731	528172	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMDRLRKTELQRKKELNVRNRLYSWWDLNKKYFLV	520695	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521755_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527558_528072
601525	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	880	-4	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
601532	contig_17470_pilon	-	1884	14	Intergenic	novelGene_110530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.7869432971453	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	237	1511	277215	270076	TRUE	35	AAACTATTCAAACTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302585	269600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_269677_269778_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302355
601547	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
601556	contig_5935_pilon	+	2406	4	Intergenic	novelGene_102724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	29.698484809835	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	20	517	1105392	1114767	FALSE	10	TAACTTTCCCGTGGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGGAKMDALRAREQLRRRYLFPQDAEAQLNSESGPGAETSTAVEKKEKPLPRLNIHSGFWILTSIAVTYYVDFFKTIKENIHTSSWFLFGGALLLVSLSVAFYCIIYLEWYCGVEDYDAKHPSLIPITTATFIAAGICFNIALWHVWSFFTPLLLFTQFMGVVMLISLLG	1105372	1116656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1105489_1107351_1107494_1111358_1111518_1114667
601561	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601563	SIRV6	+	287	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	237	11	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGCCCAGCGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
601565	contig_7396_pilon	-	1492	15	Intergenic	novelGene_79632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3435.28243202143	39	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1275	218	1492	255163	245940	FALSE	15	AACCTATTTTTGGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQSNNNNSPRPWHSIQSSVQNVMLFCKKRFMIFKINLV	257486	245939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246048_247736_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
601576	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114687
601577	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601578	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601583	contig_14322_pilon	-	315	2	Intergenic	novelGene_116392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671835	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
601589	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91668	2	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
601591	contig_7815_pilon	+	1739	11	Intergenic	novelGene_134409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	66.6340003301618	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1626	112	1737	880704	933798	FALSE	25	GTAAGTACTCTTTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLWLTGSVRFRRAARPGLRAPTLRPQVPNTQEPPNKKMLLRGMRTSWTTAFTYLSHIKKAELEAAVRKKIEFERKALCIVEQLLEENITEEFLKDCGMFITSAHYSDVVDERTISKLCGYPICQKKLGIVPKQKYRISTKTNKVYDITERKSFCSNFCYKASKFFQAQIPKTPVWIREEERYPDFQLLKEGQSGHSGEEVQLRSQAIKMSDIENPGHSEKQYESSSSSTRSDSSSDNEQDFVSSILPGNKPNAAGISPQLHKKSIMRKKAGHKVNPKHNDKEQAIVDVAERLDNCRLDSQEKAAACVLPSQNVNAQISSNNPLQEKLKASENKYSSSEVTLVGISKKSAEHFKRKFAKSNQVSRSASSSVQVSPEVAKTNLLKVLKETLIEWKTEETLRFLYGQNYASVCLKPPSVCLIEAEELDEDDLNSDPVSHPLVLRESQNSLDEALPFRGSDTAINPLPSYENLKKETETLNLRIREFYRGRYVLNEESSMSQDSEERNLTFPLMDSSSQNQIRKRIVLEKLSKVLPGLLGPLQITLGDIYTQLKNLVRTFRLTNRNIIHKSAEWTLIAMVLLS	879701	933800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_879780_880670_880766_890607_890723_891955_892055_892263_892330_893856_893946_909891_909928_911918_912847_914980_915064_918056_918138_933731
601599	contig_2890_pilon	-	1192	11	Intergenic	novelGene_60288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_10	484.264483521144	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	167	865	356543	336651	FALSE	25	AAACTCTGTTTAGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIATKDPLNPIKQDVKKGKLRYVANLFPYKGYIWNYGAIPQTWEDPGHNDKHTGCCGDNDPIDVCEIGSKVCARGEIISVKVLGILAMIDEGETDWKVIAINVDDPDAANYNDINDVKRLKPGYLEATVDWFRRYKVPDGKPENQFAFNAEFKDKDFAIDIIKSMHDYWKALVTKKTDGKGISCMNTTVSESPFKCDPDAAKAIVDALPPPCESACTIPTDVDKWFHHQKN	369061	336323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_336683_337286_337330_338549_338620_341426_341513_341986_342115_351451_351579_352504_352592_355560_355681_356537_356592_368254_368314_369002
601615	contig_2453_pilon	+	2027	13	Intergenic	novelGene_147760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	54.2775787554636	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	109	1899	56543	62827	TRUE	10	ATTTGTCGTTTCTGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	55577	63146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_55657_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
601622	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_96509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601627	contig_13044_pilon	+	1772	2	Intergenic	novelGene_100016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTTGCCTACCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439180	441368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_439239_439654
601634	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_93445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
601637	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601639	contig_7182_pilon	-	556	4	Intergenic	novelGene_117162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_3	700.856777253543	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	130	555	889318	888215	FALSE	30	CTTATGAGAAGAAGGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCVWLPLSQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQ	891389	888213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888345_888814_888961_889168_889333_891274
601669	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_89173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
601672	contig_20844_pilon	-	289	5	Intergenic	novelGene_78616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_4	295.07403731945	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGAGACCCGGAAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209171	207919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
601686	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601698	contig_6102_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_32198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1381.2103387971	4988	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	40	546	905250	896086	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKVSKVFLGVVLNQNFSTLALLTFWGNNFSPLRIAADLSDFLQ	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
601708	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
601711	contig_12080_pilon	-	1972	5	Intergenic	novelGene_128420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	23.9622098313156	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	50	403	590008	577487	TRUE	25	TGTGTCATTAATAGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASAVAEATAEGVLDKMKLIILENYSQASEWAAKYIRNRIIQFNPGPDKYFSLGLPTGSTPLSCYKKLIEYYKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGDDPHHGCSQGVCVVQGHRGGCEPYVDRVCLPAASLRSVCVR	590955	575075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_576598_577439_577615_586384_586487_589884_590015_590912
601720	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
601754	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
601768	SIRV5	+	338	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7625	-1	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTTAGCCGAATAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
601776	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
601779	contig_18794_pilon	+	2055	12	Intergenic	novelGene_54639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	407.52112960481	156	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	391	951	145406	166512	TRUE	35	TTCAAGACAATATATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEEDCHSESVRAEDDEKESPAETDLQAQLQMFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISETLKYGVWPA	145015	172943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145409_152183_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_163117_163246_166480_166600_166781_166873_167941_168038_168360_168455_169970_170123_172359
601780	contig_5033_pilon	-	1348	8	Intergenic	novelGene_29004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2701.64428390095	11	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	29	349	566787	533879	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLHLDPCPCFL	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531537_532161_533382_533491_533794_533908_544642_544686_545249_545325_547551_547686_566747
601783	contig_13051_pilon	+	1918	17	Intergenic	novelGene_140091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	114.612782200547	755	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	93	1811	60194	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGELLSYQPNRGTKRPRDDEEEELKMRRRQGGTRERGRYREEETTVVEEADDDKKRLLQIIDREGEEEEEEEEPLDESSVKKMILTFEKRSYKNQELRIKFPDNPEKFMESELDLNDIIQEMHVVATMPDLYHLLVELNAVQSLLGLLGHDNTDVSIAVVDLLQELTDIDTLHESEEGAEVLIDALVDGQVVALLVQNLERLDESVKEEANGVHNTLAIVENMAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHTNSQPDDYKDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60101	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_225559_225587_233732_233871_234075_234149_245391
601791	contig_13542_pilon	-	1363	8	Intergenic	novelGene_131492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGCCCAGGAGTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506223	346556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_346639_417044_417134_453981_454101_464615_464734_487357_487453_499877_499936_500884_500959_505495
601803	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
601832	contig_14142_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_120570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCTGGGAGACCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470996	471863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_471000_471900
601845	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1814	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
601851	contig_1406_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_25638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGCTTAAAATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2675065	2673438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2673400_2675100
601858	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
601859	contig_8712_pilon	-	1307	3	Intergenic	novelGene_58823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	350	709	322912	321995	TRUE	55	AAAAAAAAAATTTTCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYNKLYFCKIKPDFGFLRNRPGLIRDKPLKSVRQDLCHQGWGGVDRMVRAQGWFHPILASTVSKSKATCGFSARDHHQKGPLRQGKEPAHGRLPEDIQTGQQPQLDGMSWGHGWAGDP	323261	320016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_320308_321687_322284_322841
601866	contig_7202_pilon	-	643	4	Intergenic	novelGene_18567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_2	11452.731416081	1883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	201	641	29911	27897	FALSE	25	ATTGGGTGACTACGTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHLCDFIETHYLHEQVKSIK	30111	27894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28169_28486_28634_29797
601873	contig_12427_pilon	+	1428	2	Intergenic	novelGene_40421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	362	junction_1	0	6939	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	792	1325	209839	210372	FALSE	25	TCTAAGCTCAGAGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	208956	210475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_209737_209827
601879	contig_9345_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_24481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCCCTCCCTCCCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632723	631572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_631600_632700
601880	contig_11978_pilon	-	3009	7	Intergenic	novelGene_62890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	21.8454165037479	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	62	751	760226	755796	FALSE	0	CCTGGCCTGGTCTTGCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGPMRKNYRGDLEAFEEAHLTSLDPIKQFAAWFEEAVQCPDIGEANAMCLATCTRDGKPSARMLLLKGFGKDGFRFFTNVESRKGKELDSNPFASLVFYWEPLNRQVRVEGPVKKLPEEEAECYFHSRPKSSQIGALVSHQSSVIPDREYLRKKNEELERLYQEREVPKPEYWGGYVLYPRVMEFWQGQTNRLHDRIVFRRLPAGDSPLGTMTHRGEEDWFYERLAP	760287	753537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_755962_756175_756247_756550_756680_757157_757212_757922_758023_759049_759175_760181
601895	contig_9901_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_126925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACATTCCACAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127132	126733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_126700_127100
601897	contig_5031_pilon	-	2420	16	Intergenic	novelGene_133209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_15	323.994951949701	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	485	2269	116574	84514	FALSE	15	TGTCCCTTGGGATTAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVREPQPVTMIADELVFFVNGKKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRFQNKVIHFSATACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKMRLHPVQETIAKNHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNQPEPTMKEIEDAFQGNLCRCTGYRPILQGFWTFARDGGCCGGNGANPNCCMNQKKNPTEVTLSPSLVNPEDFMPLDPTQEPIFPPELLRLKDVPQKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQYPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNKLFPVIICPAWIPELNSVEHVPEGISFGAACPLSSVEKTLVDAVAKLPAHKTEVFRGILEQLRWFAGKQIKSVASIGGNIINASPISDLNPVLMASGAKLTLASQGTKRTVQMDHTFFPGYKKTLLNPEEILLSIEIPFSREGEFLSAFKQASRRDDDIAKVTSGMRVLFKPGTLEVKELAICFGGMADRTISALKTTQKQLSKFWNERLLQDVCAGLAEELHLSPDAPGGMVEFRRTLTLSFFFKFYLTVLQKLGEEDSEDNCGKLDPTFASATLLFQKDPPANIQLFQVSSRQRVVNIRGLCRSHFPE	117058	84362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_84661_87127_87303_88120_88306_90741_90852_92327_92422_93663_93816_94581_94675_97342_97485_98635_98726_99042_99112_102699_102762_103672_103800_105906_106016_107368_107466_110278_110337_116499
601899	contig_960_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_108292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACAGTTTGTTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034741	1033889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1033900_1034700
601936	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
601941	contig_6888_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_147060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTACTTCAGGTGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12232	11210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_-_11200_12200
601942	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
601947	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
601959	contig_17875_pilon	+	2853	10	Intergenic	novelGene_143174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_6	71.83331185013	360	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	86	1450	39073	80150	FALSE	10	CGTTATTGTTTGTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELATRSQIPKEVADIFNAPSDDEDFVGFRDDVPMETLSSEESCDSFDSLESGKKQDVRFHSKHFTEELRKIFIEDTDSETEDFEGFSQSDLNVKSDPEIMLVESDLSDDRKASLLSEEDEEEEKATPRRSRPRRSSIGLRVAFPFPTKKLANESDKKNSSSEPLHSSSCLQDNKKTVLGRQKSCRQWKQREDSASESEDDSRDEGQESSDALLKRTMNIKENKAMLAQLLAELNSMPDLFPVRTPNSALKKKTVRRAFSEGQIPRRTNPTRSARPPEKFALENFTVSATKYAEEFYSFRRRKTISGGKCQGYRRRRRVSSFRPVEDITEEDLENVAITVRDKIYDKVLGNTCHQCRQKTTDTKTVCRNQGCGGVRGQFCGPCLRNRYGEDVRSALLDPDWMCPPCRGICNCSYCRKRDGRCATGILIHLAKFYGYNNVKEYLESLQKQLVEDN	38987	81553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_39097_65210_65352_70946_71085_73534_73910_75808_75881_75994_76166_76881_77008_77912_78063_79145_79283_80119
601986	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
601989	SIRV4	+	332	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	445	173	-445	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATTGCCATTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
601993	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
601996	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91672	0	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
601998	contig_6795_pilon	-	2572	13	Intergenic	novelGene_27773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_12	40.1517953106292	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	973	1896	499724	483470	FALSE	40	AAAGAATGATTCTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVCHRIHRSLASQFKYALVWGTSTKYSPQRVGLTHTMEHEDVIQIVKK	504874	482793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504009
602002	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
602003	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
602022	contig_9345_pilon	+	1902	14	Intergenic	novelGene_24467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_12	103.689283224552	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	34	1530	586748	631273	FALSE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDMNSQGSDSNEEDYDPNCEEEDEEEEEDEDPGDIEDYYVGVASDVEQQGADAFDPEEYQFTCLTYKESEGALNEHMTSLASVLKVSHSVAKLILVNFHWQVSEILDRYKSNSAQLLVEARVQPNPSKHVPAAHPPHHCAVCMQFVRKENLLSLACQHQFCRSCWEQHCSVLVKDGVGVGVSCMAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLALPWLQPFLLLTLLLCPYSLNTSRLSWRLRSKTCHGRWSVQTAMIEGTWRIRCT	586714	631645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_587009_614186_614255_617044_617109_618458_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630887_631028_631248
602027	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	842	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
602037	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
602044	contig_4156_pilon	-	2906	16	Intergenic	novelGene_88079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	79.2385988994982	207	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	359	2584	433791	161269	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKTEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGKSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYEVICQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQEDLLLFSCAGAHPRHQRICPCRDFIKGQVALCKDCL	434149	160946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_161468_169170_169329_182021_182097_187879_187997_196659_196807_209648_209799_272130_272265_299446_299581_305919_306055_310022_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550
602064	contig_13924_pilon	-	2775	3	Intergenic	novelGene_147774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	212	junction_1	15	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTAAAGATGATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38716	14597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_16924_28016_28149_38399
602071	contig_10923_pilon	+	1753	10	Intergenic	novelGene_66166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	790.903764962653	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	112	1635	21667	42718	FALSE	10	CTTGTAGGTAGCTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13767	42836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42554
602080	contig_18869_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_56041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73555	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
602084	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
602091	contig_6316_pilon	+	1902	13	Intergenic	novelGene_134698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_4	170.577613484954	211	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	108	1556	140480	157164	FALSE	20	GGTTACTTTGTTCTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSKRTHCPDWDSRESWGHESYSGSHKRKRRSHSSTQENRHCKKPHPQFKESDCHYLEARSLNERDYRDRRYIDEYRNDFCEGYVPRHYHRDIESGYRVHCSKSSGLSRKSSLKRKHNRHCSSHHSRSKSHRRKRPRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136274	157510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_145291_145515_146617_146709_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
602100	contig_14322_pilon	-	977	5	Intergenic	novelGene_115686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3150.34875053541	547	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGCTGGTGTAAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674880	671270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672409_672810_672934_674670
602107	contig_5954_pilon	-	1755	11	Intergenic	novelGene_28594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	450.540386646969	3	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	268	1389	948112	945083	FALSE	5	CGTCCTTCTCTGAGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960587	944716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948137_959810_959941_960474
602116	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
602121	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602134	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602135	contig_1406_pilon	+	2010	7	Intergenic	novelGene_25552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	744	1070	2137376	2141072	TRUE	5	GGCTCTGGACTGGGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYQKVCIQCLPSTLYYLIVFWYHQIPMLSWFLYLSLNLLNSSLRLHDVVSKQDHSTCWSTMEDETGSTTSLRRVLPLYCCQTNILIVLQFPIQSRSLVLNFRILAVL	2136632	2159727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2137453_2139835_2139992_2140978_2141122_2143212_2143524_2143562_2143630_2147742_2147923_2159394
602139	contig_10082_pilon	-	2703	3	Intergenic	novelGene_63871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.5	4	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	259	1041	215403	212085	TRUE	25	GATCTCATGTGCGTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEALQEGAAHLARLWLLHLLGEGHPLTLFSCFFSTLHLTFVKAWHHRHRRQHLAGCTGRPCWSGAPCGWHLCRLAPVCQGLMNVDMAGVLTRAWLAPAENLPSAVMPEGAVLLWGESSALALGCCVLPLQGLKLRPAPRLWTGGQPLAEAPVPTLSCSVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	215661	210272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053_212198_214733
602143	contig_12142_pilon	+	3188	1	Intergenic	novelGene_147842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	144	452	235118	235426	NA	25	TATGTGCTTGTAGTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDVAVPSHLYKVILARKSPVSPEPLALGAFVVPNEAIGFQPPLTEFQMSLQDLEKLSGLVFFPRLDRTNTIRNLCAVDTCKLLDFQEFTLYLSTRKIEGASSVLRLEKIMENLKKAGIEPDGHFLSVYEKKLEELKAKEQSGAQERKPS	234974	238162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_235000_238200
602151	contig_15063_pilon	+	1260	5	Intergenic	novelGene_14387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	121	1005	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35150	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
602152	contig_7412_pilon	-	2010	7	Intergenic	novelGene_76322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1542.39215362227	1	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	147	1364	377290	365925	TRUE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGELAEGGQCWERNGGGPAVEWGLLGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVSSWPFPLLIQSLLSIPRMEKLTRYVSCSPGGAAAALPQPELGDPSSPACETPP	377436	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_366041_370159_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
602153	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602174	contig_9290_pilon	-	1617	11	Intergenic	novelGene_77545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	399.810405067202	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	490	1032	486192	481336	TRUE	30	TAGAGTTATCTTTGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGER	496991	478602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480078_481332_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490034_491484_491545_496930
602175	contig_12019_pilon	+	1079	6	Intergenic	novelGene_87630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.2011952048953	177	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	460	774	5225	8336	TRUE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKALSPSGILS	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_5400_6114_6226_8307_8485_8528
602184	contig_19647_pilon	-	1825	8	Intergenic	novelGene_144005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_3	304.708961175099	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	197	913	137920	85405	TRUE	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTIASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAGGKKGARKSKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQKETRWRRKVAKSLWRLFWNSGKRMGPWKLPEPLSVQATACPPSS	146568	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_102559_102668_112495_112694_113103_113211_137748_137954_146405
602189	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
602191	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602202	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602204	contig_18869_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_56024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73538	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
602210	contig_10734_pilon	+	747	6	Intergenic	novelGene_51425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	46.2272646822197	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	28	681	2120928	2127798	FALSE	75	ATTAAAAGGAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGH	2120139	2127864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606
602211	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_90573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602220	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_17840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602231	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602238	contig_5696_pilon	+	2113	2	Intergenic	novelGene_117521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCTCCGAGCGCCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434708	438721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_436782_438681
602245	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
602248	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
602250	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_95105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602251	contig_19812_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_100998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGAACTGGAAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21950	19913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_19900_22000
602263	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
602266	contig_12790_pilon	+	1629	12	Intergenic	novelGene_35213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	296.034200615206	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	310	795	308748	310395	TRUE	15	GTTTATAAGGGGTGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVALTVCCQ	305931	313337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307343_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310173_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348_312390_312711_312844_312960
602283	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
602286	contig_6726_pilon	+	1553	14	Intergenic	novelGene_86230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	680.459529727987	1217	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	155	1411	289880	333034	FALSE	20	ATCTTATTGTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287826	333176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_289824_289889_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
602315	contig_4686_pilon	+	3408	2	Intergenic	novelGene_118602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	72	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	152	715	947507	969584	FALSE	20	CTAACTTTGGTGTACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNTTSLGSPWPENFWEDLIISFTVSMAIGLVIGGFIWALFVCLSRRRASASISQWSTNRRPRSSYNHGLSRTGFYRHSGCERRSNLSLASLTFQRQASMEQANSFPRKSSFRASTFHPFLQCPPLPVETDSHLMTLPSSSASPTSNTSHSLSRPDFHWSNNNLRIGFSPPPPPAYESIIKAFPDS	947355	972277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_947559_969072
602320	contig_12923_pilon	-	2571	15	Intergenic	novelGene_30111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	371.33095557929	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	677	2128	68226	48997	TRUE	5	CTCGTGTGTGTCCCATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	93733	45988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73232_73299_75674_75878_77618_77720_93602
602327	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_97081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602339	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_95068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602351	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
602353	contig_3469_pilon	+	2777	1	Intergenic	novelGene_34219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561136	563913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_561100_563900
602356	contig_10299_pilon	+	3066	21	Intergenic	novelGene_79705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	96.8142035034116	1	112	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	34	1149	320559	336816	TRUE	20	TGGAATGCTTTGACATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAQREPEGRRVPSGDPGAGAADPGCAAVH	320525	340526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336227_336733_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
602363	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAACATCCACTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
602364	contig_211_pilon	-	2951	1	Intergenic	novelGene_129887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCGTCTCGTCTTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351953	349002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_349000_352000
602371	contig_3095_pilon	-	1119	6	Intergenic	novelGene_75263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	75	872	255481	246716	FALSE	10	CTGTTTCTGTTCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255555	246468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
602372	contig_10949_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_146694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGCTCTCTTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123901	124929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_123900_124900
602387	contig_14745_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_147845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6863	6659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_-_6700_6900
602392	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	635	1112	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
602398	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602399	contig_11986_pilon	-	2145	11	Intergenic	novelGene_69209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1011.52857102506	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	165	1823	792566	734311	FALSE	40	TAAAGAAAAAGGTGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCAPRGGVRRPGQTWGRRPRSPSPSASTALCRGLPPASLTTASWAGALRFEVELMSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	794749	733988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734838_745322_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
602406	contig_12427_pilon	+	1722	14	Intergenic	novelGene_40501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	189.543643785299	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	304	1416	411330	419950	FALSE	30	TGAAATTTGTCTATCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	404947	420256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_404967_407156_407253_410177_410221_410320_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
602409	contig_14322_pilon	-	333	2	Intergenic	novelGene_116337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671852	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
602417	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602437	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
602438	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
602455	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
602460	contig_12270_pilon	+	354	2	Intergenic	novelGene_113814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13854	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
602474	contig_3233_pilon	-	2704	8	Intergenic	novelGene_56597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTCAACCTCCAGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966539	925205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_925255_951287_952806_957740_957808_961023_961061_962264_962551_963812_964076_965119_965269_966204
602482	contig_3627_pilon	+	2315	14	Intergenic	novelGene_78475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	177.931474077679	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	71	1747	432362	461592	TRUE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAISSETDRRERGSGCLGCSISPHLWCIKF	432291	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461510_461631_478112_478158_483177
602491	contig_10135_pilon	-	2272	8	Intergenic	novelGene_106626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	43.1201453937195	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	575	1267	88066	86195	TRUE	30	GAAGTGTGTTTGGTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYR	89573	83914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89080_89502
602496	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602499	contig_3825_pilon	-	1699	8	Intergenic	novelGene_78016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	671.678038761952	169	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	746	1420	1465452	1462075	FALSE	15	TGATTTGCATTTCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWCPFPCSPPAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470994	1461795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
602500	contig_8878_pilon	-	1742	5	Intergenic	novelGene_147863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_4	319.121744010025	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTAAGCAAGTGAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231704	227834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228857_230277_230404_230484_231121_231647
602504	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	643	966	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
602515	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602539	contig_8538_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_4677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	142	375	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842686	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
602541	contig_20739_pilon	+	2574	1	Intergenic	novelGene_83187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATAAATTTAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170058	172632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_170100_172600
602543	contig_19459_pilon	-	1895	7	Intergenic	novelGene_59876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4386.37087718563	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	106	795	16240	7772	FALSE	10	TCCTGTCTTCTTGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSGVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQVEYQR	19069	6671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15500_15702_16203_16265_18988
602563	contig_1735_pilon	+	1649	8	Intergenic	novelGene_106895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	691.736501679001	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	923	1477	132409	137764	TRUE	5	TGTCCGGCTCGCTGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETIPAMSIAMPLASAEPQSRLSQSLVKSVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	127163	139780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_127633_131561_131841_132234_132494_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
602564	contig_7066_pilon	-	2478	19	Intergenic	novelGene_42207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	100.527758588927	352	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	103	2052	1128537	1078816	FALSE	5	CTGTCTTGTACCCTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARDAAAASAGSSASSGNPPPQEPGLGELLEEFSRTQYRAKDGSGMGGTKVERIEKRCLELFGRDYCYSVIQNVNGEICGHYPRHIVFLEYESSEKEKDTFESTVQVSKLQDLINRSKMARCRGRFVCPVILFKGKHICRSATLAGWGELYGRTGYNYIFSGGADDAWADAEDVTEEDCALRSADTHLFDKVRGHDIKLLRYLSVKYICDLMVENKKVKFGMNVTSSEKVDKAQRYADFTLLSIPYPGCEFFKEYKDRDYMAEGLIFNWKQDYVDAPLSIPDSLKRSLNIDWSQYQSWDLVQQTQNYLKLLLSIVNGDDDSGLLVHCISGWDRTPLFISLLRLSLWADGLIHTSLKPAEILYLTVAYDWFLFGHMLVDRLSKGEEIFFFCFNFLKHITSEEFCALKTHRRKSLSARDAGFTLEDLYMLRRRDRGSTTSLGSDFSLVMESSPGAAGSFTYETVELVPAGAQTQAAWRKSHSSSPQSVLWSRPQPSEDRLPSHHGLVEAKSSSSSSSNHSDNFFRMGSSPLEVPKPRSVDHPLPGSSLSTDFGSWQMVTGCGSIQERAVLHTDSSLPFSFPDELPNSCLLATLSDRETRLQEVRSAFLAAYSSTVGLQAAAPSPSGAIGGLLEQFARGVGLRGTSSSIL	1128639	1078389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1079000_1082490_1082647_1089724_1089905_1090595_1090735_1090905_1090965_1091742_1091814_1094005_1094043_1094323_1094401_1094718_1094805_1095968_1096036_1101150_1101226_1101847_1101919_1109270_1109345_1110615_1110739_1112265_1112327_1112639_1112716_1118699_1118809_1126358_1126508_1128381
602568	contig_3627_pilon	+	170	2	Intergenic	novelGene_78509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	13573	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTCCAGGCGAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621315	630946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851
602579	contig_14322_pilon	-	320	2	Intergenic	novelGene_116334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671839	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
602580	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
602581	SIRV7	-	280	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91646	0	-91640	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTAGCACGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
602583	contig_19701_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_147896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122861	120489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_120500_122900
602586	contig_15039_pilon	-	1791	9	Intergenic	novelGene_110128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_6	518.975914662713	89	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	394	1017	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260909	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_201176_201237_202795_202857_208401_208526_260778
602593	contig_10940_pilon	-	2100	4	Intergenic	novelGene_49238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	2	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
602595	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
602596	contig_8330_pilon	+	2817	3	Intergenic	novelGene_71757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	2.5	124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	172	474	614635	619164	FALSE	5	GCAGGTCTCTCTTGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVPVTLAGQQPGTRTATLEQLRERLESGEPPEKKASRLSEEEQRLVQQAFQRNFFSMARQLPMKIRINGREDRSEASAAALNLTTSSIGSINMSVDIDGTTYAGVLFAQKPVVHLIAGSAPQSVGSSASSSSSHCSPSPTSSRGTPGAEPSTSWSL	614463	621507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_614678_616152_616252_619003
602607	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
602617	contig_5649_pilon	-	1934	8	Intergenic	novelGene_82462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	111.271684426462	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	91	651	1573807	1567380	TRUE	15	TGGTGGAGACTCCTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVHCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQ	1573897	1563536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567316_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
602627	contig_10765_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_122976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGATGGTGCCCAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423137	422446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_422400_423100
602628	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
602634	contig_10609_pilon	-	3162	1	Intergenic	novelGene_123974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641401	638239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_638200_641400
602636	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602639	contig_19352_pilon	-	2321	22	Intergenic	novelGene_122407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	360	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGACGGATTTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411548	301808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_301881_338290_338439_353877_353953_358378_358416_360032_360094_363525_363622_363865_363940_365721_365861_366776_366915_368026_368196_368282_368331_368823_368878_373327_373393_385251_385310_389171_389253_389537_389598_398842_398962_400339_400419_403188_403510_403958_404079_407221_407392_411411
602644	contig_9363_pilon	+	1174	3	Intergenic	novelGene_6839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	819	junction_1	36	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCCACGCGAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624410	1625965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1625066_1625343_1625435_1625537
602648	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
602666	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
602675	SIRV7	-	245	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69031	4	35812	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78926	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
602676	contig_12032_pilon	-	1707	10	Intergenic	novelGene_139274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	113.749236871677	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	176	970	117404	98722	TRUE	25	TAGATAACTTGGCAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRGAVIQMLRGCQPSLVQHGAWG	122313	96449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_98697_98787_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
602705	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_18168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602725	contig_7457_pilon	-	1828	8	Intergenic	novelGene_31421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_7	151.364676546817	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	26	760	473193	469327	FALSE	25	AATATTGCCGAATGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473218	468258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
602726	contig_3602_pilon	+	1760	7	Intergenic	novelGene_60491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1012.58010657045	6	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	141	698	161745	169561	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEVCTDDDRKVKARAAGDARSLDSLFSRARTLSSTLPLRTLVLANTN	161604	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169424_170484_170992
602746	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
602784	contig_14814_pilon	-	2202	13	Intergenic	novelGene_137745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	125.979385438871	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	86	646	419124	406683	TRUE	65	AGAAGAAGAGAAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAMQPAEIQFAQRLASNEKGIRDRAVKKLRQYISVKTQRETGGFSQEELLKIWKGLFYCMWVQDEPLLQEELANTISQLVHVVNNSEAQHLFIQTFWQTMNREWKGIDRLRLDKYHTLIRLVLRQSFEVLKRNSWEERQIKPFLDVLMKEILHPESQCPKGVKFHFIDIYLEELSKVGGKEHSA	419209	398393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402214_402251_404264_404447_405639_406695_406814_406945_407717_407780_408364_408451_409637_409696_411513_411597_418994
602791	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
602809	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
602810	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	116	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
602811	SIRV6	+	938	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1652	0	223	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2739	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
602813	SIRV6	+	531	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	41	2	28	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
602818	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
602828	contig_10135_pilon	-	1607	4	Intergenic	novelGene_106588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	69.1873463061627	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	148	1104	31065	29065	FALSE	25	AACAGAAGCTGTGGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLKRQASQVWPEEHGEQEHGLYSLHRMFDIVGTHLTHRDVRVLSFLFVDVIDDHERGLIRNGRDFLLALERQGRCDESNFRQVLQLLRIITRHDLLPYVTLKRRRAVCPDLVDKYLEETSIRYVTPRALSDPEPRPPQPPKTVPPHYPVVCCPTSGPQMCSKRPARGRATLGSQRKRRKSVTPDPKEKQTCDIRLRVRAEYCQHETALQGNVFSNKQDPLERQFERFNQANTILKSRDLGSIICDIKFSELTYLDAFWRDYINGSLLEALKGVFITDSLKQAVGHEAIKLLVNVDEEDYELGRQKLLRNLMLQALP	31212	28561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_29442_29992_30140_30429_30538_30740
602836	contig_5947_pilon	+	1949	7	Intergenic	novelGene_101606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	293.415897471301	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	138	995	982787	1006466	FALSE	15	GGAAGGAGGCTGTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRITCYQEFAAQLKSRVSPPFKQAPLEPHLLCGLDFCPTNCHINLMEVSYPKTTPSVGRSFSIRFGRKPSLIGLDPEQGHLNPMSYTQHCITTMAAPSWKCLPAIDGDPQGQCLNDSSFGLANGALGQEDRGLSFLLKQEDREIQDAYLQLFTKLDVALKEMKQYVTQINKLLSTITEPTFSGSCDPPLAEEASSSLLVSEESEMDRVEHGGIKKVCFKVSEEDQEDSGHDTMSYRDSYSECNSNRDSVLSYTSVRSNSSYLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKRTRESHTRFRHRHYQNRSRSALGARITRSLFIGCEIAVVYLGIFCCC	981870	1007420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_981897_982675_982887_983548_983826_985586_985794_987124_987214_988514_988556_1006322
602843	contig_16098_pilon	-	1844	17	Intergenic	novelGene_45880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	62.0584401995409	12	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	909	1580	249257	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	255283	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249298_250016_250074_250211_250276_250678_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
602848	contig_9976_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_147901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13267	14900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_13300_14900
602858	contig_7202_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_18529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
602860	contig_1288_pilon	-	2094	2	Intergenic	novelGene_147917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATGTTGTTGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145145	142773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_-_144148_144425
602861	contig_5954_pilon	-	2065	13	Intergenic	novelGene_28599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_8	409.960431695006	1	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	252	1703	956264	945083	FALSE	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVILRLPNRRALRLRASFSQPLFQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956810	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705
602867	contig_7412_pilon	-	1808	9	Intergenic	novelGene_76331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1400.70131987515	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	80	1606	377290	364445	TRUE	5	TGGCTTCCTCTCATTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRSWKQVWRWQGAHSEEVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377839	364200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364372_364413_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
602878	contig_16461_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_139200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	30	368	919	362	FALSE	20	GCTATACTCCCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQNSYG	948	360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
602882	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	76	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
602895	contig_3095_pilon	+	1604	3	Intergenic	novelGene_75254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	384	692	247875	248690	FALSE	20	AAGACTTTCATCTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKAQPKEDQPQHKASDTTQQLALGRFRLRAPLHCDGAPEAGVLYTAGVDISTLGSHFQHHKDLEGPVPIPNKGSGHNASCFLLVIPKPPDFDLAWIEICH	246382	249602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_246740_247848_247969_248475
602896	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602899	contig_5551_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_134285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	615	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTGTTCTTGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834234	795296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_797108_834173
602906	SIRV2	+	624	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	-31	-70	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
602908	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91672	1	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
602916	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
602917	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
602920	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_96521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
602923	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_114048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	31	345	14409	13872	FALSE	20	TTATTACTGTCAGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14439	13869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
602934	contig_10253_pilon	-	1638	10	Intergenic	novelGene_76860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCGCTAGTGCTCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100309	16076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_-_16260_35539_35654_41572_41812_47121_47261_52946_53067_78972_79088_81283_81398_84014_84220_84983_85119_100035
602941	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
602949	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
602962	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602969	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_18689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGTCTACCTGTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
602973	contig_10689_pilon	+	1392	4	Intergenic	novelGene_118618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1784.12431056683	29	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	118	558	57608	61252	FALSE	25	TTTTTTAATTGTATATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLMTEQTSDSATRSLLPLWVFLRLSLRACCMPLALQLLPFCCIYSQPFWAHTSL	51244	62086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58309_61092
602981	contig_3960_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_138008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGCAGTTCACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353051	352505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_352500_353100
602986	SIRV7	-	284	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69000	2	35781	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78957	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
602989	SIRV5	-	308	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGTTACCAAAGTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8451_8590_10863
602991	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
602994	contig_18869_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_56215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
603001	contig_9333_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_120328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGATTACAAGGGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279816	279187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_279200_279800
603009	contig_14322_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_116246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671616	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603012	contig_7202_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_18334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27936	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603013	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_18831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCGCAGGTGCGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
603014	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
603018	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603040	contig_6063_pilon	-	1755	15	Intergenic	novelGene_27586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	398.949647735866	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	13	1572	70243	17150	FALSE	20	GACTGTGGCATGACATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70255	16966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
603046	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603050	contig_21203_pilon	+	1265	9	Intergenic	novelGene_84482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	261.601796629916	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	46	1263	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQTTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53904	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120263_120331_120376_121973
603060	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603063	contig_7457_pilon	+	1934	12	Intergenic	novelGene_31332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	284.448691069654	3	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	111	692	281205	286839	TRUE	15	CCCAGAGGTGCACTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDNIRGNTVNLNANSWSWMMS	280836	291261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285731_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
603064	contig_16228_pilon	+	2044	6	Intergenic	novelGene_147925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	155.126529001328	27	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	337	1293	59945	74335	FALSE	10	CTCCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHEDQQSDMEHRGCRWSQWWLCLEAAEDTMTTNDPVWPRSQRWGLPYPTSSLILTEDLVQPVAEHKDEGESDAISSPSLPGDQSWLRINTHQPRSSVKCDYPVTCPPQLRQEKTEDGNHVFLSL	47753	75086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843_60222_69477_69790_73641_73821_74146
603065	contig_14322_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_115845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671577	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603073	contig_5860_pilon	+	1951	2	Intergenic	novelGene_147958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153676	156868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_+_154653_155893
603078	contig_3787_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_102375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	490	828	402337	401999	NA	60	AAAAAAAAATATGAGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWGVRTRRGHRLYLKGFASNVGGTKADRTQWDTVLIIKGSSFYGTQENGLSNHPHCSPFHREIRKSQDNPETLVVQWLRATVANQKVSSLNPPGTPWKLYGAVLLCPIGSL	402826	401540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_401500_402800
603096	contig_6710_pilon	+	559	2	Intergenic	novelGene_93065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
603100	contig_11855_pilon	-	2315	12	Intergenic	novelGene_67022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	41.2031853057363	162	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	31	762	1650193	1635476	TRUE	5	GACTGTGGCCTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGARAAAAAAMRWVRVLLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHHTLNQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINATSMPVYLEVTLPTS	1650223	1631860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1632951_1633555_1633670_1634425_1634534_1634745_1634845_1634931_1635009_1635410_1635523_1636705_1636784_1636973_1637064_1637740_1637926_1638425_1638498_1647836_1647979_1650075
603118	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603141	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_97506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
603142	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
603150	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603151	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
603155	contig_13787_pilon	-	1988	8	Intergenic	novelGene_40612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	870.398219911145	8	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	201	620	183794	171777	TRUE	20	TACATGTCTTTTGGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCHKRKPLHAHSGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVCFSNKRLFWKIYYHSYWNSIWIGIY	205014	157976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171854_174983_175111_179556_179665_179762_179828_183751_183890_189120_189184_204972
603162	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603178	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603202	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603209	contig_7202_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_16393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGGTTGGTCACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27621	27866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
603224	SIRV7	-	287	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68997	2	35778	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78960	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
603237	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603251	contig_15120_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_108017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGAACGGTGAACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223474	224749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_223500_224700
603252	contig_12080_pilon	+	2555	14	Intergenic	novelGene_128393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1636	1941	199927	201287	TRUE	25	GAGACCCCAGAGGCCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNLKCHPQVCPSCCPPHLQYLLSQLLSSQCWGHLQGDTVIWELLLYINLHDKVSSLGQLHILPGGNKTDLQVNLSYLVRVNLWKSQNRVWGGGTSKTET	193870	204888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_194913_195654_195790_195898_195963_196103_196137_196232_196319_198087_198218_198301_198437_199916_200030_200118_200196_200886_200992_201266_201416_202855_202963_203237_203450_204721
603255	contig_4640_pilon	-	3837	1	Intergenic	novelGene_147969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	124	387	404987	404724	NA	80	TACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLKNNSITFIVKKNTLRSIIKYSAISDRKISIHLQGKAVNMTNIQIYAPTTNAKDEEIEDFYQLPQSETDQTCNQYALIITDDWNAKAGNKEKGTLVRKHLWFLGLELAAYMASCLPILGIVGVLII	405110	401273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_401300_405100
603256	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_115821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTCTTGAAGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671883	671352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
603266	contig_6674_pilon	-	2560	1	Intergenic	novelGene_147989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCACTTCTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87396	84836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_84800_87400
603267	contig_2867_pilon	-	1855	5	Intergenic	novelGene_135244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.747234239876	333	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	152	679	1305476	1286189	FALSE	0	TGTGTGTGTGTTTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGSADCELSAKLLRRADLNQGIGEPQSPSRRVFNPYTEFKEFSRKQIKDMEKMFKQYDAGRDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQLLAQGHLLPARVPPLPTILPPFPISLPCHLLPVLGSGPVEATCP	1305627	1285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286690_1286781_1288013_1288149_1289316_1289465_1305456
603270	contig_14142_pilon	+	2237	10	Intergenic	novelGene_120492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	31.3017965800016	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGTGGCCATTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307860	318480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308281_308382_308467_308566_308669_309006_310041_311187_311212_311318_311383_312644_312815_313548_313645_318077
603283	contig_12540_pilon	-	3087	11	Intergenic	novelGene_148131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	771	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2193	2588	1304872	1298706	TRUE	15	GTCAGTGGCCACCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSASTWLVFMALPSVASTSRQAIPCSRSARSMRSRRSCRRFRLIMKTSSKPILSGVWSGTEINWDGSAGRCFTMTSSCTCMKLSASSWSVLCARSGTGRKPYTSLLQTYICTSACLQEKAKTMMSSKDQV	1308484	1288233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1288328_1290248_1290367_1297073_1297210_1298554_1298759_1299814_1299937_1304152_1304229_1304298_1304408_1304836_1304968_1305782_1305913_1306223_1306431_1306724
603306	contig_7816_pilon	+	2299	9	Intergenic	novelGene_66458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_7	180.831715622564	122	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	4	1698	94386	148470	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMESLSRAGQEMSLAALKRHDPYITSIADLTGQVALYTFCPKANQWEKTDIEGTLFVYRRSASPYHGFTIVNRLNMHNLVEPVNKDLEFQLHEPFLLYRNASLSIYSIWFYDKNDCHRIAKLMANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSAPSGHKHLTVEELFGTSLPKEQPMVVGLDSEEVEKLPGDASQKEPSPFLPFSFEHSGGAPQSESLGVQSAALYSVQPEVTTPVLITPASITQSNEKHAPSYTIPLSPVLSPTLPAEAPTAQVPPSLPRNSTMMQAVKTTPRQRSPLLNQPVPELSHTCLVASQSPFRAPLSVTSTAGTSLASVDLLQKLRLTPQHDQIQTQSLAKGSVAPSFPPAAGQLATPESFIEPPTKTAVARAAASASLSNMVLSPLQSMQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKVCMVFLIF	94382	149071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_143942_144702_146636_146703_148224
603310	contig_11845_pilon	-	999	6	Intergenic	novelGene_148142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_5	207.10325926938	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGTTTCAAAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58412	16132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_-_16242_49622_49735_51602_51713_52018_52145_54547_54719_58041
603317	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	273	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
603333	contig_6612_pilon	+	3006	1	Intergenic	novelGene_148173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGACCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61784	64790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_61800_64800
603337	contig_15293_pilon	-	2623	2	Intergenic	novelGene_146525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTATGATTCATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94907	92234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_94104_94153
603339	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
603340	contig_5649_pilon	+	1971	7	Intergenic	novelGene_82252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	146.358483032435	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	104	892	12779	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12675	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_34681
603350	contig_14322_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_116193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671576	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603353	contig_16724_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_105327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTATCAGTAGGCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559322	560426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_559300_560400
603361	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603363	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_93784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603370	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
603383	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603387	contig_1076_pilon	-	2025	16	Intergenic	novelGene_101100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_12	339.064097512878	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1362	664	2025	66339	51354	FALSE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAIS	79744	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72589_72712_72921_72975_73869_73997_75351_75429_79474
603401	contig_10734_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_51163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	69	779	998765	999859	FALSE	20	GACACAGTCTGGGGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGEPDNNRSTSMELTEDQNTSRNAPEALMVNSSEPWSPQHLTPTSP	998696	1000774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998845_999228
603421	contig_11512_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_43312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATAACATGCTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385839	383412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_383400_385800
603438	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603447	SIRV4	+	337	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	440	173	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
603460	SIRV6	+	231	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	41	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
603466	contig_3095_pilon	+	1113	5	Intergenic	novelGene_75055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	64	702	147241	151151	TRUE	15	GTGGAGTTTTCAGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETPESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149766_150409_150696_150996_151163_151848
603471	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603472	contig_11328_pilon	+	2014	8	Intergenic	novelGene_88437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	208.458286337716	1058	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	181	1437	830591	849070	FALSE	15	GATCAGTTTTATGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLVGPFYP	829271	849647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758
603473	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_2681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532947	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
603474	contig_14882_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_115023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTTTAAAATTTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303212	302169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_302200_303200
603475	contig_14882_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_115013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1594	2073	296314	295835	NA	40	ACAGAGACTTAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVHLCSICILTDPPNQRTYCTHKRCLKSIGRQFWLFLFHRLSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	297907	295634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_295600_297900
603476	contig_10904_pilon	-	2192	8	Intergenic	novelGene_22627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_7	267.560788439196	1705	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	482	1513	510205	499813	FALSE	15	ACTACTCTGTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	516259	499133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_516169
603481	SIRV7	-	287	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35776	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78844
603488	contig_11328_pilon	+	522	4	Intergenic	novelGene_88429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_1	1460.55157008881	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	383	484	647217	647995	FALSE	40	TTAAATCATCTTTACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	644933	648033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645017_645228_645376_647064_647223_647899
603501	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603502	SIRV4	-	215	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGATCAATGTCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
603509	contig_12837_pilon	-	2115	8	Intergenic	novelGene_57305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	3	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	1705	2115	159366	128765	FALSE	25	TGACGGAACTACTGCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCQKEYTALIWAVILSHNCGLPMKHIIPNWTCRTLCWRVTGQITKFLINPFQRHSLCFSSGSALSRCALKGPAKTLDYPDGGEGLSLRLTPALPDTGAEGPGPPSSCGLGLLPARQLVPPRPYGAHAHDTATRCPL	167474	128764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_128880_129646_129800_153827_153894_153981_154012_159319_159398_161385_161492_163872_163967_166001
603520	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
603522	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603530	SIRV7	-	345	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33224	0	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
603544	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603552	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91682	0	-91676	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGAATGCAAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
603561	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_16474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27824	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
603563	scaffold_8345_pilon	+	1828	9	Intergenic	novelGene_107026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	199	junction_1	195.094808682856	1710	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	233	1588	785045	797810	FALSE	25	CTAACTGCTCTAGAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTQRELPESSLRISLHSLGLSHAGLQPAPEGVCARQSAINTGALSVLTTQPRREEENTEARCQGPGRARIPEGEEGKMKTLIPLLLLGLLLTGEKGQVLGEETISANELQEMSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQEEK	779337	798050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_795998_796229_797376_797559_797797
603564	contig_9363_pilon	+	1594	10	Intergenic	novelGene_6829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	289.747314349658	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	677	1249	1623705	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622272	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623496_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
603569	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
603576	contig_11285_pilon	+	1495	6	Intergenic	novelGene_5653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	311.741303006195	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	451	1245	768765	769878	TRUE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVTTSPAVPPSIPAADSCLGSGAAVLRQRYMGRGATRGDSVLAWTGGQTPVTLLVCPLPSPGAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	768230	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_768527_768610_768957_769085_769320_769421_769653_769740_770031_770096
603583	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	94	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
603586	contig_854_pilon	+	1066	3	Intergenic	novelGene_36314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_2	435.5	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557589	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_557752_562271_562405_563029
603589	contig_6069_pilon	+	1282	4	Intergenic	novelGene_8083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	219	junction_3	9.53356643071673	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	303	833	564608	566386	FALSE	25	GAGCAGTGTAGAGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELEAATMTVCNQTWNELQTRAPEEMSRLPHYCAGAMFVWQLMSYGYGFDEPAFRGVTFRKKAGDTAIGWALGYMLNLTNMIPADPPGLRKGSEFGSWVVLLLLFAAMLLAALVLLLRQVCSAK	564305	566835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_564695_564775_564896_565907_566043_566197
603592	contig_401_pilon	+	1818	10	Intergenic	novelGene_42873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	177.964901519484	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	26	559	1749725	1767136	TRUE	5	CTGCCTTTGTGCGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGEDVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR	1749699	1768491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764543_1764692_1764745_1765957_1765997_1767088_1767549_1767644
603595	contig_9305_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_148180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAAATGATGACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44790	43943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_-_43900_44800
603596	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
603601	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
603603	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
603609	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
603612	contig_5514_pilon	+	1465	6	Intergenic	novelGene_75277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	265.785326908767	1442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	81	1322	65296	68726	FALSE	15	TTGGACCTGTGAGTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGLGALGTSEPLPQFVDPALVSSAPESGVFFPSGPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61077	68869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
603613	contig_17936_pilon	-	1481	7	Intergenic	novelGene_29967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	483	860	126099	121018	TRUE	20	TCGTCATCTGTAGGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVKGLLEKGRPSSVAQGKGVYRKPKLDPGSHAACSKQQS	126581	95273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_95305_106374_106471_110996_111170_114805_114934_118633_118827_121017_121060_125763
603628	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603636	contig_14322_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_116401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	40	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
603643	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
603644	contig_4364_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	81	305	1530895	1531198	FALSE	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGI	1530444	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
603670	contig_11285_pilon	-	1421	11	Intergenic	novelGene_5541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	286.942921153319	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	129	524	744458	743215	TRUE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATL	745450	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_743203_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
603673	SIRV6	+	1079	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
603674	contig_7202_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_18875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
603675	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603680	SIRV4	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGCTACATGAACAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
603683	contig_3602_pilon	-	1470	10	Intergenic	novelGene_60645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	283.559299870785	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	240	815	1113579	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139450	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119227_1139295
603693	contig_5918_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_99541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGTCCAGCATGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724141	726235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_724100_726200
603710	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603715	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
603716	contig_6589_pilon	+	1346	7	Intergenic	novelGene_26108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4405	junction_1	2222.83770712624	9782	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	474	827	1879501	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876577	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
603725	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603745	SIRV7	-	233	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91678	15	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
603752	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603762	contig_7202_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_17520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603765	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603775	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657188	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657188	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
603783	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_115913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603787	SIRV4	-	306	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAACGTCGAGTCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	2454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
603801	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603807	contig_7580_pilon	+	1456	7	Intergenic	novelGene_108593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	274.840812511938	2208	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	204	1058	103420	109647	FALSE	20	TATTTTCATGGGCTGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96440	110045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_105320_105378_106952_107190_108184_108248_109428
603828	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	11	370	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14419	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
603841	contig_10437_pilon	+	1375	8	Intergenic	novelGene_38282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	67	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	103	1098	432090	451175	FALSE	5	ACGGGTTTGGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431091	451452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
603859	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
603860	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
603901	contig_19769_pilon	+	1055	5	Intergenic	novelGene_102257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.194167841727	6	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	566	1021	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_88040_88841_88958_89163
603905	contig_12841_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_55854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAATTTCCCCCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301195	301641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_301200_301600
603916	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
603921	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
603936	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7465	-4	-72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCGTTCTTTTGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
603947	contig_15031_pilon	-	2287	9	Intergenic	novelGene_138393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	45	junction_8	238.61475226817	205	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	347	1609	129549	68789	FALSE	20	ATCACCTTTTGGGAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQPVWKPYPNQDSDLLVLSGTDSELHIPRVCEFCQAVFPPSITSRGDFLRHLNSHFNGKT	161698	68110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68966_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_156131_156307_161576
603966	contig_13700_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_68266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1631	2026	71811	72206	NA	65	AAATGCTGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDGRKAALVSPVWGTEWMVAHFTETETRPRGLGVADTRLSFENAKIEVPVDIPCRDVVGMWVWSFGRRSRLEIDMGVIGFNSNKISYRLRRTFKEQPDRDLGVKPGQAGIMEARERCLRREWSYYMIPFI	70180	72580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_70200_72600
603969	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCGTCAACCGCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
603970	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
603985	contig_14483_pilon	-	2562	2	Intergenic	novelGene_133754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2086	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAACTATATTTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64427	53189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53621_62296
603989	SIRV2	-	570	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4302	35	3127	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
603992	contig_14322_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_116245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCGGTCTCACAATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
604009	SIRV2	+	656	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
604011	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
604013	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
604040	contig_13894_pilon	+	2114	2	Intergenic	novelGene_62175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1392	1739	696200	696547	TRUE	60	AAAAAAAAAAGTGGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKVRLFCVCLSVCPSVPLPTFCPLPTQLLAPAALVISQLTWRKSSSSLGLFPLCQLRGLEHMRCHVDHQLLFSLHPSHVLGSIFWLDLLLSPPLPFFWVFLATGRQRLSILAS	694808	701441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_696753_701271
604054	contig_8617_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_73457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTATCATATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62359	62070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62400
604080	contig_9133_pilon	+	2240	9	Intergenic	novelGene_109310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTCCGGCCGCCGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857473	913424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_858418_874592_875090_883416_883604_884199_884272_886993_887138_888375_888476_888590_888667_889903_889989_913289
604090	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
604097	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
604103	contig_2219_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_67172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100485	98832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_98800_100500
604118	contig_6929_pilon	+	1901	1	Intergenic	novelGene_139427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATTCAAGAAGCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143433	145334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_143400_145300
604136	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
604166	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
604168	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	49	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
604172	contig_5586_pilon	+	1629	10	Intergenic	novelGene_143561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.746899048192	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	257	1168	384614	430164	FALSE	20	ATCAGGACAGGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPIYQPGENL	380641	430625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_380723_383434_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955_430030_430140
604180	contig_4364_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532834	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
604184	contig_15039_pilon	-	1743	8	Intergenic	novelGene_110132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_6	527.283527494788	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	346	969	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260922	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_201176_201237_208401_208526_260778
604185	contig_6589_pilon	-	1277	10	Intergenic	novelGene_25915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	198.910365072646	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	193	1137	1178015	1158634	FALSE	35	AGCCAGAAGGAGGGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFEDHHKTGVTRGQEDCSAPLQMATREQQRLLPVLCWGNLFPFLFSVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178548	1158493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177382_1177927_1178088_1178428
604202	contig_16882_pilon	-	2507	11	Intergenic	novelGene_148228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	37.2194841447326	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	126	2399	435293	317333	FALSE	10	GTTGCGGAGAGTGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQAQKRQEGCGFIPCLPGFLHVLPGPGLRPHVTPQPRSQATMENANGTNQSMTEKSPPAEVGMESIIDQVTQEEQGQLLFHEETIDLGGDEFGSEENETVSEDSNNFIDKLNEQMMESVLISDSPNNSEDDVGELGCLQDVVEPVESEVDNRIENIDKEEIDTLSNISETDRDDTPKDVSDMTPDSRASLKEDPTLEVKGMPVFESEDAADSVPSDEKTNPEEQISEMSSSQSSSKDEPVPMCTIFSQSNTANSQPHLFLHDGFESQMVKSPSFSSASETSAKTPPQMVQPSPSLSKFFGDTTNTNSLASDFFDSFTTSTFISVSNPNAGSSVPEKLSSLTTQGGDKSPDSADPSYSPGIDRSESGISTASLEISQSPKPFSQIRAVFAGSDDPFATALNMSEMDRRNDAWLPSEETRNVLISVATQQYSTVFIDKENLTMPGLKFDNIQGDAVKDLMLRFLGEQAAAKRQVLNANSVEQSFVGLKQLILWFVRLALLVKLGLFQNAEMEFEPFGNLDQPDLYYEYYPHVYPGRRGSLVPFSMRILHAELQQYLGSPQESLDRLHRMKTICSKILTNLEQGLAEDGSMSNITQENRKASIQLWRSRLGRVMYSMANCLLMMKDYVLAVDAYHSVIKYYPEQEPQLLSGIGRIFLQIGDIKTAEKYFQDVEKVTQKLDGLQGKIMVLMNRAFLYLGQNNFAEAHRFFTEILQIEPTNAVANNNAAVCLLYLGKLKESLRQLEAMVQQDPKHYLHESVLFNLTTMYELESSRSMQKKQSLLEAVALKEGDSFNTQCLKLA	443521	317224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_317576_317920_318009_318765_318867_338463_338563_345751_345826_349446_349520_368818_368932_384027_384167_414223_414341_434066_435300_443402
604219	contig_6710_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_92901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
604248	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_98057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
604251	contig_9955_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_21383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACAAACAGTTTAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587761	586763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_586800_587800
604282	SIRV7	-	354	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-3	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
604289	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91623	6	-91617	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAGTAGAGTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
604290	SIRV7	-	344	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	0	6	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
604312	contig_19606_pilon	+	3167	1	Intergenic	novelGene_148266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTTTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21182	24349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_21200_24300
604321	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_97956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
604323	contig_14353_pilon	-	1992	7	Intergenic	novelGene_82137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	206.916784132065	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	41	1003	420302	402843	FALSE	35	AAAACAACTATTGTGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPPEGQRERDRLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420342	401853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_414146_414413_420261
604331	contig_5799_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_50344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727462	725124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_725100_727500
604341	SIRV4	+	234	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1537	632	1082	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2537	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
604342	contig_1244_pilon	-	1781	12	Intergenic	novelGene_37995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1101.50888998262	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	55	669	948448	927219	TRUE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAE	948502	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923916_924642_924715_927036_927222_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946578_947578_947655_948440
604344	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
604345	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	635	1016	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
604356	contig_4769_pilon	+	3026	1	Intergenic	novelGene_117955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384590	387616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_384600_387600
604378	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33222	0	3	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
604386	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
604409	contig_12894_pilon	+	2125	5	Intergenic	novelGene_140955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	32.0117166050182	537	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	35	607	85142	118692	FALSE	30	ATTAAAGCCACTCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHVFLTGPPGVGKTTLIRKASEALKSSGVPVDGFYTEEVRQGGRRIGFDVVTLSGTRGPLSRTGSEPPPGKREYRVGQYMVDLTSFEQLALPVLRNADLSSGPGQRVCVIDEIGKMELFSQTFIQAVRHTLSTPGTVVLGTIPVPKGKPLALVEEIRNRSDVKVFSVTKENRNSLLQDIVTCVQSSRK	85107	120210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12894_pilon_+_85176_90479_90643_91241_91339_112234_112445_118623
604414	contig_12938_pilon	+	1440	7	Intergenic	novelGene_99743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	601.714494867236	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	15	662	78117	85540	FALSE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	78102	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
604432	contig_14322_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_116345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671640_671817
604436	scaffold_12124_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_22051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	649.93415051065	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	243	755	846536	858123	FALSE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFRCSTRSSQPDSALEQHQSIAIKSCRTSLRVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIHGRPTAVKSIPTHGDPMCYGIEPSLLGFSWL	829620	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847726_858025
604439	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
604451	contig_4131_pilon	-	1005	4	Intergenic	novelGene_127864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	32.0555074137902	35	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1	678	350894	162549	TRUE	30	AGGCTGTAATCTTTACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPAAPAAPAPAEKTPVKKKAKKTGAAAGKRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAAPGEVKPKAKKAGAAKPKKTSGTAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPAAAAKAKKVAKSPKKVKAKPKKAVKSAAKAVKPKAAKPKVAKPKKAAPKKKLVGRLGWWGEED	350894	162012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_162153_162361_162589_162758_162834_350331
604466	contig_15134_pilon	-	2733	12	Intergenic	novelGene_140218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_9	88.1909086223538	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	1257	2642	207183	184453	FALSE	55	ATGAAATATAGAAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNIKYLSKILYLLTYSDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKIVHVLFNHIDKSGLKDKSVEELKKRYGG	211535	184361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_208019_211114
604472	contig_19957_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_57748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTAGCAAAACATTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392575	389824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_389800_392600
604478	contig_3095_pilon	-	1395	6	Intergenic	novelGene_75237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	1185.1937563116	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	75	812	255481	248388	TRUE	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	255555	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248294_248759_253535_253806_255384
604480	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
604485	contig_14322_pilon	-	154	1	Intergenic	novelGene_115691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671428	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
604502	contig_7202_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_18621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATATTTTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
604509	contig_5598_pilon	+	1552	3	Intergenic	novelGene_148297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	90	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	544	843	868870	869169	FALSE	15	TCCACTTTGAGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRLSLLMSDGSWLKTENTSKMCTCVLLTMLRHSTVWIVIKLRISLQRMGILKHLIVLTRNLYRDQKAVVQIHSLKSGKVCIRVISFHHIYSICMLSK	864231	869878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_864274_864596_864725_868496
604545	contig_14322_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_116301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAATGCGGCTGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
604554	contig_8616_pilon	+	1147	7	Intergenic	novelGene_72594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1837	junction_1	600.441342310434	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	119	1072	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	427989	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
604565	contig_18184_pilon	-	2363	5	Intergenic	novelGene_123854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACATGGCAGGAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62965	37568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_37776_48649_48731_55968_56095_60464_60612_61163
604570	contig_6710_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_93869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
604579	contig_18618_pilon	-	2089	13	Intergenic	novelGene_148302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_9	29.9428854469453	157	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	47	1549	83466	31249	FALSE	20	TTCTTTTTAAGTTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIAEPVTCIPGTGSEMSSAMPDLPVPLANLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEKLCEVEEGDKADVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDHLLLATLESINGGKLFANSYLMDLGGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPADGNYFTYTKHEPVGVCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVIVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGQMIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVFADADLDNAVEFAHQGVFYHQGQCCIAASRLFVEESIHDEFLRRSIERAKKYVLGNPLTPGVNQGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFIQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTHYGLSAGIFTKDLDKAITVSSALQAGTVWVNCYSVVSAHCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTMKISQKNS	83512	30708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18618_pilon_-_31322_36504_36580_39706_39865_42383_42549_46779_46965_49046_49150_51861_51976_53549_53679_56094_56157_58763_58894_63470_63612_69219_69325_83403
604585	contig_14441_pilon	+	811	4	Intergenic	novelGene_100655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	196	624	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112107	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
604587	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
604598	contig_7202_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_18682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTACCTGTCCATGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
604608	contig_18081_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_23818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGCCATTTGGACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172658	173062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_172700_173100
604622	contig_3745_pilon	+	2767	4	Intergenic	novelGene_85072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	37.0615104327327	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAACTTATTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364170	372816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_368691_368991_369179_369268_370637
604623	SIRV6	+	484	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	29	164	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
604636	contig_12414_pilon	-	2115	12	Intergenic	novelGene_59643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	344.860709694377	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	775	1596	766857	756525	FALSE	35	AGAATGATCCTATCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	795190	756005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129_787233_794945
604648	contig_10235_pilon	-	1436	4	Intergenic	novelGene_46620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	110.406320269972	2422	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	303	785	610325	609176	FALSE	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKRAQEGEEDGEQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSAPPSPPPGNRHTALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610627	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609738_609955_610056_610280
604650	contig_15629_pilon	+	2536	11	Intergenic	novelGene_122473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.8986398158319	192	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	376	1566	180200	202417	TRUE	40	CCCAAGTATCACAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLCWIFLWLVSRERINGFNISDCSTKKLIWTYHATSEEEFILFCDLPELQKSHFFRRSQLSPTQVPELVPCRGSKDLSNVQWYLQPQNGDPLREITRDHPSIKSALHFSTIQMNDAGSYICRPRIRSPQDDACCIKMVLEVKPKKNTSFPCFEHKHKQFLLLGSIDPIYCPSLHCQSDTQCPEVTWYQNGKLLSEKRGNPLRIGEVYNYHRGTYVCDYNQSYNTSSWIVRAVVQVETIVKNTNFKPDILEPDKDTLEVELGKPLTLNCKVRFGFEKDLKPVVRWYIKDTDQRQEVPAPEGNSSTSMLKDGVIQHILSLKEVTQRDLQRKFICFAKNSVGSTTRSIQLKKKERSGFHIHTAWHHHDPGRHAAGECSPLHVLDRNRAAVPNLSEQG	176370	208436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_176670_180123_180270_180739_181053_181149_181337_192027_192179_195237_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
604655	contig_6589_pilon	+	1342	9	Intergenic	novelGene_26048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1043.14984991371	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	238	741	1726977	1729852	TRUE	35	GTAAAATAGCTTTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLRKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGFQWLIFRK	1725445	1731815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725727_1726914_1727040_1727175_1727251_1728204_1728304_1728996_1729234_1729822_1729961_1730067_1730152_1731406
604661	SIRV2	-	616	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	34	3082	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
604664	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91663	4	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
604665	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
604674	contig_8616_pilon	-	1936	4	Intergenic	novelGene_72519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.2537731173696	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	292	1011	347284	346380	TRUE	25	TAATTTTTATTGTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALLRTFPVAALAAGMRRALGSLAGSCLADRCLWDRLHAQPRLGGAPTFDWFFGYEEAQGFLLPLLQEASTACPLQVLDVGCGTSGLCTGLYTKCPHPVDVLGVDFSPVAVAHMNSLLEGGQGQNRLCPGHPASCLRFMQADAQNLGPVAPSGSFQLVLDKGTWDAVARGGLPGAYQLLSECLRVLSPRGTLIQFSDEDPDVRLPCLEQGSQGCTVTVQELGPFRGLTYFAYLVQSAH	347846	345408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_345488_345533_347036_347220_347559_347829
604688	contig_9995_pilon	+	2196	2	Intergenic	novelGene_47683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTATATCCAGTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264068	266343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_264702_264780
604736	contig_7106_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_148326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1132	1446	665829	666143	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPNNTKGVWGSQAGKKEGKGASDTVGLESGRLDGECASGGQVRGWELGAAPGEQEATMQTSSSRAKVFVQSLSVAVQVPGPTVTILCASLLHIIWCSHNVQIT	664697	667100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_664700_667100
604756	contig_19769_pilon	+	1135	4	Intergenic	novelGene_102258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	262.801572800976	40207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	646	1101	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_88040_88841_88958_89163
604767	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
604776	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1480	632	1025	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2480	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
604786	SIRV6	+	549	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8751	2	40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGTCTAGGACGCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
604794	contig_7707_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_72173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTACAAACTATGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522884	521818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_521800_522900
604796	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
604798	SIRV4	-	341	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAACAACGATTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
604804	contig_10732_pilon	+	2729	2	Intergenic	novelGene_114672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAACACGATTTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47603	77622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_47626_74915
604823	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
604832	SIRV4	+	375	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	905	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
604836	contig_4364_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_1050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
604859	contig_7708_pilon	+	2025	7	Intergenic	novelGene_61530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	116.58425660821	36	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	127	972	250654	264717	TRUE	25	TGTTAAAGAGAGGGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMGVPEKPHSD	249572	265811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187_257288_264687_265033_265073
604877	contig_15087_pilon	-	2156	15	Intergenic	novelGene_37129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	434.038416431974	21	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	388	1389	71161	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQHLPLTVHTPVTSQSRSQNLHPVALPLNLKSSLLRSRILHQRHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89755	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33740_33801_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52954_69146_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
604879	contig_5981_pilon	+	1821	9	Intergenic	novelGene_35483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	299.558190298646	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	93	1208	23508	37804	FALSE	15	TATTTTTTGTGTCACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23415	38417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28179_28558_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
604880	contig_12873_pilon	+	1865	3	Intergenic	novelGene_27161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1198.5	1	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1122	1853	17632	19334	FALSE	25	ACTAGGGATTCTGGGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15958	19346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17033_17584_18014_18984
604888	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
604899	contig_16461_pilon	-	300	2	Intergenic	novelGene_139214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	30	299	919	431	FALSE	35	ACACTCTCACCATCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTD	948	429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
604903	contig_15063_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_12888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4046.86301349576	15	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	236	1042	34808	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPRWPSMHQPST	28165	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36154_36266
604915	contig_5419_pilon	+	2422	6	Intergenic	novelGene_15531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	96.1007804338758	191	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	141	797	384039	395000	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQGQPQGRETEVWWHQVKVWSAAVVSLLLLSACFIVSCLVNHDNFVYTKIGRKLHKLQDHQQYLSHLTCFKERKGLKDWHCCPTSWSPFQSSCYFISTELKNWTDSEKNCSEMGAHLMMINTKEEQVLSYSSSSSRSWMEILLTMWGCQTQRGSANGNGLISHHTTQKSREFWHPGEPNTHDEHCVIINSRNGNWGWNDAFCDVMQRSICEMMMISL	383898	396625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_384067_384641_384735_388326_388441_391825_391986_393841_393962_394858
604939	contig_2798_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_120059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATGAAGAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180766	182979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_180800_183000
604943	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
604947	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
604956	contig_12540_pilon	+	2180	1	Intergenic	novelGene_148111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGCTACCATGAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084413	1086593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1084400_1086600
604958	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
604963	contig_12915_pilon	+	2689	1	Intergenic	novelGene_148351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110787	113476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_110800_113500
604966	contig_11338_pilon	-	1811	9	Intergenic	novelGene_6215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_3	77.0169421296379	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	590	1675	14943	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVLCCPSLGLLFRGAGQALRPVSVQAWPVLRHGGGGGHPQGLQACACRAMGRALAWTGAEPSSLVGKSSFSLSLQVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	17291	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_15189_16641_16770_17075
604993	contig_6710_pilon	+	563	2	Intergenic	novelGene_95435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTACTCCAAGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
604996	contig_14322_pilon	-	393	2	Intergenic	novelGene_115789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	15	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671898	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
604997	contig_6445_pilon	+	1497	9	Intergenic	novelGene_77073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	301.070485933112	815	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	71	940	727272	740867	FALSE	10	GCTTTGTTGCTTGTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRAGSSLGFSAAKRPWDLGDVATMPATGKTFRRRRADSESEEDEQDSEEVRLKLEETREVQNLRKRPNGVSAVALLVGEKVQEETTLVDDPFQVKTGGMVDMKKLKERGKDKISEEEDLHLGTSFSAETNRRDEDADMMKYIETELKKRKGIVEHEEQKVKPKNAEDCLYELPENIRVSSAKKTEEMLSNQMLSGIPEVDLGIDAKIKNIISTEDAKARLLAEQQNKKKDSETSFVPTNMAVNYVQHNRFYHEELNAPIRRNKEEPKARPLRVGDTEKPEPERSPPNRKRPSNEKATDDYHYEKFKKMNRRY	727201	741424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_727355_727707_727768_736269_736322_736470_736542_736935_737014_737748_737947_738626_738764_738856_738956_740775
605007	contig_165_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_117075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGCTTCTGGACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186730	186478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_186500_186700
605008	contig_15063_pilon	+	1288	4	Intergenic	novelGene_14291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	335	1150	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCTPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35374_35839_36158_36266
605013	contig_6589_pilon	+	1083	6	Intergenic	novelGene_25779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2095.77141883365	12	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	504	995	669670	672754	FALSE	10	ACGGGCCCTGACTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668305	672842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669121_669440_669583_669748_670000_670104_671046_671188_672584
605014	contig_10581_pilon	-	2008	9	Intergenic	novelGene_41406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	100.701290954982	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	616	1254	627511	609858	FALSE	15	TGGCTCCTTGTTTTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTVTKPRRFN	649684	609103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_615220_615347_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
605020	SIRV7	-	283	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	2	35782	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
605027	contig_11507_pilon	+	3738	14	Intergenic	novelGene_103351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	82.5263092351544	128	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	191	934	50559	56482	TRUE	30	TTATTTAAGGACTGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKPLNSQKEPSACKDGEDCQENGVLRKGVPAPGDKVETDQISNEYSAVASPGTGDDTQHSTPAATTALVAEVHQVERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYLELALGHSPASQESVTPSASLPSTLPPTTTLLLPGRSTTSSPPSPTSCPGQAARTPGTLATAPTTSPRTTSPGLSTPPLQLKSFTYAMSCRSTSLRDSRTWVASTGSLPSASC	35771	78597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_35847_50443_50902_53617_53697_54709_54946_56396_56536_57442_57578_57919_58024_60375_60504_63121_63235_64368_64501_65902_66003_67762_67864_73913_74082_76827
605036	contig_6958_pilon	+	1207	3	Intergenic	novelGene_70030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	13.5	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	111	401	1044225	1046453	FALSE	30	ATATTTTATGGTAATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCFQAVNSRIQLQILEAQYLPSSSAPLTLSFFVKVAMFSSGDLIYKKKTRLLKASNGRVKWGETMIFPLIQTEKEIIFLIKLYSRSSVRRKHFVGQIWISEDSNNIDAVNQWKETVTNPEKVVIKWHKLNPS	1034956	1047259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_1035047_1044204_1044405_1046342
605037	contig_6958_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_70031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGACTTTTCAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047903	1049286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_1047900_1049300
605048	contig_18869_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_55989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTTTCTTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
605061	contig_15775_pilon	+	2640	6	Intergenic	novelGene_148368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	192.280628249442	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	109	480	1841	2943	TRUE	50	AATAATATTTATGCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPALTTMRTTTTSTSTIFTAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEGERTWLRLGWGWGSRKCVGPMAGAVIEDHLAPRLQRLAPGGPRAWGEAWSL	393	6163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1829_1945_2675_4641_4989_5140_5730_5816_5935
605065	contig_9305_pilon	+	2291	16	Intergenic	novelGene_148188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.561296502286	487	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	363	1862	163046	181019	FALSE	25	AATTTGAAACCCTTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDQRGLLLPGPSPPPPFPALYSPCGGSASLAAAAEAQREQLSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAQPPPSPSGAAANNHGAGSGAGGPSAPVEPSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPVVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRPPEENAQEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYSGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDSVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD	148640	181448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_148712_148863_149093_162870_162913_163025_163068_163755_163984_165127_165162_167242_167321_168470_168652_169269_169425_169590_169732_171502_171597_173115_173197_176990_177165_178166_178257_178590_178760_180966
605074	contig_14322_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_115972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	51	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
605077	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
605082	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
605085	SIRV4	+	230	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1541	632	1086	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2541	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
605108	contig_8020_pilon	+	2907	7	Intergenic	novelGene_114438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	9.30949336251263	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	458	1456	321628	331625	FALSE	20	TAAGGTACCTGGCCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVIIDCWIDNIRLIYNGTSRATQFPDGVDVRVPGFGQTFSLEFLDPSKSSVGSYFHTMVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317268	333076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_320934_321051_321514_321672_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
605111	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605113	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
605116	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605127	contig_10140_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_148417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTATACAAAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254217	256143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_254200_256100
605156	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
605164	contig_1867_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_54572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGGCGTTTTCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448108	449877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_448100_449900
605168	contig_11720_pilon	+	2428	7	Intergenic	novelGene_43970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	302.210007923114	127	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	3	629	262271	265368	TRUE	45	TCCTGGGAAGGAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRYCPKGPQLCSYNFCPSP	262268	268525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_266240_266453_266610_267753
605171	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
605187	contig_2487_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_148461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCCCGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132271	134711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_132300_134700
605192	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	643	974	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
605200	contig_8617_pilon	+	114	1	Intergenic	novelGene_73499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAGTCCAGTATTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63909	64023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63900_64000
605205	contig_12638_pilon	+	2192	6	Intergenic	novelGene_33142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	401.391280423479	5	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1009	1311	198134	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	193531	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_194442_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
605211	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605222	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605223	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605236	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
605243	contig_7569_pilon	-	90	1	Intergenic	novelGene_114605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAAAATACTCTAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303304	303214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_303200_303300
605251	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
605256	contig_15323_pilon	+	2578	1	Intergenic	novelGene_148510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTGATATTAGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65049	67627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_65000_67600
605265	contig_3077_pilon	+	1651	9	Intergenic	novelGene_26729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_3	3121.14872432811	2	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	470	1153	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10120	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
605302	contig_1443_pilon	+	2034	11	Intergenic	novelGene_28246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	54.5549264503216	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	940	1590	538444	541250	FALSE	25	CCCCTGAGGGCTGACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMVCTLGVLGQGENSLESRKKRIRWEELENLENSLEILRHTCV	536007	541694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028
605310	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605311	contig_21422_pilon	+	1766	13	Intergenic	novelGene_79077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	109.984089758474	24	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1656	110	1765	21493	40703	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSEVEKAIPDSAATTNNLPLLDGAANVAKDTYISEKTEDGSTACSLGSQYEEKVRPCIDLIDSLRTLGVEQDLALPAIAVIGDQSSGKSSVLEALSGVALPRGSGIVTRCPLVLKLKKLVHEDKWIGKVSYRDLEIDLSDPLKVEEEVNKAQNVIAGEGMGISHELINLEISSPNVPDLTLIDLPGIARVAVGNQPADIGRQIKSLIKQYIHKQETINLVVVPSNVDIATTEALSMAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKLLQDKDGYSWLLKERSDTSEKRKVLKERLSRLAQARRRLAKF	19944	40704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_20029_21467_21619_24358_24552_25736_25875_27016_27172_28309_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_40577
605316	contig_14133_pilon	-	1392	6	Intergenic	novelGene_119936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1619.06768234067	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	45	497	209116	208182	TRUE	25	CTCAAGTAGTATCATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209451	206559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207702_207780_208389_208585_208728_209012_209131_209421
605318	contig_10437_pilon	+	2773	6	Intergenic	novelGene_38140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	194.513341444745	3	122	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156673	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160735_160758_160814_160844_161549_161639_161868
605321	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605326	contig_1532_pilon	-	1892	7	Intergenic	novelGene_37371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	1227.72060701484	2	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	59	1096	32217	13113	FALSE	40	AAGATCTTACAAGCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34919	12316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
605328	contig_14890_pilon	-	1564	9	Intergenic	novelGene_122520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_8	1190.47018022292	2398	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	205	1020	370199	366814	FALSE	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371238	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370322_370376_371106
605329	contig_1516_pilon	+	1774	8	Intergenic	novelGene_50003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1372.74903692093	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	260	1231	347241	363190	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMMGPGAPPPSPVPSPPLHPSIRPATLVVLVQGL	336304	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356060_363091
605333	contig_12570_pilon	-	1946	6	Intergenic	novelGene_79349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	273.86098663373	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	183	890	228467	190389	FALSE	15	GTTCTGTATAGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLIAAYSGVLRGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228649	189332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211479_228427
605334	contig_10953_pilon	+	1643	4	Intergenic	novelGene_42548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2880.81577952419	176	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	268	702	422508	425337	FALSE	25	GTTAATAAATTGCCTTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIGKCLPLANTYFALKH	419766	426278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213
605346	SIRV4	+	307	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	199	444	199	-444	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATTGCCATTCCAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
605353	contig_8122_pilon	-	1438	8	Intergenic	novelGene_40252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGCTGAGAAAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748843	731397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_731482_732312_732399_737500_737594_742060_742161_744035_744127_744610_744748_745060_745152_748087
605354	contig_7078_pilon	-	2035	11	Intergenic	novelGene_130180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	333.326641599498	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	111	590	795828	777331	TRUE	80	GAAAGAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDGKLTSFSLIIFK	796277	773192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795855_796193
605361	contig_4105_pilon	-	2028	6	Intergenic	novelGene_21479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.8	7	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1366	1998	72750	63749	FALSE	20	GCCCACCTGTAGTGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLYLFAIIFLLFLFLFLFPLLVQVHDIPDIPDSPSSRGQDHCVTTVIAVTLTVQNVVPGEHDSTAHNVPFVTAGPKRVPHTTAMEDLAIICMIGHRPSTPSRMPVLGIILPGQAQGDVAFLSRVHNLHLEVVAAGAQWVPGLGQPHINDALALAQVLQQLPADSDIMQPAPLVLVTVHHHDTVILMAQLSIEVQPHLLTQGVHAHCWE	74478	63718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_63897_71020_71171_71622_71680_72378_72501_72594_72768_73130
605363	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
605369	SIRV7	-	289	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68995	2	35776	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
605371	contig_14925_pilon	-	999	5	Intergenic	novelGene_55177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	1545.02928774829	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	209	466	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNYQLIWGSGTKLFIKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	68919	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_68863
605372	contig_19863_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_148546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATGAAGATATCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24054	26600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19863_pilon_+_24100_26600
605380	contig_6980_pilon	-	3183	1	Intergenic	novelGene_36082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379249	376066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_376100_379200
605384	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_97508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605386	SIRV5	+	416	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7473	2	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
605387	contig_15063_pilon	+	1636	7	Intergenic	novelGene_11432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	231	1466	34808	39515	FALSE	15	CCCGGGGCTTCAGACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
605393	contig_498_pilon	+	3090	3	Intergenic	novelGene_148555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_1	25.5	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	16	1044	755864	760433	FALSE	40	TATAATGTATCCTAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGKCSIQESMRIRNPV	755848	762479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714
605424	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3976	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605428	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
605434	contig_15628_pilon	+	1429	9	Intergenic	novelGene_147689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	157.290932669369	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	78	728	49707	99448	TRUE	25	TTTCAAAGATTCCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFFHIKFVFAVKRWVALKQLDYLGIPQFYGSGLTTFKGRSYRFMVMERLGIDLQKISDHNGTFEKSTVLQLGIRMLDVLEYIHENEYIHGDVKAANLLLGYKNPDQVYLADYGLSYRYCPNGNHKQYQENPRKGHNGTIEFTSLDAHKGVALSRRSDLEILGYCMLRWLCGKLPWERDLKDPLAVQTAKTKYKLSAGCAPRVGAEVGSPWEQLL	49629	116692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_49832_51999_52106_53308_53402_83282_83416_92163_92295_94797_94857_99444_99612_105797_105960_116316
605435	contig_18506_pilon	+	1549	10	Intergenic	novelGene_67948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	240.499480248919	8	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	426	1184	28506	55293	FALSE	10	GCTAATCCTTTCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATIPALRGVGLRAAGDRAAAFALLRGVFIVAAKRTPFGAFGGLLKDFTATDLTEFAAKAALSAGNVSPETIDSVIVGNVLQTASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQEICVKDAEVVLCGGTESMSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCDPTIMGIGPVPAINGALKRTGLSLKDMDKTNVNGGSIALGHPLGGSGSRITAHLVHELRRRGGKYAVGSACIGGGQGIALIVQNTS	11321	55658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_25013_25181_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_44530_44661_48546_48608_53877_53971_55208
605438	SIRV2	-	609	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	45	3078	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
605445	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
605455	contig_7202_pilon	+	188	1	Intergenic	novelGene_17587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCTTGTCAAAGAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
605457	contig_16869_pilon	-	2014	7	Intergenic	novelGene_137590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_6	75.0038887880711	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	125	1129	83930	51916	FALSE	40	TTGACAAACACAAACCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVSLVVVVVGGWTAVYLTDLVLKSSVYFKHSYEDWLENNGLSISPFHIRWQTAVFNRTFYSWGRRKARLLYQWFNFGMVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRGVYLSSI	84054	51030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_83855
605460	contig_401_pilon	+	1821	10	Intergenic	novelGene_42874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	177.964901519484	2	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	23	556	1749725	1767136	TRUE	25	ACATTTCTTTTTCCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGEDVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR	1749702	1768474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764543_1764692_1764745_1765957_1765997_1767088_1767585_1767657
605461	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
605470	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
605479	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_90394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605506	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605511	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605521	contig_7286_pilon	-	956	7	Intergenic	novelGene_108684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4087.57262932416	7362	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	292	888	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293145	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_291949_292101_293119
605539	contig_7963_pilon	+	644	3	Intergenic	novelGene_58299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	270	605	39310	40190	FALSE	45	GACTGTAAGCATGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEDTHSKGDESQHKPPNSGQHFVFGRIRLCLPLHGDRTIQAGVLHMAGIDIALLGGHFQHHQDLEGPVSIMDQIGGHNPSCFFMSIPEPPDLNAAWIEICHMADKQVVVL	38326	40229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284_39405_39949
605540	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
605547	contig_9609_pilon	-	1770	9	Intergenic	novelGene_23112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	112.911954083702	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	481	1335	523112	521244	TRUE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523592	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_522993_523073
605560	contig_10904_pilon	-	1568	6	Intergenic	novelGene_22713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	286.17966384773	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	8	1114	662714	647372	FALSE	30	AGCATCACATCCGAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGESSPHLPAPTSWFSTRKSPGQLWEEHRRSGLMVRPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSADVMVFYEVSAYLAH	662721	646917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_647419_660333_660634_661462_661763_661936_662208_662304_662445_662665
605563	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
605564	contig_5153_pilon	+	2067	16	Intergenic	novelGene_74357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	291.062070508833	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	420	1523	1009994	1022174	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTFGGSNPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956563	1022718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009988_1010021_1010254_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
605568	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605572	contig_7744_pilon	-	1835	9	Intergenic	novelGene_62503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124.777239010166	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	811	1677	822865	820735	FALSE	15	GCAACTTTGCTGCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELGREWVYLPLQMILMICCVRGENMWPWLTGRTTHPYGC	824107	820576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820848_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822957_823128_823501_823760
605577	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
605580	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
605582	contig_14322_pilon	-	320	2	Intergenic	novelGene_116474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671849	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
605583	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
605587	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	671	980	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGCACATGCTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
605598	contig_1516_pilon	+	1535	6	Intergenic	novelGene_50017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	924	junction_4	338.66443568819	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	13	894	354943	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	354930	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
605642	SIRV4	+	304	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	632	1012	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
605652	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
605659	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
605680	SIRV4	+	320	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1451	632	996	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2451	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
605684	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_94813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
605707	contig_6375_pilon	-	1990	11	Intergenic	novelGene_72966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	224.78567570021	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	161	1072	229189	205052	TRUE	20	ATGCTCCAAGCTTCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVVKDFG	234041	202408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202478_202555_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205036_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_233928
605717	contig_11117_pilon	+	2871	1	Intergenic	novelGene_148579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGGTATAAAACTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49977	52848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_50000_52800
605720	contig_15063_pilon	+	1320	5	Intergenic	novelGene_14378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	181	1065	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35090	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
605725	contig_5331_pilon	+	3095	1	Intergenic	novelGene_112822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726709	729804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_726700_729800
605732	contig_3797_pilon	+	2772	6	Intergenic	novelGene_120081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	207.201351346945	12	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	492	980	328276	332908	FALSE	40	GCTCAAATCAATGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINVVQYCFGLVYYVLIGLTVLSQVPMDGRNAYVIGKNLLMQARWFHILGMLMFIWSSAHQYKCHVILGNLRKNKAGVVIHCNYRIPFGDWFEYVSSPNYLAELMIYISMAVTFGFHNITWWLVVTYVFFSQALAAFLSHKFYKSKFVSYPKHRKAFLPFLF	318173	334700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318272_326308_326452_327153_327300_328171_328370_331619_331755_332648
605740	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605751	contig_12270_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_113660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14410	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605758	SIRV1	-	228	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3989	5569	3569	-120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAAGATGTCGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
605775	contig_3627_pilon	+	2416	14	Intergenic	novelGene_78476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_10	172.75395507508	427	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	71	1624	432362	461493	TRUE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAVSGFCFLCCC	432291	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
605795	contig_15063_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_13914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	5	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	198	704	34808	35888	TRUE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNNNHQYLRHPPILC	34610	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35384_35845_36158_36266
605805	contig_10082_pilon	-	2207	13	Intergenic	novelGene_63844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	135.760819090045	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	471	1166	161180	128693	FALSE	0	TTGTGTCCCCTGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDEKMNISGKKTVESERLGMGFGNCRSAISHSVTSDMQTIEQETPITAKPRKKYSEDNDDSYFTSNSRYFDEPMELRSSSFSSWDDSSDSYWKKEAIKDTDTILKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSDMYFGRQAQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEQRKQPSGNYNLTSVLPAAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVMTSIQDRYGS	179014	127651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_128711_131093_131216_142328_142420_145619_145744_152999_153132_160521_160645_161094_161204_167918_168036_168681_168729_170066_170127_174231_174320_178513_178598_178963
605807	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_97372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
605842	scaffold_19766_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_34304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATATCAACCCTCTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554194	554642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_554200_554600
605865	contig_10855_pilon	-	3186	3	Intergenic	novelGene_124379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTTGAGAACGGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789917	782119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_782169_785797_785881_786863
605866	contig_7202_pilon	+	164	1	Intergenic	novelGene_18084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGTCACTGTCTCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
605870	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605879	contig_8538_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_4720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	79	312	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842749	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
605896	contig_3095_pilon	+	1161	6	Intergenic	novelGene_74988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2979.94225447407	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	283	756	149859	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149766_149841_149896_150413_150696_150996_151163_151848
605897	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
605904	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
605906	contig_12080_pilon	+	1053	2	Intergenic	novelGene_128398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGTGAAATGCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204881	207122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_205181_206368
605907	contig_12080_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_128399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGTCACCACCATCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207071	207773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_207100_207800
605919	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
605931	contig_6735_pilon	-	876	10	Intergenic	novelGene_15671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	821.378891834102	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	205	876	554315	541984	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKVKHQNNNPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALSPL	564856	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_541994_542807_542857_543005_543193_546556_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
605932	contig_15304_pilon	-	1557	4	Intergenic	novelGene_30627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	213.113949697235	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	843	1433	65241	64554	FALSE	10	AGTGCCTGCCTGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_65963
605933	contig_11720_pilon	+	1410	11	Intergenic	novelGene_43956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	421.872362213976	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	220	894	265261	271811	TRUE	35	ATATTTATTGAGTACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYARICQASTTCSTCCRACCFPLLCCPSSRSPACLPACTSLPMAG	262262	272463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262428_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269857_270650_270700_271268_271343_271806_271961_272096
605936	SIRV4	+	403	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	100	447	100	-447	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
605945	contig_16578_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_148623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103208	101258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_101300_103200
605948	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
605953	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACAACTAAAATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
605956	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_96447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	657812	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657813	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
605963	contig_7207_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_72045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	282	849	279	1127	519827	518979	NA	75	TTTAAAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEGGVLAGEFVKSCERAGGSGERKVGAVPEAQDREISGDPRKVSVAGGEPRACLKKRELLRSTLLPEPGTQAAGPTALPLHGGFRGRVCAPAMRIRMAVRWTWAVKSCLLLALLTVAYIVVELSVSTFHSSRGASLVREQWQRQLSDSEKKAEDLSRPLYEKPHADSYALGEWGKASKLQLSEGELKKVEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMHECKSKKFNYRRLPTTSVVIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKAQLESYISNLERVRLIRTKKREGLVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECTSGWLEPLLERISKDETAIVCPVIDTIDWNTFEFYMQTGGAHDWWV	520105	517692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_517700_520100
605967	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
605970	contig_15304_pilon	-	659	2	Intergenic	novelGene_30485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	245	616	54053	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHVPSAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53281_54037
605985	contig_13992_pilon	+	3332	4	Intergenic	novelGene_147613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	79.6255123827924	152	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	148	1959	54133	74884	FALSE	5	CTTTTGGCTGCTTCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCGNEFVETLKKIGYPKAGMLNGEDFDWLFETAEDESFFKWFCGNVNEQNVLSEKELQAFSILQKSGKPILEEAALDEVLKTCETSDLKTQSVDDKELERLEEEVQILQKLKNLKIQRRNKCQLMASVISHKSLRLNAKGEEATKKLKQSQGILNVVNTKISNELHALTDEVAKLMLFYRPSNLGQGTNPMVFLSQFSLEKYLSQEEQSTAALTLYTKKQFFQGIHEVVESSNEENFQLLDIQTPSICDNQEILEERRLEMARLQLAYICAQHQLIHLKASNLNMKSSIKWAEENLHSLTSKAVGKENLDLKISSLSSEILKLEEQITHVKNKSLPAIVKENAQLLNMPVVKGDFDLQIAKQDYYTARQELVLNQLIKQKASFELLHLSYEIELRKHRDIYRQLENVVQELSQSSMMLQRRLEILTDPSVSQQINARNTIDTKDYSTHRLYQLLEGENKKKELFRTHGSLEEAAEKLNQDISLLRDQLAVSAQERSSFMSRLNNDVDMLCDALYQGGNQLLLTDQDLMEQFHQVESHLNKLNHLLTDILADVKAKRKILTANKLHQMERELYVYFFKNQDYLQDIVENLENQSKIKAVGLED	53985	76257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_55042_56483_56924_60767_60997_74650
605989	contig_15866_pilon	+	1184	6	Intergenic	novelGene_63681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	643.595960211063	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	111	527	623258	633133	FALSE	20	AGCTTTCATTTTTCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	621859	633790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_621928_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
605995	contig_20819_pilon	+	2068	15	Intergenic	novelGene_55664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_11	23.9469012950038	339	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	38	1903	54837	62431	FALSE	25	GGAATAGTGTGTCTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHQLVGLMETAPKPGGDVPHKKNKLQSKRKKPRRYWEEEETSPTAAGASPGPSRSKKRKQELRPRRPKNTHIQKKSRISKKPQVPRKSGERRNLVPQRTLSGAQDPFPGPAPVPVEAALKFRRIDKSKKLLHSKSKTRSRLEVADAEEEETSVRAARSELLLAEEPGFLEGDDGEDTAKIRQADIVEAVDIASAAKHFDLNLRQFGPYRLNYSRTGRHLAFGGRRGHVAALDWVTKKLMCEINVIEAVRDIRFLHSEALLSVAQNRWLHIYDNQGIELHCIRRCDRITRLEFLPFHFLLATASETGFLTYLDVSVGKIVTALNARAGRLDVMTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGAAEPNFDGLENNPYRSRKQRQEWEVKALLEKVPAELICLDPRALAEVDVVTLEQEKKERIERLGYDPEAKAPFQPKPKQKGRSSTASLVKRKRKVMDKEHRDKVRQSLEQQQHDQEKKTKPTGTRPSALDRFVR	54799	62596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_56288_56394_56486_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61409_61556_61652_61826_61923_62105_62220_62329
605999	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
606000	contig_5643_pilon	+	2615	6	Intergenic	novelGene_38761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	162.146106952958	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	803	2227	158691	163341	FALSE	20	TCCTCTGAGGCAAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREKDTETAAILESNFYPWMASQFGRVRWEASTGVTFWARGCSLSLLPTEPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157888	163729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297
606001	contig_10068_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_148712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCAAGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45100	45535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_45100_45500
606004	contig_10475_pilon	-	2741	5	Intergenic	novelGene_148739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	183.686383545433	90	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	128	421	266553	240259	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTTR	268703	237692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_239882_240127_240269_263189_263254_266333_266556_268578
606009	contig_15063_pilon	+	1185	3	Intergenic	novelGene_14343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
606010	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
606012	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606013	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606025	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	232	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKQVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27137	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36152_36266
606032	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_16486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27827	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
606037	contig_4364_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
606054	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
606055	contig_15063_pilon	+	1201	3	Intergenic	novelGene_14336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	238	1059	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35033	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
606058	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606065	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
606089	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606090	contig_15752_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_148797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	333	656	436263	436586	NA	30	TTGGCTGCTAATCAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRNLFPHSQSRLKVQIQGISTRGRLSLSWPSHQCSPGLGASLRRDPSPKDALYSWHCFLDGMRSPCLTAHFCLLYLKRLPQDTIQSCRSGPALLTQLPPILPH	435930	437032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_435900_437000
606096	contig_1443_pilon	-	1997	16	Intergenic	novelGene_28257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	50.1560232341707	342	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	129	1202	560906	553931	FALSE	15	AGCACTGTTATCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYALTHPDTVEGLVLINIDPNAKGWMDWAAHKLTGLTSSAPEMILGHLFSQEELSGNSELVQKYRNIVVHAPNLENIELYWNSYNNRRDLNLERRGDITLRCPVLLVVGDQAPHEDAVVECNSKLDPTQTSFLKMADSGGQPQLTQPGKLTEAFKYFLQGMGYMASSCMTRLSRSRTTSLTSAASIDGNRSRSRTLSQSSESGTLPSGPPGHTMEVSC	562637	553135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554592_554842_554891_555155_555208_555499_555545_556763_556868_557043_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
606104	SIRV4	+	207	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1564	632	1109	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
606110	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	-1	2969	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
606112	contig_8617_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_73414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62544	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
606113	contig_5845_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_98888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCGCGAGGTTCACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102062	102468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_102100_102500
606117	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606122	contig_4364_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_3549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533045	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
606124	contig_5954_pilon	-	1899	11	Intergenic	novelGene_28686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	295.009559167157	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	673	1215	956264	947658	TRUE	15	TGTTTTATTGCTGGACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFR	960590	944736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_947641_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959941_960474
606135	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_94133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606157	contig_7839_pilon	+	3289	1	Intergenic	novelGene_45755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATTGAAAAATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130572	1133861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1130600_1133900
606165	contig_9535_pilon	-	494	6	Intergenic	novelGene_124502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	164.804854297439	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	60	494	635440	628846	FALSE	25	AGGCTGCTGCAGAAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALRLSVKRFWNRSFSAAEMTKGLVLGIYSKGKEDDVPQFTSAGESFDKSVSGKLRELLTISGPPLKVGKTRTFHGLHQDFPSVVVVGLGKKAAGVNDQENWHEGKENIRAAVAEGQRKRGRPSMRWIDTVAATMGSDITMMRAADRFKTWRSLPWRWTPVEMP	635499	628845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_628912_629779_629863_630186_630293_630765_630821_632053_632170_635431
606178	contig_11052_pilon	+	597	3	Intergenic	novelGene_115465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	5	328	103010	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	103005	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
606179	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
606186	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
606187	contig_14925_pilon	-	1236	6	Intergenic	novelGene_55132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	1714.28651047601	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	117	698	103796	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	103912	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_103145_103312_103790
606193	contig_5643_pilon	+	1272	11	Intergenic	novelGene_38777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2946.21089537053	10	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	440	1060	236700	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233652_233954_233996_236010_236111_236192_236347_236602_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
606195	SIRV4	+	227	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1544	632	1089	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2544	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
606210	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
606214	contig_7412_pilon	-	1665	9	Intergenic	novelGene_76324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1400.70131987515	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	98	1552	377290	364312	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLIEGLSQVW	377857	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364337_364541_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
606215	contig_7202_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_18631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAATTTTGCCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
606220	SIRV7	-	249	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69035	2	35816	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78922	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
606225	contig_13245_pilon	-	514	4	Intergenic	novelGene_148817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	19480	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	118	477	26752	25454	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26869	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
606240	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
606244	contig_20819_pilon	+	2347	7	Intergenic	novelGene_55606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	42.9599296502631	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	144	1475	22116	24253	TRUE	0	TTGTTTTCCTGTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEARMETRAPCPHHSSPLNWTWNLAKG	21081	25494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22063_22323_22476_23309_23427_23643_24175_24654_24809_25033_25245
606248	contig_5988_pilon	-	1300	3	Intergenic	novelGene_16005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	29	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	258	635	690419	690042	FALSE	25	GAATGCTTTGTCACAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	691158	689376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_691009_691134
606253	contig_18869_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_56305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
606267	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606270	contig_14322_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_116403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAATTAGCAGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
606271	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
606273	contig_7202_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_16635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCCCATCTTCCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
606287	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
606290	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606297	contig_18364_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_102574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141244	138570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_138600_141200
606300	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606301	contig_753_pilon	-	3124	1	Intergenic	novelGene_113000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	928	1332	1269225	1268821	NA	65	CTTTAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNRQLSHQDPTKANSRERGESDFQSYHTILFKMPRFQQRVTRHARNQERMAHTQKKSKSTQTDPNFLGRVTRHAKNREWMAHSQKKNKSTQTDPDRDQLSDYGAWSEHGIWSDKAWRRDTIKVLKEITAKLE	1270152	1267028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1267000_1270200
606309	scaffold_13553_pilon	+	3494	1	Intergenic	novelGene_73751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	587	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1934	2266	32107	32439	NA	75	AAAAAAAAAAAACAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAQLRQSEISAELPKRGNTSEGFSMGKTPGMLVGVLFLKEWGLGANEAMQPDQDLKGACTDSIFHRPLGYHYHKIFRLNFKDPQKTGVAKQGTQGSCPTCLTQETDDC	30173	33667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_30200_33700
606312	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606320	contig_6710_pilon	+	1761	9	Intergenic	novelGene_89044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_7	128.323261238951	729	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	25	960	568088	602644	FALSE	10	CATTTTGACTCTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLERGSRMQRPGPFSTLYGRVLAPLPGRAGGAASGGGCNSWAAPGYHVQPPGCVQSGSFGGSSSTSTSGGSASRVFPAPSTMSKAEEAKKLAGRAAVENHVRNNQVLGIGSGSTIVHAVQRIAERVKQENLKLICIPTSFQARQLILQYGLTLSDLDRHPEIDLAIDGADEVDADLNLIKGGGGCLTQEKIVAGYASRFIVIADFRKDSKNLGDQWHKGIPIEVIPMAYVPVSRAVTQKFGGVVELRMAVNKAGPVVTDNGNFILDWKFDQVHKWSEVNTAIKMIPGVVDTGLFINMAERVYFGMQDGSVSMREKPFC	568063	603445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_568373_574267_574329_575648_575705_584580_584641_587685_587751_594844_594914_595689_595832_597741_597842_602546
606329	contig_8045_pilon	+	1314	6	Intergenic	novelGene_35358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1470.21693637368	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118133_118243_118527_118707_118752
606340	contig_5690_pilon	+	1512	12	Intergenic	novelGene_119732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	458.968570558302	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	48	1148	1044729	1105490	TRUE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450_1105645_1105762
606353	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_96519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
606360	contig_8044_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_132400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCCCAGGAATTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588058	587361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_587400_588100
606380	contig_14566_pilon	+	1105	8	Intergenic	novelGene_148837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	395	junction_2	260.480168856186	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	169	1104	88884	125249	FALSE	30	GTAAGCATCTCAGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESVPYTLIMNCQHPKEINRNIT	66808	125250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_88762_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
606383	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
606384	contig_5050_pilon	-	1637	13	Intergenic	novelGene_110278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.83360455637	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	11	1438	716384	507209	TRUE	20	TAGATTGTACTTACTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716394	506954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507077_507131_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
606387	contig_7644_pilon	+	2706	4	Intergenic	novelGene_64237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	36.8872154908264	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCTTTGTTCTTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140248	148535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_140998_143421_143558_144996_145193_146910
606401	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
606405	SIRV7	-	355	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-13	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114751	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
606428	contig_12127_pilon	+	3570	1	Intergenic	novelGene_130099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAAGACTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31213	34783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_+_31200_34800
606441	SIRV6	+	512	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
606448	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606478	SIRV4	+	261	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1510	632	1055	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
606479	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_16637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27856	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606480	contig_12625_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_140486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTTGTTGCAACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22399	23349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_22400_23300
606483	contig_500_pilon	+	1384	9	Intergenic	novelGene_30959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	575.598547166339	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	535	1083	1466134	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446837	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452334_1461351_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
606506	contig_15087_pilon	+	2775	18	Intergenic	novelGene_37158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1680	2384	52951	72512	TRUE	25	GAGGGAGATGGGCCGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLLVHFKQLALLLQHLHLLLGCTQDAHLWQLACYHSSLLAGRHLLPCAFHLWGVWLPGGTLFVAAAHQQLLELHIFLPKPLSGLIPLFQALVQLGLQDLILLPKLLTQGLQDGGALLVLVHLGGQPVELEGHAAQMGEELAVVWLLGTHAQSGLQPLQVQHQVAVSRGRGPSSIVFLVLPPLSGGEFCSSAGTTSNSEEVPYWMEVLGPALACHWGVHRQREVLGHLCPFL	33341	89776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_34121_38965_39055_40458_40648_41125_41194_41710_41831_42908_43046_49136_49266_52531_52669_52919_52986_54483_54569_58878_58999_60951_61054_66539_66724_69119_69207_71087_71173_72505_72644_73969_74144_89690
606509	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	293	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
606516	contig_4769_pilon	-	1726	8	Intergenic	novelGene_117966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.7520085045032	226	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTGATGATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437513	407529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_418746_421191_421273_423624_423659_433960_434061_437256
606542	contig_12270_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_114062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	11	322	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14419	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606553	contig_3233_pilon	+	1305	11	Intergenic	novelGene_56551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	297.196382885122	311	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	411	1172	742531	747909	FALSE	15	CCCAATGGGATTGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVSLRPRPSRPSTLRQETIWAQLPLRGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738705	748042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742517_742613_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
606559	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606565	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606566	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_115948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
606590	contig_8729_pilon	+	2224	7	Intergenic	novelGene_40141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	422.951008457901	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	67	942	667395	676873	TRUE	65	AAAAAAAATAATAATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSINPLENLKLYISSRPPLVVFMISVSAMAIAFLTLGYFFKIKEIKSPEMAEDWNTFLLRFNDLDLCVSENETLKHLTNDTTTPESTVTSGQARVSTQSPQALEDSGPVNISVAITLTLDPLKPFGGYSRNVTHLYSTILGHQIGLSGREAHEEINITFTLPTAWSSDDCALHGHCEQVVFTACMTLTAALGVFPVTVQPPHCVPDTYSNATLWYKIFTTARDANTKYAQDYNPFWCYKGAIGKVYHALNPKLTVIVPDDDRSLINLHLMHTSYFLFVMVITMFCYAVIKGRPSKLRQSNPEFCPEKVALAEA	667328	678249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_667485_670128_670415_672253_672405_673741_673926_675394_675539_676852_677929_678022
606595	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_95582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
606600	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
606608	contig_5571_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_75533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGGTTCTGCGCCCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252908	250738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_250700_252900
606612	contig_12411_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_145690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463436	464230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_463400_464200
606632	contig_1275_pilon	+	917	2	Intergenic	novelGene_108838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	86	775	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746551	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
606633	SIRV4	+	339	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	173	-436	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCAATTGCTCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1884_2251
606654	contig_11338_pilon	-	1566	2	Intergenic	novelGene_6411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	919	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGATTCCTATAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323386	320113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_321459_323165
606661	contig_12270_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_113183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	31	381	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14439	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606679	contig_14441_pilon	+	834	5	Intergenic	novelGene_100426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	56	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	219	647	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGLQAATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81883	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81901_113156_113209_116578_116963_117220_117344_117539
606680	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	254	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
606690	contig_6589_pilon	+	806	5	Intergenic	novelGene_25774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	1651.76186237605	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	223	714	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668303	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
606694	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606700	contig_299_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_129425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1377	1793	842552	842136	NA	50	ATATACAACAAAACATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFSELSSSTEKLAPDSTALSTDLRFLFLDFVFVLLDSLISLSASLPSTVSISLITCDPSGRKFSRLSGMANASNSGLFEIFFFFFLDFFLTADTESSAISPCRPTESKDSCSCVSDWCKAMLNCGLSWVSQDASVL	843928	841569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_841600_843900
606701	contig_6283_pilon	-	1947	9	Intergenic	novelGene_100217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	157.178590701787	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	30	1055	615594	611758	FALSE	15	CCTGTGCTTGTCATGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQVPTPQSMPPPPQPSPQPGQPSSQPNSNVSSGPAPSPSSFLPSPSPQPSQSPVTARTPQNFSVPSPGPLNTPVNPSSVMSPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	615623	610865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526
606705	contig_14322_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_115832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671667	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
606738	contig_7356_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_60341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCTTGCAAATGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39796	41226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_39800_41200
606742	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606743	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606749	contig_13894_pilon	+	2001	6	Intergenic	novelGene_62160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2179	junction_2	2068.80094740891	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	511	954	523580	525849	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKVREVCRLRTVALVTES	523069	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_523625_524837_525025_525637_526580_526851_526948_527459_527580_528072
606759	SIRV6	+	777	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	7	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	34	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGTATCGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
606762	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606763	contig_6710_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_92996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1201	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
606769	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
606796	SIRV3	+	367	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4877	1751	2818	470	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTGATAGGTAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6821	7188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6800_7200
606805	contig_15063_pilon	-	1561	5	Intergenic	novelGene_8684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3923048454133	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	25	GCCATGTGACCCGTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36802	27120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34613_34925_35033_35380_35839_36157_36264
606809	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	643	983	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
606812	contig_14209_pilon	+	1973	11	Intergenic	novelGene_88324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_8	122.742657621546	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	55	873	32366	37768	TRUE	20	ACTTAGGGGAGCCTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32311	41008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_38078_40142_40344_40418
606813	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606814	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_94253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653782	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
606815	contig_15236_pilon	+	2379	7	Intergenic	novelGene_141575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	381.577864487272	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	96	1376	419232	450343	TRUE	35	TGTAATAAAACTTATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSSFHLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	419136	452529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_451100_452282
606828	contig_15047_pilon	-	1539	5	Intergenic	novelGene_52246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGCCGGGACACGGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21643	2600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2830_3229_3493_4155_4434_4550_4673_20996
606829	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
606831	contig_6418_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_81256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTCTATCGGCGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475006	1473956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1474000_1475000
606836	contig_10235_pilon	-	1290	6	Intergenic	novelGene_46478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	900.627558983179	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	345	788	221485	219405	TRUE	30	AATTTAGTGGTGTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDPSKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	221829	217920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_221464
606837	contig_11338_pilon	-	1686	11	Intergenic	novelGene_6220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_5	99.7912320797774	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	109	735	17283	14153	TRUE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLGSPP	21390	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13458_13760_13880_14105_14167_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
606838	contig_5585_pilon	-	2474	15	Intergenic	novelGene_143067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	26	junction_14	40.3796397473089	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	31	1908	497822	390145	FALSE	20	GTATCTGTACTCTGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVRAPNLTMQCTQIQINHHYVGLWFGHDFHPQFPSFAACSKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPTQSHRMDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKHGFSDIKVEDTAKGHIVLLQEAETLIQIEEDSTHIICDSDEMLRVRLRDLVLKFLQKF	497852	389578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_390322_392713_392852_394330_394430_402731_402900_405339_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_497723
606843	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
606858	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	121	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
606861	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91676	2	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
606874	contig_8259_pilon	-	1391	2	Intergenic	novelGene_148880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACACAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226345	224065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_225404_226292
606876	SIRV7	-	335	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78950_114680
606902	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
606920	contig_12074_pilon	-	2061	14	Intergenic	novelGene_53756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	428.750517104248	2	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	22	1737	45831	30300	FALSE	25	ACATATTTAATGCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKYFCFLP	45852	29975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30321_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
606944	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_17664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
606945	contig_14575_pilon	+	2296	23	Intergenic	novelGene_101876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.065624273692	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1338	959	2296	30628	63880	FALSE	75	AAAGAGAAAGAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLDTVFHQYHWPKLVLTRNELQMCFRWLPLARSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKL	17210	63880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20124_20843_21036_21521_21607_22644_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30729_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
606956	contig_7695_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_41695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCCCACAATGTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158573	1156483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1156500_1158600
606958	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
606964	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
606967	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_115997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
606969	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
607003	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	121	-9	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
607005	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607017	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
607048	contig_7530_pilon	-	2464	10	Intergenic	novelGene_141837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_9	63.2191953971787	248	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	32	2197	198218	171432	FALSE	25	TAATTCATTTTCCGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEEVAVVRSMESADAEAAGGSEGAPSTEEGSGLPGSVHHEVVPTGSASSRVIVHVDLDCFYAQVEMISNLELKGKPLGVQQKYLVVTCNYEARKLGVKKLMSVRDAKEKCPQLVLVNGEDLTRYREMSYKVTELMEEFSPVVERLGFDENFVDITEMVEKRLQQLQSDECSSVTVSGHVYNDQSINLHDISHIRLLVGSQIAAEMREAIYNQLGLTGCAGVASNKLLAKLVSGIFKPNQQTVLLPESCQDLIHSLNHIKKMPGIGYKTTKRLEALGINSVRDLQTFSSKILEKEFGISVAQRIQKLSFGEDNSPVTPSGPPQSFSEEDSFKKCSSEVEAKKKIAELLASLLNRVCQDGRKPHTVRLIIRRYSSEKHYSRESRQCPIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTLLSVCFCNLKALNTAKKGPIDYYLTPSLSTTKCSGKRSLKMKDTHMEDFSKDKETNCDFLPSGRIESTRNGKSPVNNTDFSKEKGINDFPLYSFPEGIDQEVFKHLPVDIQEEILSSKSREKFQGKGSLSSPLHASGGVFSFFSTKQMQDSPSNPTDQLSSSKQVSSVSPCEPGTSGLNSSSSSYVSIQKDYEDERMSQGPKESQGFHFSNTTPTISVFHSFPDLQSEQLFSKNHTTDSHKQPSAIASHHEGFTENRQQNSAEEKITFPSDIDPEVFYELPEEVQKELLAEWKTTGSYFQLVHK	198249	171164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_172230_179259_179466_182112_182244_185539_185632_186434_186614_189495_189733_191528_191682_193856_194022_196662_196789_198139
607061	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	0	146663	0	-91629	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGTAAGTATAAAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147923	147666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
607064	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_97847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
607069	contig_12951_pilon	+	152	2	Intergenic	novelGene_68130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAATGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64528	69478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_64614_69411
607074	contig_5331_pilon	-	1658	5	Intergenic	novelGene_112777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	340.079678163809	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	76	663	254169	248930	FALSE	0	GTGTCTTTGTTCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAFKSSKRSLETLWGSSALSYGLAMSRDRLDGNGKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	254244	247934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_254140
607078	contig_12786_pilon	-	1550	9	Intergenic	novelGene_103419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_7	517.58294926997	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	557	1492	614067	590909	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629642	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_628731_628938_629303
607093	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGATTTCACCTGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
607095	contig_19311_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_144084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCACAAAGGGGCTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147251	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_147300_147700
607098	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607102	contig_14846_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_85389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAACTGGTGTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273271	275952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_273300_276000
607106	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607108	contig_18869_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_56310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
607110	contig_14184_pilon	-	2165	5	Intergenic	novelGene_66594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.726796715492	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	662	1054	90204	89812	TRUE	25	TCATCTGAACCAAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKKWPPSPSFLLALSPRDSPWAVIEQVCLGFLGPATSHHSHPPVSQSAHYTATKPNTAHLAEGPSCKSGPGPGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126320	88553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89173_89319_90512_105809_105915_109168_109327_126229
607118	contig_10005_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_148911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATAGAATAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114601	117174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_114600_117200
607134	contig_50_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_122208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27710	25149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_25100_27700
607143	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	643	1014	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
607153	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
607176	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607177	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
607178	contig_2204_pilon	+	1526	8	Intergenic	novelGene_71666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	165.946143218153	50	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	30	785	13204	50476	FALSE	20	AAGGGCATCATGCCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTPSTSRMS	13174	51217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912_50016_50450
607179	contig_1275_pilon	+	1085	2	Intergenic	novelGene_108816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	254	943	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746060	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746308_747272
607187	SIRV7	+	360	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTTGCGTTTTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56103_70889_70982_78840_78963_114679
607196	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_115993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
607207	SIRV2	-	265	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	23	660	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
607213	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_16379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
607216	contig_8156_pilon	-	2238	6	Intergenic	novelGene_98931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	37.6435917521163	108	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	905	1813	441382	395622	FALSE	25	AGTCCCTTCTTTAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWTTKAFLPRMLELQNGHIVCLNSVLALSAIPGAIDYCTSKASAFAFMESLTLGLLDCPGVSATTVLPFHTSTEMFQGMRVRFPNLFPPLKPETVARRTVEAVQLNQALLLLPWTMHALIILKSILPQAALEEIHRFSGTYTCMNTFKGRT	442286	395196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403531_403883_404004_404665_404810_441187
607217	contig_8452_pilon	-	856	5	Intergenic	novelGene_48081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_4	889.024887165708	179	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	56	541	991128	962919	FALSE	5	GTGGTTGAGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991183	962603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
607218	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
607227	contig_2087_pilon	-	1782	4	Intergenic	novelGene_65554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAGTGAAGCCGAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71861	39327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_39635_69052_69262_69992_70057_70659
607231	contig_7151_pilon	-	1881	12	Intergenic	novelGene_40660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	108.570120541428	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	328	1776	40532	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65221	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13467_40526_40716_65077
607240	contig_10140_pilon	+	3130	1	Intergenic	novelGene_148391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	45	335	146486	146776	NA	30	GTATGTGAACTGTATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLSYPTQPLLVGQMVHTRDGRLRILGTDHPWPSLLVGWRFHTGRGKLRRPEAAAPTQHSTHTERVSLREKQPLVNFYQRIKEELIPILQTLCQKRTQYFSTHSMRSVLS	146441	149571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_146400_149600
607249	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
607259	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACTACAGTCAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
607263	contig_7202_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_16652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTCCGCAGGTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
607274	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607280	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
607297	scaffold_12124_pilon	-	1441	4	Intergenic	novelGene_22112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1996	junction_2	206.113776562579	1323	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	102	998	899419	894491	FALSE	0	GTGTGCTTCTCTGCGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGVVSYPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKILKDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDELKKVI	899520	894047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894649_895139_895281_895908_896396_899308
607304	contig_10311_pilon	-	1659	10	Intergenic	novelGene_50412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1021.66759108169	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	436	1011	68387	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68740_68961_69038_70224_70358_70446_70496_71497
607309	contig_12379_pilon	-	529	3	Intergenic	novelGene_148937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCACGCAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201248	197872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_198165_199318_199466_201158
607314	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_89182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
607325	contig_7428_pilon	+	2349	7	Intergenic	novelGene_77684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	312.471687606342	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	130	1278	221272	223939	TRUE	10	GCCCTCTGTGACTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALALPDCLVLWVPAEAHPLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTRSVLSPSEACGLLLGSTCGHWDVFSSWNISLPAVPKPPPRPPSPPAPGAPVSRILFLTDLHWDHDYLEGADPDCVDPLCCRQGSGLPPTSRPGAGYWGEYSKCDLPLRTLESLLSGLGPAGPFDMVYWTGDIPAHNVWQQSRQDQLRALTTITALVRKFLGPVPVYPAVGNHESTPVNGFPPPFIEGNHSSSWLYEAMAKAWEPWLPAEALQTLRIGGVLCPVPTPPASASSLSI	221142	225742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221584_222563_223337_223875_224050_224356_224434_224643_224790_224957_225219_225265
607336	contig_10734_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_51301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	303.205936617343	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	525	875	1378305	1388936	FALSE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368635	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368847_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
607339	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
607343	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
607347	contig_9345_pilon	-	2448	22	Intergenic	novelGene_24549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_19	176.935798085043	1	96	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	683	2350	727643	723552	FALSE	10	CTCCTGGAGTCTGTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730122	723453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_729088_729165_729316_729427_729770
607349	SIRV7	-	228	1	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	13	146677	13	-91640	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTAGCACGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147905	147677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
607353	contig_7342_pilon	-	2364	21	Intergenic	novelGene_71119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	111.265571943886	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1246	2310	78723	76155	FALSE	15	AGCTAGTTTTCTCCTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86768	76100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81088_81178_81295_81342_81436_81538_82315_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_86703
607364	contig_10037_pilon	+	1816	8	Intergenic	novelGene_148943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	189.899866202358	745	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	148	825	115453	445150	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAGTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTASTRRVTFEADENENITVVKGIRLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERSAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFKRYDFHPVCADLQAQILQCYRQHTHQTLSCSALAAQYMHCVNQAKQGTLEKGG	115305	446141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_378523_378595_425456_425593_445126
607372	contig_4486_pilon	+	2074	13	Intergenic	novelGene_38590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1581.77897388422	1	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	111	737	343083	399290	TRUE	35	CAATGTTGTGATGTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVTLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWEVNS	311797	413461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343086_360543_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390041_391130_391206_399276_399433_407559_407696_411177_411318_412424_412731_412848
607376	contig_1225_pilon	+	1833	4	Intergenic	novelGene_44125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	228	545	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250586	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274944_276042
607379	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
607386	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
607394	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
607403	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532876	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
607407	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_17594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27819	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
607408	contig_14322_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_116476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
607414	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
607417	contig_3382_pilon	-	2021	13	Intergenic	novelGene_124030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	382.216661579383	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	20	865	344734	224870	TRUE	15	CATTTGGCGTTCATTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWSGGPMEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344753	176649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_185101_185283_186028_186176_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_309848_309943_344645
607433	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607440	SIRV5	-	419	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACTTCGCACGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
607449	contig_7171_pilon	-	2768	29	Intergenic	novelGene_101290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	114.505525220936	3	85	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	310	2646	1074341	1057742	FALSE	10	GCTGTTATCTTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTVRCLPQLSPDTLPFPSATAEPSPVPQALHQPPGDSRSSSPRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARYQPPMAPRPPVISPTAVPPPFTPPAFCRKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075802	1057619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066845_1067293_1067337_1068327_1068370_1068453_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074357_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
607450	contig_1225_pilon	+	2004	3	Intergenic	novelGene_44112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	60	335	147032	148934	FALSE	25	ATTGGCGCAATATTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWRLGSPGASSPLRTSAVKMGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134412	150603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134456_147015_147136_148762
607463	contig_9839_pilon	+	1819	8	Intergenic	novelGene_88559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	396.864650756915	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	16	765	255906	264526	TRUE	25	CAGCGATCTTCTAGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQI	255890	268314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_264520_264600_266322_266513_267523
607467	contig_19459_pilon	+	827	5	Intergenic	novelGene_59879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGTGAAAATGGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6675	12643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7789_7945_10267_10330_11327_11426_12575
607478	contig_14322_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_116479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671895	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
607484	SIRV4	+	304	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	632	1012	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
607489	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
607493	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	6	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
607510	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	0	2959	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
607532	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91680	4	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
607538	contig_15720_pilon	-	1024	8	Intergenic	novelGene_41908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1696.95377734604	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	100	966	283894	278559	FALSE	15	ACTTTTTGGAAGTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKITWCECGR	283993	278500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278586_279052_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
607539	contig_8375_pilon	+	2390	9	Intergenic	novelGene_141260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	174.235428013364	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	64	1251	18749	37052	TRUE	15	TTGAAGTGTGTATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYCRKCLTEGSTEEVSGHTGSFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITV	18685	65438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_18813_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35454_37050_37308_51103_51140_59731_59755_64613
607540	contig_1435_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_115472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317065	314970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_315000_317100
607541	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
607550	contig_15498_pilon	-	2184	5	Intergenic	novelGene_42621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	28.0802421641979	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	91	1149	543957	534858	TRUE	20	CCTAAGCTGGTAGGTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGRPSLCQFILLGTSSVVTAILYSVYRQKAQVSHELKGAKKIHLGEDLKSILLEAPGKCVPYAVIEGAVRSVKETLNSQFVENCKGVIQRLTLQEHKMVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	544047	532158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_532223_533886_535588_537666_537788_538368_538457_543837
607566	SIRV6	+	758	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	796	32	-359	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	76	408	2002	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1926	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
607579	contig_9727_pilon	+	2520	5	Intergenic	novelGene_86303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	42.807709586008	508	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	91	795	275239	277981	FALSE	0	GGGTGTCTTGGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEVLASIIIIVFRPRAEQPTPETQHCPEFCFLSLSHLGPRDTLKPLEKLARFPMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGMARTPAPSAGSSAGSVPEAPNSSPSTPATSSPAGAPSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNNMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS	275148	279706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_275404_275487_275572_275748_275865_276091_276279_277828
607588	contig_2903_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_148975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTAAGAAATTTCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143862	145822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_143900_145800
607599	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
607605	contig_1337_pilon	-	2371	11	Intergenic	novelGene_84245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	47.2576977856518	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	684	1712	444479	428635	FALSE	45	CAGAACTTCTTTAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGKSDEQCAAAALACVLCIQLGPGIESEEILKTLGPILKKIICDGTTSIQARQTCATCFGVCCFIATDDITELYSTLECLENIFTKSYLKEKDPNGICSTPTTVLHISSLLAWTLLLTICPINEVKKKLEMHLHKLPSLLSCDDVNMRIAAGISLALLFELARGMDNDFFYEDMESLTQMLRALATDGNKHRAKVDKRKQRSVFRDILRAVEERDFPTETVKFGPERMYIDCWVKKHTYDIFKEVLGSGMQYHLQSNEFLRNVFELGPPVMLDAATLKTMKISRFERHLYNSAAFKARTKARSKCRDKRADVGEFF	450284	427975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_428725_431514_431611_432042_432172_434959_435095_439321_439431_439518_439698_439779_439831_442539_442698_444397_444523_445308_445630_449965
607606	SIRV4	+	257	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	265	428	265	-428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTCGTCATGGACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1720	2343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
607610	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	632	988	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
607628	contig_6794_pilon	-	1820	4	Intergenic	novelGene_148994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	280	junction_2	55.6796392070048	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	32	643	19487	13983	FALSE	20	AGAGCTACGTCTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKHEVSVPYAMHLLNGIKLFGRPIKIQFRSGSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	19518	12805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732_18827_19426
607632	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
607633	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
607642	contig_10434_pilon	-	2411	8	Intergenic	novelGene_82053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	208.275132006308	36	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	152	877	191899	164413	FALSE	10	GAATTGGTTCTTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPPSAPSVTSAPAPAAFLPFSTVCLLLGGTRFPILPPLYPVLVAGFFPHMDLVGVASPEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDNECTLVHADLSEYNMLWHAGKVWLIDVSQSVEPTHPHGLEFLFRDCRNVSQFFQKGGVKEALNERELFNAVSGLNISADNEADFLAEIEALEKMNEDHVQKNGRKAASFLKDDGGPPVLHNE	192050	162878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167670_167762_167825_177741_177790_177878_178025_178827_178947_191854
607643	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
607646	contig_4125_pilon	-	2071	5	Intergenic	novelGene_25134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	577	junction_1	292.955948053628	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	878	1573	813454	811045	FALSE	15	TTCCTTTAGCCATGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPDLSQLSGILGNAAIVLRSRLKVRVVKELRGKKAAAPNGVRENGSLAPDAEVGKQVMQYQVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	814331	810546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265
607655	contig_11115_pilon	+	1884	8	Intergenic	novelGene_102823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	473.008823320216	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	234	1364	165608	172724	TRUE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVL	165374	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172396_172461_172595_172722_172964_173047
607685	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	632	968	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
607697	SIRV7	-	287	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68993	0	35774	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
607700	contig_8106_pilon	-	1964	4	Intergenic	novelGene_139741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	125.867655363348	642	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	113	709	134968	128810	FALSE	15	TGTTTTCCTTGAATTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCSQVKPPPQGTFQVLRGNGTSVGTVLLFHCPSGHQMGGSGLVTCAWKGSVAEWSSGTPTCKSVPPHETFGFRVAVIASIVSCAIILLMSVAFLTCCLMKCVKRTEKRHSDRTAQLWYQLRGKDLETLQAASLGLKGLNNNNNSHPSCQPRLGEAALQAHDNHCFTSDHGKGTTELASMGPSVNKHPWTPLPDALSPSVSRVMVHIESPAQTLPASGPTPEMPGMPGQVSANLG	135080	127554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_129015_131522_131688_132743_132892_134889
607704	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_95116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607710	contig_6102_pilon	-	2519	12	Intergenic	novelGene_32234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_6	24.7583361034535	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	507	1358	920608	910606	FALSE	35	AATTCATCAGTATTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMAMRIIDRALKEDFGFKHRLWVYSGRRGVHCWVCDESVRKLSSAVRSGIVEYLSLVKGGPDIKKKVHLSEKLHPFVRRSINIIIKYFEEYALVAQDILENKESWDKILALVPETMHDELQQGFQKCHSSLQRWEHLKEVTSRCQSNVKNDKCGPWLEWEIMLQYCFPRLDINVSKGINHLLKSPFSVHPKTGRISVPIDLQKVDQFDPFAVPTISSICHELDLISTNEEENEAESDVKRRTRDYKKTSLAPYVKVFEQFLEKLDESRKGELLKKSDLQKDF	927137	909444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_910626_912576_912676_914069_914153_914802_914873_916454_916597_916762_916855_917934_918045_918990_919050_919654_919792_920568_920821_926066_926225_927001
607716	SIRV2	+	654	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	134	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCGTTCTAGGCCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1651_1727
607722	contig_3818_pilon	-	2461	6	Intergenic	novelGene_99289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.7857099957096	140	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	155	994	925321	920451	FALSE	20	TGACTTTTCTATTTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSPTARHQEPVTFEDVAVIFTEEEWRHLVPIQRDLYKEVMLENYRSIVSLGLPVPQPDVIFQLKRGEEAWIVDLRGSEERECPENISLDGETKPEIQDTSEEEISKGTLRERLGSKGPLCPKFEVHVPEDRLETEKENPAVETCKKFFSQEKILQQGSIPPKKIFTKERDQECRDCGKTFFDHSSLIRHQRTHTGEKPYECHECGKVFSHRSSLSRHRMSHTGESPYECNVSSVEKPSLTVRPLLDTREFILEKVLMNVISVGRPLARKASLLDIS	934468	918983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_920588_920666_921096_921605_921720_923957_924085_925288_925426_934418
607727	contig_12032_pilon	-	1970	9	Intergenic	novelGene_139269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	110.968393585741	679	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	524	1666	117404	96750	FALSE	20	TAACTTGGCAGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	122509	96445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122278
607736	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
607743	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
607749	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_113903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	19	345	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14427	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607750	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607765	contig_7321_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_53145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAGGTGTGAGGTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199532	201882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_199500_201900
607766	SIRV4	+	231	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	6	-1079	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTGGGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
607769	contig_3095_pilon	-	1217	6	Intergenic	novelGene_75238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	8	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	79	876	255481	246716	FALSE	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255559	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
607770	contig_20609_pilon	+	1800	12	Intergenic	novelGene_118476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	80.4965991787159	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	10	930	43732	58043	TRUE	5	CTACTGCCTCCTGTTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWTMAVNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHRFPRGPRAHCPSVSSAGGRGGRLQGAPGGGESLRGAPTGTARRCCF	43722	59331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56520_57551_57668_58017_58124_58541
607772	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
607782	SIRV4	+	227	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1544	632	1089	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2544	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
607789	SIRV4	+	394	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	114	442	114	-442	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGCCATTCCAATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569	2329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
607792	contig_12270_pilon	-	299	2	Intergenic	novelGene_114109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTTTCACCATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607797	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607802	contig_1406_pilon	+	2131	6	Intergenic	novelGene_25607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	500.811181983789	139	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	48	413	2214556	2228911	TRUE	20	TGTGGATATGCAGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVSISAPTGDWGRAMAEKTRKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAHPDNITPDAGDSEPKPMIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKGKLCSEFHCEK	2214508	2232139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2214579_2218160_2218226_2225347_2225454_2226996_2227086_2228828_2230056_2231565
607803	contig_13780_pilon	-	2188	16	Intergenic	novelGene_149082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	1587.67923712569	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	191	2059	702195	657588	FALSE	20	CGCACGCCCGGGAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727553	657458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_660148_660194_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438
607811	contig_19342_pilon	+	915	6	Intergenic	novelGene_41081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.61109401705356	24	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	22	486	3263	6183	TRUE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSSDRVMDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3241	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3267_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
607838	contig_13760_pilon	-	2556	11	Intergenic	novelGene_61284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	191.240790627941	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	82	1017	191898	167445	TRUE	5	CTTCTGTCTCTCACGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERSQLLLSPTQFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPKAYWGVGQGPSCQPLP	191979	161431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161583_161644_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172640_191857
607860	contig_4315_pilon	+	2085	3	Intergenic	novelGene_46838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2593	junction_1	90.5	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	76	432	575508	580260	FALSE	40	TCATGAAAAACACGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575432	581913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086
607861	contig_11816_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_98466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426235	424786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_424800_426200
607887	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
607897	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_95691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
607901	contig_10235_pilon	+	1413	4	Intergenic	novelGene_46336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	237.108976351944	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	80	400	109120	110311	FALSE	10	TCCAGTCAGCTTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQASWQKKAKPASFVCLLTSASICGAMSQIRDLQGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKNIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKM	109040	111324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_109553_110144
607902	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
607913	contig_3095_pilon	-	1122	5	Intergenic	novelGene_75022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152241	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149876_150503_150695_150995_151162_151847
607925	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1561	632	1106	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
607928	contig_11855_pilon	-	2123	9	Intergenic	novelGene_67043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1102	1626	2007337	2000932	TRUE	40	TAGGAAACAAAGCAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVLVRTGSQEGQVRTWGRRLFKYPHPLTAFWGLPFEDIAVIGPRGGSKGKDWRWAALFQEGRVTWRGGFVAGDGCQLLDCTPVLLVAGAARWLGGCQGHGGRAGQVARLQGKEGRIAAAALGRGGGTVPIGDIEDPQQLLFTLFLHKHLLQLLVEPFQASVQAGAKSQDSGP	2008486	1981513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1981611_1986606_1986776_1995525_1995623_1997478_1997591_2000909_2001045_2002252_2002454_2004011_2004165_2007279_2008031_2008078
607932	SIRV2	-	1058	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2930	-1	1751	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	347	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674_2803_2881
607939	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	83	501	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
607960	SIRV7	-	221	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69055	4	35836	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
607962	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
607968	SIRV5	+	329	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	875	1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
607971	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
607977	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
608010	contig_2453_pilon	+	2340	12	Intergenic	novelGene_147761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	58.8129125081045	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	99	1100	56543	59419	TRUE	5	TTTCTGGGTTTATTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKESS	55587	63154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_55657_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59407_59496_60185_60266_60357_60786_61900_62016_62422_62836_63026
608011	contig_16492_pilon	+	1828	7	Intergenic	novelGene_100280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	87.8794945112656	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	352	1074	86032	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	85680	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
608026	contig_15248_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_149158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAATAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194783	192937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_192900_194800
608027	contig_12080_pilon	-	1469	9	Intergenic	novelGene_128400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	49.9549797317545	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1449	20	1468	218255	211188	FALSE	25	AGACCCTGTCTGACTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPQDLDIAVWLATVHLEQYADTFRQHGLATAGAARGLGHEELRQLGITATGHRKRILRLLQAGAAEGSLDPQSDSAMEPSSSPDPQAQTLKPVPKPRTVFGGLSGPATTQRPGPSPALRGPEVSRSPESSPRSPPLPTSSSEQPSALNTMEMIPNAIYFGLDLRGQSQAAQDITPDSSQKAAPTPALRPTAGTVHIMDPGCLYYGVQPVGVAGLPDRREGRGICQDRAEHRLSRQDLEAREDASYASLELPGDSTLSMPTLDTEETSDDLISPYASFSSTADPPMPLLSGWLDKLSPQGNYVFQRRFVQFNGRSLMYFGSDKDPFPKGVIPLTAIEMTRSNKDNKFQVITSQRVFVFRTENEAQRDTWCNMLQSCLKEQRLLGHPRPPHPPRPLRTGMLELRGHKAKVFAALSPGELALYKSEQAFSLGIGICFIELQGCSVRETKNRSFDLLTPHRCFSFTAESGGARQSWAAALQEAVT	218274	211186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_211252_211493_211601_211674_211860_211939_212061_212312_212383_212526_212731_217309_217422_217528_217591_217731
608034	contig_6446_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_149182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGGGAAGGAAGAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188653	187979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_188000_188700
608047	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_96034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
608056	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608074	contig_10937_pilon	+	1288	7	Intergenic	novelGene_67308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	79.6045783161301	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	389	1069	40796	45357	FALSE	10	CCGGGTGTTGTCACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	40213	45576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_40427_40620_40892_41611_41723_42770_42916_43895_44008_44133_44249_45255
608106	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	100	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608109	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	391	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608114	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
608141	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608152	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_115729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
608159	contig_9053_pilon	-	2823	1	Intergenic	novelGene_87932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	436	873	133447	133010	NA	70	CAGAAAAAAAAAAAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSPSILILRSILTVLSKTDLFDFRVVHGIFNILPQHRHSKASILIRSSLFIVWLSHACEAVETNMACVRHTLVLKVTSLLFNILKKSFAADLPNAIYHLISRLLLPLALSVDSSKMKSLTTSVFSLFIMILLIGPIYFLYVEG	133882	131059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_131100_133900
608174	contig_6066_pilon	-	2620	3	Intergenic	novelGene_149276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2086	2391	27680	27375	FALSE	35	TAAAAATTGCATTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWSQLDSNRATGFRVDTCIALLGSLAQFSNIAVPILNPRVRGFLRFHICSHFSVSYSRFGNPGEVVIKSSAANQKFGSSNPLGTPWKLYVAGLLCPVGSL	33695	27145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6066_pilon_-_29333_32372_32552_33441
608183	contig_9727_pilon	-	3445	4	Intergenic	novelGene_86271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	32.2937902527543	105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	134	1078	114177	104594	FALSE	25	TTAAAGTTTTTAGTGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKRNIQIIEWEHLDKKKFYVFGVAMTMMIRVSVYPFTLIRTRLQVQKGKSLYHGTFDAFIKILRADGVTGLYRGFLVNTFTLISGQCYVTTYELTRKFVADYSQSNTVKSLVAGGSASLVAQSITVPIDVVSQHLMMQRKGEKMGRFQVRGNPEGQRVVAFGQTKDIIRQILRADGLRGFYRGYVASLLTYIPNSAVWWPFYHFYAEQLSYLCPKECPHIVFQAISGPLAAATASILTNPMDVIRTRVQVEGKSSIILTFRQLMAEEGPWGLMKGLSARIISSTPSTIVIVVGYESLKKLSLRPELVDSRHW	118854	102226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_104786_107884_108013_113552_114183_118726
608212	contig_11855_pilon	+	2824	16	Intergenic	novelGene_66887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	28	junction_1	65.4934771985391	180	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	286	2172	676574	727434	FALSE	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDGYDSCSEDTSSSSSSEESEEEVAPLPSNLPIIKNNGQVYTYPDGKSGMATCEMCGMVGVRDAFYSKTKRFCSVSCSRSYSSNSKKASILARLQGKPPTKKAKVLQKQPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSMEGFSWGNYINSNSFIAAPVTCFKHAPMGTCWGDISENVRIEVPNTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFENDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDFSQKVSESMQYPFKTCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESEDRTDDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDTPPHLFAKVKEVDQSGEWFKEGMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQSSRESQSGSSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQESNGSANFYIKQEP	645093	728086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_645331_676525_676728_679840_679975_681245_681361_682427_682511_694126_694245_711191_711327_711601_711691_711906_712142_712738_712795_713127_713233_716703_716852_717594_717678_718075_718311_718797_718876_727315
608214	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1461	632	1006	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2461	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
608215	contig_8452_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_48026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341385	341724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_341400_341700
608229	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
608236	contig_6740_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_142713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTTCCCAACAGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695878	695341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_695300_695900
608250	contig_7333_pilon	+	2479	14	Intergenic	novelGene_142772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	107.012193078432	228	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	640	1947	194660	217535	FALSE	5	TATGGCCCTTGCGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRVLAFSSSSITSVAVKIDGVHLGEAVHLSGPIFILKWNPRNYSNGTHNIEVIVQDSAGRRKTVHHVFSVEEDLHLTFDPLASFILLTDHYIMARVLFVLIVLIQLTILIIFRYRGHPKLKGPPGFVNLTSFSLHVLSKINIFYYSVLLLTLYTVLGPWFVGEITLGKLGCCFSFGIFVDGHFLQGSLTFIVGILQLVFFNVPLMTYLSWSLLQRCFGHNFRSHLHQGKYLKIIPVHLLMLLLYVWQVYSCYFLQVTYGTLAFFFSPLRTWLTLLTPVLIRCVWTLNPSELGTFTVQLKSHLSS	184209	218067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_187503_187630_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_202680_202841_203505_203620_206388_206474_212390_212496_214311_214431_217208
608251	contig_17440_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_7604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGAATTCCGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
608255	contig_20819_pilon	-	2358	3	Intergenic	novelGene_55616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAACTACTGCTTCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25473	22275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_24001_24172_24728_25395
608263	contig_7962_pilon	+	2602	1	Intergenic	novelGene_149295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATCCCAGCTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193796	196398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_193800_196400
608272	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608283	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
608292	contig_18794_pilon	+	2031	13	Intergenic	novelGene_54640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.493003083073	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	360	1565	156108	172468	FALSE	30	ATGTTTTCTTTCAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISVLPMEVLMYIFRWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRGCIKLVPYTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYIRFFPDGHVMMLTTPEEPQSIVPRLRTKNTRTDAILLGHYRLSQDTDNQTKVFAVITKKKEEKPLDYKYRYFRRVPVQEADQSFHVGLQLCSSSHQRFNKLIWMHHSCHITYKSTGETAVTAFEIDKMYTPLFFARVRSYTAFSERPL	145045	172934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145313_152187_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_166873_167941_168038_168360_168455_169970_170123_172359
608296	contig_6313_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_149322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTATTGTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29653	27963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6313_pilon_-_28000_29700
608307	contig_3424_pilon	+	1659	2	Intergenic	novelGene_55507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	168	1403	169443	170678	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	169193	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_169284_169365
608315	contig_7202_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_17562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28066	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
608332	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
608338	contig_4678_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_126020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGGATACAAAAGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309735	309234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_309200_309700
608339	contig_4678_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_126019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACTGCTGAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307352	306765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_306800_307400
608340	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
608352	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
608378	SIRV5	+	474	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-149	880	-35	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8166	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
608381	contig_401_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_42863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	250	1371	1724288	1721973	FALSE	10	TATACTTCTGTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1724537	1721706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174
608387	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
608402	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
608404	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
608413	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
608414	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
608420	contig_8138_pilon	+	2013	5	Intergenic	novelGene_52418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	4	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	219	674	280295	306552	TRUE	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_307324_307366
608424	contig_4364_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
608425	contig_6876_pilon	+	2433	4	Intergenic	novelGene_147019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.3398435016663	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	154	687	133885	141033	FALSE	30	AAAGCATCTTGGGTGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVFILEMTARN	126360	142779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_133860_133906_140423_140908_141004
608426	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	101	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
608440	contig_9527_pilon	+	2621	3	Intergenic	novelGene_134082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_2	24.5	310	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	787	1836	495471	499603	FALSE	25	GAACAATTGTGTGGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLLLNLDFGEPPPKKALEGNSKHQNFVKKRRFLERKGLLSKKKQPPGKVARLHSDSPKKEETAKVDGTWKVPPLPKKKKTAASSSGSEQSLDKKATVPWLTPAPSQEGHSVAAKVDLLGEFQSALPKIKTHLVCSQKKHPQKNPPQKNASQNSTPAHSENNCPGVSQEMPRKMVAVDCEMVGTGPKGHVSSLARCSIVSYDGDVLYDEYILPPCHIVDYRTRWSGIRKQHMVNATPFKIARSQILKILTGKIVVGHAIHNDFKALQYFHPKSLTRDTSHIPLLNRKADCPENTTMSLKRLTQKLLNRDIQVGKSGHSSVEDAQATMELYKLVEVEWEQHLAQNPPED	494684	500388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_496206_498389_498591_499489
608452	contig_8284_pilon	+	1059	10	Intergenic	novelGene_125699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	431.286218733147	138	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	104	649	426599	461204	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVEHRSDRTVFHEGPAVT	425051	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458485_461154
608453	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608465	contig_6424_pilon	-	1450	6	Intergenic	novelGene_109255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	483.69023144984	35	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	420	851	12076	6307	FALSE	15	GGAATCCTGTTGCTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21103	5707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_13938_14246_21012
608472	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608481	contig_5643_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_38978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTCTTGCGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550875	553069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_550900_553100
608487	contig_8317_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_20153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTCACAGAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
608503	contig_5696_pilon	-	2430	8	Intergenic	novelGene_117594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_3	409.041687411951	952	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	48	938	773050	756911	FALSE	35	TAAATTGAAATTCTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRDRASRRGSRSRLAMAMGGGGGVLEQEDSVLFRRGTGQSDDSDIWDDTALIKAYDKAVASFKHALKNGDICEASDKPRGTPKRKPIKKNKSQKKNTTTPLKQWKVGDKCSAIWSEDGCVYPATIASVDFKRETCVVVYTGYGNREEQNLSDLLLSTFGGVSNGDQNAQENAQENENESQISTDESENSSRSPGNKPNNLKSKAAPWNSFLPPPPPMPGLGVGPGKPGLKFNGPPPPPPPPPPPSFLSCWLPPFPSGPPIIPPPPPICPDSLDDADALGSMLISWYMSGYHTGYYMGFRQNQKEGKCSHFN	773097	755418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_756959_762282_762394_763244_763344_764527_764684_764836_765050_765887_766008_767711_767784_772978
608508	contig_16510_pilon	+	1936	3	Intergenic	novelGene_139091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	36	350	289563	292598	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWFSLSKARYAMGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPDSHQLGSKPAPGAPRETQAARAWGRLSQGSEHSDMTALHPAFFLYRLPLLHLS	289527	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289634_289736_289820_292437
608510	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
608512	contig_11574_pilon	-	2192	11	Intergenic	novelGene_64090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336.328842057888	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	500	1882	454111	449849	FALSE	30	AATTATTTCTGTACTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEVPLTQLTGSCQERTQESSARYPQEKTSGYFGKRPGKYYLIHPYRRKVTFPQTVTAFQQFVISLPVCSLKLIKKSGCIELHVKEWNTRVEHRLCR	462684	449538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450257_450392_450808_450912_450990_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456382_456540_462651
608521	contig_16776_pilon	-	1408	7	Intergenic	novelGene_130505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	359.962690967951	2362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	489	1016	43087	35073	FALSE	10	CAACCCTGTCTGTTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	57964	34680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43228_54109_54200_57706
608522	contig_5744_pilon	+	839	3	Intergenic	novelGene_149327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_2	214.5	1339	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	158	388	294152	297257	FALSE	5	TTTGCTGTACTGGGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFFNGLRAELVTYPGITVSNICPGPVQSNIVKNAVTEEVTKSVGNPGDQSYKMATSRCVRLMLISMANDLKEVWISDHPFLLAAYLGQYMPTLTFWIIGKLGKKRIENFKSGLDADSSYFKPLKKKHD	293278	297708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_293403_294118_294335_297209
608532	contig_14681_pilon	+	1707	10	Intergenic	novelGene_134203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	200.500484898278	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	106	525	50409	58826	TRUE	20	ATTATATTGTGAGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIATLVQMRNPEARE	45659	73207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_45707_50350_50634_56129_56208_58505_58584_58787_58917_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
608543	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	96	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
608570	contig_3243_pilon	+	1589	6	Intergenic	novelGene_147525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	297.04922151051	581	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	359	856	20577	33350	TRUE	20	GTTTGGGTTTAAACACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPGSSSQPPPVTAGSLSWKRCAGCGGKIADRFLLYAMDSYWHSRCLKCSCCQAQLGDIGTSCYTKSGMILCRNDYIRLFGNSGACSACGQSIPASELVMRAQGNVYHLKCFTCSTCRNRLVPGDRFHYINGSLFCEHDRPTALINGHLNSLQSNPLLPDQKVC	17477	34152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_17833_20573_20813_28044_28142_28539_28696_33341_33590_33658
608572	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
608585	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608586	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
608588	SIRV1	-	209	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	4008	5569	3588	-120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAAGATGTCGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
608590	contig_5928_pilon	+	1818	8	Intergenic	novelGene_40352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	40.4535510915713	545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	29	1042	141775	182805	FALSE	15	TTCTATTTGATCACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAWRGCRGTMAAPKENVNLLFKLYCLIVMTLVAAAYTIALRYTRTSDKELYFSTTAVCITEVIKLLLSVGILANETHSLGKFKTSLRENVLGSPKELMKLSVPSLVYAVQNNMAFLALSNLDAAVYQVTYQLKIPCTALCTVLMLNRTLSKLQWVSVFMLCGGVTLVQWKPAQATKVVVEQNPLLGFGAIAIAVLCSGFAGVYFEKVLKSSDTSLWVRNIQMYLSGIVVTLVGVYLSDGDEIKEKGFFYGYTYYVWFVIFLASVGGLYTSVVVKYTDNIMKGFSAAAAIVLSTIASVMLFGLQITFTFALGTLLVCVSIYLYGLPRQDTTSIQEGERASKERVIGV	141746	183581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_141791_156187_156366_172170_172331_172519_172673_177706_177774_179822_180000_180458_180594_182677
608596	contig_5344_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_125329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGAAAAAATACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33998	32638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_32600_34000
608597	contig_9058_pilon	+	1678	5	Intergenic	novelGene_149359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_4	268.449250324898	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	47	1078	41923	56652	FALSE	15	CCCAGTGTCTGCTCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNDEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPPPSHRSQARGHRPPPPGHRVQHQQQKRPPPPSGTQVHQQKGPPLPRPRVQQKPLPGAAENS	41876	57252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47502_51837_51961_56353
608606	contig_987_pilon	+	1252	8	Intergenic	novelGene_72301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_2	408.156832602371	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	18	911	945420	965284	FALSE	0	CTGCTTTTGGTTTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIANTMFSRASLAGVSAWALQPQWTQVRNMATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL	945402	965625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945476_956426_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183
608607	contig_1225_pilon	+	2523	4	Intergenic	novelGene_44152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	2	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	218	535	250814	274411	TRUE	50	GTAAATAAAGTTTGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250596	276771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275814_276185
608625	SIRV7	-	347	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	4	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
608639	contig_6048_pilon	-	1863	13	Intergenic	novelGene_73283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.1664889834512	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	52	1494	2006289	1978823	FALSE	20	TATTTGCCTGAGATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2009280	1978453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1980526_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2009242
608651	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608655	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608657	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
608663	contig_8978_pilon	-	1434	9	Intergenic	novelGene_49327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	828.424096930431	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	53	1039	194082	190819	FALSE	40	GAAGCAAAAGAATGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPA	194134	190423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190824_190912_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
608670	contig_7202_pilon	-	400	2	Intergenic	novelGene_18603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAACTGATGAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
608672	contig_12179_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_128010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGGCACGATTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533136	534178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_533100_534200
608698	contig_18869_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_56355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTTCACATCCTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73363	73565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
608702	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_17512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608728	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608732	contig_821_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_149385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGGTAACACCCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77361	79966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_77400_80000
608765	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_95134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
608774	contig_5261_pilon	+	2185	13	Intergenic	novelGene_102482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	68.005054959172	224	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	10	1539	725510	776352	FALSE	25	ATTATGACTTGCTCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLRKPGEAVEAEGSAGRRGSLGVEVMLSPDPAAPAPLCPHGPTLLFVKVNQGREETRRFYACSACRDRKDCNFFQWEDEKLSGARLAAREAHNQRCQPPLTRMQCVERYLKFIELPLSQRKFCQRCQQLLLPDDWGEHCEHQVLGDISVTQLKRPSQLLYPLENKKTYAQYLFADRSCRFFVDLLSSLGFRRVLCVGTPRLHELIRLKASDDKKSNIKSILLDIDFRYSQFYMEDSFCHYNMFNHHFFDGKAALEECRAFLQEDEGEGVIMVTDPPFGGLVEPLAITFKKLIALWKEGQSQDDSHKELPIFWIFPYFFESRIRQFFPSFCMLDYQVDYDNHALYKHGKTGRKQSPVRIFTNIPPNKIILPTEEGYRFCPLCQRYVSLENQHCEHCDSCTSKDGRKWNHCFLCKKCVKPSWIHCSICNHCAVPDHSCEGPKDGCFICGELDHKRTTCPNISLSKRANKAVRKQKQRKSNKMKLETTKGQSMNHTSVTRKKKRRERAHQ	725500	776998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_725637_726457_726577_727482_727566_741987_742264_743265_743347_752041_752115_754987_755139_757577_757679_766880_767003_767408_767485_769513_769566_770082_770228_776228
608775	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608776	contig_13787_pilon	-	1394	8	Intergenic	novelGene_40629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	721.774372569406	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	306	1049	205032	169663	FALSE	65	TTAAAAACAAAATAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEDLKKKKNSVLFCSKRSFKNTLLISKL	205337	169317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_169744_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
608783	contig_11088_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_85054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGCGCTGTGGGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14932_17117
608790	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_115964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671648	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
608814	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608819	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
608820	contig_14322_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_116607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCAGCTGCGCCATGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
608822	contig_2027_pilon	+	2857	22	Intergenic	novelGene_39927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	153.77286899221	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	402	2657	162961	170260	TRUE	5	GCAGCGTGGTTTGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPHTAQFSHTDSLDLVLHTARERFLASPQEETRLWIKHSDGSFERLCNTHVTVLDARLKTGQVIVMETRNKDGAWPSAKQYVMKSVSKEDEDFQGQPGVCGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNRYLEELNFCNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHCSIVPHVFKTKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNNSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPVSPKRVMEVFYVSMDPRRKPEQHRLIVPKKGKISDLCVALSKHTGVQPDRMMVADVFSHRFYKIYQLEDSLNSILDRDDIFIYEVSARAGTGEGIREDVVLPIYLRERSPARDFNNSYYGLMLFGHPLLLSVPRDRLTWDALYHILLYRLSRYVARPSSDDEDDGDEKGDTENKGNIAKSGQTAGGSLQDPGPEQAGPSSGVVGRNRAPADNSPGPSNWPQRSRRKQLFTLQTVNSNGTSDRMTFSEDGHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGFVKHECVSYVLKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPNCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDILVEFPIRDLDLSEFIIKPRSESDPDLYKYDLIAVSNHYGGLRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVTEDEVESKAAYVLFYQRQDVARRLRSQPDLSGPPRTPCLWFPTQL	156005	170696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_156094_162155_162266_162426_162558_162888_163007_163410_163557_163695_163758_163880_163981_164378_164553_164657_164817_165188_165414_165550_165635_165745_165841_166561_166769_167451_167505_167700_167947_168038_168110_168346_168460_169410_169561_169655_169772_169964_170054_170140_170374_170609
608827	contig_1450_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_27409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353717	355950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_353700_356000
608833	contig_7119_pilon	-	2893	4	Intergenic	novelGene_41000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	245	junction_3	323.606070537759	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	36	341	196804	196499	TRUE	20	TGAATCCTGAAGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVGASMACAGPPPAGGQGVRTPGRGSVWGRRPGNSAPWNLLRPEVVGVPGPGWRDCPLPRLGFN	196839	187966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906
608835	contig_19974_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_130485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATCCTCCTCAACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300555	300026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_3e+05_300600
608852	SIRV4	+	174	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1597	632	1142	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2597	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
608858	contig_11126_pilon	+	2573	14	Intergenic	novelGene_138105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_11	65.4623067838848	307	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	341	2215	118054	193136	FALSE	45	AAAAAGGATATATTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGETQLYAKVSNKLKSRSTSLLLEPLLALGFPAHTALKALAATGRKTAEEALDWLHCHCNDPSLDDPIPQEYGLFLCPTGPLLEKLQEFWRESRRQCAKNKAHEIFPHVTLCDFFTCEDHKVECLYEALKRAGDRILGSFPSVIPLVLHSSVSYLGFFIHDSSADIIREFAMSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQTLKATFQYKPQNTDELNLSPGDYIFVDPTQQKEASEGWVIGISRWTGCRGFLPENYTERANESDTWVKHRTYTFSLAMDLNSRRDGEASSRRNGEFHPPQTSRSLSSVQALQATILRRSVLVVRHGERVDQIFGKSWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRRNGIKDFENDPPLSSCGIFQSRLVGEALLDSGIRITSVFVSPALRCVQTAKHILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEVGKNIPTLMTLEELKEANFNVDANYRPAFPLSSLIPAESYEEYVQRCSASVERITSICSQDLGVTVVISHGSALDSCTRPLLGLPPRESGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENTKEGKWELVDPPVKTLTHGSNSAFNWRNWILGS	117713	193494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121535_133242_133430_137634_137834_143405_143576_145083_145293_158694_158822_162964_163065_167736_167860_169695_169789_187422_187568_187870_187978_189682_189793_192998
608859	SIRV7	-	288	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91636	2	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
608865	contig_14322_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_116364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
608869	contig_7744_pilon	+	1518	15	Intergenic	novelGene_62557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	217.291596144678	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	920	1462	887347	892187	FALSE	10	TCGACTGCCCCTTTGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKSPPCCVTHCGQWWPPPYR	879812	892243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883077_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889837_892129
608880	contig_2596_pilon	+	2249	13	Intergenic	novelGene_53510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	138.123334580206	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	61	1650	1030282	1048715	FALSE	35	TTAAGCATTTTGCATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKKKNCQKGAAYKIFSWIRCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDIKQTSLAGEKPALGPGPQQNPSVLEQAAVGGDAASKPASSTRPACPASTSPLTWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGTTNLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP	1030221	1049314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1030307_1030438_1030535_1030879_1031008_1032504_1032701_1033983_1034157_1034520_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046025_1047831_1047920_1047994_1048130_1048634
608897	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608898	contig_7356_pilon	-	2827	11	Intergenic	novelGene_60423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_1	242.141281073674	384	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	205	1860	515889	497323	FALSE	40	TTGAAAAAGAGAGTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSENKKQRSRPRKPRRTRNEENEQDKDLEGPVIDESVLSVKELLGLQQAEERLRRDCIDRLKRRPRNFPTAKYTCKLCDVLIESVASAHKHIKEKRHKKNIKEKQEEELLTTLPPPVPSQINAIGIAIDKVVQEFGLHNESLEQRRGIKHIMENVFQHKLPDCSLRLYGSSCSGFGFKNSDVNIDIQFPAIMSQPDVLLLVQECLKNSDSFTDVDADFHARVPVVVCREKQSGLLCKVSAGNENACLTTNHLTALGKLEPKLVPLVIAFRYWAKLCSIDRPEEGGLPPYVFALMAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLNKLGNFNLKDVEKDIVVWEYADAATGDADPAKEELPRAPRDMPVKRGQVCTLFSGLTTCF	517141	496355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_497524_499875_499996_501191_501319_502268_502339_503462_503515_505423_505513_509940_510119_510847_510965_511283_511466_515369_515921_516968
608900	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608904	contig_12139_pilon	-	2031	7	Intergenic	novelGene_146481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	19.0671328614335	317	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	83	1117	313853	297991	FALSE	20	CGTGATTAATATTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTHPHANKLPLKDLFTYEDYRWAVSSVMTRQNQIPTEDGSRVTLALIPLWDMCNHTNGLITTGYNLEDDRCECVALQDFRAGEQIYIFYGTRSNAEFVIHSGFFFDNNSHDRVKIKLGVSKSDRLYAMKAEVLARAGIPTSSVFALHFTEPPISAQLLAFLRVFCMTEEELKEHLLGDSAIDRIFTLGNSEFPVSWDNEVKLWTFLEDRASLLLKTYKTTIEEDKAFLKGRDLSRRAVMAIKLRLGEKEILEKAVKSAAVNREYYRRQLEERAPLPKYEESALGLLESSVADSRLPLVLRNLEEEGGEQEAFKLKEAVGRAKVAEHRLINGVNSVPNGTRSENGNLNQEESPRGVDDAKESPSESIEEAKE	314781	297076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_298441_300080_300242_303504_303591_304479_304647_305833_305909_313757_313873_314718
608919	contig_13216_pilon	+	1941	7	Intergenic	novelGene_47472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	941.128474521707	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	961	1401	260572	261012	FALSE	15	GTTTTGTGTTCATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229608	261552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243096_243845_243952_245961_246110_256120_256296_258447_258573_260430
608940	SIRV7	-	365	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33203	1	-16	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114754	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
608952	contig_13608_pilon	-	2666	18	Intergenic	novelGene_52379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	222.967979143157	1	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	74	925	470234	410992	TRUE	30	CTTAGTTTGAGCATAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGWEEYSDGPYALSSG	470307	368786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393260_395287_395400_400592_400711_410891_411039_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
608956	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
608983	contig_7816_pilon	+	1884	14	Intergenic	novelGene_66509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	931.988400516994	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	58	1773	170169	211658	FALSE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNIKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170111	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195805_196755_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
608993	contig_7963_pilon	-	862	4	Intergenic	novelGene_58492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	671.377357047105	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATGGACCTCAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123250	121608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_121682_121860_121959_122054_122489_122993
608996	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
608997	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_2999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
609020	contig_12638_pilon	+	1523	7	Intergenic	novelGene_33384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	116.362102459903	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	90	860	1515842	1539011	FALSE	25	CTGAAAGGATTTTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDAPILLLKNKWH	1515752	1539674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530133_1538975
609023	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609025	contig_4531_pilon	+	423	4	Intergenic	novelGene_47948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	6.16441400296898	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	112	423	780185	787351	FALSE	25	GGAACGTCACGCCATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSSLCSEYTIGGVKINFPCKAYPSQLAMMNSIVRGLNSKQHCLLESPTGSGKSLALLCSALAWQQSLSGKPVDEGLSKKAEVPLSCCCTCHSKNFTNNDLMNQ	777414	787351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_777499_780157_780281_782112_782225_787247
609064	contig_9515_pilon	+	1392	10	Intergenic	novelGene_73805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	276.970827897403	4037	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	220	1269	65880	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57123	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
609078	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
609086	contig_3627_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_78518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625255	627383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_625300_627400
609094	contig_15304_pilon	-	1517	3	Intergenic	novelGene_30623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	53.5	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	185	1030	66228	64912	FALSE	5	CTGCCTGGAGCCCTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66412	64424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104
609115	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609125	contig_7202_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_18627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTGCCAAATATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
609129	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
609135	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69000	1	35781	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
609144	contig_8059_pilon	+	1710	15	Intergenic	novelGene_111084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	62	junction_10	50.8715870338929	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	430	1275	266127	338894	FALSE	60	GGAAAAATTTATAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIK	90280	339329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283700_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661
609152	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_93504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609171	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
609188	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609196	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	4	339	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14412	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
609201	contig_8447_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_69431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTGACATAGGGCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84104	82350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_82923_83003
609208	SIRV6	+	868	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	718	0	-437	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	154	486	2002	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1848	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
609218	contig_5423_pilon	-	2286	15	Intergenic	novelGene_85230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_14	263.965056438174	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1265	1975	502619	497362	FALSE	40	TGCAAAATATTGGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534294	497050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502736_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_534094
609232	contig_18869_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_56424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGTCTGTGGAGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82876	80978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_81000_82900
609249	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_95003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609255	contig_4301_pilon	-	953	4	Intergenic	novelGene_65089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_2	19.2006944318862	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	71	358	441884	432012	FALSE	50	AAAAGGCATCAAGAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHSAARFKPKLQLVAHWPSKAFAMALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITVSN	441954	431416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_432091_432714_432825_434847_434914_441851
609256	contig_4301_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_65088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	826	1125	430641	430342	NA	70	AGAATAAAAAATTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELMLQLQAKGCLGLPEAETKKTKPIALEAIPTHRDTLGQSRTAPQGFEGVTGGFEQPTFWLAAELLTTAPPGLQPEADRNKKKIFPRAFREYMVLPIL	431466	429525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_429500_431500
609263	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_114067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
609265	contig_12864_pilon	+	1236	7	Intergenic	novelGene_76448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCCAGGCAGGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242277	252159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242888_243778_243826_244597_244767_245704_245913_246327_246348_251864_251999_252111
609280	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
609283	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_97835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609290	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
609297	contig_5423_pilon	-	2347	15	Intergenic	novelGene_85237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	266.104667147254	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	539	2041	520734	497362	FALSE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534316	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502736_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520740_530046_530122_532555_532792_534094
609322	contig_9955_pilon	-	1664	3	Intergenic	novelGene_21282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	875	junction_1	572.5	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	521	1309	49317	45240	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47737_48794
609324	contig_2100_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_50649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTGGTACGTCCAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091656	1091167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1091200_1091700
609348	contig_11752_pilon	+	1118	5	Intergenic	novelGene_37576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	842.728010689095	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	118	987	87165	94417	FALSE	15	CTTGCTATGCAGTTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	84084	94548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223
609360	contig_10958_pilon	+	1520	2	Intergenic	novelGene_5478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGTGAATCATATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895568	901691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
609375	contig_6102_pilon	-	1617	13	Intergenic	novelGene_32382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.580561090823	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	157	1104	1743430	1729928	TRUE	0	TGTGGCCTCTGCTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQTWIRPSR	1743586	1728475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729951_1730460_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743394
609389	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609407	contig_1443_pilon	-	2114	14	Intergenic	novelGene_28254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	48.1640441400947	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	330	842	559014	554813	TRUE	10	GCACTGTTATCCTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYALTHPDTVEGLVLINIDPNAKGWMDWAAHKLTGLTSSAPEMILGHLFSQEELSGNSELVQKYRNIVVHAPNLENIELYWNSYNNRRDLNLERRGDITLRCPVLLVVGDQAPHEDAVVECNSKLDPTQTSFLKVSSPAPRPA	562623	553134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554891_555155_555208_555499_555545_556763_556868_557043_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
609419	contig_16999_pilon	+	2938	1	Intergenic	novelGene_85013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342006	344944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_342000_344900
609424	contig_9706_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_20861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
609431	contig_16411_pilon	+	2555	3	Intergenic	novelGene_77352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGTGAAATCAGCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240340	243779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_240364_241202_241290_241334
609444	contig_15063_pilon	+	1511	4	Intergenic	novelGene_13322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
609448	contig_6980_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_36071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366574	365267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_365300_366600
609449	contig_14322_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_115848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609450	contig_10986_pilon	-	1667	12	Intergenic	novelGene_71464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	187.040500321002	7	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	464	799	74333	72175	TRUE	20	CCCCGTAAGCTCTCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR	80420	66791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71688_72092_72321_73924_74006_74224_74358_74980_75049_75476_75544_76171_76245_80189
609467	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
609485	contig_7202_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_18616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTTCTTCACCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	28586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
609509	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
609522	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
609525	contig_5020_pilon	+	1318	7	Intergenic	novelGene_27896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	936.896072144611	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	76	1005	122915	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	119455	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119491_122874_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
609562	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
609567	contig_14322_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_116493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609573	SIRV4	+	228	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1543	632	1088	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
609576	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609577	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609591	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
609618	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609644	contig_9516_pilon	+	2197	16	Intergenic	novelGene_106154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	39.964651047311	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	646	1356	702153	706790	TRUE	15	CTAGAGCGTATTCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAKARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKDFETLRKVDPTAALEELEKIEKARMMERMSLKHQNSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQAASESEEEGGGVEENELLVPDVVNEVHINANEPNPWMRRSCTSEAKREFREGCSPSPERGTSPGRGGAPVAAEARESTDSRRARRAGQRRLPAKYRASQTCVTRAADREEPR	690610	710986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_690684_691718_691795_692663_692735_694231_694297_695915_696059_696331_696414_696457_696488_702047_702168_702265_702361_702961_703086_703168_703247_703704_703894_706580_706912_707643_707838_707971_708072_710560
609650	contig_10861_pilon	+	516	4	Intergenic	novelGene_39431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGATCCCACTCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423656	2432748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2423810_2425542_2425640_2427138_2427241_2432584
609651	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_18068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCAGCTGTTGTCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27819	27627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
609656	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1124	0	-1124	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTCGTCAACGACGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
609659	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
609666	contig_6589_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_25969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGGGGGAGGAGCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296268	1296104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1296100_1296300
609671	contig_18869_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_56034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73546	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
609672	contig_8570_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_120160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	138	452	348448	348134	NA	20	GGGAAGCCCCTGCTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTGVSRVKLCSIGFSVADVLEVDSFFRSRGFSSEAPLGRLKPPTFWLAAECINCLHCPGTPFLTQLHGNETREGSLLEIITFCPSFYSFFYSEAKSQVHSQK	348585	347332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_347300_348600
609684	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609686	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	598	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
609689	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609693	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609703	contig_5020_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_27937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACAATTATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154148	153868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_153900_154100
609706	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609717	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609721	SIRV4	+	268	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	668	1012	-36	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATGCTAACATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
609723	contig_5467_pilon	+	2006	10	Intergenic	novelGene_111928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	335.969575342107	10	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	16	990	8246	14522	TRUE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8230	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_15046
609724	contig_6735_pilon	-	1316	11	Intergenic	novelGene_15755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1051.05527923131	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	451	1113	545923	542190	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHELDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568283	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542267_543071_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547314_554313_554374_564157_564232_564784_564869_568198
609725	contig_9668_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_58264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTAACCAAGCTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656156	655552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_655600_656200
609726	contig_9668_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_58263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGCATATGAAAAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655601	653798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_653800_655600
609739	contig_9633_pilon	-	2214	8	Intergenic	novelGene_139616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.399454629804	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	90	1346	658714	641028	FALSE	25	GAATCTGGCTGTTTTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLAFSRRPGPATSAAELSRPLADGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRWVAIKSIRKDRIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASQGDLYDYISERQRLSEPDARHFFRQIVSAVSYCHQNGVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNQYHQDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGNDHKTLVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYTTRVGEQDTLKESGHPSTDSARTSMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHVPGGGATAPGLERQHSLKKSRGSRLRHWRQDSLADSCFSLTDCQEVTEAYRQARGICSQLS	658803	640159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_641152_641783_642094_643582_643716_644259_644380_646135_646202_646567_646720_649759_649881_658483
609746	contig_9146_pilon	-	952	6	Intergenic	novelGene_79491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1939.80025775851	30605	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	17	382	147490	143310	TRUE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMVKF	147506	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143082_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
609765	contig_18869_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_56185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73697	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
609771	SIRV4	+	306	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	194	450	194	-450	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCAAATTGCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
609778	contig_5515_pilon	-	1189	5	Intergenic	novelGene_52339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_2	299.096451834521	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	41	664	71189	68158	FALSE	45	TCAACCGATCAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	75520	67632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498
609788	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_95701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
609810	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
609834	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
609836	contig_15087_pilon	-	2542	17	Intergenic	novelGene_37127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	436.7517485297	1	79	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	411	1775	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	74123	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33737_33798_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_71087_71174_72506_72642_73969
609840	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
609848	contig_1301_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_47271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGCAGCAGAGCATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236727	237024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_236700_237000
609867	contig_12622_pilon	-	2709	17	Intergenic	novelGene_6011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_15	39.1566864500816	273	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	301	2415	1653250	1645777	FALSE	25	TCCCAAGAATGTGTGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANENHGSPREEASLLSHSPGTSNQSQPCSPKPIRLVQDLPEELVHAGWEKCWSRRENRPYYFNRFTNQSLWEMPVLGQHDVISDPLGLNATPLPQDSSLVENPPAENKARKRQLSEEQPSGNGVKKPKIEIPATPISQSVPSSPSVPGTPTLKIWGASPEDKQQAALLRPTEVYWDLDIQTNAVIKHRGPSEVLPPHPEVELLRSQLILKLRQHYRELCQQREGIEPPRESFNRWMLERKVVDKGSDPLLPSNCEPVVSPSMFREIMNDIPIRLSRIKFREEAKRLLFKYAEAARRLIESRSASPDSRKVVKWNVEDTFSWLRKDHSASKEDYMDRLEHLRRQCGPHVSAAAKDSVEGICSKIYHISLEYVKRIREKHLAILKENNIPEEVEAPEVEPRLVYCYPVRLAVSAPPMPSVEMHMENNVVCIRYKGEMVKVSRNYFSKLWLLYRYSCIDDSAFEKFLPRVWCLLRRYQMMFGVGLYEGTGLQGSLPVHVFEALHRLFGVSFECFASPLNCYFRQYCSAFPDTDGYFGSRGPCLDFSPLSGSFEANPPFCEELMDATVSHFEKLLESSLEPLSFIVFIPEWREPPTPALTRMEQSRFKRHQLVLPAFEHEYRSGSQHICKKEEMHYKAVHNTAVLFLQNEPGFAKWGPTPERLQELSAAYRQSGRSHSSSSSSSSSLEAKDRDSGREQGPSHEPHPT	1656835	1645482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1646009_1646092_1646269_1646361_1646456_1647061_1647247_1647328_1647416_1647565_1647739_1648484_1648648_1649690_1649791_1650069_1650154_1650234_1650383_1651068_1651224_1651346_1651478_1651666_1651805_1652911_1653037_1653126_1653270_1654659_1654834_1656728
609876	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
609877	SIRV4	+	255	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	49	-1012	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTTCGGGTGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1800
609880	contig_14322_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_116252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609883	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1561	632	1106	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2561	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
609886	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
609887	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
609904	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609907	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_17724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609928	SIRV5	-	317	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTACATATACAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
609930	contig_1143_pilon	-	2197	18	Intergenic	novelGene_86581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_4	227.325049655096	93	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	7	1557	201052	114896	FALSE	45	AAAAAAAAATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWMVGVKMAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVSSLPELLEKKRLIDLHTNVATAVLEHIKARKLDVYFEYEEKIMSKTTLDKSLLDIISDPDAGTPEDKMRLFLIYYISTQQAPSEADLEQYKKALTDAGCNLNPLQYIKQWKAFAKMASAPASYGNTTAKSMG	201058	114255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_114963_119308_119389_121382_121454_135918_136016_147612_147695_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
609931	SIRV4	-	267	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCGTATGTTCGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2735	2468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2700
609958	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
609960	contig_11908_pilon	+	2010	17	Intergenic	novelGene_133228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	109.00442579891	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	7	1563	692429	836723	TRUE	15	AATATTTCCTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVAAGAASVELVIGWCIFGLLLLAILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSHGLAALSFSISSLTLIGMLAAITYTAYGMSALPLNLIKGTRSAAYERLENTEDIEEVEQQIQTIKSKSKDGRPLPARDKRALKQLEERLRTLKKRERHLEFIENSCWTKFCGALRPLKIIWGIFFILVALLFVISLFLSNLDKALHSAGIDSGFIIFGTNLSNPLNMLLPVLQTVFPLDYILITVIIMYFIFTSMAGIRNIGIWFFWIRLYKIRRGRTRPQALLFLCMILLLIVLHTSYMIYSLAPQYVMYGSQNYLIENNTTYDDHKGNSTISVPKRCDADAPEEGRQEASDYSDILAPPLSFLKSFYGSMYCYPDIPIPSQVLVL	692422	837351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_698010_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752803_752878_783983_784110_788412_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_830980_831054_836668_836761_836941
609961	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
609966	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_16656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
609985	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	29	379	14409	13836	FALSE	20	GCTGGTACCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14437	13834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
609990	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
609991	contig_15327_pilon	-	2304	9	Intergenic	novelGene_70720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	304.696134493039	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	24	419	967479	963579	TRUE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGDLYLLPRPPRGLPAGQQRQVLVPRAGECWH	967502	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963186_963671_963791_963928_965036_965146_967420
610000	SIRV4	-	342	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACGATTGCCACAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	2425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
610005	contig_14322_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_116412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
610011	contig_12032_pilon	-	1647	8	Intergenic	novelGene_139268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	138.331899017234	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	429	1343	117404	96750	FALSE	20	TAACTTGGCAGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	122414	96445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_117401_117697_122278
610014	contig_2646_pilon	-	1357	9	Intergenic	novelGene_69531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTGGTCTGATAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573784	560473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_560613_565255_565386_566419_566585_567965_568156_569609_569726_570832_570914_572008_572070_572765_572842_573385
610027	contig_6215_pilon	+	1842	4	Intergenic	novelGene_21216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAACCAGAATCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226752	234134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228322_231965_232035_233716_233856_234069
610030	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
610031	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
610038	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
610039	contig_12270_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_114037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	11	328	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14419	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610041	contig_12638_pilon	+	2631	15	Intergenic	novelGene_33160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	191.706887232162	36	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	373	1185	269238	270926	TRUE	20	AGACCACTGCTTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVKQ	235649	274459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_271069_271147_271746_273449_273584_273761_273999_274124
610053	contig_14322_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_115837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671884	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
610055	contig_11677_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_85874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGTGTTTGTGTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113678	116517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_113700_116500
610082	contig_4759_pilon	-	1938	3	Intergenic	novelGene_106334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_2	293	1275	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	225	629	589639	587401	FALSE	20	ATTGGAGCCTGACTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEMYQTPMEVAVYQLRNFSISFFSSLLGGDVVSVKLDNSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	589863	586091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_589517
610093	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_17841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610103	contig_12570_pilon	-	1831	5	Intergenic	novelGene_79372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	27.8601417799695	30	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	280	1008	284107	280817	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRSSRSQAEVSAWWSSRPCLCHGSAGCRLWQSCSGSSPSCFWLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVGEPRSRLGGWGSLSRCGRYCDPLRRRWTICTSATSRSCATSLRPTSSSSTSPLTSTWSSAEHQKAGHSHGRHCGAQLEVLCSEQASWRCWLNVFPEPS	300330	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282648_282875_283523_283699_284049_284255_300198
610104	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
610107	contig_12265_pilon	+	1936	12	Intergenic	novelGene_149434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	39.3053315837571	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	344	1912	23677	50211	FALSE	30	TGACTGAGAGATTTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVSAGLKKGQITPTELCQKCLSLIKKTKFLNAYITVTEEVALKQAEESEKRYAKGQSLGDLDGIPFAVKDNFSTSGIETTCASNMLKGYVPPYNATVVQKLLDQGALLMGKTNLDEFAMGSGSTDGVFGPVKNPWSYSKQYREKRKQQPHGENEDSDWLITGGSSGGSAAAVSAFTCFVALGSDTGGSTRNPAAHCGLVGLKPSYGLVSRHGLIPLVNSMDVPGILTRCVDDAAIVLGVLAGHDPKDSTTVQDPVKPFMLPSLTDMSKLCIGIPKEYLVPELSSEVQSLWTKAADLFESEGAKVIEVSLPHTSYSIVCYHVLCTSEVASNMARFDGLEYGHRCNIDVSTEAMYAATRREGFNDVVRGRILSGNFFLLKENYENYFIKAQKVRRLIANDFVNVFNSGVDVLLTPTTLSEAVPYLEFIEEDNRTRSAQDDIFTQAVNMAGLPAVSIPVALSNQGLPVGLQFIGRAFCDQQLLTVAKWFEKQVQFPVIQLQELMDDCSAVFESEKLASVSLKQ	19598	50235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_19727_23461_23686_29717_29878_30194_30294_32260_32358_36604_36782_40100_40277_40364_40478_42478_42672_43407_43526_46662_46869_49990
610111	contig_15039_pilon	-	1622	7	Intergenic	novelGene_110129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	501.265066273989	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	225	848	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TADGGAGGGGAGASWGSAASPVPIHRRRKQQQESQPDIGNWELLYRERTTKHPQYSRNLNPKSLYFYQSVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260909	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_260826
610116	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_95836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610128	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_93500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
610159	contig_7593_pilon	+	2560	2	Intergenic	novelGene_127376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754632	757836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_755363_756006
610164	contig_13481_pilon	+	2725	13	Intergenic	novelGene_119470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	27.3947480773637	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	160	1221	1272222	1317949	TRUE	35	AAAAGATTCTGTCTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQVLTPHVYWAQRHRELYLRVELSDVQNPAISITENVLHFKAQGHGAKGDNVYEFHLEFLDPVKPEPVYKLTQRQVNITVQKKVSQWWERPTKQEKRPLFLAPDFDRWLDESDAEMELRTKEEERLNKLRMESEGSPETLASMKKGYLFMYNLVQFLGFSWIFVNLTVRFFLLGKESFYDTFHTVADMMYFCQMLAAVETINAAVGVRNSPVLPSLLQLLGRNFILFIIFGTMEEMQNRAVVFFVFYLWSSVEIFRYPFYMLTCIDMDWKVLTWLRYSVWIPMYPLGCLAEAVAVIQSIPVFNETGRFSFTLPYPVKVKVRFSFFLQIYLVVLFLVNPRRWPEDDQSTPRF	1272062	1320498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1272309_1279079_1279123_1281187_1281262_1282680_1282846_1284353_1284406_1286782_1286894_1293751_1293880_1299338_1299452_1300668_1300776_1301307_1301440_1317899_1318071_1318678_1318809_1319245
610165	contig_14322_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_115672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTGTGCTGCCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671100_671600
610170	contig_7816_pilon	+	885	7	Intergenic	novelGene_66496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1212.51095069511	12	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	239	649	196907	211528	FALSE	35	ATGAATTGTCCCCAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSRFQSRRRLLCVSASSSSRSILLSRPHHGGLPQTRPAEAAGPEGHGEPTAYQLHPGHHGGGLGHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLVQCCHGRA	170079	211764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_196864_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209293_211500
610176	contig_7202_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_18619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATATTTTCTTCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30097	28589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
610178	contig_10732_pilon	+	1143	2	Intergenic	novelGene_114731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	142	456	430537	441614	FALSE	25	GACACAGGGCAGGGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHPPRLQQRGQRLRGCVLLTPGPLFRWPASHRRLRCHQQNETLCQGFTMKPHNQIPQNWGTWEEKRRCYLTAKELQLDVMGHQKATTSLVLSKGKANNGHSYG	430395	442301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_430644_441406
610207	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_96894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610223	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_98216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	35	CCTTCCCCACAAAACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
610228	contig_7202_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_17209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGATTTCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
610239	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
610259	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
610268	SIRV7	-	353	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-3	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
610271	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
610286	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610289	contig_7202_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_18837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGCTGGTTGCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29901	30115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
610292	contig_3986_pilon	-	1778	12	Intergenic	novelGene_52700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	136.156630757277	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	669	1418	47670	35282	FALSE	30	TAAGCCCAGCTTACATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108492	34921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47818_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_93430_93507_108396
610307	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610320	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610329	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	652	971	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
610330	contig_10626_pilon	-	2138	10	Intergenic	novelGene_138207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	108.433287222042	162	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	776	1840	302004	279002	FALSE	30	TGACAGTACATTGAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRDQPFGIQVRNVRCIKCHKWGHVNTDRECPLFGLSGINASSVPTDGSGPSMHPSELIAEMRNSGFALKRNVLGRNLTANDPSQEYVASEGEEDPEVEFLKSLTTKQKQKLLRKLDRLEKKKKRDRKKKKLQKSRSKHKKHKSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSIETSESSSESDDKQKKIQKQKRKKNKCSGYNSSDFEEKDKSKKRKLYEELSSSHSNKEKDREKPRFLKRESSGKNSKWSHSNSDRKSKSRNYSPKKRGSERNERSSRSQSRDEKGRRSRSRSHSSYKQREIRKWTQCSPSEEQNRNDTRSRGTDTHRGEKMHRENSGDKHTKVTQRERSRSREKIKRDYM	311875	278703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_279723_281165_281252_282448_282556_301020_301139_301971_302021_302382_302448_302536_302814_303112_303325_305150_305246_311765
610335	contig_15434_pilon	-	1351	8	Intergenic	novelGene_56693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2192	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCGAACGTCCTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33482	26607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_26685_26898_27059_28952_29078_30407_30588_31080_31265_32182_32354_32950_33061_33138
610368	contig_7019_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_149474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324167	1326097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1324200_1326100
610369	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_17665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
610377	contig_13894_pilon	+	1191	9	Intergenic	novelGene_62144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	7	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	86	1141	521729	528117	FALSE	20	TAGTGACACCTGCGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521643	528167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
610390	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	55	ATTTGTGGAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
610401	contig_1472_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_86122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACGAGATACCATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304420	303968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_304000_304400
610406	contig_3095_pilon	+	1009	5	Intergenic	novelGene_75242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAACACAGCTCACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246375	255523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_246740_247848_247969_248475_248649_253592_253806_255384
610416	contig_14322_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_115706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
610425	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_115944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671625	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
610433	contig_15304_pilon	-	1314	5	Intergenic	novelGene_30628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	200.968125582143	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	186	1190	66228	64554	FALSE	10	AGTGCCTGCCTGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65465_65566_65721_66104
610437	contig_5967_pilon	-	1749	6	Intergenic	novelGene_44348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.4	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	305	730	389302	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMMCVPSVWMNMKMETSSESYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	465431	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389241_389306_403376_403503_423963_424055_430726_430775_465395
610449	contig_5643_pilon	+	1253	11	Intergenic	novelGene_38846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2297.42737861287	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	180	1043	236124	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVERQNLAEGQPPDAFTCSPQVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233631	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237223_237402_237456_237550_237635_237720_237819_237913
610456	SIRV6	+	500	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	-230	513	-130	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTAGAAAGTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
610460	contig_15744_pilon	-	2148	5	Intergenic	novelGene_83625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	278.009442285689	3182	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	180	656	208774	199118	FALSE	25	TGAACCCCCGTATATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGDCGRGGGWCCDSGLGGGSRGGEQVRRARPSGGRVGAASERTGWKQRSASRSSAETMAGGKAGKDSGKAKAKAVSRSQRAGLQFPVGRIHRHLKTRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGMCDPSHPQISDWKEGTAKNCLESCFNQPYSSLSLYCNWDRKNNGDMWNF	208953	197625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_199266_199931_200066_202044_202159_204445_204524_208771
610464	contig_18869_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_56325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73750	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
610474	contig_12837_pilon	-	2450	3	Intergenic	novelGene_57265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	169.5	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	71	472	60580	31129	FALSE	25	CAACTAGCTTGATATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGAAGLPVSGGGSGEERTLLVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTVSEWLRLLPFLGVLALLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPKVVNEINIEDLCLTKAAYCRCWRSKTDLGKQEPCGRNQEERGIRIGGRLINNL	60650	29150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_31213_51014_51230_60477
610480	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
610485	contig_5033_pilon	-	1888	15	Intergenic	novelGene_29008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3294.18471611377	19	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	31	1605	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566817	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531132_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
610491	contig_6958_pilon	-	1848	6	Intergenic	novelGene_69927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	550.592916772455	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	178	1413	190008	149618	TRUE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAQARAHPQSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190185	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_148981_149578_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
610511	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
610519	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
610522	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
610536	contig_10437_pilon	-	2368	16	Intergenic	novelGene_38403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_15	328.930320213196	323	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	101	2152	789580	774056	FALSE	30	GATGATATTTTTCACACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSKRELDELKPWIEKTVKRVLGFSEPTVVTAALNCVGKGMDKKKAADHLKPFLDDSTLRFVDKLFEAVEEGRSSRHSKSSSDRSRKRELKEVFGDDSEISKESSGVKKRRIPRFEEVEEEPEVIPGPPSESPGMLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESAD	792998	773839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779203_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428_786576_788620_788752_789435_789628_792945
610538	contig_14441_pilon	+	672	3	Intergenic	novelGene_100776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	116.5	229	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	190	633	125667	126705	FALSE	5	GGCCGTGTGTCCGGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	122147	126744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_122188_125517_125902_126496
610546	contig_14924_pilon	+	1843	5	Intergenic	novelGene_104159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	54.3829017247149	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	442	999	45598	54105	FALSE	20	AGCTGAAGTACTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSALQMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLGHLTPPLLCARLLFFQSQPQSCCSLSGHNGSKGESSLRMAYSGSSPFSSWESEKCEDFCWL	45156	54949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47161_53924
610560	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_93599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610566	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
610567	contig_8743_pilon	+	1940	9	Intergenic	novelGene_149488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	8.73838514829828	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	27	872	81031	84266	TRUE	30	TTCTAGAAGAAGATGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALATEVEAAALKALAEVSTILEPVGLQEEAELPSEILAEFVMDSRKKDKLLCNQLQVVDFLQGFLVHEDTAQGLDPLASEDISRQKATEAKEHWKELKATYQEHVEAITCALTQALPQMEEAQRKRAQLQEALEQLQAKKQVAMEKLREAQKQWQLQQEKRLQHLAEVRDRQRGTQQEVDRLYQELRSLKHQAGQEQDKLQRHQAFLQLLYTLQNKTLLPGAEAEPQPLQGVPLRQDLLEDKAQQLTGPQHQNTGDNIAGDRGVTPQLFPWPHSLPNGL	81004	86585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8743_pilon_+_81072_82023_82115_82266_82391_82538_82706_82842_82900_83482_83614_83691_83888_84227_84304_85554
610570	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
610573	contig_7202_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_18626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTGCCAAATATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
610586	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
610590	contig_5649_pilon	-	1721	8	Intergenic	novelGene_82364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	48.7785499863978	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	453	791	1057385	1056259	FALSE	15	CTTCATGCGTCATCGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFFYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN	1064322	1055328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
610596	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
610624	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73596	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
610638	contig_15629_pilon	+	2300	3	Intergenic	novelGene_122468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	84	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACTTTTGAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154368	162635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_154523_158430_158553_160611
610639	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
610642	SIRV2	-	405	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4266	236	3091	-201	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGGAAGAATGGCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	1236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1200_1600
610650	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_114068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610653	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
610654	contig_4301_pilon	-	1971	5	Intergenic	novelGene_65125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_2	104.406357565045	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	176	862	551260	542107	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNVRTSDTSFLAFLSPLGSLLLPTHFPLQFGDR	575650	540997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_542416_543699_543840_547294_547521_551248_551329_575543
610664	contig_9345_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_24596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAACTGTGTGTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944747	944545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_944500_944700
610666	contig_6418_pilon	-	1294	13	Intergenic	novelGene_81101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	399.895298797073	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	66	1040	106563	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118013	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73079_75098_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
610672	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
610685	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610694	SIRV4	+	417	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	899	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2354	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
610699	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610701	contig_3560_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_149496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAATATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195170	193014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_193000_195200
610705	contig_5770_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_74148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGAAATAATTCCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77748	77338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_77300_77700
610711	contig_15047_pilon	+	1519	7	Intergenic	novelGene_52195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2827.28625285017	2	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	376	651	3242	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRPAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2547_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
610740	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610741	contig_15236_pilon	+	2057	7	Intergenic	novelGene_141566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	381.577864487272	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	234	1514	419232	450343	TRUE	20	GAGAAGTGTTCTTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	418998	452548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_450621_452282
610743	SIRV6	+	211	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	222	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3162_10721
610745	contig_5878_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_145731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGACAGATGATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316408	317966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_316400_318000
610755	SIRV4	+	213	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1558	632	1103	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
610756	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
610765	SIRV4	-	316	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGAACGTCGAGTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
610766	SIRV4	-	354	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTACGCGAAGTTAACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2357	1633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2251
610787	contig_8058_pilon	-	2179	2	Intergenic	novelGene_149513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_1	0	58	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	138	1124	62418	61432	FALSE	40	TAATGCATGATATACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75177	60376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_75089
610789	SIRV7	-	370	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-27	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114765	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
610805	contig_14514_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_137465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCTCGGTTACTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34541	36318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_34500_36300
610806	contig_14925_pilon	+	886	5	Intergenic	novelGene_55220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTATTCCCACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25882	66270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26322_27023_27127_27995_28040_29568_29830_66231
610808	contig_15066_pilon	-	1982	9	Intergenic	novelGene_149541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_6	92.1693414319534	189	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1209	1835	113086	111830	FALSE	5	AGGTCTCTTTTGCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGWQPLPWVPPTWPWIVFCRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114652	111682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113895_114094_114246_114324_114463_114541
610821	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_17495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
610827	contig_10982_pilon	+	1612	3	Intergenic	novelGene_87899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1	324	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	17	520	286264	294122	TRUE	20	AGATTCTGTGTCATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVFILQLAVCILAFPMYLLNFLGIWSWICRTLFPHFLAWVSVIYNEKMASKKRELFSNLQEFAGPSGKLSLLEVGCGTGTNFKFYPPGCRVTCVDPNPNFEKFLIKSIAENRHLEFERFLVAAGENMHNVADGSVDVVVCTLVLCSVKSQEQTLQEVYRVLRPE	286247	302530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_286762_294116_294187_301502
610828	contig_15410_pilon	-	1645	12	Intergenic	novelGene_130571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	97.2221618785068	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	618	1484	56848	54277	FALSE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVALVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59306	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_56829_57005_57162_57259_57488_57564_57669_57870_59216
610833	contig_12270_pilon	-	313	2	Intergenic	novelGene_114076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	4	312	14409	13878	FALSE	20	CCGCAGTTTATTACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14412	13876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610837	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610839	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_93511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610856	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610858	contig_9345_pilon	-	1953	6	Intergenic	novelGene_24364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	20	958	176056	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176075	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
610884	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
610894	contig_5485_pilon	-	2387	16	Intergenic	novelGene_37744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.877789146918	4	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	19	1059	478711	460872	TRUE	0	GGGTTCCTGTTTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRVWSGGSCHQECGSYEFCRY	478729	457789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_458094_458380_459309_460569_460638_460843_460928_461230_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
610895	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
610896	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610902	contig_13863_pilon	+	1901	11	Intergenic	novelGene_42026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	862.296955810468	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	28	738	98341	114008	TRUE	20	ATATTTAGAGGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTTLQQLFINWPRLP	98313	120385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113963_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
610904	contig_13680_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_149606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	92	541	424581	424132	NA	30	TTCAGCTTTTTAGCAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVFGYGSLIWKVDFAYQDKLVGYITGYSRRFWQGSTDHRGVPGKVRRQPAPTLTAPGAPLSSSRPSERDSSPGGRARGGGRGLLHLCVPLGHRHSLLPQTKGTPSEVAGDGGSFLEEPGVGNPSLNGADVPGRGPTSWQLLPHKKRKK	424672	424068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_424100_424700
610905	contig_13680_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_149604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAGATCAGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423964	422500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_422500_424000
610913	contig_12270_pilon	-	290	2	Intergenic	novelGene_114122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACAGACTTCACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
610928	contig_7165_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_116859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGATGATGAAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384199	384693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_384200_384700
610929	contig_15304_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_30486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53177_54044
610936	contig_1861_pilon	-	2614	15	Intergenic	novelGene_77664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	106.021561149473	1	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	958	2010	104869	96296	TRUE	20	TACCTCATCATGCCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVRQREDQLLHFTTTHPHFAYPSQC	115213	87337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96366_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104870_106120_106923_112515_112582_115124
610944	contig_3948_pilon	+	1600	3	Intergenic	novelGene_53388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	109.5	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	528	998	1860968	1861438	FALSE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1813348	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814074_1860906
610953	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
610954	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	643	1014	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
610959	contig_12873_pilon	+	1862	6	Intergenic	novelGene_27209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	308	1288	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16049	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
610966	contig_8558_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_123160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	74	331	470235	470492	NA	60	AAAAGATTAGAAAATATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAWHIVGTGYVTGWLHDQCLFIRYMGGREELQEPKKLLTVLKIRGSSSLTHSSFSCGEHRRARFWIFLFFFFFFFFFDIHRYLNLGGLVVGTQILELDFIFISGVNPGQ	470161	471640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_470200_471600
610982	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
610990	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
610991	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
610996	contig_9481_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_149646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCCATTAGCATACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140452	140900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_140500_140900
610997	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
611007	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611008	contig_5918_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_99560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTTTTTTTCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706508	1705892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1705900_1706500
611028	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
611036	contig_7428_pilon	+	2104	10	Intergenic	novelGene_77724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	127.477037389988	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1311	1856	434083	435117	FALSE	35	TTTATTATGAAAACAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428851	435365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_428900_429283_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
611039	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_93710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
611045	SIRV6	+	1341	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	32	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	186	518	1673	2560	TRUE	25	AAGTGACTTGCGTCGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1099	11651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
611050	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
611051	contig_3956_pilon	+	1879	10	Intergenic	novelGene_15255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1331.19724262238	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	10	1221	1286130	1289798	TRUE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWRMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASGAAKSLSLPDSVQSKWSVVSMVS	1284826	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284836_1286129_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289623_1289726_1289892_1290297_1290419_1290568
611052	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	19	348	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14427	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
611053	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_93489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
611055	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611058	contig_6397_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_146230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGTTCTGTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265305	267055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_265300_267100
611059	contig_6397_pilon	+	1995	1	Intergenic	novelGene_146231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAAGGTTTGCCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267206	269201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_267200_269200
611060	contig_5033_pilon	-	1724	5	Intergenic	novelGene_29102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	66.8370219264743	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	62	586	859134	789799	FALSE	20	AACTGTGTTTTTCTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGVDGSIFQKPKKLHLTIGMLVLLSEQEIQQTCEMLQQCKQEFIDDICGGQPLEAEMAGIEYMNDDPGMVDVLYAKVHMKDGSNRLQELVDRVLERFQSSGLIVKEWNSVKLHATVMNTLFRKDPNAEGRYNLYTPDGKYIFKERESFDGRNILKLFENFYFGALKLNSIHISQRFTVDSFGNYASCGQIDFS	859195	788660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_789916_812829_812916_825673_825799_846033_846154_859057
611061	contig_10990_pilon	+	2064	3	Intergenic	novelGene_7406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	239.5	29	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	122	610	119582	121424	TRUE	35	GAAGCTATGTGGTATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119460	123564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_122081_122766
611069	contig_8177_pilon	-	3279	1	Intergenic	novelGene_86495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTACAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40651	37372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_37400_40700
611072	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611080	contig_17470_pilon	-	1855	13	Intergenic	novelGene_110536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_12	48.8816598190637	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	183	1457	277215	270076	FALSE	15	TCCTTGTCTAACCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302619	269677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302546
611083	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
611086	contig_15063_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_12300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3806.5278761914	2	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	15	1094	28164	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	28149	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_38975_39092_39506
611107	contig_6710_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_95317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
611110	contig_5372_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_149717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174711	177421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_174700_177400
611123	contig_10496_pilon	-	2178	12	Intergenic	novelGene_59411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	5	junction_1	105.897112081055	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	48	1829	64679	38331	FALSE	15	GCATGCTATGTATCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPGC	64726	37981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_38344_38780_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
611126	contig_12479_pilon	+	2503	15	Intergenic	novelGene_56822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_8	146.903758582666	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	299	1843	92999	219853	FALSE	40	AGACTTTTCAAACATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEASKAYESSESSDRFMTEKQQEEAEWESINVLLMTHGLKALSLVGRTDLKDLIIFDKQSSQRMRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQRLQELISQKKAEDPEKKGEESSKDNQQQALIDHRYFQVLCSINSIIHNPRAPVVIYKQSKGGPQHFNKDFVQDCAFEHLVPIIAMWADQLTSLKDLYKSLKILSAELVPWHNLKKQDENESIKVEDLLFIVDTMLEEVENKNKDNNVPNFQTLQAVVSHFQKLFDVPSLNGVYPRMNEVYTRLGEMTNAVRNLQELLELDSSTSLYVLVSTVGKLCRLIIDGVNEQVKQLLGPEELQSIINKLEEHEEFFPAFQAFTNDLLEILEIDDVDAIVPAVKKLKVLSY	76340	220513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_76423_78775_78935_92941_93068_95744_95836_95957_96082_96398_96580_110726_110897_119057_119115_195306_195416_209149_209321_212821_212969_213175_213345_213530_213646_216920_217001_219791
611132	SIRV5	+	430	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-100	875	14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8215	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
611158	contig_18869_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_56082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
611174	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611182	contig_5815_pilon	+	2025	4	Intergenic	novelGene_141217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	405	junction_2	338.518340222013	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1222	1791	566561	571884	FALSE	20	GAGACGTTTTCCTCACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	565339	572118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_566635_566892_567037_567804_568014_571741
611199	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611202	contig_7457_pilon	+	2319	17	Intergenic	novelGene_31655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	185.500747555771	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	83	976	1019853	1032688	TRUE	80	TTAAAAAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQDSVPSPRPLQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVCSVWPCWGLCQPGF	1019770	1040572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1019863_1021032_1021063_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030433_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
611207	contig_4232_pilon	-	1576	2	Intergenic	novelGene_63449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2140	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAATTGCTGTATCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546390	542768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544082_546127
611234	contig_10225_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_86866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	150	797	46299	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFEPEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	45216	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_45224_46156_46786_47475
611237	contig_5715_pilon	-	2111	13	Intergenic	novelGene_127967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	100.374991351875	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	213	1334	659441	564052	FALSE	55	GTAGAAAAGTTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSTLAVEELGFERFHALIHKRSFRSLSELKDSVLDQYSMWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKDMALVAPEAPSEQARRVFQTYDPEDNGFIPDSLLEDVMKALDLVSDPEYINLMKNKLDPEGLGIILLGPFLQEFFPDQVT	659653	563274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_564149_566702_566776_576738_576812_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631757_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
611238	contig_10197_pilon	-	2510	9	Intergenic	novelGene_115295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	60.5917434556887	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	66	1667	1287201	1267124	TRUE	5	TGTGCCCCTTATTGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNASLFCKEGGNRKFQEKDYMGAAVLYSKGVSHSRPNTEAISLCYANRSAALFHLGQYETCLEDIIRAQSHGYPERLQPKMMLRKAECLVTLGRLQEASQTISDLEGIFAARPTLAASHFQVLQRNLHHLKTKVQEKENISETFPAAPTKAFKDMDLMEESEQIPSASSSVSLCTDPLKGRYLIATKDILPGEILVKEDAFVSVLNPGEMPQLHHGLESKWDTRVTNGDLHCHRCLKHTLATVPCDQCSYAKYCSQECMQQAWELYHSVECPQGGLLLTLGVFCHIALRATLLARFEDSGKVIRKLCGEISNKDICLPESENMLKTLSCNLGENEENGKIVETPIPGCDINGKYENNYNAVFNLLPHTENHSPEHKFLCALSVAALCRQLEAASFWALKPDLKSSKPKAFCCHSCRAVMQGDDVLSCGNRSCMESVSRGHLVSRLQDLQQQVGMAQKLLRNGKLEQAIQQLLGCQRDAESFLSAEHTMVGEIEDDLAQAYAALGDWQKSATHLQKSLRVVEVRHGPSSIEMGHELFKLAQIFFNGRDLCLLCC	1287266	1265164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267064_1267152_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569_1268703_1269927_1269963_1280946_1281995_1283361_1283452_1287174
611241	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611242	contig_5023_pilon	+	1521	9	Intergenic	novelGene_7366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1290.10531910189	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	98	961	622609	646990	FALSE	35	TTGTGGATGTCTAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNSETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	618651	647550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_618668_622527_622624_625648_625788_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
611245	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
611246	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
611256	contig_7426_pilon	-	1977	8	Intergenic	novelGene_27538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	278.014094489279	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	33	341	1102797	1094507	TRUE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRATGVYWSWLRGPR	1102829	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094666_1094740_1100318_1100420_1102705
611260	contig_12638_pilon	+	2303	11	Intergenic	novelGene_33366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	124.125581569635	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	134	1318	1515842	1537905	TRUE	25	TGCCTGAAAGGATTTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKNLRAA	1515708	1539671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1537887_1538019_1538799
611282	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611303	contig_7119_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_40866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCAGTGGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58498	56765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_56800_58500
611306	contig_15354_pilon	+	2244	9	Intergenic	novelGene_65756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	51.5333629797241	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	250	978	642871	647109	TRUE	30	GCTGCCTCTGCTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	639010	648498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085_648080_648202
611334	SIRV4	+	172	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1599	632	1144	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2599	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
611336	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
611339	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_94702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653782	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611364	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1466	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611370	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_90340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611371	contig_8673_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_129920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	530	844	308918	308604	NA	40	TAAAATTATTTTCACTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLVKNIEYTMDCQKNEQICLGRSTAGILLRSKDGKIHLTYFGHVFRRDQSLEKDIMLDKVEGQWKRRRPSMRRTDTAAATVGSNSNNCEGGVGPGSVSFCCT	309447	307839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_307800_309400
611372	contig_8673_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_129919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACACCAGATAACGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307637	306411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_306400_307600
611374	contig_233_pilon	-	2026	13	Intergenic	novelGene_14666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1549.2389776023	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1008	1889	93993	78579	FALSE	20	AAATTTCTCTTTGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127012	78441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94924_98328_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105615_109914_109976_126898
611378	contig_4364_pilon	+	1322	5	Intergenic	novelGene_195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	812.912472225639	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	694	705	1270448	1270459	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKSECTWAQAAQAPASAVVIVVSVLLLLLPVLWARRPRPHFPFCTQVPASFLAGGWYGVSQVLSAPLSPCGCPGCLPPLPQPPGPGRPPVAVSHRVTMMP	1268719	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269739_1270189
611385	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
611388	contig_6497_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_35553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATTCTATAAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135717	132878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_132900_135700
611393	contig_18869_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_56289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATTTGGCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73547	73354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
611395	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_18081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611396	contig_7202_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_18132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACGTAGTCACCCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
611402	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611409	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
611414	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_97714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611430	contig_1055_pilon	-	2417	9	Intergenic	novelGene_149721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	65.3222779762004	180	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	61	1125	97107	56813	FALSE	40	GACGCTCTGTAAAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQWDRLTDEQEEAVNRSESVKFDARSMTALIAQNPKNGPTLQEKLKSFKAALIVLYLLVFALLIPVIGIVAAQLLKWDMKNCTAGSINTNGISTSLTGKENDSKGETRFREIVMEHMSILEKRIHYIADTETNLIDSEHFQNFSVTTDQRFNDVLFQLSTLVSSVHGHGNAIEEISKSLMSLNTTLLDLLLRTETLNGKVQENTFKQQEEIRKLEEHVYNASAEIMSMKEEQVHLEQEIKGEVKLLNNITNDLRLKDWEHSQTLRNITLIQGPPGPRGEKGDRGLTGERGPPGIPGPMGPPGLKGDQGAIGFSGSRGLPGPSGRTGRPGNSGQKGQKGEKGSGSTLRPVHLMT	108852	55520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_56836_59241_59296_69383_69474_75880_75962_82675_82863_84653_85067_95486_95601_97004_97112_108796
611440	contig_15063_pilon	+	1057	3	Intergenic	novelGene_14390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	94	915	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35177	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
611449	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
611450	SIRV7	-	908	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	6	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
611455	contig_6175_pilon	+	2035	4	Intergenic	novelGene_16333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	211.485749454242	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTCCTTAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517984	1522821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1518006_1518667_1518761_1520852_1521699_1521746
611457	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611460	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_16630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27853	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611461	contig_5799_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_50231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129309	131470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_129300_131500
611465	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
611469	contig_11186_pilon	-	2500	6	Intergenic	novelGene_98874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	181.875121993086	3	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	140	634	285822	236204	FALSE	40	TAAGAAGTTAAGCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWLHRAFLFHLTFLLGFGPLPKAGTFRSPARSKSSVSAHLTVGRDDMSNKEGSGGFRKRKHDNFPHNQRREGKDVNSSSPVMLAFKSFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKALL	285961	234337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_239968_240086_266595_266727_280493_280609_285290_285396_285806
611473	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_95542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657522	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVQQKPVSAEGPKWIFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653861_657479
611486	contig_6191_pilon	-	3362	3	Intergenic	novelGene_107812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	13	150	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	372	1142	7574	6377	TRUE	20	GTAACAGACTGTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIKERGGELTVLGPQDDVSAAKRFLAPQISESPVKTRVEISAPNGLRTGIEVDTAHYKLLEAALQQEIPAIETKYNTNVRASGKTNDAQKTCILFEPKDKEVDLSAHACVHFIDAYQYVSCQLMREVLSLKLSGKDRQHLHGAKFHDDFREKHPDTHMVLTQESVHLTGLPSHLAKAKQYVLGREGMPLSAGQRWNEDHGTLMDIDSNDSETASPPVKGSTSSGASEVDKKEEDTCAICMDTITNKHVLPNCKHEFCTPCIKKAMSYKPVCPVCQTHYGVLKGNQPDGTMDVTCSPLRLPGYESCGTIVITYNMRGGLQTKDHPNPGRRYPGTQRIAYLPDNVEGNEVLRLLCRAFEQKLIFTVGGVSNIWSLRCHYME	7945	2988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_5169_6336_6557_6983
611487	contig_9848_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_79977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTACATCTAGCCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128383	129475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_128400_129500
611488	contig_10235_pilon	+	2564	21	Intergenic	novelGene_46549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	40.2532917908585	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	27	2198	418425	429067	TRUE	15	TGTGAGCTCAAGGTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSCSGTKMLETERLVLPPPGPLDLPLRAVELGCTGRWELLNVPGAPESTLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQRKMDPWSLLSAPGAPVPSDLQAQRHSTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPLSQALWGNPTQYPFWPGGMDEPTITDLSIREEAEEEIDFEKDLLTVPPGFKKGVDFAPKNHPAPAPGLLSLSYLLEPLDLGGGDEDGSEAVGQPGDTRGDTVSAFPCSAPLVRASSLEDLVLKEASTAVSTPEVPKPPPQEQWAIPVDVTSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDAERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVARPVPLEHYLFTGNSPKTQGELFLLLDSRGVFHMKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHHGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLQRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDTMRKHDGSTFRDLLPGEYLPEFWGLWGSAPEHPQAGSGAGPGCG	418398	429525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_418447_418525_418630_419184_419295_419375_419494_419592_419708_419822_419898_420192_420247_420345_420537_420700_420830_421033_421180_421549_421697_421835_421921_422113_422221_422554_422702_422777_422875_423052_423266_423346_423458_425691_425812_428776_428829_429038_429180_429271
611494	contig_14322_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_115715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATTTTCCTTTTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
611502	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	19	366	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14427	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
611510	contig_6576_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_42243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTTTCACTAATAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290808	293108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_290800_293100
611519	contig_12050_pilon	-	2132	4	Intergenic	novelGene_62695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	131.486374452514	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	298	1041	617317	616574	FALSE	5	GCCTCTGCCTGCCAGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQVRRGGRCCEVVGAAGGWDCRAPACLCIWDGSRGQIQSFLKGNQRHQALGDTGPLARSCSLLKRRWRKLNWPPEGVSPGDGAYHRGLCRGLLGRGRPPGL	659679	615482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_617366_617771_617820_619129_619256_659604
611527	contig_19769_pilon	+	1049	5	Intergenic	novelGene_102259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.444799541576	107	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	36	686	87249	88993	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNVSSSEIEVQGP	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841
611528	contig_9995_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_47818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894102	892151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_892200_894100
611541	contig_15327_pilon	-	1879	8	Intergenic	novelGene_70713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	31	junction_3	287.000462205416	1702	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	40	834	967479	960518	FALSE	5	TACCTGGCTCTGTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967518	959472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
611549	contig_10196_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_132122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1085	1459	925908	926282	NA	20	CAGGCCCAGTGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGQAGGSSWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	924823	926561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_924800_926600
611553	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCACTTCAGTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
611562	contig_2069_pilon	+	779	2	Intergenic	novelGene_23540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGCCGCCGCGCTCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508447	1509870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1509111_1509754
611567	contig_20506_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_149732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAAGTCCCGTTTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15254	15780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20506_pilon_+_15300_15800
611577	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
611587	contig_14322_pilon	-	331	2	Intergenic	novelGene_115941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671840	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671664_671817
611588	contig_8627_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_149733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGATTTACTGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48492	48769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8627_pilon_+_48500_48800
611591	contig_7179_pilon	+	2445	9	Intergenic	novelGene_78167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGCTTTCTGGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057307	1065275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1058171_1058816_1058960_1060226_1060444_1060731_1061364_1061953_1062109_1062590_1062710_1062824_1062890_1064932_1065081_1065172
611594	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	208	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611596	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611611	SIRV6	+	302	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10522	2	1285	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11522	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
611616	contig_14219_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_54330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGACCTCGGTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752184	752834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_752200_752800
611617	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611621	SIRV6	+	960	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	217	708	1733	10736	TRUE	30	TAAGTTTAATTTACCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1133	11201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1627_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
611644	contig_11656_pilon	+	2030	13	Intergenic	novelGene_54009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	178.05638542015	50	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	155	1444	465719	536764	FALSE	30	TTAAAAATTGTCTCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKVWPSVTMLDTLSAHLEGLHRRDPAHFDAK	464950	537350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523802_536673
611649	contig_5050_pilon	-	1664	12	Intergenic	novelGene_110277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	208.286555629974	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	15	1364	716384	507209	FALSE	10	GGGCACATCCCTTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716398	506908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625276_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
611650	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
611653	contig_6589_pilon	+	1253	9	Intergenic	novelGene_25998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	799.696651471669	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	2	916	1725160	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METWEELPHVSLVPTNAKAPQEKMSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725158	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725223_1725476_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
611655	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611681	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611684	contig_10319_pilon	-	3630	15	Intergenic	novelGene_147235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_1	54.5602082705942	9	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	269	1762	250190	33621	FALSE	25	CATAATGCTTGGTTACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFTEDESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNNAGTQEAV	251609	31752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_33626_44263_44406_46664_46848_47681_47772_50320_50448_52732_52870_59106_59227_63369_63502_67769_67878_71419_71525_79991_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
611686	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
611697	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
611707	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611714	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
611723	contig_1443_pilon	-	1334	8	Intergenic	novelGene_28305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	637.092502814824	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	216	695	776427	748649	FALSE	35	CCTTATTAAACCAGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809508	748009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748880_766794_766826_767479_767556_776186_776462_805197_805224_808694_808741_809399
611729	SIRV7	-	275	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69011	0	35792	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78946	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
611742	contig_610_pilon	-	2573	6	Intergenic	novelGene_76814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_4	68.9770976484224	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	49	1398	343470	331286	FALSE	50	TGAATGAATAAATGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	343518	330110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338808_343421
611754	contig_21203_pilon	+	1173	7	Intergenic	novelGene_84475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	285.975523428142	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	76	711	53950	108269	TRUE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGLMQPINRFS	53874	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_108238_108379_120210_120376_121973
611758	contig_5018_pilon	-	4042	8	Intergenic	novelGene_47115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_5	36.7767672892126	7	113	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1599	1961	1432570	1432127	TRUE	20	AGTGGACCTCTTAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAVSRELVLGHPLVHLSWVNPVLVEPTQ	1434632	1427823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1432425_1432505_1433868_1434048_1434193_1434388_1434425_1434511
611760	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
611763	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
611766	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
611769	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611770	contig_15063_pilon	+	1669	6	Intergenic	novelGene_14107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2358.1475441541	2	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	189	1418	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34619	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35371_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
611778	contig_9297_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_69837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651790	649508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_649500_651800
611783	contig_14441_pilon	+	887	3	Intergenic	novelGene_100707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_2	265	124	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	153	413	116728	117123	TRUE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	116575	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117097_117344_117539
611786	contig_15545_pilon	+	1007	2	Intergenic	novelGene_120122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGGGCATAGGATAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9188	27928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
611789	contig_11413_pilon	+	2398	8	Intergenic	novelGene_103149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	172.172433736576	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	124	2049	280740	426022	FALSE	5	CCACGTGGGCCCTGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLSLADALTEPSPEIEEEIKRDFIATLEAEAFDDVVGETVGKTDYIPLMDVDEKTGNSESKKKPCSDISQVEGTPSSKPAVLANGDHEIKGNDTTGSPTEFLEEKVAYQDYMNNQNWPEDINFCYQPEQVVNPIQTDSFKMHKDDGLEDFLFIPSGTTNASTFTGQNDPLKDIYGMPHCDTFASATGDVHQGWLMEAPDSPHSASFISPESIKQPLQPTEEPAKEVEVASAKERTPTEVLEILPPRETEIAPAKDVGPATETEMALAKDMEPSTKSDVALAKDTEPFIDSDLTLVKDMVLPKETEVVPGKDVVLPTETNVSLDKDTVLSTETAVTLGKNLTLLKETEAALPIKMDLASAEGMVSLSEIEVAMAKDNVTSAEISLAKELSLYPETEVALASAVTLPAETKVVLTKDVAPPPEAEVTLVKDTAPPPKAEVAPLKVLTPSAETVVAPVKDVAASPETEMTPAKGMALPPETEVAPVKDVAPSSEAEVAPVKDVASSSETEVAPVKDLAPSPETEVAPVRDVAPSSETEVAPVRDVAPSSETEVAPVRDLAPSSETEVAPVKDVPLLPEEVALVMGMPLPPKTEVAVPKDVALPSATDVTQANNLTPTKDVAPPSKAEVTPAPVQDVEIAGRG	199386	426371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_199491_280720_280963_312527_312597_351380_351504_364503_364618_366246_366385_367194_368437_426005
611795	contig_1443_pilon	+	2189	10	Intergenic	novelGene_28233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	53.4404017875042	39	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1230	1880	538954	541541	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535991	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536604_537644_537727_537987_538483_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
611805	contig_1545_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_149744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167288	166517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_166500_167300
611807	contig_3975_pilon	-	1637	9	Intergenic	novelGene_54833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_2	132.335215929094	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	427	1176	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2065227	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204
611813	contig_10253_pilon	+	1090	7	Intergenic	novelGene_76862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	134.754921575759	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	84	776	16207	84045	TRUE	40	AAGACACTGACCTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPGSKKVKLSNNTQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERGVSSTCQCL	16123	85123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_84015_84222_84985
611837	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
611839	contig_3700_pilon	-	3195	2	Intergenic	novelGene_138071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	14	469	177895	177008	FALSE	35	AAGGACTTGGCATATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKAVLKAQIPIHARGQGNQCLKGLLTHQQEDRGESWSWRPAGPTGAEIPAMTKSYPHQFPSNPSQGPLNRRQHDGVFPTLQLQKLEQGPEKPRKQHMSKAFRATLRKLLIGLLSVVPVDIVRRDLPISVGFHHTWMPFLLGLLKSHIHL	177908	174281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_177317_177748
611857	contig_7202_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_18432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611883	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611902	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTACCCAGCTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
611906	contig_14925_pilon	-	2038	2	Intergenic	novelGene_55368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	331	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	258	710	322203	129433	FALSE	55	AAAAAACATAGTAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEISFRVCLLCLCRLLNISAWYLLSLLFPTGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPHAVIQAHLWERNSCDCGTK	322460	128104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_129491_321808
611923	contig_9706_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_20839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATATGTCTGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230	2738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
611938	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
611940	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
611964	contig_8263_pilon	-	1398	2	Intergenic	novelGene_83104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAAGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211881	148793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_150108_211797
611967	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
611968	contig_10569_pilon	-	2004	2	Intergenic	novelGene_44060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGCATGTTTTGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87017	82263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_82951_85700
611975	contig_7119_pilon	-	2299	5	Intergenic	novelGene_41007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	367.402708209942	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCTCTAGTAAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196802	188211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_196379_196690
611985	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
611994	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	226	15	-56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGGCATATGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	1894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
611998	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
612000	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
612005	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_17607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
612013	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612021	contig_9345_pilon	-	1412	13	Intergenic	novelGene_24496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	255.761390535962	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	47	1369	671829	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671875	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670737_670798_670910_671013_671225_671275_671731
612028	SIRV6	+	428	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	1	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
612042	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612047	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612065	SIRV4	+	208	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1563	632	1108	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2563	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
612072	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612074	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612076	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_16472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
612081	contig_4156_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_88075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2202	2507	156451	156146	NA	25	GTGACAGGTGGAAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNGTCSFPRKSLCPLLARVAPPVQRFKFPGRLPLPCFHQIKVQFHGPSPGRGLPVSQSSSARLETPSPHMTTWAVVGSPGLLRTAPKETAHGLTRFSQIT	158652	155347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_155300_158700
612092	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	642	1123	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
612136	SIRV4	+	408	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	13	-895	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCGCTAGGTTATCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
612158	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612160	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	8	355	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14416	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612176	contig_16303_pilon	+	1622	7	Intergenic	novelGene_34089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	664	972	37468	38653	TRUE	35	GTTACAAACAGAACGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLCVRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	33134	45517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33219_35396_35766_37134_37302_37424_37706_38582_38854_40432_40723_45357
612177	contig_10734_pilon	-	1932	6	Intergenic	novelGene_51407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	67.5319183793856	823	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	863	1183	2075693	2073385	FALSE	20	GACGTGTTCATTTGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLYKENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCGKRMSECPICRQYVVRAVHVFKS	2091288	2072635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2073576_2075563_2075766_2076034_2076122_2077859_2078270_2079518_2079735_2091211
612188	contig_2069_pilon	-	1633	6	Intergenic	novelGene_23453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	259	684	1439189	1436583	TRUE	20	GAGTGGGTGTGAGAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLQVNMLGEATWAAAALKGPGPRVQAQVSLEVAGAAEALVAQRALVGPFPGVHQVVLLQVGKLGEALLARGTLERALPAVHAQVDLEVGELPKSLAAHVALIQDFAILFLQRVGQGCSAHSGAQWSPLCRSHHTSLLQP	1439447	1431979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1432057_1432932_1433060_1433697_1433913_1436052_1436746_1437868_1437999_1439056
612192	contig_14133_pilon	-	2564	17	Intergenic	novelGene_119968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_16	45.5672151195352	276	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	323	2392	227234	213631	FALSE	30	AAATGGTTTAATTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRNKDNDKSRAKTPEDDEEERKRKEREDQMYRERLRTLFIIAVVMSLLNSLSSSGGNISWNDFVNEMLAKGEVQRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEVKDRIPVSYKRTGFFGNALYALGMTAVGLAILWYIFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTVVDGKMGKGISFKDVAGMHEAKLEVKEFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARHRAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSSFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDSALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTRASSFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTSNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQRVVAFHESGHALVGWLLEHTEAVMKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	231383	213458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220461_220587_221852_222027_222355_222519_222935_223062_224401_224505_225467_225608_226191_226434_227173_227264_228605_228709_231193
612201	contig_7202_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_17684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCATCTTCCGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
612204	contig_9345_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_24330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAATATTAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24257	22551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_22600_24300
612205	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612212	contig_1406_pilon	-	1885	6	Intergenic	novelGene_25556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	345.068920652092	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	116	1138	2159494	2137428	FALSE	5	GTCGTTGCAGCCGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159609	2136680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391
612220	contig_3233_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_56521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGATAATCAAATTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249459	249870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_249500_249900
612230	contig_11978_pilon	+	1736	4	Intergenic	novelGene_63073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6366	junction_3	2885.28762286651	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTAAAGTTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1827921	1831976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830785_1831161
612248	contig_16703_pilon	+	2462	1	Intergenic	novelGene_72789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTTTGATTTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42425	44887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42400_44900
612249	contig_6589_pilon	+	1303	8	Intergenic	novelGene_26017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	855.401779330411	3139	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	118	966	1725483	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725365	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728993_1729234_1730067_1730152_1731406
612251	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
612252	contig_2894_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_86554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.5	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGCCTACTGGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314496	313271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_313332_313526_313891_314226
612259	SIRV2	-	610	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4263	34	3088	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
612261	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_97863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
612272	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612280	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1459	635	1004	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2459	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
612302	contig_7179_pilon	+	3229	1	Intergenic	novelGene_78091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGAAAATAACCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584917	588146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_584900_588100
612315	SIRV7	-	344	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-4	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114742	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70873_70988_78841_78957_114680
612318	contig_15304_pilon	-	931	3	Intergenic	novelGene_30448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	64	888	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54163	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
612321	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612327	contig_10354_pilon	+	1962	5	Intergenic	novelGene_50859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	72	779	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432298	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
612347	contig_5196_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_38684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCATTTTACCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202090	201276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_201300_202100
612355	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
612369	contig_5862_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_54962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230153	233050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_+_230200_233000
612377	contig_14322_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_116497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAATAAACGCTCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
612385	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612396	contig_6102_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_31933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTTTTATGACAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392642	392346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_392300_392600
612440	contig_12873_pilon	+	2179	6	Intergenic	novelGene_27184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1436.51843009409	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1665	1988	19035	19855	FALSE	10	GATTTGTTATTCTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15985	20046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_18012_18984_19264_19611_19703_19851
612447	contig_14525_pilon	-	2191	9	Intergenic	novelGene_149748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	273.921863859021	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	477	866	148448	127841	FALSE	30	CATATCTACTGAAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQINKDDVTALHCKVVCLIQNGSFKEALNVINTHTKVLANNSLSFEKAYCEYRLNRIENALKTIEGANQQTDKLKELYGQVLYRLERYDECLAVYRDLVRNSQDDYDEERKTNLSAVVAAQSNWEKVVPENLGLQEGTHELCYNAACALIGQGQLNQAMKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQIIKLKPTDVGLLAVIANNIITINKLPQIQKDGYQCENVLTTEEGRRVKRRIRLEKGPREQLQELHLNWMPVKL	155447	126515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434_128565_145157_145216_145303_145429_146713_146746_148423_148536_148614_148759_153473_153598_155326
612457	contig_10581_pilon	+	1381	4	Intergenic	novelGene_41347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_3	169.146878974064	2623	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	193	642	74587	87174	FALSE	10	CTTTGGGCTATAGTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSIKLVVEWELLDDKGQRLFCWKIPLEIIS	74394	87913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85207_87087
612458	contig_5485_pilon	-	2261	15	Intergenic	novelGene_37753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.518842958965	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	23	1057	478711	459217	TRUE	30	TGAGTGAAGAAGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKVGTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAIPN	478733	457945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_458353_458419_459227_460889_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471264_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
612459	contig_17440_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_7590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTATATGAATTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3015	3298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3000_3300
612464	contig_6837_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_149804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	401	772	10764	10185	FALSE	10	AGCCTTGCTGTCTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRGKKGAVAEDGKEPKTEPEAKKSKAAAKKNEKEATGEGTVLYEDPPDRTTSPSGKSATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDVSGIQGGEVKLPFQSVGCSFYFPLSVIILWKRYKGNFTKTC	11164	8684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_10499_10706
612467	SIRV4	+	336	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	441	173	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
612474	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612481	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
612482	contig_11309_pilon	-	1226	10	Intergenic	novelGene_149853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2863.27149504216	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	639	938	60241	54869	TRUE	30	ATATATTTATATGCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKLHSECTEKCNSILKKKKGRNEILWTC	65796	50641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_50916_54854_54950_56334_56393_56928_57018_60169_60348_61301_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
612483	contig_13145_pilon	+	2264	2	Intergenic	novelGene_116632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTGCTGAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62823	65766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_64137_64815
612501	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_114003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612503	contig_20600_pilon	+	2410	6	Intergenic	novelGene_137114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	57.7408001330082	76	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	388	1038	112324	117548	FALSE	10	GGCCTAATTTTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111271	118920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111604_112268_112446_113990_114161_114959_115049_116223_116332_117386
612509	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_93683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
612527	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_96517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
612528	contig_16098_pilon	+	2114	8	Intergenic	novelGene_45819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	70.6468654070139	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	862	1407	151768	152636	TRUE	15	GACTAGCTTGTGTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGTGSLGTQGLTPG	150549	154035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152878_152983_153104_153689
612529	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
612532	contig_11493_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_143660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACAGGTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125528	123212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_123200_125500
612533	contig_3095_pilon	-	1125	6	Intergenic	novelGene_75220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	776.609296879712	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255543	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255461
612534	contig_9807_pilon	+	1436	9	Intergenic	novelGene_32867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	592.537129638304	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	766	1212	151799	158783	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_151695_151820_154095_154270_156624_156770_158676
612539	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
612540	contig_19342_pilon	+	791	5	Intergenic	novelGene_41132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.20156211871642	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	96	365	5208	6183	TRUE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	5112	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
612549	contig_14322_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_116226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
612564	contig_12414_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_59548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	93	494	370898	373887	FALSE	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFSTVA	370805	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373380_373869
612566	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_90412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
612576	contig_12250_pilon	+	2031	6	Intergenic	novelGene_80622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	45.810915729769	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	86	1267	350196	353654	TRUE	50	TAAGAAAAAGAATCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCALWLCVQPLLPADWRRALGVEHHSHHQSLLCAFLPDMECGELGALGQWFNTGAASHHHPAASDGLAAGGLSPHCHWRHLREEQR	349807	354957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349876_350178_350544_351345_351928_352353_352443_353491_353766_354304
612583	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
612594	contig_10990_pilon	+	2247	3	Intergenic	novelGene_7401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	130	618	119582	121424	TRUE	40	AAATGTAGCTGATGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119452	123551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_122073_122570
612595	contig_14326_pilon	+	1727	9	Intergenic	novelGene_120701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	62.5574735743061	668	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	77	1180	221889	248940	FALSE	25	AGGCCCATGTCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGVCVSGDSKCGRSYRFFPPGLATMSSTLAKIAEIEAEMARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQLLDLPGIIEGAKDGKGRGRQVIAVARTCNLILIVLDVLKPLGHKKIIENELEGFGIRLNSKSPNIGFKKKDKGGINLTATCPQSELDAETVKSILAEYKIHNADVTLRSDATADDLIDVVEGNRVYIPCIYVLNKIDQISIEELDIIYKVPHCVPISAHHRWNFDDLLEKIWDYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPDSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKK	221812	249487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_248840
612612	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	443	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612619	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612628	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
612658	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612661	contig_2342_pilon	+	2170	18	Intergenic	novelGene_132769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCAAGGGAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481496	547627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_481531_487030_487113_487507_487616_488805_488899_507426_507525_510172_510236_511527_511609_513946_514114_519719_519877_520187_520295_522042_522176_522363_522558_525395_525548_526403_526522_528877_529005_529094_529216_547074_547177_547394
612667	SIRV7	-	346	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	2	2	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
612669	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
612670	contig_7004_pilon	+	2003	4	Intergenic	novelGene_126466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_2	97.3390409285446	1729	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	59	1405	392109	395731	FALSE	10	CTTAGTATCTGTCTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRNGPYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	392050	396329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394061_394364_394514_394759
612675	SIRV7	-	299	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91627	0	-91621	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAACTAGTAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
612682	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612697	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_114009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612706	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
612710	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612726	contig_6494_pilon	+	2868	1	Intergenic	novelGene_108538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1791	2186	3158	3553	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTNKPKEYKHGTATPKMNFPNTEVYMENHPYPQNALYPKHSQLLTLSEQHMSHSCVNVVVNRVPTVNHQAIHKFHGFSPLSSEFPRHHDLAALGSTLHDESQHTIAGPLKQRPIRVINKDRPYQPQRPH	1367	4235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_1400_4200
612728	contig_4742_pilon	-	2168	3	Intergenic	novelGene_130971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138074	133703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_135646_137325_137421_137943
612740	contig_15087_pilon	-	1325	12	Intergenic	novelGene_37207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_3	171.978232333904	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	72	803	134824	113497	TRUE	30	CTGTAAAATGAGTGACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	134895	110649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811
612745	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
612749	contig_8729_pilon	+	2861	8	Intergenic	novelGene_40065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	28.329691642717	50	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	27	695	45249	51405	TRUE	5	TGTGTCTCGGACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQPAGPGSGIREKLELPVLHVSWNDARTYCAWRGKRLPTEEEWEFAARGGLKGIRAPRRFPFNFLSFLPCSRGLQKVGRPLFPRAMLCKLPVGKDEL	45222	57034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_51117_52603_54672_54758_54932_55078_56295
612754	contig_6980_pilon	+	1333	9	Intergenic	novelGene_36042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	71	967	356720	372790	FALSE	15	TATTACTTTATTTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346112	373156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
612758	contig_14353_pilon	-	2444	12	Intergenic	novelGene_82082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	483.767941773329	2	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	50	679	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104421	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_79561_79638_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
612762	contig_6283_pilon	+	3423	19	Intergenic	novelGene_100200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	82.6374089503337	239	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	326	2533	571844	588463	FALSE	35	TATGACAACTATATGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLVYKLQAEDYKFDFPVSYLPGPVKASIQERVLPDSPLYHNKVQFPPSGGLSLNLALNPFEYYIFFFALSLITQKPLPLSLHVRTSDCAYFLLVDRYLSWFLPTEGSVLPPLFSSPGGSSPSPAPRTPAMPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHTKLEVLHYRLSVSSALHSPAQPGFQALHTYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFSNSLKPEQVSPSAHSHATSPLEEFKRAAIPRFVQQKLYLFLQHCFGHWPLDASFRAVLEMWLSYLQPWRYAPEKQAQSSDSQPRCISERWAPFVQENLLMYTKLFVGFLNRALRTDLVSPKNALMVFRVAKVFAQPNLMEMIQKGEQLFLEPELVLPHRQHRIFMTPTFTGSFLSSWPPAVTDTAFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEVRSLVLRLAQLITQAKQTAKSISDQSAESTAGRSFLSWLGFWPVDTNSSYPTNDLDEVGQDSVRKTDEYLEKALEYLCQIFRLSEAQLAQLTLALGTTQDENGKKQVPDCIVGENGLVLTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDSELQPIRSYEIAGLVRMLFRLSSAINCRFAGQMAALCSRADFLGSFCRYHLTEPALANRHLLSPVRQAHAASRAQVPRISLRFLGSYRTLFLLLLAFFVASLFCIGPLPCTLILILGYLFYATAMALLTEQGKPHQA	565401	589353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_565549_568334_568419_570594_570682_571836_571913_572480_572590_572742_572796_573522_573675_576600_576734_577535_577608_580719_580807_583268_583415_584154_584246_584746_584848_585567_585732_586395_586602_586978_587213_587530_587663_587830_587960_588133
612781	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612798	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_96414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGATGGCTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	657179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
612826	contig_6710_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_97811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
612838	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
612847	contig_7963_pilon	+	1209	5	Intergenic	novelGene_58505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	184.665914559239	3320	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	61	918	145910	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGIRVCWVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWGAHVIPLGGRLLNHASKLTCSPFSPVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145849	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149344_149546_149948
612853	contig_6589_pilon	-	1098	2	Intergenic	novelGene_26297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAAAATTGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2273305	2272083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272093_2272216
612861	contig_8394_pilon	-	1817	2	Intergenic	novelGene_27311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	162	junction_1	0	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	234	1475	38778	32466	FALSE	20	TCTTCATTAACCCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCFQELVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39011	32123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_38754
612863	SIRV6	+	486	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470
612868	contig_4891_pilon	+	1227	6	Intergenic	novelGene_124550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	458.062004536504	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	140	439	701017	733761	TRUE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLDLQEQ	700877	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
612870	contig_9290_pilon	-	1517	10	Intergenic	novelGene_77538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.836239679556	12	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	78	1178	496936	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497013	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486154_489983_490037_491390_491545_496930
612873	contig_5467_pilon	+	1865	8	Intergenic	novelGene_111941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_1	310.055162965613	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	559	1191	13537	15166	FALSE	10	CATGAGTTGGGCCTCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPRILLWAQNFSVTYNGQTEDLTSLTFGAQELNLTGSFWNSSAAGLALTYEQLFGTMVTFKFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCQYVSSLTKNGNLLVPHTQPSAWDVTLRDFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTSLLMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPAISLTQIV	11074	15840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956
612878	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
612888	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1116	0	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
612896	contig_2069_pilon	-	1221	6	Intergenic	novelGene_23421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_5	918.346688348142	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	1330579	1327936	FALSE	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLLLPGAVAQAALVSPCASRLFVPRFPGQIDSDSVPQISLAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1330579	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1330456
612903	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_18701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCTACGTCTACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
612922	contig_4555_pilon	-	2600	4	Intergenic	novelGene_149880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	60.4556770608757	150	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	150	572	45924	41195	FALSE	30	TCAAATTTGTTTTAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMDFKTYVDQACRAAEEFVNIYYETMDKRRRALTRLYLDKATLIWNGNVVTGLDALANFFEMLPSSEFQVNMLDCQPVHEQATPSQTTVLVVTSGIVKFDGNKQHYFNQNFLLSAHSTLNNTVWKIASDCFRFQDWASS	46073	39166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4555_pilon_-_41377_42439_42585_44849_44937_45915
612925	contig_7202_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_18666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCCATGGTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
612926	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
612933	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
612935	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
612947	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
612955	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
612959	contig_12873_pilon	-	1968	6	Intergenic	novelGene_27147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1383	1685	16860	16230	FALSE	0	TCTGTCTTCCTCTTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQLIQPTRAQILFPGMVVIRCYLDDMVGDRFLERFLPSSLSPPGRRTATNRSCRNSISFAGVLSFSQKSWSLVFVLHKPTLHYLYSDFLLSPTDKTPL	20425	15946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16425_16752_17021_17734_18012_18982_19262_19609_19700_19849
612970	contig_11056_pilon	+	1893	9	Intergenic	novelGene_130365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	109.327418221597	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	170	1105	340996	369990	FALSE	25	ATAATGTAGAGTCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEGGFGGTSSSDAQQSLQSFWPRVMEEIRNLTVMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPVQLNAGQLQYIRLAQPVSGTQVVQGQIQTLATNAQQITQTEVQQGQQQFSQFTDGQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294531	370778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_340987_341101_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_365410_365519_368561_368622_369870
612973	contig_7457_pilon	-	2071	2	Intergenic	novelGene_31496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCGTTACCACTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650976	648743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_648792_648953
612979	contig_9099_pilon	-	2808	2	Intergenic	novelGene_149918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1968	2288	404047	403727	FALSE	55	AAAAAAAAAGCGGCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTIVIKRNEVLIHAAKWLNLENIMLREISQTPKDASCMIPLIQSISEVNRQHGASVWGADKVSVETVVMVTQHCAMKCTLKNGQFYGICILPQLKKKKKASRTK	406256	403206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_405110_405351
612986	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	632	969	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
612997	contig_12270_pilon	-	310	2	Intergenic	novelGene_114092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	27	308	14409	13905	FALSE	20	CATCAGCAGCTTCCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTF	14435	13902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613002	contig_12729_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_149933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGATCTCTTTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79432	81790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12729_pilon_+_79400_81800
613005	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	734	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
613006	contig_20719_pilon	-	2845	21	Intergenic	novelGene_140559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	74.1898072514008	161	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	166	2319	91663	8596	FALSE	0	TGCCTCCTCCTGCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDAATEQAAEYVPEKVKKAEKKLEENPYDLDAWSILIREAQNQPIDKARKTYERLVAQFPSSGRFWKLYIEAEIKAKNYDKVEKLFQRCLMKVLHIDLWKCYLSYVRETKGKLPSYKEKMAQAYDFALDKIGMEIMSYQIWVDYINFLKGVEAVGSYAENQRITAVRRVYQRGCVNPMINIEQLWRDYNKYEEGINIHLAKKMIEDRSRDYMNARRVAKEYETVMKGLDRNAPSVPPQNTPQEAQQVDMWKKYIQWEKSNPLRTEDQTLITKRVMFAYEQCLLVLGHHPDIWYEAAQYLEQSSKLLAEKGDMNNAKLFSDEAANIYERAISTLLKKNMLLYFAYADYEESRMKYEKVHSIYNRLLAIEDIDPTLVYIQYMKFARRAEGIKSGRMIFKKAREDTRTRHHVYVTAALMEYYCSKDKSVAFKIFELGLKKYGDIPEYVLAYIDYLSHLNEDNNTRVLFERVLTSGSLPPEKSGEIWARFLAFESNIGDLASILKVEKRRFTAFKEEYEGKETALLVDRYKFMDLYPCSASELKALGYKDVSRAKLAAIIPDPVVAPSIVPVLKDEVDRKPEYPKPDTQQMIPFQPRHLAPPGLHPVPGGVFPVPPAAVVLMKLLPPPICFQGPFVQVDELMEIFRRCKIPNTVEEAVRIITGGAPELTVEGNGPVENNAVLTKAVKRPNEDSDEDEEKGAVVPPVHDIYRARQQKRIR	91828	8069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_8799_9398_9460_9604_9700_10437_10592_13072_13269_14568_14639_20114_20218_20800_20945_22688_22764_23024_23142_23412_23523_28456_28620_29354_29433_33576_33704_33813_33849_33931_33999_36787_36886_37281_37315_72123_72220_72337_72440_91636
613008	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_113938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	13	339	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14421	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613009	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_96031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613013	contig_14322_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_116356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671581	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
613022	contig_4678_pilon	-	2259	15	Intergenic	novelGene_126056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_6	50.3636267355637	114	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	389	1465	577200	572868	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVKAGLTRVYLQRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKGQGGACIGTDPAATAAPS	578045	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
613026	contig_15304_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_30541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	25	ACCAGAAGCAGCCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
613030	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
613044	contig_14322_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_115831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
613046	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_96746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
613051	contig_3956_pilon	+	1422	6	Intergenic	novelGene_15128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1459.68700754648	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	71	856	1281682	1290447	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARWWPRPASAKA	1281611	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284821_1290409
613060	SIRV4	+	310	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	200	440	200	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
613064	contig_8538_pilon	-	2169	8	Intergenic	novelGene_4601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	53.0175173207605	409	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	167	1009	697938	688211	FALSE	10	ACGTGCATGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPYTLNGKKVEVAVKQVIAGKSVEHRGAFSNPETLDLYQSIPELQDF	698104	687050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688349_692701_692905_693724_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928
613066	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613095	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
613110	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613111	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613112	contig_8978_pilon	+	2419	1	Intergenic	novelGene_49434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGTGACAGTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524883	527302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_524900_527300
613125	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCATCCCCCTCGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613136	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	46	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
613144	contig_10135_pilon	+	1873	13	Intergenic	novelGene_106638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	66.4844906726373	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	13	891	106830	113630	TRUE	20	TAAATTAGCCGCTTTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNKMAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFRCEE	106817	116034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_114015_114473_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
613148	SIRV7	-	301	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91624	1	-91618	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTAGTAGAGTGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
613150	contig_15185_pilon	-	1432	8	Intergenic	novelGene_99446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	350.588426645774	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	221	979	444652	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472462	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444647_444701_472290
613152	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
613153	contig_7760_pilon	+	2412	7	Intergenic	novelGene_138439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCGCGGTCACAGCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256221	266245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_257862_258606_258695_260543_260663_261239_261391_262297_262448_265423_265570_266127
613162	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_97325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
613165	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613178	contig_1443_pilon	-	2126	9	Intergenic	novelGene_28273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_7	455.791070557553	4	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	209	1093	776427	748649	FALSE	40	CGAGATTTCAGTAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809527	747615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_808694_808741_809399
613196	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
613201	SIRV7	-	338	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	8	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114730	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78960_114680
613203	SIRV7	-	254	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69032	0	35813	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78925	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
613216	contig_5023_pilon	-	2260	2	Intergenic	novelGene_7385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642792	640129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_641607_642009
613221	contig_11590_pilon	-	2706	2	Intergenic	novelGene_125567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1856	2164	62128	61820	TRUE	10	AGGTTTGGTTCCCAGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKSIKYTMDFQKNERVCLGRSTARMLLRSKDGETVSHVLWTCYQEGAVLGEGKAEGQRKGGRPLTRWIDTVAATMGSNSNYYEDGTAPGTVLFCCIQGL	63983	60679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_61167_61764
613229	contig_15304_pilon	-	1344	4	Intergenic	novelGene_30497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	37	junction_3	1473.29841587583	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	477	1301	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	57786	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991_54295_57504
613230	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613231	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613240	SIRV7	-	163	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69086	31	35867	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTACAAAAATGTATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78871	56068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
613247	contig_18420_pilon	-	1721	12	Intergenic	novelGene_109364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	330.995143656167	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	562	1299	118470	109372	FALSE	10	AGTGGCCTTGTGACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFHRRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	129217	108949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_118456_118531_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147
613248	contig_15123_pilon	-	2234	12	Intergenic	novelGene_110915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	176.139454518335	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	181	1947	227068	217521	FALSE	40	TTACTTGTAAATAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEENRGLGERANLGRQFLEVELDQAREKYVQELAAVRADAETRLAEVRQEAQNAARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEELSKKLADHDQASKMQQQKLKAQGSESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHYKLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRGLEQLQKENKELRAEAERLGQELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLAITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPVSQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKAKH	227248	217233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_217920_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219374_220063_220293_221228_221476_222752_222911_223020_223240_223326_223438_224870_224940_226981
613251	contig_5059_pilon	-	1781	14	Intergenic	novelGene_140698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_11	139.864304483449	580	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	44	1102	231713	166409	FALSE	10	TCTGCTGTGTCCTATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGSDCSAGVGRQFSCSLSREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231756	165729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_217261_217310_226820_226893_231639
613252	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613260	contig_3602_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_60501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1001.80011590248	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	221	565	168543	169451	TRUE	30	GTTAAGTTCAAGCTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKQDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161627	171066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161774_168468_168613_168749_168857_169142_169282_169422_169647_169908_170724_170945
613276	contig_8885_pilon	-	2006	5	Intergenic	novelGene_115555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	158.267179162327	788	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75540	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_58183_58308_62972_63130_75399
613290	contig_4874_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_78619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAAAAAAAATGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9524	10526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_9500_10500
613295	contig_5690_pilon	+	1632	11	Intergenic	novelGene_119713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	447.568095377675	13	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	152	1150	1073823	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVAASCHLISRSWDLSCQLICQTWDSSICTASDGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1032541	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1032640_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
613299	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613302	contig_15304_pilon	-	1307	4	Intergenic	novelGene_30603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	165.007743926022	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	186	1169	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65187_65396_65721_66104
613312	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613314	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613319	contig_15063_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_14148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2539.00909559222	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	214	984	34860	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWCAKSNTPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34646	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34888_35872_36158_36266_36600_38975_39092_39506
613325	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
613328	contig_2027_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_39933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTGCTATAGATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188117	187941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_187900_188100
613329	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
613330	contig_11422_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_99091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGAGGTGTTAGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539	748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1500
613333	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	187	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
613338	SIRV4	+	155	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1161	0	-1161	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTCGTTAACTTCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
613347	contig_12270_pilon	-	314	2	Intergenic	novelGene_113351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	3	314	14379	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14381	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613358	contig_4364_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_4376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAGTAACAACCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
613360	contig_14882_pilon	-	2079	15	Intergenic	novelGene_115018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	331.431065261554	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	615	1994	317300	295835	FALSE	70	TTCTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGEFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363661	295749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_316351_316501_316882_316984_317224_317321_320747_320816_321327_321410_321539_321739_363416
613367	contig_3956_pilon	+	1254	6	Intergenic	novelGene_14846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1581.24591382871	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	84	749	1281682	1289798	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPHGAYLPCGDPGEGGWAFCPRSRGCPAEGAAKSLSLPDSVQSKWSVVSMVS	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284168_1289645_1289884_1290590
613368	contig_7963_pilon	-	1568	4	Intergenic	novelGene_58302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1139.5467910046	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	755	1177	40241	38897	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	40995	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38667_38845_38917_39293_39405_39949
613373	contig_6227_pilon	-	1653	16	Intergenic	novelGene_49749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	346.831153284835	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	15	1355	1224979	1202920	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224993	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203567_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213192_1222070_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
613376	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613380	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613382	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613386	contig_854_pilon	-	2722	17	Intergenic	novelGene_36113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	126.637878787312	328	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	14	1921	158736	134922	FALSE	5	TCAGTTGCTCTCGTGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEMEPETLEARINRATNPLNKELNWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQEWEAVQALTVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKSKVLELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDATFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGSASGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDAAATGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPATPTRPGNQASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPGLEGARWNSFQSSDGAEPPAPAPSTDSRPPTQTPQPASSGLDDLDLLGKILLQQSLPPESQQVRWEKQQPAPRLTLRDLQNQSSCSSPSSGATSLLHTVSPEPPAPPQQPTPTELSLANITVPLESIKPSSILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPTAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLIFTMGEQTYNEMGDVDQFPPPESWGSL	158749	134120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_135033_135122_135234_135444_135615_136724_136919_137441_137603_138134_138200_141639_141793_142449_142561_143542_143625_143702_143844_148834_148916_149610_149712_150136_150261_151212_151312_152279_152356_154922_155008_158693
613402	contig_10235_pilon	-	1130	5	Intergenic	novelGene_46480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	794	junction_4	781.958238974435	96	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	13	396	222843	220246	TRUE	30	TGAAAATTTAGTGGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYRGTQEGEGGAGKFWKRERLKKSKTEMVVGLRQGS	222855	217924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220481_220677_220788_222804
613413	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613421	contig_4845_pilon	+	1730	2	Intergenic	novelGene_53624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGGCTGGAGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220441	223439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_220462_221729
613437	SIRV6	+	398	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10426	2	1189	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11426	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
613449	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613450	contig_6412_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_149986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGAAACAAGAAGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652928	655017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_652900_655000
613460	SIRV6	+	1521	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	843	72	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2022_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
613461	contig_4442_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_127939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTAAGAGCTGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187237	187724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_187200_187700
613462	contig_10904_pilon	-	1580	6	Intergenic	novelGene_22747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_5	281.496287719749	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	347	1330	662171	652201	FALSE	15	CTACTGTTGTTGAATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662738	651950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662445_662665
613482	contig_14525_pilon	-	2740	8	Intergenic	novelGene_149774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	36.2862767110518	227	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	216	1205	187065	173288	TRUE	25	TGGTTCTGTAGATTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSEVLNIGKKLYEGKTKEVYELLDSPGKVLLQSKDQITAGNAARKNHLEGKAAISNKITSCIFQLLQEAGIKTAFTRKCGETAFIAPQCEMIPIEWVCRRIATGSFLKRNPGVKEGYKFYPPKVEMFFKDDANNDPQWSEEQLIAAKFCFAGLVIGQTEVDIMSHATQTVFEILEKSWLLQNCTLVDMKIEFGVDVTTKEIVLADVIDNDSWRLWPSGDRSQQKDKQSYRDLKEVTPEGLQMVKKNFEWVAERVELLLKSESQCRVVVLMGSTSDLGHCEKIKKACGNFGIPCELRVTSAHKGPDETLRIKAEYEGKLQRTRAFSDK	187280	167658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_167945_172038_173507_174605_174690_175360_175475_175577_175758_179338_179518_182727_182926_187049
613483	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCTGGCTCTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
613495	contig_9653_pilon	+	3030	1	Intergenic	novelGene_48201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGGTATTACATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181274	184304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_181300_184300
613496	contig_8538_pilon	+	174	1	Intergenic	novelGene_5104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842953	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_843000_843100
613505	contig_6589_pilon	+	1147	8	Intergenic	novelGene_26096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_4	2382.70637584017	59126	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	26	637	1876599	1880585	FALSE	30	TGTAAACAAGATTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876573	1881095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
613512	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_94810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
613515	contig_7869_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_149999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGATATACAATTCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96327	96812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_96300_96800
613526	contig_15063_pilon	+	1802	7	Intergenic	novelGene_13070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3782.04149751016	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	312	1547	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	33061	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_33179_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
613535	contig_18869_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_56049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73562	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
613538	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_16641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27858	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613547	contig_11816_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_98603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACTCGGCTGCTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444428	1445502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1444400_1445500
613548	contig_10311_pilon	+	2436	8	Intergenic	novelGene_50488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	70.236045167822	242	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	116	994	232199	245838	TRUE	30	GAAAGCTCTCTCTGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGVLLWVKAEPFIVGALQTPPPSKFSLHYLRKISAYVRTRATEGAYPRLYWSTWRHIACGKLQLAKELAWLYFEVFDSLVVRTPEERLEWSEVISNCTSEDEVEKQRNQLSVDTLQFLLFLYTQQLNKVSLRTSLIGEEWPSPRNRCQSPHVTEKSTCHDKNWNDYSHQAFVCDHLSDLLELLLEPEQLTTTFHSTHSSLVSREAVVALSFLIEGTVSRATKVYPFHELALWQPLHAESGFSKISKTFSFYKLEAWLRAHLTGNPFGTSACLKSGKKLAWAHQGCTAWW	229700	254958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_229773_232155_232535_238596_238753_242425_242793_245818_245951_246100_246599_251298_251451_254278
613550	SIRV7	-	275	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91636	15	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
613552	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_91655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
613563	contig_7457_pilon	-	1873	8	Intergenic	novelGene_31383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_7	54.3428270992857	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1216	1692	437993	437249	FALSE	40	TAGCTATAAATCAAGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	440631	437067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438030_438414_438566_438678_438766_438987_439115_439569_439651_439898
613568	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
613574	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
613581	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613582	contig_4754_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_35890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	3	344	90895	95236	FALSE	40	CTACAGAGTGAGAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGTHRSLGENEVSGCFVLGTRQVRLKKSHPRGKKERRSHHYKGRGARSRVSPLTWDPYAEKLLEPGDRECCSTKDGKKQWQRNSRSRGKRTRRLQETGRRPGGDRQETAQWASR	90892	95237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_90966_94965
613590	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
613595	contig_5063_pilon	+	772	4	Intergenic	novelGene_109984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	314.554711722248	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	55	480	9407	57319	FALSE	35	TCCAAATATATAATTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_35531_35646_57258
613600	contig_19769_pilon	+	1033	4	Intergenic	novelGene_102297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3673	junction_3	102.84076148212	102	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	544	999	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_88040_88841_88958_89163
613609	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	31	354	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613614	contig_14513_pilon	-	1026	4	Intergenic	novelGene_70376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1293.11518778835	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	198	566	18880	11982	TRUE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11380_11607_12158_13087_13136_18735
613615	contig_6710_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_93622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGAAGCACTTGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
613620	contig_6576_pilon	-	1552	10	Intergenic	novelGene_42274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	664.930479982589	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	553	1344	329191	322526	FALSE	10	TACTGTATGGCTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339557	322317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330845_330893_331028_331197_337921_338049_339396
613625	contig_6102_pilon	+	1726	4	Intergenic	novelGene_32219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894921	897369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895940_896211_896363_896629_896706_896888
613633	contig_15045_pilon	-	2531	3	Intergenic	novelGene_130064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	189	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	180	1130	166837	157201	FALSE	35	TTCATAAATGCACTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNAVVILAFVVDKKLRHRSNYFLLNLAISDFFVASVYNIVLISYDRYQLVLNAVSYRAKQTEILKIVALMVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKECEPGFFLVWYIIAITSFFEFLVPVISVAYFNMYMYWSLWKRGSLGRRQSHPGLNSPDSSNDCGHSFKCRPFSRTSLPELKETEVPLRSEKQRRKSSFLHSFRTQVNTCTIASKMCSFSHSHSVTHQREHLELLRAKKLAKSLAILVGVFAICWTPYSVSAIVLSDKHPKPYWYEIAFWLQWLNSFVNPFLYPLCHKRFQKAFLKIFCMKKKTILSQS	167016	155799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157987_164354_164414_166731
613635	contig_1735_pilon	+	1709	9	Intergenic	novelGene_106885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	619.715345440953	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	91	1503	126256	137692	TRUE	10	CAACCTGTCCGGCTCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGKQRSYVGNSSHSV	126165	139775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137649_137757_138447_138468_139653
613643	contig_11855_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_67073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATTCTAGACCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2059008	2057909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2057900_2059000
613644	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_95847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613649	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613650	contig_7870_pilon	-	834	2	Intergenic	novelGene_108981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACAATGAAAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411159	409351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_409501_410474
613654	contig_11338_pilon	-	1728	12	Intergenic	novelGene_6227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	99.9221184326379	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	932	1600	13877	12549	FALSE	30	TATGGAAACCTGACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21396	12420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_13964_14167_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
613655	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613670	contig_9727_pilon	+	1066	6	Intergenic	novelGene_86307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	160.403989975312	4122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	46	597	309192	314189	FALSE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308420	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078
613682	SIRV7	-	338	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	5	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114685
613683	contig_7182_pilon	-	1405	5	Intergenic	novelGene_117151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	2397.15529325907	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	356	1003	889318	887056	FALSE	25	AAAAGTTGCAGCTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889847	886653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_889506
613686	contig_14209_pilon	+	1697	12	Intergenic	novelGene_88319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	211.133305585056	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	68	1357	32366	40625	TRUE	20	ACTTAGGGGAGCCTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKLPFPYPDGFNSCPDICFRVADCSFLCHKAFFCSRSDYFRALLDDHFREKEEPEASGGLPTITLHDISPNIFTHVLYYMYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32298	41008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37205_37727_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
613690	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613699	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613702	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
613708	contig_12425_pilon	+	1428	8	Intergenic	novelGene_46641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	199.790911112756	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	603	1238	181735	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167099	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181687_181819_186767_186945_190682_190836_198178
613715	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
613720	SIRV6	+	243	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	61	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2750_2829_3106_3165_10721
613721	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
613725	contig_6726_pilon	+	1423	13	Intergenic	novelGene_86224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	554.111275427197	318	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	18	1280	287836	333034	FALSE	15	TCTTATTGTGAATTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSATQDSGFY	287818	333177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331614_333007
613726	contig_3588_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_72885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAGTGGTTCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123468	122829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_122800_123500
613743	contig_18671_pilon	-	2610	6	Intergenic	novelGene_150005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_5	70.8079091627482	267	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	279	584	153708	139175	FALSE	45	GAAATTTAATAGCAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIFMLHGVSQEDFLRKNQDKNVRDVIYDIASQAHLHLKHARSFQKSVPVKAFPAFLHTVALEDYLKKIQQVDFDIFHPTLQQKNTLLPLSLYIQSWRKRY	155154	137148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_-_139304_148261_148319_152874_152977_153690_153825_154870_154974_155095
613747	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613763	contig_7379_pilon	-	2537	11	Intergenic	novelGene_150025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	102.955524378248	110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2167	2481	542476	536814	FALSE	45	CTATAAATACATTTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	569932	536757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_546256_547847_548008_549695_549784_549955_550115_553209_553328_569829
613766	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_18844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613769	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613771	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
613786	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613802	contig_13093_pilon	+	2410	5	Intergenic	novelGene_105216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGTGGAGAAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55673	80572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_56394_59533_60770_77589_77721_80073_80122_80297
613807	contig_13894_pilon	+	1065	8	Intergenic	novelGene_62157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2179	junction_3	2050.74034416444	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	52	1014	522731	528117	FALSE	20	AGTGACACCTGCGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	522679	528168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
613808	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
613810	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
613820	contig_9243_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_60334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTCATACACATACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62719	62192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_62200_62700
613821	contig_5643_pilon	-	2027	7	Intergenic	novelGene_39170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	59.9295883145843	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	69	1451	784100	772569	TRUE	30	ATTCAAAATTGTGCGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVSQWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVENNMQQQSVCHGDSGSVYVVWDDCAHHWVATGIVSWGIGCGKGYDFYTKVLNYVDWIKRVMEGKD	784168	771724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_772063_772330_773342_775224_775288_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
613826	contig_18869_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_56216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
613847	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_97844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613852	SIRV4	+	257	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1514	632	1059	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
613869	contig_3424_pilon	+	2789	4	Intergenic	novelGene_55520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_1	61.9157133170212	372	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	243	695	237586	243935	FALSE	30	AAAACTTTGATCTGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENFDIEAPNYLSKESEILLYAKQDSQCVDCFQAFLPVHYRYHRPHSKDGETFIVVNNPDLLMYCDQEFPILKCWAQSEVAAPCALRNKDICQWKNMKYKSVYKNVTLQVPVGLTLHTSLVCSVTLLITVLCSTLILIAVFKYGHFSL	235083	246029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_235320_237579_237794_241360_241462_243791
613874	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
613878	contig_10134_pilon	-	2095	4	Intergenic	novelGene_16220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	2	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39678	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38768_39594
613887	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613890	contig_16211_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_150091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	76	366	187345	187635	NA	25	TCAAGTTGTGGTAATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNQLRGTLGERPGNLLLKKSATENSMQHSSTLDTLMVTMSQIDFMATGQLLERSFSVSILNIYKLPVNISLTKKAEAQHRSGFEMRPVHKHPHKTAPCQNTLCRTQLNAKHTSWAMSFITT	187269	187668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_187300_187700
613924	contig_5594_pilon	+	2166	11	Intergenic	novelGene_150112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	36.4775273284799	309	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	117	1055	21665	206933	FALSE	25	TGGAATCAGTTTGACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVVPVASFFYWVGAGTVAYLALRISYYLFTAFRVWGLGNETGVGPGLGEWAVVTGSTDGIGKSYAQELAKRGMKVLLISRSQDKLNQVSSEIREKFKVETRTIAVDFGSEDIYDRIKTGLAGLEIGVLVNNVGMSYEYPEYFLDIPDLDNTIRKLININVVSVCKMTRLVLPGMVERSKGVILNISSASAMYPVPMLTIYSATKAFVDFFSQCLHMEYKSKGIFVQSVLPFFVATKLAKIRKPTLDKPSSETYVKSAMKTIGLQSRTSGYLIHSLMASIISSLPSWIYLKMAMNLNKSTRARYMKKTKKN	21548	208044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_+_21825_87191_87239_89890_89967_143563_143672_160903_160969_161803_161849_183751_183787_192778_192861_194638_194705_206170_206321_206828
613933	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
613938	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
613944	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613945	contig_17427_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_30268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23487	21375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_21400_23500
613951	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
613956	contig_593_pilon	-	2097	6	Intergenic	novelGene_101969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.185178550408	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	116	553	118610	110358	FALSE	20	CTCATTGTGTTGCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSEIFVELQGFLAAEQDIREEIRKVVQSLEQTAREILTLLQGVHQGAGFQDIPKRCLKAREHFGTVKTHLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGIEPDREKGFHLDVEDYFRQEV	118725	108813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_110376_113045_113093_113732_113849_116125_116223_117343_117438_118544
613962	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
613967	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
613977	contig_8269_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_106227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACAAGAACGTGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273459	273215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_273200_273500
613980	contig_11328_pilon	+	926	6	Intergenic	novelGene_88397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2297.08453479623	840	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	40	417	643683	645256	TRUE	55	GTATACATGAAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGGEGYSRTD	643643	648131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645227_645376_647064_647223_647899
613989	SIRV4	+	1545	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	2	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	66	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGCTAGAAACAGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1347_1678_1882_2389
613999	contig_15185_pilon	-	1523	7	Intergenic	novelGene_99461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	354.585046999384	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	427	1170	435678	429911	TRUE	15	ACAGCCCCCTCCCTATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	436104	429509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_429591_429638_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509
614013	contig_5514_pilon	+	1360	7	Intergenic	novelGene_75281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	301.975164541722	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	69	1055	65296	68614	FALSE	15	TATGTGTCAGCATCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGLGALGTSEPLPQFVDPALVSSAPESGVFFPSGPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGGLKFDIGPTWYCPSLPRSGPRGAVRAC	61089	68919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354_68386_68528
614027	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
614032	SIRV7	-	251	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35824	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78914	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56100_70877_70988_78841
614034	contig_177_pilon	+	1914	3	Intergenic	novelGene_41817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	80	790	417672	419027	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIVVQKTCPWCPTLCPKLCQLLELGLSYHWAHSTLFSEIF	415651	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418267_418911
614042	contig_7234_pilon	-	1589	15	Intergenic	novelGene_145933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	182.090930973668	83	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	141	1025	510034	411977	FALSE	30	TAAATTGTGTCTGATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESRTLTVKEQNGNRLTVFLSFHGTITSQFAANQSLFSVLILRLQKLSYSPSMTMSV	587404	411412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_419812_419948_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
614080	contig_1546_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_150125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGAACATAATTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352284	351968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1546_pilon_-_352000_352300
614084	contig_16098_pilon	-	1433	9	Intergenic	novelGene_46126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	134	1228	458816	456273	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460260	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
614090	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4265	34	3090	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
614092	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614105	contig_6710_pilon	+	540	2	Intergenic	novelGene_97497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTCCAAGAGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653385	657515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
614109	contig_13780_pilon	-	2461	16	Intergenic	novelGene_149026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	306.225291066706	520	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	313	2142	515426	468957	FALSE	15	GCCTTCATGTGAGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDDESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASPAENDSGSSGLEDAGFN	544209	468637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482_469541_483206_483338_490695_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162_513394_515177_515440_543910
614110	contig_12638_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_33349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGCTCAGATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389717	1390607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1389700_1390600
614111	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
614114	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_91998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657185	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657186	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
614118	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614122	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614123	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
614127	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
614141	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
614145	contig_2646_pilon	-	1804	7	Intergenic	novelGene_69506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCTACCGGACGTGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574401	553997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_554188_566421_566584_567967_568156_569609_569726_570832_570914_572008_572054_573379
614156	contig_1948_pilon	-	1353	4	Intergenic	novelGene_31177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	286.591850702159	1912	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	81	551	552044	544410	FALSE	20	GAAGTGTATTCTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552124	543607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551992
614158	contig_3602_pilon	+	1359	7	Intergenic	novelGene_60514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	412	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	55	504	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161690	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170110_170935
614163	contig_3233_pilon	+	3427	1	Intergenic	novelGene_56616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	239	720	1813	2532	1019372	1020091	NA	55	ATCTAAGAAGTAAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEMVKNSNSLLTLDELIDQDDCISHSEPKDVTVLSVAEEQDLLKQERLVTVDEIGEVEELPLNESTDITFATLNTKGDEGNTVTDSIGFISSQMPEDPSALVTVDEIQDENSDLHLVTLDEVTEEDEDSLADFNNLKEELNFVTVDEVGEEEDGENDLNVELAQSKNDHPTGKKGDRKKRAVDTKKTKLALSQVGQVNENVKEEDLKAMIERHLAGRYLAVIIFLFFEGNTFKVNYKI	1017559	1020986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_1017600_1021000
614169	contig_7527_pilon	+	2215	5	Intergenic	novelGene_139569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	790	junction_2	582.273131786106	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	21	695	85507	94676	FALSE	70	ACTAAGAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRGRGMGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKVILRVLFPLLSNSHTSFGKALAVCFWGI	85486	96196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_85578_85690_85781_86443_86519_89859_90038_94415
614185	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	6	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
614186	contig_14441_pilon	+	1298	6	Intergenic	novelGene_100324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	387.049040820411	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	304	732	6011	116621	TRUE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTVLRRDQGLEPCPSPCRQPDQGEPAQGGRV	5707	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6940_116558_116712_116865_116963_117220_117344_117539
614202	contig_7816_pilon	-	1800	9	Intergenic	novelGene_66522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	72	419	211694	209366	TRUE	30	GGAAGACCGTCTGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKTYIYHSSQYIFEHLCQQLSGMCRIPTLHPIAPLGLGDQAPHGLHNGVLVNAKHLQQLIWLPASWYLADGQAGDSDARLAHDSTAHCLTYATFVIMVLHREDPALGGAGAVENEFSIQGLDGERIQHADVNLVFLQ	211765	192470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_193101_195816_195948_196742_196909_207502_207660_207802_207933_209064_209149_209282_209377_210625_210749_211480
614204	contig_2027_pilon	+	2133	14	Intergenic	novelGene_39951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	2	junction_7	93.7436388374444	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	214	1689	639829	648974	FALSE	5	GGCTTTTGCTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLLVLEVVVMEPTGGTPARLACPRGGSPHIPSHLQSSGSGSPWLMRRRKWKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRTQADELPACLLSAARLVP	638059	649418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643301_643448_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505_648641_648839
614206	contig_12566_pilon	+	2243	20	Intergenic	novelGene_86003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.419465392558	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	894	2111	63039	86354	FALSE	25	CTCTTTAGATTGTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENVRRTTSPSSTTQELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44361	86486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44421_47507_47552_50028_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56534_57040_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65201_69034_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
614212	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
614216	contig_17790_pilon	+	2538	7	Intergenic	novelGene_128480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_4	110.792097592242	997	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	126	1391	80375	129991	FALSE	20	TAGTATCTTTTTCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEARVKKMGLGHEQGFGAPCLKCKEKCEGFELHFWRKICRNCKCGQEEHDVLLSNEEDRKVGKLFEDTKYTTLIAKLKSDGIPMYKRNVMILTNPVATKKNISINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGSEGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELTPREVKEMEQFVKKYKNEALGVGDVKLPQEMDAQGPNRTYIPGGDRSTTAAVGAMEDKSAEHKRTQYFCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDKLWHPACFVCSACSELLVDMIYFWKNGKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQNWHLKHFCCFDCDNILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNSFSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKMMS	80249	131138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_80402_113272_113359_122633_122887_123770_124107_124999_125216_125625_125785_129802
614245	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614246	contig_15063_pilon	+	1205	5	Intergenic	novelGene_12303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1191	13	1203	28164	36442	FALSE	15	GATGCCCGAGCCTCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYYGMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTST	28151	36444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
614253	contig_610_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_76726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	1509.68341052023	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252613	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_221826_222063_252475
614256	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614258	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614269	contig_10235_pilon	-	2207	7	Intergenic	novelGene_46592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	40.8360543311096	237	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	582	1106	588881	587184	FALSE	5	TCTGGGCTCTTTATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLPGRCVPIAKRELLWAGSAGLACWLAGVIFIDRKRTGDAINVMSEVAQTLLTQDVRVWVFPEGTRNHNGSMLPFKRGAFHLAVQAQVPIVPIVMSSYQDFYCKKERRFTSGQCQVRVLPPVPTEGLIPDDVPALADRVRHSMLTVFREISTDGRGGGDYLKKPGGVAEARL	595808	586082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_587369_588247_588321_588449_588546_588710_588887_589221_589357_589564_589785_595587
614270	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614271	contig_12977_pilon	-	1649	7	Intergenic	novelGene_122810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	366.675151416982	1044	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	698	835	76232	68817	FALSE	30	CAAGTAGTTTTTAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAVARRGRALLRPGVYDGAGDCGVRRAGRAVRSPEAPSPLPPGSGAAGILCYVGAYVFITYDDYDHFFEDVYTLIPAVVIIAVGALLFIIGLIGCCATIRESRCGLATFVIILLLVFVTEVVVVVLGYVYRAKVENEVDRSIQKVYKTYNGTNPDAASRAIDYVQRQLHCCGIHNYSDWENTDWFKETKNQSVPLSCCRETASSCNGSLAHPSDLYAEGCEALVVKKLQEIMMHVIWAALAFAAIQLLGMLCACIVLCRRSRDPAYELLITGGTYA	94036	68002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_68910_76187_76272_76557_76711_77707_77810_79526_79602_79843_80036_93900
614274	contig_10217_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_87419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCTTGCACCTACTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118644	119185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_+_118600_119200
614278	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614289	contig_17680_pilon	-	2155	7	Intergenic	novelGene_150126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_6	128.568723516517	206	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	55	597	28724	19808	TRUE	10	GTGGTTGTCTCTTTAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSAGSNGPRHREAGGGRMVKLTAELIEQAAQYTNAVRDRELDLRGYKIPVIENLGATLDQFDAIDFSDNEIRKLDGFPLLRRLKTLLVNNNRVCRIGEGLDQSLPCLTELILTNNSLVELGDLDPLASLKSLTYLSILRNPVTNKKHYRLYVIYKVPQVRVLDFQKVKLKVSISIILLIGSCYGVVCFPLYFCTGFF	28778	9860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17680_pilon_-_10291_18023_18118_18773_19995_20302_20350_23410_23490_24125_24274_28642
614290	contig_3774_pilon	-	2004	9	Intergenic	novelGene_142049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	166	junction_7	125.900506353231	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	161	1066	210407	152032	FALSE	30	GTTAGCCATCAGAGAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLSWVVLLRRASCAGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRYGISKH	210567	151093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
614332	contig_13048_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_138941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTATACGTATTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520828	519574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_519600_520800
614341	contig_3151_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_139195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223544	226026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_223500_226000
614344	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_18757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
614346	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_18375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27903	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614349	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614351	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
614363	contig_12837_pilon	+	2718	11	Intergenic	novelGene_57357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	70.1259581039717	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	244	1098	285290	338988	TRUE	40	CAAGTTGCTATAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALRVWGGGIYEQDEFYELCDQLGIMIWQDFMFACALYPTDRSFMDSVSAEVAYQIRRLKSHPSIIIWSGNNENEAALMTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVTQAQCVKIETEFYRRSRSEVWRKVENASLLCSAFLCCTVASGL	267003	353574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_267058_282716_282869_285252_285371_286821_286909_289906_290075_302652_302872_310874_311040_329876_329936_338912_339056_339886_340145_352279
614364	contig_10437_pilon	-	1609	7	Intergenic	novelGene_38257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	554	1099	407733	401416	TRUE	5	GTCTCCTGGCCCTGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGWDAGGWLESHPGEAGQVGNATGAVLIPGHEDIAFVSPVFSPAVFNYPVLVPLLGPVPHCQNRVVQVIAIASFIVIHTSAVKLEGGQACINGHRDGAHSGHCPLQRFLIAHRDLSVASAFSRLACRAVHTIFILSHVRVGIFRVDAPVLLHILKGIGHIAPSAAIILRHTIHQVLGTQI	408286	396453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_396605_397109_397234_398842_398993_401330_401554_405376_405544_405814_405921_407598
614367	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
614386	contig_513_pilon	+	2375	9	Intergenic	novelGene_80162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCAACGAGGGCGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448993	454710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_450360_450615_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451777_452193_452363_453008_453114_453310_453439_454590
614387	SIRV4	+	219	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1097	0	-1097	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGTGTGGTTTCGGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
614425	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614439	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	430	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
614452	contig_14666_pilon	+	1673	5	Intergenic	novelGene_39581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	86	1441	477340	484940	TRUE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484944_485002
614453	contig_6375_pilon	-	1969	14	Intergenic	novelGene_73003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36.9562351114053	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	25	1581	334545	327598	FALSE	10	CCCCACTGCCCGCTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGGAGGSRVSSGRDLNCVPEIADTLGAVARQGFDFLCMPVFHPRFKREFTQEPAKNRPGPQTRSDLLLSGRDWNTLIVGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVTLENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKGMFSWFPILFPIKQPITVREGQTICVRFWRCSNSKKVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGRSYTIGL	334569	327209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328761_330332_330509_330594_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302_333389_333701_333821_334444
614473	contig_12270_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_114071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13875	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
614505	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	640	1118	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCGTCTTCTTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
614509	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_90375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614513	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614514	contig_4301_pilon	-	2239	6	Intergenic	novelGene_65119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_3	297.914350107543	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	158	760	551260	539500	FALSE	25	AGTAACGCTATTGTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNEMD	575632	538020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_547294_547521_551248_551329_575543
614517	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614518	contig_15720_pilon	-	930	7	Intergenic	novelGene_41924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_5	1103.38398675267	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	104	928	283894	279068	FALSE	30	CACCAGTAGCAAGGCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVI	283997	279065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
614519	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
614529	contig_15459_pilon	-	2842	3	Intergenic	novelGene_106376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	83	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACTTTGGCTGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19520	15506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_17791
614549	contig_2027_pilon	+	2385	16	Intergenic	novelGene_39944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	89.8434688159851	352	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	237	1946	639829	648974	FALSE	0	TGCTGGGCTTTTGCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLTAQSFSTDAAGTRGGGDGAHRRNPSPASMSSGRKSPHSKSPSEQRERKSLADEKKKVQKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVAQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRTQADELPACLLSAARLVP	638036	649413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643195_643224_643301_643448_643530_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505_648641_648839
614552	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
614572	contig_4924_pilon	+	2173	2	Intergenic	novelGene_84727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120526	122751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_121417_121468
614583	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_90577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
614586	contig_16098_pilon	-	1442	9	Intergenic	novelGene_46086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	138	1232	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460264	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
614599	contig_13542_pilon	+	1359	10	Intergenic	novelGene_131488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1003.03747329774	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	99	917	346638	505589	TRUE	25	ACAGTAAGCATCGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346539	506339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501_505952_506259
614608	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614610	contig_12427_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_40476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2831.54402324166	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	54	506	315977	314393	FALSE	25	TAACATCTGTATCAGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	316030	313949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315937
614616	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
614631	SIRV6	+	315	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10510	1	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11510	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
614634	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614635	contig_7202_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_18519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
614636	contig_7342_pilon	-	2186	15	Intergenic	novelGene_71209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.130374854034	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	99	2186	716514	679923	FALSE	20	CCCTTTACTTAAAGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPVEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSGEDDSDTKRLSKEEKGRSSCGRNFWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGRMISVEKAKNEPAGKKTSDKRESEGKKDKSSNSDRSAHLKRDDKADRKDDAKKGEDGSGEKGKDPDGQKSGPSERSRTTKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSGSKERASKSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPRKSRLEGTDLTKPASLAATNAFQPCVPALWPPESVLLGILLNCVKINFFFICCHTVAQYNVNLGFCFLFWFFVINVFLFT	716612	679922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_680155_688403_688493_690313_690403_690585_690726_691085_691169_691266_691417_693321_693417_694223_694274_694924_695445_696385_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
614640	contig_10436_pilon	-	1529	3	Intergenic	novelGene_108479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3268	junction_2	1395	1123	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	111	407	103480	102527	FALSE	30	TTCGATGGAATGGAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQVW	103590	101404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102655_102788_102868_103390
614655	contig_14322_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_116410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671628	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
614680	contig_9083_pilon	-	2265	2	Intergenic	novelGene_150130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTGGTCTCTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042405	1039101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_-_1041328_1042366
614693	contig_6410_pilon	+	2004	8	Intergenic	novelGene_108618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	122.460155952532	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	132	680	300693	313081	TRUE	35	GCACATCATTACATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVPQMVTVGFTPTGSSRTVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299800	314629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306345_306397_306809_306947_310261_310369_312966_314117_314340
614697	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
614701	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
614733	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
614745	contig_11677_pilon	+	2332	12	Intergenic	novelGene_85899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	97.4204485806388	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	307	1362	465595	468297	TRUE	5	CCCCTGCATTGTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKELLAVACEQFLGKNVQDIKNVVLQTLEGHLRSILGTLTVEQIYQDRDQFAKLVREVAAPDVGRMGIEILSFTIKDVYDKVDYLSSLGKTQTAVVQRDADIGVAEAERDAGIREAECKKEMLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVHRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKGEAERMKLKAEAYRKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIASPLTKVDEIVVLSGDNSKVASEVNRLLAELPACVHALTGVDLSKIPLIQKATGAQV	452041	469549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_452165_458896_458979_464465_464558_465585_465710_466156_466276_466393_466508_466607_466728_466816_467032_467449_467634_467997_468148_468258_468579_468860
614750	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_96030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653781	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614753	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
614762	contig_6102_pilon	+	2706	24	Intergenic	novelGene_31734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_15	146.724076522498	425	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	243	2447	216236	228987	FALSE	20	CACTAGGCTATCTGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQNLGKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFHIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	210253	229246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_227023_227264_227330_227565_227657_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
614774	contig_5643_pilon	-	2071	11	Intergenic	novelGene_38716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	261.809186240667	10	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	218	1528	48733	31788	FALSE	10	CTCTGCTCCTGGAGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPTVPGLLPPLVLLALLVGIYPSGVIGLVPHLGDREKRDNLCPQGKYNHPQNNSICCTKCHKGTYRYNDCPGPGLDTDCRECETGTFTASENHVGQCFSCSKCRKEMDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	48950	31244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32408_32458_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461_37616_48694
614793	contig_9177_pilon	+	1715	3	Intergenic	novelGene_32673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	315	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTTATGTAATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395337	416869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_415315
614807	contig_10134_pilon	-	2346	5	Intergenic	novelGene_16235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	713.292147370206	1	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39729	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_37632_37774_38558_38817_39584
614843	contig_12644_pilon	+	976	7	Intergenic	novelGene_44654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5287.03311308799	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	200	886	2679113	2680545	FALSE	15	TGTGTTGGAGTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677366_2679106_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
614846	contig_6710_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_90676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCATCAGCCCCTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
614848	contig_10134_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_16191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33732	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32200_33700
614858	contig_19459_pilon	-	673	3	Intergenic	novelGene_59845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11044	junction_2	7997	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	10331	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	10333	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268
614861	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_17842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614862	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_114014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
614877	contig_3095_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_75036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	103	828	147280	151151	TRUE	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151904
614880	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
614889	contig_11171_pilon	+	1467	9	Intergenic	novelGene_48606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	589.917247904314	8	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	792	1250	246411	251735	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYNSLYLQVPMQGTCSAVTLRSTHASRAKPTTCPSRGAPSPRRDCTDLKMKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212201	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_223862_224016_235063_235171_235212_235394_236868_236982_239236_239336_246290_246455_249980_250068_251407
614894	contig_15327_pilon	-	1620	7	Intergenic	novelGene_70719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	290.225630616365	178	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	22	618	967479	960518	FALSE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQAYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967500	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961542_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
614902	SIRV4	-	341	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAACAACGATTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
614908	contig_12644_pilon	-	1039	8	Intergenic	novelGene_44663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGGAAAAGGAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680633	2675483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2675528_2677222_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678783_2679891_2679961_2680105_2680227_2680309
614916	contig_6589_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_25887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTGGATATATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144169	1145089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1144200_1145100
614918	contig_6589_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_25888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACATCCCCTGAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145789	1146959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1145800_1147000
614927	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
614941	contig_16595_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_150142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTACCTTCCCCTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202934	203622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_202900_203600
614948	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_18408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614960	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
614965	contig_14322_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_115683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCGGCTGTGGGGAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671270	671655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671300_671700
614968	contig_5145_pilon	+	1692	4	Intergenic	novelGene_131375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	76.3165920506296	562	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	380	817	553862	554299	FALSE	20	GCAAGTATGGTTTTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLRSSVPDYFKNVFGTFRQPAQKVQVCGGWNNVLQDASGFPAMPFLSFRFVSKILSLRPLNWNAVHLRSVRSCDKITSLVDEKNILDCFIALESLFQQAFTRYLFLDIFLFLFNNHLFVYNCTGVFVIFTWGSEQIAWHVSVT	544000	555174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_544181_544683_544740_550233_550325_553809
614985	SIRV7	-	395	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33174	0	-45	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114783	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
614988	contig_14322_pilon	-	327	2	Intergenic	novelGene_116336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671846	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
614994	contig_9609_pilon	-	1923	9	Intergenic	novelGene_23140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	112.911954083702	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	869	1819	523112	520853	FALSE	50	AAATAAATTAATTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523980	520748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521439_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
614998	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615000	contig_9653_pilon	+	3062	1	Intergenic	novelGene_48315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	90	398	1012244	1012552	NA	70	AAAAAAGAAAAAAACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRHSGCNNGLKIPMITRMAQDGTMFCSVVHRVAMSQNQLDSTQQQQQQCTSEGRIKTFSDCYLLSVLLRELLEDVFHDKGVSQESKDMQCKKQDVAQACLG	1012154	1015216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1012200_1015200
615001	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_12072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	54	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	218	1393	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27151	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
615012	contig_10103_pilon	-	3041	11	Intergenic	novelGene_86146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	27	junction_10	29.0945011986801	89	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	227	1609	475881	441475	FALSE	40	GGTATACATGTATTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRSRLRSGRRRSLAFSRRFTVQCGRQAGELWSQSAVLLRLLLLRSAFFAALRASLSAGSGRSGFVRLSYDEAFAMANDPLEGFHEVNLASPTSPDLLGVYESGTQEKTTSPSVIYRPHPSALCSAPVQANALDVSDLPTQPVYSSPRRLNCAEISSISVHVTDPAPCSTSGATAGLTKLTTRKDNCNAEREFLQGATITEACDGSDDIFGLSTDSLSRLRSPSVLEVREKGYERLKEELAKAQRELKLKDEECERLSKVRDQLGQELEELTASLFEEAHKMVREANVKQATAEKQLKEAQGKIDVLQAEVAALKTLVLSSSPTSPTREPLPGGKTPFKKGHSRNKSTSSAMSGSHQDLSVIQPIVKDCKEAELSLYNEFRSWKDDPTMDRTCPFLDKIYQEDIFPCLTFSKSELASAVLEAVENNTLSIEPVGLQPIRFVKASAVECGGPKKCALTGQSKSCKHRIKLGDSSNYYYISPFCRYRITSVCNFFTYIRYIQQGLVKQQDVDQMFWEVMQLRKEMSLAKLGYFKEEL	484870	440042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_441558_444375_444446_444530_444631_448235_448349_449627_449757_452760_452965_453612_453691_460366_460463_474368_474628_475630_475907_484669
615013	SIRV7	-	303	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91623	0	-91617	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAGTAGAGTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
615024	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615048	contig_16846_pilon	-	1198	4	Intergenic	novelGene_82985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	61	579	555239	551492	FALSE	15	GCTGAGCACTACTTCGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558710	550872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
615060	contig_19577_pilon	-	3139	8	Intergenic	novelGene_119840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.4470313714127	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	28	936	60130	40657	TRUE	30	ACTTATTTTAATGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLSTLFCLGLCLRQAIQTRQVPLPKPSLQASPSALVPLKKSVVIQCQGPPGVDLYRLEKLKPRSYEDQAVLSIPVMKESFAGQYRCSYQNGTLWSPPSDLLDLVATGVFSKPSLSAWPSSAVSPGGDVTLSCQAQYGFDRFALHKEGDPGPSKSPERWYQAEFPIITVTAAHSGTYRCYSFSSSSPYLWSHPSDPLELVVTGTSVTPSWLSAEPSSFVSGTSKNTVFSTESGSPTGPPHQHYTEANLVRICLGAVILVLLVGILAEDWHSRKKLLVHRVRAVQRPLPPLLQTQKLHQSG	60157	38414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_39405_39443_40851_41350_41399_46577_46632_51818_52104_54854_55113_55259_55296_60096
615106	contig_2730_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_135376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAGAAAAATACTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312343	312675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_312300_312700
615115	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615127	contig_14322_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_116567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACAGCAGCGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
615144	contig_401_pilon	+	1920	3	Intergenic	novelGene_42878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	14	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACATTTCTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764245	1768470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1764745_1765957_1765997_1767088
615152	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615158	contig_20199_pilon	-	938	4	Intergenic	novelGene_82551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.835978296108	53	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	182	484	43987	41171	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44168	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40777_40846_41250_41934_42078_43906
615172	contig_12080_pilon	-	1912	15	Intergenic	novelGene_128379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_7	206.217984528162	381	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	54	1340	177526	166885	FALSE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPTCIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTVRNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQNSRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPSDLLTYDRTDEADAEERGPEENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI	177579	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_170834_171180_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
615175	contig_7744_pilon	+	2131	17	Intergenic	novelGene_62555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_16	196.713624337513	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	919	1596	887347	890685	FALSE	20	TGCTAAAAGCGTCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPSPVSLSSSPPG	879811	891220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890650
615177	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	74	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
615180	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
615187	contig_9345_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_24454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATTTAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449797	452335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_449800_452300
615197	SIRV7	-	441	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-82	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114820	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78973_114680
615202	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
615208	contig_401_pilon	-	1380	6	Intergenic	novelGene_42773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	615.881352209985	7444	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGGGTGTGTGTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086629	1078895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1081766_1081895_1081983_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
615214	contig_151_pilon	+	2688	5	Intergenic	novelGene_132562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTGGCCCCGTGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168025	208436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_170122_172695_172827_174439_174526_203457_203678_208281
615215	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615223	contig_18055_pilon	+	1939	12	Intergenic	novelGene_117820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	457.913918793471	3	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	609	1043	78006	80793	TRUE	55	TTTAGAAAAGGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40694	85620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75334_77932_78311_80663_81263_82117_82236_83360_83470_84605_84757_85571
615224	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
615225	contig_3797_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_120117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCAGTTCTACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568034	566630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_566600_568000
615227	contig_18916_pilon	-	2625	1	Intergenic	novelGene_136880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53585	50960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_51000_53600
615228	contig_9848_pilon	-	1509	12	Intergenic	novelGene_79947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	544.211371186716	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	80	595	110549	104044	TRUE	5	AGTCGTTCTCCTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALRAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	113899	98494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110506_110570_113840
615231	contig_7119_pilon	-	1264	5	Intergenic	novelGene_41001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_4	315.700312796804	2508	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	77	580	196804	188651	FALSE	20	TGAATCCTGAAGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196880	187966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196690
615237	contig_7230_pilon	-	1807	11	Intergenic	novelGene_52521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	109.610036036852	4	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	480	1580	43537	15131	FALSE	30	TTTCCGTGAAATCTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIDTSWQCLEYYAGLAGSMAGEHILLSGGSFGYTRREPLGVCVGIGAWNYPFQIACWKSAPALACGNAMIFKPSPFTPVSALLLAEIYTEAGVPSGLFSVVQGGAATGQFLCQHPDVAKVSFTGSVPTGTKIMEMAAKGIKPVTLELGGKSPLIIFSDCVMENAVKGALMANFLTQEEVVKQTQKIKIGDPLLEDTRMGPLINRPHLERVLGFVKLAEEQGAKVLCGGDLYEPEDPKLKGGYYMRPCVLTNCRDDMTCVKEEIFGPVMSILSFDTEAEVLQRANDTTFGLAAGVFTRDIQRAHRVVAELQAGMCFINNYNVSPVELPFGGYKKSGFGRENGRVTIEYYSQLKTVCVQMGDMESAF	67774	14903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_15226_17154_17268_20205_20348_23126_23215_23458_23590_28173_28310_28991_29189_32632_32768_43473_43605_65630_65777_67508
615239	SIRV7	-	229	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69055	2	35836	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
615242	contig_16098_pilon	-	1428	9	Intergenic	novelGene_46107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1842.43734204857	5	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	135	1220	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTCSAGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALVRILACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460261	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456361_456451_456670_456843_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
615247	SIRV4	-	326	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTACATGAACAACGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	2434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
615270	contig_13481_pilon	+	2318	6	Intergenic	novelGene_119557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	526.909631720659	339	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	107	757	1568681	1586220	TRUE	20	TATTCCTTATGTTGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRHLKLGARVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568574	1587830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080_1587560_1587608
615271	contig_2903_pilon	+	1857	7	Intergenic	novelGene_148987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	486	junction_1	155.439609566617	87	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	135	569	221148	238492	FALSE	40	ACTACAGAGTATATTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKGKGGKNRRRGKNENESEKRELVFKEDGQEYAQVIKMLGNGRLEAMCFDGVKRLCHIRGKLRKKVWINTSDIILVGLRDYQDNKADVILKYNADEARSLKAYGELPEHAKINETDTFGPGDDDEIQFDDIGDDDEDIDDI	221013	239780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_221164_228693_228778_231689_231794_233695_233747_235105_235188_236334_236427_238486
615274	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
615292	contig_7963_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_58509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	127.92271972649	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	19	864	145910	149613	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSGGTSGHWEGVDEPWVLDTMLHV	145891	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149419
615304	contig_5643_pilon	+	1948	7	Intergenic	novelGene_38753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	163.954939609096	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	472	1440	159302	163341	FALSE	20	CAGAAGCAGCCCTGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157284	163849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_157451_158841_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297
615309	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615315	contig_12425_pilon	-	2051	10	Intergenic	novelGene_46689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	687.426117242185	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	318	1109	209477	204225	FALSE	25	CAACTTGAAATTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226597	203282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209495_210319_210389_211048_211200_226517
615319	contig_15063_pilon	+	1184	4	Intergenic	novelGene_13963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	197	1183	34808	36475	FALSE	30	TCACCTACAGCATCCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFY	34611	36476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
615327	contig_9177_pilon	+	1299	6	Intergenic	novelGene_32668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	834.632757564667	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	68	484	395377	415476	TRUE	25	GTAATATCTTCCTCCAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERRGAGIELSLSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395309	416879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405526_405933_406017_407998_408077_415315_416123_416710
615329	contig_4131_pilon	+	2709	2	Intergenic	novelGene_127832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	54	junction_1	0	95	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1775	2317	87286	87828	FALSE	45	TTGGAGGGAAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKVSMGARKARQGLVSCCSSRPEIVQSETQDYDPEMQLSLCHSSEK	85350	88220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607
615337	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
615361	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
615366	contig_7457_pilon	+	2554	11	Intergenic	novelGene_31312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_10	57.1310773572493	32	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	38	808	183157	189512	TRUE	20	CTTCATGTTGTATAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183119	193606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189537_189996_190064_190243_190336_190768_190824_192098
615372	contig_16846_pilon	-	1360	4	Intergenic	novelGene_82960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1375.12528722133	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	99	530	555239	551692	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGRHPGWKPEHPELAGQGVGVLTATQPKP	558748	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551747_552630_552824_555055_555278_558688
615381	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615387	contig_7019_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_149468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTGTACCACCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175630	1173751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1173800_1175600
615398	contig_2798_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_120061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATATATATATTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182979	180797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_180800_183000
615408	contig_1813_pilon	-	2323	10	Intergenic	novelGene_105474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	908	1210	155314	155012	TRUE	25	GAACGCGGAAGAGGCGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPLEKAFSSRTLGNWGTGWEPQGLCGGEGLNGTAQQVPQLALQTLTSQLSGGYTWTDLGPRRGDCVGHLHGSECCGCRAQSRICTAACLGQGPPAGQA	156221	102751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_102828_113653_113836_128310_128371_141523_141602_144963_145020_147587_147685_149920_150117_152057_152224_153456_153500_154852
615412	contig_10923_pilon	+	1740	11	Intergenic	novelGene_66175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	919.338354470214	2	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	54	974	21667	36616	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKDIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLFTPWMVPSVHLRRCVMWPTSTGPSPLWMRSML	13825	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29354_29572_30133_30319_32870_32980_33028_33051_36532_36698_37270_37544_38609_38742_42554
615415	contig_5988_pilon	+	1317	3	Intergenic	novelGene_16016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	214	1202	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	102	1199	779480	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779378	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783508_785922
615424	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
615441	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615467	scaffold_12124_pilon	+	2279	11	Intergenic	novelGene_22009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	152.418502813799	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	171	890	800112	807554	TRUE	35	AGCCTAGATCCTCCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791889	815393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808331_808432_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
615482	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
615485	contig_7176_pilon	-	2067	8	Intergenic	novelGene_107873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	18.6449095750348	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	81	1055	676513	646777	FALSE	5	CCCTTGTCACTGGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAAAVRFRALPTRSVLLADLLPVCRTMDAPKQVVNFGPGPAKLPHSVLLEIQKELLDYRGVGISVLEMSHRSSDFAKIINTTENLVRELLAVPDNYKVIFVQGGGSGQFSAVPLNLIGLKAGRCADYVVTGAWSAKAAEEAKKFGTVNIVHPKLGSYTKIPDPSTWNLNLDASYVYYCANETVHGVEFDFIPDVKGAVLVCDMSSNFLSKPVDVSKFGVIFAGAQKNAGSAGVTVVIIRDDLLGFALRECPSILEYKVQAGNNSLYNTPPCFSIYVMGVVLEWVKNNGGATAMEKLNSIKSQMIYDVIDNSQGFYVSVGGIRASLYNAVTIEDAQKLADFMKNFLEMHQL	676593	645764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_646883_654519_654649_662044_662215_665198_665372_666207_666414_669908_669979_673814_673876_676453
615497	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
615498	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_19066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
615501	SIRV4	+	330	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	632	986	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
615510	contig_14353_pilon	-	2085	10	Intergenic	novelGene_82092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	526.694889070361	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	510	980	83931	80179	FALSE	35	AATCAAAGTATGGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLRLQLPKSYLPMRGAQLGALCAG	104407	79073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80253_80549_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_86233_86354_88547_88750_90961_91054_104333
615513	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615518	contig_13625_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_150148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTGTTGAGACTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12834	12108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_12100_12800
615536	contig_10494_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_102230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTGACGGTATAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1262981	1262076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1262100_1263000
615538	contig_15063_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_13649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	15	TATACTGCGTTCTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
615547	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_113582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	11	346	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14419	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615550	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
615553	contig_7253_pilon	+	2773	7	Intergenic	novelGene_140206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	55.7596528763306	145	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	410	961	201721	215768	FALSE	30	CACAATAATTTTTCCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESMELEALRSIYEGDESFRELSPVSFQYRIGENGDPKAFLIEISWTETYPQTPPIISMNAFFNNTISSAVKQSILAKLQEAVEVNLGTAMTYTLFEYAKDNKERFMENHHPINSTTSISNIISVETPNIGPSSKKKDKKEQLSKAQKRKLADKTDHKGELPRGWNWVDVVKLSKTGSKDDE	201311	217580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_201733_204133_204215_207379_207490_207570_207719_209612_209731_212355_212406_215735
615555	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615556	contig_3948_pilon	-	2550	17	Intergenic	novelGene_53359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	306.716576979057	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	797	2242	1776789	1747471	FALSE	25	GAGATTGGGTTTAAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSRNLLWQLVKKSVSQVTKSVDFHFCTDERIKHHKNQEYKEVNFTSELRKHPPSPARVTKGGCTIIKPFNLSQGKKRTFDETASTYVPLAQQVEAFHKQTPSRYHLRSKKDDIGLLPSKSAVAKICRDPQTPVLQTKQRTRPVTYKSAADQEAELLEKLQQYKFKAQELDPRILEGGPILPKKPPVKPPTQPIGFDLEIEKRIQERELKKKPEEEHFEFHSRPCPTKILEDVVGVPEKKVLPITVPKSPAFALKNRVRVFSKEEEEEEEPVMIKAQPVPHYGVPFKPQIPEARTLEVCPFSFDSRDKERQLQKEKKIKELQKEEMPKFKALPLPHFDTINLPEKKVKSATQIEPFCLETDRRGALKTQTWKHQLEEELKQQKEAACFKARPNTVISQDPFVPKKEKKLVAVQEPFQLATEKRAQERQELEKKMAEIEAQKAQRLEEIKQQEEEQEKEELAQLRKELVTGQHVLSQVTSL	1805281	1747162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1747496_1749472_1749657_1750365_1750478_1755092_1755240_1755628_1755806_1757607_1757704_1770456_1770674_1771185_1771328_1774315_1774491_1775519_1775666_1776764_1776876_1778343_1778446_1779326_1779450_1785358_1785486_1789686_1789810_1792579_1792755_1805221
615583	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615585	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
615592	contig_1596_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_131583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTATACCTCAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74987	77447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_75000_77400
615605	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615606	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
615608	contig_8317_pilon	+	439	2	Intergenic	novelGene_19364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16243	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
615620	contig_14322_pilon	+	351	2	Intergenic	novelGene_116342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	108	243	350	671606	671869	FALSE	25	TGCTCCTCGGCAAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVE	671363	671870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
615630	contig_9799_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_145573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	16	417	1126330	1126731	NA	15	GTGTTCTGTGCTTAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYGVSMSWGPTRWQVKTSSLQILTFRFFCLLSPLVLGAIKFSTVESRHTGLMRAGWQRGRGWLETADCAVEIGSPASPSLLLIPNERNLRTHLISLTLASTTQQHMVVFPCLPVVGVIGGQNDSYHRITLALNSDLQQ	1126314	1127356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1126300_1127400
615643	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
615649	SIRV4	+	282	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1489	632	1034	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2489	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
615659	contig_11115_pilon	+	1829	9	Intergenic	novelGene_102809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.77753065112	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	170	1705	165608	173204	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSLQAQCARRDPIPRQVIPQWHLPLSGRQLAGHDHRGGGDGSSGLERPLRHHHHGGVSGLGPGDYYSSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	165320	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165436_165553_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172770_172834_172964_173047
615660	contig_10436_pilon	-	1472	2	Intergenic	novelGene_108499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3268	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	115	387	103480	102685	FALSE	20	AGCTGAACTGATTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTGGNLTQDPRLFPVGGSATSVGGGATYKLLLREHL	103594	101599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102868_103390
615677	contig_2078_pilon	-	1733	4	Intergenic	novelGene_100194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	55.4496768851421	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1143	589	1731	532773	521686	FALSE	5	TGGGTGTCTACCTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISQGHLLRISPLSRARKNWVLGPCANVGYNIFRQVQSCSSSLLGRNENWKKEAVGDKLNVFLHLFAGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQGIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKS	533361	521683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_521793_529455_529735_530102_530388_532301
615695	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
615698	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	34	3078	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
615702	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
615703	contig_2204_pilon	+	1666	5	Intergenic	novelGene_71656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	187.553992226239	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	30	584	13204	50123	FALSE	35	GTTAAATTTTTAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKKANLPIVCPAMKRAPRGGPTGGRGTSKANSISATWGHEAPTCCPAWQRLSLPISLIFRSPSKRRAVRCLTTAPGPLLQIFPSLPL	13174	51205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_48669_48717_49912
615710	contig_7285_pilon	-	1596	7	Intergenic	novelGene_143413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_6	48.6326936215638	3046	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	402	815	370123	356156	FALSE	15	GCTATACCCAGTCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAATGHKVALVDQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	380010	355374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
615711	contig_6795_pilon	-	2105	14	Intergenic	novelGene_27764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_11	40.9987732534039	325	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	547	1398	493668	483470	FALSE	15	GCTGGTACTTTTGCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVCHRIHRSLASQFKYALVWGTSTKYSPQRVGLTHTMEHEDVIQIVKK	504874	482762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_496920_497165_499670_499832_504751
615715	contig_13428_pilon	-	1990	2	Intergenic	novelGene_143456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	306	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	476	877	152370	151969	FALSE	30	GATGTTAAGTTTTGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILDFVPGDTDDTPGKSPSTRRMLEGHSGEMLVFIAIVLPEAHCQGASPVHFPRPRSSPLISGCVISPPAPEPLCSCRWPWRCLHTCSGSPGWATSLQASGSCRDCCCPNFTCSFPSNCQKSWAVLPVRAGS	157496	150855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_152685_157335
615727	scaffold_7386_pilon	-	2015	11	Intergenic	novelGene_136589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	70.0159981718464	334	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	53	1138	309042	297870	TRUE	15	CAAGGGAGCCTCTCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHAAAAAAGWLVSKEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKPPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEDLRLLHFSLFILIHHSQHPASPEADPARAF	309094	296514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_297890_298259_298333_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308864
615730	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
615734	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
615735	contig_15063_pilon	-	1559	5	Intergenic	novelGene_9035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTGCCATGTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	27126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34607_34924_35035_35378_35836_36156_36264
615743	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
615750	contig_14925_pilon	-	999	5	Intergenic	novelGene_55122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83759	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_83708
615758	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
615762	contig_5999_pilon	+	1302	2	Intergenic	novelGene_45655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTCGATCCTATAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273174	274540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_274392_274455
615772	SIRV4	+	191	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1580	632	1125	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2580	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
615773	contig_14322_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_116469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671373	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
615775	contig_4364_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	81	404	1530895	1531297	FALSE	30	CCCCTGAATCCCAAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEA	1530444	1531297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
615780	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615782	contig_18231_pilon	+	1981	9	Intergenic	novelGene_105880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	1616	1981	258743	277166	FALSE	55	AATCGCCTTTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFSHKVFNSIRTCSSTPSSRNMSLTSLMTSSITDLYNLGTVFVFAEFAISTHNTNKRGGNPEKQDKNKTKREKTKPKHPEGDRSHRTIGEKFLKSDPEGVERRAVRGGGGNTPPGAKNLE	231692	277166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_232441_238281_238367_246668_246987_249439_249577_250801_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_276922
615789	contig_10074_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_57152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATCAGTCTATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481509	483136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_481500_483100
615797	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	349	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
615808	contig_13740_pilon	+	1275	10	Intergenic	novelGene_34695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	913	1269	160875	161933	FALSE	20	CCCATTGCTCATAGTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGMVFLQYNFIHGIMVIKSNKAKASFLSRLPISNYLNGINFSIFLEIISKMMFLSIFFNSTNKQLLHSYVSAWLSRFLSCYSTFWLNHSPINGMGSCSHILLIFCLQDPSLPHSL	156813	161939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157299_157451_157534_158265_158393_160070_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161269_161573_161641_161684_161719_161916
615815	SIRV4	+	184	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1587	632	1132	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
615822	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
615824	contig_3095_pilon	+	1086	5	Intergenic	novelGene_74978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	108	833	147280	151151	TRUE	20	ACCCCCATGCAATGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	152090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
615839	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91674	0	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
615840	SIRV7	-	411	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-67	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114805	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114687
615851	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
615857	contig_9833_pilon	+	959	5	Intergenic	novelGene_68560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.200227926814	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	135	431	251875	254740	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	251136	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254901_259969
615861	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
615868	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_93501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
615870	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
615884	contig_10235_pilon	+	2184	5	Intergenic	novelGene_46450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_3	71.2618411213182	2	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	489	638	211879	212152	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210733	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
615891	contig_14441_pilon	+	1515	3	Intergenic	novelGene_100704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	756.5	4	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	920	1279	116876	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMVRRAKKES	115956	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117097_117356_117545
615902	contig_3747_pilon	+	1407	2	Intergenic	novelGene_24951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10121	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	87	608	202819	203441	FALSE	65	GAAAATGAAAAATATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTILSSNKSSSFLLLGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGEPDLMPFLPHSACCLGL	202732	204240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203128_203228
615903	contig_3747_pilon	+	921	2	Intergenic	novelGene_24966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204188	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204299_204395
615917	contig_16098_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_46191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTTTTTCCTCCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684937	686232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_684900_686200
615918	contig_15031_pilon	-	2896	1	Intergenic	novelGene_138417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACTTAACAAATGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138768	135872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_135900_138800
615930	contig_5959_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_150178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAGCATGTTTACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120604	119691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_119700_120600
615931	contig_12414_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_59604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	85	558	373581	374054	NA	40	TACACATTTTTCAGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373496	374104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373500_374100
615934	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
615937	contig_7202_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_18658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGAGGCCTGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
615946	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	11	352	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14419	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
615973	contig_1532_pilon	-	1846	7	Intergenic	novelGene_37384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1234.38186285012	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	53	715	32217	13495	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTVAARKGHHL	34913	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13521_17967_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
615975	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_96607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
615991	contig_20199_pilon	-	867	4	Intergenic	novelGene_82597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.835978296108	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	148	450	43987	41171	TRUE	30	CTGAAGTCAAAGAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44134	40657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40785_40880_41250_41934_42078_43906
616008	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
616009	contig_15219_pilon	+	2014	9	Intergenic	novelGene_40814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_8	262.574721507993	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	125	1312	19617	25321	FALSE	15	ATCTTTCCACTTTCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGRDSFPWEVPKKLKY	19492	26023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24588_25218
616026	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616027	contig_14322_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_115816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671848	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
616028	contig_15691_pilon	-	1543	12	Intergenic	novelGene_60760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	532.435927158307	125	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	69	1385	114377	27919	FALSE	20	CCCTCCTCTTGTACAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVALLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDELVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRVT	114445	27760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51904_51983_69380_69581_114283
616032	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
616033	contig_19342_pilon	+	786	6	Intergenic	novelGene_41087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.61109401705356	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	30	437	5070	6183	TRUE	30	GTTGATGGGTTAATTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSFSDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3255	6700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3265_5049_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
616037	contig_14513_pilon	-	1201	2	Intergenic	novelGene_70280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	182	346	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19061	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
616040	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	643	967	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
616047	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
616052	contig_9199_pilon	+	2191	5	Intergenic	novelGene_65612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	100.556886884987	5	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	67	441	42527	57407	FALSE	15	ATCAGCTGGACCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAALAADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42460	59157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52074_57322
616055	contig_10940_pilon	-	1864	4	Intergenic	novelGene_49267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1064.90281246694	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	216	437	893258	875564	TRUE	35	AACATCTGTGCTCAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVPAASPPPARPRRLPRSLTPRLGRSGSLACFWGGSFAAALRRWPQGSTKRLAGQHDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917130	874093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875501_875543_875675_893147_893306_916962
616061	SIRV7	-	280	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68996	4	35777	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78961	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
616079	contig_9415_pilon	+	1855	16	Intergenic	novelGene_109834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	277.316826431831	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	74	1726	1925966	2014065	FALSE	30	CTGCACATTCCAGAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPENCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAFATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVLKKARYMFLIVKSNTTACCPVTAVTEIRLTLNQRIMCAHDLWPTRFHSGCSQ	1925892	2014194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077_2000159_2010366_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398_2013502_2013912
616080	contig_12873_pilon	+	1832	6	Intergenic	novelGene_27151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1200.00389999366	2	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	765	1337	17896	19940	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFCSYTVNMRSYCEPPHHSSPFGTRSQHLRSSGYT	15946	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16283_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19688_19840
616088	contig_6048_pilon	-	2273	16	Intergenic	novelGene_73280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	87.5187345023275	4	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	79	1902	2006289	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049071	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979590_1980112_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
616098	contig_17936_pilon	+	2016	10	Intergenic	novelGene_29956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	890.049811340167	2	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	79133	111001	TRUE	25	ACCAGCCTAGTGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAESPPAICCHWQHRRTEDRQQDDEGTAVSLGHGAG	68337	126583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95288_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118652_118827_121017_121063_125766
616107	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616110	contig_7207_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_72065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAAAGTGTGTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659755	661862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_659800_661900
616111	contig_7207_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_72066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAGCATTTAAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663169	663970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_663200_664000
616120	contig_6544_pilon	-	2521	1	Intergenic	novelGene_142098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCTAAAGAAGTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107163	104642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_104600_107200
616124	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
616132	contig_9415_pilon	+	1962	15	Intergenic	novelGene_109947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	141	junction_14	64.5807910405917	416	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	11	1576	2492884	2527310	FALSE	30	TCACATGACTCAGAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSGGCSASERLPPPFPCLEPESEGAAGGSEPEAGDSDAEGEDIFTGAAAASKPQSPKRTASLRPINSGSKENGVHEEQDQEPQDLFADATVELSLDSTQNNKKVSAKTLISLPPQEATHSSKPQPSYEELEEEEQEDQFDLTVGITDPEKIGDGMNAYVAYKVTTQTSLPMFRSKQFAVKRRFSDFLGLYEKLSEKHSQNGFIVPPPPEKSLIGMTKVKVGKEDSSSAEFLEKRRAALERYLQRIVNHPAMVQDPDVREFLEKEELPRAVSTQTLSGAGLLKMFNKATDAVSKMTIKMNESDIWFEEKLQEVECEEQRLRKLHAVVETLVNHRKELALNTAQFAKSLAMLGSSEDNTALSRALSQLAEVEEKIEQLHQEQANNDFFLLAELLSDYIRLLAIVRAAFDQRMKTWQRWQDAQATLQKKREAEARLLWANKPDKLQLAKDEIAEWESRVTQYERDFERISTVVRKEVVRFEKEKSKDFKDHVIKYLETLLYSQQQLAKYWEAFLPEAKAIS	2492873	2527696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2493043_2505148_2505261_2509100_2509226_2509765_2509833_2512825_2512870_2514572_2514715_2519601_2519681_2520123_2520200_2521258_2521373_2521587_2521682_2522712_2522919_2525318_2525463_2525981_2526063_2526531_2526604_2527259
616135	contig_9014_pilon	-	2090	12	Intergenic	novelGene_106759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_11	60.5118661950962	15	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	674	1222	82349	79637	TRUE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	85921	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_83146_85745
616142	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616146	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27903	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616165	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
616167	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
616169	contig_7428_pilon	+	2140	12	Intergenic	novelGene_77740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.5717255406616	45	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1466	1903	440942	443217	TRUE	20	TCTGCCAAACTGCTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPALIRYSTSRLASIPAQPWPCFPTTRATDAWCAKFPPKRRMNLARSESWKYCSRNWAQAWLLLVVPEPTSCAVRLYRSRITDGVTPRCKPTVPATCGLGRCLRDDVAGKRCSPPTKVHMGCQGLWELIWMWGPYNMGLPSRH	438163	443844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_438933_439108_439239_439437_439597_439706_439829_440266_440332_440572_440770_440918_441115_441303_441485_441616_441685_443201_443358_443640_443716_443822
616182	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616183	contig_8801_pilon	+	2156	9	Intergenic	novelGene_66324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_2	122.845367739284	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	817	1692	938911	944080	FALSE	35	CATAAATAAACGGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGEIDTRFSFCAVATLSLLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSESHAGQIYCCTGFLAITSQLHQVNSDLLGWWLCERQLPSGGLNGRPEKLPDVCYSWWVLASLKIIGRLHWIDREKLRSFILACQDEETGGFADRPGDMVDPFHTLFGIAGLSLLGEEQIKPVNPVFCMPEEVLRRMNVQPELVS	935723	944544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_935742_936730_936839_938220_939100_939696_939803_940884_940938_941018_941130_941744_941871_942886_943037_943939
616186	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616188	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	210	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616190	contig_10134_pilon	-	2155	6	Intergenic	novelGene_16222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	668.25432284423	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33214_33349_33731_34922_35178_37632_37774_38568_38831_39594
616191	contig_4951_pilon	+	1815	2	Intergenic	novelGene_122119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAAATTTCACCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16112	27022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_16999_26093
616194	contig_4754_pilon	+	2288	15	Intergenic	novelGene_35941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_14	113.994472655118	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	88	1857	380119	420387	FALSE	15	TAGCTGGTTGTCTGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380031	420818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
616196	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
616200	SIRV2	-	397	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTCATTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4088_4338_4480_4687_4798_5786
616210	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73744	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
616216	contig_8683_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_150268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTAGCACCCCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707465	709215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_707500_709200
616217	contig_12327_pilon	-	1957	5	Intergenic	novelGene_140622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCTCTGACGGCGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172295	148610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_148686_168890_169076_169394_169506_170310_170446_170844
616219	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
616231	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
616234	contig_14322_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_115983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
616235	contig_13004_pilon	-	3548	1	Intergenic	novelGene_112669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651489	647941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_647900_651500
616237	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616241	contig_11751_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_150289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCGTGCTCTCGCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112711	113698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_112700_113700
616242	contig_15063_pilon	+	787	3	Intergenic	novelGene_13113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4631.5	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	202	786	34808	35961	FALSE	15	CTTGGGCCCGCCAGAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHI	34606	35962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839
616248	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_93623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616253	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
616269	contig_8822_pilon	-	3131	6	Intergenic	novelGene_117935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.0985856738742	8	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	495	1682	155442	154255	FALSE	35	TAAGCAAAGTCTGATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHNTSKEFLRSLTDQSSFNQHKQIHSRSKSYECHLCGKAFIQSSGLKQHIRTHTGEKPYECHICGKAFSNFSGLTQHYRTHTGEKPYECHVCGKAFSTNSNLRQHGRIHTGEKPYVCHLCGKAFTNCADLIQHNRIHTGEKPYVCHLCGKAFIQSSGLKQHNRTHTGEKPYECHICGKAFSNFSDLIQHNRTHTGEKPYECHLCGKAFSNCSHFRRHERSHTGEKPYECHICRKAFSRSSNLRLHERIHTGEKPYGCQLCGKAFSQCSDLRNHEKTHTGEKPFECHICGKAFSRSSNLRLHERIHTKEKPHVCQLCGKAFSQCSDLRNHEKTHTGEKPCECHVCGEAFTYCSDLRHHENGHTIYLINVEESSTLALTFQHPTESHIEGTLCL	224917	152805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_155504_156001_156085_156595_156692_177559_177687_179427_179515_224877
616282	SIRV7	+	223	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGCACATAGTAGTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147728	147951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
616299	SIRV7	-	213	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69067	0	35848	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78890	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
616310	contig_7045_pilon	-	1942	2	Intergenic	novelGene_77470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	998	1351	380901	380548	FALSE	35	ACTTGAAAGGCAAGGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFGPNPPEVKENEEHQSHKESRSPTDRKGHINQRLHQPETRRTKWCRATTNDRPDREHNRQSLMEQEKTGVQNSNSSKKTRLNSAAETGQPQKAWPPDCQPRTKNHSQGQFFRQD	382494	379956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_381641_382236
616315	contig_10581_pilon	+	1385	4	Intergenic	novelGene_41355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	379.861670728818	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGGCTATAGTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74566	87913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_83027_85033_85207_87087
616316	contig_16411_pilon	-	2854	2	Intergenic	novelGene_77268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGGGGAGAAAAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22996	18705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_20513_21949
616323	contig_11386_pilon	+	1665	8	Intergenic	novelGene_82751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	447.774405663552	600	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	732	1391	17940	31994	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7875	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11416_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990_32183_32370
616329	contig_10437_pilon	-	2326	16	Intergenic	novelGene_38404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_15	328.930320213196	1	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	64	2115	789580	774056	FALSE	20	TTTGGGATGATATTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSKRELDELKPWIEKTVKRVLGFSEPTVVTAALNCVGKGMDKKKAADHLKPFLDDSTLRFVDKLFEAVEEGRSSRHSKSSSDRSRKRELKEVFGDDSEISKESSGVKKRRIPRFEEVEEEPEVIPGPPSESPGMLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESAD	792961	773844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779203_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428_786576_788620_788752_789435_789628_792945
616341	contig_14322_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_116461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671586	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
616344	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_18640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
616345	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616349	contig_12624_pilon	-	1515	7	Intergenic	novelGene_61050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1243.62087827798	20	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	639	1154	868029	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903932	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871278_900245_900333_903447
616355	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
616368	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_93681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616369	contig_6589_pilon	+	2768	2	Intergenic	novelGene_26285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	833	1363	2272905	2273435	TRUE	5	CTCCCTTTTCCGCCGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWVVVGGKRGSNGRNTNDTPRIHTYWVAAWTIGIKCCLPAKAKVKPQNSLLNSTITGKKERKTNKQVIKHQVITAHSLPPWPTDAHQSKVIRKLRSCSLRRPSHTLLASSTRRCSRAEFWSTHCSESMCALRILQICCSGSLESAGPPAVFRCSMMSLRSCAMRLSCASMFSASL	2272072	2290223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2274793_2290175
616370	contig_14618_pilon	-	1653	12	Intergenic	novelGene_136785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	666	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1056	1493	306114	296089	FALSE	15	CACTTCCTGTGTCGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGFNRSVVLCNLYRLITVEVPHFGSFITRCCKYFASIITPANVKHGPGVHLLGFWNSLPTVLNFPTANIISPRSCNQKVPRQSWWAKRQTTNAVIGRRCYFNILHRVVIIRGCAAKHAGPTSSETRGRSKQTHFGPESRAAAGG	312420	295928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_296116_298701_298799_299301_299409_301268_301362_305016_305102_306085_306174_306281_306355_307515_307623_308387_308497_308603_308679_310015_310210_311982
616376	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_18652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGAGGCCTGGCGGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
616378	contig_16098_pilon	-	1626	9	Intergenic	novelGene_46092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	4	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	322	1416	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460448	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
616385	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
616392	contig_17427_pilon	-	1736	8	Intergenic	novelGene_30381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_1	1100.26332655192	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	48	860	188879	181263	FALSE	75	ACCTTAAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHGE	204690	180386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
616397	contig_8284_pilon	+	1148	10	Intergenic	novelGene_125693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	696	junction_8	269.385216858179	5907	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	107	874	426599	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425048	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
616403	SIRV6	+	248	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
616404	SIRV6	+	723	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	751	112	-404	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	121	453	2002	10736	TRUE	20	TCGTCATTGTATATGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1881	11219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
616415	SIRV7	-	338	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33229	2	10	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
616416	contig_18869_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_56094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
616435	contig_10973_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_150308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_900
616438	contig_10437_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_38169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162328	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_162300_164100
616439	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616449	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1475	632	1020	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
616451	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616452	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
616458	contig_1239_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_150419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAAGTTGTTTTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672415	680038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_673965_679962
616462	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
616476	contig_12624_pilon	+	1740	4	Intergenic	novelGene_61145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAACCCCTGCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947533	955839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_948849_950616_950774_952911_952987_955646
616480	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616493	contig_8075_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_42513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCATAGCAATCCTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781221	783281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_781200_783300
616504	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
616519	contig_17042_pilon	+	1505	2	Intergenic	novelGene_140182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_1	0	1380	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	28	891	4885	10091	FALSE	20	TCACGTCCAGCATTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKYPEIKSLMKPDSNLIWIITVMVLTQLVAFYLVKDLDWKWVIFWAYAFGSCINHSMTLAIHEVSHNSAFGHCKAMWNRWFGIFANLPVGVPYSISFKRYHMDHHRYLGSDGIDVDIPTDFEGWFFCTTFRKLIWVILQPLFYAFRPLFINPKPISYLEIINTIAQISFDIIIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKNLPLVRKIAAEYYDSLPQYTSWIKVLYDFVMDDTISPYSRMKRHQKGQVELE	4857	10705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_5602_9944
616520	contig_5571_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_75528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGTGGGATCATACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227979	228638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_228000_228600
616525	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616538	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
616539	contig_14441_pilon	+	1109	6	Intergenic	novelGene_100338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	387.296475584274	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	504	932	116728	117610	FALSE	10	TGGCGCTGCCTACGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRWCGERPALEDAGAASARGARSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTAVSNNSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	5971	117787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6686_6913_114102_114161_116578_116963_117220_117344_117539
616540	contig_16303_pilon	-	2490	8	Intergenic	novelGene_34111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	1	135	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	99	1190	45428	35759	TRUE	45	AAGAAAATAAATTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45526	33164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33560_34853_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
616547	contig_2917_pilon	+	2418	1	Intergenic	novelGene_147577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81402	83820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_81400_83800
616552	contig_15449_pilon	-	1636	7	Intergenic	novelGene_33666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_6	90.1585024030211	993	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	171	1334	196078	191270	FALSE	20	AGAGATGTGGCAGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196248	190967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
616555	contig_10904_pilon	+	2153	4	Intergenic	novelGene_22453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	866.912913734707	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	178	1146	149100	150068	TRUE	25	CCGGCCTTAAAGGCAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143862	151165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146155_146226_149097_150086_150175
616556	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
616559	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	1101	6	-1101	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACGAGTGTGGTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
616564	contig_11512_pilon	-	2207	12	Intergenic	novelGene_43383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1226.11680917932	10	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	135	881	609650	556769	TRUE	15	CTGAATGGGCGGCCCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNRFQRHLPGGCPQPLPH	622335	555361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556146_556226_556818_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
616573	contig_14868_pilon	+	3034	2	Intergenic	novelGene_150448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141074	149994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_143115_149000
616583	SIRV7	-	226	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69043	11	35824	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78914	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
616594	contig_4114_pilon	-	444	3	Intergenic	novelGene_15636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTCTGTGTGAGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511697	507695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_507907_509717_509901_511647
616595	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	254	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616597	contig_10311_pilon	-	1630	11	Intergenic	novelGene_50400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1065.01438487938	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	310	1101	68953	65773	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71543	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65245_65363_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
616598	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91680	0	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
616607	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
616608	contig_7396_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_79649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	59	355	252467	252763	NA	75	TACAGTAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGTETLALYCIGHWRSWMLALGMGIQSEVVKYGTRLATSTFLGIANQGFHMGVQGRMGQRHGGQRRGKSIQYMGNGDIWPKKQGEGKGGKAINFNLIQTILILSINETSLSCSED	252408	255015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_252400_255000
616613	contig_5727_pilon	+	1880	6	Intergenic	novelGene_7965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1692	junction_5	450.790239468425	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	88	1215	176605	179323	FALSE	40	TTATAGTATTGAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYSWDRENTKLCSLQETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	176517	179988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
616629	contig_4686_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_118600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAACAGTTGAGGCCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883609	881943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_881900_883600
616635	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
616640	contig_10311_pilon	-	1988	12	Intergenic	novelGene_50447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1074.30784944163	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	32	682	71526	68377	TRUE	25	CTTAAAAGTTGCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSCVAICHNAN	71557	65131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66642_66754_67180_67246_67487_67582_67823_67962_68264_68409_68651_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
616644	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_115850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671626	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
616645	contig_9955_pilon	+	2108	8	Intergenic	novelGene_21379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.4244424369571	384	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	634	1119	574800	576514	FALSE	10	TTTGCTTTGTCCATCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAASASLTPDFLSPGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDL	567679	581345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_567700_570756_570897_571397_571503_571634_571841_574376_574487_574747_574960_576188_576515_580356
616647	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
616648	contig_9345_pilon	-	1856	7	Intergenic	novelGene_24368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	4	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	95	1033	176056	142100	TRUE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176150	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141696_141867_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
616660	contig_9434_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_150483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTATTTCACTCAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68362	68821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_68400_68800
616668	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	0	35775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
616675	contig_18859_pilon	-	3652	1	Intergenic	novelGene_150561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTGACGTAGAAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257643	253991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_254000_257600
616676	contig_12570_pilon	-	1783	5	Intergenic	novelGene_79378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	46.8794997840207	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	45	794	300289	280987	FALSE	25	TGAAGGGATTCTATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGGEAYRGAEDTATLSGGGGPSAPALHQGAVQPL	300333	279997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_283523_283699_284049_284255_293908_294088_300198
616681	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
616683	contig_7898_pilon	+	799	5	Intergenic	novelGene_47516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	497	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	464	790	283762	284308	FALSE	45	CTGCAAAGAAAAGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPKEKGEMFSMFSRVASLAPTLSPVLISCTSLWISMVPLEILVVMPKAWKKEVFSGPRPVFWAGTVTSHGAMAPARAAAGTLLARSMSLISVRSSLVNTKPTFPRM	282046	284317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_282284_282656_282800_283678_283866_283961_284104_284227
616690	contig_7202_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_19104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCACCGTCTCTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
616702	contig_10937_pilon	+	2415	11	Intergenic	novelGene_67291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	62.7838354992748	458	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	1273	2199	40796	45357	FALSE	10	TTCCCGGGTGTTGTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33187	45573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40162_40427_40620_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
616705	SIRV1	-	756	2	ISM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	3700	51	3700	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGATCGTCGAGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6666	1057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_1485_6337
616721	contig_12622_pilon	-	2776	18	Intergenic	novelGene_6010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_17	53.9935918278967	228	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	368	2482	1653250	1645777	FALSE	25	TCCCAAGAATGTGTGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANENHGSPREEASLLSHSPGTSNQSQPCSPKPIRLVQDLPEELVHAGWEKCWSRRENRPYYFNRFTNQSLWEMPVLGQHDVISDPLGLNATPLPQDSSLVENPPAENKARKRQLSEEQPSGNGVKKPKIEIPATPISQSVPSSPSVPGTPTLKIWGASPEDKQQAALLRPTEVYWDLDIQTNAVIKHRGPSEVLPPHPEVELLRSQLILKLRQHYRELCQQREGIEPPRESFNRWMLERKVVDKGSDPLLPSNCEPVVSPSMFREIMNDIPIRLSRIKFREEAKRLLFKYAEAARRLIESRSASPDSRKVVKWNVEDTFSWLRKDHSASKEDYMDRLEHLRRQCGPHVSAAAKDSVEGICSKIYHISLEYVKRIREKHLAILKENNIPEEVEAPEVEPRLVYCYPVRLAVSAPPMPSVEMHMENNVVCIRYKGEMVKVSRNYFSKLWLLYRYSCIDDSAFEKFLPRVWCLLRRYQMMFGVGLYEGTGLQGSLPVHVFEALHRLFGVSFECFASPLNCYFRQYCSAFPDTDGYFGSRGPCLDFSPLSGSFEANPPFCEELMDATVSHFEKLLESSLEPLSFIVFIPEWREPPTPALTRMEQSRFKRHQLVLPAFEHEYRSGSQHICKKEEMHYKAVHNTAVLFLQNEPGFAKWGPTPERLQELSAAYRQSGRSHSSSSSSSSSLEAKDRDSGREQGPSHEPHPT	1656798	1645482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1646009_1646092_1646269_1646361_1646456_1647061_1647247_1647328_1647416_1647565_1647739_1648484_1648648_1649690_1649791_1650069_1650154_1650234_1650383_1651068_1651224_1651346_1651478_1651666_1651805_1652911_1653037_1653126_1653270_1654659_1654834_1656176_1656281_1656728
616727	contig_10581_pilon	-	2162	11	Intergenic	novelGene_41404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	81.6764960071133	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	186	653	633234	627471	TRUE	25	GCTCCTTGTTTTGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDELESKPELLVQFVQNTSIPLEQGLVESETKDITCLSLLPVTEASECSRLMLPDDTPNHTNSSKEVPSSAVLRSLQVNVGPDGEETRAQTVQKSPEFLSTPESPNLLQDLQPNDSTSFILLNLTRAGLGSSAEHLVFVQDEAEDSGNDFALQ	649681	609101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620331_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
616739	contig_14322_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_115647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1371	1781	411099	410689	NA	65	TGGGAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLIQNLHIDQEAVAGTEQGDTVWFKIRKGACQGCILSSYLFNLYAEQIIRETGLYEEEQGIRIGGRLINNLHYADDTALLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLSIKKTRNPHKWTNKQHHDKCRKD	412469	409842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_409800_412500
616742	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
616760	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4138	-1	2959	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1773	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
616764	contig_11396_pilon	-	2008	5	Intergenic	novelGene_71329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	135.778081809989	870	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	496028	492463	TRUE	55	TAATATAAAACAACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAGDETHQFPSPAGPPTPRHHTWTPPGLGKTLLRGLQTTACLSPGGETRPQAGLSLLEGFQSPQWIQHSTAGQTLPSTPSSLAGNTPSPVSLLDSEVPRAWGGRGQASVYL	496028	477235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_478373_491301_491528_491878_492054_492334_492642_495865
616778	SIRV7	-	268	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35774	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70995_78847
616792	SIRV4	+	191	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	1119	6	-1119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCAACGACGAGCCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
616797	contig_10299_pilon	-	2328	5	Intergenic	novelGene_79763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	18.1107702762748	289	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	139	1764	593453	580210	FALSE	0	TCTGCTGTGGGCTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLTRGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622523	579645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580419_584724_584887_591057_592259_593399_593495_622426
616798	contig_14618_pilon	-	3045	6	Intergenic	novelGene_136781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	43.0190655407576	166	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	415	2388	35866	24996	FALSE	15	CTCAGGCTGTGTTACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWSQEKKRKPTILEPVTFEDVTVVFTEAEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELQPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGCSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREEVSRLLCGRRGERGTSRAFSSPPQRRSASPREGNTEVGVEPNSAQKIKSVVRGQGLKELETSRFGALSSREDEPDCGLKSDFITRQRSLLQEKPYVCSECGRGFTRKSVLLMHQRTHAGEKPHMCKECGQGFRWKSGLLIHYRTHSGEKPHVCKECGLSFNQESSLLLHERTHSGEKPHVCEQCGRGFNHQSALIRHQRTHSGEKHYLCLECGRGFSRKSGLFLHQRTHSGEKPHMCKECKRSFRRKSDLLIHQRTHSGKKPHVCKDCGQGFNWESSLPLHQRIHTGEKPHVCKECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLIGHQWKHTDKKPYVCSECGKGFTQKSSLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFTQKSVLLNHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHLRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSILLTHQGTHSGEKPYLCKECGRGFNRESSFLLHQRTHSG	37946	24338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_26750_32011_32139_35599_35659_35832_36096_37333_37504_37931
616801	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_17877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616803	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616810	contig_10135_pilon	-	2372	7	Intergenic	novelGene_106607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46.9668914118115	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	677	1546	88066	84749	TRUE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRGAPGWDEDLSTPYIRGTL	89012	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85944_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88231_88500
616838	contig_7457_pilon	-	3306	5	Intergenic	novelGene_31300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	52.8222254358901	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	13	1848	173419	166353	FALSE	20	TTTGTGTAACTTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVETAADPVTVVAAVGPKAKDEEEEEEESLPPCETVRWAPVGAVAEAGPGTAAFSEEASAEESGVAPSSPPDSPGRTLRRLRAERRRLDSALLALSSHFAQVQFRLRQVVRGAPAEQQRLLRELEDFAFRGCPHVLGYRDSEDPASDELLGDRPRLWGEDPSEQEKRERQETQREKQRELILQLKTQLDDLETFAYQEGSYDSLPQSVVLERQRVIIDELIKKLDMNLNEDISSLSTEELRQRVDAAVAQIVNPARVKEQLVEQLKTQIRDLEMFISFIQDEVGSPLQTGDRHCECKTSGKTGSGSTRTGSSRLPPGNGKAKPEDVKRVREMGLHLMRRALAMLQIFAASQFGCATGQIPQTLWPRGQADRDYSPLLKRLEVSVDRVKQLALRHQPPYDHVVTSANLQDLSLRGKDELTMAVRKELTVAVRDLLAHGLYASSPGMSLVMAPIACLLPAFSSAPEAMHPWELFVKYYHAKNGRAYVESPARKLSQSFALPVMGGTVVTPKQSLLTAIHMVLTDHDPFKRSADSELKALVCMALNEQRLVSWVNLICKSGSLIEPHYQPWSYMAHTGFESALNLLSRLSSLKFSLPVDLAVRQLKNIRDAF	173431	164894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_167222_167652_167773_168703_168903_169886_170046_172930
616839	contig_19851_pilon	+	1609	6	Intergenic	novelGene_29851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_3	3218.55896947687	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTGTTCCGTGTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53465	56528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54717_55650_55753_55840_55882_56006
616847	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_94898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
616860	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
616869	SIRV4	+	332	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1423	648	968	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
616870	contig_8772_pilon	+	1398	10	Intergenic	novelGene_21085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5359.65781338167	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	143	829	15355	20004	TRUE	40	ATCTTAAAGAAACAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVC	15212	23163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15445_15531_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19248_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
616877	contig_11908_pilon	+	1855	15	Intergenic	novelGene_133231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	104.770911409375	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	152	1513	698161	837058	FALSE	15	GTGCCTTTGAGTCTCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSHGLAALSFSISSLTLIGMLAAITYTAYGMSALPLNLIKGTRSAAYERLENTEDIEEVEQQIQTIKSKKQLEERLRTLKKRERHLEFIENSCWTKFCGALRPLKIIWGIFFILVALLFVISLFLSNLDKALHSAGIDSGFIIFGTNLSNPLNMLLPVLQTVFPLDYILITVIIMYFIFTSMAGIRNIGIWFFWIRLYKIRRGRTRPQALLFLCMILLLIVLHTSYMIYSLAPQYVMYGSQNYLIENNTTYDDHKGNSTISVPKRCDADAPEDQCTVTRTYLFLHKFWFFSAAYYFGNWAFLGVFLIGLIVSCCKGKKSVIEGVDEDDSDLSDDEPSVYSV	698009	837400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752803_752878_783983_784110_788457_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_836668_836761_836941
616885	contig_18869_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_56026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73539	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
616892	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_18379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616894	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
616895	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
616902	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
616914	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
616917	contig_2341_pilon	+	2450	6	Intergenic	novelGene_84359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	45.5121961676208	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	66	542	129589	157640	TRUE	35	ATGGTAGAACCTAGATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEPQTTGYTNVQDTPAMPWWKDKFWIFLAGAIIVTSVSLGLILYCVCRRLFRQGKKLKTAKPLKQNEDEEMTYENVLNQSPGKLPPLPPRDLPSLEDASPADTQSEPPAAYSSIHKVKKAKRVSIPSYIEPEDDYDDVEIPTTTGKHHIKTKVSHF	129523	159892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129631_147326_147451_149686_149748_155756_155831_157464_157870_158213
616921	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616922	contig_990_pilon	-	2785	2	Intergenic	novelGene_76001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210565	207662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_208859_208976
616933	scaffold_16539_pilon	-	1849	12	Intergenic	novelGene_68361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	319.715912120135	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	115	1491	502141	490145	FALSE	15	ACAGCCTGGGCCTGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTGPDPIFPCQPQQVPGDRTCCLHRNLQLVRQLLHGDSRHLTAGDPEWTGRPAEPAGGCVREGLGLALQL	516054	489786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490461_490987_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_516002
616936	contig_10937_pilon	+	2184	11	Intergenic	novelGene_67298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.5131390691311	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	105	2003	35798	45357	FALSE	35	AATAAATCTTTAATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33205	45538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33257_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
616938	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616939	SIRV4	-	198	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGAATCTAGATCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	2564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
616947	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
616961	SIRV2	-	625	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4248	34	3073	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
616969	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
616986	SIRV7	-	232	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	21	91673	-11	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147936	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
616992	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
616995	SIRV5	-	212	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTAAATAGATGTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8579_10851
617003	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	635	1119	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
617018	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
617025	contig_91_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_127082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCCATAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107652	107938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_107700_107900
617035	contig_9515_pilon	+	2298	8	Intergenic	novelGene_73822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_4	250.489480002328	32	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	745	1575	65880	68511	TRUE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVEGTLGWVAGSLCLEVARRGGDHLGGMWVAGGGWQEGSGVLMRSVAGSQGAYV	65135	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68824_69343_69477_71788_71878_72464
617049	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
617052	contig_14322_pilon	-	159	1	Intergenic	novelGene_115697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671433	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
617054	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
617057	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
617059	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
617083	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
617094	contig_9345_pilon	-	1988	6	Intergenic	novelGene_24397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	576.426231186611	3	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	76	774	176056	142333	FALSE	30	GCAAACATTTGGAACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGEYHGCLSNLLTTRPTWIPQRQPP	176131	141118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142386_142546_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
617100	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617108	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617115	contig_7151_pilon	-	2861	14	Intergenic	novelGene_40678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	134.42958606448	1	147	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	918	2757	17	2773	65162	1924	FALSE	20	TACTCTGAGTTTCTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAVTGSAAAFPDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65178	1835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6286_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
617117	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617123	contig_6501_pilon	+	2755	13	Intergenic	novelGene_150568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_12	195.560785520342	188	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	31	1164	227511	310940	FALSE	40	TAAAAAATTACTTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPPAGDEGKMSVSGLKAELKFLASIFDKNHERFRIVSWKLDELHCQFLVPPPAPPSSPHSPPPPLTLHCNITESYPSSSPIWFVDSDDPNLTSVLEHLEDTKNNNSLRQQLKWLICELCRLYNLPKHLDVEMLDQPLPTGQNGTTEEVTSDEEEEEEMAEDIEDLDHYEMKEEEPTSGKKSEDEGIEKENLAILEKIRKTQRQDHLNGAVSGSVQASDRLMKELRDIYRSQSYKTGIYSVELINDSLYDWHVKLQKVDPDSPLHSDLQILKEKEGIEYILLNFSFKDNFPFDPPFVRVVLPVLSGGYVLGGGALCMELLTKQGWSSAYSIESVIMQINATLVKGKARVQFGANKNQYNLARAQQSYNSIVQIHEKNGWYTPPKEDG	227480	312531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_227700_246741_246844_251353_251459_262928_262986_266176_266318_268262_268348_269837_269899_270670_270762_277559_277619_301376_301426_301878_301975_308910_308978_310908
617124	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
617138	contig_6710_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_98066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
617144	contig_6710_pilon	+	569	2	Intergenic	novelGene_92280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACTCCAAGAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
617153	contig_5690_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_119745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACTTATCTAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088409	1086048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1086000_1088400
617170	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_97231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617176	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
617180	SIRV7	-	311	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33232	26	13	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114725	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
617182	contig_15410_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_130607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	0	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	166	702	145617	147258	FALSE	40	ATAAATTAATCCTTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPALPASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSVRRGLTLARLGEAPGNWDCQVGFGCLCPSSRTSQDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVKAGRQLQGTGRGVHRSRGHISLYFW	145451	148528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817
617183	contig_6048_pilon	+	1925	5	Intergenic	novelGene_73096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	174.114007190691	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	533	865	132371	133829	TRUE	35	GAAAAACATTTCTGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSMRKLGSETLNDVYS	131838	136360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_132550_133132_133242_133784_133998_134181_134320_135606
617185	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617190	contig_13216_pilon	+	1993	8	Intergenic	novelGene_47463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	825.965903333417	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	91	1362	229682	260918	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPVIWLR	229591	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430_260840_260901
617197	contig_15866_pilon	-	4374	1	Intergenic	novelGene_63671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCAGATTCTGTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612507	608133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_608100_612500
617206	contig_2646_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_69720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTCAAATAGCTGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2608541	2607392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2607400_2608500
617210	contig_9931_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_134840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGTTGACATCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361892	359324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_359300_361900
617211	contig_7171_pilon	+	2212	15	Intergenic	novelGene_101331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	397.71559420967	391	42	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	446	1264	1156386	1166930	TRUE	30	AGAAGGGTTCCTAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNCWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKQRDYETATLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQRICDQWDALGSLTHSRREALEKTEKQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIERA	1146890	1172842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1146934_1147899_1147988_1149761_1149841_1150885_1150972_1151796_1151883_1156322_1156416_1158263_1158495_1159643_1159792_1163553_1163705_1166391_1166501_1166701_1166843_1166921_1167107_1167194_1167330_1168339_1168520_1172385
617226	contig_11017_pilon	+	1300	10	Intergenic	novelGene_128074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_6	580.397947771852	731	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	209	853	233889	294618	FALSE	20	AGAGACTTTATTCTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPKPVKPGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233680	295065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
617229	contig_5337_pilon	-	2429	3	Intergenic	novelGene_136558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	550	1893	322179	320836	TRUE	15	CATTTGTGTGTGTATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	339695	319671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_320085_320712_322308_339274
617230	contig_3948_pilon	-	1579	12	Intergenic	novelGene_53415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_11	165.766588863592	961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	112	1239	1975758	1933521	FALSE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975869	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
617249	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617251	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
617264	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_115734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
617267	contig_15063_pilon	+	1305	4	Intergenic	novelGene_14273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	342	1163	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34817	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
617269	contig_16510_pilon	+	2315	5	Intergenic	novelGene_139089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	15.9432587635025	249	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	18	488	289339	291328	TRUE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAELRAESDSLLLQLLRDLEELEAKREALNARVEEGWFSLSKARYAMGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPALRRRKGLSRTSKPEPSAAPEDPLNWFGILVPHSLRQAQASFQEGEWTLPVDHVALG	289321	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289450_289529_289634_289736_289820_291155_291374_292402
617284	contig_5020_pilon	+	1064	5	Intergenic	novelGene_27894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	966.774889775278	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	258	749	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	119440	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124245_125694
617290	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
617321	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
617323	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617333	contig_5020_pilon	+	1387	7	Intergenic	novelGene_27853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	997.972736768562	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	559	1323	122915	126023	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARQPSQALLPFFSFPSLFISLPSPPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	118463	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119241_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124466_125811
617341	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_94115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
617360	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
617371	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
617373	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_96593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
617382	contig_11978_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_63039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1674	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	306	344	1648347	1648385	NA	5	TGACTTGGTTTCCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGVSAVVSGYVQVGTCEGTWSRCLLIFSSKPTVRGRALGSKVLLCSLGRKLLSSWVPHSVGSPLRPLPRFHKASLKQRESVPGLHNWKHRLWDEEGKDGAMFKFLLSAHWRL	1648041	1649719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1648000_1649700
617386	contig_960_pilon	-	2401	10	Intergenic	novelGene_108213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	88.9458151049916	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	563	1741	316876	292669	FALSE	50	TTAAAAAATAGGACTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRVNQKEEEPIPVIVSPHQTILASLGSRLTIPCKVFLGVGIKSTSTVWWTANDTIIDSAYPGGRVTEGLEKEYSENNENYIEVPLVFDPVIKEDLKTDFKCIVTNRMSLQTLRTTVKEASTFSWGIALAPLSLVFLVLGGIYMYRWCKHRPEKGYSLTTVKTDHEDF	335610	292008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_292818_294744_294888_296943_297080_304259_304323_306536_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_318321_318753_335540
617389	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617392	contig_9415_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_109785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	999	1352	1663947	1664300	NA	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVVRLVIRALFLCSYPLCWQSNGPLGDESLKYHDEFILPALSLSRCMIISELLIWTSVSSCVKWRKLWEFEESILGDIIDPIIQSYLTQCSSCLAAFCSLVHLVLKPLCTDLSCSP	1662948	1665398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1662900_1665400
617404	contig_10354_pilon	-	3641	1	Intergenic	novelGene_50862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438722	435081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_435100_438700
617408	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617413	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617419	contig_3588_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_72874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAATTTTTATGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98071	95931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_95900_98100
617420	contig_12964_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_131744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACATGTTGTTTTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700500	701281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_700500_701300
617422	contig_7202_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_18422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCTCATGCAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27642	27909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
617424	contig_9579_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_150583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787698	787954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_787700_788000
617435	contig_5643_pilon	-	2091	11	Intergenic	novelGene_38714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	261.809186240667	47	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	220	1248	48733	32077	FALSE	15	GAGGGAGTGGTCTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPTVPGLLPPLVLLALLVGIYPSGVIGLVPHLGDREKRDNLCPQGKYNHPQNNSICCTKCHKGTYRYNDCPGPGLDTDCRECETGTFTASENHVGQCFSCSKCRKEMDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYHPGTSSEGGGALAHAARRC	48952	31233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32260_32303_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461_37616_48694
617436	contig_10011_pilon	-	2811	7	Intergenic	novelGene_68070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	29.8998327754521	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	364	1575	282612	277516	FALSE	30	TTACCTCATAATGTCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTVDLKVATDLNPQIRALWETKGSVTESSSHSKKSSPQMDSLHPESSRRDFRNFHYHEAAGPLEAVSQLQELCRQWLRPEIHSKEQILELLVLEQFLTILPRETQTQMQKHHPQSIKEAVALVEYLQRESGQTRNGVTFHELGKEAVILGGTAEAPGFMLKSAELQSVGRSQDEEFWNTYRGLQEQPSRNTLKETEALYKKALPTPQTLALSEQTNTKDWTMAPNLILPESQSLLTFEEVAMYFSQEEWELLEPPQKVLYHDVMQENYETVISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWIQGPQEFKDSHVESPTGLKFKNDTGSHQPVSLPALEIEAPGDIVSKKARAKVPQKTTDKENQGDIHRVGKRHQDFPVKKRKKTFNLETRVAETYGSSQERPCRRKAF	284779	276279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_277791_277971_278083_279704_279832_280160_280253_280936_281133_282201_282712_284515
617442	contig_8443_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_150619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	42	431	827143	827532	NA	50	ACCTCACAACACCAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVRKAATLQTGQMARISNRQQQQLRNGSSRTRRPAQDSAGAHPRSERAECFLAEWGASGHLLVELCLPTHKVRELSALWPKFTGRVGCLQALISGAKELWNTCPSKADAGGKAQGSKRPRNQKAEAEKTRNTGSRAASVSG	827101	828296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_827100_828300
617443	contig_15092_pilon	+	2029	3	Intergenic	novelGene_57810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	27	593	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325132	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
617450	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617451	contig_9730_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_150632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTTTTTTTTTTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451806	450593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_450600_451800
617452	contig_7004_pilon	-	1680	2	Intergenic	novelGene_126483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCCTCTCTGATACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405507	403419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_404997_405404
617455	contig_233_pilon	-	1772	2	Intergenic	novelGene_14488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGGCGTTCCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42436	40592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_41200_41271
617471	contig_4315_pilon	+	1961	9	Intergenic	novelGene_46749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	153.920789287867	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	553	1122	222198	225049	TRUE	5	GCTTCTTGTCTTGCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTDPKNPVCM	221396	226147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_221808_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223933_225023_225219_225477
617480	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617483	contig_8729_pilon	+	2922	3	Intergenic	novelGene_40056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	29	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	78	485	33998	36996	FALSE	25	TTCCCCAGCATCAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEVHVALMFWAFHVYRKYLSFIYSS	33920	39433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789
617487	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
617507	contig_6059_pilon	+	2993	1	Intergenic	novelGene_44873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCACATATAAGTTAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572869	575862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_572900_575900
617510	contig_1694_pilon	+	4103	1	Intergenic	novelGene_144975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTATAAAACCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605497	1609600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1605500_1609600
617518	SIRV7	-	372	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33197	0	-22	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114760	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
617533	SIRV4	+	247	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1524	632	1069	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2524	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
617534	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	23	364	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14431	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
617545	contig_15866_pilon	+	2779	1	Intergenic	novelGene_63621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425412	428191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_425400_428200
617559	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617562	contig_15003_pilon	-	2690	26	Intergenic	novelGene_137335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	58.3647016611924	28	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1358	2176	239085	223109	TRUE	20	TCAGTGTAACCTGTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLILVKRKKSQWYLWHLWVQFFTARITELMQVLKDLNHGRYERTMVSQQERGAEGPQVIPLVLGAGEIINADNIIKFDHVPLATPNGDILIRDLNFEVPSGANVLICGPNGCGKSSLFRVLGELWPLFGGRLTKPERGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQVIYPDGREDQKKKGISDLVLKDYLDNVQLGHILEREGGWDSVQDWMDVLSGGEKQRMAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEDYIYSHCRKSSASHSEQITFVSNKHIIAGI	313685	215837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_216186_219570_219628_222999_223175_224440_224546_225456_225577_226789_226880_226979_227046_227150_227229_237550_237615_237741_237815_237894_237987_239020_239126_239529_239622_239917_240016_240106_240177_242386_242457_245915_246059_248538_248596_252630_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265957_273246_273284_285992_286082_313505
617575	contig_4950_pilon	+	3306	10	Intergenic	novelGene_150640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_8	21.6766358831318	132	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	157	1785	263475	274786	FALSE	40	CCCAGAATCACCCTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAHDEIGGLLPIKRTIRVLDVNNQSFREQEEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRSDNRSPASAHKSYSRSAVPAPTKRRNSVLWSEMLDISTKESLTTKEIKRQEAIYEMSRGEQDLIEDLNLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDAYIPLHEDLLARIGDATKPDGTVEQIGHILVNWLPGLNAYKVYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLIKEILRHTPKDHPDVQLLEEALLIIQEVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELKNKNGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSDKAKNIFRVRFQDPSPGQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRTAIAPFQQAASPTELKDLPELNEECEENNLSASNIKAQRRVSTVSSVIQVEVDEHASECGSSVQTAADTKSVKAHRTQSGFRKAREKTQLSGKRKETLV	263318	276307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4950_pilon_+_263568_269277_269386_269783_269952_270359_270423_270891_270989_271126_271204_271910_272169_272628_272800_273815_274003_274379
617577	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
617578	contig_1532_pilon	-	1860	8	Intergenic	novelGene_37379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1257.67539045459	46	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	105	1178	32097	13113	TRUE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32201	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12578_12644_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049
617582	contig_12629_pilon	-	2403	11	Intergenic	novelGene_150643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	31.2627573959816	208	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	23	1537	81596	13371	FALSE	55	TGAGAAAATAGAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACEKAGKMAASWRLGCDPRLLRCLLGFRGRRSPGLVKGAAGCSGCRVANWRWFHSTQWMHGDPIKILMPSLSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSAGDALCEIETDKAVVTLDAGDDGILAKIVVEEGAKNIRLGSLIGLMVEEGEDWKHVEIPKDVGPPSPAAKPSVPHPPPEPPISIPVQKEHTPGKLQFRVSPAARNILDKHALDASEGTATGPRGIFTKEDALKLVELKQMDKITESKPTPVPLAPPTTPTAPLPTPASGGPSYPRPMIPPVSTPGQPNAVGTFSEIPASSIRRVIAKRLTESKSTVPHAYATTDCDVGAILKVRQDLVKDDIKVSVNDFIIKAAAVTLKQMPDVNVSWDGEGPKQLPFIDISVAVATDKGLITPIIKNAAAKGIQEIADSVKALSKKARDGKLLPEEYQGGSFSISNLGMFGIDEFIAVINPPQACILAVGRFRPVLKFTQDEEGNAKLQQHQLITVTMSSDSRVVDDELATRFLKNFKANLENPFRLA	81618	12504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_-_13630_14229_14295_17432_17592_23168_23228_26774_26923_29082_29267_40368_40468_42271_42472_50820_50922_63738_63820_81436
617588	SIRV6	+	1068	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	11	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	35	GATGACTATGGGGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
617596	contig_17936_pilon	+	1696	8	Intergenic	novelGene_29923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	772.025853431961	5	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	55	840	50646	121021	TRUE	20	TTACCAGCCTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50591	126581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
617610	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
617615	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617619	contig_18869_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_56384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
617621	contig_1516_pilon	+	1637	7	Intergenic	novelGene_50015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	837.171958971924	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	176	1000	354943	363092	FALSE	10	AGCACCTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	353666	363729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_353693_354793_355065_356022_356117_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
617633	contig_2689_pilon	-	2204	4	Intergenic	novelGene_100818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	162.936252019685	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGTATAGTGTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156459	142598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153567_154011_154098_156318
617636	contig_233_pilon	-	1845	11	Intergenic	novelGene_14593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1426.71780321127	2	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	82	1239	126907	79079	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNSAWRGRKWPPSSGAQWQGSC	126988	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
617639	contig_7695_pilon	-	1550	4	Intergenic	novelGene_41542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	58.1626073082087	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	311	406	379725	378805	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQDLQFLWQEWQL	380035	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376521_378788_378840_379664
617642	contig_10904_pilon	-	1306	7	Intergenic	novelGene_22738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	375.140158992461	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	248	883	662171	660357	TRUE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGQLHHEPCELSPCGDLQVLQLTQHISLPVVTTQ	662728	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660458_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
617682	contig_20742_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_150653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1625	1951	70769	70443	NA	40	TTCTGTTCCTTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPTLRPEELEGYLYQPFPPGIQQVFLDRTGKKGRTKLKFLKKGQTYWTGRNQMNPEITALGYTLNLELRPLPEVTFQPNDRLAHKINNITQEYCAPLNNHLNETKW	72393	70034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_70000_72400
617688	contig_8362_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_150675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATTCACTGGCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69447	70506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_69400_70500
617690	contig_4803_pilon	-	2389	3	Intergenic	novelGene_150739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTTTTCCAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127276	114710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_115167_124167_125457_126632
617699	SIRV4	+	483	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	18	449	18	-449	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAATTGCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
617701	SIRV7	-	289	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35774	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78843
617702	contig_12873_pilon	+	1243	5	Intergenic	novelGene_27163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	957.879559234876	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	780	1241	17896	19676	FALSE	25	TATATTTTGGTTTAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIG	15959	19678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611
617706	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGCCGCCGTCAACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
617712	contig_20641_pilon	+	1667	7	Intergenic	novelGene_52829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1292.21860250759	2	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	379	1374	38568	56882	FALSE	35	AAAGATCTCTGTGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14537	57175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14725_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45932_54835_54968_56379
617729	contig_12250_pilon	+	2080	18	Intergenic	novelGene_80543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_7	62.3920521067384	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	327	2030	272853	278399	FALSE	25	GGAGAAACTCCCTCGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	260760	278449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_260819_261003_261219_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
617733	contig_13021_pilon	-	2368	10	Intergenic	novelGene_8229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	466.310128350724	14	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	31	1077	236115	210494	TRUE	40	ACAAGTAAGACAATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKLESLNQNMMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236145	202279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_203365_206081_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
617741	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617746	contig_3386_pilon	-	1440	7	Intergenic	novelGene_34513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	779.879834048525	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	357	686	407739	404773	FALSE	40	ATAATTGTGTAATATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVADLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412207	404018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409465_409525_409607_412096
617747	contig_16098_pilon	-	1343	9	Intergenic	novelGene_46105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2264.23620882959	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	134	1135	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALAGAAASQSLFISNHAY	460260	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456324_456459_456660_456824_456992_457137_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
617753	contig_14638_pilon	-	2024	5	Intergenic	novelGene_71558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.773715202455	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	42	314	277550	254501	TRUE	10	GTGGTGTGTTCTTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNKPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_252887_252929_254614_262339_262459_277509_277556_277660
617754	contig_10748_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_150751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCTTTGGGAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174917	176184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_174900_176200
617756	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617762	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_19102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCAACCGCCGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
617771	contig_16122_pilon	+	701	2	Intergenic	novelGene_134503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	118	522	131969	132738	FALSE	35	ATTATTTTGGGATCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVPLVLLRGATTEQGLPHFLHPVRPHELIPRILGPLPSMNAAIPHHSQCHLQPRNFNWIGDPAAKGPCSLLMKKSGRRYFSSARVGLTSQASRRLEAINRALAGSVPPSLTPKQGYLLHPGRVASDSWTGCTLPSMVDSAHRAVKARELTFCPASAPLLQRSSALLNISHHR	131851	132917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_132123_132487
617776	SIRV5	+	407	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-80	878	34	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8235	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
617791	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGGACTCGGAGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
617794	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
617804	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_89617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653781	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617808	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_89572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653771	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
617819	contig_10011_pilon	-	2326	4	Intergenic	novelGene_68065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	58.0344725141876	105	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	597	1751	242740	236529	FALSE	30	ATACATGTGTGTATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKMEITLSLQPHSPDSPKQERHIIAKLEERQEPALHNNRRDPELSRQRFRQLCYQELSGPKEALCRLGQLCREWLQPELHTKEQILELLVLEQFLTILPPEIQTWVRKRCPVNSKEIVNLVEEFHRASKRPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGAQLGEQELPDFLEESSQAEPQDQLSHHHGEKYHLLQEPTLKLAGTEATRMRSDNKENPQQEGTKGAKPCAVSADRSKGNGLQSPEHTAVNMSEPWLSPRQVSPPNAQKPFTHHQRHCRQLEYISSPLKSHLLRDVEKSNHLERLGHPKKSYKCDHCGKSFSFNSELERHKRVHTGERPYTCEVCGNCFGRQSTLQLHQRIHTGEKPYHCNLCGKSFRQNSNLRKHQSLHHGE	243508	235953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_237092_241170_241355_242332_243019_243190
617826	SIRV7	-	353	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-19	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114757	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
617831	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
617838	contig_14441_pilon	+	1610	7	Intergenic	novelGene_100361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	350.658626333678	3	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	378	1424	26678	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTGAMLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23052	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_26652_26781_26886_27189_113646_113711_116578_116963_117220_117344_117539
617841	contig_7202_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_17763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACGTAGTCACCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
617848	scaffold_17907_pilon	+	2170	17	Intergenic	novelGene_150757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	98	junction_1	155.13803077824	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	2	2026	19269	81494	FALSE	40	AGATTTAAACTAATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGLVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTSDQDTLISGILRVLEKDSEVIVDWRPLDDALDSSSILYARKDSSSVVEWTQAPKERAHRGMEHLNNYEAEWDMVNTVSFKKKPHTNGDAPSHRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQSREGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLIDSLEKYVVLCDSPQDKRTLLVNCQNKSLSQSFENLLDEPAYGLIQKIKKDPYTATMVGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLAEWSKHIDSEGRILNVDSVKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSVSEEQERRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDILSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQIQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWTELPCKNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDVLCKAEAISLQMAKCKELPQAVCEILGLQNSEVPTPDSDIGEDENVGMTSCPTPAFHSNSLPLLATSGSRDDNPPQISVSPNVSRLTPA	19267	81638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_19299_33766_33866_34290_34366_41628_41768_46177_46389_53576_53680_55156_55355_56657_56787_57275_57380_58385_58481_67571_67689_72988_73090_76862_76963_77368_77467_79542_79660_80188_80276_81272
617851	contig_15087_pilon	-	2597	26	Intergenic	novelGene_37197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_23	986.972083901059	1	112	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	355	1068	149033	138311	TRUE	30	TAAAATGAGTGACGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDE	181131	110646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138186_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149713_150480_150572_158907_158952_181066
617853	contig_312_pilon	+	2294	13	Intergenic	novelGene_128308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_10	244.371458485279	37	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	31	1353	402673	440781	FALSE	30	GTACCTAACTGTGTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGTAAGALSMARLVLSLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKVATALKDIVKVGAVDADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRAEDYQGGRTAEAIVDAAISAVRQLVKDRIGGRSGGYSSGRQGRSESSSKKDVIELTDDTFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAATEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLANRYGIRGFPTIKIFQKGEPPVDYDGGRTKSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIISEDIAKKTCEDHQLCVVAVLPHILDTGATGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	402642	441722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415_409558_414598_414657_415103_415231_424174_424282_428888_429020_429396_429512_430056_430198_433659_433745_433872_433946_435041_435201_439433_439531_440712
617856	scaffold_9100_pilon	+	1642	8	Intergenic	novelGene_83283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	509.37713064535	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	98	1096	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPYALQQGSWQKPHEELASRLINVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	646186	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_646260_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
617867	contig_2733_pilon	+	2138	8	Intergenic	novelGene_128540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_7	277.272282003353	1899	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	267	905	504770	614101	FALSE	10	GTGTTCTTTTTTTATTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGSQGGQQAGGGCC	504503	615334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_504816_544501_544574_560425_560494_570777_570861_571294_571388_578069_578182_611519_611589_614005
617869	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
617871	contig_11994_pilon	+	4178	1	Intergenic	novelGene_129338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTGTTAATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51240	55418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_51200_55400
617887	contig_10235_pilon	-	2278	8	Intergenic	novelGene_46594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	47.7818170522671	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	655	1179	588881	587184	FALSE	10	GATCTGGGCTCTTTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLPGRCVPIAKRELLWAGSAGLACWLAGVIFIDRKRTGDAINVMSEVAQTLLTQDVRVWVFPEGTRNHNGSMLPFKRGAFHLAVQAQVPIVPIVMSSYQDFYCKKERRFTSGQCQVRVLPPVPTEGLIPDDVPALADRVRHSMLTVFREISTDGRGGGDYLKKPGGVAEARL	595806	586084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_587369_588247_588321_588449_588546_588710_588887_589221_589357_589564_589774_594765_594840_595575
617888	contig_10158_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_150768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1128	1469	26184	26525	NA	75	GGAAAGAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAHLISRDFKMHCLEWRFWLFITMQSHAFWIFRNRGKGKNLWGLCAASRFELQNVLIPLYCESPQDNGGSGIQDLRRPLFPTQKTAGIHLERCRSVLALLTSYSSHISKQM	25056	27366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_25100_27400
617891	contig_6760_pilon	-	1932	12	Intergenic	novelGene_150800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	84.3653996680927	409	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	135	1748	435262	402618	FALSE	10	TTCTCCCAGCATCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFANLRKVLISDSLDPCCRKILQDGGLQVVEKQNLSKEELIAELQDCEGLIIRSATKVTADVINAAEKLQVVGRAGTGVDNVDLEAATRKGVLVMNTPNGNSLSAAELTCGMIMCLARQIPQATASMKNGKWDRKKFMGTELNGKTLGILGLGRIGREVATRMQSFGMKTIGYDPIIPPEVSSSFGVQQLPLEEIWPVCDFITVHTPLLPSTTGLLNDSTFAQCKKGVRVVNCARGGIVDEGALLRALQSGQCAGAALDVFTEEPPRDRALVDHENVISCPHLGASTMEAQSRCGEEIAIQFVDMVKGRSLVGVVNAQALTSAFSPHTKPWIGLAEALGSLMRAWAGSPKGTIQVVTQGTSLKNAGNCLRPAVIVGLLKEASNQADVNLVNAKLLVKEAGLNVTTSHSPAAPLLPGEQQGCGECLLTVTLAGAPYQAVGSVQGTTPVLQALNGAVFRPEVPLRRGLPLLMFRAQPSNPAMLPTMIGLLAEAGVQLLSYQTSVVLNGETWHVMGISSLLPSLEAWKQHVTEAFQFHF	435396	402433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_402773_403802_404053_405679_405811_407060_407194_409110_409264_411082_411232_411721_411855_418731_418831_418930_418986_423119_423186_425004_425157_435124
617895	contig_9706_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_20929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207812	206291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_206300_207800
617896	contig_6842_pilon	-	1214	4	Intergenic	novelGene_130711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_3	147.443397802532	2522	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	91	654	433953	429481	FALSE	30	CCAGGACTATCGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGCSESVLLGCRALRQLLHSRLPAPLGPAMPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	434043	428920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547_432658_433818
617910	contig_10299_pilon	+	1968	16	Intergenic	novelGene_79691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.7230469545992	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	953	1810	337976	340377	FALSE	15	TTGACATGCTTGTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320498	340535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_334703_334789_334912_335029_335130_335176_336817_337087_337220_337257_337438_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
617913	contig_18055_pilon	-	2277	2	Intergenic	novelGene_117791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	0	4	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGCTTGAACTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23018	4333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_5353_21760
617916	contig_5686_pilon	+	1886	9	Intergenic	novelGene_45247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1746.34353722285	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	55	798	93843	189126	TRUE	60	TGAAAGAAAAAAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGILFPVQRE	93788	194176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189979_193940
617922	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_19010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
617939	contig_8476_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_121356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCCCTCTGTATGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208088	210542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_208100_210500
617948	contig_2487_pilon	+	2644	1	Intergenic	novelGene_148473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167878	170522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_167900_170500
617950	contig_13850_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_141169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGTCTTGTTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49087	51249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_+_49100_51200
617958	contig_2892_pilon	+	1748	8	Intergenic	novelGene_119012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1095.6084322123	2710	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	397	708	324837	331810	TRUE	10	GTTTTTGCTGTAGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRFSTYFPGYFDGQYWLWWVFLVLGFLLFLRGFINYAKVRKMPETFSNLPRTRVLFIY	264897	339507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265051_305260_305301_318539_318671_324764_324853_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
617959	contig_5988_pilon	-	1367	5	Intergenic	novelGene_16006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.641695452624	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	94	690	693353	690197	FALSE	35	GTTAATATGTCACAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVMTSVVETLILSAQPILT	693446	689519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690251_690335_690504_690859_691009_691134_691358_693350
617961	contig_15459_pilon	+	1471	4	Intergenic	novelGene_106358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	321.702761360027	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9151	10958	TRUE	30	AATTTTGTGACTAACCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKADTNKDRIENANARAKKLIES	8161	12148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892_11507_11597
617991	contig_10013_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_125053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242333	241561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_241600_242300
617995	contig_2100_pilon	-	1362	9	Intergenic	novelGene_50690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	862.359118928999	8	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	438	1013	1174340	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185519	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1178740_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
618002	contig_5247_pilon	+	1915	12	Intergenic	novelGene_81791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	233.674634290382	21	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	248	1576	130402	161215	FALSE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAGSGAQRSGGRRRTRGSSSGGSGCGGISLSHRLRSFPPRGSPSSLRSALPAPLARPGAAAFLSLLFSSDRTRRRAQTTATMGKGVGRDKYEPAAVSEHGDKKKAKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRGLTTARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	130154	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_130414_141035_141141_141772_141833_144123_144328_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
618004	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618021	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618022	contig_13004_pilon	+	2110	9	Intergenic	novelGene_112705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	317.706527317271	116	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	965	1579	943766	952167	FALSE	10	CTTCTCTAGAGTGTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837832	952698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039_898240_923623_923840_926828_926989_927531_927669_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951
618024	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618047	contig_12050_pilon	-	2427	3	Intergenic	novelGene_62693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	161	15	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	226	969	617317	616574	FALSE	25	AGCAGACTCTGCAAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQVRRGGRCCEVVGAAGGWDCRAPACLCIWDGSRGQIQSFLKGNQRHQALGDTGPLARSCSLLKRRWRKLNWPPEGVSPGDGAYHRGLCRGLLGRGRPPGL	659663	615115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_617366_617771_617890_659604
618048	SIRV6	+	731	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGACATCTGAGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	11182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
618056	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618058	SIRV4	+	329	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	648	971	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
618061	contig_7202_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_18667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCCATGGTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
618073	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618087	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_18858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCATCCCCCTCGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
618089	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	69	513	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
618098	contig_5684_pilon	-	1054	3	Intergenic	novelGene_81012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_2	876.5	36602	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCGTTTGTTCATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361770	351244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_358810_361315
618105	SIRV7	-	345	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33224	0	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
618107	contig_7870_pilon	-	936	5	Intergenic	novelGene_108971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_2	332.38334419763	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	240	548	496465	370804	FALSE	60	AAAACATATAATAGGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQGK	497931	370415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
618121	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_97244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
618122	contig_12427_pilon	+	2191	11	Intergenic	novelGene_40591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	434.984827321597	424	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	18	1781	624033	656818	FALSE	20	TGTGAATGTTTCCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVPVMEVSAACLFLVLLLGAWAPALGSASSEVLPLVNEDVKRTVDLSSHLAKVTAELEPELEARLAHLGVQVKGEDEEENNLEVRETKIKGKSGKFFMVKLPFALDPGAKISVIVETVYTHVLHPYPTHITQSEKQFVVFEGNHYFYSPYPTKTQTMRVKLASRNVESYTKLGNPTRSEDLLDYGPFRDIPAYSQDTFKVHYENNSPFLTITSMTRVIEVSHWGNIAVEENVDLKHTGAVLKGPFSRYDYQRQPDSGISSIRSFKTILPAAAQDVYYRDEIGNVSTSHLLVLDDSVEMEIRPRFPLFGGWKTHYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALKMRFVDHVFDEQVIDSLTVKIILPEGAKNIQVDSPYEISRAPDELHYTYLDTFGRPVIVAYKKNLVEQQIQDIVVHYTFNKVLMLQEPLLVVAAFYILFFTVIIYVRLDFSITKDPAAEARMKVACITEQVLTLVNKRIGLYRHFDETVNRYKQSRDVSTLNSGKKSLETEHKALTSEIALLQSRLKTEGSDLCDKVSEMQKLDGQVKELVLKSAVEAERLVAGKLKKDTYIENEKLISGKRQELVTKIDHILDAL	624015	657228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_624189_624248_624294_627551_627617_635029_635337_643626_643837_644727_644921_649146_649247_650460_650600_650876_650997_655080_655327_656635
618125	contig_14513_pilon	-	1293	4	Intergenic	novelGene_70338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
618141	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_115860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
618156	contig_312_pilon	-	1392	2	Intergenic	novelGene_128310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	121	459	417345	417007	FALSE	65	TCTTAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	423403	416073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_417365_423302
618163	contig_12852_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_141441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGATGTAGAGCATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368345	367791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_367800_368300
618168	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_94873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
618169	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618174	SIRV7	-	344	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	5	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78840_78964_114680
618182	contig_7963_pilon	+	1581	5	Intergenic	novelGene_58499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	111.916263340053	81	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	513	1295	145910	149953	FALSE	10	CTCAATGTGGCTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145397	150239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149419_149546_149948
618184	SIRV4	+	411	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	98	441	98	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1553	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
618190	contig_12270_pilon	-	254	2	Intergenic	novelGene_114135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGGTCCCTGACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618194	contig_19564_pilon	-	1970	2	Intergenic	novelGene_29671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	84	608	70080	68236	FALSE	35	AAGGTACATTACCTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPASGRAHPCEEAGGRLGRRFLRSRNIMYQSCRGTTRRLSPCLRAYQTRPQNQLSPRALPFPPLWPHSTTTTSPSFPLLWSPPHPCPSTWPLLQAPSLPLPQVQALSSPWVVLPPGNGEEGLGPELHRGCLDGLRSLFEGPPCPYPGALIPFQAPGTTHSSPATPSGDPSMEEHLAVMYEKLRQEVSHFESGLCPQWEGYR	70163	66873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_68689_70008
618200	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
618221	SIRV4	+	219	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1552	632	1097	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
618222	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618227	contig_14681_pilon	+	1636	8	Intergenic	novelGene_134205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_1	83.3176856057216	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	160	867	50409	71147	TRUE	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	50249	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_50634_56129_56208_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
618233	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618245	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	632	1116	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
618246	contig_17753_pilon	-	2354	10	Intergenic	novelGene_105063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	396	773	141857	137902	TRUE	0	TCCCGCTGCTCTCGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEDDREDAGGGVPPVALQPVVEDILDEGRVVDEDLLLFHLDLCGDGDIGMGDGALGGGTDYPLQVNSLEGDQDHVDVLPQLPEALRIHKMVGGLAPNIGLKPYRGGLVHPQHKVMLVYLGAIL	147853	45524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_45695_74888_75171_96132_96218_130833_131723_137746_137944_138963_139146_140838_140883_141747_141872_143094_143391_147768
618259	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_97599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
618291	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618294	contig_7045_pilon	-	1994	8	Intergenic	novelGene_77439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28.1780056072107	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	19	624	279183	256998	TRUE	15	TGATTCTCTGGGCTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPVLETSHVFCCPNRVRGSLSWSPGPGGLLAFGTSCSVVLYDPQKRVVITNLNGHTARVNCIQWICKQDGSPSTELVSGGSDNHVIHWEIENNQLLKAVHLQGHEGPVYSVCAVYQRRASDVTLHTLIVSAASDSTVRIWSKKGSEVTCLQTLDFGNGFGLALSLSFLPNTDVPILACGDDDCKIHLFVQKNDQVEIFS	279201	254465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_255713_256874_257016_258389_258455_260770_260849_261668_261826_272262_272334_275191_275271_279045
618299	contig_7887_pilon	+	2009	11	Intergenic	novelGene_124892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	95.4038259190898	332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	319	1947	336888	341054	FALSE	15	CCCGTGCTGTCTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGQTSRGRNESEEEEGPKHLSRIDTMAASLTVLLLLQAVSWASGARPCIPQSFGYSSVVCVCNATYCDSLDPLTLPALGNFSLYESTRSGRRMELSTGTVQTSRTGTGLLLTLQPEQKFQKVKGFGGAMTDAAALNILALSPAVQNLLLKSYFSEEGIEYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADITNDFQLHNFSLPEEDTKLKIPLIHRALEMTQRPISLFASPWTSPTWLKTNEAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLRFWAVTAENEPTAGLLSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPILANSTHRDVHLLILDDQRLLLPGWAQVVLADPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPAKATLGETHRLFPTTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGTQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDSPIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASAKNDLDTVALVRPDGSAVVVVLNRSSKDAPLTIADPAVGFLETMVPGYSIHTYLWRRQ	336569	341116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_336933_337150_337239_337503_337696_337808_337956_338262_338397_338619_338793_339030_339269_339579_339805_340204_340369_340720_340838_340948
618304	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618319	SIRV4	+	298	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	197	455	197	-455	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTACCTCTTCAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	2316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
618324	contig_11429_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_60446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_3	760.773820235394	7775	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	109	579	46162	48504	TRUE	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45383	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899
618326	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_97797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
618332	contig_11292_pilon	-	1498	13	Intergenic	novelGene_109415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	292.954869485994	36	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	185	856	167479	164534	TRUE	5	TCCCTGCCACCTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELNDPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKPCWPGLVLHRLRPPS	167663	161771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164699_164765_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
618334	contig_16303_pilon	-	1967	8	Intergenic	novelGene_34060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.734880099972	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	421	1050	38748	35759	TRUE	50	ATATAACAAAACATTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45393	32602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33158_35396_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38849_40433_40731_45370
618338	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4251	35	3076	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
618351	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	11	367	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14419	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618359	contig_14243_pilon	-	2852	6	Intergenic	novelGene_57444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	76.5950390038415	90	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	2122	2697	705976	702878	FALSE	40	GTTGGAAAGCTTTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	708097	702722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856
618374	contig_7202_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_17491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27785	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
618377	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618378	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618380	contig_17989_pilon	-	1681	6	Intergenic	novelGene_150814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_2	587.075940573279	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	380	1165	205841	201145	FALSE	50	AAATTAAAAAACCCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVGGLSWDTSKKDLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDSTSVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKKAMAMKKDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKSNKRRGFVFITYKEEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVYQQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGSGGQSQSWNQGYGNYWNQGYGYQQGYGPGYGGYDYSPYGYYGYGPGYDYSQGSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY	206220	200628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_201521_201663_202346_202465_204529_204662_204856_205016_205676
618382	contig_2365_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_103756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	150.756595279968	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	300	1193	258130	319997	FALSE	30	ACGATACCTAATGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCAGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESNCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYETSAQEELLSDSELSRTYLP	248940	320540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_249030_254096_254242_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_319819
618392	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
618403	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
618405	contig_8452_pilon	-	2610	16	Intergenic	novelGene_47971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	369.67695206611	66	115	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	130	1629	145829	85269	TRUE	15	TCTTCCTTGCATCATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNTQFEPIRFHVRFLSSRSTQSRCLVLSWEGFCHLGVSLYSFSSF	145958	74482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85401_85909_86070_91579_91638_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
618406	SIRV4	+	561	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	389	0	-389	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	301	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTAGAAGTCTGACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
618409	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
618430	SIRV7	-	236	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69044	0	35825	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78913	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
618435	contig_6710_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_89141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653670	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
618450	contig_5482_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_144443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATAAAAAGTCTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264620	262254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_262300_264600
618451	contig_8693_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_150880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	886	1224	1168584	1168246	NA	25	GTCCCTGAGGGATGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRNFTKDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHFTPTLLARIKKTENNKCWRDCGEIGTLMHCWWECKMVQPFWKTIWHFLKNLEIEIPYDPAILFLGLYPREIRAIT	1169469	1167792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1167800_1169500
618465	contig_15304_pilon	-	1107	4	Intergenic	novelGene_30686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	393	989	106308	105631	FALSE	5	CAGCTCTGCCCTGGGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107219	105512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
618466	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
618468	contig_7870_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_108973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCATAAATGACAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381521	381128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_381100_381500
618473	contig_2204_pilon	-	1919	7	Intergenic	novelGene_71653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1481	1810	25709	14748	TRUE	80	GAAAAAAAAAAAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTVLSTSFFIAEVRTAYSGERSLTPLLSPKDDSTGSCLMCLTLSSFSVFVFFPFLEGRSDKGNILYTLKALFPFFMLLSLTSSISGKEFMAHRKFAFHVFGSGLSTPG	51175	13174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_13275_14738_14916_15420_15468_25594_25713_38677_38843_48667_48715_49910
618478	contig_6497_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_35551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCTTTACGGAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128686	128286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_128300_128700
618486	SIRV2	-	620	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	35	3077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
618492	contig_15859_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_50225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGTCAAATATATGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377528	378986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_377500_379000
618515	contig_1301_pilon	-	980	3	Intergenic	novelGene_47346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	928	junction_1	226	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	83	514	322831	305175	FALSE	40	CAAATGATTTACTTAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVVGFLNILNILTFRNNSFSLNCYKNINYVI	322913	304708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_305410_309751_309912_322794
618518	contig_17440_pilon	-	151	1	Intergenic	novelGene_7584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAGTATTAGGTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2164	2013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_2000_2200
618530	contig_14322_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_116501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGCAAATAAACGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
618536	contig_15063_pilon	+	1691	6	Intergenic	novelGene_13104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	3	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	203	1441	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34605	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
618540	contig_5947_pilon	+	2102	9	Intergenic	novelGene_101614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_3	75.0690307317205	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	641	1438	995846	1005780	FALSE	10	GGGAATTTTTTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	993346	1006444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737
618556	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618560	contig_12638_pilon	+	1938	11	Intergenic	novelGene_33237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_8	19.1885382455256	627	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	73	1809	737245	764546	FALSE	35	AATTACGAATCTAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737172	764675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_762088_762211_764045
618579	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_97959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
618591	contig_13292_pilon	+	2162	20	Intergenic	novelGene_142924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_16	207.839406361174	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1986	175	2160	148568	548788	FALSE	55	AGTACAAGAAAATTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLSETRHPLQPEEQEVGIDPLSSYSSKSGGDANKNGRTSSTSDSDGTFNSYRKEWEELFVNNNYLATIRLKGINGQLRSSRFRSICWKLFLCVLPQDKSQWISKIEELRAWYSNVKEIHITNPRKVVGQQDLMINNPLSQDEGSLWNKFFQDKELRSMIEQDVKRTFPEMQFFQQENVRKILTDVLFCYARENEQLLYKQGMHELLAPIVFILHCDHQAFLHASESAQPSDEMKTLLNPEYLEHDAYAMFSQLMETAEPWFSTFEHDGQKGKEALMTPIPFARPQDLGPTIAIVTKVNQIQDNLLKKHDIELYMHLNRLEIAPQIYGLRWVRLLFGREFPLQDLLVVWDALFADGVSLSLVDYIFIAMLLYIRDALISSNYQTCLGLLMHYPPIGDVHSLILKALFLRDPKRNPRPVTYQFHQNLDYYKARGADLMNKSRTNAKGAPLNINKVSNSLINFGRKLISPAVAPGSAGGPVPGGSGGSSSTAGIPTRTSAEAPKPHLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRLMKSESMPVQLNKGDVVTGSDAQVYVPVQTLTDLQGQSSKNISSSPSIESLPGGREFTGSPPSSATKKDSLFSNISRSRSHSKTMGRKESEEELEAQISFLQGQLNDLDAMCKYCAKVMNTHLVNIQDM	66994	548790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_67134_148532_148665_241658_241726_262862_262972_264453_264544_264639_264715_265803_265872_288559_288663_295514_295604_297098_297150_297247_297318_302678_302852_373571_373715_389668_389776_426697_426784_445078_445390_449612_449679_471397_471562_516722_516823_548771
618592	contig_3789_pilon	+	2045	5	Intergenic	novelGene_79841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	260.925276659813	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	197	526	445610	468597	TRUE	10	CAGTGTTTTCCATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGLLSTLGYPWIQLYHRRLSNQ	445413	473622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_467056_467110_468585_468697_472202
618593	contig_12425_pilon	+	1810	9	Intergenic	novelGene_46700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAAGAAAAGGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203452	211200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204322_204828_204962_206555_206669_207179_207327_207650_207734_208652_208764_209380_209497_210302_210388_211047
618597	contig_7963_pilon	+	2424	12	Intergenic	novelGene_58582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	202.837719608232	1	72	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	853	2187	264063	269915	FALSE	40	TTTCATTATTACATCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	259749	270152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260888_261040_261156_263629_263761_264031_264231_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
618613	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
618615	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618618	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618620	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
618624	contig_6710_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_89201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
618638	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618644	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
618650	contig_10297_pilon	+	930	7	Intergenic	novelGene_112539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.0364161364994	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	15	566	543854	554450	TRUE	25	TTGGTACCATGGAGACGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSTMASGCKIGPSILNSDLANLGTECLRMLDSGADYLHLDVMDGHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMNHLFPRVCLGSLVEDPVPVFGHRGRWWSRS	543839	558025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543976_548403_548484_553280_553421_553806_553923_554356_554473_557036_557305_557951
618657	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
618668	contig_11256_pilon	-	3035	1	Intergenic	novelGene_150890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1421	1822	14791	14390	NA	65	GAATAAAAAAAAAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTEKELMPLNYGVVKSTEHTRHCQKNEQICLGRSTVRTLIRSIFGRVIRRDQSLEKDIILGKVEGQRKRGRPSVRWTDTVAATMGSNTAMIVRMAQDQAVFCSVAHRVAISWNGLDGTKQQQYALFEFLLV	16211	13176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_-_13200_16200
618685	contig_2453_pilon	+	2351	12	Intergenic	novelGene_147762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	56.2531174526399	81	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	101	1318	56543	60410	TRUE	5	TCTGGGTTTATTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGYD	56285	63156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56357_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60786_61900_62016_62422_62836_63026
618686	contig_12837_pilon	+	1483	8	Intergenic	novelGene_57309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	2218.19382307649	4	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	225	668	129778	166049	FALSE	25	ACCAATGAGTTAGCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128786	166864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
618724	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
618733	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_91312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
618745	contig_7202_pilon	-	399	2	Intergenic	novelGene_18596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGATGAAGCTGCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	28541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
618748	contig_8317_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_19553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	471	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
618752	contig_16400_pilon	+	810	3	Intergenic	novelGene_150896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	17	2169	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	172	366	16949	36995	FALSE	30	AACAAAGCTGTCTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQYNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVMYLKEILREIGIQNVKGTHKNTWELKPEYRHYQGEEKSD	3464	37439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879_17024_36875
618755	contig_8365_pilon	-	2987	8	Intergenic	novelGene_150906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	43.3975453081797	159	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	55	1017	63377	12440	FALSE	10	GTGTGATTTTCTTTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDSSLESSLDNSCQGAQMDNKSEIQLWLLKRIQVPIEDILPSKEEKSKTPPMFLCIKVGKPMRKSFATHSAAMVQQYGRRRKQPEYWFAVPRERVDHLYTFFVQWSPDVYGKDAKEQGFVVVEKEELNMIDNFFSEPTTKSWEIITVEEAKRRKSTCSYYDDEEEEVLPILQPHSALLENMHIEQLARRLPARVQGYPWRLAYSTLEHGTSLKTLYRKCALLDSPVLLVIKDMDNQIFGAYATHPFKFSDHYYGTGETFLYTFSPNFKVFKWSGENSYFINGDISSLELGGGGGRFGLWLDADLYHGRSNSCSTFNNDILSKKEDFIVQDLEVWTFE	63431	10469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_12576_13125_13200_13635_13732_15371_15525_17725_17852_30841_30990_62393_62563_63316
618763	SIRV4	+	483	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	467	0	-467	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGTCGGAAGAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
618769	contig_10011_pilon	+	2745	8	Intergenic	novelGene_68041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_7	159.325107236488	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	147	608	136184	140376	TRUE	55	CACAGCCAAACAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALYTNQTLLSLNLRENSINPEGAQALARALCTNSTLKNLDLTANLLRDQGAQAIAEAIRENRALTSLHLQWNFLQAESGQGPGTSTTAQQQPGQLGFTGERHRGRRSFRSGQGAEGKHGPHRPLPPGDLHRCLWGPGPGGSPGGEQNLGDS	136037	143634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_136225_136715_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139856_140292_140377_141077_141162_141581
618774	contig_5317_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_76603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694234	696352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_694200_696400
618778	contig_3270_pilon	-	1936	12	Intergenic	novelGene_104448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	95.6706644330322	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	304	1908	64325	48840	FALSE	15	CTTAACGCCTTGCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMVCYEEKEVLVKTSWDPGF	78132	48811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_70709_70822_78048
618781	contig_5018_pilon	+	732	4	Intergenic	novelGene_47163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_1	124.946210649045	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2	496	1498400	1500271	FALSE	35	ATTAGGAACAGGTGCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498398	1500507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
618782	contig_13664_pilon	+	2133	3	Intergenic	novelGene_144192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.5	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	146	463	16659	34981	FALSE	40	TACAAAGTGTCATCATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRVGDNLAEDERYTILEEEFFSFQKSWLFGDLSLVATFQSSLFTSSEMFLTISRKNMSQKLSFLLLVFGLIWGLMLLHYTFQQPRHQSSVKLREQILDLSKRYVKALAEENKNTVDVENGASMAGYADLKRTIAVLLDDILQRLVKLDYQWY	16513	36651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_16897_34857_34921_34964
618794	contig_10930_pilon	-	986	3	Intergenic	novelGene_37055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2501	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATTGTTTTCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280385	277960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_278637_279700_279804_280178
618797	contig_7744_pilon	-	2375	7	Intergenic	novelGene_62472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	46.4880510334526	62	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1022	1738	488892	487677	FALSE	30	AACCCTAAATGGTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRYQACRCEDPGRWLKEAQPRCGGGNREAGEDCGLGVGVSPGLTRMQEGTNLHRQVGRPWELSSLSPGPRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	490819	487039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_489172_489350_489572_489750_489944_490491
618823	contig_6975_pilon	-	1397	10	Intergenic	novelGene_74260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_9	379.460760996183	178	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	173	1174	164514	159453	FALSE	20	CTGATGTTGATACTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169976	159229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_163849_164402_164538_169827
618826	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
618831	contig_8069_pilon	+	1795	14	Intergenic	novelGene_136772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	85.7378693957385	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	275	1237	394109	467153	TRUE	30	AAATGAGCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKVIILLVLSTLNPSDGLFHSLYQNVQVSTPKRGDPGKPLFLTPYIEAGNTVKGKELSLVSPFLGTNLKSYCGYITVDKTYNSNLFFWFFPAQVQPEDAPVVLWLQGGPGGSSMFGLFVEHGPYVVTSNMTLRTRDFPWTTTFSMLYVDNPVGTGFSFTDDPRGYAVNEDDVARNLYSALIQFFQLFPEYKENDFYATGESYAGKYVPAIAHYIHTLNPMAELKINLKGIAIGDAYSDPESIIGGYAAFLYQIGLLDEGQQKYFQNQCDECLKHIKQGNWTKAFEILDRLLDGDLTDEPSYYENVTGCTNYYNFLQCTK	380941	513501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_381068_388703_388829_394085_394272_411726_411846_429363_429479_430568_430628_432622_432703_440137_440205_455951_456075_456429_456562_465445_465545_467147_467276_486785_486969_513248
618832	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
618852	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
618853	contig_6102_pilon	-	1674	10	Intergenic	novelGene_32130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	304.713344345505	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	23	1609	822105	816763	FALSE	15	CAGTTTTCTGTGTAGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822127	816697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
618856	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCATCCCCCTCGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
618858	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
618861	SIRV4	-	203	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTAAAGAATCTAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
618873	contig_3077_pilon	+	1554	10	Intergenic	novelGene_26726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3405.09325845349	3	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	504	1187	13867	17590	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEEGQGALVGGLTLDFPAGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10114	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17741_17866
618874	contig_5671_pilon	+	1086	6	Intergenic	novelGene_79410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2088.44123690373	25	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	143	526	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPEGYQDYEPEA	368782	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521264_531205
618879	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618881	SIRV7	-	350	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
618890	contig_3095_pilon	-	610	4	Intergenic	novelGene_75245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	433.811787145839	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTGTACTCTGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248598	246376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476
618895	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_18169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618906	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	641	1112	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
618908	contig_15105_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_150985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGAACACACTAGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667110	666827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_666800_667100
618932	contig_2100_pilon	-	846	4	Intergenic	novelGene_50616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_3	79.3263302231149	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	163	486	836402	813534	FALSE	45	GAAATAAATTTAGTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPFSPCRRLNSTQGEIRVGPSHQAKLPDLQLFPSPDGDTVTQHEELVWMPGVNDCDLLMYLRAARSMAAFAGMCDGGSTEDGCVAASRDDTTLNALNTVSLLLSP	836564	813173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_813658_814882_815008_822281_822331_836376
618937	contig_5145_pilon	+	2798	7	Intergenic	novelGene_131385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	112.998033414549	214	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	120	920	616971	628880	TRUE	45	AAATTTATAGCGAGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFYPRYVLPLAFGKYFASVSAHVSIWKVPVSYAHTVKATMPIWVVLLSRIIMKERQSTKVYLSLIPIISGVLLATVTELSFDMWGLLSALAATLCFSLQNIFSKKVLRDSRIHHLRLLNILGCHAIFFMIPTWVLVDLSAFLVSSDLTYISQWPWTLLLLAVSGFCNFAQNVIAFSILNLISPLSYSVANATKRIMVITVSLIMLRNPVTSTNILGMMTAILGVFLYNKTKYDANQQARKHLLPITTGDLSSKEHPRGTLEKPQNGLLFPQHTDYPYGRNNILTDHFQYGRQNYPNTYSLNRYDV	616555	631173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_616664_616959_617031_619662_619801_620961_621088_626851_627098_628649_630213_630627
618944	contig_6710_pilon	+	534	2	Intergenic	novelGene_97424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
618945	contig_3627_pilon	+	1976	1	Intergenic	novelGene_78519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625407	627383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_625400_627400
618948	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
618957	contig_610_pilon	-	2424	4	Intergenic	novelGene_76818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	86.6653846059018	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	49	921	343470	333164	FALSE	80	TGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSGKCLLRNPLHPGQPLPIPQHLCLPSLGL	343518	331660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_333517_333619_333950_334228_334370_343421
618958	SIRV6	+	760	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-343	-16	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	60	395	2002	10736	TRUE	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1942	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
618960	contig_2817_pilon	-	2127	2	Intergenic	novelGene_104340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	106	414	274701	274393	TRUE	45	GGCATTTAAATAAATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLPHFPDHQQPLLPKLKKKKKFILIFESLFQESHIFKTENKDVRRNCLLSPVLLYELLPFILLTSQTQILLRTPQSSSPTRSSSSHLPSTPPSPIPQPQI	274806	271123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_271338_272893
618973	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
618982	contig_12102_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_151062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAACACTGTAGAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87636	101316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_88631_95072_95275_98226_98295_100664_100808_101288
618990	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
619006	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619019	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619023	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619030	contig_1594_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_138845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1046	1369	691161	691484	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTRKVINPRDRKGYINQRLHHPETRTRWCPATTNDRPDREHNRESMMVQEKNRVQNSNSSKKTRLNRLRLEVPQKAWPPDSVNPELKQFLRPTLQTGLWDIK	690115	692321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_690100_692300
619031	contig_8017_pilon	-	2167	4	Intergenic	novelGene_65380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	248.936850537552	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	57	437	1511273	1500278	FALSE	60	AAAAAAAAAAAATGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRPARPSRLLVPGSRSAMAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERQLSPVQ	1511329	1498547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1500300_1503095_1503195_1509748_1509876_1511140
619035	contig_15991_pilon	-	1092	6	Intergenic	novelGene_70877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3026.44372159801	13	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	655	1023	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105087	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103791_104907
619036	SIRV5	+	419	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7463	1	-70	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTCTTTTGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
619055	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_96917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
619068	contig_14528_pilon	-	1963	13	Intergenic	novelGene_111263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	111.563229456065	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	8	1912	201850	188878	FALSE	25	ATGTAAGCTCCATGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRAQIHPINTSVGSNLLTTSTAIKEAFPSLTRLKIPTPATSSFLSCCISSVTLDTV	201857	188826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_189042_191155_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
619076	contig_18108_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_33466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAAAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129622	129296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_129300_129600
619081	contig_5758_pilon	-	2713	6	Intergenic	novelGene_119072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1081	junction_5	804.994012400092	59	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	165	1145	113963	92577	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEIGSPPRFFHMPRFQHQAPRQLFYKRPDFAQQQAMQQLTFDGKRMRKAVNRKTIDYNPSVIKYLENRIWQRDQRDMRAIQPDAGYYNDLVPPIGMLNNPMNAVTTKFVRTSTNKVKCPVFVVRWTPEGRRLVTGASSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSPVRAMTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREARFIHNIPFSVVPIVMVRLFSKCILGAEMHGLCQILGIFLHPINTIFFFVFTHSPFCWHLSEVVWSWYLPLQYVRDVLSAAFCTGFLFSFMVNNVYTLFFFITYCVRQEYFILNKEFSL	179155	91008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
619083	contig_14807_pilon	-	1161	3	Intergenic	novelGene_124683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13282	junction_2	90.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	366	977	38792	37336	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKVSSAPALPSPPHPAPPCPWIPDSVLCLPRSTSPRSGVLPSLMLMNLKTW	39157	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37649_38298_38438_38632
619087	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619091	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
619094	contig_1154_pilon	+	1427	4	Intergenic	novelGene_87149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	417.027577025789	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	158	547	900214	901946	FALSE	15	TTGTCCTGTGTGATGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895934	902826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896064_900185_900253_900808_900990_901776
619104	contig_3627_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_78532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAACCAAAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634750	634984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_634800_635000
619106	contig_5643_pilon	+	2631	7	Intergenic	novelGene_38956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_6	81.9444256120506	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	12	1073	495048	501081	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	495036	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
619107	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619124	contig_6589_pilon	+	1504	10	Intergenic	novelGene_26015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	985.668689485518	790	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	692	1174	1728220	1731484	FALSE	35	GGTAAAATAGCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725364	1731814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725727_1725977_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1727965_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
619138	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619140	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
619142	contig_19564_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_29596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	234	671	12638	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15665	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12712_15505
619150	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_97224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619154	contig_6364_pilon	-	2297	4	Intergenic	novelGene_51782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	49.0781689416656	392	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	173	1327	1102801	1099520	TRUE	10	CATGGTATGTGGTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPETSCPWMGHLPRLQVRTWIEPVVASTQVAASLYDAGLLLVVKEYYDAGGSSNHSASPSTRGAVEDQQQRAISNFYIIYNLVMGLTPLLSAYWLGWLSDRYHRKISICVPLLGFLLCRLGLLLKVLLDWPLEVMYAAATLKGLCGGFSAFWSGVMALGSLGSSEGRRSVRLVLIDLILGLAGFCGSMASGHLFKQIAGRARQGLVLTACSVSCATFGLFYSLLVLKVPESVAKSNKALTTVDTVSGMVGTYRTLDPDQSEKQSVVGHPPPLGKGKPPKAIIALLFVGAIIYDLAVVGTVDVMPLFVLRAPLSWNQVQVGYGMAAGYIIFITSFLGVLIFSRCFRDTTMIINVQAHKGLLLWKGVCHTAAVPGSNRGSDIHSV	1102973	1090619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1091500_1099429_1099587_1100102_1100136_1101746
619160	SIRV4	+	297	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1474	632	1019	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
619165	contig_16492_pilon	-	2007	2	Intergenic	novelGene_100285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTAATGTTTGTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113117	102742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_104502_112869
619167	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
619168	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_90570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
619171	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619178	contig_13633_pilon	+	1667	12	Intergenic	novelGene_15325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	421.226642435543	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	322	432	22853	28350	TRUE	45	AAAATCGCAACAATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	20274	49428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49023
619185	SIRV4	+	303	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-1013	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTTTCGGGTGTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1800
619190	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
619200	SIRV5	+	354	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	875	-24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
619207	contig_19459_pilon	-	1049	8	Intergenic	novelGene_59839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4124.17644963878	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	167	769	16240	6947	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLT	19130	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6951_7859_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
619219	contig_7708_pilon	+	2394	5	Intergenic	novelGene_61523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_3	56.4330355377061	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	206	1069	250654	257335	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMVSKTVSFLNAWGFLA	249493	258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187
619228	contig_2636_pilon	+	1432	3	Intergenic	novelGene_52080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGAGAAACCAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59557	85670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_59968_61644_62548_85551
619244	contig_15267_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_151066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTGAACGTGTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12399	10101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_-_10100_12400
619258	contig_13004_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_112589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCTTCAGACACTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51771	52097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_51800_52100
619279	contig_7202_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_18650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
619294	contig_1867_pilon	+	789	7	Intergenic	novelGene_54494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGCCGAGTGCGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6646	29318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_6778_10433_10520_12023_12083_14229_14404_21826_21891_23161_23293_29174
619317	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_17693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619327	scaffold_9100_pilon	+	1291	5	Intergenic	novelGene_83289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_2	223.964701459851	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	266	745	651131	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	650416	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
619329	contig_3975_pilon	-	1827	13	Intergenic	novelGene_54850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	243.214283092091	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	103	1434	2066301	2056772	FALSE	20	GAACGTTGTACATCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTRYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRISA	2079243	2056378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056783_2056892_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
619332	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619338	contig_366_pilon	-	2197	11	Intergenic	novelGene_51596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	599.876787348869	268	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	413	1471	803057	760695	TRUE	30	TTAATTAACCCAGCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGTWLVTQQRSPNHRGRP	803469	758950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_759315_760332_760748_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
619345	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
619355	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_17590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
619359	contig_12250_pilon	-	1316	9	Intergenic	novelGene_80703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	323.971811080841	1853	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	853	1182	399293	398710	FALSE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHPHPHAYSALVWGQRPGLMPSSPAPHTSSTSHRYFSERGDAVTKAAKQPHVGDYRQLVHELDEAEYRDIRLMIMEIRNAYAVLYDIILKNFEKLKKPRGETKGMIY	401337	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400659_401160
619362	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_95815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619363	contig_6710_pilon	+	543	2	Intergenic	novelGene_97028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATACACAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657792
619383	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_116184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
619386	contig_5690_pilon	+	1424	10	Intergenic	novelGene_119728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	463.090530572773	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	48	671	1044729	1094229	TRUE	25	GAGAAATTTCACGTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCD	1044681	1105966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087750_1094221_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
619387	contig_14618_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_136794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAATCCTATGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298442	297985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_298000_298400
619390	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619401	contig_5300_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_144240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGATAATGAAAGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30698	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_29900_30700
619402	contig_5300_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_144239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAAAATTTTTGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29616	27791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_27800_29600
619428	contig_11294_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_50071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGAGTGTGTAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335462	336481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_335500_336500
619429	contig_11294_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_50072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAAATTTAAGTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337034	337443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_337000_337400
619436	contig_9112_pilon	+	1433	4	Intergenic	novelGene_60210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.551661385832	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108412	114783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108616_111553_112128_113625_113750_114251
619437	contig_5684_pilon	-	643	2	Intergenic	novelGene_81029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6312	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCTCCATCTGTGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361523	351260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361315
619442	contig_854_pilon	+	1195	5	Intergenic	novelGene_36300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2878.59258145365	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1	432	545953	562402	TRUE	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQRLPGRVHPHCVTSPHRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	545952	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_545993_556963_557065_557591_557752_562271_562405_563029
619443	contig_7457_pilon	-	1747	3	Intergenic	novelGene_31712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2013	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3	413	1176900	1175459	FALSE	25	GTTTTCAGAAACAGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPPPPSAGRFHRGKGIVSYVHPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEVSSITSWYCAASGRSQILPSQFLLET	1176902	1174124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1175642_1175967_1176132_1176836
619459	contig_165_pilon	-	2118	7	Intergenic	novelGene_117067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1589	1894	61738	61433	FALSE	30	AGCCACTTACCTTAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKVLASSTGYRNTTATPTALPGAGLLPCAVHIHLVCVTCACGLSRWTWLAPTGRQCWHLLSNDQGCHMPPCNATHLTLCQGHSTFSEYSLVIKGEGGSE	72442	61208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_62056_62143_62226_63550_63586_63669_63753_64900_65064_69627_69714_71620
619462	SIRV5	+	407	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	23	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8371_8454_8586_10858
619463	contig_14925_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_55141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	287	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	15	AGGCTGTGCTCCTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
619468	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCAGGACTCGGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
619471	contig_15720_pilon	-	914	8	Intergenic	novelGene_41882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	6	872	283807	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283812	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
619494	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_97129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
619501	contig_13894_pilon	+	1471	10	Intergenic	novelGene_62123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	2545.565473573	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	660	1415	523580	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520692	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523305_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
619503	contig_9345_pilon	-	2439	24	Intergenic	novelGene_24543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	170.494532561224	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	501	2339	728826	723552	FALSE	10	CCTGGAGTCTGTGTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPASLEVVEAALVDCSVALAMPFDKFQFERLGYFSLDPDSRQGQLVFNRTVTLKEDPGKV	730162	723451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724116_724193_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728869_729088_729165_729316_729427_729770_729919_730038
619506	contig_10986_pilon	-	1374	12	Intergenic	novelGene_71476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	174.02602636169	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	86	1156	80340	67011	FALSE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80425	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_73965_74330_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
619507	contig_14513_pilon	-	726	4	Intergenic	novelGene_70320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1293.11518778835	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	198	515	18880	11499	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIF	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11505_12038_12158_13087_13136_18735
619516	contig_13375_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_151077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCCAAATGAACCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36912	38136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13375_pilon_+_36900_38100
619519	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
619520	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
619524	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
619528	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619530	contig_6434_pilon	+	2440	9	Intergenic	novelGene_61909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1577.89351272511	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	194	565	924065	927489	TRUE	25	TTACATGCATATGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEAIELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDAAKICCSDL	921558	933833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_921686_923998_924132_924283_924383_925563_925741_927460_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
619534	contig_15134_pilon	+	2666	3	Intergenic	novelGene_140229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	28.5	313	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	99	539	307508	314621	FALSE	15	TCAGATTTTTTTTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRLQLGLRAAYSGISSVAGFSIFLVWTVVYRQPATAAMGGLAGVLALWVLVTHVMYMQDYWRTWLRGLRGFFFVGVLFSAVSIAAFSTFLVLAINRRQSLTDPNSYYLSCIWSFISFKWAFLLSLYAHRYRADFADISILSDF	307409	316748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_307644_313204_313373_314484
619535	contig_6630_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_30743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	873	1208	829458	829793	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFGSQKGARSPGGAVVKGSAANQKVSSSNLPAGNPMGQLHSVLQGCYESESTRWHWVKGTMLWIKLCPPKICTGILTPIPTDVILFGNRVFFVILMSPYQCRVCPKPNQF	828585	831240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_828600_831200
619546	contig_16869_pilon	+	2187	11	Intergenic	novelGene_137585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCTCGCAGTGGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35295	84057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_+_36069_37290_37372_39061_39258_39616_39712_51938_52101_53093_53162_65283_65414_67156_67260_79171_79398_80688_80840_83855
619549	contig_18869_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_56267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
619555	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
619557	contig_11855_pilon	-	2280	11	Intergenic	novelGene_67020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_2	31.6189816407803	223	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	106	1329	1650193	1632810	FALSE	0	CTGTGGCCTGGCTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNRVAEPGWTRLGRAGRELCARCDRVGARAAAAAAMRWVRVLLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHHTLNQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINASNPKQPVHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLTLPPIKVMLALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTPQPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS	1650298	1631858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1632951_1633555_1633670_1634425_1634534_1634745_1634845_1634931_1635009_1636705_1636784_1636973_1637064_1637740_1637926_1638425_1638498_1647836_1647979_1650075
619562	SIRV4	+	336	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	203	411	203	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
619584	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619586	contig_10734_pilon	+	1242	7	Intergenic	novelGene_51296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	287.585011585946	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	15	728	1368595	1388936	TRUE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRGMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368580	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739_1389140_1389188
619592	contig_14441_pilon	+	1140	7	Intergenic	novelGene_100484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	360.158491346364	107	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	529	957	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERGPPPKHAESPAASPGTRCEPCCLGSWGLLSLELGSAFGVLVSQKPSRHICQHGTPVTIQCQGSEATYESGFTKDKFAINHPDFTFSTLTVKNSSPEDSSVYLCSAGAHNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	92175	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92266_92384_92487_92567_92708_112106_112154_116578_116963_117220_117344_117539
619599	contig_7202_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_18336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28074	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
619607	SIRV6	-	214	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTTTTTCCAGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11248	10725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11108_11205
619610	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
619625	contig_2209_pilon	-	1726	11	Intergenic	novelGene_141025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	268.178392119872	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	183	1235	275996	258117	FALSE	40	AACAAAGCAGTGATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRQTPLTCSGHTRPVVDLAFSGITPYGYFLISACKDGKPMLRQGDTGDWIGTFLGHKGAVWGATLNKDATKAATAAADFTAKVWDAVSGDELMTLAHKHIVKTVDFTQDSNYLLTGGQDKLLRIYDLNKPEAEPKEISGHTSGIKKALWCSEDKQILSADDKTVRLWDQATMTEVKSLNFNMSVSSMEYIPEGEILVITYGRSIAFHSAVSLDPIKSFEAPATINSASLHPEKEFLVAGGEDFKLYKYDYNSGEELESYKGHFGPIHCVRFSPDGELYASGSEDGTLRLWQTVVGKTYGLWKCVLPEEDSGELAKPKISFPETTEEELEEIASENSDSIYSSTPEVKA	276284	257625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_258179_262341_262408_262852_263003_265205_265343_265496_265635_266280_266378_268909_268983_270026_270109_275103_275240_275884_276039_276144
619632	contig_5484_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_151110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGGTTAGCAGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338941	340668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_338900_340700
619633	contig_5484_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_151111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAGAAAATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340927	342192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_340900_342200
619634	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
619636	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_16643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27859	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619637	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_114043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	TATTACTGTCAGTATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
619640	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
619665	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_18823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCCAGAACTACAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
619673	contig_9705_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_41760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCGAGAAAAAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504211	506093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_504200_506100
619675	contig_3727_pilon	+	1544	2	Intergenic	novelGene_146748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATATTGGCTTTTAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303664	307454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_305091_307336
619679	contig_7202_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_18467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGATTTCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27644	27897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
619694	contig_12948_pilon	+	3739	1	Intergenic	novelGene_126183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTCTTGGTTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196220	199959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_196200_2e+05
619695	contig_15042_pilon	-	986	7	Intergenic	novelGene_115427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	138	986	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
619699	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_96352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619719	SIRV3	+	141	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	2678	4176	619	-1955	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAACTTGTGGTATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4622	4763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4600_4800
619721	contig_6076_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_81717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAACACATGCCATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8874	7445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_7400_8900
619723	contig_8476_pilon	-	2110	16	Intergenic	novelGene_121334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	309	junction_8	178.265644474756	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2	433	210203	209772	TRUE	25	GGAAGGAACTACTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EESFEVRRRVCEEQLRGPLEEGNENGEVSTPSLCRLRCGRGAPAPRRTTAARLQPSEWNGTACSDPRPELEARPQAGKETSLSSCRGGPSLSAGTLRNREGEDWIALPQGFIKSSGGSCGGCRDSLCPPRTSLPPLLPSSVSP	210204	104681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_104864_106930_107099_113163_113257_114099_114145_130076_130173_144931_145011_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187519_188560_188630_188745_188854_189298_189381_206168_206241_208667_208740_209471
619726	SIRV4	+	323	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	918	-75	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGACAGCGAGTCAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373	2696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
619739	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619754	contig_12622_pilon	+	2268	3	Intergenic	novelGene_5896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_2	85	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	24	977	1538438	1541084	FALSE	25	AATTCTTGTGTTGTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSCTVNIMFGTPQEHRNMPQADAMVLVARNYERYKNECREKEHEEIARQAAKMADEAIIQERERGGPEEGVRGGHPPAIQSLINLLADNRYLTAEETDKIINYLRERKERLMRSSTDSLPGELRGRAEARFPASHSGATSGASLKTQPSSQPLQSGQALPSAPPTPAVTSTSQQELQAKILSLFNSGTVAANSSSASPSVIAGSAQNQNFSTAANSQPQQRSQASGSQPPNILGQAGSARNMGPRPGAPSQGLFGQPSSRLASASKMASQRPVSSTGINFDNPSVQKALDTLIQSGPALSHLVSQTTAQVGQPQAPLGSYQRHY	1538414	1542375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1538457_1539715_1540060_1540493
619772	contig_7594_pilon	+	2629	5	Intergenic	novelGene_55419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	672.667451271429	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2212	2622	551134	554556	FALSE	35	CAATGTATAGAAACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFICILNQCFNFTVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	538972	554563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_551292_552953_553000_554349
619778	contig_1154_pilon	-	2813	19	Intergenic	novelGene_87240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	1	junction_18	33.9152902623617	641	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	172	1773	1875601	1856525	TRUE	15	CACCTGCCTGTGCTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCVLVATEGAEVLFYWTDEEFEESLRLKFGQPENEEEELPALEDRLSTLLAPVIISSMTMLEKLSDAYTCFSTENGNYLYVLHLAAAPRPRAAQPGVGALPESAVDLQPPAGAGTVLRCGGDYRCGAGALRPWKCQAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETETDSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSGSIVWLDEGTPPTDTYQIQVAEDTLQMLVPHSPTASSPRRIFLDASIKESYCPLVPHTFYCLPLWPGINMVLLTKSPSAPLALVLYQLLDGFSLLEKKLKEGHEAGGTLRSHPLVADLRQRMDKFVKNRGGQEIQSTWLELKTKAFSRSEPGSSWELLQACGKVKQQLCAIYRLSLLSTAPSRGRPPPAPAPPGPSPKAHARKAGRLEGLFVSEEPAEHHHGVIPRRLPRFGAFHLRGPHDWADGGSFPQHP	1880501	1850285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840_1860021_1860112_1860281_1861540_1861597_1864160_1864231_1864370_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868385_1868542_1870002_1870141_1875484_1875602_1878694_1878827_1880462
619782	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619783	contig_5988_pilon	-	2013	10	Intergenic	novelGene_15851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	164.551766780601	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	129	1607	259970	242253	FALSE	10	TGCCTTTCCTCACCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTHICQDTNQVLFKCCQGSEEVPCNKAVPVSLSEDPCCPLHFQLPPQMYKPEQVLSVPDDLEAGPMDLYLSAAELQPTESLPLEFSDDLDVVGDGMQCPPSPLLFDPSLTLEDHSIKEIAEGPVDILGQIQMNVDGCRSQGSRNSEKASAPLPQSGVATANGEAEPTSIS	260298	241846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_249656_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260178
619786	contig_1443_pilon	-	1677	12	Intergenic	novelGene_28314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_8	484.129738092781	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	509	1393	776427	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809532	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_804484_804590_805197_805224_805553_805718_808694_808741_809399
619788	contig_5671_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_79448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2117.30917413799	924	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	500	922	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368893	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369248_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
619796	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_97697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619797	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
619808	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
619816	contig_7202_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_18624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	22	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATATTTTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
619821	contig_3095_pilon	+	1213	5	Intergenic	novelGene_75026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4009.92178851409	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	103	819	147280	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151005_151208_151904
619829	contig_3018_pilon	+	1719	2	Intergenic	novelGene_78918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	79	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTTTGGGTTTTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626275	673293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_626378_671676
619854	contig_3560_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_149502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGTTGTCATTGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198212	197088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_197100_198200
619863	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619870	contig_8978_pilon	-	1432	8	Intergenic	novelGene_49319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	883.128599043752	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	201	455	193675	192962	TRUE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKSNPLGSGKFNTSPPE	194075	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193250_193398_193613_193768_193967
619877	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
619887	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
619890	contig_11702_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_141959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	170.705399250678	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	262	504	313781	297579	TRUE	20	GCAATCGTGCTTCAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLRAGLGRRQAQGRAPETTSRQRFSCLCPPLSSFGEHLQLASTPGDSHLPAGHAAGLQ	319842	289171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297751_313710_313853_318184_318286_319753
619912	contig_17440_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_7649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3531	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
619921	contig_12142_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_147827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAAACCCCAAGAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141673	143872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_141700_143900
619924	contig_9463_pilon	+	1654	9	Intergenic	novelGene_83823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	221.252083323525	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	57	344	216051	219267	TRUE	15	TATTGGCTCTGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQAPRDSARPPRIFSEDAMEVVLIFLCSLLAPVVLASATEQEKEKDPFHYDYQTLRIGGLVFAVVLFSVGILLILSRRCKCGFSQKPRAPGDEEAQVENLITANATEPQKAEN	185911	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185963_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222150_222327
619933	contig_19899_pilon	+	1974	3	Intergenic	novelGene_102505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	8.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	895	1500	134511	135116	FALSE	10	TGCGTTGTTCTTTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFVILGNKVDISERQVSAEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAARRVLATEDRSDHLIHTDTVNLHRKPKPSSSCC	115520	135590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_115674_130681_131390_134477
619934	contig_21113_pilon	-	2275	4	Intergenic	novelGene_151113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	29.044027881056	98	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	438	1988	7003	5453	FALSE	30	GATAATCAGTGTCTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQCYEHNASENIVHQHKNHFPLRENHAVFDLHEKAVKSNLTLPAVNQSRSNEIKNSAEPNGDKKSFLHADQKQFCTEMQFPESQKSNSTDFQIIKRRKTHKIQKQHVCNECGKAFLRKFLLTEHQFIHTGEEPYKCNLCGEIFFKKFKLSEHYHTTHKGEKPYKCTECDKAYLHKSHLNKHQKTHMAEKPYVCGECGKGFNQKGHLTVHQRTHTGEKPYTCSECGKGFNQKGNFVSHQRIHTGEKPYICSECGKGFIQKGDLTVHQRSHTGEKPFICSACGKRFIQKGDLTVHQRIHTGEKPYVCRECGKAFSQKPCLVAHKRCHTGIVSFVCNECGKSYSQKSNLTKHQKIHTGEKPFKCGECEKSFDKKEKLIEHQRSHTGETPYGCNECEKTFASKSCLLSHKRIHTREKCVDSVNVEDPSTASHIKSHTTDLQQEKSPVNTVSKEMPSLAAQTSVNTSECLTDKSIVLEGQPFAGCEPSGDNREFVQERNLMNAANGEEPSVINYLIFYVT	12602	5165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21113_pilon_-_7066_10653_10803_12127_12224_12472
619942	contig_12046_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_83485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATTACAGCTCAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412035	413346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_412000_413300
619944	contig_15063_pilon	-	1680	6	Intergenic	novelGene_13863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	970	1293	35891	35108	TRUE	45	GACCCAAGAGTGGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	34608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36264_36597_38972_39090_39504
619951	contig_5988_pilon	+	1959	2	Intergenic	novelGene_15991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1975	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTCATATTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689302	691617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_690503_690858
619953	SIRV7	-	346	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	2	2	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
619958	contig_3745_pilon	+	1973	4	Intergenic	novelGene_85077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	140.98305650759	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	104	439	364282	370795	TRUE	20	TGAACTGCTGCAGCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364178	372502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369268_370637_371574_371746
619964	contig_3584_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_108188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	528404	528778	NA	15	CACTCGGTCCGCTATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIAGGYLGSCASPALLHSTLALSDPHPLWEDPVPASHPNLCAFSTVKNIRDLARNQGRLPFLGFHLGWRGADVQSTSSPQTFHGLWEQLLNINLLFLFLFFCR	528402	528821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_528400_528800
619965	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
619967	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
619968	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_97354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
619973	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_95106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
619982	contig_14289_pilon	-	2132	5	Intergenic	novelGene_110546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	412.856134143602	18	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	98	619	66533	51527	FALSE	15	AGGGATTTCCTGCTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66630	50013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61245_66468
619995	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620011	contig_2069_pilon	-	1251	6	Intergenic	novelGene_23434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	920.26835216691	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330758	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1330597
620026	contig_854_pilon	+	1663	14	Intergenic	novelGene_36450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	454.652959530088	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	97	1539	1453661	1465350	FALSE	15	AGTCTCTTTCCTTTATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451234	1465474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464599_1464823_1465336
620027	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620033	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
620043	contig_614_pilon	+	2396	5	Intergenic	novelGene_132620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	30.62984655528	294	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACGTATCAATCTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588628	642171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619859_619971_621721_621753_640090
620044	contig_9290_pilon	-	2244	6	Intergenic	novelGene_77530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	277.951074831525	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1124	1903	483241	478940	FALSE	25	GTTATCTTTGCAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	484364	478598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136
620053	contig_6446_pilon	+	2932	1	Intergenic	novelGene_149217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1201	1542	381546	381887	NA	35	ATAGGACAGGGTAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVTVLKRIRGLYRTEGETTPSASPPRLPHTPFGDAVLLLIAVMTTCVQSRTVEQGFQDCMTFGSVSPGLSSQVPLGGFKLPTSQLVVESLPVCATQELPCVFSLGCILFFL	380345	383277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_380300_383300
620067	SIRV4	+	284	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	197	469	197	-469	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAACTGTCGGAAGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
620068	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
620071	contig_9921_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_23738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATAAAATACTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188468	189250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_188500_189200
620087	contig_987_pilon	+	3129	2	Intergenic	novelGene_72349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	53	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1389	1745	1289789	1295626	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLVSSP	1288400	1297010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1289988_1295468
620094	contig_11752_pilon	+	1424	9	Intergenic	novelGene_37630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1543.54810420667	3	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	85	1140	84194	105616	FALSE	45	AAATATAAAGATGTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQMAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84109	105900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92876_93060_94223_94410_96502_96572_100956_100976_105597
620097	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
620101	contig_1964_pilon	-	488	4	Intergenic	novelGene_130936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	10.6144555520604	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	66	488	751122	714986	FALSE	20	TGCTATATTTCCCTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRDNFPGPSRKSRLHPRRTEMDSKIKEEIPVHEEFVLCCGIETQVLKCGPWTDLLSDQGANRPKVLIFIITGNPGLTTFYLPFAKALYSLINGRFPVWIIGHAGHSVAPRDKKIRAASDDSNTQEIKDIYGLRGQIEHKLVFLRTHVPKQIKLVLIGHSIG	775477	714985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_715111_726024_726169_750968_751125_775414
620108	contig_7285_pilon	+	2267	13	Intergenic	novelGene_143387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	248.360107617056	816	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	212	1066	222945	324708	TRUE	65	CATAAAAAAAACAAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPNGRGDCNLTLIFLPLTTKQFYFSLVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWQGQPVYPITGGFRQPYPSSLSVDTSMSRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	220207	343301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_220225_220746_220809_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_310159_310244_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_342106
620111	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
620113	contig_15120_pilon	+	964	7	Intergenic	novelGene_107992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTAAAGCAGCTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90917	116092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_91208_92044_92293_99849_99956_104332_104446_107824_107945_115271_115338_116071
620124	contig_6589_pilon	-	1184	10	Intergenic	novelGene_25909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_9	155.492129926681	6710	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	224	1036	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178563	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
620130	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	29	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
620136	contig_10205_pilon	-	2054	15	Intergenic	novelGene_143109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_13	59.2702217278919	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	185	1960	255837	220058	FALSE	20	TACTCTCGGATCCATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVAALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDLPESAVRDLIIATIAVKYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	256021	219963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694
620140	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620153	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
620154	contig_1008_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_121612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTGTAGGACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775126	774024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_774000_775100
620174	contig_7963_pilon	-	2634	2	Intergenic	novelGene_58400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAGCACAGGAACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59230	51410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_51531_56716
620190	contig_10549_pilon	+	3648	1	Intergenic	novelGene_110617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	1083	1565	214370	214852	NA	70	TAAAAAAAAAAAATCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSLFASKGECALVLSGDFLKLLNPCCFSPARTSLLLDASLLFLFSLSSSWTVAAYFLSFSFLIYSLSSLLSHLSFQGQGLVHMVCTCGLAQVVERGRTRWSRLMGGLVLGVLCSQPNQCGPRFHLLEIDVDDMKFIAWMLNLVLLLVASVYHVLVLYL	213287	216935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_213300_216900
620193	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
620194	contig_14133_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_119983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGTATTGTACTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280027	282535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_280000_282500
620202	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
620204	contig_10940_pilon	-	1816	5	Intergenic	novelGene_49274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	TRUE	40	GATTTTTTTTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874888_874973_875675_893147_893306_916664_916748_916923
620210	contig_6270_pilon	+	1498	10	Intergenic	novelGene_99798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	387.515160993734	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	86	1042	27433	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REESVKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQVTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27347	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40431_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
620225	contig_13863_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_42101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCAACATTCCTATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483390	483133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_483100_483400
620226	contig_13863_pilon	-	2454	5	Intergenic	novelGene_42095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTTAAAATAACTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483185	476897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_477786_478578_478752_479270_479366_481368_481474_481992
620228	contig_10197_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_115232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	932	1255	939672	939349	NA	80	TGTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILLWKLGSKCSVMVAGHHPVLLASLQRRQLLIEAVSHTFHIFLLFLTLLPLLHQANRERPVVVPWMAACKLLRPQTLCVQLGGRTRSTKHVVRPVNWDVPCNCDP	940603	938025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_938000_940600
620246	contig_12786_pilon	-	1478	10	Intergenic	novelGene_103395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	614.125716007503	118	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	508	1416	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVCAAGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629487	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592945_593252_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
620252	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620257	SIRV4	+	288	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	919	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGCCGCGGCGTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374	2662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
620269	contig_10058_pilon	+	2441	11	Intergenic	novelGene_67714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	163.105763233553	1	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	78	896	72602	99369	TRUE	35	CTTTTGAGTTGAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72524	101562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100242_100583_100764_100943
620271	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
620273	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620288	contig_12270_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_113106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	ACAGTGCTTCAGCCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
620289	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
620305	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
620307	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620321	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620325	contig_12050_pilon	+	2060	5	Intergenic	novelGene_62610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	122.397916648936	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	25	360	321302	355022	FALSE	40	GCAATTAACAAAGCTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQHTHTHPTLALTPG	321277	356722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_354980
620327	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620337	contig_12340_pilon	-	2393	3	Intergenic	novelGene_122092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	100	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	922	1260	5507	3862	FALSE	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	13680	2728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_12767
620346	contig_10197_pilon	-	2031	11	Intergenic	novelGene_115275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	457.293133558771	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	908	1474	1170438	1168440	TRUE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPPAVTPGCHYPCQDHG	1176461	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168305_1168426_1168536_1168688_1168830_1170017_1170160_1170250_1170491_1171232_1171427_1175377_1175539_1175643_1175784_1175985_1176166_1176281
620358	contig_12000_pilon	+	1526	10	Intergenic	novelGene_43161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	557.906603095695	75	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	96	827	417192	625269	TRUE	20	TATCACATGTTGCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416858	669837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_625268_625356_669224
620380	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_95039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620381	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_93428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
620386	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
620406	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	600	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620407	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620410	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620418	contig_6938_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_69068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155945	156754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_155900_156800
620420	contig_2646_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_69498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAAAACCCTATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228403	229630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_228400_229600
620421	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
620425	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	91	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
620429	contig_11656_pilon	-	2804	6	Intergenic	novelGene_53971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_5	393.793042091909	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	402	1448	224380	162120	FALSE	40	GAAGGGGTCGGAAACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNRDKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGMWICQICRPRKKGRKLLQKKAAQIKRRYANPIGRPKNRLKKQNTV	227391	160763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_162260_164495_164578_165175_165292_169387_169497_223780_224705_227314
620459	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620463	contig_5880_pilon	-	2200	11	Intergenic	novelGene_151119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	30	junction_10	52.261266727855	260	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	167	1642	198942	157805	FALSE	10	TATTTCTTGATGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGSQGQDWQIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISSGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYVICPDLKIDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVETYGTMLRNIFDFNALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMKTGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVANATKISLYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDMEALMFDRSFVGKQFSAGDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRNQGLRLIFTDGSRIIFRLSGTGSAGATIRLYIDSYEKDIAKIHQDPQVMLAPLISIALKVSQLQERTGRTAPTVIT	199108	157246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_157895_161111_161247_164537_164722_167818_167955_177259_177376_180301_180457_181729_181921_184511_184638_186266_186414_187133_187297_198909
620465	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620496	contig_5009_pilon	-	2208	6	Intergenic	novelGene_119246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_3	50.4007936445449	456	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	140	847	29459	26082	FALSE	5	TTTTATTTGTTTCTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHLKETFCHLDQDISGLQDHEFQIRHPDSPALLYQFRLGDEKLQAPMALFYPATFGIVGQKMTTLQHRSQGDPEDPHDEHYLLATQSKQEQSAKATADRKSASKPIGFEGDLRGQSSDLPERLHSQEVDLGSSQGDCLMAGNDSEEALTALMSRKTAISLFEGKALGLDKAILHSIDCCSSDDTKKKMYSSILVVGGGLMFHKAQEFLQHRILNKMPPSFRRIIENVDVITRPKDMDPRLIAWKGGAVLACLDTTQELWIYQREWQRFGVRMLRERAAFVW	30885	24720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_26226_27130_27295_28112_28378_29324_29466_29955_30052_30848
620498	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
620502	contig_14322_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_116505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTGTGCAAATAAACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
620515	contig_13558_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_123010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	1005	1964	40701	41660	FALSE	45	CAAAAAACCTGCAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36705	41899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_37454_40444
620522	contig_9144_pilon	+	499	2	Intergenic	novelGene_151144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAATGTATGATCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770941	776152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_771116_775827
620535	contig_12938_pilon	+	1279	9	Intergenic	novelGene_99715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	928.139907287689	31	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	113	691	78117	85615	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLCLWKFKTTCNMNP	51950	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84595_85572_85648_85765
620539	contig_11448_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_66445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGCAGTCTTGAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675273	677531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_675300_677500
620541	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_93513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620546	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620547	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
620548	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_18405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620550	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_18133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620551	contig_3410_pilon	-	2082	11	Intergenic	novelGene_58915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	473.261333725881	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	114	1460	57649	14314	FALSE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSSVPLAPPPCFWGPRPQGSCRAILVLCLL	57762	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14401_15527_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
620556	contig_10734_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_51014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAACAGCCTTAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311587	310161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310200_311600
620560	contig_7594_pilon	+	1593	9	Intergenic	novelGene_55427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_7	941.53597083436	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	54	695	539045	556488	TRUE	20	GATCTTGAAGTTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKAPDLALTHLMQFWRLAGVSTNHRTFWSNWELLACFFHLCRALS	538991	566726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_561539_561752_566069
620590	SIRV6	+	871	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	374	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	103	312	234	545	2021	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1677	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033
620609	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
620618	scaffold_12124_pilon	+	1713	9	Intergenic	novelGene_22032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	536.427869685198	16	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	637	1185	846536	858450	FALSE	35	AAACTGGCGTCTTCTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSDSKVDRQAFLPRCLRVDSNLQPFS	829556	858978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837456_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852376_858377
620625	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620632	SIRV7	-	233	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69053	0	35834	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78904	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
620636	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620639	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620641	SIRV4	+	316	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1455	632	1000	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2455	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
620643	contig_14840_pilon	-	2098	11	Intergenic	novelGene_66229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	102.010832758095	141	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	698	1639	19511	11241	FALSE	10	GTTTGCATGCTGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSTNLDIGAQLIVEECPSSYSLSGMTDIKTEHPLDSNSEEGSAQGVAMGMKFILPNRFDMNVCSRFVKSLNEEDSKNIQDQVNSDLEVASVLFKAECNIHTSPSPGIQVRHVYTPSTTKHFSPIKQSTTLTNKHRGNEVSTTPLLANSLSVHQLAAQGEMLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNGADPQLLGKGRESALSLACSKGYTDIVKMLLDCGVDINEYDWNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	22442	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13215_13342_13764_13863_15810_15877_18220_18380_19222_19609_19916_19980_20648_20682_21938
620645	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
620649	contig_9609_pilon	-	2009	7	Intergenic	novelGene_23110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	130	junction_6	88.1620981803153	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	763	1248	522751	521564	TRUE	15	TTGAGTACCACTTCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGSGQKMVSSGGGYLGAGRASW	523958	520717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_523297_523741
620653	contig_3975_pilon	-	2039	10	Intergenic	novelGene_54883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_9	123.842592246452	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1321	1974	2096423	2091957	FALSE	30	AAATACATGGTTTCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099575	2091891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097540_2097850_2097939_2099364_2099458_2099552
620658	contig_11639_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_151149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	309	701	13251	13643	NA	55	ATGGAAATGTAAAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQTVAALEVLTLLCQEIWKTATWPTDWKRSIFMPIPKKGDPTECRNYRTISLISHTSKILLKIIQKWLQQYIDRELPEIQAGLRRGCGTRDITAGVRWIMSESRKYQKNVYLCFTDYAKAFDCVDHNK	12942	14917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_+_12900_14900
620665	contig_14322_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_116346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
620672	contig_2596_pilon	+	2069	11	Intergenic	novelGene_53513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	129.003875910765	502	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	43	1437	1033998	1048715	FALSE	10	TTTTGGTTCAGTTTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCDQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP	1032672	1049347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1032701_1033983_1034124_1034532_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046105_1046180_1046321_1047742_1047920_1047994_1048130_1048634
620680	contig_7457_pilon	-	2191	5	Intergenic	novelGene_31572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	22.9673681557117	375	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	202	777	924001	922396	FALSE	0	GTTTCCCTTCCCTCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCKVVVCGQASVGKTSILEQLLYGNHVVGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVTIVVLGNKCDLQEQRRVDPDVAQHWAKSEKVKLWEVSVADRRSLLEPFIYLASKMTQPQSKSAFPLSRKNKGSGSLDG	925111	920981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_922636_923245_923488_923907_924016_924302_924384_925005
620682	contig_14441_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_100656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	203	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	194	622	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112109	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
620684	contig_6227_pilon	-	2727	8	Intergenic	novelGene_49793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	82.2849702347313	36	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	831	1535	1291269	1260481	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1331869	1249835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1292061_1331830
620691	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	163	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
620694	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
620695	contig_5643_pilon	+	1140	7	Intergenic	novelGene_38971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	625.267853714621	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	283	663	551251	552439	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIP	549628	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552215_552427
620701	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
620742	SIRV4	+	274	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1475	654	1020	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAATAACTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	2749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
620758	contig_20641_pilon	+	1577	7	Intergenic	novelGene_52847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1358.65391922381	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	365	1273	38688	56882	FALSE	20	TGAAAGCTCCGCCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14545	57186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14603_16769_16912_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
620772	contig_11413_pilon	+	629	4	Intergenic	novelGene_103129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	17	517	87465	90735	FALSE	30	CAGCTCAGAACCTACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87448	90847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
620789	contig_14322_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_116187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	33	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
620809	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_90548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653844	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620828	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	632	1123	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
620840	contig_5671_pilon	+	916	5	Intergenic	novelGene_79472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_4	418.042088192086	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	246	371	392910	531238	FALSE	25	CGTTATCTCATTGCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370481	531783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
620849	contig_18869_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_56007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTGATCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73692	73333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
620855	contig_854_pilon	-	1810	5	Intergenic	novelGene_36179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	48.8134202858189	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	849	1421	471014	470442	FALSE	45	AGACGAGAATAAAGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	479205	470052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471115_471216_471401_474490_474756_476675_476788_479018
620860	contig_10011_pilon	+	2217	11	Intergenic	novelGene_68103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.874293246135	1	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	134	1243	323066	333199	FALSE	10	CTTATTAGTGTGGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKNLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKLM	322932	334173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_325624_326373_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994_333045_333190
620864	contig_15031_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_138400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_5	230.839373432113	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	767	1411	78772	72478	FALSE	45	AAATATATGTTGATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQVTVLH	161637	71716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_112064_112262_129450_129599_161576
620903	contig_9274_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_151162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAGAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558131	556668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_-_556700_558100
620907	contig_9471_pilon	-	1558	13	Intergenic	novelGene_21850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	962.157298297252	142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	89	1480	445281	430625	FALSE	15	GCCATGATTGTTCAGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELVAEQAIKHLKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEVRSNGSRHGKQLKNGENWIAGNPDSSWHSEQPQVQPSKSDCCIIHV	446572	430546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_430765_434622_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
620917	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
620919	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
620934	contig_11752_pilon	+	1158	5	Intergenic	novelGene_37659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1225.38126719809	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	29	853	87210	94417	TRUE	45	TATTACTGTGAAATATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	87181	105890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94430_105597
620936	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_18490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
620950	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
620954	contig_2646_pilon	-	1751	10	Intergenic	novelGene_69655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	316.957760943351	6	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	194	658	2176869	2174850	TRUE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2178915	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876
620960	contig_299_pilon	-	2811	7	Intergenic	novelGene_129429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTACGTTTTTTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883456	863140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_863262_864117_864195_867485_867619_869261_869496_873328_874685_881779_881865_882651
620969	contig_4891_pilon	-	3880	1	Intergenic	novelGene_124578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750015	746135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_746100_750000
620978	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
620982	contig_15219_pilon	-	1748	7	Intergenic	novelGene_40834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGACGTAATTTCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25935	22833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_22903_23149_23263_23344_23491_23690_23905_24126_24312_24451_25052_25514
620998	contig_8377_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_35122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCACAGCAATTTAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170933	173638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_170900_173600
621001	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4394	43	3219	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGTGATTCGCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513	1043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
621002	contig_4228_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_151177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAAGCTTTTAAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573770	575921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_573800_575900
621003	contig_10311_pilon	-	1490	11	Intergenic	novelGene_50403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1087.61804416808	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	27	686	71526	68377	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQGCVAICHNAN	71552	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65528_67199_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68410_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
621014	SIRV4	+	340	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	632	976	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
621017	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1446	632	991	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2446	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
621026	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	651	1114	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATAACTTTAACCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
621031	contig_17440_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_7618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTAGCCCTAGCCCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3065	3278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
621046	SIRV4	+	507	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	443	0	-443	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGCCATTCCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
621049	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_97611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
621054	contig_4059_pilon	-	779	3	Intergenic	novelGene_140600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1941	junction_2	486	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	17	535	422646	398089	FALSE	40	ATCCCAGGAAAATATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	422662	397844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411209_422462
621064	SIRV5	+	481	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	875	-37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
621069	contig_5585_pilon	-	2514	15	Intergenic	novelGene_143068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	44.2225355792861	146	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	31	1785	497822	390308	FALSE	20	GTATCTGTACTCTGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVRAPNLTMQCTQIQINHHYVGLWFGHDFHPQFPSFAACSKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPTQSHRMDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKNTHQSPFLFSFGAAWLQ	497852	389578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_390362_392713_392852_394330_394430_402731_402900_405339_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_497723
621082	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621089	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
621091	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_95882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
621092	contig_10205_pilon	-	1832	15	Intergenic	novelGene_143114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	73.0332605246209	1	54	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	88	1104	256249	232772	TRUE	25	TCTTAATACTCTCGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPPGPNPYLRTWITAAACPSAPDAPSAIMAPGQLALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVF	256336	219969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229436_232746_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
621095	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_95697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621103	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	110	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621113	contig_6445_pilon	+	2121	8	Intergenic	novelGene_77076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	316.041459434728	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	15	629	727272	738019	TRUE	10	GCTTTGTTGCTTGTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATGKTFRRRRADSESEEDEQDSEEVRLKLEETREVQNLRKRPNGVSAVALLVGEKVQEETTLVDDPFQVKTGGMVDMKKLKERGKDKISEEEDLHLGTSFSAETNRRDEDADMMKYIETELKKRKGIVEHEEQKVKPKNAEDCLYELPENIRVSSAKKTEEMLSNQMLSGIPEVDLGIECVSGPLSRLPLALGKRKSSLLPS	727257	741424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_727355_727707_727768_736269_736322_736470_736542_736935_737014_737748_738764_738856_738956_740775
621118	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621125	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621128	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	16	363	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14424	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621132	contig_10436_pilon	-	1237	3	Intergenic	novelGene_108480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_2	116.5	693	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	123	395	103480	102685	TRUE	30	TTCGATGGAATGGAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTGGNLTQDPRLFPVGGSATSVGGGATYKLLLREHL	103602	101404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102868_103390
621135	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621152	contig_13457_pilon	+	2352	15	Intergenic	novelGene_118324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	200.601404455173	5	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	67	558	52406	54204	TRUE	20	GACAATTCCCGATGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWFVQVLWWLAEVASGYVGTGYMEGDGSDPEPPDAGEDSKSENGENAPIYCICRKPDINCFMIGCDNCNEWFHGDCIRITEKMAKAIREWYCRECREKDPKLEIRYRHKKSRERDGSERDSSEPRDEGGGRKRPAPDPDLQRRVGSGTGVGTILARGSASPHKASPQPLVPTSSQVSDWWSGWVG	52339	58006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53413_53513_53615_53935_54440_54805_54833_54909_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56084_56132_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
621153	contig_14525_pilon	+	1971	10	Intergenic	novelGene_149772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGGGAGGGGGACACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167211	187267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_167943_172036_172197_173324_173507_174605_174690_175360_175475_175577_175757_179337_179517_182726_182928_187050_187117_187192
621159	contig_15327_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_70807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTGTACTTCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312171	1311023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1311000_1312200
621160	contig_15327_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_70806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1425	1736	1309447	1309136	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMRTQVKKVSLEWGKEEYFLETRRKYGWKYREVVSVETFAVEKKGEKGASQSQRGESMPKEGKKKGKGRLVGDLRMWERFRFIDVYCKAAVIKTIVLVQNRV	1310871	1308968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1309000_1310900
621175	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621185	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_96106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
621186	contig_500_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_30966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	496.208463759107	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	120	1232	1452302	1480676	FALSE	30	CAAAGCTTCTCTTTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446851	1480867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
621198	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621207	contig_16098_pilon	-	1841	7	Intergenic	novelGene_46130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_4	1117.55199978445	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	279	1028	458816	456972	TRUE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCLPAWAVWWAGDPGSHPCTPPHPTLVLPCSRCWLPSTRL	460405	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
621223	contig_15327_pilon	-	445	4	Intergenic	novelGene_70485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	175.501820186826	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	91	444	390867	381482	FALSE	30	GTGGTGGGAGATTGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKGLRSATGILHSGVLGRDRI	390957	381480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_381539_381621_381720_382830_382974_390811
621235	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
621258	contig_7426_pilon	-	2227	16	Intergenic	novelGene_27470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	83.9564966713913	35	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	15	1055	668289	647362	TRUE	40	AAAAGTTTCCAGACTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGWMMAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICSA	668303	637240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647370_648935_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
621264	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621269	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
621272	contig_14441_pilon	+	1160	5	Intergenic	novelGene_100379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	416.529335701581	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	42	977	30688	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRERPPALPSLPSMVPTLLCLAVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVKARQQIARMDCVPIKQHVHVYWYRQKLREELKFLAYLKNEETIDGSGLPDKRFSAHCSKNSSCSMEIQSTELGDSAVYFCASSLSTPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	30646	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_30737_30842_31145_116571_116963_117220_117344_117539
621273	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621286	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91682	0	-91676	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGAATGCAAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
621291	contig_4678_pilon	-	1640	8	Intergenic	novelGene_126030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	263	junction_1	137.26140709446	843	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	30	1106	405748	386466	FALSE	10	CCTCAGCGTGTGACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEGWFWRLGWGRRCPGRPGLPGPGPGPTASVLLVLLLLLGLVTSDITDGNSEHLKREHSLIKPYQGVGSSSMPLWDFQGSTMLTSQYVRLTPDERSKEGSIWNHQPCFLKDWEMHVHFKVHGAGKKNLHGDGIALWYTRDRLIPGPVFGSKDNFHGLAVFLDTYPNDETTERVFPYISVMVNNGSLSYDHSKDGRWTELAGCTADFRNRDHDTFLAVRYSRGRLTVMTDLEDKNEWKNCIDITGVRLPTGYYFGASAGTGDLSDNHDIISLKLFQLMVEHTPDEENIDWTKIEPSVNFLKSPKDNVDDPTGNFRGGPLTGWRVFLLLLCALLGITVCAVVGAVVFQKRQERNKRFY	405777	385931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_386627_388666_388787_392168_392284_392385_392548_392712_392793_393838_393957_405273_405393_405546
621294	scaffold_9100_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_83290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_2	223.964701459851	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	213	692	651131	654304	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	650469	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
621299	contig_9706_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_20836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2227	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
621303	contig_12869_pilon	+	2212	8	Intergenic	novelGene_75332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	228.514903725096	7	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	39	1118	67397	97384	FALSE	20	TTTTAAACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67358	98478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
621304	contig_10766_pilon	+	2234	7	Intergenic	novelGene_151245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	88.3548715880077	516	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	302	1063	594726	607996	TRUE	15	ATGCTATCAGTGGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETRCSPPSFTYKYTPEEEQELEKEVTEHDGQSLVKSTVFISPSSVKKEEASQSEVNRLEEGHHRRTPTCSFCAQAPISQSTCSLHSLHSECQERPLCEHMRTLSTHSVPNISGITCSAFSSPFGCPYAHRHAAYPYRAYSVNPPSAIEMQLRRVLHDIRNSLQNLSQYPMIRGPDLAAAPYSTQKSSVLPLYENTFQELQVMRRSLNLFRTQMMDLELAMLRQQTMVYHHMTEEERYEVDQLQSLRNSVRMELQDLELQLEERLLGLEEQLRALRMPSPFRSSALVVVEEGHRNIPLMPAAEEMHKNVEQDELQQVIREIKESIVGEIRREIVSGLLAAVSSSKASSSKQDK	594424	610048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_594930_596992_597071_598087_598216_598634_598790_601173_601269_607894_608017_608897
621305	contig_8538_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_5066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842833	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
621307	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621317	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
621322	contig_6710_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_97498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
621323	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621324	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_92013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2068	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657500	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621327	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
621328	contig_6102_pilon	+	2174	4	Intergenic	novelGene_32129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAACCACCATGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816686	819953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_816859_817267_817471_818041_819038_819150
621337	contig_12270_pilon	-	388	2	Intergenic	novelGene_113145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	31	387	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14439	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621338	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621349	contig_13894_pilon	+	1386	9	Intergenic	novelGene_62139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2847.23158304694	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	614	1330	523580	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521598	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523305_523625_524876_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
621353	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621356	SIRV6	+	260	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	41	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2811_3092_3165_10724
621360	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_94744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657493	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657493	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621363	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
621364	contig_6842_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_130825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCGGCATGACGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783256	1780906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1780900_1783300
621382	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_95812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
621383	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
621394	contig_4364_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_1749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532913	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
621409	contig_6958_pilon	-	1668	4	Intergenic	novelGene_69937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	371.124716982789	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	24	641	183199	149618	FALSE	20	TGTAAACGGCATCCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	183222	148590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154540_160968_161061_183108
621410	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91683	1	-91677	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTGAATGCAAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
621412	SIRV5	-	286	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
621421	contig_16103_pilon	+	2750	5	Intergenic	novelGene_118732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	119	junction_2	110.799368229246	78	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1901	2575	297648	303376	FALSE	20	TTGTATGAAACCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKNKQPMPVTIRASMQQQQQLASARNRRLAQQMESRPSVQAALKLKQKSLKQRLGKSNIQARLGRPIGALARGAIGGRGLPIIQRGLPRGGLRGGRATRTLLRGGMSLRGQNLLRGGRAVAPRMGLRRGGVRGRGGPGRGGLGRGAMGRGGIGGRGRGMIGRGRGGFGGRGRGRGRGRGALSRPVLTKEQLDNQLDAYMSKTKGHLDAELDAYMAQTDPETND	294833	303551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_297792_300401_300589_301382_301521_303170
621423	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
621434	contig_12644_pilon	+	1346	10	Intergenic	novelGene_44596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4922.28687692676	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	844	1266	2679895	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675463	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679141_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
621444	contig_14441_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_100565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.235024042872	21	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	385	645	125667	126062	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	111196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_122147_122188_125517_125902_126036_126283_126514
621448	contig_7202_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_17038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAATTCTTTGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
621449	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621451	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621455	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621456	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
621458	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621459	contig_10861_pilon	-	2898	1	Intergenic	novelGene_39247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATGCCTGTTGAGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802708	799810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_799800_802700
621460	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_97751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621463	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621469	contig_12270_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_114038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	16	333	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14424	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621491	contig_15185_pilon	-	1208	8	Intergenic	novelGene_99454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	332.885835673188	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	81	905	444599	429911	TRUE	10	GAGCCCATCTGTGTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	444679	429459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_429519_429666_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528
621492	SIRV6	-	753	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8662	510	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTTTACGCAAGGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11209	1848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11033
621495	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_95820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621502	contig_11378_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_112254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCTGAAAATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372799	369494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_369500_372800
621507	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621517	SIRV6	+	367	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10440	19	1203	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11440	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
621518	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621519	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621521	contig_12786_pilon	-	2091	8	Intergenic	novelGene_103451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4571362157133	212	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	129	1019	674025	650058	FALSE	25	GTAAGGCATTCATTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAAGLLVVLPLRPQPGKLHRLGAAGGTHGDPLGKRCLQTPVMRNTSKELHGATNRYAPCDWYYHLPVKRSEKAVDAPPASQIPGLSEVGDTQNGNTFGTRRYWIKETDSEYIKLAKQGGRPDLLKHFGPATQKGSPVTYSMPDWYLHHSKPPTANQREVPFTSMPDYMVHEEFNPNQANGNYESRRGPFDFDMKTVWQREAEELEKDKKKVRLPAITSKHPSKVGTPVTSKETSGNRISFPPMPGQKTSSPTNFSKLISNGYKDEWLQQRADSEKRTPQTSKTSTSSRSPENPEGQQDPEALPDPDVPEGSQRDEDFALQVRRHLCLLQHPRSSNEP	674551	648985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_650126_653179_653398_655354_655453_660804_660962_664259_664369_669384_669571_673970_674044_674441
621533	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621536	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
621543	contig_5696_pilon	+	1963	17	Intergenic	novelGene_117537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	62.8639403792031	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	415	1233	641940	653889	TRUE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGHCKNGVTASDVLTS	635080	657661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_635142_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638569_638911_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840_652953_653842_653931_656972
621560	contig_10674_pilon	-	2139	12	Intergenic	novelGene_6432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	1742	2137	208919	198555	FALSE	0	TCTGGGCGGCTCTGCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYDLHLHHHYGLLIHCADLHLKGHCLQGQNAQKLLIYCQIFPSDYHSHYDEKLPHPHCHLQTVPYYLAFLNHLFHLDRFHFQRHYCQKQHSLDQNLSQIQNQNLYVQHRYRRRCQRDPPYPPLPHSPAAAS	251477	198552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_198637_208605_209362_211780_211885_223313_223411_224011_224158_224943_225029_236826_236923_237450_237586_238934_239056_241075_241247_243627_243730_251235
621565	contig_12566_pilon	+	3567	3	Intergenic	novelGene_85986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	14	41	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	106	357	5720	10586	FALSE	70	TTACTTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPRLGDILRRFARFFGLLFRDTVLISPARARICSLMAEVKVKVQPPDADPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPHIEAQQRAVAINRLLSMGQLDLLRSNTGLLYRIKDSQNAG	5614	13796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5782_6777_6896_10514
621566	contig_4891_pilon	-	2239	3	Intergenic	novelGene_124557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGCTGCCCGGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758509	700883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_701143_707768_707832_756592
621592	SIRV6	+	341	3	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	164	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845
621596	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621598	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_94841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621609	contig_9463_pilon	+	1772	6	Intergenic	novelGene_83820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	175.633026506976	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1005	1373	222660	223028	FALSE	15	TATTGGCTCTGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185905	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216851_219238_219290_221961
621610	contig_1535_pilon	-	2762	4	Intergenic	novelGene_127238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	735	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTGGCTGTGCGCACGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123539	116106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_116328_118206_118256_118641_118795_121200
621611	contig_6710_pilon	+	569	2	Intergenic	novelGene_95672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTCTTAACCTCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
621614	contig_7066_pilon	-	2128	3	Intergenic	novelGene_42171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	495	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	445	834	919595	919206	FALSE	25	TATAAGATGTGTACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGHLRLLPHDQVAMPYQWEYPYLLSIVPSLLGLLSFPRNNISYLVLSMISMGLFSIAPLIYGSMEMFPAAQQLYRHGKAYRFLFGFSAVSVMYLVLVLAVQVHAWQLYYSKKLLDSWFTSTQEKKRK	921734	917911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_919669_920573_920719_921508
621631	contig_9797_pilon	+	1585	5	Intergenic	novelGene_65576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440.017613283832	5	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	417	800	188724	191368	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTSESPCPAIRTGRAAQELQDKHPEPLRVATTLGPPHGGGQYGSGVPPGGGYGGPAPGGPYGPPAGGGPYGPGGLTSGTPGGPYGGAAPGEPLCVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172523	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183923_188593_188734_189277_189422_191138
621636	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621649	contig_14322_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_116399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	45	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671884	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
621652	contig_11615_pilon	+	1984	3	Intergenic	novelGene_151263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	32	31	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1029	1490	61769	62230	TRUE	15	TTTGGTTGATGACCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLKVKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFTFLGSTISAHGSSSQEIKRHIAPGKSAAKNLVKVFKSKDVTLRPEVHLTQAVVFSITSYAWESWTMNKEDQRRIDAFELWCWSRILNIPWNARRTNKSAWKKYSQSAPWN	59499	63222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_59792_61032_62570_63067
621653	contig_233_pilon	-	1463	8	Intergenic	novelGene_14528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1385.07624486222	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	153	962	108727	78637	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSDLREYKRFEKEKLKSQWNNVR	127002	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78970_79033_104162_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108831_126953
621656	contig_11512_pilon	-	2324	2	Intergenic	novelGene_43296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	75	380	396289	367967	FALSE	30	TAATACGTACGGAACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSKLGHSARRGLGAWLNFRVCLLCPRLPVAPTARRGEREMGNSMNESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396363	366022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368136_396152
621661	contig_2867_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_135241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTTTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286289	1285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285000_1286300
621674	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621689	contig_3068_pilon	-	2118	13	Intergenic	novelGene_137623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	419.320647661853	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	139	1263	241452	233625	FALSE	75	TGTAAAAAATAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	242364	232769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_236361_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241527_242300
621697	contig_9706_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_20867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2482	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
621702	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621713	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621722	SIRV7	-	171	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76969	0	43750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
621727	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10520	1	1283	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11520	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
621728	contig_9683_pilon	-	2297	11	Intergenic	novelGene_151274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	18.2978140770967	196	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	348	1040	445454	441421	FALSE	25	AATTCTTGATCTTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQVPMNMIITGCMLNFYRKTPTVVFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDAPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLSTLVGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVTDEEGQRLGHSVAAAKQGIFQVVISRICMAIPAMAIPPVIMDSLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQRSSIHVSRLEPDLRAQIREQNSSVEVVFYNKGL	447664	440163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_441518_441787_441836_442324_442375_443603_443654_443856_443985_444274_444361_444523_444600_444983_445083_445395_445567_446218_446384_447594
621731	contig_1154_pilon	-	2223	9	Intergenic	novelGene_87244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	20	junction_2	33.3183039034102	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1224	1799	1857843	1850911	FALSE	25	TAAAAGGTGCTTCATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKLADWKDFLLVKSRRNITMVSYLEDFPGLVHFIYVDRTTGQMVAPSLSIHDKTTSELGKGPLAAFVKTKVWSLIRLARRYLQKGYTTLLFREGDFYCSYFLWFENEMGYKLQIIEVPVLSDDSVPIGMLGGDYYRKLLRYYNKSHPAEAVKCYELLALHLSVIPTDVVVQQAGELARRLWEASRIPLL	1860962	1850486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840_1860021_1860112
621741	contig_7391_pilon	-	2079	2	Intergenic	novelGene_112167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	361	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGCTGAAATATTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443743	438746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_443033
621754	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGCCAGATCAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
621761	contig_6735_pilon	-	1376	11	Intergenic	novelGene_15670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1069.95824217583	9	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	342	1079	545923	542281	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGFP	564849	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542290_542779_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547314_554318_554374_564157_564232_564784
621767	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_115830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
621769	contig_5945_pilon	-	1405	8	Intergenic	novelGene_104565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.013069318928	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	39	767	249708	219523	TRUE	15	ATATGACTGTGCCTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249746	215591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_215800_215905_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
621770	contig_9345_pilon	-	1944	6	Intergenic	novelGene_24395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	628.106233052977	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	71	958	176056	142100	FALSE	15	CATTTGGAACTGCTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176126	141113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142366_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175992
621771	contig_4732_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_75457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1	384	677303	676920	NA	10	ACAGCTCTGCTCCCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGPQEASTGPRAQVAWSQGLHRVGLWSGGTVDLRGAHLAHEHPNSLGGYQEGEGPPDTAVATHGPEDPKANEESGESGEGVPEEVQGLDPKPNKSLWAGFGPSQPEPQEPHSQEDRSPGWQPKQKP	677303	676650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_676600_677300
621773	contig_18869_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_56219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73749	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
621787	contig_8045_pilon	+	1227	3	Intergenic	novelGene_35357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1784.5	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACACTTGAGTTCAGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116218_118080_118243_118527
621791	contig_19342_pilon	+	865	5	Intergenic	novelGene_41126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.20156211871642	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	52	459	5070	6183	TRUE	30	GGAGACCTGAGAACCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	5018	6757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
621805	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_95831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621806	contig_3700_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_138096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAACAAAATCAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358659	358080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_358100_358700
621811	contig_7202_pilon	-	198	2	Intergenic	novelGene_18565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACTAAGCTTTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28084	27794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
621813	contig_15185_pilon	-	1703	7	Intergenic	novelGene_99460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	350.06352598096	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	77	757	472420	430536	TRUE	35	TGAGATAATAAAGCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKVAQHSTSGEGLACLPGVLLQVLHPAGRYHGRCHVPHPGV	472496	429483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430258_430363_430541_430670_430749_434054_434172_435509_435689_444528_444701_472290
621817	contig_500_pilon	+	1327	9	Intergenic	novelGene_30956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	555.62194881052	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	136	1035	1452302	1480676	FALSE	10	CTGAATGTGTTTTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446835	1480968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
621827	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_18106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
621829	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	655	982	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGTCAATAACTTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
621839	contig_20314_pilon	+	871	7	Intergenic	novelGene_125627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	5	GCCCCAGTGCCCTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
621844	contig_12969_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_61646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCCTTCTACAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1833	864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_900_1800
621845	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
621846	contig_12570_pilon	-	2100	6	Intergenic	novelGene_79384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	42.9073420290747	658	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	42	782	300289	283433	TRUE	40	ATTAAATGAAGGGATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	300330	280003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283397_283699_284049_284255_293908_294088_300198
621848	contig_12951_pilon	+	2892	1	Intergenic	novelGene_68240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1242	1547	820352	820657	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLFSFYSVIPRLLSCIMELCKQTYFEKQVFTFFIFSALPAGRSAPPVDCRGLCSAGGHVRAWPHLFSVDTVCLCMYFRIWVILSSKFFATLIAPLREPMG	819110	822002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_819100_822000
621849	contig_12622_pilon	+	1385	9	Intergenic	novelGene_5989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGACTGCAGCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583563	1590983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583867_1585365_1585476_1585559_1585711_1586269_1586406_1586527_1586573_1589141_1589228_1589523_1589694_1590003_1590238_1590833
621852	SIRV5	+	301	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	17	887	17	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8332	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
621859	contig_3463_pilon	-	2347	16	Intergenic	novelGene_62004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_15	178.91065430047	11	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	344	1939	565112	508757	FALSE	25	ATTTTTATGTGAAGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEVARVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597529	508348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_565091_565315_597388
621871	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
621874	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
621879	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1432	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
621881	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621901	contig_12032_pilon	-	1898	9	Intergenic	novelGene_139273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	114.692796199238	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	454	1596	117404	96750	FALSE	25	GATAACTTGGCAGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	122996	96447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122683
621902	contig_7202_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_18651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGAGGCCTGGCGGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30097	29798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
621910	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621911	contig_11896_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_88025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151206	149681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_149700_151200
621912	contig_1982_pilon	+	2082	11	Intergenic	novelGene_151324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	23.9491127184286	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	687	1631	253172	269851	FALSE	25	ACTCTTATTTGTCCATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQVDFLDTNIIITEPYFNFTSIQESMNEILFEEYQFQAVLRVNAGALSAHRYFRDNPSELCCIIVDSGYSFTHIVPYCRSKKKKEAIIRINVGGKLLTNHLKEIISYRQLHVMDETHVINQVKEDVCYVSQDFYRDMDIAKLKGEENTVMIDYVLPDFSTIKKGFCKPREEMVLSGKYKSGEQILRLANERFAVPEILFNPSDIGIQEMGIPEAIVCSIQNLPEEMQPHFFKNIVLTGGNSLFPGYRDRVYSEVRCLTPTDYDVSVVLPENPITYSWEGGKLISENDDFEDMVVTREDYEENGHSICEEKFDI	242460	270302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_242969_252487_252606_253111_253181_254228_254353_255455_255592_255682_255740_259471_259571_259666_259746_265429_265602_267302_267442_269721
621916	contig_11512_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_43240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	11	352	4011	4575	FALSE	20	AGTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAY	4000	4575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
621931	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
621934	contig_18869_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_56196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
621938	contig_18869_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_56276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73684	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
621955	contig_4891_pilon	-	1805	3	Intergenic	novelGene_124608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	5	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATTCTCCCTACTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053829	1043913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1045506_1051070_1051169_1053714
621967	SIRV4	-	216	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGATCAATGTCCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
621971	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
621974	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_89614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653780	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
621975	contig_4364_pilon	+	2160	8	Intergenic	novelGene_65	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	38.7740708648005	360	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	77	655	703017	707465	TRUE	20	TATTAGTGTGATTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGCRSIGCGPAAGSLSPPSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPESPRDVSQSSDSDPDAGGHS	701283	709035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_701336_702992_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707701_707765
621976	contig_14513_pilon	-	1167	2	Intergenic	novelGene_70236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	163	321	18880	18722	TRUE	10	TGCTTTTGTCCATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19042	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12126_18719
622010	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622018	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
622024	contig_12265_pilon	+	2009	13	Intergenic	novelGene_149435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	49.949071284882	207	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	342	1985	23677	50211	FALSE	30	TGACTGAGAGATTTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVSAGLKKGQITPTELCQKCLSLIKKTKFLNAYITVTEEVALKQAEESEKRYAKGQSLGDLDGIPFAVKDNFSTSGIETTCASNMLKGYVPPYNATVVQKLLDQGALLMGKTNLDEFAMGTQDQGSKLEMEAAPSGGLLCRVGEGSGSTDGVFGPVKNPWSYSKQYREKRKQQPHGENEDSDWLITGGSSGGSAAAVSAFTCFVALGSDTGGSTRNPAAHCGLVGLKPSYGLVSRHGLIPLVNSMDVPGILTRCVDDAAIVLGVLAGHDPKDSTTVQDPVKPFMLPSLTDMSKLCIGIPKEYLVPELSSEVQSLWTKAADLFESEGAKVIEVSLPHTSYSIVCYHVLCTSEVASNMARFDGLEYGHRCNIDVSTEAMYAATRREGFNDVVRGRILSGNFFLLKENYENYFIKAQKVRRLIANDFVNVFNSGVDVLLTPTTLSEAVPYLEFIEEDNRTRSAQDDIFTQAVNMAGLPAVSIPVALSNQGLPVGLQFIGRAFCDQQLLTVAKWFEKQVQFPVIQLQELMDDCSAVFESEKLASVSLKQ	19600	50235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_19727_23461_23686_29717_29878_30194_30294_32260_32358_34568_34644_36604_36782_40100_40277_40364_40478_42478_42672_43407_43526_46662_46869_49990
622028	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
622030	contig_14441_pilon	+	1357	5	Intergenic	novelGene_100499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	740	1168	116728	117610	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	95909	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_96448_113156_113209_116578_116963_117220_117344_117539
622032	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622038	contig_2703_pilon	+	1603	14	Intergenic	novelGene_101736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	914.371197266478	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	825	1418	602068	610870	FALSE	45	CAAGAAGCAATGGGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526214	611055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_584442_584569_599710_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
622040	contig_5013_pilon	-	1299	6	Intergenic	novelGene_110091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	357.961673926134	1177	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCTATCTGAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216365	173839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_179573_179632_187933_187998_205757_205926_216282
622056	SIRV7	-	385	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33178	6	-41	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114779	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
622057	contig_2069_pilon	-	2128	6	Intergenic	novelGene_23194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	211.105281790864	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	23	2005	114391	82208	FALSE	25	TCATGGCGCACAATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEDLIAQFSLPCEVKVVAKDTSHPDDPLTSFLGLRLEEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIESSQVLGLEQQPLLPEPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPVLNKVPGTEEDARTFLTAHQSPGSSTVTSPSPCHQNHLTTF	114413	82084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_82333_97870_98025_102635_103694_109097_109509_111852_111994_114297
622063	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622072	contig_5718_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_110423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGGTATATCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462586	1461186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1461200_1462600
622074	scaffold_12510_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_151366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACTTAAAGCACAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198681	200373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_198700_200400
622085	contig_14184_pilon	-	2806	6	Intergenic	novelGene_66586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	275.457002089255	455	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1147	1539	90204	89812	FALSE	20	CCAAGTGTGTTGTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKKWPPSPSFLLALSPRDSPWAVIEQVCLGFLGPATSHHSHPPVSQSAHYTATKPNTAHLAEGPSCKSGPGPGSLEALARPTTGLFPSWGVGGSCGSTCTLAWMGGDLCKSREPLQGNPPFPMTKNVQ	126326	88544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90772_91298_91348_91951_92112_105799_105915_109168_109327_126229
622089	contig_5372_pilon	-	3055	2	Intergenic	novelGene_149704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	2736	3053	142060	141743	FALSE	25	ATTAACTGGCATGCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAALVMFLCRNQSLGFGDEVICLVIPRPQRVVLMERGVPERKELYRREREDGGGKVTTISLKTFDLDFSIFKIRELVKMMYLVPSGSKFYMYLCNKSLCKTMQN	147716	141740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_144487_147407
622096	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	127	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
622104	contig_3975_pilon	+	2418	7	Intergenic	novelGene_54872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	167	313	2092179	2093047	TRUE	40	AGTAAAAGGTCAAGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRLIYFSESKTFCKQPRWRSSFLRLKLKLKILWIEVVDAHITIFSTAAIALAIRMEGNTVDRSEVTLDSSKLFFKGQMEEPGFKLANPGGGCGYIHGFLTTT	2091886	2098116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2092039_2092164_2092256_2092977_2093052_2093358_2093451_2093572_2093684_2096132_2096263_2096348
622112	SIRV4	+	185	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1586	632	1131	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
622114	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_95842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622118	contig_7171_pilon	-	1922	3	Intergenic	novelGene_101370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	108	350	1360418	1360176	TRUE	15	ACTCCTTTCTTTCTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNGGAGGGFSRTPGAGDAAVLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLQVTSGPEHILHVQINWPEKRNAMNRAFWRSDLCILEACMQEEAEAEGRDRVECRG	1360960	1358339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1359501_1359764_1360465_1360899
622119	contig_15371_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_151428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGACCCTGGGTGGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12787	12194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_12200_12800
622122	contig_14445_pilon	+	3533	1	Intergenic	novelGene_137347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243587	247120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_243600_247100
622124	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622125	contig_9345_pilon	-	1715	4	Intergenic	novelGene_24357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_3	443.50297506205	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	73	720	144517	142100	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144589	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_144512
622126	contig_9609_pilon	-	2205	8	Intergenic	novelGene_23135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	87.3708960088413	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	843	1778	523112	521244	TRUE	25	TTAACCTACCTCTATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523954	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
622131	contig_15063_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_14346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	568	1056	36064	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35384_35844_36158_36266
622140	contig_5092_pilon	+	2043	3	Intergenic	novelGene_62293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTACTGCCAGAGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443175	449450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_445019_447827_447990_449412
622141	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_17591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
622144	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622149	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622150	contig_10479_pilon	+	2317	3	Intergenic	novelGene_147113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_2	65	292	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	248	394	135366	155335	FALSE	15	CAATTTATCTCTTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSGASVRSFSITSRLASSLGNLNAATDDPENKKTSPSSKPGFIASPFTNLLNGSGQPTARNYSELNNNQYNRSSSSSGSNMNSYPSPHGTKTEEHGSILRPSYTGLSSSSARFLSRSIPSLQSEYVHY	134379	157258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_134410_135148_135483_155305
622159	contig_12923_pilon	-	1785	17	Intergenic	novelGene_30152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	174.092636529378	3	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	642	1544	230738	225749	FALSE	5	CTACCCGTTTCTTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236082	225507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
622170	contig_15859_pilon	+	2018	8	Intergenic	novelGene_50208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	64.6611260688352	469	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	163	1338	361287	375993	FALSE	20	ATCTGAGGTGCACGGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPLGDGPKRVLVTQPFPSQNPLSASGGQAQRVLCPSNSSQSGPSQAQKLVSSRKPVQSQKQKPLQITTVPRPVSRPPNNTPKSEQAQPPASGDNSGEELASKQKKEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQVRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELADALSYCHSKKVIHRDIKPENLLLGSTGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEASTYQETYNRISRVEFVFPDSVTAGARDLISRLLKHNPSQRLTLKEVLEHPWITANSAKPPSSQNKDPASKQP	361124	376673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_361290_361884_362165_364777_364833_365927_366120_367454_367594_372607_372757_375496_375672_375810
622171	contig_12250_pilon	-	1484	8	Intergenic	novelGene_80646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.206069269252	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	57	1085	379717	376087	FALSE	25	GAATCAGTATCTGATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAELRATECWDSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRVFLYRWSRPLHDIY	380578	375687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376131_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
622174	contig_5316_pilon	+	2067	9	Intergenic	novelGene_61237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	309.212608895562	88	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	289	1368	453918	544272	FALSE	65	AGAGAAATCTTAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLG	450443	544971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453775_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132
622176	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622188	contig_4659_pilon	-	1959	8	Intergenic	novelGene_118239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_7	171.373800774321	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	70	1053	860030	819799	FALSE	25	TATTTATATTGTCACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884154	818892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_884093
622202	contig_14441_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_100657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	100	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	194	622	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112109	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
622206	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622208	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622215	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622225	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622232	contig_12644_pilon	+	1037	8	Intergenic	novelGene_44628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4910.39956809701	178	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	53	949	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677332_2678785_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
622239	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622241	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622242	SIRV2	-	647	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	-1	2971	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
622261	contig_7815_pilon	-	4467	9	Intergenic	novelGene_134367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.827401743792	242	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	21	1202	390265	306303	FALSE	20	TCGATTCCACATTTCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWSAEAMEPASDPSPGKGYQTQVLGEVKPPESLVLEEASGLSSQSRKTKSRGGAGPDAVILQAVAHDNEWEMLSPQPSQKNMIPEAEVEEETEFLEPRKRKPRTNGLLSEDVGMDTPFEEGMLSPSAADMRPEPPNSLDLNGAHPQRIKLTAPNINLSLDQSEGSVLSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGHEDLTANKDSGQESESIPEYTAEEEREDNRLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYRRVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYLNGATPRRKMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSKIKYVSSLSELSGLIPMDCIHIPESIIKY	390285	303037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_306310_318887_318987_323833_323921_325074_325207_325835_325939_332591_332766_341550_341752_343747_343828_389966
622277	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622284	contig_15498_pilon	-	1070	5	Intergenic	novelGene_42628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.521178838251	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	990	81	1070	543957	534885	FALSE	15	CGCGTGGTTCCTTTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGRPSLCQFILLGTSSVVTAILYSVYRQKAQVSHELKGAKKIHLGEDLKSILLEAPGKCVPYAVIEGAVRSVKETLNSQFVENCKGVIQRLTLQEHKMVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVT	544037	534884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535210_535251_535588_537666_537788_538368_538457_543837
622292	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622295	contig_13894_pilon	+	1255	10	Intergenic	novelGene_62107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2047.15526801413	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	27	1199	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527498_527580_528072
622303	contig_9579_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_150600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGATCAAGTTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832364	832009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_832000_832400
622306	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622310	contig_16098_pilon	-	2012	18	Intergenic	novelGene_45878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	54.6555745913446	45	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	388	1509	253301	244693	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWQQEEAPPTPCPTTSGTRCCTRPVSLPPALLFAAVASATHGFWPCCSASTWAS	255231	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247189_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
622324	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
622340	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
622343	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
622360	contig_1301_pilon	+	4077	1	Intergenic	novelGene_47347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308863	312940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_308900_312900
622364	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_17627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
622366	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622369	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
622376	contig_4857_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_48806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATCCCAACTACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247101	1249607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1247100_1249600
622393	contig_10324_pilon	+	1982	16	Intergenic	novelGene_7715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1005.21529811059	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	34	1548	51839	80335	FALSE	10	CAGGCCTGGCGAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGQAGRRRRLMAS	51805	80769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74740_80299
622397	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622415	contig_2770_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_107411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTCTTCTCATTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174899	173131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_173100_174900
622425	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_90563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622426	contig_9440_pilon	-	2636	1	Intergenic	novelGene_59119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAAAAAAAAAACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1920567	1917931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1917900_1920600
622453	contig_14322_pilon	+	2272	12	Intergenic	novelGene_115628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	125.861001646806	433	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	554	1003	246326	249230	TRUE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALSSLNKHSEAVAHYRRALELDPDNETYKSNLKIAELKLREVPSPTGSVGTFDIAGLLNNPSFMSMASNLMNNPQVQQLMSGMISGSPNPLGTPGTSPPQNDLASLIQAGQQFAQQMQQQNPELIEQLRSQIRSRTPSASNDDQQE	232554	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_232579_240175_240312_240814_240922_241270_241356_244262_244363_246224_246331_246654_246794_247065_247129_247603_247642_247920_248011_249115_249238_251009
622454	contig_17796_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_33781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTTTCCACCCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35308	33623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_33600_35300
622465	contig_1009_pilon	-	1751	9	Intergenic	novelGene_121773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	67.6968195338599	501	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	288	917	319062	301449	FALSE	30	GCCATCAAAGATTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSTDADLAMSKSAVKISLDLLSNPLCEQDQEFLKMVTALDTAMKRMDAFNQEKVNQIQKTVIEPLKKFGSVFPSLNMAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356428	300614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_312563_313138_313276_319034_319097_319409_319533_326889_326939_356347
622467	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622481	contig_9389_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_83951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	26	508	204666	204184	NA	15	TCCAGGTAGGTCGCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVREDLGTCGRCHRIPNRRCPKQVFWKSPEGSVQPQVHSLQLGVWNCLPHSEAETWHLLLMAQSPPRRGVMSRTPSSAAPRQPATPIPAHHPTVQTGSGHLSWRMPPMIQPARNLMLGSWAPAALLDWLVLYTKSCWASSSAPSSGASSGSLPPPRAASS	204691	204183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_204200_204700
622492	contig_18869_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_56170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73603	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
622497	contig_7657_pilon	+	1099	3	Intergenic	novelGene_30005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	846	254	1099	109010	109855	FALSE	15	TCCTCAGATCTTCTGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGKGKLLRTGLNALYQAVHPVHGLAWTDGTQVVLTDLQLHSGEAKFGDSKVIGQFEHIYGLSWAPPGTADTPTLLAVQHKRHVAVWQLCPSTTETSKWLMSQTCEIRESLPVLPQGCVWHPKSAVLTVLTARDVSVLPNVHCDDSRVKVDINTQGHIHCACWTQDGQRLVVAVGSSLHSYIWDSVHKTLHRCSFCPVFDANSYIRAIRATVDSQVAIATELPLDKICGLNASETFDVPTSGKDSYLYPLPVIDEVLSMDKGANVLETNSEIPVSPSFSSS	92842	109855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_92925_102275_102428_108990
622498	contig_7657_pilon	+	2035	3	Intergenic	novelGene_30008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	30.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	47	502	110753	118443	FALSE	20	TTCTTATGGACGAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LICKKLEVLSRNLTEMQQCLSELMNCLHNGKKSSPGYPLSEDPPYVHIIYQKPYYVGPLVERRAMLLCRGKLRLSTVQQTFGLSLIEMLHDSLWILLSADSEGFIPLTFTATQEIIIRDGKLSRSDVFKDSFSQSLDPGPSLEIFRDHTAQSLDTTGCSNHLGSTA	110706	119976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_110861_116724_116843_118213
622517	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622526	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
622528	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_89622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622530	contig_8259_pilon	+	1395	4	Intergenic	novelGene_148852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	97.2773811782004	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	275	601	57950	63870	FALSE	30	ACTATCCTAAATGGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSSSSAGGVSGSSVTGSGFSVSDLAPPRKALFTYPKGAGEMLEDGSERFLCESVFSYQVASTLKQVKHDQQVARMEKLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTPS	53089	64664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53337_57922_58092_62754_62830_63760
622531	contig_6710_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_96377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
622532	contig_15977_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_137224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97928	97515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_97500_97900
622536	contig_1443_pilon	+	2021	11	Intergenic	novelGene_28245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	38.3348405500792	4	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	997	1722	538444	541541	FALSE	40	AGAATGGAAATGAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	536003	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536604_537644_537727_537987_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
622539	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	16	354	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14424	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622558	contig_3975_pilon	+	2415	7	Intergenic	novelGene_54746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_5	56.7969091490804	361	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	7	510	1732342	1753558	FALSE	35	AATATTTGTTTTAATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIMAQGGEDVRDYNLTEKQKAVKAKYPPVNRKYEYLDHTADVQLHAWGDTLEEAFEQCAMAMFGYMTDTGTVEPLHTVEVETQGDDLQSLLFHFLDEWLYKFSADEFFIPREVKVLSIDQSNFKLRSIGWGEEFSLSKHPQGTEVKAITYSAMQVYDEENPEVFVIIDI	1732335	1755463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1732439_1740689_1740715_1740981_1741104_1741327_1741411_1743744_1743798_1749928_1749966_1753471
622559	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622562	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622566	contig_8284_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_125720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTACATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441980	441534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_441500_442000
622569	contig_10511_pilon	-	1758	3	Intergenic	novelGene_126907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	32	169	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATTAGTGCATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596307	593435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_594194_595170_596094_596230
622573	contig_5988_pilon	-	1430	3	Intergenic	novelGene_15927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1070.5	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	93	1256	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655551	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653592_653773_655456
622574	contig_12019_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_87664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	10	TCATCTCTTTCCTGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
622575	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_115890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622578	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
622582	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622586	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622591	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622593	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_93690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622597	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622599	SIRV4	+	306	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1434	663	979	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTAACATAAGTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2434	2740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
622606	contig_11052_pilon	+	989	3	Intergenic	novelGene_115447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2532.5	417	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	114	431	102902	106253	TRUE	15	TACTTCTCGACTTGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRSLLTEALVLTFPALLRCPFARLLVCSPTPPSQPAMAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQEGGLCTSCRQFWQCMKAGPKALRSMQF	102788	107796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106169_106461_107445
622611	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_98150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653800
622613	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_93702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622614	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_4	1550.18466641881	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDANRFFFGSGTKLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	54557	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_54502
622620	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
622631	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	1	1289	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
622647	contig_17964_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_33867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTGGCTGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135075	134195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135100
622648	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622653	contig_2888_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_151487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGCTCCAATGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49570	49091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_49100_49600
622657	contig_8538_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_4691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
622671	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622675	contig_19342_pilon	-	965	3	Intergenic	novelGene_41059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTCCCTCGGATCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	3234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_3320_3615_3872_6146
622677	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622685	SIRV4	-	178	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTCAACTTGGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
622705	contig_12270_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_114091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGCAGCTTCCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14419	13902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622711	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_97221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622716	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622729	contig_4232_pilon	+	1150	4	Intergenic	novelGene_63219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	1423.98338005282	50	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	207	656	148279	149200	FALSE	30	AAGATTCATTAATGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSPAGDGEGKARKRYWRARPTQGLFLSPRHPPSAAGRLNWRAGGRDACARKASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146747	149694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146906_148230_148539_148806_148884_149087
622734	contig_9121_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_134459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAACAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171183	173504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_171200_173500
622735	contig_2799_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_85501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591592	593024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_591600_593000
622738	contig_6589_pilon	+	1870	15	Intergenic	novelGene_25735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	68.281716858489	13	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	852	1508	479605	507033	TRUE	25	GATCTGGAGGAGTCTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457290	509757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_477749_477883_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
622742	contig_10354_pilon	+	1759	6	Intergenic	novelGene_50844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	519	junction_5	274.014306195863	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	172	879	432370	475314	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432198	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056_475368_475670
622749	contig_9797_pilon	+	1561	5	Intergenic	novelGene_65585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	400.965709257039	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	242	685	183892	191277	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQAGPLHPGVHPAAGAD	172537	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191230
622750	contig_5057_pilon	-	1402	7	Intergenic	novelGene_151511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_6	409.760770314691	2136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	161	853	523430	507037	FALSE	5	CTCTTGTCATTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKRSRSDRFYSTRCCGCCHVRTGTIILGTWYMVVNLLMAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523590	506487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523328
622755	contig_5791_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_35848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAAAAATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052211	1051362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1051400_1052200
622763	SIRV7	-	394	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33169	6	-50	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114788	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
622765	contig_7815_pilon	+	2291	3	Intergenic	novelGene_134351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	98.5	136	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	560	1855	173960	175255	FALSE	45	AACCGGTCATAAAGATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLRRRLFPYPTKCYFVVVIFSLVAFSVLIIHQKTEFVSIGHLELIEENPSSDVNCTKVLQGDVDEIRKVKLKMLTVKFRNRPRWTTYDYINMTSDCRSFIKRRKYIVEPLSKEEVEFPIAYSIVVHHKIEMLDRLLRAIYMPQNFYCIHVDKKSEDSFLDAVMGIASCFSNVFVASQLERVVYASWSRVQADLNCMKDLYRMSADWKYLINLCGMDFPIKTNLEIVRQLKSLMGENSLETEKMPAHKAERWKKRYEVINGKLTNTGADKVPPPLETPVFSGSAYFVVSRKYVGYVLENEKIQNFIEWAKDTYSPDEYLWATIQRIAEVPGAFSSSHKYDMSDMQAVARFVKWYYYEGDVSKGAPYPPCSGVHVRSVCVFGAGDLNWMLHKHHLFANKFDMDVDPFAIQCLDEHLRHKALEPVKHLQW	126921	175691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_127191_171442_171589_173815
622772	contig_6102_pilon	-	2040	7	Intergenic	novelGene_32158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_6	345.472020092318	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	867501	847043	TRUE	20	CTCTAAATCTTTGAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867502	838834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_847094_867237
622777	contig_14322_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_116481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCTCACTCCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622782	contig_10986_pilon	-	1385	12	Intergenic	novelGene_71481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	182.904482139659	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	69	1349	80340	66838	FALSE	30	GTAAAACTTTCCCCGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVGVDVNSLQPTPTEPWGIQLSFLTHM	80408	66801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_66918_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
622786	contig_15631_pilon	+	1979	4	Intergenic	novelGene_151542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.756790492146	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1386	1745	391472	393584	FALSE	30	GGAGTATGCCAACATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGLLHCHCLVCSCFRGAVYPLPGCTLGAGGGLGAHAGQSSHQSALCFTAVPEHAARLQRLAQIHIQQQDQCVEITEESKALLEEYNKTTMLLSKQFVQWDELLCQLEAAKQVKPVEE	390086	393818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_391606_392540_392617_393240_393301_393494
622808	contig_5280_pilon	+	2172	9	Intergenic	novelGene_52592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	683.459764726498	2	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	800	1117	47432	78098	FALSE	30	CTCACGTAGTATTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38311	79153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39087_39235_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
622812	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_16487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27827	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
622813	contig_17311_pilon	-	790	6	Intergenic	novelGene_57843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8459.12428091703	31	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	39	362	126865	121854	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARDGAEEKKMWEPSEL	126903	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121899_123344_123555_123642_123709_126862
622816	contig_14441_pilon	+	1381	8	Intergenic	novelGene_100638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.595595727474	11	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	767	1195	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111301	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112112_112154_112454_112665_113185_113209_115357_115611_116578_116963_117220_117344_117539
622817	contig_9345_pilon	+	1330	2	Intergenic	novelGene_24613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGACAGAAATGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946882	949557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474
622819	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
622820	contig_11003_pilon	+	1860	8	Intergenic	novelGene_105421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	199.869140863185	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	389	1435	56015	72610	FALSE	10	CATGCCGCAGCGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYTSGSLPFLQMSL	55626	73035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66305_72570
622827	contig_15354_pilon	-	2305	2	Intergenic	novelGene_65709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	478	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	124	1266	224900	223758	FALSE	20	GCTTCACAGTTTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTEEIVGFRIVLGNVLGSLPDQTLAAEASRPIPQLLLLCVAMGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227716	222718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224922_227614
622835	contig_14441_pilon	+	1233	6	Intergenic	novelGene_100523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	390.062251441997	68	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	620	1048	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111136	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113670_113711_114556_114732_116578_116963_117220_117344_117539
622836	contig_2046_pilon	-	2990	16	Intergenic	novelGene_151558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_15	50.9044420676843	487	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	202	1932	53659	15125	FALSE	30	AGAATCATATAGGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQLAKSTEERTFQYQDTLPSLPVPSLEESLKKYLESVKPFANEEEYKKTEEIVKKFQNGVGEKLHQKLLKKAKGKRNWLEEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAYIEHYWPPKEGTQLERGSITLWHNFNYWQLLRKEKLPVQKVGNTPLDMDQFRMLFSTCRVPGITRDSVMNYFSTESEGCSPSHVTVLCRGRVFVFDVMHEGCLITPPEICRQLTYIHKRCHSEPDGPGIAALTSEERTQWAKAREYLIGLDPQNLTMLEKIQSSILVYGMSDGSPHVTPEDYSQVTAMILTGDPTVLWGDKSYNLISFSNGVFGCNGDHAPYDGMIIINVSRYVDEKIFENEGKWKASDLDIVVYAFTPFGKKLTKKKMLHPDTFVQLALQLAYYRLHGRPGCCYETAITRYFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPYAHLHERRQKMLQAFAKHNEMMKDCSNGKGFDRHLLGLSLIAKEEGLPVPEIFTDPLFSKSGGGGNFVLSTSLVGYSRTRGLVVPMVHNGYGFFYNIRDDRFVVSCTAWKSCAETDAEKLVQLVFHAFHDMMQLMNTAQL	61914	14066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_-_15246_26067_26188_26314_26409_26499_26579_28131_28256_32938_33070_33796_33881_38541_38644_40137_40264_40376_40471_42474_42584_43710_43836_44005_44188_45848_45974_53544_53681_61734
622837	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
622839	scaffold_19766_pilon	+	1967	11	Intergenic	novelGene_34423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	172.314276831608	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	651	1808	846171	851417	FALSE	15	CCACCTTCTAATCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844362	851576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844446_845085_845163_845497_845663_845845_846225_846509_846621_847932_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
622841	contig_16907_pilon	-	2463	16	Intergenic	novelGene_87472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	81.3245896939474	18	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	87	1217	524752	502095	TRUE	65	TTACACCAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIPAEESDQLLIRPLGAGQEVGRSCIILEFKGRKIMLDCGIHPGLEGMDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKITSKPVNLFVL	524838	485013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502131_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520295_524702
622846	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27909	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
622847	contig_4315_pilon	-	2096	3	Intergenic	novelGene_46801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_1	63	9	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	768	1187	333701	327997	FALSE	65	AAGAAAGAAAACTCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLPTSAPGRGTNRRGHPPRPPTGLWYLATAPPAPAPPAFAYVSSVPVMPYPAATVYYVSPGPTSAQAATEWPPKASSQPAAAHRHSIQLDLAGLEELNKALSRAVQAAKSVRSTTKQMSRSLSADLRQARGLRGSCLF	334731	327087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991
622848	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
622849	contig_4315_pilon	-	2115	11	Intergenic	novelGene_46791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.123132834727	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	79	1449	358035	327739	FALSE	25	CAAAACATCCTGTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLS	363188	327072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327742_344468_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155
622858	SIRV2	-	608	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	42	2967	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATTGTGAAGATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
622870	contig_11720_pilon	+	1263	9	Intergenic	novelGene_43977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	379.457425148066	2	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	74	1009	262352	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262278	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_267819_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
622871	contig_21315_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_151569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGAAGGACATGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46208	47459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_46200_47500
622879	contig_9708_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_67263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGTAACTCTGATACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66274	59234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_59594_66096
622880	contig_5954_pilon	-	1708	4	Intergenic	novelGene_28414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	66.0420741312351	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	37	471	97313	94607	FALSE	15	CTGTCTCCAGCAACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVFRSALWGWRTGVQPSCGLRHLSQVQGPPDYPSFVESVDEYHFVERLLPPTRIPEPPKHKHYPTPSGWQPPQDITHGNRQMTVIRKVEGDIWALQKDVEDFLSPLLGKMPVTQVNEVTGTLRVKGYFDQQLKAWLLEKGF	97349	93369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_94754_94886_94946_95847_95999_97235
622889	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
622909	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	364	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622917	contig_2033_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_71538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTGGTGGCGTAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136182	135526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_135500_136200
622944	contig_16103_pilon	-	2112	8	Intergenic	novelGene_118866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	34	junction_6	3576.34660809386	4	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	339	701	735970	733331	TRUE	35	TAAAGAACCAGTCCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743698	722301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735973_737495_737630_743496
622945	contig_12864_pilon	-	1100	7	Intergenic	novelGene_76450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	166	675	251873	242831	FALSE	10	TGTTGGCAGATGTCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252151	242405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
622949	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622957	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	94	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
622963	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
622964	contig_14322_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_115817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	32	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671879	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
622966	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623012	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
623018	SIRV2	+	306	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	291	-74	-291	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAACCATACTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
623023	contig_3948_pilon	-	2025	13	Intergenic	novelGene_53299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	406.042861722202	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	431	1699	1490755	1468245	FALSE	15	TCAACAGGTTTGCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511000	1467918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494261_1510762
623038	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
623042	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
623046	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
623050	contig_5499_pilon	+	1870	11	Intergenic	novelGene_56988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	247.183009124818	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1	645	803317	824866	TRUE	25	TCTCTGGGTAAAGTTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRAAGRMGGRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTGKSGSLSFKNYCPE	803316	840246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_824822_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
623052	contig_610_pilon	-	1676	6	Intergenic	novelGene_76727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1523.64833212917	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	57	461	252557	222001	TRUE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPDSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGFCGASRLRWTRKKGLVMSF	252613	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_221826_222063_234998_235203_235244_235302_252475
623054	contig_8330_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_71998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCCTGGCTGCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2104953	2105763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2105000_2105800
623059	contig_10437_pilon	+	2209	6	Intergenic	novelGene_38144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	207.72443284313	4	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156674	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859_162093_162724
623064	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623072	contig_2487_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_148444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCTCTGGTCCTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96104	94787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_94800_96100
623094	SIRV3	-	270	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGGGATCGTCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6522	6252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6300_6500
623097	contig_5891_pilon	+	1540	7	Intergenic	novelGene_151578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_1	77.6015463763448	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	878	1540	136574	173821	FALSE	30	GTACGTATTTGAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLEDDDYEEKDDCGMDNLNKKFSSATLREGPNNGYFDKLPYELIQLILNHLTLPDLCRLAQTCKLLNQHCCDPLQYIQLNLQPYWAKLNDTSLEFLQARCSLVQWLNLSWTGNRGFISVSGFGRFLKVCGSELVRLELSCSHFLNETCLEVISEMCPNLQELNLSSCDRLPPQAFNHIAKLCGLKRLVLYRTKVEQTALLSILNFCSELQHLSLGSCVM	107853	173821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_107964_125314_125433_126084_126669_136508_136706_143057_143303_150823_151038_173749
623098	contig_20731_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_151594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCCCTAAAAGAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52916	50664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20731_pilon_-_50700_52900
623118	contig_12125_pilon	+	2121	8	Intergenic	novelGene_76189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	126.153453688557	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	83	817	64006	82673	TRUE	40	ACTAAATTTGTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPITPSTYVRCLNVGLIRKLSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQAGKSPTCELLFDWGTTNCTVGDLVDLLVQNEFLAPASLLLPDAVPKTVNTLPSQEAITVQQKQLPVYGKDRTSVTPVQNLELNYMPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKYQRRN	56154	84107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69243_69309_82654_82810_82939
623122	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623127	contig_18869_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_56042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73555	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
623128	contig_3095_pilon	+	1175	5	Intergenic	novelGene_74989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	3	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	68	769	147241	151151	TRUE	15	CTTAGGTGGAGTTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNVCFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150476_150696_150996_151163_151848
623138	contig_10197_pilon	+	1961	6	Intergenic	novelGene_115172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	12.280065146407	371	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	221	637	306637	310853	FALSE	30	TACTAGGATATTGTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITLASSQAVSNARNVEWPLSEVAEGVFETEAPGGYKFYLQNQDLPQSDPVLKVTLAVSDLQKSLNYWSNLLGMKIYEKDEQKQRALLGYADNQCKLELQGIKGTVDHAAAFGRIAFSCPKKELPDIEDLMKRENQKILTPLVSLDTPGKATVQVVILADPDGHEICFVGDEAFRELSKMDPEGSKLLDEAMAADKSDEWFAEQNKPKASG	304304	312177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_304451_306562_306700_307710_307798_308055_308170_308257_308345_310787
623158	contig_8617_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_73447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62462	62046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
623159	contig_8538_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_4936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842792	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
623165	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623167	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623179	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623190	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
623202	contig_8616_pilon	+	1488	9	Intergenic	novelGene_72563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	299.081406142207	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	18	1106	425778	435958	TRUE	30	CGGAACATTGAACCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGEKTVGSGKRKRAKVEWGM	425760	436579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_436119_436357
623203	contig_401_pilon	-	1265	4	Intergenic	novelGene_42849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_3	177.22365029031	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGAATCCACCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728575	1713854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1714795_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
623206	contig_17440_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_7683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCAGCTATGAAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3700_4000
623213	contig_13424_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_151602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAGACGGATTTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116179	115920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_-_115900_116200
623214	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623216	SIRV7	-	350	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
623218	SIRV5	-	369	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAGATGCGTAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
623220	contig_14925_pilon	-	943	4	Intergenic	novelGene_55192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	25	AGCAAAGGCTGTGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
623222	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_97509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623224	SIRV7	-	278	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69006	2	35787	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78951	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
623231	contig_18869_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_56399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGCATTTATCACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
623241	contig_18869_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_56193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73722	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
623245	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91677	2	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
623249	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
623251	contig_19564_pilon	-	1648	4	Intergenic	novelGene_29627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	11	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	131	1465	15529	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15659	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
623257	contig_5598_pilon	+	1505	3	Intergenic	novelGene_148298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	498	797	868870	869169	FALSE	20	ATCCACTTTGAGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRLSLLMSDGSWLKTENTSKMCTCVLLTMLRHSTVWIVIKLRISLQRMGILKHLIVLTRNLYRDQKAVVQIHSLKSGKVCIRVISFHHIYSICMLSK	864242	869877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_864274_864596_864690_868496
623283	contig_10500_pilon	-	2738	19	Intergenic	novelGene_41161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	97.8696065004004	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	884	2652	87	2738	1290675	1254494	FALSE	20	TCCCAGTATCTTCTCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSKADVERYIASVQGSAPSPREKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLYELEENIDKAVECYKRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPTIYKLKEQLLDCKGEDGWNKLFDLIQSELYARPDDVHVNIRLVELYRSNNRLKDAVAHCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKDYLESLQCLDSDKSNWRITSRDLLLAYANLMFLTLSTRDVQECRELLESFDSALRSVESSVGGNDELSATFFEMRGHFYMHAGSLLLKMGQHSDVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLMKGEAGQNLLEMMAYDRLSQSGHMLLNLSRDKQDFLKEVVESFANKSGQSALYDALFSSQSSKDRSFLGSDEIGNINVQAPEPDDLARYDVGAVRAHNGSLQHLTWLGLQWSSLPTLPAIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVIYTSHLQLEERCNSYYNSYQPLCLALPVCKQLCTERQKSWWDAVCSLIHRKVIPGTSAKLRLLVQHEINTLRGQEKHGLQPALLIYWAKCLQKTGSELNSFYDQREYIGRSVYYWKKVLPLLKTIKKKTSIPEPIDPLFKHFHSADIQVSEIGDYEEEAHITFAILDAVNGNTEDAMTAFESIKNVVSYWNLALIFHRKAEDIENDALSLEEQEECKNYLRKTRDYLIKILDDSDSNPSVIKKLPVPLESVKEMLNSVMQELEDYSEGGLLYKNGSLRNADSEMKHSTPSPTKYSPSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLLKMICQQVEAIKKEMQELKLNTSNSASSHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQSFHGAPLTIATTGPSVYYSQSPAYN	1290761	1254493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1254544_1258136_1258273_1260918_1261003_1261086_1261267_1262166_1262314_1262391_1262530_1262788_1262951_1268147_1268272_1268411_1268588_1268668_1268851_1270051_1270262_1272018_1272107_1275639_1275833_1278008_1278155_1278499_1278731_1282879_1283033_1283520_1283633_1284886_1284955_1290603
623293	contig_18898_pilon	-	2416	19	Intergenic	novelGene_77630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCGGGAGGGACTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70266	38915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_-_39071_39599_39816_53322_53387_53470_53559_56519_56757_56849_56935_59827_59963_61113_61172_61248_61333_62140_62300_62386_62496_63947_64010_64578_64699_64915_65060_66091_66242_67302_67498_67955_68058_68475_68539_70076
623314	contig_17493_pilon	+	2390	9	Intergenic	novelGene_122190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	460.786827068657	16	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	524	916	118558	156476	FALSE	25	GTTCAGCTCACTTGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADEDAFAEECRRRGQNALPSQPAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGFKEGGKRKKQKQREEQKKKKSTKGNH	49996	157950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104445_118476_118590_119116_119188_146410_146618_156393
623316	contig_6710_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_90545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653841	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623331	SIRV4	-	315	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAACGATTGCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2700
623334	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
623345	contig_19534_pilon	-	1593	6	Intergenic	novelGene_151615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	409.525872198571	34	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	67	843	68652	62762	TRUE	30	CATGATGTTTCTAAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAVGSRALLWIALLLFAPAGSLVATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDGEALQYWYENHNISIPKATLKDNGTYHCEGFVQKLHRISDSLNITVQEAEQIKNYWPQFFIPLLVGILFTVDTALFFFTRQQFKLLLKIKRTRRGSRLLDPQPKTDPQKK	68718	61956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62308_62362_62953_64567_64823_66767_67023_68150_68172_68597
623358	contig_2069_pilon	-	901	3	Intergenic	novelGene_23522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	470	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509898	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509212_1509710
623381	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623391	contig_18869_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_56039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73554	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
623392	contig_15118_pilon	+	2142	5	Intergenic	novelGene_74631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	132.850244636583	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	31	537	438502	457375	FALSE	10	CGTCTGTCTCTGTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVPGSDSRKMAELRALVGVKRVIDFAVKIRVKPDKTGVVTDGVKHSMNPFCEIAVEEAVRLKEKKLLKEVIAVSCGPAQCQETIRTALAMGADRGIHVEVPAAEADRLGPLQVARILAKLAEKEKVNLLLLGKQAIDDDCNQTGQMTAGFLDWPQACIQQWNIKDYSVPKEPWWHSG	438471	458980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_438559_448781_448941_449190_449350_451928_451992_457306
623393	contig_5189_pilon	-	1941	8	Intergenic	novelGene_34847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.65900708742	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	103	807	244235	199237	FALSE	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247743	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199300_218559_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
623399	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623402	contig_4103_pilon	-	3404	1	Intergenic	novelGene_52034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAATAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678464	675060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_675100_678500
623408	SIRV7	-	349	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	1	0	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
623427	contig_5711_pilon	+	2042	11	Intergenic	novelGene_80260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	73.5502549281782	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	23	1318	52529	113457	TRUE	40	GATTTTAATCTGAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLEREKKLCSSPLKMRRFLNSSTFVIIL	52506	122432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_87382_87549_98806_98996_105546_105642_107307_107419_108771_108937_113379_113568_121458_121637_121996
623431	contig_7457_pilon	-	2861	6	Intergenic	novelGene_31427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.298544259895	17	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAATAAATATTGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473231	468266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468353_468487_469384_470289_470492_470902_471292_471559_472768_473151
623439	contig_9363_pilon	+	1818	9	Intergenic	novelGene_6830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	294.837852683471	35	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	270	626	1622549	1623661	TRUE	10	GGCCACGCGAGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRAPAPRCGLPTGCA	1622279	1625968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623496_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1625066_1625343_1625435_1625537
623446	contig_9940_pilon	+	2381	1	Intergenic	novelGene_125341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGACCCAAGCCATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104927	107308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_104900_107300
623453	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
623454	contig_9345_pilon	-	1304	5	Intergenic	novelGene_24689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2281.55243200765	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	128	709	955353	947957	FALSE	30	AGACTAGATGTAGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001343	947361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_1001218
623457	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
623469	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	893	-24	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
623474	contig_14322_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_115942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671883	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
623476	contig_6633_pilon	+	1920	7	Intergenic	novelGene_143170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.5826120686356	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	943	1524	102039	105616	FALSE	20	CTATTTTATAGTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKINQKEQKPVQMMFQEATFKISYVKEVQAQVLELPYAGEELSMVILLPDDNVDLSMVEKNLTFEKFVAWTKPDCMSSTEVEVLLPRFTLEEDYDMEYVLQNLGVVDAFQQGKADFSAMSAKTDLFLSKFVHKSFVEVNEEGTEATAASAAVVVECCLEAGPRFCADHPFLFFIRHNTANSILFCGRFSSP	86835	106012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_86994_89340_89518_99627_99766_100129_100477_101916_102060_103843_104000_105211
623479	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
623484	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
623487	SIRV2	-	641	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	5	2971	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
623494	contig_10093_pilon	+	2312	4	Intergenic	novelGene_147499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	116	junction_1	100.057761096057	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	63	482	73194	101883	FALSE	75	AAGAAAAAAGAAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSACGLGAPALASGGPLLAAMDRFLWTSGLLEINETLVIQQRGVRIYDGEEKMKFDTGTLLLSTHRLIWRDQKNHECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKSAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEVSFCINKIGLEMCVCAFFCCLL	73131	103713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90936_91006_93068_93140_101699
623497	contig_13894_pilon	-	3150	11	Intergenic	novelGene_62074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_10	45.8711238144434	152	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	13	1527	435096	399494	FALSE	15	CATTGTTTAATGGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQRRSLLQSEQQPSWTDDLPLCHLSGVGSASNRSYSTDGKGTESHPPEDSWLKFRSENNCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLSTEHTDADVRRVLLQAFDVVERSFLESIDDALAEKASLQSQLPEGVLQHQLPPQYQKILERLRTLEREISGGAMAVVAVLLNNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNADHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQESTRRVGDYKVKYGYTDIELLSAAKSKPIIAEPEVHGGQPLDGVTGFLVLMSEGLYKALEAAHGPGQANQEIAAMIDTEFAKQTSLDAVAQAVVDRVKRIHGDTFASGGERAKFCPRHEDMTLLVRNFGYPLGEMSQSTPTPSPAAGGRVYPVSVPYSSAQSTSKTSVTLSLVMPSQGQMVNGAHSVSTLDEATPTLTNQSPTLTLQSTNTHTQSSSSSSDGGLFRSRPAHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDHGEQSVMTAP	435108	397870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_399702_401555_401719_402744_402968_405219_405365_406995_407108_408221_408336_409304_409444_409993_410081_411118_411273_411603_411741_435063
623498	contig_15047_pilon	+	1264	4	Intergenic	novelGene_52122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.7839705731869	3	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	30	692	2194	21082	FALSE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAVPRALMCLSQLLKVRPWKA	2164	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_21023
623502	contig_5083_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_151685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGTGTGTGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665570	664525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_664500_665600
623513	contig_6914_pilon	+	1973	7	Intergenic	novelGene_151711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	101.614330791588	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	671	730	17530	17589	TRUE	20	TGTGGATTATTATTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRKIPLVPENLLKKRKAYQALKATQAKQALLEKKKQRKGKGLRFKRLESFLLDSRRQQRDRVRIRRLKVKPHGLEVPDGHSLAFAVRIQRINGVSGLVRKTIARLRLRKIFSGVFVKVTPVTLKVLRTVEPYVTWGFPNLKSVRELILKRGQAKVKNKTIPLTDNTVIEEHLGKFGVICLEDLIHEIAFPGKYFQVISQFLCPFYLSVARHATKNKVGFLKEMGLPGYRGESINQLIRQLN	14238	20483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_14348_15166_15331_16344_16483_17103_17214_17380_17596_18757_19780_20268
623517	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
623524	contig_7594_pilon	+	1570	9	Intergenic	novelGene_55429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	934.984458426984	30	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	50	781	539045	556375	TRUE	30	GAATCCAGTTTCCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKKPQTWL	538995	557737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349_554553_556356_556518_557090
623538	contig_4857_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_48898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1011	1421	1474186	1473776	NA	50	GGGAAAGATAGAATAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSLVWRFRVMVSWDIPVNCLIMCLVLLFFLLVCFVMPGVLKVCRQPTIQGTTIGLFTWSNRRRRRVRDRRRIWNVWLIASMNSCLLCHETRTGWCMATITEHFDQRFHRKILIKRGKMENRISDSHRLDFLKP	1475196	1473239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1473200_1475200
623550	contig_11258_pilon	+	1836	7	Intergenic	novelGene_67794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	161.988425512442	6	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	20	1003	279549	292582	FALSE	35	GAGTTATTTAAATAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVGHEAQGCVWRREFVGGSQRNHYGKKEGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279529	293415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279640_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
623552	contig_7594_pilon	+	1276	6	Intergenic	novelGene_55430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	606.040460695488	1779	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTTTGTGATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538998	555178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
623558	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	1539.44460358273	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFQKLVFGTGTQLLVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	42392	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_42337
623574	contig_7426_pilon	+	811	7	Intergenic	novelGene_27508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_6	239.509742320989	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	23	694	962152	987945	FALSE	55	TAATCAAACACTTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAGDKPRMQTYEIDLNKCGPMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIEDREKLDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDFTEERLAKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	962129	988062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_962181_970075_970162_979923_980061_980784_980902_983658_983761_985081_985205_987867
623583	contig_5467_pilon	+	2092	10	Intergenic	novelGene_111931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_1	331.725120477114	1219	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	14	988	8246	14522	TRUE	5	GAGTTGGGCCTCCGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRYHGDVQVHLR	8232	15843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956
623588	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_96033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623594	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_18213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTACCCAGCTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
623602	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
623607	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
623609	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
623622	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1564	643	1109	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
623624	contig_6823_pilon	-	1482	7	Intergenic	novelGene_131209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_1	205.5583858664	2142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	69	1019	227609	187659	FALSE	35	TTCTTGACATCAGCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSLFLFSVLLLLLVAEAAVAVKMASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDLSTMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIASACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAVELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL	227677	187195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_187793_189479_189762_191013_191144_191275_191423_193825_193960_221526_221634_227592
623629	SIRV6	+	209	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	455	1	224	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2740	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
623638	contig_2703_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_101841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGACATCAGCAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294908	1293388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1293400_1294900
623640	contig_5549_pilon	-	2034	6	Intergenic	novelGene_81654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_5	729.098182688724	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTAATTTTAATAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_442936_443118_443683_443958_444755_444949_445003_445604
623644	contig_5499_pilon	+	2370	11	Intergenic	novelGene_57009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	268.542007887034	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	139	1185	816576	840037	TRUE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRSPEGTQLPARHPRTAFRRHQHGCGPARCGRSAPRPAKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803405	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840273_840324
623647	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623652	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
623656	contig_6710_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_89150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653685	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
623662	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
623665	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623669	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623679	contig_2733_pilon	+	1642	5	Intergenic	novelGene_128558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	463.712936524311	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCTTTTTTTATTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570819	615334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_570861_571294_571382_578069_578186_611519_611589_614005
623683	contig_10019_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_86675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257485	260053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_257500_260100
623684	contig_5954_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_28511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGTGGTTTTACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432098	433003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_432100_433000
623685	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_97417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	657174	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRWDRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657158
623687	contig_8156_pilon	+	1680	6	Intergenic	novelGene_98943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396444	441762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_396920_398419_398542_403288_403537_403887_404006_404667_404810_441187
623702	contig_5041_pilon	-	2554	3	Intergenic	novelGene_27112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	365	junction_2	427	36	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636082	603148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_605439_616559_616729_635987
623704	contig_19564_pilon	-	1303	5	Intergenic	novelGene_29584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.398310486997	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	122	514	15529	12201	TRUE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATVWCPHPKYPTLWLSPTTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15650	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11779_11852_12379_12983_13033_13945_14055_15472
623711	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
623715	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623728	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
623731	contig_6576_pilon	+	2249	3	Intergenic	novelGene_42403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	111	557	1301228	1303557	FALSE	35	CAGAAACACTTCCATGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPCLVMSVEQPYLCLQ	1295666	1305249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301630_1303512
623741	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623749	contig_7202_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_18337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28082	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
623754	contig_14322_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_116242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGCAGTATATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671658	671362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
623759	SIRV6	+	331	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	1	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
623764	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
623765	contig_12080_pilon	-	2941	16	Intergenic	novelGene_128394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_13	90.1202653248548	284	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	225	1769	206402	195785	TRUE	25	GGCTATCATTCATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLEAWTSALGKWFSPLSCHQLLGPGLLRLGRLWLRSPSHTALASGLWLSGFGLLRGDHLFLCPAPGPGPLAPEDMVHLRRLQEISVVSAADTPDKKEHLVLVETGRTLYLQGEGRLDFSAWNAAIEGAAGGGGTGLQEQQMSRCDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFVEDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKEVIGCLPWVNRRTLATLIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQVRGKRKLWAAPVVPWLLAISLSAPCAHLCQPLTLSPA	208503	193870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195651_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200886_200956_201268_201417_202856_202963_203237_203451_204722_204887_205119_205184_206371_206592_208468
623766	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623781	contig_7202_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_16941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCACCCAATTCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
623793	contig_9484_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_105600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAGATTATATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66798	66222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_66200_66800
623797	contig_5039_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_64856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATATACACCTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345587	346336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_345600_346300
623798	contig_5039_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_64857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346285	348129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_346300_348100
623800	contig_1624_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_138367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45698	45303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_45300_45700
623807	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
623808	SIRV6	+	1071	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	14	3	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
623825	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_115998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
623830	contig_7428_pilon	+	2084	12	Intergenic	novelGene_77726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	97.5071092979192	676	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	561	1823	432562	435117	FALSE	20	CAGGCTGGTATGGGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPPLHWACREGRSAVVEMLIMRGARINVMNRGDDTPLHLAASHGHRDIVQKLLQYKADINAVNEHGNVPLHYACFWGQDQVAEDLVANGALVSICNKYGEMPVDKAKAPLRELLRERAEKMGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSRDFNEECPRLRIFSHPNVLPVLGACQSPPAPHPTLITHWMPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428912	435378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433254_433360_433445_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
623842	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
623850	contig_12250_pilon	-	2265	5	Intergenic	novelGene_80636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_3	182.461639804097	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	5	847	379717	377252	TRUE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRGEAVPTEPLPLTSGYPVDPTW	379721	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_377659_378286_378359_379009_379194_379537
623851	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
623853	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
623854	SIRV5	+	411	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2069_2157_2270_2316_3298_3405_3483
623856	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
623858	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
623863	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
623884	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623885	contig_13293_pilon	-	1868	3	Intergenic	novelGene_146433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.5	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTCCCCCCTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160868	155991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_-_157342_157432_157795_160712
623898	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
623899	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
623912	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623913	contig_1154_pilon	+	1540	4	Intergenic	novelGene_87151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	306.81844070322	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	64	726	896007	901946	FALSE	35	CAGTTTGAACATAACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLVLIRHGESTWNLENRFSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895943	902760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900232_900889_900990_901776
623926	contig_14519_pilon	-	1643	5	Intergenic	novelGene_66827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_4	98.7636066575133	4	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	122	706	283786	281887	FALSE	30	ATCTTCATGAGTTCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFGKSANNALHLLFPVTTAPPPQQLWVHMKYFIYISFLIIIKINKSL	287178	280949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283842_287112
623929	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623934	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623947	contig_18869_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_56356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73578	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
623950	SIRV2	-	561	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4312	34	3137	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
623952	contig_18869_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_56017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73532	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
623953	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
623971	contig_14209_pilon	+	1643	10	Intergenic	novelGene_88341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	34	junction_4	196.063166943969	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	827	1255	38057	40625	FALSE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32342	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418
623979	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
623984	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
623986	contig_17936_pilon	-	1839	6	Intergenic	novelGene_29984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	112.130994823019	6	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTTGTAGTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167541	160231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161506_161839_161929_162751_162846_166658_166685_167090_167179_167273
623994	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
623999	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624005	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
624011	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624020	contig_2069_pilon	-	1903	4	Intergenic	novelGene_23208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_3	129.377999160084	390	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	27	1742	114391	102624	FALSE	25	GGTTGGTATGAGTATCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEDLIAQFSLPCEVKVVAKDTSHPDDPLTSFLGLRLEEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	114417	102462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_103694_109097_109509_111852_111994_114297
624022	contig_7457_pilon	-	2257	2	Intergenic	novelGene_31465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_1	0	17	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGGGAAGGCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506634	497675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_499079_505780
624027	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624031	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_115781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671881	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
624032	contig_1861_pilon	-	1811	16	Intergenic	novelGene_77657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	127.218691848154	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	372	1652	104869	87490	FALSE	10	TCATGCCTCCCACTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKIKSPASCLTP	115224	87330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106035_106083_106881_106923_112515_112582_115124
624040	contig_19342_pilon	+	965	7	Intergenic	novelGene_41067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.33749739908346	133	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	29	331	3263	5272	TRUE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPDHGGALWRGAKIHLSCAVREAN	3234	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3795_5205_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
624043	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_18160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624046	SIRV7	+	1272	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGTTAATATGCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1541_1732_1994_2391_2679_2996_3107_3823
624070	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
624078	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624080	contig_6050_pilon	-	2078	2	Intergenic	novelGene_123122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTTTCACACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381182	377073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377904_379934
624082	contig_2069_pilon	+	1894	14	Intergenic	novelGene_23245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	330.879284017171	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	313	1155	333898	341321	TRUE	10	CTTCTGTCTTAAGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323990	345505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332216_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_345282
624083	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624086	contig_14441_pilon	+	1110	5	Intergenic	novelGene_100588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.651485960052	5	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	509	937	116728	117610	FALSE	10	TGCTTGGCGCTGCCTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111199	117783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112003_112197_116604_116963_117220_117344_117539
624092	contig_1594_pilon	-	2216	18	Intergenic	novelGene_138819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	66.028933576154	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	45	1994	777962	503479	FALSE	15	TTGCTCTGGGAATTGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEYSAFDMSAPTPAHCCPAVGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESIPLIQGPVGLHQKFSPKQIQALEHTYDDLCHTEGVTALPYFLIKYDENTVLVSLLKHCSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSHFQSVEVLCFRDRTMQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETV	810145	503256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_771341_771460_777250_777306_777805_777976_810114
624099	contig_17440_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_7642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3500	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
624100	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_95069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624102	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624109	contig_12265_pilon	+	2472	12	Intergenic	novelGene_149436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	51.8288665220327	5	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	339	1883	23677	46990	FALSE	20	GGCTGTGTTACAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVSAGLKKGQITPTELCQKCLSLIKKTKFLNAYITVTEEVALKQAEESEKRYAKGQSLGDLDGIPFAVKDNFSTSGIETTCASNMLKGYVPPYNATVVQKLLDQGALLMGKTNLDEFAMGTQDQGSKLEMEAAPSGGLLCRVGEGSGSTDGVFGPVKNPWSYSKQYREKRKQQPHGENEDSDWLITGGSSGGSAAAVSAFTCFVALGSDTGGSTRNPAAHCGLVGLKPSYGLVSRHGLIPLVNSMDVPGILTRCVDDAAIVLGVLAGHDPKDSTTVQDPVKPFMLPSLTDMSKLCIGIPKEYLVPELSSEVQSLWTKAADLFESEGAKVIEVSLPHTSYSIVCYHVLCTSEVASNMARFDGLEYGHRCNIDVSTEAMYAATRREGFNDVVRGRILSGNFFLLKENYENYFIKAQKVRRLIANDFVNVFNSGVDVLLTPTTLSEAVPYLEFIEEDNRTRSAQDDIFTQAVNMAGEDPLRMFWFFSNSWVGPWFSTCTVAVLFPKSNSLSFWNA	19603	47579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_19727_23461_23686_29717_29878_30194_30294_32260_32358_34568_34644_36604_36782_40100_40277_40364_40478_42478_42672_43407_43526_46662
624114	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624124	contig_614_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_132638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907213	907447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_907200_907400
624129	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624132	contig_8898_pilon	-	2389	6	Intergenic	novelGene_137227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_5	27.7920852042447	322	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	333	1619	208485	202709	FALSE	20	GAAAACTTGTTCCCGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKIEREIKSSPSESPLMEKKNSLKEDREETKLSLGDVESRNPVVPDVGCAAAPLRAVVEERTVSFKLGDLEEAPEQEKLPSMDLKEETSIDSAMNGAVQLPNGNLVQFNQAVSNQINSSGHYQYHTVHKDSGLYKELLHKLHLAKVGDCMGDSGDKPLRRNNSYTSYTMAICGMPLDSFRAKEGEQKGEEMEKLTWASADTKKRIRMDSYTSYCNAVSDIHSASEVDISVKGEMGLGDRKGSNGSLEEEWYDQDKPEVSLLFQFLQILTACFGSFAHGGNDVSNAIGPLVALYLVYDTGDVSSKVATPIWLLLYGGVGICIGLWVWGRRVIQTMGKDLTPITPSSGFSIELASALTVVIASNIGLPISTTHCKVGSVVSVGWLRSKKAVDWRLFRNIFMAWFVTVPISGVISAAIMAVFKYVVLRV	208817	201938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_202871_203878_203964_204522_204709_205342_205905_206009_206283_208466
624140	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624147	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624151	SIRV7	-	289	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91637	0	-91631	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGAAGTAAGTATAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
624158	SIRV7	-	353	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33215	1	-4	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114742	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
624173	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_95014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624182	contig_5791_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_35841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	920	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTACAATACTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044984	1043733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1043700_1045000
624187	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624188	contig_2069_pilon	-	1349	5	Intergenic	novelGene_23440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1817	junction_1	284.840635268214	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGCTGGATACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330480	1327124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155
624197	contig_14925_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_55184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_4	1559.20723045399	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	214	471	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVSYNKLIFGQGTSLSIIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	87436	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_87375
624201	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624203	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624210	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624217	SIRV4	-	145	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTCGGTTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2766	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
624222	contig_14441_pilon	+	968	5	Intergenic	novelGene_100413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.563872498141	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	230	490	116728	117123	TRUE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPLCQQLSHSDEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	75884	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_75920_113163_113209_116578_116963_117097_117344_117539
624225	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624229	SIRV7	-	950	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	44	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680_114989_147608
624258	contig_18778_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_151771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCATTTTAAATCAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35764	37357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18778_pilon_+_35800_37400
624261	contig_13888_pilon	-	2719	7	Intergenic	novelGene_151822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	29.784876848644	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	2236	2718	375970	369397	FALSE	70	AAGCAAATGAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNIHPIYNIKTLMIKRELAKDSELRSQSWERFLPQFKHKNVNKRKEPKKKTVKKEYTPFPPPQPESQIDKELASGEYFLKASQKKRQKMEAIKAKQAEALSKRQEERNKAFIPPKEKTVVKPKEASIETKIDVAAIKEKVKKAKNKKLGAFTAEELKLKM	381772	369395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_369504_371205_371300_371407_371486_374689_374861_375937_377946_378829_379003_381685
624262	contig_15244_pilon	+	1985	15	Intergenic	novelGene_118051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	68.075438346899	804	5	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	523	1914	567685	583369	FALSE	20	GATTCTATTCTGGGTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILFRIRGGLDLAFQLATPDEIFVKKALKHVLRDLSAKLSSNALVFRICRSSVYVWPNSDMNTIPGELTDSSACKNIMRFIQFEQEEDTQRKFMRKKEKKLPDMHQIVNIDLMLEMSTPLSAVTPIIERESGEHHYVNMTLPVDTVLAVAPEEPWGKVRKLLVDAVHSQLTNMEKCILKYMKGTSIVVPEPLHFLLPGEKSLVTISYPSGIPDGQLQAYRKELHELFNLPHDRPYFKRSNAYHFPDEPHRDGYIRNPHTFLNPPNIESGMTYMVQGIYSYHHYMQDRIDDNGWGCAYRSLQTICSWFRHQGYTERSIPTHREIQQALVDARDKPATFVGSRQWIGSIEVQLVLNQLIGVTSKILFVSQGSEMASKGRELANHFQSEGTPIMIGGGVLAHTILGVAWNEITGQIKFLILDPHYTGAEDLQVILEKGWCGWKGPDFWNKDAYYNLCLPQRPQII	560536	583440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_560560_561672_561859_561983_562150_564444_564577_567669_567749_569829_570014_570094_570162_571877_572036_572415_572609_574208_574356_576308_576474_576690_576816_578417_578495_580848_580974_583282
624264	contig_1107_pilon	+	2119	7	Intergenic	novelGene_126553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	68.0622672427405	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGATATGAATGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209710	234111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_210377_210850_211189_230510_230568_231310_231407_231544_231632_232190_232244_233289
624265	contig_12270_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_113828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	2	331	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14410	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624271	contig_14925_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_55234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54557	52977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_53000_54600
624273	contig_14441_pilon	+	798	4	Intergenic	novelGene_100665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	190	618	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112113	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
624278	contig_12425_pilon	+	1613	8	Intergenic	novelGene_46647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	197.735754408323	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	362	1423	174111	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173658	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_173873_173963_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
624282	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91681	1	-91675	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAATGCAAATAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
624288	SIRV2	-	588	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	70	3074	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
624290	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_113546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	9	344	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14417	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624296	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624301	contig_16831_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_134807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572587	571936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_571900_572600
624305	contig_6710_pilon	+	576	2	Intergenic	novelGene_92583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGAGCACAGTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
624311	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_93624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624312	contig_11630_pilon	+	1975	5	Intergenic	novelGene_147178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.537101273712	12	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGATTGTTCCTGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96051	146274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_96137_97081_97254_131895_132058_144489_145725_145953
624317	contig_11171_pilon	-	1948	3	Intergenic	novelGene_48522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	24	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33739	15457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_16590_19469_19941_33394
624331	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91663	-15	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
624339	contig_10437_pilon	+	1384	2	Intergenic	novelGene_38213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCGTTTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234494	236377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_235481_235979
624340	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	232	-2	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
624343	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
624347	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624351	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657182	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657183	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624354	contig_5585_pilon	-	2526	16	Intergenic	novelGene_143070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	38.0029238641216	2	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	65	1969	497788	390145	FALSE	30	TTTATACAAGTATCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLSGHPTLPCNVLKFKSTTIMLDCGLDMTSTLNFLPLPLVQSPRLSNLPSWSLKDGNAFLDKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPTQSHRMDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKHGFSDIKVEDTAKGHIVLLQEAETLIQIEEDSTHIICDSDEMLRVRLRDLVLKFLQKF	497852	389587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_390322_392713_392852_394330_394430_402731_402900_405339_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_467045_467107_497723
624359	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
624364	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_92008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624367	contig_7179_pilon	+	2604	9	Intergenic	novelGene_78082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_8	68.3479151108503	281	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	14	1054	576847	583405	TRUE	25	TCTGTGCACTTTTATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGVSHLKQEPEKVKVSSSVRHPETPLLISGFHLPSKLKPPREKVDHEHPASEPENLEFSSFMFWRNPLPNIDHELQELLLDKGESVPSEEEDEEENGFEERKDEDSDADGGGWITPSNIKQIQQELEQCCVPNNVRVGCMTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRVSGRLSHTPQQQDLIWESESF	576833	586907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657_579730_579945_580075_580168_580373_580923_581022_583194_584391_586342
624374	contig_3223_pilon	+	1273	5	Intergenic	novelGene_151829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_3	12.0286117237194	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	25	708	967295	1003577	FALSE	10	CACATTTGTCTTTGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTPVFVPMKTHVMLHRMSGKGLAAHYYFPRQPCIFGDKMISVQITLNNTADRKIENIHIGEKKLPTGMQMHVFNPIESLEPEGSITVSVGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVSIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGMLTGMNETSTIIIAAPQNFTPTVILQKVVNVANVGVVPSGQDSIYRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG	967270	1004142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_967503_973414_973500_986171_986270_991371_991511_1003423
624376	contig_6870_pilon	+	3791	1	Intergenic	novelGene_103962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACTAGGATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393245	1397036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1393200_1397000
624385	contig_10197_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_115174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1047	3144	26	3169	318448	321591	NA	5	GTTCGTCTTGTTTCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVNICEEMTILHGGFLLAEQLFRPKALAELTKSDWEHVGQPIVEALKEISTTACSQPFAWKKKALIIIWAKVLQPYPATPSDTETRWQEDVFFSVGNMLPTINHTILFELLKSLEASGLFIQLLMALPTTICHVELERFLEHMTIDTSSKDVAFFLDIWWEMMKHKGNQQDPLLSQFRTMAHKYLSSSDEFSHPPKRFKSDPDVCPTMPLLAMLLNGLKQIQNKILCPGMKCCALANLADMLTVFALVEDDPQEVSATVYLDKLATVISVWNSDPENPYHQQALTEKVKEAERDVSLNSLARLPTETLFVGFEYMLSLLQEWGEELQTMLNSSQGTNYDSYRLCDSLTSFSQNLKLYLDDTTLSKEERQVVSELAECVKDFLRKTSRVLKNKGLEKDITASIAMAIIEQKMDRHMEMCYVFASEKKWAFSDEWLTCLVNNRALFREPGLVLKLLETVMEVGTSDRVIPESQIKQVVDLILECYADLSLPDKNKVLSGVLHSWGRKGLSEKLLACLEGFQEDLNTTFNQLTQSASEQGLAKAVASVARLVILHPEITVKKMCGMAVVNLGTHKFLAQILSAFPALRFTEEQGPNAPTTFVVSCLKETVWGKFSTPKEEKQFLEFLSCLMSPVKPQGIPVAALLEPDEVLKEFVLPFLMLDVEEVDLSLKIFIQTLEANAGLEEYWLQTCSPFPLIFSLCQLLDCYSRYWQLPKEQRCLSLDGKDVVIHILALLCEIVLANAETFSPDTWTKSLSWLHRKLEQLDWTVGLRLKNFFEGHFKCEVPATLFEICKLSEGEWTSQAHPGYGPGTGLLAWMECCCISSSICEQMLSLLVVDVSNPEEVRLFSKGFLVALVQVMPWCSPQEWQYLHQLTRRLLEKQLLHVPYSLEYIQFVPLLNLKPFAQELQLSVLSLRVFQFLCSQSCRNWLPIDGWSHVVKLLCSSLTNLLDSVRLIQSVSPWTQGQEQDLTQEALFVYTQVFCHVLHIMAMLHQEVCEPLYVLALEILTCYETLSKANPSVSSLLQKVNEQRFLKSIAENISPEERRHTLLQKISNF	318422	321773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_318400_321800
624388	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624412	contig_6710_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_89137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653667	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
624415	SIRV6	+	1003	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	32	162	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	37	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
624418	contig_5770_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_74153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGACATGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133728	134209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_133700_134200
624432	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_97002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624455	contig_15410_pilon	-	2334	10	Intergenic	novelGene_130589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_7	221.746657803254	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	476	886	89172	87704	TRUE	40	TAAAATTAAATGGTGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPISFSFSRTSARRRVVDLGDSARAAPEEKDFLKTVEGRELQSISVKPSEAPKELVIPLIQNGHRRRLLTQAPGPSTDAETLVDGVLLSQAVKELIEESKKSLEERKNESVDPTLAIPVIQKGCIPSGEGADSELQAETVPEEADYEAVPVEAYGLAMLRGMGWKPGEGIGRTFNQVVKPRVNSLRPKGLGLGANLTEAQALASTGPHRLPKPDEEQEKEKEDQPQGLVPGGAVVVLSGPHRGVYGKVEGLDPDNVRAMVRLAAGSRVVTVSEYCLRPVSQQEFDKNSSDLSK	92456	85340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_85697_85793_85880_86394_86465_86562_86687_86891_87845_88121_88336_89116_89227_91215_91341_91434_91599_92324
624456	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624463	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_97614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624469	contig_14341_pilon	+	2231	4	Intergenic	novelGene_111777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	26.2466929133727	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	107	871	313348	324581	TRUE	25	TATATTTCTGTGGCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTSVVRCRARKAPALSPAPREPGGKGLAHQEECPVAQLDPQEDPFPDGKRGSRPLRKMEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEGGCDLPGCSRGFQPGGVEAAGPNTEDGVP	313241	329064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_313448_316308_316885_324492_324620_327742
624472	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624475	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_18523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTTCAAAATAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
624476	contig_1213_pilon	-	1892	13	Intergenic	novelGene_76472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	201.605155908496	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	508	1410	82743	71277	FALSE	10	TGTTTTAGTTTCGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQRNENRDISEVIALGVPNPRTSNELQYDQRLFNQSKGMDSGFAGGEDEIYNVYDQAWRGGKDMAQSIYRPSKNLDKDMYGDDLEARIKTNRFVPDKEFSGSDRRQRGREGPVQFEEDPFGLDKFLEEAKQHGGSKRPSDSSRPKEHEHEGKKRRKE	101801	70794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_71476_71553_71718_73622_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84310_85476_85529_92927_93090_96621_96776_101761
624482	SIRV7	-	349	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	0	1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
624484	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624494	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624497	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_90581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624506	contig_5018_pilon	+	1683	4	Intergenic	novelGene_47143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	304.766577345133	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	70	498	1498209	1499336	FALSE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRYCGALSRALGDSSPG	1497678	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164
624513	contig_9363_pilon	-	2169	11	Intergenic	novelGene_6572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1097.42134114478	3	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	339	1166	780887	754431	FALSE	50	TTACAATAATGCTGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITS	787928	753427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754434_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781241_781352_786541_786648_787826
624516	contig_7179_pilon	-	2319	9	Intergenic	novelGene_78169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	144.684516707905	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	148	531	1071584	1062672	TRUE	60	AAAAAAAAAAAACTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAASGGSAGSRSRPPPRAPRAGPSTWAFRGRTEAASSTAGCGADPGDEMTTSTLQKAIDLVTKATEEDKAKNYEEALRLYQHAVEYFLHAIKYEAHSDKAKESIRAKCMQYLDRAEKLKDYLRNKEKHGKKPVKENQSEGKGSDSDSEGDNPEKKEIARATDGCCCDGEAQHSVE	1071731	1057775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058958_1060225_1060446_1061212_1061362_1061952_1062110_1062591_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
624525	contig_5485_pilon	-	1647	6	Intergenic	novelGene_37694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	497.666715784771	4	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	171	887	87818	85442	FALSE	15	ACCAACCTTGTGCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLQQAAENLRQSLQRRRSERAVLALLPSSAHSSHLASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPAA	88088	84681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85449_85806_86133_86257_86366_86774_87027_87794_87880_87979
624535	contig_6163_pilon	+	1308	6	Intergenic	novelGene_103772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	248	1192	9709	16461	FALSE	40	AAAATAAATTCTTGCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9461	16577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
624543	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624548	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_17250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27903	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624549	contig_8538_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_5084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842858	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
624550	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
624551	contig_7119_pilon	+	1414	4	Intergenic	novelGene_40935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	163	1257	137044	139798	TRUE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127506	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_139866_140858
624555	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624556	contig_15459_pilon	+	1353	4	Intergenic	novelGene_106360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	321.702761360027	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9151	10958	TRUE	25	GGAATTGTTCTTTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKADTNKDRIENANARAKKLIES	8161	12167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892_11201_11428
624559	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
624566	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624587	SIRV4	+	188	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	638	1122	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
624593	contig_7202_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_18625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATATTTTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28627_29797
624595	contig_10801_pilon	+	2115	10	Intergenic	novelGene_74028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	461.414037042922	13	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	21	884	235415	368915	TRUE	25	TATCTTTGATATTTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRAYSMEVCYQLPVLPLDRPVPQHVLSRRGAISFSSSSALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEFEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTTVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKVSEILLLKSAV	235394	370603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_235553_319908_319970_323393_323478_345671_345824_347622_347687_352563_352660_354573_354675_356986_357141_368901_369072_369528
624609	contig_4531_pilon	-	2104	10	Intergenic	novelGene_47916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	20	junction_9	47.9003595439997	302	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	241	1440	422163	413360	FALSE	25	TTTTTATATAGTGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRERCSKIQCAWLLVFLAGSSVLLYYTFHSQSLYYSLIFFNPTLEHLSFWEILWIVGITDFVLKFIFMGLKCLILLVPSFIMPFKSKGFWYMLLEELCQYYRTFVPIPVWFRYLISYGEFGNVTRWSLGILLALLYLILKLLDFFRHLRTFRQVLRIFFTRPSYGVAASKRQCSDVDDICSICQAEFQKPILLICQHIFCEECITLWFNREKTCPLCRTVISDHINKWKDGATSSHLQIY	423597	412695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_419856_419958_421469_421547_421757_422218_422851_422904_423463
624612	contig_14508_pilon	-	2155	13	Intergenic	novelGene_79046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1285.31853758341	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	213	1106	172340	43875	FALSE	40	AAAAAAAGGTTTATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRWESEGRCTRVAARSRATCARVKVLGGAAGGIEAKVLLLQVVAACTCCRARVPVHSRRPPPSPAPAVRAMAPRKNAKGGGNTSSSSSGSGSTSAGSSSSSGSSRARREAKHGGHKNGKKGGLSGSSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEILGKLGVYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHGEDLYQEEDEPTRDQQLEDEDFLTGSDADDKIENLETETFHEETEDSYQVEETAPQDYNQDMEEIIYEQENPGSSEPVVDDERLHHDAVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPDT	172552	42825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_43883_49687_49733_54504_54541_54910_54950_64057_64106_64597_64655_65526_65560_69277_69404_74524_74600_77847_77941_109280_109350_111889_112040_172225
624619	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624625	contig_6270_pilon	+	1202	8	Intergenic	novelGene_99823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	140.393034305954	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	351	746	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37518	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
624634	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624635	contig_11253_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_126842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAAGAAAAGGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212404	210707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_210700_212400
624636	contig_12622_pilon	-	1031	9	Intergenic	novelGene_6032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	411.950543148082	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	110	862	1690387	1685282	FALSE	15	ACCCTGTCTTCTCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPEGHSTSCRQPRVVSTLFLQ	1690914	1685112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685349_1687801_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690814
624638	contig_3948_pilon	-	1443	9	Intergenic	novelGene_53306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	385.479490375299	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	235	882	1494311	1471793	TRUE	20	TTCATCAACAGGTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAQPQRQAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKVSWSLHPWCVRLLTSAWHGLLRTMSIQLEKGPSSPSSGQLLKPSILAPSPLSQTSGPLVFC	1510999	1467922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473289_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
624642	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624649	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	0	2967	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
624654	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
624656	contig_7202_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_18668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGTCCATGGTGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29958	29808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30000
624665	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	350	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
624673	contig_16121_pilon	-	2388	5	Intergenic	novelGene_6878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAGATGTAGAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63802	51440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_51643_57942_58199_58864_59394_60691_60854_62563
624676	contig_5671_pilon	+	1124	6	Intergenic	novelGene_79408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1831.47420402254	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	142	564	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	367765	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_367882_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
624681	contig_14322_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_116409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671621	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
624682	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_95886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624683	contig_9516_pilon	-	1803	14	Intergenic	novelGene_106174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	104.673513262421	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	284	1615	898344	877957	FALSE	35	AAATTAAAATCTGTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTGIRSESETESEASEITIPQSSAAVPQVPVEGEDYGKGVIFYLRDKVVVGIVLWNIFNRMPIARKIIKDGEQHEDLNEVAKLFNIHED	913231	877768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878565_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_899602_899703_913084
624687	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624690	SIRV2	+	474	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	123	-74	-123	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACCTCTTGCAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
624693	contig_11702_pilon	-	1183	8	Intergenic	novelGene_141956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	101.926343954037	2166	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	137	850	319845	289501	FALSE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321160	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
624702	contig_12644_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_44542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTGTGGTTTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493295	1493866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1493300_1493900
624704	contig_13216_pilon	+	1973	7	Intergenic	novelGene_47458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_4	839.887823197572	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	998	1438	260572	261012	FALSE	15	ACTTAGTTTTGTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229577	261547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256214_256296_258447_258573_260430
624710	SIRV7	+	1152	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATACTACTGTTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	2157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1000_2200
624726	contig_14441_pilon	+	1257	4	Intergenic	novelGene_100594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	649	1071	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111200	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111796_116674_116963_117220_117338_117539
624745	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624748	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624751	contig_19851_pilon	+	1126	5	Intergenic	novelGene_29838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_4	822.151141822475	1655	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	175	501	53637	55693	TRUE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKGNAAAGRGRDKSGASHPPRGQHCVPFCRFVRRWFRRAPLLPLSGCRSAQGALDSGRIQHCWFCHVLFYI	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_54146_55650_55753_55840_55882_56006
624753	SIRV5	+	396	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-66	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8249	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
624754	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_93790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657164	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657166	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
624755	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624761	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
624762	contig_4442_pilon	+	1981	16	Intergenic	novelGene_127933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.210227025114	186	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	218	1726	255566	397305	FALSE	15	CCAGTTGTGTCTTCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI	151360	397560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_151381_254729_254922_255560_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
624777	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
624804	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624808	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624817	contig_6217_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_109571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	75266	75628	NA	50	AGACTTCATAAACAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSATRQKPCAKLFSAWLTQLSLHQGTSPLDLTTSSSFHTYPHSFSLTFLSNYIRKTSHQVLDLNSKSDTHVAILEYILFFLIGARVVQWLSTQSKGWLFEPTQWLCRRKTRQSAPVKITA	75265	78005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_75300_78000
624818	contig_6217_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_109572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCGTCTCTGGGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78152	78978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_78200_79000
624829	contig_7593_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_127368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720243	722851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_720200_722900
624830	contig_5643_pilon	-	1990	6	Intergenic	novelGene_39172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	62.0921895249314	15	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	57	746	784100	773206	TRUE	40	CGATAGCAGGATTCAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAVSSVWTTSLSHHPEPRIPWFFQSSVGQLPLASLHQYPRPWRRSPAGR	784156	771734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_772550_772776_773349_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
624841	SIRV7	-	361	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33198	10	-21	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114759	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
624849	contig_1867_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_54497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATGAAGCATGCCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13410	13619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_13400_13600
624851	SIRV4	+	208	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1563	632	1108	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2563	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
624855	contig_4884_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_63778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	238	606	90133	89765	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTHLQELGEEHESMNGDYFFKDFSREVSPSGVHRAVHKGKVSLSSSPWSGKLPQDSSQRLFLKWGIRFLCMFTLGLEAKLPSASPASSWSSIMSVYRPEKTQVSVLRWKLVGRLFDLLWL	90370	88147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_88100_90400
624862	contig_6270_pilon	+	1127	5	Intergenic	novelGene_99825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	175.531158202753	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	371	709	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	39058	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_47302
624865	contig_10734_pilon	-	2103	11	Intergenic	novelGene_51452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_10	77.159639708853	385	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	118	726	2234466	2223119	TRUE	10	TCTTAATCCGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRAVVAGFLFEYDTPRIVLIRSRKVGLMNRAVQLLILAYVIGWVFVWEKGYQEVDSVVSSVTTKAKGVAVTNTSELGFRIWDVADYVIPAQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSK	2234583	2216275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2229766_2229915_2234332
624867	SIRV4	-	223	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTCCAAAAAGATTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
624879	contig_9706_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_20852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2334	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
624887	contig_6410_pilon	+	2121	7	Intergenic	novelGene_108631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	121.006083409977	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	111	608	300693	313081	TRUE	10	TTGCTGTTGTTTCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299821	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310261_310369_312966_314213_314276
624891	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624906	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
624925	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624930	contig_18869_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_56036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73550	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
624932	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624936	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624937	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
624954	contig_13888_pilon	+	926	3	Intergenic	novelGene_151801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAACAAAACAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342751	428166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_343446_343897_344092_428128
624955	contig_7272_pilon	+	2746	10	Intergenic	novelGene_25377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	126.255472928679	48	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	158	1219	750014	769117	FALSE	15	TATTGTCTTTGTGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRGAVVVAARWRGAGCCCRRPESTIINRQLWIEHGCAAPAPAPSTSLALIMSTLYATSLCVFDKTTSSSSLCLPPLSWKPPLLRLSLHLQWIMSSLTLCMLSILRYLLTQHLTLWHPPPPTHVASAAAPVPQHLAPGHQPVSHHIPTAPPAQRLHPHEVMQRMEVQRRRMMQHPTRAHERPPPHPHRMHPNYGHGHHIHVPQTMSSHPRQAPERSAWELGIEAGVTAATYTPGALHPHLAHYHAPPRLHHLQLGALPLMVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKVTTDWFSQRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	669573	770644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_669627_749909_750040_757778_758039_758107_758196_759891_760018_760750_760878_763506_763600_766027_766124_767135_767264_768999
624956	scaffold_16539_pilon	-	1970	11	Intergenic	novelGene_68362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	403.506926830259	3	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	634	1455	498993	490413	TRUE	15	TCTACAGCCTGGGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSHRPTYRLCYRVVSRGAARAAGPGPAKPAPDHPTSAPLVTGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVTRPRPGSHIPVSTTTSTW	502773	489789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490470_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_499070_500548_500733_501684_501832_501917_501987_502111_502243_502747
624965	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
624973	contig_1948_pilon	-	2511	4	Intergenic	novelGene_31194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_3	77.5342218349778	53	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	53	394	568353	558659	FALSE	30	TATTTTTTGCAATTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPLGKVLLRNVIRHTDAHNKIQEESDMWKIRELEKQMEDAYRGSKRKMLPSSSSRMRSDGFDEESQRDYWKPRHEISGTLEDDFLKAKSWNKKLYDYEANMPDRFVSKFL	569597	556541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_558831_563196_563298_568284_568362_569553
624975	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91670	0	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
624982	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_95879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
624984	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
624991	contig_10354_pilon	+	2044	5	Intergenic	novelGene_50850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	162	869	432370	475314	FALSE	30	TCCATTCATATAGTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432208	476489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
625018	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
625022	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
625026	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
625033	contig_7428_pilon	-	2455	15	Intergenic	novelGene_77689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	73.0471262477945	320	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	690	2039	236801	226280	FALSE	10	GCTGTATGCATTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP	250487	225863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226448_226528_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_242494_242675_243113_250404
625037	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	34	3253	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
625038	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_115717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTTATATTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671582	671291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
625039	contig_2323_pilon	-	2700	1	Intergenic	novelGene_151843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCAGCTTAAATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66971	64271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_64300_67000
625040	contig_12786_pilon	-	1412	9	Intergenic	novelGene_103402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	642.818780353375	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	574	1350	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629580	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628911_629303
625047	contig_6710_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_96859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
625051	contig_6102_pilon	+	1804	11	Intergenic	novelGene_32277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.5770724786643	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	30	1457	1445549	1449029	FALSE	20	CCACCCTGAGTATCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNNRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1445519	1449376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1445717_1446169_1446223_1446426_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
625054	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625067	contig_7188_pilon	-	2922	24	Intergenic	novelGene_108525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	78.9213913419052	219	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	47	2770	150911	95694	FALSE	40	GAATCTAGTGAAAATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDRTTPASVVSLEELSSWPEELCRRELPSVLPRLLSMYQHSDSWIEHIQLLKIIVEMFLPHMNHLTLEKTFFSQVLPKTVKLFDDMIYELTSQARELSSQNLEIQSTLRNILQTMVQVLGALTGCVQHVCATQESIVLENIHSLPSSVLHVIKSTFVHCKNSESVYSGRLHLVSDLLQALFKEAYSLQKQLMELLDMVCMDPLVDENDDILNMVIVIHSLLDICLVISSIDSAFHANTWKFIIKQSLKHQSVIKNQLKHKDIITSLCEDILFSFHSCLQLAEQMTQSDTQDNADYRLFHKTLKLCRFFANSLLHYTKEFLTFLSDSCCTLHQLYLQVHSKLPPSLYATTISKAQQEEIAGAFLVTLDPLITQLLTFQPFIQVVLDSQLDLPCELQFPQCLLLVAIMDKLPSQPEDVQVLWCTEGQLSEATARVSLLKAIFYSFEQCSGELSLPVRLQGVKTKGQAQVAVTLYQHVCVHLCTFIASAHPSLFPELDAALLNAVLSTKMITSLLAMDAWCFLARYGTAEICAHHVTIVAHLIKSCPGECYQLTNLSILLRRLFFFMAPPHQAEFIQKFSPKEAENLSLWQYISFQALSADLRKQTADEVTRTGTTQCREWLSSGRTLGELESLNTALSALLTVCNSAGEALDIGQQTEITEVGSQLWAFLNKQVTGQPYVQQTFSLLLPLLGFFIQTLDPQLISQVLTLQTSLLKLEPPDHACLAVLDFVSSLGKLFIPQAIQDKILPNLSCIFALLLADRNWLLEQHTLEAFTLFAEGTNHEEIVPQCLSSEETKNKVVSFLEKTGLIDETDAARVERVKQERGIFSEPFVKVTAEEARWSSLQPCAKRARHEPPLEEEYRAAVQTAAGALEAIELLLQKSPAPDWLLMKMEVLQGKIQKLKRCSL	150957	95541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_95883_96717_96838_97866_97948_98777_98883_103531_103646_107538_107635_108800_108921_110232_110419_116646_116737_118458_118511_118866_118950_119795_119983_121158_121289_121556_121706_126169_126235_132550_132632_138282_138422_141087_141173_142655_142822_143595_143737_144252_144358_145966_146056_147049_147090_150800
625075	contig_5799_pilon	-	2373	11	Intergenic	novelGene_50320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1693	2187	671885	667942	TRUE	50	CTAAATGAGAAAAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFYHQRCRSYVFLNPYTSILPYTPCRSVFISENSDKYFLHFLPEFYEIQFHLLLLVCLICILEFTLCSLSSELQASSGLLIHVSILGYNFHLLLPDDQTPISVLHRQQCPHLVTSMCSCQCHNDRSHFSEICYSSQRNPNNVPMCRSAFVECQCTFYGMTWH	705437	633742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_633807_650858_650972_667932_668144_670371_670602_671822_672046_674928_675063_687589_687738_689073_689195_691447_691582_699670_699774_704545
625085	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	23	373	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14431	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625097	SIRV6	+	397	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	24	1168	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
625101	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625102	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625107	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	0	35782	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
625111	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_97361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625118	contig_10904_pilon	-	1638	8	Intergenic	novelGene_22788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	223.882257684977	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	34	699	773328	759347	TRUE	15	CCTATGGCAGCCCTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTGFPGSFSSSPTTPHSSLVEYQRPQPGDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGSGQVLMS	773361	757106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759593_759723_768446_768525_769599_769885_772375_772412_773216
625126	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_113453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	9	347	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14417	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625130	SIRV2	-	450	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4417	40	3242	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
625138	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_95104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625143	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625148	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
625149	contig_6102_pilon	-	1659	13	Intergenic	novelGene_32381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	179.22092201774	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	129	1274	1743430	1728861	FALSE	0	TGTGGCCTCTGCTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGK	1743558	1728475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743394
625151	contig_14925_pilon	-	1777	3	Intergenic	novelGene_55371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.5	340	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	35	457	322420	129433	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQNLLSAVIQAHLWERNSCDCGTK	322454	128112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_129503_321808_322113_322371
625158	contig_1008_pilon	+	2159	4	Intergenic	novelGene_121602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	202.491700790153	473	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATAATCTGGGCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750506	770429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_768733_769309_769575
625170	contig_7357_pilon	+	2607	6	Intergenic	novelGene_36896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	72.8131856190896	510	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1101	1649	269181	272742	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMVYDLSVLILKQLFRIEFESLVALKLLKSPLLL	263553	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_263630_268156_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519
625173	contig_4071_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_151880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCATACACCAACTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206396	206124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_206100_206400
625177	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625185	contig_5280_pilon	+	2050	8	Intergenic	novelGene_52626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	566.738394820102	1	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	679	996	47432	78098	FALSE	30	TCTCACGTAGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEIEKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	39266	79152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_39451_40882_41075_41729_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043_62065_78042
625189	contig_8885_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_115557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	138.146878357783	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	181	570	75477	49174	TRUE	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATSASKEQTGSEKNKHALGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75657	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47007_47157_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
625190	contig_14925_pilon	-	1909	2	Intergenic	novelGene_55067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3898	junction_1	0	331	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28390	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018
625195	contig_6710_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_89147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653683	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
625198	contig_6445_pilon	-	2643	10	Intergenic	novelGene_77113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_5	96.6277060694649	619	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	164	1138	1394021	1358171	FALSE	10	TCACCTGTGTGAGGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGERQPPAPDSLEETLPASQNFIIPKKEIHTVPDMGKWKRSQAYADYIGFILTLNEGVKGKKLTFEYKVSEAVEKLVALLNTLDRWIDETPPVDQPSRFGNKAYRTWYAKLDEEAENLVAMVVPTHLAAAVPEVAVYLKESVGNSTRIDYGTGHEAAFAAFLCCLCKIGVLRVDDQIAIVFKVFNRYLEVMRKLQKTYRMEPAGSQGVWGLDDFQFLPFIWGSSQLIDHPYLEPRHFVDEKAVNENHKDYMFLECILFITEMKTGPFAEHSNQLWNISAVPSWSKVNQGLIRMYKAECLEKFPVIQHFKFGSLLPIQPVTSC	1394184	1356665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1358249_1365038_1365147_1369355_1369457_1370536_1370662_1371657_1371758_1373344_1373463_1375300_1375427_1380524_1380612_1383553_1383652_1393987
625202	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_95827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625226	contig_10500_pilon	-	3482	10	Intergenic	novelGene_41174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	480.893381576878	1	113	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	86	529	1345339	1325512	TRUE	25	ATAACCTGTTTATGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYELDVFSPYWTYFICCFSTGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFRRN	1409629	1315937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1317885_1317953_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327697_1327802_1328581_1328755_1345183_1345344_1409548
625232	contig_14322_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_115722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTTAATTCTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
625237	contig_14838_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_151910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.19499805836	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	77	1342	112817	109062	FALSE	10	GCATTGTGGTCTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRSPPVCSVPTASQGLPPPLRSRTMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112893	108870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_109320_109397_110129_110895_111007_111351_111461_112760
625240	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625252	contig_5549_pilon	+	927	5	Intergenic	novelGene_81567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	81	755	82155	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82074	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
625268	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625273	contig_14029_pilon	+	2461	3	Intergenic	novelGene_151946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_2	99.5	34	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	35	322	131739	133480	FALSE	45	ACACAAGAAAGTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQVT	131704	135619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407
625285	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	28	1102	28	-1102	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAACGAGTGTGGTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
625302	contig_10437_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_38124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	492	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGGGTGTCACTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123727	120989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_121000_123700
625306	SIRV6	+	1064	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	24	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	191	682	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1154	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
625337	contig_5571_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_75530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	118	468	230194	230544	NA	30	TACTGTTTAGTTCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRFLTKLEILYNPAIPFLGIYPREIRAVTRIDICTPMFTAAVFTTAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMKYYATIKNNDESVKHLIIWMKLEDTMLSEISQSQKGKYCMRPLL	230076	232189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_230100_232200
625339	SIRV4	+	179	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	651	1118	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATAACTTTAACCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
625343	contig_10235_pilon	-	1781	12	Intergenic	novelGene_46271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	412.115626076224	62	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	181	1578	25335	14164	FALSE	20	AAACAGTGTGCGTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKTYSFSIVWKLVGNADYMGPTPDLLNMNIHFKEIHRNLRSEVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYSD	27178	13960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14487_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21035_22892_23013_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
625357	contig_6424_pilon	-	490	6	Intergenic	novelGene_109257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.293543869014	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	54	488	21039	5745	FALSE	20	AGCTGCCTTCATGGAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPEMLPQP	21092	5742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_5762_6368_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_21012
625358	contig_3077_pilon	+	1371	7	Intergenic	novelGene_26762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_5	2896.69378583393	4	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	190	873	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	12035	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
625381	SIRV6	+	741	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-439	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	156	491	2002	10736	TRUE	30	TGTAAGTTTAATTTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1846	11199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031
625383	contig_10940_pilon	-	2360	1	Intergenic	novelGene_49285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910124	907764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_907800_910100
625385	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625395	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625398	contig_12622_pilon	-	2319	12	Intergenic	novelGene_5952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2518.3498598346	1	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	764	1516	1588902	1586655	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585484_1585705_1586266_1586407_1586528_1586834_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589200_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
625399	contig_2730_pilon	+	1007	8	Intergenic	novelGene_135396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	56.6838709377703	1656	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	97	831	430881	451321	FALSE	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLSPRRGCLRLPLSSLLSRLRPGGPEREAGTMFRRKLTALDYHNPAGFNCKDETEFRNFIVWLEDQKIRHYKIEDRGNLRNIHSSDWPKFFEKYLRDVNCPFKIQDRQEAIDWLLGLAVRLEYGDNAEKYKDSVPDNTKNADNAAKNAEPLINLDVNNPDFKAGVMALANLLQIQRHDDYLVMLKAIRILVQERLTQDAVAKANQTKEGLPVALDKHSLGFDTGDAVLNEAAQILRLLHIEELRELQTKINEAIVAVQAIIADPKTDHRLGKVGR	430784	451497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_430942_432136_432262_434910_435011_439839_439927_445378_445468_448469_448539_450989_451039_451166
625400	contig_4392_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_117295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCAAGTTATGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97090	98697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_97100_98700
625428	SIRV7	-	289	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68995	2	35776	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
625433	contig_7202_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_18659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCATGGTGAGGCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	29804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
625445	contig_18869_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_56168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73602	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
625447	contig_12540_pilon	-	2465	6	Intergenic	novelGene_148113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	196.99441616452	491	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	89	1432	1108562	1092652	FALSE	35	TAAAGACTTCAGAGCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVMERGGPYSRGLHKAGGGERGCWYYFRYFFLFVSLIQFLIILGLVLFMVYGNVHGGTESNLQATERRAEGLYGQVVGLTASQANLTKELNLTTRAKETIMQLLLNARRDLDRINASFRQCQGDRAIYLNNERYMAAIILSEKQCKEHLNENNKSCNSLLFMLGQKAKTLELELEKEKAVCTKDKEALVLGKRQVEEQLVDCGKIQGQLQQEKRIAEEQLRKVETLCLQWDKDKFETDVRNLWRDSIIPRTLDSLSYGPYHSFGGELASIHRSCDRMPELMNAKVAELARSLRVDIDRVARENADLQRQKLEAERGLQASQEAKEKVEKEAQAREAKLQAECARQTQLALEEKATLRKERDSLAKELEEKKKEAEQLKMQLAIGNSALDTCIKAKSQPMPFPLPRPVGSLPNPPPIDSATLEEFKRKILESQRHSASNVAAPYSG	1108650	1091618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1092659_1099535_1099618_1099772_1099837_1102438_1103152_1103234_1103332_1108181
625448	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_16414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
625451	SIRV4	+	324	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1447	632	992	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
625465	contig_10436_pilon	+	1296	10	Intergenic	novelGene_108469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	38.9266483352636	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	176	988	84734	86641	FALSE	25	GCTACGTGGCCCCCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTDLGCGQSPSLQPLCWETAEPPCDPRALFQVNHATNRTQFGEKIHNFGVIQEKLARMAVLQYVTESMAYMVSANMDQGSKDFQIEAAISKIFSSEAAWKVTDECIQVMGGMGFMKEAGVERVLRDLRIFRIFEGTSDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGNALKNPFGNAGLLLGEAGKQLRRRAGLGSGLSLSGVVHPELSRSGELAVQALEQFATVVETKLIKHKKGIVNEQFLLQRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDSWCIEAAARIRESMAALQSDPQQQELFRNFKSISQALVEQGGVATRNPLGF	84558	86949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_84761_85178_85266_85350_85414_85517_85620_85699_85798_85885_85959_86041_86115_86195_86269_86355_86432_86500
625468	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625469	contig_12057_pilon	+	2187	18	Intergenic	novelGene_131639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	41.7731557317901	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	113	1771	136654	161653	FALSE	5	CCCTGTTCAGTTGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	136140	162069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_136221_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
625477	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_93634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625487	contig_15063_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_14105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	189	1025	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEACTSRLPDATHPGAAESA	34619	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36274
625499	contig_5018_pilon	-	1661	9	Intergenic	novelGene_47105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	814.83311174743	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	320	1210	1401907	1399645	FALSE	15	CTCCTAGGACTGGGCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVLKGPRVTAPSARHGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402839	1399193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400616_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402792
625504	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_98017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625533	contig_4114_pilon	-	2159	11	Intergenic	novelGene_15639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	107.959297885824	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	273	1547	592330	567115	FALSE	10	TTTTTGTGTGTGTCCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLMRNEFTITHVLIPKQSAGSDYCNTENEEELFLIQDQQGLITLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQMMLPESIAIVCSPKFQETGFFKLTDHGLEEISSCRQKGFHPHSKDPPLFCSCSHVTVVDRAVTITDLR	594237	566502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127_592346_592746_592909_594142
625534	SIRV4	+	950	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	257050	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
625559	contig_14528_pilon	-	2047	13	Intergenic	novelGene_111262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.326409282155	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	25	1908	201850	188949	FALSE	10	GCCAGGATGTTTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGAQAKNPGVILDSSLPQPRSTPSTHLLAPTFSPPLLLSRRPSLASPD	201874	188809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_189092_191155_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
625560	contig_7202_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_19091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30085	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
625567	contig_5671_pilon	+	1040	5	Intergenic	novelGene_79409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_4	2297.26994223578	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	143	481	370430	531238	FALSE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKEGYQDYEPEA	368782	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_531205
625575	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1460	632	1005	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2460	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
625578	contig_14925_pilon	-	1265	4	Intergenic	novelGene_55188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	1725.85070810504	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	352	732	103374	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	103725	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_103145
625581	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
625609	contig_14353_pilon	-	1492	5	Intergenic	novelGene_82084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.0044641077834	31	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	53	619	104372	79945	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVSKYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQHLPLVLSTTSSPPTGLLPSPQATSCALQVGGDFSPSLSLMFNLHPHPAPKLHPF	104424	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80109_87385_87447_88538_88750_90961_91054_104333
625631	contig_14219_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_54348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGTATAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842667	841964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_842000_842700
625649	contig_5832_pilon	+	3601	3	Intergenic	novelGene_134191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	22	149	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTATTTTGCCTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705805	712439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_705902_708678_708759_709014
625650	contig_3986_pilon	-	2147	13	Intergenic	novelGene_52697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	109.412921997358	18	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	180	1481	60653	35584	FALSE	25	CCCAGCTTACATGTATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPV	153862	34917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35589_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
625654	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_17729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTCACGTAGTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
625667	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625669	contig_10627_pilon	+	1270	6	Intergenic	novelGene_59918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	180	junction_5	113.513699613747	1939	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	106	786	105394	109221	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	105288	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108139_108453_108573_108962_109005_109122
625690	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
625692	contig_18869_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_56029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73542	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
625698	contig_5779_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_106432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94249	93294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94200
625706	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
625707	contig_6710_pilon	+	560	2	Intergenic	novelGene_91564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3798	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
625717	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_90612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625721	contig_11512_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_43222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	26	352	4011	4560	FALSE	15	GCTTATGCTGCTTATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	3985	4560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
625734	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625756	contig_4531_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_47949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGCCTAAGGTCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805072	805996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_805100_806000
625758	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625759	contig_15353_pilon	+	2338	12	Intergenic	novelGene_151980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_9	4637.83135591953	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	93	2126	529420	543258	TRUE	15	TCTAGTTGTACATCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRHFERSKVAFTFPERLLRFCLDRPLITDMSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLHDFRSPPPGMGLTQNRGPMGPGPGQGGPKPPIPPPPPHQVQQQQQQQQQVPSQQPPPQQQPPPPPHQQPPPPHQQSHQQPHQQPPPPQDSSKPVVPQGPGPAPGVGNVPPAPGSAPPATPPTSGAPTGPGPTPTPPPAVTTAPPGAPPPTPPSSGVPTTPPQTGGPPPPPAGVPGPGPKQGPGPGGPKGGKMPGGPKPGGGPGLSTPGGHPKPPHRGGGEPRGGRQHHLPYHQQHHQGPPPGGPGGRSEEKISDSEGFKANLSLLRRPGEKTYTQRCRLFVGNLPADITEDEFKRLFAKYGEPGEVFINKGKGFGFIKLESRALAEIAKAELDDTPMRGRQLRVRFATHAAALSVRNLSPYVSNELLEEAFSQFGPIERAVVIVDDRGRSTGKGIVEFASKPAARKAFERCSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEKLAQKNPMYQKERETPPRFAQHGTFEYEYSQRWKSLDEMEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLMRRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRMGYMDPRERDMRMGGGGAMNMGDPYGSGGQKFPPLGGGGGIGYEANPGVPPATMSGSMMGSDMVRMIGVG	529327	544848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_530272_531043_531233_531813_532116_532207_532304_532973_533171_533269_533355_533693_533812_534315_534365_534444_534567_543234_543283_543791_543881_544749
625770	contig_7843_pilon	+	3333	8	Intergenic	novelGene_152022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACCCATCGATTCGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198852	214904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_200947_201063_201410_207186_207376_208282_208496_209064_209169_211506_211665_213303_213426_214797
625781	SIRV6	+	188	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9685	564	535	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10772	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
625794	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625797	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_90843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
625816	contig_10299_pilon	+	1524	10	Intergenic	novelGene_79661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	71.457489736949	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	362	1453	184802	187611	FALSE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182349	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_184692_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
625827	contig_12279_pilon	+	1094	7	Intergenic	novelGene_50090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1868.87993788318	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	69	728	68297	77256	FALSE	25	TGTATATTCTGACTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTLDRMRPSAHPFPHLCHLEGPFQSCLSPIPSHCSQLGSVPMLPILSY	57534	77622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928_77045_77115
625854	contig_6829_pilon	+	1947	10	Intergenic	novelGene_123758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	50.5986385411922	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	419	1471	33338	59222	FALSE	20	AACCTTTTATGTCTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPIYSLDSWIALKYPSIAIYVDTCRECYEAYVIYNFMGFLTNYLTTRYPNLVLILEAKDQQKHFPPLCCCPPWPMGEVLLFRCKLGVLQYTVVRPFTTIVALICELLGIYDEGNFSFSNAWTYLVIINNMSQLFAMYCLLLFYKVLKEELSPIQPVGKFLCVKLVVFVSFWQAVVIALLVKVGVISEKHTWEWQTVEAVATGLQDFIICIEMFLAAIAHHYTFSYKPYVQEAEEGSCFDSFLAMWDVSDIRDDISEQVRHVGRTVMGHPRKKFFPEDQDQNEHTSLLSSSSQDAISVASSMPPSPMGHYQGFGHTVTPQTTPTAATIPDEMFNDTTGEKKELSDKFVAS	18169	59698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18447_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898_52974_54349_54444_56463_56577_57944_58045_58565_58738_58956
625855	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	636	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625857	contig_14322_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_116592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGGCGGCCACAGCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
625859	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
625860	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_114020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	31	351	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14439	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625872	contig_6233_pilon	-	1666	11	Intergenic	novelGene_74802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	284.331426332018	710	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	415	1302	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250354	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
625879	contig_9463_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_83842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	252.809587436869	2	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1032	1400	222660	223028	FALSE	15	TATTGGCTCTGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	216807	223427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_216845_217424_217462_218620_218829_219238_219290_221961
625881	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_93567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625886	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	15	1248	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
625888	contig_14575_pilon	+	2771	10	Intergenic	novelGene_101860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	64.7938802170409	237	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	146	691	17236	26356	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17090	32324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473
625909	contig_2940_pilon	-	2756	15	Intergenic	novelGene_81899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	96.9592013926161	3	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	63	1313	477381	454417	TRUE	40	CAATTATGTTATTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTVGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRVIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPRTPVPAQRERAPGSGTQEKNKIRSRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNTQRSLGRSEVARLLCYKEL	477443	452258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236_454476_455835_455883_458238_458416_459146_459232_466868_466987_467360_467489_467597_467626_470951_471106_472710_472810_474434_474593_474886_474990_477286
625927	contig_1301_pilon	-	2351	13	Intergenic	novelGene_47406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	426.051151076175	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2292	59	2350	852486	799245	FALSE	70	AGAAAAGCAAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPICPVVSFTYVPSRLGEDAKMATGNYFGFTHSGAAAAAAAAQYSQQPASGVAYSHPTTVASYTVHQAPVAAHTVTAAYAPAAATVAVARPAPVAVAAAATAAAYGGYPTAHTATDYGYTQRQQEAPPPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRLQYKKVNPDLQVEVKPSIRARKIQEEKMRKQMQKEEYWRRREEEERWRMEMRRYEEDMYWRRMEEEQHHWDDRRRMPDGGYPHGPPGPLGLLGVRPGMPPQPQGPAPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKIVSITERALKLVSDSLSEH	852544	799243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_799398_800425_800589_804161_804308_805027_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469_822615_824145_824429_852066_852167_852449
625928	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
625929	contig_12603_pilon	-	2618	16	Intergenic	novelGene_105811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	81.9824913557089	2	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	147	1535	643013	625227	TRUE	15	TGTCTAACTTTGTGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVFTLKLRHKIIPRMVAIGRYDGTHPCLAAATQADKVFIHNPHTRSQHFSASRVIQSPLESDVSLLNINQAVSCLTAGVLNPQLGYDALLVGTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVDARSDRTGEVIFKDNFSSAIAGVVEGDYRMDGHIQLICCSVDGEIRGYLPGTAEMRGNLMDTSVEQDLIRELSQKKQNLLLELRNYEENTKAESSSPLSEADGHRGIIPANTKLHTALSVNLGSETQAAHAELCISTSNDTIIRAVLIFAEGIFIGESHVVHPSIHNVSNSICIPITPPKDVPVDLHLKTFKQ	643159	618155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_618624_619319_619469_621985_622099_623815_623954_625011_625236_627110_627266_627356_627502_627692_627833_628017_628154_631065_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248_638477_642896
625939	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
625942	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
625948	SIRV7	-	197	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69089	0	35870	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78868	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
625953	contig_7870_pilon	+	2713	1	Intergenic	novelGene_109060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1450	1788	670094	670432	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASYTKQISNKWYVMKLLIFFSLLRSAQQMKNKLLHFFLFEKRMAKNEFISTLVFSGPTKGEKKKEVWEGIRQHFSKLQHKNTNHNSNENKTKKNTQNTKKYEASEHVEES	668644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_668600_671400
625956	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_94855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
625959	contig_19812_pilon	+	2339	9	Intergenic	novelGene_101006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1399	1737	53429	54061	TRUE	10	CCCGCCCCCGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTQADALATSHGEIWPPAGRDDSGNRVMERQPLAVFSHWRPHKPPGDPHLLLGHPSPRSRRGRGCWVPCDMALGKVAHQDPWLRQDGQGPPTLVLIPPLTSCSPTRSWFLA	49130	67118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_50267_51992_52079_53252_53763_54056_54200_54360_54432_59829_59922_60120_60168_60346_60475_66992
625969	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
625984	contig_3155_pilon	-	2130	4	Intergenic	novelGene_26344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	56.8291787337769	305	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGATTTTTGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141470	136774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_138462_138898_138951_140758_140902_141222
625985	contig_12993_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_136745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCAGCACATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171361	172463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_171400_172500
625986	contig_12125_pilon	+	647	2	Intergenic	novelGene_76206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATATTCAAGAGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121375	122580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_121437_121994
625989	contig_15857_pilon	-	2289	3	Intergenic	novelGene_152064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	15	517	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	264	980	50262	48131	FALSE	45	TTTTGAACAACAGAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEKVNDGKPDPESCLDFSEHFNQLELLETHGHLIPTGTQSLWAGNSDDDEEQDEKTEEWYQLQEKKMEKDPSKLLLWAAEQNRLTTVQRLLSEKATHVNTRDEDEYTPLHRAAYSGHLDVVRELITQGADVHAVTVDGWTPLHSACKWNNTRVASFLLQHDADINAQTKGLLTPLHLAAGNRDSKDTLELLLMNRYIKPGLKNTVDETAFDIARRTSIYHYLFEIVEGCTNSSPQC	53231	46821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_48593_50007_50361_53066
625990	contig_10904_pilon	-	1941	9	Intergenic	novelGene_22636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.261628208572	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	979	1449	505089	499813	TRUE	40	ATAAAGTGTTGCACAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	515984	499150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499391_499560_500201_505006_505184_507168_507532_510095_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
625992	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
625996	contig_854_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_36465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	34.0293990543471	1293	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	208	708	1514567	1526706	FALSE	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRLLLRRFLALAISRNPPQGRWAPLTSGALQSPQCHPGGLAATLSPARTVHTTRVCTTTFNIQDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG	1513486	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514830_1517440_1517565_1526592
626001	contig_6102_pilon	+	2059	17	Intergenic	novelGene_31736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	138.896487986558	4	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	236	1798	216236	228987	FALSE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFLPCSSSPTTIHAAPRALTTPEQIPGRKKLKGSLFTPYFWPAPSATPAKAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRICGKPLDLSNLSLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	210260	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
626002	contig_15687_pilon	-	2119	11	Intergenic	novelGene_129143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	39.8803209615971	175	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	346	1428	198511	188064	FALSE	25	CCCCAAGGAATGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGNEDLRADDFPGPAFESYESMELACPAERSGHVAVSDGLHMFVWGGYKSNQVRGLYDFYLPREELWIYNMETGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRDARMNDLHYLNLDTWEWNELIPQGICPVGRSWHSLTPVSSDHLFLFGGFTTDKQPLSDAWTYCISKNEWIQFNHPYTEKPRLWHTACASDEGEVIVFGGCANNLLVHHRAVSIVLSMLKGTS	198856	187372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190333_190404_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198358
626003	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626007	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
626017	contig_3588_pilon	+	1897	17	Intergenic	novelGene_72863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	610.652097658724	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	122	544	84577	122325	TRUE	35	GCTTAAATATACTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEETEARNLP	84455	141431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117009_122301_122368_125374_125401_125591_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
626019	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626022	contig_20819_pilon	+	2244	14	Intergenic	novelGene_55669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_11	24.7740081393775	330	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	27	1823	54837	62069	TRUE	15	TAGTGTGTCTGGATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHQLVGLMETAPKPGGDVPHKKNKLQSKRKKPRRYWEEEETSPTAAGASPGPSRSKKRKQELRPRRPKNTHIQKKSRISKKPQVPRKSGERRNLVPQRTLSGAQDPFPGPAPVPVEAALKFRRIDKSKKLLHSKSKTRSRLEVADAEEEETSVRAARSELLLAEEPGFLEGDDGEDTAKIRQADIVEAVDIASAAKHFDLNLRQFGPYRLNYSRTGRHLAFGGRRGHVAALDWVTKKLMCEINVIEAVRDIRFLHSEALLSVAQNRWLHIYDNQGIELHCIRRCDRITRLEFLPFHFLLATASETGFLTYLDVSVGKIVTALNARAGRLDVMTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGAAEPNFDGLENNPYRSRKQRQEWEVKALLEKVPAELICLDPRALAEVDVVTLEQEKKERIERLVRSKPLHAHPQTHHSECPAFLTPTSSAYHGPVPGSAAQQASAATVPCP	54810	62600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_56288_56394_56486_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61409_61556_61652_61826_62220_62329
626023	contig_7378_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_120234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAAATTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123694	121862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_121900_123700
626024	contig_8729_pilon	+	1865	13	Intergenic	novelGene_40166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	49.9972221450574	447	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1695	171	1865	772435	920254	FALSE	40	GTAAGAATTATGACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLDTWNFSSPLISLWINRFYIYLGFAFGISLWICVQIVLKKQDKNSQEKSVPKVTWDLMTNGSVSHQKREVFVSGVKIFYGSQTGTAKGFAEVLAESVTSLDLPATIINLKDYDPDDHLVEEVTSENVCAFLVATYTDGQPAESAKWFCKWLEEAANDFRFGRTYLKGMRYAVFGLGNSAYTSQFNKVGKNVDKWLWLLGARRVLTRGEGDCDTVKSKHGSIEADFSAWKTRLTSRLQELHQGEKKPCGSNCKKGKCESGQHGPEGREPGPHTLEESPHRDAEEEEPFESSSEEECGTEDQQSLNSVVDVEDLGNIMDRVKKEKKEKEQQEEKSSLFRNTGKNEDNERRAMITPALREALTKQGYQLIGSHSGVKLCRWTKSMLRGRGGCYKHTFYGIESHRCMETTPSLACANKCVFCWRHHTNPVGTEWRWKMDQPEMILKEAIENHQNMIKQFKGVPGVRAERFEEGMKVKHCALSLVGEPIMYPEINRFLELLHQCKISSFLVTNAQFPEEIRNLKPVTQLYVSVDASTKDSLKKIDRPLFKDFWQRFLDSLKALAEK	772264	920254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_772439_773318_773450_774417_774556_776209_776312_778257_778453_780469_780758_791743_791867_816963_817082_825451_825505_840183_840303_874362_874473_910607_910786_920118
626025	contig_4908_pilon	+	2345	7	Intergenic	novelGene_117369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	109.841426105495	30	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	383	766	53589	60051	FALSE	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALFQLSMWIRTCHNYFIEDLGLPVWGSYTVFALATLLSGLLLGLCMIFVADCLCPSKRRRPQPYPSKKLLPESSQPLKKVEEEQETDEGDVSEEEAESEAGTKSGFSENALRQRSVGPSPRMEES	43742	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_43940_49589_49636_51352_51482_53578_53625_53724_53827_53950_54018_59872
626027	contig_5649_pilon	-	1473	5	Intergenic	novelGene_82465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	127.433070668489	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	249	878	1567388	1564135	FALSE	10	CCCTGGTGGAGACTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1569837	1563539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704
626040	contig_211_pilon	-	1996	2	Intergenic	novelGene_129868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	535	855	150748	150428	FALSE	15	CTGTCGAGTTGACTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPTPKSGYMDQAQEGLQLLAQAALQMGAIAAMLVTESEEAEKVAALVQTMQVNLNQTILHTQRTQEVIRSLLIEPQMPAVFRSVGRRARRTRAHPTPSHLWQDL	153239	149286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_151097_153053
626055	contig_9345_pilon	-	925	6	Intergenic	novelGene_24695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	241	822	955353	947957	FALSE	50	AGATTACAAATCAGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001315	947853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
626060	contig_10855_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_124284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2280	2582	164277	164579	NA	5	CTCACCTCTCTCTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSSRLTRWKLLCGPCQPRSSPSLSPPPSTTWLSAILPPPGGSFIMVPSPQPLSPHPRTGIPHLFLAVQLYCLAHFRCNPGPQLTPSVPLPLLLFTLKR	161997	164612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_162000_164600
626079	contig_3817_pilon	+	1647	4	Intergenic	novelGene_78321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	553.252403720239	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	236	628	199102	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178659	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_199026_199161_201700_201852_204349
626095	contig_10629_pilon	+	2201	12	Intergenic	novelGene_52921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGGAGGAGCTCACGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245939	256626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_247140_247316_247396_247692_247753_248314_248410_252333_252438_253094_253216_253749_253900_254170_254230_254591_254691_255096_255142_256068_256222_256590
626102	contig_12270_pilon	-	325	2	Intergenic	novelGene_113827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	19	324	14385	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14403	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626111	contig_10581_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_41359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCCAATGGAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87967	88374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_88000_88400
626114	contig_4364_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_1206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532898	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
626132	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626136	contig_4519_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_123682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATTAAGTTACGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84984	84168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_84200_85000
626137	contig_4519_pilon	-	1269	2	Intergenic	novelGene_123680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCCATTATCCAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84218	82767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_83589_83770
626145	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626146	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
626148	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_96647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626152	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
626156	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626189	contig_5059_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_140697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTGTGTCCTATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166578	165729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_165700_166600
626192	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
626199	contig_8773_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_74528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGGATATACATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43752	44224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_43800_44200
626201	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626207	contig_14811_pilon	-	1597	3	Intergenic	novelGene_74491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.5	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	249	704	375703	357477	FALSE	40	AATGACAACCCCAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYTPVPGRPGGDPSSH	386715	356583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357521_375291_375765_386528
626209	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
626212	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626216	contig_3602_pilon	+	1354	7	Intergenic	novelGene_60481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	1038	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	153	602	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161592	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170003_170931
626217	contig_10526_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_142575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255205	252619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_-_252600_255200
626222	contig_14322_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_116178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671865	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
626223	contig_1301_pilon	-	2922	1	Intergenic	novelGene_47373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	2261	2734	607884	607411	NA	25	TCAGTTTCTAATGTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMFVSQRSPPQIVYILTHSSQEQMVHIPTFCFLGVHVDPVILTSDTSTSSLKLCHLQQYTCLIAEVERGALLSCSEKNYKFFKLSESLSPHVKWRVVIPHVGSGYVADVCCFTIPYCLPPVLCSRRIPMEASSPSFCGAARLRLVQSDVFSWGFGS	610144	607222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_607200_610100
626232	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626233	contig_14209_pilon	+	2201	15	Intergenic	novelGene_88311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	214.64570951278	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	83	901	32366	37768	TRUE	25	GAATTCACTTAGGGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGVYIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32283	41002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38271_38394_38557_38783_40142_40344_40418_40859_40901
626237	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_116371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
626267	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
626271	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626275	contig_7357_pilon	-	1568	6	Intergenic	novelGene_36833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2831.21778745472	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	153	938	166824	136344	FALSE	15	CAGTCTTCTGTTTGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSNLSHWQEEKSRWVSDDLAFTLALSTTTTTIDQQQLQEVYIHFP	166976	135713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136474_139863_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160031_166772
626278	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_96009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
626297	contig_19899_pilon	-	1673	7	Intergenic	novelGene_102514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_5	80.0950823847646	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	198	620	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156640	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_144679_145500_145554_156555
626300	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626304	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
626305	SIRV4	-	345	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACGATTGCCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
626311	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626312	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	875	-12	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
626317	contig_1948_pilon	-	1527	4	Intergenic	novelGene_31178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	165.471044798378	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTGTATTCTAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552077	543608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551770
626324	contig_7202_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_17768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACGTAGTCACCCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
626354	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
626362	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
626371	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626373	contig_5649_pilon	-	2058	16	Intergenic	novelGene_82474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	58.072904372196	225	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	106	1899	1667499	1648882	FALSE	20	TTTCTTTTAAACATCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIYIYNEKIVNGHLQPNLVDLCATAVELDDKNISDMWTMVKQMTDVLLAPATNALKSRSSVEVRMEFVRQALGYLEQSYKNYTLVTVFGNLHQAHLGGVPGTYQLVRSFLNIKLPAPLPGLQDGEVEGHPVWALIYYCMRCGDLLAASQVVNRAQHQLGEFKTWFQEYMNSKDRRLSPATENKLRLHYRRALRNNTDPYKRAVYCIIGRCDVTDNQSEVADKTEDYLWLKLNQVCFDDDGTSSPQDRLSLSQFQKQLLEDYGESHFTVNQQPFLYFQVLFLTAQFEAAIAFLFRMERLRCHAVHVALVLFELKLLLKSSGQSAQLLSHEPGDPPCMQRLNFVRLLMLYTRKFESTDPREALQYFYFLRDEKDSQGENMFLRCVSELVIESREFDMILGKLENDGSRKPGVIDKFTSDTKPIINKVASVAENKGLFEEAAKLYDLAKNADKVLELMNKLLSPVVPQISAPQSNKERLKNMALSIAERYRAQGISANKFVDSTFYLLLDLITFFDEYHSGHIDRAFDIIDRLKLVPLNQESVEERVAAFRNFSDEIRHNLSEVLLATMNILFTQFKRLKGTSSSSASRPQRVIEDRDSQLRSQARALITFAGMIPYRTSGDTNARLVQMEVLMN	1669104	1648722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1648993_1650155_1650285_1651700_1651785_1652259_1652378_1654464_1654584_1655343_1655461_1657297_1657343_1657610_1657684_1657798_1657926_1658641_1658834_1659677_1659772_1660050_1660217_1661353_1661512_1662924_1663058_1667371_1667512_1669011
626387	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_89176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
626399	contig_6589_pilon	+	1203	5	Intergenic	novelGene_25800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_4	2215.31299989415	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	495	896	669670	671366	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTTQGPLEMSPGATCLPEELMGVVVFSD	669175	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_669748_670000_670104_671046_671188_671286_671412_672584
626410	SIRV5	+	448	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-118	875	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8197	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
626420	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_113217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	22	345	14385	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14406	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626425	contig_11056_pilon	+	1961	11	Intergenic	novelGene_130366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	132.065286884934	85	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	166	1173	340996	369990	FALSE	25	ATAATGTAGAGTCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEGGFGGTSSSDAQQSLQSFWPRVMEEIRNLTVKDFRVQELPLARIKKIMKLDEDVKMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPVQLNAGQLQYIRLAQPVSGTQVVQGQIQTLATNAQQITQTEVQQGQQQFSQFTDGQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294605	370778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_340102_340173_340987_341101_347924_347997_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_365410_365519_368561_368622_369870
626426	contig_3095_pilon	+	1066	4	Intergenic	novelGene_75146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_2	1046.09570414098	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	33	656	149709	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149676	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150696_150996_151163_151848
626433	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
626439	contig_14666_pilon	+	1617	5	Intergenic	novelGene_39563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1651.07743231503	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	120	1433	477340	484940	TRUE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQILQEVTTATRPCSWRGSVCTTTRPTVRNMCPGLSWWTWSLGPWTASDLANLEPSSSPTVLSTVGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477384_479867_479944_483205_483321_483861_485022_485128
626442	contig_15459_pilon	-	1648	2	Intergenic	novelGene_106372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGGCTGGAAACAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17555	15502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838
626444	contig_14925_pilon	-	1003	5	Intergenic	novelGene_55095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	1557.91824239913	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	28	465	44831	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGADKITFGMGTWLKVEPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	44858	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_44803
626458	SIRV7	-	217	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69059	4	35840	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78898	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
626500	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626512	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	128	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626514	contig_10235_pilon	-	1267	8	Intergenic	novelGene_46482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	887.61662067929	127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	308	769	222843	219405	TRUE	30	TGAAAATTTAGTGGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224484	217924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223231_223370_224427
626519	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626521	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	654	967	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAATAACTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
626527	contig_16098_pilon	-	2239	15	Intergenic	novelGene_45891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_14	54.44525428617	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	371	1279	253301	247493	TRUE	15	CAGTTTACTTTCTTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	255214	244097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
626528	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626534	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626541	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626542	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
626546	contig_13608_pilon	-	2192	15	Intergenic	novelGene_52381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_10	224.556933374435	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	103	681	470234	411630	TRUE	80	ACAAAAAGAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGHLKSRVQHQHQ	470336	382008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411667_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
626550	contig_13894_pilon	+	1102	10	Intergenic	novelGene_62108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2509.51212611358	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	27	1046	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521681_522781_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
626560	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
626562	SIRV6	+	1305	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8196	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3111	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
626563	contig_10689_pilon	+	1206	4	Intergenic	novelGene_118611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	1696.87320288425	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	203	721	57608	61101	FALSE	20	TTTCTTGTTTAAAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	50832	61586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51020_57592_57792_58211_58374_60928
626590	contig_9871_pilon	+	1781	7	Intergenic	novelGene_75649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.951912483682	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	363	1112	408711	419187	FALSE	5	ACCCTCCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384504	419856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384738_384900_384991_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
626600	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626602	contig_4816_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_115600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGCTCTGGACAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43621	43894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_43600_43900
626610	contig_5988_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_16009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTACTTTAGATGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712826	712402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_712400_712800
626616	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626630	contig_7182_pilon	-	1446	4	Intergenic	novelGene_117154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2351	junction_3	1797.04652756188	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	402	1049	889318	887056	FALSE	50	AAAAAAAAAGTTGCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889719	886658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168
626634	contig_12790_pilon	+	2044	10	Intergenic	novelGene_35225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_9	222.212333113296	1	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	210	1190	307252	312473	FALSE	35	AAGTTTAATTGTTTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305934	313327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
626650	contig_6589_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_25966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACGTCAACCTCCTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296048	1296272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
626674	contig_12270_pilon	-	383	2	Intergenic	novelGene_113149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	27	383	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14435	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626677	contig_12257_pilon	+	2381	5	Intergenic	novelGene_152105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	70.0263343321639	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	101	1948	151413	162361	FALSE	25	AATCATTTTATTGTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPVPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLTASSILSLKTLRHLFRGTGRSFPWSAASLPAV	148851	162794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_151405_152947_156678_156787_157405_157514_162263
626680	contig_7440_pilon	-	1923	3	Intergenic	novelGene_61165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	275	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGAATTATGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57942	53817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649
626690	scaffold_12124_pilon	+	873	11	Intergenic	novelGene_22214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	TRUE	15	TTCCACGCCATTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1508439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508120_1508221
626698	contig_20951_pilon	-	1766	6	Intergenic	novelGene_43077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	5	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	FALSE	35	TACACTGACTTAAGACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
626701	contig_5033_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_28991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2851.75478598266	39	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	27	905	566787	531394	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKLCVVSL	566813	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531415_536555_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
626711	contig_13021_pilon	+	2062	2	Intergenic	novelGene_8219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1377	1763	180464	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	178841	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_180211_180456
626720	contig_3942_pilon	-	2727	6	Intergenic	novelGene_128846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_5	36.6060104354463	355	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	420	800	1388913	1385047	FALSE	10	AGGAGCTTCGTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNAEDLNRLTACSLVLLGHIFYVLGNHRESNNMVVPAMQLASKIPDMSVQLWSSALLRDLNKACGNAMDAHEAAQMHQNFSQQLLQDHIEACSLPEHNLITWTDGPPPVQFQAQNGPNTSLASLL	1389629	1383119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1385122_1385238_1385367_1385623_1385715_1388826_1388939_1389099_1389178_1389313
626724	SIRV4	+	247	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1524	632	1069	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2524	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
626735	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
626736	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
626754	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626756	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626765	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626779	contig_5467_pilon	+	3421	3	Intergenic	novelGene_111971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	27.5	165	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCTCCTCCCTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156218	160248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_156651_156853_156922_157327
626809	contig_10140_pilon	-	3089	1	Intergenic	novelGene_148392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGGTTTGTCCAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200125	197036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_197000_200100
626823	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	87	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
626825	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	975	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626828	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_114046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	27	341	14409	13872	FALSE	20	TTATTACTGTCAGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14435	13869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
626838	contig_12270_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_113525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14517	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14500
626840	contig_835_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_152139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93593	94835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_93600_94800
626842	contig_20614_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_107579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1380	1745	249018	249383	NA	70	AAAAATATAGGAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINSFKHPLITGTWNVGSMNLGKLEVVKNEMECIKINILCVSEQKWTGIGHFELDDHMVYYARNDKLKRSDVAFIVRKIISRCVLRYRAVSDRIISIRLQGKRVNMTIIQIYTATTNCQR	247638	249736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_247600_249700
626865	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_94828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
626876	SIRV6	+	1030	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	480	18	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
626890	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91678	1	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
626892	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
626910	contig_8538_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_4695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAAGATCAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843127	842741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
626921	contig_990_pilon	+	2051	4	Intergenic	novelGene_76116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACCTCTTTTTTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585412	1601603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1587076_1591042_1591182_1598931_1599015_1601437
626929	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626941	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
626944	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
626957	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	196	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626969	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_16489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
626972	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
626976	contig_2703_pilon	+	1625	16	Intergenic	novelGene_101729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1144.27963948212	3	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	270	1052	559489	603438	TRUE	35	TTAGAACACCCATGAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQDSTQAWGS	526197	611006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602136_603413_603520_605179_605221_606091_606141_607656_607732_609320_609402_610760
626983	contig_10436_pilon	-	1197	4	Intergenic	novelGene_108482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	2470.29350482893	1041	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCGATGGAATGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103626	101406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102463_102655_102788_102868_103390
626988	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_89227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653720	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
627012	contig_1996_pilon	-	1591	8	Intergenic	novelGene_131948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.669523279059	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	399	917	509912	508953	TRUE	15	TCTGTGACAGTGCGGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSSTTSG	511086	507996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_508972_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732
627018	contig_10299_pilon	+	2586	23	Intergenic	novelGene_79707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	113.394396934762	1	96	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	871	2457	335813	340377	FALSE	40	GTACTGATTGTAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRASSLCWTRTHTWCLSLMESASSHAAAMSSCMRFQVRPSEGHHKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320526	340506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334558_334643_334782_334912_335005_335130_335254_335378_335437_335747_335832_335938_336058_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
627027	contig_252_pilon	+	3267	1	Intergenic	novelGene_99928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	443	1332	85	1416	355688	357019	NA	10	TTTCTTATTTTTCACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLDRGERTPLPETCSITIPDNAPGDPDRHHCQSLREKTEATQVMAETGKGNLKTVALPPPQLPEKGDAPRDPAGCGHTCQIRVSGARSHLATIEGKEEAARPTEGLKAAFASVSVATDGSLKNDCQCGEPRGPGGKKALETCDEGRSGSEVIVGAKAKEMKPERCAIFAVAVDEERAEVAVERMEKEGVMEEKVVEEVMKVEEKPVGEEMEVVEESRVIEEARPRPLSRDLHMNPLEAIQQELDTVNAQADRAFLQLEQKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWAAAFRNHPQLSAMIRGQDAEMLRYITSLEVKELKHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVVSLSTPIIWRRGHEPQSFIRRNQDIICSFFTWFSDHSLPESDRIAEIIKEDLWPNPLQYYLLREGARRPRLRPIREPVEIPRPFGFQSG	355603	358870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_355600_358900
627028	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
627035	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
627041	contig_12746_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_152201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATCAACTCGACAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696033	695284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_695300_696000
627044	contig_19851_pilon	-	673	3	Intergenic	novelGene_29882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	632	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATAAGAGTATCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	55648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_55751_55838_55880_56001
627047	contig_10609_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_123953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTTAGCAGTCGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485590	487418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_485600_487400
627053	contig_12250_pilon	-	2480	5	Intergenic	novelGene_80623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1604	1960	351486	350328	FALSE	15	GCGGGGGTCTCCCCAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPESYLVGVWQEATLLHVAHKATDWQVIYHKFKVVQFLNGLTQLFYLYRTELHVAQNSLLHILPKADLIQRLRHAIPIQHFTQAKAFMTNLLRAADRKLIVMVSLLGVMVGSHFVDI	354966	349807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_350542_351343_351965_352253_352440_353488_353764_354302
627054	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627058	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_97755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627060	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627062	SIRV7	-	299	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91625	2	-91619	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACTAGTAGAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
627065	contig_10861_pilon	+	1083	3	Intergenic	novelGene_39319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCAATGCCACGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489330	1490604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1490213_1490299_1490471_1490574
627066	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627070	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627078	contig_7318_pilon	+	2219	10	Intergenic	novelGene_152226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_7	55.8127380478244	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	123	1637	277723	314909	FALSE	15	ATATTTTTTTAGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQALALLREMSRLEAPLEELRALHSVLQAVPLSELREQVAEMHLGPLFSLLNQNHREQTALCVSILERLLQAMEPVHMARNLQVDLQRGLTHPDDSVKILTLSQVGRIIENSDAITEILNNSELLKQIIYCIGGENLSIAKAAIRSLSRVSLTQAGLEALFESNLLDDLKSVMKTNDVVRYRVYELIVEISSVSPESLNYCTTSGLVTQLLRELTGEDVLVRATCVEMVTSLAYTHHGRQYLAQEGVIDQISNIIVGADSDPFSSFYLPGFVKFFGNLASMDSPQQICERYPVFVEKVFEMTESQDPTMIGVAVDTIGILGSSVEGKQVLQKTGTRFERLLMRIGHQAKNASTELKIRCLDAISSLLYLPPEQQTDDLLRMAESWFSSLSRNPLELFRGISNQPFPELHCAALKVFTAIANQPWAQKLMFHSPGFVEYVVDRSVEHDKASKDAKYELVKALANSKTIAEIFGNPNYLRLRTYLSEGPYYVKPISTTAVEGGE	277600	315491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_277896_291587_291733_292820_292935_293282_293412_304922_305033_306903_307047_307796_307989_309165_309276_311753_311895_314651
627080	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
627082	SIRV2	+	322	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	275	-74	-275	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTTTGATGTTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
627098	contig_19459_pilon	-	996	7	Intergenic	novelGene_59844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4360.87523389004	1094	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	174	695	16240	10260	TRUE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKVN	19137	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6956_10247_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
627099	contig_10740_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_152246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_5	4.2614551505325	283	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	37	816	108687	99887	FALSE	15	TTTCTCATTTGCTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSDSSSSSSDAEELARCREAAMPAWGLEQRPSGPEKARADAANNQLPATQPSLRLKVDEHEQDGNELQTTPEFRAHVAKKLGALLDSSITISETQKEPTNARVQKAVSEDDGFRLFFTSIPGDPKKEASPQPRQKRPPSSSSSEDSDEEWQRCREAAVSASDILKESAIHGPIKVEKEAKKKKKRKKKAKEEANAISATATTTTSGAMVQKQEKETAKLNGDQASLGTKKRKKKKKAKPSEAPQFPPAKSAAAMLAN	108723	98444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_100236_100753_100845_101534_101609_105055_105155_105532_105576_108563
627110	contig_14322_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_116423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
627115	contig_7202_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_18063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27934	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627116	contig_14925_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_55266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGCTTGATTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113261	112090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112100_113300
627117	contig_9727_pilon	+	1668	6	Intergenic	novelGene_86318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	262.934516562584	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	23	298	309192	310109	TRUE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPYPLGTG	308443	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310713_310904_311014_312912_312991_314078
627118	contig_10003_pilon	-	3725	1	Intergenic	novelGene_88250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716409	712684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_712700_716400
627128	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	-1	2974	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
627136	SIRV7	-	227	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69053	0	35834	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78904	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
627137	contig_4232_pilon	+	922	3	Intergenic	novelGene_63226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	835	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	162	443	148447	149200	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	148285	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_148539_148806_148884_149087
627148	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_17592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27817	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
627149	contig_7202_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_18670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGTCCATGGTGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30108	29808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
627150	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627153	contig_8914_pilon	-	2347	5	Intergenic	novelGene_112872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_4	2000.04074958487	6	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1873	2310	265795	264566	FALSE	5	TTTGTGATGCTGTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268938	264528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_267508_268075_268180_268882
627156	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627177	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
627182	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627187	contig_5954_pilon	-	1726	14	Intergenic	novelGene_28650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	269.981239760257	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	590	1609	956264	944841	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLTCLHHGFVQTRVLTGLDSATTGLGRGRAPLPLPEWPRPIPRPICSP	960586	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944981_946798_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705_956942_959766_959821_959899_959941_960474
627193	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627196	contig_5050_pilon	-	1567	11	Intergenic	novelGene_110273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	211.001445492679	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	11	1246	716384	507209	FALSE	15	GAGACTTGGATGTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716394	506887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_716268
627203	contig_11492_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_152253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCAACATCTGTGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381103	380801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_380800_381100
627219	contig_10437_pilon	-	2087	2	Intergenic	novelGene_38262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGGCCAACGAGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405984	400077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_401554_405373
627227	contig_9668_pilon	+	1505	7	Intergenic	novelGene_58072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42380	51254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_42612_43440_43598_44472_44586_45889_45953_47221_47354_48098_48252_50598
627241	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627242	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627243	contig_18156_pilon	+	2300	16	Intergenic	novelGene_101445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	120.711152020939	49	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	939	2153	35609	64324	FALSE	30	AAACTTGTAATCCATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIEHFVDPSEKDHPKFQSVADLHLYLYSAKAQVTGQSARKMRLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGVSPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHAKATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAIGKAYKKDAKLVMEYLTICDECYITEMEKLLNEKGEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7327	64471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23501_23893_23975_32200_32351_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
627244	contig_8320_pilon	-	2161	8	Intergenic	novelGene_152273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	41.2647005345257	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	941	1843	558034	539063	FALSE	25	ATTATATAGCTCTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSNGAKQDSHNKARTSPYPGSKVERSQVPNEKVGWLVEWQEYNPVEYTAVSVLAGPKWADPQISESNFSPKFNEKDGHVERKSQNGLYEIENGRPRNPAGRTGLVGRGLLGRWGPNHAVDPIITRWKRDSSGNKITHPVSGKNILQFVAIQRKDCGEWAIPGGMVDPGEKISATLKREFGEEALNLLQKSSAEKREIEEQLQKLFSQEHLVIYKGYVDDPRNTDNAWMETEAVNYHDETGEIMDSLTLEAGDDAGRVKWVDISDKLKLYASHSQFIKLVAEKREAHWSEDSDPGCPGL	560994	538744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_539242_542124_542210_543282_543430_545318_545431_551376_551464_555377_555474_557837_558078_560097
627251	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	19	369	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14427	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627256	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627265	SIRV7	-	261	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91663	2	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
627267	contig_1996_pilon	-	1812	6	Intergenic	novelGene_131938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	692	junction_1	174.224452933565	1928	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	508	1317	509679	508483	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTCSSSFARRVSPTCWRHCPRPRPQGSAPAGEWGARSAHSWGDSAELADTSLCRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYRWAGVPAGVPQASVAAGASCHFSPTLPSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511080	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509242_509346_509712_509829_509957_510732
627283	contig_14322_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_116445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671897	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
627284	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
627319	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	56	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
627327	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	192	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
627346	contig_7426_pilon	-	1452	4	Intergenic	novelGene_27471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	68.1909084849293	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	618	1205	642214	637491	FALSE	45	TAAAAAAGTTTCCAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSDLSVSCLQGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	642831	637243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075
627348	contig_13740_pilon	+	1816	6	Intergenic	novelGene_34727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	959	junction_1	125.450229174761	235	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	113	664	167703	176906	FALSE	15	TTTATGTGGTTAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	166399	178058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_167674_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
627351	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_94280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627362	contig_500_pilon	+	2591	10	Intergenic	novelGene_31002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	942.371594553986	1	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485750	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492755_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1498078_1498882_1498974_1499277
627370	contig_5718_pilon	+	1695	12	Intergenic	novelGene_110445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	343.664765541043	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	7	1242	1617860	1631132	FALSE	35	CAAGATTCAAACTTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIVIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKSITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPVFPTQDEEVMMLTERVAEAQRIKT	1617853	1631585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1622890_1622963_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477_1625616_1628563_1628635_1629215_1629334_1631120
627379	contig_8978_pilon	+	2154	10	Intergenic	novelGene_49374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	330.894671988863	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	524	1261	343379	347248	FALSE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331447	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339950_342532_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
627386	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627395	contig_4364_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGCGACTGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
627411	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
627413	SIRV7	-	215	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69071	0	35852	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78886	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
627414	contig_9345_pilon	+	2522	10	Intergenic	novelGene_24472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	97.6148895746272	27	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	40	975	618498	629879	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAAHPPHHCAVCMQFVRKENLLSLACQHQFCRSCWEQHCSVLVKDGVGVGVSCMAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLVRRSNPSTLLS	618458	631647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_631028_631248
627418	contig_7428_pilon	+	1826	13	Intergenic	novelGene_77721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	112.788488134009	696	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	303	1565	432562	435117	FALSE	20	CAGGCTGGTATGGGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPPLHWACREGRSAVVEMLIMRGARINVMNRGDDTPLHLAASHGHRDIVQKLLQYKADINAVNEHGNVPLHYACFWGQDQVAEDLVANGALVSICNKYGEMPVDKAKAPLRELLRERAEKMGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSRDFNEECPRLRIFSHPNVLPVLGACQSPPAPHPTLITHWMPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428786	435378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_428900_429283_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433254_433360_433445_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
627434	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
627468	contig_7080_pilon	+	2174	10	Intergenic	novelGene_100096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	68	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	83	895	488513	540726	TRUE	30	CAGAATGGTATTGAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460799	542215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_541085_541294
627481	contig_1275_pilon	+	920	2	Intergenic	novelGene_108834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	88	777	747279	747968	FALSE	20	CATAATTGTGTCTGTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
627483	contig_11538_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_152281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGGCTCATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114534	115680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_114500_115700
627484	contig_12425_pilon	+	1510	8	Intergenic	novelGene_46629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.18673427726	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	435	986	174111	190717	TRUE	20	CCCTCAGCAACTTGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVTGNGDCYFGCLL	166976	198584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_170066_170141_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181826_190682_190836_198178
627500	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627505	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
627507	SIRV7	-	336	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	6	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78843_78964_114680
627530	contig_10196_pilon	+	964	8	Intergenic	novelGene_132167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_3	222.374477319825	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	31	774	1038403	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1038372	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
627536	contig_8452_pilon	-	754	5	Intergenic	novelGene_48094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_4	889.024887165708	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	228	449	968728	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991091	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
627542	contig_3095_pilon	-	1346	5	Intergenic	novelGene_75206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	861.266327856837	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253926	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248294_248759_253535
627545	contig_7571_pilon	-	2050	15	Intergenic	novelGene_106397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	106.945818820865	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	122	1909	136475	84922	FALSE	60	CAGGGAAAAAAAAAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLLGGRRRDWSGETRGPSGSDSDIRAATAENGPAGQIINMHFQGFRLCLGLLLISVNAEFMDDGVEMEDFDENSEEIDVDEDELSSEIKYKTPQPIGEVYFTETFDTGRLAGWVLSKAKKDDTDAEISIYDGRWEIEELKENRLPGDRGLVLKSRAKHHAISAILSKPFIFADKPLIVQYEVNFQDGIDCGGAYIKLLADTDDLNLENFYDKTSYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKHPKTGVFEEKHAKPPDVDLKNFFTDRKTHLYTLVVNKGSLLEDVVPPINPPKEIEDPSDRKPDDWDERAKIPDPSAVKPDDWDESEPAQIEDSSIVKPDGWLDDEPKFIPDPTAEKPNDWNEDMDGEWEAPHIPNPACRVGCGEWKPPMIDNPKFKGVWRPPMIDNPNYQGIWSPRKIPNPDYFEDDHPFLLTSFRAIGLELWSMTSDIYFDNFIICSKKEVADHWAADGWSMKIMVANANEPGVLKQLMAAAEDRPWLWLIYLVTAGLPVVLITSFCWPRKVKKKYEDAEYKKTDIGKPQTKGALEQEVKEEKAALEKPVELEEEKKQSDGEILEKEEKGEPEEKSEEEIEVIEGQEEGNKSNKSGSEDEMKEADESTGSGDGPVKSVRKRRVRKD	148986	84780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_85003_86960_87062_89561_89722_89950_90077_91174_91391_92649_92801_92927_93042_115798_115944_119617_119811_121249_121332_125250_125393_128759_128819_129467_129542_136331_136485_148874
627549	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
627562	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627565	contig_7165_pilon	+	1542	6	Intergenic	novelGene_116891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	628.245939103469	915	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	65	457	1016847	1060300	TRUE	5	TCTTCTTTGTTTTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKVALQHNIGLGGAVVVTVYKMGFPEAARTHQIEAVPTSSAFDGFKANLVFKEIEKKLEEEGEEFVKKIGGIFAFKVKDGPGGKEATWVVDVKNGKGSVHPNSGSHKAAIKVLTRAEFSSGGLTGEGPTSKLPQIRRLTAQSQWLTRTYWL	1016782	1064322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582_1043677_1053994_1054125_1059383_1059476_1060246_1060327_1063263
627578	contig_10182_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_134621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1598	1948	326434	326084	NA	10	GTGCCCCTAGATCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHLQYCIYLLKHLSWYSISAIQSALKALQKKKRLQEIDGIPVEMFQQTEGHSEGTLKSRWHTAWSTSMSVLVCLTLRRLLSGQAWLPHEESFPSWITFPAPLPLSQPRGPSQGA	328031	325983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_326000_328000
627583	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627588	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_16456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
627596	contig_5231_pilon	-	2032	10	Intergenic	novelGene_65894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	145.031116286671	772	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	524	1747	222876	209128	FALSE	35	TAGAATGTGGAAAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDNVSAMEGSWKIGEEFHIDKDMGFALPNPLEELPHTYAPWISIARNLPVLIENGQLRAEVEKLSQLSIDELRGHKLQRLAHLVLGYITMAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	225856	208842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283_219380_222777_223384_225840
627602	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
627606	contig_14142_pilon	-	2470	9	Intergenic	novelGene_120481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCGCCAGTGCGAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274998	261236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_261372_268534_268651_268885_269156_269606_269795_269876_270351_270671_270812_270913_270982_273341_273455_274032
627607	contig_610_pilon	-	1397	4	Intergenic	novelGene_76732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1334.73950850177	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252662	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235212_252519
627608	contig_11258_pilon	-	1271	6	Intergenic	novelGene_67845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	131.721828107569	2122	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	435	1055	360591	352060	FALSE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVPAQQHPLPAPSLSEGALVLEHAQCCPLGEQASEGS	370120	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354741_355099_360530_360759_361438_361618_370032
627621	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_17641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
627634	contig_15732_pilon	+	2028	7	Intergenic	novelGene_88830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	463	junction_6	157.901252545873	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	297	1457	53547	185225	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSVSFLFVCFTSKIVFIT	11001	185796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977
627638	contig_19579_pilon	-	1664	7	Intergenic	novelGene_59378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_6	519.952775633412	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	15	893	13090	7943	FALSE	55	AAAAAAAATCTATATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13104	7171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12301_12900
627648	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627663	SIRV7	+	235	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTCATCGTCTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147673	147908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
627665	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627669	contig_14289_pilon	-	2269	6	Intergenic	novelGene_110547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_1	330.871818080658	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	90	767	66533	51527	FALSE	15	TGTTTTGTCCAAGGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66622	50024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
627674	contig_5954_pilon	-	1765	4	Intergenic	novelGene_28413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	66.0420741312351	590	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	28	528	97313	94607	FALSE	15	CTGTCTCCAGCAACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVFRSALWGWRTGVQPSCGLRHLSQVQGPPDYPSFVESVDEYHFVERLLPPTRIPEPPKHKHYPTPSGWQPPQDPPPNLPYFVRRSRMHNIPVYKDITHGNRQMTVIRKVEGDIWALQKDVEDFLSPLLGKMPVTQVNEVTGTLRVKGYFDQQLKAWLLEKGF	97340	93369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_94754_94886_95012_95847_95999_97235
627683	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_115868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
627685	contig_4083_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_152313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	939	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21270	19769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_19800_21300
627691	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627697	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627707	contig_567_pilon	-	1921	11	Intergenic	novelGene_33962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	851.190789423852	4	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	254	1183	327060	308820	FALSE	40	GGAAAAAAGGGAGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLAATIVDIRSPNVIVSTSAEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	331056	308081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_327065_329124_329358_331040
627714	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627715	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_94783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
627730	contig_4797_pilon	+	458	5	Intergenic	novelGene_6918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2294	junction_4	2878.64719746967	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1	417	368558	371710	FALSE	20	CAAGACTTTCGTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA	368557	371751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368591_368764_368844_369855_370026_370914_371016_371676
627734	contig_12080_pilon	-	2297	12	Intergenic	novelGene_128376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_7	224.718041881615	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	263	838	175991	171125	TRUE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	176253	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881
627737	contig_854_pilon	-	1898	10	Intergenic	novelGene_36425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	106.867519231367	793	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1018	1728	1074160	1064774	FALSE	40	AGGCAAGGTTGAGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1082396	1064603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
627760	contig_15087_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_37296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGATATACTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303731	302317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_302300_303700
627769	SIRV3	+	182	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5157	1656	3098	-539	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATATTGGTAAATGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7101	7283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7100_7300
627771	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_18716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCAACCTGGAGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
627773	contig_18822_pilon	+	2063	15	Intergenic	novelGene_111727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	89.781622818472	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	45	1913	140694	246273	FALSE	20	TGAGGTTACCGTCTCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGAHCEPGGRRVNMSGFLVHTLSLLLMPLLLGSARGLHNASQRMFKIDYSQNCFLKDGQPFRYISGSIHYHRVPSFYWKDRLLKMKMAGLNAIQMYIPWNFHEPLPGQYQFSDDHDVEHFIQLAHEMGLLVILRPGPYICAEWDMGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKFEKVPDGPIPPSTPKFAYGKVALKKLKTVGEALNILSPSGPTKSIYPLTFVQVKQVPQGILERNQVFTVNITGEAGATLDVLVENMGRVNYGRYNNDFKGLISNLTLGCSILTDWLIFPLNAENAVRGHLGGWGGHGNSCHVEPEPHSSSNFTLPAFYVGNFSIPAGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQMTLFVPQHILVTSAPNTVTVLELERAPCSSVDPALCTVEFVDKPVISTAVTYSHLPTWPDHV	140649	246423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_165852_166023_168082_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191259_209335_209411_212481_212572_223825_223958_229459_229715_246024
627800	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
627808	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627826	contig_12019_pilon	-	2442	5	Intergenic	novelGene_87700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	30.2034766210779	947	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1265	1900	189002	178012	FALSE	25	TGCCATACATATATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNACESPTDKGGETGESNETPAAPLGSGTTSTDGIPEETDGDGDGDLKETPVEEGELKSQDISDLTAIEREDSSLLTPAAKKLKIDTKEKKEKKQKVDEDEIQKMQILVSSFSEEQLNRYEMYRRSAFPKAAIKRLIQSITGTSVSQNVVIAMSGISKVFVGEVVEEALDVCEKWGETPPLQPKHMREAVRRLKSKGQIPNSKHKKIIFF	190266	177469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_178143_178801_178899_179255_179344_183618_183768_188831
627839	contig_3077_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_26824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1143	1571	481868	482296	NA	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLSHPPPQQGTLSPHRDSTLKLMLGFYPLFQPFWEKMMDWDSSEILFLEENVLPLPPSFLCNLAYSGPPIFVAHFSKTIITWSHLSRAWICLHSRKNKATNFYIARLIMEVVQASNNLSFNFFFSWQSNVKLKWEKIFNI	480725	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_480700_482400
627840	contig_6576_pilon	+	2222	13	Intergenic	novelGene_42253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCGTCCCACAGGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315091	339533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_315456_319393_319444_322201_322685_322833_323000_323861_324104_326530_326689_329123_329193_330287_330338_330841_330914_331027_331198_332095_332236_337925_338052_339401
627843	contig_7202_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_17212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGATTTCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
627844	SIRV5	-	371	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGATGCGTAAGCACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
627848	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
627858	contig_14322_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_116104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGCGGCTGTGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671357	671652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
627860	contig_4336_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_152369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCAATCCCAGCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375530	375125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_375100_375500
627861	SIRV7	-	283	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91626	-15	-91620	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAACTAGTAGAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
627867	contig_14441_pilon	+	764	3	Intergenic	novelGene_100706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	124	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	156	584	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116572	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
627875	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
627882	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
627894	contig_7202_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_16649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTCCGCAGGTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
627895	contig_1084_pilon	-	1335	3	Intergenic	novelGene_152397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.5	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTATTTCAACAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569122	564917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_565902_568478_568748_569040
627896	contig_1084_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_152396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGAATCCTGTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563348	562590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_562600_563300
627897	contig_1084_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_152395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATACAGTTAATCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562494	562034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_562000_562500
627899	contig_1331_pilon	+	2716	16	Intergenic	novelGene_37864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_13	146.265724700704	203	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	96	1448	293457	335269	FALSE	15	TGTAATTGTAGCTTTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGRAWLRLALMQKKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCMKGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSKGSEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQAKVDALEKSNTKLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYILESNRKGPKQDRTSEGQALSEARKHLKEETQLRLDVEKELEIQIGMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDALVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSSDLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQRLRQAERGRQSAELDNRLFKQDFGDKINSLQLQVEELTRQRNQLELELKQERERRLQNNRNVPAKGSQKTEPKTDGKHKIQEENVNLKKPLEESHRLQSHPMDQQDQPLLSEKPQVCQLCQEDDGSVKKNVCENCKGTFCNACSTNELPLPSSIKPERVCNPCHKHLMKQYSTSPS	292589	336537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_292642_293413_293516_297707_297832_299143_299206_300407_300474_301810_301881_317680_317774_319866_319951_321811_321980_322504_322603_326730_326851_327852_327953_329868_329934_331941_331970_332773_332846_335125
627900	contig_5791_pilon	-	2433	2	Intergenic	novelGene_35858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	491	junction_1	0	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1105	1455	1080744	1080394	TRUE	30	AATTATTGCTGTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFVFFLPYKDDLSLIRKNRMALFQHLTCVLPILDSLLTARVINEQEHDVIKQKRQTPLQARELIDTILVKGNSAATIFRHFLHENDPVLYKNLFGKCWKIIWGKFLGELKICSH	1081848	1079303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126
627906	contig_12270_pilon	-	383	2	Intergenic	novelGene_113150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	27	383	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14435	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627911	scaffold_2602_pilon	-	2330	4	Intergenic	novelGene_127682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	463	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGCCTGCTTCCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39291	25285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_25634_36847_36949_37299_37627_37737
627929	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
627934	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_93614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
627942	contig_5981_pilon	+	2278	14	Intergenic	novelGene_35535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	132.094640628756	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	166	2019	299524	317012	FALSE	90	TAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVLLNFAEMNKLWVRMQHQGHSRDREKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLTGILEQVVNCRDALAQEYLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIIIALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLFDIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIATSSAVSKELTRLLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNVLDYNTEIVSQDQVDSIMNLVSTLIQDQPDQPVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRSEDPDQQYLILNTARKHFGAGGNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFLQGALAAGEIGFENHETVAYEFMSQAFSLYEDEIGDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLRRESPESEGPIYEGLVL	289081	317271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_289117_294391_294491_299492_299707_300849_300934_302162_302273_305007_305105_305209_305359_307394_307603_308170_308327_311271_311395_313213_313394_313869_314110_314545_314690_316832
627964	contig_11512_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_43242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	4011	4581	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSA	4000	4583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
627972	contig_6217_pilon	-	2106	17	Intergenic	novelGene_109623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	439.797396536178	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2061	46	2106	559453	435510	FALSE	55	GAACTGAAAAAGAAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPVTTTFRWKTYRFDLPGQVALQACRRLPDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSTPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETS	559498	435509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_435613_439647_439694_442461_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_559359
627974	SIRV4	-	297	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCGTGAACGTCGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2755	2458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
627988	contig_5978_pilon	-	3225	19	Intergenic	novelGene_152400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCACCAGCCAGTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474031	360082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_-_360188_363385_363593_377912_377954_395639_395741_409509_409624_425204_425272_437448_437624_440282_440389_442804_442903_445584_445696_446392_447288_447373_447503_448903_448991_449791_449911_453272_453420_458114_458185_467738_467838_470930_471071_473617
627997	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
627998	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628010	contig_1948_pilon	-	2776	9	Intergenic	novelGene_31136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	11.5325625946708	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	373	1476	65876	43620	FALSE	45	GTGTTTACAAGAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRVEREGTGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKELRADVDTFLEYWPPQSQQFSMQYISHIFGVINCNGFTLSDQRGLQPVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGKIELRALGKISEGEELTVSYIDFLNVSEERKKQLKKQYYFDCTCEHCQKGLKDDLFLGVKDDPKPSQEVVKEMTQLSKDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLQKQEPVFSDTNLYVLRMLSIVSEVLSYLQAFEEASHYARRMVDGYMKLYHPNNAQLGMAMMRAGLTNWHAGNIEVGHGMICKAYAILLVTHGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALSNQPMQVMAEPSKEPAPALFHKKQ	103468	42319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_43779_45221_45391_45926_46091_50192_50286_55474_55665_63027_63159_65678_65893_68566_68744_103289
628019	contig_6589_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_26302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	341	1026	201	1226	2274190	2273165	NA	60	GTGAAACAAAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2274390	2272088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272100_2274400
628020	contig_9389_pilon	+	1339	5	Intergenic	novelGene_83911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1022.88061375705	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	39	647	159587	167696	FALSE	45	GGAAAAAAAGTGGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRNLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGLTRPLPSFIFLYVGALPAEGLWAAWGGVARGVGPTLPWILARTEPPG	159548	168388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_164407_164540_165815_165933_166074_166253_167577
628022	contig_12000_pilon	+	1525	9	Intergenic	novelGene_43153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	419.047357108955	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	335	886	488478	669327	FALSE	55	TTTCCATGAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	416848	669966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484170_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_669224
628025	contig_14666_pilon	+	1518	13	Intergenic	novelGene_39488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1078.9984553588	1744	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	35	1177	303800	323175	FALSE	25	AGATGTGACTCTTGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLGNSKTEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGDSEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	303492	323516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_303518_303790_303939_307502_307576_315320_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322434_322677_322746_323028
628029	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628038	contig_8063_pilon	-	3816	1	Intergenic	novelGene_152414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACAGTTGATGTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41863	38047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_38000_41900
628041	contig_3004_pilon	+	2390	12	Intergenic	novelGene_127484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_9	196.285548446455	71	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	189	968	277854	281328	TRUE	40	AAACAAAGTCAGCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275444	287249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284415_285297_285751_286379_286451_286738_286875_287113
628044	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628045	contig_5643_pilon	-	2114	14	Intergenic	novelGene_39149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	74.0326171519477	367	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	82	1221	708267	659148	TRUE	10	CTGCTAGTATTCCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAAEGDVGTVVELVRLLRSGFEELSLNKLATSLGASEQALRLIISIFLGYPFALFYRRYLFYKDSYLIHLFHTFTGLSIAYFNFGNQLYHSLLCVVLQFLILRLMGRTITAVLTTFCFQMVYLLAGYYYTATGNYDIKWTMPHCVLTLKLIGLAIDYFDGGKDQNSLSSEQQKYAIRGVPSLLEVAGFSYFYGAFLVGPQFSMNHYMKLVQGQLTDMPGKTPNSIIPALKRLSLGLVYLVGYTLLSPHITEDYLLTEDYENRPFWFRCMYMLIWGKFVLYKYVTCWLVTEGVCILTGLGFNGFDENREAKWDACANMKVWLFETTPRFTGTINSFNINTNAWVARDVSSTSRELVYRVHHCGLSIRHSVGTQSLSVE	708348	657022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_657423_658274_658404_658503_658663_658740_658889_659090_659248_659576_659744_659840_659928_660723_660833_661998_662178_662608_662647_662798_662893_663452_663560_664488_664597_708116
628063	contig_11338_pilon	-	1997	9	Intergenic	novelGene_6235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_8	89.4972066603198	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	696	1652	14943	12948	TRUE	35	AACTTTTATTATGGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVLCCPSLGLLFRGAGQALRPVSVQAWPVLRHGGGGGHPQGLQACACRAMGRALAWTGAEPSSLVGKSSFSLSLQVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGALVTLSAVQGFPAAHPGGHQSVWPRDGH	21396	12429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13458_13760_13880_14528_15189_16641_16770_17075_17288_21286
628068	contig_12623_pilon	-	2729	7	Intergenic	novelGene_138161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	141.136655605677	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	12	1037	177710	51811	FALSE	0	CCTTGTTTCCCTGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177721	50118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_147430_147540_177617
628086	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
628097	contig_3155_pilon	+	1247	5	Intergenic	novelGene_26355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	34	junction_4	901.962443785771	58	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	82	588	258156	261211	TRUE	20	CCTCACTCCAAGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258074	262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261733_262413
628107	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
628108	contig_9609_pilon	-	1947	3	Intergenic	novelGene_22919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATATACTCAAGGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53419	4295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_4589_7514_7672_51922
628114	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
628118	contig_6589_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_25964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCAACGTCAACCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296048	1296268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
628121	contig_18869_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_56291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATTTGGCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73602	73354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
628122	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
628137	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
628146	contig_12427_pilon	+	2059	6	Intergenic	novelGene_40557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCCCGAGCGGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504816	578168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_506130_507798_507925_510390_510617_520312_520440_522284_522346_577962
628163	contig_2932_pilon	+	729	4	Intergenic	novelGene_47962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_3	12.0830459735946	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	6	728	360210	363926	FALSE	35	CACACACAGGGGAGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMTFKDVLVEFTQEEWRLLNPAQRTLYRDVMLENYSHLVSVGYVTKPSKVFKLKQGKEPWILEVESPRQGYPEGLWDIDDLGTRYQERQAENSRNGELTKHRKTCTREKTWDCNECGKSCQKSALILHQRTHSEDKQHEHSERGKSSSRNGNVAIHQKTHTREKTYECKECEKTFYHLSSLSRHMRTHVGEKPYECNQCEKTFYQKPHLVEHQKTHTGEKPYECKECGKFFYVKAYLMVHEK	360204	363927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_+_360331_360661_360755_362925_362990_363481
628164	contig_2932_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_47963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGATATGTGTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365149	367065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_+_365100_367100
628167	contig_1230_pilon	+	1882	8	Intergenic	novelGene_28854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1533.84695774902	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	416	1648	406520	408754	FALSE	25	GGCACCATATAGTTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404458	408988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405355_406143_406211_406352_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
628176	contig_10674_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_6446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGATGGCAGTGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246459	245010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_245000_246500
628186	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628195	contig_11978_pilon	+	1559	12	Intergenic	novelGene_62788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	73.625700687008	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	163	1179	299759	587379	TRUE	10	GCCATGTCTGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HALRLGQAEAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPDEEHNLDEDESGTRRKGVEYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299596	589574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335654_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587387_589201
628199	contig_8317_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_20625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTAATGAGAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
628212	contig_20600_pilon	+	2294	6	Intergenic	novelGene_137110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	58.3698552336735	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	415	915	112379	117548	FALSE	15	TTTTTCTTTGTCTTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMSTALCSRGRVIGLKEEPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111248	118927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111553_112268_112446_114085_114161_114959_115049_116223_116332_117386
628215	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
628222	SIRV4	+	290	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1481	632	1026	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
628223	contig_10437_pilon	+	2257	15	Intergenic	novelGene_38446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	836	1249	1006137	1018107	TRUE	5	AGCGGCTTCCTGCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIHIFYSLQSFEELFGYSHSIFGAEEIASSDPFTTVFHNRRHELSILLRNPFVPEVHHESWQTIAAVALIMQSVKHHQASSIELCHSGVLQEPLHILESTGMVILTGQFLLNLRNLQQIPFTDQPRQLSDHRHML	950942	1030269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_951551_986392_986525_1006041_1006163_1007554_1007664_1007873_1008033_1017987_1018158_1018561_1018676_1019088_1019222_1021496_1021610_1022053_1022189_1022310_1022363_1023447_1023485_1027648_1027708_1029379_1029520_1030094
628225	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	632	988	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
628228	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_115971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671888	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
628234	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
628236	contig_8729_pilon	+	2414	8	Intergenic	novelGene_40068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	28.7990929562381	164	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	13	453	45249	50335	TRUE	5	GTCTCGGACTTTTCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQVRVGSCTSFSTPVDADWLP	45236	57037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_51269_52546_52603_54672_54758_54932_55078_56295
628237	contig_14441_pilon	+	1316	7	Intergenic	novelGene_100530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.342470313716	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	722	1150	116728	117610	FALSE	10	CACAGCCTGCTTGGCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111383_112112_112154_112524_112665_113867_114048_116554_116963_117220_117344_117539
628248	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
628249	contig_6488_pilon	-	2169	8	Intergenic	novelGene_44714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	787.000816844739	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	275	1051	54113	31233	TRUE	15	ACCACAGGTGGTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFKGMSVSRPNAVVGKCRMIRHSRDRKNEPNPQRFDRIAHTKETMRLDGLNTLTYKVLDTQRYPLYTKITVDIGKPS	91405	28389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_28715_30439_31366_31558_31664_34242_34366_36841_37030_53885_54122_90850_90974_91262
628255	contig_7286_pilon	-	1435	6	Intergenic	novelGene_108689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	2699.03987373288	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	771	1367	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293171	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_292101_293119
628262	contig_7202_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_17316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCATGCAGGTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
628280	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
628298	contig_1813_pilon	+	2518	11	Intergenic	novelGene_105516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	56.6960316071592	299	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	908	2059	437751	442898	FALSE	30	GCAAACATCATGCAGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIGEVACGALDGSDPSCLGLPALDASQRFRSISTLELFTVPLSTEAALTLCHLLSSWVSLESLTLSYNGLGSNIFRLLDSLRALSGQAGCRLRALHLSDLFSPLPILELTRAIVRALPLLRVLSIRVDHPSQRDNPAVPGNAGPPSHIIGDEEIPENCLEQLEMGFPRGAQPAPLLCSVLKASGSLQQLSLDSATFASPQDFGLVLQTLKEYNLALKRLSFHDMNLADCQSEVLFLLQNLTLQEITFSFCRLFEKRPAQFLPEMVAAMKGNSTLKGLRLPGNRLGNAGLLALADVFSEDSSSSLCQLDISSNCIKPDGLLEFAKRLERWGRGAFGHLRLFQNWLDQDAVTAREAIRRLRATCHVVSDSWDSSQAFADYVSTM	423592	443357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_423657_427785_427873_429345_429417_436814_437216_437466_437959_440465_440727_441230_441396_441490_441590_442159_442283_442510_442587_442678
628324	contig_11248_pilon	+	2864	9	Intergenic	novelGene_142557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	65.4053466851144	246	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	486	1100	391144	410462	FALSE	25	TTAATTTCTTTGTTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKGNSSHTSWENKCQCISNSPRNTGEPVTPKPEEQEERKTTEMRSQMQPPDQENLLGHCREPPPWKHEAMGRKYHFVVGQTVQYQCTNGYWAQRRGPAESTCRVICGKTRWTQPRLTCTNEVITGKEEAESSTDTLPESETSCPSITTVSQKYTEVVATMETFVFTTEYQVAVAGCVFLLISILLLSGFTWRRKWRKSRRTI	351839	412226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_352045_378362_378515_391015_391208_392098_392210_398645_398850_404085_404158_404624_404697_405590_405658_410437
628326	contig_7020_pilon	-	2222	16	Intergenic	novelGene_57043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	230.779509970496	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	579	1790	49546	39469	FALSE	10	GTTCTCTGCTATCTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEEGYIPSNYVTEAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAEQLLKQEGKEGGFIVRDSSKAGKYTVSVFAKSAGDPQGVIRHYVVCSTPQSQYYLAEKHLFSTIPELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQGVVKVSDFGLSRYVLDDEYTSSVGSKFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYSLGKMPYERFTNSETAEHIAQGLRLYRPHLASERVYTIMYSCWHEKADERPTFKILLSNILDVVDEES	74734	39036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_39541_42143_42302_43260_43380_44004_44070_45083_45301_45811_45984_46835_46911_47791_47920_48094_48175_48471_48527_49076_49140_49538_49731_51550_51619_51944_52074_63085_63176_74627
628327	contig_635_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_152458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	418	1257	231	1487	73304	74560	NA	10	CTTCATTGCACCTGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQPGNSSVFLLAPNGSHEPDHNVTQERDEAWVVGMGIVMSLIILAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGASHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVVILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAKETCCDFFTNQAYAIASSVVSFYLPLVVMVFVYSRVFQVAKRQLQKIDKSEGRFHTQNLNQMEQDGRSGHGHRRSSKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLISKEVYILLNWVGYVNSAFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCLHRSSLKAYGNGYSNNSNSKTDYTGEHSGYHLGQEKESELLCEDPPGMQDFVNCQGIVPNDSIDSRGRNCSTNDSLL	73073	75106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_635_pilon_+_73100_75100
628333	contig_14925_pilon	-	951	5	Intergenic	novelGene_55106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	1817.42551429213	204	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67867	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611_29828_67822
628347	contig_7045_pilon	+	2498	5	Intergenic	novelGene_77479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTTCAGGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524045	537914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_524728_526697_526895_529563_529764_533133_533318_536679
628349	contig_12624_pilon	-	2044	14	Intergenic	novelGene_61042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	924.631690628009	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	157	1683	903621	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKVLTISSCHLQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903777	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874166_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
628352	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
628354	contig_6397_pilon	-	2485	19	Intergenic	novelGene_146246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_7	88.614785712733	280	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	227	1900	554772	437797	FALSE	5	GTTGTTGGGGTTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	601789	437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455606_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
628378	contig_11258_pilon	-	2212	8	Intergenic	novelGene_67818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	12.5519329351365	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	470	799	354806	334055	TRUE	35	ATGCTCGCAATCATTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVERWSLFERSHLPGDDICVPSSRRKRLRKEAALWHKEKQKCESWRFGPPFLGRAETWYPAGAQAISADTCLRGMTQRDRAVWLLSVLLLLWVPGILRPLSHLTPPKAT	360617	326535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328660_328767_330514_330657_334001_334102_336870_337089_354741_355099_358490_358581_360530
628390	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
628393	contig_8617_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_73395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62284	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
628399	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_97230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628401	contig_14322_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_116408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
628408	contig_12125_pilon	+	2904	9	Intergenic	novelGene_76199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	130.15705657013	1	162	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1419	1781	78461	82984	FALSE	40	ACTAAATTTGTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	66496	84107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73129_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
628415	contig_6102_pilon	-	2234	9	Intergenic	novelGene_32107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	278.349488054137	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	564	2042	821539	816763	FALSE	30	ATGCTTAAATATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFCLLGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822102	816570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337
628420	SIRV7	-	301	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91625	0	-91619	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACTAGTAGAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
628422	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_115826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
628426	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	10	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
628427	contig_21203_pilon	+	3100	2	Intergenic	novelGene_84466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	303	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	261	437	4320	4496	FALSE	45	GAGCCTACTTTAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQIWDTAGQERFRSITQSYYRSANALILTYDITCEESFRCLPEWLREIEQYASNKVITVLVGNKIDLAERREVSQQRAEEFSEAQDMYYLETSAKESDNVEKLFLDLACRLISEARQNTLVNNVSSPLPGEGKSISYLTCCNFN	979	7159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_1166_4245
628433	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628440	contig_5482_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_144457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTATGTGACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308539	309492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_308500_309500
628441	contig_5482_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_144458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGGTGAAATTCTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309891	310495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_309900_310500
628442	contig_12786_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_103441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAACTAGTCTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621166	618492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_618500_621200
628461	SIRV5	+	495	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7382	-5	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCACGCCGACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
628465	contig_9955_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_21390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCGTACTTCCCAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667281	666275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_666300_667300
628470	contig_11512_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_43244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	8	349	4011	4575	FALSE	20	AGTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAY	4003	4575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
628472	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
628477	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
628487	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_94706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628503	contig_2100_pilon	-	1371	11	Intergenic	novelGene_50664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	876.208200144235	6	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	30	1022	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185440	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173345_1175647_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
628509	contig_11285_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_5594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	545.292400890693	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	35	682	766060	767445	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAGKGVGKEPWWHSG	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768681_769921
628515	contig_4659_pilon	-	2014	8	Intergenic	novelGene_118244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	188.004342112253	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	175	1107	860030	821106	FALSE	65	AAAAAAGAAAAAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNRLEPSSFQLPSSFNKKYLLYARQALCYWPRI	884143	820198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_821200_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_883977
628519	contig_11994_pilon	+	2194	11	Intergenic	novelGene_129342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	65.2509770041798	34	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	405	1646	95169	108340	FALSE	10	AGGCTTTGTCTTAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93694	108888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93885_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
628522	contig_10642_pilon	-	1983	3	Intergenic	novelGene_78661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.5	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	431	787	172833	170362	FALSE	10	CTGTGTCCCATGTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARATDSVLNGHRSKGLCDSAKKEDLPELAGQALSAGPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGI	178083	169165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170367_172481_173129_177948
628524	SIRV7	-	300	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91626	0	-91620	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAACTAGTAGAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
628527	contig_6710_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_89304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGGCATTATCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
628532	contig_4364_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_3726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533057	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
628535	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628546	contig_3956_pilon	+	1233	7	Intergenic	novelGene_14971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1642.05629894011	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	81	1070	1281682	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284777_1290491_1290658_1290727
628560	SIRV7	-	344	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	7	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
628563	contig_12951_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_68159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTAAGAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297122	295358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_295400_297100
628573	contig_401_pilon	+	1743	10	Intergenic	novelGene_42876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	177.964901519484	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	23	556	1749725	1767136	TRUE	5	CTGCCTTTGTGCGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGEDVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR	1749702	1768491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764543_1764692_1764745_1765957_1765997_1767088_1767561_1767728
628580	contig_14694_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_152466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCACTCTATCGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84949	87080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_84900_87100
628593	contig_8712_pilon	+	278	2	Intergenic	novelGene_58824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGAGACTGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320061	320813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_320229_320702
628602	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628609	contig_9515_pilon	+	2038	6	Intergenic	novelGene_73828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	275.228341563873	40	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGCCTGCACTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66231	72661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_66248_66345_66494_66544_66856_68199_69477_71788_71878_72464
628620	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628625	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
628626	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
628638	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
628655	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628660	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628662	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628668	contig_414_pilon	-	2006	2	Intergenic	novelGene_115100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	289	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	546	1322	373842	373066	FALSE	20	ATGTACCATGTTTTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384211	372381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_383938
628669	contig_6735_pilon	-	1708	11	Intergenic	novelGene_15749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	779.564885048063	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	617	1231	543914	542464	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHSPQAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568274	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543915_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564182_564232_564784_564869_568198
628673	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628676	contig_4364_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_3711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
628678	contig_4364_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532798	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
628693	contig_7201_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_152526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTTGTTTCTTGTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335290	337760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_335300_337800
628705	contig_14890_pilon	-	1504	8	Intergenic	novelGene_122518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	855	junction_5	1054.07942232615	2204	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	145	960	370199	366814	FALSE	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371231	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_371106
628709	contig_8317_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_20623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTCCAGCAGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16742	16463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16700
628710	contig_5485_pilon	+	1815	3	Intergenic	novelGene_37679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	864	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACGAAAACAGAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84680	87028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_86135_86258_86366_86774
628715	contig_8674_pilon	-	2388	3	Intergenic	novelGene_102899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_2	257.5	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1558	1863	158414	154585	FALSE	45	GGAAAATCTGTCAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNISRYITDIKPLPPNIKDRLIKIMSMQGRITDSNISEILHPEVQTLDLQSCDISDTALLHLCNCRKLKKLNLNSSKEDRISITSEGVCLSLVFLEEQNQ	202281	154059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_154774_158297_158431_200740
628722	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
628726	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628727	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
628740	contig_4496_pilon	+	2473	14	Intergenic	novelGene_66645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	118.311493386972	353	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	20	1372	689129	757029	FALSE	20	CTGATTTTTATGATTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRIAAMEGARSEPERQLQPAPLEPLGGLDAEQDAAVGEEAEGDLEEGSEDRKMTENNFSLKKIEISVSEAEKRSGRNAVNMQETYTAYLVETRSVEHIDGQSVLTDSLWRRYSEFELLRSYLLVYYPHVVVPPLPEKRAEFVWHKLSADNMDPDFVERRRIGLENFLLRVASHPILCRDKIFYLFLTQESNWKETVNETGFQLKADSRLKALNATFRVKNPDKRFTELKHYSDELQSVISHLLRVRARVADRLYGVYKVHGNYGRVFSEWSAIEKEMGDGLQSAGHHMDVYASSIDDILEDEEHYADQLKEYLFYAEALRAVCRKHELMQYDLEMAAQDLASKKQQCEELATGTVRTFSLKGMTTKLFGQETPEQKEARIKVLEEQINEGEQQLKSKNLEGREFVKNAWADIERFKEQKNRDLKEALISYAVMQISMCKKGIQVWTNAKECFSKM	689109	758130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_689270_705632_705755_707657_707794_707868_708019_709514_709563_717024_717081_725591_725665_735034_735097_743050_743117_747660_747751_749352_749453_752295_752442_753351_753467_756981
628745	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
628748	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628758	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
628765	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
628782	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628786	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
628787	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91622	2	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
628792	contig_11171_pilon	+	1504	6	Intergenic	novelGene_48604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	70	345	212165	235078	TRUE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGAVEWEQVLGLPVPRTLPFCKMRLLLVSAVNVARNMESCTPSTRHSTQKAGELETASKSDLLFFSFLPLQEDSR	212095	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_234857_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
628795	contig_13457_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_118335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	70.2465047427374	7	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	185	817	60777	70796	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPQAAAAQCLGRV	59226	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68617_70761
628813	contig_15498_pilon	-	2234	2	Intergenic	novelGene_42622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	419	916	535355	534858	FALSE	15	GTGTTAGCCTGTCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	544023	533539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535588_543837
628837	contig_1948_pilon	-	1323	4	Intergenic	novelGene_31179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	286.591850702159	1673	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	54	524	552044	544410	FALSE	30	ATAGAAGTGTATTCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552097	543610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551992
628842	SIRV5	-	322	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATACAGATTTCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
628844	contig_6017_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_152555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	816	1136	467484	467164	NA	75	AAGGAAAAAAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF	468299	465625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_465600_468300
628849	contig_19459_pilon	-	1105	8	Intergenic	novelGene_59873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4124.17644963878	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	138	836	16240	6939	FALSE	10	CTGTCTTCTTGTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQVDLASDIIQ	19101	6669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6964_7784_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
628850	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
628857	SIRV5	+	262	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	154	138	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
628892	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	641	966	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
628898	contig_9982_pilon	+	1669	12	Intergenic	novelGene_55745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_10	110.033728863487	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	25	1374	315214	338345	FALSE	25	GACTTGTTTTATTACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	315189	338640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_337965_338123_338220
628910	contig_6710_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_89231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653722	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
628928	contig_10197_pilon	-	3079	14	Intergenic	novelGene_115266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	172.913290169263	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	105	1814	1143371	1107972	FALSE	35	GAGATACCCCTTCGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTSGTVGGTAEPEHEETSWMNGWLSCKAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRLLGSACFAVSCLLIAYGASNPDSLSVLIFISLALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFIALMIGSYASSAVTFPGVKVIYDFGVSFIAILVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDMDYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQAALQEGHKLCLSTVDLEVKCQPDAAAAPSFMQSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQDIVSLYTSIFGVLQLLCLLTSPVIGYVMDWRLKECEDASEEPEEKDASQGEKKKKKRDRQIQKISNATRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGFIHSAAGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLGLSMLGFCLPLYLICYRRQLEQQLQQKREDDKLFLKINGSSNQEAFV	1144342	1106706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1108134_1108600_1108725_1109972_1110047_1112032_1112166_1113554_1113694_1116490_1116638_1117310_1117514_1117601_1117736_1118342_1118436_1131243_1131321_1132154_1132211_1133770_1133979_1143211_1143420_1144286
628937	contig_20727_pilon	+	504	2	Intergenic	novelGene_152575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTGCTGTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25359	26357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_+_25387_25880
628941	contig_3469_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_34190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGGAAAGGGTGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467403	469156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_467400_469200
628946	contig_846_pilon	-	1781	4	Intergenic	novelGene_136109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	39.8357739838062	146	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	286	657	220442	217175	FALSE	20	AGTACAGTTTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAGTCSTFQSDLDFCPDCGSVLPLPGVQDTVTCTRCGFSINVRDFEGKVVKTSFVFHKLGTTVPSLVEEGPEFQGPVIDRRCSRCGHEGMAYHTRQMRSADEGQTVFYTCTNCKFQEKEDS	220727	216050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_217200_219682_219793_219984_220086_220306
628954	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
628958	contig_14528_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_111270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_6	97.4733699593877	481	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	19	1962	201850	190953	FALSE	0	GGTTCTTTGCCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	201868	190721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
628959	contig_18869_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_56213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73743	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
628967	contig_15063_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_13002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	25	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	215	1387	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28184	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
628971	contig_10135_pilon	+	2391	13	Intergenic	novelGene_106640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_7	67.4221258605479	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	934	2172	107797	115842	FALSE	25	CCCAAACTTCTGGTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIILQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGTTYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAILGTQDIVFGEVDR	106863	116061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114015_114473_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
628983	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
629012	contig_7202_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_18217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
629013	contig_9436_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_60892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1068	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTCTTGACCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352123	354293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_352100_354300
629020	contig_15491_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_75977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	581	895	80724	80410	NA	20	AACTTATACTGTTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALSRLQNSLAQTWVPAACHLCVKSLSNLSQASLPAFNSSSLFKCYYSASLGTLLHSVLSTSEPPHPHPPKTTQTREQGELAQLLAEREKNRKRGNMRGQQCT	81304	79482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_79500_81300
629026	contig_10299_pilon	-	2648	23	Intergenic	novelGene_79686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1389	1814	337017	335395	TRUE	5	CGCTTCCGCTTCCGCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKLSGGNLSRKHFPKEAAAWVSCPSSWISRRYSSAFWLSFSYSFWASNSSAPGAIEAILKISSLATGTSCRNSWLLREKMRTPSSSGTRYESSSSTNWMLSGASPTTISRLSQATTMALSLLRGRLHLPSALGGPGCCS	340520	320493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_320611_333954_334044_334251_334343_334429_334565_334643_334786_334909_335028_335129_335248_335370_335432_335739_335832_335938_336030_336183_336263_336731_336800_336958_337114_337425_337539_337702_337838_337922_338032_338121_338219_338301_338410_338730_338809_338904_339075_339156_339253_340017_340133_340249
629031	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
629038	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
629041	contig_12278_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_152602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTCAAATTTCTCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221978	224490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_222000_224500
629042	SIRV6	-	427	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAGGCGCGCGATGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
629085	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_16631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27853	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629089	contig_10904_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_22647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTCAAGTCTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524579	526523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_524600_526500
629101	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
629109	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
629120	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_17317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629129	contig_11720_pilon	-	2259	12	Intergenic	novelGene_43891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	155.852653447982	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	88	1017	124674	118106	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134609	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
629133	contig_11126_pilon	+	2186	15	Intergenic	novelGene_138108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	76.7293480823528	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	491	1846	137800	193136	FALSE	60	AAGACCCATCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQTLKATFQYKPQNTDELNLSPGDYIFVDPTQQKEASEGWVIGISRWTGCRGFLPENYTERANESDTWVKHRTYTFSLAMDLNSRRDGEASSRRNGEFHPPQTSRSLSSVQALQATILRRSVLVVRHGERVDQIFGKSWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRRNGIKDFENDPPLSSCGIFQSRLVGEALLDSGIRITSVFVSPALRCVQTAKHILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEVGKNIPTLMTLEELKEANFNVDANYRPAFPLSSLIPAESYEEYVQRCSASVERITSICSQDLGVTVVISHGSALDSCTRPLLGLPPRESGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENTKEGKWELVDPPVKTLTHGSNSAFNWRNWILGS	118042	193476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121535_133242_133354_133393_133430_137634_137834_143405_143576_145083_145293_158694_158822_162964_163065_167736_167860_169695_169789_187422_187568_187870_187978_189682_189793_192998
629138	SIRV7	+	268	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTGGCACATAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147678	147946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
629139	contig_4924_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_84730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120907	122751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_120900_122800
629152	contig_2069_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_23413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATATGGAGTACGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246804	1246505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1246500_1246800
629156	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629166	SIRV4	+	251	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1481	671	1026	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGCACATGCTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	2732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
629178	contig_13021_pilon	-	1723	10	Intergenic	novelGene_8237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.989365998033	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	170	1216	236115	210494	TRUE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236284	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_205595_205933_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
629179	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
629180	contig_854_pilon	+	1150	7	Intergenic	novelGene_36291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	3	581	543600	562402	TRUE	30	CAATCAGGAAGCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543597	563596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
629181	contig_6954_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_64404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTCAGATGTAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8656	10054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_8700_10100
629186	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_9532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	240	1412	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
629206	SIRV7	+	272	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATTTTTATTATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56096_70881_70988_78843
629212	contig_4131_pilon	-	2745	2	Intergenic	novelGene_127859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	0	570	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1	717	163435	162549	FALSE	15	TATTTTATCTCCTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRCYLSPSLTSSLCRRLLQLPLLPPPPVEKTPVKKKAAKKPAGARRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEVKPKVKKAGAAKAKKPAGAAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPAAAAVAKKVAKSPKKAKAAKHKKAAKSAAKAVKPKAAKPKVAKPKKAAPKKKLVGRLGWWGEED	163435	160520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_162589_162758
629213	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629230	contig_9150_pilon	-	1716	5	Intergenic	novelGene_140900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.63467438331	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	279	1052	47776	46907	FALSE	15	TCATTTGCAGTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRKQGSQTRGQQSAEEDNFKKPTRSNMQRSKMRGAASGKKTAGPQQKNLEPALPGRWGGVALQRTPPSGSVRKTRKNKQKTPGNGVEVKVKIPEELKPWLVEDWDLVTRQKQLFQLPAKKNVDAILEEYANCKRSQGNVDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILMAHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLGYLHDFLKYLAKNSAALFTASDYKVASAEYHRKAL	59167	46242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47421_47516_47801_49153_49253_57679_57770_59102
629236	SIRV4	+	312	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1456	635	1001	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2456	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
629244	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629247	contig_15146_pilon	+	2041	10	Intergenic	novelGene_116973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	121.613940883782	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	65	1774	615265	628824	FALSE	10	TCATGTTGATTTTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTASAVASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSRRSPPIPLAKVDATAETDLAQRFGVSGYPTLKIFRRGKPFDYNGPREKYGIVDYMVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFSTEIAKFLKVAPGTLVVMQPERFQSRFEPKSHVMDIQGSTEASAIRDHVVQHALPLVGHRRVATEAKRYTRRPLVVVYLSVDFSFDYRVATQFWRSKVLEVAKDFPEYTFAIADEDDYASEVKDLGLGESGEDINAAVLDEGGRRFAMEPTEFDADALREFVTAFKKGGRLPHHLLRAQWGQAEPHQVRGCQQGPGTPEPVHRGARHAAGPGQGGALSPGPGGHRTDAT	615200	629091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625893_626792_626950_627221_627456_628636
629279	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
629291	contig_11281_pilon	+	2051	7	Intergenic	novelGene_125427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282.903202919695	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	417	737	231812	237909	FALSE	35	ATGGGCATTTTAAACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGSISGVFVTSSGSTSNGTRLSASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETPVSYVGEDDDDDDDFNENDDED	224872	239223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_224935_227112_227173_228437_228507_230872_231025_231738_231906_233428_233508_237761
629300	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	13	369	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14421	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629306	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
629308	contig_5988_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_16043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGAGCAGAGTGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999976	998353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_998400_1e+06
629312	contig_3986_pilon	-	2749	14	Intergenic	novelGene_52692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.4632812345764	2	113	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	168	1676	60653	35182	FALSE	30	TTGGTACTTTTTCATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFDSRRDAQLEEMQPEPRVLMGLSF	153850	34108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35252_35348_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46115_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
629317	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_94247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
629326	contig_11285_pilon	-	2066	20	Intergenic	novelGene_5668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	372.101689851078	8	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	43	1875	798530	784252	FALSE	5	TCCGCCAGCGTGCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798572	784060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787773_793910_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
629337	SIRV6	+	174	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	545	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10782	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10806_11022_11109_11205
629340	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_89999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629349	contig_16666_pilon	+	1087	4	Intergenic	novelGene_61763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	701	1030	55959	58267	TRUE	35	GCAAACTCGCACCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPQLNSTTLNVLSEILVLTMLLPCHPCSNALWIADNPLRASYSLSDIILQQNIARYATGINCSWGFAIITPVAAIDLKNPVISAFASRIVVCSFGVVTTLPSGQTHP	55258	59608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_56040_56583_56664_58098_58271_59554
629352	contig_9653_pilon	+	2881	1	Intergenic	novelGene_48349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGTTCGTCTGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111797	1114678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1111800_1114700
629355	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629357	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629358	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_97674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629359	contig_16411_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_77370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCACCACGAAGGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309892	309495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_309500_309900
629374	contig_16724_pilon	-	1645	7	Intergenic	novelGene_105305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	710.129487409788	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	201	917	569099	541872	FALSE	30	AAAGCAATGTTTGTGTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWSFSRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575966	541143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575806
629378	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_114039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629383	contig_5791_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_35852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075071	1072887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1072900_1075100
629399	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	942	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
629412	contig_4891_pilon	+	1265	6	Intergenic	novelGene_124542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	549.884933417892	511	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	149	910	701017	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700868	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_755867_756027_756579
629417	SIRV4	+	318	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	923	-75	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGACAGCGAGTCAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2378	2696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2700
629423	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
629428	contig_17470_pilon	-	2014	14	Intergenic	novelGene_110508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	60.155616735697	2	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	253	1527	277215	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302542	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_279666_279726_302355
629444	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629445	contig_9484_pilon	-	1644	4	Intergenic	novelGene_105599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	96.1803860808776	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	8	523	75875	65427	FALSE	55	AAAAGCAAAATCAGAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQQEPGPPQEKGDQPEKGAQVAAWLKKIFGDHRIPQYEVNPRTTEILYHLSERNKARDRDVSLVIEDLKQKASEYESEAKHLQDLLMESVNFSPASLSSTGSRYLNALVDIAVVLETKDTSLTSFIPAVNDLTSDLFHTKSKNEEIKLELTKLENNLTGTLVLEKCLQE	75882	64305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_65566_68276_68413_74863_75039_75809
629447	contig_7357_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_36850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAACCCATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172571	170599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_170600_172600
629452	contig_5643_pilon	-	1536	9	Intergenic	novelGene_39125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	235.388508640503	799	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	310	1179	651279	647313	TRUE	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNLKDLAGRLPAGPRGMGMALKLLLGAGAVAYGVRESVFTVEGGHRAIFFNRIGGVQQDTILAEGLHFRIPWFQYPIIYDIRARPRKISSPTGSKDLQMVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	651588	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344_649530_650490_650571_650870_650956_651152
629470	contig_10800_pilon	-	1727	5	Intergenic	novelGene_152618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_4	57.5695231871865	538	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	107	727	457582	429975	FALSE	10	CTTTTTATGCCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKSGGAGRRRPRRCGTSPSSSGSSVCVLQPQKTSRMAANKNKSQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVQIEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRAKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL	497192	428974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_430095_432709_432888_436425_436635_457468_457632_497135
629495	contig_6101_pilon	+	1915	6	Intergenic	novelGene_114267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	52.3388956704285	5	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	103	681	62190	68799	TRUE	10	TCTTGTTTCCGTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNENVSIFSSASLAVEYVDSLLPENPLQEPFKNAWNYMLNNYTKFQIATWGSLIVHEALYFLFCLPGFLFQFIPFMKKFKIQKDKPESLESQWKCFKVLLFNHFCIQLPLICGTYYFTEYFNIPYDWETMPRWYMLLLRCFGCAVIEDTWHYFLHRLLHHRRIYKYIHKIHHEFQGSCSCVIMSFFFGRG	57103	71673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_57176_62159_62445_66346_66496_67731_67859_68751_68834_70473
629498	contig_16622_pilon	-	2068	16	Intergenic	novelGene_48427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	505	junction_4	867.461727621968	485	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	241	1899	128619	108374	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQASDLNAPSSWAKRSSSPIQQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	132354	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128277_128679_132173
629507	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
629518	contig_6102_pilon	-	1799	10	Intergenic	novelGene_32105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	304.713344345505	5	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	20	1606	822105	816763	FALSE	25	TGCTTAAATATTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	822124	816569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
629519	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
629526	contig_7202_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_18845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCGCTGCTGGTTGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29903	30113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
629536	contig_804_pilon	-	1450	8	Intergenic	novelGene_138788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_3	59.0603288932562	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	114	935	204639	171754	TRUE	20	ACATTCTATCTAGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMALQPGALQLIPKRPALEKTNGATPIFNPSVFHCQQAMANLQLPQPAFIPAGPILCMAPTSSIVPMMHGATPTTVSAATTPATSVPYVATTTGNQIPQLSIDELNSSMFVSQM	204752	169029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_171736_171811_172738_172834_175918_175955_178352_178504_183049_183287_184285_184478_204585
629537	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629542	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_95838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629543	contig_4315_pilon	-	1982	4	Intergenic	novelGene_46847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	1614	1982	580294	575493	FALSE	20	AAGGCCGAGGTGACCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHGTGASFFLIHLCGSFHGFLAGCHRQRPTGYPGLHLLLGLLLHFSAATAMGSQSRSLLGLELFLPLQAVLFNFNLSFFFGLLQPPVLSLAGLGHLLRGTLLRLQQLLDALRLTGHGGRDS	581907	575492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_575590_578761_578862_580085_580148_580184
629550	SIRV4	+	450	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	500	0	-500	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGGTTACAACGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
629556	contig_8576_pilon	+	1909	4	Intergenic	novelGene_88793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	313.786551655739	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	8	610	893619	910149	TRUE	60	AAACGAAAGAAAAAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVMAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRGEYSHEEGQGQRLRRSVIS	893611	913911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910783_913245
629565	contig_11751_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_150288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1290	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	134	1204	114084	113014	NA	40	AAAAAATTGCTTCATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIITLTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMTIPYQPMPATSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQVARQQSHFAMLHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTTHELTIPNNLIGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKGMGCS	114217	112669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_112700_114200
629577	contig_14441_pilon	+	1158	5	Intergenic	novelGene_100352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.738747058205	61	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	651	1157	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	13056	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_13214_30842_31145_113166_113209_116578_116963_117523
629582	contig_16578_pilon	-	3291	1	Intergenic	novelGene_148608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCTGAACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12528	9237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_9200_12500
629586	contig_14322_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_116179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671868	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
629590	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629592	SIRV7	-	349	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
629594	contig_14441_pilon	+	1604	4	Intergenic	novelGene_100591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	403.5693524318	2	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	504	1418	111703	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111199	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117220_117344_117539
629595	contig_4857_pilon	-	1788	2	Intergenic	novelGene_48899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGATAGAATAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475196	1473239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1473741_1473909
629596	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629610	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
629622	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
629637	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_18527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCATTCTTTCAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27937	27656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
629638	contig_2940_pilon	-	2032	11	Intergenic	novelGene_81893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	100.181285677516	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	16	1146	472751	453111	FALSE	25	AGGTTTAATGGCTGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRVIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPRTPVPAQRERAPGSGTQEKNKIRSRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSILWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	472766	452224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236_454356_455835_455883_459146_459232_466868_466987_467360_467489_467597_467626_470951_471106_472710
629639	contig_8122_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_40269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751813	749711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_749700_751800
629649	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
629650	contig_10331_pilon	-	605	5	Intergenic	novelGene_54115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	26.5929971985107	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTATTCAGTAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371643	350467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_350528_355498_355627_364604_364909_365333_365391_371587
629653	SIRV7	-	258	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69028	0	35809	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78929	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
629694	contig_14209_pilon	+	1827	12	Intergenic	novelGene_88352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	232.14120097493	3	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	345	737	35610	37768	TRUE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGCGPRLAPGPSPVQRAADALLTGSPATPGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	35116	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38557_38783_40142_40172_40266_40344_40418_40857_40901
629695	contig_6446_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_149224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407596	408672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_407600_408700
629696	contig_6137_pilon	+	1602	4	Intergenic	novelGene_59283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	627.898257858885	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAATGAGATTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347662	1354909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1347749_1348119_1348281_1353512_1354774_1354815
629697	contig_12227_pilon	+	1670	15	Intergenic	novelGene_127394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	93.4424410849715	919	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	345	1292	117403	142650	FALSE	10	TTTCTTCATAGTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEKSEYIFPKDLDKSKLKPGTRVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNPELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIREMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSDGFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV	114788	143028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_114884_115858_115939_116032_116073_116307_116361_117326_117439_118433_118502_118963_119079_123311_123400_124702_124765_124848_124973_125339_125402_127297_127419_127993_128075_132517_132590_142531
629701	contig_18184_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_123865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTTGAAGTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96518	95262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_95300_96500
629704	SIRV5	+	305	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	22	878	22	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8337	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
629722	contig_15538_pilon	-	2369	2	Intergenic	novelGene_152635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAATTTTGGTGTGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59297	55260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_-_57567_59234
629735	contig_501_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_134881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCATGTGTAAATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11199	13351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_11200_13400
629745	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_17741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629748	contig_5280_pilon	+	2097	9	Intergenic	novelGene_52599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	628.045131738158	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	67	1071	38385	78098	FALSE	65	AAATAGAAATAAATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWKSPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38318	79124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47484_56218_56333_62043_62065_78042
629749	contig_8538_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_5091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842871	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
629753	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657490	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657492	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
629754	contig_1861_pilon	-	1912	15	Intergenic	novelGene_77654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_12	90.5090197331803	1	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	139	1758	112534	87440	FALSE	25	CCCAAAAGGCTGGAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115215	87285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_106881_106923_112515_112582_115124
629756	contig_12050_pilon	-	2098	3	Intergenic	novelGene_62738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	97	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTGTGGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694137	685536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_687460_693021_693120_694060
629762	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
629765	contig_4315_pilon	-	1916	7	Intergenic	novelGene_46787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	214.565193408023	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	36	839	343489	328146	FALSE	10	ACATCCTGTGTCTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGTMCPQDLPQPKQLLSGPPKPPPSQLRRTGTPSS	343524	327068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485
629770	contig_5033_pilon	-	1554	10	Intergenic	novelGene_29046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3290.13405483203	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	179	991	540619	532125	TRUE	15	TTCTGTCCACCAGACCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	542228	530997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531078_531641_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092
629805	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
629832	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-6	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114744	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56095_70883_70981_78841_78964_114680
629834	SIRV4	+	184	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	23	1109	23	-1109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACCGTAACGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
629839	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
629840	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
629855	contig_5057_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_151507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTTAGGTATATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371423	370717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_370700_371400
629865	contig_7202_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_18634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCTGAAGAATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
629867	contig_15134_pilon	-	2314	17	Intergenic	novelGene_140216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_16	94.1585887943846	537	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	104	2101	216759	184453	FALSE	35	TTATATGTAAGAATTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKIVHVLFNHIDKSGLKDKSVEELKKRYGG	221854	184239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216789_221780
629888	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
629889	contig_14322_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_116358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671619	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
629892	contig_5797_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_56961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGGGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403131	400816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_400800_403100
629893	contig_9363_pilon	+	1425	11	Intergenic	novelGene_6822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	265.272312916369	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	515	1087	1623705	1625624	FALSE	10	CCCTGGGGCCACGCGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622249	1625962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623066_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
629905	contig_11375_pilon	+	1040	7	Intergenic	novelGene_152659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_5	189.083461877435	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	316	1038	180735	182541	FALSE	30	CAGACCTACCATACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFTCGPNEAMVVSGFCRSPPVMVAGGRVFVLPCIQQIQRISLNTLTLNVKSEKVYTRHGVPISVTGIAQVKIQGQNKEMLAAACQMFLGKTEAEIAHIALETLEGHQRAIMAHMTVEEIYKDRQKFSEQVFKVASSDLVNMGISVVSYTLKDIHDEQDYLHSLGKARTAQVQKDARIGEAEAKRDAGIREAKAKQEKVSAQYLSEIEMAKAQRDYELKKAAYDIEVNTRRAQADLAYQLQ	180419	182543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_180778_181047_181124_181211_181303_181578_181723_181877_181998_182083_182180_182388
629908	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
629921	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
629937	contig_2069_pilon	-	1051	3	Intergenic	novelGene_23483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	157	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509870	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509407_1509733
629951	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
629953	contig_15304_pilon	-	907	3	Intergenic	novelGene_30527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	44	868	54100	52925	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54143	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
629956	contig_6589_pilon	+	1303	9	Intergenic	novelGene_26049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	994.801456321813	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	34	759	1725483	1729133	TRUE	35	AATAGCTTTATATTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLVGGSSPSSGSSEEKMWPSAPKRSQPWKSYGAALLCTRAVAMSQNPLEAGAEGARNGAGDDPELPRQPGGDGGRGELGLRAVPAALLRLEFSAGLAPGPQPERQRVGGVPRALLLLQLVVDQRLRNLR	1725449	1731819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1727822_1727965_1728198_1728304_1728996_1729206_1730092_1730152_1731406
629967	SIRV7	-	299	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33191	14865	-28	-14859	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTATCTAATGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114766	70896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680
629972	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
629980	contig_8617_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_73460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTATCAATCCCTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62314	62079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62300
629984	contig_11850_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_125217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	549	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1218	1586	284312	286326	FALSE	40	TAAAATGGCGGCGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSIFSISPKAPKYSLICSSEVSGLNPPTKTFLGGSFPFKALALLGSINLPSSLCSFSSKTLSTLAASLKSTNPNPLDRPVTGSVLIVQSTTSPNRDKYSVRSFLLVSQLKPPINILPSSC	281434	286483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_281692_282856_282949_283291_284051_284202_284335_285098_285259_285359_285531_286311
629996	contig_6102_pilon	-	1678	2	Intergenic	novelGene_32369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_1	0	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCGTATTCTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1719040	1714864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1716444_1718941
629997	contig_15304_pilon	-	984	3	Intergenic	novelGene_30574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	786	198	983	54100	52964	FALSE	10	CTGTGGTTATGGCCGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNV	54297	52962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
630031	contig_1516_pilon	+	1870	14	Intergenic	novelGene_49938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_12	87.5314313791905	304	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	100	1689	208425	238082	FALSE	40	TCTATAATGAACATGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSTLWFPLLLAAATAGPVTALWPWPQYIQTSDQRYALWPKNFDFQYHAGSAAQPGCSVLDQAFQRYRHLFFHTVSDSLTGRTEKQYKAEKNTLTVFVATPGCHQLPSLESVENYTLTINDEQCFLLSETVWGALRGLETFSQLIWRSADGTFFINKTDIVDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSRILDTLDVMAYNKFNVFHWHLVDDPSFPYDSVTFPKLARKGSYNPATHIYTVQDVKEVIEYARLRGIRVVPEFDTPGHTLSWGAGVPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPILNSTYEFMSTFFLEISSVFPDFYLHLGGDEVDFSCWKSNPDVQAFMKKKGFGDDFKQLESFYIQMLLNIVSAYGKGYMVWQEVFDNKVKVQPDTIIQVWREEAPVTYLKELELITQAGFRALLSAPWYLNRITYGPDWKEVYMVEPLAFDGSPEQKALVIGGEACMWGEYVDSTNLVPRLWPRAGAVAERLWSNSRVTDLEFAFTRLTNFRCELLRRGVQAQPLSVGYCEQEFEET	208325	238263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_208678_226522_226616_227739_227806_230161_230209_230728_230840_231704_231807_232280_232414_233368_233550_234537_234625_234901_234975_235702_235887_236105_236197_236844_236950_238018
630039	contig_6710_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_89140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653669	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
630040	SIRV5	-	296	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACAGATTTCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10964	8321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
630043	contig_3394_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_152668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGAAAGCTGGAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374682	373849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_373800_374700
630050	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_96488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
630060	contig_14341_pilon	+	2500	8	Intergenic	novelGene_111767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_7	36.1702324333935	607	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	93	2102	299952	328668	FALSE	20	TATTTCTGTGGCAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSEERIVSGLPKAWSGEPVTFEDVTLGFTPEEWELLDPMQKTLYREVMLENYRNLVSVEHQLSKPDVVSQLEEAEELWLKEREIPQDTFPECPVAQLDPQEDPFPDGKRGSRPLRKMEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGWETTVESKELTPTPDASEQEPTHSLKVDESSKGGPMSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	299404	329066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_299457_299911_300006_300969_301097_301864_301961_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327742
630081	contig_9345_pilon	-	1504	5	Intergenic	novelGene_24406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	62	709	144517	142100	TRUE	5	TACCTCGGTGTTCTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144578	141224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141277_141356_142414_142567_142781_142955_143072_144512
630102	contig_5711_pilon	+	2738	11	Intergenic	novelGene_80294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	621	junction_8	460.814941164021	15	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	976	2406	230969	249320	FALSE	5	TTTTCTGTCTGTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWSLTKEKVEELIKQRDAKGRELCDVKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVEAQEREDILAGMSGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRVVPEITAMKADASKKLLKKKKGDLDTTIVKVEFDEEFSGTVEGTGEEALTPSAPINKGPKPKREKKEPGTRVRRTPASSGKSNTKKVKKRNPWSDDESKSESDLEETEAVVIPRDSLLRRAAAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDNNDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKPKATPEKPSHDKKSQDFGNLFSFPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKPTDKVPSKTVAAKKGKPSSDITPKPKRTPKQKKVEAVNSDSDSEFGVPKKTAASKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKTSKTTTSKKPKKSSFDQDSDVDIFPSDFASEPPSLPRTGRARKEVKYFAESDEEEDVDFAMFN	229993	249652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_231032_231179_231264_232672_232868_235431_235574_235807_235970_237916_238122_240295_240376_241604_241716_246411_246535_248135_248234_249152
630109	contig_10986_pilon	-	1349	12	Intergenic	novelGene_71468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	173.290803216267	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	7	1131	80340	67011	FALSE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTREDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80346	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74286_75006_75049_75476_75544_76171_76245_80189
630119	contig_3469_pilon	+	2837	20	Intergenic	novelGene_34172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	169.819686025422	1	126	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1205	2479	461740	479914	FALSE	10	ATCAGCCTCTGCCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDVSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	427962	480272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464_443604_445576_445664_447286_447382_456227_456351_456836_456956_459872_459930_461491_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864_478980_479534_479681_479768
630137	contig_15063_pilon	+	1572	5	Intergenic	novelGene_8480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3943.49523741313	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	255	1430	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26341	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
630140	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
630141	contig_18859_pilon	-	2420	8	Intergenic	novelGene_150542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_5	20.1403240555167	271	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	110	1570	168580	97303	FALSE	20	TTGGGACTAATTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPRATTDTTPAAGAAGEEGEHVKPFTPEKAKEIIMSLQQPAIFCNMVFDWPARHWNAKHLSEVLHGKQIRFRMGMKNTNTVPQFETTCSYVEATLEEFLNWNCDQSRGSGPFRNYDHSQFWAYADYKYFVSLFENKTDVFRDVIWSDFGFPGRNGRESTLWIGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQVQGRKRWHLFPPEDTPFLYPTRIPYEESSVFSKISVVNPDLKCFPQFRKAQRHTVTLNPGQVLFVPRHWWHYVESIDPITVSINSWIELEEDHQARVEEAITRMLVCALKTAEDPDNTKAWLNPTEIEETSHEINCRYLNEAVSALFDHYRTSKKVDIEALGTNGEHTKTEGLNVHNHMEVEQPHSQNLTTGTVKQEAASPFGPDLVPVMPSSEEPSTERGRIFESDGNSLDGEHFGKSHCTKRQRMMYKSKNAIVEQIASNSTVAPSQTFISTDDLLDCLVNPQVTRIVAQLLIQGRTL	168689	96452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_97828_97942_98054_111646_111731_114358_114531_118430_118568_131869_132052_148363_148550_168516
630145	SIRV7	-	292	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91623	11	-91617	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAGTAGAGTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
630152	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
630175	contig_20719_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_140578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAGTAAACTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91806	89437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_89400_91800
630187	contig_15859_pilon	+	1956	9	Intergenic	novelGene_50207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	68.6658576004116	471	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	61	1275	357922	375993	FALSE	15	TCTGAGGTGCACGGGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATILGGLAAAGDLCVAGKGIMDKSKENCISGPVKTILPLGDGPKRVLVTQPFPSQNPLSASGGQAQRVLCPSNSSQSGPSQAQKLVSSRKPVQSQKQKPLQITTVPRPVSRPPNNTPKSEQAQPPASGDNSGEELASKQKKEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQVRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELADALSYCHSKKVIHRDIKPENLLLGSTGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEASTYQETYNRISRVEFVFPDSVTAGARDLISRLLKHNPSQRLTLKEVLEHPWITANSAKPPSSQNKDPASKQP	353150	376674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_353206_357916_357964_361884_362165_364777_364833_365927_366120_367454_367594_372607_372757_375496_375672_375810
630190	contig_5020_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_27808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	887.656355554082	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	365	1075	122915	125970	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDPFPPPYSHPSSLPYLPLFSQSWWY	118460	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_125893
630197	contig_7457_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_31501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660286	659051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_659100_660300
630204	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630218	contig_5961_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_144186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGACAAAAGAAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337272	336228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_336200_337300
630220	contig_17108_pilon	-	2552	1	Intergenic	novelGene_109513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAAGAAAAAAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42461	39909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_39900_42500
630224	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
630227	contig_6980_pilon	+	1435	9	Intergenic	novelGene_36045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	836.533770985966	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	69	368	356720	364925	TRUE	50	TAAGCATCTAGAATAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGVSVGSTAFQYELYGGSCNW	346114	373402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362446_364869_365032_368206_368333_370564_370641_371430_371523_372735
630239	contig_18869_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_56345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAACTAAAATTTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73744	73359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
630249	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
630252	contig_18544_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_152750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTACCTCCACTCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46956	47605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_47000_47600
630253	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630254	contig_1143_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_86627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270795	1272956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1270800_1273000
630258	contig_3602_pilon	-	1513	10	Intergenic	novelGene_60646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	292.469857051886	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	73	858	1139393	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVRSSLKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139465	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108751_1111694_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
630259	SIRV4	-	299	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCATCGTATGTTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
630280	contig_14322_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_116407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671591	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
630297	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630298	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630306	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
630320	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
630327	contig_6842_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_130685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAAAGAAATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364305	365226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_364300_365200
630338	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630341	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
630347	contig_12120_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_21445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAACAAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264987	266499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_265000_266500
630348	contig_7357_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_36921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGAGTATGAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565821	565311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_565300_565800
630360	contig_8138_pilon	+	2641	5	Intergenic	novelGene_52414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	382.380373450312	9	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	220	630	280295	305213	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGERPGLWGSWPCFCLGLQSQSQLWSMRTEAALALLLGA	280075	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_306922_307635
630361	contig_11429_pilon	+	1106	8	Intergenic	novelGene_60455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	954.008449883427	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	81	551	46162	48504	TRUE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45411	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899_49117_49181
630364	SIRV7	-	279	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91632	15	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
630369	contig_7753_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_41484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGGAAGAAAACGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019318	1018659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1018700_1019300
630370	contig_7753_pilon	-	3154	1	Intergenic	novelGene_41483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAATAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017909	1014755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1014800_1017900
630371	contig_11422_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_99079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1500
630372	contig_14322_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_116227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
630397	contig_18869_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_56166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCTTCCCAGACACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
630403	contig_17470_pilon	-	1575	11	Intergenic	novelGene_110531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	64.6702404510761	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	224	1108	273908	270076	FALSE	50	AAAGTTTCAAACTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302667	269608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_277158_277222_302546
630404	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
630429	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	158	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630430	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
630451	contig_5696_pilon	+	2046	16	Intergenic	novelGene_117536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	45.4793726136733	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	35	1636	635115	657250	FALSE	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSEKNTRICYLETHITALGKSAAKDLFKMLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSVAASACESWTINKEDRRRIDAFALWCWQRVLNIPWTTRRINKSLLEEVQPEFSLEMRMARICLTYSGHVIRRDQSLEKDIMLGKCMMSGIKV	635080	657660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638565_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840_652953_656828
630452	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630457	contig_21162_pilon	-	2028	3	Intergenic	novelGene_152766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14	59	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	610	1095	29768	25339	FALSE	60	GCAAATCTAATAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTRRFSGVRGVKVEQSPSALSLQEGTNSTLRCNYSTTTNNVQWFRQTPGGGLISLFFIASGTKQNGRLKSTINSKELYSTLHIATSQLEDSATYLCAVETQCSQVTHSLHPNCSCSPTPYFRQAHCAHSSICTTLKFISSCCSTFIPAKITPFRVFISL	30513	24405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21162_pilon_-_25800_29743_30277_30412
630474	contig_6270_pilon	+	1415	8	Intergenic	novelGene_99804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	398.950664434916	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	72	1004	27433	45668	TRUE	25	ATTACAATTGCTGGGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27361	47669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_47302
630479	contig_18096_pilon	-	2020	13	Intergenic	novelGene_58037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	891	1208	69547	62869	TRUE	50	GAGGAAATGAAAACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAKEVFLRGRRQCEGMPLQLGHLGALDKNVLSHLHLESLLLHLQLKGFERVSDHLCDDHFLLRSPKPDQPLTEIQEHGTHYPFPSLRRVPSKFWNWAFFYFPPV	78891	40320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_40427_42488_42576_44135_44256_53716_53800_57199_57353_59463_59657_62798_62927_66640_66734_69380_69637_70499_70686_71994_72125_75371_75465_78499
630496	contig_14711_pilon	+	2732	8	Intergenic	novelGene_68876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	109.521966858205	204	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	300	1643	58444	67289	FALSE	35	TGATGGAAACTCATAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDCMETFAPGPRRLYGAAGPGAGLLRRATGSSCFAGLEPFAWPQPASLQSVETQSTSSEEMVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSCEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKKKKEVKEEGSPDSYELSPQLEELINKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLWDKFSELATKCIIKIVEFAKRVPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKVDKLQEPLLEALRLYTRRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGPMPPLIQEMLENPEMFEDDSSQPGPHPKASSEDEVPGGQGKGGQSPQPDQGP	58144	68378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_58595_63273_63423_63802_63945_64602_64764_64976_65154_65703_65909_66294_66454_67089
630510	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
630516	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630530	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1434	632	979	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2434	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
630537	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630538	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630556	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630567	contig_7963_pilon	+	2429	3	Intergenic	novelGene_58573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	85.5	13	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1838	2194	256515	257509	FALSE	20	TAAATGAGTCTGTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254677	257744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_256578_256972_257178_257420
630572	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
630580	contig_3386_pilon	-	2855	4	Intergenic	novelGene_34489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.0831174424198	51	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	94	588	336673	334239	TRUE	20	GACTTTACTTGTGGTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPSGDIPQIPCSSKVCRRLFGPVDEEQLRRDCDALMADCLQEARARWNFDFVTETPLEGNYAWEPVQGLGLPKFYLPPGPRGAWDDLGGGKRPCTSTVLLQGMAQGDHVDLSLSCTLVPHSPERPEVSPGGPGAPRGRKRGQTSMTDFYHSKRRLVFSKRKP	341907	331893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_332914_332991_334289_336228_336685_341825
630589	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
630592	contig_10235_pilon	-	2169	3	Intergenic	novelGene_46528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_2	24.5	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1275	1652	328688	328214	FALSE	40	AGAACGAACATTTGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	330145	327696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328943
630601	contig_7179_pilon	-	2127	10	Intergenic	novelGene_78166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	136.599170324469	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	954	1364	1060393	1058069	FALSE	10	TCTGGAGCCCCCTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEEFGQES	1071715	1057305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058171_1058816_1058958_1060225_1060446_1061212_1061362_1061952_1062110_1062591_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
630605	contig_10629_pilon	+	2061	10	Intergenic	novelGene_52896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAAGGAAAAGAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245853	255141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_247140_247320_247402_248128_248175_248335_248410_252333_252438_253094_253216_253749_253893_254169_254230_254591_254685_255088
630615	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_96800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630621	contig_6837_pilon	-	2508	1	Intergenic	novelGene_149800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11191	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_8700_11200
630622	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_93961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630640	contig_11677_pilon	+	2376	8	Intergenic	novelGene_85883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_7	108.916369339985	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	112	1107	264954	281836	FALSE	0	TTTTCCTCCTGGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEIEDLHLQIGDITKAKTALEEQLSRLQREKNEIQNRLEEDQEDMNELMKKHKAAVAQASRDLAQMNDLQAQLEEANKEKQELQEKLQALQSQVEFLEQSMVDKSLVSRQEAKIRELETRLEFERTQVKRLESLASRLKENMEKLTEERDQRIAAENREKEQNKRLQRQLRDTKEEMGELARKEAEASRKKHELEMDLGSLEAANQSLQADLKLAFKRIGDLQAAIEDEMESDENEDFINSEGDSDVDSELEDRVDGVKSWLSKNKGPSKAASDDGSLKSSSPTSYWKPLAPDRSDDEHDPLNSTSRPQYSHNYLSDSDTEARLTETNA	264842	283105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_265017_266362_266480_266664_266749_267199_267338_269937_270124_270507_270648_274603_274727_281691
630642	contig_6589_pilon	+	1096	6	Intergenic	novelGene_25760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_5	2097.97511901357	490	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	390	791	669670	671366	TRUE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTTQGPLEMSPGATCLPEELMGVVVFSD	668287	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_671046_671188_671286_671412_672584
630652	contig_4797_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_6922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATTAAAACAGTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433401	435191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_433400_435200
630654	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630656	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
630657	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630658	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630661	contig_3942_pilon	-	2655	10	Intergenic	novelGene_128614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	91.250300185537	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	356	886	154887	152775	TRUE	30	AAAAGACGGTTTGTTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFGLRKDLASAILDLPVLEHLFAQHRSDLVSGHLSLGLSLKEQGECLSLAVLDLTRIAQEQAQRPEKLLKKVSYKACLPPGLRDLIQGLSFVTRRRIRRTVLLALRRVAACQADRQSLMAKYIMDLERLNPAGTTETFRVGLPGASGGQGQDPQGLLRVAGDSGIAWSPRDHETLQPFCDFPEIVDISIKQAPRVGPAGEHRLVTVTRTDNQILEAEFPGLPEALSFVALVDGYFRLTTDSRHFFCKEVAPPRLLEEAAEQCHGPITLDFAIDKLKMGGLTLWLLPSPPQPPGL	156040	142019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_143346_144266_144378_144598_144717_145140_145314_152733_152860_153333_153492_153591_153715_154722_155024_155375_155522_155967
630668	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
630675	SIRV7	-	338	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	8	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114730	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
630677	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630692	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
630702	contig_4678_pilon	-	2054	17	Intergenic	novelGene_126058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	61.0572221362879	2	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	987	1811	573864	571931	FALSE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	578127	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573908_574800_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
630705	contig_5684_pilon	-	625	2	Intergenic	novelGene_81014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6312	junction_1	0	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGTGAACTCGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361498	351253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361315
630709	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630717	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	29	355	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14437	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
630718	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
630720	contig_3825_pilon	+	1153	7	Intergenic	novelGene_77924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1356	junction_1	833.348416530165	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	20	370	12232	13848	TRUE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVSKQAF	12212	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
630724	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630730	contig_5236_pilon	+	1826	4	Intergenic	novelGene_100909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.6006992921502	271	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	482	1432	448615	452090	FALSE	20	TGAGCTTGACCTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERRKPYCVEEAMEELVGPDGQKWASMDPEERMLAAATAFTQICAGQGEGDVRREAPSTRYDPYSKASVTAGKRPVALPLQVQYPHLDCNVTSETVSEASQRLQKPVMKRKVLRRKPGGEVLVTDESIISESESGTEREMDLWDLRQRLMNMQFQEDRESPVEISQKFNLPHEYQTLTQEDQLVYYLQREGMGPPADEQDLIVASRPKSFILPRLDQLSRNRGKIDRVARYFEYKRDWDSMRLPGEDHRKELRWGVREQMLCRAEPQPKPQHVYVPNNYLVPTEKKRSALRWGVRCDLANGVMPRKQLPFPLSPS	436126	452484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_436191_446976_447290_448510_448629_451153
630733	contig_11846_pilon	+	2322	10	Intergenic	novelGene_105918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	200.060237842086	382	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	40	1350	148670	190948	FALSE	10	GGCTGGCTTCAGTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRTREELVSQGIMPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVVDSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLPSATSLSPTQVVSQLPTGPDSRETLFLAEQPPPPPPPLLAPSLTNGTAVPTAKSTPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDKGPPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQHYNYQTILPAPPKPAVETLGSNGAPPVRSLSTTSSSSSSGAPGPSGLVRQNSISQPGKPGALPANLDEMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTDLIERLRAYQDQISPAQGAPKAPAAASILPKAGEVVVAFPAARAEPGPPQHYGPQPLLHGLPRRP	148630	191920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_148677_173729_173786_176059_176136_177094_177257_180800_180977_181533_181684_184017_184272_184606_184779_185811_185996_190874
630735	contig_17198_pilon	+	3837	3	Intergenic	novelGene_62352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_2	47	22	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	58	438	708294	720693	FALSE	25	AAGCGAGGATGTCTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSFRAQDGTRTPAVWLCLMCLQGLGKSLTQGGYDMVQKLFLDFFRRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEQQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEELRERKILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKVNLAGGGEREGA	708236	724092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_708433_715278_715341_720513
630743	contig_414_pilon	-	2288	2	Intergenic	novelGene_115112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTTATTCTACAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384209	374880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_376898_383938
630746	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_17501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630758	contig_5569_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_86744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAATGTTGTTCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468481	466257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_466300_468500
630759	contig_13542_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_131528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	44	319	501822	501547	NA	30	TCTCCATCTGCAAATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQREPLLYFKIIEEMSPNLSQGQIPKLGGFLPLLCPPEDWSTQWKPRAEQKPHTHTAVQACRMLQTLNQLIKFPQQPCLLEWTGGAERSDSSKATQARVIAWMRS	501865	499878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_499900_501900
630762	contig_4519_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_123740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCATAAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796840	796111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_796100_796800
630765	contig_11269_pilon	-	2009	9	Intergenic	novelGene_145806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	207.612017956572	387	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	122	1015	299711	256778	FALSE	20	TGACTCATTGTCATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELDALLEELENSTLQDSDEYSNPASLPLDQHSRKETNLTETSKVLSVQDDTTPLQAQLVYTTNIQEPNTCSKLQEPKKSPLPKTSAAAQLDELMAHLCEIQAKVAVKTDVGKKHLPDKQDHNASLDSMLGDLEQDLQDLGIATVPKGHCASCQKPIAGKMIHALGQAWHPEHFVCTHCKGELGSSPFFERGGLAYCPKDYHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMDQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDFLAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDAVWHPECFVCGV	299832	255783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_256780_257113_257267_271445_271528_271645_271820_272865_273034_276695_276793_286864_286912_294698_294857_299698
630784	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
630788	contig_11978_pilon	+	1079	5	Intergenic	novelGene_63060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2887.59106999243	4119	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	29	388	1827946	1830788	TRUE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHM	1827917	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1831273_1831759
630794	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_96907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
630795	contig_7202_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_18104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCCAGACGCCGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
630797	contig_13428_pilon	+	2102	2	Intergenic	novelGene_143455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1088	1708	151943	152563	TRUE	5	CCCCCCAGCCCCCTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFCPVNHQLPALTGSTAQLFWQLLGKLHVKLGQQQSRHEPEACRLVAHPGEPLQVCKHLQGHLQEQRGSGAGGEMTQPEMRGEDLGLGKCTGEAPWQCASGKTMAIKTNISPLWPSSMRRVLGDFPGVSSVSPGTKSRILIRRSSTAYSAQGSLQSAGVRRRVRPSFASCVQGVHSPVEETERHSPYIVLNAMMEVSNGTLGAQ	150855	153266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_152685_152993
630830	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
630833	contig_15442_pilon	+	2426	17	Intergenic	novelGene_119143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	94.26293014754	336	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	109	1977	243902	288512	FALSE	20	TGTAGTTGAGATTTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPGVGSQCRNHSHGPHLPGFGRHGICADENKELAKAKDALPLIEDSSNCDIVKATQYGIFERCKELVEAGYDVRQPDKENVSLLHWAAINNRLDLVKFYISKGAVVDQLGGDLNSTPLHWAIRQGHLPMVILLLQHGADPTLIDGEGFSSIHLAVLFQHMPIIAYLISKGQSVNMADLNGQTPLMLSAHKVLGPEPTGFLLKFNPSLSVVDKIHQNTPLHWAVAAGNVNAVDKLLEAGSSLDIQNVKGETPLDMALQNKNQLIIHMLKTEAKMRANKKFRLWRWLQKCELLLLLMLSMITMWTVGYILDFNSDSWLLKGTLLVILFFLTSLFPRLLIGYKSLIYLPTVFLLSSVFWIFMTWFVLFFPHLAGTPFYFTFILSVVAFLYFFYKTWATDPGYMKSSEEERNTNIITLAETGCLDFRAFCTSCLIRKPLRSFHCHVCNSCVARYDQHCLWTGRCIGFGNHHYYIFFLVFLSLVCDWIIYESFAYWSNHCTTTFRQDGLWTYFNQIVACSPWVLYIFMLAVFHFSWSTFLLLNQLFQIAFLGLTSHERSSLLKQNKRMKQTLSLRKTPYNLGFTQNLADFFQCGCFGLVKPCVVDWTSQYTMVFHPAKEKVLRSV	243793	288961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_243929_253373_253520_257494_257618_258867_258946_260670_260816_262452_262518_263193_263357_263597_263724_266844_266979_269355_269456_274649_274776_275631_275695_276550_276645_278459_278544_282672_282831_285869_285968_288373
630836	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_91284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657161	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657163	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630846	contig_5643_pilon	+	2008	7	Intergenic	novelGene_38754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	154.223232865725	616	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	142	1479	157978	163341	FALSE	25	TCTCAGTTGCTCTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEAWCLLLCLALSRAAEAKPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157836	163870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297
630847	contig_18869_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_56075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
630848	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
630849	contig_9653_pilon	-	220	3	Intergenic	novelGene_48319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_1	517.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAAAGTGTTCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018199	1016720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1016779_1017925_1018025_1018136
630861	contig_14209_pilon	+	1620	10	Intergenic	novelGene_88332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	230.62721777849	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	867	1232	40185	40625	FALSE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32325	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40182_40344_40418
630875	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630876	contig_17603_pilon	+	696	2	Intergenic	novelGene_152791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1477	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAGTTTCGATTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60413	61890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_60788_61568
630885	contig_15063_pilon	+	982	3	Intergenic	novelGene_14412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	19	840	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35252	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
630888	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTTCATTTGTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
630889	contig_18272_pilon	+	2711	8	Intergenic	novelGene_6983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGACAGTTAACCGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120742	262860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_121973_122068_122654_128531_128606_157876_157921_168451_168664_172637_172800_184346_184550_262659
630892	contig_7078_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_130122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAACCTCATGAATGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51434	52220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_51400_52200
630900	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
630906	contig_6710_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_96338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
630908	contig_10482_pilon	+	1873	1	Intergenic	novelGene_152819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAAGCCTTTACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98953	100826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_99000_100800
630915	contig_13571_pilon	+	2179	10	Intergenic	novelGene_128110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	169.512882353969	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	35	643	88439	108790	TRUE	20	CAAAGTGTATGTTTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVDEVKALASLMTYKCAVVDVPFGGAKAGVKINPKNYTDNELEKITRRFTMELAKKGFIGPGIDVPAPDMSTGEREMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGRISATGRGLFHGIENFINEASYMSVLGMTPGFGDKTFVVQGFGNVGLHSMRYLHRFGAKCVGVAESEGSIWNPDGIDPKELEDFKLMKGTLTTTCSCLFKRA	88404	117615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_88464_92165_92222_93420_93485_98158_98254_102369_102550_103316_103455_107930_107961_108769_108862_115192_115256_116213
630918	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_94789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
630921	SIRV7	-	286	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69000	0	35781	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78957	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
630931	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
630938	contig_12270_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_113662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	4	336	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14412	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
630940	contig_19459_pilon	-	1166	9	Intergenic	novelGene_59838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7109.10526960848	5	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	126	830	16218	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSHPLRLQFTEPVWPCLAAVSHLELKRKPSRRSWQVLTGDMMAKTVPSNGASCTPLPMEITSVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19067	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15593_15651_15702_16203_16265_18988
630941	contig_6048_pilon	+	2189	19	Intergenic	novelGene_73111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	338.490275586562	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	174	1787	909094	1358999	FALSE	15	CTGGATGCCCCAAGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDASKPLEVLLLEKNRSLQSENATLRISNSDLSGRCAELQVQVTEAAATVAEQRELIAHLEQDLSTIQTIQRPDAEGAAEHSLEKIPEPIKEATALFYGPSAPASGSLADDQVGSLLSIISSQRERFRTRNQELEAESRLAQHTIHALQGEL	908920	1359401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258621_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1350868_1350997_1351717_1351785_1352522_1352636_1355001_1355046_1358992
630946	contig_15304_pilon	-	1027	3	Intergenic	novelGene_30540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	167	991	54100	52925	FALSE	25	ACCAGAAGCAGCCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54266	52888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
630976	contig_7202_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_18768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29868	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
630977	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
630982	contig_6364_pilon	+	2378	7	Intergenic	novelGene_51849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	245.841016829079	389	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	66	1235	1772471	1785208	TRUE	0	TTCTTGGCCCTTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLAKDMKNKLGIFRRRNESPGGPASGQGRQSDEVIQAHLRGSPQVG	1769974	1787719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1770040_1772470_1773440_1781110_1781176_1784680_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772
630992	contig_3382_pilon	-	1874	12	Intergenic	novelGene_124032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	305.850663068063	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	337	1050	272914	224870	TRUE	10	GTTGCATTTGGCGTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344851	176653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_344614
631031	contig_18272_pilon	+	1780	4	Intergenic	novelGene_7082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2606.88132108507	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	158	547	535645	538332	TRUE	5	TGATGTGGGTTTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSWTGNGFSPGVETGKGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	535487	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_535700_537077_537197_538116_539041_541315
631034	contig_5039_pilon	+	2987	3	Intergenic	novelGene_65015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	4.5	75	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	431	1567	1737643	1738779	FALSE	50	AAATAAAACTGCATCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQILRSHLIDASVIPNGMKILSYLGVIRNRMMSTHKSKKKISEYYRLLNLDEECSADDVRESFRKLAKQYHPDSGSNTADSATFIRIEEAYRNVLSRVIEKTNARQNKAEDMEEEDKFKYKTPQHRHYLSFEGIGLGTPSQREKQYRQFRADRATEQVMEYQRHKLYSQQFPDSVIVKDVRESKKQKITQAIERLVEDLIQESMAKGDFDNLSGKGKPLKKFSGCSYIDPMTHNLNRILIDNGYQPEWILMQKEIKDTIEQLREAVLVSRRKLGNPMTPTEQKQWDQACEQFQENIRKLNKLIDDFNLIVPLLTRQKVHFDAQKEIVRAQKIYETLTDTKEVAHKDPNVIDQGEGEKAPDFKTGFFKWMKLWRFIKI	1735499	1740199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1735575_1735815_1736119_1737590
631035	contig_9753_pilon	+	1576	5	Intergenic	novelGene_41319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	995	1309	70107	73280	TRUE	15	ATTAGGAGCGTCCGGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQHYTNTSTDGKHSASQSRFRFITPGLQRCMDVALGGLLQKCSAAPNTLLVHSLKVGVIPIIRIFNNKLFLGIIASKQFNSSFAVFNLITFSIQISQIAFIHT	69112	93367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_+_70289_70451_70561_73256_73312_85976_86101_93255
631036	contig_10003_pilon	+	2511	2	Intergenic	novelGene_88189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454297	459136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_455906_458233
631041	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631050	contig_7202_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_18732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29849	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
631060	contig_10626_pilon	-	1636	10	Intergenic	novelGene_138187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	106.223035794188	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	503	1219	84235	10495	FALSE	5	GCCTTGGTGTGTTTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKWLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSALPKIIKAGFAALQLEYFFTAGPDEVRAWTIRKGTKAPQAAGKIHTDFEKGFIMAEVMKYEDFKEEGSENAVKAAGKYRQQGRNYIVEDGDIIFFKFNTPQQPKKK	199458	10077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_10597_13875_13999_16072_16170_16855_16997_59101_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_199329
631075	contig_13457_pilon	+	2496	14	Intergenic	novelGene_118325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	232.01818435162	2	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1175	2227	55314	57730	FALSE	40	AAACGAGGACAATTCCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52345	57999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53073_53180_53293_53413_53513_53615_53937_54450_54888_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
631078	contig_9609_pilon	-	1856	8	Intergenic	novelGene_23131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	121.352917609116	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	386	946	523112	521807	TRUE	25	ACCTACCTCTATTGAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQVVGSG	523942	520728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521625_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523297_523741
631081	contig_4678_pilon	-	2011	17	Intergenic	novelGene_126050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	61.0572221362879	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	14	1258	578108	572959	TRUE	0	GCCTGCCTTCTGGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQQRMEESEPERKRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGLRGRHPHHLFLLQGPAADSALQCHHAQEDSEFCQERPSEACDNQCGPRRGCQPRRHPGGGICEGRGQDGVPARVLAEDTPTSAHLCGEEGRRGRHPRVPAA	578121	571682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573855_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
631084	SIRV4	+	204	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1567	632	1112	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
631100	SIRV5	-	342	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGACCTGGCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
631101	contig_1532_pilon	+	1394	8	Intergenic	novelGene_37436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGCCCCAGGGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12682	32112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_12989_13109_13518_15732_15889_17971_18116_27266_27380_28827_28968_29440_29507_32051
631109	SIRV7	-	262	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91660	4	-91654	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAACCGATTTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
631117	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_97588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
631123	contig_16156_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_137093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAAAAGTAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677475	675775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_675800_677500
631126	contig_1230_pilon	-	1241	5	Intergenic	novelGene_28883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	370	696	408595	407721	TRUE	20	CTTCAAATCGGGCTCGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408964	406721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_406930_407146_407348_407584_407787_408002_408234_408565
631142	contig_15146_pilon	-	2308	4	Intergenic	novelGene_116936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.8872154908264	33	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGAGAGTGGCCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112828	106233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_108069_108967_109084_111059_111224_112635
631159	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
631162	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
631176	contig_6568_pilon	+	2022	12	Intergenic	novelGene_152862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	38.6572136255222	89	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	297	1784	157628	181774	FALSE	20	CTGGACTTAGTGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGKGCDLNTSGHSKTDGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	144103	182012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148856_153370_153491_157598_157683_160247_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
631178	contig_205_pilon	+	2296	6	Intergenic	novelGene_144313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	224.440281589558	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	282	2114	292858	296995	FALSE	35	AAAAGCAACGTTTTAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDSNDKGSGDQSAAQRRSQMDRLDREEAFYQFVNNLSEEDYRLMRDNNLLGTPGESTEEELLRRLQQIKEGPPPQNSDENRGGGSSDDVSNGDSIIDWLNSVRQTGNTTRSGQRGNQSWRAVSRTNPNSGDFRFSLEINVNRNNGSQNPENENEPSARRSSGENTENNSQGQVENPRSESTSARPSRLERNSTEALTGEAPPTRGQRRARSRSPDHRRTRARAERSRSPLHPMSEISRRSHHSISSQTFEHPLVNETEGSSRTRHHVTLRQQITGPELLSRGLFAASGTRNASQGAGSSDATGNTESTGSGQRPPTIVLDLQVRRVRPGEYRQRDSIASRTRSRSQTPNNTVTYESERGGFRRTFSRSERAGVRTYVSTIRIPIRRILNTGLSETTSVAIQTMLRQIMTGFGELSYFMYSDSDSEPSGSVPSRNMERSELRNGRGSSAGNSSSGSSSSSSSSPSSSSSGESSESSSEMFESSNEGSSSSGARREGRHRAPVTFDESGSLPFLSLAQFFLLNEEDDDQPRGLTKEQIDNLAMRSFGENDALKTCSVCITEYTEGNKLRKLPCSHEYHVHCIDRWLSENSTCPICRRAVLASGNRESVV	273873	297177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_273937_275870_275935_276994_277125_292833_293027_293874_293959_295415
631182	contig_10581_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_41353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	358.203416371201	2208	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	128	556	80448	87174	FALSE	10	TTCCGCCTTTGGGCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRFPEDKLLGKGFARRFGEGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSIKLVVEWELLDDKGQRLFCWKIPLEIIS	74563	87907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_80425_80509_82742_82851_85033_85207_87087
631192	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1467	635	1012	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
631198	contig_253_pilon	+	1402	7	Intergenic	novelGene_129726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	262.050090631543	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	450	1061	583193	585056	FALSE	5	GCCACGGCCTCTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSGPGSGCCPGKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK	580225	585397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_580318_582710_582843_582967_583230_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
631200	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
631203	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_18414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631204	contig_10013_pilon	-	2648	19	Intergenic	novelGene_125071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	76.2997661922214	253	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	17	1330	462946	455870	TRUE	10	CACGGTCTGAGCCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRYRKMVVMARISRPERPDLVFEEEDLPYEEEIMRNPFSVKCWLRYIEFKQGAPKPRLNQLYERALKLLPCSYKLWYRYLKARRAQVKHRCVTDPAYEDVNNCHERAFVFMHKMPRLWLDYCQFLMDQGRVTHTRRTFDRALRALPITQHSRIWPLYLRFLRSHPLPETAVRGYRRFLKLSPESAEEYIEYLKSSDRLDEAAQRLATVVNDERFVSKAGKSNYQLWHELCDLISQNPDKVQSLNVDAIIRGGLTRFTDQLGKLWCSLADYYIRSGHFEKARDVYEEAIRTVMTVRDFTQVFDSYAQFEESMIAAKMETTSELGREEEDDVDLELRLARFEQLISRRPLLLNSVLLRQNPHHVHEWHKRVALHQGRPPGDHQHVHRGRADGGPLQGHRQAAHTVGCLCQVLRGQWAAGRRPRHPGEGHQGELQAGGRPGERVV	462962	452365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_452490_452571_452682_452808_452939_453487_453660_453778_453902_454099_454291_454374_454539_455387_455502_455585_455718_455811_455944_456425_456546_456620_456774_457212_457358_458530_458696_458782_458918_460673_460872_461173_461298_461568_461718_462895
631216	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
631227	contig_13707_pilon	-	2369	12	Intergenic	novelGene_43560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_11	545.896563326094	1	124	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	40	1335	275489	270728	FALSE	35	ATATTTACAAAAGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKTEAARGTLTYSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	275528	269693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
631230	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
631247	contig_15063_pilon	+	1179	3	Intergenic	novelGene_14342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	55	ATAAAAATATCAGTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
631248	contig_3825_pilon	-	1602	9	Intergenic	novelGene_78008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_7	883.920634163498	124	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	781	1320	1465317	1462075	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470994	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1468664_1469125_1470880
631254	contig_12123_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_144615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATTTTCATAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161023	163122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_161000_163100
631255	contig_7171_pilon	-	2710	31	Intergenic	novelGene_101294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_30	110.31105515264	247	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	261	2588	1075454	1057742	FALSE	10	GCTGTTATCTTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075825	1057619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075592
631256	contig_20641_pilon	+	1633	8	Intergenic	novelGene_52842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1700.4038055829	3	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	439	1341	38688	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14541	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14614_14708_14771_16769_16905_38518_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54962_56379
631264	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	612	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
631269	contig_3095_pilon	+	1185	6	Intergenic	novelGene_75256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	384	692	247875	248690	TRUE	40	GAAACTAACCAATCGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKAQPKEDQPQHKASDTTQQLALGRFRLRAPLHCDGAPEAGVLYTAGVDISTLGSHFQHHKDLEGPVPIPNKGSGHNASCFLLVIPKPPDFDLAWIEICH	246382	255625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_246740_247848_247969_248475_248759_253535_253805_255383_255482_255567
631278	contig_6589_pilon	+	1276	8	Intergenic	novelGene_26034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_7	637.63149104114	39	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	101	946	1725483	1731484	FALSE	35	GGTAAAATAGCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725382	1731814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
631279	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
631286	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_90578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
631292	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
631297	contig_7202_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_17238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATTTCACCTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
631299	contig_15570_pilon	+	2737	13	Intergenic	novelGene_137830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	87.535072336115	55	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	142	594	449901	452418	TRUE	75	TGTAAAAAAAAAAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPDDLKTRSGSESLRPVAHAVSPWGSLRTFSVSASTPRFRPGSQQSRMTKKRKRQDDFQKVKLKVGKKKPKLENATDTNFKTKTIHLPEQLKEDGTLPTNNRKLNIKDLLSQMHHYNAGVKQSALLGLKDLLSQYPFIIDAHLSNILSEVTAVFTDKDANVRLAAVQLLQFLAPKIRAEQISPFFPLVPGWRTRWCG	445935	487401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_446068_449891_450081_451303_451544_452385_452630_454134_454248_460705_460945_461706_461841_463717_463894_465781_465960_472481_472571_474156_474291_484961_485032_486602
631300	contig_14513_pilon	-	1213	5	Intergenic	novelGene_70378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	TRUE	30	AACATTAGAACTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11870_11943_12158_13087_13136_14952_15001_18735
631303	contig_6062_pilon	-	1131	3	Intergenic	novelGene_5253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_1	72	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAATAAATCCTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547214	541250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484
631308	contig_5389_pilon	+	2973	16	Intergenic	novelGene_143013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_6	236.063324837496	310	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	135	2318	367865	395369	FALSE	55	CTGAAAAGGAAATTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGHTWCSVVTAGRFGLAWEVSISFTRRKPDLALRPGSGPDSAGKMVKPKYKGRSSINPSKASTNPDRVQGAGGHNMRDRATIRRLNMYRQKERRNSRGKVIKPLQYQSTVASGTVARVEPNIKWFGNTRVIKQSSLQKFQEEMDTVMKDPYKVVMKQSKLPMSLLHDRIQPHNSKVHILDTESFETTFGPKSQRKRPNLFASDMQSLIENAETSMDSYDQGKDRDLVAEDTGVRNEAQEEIYKKGQSKRIWGELYKVIDSSDVVVQVLDARDPMGTRSPHIETFLKKEKPWKHLIFVLNKCDLVPTWATKRWVAVLSQDYPTLAFHASLTNPFGKGAFIQLLRQFGKLHTDKKQISVGFIGYPNVGKSSVINTLRSKKVCNVAPIAGETKVWQYITLMRRIFLIDCPGVVYPSEDSETDIVLKGVVQVEKIKTPEDHIGAVLERAKPEYISKTYKIDSWENAEDFLEKLAFRTGKLLKGGEPDLQTVGKMVLNDWQRGRIPFFVKPPNAEPPAAPQLPSSSSSSLEVATETTQNNLEEQHTGTVGEESESVIEKEKGENDPCDANSEMQQILARVRQNFGKINVAPQFSGDDLVPLEMSDIDEEPESFSEEEEEEQEQQGDEEEESCRESQEEHVENDTKAVIKALDEKIAKYQKFLNKAKAKKFSAVRISKGLSEKVFAKSEEQEDVEDKAPAKKGKKRKAQREEEHSNKTCRMLTSKERRRAARQQQSRRVGVRYYETHNVKNRNRNKKKTSDSEGQKHKHRKFKHNKQ	367730	396024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_367929_369967_370053_371025_371121_372878_373019_377126_377312_379222_379290_380211_380371_380931_381046_384409_384539_385280_385386_386173_386333_386546_386661_392759_393218_394078_394147_394470_394557_395213
631311	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
631322	contig_3602_pilon	-	1534	9	Intergenic	novelGene_60657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	337.711021992176	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	55	738	1139393	1107817	TRUE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRSC	1139447	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108574_1108763_1110847_1110917_1112151_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
631324	contig_12270_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_114125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGGGACAGACTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14427	13926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14357
631338	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
631341	contig_18108_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_33532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	82	654	310636	311208	NA	40	ATAGACAGGGAAACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQRLSNHLQAQLGVALNHVVPKHLCRPVSIRITWRVSENYRFPGPTPSSESAGLGWGPGTCGSKAHPGLGTTHQHPPSTPVETEASQGKGLVRPTGRQAAGRTARAGIGAPFLLPPLLSLFLLPHSSPCPQPPGDSRALSHQWWHTEESFLGKTIPKQSFPRPGEQNRPKGVVAGRLDKELSPSEPVS	310554	311329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_310600_311300
631342	contig_10753_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_105144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGTGTTTGCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324488	322969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_323000_324500
631348	SIRV7	-	360	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33208	1	-11	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114749	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
631350	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631364	SIRV2	-	611	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1100_1700
631367	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
631379	contig_12079_pilon	-	1273	6	Intergenic	novelGene_67561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_5	244.724661609736	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	205	699	871530	867179	FALSE	15	TTTGAGGAGTGGATGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKVSSRHACQNSLSVGSDTFILRK	872411	866604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
631388	contig_2940_pilon	-	2882	1	Intergenic	novelGene_81982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAAACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118833	1115951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1116000_1118800
631395	contig_12000_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_43156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAACTCTAACTAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669837	416851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_416949_417186_417301_449720_449772_484101_484221_488474_488596_490220_490304_490573_490685_558468_558606_584748_584939_669223
631411	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
631428	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631432	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631433	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
631438	SIRV7	-	331	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	11	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
631446	contig_11656_pilon	+	1955	12	Intergenic	novelGene_54004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	182.812915253466	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	164	1288	465719	536690	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQWCGPQ	464941	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522836_536673
631449	SIRV5	-	396	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAATTTACGGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8450_8590_10863
631458	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
631472	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_92157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
631476	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631477	contig_15021_pilon	+	2919	11	Intergenic	novelGene_26960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	141	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1867	2400	241786	252006	TRUE	35	ACCTTTCGTGGGAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQHTDSPLTISWKTPLCDSCGMFSFYPEKCFLSRVVPVRAAVTVPRLPLHLHLRLHPRDHLLHAAKFSFLFQQDLVFIHVLILYFSAASLEPLGAEVLIVEVLGHLLEVLHVSYEHGPQLQEVVVLWVLHLHHPPRVEAASDLLAFGFNQLVGSNHRKWDTGLKKPGLLFKIFILI	239761	263361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241355_241512_241884_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251396_251960_252065_260955_261073_261236_261377_262376_262499_263279
631479	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_95852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631483	contig_233_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_14482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTCTGTCTCTTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13435	11721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_11700_13400
631494	contig_5799_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_50235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142793	142348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_142300_142800
631497	contig_9471_pilon	-	1456	6	Intergenic	novelGene_21838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATGTCTACCTCCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417221	413725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_414728_414804_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
631500	contig_14722_pilon	-	2931	1	Intergenic	novelGene_110218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1323	1649	63347	63021	NA	75	AGAAAATAAAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCDVGTCRFPGLGAGSFHCSITASSSAGPSGLTWSRLTHLASQIEAGSPHSGGVFSCPVFGHLSREGARPAPSLPICSQPTGFEGRGQWEGKSFSLWYCGKPWWHSE	64669	61738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_61700_64700
631503	contig_12638_pilon	-	1244	12	Intergenic	novelGene_33203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	277.576227338494	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	70	1101	333499	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSGPEAAGCGAGRLASLFRLVPMEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELHAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333568	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332776_333221_333274_333411
631506	contig_19851_pilon	-	1211	7	Intergenic	novelGene_29825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	861	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGAGCCTCCTCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56529	53459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53701_53922_53979_54058_54188_54600_54715_55648_55751_55838_55880_56001
631515	contig_11708_pilon	-	2617	2	Intergenic	novelGene_138953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTAATATTTGAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223605	219323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_221553_223217
631520	contig_5779_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_106442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	94328	94011	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94330	93306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94300
631526	contig_17427_pilon	+	2155	9	Intergenic	novelGene_30295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	273.758903964784	2	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	300	857	152221	175576	FALSE	10	CTTATCCTTGGTGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147959	176874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152144_152250_152572_152644_155691_155774_171334_171426_172209_172309_173605_173669_175453
631527	contig_14513_pilon	-	1200	2	Intergenic	novelGene_70237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	10	TGCTTTTGTCCATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
631530	contig_5084_pilon	+	1701	5	Intergenic	novelGene_64667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1494.59716562691	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	62	490	1751485	1754788	FALSE	15	GCACGGTTGTCTCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLESEQFLTELTRLFQKCRLSGSVFITLKKYDGRTKPIPRKGTVDSFEPSDNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMVSFWRSLCPPSQARVGIILTTGLRAGLRTKFSAGVQTGTNLFEALVKTGFWVYCSFLVSFW	1751423	1755999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751509_1751646_1751720_1752165_1752279_1754409_1754529_1754688
631533	contig_12327_pilon	-	1579	7	Intergenic	novelGene_140627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	766	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCACAAGATGGCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172354	148624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_148686_168890_169076_169394_169506_170310_170446_170844_171060_171417_171629_171693
631535	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
631544	contig_14176_pilon	+	2836	5	Intergenic	novelGene_74844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	130.84532853717	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	80	475	246102	249415	FALSE	35	AATACAAGTTTTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVNYSSALRTCEIQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRKGKRRTRGESM	246022	251776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_249378
631551	contig_14711_pilon	+	2149	9	Intergenic	novelGene_68890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	408.173504009018	6	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	746	1909	88011	90570	FALSE	20	AGACCTCAGTTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCVGVGVCVCVCVCMCKLSLIPQVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70416	90810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82368_86207_86242_87717_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
631558	contig_8312_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_152879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATGTTTATTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260934	262157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_260900_262200
631560	contig_4754_pilon	+	2219	15	Intergenic	novelGene_35949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	183.743901745259	1	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	62	982	380119	410462	TRUE	5	TTTTTTCCCCTCCTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKG	380057	420777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407594_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410352_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
631562	contig_3077_pilon	+	2251	11	Intergenic	novelGene_26872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	76.3911644105521	7	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	92	1174	1337784	1346705	TRUE	15	TGATTCATTCCTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336621	1348267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611_1346935_1347419
631577	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_97179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
631586	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_95772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631592	contig_7457_pilon	-	1900	5	Intergenic	novelGene_31624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.579474460415	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	142	828	962606	956489	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962747	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960281_960856_960896_962603
631596	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_95869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631613	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	635	1119	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
631622	contig_12923_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_30168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCTGTGTGCGCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308998	309333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_309000_309300
631623	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
631626	contig_6327_pilon	-	2687	1	Intergenic	novelGene_147488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGTACACTTGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71002	68315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_68300_71000
631628	contig_10642_pilon	-	1965	2	Intergenic	novelGene_78660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1143	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTCCCATGTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171180	169165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170385_170434
631636	SIRV4	-	202	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAGAATCTAGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
631658	contig_17281_pilon	+	787	2	Intergenic	novelGene_105181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2151_2209
631665	contig_12528_pilon	+	3712	4	Intergenic	novelGene_81295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_3	220.142882894017	543	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGTATAACTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332302	347411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_333042_337048_337153_338090_338141_344592
631675	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_17872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631682	contig_3386_pilon	-	1891	8	Intergenic	novelGene_34509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	810.004006036957	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	340	1128	407739	404773	FALSE	35	TAATATAGTCAGTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVAESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412207	404009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407838_409398_409464_409541_409607_412096
631684	contig_7171_pilon	-	2722	30	Intergenic	novelGene_101298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_26	111.528745701353	3	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	604	2601	1071125	1057742	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTVRCLPQLSPDTLPFPSATAEPSPVPQALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075821	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074294_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
631695	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1539	655	1084	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGTCAATAACTTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	2748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
631704	contig_12873_pilon	+	1578	5	Intergenic	novelGene_27195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	31	junction_4	913.276518914179	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	357	1304	16357	23907	FALSE	45	TTGTGAAAGAAAGAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGLCCKGHTVRLSRAPCWLHL	16000	24181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_23845
631707	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
631715	contig_6710_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_89856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGCACACTACAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
631723	contig_9014_pilon	-	1328	12	Intergenic	novelGene_106766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_11	64.5394363391501	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	172	1092	82349	78380	FALSE	40	AATAAACCAGCTCTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	82694	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82480_82653
631728	contig_14322_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_115713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTTTTATTGCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671526	671278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671500
631742	contig_8617_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_73397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62315	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
631744	contig_16121_pilon	+	1576	4	Intergenic	novelGene_6863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	508.480088105719	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	142	1050	58910	62826	FALSE	5	GCTCCTTGATTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33609	63352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_58867_59396_60693_60856_62565
631746	contig_3382_pilon	-	2524	5	Intergenic	novelGene_124067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.768656358147	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGAGTGTCTGTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344850	287458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_289212_291104_291524_306326_306380_309848_309943_344645
631752	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631753	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631754	contig_13547_pilon	+	4254	4	Intergenic	novelGene_104849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGGATTCAGGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4031	14572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_7414_8112_8428_12191_12687_14510
631757	contig_6735_pilon	-	1189	6	Intergenic	novelGene_15782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	774.368801024421	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	378	719	543144	542464	FALSE	20	TTCACCCTTATGCTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568279	541993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543283_564157_564232_564784_564869_568198
631765	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
631780	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
631782	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7456	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
631786	contig_817_pilon	-	2579	1	Intergenic	novelGene_132450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1517	1957	551087	550647	NA	25	GGATGGAGGGGAGGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGHMDGFFFSPWLTLPQKTLPKTESSWLSSPGSLYVGTTDVLNGIILCGGGCPMHCMTLSSIPGLHPLDTSSTPPMPVVTTKTVSRKRPGGEPQIDYPERFRSSRWKTCLVINNHLLSLHLLRLPFLLNLPVTRQLCLSAPICQG	552603	550024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_550000_552600
631792	contig_8122_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_40221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATAAAAATTTATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496689	496246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_496200_496700
631794	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	3	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78957_114680
631795	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	178	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
631806	contig_14243_pilon	+	911	4	Intergenic	novelGene_57443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACCATCCCAGCATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702714	704771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_702925_703269_703419_703630_703729_704317
631820	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
631832	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
631837	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_96038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631844	contig_2036_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_131857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691043	688630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_688600_691000
631851	contig_2365_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_103739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156432	156074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_156100_156400
631856	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631871	SIRV6	+	289	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	176	9	126	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGAAATTTAAAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
631873	contig_12151_pilon	-	2820	14	Intergenic	novelGene_54977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_13	159.561232704716	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	5	2392	1023634	975052	FALSE	45	AATAAAGTCTATTTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	1023638	974623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016743_1023563
631876	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
631881	contig_19899_pilon	-	2179	3	Intergenic	novelGene_102518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	202	junction_1	7.5	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	740	1129	142289	140028	FALSE	30	CAAGATTGTGGTACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAFLVLHGAVNLAAPIVIQDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	143028	138977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080
631893	contig_5881_pilon	-	3378	1	Intergenic	novelGene_129067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	120	1190	765838	764768	NA	5	TCTGGCTTGTTGTGGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKRSQSCPSPAVSTPLKRAEEQDSMNVVVAVGADGCSNRFSFGEVRIDPVLLRLVADEEKCRSIRKQYRQLMYNVQQQRDDIVNTASESLTEALEEANVLFDEVSRTREAALDAQFLVLASDLGKEKAKQLNCDMSFFNQGAFRDYLCIFVGLNWLEEERDELGDFDDSIALSFWEKVQKEATSWTLRAETFHFIFGSFKSEPSAPKPRQRKRVCSMEENGDMPTKLRKMDLNGNQEATEKEVERILGLLQTYFRKYPDSPVSYFEFVVDPHSFSRTVENIFYVSFIIRDGFARISLDQDRLPILEPINNNQMDEGYDSSSHGRRQGVISLSLQDWKNIVATFEISEAMITNLQ	765957	762579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_762600_766000
631894	contig_12327_pilon	+	1880	5	Intergenic	novelGene_140629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	620.554993534014	40	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	98	643	168930	171003	FALSE	35	GACTGCTTTCAATACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148627	172240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841
631895	contig_2069_pilon	-	3667	9	Intergenic	novelGene_23444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_8	36.7083096859553	145	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	539	1540	1360978	1334659	FALSE	15	TGCAATTGTCTATTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIKEGELSLWERFCANIIKAGPMPKHIAFIMDGNRRYAKKCQVERQEGHSQGFNKLAETLRWCLNLGILEVTVYAFSIENFKRSKSEVDGLMDLARQKFTRLMEEQEKLQKHGVCIRVLGDLHLLPLDLQELIAQAVQATRNYNKCFLNVCFAYTSRHEISNAVREMAWGVEQGLLDPSDISESLLDKCLYTNHSPHPDILIRTSGEVRLSDFLLWQTSHSCLVFQPVLWPEYTFWNLCEAILQFQMNHSVLQKARDMYAEERKRQQLERDQAAVTEQLLREGLQASGDTQLRRTCLHKLSARREERIQGFLQALELKRADWLARLGTASA	1361594	1332531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1334896_1343023_1343132_1345524_1345640_1350401_1350504_1351478_1351596_1354912_1355056_1359034_1359152_1360915_1361030_1361107
631896	contig_7410_pilon	+	2307	6	Intergenic	novelGene_106096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	324	junction_4	184.696940960049	16	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTAGAATTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406113	412173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_406784_407069_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
631900	contig_10300_pilon	+	1418	3	Intergenic	novelGene_152922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0.5	199	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	18	404	56973	177331	FALSE	30	AAAACATATTTGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKEAMQDAVLKAIEEERKNLEKAHAEERELWKTEHAKDQEKVSQEIQKAIQEQRKVSQETVKAAIIEEQKRSEKAVEEAVKRTRDELIEYVKEQKRLDQVIRQRSLSSLELFLSCAQKQLSALIATEPVDIE	56955	178345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_57135_112044_112159_177220
631903	contig_11427_pilon	+	2106	5	Intergenic	novelGene_78966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.6145104689863	255	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	580	1617	93223	94260	TRUE	40	ATTTTAGTAAAAATATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92159	101692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_92733_92898_93163_94278_101140_101394_101473
631923	contig_9014_pilon	-	2083	9	Intergenic	novelGene_106721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	84.069818454663	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	745	1524	43367	41867	FALSE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	46685	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43372_43480_43559_44086_44240_44434_44533_44785_45016_46504
631927	contig_3818_pilon	+	1731	12	Intergenic	novelGene_99245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	408.257514746646	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	56	1360	450969	455535	FALSE	0	CCGTTTTCTTCTGTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHANRPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCTHDHFNAETVTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	449805	455906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_449827_450934_451044_451469_451560_451607_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
631929	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
631943	SIRV7	-	194	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69092	0	35873	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78865	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
631954	contig_4180_pilon	-	955	6	Intergenic	novelGene_8383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCATCTGCTACAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888440	874312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_874403_875177_875362_882858_882929_886080_886187_886317_886467_888084
631957	SIRV1	-	1355	6	NNC	SIRV1A	novel	1363	6	NA	NA	0	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	512	51	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCGATGCATACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10791	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1485_6337_6464_6557_6814_7552_7815_10282_10367_10647
631958	contig_10009_pilon	+	1653	6	Intergenic	novelGene_82715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	521.965286202062	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTATGTTAAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41092	71603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_42024_55211_55301_63219_63357_68605_68816_70219_70384_71481
631969	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	108	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
631972	contig_9727_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_86275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGAATGGTGTGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134399	133851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_133900_134400
632016	contig_3612_pilon	+	1497	5	Intergenic	novelGene_87823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	114.161070422452	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	76	1287	932543	978135	FALSE	35	TAATGAATTAGCTAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLRSRIERAARGFCPVPKRRLKLEMLHFSSPKDMDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEHYLEPRVKLCEALERYGLNTEDFFVLNHGESRYLNTDSENVK	932467	978345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932554_955598_955909_965350_965998_969734_969850_978006
632029	contig_3095_pilon	-	1138	7	Intergenic	novelGene_75221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1110.34160159035	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	63	380	255481	248744	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPCADTTTGLRSASRCSGEWSLK	255543	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253588_253651_253806_255384
632034	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632041	contig_10734_pilon	-	2658	9	Intergenic	novelGene_51227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGACTAGGGGCGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280365	1198710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1198809_1243188_1243382_1247252_1247830_1260391_1260515_1262351_1262578_1267422_1267618_1268185_1268291_1270216_1270278_1279285
632045	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632049	contig_6795_pilon	-	1780	11	Intergenic	novelGene_27667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	97.5430161518496	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	233	1195	129029	46152	FALSE	30	TTAACATGCTGTGGATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134332	45566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
632064	contig_11003_pilon	-	2085	15	Intergenic	novelGene_105411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	92.1767379570798	307	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	46	1812	27839	13005	FALSE	15	GTTGGATTCTGTGTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRSFGGDVSWDKSLCIGATYDITDSCITHQIVDRPGQQTPIIGRYYVQPQWVFDSVNARLLLPVEDYFPGVPLPPHLSPFISEKEGDYIPPEKLKLLALQRGEDPGNLNESEEEEEEEENNEDDEEEEGGENEEEEDAEAALEKEEEARLAALEEQRMEGKKPRVMAGTVKLEDKQRLAQEEESEAKRLAIMMMKKREKYLYRKIMFGKRRKVREANKLAAKRKAHDEAVRSGKKAKKARPV	27884	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_13089_14043_14206_14320_14488_14988_15174_15307_15434_15827_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
632073	contig_4125_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_25087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTACTTGATTCTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535988	534887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_534900_536000
632074	contig_10609_pilon	+	2889	14	Intergenic	novelGene_123914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	33.6485490336657	141	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	359	1798	289268	309992	FALSE	35	AGAAACTACTATGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMDSELMHSIVGSYLKPPERVFVPSFTPYETSQNCHPVNMEVTPPKMFYSPNNQAALILALKTLQDKIHRLELERTQAEDNLNILSKEAAQYKKALENETNERNLAHQELIKQKKDISIQLSSAQSRCALLEKQLEYTKRMVLNAEREKNIILEQQAQLQREKEQDHLKLHAKLDKLDVLEKECFRLTTTQKTAEDKIKHLEEKLKEEEHQRKLFQDKASELQTGLEISRILMSSVSNPKHSKGKKKSSKKTKCLQRGLPQESYLKFGAPPFVPGKLVSTSHSGNASVQNLLQMMRDCGPHTLQKHSKAPEPRCLHKPSTTPQCKAVPPDPEKSVSICDNLSELLMAMQDELDQMNMEHQELLNQMKETQSHSVCEDIESELEHLVKKMGIKAEQISKLKKHQNSVRELQQKLQNSKMSEASGIQQEDSNPKGSKNMKNSPRKCSHETSPLQKNSNFHPKRVRNLQMKLSKDDIMWEQ	255782	311083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_255839_287573_287651_288402_288551_289190_289271_290480_290644_294368_294552_295600_295723_299061_299179_300129_300208_300686_300774_305585_305664_305779_306022_307668_307814_309770
632075	contig_15063_pilon	-	791	3	Intergenic	novelGene_13114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	79	402	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	35969	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839
632084	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_93006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657815	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
632097	contig_12074_pilon	-	1984	14	Intergenic	novelGene_53762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	284.486186892342	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	23	1738	45831	30226	FALSE	40	AAATACATATTTAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDHGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	29979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33467_33657_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
632101	contig_17198_pilon	-	2573	14	Intergenic	novelGene_62410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_13	414.06251135983	523	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	217	1716	1150359	1105575	FALSE	20	CTAGAGTGTCAGTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGLSAQGVNMNRLPGWDKHSYGYHGDDGHSFCSSGTGQPYGPTFTTGDVIGCCVNLINNTCFYTKNGHSLGIAFTDLPPNLYPTVGLQTPGEVVDANFGQHPFVFDIEDYMREWRTKIQAQIDRFPVGDREGEWQTMIQKMVSSYLVHHGYCATAEAFARSTDQTVLEELASIKNRQRIQKLVLAGRMGEAIETTQQLYPSLLERNPNLLFTLKVRQFIEMVNGTDSEVRCLGGRSPKSQDSYPVSPRPFSSPSVSPSHGMNIHNLASGKGSTAHFSGFESCSNGVISNKAHQSYCHSKHQSSNLNVPELNSINMSRSQQVNNFTSNDVDMETDHYSNGVGETSSNGFLNGSSKHDHEMEDCDTEMEVDPGQLRRQLCGGSQAAVERMIHFGRELQAMSEQLRRECGKGTANKKMLKDAFSLLAYSDPWNSPVGNQLDPIQREPVCSALNSAILETHNLPKQPPLALAMGQATQCLGLMARSGIGSCAFATVEDYLH	1218954	1104717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1105706_1110203_1110316_1117273_1117426_1119094_1119217_1122034_1122180_1124906_1125098_1126926_1127036_1128153_1128267_1131162_1131348_1144509_1144533_1148908_1149077_1150310_1150364_1199990_1200103_1218854
632119	contig_7119_pilon	-	1329	5	Intergenic	novelGene_40995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	374.781269542649	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAAGGTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196490	187962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196239
632121	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632123	contig_3721_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_123826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGTGTGATTGGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237161	238589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_237200_238600
632127	contig_21027_pilon	+	1247	5	Intergenic	novelGene_127568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	577.63889022468	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	61	597	1763	8128	TRUE	25	ATACTATGCTTGCCTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILKCPLSHLISLILLLFHSEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1702	8825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_5261_6365_6482_7912_8455_8501
632133	contig_12622_pilon	-	1702	14	Intergenic	novelGene_6034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	411.774684181221	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	32	868	1691275	1687872	TRUE	15	ACCCTGTCTTCTCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKYTRRTPWWSMIWATSSLASHSSGRGIRYCCNLEVGHA	1691513	1685112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688860_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
632134	contig_16098_pilon	-	1407	9	Intergenic	novelGene_46103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1954.21614720583	5	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	105	1199	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460238	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460155
632150	contig_18419_pilon	-	2392	2	Intergenic	novelGene_141466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGACTTTTCAGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31089	28654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_30566_30608
632162	contig_9415_pilon	+	1703	9	Intergenic	novelGene_109753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	774.792462130989	751	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	80	493	1489186	1505565	TRUE	10	CATTTGGTGGTCCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEEDIAAKEKLLRVSEDERDRVLEEMHKAEDSLLAADEAAAKAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKR	1489106	1518296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1489300_1490019_1490146_1503364_1503499_1505525_1505645_1506854_1506926_1507180_1507257_1508229_1508293_1508784_1508855_1517445
632168	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	632	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
632169	contig_7202_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_18676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
632174	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
632193	SIRV7	+	399	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTAGGTCAGTTACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
632197	SIRV6	+	834	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	751	1	-404	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	121	453	2002	10736	TRUE	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1881	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
632216	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632252	scaffold_6394_pilon	+	986	7	Intergenic	novelGene_110998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1073.58160948398	257	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	512	826	405365	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398198	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_405097_405201_405302_405501_405717_405864_406086
632255	contig_1443_pilon	+	1629	14	Intergenic	novelGene_28230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	68.0004350838848	405	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	675	1493	538444	541708	FALSE	30	TGGAAATGAATTTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535990	541844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538351_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
632261	contig_15063_pilon	+	1129	3	Intergenic	novelGene_14379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	175	996	35271	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35096	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
632266	contig_4857_pilon	-	1926	7	Intergenic	novelGene_48844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACATCCTAAGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411062	1331397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1335190_1335516_1336703_1336826_1343175_1343263_1405451_1405553_1407010_1407073_1409985
632276	contig_21388_pilon	-	2495	1	Intergenic	novelGene_136641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTAGTTCTGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33307	30812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_30800_33300
632281	contig_13051_pilon	+	1751	16	Intergenic	novelGene_140095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	105.277917912542	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	208	1647	103729	245480	FALSE	10	GTATTCCTGGGCTGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILTFEKRSYKNQELRIKFPDNPEKFMESELDLNDIIQEMHVVATMPDLYHLLVELNAVQSLLGLLGHDNTDVSIAVVDLLQELTDIDTLHESEEGAEVLIDALVDGQVVALLVQNLERLDESVKEEANGVHNTLAIVENMAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60125	245584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99872_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
632300	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_90565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653855	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632305	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632338	contig_15304_pilon	-	1063	3	Intergenic	novelGene_30524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	199	1023	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54298	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
632341	contig_2093_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_153002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAAGTAAAATACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417375	1417838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1417400_1417800
632347	contig_17796_pilon	+	1960	12	Intergenic	novelGene_33813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_11	349.68644750726	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	90	1169	53527	117926	TRUE	25	TTCATGCCAGTGCTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGTYISDESHREVKFISL	53437	121181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_117874_117961_120424
632354	contig_8538_pilon	-	2182	4	Intergenic	novelGene_4604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	18.3726850393609	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	611	1024	694515	688211	FALSE	10	CCACGTGCATGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPYTLNGKKVEVAVKQVIAGKSVEHRGAFSNPETLDLYQSIPELQDF	695125	687052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688349_692701_692905_693724_693784_694501
632358	contig_13055_pilon	-	2781	16	Intergenic	novelGene_104950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	35.4774419721728	12	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	571	1878	138806	88287	FALSE	20	TCTTTATATTTGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHSGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAVISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD	159220	87383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88371_89894_90042_98669_98832_103038_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115979_116548_116625_119247_119368_138770_138823_139495_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_159175
632365	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632367	contig_7428_pilon	+	2002	11	Intergenic	novelGene_77725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	121.345333655646	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1204	1749	434083	435117	FALSE	35	TATGAAAACAGGCTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428851	435370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_428900_429283_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433254_433360_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
632369	contig_5499_pilon	+	1958	9	Intergenic	novelGene_56992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	328.672305457883	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	215	943	816585	835383	TRUE	40	ATCTGTAAAGAATTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGWSDILAGASNR	803338	841270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834950_835345_835454_840325
632376	contig_935_pilon	-	2640	8	Intergenic	novelGene_45509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	39.4187358332795	145	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	196	1149	27171	19993	FALSE	50	AAAAAAGCATCCCTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDCIKTIVCQERKKDPIEMFCSGRLVKVCAPMVRYSKLAFRTLVRKYNCDLCYTPMIVAADFVRSLKARDSEFTTNQGDCPLIVQFAANDARLLSDAARIVYPYANGIDINCGCPQRWAMAEGYGACLINKPELIQDMVKQVRNEVENPRFSISIKIRIHDDLTRTVDLCRKAEATGVSWITVHGRTVEERHQPVHYDAIKIIKENMSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	32118	18501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_22450_22574_23645_23764_26040_26163_27055_27193_31616_31707_32034
632377	contig_9609_pilon	-	1538	11	Intergenic	novelGene_23122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	106.370343611366	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	135	1325	523819	521023	TRUE	25	ACCTCTATTGAGTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVDFAGARAPVAQASELPLTGVPKGGGVFAREGLEATDLGPAGAMGSSCRIECIFFSEFHPTLGPKITYQVPEDFISRELFDTVQVYIITKPELQNKLITVTAMEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQEADPVWAYEEPHPAAAEVPCAGVSGGAEPPCPALHGLSQLR	523953	520724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521291_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523120_523204_523297_523741
632379	SIRV4	+	460	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	36	454	36	-454	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACCTCTTCAAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491	2317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
632396	contig_5642_pilon	-	2254	2	Intergenic	novelGene_153031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	283	junction_1	0	192	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97904	92533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_94672_97788
632414	contig_15063_pilon	+	1144	3	Intergenic	novelGene_14375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	186	1007	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35085	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
632417	contig_10752_pilon	-	3652	11	Intergenic	novelGene_153038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCGCGTCACTGCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256725	182893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_183048_186640_187354_189330_189450_218946_219067_230376_230558_235573_235993_236128_236697_250489_250627_251559_251740_253623_253813_255853
632426	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
632439	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
632446	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_97305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
632452	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632458	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632459	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632471	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_96336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
632485	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632486	contig_6137_pilon	+	2737	4	Intergenic	novelGene_59127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCAAACCCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871327	878469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_872322_873560_873654_875173_875247_876892
632503	contig_19564_pilon	-	2199	4	Intergenic	novelGene_29620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	48	1382	15529	12201	FALSE	30	GATGACATTGCCCCAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15576	11383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
632507	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
632508	contig_11163_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_153060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107422	108307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_107400_108300
632510	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_95067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632519	contig_8558_pilon	+	2272	8	Intergenic	novelGene_123166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	11.9761668086484	438	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	355	1317	544862	612149	FALSE	25	TAAATTGTTAGCTATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASLANEDGQISPGSLLLAGAVAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRITLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSASTSTAISGGP	544507	613104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_544974_558872_558926_560307_560389_582513_582655_598745_598885_611350_611510_611603_611695_611962
632523	contig_17440_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_7668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3605	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
632531	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_94303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632533	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_96299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657815	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657816	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
632535	SIRV6	+	854	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	717	15	-438	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	155	487	2002	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1847	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
632540	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
632543	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632546	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
632567	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_93658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632571	contig_4519_pilon	+	1765	2	Intergenic	novelGene_123707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCTCTGTTAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633761	637724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_634419_636616
632581	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
632582	contig_5331_pilon	+	1711	14	Intergenic	novelGene_112810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	367.075020950646	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	41	1252	711291	741184	TRUE	15	CAGTCATCCTGCTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGAGERGGFNKPGGPMDEGPDLDLGPPVDPDEDSDNSAIYVQGLNDSVTLDDLTDFFKQCGVVKMNKRTGQPMIHIYLDL	711250	741804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_733574_733610_734135_734169_734490_734610_737891_737930_741171_741240_741400
632583	contig_14341_pilon	+	2332	5	Intergenic	novelGene_111778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	61.2596931105601	309	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	96	1928	313348	328668	FALSE	15	TGTGGCAGAATCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTSVVRCRARKAPALSPAPREPGGKGLAHQEECPVAQLDPQEDPFPDGKRGSRPLRKMEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGWETTVESKELTPTPDASEQEPTHSLKVDESSKGGPMSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	313252	329072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_313448_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327742
632596	contig_14322_pilon	-	392	2	Intergenic	novelGene_116228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
632598	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632604	contig_17427_pilon	-	2412	1	Intergenic	novelGene_30388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195623	193211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_193200_195600
632605	contig_11416_pilon	+	2772	3	Intergenic	novelGene_145364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	18.5	731	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	262	1308	563135	568561	FALSE	20	GCCCCAACTCCCTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGNATLVTTPQTSLGFQVKHCNESSFEDIREQSRVLLVVVYSVVCALGLPANCLTAWLTLLQVLQGNVLAVYLFCLALCELLYASTLPLWIIYIQNQHHWTLSPQACRLTAYIFFCNIYVSILLLCCISCDRFMAVVYALESRGHRHQKTAIFISVSVFILVGVVHYPVFQMEEQDTCFEALPTDNRIARYYYSRFVVGFAIPLFIIAFTNHGIIRRVRLSVGLSASQKAKVRHFAVAVVLIFLVCFAPYHLVLLIKAVAFSYHQDNKAALCAFEASLYMASVTFLCFSTVNSVADPIIYVLATDNSRQKISRIHKEWKVWTTKTDVIKFTCSKDLEEAKSATHELL	557576	570025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_557711_563007_563142_567521
632608	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632617	contig_15152_pilon	-	1664	5	Intergenic	novelGene_126967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.27451439082	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	118	726	206402	203562	FALSE	40	ATAAAAAGGTACTTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPLRCEARVRALFPTRTAATALRFAVRQLAFGPLPATAMPRVYIGRLSYNVREKDIQRFFSGYGRLLEVDLKNGYGFVEFEDSRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDRDGYSYGSRSGGGGYSSRRTSGRDKYGPPVRTEHRLIVENLSSRCSWQDLKDFMRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRFPLSK	206519	202623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203581_204159_204369_204512_204638_205925_206075_206295
632621	contig_7202_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_19101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACCGCCGCCATGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
632637	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632645	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
632651	contig_12622_pilon	-	1652	10	Intergenic	novelGene_5991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2540.41864441452	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	234	1472	1590968	1583745	FALSE	30	GGATTCTCTAACCTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFKNGRYWRLSEGRGRRAQGPFLISDTWPKLPPKLDSAFEDPLTKKVFFWRQVWVYTGASALGPRRLDKLGLGPQVDHVTGVLPRGEGKALLFSRQRFWRFDVKTQTVDPESVASVDQMFPGVPLNTHDIFQYRDKAYFCQDRFFWRVNSRNEVNQVDQVGYVTFDLLQCPEEE	1591201	1583564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586272_1586407_1586528_1586537_1588956_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
632652	contig_7202_pilon	-	165	1	Intergenic	novelGene_19105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCGCCGCCACCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
632654	contig_14441_pilon	+	1155	5	Intergenic	novelGene_100500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	412.931289683889	26	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	546	926	116728	117560	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	95924	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_95975_96144_96458_116545_116957_117212_117344_117539
632662	SIRV4	-	231	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATTATTTCCATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
632672	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
632677	contig_6102_pilon	+	2037	12	Intergenic	novelGene_32270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	56.1877019572759	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	62	1477	1444370	1449029	FALSE	5	CGGCTGCTTCTGTTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSDFPEGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444308	1449589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447571_1448022_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
632678	contig_6795_pilon	-	1265	8	Intergenic	novelGene_27699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_7	100.111162704062	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	233	820	129029	110792	FALSE	35	AACATTTGTATGTGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKR	134332	110346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
632698	contig_16666_pilon	-	1085	5	Intergenic	novelGene_61738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	669.189995442251	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	TRUE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55451_55717_56041_56584_56664_58098_58264_59552
632713	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_116250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
632728	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632733	contig_7045_pilon	-	2335	8	Intergenic	novelGene_77480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_7	73.4591376069661	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	645	1838	539536	524577	FALSE	35	GTAGCAGTGACTGCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASDLDVADRTKFDKIFEQVLSELEPLCLAEQDFISKFFKLQQHQSMPGTMTEAEDLDGGAFSRQHNSGTPLPVSSEKDMIRQMMIKIFRCIEPELNNLIALGDKIDSFNSLYMLVKMSHHVWTAQNVDPASFLSTTLGNVLVTVKRNFDKCISNQIRQMEEVKISKKSKVGILPFVAEFEEFAGLAESIFKNAERRGDLDKAYTKLIRGVFVNVEKVANESQKTPRDVVMMENFHHIFATLSRLKISCLEAEKKEAKQKYTDHLQSYVIYSLGQPLEKLNHFFEGVEARVAQGIREEEVSYQLAFNKQELRKVIKEYPGKEVKKGLDNLYKKVDKHLCEEENLLQVVWHSMQDEFIRQYKHFEGLIARCYPGSGVTMEFTIQDILDYCSSIAQSH	540180	524079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_524730_526699_526895_529563_529764_533133_533318_536679_536909_537447_537525_538831_538940_539488
632745	scaffold_13505_pilon	+	985	4	Intergenic	novelGene_111545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	40	345	595004	596988	TRUE	20	GTATATTGTCTCCCGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHSVFTVRMRGSLLLELTRLETSHWYSPASSLLTGSMVRELLPWDSVILSISCKICPWKTHRMEIPVCLVRQIRVTGPSCSVTVVLLVQMEGFVADSRL	594964	601991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_595301_596979_597232_597627_597907_601873
632747	contig_5981_pilon	+	1964	4	Intergenic	novelGene_35526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	27.9205221218292	244	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	445	822	271511	276427	FALSE	5	CTGTAGTTTCCTTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSMGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHDWLNNLPAKASESKVRLKSQLLLQKYMAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP	271066	277569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_271543_272668_272822_274430_274564_276367
632765	contig_5732_pilon	-	2284	2	Intergenic	novelGene_119584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	659	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150194	147863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_148978_149024
632766	SIRV6	-	643	5	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8752	-130	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAATGGCGAGCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11299	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10722_10825_11035
632770	contig_4538_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_153076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTGTTTCTTGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96117	98858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_96808_97491
632775	contig_16431_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_87606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAACTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155790	154828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_154800_155800
632776	contig_2537_pilon	+	1388	13	Intergenic	novelGene_33419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_11	202.00343781453	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	366	1388	228691	239864	FALSE	75	CAGAAAGAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRR	205840	239864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846
632783	contig_10074_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_57210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGAATTGTGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616638	618966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_616600_619000
632788	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
632792	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632793	contig_9390_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_153087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGGAAATGTATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824639	825850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9390_pilon_+_824600_825800
632796	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_93638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632799	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632804	contig_5988_pilon	+	1924	2	Intergenic	novelGene_15983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAACCTCGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652806	654858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_653422_653549
632813	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
632816	contig_10434_pilon	-	2382	18	Intergenic	novelGene_82033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	254.704007600763	424	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	334	1170	150439	139455	TRUE	40	CTCAGTTGTTACTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKGEVKCIKFSLENKILAVQRTSKTVDFSNFIPDNSQQEYTQECKTKNANILGFCWTSSTEIVFITDQGIEFYQVLPEKRNLKLLKSQNINVNWYMYCPESSVILLSTTVLGNVLQPFYFRAVTMSKLPKFEIELPAAPKSTKLSLSERDIAMATIYGQLYVLFLRHHSRTSNSTGAEVVLYHLPREGACKKMHILKLNRTGKFALNVVDNLVVVHHQDTETSVIFDIKLRGEFDGAVTVHHPVLPPRSIQPYQIPAAGPASVTSQSPVPCKLCIL	151689	132740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139271_139511_142485_142598_143308_143415_143506_143597_144855_144960_145447_145589_148181_148269_149454_149512_150355_150441_151357
632825	contig_18272_pilon	+	2047	3	Intergenic	novelGene_6988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAGAAAGAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120747	126393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_122697_124257_124292_126329
632826	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_115989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671626	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
632831	contig_18869_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_56312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
632838	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
632847	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
632853	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632863	contig_10134_pilon	-	1552	4	Intergenic	novelGene_16260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTCACCTTATCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	32799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38839_39594
632866	contig_6375_pilon	-	2933	7	Intergenic	novelGene_73014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	35.574647651882	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	487	2088	404557	395248	FALSE	25	CATATAGATTGCTTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSATILFSPPSGSEATCCCCACKNETSGGGTGSQGRNPPPSTPITVTGHGLAVQSSDQLLHIIYQRVEKAVGLAEAALGLARANNELLKRIQEEVGELRQGKVSTPDEDGEGGAQSSPPEEPGPLKESPGEACKAVSAVEEECDSVGSGVQVVIEELRQLGAASAMGPGPLSFPATQRCALAASEGAFLLNPLVDDYVASEGASQRVLVPAYAKQLSPATQLAIQRVTSETGPENGTKLPPSHPEDVLSAAAALDSALEESGPGGSGELRHSLGFTASQCRTRGSGQKNSRRKRDLVLSKMVHNVHNHITNDKRFNGSESIKSSWNISVVKFLLEKLKQELVTSPHNYTDKELKGACVAYFLTKRREYRNSLNPFKGLKEKEDKKLRSRRYRLFANRSSIMRHFGPEDQHLWKDVTEELMSDEEDSLNEPGVWVARPPRFRAQRLTELCYHLDANSKHGTKANRVYGPPSDRLPSAEVQLLPPELYNPNFQEEEDEGGDENGLVSPSFDQPHKTFCPDLNSFIEIKVEKDE	415781	394402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_395668_395950_396064_396709_396814_397040_397103_401503_401825_403975_405011_415748
632871	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
632876	contig_233_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_14679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGAGTGGCACCCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92973	93319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_93000_93300
632878	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	15	341	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14423	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632925	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
632928	contig_8330_pilon	+	2057	11	Intergenic	novelGene_71858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	552	893	895911	896252	TRUE	30	AGACCCAGCGACACTCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASDPKWYVCVVEGRGFSSTASKETTEPYQTTTRERKTFFFLFSCVKISPFLPHLPSGGRESWLLRKEEEPWQDPPQVCAGHNHHIRHPRKVQLRRQVREKAGAEGGESQEG	895359	916162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_896381_896598_896717_899563_899668_900693_900852_901500_901632_902240_902357_904309_904412_904827_904896_906495_906594_907413_907446_916053
632935	contig_14273_pilon	-	1809	6	Intergenic	novelGene_21157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCCACATTCGATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151397	135379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_135519_137933_138052_139057_139183_147780_148027_148889_149540_150866
632937	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	4	354	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14412	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
632946	SIRV6	+	194	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-7	514	0	-344	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGGAAGAAGGTAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
632950	contig_17470_pilon	-	1844	11	Intergenic	novelGene_110512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	63.5034644724207	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	290	1357	277306	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPETSHFLQRDQAAIPERTLTALLLSPGRHGQAAAGPKAGWARQKPMVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302626	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_277162_277325_302355
632951	contig_7171_pilon	+	1641	7	Intergenic	novelGene_101234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_5	366.101723872235	901	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	397	1155	734335	764486	FALSE	15	GAGATTTCAGCTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLCGPRWCRALLALLGSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	733938	764972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
632952	contig_11056_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_130368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303254	305093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_303300_305100
632953	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	194	1018	54100	52925	FALSE	20	CAGAAGCAGCCCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54293	52886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
632969	contig_7898_pilon	-	1087	8	Intergenic	novelGene_47530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3244.82611087188	14	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	592	1020	283799	282118	FALSE	25	AAAAGCCCTCTGCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286096	282050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284099_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
632982	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
632998	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91671	2	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
633006	contig_6397_pilon	-	2424	18	Intergenic	novelGene_146245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	97.844449674879	450	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	205	1839	554772	437797	FALSE	5	GTTGTTGGGGTTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGEKYFSEEESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	601767	437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455598_463224_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
633042	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_96072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633049	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633051	contig_9871_pilon	+	2512	9	Intergenic	novelGene_75722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	105.164157392146	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	82	627	598042	606689	TRUE	45	AGTTCGAGGAATAGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGRETFLPI	597960	616938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606694_608257_608412_609136_609280_610796_611653_613744_613970_616435
633064	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
633075	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_93603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633078	SIRV7	+	909	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56038	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683_114961_147608
633079	contig_4754_pilon	+	2200	5	Intergenic	novelGene_35889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	35.2659538365262	176	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	492	1673	99028	102348	FALSE	25	GGGTTATATGTTTATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYGNLVSMGYEVSKPDALSRLERGEQPWTVLDESHSRTFSEIWIFDNHLPEHMKNENRMDKMKQCYEHNTLENIVHQHKSRLPFTPNHGIFDLHEKFVRSNLTLVKQSKNYEINNSAELNRGEKIFHHADHEQFHTDSKFPDSRISNTTKCQLIKHQKTQKVDKLHVCSECGKAFIKKSWLIRHQKCHKLFQCTECGKSFSQKSSLIRHQKHHRREKPFQCSECGKAFPTKQRLIIHQRSHTGERPYGCNECGKTFAYMYFLVKHRRIHTREKCVDSVKVKDPSAAHHSSSHTSDLMQEKSPVNTVTVHMTSVAAQTSVNMSGLLSNRNVVLLGQPLARSDTSDNNTDLVQQRILMNAVNVVVPMNAVNVVVPSMTNYVLFYVPQNPGIN	90878	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_90966_95835_96039_98826_99062_99337_99434_101296
633083	SIRV7	-	252	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69028	0	35809	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78929	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
633084	contig_20819_pilon	+	2592	6	Intergenic	novelGene_55613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	41.2727513015549	11	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	387	1715	22116	24253	TRUE	0	TTCCTGTCTTTTCCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSEARMETRAPCPHHSSPLNWTWNLAKG	21729	25499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_22323_22476_23309_23427_23638_24173_24654_24809_25033_25245
633086	contig_5236_pilon	+	1863	4	Intergenic	novelGene_100910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.9635786616379	277	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	519	1469	448615	452090	FALSE	20	TGAGCTTGACCTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERRKPYCVEEAMEELVGPDGQKWASMDPEERMLAAATAFTQICAGQGEGDVRREAPSTRYDPYSKASVTAGKRPVALPLQVQYPHLDCNVTSETVSEASQRLQKPVMKRKVLRRKPGGEVLVTDESIISESESGTEREMDLWDLRQRLMNMQFQEDRESPVEISQKFNLPHEYQTLTQEDQLVYYLQREGMGPPADEQDLIVASRPKSFILPRLDQLSRNRGKIDRVARYFEYKRDWDSMRLPGEDHRKELRWGVREQMLCRAEPQPKPQHVYVPNNYLVPTEKKRSALRWGVRCDLANGVMPRKQLPFPLSPS	436134	452484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_436191_446931_447290_448510_448629_451153
633088	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_94885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633091	SIRV4	-	219	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAATGTCCAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
633096	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
633097	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_116224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
633115	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
633121	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
633125	contig_13457_pilon	+	1687	15	Intergenic	novelGene_118348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	67.1123410896283	112	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1104	584	1687	68182	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRHLAHRLRRRHQRCQRRPPLAVAPPAGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59275	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60791_60849_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
633131	contig_16228_pilon	+	1730	4	Intergenic	novelGene_147942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	181.212582344604	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	37	801	47816	74151	FALSE	20	TAAAGCCTCCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHG	47779	75080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_74146
633135	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	284	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
633136	scaffold_12510_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_151399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAATAATAATAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418060	415612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_415600_418100
633141	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
633142	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
633144	contig_11752_pilon	+	1393	9	Intergenic	novelGene_37566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1375.71288338083	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	205	1089	87309	105616	FALSE	5	GTGCTCTCTTTCTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84077	105920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87305_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
633148	contig_3986_pilon	-	2176	15	Intergenic	novelGene_52667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	126.471582675674	4	69	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	609	1586	48331	35282	TRUE	15	TTTTCAATGTCTTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153860	34070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_34621_35241_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54777_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684_153742_153827
633151	contig_6710_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_97670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
633159	contig_12279_pilon	+	1162	6	Intergenic	novelGene_50104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3417	junction_3	967.051187890279	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	54	656	68297	77128	FALSE	15	CTGAGATCTTCATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57549	77634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
633163	contig_6589_pilon	-	1540	11	Intergenic	novelGene_25910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	209.55001789549	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	596	1393	1177322	1158634	FALSE	25	AGGAGGGCATCATTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATREQQRLLPVLCWGNLFPFLFSVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178507	1158486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177382_1177535_1177785_1177927_1178132_1178424
633170	contig_7202_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_18930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
633181	contig_12250_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_80696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_8	301.179737656769	2418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	71	733	401239	399347	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVSTEGSRKGLSGRRGSEKPRASPTLLQPLTRVEVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401309	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401101
633196	contig_7157_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_131301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTGTTTAATGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907689	906193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_906200_907700
633219	contig_20875_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_153092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGATTATATGAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11680	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_11700_12700
633238	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3953.40273530284	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	231	1073	34808	36333	FALSE	30	TCACAAGATGCTGGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27138	36797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268
633250	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633259	contig_1331_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_37820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	TRUE	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159604_159875_160214_160867_160949_166406_166534_169860
633274	SIRV7	-	254	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69030	2	35811	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78927	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
633277	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGTCAACCGCCAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
633283	contig_13301_pilon	+	1405	7	Intergenic	novelGene_153118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	272	junction_4	163.687710799152	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	41	1225	169218	172888	FALSE	15	TCCATTCCCCAACTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRCECLHRLCCEGGAPHAGTRIH	169177	173068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171671_171809_172002_172203_172378_172631
633289	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	635	1124	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
633291	contig_12425_pilon	+	1593	6	Intergenic	novelGene_46646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	231.15414770235	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	75	1403	173715	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKPYAEPAILMAAAACSTKAMSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173640	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
633295	contig_11370_pilon	+	807	3	Intergenic	novelGene_98727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	82	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	140	562	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145691	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
633311	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
633313	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
633335	contig_12570_pilon	-	2637	5	Intergenic	novelGene_79366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	14.8492424049175	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	42	782	300289	283433	TRUE	10	TTCTATTTTAGTCCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	300330	279989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_283699_284049_284255_293908_294088_300198
633338	contig_5210_pilon	+	2001	6	Intergenic	novelGene_65418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	663	1016	434308	438174	FALSE	35	CCCTCAAAAGCTCACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECFCHPKVLGFLSGKALVGCVASISQACLLLKPVNALLGLFCDQRIHDDMGGFSLHHWDLVHTVSGGYTGLSFLHLSFERAVVPNWQLFQLGHRGNWKPVLCLVRFSSLYKRVHSP	431298	439159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_431710_431818_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436662_438050
633339	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
633351	contig_8617_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_73399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62331	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
633354	contig_16635_pilon	-	1616	3	Intergenic	novelGene_153136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	493	828	88362	88027	TRUE	65	AAAAAAATTACAAAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRRNLKFSQQLNKSQKQRNLKLGGGGDGERSPSGAVVKALSCQQKGQQFEPPAAPREKDVQSASVKVTALEILWGSSTVLQGGCESESTQVAVRLVCFLVMGHGEVGKT	88854	53052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_53199_86052_86141_87472
633369	contig_9437_pilon	+	3348	9	Intergenic	novelGene_141741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	135.827498596565	133	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	152	862	527782	558005	FALSE	35	ATGTCAATAAATATTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCVLLLRQCPAPALWTWARGGRPAASRAKWLKEIQGPTRGSAPWLRGQERMDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPEPETTKKTEEEDVECEEDLALACDSESPVKALETDISENKTETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQVKMVLSKLYENKKIANATHNIYAYRIYCEDKQTFLQDCEDDGETAAGGRLLHLMEILNVRNVLVIVSRWYGGILIGPDRFKHINNCARNILLEKNYITLPEESSKAVGKNKKVKKDKKRSEH	524067	560491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_524191_527753_527817_535608_535695_538464_538588_549658_549757_551903_551978_554779_554871_557035_557171_557936
633374	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
633393	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
633404	contig_6929_pilon	+	1260	10	Intergenic	novelGene_139381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5921.48613937122	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	549	857	127176	130935	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGERTPESPEQPHRRRRPSYHHSPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDG	101632	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101702_101866_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130862_130929_130971_131948
633405	contig_7202_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_18655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGAGGCCTGGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
633407	contig_13952_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_133249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGGTGTTTATGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56809	55811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_55800_56800
633411	contig_12427_pilon	-	1525	5	Intergenic	novelGene_40463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2184	junction_3	1899.97781237045	8	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	138	650	316061	314393	FALSE	20	GTTTGACTAAAGTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325976	313517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_325856
633412	contig_18544_pilon	-	2608	16	Intergenic	novelGene_152759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	20	junction_15	62.3952989682182	193	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	138	1892	207825	152702	FALSE	15	TTGCTTTAATCTTGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRLRVVASPCNLVCRHLHRKEKGKPLMLNPRTNKGMAFTLQERQMLGLQGLLPPKIETQDIQALRFKRNLKKMTDPLEKYIYIMGIQERNEKLFYRILEDDIESLMPIVYTPTVGLACCQYGNIFRRPKGLFISISDRGHIKSIVDNWPENDVKAVVVTDGERILGLGDLGVYGMGIPVGKLCLYTACAGIRPDKCLPVCIDVGTDNPALLKDPFYLGLYQKRDRSQRYDDLIDEFMKAITDRYGRNTLIQFEDFGNHNAFRFLRKYREKYCTFNDDIQGTAAVALAGLLAVQKVIGKPISEHKILFLGAGEAALGIANLIVMSMVENGLSEDEAQKKIWMFDKFGLLVKERKSKIDIHQEPFAHLAPESIPNTFEDAVNVLKPSAIIGVAGAGRLFTPNVIKAMASINERPVIFALSNPTAKAECTAEEAYTLTEGRCLFASGSPFEPVKLSDGQVFMPGQGNNAYIFPGVALAVILSGTRHICDTVFLEAAKALTDQLTDKELSLGRLYPPLANIQEVSVNIAIKVIQYLYAKKMAFRHPEPEDKAKYVRERLWRSEYESLLPDVYEWPESSSKPPQIAD	217820	151985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_152870_156615_156715_158025_158097_162003_162107_169057_169201_171107_171223_173678_173793_174123_174222_175501_175612_177345_177450_179106_179269_180352_180429_183535_183686_194114_194249_207717_207838_217695
633423	contig_7816_pilon	+	1522	10	Intergenic	novelGene_66502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	784.427856292977	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	83	1342	170169	211585	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESHQPGTKKREAK	170086	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207619_211547
633426	contig_14322_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_116602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTGCACGGCCGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
633432	contig_13021_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_8124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAAAGTGGATGTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168970	167246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_167200_169000
633433	contig_13021_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_8123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAATCAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167145	164677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_164700_167100
633434	contig_11338_pilon	+	1549	8	Intergenic	novelGene_6158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	530	junction_6	449.944032800815	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	446	1336	6086	8437	FALSE	35	AAGGAAAAGCAGCTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPVSPQAGRGISPPAHPIAQVPTAPLQPSFPHFLPLCASPTLLLPQTYLRAFAPAVPSAWDIFLPLHVSALYLFPVLVQMSPSH	745	8650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964
633435	contig_6102_pilon	+	2116	14	Intergenic	novelGene_31863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_3	517.277545589984	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1053	1895	373928	376333	FALSE	65	AACAAACAAAAGAACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVRESSIQSPSPH	370752	376554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373183_373275_373405_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207
633442	contig_17274_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_26588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCATTTTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242619	243042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_242600_243000
633443	contig_17274_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_26590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGAGGTTGTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243092	245142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_243100_245100
633448	contig_8617_pilon	-	149	1	Intergenic	novelGene_73488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAGGGATAACAGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63522	63373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63400_63500
633449	contig_12402_pilon	+	2654	2	Intergenic	novelGene_133393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_1	0	2	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	310	1944	659800	661788	FALSE	10	ATGGTCTGTGAGTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSSCLYCFVSSCETSLKIIWSVFKQDDNGQTFMKNDSSSSMLGKICEFHGIEHQYNNQGRHVRIFTVESLCESKDGKVNKGEEGNQCGKTFTSIGNLTSLKRTEGNPFECLECGKAFMDNSSFKHHIRSHTGYKPYHCKECGEDCRCPYLKPRLREKLCKCKDYGKPCSCSLSLTSHLRTHNGERPYECKECGKAFSYLSSLIRHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLATHIRTHSGERPYECKECGKAFTCSSSLTTHMRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRSHSGERPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIRTHSEERPYECKQCGKAFKQFTQLTTHIRTHSEERPYECKECGKAFKQFVQLTRHVRVHSGEKPYECKECGKSFSQFSYLTGHIRAHNGYRPYECKECGKAFIRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFFRSSHLTDHVRSHSGEKPYECKECVKAFSCFSSFRKHVRTYHGNRPYDSKECEKAFSQFSHLTDHIRSHSGENLQCSELLSYGPSNHGLVTPTK	659490	662498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_659994_660347
633452	SIRV7	-	351	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33217	1	-2	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
633456	SIRV4	+	222	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1520	661	1065	-29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAACATAAGTCAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	2742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
633459	contig_8259_pilon	-	2142	10	Intergenic	novelGene_148878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	158.650637223296	425	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	169	1335	392235	181319	FALSE	20	AAAGGCTCCTGTCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAHAESPPSVNNLKTEGKNKDEGEVCNREKKAADTSLEPYPEEKKKKRSGFRDRKVMEYENRIRAYSTPDKIFRYFATLKVINEPGESEVFMTPEDFVRSITPNEKQPEHLGLDQYIIKRFDGKKISQEREKFADEGSIFYTLGECGLISFSDYIFLTTVLSTPQRNFEIAFKMFDLNGDGEVDMEEFEQVQSIIRSQTSMGMRHRDRSTTGNTLKSGLCSALTTYFFGPDLKGKLTIKNFLEFQRKLQHDVLKLEFERNDPVDGRITERQFGGMLLAYSGVQSKKLTVMQKQLKKHFKEGKVGSFTWRKKRNHGNIYCKGPNVMGLTFQEVENFFTFLKNINDVDTALSFYHMAGASLDKVTMQQVAKTVAKVELSDHVCDVVFALFDCDGNGELSNKEFVSIMKQRLMRGLEKPKDMGFTRLMQAMWKCAQETTWDFAFPKQ	406656	180511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_181480_185324_185415_230425_230535_245329_245537_292588_292787_301983_302067_341829_341945_363021_363066_392075_392239_406491
633464	contig_8304_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_153174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111750	109768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_109800_111800
633474	contig_14441_pilon	+	756	3	Intergenic	novelGene_100709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	109	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	116728	117610	FALSE	10	TTGGCGCTGCCTACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116576	117786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
633475	SIRV7	-	237	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91678	11	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
633477	contig_11338_pilon	-	1906	11	Intergenic	novelGene_6237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	100.374498753418	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1147	1815	13877	12549	FALSE	25	GTTAAAGCTGTAGATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21369	12457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14105_14167_14528_15189_16641_16770_17075_17288_21286
633493	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
633508	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
633515	contig_7512_pilon	-	1887	14	Intergenic	novelGene_153194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	111.604012568105	632	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	105	1169	140730	108364	TRUE	15	CCACTTCGAGAGTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKIKVLQKLGKADETKDEQFEQCVQNFNKQLTEGTRLQKDLRTYLASVKAMHEASKKLNECLQEVYEPDWPGRDEASKIAENNDLLWIDYHQKLVDQALLTMDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSKLNQNLNDVLISLEKQHGSNTFTIKAQPSDGAPAKGNKSPSPPPDGSPAATPEIRVNHEPEPAGMAAPGATLPKSPSQPGEASEVAGGTEPAAGGQEPRETAASETASSSLPAVVVETISATVNGAVEGGSGAGRLDLPPGIHVQGTGPA	140834	105715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_109049_109140_116678_116827_120235_120319_121698_121775_122012_122099_126699_126808_128472_128569_128951_129047_129306_129362_134475_134557_140712
633527	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	40	3411	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
633530	contig_9482_pilon	+	1640	11	Intergenic	novelGene_44307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	340	1035	1236476	1240870	TRUE	15	CGGCCTCTCGCGGGAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLHIIGALVQTVDAQRWVRLLHLAGAHLSHRLDGVHATVLSKGHGDDLQRVGERPHGVLLQGRALSASWLTARAQEISAAPPPYTTRLSRMRFRMTHKASCRDRLASSMIILFPPRMKMVTALEFLHCSMTSILSFVVPNEISFTSPAKPSFSAVSSENRGTMRPPVAMAISSISGPPTQRTAGKLLWRSKWFASSSKPHWQTARLAPVSLICWIISSNFSFSYFWRAL	1236136	1253224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1237438_1238170_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240971_1241045_1241084_1242526_1242603_1244305_1244463_1245317_1245387_1253059
633532	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
633537	SIRV5	+	400	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-70	875	44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8245	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
633539	contig_14441_pilon	+	928	4	Intergenic	novelGene_100684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_1	564.488165410834	180	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	190	450	116728	117123	TRUE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	113670	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113711_116578_116963_117097_117344_117539
633541	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633550	contig_8693_pilon	+	2605	16	Intergenic	novelGene_150866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	59.4528384520033	197	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	141	1736	1081094	1197232	FALSE	45	ATAAGCATTTTAAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLALGATGGRGAMEDEEDQPELSDSGDEAAWEDEDDAELPHDKQQTPCLFCDRLFTSAEETFLHCKSEHQFNIDNMVHKHGLEFYGYIKLINFIRLKNPTVEYMNSIYNPVPWEKEEYLKPVLEDDLLLQFDVEDLYEPVSLPFSYPNGLSENASVMEKLKHMEARALSAEAALARAREDLQRMKQFAQDFVMNADVKTCSSSTAAIADLQEDEDGVYFSSYGHYGIHEEMLKDKVRTESYRDFIYQNPHVFKDKVVLDVGCGTGILSMFAAKSGAKKVLGVDQSEILYQAMDIIRLNKLEDTIILIKGKIEEVRLPVEKVDVIISEWMGYFLLFESMLDSVLYAKHKYLAKGGSVYPDICTISLVAVSDVNKHADRIAFWDDVYGFNMSCMKKAVIPEAVVELVDPKTLTSDPCCIKHIDCHTTSIADLEFSSDFTLKITKTSVCTAVAGYFDIYFEKNCHNRVMFSTGPQSTRTHWKQTIFLLEKPFSVKAGEALKGKITVHKNKKDPRSLIVTLTLNNSTQTYGLQ	1080953	1198101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1081122_1081375_1081512_1083351_1083435_1084782_1084833_1085763_1085867_1089060_1089221_1090800_1090946_1095069_1095136_1099982_1100105_1125092_1125193_1143376_1143456_1152657_1152846_1155205_1155293_1182181_1182233_1182427_1182516_1197122
633560	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
633562	contig_4151_pilon	+	2675	25	Intergenic	novelGene_65287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	91.1058221703385	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	70	2427	707721	828280	FALSE	35	CAAGTTCAGTATCCTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPQFYISKIPICIRNGCGSRHRHFLMANKQRSLPLPRTREISAGIMASPLRFDGRVVLVTGAGGGLGRAYALAFAERGASVVVNDLGGDFKGDGKSSLAADKVVEEIRRKDGKAVANYDSVEAGEKIVKTALDAFGRIDIVVNNAGILRDRSFARISDEDWDLIHRVHLRGSFQVTRAAWDHMKKQNYGRIIMTSSASGIYGNFGQANYGAAKLGLLGLSNTLAVEGRKNNIHCNTIAPTAGSRMTKTILPEDVLEGLKPDYVAPLVLWLCHESCEENGSLFEVGAGWIGKLRWERTLGAIVRQKNQPMTPEAVKANWAKICDFDNTSTPQSIQESTGSIIGVLSKIDSGGVSTNHTSHTASTTTSGFDGAIGHQLPPFSSAYTELEAIMYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLKQFADNDASRFKAIKVRFVKPVYPGQTLQTEMWKEGNRIHFQTKNKETGDIVISNAYVDLVTTSEASDISAQTTSEGGELQSTLVFEEISRRLKDVGHEVVKKVKAVFEWHITKGGNVAAKWTIDLKNGSGKTYQGPAEGSADITIIISDEDFMQVVLGKLDPQKAFFNGRLKATGNILLSQKLQMILKDYAKL	707651	828528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_707854_723769_723836_726654_726709_740934_741043_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757522_760496_760598_763406_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940_793048_799587_799675_803058_803155_804394_804534_811593_811722_828190
633563	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1116	2	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
633571	SIRV2	+	333	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	264	-74	-264	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATCACTGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
633574	contig_211_pilon	-	2628	16	Intergenic	novelGene_129855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	142.169132452239	44	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	110	2251	98758	77830	FALSE	15	TGTGTGAATTTATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGLYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYIGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIITKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERSYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKVKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDVQPSFSEDIPKIKKFSKTRSKDIFDQLARSLAPSIHGHEYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDSEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSVVDILATDDPNFNQEDQQDTQIYDKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKLVKPVLTQESAAYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRNEDESETEDEEEKSQEDHEQKKKRKKTRHSEAKDGDSYDPYDFIFLS	98867	77452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_77844_80549_80609_81082_81187_82164_82306_86086_86238_87063_87191_87563_87739_90156_90366_90931_91064_91417_91572_92394_92501_92983_93223_95861_95993_96865_97075_97505_97619_98680
633579	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
633580	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
633589	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633605	contig_3986_pilon	-	2682	12	Intergenic	novelGene_52681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	101.612535831051	1	107	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	998	1474	41485	35282	FALSE	25	ATATTTTCAATGTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108507	34073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_46174_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54777_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396
633611	contig_12756_pilon	+	1677	10	Intergenic	novelGene_153202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	113.368621957067	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	369	1100	47123	64000	TRUE	35	TATAACAAAGTTGTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAGQSRTAP	46754	66922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_63977_64092_66436
633630	contig_6710_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_92997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
633642	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
633646	contig_3132_pilon	-	2798	12	Intergenic	novelGene_127449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	24.978006854957	159	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	84	1031	369684	361218	FALSE	75	TAAAAATAAAAAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRAGSEFADKLILPLSLKSTVLCLSRMEADLSGFNIDAPRWDQCTFLGRVKHFFNITDPRTVLVPEQELDWAKMMVEKSRMGAVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNIIGRMSFQVPGGMIITGFMLQFYRTMPAVVFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNLLTKRAPPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIQGICVKDKNHSEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMAAPGMRAFKDILSLEKDALGLEVHDLLCDYSLTTSPHGTTGEAAFHEESQGPACPIAGHAVWVLPHLHGASGMRALPTDM	369767	359450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_361221_362047_362096_363923_363974_364326_364377_364592_364669_365018_365086_365467_365529_366805_366892_367360_367437_367926_368026_369184_369356_369523
633647	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2761	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
633652	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	632	1116	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
633653	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
633660	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
633676	contig_9505_pilon	+	1691	15	Intergenic	novelGene_121817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	40.1027379593555	375	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	117	1526	404142	447348	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVTGQFPWSSLRETDRGLSAEYSFPVWKTSHTVKWEGVWRELGCLARTASFAVRKESGHSLKSSLSHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404025	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419604_422552_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
633681	contig_9797_pilon	+	1240	3	Intergenic	novelGene_65603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_2	69.5	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	74	457	188724	191368	FALSE	10	GAGTTCTGCGTTTTCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	188650	192151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_188734_189277_189422_191138
633689	SIRV2	-	595	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4278	34	3103	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
633697	contig_7293_pilon	+	968	3	Intergenic	novelGene_54241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	646	junction_1	44	4453	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	61	417	329270	330139	FALSE	20	GCAGTGGTTATTTCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRHNTTSCTSVSPFGVLQVWLLLSLLLTALVPGTSQETNCVEAELYTELRCMCVKTTSGVHPSYINTLKVIRAGAHCNKVEVIATLKDGKKICLDPEAPIIKKIVQKILQSDGSAA	329209	330690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329388_329744_329881_330036
633704	contig_10629_pilon	+	2803	14	Intergenic	novelGene_52910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	142	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCAGGACTGCGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245853	267940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_247140_247316_247402_248128_248170_248335_248410_252333_252438_253094_253216_253749_253900_254170_254230_254591_254691_255096_255142_256068_256223_256593_256667_256939_257147_267635
633708	contig_987_pilon	+	2162	5	Intergenic	novelGene_72341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	380.890404184721	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	489	1397	1286769	1304347	FALSE	75	TTAAGAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTVGSKKSRYVLCKLSDYHYHPLEEKCQRRPCLQCLWAVLQAAQY	1285829	1305112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1285917_1286367_1287010_1289450_1289988_1300073_1300200_1304342
633710	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
633712	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633714	contig_8242_pilon	+	2092	11	Intergenic	novelGene_80181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	450.817967698715	1838	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	632	1465	30708	37065	FALSE	20	CAAATACGGGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNWDEKKLEEVVNKKHGEAEKKKPKTQIVCKHFLEAIENNKYGWFWVCPGGGDMCMYRHALPPGFVLKKDKKKEEKEDEISLEDLIERERSALGPNVTKITLESFLAWKKRKRQEKIDKLEQDMERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3401	37692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_5536_5591_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702_30795_31973_32157_33656_33804_33959_34062_35060_35185_36874
633721	contig_3095_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_75108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCAGTACAGACAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152247	147196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995_151160_151846
633725	SIRV2	-	286	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	34	3412	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
633728	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	42	3079	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
633755	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_90376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633760	SIRV4	+	294	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1477	632	1022	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
633761	contig_2027_pilon	+	2087	15	Intergenic	novelGene_39943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	59	junction_6	84.893360476902	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	421	2037	639829	648685	FALSE	15	GGTGTACCATGTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLTAQSFSTDAAGTRGGGDGAHRRNPSPASMSSGRKSPHSKSPSEQRERKSLADEKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVAQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQVGWVEGLDTLGRGL	637852	648735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643195_643224_643301_643448_643533_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505
633771	contig_14925_pilon	-	1083	5	Intergenic	novelGene_55109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	1545.02928774829	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	27	545	67931	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSSSHPAMPLPECFCKALKGWVNYAGAGNKLIFGTGTLLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	67957	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_67822
633776	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
633777	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
633785	contig_14441_pilon	-	693	3	Intergenic	novelGene_100659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	117785	116874	TRUE	55	AGTTAACACACCAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGLKKRSSPARPQTTALTFWVTGLGRVSPHSSSAESP	117787	112111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_112152_116576_116968_117525
633793	contig_5988_pilon	+	2694	1	Intergenic	novelGene_15884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	488	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGGACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479071	481765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_479100_481800
633797	contig_10299_pilon	-	2585	5	Intergenic	novelGene_79756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	28.69995644596	373	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	637	2016	592066	580210	FALSE	0	TGTGGGCTTCTTCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLTRGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622528	579640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580419_584724_584887_591057_592506_593399_593495_622426
633830	contig_854_pilon	-	2581	10	Intergenic	novelGene_36420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	112.439064429924	8	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	422	757	1074160	1068926	TRUE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGFSKG	1081800	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1068944_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
633857	contig_3825_pilon	-	2207	7	Intergenic	novelGene_77968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	127.784649573674	535	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	62	871	39691	27914	TRUE	20	TGCAGTGTGATCATCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPSAEQASEPASPRASAAAMGQNDLMGTAEDFADQFLRVTKQYLPHMARLCLISTFLEDGIRMWFQWSEQRDYIDSTWNCGYLLASSFVFLNLLGQLTGCVLVLSRNFVQYACFGLFGIIALQTIAYSILWDLKFLMRNLALGGGLLLLLAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	39752	25821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_26191_26946_28181_29179_29367_30072_30117_30782_30860_31393_31581_39643
633860	contig_7202_pilon	+	178	1	Intergenic	novelGene_17584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCCAGGGTGTGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
633871	contig_5302_pilon	+	2205	3	Intergenic	novelGene_81492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	2007	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	57	848	342315	355700	FALSE	20	TGATTTTATTAAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342258	357057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
633899	contig_8538_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_4777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
633902	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
633910	contig_2087_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_65570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCACTCATTCTCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71631	70177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_70200_71600
633911	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_114015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
633915	contig_9290_pilon	+	2591	12	Intergenic	novelGene_77568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1858	2157	506728	509197	TRUE	0	GGGGCGCCGGCGCCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPLAQGTGPDSLAIGPNKSKERPESIWSEPLAECFLIQGLCEESPQKIQLALEFVPQEFVDNFFLLIGCFVTELGKEPDPTIFILSLHSPWPPSGPSA	502894	516546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_504441_504532_504604_505280_505381_506186_506244_506644_506750_507091_507163_507444_507507_508549_508661_509163_509229_509605_509731_510198_510368_516437
633917	contig_15866_pilon	-	1166	13	Intergenic	novelGene_63630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCGACGAGTGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633134	458917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_459066_519221_519275_581432_581473_581683_581703_608105_608228_613653_613758_619603_619743_620760_620840_623213_623331_624422_624505_626203_626331_627916_627992_633073
633923	contig_12270_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_114113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACTTTCACCATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
633931	contig_8616_pilon	+	1408	10	Intergenic	novelGene_72575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	886.729418553594	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	18	1328	425778	436516	FALSE	10	TCATGTCCTGCCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLWQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428784_430484_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
633932	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
633945	contig_546_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_117215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTCACTGTGTGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121044	123354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_121000_123400
633956	contig_13457_pilon	+	1898	13	Intergenic	novelGene_118349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	69.1670682719264	5	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	136	873	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTPSPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59275	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60872_67340_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
633962	contig_10205_pilon	-	1863	16	Intergenic	novelGene_143107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	70.9868219382224	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	621	1766	236815	220058	FALSE	15	TCTCGGATCCATAGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPIWADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDLPESAVRDLIIATIAVKYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	256321	219960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229502_231373_231464_232780_232867_233949_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237311_237880_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
633984	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
633991	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_93571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634000	contig_2078_pilon	-	2219	9	Intergenic	novelGene_100192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	66.9821571390471	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	89	1909	535379	521659	FALSE	60	AAAAAAAAGATAATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGCLPLSL	535467	521348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
634001	contig_7695_pilon	-	2365	1	Intergenic	novelGene_41566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385499	383134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_383100_385500
634002	contig_6048_pilon	+	2425	6	Intergenic	novelGene_73262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	68.1422042496425	25	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1510	1902	1977201	1977696	TRUE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPELLAHISAFCLRPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVGELGLEPQRGAGKVGTFLCSHVTSKCVYFSPVVLGPDAFSSQRASNPGCGGASPSCCPFFSLDM	1972075	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974327_1975328_1975406_1976314_1977307_1977409_1977868_1977950
634008	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	91	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634018	contig_12671_pilon	+	2205	7	Intergenic	novelGene_19227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	587.849021622238	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	579	995	206763	211199	FALSE	15	TGTTTCTTCGTGTTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDVSMLFNTFDIYIKTNKPVLEEVQPECSP	197492	212409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197747_200235_200410_203720_203804_206695_206772_207057_207206_210609_210724_211053
634020	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634025	contig_5690_pilon	+	1567	11	Intergenic	novelGene_119734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	470.275196028878	235	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	46	1092	1044729	1105490	FALSE	30	AGAGAAATTTCACGTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNINLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044683	1105965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086514_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
634037	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634039	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634041	SIRV7	-	260	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91662	4	-91656	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAACCGATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
634044	contig_10629_pilon	-	2519	21	Intergenic	novelGene_52934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	77	junction_20	240.440637164353	268	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	34	2385	383003	353156	FALSE	10	TCTTTATGTGTGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLTDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLVGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVHNR	383036	353021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_353268_354225_354315_356287_356395_357347_357457_357911_357973_359037_359122_360253_360328_360849_360986_363537_363644_364297_364492_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372183_372258_372880_373047_374990_375096_377674_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
634046	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	62	517	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
634056	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_90324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634061	contig_12079_pilon	+	2160	16	Intergenic	novelGene_67408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	153.037889280908	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	206	1840	494650	578891	FALSE	15	GTAACCTGTGTCTCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGEEHRPLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	491118	579211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494677_494728_494839_510897_510963_531245_531298_532326_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
634068	contig_10106_pilon	-	2963	1	Intergenic	novelGene_73908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	237	671	244814	244380	NA	45	AAATTAAACGGGAGCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGSPGGNRYPPQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGGWGQGGTHSQWSKPSKPKTNMKHVAGAAAAGAVVGGLGGYMLGSAMSRPLIHFGNDYEDRYYRENMNRYPNQVYYRPVNEYSSQNNFVHDCVNITVKQHTVTTTTKGENFTETDVKIMERVVEQMCITQYEKEFQAYQRGSSVVLFSSPPVILLISFLIFLIVG	245050	242087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_242100_245000
634077	contig_15063_pilon	+	985	3	Intergenic	novelGene_14401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	353	841	36064	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35217	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35873_36158_36266
634078	SIRV5	-	346	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCAATCTCTCTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
634079	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634083	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634090	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634108	contig_6557_pilon	+	2530	3	Intergenic	novelGene_33012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	19.5	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3	437	579694	580617	FALSE	40	TAGCTTCCTAAACTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLYVRDNTGVLGCELIDLDLSWLGHLFLFPSWSYLPPARRNSSGEGHLELWGAPVPVFPLTVSPGPASPIPVLYPEIASRLLRQRSKVRVVYPNLAGKLVRLSALVNSHRKTYFVLSLGSSSPAVSHVPIVVQVRIRAGSEAWR	579691	582710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_579736_579881_580094_580436
634109	contig_5463_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_144779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	530	916	47218	46832	NA	30	CAGTGGAGTTGGAACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANQKPGSPNPPSTPWKPYEAVLLCPLGSLWVRNNLIATGLVWFWSLLITCSKYMRQSLTILTSKEPSGCTSSKTDLFILLQVHSIFNILRQHHNLNLSTLLWSSIFIVQLLYAYVLVRCYRVSSDS	47747	45979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_46000_47700
634110	contig_10629_pilon	-	2465	14	Intergenic	novelGene_52926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	357.741419291816	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	190	1446	256957	247024	FALSE	40	ATGTGTATATAATTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPGEKQTELMRGELERGLSRLNGEGQRGRMDRGNSLPCVLEQKIYPYEMLVVTSKGRTKLPPGVDRMRLERHLSAEDFSRVFSMSPEEFGKLALWKRNELKKKASLF	257146	246004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247759_248073_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939
634121	contig_5686_pilon	+	2405	3	Intergenic	novelGene_45309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCTCCTTCCAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95639	99366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_96074_96924_97738_98208
634139	contig_14167_pilon	-	1471	3	Intergenic	novelGene_105534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	747	725	1471	22529	21738	FALSE	5	GGTTTATTTTTGGTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSAFVNCASYPCWRQRQQEPCVLCQEAALQSSCHSLLLLTRVLSVPALEGPPNGPTGTSPRLESPHRGSVAGQSCGAGKFPSGTRKTVGPVSCVGVHEDRVACSRPWGCGGGLIYAGFPPRVTQWLSSSSPAPGSVPEPCPLLEGNCEESTEVCRGPSSLPIGHPFARQAFTPPSDESLRPALTEICVPCEMGAPKLLGGLPPPGTCLATASEIRCPLTCLRIWNLILYIVSMPVLYVFLSLRVFSL	23415	21737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_22080_22124_23175_23336
634140	contig_8801_pilon	-	2793	7	Intergenic	novelGene_66293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	34.4419801985891	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	72	1709	509350	500441	FALSE	25	TGTAAAGCTTAGACTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFAEDETYQYIRHNPSRFFHVDVFEILPYLSCLTPSDQDRLRAMYTSRGNRDTLWYLFDCLKRRSGWVDSLIKALRACELASLAEEVARVYSSNLPRTLNCPSAPLEPLSVSAEVPGPAAAPSAPHNSYREDKPSYPTPVQDTQPPESQEERSEEALQTPSSGAVPRRPGGPQGPSSDLAALSPPTSSRHQEQDTDLDSTHTAGVVSSPLSPRGPVSPSVSFQPLARSIPRASRLPGPPLSSPSTGTSSSSTPTGLASAGGAGDQAKVTICSSETGVPTNPVTTSTAPTRVPTNSARTSTAPSKLPMMPVNTVPSKAPATSTFASTAPSKLPTSLKPPGTMPSNVLPSRLPTNSVHVGTVPSKASTGLGSDHRMPASVVPNEVPANTVPTSKSSSRPEETPAAPAPAGTGGSSPWPDSSLETVGSEQELTKPGVLVSRIDSQPFSGSSEDLAISRSYSQDAGPSNIPEEDEYVSRSTDSFEIHVTESPTADLLDGNPGSRAAPQPPVQEMPAITVVWAPWLGAAAAAALMATILTVLYRRRLLH	516503	499356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_500882_501722_502307_504255_504413_505136_505301_507311_507487_509233_509403_516484
634145	contig_4364_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_2761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532984	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
634149	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634150	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634151	contig_8330_pilon	+	1338	7	Intergenic	novelGene_71802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	669.699787632903	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	140	769	852673	857242	FALSE	5	CGCTGCCCAGCCTTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCSVSSLNTSKPTSCTCDHPPLPRLWACGDWTWRDCGPGAPAHWAQN	837611	857811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855025_857103
634162	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634163	contig_4908_pilon	+	2898	23	Intergenic	novelGene_117381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_17	73.4659222737807	362	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	867	2604	57	2660	231287	332813	FALSE	25	TTTCAAAACTTTTGGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEFIEEKENRLLQLCQRTMALPVGRGMFTLFSYHPVPTEPLPIPKLNLTGRAPPRNTTVDLNSGNIDVPPNMTSWASFHNGVAAGLKIAPASQIDSAWIVYNKPKHAELANEYAGFLMALGLNGHLTKLATLNIHDYLTKGHEMTSIGLLLGVSAAKLGTMDMSITRLLSIHIPALLPPTSTELDVPHNVQVAAVVGIGLVYQGTAHRHTAEVLLAEIGRPPGPEMEYCTDRESYSLAAGLALGMVCLGHGSNLIGMSDLNVPEQLYQYMVGGHRRFQAGMHREKHKSPSYQIKEGDTINVDVTCPGATLALAMIYLKTNNRSIADWLRAPDTMYLLDFVKPEFLLLRTLARCLILWDDILPNSKWVDSNVPQIIRENSISLSEIELPCSEDLNLETLSQAHVYIIAGACLSLGFRFAGSENLSAFNCLHKFAKDFMTYLSAPNASVTGPYNLETCLSVVLLSLAMVMAGSGNLKVLQLCRFLHMKTGGEMNYGFHLAHHMALGLLFLGGGRYSLSTSNSSIAALLCALYPHFPAHSTDNRYHLQALRHLYVLAAEPRLLVPVDVDTDMPCYALLEVTYKGTQWYEQTKEELMAPTLLPELHLLKQIKVKGPRYWELLIDLSKGTQHLKSILSKDGVLYVKLRAGQLSYKEDPMGWQSLLAQTVANRNSEARAFKPETISAFTSDPALLSFAEYFCKPTVNMGQKQEILDLFSSVLYECVTQETPEMLPAYIAMDQAIRRLGRKEMSETSELWQIKLVLEFFSSRSHQERLQNHPSRGLFMNSEFLPVVKCTIDNSLDRWLQAGGNVCVQAYLSRQPFEESQLSMLACFLVYHSVPAPRHLPSIGLEGSTSFAELLFKFKQLKMPVRALLRLAPLLLGNPQPMVM	228505	333051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_228537_231261_231381_234635_234908_244497_244733_246911_247004_248558_248694_248862_248946_249851_249931_260054_260130_265600_265678_266220_266312_266405_266460_267354_267549_292469_292557_294593_294712_296001_296080_296440_296509_297480_297620_298721_298809_306532_306629_307762_307962_316449_316585_332697
634170	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634173	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_93962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634175	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
634178	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_18681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTACCTGTCCATGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
634185	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_18838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATCCCCCTCGCAGGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
634195	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634210	contig_9646_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_117470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAAATCCCATACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364750	365136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_364800_365100
634222	contig_7457_pilon	+	2343	11	Intergenic	novelGene_31327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_9	224.812277244816	4	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	372	1718	281205	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280833	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
634224	contig_9871_pilon	+	2165	10	Intergenic	novelGene_75720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_7	88.4659382034816	202	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	82	1593	598042	614769	FALSE	40	TACTTAATACAGAAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGLIECYLASNSIREAMVMANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLSREQKYEDGIALLRSALANQSDCVLHRILGDFLVAVNEYQEAMDQYSIALR	597960	615341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_614614
634238	contig_10235_pilon	-	1969	20	Intergenic	novelGene_46392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	97.5466647331113	598	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	47	1723	192397	177880	FALSE	10	CTGGCTGGCTGATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLLSCVLGPRLYKIYRERDSERTPSGVPEPPTTVTTPSSSSWDTYYQPRALEKHADSILALASVFWSISYYSSPFAFFYLYRKGYLSLSKVVPFSHYAGTLLLLLAGVACLRGIGRWTNPQYLQFITILEATHRNQSAENKRQLSKYNFDFRSWPVDFHWEEPSSRKESRGGPSRRGVALLRPEPLHRGTADTFLNQVKKLPCQITSYLVAHTLGRRMLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192443	177633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_190402_190470_191199_191257_192265
634239	contig_2069_pilon	-	869	3	Intergenic	novelGene_23521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	417	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509889	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509212_1509733
634244	contig_20058_pilon	-	1710	9	Intergenic	novelGene_109279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	638.682909881735	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	53	1279	59150	30516	TRUE	25	CTGATGTGTAAAGCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGGSAGGGGGGRGRRKMADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59202	23447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_23874_30510_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39448_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
634247	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_18475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634248	contig_3449_pilon	-	1713	12	Intergenic	novelGene_73708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	228.096579515732	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	368	1192	322075	299208	FALSE	20	AAAGGTGTATTGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGSLLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLITLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAMLLQPNKKTIKKLREVLYELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK	346958	298686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_299304_305148_305276_306287_306386_307835_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_318314_318407_322018_322114_327360_327429_328710_328880_346866
634250	contig_4180_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_8340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1177.34436763421	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	67	723	865772	888134	FALSE	60	AGTTAAAAAAAAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865705	888667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
634271	contig_16103_pilon	-	1819	8	Intergenic	novelGene_118905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	113.468686681141	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	582	1034	762237	759680	FALSE	55	ACAAACTGTTAGAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDAIRASEIPFHAEGRHPRSLMGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	766617	758894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761648_762206_762261_762483_762602_763340_763447_765904_766007_766385
634281	contig_5951_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_153245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197612	198104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_197600_198100
634287	contig_7410_pilon	+	1958	7	Intergenic	novelGene_106084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	324	junction_5	175.92959450366	30	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	107	505	405351	407259	TRUE	25	AGAATTTTGATTTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	405244	412179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
634291	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	642	1119	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
634294	contig_12270_pilon	-	295	2	Intergenic	novelGene_114118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTTCACTTTCACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634314	SIRV4	+	329	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	632	987	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
634325	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_93555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634330	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634331	contig_10341_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_47241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	73.8928954636371	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3	452	136040	156517	FALSE	30	TAGTTTGAGCACTACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFAEDPVSEVVPEVTAERTRAFPGAETQDLKRFLYKKLPSVEGLHAIVVSDRDGVPVIKVANDNAPEHALRPGFLSTFALATDQGSKLGLSKNKSIICYYNTYQVVQFNRLPLVVSFIASSNANTGLIVSLEKELAPLFEELRQVVEVS	136037	157296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_136124_139287_139323_147431_147491_149233_149368_151628_151693_156443
634333	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
634335	contig_13760_pilon	+	2786	4	Intergenic	novelGene_61311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAAGCCCTCTCGCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177475	194542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_179610_180117_180154_191856_192339_194408
634338	contig_10494_pilon	+	1901	10	Intergenic	novelGene_102220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	55.9166045702586	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1737	163	1899	1254686	1300155	FALSE	15	AGGGACCTGGATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLVTLPLRRLAWAWASGWPAPLKHRGRGLLHTASTTCPDSSAPVFTRALAFGDRTALVDQHGHHTYKDLYQRSLRLSQEICRLRACTSGDLGEERISFMCSNDASYIVAQWASWMSGGVAVPLHSKHPAAQLEYFIQDSRSSVVMAGPEHLELLGTVASKLGVPLLPLLPDIYSGAAEGLVGGEAPAPSWKEWGWKERGAMIIYTSGTTGLPKGVLSTHCNVSSMVTGLVDKWTWTPDDVILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTGDTVMFKDGRYWIRGRTSVDIIKSGGYKLSALEIEQHLLAHPSITDVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLRDGHSLSQQELREWARKKDVYPVLRALLSRVPQSPGLWVVRSRSCSSSDSSSP	1240294	1300157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1240418_1254646_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283905_1284033_1297703_1297839_1298214_1298327_1300043
634344	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
634360	contig_14711_pilon	+	1868	12	Intergenic	novelGene_68895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	411.257153470905	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	51	1625	82000	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALLTVLGFLLALSRGERELDTKIPSPGGGHGMGGILTCLYWGPASQLPPVEMPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	70416	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82160_84855_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86182_88238_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
634364	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
634380	contig_6735_pilon	-	1547	12	Intergenic	novelGene_15682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1029.12155431403	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	133	1341	554315	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQQPEREPGVVVRSWDSESQTHDWSIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGWTSLLMDTYLVVLPHPP	568272	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542244_542779_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_568198
634398	contig_12644_pilon	-	2004	4	Intergenic	novelGene_44504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	903	junction_3	186.987224756726	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	13	657	1151228	1068314	FALSE	15	TGACTTCTGGGTAAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRYSVDYNIYPKFKS	1151240	1066966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
634399	contig_10299_pilon	+	2576	24	Intergenic	novelGene_79720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	98.7838717004377	1	99	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	2	1165	320559	337002	TRUE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSRGLLWKVFPRQIST	320557	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335179_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_336858_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339106_339211_339256_340019_340124_340232
634408	contig_9871_pilon	+	2073	3	Intergenic	novelGene_75636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	715	junction_2	71.5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	142	546	348525	350078	TRUE	20	AAATCCTCTCAGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVLILNFTCTLKSMCVSTDSPC	348383	352615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_348640_349788_350355_351364
634415	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634427	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634428	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_90974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
634434	SIRV7	-	288	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91632	6	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
634437	contig_3426_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_57941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1197	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCATTGATGGCTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368450	366821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_366800_368400
634444	contig_5485_pilon	-	1402	2	Intergenic	novelGene_37705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	244	603	85850	85491	FALSE	30	GTTGAACGCAACCAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85963_87957
634452	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_97245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634457	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634465	SIRV6	+	906	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1684	0	-252	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
634466	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91629	0	-91623	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAAACTAGTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
634468	contig_9389_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_83912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	205	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	39	728	159587	167812	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHVTSHSTGGVRGAELGEPSLAGYNQQPVPQQAGP	159548	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166156_167710
634471	contig_17144_pilon	-	1122	6	Intergenic	novelGene_29207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1566.78465654984	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	85	1038	172736	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPSPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	173209	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166537_168239_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
634476	contig_1996_pilon	-	1523	9	Intergenic	novelGene_131936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	424.592286052161	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	253	1017	509912	508494	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRWSR	511075	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508626_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732_510849_510983
634478	contig_14618_pilon	-	2091	5	Intergenic	novelGene_136851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCCAGAGGGGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355323	1279737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327382_1348516_1348598_1350876_1351054_1353798
634481	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
634483	contig_3386_pilon	-	1605	6	Intergenic	novelGene_34515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	674.753999617638	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	189	977	407739	404773	FALSE	15	AAAGCCTGTTGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVAESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRSMYRKFKFCLRLLGAFLRCLAVRICLL	412186	404144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407838_412096
634484	contig_5499_pilon	-	890	2	Intergenic	novelGene_57040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	83	877	1610053	1602345	FALSE	20	TTCAGGCATTATCAGCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPQTRVTQHKRVRRTKKTSAPQKKHYKMTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHDFNPNIIQWHYRGWK	1610135	1602331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1602392_1609305
634488	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634493	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634494	contig_13547_pilon	-	2002	11	Intergenic	novelGene_104880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_10	334.763857069427	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	36	1400	223705	93705	FALSE	5	GCCTGGTGTTTCTTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVGFINIKGMKVIFKL	223740	93102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
634497	SIRV4	-	329	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGCTACATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
634500	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634504	contig_8693_pilon	+	1890	6	Intergenic	novelGene_150855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	10.1271911209377	340	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	110	574	1055936	1073759	TRUE	10	CTTTCTGGCCCAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDGVSLEEDGQHTIENRGLGCQGRWKSGEVHWLKPWMWVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAEGFVRVDRDYVLKSAELAKAGGVQTFQLAVLSRSR	1055826	1077284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1055942_1056608_1056852_1061608_1061717_1073651_1073791_1075676_1075739_1076061
634507	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634509	contig_14868_pilon	+	1610	12	Intergenic	novelGene_150456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	85.6422503284583	22	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	118	1608	186170	252478	FALSE	45	TGACAAAAGATGACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSCRKLASAPQVLGLLFSEGSPLDKSARNSYLWAPGPCMAKSPGNSTLEEILGQYQRSLRERANRSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVR	186052	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
634513	contig_11338_pilon	-	1454	11	Intergenic	novelGene_6378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_7	179.120657658462	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	300	1454	319426	300285	FALSE	30	GTGTCCACACTTCAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNND	323315	300284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
634514	contig_7342_pilon	-	2169	9	Intergenic	novelGene_71234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1743	2168	723007	716955	FALSE	20	GCTGTAGCGGCTCTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFCKFSKPASISSCPSLESSSRPLSSVPSSSIFCPLTHFFVVFLLVTSNSISSSSGSCPSSLTAFLSRSIRALLLPPVSRFRFFNSARRSITRRSLSRRVPVSEAFESTAAVSEPESPGPARVSAILGFLSPPPTSHTAG	735946	716953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_717182_718358_718447_722810_722876_722961_723168_726444_726520_729421_729485_730006_730108_734513_734665_734754
634517	contig_10813_pilon	+	1921	11	Intergenic	novelGene_87014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60.3261137485252	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	289	1359	62667	85000	FALSE	15	ATCCTTTTTTCTCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55833	85562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_62537_62675_63308_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
634523	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91662	11	-91656	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAACCGATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
634526	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_96551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	657490	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657491	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634529	contig_5988_pilon	+	1155	2	Intergenic	novelGene_15913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	605	940	652391	652726	TRUE	10	TTGCCTGTGATGAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVTFHHLVGWLKASISNLCYRKLFMVGFLSRDDGGVCGQREVDAGVGHQVGLEFCQIDIQGTIKSEGSSDGGHNLANKAVKVSIGWALNIKVSTTDVIDGLIVYHEGTI	651786	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652881_653299
634533	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634551	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634570	SIRV7	-	381	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	1	-32	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
634575	contig_16667_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_153254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTGAGTGAAATAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68170	67875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_-_67900_68200
634578	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634582	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_94392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634586	contig_10235_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_46557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	26.4575131106459	20	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	115	1164	431644	429593	FALSE	15	TTCTAAGTGGTTCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRHKLLKWWAQSFLPGVPNVVTGFRNPEGFICSLKTFPTMEMFENVRNDRDGWNPSVCMNFCAAFLSFAQSTVVQDDPRAY	431954	429592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429600_429878_429974_430084_430221_430355_430576_430660_430897_431288_431651_431846
634593	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
634595	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634624	contig_9014_pilon	-	1552	14	Intergenic	novelGene_106762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	69.4902828335302	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	105	1301	83127	78380	FALSE	10	AAGGTTTTGTTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVIRVGTRKSQVSAGAGVREFFTRILVPVVSQVEGPRGLVPSSSRMKEMGWLEKINCVKSHVEWQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83405	78128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_82929_83146_83319
634629	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634633	contig_13456_pilon	-	3073	2	Intergenic	novelGene_153298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1891	2208	346328	346011	TRUE	60	AAAAAAAACCAACCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREGDAGRRGSSTDCLPQPASGHLTNTRLAPHGRYAKPQRALNTSSERTDRKHHNQDSNSGRQLLPALGTMFCRQASTPHAITGAGQVKRGLTQILREGSLPSG	348218	343995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_344543_345692
634638	scaffold_12124_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_22193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAAAAAAAAAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292948	1293816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1292900_1293800
634648	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_95688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634653	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
634661	contig_19769_pilon	+	1126	4	Intergenic	novelGene_102269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	259.261772474591	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	432	764	87859	88993	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNVSSSEIEVQGP	86996	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87609_87820_88040_88841
634662	contig_5981_pilon	-	1922	9	Intergenic	novelGene_35490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	518	853	37888	35697	TRUE	30	AGGCCGAGGCAGACAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRHSSWMADNQPGNRGGQVHLRTCLRHLLMGTLHSGAVVAAALLVRAVIIGFAPLAASRAPSAIELLKLYLLCVSNDVRNFWSRRQKVFEFQSLSGLIQLFSGNCTSNFM	38405	23427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_23583_25005_25070_25399_25619_28114_28201_28457_28592_29978_30176_34580_34726_35627_35756_37611
634664	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_17730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634672	contig_753_pilon	-	2594	3	Intergenic	novelGene_112999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	22	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	384	788	1269225	1268821	FALSE	25	AAGCTATTTCTTCAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNRQLSHQDPTKANSRERGESDFQSYHTILFKMPRFQQRVTRHARNQERMAHTQKKSKSTQTDPNFLGRVTRHAKNREWMAHSQKKNKSTQTDPDRDQLSDYGAWSEHGIWSDKAWRRDTIKVLKEITAKLE	1270166	1267014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1269329_1269677_1269786_1269994
634683	contig_3270_pilon	-	2558	28	Intergenic	novelGene_104516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_26	34.3953453321996	181	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	11	2368	464578	420708	FALSE	40	TTTTATTAAAAGTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGVMAACRCCCSCLRLRPLGDGPLRLPGRARTLTPLQVRALWGGTGPRAVAVDLGSRKLEMSSGKLARFADGSAVVQSGDTAVMVTAVSKTKPSPSQFMPLVVDYRQKAAAAGRIPTNYLRREIGSSDKEILTSRIIDRSIRPLFPAGYFYDTQVLCNLLAVDGVNEPDVLAINGASVALSLSDIPWNGPIGAVRIGIIDGECVVNPTRKEMSSSTLNLVVAGAPRSQIVMLEASAENVLQQDFCHAVKVGVKYTQQIIQGIQQLVKEIGVTKRTPQKLFTPSPEIVKHTHKLAVERLYAVFTDYEHDKISRDEAVNKIRLDTEEQLREKFPEADPYEIIESFNVVSKEAFRSIILNEYKRCDGRDLTSLRNISCEVDMFKTLHGSALFQRGQTQVLCTVTFDSLESSIKSDRIITAINGIKDKNFMLHYEFPPYATNEIGKVTGVNRRELGHGALAEKALYPVIPRDFPFTIRVTSEVLESNGSSSMASACGGSLALMDAGVPISSAVAGVAVGLVTRTNPEKNDIEDYRLLTDILGIEDYNGDMDFKIAGTSKGITALQADIKLPGIPIKIVMEAIQQASVAKKEILQIMNKTISKPRASRKENGPVVETVQVPLSKRSKFVGPGGYHLKKLQAETGVSISQVDEETFSVFAPTPSAMHEARDFITEICKDDQEHQLEFGAVYTATITEIRDTGVMVKLYPNMTAVLLHNTQLDHRKIRHPSALGLEVGQEIQVKYFGRDPADGRMRLSRKVLQSPATAVVRTLSDRSSIVMGEPVSQSSSNSSSS	464588	420517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_420870_422493_422542_424493_424573_425765_425822_425908_426016_426922_427007_427308_427393_428848_428913_429004_429077_430087_430195_435740_435795_436724_436815_436897_436965_437921_437959_439743_439815_447017_447121_447578_447676_450808_450867_451237_451290_453303_453491_454382_454497_456300_456349_456446_456511_458208_458259_459167_459274_460219_460295_460917_460979_464417
634685	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634687	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-5	879	-5	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGTTTACCGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8310	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
634689	contig_8617_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_73413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATTACTAGTGAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62027	62543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62000_62500
634692	SIRV2	-	614	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	35	3083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
634700	contig_5499_pilon	+	2371	10	Intergenic	novelGene_57017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	245.504469296273	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	144	707	816576	834874	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGFHSALQTTFSKNWTIFHLRREARWSFFFLLTHCQCLWSTEGTPILRR	809519	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_827957_831315_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
634714	contig_14322_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_116115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
634720	contig_10311_pilon	-	1463	10	Intergenic	novelGene_50413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1199.85878798762	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	175	954	70287	65634	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLRSLQLFSRELLFLVLKIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDQNNRF	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65651_67211_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70356_70446_70493_71497
634725	contig_9127_pilon	-	2516	1	Intergenic	novelGene_103024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAGCTACCTATCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233306	230790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_230800_233300
634727	contig_14322_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_115776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671841	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
634730	contig_18420_pilon	-	2223	12	Intergenic	novelGene_109362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	338.451651881265	1671	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	808	1800	127614	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142900	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_128016_128822_128902_129147_129286_142711
634731	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
634732	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	170	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634736	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
634739	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634744	contig_6847_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_143901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACCAAGATTAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245202	245583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_245200_245600
634745	contig_17470_pilon	-	1853	13	Intergenic	novelGene_110514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_12	46.548287353624	932	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	92	1366	277215	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302631	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
634749	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634750	contig_8538_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_4959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842803	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
634758	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
634763	SIRV6	+	514	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
634766	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657833	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657834	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
634767	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634773	contig_7457_pilon	-	1811	3	Intergenic	novelGene_31618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.5	30	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	121	783	962606	956445	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCALGQWALDAEPGQEDGGQGHLHGVLREGQTCAHTQQPEGGHPAVLYHCLSTLSPPAPRPCSGG	962726	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956633_960423_960896_962603
634780	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634788	contig_9363_pilon	-	1467	8	Intergenic	novelGene_6759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	510.57782392669	345	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	152	1084	1548961	1505706	FALSE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVAKLPPVSLPHSSLCLEHPPPLSWLALTHPSDLSSCITSSGQPLPLHLSWVPILYTLLTACTCPSSHGSYLN	1549112	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505920_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
634792	contig_5727_pilon	+	2506	14	Intergenic	novelGene_7946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	978.135468165244	2	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1128	1751	177195	179323	FALSE	15	ACTTGATGTAGTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168148	180078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168371_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173744_177098_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
634795	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
634802	contig_5429_pilon	-	2394	5	Intergenic	novelGene_127777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	516.535272270926	178	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	179	1045	119158	111060	FALSE	5	CTCAGCTGTGCTTGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLSFSELCCLFCCPPCPGKIASKLAFLPPDPTYTLMCDESGSRWTLHLSERADWQYSSREKDAIECFMTRTSKGNRIACMFVRCSPSAKYTLLFSHGNAVDLGQMSSFYIGLGSRINCNIFSYDYSGYGASSGKPTEKNLYADIEAAWLALRTRYGIRPENVIIYGQSIGTVPSVDLAARYESAAVILHSPLTSGMRVAFPDTKKTYCFDAFPNIDKISKITSPVLIIHGTEDEVIDFSHGLALFERCQRPVEPLWVEGAGHNDVELYGQYLERLKQFVSQELVNL	158846	109710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_111280_113955_114136_118691_119162_158292_158349_158727
634805	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634809	contig_12140_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_86515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4466	4707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_+_4500_4700
634815	contig_11378_pilon	-	2217	6	Intergenic	novelGene_112259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.08267191601	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	5	856	404827	379781	FALSE	40	CAAGAATATTAAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMLPVITGNRDGFNVRIPLPGSLFDSLPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEVLPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKDRTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRRSAVTVTMGALVAQWLSARLLPKRSAVRIHRQLLGNSTGQFYPVLQGRYEQAVGLGCVFVFVSLILFLFLYKTTIEKQLKFSQVRFRKGFMGCKTGITYKRPGHLL	404831	378419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_380100_390332_390488_395099_395213_401731_401830_404291_404433_404801
634819	contig_8696_pilon	+	4031	4	Intergenic	novelGene_153331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	30.9228430488243	360	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	121	759	953016	975364	FALSE	20	TTTTTCCCTGTTAATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSLNQEIKAFSRNNLRKQCTRVTTVTGKKIMETWKDARIHVVEEVEPSSGGGCGYVQDLSLDLQVGIIKPWLLLGSQDAAHDLDTLKKHKVTHILNVACGVENAFLSDFTYKSISVLDLPETNLLSYFPECFEFIEQAKMKDGVVLVHCNAGVSRAAAIVIGFLMNSEEISFTSAFSLVKNARPSMCPNAGFMEQLRTYQEGKERNKCDKI	952895	978636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_953242_959466_959514_968149_968303_975151
634824	contig_6710_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_95156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
634828	contig_12790_pilon	+	2061	10	Intergenic	novelGene_35223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	274.514925722527	2	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	466	1194	309644	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305932	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308844_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
634830	contig_6164_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_121260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTGACACATACATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233508	234095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_233500_234100
634861	contig_1618_pilon	-	1683	9	Intergenic	novelGene_141799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	316.550154004069	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	654	1280	338963	317005	FALSE	35	AATTACATTTCTCAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEVRLISERACSKQTLSALKLDCKTEVNISDKLAIVDEWRKEMGLCWKEVAYLGNEVSDEECLKKAGLSGVPADACSTAQKAVGYICKCNGGRGAIREFAEHIFLLMEKVNNSCQK	353782	316601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_327214_327369_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341021_341076_341116_342025_342169_353491
634865	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
634872	contig_12644_pilon	+	1398	10	Intergenic	novelGene_44618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4922.28687692676	12	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	53	1318	2675526	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678840_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
634877	contig_4413_pilon	+	1527	9	Intergenic	novelGene_116977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	117.738056719142	1519	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	307	1248	126062	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDIRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNSTPEAPDPSLPNAPDASSCPSLRSPVMMICMRKVFPGQSTSVTWSCSSVGLGVASDATWGMGSTSCSQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	125755	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131083_131285_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
634879	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_97605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634880	contig_13992_pilon	-	2436	13	Intergenic	novelGene_147650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.511441044865	8	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	462	1967	666315	656259	TRUE	15	GAAGTTGCATGTCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSILKTWRPLLGLPPWTRQRVPTKPQRTPPDGGVSAVPTEAALPPTVSPEGPCGEALLADLPGVAPACPKDTCTPQEKEQKPLASTAGDIEASGAPVPRDEAEALLPTHASGLEDTAPASPLRAGRAVTPSPQKEEGPRQMADSAKSEPIKLEFDFSDSVVSKRAPPPRKLGKRPGIKPPSKRQEARQAPTETDERPVPATRGSYNLDWDKLDGPNFNPFGNGSQCGGGEARPPERPEARPARPMAEPLSAEPEAAEASPPSQQVGSALPGGSPEVQVTAPEVPAEAPGAAGEGGTSCSSDTSVPTSSPGSEPTAPPAELPPSLDLAKESFKDPAEVLGTGAEVDYLEQFGASSFKESALRKQSLYLKFDPLLRDSPNRLVPVAAETSREAAQAAAVPSPLSVSTQVASNPSSGSVPEARLVEFDFLGSLDVPVPSPAPCVLGPGGPPLQVSPIVDVLQYSQKDLDAAVRALQLENLELKGRCEELYAKNQEMGRTKSH	670072	655223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656278_660024_660102_660361_660467_660821_660955_662112_662217_663349_663403_664196_664327_664510_664602_665521_666583_669720_669864_670021
634882	contig_15063_pilon	+	1528	4	Intergenic	novelGene_13582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	202	1041	34808	36333	FALSE	10	AGCGCTGCTCACCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36274
634884	contig_16766_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_153345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTTGTCTTTAACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98831	96517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_96500_98800
634885	contig_9002_pilon	-	1834	11	Intergenic	novelGene_116722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	68.2249221326049	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	107	1363	331854	317628	TRUE	25	CATTGCTGTAGTCACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGIWALFGSDECLSVQCLSAMKIAHRGPDAFRFENVNGYTNCCFGFHRLAVVDPLFGMQPIRLKRYPYLWLCYNGEIYNHKEMQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKPRTESPVPGSSIFFLLLVSATRNEDSKAWDRKTSPERDI	337858	316734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319664_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331605_331878_337775
634888	contig_12327_pilon	+	1511	6	Intergenic	novelGene_140671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	48.7171427733606	110	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	514	891	1131147	1137031	FALSE	15	TGTTTTATGGAAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERKGGFFVDLFVRVSNQVAVNMYKQLGYSVYRTVIEYYSASNGEPDEDAYDMRKALSRDTEKKSIIPLPHPVRPEDIE	1124011	1137651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128699_1131089_1131157_1131801_1131938_1136332_1136479_1136945
634889	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634892	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
634898	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634900	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_96481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
634907	contig_11328_pilon	+	832	6	Intergenic	novelGene_88395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	848	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	40	789	643683	647995	FALSE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643643	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
634911	contig_9609_pilon	-	2986	19	Intergenic	novelGene_22939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_10	20.3072844681197	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	937	2898	78975	72930	FALSE	35	CATAAGTGGAGAGGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALECLPEDGEPLPSPEDCAPRGCRYDGQIAVFGAGFQEKLSCQHYFLVGAGAIGCELLKGFALMGLGASDSGSITVADMDHIERSNLSRQFLFRPQDIGSPKAKVAAEAASRLNQGLRVTPLTHPLDHTTEHIYGDSFFSRVDGVAAALDSFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTQGTRGSAAVFMPHVTEPYRAPASAATSEDAPNPVCTVRFFPSTVEHTLEWAKNEFEGLFRLSAETINRHQQASTSLADMDGPQVLTLLQPVLGVLRVRPQTWQDCVAWARGHWQLCFHDSIIQLLRCFPPEKVLEDGTPFWSGRKQCPQPLEFDANQDMHLLYVLAAANLYGQMHGLPGSKDQTALRGLLKLLPLPSSQHLAPIFASDLELAQASTKFGPEQLKELHKALEDWNKGPPLRPLLFEKDNDNNFHVDFVVAAASLRAQTYGIPPASRAQSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLMGLELYKVVGRSTPLRAFRHSYLHLAENHFSRWVPCAPAIQTFRHLTWTCWDRLKVPAGKPERTLESLLAHLQEQHGLQVRMLLYGPAVLYSTRWPPDKQAQHLPLKVTELVQQVTGQVPEPRQQVLVLELSCEGEEEDTAFPPLHYEL	80458	72841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_73060_73491_73593_73672_73766_75368_75561_75654_75748_76026_76110_76589_76774_77020_77096_77180_77365_77454_77520_77616_77823_77902_78069_78149_78306_78385_78467_78623_78732_78930_79102_79453_79601_79693_80119_80220
634933	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	108	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
634939	contig_10923_pilon	-	1772	11	Intergenic	novelGene_66172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGGTCAGGACTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42832	13821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_13861_21648_21846_22990_23116_29347_29567_30128_30317_32868_33046_36531_36697_37269_37335_37383_37539_38577_38741_42553
634945	contig_19851_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_29808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTTTTTAGTTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7841	6763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_6800_7800
634962	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_96600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
634963	contig_10235_pilon	-	1440	9	Intergenic	novelGene_46472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	894.838113850768	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	475	936	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224484	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223231_223370_223612_223780_224427
634970	contig_12570_pilon	-	1805	5	Intergenic	novelGene_79373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	28.1013789697232	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	280	867	284107	280932	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRSSRSQAEVSAWWSSRPCLCHGSAGCRLWQSCSGSSPSCFWLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300330	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_300198
634975	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
634981	contig_9871_pilon	+	1671	8	Intergenic	novelGene_75626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_7	290.285081551616	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	20	991	331361	351454	TRUE	20	CAGTCTCAATTTGGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK	331341	352714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364_351742_352321
635001	contig_7202_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_19100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCGCCGCCATGACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
635011	contig_15063_pilon	+	1965	7	Intergenic	novelGene_13025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3666.41777943176	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	490	1728	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30027	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
635012	contig_753_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_113030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTGCGGTTGTCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410648	1413291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1410600_1413300
635022	contig_13292_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_142969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATTTAAAAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451994	453978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_452000_454000
635025	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635032	contig_3424_pilon	+	2214	4	Intergenic	novelGene_55466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	170	1972	163695	170678	FALSE	30	TTTTTTTACTCAAATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSLMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149834	170920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168760_169041
635051	contig_7207_pilon	+	4166	1	Intergenic	novelGene_72060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAATACCAGCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637772	641938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_637800_641900
635056	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635061	contig_14142_pilon	-	2761	4	Intergenic	novelGene_120616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	192.390805971133	11	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCCGTCTGTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598556	589697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_590947_591055_591101_591232_592532_598388
635062	contig_4891_pilon	+	1991	7	Intergenic	novelGene_124543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	549.285293206848	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	423	941	707917	757778	FALSE	25	CTTAATAACCTGCTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCQECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVSYVQAHLTFGVLRILCSPRPDRRGQ	700868	758828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708889_708977_733743_733930_754711_754766_755867_755971_757697
635067	contig_14755_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_129390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAGAGGGGCAGTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295361	295006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_295000_295400
635068	contig_15384_pilon	-	2384	22	Intergenic	novelGene_85134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_21	55.8410442436585	353	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	24	2222	127943	118939	FALSE	5	CTGGTTCTCGTTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	127966	118776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
635071	contig_5891_pilon	+	1719	7	Intergenic	novelGene_151577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	74.4731495238385	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	331	1719	126157	173821	FALSE	30	GTACGTATTTGAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVFPMLTVLTMFYYICLRRRARTATRGEVMNSHRTIESNSRTSPLNAEVIQYAKEVVDFSSHYGSENSMSYTMWNLAGVPNVFPSSGDFTQTAVFRTYGTWWDQCPSASLPFKRTPPNFQSQDYVELTFEQQVYPTAVHVLETYHPGAVIRILACSANPYSPSLPAEVRWEILWSERPTKVNGSQARQFKPCIKQINFPTNLIRLEVNSSLLDYYTELDAVVLHGMKDKPVLSLQTSLIDMNDLEDDDYEEKDDCGMDNLNKKFSSATLREGPNNGYFDKLPYELIQLILNHLTLPDLCRLAQTCKLLNQHCCDPLQYIQLNLQPYWAKLNDTSLEFLQARCSLVQWLNLSWTGNRGFISVSGFGRFLKVCGSELVRLELSCSHFLNETCLEVISEMCPNLQELNLSSCDRLPPQAFNHIAKLCGLKRLVLYRTKVEQTALLSILNFCSELQHLSLGSCVM	107823	173821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_107964_125314_125433_126084_126669_136359_136706_143057_143303_150823_151038_173749
635074	contig_8617_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_73468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCATATCCCCTAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
635085	contig_3285_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_153384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATATTGTTTTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72584	71282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_71300_72600
635105	contig_14322_pilon	-	291	2	Intergenic	novelGene_116522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGGCGAGGGAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674873	672845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
635111	contig_5499_pilon	+	2406	13	Intergenic	novelGene_56984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	193.57404196385	829	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	74	700	776530	791065	TRUE	10	CTTAGTTGGCTTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVAKATAGMVLGELYVSDREGNDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWDVISKSQMKNIRKMWHREQMKNECREKKEAEDNLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIHALEAHRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQFLSVVPGDLPPIARRCILHCTVIQGRAIQNSKAPGRVHSH	776456	796481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_776573_777638_777722_780037_780104_780189_780283_780368_780459_782346_782426_783301_783353_790558_790666_791050_791187_791872_791987_794159_794292_794615_794748_795274
635116	contig_9937_pilon	-	2629	8	Intergenic	novelGene_129212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTTTTTAACCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178474	157608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_158961_162840_162953_164229_164358_167964_168070_168568_168688_169459_169514_175552_175649_177811
635119	contig_10726_pilon	-	3009	13	Intergenic	novelGene_132498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_12	57.2601276825526	261	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	604	2367	106060	8017	TRUE	10	GGACTCTTTGTGTATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNAVHWFRKGLRLHDNPALKECIQGADTIRCVYILDPWFAGSSNVGINRWRFLLQCLEDLDANLRKLNSRLFVIRGQPADVFPRLFKEWDITKLSIEYDSEPFGKERDAAIKKLATEAGVEVIVRISHTLYDLDKIIELNGGQPPLTYKRFQTLISKMEPLEIPEETITSEVIEKCTTPLSDDHDEKYGVPSLEELGFDTDGLPSAVWPGGETEALTRLERHLERKAWVANFERPRMNANSLLASPTGLSPYLRFGCLSCRLFYFKLTDLYKKVKKNSSPPLSLYGQLLWREFFYTAATNNPRFDKMEGNPICVQIPWDKNPEALAKWAEGRTGFPWIDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGMKVFEELLLDADWSINAGSWMWLSCSSFFQQFFHCYCPVGFGRRTDPNGDYIRRYLPVLRGFPAKYIYDPWNAPEGIQKVAKCSIGVNYPKPMVNHAEASRLNIERMKQIYQQLSRYRGLGLLASVPSNPNGNGGLMGYSPGENIPGCSSNGSCPQGNGILHYAHRDSQQAHLLKQGRSPTGTGVSSGKRPSQEEETQSIGPKVQRQSAN	106663	6596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_-_7239_8016_8121_8193_8266_16825_16922_17027_17231_17454_17607_18963_19276_19354_19496_20455_20545_20935_21121_23463_23607_30914_31024_105902
635122	contig_9955_pilon	+	1383	2	Intergenic	novelGene_21271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	613	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAGTACCTGACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44884	46830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_45362_45924
635123	contig_5023_pilon	-	1439	2	Intergenic	novelGene_7156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380966	363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_364302_380474
635124	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635125	contig_9233_pilon	+	3009	4	Intergenic	novelGene_78239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	39.5502493319855	664	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	116	424	582395	676460	FALSE	5	CATTTCTTCTTGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARGDKDFPPAAAQVAHQKPHASMDKHLSPRTQHIQQPRK	582279	679045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644_674688_676346
635150	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635153	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_114026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	20	TACTGTCAGTATGGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
635160	contig_19342_pilon	+	1328	7	Intergenic	novelGene_41093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13138237134266	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	6	317	3263	5037	TRUE	30	GAGACCTGAGAACCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTAQRHM	3257	6758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3775_4285_4365_5020_5289_5413_5522_5960_5994_6139
635165	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635166	contig_17897_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_153404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTCTAACACACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218304	217104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_-_217100_218300
635167	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_115731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671624	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
635172	contig_7171_pilon	-	1853	13	Intergenic	novelGene_101386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	53	junction_7	958.796018742024	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	823	1560	1367042	1363653	FALSE	35	AAATAACTAGAGCGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1372796	1363359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233_1367306_1368352_1368423_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690
635175	contig_15063_pilon	+	1326	6	Intergenic	novelGene_11608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	230	1279	34808	36756	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSRYVCVHVCIQTNHVCG	27139	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36487_36704
635176	contig_1725_pilon	-	1585	9	Intergenic	novelGene_24320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGATTTTAGCCACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255844	247164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_247187_247639_247759_248347_248446_248573_248724_248851_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252780_255364
635181	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
635190	contig_8616_pilon	-	1230	4	Intergenic	novelGene_72444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	484.041550098979	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTCTTCCTTCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255405	253316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254675_255272
635200	contig_14441_pilon	+	803	6	Intergenic	novelGene_100445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.824776566424	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	194	622	116728	117610	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCVPLCQHGPRRLCSGNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112596_112665_116578_116667_116714_116963_117220_117344_117539
635202	contig_11816_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_98478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAACATTTGCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458256	457597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_457600_458300
635203	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91622	2	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
635205	contig_5514_pilon	+	1477	6	Intergenic	novelGene_75275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	316.996908502275	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	292	1284	66040	68726	FALSE	15	TATGTGTCAGCATCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61071	68919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61143_65324_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
635209	contig_13074_pilon	-	2423	21	Intergenic	novelGene_153442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	179.153397958286	4	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	463	2217	661328	534451	FALSE	30	ACTACCTATGAGCATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVDTGNTGRVLASDAAAFLKKSGLPDLILGKIWDLADTDGKGILNKQEFFVALRLVACAQNGLDVSLSSLNLAVPPPRFHDTGSPLLISGTSAAELPWAVRSEDKAKYDAIFDSLSPVNGFLSGGKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSALLAHIWALCDTKDCGKLSNDQFALAFHLINQKLIKGIDPPQILTPEMIPPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNAEQDLKEKEDTVKQKTSEVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQRISSLKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAHLGPLQQHLQDSQQEISSMQMKLMEMKELENHNHQLNWCSSPHSILVNGAVDYCSLSTSSSETANLNEQAEGQSNLEAEPIHQESPARSSPEIPPTGMTYEKEVVTAAVNGKACPEFNSDKHSKEEDPFNVESSSLTDPVADTNLDFFQSDPFVGSDPFKDDPFGKIDPFGGDPFKGSDPFASDCFFKQSSADPFATSSTDPFSAASSNSNTSVETLKHNDPFAPGGTIVVAASDSATDPFASVFGNESFGDGFADFSTLSEVNNEDPFSSATLSSASNMVTTKNVFEETSFKSEDVPPALPPKIGTPTRPCPPPPVSL	670809	534244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_534462_539574_539738_541042_541120_556624_556695_560585_560723_563081_563118_564214_564306_564557_564675_566189_566394_572615_572814_583611_583774_596954_597028_623120_623207_627541_627699_629321_629468_661301_661362_664969_665096_666202_666269_667204_667301_669883_669932_670716
635210	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
635222	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635223	SIRV1	-	1549	6	FSM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	212	55	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10774	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444
635224	contig_7440_pilon	-	1169	9	Intergenic	novelGene_61160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	428.057074903569	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	75	722	74491	58960	TRUE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVGR	74565	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54249_58950_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
635230	contig_6397_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_146283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	179	532	587016	586663	NA	50	CAAATTATATCATCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIESHKDIVDLNNSINQLHLINIYRIFPSTAAQYTFFSIAHRTFSMMDHILGNKTSLKFKRIEIMQSVFSNYNGIKLEIINRNLSGKTNIWELNNTNLNNLWVKEEIKEKLDSILN	587194	584625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_584600_587200
635233	SIRV2	+	285	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	306	-68	-306	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATACGCAGTAATGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
635250	contig_9955_pilon	+	1078	7	Intergenic	novelGene_21332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	382.713556941306	1522	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	189	662	69965	84621	FALSE	20	TCCAGTGGTCAGAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLEGLRCSECVDWGEKRNTIASITAGVLFFTGWWIIIDAAVIYPTMEEFNHSYHACGVIATIAFLMINAVSNGQVRGDSYSEGCLGQTGARIWLFIGFMLAFGSLIASMWILFGGYVVKEKPTVYPGIAVFFQNAFIFFGGLVFKFGRTEDLWQ	68006	85037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_68183_69952_70058_71904_72018_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575
635256	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
635261	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635267	contig_9807_pilon	+	2075	16	Intergenic	novelGene_32881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	533.029188277298	1	77	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	860	1858	140826	158783	FALSE	25	GCTTAAACCACGTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109037	159000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128601_128652_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
635268	contig_4232_pilon	+	1261	3	Intergenic	novelGene_63204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3494	junction_2	927.5	20041	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	78	782	146362	149200	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGKGQHWWCFMPTPPGGVNSMVEEVLPFPCLLESNLVSIHLLLLAPSQPHNYPLLPMLPAHSCFPFFPPGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146284	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806
635269	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635271	contig_11512_pilon	-	1900	10	Intergenic	novelGene_43287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	478.856224717417	26	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	431	1105	382664	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGAGGKPFLLALVERTIFLEYVWPEFTTGEWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409402	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366360_367518_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381691_381783_382663_382764_396108_396210_401723_401866_409314
635273	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635275	contig_17214_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_153472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83392	81734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_-_81700_83400
635276	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635290	contig_15888_pilon	-	1433	9	Intergenic	novelGene_84431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	403	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	92	901	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRARARGFRRFLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259817	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251848_252025_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
635292	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635295	contig_3602_pilon	+	1613	7	Intergenic	novelGene_60502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1013.66085715753	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	118	579	161745	169945	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGERPLPRQKSMPSAIACPASL	161627	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169262_169884_170233_170385
635300	contig_5643_pilon	-	2102	9	Intergenic	novelGene_38892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	35.4275228459456	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	388	1974	257904	253080	FALSE	5	GCCACTGTGTTTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFPLSELVEFLEANEVPRPITLRANTLKTRRRDLAQALINRGVNLDPLGKWSKTGLVVYDSSVPIGATPEYLAGHYMLQGASSMLPVMALAPQEHERILDMCCAPGGKTSYIAQLMKNTGVILANDANAERLKSVVGNLHRLGVTNTIISHYDGRQFPKVVGGFDRVLLDAPCSGTGVISKDPAVKTNKDEKDIQRCAHLQKELLLSAIDSVNATSKTGGYLVYCTCSIMVEENEWVVDYALKKRNVRLVPTGLDFGQEGFTRFRERRFHPTLRSTRRFYPHTHNMDGFFIAKFKKFSNSIPQSQTGDSATVTPTNPDLPDLKGQVAPKPENSSQPTKKAKGAGKAKQKLQKQKHLKKASFQKQNGISKRTDSELSTVPSVTKAQASFKVQDSNQLAEKAEVVREPKVTGTLKQRLPKLQSPKKVVFLKQNAPPKGTDSGTPAALSFSKIQPTTPKPEDQGQPLWKAKGAEKVKQHLPELPFKKAAFQKQNGTPKRSTSYSHSPSRPPPAKRRKSQSRGNSQPPLS	258291	252951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_253742_254843_255073_255186_255310_255450_255541_255664_255805_256547_256689_256762_256851_257651_257742_257880
635305	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635312	contig_6506_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_153486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACACCCAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138040	135979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_136000_138000
635317	contig_10581_pilon	-	2148	12	Intergenic	novelGene_41410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	98.7487838611169	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	770	1777	627511	609845	FALSE	25	GTCTTTTCACATGGATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTAEPLMGSSLLEEASVPSKNLVSVNSQPSLGGESLNLPNTSSILGVDEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	650043	609473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_614126_614265_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649850
635318	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635331	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	139	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
635333	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
635340	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635347	contig_14643_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_99141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139118	139406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_139100_139400
635349	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
635356	contig_20293_pilon	+	3275	2	Intergenic	novelGene_153492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTACTGGATTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13279	16599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_15520_15564
635367	SIRV5	+	421	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7468	2	-75	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGAGGTCGTTCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
635371	contig_15304_pilon	-	935	3	Intergenic	novelGene_30551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	259	900	54039	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSNLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53729_54029
635390	contig_6233_pilon	-	1514	9	Intergenic	novelGene_74801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	261.124491382942	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	311	1150	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
635400	contig_14034_pilon	+	2099	4	Intergenic	novelGene_72676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	119.402214757051	28	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGGGTCATATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404253	409114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_404321_406464_406532_407086_408807_408869
635407	contig_13740_pilon	-	1260	7	Intergenic	novelGene_34675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4408.11480554771	365	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	178	774	165243	157286	FALSE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEEPILSFFLFDMGFTV	165420	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157487_160829_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
635412	contig_10437_pilon	+	2297	3	Intergenic	novelGene_38147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.5	5	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156692	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160090_162072
635415	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635416	contig_7629_pilon	-	1979	2	Intergenic	novelGene_153546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	0	372	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTTATATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222937	217361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_218775_222371
635417	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635419	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
635423	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_89240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
635427	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
635447	contig_6710_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_95996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653694	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
635463	contig_12886_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_135514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGAAAAAGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625820	623447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_623400_625800
635468	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_18347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27857	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635473	contig_253_pilon	-	2101	2	Intergenic	novelGene_129674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2562	junction_1	0	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1709	2026	419231	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASSGQEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	420939	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102
635475	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635476	contig_5485_pilon	+	2027	4	Intergenic	novelGene_37710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTGCAGATGCGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84742	88070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_86135_86258_86366_86774_87026_87793
635479	SIRV5	+	254	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	162	138	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
635482	contig_15087_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_37239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGAAACAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172599	174387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_172600_174400
635490	contig_15063_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_14365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	235	1056	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35036	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
635495	contig_5718_pilon	+	1792	11	Intergenic	novelGene_110439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	353.158944386235	757	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	15	1316	1617860	1631112	FALSE	30	GATTCAAACTTCTTGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSVVATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKSITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPVFPTQDEEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR	1617845	1631588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1623151_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477_1625616_1628563_1628635_1629215_1629346_1630980
635498	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635503	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635505	contig_12414_pilon	+	1621	3	Intergenic	novelGene_59557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	91	1092	370898	374054	FALSE	30	AAACTTAGTGTTATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILALKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370807	374583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373382_373438
635516	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635523	SIRV7	-	297	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91628	1	-91622	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAAACTAGTAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
635536	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
635543	contig_15666_pilon	+	2090	3	Intergenic	novelGene_70108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52	134	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	116	514	55151	58634	FALSE	25	CAAGAGTCATTCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSAPSTAFLMKEDFHMQVFNRTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANATIMAVIRFSWTLHTPIKSLGHSTGYIVQCLVKKGLTLDKERKACWFLKGKHNHQAERRTRITFLFGLRKQGL	55035	60210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_55184_57355_57550_58462
635544	contig_10225_pilon	+	2089	12	Intergenic	novelGene_86836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	555.521376726405	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1084	1848	42707	47511	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFDSSLLRTWRT	21396	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21615_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46784_47480
635551	contig_10861_pilon	-	1575	5	Intergenic	novelGene_39359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1497.00724363645	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	19	420	1585418	1582703	TRUE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVV	1585436	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1582841_1583241_1583349_1584525_1584677_1585412
635552	contig_20951_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_43099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCCCCCTGAACCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28879	28729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
635559	contig_15031_pilon	-	2282	8	Intergenic	novelGene_138399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_7	243.326856683913	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	350	1453	129549	72478	FALSE	55	CTGAAAAAAAAAACTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQVTVLH	161701	71648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_156131_156307_161576
635566	contig_7202_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_16789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
635569	contig_7816_pilon	+	1395	9	Intergenic	novelGene_66485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1276.84072396482	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	216	1292	195803	211658	FALSE	50	AAAATGAATTGTCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170075	211761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_195787_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
635570	contig_7378_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_120277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541592	543647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_541600_543600
635573	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	81	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635602	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
635604	contig_15221_pilon	-	1162	5	Intergenic	novelGene_133070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	46.6764126727837	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	255	689	182332	140413	FALSE	15	GATGTCACCTTTTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEGVVSPSDLDLVMSDGLGMRYAFVGPLETMHLNAEGMLSYCDRYSESMRHVLKTFGPIPEFSGATVQKVNQAMCEKVPDDPQHLAARRKWRDQCLLRLYKLKREMPSE	190693	139939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_140527_141050_141158_149435_149542_182224_182420_190526
635608	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635611	contig_14209_pilon	+	2361	13	Intergenic	novelGene_88338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	216.566948206682	2	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	66	839	32406	37768	TRUE	30	AAGCTTGAATTCACTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPEYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32340	40996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32417_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38783_40142_40344_40418_40729_40901
635621	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635647	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
635664	contig_12078_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_74084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150041	151121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_150000_151100
635684	contig_6795_pilon	+	3026	11	Intergenic	novelGene_27723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_8	52.9316540455709	66	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	349	1506	272536	297696	FALSE	25	TCTATGCGTGTATGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAFRGVRKVLCVAEKNDAAKGIADLLSNSRMRRREGLSKFNKIYEFDYHLYGRNVTMVMTSVSGHLLAHDFQMQFRKWQSCNPLVLFEAEIEKYCPENFLDIKKTLERETQQCQALVIWTDCDREGENIGFEIIHVCKAVKPSLPVLRARFSEITPQAIRLACENLTDPDQRVSDAVDVRQELDLRIGAAFTRFQTLRLQRIFPEVLAEQLISYGSCQFPTLGFVVERFKAIQAFVPETFHRIKVTHEHKDGIVEFSWKRHRLFNHTACLVLYQLCMEDPMATVVGVCSKPKSKWRPQALDTVELEKLASRKLRINAKETMRIAERLYTQGYISYPRTETNIFPKDLNLTVLVEQQIPDPRWGAFAQSILEQGGPTPPQRKQV	272187	299216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_272641_282966_283027_283772_283847_284529_284606_285702_285812_287853_287998_288121_288293_289040_289142_291021_291097_295821_295905_297536
635687	contig_6710_pilon	-	507	2	Intergenic	novelGene_97922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635688	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635690	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635691	contig_7657_pilon	-	2312	14	Intergenic	novelGene_30010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	18.4246426185503	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	522	1601	132524	124409	FALSE	15	TCACCTGGTGTGTCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYCLFQALATFFQVPYTALTMLLTSNPRERDSATAYRITMEMAGTLMGATVHGLIVSGAHEPHRCEDARLPLPDGVSPDAIHLYSIAAAVVAVTYPVCTGLLCLGVKERPDRSAPASGQGLSFLAGLGLTVRHPPYLKLVVSFLFISAAVQVEQSYLVLFCTHASRLHDHVPRLVLTILVSAVLSTPLWEWVLHRFGKKTSAFGICVMVPFAILLAAVPIAPVAYIVAFVSGVSIAVSLLLPWSMLPDVVDDFQLQHQHGPGLETIFYSSYVFFTKLSGAGALGISTLSLEFVGYKAGACEQAEEVVVTLKVLIGAVPTCMILTGLCILLVSPTLKVPSQDPSRQLSLRRRTSYSLA	137908	123697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_124434_126028_126206_126600_126745_127031_127142_127367_127449_127769_127854_128328_128451_128564_128656_131439_131571_131684_131764_132488_132614_133180_133306_134602_134729_137727
635692	contig_6929_pilon	+	1141	7	Intergenic	novelGene_139389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	6782.92546685343	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	476	742	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESAAQETDLEEKRLSATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	102450	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_102501_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127221_130717_130971_131948
635699	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635715	contig_8317_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_20157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCTTGATGACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
635720	contig_11978_pilon	+	1186	5	Intergenic	novelGene_63068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6366	junction_4	2623.73693422187	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	27	497	1827946	1831276	FALSE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLA	1827919	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161
635752	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635754	contig_8978_pilon	-	1350	7	Intergenic	novelGene_49345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	853.314859826079	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	30	971	194082	190856	FALSE	45	ATAAGAATAAGAATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRLGVACLRDWRRVCSQTTVNDSATSVKFSQKGEP	194111	190476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
635761	contig_15304_pilon	-	1002	3	Intergenic	novelGene_30459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	189	959	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53756_53988
635765	contig_7050_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_153620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	271	573	620931	621233	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKDATEKQCIIGKKKKKDLNIKPKTIKIMEEKIGTTLWVLIHGISTIQTVTNNAQTPEEKLDNWELLKIKHLMLIKGLHQKSKKTTYRLGKKIWLQRI	620660	622972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_620700_623000
635771	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1584	632	1129	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
635774	SIRV5	+	458	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-133	880	-19	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
635775	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
635779	contig_2380_pilon	+	4402	14	Intergenic	novelGene_117884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_13	53.830986874931	195	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	437	1669	58316	76931	FALSE	5	TGTTTGGTGTCTGTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTIALALGVERTRTELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRQISQEHTPVALEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRRHFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELESVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEACVSIAQLLTQDDLETLVMPTLQQAAEDKSWRVRYMVADKFSELQKAVGPKITLNDLIPAFQNLLKDCEAEVRAAAAHKVKELCENLPIEGRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASVIMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNVISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMKLVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKMAGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTDALQGEVKPVLQKLGQDEDIDVKYFAQEAISVLALA	52952	79664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_53021_53655_53757_57761_57995_58281_58430_64963_65120_65310_65426_65854_65926_66233_66369_67619_67794_69766_69828_74926_75082_75456_75600_76377_76470_76914
635781	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
635787	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_17603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
635790	contig_11386_pilon	+	1500	5	Intergenic	novelGene_82780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	335.795696815787	824	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	121	750	17940	20925	TRUE	15	GCCACTCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	17819	32452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_20050_20816_21022_27700_27893_31990
635791	contig_15449_pilon	+	2230	2	Intergenic	novelGene_33636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2112	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	911	1255	84815	86207	FALSE	80	GCACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSYFSSF	83904	87182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_84953_86000
635801	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635814	contig_14925_pilon	-	988	5	Intergenic	novelGene_55199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAAAGGCTGTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86537	25796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29820_86482
635815	contig_10904_pilon	-	1732	4	Intergenic	novelGene_22655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCACGGCACCCTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535195	530608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_530637_530881_530998_531232_531360_533734
635820	contig_20602_pilon	-	1619	11	Intergenic	novelGene_133705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	295.123448746453	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	314	703	24969	19774	TRUE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPRPLMSTSLAVRLMTLRAVLPVVVF	28907	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19848_21179_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884
635829	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCAGGACTCGGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
635841	contig_10297_pilon	+	1858	8	Intergenic	novelGene_112537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_4	90.8023194884899	277	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	52	570	543854	554398	TRUE	75	AAGCTGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGCKIGPSILNSDLANLGTECLRMLDSGADYLHLDVMDGHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKESLISSCMSRFTG	543802	561219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543976_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554356_554473_557036_557305_558563_558617_560326
635843	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_96368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635874	SIRV4	+	318	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1453	632	998	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2453	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
635882	contig_253_pilon	-	2383	17	Intergenic	novelGene_129637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_16	114.615917715429	552	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	452	2305	257405	249651	FALSE	15	AGGAACTGCGTTCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCRRRCGGPAWCCLRPRGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRAQLHQLQLHAAVLGQGHGPPVEASHLDGLSERTSLLQPSAGPHQDLRVNFVAGAVEPHKAAALERLLWRACRGFLIASFLETEQPLEDPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIHKITDCFHCHVFPFEEQEEARRGVLQQLQQQSQELREVLGETERFLSQVLGRVQRLLPPWQVQIRKMKAVYLALNQCSVSATHKCLIAEAWCPTRDLPTIQQALQESSSEVGVSAVVHCIPCRDMPPTLIHTNRFTASFQGIVDAYGVGRYMEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAEDQPAVKAAQNEIWRTFFGGRYLLLLMGLFSVYTGFIYNECFSRAATIFRSGWSVAAMANHSGWSDAFLAQHPILTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSIILGVIHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLEFLPQLTFLLGLFGYLVFMVVYKWLRVSAAGAAEAPSILIHFINMFLFSRSPTNRPLYSGQEVVQSTLVVLALAMVPILLLGTPLYLRWQHRRHSLRRPSGPQLDEDKAGFMDSRDSGASVNSWGSDEEKGGPPGDEEQAKFAFSEVFMHQAIHTIEFCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMRTGLGMGSRVGVTAAVLVPLFAAFAMLTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLTPFTFAVEDE	258443	249572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_249730_249813_249992_250164_250283_250358_250470_250724_250854_251200_251415_251497_251617_252198_252290_252525_252684_252757_252898_255913_256059_256661_256875_256959_257054_257340_257424_257617_257745_258062_258149_258223
635886	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635903	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14346
635913	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	195	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635925	contig_14322_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_116502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGCAAATAAACGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
635928	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635933	contig_9982_pilon	-	3676	8	Intergenic	novelGene_55718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_4	45.1772021249295	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1140	2535	3674	260436	250695	FALSE	70	GTTAAAAGAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLESTVSSESYFSERWTLLSLVLSQHIENDYLIGEVYVERIIVKLHETLSKTKTLSEAENSRSSVSRVCDVACNYFSSAKGRLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKERTHLPDSLICKLKNTWLSGVNFLVHHVDSTYKQSSFLRLSAVWLKNQVQSSSLDVRSLQVLLSAVDDFLNKLLESKDTDLLGVCIGSVMPNDSEWGQMRQSLPMQWLHRPLLEGRLSLNHECFQTEYKEEDIKTLPSHLCTSALLSKMMLVALKKEVVLENNELVKIIAELLYSLQWCEELDNPPAFLTEFCEMLQRMNITYRHLCALGDTSGLLKLIFSRSKANGTLWSLIIIKLVFSGSITSEDVKHHYRNSEDSFFPLTEGNLHTIQSLCPF	262970	250692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_250750_252711_252820_254345_254506_256139_256327_256739_256885_257943_258098_259263_259504_260345
635935	contig_11720_pilon	-	1470	2	Intergenic	novelGene_43756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	217	618	16194	15793	FALSE	20	GCCCTTCTGGAAGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	16834	14940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16337_16760
635936	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
635944	SIRV7	-	264	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91662	0	-91656	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAACCGATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
635946	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
635963	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	3	356	14437	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
635969	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
635971	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_90353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
635972	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
635978	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
635985	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
635987	contig_14322_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_116395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671870	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
635989	SIRV5	-	354	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
635991	contig_10235_pilon	+	2209	5	Intergenic	novelGene_46439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	212.570429505141	1	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2	424	210478	211768	TRUE	45	CAGTACATGAGTGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPWPWFCSCCCSQELKGTRGPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFGETNSTPFFYSHIPHPSVPES	210476	213677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210879_211046_211193_211285_211662_211924_212047
636005	contig_233_pilon	-	2621	17	Intergenic	novelGene_14644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1582.08572776572	1	138	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	308	982	107460	99823	TRUE	20	ATGGGGTGTCCTAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVKAHRDHPQVSSRRAL	126915	78151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79106_91456_91677_92140_92359_93764_93996_94748_94914_98310_98452_99779_99870_101699_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107467_108401_108466_108502_108573_108724_108814_109914_109976_126898
636008	contig_1225_pilon	+	2883	3	Intergenic	novelGene_44167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	523	junction_1	57.5	1	142	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	179	496	250814	274411	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250635	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222
636009	contig_593_pilon	+	1256	4	Intergenic	novelGene_101985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_2	1014.01194382622	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	285	878	148874	152494	FALSE	20	GCTACCAAGCCTTCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFPLQTGNSKGYAFVEFESDDVAQIVAETMNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQGSTPVCTPTFLEKRKSEVAKMNDDDEDNEITFKQPVVGVRAEIQETQTPTRSGKRRRRKSKQ	148589	152872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_149001_151208_151421_151590_151657_152305
636010	contig_14322_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_116488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACGCTCACTCCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
636013	contig_5566_pilon	+	2160	4	Intergenic	novelGene_153660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	330	junction_1	98.800584793591	34	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	866	1258	177541	181645	FALSE	50	ATAGACAGTAACTGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKAFFYIVSLDSSCLHKTKSISLATQKELVWCYFCLIVVLWRRACSQYKQATSNEDLPIPMENPYKEPLKKCLLCGKRVDYKNVQLLSQFISPFTGCIYGRHITGLCGKKQKEITKAIKRAQIMGKNN	176675	182547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_177718_179689_179774_180773_180832_181571
636016	contig_11961_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_153685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCAAGCCTAAAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22335	22152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_22200_22300
636017	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636018	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636023	contig_6102_pilon	+	601	6	Intergenic	novelGene_31955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2298	junction_1	387.78839590684	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	42	497	413086	416047	FALSE	20	TCTCTTGGATAATCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
636032	contig_10235_pilon	+	2305	16	Intergenic	novelGene_46344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	159.782435413492	3	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	551	2152	125852	129123	FALSE	65	TGTTAAAAAAGAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGPSPLNAVSSGGPPGSEPSEPLRRRPPAPHDGDRKELPQEQPLPPGPIGTERSQRTDRGPEPGPLRASHRPGPPVQFGTSDKDSDLCLVVGDSLKAEKELTSVPEAIPISRDWELLPSASASASAEPQSKSLGSGHCVPEPTSSGQRLYPEVFYGSPGPPGSQVSGGAIDSQLHPNNGGFRPGTPSLHTYRSHPLYLPPGPATPSALLSGVALKGQFLDFSALQAAELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDPPLLQVRQDLPSPSDFYSTLQPGGQNGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVMNFGSLPPAPPPAPPSLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPPSLGRAELHSVELKPFQDYRKLSSNLGGPGSSRTPPAGRSFSGLNSRLKAPPSTYSGVFRTQRIDLYQQSSPPDALRWMSRPWERTGPPSQEGPSRRAEDPGSRGDKNPGLPPPR	114058	129276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_114184_116075_116220_125212_125332_125586_125717_125819_125906_126115_126350_126642_126784_126902_126972_127088_127263_127462_127546_127732_127944_128036_128133_128283_128497_128611_128707_128804_128896_128982
636033	contig_6048_pilon	-	1399	10	Intergenic	novelGene_73239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	340.889287266173	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	12	938	1916833	1898780	TRUE	20	GGTCCTCTCTGTAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGDLTAGHRICLSVS	1916844	1896673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1898637_1898822_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
636039	contig_614_pilon	+	1605	7	Intergenic	novelGene_132624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32.9983164553722	291	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	67	417	588714	640115	FALSE	15	TTTGCTTCTTCTAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGVSVLLLLVNIFGPIPGTLVSFYQRQEGCCVTDVGKAQVLATGESAVTETDAKYAIIGTALGVAISAGFLALKICMYRKHVFDNDSSDAIVLKKSTLRRNCRSSERDARVIEL	588647	641303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_592401_592474_618939_618994_619859_619971_621721_621753_634039_634064_640090
636042	contig_10377_pilon	-	1815	3	Intergenic	novelGene_115365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATGAAAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200669	197967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_198450_199280_199428_199483
636044	contig_6710_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_92998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636050	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	886	-22	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
636060	contig_15063_pilon	+	996	4	Intergenic	novelGene_11992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3951.08955437189	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	219	995	34808	36156	FALSE	5	GTGAGGCCCCTTTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPK	27148	36157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839
636063	contig_9609_pilon	+	1857	8	Intergenic	novelGene_23054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1014.23661853009	2	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	164	850	450196	454609	TRUE	70	AGAAAAAAAATACCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVPGSCLQQHHPVYHGHCQGHEQPADYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435629	456265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449854_449889_450162_450279_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
636071	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_16653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636077	contig_7202_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_16660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGCAGGTTGGTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
636079	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
636080	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636083	contig_2867_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_135257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATATTCCTATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305819	1285023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286311_1305705
636087	contig_8538_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_5095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842899	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
636090	contig_7171_pilon	-	1817	16	Intergenic	novelGene_101403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	103.239312064521	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	40	705	1437436	1413010	TRUE	55	AAAACAAAAAGCACTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGDSPEGAGPAPMAEPDPSDPLETQAGKVQEAQDSDSDSDTEEGATGRETEMDFLRNFFSQTLGLGSQKERLLDELTLEGVTRYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYANLEKYHLPYPEAIFEIGYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFIRLLKEKGLLLRCYTQNIDTLERVAGLEPEDLVEAHGTFYTSHCLSPLCRQEYALNWMKDLLRGDSQV	1437475	1409323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410475_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413039_1414806_1414937_1421053_1421123_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
636091	contig_18184_pilon	+	2215	6	Intergenic	novelGene_123851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	60.387415907621	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	295	1680	48717	62430	FALSE	15	CCTTCTCATGAGTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSIRSNLQTHRRIHTGEKSYNCEECGKVFRQAVHLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKCFRQSAHLLTHQRVHSGEKTFKCEECGKYFRNRSNLQTHHRIHTGEKYFNCVSGPYSWGFSSLCRNSKSGLLL	37548	62965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37780_48653_48732_55969_56097_60466_60614_61165_62031_62198
636093	contig_1244_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_37927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTTAAATTAAACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340727	338330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_338300_340700
636099	contig_3627_pilon	+	1036	2	Intergenic	novelGene_78526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	109	357	634068	634316	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	630892	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_631000_634066
636100	contig_6576_pilon	-	1606	14	Intergenic	novelGene_42235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	91.0173271754002	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	436	1410	252452	229096	TRUE	50	GGGAAATTGCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261293	228780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258572_258854_261240
636115	contig_19564_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_29659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	838	1236	39079	39477	FALSE	35	TCCAGAAGAGATTACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGARESSPRPLEAKDWRLSPGETGDRSSRQSEAQKWRLSPGETPEWSLRLAEPQEQSLRRTEVVESRLSPGESGNQKLGLTEVHKWRPDCEESQEQTSVQLVPSQWRLSSGEENKDFLGECGKKEERPIPTV	37986	39479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_38566_38820
636128	contig_5023_pilon	+	2114	12	Intergenic	novelGene_7147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	241.454785049169	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	892	1590	359358	402047	TRUE	5	TTTGTTGTTTACTGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPTH	349672	405750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_349802_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_402039_402194_403088_403180_405463
636136	contig_19342_pilon	+	1320	4	Intergenic	novelGene_41082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	4	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCTGTGTTTGCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3242	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3464_5094_5522_5960_5994_6139
636137	contig_10299_pilon	+	2484	4	Intergenic	novelGene_79759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	871	1236	584817	591353	TRUE	65	CCCTTAAATAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRVDVTAISKLCDSFCSWDIGPVEQSMCVRPSSLAAFIFLAVCSEVVGETRGLVAEKQEAFIPRLLSGACSACSIFLFREGVTMEEGVAATAVCALPSRWQPGMECWSRKWSIRAFREG	579642	593492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_580422_584725_584889_591059_592504_593394
636146	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636147	contig_6654_pilon	-	2732	1	Intergenic	novelGene_85766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAAAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614540	611808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_611800_614500
636161	contig_15937_pilon	-	2283	2	Intergenic	novelGene_143133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3847	junction_1	0	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTTCTTAAAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30551	28043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601
636165	contig_15304_pilon	-	691	2	Intergenic	novelGene_30552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	198	656	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53288_54004
636187	contig_15787_pilon	+	2303	7	Intergenic	novelGene_143958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	689	junction_3	436.804558380773	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	90	1055	56204	98367	FALSE	30	TTACATTTGCACAGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRKPSNASEKEKHQKPKRSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQEYISTLLLNGYETIEDLKDIKESHLIELKIENPEDRMRLLSAAENLLDEESKCVHLLVFLADSRS	56114	99615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_96021_98169
636188	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
636189	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636198	contig_5196_pilon	-	1986	6	Intergenic	novelGene_38657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	338.408865132106	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	63	1055	14523	9365	FALSE	15	CTTAATTGTGTTGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLIAIFVIFYIIYSLAFVLIVFNFFLNIPFYPENPFYLYRNTHKCTTHMHTCVQLFLNTTKIYIIDLEGFHLSKQSRFRVQREKNG	16068	8433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9618_9663_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
636202	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_94889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636216	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636223	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_96577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
636224	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636244	contig_4232_pilon	-	1691	2	Intergenic	novelGene_63262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4102	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCACTGGTGTGGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462617	460882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_461228_461271
636245	contig_2069_pilon	-	734	3	Intergenic	novelGene_23484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	1239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	69	350	1509802	1508747	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509870	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
636247	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_96616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636259	contig_7428_pilon	+	1735	13	Intergenic	novelGene_77723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	132.14732939665	19	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	518	1474	433208	435117	FALSE	20	CAGGCTGGTATGGGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDKAKAPLRELLRERAEKMGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSRDFNEECPRLRIFSHPNVLPVLGACQSPPAPHPTLITHWMPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428846	435378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_428900_429283_429465_432553_432721_432924_432990_433156_433254_433360_433445_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
636268	SIRV7	-	229	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91672	-7	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
636272	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636288	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636289	contig_233_pilon	-	1600	6	Intergenic	novelGene_14479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.1234397801217	447	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	96	410	22361	13017	TRUE	5	CTGTCTCTTGGCTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKPKEGVKTENDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGTRAARRLSGCGV	22456	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_12583_12622_12660_12728_13110_14678_14751_18722_18852_22340
636294	contig_18898_pilon	+	2310	18	Intergenic	novelGene_77634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	384.815041178168	1	23	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	37	1926	39761	70123	FALSE	15	TCAGCCCTAGTGTTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATGTGAVQTEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQEVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSQDQPHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRVVTALHSLTLLTVVIRSLNSMLLGTTLAISGMDISRISSEALGRVDHGEPHEVVEGPQDPTEGCRK	39724	70507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_39818_53324_53388_53471_53559_56519_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66244_67304_67449_67967_68059_68476_68541_70078
636320	contig_18194_pilon	-	1589	6	Intergenic	novelGene_55956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	116.96255811156	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	128	658	18897	5085	TRUE	10	GCCCTAAGCTCTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLLFPPALWTTQPGHQQKPKPAS	20413	3353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_3845_4644_5150_5192_5501_7034_7162_18866_18976_20364
636337	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
636338	contig_14525_pilon	+	429	3	Intergenic	novelGene_149779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACTACTCTTCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234606	240476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234709_235512_235779_240415
636344	contig_8538_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_4696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
636353	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
636360	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	157	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636361	contig_10037_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_148966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATTAAAAAAAAACGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440889	440482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_440500_440900
636369	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	35	3086	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
636371	contig_15063_pilon	+	1649	6	Intergenic	novelGene_14150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	159	1394	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34649	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
636379	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
636380	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636389	contig_10904_pilon	-	1202	6	Intergenic	novelGene_22742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.911760695085	454	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	205	951	661760	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662755	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661766_662335_662445_662665
636397	contig_13800_pilon	+	1758	8	Intergenic	novelGene_153718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	333.379969526714	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	347	865	125068	139782	FALSE	50	AACCAATGAATAGCCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSAFMVMIVLFDYLKKMRRRRKRRKKSKMIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQVNE	99664	140675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_99821_109046_109072_114289_114436_125048_125161_125897_126022_127741_127807_131981_132055_139618
636403	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_95680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653730	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
636412	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_95814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
636413	contig_8772_pilon	+	1771	8	Intergenic	novelGene_21074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5397.67372795627	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	146	778	15355	19182	TRUE	55	CAATAAATCTTTGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQVC	15209	23402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16615_19177_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21519_21966_22053_23063
636416	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	19	357	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14427	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636418	contig_1443_pilon	-	1929	16	Intergenic	novelGene_28255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	50.6434157176978	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCACTGTTATCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562600	553135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554592_554842_554891_555155_555208_555499_555545_556763_556868_557039_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559584_559691_560831_560913_561588_561649_561750_561837_562575
636422	contig_9354_pilon	+	2735	13	Intergenic	novelGene_108062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	19.058936369996	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	127	2379	233330	263373	FALSE	25	TAACTAGTTCCATCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAKTRLFLLSPHHLKQLKESPGPRLKWQRLLHQQQPLHPEWAALAKKQLKGKNPEDLTWHTPEGIAIKPLYSSRDTKDFPEELPGMKPFTRGPYPTMYTFRPWTIRQYAGFSTVEESNKFYKDNIKAGQQGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVRGDVGMAGVAIDTVEDTKILFDGIPLERMSVSMTMNGAVIPILATFIVTGEEQGVPKEKLTGTIQNDILKEFMVRNTYIFPPEPSMKIIADIFQYTAKYMPKFNSISISGYHMQEAGADAILELAYTIADGLEYCRTGLQAGLTIDEFAPRLSFFWGIGMNFYMEIAKMRAGRRLWAHLIEKMFQPKNSKSLLLRAHCQTSGWSLTEQDPYNNIIRTTIEAMAAVFGGTQSLHTNSFDEALGLPTVKSARIARNTQIIIQEESGIPKVADPWGGSYMMESLTNDVYNAALKLINEIEEIGGMAKAVAEGIPKLRIEECAARRQARIDSGSEVIVGVNKYQLEKEEPVEVLAIDNTSVRNKQIEKIKKIKSSRDQALADQCLAALTDCAASGDGNILALAVDAARARCTVGEITDAMKKVFGEHRANDRMVSGAYRQEFGESKEITFAIKRVDNFMEREGRRPRLLVAKMGQDGHDRGAKVIATGFADLGFDVDIGPLFQTPREVAQQAVDADVHAVGVSTLAAGHKTLVPELIKELSSLGRPDILVMCGGVIPPQDYEFLYEVGVSNVFGPGTRIPKAAIQVLDDIEKCLEKKQQSM	230044	263729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_230131_233289_233715_234873_235242_238363_238522_239133_239306_242315_242565_245143_245256_246928_247045_255182_255299_256771_256904_258046_258195_259837_260006_263244
636432	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636442	contig_15991_pilon	-	987	7	Intergenic	novelGene_70886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3245.72818828414	32	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	550	918	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106338	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_105001_105142_106315
636456	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
636467	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
636478	contig_14191_pilon	+	2062	4	Intergenic	novelGene_153761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1602	junction_2	1758.62717923827	1697	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	163	522	25902	44263	FALSE	10	TTCCTGGATTTCATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLLVDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR	25739	45803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_25916_34342_34420_42206_42399_44186
636480	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	215	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636481	contig_14666_pilon	+	1580	14	Intergenic	novelGene_39487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1056.0428032835	2030	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	54	1238	303800	323175	FALSE	25	GATGTGACTCTTGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLGNSKTEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGEGGEEDPHAARSNSDGEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	303277	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_303311_303779_303939_307502_307576_310680_310726_315323_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322434_322677_322746_323028
636487	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
636492	contig_14322_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_116099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
636497	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636504	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_95022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636507	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
636512	contig_6007_pilon	+	1600	11	Intergenic	novelGene_87907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.1692012568726	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	187	1269	58259	80410	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGLSGLRGRDFELSDVFYFSKKGLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	34840	80741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_35001_58232_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
636513	contig_1948_pilon	-	1396	5	Intergenic	novelGene_31175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	293.905916068391	1263	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	25	345	552044	545223	TRUE	20	GAAGTGTATTCTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWQGPT	552068	543607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_545139_545235_546750_546900_548485_548594_551992
636514	contig_5643_pilon	-	2236	13	Intergenic	novelGene_39148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_12	58.3357142371254	369	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	84	1547	708267	658287	TRUE	30	AACTCCACAGTCTCAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAAEGDVGTVVELVRLLRSGFEELSLNKLATSLGASEQALRLIISIFLGYPFALFYRRYLFYKDSYLIHLFHTFTGLSIAYFNFGNQLYHSLLCVVLQFLILRLMGRTITAVLTTFCFQMVYLLAGYYYTATGNYDIKWTMPHCVLTLKLIGLAIDYFDGGKDQNSLSSEQQKYAIRGVPSLLEVAGFSYFYGAFLVGPQFSMNHYMKLVQGQLTDMPGKTPNSIIPALKRLSLGLVYLVGYTLLSPHITEDYLLTEDYENRPFWFRCMYMLIWGKFVLYKYVTCWLVTEGVCILTGLGFNGFDENREAKWDACANMKVWLFETTPRFTGTINSFNINTNAWVARYFFKRLKFLGNKELSHGLSLLFLALWHGLHSGYLICFQMEFLIVIVERQAASLIRESPVLSNLASTTALQPFFYLVQQTIHWLFMGYSMTAFCLFTWDKWLKVYKSIYFLGHIFFLSLLVILPYLHKAMVPRKEKLKKME	708350	656745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_657423_658274_658404_658503_658663_658740_658889_659576_659744_659840_659928_660723_660833_661998_662178_662608_662647_662798_662893_663452_663560_664488_664597_708116
636532	SIRV4	+	183	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	648	1117	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
636538	contig_15063_pilon	+	1609	6	Intergenic	novelGene_10436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3915.82020016241	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	237	1079	34808	36333	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKGGQACTSRLPDATHPGAAESA	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36268_36600_39506
636549	contig_5988_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_16140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGATACAGCTAAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598115	1597824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1597800_1598100
636553	contig_7091_pilon	+	1807	15	Intergenic	novelGene_131778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	339.314946109159	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	69	764	368213	417113	TRUE	35	TGACTTACTAAGTGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKDYHEEKKVLNGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTI	354353	435616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_354396_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415649_417106_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
636554	contig_14326_pilon	-	2298	8	Intergenic	novelGene_120731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	53.1451612403736	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	116	1165	487141	442066	FALSE	30	AAACCTTATGTCAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSVGPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQCLSQATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493214	440932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443571_443868_443932_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
636555	contig_2078_pilon	-	2081	8	Intergenic	novelGene_100130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1186	1491	308324	306374	TRUE	50	GAAACACAATAACATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFQSHLLQREPLHRQMLPRSKVAFFWSAGLLTTQMTWVLTWLRGRLRLTILELGVGSCVPLFSRCPGRPLPNQVTVRFSVAPGVPHSRVKLHQPDVLDDE	311945	266389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_266463_280080_280213_285913_286266_306340_306645_308289_308399_308812_308960_310935_311589_311634
636556	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
636572	contig_8138_pilon	+	1851	5	Intergenic	novelGene_52444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	198	653	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280097	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306779_306966
636590	contig_2161_pilon	-	2078	9	Intergenic	novelGene_114907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_8	31.4434015335491	243	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	367	1833	791304	760359	FALSE	30	TGTATGGCTCTAGAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRGPSRQQLSRSALPSLQTLVGGGCGNGTGLRNRNGSAIGLPVPPITALITPGPVRHCQIPDLPVDGSLLFEFLFFIYLLVALFIQYINIYKTVWWYPYNHPASCTSLNFHLIDYHLAAFITVMLARRLVWALISEATKAGAASMIHYMVLISARLVLLTLCGWVLCWTLVNLFRSHSVLNLLFLGYPFGVYVPLCCFHQDGRAHLLLTDYNYMVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHIWSENTIWPQGVLVRHSRCLYRAMGPYNVAVPSDVSHARFYFLFHRPLRLLNLLILIEGSVVFYQLYSLLRSEKWNHTLSMALILFCNYYVLFKLLRDRIVLGRAYSYPLNSYELKAN	792863	760113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763652_763774_765726_765915_766656_767006_773463_773619_778784_778869_782626_782850_791191_791379_792571
636600	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636603	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
636605	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
636610	contig_14322_pilon	-	288	2	Intergenic	novelGene_116524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGTGGGCGAGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674873	672848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
636621	contig_8376_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_153772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAACCAACTTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146272	147687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_+_146300_147700
636626	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636632	contig_6946_pilon	-	2978	5	Intergenic	novelGene_59756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.9675141634355	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	364	807	108667	108224	TRUE	15	TATGTAGTTGTGGGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLGVSGEPSPCTSTSRNAPGAASTQRHQVSSSRVHFVSGGDRPLTSEPPPRWARRRRRSVSRTIAAELAENRRLARELSKREEEKLDRLIAIGEEASAQQDTANELRRDAVIAVRRLATAVEEATGAFQLGLEKLLQRLISNTKS	113091	105261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_105745_106535_108748_111802_111886_111959_112041_112972
636641	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
636646	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636663	contig_401_pilon	-	1799	2	Intergenic	novelGene_42897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAAGAATTTCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1820091	1818095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1818909_1819105
636685	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
636693	scaffold_12124_pilon	-	1990	8	Intergenic	novelGene_22013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTGGGTGGAAAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815412	800021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_800146_802988_803111_803837_803971_804058_804234_807297_808329_808431_808462_813912_813995_815119
636700	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_97647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636705	contig_12125_pilon	+	2285	10	Intergenic	novelGene_76185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	128.554163057857	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	210	1166	67320	82984	FALSE	40	AGTCACTAAATTTGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQRDDNFRIS	56146	84103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_67191_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650_82810_82939
636722	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636723	contig_5566_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_153650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	552	935	154335	154718	NA	50	TGAAATAAGTCAGTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLSITYFGHVIRRNRSLEKDTMLGKVKGQQKRGRPSTRWTDTVAATMGLSLTTIVRMAQDWAVFRSVVHRVTMSWNDSTAPNNNDNKLPEDIMIMPFTCNIIKSYFVISVLLISCLLHFHLNCSR	153783	156267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_153800_156300
636735	contig_14513_pilon	-	1005	3	Intergenic	novelGene_70385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	132	587	18880	11833	TRUE	60	AATTTAAAAAACATTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMSTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19011	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11498_11608_12138_18729
636736	contig_12270_pilon	-	392	2	Intergenic	novelGene_113130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	3	392	14437	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLWCASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14358
636748	contig_13894_pilon	-	1784	7	Intergenic	novelGene_62193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	204.385868722212	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	568	1116	753211	750013	FALSE	25	GAGTAGCGGTGCCACGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766683	749344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_762021_762299_763800_763958_766578
636749	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636750	contig_1948_pilon	-	1553	4	Intergenic	novelGene_31182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	289.049399853305	23	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	34	393	552044	546700	TRUE	65	TAACAAAAAATTGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWQVQQSLQYFVLCSVCLL	552077	543642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546472_546900_548485_548594_551992
636768	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
636773	contig_12270_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_114090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	19	303	14409	13902	FALSE	25	ATCAGCAGCTTCCAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFT	14427	13901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636781	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636827	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636829	contig_15327_pilon	-	1209	11	Intergenic	novelGene_70512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	43	junction_10	82.9361802833962	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1191	17	1207	465117	450627	FALSE	5	TGAGGTCCCCTGGGGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGCNMAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEAVQALTVLEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTLALPEESKIKDAYHMLKRQGIVHSDPTIPADRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLNEMLLHYSKEDSSEADKELMQELFDRCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIQGQVVNGEVATSAPPGPEGNTHTSSHGTLIDLAESDTPGSSPPVLAPIPVPPTSGIPVLPPPPQTTGPLHSCSSSQAEAPPETSGTSNALSLLDEELLCL	465133	450624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_450872_451139_451257_452062_452145_452635_452774_453168_453250_453399_453504_453770_453895_454528_454628_456325_456402_456527_456613_465077
636834	contig_11126_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_138117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTATTGGGATTTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165760	166039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_165800_166000
636840	contig_12951_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_68206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGGAAAAAAAAGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763297	762766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_762800_763300
636841	contig_7202_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_16375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTCTTGGCGATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636849	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
636851	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
636864	contig_12120_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_21398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAATAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18437	20499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_18400_20500
636874	contig_6027_pilon	+	3132	4	Intergenic	novelGene_74446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	271	681	262788	263198	TRUE	65	AGTTAAAAAAAAAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKEACPPGANPLSKTFTTKASSVQLEEDLWLSLDCSLARFSATCTLRRPSPSLSRVRGYSLGLRIPDGSIRTALSPEFPVRSGNWEHFPSFPSLGEEEPIPLLSLSVPEVSTSAPHPSPATGLGKGADEESLGHS	262517	267277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_263490_263777_264269_265057_265158_265708
636876	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
636886	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
636893	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
636904	contig_14322_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_115784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
636905	contig_1443_pilon	+	866	2	Intergenic	novelGene_28174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	36	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	102	566	344128	344592	FALSE	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343647	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
636906	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	11	352	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14419	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636915	contig_18108_pilon	-	2475	17	Intergenic	novelGene_33508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_16	300.927706226928	2	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	68	2263	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335421	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_335363
636918	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
636922	contig_12080_pilon	-	2169	3	Intergenic	novelGene_128422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	12.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	373	753	584057	576497	FALSE	45	TAAAATGTGTCATTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTILANARFFHGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREVMILITGAHKAFALYKAIEEGVNHMWTVSAFQQHPCAVFVCDEDATLELKVKTVKYFKGLMLVHNKLVDPLYSIKEKEAEKSQSSKKPYSD	584429	575080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_576598_577439_577615_583952
636935	contig_211_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_129876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGCTCAGCTCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265995	265605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_265600_266000
636940	contig_8673_pilon	+	2466	1	Intergenic	novelGene_129933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1935	2300	331438	331803	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPTKAYSLSPKDQERGRKLLLDDNHSIPTKHHRKKLWSYSHLPQQRLSGDPRFLPVEAYNEALQHLCQRGIRGSLVESQDLHHYPAITRPVPLGYQWRPFGEPEFPPPPLGNRDPIPLF	329503	331969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_329500_332000
636944	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
636951	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
636953	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91674	11	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
636958	contig_9797_pilon	+	1343	5	Intergenic	novelGene_65597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	381.452814906379	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	140	766	183892	191368	TRUE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	183752	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_183989_188577_188734_189277_189422_191138_191731_191938
636977	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
636983	contig_3095_pilon	+	841	4	Intergenic	novelGene_75011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1141.34929895375	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	103	828	147280	151151	FALSE	25	GAGTTTAGTATTGCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	151164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996
636985	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_93688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
637003	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
637033	contig_12786_pilon	-	1610	10	Intergenic	novelGene_103388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_9	557.417347025935	3497	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	612	1547	614067	590909	FALSE	15	CTCCTTTTGTATGATTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629618	590845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628911_629303
637047	contig_9400_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_146598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATACTGTGGTGGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145094	145654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_+_145100_145700
637052	contig_11752_pilon	+	1303	7	Intergenic	novelGene_37606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	763.599244077386	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	115	651	87165	94226	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVEHLETGHLWNHPVK	84087	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_93015_93060_94223_94410_96442_96576_105573
637053	contig_6710_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_89072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTCCAAGAGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653350	657515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
637054	contig_7744_pilon	+	2100	15	Intergenic	novelGene_62571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	209.416694751914	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	504	1436	884711	890227	TRUE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGELTNAPTATCTPVTPPIIHGNLTCDTIFIQHNGLIKIGSVAPDTINNHVKTCREEQKNLHFFAPEYGEVTNVTTAVDIYSFGMCALEMAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHVILRARAALGWVARWRGREASFSVFSS	882673	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_882894_883079_883169_883412_883515_884618_884731_885263_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890288_890539_890596_890680
637085	contig_12786_pilon	-	1514	9	Intergenic	novelGene_103404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	691.616042324063	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	847	1452	600902	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629610	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602804_602956_604600_604719_614020_614079_628731_628938_629303
637090	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637100	contig_10009_pilon	-	2103	3	Intergenic	novelGene_82716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGTCCCCGGGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43594	41112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41656_41787_43212_43458
637101	contig_5039_pilon	+	2351	9	Intergenic	novelGene_64955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	25	junction_1	22.5277606521376	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	347	706	1647338	1649689	TRUE	50	CCTATTCAAGAAAAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTIIELSKTSPASFSETDTPSSESAELPVDWSIKTRLLFTSSQPFAWADHLKAHEEAQGLVQHCRATAVTLPQSIQDTRLSTELRCAFQQSLIYWLHPAFPWLPLFPRIGADRKMAGKTSPWSNDESLQHILMSDWSVSFTSLYNLLKTKLCPYFYVCTYQFTVLFRAAGFAGSDVITALISPTTRGLREAMKNEGIEFSLPLIKENAHKKKASGTSLGHGEYVITMTFYAVQ	1643970	1654833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1643999_1646022_1646227_1647223_1647403_1648779_1648959_1649573_1649878_1650331_1650531_1651499_1651713_1652755_1652902_1653934
637112	contig_6102_pilon	+	688	7	Intergenic	novelGene_32220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGTAGCAGGGACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894921	905209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_905179
637115	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
637120	contig_19769_pilon	-	3871	2	Intergenic	novelGene_102248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	932	1237	52325	52020	TRUE	5	CGGTCTGGTCCCGACGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSFYFSFQCPCSSSHQPNFWKQRTVSPHPLPLIQFNLKALQMNFETHSLSTKIVLVTNVKTVNSQRLDHGLLFKQSLPCVVMTLHSGFPSTSLPLLPLL	53256	49060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_49177_49501
637127	contig_11615_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_151261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTATGTGATGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58853	59228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_58900_59200
637128	contig_11615_pilon	+	1980	2	Intergenic	novelGene_151262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	76	junction_1	0	33	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1093	1554	61769	62230	FALSE	35	GAGTGAGACATTAGAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLKVKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFTFLGSTISAHGSSSQEIKRHIAPGKSAAKNLVKVFKSKDVTLRPEVHLTQAVVFSITSYAWESWTMNKEDQRRIDAFELWCWSRILNIPWNARRTNKSAWKKYSQSAPWN	59435	62656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_59792_61032
637147	SIRV7	-	227	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69049	4	35830	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78908	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
637148	contig_10331_pilon	-	1860	3	Intergenic	novelGene_54065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67410	59615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_60971_64318_64470_67056
637151	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637167	contig_12790_pilon	-	1827	10	Intergenic	novelGene_35256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGCGGAGGATGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313340	306061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306137_307244_307339_308741_308840_309576_309746_309871_309922_310030_310115_310398_310488_311027_311078_311896_312029_312354
637172	contig_10000_pilon	-	1879	5	Intergenic	novelGene_139305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	569	junction_4	133.478462682187	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	641	1000	168014	159846	FALSE	15	CAAGAGTGTGGTGTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	169116	158966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530
637193	contig_14034_pilon	-	1850	7	Intergenic	novelGene_72679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	39.9444058105206	592	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	126	695	430673	421075	FALSE	5	GCTCTGGCTCTAGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAGAAGSVAAASSSLRSGSIIHNRCRQVPPDSALESPFGEMALVRGGWLWRQSSILHRWKRNWFALWLDGTLGYYRDETAQDEEDRVLIHFNVRDVKVGQECHDVQPPEGQSRDGLLTVHLREGSRLHLCAETQDDAIAWKTALMEANSTPVRVYSPYQDYYEVVPPNAHEATYVRSYYGPPYAGPGVTHVVVREDPCYSAGAPLAMGMLAGAATGAALGSLMWSPCWF	431967	419919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_421212_421835_421936_427441_427482_428601_428705_429295_429449_430636_430713_431881
637197	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_90413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637202	contig_9206_pilon	-	2717	2	Intergenic	novelGene_137490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	217	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	395	886	276688	276197	FALSE	15	TACTCTGTCCTATTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIKLRSLSIIVLQIHFLKEFLLVSKPIFVLNLGMLLCILLWLHNTRKHIIEKNLTNVMSVAKPLTEALTSPNIRVYIFEKNLTNVTSVENPLTRAHTSLDISIYVLERNHTNVLCVTKLLSKNQSLWNISKFILEKDVVRLLLDIQTFDIMRKTNTGKETY	304849	274365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_277039_304805
637206	contig_5041_pilon	-	1821	15	Intergenic	novelGene_27082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	812.495513331411	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	864	1385	576515	570867	TRUE	55	AAATAAGAGGTTATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSVIIIVSSQRKLGVSRK	636089	532764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_532798_554495_554617_565850_565986_569904_570047_570861_570914_572065_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581106_595051_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
637213	contig_998_pilon	-	3045	8	Intergenic	novelGene_153798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	59.9986394403563	35	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	96	689	365529	346945	FALSE	80	CAGGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKYVLFTY	373662	344588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
637219	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
637242	SIRV7	-	305	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	32	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114706	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70988_78841_78964_114686
637258	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1446	632	991	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2446	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
637259	contig_12000_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_43152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	556.908998538416	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	109	792	417192	669310	FALSE	20	TTATATCACATGTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELASTADTCRQTQNRQRRIMTNRKRSAGNP	416845	669834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_669224
637267	contig_4059_pilon	-	1063	4	Intergenic	novelGene_140596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	1208.73414042221	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	222	740	422646	398089	FALSE	30	GATTATGCTGACTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	436369	397765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411209_422462_422662_436163
637270	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_17690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637291	contig_20614_pilon	-	2525	7	Intergenic	novelGene_107556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	183.220647186816	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	86	1135	164772	158375	FALSE	35	CTCAAAAAATACCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPRETRGRFQLPEPEGSGVPSPQPDATMLSRLLKEHQAKQNERKELQEKRRREAITAATCLTEALVDHLNVGVAQAYMNQRKLDHEVKTLQVQAAQFAKQTGQWIGMVENFNQALKEIGDVENWARSIELDMRTIATALDSCDWCGNLARLGAESQSKRGNCKHCSTRQLPPEELRPPPAGHLGSSMWLPLLLGALVWGVLWLLRDQQTLPRSDAFIFITGCDSGFGRLLALRLDQQGFRVLASCLTPAGAEDLQRMASSRLHTILLDVTDPQSVQWAAKWVKTQVGEAGLFGLVNNAGVAGIIGPTPWLTWDDFHRVLSVNTLGPIGVTLALLPLLQEAHGRVVNVTSVLGRLAANGGGYCVSKFGLEAFSDSLR	164857	156984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_158638_158839_159186_159734_159838_160658_160730_160918_161052_163291_163365_164711
637304	contig_12000_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_43206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATGAAAAGAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669105	671250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_669100_671200
637306	contig_11594_pilon	+	1792	10	Intergenic	novelGene_80924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	515.550622581764	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	30	1358	540415	568385	FALSE	25	GAGCTATACTTCAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAADGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	540385	568819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
637308	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
637310	contig_14288_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_153841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATATAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473677	476284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_473700_476300
637313	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
637315	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637316	SIRV4	+	384	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	81	485	81	-485	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGCGGAGACCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536	2286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
637317	SIRV4	+	228	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1543	632	1088	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
637326	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637331	contig_6871_pilon	-	2561	15	Intergenic	novelGene_21657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	9.95833155437892	174	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	166	1761	784881	780734	FALSE	35	CATTCATTGTCTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGMQLYKNYQQAQSRHLRPSCLGSPPLRSVSDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSAALEEAQAWRKKTNHRLSLPTPSSGSSLSAAIHRTQPWFHGHISREESQRLIRQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL	789422	779933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781196_781300_781389_781511_781573_781760_781878_781977_782059_782347_782447_782687_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_789262
637334	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1117	0	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
637336	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
637339	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
637341	contig_7457_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_31495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	246	332	646778	646692	NA	20	ATGCAGGCAGTCTGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSLSLACSSTQANPNSFTFKLSSNVCFPVKTYSTSLYNITHILLYVFLTLSVCVPIIQLDCKPLGSQSHLLIFLSPSALPMIDTKNMTDEINRENNSKAWVKPQISNW	647023	645977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_646000_647000
637350	contig_498_pilon	+	1899	4	Intergenic	novelGene_148559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	68.0800182791463	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	9	1160	755864	768386	FALSE	5	CGGTCCCAGCTTCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGDNLGQQYNSPQEVIGKQGSDVIIVGRGILTAPNRLEAAELYRKAAWEAYLSRLGM	755855	769125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760387_768216
637354	contig_14322_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_115823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTCTTGAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
637359	SIRV7	-	218	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69055	7	35836	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
637361	contig_6589_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_25747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509129	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_509100_509800
637370	contig_15327_pilon	-	1792	8	Intergenic	novelGene_70722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	292.115297337841	1571	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	53	790	967479	960518	FALSE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967531	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961871_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
637372	contig_6735_pilon	-	1658	15	Intergenic	novelGene_15678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.44530929742	4	49	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1422	237	1658	564868	541984	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALSCRDISESSLCPVLKLKIKWDYGSPL	568261	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542063_542807_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_565256_565430_568198
637412	contig_18869_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_55992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTTTCTTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73598	73289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
637420	contig_6418_pilon	-	1272	9	Intergenic	novelGene_81095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	593	junction_7	313.552926154421	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	350	1018	81719	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	82068	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713
637421	contig_9683_pilon	-	2299	11	Intergenic	novelGene_151273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	19.0181492264626	202	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	348	1040	445454	441421	FALSE	15	TTCTTGATCTTTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQVPMNMIITGCMLNFYRKTPTVVFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDAPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLSTLVGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVTDEEGQRLGHSVAAAKQGIFQVVISRICMAIPAMAIPPVIMDSLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQRSSIHVSRLEPDLRAQIREQNSSVEVVFYNKGL	447629	440161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_441518_441787_441836_442324_442375_443603_443654_443856_443985_444274_444361_444523_444600_444983_445083_445395_445567_446218_446384_447559
637425	SIRV4	+	400	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	916	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2371	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
637427	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_18873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
637437	contig_12270_pilon	-	302	2	Intergenic	novelGene_114104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	14409	13911	FALSE	25	ACTTTCACCATCAGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDF	14435	13910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
637442	contig_10197_pilon	-	1397	6	Intergenic	novelGene_115219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1335.85978306108	120	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	108	818	952331	910197	FALSE	25	CCAAATATTATTGCGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTGFFSITVLSPCQMWQDHL	952438	909617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910255_915192_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
637456	contig_11186_pilon	-	2364	5	Intergenic	novelGene_98878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	145.461979568546	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	121	888	285822	235837	FALSE	45	ATCTTTTGAATAAAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFHLTFLLGFGPLPKAGTFRSPARSKSSVSAHLTVGRDDMSNKEAFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKENKTPSSDAQDKQFGAWSLKVTPVDYLLGVADLTGELMRMCINSVGNGDIDTPFEVSQFLRQVYDGFSFIGNTGPYEVSKKLYTLKQSLAKVENACYALKVRGSEIPKHMLADVFSVKTEMIDQEEGIS	285942	234360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_239957_240086_266595_266727_280493_280609_285806
637467	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
637478	contig_7410_pilon	+	1591	8	Intergenic	novelGene_106094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	227.115991223401	548	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	94	507	405351	407457	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405257	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407879_408138_408410_410366_410421_411209_411246_411881
637485	SIRV7	+	291	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTAAATGCGATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	78962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
637499	contig_15063_pilon	+	1349	4	Intergenic	novelGene_14233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	52	1221	34808	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34756	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35358_35820_36158_36266
637510	contig_2100_pilon	+	1435	8	Intergenic	novelGene_50701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGTTAGGCCAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169920	1185478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170340_1172312_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176817_1185408
637513	contig_20293_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_153528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTACTGAATTTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97394	97838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_97400_97800
637518	contig_5643_pilon	+	1146	9	Intergenic	novelGene_39099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	679.009710902576	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	258	848	636518	641123	TRUE	10	TCCGGTCATTGTGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQTQGGYV	635156	641590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_635274_635373_635460_636463_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641102_641244_641412
637523	contig_12270_pilon	-	297	2	Intergenic	novelGene_114114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCACTTTCACCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
637528	contig_5145_pilon	-	1619	13	Intergenic	novelGene_131427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.487002152833	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	696	1370	925621	916397	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947088	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915722_916314_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
637534	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
637535	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
637542	contig_10968_pilon	+	1613	10	Intergenic	novelGene_84292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	235.825160177703	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	145	834	166381	176209	TRUE	35	GGATACATGCCTTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRNGVSFTSPSSHGSCSPTLSKSSGLSCEPSGAAAPSGEHQITRGLAMATSGQSCVRPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGKSQQF	166029	178570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173506_176189_176248_177829
637544	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
637559	contig_8710_pilon	-	2379	16	Intergenic	novelGene_73537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	111.075149736063	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	35	1870	518747	459003	FALSE	25	CATTAACTTTTCATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	520668	458493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459114_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500_495617_502005_502097_516296_516415_518639_518757_520643
637564	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91668	6	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
637574	contig_7744_pilon	-	1843	12	Intergenic	novelGene_62505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	289.296724905973	470	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	551	1801	823397	820619	FALSE	15	GCAACTTTGCTGCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKSLGRRDRRKKGDRGKEILEKDGYLGQSILTVHFLSSFIPQVLNSRPLVLFPCFVKVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQYMSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	825062	820576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823501_823760_823968_824143_824304_824625_824670_825026
637581	contig_10940_pilon	-	2095	4	Intergenic	novelGene_49256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	FALSE	30	TCCAAGAACAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
637591	contig_10940_pilon	-	2046	4	Intergenic	novelGene_49227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	90	518	917000	875564	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917089	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
637602	contig_15410_pilon	+	1178	5	Intergenic	novelGene_130604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	302.224254486631	4479	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	255	722	145617	148093	FALSE	35	TGTGGATAAATTTCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPRGCAQSGEYTWRAGRGCFRGGSHLARPPPALPASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145362	148549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
637621	SIRV7	-	214	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69071	1	35852	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78886	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
637624	contig_19769_pilon	+	978	6	Intergenic	novelGene_102271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1462.15192097128	40888	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	34	573	87249	88080	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGEWQVASRWLVGG	86996	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88177_88841_88958_89163
637629	contig_14882_pilon	-	2574	3	Intergenic	novelGene_115029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	49	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	241	549	363421	321305	FALSE	70	AGAAAAAAAAATCAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSTGAGNSLVHKRSPLRRNQKAPTSLTKLSLQDGHKAKKPACKFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINILKQSCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTGRCYYFS	363661	319279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_321410_321539_321739_363416
637630	contig_18511_pilon	+	1873	11	Intergenic	novelGene_126866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	388.124413043034	7	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	232	1551	48154	61229	FALSE	20	TTTGAATGTTCTGAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLAREDHCSETYGTETTSEGGIRK	35391	61551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59802_59917_59948_61191
637641	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_17600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
637644	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637654	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_93960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637656	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637659	contig_14481_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_153860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATACAACAGAATGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238870	239077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_238900_239100
637682	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637693	contig_15063_pilon	-	1493	5	Intergenic	novelGene_12864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACCGTAGTAATCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36745	28165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_34924_35035_35378_35838_36158_36264
637698	contig_5779_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_106437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	149	481	94343	94011	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94491	93302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
637699	contig_18511_pilon	+	1997	10	Intergenic	novelGene_126879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_8	274.412413785357	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	218	1591	47371	59765	TRUE	5	GCTTGTACTTTTTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEWNV	35421	61415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59753_59948_61191
637717	contig_14322_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_115785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671832
637722	contig_13954_pilon	+	2084	9	Intergenic	novelGene_130049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	101.79882121125	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	169	1413	60851	98406	FALSE	25	ATTATAATTTTTGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRVKRFLSKNGLVILGFTFILSLIALLAVGLTQNKNTPENFKFGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKLCNLQAYHNCNQQLKNVTFVLFNTSWIFLSIIVN	35391	99077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_35521_60811_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_98301
637723	contig_8617_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_73463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCCTAATCAACATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63014	62712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
637734	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_96612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637739	contig_12873_pilon	+	1487	6	Intergenic	novelGene_27146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	1104.4616788282	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	793	1284	17896	19855	FALSE	0	TGGCCTGGGTTCTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15946	20058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
637746	contig_14441_pilon	+	1193	6	Intergenic	novelGene_100416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	380.018104831862	14	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	25	1008	81887	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRLLCCVVLCLLGAGAEDAVVTQFPRHRVLGKGKELTLECSQKMNHLVMYWYRQVPGHGLQLIYYSTGTGSIEDGDVTEGYSVSRDKTQNFPLTLASTSPSQTAVYLCASSEGTAMSNNSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81862	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82368_114106_114161_116578_116963_117220_117344_117539
637747	contig_20670_pilon	+	2142	7	Intergenic	novelGene_144823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	45.2821402124747	306	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	112	945	21913	27158	FALSE	10	TGCTAATTTGTCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGGGDCAASAPDADRPHQRPFLIGVSGGTASGKSTVCEKIMELLGQNEVDHRQRKLVILSQDRFYKVLTAEQKAKALKGQYNFDHPDAFDNDLMHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMVAINLIVQHIQDILNGDICKWHRGGSNGRSYKRTFSEPGDHPGVLTSGKRSHLESSSRPH	21801	28355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_22021_22403_22564_23577_23675_23884_24028_24115_24211_26468_26518_26976
637761	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_94250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637762	contig_3004_pilon	+	2151	12	Intergenic	novelGene_127482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	202.390833751869	370	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	212	991	277854	281328	TRUE	10	GTTTTGGCTCGAAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275421	287267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_284415_285297_285547_286522_286875_287113
637763	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637771	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637772	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_96277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637779	contig_5696_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_117554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGGAGTTTATCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685924	687607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_685900_687600
637784	contig_13744_pilon	+	3177	2	Intergenic	novelGene_77152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGGAGTAGAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151852	155079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_154478_154527
637791	contig_6710_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_96458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGGAAGCACAGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653365	653885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
637798	contig_17311_pilon	-	3028	5	Intergenic	novelGene_57855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_1	7648.71253872179	608	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	37	558	126865	121275	FALSE	30	AAAACTTATATGTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKKVMCFEMLCSIVCLSTVGWATSVQLSWWAPLKPYHKVFLSFYC	126901	118804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121407_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
637804	contig_513_pilon	+	2221	2	Intergenic	novelGene_80142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338806	343241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_340164_342377
637814	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637825	contig_18869_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_56142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
637826	SIRV2	+	320	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	277	-74	-277	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGACTTTGATGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
637829	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
637835	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
637840	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
637860	contig_15093_pilon	+	1680	3	Intergenic	novelGene_143312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_2	40	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	28	585	199261	203235	FALSE	25	TGTTTTAGAAAGGGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPVSRVECMLKLPSLDLVFSSNRGELETLGTVYPAETLSPGSNIPQSGTKTSANKTGIPGSSGLGSPLGRSRHSSSQSDLTSSSSSSSGLSFTACMSDFSLYVFHPYGAGKQKTAISGLTPVSGGLGNVDEEPTSVTGRKDSLSINLEFVKVSLSRIRRSGGASFFESQSVSKSASKMDTTLINISGIQFYSF	199233	204330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_199415_202071_202273_203032
637864	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637878	contig_7342_pilon	-	2415	20	Intergenic	novelGene_71100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	99.4141007850649	2	98	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	74	2350	86720	76155	FALSE	5	TCCTGGCGAGTCCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQGLGSSPQDPRAPHFSPLSIQKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86793	76089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78844_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
637881	SIRV2	-	621	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
637882	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	16	354	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14424	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
637886	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
637889	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
637894	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
637896	contig_6445_pilon	-	1321	14	Intergenic	novelGene_76967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	742.77556399059	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	42	1223	96360	43105	FALSE	10	CTGGCTGGCAGCATCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAAGPAPPPATNAWAPANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96401	43006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80510_80562_85287_85477_88146_88216_96306
637900	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
637903	contig_3382_pilon	+	2368	9	Intergenic	novelGene_124162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	274.800382095804	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	34	2313	931459	978251	FALSE	50	ATTTTCAAAAAACAAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRPPSGNGVAMADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIEVLTHCGDCNQCHGTICV	931425	978306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967526_978196
637904	contig_3077_pilon	-	1245	9	Intergenic	novelGene_26740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGACTGCAAAGCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17864	10188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_10203_11389_11482_12017_12066_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
637930	contig_10734_pilon	-	2046	4	Intergenic	novelGene_51016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	458.659641419066	3	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	59	457	320632	315922	TRUE	35	TTTAAAAACAGCCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGGSRDRSPGRGLGTSPTMVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAEQARRND	320690	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315948_318838_319032_320452
637931	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
637935	contig_12638_pilon	+	2093	10	Intergenic	novelGene_33388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138.762876168193	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	561	1355	1529467	1538931	FALSE	25	GGTGCCTGAAAGGATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMANGILKVPAINVNDSVTKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515756	1539669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521323_1522656_1522733_1524399_1524550_1529422_1529527_1529961_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
637939	contig_15304_pilon	+	1122	3	Intergenic	novelGene_30666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	657	1121	106226	107220	FALSE	30	GCTGCAAAAGAAGGGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQVKWTSRSSWPTSITRHVTVGVREIMRKSLGLGGKMKTEGPPGSSGAAHLQPCPWLTYLLLHVGLAGSVGNVAGVGLAGPAAGRHSHRATEGVQARRLQDGWEGVCARLVSRVPGHRHWLWEVVGDHAGQHHCGSGCGPTAGGQGEDCWGCGG	105488	107221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_105962_106042_106374_106903
637945	contig_7057_pilon	-	2207	12	Intergenic	novelGene_123217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	46.1972057399776	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	5	739	539698	537363	TRUE	35	TCAATAAAGTTTCCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRYLGTGLPRLLIPRGQPGYPESGLILSLSDSTPSPLCPEASPSYILRSAPES	539702	534254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534688_534758_534852_535074_535348_535534_536039_536305_536986_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539509_539654
637948	SIRV6	+	730	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	27	544	20	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
637977	contig_3975_pilon	-	1519	13	Intergenic	novelGene_54853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	221.081857012284	13	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	99	1382	2066301	2056518	FALSE	20	TTGAACGTTGTACATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKERTEACD	2079239	2056380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056543_2059901_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
638011	contig_4486_pilon	-	3468	1	Intergenic	novelGene_38618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417992	414524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_414500_418000
638012	contig_12837_pilon	+	1342	8	Intergenic	novelGene_57308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2604.30198255243	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	225	641	129778	166162	FALSE	30	AACCAATGAGTTAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRPIRPHLF	128786	166863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163964_166138
638016	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_90574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
638022	contig_7066_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_42196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGGTGTATGTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011857	1013424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1011900_1013400
638023	contig_13093_pilon	+	2669	5	Intergenic	novelGene_105225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	813	1199	59137	59523	TRUE	5	CGTATCTTCCCTGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFDLQLKPRPHSMHTYGFSPECVLWCLMRVDLSLKPRLQSMHTYGFSPECVLWCLMRVDLSIKPCPHSMHTYGFSPECVLWCLTRVDLSLKPRPHSMHMYSFLSECVLWWRRRPDFWLKPRPQSRHM	57560	80347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_57855_58618_60770_77589_77720_80073_80126_80305
638032	contig_10674_pilon	-	2365	11	Intergenic	novelGene_6447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	704.902149237751	32	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	229	1287	355630	305906	TRUE	35	TATTAATTTTAAACTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKSTTGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKIFIPKQKPVQTLTEEKVSLDPELEEALTSASDTELCDLAAILGMHNLITNTQFCNIVGSSNGVDQKQFSNVVKGEKILPVFDEPPNPTNVEESLKRMKENDARLVEVNLNNIKNIPIPTLKDFAKALETNTHVKYFSLAATRSNDPVAVAFADMLRVNRTLKSLNVESNFITGAGILALLDALRDNETLAELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRRVEGDHQ	395364	301870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_302325_305281_305941_313927_314073_315665_315810_318345_318454_320217_320349_326400_326491_327662_327786_353817_353975_355504_355707_395212
638034	contig_6710_pilon	-	451	2	Intergenic	novelGene_98179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	15	CCCTATTTCAGCCTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638047	contig_11832_pilon	-	1578	13	Intergenic	novelGene_106936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	944.584752241252	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	474	1130	86997	84249	FALSE	10	GCATGAGTGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	89446	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87304_88196_88281_88490_88536_88646_88802_89418
638048	contig_5321_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_153876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60238	57503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_57500_60200
638055	contig_6958_pilon	+	1947	13	Intergenic	novelGene_69916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_8	64.6765456371594	76	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	117	1418	99742	138329	FALSE	35	AACCCAAGTATTAATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRAALLLGLALGTGAFLLDDPEDGGKHWVVITAGSNGWYNYRHQADACHAYQIVHRNGIPDEQIIVMMYDDIANCSDNPTPGVVINRPNGTDVYKGVLKDYTGEDVTPQNFLAVLRGDAEAVKGKGTGRVLKSGPRDHVFVYFTDHGAPGILAFPSDDLSVKDLNETIRYMYKHKKYQKMVFYIEACESGSMMKHLPNDINVYATTAANPRESSYACYYDEERGTYLGDWYSVNWLEDSDVEDLTKETLHKQYQLVKSRTNTSHVMQYGNKSISAMKLMQFQGIRHKVSSPISLPPVRHLDLTPSSEVPLAILKRKLMATNDLQESRVLLEKISGHLEARHVMEKSMQKIVSLLVMSNAEAEQFLSQRVELTKYACYQEAAMHFRTHCFNWHSSMYEYALRHLYVLVNLCEKLYPVDRIKLAMDKVCLGYY	99625	138858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_99880_121575_121674_122965_123048_124493_124580_126347_126424_127155_127219_127879_127947_129771_129891_129976_130067_132013_132215_135018_135190_138007_138076_138286
638058	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638076	contig_5770_pilon	-	1517	5	Intergenic	novelGene_74187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2345.69439345794	13	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1043	1483	264028	261935	FALSE	25	AGAAGAATGTTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265775	261900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766
638084	contig_12270_pilon	-	326	2	Intergenic	novelGene_114025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	6	326	14409	13866	FALSE	20	TACTGTCAGTATGGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14414	13865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638099	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638100	contig_12032_pilon	-	2467	9	Intergenic	novelGene_139260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124.733465838162	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	408	1190	117404	88649	FALSE	20	ATTTCCATTTCAGATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCQGDASGRERGAGVAFAEVPAARTHGPASRGLRPPPDSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKEVQKL	122393	87371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_88664_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122278
638107	contig_11832_pilon	-	1587	14	Intergenic	novelGene_106929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_10	953.840607924324	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	480	1136	86997	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92510	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
638110	contig_14727_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_56620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATGCTGTATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26785	28185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_26800_28200
638114	SIRV7	-	290	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68996	0	35777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78961	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
638118	contig_11720_pilon	+	1758	12	Intergenic	novelGene_43926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	367.765084020756	4	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	15	1505	262271	272210	FALSE	35	ATATTTATTGAGTACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVRLYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262256	272463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264436_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
638124	contig_14516_pilon	+	2121	12	Intergenic	novelGene_153936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_10	102.092001936999	18	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	98	1594	317115	422609	FALSE	70	AAAAAAAAATATAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNSLMYYYNGKAVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	317017	423136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_317157_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418336_421549_421780_422472
638127	contig_16724_pilon	-	2273	2	Intergenic	novelGene_105296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2271	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545326	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916
638142	contig_11370_pilon	-	2211	12	Intergenic	novelGene_98767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_11	122.561571640442	591	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	109	1452	219011	215829	FALSE	15	CCATTTGGAGCCCCGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQRTPEEERSLLHADSNGYTNLPDVVQPSHSPTENSKGQSPPSKDVGSDYQSRGLVKAPGKSSFTMFVDLGIYQPGGSGDTIPITALVGGEGSRLDQLQYDVRKGSVVNVNPTNTRAHSETPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTENGLMLLDRSGQGKVYGLIGRRRFQQMDVLEGLNLLITISGKRNKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDMEGCGHYRVVKYERIKFLVIALKSSVEVYAWAPKPYHKFMAFKSFADLPHRPLLVDLTVEEGQRLKVIYGSSAGFHAVDVDSGNSYDIYIPVHIQSQITPHAIIFLPNTDGMEMLLCYEDEGVYVNTYGRIIKDVVLQWGEMPTSVAYICSNQIMGWGEKAIEIRSVETGHLDGVFMHKRAQRLKFLCERNDKVFFASVRSGGSSQVYFMTLNRNCIMNW	220089	215069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_215913_216319_216460_216563_216724_216804_216955_217036_217138_217311_217447_217649_217794_217900_218069_218443_218553_218777_218916_218996_219104_220073
638143	contig_4852_pilon	-	2112	7	Intergenic	novelGene_153961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_5	75.9745937066391	152	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	10	375	62078	26582	FALSE	40	TTCTAAGCTCTGAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLMLLCSLLVIFAPVSEQSGGSSAYNASRGPFSPGSQESTYSSPLPAVEELQLMYANDETTHPSPLTVTEELQPAYMNVGAADTDVVYSQVWCTQQTEGSANIRKTFLEIKDSSAIYSEVKKA	62087	24844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_26621_26715_26748_28559_28626_28870_29020_29871_29900_60689_60711_62047
638145	contig_1406_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_25534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCAGTCTCATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2138310	2136616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2136600_2138300
638146	contig_5649_pilon	-	3386	15	Intergenic	novelGene_82403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_14	38.3768238947011	207	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	261	1988	1286943	1250250	FALSE	50	GAAGAAATAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFGWAVFLASRSLGQGLLLTLEEHIARFLGTRGTTTMGNSCICRDDSGAEDSVDTQQQQSENSAVPTADTRSQPRDPVRPPRRGRGPHEPRRKKQNVDGLVLDTLAVIRTLVDNDQEPPYSMITLHEMAETDEGWLDVVQSLIRVIPLEDPLGPAVITLLLDECPLPTKDALQKLTEILNLNGEVACQDSGHPAKHRNTSAVLGCLAEKLAGPASIGLLSPGILEYLLQCLKLQSHPTVMLFALIALEKFAQTSENKLTISESSISDRLVTLESWADDPDYLKRQVGFCAQWSLDNLFLKEARQLTYEKVDLNNIRAMLNSNDVSEYLKISPHGLEARCDASSFESVRCTFCVDAGVWYYEVTVITSGVMQIGWATRDSKFLNHEGYGIGDDEYSCAYDGCRQLIWYNARSKPHLHPCWKEGDTVGFLLDLNEKQMIFFLNGNQLPPEKQVFSSTVSGFFAAASFMSYQQCEFNFGAKPFKYPPSMKFSTFNDYAFLTAEEKIILPRHRRLALLKQVSIRENCCSLCCDEVADTQLKPCGHSDLCMDCALQLETCPLCRKEIVSRVRQISHIS	1301123	1248851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1250347_1253589_1253695_1258577_1258731_1259043_1259147_1261256_1261369_1270967_1271112_1272067_1272184_1273155_1273288_1274126_1274194_1276017_1276077_1276851_1276979_1279129_1279243_1280476_1280530_1286596_1287099_1301018
638149	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638154	contig_9014_pilon	+	2112	9	Intergenic	novelGene_106781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	11.0163231161763	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	334	1581	141549	145866	FALSE	25	CACTGTCAGTAATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWKDYEYDLCMTEERCLSGVCTCDPHVPSEALFILGLITSSQSAAYAISKFVSGVLSDQMSARWLFSSGLLLVGLVNVVFSWSSTVPVFAALWFLNGLAQGLGWPPCGKILRKWFEPSQFGTWWAILSTSMNLAGGLGPILATILAQSYSWRSTLALSGALCVVVSFLCLLLIHNEPADVGLRNVDPTPSKGKKGSVKKDSTLQELLLSPYLWVLSTGYLVVFGVKTCCTDWGQFFLIQEKGQSALVGSSYMSALEVGGLVGSIAAGYLSDRAMAKAGPSIYGNPRHGLLLFMMAGMTVSMYLFRVTVTTDSPKLWILVLGAVFGFSSYGPIALFGVIANESAPPNLCGTSHAIVGLMANVGGFLAGWPFSTIAKRYSWSTAFWVAEVICAASTAVFFLLRNIRTKMGRVSKAE	141215	146397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_141558_141727_141828_142401_142635_142956_143201_143667_143827_144071_144158_144683_144798_145428_145568_145702
638162	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	79	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638170	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	1	2	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
638173	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638180	contig_8544_pilon	-	951	8	Intergenic	novelGene_55924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTAGTGGGGGGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152825	83414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_83520_83788_83834_87134_87317_90453_90624_91486_91584_92521_92616_120263_120357_152660
638182	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_96793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638206	contig_7912_pilon	-	2956	1	Intergenic	novelGene_129557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGATCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44638	41682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_41700_44600
638233	contig_13457_pilon	-	1897	12	Intergenic	novelGene_118333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	3	587	71293	69567	TRUE	5	GCCGCCTCTCTTGGGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWDSQAAIQEKSEWLCLVSSLLGHPSSLASPATELLWNGQGQALARDCLRPPVGTQGQCQVGAAQSHHLTPASLEPGHVPVGLWAWLRGTPEWARAGAGGQRQASFDDDRVRAALLHPQTLPRHWAAAASWQTAGTGASGTSGASDCCLQIWAYHSRSHSGHSLSAAGRLHRTRTFGSVAGSCKAAGDSSSSTQ	71295	59218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_-_59383_60744_60885_67347_67463_67568_67734_67817_67906_68147_68189_68532_68968_69320_69436_69519_69589_70240_70415_70760_71057_71200
638235	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	276	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638246	contig_10000_pilon	-	1551	6	Intergenic	novelGene_139295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_5	231.208131344899	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	59	619	192623	159846	FALSE	10	TGTGGCCTCTTATTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	192681	158913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_192582
638258	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638261	contig_3233_pilon	+	2503	3	Intergenic	novelGene_56582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	842	junction_1	1	168	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2056	2370	746379	747909	FALSE	15	CCCAATGGGATTGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	744323	748042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_746424_746936_747016_747718
638262	contig_18272_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_7025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTCCAGGGCTCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208068	206719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_206700_208100
638263	contig_18272_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_7024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	696	1028	205924	205592	NA	55	AAAAAAATTGACAAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIRLLATKEENTLERIVHPNVKVGNTVPSAPTRGSAAPRLDGHEVTTMALQHKSQREAASKNWEMGSGSPLSNACGEMAVSRSTLSVLGTKMAFSPAGASHGSQMLPE	206619	205322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_205300_206600
638270	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638277	contig_10331_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_54166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCCACTGCCCTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517287	515988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_516000_517300
638293	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638297	contig_14441_pilon	+	911	5	Intergenic	novelGene_100636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	296	724	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111297	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111315_113079_113209_116578_116963_117220_117344_117539
638298	SIRV2	-	604	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	51	3077	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
638314	SIRV6	-	256	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCATGACCATTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11766	11510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
638317	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638320	contig_848_pilon	+	2032	8	Intergenic	novelGene_83352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	68.5038357335126	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	144	1322	783225	792105	FALSE	45	ATTTGAATAAAGATAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSTANVEFCLDVFKELNSNNIGDNIFFSPLSLLYALSMILLGARRNSAEQMEKVLHFNHVVESLKPGFKDSSKCSQAGRIHSELGALLSQIKQPDSNYTLSIANRLYGTKLMAFHQQYLTCSEKLYQAQLKTVDFEHSPEETRKTINAWVESKTNGKVTNLFGKGTIDPSSVMVLVNVIYFKGQWQNKFQEGETSKTPFQLGEGKSVTVDMMYQTGIFKLAFIKKPRIQVLELPFVNNRLSMIILLPVGKAKLEQIEKELNLKTFQEWTSSSNMMEKEVEVYIPRFKLEIKYELNSLLKSLGMTDIFDQTKADLSRMSPAKNLYLSKVIHKSYVDVNEEGTEAAAATGNIVVVKNVPMRAQFMANRPFLFFIKHTRTNMILFFGKLASP	758571	792815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_758696_783205_783393_784636_784697_785878_786008_787957_788076_789566_789710_790763_790920_791700
638333	contig_9863_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_153990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	498	800	20272	20574	NA	45	GATCAGATTTATAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILFAFSFTSACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKGSQVVSSPGKEPGSAIFAG	19774	22380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_19800_22400
638334	contig_9863_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_153993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGATTAAATTAGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27256	27617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_27300_27600
638337	SIRV4	+	482	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	8	460	8	-460	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGAAGAGTACCTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463	2311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
638341	SIRV7	+	344	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTATGAAACTTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56047	114749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114680
638349	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	503	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638360	contig_7815_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_134362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1095	1394	167198	166899	NA	65	AAAAAAAAAGGCAGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLFLHSPVGYKSQFRVSAPGERFLCWLCRKVHVISLSLVWELLCAGTSDPKDALCSHLCFLGGMRFPCVSAHFSLFYFKRDCIKTLILSTSSQ	168292	166424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_166400_168300
638366	contig_7622_pilon	-	1971	15	Intergenic	novelGene_132420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	191.01175303085	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	207	1571	297961	269279	FALSE	30	CTGGCTATAGGAAATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD	306643	268878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_274472_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
638387	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638401	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638403	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638406	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_114047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	27	341	14409	13872	FALSE	20	TTATTACTGTCAGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14435	13869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638418	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_94860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638424	contig_5649_pilon	+	1988	10	Intergenic	novelGene_82387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	32.5371582450998	329	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	113	1048	1086027	1096594	TRUE	5	CTTGGTTTGATCCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGASCCRERREARSRRLRRNRELAGHPAFRSISTAGMADFGISAGQCVIVVWDRSSPVKALKDLVGKLQALTGSEGRVSVENINQLLQSAHEESSFDIILSGVIPGSTTLHSAEILAEMARILRPGGCLFLKEPVETAVVNNSKVKTASKLCSALTLSGLVEVKELQRESLSPEGIQSVQEHLGYQSDGLVSVQITGKKPNFEVGSSSQLKFSIAKKSPSVKPAVDPAAATLWTLSVNDMEDDSLDLIDSDELLEPEDLKKPDPASLRAASCGEGKKRKACKNCTCGLAEELEKEKSKEQKSSQPKSACGNCYLGDAFRCASCPYLGMPAFKPGEKVLLSNSNLHDA	1082072	1097587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1082159_1086000_1086184_1086660_1086814_1088284_1088362_1089885_1090052_1091407_1091482_1092355_1092472_1095901_1095984_1096483_1096863_1096915
638425	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCATCCCCCTCGCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
638428	contig_7202_pilon	-	441	2	Intergenic	novelGene_18581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTGAATGAATAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30091	28489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29794
638438	contig_1275_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_108871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	144	605	747507	747968	NA	20	TAGCATAATTGTGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747363	748108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747400_748100
638441	contig_3004_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_127504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTTAAAAATGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287428	287844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_287400_287800
638442	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91673	0	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
638453	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_97676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638462	contig_12622_pilon	-	1489	5	Intergenic	novelGene_5914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	495.738023052499	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587303	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528
638467	contig_7426_pilon	+	2597	12	Intergenic	novelGene_27520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	230.610042573035	135	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	256	1530	1011980	1016431	TRUE	10	GCTCTGCCATGCATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSPATCPWGPCSEHWPPATPSASSGTPQWVTPWTSRWWSLLAGIGHSRPSWQPAPWRPTSLPASQVLEGAPAADSTFGTQVLAVMRPPLGEPQLQEEPPVPVSILCRFPFSSTLQRMAVVVTWPRATQPEAYVKGSPELVSGLCRPETVPTNFAQTLQSYTAAGYRVIALASKPLPIAPNLEAAQQLTRDTMEQDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQALRRTHIRAVMVTGDNLQTAITVARGCSMVGPQEHLVIVHAIPPEQGQPASLEFLPVESSAAVNGTKDPGQAVSCTMELDPRSSHLALSGSTFTILVKHFPKLLPKVLVQGTIFARMTPEQKTKLVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSSFTSSAASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDMQFLTIDLVITSTVAVLMSRTGPALVLGRARPPGALLSVPVLCSLLLQVALVAGVQLGGYFLTMAQPW	1011294	1017578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1011426_1011855_1012013_1012100_1012261_1012365_1012487_1012605_1012731_1013438_1013600_1013721_1013839_1013929_1014010_1014671_1014825_1014907_1015005_1016203_1017077_1017156
638473	contig_14925_pilon	+	1243	5	Intergenic	novelGene_55128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCTGGACCCTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25789	100516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_100223
638474	SIRV6	+	342	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1244	383	6	-203	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGATAGTGAAGGGGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	10585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10200_10600
638481	contig_6710_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_97296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657515	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638484	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638486	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638491	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638495	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_91250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
638499	contig_2854_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_120864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTACCACCCTATAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937287	937885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_937300_937900
638506	contig_14925_pilon	-	989	5	Intergenic	novelGene_55179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	1560.06656508625	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	199	456	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKLIFGTGTRLTVFSYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	72479	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_72433
638515	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_95037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638516	contig_14322_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_115782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671881	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
638530	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638541	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638567	contig_7202_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_18497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638568	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_113379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	8	346	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14416	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638570	contig_11086_pilon	+	1674	9	Intergenic	novelGene_61197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	180.165722322533	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	108	641	45601	47763	TRUE	30	ACTGTAAAGTTTTCATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGQ	45493	52161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_45812_46372_46688_47755_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_49661_49738_50803_50951_51960
638575	contig_6710_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_89148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653683	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
638577	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
638578	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638589	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4579	37	3404	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
638597	contig_10861_pilon	-	1859	8	Intergenic	novelGene_39330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	290.241208624264	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	128	775	1492163	1490608	TRUE	10	AGTTTGGGCTTGGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLCLELSGKRPRHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQVRGEVGGGWWVGELCPHDFSFSLPSRVGPCPSTLPSPAPTLWLASWH	1493789	1489331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1492122_1492227_1493725
638619	contig_13283_pilon	-	2367	1	Intergenic	novelGene_154010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACCCTTGGTAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11186	8819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_8800_11200
638625	SIRV4	+	324	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	453	173	-453	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTCTTCAAATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
638629	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1095	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638632	contig_9653_pilon	+	2504	5	Intergenic	novelGene_48238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	54.7174560812178	97	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	117	383	819546	825126	TRUE	30	AATCTCCAAGGTGTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVALLSTPRKFSLLLPLPLHSIAPTLSRRPAPLPAPHKMSEDLAKQLASYKAQLQQVEAALSGNGENEDLLKLKKDLQEVIELTKDLLSTQPSETLASSDSFASTQPTHSWKVGDKCMAIWSEDGQ	818193	831520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_818310_819545_819666_824979_825879_829205_829360_830305
638634	contig_17274_pilon	+	1864	17	Intergenic	novelGene_26477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_15	486.050726358628	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	21	1607	26186	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEDKVTTWTLESFNLEFKTWLLQSSVGERDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	7066	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_36255_36337_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78575_78720_79944
638646	contig_18096_pilon	+	2053	12	Intergenic	novelGene_58047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	589.742638924208	6	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	10	1494	40382	77599	FALSE	65	GAAAAGGAGAAAACGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLTSLFEAWRKGGRRQTIDLLT	40372	78158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72087_77532
638647	contig_7593_pilon	-	3386	1	Intergenic	novelGene_127301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAATAGCCACATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193051	189665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_189700_193100
638652	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638654	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638655	contig_12125_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_76218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGGGGACATCTAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255639	254820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_254800_255600
638671	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
638681	contig_2069_pilon	-	1023	3	Intergenic	novelGene_23486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	77	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	70	381	1509802	1509135	TRUE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREVSASQGGLQGKGRGPCPGAPDQALGTRPQGRGRAGAGGGGRRGPELGLQDLEAGPQLHPGLLREPKLLVTALRTAQASPRHIPQPAR	1509871	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509212_1509567
638706	contig_4315_pilon	-	1741	8	Intergenic	novelGene_46809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.874490649986	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	261	923	337246	327997	TRUE	65	CAAATGAAGAAGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQAVLPPGTHWDHLQPKPLGVPCVIELCPPQRGRAQTQPPLEQKRLPQGEMCLPTSAPGRGTNRRGHPPRPPTGLWYLATAPPAPAPPAFAYVSSVPVMPYPAATVYYVSPGPTSAQAATEWPPKASSQPAAAHRHSIQLDLAGLEELNKALSRAVQAAKSVRSTTKQMSRSLSADLRQARGLRGSCLF	339022	327119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327538_327596_328250_333534_333729_333991_334109_335736_335775_337185_337333_337998_338115_338964
638717	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
638725	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638729	contig_17144_pilon	-	2105	7	Intergenic	novelGene_29168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_6	190.63898400438	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1620	2105	162026	157620	FALSE	20	ATTCTGTGACAGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQKEKLKIKQEWLMNKIVANPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	164748	157619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875_164261_164551
638732	contig_3602_pilon	+	1401	7	Intergenic	novelGene_60485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	115	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	148	597	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161597	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170055_170931
638739	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	902	-7	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
638742	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91685	0	-91679	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGGCTGAATGCAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
638747	SIRV4	+	181	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	652	1115	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
638752	SIRV5	-	283	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACTAACGTGTACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
638754	contig_14441_pilon	+	1215	7	Intergenic	novelGene_100410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	359.832213986216	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	609	1037	116728	117610	FALSE	10	GGCGCTGCCTACGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	72522	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_72553_72680_72761_72890_73191_113159_113209_116578_116963_117220_117344_117539
638755	contig_1867_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_54564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	750	1709	449145	448186	NA	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449894	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448000_449900
638760	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91671	4	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
638765	contig_6710_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_96036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCACTATGCACACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
638774	contig_19941_pilon	-	2649	16	Intergenic	novelGene_139762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_15	22.4608301024002	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	16	1809	86769	51496	FALSE	15	ATGTGACTGTGTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIASVVPVAVTAAVVPVQTASGDFSDLREIKKQLLLIAGLTRERGLLHSSKWSAELAFSLPPLPLAELQPPPPVTEEDARDMDAYTLAKSYFDVKEYDRAAHFLHGCNSKKAYFLYMYSRYLSGEKKKDDETVDSLGPLEKGQVKNEALRELRVELSKKHQARELDGFGLYLYGVVLRKLDLVKEAIDVFVEATHVLPLHWGAWLELCNLITDKEMLKFLSLPDTWMKEFFLAHIYTELQLIEEALQKYQNLIDVGFSKSSYIVSQIAVAYHNIRDIDKALSIFNELRKQDPYRIENMDTFSNLLYVRSMKSELSYLAHNLCEIDKYRVETCCVIGNYYSLRSQHEKAALYFQRALKLNPRYLGAWTLMGHEYMEMKNTSAAIQAYRHAIEVNKRDYRAWYGLGQTYEILKMPFYCLYYYRRAHQLRPNDSRMLVALGECYEKLNQLVEAKKCYWRAYAVGDVEKMALVKLAKLHEQLTESEQAAQCYIKYIQDIYSCGEIVEHLEESTAFRYLAQYYFKCKLWDEASACAQKCCAFNDTREEGKALLRQILQLRNQGETPTTEMPAPFFLPASLSTNTTPTRRVSPLNLSSVTP	86784	50655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_51667_51857_51978_52054_52134_52843_52906_53425_53502_53806_53927_54049_54204_61675_61758_61895_61994_62076_62255_63785_63919_64020_64127_65172_65216_70252_70391_86448_86522_86608
638776	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_93546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638780	contig_10711_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_118439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800945	801313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_800900_801300
638782	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
638787	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	47	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
638792	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
638805	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	878	-15	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
638806	SIRV6	+	378	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1176_1468_1535_1640_1736_1845
638808	contig_13123_pilon	+	1701	5	Intergenic	novelGene_136903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	31	519	434529	444679	FALSE	30	TCCTCTGTGAAAGTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434498	445861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
638815	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638820	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_95091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
638831	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_96866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638842	SIRV7	+	283	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAATGCGATAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70979_78840
638854	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
638859	contig_4105_pilon	+	2557	11	Intergenic	novelGene_21474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	106.407894443974	1	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	17	1342	58775	73266	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGLWMRRTRRPRFVLMNKMDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58758	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72766_73131
638869	contig_6215_pilon	-	2302	12	Intergenic	novelGene_21172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCAGCTCTCGGGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211278	161583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_161769_190229_190342_190495_190620_191271_191399_196034_196111_198908_198971_199890_199981_201233_201383_201778_202022_202665_202772_209829_209913_210333
638871	contig_4413_pilon	+	1195	9	Intergenic	novelGene_116987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.526272692839	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	329	916	129556	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	126635	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126787_128681_128728_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
638873	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
638884	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
638905	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	8	340	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14416	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
638912	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
638929	contig_10848_pilon	-	1780	7	Intergenic	novelGene_133534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	196.908326103517	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	307	735	843747	830918	TRUE	25	GGTGTTTGGAATAATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCKSVGYPHPEWVWQKKGDDGFSDISNASGRFFIINKENYTELNIVDLQITEDPGEYQCNATNAIGSTSVVTVLRVRSHLAPLWPFLGILAEIIILVVIIVVYEKRKRPDEVPDDDEPAGPMKTNSTNNHKDKNLRQRNTN	907385	829328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_830360_830903_830979_831835_831858_838740_839015_843675_843798_858411_858549_907266
638938	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
638951	contig_8631_pilon	-	3071	1	Intergenic	novelGene_121975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1278	1628	801909	801559	NA	5	CCCTGTAGCTCCTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQTPVFGYNWDLINLFLRKILRFGIKLNDCQDLVLGPGRGTVVRKRKRRKGLTLSLFFFPLLSLSITCHAFCHHRFLQSQVQGRVNPVFCYCVGKRRANQQLLRKGPWTHALVS	803186	800115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_800100_803200
638955	contig_15063_pilon	+	1223	4	Intergenic	novelGene_14358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_3	2542.75707757457	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	236	976	35271	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVK	35035	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35836_36158_36266_36569_39506
638959	contig_5539_pilon	+	2807	1	Intergenic	novelGene_104766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161077	163884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_161100_163900
638991	contig_1443_pilon	+	991	2	Intergenic	novelGene_28169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	26718	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	221	685	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343528	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
638998	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639004	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639008	contig_1719_pilon	+	1845	2	Intergenic	novelGene_87308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTTGTTCTCCGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423814	427575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_424141_426056
639012	contig_6027_pilon	-	2891	17	Intergenic	novelGene_74441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.8676659515605	18	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	688	1578	283869	265877	TRUE	15	ATCACTCTGTCTGTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNA	290887	262066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262625_263209_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265882_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_290862
639014	SIRV6	+	150	2	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	489	120	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTTCACAAAGAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11030
639016	contig_11832_pilon	-	1349	11	Intergenic	novelGene_106930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1041.12433935626	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	326	760	86997	84681	TRUE	10	ATGAGTGTGTGTGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGRS	88707	83798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88490_88536_88646
639027	contig_14322_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_116293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTACGGAGCAATGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
639048	contig_8435_pilon	+	2373	6	Intergenic	novelGene_72008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1312	2310	95024	97944	FALSE	15	GACCATGCTGTGAGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	90972	98007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_94799_94947_95334_96398_96685_97030_97164_97674
639054	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_96355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639077	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_18988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
639089	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639095	contig_14322_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_115726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671572	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
639097	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_93711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639098	contig_3602_pilon	-	1557	12	Intergenic	novelGene_60670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.510225395575	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	136	1023	1139393	1106687	TRUE	30	ACAACACTTTTGCATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139528	1106043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106445_1106553_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
639108	SIRV4	+	255	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1516	632	1061	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2516	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
639110	contig_18869_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_55998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73601	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
639114	SIRV7	-	402	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33167	0	-52	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114790	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
639129	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639132	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
639144	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_97905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639150	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
639153	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4559	53	3384	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
639158	scaffold_19766_pilon	-	1349	9	Intergenic	novelGene_34324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	430.343975791459	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	223	1125	622597	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFRLQGSSLSSTLLLVFSSFPGGYRGDNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623664	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622205_622285_622591_622736_623580
639175	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
639178	contig_18822_pilon	+	2240	16	Intergenic	novelGene_111721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_14	81.3535494001337	295	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	108	2090	140694	246273	FALSE	20	TGAGGTTACCGTCTCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLVHTLSLLLMPLLLGSARGLHNASQRMFKIDYSQNCFLKDGQPFRYISGSIHYHRVPSFYWKDRLLKMKMAGLNAIQMYIPWNFHEPLPGQYQFSDDHDVEHFIQLAHEMGLLVILRPGPYICAEWDMGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKFEKVPDGPIPPSTPKFAYGKVALKKLKTVGEALNILSPSGPTKSIYPLTFVQVKQYFGFVLYRTTLPKNCSDPTPLSAPINGVRDRAYVSVNGVPQGILERNQVFTVNITGEAGATLDVLVENMGRVNYGRYNNDFKGLISNLTLGCSILTDWLIFPLNAENAVRGHLGGWGGHGNSCHVEPEPHSSSNFTLPAFYVGNFSIPAGIPDLPQDTFIQFPGWTKGQVWINGFNLGRYWPARGPQMTLFVPQHILVTSAPNTVTVLELERAPCSSVDPALCTVEFVDKPVISTAVTYSHLPTWPDHV	140586	246423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_165852_166023_168082_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191259_209335_209411_212481_212572_221549_221664_223825_223958_229459_229715_246024
639181	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639190	contig_8330_pilon	-	1811	6	Intergenic	novelGene_71840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	247.688837051652	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	35	568	901522	896249	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	901556	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895502_895645_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500
639202	contig_17440_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_7611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCGCTACCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
639207	contig_17470_pilon	-	1921	14	Intergenic	novelGene_110515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	66.0813556317527	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	182	1435	276627	270076	FALSE	5	ACTCTTGTTGGCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPQAEPEERVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302568	269589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_276595_276728_277162_277222_302546
639209	SIRV7	-	283	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	14847	6	-14841	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCGATAAATAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	70878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680
639212	contig_15063_pilon	+	699	3	Intergenic	novelGene_9496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3096	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	240	698	34808	35378	FALSE	25	GTAAGTGCACAGGTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRL	27129	35379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037
639218	contig_17274_pilon	+	1784	5	Intergenic	novelGene_26536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	373.77566801492	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	241	711	163818	166963	FALSE	70	AAAAAAAAAGATATAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNSIWIKAIFLSIKRARIQET	131669	168036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_158967_159130_163816_163980_165066_165236_166823
639222	contig_3018_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_78931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAATAAGGGATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643849	646166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_643800_646200
639223	contig_2444_pilon	-	3097	1	Intergenic	novelGene_83745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	593	1782	83	1864	52642	50861	NA	15	TTCAGACCTGTTCTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRISAFRLLGCIRYSRISLPQESGPRHYGSCPLGAHDEVRDGRAYFTTPIFYVNAAPHIGHLYSALLADALCRHRRLRVPVAAATRFSTGTDEHGLKIQQAAATAGLAPAELCDRVSAQFQQLFREAGIASTDFIRTTEARHRLAVQHFWEVLKARGLLYKGLYEGWYCASDECFLPEAKITWQQGPSGDACPVSLESGHPVSWTKEENYIFRLSHFREPLRQWLRDDPQAVIPQPFYHAVLQWLEEELPDLSVSRKSSHLHWGIPVPGDDSQTIYVWLDALVNYLTVIGYPDAEFKSWWPVTSHIIGKDILKFHAIYWPALLLGAGMSLPHRIYVHSHWTVCGQKMSKSLGNVVDPRTCLERYTVDGFRYFLLRQGVPNWDCDYYDEKVVKLLDSELADALGGLLNRCTAKRINPSGTYPAFCTACFPSKSGLVGPLVRAQAEDYALVSAVTALPQQVADHYDNFQIYKALEAVSSCVRQTNGFVQRHAPWTLNWESPVDAPWLGTVLHVALECLRVFGTLLQPVTPTLADKLLSRLGVSATERSLGELCFLPRFYGHPCPFEGRRLGPESGLLFPRLDQSRAWLVKAHRT	52724	49627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_49600_52700
639226	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
639239	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639240	contig_10777_pilon	+	1075	13	Intergenic	novelGene_101158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.119397733741	1	49	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	263	568	8328	26645	TRUE	30	CACCAGTGCTGTTAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLALEICQQRNFVEETVYLLSEC	5057	53481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_5065_6469_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10956_15087_15220_24486_24546_26638_26726_28511_28649_50355_50456_50560_50606_52656_52725_53404
639242	contig_14322_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_116353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671905	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
639244	contig_11259_pilon	-	1789	7	Intergenic	novelGene_144531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_6	134.363623549431	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	100	717	159043	131887	FALSE	30	TACAAACGCACTTGGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLCVGDCVRSTAGPRRRRADVAARNWGWRSAAMLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLAVVIMGVVLQGANLYGYIRCKVGSRKNLTSMATSYLGKQFLRQNAGDDQTS	159142	130814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_159031
639255	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
639275	contig_20550_pilon	+	2288	20	Intergenic	novelGene_142608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	292.192684879264	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	68	1291	3777	21243	TRUE	15	AATAGTGTTTTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQVRLDRAAGSRQLMIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGR	3709	38254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3930_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20614_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37627_37774_37993
639283	SIRV5	-	437	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGATGTCCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10985	8201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
639286	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639291	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639306	contig_7171_pilon	+	960	8	Intergenic	novelGene_101318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	149.529739039239	70	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	528	923	1079930	1088749	FALSE	0	GCTCCGCTGTGTCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDSVSSIMASSQ	1077064	1088786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078779_1079789_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088717
639310	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_94277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639314	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_94843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639315	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4257	38	3082	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
639328	contig_6001_pilon	-	2041	4	Intergenic	novelGene_128056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	12.2292908852294	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	370	1311	756765	755824	FALSE	75	AAGAAAAAAGAAAAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALFSPSPRWRRSAALRRDPGEPSEDCFDDDHSFEDIGLAAGRSQREKKRSYKDFLREEEEIAAQVRNSSKKKLKGSELYFLGTDTHKKKRKHSSDDYYFGDISSLESSQKKKKKSSPQSADTAMDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKVKKKKFFNIVSGLGVKQPR	763669	755093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_756834_757621_757701_757972_758122_763596
639329	contig_20493_pilon	+	2491	12	Intergenic	novelGene_86391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1314	1814	38363	46109	TRUE	35	AGACGAAGAGTGCTAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRPSGNTMSWVQQREMLMTEGCSRRLSLMHMVKKGSWTRSSHSISSGLRSFRSSCTSCRQRSWYSGCLARLYRTQEMPLAVESWPPNMKVLASARISSSDNSFPSSSLLSRSTSMKSKVLALVLALRKSSTPCSERVQRRCWMAASVKSCTRRQALRKRRPSGVR	36411	54666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_+_37568_37953_38043_38203_38266_38356_38488_43049_43180_43376_43444_45930_46202_46995_47114_47973_48053_48980_49110_49201_49255_54460
639330	contig_11378_pilon	-	2603	14	Intergenic	novelGene_112316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_12	143.852282880533	497	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	147	2000	1169877	1152565	FALSE	5	TCTCTGGTGTGAGCGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPVLPLAHPEPAVCRRWGPETSGGLFTTICTGSTRRRGTLRAAAVVMPDPAAHLPFFYGSISRSEAEDHLKLAGMADGLFLLRQCLRSLGGYVLSLVHDVRIHHFPVERQLNGTYAIAGGKAHCGPAELCEFYSRDPDGLPCNLRKPCNRPPGLEPQPGVFDSLRDAMVRDYVRQTWKLEGEALEQAIVSQAPQVEKLIATTAHERMPWYHSDLTREEAERKLYSGAQTDGKFLLRPRKEQGTYALSLIYGKTVYHYLISQDKAGKYCIPEGTKFDTLWQLVEYLKLKADGLIYCLKEACPNSSACATSGAAAPTLPAHPSTLTHRRTDTLNSDGYTPEPARPVSPEKTRPLPMDTSVYESPYSDPEELKDKKLFLKRENLIMADLELGSGNFGSVRQGVYRMRKKQIDVAIKVLKQSTEKADKDEMMREAQIMHQLDNPYIVRLIGVCQAEALMLVMELAGSGPLHKFLVGKREEVPVSNVAELLHQVTMGMKYLEEKNFVHRDLAARNVLLVNRHYAKISDFGLSKALGADDSYYTARSAGKWPLKWYAPECINFRKFSSRSDVWSFGVTMWEAFSYGQKPYKKMKGPEVITFIEQGKRMECPAECPPEMYTLMRECWTYKWEDRPDFVTVEQRMRAYYYSLASKTEGPEGCGQGAEAVRA	1179416	1151961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1152689_1153987_1154101_1154188_1154330_1154420_1154614_1158189_1158397_1158961_1159155_1160481_1160528_1160748_1160796_1160872_1160961_1161058_1161198_1168494_1168656_1169475_1169922_1179105_1179172_1179380
639336	contig_14441_pilon	+	1212	4	Intergenic	novelGene_100694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	456.48390503451	156	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	597	1025	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	114284	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114732_116578_116963_117220_117344_117539
639339	contig_5643_pilon	+	1403	5	Intergenic	novelGene_38975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	878	junction_1	306.118441130227	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	465	968	551324	552476	FALSE	20	ACAAAGCCTTGTGGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVIRVDIRDTLCQDRCLTKPVLLQLIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549633	552911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551535_551805_551892_552142_552231_552357
639348	contig_18869_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_56187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73699	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
639352	contig_34_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_39966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51504	50854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_50900_51500
639354	contig_3774_pilon	-	1461	11	Intergenic	novelGene_142038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	32	junction_9	133.5866759823	2320	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	564	1268	198922	144743	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210613	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200837_200987_210294
639355	contig_953_pilon	-	2258	8	Intergenic	novelGene_129995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	15.3755703395128	394	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	126	965	252230	250565	FALSE	10	CGGAGCCTTTTGCATCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVGLADEEVAGKLVLGTFLWHRSLRALHDSPSGSPTESLARMEAVVNLYQEMMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVFFVLSLGPRIMANRKPFQLRGFMIVYNFSLVALSLCIVYEFLMSGWLTTYTWRCDPVDYSNNPEALRMVRVAWLFLFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKFAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYLYYGLSALGPVAQPYLWWKKHMTAIQLVQFVLVSLHISQYYFMPSCNYQFPIIIHLIWMYGTIFFVLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGALGTTKVKAN	254974	249271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_250787_250967_251105_251186_251293_251384_251442_251573_251655_251821_252013_252184_252245_254863
639363	contig_15952_pilon	+	1860	8	Intergenic	novelGene_154073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	217.770333992826	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	26	895	314905	348620	FALSE	50	TAAAGAATAAAATTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKFLQGFMAPKQKRRKLQSEDSAKTEEVDEEKKMAEEAKVASALEKWKTAIREAQTFSRMHVLLGMLDACIKWDMSAENARCKVCRKKGEDDKLILCDECNKAFHLFCLRPALYEVPDGEWQCPACQPATARRNSRGRNYTEESASEDSEDDESDSEEEEEDEEEEDYEVAGLRLRPRKTVRGKQGVIPAVARPGRRPGKKPHPTRRARPKAPPVDDTEVDELVLQTKRSSRRQSLELQKCEEILHKIVKYRFSWPFRKRNKFPDRLPEDEGDSEPTHIPDKLWGEQKKSRKNLNV	314879	349585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_315001_327535_327684_328687_328836_330661_330772_344969_345116_346376_346481_347644_347697_348554
639372	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACAGTCAGGACTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
639382	contig_10103_pilon	+	1873	16	Intergenic	novelGene_86157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGAAGGCGGAAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638347	657010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_638628_642594_642738_644399_644500_644796_644900_645102_645220_645668_645751_649862_649967_651344_651475_651637_651738_653442_653647_654456_654569_654693_654772_655131_655243_655979_656052_656151_656223_656944
639397	contig_15570_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_137836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGTGGACTATTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471341	472529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_471300_472500
639407	contig_7202_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_18641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
639410	contig_10235_pilon	+	1167	5	Intergenic	novelGene_46465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1624	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGAGGGGCCGGGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217918	222883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_218323_219303_219485_220089_220483_220677_220787_222803
639414	contig_19579_pilon	-	1262	4	Intergenic	novelGene_59394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_1	92.7948753374285	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGATTCTTCATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9402	7751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569
639416	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	275	1	44	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2560	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
639417	contig_14441_pilon	+	799	2	Intergenic	novelGene_100698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAACCCAGAAGGCCACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114876	116643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_115611_116578
639421	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
639422	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_97001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639438	contig_11735_pilon	+	1484	2	Intergenic	novelGene_137329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	127	501	9695	11504	FALSE	70	ATGAAAAAGAAGAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRRKKIHLSKPVFLTLKHTQPVGARTKRLCASWKRWKEGGSWSTEGCSSTGSSDSHTTCRCFHLPSFAVLMALTPKVPEFIVRSLNLTVSSELRSHPHILEKDSKIRTPVQVAFLEGDSRKHQ	9568	12487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11735_pilon_+_9758_11192
639442	contig_9807_pilon	+	1840	14	Intergenic	novelGene_32855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	679.031846470186	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	772	1698	140826	158865	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQVCVLGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQGYTTSAAWPGWTSTRWSQPPTTPPSKSGQSPTEAHPLGPTGSGTRTSLQQNVFFLSMFL	109020	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128611_139449_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149056_154120_154252_156624_156770_158686
639458	contig_7202_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_18662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCATGGTGAGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
639465	contig_7285_pilon	-	1530	7	Intergenic	novelGene_143416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_6	48.6326936215638	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	364	777	370123	356156	FALSE	45	AAAGTAAAGATTGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	379972	355402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
639472	contig_5515_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_52353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCTCCTGTCCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160803	158844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_158800_160800
639482	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_96075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639485	contig_10813_pilon	+	1984	11	Intergenic	novelGene_87016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_3	48.9919381123058	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	76	1413	55923	85000	FALSE	30	TCTCAGTATTGAAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKMLSRNPDNYVRETKLDIQRVPRNYDPTLHPFEVPREYVRALNATKLERVFAKPFLASLDGHRDGVNCLAKHPKSLATVLSGACDGEVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55847	85571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_62537_62738_63303_63412_66126_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
639486	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639489	contig_5201_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_82180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	269	676	293496	293089	NA	90	AAAAATAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDASELRCWQGILNIPRAARRTNKSVLKEVQPERSLEARKGRLQLTYFEHIIRRDQALEKHIILGKADGQRKRGRSSTRWTDTVAATMGSNIATTVRMAQDWAVFRSVVHRFTMRQNLTTFMRHAVGSHSLRP	293764	291912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_291900_293800
639491	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
639496	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	63	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
639509	contig_5967_pilon	-	2106	9	Intergenic	novelGene_44382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.256742956267	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	9	1115	488569	388566	FALSE	30	CATGTTTTCCACGTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	488577	387574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388910_389224_389306_403376_403453_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455
639512	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	20	CTGGTACCACAGTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
639516	contig_17281_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_105196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTCAAGGAAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2072	2882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2100_2900
639521	contig_11285_pilon	-	2637	23	Intergenic	novelGene_5740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	120.696087155075	4	28	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	553	1347	1213192	1200229	TRUE	10	CATTCTGACCTCTGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGGGHE	1230743	1192583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195578_1197853_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215206_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
639524	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91666	4	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
639533	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
639540	contig_15888_pilon	-	1411	8	Intergenic	novelGene_84433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1605.63764433261	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	60	617	259726	252829	TRUE	5	ATTTCGGCTCCTGTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHHKPGHEHGPRHVRVQWHQRPGHQPRRRDPARAQPSGRPLALPGHRGRGPRASHHHLHLREAVEARGGPGR	259785	251597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253612_254027_254066_254198_254282_254527_254685_259659
639541	SIRV6	+	285	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	239	11	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCGCCCAGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
639544	contig_4301_pilon	-	1909	5	Intergenic	novelGene_65113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	376.93931872385	5	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTGTGACTGTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575650	538011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542346_547441_547521_551248_551329_575543
639554	SIRV7	+	287	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147670	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
639555	contig_10000_pilon	+	2836	1	Intergenic	novelGene_139316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177573	180409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_177600_180400
639573	contig_9186_pilon	-	1281	11	Intergenic	novelGene_85344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	69.1002894349944	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	151	1164	302315	274201	FALSE	25	AATTTCTGCAGCAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRPFLPYPLPHFAYKLIARLFEISPFEPWTTRDKMERVHLTDMKLPHLPGLEDLGIQATPLEAKAIEVLRHHRAYRWLSSEMEDVKLTKTVNI	308856	274083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_308777
639575	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639579	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_18086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
639596	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1268	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639597	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_95580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
639599	contig_15434_pilon	+	1265	9	Intergenic	novelGene_56694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	443.286853374877	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	543	1085	31167	33302	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26607	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_29080_30409_30480_30537_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
639605	contig_6795_pilon	-	2572	13	Intergenic	novelGene_27771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42.2578066423498	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	58	1233	504815	486379	TRUE	40	ACTGAGGAAAAAGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAEITGAATAAGPILTAAMGILEKISEIEKEIARTQKNKATEYHLGLLKAKLAKYRAQLLEPSKSASSKGEGFDVMKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVVSEGAPSGPLGTLSACACPSGASTGGRALPPTLSGALSAVALWLRLGLILVGPGMEPTMVAKWPRASFGAGQA	504872	482774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_485875_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504751
639608	contig_14925_pilon	-	1013	5	Intergenic	novelGene_55090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	1556.62927105332	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	218	475	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSGDYSKLIFGAGTRLAVHPYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	34478	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_34413
639611	SIRV2	-	326	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3175	565	1996	-565	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGAAGTTAGACGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2736	1600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
639615	SIRV4	+	211	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1560	632	1105	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2560	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
639636	contig_12270_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_113108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	ACAGTGCTTCAGCCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
639638	contig_253_pilon	-	1580	10	Intergenic	novelGene_129663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	111.34841326127	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	516	1502	393089	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREAPPPHAPLASAAGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395606	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390242_390353_390436_390689_390857_391020_391234_391669_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
639648	contig_20314_pilon	+	852	7	Intergenic	novelGene_125621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	30	GCTCATTTCAGAAATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
639649	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
639655	contig_6102_pilon	-	1470	13	Intergenic	novelGene_31779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	170	538	357461	356561	TRUE	5	CCCCTGAGCCCCCGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTNCTSEPRVWWEGDEAGAASWGDGTHLSPQLHSLLMFLHWWRSLRSWRPIFFLFLSFPACRTLEEGLQLCILDLHLRLVEVRLKGATGYPHGAIGHEQNCKFKLGNKLTLLLIENIKWL	357630	349990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_350106_352255_352383_352649_352758_352864_352933_353141_353235_354960_355025_355269_355351_355504_355582_355669_355804_356495_356602_356753_356873_357036_357088_357303
639667	contig_3774_pilon	-	1274	9	Intergenic	novelGene_142039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	119	junction_6	131.002325838132	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	635	1081	175510	144743	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210622	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_198895_199018_200894_200987_210294
639672	contig_18869_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_56043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73555	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
639674	contig_6136_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_154105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	260.415514130783	586	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	230	982	460760	494274	FALSE	30	GAACAATATGGGTATCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	460080	494610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460290_460739_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
639683	contig_5229_pilon	-	2054	6	Intergenic	novelGene_117717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	19.5550504985285	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1448	2050	655675	653853	FALSE	20	TGGCTTGAAGGCTCAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGCFLIPSRQTPRTSHWFRATLGSHRSTPYSAYNPETYAGYWKQLTVRTSRRGQAMAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQVSPPHRAHPCADTCPW	657604	653848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_654027_655073_655186_655263_655380_655474_656307_656546_657083_657324
639690	contig_12622_pilon	-	3852	1	Intergenic	novelGene_5890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530512	1526660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1526700_1530500
639691	contig_10299_pilon	+	2090	19	Intergenic	novelGene_79695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.202201742232	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	591	1928	336845	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320501	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_335195_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336258_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
639696	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639707	SIRV7	-	348	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33219	2	0	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
639735	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639737	contig_5445_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_135422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCTACTTGAATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51700	53916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_52579_52622
639743	contig_10523_pilon	-	1999	8	Intergenic	novelGene_120916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	186	1169	39240	15001	TRUE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39425	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13137_14580_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
639749	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639755	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTCATTTGTACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
639756	SIRV4	+	206	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	18	-1092	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTTTCGGTTCGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
639781	contig_11978_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_63080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGACCCCAATGAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1827938	1829143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827900_1829100
639784	contig_7286_pilon	-	1066	6	Intergenic	novelGene_108676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4830.27202546606	5	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	339	998	291231	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSGFLGWFVWKFGELARKPVQSGVHGVMEDHYGKLSYCLKTDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292095	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290909_291153_291497_292022
639788	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639789	contig_16724_pilon	+	1786	8	Intergenic	novelGene_105300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCGGGAGAAACTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541140	575944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_542008_543918_543998_547912_547980_553367_553527_560939_561029_567595_567764_568917_569130_575799
639790	contig_4315_pilon	+	1791	8	Intergenic	novelGene_46713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.699027762882	127	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTTTGTGTAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43159	76641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_43221_49226_49368_62427_62511_62740_63167_63254_63361_67262_67480_74926_75101_76058
639793	contig_7630_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_133644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	888	1310	432650	432228	NA	45	ATGTACCTAGAAAAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSQETVAVGCRGGPVGVKKGGGWESIYHQLPVVLSPAGSSAKLLSCTPCSLVSDRSPRWQICAALSDRGPLHVCLLALCSLSVSPFGAWLSSLSIHLMFRVSGLLFSLFSFVGSLLWRDGMVFLPRVPRCQKSLINKY	433537	432052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_432100_433500
639803	contig_13854_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_154113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11534	13589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_11500_13600
639810	SIRV7	-	260	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91664	2	-91658	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAAAACCGATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
639820	contig_9345_pilon	-	1557	10	Intergenic	novelGene_24491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	139.449800693942	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	432	1514	670230	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	670661	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161
639827	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639831	contig_3095_pilon	-	1202	5	Intergenic	novelGene_75100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAGACAGGAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152223	147189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995_151162_151847
639835	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
639846	contig_3386_pilon	-	1108	3	Intergenic	novelGene_34530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTGTTGTTTAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412193	404163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404967_409398_409607_412096
639872	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639877	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
639887	contig_20527_pilon	-	2009	5	Intergenic	novelGene_138588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGTTACTTCTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28830	13487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25004_25449_25613_26237_26346_27308
639895	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_93636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639912	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_96876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
639926	contig_10141_pilon	-	2805	8	Intergenic	novelGene_84627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_4	115.791508623853	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	42	2561	418631	395520	FALSE	30	AACAGTGGTCACAACTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFKKIYKTLKKDEDIPVFPVQTKYMDTVKERICLARQIEKAEYRNFQACLHNSWIEQAAAALEIELEEGMYKGGKADEQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPLFKDDLKTKYPTQSGKPIVVSAPGNGKSALSCISKQKKKKKKKLKEQQQPQPSTSAD	418672	395275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397364_399918_400108_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835_409370_417973
639929	contig_15063_pilon	+	1285	4	Intergenic	novelGene_14311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	322	1143	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34837	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
639933	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
639964	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
639967	contig_5958_pilon	-	3147	8	Intergenic	novelGene_140078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	15.9078981795143	117	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	271	2373	116728	102387	FALSE	25	GCCAGTAAGTTTGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLPKSSKEFGSVDYWEKFFQLRGKKAFEWYGTYLELCGVLHKYIKPREKVLVIGCGNSELSERLYDVGYQNIVNIDISEVVIKQMKEHNASRRPQMSFLKMDIMQMQFPDASFQVVLDKGTLDAVLTDEEEKTLQQVDRMLAEVGRVLQVGGRYLCISLAQAHILKKAVGHFSREGWMVRVHQVTNSQDQVLEAEHQFSLPVFAFIMTKFRPVPGSALQIFELCVQEQGKPTRLESAERLAEAVLERQQYAWLCSQLRRKSWLGSVSLDLCNGDTGEPRYTLHVVDSSAVKPSRDNHFAIFIIPQGRETEWLFGMEEGRKQLAASAGFRRLVTVALHRGQQYEGMDSIQAELSARVMELAPVGMPAQQQVPFLSVGGDIGIRTVQHRDCSPLSGDYVIEDVQGDDKHFFRRLIFLNNRNVVQSEARLLKDVSYRAQKKHKKDRKKQWPAETPDAVPAAPSQSIDKSYLCCEHHKAMIAGLALLRNSKLLLETPLALLVVGLGGGSLPLFVHDHFPKSCIDAVEIDPSMLEVATQWFGFSQSERMQVHIADGLDYVTSLAQGGEARLHYDVIMFDVDSKDPTLGMSCPPPAFVDQAFLQNVKSILTSEGVFILNLVCRDLELKDSVLAGLKLVFPLLYVRQIEGEVNEILFCQLHPEPKLATPELLETAQALEQTLRRLGRGWDDTYVLSDMLKTVKIV	116998	101612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_102662_103971_104104_106592_106812_108319_108488_110724_110921_112593_112794_114152_114913_116575
639968	contig_6102_pilon	+	2288	11	Intergenic	novelGene_32268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	72.222503418256	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1431	1949	1448039	1449029	FALSE	30	ATGCTAACCCACCCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLQFHPQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444305	1449368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447302_1447414_1447484_1447907_1448053_1448225_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
639969	contig_15152_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_126958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACAGAAATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88473	87419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_87400_88500
639978	contig_15982_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_145972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41790	43237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_41800_43200
639981	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
639987	contig_16632_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_154130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCTAAATTTTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84404	83260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_83300_84400
639989	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	15	371	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14423	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
640017	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640024	contig_10436_pilon	-	842	4	Intergenic	novelGene_108491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	56	409	103480	102032	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103535	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
640025	contig_16882_pilon	-	2010	5	Intergenic	novelGene_148207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3649	junction_4	726.969523088829	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTCTGTCTTAGGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189468	181935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_188756_189058
640029	SIRV4	+	339	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	170	441	170	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
640033	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640037	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640042	contig_6477_pilon	+	2060	5	Intergenic	novelGene_154153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	9.72111104761179	268	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	378	1880	748456	767211	FALSE	15	CATGTGGGAGGTGTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGVLSSPDPALPQEESTGEEGMAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDWKTVSKESPPEQDISEESFQDPSVEIPPGESDHRNSEFGKSFNLRLVLSPQPRVPTEVRPRKCEIHPKSFKKNSDIIKPHRAKPYTCNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYKCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCNECGKAFSYCAAFFQHQRIHTGEKPYKCKTCGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGMKPYKCIECGKAFRCSSAFIRHQRLHIGE	748078	767391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_754498_754588_757413_757541_758317_758414_766036
640054	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
640085	contig_7202_pilon	-	170	1	Intergenic	novelGene_19029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30085	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
640089	contig_7992_pilon	-	2725	10	Intergenic	novelGene_115545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTAAGACCTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647389	609995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_610132_611206_611309_614478_614560_615803_615885_617126_617255_622057_622112_637905_637957_638729_638777_645233_645875_645985
640092	contig_1443_pilon	-	1541	9	Intergenic	novelGene_28275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	518.721008226002	79	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	218	841	776427	748649	FALSE	25	TAACTGTTCACTTCGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809516	747948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767469_776399_776478_808690_808741_809399
640093	contig_11264_pilon	+	1868	11	Intergenic	novelGene_154203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	6.94910066123668	153	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	24	1361	16313	80648	FALSE	20	CTAACTCAGTCATTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDAGWKMSPSLFLHGMEEGNNLYKDIWKNKDESWNFPQDYDPELIKEEKRKELESEIRVQVDELMRQELKNLKLAVDREKELPVKGGKKRGGKKRKKGKKGKKGKRGKKVKDLTANRSIESLYKELVEEGLLIQALKVNLSDYIGEYSYLGTTLRQVSIEPMPSLLDVRQLITLYGILPLGSPTVHEKAPLVKSLLLAGPSGVGKKMLVHAICTETGANLFNLSASNIAGKYPGRSGLQMMLHVVFKVARQLQPSVVWIGETEKTFYKKVPSNEKKMEPKRLKKQLPRILKLLKPDDRVLIVGTTQRPFDAELQSFCKVYQKIILVPRPDYASRYVLWKQIIQRNGGVVTNALNISCLAKVTDGFTQGHIVQVVRGVLTDRRIRQQIHKPLRAVEFISAIASMDPVYQEEEDSFKDWYAKTPLGRKRALALTGGEAEKEKDKGKKKEKKKK	16289	81155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_16368_23716_23824_24006_24109_27323_27392_32007_32091_38872_38981_39354_39555_60715_60803_69855_70034_77437_77677_80537
640103	contig_8576_pilon	+	1474	5	Intergenic	novelGene_88780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	271.945766652103	598	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	32	1021	893619	913464	FALSE	40	AAGAAAAAGGAGTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIK	893587	913917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245
640104	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640130	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_96359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640133	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640134	contig_3627_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_78530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAATGTTACTCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634671	634958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_634700_635000
640137	SIRV4	+	188	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1583	632	1128	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
640145	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_93704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
640147	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_17731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640154	contig_9471_pilon	+	1424	7	Intergenic	novelGene_21817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	529.347292007389	5	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	289	900	412726	414943	TRUE	40	ATCAAATTTATATGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILGL	412437	417514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414961_416882_417028_417152
640155	contig_6735_pilon	-	1860	13	Intergenic	novelGene_15672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	890.999014059811	2	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	3	854	564868	543845	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTSSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSQRWCFILHRLGLQQRVVHLQSLSL	564870	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543273_543788_543919_544928_545064_545892_545945_546577_546634_547273_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
640159	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_97067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640167	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_93124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657825	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRWHQAGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657803
640171	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	793	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
640177	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640178	contig_8447_pilon	+	1975	2	Intergenic	novelGene_69429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGTTTTTAGCAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82286	84322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82777_82837
640184	contig_7426_pilon	-	1478	5	Intergenic	novelGene_27529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	91.9524333555127	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	32	331	1091096	1087105	TRUE	40	TATGTCAAAGATGCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1093400	1085917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1086972_1087011_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372
640188	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640190	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640194	contig_10235_pilon	-	2451	10	Intergenic	novelGene_46609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	247.971971733565	62	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	77	1168	607523	604892	TRUE	20	GTTTAGTTGAGAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGSIFSAAGGRGLLWGAQPVPQQIMTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGGSHRHPAWLFCTLSAFVLISCLGRIIVEGAFWGERDQAETRWECRDRGHSGVVPSAFLPAGGQRWLGNSLLFPSAGVLFCG	607934	602669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_603180_603864_604332_604460_604548_604672_605294_605419_605556_605714_605906_606003_606252_606487_606562_607482_607530_607864
640208	contig_8491_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_154219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCATAGCGACTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266420	268034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_266400_268000
640209	contig_8491_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_154220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268281	269405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_268300_269400
640213	contig_17440_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_7645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCACAGCCATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3508	3758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_3800
640221	contig_1735_pilon	+	1717	9	Intergenic	novelGene_106880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	561.381874818737	1022	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	116	1546	126256	137764	TRUE	5	CTGTCCGGCTCGCTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	126140	139779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
640226	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_90391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640238	contig_18869_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_56149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
640239	contig_6439_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_154246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCCTACTGAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381728	384255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_381700_384300
640240	contig_6439_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_154247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACAAGAGATGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385058	385665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_385100_385700
640245	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640249	contig_3571_pilon	-	2216	10	Intergenic	novelGene_88705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.7206480479783	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	696	1439	41961	30481	FALSE	70	AAAAAGAAGGAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAANFYAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGL	100120	29703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30495_33448_33490_36653_36892_38625_38763_40254_40416_41808_42008_42749_42976_45517_45659_49302_49434_99969
640250	contig_10163_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_82652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGCATCTGTCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184058	183670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_183700_184100
640258	contig_1275_pilon	-	784	2	Intergenic	novelGene_108829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	397	783	747710	746551	FALSE	25	CTGATATGGGAAGGCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGSPL	748106	746549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_746561_747333
640261	contig_5758_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_119101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTCTTTCATAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231532	233814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_231500_233800
640266	contig_1957_pilon	-	3228	4	Intergenic	novelGene_154257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	37.4640568486056	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	30	1829	203388	194939	FALSE	25	ACTTGGAATTTTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWLREKSAMAAARVSPDICLREATQRKLRMFSELRGKPVAAGEFWDIVAITAADKQQELAYKQQLSEKLKRKELPLGVQYHVFVDPVGAKIGNGGSTLCTLQCLEKLYGDKWSSFTILLIHSGGYSQRLPNASALGKIFTALPLGNPIYQMLELKLAMYIDFPSHMNPGILVTCADDIELYSLGESEFIRFDKPGFTALAHPSSLTVGTTHGVFVLEHFDHSEHRDLEYRCCYRFLHKPSIEMMHQCDAVFRAGNFSQQDFAGDNTPSLKLNTEYVYTDSLFYMDHKSAKKLLAFYEKIGTLNCEIDAYGDFLQALGPGATMEYTRNTSNVTKEESELIDMRQRIFHLLKGTSLNVVVLNNSRFYHIGTTEEYLFHLTSESSLKSELGLQFMASSIFPAIPECFGRTFCVIQSILDSGCSVAPGSVVEYSRLGPDVSVGENCIISGSCIITKAVLPAYSFVCSLSLKMNGYIKHSTMAFGVQDNLKKNVKTLSDIKLLQFFGVSFLSCLNIWNLKVTEELFSGNTTSLSLWTARIFPVCSSLSDSVTTSLKMLSAVKNKSAFNLNSYQLLSIEEMLGYKDVEDMIAYREQIFQEISLKEKQSDLETF	203417	193539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1957_pilon_-_196396_198893_198987_201056_201225_203306
640273	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640277	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
640286	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_97362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640298	contig_17737_pilon	-	2819	7	Intergenic	novelGene_72905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_6	107.156298098722	1043	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	89	922	68869	53442	FALSE	15	CCAACGTGTTCGTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYAHKLELMRILTRVNWKVATEFESYSPDSTFHAKKQIPCIVSMLTKELYFNQ	94244	51544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_53672_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_94171
640302	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640305	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
640313	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640322	contig_9516_pilon	+	1968	15	Intergenic	novelGene_106178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	233	412	878005	878523	TRUE	30	ACCGACCGCTGGGTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQVLFSDVNIKNSSTWLKIFTKDLIIHTHTHRESLLNKKCCGTHPIHCQGQRRACPFHCGASVFVNVEELGYFIEIFMLLTVLNDLPCYWHSVKDVPQHDPHHHFVPEVEDDTFAVVLPFNRDLWDCCAALRNSDF	877772	913240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_878029_878367_878567_880055_880184_881624_881764_883610_883750_884202_884297_884628_884735_888747_888857_889790_889867_890735_890799_898249_898384_898505_898634_899605_899705_905483_905627_913085
640329	SIRV7	-	258	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91666	2	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
640345	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640346	contig_7580_pilon	+	1918	8	Intergenic	novelGene_108595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	324.739393159173	50	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	640	1533	103420	109647	FALSE	20	CCTATTTCATCTATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96444	110032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_101268_101709_103406_103579_104052_104173_105320_105378_106952_107190_108145_108248_109428
640359	contig_12250_pilon	-	1663	9	Intergenic	novelGene_80705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	207.484939212464	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAAGTCTCTTTATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401294	398576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528
640360	contig_2817_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_104352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	0	491	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATACAGTGATTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420841	424229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_421054_422231
640364	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
640365	contig_17440_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_7592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTTTAAGTCTTACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3323	3021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3000_3300
640367	SIRV4	+	321	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1450	632	995	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2450	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
640393	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_97220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640398	contig_9468_pilon	-	1772	12	Intergenic	novelGene_59461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAAGAATCACCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206575	150955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_150988_172514_172567_172893_172971_173052_173128_173540_173650_175886_175932_177205_177311_189779_189930_200356_200571_201334_201503_205634_205777_205972
640403	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
640404	contig_5643_pilon	+	1248	10	Intergenic	novelGene_39063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	825.491742710944	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	627	1247	634983	641591	FALSE	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRPSKAQAGSCPSTLVNKVS	631222	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_641537
640418	contig_14441_pilon	+	801	4	Intergenic	novelGene_100666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	105	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	187	615	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112116	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
640427	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640436	contig_2453_pilon	-	2115	13	Intergenic	novelGene_147758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	341	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1020	1352	58793	58089	TRUE	10	TACCCCCGCTCCTGGCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERLIGIFVWSLTSRYFTKSFALPCKRATSRGGGISGSWDDWSLAALRRALPLRALGDLRESKALRAQAANRVLEALRAQKAMGPLEALRAIEAIRAFETLRPPVFPEA	63158	55546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_-_55700_56513_56581_56923_57421_58042_58353_58463_58526_58786_58868_59398_59501_60188_60265_60356_60400_60721_60790_61904_62020_62426_62830_63020
640443	SIRV7	-	266	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35800	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78938	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78840
640445	contig_16126_pilon	-	2351	14	Intergenic	novelGene_141880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	32.1208885196213	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	1043	2290	60404	47184	FALSE	25	TTGTATTTTTCAAATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLLKNLGGDTIQMEYNASTNNISNLRHSSDEAGGKMNTCVNYTTSPKKDTGVQTDDLNTGMFSTESHCGSVLEREIIDCPSPEISAEFNGQFNTKKNKQELSQDKGANLENSWHSGHCNQLTRTEKQIRHMKKCLKRPDWNIHKPLRGYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLHLVERNNLGHLSPNSSSSPEALPTSHQETESRFRWHLVKKEEEPLKINSFSKESRPQSPIPAVKNRTQQTQTNTLHLPLKNSSYERENLISEASQTESSLGISEPSDFIPYVRTNEIYYLNPDAPLSGPSTQDPQYQNSHDGDQEQQQLSESDLVRDPLLNPNLVRNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELETNLMPSAANQEENFSSLF	95748	47122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_47271_48546_48675_48939_49200_50842_50884_51363_51849_54828_54970_60298_60444_63157_63327_64113_64199_64397_64666_65261_65394_79850_80014_81806_81911_95666
640456	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640464	contig_6048_pilon	+	1526	12	Intergenic	novelGene_73249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_9	50.5559178182563	645	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	91	1122	1972099	1978064	FALSE	25	TATTCCAAGGGTCAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972008	1978468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
640466	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
640467	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640474	contig_3386_pilon	+	1813	5	Intergenic	novelGene_34482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	38.9254094390798	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	252	752	122000	138941	TRUE	15	CTGCTGTGGTCTGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIPPDSWQPPNVYLETSMGIIVLELYWKHAPKTCKNFAELARRGYYNGTKFHRIIKDFMIQGGDPTGTGRGGASIFGKQFEDELHPDLKFTGAGILAMANAGPDTNGSQFFVTLAPTQWLDGKHTIFGRVCQGIGMVNRIGMVETNSQDRPVDDVKIIKAYPSG	121748	140108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_122056_124670_124826_138079_138149_138720_138981_139086
640475	contig_14322_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_116492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
640478	contig_8878_pilon	-	1265	6	Intergenic	novelGene_147865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_5	289.522365284618	2824	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	97	570	231110	228630	TRUE	45	AACCTAAGCAAGTGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGCVSGHLNCASAIFPSLSQTGPGDASRRTITMAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQVCFLIYKVMIVR	231733	227835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231121_231647
640483	contig_6137_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_59180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTAACTTCTCAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264391	1262442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1262400_1264400
640486	contig_5023_pilon	-	2676	1	Intergenic	novelGene_7384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCAGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642792	640116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_640100_642800
640492	contig_14441_pilon	+	1368	6	Intergenic	novelGene_100376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	381.824776566424	6	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	754	1182	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	30616	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_30737_47159_47571_112591_112665_116578_116963_117220_117344_117539
640495	contig_11832_pilon	-	1778	15	Intergenic	novelGene_106927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_14	905.975773429299	1949	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	671	1327	86997	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92502	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
640505	contig_2078_pilon	-	2754	14	Intergenic	novelGene_100183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	82.0704705127095	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	58	1926	535379	514649	TRUE	20	CAGGTGACTGTATCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSVIDPMSLQSLPCPGPLEQVPRSWS	535436	505012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_506840_506907_508726_508796_514636_514723_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
640518	contig_9955_pilon	+	844	6	Intergenic	novelGene_21362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	34.0317498815444	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	99	641	276111	296637	FALSE	25	GTGGGGCCCACCATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALKSAGRALIRSPSIAKQSWGGAGRHRKLPENWTDTRETLLEGMLFSLKYLGMTLVEQPKGEELSAAAVKRIVATAKASGKKLQKVTLKVSPRGIILTDSLTNQLIENVSIYRISYCTADKMHDKVFAYIAQSQHNENLECHAFLCTKRKMAQAVTLTVAQAFKVAFEIWQVSKEECL	276012	296840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_276199_286696_286840_287971_288085_290376_290492_296339_296413_296626
640521	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4246	38	3071	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
640528	contig_2069_pilon	-	1260	3	Intergenic	novelGene_23482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509866	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509595_1509708
640537	contig_9438_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_154259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTGATATGTTTTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16913	16158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_16200_16900
640538	contig_7171_pilon	+	2635	31	Intergenic	novelGene_101293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	570	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	133	837	1057752	1063116	TRUE	10	ACTGGCACCTCCTTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRLLGAVGSSTGRVSTTTGLGEPRRRKVRVGSLSSCSSWSEPGAHTCTPCFQKAWSRPPTIATASTASLMGISEVRSPRTGAPSGVTSFKVPSIKTITMSSSTWVTCTGPLCSGAHLAQPARERAEAHGVEEHGLRRLPGAHADAHGGQLGARPGQQREHRQGRGQWKQHLPDEQKLVHGLVPLEQDHGRLQCPTQERATTARAFRSHNTPGSLWCPGSWWRPCSSLPVAGGG	1057619	1075815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1057811_1060195_1060253_1060944_1061016_1061098_1061188_1061371_1061438_1061854_1062029_1062644_1062751_1062949_1063007_1063090_1063199_1065000_1065064_1065154_1065232_1066088_1066173_1066537_1066622_1066696_1066854_1067297_1067337_1068327_1068372_1068452_1068500_1068577_1068634_1069147_1069232_1069475_1069588_1070322_1070403_1070511_1070577_1070994_1071130_1072149_1072220_1072312_1072355_1072518_1072567_1072662_1072720_1074298_1074363_1075207_1075303_1075426_1075485_1075660
640540	contig_14322_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_116397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671880	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
640541	SIRV7	-	225	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91676	-7	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
640547	contig_854_pilon	+	1003	3	Intergenic	novelGene_36315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_2	435.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557638	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_557752_562271_562405_563029
640550	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640565	SIRV4	-	301	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCGTATGTTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
640584	contig_8317_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_20227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCACTGCCTTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16696	16444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
640587	contig_14322_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_115824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTCTTGAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
640589	contig_15047_pilon	+	1168	5	Intergenic	novelGene_52147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3251.26752205967	54	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	27	332	2194	4178	TRUE	30	TGGAAGACCGGAGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_3269_3498_4158_4434_4552_4676_21181
640590	contig_10354_pilon	-	1875	5	Intergenic	novelGene_50853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTGTAGAAATGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476494	432216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_432500_432960_433032_434099_434151_471879_471991_475135
640591	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640596	contig_13952_pilon	-	3297	8	Intergenic	novelGene_133255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_4	152.041750442275	828	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	329	1291	180960	162555	FALSE	25	TTGATGAGGTGGCAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSSGHRLRDVEHHPLLTENENYDSSSSSSSEADTADRVWFIRDGCGMVCAVMTWLLVVYADFVVTFVMLLPSKDFWYSVINGVVFNCLAVLALSSHLRTMLTDPGAVPKGNATKEYMESLQLKPGEVIYKCPKCCCIKPERAHHCRAWDTNTRPLLFSICKRCIRKMDHHCPWVNNCVGEKNQRFFVLFTMYIALSSVHALILCGFQFFSCVRGQWTECSDFSPPITVILLIFLCLEGLLFFTFTAVMFGTQIHSICNDETEIERLKSEKPTWERRLRWEGMKSVFGGPPSLLWMNPFVGFRFRRLQTRTRKGGPEFSV	187173	160548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_162732_165769_165901_166964_167047_167521_167655_169525_169651_180645_180968_183053_183140_186938
640597	contig_15610_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_154287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAGTAATCATCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702724	700669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_700700_702700
640600	contig_8452_pilon	+	1728	3	Intergenic	novelGene_48040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	150	1235	432928	434013	FALSE	35	TACAAAACTTTGAGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423966	434506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_427775_427862_432909
640608	contig_8317_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_19554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
640611	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
640612	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640615	contig_990_pilon	+	2134	8	Intergenic	novelGene_76169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_4	174.690747158678	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	900	1781	1919701	1932551	FALSE	20	AATTTACCTTTTTCCGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHFPPLLRDSENYVVLLDSTLPKSQYDYVLPQVSFTAVGYHKHITLIFNPTRKLPEQDIAQGSYIALPLTLLVLLAGYNHDKLIPLLLQLTSRLQGVRALGQTVSDNSGPEDAKRQAKKQKTRRT	1918801	1932904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769_1929890_1930456_1930550_1932419
640619	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640624	contig_12250_pilon	+	2130	8	Intergenic	novelGene_80574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	73.0806096731827	207	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	239	1378	311980	313836	FALSE	10	TGCTGCCATGTTATCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQLQDMLSWMQPGVSITSSFALSQYGVDMGWTLPECSITDSVTMTQPMEPNPPQQPRLALGSSLPNTKHSPHFPQEPASRTHPEPLTGHHFNLAPIGRRRIQSRWASTRGGHKERPTVMLFPFRNLGSSAQVISKPENRRQHWTHTADPACAVGTRTASAGKPKCPSQHLGGRALKENPVGSSASEQKENCLDCALDPLKLSLSPPRTRKPV	311741	314588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_312793_312871_312969_313132_313596_313684_313753_313831
640628	contig_2367_pilon	-	1595	3	Intergenic	novelGene_65321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	673.5	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATAATTTAAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213294	192226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208634_213172
640640	contig_11563_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_142307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGTTGTTGGGAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244257	244945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_244300_244900
640654	contig_10953_pilon	+	1756	11	Intergenic	novelGene_42538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_9	138.969205221876	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	45	1202	180087	188559	TRUE	20	TGTCATCGGCTTATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILCQTCLGENPYIRMTKEKYGKECKICARPFTVFRWCPGVRMRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMEREISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDPQRMGAHAGKHSSP	180042	189554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_180090_181091_181122_181995_182129_183136_183238_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328_187461_188428_188891_189331
640655	contig_14322_pilon	-	413	2	Intergenic	novelGene_115679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTGGTGTAAGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671838	671269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
640657	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640658	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
640659	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640663	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640669	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640691	contig_14322_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_116568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACAGCAGCGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
640695	contig_7342_pilon	+	2089	8	Intergenic	novelGene_71227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	315.412848987042	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	75	908	716998	727771	TRUE	45	CGAAAAAGGTATGATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILCSEPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTTVTVCEFSFTLLFFLSCVCIKLCYGLVYGFSGGQSRSFKDQRLETHSYHQICASGVLVS	716923	729479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_728798_728899_729013_729437
640696	contig_10749_pilon	-	1040	9	Intergenic	novelGene_133439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1621	junction_3	372.896915212502	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	50	643	150667	136250	FALSE	10	TTTCATGTGGGTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	150716	135852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658
640713	contig_15449_pilon	+	1321	3	Intergenic	novelGene_33638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	807	junction_2	652.5	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	11	385	84815	88945	FALSE	50	AAATAATAGTAGAACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTMKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	84804	89881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_84953_86000_86181_88888
640717	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640719	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640723	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640726	contig_15491_pilon	-	1595	6	Intergenic	novelGene_75980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	205.339328916796	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	49	501	91394	81757	TRUE	85	AATTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAWRKLLLIFL	91442	80076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81787_85979_86213_87650_87753_91306
640727	contig_6710_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_97684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
640730	contig_8330_pilon	-	1866	8	Intergenic	novelGene_71962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	316.024153042331	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	401	1105	2056084	2038853	TRUE	40	CTGCTGGATTAAAACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056595	2032072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2032828_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056297
640731	contig_3822_pilon	-	1496	15	Intergenic	novelGene_133307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_14	991.339747461968	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320818	277216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_280890_280939_281136_281227_282994_283043_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985_306208_320744
640735	contig_7234_pilon	-	1318	13	Intergenic	novelGene_145928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	195.477389286388	398	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	187	750	463571	411977	FALSE	20	TTGTGTCTGATGCAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	411408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463572_464442_464483_481374_481435_587318
640736	contig_19974_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_130471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAGAGACAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191511	192528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_191500_192500
640738	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_19068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCATGACGACCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
640744	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_93662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640748	contig_7396_pilon	-	1888	5	Intergenic	novelGene_79652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_4	5152.20850703851	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACAGCAGTGGCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257077	252419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
640751	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
640752	contig_10434_pilon	-	2211	19	Intergenic	novelGene_82039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_18	211.352668819875	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	334	2127	150439	132856	FALSE	50	AAATGTTATAATAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKGEVKCIKFSLENKILAVQRTSKTVDFSNFIPDNSQQEYTQECKTKNANILGFCWTSSTEIVFITDQGIEFYQVLPEKRNLKLLKSQNINVNWYMYCPESSVILLSTTVLGNVLQPFYFRAVTMSKLPKFEIELPAAPKSTKLSLSERDIAMATIYGQLYVLFLRHHSRTSNSTGAEVVLYHLPREGACKKMHILKLNRTGKFALNVVDNLVVVHHQDTETSVIFDIKLRGEFDGAVTVHHPVLPPRSIQPYQIPAAGPASVTSQSPVPCKLYSSSWIVFQPDIIISASQGYLWNLQVKLQPIVNLLPDKGRLMDFLLQRKECKMVILSVCSQMLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	151689	132771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139146_139201_139465_139511_142485_142598_143308_143415_143506_143597_144855_144960_145447_145589_148181_148269_149454_149512_150355_150441_151357
640755	SIRV2	-	389	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4484	34	3309	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1423	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
640757	contig_854_pilon	+	1792	14	Intergenic	novelGene_36452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	377.143106893024	1	47	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	963	1667	1460156	1465350	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451234	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455031_1455691_1455804_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460095_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
640771	contig_17840_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_154302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATTTTTTTTTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74558	74206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_74200_74600
640780	contig_13740_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_34723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	487	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACGTACGAGGGTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165438	164296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_164300_165400
640781	contig_8242_pilon	+	2543	4	Intergenic	novelGene_80182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_3	70.1046836286041	6	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	125	424	3532	29118	TRUE	65	GTTGAAAAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGKL	3407	32086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29854_30702
640791	contig_12677_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_110870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGACACACCAGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3767	2948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
640792	contig_18184_pilon	+	2598	5	Intergenic	novelGene_123849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.3739406695128	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	215	2068	48717	62430	FALSE	25	GTAAACCTTCTCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGDSPSLVAGGLFIIHTGGKTYQCKEYIETFSEVPSFDIYHRLYSKEKSVTCSECGKGFRYISGLRNHHRVHMGKNYYMLDGCGKEVSQSSHLQTYLNAHTLEKPHKCEECGKRFRHRATLNVHYKGHTGVKPYNCEECGRGFMYPSHLREHQRIHTGERPFRCDTCGKNFHRRAALNTHCMVHTGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSKEKPYKCEECGKYFGTRQNLQVHFRIHKGEKSYNCVECGKCFRQSAHLLTHQRVHSGEKTFKCEECGKYFRNRSNLQTHHRIHTGEKYFNCVSGPYSWGFSSLCRNSKSGLLL	37547	62960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37699_48653_48732_55969_56097_60466_61828_62079
640794	contig_12427_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_40537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506425	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504700_506400
640796	contig_610_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_76697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196425	195119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_195100_196400
640799	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
640801	contig_15991_pilon	-	923	6	Intergenic	novelGene_70875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	66	854	105009	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105074	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
640802	contig_15063_pilon	+	1695	7	Intergenic	novelGene_10378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	2816.68538455319	4	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	237	1475	34808	39515	FALSE	35	GTGGCCATGAAATAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27132	39735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
640804	contig_5797_pilon	+	2192	11	Intergenic	novelGene_56927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	86.7721729588467	374	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	496	1503	254852	273501	FALSE	20	GCTGTCAGTGTATTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRIHKFHRLESTLSPAENRVFSLQQPLPGEGSREPEHTGDFHVEEALDWPGVYLLPGQVSGVALDLKNNLVIFHRGDHVWDGNSFDSKFVYQQRGLGPIEEDTILVIDPNNAAVLHSSGKNLFYLPHGLSVDKDGNYWVTDVALHQVFKLDPNSKEGPLLILGRSMQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	221697	274190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_221816_230464_230595_250787_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_273319
640811	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	165	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640816	contig_3789_pilon	+	2024	8	Intergenic	novelGene_79851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_7	140.615701506639	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	166	921	445610	472341	FALSE	25	AATAATCTGGGGTTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVITGLAMDMQLLMIPLIMSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	445444	473444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465169_465197_465816_465913_467056_467110_468585_468697_472202
640821	SIRV7	-	320	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	14	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114724	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
640824	contig_18869_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_56027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73539	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
640825	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	185	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640828	contig_5566_pilon	+	3179	12	Intergenic	novelGene_153644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2838	3140	66478	78772	FALSE	15	GAAGCGCCCTTTCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQETSLWPKCEALENSRKVRNRGSVTRLASMVKDRKAGLTRCTGRLVKKSSSTVSSASPCAARAPRQRRPSCPRSSSSSSPGLQRSSIAGSPGCRTRELP	24737	78811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_26372_32362_32510_33996_34120_45551_45662_46909_47022_47462_47555_48077_48126_48612_48782_51460_51634_63968_64096_66375_66524_78515
640830	contig_817_pilon	+	1106	2	Intergenic	novelGene_132478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720123	724585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_720718_724073
640832	contig_6069_pilon	-	2658	13	Intergenic	novelGene_8063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	38.0966424592334	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	114	2018	515909	498920	FALSE	20	GACGTCTAACATGTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPSLQPPPHRDFISVTLSLGESYDNSKGWRRRSCWRKWKQLSRLQRNVLLTLLAFLIICGLLSYMNTTHHWKALSGRSSEKQKARPDIPGLKPVNPPVLPAPQTAGAAQDVKDRIQDRVEQEQEEPGNAHKENSQRTVISWRGAVIEHEQGTESPSRRADVPTNRPGPESRTQKASAPLNKRQKAVVEAFRHAWKGYRKYAWGHDELRPLSKSFGEWFGLGLTLVDALDTMWILGLTKEFEEARKWVSQKLQFQKDVDVNLFESTIRILGALLSTYHLTGDSLFLEKAKDFGNRLLPAFKTPSKIPFSDVNIGTGIAHPPRWTSDSTVAEVTSIQLEFRELSRLTGNEKFQEAVVEVTRRVHSLSGKKDGLVPMFINTHSGHFTHLGVYTLGARADSYYEYLLKQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	516022	498279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501622_505367_505557_505922_506072_506906_507093_508364_508475_509812_509904_514308_514420_515227_515337_515795
640836	contig_6710_pilon	+	559	2	Intergenic	novelGene_93076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2926	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
640841	contig_7229_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_39841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTAGAGGAAATTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959498	961316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_959500_961300
640856	contig_5954_pilon	-	1859	14	Intergenic	novelGene_28702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	198.831765585676	124	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	30	1727	975610	962223	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFNGVPGRAMEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSESRDSFLRYSYSRCLGPPSSRMVSSLLPSVPCVCPFPSVAVSAALP	975639	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962362_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
640887	contig_12622_pilon	-	1861	13	Intergenic	novelGene_6037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	315.933361468663	6	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	540	1493	1690387	1685486	FALSE	25	TTAAAACCCTGTCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVRASGSLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691500	1685117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686977_1687994_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1691276_1691482
640901	contig_11171_pilon	+	1483	8	Intergenic	novelGene_48602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	632.794127788229	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	735	1034	237742	251467	FALSE	30	AGCATGGAAGGGGGGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTETNVALFTRLHVGNGKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212093	251916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_223862_224016_235063_235394_236868_236982_237729_237796_239236_239336_249980_250068_251407
640904	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640908	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_95853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640909	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
640915	contig_6710_pilon	-	904	2	Intergenic	novelGene_95544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	59	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
640917	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
640918	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
640927	contig_6364_pilon	-	2449	12	Intergenic	novelGene_51720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	912.914359674101	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	148	1506	472628	436151	FALSE	55	AAAAAAAAATCTCAAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANGNDNKKFKGDRPPCSPSRVLHLRKIPNDVTEAEVISLGLPFGRAFLEMASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	477736	435207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477601
640945	contig_13645_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_146154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1007	1312	10212	9907	NA	10	TTTGTGATTGTACTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVCYQVKLRNRTLFSFYNVFLQTTVNSKSMPILNRGKRCVDFVLLHQYFRNICLPFPQLHEPAVVYSCGFHACTPLSITLQEKHRMEFRLRKIPLCFKKL	11218	9172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_9200_11200
640947	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
640952	contig_7254_pilon	-	1110	7	Intergenic	novelGene_145850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGATAGGAGAGTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274648	228439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_228487_230868_230991_242397_242488_243049_243151_247412_247513_250252_250328_274073
640962	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640974	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4460	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640977	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
640981	SIRV2	-	621	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4252	34	3077	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
640994	contig_9227_pilon	-	2753	5	Intergenic	novelGene_154308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	14.9059551857638	88	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	463	2427	51694	47907	FALSE	35	TTATTTAGAATCTAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIETFRNLASVVSQTLNDGKNLSSKYLIVEFMKNDTWSSMLGDICKLHDIEDQHKNQGRHKRRHIIKNLFESNEENQGGKTYRRIPNLAVFKRTPAIINSSECHECGKSFINHSSLKRHIRSHSDCNTYRYKTCKEACICPSDQSIPVRTLTEEKPYKCKVKTLTGEKPYECNKCGEDFCSFLSFQTHVRGCKRECKECWKTYPSSLLLCKKFHSGDKPYKCKEFGKGFSDSSSFTIHIGTHSGERQCKHCGKAFSNSSALATHQRTHSGERPYECKECGKVFSCSSHLTSHIKSHSGERPYKCKVCGKVFSFSSSLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSATLTSHIRVHTGEKPYECKDCGKAFSQSSALTSHKRVHTGEKPYECKECGKVFTFSSSLTEHIRTHSGEKPYECKECGKTFSQSSHLTIHVRTHNGERPYPCKECRKAFSDYSSLTRHIRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSSLTKHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTSHTKTHSGERPYECKECGKAFSDYSSLTKHTRTHSGERPYECKECGKAFRQSATLTSHIRVHTGEKPYECKECGKAFSQSSALTSHIRVHTGEKPYECKECGKVFSCSSSLTKHIRTHRSLTNVRYVGKSSVVPHPSLDT	91540	47580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_49687_50025_50177_51660_51876_74213_74454_91499
640996	contig_513_pilon	-	1754	10	Intergenic	novelGene_80159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	443.353912081561	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	303	968	453021	447909	TRUE	85	AATAAAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYG	454719	446315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_447914_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453068_453312_453443_454593
641005	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641009	contig_8453_pilon	-	2367	1	Intergenic	novelGene_125133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGGCCTGAGCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225259	222892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_222900_225300
641010	contig_9482_pilon	-	1807	11	Intergenic	novelGene_44325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	122.186906008786	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	18	746	1253164	1240922	TRUE	30	GTTCCATTAAAGGATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFNRDSHLSV	1253181	1236162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240948_1241060_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
641024	contig_3386_pilon	+	1916	4	Intergenic	novelGene_34481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	32.7040602304294	393	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	252	752	122000	138941	FALSE	10	TCACTGCTGTGGTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIPPDSWQPPNVYLETSMGIIVLELYWKHAPKTCKNFAELARRGYYNGTKFHRIIKDFMIQGGDPTGTGRGGASIFGKQFEDELHPDLKFTGAGILAMANAGPDTNGSQFFVTLAPTQWLDGKHTIFGRVCQGIGMVNRIGMVETNSQDRPVDDVKIIKAYPSG	121748	140105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_122056_124670_124826_138079_138149_138720
641034	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
641040	contig_14322_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_115727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671586	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
641042	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
641058	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_97234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641059	contig_6557_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_33022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGTAAAAAAAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627081	625780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_625800_627100
641060	contig_6557_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_33021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGACCAGTAAAAGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625830	625181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_625200_625800
641065	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641089	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	74	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641091	contig_6710_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_89120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653649	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
641095	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_16620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27848	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
641096	contig_6397_pilon	-	2492	19	Intergenic	novelGene_146247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_7	88.614785712733	322	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	234	1907	554772	437797	FALSE	5	GTTGTTGGGGTTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	601796	437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455606_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
641112	contig_11201_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_154313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	287	586	116543	116244	NA	45	CAAAAAATGCATCTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTNRGTVVLFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLRSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEVDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	116829	115976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11201_pilon_-_116000_116800
641114	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
641130	contig_13894_pilon	-	1171	4	Intergenic	novelGene_62034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	679.409711113666	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	177	1091	288137	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTAFSSSVAVTDKDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287251_287491_287538_288132
641131	contig_6576_pilon	+	1997	3	Intergenic	novelGene_42402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	111	1457	1301228	1302574	TRUE	20	TTGGAAAGTGTCTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295666	1303504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302879_1303268
641133	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
641134	contig_14441_pilon	+	1219	4	Intergenic	novelGene_100378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.1682057859982	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	736	1179	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	30630	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_31141_121614_121691_125517_125902_126496
641139	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
641140	SIRV7	-	245	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69031	4	35812	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78926	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
641165	contig_4678_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_126001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99903	99083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_99100_99900
641170	contig_18800_pilon	+	1037	2	Intergenic	novelGene_110664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	709	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	8	334	782	2248	FALSE	10	TGTTGGCCTCCTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKRFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	774	2951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_893_2032
641177	contig_16622_pilon	-	1847	9	Intergenic	novelGene_48442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	932.197672170447	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGACCAGTCTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121369	108210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113041_113602_113739_115153_115292_115499_115559_118811_118884_121330
641179	contig_15067_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_154323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55232	52870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_52900_55200
641184	contig_6958_pilon	-	2775	13	Intergenic	novelGene_69906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_2	243.574423944716	355	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	180	2378	50997	18492	FALSE	10	TTCAGTCTGCTTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWFADLAGKAEDLLNRVDQGAATALSRKENTSNIIYNKNIDCPELHQQNAELTYQTGSKAAYISSAADNIRNQKATILAGTANVKAGSRTPVEPSHPVENASLPRPSSQFVRRKKSEPDDELLFDFLNSSQKEPSGKVEIKKERGKTPAFQSSRTSSVTSVNTSVTTITTMEENSSESQSHEASNNSDVGPEDQENSSKENASSNVTCTDPTPTSNDDGKSHELSNLRLENQLLRNEVQSLNQEMASLLQRSKETQEELNKARTRVEKWNIDHAKSDRITRELRAQVDDLTEAVAAKDSQLAVLKVRLQEADQLLNTRTEALEALQSEKSRIMQDHTEGSSLQNQALQTLQERLHEADTALKREQESYKQMQSEFAARLNKMEVERQNLAEAVTLAERKYSDEKKRVDELQQQVKMHKSNLESSKQELIDYKQKATRILQSKEKLINSLKEGSGFEGLDSSTASSMELEELRHEKEMQREEIQKLMGQIHQLRSELQDMEAQQVNEAESAREQLQDLQDQIAQQKASKQELEAELDRQKQEFHYIEEDLYRTKNTLQSRIKDREEEIQKLRNQLTNKTLSNSSQSELENRLHQLTETLIQKQTMLESLSTEKNSLVFQLERLEQQMNSASGSASNGSSINMSGIDSGEGTRLRNVPVLFNDTETNLAGMYGKVRKAASSIDQFSIRLGIFLRRYPIARVFVIIYMALLHLWVMIVLLTYTPEMHRDQPYGK	54291	18094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_18573_20075_20140_21861_21968_25626_25853_28298_28398_32472_32602_33473_33645_38491_38696_40536_40661_41738_41959_43314_43543_50450_51028_54142
641186	contig_5083_pilon	+	3086	1	Intergenic	novelGene_151645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCTAGAGTACATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251793	254879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_251800_254900
641189	contig_13954_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_130057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATGATTACACCATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90469	90669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_90500_90700
641190	contig_6589_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_26019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	855.100638545438	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	629	1270	1726977	1731484	FALSE	30	GTTTTGGTAAAATAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725368	1731809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1726064_1726937_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
641193	contig_12923_pilon	-	2264	16	Intergenic	novelGene_30193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	56.5584849710653	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	74	1975	577741	511090	FALSE	30	CAATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATRLGEKPGLFIVVGGGRPGLGTMGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVVSGTIGLKKKIYLSKPVFLTFKHTQAVGTETKHLCVYWEASKEGGSWSTEGCSHMGSNNSHTTCQCFHLSSFAVLVGLTPKADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTREFCSSSYTVSLIARCEWSTRNGLVGCGKGLKQKALSCLTLLPTPKWRNSRSRQSLHIQETPETLSPPNDSHQLILSLFLG	585698	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515342_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_531948_532117_533560_533746_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
641203	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
641208	SIRV2	-	568	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4303	36	3128	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
641213	SIRV7	-	207	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69077	2	35858	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78880	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
641214	contig_8674_pilon	-	2755	7	Intergenic	novelGene_102891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_6	181.583237723701	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	17	793	189511	116462	FALSE	30	CCACATTGCAACTCAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRVAAMPRPRRVSQLLDLCLWCFMKNISRYITDIKPLPPNIKDRLIKIMSMQGRITDSNISEILHPEVQTLDLQSCDISDTALLHLCNCRKLKKLNLNSSKEDRISITSEGIKAVASSCLYLHEAFLKRCCNLTDEGVLALALNCRLLKVIDLGGCLGITDVSLHALGENCLFLQCVDFSATQVSDSGVIALVSGPCSKKLEQIHMGHCVNLTDEAVEAVLTCCPQICIFLFHGCPLITDHSREVLEQLVGPNKLKQVTWTVY	189527	114499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_116536_140502_140615_148677_148735_149048_149267_154628_154774_158297_158431_189473
641216	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641238	SIRV7	-	223	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91678	-7	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
641245	contig_16622_pilon	-	1536	9	Intergenic	novelGene_48432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	1219.64369156529	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	790	1368	113714	108374	FALSE	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	121945	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115436_121336
641247	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641251	contig_9696_pilon	+	3030	4	Intergenic	novelGene_68794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCCGAGAGAGGCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319737	324023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_322247_322334_322414_322530_322839_323889
641255	contig_18869_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_56247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73545	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
641258	contig_6412_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_149979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAAAAAAAAACCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579356	578823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_578800_579400
641259	contig_10734_pilon	+	2086	11	Intergenic	novelGene_51106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_10	54.5032109145874	228	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	689	2014	704822	719124	FALSE	0	CTTGCGTGTCCCGTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIKEYRIPLPMTVEEYRIAQLYMIQKKSRNETYGEGSGVEILENRPYSDGPGGSGQYTHKVYHVGMHIPGWFRSILPKAALRVVEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKADAGENPAVFSLSPAEKSQLTIDFIDIVKDSIPPSEYKTEEDPKLFHSTKTQRGPLSDNWIEEYKKHVFPIMCAYKLCKVEFRYWGMQSKIERFIHDTGLRRVMVRAHRQAWCWQDEWYGLSMEKIRELEKEAQLMLSRKMAQFSEDEDETMELSREEAAQDQASREPAEPSSNKNGEPLAGRGLKKQWSTSSKSSRSSKRGASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDSEDMFPKDISKWNSNDLMDKIESPAPEDAQEGLYRQNTPGFRVDSSVEQLNIMEIKNKIIAFFPTCVMKMKGWKGRRRKPRPCRQK	634177	719196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_634662_638214_638324_704726_704900_711300_711516_712728_712851_713817_714046_715406_715719_716881_716978_718396_718502_718729_718801_719025
641278	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
641285	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
641287	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641288	contig_21113_pilon	-	2266	4	Intergenic	novelGene_151115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	29.044027881056	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	438	1988	7003	5453	FALSE	55	AACAGAAAAGATAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQCYEHNASENIVHQHKNHFPLRENHAVFDLHEKAVKSNLTLPAVNQSRSNEIKNSAEPNGDKKSFLHADQKQFCTEMQFPESQKSNSTDFQIIKRRKTHKIQKQHVCNECGKAFLRKFLLTEHQFIHTGEEPYKCNLCGEIFFKKFKLSEHYHTTHKGEKPYKCTECDKAYLHKSHLNKHQKTHMAEKPYVCGECGKGFNQKGHLTVHQRTHTGEKPYTCSECGKGFNQKGNFVSHQRIHTGEKPYICSECGKGFIQKGDLTVHQRSHTGEKPFICSACGKRFIQKGDLTVHQRIHTGEKPYVCRECGKAFSQKPCLVAHKRCHTGIVSFVCNECGKSYSQKSNLTKHQKIHTGEKPFKCGECEKSFDKKEKLIEHQRSHTGETPYGCNECEKTFASKSCLLSHKRIHTREKCVDSVNVEDPSTASHIKSHTTDLQQEKSPVNTVSKEMPSLAAQTSVNTSECLTDKSIVLEGQPFAGCEPSGDNREFVQERNLMNAANGEEPSVINYLIFYVT	12602	5174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21113_pilon_-_7066_10653_10803_12127_12224_12472
641289	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_16473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
641310	SIRV4	+	321	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1447	635	992	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
641311	contig_2036_pilon	-	1910	3	Intergenic	novelGene_131848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	608	junction_1	77.5	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	112	726	661441	636526	FALSE	75	TCCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQVTFTVLLLMA	661552	635341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_636731_647832_647936_661134
641320	SIRV5	+	451	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	7425	-4	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTCGGTAAATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	3566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
641323	contig_19778_pilon	+	1770	5	Intergenic	novelGene_143759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_3	153.633289035938	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	1327	1770	32958	34222	FALSE	15	AATGGCAGGCCTCTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLLEGLGYSVDVKQNLTASDMTAELKTFADCPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPG	24850	34222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_25219_28501_28565_32062_33021_33442_33678_34076
641329	contig_1982_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_151304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1192	1563	98104	98475	NA	60	CCAAAAAAACGAACACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGRNIPVTLIDMDNVLLYFVHIIDHIAVKEYVSVYFHTLTSEYNHLDSDFLKQLYDVVDIKYQRNLKAVCSSNILFKDVNMVCHHLFYLRTEGQNPPRGEPPPAIFCHNSRTDRLSSLCS	96912	99119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_96900_99100
641339	contig_6163_pilon	-	1561	9	Intergenic	novelGene_103792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	252.427681475309	882	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	100	1149	50010	29418	FALSE	35	AAATCAACACTTGAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSSFSSFGSKRAKPGQGQAEGPEGAGGAGRGAMAHQTGIHAAEELKEFFAKARAGSVRLIKVVIEDEQLVLGASRELAGGWDQDYDRAVLPLLDAQQPCYLLYRLDSQNAQGFEWVFLAWSPDNSPVRLKMLYAATRATVKKEFGGGHIKDELFGTVKDDLSFAGYQKHLSSCAAPAPLTSAERELQQIRINEVKTEISVESKHQTLQGLAFPLQPEAQRALQQLKQKMINYIQLKLDLERETIELVHTEPTDVAQLPSRVPRDAARYHFFLYKHTHEGDPLESVVFIYSMPGYKCSIKERMLYSSCKSRLLDSVEQDFQLEISKKIEIGDGAELTAEFLYDEVHPKQHAFKQAFAKPKGPGGKRGHKRLIRGRSENGDDS	50109	29005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_29586_29959_30082_30198_30350_31084_31211_31354_31460_31667_31764_32214_32394_34727_34806_49985
641381	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641387	contig_1867_pilon	+	1492	6	Intergenic	novelGene_54512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5479.67599772103	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	147	509	194973	218805	TRUE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTINLQPI	194826	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215702_218786_218898_219457_219609_220857
641390	contig_21315_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_151568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTAGTTGCCAGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43981	45640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_44000_45600
641398	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
641405	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641422	contig_14030_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_62238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAATGCATGTTAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338507	337616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337600_338500
641439	contig_9197_pilon	+	1305	3	Intergenic	novelGene_154352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52301	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80810_92373
641440	contig_8270_pilon	-	2328	2	Intergenic	novelGene_143806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	170	junction_1	0	209	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	15	464	429496	412701	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVVKMAATIQDSRASAGKKLKNSLKKKKKMKVIARATSSKLEDEDKDAADGGGSVGSCGLEEDDFSSDNKAIDADNEEEVEPCDRGNENAAESSVGTDPGWADAMAKILNKKTPKTKPGILMKNKELEKEKETLKRERLEKRKQVCPARCLLD	429510	410836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_413006_429351
641441	contig_20487_pilon	-	2451	8	Intergenic	novelGene_154380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	115.827281689909	1723	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	77	889	22178	8405	FALSE	10	TACCCCTTGTCAGTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPLPKLLAATTPARSRRVLLPLLLLLLPTGALRGWEAEERPRTREEECHFYAGGQVYPGEPSRVSVADHSLHLSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFRSINTEVVACSIDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIKPEDAMKAWWPREEL	22254	6842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8409_8648_8696_12726_12762_13744_13876_15072_15196_17370_17488_18175_18294_21940
641449	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641457	contig_1443_pilon	+	1792	12	Intergenic	novelGene_28227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	55.1693111481554	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	675	1493	538016	541541	FALSE	40	AGAATGGAAATGAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535986	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
641470	contig_11752_pilon	+	1216	7	Intergenic	novelGene_37649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1482.78001852376	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	137	676	87309	93067	TRUE	10	ATGTCCAGTTGTGCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQGE	85050	105910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_87159_87227_87305_87547_88667_88776_92873_93088_94223_94418_105584
641471	contig_13894_pilon	+	1154	10	Intergenic	novelGene_62122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2509.7943745393	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	22	1098	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520691	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525015_525762_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
641475	contig_1230_pilon	-	1321	5	Intergenic	novelGene_28881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	345	671	408595	407721	TRUE	15	GTTCGCAAGCGGTGCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408939	406616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_406930_407146_407348_407584_407787_408002_408234_408565
641486	contig_12019_pilon	+	2802	16	Intergenic	novelGene_87722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	52.685228796441	205	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	308	2023	606598	620414	FALSE	10	TTCCACCTGAGTTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGLQTVTLSDGTTAYIQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVAVQKESLSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPKEGYDPSALEAVQLEDGSTAYIHHPVAMPSDSTILAVQAEVGLEDLAAEDDEGFSADTVVALEQYASKVLHDSQAPHNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFRCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQVTLITQDGAQQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	586879	621193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_586917_593935_594023_594436_594524_606501_606671_611574_611656_611769_611848_613067_613268_615363_615481_615814_615891_616485_616612_616741_616922_617737_617972_618078_618243_618950_619119_619648_619763_620309
641490	contig_12948_pilon	+	3917	1	Intergenic	novelGene_126212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCACGCAGATCACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254463	258380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_254500_258400
641498	contig_11017_pilon	+	2335	11	Intergenic	novelGene_128079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	688.929720653711	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1363	1878	268852	294618	FALSE	0	TTCTCTTTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233694	295075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_262882_263922_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
641509	contig_13542_pilon	+	1654	9	Intergenic	novelGene_131484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	910.658475705904	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	101	919	346638	505589	FALSE	60	AAAATAAAAAGCTGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346537	506324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
641510	contig_14322_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_116569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACAGCAGCGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
641521	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641529	contig_12427_pilon	-	1892	6	Intergenic	novelGene_40539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1114.72787710723	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	140	631	522337	505937	FALSE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINKT	578091	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505950_507848_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
641530	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641535	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641539	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTTCATTTGTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27921	27670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
641552	contig_13542_pilon	+	1327	5	Intergenic	novelGene_131560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_4	99.3038267137778	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	786	1325	650792	653588	FALSE	15	GACATCCCTGCTTGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQNALQGVVPTEMEDLNIEHLQLLLLIFHNFTEKGQRAILTLFVQIIQELSVNMEAQMRSVPLILARLLLIFDYLLHQYSKAPVYLFEQVQHNLLSPPFGWASGSQDSSSRRVTIPLYHGFKEVEENWSKHFSSDAVPQPRFYCVLSPEASEDDLNRLDSGACDVLFSKLVKYDELYTA	648775	653590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_649548_650778_651062_651916_652053_652938_653019_653534
641562	SIRV4	+	315	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1445	643	990	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2445	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
641571	contig_6102_pilon	-	821	8	Intergenic	novelGene_32203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1290.43035061793	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	64	711	905250	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906146	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
641578	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_16466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27820	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
641592	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_89067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641608	contig_11752_pilon	-	1156	7	Intergenic	novelGene_37594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAGTGTCACCAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105640	84087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_84196_87158_87545_88665_88775_92872_93056_94218_94409_96440_96562_105581
641614	contig_16666_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_61799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAAAATTTATTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151463	152656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_151500_152700
641620	SIRV2	+	461	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	136	-74	-136	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCGAATGACTCTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
641624	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
641638	contig_9731_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_154394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	127	561	89617	89183	NA	60	ACCACCCTTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACESWAMNKEDQRRIDAFELWCWQRILNIPWTARRTNKPVLEEVWPKCSLEARMVRLHITFFGQVIRRDQSLEKSIMLGKIEGLRKRGRPSMKWIDTVAATAGSNIAAILRMAQDSVVFCSLVHRVTVSQNRLDGS	89743	88236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_-_88200_89700
641641	contig_1725_pilon	-	1353	8	Intergenic	novelGene_24321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGAAAGAGGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255856	248343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_248446_248573_248724_248851_248911_249014_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252777_255364
641652	contig_8357_pilon	-	1732	11	Intergenic	novelGene_39698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	70.3616372748673	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	63	1502	332697	312261	FALSE	15	GGCTTAGTACTCTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSGKKHGVCASRAVKPSCQMCSQKKSRAGGRFRADNLNKLKNLCSKTIGEKMKKKEPVGDDESISENMLNLDDLTADTLTSLKVSQIKKVRLLIDEAILKCDAERIKLEGERFENLREIGNLLHPSVPISNDEDADNKVERIWGDCTVRKKYSHVDLVVMVDGFEGEKGAVVAGSRGYFLKGVLVFLEQALIQYALRTLGSRGYTPIYTPFFMRKEVMQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	332759	312030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318125_318967_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332666
641655	contig_14215_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_59353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAAGTCTTTATCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40094	39154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_39200_40100
641657	contig_13894_pilon	+	1248	9	Intergenic	novelGene_62136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2090.90919219367	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	151	1206	521729	528117	FALSE	25	ATATTTTCTAGTGACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521578	528159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
641686	contig_9594_pilon	-	1665	11	Intergenic	novelGene_73929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	425	1009	321995	316262	TRUE	5	GCCCTTTCCTGGCCCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFILCVPFGTASGSVSTTYDGDAAPGSGFYHFIHESFGSPGKSFPFKYSHRSVPHNLLSPSDSLSILLAALRTTVQAHPASGYARGHGGLASLGILIKLVSGDKVNRQGNLHTILLSFGHQVFDNLGSFFIKQRSANLHAVEHFKKGKSHSTTNNHLIDFVQHIIDQLDLVCNFSSRMARKGRSGLSKALAK	322794	301179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_301398_307476_307535_310443_310613_310773_310858_315281_315344_316196_316314_319364_319479_319721_319903_321479_321657_321934_322034_322408
641689	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
641700	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
641710	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_93785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
641715	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
641718	contig_3394_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_152667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAACCTTATGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371972	373593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_372000_373600
641725	contig_7695_pilon	-	2188	14	Intergenic	novelGene_41595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	27.8429662433938	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1213	1791	512113	504301	FALSE	5	TCTTTGCCATGTGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525582	503903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514684_521091_521203_521999_522090_524166_524442_525015_525168_525549
641742	contig_9875_pilon	+	2268	6	Intergenic	novelGene_154398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	40.6369290178281	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	35	367	10870	13182	TRUE	30	AACTTTCAGTTATTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAVPAAAATAMERDEEQLSARPALETEGLRFLHVTVGSLLATYGWYIVLIGILLFVVIQKLSARLRALRQRHLDRAAAAMDKIPVISTTTHTRIRMCYFGCDILVPDQLSGLFPVLVVCR	10835	22032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_10946_11610_11746_13060_14234_19197_19288_19388_19468_21351
641753	contig_5988_pilon	-	1168	2	Intergenic	novelGene_15946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	62	994	786277	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPEGTGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786338	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652879_786261
641759	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
641762	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
641769	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	23	373	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14431	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641780	contig_14443_pilon	+	1137	5	Intergenic	novelGene_126667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8626	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGACTACGCGGCAGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29092	39498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_+_29709_33848_34014_37689_37859_38984_39045_39371
641783	SIRV4	+	189	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	1121	6	-1121	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTCAACGACGAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
641787	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
641794	contig_9777_pilon	-	3078	7	Intergenic	novelGene_154424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	37	junction_3	60.882400303098	190	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	1107	2195	12571	2236	FALSE	40	ATTTATTAATGCCTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTHSQNFRKLLNEITGEAALRLAELSTKEFAGFQIGLLNKDLKPQTYRNAYDIPRSGLLDQLTRMRSNLLKTRKFIVGQDEDSLHSVPVAQMGNYQEYLKTLPSPLREIDPDQPKRLHTFGNPFKQDKKGMMIDEADEFVAGPQNKVKRPGEPNSPLSSKRRRNATVIHDCHEEGMENGQTAPDGFLSKSVPPKLVNMAGDDIPANRVDSPSDDFACFRKDGLIHKPGSNALGGGTVNCSLSIDGPKVTTTSTLGTVANTLQITPAMAQGINADIKHQLMKEVRKFGRKYERIFILLEEVQGPLEVKKQFVEFTIKEAARFKRRVLIQYLENVLEKINSHHLLNKVNHINHRSSCYRKDQ	13677	1352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_2360_2959_3054_4076_4452_7023_7127_10149_10293_11287_11412_12445
641797	contig_14925_pilon	-	972	5	Intergenic	novelGene_55102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1828.13038033396	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57700	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611_29828_57634
641798	contig_18869_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_56202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73739	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
641811	contig_6589_pilon	+	944	4	Intergenic	novelGene_26143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	6574.93274997294	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	455	820	1886541	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGLLGSPVQQLPIPSIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885098	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886783_1887705
641812	contig_8978_pilon	-	1503	8	Intergenic	novelGene_49329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	878.855494146698	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	205	531	193675	192962	TRUE	40	GTGAAGCAAAAGAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGQGNDHTRTHISSNPLGSGKFNTSPPE	194079	190425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193045_193215_193398_193613_193768_193967
641814	contig_7342_pilon	-	1831	10	Intergenic	novelGene_71211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	575.627987720293	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	714	1271	694929	680488	FALSE	35	CATAACCCTTTACTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGEDDSDTKRLSKEEKGRSSCGRNFWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGRMISVEKAKNEPAGKKTSDKRESEGKKDKSSNSDRSAHLKRDDKADRKDDAKKGEDGSGEKGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSGSKERV	700648	679927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_680494_690313_690403_690645_690726_691085_691169_691266_691417_693321_693417_694223_694274_694924_695474_698774_698848_700552
641815	SIRV7	+	264	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTATTATCCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	78949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56096_70881_70987_78841
641822	contig_9843_pilon	-	2258	9	Intergenic	novelGene_114340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	24.4425346476179	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	227	1366	302693	259346	FALSE	35	TTTAATAAACAGTGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQDQK	303965	258453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_259358_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_303747
641828	contig_5954_pilon	-	1915	13	Intergenic	novelGene_28701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	205.779345146419	203	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	74	1144	975610	963701	TRUE	5	TTGTTATGGTTTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRRVRLGTRSGRVRFNGVPGRAMEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEENIIQKPSNGIHEMPNCTATELLVTPNSLSFSWHSRTVRSVSS	975683	962086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967093_968053_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
641832	contig_9848_pilon	-	1729	2	Intergenic	novelGene_79979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGCTTGTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130513	128383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_128683_129083
641836	contig_14811_pilon	-	1319	4	Intergenic	novelGene_74482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	288.74941077381	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386596	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375370_375519_375695_375765_386528
641843	contig_10434_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_82056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1555	1866	164457	164768	NA	45	GGAAGAGGGAAAAAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPSFHSSEHDLRSSSLKLLSVKLIHSSKCYFTETILQIEPVISTLLNTRTFLMMADLELELQCMWVYVYSSHVHVCYWFDYITRVNIYSIFIKLATGIRYV	162902	164792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_162900_164800
641849	contig_11248_pilon	-	1612	12	Intergenic	novelGene_142546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_11	269.066491521156	2546	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	220	1425	294216	257261	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAGEVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQKEIEEREKRRKDRHEASGFSRRPDPDSDEDEDYERERRKRSMGGAAIAPPTSLVEKDKELPRDFPYEEDSRPRSQSSKAAIPPPVYDEQDRPRSPTGPSNSFLANMGGTVAHKIMQKYGFREGQGLGKHEQGLSTALSVEKTSKRGGKIIVGDATEKDASKKSDSNPLTEILKCPTKVVLLRNMVGAGEVDEDLEVETKEECEKYGKVGKCVIFEIPGAPDDEAVRIFLEFERVESAIKAVVDLNGRYFGGRVVKACFYNLDKFRVLDLAEQV	302264	257073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_257365_257495_257569_273164_273264_273955_274030_275172_275325_279315_279458_281127_281185_283154_283253_285271_285439_290108_290226_294093_294235_302063
641854	contig_17518_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_117362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAGTGAATTCTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122651	120185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_120200_122700
641855	contig_14322_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_116556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
641868	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
641869	contig_3004_pilon	-	3083	16	Intergenic	novelGene_127500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	44.9628982853888	136	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2613	405	3017	304682	287258	FALSE	10	CATATGTCTTTTTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVTDSGRTQEPFPTRSNNSIPSNLPEIPGTHDRLLSLSQSVLPQQDNLDLQELLDLQRKAVCSSEKTQEKLLLNKQSKLSRSESSEHTVFSVSVPKESKHSFIPLPFAETKPRRICECYSSNSEHKVPSSDFMIPKLQDILSFSQPVLAYQDNSGLQKQLDLQKEALRYSQKAQEELLVQRQAALQQQIQKHQETLKDFFKDSQASKPTFENDLKTQKMEQLREWFPHIQDLVTDDQEDINHVDRNNSDDNQLLSQDLTTKQRGEHLDKELSRRFSKPPLAKVKCGLDLNQHELSAIQEVESPGSGRASILGKTDFSQDRDPVRVSVSREQSLLGSSLDHNSFGHHQPVTQKNVYGDNYDETVKVEETVADCHAALSDAVEERERTYLESIVKPDNKAETQEISHEPLSSITVSTGSLLSYENTDLSLTDPEELTSGQMHIQQIIDKYINEANLMPGKTNFMVPSVDLDLSELEQTFPNLHRQLFKPLEPHPDFDLLSSFSGISQDSRDFYKGSESSSESQHATGSSKSTVSFSTPRNLHFSLNVSLDPQLDPNSAHVAAQSCVTENVIEGSEQSFQQLLPEFSSQEGSQHVDLPSIFSIEERDSSQGLENQNYPSEEVLQIKKEGVPFPVSLENLLSSSDEVNVFNQLNVQHNTPCGSTSSECSIKDQPEDRKRRLSFKELSERRLGVMLDDQGLTEDDKNEAGGVLDIRPHAEEIDSQLHVRTVEMGTSLHTPHSLTIRNEKYFENSTKRETPEILKNLSQSAQSELFLSSGTFSVQNCIPVWETESGHGIMEEPELTLVSTSDISIAETDFENLTLEERSETEAKSCFQVSEFLPLVPETETSACPSVSEHSGEELVTQPAETLPKFIAIPETAIPESLQEAFLKRKKTFIERSTQRQKEVRNRVHVTENSQVKAAEKPTGSSVSHLKGVSKVRVSLPEDRRTAQALMCQRALRSYNQLAEVKQQKEEKARKAAYAQNRARAKEFHQKTLEKLRAKTTG	305086	287191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_287297_287378_287479_287553_287654_287741_287919_288082_288180_289880_290022_290784_291429_292146_292322_295191_295341_296096_296190_296718_296822_297388_297493_301054_301208_303502_303647_303786_303965_304466
641877	contig_7333_pilon	+	2035	12	Intergenic	novelGene_142768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	111.793714987667	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	122	898	185614	206419	TRUE	5	TATGGCCCTTGCGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRILLEGERPFTTYFLLKRIFISRLIPWHHLFFLLTTISWPGSFLCLLC	170341	218067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_170365_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_203505_203620_206388_206474_212390_212496_214311_214431_217208
641880	contig_3147_pilon	+	1640	12	Intergenic	novelGene_142264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	61.7302851052346	543	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	104	1375	54862	83545	FALSE	20	CTTAAATGTTGATGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFWRPSGGLVLPLLPERPLFPAELPPLLGPPGGNMASALEQFVNSVRQLSAQGQMTQLCELINKSGELLAKNLSHLDTVLGALDVQEHSLGVLAVLFVKFSMPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS	54758	83810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_54917_58006_58137_60341_60455_60549_60600_62108_62202_63668_63849_66431_66573_68233_68408_75870_75958_81622_81737_83158_83240_83491
641884	contig_6233_pilon	-	1594	11	Intergenic	novelGene_74780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	295.837945503953	871	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	411	1298	149777	143464	TRUE	25	AAAGCTTTGGAGTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250350	136678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
641890	contig_10609_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_123905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACCAACTCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188578	186384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_186400_188600
641891	SIRV6	+	253	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	485	142	485	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGAGCTATTGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10722	11188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
641892	contig_233_pilon	-	1961	10	Intergenic	novelGene_14559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1531.57095175082	1	98	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	630	1460	93993	78640	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNVSG	109972	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78964_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99775_99870_101673_101728_109836
641904	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
641905	contig_3975_pilon	-	1287	9	Intergenic	novelGene_54879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_4	80.8639868853868	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	80	721	2097890	2093304	TRUE	25	ATACATGGTTTCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLFTVAKDPIVNVWYSVNGERLGTYMGHTGAVWCVDADWDTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVRELHPGFLLKPQKASRI	2099395	2091889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364
641925	contig_8330_pilon	-	2428	10	Intergenic	novelGene_71843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	272.47661582756	2	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	548	1081	901522	896249	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	916215	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895021_895060_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904402_904827_904897_916051
641945	contig_10475_pilon	-	1446	6	Intergenic	novelGene_148741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_5	137.300546248003	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	94	732	266553	239828	FALSE	45	TATCCATCAAAGTACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTKLYVMASVFVCLLLSGLAVFFLFPRSIDVKYIGVKSAYVSYDVQKRTIYLNITNTLNITNNNYYSVEVENITAQVQFSKTVIGKARLNNLTSIGPLDMKQIDYTVPTIIAEEMSYML	268669	239113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_239882_240127_240269_243988_244149_263189_263254_266333_266556_268578
641951	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	13	357	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASVAGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14421	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14144_14360
641958	contig_10734_pilon	-	1825	3	Intergenic	novelGene_50990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1012	junction_2	53	7	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	78	428	318956	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	319033	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838
641961	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
641966	contig_18168_pilon	-	1241	6	Intergenic	novelGene_122085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	167.4168450306	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	448	888	25980	23837	FALSE	20	TCTTGCTATAAAGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	26788	23483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26104_26464
641992	contig_9833_pilon	+	1534	12	Intergenic	novelGene_68548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	445.807911790354	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	217	894	246680	254740	TRUE	15	TCCATCTTCTACACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230907	260205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246685_249450_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
641993	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91680	4	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
642006	contig_9482_pilon	-	1557	10	Intergenic	novelGene_44301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	154.158248018388	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	29	793	1253164	1240922	TRUE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKGEQLSPADGRDRGERRPHSGRHAAQRCGLRAHQGGGQGGRAAGGHEAHQGRHRGQGFQSPPDAKESGGCQDRDSHLSV	1253192	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1238986_1240902_1240966_1241040_1241234_1242405_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
642012	contig_5419_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_15519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTACAAACCCATTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250211	251804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_250200_251800
642018	contig_8286_pilon	-	2197	3	Intergenic	novelGene_139805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_2	111.5	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	146	478	189870	182745	FALSE	75	AAAAAAAAAGAAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDCKESGVQLLGLPALCRPRSRGGRIPPQSLPKVSHHPFCLSVKGHVKMLRLVLTVTSMIFFILAQAPEPYIVITGFEVTVIFFFIVLYLLRLDRLLKWLFWPLLDIVNSLVTTIFMIIVSVLALIPETTTMTVLGGVSGYLSGFSFRFDQNTNSCEK	190015	181025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_182907_184959_185119_189858
642028	contig_12151_pilon	-	2896	14	Intergenic	novelGene_54972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	203.656137853017	767	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	147	2447	1023567	975052	FALSE	25	TTTTGGCCAAAGCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	1023713	974602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016723_1023563
642046	contig_12644_pilon	+	1224	9	Intergenic	novelGene_44622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5099.89329392047	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	279	1139	2678184	2680545	FALSE	25	AAATATGTGTTGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677343_2678079_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
642065	contig_13780_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_149099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733694	735390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_733700_735400
642069	contig_5013_pilon	-	1391	6	Intergenic	novelGene_110084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	355.808038132924	2299	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	22	336	216357	197341	TRUE	15	TTTGAAATTTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLQKKLAMALRPGEYFWPAFGLRLLLMTMFQAVSAFGAEFSSEACRELGFSSNLLCSSCDLLGQFSLLQLDPDCRGCCQEEAQFETKKSCVVGYCLRRPDYRRRCDRWCPV	216378	173824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933_187998_197290_197413_205757_205926_216282
642071	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642087	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
642088	contig_7202_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_17598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAGAGATACTCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
642092	contig_5253_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_61537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51766	52257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_51800_52300
642096	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	971	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642097	contig_3252_pilon	-	1273	2	Intergenic	novelGene_61522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	512	1123	753059	748870	FALSE	20	GGAGGCATGAGGGCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPPAAFSRPWGRPSSVWSLTWPLVCASQVLFALCSLLRHFPYAQQQFLKLGGLQVLRSLVQEKGTEVLAVRVVTLLYDLITEKMFAEEEAELTRETSPEKLQQYRQVHLLPGLREQGWCAITASLLALPEHDAREKVLQTLGTLLATCQDHYRQDAQLSRTLASLQAEYQALAALELQDGEEEGYFQELLGSINSLLQGLR	753570	748719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_749227_752804
642104	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642108	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642111	contig_7202_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_18613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCTTCACCAATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30089	28584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
642115	contig_6954_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_64448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACACACAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533854	532350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_532400_533900
642116	contig_5403_pilon	-	1774	13	Intergenic	novelGene_87968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	69.8438735084665	60	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	369	1391	433348	424565	FALSE	15	GTTTCAAGACTTCGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	458255	424181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434718_435798_435844_453841_453877_458132
642126	contig_7887_pilon	+	1951	5	Intergenic	novelGene_124925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	106.073088010107	1570	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	86	928	578008	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCPDSDKSWVLAGSEPSCSHPSPQSLPVETLGPESTMDPESDMAPQTPPSLSKADGEELAGTLDGEEGKLRVQEWEDKDGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	575180	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_575232_577973_578059_579911_580066_584577_585122_585612
642127	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642134	contig_7895_pilon	-	2055	9	Intergenic	novelGene_154432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_8	39.1182102734775	266	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	130	1371	455395	426514	FALSE	15	TGGAATTGATTTTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPSVFAEVSQAQPVLVFKLVADFREDPDPRKVNLGVGAYRTDDCQPWVLPVVRKVQQKIANDNSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALKDKRVGAVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFSAAGFKDIRSYHYWDAEKRGLDLQGFLNDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASIMKRRFLFPFFDSAYQGFASGDLERDAWAVRYFVSEGLELFCAQSFSKNFGLYNERVGNLTVVGKETDSVLRVLSQMEKIVRITWSNPPAQGARIVACTLSNPELFKEWTCNVKTMADRILTMRSELRARLEALKTPGTWNHITEQIGMFSFTGLNSKQVEYLVNEKHIYLLPSGRINMCGLTTKNLDYVATSIHEAVTKIQ	455524	425829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_426654_431625_431769_432535_432702_432786_432938_435236_435342_435590_435704_436648_436773_443593_443776_455277
642135	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671656	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
642138	contig_1443_pilon	-	1403	7	Intergenic	novelGene_28293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	524.565110882868	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	223	741	750529	748649	FALSE	55	GAAAAAAAAAGAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809508	747986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766844_808694_808741_809399
642141	contig_14322_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_115849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
642149	contig_14513_pilon	-	1222	3	Intergenic	novelGene_70356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	164	532	18880	11982	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19043	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
642150	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642154	contig_6137_pilon	+	2249	6	Intergenic	novelGene_59311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_2	67.6934265641798	922	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	161	946	1677350	1682139	FALSE	30	GATTAACTTCTCAAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEARLVQGSILKKVLEALKDLINEACWDISSSGVNLQSMDSSHVSLVQLTLRSEGFDTYRCDRNLAMGVNLTSMSKILKCAGNEDIITLRAEDNADTLALVFEAPNQEKVSDYEMKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVISCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTSNVDKEEEAVTIEMNEPVQLTFALRYLNFFTKATPLSPTVTLSMSSDVPLVVEYKIADMGHLKYYLAPKIEDEEGS	1677189	1683442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1677571_1678870_1678969_1679085_1679154_1679889_1680085_1681848_1681973_1682059
642163	contig_16846_pilon	-	1171	5	Intergenic	novelGene_82973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3317.45135608648	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	97	543	555167	551492	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555177_555237_555278_558688
642165	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642168	contig_12864_pilon	-	1332	7	Intergenic	novelGene_76385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	497.622235123079	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	81	713	223293	215462	FALSE	20	TGTATTTGCACTTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKNWATNQKVGDLSPPRAPQKKGLEIHFQKISC	223373	214842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215553_217842_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
642171	SIRV4	+	177	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1582	644	1127	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
642184	SIRV4	+	317	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	656	975	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAGTCAATAACTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
642189	contig_13894_pilon	+	1244	10	Intergenic	novelGene_62109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2192.71354521242	1	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	27	1067	520713	527503	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCASHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKD	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520725_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526925_527495_527580_528072
642191	contig_16122_pilon	+	1543	2	Intergenic	novelGene_134513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	370	1065	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133720	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134161_136976
642202	contig_8712_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_58822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	499	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTCCCAGATTCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320016	321576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_320000_321600
642210	contig_34_pilon	-	607	4	Intergenic	novelGene_40022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	264.778313982765	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	90	605	214146	212208	FALSE	20	TACAAACGGTGCTCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPG	215372	212205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288
642211	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642215	SIRV6	+	1017	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	353	0	180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	144	635	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1483	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
642231	contig_3095_pilon	-	1032	4	Intergenic	novelGene_74973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATCTGAGGATGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152241	147167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150646_151842
642233	contig_10135_pilon	-	3008	7	Intergenic	novelGene_106605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_6	46.5740151682125	2	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	557	1093	88066	86976	TRUE	5	TCTGTTCTTGCTTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQVPQPPPHPDSFL	89555	83785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89080_89502
642234	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642235	contig_14322_pilon	-	169	1	Intergenic	novelGene_115701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671443	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
642236	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	450	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642246	contig_3155_pilon	+	1892	4	Intergenic	novelGene_26394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1141	junction_3	654.274322351786	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	48	554	258156	261211	FALSE	25	CACCTCACTCCAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258108	262549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082
642260	contig_16204_pilon	+	1463	3	Intergenic	novelGene_154534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	34	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	122	364	459566	461345	FALSE	20	ACCCACCCGTGGTACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSGCHAILDTGTSLVTGPPEPIFNIQRIINARQSYGGEYIMDCEAINTLPDIIITINGVDYPLPASAYIRQEHTGICYSNFLATPGNLSREIWILGDVFLRLYFSVFDRENNRIGLAPAA	459353	462444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_459469_459559_459659_461195
642270	contig_500_pilon	+	3158	14	Intergenic	novelGene_30920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	69.520845283944	42	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	38	2557	1063342	1089765	TRUE	35	ATAAAAGGATTTATCGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVHASASAIIQYGKIARKQGLVNVALDILSRIHTIPTVPIVDCFQKIRQQVKCYLQLAGVMGKNECMQGLEVIESTNLKYFTKEMTAEFYALKGMFLAQINKSEEANKAFSAAVQMHDVLVKAWAMWGDYLENIFVKERQLHLGVSAITCYLHACRHQNESKSRKYLAKVLWLLSFDDDKNTLADAVDKYCIGVPPIQWLAWIPQLLTCLVGSEGKLLLNLISQVGRVYPQAVYFPIRTLYLTLKIEQRERYKSDPGPIRATAPMWRCSRIMHMQRELHPTLLSSLEGIVDQMVWFRENWHEEVLRQLQQGLAKCYSVAFEKSGAVSDAKITPHTLNFVKKLVSTFGVGLENVSNVSTMFSSAASESLARRAQATAQDPVFQKLKGQFTTDFDFSVPGSMKLHNLISKLKKWIKILEAKTKQLPKFFLIEEKCRFLSNFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQVLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPALRCRAAGEHGQPAAGLPGPEGGDRHCDAPAQPGAVRGWGEQGEHPGGRGQQPGQPVPHGPRLAPVAVTPCAAHPGM	1063304	1090436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1063552_1064169_1064271_1069626_1069829_1071515_1071681_1073181_1073273_1074629_1074776_1075645_1075908_1079806_1080033_1081309_1081528_1083490_1083676_1086058_1086263_1086347_1086543_1089450_1090051_1090120
642271	contig_1867_pilon	-	2570	12	Intergenic	novelGene_54614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.317571652842	29	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	804	1712	547888	531467	TRUE	25	CCCAGCACTATTCTAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQVRTPGCLLTHLLET	566879	528679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_529173_531101_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885_551129_566772
642277	contig_15063_pilon	+	1036	3	Intergenic	novelGene_14394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	86	907	35271	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35185	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
642282	SIRV7	-	246	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69030	4	35811	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78927	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
642300	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642314	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642316	contig_10235_pilon	-	2230	7	Intergenic	novelGene_46593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	37.6740405761492	271	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	607	1131	588881	587184	FALSE	10	GATCTGGGCTCTTTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLPGRCVPIAKRELLWAGSAGLACWLAGVIFIDRKRTGDAINVMSEVAQTLLTQDVRVWVFPEGTRNHNGSMLPFKRGAFHLAVQAQVPIVPIVMSSYQDFYCKKERRFTSGQCQVRVLPPVPTEGLIPDDVPALADRVRHSMLTVFREISTDGRGGGDYLKKPGGVAEARL	594054	586084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_587369_588247_588321_588449_588546_588710_588887_589221_589357_589564_589774_593797
642320	contig_3602_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_60534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTCCACCCAGAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236927	238192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_236900_238200
642336	contig_8156_pilon	+	1536	7	Intergenic	novelGene_98939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395211	441765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398544_403289_403537_403887_404006_404667_404810_441187_441338_441505
642359	contig_14925_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_55082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
642361	contig_7334_pilon	+	2579	3	Intergenic	novelGene_50572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	239.5	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	279	647	120109	120565	FALSE	20	CAACTGTACTCACTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGTWPSSTLCFPCGPGPSPLVS	116762	122497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097_120413_120500
642367	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
642374	contig_11171_pilon	+	2103	9	Intergenic	novelGene_48555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	154.447756134558	4	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	83	1297	70574	106977	FALSE	35	TTCGGAAGGAGAGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRMKCNLHMNGNVITSDQPILLRDIPSCHQGILSPTLWVAHPSVTRGVFSCFGSRWLREQSSCSRQASG	70491	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93793_104192_104253_106832
642377	contig_18869_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_56321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73734	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
642378	contig_5954_pilon	-	1491	9	Intergenic	novelGene_28642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	474.198797974014	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	421	1131	947127	945083	FALSE	15	ACCATCCGTCCTTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960583	944722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947855_960474
642384	contig_12250_pilon	-	1711	8	Intergenic	novelGene_80639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	178.868438712219	1491	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	721	1449	378386	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAFASLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380553	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379760_380523
642391	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	53	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642407	contig_8878_pilon	-	1558	6	Intergenic	novelGene_147868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_5	317.084468241508	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	844	1230	228839	228170	FALSE	45	TCAAATAACCTAAGCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231711	227841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_231121_231647
642410	contig_8660_pilon	-	917	3	Intergenic	novelGene_136500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	1230	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	20	CTTAGTTTCCTGTCGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
642417	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642420	contig_9848_pilon	+	1343	11	Intergenic	novelGene_79913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_10	117.826312850738	1515	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	20	1078	58813	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQESSGGAEELGAQDPSPAPSKAPSSTGHYELPWVEKYRPVKLNEIVGNEDTVSRLEVFAREGNVPNIIIAGPPGTGKTTSILCLARALLGPALKDAVLELNASNDRGIDVVRNKIKMFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58793	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_75091_75162_77678_77721_78015_78123_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
642421	contig_9258_pilon	+	853	3	Intergenic	novelGene_104616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3170	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96761	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97620_99320
642428	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_96046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642429	contig_11321_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_86658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACCCACAGGGCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178152	179064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_178200_179100
642445	contig_12270_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_113184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	31	381	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14439	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642453	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
642456	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642457	contig_3077_pilon	+	1345	7	Intergenic	novelGene_26704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_4	4366.14820395379	21	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	422	847	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_16328_17449
642465	SIRV5	+	401	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-76	880	38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8239	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
642469	contig_5145_pilon	-	1931	13	Intergenic	novelGene_131426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.292280591796	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	688	1425	925621	916265	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGATPAPRKHLPSSWIEAGVWTRCPPQPPRTSPRAPLCLQHSGW	947080	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915724_915927_916396_916585_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
642492	contig_7151_pilon	-	1457	10	Intergenic	novelGene_40644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	105.870990675759	2	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	225	1352	12708	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	13486	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6148_6347_6390_12491_12807_13360
642497	contig_17968_pilon	-	3172	20	Intergenic	novelGene_154537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	73.3032633724627	765	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	60	1832	112557	12246	TRUE	25	GGGAAAATGTTTTTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYSYFKTIVEAPSFLNGVWMIMNDKLTEYPLVINTLKRFNLYPEVILASWYRMYTKIMDLIGIQTKICWTVTRGEGLSPIESCEGLGDPACFYVAVIFFLNGLMMALFYIYGTYLSGSRLGGLVTVLCFFFNHGECTRVMWTPPLRESFSYPFLVLQMLLVTHILRATKLYRGSLIALCVSNIFFILPWQFAQFVLLTQIASLFAVYVVGYIDVCKLQKIIYMHMISLALCFVLMFGNSMLLTSYYASSLVIIWAVLAVKPHLLKINVSELSLWIIQGCFWLFGTIILKYLTSKIFGIADDAHIGNLLTSKFFSYKDFDTLLYTCAAEFDFMEKETPLRYTKTLLLPVVLVVFIAIVRKIISDMRSALAKQQTHIRKHQFDHGELVYHALQLLAYAALGILIMRLKLFLTPHMCVTASLICSRQLFGWLFCKAHPGAVVFAVLAAMSIQGSANLQTQWNIVGEFSNLPQEELIEWIKYSTKPDAVFAGAMPTMASVKLSALRPVVNHPHYEDAGLRARTKIVYSMYSRKAAEEVKQQLIKLKVNYYILEESWCVRRSKPGCSMPEIWDVEDPANAGKTPLCNLLVKESRPHFTTVFQNSVYKVLEVIKE	112616	9579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_10883_12208_12403_16809_16936_27706_27807_28548_28724_30108_30229_30978_31004_36505_36556_38591_38664_46305_46408_52212_52294_52855_52916_54891_54979_62193_62272_64363_64464_75406_75499_91214_91273_108194_108289_109032_109154_112482
642498	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642505	contig_1076_pilon	-	2865	9	Intergenic	novelGene_101151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	23.4454153300811	202	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	95	1528	1054783	1039797	FALSE	10	TTGGAATTTGTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNSLLYNIGEQLDSDKLASLKFLSLDHIPQRKQEHIKDPLAFFRALQEKRLLEENNQSFLKELLFRIQSLDLLTKYLGISKQEMERELQKPGKAQVSAYRVMLFQIFEDVNKEELKSFKFLLKKEIPKCKLDDDLTLLDIFIEMEKRVILGESNLDTLKRICDQINKSLLLKINDYEDLSREGRASLESSDGFSNGEELFRELAISDSPRELESESQISDKVYRMKSKPRGYCLIFNNYNFSVARKAVDKLCNIKDRNGTELDAEALKKTFSDLHFEVVHFQDLTAKKICEVLESYQNKDHSNNDCFICCILSHGDKGIIYGTDGQEASICELTSYFTGLKCPSLAGKPKIFFIQACQGSNYQKGIAVETDAEQQEACSEMASSQKSYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRSPVEGTWYIQSLCESLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDRKNMGKQMPQPMFTLRKKLYFPLN	1071899	1038459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1039933_1041752_1042252_1043959_1044102_1046009_1046075_1047986_1048029_1048145_1048285_1049024_1049131_1054478_1054815_1071836
642506	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642508	contig_6175_pilon	+	3327	17	Intergenic	novelGene_16317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	188.165776311741	6	113	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	46	2004	1478936	1520939	TRUE	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1478890	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518667_1518761_1520852_1521000_1521789
642512	contig_18342_pilon	-	2225	3	Intergenic	novelGene_154553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTACTTCCCTTTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40194	26121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_-_26308_36933_37095_38316
642514	contig_11285_pilon	+	1973	12	Intergenic	novelGene_5629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	513.647996650245	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	4	1794	766060	769878	FALSE	40	AACTTGTGGCAAAAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGFRTVSSQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766056	770057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767162_767248_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
642533	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_89177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
642538	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
642552	contig_7202_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_18583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGACATCAAGGTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30087	28497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
642555	contig_14575_pilon	+	2073	20	Intergenic	novelGene_101875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	127.072383237734	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	96	641	17236	26356	TRUE	50	AGTTAAAAGCAACAAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17140	59946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27688_27780_28958_29022_30473_30729_32691_32850_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_59252_59376_59882
642556	contig_13807_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_154569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	665	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACACTTTCCCCTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7626	8632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13807_pilon_+_7600_8600
642558	SIRV7	-	346	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33223	0	4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
642559	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
642565	contig_10235_pilon	+	1097	9	Intergenic	novelGene_46539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	54.2700135894584	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	24	869	388599	394171	TRUE	50	AAGAAATCCTGAACATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLVALLCLLPLYPGLAAVTPSCPRNVNISGGTFTLSHGWAPGSLLTYSCPLGRYPSPASLLCKSNRQWQAPGATRLTKAVCKFVRCPAPVSFENGMYTPRLGSHPVGGNLSFECEDGFTLRGSPVRWCLPNGMWDGETAVCDSGDGHCANPGISVGAVRTGSRFGLGDKVKYRCSSNLVLTGSAERECQDNGVWSGTEPICRQPYSYDFPEDVAPALGSSLSHILGATNPTQKKTENVGRKIQIQRSGHLNLYLLLDASQSVTEDNFHTFKSCTKTPRM	388575	395649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_388645_388804_389012_389862_390049_391813_391988_392072_392172_392358_392465_394143_394211_394836_394978_395601
642572	contig_3397_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_154592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATACCACTCTGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190169	192630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_190200_192600
642580	contig_10324_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_7870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1863	2249	499988	499602	NA	15	ACGCTCAGTCTCCCATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSGPQPPQGLPAHPSGTTIGLAHSICSMFSLPRILRLSFFFFCKATSVVLKSSWTSQSSSRNSHRHTTCVTQGEECLVASLIPVPSPPTALSRHLVPSCLGMEAPGVLGRSASGVRSTGLVAQAWA	501850	499549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_499500_501800
642587	contig_16204_pilon	+	2326	5	Intergenic	novelGene_154528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	47.0764006695499	403	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	118	765	454855	461345	FALSE	75	CAAAAAAAAAAGAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPNPTSQGFTQKHRPLPQVTGLPEVVQEFGLSIQEPGQFMDSVPFDGILGLAYPTLGIRGTTPFFDNLWRQGLVSQGLFAFYLTNEEKNSSVVMFGGVDPAYYKGELNWVPVTRPFFWQFTVSSISMNGAVIGCDSGCHAILDTGTSLVTGPPEPIFNIQRIINARQSYGGEYIMDCEAINTLPDIIITINGVDYPLPASAYIRQEHTGICYSNFLATPGNLSREIWILGDVFLRLYFSVFDRENNRIGLAPAA	454737	462906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_454992_457373_457491_459323_459469_459559_459659_461195
642593	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642599	SIRV7	-	209	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69077	0	35858	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78880	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
642605	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
642607	contig_12638_pilon	+	3588	3	Intergenic	novelGene_33176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	157	261	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	947	2844	240	3083	244439	247282	FALSE	15	TTCTTTGTATGTACCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVIRLQGLPIVAGTMDIRHFFSGLTIPDGGVHIVGGELGEAFIVFATDEDARLGMMRTGGTIKGSKVTLLLSSKTEMQNMIELSRRRFETANLDMPPANASRSGPPPSSGMSGRVNLPTTVPNFNNPSPTVVTAATSVHESSKNIQTFSTASIGTAPPNMGGSFGSPTFSSTIPSTASPMNTVPPPPIPPIPAIPSLPPMPSIPPIPVPPPVPTLPPVPPVPPIPPVPSVPPMTTLPPISGMPPLNPPPVAPLPAGMNGSGAPMNLNSNLNPVFLGPLNPVNPIQMNSQNSVKPLAINPDDLYVSVHGMPFSAMENDVRDFFHGLRVDAVHLLKDHVGRNNGNGLVKFLSPQDTFEALKRNRMLMIQRYVEVSPATERQWVAAGGHITFKQSMGPPGQTHPPPQTLPRSKSPSGQKRSRSRSPQEAGFCVYLKGLPFEAENKHVIDFFKKLDIVEDSIYIAYGPNGKATGEGFVEFRNEADYKAALCRHKQYMGNRFIQVHPITKKGMLEKIDMIRKRLQNFSYDQREIMLNPEGDVSSAKVCAHITNIPFSITKLDVLQFLEGIPVDENAVHVLVDNNGQGLGQALVQFKNEDDARKSERLHRKKLNGREAFVHVVTLEDMREIEKNPPAQGKKGLKIPVPGNPPVPGMPGAGMPGAGMPGAGMPGAGMPGAGMPGSGVPGTGMPSTGMPGAGMPGAGMPGAGMPGAGMPGVGMPGAGGEEHAFLTVGSKEANNGPPFNFPGNFGGSNAFGPPLPPPGLGGAFGDARPGMPSVGNSGLPGLGLDVPGFASGPNNLSGPSGFGAGPQNFGNGPGSLGGPPNFGSGPPGLGNAPGHMSGPPAFGPGPGPGPIHIGGPPGFGSSSGKPGPTVIKVQNMPFTVSIDEILDFFYGYQVIPGSVCLKYNEKGMPTGEAMVAFESRDEATAAVIDLNDRPIGSRKVKLILG	235661	247787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416
642609	contig_14322_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_115708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
642617	contig_14855_pilon	+	2147	7	Intergenic	novelGene_146039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	43.831749020798	232	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	302	940	650839	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648609	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_649854_649926_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340
642620	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_55993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73535	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
642627	contig_16846_pilon	-	1087	3	Intergenic	novelGene_82983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3154	junction_2	2957.5	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	18	464	555167	551492	FALSE	15	AGCACTACTTCGGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555184	550868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055
642635	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
642640	contig_6101_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_114276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	42	380	191287	191625	NA	20	ACCCCGAGAGTATGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRKKLDPSLLPYMKMNSKWIKDLNVRTKILRPKRRSNALGPSLDNGFLDMTPKAQAIKDKIHKMDFIKIKNFHASKDFTNNSTRRYIRRRRAIKDSDSYLYTNVHCSIIYNSRKVETTQVSIDT	191245	192354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_191200_192400
642654	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
642663	contig_854_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_36384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGGACAGGCTGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974752	976260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974800_976300
642664	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642671	SIRV7	-	186	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69100	0	35881	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78857	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
642680	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_18109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
642683	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_18244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTCACCCAATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
642699	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642700	contig_5715_pilon	-	2072	12	Intergenic	novelGene_127966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	106.857671617302	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	213	650	659441	630791	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSKDRSEVYQN	659653	563261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_564149_566702_566776_576738_576812_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
642707	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642717	contig_10324_pilon	+	1986	16	Intergenic	novelGene_7712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1235.79862437211	3	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	42	1553	51839	80335	FALSE	10	CCAGGCCTGGCGAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSACVDRPEQAGRRRRLMAS	51797	80768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69067_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73149_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74731_80278
642721	contig_5229_pilon	+	2477	9	Intergenic	novelGene_117698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	61.6948133962653	4	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	38	868	555782	596228	TRUE	35	CAATGCATGAACTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILFFKFDPCPVSKNAYRLVLAANRDEFYHRPSKLASFWGDNNEILSGLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPGIYGLSNALLDTPWRKLSFGKQLFQEVVEQSQALSKDALIAQLLDVLNNEEAQLPDPAIVDQGKEYVQPILSKYAAVCVRCPDYGTRTNTVILVDAEGHVTFTERSMLDKDPTCWETSTYEFKLQS	555744	598103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_555838_565421_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_591290_591445_593087_593193_596107_596272_596537
642722	contig_401_pilon	+	1214	11	Intergenic	novelGene_42834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1494.33885380793	733	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	53	982	1711949	1715475	TRUE	5	TCTCTTATGTTTTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711896	1718329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1712971_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
642745	contig_10732_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_114695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGTCCTTTATTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96554	94297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_94300_96600
642748	contig_6740_pilon	-	922	2	Intergenic	novelGene_142637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGAGTAAGAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12142	10143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_10226_11302
642750	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22083	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642755	contig_7704_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_154598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGACAACGGTCACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127800	127191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_127200_127800
642756	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642773	contig_7202_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_18644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
642776	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	134	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642783	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_96492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642803	contig_6929_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_139358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTCTTACAATCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70466	72078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_70500_72100
642808	contig_7816_pilon	+	1479	6	Intergenic	novelGene_66528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2470	junction_1	508.844730738169	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	704	1372	207600	211658	FALSE	30	TGAATTGTCCCCAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	206896	211765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
642812	contig_11512_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_43256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACTCCCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43478	44071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_43500_44100
642824	contig_15063_pilon	+	1519	4	Intergenic	novelGene_13529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	6	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	202	1377	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
642828	contig_5018_pilon	+	2089	16	Intergenic	novelGene_47202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	561.938509882433	4	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	242	1153	1596083	1600962	TRUE	20	TTTTTAAGGCGTGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLKTVDQYFYGIHNDIQHAGVQYILDSVVSALVAEPTRRFIYVEIAFFAQWWHQQTKAKQEVVRDLVRQGRLEFANGGWVMNDEAATHYGAIIDQMTLGLRFLEDTFGIDGRPLVAWHIDPFGHSREQASLFAQMGFDGFFFGRLDYQDKKIREEMLEMEQVWRASASLKPPAADLFTGVLPNMYSPPENLCWDMMCDDKPVVDDPNSPEYNAKELVNYFLQLAAAQGQHYRTNHTIMTMGSDFQYENANVWFKNLDKLIQLVNTQQASGSRVHVLYSTPACYLRELNKANLTWSVKQDDFFPYADGPHNFWTGYFSSRPALKRYERLSYNFLQVSVPAAGGAGGTCSQPGTLWLRRECAPQRSNGCAPAPRRCQRHFPAACG	1595320	1608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1595356_1595526_1595701_1596050_1596245_1596895_1597029_1597282_1597429_1597973_1598091_1600267_1600351_1600430_1600556_1600631_1600711_1600895_1601006_1601161_1601270_1606329_1606376_1606789_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
642832	contig_11752_pilon	+	2531	2	Intergenic	novelGene_37668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2049	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2064	2402	92915	94417	FALSE	20	AACTTGCTATGCAGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSK	90851	94546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_93060_94223
642840	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642841	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642848	contig_17440_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_7678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3706	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
642853	contig_6477_pilon	+	2142	6	Intergenic	novelGene_154158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	26.5661438677125	215	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	337	837	748456	766085	FALSE	20	ACATGTGGGAGGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGVLSSPDPALPQEESTGEEGMAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDSLFWRAIKPIHDRIPSYVEIHRDAINLKWESLSGSCINVHLLEDCIQGVTTRARYF	748119	767390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_754498_754588_757413_757541_758317_758414_761096_761221_766036
642856	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_91286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657164	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657164	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642863	contig_5643_pilon	+	1486	6	Intergenic	novelGene_38730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	239.857957966793	909	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	936	1286	156118	157107	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152283	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
642867	contig_8538_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_4686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
642878	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
642881	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
642889	SIRV4	+	319	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	643	986	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
642894	contig_6270_pilon	+	1628	9	Intergenic	novelGene_99813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	141.252378298562	853	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	777	1172	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	36322	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
642895	contig_9014_pilon	-	2098	8	Intergenic	novelGene_106723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	74.5268065729317	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	760	1539	43367	41867	FALSE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51574	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43525_44171_44240_44420_45016_51551
642899	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10425	1	1188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11425	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
642903	contig_9633_pilon	+	1543	4	Intergenic	novelGene_139586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	34.9380403953437	401	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	71	544	7299	131868	FALSE	15	GATCTGTGTGTTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCFDAKINFDDNAEFRQKDIFAMDDKSENEPIENEAAKYDLKYIGLDGNIACFVNGAGLAMATCDIISLNGGKPANFLDLGGGVKEAQVYQAFKLLTADPKVEAILVNIFGGIVNCAIIANGIIKACRELELKVPLVVRLEGTNVHEAQNLLNNSGLPITSAIDLEDAARKAVASVAKK	7228	132867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_7393_9721_9865_107131_107253_131752
642909	contig_4103_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_52003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAAGACAGTGTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233072	234176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_233100_234200
642920	contig_8570_pilon	+	2491	22	Intergenic	novelGene_120138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_11	471.136869830179	360	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	85	2355	284365	384590	FALSE	25	ATGTAGTAATTGTACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWRKTDKERQGVAIYNFQGQGVPQLSLQIGDVVRIQETCGDWYRGHLIKHKMLEGIFPKSFIHIKEVTVEKRRNTENIIPAEIPLAQEVTTTLWEWGSIWKHLYVASKKERFLQVQSMMYDLMEWRSQLLSGTLPKDELKELKQKVTSKIDYGNKILELDLIVRDDDGNILDPDNTSVISLFHAHEEATEKITERIKEELSKDQPDYGMYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAVMDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLTQNVGLLGLLKWRMKPQLLQENLEKLKIVDGEEVVKFLQDTLDALFNIMMEHSQSNEYDILVFDALIYIIGLIADRKFQHFNTVLEAYIQQHFSATLAYKKLMTVLKTYLDTSSRGEQCEPILRTLKALEYVFKFIVRSRTLFSQ	284280	384726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594_361731_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530_379715_379853_379952_382407_382498_383493_383595_384451
642926	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
642930	contig_13547_pilon	-	1911	8	Intergenic	novelGene_104886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_7	385.079371622241	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	36	884	223705	101101	FALSE	75	AACAAAAAAAAAAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEEVG	223740	100073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
642932	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
642934	contig_16113_pilon	-	2849	3	Intergenic	novelGene_140551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	19.5	210	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	662	1678	95552	94536	FALSE	20	TCACACTTCGTTGGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLTTAAGNGSVCTRNYKINQVLFPLLYTVLFFIGLITNSLAMRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAELGTGSLRAFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTFKPNNLLGAKVLSAVIWVFMFLISLPNMILTNKKPRENVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIIIVCYTLITKELYRSYIRTRGVGKVPKKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESMLWLTSLNACLDPFIYFFLCKSFKNSLMSMLKCSNSVTSPAQEKRKNGQDGGTPFVETPM	107179	93364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_95576_97682_97850_106708
642937	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
642943	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
642952	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_115856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
642959	contig_13112_pilon	-	2630	17	Intergenic	novelGene_98841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_6	62.8097014301931	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	11	1954	644928	632026	FALSE	15	AATCCCCATTGCCTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLNMEIDNSAACSSAVRKPAISLADSTDLRVLLNIMYLTVETVHQECESDKAEWRTMRQTFRAELGSPLYNNEPFAIMLFGMVTKFCSGHAPHFPMKKVLLLLWKTVLCTLGGFEELQTMKAEKRTILGLPPLPEDSIKVIRNMRAASPPASASDLIEQQQKRGRREHKALIKQDNLDAFNERDPYKADDSREDEEENDDDNSLEGETFPLERDEVMPPPLQHPQTDRLNCPKGLPWAPKVREKDIEMFLESSRSKFIGYTLGSDTNTVVGLPRPIHESIKTLKQHKYTSIAEVQAQMEEEYLRSPLSGGEEEVEQVPAETLYQGLLPSLPQYMIALLKILLAAAPTSKAKTDSINILADVLPEEMPTTVLQSMKLGVDVNRHKEVIVKAISAVLLLLLKHFKLNHIYQFEYMAQHLVFANCIPLILKFFNQNIMSYITAKNSISVLDYPHCVVHELPELTAESLEAGDNNQFCWRNLFSCINLLRILNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMMQLYVLKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQAEECALRANIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREVFSKPISWEELLQ	644938	631349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_632274_633048_633254_633886_633992_634689_634757_635430_635532_635733_635861_637124_637223_637459_637535_638042_638115_639231_639296_639419_639486_640406_640625_640982_641166_642624_642753_642857_642965_644000_644070_644917
642975	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_93576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
642977	SIRV7	-	281	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69005	0	35786	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78952	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
642980	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
642981	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
642984	contig_15087_pilon	-	2498	16	Intergenic	novelGene_37130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	431.741877617737	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	305	1669	66689	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89760	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69166_87560_87712_89687
642991	contig_15744_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_83589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_2	622.415902396103	677	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	324	638	152344	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149505	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152353_152532_152706_153245
642994	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
643000	scaffold_6394_pilon	+	1333	6	Intergenic	novelGene_111020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1163.74292693876	9	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	59	664	402184	405393	TRUE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGASAFWLTAVVSCRGEECHQNLQLLQEVRLQDHRHGRLLPQHG	402125	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405214_405275_405501_405717
643001	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
643005	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_94305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
643013	contig_4315_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_46875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCGTTTCTCAAGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880105	879463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_879500_880100
643014	contig_12277_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_139694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTCTAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251490	251152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_251200_251500
643015	contig_12277_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_139693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTATTTAAAAGATAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250478	249483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_249500_250500
643017	contig_1154_pilon	+	2144	7	Intergenic	novelGene_87084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	271.926103115452	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	485	1786	439267	445998	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	330752	446356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330874_389032_389099_389755_389867_434841_434975_439213_439505_442410_442505_445028
643021	SIRV7	-	280	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69004	2	35785	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78953	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
643028	contig_6434_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_61858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTCTGACCTCCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811641	810179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_810200_811600
643032	contig_2367_pilon	-	1336	3	Intergenic	novelGene_65327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	673.5	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAGAAACATAATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208634	192233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193250_193380_193619_208552
643035	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_18157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643048	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_17697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643051	contig_7202_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_18209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27942	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643052	contig_9471_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_21863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGACCTAGAGACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441220	440649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_440600_441200
643056	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643057	contig_16846_pilon	-	1068	4	Intergenic	novelGene_82953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3812.94558051908	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558745	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552701_555108_555278_558688
643059	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1572	632	1117	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
643069	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1715	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643099	contig_7202_pilon	+	300	2	Intergenic	novelGene_18606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCTGGTAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28550	30013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28628_29790
643104	contig_14322_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_116599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCCGCGGCGGCCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
643112	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643122	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
643123	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_18411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643124	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643126	contig_9319_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_154641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCCCTATTTCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74999	72849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_73977_74763
643132	contig_16103_pilon	-	1702	7	Intergenic	novelGene_118895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	130.701632226482	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	514	894	761606	759680	FALSE	25	CTGTATGATTAATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	765999	758871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761747_762206_762261_762483_762602_763340_763447_765904
643140	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	16	372	14409	13830	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14424	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643145	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
643160	contig_7234_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_145948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATCAGATCCTTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459398	458545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_458500_459400
643168	contig_2596_pilon	+	2680	24	Intergenic	novelGene_53459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	30	junction_3	47.6855246669251	253	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	19	2097	627602	656411	FALSE	15	TCCATGTGTATGAGTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAAVRWFSGRCRPYLPTGRGAAPGGRASSCRFYSGSAAIPEVEGADVTSVEEVIIPRKKTWDKVAVLQALASTVNRDPTAAPYAFQDDPYLIPASVMESRSFLLAKKSGETAAKFVINSHPKYFQRDIAEPHIPCLMPEYFEPQIDDISEAALKERIKLKKVKASVDMFDQLLQAGTAVSLETTNGLLDLLCYYGDQEPPADYHFQQTEKSKELEEATEEENEKSGKSGHQHGSTWRGKNNVERIFALMPEKNARSYCTVIRGMVKHRANEQALNLYTELLNNRLTADVYTFNALIEATALTGNDKFEEKWNKIQELLKHMVAQKVKPNLQTFNTILKCLRRFHIIGRVPALHTLREMKAIGIEPSLATYHYLIQLFYPTESSSKMSSLIIYDIMNELTGKKFSAKDLEDDMFFQSAMRVCSSLRDLELAYQVHDLLNTGDNRTFLGPAQRRHFYYYKFFNLLCLMEQIDVTLKWYKDLIPSVFFPRSQTLIDLLQALDVANRLEMIPQIWKDSKEYGHTFCSDLREEILMLMARDKHPLELQVVFADCAADIKSTYESQDARQTHSDWSARTLNCIAVLFLRAGRTQEAWKMLGLFRKHNKIPRNELVNEFMDSAKASNSPGQAIEVVRLASTFSLLVCEDLTQRVMADFALSQEQKDTLRKLTALTSDSDSSSDSDSSSDTDISEVK	627583	656994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_627703_629245_629299_629409_629447_633487_633534_635397_635467_635920_636026_637149_637274_640892_641009_642805_642874_644570_644659_645004_645066_645334_645421_646135_646281_647122_647174_649069_649160_649452_649482_650907_651015_651657_651737_651829_651921_652861_652948_653620_653770_655372_655415_655821_655981_656314
643170	contig_19352_pilon	-	1637	7	Intergenic	novelGene_122357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	581.975371758405	971	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	210	752	122805	104000	TRUE	45	CAAAAAGGATGTATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123014	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103427_103665_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
643197	contig_17144_pilon	-	2226	6	Intergenic	novelGene_29159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_1	103.137578020816	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1726	2211	162026	157620	FALSE	20	TTTCTTTCTGCCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQKEKLKIKQEWLMNKIVANPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	164563	157604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875
643209	contig_13021_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_8110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGCATCCAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143408	145495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_143400_145500
643210	contig_4156_pilon	-	2758	18	Intergenic	novelGene_88078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_17	90.5227417945729	173	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	210	2435	433791	161269	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKTEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGKSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYEVICQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQEDLLLFSCAGAHPRHQRICPCRDFIKGQVALCKDCL	559001	160945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_161468_169170_169329_182021_182097_187879_187997_196659_196807_209648_209799_272130_272265_299446_299581_305919_306055_310022_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550_433925_534744_534795_558975
643212	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
643215	contig_11512_pilon	+	310	2	Intergenic	novelGene_43208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	30	308	4011	4512	FALSE	25	CACCATCAGCAGCTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	3981	4514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
643221	contig_2069_pilon	-	858	2	Intergenic	novelGene_23517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2176	junction_1	0	11	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	69	350	1509802	1508877	FALSE	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGVWAWGLEAGGSVVEVSRQGQT	1509870	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1509111_1509754
643226	contig_13608_pilon	-	2751	5	Intergenic	novelGene_52393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_1	252.353422802228	156	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	116	2032	470234	450109	FALSE	20	GTTTTCAAGCATGGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGVLFSSSEVSADNVQSHCPSSANHLGSSSTLFDFSGPVVKCGLYHNSPVVPSHGLLHKKKKLDRPKSEKKLESCKLTEELSLADLINDMPRDSFYESYKSQPSVRLSSTDSLESLLSKSLDAELLRPHASECISKGDTQFKGVSDLKSLMIKSTPDKSLFIQNKSLPDFQNIPVQNSLRNLNNPSHLTSSLENMTLDNLNASKKTEFESVPLAEQSTKNSIFKKDNLQFSQCESPSLAELCQEHKENNPNQCFTSSSDLCNPSSASFTDLSLGSFPLSQLANRHQSSTGVSELTGSLSSLAFCKASPTRDLNNLSLSDLIAETIDVDKSQIKNDSYKFSSSEMRTSGIDSNIDLSVLIKTPDFVPKPVVDQSAAPAPGTKVLNSKLGKNSNSAKDNKKNSKGSLTRKPPFSLSWTKALAARPSAFASTLCLRYPPKSCKRHTLDLYKTFLYSRQVQDVKDKEKSPLIAITPFDFKSASPDDIVKANQKKAFTRE	470349	449389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_451593_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
643231	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643232	contig_3627_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_78529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCATCTTGACCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634984	634295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_634300_635000
643240	contig_8259_pilon	-	3019	9	Intergenic	novelGene_148866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_7	35.1559027760631	311	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	40	1170	167682	149797	TRUE	0	TTGGCTGTGGTGGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNKDEAERCISIALKAIQSNQPDRALRFLEKAQRLYPTPRVRTLIESLSQKPQPAGDQPQPTGTTCATRRKASGPEVPSANGEAGGGESTKGYTAEQVAAVKRVKQCKDYYEILGVSRGASEEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATEAFKAIGTAYAVLSNPEKRKQYDQFGDDKSQAARHGHGHGDYHRGFEADISPEDLFNMFFGGGFPSSNVHVYSNGRMRYTYQQRQDRRENQGDGGLGVFVQLMPILILILVSALSQLMVSSPPYSLSPRPSVGHVHRRVTDHLNVIYYVADSFSKEYTGSSLKTVERNVEDDYIANLRNNCWKEKQQKEGLLYRARYFGDTDMYHKAQKMGTPSCNRLSEVQASLHG	167721	146891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_148711_149766_149919_150404_150578_151958_152069_153140_153221_153351_153538_155598_155745_156985_157167_167549
643242	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643243	contig_6710_pilon	-	589	2	Intergenic	novelGene_93003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	657532	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657533	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643246	contig_14815_pilon	+	378	2	Intergenic	novelGene_127210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCTGCCAATTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22441	23303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_+_22769_23252
643254	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643263	contig_9668_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_58208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTTCCTAGAAATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526730	527477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_526700_527500
643268	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
643269	contig_1948_pilon	-	2830	10	Intergenic	novelGene_31134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	10.3183882366612	161	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	373	1515	65876	43620	FALSE	15	TAGATATGGCTTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRVEREGTGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKELRADVDTFLEYWPPQSQQFSMQYISHIFGVINCNGFTLSDQRGLQPVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGNHEAVKSMFHTQMRIELRALGKISEGEELTVSYIDFLNVSEERKKQLKKQYYFDCTCEHCQKGLKDDLFLGVKDDPKPSQEVVKEMTQLSKDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLQKQEPVFSDTNLYVLRMLSIVSEVLSYLQAFEEASHYARRMVDGYMKLYHPNNAQLGMAMMRAGLTNWHAGNIEVGHGMICKAYAILLVTHGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALSNQPMQVMAEPSKEPAPALFHKKQ	103468	42304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_43779_45221_45391_45926_46091_50192_50286_55474_55665_60701_60741_63027_63159_65678_65893_68566_68744_103289
643271	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_93609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643276	contig_4429_pilon	-	2273	4	Intergenic	novelGene_50805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185828	174738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_174937_182069_182220_182827_182910_183985
643286	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_96919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
643298	contig_6137_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_59184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAACAGAGGGTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279281	1279036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1279000_1279300
643301	contig_5965_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_154674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1907	2221	235969	236283	NA	50	TTAAATTAAAAAAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNISHGGKCNQLSFRLALSKQLSECLKRQKRGRPLFWVLDKPGKTGVPDEVRLQKEGKHFPVNTSSRRCRQCSTMKKHRRTKFMCGHCQVPLCITLCFAKFHE	234062	236382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_234100_236400
643313	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
643317	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
643319	contig_7426_pilon	-	1989	7	Intergenic	novelGene_27542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.884748105756	5	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	37	726	1102797	1087185	FALSE	50	AATATATGTCAAAGATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGQCTSNI	1102833	1085921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087197_1090910_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
643323	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_96484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653764	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643328	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643338	contig_14326_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_120777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822007	820093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_820100_822000
643340	scaffold_12124_pilon	+	2592	13	Intergenic	novelGene_22004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	155.238436677977	12	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	208	708	800112	807330	TRUE	35	AGATCCTCCACAAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMMQKGTVHPSTSP	791852	815398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807292_808331_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647_810745_813529_813765_813915_813998_815122
643343	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_18110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
643345	contig_20600_pilon	+	2272	6	Intergenic	novelGene_137115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	57.9599861973759	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	393	893	112379	117548	FALSE	15	TTTTTCTTTGTCTTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMSTALCSRGRVIGLKEEPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111321	118927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111604_112268_112446_114085_114161_114959_115049_116223_116332_117386
643354	contig_9290_pilon	+	2180	2	Intergenic	novelGene_77511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	844	1182	46400	47646	FALSE	55	TGAGCACAGGCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTHQLDLFPECRVTLLLFKDVKNAGDLRRKAMEGAISGSLINPTVIVDPFQILVAANKAVHLYKLGKMKTRTLSTEIIFNLSPNNNVIWNLLTFFLLSKQHSFTQCWVGG	45556	48644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_46541_47448
643358	contig_12503_pilon	+	2557	1	Intergenic	novelGene_143816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1263	1670	74595	75002	NA	65	TTAGGCATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGEGVSRITANAHCLSCLIFKVRSYFSRRRGTGSALSKTSEYTMFLFHILPPPVVSFFLLPGFLFAHMPSTVMAAQILIAISCPTTKLPLSSLSLQAYIMAHLAKCWEENNLKNLILQFAFYKTILANLNELMA	73332	75889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_73300_75900
643359	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_16544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27836	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
643362	SIRV7	-	333	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	12	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114726	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56093_70877_70988_78841_78964_114680
643366	contig_8686_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_154680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64464	64739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8686_pilon_+_64500_64700
643393	contig_12605_pilon	+	845	7	Intergenic	novelGene_64210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2883.50144018614	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	20	388	3897	4829	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3877	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_4955_5007_5072_5728_5787_5907_6005_6124
643407	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643414	SIRV2	-	611	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	38	3083	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
643416	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
643418	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643420	contig_9955_pilon	-	1512	6	Intergenic	novelGene_21283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	726.427147069821	2041	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	229	885	49296	46990	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEKS	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_46924_46999_47590_47737_48794_49380_49692
643426	contig_11115_pilon	+	1911	7	Intergenic	novelGene_102803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	507.49857690003	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	298	1236	165608	172436	TRUE	20	CTTCAAACTCCGGAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTGLEGPGPLGAGGPDAESHGPETQGCVHGHSHGHNARGAGGRPDCLQRDPGRRQPRDPEERDRLPLRGAHAVPEQGQRPGGYHGECDLQGRDPSYS	165310	173317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171330_171787_171981_172339_172593_172714_172964_173047
643430	contig_15376_pilon	-	2214	3	Intergenic	novelGene_154685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	625	930	174793	174488	TRUE	10	CTCCTGGGAAGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVCVRRSFTILTSELSGCTSSKIDLFILLTVHGVFNILCQHYNSKASILLWSFLFIVQLLHTYAAIENIMAWVRCTLVLIVTSLLFSTLKEVFCSRFAQ	175417	162926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_163132_163440_164488_174455
643439	SIRV2	-	636	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	23	2958	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
643440	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_115780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671880	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
643441	contig_16098_pilon	+	1611	10	Intergenic	novelGene_45811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	62.9557947989336	586	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	79	1437	150572	153863	FALSE	10	CTAGCTTGTGTGTCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150493	154037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
643444	contig_7870_pilon	-	3290	1	Intergenic	novelGene_109100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854176	850886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_850900_854200
643448	contig_1618_pilon	-	1639	7	Intergenic	novelGene_141798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	325.73169770363	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	75	1064	353751	317166	FALSE	40	TCAAACTTGATGAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRAEVASGELPDVEKLGRRRGRKMDSVEKGATTSVSNPRGRPSRGRPPKLQRNSRGGQGRGVEKPPHLAALILARGGSKGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEGMKCLMKSA	353825	316590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
643450	contig_7513_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_89021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	983	1333	679419	679069	NA	35	CACTGAAATGCAAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLNRCVFSVDILNVLLSSIKYMRPNGDTCPEAKTRRQEGTGRPEEWTRRTRSEEGKGESAGTVWGLQPMSQNNLCIKFLNLYTIKFLKNTIKNKKVKKKNGNVGSKPRATMGS	680401	677529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_677500_680400
643458	contig_19815_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_154696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCAAAACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47795	45999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_46000_47800
643460	contig_12270_pilon	-	383	2	Intergenic	novelGene_113151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	27	383	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14435	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643464	SIRV5	-	450	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTTCTCCACCTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
643469	contig_10068_pilon	-	2286	7	Intergenic	novelGene_148709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	155.017920111049	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	290	1099	57243	44668	FALSE	15	ACTCTGTGATGTTAGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLEVGTRRHPQLRAGSEVRLCQAWALFKGKFREGIDKPDPPTWKTRLRCALNKSNDFEELVERSQLDISDPYKVYRIVPEGAKKGAKQLTLEDPQMAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61146	43480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_56355_56498_57186_57276_58180_58376_61084
643470	contig_15888_pilon	-	1317	7	Intergenic	novelGene_84414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1427.25408467526	172	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	56	607	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259781	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254230_259708
643471	contig_20844_pilon	-	1232	10	Intergenic	novelGene_78603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_9	262.97209165167	454	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	541	1122	206899	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209188	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208371_208934_208982_209120
643474	contig_14322_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_116140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	249	305	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671357	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
643475	contig_17897_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_153399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	521	886	32489	32854	NA	60	GCCTGGAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQSGASKLEEDSLTTCNMCRHNLVCRKRRGFEALTDKDQRMQPSVWIIPQHKENKNPQTGIISNIMINREKTEVVKDFTFLGSTTIDTHGSSSPEIKQCIVLGKSATKDLFKVLKAKISL	31968	34016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_32000_34000
643483	contig_14209_pilon	+	1920	15	Intergenic	novelGene_88340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	226.330093501703	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	24	842	32366	37768	TRUE	30	AAGCTTGAATTCACTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32342	40996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38286_38394_38557_38710_40142_40344_40418_40731_40901
643491	contig_15304_pilon	-	1086	3	Intergenic	novelGene_30426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	5	GCTGCTTGTCTGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
643492	contig_7457_pilon	+	1966	10	Intergenic	novelGene_31324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	293.141224971476	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	136	1341	281205	290630	FALSE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEVTEVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280811	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283584_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
643493	contig_10196_pilon	-	789	2	Intergenic	novelGene_132030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCTGTCCACGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409414	403566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404262_409320
643495	contig_1225_pilon	+	2139	4	Intergenic	novelGene_44179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300.756084264678	1	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	161	427	253442	274411	TRUE	10	TTTCCACTCTGGCCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSFDPFRLHSLKKKNRGVFAGGQEDSPSQFRAGRIPGQAGDCEGFPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251372	276792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251508_253416_253520_274222_275659_276327
643497	contig_14322_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_116416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
643522	contig_14322_pilon	+	1097	4	Intergenic	novelGene_115685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3043	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	301	624	671571	672388	TRUE	40	GGAGGAAAACAGGGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQASGLLGTRGCPGLTISKPRKLKVRSNAALSSRFLWKQTKTWSTWSCSSANSRTTAKLSLLPLGQGTAWNLDVEAAAAQHSSPGDVFGLGEPGLDVKNSRLVIGR	671270	672935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819_671904_672241_672713_672786
643523	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643525	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
643526	SIRV4	-	304	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTATGTTCGTGAACGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
643528	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	13	354	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14421	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643530	contig_6958_pilon	-	2234	6	Intergenic	novelGene_69935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	550.592916772455	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	172	1206	189807	149618	FALSE	20	GTAAACGGCATCCCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPLRQPWCACLCCRPGLLFNQQHRGGTGTVPQPQREEEAVDDPGQGTAPHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190132	148589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698_189829_189982
643532	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643535	contig_6630_pilon	+	3160	1	Intergenic	novelGene_30706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCACCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367374	370534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_367400_370500
643544	contig_3956_pilon	+	1204	6	Intergenic	novelGene_15278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1380.12092223834	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	169	747	1288971	1290310	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNELHG	1288004	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289884_1290297_1290362_1290605
643549	contig_15905_pilon	+	2239	13	Intergenic	novelGene_154713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGCCGGCGAGAGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269468	294467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_270195_270500_270624_271712_271866_278198_278271_278399_278597_280806_280937_281364_281424_282957_283078_287581_287686_288831_288894_289789_289900_289979_290132_294236
643554	contig_17440_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_7679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTATCATATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3709	3970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
643556	contig_9609_pilon	+	1616	8	Intergenic	novelGene_23115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	820	1248	522699	523127	TRUE	55	AAAGTCAACAACAGCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVHRPEAFSSSSKMVMMGTNFCLLSSVDTKLLSSWMEHGQHGGHTPGPLAGCLPCLGPELAGSSRRHGSTCPSSACPFAQADLQGGQVAGQFFDDGLEGTGLGLGITHEAQVEEQGIAAVLLVLDANGAANQLLLHGCAR	520723	523939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_520925_521008_521148_521423_521545_521630_521730_521960_522081_522171_522309_522696_523297_523740
643558	contig_1596_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_131599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTCTTTCAGCACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128157	127037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_127000_128200
643559	contig_1596_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_131598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127037	126143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_126100_127000
643581	SIRV4	+	211	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1560	632	1105	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2560	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
643593	contig_9014_pilon	-	1489	13	Intergenic	novelGene_106757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	63.9389357121308	952	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	102	995	83127	78618	FALSE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQVPSLEGKGGE	83402	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_83319
643595	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_97680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
643596	contig_20493_pilon	-	1841	12	Intergenic	novelGene_86412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_11	49.4645711762762	445	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	44	1780	54655	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVPPSPTILIHCRNMRGGGPEWGIRHHIWHYMHVCLSKVVCLGIPHPAALSPHPQVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55245	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
643598	contig_9345_pilon	-	1573	5	Intergenic	novelGene_24387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	69	716	144517	142100	TRUE	10	GGAACTGCTTCCCTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144585	141108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141566_141699_142414_142567_142781_142955_143072_144512
643604	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643609	contig_9706_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_20848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAGATCAGTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2300_2700
643623	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
643627	contig_10106_pilon	-	2611	2	Intergenic	novelGene_73891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	559	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165651	162419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_164650_165270
643631	contig_3382_pilon	-	1851	12	Intergenic	novelGene_124029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	313.978969659482	849	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1009	1647	224882	176852	FALSE	10	TTTGGCGTTCATTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEIVGQAFIFLIAGYEIVTNTLSFATYLLAIHPDCQEKLLREVDRFYEKHAVLEYHTLQEGLPYLDMVIAETLRLYPPAFRFTRESAKDCELLGQRIPAGAVLEMAVGALHRDPEYWPQPEAFDPERFTAEARRQRRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLRVLRKFRFQACAETQVPLQLESKSALAPKNGVYIKIVPRQAGRPP	344862	176647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_189061_189154_224729_225047_229630_229804_234086_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
643643	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643650	contig_11003_pilon	+	1915	9	Intergenic	novelGene_105433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_8	155.56344164038	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	114	1418	56015	72538	FALSE	10	CATGCCGCAGCGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW	55901	73035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476
643659	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643662	contig_14341_pilon	+	831	5	Intergenic	novelGene_111838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	2137.68687779572	123	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	78	722	548758	551679	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKVGRVGRVRVLRWGMGGGLWHPELTIYLLPGLI	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481
643665	contig_10235_pilon	-	1849	7	Intergenic	novelGene_46522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.8958825016466	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	149	1399	331785	328214	TRUE	10	AGGCTCTGTGGTTCTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVVSDAETGVVFLFYSLCAHKFGCQVASTMLVWSKDDGLSWSKPQNLSLDIGTEMFAPGPGSGIQKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	331933	327679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_327988_328071_328441_328537_328761_328943_329127_329763_330027_331063_331257_331623
643666	contig_6589_pilon	+	946	4	Intergenic	novelGene_26140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	6574.93274997294	30	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	457	822	1886541	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGLLGSPVQQLPIPSIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885096	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886783_1887705
643667	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643668	contig_6902_pilon	+	2151	9	Intergenic	novelGene_135554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	26.0624250598443	185	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	289	1719	282413	335115	FALSE	10	CCAGCCTTGCCCCCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRVAVIGAGVSGLSSIKCCLDEDLEPICFERSNDIGGLWKFTETSKDGMTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFNHENYGLSITKGKKSKIIVNDELPTCILCGSVTMKTSVKEFTETSALFEDGTVEENIDVVIFTTGYTFSFPFLEEPLKSLCSKKLFLYKKVFPSNLEKATLAIIGLISLKGSILSGTELQARWATRVFKGLCKLPPSQKLMADATKKEQLIKSPVGYKSKFRASAPGKGSLSLLALEDGPCHQSFLGLGASQFRNLRSKGHRSSPVAAFLVV	278401	335547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_282377_282545_283762_283952_284527_284691_294102_294246_295100_295301_297370_297724_298673_298744_334934
643675	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643680	contig_11720_pilon	+	1613	5	Intergenic	novelGene_44008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	468.06009229585	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	681	1094	270457	271811	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWAEGRQEVSPLKSPALPPLTKLPTLPTPQGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGCWLWAPEEEEKEKRWVVQLHSTSPEIPFCPPG	269650	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_269907_270032_270700_271268_271343_271714_271961_272096
643681	contig_13702_pilon	-	1547	7	Intergenic	novelGene_102614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_6	70.9587125650465	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	124	1002	151513	144255	FALSE	15	CACTTTAGTAGTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESARQPARPRFAGPAFQEQIKHCLACPLTESAERSFSGFFRMPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	159856	143709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151585_159804
643701	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
643708	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
643712	contig_3948_pilon	+	1935	3	Intergenic	novelGene_53381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	883	1353	1860968	1861438	FALSE	30	AACTGTGTTGACTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1813330	1862020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813826_1813921_1860434
643716	contig_2069_pilon	+	1677	5	Intergenic	novelGene_23464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	338.893419823991	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	85	1611	1432896	1439381	FALSE	15	TGAGTTGAGGCCTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLHCSPVTVFPAGSGGMKGEPALEPDCCHKPKHLRDTGSSLSPSLDFQFCQGDQVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432811	1439447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1433064_1433701_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
643720	SIRV2	+	367	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	230	-74	-230	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTAGTCGCGAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
643726	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643727	contig_7887_pilon	+	2058	11	Intergenic	novelGene_124893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	93.748013312283	337	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	347	1996	336916	341054	FALSE	15	CCCGTGCTGTCTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKRRCRRVLVGVGRELSPAEEGPKHLSRIDTMAASLTVLLLLQAVSWASGARPCIPQSFGYSSVVCVCNATYCDSLDPLTLPALGNFSLYESTRSGRRMELSTGTVQTSRTGTGLLLTLQPEQKFQKVKGFGGAMTDAAALNILALSPAVQNLLLKSYFSEEGIEYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADITNDFQLHNFSLPEEDTKLKIPLIHRALEMTQRPISLFASPWTSPTWLKTNEAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLRFWAVTAENEPTAGLLSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPILANSTHRDVHLLILDDQRLLLPGWAQVVLADPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPAKATLGETHRLFPTTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGTQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDSPIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASAKNDLDTVALVRPDGSAVVVVLNRSSKDAPLTIADPAVGFLETMVPGYSIHTYLWRRQ	336569	341116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_336982_337150_337239_337503_337696_337808_337956_338262_338397_338619_338793_339030_339269_339579_339805_340204_340369_340720_340838_340948
643730	contig_8538_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_4710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	82	315	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842746	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
643743	contig_8616_pilon	+	1209	6	Intergenic	novelGene_72595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1864	junction_1	624.06377879188	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	256	1134	428707	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	428451	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
643751	contig_16846_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_82902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1696	2079	452320	451937	NA	60	AGACTAAACCAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWPTQHRNLFCTFPLKTLLKMQKKKSPFFCFLQKLYKKACLKSQNYAHTNTDMRACTHKELGSKNLIREQEKAGKRRQIWRFDLLRMLECYSNGMDGVLGTYKKEGGQAERMINSGYQRERFSGHA	454015	451309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_451300_454000
643752	contig_14005_pilon	+	1789	2	Intergenic	novelGene_154720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	155	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTGTTCACAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774	18706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_892_17034
643756	contig_12301_pilon	-	2047	9	Intergenic	novelGene_110018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	298	junction_6	179.243375051911	33	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	120	1172	136698	102891	FALSE	15	TTTGTGTCATTTCAGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRAGAGNWDERVTFSSFGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136817	102015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
643760	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643782	contig_14666_pilon	+	2580	14	Intergenic	novelGene_39514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_10	84.5523541465049	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1497	2168	446586	448893	FALSE	15	AAGTCTTTTTGCTGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFQNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429334	449305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440707_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
643784	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
643789	contig_14322_pilon	-	243	2	Intergenic	novelGene_116533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTCCAGGGCCTCGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674880	672900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
643791	contig_3602_pilon	+	1377	5	Intergenic	novelGene_60493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	831.231917096547	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	127	417	161745	170172	FALSE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFSEAGILLPLEGPTHSGGTGWTTLRPHWLHF	161618	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168768_170077
643793	contig_11994_pilon	-	2573	22	Intergenic	novelGene_129358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_9	18.8236836394909	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	256	1893	140773	116651	TRUE	45	ATAAACTATTGCAAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIFNFLFSPLPTPALICILTFGVAIFLWLINRPQPVFLRIDLNNQSVGIEGGARKDPCQKNNDLVRYYFSDATTVYEIFQRGLAVSDNGPCLGYRKPNQPYRWLSYKQVSDRAEYLGSYLLHKGYKPPPDQFVGIFSQNRPEWIISELACYTYSMVAVPLYDTLGAEAVIYIVNNADIATVICDTPQKASVLLENMEKGLTPGLKIIIVMDPFEDDLKQRGEKTGVEILSLLDAENIGKENFTKPVPPKPEDLSVICFTSGTTGDPKGVMLTHQNIVANVAGFLYRVEDTFQPTPEDVSISYLPLAHMFERIVQAVIYSCGARVGFFQGDIRLLPDDMKTLKPTMFPAVPRLLNRIYDKVQNEAKTPLKKFLLNLAIACKFSEVKKGIIRKDSFWDKLIFAKIQASLGGNVRIMVTGAAPISSPVLTFLRAAIGCPVYEAYGQTECTAGCTFTLLGDWTSGHVGAPLPCNHVKLEDVADMNYFSVNNEGEICIRGTNVFKGYLKDPEKTKEALDKDGWLHTGDIGRWLPNGTLKIIDRKKEYF	158650	110755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_111015_112085_112233_114754_114827_115519_115622_116550_116696_118876_118994_119286_119376_119660_119734_121917_122014_122541_122677_125143_125279_128208_128287_128628_128703_129474_129527_129612_129646_130052_130232_131220_131321_132540_132643_132743_132809_136986_137096_140617_140806_158427
643796	contig_8538_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_4718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTGTTTCCCAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843117	842749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
643799	contig_18869_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_56201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73738	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
643802	contig_8772_pilon	+	1524	9	Intergenic	novelGene_21107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	64	1464	15355	23105	FALSE	45	CTTAAAGAAACAGCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSQSQSAPSQPPSPLPPSAAMSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15291	23165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
643806	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
643815	contig_8617_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_73404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62338	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
643823	contig_12638_pilon	-	2128	8	Intergenic	novelGene_33244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCGAGGGACGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755923	737573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_737686_739518_739558_745279_745387_746398_746524_750459_750674_751877_752019_753482_754112_755162
643826	contig_16650_pilon	+	2064	4	Intergenic	novelGene_61972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	80	457	244670	254361	FALSE	50	ATGAACTAAGGTGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244590	255968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
643838	contig_13780_pilon	-	1360	8	Intergenic	novelGene_149128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1216.64391181778	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	424	1206	826505	823681	FALSE	15	ATTCTGCGTTTCTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKVSLQMRFRPALGF	827939	823526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827630_827825_827918
643853	contig_11448_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_66343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTTTAAATACCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157558	155401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_155400_157600
643858	contig_7078_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_130196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	211.221447774605	810	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951246	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325_965543_975071_975387_982119
643876	contig_12786_pilon	-	1590	11	Intergenic	novelGene_103429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	786.545109958736	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	604	1539	614067	590909	FALSE	20	ATTGTCCAGAATCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629466	590857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628319_628464_628731_628911_629303
643877	contig_9807_pilon	+	1560	12	Intergenic	novelGene_32889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	646.965516983161	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	739	1509	140826	158956	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPGLAGRAHAGHNLPRRLRQRVDNHLLRPTPSDRPDQGLELHCSRTCSFSRCFCNTPHPCPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	109052	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128636_140298_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151766_158704
643895	contig_10013_pilon	-	1689	11	Intergenic	novelGene_125094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	170.794759872778	1195	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	503	1255	526951	520669	FALSE	20	GATTTGGCCCTGTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERPYIVFESPPRKRCCRQGTWLTLLGLVTASMWAVLLTLLILWHWDTAQNLKQLEGSASQNVSQVSKDLEGHKSDQMAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	528813	520234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714_524778_525330_525385_525686_525801_526929_527050_528409
643896	contig_7594_pilon	+	1388	8	Intergenic	novelGene_55434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_7	987.785029905861	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	39	680	539045	556488	TRUE	25	TGTAATATTATGTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKAPDLALTHLMQFWRLAGVSTNHRTFWSNWELLACFFHLCRALS	539006	557769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_557090
643897	contig_233_pilon	-	1669	9	Intergenic	novelGene_14533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1116.235974156	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	120	1226	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127026	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91640_105503_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
643905	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91675	0	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
643909	contig_11719_pilon	+	2829	1	Intergenic	novelGene_154774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2116	2475	141122	141481	NA	15	ACAGCCCTGTTAGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFSVFSFVSKTTVLGTAWKTELSFLPCLPGPGPFPSIFTVLVRRTSQCCQELRGNRIRSREGRRNLSFPISFSQGRCLGFPHSSLSHGCRLVFTGSSGTVGLWRRQKRKGNWVHPQV	139006	141835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_139000_141800
643911	SIRV6	+	494	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	19	164	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
643918	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
643919	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
643922	contig_7775_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_37453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34256	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_34300_36800
643923	contig_5623_pilon	+	2058	2	Intergenic	novelGene_154874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGTGATAATAAAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276317	278831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_276378_276833
643935	contig_401_pilon	-	1148	5	Intergenic	novelGene_42771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	688.097876395502	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	56	334	1083727	1079710	FALSE	15	TTATGGGTGTGTGTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLCTWSSSSATAPHPLKMYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSFQTTAISRDIDTAANSSPTPFWALPSQKPWDSFA	1086599	1078895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079771_1081664_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
643937	contig_10581_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_41428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	77	454	661227	659037	FALSE	25	AATAGTGTTATTGCCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDTGSDYLTPWQLSQVVDGGGVGIIEESKHTNLTKGDFVTSFCWPWQTKVILDGNVLEKVDPQLVDGHLSYFLGAIGMPGLTSLFGIQEKGHVTPGANQTMVVSGAAGACGSLAGQVNFWRII	661303	658925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_659232_661044
643943	contig_10861_pilon	-	2366	12	Intergenic	novelGene_39249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_11	74.5853551752056	129	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	352	1572	855373	803471	FALSE	45	AAAAAACCCTTTTAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAHSADLRLQQLPPTSSVVSMSEVSFSYKENLIGALLAIFGHLVVSIALNLQKYCHIRLAGSKDSRAYFKTKTWWLGLFLMLLGELGVFASYAFAPLSLIVPLSAVSVIASAIIGIIFIKEKWKPKDFLRRYVLSFVGCGLAVVGTYLLVTFAPNSHEKMTGENITRHLVSWPFLLYMLVVIILFCLLLYFYKEKNANNIIVILLLVALLGSMTVVTVKAVAGMLVLSIQGNLQLDYPIFYVMFVCMVSTAVYQAAFLSQASQMYDSSLIASVGYILSTTVAITAGAIFYLDFIREDVLHICMFALGCLIAFLGVFLITRNRKKAIPFEPYISMDAMPGMQNMHDKGMAVQPDLKASFSYGALENNDSISEIYAPATLPVMQEEHGSRIASGVPYRVLEHTKKE	859974	802676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_803671_808569_808665_814141_814206_816018_816108_818105_818242_821698_821796_825419_825566_829658_829719_832191_832364_834336_834406_855280_855616_859865
643949	contig_1331_pilon	+	1685	2	Intergenic	novelGene_37852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	252	1625	194500	195936	FALSE	25	AGCGAGGTGCTTGTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRSRRRAAAKWATVRANSGRTPADENEDDCELPPSPGDSSYYQDQVDDFHEARSRAALTMGLDIDDEDDEDGESVGDEEDGDDNDGGGSSVESETEASVDPSLSWGQRKKLYYDTDYAPKSRGRQSQQEVEEEEREEEEEAQLIQRRLTQALQEDDFGVTWVEAFAKPVTQVDEAETRVVKDLTKVSVKEKLKMLRKESPELLELIEDLKVRLTEVKDELEPLLQLVEQGIIPPGKGSQYLKTKYNLYLNYCSNISFYLILKARRVPAHGHPVIERLVTYRNLINKLSVVDQRLSSEIRHLLTLKDDTGKKELNLKVKSTKAKPKSVSETSAAASDVTDLSDDSNFDKEAALKYYKEIEDRQKLKRKKEESSTEEQALEDQNAKRAITYQIAKNRGLTPRRKKIDRNPRVKHREKFRRAKIRRRGQVREVHREVQRYSGELSGIRAGVKKSIKLK	194248	195996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_194687_194749
643955	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643957	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
643960	contig_253_pilon	+	1839	11	Intergenic	novelGene_129715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_10	105.208554785245	378	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	718	1512	548329	551297	FALSE	15	GCTAGGTCTGACCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIFLADGKVFTTGFSRMSERQLALWDPGNLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDSSVVYVCGKGDSSIRYFEITDEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKVSRRNVLSDSRPTATPARPGAPTPAATTAMTTASGSLAGAGEARKLEEVMQELRALRALVKEQGERIGRLEEQLGRLENGDA	546202	551624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_546248_546957_547161_547537_547661_547750_547882_548030_548213_548295_548416_548970_549076_549151_549298_549601_549660_550755_551029_551171
643967	contig_116_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_154898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTCAAAGACAAAGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263159	261083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_261100_263200
643974	contig_755_pilon	-	1285	5	Intergenic	novelGene_119766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	223.170898640481	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	53	664	88997	83959	TRUE	35	GAAGTGCCACCTGACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	82754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_82921_83503_84122_85521_85704_87670_87817_88876
643975	contig_6275_pilon	-	2556	10	Intergenic	novelGene_142465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	140.286303371285	77	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	613	2352	182628	142601	FALSE	0	TTGTTGGTTTTTGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLCDICGETVASEPDMKTHLLIVHMENEVICPFCKLSGVNYDEMCFHIETAHFEQNELERNFERINTMQYGTSDSKKDNTLQHRMEVNSNLQSACASNHPKSSAQSLPEDGTLKHKAFCSENLTESRKLLKSREKQFDLTKIKGPIYETMYSPPECPFCGKIEVCSQDMETHVKTKHANLLDTPLEDHDQPLYDCPMCGLICSNYHILQEHVDLHLEESSFGQGMDRVQCSRDLELAHQLQQEEDRKRRSEESRQELEEFQKLQRQYGLDNSGGYKQQQLRNMEIEVNRGRMHPSEFHRRKAEMMESLAVGIDDGKTKSSGIIEALHRYYQNAATDVRHVWLSAGVDHFHSSLGDKGWGCGYRNFQMLLSSLLQNDAYDDCLKGMSVPCIPKIQSMIEDAWKEGFDPQGASQLNNRLQGTKAWIGACEVYTLLTSLRVKCHIVDFHKSTGPLGTHPRLFEWILNYYSSEREGSPKVVCTSKPPVYLQHQGHSRTIVGIEERKNRTLCLLIFDPGCPSREMQKLLKQDIEANSLKQLRKFVGNLKHKQYQIVAVKGVLSQEEKVARRQASQVFTAEKIP	185053	142396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_142649_149840_150062_151081_151234_157915_158082_158370_158560_160689_160859_165857_165980_171255_171367_182066_182643_184455
643979	SIRV7	-	227	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91682	-15	-91676	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGAATGCAAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
643999	SIRV5	-	339	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGACCTGGCTCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10987	8301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
644013	contig_7744_pilon	+	1555	13	Intergenic	novelGene_62568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	233.397059750118	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	88	702	882687	885326	TRUE	25	ACTTTTTGCTAAAAGCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSTPLSPAHPGSNSFTAFVLRGLSDHSSMSEGESQIVLSSGSDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQRNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFHKYWADTKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHSCDPPHHPWEPDL	881561	891214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_881629_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889450_890890
644014	contig_12790_pilon	-	2501	4	Intergenic	novelGene_35258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	213	650	311255	310282	TRUE	65	AAAAAAAAAAAGCTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFLPAKEGSAPQPLVGLYLRPSHSSSGLPSDEEMFTGSLLTEKRPLQKCGQVGRGFTFMMSSGSFPSSSSSVAASEVEGMGDTWKLYRSLVLSGKISTGMRQSGRVLLTAHGESAGGQQKPQVRAVCFLSLQDTQHSPSCSLF	311467	308203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_309754_309871_309922_310030_310492_311027
644017	contig_762_pilon	-	1979	6	Intergenic	novelGene_135946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	41.4892757227696	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGAGATTATTATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266764	255260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_257668_259724_259837_263480_263602_263903_264056_266666
644023	SIRV4	+	320	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	642	986	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
644034	contig_2257_pilon	-	3326	1	Intergenic	novelGene_122494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTTGAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293602	290276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_290300_293600
644036	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644038	contig_10523_pilon	+	2437	7	Intergenic	novelGene_120943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1338	1703	15113	18377	TRUE	25	TCCCCAGATGCCAGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNPSSSSSWASKSYSARAHRTRSCHLKLYWVCMSPVHEGGIHFTAHTQATVPVIYVKAASTALPDENGDAAGTAAVVVAALPRNTVEQAADADGTVGAWEAGDRTACGSLRAGSLLPQLH	13775	39460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_15183_15884_16003_18199_18426_20927_21094_26575_26710_31049_31138_39162
644056	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644063	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644067	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2049	580	31	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
644070	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	8	340	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14416	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644087	contig_10437_pilon	+	2831	5	Intergenic	novelGene_38141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	231.57868533179	1	139	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156673	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161549_161643_161874
644089	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_17808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644098	contig_7744_pilon	+	2151	18	Intergenic	novelGene_62559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	176.090138918173	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	912	1715	887347	890785	FALSE	20	GCTAAAAGCGTCGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879818	891221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
644103	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-35	94	15	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
644127	contig_854_pilon	+	1363	7	Intergenic	novelGene_36287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	29	607	543600	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATPQAPDTMQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543571	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
644129	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644139	contig_10923_pilon	+	1524	10	Intergenic	novelGene_66189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	899.026812657188	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	51	1511	21667	53256	FALSE	25	ATAAAATGTTTTGGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVVLEPPSSMAAERTQSAAFPPGGLQGCLSVVIRK	13828	53269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36682_37383_37540_38578_38742_53155
644141	contig_4125_pilon	-	2702	13	Intergenic	novelGene_25145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	565.83101987745	28	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	109	1131	875313	853458	TRUE	20	GACATGAGGGACCTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	935378	851445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_851762_851836_851940_852023_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177_858245_863756_863920_864951_865016_869024_869132_870351_870391_875256_875360_935316
644145	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	55	TTTGTGGAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644149	contig_8263_pilon	+	1715	4	Intergenic	novelGene_83112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_1	56.6058497173413	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1232	1657	192474	192899	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	187129	192957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_188098_188939_189005_189258_189386_192402
644153	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_114010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644157	contig_987_pilon	+	1859	4	Intergenic	novelGene_72346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.47010170533	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	372	701	1289789	1304347	FALSE	10	GGTGGTGTACTCTGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTVGSKKSRYVLCKLSDYHYHPLEEKCQRRPCLQCLWAVLQAAQY	1286732	1305505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1286970_1289654_1289988_1300073_1300200_1304342
644167	contig_4857_pilon	+	2405	22	Intergenic	novelGene_48662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	117.451355299452	1	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	1053	2144	1084250	1109542	FALSE	20	CAGGAGACCCCTTCGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEESSNGSLSVEFRHLQPKEMKSSAGSKGNEGSHMVTEELHSITFETQICLYGLTIDLETSSLPVVMISNVSQLPNAWASIIWYNVSTNDSQNLVFFNNPPSATLSQLLEVISWQFSSYVGRGLNSDQLNMLAEKLTGLSSYSDGHLTWAKFCKEHLPGKSFTFWIWLEAILDLIKKHILPLWIDGYIMGFVSKEKERLLLKDKMPGTFLLRFSESHLGGITFTWVDHSENGEVRFHSVEPYNKGRLSALPFADILRDYKVIMAENIPENPLKYLYPDIPKDKAFGKHYSSQPCEVSRPTERGDKGYVPSVFIPISTIRSDSTEPHSPSDLLPMSPSVYAVLRENLSPATIETAMKSPYSE	1012048	1109803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039_1077126_1077750_1077903_1079777_1079937_1080626_1080720_1083743_1083804_1084191_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107876_1107986_1109518
644185	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_116076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
644193	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	413	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644196	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1444	632	989	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
644202	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_95854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644210	contig_11656_pilon	-	2049	2	Intergenic	novelGene_53982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	401	1045	224380	223736	FALSE	30	CAATTTTCTCTGTGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKVRMVFASEFIELMI	227390	222731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_224705_227314
644213	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644214	contig_10986_pilon	-	1320	12	Intergenic	novelGene_71470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	168.429007532884	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	61	663	80340	71560	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKRHQAVLCGGGKRRVEV	80400	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71612_72214_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76201_80268
644219	contig_14322_pilon	+	391	2	Intergenic	novelGene_115786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCGAAGCTGAAGCCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671349	671895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671818
644221	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644223	contig_8284_pilon	+	1212	10	Intergenic	novelGene_125698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	429.528940947069	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	105	728	426599	468285	FALSE	30	CACAAGAGGGTAGCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKILKTSLQSSTAPSYQQRD	425050	468769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_468228
644235	contig_9548_pilon	-	1922	6	Intergenic	novelGene_141058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTGTCTTGCCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141965	129837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_130990_132205_132314_137202_137341_137799_137868_139965_140062_141605
644241	contig_9415_pilon	+	1392	7	Intergenic	novelGene_109760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	946	junction_6	526.466444008226	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	188	622	1505573	1517528	FALSE	5	TTTGGTGGTCCTGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMDQTLKALMAAEDKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEEKVAHAKEENLSMHQMLDQTLLELNNM	1503358	1518298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1503499_1505525_1505645_1506854_1506926_1507180_1507257_1508229_1508293_1508784_1508855_1517445
644248	contig_14513_pilon	-	1150	3	Intergenic	novelGene_70248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11523_11569_12153_18725
644249	contig_11386_pilon	+	1397	7	Intergenic	novelGene_82756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	472.177373687285	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	358	1017	17940	31994	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7878	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7944_13554_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990_32293_32374
644250	contig_11386_pilon	+	1587	6	Intergenic	novelGene_82778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	508.637395400692	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	277	981	17940	27749	TRUE	15	CCACTCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	16677	32453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_16859_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
644259	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644262	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644268	contig_14322_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_115704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAAGCCCAGAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671274	671623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671300_671600
644272	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644273	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644280	contig_4891_pilon	+	1223	8	Intergenic	novelGene_124556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	527.822326321335	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	331	882	707907	756631	FALSE	10	TCATGTTGCCGGTCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILAAGGDWARASGARERRVIRSRRAAPAHYTLALLSPACAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700882	756972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_700995_701062_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
644292	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_96797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644295	contig_15991_pilon	-	947	6	Intergenic	novelGene_70879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	18	878	105081	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105098	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
644298	contig_12622_pilon	-	1773	9	Intergenic	novelGene_5979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1672.996222164	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	204	962	1588902	1586655	TRUE	35	CTAACCTTCAGAAGCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1589194	1583557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585821_1586523_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098
644307	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644309	contig_6710_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_90844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGAGGAAGGAAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
644312	contig_12624_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_60995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACACGGAAAAGAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129343	128236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_128200_129300
644313	contig_8020_pilon	+	2370	19	Intergenic	novelGene_114399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	47.0371864972837	229	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	549	1877	173375	202853	FALSE	15	TGCACAGACTTTTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETIQRPLDRLFCSVVTVAEQKYQSTLWDKSKKLAEQAAAIVCLRSQGLPRGSAG	167147	203346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_168035_169128_169206_171004_171097_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_202483_202558_202768
644324	contig_6027_pilon	-	2358	4	Intergenic	novelGene_74443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	39.6176167324027	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	948	1421	263882	263119	FALSE	25	GAGCTAGTTGGTTAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	265900	262181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_263491_263780_263899_264179_264274_265063
644327	contig_9098_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_75821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAGTTACTGTGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315942	314911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_314900_315900
644332	SIRV7	-	261	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91665	0	-91659	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACAAAACCGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
644344	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644347	contig_8303_pilon	-	1459	6	Intergenic	novelGene_154920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	309.212936339992	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	360	746	36230	29167	FALSE	15	TGTCTGATTGCGGTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	51422	28453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36329_40099_40272_51333
644348	contig_11413_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_103137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2074	junction_2	1568.5	33	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	8	451	87465	88388	TRUE	10	CCTACTCAGTGTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGVRSSDPSSLYPIPRLSSEFLALFFGYLRTRSPVCPDFYAALVPSRR	87457	90857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88508_90624
644350	contig_6654_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_85740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCTGTAGATGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445893	445327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_445300_445900
644351	contig_15134_pilon	+	2500	13	Intergenic	novelGene_140222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCACCACCACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189413	221799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_190596_194698_194800_194916_194989_199386_199509_204639_204771_205889_206012_207056_207133_207898_208019_211114_211242_212052_212176_215639_215786_216606_216765_221779
644362	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644365	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644372	SIRV2	-	302	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	346	2969	-346	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTGATAGAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
644382	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644393	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644396	SIRV2	-	605	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4268	34	3093	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
644404	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644407	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1480	632	1025	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2480	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
644410	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644421	contig_12923_pilon	-	2116	15	Intergenic	novelGene_30074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	273.553561520241	10	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	62	1960	93727	45496	FALSE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDSLS	101229	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45506_51265_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
644438	contig_4924_pilon	-	2495	2	Intergenic	novelGene_84754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252595	195412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_197746_252433
644441	contig_14768_pilon	+	3609	23	Intergenic	novelGene_115084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	216.569268212007	33	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1007	3024	374	3397	234497	261435	FALSE	25	CTGAAGCCTATGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPFDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEESGGDVKVESASPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDNKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPYRVAGLQMTLAELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGILEQVEAYQTEAREALASLPSSPGLLQSLLERGQRLGVEVPEDQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKARAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVLPFPFSLPLTVPPRRRKLLCSQFFLF	227710	261647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_227739_231589_231668_233935_234059_234352_234524_235056_235192_235913_236038_236145_236328_237318_237478_239520_239641_239772_239932_240841_241024_241121_241285_248693_248814_248923_249119_254073_254256_254343_254469_254594_254743_255362_255469_256182_256542_257164_257304_257843_258024_258367_258506_261354
644453	contig_15063_pilon	-	1494	4	Intergenic	novelGene_13177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	3	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36777	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35838_36156_36264
644454	contig_13216_pilon	+	1979	7	Intergenic	novelGene_47491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	31	1458	229682	261012	FALSE	50	AAAATATTTTTAAAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229651	261533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
644456	contig_5727_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_7995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGAGTGTCCAGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579810	578372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_578400_579800
644464	contig_19459_pilon	-	870	5	Intergenic	novelGene_59846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6898.34712086888	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	194	535	11335	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	12687	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584
644468	contig_8259_pilon	+	1692	3	Intergenic	novelGene_148853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	108	1019	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAGGAAAAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53096	65302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53172_62754_62830_63760
644469	contig_4555_pilon	-	2496	3	Intergenic	novelGene_149881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	74	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	137	472	45924	41195	FALSE	30	TTTATCAAATTTGTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMALTRLYLDKATLIWNGNVVTGLDALANFFEMLPSSEFQVNMLDCQPVHEQATPSQTTVLVVTSGIVKFDGNKQHYFNQNFLLSAHSTLNNTVWKIASDCFRFQDWASS	46060	39170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4555_pilon_-_41377_42439_42585_45915
644471	contig_7357_pilon	+	3958	2	Intergenic	novelGene_36855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1377	1706	197191	199369	FALSE	60	AAAAAAAAAGTTGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPESFPFLLIRKYPQRVQSQKGRETAQMCFIALKVHSSVLLKENSLLTSLCHVVVLIGIVFISLHIVSVYKRFNSLFQISRLQISADYTVQKPEDYDQESFSSSLFLL	195814	201621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_197441_199289
644476	contig_13055_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_104957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGAGCTCATTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94045	93196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_93200_94000
644478	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_18376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644488	contig_20951_pilon	-	148	1	Intergenic	novelGene_43100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGGCCCCCCTGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28881	28733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
644512	contig_826_pilon	-	2919	1	Intergenic	novelGene_154948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTATACATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378957	376038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_376000_379000
644514	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644525	contig_1275_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_108868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	188	649	747507	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747319	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
644532	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
644546	contig_3602_pilon	-	4196	1	Intergenic	novelGene_60576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAGCAAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643958	639762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_639800_644000
644558	contig_2365_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_103738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTCCTCCAGCATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146449	145032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_145000_146400
644563	contig_13674_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_140305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTTTGCGGTTCTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11038	12644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_11000_12600
644568	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_95092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644575	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
644582	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_115903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671640	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
644585	contig_14513_pilon	-	1247	4	Intergenic	novelGene_70331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	138	554	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19017	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
644587	contig_6710_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_94777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653692	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
644593	contig_6233_pilon	+	1478	10	Intergenic	novelGene_74793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	193	681	136880	145773	TRUE	20	GCACTGACAGCGGCGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGLLHSTVTGSSSLCVSSPSSSPSSRACASPWGVPASEAVSSWGAGGRLLPPLLPLPLALALALSPFFLPSGLAFCSSAICSRRPSKASMLDLICVNSVLMVCSSLLFNLILAELVVMAVERAKSLTGMVVLTRRTKGTVTRGRFTGTALGTGTGDRRPR	136687	250348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_136915_144361_144544_144765_144880_145615_145785_147890_147937_148115_148191_149522_149789_199839_199946_200465_200545_250134
644594	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
644595	contig_18869_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_56183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73694	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
644607	contig_6589_pilon	+	2051	7	Intergenic	novelGene_26177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	54.4071584342436	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	111	854	1901836	1911490	TRUE	20	GAATTGATTGTGTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGNSLRTGCRRNWGLQSREPARTQAGSERGCRLRLRMRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901334	1913574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901431_1901821_1901909_1903195_1903448_1903648_1903925_1911347_1912249_1912478_1912596_1913252
644608	contig_5057_pilon	-	1273	7	Intergenic	novelGene_151514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	509.094184693647	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	151	726	514257	507037	FALSE	10	TACTCTTGTCATTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523571	506489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523436
644618	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
644621	contig_3942_pilon	+	1524	2	Intergenic	novelGene_128786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15141	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTTTGTGGCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793854	795513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_795179_795313
644626	contig_11285_pilon	-	2702	25	Intergenic	novelGene_5735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	144.172200038318	6	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	98	1393	1220424	1200229	TRUE	0	TCTGCCTGGCTCTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGREAKDLDEMDDDDDDDDIGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGGGHE	1229325	1192573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192715_1194283_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228
644627	contig_5331_pilon	+	1882	15	Intergenic	novelGene_112815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	355.307031642626	677	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	15	1532	711291	741440	FALSE	45	CAAATGTTTATAAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	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	711276	741790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_733571_733610_734135_734169_734490_734610_737891_738022_739077_739195_741172_741240_741400
644639	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91677	2	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
644641	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644642	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644645	SIRV4	+	274	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	660	1014	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
644648	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644653	SIRV6	+	724	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-295	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	36	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	12	344	2002	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1990	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11033
644654	contig_6217_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_109581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGCAAAAAAAAAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175895	178613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_175900_178600
644655	contig_16385_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_86196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTGAACATTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7805	8522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_7800_8500
644685	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644689	contig_3463_pilon	-	2158	11	Intergenic	novelGene_61992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_10	149.190515784349	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	10	1107	531116	508757	FALSE	20	CACTGCAGTGTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	531125	507705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072
644697	contig_11978_pilon	-	1846	6	Intergenic	novelGene_62866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.6219475480574	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	76	297	603930	601554	TRUE	25	TTTAAGATTGTTGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQPGSFVGSTYWLKSVFISRCFFPMGVWCRMLENQEQEEVITVRVQDPRVQNEGSWNSYVDYKIFLHVSTSSFSTEKRWFSACTRTSWEVNLLWQLR	604967	598793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600308_601518_601605_602843_602867_603252_603359_603888_603944_604905
644708	contig_10437_pilon	+	1648	9	Intergenic	novelGene_38252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	170.558457720513	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	644	1090	401482	407700	FALSE	45	TTTAATAAATAGCTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396432	408258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397108_397230_398632_398756_398840_398908_398978_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
644709	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1107	0	-1107	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACCGTAACGAGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
644711	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	313	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
644716	contig_2444_pilon	+	1689	10	Intergenic	novelGene_83775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	320.047565909264	3	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	108	1313	235561	243122	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMVLIPRIVLYHLLMNCDRKLKAVFLTINFREVS	234455	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877_242984_243024
644723	contig_9415_pilon	-	2808	14	Intergenic	novelGene_109870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	94.8386983157448	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1194	2177	2033980	2027180	FALSE	5	TCCGAGCCTGGGCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQELETGIVDLLIPSPNATAEVGYNRDRFLFNPSACLDEHLMQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPLVWKQLCCVPLSLEDLEEVDLLYVQTLNSILHIEDSGITEESFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLTFSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREGMSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVEVLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWRTLEEFSNEERVLFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQPVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY	2049552	2026548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2027366_2029894_2030201_2031414_2031568_2032050_2032304_2033088_2033166_2033971_2034007_2034397_2034556_2035744_2035915_2037808_2037948_2044478_2044649_2046276_2046380_2047124_2047248_2048593_2048750_2049404
644724	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91672	11	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
644731	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644732	contig_15118_pilon	+	1680	5	Intergenic	novelGene_74590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	283.659567087028	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	582	1028	377560	378861	TRUE	25	ACACTAAGCCCCTCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	376630	379650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376995_377342_377591_377789_377838_378493_379440_379576
644740	contig_9436_pilon	+	2059	2	Intergenic	novelGene_60891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	968	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	70	477	350979	351386	TRUE	5	CCTCTTGACCCTGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTIEGSLAKPMAFRQCCKACAKEKGQVRGCLWTSQAHAFLKPSSSQLLQTDNTSGKMRTCFQNWHPGRHGVLWPKCCTCLQPSAWRGPLLCLLSGWGWACLPPHLAIVLNLWGRRSSPCLGRGHRTDFRSFTLF	350909	354296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_351531_352858
644741	contig_12270_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_113543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	538	873	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14946	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644749	contig_5502_pilon	+	2038	7	Intergenic	novelGene_154974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	410.624186114533	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	34	720	357713	379535	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVLVPVQQWTPPCCSVYTPAGTRTLCL	357679	381537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_379456_380744_381427
644762	contig_7202_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_16666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGCAGGTTGGTCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
644775	contig_5779_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_106496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCTGCCCTCTCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200222	200675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_200200_200700
644776	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644785	contig_14553_pilon	-	1828	2	Intergenic	novelGene_125005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1261	1587	14363	14037	FALSE	45	TGGGAAGGGGGAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEQSGLLEPFSWRRPLSEFRLQDNWDKLAVSRLREEAVSFLFSWILWPECWTSMSSEPEEWEIESRDSFRCSSAPEVVRGSSSESGQSPERASGVSVHSFKMADL	23652	13795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_14423_22451
644786	contig_15327_pilon	+	2250	9	Intergenic	novelGene_70407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_6	148.005067480813	888	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	54	725	25249	32853	FALSE	5	GTACGCCCCCTGCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSLSRSPAPAYLSSRDMPGTPGAAATQDGEAPGRSPPCSQSYDLTGKVMLLGDSGVGKSCFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADVNSERVIRSEDGETLAREYGVPFMETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRARGQADEPSFQIRDYVESQKKRSSCCSFV	25195	34378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_28869_29900_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31758_32351_32409_32488_32566_32747
644796	contig_7202_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_18622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATATTTTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
644799	contig_8617_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_73435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62537	62034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
644812	contig_2419_pilon	+	3094	1	Intergenic	novelGene_137124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGCCTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119200	122294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_119200_122300
644817	contig_12540_pilon	+	3068	11	Intergenic	novelGene_148130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	160.928431297891	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	171	1604	1290310	1306992	FALSE	20	TAAATTTTCTAGTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATDHNADNTSAVLREWLVAVKSLYHSVEWRPAEEPRLYPDEEGPKHWSDLRYEHVMKLRQAALKSARDMWADYILFVDADNLILNPDMLTLLMAENKTVVAPMLDSRAAYSNFWCGMTSQYKRTPAYIPIRKRDRQGCFPVPMVHSTFLIDLRKVASRSLAFYPPHPDYTWSFDDIIVFAFSCKQAEVQMYVCNKEVYGFLPVPLRAHSTLQDEAESFMHVQLEVMVKHLPAEPSQFISVPDQTPDKMGFDEVFMINLKRRQDRRERMLRALRLQGIACRLVEATDGKAMNTSQVEALGIQMLPGYRDPYHGRPLTKGELGCFLSHYSIWKEVVDRGLQKSLVFEDDLRFEIFFKRRLMNLMRDVEREGLDWDLIYVGRKRMQVEHPEKAVPHVRNLVEADYSYWTLAYVLSLQGAHKLLSARPLNKMLPVDEFLPVMFDKHPVSEYKAHFSPRNLRAFSVEPLLVYPTHYTGDDGYVSDTETSVVWNNEHVKTDWDRAKSQKMREQQALSREAKNSDVLQSPLDSAARDEL	1288219	1308456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1288332_1290251_1290370_1297076_1297212_1298562_1298762_1299817_1299938_1304153_1304231_1304300_1304408_1304836_1304970_1305784_1305913_1306223_1306431_1306724
644819	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
644820	contig_7171_pilon	-	1732	16	Intergenic	novelGene_101398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_15	101.609623341274	595	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	51	1226	1437436	1409817	FALSE	5	CTCAGCTGTCTGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDRAVGDSPEGAGPAPMAEPDPSDPLETQAGKVQEAQDSDSDSDTEEGATGRETEMDFLRNFFSQTLGLGSQKERLLDELTLEGVTRYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYANLEKYHLPYPEAIFEIGYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFIRLLKEKGLLLRCYTQNIDTLERVAGLEPEDLVEAHGTFYTSHCLSPLCRQEYALNWMKEKIFSEVIPKCEKCQSVVKPDIVFFGENLPAHFFSCMQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1437486	1409310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413044_1414806_1414937_1421053_1421123_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
644836	contig_20951_pilon	+	2178	4	Intergenic	novelGene_43131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	3.85861230093008	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCACTTGTTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286853	302751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286955_289624_289758_298111_298155_300850
644848	contig_14322_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_115917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
644858	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_93416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
644874	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
644885	contig_8616_pilon	+	1136	9	Intergenic	novelGene_72560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	937.063623440266	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	756	1061	435878	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425759	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428718_431097_431238_435726_435900_435993_436119_436357
644889	scaffold_19766_pilon	-	1073	4	Intergenic	novelGene_34362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.422337625255	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	6	905	678108	676839	FALSE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGSLGSQGSSSLVVSSSCTCFSRGIGLSLGFCHPTPAPGHKGELSLLARPPGPPSTSPTPPSTLTTSAQQPWRWPTTTSNSPGGHRSPFPPHPRPRHWPPGHPCLRPPTAVSSLLRMYSMLRQEGALLTLAQVAPTSSHSLTLWSPSHGGTLSSIREAPSPPGFPCLPGLWNLPSGGSLVPGLLTFLHIMFYS	678113	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677548_677621_677786
644894	contig_12644_pilon	+	947	8	Intergenic	novelGene_44606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5451.39577708016	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	53	625	2675526	2679523	TRUE	25	ACCATTCTTCGACAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKSFKRNYSA	2675473	2680204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679496_2679665_2679878_2679963_2680107
644916	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644927	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
644929	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644932	contig_366_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_51633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406853	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406000_1406900
644936	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644938	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_95875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
644948	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
644953	contig_5018_pilon	-	1824	9	Intergenic	novelGene_47044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	686.834769067496	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	782	1264	1400899	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402824	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401242_1401348_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
644955	contig_9014_pilon	-	1999	11	Intergenic	novelGene_106732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	82.1023751178978	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	39	869	50592	43394	TRUE	15	CACCTTCGTTCCCATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTMKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDPLFLLPAPPQSNASSALTVPRDLPQSGCCGTTCVIT	51587	41542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43588_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51551
644965	contig_11832_pilon	-	1646	15	Intergenic	novelGene_106940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	744.484563510972	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	63	494	92410	87289	TRUE	10	GGCATGAGTGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPNAQPTPAPDPPAGPAAEEAGPACPPLFFSQYPRICLALSPCSQAQRTRGRPAG	92472	83801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86707_87034_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
644972	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
644973	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
644975	contig_7051_pilon	-	1931	4	Intergenic	novelGene_64298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	197.99158231265	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5	310	231129	216979	TRUE	75	AAAAAAGATAAAAATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLVVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231133	187787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_189291_216860_217052_217573_217734_231056
644977	contig_10581_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_41434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAGATAACCATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731110	730548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_730500_731100
644978	contig_10581_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_41435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTAATGGGTATGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731435	731080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_731100_731400
644987	contig_9313_pilon	-	1841	5	Intergenic	novelGene_86477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGGGATCTGGCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463169	387209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_-_387418_432551_432583_457278_457366_461605_461787_461835
644988	contig_14209_pilon	-	2033	10	Intergenic	novelGene_88350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	787	1155	38017	37176	TRUE	5	GGTGGTAGTGGCGGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCNGREAPRGLRLLLLSEVIIQQGPEIVTAAAEERLVAEEAAISHTEADVRAAVEAIGVGEGKLPQIATELGGAGRSQPAVPGPLAGGSQLGAARWSGPSHKCQVWRPQTRTPSHIWPQGH	40985	34756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_35354_35502_35661_35767_35813_37097_37217_37299_37421_37712_37810_37907_38073_40136_40342_40416_40862_40904
644991	contig_14322_pilon	-	307	2	Intergenic	novelGene_116490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACGCTCACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671841	671378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
645000	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
645002	contig_17493_pilon	+	2006	7	Intergenic	novelGene_122188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_5	446.455453793794	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	136	774	92066	118614	FALSE	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRYSGIVYF	49990	119846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447
645006	contig_12888_pilon	-	1975	2	Intergenic	novelGene_155025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCTAAAATATGGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162134	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12888_pilon_-_159475_160385
645018	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645020	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	234	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645021	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645022	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645023	contig_10003_pilon	-	3073	7	Intergenic	novelGene_88177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_6	1088.05413723562	50	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	235	912	473315	430736	FALSE	50	AATTGGCTTAAGCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQPEPIYSEKTEIQRQTVRAHSVKLFIFSALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLK	548618	428574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195_473334_531527_531657_548531
645034	contig_13760_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_61344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACATCCTCATGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351874	351569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_351600_351900
645045	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
645048	contig_19459_pilon	-	959	6	Intergenic	novelGene_59816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	163	junction_2	9809.56026333495	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	97	621	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19060	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_11329_11426_12584_12704_16203_16265_18988
645053	contig_12638_pilon	+	2031	10	Intergenic	novelGene_33392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	118.592673560479	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	688	1347	1530025	1538931	FALSE	25	AATTTGGTTTATAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515776	1539615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524545_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538811
645055	SIRV2	-	578	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4249	80	3074	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
645057	contig_9937_pilon	+	2461	11	Intergenic	novelGene_129207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	779.971127670762	634	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	166	1368	145019	177905	FALSE	30	AATTTAAATAGTTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGRRLLRLKRGGAEPGPAAPRLHEARVRRSGKSRRAVPPPAASSERSGSGRRRSMSDGFDRAPEQARPLRAPPCSQDKIPQQNSESAMAKPQVVVAPVLMSKLSVNAPEFYPSGYSSNYTESYEDGCEDYPTLSEYVQDFLNHLTEQPGSFETEIEQFADTLNGWVTTDDALQDLVELIYQQATSIPNFSYMGARLCNYLSHHLTINPQSGNFRQLLLKRCQTEYEAKDQAAKGDEATRKRFHAFVLFLGELYLNLEIKGTNGQVTRADILQLGLRELLNALFSNPVDDNLICAVKLLKLTGSVLEDAWKEKGKTDMEEIIQRIENVVLDANCSRDVKQMLLKLVELRSSNWGRVHATSTYREATPENDPNYFMNEPTFYTSDGVPFTAADPDYQEKYQELLEREDFFPDYEENGTDLSGAGDPYLDDIDDEMDPEIEEAYEKFCLESERKRKQ	144853	178998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_145047_145877_146048_155159_155346_158849_158963_162842_162955_164231_164358_167964_168072_168570_168689_169460_169516_175554_175649_177811
645058	contig_15236_pilon	-	1748	3	Intergenic	novelGene_141649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1107	junction_2	328	57	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATCTGATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685429	682867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_683475_684093_684223_684417
645062	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645089	contig_12644_pilon	+	1318	8	Intergenic	novelGene_44656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4948.73651159814	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	816	1238	2679895	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675480	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678292_2679429_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
645098	contig_5210_pilon	-	2037	4	Intergenic	novelGene_65416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	212.594031483065	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTCTCAAATGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444358	430125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_444156
645100	contig_14322_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_116443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671888	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
645111	contig_18637_pilon	-	2091	5	Intergenic	novelGene_81845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGCCAGAGGGGACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154885	141649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_141775_147071_147122_148219_148389_149542_149604_153199
645112	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
645123	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_17781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645135	contig_1706_pilon	+	1158	2	Intergenic	novelGene_155037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	802	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAAATTGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25572	29245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_26270_28784
645143	SIRV4	+	214	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1557	632	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
645159	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_115743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671635	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
645162	contig_3745_pilon	+	2004	5	Intergenic	novelGene_85075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	134.165010341743	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	107	442	364282	370795	TRUE	20	TGTGTAAACTTATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364175	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369268_370637_370912_371191_371378_371554
645173	contig_15304_pilon	-	3147	7	Intergenic	novelGene_30587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	196.364810719459	3	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	1053	2357	66228	60349	FALSE	20	TACGCTTTATTGTCACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSELEVQDLCMEEDESKELDELWTSTFVFITLFLLSVSYSAMVTLFKVQWIFSALLQGKLQDSHEYSNIM	71727	59558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_60421_60504_60639_64561_64892_64988_65310_65396_65721_66104_66402_70848
645174	contig_12019_pilon	-	1493	3	Intergenic	novelGene_87640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTTACCCTGTTTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8433	2055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_2298_5116_6238_8303
645175	contig_4531_pilon	-	3306	8	Intergenic	novelGene_47902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_6	18.7268224093416	8	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	132	1394	369728	345822	FALSE	40	TTCAAAAGGGACTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLAGFKDPALYTSWLEPDNAFNVWKTQRAFNKYEKSAALVSNSQFLVKPLDVIVGKAWNMFASK	370849	343909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_346010_348653_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370754
645182	SIRV2	+	318	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	279	-74	-279	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGACTTTGATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
645193	contig_10258_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_155052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTCATATACCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102340	104249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_102300_104200
645195	contig_9242_pilon	+	2416	5	Intergenic	novelGene_155063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	281	junction_2	81.0262303208041	584	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	16	1200	419007	432735	FALSE	30	CTTAATGAGCTTCAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCRGKMAQDASAMEDGQLSDSDSDMTVAPSDKPVQVPKVLGGDIAMRPFQNTAAACAPVSHYRTVTSLDSSEESFSDSDDDSSVWKRKRQKCFNPLPKSEPFQFGQSSQKSSVAGGKKVNNIWGAVLQEQNQDAVATELGILGMEGTIDKSRQSETYNYLLAKKLKRESQEHTKELDKELDEYMHGGKKMESKEEENGQGHLKRKRPVKDRLGDRLEMNYKGRYEISEEDSQEKVADEISFRLQEPKKDLIARVVRIIGNKKAIELLMETAEVEQNGGLFIMNGSRRRTPGGVFLNLLKNTPSISEEQIKDIFYIENQKEYENKKAARKRRTQVLGKKMKQAIKSLNFQEDDDTSRETFASDTNEALASLDESQEGHGETKLDAEEAIEVDHSHDLDIF	418991	433951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_419103_420466_421081_423518_423640_432052_432137_432465
645199	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
645202	contig_9429_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_155104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75951	75010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_75000_76000
645203	contig_9429_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_155102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTAGTATTATTCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73164	71757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_71800_73200
645215	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_93265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTGGTTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
645216	contig_5280_pilon	+	2092	8	Intergenic	novelGene_52620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	765.375884711531	2	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	732	1175	47432	78235	FALSE	30	TCTCACGTAGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSDLSPTESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGTETFRTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38415	79152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47487_56203_56392_78034
645223	contig_6710_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_97584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
645225	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645234	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645242	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_93572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645246	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
645247	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1114	2	-1114	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACGAGCCACCGTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
645250	contig_9594_pilon	+	1781	11	Intergenic	novelGene_73947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_10	395.189182544259	8	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	98	1351	301335	322451	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301237	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
645259	contig_6825_pilon	+	1717	2	Intergenic	novelGene_155122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCCACATGATTTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40131	42081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_40732_40964
645263	contig_9609_pilon	+	2084	11	Intergenic	novelGene_23158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	117.112595394347	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	161	991	821362	828402	TRUE	5	CCACTGGTTCCTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGKVLECFHRRTGQKCALKLLYDSPKARQEVDHHWQASGGPHIVRILDVYENMHHGKRCLLIVMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAGIMRDIGTAIQFLHSRNIAHRDVKPENLLYTSKETDAVLKLTDFGFAKETTQNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSDDAKQLIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSALATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGGSLASQGCNNQ	796955	829647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_797017_821262_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825638_825715_826058_826184_827134_827221_827502_827584_828249_829353_829504
645265	contig_11855_pilon	+	2666	16	Intergenic	novelGene_66889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	69.2603461986406	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	85	2046	645594	727434	FALSE	35	AAGAACTCTTGATACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRGACPQRGEGAPRARGARTTPTHEALMENTKDLTEHSSRPERKRRDSFGMFDGYDSCSEDTSSSSSSEESEEEVAPLPSNLPIIKNNGQVYTYPDGKSGMATCEMCGMVGVRDAFYSKTKRFCSVSCSRSYSSNSKKASILARLQVTGKPPTKKAKVLQKQPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSMEGFSWGNYINSNSFIAAPVTCFKHAPMGTCWGDISENVRIEVPNTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFENDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDFSQKVSESMQYPFKTCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESEDRTDDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDTPPHLFAKVKEVDQSGEWFKEGMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQSSRESQSGSSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQESNGSANFYIKQEP	645509	728054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_645615_676525_676728_679840_679981_681245_681361_682427_682511_694126_694245_711191_711327_711601_711691_711906_712142_712738_712795_713127_713233_716703_716852_717594_717678_718075_718311_718797_718876_727315
645270	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_17732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645272	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645280	contig_8270_pilon	-	2529	5	Intergenic	novelGene_143802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	67.7878123264057	342	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1873	2361	409593	380364	FALSE	25	TGTTTTCAAATTTTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFKKCLIFFHMPIFVTQLDRRREWEMMCRVQPDVVKDKETERNLQRIATRGVVQLFNAVQKHQKNVDEKVKEAGGSIRKRAKLISTVSKKDFISVLRGTDGSTNEKSSAGKKSKAKQTEVKSEESPGWNIFRDDFMMGASMRDWDKESDGSADSQPGATS	429510	380195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_380496_406158_406361_409438_410032_411730_413006_429351
645286	contig_3077_pilon	+	1816	6	Intergenic	novelGene_26883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	54.6347874526844	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	88	498	1342656	1346705	TRUE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1342178	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611_1347064_1347310
645294	contig_4232_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_63438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAAATTATCTTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529719	528403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_528400_529700
645295	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645302	contig_6062_pilon	-	1469	7	Intergenic	novelGene_5248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_6	61.5710971154486	1962	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	223	1308	597983	541389	FALSE	25	CTGTGTCATAAATTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598205	541227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597863
645306	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645307	contig_10444_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_139458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	758	1306	736216	735668	NA	30	TCCAACAGGGCCAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMEAAAKKSNDVLHWANLLQKTSQVLKSKDVTLRTKVPLTQCMIFSIASYACESLTMNKEDRRRTDASELWCWQRILNIPWTVERMNKSVLEEVQPECSLAVMMARLPLTYFGHVIRREQSLEKDIKLSKVECQRKRGRPSMTWTDTMAATMGSNTATTARMVQDQAMFRSIVHRVTMSQN	736973	735213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_735200_737000
645317	contig_7202_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_18610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAATCTCACGAGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28625_29797
645324	contig_7962_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_149286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111849	114508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_111800_114500
645327	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645338	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645341	contig_14925_pilon	-	1460	4	Intergenic	novelGene_55328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115932	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
645347	contig_12622_pilon	+	2587	19	Intergenic	novelGene_5868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	125.277420546423	9	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	143	2041	1189844	1212133	TRUE	25	CTACGGTTCCCACTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPNPEYYTLRYADGPQLYITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSSMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIMLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSSVTGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1185108	1213462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1185179_1185536_1185588_1189822_1190005_1191869_1191970_1193172_1193325_1195670_1195750_1199073_1199125_1203275_1203399_1203770_1203906_1205405_1205511_1205604_1205714_1206107_1206245_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932_1212407_1213189
645351	contig_11752_pilon	+	1318	7	Intergenic	novelGene_37626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	819.758839876433	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	542	1018	92915	105606	FALSE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVIQHE	84103	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87493_88692_88767_92873_93060_94223_94410_96442_96572_105589
645356	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_93577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645364	contig_998_pilon	-	1546	13	Intergenic	novelGene_153790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	417.160532316064	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	77	1111	365529	330554	FALSE	45	CTAGTCTAGACTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDYNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTGMLHGIGKFIVEIICCRFRLGAYKPVNSITFEDDHTDNHLPLLENNTH	373643	330118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330869_332165_332329_335041_335140_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
645365	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
645368	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
645370	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_16842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645376	contig_4125_pilon	+	1854	5	Intergenic	novelGene_25237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	180.467968071899	622	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	508	741	2794348	2795244	FALSE	5	ATGTGGCTGTTGTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGGGGGRAGAGTPLRQTLWPLSVHDPTRRARVKEYFVFRPGTIEQAVEEIRVVVRPVEDGEIQGVWLLTEVDHWNNEKERLVLITDQSLLICKYDFINLQCQQVVRIALNAVDTISYGEFQFPPKSLNKREGFGLRIQWDKQSRPSFINRWNPWSTNVPYTTFIEHPMADADEKTTSLCQLQSFKALLIQAVKKAQKECPLPGRANAVLILERPLLIETYVGLMSFINNEAKLGYSMTRGRIGF	2792365	2796357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2792489_2792608_2792701_2793073_2793251_2794232_2794387_2795049
645383	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645387	contig_7744_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_62486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	375.338698895929	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTGTTTTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670964	675229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671647_671777_671897_673753_673826_674032_674105_674198_674321_674595_674694_674912
645407	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_93514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645426	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645427	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
645428	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	20	352	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14428	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
645434	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	491	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645440	contig_6364_pilon	-	1928	9	Intergenic	novelGene_51731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_7	948.58654718481	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	124	1152	490750	445006	FALSE	25	CGTGCCATAATGAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSTSAPGVYANGNDNKKFKGDRPPCSPSRVLHLRKIPNDVTEAEVISLGLPFGRVTNLLILKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDVS	521117	444229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_490716_490802_521045
645442	contig_16303_pilon	-	1653	2	Intergenic	novelGene_34119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1105	junction_1	0	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	99	527	45428	40360	FALSE	20	GGCATGGAAGGAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGKSCERAVGSSPHSHPTSWGGRPS	45526	39233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_40731_45370
645443	contig_16303_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_34024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCTGCCCTCTCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25047	24670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_24700_25000
645445	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645447	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645448	contig_12414_pilon	+	1660	2	Intergenic	novelGene_59570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	83	1141	370898	374054	FALSE	40	AGTACATGATAAACTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370815	374573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
645449	contig_5033_pilon	-	1425	12	Intergenic	novelGene_29009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3595.72753589544	8	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	41	1363	566787	531046	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKPGRHVVTSKWT	566827	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531082_534260_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
645457	contig_9029_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_155137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	2168	2536	883767	884135	NA	80	TACCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKQRIHTVKYFSAIRRQEWLLHAAWRNVKHTTLSVRSQTLKKNDLQDSIHVKSRANNCGRASQSTGTSGTVEQELTGKGHRGLLGDSDGLHPKRGFDDRGARICQKSLKGPLEICISLYVS	881599	884137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_881600_884100
645460	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
645461	contig_13037_pilon	+	2870	1	Intergenic	novelGene_155145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41289	44159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_41300_44200
645477	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645481	contig_6710_pilon	-	701	2	Intergenic	novelGene_94523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657335
645498	contig_9132_pilon	-	1635	9	Intergenic	novelGene_121372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	71.5572323388768	554	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	193	1350	137052	97662	FALSE	10	TTTCCTTTCTCCAACTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMALSKTFGQKPVKFQLEDDGEFYMIGSEVGNYLRMFRGSLYKRYPSLWRRLATVEERKKIVASSHGKKTKPNTKDHGYTTLATSVTLLKASEVEEILDGNDEKYKAVSISTEPPTYLREQKAKRNSQWVPTLPNSSHHLDAVPCSTTINRNRMGRDKKRTFPLCFDDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW	137244	97376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786_105954_125469_125598_127955_128094_131337_131468_133154_133294_136959
645506	contig_16310_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_70073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285794	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
645510	contig_1225_pilon	+	2866	4	Intergenic	novelGene_44163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	176	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	209	526	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250605	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275769_275815
645517	contig_14322_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_115834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671877	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
645519	SIRV7	-	397	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33172	0	-47	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114785	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
645520	contig_3747_pilon	+	1286	2	Intergenic	novelGene_24806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGTTGAGTTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200983	205202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201415_204347
645529	contig_5684_pilon	-	1070	4	Intergenic	novelGene_81024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	1086.11724351778	34381	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361736	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_358810_359357_359419_361315
645533	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645539	contig_5684_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_81071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCCCAAGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447175	445663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_445700_447200
645541	contig_18869_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_56222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	73776	73462	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73778	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73800
645543	contig_12873_pilon	+	1795	6	Intergenic	novelGene_27194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1310.88199316338	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	729	1220	17896	19855	FALSE	30	CCAAATTTGTAGTATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16000	20430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16403_17091_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
645553	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645557	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_96597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
645564	contig_6102_pilon	-	1712	10	Intergenic	novelGene_32115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	368.649185842343	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	20	1552	822105	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAEAVAKADKLAEEHS	822124	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816807_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
645575	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645583	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
645589	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645590	contig_11752_pilon	+	1012	7	Intergenic	novelGene_37599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	1480.45327143037	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	107	730	84194	105616	FALSE	45	TGAAATATAAAGATGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84087	105898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
645594	contig_10331_pilon	+	2130	6	Intergenic	novelGene_54122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCGCAGGCGTCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396708	409106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_397797_398048_398117_398573_398646_400195_400803_401970_402064_408904
645603	contig_15063_pilon	+	1228	5	Intergenic	novelGene_14393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	89	973	35271	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35182	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
645607	contig_6589_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_25963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGCAACGTCAACCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296048	1296267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
645611	contig_16303_pilon	-	1584	8	Intergenic	novelGene_34093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	56	1168	47976	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48031	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33221_35428_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
645616	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645618	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645621	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	3	146669	-2	-91635	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCACGAAGTAAGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147920	147672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
645623	contig_9389_pilon	+	1313	6	Intergenic	novelGene_83925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	878.324404761703	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	28	666	159587	167739	FALSE	45	AGGGAAAAAAAGTGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIVASPHIIASSGFWGFVLFFYMLERCQRRVCGRLGGEWPGVWVPPSLGFLPELSHQARGRGKGHISLHWGS	159559	168386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165853_167527
645632	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645636	contig_9177_pilon	-	1240	7	Intergenic	novelGene_32563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	965.840293331264	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	101	589	3704	2469	TRUE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQITW	3804	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2481_2688_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697
645646	contig_11978_pilon	+	1229	5	Intergenic	novelGene_63076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5399	junction_4	2846.77576391257	21	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	819	1145	1830693	1831883	FALSE	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827932	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830785_1831161_1831273_1831759
645661	contig_7839_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_45750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCCCATAAAACCAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091332	1089872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1089900_1091300
645672	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645673	contig_12425_pilon	+	1508	8	Intergenic	novelGene_46635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_1	124.302461925806	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	84	1337	167145	198400	FALSE	30	GAAGGATACATTGCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167061	198571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
645674	contig_8377_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_35093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAATAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143510	142522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_142500_143500
645686	contig_20609_pilon	+	1877	13	Intergenic	novelGene_118472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	73.3727166973907	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	25	1233	43732	58681	FALSE	5	TGCCTGCTACTGCCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRTGADWTMAVNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEEAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKERAMSTTSIPSPQPGRLRSPFLQKQLTQPETPVTREPVPASLRPSTDFLEDPEPIVPQSPVQVEGEAVCKEPLEEENLYEEPPLVQQEDAASEHSICYKQGTGLLGKGLCARALYDYQAADDTEISFDPENLITGIEVIDEGWWRGYGPDGHFGMFPANYVELIE	43707	59325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55765_55825_56053_56103_56493_56588_57337_57434_57554_57668_58017_58124_58541
645687	contig_6418_pilon	+	2692	2	Intergenic	novelGene_81178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGACAATTTCTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104947	1125372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1105674_1123406
645688	contig_15063_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_14435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
645689	contig_8045_pilon	+	1217	4	Intergenic	novelGene_35402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	583.850627776965	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	431	526	118627	118722	FALSE	25	TTGAACACTTGAGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	117246	119413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075_118243_118527
645696	contig_15063_pilon	+	1677	6	Intergenic	novelGene_13603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	202	1440	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
645702	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
645704	contig_10253_pilon	+	1036	8	Intergenic	novelGene_76866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	72.4366014145459	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	96	1034	24178	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHRLLRPQMLLTKGMQRATNVTYQAHHVSRNKDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	16190	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_24152_24223_35540_35598_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
645708	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645714	contig_4103_pilon	+	2197	13	Intergenic	novelGene_51891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	59.6328465603386	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	641	1933	61447	65783	FALSE	15	AGCTTTGCATATTTCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVRGQAGRLREKECIPCWQAHVHSRPEQKPSIHISPTHKGLNGLTHRTGPVNGICSYGHGKVRSLSPCIQCLSGSPKTRCLPWVV	53849	66047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_54615_54777_58096_58213_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381
645729	contig_15720_pilon	-	944	8	Intergenic	novelGene_41883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	36	902	283807	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283842	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
645737	contig_16369_pilon	-	2320	3	Intergenic	novelGene_98697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13	85	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	27	302	16597	13251	TRUE	5	TGTGGAGGCGTTTGTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTPPYQWMSLCSLTPPSTKSTTAWMTSLQVATVFWRDRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKQAFQDRYFMIGGMLLTCVVMVLVVHYLT	16623	11182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_12904_12953_13413_16483
645748	contig_9332_pilon	+	3167	1	Intergenic	novelGene_60738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAGATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572693	575860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_572700_575900
645749	contig_1275_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_108875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	201	434	747735	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747534	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747500_748100
645755	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_17318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645762	contig_720_pilon	-	2100	7	Intergenic	novelGene_155165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_6	108.406257506966	451	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	111	1091	190635	162408	FALSE	15	TGTCCTGCTGTGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKKLGADFHGTFSYLDDVPFKIGDKFKTPAKVGLPIGFSLPDCLQVVREIQYDFSLEKKTIEWAEDIKKIQEAQREAERKAEEAEATKVNSKSGPEGDSKMSFSKTHSTATMPPPINPILASLQHNSILTPTRVSSSATKQKVLSPPHTKADFNPADFECEEDPFDNLELKTIDEKEELRNILVTPPNFSMSQVPNTSSCPQAYSELQTLSPSERQCVETVVNMGYSYECVLRAMKKKGDNIEQILDYLFAHGQLCEKGFDPLLVEEALEMHQCSEEKMMEFLQLMSKFKEMGFELKDIKEVLLLHNNDQDNALEDLMARAGAS	215564	161398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_162549_163166_163269_163993_164177_179820_180217_183857_183983_190601_190643_215461
645767	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645772	contig_9114_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_155176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGATTTGTGTTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14772	14045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_14000_14800
645773	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_91992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657183	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
645774	contig_1516_pilon	+	2275	11	Intergenic	novelGene_49969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1205.75944532896	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	494	1327	353572	360102	TRUE	10	AGCACCTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQLPVRQRLPSTTCNCLRSSAAWRPLPATPQKPPPWAPWRPRSSAAVGP	335180	363729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352949_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356519_359957_360125_362116_362299_362985
645791	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_97749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645794	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645798	contig_7457_pilon	-	1107	3	Intergenic	novelGene_31673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	12	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176113	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967
645800	contig_15732_pilon	+	1979	8	Intergenic	novelGene_88837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	341.335791338939	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	794	1450	97720	185225	FALSE	55	ACACTATTAAACACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSVSFLFVCFTSKIVFIT	11106	185754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_85818_85917_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977
645805	contig_9290_pilon	-	1542	10	Intergenic	novelGene_77536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	344.99726246901	5	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	64	1203	496936	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNIINKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	496999	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486675_491471_491545_496930
645823	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
645832	contig_10482_pilon	+	3108	28	Intergenic	novelGene_152844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_17	207.507475859842	262	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	923	2772	84	2855	157875	214010	FALSE	15	TTCCAGGATTGGCTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRAGRLKRGGSIRTEVGSFLVESAIAMDRSGFGEMLSPVIREAEVTRTARKQSAQKRVLIRASQDENFANTTPRNQVIPRTPSSFRQPFTPPNRSLLKQPDVSCVLGTGGRSPRLTQSSGLLGNLSMVTNLDDSNWATAFSSQRSGLFTEPHNMTEDITLSAVMLREDDPGEAASMSMFSDFLQSFLKHSSTTVFDLVEEYENICGSQVNILSKIVSRATPGLQKFSKTASMLWLLQQEMVTWRLLASLYRDRIQSALEDENMFTVTALNASEKAVVEALFQRDSLVRQSQLVVDWLESIAKDEIGDFSDNIEFYAKSVYWENTLHTLKQRQLTSYIGTVRPLVTELDPDAPIRQKMPLDDLDREDEARLLKYIFTLIRAGMTEEAQRLCKRCGQAWRAATLEGWKLYHDPNVNGGMELEPIEGNPYRCIWKISCWRMAEDELFNRYERAIYAALSGNLKQLLPVCDTWEDTVWAYFRVMVDSLVEQEIRTSVMTLDETEELPREYLETNWTLEKVFEELQATDKKRVLEENQEHYHIVQKFLILGDIDGLMDEFSKWFSKGRNSLPAHLLRFMTHLILFFQTLGLQTKEEVSIEVLKTYIQLLINEKHTNLIAFYTCHLPQDLAVAQYALFLEGVTEFEQRHHCLELAKEADLDVATITKTVVENIRKKDDGEFSHHDLAPALDTGTTEEDRLKIDVIDWLVFDPAQRAEALKQGNAIMRKFLASKKHEAAKEVFVKIPQDSIAEIYNQWEEQGMESPLPAEDDNAIREHLCIRAYLEAHETFNEWFKHMNSSPQKPTLTPQATFTEKVAHEHKEKKYEMDYGIWKGHLDALTADVKEKMYNVLLFVDGGWMVDVREDAEEDHERAHQMILLRKLCLPMLCFLLHTILHSTGQYQECLQLADMVSSERHKLYLVFSKEELRKLLQKLRESSLMLLDQGLDPLGYEIQS	157791	214263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_157883_160180_160273_160903_160991_162002_162119_165592_165732_173062_173167_176056_176185_177914_177964_182397_182470_182804_182894_193384_193464_195065_195180_195885_195977_196129_196207_197991_198052_198848_198995_199109_199159_201555_201626_201931_202051_202924_202964_203274_203426_203733_203847_204478_204582_205057_205219_207119_207246_207613_207728_213392_213561_213902
645835	contig_11171_pilon	+	1344	6	Intergenic	novelGene_48589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1142	junction_1	80.9775277469003	3943	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	116	859	212165	251467	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFQEQKRKEGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212049	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
645837	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645838	contig_10734_pilon	+	1868	3	Intergenic	novelGene_51273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	155	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	52	405	1331053	1333513	FALSE	30	CTTAAATTCATATTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCFRVFLLLTTLSFHQQMIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1331001	1334976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1331056_1332594_1332720_1333287
645844	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645852	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645860	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645866	contig_13744_pilon	-	1762	15	Intergenic	novelGene_77206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	70.1747454427815	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	8	1411	1197382	1050039	FALSE	5	GCCCTCGGGGCACGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGPSFWLGNETLRVPLALFGLNRRRLCERLRKNSAVQESFFHWAFGVTEPGCYGVIDVDTGKSTLFVLRLPASYATWMGKIHSKEHFKEKYAVDDVWYTDEIATVLTSQSPSVLLTLRGVNTDSSSVCREASFEGISKFNVNNTILHPEIVECRVFKTDMELEVLRYTNKISSEAHQEVMKAVKVGMKEYEMESLFEHYCYSRGGMRHSSYTCICGSGENSGVLHYGHAGAPNDRTIQDGDMCLFDMGGEYYCFASDITCSFPANGKFTADQKAIYEAVLRSCRAVMSAMKPGVWWPDMHRLADRIHLEELARIGILSGSVDAMAQVHLGAVFMPHGLGHFLGIDVHDVGGYPKGVDRIDEPGLRSLRTARHLEPGMVLTVEPGIYFIDHLLDEALADPARACFFNREVLQRFRGFGGVRIEEDVVVTGSGMELLTCVPRTVEEIEACMAGRDKAFTPFSGPK	1197389	1049687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1050177_1050622_1050815_1054042_1054228_1064637_1064787_1075193_1075272_1076753_1076823_1129486_1129534_1130576_1130653_1145459_1145505_1165457_1165520_1167403_1167452_1173954_1174019_1185394_1185523_1187661_1187768_1197365
645884	contig_8773_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_74508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGAGTATGGTCTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15641	15982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_15600_16000
645891	SIRV5	-	399	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATACCCGTCATACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8586	8114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453
645892	contig_18299_pilon	+	2489	1	Intergenic	novelGene_135349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	419	835	63480	63896	NA	35	AACTCCATACAATGCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVWVVSVLVPAALLVVRSLQDLARIAIRSTIKKIIPQETASKNENGLKNTPRLKQRRIRRRRMQTVVFLDKEVFASRVSNPSDDNACEDCDEEQQEDEGKAPSEVKPHAPVNFLREKVLSLPLPDPLKYYLLYYREK	63061	65550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_63100_65600
645894	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645896	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
645904	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_96088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
645909	contig_15304_pilon	-	764	2	Intergenic	novelGene_30434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	189	383	54100	53260	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRAISRLQGTASHPRSTCCHHRRRSWR	54288	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53334_53979
645916	contig_13664_pilon	+	2177	2	Intergenic	novelGene_144193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	276	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	146	568	16659	35042	FALSE	40	TACAAAGTGTCATCATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRVGDNLAEDERYTILEEEFFSFQKSWLFGDLSLVATFQSSLFTSSEMFLTISRKNMSQKLSFLLLVFGLIWGLMLLHYTFQQPRHQSSVKLREQILDLSKRYVKALAEENKNTVDVENGASMAGYADLKRTIAVLLDDILQRLVKLENKVNYIVVNGSAANTTNGTSGNLVPVTTNKRINASGTIR	16513	36651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_16897_34857
645923	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645932	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
645936	contig_11720_pilon	+	1484	12	Intergenic	novelGene_43949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	330.429872781573	3	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	13	1194	262271	272176	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARLPEAAVVSLCPRPPHPLLRHPAHRASGRLQGSEGSVRPQRPAQRAAEPAASLCCAAHPHVHQHACLHARVCQWLAEQGHHFLHHGANLCHQSLLRGQLPAQSPPPCLLWSCSPAGRSLPGTYHLPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266467_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
645942	contig_3132_pilon	-	2038	4	Intergenic	novelGene_127437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	54.9929288383718	390	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	28	402	246078	239785	FALSE	10	CACGCCGTTCTGTGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTPDSQARFGQSVKGLLTEKVNTCGTDVIALTKQVLKGSRSSELLGQAARNMVLQEDAILHSEDVRNNFFCDLGFIYIVWLQRSGMFCYFFLLFFLNAEFKENGNNNNASSIPARSYSEEC	246105	238148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_239791_240290_240312_241484_241695_245940
645946	contig_10300_pilon	+	1362	4	Intergenic	novelGene_152923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	42.6640624205223	186	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	18	404	56973	177331	TRUE	5	TATTTGGGTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKEAMQDAVLKAIEEERKNLEKAHAEERELWKTEHAKDQEKVSQEIQKAIQEQRKVSQETVKAAIIEEQKRSEKAVEEAVKRTRDELIEYVKEQKRLDQVIRQRSLSSLELFLSCAQKQLSALIATEPVDIE	56955	178351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_57135_112044_112159_177220_177596_177657
645952	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
645961	contig_9345_pilon	+	2338	2	Intergenic	novelGene_24700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	176	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954430	958313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_955781_957325
645968	contig_9177_pilon	-	2301	2	Intergenic	novelGene_32761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1840	2265	1310223	1309798	FALSE	80	AAAAAAAAAAAACCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNNNWNRKNYRLKPWNGRLGRGVVSSFRSLMWEIGLLAGLWSVTYVQSSVVGHHLCVGHLCFQVCSKSNEARDLVAMQHVRCPCFLRERFDFQQGFDPYFFPFQSTQILKIRVCSSFPSSTMTEPGRSGLKPREILENKQ	1312141	1309761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1311198_1311276
645972	contig_11656_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_53949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGATTTATTTTACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119592	118093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_118100_119600
645973	contig_9982_pilon	-	1535	12	Intergenic	novelGene_55767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	243.267835254523	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	105	1157	353538	343153	TRUE	30	AATGTGTTGTTACTATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMEQQKLSWPNRSHHMERHVLDLNSTLLRSLLRHLKLFRGHWQKILVLRPVK	353642	339730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343383_345172_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
645978	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
645980	contig_1143_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_86614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAAATCAATCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807698	807480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_807500_807700
645990	contig_7962_pilon	+	2192	5	Intergenic	novelGene_149293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	202.04145614205	120	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1027	1716	196933	204542	FALSE	35	AATCACTATTTTCCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSAKAEEYGKISFEETQPLVNSETESSFSINENTTASGSGPSENAPICERVGTPKKRRMEFEDDLIKESSSCGEDKKRTLDAEIFPEKKGSGDDGSTSKKRKIEADDVPTNGSSTRDGSQQKRKIELEDVSEKRKRLEEGHSSAVAAHYNELQEVGLEKRSQSRIFYLRNFNNWMKSVLIGEFLEKVRQKKKHGITVLDLGCGKGGDLLKWKKGRINKLVCTGKRHK	193778	205018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_194694_196268_196339_196891_197344_198704_198841_204399
646000	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
646013	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	281	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646016	contig_5018_pilon	-	1472	7	Intergenic	novelGene_47100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	745.744687469437	3	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	46	927	1401907	1399645	FALSE	10	AAGTTTTGTGTCTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1401952	1399099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400758_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873
646018	SIRV4	+	291	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	671	986	-39	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGCACATGCTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
646036	contig_3948_pilon	-	1281	7	Intergenic	novelGene_53310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_6	387.231484027606	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	103	960	1485208	1468245	FALSE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1485661	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600
646043	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	35	3084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
646056	contig_17274_pilon	+	1839	3	Intergenic	novelGene_26559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTTCCTATTATTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195917	201548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_196350_197796_198003_200347
646062	contig_15549_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_142355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	119	559	82986	83426	NA	5	CACTTTTTTCTTGGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKPGLLQHFYFSNKCIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLLGHDFHHFLPDLADLLVLSIRHLLNLIVAFFSKTNTEQTKQITIGSLDINMSFSHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	82867	83618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15549_pilon_+_82900_83600
646064	contig_7275_pilon	+	2542	1	Intergenic	novelGene_111249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	352	1059	110	1168	408481	409539	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEHSWRLPIPFQSEKGLTKCISLCSFLEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	408371	410913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_408400_410900
646068	contig_11512_pilon	+	382	2	Intergenic	novelGene_43215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	30	380	4011	4584	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSAG	3981	4586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
646069	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
646075	contig_15304_pilon	-	1089	3	Intergenic	novelGene_30428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	201	1025	54100	52925	FALSE	5	GCTGCTTGTCTGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54300	52860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
646079	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646080	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646095	contig_5954_pilon	-	2974	3	Intergenic	novelGene_28415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	343	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1280	1738	96034	94607	FALSE	20	ACTGTCTCCAGCAACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFCACFLFLPQSQVQGPPDYPSFVESVDEYHFVERLLPPTRIPEPPKHKHYPTPSGWQPPQDPPPNLPYFVRRSRMHNIPVYKDITHGNRQMTVIRKVEGDIWALQKDVEDFLSPLLGKMPVTQVNEVTGTLRVKGYFDQQLKAWLLEKGF	97313	93370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_94754_94886_95012_95847
646108	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_114040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646124	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_17725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646125	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
646128	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646136	contig_7272_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_25296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGGTCAACAACCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347137	347948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_347100_347900
646137	contig_7272_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_25295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGACTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343964	345681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_344000_345700
646139	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646141	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646143	contig_20398_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_155193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTAGTAGTAATTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30689	32169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_30700_32200
646148	contig_6710_pilon	-	587	2	Intergenic	novelGene_94048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	657532	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657532	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646152	contig_12638_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_33262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCAATTAAAAAATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826004	824113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_824100_826000
646160	contig_7898_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_47602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGACTCTTTAACAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551700	550956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_551000_551700
646161	contig_7898_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_47601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAGGCTGTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549073	548348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_548300_549100
646169	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646174	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646183	contig_7272_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_25282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTGTACATTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306752	305777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_305800_306800
646188	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646190	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646191	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
646193	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	0	2969	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
646195	contig_8978_pilon	+	1410	8	Intergenic	novelGene_49346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAACATGGCGCTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190479	194074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_190958_191285_191361_191597_191693_192265_192443_192866_193008_193215_193404_193619_193772_193970
646210	contig_16125_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_155291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGGTTATTAACCTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207808	208458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_207800_208500
646213	contig_2455_pilon	+	995	12	Intergenic	novelGene_119206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	48.0707123769739	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	240	995	1357912	1491556	FALSE	40	AAAAAATTTGCTGTGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLSRELLDLVASHFNLKEKEYFGITFIDDTGQQNWLQLDHRVLDHDLPKKPGAAILYFAVRFYIESISFLKDKTTVELFFLNAKSCVHKGQIEVDSETTFKLAALVLQEAKGDYTSDENARKDLKTLPAFPTKTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKGLTRGQAVVQYMKIIEALPTYGVHYYAVKDKQGIPWWLGISYKGIGQYDLQDKVKPRKLFQWKQLENLYFRE	1329982	1491556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1330222_1357911_1357978_1362024_1362120_1369917_1370011_1389771_1389857_1433372_1433430_1434187_1434211_1463417_1463502_1465385_1465452_1468606_1468665_1470318_1470406_1491514
646214	contig_2455_pilon	+	3203	11	Intergenic	novelGene_119240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	22.154909162531	28	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	169	2097	1493186	1516452	FALSE	20	AATTAGTTATGGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQWKQLENLYFREKKFAVEVHDPRRISVSRRTFGQSGLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQFYLDRKQSKAKIPSARSLDDIAMDLTETGTPRVSKLVSLEAKNQLIMASNGSLISSGSQDSEVSEEQKREKILELKKKEKLLQEKLLQKVEELKKICLREAELTGKMPKEYPLSVGEKPPQVRRRVGTAFRLDDNLLPSEEDPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLAREPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKKLQEIENAINEYRMRCGKKPSQKATVILPEDIIPSESSSLSDTTAYDDPNDSFTLAGQRSSSVPRSPRILPPKSLGIERIHFRKSSINEQFVDTRQSREMLSTHSSPYKTLERRPQGGRSMPTTPVLTRNAYSSSHLEPEASSQHCRQRSGSLESQSHLLSEMDSDKPFFSLSKSQRSSSTEILDDGSSYTSQSSTEYYCVTPVTGPYYTTQTLDTRARGRRRSKKQNVSTSNSGSMPNLAQKDSLRNGVYPKSQEQPSSSYYIAGYTPYAECDLYYSGSYVYENDTEGQYSVNPSYRSSAHYGYDHQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAVTKSEHITKNIHKALVAEHLRGWYQRASGQKDQGHSPQTSFDSDRGSQRCLGFPGLQVPCSPSSRASSYSSADNTQRPINWTVQMETGWRTAWGVVSRGSFGMKIQSLEH	1491514	1517558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1491592_1493094_1493234_1493867_1494010_1494984_1495119_1495212_1495333_1496495_1496725_1500063_1500121_1501407_1501556_1504103_1504224_1505331_1506144_1516333
646227	contig_16261_pilon	-	302	2	Intergenic	novelGene_155303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	46215	45717	FALSE	25	ACTCTCACCATCAGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQSGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDF	46241	45716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
646231	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
646234	contig_9460_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_155304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGATTGCATTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33778	32066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_32100_33800
646240	contig_15407_pilon	-	1696	5	Intergenic	novelGene_123094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTTTCTAAAACAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527604	519924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_520054_520336_520399_520495_520545_523323_523436_526260
646249	contig_18869_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_56210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73742	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
646252	contig_7165_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_116883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	609	923	732098	732412	NA	25	GACAGCAACAGGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIQRINDWSLLTWSNRGKRRVRNRRKKWNVWLIASLNNCLLCHETRRTEWFPSIITKHFDQRFYRRILIKKEKTQNRISNSRGIQVFGGHGGCWITPETLSLR	731489	733056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_731500_733100
646257	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646260	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
646263	SIRV6	+	692	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8211	1	580	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATGAATGGTCGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	3120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
646269	contig_7942_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_155325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATTCCATGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14876	14362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_-_14400_14900
646280	contig_5698_pilon	+	2028	7	Intergenic	novelGene_54999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	899.928515679625	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	20	577	4103	19243	FALSE	5	GTGCTTCAGCTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQVRR	4083	20694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18862_19240
646283	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646292	contig_12050_pilon	-	1535	7	Intergenic	novelGene_62743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	138.803718329958	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	327	878	697920	686686	TRUE	30	AACCTAAATTGTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	698246	685541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_685970_686456_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
646297	SIRV4	+	151	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	681	1116	-49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTATGTTAATTTGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2700
646298	contig_7285_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_143411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGATCTCAGAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333021	333317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_333000_333300
646299	contig_11328_pilon	+	1078	6	Intergenic	novelGene_88388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2297.08453479623	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	41	463	643683	645354	TRUE	20	GTAAGTCTTTTGTACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGPKELAESANFSISLKRMMSASML	643642	648335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645280_645376_647064_647223_647899
646303	contig_12301_pilon	-	1484	5	Intergenic	novelGene_110020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	332.028895579888	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	311	613	110773	102891	FALSE	25	CAAATTTGTGTCATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136731	102019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113693_130601_130737_136661
646306	SIRV7	-	289	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91637	0	-91631	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGAAGTAAGTATAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
646312	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646322	contig_4083_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_152320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCCCAGCAGGAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41202	41676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_41200_41700
646325	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
646327	contig_762_pilon	-	2148	6	Intergenic	novelGene_135939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	38.0242028187311	326	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266764	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_257668_259724_259837_263480_263602_263903_264056_266666
646338	contig_14513_pilon	-	1150	2	Intergenic	novelGene_70384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	132	617	18880	11833	FALSE	50	TAAAAAACATTAGAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRACPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19011	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12174_18735
646339	contig_7286_pilon	-	983	6	Intergenic	novelGene_108719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5276.36139778162	9	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	55	567	292049	288662	TRUE	30	ATGATCTCTAGTTGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGKQPLYSWCKS	292103	286946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288674_289226_289422_290758_290857_291315_291497_292022
646342	contig_5020_pilon	+	1342	8	Intergenic	novelGene_27875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	828.976797390762	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	355	1227	122915	125970	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLLLPPHPFPPPYSHPSSLPYLPLFSQSWWY	118470	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125056_125877
646369	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
646371	contig_19938_pilon	+	1458	8	Intergenic	novelGene_146565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	129.414537239754	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	234	1094	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5741	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_6412_6566_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18535_18953
646377	contig_10331_pilon	-	2967	1	Intergenic	novelGene_54116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	140	556	366981	366565	NA	45	GTCCCAGAATCAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCIFQDFYIAGERNPAQTGVYKRKNLVVDLNMSQNGLSKMGLFFELTGIIKRFRHSSISLFLPKLSFPLSLFSGKIFFPHIVAKVPLSYSRFKWSFHFKISGRDWCSLERSNCYIQGNERDDGSSDWLSSAMCPLLW	367120	364153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_364200_367100
646391	contig_3095_pilon	-	1206	5	Intergenic	novelGene_75228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1322.24288615973	62	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	91	864	255481	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGLLH	255571	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
646395	contig_15905_pilon	+	3434	2	Intergenic	novelGene_154709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_1	0	26	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	60	344	131014	131298	TRUE	15	AAGATTGTTTTCTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFSETQRCELLLHVTLTKMPFSAVMSVLDGEKSLPHDLVIVYSALFPPANGLAFIARDELIRLLGGARDISFYLKYFKFPGESVHIISENVMFYILGYSLTFVQRSAAFLPG	130954	135965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_133309_134885
646399	contig_5419_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_15517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATATGACATCACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250172	252113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_250200_252100
646402	contig_18869_pilon	-	1951	3	Intergenic	novelGene_56377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_2	1547	37	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	23	382	79419	74943	FALSE	40	AAAATTCATTTTTCTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79441	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74957_75486_75766_79352
646405	contig_15063_pilon	+	1647	6	Intergenic	novelGene_13587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	3	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	202	1329	34808	38994	TRUE	30	AGGCACTTGTGGCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGGSEC	34606	39727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38977_39092_39506
646407	contig_6159_pilon	+	1923	13	Intergenic	novelGene_128235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	80.328967723702	426	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	72	1778	34609	45745	FALSE	10	GCCTCAGCATCCTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGTRAAGGRQWRGWELWRGIARAMKKRYAVLGLVAVVLVALITGLCIWLPSSSQHPNHVYPRAAVATDAKRCSEIGRDALQDGGSAVDAAIAALLCVGLMNAHSMGIGGGLFLTIYNNTMRKAEIINAREVAPALAFASMFNSSEQSQEGGLSIAVPGEIRGYELAHRRHGRLPWARLFQPSIQLAREGFPVGKGLAAALERSRGTIERHPFLCEVFCRNGKVLQEGERVVMLRLASTYETLALEGAQAFYNGSLTAQIVQDIQAAGGIVTAEDLNNYRAELIEHPLNISLGDSVLYMPSAPLSGPVLALILNILQGYNFSQASVETPEKKGQTYHRIVEAFRFAYAKRTLLGDPKFVNVTEVVHNMSSEFFAAQLRARISDDTTHPISYYEPEFYTPDDGGTAHLSVVSEDGSAVSATSTINLYFGSKVRSMASGILFNDEMDDFSSPSITNQYGVPPSPANFIQPGKQPLSSMCPSIIVGRDGQVRMVVGASGGTQITTATALAIIHSLWFGYDVKQAVEEPRLHNQLLPNTTTLERHMDQAVTAALESRHHYTEVTSTFIAVVQAVVRTASGWAAASDSRKGGEPAGY	24733	45890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_24801_34604_34770_36106_36238_36396_36484_39342_39536_39901_40060_41556_41707_42111_42249_44448_44637_44892_45021_45104_45218_45286_45401_45598
646409	contig_14322_pilon	+	364	2	Intergenic	novelGene_115779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	108	257	364	671606	671869	FALSE	25	CTGCTCCTCGGCAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLIWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVE	671349	671869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
646414	contig_18869_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_55994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
646415	contig_5643_pilon	+	1128	9	Intergenic	novelGene_39116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACGGCGCCGGCTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646192	651182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650570_650869_650958_651155
646450	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_17632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
646460	contig_17790_pilon	+	2350	8	Intergenic	novelGene_128483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	157.529524281667	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	53	1318	80375	129991	TRUE	25	TAATAGTATCTTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEARVKKMGLGHEQGFGAPCLKCKEKCEGFELHFWRKICRNCKCGQEEHDVLLSNEEDRKVGKLFEDTKYTTLIAKLKSDGIPMYKRNVMILTNPVATKKNISINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGSEGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELTPREVKEMEQFVKKYKNEALGVGDVKLPQEMDAQGPNRTYIPGGDRSTTAAVGAMEDKSAEHKRTQYFCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDKLWHPACFVCSACSELLVDMIYFWKNGKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQNWHLKHFCCFDCDNILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNSFSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKMMS	80322	131135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_80402_113272_113359_122633_122887_123770_124107_124999_125216_125625_125785_129802_130571_130682
646468	contig_7285_pilon	-	825	8	Intergenic	novelGene_143420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.8186577086313	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	402	824	370123	356039	FALSE	25	CAGTGTACATTTTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAATGHKVALVDQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIKHVPAGSPSARGNVLWSDIPSHRTVC	380010	356037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356121_356228_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
646479	contig_18613_pilon	+	1250	4	Intergenic	novelGene_80226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2336	junction_1	1169.65322496314	161	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	691	990	28443	31105	FALSE	5	TATGGTCTTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	24253	31365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_24454_27952_28639_30137_30195_31058
646480	contig_6871_pilon	+	1362	10	Intergenic	novelGene_21517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	334.411257120464	1009	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	115	1296	57964	72153	FALSE	5	TGGTGTTATGTGGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGAYAGQREEKLELRALCLPAERPSYAPPPTPAPATQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTASSGITIPKPPKPPDKPLMPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	52464	72219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54695_54740_57960_58066_63387_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
646492	contig_4071_pilon	-	2181	8	Intergenic	novelGene_151896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_7	60.6603121438371	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATCTGGTGGTCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363787	343565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_343827_344069_344130_345262_346455_347957_348032_354570_354660_355444_355542_360908_361010_363480
646497	contig_19402_pilon	+	1748	12	Intergenic	novelGene_80755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1612.67826101604	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	10	1677	23458	146583	FALSE	20	GTAGTGTTTAGATACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSAESN	23448	146654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97661_146569
646501	contig_13707_pilon	+	2268	10	Intergenic	novelGene_43572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	103	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGAGTAAGTGAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269708	275440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_270898_271536_271633_271759_271898_272366_272450_273317_273441_273706_273841_273958_274038_274145_274253_274510_274587_275197
646502	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646515	contig_7963_pilon	+	1487	5	Intergenic	novelGene_58523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	278.76244366844	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	31	609	194098	200117	FALSE	45	TCACAATAACCCCGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAEYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSQHTF	194067	200995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195203_195309_197688_197974_199411_199529_200100
646525	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646526	contig_12622_pilon	-	1241	3	Intergenic	novelGene_6005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4789	junction_2	467	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	209	508	1588902	1588376	FALSE	25	CCAGCATCTCTACGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGTSAQPTRFSPVPWSFIGP	1589199	1587642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1588609_1588835_1589010_1589098
646527	contig_9098_pilon	-	1985	12	Intergenic	novelGene_75851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	146.990414035004	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	314	1144	350397	337551	TRUE	20	CTTGCTATTTATATCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLRSCWSIFVKERF	355829	335334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330_350461_355579
646528	contig_10235_pilon	+	2625	18	Intergenic	novelGene_46538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_17	45.0166443651256	274	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	93	2345	388599	405052	FALSE	10	ATCCACCTGTCCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLVALLCLLPLYPGLAAVTPSCPRNVNISGGTFTLSHGWAPGSLLTYSCPLGRYPSPASLLCKSNRQWQAPGATRLTKAVCKFVRCPAPVSFENGMYTPRLGSHPVGGNLSFECEDGFTLRGSPVRWCLPNGMWDGETAVCDSGDGHCANPGISVGAVRTGSRFGLGDKVKYRCSSNLVLTGSAERECQDNGVWSGTEPICRQPYSYDFPEDVAPALGSSLSHILGATNPTQKKTENVGRKIQIQRSGHLNLYLLLDASQSVTEDNFHTFKACATLMVDRLFSFEIKVRVAIITFASKPKVIMSVLHENSQDVTEVISSLENANYKDHENGTGTNTYEALNSVYIMMNNQMQRFAMNTAAWQEIRHTVILLTDGKSNMGGSPKPAVDNIKEILNINQKRNDYLDIYAIGVGKMDVDWKELNELGSKKDGERHAFILQDTKALHQVFEHMLDVSQLTDTICGVGNMSANASDQERTPWHVTIKPKSQENCRGALISDQWVLTAAHCFRNAEGRSLWRVIVGDPNSPWGKEFRIEEVVINPGFDVFAKKNQGIPEFYGNDIALLKLAEKVKMSTHARPICLPCTVEANLALRRPQNSTCRDHENKLLDKSSVPAHFVALNGSKLNVNLKTGIEWASCIQAVSQDKTTFPNLTDVREVVTDQFLCSGTQNDDNSCKGESGGAVFLERKFRFFQVGLVSWGLYNPCVNSDKNFRKKAPRNRVPPPRDFHISLFQLQPWLRQHLQGVLQFLPL	388506	405332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_388645_388804_389012_389862_390049_391813_391988_392072_392172_392358_392493_394071_394211_394836_394978_395601_395692_402987_403129_403252_403348_403443_403556_403642_403809_403917_403995_404118_404211_404406_404534_404682_404733_404875
646533	contig_4469_pilon	+	2290	3	Intergenic	novelGene_21957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	142	411	755197	755521	TRUE	45	AAGAGAAAAAGAGTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTFPHSSGEQSGSDTDTDSGYGGELEKGDLRRSALLSKNPKNPPPKRAECSFQMMKAISLAVT	755055	757503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755369_755423_755655_755757
646539	contig_3948_pilon	+	1989	3	Intergenic	novelGene_53375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	3	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	913	1383	1860968	1861438	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1813268	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813826_1813889_1860434
646543	contig_2365_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_103747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATGAAACTGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205535	206276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_205500_206300
646547	contig_15118_pilon	+	2956	5	Intergenic	novelGene_74581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	137	junction_3	261.723494359983	465	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	963	1409	377560	378861	TRUE	35	ATATTAACCATTTCAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	376597	380641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151
646554	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_16457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
646556	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
646559	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_18158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646571	SIRV7	+	329	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATAGCCTCTACCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	114730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
646573	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_93148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATACACAGTGGTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
646575	contig_8330_pilon	-	1659	7	Intergenic	novelGene_71976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	313.197843046354	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	287	991	2056084	2038853	FALSE	30	CTTAAATGGAAGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056574	2038184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056390
646577	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
646590	contig_2890_pilon	-	3324	8	Intergenic	novelGene_60270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_7	39.2163023160897	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	18	1139	283193	272595	FALSE	45	ATTGTAAGAAAGACATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQVSVDVGSMHVVIVGGGFGGIAAASQLQALNVPFTLVDMKDSFHHNVAALRASVESGFAKKTFISYSETFKDNFRQAMVVGIDLKNQMVQLKGGEALPFSHLILATGSTGPFPGKFNQVSSQEAAIQAYEDLVKQVQSSLFIVVVGGGSAGVEMAAEIKTEYPQKEVTLIHSQAVLADKELLPCVRQEVKEILLRKGVQLLLSERVSNLEELPVNVCRDYIKVQTDKGTEVATNLVILCSGIKINSSAYRSAFESRLVSNGALRVNEYLQVEGYSNIYAIGDCADVKEPKMAYHAGLHANIVTTNIVNSMKQRPLKAYKPGALTFLLSMGRNDGVGQISGFYVGRLMVRLVKSRDLFVSTSWKTMKQSPP	283210	270409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_272747_273015_273217_274910_275064_277231_277341_279914_280008_280774_280895_282546_282663_283015
646591	contig_11512_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_43247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	4	351	4011	4581	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSA	4007	4583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
646593	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
646595	SIRV7	-	288	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68997	1	35778	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78960	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
646600	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
646611	contig_9696_pilon	-	1176	6	Intergenic	novelGene_68766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	525	junction_2	212.235718011837	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	43	903	150836	136106	FALSE	25	TTAAAATGTTCTGGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPAGVLCGLVQDTMNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAAQVTKKKKKKRYRIPTNDELLYDPEKDNRDQAWVDAQRRSYHGFGIQSPRQQQPVPNSDAVLNCPACMTTLCLDCQRHESYKTQYRAMFVMNCSVNKEEILRYKTPENRKKRWGHKKMRSSQEDTAKWAETEAEEIYHPVVCTECSTEVAVYDKDEVFHFFNVLASHS	150878	135832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_137980_138092_139913_140032_140957_141057_146412_146595_150762
646616	contig_16999_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_84988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGATTGTGGTTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117026	116691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_116700_117000
646617	contig_16999_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_84987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGACCCACTGATACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116436	115988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_116000_116400
646621	contig_1275_pilon	+	916	2	Intergenic	novelGene_108840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	85	774	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746552	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
646622	contig_11386_pilon	+	2005	7	Intergenic	novelGene_82761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	432.234761314831	865	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	884	1543	17940	31994	FALSE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7892	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990
646634	contig_9345_pilon	-	1572	6	Intergenic	novelGene_24686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	277	858	955353	947957	FALSE	40	AAATTCCTTTTAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001351	947242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
646640	contig_5566_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_153673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCTACCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202479	203855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_202500_203900
646646	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTAATTTGGTACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646647	contig_6102_pilon	+	1910	13	Intergenic	novelGene_32264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60.9828641687337	277	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	798	1559	1447451	1449029	FALSE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444278	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445584_1445628_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447304_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
646650	contig_8864_pilon	-	3442	1	Intergenic	novelGene_135996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	489	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACGTAATACAGAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680863	677421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_677400_680900
646659	contig_18869_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_55995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTTCAGTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
646660	contig_3095_pilon	+	976	5	Intergenic	novelGene_75070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	100	825	147280	151151	TRUE	10	TGATGCCTTCCTCTGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147180	151988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
646673	contig_17281_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_105176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGAGTGAATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2600
646679	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
646680	contig_2069_pilon	-	2443	5	Intergenic	novelGene_23331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	15.3133928311136	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	10	552	595572	588937	FALSE	5	GATGGTGCCCTGTCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEGSFPLLLPPPPLLPGMAEVEVKTAAETDMKHFRGPGSGVMDVERSRFPYCVVWTPIPVLTWFFPIIGHMGICTSTGVIRDFAGPYFVSEDNMAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVR	595581	587045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_589072_589149_589247_590792_590825_592127_592213_595378
646687	contig_9548_pilon	+	1868	6	Intergenic	novelGene_141083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	94.6010570765465	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	102	1670	308859	321224	FALSE	55	AAAATTAAGGAAAAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGFDQRQVKLLPGLQKFTAPPPPVAGVIPETQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIYAHKVVLASISPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCHDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLCAVGGKSGLFTCLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIETNVLRAGITVRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDVWLDSAGMIYCRCNFGLTAL	296611	321422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_296713_308858_309486_309635_309758_317580_318028_319956_320166_321060
646692	contig_19342_pilon	+	1119	4	Intergenic	novelGene_41083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	20	625	3263	6276	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRGDMTGLWRYFLIWTF	3243	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4358_6227
646695	contig_8772_pilon	+	1298	9	Intergenic	novelGene_21118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	11	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	41	982	15814	23105	FALSE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15773	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
646696	contig_20951_pilon	-	167	1	Intergenic	novelGene_43096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGGCCAATCGTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28881	28714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
646699	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTACCATTCTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
646706	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10536	15	1299	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11536	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
646714	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
646718	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
646719	contig_6710_pilon	+	565	2	Intergenic	novelGene_92142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCTGTACTCCAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
646724	contig_3095_pilon	+	1023	5	Intergenic	novelGene_75141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3099.60936046786	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	62	631	149709	151151	TRUE	20	ACTATTGGATGGGTCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLIFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149647	152229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150513_150566_150696_150996_151163_151848
646733	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646734	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
646736	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646744	SIRV2	-	662	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	2630	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
646748	contig_11855_pilon	+	2162	7	Intergenic	novelGene_67061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	63.578691398927	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1385	1981	2013753	2016987	FALSE	25	CAAGACAGAGTTGGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2011118	2017168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011338_2012006_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
646752	contig_10904_pilon	-	1430	7	Intergenic	novelGene_22745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_5	322.256842009944	643	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	61	1179	662714	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662774	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662408_662445_662665
646754	contig_12786_pilon	-	1359	10	Intergenic	novelGene_103399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	603.285960898548	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	362	1297	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629494	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628857_629375
646756	contig_18735_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_132676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTAGAAGAATTACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63177	62663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_62700_63200
646770	contig_13051_pilon	+	1771	15	Intergenic	novelGene_140092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	101.641828124497	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	900	1664	147354	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60105	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133474_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
646793	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	80	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646796	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
646803	contig_9345_pilon	+	1189	2	Intergenic	novelGene_24698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGAAAGGTTGGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952149	955975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_952563_955199
646807	SIRV2	+	305	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	279	141	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGCCTACGTGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387	1772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
646813	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
646814	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646816	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
646831	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646833	contig_5988_pilon	-	1315	4	Intergenic	novelGene_15980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	874.727513127501	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	810	504	1313	652858	652049	FALSE	20	CATGGCTGCCCTTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEARE	655519	652046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652927_653272_653422_653549_653773_655456
646834	contig_11846_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_105972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307075	304609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_304600_307100
646835	contig_15063_pilon	+	1722	7	Intergenic	novelGene_11227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	2	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
646836	contig_15039_pilon	-	1883	9	Intergenic	novelGene_110133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_8	509.418479739399	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	443	1111	200602	185257	FALSE	20	AATGCTCCTTGTATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260918	184484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_222093_222255_260778
646841	contig_7963_pilon	+	1746	10	Intergenic	novelGene_58593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	183.009275889853	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	572	1513	265492	269915	FALSE	25	GTTTTTTCATTATTACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	261127	270148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_261156_263629_263761_264024_264212_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
646852	contig_14925_pilon	-	1359	6	Intergenic	novelGene_55275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	260.264788244588	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	26	427	322420	129449	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPHLECCDTSSSLGKELM	322445	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112285_112446_112888_115814_116101_129436_129498_321808_322113_322371
646854	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_16627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27850	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
646864	contig_19744_pilon	+	2872	4	Intergenic	novelGene_120410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	126.265153106029	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	394	1224	260398	271834	FALSE	30	TGGAATACTTTTAAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPKSHFISALTVVFVNSKSLSSLKIDDTPVDDPSLKVLVANNSDTLKLLKMSSCPHVSPAGILCVADQCHGLRELALNYHLLSDELLLALSSEKHVRLEHLRIDVVSENPGQTHFHTIQKSSWDAFIRHSPKVNLVMYFFLYEEEFDPFFRYETPATHLYFGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	250871	273482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_251157_260289_260413_263501_263674_271190
646865	contig_6233_pilon	-	1707	11	Intergenic	novelGene_74804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_7	264.206756158884	670	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	504	1343	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250356	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
646869	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
646871	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646873	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646875	contig_17427_pilon	-	2140	7	Intergenic	novelGene_30382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_1	1088.96532186393	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	882	1475	186489	181263	FALSE	20	ATAGTATGTCCTCTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHGE	204695	180597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188890_204671
646882	contig_11832_pilon	-	1443	12	Intergenic	novelGene_106928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	947.142985356881	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	93	992	88105	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92505	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88142_92449
646885	contig_6589_pilon	+	1320	4	Intergenic	novelGene_26130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6874	junction_3	1529.79831640935	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	448	801	1879501	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1879053	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
646891	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
646892	contig_2074_pilon	-	1817	5	Intergenic	novelGene_155329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	37	junction_2	74.5486418387351	279	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	350	1618	138653	131358	FALSE	25	CTCAGCTCCAAGAGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAWLWLLGAAVLASVHCQPFPAHGDKSLEVPQAPSDQLSEPAPAYHKITPTITNFALRLYKQLAADIPRNIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSTQILEGLGFNLTETPEADLHHSFQSLLHTLDLPSPKLELKVGNSLFLDKQLKPQQWFLDSIKELYGALAFSANFTDSAGTARNINEYVRKRTYGQVSDCLQEFSQDTLMVLLNYIFFKAKWKHPFNRYQTQKQERFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQELACTVLKIEYSGNALALLILPDPGKMKQVEAALQPETLRKWDQLLLPSLLDLHLPRVSISGTYNLEEILPRIGLTNIFNLEADFSGITGQLNKTISRVSHKAVVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNATAAPHAHFNRPFLLLIWDVTTQSLLFLGKVVNPAAG	145208	131158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2074_pilon_-_131562_133442_133591_135046_135321_138010_138657_144862
646896	contig_3825_pilon	+	1020	8	Intergenic	novelGene_77925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	1205.89568709871	16633	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	20	313	12232	13924	TRUE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVHPPKMPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTVSRTLR	12212	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_13904_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
646897	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646899	SIRV5	+	395	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7482	-5	-89	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTCCACTTTGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
646904	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	16	357	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14424	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646906	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	188	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646915	contig_20610_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_67635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGAAGGCTGTAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17557	19128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_17600_19100
646923	contig_15859_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_50212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378830	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377400_378800
646926	contig_401_pilon	-	2954	1	Intergenic	novelGene_42918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1944250	1941296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1941300_1944200
646931	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
646932	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
646940	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_18825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTGCGCCAGAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
646944	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	636	1126	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
646957	contig_10135_pilon	-	2053	9	Intergenic	novelGene_106606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	42.3106074170532	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	357	1547	88066	84292	FALSE	5	TCTGTTCTTGCTTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89573	83785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88963_89057_89502
646972	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
646979	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
646981	contig_11978_pilon	-	1441	12	Intergenic	novelGene_62794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCTAGCCGCAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589574	299618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_299806_335600_335720_379900_380024_539031_539114_540005_540089_542949_543073_545619_545685_547580_547774_556589_556642_564819_564921_587275_587385_589370
646984	contig_253_pilon	-	1631	10	Intergenic	novelGene_129667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	111.966264760616	718	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	603	1553	393089	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395693	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390206_390353_390436_390689_390857_391020_391234_391669_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
646987	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
646989	contig_14322_pilon	-	238	2	Intergenic	novelGene_116519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATCACAATCTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674798	672823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
646996	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
646997	contig_16860_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_155348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	378	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	72	314	144620	144378	NA	50	AAAAACTTATGCATTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCRISWDRPGTLFSKETKPNASMLGQVLRGSEAQGSQPWVGSQPWEPPMRGVSCAFVAGTMEPWPVHWYLGTICRTNMEWSFASWTHIMCVHMLELTFHFSF	144691	143666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_143700_144700
647023	contig_4759_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_106355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	540	839	1039827	1039528	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLHQTESSTTRWCPATTIDCSGRDHNRGSWTELGKNVEQNSNSHIYKKDQTYWSDRDWRNPKSMVPGHPYSSVMKSLLRFTLLPKIRQAHKTK	1040366	1038672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_1038700_1040400
647032	SIRV7	-	237	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69048	1	35829	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78909	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
647037	contig_11839_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_155352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGACTAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26883	24740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11839_pilon_-_24700_26900
647038	contig_19378_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_73791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	33.3816316757185	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	17	418	29945	47270	TRUE	40	AAAACACGTCTACTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNNMTKAVDAFQKSLKLCVTKEMLLLSITTAYTGLELTFFSGVYGTCIGAVNKFGMEEKSLIGLSGIFIGIGEILGGSLFGLLSKNNRFGRNPVVLLGILVHFVAFYLIFLNMPADAPIAPVEGTDSSAYITSRST	29928	50579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_29970_38367_38434_40391_40518_46836_47012_47260_47354_47741_47878_49470
647053	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647067	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647081	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647088	contig_7629_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_153563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245722	247435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_245700_247400
647093	contig_11512_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_43213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	30	368	4011	4572	FALSE	25	ATAGTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAA	3981	4573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
647100	contig_10752_pilon	+	2076	5	Intergenic	novelGene_153036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	202.566501426075	118	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	74	319	182954	186792	TRUE	20	ACTTTTTTTTAATACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRAWLLPGRVGHQEKTSAAAGAGMSRSSKVVLGLSVLLTAATVAGVHLKQRQDQQRLRDGVIRDIERQNRKKENIRLLGEQIILTEQLEAEREKMLLTKGSQKT	182880	220707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_183050_186642_187354_189330_189450_218946_219069_219752
647101	contig_11396_pilon	+	2897	21	Intergenic	novelGene_71257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	17	511	121382	124511	TRUE	30	AGGAACAGGACGCGGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQNRTSPSQALPAEPQEPPRGGCPLGAVWPLEGVLDAGGHQHEHLPDLLLPVGDVLGYGAPQLPMPWLCILTAFPHLFLLLLCAVLQLKLVEERPGIPQVRVDLHGAVEPLPGLGDLPFTPEQLGHGQEHVRVMLTLLQSVHTLGLPLGSGLEENCFRPEDA	121365	155326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_121630_122168_122296_124391_124514_125490_125576_126105_126244_127269_127443_127612_127735_128715_128855_130391_130515_133875_133998_137865_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144295_146253_146407_146608_146792_147260_147333_147885_148006_153256_153359_155231
647108	contig_15304_pilon	-	1022	2	Intergenic	novelGene_30579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	189	719	54100	53391	FALSE	25	GGAGGCCCAGACCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54288	53087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
647114	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	31	384	14409	13833	FALSE	20	GTACCACAGTGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSC	14439	13830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
647115	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
647136	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
647142	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647158	contig_9839_pilon	+	1918	7	Intergenic	novelGene_88557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	284.276078643436	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	18	926	255906	270293	FALSE	35	AAACTGATACATGTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFKKFVARFSTLRPGCKRETECLY	255888	271285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266418_270223
647161	contig_13292_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_142942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATATGTAATAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248192	247053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_247100_248200
647165	contig_18869_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_56349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACAACTAAAATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
647167	SIRV2	+	1060	5	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	1347	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCGGCTTCTTTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	2978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726_1853_1972_2062_2671_2802_2877
647170	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647180	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
647183	contig_12113_pilon	-	1814	9	Intergenic	novelGene_134733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_7	244.770268568305	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	532	1029	231875	211148	FALSE	20	ATTGGTGGTGTTTGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	259686	210362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_232488_232682_233167_233273_259482
647189	contig_11370_pilon	-	804	3	Intergenic	novelGene_98730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	430	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCGGCAGCGCTCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148548	145694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
647195	contig_14322_pilon	-	155	1	Intergenic	novelGene_115693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671429	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
647200	contig_11429_pilon	+	1125	6	Intergenic	novelGene_60445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.67825456641	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45382	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45484_46476_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899
647207	contig_16775_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_107793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATAAAATTAGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185581	183856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_183900_185600
647209	contig_10923_pilon	+	1223	8	Intergenic	novelGene_66180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	791.447988415756	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	52	1107	21667	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13827	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30181_37384_37540_38578_38742_42554
647213	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_97360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647214	contig_12603_pilon	-	3326	16	Intergenic	novelGene_105810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_14	75.198286032477	5	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	135	1535	643013	627090	TRUE	25	AACTTTGTGTTGACTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVFTLKLRHKIIPRMVAIGRYDGTHPCLAAATQADKVFIHNPHTRSQHFSASRVIQSPLESDVSLLNINQAVSCLTAGVLNPQLGYDALLVGTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVDARSDRTGEVIFKDNFSSAIAGVVEGDYRMDGHIQLICCSVDGEIRGYLPGTAEMRGNLMDTSVEQDLIRELSQKKQNLLLELRNYEENTKAESSSPLSEADGHRGIIPANTKLHTALSVNLGSETQAAHAELCISTSNDTIIRAVLIFAEGIFIGESHVVHPSIHNVSNSICIPITPPKDVPVDLHLKTFVGYRSR	643147	618150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_618624_619319_619469_621985_622099_623815_623954_625011_625144_626303_627266_627356_627502_627692_627833_628017_628154_631065_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248_638477_642896
647220	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647229	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
647234	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
647236	contig_7202_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_18582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAAGGTGAATGAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
647245	contig_8045_pilon	+	816	6	Intergenic	novelGene_35380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1183.94678934486	21	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	14	607	116067	118791	FALSE	50	GATATGAGATTAAAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENIAFFPPRKEKRL	116053	119000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527_118630_118746
647247	contig_12464_pilon	+	1872	2	Intergenic	novelGene_68723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCATGCAGAACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	379219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_376344_378529
647253	contig_14133_pilon	-	935	6	Intergenic	novelGene_119953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1619.06768234067	74	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	45	497	209116	208182	TRUE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209451	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207577_208110_208389_208585_208728_209012_209131_209421
647255	contig_17194_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_155369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAGGTATCACATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208757	211101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_208800_211100
647284	contig_7083_pilon	+	1409	7	Intergenic	novelGene_125158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_4	800.430647977838	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	255	350	161470	178745	TRUE	25	ATTTTCCTGTGACATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYIERPQLIRAKVPIVKFRDKVNCVEFDLNVNNIVGIRNTFLLRTYAYLENRVRPLVLVIKKWASHHEINDASRGTLSSYSLVLMVLHYLQTLPEPILPSLQKTYPLGQSDDFSS	156657	183087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_156728_159880_159958_161362_161492_169672_169717_178715_178808_180833_180914_182170
647286	contig_15063_pilon	+	1032	3	Intergenic	novelGene_14397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	69	890	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35202	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
647288	contig_3601_pilon	-	499	6	Intergenic	novelGene_132901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_1	1504.44336550101	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	66	443	312995	207146	FALSE	30	TGAGAAACCCAGCTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVVLGINRAHAKNAISKNLIKMLSKAVDALKSDKKVRTIIVRSEVPGVFCAGADLKERVKMHSSEVGPFVSKIRAVVNDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLELALACDVRVAASCAKMGLVETKLAIIPGAGSLGAYVSGNHSFWLF	313060	207089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_207196_252871_252929_254568_254662_274999_275087_312798_312887_312992
647293	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4278	57	3103	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATCTAAGGAGACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629	1057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
647298	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
647299	contig_4604_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_19146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGATACAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350979	353077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_351000_353100
647300	contig_10479_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_147091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGCAAAAGGAGAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3778	4090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_3800_4100
647305	contig_6361_pilon	-	844	6	Intergenic	novelGene_24002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_5	5266.57814524763	470	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	160	306	424165	420894	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAIETLVVLTFHVAFSSGEILSQARRHFLQSCQTDTLNGDVVGITTPASFKSLMVAVISAIPSVMSLLRACIENATFPSGHCVSTWEWSSSPNLQLAHWPV	436382	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_424127_424231_436288
647308	contig_14273_pilon	+	2154	8	Intergenic	novelGene_21139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	493.268523965085	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	315	1955	128229	151187	FALSE	75	AATAATACGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKADILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127914	151386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148942_149510_150873
647328	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647329	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	318	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647332	contig_12873_pilon	+	1870	7	Intergenic	novelGene_27173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1119.29572350951	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	386	1366	16357	19855	TRUE	30	TGACTTTAAGCCAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15971	20420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851_20103_20163
647336	contig_5799_pilon	-	2115	15	Intergenic	novelGene_50312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCCACTGTGAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717990	606870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_606951_612803_612914_619550_619745_631537_631621_633744_633807_650858_650973_667932_668146_671825_672046_674928_675063_687589_687738_689073_689195_691447_691582_699670_699774_704545_704599_717644
647337	contig_11825_pilon	+	1949	16	Intergenic	novelGene_155389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	367.732233500893	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1935	13	1947	10468	65127	FALSE	70	GGAAAAAAAAATACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPNMWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEEESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQL	10455	65129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46140_57038_57168_65051
647353	contig_8060_pilon	+	2933	7	Intergenic	novelGene_104830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	84.3315217196723	478	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	12	599	158272	215146	TRUE	15	GTCAGCGTGTGGTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVMAPRGLPGSAVLAAAVFVGGTASSALEAPDNGGSHALHSRTEMTPSPASNAENGHPEYIAYVLVPVFFIMGLFGVLICHLLKKKGYRCTTEAEQEVEEEKIEKIELNDSINENSDTVGQIVHYIMKNEANADVLKAMVADNSMGDPESPVTPSTPGSPPVSPGPLSPGGTPGEARLWTPSAHSGWCCGEGRVSSV	158260	243769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_158360_201356_201582_203636_203709_212184_212243_215001_215240_219456_219596_241667
647381	contig_13718_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_142909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACTAGATGACTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266241	265992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_266000_266200
647384	contig_6361_pilon	-	2285	2	Intergenic	novelGene_23893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCTTATTTGGACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124593	121265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122886_123928
647418	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_16578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
647430	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
647433	SIRV2	-	272	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4586	49	3411	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
647438	contig_2596_pilon	+	2154	12	Intergenic	novelGene_53446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.985921007487	423	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1052	1693	45320	61358	FALSE	20	AACTAGCCTCTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFTKKLPHPDLPAEEKEQLLHNAEYQETMVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA	25382	61819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_25699_32569_32681_33834_33972_36842_36996_42489_42717_44873_44952_45290_45359_45872_46062_48753_48897_58522_58659_60346_60434_61310
647441	contig_9290_pilon	-	1850	12	Intergenic	novelGene_77552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	345.289147007725	7	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	69	1697	496936	478765	FALSE	30	CTTAAAGCCTAGAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGMWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDTPPPGGRGRGRGRPH	497004	478611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478984_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
647453	contig_4156_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_88106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338205	338778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_338200_338800
647454	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
647456	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
647462	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647463	contig_18869_pilon	+	176	1	Intergenic	novelGene_56011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGATTTGACCAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73500
647477	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	390	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647481	contig_14467_pilon	-	2192	12	Intergenic	novelGene_138275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1210	1995	374577	354783	TRUE	15	CCCGACTGCGTCACACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLTPALTIVSVPVGGLNLMVVPVGAAVKLLGPKREPDVLPKGLEVVFVVPKSPPLLVLVPKFPKPLGLFCAKALFWDEKRPVPVLAVPNKLFDVPVDVPNPKPVLVEVAGWLNELVPNNPPGLVCEFPNRPPVLLLEPNADVPNAPPVVVPKPVFCPNVEVVPKPPVPPPKGVPNDLLNILKMSPCFRKQKSQPYSATATTSNVAVVRCRQVGLDPQRPYVQQNKTLPSPTSPSQLLLCLSPLLQPLCQSISLRVFLFL	387595	352169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_352318_354733_354959_367939_367976_369702_369808_371154_371253_371359_371541_373147_373288_374527_374634_375781_375966_377855_378015_384888_385027_386923
647483	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647488	contig_19938_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_146564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	129.414537239754	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	209	1069	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5740	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_6438_6566_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18535_18953
647491	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_95884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
647495	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
647499	contig_5549_pilon	+	908	5	Intergenic	novelGene_81580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	438	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	62	736	82155	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
647503	contig_10780_pilon	-	2952	9	Intergenic	novelGene_155430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	78.8416133777081	195	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	21	455	113602	104723	TRUE	35	TTAAACCGTGAGTACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDYPPVEERRRLQEELSEFVESCCRTLEEVTASLGWSLDQLDPGEEETAEDEVVICPYDSNHHMPKSSLAKHMVSCRLRKLDYTKEEEDEMYNPEFFYENVNIPSITLNKDSQLQIIKQARTTDGKDGDCSNQIIGVSIKRN	113622	94762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_-_94946_97504_97670_98429_98519_102076_102199_102784_104752_108010_108086_108921_108983_109208_109323_113446
647520	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
647522	contig_10734_pilon	-	1812	6	Intergenic	novelGene_51409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	122.467301758469	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	744	1064	2075693	2073385	FALSE	20	AGACGTGTTCATTTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLYKENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCGKRMSECPICRQYVVRAVHVFKS	2091301	2072636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2073576_2075563_2075766_2076034_2076122_2077991_2078270_2079518_2079735_2091211
647530	SIRV7	-	211	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146708	1	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
647532	contig_19769_pilon	+	652	4	Intergenic	novelGene_102325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	165	620	87859	89322	FALSE	15	CACTTAGCTGTGTACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87544	89354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87639_87788_88040_88841_88958_89163
647545	contig_14322_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_115973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671903	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
647555	contig_233_pilon	-	2324	14	Intergenic	novelGene_14620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1600.59241991038	1	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	538	1407	104176	92266	TRUE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYELTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	127004	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79138_91473_91677_92214_92355_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99867_101673_101770_104152_104324_108495_108583_108724_108861_109914_109976_126898
647560	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647563	contig_7357_pilon	-	1689	10	Intergenic	novelGene_36778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2394.52871725895	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	168	1304	166824	116932	FALSE	55	GCTAATACTTACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSGLDSSAKTS	167061	116546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_116961_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160031_166772_166901_166970
647564	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
647565	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647576	contig_990_pilon	+	2720	5	Intergenic	novelGene_76056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	8.40758586040012	134	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	496	987	1052551	1057355	FALSE	25	CATAAATGTTCTTCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLNPLKICLPSVVNFFASITSKYQLVFCYTIIERNNRQMLPVIRNTAGGDSVQTCTNPLDTFFPFDPCVLKRSKKFIDPIYQIWEDMSAEELQEVKKPIKKEMVEDEDDDFLKGEVPQNDPVIGITPSSFDLHFRSPSSSVGSPPVLYMPDQSPLTSRICD	1049501	1059088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1049956_1052509_1052619_1055097_1055251_1056206_1056295_1057172
647618	contig_2214_pilon	-	1295	2	Intergenic	novelGene_144264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACCTGAAACACAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315176	313677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_314909_315112
647630	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647637	contig_5981_pilon	-	2147	3	Intergenic	novelGene_35508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	813	1262	51396	50947	TRUE	10	GCTCGTCTAGTGGTCGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	53084	49895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_50525_50690_52013_52888
647653	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
647656	contig_753_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_112915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATGTTTAGACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320455	322509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_320500_322500
647659	contig_12270_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_114084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	31	327	14409	13890	FALSE	20	GGCTGAAGATGCCGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSF	14439	13887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
647663	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647665	contig_12528_pilon	-	2336	2	Intergenic	novelGene_81292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	565	876	335789	335478	TRUE	85	AACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCCQLPSSWPPTHGDSMSYTTGSDCCEPEGFHWLMFKVDPRPFFLVHLSLEVPLKPVQHHSNTQASTTTRVVAASEVHSSGIKPGSPIWKARILLRNHYCSH	336353	330001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_330415_334430
647669	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91677	2	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
647671	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
647676	SIRV4	-	216	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGATCAATGTCCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
647680	contig_15063_pilon	+	1415	4	Intergenic	novelGene_14209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	101	1273	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34707	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
647686	contig_6710_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_89153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653688	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
647697	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91671	2	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
647709	contig_8544_pilon	+	766	7	Intergenic	novelGene_55925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_6	297.997436603442	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	226	765	90532	152824	FALSE	45	TAAATAATTTTTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQRQKKVKVKKPKPEFPVYTPLESTYIESYEHGTSIEEIEEQMDDWLENRNRTQKKQ	83414	152825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523_92618_120265_120357_152660
647710	contig_5684_pilon	-	733	3	Intergenic	novelGene_80990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACACCTATGAAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96155	94911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_95320_95610_95709_95928
647712	contig_15063_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_13746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	11	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	201	1376	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34607	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
647713	contig_4151_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_65211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTTTCTTTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170398	170644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_170400_170600
647726	SIRV4	+	285	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1486	632	1031	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2486	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
647734	contig_9527_pilon	+	1975	8	Intergenic	novelGene_134089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.4085280116771	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	197	1543	615826	625436	FALSE	20	TCAGCCCATGGATTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTPEVKSRGMKFAEEQLLKHGWTQGKGLGRKENGITQAIRVTLKQDTHGVGHDPAKEFTNHWWNELFNKTAASLVVETGQDGVQIRRLSKETTRHDRPKPNLLYQKFVKTATLTSGGEKPDKDLENCSDDDNQGPKTPKILTDEMLLQACEGRTAHKAARLGITMKAKLARLEAQEQAFLAHLKGQDPGAPQPQSDSKPPPKKKKKKQKEEAAAPVAERNGEEEHREQTDHSNRKSKKKKRRHQEEKVPEEREGTIENEEEEAAGTGGLGELKSREQTDQPLRKRKKKRWQQEEGGILAKGEGGKEAAGGVRTEEVENRAYTDPCSQSKKRRQREEEDSLKIEDEEGEAASGDGRTGEAASKACNDLGIRRSKKKRKRHREEEAVLDRKGEEDETGGGGGTREAESRTRTGPGSRDKKRKQQHPEEGRAVVSTGQRAKKKKEKKRD	612795	625868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_612856_615689_615905_616383_616458_616558_616652_616751_616839_618562_618655_618888_618940_624565
647747	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
647750	contig_6163_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_103807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2172	2522	78120	78470	NA	30	GATTCAGAGATTTACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCSTASESKGNEFMRRKRTQAHTLTSESRASAGLHQPAKTTLSPGGMSMEMAILKGCQLTPNVCITTPLNASMRRMKLPLVEMRMSLPSLLNFSPVHSQVLSYCILKVANGPCKK	75948	78683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_75900_78700
647757	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
647763	contig_9505_pilon	+	1539	10	Intergenic	novelGene_121820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	52.9444152967158	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	97	660	404142	419283	TRUE	30	TTGAAGTGACCCATAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERK	404045	434187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419604_422552_422682_424523_424611_431207_431279_433915
647775	contig_2100_pilon	-	999	5	Intergenic	novelGene_50751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	669.351551876889	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	264	485	1172416	1172042	TRUE	25	TGTAGCCCATAAGAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQVKNYMEEKVPLLLLSDLHFLGRPKTFSLVFLKLMSLCHSPLPLPPEHP	1174231	1169930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1172109_1172261_1172451_1173171_1173374_1174204
647776	contig_5988_pilon	-	1963	16	Intergenic	novelGene_16051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	72.6082333868244	60	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	254	1606	1050018	1042346	FALSE	20	AGGTAGTTTCTTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLKDMRDEVLEHELTVADRRQKREIRQLEQELHKWQVLVDSITGMSSPDFDNQTLAVLRGRMVRYLMRSREITLGRATKDNQIDVDLSLEGPAWKISRKQGVIKLKNNGDFFIANEGRRPIYIDGRPVLCGSKWRLSNNSVVEDLIALIRAEAAKITPQ	1052678	1041988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042397_1042547_1042676_1042844_1042933_1043068_1043152_1043345_1043439_1043557_1043587_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1051477_1051541_1052598
647781	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_18284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27915	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
647785	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_96445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647789	contig_14322_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_115714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTTTTATTGCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671598	671278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
647795	contig_1107_pilon	-	3127	5	Intergenic	novelGene_126534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_3	63.1704044628495	92	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	19	1485	126174	115175	FALSE	25	TAAATGGCTTTTACAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSEPGAMDDDLVLALQLQEEWDLQALRRDHAQEPLSLVDASWELVDPTPDLQALFVQFNDRFFWGQLEAVEVKWSVRMTLCAGICSYEGRGGMCSIRLSEPLLKLRPRKDLVETLLHEMIHAYLFVTNNDKDREGHGPEFCKHMHRINRLTGANITVYHTFHDEVDEYRRHWWRCNGPCQNKKPYYGYVKRATNRAPSAHDYWWAEHQRTCGGTYIKIKEPENYSKKGKGRTKLGEHPVSAAESKDKPSRGETQLLIPFTGKGYVLGGTSNSLSSGKFITTHAVNKMQNLSSQDHSANALRPNSKIEVKFEQNGSSKKTSLVSSVLNNSHQNVLSNYFPRVSVANQKAFRSVNGSPTKSLTAGDIPKNSVSSGSQRRVTSSKTFLRNSLKALESTSLTASQDVSGSDDKFPNKRPRLEDKTVFDSFFIKKEQTQSGGNDPKCNSHPTTSAQNSSSSSGQNKMVNCPVCQKEVLESQINEHLDWCLEGDSTKIKS	126192	113532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_115924_117460_117729_120921_121051_124691_124792_125953
647802	contig_2069_pilon	-	2132	4	Intergenic	novelGene_23222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_3	60.4152298679729	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	112	570	218699	196173	FALSE	50	AATAACTTTAAAAAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRNPGPSGPQLRDFNSIIQTCSGNIQRISQATAQIKNLMSQLGTKQDSSKLQENLQQLQHSTNQLAKETNELLKELGSLPLPLSTSEQRQQKLQKERLMNDFSAALNNFQAVQRRVSEKEKESIARARAGSRLSVSLTSPPPRRHQKKRPL	218810	194610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_196365_201208_201309_202852_202923_218602
647807	contig_15114_pilon	-	1531	8	Intergenic	novelGene_121120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.858455699482	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	13	975	123696	100525	TRUE	10	ATCCACTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPQTPTLELLDTGLV	123708	94768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94825_100024_100567_100673_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580
647811	contig_5018_pilon	-	1094	6	Intergenic	novelGene_47053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.838914280781	112	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	70	861	1402792	1399318	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGAWARAVHFSANPLVPLHPRGRGCEAQA	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399380_1401024_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
647825	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	57	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
647834	contig_12709_pilon	-	1638	4	Intergenic	novelGene_147405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	101.161037734671	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACTCAACAGAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59055	32533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_33809_41999_42166_57378_57450_58929
647836	contig_2453_pilon	+	1962	12	Intergenic	novelGene_147766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	48.088932765715	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	32	1822	56543	62827	TRUE	5	TGGGTTTATTGCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGLARPTLDMSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	56511	63158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
647838	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
647856	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
647863	contig_10235_pilon	-	1735	10	Intergenic	novelGene_46286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	372.373468442638	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	962	1624	19749	14481	FALSE	15	TGGTTTTTGATACCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYSEY	27178	14369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21198_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
647867	contig_20670_pilon	+	2326	7	Intergenic	novelGene_144822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	60.1537382231746	298	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	112	813	21913	26841	FALSE	15	ATGCTAATTTGTCCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGGGDCAASAPDADRPHQRPFLIGVSGGTASGKSTVCEKIMELLGQNEVDHRQRKLVILSQDRFYKVLTAEQKAKALKGQYNFDHPDAFDNDLMHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMGLIPDGCPSVKNCFRE	21801	28354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_22021_22403_22564_23577_23675_23884_24028_24115_24211_26468_26518_26791
647875	contig_10159_pilon	+	2208	6	Intergenic	novelGene_30867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_4	94.4978306629311	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	895	1149	976848	977102	FALSE	40	AAACAATGAATTTTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTQGLKRGHCWVSCTSSASLQGQTQTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVKRCRLAKRELSYILITTIHLGVPGWCKQLMHSATNRKVGSLSPSRGATEERRGDLLLEKSATENLRKQFYSDTHGIAMSQSQLDGDWFGLIFTMHLQVSLIIKKVSIKKTQCL	957470	978161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643
647882	contig_13952_pilon	+	4310	15	Intergenic	novelGene_133246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_14	50.2897725635123	286	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	181	1674	30903	81778	FALSE	40	AAAATGTTTCTGGAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVLNGIIPLGLVLLLYGAQGFFLPNATHLERLLSKYQQDGPHSRARRAIPRVDKEEILMLHNKLRGQVYPTASNMEYMTWDEELEKSAAAWAEGCIWEHGPTSLLVSIGQNLAVHWGRYRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPHECNPWCPERCSGAMCTHYTQIVWATTNKVGCAVHTCQRMNVWGEMWENAVYLVCNYSPKGNWIGEAPYKSGRPCSECPPSYGGSCKNNLCYREETYDQKLETDEMNEVETAPVPEEKPMRVPPKVMRPTKPRKASVVSYMAQVVGCDTKMKDKCKGSTCNRYQCPAGCLNNKAKIFGTLYYESSSSICRAAIHYGIIDDKGGLVDVTRNGKVPFFVKSERHGVGSLSKYKASSSFMVSEVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPTTHCPRVRCPAHCKDEPSYWVPVFGTNIYADTSSICMTAVHAGIIRNEHGGYVDVMPVDKKKNYVGSLRNGVQSESLQTPRDGKAFRIFAVRQ	14010	84414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_14115_30826_31143_32117_32237_35980_36114_37060_37177_40843_40945_47239_47384_49692_49754_53997_54065_54538_54670_57158_57203_58062_58136_60869_60946_68148_68283_81723
647883	contig_11832_pilon	+	2850	1	Intergenic	novelGene_106962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCTCTGGCTTGAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452872	455722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_452900_455700
647884	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91627	15	-91621	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAACTAGTAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
647893	contig_11281_pilon	-	2350	3	Intergenic	novelGene_125487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1175	junction_2	85	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	43	432	972015	900517	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKNLPTYPGPNKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIRKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQVRPPLPTSSARALGTKVLGGHRRSLGMEHSLRLRLKK	972057	898598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_900726_925832_925937_971938
647904	contig_2365_pilon	+	2241	13	Intergenic	novelGene_103728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	362.130846518216	210	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	962	2185	193858	220184	FALSE	75	TAAAAAAAGAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQDYDLVSKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEEPSGNSGDLRKDVVMKENVSFKGDEDEKPTFVDLAKEETKDNDKLLQQQLDDQNRTISLVHGVNNDIVKALDRITLQNIPSQTSPAFTAGMKKDYSLPLTVLSCTKACPHMASCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVDVPDGPTLHDSDLYVEIVKSTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQR	116730	220240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137_212255_219467
647912	contig_5686_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_45379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCCTGGCAATAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151590	153747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_151600_153700
647913	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
647925	contig_18869_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_56076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
647930	contig_6735_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_15652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538847	540745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_538800_540700
647945	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
647964	contig_6159_pilon	-	2241	3	Intergenic	novelGene_128264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	89.5	2306	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	122	478	314676	312482	FALSE	35	TAATAAAGCTTTATTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLELDTNLPADRVPAGLEKRLCAATAAILSKPEERVNVMVRPGLAMVVNGSAEPCAQLLVSSIGVVGTAEENRGHSAHFFEFLTKELALGQDRIIIRFYPLEPWQIGKKGTVMTFL	314797	310718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312555_314132_314309_314568
647968	contig_9515_pilon	+	1207	9	Intergenic	novelGene_73807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	313.437693170429	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	184	1083	65880	72530	FALSE	5	CCTTGGCTCTCTGCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57159	72654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
647976	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_95008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647986	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
647997	contig_6048_pilon	+	1447	12	Intergenic	novelGene_73257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	56.5451622325096	704	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	317	1060	1974298	1978064	FALSE	50	TACAGAAAACAGAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972047	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974232_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
647998	contig_15545_pilon	+	883	2	Intergenic	novelGene_120124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGTCATTTAATAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9189	27805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
648033	contig_12079_pilon	+	2347	3	Intergenic	novelGene_67385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGCGCCTGCGCAGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461554	471280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_463797_467103_467149_471220
648034	contig_11396_pilon	+	2549	2	Intergenic	novelGene_71367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	40	junction_1	0	402	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	121	1263	815381	820788	FALSE	10	CGTTGAGTGTCATGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQTQSSAYGSSYTYPPSSLGGTIVDGQTGFHSDTLNKAPGMNSLEQGMVGLKIGDVTTSAVKTVGSVVSSAAMTGVLSGNGGANVNMPVSKPTSWAAIASKPAKLQPKMKAKSGPVMGGAMPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVTKAPAPQQTPSPQSVPQPQQIVQPVPAQPPPLAQPQYQNAQQPPQTRWVAPRNRNAAFGQGTGAGSDSNSPGNAQPSVAPSVESHPILEKLKAAHSYNPKEFDWNLKSGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYSIWCSTEHGNKRLDGAFRSLGSKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSPVDYGTSAGVWSQDKWKGKFDVKWIFVKDVPNNQLRHIRLENNDNKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEEVVRKERQNRNKQ	815260	822074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_816497_820761
648046	contig_9036_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_155469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213864	213204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_213200_213900
648050	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648051	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648052	contig_2087_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_65558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	18	374	39358	70593	FALSE	30	CATTTCAAAGTGTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSDAMAGLPPRGPGIPGGLAAGRPLGLGAGRPLRTGGGGAGGRGLTAPVPGAAAVGGAPGSVPAEQRPQQPLPDLLRRAQPAHPGAGREEGAYTLQEELQEQFVLAGRSILLPTLLIIDVTW	39340	71913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_70515
648057	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
648058	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_93578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648059	contig_990_pilon	-	2175	10	Intergenic	novelGene_76036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_7	68.061700402858	501	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	98	760	865835	850677	TRUE	60	GAAGAACGCAAAAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWK	865932	848223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_848260_849297_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
648083	contig_16870_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_155511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGAATAGAGGGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191375	191744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_191400_191700
648090	contig_6551_pilon	-	1821	3	Intergenic	novelGene_155544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	1	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCTTTTCAAAATCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161343	153017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_153859_159582_159637_160417
648092	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33179	10	-40	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114778	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
648099	contig_11386_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_82762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	453.311151418096	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	168	827	17940	31994	FALSE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7892	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990
648100	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_19096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
648115	contig_7411_pilon	-	2283	5	Intergenic	novelGene_136965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_4	4.27200187265877	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	116	1516	97125	86221	FALSE	20	GTTAATTTTGTACTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRWGPWAAEPRVWPGLGPSQLCHFRFCCSPRSLLRAMFQGSVTFRDVAIDFSQEEWEWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKGDVRRDLFSVSESNSEINEISPKNDIYENDSYQYLIMERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	97648	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_87390_94994_95091_95331_95459_97116_97174_97581
648121	contig_4105_pilon	-	1978	14	Intergenic	novelGene_21503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	712.207494198776	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	29	1741	137447	100151	FALSE	30	GAGAAGTTGTACATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137475	99913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100937_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
648122	contig_11285_pilon	-	1884	17	Intergenic	novelGene_5694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	367.882576162218	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	30	1694	798530	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798559	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_793812_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
648123	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
648126	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
648129	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648130	contig_8978_pilon	-	1914	2	Intergenic	novelGene_49343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1214	1618	191505	190773	FALSE	45	ATAAGAATAAGAATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSPKRAWWWRKLQAPTTWNHFILYWGTGRRVIKERNQCALAFSFSSLRTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	192718	190476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286
648132	contig_14925_pilon	-	995	5	Intergenic	novelGene_55167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	204	461	29675	27020	TRUE	20	CAAAGGCTGTGCTCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGVLHFGSGTQVIVKPRKCSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	70977	25793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29819_70917
648134	SIRV7	-	280	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69006	0	35787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78951	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
648144	contig_11316_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_122686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGTCCTCGTAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139557	140521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139600_140500
648148	contig_9833_pilon	+	1648	10	Intergenic	novelGene_68542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.728709845538	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	275	883	250070	254740	TRUE	15	CTCTTCACTCCTTGGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAPCYGRPPGLLPASDPAWAAASYLPPPPTPCRRPTRSPRSFTTSLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230810	260330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_249378_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
648149	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648152	contig_3825_pilon	+	898	8	Intergenic	novelGene_77929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	903.299620326297	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	20	820	12232	15603	FALSE	10	GGTATGCATGTTTGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12212	15681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
648156	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
648157	contig_12873_pilon	+	1431	5	Intergenic	novelGene_27219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_1	767.731235524516	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	431	922	17896	19855	FALSE	30	CTCTACTTAATATATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16751	20364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
648169	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648170	contig_16650_pilon	-	2082	4	Intergenic	novelGene_61975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCGACTTCCCTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255997	244599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_244705_251251_251311_252974_253080_254184
648174	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
648176	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648177	contig_14925_pilon	-	990	5	Intergenic	novelGene_55151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	1559.6368968449	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	197	454	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWIFGSGTRLLVRPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	46426	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_46382
648196	contig_8317_pilon	+	398	2	Intergenic	novelGene_19363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16243	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16275_16377
648197	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648202	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_93477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
648210	SIRV4	+	315	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	663	970	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTAACATAAGTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
648219	contig_3095_pilon	+	1142	5	Intergenic	novelGene_75031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	64	762	147241	151865	FALSE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSRPQRIWCASWACWWVWWASLLAPFSSSRACAKAMLLNVVGLCEAPEGYGLS	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150629_151023_151163_151848
648221	SIRV7	-	249	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69037	0	35818	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78920	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
648224	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648228	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648234	contig_14925_pilon	-	1042	5	Intergenic	novelGene_55160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1562.64461330784	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92915	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_92819
648250	contig_15039_pilon	-	1670	7	Intergenic	novelGene_110143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_6	480.886218928715	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	280	903	200602	185257	FALSE	25	ACCAGAATGCTCCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260916	184489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_260778
648261	SIRV5	-	469	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACGGGTGACTACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
648262	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648269	contig_17440_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_7677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3704	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
648272	contig_6837_pilon	+	1958	9	Intergenic	novelGene_149824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	24.9546463609485	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	58	588	11753	15241	TRUE	15	TATGTTGGTAATTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11695	17338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15471_15617_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
648277	contig_7202_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_18340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
648282	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648290	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
648301	contig_8640_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_117734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTGTTTTCATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50854	50399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_-_50400_50900
648304	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_115947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
648307	contig_9468_pilon	-	1112	4	Intergenic	novelGene_59477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGGGCGTACGGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206755	201401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_201503_203173_203264_205638_205777_205972
648314	contig_6760_pilon	-	2034	13	Intergenic	novelGene_150798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	90.3427116902939	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	89	1240	435262	406719	TRUE	10	TTCTCCCAGCATCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKSSLGPAVVSQLCSSVKGAQRIPRPTPAMAFANLRKVLISDSLDPCCRKILQDGGLQVVEKQNLSKEELIAELQDCEGLIIRSATKVTADVINAAEKLQVVGRAGTGVDNVDLEAATRKGVLVMNTPNGNSLSAAELTCGMIMCLARQIPQATASMKNGKWDRKKFMGTELNGKTLGILGLGRIGREVATRMQSFGMKTIGYDPIIPPEVSSSFGVQQLPLEEIWPVCDFITVHTPLLPSTTGLLNDSTFAQCKKGVRVVNCARGGIVDEGALLRALQSGQCAGAALDVFTEEPPRDRALVDHENVISCPHLGASTMEAQSRCGEEIAIQFVDMVKGRSLVGVVNAQALTSAFSPHTKPWIGLAEALGSLMRAWAGSPKGTIQVVTQVFVRYSSFGSKRYLTRRGLACKRQ	435350	402433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_402773_403802_404053_405679_405811_406644_406793_407060_407194_409110_409264_411082_411232_411721_411855_418731_418831_418930_418986_423119_423186_425004_425157_435124
648316	contig_15063_pilon	+	1294	4	Intergenic	novelGene_14292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	335	1156	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34827	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
648318	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648323	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648347	SIRV7	-	286	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68998	2	35779	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78959	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
648348	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648351	contig_8538_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_4744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
648362	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648363	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657812	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657814	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648364	contig_7035_pilon	-	2665	1	Intergenic	novelGene_83510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCCTGTTACTGGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224946	222281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_222300_224900
648376	contig_960_pilon	-	1403	8	Intergenic	novelGene_108214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.5709755345731	86	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	61	828	335554	297068	TRUE	25	TGTACCTTGTATCTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEGESRAWQPSPGKKPQGERMQSCRLLGAGPQLSTFCVLQKLSGTMFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRGQD	335614	292509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_292818_294744_294888_296943_297080_306543_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_335540
648379	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648385	contig_12638_pilon	+	1726	9	Intergenic	novelGene_33059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1326	1679	39856	52021	FALSE	20	CTTGCATCTAAACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTPGLCEVPHLVIANVLGGEGSWEVSLTSSLQGHSGLAFFFFFFFFFGFTFTNSLNFFSLFFSLSFAVGELAETRFLARLSWLALSEDEEPLVWTCLFPGLSSGSGDFSIPWKYFM	13099	52068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_13305_17613_17795_19586_19992_23907_24102_26721_26826_38675_38856_39799_39965_40657_40754_51872
648399	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_115754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
648401	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648409	contig_9345_pilon	-	1616	4	Intergenic	novelGene_24401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.865756075907	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	47	466	173741	142333	FALSE	10	AGCTTTGTTTCTGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDRFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGEVQPCPTLPANLLTTRPTWIPQRQPP	173787	141182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142655_142781_142955_143072_173643
648411	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
648420	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648421	contig_4486_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_38607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCAGTGTGAAATGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353616	351673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_351700_353600
648435	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648438	contig_12603_pilon	-	2072	4	Intergenic	novelGene_105781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_2	222.796369409877	670	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	90	623	529148	523691	FALSE	15	TGTTGTATGTGGCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQVPYHLVLQDLQLTRSVEITTDNVLEGRIQVPFPTQRSDSIRPALNSPVERPNSDQEEGEASTQTERVPLDLSPRLEEALDFSEVEVEPSEVEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQRKDDLLQQARKRFLNKSSEHDSASESYLPSEGTSSDPVTLRRRMLAAAAERRLQKQQTS	529237	522241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_523839_524716_524902_527234_527319_529031
648439	contig_15304_pilon	-	1527	3	Intergenic	novelGene_30604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	53.5	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	186	1031	66228	64912	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104
648442	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648450	contig_1813_pilon	+	2355	12	Intergenic	novelGene_105473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	391.26932661584	133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	422	1207	128315	155153	FALSE	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSPLLGPRSVQV	102749	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_106495_106653_113656_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150064_155117
648451	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
648456	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648457	contig_16098_pilon	-	1579	9	Intergenic	novelGene_46138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1842.6311859675	2	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	279	1376	458816	456273	FALSE	10	AGGGGGAGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGSAGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460405	456069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456465_456669_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
648459	contig_5020_pilon	+	1446	7	Intergenic	novelGene_27805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1002.87032506147	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	365	931	122915	124860	TRUE	5	CCTTTTCTCTCAGTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGVLLVFLLEQG	118460	125942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124367_124829_125091_125657
648460	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648469	contig_11386_pilon	+	1481	6	Intergenic	novelGene_82763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	510.920111171991	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	168	872	17940	27749	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7892	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
648477	contig_10299_pilon	+	1536	7	Intergenic	novelGene_79675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	72.8005265548723	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	51	515	184652	185364	TRUE	40	ACAAAACTTGATACATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALCREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	184601	187676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_184854_184935_185088_185253_185534_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
648488	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648499	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
648512	contig_854_pilon	+	1119	4	Intergenic	novelGene_36219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1479.93941317429	69	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543481	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545993_562271_562405_563029
648515	contig_15063_pilon	+	1011	3	Intergenic	novelGene_14402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	53	874	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35218	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
648524	contig_11720_pilon	+	1340	10	Intergenic	novelGene_43938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	335.361312432641	64	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	13	1065	262271	272176	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFSLCPRPPHPLLRHPAHRASGRLQGSEGSVRPQRPAQRAAEPAASLCCAAHPHVHQHACLHARVCQWLAEQGHHFLHHGANLCHQSLLRGQLPAQSPPPCLLWSCSPAGRSLPGTYHLPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	262258	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265789_270570_270700_271268_271343_271806_271961_272096
648527	contig_8978_pilon	+	1978	10	Intergenic	novelGene_49390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	395.216677560831	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	77	856	339807	345642	TRUE	15	AATTTCCTGTGCTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQSEGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDARESRRYGWARWLWEVLWA	331586	348139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339968_342588_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345354_345397_345627_345738_347112
648543	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648544	contig_11846_pilon	+	1256	2	Intergenic	novelGene_105913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCTGAAATTGATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109909	112975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_110096_111905
648549	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_18509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648551	contig_9083_pilon	+	2636	21	Intergenic	novelGene_150132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_13	22.7100748567679	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2538	97	2634	1042625	1084022	FALSE	20	GTGAGAAGCGCCGGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAQDGGAQSCSVNVGGSRCPIVPDSEQWGRCAMSRLIVKNLPNGMKEERFKQLFASFGTLTDCSLKFTKDGKFRKFGFIGFKSEEEAQTALNHFNKSFIDTSRITVEFCKSFGDPTKPRAWSKHAQKPSQPKLSSKDPISPETKQDNKKKMVTSELEKLKGDTEFREFLSVHQRRMQVATWANDALDTKPVKGKSEPASDYLNFDSDLEQESEEEGAGKGSEAEEDLAPKAAVQKELSDMDYLKSKVVKAESSSSSSEEEESEDEAVNCEEGSEDEDSSAAPAQSEIGRKGASHKQEALSGKKQPQEAIAETEKPATQKEPTTPYTVKLRGAPFNVTEKSVMEFLAPLKPVAIRIVRNAHGNKTGYVFVDFSSEEEVKKALKCNREYMGGRYIEVFREKSVPMAKGPLKNSTKPWQGRTLGENEEEEDLADSGRLFVRNLPYASTEDDLEKLFSKYGPLSELHYPIDSLTKKPKGFAFITFMFPEHAVKAYAEVDGQVFQGRMLHVLPSTIKKEASEDADAPGSSSYKKRKELKDKANSSSSHNWNVLFMGPNAVADVIAQKYNATKSQVFDHETKGSVAVRMALGETQLVQDVRRFLIDNGVCLDSFSQAAAERSKTVMLVKNLPAGTLAAELQETFGRFGSLGRVLLPDGGITAIVEFLEPLEARKAFRHLAYSKFHHVPLYLEWAPMGVFSSSDPQKREPRDAAVDTDKADPETVPDSETPEVEKPAAGGEDDSSAKMEEEEEEEEEESLPGCTLFIKNLNFDTTEATLKDVFSKVGMVKSCSISKKKNKAGALLSMGFGFVEYRKPEHTQKALRQLQGHVLDGHKLEVRISERAIKPATTSTRKKQVARKQTTSKILVRNIPFQADSREIRELF	1042528	1084024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_+_1042661_1043194_1043378_1045881_1046002_1046195_1046235_1046546_1046740_1048520_1048787_1050579_1050661_1051336_1051416_1052845_1052918_1054329_1054534_1055893_1056025_1057059_1057182_1057948_1058046_1058984_1059096_1061725_1061927_1064090_1064212_1072920_1073091_1076201_1076263_1080185_1080266_1082120_1082177_1083907
648557	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_89425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648560	contig_5643_pilon	+	1865	8	Intergenic	novelGene_38757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	113.01959375006	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	829	1473	160600	163341	FALSE	25	CTGAGGCAAAGCTTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157844	163733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_159501_160367_160415_160519_160859_161443_161717_163015_163085_163297
648565	contig_12270_pilon	-	333	2	Intergenic	novelGene_114001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	9	332	14409	13863	FALSE	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14417	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
648569	contig_401_pilon	+	2524	2	Intergenic	novelGene_42889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1807195	1810371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1808842_1809493
648579	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
648592	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
648607	contig_12786_pilon	-	819	5	Intergenic	novelGene_103438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_4	659.894830635913	9	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	629441	615730	TRUE	60	ATATAACTGAAACAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPVREPSESCHFLSPWVFVAGVAARIWRSGSKRSPRSVLQIRTDLPAAHSPLRPRVRIRSGGGSEEGGQGRRSSAPRESSPVPLEGVWRALWNVPGAHGRAGKN	629441	604380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628911_629303
648624	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	2	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
648631	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648636	contig_16098_pilon	-	1224	14	Intergenic	novelGene_45775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_12	291.517941230332	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	253	954	36010	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	37600	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_37075_37228_37500
648638	contig_6020_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_155564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAAAGTGGCCAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290461	289701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_289700_290500
648642	contig_20646_pilon	+	1561	11	Intergenic	novelGene_145018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_6	201.66182087842	899	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	23	1345	25749	40819	FALSE	5	GACCCTTCTGTCCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	25726	41035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_25752_31252_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_38470_39122_39278_40684
648645	contig_10976_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_155603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228169	229564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_228200_229600
648652	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648670	contig_730_pilon	-	1841	13	Intergenic	novelGene_155618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	29.7414787049258	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	300	1280	212398	207837	TRUE	25	TACTATATCCCAATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTSKDKRDVYYRLAKENGWRARSAFKLLQLDEEFQLFQGVTRAVDLCAAPGSWSQVLSQKIEGGHVVAVDLQAMAPLPGVLQIQGDITQLSTAKEIIQHFDGCPADLVVCDGAPDVTGLHDVDEYMQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVEDSDMNCSP	214552	205810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_206363_207827_207870_208085_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211836_211931_212002_212277_212439_214293
648677	contig_17274_pilon	+	2295	11	Intergenic	novelGene_26555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_10	227.549994506702	1	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	144	923	195747	215532	FALSE	25	AAATAGGGCTTATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLDRKFARLGLQLEAIFEKNFKDIFAIQENNE	184666	216904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_215439
648683	SIRV2	-	572	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4301	34	3126	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
648692	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10391	45	1154	-43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTACTAAGCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11391	11781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
648700	contig_8538_pilon	-	2533	3	Intergenic	novelGene_4612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	5	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1383	1781	694515	692579	FALSE	15	GCGCCTGATCATCCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPVWQLMMGSVSCHLTVRLLSPSHGPCALGDLGTGGLLMIYI	695897	691826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_692905_693724_693784_694501
648706	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648711	contig_20819_pilon	+	1388	6	Intergenic	novelGene_55619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.4347497948847	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	120	1199	23529	25305	FALSE	0	TTGTTTTCCTGTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPVSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	23224	25494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_23309_23493_23643_23798_24004_24175_24654_24809_25033_25245
648713	contig_18869_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_56248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73565	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
648722	contig_5945_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_104581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAAAAACCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265320	266371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_265300_266400
648729	contig_9146_pilon	-	631	5	Intergenic	novelGene_79497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3629	junction_4	529.961791075545	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	86	592	146356	142549	FALSE	25	CTGACAATGTTTGCACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	146937	142509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894
648736	contig_612_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_155629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241224	237896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_-_237900_241200
648737	SIRV5	+	445	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-115	875	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8200	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
648739	contig_7440_pilon	-	1217	9	Intergenic	novelGene_61156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	260.705503154421	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	53	763	71121	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	71173	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070
648742	contig_18794_pilon	-	2176	8	Intergenic	novelGene_54657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	90.0657356306708	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	10	909	353203	325647	TRUE	25	ATTATCTGTGCTTGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	353212	323918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325149_325609_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145
648743	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTAGAGGTCGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1994_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
648748	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648751	contig_8259_pilon	+	1265	4	Intergenic	novelGene_148858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	83.1504660239496	1481	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	141	467	57950	63870	FALSE	25	TCCTAAATGGTAGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSSSSAGGVSGSSVTGSGFSVSDLAPPRKALFTYPKGAGEMLEDGSERFLCESVFSYQVASTLKQVKHDQQVARMEKLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTPS	53152	64668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53266_57922_58092_62754_62830_63760
648760	contig_9594_pilon	+	1403	8	Intergenic	novelGene_73940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	549.434217339686	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	393	968	319403	322451	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301217	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310575_319384_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
648768	contig_17281_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_105199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACATGGTACTTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2400_3500
648771	contig_4604_pilon	+	2794	2	Intergenic	novelGene_19131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	287	junction_1	0	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAATAAATAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339836	351029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292
648774	contig_8167_pilon	-	2218	9	Intergenic	novelGene_155659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	14.6543508897528	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	471	1463	148855	137246	FALSE	35	CTGAGTAGGTCAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKWPLPGPVTQKMSLVSAVFDQVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKALLPSMIERRQGHVAVISSIQGKISIPFRSAYAASKHATQAFFDCLRAEVRQHEIEVTVISPGYIRTNLSLNAITADGSRYGAMDKTTAQGRSPADVARDVLTAVGKKKKDVILADLLPFLAIYLRTLAPRLFFSLMASRARKERKSKDL	180453	136490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_143387_143934_144212_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_180258
648789	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_95858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648797	contig_16411_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_77283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAACTGTTTTGTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40552	38558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_38600_40600
648798	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
648803	contig_12977_pilon	+	1564	14	Intergenic	novelGene_122775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_11	678.864253408745	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	228	1385	10887	58627	FALSE	0	GCCCTGTTCTCTTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPGSPGCCMQVPRWRQPQLLPPPERPRPPPPEKSDAVYAAIAVQDGLRTPTAPAQDYRALYDYTAQNHDELDISAGDILQVVLEGEDGWWTVERNGQRGFVPGSYLEKL	10659	58806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_56950_57007_57242_57378_58495
648809	contig_8729_pilon	-	1434	4	Intergenic	novelGene_40155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	281.033015063276	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	180	767	770511	765591	FALSE	25	CACAGTAGTTTATGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFTPTNQIRLTNVAVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770690	764923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_768620_768822_769438_769569_770383
648811	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	635	1121	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
648814	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648823	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648829	contig_9706_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_20816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGCCCTAACTATATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
648834	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_97022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	68	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
648844	contig_12654_pilon	-	1679	15	Intergenic	novelGene_129303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	504.560148919384	26	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	173	1306	776288	759069	FALSE	20	TAGCCCACACTGATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTATDWWTEDCRRSMYPPSGPTYRGPVPWYTVNLDLPPYKRWHELMADKAPALRIIVNSLKNLVNAFVPSGKVMQIVDQKLPGLLGPLPSPFEEEMKGIAAVTEIPLGEIILFNIFYEFFTICTSIVTEDKEGHLLHGRNMDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788148	758695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_768979_769059_771246_771334_771768_771860_775941_775989_776264_776354_788041
648856	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648862	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	234	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648865	contig_19342_pilon	+	798	6	Intergenic	novelGene_41122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.18747549010185	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4284	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4365_5016_5151_5443_5522_5960_5994_6139_6186_6353
648879	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
648881	contig_14326_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_120654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATCTCTGTATTACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32204	31825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_31800_32200
648887	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
648904	contig_10940_pilon	-	1835	4	Intergenic	novelGene_49273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1028.13325984524	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	281	496	893258	875564	FALSE	70	TTTTAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPRRLPRSLTPRLGRSGSLACFWGGSFAAALRRWPQGSTKRLAGQRTTWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917102	874224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893153_893306_916664_916748_916952
648927	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_97340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
648937	contig_5981_pilon	+	2273	10	Intergenic	novelGene_35537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	117.748738558418	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	917	1489	313385	317012	FALSE	25	GGACATTTGTACCTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAFSLYEDEIGDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLRRESPESEGPIYEGLVL	302222	317796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_302273_305007_305105_305209_305359_307394_307603_308170_308302_311284_311395_313213_313394_313869_314110_314545_314690_316832
648938	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657833	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657834	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
648942	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648943	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
648951	SIRV7	-	337	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33232	0	13	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114725	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
648966	contig_3986_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_52701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	129.606971039944	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	108	464	60653	52941	TRUE	30	TAAGCCCAGCTTACATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSSAAAASEQVSLLPDLHPTISSLHSSERELFKQMGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVVL	108502	34921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39820_44798_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54777_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396
648967	contig_4469_pilon	+	2324	2	Intergenic	novelGene_21956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	169	522	755197	755701	FALSE	45	AAGAGAAAAAGAGTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTFPHSSGEQSGSDTDTDSGYGGELEKGDLRSEQPYFKSDHGRRFATGERIGTIKQESEEPCPCWRSAGIPPPFQCYTQVSTLLLQPSPAS	755028	757503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755456_755606
648977	contig_5317_pilon	-	3028	15	Intergenic	novelGene_76575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_9	185.9113377667	191	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	23	1651	308205	233889	FALSE	40	AATTAGTATTATCTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELDQLPDESSSAKALVSLKEGSLSNTWNEKYSSLQKTPVWKGRNTGSAAEMPFRNSKRSRLFSDEDDRQINTRSPKRNQRVAMVPQKFTATMSTPDKKASQKIGFRLRNLLKLPKAHKWCIYEWFYSNIDKPLFEGDNDFCVCLKESFPNLKTRKLTRVEWGKIRRLMGKPRRCSSAFFEEERSALKQKRQKIRLLQQRKVADVSQFKDLPDEIPLPLVIGTKVTARLRGVHDGLFTGQIDAVDTLNATYRVTFDRTGLGTHTIPDYEVLSNEPHETMPIAAFGQKQRPSRFFMTPPRLHYTPPLQSPITDNDPLLGQSPWRNKISGSDTETLGGFPVEFLIQVTKLSKILMIKKEHIKKLREMNTEAEKLKSYSMPIGIEFQRRYATIVLELEQLNKDLNKVLHKVQQYCYELAPDQGLQPADQPTDMRRRCEEEAQEIVRHANSSTGQPCVENENLTDLISRLTAILLQIKCLAEGGDLNSFEFKSLTDSLNDIKSTIDASNISCFQNNVEIHVAHIQSGLSQMGNLHAFAANNTNRD	308227	232511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_233995_234486_234585_234740_234921_241677_241804_246223_246305_250417_250520_250795_250916_253010_253145_267415_267574_273634_273761_275004_275139_297457_297563_299180_299276_300751_300785_308174
648984	contig_17603_pilon	-	1536	5	Intergenic	novelGene_152774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	31.8198051533946	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	261	578	42632	42315	TRUE	40	CTGGCTTAAATAGGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHICNSRGSVSTAVWCVDQTLFICLQTAQCSASTPVPLPDVASWAQRRHSLRLPEAGEGNGEFYGELGSPYHKRVRLDMNCWGSSCVLRDWFLKEEEKWQRRPRD	47103	28906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_29014_29505_29578_30571_30807_41770_42697_46907
648996	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649004	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_89422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
649009	contig_14209_pilon	+	1912	12	Intergenic	novelGene_88310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_8	141.102213698949	865	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	87	905	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTGVYIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32279	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418
649013	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
649015	contig_16870_pilon	-	2454	23	Intergenic	novelGene_155513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	87.0316746747655	875	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1311	1144	2454	199125	194661	FALSE	20	GCCACGTCCCAGCGTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGVEELQKKLEMSELLLQQISSASDKSEVLQQAQAEQAKLESRIEQLMEIVKQLQIERDHYAETLKTESAIWRQQAQQLLEQVQTLGEEKEHGVVRVQELEASLAELKNQTAVPPPEEPPPGPSEEEQRLHAEAERLQKELERLTGQLHFHLKDNETLTHQNQEQEQKLRELQRIAECWNEQEAAREKILETMQNDRTTISRALSQNRDLKEQLAELQDGFVRLTNENVELTTALQSEQHVKKELAKKLGQLQEKLGELKETVEVKSQEAHSLQEQRDQYLSDLQQYMAAYQQHVAAYQNLTSEKETLQKQLQLQTQLMEQLQLEEAQRKMAAEVVRQELQQTQERLEAASQQNQQLQAQLSHMAVPEEGNGLDNEEEDEEASQPELSIPEDLDSRDALVAFFNSALASARKEQAQLRGQLKEQKLRCQQLAHLE	209245	194660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_194769_195040_195130_195364_195441_195525_195772_196501_196616_196927_197266_197706_197795_198281_198390_198506_198588_199062_199205_199521_199581_200599_200707_200806_200901_200988_201052_201321_201366_202226_202308_202502_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_206376_206458_207462_207586_209118
649016	contig_10082_pilon	-	1799	2	Intergenic	novelGene_63874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCGTTTCTTGAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212269	210320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210904_211053
649022	contig_3948_pilon	-	2017	13	Intergenic	novelGene_53320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_12	390.476089394586	4	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	187	1698	1494311	1468245	FALSE	25	GACTTCATCAACAGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510951	1467925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
649028	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	15	350	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14423	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649037	contig_4105_pilon	+	2058	6	Intergenic	novelGene_21482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	162.472151459873	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	661	1014	72453	73266	TRUE	30	CATATTTATCAGAACTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGIMFPRDYILDSEGDDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	70641	74470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_71173_71624_71683_72381_72506_72602_72769_73131_74228_74387
649046	contig_6230_pilon	-	2450	14	Intergenic	novelGene_102090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	71.7193742237985	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	13	1083	157542	118618	FALSE	35	CCATGAAGTATTTCAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVATFEPQASAGPRPPVCLLVLGMAGSGKTTFVQRLTGHLHSQGSPPYVISLDPAVHEVPFPANIDIRDTVKYKEVMKQYGLGPNGGIVTSLNLFATRFDQVIKFIEKAQNMSKYVLIDTPGQIEVFTWSASGTIITEALASSFPTVVIYVMDTSRSTNPVTFMSNMLYACSILYKTKLPFIVVMNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVSNLTRSMSLVLDEFYSSLRVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATDSLSPVLDPSDLILTRGTLDEEDEEVDSDTDDIDHRVTEESHEEPAFQNFMQESMAQYWKRSNK	157554	117250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128222_132861_132953_133621_133662_134932_134962_135714_135862_136512_136559_137144_137240_137622_137702_147637_147676_148371_148439_149453_149494_156635_156730_157431
649051	contig_9099_pilon	+	2568	4	Intergenic	novelGene_149926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	215.846138616274	776	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACATGTCCATTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420069	430894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_420098_420792_420845_428013_428456_428848
649054	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649058	contig_12250_pilon	+	1698	8	Intergenic	novelGene_80679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	259.394585564942	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTTCTGGTGTGCGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391613	394992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_394382_394687_394775_394867
649060	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649067	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_116455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
649069	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649079	contig_6710_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_95108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGCCCCTGAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
649083	contig_1146_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_84864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	134	499	1269451	1269816	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKNEVVKDFILHGSTINVHGSSSQEIKCHIALGKSAAKDLFQVLKIKDVILQTKVHLTEAVVFSVASYACGSWTMNKEDRRRIDAFELWCWRRILNIPWTSRKMNESVLEEIQPEWF	1269317	1271091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_1269300_1271100
649086	contig_8138_pilon	+	1323	5	Intergenic	novelGene_52407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	229	684	280295	306552	TRUE	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280066	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306886_307631
649093	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649094	contig_13787_pilon	-	2663	9	Intergenic	novelGene_40606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.379683521758	1	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	292	960	205032	131430	TRUE	30	ATTTAAGACTATATGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	205323	129657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_130993_131061_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
649098	contig_2730_pilon	+	1429	5	Intergenic	novelGene_135360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.650551831383	118	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTGTGCAGTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291590	394316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685_391147_393657
649104	contig_21388_pilon	-	1559	4	Intergenic	novelGene_136631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	599.200207684284	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1003	1353	26799	21603	FALSE	10	TAACCTGCGTGTGGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28505	21396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_27649_28352
649107	contig_4301_pilon	-	1973	5	Intergenic	novelGene_65124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_2	104.406357565045	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	177	863	551260	542107	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNVRTSDTSFLAFLSPLGSLLLPTHFPLQFGDR	575651	540996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_542416_543699_543840_547294_547521_551248_551329_575543
649116	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649125	contig_10311_pilon	-	1538	9	Intergenic	novelGene_50455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1045.01614820059	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	324	689	68953	67247	TRUE	25	TCACTTAAAAGTTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIPIRVKPCSHNYRLVGSWD	71557	65134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67536_68295_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
649126	contig_9389_pilon	+	1403	6	Intergenic	novelGene_83931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	878.324404761703	14	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	149	745	164237	167739	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQALGRPLSSPPTTRRGQTTEVPHVASPHIIASSGFWGFVLFFYMLERCQRRVCGRLGGEWPGVWVPPSLGFLPELSHQARGRGKGHISLHWGS	159627	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_167460
649132	contig_7963_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_58595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	510	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	567	983	268683	267891	FALSE	0	GGTTTTGTTTTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFRYEFICTGILGSSHNLLIRAVLQSISNVVPHRAREKHRLLPHQNHLSVQVAVLILGDGLPIQQQLAPCGLVQILQQGSHCALPRPIGSHQRGHLTRTKGERQPLEHRLVRMTGICKGDIFEFHMPLQGGRGPCP	270151	266652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_267985_268168_268343_268534_268695_269100_269239_269734
649135	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
649139	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649144	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
649145	contig_7887_pilon	+	1864	5	Intergenic	novelGene_124923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.72041357143	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	248	841	580030	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLSWAGNQGRQQQVQRKTEAGSGGSHQSLGPPQLWPPVRTRIKVGYSLAQRACLWRPWAQNPRWTQNLTWPPRPLQASPRQMVKNWLGRWMEKSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	575160	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_575232_577973_578059_579938_580066_584657_585122_585612
649148	contig_5928_pilon	+	2080	6	Intergenic	novelGene_40354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	57.0508545071851	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	98	700	172241	180115	TRUE	25	AATTCTATTTGATCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNNGCPESETHSLGKFKTSLRENVLGSPKELMKLSVPSLVYAVQNNMAFLALSNLDAAVYQVTYQLKIPCTALCTVLMLNRTLSKLQWVSVFMLCGGVTLVQWKPAQATKVVVEQNPLLGFGAIAIAVLCSGFAGVYFEKVLKSSDTSLWVRNIQMYLSGIVVTLVGVYLSDGDEIKEKGFFYGYTYYVWFVICKYLRIKGFGSIPPSSPFLKLDVHFKDLQHFDIVPLVL	141763	183579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_141791_172170_172331_172519_172673_177706_177774_179822_180594_182677
649166	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
649179	contig_14322_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_116551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGCAGCGAGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
649181	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649187	contig_13863_pilon	+	2041	21	Intergenic	novelGene_41980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	421.43331619605	18	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	992	2041	65713	77680	FALSE	40	AATAAACGTTCCTTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSK	48550	77680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54864_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65657_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545
649192	contig_6975_pilon	-	1252	6	Intergenic	novelGene_74273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	398	junction_1	322.655605871028	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	430	1065	162573	159453	FALSE	50	ACTTTGACTTAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFSLNCTGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	163002	159265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461
649194	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649197	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649207	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649210	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649224	contig_11285_pilon	+	2095	13	Intergenic	novelGene_5569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	498.001359603231	2	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	43	1830	766060	769878	FALSE	0	GGTGTGCGTGTGCGTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763554_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
649225	contig_7412_pilon	+	1633	8	Intergenic	novelGene_76337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTCGGGAGCCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364270	377345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_364411_364520_364699_365778_365993_370207_370336_370533_370749_373400_373528_375276_375803_377240
649232	contig_7119_pilon	+	1553	4	Intergenic	novelGene_40977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	433.692159127749	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	45	1040	137087	139798	TRUE	40	GCAGGCACTCAATAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTAPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137042	140920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707_138900_139004_139842_140450
649237	contig_753_pilon	-	1810	1	Intergenic	novelGene_112995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1379	1690	1254251	1253940	NA	30	AATACTAAGGTTTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTPKAYDLLPGDQLVWRGLAGALSTGGVQDADQLLDVSYVGLHLHQHGLMFQAGGSTQNGKSFMERKLDIQMVVLKCFILGTAKIDIINDIIYQVFYTCLS	1255629	1253819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1253800_1255600
649240	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649250	contig_3095_pilon	+	1184	5	Intergenic	novelGene_75106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	145	768	149709	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLLSSTDSYQITPEDNGPKWSPGTRISEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147191	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147272_149644_149896_150413_150696_150996_151163_151848
649254	contig_7342_pilon	-	2139	16	Intergenic	novelGene_71101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	104.642120263942	3	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	442	1200	81495	77251	TRUE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKPLRSSATAPANHTALWKEPAPSP	83032	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77719_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798
649265	contig_9195_pilon	+	2656	3	Intergenic	novelGene_155686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	18.5	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1854	2531	321541	325639	FALSE	10	TGAGGTGGTTTCCAGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCYVGEGPHGAGRGGSGTRGSVSGSGPTRRHSTVGSSFALLTVTLRSCFYSLGIKSLHPSVSRFPAALLHVHLEQKRNAVPGREGGVPSAEDLICGASAGEHLSQCLSSSLLLEKEENRRFEDQLQQWLSEDSEAFTDSTSLPLYLPQTLVSMPQIIQSVKTSTTPSPQNKRTREHLQPSEVMGASLTEQLKHLERLIRSSREEEAASELHLLCAAGHGGHLST	319687	325764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_321903_324276_324425_325471
649273	contig_5222_pilon	+	2016	6	Intergenic	novelGene_58981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.275409178782	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	59	742	155000	188217	TRUE	35	TTGCAAAAATGATTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNVCKPAEEPRQPPTLQEIKQKIHSYNSREKNCLGMKLSEDGTYTGFIKVHLKLRRPVTVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSEVIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSVADCPLYLRLLAGPDTDVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYDKFRQKLEEALRESQGKPG	154941	190399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_155006_183985_184097_185448_185747_186224_186341_188064_188818_189725
649280	contig_2892_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_118992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTGATGACAACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75540	77748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_75500_77700
649283	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649285	contig_10324_pilon	-	2196	8	Intergenic	novelGene_7802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	331	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	169	477	135727	135419	TRUE	10	TTCTTCTTGCTGGGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQTPGNKLCSNHFDQFLPEQTQNLASQRRGRLCCKKNCRPDPNSYEFPKRTPARTQDLSRVRWCSSAHRDERDYRRSQAGCVPSNTAPLWAGSSLGKEAAY	135895	131636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_131655_132017_132236_132665_132820_133235_133362_133455_133602_133736_133879_134039_134097_134560
649288	SIRV2	-	273	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	35	3424	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
649294	contig_11088_pilon	+	921	5	Intergenic	novelGene_85024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	75.9420008954202	35	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10720	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_10919_13625_13696_14663_14937_16250_16348_17119
649302	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649305	contig_5229_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_117672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACCTTTGAAATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153364	153050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_153000_153400
649306	contig_15434_pilon	+	1207	9	Intergenic	novelGene_56700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	443.286853374877	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	32	1027	26904	33302	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSVAHLARANPFNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26633	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_26945_27034_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
649310	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649320	contig_9183_pilon	+	2400	7	Intergenic	novelGene_40327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	367	801	312219	315445	TRUE	0	GCGTCTTCCTGCCGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQASSRVMPCMAELASCRISSPGWTVSLCSEAVPLNILLMVRGLSPWSEPFPPSRLKPSPAEVFSRVTVQTSVESTEASLATEIEAEESVEEFRSGVSSKAGFLVTITACRGSRAWRRMARASVCVAPLRDFPLMDRTSLPF	311852	325972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_312324_314769_314888_315233_315491_318242_318342_320551_320727_322743_323919_325867
649328	contig_1225_pilon	-	1580	4	Intergenic	novelGene_44184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGTGTACCCTGCCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276800	251373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_251502_253414_253517_274219_274839_276069
649330	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
649343	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649344	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_93789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657164	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657165	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649357	contig_14909_pilon	-	1860	13	Intergenic	novelGene_155708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCTATCAAGCCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133240	108300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_-_108788_112654_112702_116615_116727_117843_117964_119445_119520_120069_120210_121369_121511_123936_124029_124108_124218_131056_131199_131426_131537_132125_132257_133084
649362	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
649373	contig_18869_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_56258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTGAGAATTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73352	73550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
649387	contig_21388_pilon	-	872	5	Intergenic	novelGene_136624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	247	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	13	663	28487	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28499	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
649394	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_89166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653696	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
649395	SIRV4	+	509	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	7	434	7	-434	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAATTGCTCGTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462	2337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
649402	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649406	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCCAGATCAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
649409	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649434	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649437	contig_4105_pilon	+	1962	12	Intergenic	novelGene_21458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	122.274518405266	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	89	1258	60529	73617	TRUE	30	AGAACTGCCGTGACAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQREVSTPFSAAVWA	58728	74480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72745_73575_74232_74390
649442	contig_10494_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_102145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATTGAAGTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440123	441562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_440100_441600
649445	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649455	contig_9839_pilon	-	3069	2	Intergenic	novelGene_88550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204779	197447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_198608_202870
649457	contig_9199_pilon	+	2158	12	Intergenic	novelGene_65618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	91.5376452388184	12	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	52	1182	42527	57407	TRUE	25	GACACATCAGCTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF	42475	59152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087_57129_57304_57988_58756
649460	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649461	contig_15304_pilon	-	1705	3	Intergenic	novelGene_30606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	191.5	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	277	741	66228	65380	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLGTALP	71750	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65721_66104_66402_71647
649498	contig_13894_pilon	+	1136	10	Intergenic	novelGene_62110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2509.51212611358	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	130	1080	521676	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPSLSTSRPSWTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521713_522779_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
649499	contig_6710_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_96057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACAGAAGCACTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
649507	contig_848_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_83336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGGCTATATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549938	547963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_548000_549900
649510	contig_17859_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_155717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGGTGTGGCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204490	201967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_204270_204461
649518	contig_15354_pilon	-	2089	3	Intergenic	novelGene_65710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.5	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	124	1050	224900	223758	FALSE	20	GCTTCACAGTTTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTEEIVGFRIVLGNVLGSLPDQTLAAEASRPIPQLLLLCVAMGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227716	222718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224041_224256_224922_227614
649521	contig_5485_pilon	-	1683	3	Intergenic	novelGene_37690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	671	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	175	873	86314	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88088	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_87965
649524	contig_14744_pilon	-	2214	13	Intergenic	novelGene_66121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.1389405553514	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	60	1739	1601809	1588029	TRUE	10	TATTTTCTCCTGTGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604744	1586136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1586505_1587921_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
649525	contig_15304_pilon	+	1038	3	Intergenic	novelGene_30542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	148	609	53036	53680	TRUE	35	CAGGCTCTGGAGCAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHQAGEIITLLPGLGLHAQHTGHGKGDSFLAWLLPWGPGQVVVLGQLLGPVPPAHQHVLGAESTHHACQCHQFVQRQLLRRWWQQVDLGWESFWKWWQIGSQPRGGWQCRRSSSHSSRAPCSQEGCWTRYSSHRSLAQVPSVRHLSHLRSAR	52888	54288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53312_53494_53813_53991
649530	SIRV7	+	362	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTGCGTTTTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78962_114683
649534	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
649541	contig_14322_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_116190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671894	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
649542	contig_6027_pilon	-	1831	11	Intergenic	novelGene_74436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.2456322602597	18	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	45	1337	279665	263119	TRUE	5	CTCTGTCTGTTCTCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNVSRTDLDMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	280669	262062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262344_262905_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265867_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648
649545	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649548	contig_7695_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_41548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	166.785041295675	18	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	68	1165	380076	375835	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRHLLPTSGAAAASAAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381072	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373807_373881_373991_375826_376521_379664_380089_381017
649549	contig_10003_pilon	-	2327	8	Intergenic	novelGene_88171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_7	1019.85649250575	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	221	1024	473315	416793	FALSE	75	GGAAAAAAAAAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYSEKTEIQRQTVRAHSVKLFIFSALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQVKPHLFLILPQYS	548604	415489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_416923_430739_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195_473334_531527_531657_548531
649558	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
649559	contig_6191_pilon	-	1999	5	Intergenic	novelGene_107845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	59.3316947339278	1016	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	84	551	194667	161767	FALSE	25	GCTCACAAATGTTGCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLRGLRLAAGSFFRSCERDVSLSIRLTRSTDLKRRNGFCTKPQESPKAPSHSYSHKVPLHKPTDWERKILMWSGRFKKEEDIPETISFEMLDAAKNKIRVKISYLMIALTVAGCIFMVIKGKKAAKRHESLTSLNLEKKARLREEAAMKAKAE	194750	160318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_161860_163091_163201_166280_166390_169254_169378_194633
649568	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649580	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
649587	contig_14682_pilon	-	2574	7	Intergenic	novelGene_139106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.9356821279038	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1028	1573	96253	94370	FALSE	20	TCATTTTTCACACTTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	141873	93368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96470_119765_119809_122397_122532_124154_124254_137167_137317_141487
649593	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649603	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649606	contig_6795_pilon	+	2188	4	Intergenic	novelGene_27712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAACAACCAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136176	154292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_137888_147311_147426_148238_148359_154049
649638	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649644	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_93684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
649645	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_116380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671655	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
649650	SIRV4	-	176	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1347	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3811	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
649653	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
649660	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	15	350	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14423	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649662	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
649668	contig_1154_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_87232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652240	1651297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1651300_1652200
649669	contig_15029_pilon	-	3146	22	Intergenic	novelGene_128208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	212.767233594861	543	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	113	1771	243863	238231	TRUE	25	CAAGGCTCATGCTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPGSGVSRLPAFSPSFSPAATPLCPAAPLPGSPPGASMALLASTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQGLCEALGVEAGGGLTQYHKIKAQLNYWSAKSLWAKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRAAVELALLGARVVLVEKRTKFSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWGVTFNGLQPPPKKGGGWRAQLQPSPPTQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFTVREMRGKLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLRLGVLRQDYSETDRLLGSANVVPEALQRFARAAADFATHGKLGKLEFAQDAHGRPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVEPFWPLGTGVARGFLAAFDAAWMVKRWAEGAEPLQVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAVTPNQVRDLYDVLAKEPVQKSDKTDAGKLATAGTQEALLHWCQEQTAGYAGVHVTDLSSSWADGLALCALVHRLCPGLL	245483	233447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_233778_234224_234299_234399_234500_234712_234807_234933_235048_235333_235447_235595_235873_236124_236202_236533_236691_236806_236846_238230_238377_238940_239020_239166_239294_239477_239594_240117_240376_241286_241388_242008_242165_242490_242596_242939_243045_243322_243531_243605_243952_245459
649675	SIRV4	+	299	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	212	439	212	-439	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATTCCAATTGCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667	2332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
649678	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	15	365	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14423	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649683	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649689	contig_4232_pilon	+	2227	2	Intergenic	novelGene_63221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	904	1242	148204	148542	TRUE	30	AAGATTCATTAATGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCVWLISQASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	147300	149694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_149337_149503
649690	contig_11656_pilon	+	1740	8	Intergenic	novelGene_54038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	117.376074466404	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	103	990	521809	536596	FALSE	30	TCTTTTAAAAATTGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLRLASEVSPYSLFLCFYWHSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDPWPEALAQWPLLQ	521706	537346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527575_536553
649691	contig_4783_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_108390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAATCACAGTGGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244880	245992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_244900_246000
649694	contig_6364_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_51749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACACATACAGATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575539	575790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_575500_575800
649697	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	20	CTGGTACCACAGTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649699	contig_1948_pilon	-	2386	2	Intergenic	novelGene_31183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1593	1967	546963	544410	FALSE	40	AGAAAATTATACTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIGGVYFPPSSLVNLVHFVAASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	548555	543990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754
649702	contig_14322_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_116570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACAGCAGCGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
649711	contig_9482_pilon	-	1463	9	Intergenic	novelGene_44289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	148.839468891823	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	41	1234	1253164	1236365	FALSE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253204	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238287_1240918_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
649715	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
649720	contig_14322_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_115774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671665	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
649723	contig_4301_pilon	+	1622	5	Intergenic	novelGene_65084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCAGGAGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419761	425718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_420177_421109_421196_422457_422552_424139_424209_424760
649725	contig_13780_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_149104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAGTTAAAATAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807267	805171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_805200_807300
649726	contig_8357_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_39719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_2	132.831555822486	754	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	67	441	499229	509868	FALSE	25	TTAATGCTTCAACCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEEDPTFEEENEEIGGGVEGGQGKRKRLFSKELRCMMYGFGDDQNPYTESVDILEDLVIEFITEMTHKAMSIGRQGRVQVEDIVFLIRKDPRKFARVKDLLTMNEELKRARKAFDEANYGS	499162	510931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_499256_500143_500223_507469_507568_509697
649733	contig_19579_pilon	-	1259	6	Intergenic	novelGene_59397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_5	556.754739539773	348	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	106	918	13090	8093	FALSE	25	TTCCAGATTCTTCATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVSLSSPTSSPSSVPSSSTLSHFVSPC	13195	7751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12301_12900
649734	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649739	contig_15063_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_12658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	4	1416	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
649755	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
649765	contig_6227_pilon	-	1884	17	Intergenic	novelGene_49731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	419.828978387331	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	34	720	1224979	1211239	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNVSGEMGLPYQSEGVWN	1225012	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203153_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204210_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206591_1206641_1211210_1211265_1213124_1213222_1214096_1214244_1214340_1214386_1222034_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
649771	contig_6654_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_85765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAACAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610776	611447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_610800_611400
649774	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649775	contig_15888_pilon	-	1322	7	Intergenic	novelGene_84408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1427.25408467526	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	253	612	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGVGGRTRRYGGGAARKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259757	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254259_259708
649796	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649808	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10439	1	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11439	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
649810	contig_1594_pilon	-	2251	18	Intergenic	novelGene_138821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_15	67.6792762155872	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	736	2031	747636	503479	FALSE	20	CATTGCTCTGGGAATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKVSYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKAKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETV	810141	503258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_777250_777306_777805_777976_810114
649813	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649824	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649830	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649848	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
649851	contig_13021_pilon	+	1815	11	Intergenic	novelGene_8251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGATGGAAGTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208095	260041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_208141_209328_209716_210464_210559_211873_211936_212063_212127_213079_213167_215156_215269_218018_218308_231603_231882_252257_252369_259754
649860	contig_2100_pilon	-	1269	9	Intergenic	novelGene_50716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1019.92768585572	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	453	923	1175725	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTN	1185504	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170271_1173266_1173374_1174204_1174403_1175562_1175771_1176761_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
649874	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649880	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649890	contig_14924_pilon	+	1511	7	Intergenic	novelGene_104158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	45.5902645552998	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	6	569	44129	54014	FALSE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPALLLTFWSQWE	44123	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46798_53981
649893	contig_8317_pilon	+	473	2	Intergenic	novelGene_19324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
649895	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_89285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
649907	contig_1225_pilon	+	1469	4	Intergenic	novelGene_44176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	91	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251344	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274720_276088
649909	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
649910	contig_18869_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_56279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73701	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
649911	contig_7202_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_18656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGAGGCCTGGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
649917	contig_8317_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_19952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
649918	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649926	contig_2069_pilon	-	1269	6	Intergenic	novelGene_23424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	899.078995416977	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331366	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329558_1329857_1329892_1330155_1330201_1331254
649927	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	88	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
649929	contig_14441_pilon	+	1166	6	Intergenic	novelGene_100465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	380.031893398436	168	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	8	394	85423	113194	TRUE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAMRALPLACALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASSFATAPRRKTVFRQRD	85415	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85881_113163_113209_116578_116963_117220_117344_117539
649936	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
649937	contig_9017_pilon	-	2289	4	Intergenic	novelGene_130330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	38.1779459315919	305	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	223	564	218109	217768	FALSE	20	GTGGAGCATCAGTCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	224369	216042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218126_219573_219605_220072_220147_224268
649955	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
649968	contig_7066_pilon	-	1894	2	Intergenic	novelGene_42173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	506	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	138	689	921597	919206	FALSE	65	TGAAAAAAAAAGAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRAGPRAAGTDGSDFQHRERVAMHYQMSVTLKYEIKKLIYVHLVIWLLLVAKMSVGHLRLLPHDQVAMPYQWEYPYLLSIVPSLLGLLSFPRNNISYLVLSMISMGLFSIAPLIYGSMEMFPAAQQLYRHGKAYRFLFGFSAVSVMYLVLVLAVQVHAWQLYYSKKLLDSWFTSTQEKKRK	921734	918000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_919669_921508
649969	contig_5018_pilon	+	1774	5	Intergenic	novelGene_47123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	47	junction_1	102.555777506682	881	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	181	489	1448095	1448541	TRUE	10	GCTGTTAGCCTTTTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALCPLLLAVLMGVPAGTLTCYGDSGQPVDWFVVYKLPAKSGPGDAAGRGLRYKYLDAGSGGWRDGAGLISSSAGAVGRSLLPLYRSNASEVKGRGDKSRV	1447914	1450987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1448190_1448327_1448689_1448986_1449152_1449244_1449443_1450212
649975	contig_7720_pilon	-	2260	16	Intergenic	novelGene_155777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	108.171879689481	87	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	181	1242	860670	798987	TRUE	5	TCTCCGAGGCTCCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872315	795752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796358_798573_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_860593_860723_872187
649976	contig_20314_pilon	+	1447	2	Intergenic	novelGene_125651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTACATATGTGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21559	73677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_21647_72317
649979	contig_12728_pilon	-	3087	11	Intergenic	novelGene_155806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	36.0983379118762	254	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	81	1079	214046	189833	FALSE	15	ACTTTATTGAGTCCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLCYNRGCGQRFDPETNSDGACTYHPGVPVFHDALKGWSCCKRRTTDFSDFLSIVGCTKGRHNSEKPPEPVKPEVKTTEKKELSELKPRFQEHIIQAPKPIEAIKRPSPDEPMTNLELKISASLKQALDKLKLSSGNEEDKKEEESDEIKIGTSCKNGGCSKTYQGLQSLEEICIYHSGVPIFHEGMKYWSCCRRKTSDFNTFLAQEGCTTGKHMWTKKDAGGKVVPCRHDWHQTGGEVTISIYAKNSLPELSRVEANSTLLNVLIVFEGEKEFHQNVKLWGVIDVKRSYVTMTATKIEITMRKAEPMQWASLELPAAKKPEEQKEDITD	214126	187824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_189980_190221_190285_190726_190847_192791_192898_194279_194351_198684_198744_199399_199504_201483_201642_202943_203001_209323_209374_213982
649989	scaffold_12124_pilon	+	2729	14	Intergenic	novelGene_21996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	166.261218867805	4	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	198	1085	799011	807554	TRUE	40	ACATAAATCTCAGCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791838	815382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808331_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647_810745_813529_813765_813915_813998_815122
649994	SIRV7	-	249	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69016	15	35797	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78941	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
649996	contig_13894_pilon	-	1389	9	Intergenic	novelGene_62207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	211.839230018899	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	109	1215	766610	750013	FALSE	25	CTTTTATAAGTGGCTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSHYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766718	749838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753147_753197_753240_761484_761600_762021_762299_763800_763958_766578
650002	contig_9482_pilon	+	2012	3	Intergenic	novelGene_44309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	144	626	1236282	1237530	TRUE	35	ACCACACAGATGCACGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSCRRVPGCRLFKRTAGISFHPRSRRLYSSDSPGLRMSSIFRIIRTICVASDICCFLPIKVSMTCCCFISLVPLCRQSMPNAGFVSFTWRARTSVIVWMGFMPLFSARAMGMTSSASANARMAYCSRVGHWGHRDSERPQNEHSTTQDPRYTHWHALEL	1236138	1242926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1238048_1242057
650006	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650007	contig_13894_pilon	+	1289	10	Intergenic	novelGene_62093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2509.34517551423	8	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	274	1236	522731	528117	FALSE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522679_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
650018	contig_5338_pilon	-	2186	4	Intergenic	novelGene_114582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	11.8977121983832	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1345	1815	388825	387912	FALSE	25	GGAAAGGGCTTTCTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSPLYTSSSIQPAHIPYFLSCSFLLFPWVTVLELYNNNSPTPLGRWFLRQGWLLVVPPRGEPRPRMFFLFTDVLLMAKPRPPLHLLQSGSFACRALYPMAQCQLHRVFGHSGGPCGGLLSLSFPREKLLLMSTDQEELSRWYHSLTLAISSQKN	390754	387540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387928_388106_388196_388459_389730_390314
650025	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650028	contig_9981_pilon	-	2232	4	Intergenic	novelGene_121044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_3	64.7508043708081	343	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	42	311	256353	256084	TRUE	40	TAATACTTTGTTTCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVTVRAVPGCRAAMAANTESWEEDTLRSFVRTLEKRDGTVLRLQQYGSGGVGCVVWDAAIVLSKYLETPGFSGDGDHALSQRSVLELGSGTGAVGLMAATLG	256394	249286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080_253186_254386_254507_255642
650037	contig_6740_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_142731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTTGTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753069	755246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_753100_755200
650043	contig_13894_pilon	-	1356	7	Intergenic	novelGene_62202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_4	157.378171576902	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	11	1129	763950	750013	FALSE	40	TTTTAAGTCTATAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	763960	749785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762299_763800
650060	contig_5574_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_155830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	335	697	69258	68896	NA	30	ATTTAGCACTCACAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSLVGYKSKFRASAPGEVFLSLLALEECPCHQSSLGLGASQRRNLGSKGCTLLLVLLSWWYEVPNSLLTSLSFYLLRDKRCCRPCPRETSFALDQGCDLSKGVTSHPNPL	69592	68045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_68000_69600
650063	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650066	contig_2768_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_57502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCCCCAGAAAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743428	745222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_743400_745200
650072	contig_14467_pilon	-	3803	1	Intergenic	novelGene_138232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180266	176463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_176500_180300
650078	contig_5968_pilon	-	2118	8	Intergenic	novelGene_112174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	444.851316596401	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	24	1061	732362	578708	FALSE	55	CCTAAAGCACAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAAGETEFQRVNSLGQDHAAKTFHSKC	732385	577650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_578785_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
650080	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650083	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
650091	contig_6217_pilon	+	2820	4	Intergenic	novelGene_109683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	88.6954840388669	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	669	1901	1016733	1017965	FALSE	30	CAATTTAAGTCACTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSHTHSPSEQISQPVQPLPEPLPSLHPSASPSSPPSLQNHKYNTTSTSYSPLASLPLKADTKGFCNINLLEDLPLQEPQSPHKLNPGFDLAKGSAGKVNLPKELPADAVNLTIPASLDISPLLGFWQLPPPATQNAFGNSTLSLGPGEPLPHRLSCLGQQQQEPPLAMSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	877388	1018884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_877532_964389_964428_1008903_1009387_1016728
650092	contig_2768_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_57483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTTAGTGTGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656195	657908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656200_657900
650097	contig_10973_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_150307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_800
650098	contig_6739_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_155874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTCCCCATTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63265	62042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6739_pilon_-_62000_63300
650100	contig_7909_pilon	+	2241	5	Intergenic	novelGene_155920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	175.120494231829	16	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	38	1408	538935	550408	FALSE	30	CTGGCCCAAAGGAAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKPRQPTIDLSQMAVPIQMTQEKRHSPESPSIAVVESELVAEYITTVSHRSQPQQPSQPQRTLLQHVAQSQTATQTSVVVKSIPASSTGAITHIMQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQASEKTAVSDILKMSLMEAQIDTNVEHMVVDPPKKAFATSMLTGEAGSLPSTHVVVAGLANSTSQQQKCRESCSSPSAVGPPLTTRKIDAPGVPITGQFMRIQNIGQKKPEESPAEIIIQAIPQYAIPCHSSSNVVVEPSGLLELNNFTSQQLDDDETAMEQDIDSSTEDGTEPSPSQSSAERS	538897	551241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_539038_542365_542518_544443_545008_546109_546467_550213
650101	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
650104	contig_14638_pilon	-	2136	6	Intergenic	novelGene_71580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	20	AGCTATATATTTTCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253179_253223_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
650106	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_89542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650109	contig_10861_pilon	-	1734	14	Intergenic	novelGene_39226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	251.086821071868	18	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCCTCGACGACGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614327	590808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603017_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611258_611521_611612_614296
650119	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_93700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
650120	SIRV4	+	492	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	456	2	-456	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTACCTCTTCAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	2315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
650124	contig_6876_pilon	+	2075	5	Intergenic	novelGene_147023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	69.908422239384	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	494	1621	133885	142269	FALSE	40	TTAAGAGTGCGAAGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTITVLTAFLLSQFPYNCILLVQTINAYTMIISNCTISTNIDICFQVTQTVAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSGSPHISVSCWRFCDSTPAVGLIWVRIQLVP	126393	142723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_129122_129496_133860_133906_140423_141437_142175
650125	contig_11656_pilon	+	2827	1	Intergenic	novelGene_53979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTTTATGGAGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209007	211834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_209000_211800
650130	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650131	contig_5698_pilon	+	1725	8	Intergenic	novelGene_55014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	20	661	4103	19821	FALSE	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPLKRLCYKL	4083	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19299_19794
650135	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1475	632	1020	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2475	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
650143	contig_19342_pilon	+	1387	7	Intergenic	novelGene_41109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.41565025531987	3	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	482	958	4349	6183	TRUE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3625	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
650144	contig_11386_pilon	+	1953	7	Intergenic	novelGene_82765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	455.827970717999	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	883	1644	17940	24897	FALSE	5	CTTTCACTGTTGCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	7893	25206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_24791
650158	contig_11413_pilon	+	630	4	Intergenic	novelGene_103135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	13	513	87465	90735	FALSE	25	CAGAACCTACTCAGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87452	90852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
650162	contig_5261_pilon	+	2146	13	Intergenic	novelGene_102481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_1	69.7953357244514	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	279	1496	727549	776352	FALSE	15	TGACTTGCTCTGTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCVERYLKFIELPLSQRKFCQRCQQLLLPDDWGEHCEHQVLGDISVTQLKRPSQLLYPLENKKTYAQYLFADRSCRFFVDLLSSLGFRRVLCVGTPRLHELIRLKASDDKKSNIKSILLDIDFRYSQFYMEDSFCHYNMFNHHFFDGKAALEECRAFLQEDEGEGVIMVTDPPFGGLVEPLAITFKKLIALWKEGQSQDDSHKELPIFWIFPYFFESRIRQFFPSFCMLDYQVDYDNHALYKHGKTGRKQSPVRIFTNIPPNKIILPTEEGYRFCPLCQRYVSLENQHCEHCDSCTSKDGRKWNHCFLCKKCVKPSWIHCSICNHCAVPDHSCEGPKDGCFICGELDHKRTTCPNISLSKRANKAVRKQKQRKSNKMKLETTKGQSMNHTSVTRKKKRRERAHQ	725494	777002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_725588_726457_726577_727482_727566_741987_742264_743265_743347_752041_752115_754987_755139_757577_757679_766880_767003_767408_767485_769513_769566_770082_770228_776228
650163	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650178	contig_4422_pilon	+	951	6	Intergenic	novelGene_155954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.8	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	82	348	52234	53372	TRUE	30	AATGTTCCCAGAATGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQTFQRNLRTALRYYNQSDTGSHTTPLMYGCEEGPDRCLLRGYYQYAYDGADYLALNEDLSSWTAANTAAQLSKGKFEMGREAERWRAYLEGRCVERSRDTCAVCSMKGCWSPSP	51906	54811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_51968_52213_52440_53311_53379_53479_53611_54179_54228_54393
650180	contig_2596_pilon	+	2274	3	Intergenic	novelGene_53465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_1	48	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCATGTGTATGAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653978	656993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_655415_655821_655981_656314
650185	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
650186	contig_16776_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_130542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGAAACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127219	127719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_127200_127700
650188	contig_13608_pilon	-	2645	17	Intergenic	novelGene_52374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	221.802338454197	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	101	1105	470234	400675	TRUE	40	CATAACAGCAAAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERSNNGCWYDKV	470334	368775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400709_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
650193	SIRV7	-	303	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91623	0	-91617	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAGTAGAGTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
650198	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650199	contig_14322_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_115846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671612	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
650200	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650215	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_89543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650217	contig_5125_pilon	+	3151	12	Intergenic	novelGene_43496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_10	62.3485271917084	356	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	257	1693	977418	1058270	FALSE	30	TGAAATTGCACCGGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCCFYIVGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQAIETNIVLRNGTETFDSWEKPPLPVYTQFYFFNVTNPEEILEGETPLVTEVGPYTYRELRDKANVQFGDNGTTISAVSNKAYVFERNLSIGDPKIDLIRTLNIPVVTAMEWVQNHFLREIIEALLKAYQQKLFVTHTVDELLWGYKDEILSLISVFRSDISPYFGLFYGKNGTNDGDYVFLTGEDNYLNFTKIVEWNGKKSLDWWTTEKCNMINGTDGDSFHPLITKEETLYVFPSDFCRSVYLTFSGFESIQGLPAFRYKVPAEILANTSENAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADEKFLSAIAGMHPNEEYHETFVDINPLTGIILRAAKRFQINIYVRKLDEFAETGNIRSLVFPVMFLNESVLIDKETANRLKSVINTTLIITNIPYIIMALGVLFGLIFTGLACRVQGSMDEGTADERAPLIRT	977161	1059728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_977535_1000321_1000480_1022096_1022245_1023727_1023917_1030314_1030407_1043437_1043558_1045920_1046091_1048993_1049113_1050520_1050595_1053391_1053444_1056514_1056674_1058231
650218	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650226	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
650230	contig_13456_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_153289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTTTGTTGCCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313411	312959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_313000_313400
650235	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	2	361	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14410	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
650238	contig_6589_pilon	+	1522	8	Intergenic	novelGene_25999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_7	637.63149104114	2853	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	149	994	1725483	1731484	FALSE	35	AAAAAGTATTTTCAGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725334	1732012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
650242	contig_1725_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_24304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCAGCTGAAGGGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232876	231347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_231300_232900
650251	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650271	contig_817_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_132487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGGGAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753246	752845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_752800_753200
650289	contig_15034_pilon	+	2380	2	Intergenic	novelGene_143642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54024	64010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_55948_63553
650293	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	49	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650296	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_16475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27824	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
650304	contig_11417_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_103294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491116	493855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_491100_493900
650307	contig_165_pilon	+	2215	1	Intergenic	novelGene_117073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80772	82987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_80800_83000
650315	contig_15025_pilon	-	3177	2	Intergenic	novelGene_155966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	2785	3177	32119	29166	FALSE	55	GAAAATGAAGGTAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKSKFLDLRRRIDTKNKQIFTEESEKQFCKKSKTLSKVEKFLKWVNEQMDEETSKESFSHNDTQDTCTSSGSEEQVSVTQGDSPFETSNREPDKCHTVYSPGEFETEKNGDSVVATVTEEQEKPDSLQV	34903	29165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_29442_32002
650327	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
650333	contig_9721_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_155996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTATTCAGAGCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619010	620109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_+_619000_620100
650336	contig_5671_pilon	+	910	7	Intergenic	novelGene_79438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1908.71629345193	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	79	501	370430	531238	TRUE	35	ATTGCATATATATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368846	531792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205_531339_531483
650349	SIRV6	+	180	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	534	69	534	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10771	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
650358	contig_4659_pilon	-	2700	14	Intergenic	novelGene_118183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_6	177.667097778784	247	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	165	1919	134687	126705	TRUE	60	AGAGAGGAAAAAATGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNGGQQLSISDAFIKESLFNRRVEEKSKELPFTPLGWHHNNLELLREENGEKQAMERLLSANHNHLMALLQQLLHNESLSPSWRDIIVPLVCQVVQTVRPDVKNRDDDMDIRQFVHVKKIPGGKKFDSVVVSGFVCTKNIAHKKMNSCIKNPKILLLKCSIEYLYREETKFTCIDPIVLQEREFLKNYVQRIVDVRPTLVLVEKTVSRIAQDMLLEHGITLVINVKSQVLDRISRMTQGDLVMSMDQLLTKPRLGTCHKFYMQMFQLSNEQTKTLMFFEGCPQHLGCTVKLRGGSDYELARVKEILIFMICVAYHSQLEISFLMDEFAMPPTLTQNSSFHSLIEGCGEEGAAQEQFSGSTLPRDPDFPPDRPIMISEALPSDDGSSLESRIVFEKGDQENKSVLQDVVSLKHQECAATACVSGIPCALFPSLPESLLPLHMDDQQDVIGSEQPETLQQTDELHDPKSQMRAFRDPLQDDTGLYVAMEVTSSEDKRKTYSLAFKQELKDVILCMSPVITFREPFLLTEKGMKCSTRDYFAEQVYWSPLLNKEFKEMESRRKKQLLRDLTGLQGMNGSIQAKSIQVLPSHELVSTRIAEHLGDSQSLGRMLADFRARGGRIQQKKFRSFCSFKGCIRHFW	136499	118414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_118485_118913_119028_120654_120834_122174_122347_123004_123077_124458_124560_126631_127814_128062_128190_128865_129007_130218_130327_133348_133424_134065_134247_134673_134804_136451
650362	contig_15410_pilon	-	1257	8	Intergenic	novelGene_130568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_7	44.8161778370085	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	164	1096	57380	54277	FALSE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	57543	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295
650365	contig_15410_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_130628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	236.449195858692	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	53	622	145617	148093	FALSE	35	GATCAATGTGGATAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSVRRGLTLARLGEAPGNWDCQVGFGCLCPSSRTSQDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145564	148543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_147178_147750_147842_148070
650368	contig_6191_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_107854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGGCTATCAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182914	183511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_182900_183500
650370	SIRV7	-	345	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33224	0	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
650375	contig_3825_pilon	+	945	8	Intergenic	novelGene_77934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1322.12866396642	16143	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	18	647	12232	14915	TRUE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNS	12214	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14991_15231_15302_15498
650384	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650387	contig_20697_pilon	+	1794	2	Intergenic	novelGene_134606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACTAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3753	6129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_4000_4581
650389	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650392	contig_9919_pilon	-	2356	14	Intergenic	novelGene_137992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	127	junction_6	58.0896063583143	361	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	29	2005	866377	835210	FALSE	25	TATGTCTTACTGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRKATGGGSLGRTLIRRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILLNGIPKKQVNRGAGETNTAESENSDFDEAGIPYDETERLPGRGSPSLSEGASSDEDDSEYEDCQEEEEEDWQTCSEEDSNFEESRGQDWKKSCTVDSDTQDRRTPQKRQTHNFSHLVSKQELLEIFKQLHTGKTVKDGQLTVGLVGYPNVGKSSTINTILGNKKVSVSATPGHTKHFQTLYVEPGLCLCDCPGLVMPSFVSTKAEMICNGILPIDQMRDHVPSVSLVCQNIPRRVLEATYGITIIKPREDEDPHRPPTSEELLTAYGYLRGFMTAHGQPDQPRSARYILKDYVSGKLLYCHPPPGTDPVLFQQQQRPLTENKRSSDEGRMPPGREKKVKQIENVVDKTFFHQENVRALTKGVRAMTGYEPGSGLVTAATQSREFVAGKPWKKHGNRNKKEKSRRLYKHLDM	866405	834858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026_843107_845428_845553_850459_850604_850743_850846_853096_853511_855898_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
650400	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
650402	contig_16620_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_156001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGACTTTTCCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20664	21191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_20700_21200
650405	contig_14209_pilon	+	1930	14	Intergenic	novelGene_88329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	221.909491651905	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	44	862	32366	37768	TRUE	15	TTAGGGGAGCCTGAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32322	41010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38286_38394_40142_40344_40418_40859_40901
650406	SIRV5	-	315	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGATTTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
650411	contig_7629_pilon	+	3004	7	Intergenic	novelGene_153551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	75.7715865831865	16	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	162	587	225941	229873	TRUE	15	TGTTCTTTGTCATTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPFWSMSTSSVRKRSDGEEKTLTGDVKTSPPRTAPKKQLPSIPKNALPITKPTSPAPAAQSTNGTHASYGPFYLEYSLLAEFTLVVKQKLPGVYVQPSYRSALMWFGVIFIRHGLYQDGVFKFTVYIPDNYPDGDCPVSR	223198	232551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_223290_225870_225983_227159_227366_229608_229674_229760_230580_230674_231641_231806
650412	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
650421	contig_8284_pilon	-	3232	4	Intergenic	novelGene_125669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.9444274757332	183	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	224	1375	226911	225660	TRUE	25	AAATGTACGGCATTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLYFLPKASTPMNEEPMNSSNINDYFGLTDMEYSVDGETSPCSLGEVRKFSSLFVPIAYALICIFGLLGNILVVITFAFYKKAKSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVNHASGAWYFSNVMCKLTKGIYAINFNCGMLLLTCISLDRYIAIVQATKSFRLRSKTLAHNKVICFAVWVVSIIISSSTFIFSQKYSMQGVDVCEPKYHNVLEPIKWKLLMLVLQLIFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLVCQTPHNMVLLVTAVTMGRTDRACSSEKLIGYTKTITEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKIMKDLWCVRRKHQSTGFSCSRMYSESAVSKQTSETVDNENASSFTM	254698	223713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_223935_224023_226764_226863_226980_254543
650422	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	149	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650425	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
650426	contig_5549_pilon	+	1024	5	Intergenic	novelGene_81562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1335.25334674735	392	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	111	506	82155	93295	TRUE	15	GCTCAAATTTGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYSAAKGDRRFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKCLFLVLIRN	82044	97022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91801_93264_93412_96620
650428	contig_18919_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_156023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68498	71206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_68500_71200
650435	contig_6710_pilon	+	579	2	Intergenic	novelGene_92700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
650446	contig_848_pilon	-	1886	4	Intergenic	novelGene_83337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	209.879859814027	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGGCTATATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556557	547963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_549439_551874_552016_555808_555958_556436
650452	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
650454	contig_5484_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_151087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	209	442	79707	79474	NA	60	AAAATGAAATGAACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSCNTEDHGLAKLTDISGEHNSIHDKDQRGTDAFELWYWRRIVNILWTARRTNKSVLEEVQPERSLEARMVRLLLTYFGHVIRRDQSLEKNTMFGKVESQRKRGRPSTRQTDTVAAMGSNTANDCEDGTGRAVFHSVVCGVSVSHN	79915	78500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_78500_79900
650455	contig_18869_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_56243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73746	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
650458	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_90329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650463	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_95089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
650466	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650469	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	273	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650477	contig_11086_pilon	+	2870	15	Intergenic	novelGene_61191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	156.593520339269	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	44	2722	24460	52082	FALSE	15	CCCAGTGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFFPEEGHGTRYSQTDASIQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	24416	52230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_49698_49738_50803_50951_51960
650478	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650483	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650487	contig_14441_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_100336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	605.322856003307	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	46	432	6011	113710	TRUE	25	TAAACACAGCCTGCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNLLGDGVVRGQLWRMLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTATRRSTLERGRGSLS	5965	117772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_113662_113711_116578_116963_117097_117344_117539
650488	contig_11512_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_43227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	26	358	4011	4566	FALSE	15	CTGCTTATAGTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAY	3985	4567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
650489	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650490	contig_7202_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_18657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGTGAGGCCTGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
650497	scaffold_13505_pilon	-	2048	6	Intergenic	novelGene_111670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	662.0686973419	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	90	1187	882789	870492	FALSE	15	GAGGTGTTACTGCACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAGKTTWAIKHAASNPSKKYNILGTNAIMDKMRVMGLRRQRNYAGRWDVLIQQATQCLNRLIQIAARKKRNYILDQTNVYGSAQRRKMRPFEGFQRKAIVICPTDEDLKDRTIKRTDEEGKDVPDHAVLEMKANFTLPDVGDFLDEVLFIELQREEADKLVRQYNEEGRKAGPPPEKRFDNRGGGFRGRGGGGGFQRYDNRAPPGGNRGGFQNRGGGGGGGGNYRGGFNRSGGGGYNQNRWGNNNRDNNNSNNRGSYNRTPQQQPPPQQPPPPQPPPQQPPPPPSYSPARNPPGGEQLQQKQQHPWLQRQYQHPHCQQLQPSSPPPGPVVLGDGPSQGCLPAQPLSSPLPPHQGASSPTQGQAFLSGFKQATVTFYFLFAPPPASSFSTFLFH	882878	869630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870708_873247_873535_875048_875331_875867_876037_882556_882686_882774
650511	SIRV6	+	860	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	726	0	-429	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	146	478	2002	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1856	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
650517	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650518	SIRV6	-	1834	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	63	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTGTCTACTGCTTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10891	9057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_9100_10900
650522	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
650528	contig_16870_pilon	-	2682	16	Intergenic	novelGene_155503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	90.7498148146259	346	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	264	2036	129493	110538	TRUE	25	CACAGTGCCCACCAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSNNSSSSSFSNSNCSSSSCCNSSSCYSSPHRRPPCPWRWAGGLPQQQPQQQLLNLQGTNSASLLNGSVLQRALLLQQLQGLDQFAMPPAVYDSAGLTMPTATLGNLRSYNLATPNLPAPSLTPPQLATPNLQQFFPQATRQSLLGPPPVGVPMNPSQLNLSGRTPQKQARTPSSTTPSRKDSSSQTTPVEDKSDPPEGSEEAAEPGTDTSEGQESPHCPDGITKEKCTPASEPEPCEASQPPAKRLKSSEEPAEKGPPGKLQAKVQPQAGMTVPKQTQTPDLLPESPEACVPPRFPPRVLQIQAQVQPQTQLQMPQMDAQVQPKLQKQAQTQTYPEHSVPQQKQVQPQVQPQAPSQPSKQAQLQKQAQTQTYPQAQTQLQTQARPRVQPLEQPREQQLEQPPVQLPPEQTQGQPQTQPQVLMPAEQAPVLDHGTVLDTLPDMVEAGGGLEEASLGPVDAQVSMEESQEESASSLDVGECEKRAGEMLRVWGAGGSLKVTILQSSDSRAFSTVPLTPAPRPSDSVSTTAAASSTPSKQALQFFCYICKASCTSQQEFQDHMAGAQHQQRLGEIQHMSQACLLSLLPVPRDVLEREEEEPPPRRWCNTCQVYYMGDLIQHRRTQDHKIAKHSLRPFCTVCNRYFKTPPQVCGACEVPGAQGQSQGAEDAREGDSRSR	131856	108995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_109337_109622_109746_109955_110026_110425_110576_110775_110891_111399_111488_121821_121947_122652_122851_123104_123227_123480_124080_124553_124663_124874_124969_127392_127623_129438_129511_131403_131521_131727
650529	SIRV5	-	465	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTCACGGGTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
650536	contig_16622_pilon	-	1686	9	Intergenic	novelGene_48438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_8	1217.16283190664	512	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	657	1520	115540	108374	FALSE	15	TGACCAGTCTCTTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	121968	108207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_121330
650545	contig_14513_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_70290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	310	330	11853	11833	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12019_18919
650548	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1449	632	994	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2449	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
650553	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650558	contig_15063_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_14436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	346	708	36299	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36153_36266
650563	contig_11285_pilon	+	1479	8	Intergenic	novelGene_5612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	426.44534544659	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	131	1156	768070	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARTRTQVYHVDPGELGGLGGRAGGWNTAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766116_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
650566	contig_9471_pilon	-	1731	6	Intergenic	novelGene_21723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	235.912356607279	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	259	987	153444	147722	FALSE	15	TTAACCTCTCTATGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGVSLEQLCGIAA	166990	146977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_161599_161730_166912
650568	contig_9706_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_20837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2228	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
650574	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	127	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650578	contig_3095_pilon	-	1071	7	Intergenic	novelGene_75262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1077	junction_6	874.60384682946	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	21	818	255481	246716	FALSE	15	CTGTTCCCCCCACAGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255587	246462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384_255482_255567
650579	contig_9463_pilon	+	1619	4	Intergenic	novelGene_83839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	221.678947028254	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	857	1225	222660	223028	FALSE	15	TTTCCTATTGGCTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	216043	223422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_216109_216587_216627_216769_216859_221996
650585	contig_9290_pilon	-	1898	12	Intergenic	novelGene_77539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.029654326448	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	636	1559	486192	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497039	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483299_486105_486278_486625_486679_487536_487649_489914_490037_491390_491545_496930
650586	contig_5988_pilon	-	1507	5	Intergenic	novelGene_15921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	918.537526451696	9	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	881	1333	652414	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655543	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652723_652829_652943_653272_653422_653549_653773_655456
650588	contig_9414_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_131084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCAGCTTCTGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398049	400944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_398000_400900
650591	contig_8616_pilon	+	2542	10	Intergenic	novelGene_72542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.9873565701464	253	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	437	2497	419454	424565	FALSE	20	TGCACTCCAGTTTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410543	424610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412295_419168_419239_419417_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
650596	contig_2257_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_122505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTGTCTTGGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313915	313514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_313500_313900
650597	contig_6823_pilon	-	1325	3	Intergenic	novelGene_131251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGATCTTATTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461469	453447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_454578_460583_460751_461441
650600	contig_9937_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_129202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	824	1192	72117	71749	NA	30	GTAAGTAAAGAGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCHSCFQGAFWLYFVQDRLFVLLAVDAIFNILLQHHNSKASILLGSSLFIVQLSHAYEAIENTMAWVRCTLVLKVTSLLFNTLKRFFAADLPSAICCLISWLLFPWALIVDPSKMKSFAA	72940	71082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_71100_72900
650604	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650606	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650616	contig_5643_pilon	+	2685	9	Intergenic	novelGene_38942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	140.15772365446	1	117	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	601	1221	498119	501175	FALSE	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRVSEPPQTLQHGQLHPGSRRHVVSLEAPDEGELPTHSLPSCPLLCFLLCSRGLQTR	462243	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482115_482160_482251_494961_495053_497950_498249_499454_499656_500129_500295_501050
650618	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650624	contig_14925_pilon	-	950	5	Intergenic	novelGene_55153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	1823.63378656462	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61668	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611_29828_61622
650635	contig_9290_pilon	+	1874	7	Intergenic	novelGene_77534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	103	414	478703	479909	TRUE	25	TGAAACATTTCTAGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTLQPACQPITGCRVMGGMSQWGRPRPRPRPPGGGVSTVERGFLMVSSTDTMRHAASEAAVRALIRTIAGSHTKASKLSAMSSLLMSTPYHMPPGHAEPAAY	478600	486801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_478985_479879_480088_480828_480958_481334_481437_482140_482330_483135_483304_486107
650638	contig_14060_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_156050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAATAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48696	49393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_48700_49400
650639	contig_4087_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_156065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGCTACGCAGGGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16677	15998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_-_16000_16700
650641	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650646	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650652	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
650661	SIRV7	-	333	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33234	2	15	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114723	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
650669	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650673	contig_12622_pilon	-	1233	7	Intergenic	novelGene_5929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2504.78551421518	22	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	18	821	1590968	1585459	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKGHRAPSLSRTRGPSFLQSWTLPLRTRSPRRFSSSLGARCGCTQARRRWARGGWTSWAWVRRWITSPASFLGARVRRCYSAGNDSGGST	1590985	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586371_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
650688	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
650693	contig_8580_pilon	-	2227	8	Intergenic	novelGene_156084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1709	2017	266410	256897	TRUE	10	GTCCCGCCCCCGTGACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVFGELVYLCQQNHFEVSLRACLELLRLRHRFQHLLNHHPVTVASITGINFKVIITCNGADFNLLFRWSCDGLMFNSQLLHSNAIQLTQNTHYSCLFPSA	273194	252928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_-_253094_256851_256993_260718_260784_262173_262273_266361_267666_267739_267837_271124_271195_272908
650712	SIRV6	+	377	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10447	2	1210	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11447	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
650720	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671653	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
650721	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650726	contig_12250_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_80737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTCCCTTTCAGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417682	417957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_417700_418000
650728	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_96981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657490	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657492	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650731	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	215	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650732	contig_19352_pilon	-	1574	7	Intergenic	novelGene_122364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	581.975371758405	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	210	752	122805	104000	TRUE	40	TACTGTGAACGATAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123014	103061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103657_103772_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
650739	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_96590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
650745	contig_15498_pilon	-	2468	4	Intergenic	novelGene_42623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	18.4451137763426	253	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	92	1150	543957	534858	FALSE	15	GTGTTAGCCTGTCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGRPSLCQFILLGTSSVVTAILYSVYRQKAQVSHELKGAKKIHLGEDLKSILLEAPGKCVPYAVIEGAVRSVKETLNSQFVENCKGVIQRLTLQEHKMVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	544048	533539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535588_537666_537788_538368_538457_543837
650756	contig_2636_pilon	-	1052	6	Intergenic	novelGene_52056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	289.580109814193	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	465	764	62513	59826	FALSE	25	CGAATTTGGTAGATCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85670	59537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_74122_74256_81113_81216_85551
650760	contig_13894_pilon	+	1291	10	Intergenic	novelGene_62094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2223.11118330445	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	27	1238	520713	528117	FALSE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
650769	contig_4654_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_103054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGGAAAGCAGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427609	429146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_427600_429100
650770	contig_2358_pilon	-	1083	9	Intergenic	novelGene_156096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	45.9032610497337	40	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	142	1083	82800	44746	FALSE	20	CCGCGGCCTGTAAGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSDRVEARKSLLESFLKQLCAIPEIANSEEMQEFLALNTDARIAFVKKPFMVSRIDKMVVSAIMDTLKTAFPRSEPQSPTEELSEAETESKPQTEGKKANKTPDDPWKHSWPTCGRALNILTLAENFIRIQTVMRREKRERVSRLRFSSSKIAPALSMTEVHEKVLYCLQEGNMESEILSLSGMESFIKKQSKLLEMQPEEAPETDPEQIHKGCVDGCLSDASVPAHDLSNSDPGTETELADTALNLLLLLLMEQWRWLCTENVKKVLHLVFGTLIQRWLEVQVANLTCPQHWVQYLRLLQESIWPGGLLPES	83965	44745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_44852_75471_75602_77899_78081_78564_78662_79269_79393_79874_80006_82506_82627_82746_82849_83872
650777	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
650780	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650782	contig_1594_pilon	-	2356	18	Intergenic	novelGene_138817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	60.6731557932339	284	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	15	2123	777962	503479	FALSE	20	ATTGATCCCCCTCCATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEYSAFDMSAPTPAHCCPAVGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESIPLIQGPVGLHQKFSPKQIQALEHTYDDLCHTEGVTALPYFLIKYDENTVLVSLLKHCSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSHFQSVEVLCFRDRTMQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKVSYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKAKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETV	777976	503245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_771341_771460_777250_777306_777805
650784	contig_6589_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_26300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	376	606	2273395	2273165	NA	65	GAAACAAAAAAAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2273770	2272086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272100_2273800
650797	contig_5643_pilon	+	1943	16	Intergenic	novelGene_39087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	941.488599093065	1	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	313	1611	631988	640691	TRUE	15	CATTGTGTGTGTAGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISGWTVTSTSRRQSRWCGRSARAWCRQRRSTSSSTWPLPSSLKQPRRSWRSCSPRRAGSRSTGTSHTPQP	631298	641596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631351_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635467_635675_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640278_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
650816	contig_9753_pilon	-	1318	3	Intergenic	novelGene_41321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	501	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGAGTGGAAAAATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93331	69125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_86172_86247_93251
650817	contig_13593_pilon	+	298	2	Intergenic	novelGene_156125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAGAAAGAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69556	70135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_69564_69844
650818	SIRV3	+	227	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4595	2173	2536	48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGGTGGACGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6539	6766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6800
650819	contig_4891_pilon	-	1858	15	Intergenic	novelGene_124516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	369.299951369659	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	185	1360	68026	30210	TRUE	30	TCTTTAAGAGGTAGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92762	29288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_29663_30085_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_72021_72053_92719
650823	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_97161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650826	contig_12120_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_21410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACTTAGAAATTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22805	24469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_22800_24500
650827	contig_12120_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_21412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAGCAAGAAGATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24469	25208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_24500_25200
650829	contig_6975_pilon	+	2419	8	Intergenic	novelGene_74230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	90.8733139247902	315	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	167	871	15471	42387	FALSE	25	CAATTGTTTCTTTTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIAGCCAKTTVAPLDRVKVLLQAHNHHYKHLGVFSTLRAVPQKEGYLGLYKGNGAMMIRIFPYGAIQFMAFEQYKTLITTKLGVSGHVHRLMAGSMAGMTAVICTYPLDMVRVRLAFQVKGEHTYSGIIHAFKTIYAKEGGFLGFYRGLMPTILGMAPYAGVSFFTFGTLKSVGLSYAPTLLGRPSSDNPNVLVLKTHINLLCGGVAGAIAQTISYPFDVTRRRMQLGTVLPEFEKCLTMWETMKYVYGHHGIRKGLYRGLSLNYIRCVPSQAVAFTTYELMKQFFHLN	10175	43935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_10271_15399_15534_16982_17047_29372_29495_29744_29812_35586_35750_41045_41115_42230
650832	contig_9389_pilon	-	1453	7	Intergenic	novelGene_83869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	495.954775043944	62	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	274	522	38585	36611	FALSE	0	CTCGGGCTGGGCGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWWRWRTRRAARKRRRRWRRSPPAGGGCCPCQAACLLWLALEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45841	35679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38917_40169_40206_45753
650836	contig_10902_pilon	+	1409	8	Intergenic	novelGene_65678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	354.316127726846	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	629	979	189165	209479	TRUE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGGSATVVFCSHSKKHRGE	160602	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_165571_165732_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_209426_209783_218452
650844	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	4	351	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14412	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
650850	contig_730_pilon	-	1846	13	Intergenic	novelGene_155615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_9	26.8807810319732	318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	298	1278	212398	207837	TRUE	15	TCCCAATTTTGTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTSKDKRDVYYRLAKENGWRARSAFKLLQLDEEFQLFQGVTRAVDLCAAPGSWSQVLSQKIEGGHVVAVDLQAMAPLPGVLQIQGDITQLSTAKEIIQHFDGCPADLVVCDGAPDVTGLHDVDEYMQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVEDSDMNCSP	214640	205803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_206363_207827_207870_208085_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211836_211931_212002_212277_212439_214383
650852	contig_6230_pilon	+	3028	14	Intergenic	novelGene_102088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACCCTACGATAGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116733	157558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_118706_128115_128222_132861_132957_133624_133661_134931_135014_135712_135864_136513_136559_137144_137239_137621_137704_147638_147674_148369_148439_149453_149494_156635_156730_157431
650857	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-10	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114748	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78841_78966_114680
650874	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650879	contig_6102_pilon	+	2521	22	Intergenic	novelGene_31733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	131.99855699067	419	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	267	1823	216236	227989	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQNLGKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPPWI	210229	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_226981_227977_228161_228274_228396_228586_228648_228903
650884	contig_6227_pilon	-	1305	9	Intergenic	novelGene_49770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	277.492314082751	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	70	1017	1224979	1202920	FALSE	35	TGCCACAAAAGAGGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225048	1202631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206005_1223761_1223838_1224857
650887	contig_546_pilon	+	2259	6	Intergenic	novelGene_117179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	582.533569848125	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	115	1524	119834	146902	FALSE	40	TATCCCAGTAAATTAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEGEMSFPLLGTFSGLQSSN	61169	147637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633
650890	contig_16882_pilon	-	2600	12	Intergenic	novelGene_148227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	43.723965098867	379	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	105	2492	435293	317333	FALSE	10	GTTGCGGAGAGTGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGCGFIPCLPGFLHVLPGPGLRPHVTPQPRSQATMENANGTNQSMTEKSPPAEVGMESIIDQVTQEEQGQLLFHEETIDLGGDEFGSEENETVSEDSNNFIDKLNEQMMESVLISDSPNNSEDDVGELGCLQDVVEPVESEVDNRIENIDKEEIDTLSNISETDRDDTPKDVSDMTPDSRASLKEDPTLEVKGMPVFESEDAADSVPSDEKTNPEEQISEMSSSQSSSKDEPVPMCTIFSQSNTANSQPHLFLHDGFESQMVKSPSFSSASETSAKTPPQMVQPSPSLSKFFGDTTNTNSLASDFFDSFTTSTFISVSNPNAGSSVPEKLSSLTTQGGDKSPDSADPSYSPGIDRSESGISTASLEISQSPKPFSQIRAVFAGSDDPFATALNMSEMDRRNDAWLPSEETRNVLISVATQQYSTVFIDKENLTMPGLKFDNIQGDAVKDLMLRFLGEQAAAKRQVLNANSVEQSFVGLKQLINSKNWRAAVDLCGRLLTAHGQGYGKSGLPTSHTTDSLQLWFVRLALLVKLGLFQNAEMEFEPFGNLDQPDLYYEYYPHVYPGRRGSLVPFSMRILHAELQQYLGSPQESLDRLHRMKTICSKILTNLEQGLAEDGSMSNITQENRKASIQLWRSRLGRVMYSMANCLLMMKDYVLAVDAYHSVIKYYPEQEPQLLSGIGRIFLQIGDIKTAEKYFQDVEKVTQKLDGLQGKIMVLMNRAFLYLGQNNFAEAHRFFTEILQIEPTNAVANNNAAVCLLYLGKLKESLRQLEAMVQQDPKHYLHESVLFNLTTMYELESSRSMQKKQSLLEAVALKEGDSFNTQCLKLA	443500	317224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_317576_317920_318009_318765_318867_338463_338563_345751_345826_349446_349520_368818_368932_384027_384167_386096_386211_414223_414341_434066_435300_443402
650893	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_97512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
650894	contig_8617_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_73396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62298	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
650900	contig_12312_pilon	-	3627	20	Intergenic	novelGene_64001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	811	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	315	653	535828	535490	TRUE	35	CGAGGGAGCAAGAGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSACWHCRLLGRKGTGPRSWGMHEVLGGAWPNPSTSTCESALVSAGSKVNPALPLPQLLCLLEICQGVGVYIPFPQSADICADNSEQLFWENPGHDQLLLHSLLCYLLRA	536142	476936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_477062_478471_478565_490339_490409_501199_501256_502314_502379_504843_504918_505068_505186_505625_505696_506119_506216_506867_506991_510273_510356_510591_510635_515483_515528_525180_525250_526425_526471_527904_527954_531360_531439_531800_531896_533464_533708_534150
650901	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
650913	contig_15371_pilon	+	2268	2	Intergenic	novelGene_151441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAGTGTTAGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129161	134173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_130618_133361
650918	contig_14441_pilon	+	1271	5	Intergenic	novelGene_100592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.2273855876338	128	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	763	1269	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111199	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111995_112154_112401_112665_116578_116963_117523
650936	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
650941	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
650944	contig_3900_pilon	-	3271	12	Intergenic	novelGene_84174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	84.3482548673863	6	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	344	1537	232131	186008	FALSE	50	GGTCTGCTATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDSDSRHLLISEVDHEINPGPMNIQFDSSDLRSKRPFYIEPTNIVNVNDAIQRVSDHASAMNKRIHYYSRLTAPADKALIAPDHVVPALEECYVYSPLGSAYKLESYTEGYGKNSSLVTIFMIWNTMMGTSILSIPWGIKQAGFTTGMCVIVLMGLLTLYCCYRVVKSRTMISSLDTTTWEYPDVCRYYFGSFGQWSSLLFSLVSLIGAMIVYWVLMSNFLFNTGEFIFNFIHHINDTDSVLSTNDSNPVICPSASSGGHPDNSSMIIFYTNETGVQQFEKWWNKSKTVPFYLIGLLLPLLNFKSPSFFSKFNILGTVSVLFLIFLVTLKAVRLGFHLEFHWFTPTEFFVPEIRFQFPQLTGVLTLAFFIHNCIITLLKNNKNQENNVSNYLMN	248897	184273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_186139_194873_194982_198880_199079_202002_202063_206194_206366_210091_210186_210627_210692_210822_210945_214508_214642_232018_232166_242269_242484_248802
650949	contig_7151_pilon	-	3054	14	Intergenic	novelGene_40639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	135.600570769077	1	176	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1235	2464	13845	4720	TRUE	25	CCAATGTTTTTCTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPCLTQQTLQPQRRVLPTAQVRGWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDIFFLLRHKFRLRPCLRHLLPTCGHLPHSGGPSLPGPYLLGNSAAQMENRAPSLI	65341	1817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5303_5928_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13669_13774_13876_18160_18477_18570_18880_40400_40716_65077
650953	contig_2770_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_107499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCACAACTACCACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826962	826366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_826400_827000
650965	contig_6102_pilon	+	904	5	Intergenic	novelGene_31959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2298	junction_1	428.547546953661	23	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414788_414877_414956_416018
650973	contig_11631_pilon	+	1474	8	Intergenic	novelGene_104201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_2	438.382695547055	805	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	319	1323	257411	283438	FALSE	20	GAAAATTTCCTTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	257092	283589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257554_260336_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390_281540_283353
650974	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
650975	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
650980	contig_8570_pilon	-	2419	22	Intergenic	novelGene_120146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAATGGAACAGAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425775	306599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_306684_321019_321061_322724_322781_323276_323375_325406_325557_332072_332206_343183_343344_347291_347367_361586_361729_364108_364187_365140_365216_365986_366112_367596_367725_373527_373625_377062_377138_377249_377352_379528_379714_379852_379950_382405_382495_383490_383595_384451_384587_425585
650981	contig_10013_pilon	-	2206	9	Intergenic	novelGene_125095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	184.431855640505	13	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1136	1777	524856	520669	FALSE	5	CTGTGGATTTGGCCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRLEQVFKGLSSWSSRTLLLPCCPVSQVSKDLEGHKSDQMAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	528480	520239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714_525801_526929_527050_528409
650983	SIRV6	+	378	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	0	405	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
650988	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
650996	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
650997	contig_513_pilon	-	1568	2	Intergenic	novelGene_80126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATAAGTCCTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338245	302423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_303968_338221
651001	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651003	SIRV7	-	265	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69015	0	35796	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78942	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
651005	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_93655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651027	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651028	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651030	contig_17936_pilon	+	1667	12	Intergenic	novelGene_29926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	938.891644792495	1	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	214	855	79133	111027	TRUE	30	CCTGAGGTGCCTCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVLKTRPTATL	50593	126218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68387_79112_79300_90970_91161_95142_95305_106374_106468_110997_111167_114800_114943_118686_118827_121017_121063_125766_125821_125926
651035	contig_9471_pilon	-	1141	9	Intergenic	novelGene_21832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAACATTAAATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417237	412528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412820_413708_413828_413916_414084_414633_414728_414804_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
651040	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651043	contig_14925_pilon	-	1639	4	Intergenic	novelGene_55261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	38	451	116065	114666	TRUE	10	CTTTGGCTTGATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116102	112089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
651045	contig_10937_pilon	+	2604	10	Intergenic	novelGene_67293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	64.6546380565403	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	1477	2403	40796	45357	FALSE	20	GCTCAGCACCAAGGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	33191	45558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40148_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
651047	contig_990_pilon	+	1828	9	Intergenic	novelGene_76047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	58.1032217265101	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	144	935	880846	890739	TRUE	15	GACCTCACACTGTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQKSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870470	895987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893438_894961_895390_895892
651056	contig_9706_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_20855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2353	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
651061	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	35	3253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
651064	contig_6710_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_94265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
651067	contig_5092_pilon	+	2079	5	Intergenic	novelGene_62311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGGGCAGGAAGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443237	451581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_444952_446103_446166_447837_447997_449415_449495_451516
651070	contig_4364_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTCTGAGATAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532834	1533212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533200
651077	contig_15146_pilon	-	2284	4	Intergenic	novelGene_116935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	7.76029781788188	452	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	181	426	112739	108990	TRUE	20	CTGGAGAGTGGCCTACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSVPLGSWGLRSSCACACSASCSADACANSPFPGRGPAPTRRFAVFCFGHAGRPGRPPPAMTAHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVTTAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLWE	112919	106232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_108069_108967_109084_111059_111108_112635
651081	contig_19701_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_147882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATATAATCATAGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38414	37823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_37800_38400
651095	contig_987_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_72330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAGGTTCTAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126855	1128412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1126900_1128400
651103	contig_18869_pilon	-	838	4	Intergenic	novelGene_56226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_3	1442.53719382051	123745	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	28	387	79419	74943	TRUE	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79446	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73786_74928_74957_75486_75766_79352
651110	contig_11285_pilon	-	1351	6	Intergenic	novelGene_5651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	480	1217	769622	768472	TRUE	15	GCAGCAGTGCAGGTGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSTWANGQQPQAPVERRQHV	770190	768057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_768147_768426_768531_768612_768855_769083_769320_769421_769634_769722
651115	contig_15063_pilon	+	1178	3	Intergenic	novelGene_14340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
651116	contig_9527_pilon	+	1740	4	Intergenic	novelGene_134073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	29.1013554476229	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	409	816	486523	487011	TRUE	55	AAATGAAATCTTACATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTVSEGGGWGWSRSLAHLSLFIKSSDGKRETGRGDGGMPEPFYF	486114	488356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_486706_486786_487197_487515_487647_487748
651121	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651132	SIRV4	+	149	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1167	0	-1167	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTGGTTCGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
651151	contig_3602_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_60599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825801	827991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_825800_828000
651153	SIRV7	-	287	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35785	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78953	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70877_70988_78841
651159	contig_17796_pilon	+	2151	13	Intergenic	novelGene_33792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_7	351.148314660471	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	156	1280	53527	117926	TRUE	35	ATATGCATATACTACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGTYISDESHREVKFISL	53371	121261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_117874_117961_120424
651162	contig_12479_pilon	-	2499	20	Intergenic	novelGene_56862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	113.976549077484	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	123	2018	537841	451002	FALSE	20	TTTCTACAGATTTTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	537963	450520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773
651169	contig_12528_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_81363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAACAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039237	1036823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1036800_1039200
651180	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_96103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651198	contig_3942_pilon	+	538	4	Intergenic	novelGene_128660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_1	571.038235730907	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178337	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179177_179714_179825_179974
651201	contig_13496_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_107649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTTGCCTTTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387733	390206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_387700_390200
651202	contig_6633_pilon	-	2165	7	Intergenic	novelGene_143173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTGAGTGCGTCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106741	89366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_-_89516_99625_99765_100127_100245_101913_102058_103841_104006_105216_105731_105803
651206	contig_4315_pilon	+	1617	6	Intergenic	novelGene_46714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.1095004025765	102	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTTTGTGTAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49256	76641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_49368_62740_63167_63254_63361_67262_67480_74926_75101_76058
651208	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651217	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
651223	contig_13608_pilon	+	2652	18	Intergenic	novelGene_52380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	118	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTTCGCAACAGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368796	470245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_369367_370847_370989_373608_373727_382430_382540_382985_383077_385448_385555_391792_391861_392468_392586_393163_393236_395258_395399_400585_400710_410882_411048_411534_411809_416273_416377_453179_453379_456287_456419_466411_466478_470187
651227	contig_10082_pilon	+	1777	3	Intergenic	novelGene_63914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_2	102.5	276	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	72	491	580253	583824	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQSPSRSATSSAELSGAAVAAAMAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWVSMASTCLPGLSLAGCGDITSQMWSECLSRSF	574376	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_574419_580223_580435_583586
651235	contig_10196_pilon	+	1130	8	Intergenic	novelGene_132163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	499.23279915797	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	611	940	1046427	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034994	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1035140_1038292_1038475_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
651240	contig_854_pilon	+	1280	7	Intergenic	novelGene_36296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2810.57461503278	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	58	708	545012	562402	TRUE	20	TCAGGAAGCTGGGCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITIYLVLAVCQALNWTCLLCFILPPTLTSGPFYRAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	544954	563599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_545119_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
651250	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_94854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651251	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_97608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651259	contig_14513_pilon	+	901	5	Intergenic	novelGene_70339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	87	326	11375	12006	TRUE	45	TGTAGGGGAAAGTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLNLLFLYIKNKVQNSSSKEGGFREYKMEGFKVVIWLRNTLSGHGRSPWVVQMVKCSSANQRVGDSSPLRSASVERPCDLLLKSSHENPKRWPLCATICYGLFPPP	11288	19063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_11561_11952_12158_13087_13136_14952_15001_18735
651267	SIRV4	+	327	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	450	173	-450	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCAAATTGCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
651270	SIRV5	-	388	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGGACGAATTTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8378_8453_8590_10863
651277	SIRV2	-	274	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4599	34	3424	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
651278	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651279	contig_6589_pilon	-	1301	10	Intergenic	novelGene_25916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	168.201598618378	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	349	1161	1178015	1158634	FALSE	35	AGCCAGAAGGAGGGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178553	1158493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178100_1178289
651289	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651315	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	636	1126	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
651316	contig_3787_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_102378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCTGAACCTCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410858	410105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_410100_410900
651322	contig_14322_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_115968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
651324	contig_6710_pilon	-	800	2	Intergenic	novelGene_92002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657390	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653903_657138
651330	contig_14704_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_82693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATACAAAGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72864	73578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_72900_73600
651331	contig_14513_pilon	-	1151	2	Intergenic	novelGene_70335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	171	458	18880	11982	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGILRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19050	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12121_18731
651336	contig_4847_pilon	+	1319	9	Intergenic	novelGene_156156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	35.1887766198258	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	126	1076	82326	92768	FALSE	35	TATTGTCATTTCAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKWTPVADFTHHAHTASLSAVAVNSRFVVTGSKDETIHIYDMKKKIEHGALVHHNGTITCLKFYGNRHLISGAEDGLICVWDAKKWECLKSIRAHKGHVTFLSIHPSGKLALSVGTDKTLRTWNLVDGRSAFIKNIKQNAHIVEWSPKGEKYIVVTMNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	82200	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_82369_85410_85532_85605_85681_86203_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
651341	contig_15327_pilon	-	847	4	Intergenic	novelGene_70695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	127	537	901528	900904	FALSE	30	CAGGGTCCTTTTGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902154	900593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
651367	contig_11855_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_67057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	855	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCATGAGGTTCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006725	2008513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2006700_2008500
651371	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651377	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
651381	contig_16098_pilon	-	1244	8	Intergenic	novelGene_46089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1942.28837262879	10	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	277	729	458816	457641	TRUE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKTRVWYPWQEQMARPPPKGWMGCLSAVPSIRRTELTLPNGAVC	460403	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456299_456887_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457903_458405_458618_458704_458838_460148
651383	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651397	contig_15410_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_130636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCCTATAGGACAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226158	225351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_225400_226200
651398	contig_11285_pilon	-	1512	11	Intergenic	novelGene_5545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_10	293.485195538037	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	61	936	744458	741876	TRUE	25	ACTTTTGTCAAGTGTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRGEGSG	745382	741217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
651403	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_97370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651410	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671655	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
651412	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651417	SIRV6	+	300	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGTGGCATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
651424	contig_15304_pilon	-	737	2	Intergenic	novelGene_30444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	665	694	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53790	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
651425	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
651429	contig_5145_pilon	+	2651	13	Intergenic	novelGene_131399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	42.454141925926	145	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	25	1527	693521	751034	FALSE	0	TCTTTTGGTTTGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPLIPLSQQIPTGNPLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDITLGKIWDLADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHDVSLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMAAVPPAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPAVLPPSLVPPAKRKKTVFPGAVPVLPASPPPRDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHGVKQAQPVVSWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVKDIFMHSGLTQSLLAHIWALADTRQMGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGLDPPQVLSPDMVPPSERGTPVQDGSGSLGSGEFTGVKELDDICARGGGFQFLLLLCVPTRACSRLVWLGSSGSRAKDRLESPVTSSMQEHLNKLTPPNSGGFSKLKRIDMCTHSETQGHSSGGLGGVCVCVCVCVCVFVCHVHVCICVSRRAP	693496	752158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_693554_715248_715291_715812_715903_716421_716470_718772_718869_719044_719108_724140_724267_725568_725629_726482_726717_729680_729839_733079_733237_733632_733690_750695
651430	contig_11429_pilon	+	2003	4	Intergenic	novelGene_60468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_2	789.040063762432	13	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	158	715	46299	46856	TRUE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSLGPLDFKKQKGQCSGPSRSSCVPMLRRTQSISPQDRWEGFLFQTTPCSLTLLVLTDSHFPVSPLLSPVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEVRPPTHRGALPPSAGSSILLFFPLCLLGAARPPGPAVPTHGSVTTFCSRGWRAAADRARLLGRRRLVLHEAEKPPVDG	46141	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_47370_47457_47552_48443_48530_48899
651433	contig_401_pilon	+	1922	9	Intergenic	novelGene_42870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	89	junction_1	140.475754135723	1932	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	34	567	1749725	1767136	FALSE	5	CTGCCTTTGTGCGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPRLHQLRGKMEALILEPSLYTVKAILILDNDGDRLFAKYYDDTYPSVKEQKAFEKNIFNKTHRTDSEIALLEGLTVVYKSSIDLYFYVIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKNVEKRALLENMEGLFLAVDEIVDGGVILESDPQQVVHRVALRGEDVPLTEQTVSQVLQSAKEQIKWSLLR	1749691	1768491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1749743_1759798_1759868_1761158_1761241_1761853_1761946_1763107_1763164_1764464_1764543_1764692_1764745_1765957_1765997_1767088
651436	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651445	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651447	contig_14322_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_116349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671893	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
651449	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651450	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671657	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
651452	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651456	contig_6710_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_94800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
651458	contig_13760_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_61364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGATGGCGGGGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402993	402583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_402600_403000
651467	contig_18108_pilon	-	2538	19	Intergenic	novelGene_33522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	375.92171909706	3	83	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	261	2339	297156	266909	FALSE	20	TTGGAGTGTGTTAGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335447	266709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289408_289454_296016_296172_296960_297166_298632_298709_316667_316759_335363
651471	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
651473	contig_10064_pilon	+	2382	8	Intergenic	novelGene_122706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_3	65.8997383166586	468	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1597	2157	268353	273630	FALSE	35	TCATCTTGTAATCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCPDQKCLYTCQIKDGGLQPQFEIVPEDNPQNAIVSSSADVCHEELLKTIRASAGRLTPSLLPSGADFFGFSHPTIHNLIQSCPGARKCVNYQWVKFDVCKPGDGQLPQGLPENDAALSFEAFQRQTFEDQNDPILPGSLDLPELQPAAFVSSYPPMFLTHEPLVETHLQHLKSPVQCSPTRSSD	264369	273855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_264725_266181_266253_267020_268110_268271_268419_271806_271905_272159_272271_272657_272798_273484
651475	contig_10982_pilon	+	3171	1	Intergenic	novelGene_87852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1735	2034	48207	48506	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWHFCGCFLYIISYHGCLLASRIKMSFLSMSYKSLSNPALPTCPASFFITTNFASCASPSLSFFHISKFALFSVTSKLSHMLFPLSDSSPPASIHGHS	46472	49643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_46500_49600
651477	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_95575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651481	contig_2054_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_51677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCGATTTAATTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88344	89607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_88300_89600
651487	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651488	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651489	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_98029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651495	SIRV4	+	343	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	191	416	191	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTCCACTCTTAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	2355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
651496	SIRV4	+	223	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1548	632	1093	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2548	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
651500	contig_6361_pilon	-	1066	6	Intergenic	novelGene_24006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4978.63537929823	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	486	785	419660	415399	TRUE	20	TCAAGACTGTGCTTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTNFQLWWGQSGVTCLSFMCPGLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436326	410938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419853_420850_421003_424127_424231_436288
651514	contig_2100_pilon	+	3006	1	Intergenic	novelGene_50609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGAACCCCTCCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736717	739723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_736700_739700
651517	contig_20332_pilon	+	1575	5	Intergenic	novelGene_156188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	332.690922629398	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	208	549	642243	644522	TRUE	25	GGCATCCGTAAAATGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLLEVGIVKEEQLKVHGF	642035	645650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932_644035_644477_644531_644632
651525	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_18702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCTACGTCTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30091	29822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
651527	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
651528	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651533	contig_6102_pilon	+	2040	13	Intergenic	novelGene_32380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGAGCGGCGGCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728475	1743534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1728945_1729883_1729979_1730098_1730200_1730453_1730521_1730601_1730698_1731755_1731799_1732001_1732545_1732742_1732898_1733180_1733284_1733600_1733663_1733866_1733963_1742374_1742444_1743393
651538	contig_14322_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_116600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCCGCGGCGGCCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
651562	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651564	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	107	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651566	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
651567	contig_12644_pilon	+	1993	2	Intergenic	novelGene_44702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	80	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACACTTTGGGGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2682583	2685549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2683381_2684353
651583	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
651591	contig_6710_pilon	+	549	2	Intergenic	novelGene_96460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653365	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
651595	contig_14441_pilon	+	845	4	Intergenic	novelGene_100738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	5	805	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121131	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
651605	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651606	contig_8658_pilon	-	1115	5	Intergenic	novelGene_55822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1001.50499249879	39	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	374	769	13203	6049	FALSE	20	CTGAAGCAGTGTGATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55696	5702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_36529_36674_55528
651609	contig_9235_pilon	+	2599	5	Intergenic	novelGene_156228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	256	1404	45805	46953	TRUE	40	ATAAACTGATTTTTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45117	48302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45233_45664_46981_47032_47492_47549_47942_47985
651616	contig_7695_pilon	-	2707	4	Intergenic	novelGene_41576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.3197870132361	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	84	2093	397040	388811	TRUE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRTAGRPDVSLLSGGEVLAFREGGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	397123	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_388441_388490_389019_389793_391259_396703
651620	contig_5023_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_7243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3534	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAACAGAAAGAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580846	582998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580800_583000
651621	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
651637	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	9	2958	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
651641	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
651646	contig_12790_pilon	+	1369	10	Intergenic	novelGene_35220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	244.985310721145	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	324	1211	308748	312473	FALSE	10	CTTCTCAGGGCCTGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305932	312631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308722_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
651649	contig_1225_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_44131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	225	542	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250589	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274719_274839_274906_276205
651657	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAACCTGGAGCTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
651665	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_97069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651667	contig_6975_pilon	-	1375	10	Intergenic	novelGene_74261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	448.915180748182	124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	106	1152	164514	159453	FALSE	20	CTGATGTTGATACTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSMYDRMRRGGDGYDGGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169980	159229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163009_163195_163709_163849_164402_164538_169898
651674	contig_3948_pilon	+	1784	2	Intergenic	novelGene_53400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	266	316	1860522	1860572	FALSE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVPHCLGSVGELQLLCLLLSAQGSGASSPSTHGKARTQSVGFCEALQFGDRLWKQTDTSDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1815210	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1815389_1860434
651691	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	15	1248	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
651724	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651725	contig_3602_pilon	+	1146	7	Intergenic	novelGene_60487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	145	594	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161600	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_169665_170793
651732	contig_6069_pilon	-	2545	13	Intergenic	novelGene_8067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	55.3501480475788	3	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	726	1934	506931	498920	FALSE	45	AATTAGGATAAACATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWILGLTKEFEEARKWVSQKLQFQKDVDVNLFESTIRILGALLSTYHLTGDSLFLEKAKDFGNRLLPAFKTPSKIPFSDVNIGTGIAHPPRWTSDSTVAEVTSIQLEFRELSRLTGNEKFQEAVVEVTRRVHSLSGKKDGLVPMFINTHSGHFTHLGVYTLGARADSYYEYLLKQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	515919	498308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501622_505367_505557_505922_506072_506906_507093_508364_508435_509837_509965_514285_514420_515227_515337_515795
651738	contig_10904_pilon	-	1791	9	Intergenic	novelGene_22782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	189	junction_7	168.095536451745	974	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	34	954	773328	757834	FALSE	10	GTCAGTGGTTTCTGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTGFPGSFSSSPTTPHSSLVEYQRPQPGDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGIPRSKGEEQNPQERFGPGVDVLKSTPDMATVNGLPENDRKMDTSAPTAGNPQEVTYAQLDHWALTQGAAPAVSPQFTEPMAKSSMYASLTKR	773361	756996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759452_759496_759593_759723_768446_768525_769599_769885_772375_772412_773216
651743	contig_9848_pilon	+	1519	12	Intergenic	novelGene_79914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	182.854049191658	5	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	301	1254	59378	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKYRPVKLNEIVGNEDTVSRLEVFAREGNVPNIIIAGPPGTGKTTSILCLARALLGPALKDAVLELNASNDRGIDVVRNKIKMFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58793	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_59203_59380_75091_75162_77678_77721_78015_78123_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
651754	contig_5945_pilon	-	1364	8	Intergenic	novelGene_104559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.013069318928	15	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	51	779	249708	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249758	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_215800_215961_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
651786	contig_7594_pilon	+	1142	7	Intergenic	novelGene_55436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	715.466456236769	1079	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	33	749	539045	554556	FALSE	55	TAATGTATTAAAAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGVAGGFVATMASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	539012	554949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
651787	contig_15304_pilon	-	1083	4	Intergenic	novelGene_30613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	213.113949697235	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	166	948	66228	64554	FALSE	10	GGAGCCCTGGGCTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66393	64418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65440_66147
651792	contig_13366_pilon	+	3112	1	Intergenic	novelGene_99772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCAAATACCAGAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51910	55022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_51900_55000
651799	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651810	contig_14322_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_116259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
651812	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651816	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651819	contig_6164_pilon	-	3167	1	Intergenic	novelGene_121294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608148	604981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_605000_608100
651821	contig_5549_pilon	-	1859	8	Intergenic	novelGene_81647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	886.505153823204	8	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGGAAAAGTGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442936_443118_443145_443324_443683_443958_444755_444949_445006_445604
651822	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	35	CTTTAATCATACTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651824	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	88	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
651829	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651830	contig_6710_pilon	-	406	2	Intergenic	novelGene_98269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	10	TGGTCCTCAGTCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651834	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1555	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651868	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651872	contig_7457_pilon	-	1466	9	Intergenic	novelGene_31433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.238104082643	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	8	742	473193	469327	TRUE	50	ACATAACAATAAATATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKMTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473200	468269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468348_468680_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
651887	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
651888	SIRV6	+	457	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8844	1	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGTGCAGTTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
651890	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
651891	contig_15066_pilon	-	2211	7	Intergenic	novelGene_149538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_4	150.6339381857	127	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	67	693	114591	113409	TRUE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVVSMCWTRNL	114657	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112847_112954_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
651894	contig_5372_pilon	+	2724	1	Intergenic	novelGene_149718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTTTGTTTAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175310	178034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_175300_178000
651895	contig_7730_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_156304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	673	1017	455723	455379	NA	55	TAGAGACAGAAGAGAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKVAGLFSWMVCMGDWRREFRDGGPNTVLLKELVGEPRPEPLVVYGKLELRCMSPPVGDDWDDGSVMLSSRSSMRLSASPSFRFMVPAMSVSRGSSTVHGLLTGGERLAELL	456395	454956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_455000_456400
651898	contig_1450_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_27383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTTTAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270142	272715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_270100_272700
651899	contig_160_pilon	-	2797	4	Intergenic	novelGene_156311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	83.4386001800126	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAAGGACTGTATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20338	11562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_14093_17841_17976_18104_18172_20272
651903	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651904	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
651905	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651906	contig_12340_pilon	+	2143	3	Intergenic	novelGene_122091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGCACAGGCCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2728	13051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_4141_5447_5516_12388
651907	contig_5145_pilon	+	1414	7	Intergenic	novelGene_131356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_1	10.5514611942296	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	377	1237	57497	66748	FALSE	5	TTGCAGCCTTGGTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLDDLQKELATTHYLLGELGANHSEESVKVLDFLSELKDVTAKKDLELRRSFAQVLELSAEASKEAALINQDVWEEAQDPVAVSRWYFYHEGAGGEPHGGDLQNRPLLVNNEPCAP	57120	66925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509_60652_65307_65450_66546
651910	contig_12250_pilon	+	2119	16	Intergenic	novelGene_80545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	64.6863887451517	30	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	227	1135	272853	275217	TRUE	15	CCTCGGTTCACCAACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWVS	265170	278459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_265230_272685_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
651912	contig_15687_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_129136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAATAGTAATTTATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131810	132985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_131800_133000
651913	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
651914	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651915	contig_3424_pilon	+	2999	5	Intergenic	novelGene_55517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	65.9597415094996	42	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	462	779	237586	241470	FALSE	55	AAGGAAATGATCAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENFDIEAPNYLSKESEILLYAKQDSQCVDCFQAFLPVHYRYHRPHSKDGETFIVVNNPDLLMYCDQEFPILKCWAQSEVAAPCALRNKDICQWKNMKYKSVS	220038	243690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_220288_223230_223295_232342_232485_237579_237794_241360
651919	contig_14322_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_116243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671573	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
651922	contig_8617_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_73485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCCTAACTATATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
651925	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_115893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
651926	contig_6958_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_70001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736734	734482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_734500_736700
651927	contig_9609_pilon	+	2067	9	Intergenic	novelGene_23053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_8	557.664535697762	2	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	34	1050	435659	454609	TRUE	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435625	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
651933	contig_19352_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_122389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAAATTTTCTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162171	161823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_161800_162200
651936	contig_12074_pilon	-	2051	14	Intergenic	novelGene_53754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	298.255856963477	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	23	1291	45831	33160	TRUE	20	CATATTTAATGCCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKRMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEAKSLMISV	45853	29974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33186_33340_33515_33636_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
651949	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
651950	contig_11396_pilon	-	2201	7	Intergenic	novelGene_71279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_6	690.121346012585	8	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	145	765	249053	232299	FALSE	20	GAAAACCCTCTTCGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249197	230862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
651952	contig_987_pilon	+	1521	12	Intergenic	novelGene_72290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1383	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGGCGGAGGGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919728	945201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_920169_921709_921813_922618_922690_927661_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933247_936244_936427_937202_937323_937404_937454_941073_941170_945029
651957	contig_14322_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_116581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCCACAGCAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
651963	contig_10923_pilon	-	1512	10	Intergenic	novelGene_66176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	272	310	38632	38594	TRUE	15	GGGTGCTATGGGTCAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGGDILGPHVPKVGTFPFTHELEVHRAVTEIAGSHRHILEGQPHLSPCHQQLFHKIFHHLRAVVGGGRQAQQLLTPGDSWVVDGLHIDAMLGEQEITNLAV	42716	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_13861_21648_21846_22990_23114_29346_29550_30172_30317_32868_33050_36531_36686_37387_37539_38577_38741_42553
651964	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
651966	contig_16594_pilon	-	1661	4	Intergenic	novelGene_53898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.8094638358646	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCTCGATTTAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274264	240037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_240137_242309_242430_272662_273670_273829
651970	contig_1406_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_25599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2179513	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2179551_2185850
651971	contig_10324_pilon	+	1900	8	Intergenic	novelGene_7761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1376.8398599692	2	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	126	626	75827	79380	TRUE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	74830	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80191_80299
651984	contig_5539_pilon	-	2457	4	Intergenic	novelGene_104778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2524762184584	11	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACGTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301998	282431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_284248_289975_290521_297220_297298_301979
651985	contig_13749_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_156339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTAGGAAACCCTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172209	173654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_+_172200_173700
651994	contig_987_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_72240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTGGTATTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216547	214067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_214100_216500
651996	contig_9706_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_20825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2100_2700
651997	contig_8167_pilon	-	2541	10	Intergenic	novelGene_155657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.3918076496978	49	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	349	909	148855	143703	TRUE	20	GTCTAAGGTAGCACGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKASNQDLFSSVTALSAQCCLHAPLLAS	180463	136381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_143783_143934_144152_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_168994_169037_180432
651998	contig_7898_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_47546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	995	1375	290648	290268	NA	5	CCTGTGCTAGTGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVVAGGPARTWDRETGSWADTELSSPRRIQEQASPGVSGQQEGAPEGSKVRKLHPTSLIAEAECPGVSEEVPPPMQGWKPSSGKVSWWSPPPPMGLIALFTVTRPSPPPGDWGFWGPPSESMII	291642	290165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_290200_291600
652001	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_91664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
652007	contig_5728_pilon	-	1933	4	Intergenic	novelGene_126698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	103.480540306969	218	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1296	1847	350408	344906	FALSE	25	TGCATTGATGTCAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDSLFLKLDALSNFHFIPKPPAPEIKVVSNLPAIAMEEVAPVSVSDAALLAPEEIKEKNKAGDTKTAAEKTATDKKRERRKKKYQKRLKIKAQEKWRKLLEKSHPDQEGKYTKAVASEKLKKLTKAGKAALLKDEGKDKALKSSQAFFSKLQDQVKMQINDAKKTEKKKKKTQDISSHKLKL	351703	344819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_345056_345507_345739_346761_346870_350345
652012	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652028	contig_5643_pilon	+	1334	9	Intergenic	novelGene_39124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	834	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCCTCCCCCCCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646192	651430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650552_650893_650958_651155
652038	contig_9345_pilon	-	1788	6	Intergenic	novelGene_24646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2078	3	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	151	651	955353	948024	FALSE	20	TAAACTTCCTGTATCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQACKTRRRQRHGKQDWCFWVHGVFSKDQRWSEGGF	1001268	946886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948124_949470_949595_952439_952561_955197_955356_997038_997075_1001156
652043	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652046	contig_4105_pilon	+	1544	11	Intergenic	novelGene_21470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	106.407894443974	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	73	1146	60529	74073	FALSE	30	ATATTTATCAGAACTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMCLLLW	58744	74471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72672_74054
652049	contig_6929_pilon	+	1279	8	Intergenic	novelGene_139385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	5937.79001354022	14	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	530	880	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADTKPGTTGSGAGSGGPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101816	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127757_130707_130971_131948
652054	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4152	-1	2973	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1759	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
652056	contig_14101_pilon	+	2103	4	Intergenic	novelGene_122758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52.9549074422968	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	116	949	260068	273778	FALSE	30	TTGAGACAAAATCCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257184	274932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260572_264670_264833_273610
652058	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_89175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
652059	contig_11498_pilon	-	1836	12	Intergenic	novelGene_65509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	665.21264853323	1147	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	24	1403	177267	173305	TRUE	5	CATGCGCGTTCGCCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIQTKFRMPLLNWVALKPSQITGTVFTELNDEKVLQELDMSDFEEHFKTKSQGPSLDLSALKGKASQKAPTKATLIEANRAKNLAITLRKGNLGADRICQAIETYDLQTLGLDFLELLTRFLPTEYEHSLIARFEREKRPIEELSDEDRFMLRFSRIPRLPERMATLTFLGNFPDTAQMLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQSLDVLLEMKSTDRKQTLLHYLVKVITEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGTVSLDSVLGDVRSLQRGLELTQREFMRQDDCMVLKEFLRANTPTMDKLLADCKTAQEAYESVVEYFGENPKTTSPSMFFSLFSRFIKAYKKAEQEVEQWKKEAVAQEAGTDAQGRGEPSAPKSPPKARRQQMDLISELKRKQQKEPLIYESDRDGAIEDIITVLKTVPFTARTGKRTSRLLCEASLGEEIPL	177290	172641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173296_173397_173555_173677_173933_174030_174180_174283_174499_174664_174824_174955_175035_175117_175666_175736_175914_176150_176587_176791_177180
652065	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652087	contig_2069_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_23488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	81	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509891	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509310_1509750
652093	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652100	contig_12270_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_113449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	22	336	14385	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14406	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652107	contig_5643_pilon	+	1164	11	Intergenic	novelGene_38856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2949.61489181215	1	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	469	954	236928	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233970	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236072_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236859_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
652114	SIRV4	-	220	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTCCAAAAAGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2769	2549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
652118	contig_8704_pilon	+	2125	18	Intergenic	novelGene_156342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	177.389392410573	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2037	87	2123	580736	674118	FALSE	30	TAAGTGTATTTCACACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVTCQVFTEGKPLALPVRTSYKAFSTRWNWNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAVPVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTKAHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFQCVKCEDKEYGIVYYEKDGDESSPILTSFEIVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDVEDSLELLSSHYTNTTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQGSVSESVSNSGMNSAEIDSSQIITSPLPPVSSPPPASKTKEVSDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKH	580649	674120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8704_pilon_+_580804_585341_585531_586445_586590_598090_598221_611991_612079_613674_613771_616382_616455_618755_618861_619711_619805_628427_628614_637015_637171_643192_643284_657388_657457_663184_663291_664862_664980_668099_668232_673409_673539_674049
652119	contig_8394_pilon	-	2048	3	Intergenic	novelGene_27307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	456	1700	35322	32466	FALSE	20	TTAACCCTTTTCATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39016	32117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35516_38754
652122	contig_9732_pilon	+	1133	11	Intergenic	novelGene_98355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	93.5668744802347	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	164	1132	221707	285420	FALSE	40	GTATGAATATATTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLFSRWRTKPSTIEVLESIDKEIQALEEFSEKNQRLQKLWVGRLILYSSVLYLFTCLIVYLWYLPDEFTARLAMTVPVFAFPLIIWSIRTVLIFFFSKRTERNNEALDDLKSQKKKIEHEPPSAGAAVIARPGQEIRQRTAAQRNLSPAPATANQGPPPQVPVSPGPPKDTSAPGGPPERTVTPALLSNVLPRRLGSPATSVPGMGLHPPGPPLARPILPRERGALDRIVEYLVGDGPQNRYALICQQCFSHNGMALKEEFEYIAFRCAYCFFLNPARKTRPQAPRLPEFSFEKRQAVEGSSSAGTSPSGSALPSENQFSE	204991	285421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_+_205093_221644_221734_224507_224550_225346_225535_236232_236292_244065_244107_252528_252581_273059_273273_282539_282646_284045_284117_285250
652124	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652140	contig_12624_pilon	-	1828	13	Intergenic	novelGene_61039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1155.01107197675	4371	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	688	1467	875457	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903654	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877484_882950_883083_884679_884815_888700_888778_903447
652152	contig_10793_pilon	+	1179	10	Intergenic	novelGene_83391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4166.80199780226	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	243	680	152887	162548	TRUE	45	AATGTCAAATACAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQ	130871	167256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_131015_151418_151500_152868_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_162545_162690_163141_163288_163929_164053_167167
652153	contig_5031_pilon	+	2179	2	Intergenic	novelGene_133216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGAGTGCAGAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97982	103749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_99111_102698
652157	contig_18113_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_137546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTTTTTAAACAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235445	237054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_235400_237100
652165	contig_6102_pilon	+	2158	19	Intergenic	novelGene_31732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	174.783119576488	402	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	275	1897	216236	228987	FALSE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFHIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	210221	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220146_226990_227023_227264_227330_227565_227657_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
652166	contig_12970_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_50529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACACATAAACGTACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212457	214902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_212500_214900
652167	contig_9515_pilon	+	1292	9	Intergenic	novelGene_73806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	260.603026651649	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1086	207	1292	65880	72655	FALSE	5	CTTGGCTCTCTGCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGGDSAPGPRESHLQAILQELEMRALVSLHPTLLPGHHLPALFPLANGQCGREPCGCSIKEANAF	57136	72655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_72464
652175	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652176	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652177	contig_6048_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_73195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGATTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463944	1462559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1462600_1463900
652193	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_96728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652194	contig_9027_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_156348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAGATAGTACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29909	32052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_29900_32100
652200	contig_12270_pilon	-	302	2	Intergenic	novelGene_114105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	14409	13911	FALSE	25	ACTTTCACCATCAGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDF	14435	13910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652206	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652213	contig_4845_pilon	+	3237	18	Intergenic	novelGene_53608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_17	58.6249589607429	269	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2589	166	2754	147626	168460	FALSE	20	CTTGTTTTCCAAAATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEPKPDPKKAKTLGVSSKAKNTQGKKVPSKTSLKEDDDKSGPIFIVVPNGKEQRMKDEKGLKVLKWNFTTPRDEYIEQLKIQMSSCVAKWLQDEMFHSDFQHHNKALAVMVDHLESEKEGVIGCLDLILKWLTLRFFDTNTSVLMKALEYLKLLFTLLSEEEYHLTENEASSFIPYLILKVGEPKDVIRKDVRAILNRMCLVYPASKMFPFIMEGTKSKNSKQRAECLEELGCLIESYGMNVCQPTPGKALKEIAIHIGDRDNAVRNAALNTIVTVYNVHGDQVFKLIGNLSEKDMSMLEERIKRSAKRPSAAPIKQVEEKPQRTQNISSSANMLRKGPAEDMSSKLNQARSMSGHPEAAQTVRREFQLDLDEIENDNGTVRCEMPELVQHKLDDIFEPVLIPEPKIRAVSPHFDDMHSNTASTINFIISQVASGDINTSIQALTQIDEVLRQEDKAEAMSGHIDQFLIATFMQLRLIYNTHMADEKLEKDEIIKLYSCIIGNMISLFQIESLAREASTGVLKDLMHGLITLMLDSRIEDLEEGHQVIRSVNLLVVKVLEKSDQTNILSALLVLLQDSLLATASSPKFSELVMKCLWRMVRLLPDTINSINLDRILLDIHIFMKVFPKEKLKQCKSEFPIRTLKTLLHTLCKLKGPKILDHLTMIDNKNESELEAHLCRMMKHSMDQTGSKSDKETEKGASRIDEKSSKAKVNDFLAEIFKKIGSKENTKEGLAELYEYKKKYSDADIEPFLKNSSQFFQNYVERGLRMIEMEREGKGHIPTSTGISPQIEVTCVPTPTSTVSSIGNTNGEEVGPSVYLERLKILRQRCGLDNTKQDDRPPLTSLLSKPAVPTVVSSTDMLHSKLSQLRESREQHQHSDLDSNQTHSSGAMTTSSSCTANIDDLKKRLERIKSSRK	145660	168943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_145724_147523_147650_148942_149093_149393_149598_149815_149952_150395_150590_151425_151599_152770_152945_153394_153516_159217_159398_160151_160340_160649_160726_161681_161871_161964_162103_162626_162711_162804_162965_167915_168068_168214
652222	contig_5988_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_16104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGTTTTCAAGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221783	1221229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1221200_1221800
652224	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652237	contig_12079_pilon	+	1874	6	Intergenic	novelGene_67553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAAATCTGATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861430	868338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864700_866538_866649_867246_867409_868245
652243	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652244	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652249	contig_10902_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_65679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	338.220688863056	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	633	1598	189165	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	160602	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_165571_165736_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
652250	contig_11396_pilon	+	270	2	Intergenic	novelGene_71444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	1403	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTTTTAAAAGAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1789216	1789874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1789265_1789652
652252	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652253	contig_7171_pilon	-	1656	13	Intergenic	novelGene_101380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	926.896149642571	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	134	1357	1372066	1363653	FALSE	15	CTAGAGCGCTTGCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENYDDPHKTPASPVVHIRGLIDGVVEADLVEALQEFGPISYVVVMPKKRQALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQKISRPGDSDDSRSVNSVLLFTILNPIYSITTDVLYTICNPCGPVQRIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKPTRLNVFKNDQDTWDYTNPNLSGQGDPGSNPNKRQRQPPLLGDHPAEYGGPHGGYHSHYHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1372810	1363353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1366942_1367088_1367123_1367233_1367306_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690
652263	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652270	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
652277	contig_20600_pilon	+	2295	6	Intergenic	novelGene_137111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	52.2440427225918	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	20	916	111268	117548	FALSE	15	TTTTTCTTTGTCTTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAACNVKVRDCLAVTSVILRRCLSLGAVMAKSKFEYVRDFEADDTCLAHCWVVVRLDGRNFHRFAEKHNFEKPNDSRALRLMTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111248	118927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111459_112268_112446_113990_114161_114959_115049_116223_116332_117386
652283	contig_10324_pilon	+	1417	2	Intergenic	novelGene_7771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79174	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79242_79416
652284	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652285	contig_10044_pilon	+	2636	5	Intergenic	novelGene_156372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	6.94172168845741	86	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	270	2138	9485	25515	FALSE	40	AAACCACTTTAACTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQKKMVEAQESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLYRDVMLENCRNLVSVGCQVNKPDALSRLKREQPWTVLDENHSGIFSEIMNIDDHLLGHSQKESKVNSKEQCYEHNALVDIVHRHKNHFPLRENHAMFDLHERAVKSNLTLPSVNHSKCDEIKNSAELTGDEKTFLHDAQEQFCLEMKFPESQKSNSTKSQLIQHQKTHKTEISHVCSERGKAVISKSFLTEPQVIHTGEKRYRCSLCRETFFKKFKLIEHHHTTHKGQKSYKCMECGKAYLHKSQLNNHQKAHLAEKPYICHDCGKGFIQKTHLTIHQRTHTEEKPYICDECGKSFNQKGHLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGDLTIHQRTHTGEKPYICSECGKNFSHKGNLIIHQRIHTGEKPYICGECGKQFSQKSRLIAHQRFHTGKMPFSCSENGKSYSQNATFIRHLKIHAGEKPFQCSECSKAFETKLEVIEHQRSHTGETPYCCKECGQTFTCTSSFYSHKRKHKREKGVDSIKLEDSSTTSQISSHTSELMQEKSPVNTATVQMPSLAPETSVNISGLLTNMNLVLVGEPVARCEPSADNREFVRQRNLVNAVNLVVPSVVNYVLFYDK	3844	26013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_3939_9309_9521_16094_16222_16476_16570_23902
652286	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652291	contig_10765_pilon	+	2370	6	Intergenic	novelGene_122849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	187.215811298085	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	441	2201	18249	34929	FALSE	35	ATTTTAAATGTTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15613	35098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_17961_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
652304	contig_14513_pilon	-	1214	5	Intergenic	novelGene_70311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11559_11641_12158_13087_13136_14952_15001_18735
652308	contig_11427_pilon	-	2234	17	Intergenic	novelGene_78981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	58.2298449572897	192	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	37	2079	138608	106977	FALSE	20	TGGATTTTCTTTTCTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVFATLLSLGALGLCLATPENTVRWCTISGDEATKCSEFQKNMARVGAAPLTCVNRTSYRECVKAIVKNQADAVSLDSGLVFKAGQAPYKLKPVVAEVYGSKEQPQTHYYAVAVVKKDTNFQLNELRGKKSCHTGFRRSAGWYIPCVPCVDARQFPKLCSLCAGQGANKCACSSQEPYFGYSGAFRCLQDGAGDVAFVKDSTVFENLPNKNDRDQYQLLCPNNTRKPVDAFKSCHLGRVPSHAVVARSVNGKEDLIWELLRQAQARFGKTKAPEFQLFASPPGKKDLLFKDSALGFLRIPSKIDSALYLGFKYLSALQNLKKKKSSLDARRKQIVWCAVGREEQSKCNQWRRWSRRQVSCALASTSEDCIALIMKGEADAMSLDGGLVYTAGKCGLVPVLAENARSQESNGSDCVTRPSKGYLAVAVVRKSDADLTWNSLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLFNQTGSCRFGEFFRQSCAPGADPGSNLCALCIGDDSGQNKCVPNSKERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLDNTDGKNTQEWAKNLKPEDFELLCLDGSRKSVSEAWKCHLAVAPSHAVVSREEKAEYLENVLLQQQEQFGQNGSKCPKQFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYEKYLGAAYVTAVANLKKCSSSGLLEACAFLNS	138644	106821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_107012_108713_108904_110424_110610_111779_111848_115228_115371_116173_116330_117356_117405_118609_118701_120840_120996_121855_122031_123102_123282_127146_127203_128162_128286_128721_128846_129192_129302_131655_131820_138565
652316	contig_2596_pilon	+	2214	13	Intergenic	novelGene_53444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	162.868726961999	481	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1110	1751	45320	61358	FALSE	10	CTAGCCTCTTGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFTKKLPHPDLPAEEKEQLLHNAEYQETMVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA	25378	61821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_25699_28994_29065_32585_32681_33834_33972_36842_36996_42489_42717_44873_44952_45290_45359_45872_46062_48753_48897_58522_58659_60346_60434_61310
652319	SIRV7	-	324	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	19	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114719	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
652323	contig_6241_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_156448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGCCCCAGGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591604	591839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_591600_591800
652335	contig_2453_pilon	+	2379	12	Intergenic	novelGene_147757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	55.177399853069	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	128	1345	56543	60410	TRUE	5	CTGGGTTTATTGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGYD	55523	63157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_55622_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60786_61900_62016_62422_62836_63026
652338	contig_5229_pilon	-	2600	11	Intergenic	novelGene_117709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_8	26.4652602481064	171	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1212	2114	655895	652839	FALSE	10	GGATTGTTTCTGTGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTTLSAAGWAGTRAGPVPWQPPFDTVHIPEATKQVVRAFQEFIRSTPYSAYNPETYAGYWKQLTVRTSRRGQAMAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657588	652352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655474_655590_655758_656307_656546_657083_657324
652351	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652353	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652354	contig_1225_pilon	+	1439	3	Intergenic	novelGene_44158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	261.5	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250600	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253464_275645
652355	contig_6048_pilon	-	2932	11	Intergenic	novelGene_73330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	47.1899353676184	94	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	69	1136	2733105	2589914	FALSE	35	ATGTGCAATGAACAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPSPWLSEEDESLKGCELYVHKHSIQQVLKECIVHLCIAKPDRPMKFLREYFEKLEKEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGAPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYMEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGAPQVREAGPATL	2744509	2588117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2590009_2590685_2590768_2612162_2612285_2620452_2620514_2631321_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2732928_2733128_2744463
652359	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652371	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	2	1248	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
652373	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
652376	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_89544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652392	contig_13528_pilon	-	2090	9	Intergenic	novelGene_66877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	165.657779775053	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	188	313	57141	55955	TRUE	25	TCACCTTTGTTTAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPGILI	61452	40009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43525_43584_45852_45930_46533_47757_55922_55969_56014_56039_57053_57228_61351
652403	contig_15327_pilon	-	814	4	Intergenic	novelGene_70696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	120	530	901528	900904	FALSE	50	AAGGTACTAGAATTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902147	900619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
652409	contig_12786_pilon	-	1441	10	Intergenic	novelGene_103411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	534.692596581911	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	515	1381	614067	590909	FALSE	20	AATCTCCTTTTGTATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDLGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629494	590848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602893_604606_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
652412	contig_2209_pilon	+	3185	1	Intergenic	novelGene_141009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGGTCTAAAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135256	138441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_135300_138400
652413	contig_16098_pilon	-	2393	12	Intergenic	novelGene_45893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_6	43.7014665865824	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1797	2144	247137	244355	FALSE	15	TATTTTGTCAGTTTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253511	244105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250765_251545_251643_253023_253103_253255
652414	contig_6710_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_98330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTCAGTAGCACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657178	653687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652417	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
652421	SIRV7	-	1122	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	112492	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCAAGCGTAATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2246	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2114_2223
652423	contig_12873_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_27138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1487.57789712001	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	416	748	16357	19132	TRUE	35	GACTTTAAGCCAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFITRVGDVDAGRARAARHSAR	15941	20421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17734_17948_19073_19251_19611_19703_19851
652424	contig_9132_pilon	-	1564	9	Intergenic	novelGene_121375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	70.8421440598744	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	151	1281	137052	97662	FALSE	15	TATTTCCTTTCTCCAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMALSKTFGQKPVKFQLEDDGEFYMIGSEVGNYLRMFRGSLYKRYPSLWRRLATVEERKKIVASSHDHGYTTLATSVTLLKASEVEEILDGNDEKYKAVSISTEPPTYLREQKAKRNSQWVPTLPNSSHHLDAVPCSTTINRNRMGRDKKRTFPLCFDDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW	137202	97378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786_105954_125469_125598_127955_128094_131337_131468_133181_133294_136959
652429	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_95878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653837	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652430	contig_11292_pilon	-	1387	12	Intergenic	novelGene_109419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	269.404178828481	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	255	1385	166472	161869	FALSE	30	AGCCAACCTGCAGTACTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKK	167454	161866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165909_166349_166602_167109_167194_167413
652435	contig_6227_pilon	-	1484	12	Intergenic	novelGene_49718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	274.790619012951	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	24	722	1224979	1204205	TRUE	15	GTTATGGCTTCAGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLVSRGLKPCYPMTSTCTALLPTSSRVTWSPTGSTLPSLAPEWTTRQAPSCGGSQGPMASMPSTSLSTKAPG	1225002	1202618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1205914_1214325_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
652437	contig_4604_pilon	+	1579	4	Intergenic	novelGene_19180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_3	97.8445479091991	10	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	198	716	377361	379856	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	377163	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_377535_378442_378607_379336_379470_379808
652439	contig_4103_pilon	-	1383	6	Intergenic	novelGene_51873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	297.413785827086	42	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	208	579	43906	40734	TRUE	5	CCTGTTTCACGTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	45220	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40327_40416_40878_41783_41930_42374_42449_43898_44023_45129
652442	contig_9901_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_126922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAATGACATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113616	113935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_113600_113900
652446	contig_18145_pilon	+	1207	4	Intergenic	novelGene_37311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	44.342104395509	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	55	699	66694	70718	FALSE	45	GTATAATGAATAGCATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKVSVLLFLAWVCFLFYAGISLFTSGFLLTRLELTNHSSCQEPPGPEPLPLGHRGEPGACWMASRFSRVVLVLIDALRFDFAQPQSSHMPGEPSASLPFLGKLSSLQRILEIQPHRGRLYRSQVDPPTTTMQRLKALTTGSLPTFIDAGSNFASHAIVEDNLIKQLTGAGRRVVFMGDDTWKDLFPGAFSQAFFFPSFNVRDLHTRGTTLRAP	65889	71226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_65914_66663_67205_67820_67928_70691
652448	contig_3410_pilon	-	2619	10	Intergenic	novelGene_58922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	487.360869668412	1	122	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	10	1005	57559	15311	FALSE	15	TGTTTTACACGTTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEATLRSGSWSLQASTPRT	57568	13696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15366_19508_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
652450	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671645	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
652454	contig_11720_pilon	-	1632	10	Intergenic	novelGene_43877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	72.7614061314253	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	378	1223	110844	108190	FALSE	20	GACATGTATGTGTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASQPSLGEGEESESNSVESLGFCSVMPLAAVGYLDGTLAIYDLSTQTLRHQCQHQSGIVQLLWEAGTAVVYTCSLDGIVRLWDARTGRLLTDYRGHTAEILDFALSKDASLVVTTSGDHKAKVFCVQRPDR	113361	107780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109022_109209_109301_109506_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_113170
652459	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
652463	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
652466	contig_19816_pilon	+	2305	4	Intergenic	novelGene_156461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_3	17.4419672692682	184	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	35923	36578	TRUE	15	ATCTTTCCACTTATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRHRPGRRAGRWDGGLSRFSPPGSHSLRYFETAVSRPGGGEPRLISVGYVDDTQFVRFDSDRDSANRRKQPQAPWIQQERPDYWDRNTRVYEHTAQTFRVGLRILRGYYNQSDAGLLPSR	35922	42687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_36266_36558_36834_38399_38433_41033
652485	contig_7272_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_25330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACACACATTGCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572103	573425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_572100_573400
652486	SIRV7	-	263	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91648	15	-91642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAATTAGCACGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
652489	contig_15304_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_30618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	193.325861924598	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	176	994	66228	64723	FALSE	5	TGGAGCCCTGGGCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVAVQQGARAFGPGLHH	66403	64419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_64988_65310_65396_65721_66104
652497	SIRV6	+	432	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-42	95	8	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
652499	contig_3009_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_132516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAGAGAGGAAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68094	68292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_68100_68300
652509	contig_11493_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_143703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236112	238206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_236100_238200
652515	contig_3077_pilon	+	1583	8	Intergenic	novelGene_26666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3985.53131172428	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	101	1093	9719	17590	FALSE	20	TAACAGTGTGCGGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9618	18080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
652522	contig_18184_pilon	+	2560	5	Intergenic	novelGene_123855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_4	59.8304897188716	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	486	2039	48717	62430	FALSE	15	TTTCTTTGTGTAAACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSIRSNLQTHRRIHTGEKSYNCEECGKVFRQAVHLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHSKEKPYKCEECGKYFGTRQNLQVHFRIHKGEKSYNCVECGKCFRQSAHLLTHQRVHSGEKTFKCEECGKYFRNRSNLQTHHRIHTGEKYFNCVSGPYSWGFSSLCRNSKSGLLL	37574	62951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37997_48653_48732_55969_56097_60466_60614_61165
652527	contig_6710_pilon	-	586	2	Intergenic	novelGene_93000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	52	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652531	contig_12951_pilon	+	2375	4	Intergenic	novelGene_68202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_2	55.1502996869061	107	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	734	1039	820352	820657	FALSE	75	GTATAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLFSFYSVIPRLLSCIMELCKQTYFEKQVFTFFIFSALPAGRSAPPVDCRGLCSAGGHVRAWPHLFSVDTVCLCMYFRIWVILSSKFFATLIAPLREPMG	755140	821993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990
652533	SIRV4	+	417	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	18	-881	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTTATAGGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
652536	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652559	contig_5153_pilon	+	1796	14	Intergenic	novelGene_74367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	318.718718154073	2	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	396	1346	1010261	1022263	FALSE	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVDSAEDLWWQRLTRAWWSLLPTCQQQKAKECLFLPPPESSP	956661	1022713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010041_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1022141
652563	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652566	contig_6191_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_107840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCCTCCTCACATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133948	136103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_133900_136100
652567	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652570	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652573	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	393	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652576	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
652591	contig_5649_pilon	+	2434	10	Intergenic	novelGene_82258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	175.711885388174	3	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	612	1361	25982	34768	FALSE	35	ACCCAACCACTGTCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGILQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12689	35841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23143_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33756_34638
652594	contig_15899_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_128911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAACCCTCTAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49653	50890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_49700_50900
652598	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652607	contig_7843_pilon	-	2079	4	Intergenic	novelGene_152000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	33.8657480190367	350	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	217	597	115284	112946	FALSE	25	TATCAGAGTGTGAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSAAIFITLLGLLGYLHFVKIDQEALLIIDSLGIQMTSSYASGKESTTFIEMDKVKDIVINEAIYMQKVIYYLCILLKDPVEPHGISQVVPVFQSAKPRLDCLIEVYRSCQEILAHQKATSTSP	122801	111463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_113039_114507_114592_115080_115286_122586
652610	contig_15063_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_14424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	3895.98273866813	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	19	825	35349	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35330	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
652622	contig_12786_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_103396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	684.530794167264	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	378	1022	614067	591100	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRVS	629490	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591108_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_628731_628911_629303
652624	contig_3948_pilon	-	2023	13	Intergenic	novelGene_53300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	485.6046274148	2	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	840	1697	1485208	1468245	FALSE	15	TCAACAGGTTTGCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511002	1467918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485888_1485988_1489829_1489929_1490775_1490839_1491191_1491221_1494190_1494313_1510766
652626	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_97013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652633	contig_3948_pilon	+	2272	16	Intergenic	novelGene_53177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	30.8864587373388	116	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	310	2103	346422	384260	FALSE	20	ACTAAAGTGGTCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLQHVLRAQGSLRQGTLASVSWLLLRNCRAHSGLPSTACPSPERQEDGVPKDFSSRLATGPTFQHFLRSASTPQEKPSSPEVEDPPPYLTVDELLGRQRKVYLETYGCQMNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQGLKEVTLLGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRQKTRAYHRLQDDVPGEVKIRRLEELITVFREEATTANKTSVGCAQLVLVEGLSKRSATDLCGRNDGNLKVIFPDTEMEDVSNPGLRVRAQPGDYVLVKITSASSQSLKGHVLCRTTLKDSSAYCSPGWMATQS	343576	384429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343633_344342_344467_345535_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361249_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368963_371245_371396_379631_379773_384152
652635	contig_5236_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_100875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGCTATTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37467	36857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_36900_37500
652638	contig_10968_pilon	+	2009	5	Intergenic	novelGene_84300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_2	182.543659161309	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1330	1719	172393	177921	FALSE	15	TGTGCAATTGTGTGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	170601	178211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
652639	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
652660	contig_7202_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_17216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGATTTCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
652662	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
652667	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652668	contig_9363_pilon	-	1917	11	Intergenic	novelGene_6599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1018.61194279274	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1017	1730	777144	754100	FALSE	50	AAACATGTCAAATGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDACWAFQDGSDGSSCG	787927	753912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754144_773616_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
652669	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
652679	contig_17470_pilon	-	1669	11	Intergenic	novelGene_110525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	54.0921436069971	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	285	1298	274118	270076	TRUE	15	TTCAAACTCTTGTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	274402	269594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_269627_269736_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028
652681	contig_3975_pilon	+	2137	13	Intergenic	novelGene_54827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.276385399196283	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	939	1505	2060191	2064710	TRUE	5	TGCCTCCTCCTGAGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAIWAAMSKSLLTVSLMPGGVLRKSTRLPVLHVFRDDVDGLLGDHGIQPDQPLVLQLLHEIGLGQKGVGRHAALLQALHRHFRVPVVVPHPHLPELASPQTLHQLQRLPGNLPLVLPPRLLGFLGLAGAAQPRAQPVRSIGVMANQFMQAGESDAGGDVEAAVVQVTDLVMFHHLSLVLVEVPDRQ	2056371	2079283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2057046_2059841_2059965_2060049_2060205_2060294_2060374_2063812_2063991_2064110_2064265_2064568_2064719_2064958_2065064_2065204_2065303_2065576_2065671_2065860_2065941_2066196_2066303_2079142
652690	contig_4103_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_51956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	182	523	152564	152905	NA	75	GAGTTAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRRKQLQWPTASLGPPRFPGGGCEVLWKLWDLALGWPHPPTEAAESQPRERKADPLGGLGPRKVLEWLSSEIRKGKAESNSNLSLIRDIHQLTKHFLLTDPQSHEADLTYR	152382	154276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_152400_154300
652691	contig_16122_pilon	+	1675	3	Intergenic	novelGene_134511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.5	49	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	502	1197	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133522	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_133674_133739_134161_136976
652704	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652705	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
652717	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652722	contig_1863_pilon	-	2198	5	Intergenic	novelGene_156519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	22.0042609510067	1945	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	152	481	56971	49514	FALSE	35	TGAACAAATCTTTATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINSALAQRVRNRVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVEFREVTELIKVDKVKIVACDGKNTGSNTTE	62711	47796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_49540_51778_51906_56340_56446_56899_57021_62609
652724	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4148	3	2969	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
652728	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_11957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	224	1396	34808	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27145	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
652730	contig_4364_pilon	+	1519	6	Intergenic	novelGene_194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	813.698617425395	17	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	428	610	1269855	1270037	TRUE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1268718	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1270653_1270782
652731	contig_3747_pilon	+	1490	2	Intergenic	novelGene_24961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	7595	junction_1	0	2	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	32	427	203607	204120	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLKTALFLCMPLSSSSCHHLLTLRWIPALSTTMCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	203575	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203651_203768
652747	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_96503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652765	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_96912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652771	contig_1435_pilon	-	2770	20	Intergenic	novelGene_115478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAAGTGCTCTGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394017	338686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_338755_345578_345650_348727_348816_350409_350592_357554_357717_361448_361556_364175_364356_365983_366185_366906_366963_367365_367461_370112_370213_371097_371179_386167_386290_386388_386466_388127_388168_388713_388814_388935_389041_389552_389655_390212_390284_393255
652778	contig_15629_pilon	+	2452	12	Intergenic	novelGene_122471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	92.8917436215827	154	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	304	1494	180200	202417	TRUE	25	TTATTTTATGTCCCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLCWIFLWLVSRERINGFNISDCSTKKLIWTYHATSEEEFILFCDLPELQKSHFFRRSQLSPTQVPELVPCRGSKDLSNVQWYLQPQNGDPLREITRDHPSIKSALHFSTIQMNDAGSYICRPRIRSPQDDACCIKMVLEVKPKKNTSFPCFEHKHKQFLLLGSIDPIYCPSLHCQSDTQCPEVTWYQNGKLLSEKRGNPLRIGEVYNYHRGTYVCDYNQSYNTSSWIVRAVVQVETIVKNTNFKPDILEPDKDTLEVELGKPLTLNCKVRFGFEKDLKPVVRWYIKDTDQRQEVPAPEGNSSTSMLKDGVIQHILSLKEVTQRDLQRKFICFAKNSVGSTTRSIQLKKKERSGFHIHTAWHHHDPGRHAAGECSPLHVLDRNRAAVPNLSEQG	176355	208424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_176412_176522_176670_180099_180270_180739_181053_181149_181337_192027_192179_195237_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
652785	contig_3627_pilon	+	1036	3	Intergenic	novelGene_78495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_2	6677	182	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	206	418	630924	634377	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNREVGVQAAGATVCWSPWRSSSSATNWSWLSPSSCFWNLRFKVILCGEPGTSGYAAIQTVILPTALMNRDQCSTYFQANPTGFYIRGLTLFRLVGGICPQTSRTWVKMEQKRILLCKREGFPTLTPGNVFNTFCIP	621257	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634240
652789	contig_513_pilon	+	1889	8	Intergenic	novelGene_80163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGAGTATCTGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448995	453432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_449994_450615_450707_450793_450922_451014_451129_451621_451777_452185_452365_453009_453112_453310
652792	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	16	366	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14424	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
652793	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_97796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652795	contig_12250_pilon	-	1242	10	Intergenic	novelGene_80711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_9	300.419500936956	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401316	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401003
652802	contig_12178_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_156542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGATCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67947	66205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_-_66200_67900
652803	contig_16492_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_100283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCATATTACCTTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101159	101561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_101200_101600
652808	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
652813	contig_6795_pilon	-	2600	19	Intergenic	novelGene_27741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCGTGGGGTGAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333734	327092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_327240_327430_327563_327758_327972_328196_328373_329027_329117_329244_329311_329535_329618_329771_329945_330462_330568_330652_330840_331216_331409_331550_331691_331764_331996_332124_332277_332380_332435_332538_332669_332733_332842_332947_333013_333576
652823	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91669	11	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
652833	contig_19342_pilon	+	960	6	Intergenic	novelGene_41119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.18747549010185	85	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	65	541	4349	6183	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	4284	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
652834	contig_7151_pilon	-	1706	7	Intergenic	novelGene_40671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.932735308366	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	60	1565	65162	1967	FALSE	20	TTCTCAACCCAATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQADASIQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	65221	1825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2092_13414_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
652835	contig_7171_pilon	+	2195	8	Intergenic	novelGene_101379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1607	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGTCAAGTTAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363353	1370851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1363712_1364242_1364338_1364429_1364489_1365180_1365386_1365698_1365814_1367229_1368422_1370595_1370670_1370754
652849	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
652850	contig_17311_pilon	-	306	3	Intergenic	novelGene_57832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7771	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123447	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118889_121530_121642_123344
652851	contig_20614_pilon	+	2167	7	Intergenic	novelGene_107576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_6	53.8529376068649	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	50	1033	245101	265175	FALSE	20	AGACATGTTGGTTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGWESYYKNEGDEEEEEQHEGPEAGGEYKYSGRDSLIFLVDASRAMFESQNEGDENELTPFEMSIECILSVYTNKIISSDRDLLAVVFYGTKKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRVLELDRFKGQLGKKHFQDLIGCGSDYSLSEALWVCANLFSDVQFKMSHKRIMLFTNEDDPHGNDSAKASRARTKAADLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISVAEDEDIGVHFEESSKLEDLLRKVRAKESKKRALGRLKFKLSKDVALTVGIYNLVQKAFRPPPVRLYRETNEPVKTKTRTFNVNDGSLLLPSDTKRSQVAVPS	244431	266309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_244466_245085_245180_251570_251693_255565_255705_255999_256255_256970_257155_264970
652861	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_90575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653859	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652867	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652869	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_10745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	233	1405	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
652870	contig_4782_pilon	-	2543	4	Intergenic	novelGene_73639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.3629956194955	105	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	251	1210	412864	403826	FALSE	55	GATGAATAAAACAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPAPRVRAEDVSSLSNSPQPSSFSKSTPWGGSRDQGKSSLGSFESGTSASRDREFGLSQNPFASLSPDEQKEEKKLLEGIVKDMEVWESSGQWMFSVYSPMKKEPNISGSYCYEIPDKDFRNLVLSFLKEIKENTGRVLEEFRETIQEQNEKLSKEIEALNEKQLEIPKLNNKITELNNSMEEHRSRIETLEGGVSKIEDKTSEITQFEKQIETRMKKHEQNLRVMWDTIKKNNIRIMGIPEEEESNKSSEKIFEEIMAENFPNIMEDKKIFVEEAQRTPYRLNPKRNTPRHIIIKLSRTKDKERILRAAREKQNITYKGVPIRLTADFSSETMQARRQWDDIYKVLKEKNCQPRIIYPAKLLFRNEGEIKIFPDKQKLREFVTTSPALQELLKGVFQKENQ	418322	402492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_404710_412788_412884_414170_414344_418264
652871	contig_7202_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_16438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27796	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
652873	contig_16148_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_50367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGAATTGAAATGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67424	65562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_65600_67400
652875	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_90571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
652879	contig_6028_pilon	+	2133	7	Intergenic	novelGene_156607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	130.309460729279	16	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	215	790	384610	413558	TRUE	40	AATTGAACAGTTTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILYSEPICQAAYQNDFGQVLRWAREDNDYINIQDGFNGDTPLICACRRGHLKIVSFLLRRNANVNLKNQKERTCLHYAVKKRFTFFDYLLIILLMPVLLIGYFLMISKTKKNETLVQMILDAGIEVNATDCYGCTALHYACEMKNQTVIPLLLEAHADPTIKNKDGESPLDIAQRLKFSQIELMLRKVS	384395	414968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_384631_402437_402630_407315_407424_409888_409967_412683_412783_413480_413759_413825
652888	contig_3942_pilon	+	2576	11	Intergenic	novelGene_128882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	11.0040901486674	119	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1321	1743	1536880	1549972	TRUE	20	GAATGGGGTCTGAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVRGVRHLGSRGFLSSATSKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMAEDRPGLQ	1531855	1551324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534080_1534131_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1537094_1549644_1549706_1549824_1549974_1550064_1550179_1550283_1550459_1550671_1550769_1550878
652896	contig_9706_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_20835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAAACTTCATAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2200_2700
652904	contig_9074_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_156629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87097	88224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_87100_88200
652905	contig_10235_pilon	-	2410	18	Intergenic	novelGene_46573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.0567782102615	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	24	2027	546922	537548	FALSE	25	GGGAGTTGAAGGAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLNPEDWGLRNCTLYTGLDEVAEEQTQLFRCLEQDVPFDSSSLDVGMDASPPEPPWDPLPLFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSDVQTKIEPVSPSSSINSEASLLSADSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKIAAVPNPQQYHEGPLASSCRQPGPPGLPPTPLPQSPLTSTTHTDFKLGSGD	546945	537164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537702_538356_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811_545904_546165_546245_546384_546465_546831
652906	contig_6102_pilon	-	2698	15	Intergenic	novelGene_32252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_8	213.598815730876	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	239	1192	1311623	1308361	TRUE	20	GTTATGTCCCAGCGACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWGLVSKMPPEKLQRLYIDFPQHLRHLLGDWLENQPWEFLVGSDAFCCNMASALLSATVQRLQTTAGEQGEGSTILQHISTLESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKAVMEQFHHLPRPFHWKQEELKFNTALQRLQHRVRKICLLREALQQGPEAGQVSLHSLIETPVNGSGSKEALPKLLQESVGELEVVQTLVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRALLVSRLDEVLRTLVTSSFLVEKQPPPGFEDSDKVPGRGPVSAGLAVPGTPSQAPACQGGHGD	1315085	1303791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1304644_1304739_1304835_1306035_1306243_1306604_1306698_1307617_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507_1311645_1314868
652907	contig_5084_pilon	-	2253	7	Intergenic	novelGene_64636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	27.027249623708	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	515	1096	1333870	1328304	FALSE	30	AAGTAAACCCATCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGGNGYINDFPMGRILRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH	1335711	1327146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330262_1330746_1330841_1333776_1333874_1335200
652908	contig_12635_pilon	+	1877	2	Intergenic	novelGene_60852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	75	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCTACTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582350	603918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_582786_602476
652909	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
652911	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1113	0	-1113	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGAGCCACCGTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
652912	SIRV4	+	336	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	203	411	203	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
652913	contig_10235_pilon	+	973	6	Intergenic	novelGene_46483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGAAGCGGCCGTCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217925	222857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_218323_219303_219483_220087_220203_220361_220480_220676_220787_222803
652916	SIRV2	-	279	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4594	34	3419	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
652943	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_95242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	657166	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPSWNSNVIFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653861_657138
652946	contig_6807_pilon	-	1870	5	Intergenic	novelGene_84564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	368.948759992495	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	207	968	120486	111018	FALSE	40	CTAAAAAATATATGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	124761	110115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_118069_118173_120423_120520_124588
652951	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_93391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	848	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657836	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
652957	contig_6898_pilon	+	1836	9	Intergenic	novelGene_35731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1775.87175335805	5	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	473	1087	115973	126957	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQLCRFIHHHAQDDQCACDHHGCRTGVCHPAQPVTSCYSQVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKPPFDKPSTRVFLPVVLSLGTVNQEAA	59638	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104609_114227_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122729_126875
652959	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_18429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
652960	contig_7815_pilon	+	2164	3	Intergenic	novelGene_134353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	100	234	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	426	1721	173960	175255	FALSE	40	CATAAAGATGTAATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLRRRLFPYPTKCYFVVVIFSLVAFSVLIIHQKTEFVSIGHLELIEENPSSDVNCTKVLQGDVDEIRKVKLKMLTVKFRNRPRWTTYDYINMTSDCRSFIKRRKYIVEPLSKEEVEFPIAYSIVVHHKIEMLDRLLRAIYMPQNFYCIHVDKKSEDSFLDAVMGIASCFSNVFVASQLERVVYASWSRVQADLNCMKDLYRMSADWKYLINLCGMDFPIKTNLEIVRQLKSLMGENSLETEKMPAHKAERWKKRYEVINGKLTNTGADKVPPPLETPVFSGSAYFVVSRKYVGYVLENEKIQNFIEWAKDTYSPDEYLWATIQRIAEVPGAFSSSHKYDMSDMQAVARFVKWYYYEGDVSKGAPYPPCSGVHVRSVCVFGAGDLNWMLHKHHLFANKFDMDVDPFAIQCLDEHLRHKALEPVKHLQW	127347	175698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_127483_171442_171589_173815
652966	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652976	contig_14322_pilon	+	2249	12	Intergenic	novelGene_115625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	24	junction_9	116.061397259745	418	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	580	1029	246326	249230	TRUE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALSSLNKHSEAVAHYRRALELDPDNETYKSNLKIAELKLREVPSPTGSVGTFDIAGLLNNPSFMSMASNLMNNPQVQQLMSGMISGSPNPLGTPGTSPPQNDLASLIQAGQQFAQQMQQQNPELIEQLRSQIRSRTPSASNDDQQE	232528	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_232579_240175_240312_240814_240922_241270_241356_244262_244363_246224_246331_246654_246794_247065_247129_247603_247642_247920_248011_249115_249238_251058
652979	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
652985	contig_14441_pilon	+	839	4	Intergenic	novelGene_100475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	228	656	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLCASSESTARSPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	87305	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_87341_116535_116963_117220_117344_117539
652988	contig_8658_pilon	-	1185	7	Intergenic	novelGene_55816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1302.76227898859	265	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	442	837	13203	6049	FALSE	20	GAAGCAGTGTGATGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55675	5700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30175_30226_30246_34540_34626_55528
652989	contig_8843_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_156659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAACACTAATGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97935	98786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_97900_98800
652990	contig_8843_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_156660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCAGAATGTTGTTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99138	100192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_99100_100200
652995	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_18813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTACAGTCAGGACTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
653006	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_17196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
653013	contig_11677_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_85929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595204	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594900_595200
653017	contig_12425_pilon	+	1525	7	Intergenic	novelGene_46649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_6	121.079519325111	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	52	1509	173715	198400	FALSE	35	GAGGCTAAAGTTCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRASPDLGGRLRAPLGSMEEKPYAEPAILMAAAACSTKAMSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173663	198416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
653029	contig_15304_pilon	-	1124	4	Intergenic	novelGene_30631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.275554691886	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	185	1123	66228	64599	FALSE	45	CAAGAATTCAGGAGAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPE	66412	64597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64769_64988_65310_65396_65721_66104
653030	contig_13453_pilon	+	2521	17	Intergenic	novelGene_146725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	226.393730243905	34	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1059	2288	163830	185512	FALSE	15	CATGTTTTGTCTGTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCSLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAVNLLRRIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLEPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNACLGWKKARQEGGYRSEMAYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSNSWEGNRASQTLSFKEIALLKAVLAAGLYDNLGKIIYTKSVDVTEKLACMVETAQGKAQVHPSSVNRELQTYGWLLYQEKVRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSVDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENNN	149657	185745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_149838_151148_151293_154791_154969_155563_155705_156843_156989_157123_157242_159549_159595_161119_161209_163810_163940_164575_164652_166041_166267_167418_167556_167968_168063_173658_173962_175345_175478_182908_183006_185456
653033	contig_10734_pilon	+	2106	10	Intergenic	novelGene_51185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	487.625184939882	12	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	765	1295	1139083	1142903	FALSE	20	AAGTCCTTCGTATGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKQKQQEMAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123692	1143714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134412_1139065_1139120_1140668_1140893_1141326_1141417_1142723
653038	contig_18869_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_56367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73744	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
653041	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653042	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653052	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653053	contig_10372_pilon	-	2206	2	Intergenic	novelGene_112516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCATTATAAAAAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52571	49602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_49669_50431
653059	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_16459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27816	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
653062	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653063	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_94140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653844	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653064	contig_6063_pilon	-	1554	14	Intergenic	novelGene_27587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	601.909584513317	8	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	22	1347	70243	18597	TRUE	30	TTAAATGTGGTTTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREILNRSLKRFEKKWEDLKGTSERF	70264	17042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18747_18797_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27982_36205_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
653065	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653068	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653070	contig_7870_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_109028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCATTAATGAATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574028	573684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_573700_574000
653099	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653134	SIRV7	-	318	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	26	6	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
653140	contig_11286_pilon	-	2860	3	Intergenic	novelGene_156666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	18	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	42	1379	180483	161730	FALSE	75	TTGCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESIPLAAPVPVEQAVLETFFSHLGIFSYDKAKDNVEKEREANKSSGGSWLSLLAALAHLAAAEKVYHSLTYLGQKLGGQSFFSRKDSIRTIYTSLQNELKKVVTGRGALGGTAPHVEELLSHLSEQLCFFVQARMEIADFYEKMYTLSTQKFINAEELIGLLDTILKKYSSRFHHPILSPLESSFQLEVDVLSHLLKAQAQVSEWKFLSSLVNLHSAHTKLQTWGQIFEKQRETKKHLFGGQSQKAVQPPHLFLWLMKLKNMLLAKFSFYFHEALSRQTSASEMKTLTAKANPDLFGKISSFIRKYDAANVSLIFDNRGSESFQGHGYHHPHSYREAPKGVDQYPAVVSLPSDRPVMHWPNVIMIMTDRTSDLNSLDKVVHFYDDKVQSTYFLTRPEPHFTIVVIFESKKSERDSHFISFLNELSLALKNPKVFASLKPGSKG	180524	160248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11286_pilon_-_162547_174081_174368_180248
653156	contig_7457_pilon	-	1826	10	Intergenic	novelGene_31438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	155.598486139451	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	454	915	471570	469327	TRUE	55	TATCAAACTACATAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSREAMMTFRPLSPPASSRTSPLAPKSSAKPSFYKRYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473231	468278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468488_469384_470289_470492_470902_470995_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472326_472477_472730_472768_473151
653174	contig_3604_pilon	+	2283	5	Intergenic	novelGene_139989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_4	708.951690878864	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1272	1643	49018	49389	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLCAPVLLGPVFQNIFSYSSKCPEAPHSASRPSPEGTQLSLWVSEPSSAKCLEAPHSASKPPAQRRSLGTPTLASLLCGLGSPPCHLVLVSWFCCSRFSATASRCLVCCLWCDSSLSSGLGR	45354	50029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47666_47849_47925_48032
653181	contig_10861_pilon	+	2028	4	Intergenic	novelGene_39397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	365.460744205935	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	95	526	1907049	1910382	FALSE	35	AAAGAAGGGTTCCATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQVNGNAVQLKEEEEPMDTSSVTHTEHYKTLIEAGLPQKVAERLDEIFQTGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKVKLELDSFNEIKFND	1903793	1911884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1907039_1907206_1909485_1909605_1910226
653186	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653193	contig_6589_pilon	+	1019	7	Intergenic	novelGene_26114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2176.2272208266	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	21	503	1876599	1880585	FALSE	20	CAAGATTGGTGTCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876578	1881101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1880219_1880274_1880498
653200	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91666	11	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
653203	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
653216	contig_6175_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_16358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733091	1730845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1730800_1733100
653227	contig_14133_pilon	+	2248	8	Intergenic	novelGene_119918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	116.0928551652	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	381	779	143029	146688	TRUE	5	GAGCTTTTGTGTGTCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136627	148454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_141578_141677_142282_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666_147737_148033
653232	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	533	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
653233	contig_1443_pilon	-	2100	6	Intergenic	novelGene_28386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	34.6906327414188	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	303	758	1040199	1038883	TRUE	30	TAGTATGTGATCTTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGR	1041439	1036791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038033_1038153_1039075_1039300_1039518_1040152_1040324_1041261
653247	contig_3525_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_135119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTATGCCCCTGGATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39734	40195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_39700_40200
653260	contig_19769_pilon	+	832	6	Intergenic	novelGene_102285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	241.073432795901	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	29	802	87249	89322	FALSE	15	GCCACTTAGCTGTGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87001	89352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
653261	contig_10848_pilon	-	1868	9	Intergenic	novelGene_133535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	170.956134724671	379	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	29	673	907357	838809	TRUE	30	AGGTGTTTGGAATAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSSLPSALALSLLLVSGSLLPGPGAAQNEPRIVTSEEVIIRESPVLPITLQCNLTSSSHTLTYSYWTKNGVELTAHQKNVSSMEHRISKPRAEDSGEYHCVFHFLSAPKANATIEVKAAPDITGHKRSENKNEGQDAMMYCKSVGYPHPEWVWQKKGDDGFSDISNASGRFFIINKENYTELNIVDLQITEDPGEYQCNATSPTLAFLGNSG	907385	829329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_830360_830903_830979_831835_831858_838740_838844_838896_839015_843675_843810_855199_855295_858376_858549_907266
653266	contig_13265_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_145998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTGAGAATTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19607	19906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_19600_19900
653269	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653278	contig_3077_pilon	+	1504	9	Intergenic	novelGene_26730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3732.25471397653	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	496	1062	13867	17590	TRUE	35	AAAGATTAACAGTGTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGQGALVGGLTLDFPAGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10122	18074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449_17634_17675
653285	contig_13762_pilon	-	2914	4	Intergenic	novelGene_156669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	33.3299998333167	124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	43	300	42299	10615	FALSE	40	AATTTCGAATTTAACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDPDKHLGKTLDQMEPHLLELSEKYGVHVCGEGGEYETFTLDCPLFKKKIIVDSSEVVTHSADAFAPVAYLRFLEMHLEDKVSPVPDNNRTSNYIHNS	42341	8000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13762_pilon_-_10669_12023_12112_16394_16490_42278
653288	contig_6589_pilon	+	1491	8	Intergenic	novelGene_26075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	63.5336966675551	129	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	58	444	1865997	1868041	TRUE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDVSHRWEGPGMEVGARDSRSPPFRGPGRGLRGALAAGPGPALDDTPQDSGWVPDVHPAGGCGH	1865620	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1865644_1865962_1866030_1866757_1866869_1867326_1867457_1867928_1868073_1868960_1869046_1872155_1872787_1874884
653297	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
653302	contig_20602_pilon	-	1619	7	Intergenic	novelGene_133726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	495	junction_1	127.669386394007	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	571	1452	23530	10026	FALSE	55	ACAATAAATGTAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	24100	9858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430
653328	contig_13664_pilon	+	2183	2	Intergenic	novelGene_144194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	271	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	146	568	16659	35042	FALSE	20	GTGTCATCATAAGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRVGDNLAEDERYTILEEEFFSFQKSWLFGDLSLVATFQSSLFTSSEMFLTISRKNMSQKLSFLLLVFGLIWGLMLLHYTFQQPRHQSSVKLREQILDLSKRYVKALAEENKNTVDVENGASMAGYADLKRTIAVLLDDILQRLVKLENKVNYIVVNGSAANTTNGTSGNLVPVTTNKRINASGTIR	16513	36657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_16897_34857
653329	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_113454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653342	contig_17737_pilon	-	1546	8	Intergenic	novelGene_72906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	118.410906833547	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	295	792	66677	52301	FALSE	20	TACCAACGTGTTCGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPAA	94209	51546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_52309_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_67535_67663_68816_68885_94171
653349	contig_10892_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_116750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	394	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	769	1089	163331	163011	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEKNTEYTMDCQKNKSVLEEVQPECSLEARMVRLRLTYFGRVVRRDQSLENDIMLGKAEGQRRRERPSMRWIDTVAATMGLSMTTIVRISRTGQCFILLYIESL	164099	161974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_162000_164100
653350	contig_3122_pilon	-	3068	21	Intergenic	novelGene_64386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	129.123622935542	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	917	2754	312	3065	270409	250499	FALSE	55	AAGTCAAGAGAAGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQLKIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEKKENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRLMQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKEHLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENSVTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG	277558	250495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256546_257951_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_275923_275983_276264_276420_277512
653356	contig_14441_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_100374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	365.203176327918	8	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	604	966	116728	117560	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	26700	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_26781_26886_27178_113125_113209_116578_116963_117236_117344_117539
653360	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653372	contig_10299_pilon	+	1723	11	Intergenic	novelGene_79664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	76.3426486310241	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	28	1659	182394	187611	FALSE	40	CACAAAACTTGATACATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182366	187675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182627_183843_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185864_186084_186207_186389_186528_187233
653387	contig_14326_pilon	-	2229	4	Intergenic	novelGene_120736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	44.4397219713275	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	101	697	444202	443443	TRUE	60	TTTTGAAATAAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPGALSPAGAWRGPAEVGRGGKAGKAVGNKGQSLLRTKLLGPLLGVQVQTAHSFEQVLTIAGWTGAHLRACPKLALVSVPSHLLPLLQEPAGHQGRERALPLCHLPGPRRLPLLPLPH	444302	440951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443932_444094
653388	contig_11574_pilon	+	1499	4	Intergenic	novelGene_64085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGGTAACTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449293	451708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_449898_450252_450391_450807_450909_451052
653406	contig_11304_pilon	+	2187	8	Intergenic	novelGene_156676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	180.644876563304	62	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	934	1611	447600	558215	FALSE	30	CATTGAATTCCAAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSCVFCKCVRELIGNVPSPIQQVTLIQVSSACPSTVVPRQMLPRCPLSSAGCRLFFFWKQISL	270989	558791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_271608_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458134_558027
653422	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653423	contig_9463_pilon	+	1769	9	Intergenic	novelGene_83821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1022	1390	222660	223028	FALSE	30	ATAAAGTATCATTTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185906	223407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222465_222527
653424	contig_6001_pilon	-	2720	17	Intergenic	novelGene_128037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	12.0453245597618	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	73	2277	608483	587665	FALSE	25	GAATTCAGCAAGCTCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFDDPGIFYSDSFGGDPGADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGLTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPTGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDTMSHLVKIPGIVIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTITNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTSRRGYDRVGVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAITPQEEEEFRRLATLPNIYELISKSIAPSIFGGMDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDMMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLATLKKFIAYCRARCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIQDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK	608781	587221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_587767_588958_589087_591153_591297_592260_592390_594363_594477_595424_595602_595797_595864_596214_596359_597722_597835_598987_599160_600775_600943_602665_602822_604854_605028_605835_605965_606044_606172_608316_608492_608717
653425	contig_8161_pilon	-	2012	6	Intergenic	novelGene_156751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.3689129038482	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	28	906	254234	230026	TRUE	50	TGGCTCATAAAATAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEEQDGIFYLPTPNQ	254261	226470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227340_229788_230067_232136_232413_235310_235587_236169_236434_254212
653440	contig_3426_pilon	-	2100	16	Intergenic	novelGene_57916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	190.17629248206	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	221	1840	196454	145330	FALSE	30	CTCAGTAAGTTAAATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	205458	145069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196594_203813_203863_205426
653443	contig_10904_pilon	-	2732	10	Intergenic	novelGene_22520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	341.977907018697	1	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	307	960	354723	352112	TRUE	25	CCAGCACCTGAGAGTCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362546	346347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348254_348342_348716_348863_349922_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_362368
653447	contig_13074_pilon	+	1917	2	Intergenic	novelGene_153452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAACTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572933	613352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_574363_612864
653455	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653456	contig_12464_pilon	-	1936	9	Intergenic	novelGene_68704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	136.826475416858	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	929	1558	357758	345591	TRUE	65	CAGAAAAAAAGGAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPEMHLQRRLLLLLKWIRTDPPRNFIVHLCLPVKTNRILGKEF	381602	337771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_357014_357109_357347_357838_376096_376341_378505_379024_381087_381156_381583
653464	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
653478	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653487	contig_3181_pilon	-	2085	3	Intergenic	novelGene_136923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	9.5	236	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATTTTATATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266444	263072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_264765_265262_265389_266177
653491	contig_3825_pilon	-	1180	7	Intergenic	novelGene_78010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	937.544265621629	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	359	898	1465317	1462075	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470995	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465893_1469010_1469125_1470880
653492	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
653493	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
653496	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653500	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
653503	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653516	contig_4531_pilon	-	2036	9	Intergenic	novelGene_47917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	50.1695562567579	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	195	1394	422163	413360	FALSE	20	GCTTTAATGTTCATGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRERCSKIQCAWLLVFLAGSSVLLYYTFHSQSLYYSLIFFNPTLEHLSFWEILWIVGITDFVLKFIFMGLKCLILLVPSFIMPFKSKGFWYMLLEELCQYYRTFVPIPVWFRYLISYGEFGNVTRWSLGILLALLYLILKLLDFFRHLRTFRQVLRIFFTRPSYGVAASKRQCSDVDDICSICQAEFQKPILLICQHIFCEECITLWFNREKTCPLCRTVISDHINKWKDGATSSHLQIY	423603	412717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_419856_419958_421469_421547_421757_422218_423463
653535	contig_2069_pilon	-	1788	5	Intergenic	novelGene_23213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.898379312188	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	23	1630	114391	102624	FALSE	20	TGAGGTTGGTATGAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	114413	102465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_102921_103028_103694_109097_109509_111852_111994_114297
653537	contig_9345_pilon	-	1515	6	Intergenic	novelGene_24682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2151.54378063752	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	354	785	955253	947957	FALSE	5	TTCCCGTTTTGTCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPQCLRTTWQILKWTDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001341	947226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952517_955203_955356_997013_997093_1001169
653538	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671652	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
653541	contig_15371_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_151448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTATACAGTAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154402	156758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_154400_156800
653561	contig_16724_pilon	-	1671	10	Intergenic	novelGene_105315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	789.596865417121	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	277	720	569099	560936	TRUE	20	GTTTATCTAATATGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSM	575931	541296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_557699_557766_560935_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
653566	contig_5935_pilon	+	2738	6	Intergenic	novelGene_102711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACAGCCGGCTGCGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020618	1057420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1021786_1028410_1028573_1028661_1028744_1045188_1046293_1049158_1049329_1057367
653567	contig_20614_pilon	-	2641	7	Intergenic	novelGene_107559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.542521917586	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	63	569	243953	217319	TRUE	0	TGTGTTTGTGTCCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPNLYPVKLYVYDLSKGLARRLSPIMLGKQLEGIWHTSIVVHKDEFFFGSGGISSCPPGGTLLGPPDSVVDVGSTEVTEEIFLEYLSSLGESLFRGEAYNLFEHNCNTFSNEVAQFLTGRKIPSYITDLPSEVLSTPFGQALRPLLDSIQIQPPGGNTVGRPNGQS	244015	214835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_215530_215940_217413_219158_219282_219985_220096_222742_222813_223969_223992_243865
653578	contig_3866_pilon	-	2855	5	Intergenic	novelGene_112415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_4	180.88860522432	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	171	509	222507	217649	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPLRVGAIVETKTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVGKQLSNLIRRFDLGVAYTSVF	223767	215302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
653591	contig_3602_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_60689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAGCTACAAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308661	1307965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1308000_1308700
653594	contig_13571_pilon	-	3259	12	Intergenic	novelGene_128115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_11	53.2947518852691	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	225	1823	254247	206603	FALSE	30	CCTTGTTATCCCAAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLYIYIRLLGAYLFIIFHVQGQNLDNMLHGTGMKSDSNQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVVLISMAVCIMAMIIFFSCFCYKHYCKSISNRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI	315913	205166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_206729_206815_206947_208171_208348_214754_215053_223397_223591_227447_227593_229665_229766_229918_230016_240099_240203_247235_247399_254180_254396_315837
653595	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
653596	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_16661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
653599	contig_9440_pilon	-	2074	6	Intergenic	novelGene_59101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	373.001018765365	847	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	60	515	1716626	1705503	TRUE	30	ATTTCAGAACTGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVVRR	1716685	1698671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699079_1699772_1700814_1705391_1705511_1706371_1706549_1709277_1709398_1716475
653600	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653602	SIRV5	+	392	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	18	7473	-1	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
653605	contig_9706_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_20858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATCCCCCCACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2412	2716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
653611	contig_8386_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_82233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAGGAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60717	58447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_58400_60700
653612	contig_2987_pilon	-	1876	8	Intergenic	novelGene_125859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	190.41008376659	367	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	180	1298	545821	535740	TRUE	10	ATTTGTCTGTGCCTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVLQCLARGLPADSLGDQGRGLEPRDENVQGRCEPGQQPADQSLKQAPRLGLPHPRPSMRLSVRRLLLVAGCALALVLAVQLGQQVLECRAVLAGPRSPRRVMRPEQEELVIVGTNHVEYRYGKAMPLIFVGGVPRSGTTLMRAMLDAHPEVRCGEETRIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQQPPSPTGR	593466	533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_535550_535713_535767_538273_538325_539478_539678_544979_545901_553777_553850_593438
653615	contig_14516_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_153930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAATATCAGAATTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299572	300219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_299600_300200
653620	contig_15720_pilon	-	911	8	Intergenic	novelGene_41896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1780.89844328814	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	564	869	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282599_283822
653627	contig_14811_pilon	-	1256	2	Intergenic	novelGene_74493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATGACAACCCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368332	356586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_368102
653629	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
653634	contig_16411_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_77382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATGCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351310	354073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_351300_354100
653643	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653644	contig_7457_pilon	+	1894	15	Intergenic	novelGene_31583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_10	207.023031844975	210	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	9	1052	927933	948647	TRUE	0	CCTTTCTGGCTCTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASECDVVMAATEPELLDDEEAKREAESFKEQGNAYYAKKDYNEAYNYYTKAIDMCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRNAKALKAKKEDGNKAFKEGNYKLAYELYTEALGIDPNNIKTNAKLYCNRGTVNSKLRKLDDAIEDCTNAVKLDDTYIKAYLRRAQWWDCSSPRLSL	927924	954185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687_946842_947373_947539_948394_948487_948613_948718_951589_951664_952018_952166_952384_952538_953360_953424_953850
653649	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1112	2	-1112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGAGCCACCGTAACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
653656	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_98006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	TCTTCTTTAACTTTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653659	contig_16122_pilon	+	1623	3	Intergenic	novelGene_134508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	303.5	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	622	1038	134090	137497	FALSE	0	TTGCTTGGTGCCGTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGCRRTTPVIVRALEELSVMDCQMVRSWRS	133468	138082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134161_136976_137234_137408
653660	SIRV2	-	397	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3036	-1	-406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGTCTACTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
653677	contig_9177_pilon	+	1989	2	Intergenic	novelGene_32756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	0	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	86	694	1299096	1299704	FALSE	60	GTAGGAAAAAAAGAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGYETIEAYEDDLYREESSSESVDSEVEFQLYSQVHYAQDLGNAGEEEHEEKDSGSSESPSSKANQKNLIILSDSEVIQLSDGSEVITLSDEDSIYRCKRKNIRVQPQEKTQCPPAFIHSNELADKKCKRGIEKPKPEERSDMIREVMIIEVSSSEEEDSTISESDNVESWMLLGCEVDDDKDDDILLNLVGCENTVNEG	1294596	1300999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1294658_1299071
653690	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
653695	SIRV6	+	290	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10535	1	1298	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11535	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
653701	SIRV7	-	234	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91677	15	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
653703	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
653709	contig_15047_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_52236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	730	873	4573	21237	FALSE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNPEREPAHLDGGGHGCSDHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGGDSAQGSDVSLTASKV	2551	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2812_3323_3498_4158_4434_4552_4664_21013_21062_21232
653710	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
653712	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_96614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653725	contig_13145_pilon	-	2468	2	Intergenic	novelGene_116633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTCCTTAAGCACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65416	62908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_63945_63984
653730	contig_12654_pilon	-	1889	8	Intergenic	novelGene_129323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	130.301690749755	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1189	1824	816947	808478	FALSE	15	TTTTACAGAGTCCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYCLNIKRKKLHCFTAKNNFTCVFIANVKFILKWFSFVVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827343	808412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_817837_823815_823887_827115
653737	contig_6710_pilon	-	479	2	Intergenic	novelGene_98121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CATCTCGTCCCCCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
653740	contig_5020_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_27956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTAGTAATCAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204161	203268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_203300_204200
653741	contig_7066_pilon	+	1982	10	Intergenic	novelGene_42186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	61.7163963647175	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	300	1598	994581	1003261	FALSE	45	TTTTAAAAAAGTACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKDCPLQFHDFKSVDHLKVCPRYTAVLARSEDDGIGIEELDTLQLELETLLSSASRRLRVLEAETQILTDWQDKKGDRRFLKLGRDHELGAPPKHGKPKKQKLEGKVGHGPGPGPGRPKSKNLQPKIQEYEFTDDPIDVPRIPKNDAPNRFWASVEPYCADITSEEVRTLEELLKPPEDEAEHYKIPPLGKHYSQRWAQEDLLEEQKDGARAAAVADKKKGLMGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993484	1003645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993700_993803_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997150_998459_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
653742	contig_10437_pilon	-	2411	2	Intergenic	novelGene_38157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGATGGTGGCAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164091	159606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_160809_162882
653760	contig_6361_pilon	-	2419	2	Intergenic	novelGene_24036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	256	junction_1	0	79	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681293	676680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_679076_681269
653772	contig_6710_pilon	-	589	3	Intergenic	novelGene_94700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3872	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2	385	680422	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKQKFPTEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	680423	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471_657514_680400
653777	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_97215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653780	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653781	contig_7870_pilon	-	1245	3	Intergenic	novelGene_108995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	813	143	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAATGTTTTTTAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497931	458346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_459352_496464_496595_497821
653784	contig_12270_pilon	-	159	2	Intergenic	novelGene_114152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGTGCGAGCAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	14049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
653789	contig_8580_pilon	+	1968	2	Intergenic	novelGene_156093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1062	1535	262115	266677	FALSE	15	GGTATGATTAGCTCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAQCLLECACGTFTLSVRCSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETSSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCRLILCCNSTSKVIAPIRSRCLAVRVPAPSIEDVSQVGLSGNVLFRICDVCFVKMQRTWQSFKDSCGPGGRLLVDG	261053	267110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_262275_266363
653794	contig_10749_pilon	+	1523	12	Intergenic	novelGene_133452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	601	924	143609	150742	TRUE	50	ACTCATCTGGAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSLSRCIQTCTESGVAMRHRKMRLLHCQLVQLGQLQWLWNGILSLNGIGLTTCKDDWRTGRLGPVRDGHALRGGLGESLQHDHADLFDTLNDGLRNASNSDGPLS	135877	160050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_136289_142196_142365_143587_143644_145189_145269_146515_146554_149594_149683_150658_150788_151767_151899_153557_153676_154232_154268_155160_155323_159942
653799	contig_610_pilon	+	2378	5	Intergenic	novelGene_76799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	110.289108709791	276	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	21	923	296008	309451	FALSE	20	GGTGAGCAAGTCTATCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAAGETDAPKFILYLLLVPILLIVFVLGFFTWSGQRDRGKEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNVSLPGPLPPL	295987	310906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_306612_306733_309314
653801	contig_5832_pilon	-	2812	12	Intergenic	novelGene_134178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	43.0210404029862	108	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	298	1401	590172	573341	FALSE	0	GTGTCCTTTTTTCTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKSWLLIFILFPLKLVEKCESTVDLIVPPVVRLENGSSTSVSIALRHPLNATLVVTFKITFRSKNITILELPDEVVMPPGATNSSFQVMSRNVGQVTVYLHRNDSNQTGPRIRFLVIHSNVVSIMNQVIGWIYFVAWSISFYPQVYENWRRKSVIGLSFDFVAMNLMGFAAYSVFNIGLLWVPSIKEQFFHKYPNGVNPVDSNDVFFSLHAVVLTLIVILQCFLYERGAQRVSWPALGFLLLSCLFALVTMVVAAVGAITWLQFLFCFSYIKLAVTLLKYFPQAYMNFYYKSTEGWSIGNVLLDFIGGSFSLLQMFLQSYNNDQWTLIFGDPTKFGLGVFSIFFDIVFFVQHFCLYRKKPGYDQLN	592859	571929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_573475_573734_573853_576268_576440_577683_577804_577890_577991_580642_580775_580887_580992_584354_584440_585683_585763_590111_590192_591672_591829_592737
653808	contig_15063_pilon	+	1278	4	Intergenic	novelGene_14266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	344	1165	35271	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34815	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
653811	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653819	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
653823	contig_14441_pilon	+	815	5	Intergenic	novelGene_100472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	89	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2	628	85675	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	85673	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85682_112111_112154_116578_116963_117220_117344_117539
653829	contig_2027_pilon	+	1565	10	Intergenic	novelGene_39903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	253.786436902281	12	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	489	1370	132640	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	123514	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_123598_124591_124699_124919_125011_132432_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
653832	SIRV7	-	289	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68995	2	35776	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
653846	contig_14142_pilon	+	2327	2	Intergenic	novelGene_120581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	3	686	526719	527523	FALSE	60	AAAAAAATAAACCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGQGTGAGTGIVDIPGTTFGVWCRGGAYGKCPISHRPGSPRRLKPFKVPHPGPVGSQNCPMCPVPGCLRKGGEVTALFPASRFRVYERTKSGVPKGSGCVWGEGVRSPGLSSNKDCRLEAWVPEGGISWDCRGEVGVCELLFLVSPRDLRLLRWLGSPPPPFLLFLQLFDKTNKHHFLHSLALLAVPHCRKPLWVIFPLA	526716	529164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526982_527102
653850	contig_11816_pilon	+	3615	1	Intergenic	novelGene_98465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTACCCAGGAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420976	424591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_421000_424600
653851	contig_12250_pilon	-	1918	5	Intergenic	novelGene_80619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1332	1688	351486	350328	TRUE	30	GGTTGGAGAGGACCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPESYLVGVWQEATLLHVAHKATDWQVIYHKFKVVQFLNGLTQLFYLYRTELHVAQNSLLHILPKADLIQRLRHAIPIQHFTQAKAFMTNLLRAADRKLIVMVSLLGVMVGSHFVDI	354969	349771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_349844_350169_350542_351343_351965_352253_352440_354302
653853	contig_15353_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_151973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCCATTGCCATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386373	388222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_386400_388200
653862	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653864	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653867	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
653869	contig_7338_pilon	-	2953	8	Intergenic	novelGene_156801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_7	84.4794383871252	173	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	44	1321	295082	278431	FALSE	50	AGAGAAAGAAGGGACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGISPEDRTGSGPTMAAEEADVDVEGDVVAAAAQPGSDENTVSVLQQDHYLDSSWKTDNDLIPWTLDSTISEENKAVIEKMLLEEEYYLSKKSLPEKFWLDQKENDKKYVKSLQKTGKIMVHSPTKPASYSVKWTIEEKELFEQGLAKFGRRWTKIAKLIGSRTVLQVKSYARQYFKNKVKLGGLEKETPNQKSNSDLQIKNEDEGTKAWSPSLSGLRGLADPNLNAVKIEKLSDDEEVDITDEADELTTHAPEKNPSSGRLVDIPDSITHETNQGEFIASHTEKESFSKSSKEGLRNVKQGEAEILSSSVITLWTEKQSTSDKKSVDLNNQKCNELIKNCDKHCENGIRDGARQLPFPEPCEVQKDLIDKEMLFHSSCQIKEENREEEELKPPEEEVEIDRNIIQEEEKQAIPEFFEGRQAKTPERYLKIRNYILDQW	295125	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_279214_281304_281404_284800_284880_286095_286120_286206_286285_289074_289146_290818_290898_295017
653884	contig_20819_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_55626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	503.011617659076	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	29	910	29817	42996	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVTSHIP	29788	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40517_42977
653886	contig_12270_pilon	+	357	2	Intergenic	novelGene_113463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGCTGATCAGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13847	14427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
653916	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_93532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653769	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
653919	contig_5981_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_35505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36243	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_36200_38400
653924	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
653927	contig_21388_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_136633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	82	315	22424	21603	FALSE	20	TAATAACCTGCGTGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	22505	21399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313
653930	contig_5461_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_156819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAATTCCTCGACCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241973	240869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_240900_242000
653932	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_16505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
653941	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
653950	contig_6589_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_25960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTCCTGGTTAACCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296036	1296279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
653957	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
653958	contig_5799_pilon	+	2664	19	Intergenic	novelGene_50298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	261.355228674606	2	66	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	27	1235	561019	670411	TRUE	45	GGCTAATAAAGTAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGAVSAAPECRLLPYALHKWSSFSSTYLPENILVDKPNDQSSRWSSESNYPPQYLILKLERPAIVQNITFGKYEKTHVCNLKKFKVFGGMNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQATADENYIPIC	560992	717968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_670375_670607_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
653959	contig_14209_pilon	+	1770	13	Intergenic	novelGene_88307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	229.276034508625	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	87	884	32366	37768	TRUE	40	AATAAAGCTTGAATTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTGVYIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKLASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32279	40992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38045_40166_40344_40418_40859_40901
653970	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1553	641	1098	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2553	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
653976	SIRV4	+	334	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	443	173	-443	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGCCATTCCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
653978	contig_14925_pilon	-	736	4	Intergenic	novelGene_55174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	44	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42388	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_42337
653986	contig_7066_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_42182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGGGGGTGATAGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979494	980779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_979500_980800
653987	contig_7202_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_17108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATTCTTTGATGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
653993	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	255	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654002	contig_12270_pilon	-	215	2	Intergenic	novelGene_114146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGCTGCTCATCTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
654006	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654024	contig_5899_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_146988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCAAGGAGATACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486600	487143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_486600_487100
654032	contig_2114_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_104302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTCTGATATGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892628	894404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_892600_894400
654034	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_94299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654035	contig_12622_pilon	-	1823	15	Intergenic	novelGene_6028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_14	339.651922667057	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	19	1449	1691275	1685486	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691500	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
654047	contig_610_pilon	-	1194	3	Intergenic	novelGene_76730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_2	1527	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	72	500	252557	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGLLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252628	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_252475
654049	contig_14322_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_116446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671903	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
654050	contig_5324_pilon	+	2806	1	Intergenic	novelGene_102052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	226990	227292	NA	25	CCTGTGTGGTAGATAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIKNKIYLLIITAGKHIYSSLFLPVPSARHSIYLVGSHTDGNRVWKQPWRSLIGTIRGLSFFNDLPQSQSYLKENQDLNSEPEFPIPVQYSSHTPSTHFF	226989	229795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_227000_229800
654051	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654058	contig_11338_pilon	-	1321	11	Intergenic	novelGene_6218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	101.23359126298	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	175	1185	16704	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21355	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16722_17199_17288_21286
654066	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
654080	contig_4131_pilon	+	1281	2	Intergenic	novelGene_127878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	73	465	240672	241064	TRUE	5	TTTCTTTGTGTGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240599	248865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248183
654086	contig_3529_pilon	-	2520	8	Intergenic	novelGene_105338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_7	416.422420929831	1614	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	166	720	550554	529100	TRUE	20	TTCTTTTGGGTTTCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621564	524368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_621426
654107	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_97837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654127	contig_2940_pilon	-	3138	1	Intergenic	novelGene_82005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTTGTCCTAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192138	1189000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1189000_1192100
654135	contig_8658_pilon	-	1386	7	Intergenic	novelGene_55807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_2	697.538688692048	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	46	1035	55624	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55669	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
654138	contig_15047_pilon	+	1420	8	Intergenic	novelGene_52220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2653.98825797504	5	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	15	551	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2179	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3347_3433_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
654151	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
654156	contig_1443_pilon	-	2284	10	Intergenic	novelGene_28278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	416	junction_5	411.160177252156	3	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	728	1612	776427	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_805197_805718_808694_808741_809399
654165	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654169	contig_2100_pilon	+	1026	7	Intergenic	novelGene_50724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGGTACGGCAGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169922	1180259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170291_1174300_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187
654170	contig_14322_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_115709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
654174	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654175	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91672	11	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
654185	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_89574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654187	contig_18869_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_56028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73540	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
654190	contig_14441_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_100541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.9111974273539	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	656	1165	116728	117798	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLALP	111195	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112110_112158_112401_112665_116578_116963_117523
654194	contig_11846_pilon	+	2686	5	Intergenic	novelGene_105969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294893	301913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_295085_295497_295722_298106_298202_298461_298610_299885
654199	contig_14666_pilon	-	1334	7	Intergenic	novelGene_39539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1101.97586432533	1167	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	304	915	458202	449808	FALSE	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	475139	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_462064_462126_475054
654205	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654221	contig_20697_pilon	+	1794	2	Intergenic	novelGene_134607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	108	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACTAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3753	6129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_4000_4581
654222	contig_9696_pilon	-	219	2	Intergenic	novelGene_68769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	727	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAACTTAAAGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141058	139913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_140032_140957
654226	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654232	contig_17753_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_105118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	102	362	148219	147959	NA	25	CACGAAGCCCAGCCCGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLFIHSDSDHWKFLTINTAGAKEGGLLLTSFKMHPDLTLSCEANTREAGRREKPDCKTPTTKQTGLRRRKVLKKLWLREGIQGGADAILHKKGMRPSSSRRGGAPDPGAGLLTRGRGS	148320	146698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_146700_148300
654234	contig_15410_pilon	-	1582	10	Intergenic	novelGene_130580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_9	57.4064993954474	411	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	414	1424	57546	54277	FALSE	25	CAAGCAATTCTTCCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59306	54118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57870_59216
654236	contig_8538_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_4772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	66	299	842828	843061	NA	25	TTGTTGCATTCCCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842762	843115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
654242	SIRV7	-	186	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69094	0	35875	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78863	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
654248	contig_57_pilon	-	2492	4	Intergenic	novelGene_44879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACCCAGGCAGGCGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86116	66733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_66961_74474_74605_82075_82171_84076
654251	contig_9297_pilon	-	2092	10	Intergenic	novelGene_69887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	8.88194172964949	165	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	1175	2086	927198	914923	FALSE	25	CTATGTTTTATTACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGTHQWNLATWEGLLPRYEHASFIPSCTPDSIWVFGGAHQSGNRNCLQVLNPETRTWTTPEVTSPSPSPRTFHTSSAAIGNQLYVFGGGERGAQPVQDVKLHVFDANTLTWSQPETLGKPPSPRHGHVMVAAGTKLFIHGGLAGDKFYDDLHCIDISDMKWQKLSPTGAAPTGCAAHSAVAVGKHVYIFGGLAPTGALDTMYQYHTEKQHWTLLKFDTFLPPGRLDHSMCIIPWPVTSSEEEDSNSVPLNCEVQKEDFADKGVIQVDDSQESQADILLCFVFGGMNTEGEIYDDCIVTVVD	939055	914916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_915210_915483_915634_917329_917480_920216_920379_924278_924432_927188_927348_930417_930483_933831_934296_936099_936400_938859
654252	contig_3861_pilon	+	1664	13	Intergenic	novelGene_57887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	822.41757439069	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	134	1648	141869	176828	FALSE	15	TGGAGCTTTAAGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEDDYTHSACRNTYQGFNGMDRDYGPGSYGGMDRDYGHGSYGGQRSMDSYLNQSYGMDNHGGGGGGNRFGPYESYDSRSSLGGRDLYRSGYGYNEPEQSRFGGSYGGRYESSYRNSLDSFGGRNQGGSSWEAPYSRSKLRPGFMEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQLIEGEEEAKEEPVNFSVDQPEEN	141735	176844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_147877_150018_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171890_176396_176452_176769
654264	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654278	contig_15498_pilon	+	2071	5	Intergenic	novelGene_42647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.166642413657	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	238	834	679496	686143	FALSE	30	ACATGTGCCTTAAACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADFWPTWSVKPSARQPSSSSPGGQPRDGSACS	679258	687380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_686048
654286	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACATTCACTGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653390	652982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653000_653400
654304	contig_6842_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_130673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGTCTAAAGGTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318459	319173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_318500_319200
654305	contig_6842_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_130674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319223	321067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_319200_321100
654309	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654310	contig_18869_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_56302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73578	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
654317	contig_5889_pilon	-	1578	13	Intergenic	novelGene_133671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGGGTTGAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323216	20412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_20516_84618_84708_128185_128282_138336_138466_139404_139493_140468_140553_168758_168912_196894_197032_201116_201206_255471_255552_256678_256757_273380_273599_322982
654320	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_95817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654324	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91668	15	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
654328	contig_17976_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_32530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCCAAATTTCACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48911	47215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_47200_48900
654333	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_16412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
654334	contig_16205_pilon	-	1373	5	Intergenic	novelGene_156869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_2	618.614985269513	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1284	89	1372	103379	79951	FALSE	35	CTGAGAAGATGGAGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKSKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIDDEDPSSSIESSDPSLSSTTTSSRNQASRSRVSSSTGIKGTTTVLKPGNAKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQTVPEGEATVTNSMQEETLNSSVQSIRTIQAPAQVPVVVSAGNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSSGAGSQKFILQAIPSSQPMTVLKENVMLQSQKPGSPPIVFSPAHVQQVLTSNVQSICNGTGSMASSPSFSATTPVVTFSRSSQLVAHPPGTVITSVIKAQETKTLIQEVEKKEVEDNLDED	103467	79949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_80432_86981_87429_88544_88738_89468_89553_103300
654345	contig_5727_pilon	+	2367	14	Intergenic	novelGene_7955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	996.321221459907	5	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	677	1606	172832	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKTEPEMLMSMISVKIPSFLRRRNREPLLRSRCWGTSNSLESLASLILFMNLSFISASKHFWKRRRDGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168217	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169895_170318_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173739_177094_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
654347	contig_1301_pilon	-	2456	5	Intergenic	novelGene_47362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	520.198519797971	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	229	1125	618221	551789	TRUE	30	AGTGCCTGAATCAGCGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLTQRSSGLVQRRTEASRNAADKERAAGGSGSNGEDDAQSRRDEQDDDDKGDSKETRLTLMEEVLLLGLKDREGYTSFWNDCISSGLRGCMLIELALRGRLQLEACGMRRKSLLTRKVICKSDAPTGDVLLDEALKHVKETQPPETVQNWIELLSGETWNPLKLHYQLRNVRERLAKNLVEKGVLTTEKQNFLLFDMTTHPLTNNNIKQRLIKKVQEAVLDKWVNDPHRMDKRLLALIYLAHASDVLENAFAPLLDEQYDLATKRVRQLLDLDPEVECLKANTNEVLWAVVAAFTK	618449	550303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_551090_551243_552214_558856_558972_567267_567400_617996
654348	contig_2793_pilon	+	1189	8	Intergenic	novelGene_142864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1093	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	322	666	79482	81853	TRUE	20	ACTCCGGGCTGCACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTKVSGKIKKKRQTLLGQIFLLRVKATLDHLTAPADRTAQDHAEDHAEYHHHGDPDAHRADDVKLVGEDLFDGLRAGLYCDGCDQLLFGANVYNKLFCTSMHTTAVQRIVDGF	79160	118469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81930_84250_84328_85118_85216_92110_92217_118302
654352	contig_9548_pilon	+	1478	8	Intergenic	novelGene_141057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	264.466964875018	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	6	395	127751	134402	TRUE	15	CTGGATAATTCTTCGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAANVPQRAWTVEQLRSEQLPKKDIIKFLQSHGSDSFLAEHKLLGNIKNVAKTANKDHLVTAYNRLFETKRFKGTESINKVSEQVKNVKVNDDKPKETKSEETLEEAYWRVPELRIQTNPSMNSSSTTL	127745	142272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_127859_130889_130992_132207_132316_134330_134519_137204_137341_137799_137868_139965_140064_141607
654354	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654357	contig_6494_pilon	-	1013	7	Intergenic	novelGene_108545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	939.276213664306	28	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	13	612	8286	2958	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQVPCSVVLVIGSFCKGVLFIG	8298	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_3020_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
654360	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654361	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654362	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
654366	contig_11173_pilon	+	2092	9	Intergenic	novelGene_156895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_8	312.1466001737	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	959	1936	433323	450103	FALSE	30	AAATATCATTGCTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFSLAISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVTSSGLTFIPDGSLTVLQ	430172	450259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430322_431765_431849_432247_432344_432692_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936
654367	contig_2069_pilon	+	1488	6	Intergenic	novelGene_23450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	363.582397813756	569	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	106	1422	1432950	1439381	FALSE	15	TGAGTTGAGGCCTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHSGLSHRQLLPTCPPSFFLWPKRTAAESAGSGGMKGEPALEPDCCHKPKHLRDTGSSLSPSLDFQFCQGDQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1431968	1439447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432060_1432935_1433064_1433857_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
654368	contig_3817_pilon	+	1688	5	Intergenic	novelGene_78318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	600.461072843194	4253	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	439	669	201804	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVGGRRGRPRRRLGHHRGPRPRNGAAGRAPPEAAARRQADRDGALPRGRVPPSALLRLPRVPSIYSHQGGHQWQHHENQGRVRYQPHQVPDPAEHPGGGERDVWSTVAQSGGHAGADVAEKSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178646	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199161_201731_201852_204349
654375	contig_12709_pilon	-	2259	9	Intergenic	novelGene_147419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_8	39.1724951337032	446	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	45	1109	110619	73650	FALSE	40	TAAATACTGTAACTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQAGRVRVPGFRAMGRLVALSLLGISLALLGERFLALRNRLKASGEVESVDLPNCHLIKGIEAGSEDIAILPNGLAFFSVGRKHPGLHSFAPDKPGGILMMDLKEKKLRALELRISRGFNLASFNPHGISTFIDDDDTVYLFVVNHPESKNTVEIFKYEEEENSLLHIKTVKHELFPSVNDVVAVGPAHFYATNDHYFSDIFLKYLETYLNLRWANVVYYSPNEVKVVAEGFDVANGISISPDEKYIYVADMLAHEIHVLEKHTNMNLTQSKVLKLDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPSSEILRIQNILTEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASIYDGKLLIGTLYHRALYCEL	110663	72499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_73809_74443_74573_75355_75438_86035_86237_87708_87836_88734_88901_94625_94682_102694_102766_110545
654393	contig_5549_pilon	-	1751	6	Intergenic	novelGene_81646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_5	173.517261389177	25	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGAAAAGTGCTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_443683_443958_443989_444483_444755_444949_445003_445604
654394	contig_9771_pilon	-	1608	7	Intergenic	novelGene_156913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	80.1782735880211	460	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	66	1001	350071	332612	FALSE	25	CCTCAAATGTTTTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVGSADRGASLFLREAFERPMAVDIQPACLGLYCGKTLLFKNGSTEIYGECGVCPRGQRTNAQKYCQPCTESPELYDWLYLGFMAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLYYAFPYIILVLSLVTLAVYMSASEIENCYDLLVRKKRLIVLFSHWLLHAYGIISISRVDKLEQDLPLLALVPTPALFYLFTAKFTEPSRILSEGANGH	350136	332004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_339573_339756_341990_342198_346911_347067_347659_347752_350067
654395	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654399	contig_1594_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_138853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1939	2244	734577	734272	NA	30	TATTTTTAGGACCCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSQFSRLQVQIQGISSRERPSLSFGSKGRSLSSVFPWTGSVSVQEPQVQRTRSVPGAAFLVVRGPHVSLLTSLFYISKEIGLRHYLTLKTSSV	736515	734083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_734100_736500
654435	contig_12019_pilon	+	2772	16	Intergenic	novelGene_87723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_13	55.7456924095685	209	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	308	1990	606598	620414	FALSE	10	CACCTGAGTTTCTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGLQTVTLSDGTTAYIQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVAVQKESLSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPKEGYDPSALEAVQLEDGSTAYIHHPVAMPSDSTILAVQAEVGLEDLAAEDDEGFSADTVVALEQYASKVLHDSQAPHNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFRCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	586879	621196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_586917_593935_594023_594436_594524_606501_606671_611574_611656_611769_611848_613067_613268_615363_615481_615814_615891_616485_616612_616741_616922_617737_617972_618078_618210_618950_619119_619648_619763_620309
654440	contig_16846_pilon	+	1082	4	Intergenic	novelGene_82942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	780	1082	552742	555275	FALSE	10	GGCTGCAGGGGAGGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNMVKLMGPGASLIMPSRYSSVGFFPHRGQHVVQVLLVNEAVAVLVDHVEGLLKLLNLGLIKHCEDIGSGPLRPLLGGLGLGAFAGHLGFRRGGLLCRK	550861	555275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_551448_551552_551671_552666_552826_555056
654445	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654456	contig_20819_pilon	+	2469	8	Intergenic	novelGene_55603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	40.3302691814089	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	205	2388	22116	25305	FALSE	25	AGGAGGGGATGGACTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	21020	25386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22063_22323_22476_23309_23427_23643_23798_23968_24175_24654_24809_25033_25245
654457	contig_9653_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_48286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCACAAATAAACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006707	1005037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006254_1006296_1006584_1006644
654472	contig_11285_pilon	+	1750	12	Intergenic	novelGene_5534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	520	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	825	1271	742690	744172	TRUE	20	GATCCCCAGAGGCCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLQLCSHQLQGADHSHGAHSGQSTSHHGCVEVRGQGSATQEGLELVVGGKVDGSGWHGHHPGGWEATPQGLGTLVPHDLHKGIHGASEAGGILKPGGTADTIWAQVQGLQNTIAVQEALPCGLETGWQFGVGNTPESGGRRQFTGH	741216	745270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_741655_741736_741819_741892_741972_742185_742299_742577_742754_742935_743061_743220_743286_743608_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744473_744937
654475	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654477	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654482	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
654483	contig_3942_pilon	-	1150	6	Intergenic	novelGene_128690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	97	312	430070	429771	TRUE	15	GAATCCGGCCGAGGCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKSLFKEFPFSTILRGARFLILGWDSESGLHGMCRSYPGAKSWQSKKWRQLGFYGRHWKQTSLWDLVPIWQTSGFSPWYKWQTRLRSSSCSLMGFCTKQDRLG	430166	426537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426703_427974_428157_428244_428321_428491_428584_429447_429849_429932
654497	contig_3817_pilon	+	3303	2	Intergenic	novelGene_78357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	145	junction_1	0	46	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	39	350	600174	612856	FALSE	30	GAGTAGAACTGAGCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGKPTLARHPPLVMHSTLWQMLGTCLWWRTSV	600135	615809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547
654500	contig_5041_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_27015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAGACATACAGACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218789	217032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_217000_218800
654518	contig_7744_pilon	+	1615	6	Intergenic	novelGene_62489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	365.560938832365	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTTTGTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670966	675233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671897_673753_673826_674032_674105_674198_674321_674595_674694_674912
654521	contig_7775_pilon	-	1809	2	Intergenic	novelGene_37479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAGTTAGCTATTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149555	135304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_135756_148197
654534	contig_2069_pilon	+	1532	6	Intergenic	novelGene_23455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	366.048302823548	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	405	1472	1436133	1439381	FALSE	20	CTATGATGAGTTGAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432000	1439441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432060_1432935_1433064_1433775_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
654536	SIRV7	-	405	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-64	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114802	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
654542	contig_6227_pilon	-	1961	6	Intergenic	novelGene_49758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	56.4177277103571	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1069	1665	1204494	1202920	FALSE	25	AAGAGGTTATGGCTTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1205562	1202623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370
654543	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657833	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657834	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
654548	SIRV4	+	198	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	632	1118	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
654561	contig_21113_pilon	+	2125	3	Intergenic	novelGene_151114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1379	1711	6545	6877	TRUE	30	TATTAAGAGGATCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTKLELFKENFPTQIAFIGFLSCMNELVFGEQKLPQEGFPTFIAYMLFLYFVSFPTLNDLKVSAVGFLTLRELHFSTKLLLVSMEKAFLISIRLSRVLYFIASALVDCR	5166	12602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21113_pilon_+_7066_12127_12222_12470
654579	contig_7202_pilon	-	405	2	Intergenic	novelGene_18593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGAACCAGCGAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	28530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29794
654580	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
654584	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	900	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654585	contig_2646_pilon	-	3568	1	Intergenic	novelGene_69706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACACAAAAAGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539411	2535843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2535800_2539400
654594	contig_6102_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_31742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCGGTCCGGTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215975	215578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_215600_216000
654595	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
654598	contig_1715_pilon	-	1541	9	Intergenic	novelGene_127189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	241.004116925417	25	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1320	221	1540	312293	252428	FALSE	80	TAAAAAGAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSWQDELAQQAEEGSARLREMLSVGLGFLRTELGLDLGLEPKRYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKMMIKKRERELLKLGN	312513	252426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252473_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
654599	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
654604	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
654605	contig_6102_pilon	+	967	9	Intergenic	novelGene_32222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGAGCCACAGCGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894941	906124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_898130_898351_905182_905253_906085
654606	contig_20293_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_153524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAACACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79837	80548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_79800_80500
654610	contig_6589_pilon	+	903	6	Intergenic	novelGene_26127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3821.74428239253	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	97	519	1879232	1880720	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMILGHGGLFTTVNVQVPQEAWGCAERA	1878958	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880639
654622	contig_116_pilon	-	2955	18	Intergenic	novelGene_154901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	169.851410739222	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	118	1614	327496	271129	TRUE	15	ACACCAGGCCGCGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNHRRSSPSAAPLQCARLPRLSEPPSLAPSQAVAQTCSMAGIAAKLVKDREAAEGLGLHERAVKYLNQDYAALRDECLEAGTLFQDPSFPALPSSLGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICTDPQFIVGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEVLARVVPLDQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKAPPNLFKIIQKALEKGSLLGCSIDITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGKWNDNCPNWDTVDPEVRERLTRRHEDGEFWMSFGDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVHQLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCL	327613	261875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_262793_264796_264856_265118_265236_266738_266818_267677_267747_268639_268705_271093_271135_275980_276167_278967_279138_281073_281235_281943_282019_283324_283411_285621_285706_286887_287057_288523_288658_289399_289519_321165_321236_327259
654624	contig_7457_pilon	-	1435	4	Intergenic	novelGene_31682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1903.55667107654	5	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	142	621	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFGKPQARVESGTFRAWRRPGKLPDLQAFISFDGGKTSGFGGSRLGSWDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176673
654635	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654636	contig_2817_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_104355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	152	319	422064	422231	NA	20	CTATACAGTGATTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFVSECVCECVFVSRSVYVSVFVIISVYVNVCVCVQTCLTVPEDAVVSVGMCTCAHHRKSWAQYIFLGCGYGFGYGFGIITPEPDSLTDLAALVLCGILSLSLPI	421912	424229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_421900_424200
654641	contig_8568_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_156935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	225	678	66	743	64870	65547	NA	75	ACAACAAAAAAACAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NADIKTRQRHHKKENYRPIFLMNIDAKILNKILANRIQHHINKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINLIHHINKRKEKNHMIISIDAEKTFDRVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPRDFMRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIGKQYHFQ	64804	66448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_64800_66400
654659	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_116006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
654661	contig_17414_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_156941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAACCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49782	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17414_pilon_+_49800_51800
654667	contig_11304_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_156701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGCTAATTTTCAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364167	363455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_363500_364200
654671	contig_14322_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_116350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671893	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
654684	contig_13547_pilon	+	2514	6	Intergenic	novelGene_104881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAGTTTGAAAAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96662	163475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_98303_98905_99063_101109_101249_103068_103245_114701_114835_163206
654698	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
654699	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654702	contig_8617_pilon	-	102	1	Intergenic	novelGene_73500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCACTAACCAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64015	63913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63900_64000
654705	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654706	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_93486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
654718	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654720	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654739	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654751	contig_14322_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_116339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671855	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
654752	contig_5331_pilon	-	1700	6	Intergenic	novelGene_112778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.67557217191	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	5	796	253336	248930	TRUE	5	CAGTGTCTTTGTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253340	247936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_248709_248797_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253103
654756	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654758	contig_12123_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_144588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAACTAAAGTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65374	65175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_65200_65400
654759	contig_12123_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_144587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTTAAAAAGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64784	64371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_64400_64800
654766	contig_1406_pilon	-	2730	1	Intergenic	novelGene_25480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307789	1305059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1305100_1307800
654784	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_2956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
654785	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654795	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
654797	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
654801	contig_10861_pilon	-	1994	8	Intergenic	novelGene_39326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	232.853549490241	971	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	114	545	1492200	1491104	TRUE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSW	1493812	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
654811	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654826	contig_12638_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_33070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTCACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103986	102739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_102700_104000
654829	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
654837	contig_10311_pilon	-	1596	8	Intergenic	novelGene_50422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1132.11315869114	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	33	785	71526	68253	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIRYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREVIC	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65924_68240_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70254_70358_70446_70493_71497
654846	SIRV7	-	234	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91681	11	-91675	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAATGCAAATAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
654852	contig_9435_pilon	-	1968	2	Intergenic	novelGene_156946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	152	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAGATCTGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167261	148621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_150455_167126
654853	contig_5093_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_135076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTACACCTTGAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490278	489470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_489500_490300
654857	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_96915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654865	contig_3095_pilon	+	1232	5	Intergenic	novelGene_75023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
654872	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
654877	SIRV4	+	259	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1512	632	1057	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2512	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
654879	scaffold_12124_pilon	-	1667	12	Intergenic	novelGene_22047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	377	685	857198	847715	TRUE	15	GAGAACCTCTTCTTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWCWVLTFFWMSS	858934	829614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_829718_836043_836147_837228_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846898_847601_847752_852322_852461_854702_854801_857162_857231_857788_858021_858822
654888	contig_17964_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_33900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAACCGAAAGATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343425	342822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_342800_343400
654889	contig_16724_pilon	-	1500	9	Intergenic	novelGene_105302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	825.209433643969	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	202	996	569099	541645	FALSE	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFWSFSRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMYFFQKGGGQPRFAEVRVYSVTLLYSLLTSSAVTPT	575967	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541753_541934_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575806
654890	SIRV5	+	224	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	290	154	176	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8491	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
654891	contig_5954_pilon	+	2880	31	Intergenic	novelGene_28495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	131.356601153755	1	47	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1499	2554	413352	420257	FALSE	45	GAACATGGTATTTAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGSTFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSLAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHILPLEAGLRPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTVLVSFQRCVRIVNLQGEPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLGTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIVLESIPTDNPGAHSNLYILTGHQSSY	408274	420583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_408384_408506_408565_408783_408875_408957_409023_409302_409359_409667_409716_409807_409851_410239_410313_410389_410523_410598_410662_411009_411092_411179_411289_411733_411813_411904_411964_412495_412540_412619_412659_412745_412780_412879_412986_413066_413156_413233_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_418055_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
654893	contig_11370_pilon	+	990	3	Intergenic	novelGene_98716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1310	157	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	166	513	145831	148070	FALSE	10	AGTGCTGTGTGGTTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLLFQGD	145665	148547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148047
654906	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
654911	contig_5981_pilon	+	2576	9	Intergenic	novelGene_35498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.302963223243	1	110	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	225	1214	25511	37804	FALSE	35	TGACAAAATGAAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGERGRHEAVRHPGRLKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23504	39166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23553_25004_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
654912	contig_10246_pilon	-	2820	11	Intergenic	novelGene_46909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCCCTTGCGTCCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186385	140770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_140797_144692_144805_148216_148335_168073_168273_169670_169781_171153_171296_175057_175201_176293_176365_183544_183626_184510_186189_186245
654933	contig_10311_pilon	-	1678	10	Intergenic	novelGene_50423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1075.85749893966	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	33	1079	71526	65724	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLSWDEMVPNAVLAVVE	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65772_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
654937	contig_14223_pilon	+	1896	2	Intergenic	novelGene_156975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170714	176549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_+_171004_174942
654940	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654942	contig_10017_pilon	-	2121	19	Intergenic	novelGene_156999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	39.2074256005444	306	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	77	1966	414343	359979	FALSE	5	GCCCGACCCTCTCTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSGEQAPDYRWILSIGDEAVRLEALNEHLSTRSYVQGHALSQPLEKAVQAKLPAEEISSCAEVLLEAAKDLLSDWLDSRFGSEVTDNSIFSKLPKFWEEEFHKDMAALNVLPPDVLTRVSEYVPEVVNFVQRIVDNGYGYASNGSVYFDTVKFASSEKHSYAKLVPEAVGDQKALQEGEGDLSVSAEHLSEKRSPSDFALWKASKPGEPSWPCPWGKGRPGWHIECSAMAGTLLGASMDIHGGGFDLRFPHHDNELAQSEAYFENDCWVRYFLHTGHLTIAGCKMSKSLKNFITIQDALKKHSARQLRLTFLMHSWKDTLDYSSNTMESALQYEKFMNEFFLNVKGLLRAPVDVTGQFEKWEEEEAELNKNFYDRKAAVHEALCDNVDTRAVLEEMRALVSQCNLYMAARKAARRRPNRALLESVARYLTHLLKIFGAIEEDSTLGFPVGGHGAGLDVEATVMPYLQALSEFREGVRRIAREKKVPEVLQLSDTLRDDVLPELGVRLEDHEGLPTVVKLVDRATLLTEREEKRRGEEERRRKKEEAARKKREHEAAKLAKMRIPPSKMFLSESDKYSKFDDTGLPTHDAEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLHQEYLQTVQNGSVQ	414419	359823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_360114_360435_360520_361207_361268_362791_362860_363404_363486_367782_367865_368899_368969_369696_369887_370272_370371_370796_370901_371003_371134_371455_371585_372135_372249_381993_382116_385023_385113_385335_385477_391388_391449_403933_404044_414318
654943	contig_10135_pilon	+	1747	14	Intergenic	novelGene_106632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_8	67.4030533257444	971	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	131	1522	106830	115842	FALSE	15	CTTCTGGTATATCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIILQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGTTYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAILGTQDIVFGEVDR	106699	116067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114015_114473_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
654947	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
654953	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
654962	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
654966	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
654967	contig_15219_pilon	+	1619	7	Intergenic	novelGene_40827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	210.315173542525	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	111	1097	19617	24349	FALSE	35	TGTTCTAGGCTATGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVYTLLCNWSDF	19506	24871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130
654986	contig_15666_pilon	-	1730	3	Intergenic	novelGene_70206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	145.5	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	708	1082	132068	129060	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMECHIRISSEHSSHLLSH	132775	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_131446_131711_132007
654987	contig_12250_pilon	-	1495	10	Intergenic	novelGene_80655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.651865517482	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	57	1328	379717	375947	TRUE	30	AGGAATCAGTATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAELRATECWDSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380578	375689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_375796_375885_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
654990	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
654993	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
654996	contig_11056_pilon	+	2288	10	Intergenic	novelGene_130363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_9	100.358001151187	639	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	177	1496	340996	369990	FALSE	10	TGTAGAGTCTGGGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEGGFGGTSSSDAQQSLQSFWPRVMEEIRNLTVKDFRVQELPLARIKKIMKLDEDVKMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPVQLNAGQLQYIRLAQPVSGTQVVQGQIQTLATNAQQITQTEVQQGQQQFSQFTDGQRNSVQQAPGSELTGEAEPREVKATGNSTPCTSSLPTTHTPSHRAGASCVCCSQPQQSSTPPPPSDALQWVVVEVSGAPNQLEAHRELHAPLPGVTSLSPLHPSQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294524	370782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_340987_341101_347924_347997_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_365410_365519_368561_368622_369558
654997	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_94046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655011	SIRV4	+	324	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1444	635	989	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
655013	SIRV7	-	407	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-70	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114808	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70988_78841_78964_114686
655024	contig_500_pilon	+	1396	9	Intergenic	novelGene_31078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_7	904.238871924891	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	8	985	1492663	1498065	TRUE	10	GGCATGTTTGACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1492655	1499585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
655028	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_93544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655029	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
655030	contig_753_pilon	+	2236	14	Intergenic	novelGene_112883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	62.4493167277538	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	22	1677	218165	243501	FALSE	10	TTCCTCATCTATGGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAFWVKMDGHDLFRRLGAGAKFDVKRFSSDAARFQLGKRKRDFNSSEVLQGLDFFGNKKSVPGKYGASRTHQELQDEEKQEEKLIERKRKQNKKKRKMMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSKQKKKMIKKPLERESISTTPKYFLEKAKDKRKKVTG	218143	244060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_218252_219571_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236217_236308_236440_236592_236763_236840_238494_238588_243482
655031	contig_11115_pilon	+	1436	6	Intergenic	novelGene_102824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	644.528975299016	1806	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	234	1349	165608	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165374	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166513_171904_171981_172339_172595_172714_172964_173047
655040	contig_9727_pilon	-	2272	12	Intergenic	novelGene_86276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	255.330477798014	70	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	123	1490	157863	137693	FALSE	5	TGACTTGTGCTGTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQIMLSGALIVLLASPLGALRARGKVQGCGTLLPGEKSSLSKEQSFRPPKEHRTSASDMDTDNNQLGTEVA	158222	136910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_137899_138719_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156121_156165_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121
655056	contig_9527_pilon	+	2347	8	Intergenic	novelGene_134046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	61.8077995210366	348	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	78	1151	412633	419761	TRUE	5	TCCAGGCTTCTGTCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSVLNFPEHRHTPCSRGSPSTAAPMEFPLAQICPQGSRQIPSPTFSTFLPTDLTRRSCQGLGLLSQPRSQALEAEEVQPSPRALAIEAPVSGHLGGCSPPSAPTLPQVSLQAQGTASNPEGAGKAEEVPGEGGLNLQAETRAWFQKTQAHWLPQHGAAPAWFHGFITRKEAERLLETKPQGCYLVRFSESAVAFVLTYRSRTCCRHFLLAQLRDGRYVVLGEDSAHARLQDLLRHYTGSPLSPYGEKLTEPCARQTPEPIGLPLRTEETDSGSKTQDPDPHYSTVLKQGHAPALLKKEGAGESKEPSQQPRPKPPIPAKPQLCPEVYTGLAPRPRPAPPRKPSNPIYHELDEPIAFYAMGRGSPGGSPQQHLCRGGGALKK	412555	422824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_412667_413212_413428_414398_414584_415418_415509_415644_415814_419182_419333_419530_419832_421698
655060	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
655081	SIRV7	-	238	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69046	2	35827	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78911	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
655088	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
655089	contig_6414_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_157018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATAAACCCGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181295	182018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_+_181300_182000
655105	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
655110	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
655127	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655128	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655149	contig_4659_pilon	+	2611	10	Intergenic	novelGene_118195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	64.2287578373841	57	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	244	1440	191727	208048	FALSE	25	GCTAATGACTATTCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDKLIDDMVAQAMKSEGGFIWACKNYDGDVQSDSIAQGYGSLGLMTSVLICPDGKTVEAEAAHGTVTRHYRLYQQGRETSTNPIASIFAWTRGLAHRAKLDNNKELSFFAQALEEVCIETIEAGFLTKDLAACIKGLPNVQRSDYLNTFEFMDKLEENLKIKLAHVKL	186952	209219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187105_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559_199738_201105_201210_204160_204302_205905_206069_207957
655160	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
655168	contig_11498_pilon	+	1855	5	Intergenic	novelGene_65543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.5765020765111	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	500	913	334400	341504	FALSE	20	AACACCCTGCACTGCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKETFKYFLRGYRYVILDIPLLFETKKLLKYMRHTVVVYCDRDTQLKRLMQRNKLNRQDAEARISAQLPLKDKARMARHVLDNSGEWSITKRQVVLLHAELEHSLEYLPLRLGVLTGLAGIASLLYLLTRYLLPAP	314253	342446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_314289_320988_321283_334229_334434_337797_337886_341212
655171	contig_10990_pilon	-	1707	11	Intergenic	novelGene_7396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_8	70.343798589499	760	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	105	1367	42338	29709	FALSE	10	CCTCCCCCAGGTGTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPVAWAGLIVLLMIQWGSASKLVCYFTNWSQDREGVARFLPKDVDPNLCTHLIYAFAGMDNNHQLSVIRWNDKTLYKDFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFDTQKFTSMVATANNRRTFINSAIKFLRKYDFDGLDLDWEYPGSRGSPASDKQRFTALVQELGDTFRQEAQSSGKERLLLSAAVPSARVYVDAGYEVDKIAQNLDFINLMAYDFHGTWEKITGHNSPLYKRQGESSAAAEVNVDFAVRYWLQRGAPANKLILGMPTYGRTFTLASSSDTGVGAPATGPGTPGPFTKEGGVLAYYEVCSWKGATKVRIQDQKVPYAFQGNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWTLDLDDFTGSFCNQGRHPLIRTLRQKLSLPYVLSGTREPEVLTADKPSETERGHSPGEDTF	42442	29368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_29813_30612_30740_32140_32255_32553_32740_34277_34402_35098_35224_35445_35612_36933_36991_37682_37888_40672_40703_42313
655176	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
655186	contig_17427_pilon	+	1739	7	Intergenic	novelGene_30299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	276.032858350032	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	88	552	148069	175469	FALSE	35	GCCCCCAACAGACCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLG	147981	176656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155718_155795_171334_171404_175462
655194	SIRV2	-	296	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	34	3402	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
655198	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_93547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655206	contig_2069_pilon	-	1068	2	Intergenic	novelGene_23513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	0	243	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509888	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1509301_1509754
655209	contig_8354_pilon	-	2769	1	Intergenic	novelGene_24163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	202	537	579558	579223	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTRQKESVLELLHKGVEDLLGDLSKVPFHVLSSPETLPLTEQQEGCARSVILVGAAHWVLGRSSMHTGKGHLERLDSRLVAGAEWLSSLPNCCGFLSCNIEMSVTWWYV	579759	576990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_577000_579800
655218	contig_15135_pilon	-	3884	1	Intergenic	novelGene_119875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATACTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84213	80329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_80300_84200
655219	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_96729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655222	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
655224	contig_8357_pilon	-	2517	19	Intergenic	novelGene_39739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	290.392502581516	722	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1007	1864	787951	762891	FALSE	10	CTTTATCTTGATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818344	762237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787999_788101_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808821_818245
655229	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655230	contig_12624_pilon	-	795	4	Intergenic	novelGene_61061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1250	junction_1	1066.77874411187	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	107	442	867719	862389	FALSE	55	AAAACAAACAAGGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	867955	862035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898
655233	SIRV5	+	247	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	8697	1	-104	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTATTTAGCGAAGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270
655238	contig_3627_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_78531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634693	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_634700_635000
655242	contig_709_pilon	-	1957	6	Intergenic	novelGene_57652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.4845441770991	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	59	691	3772541	3761720	FALSE	20	ATACGTGATGCGTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSNEFKLNQPPEDGISSVKFSPNTSQFLLVSSWDTSVRLYDVPANSMRLKYQHTGAVLDCAFYDPTHAWSGGLDHQLKMHDLNTDQDNLVGTHDAPIRCVEYCPEVNVMVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVLMELPYMQACSQRTDPSVLSHRMLNQNETLGMVNNVILRN	3773011	3760453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3761846_3767188_3767279_3769806_3769959_3771705_3771776_3772346_3772542_3772953
655247	contig_5515_pilon	-	2710	11	Intergenic	novelGene_52357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	153.076582141097	7	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	156	1877	172625	160151	TRUE	20	GGCAAAGAGTCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHAAEPARDGVEASAEGPRAVFVLLEERRPADSTQLLSLNSLLPESGIVADIELENVLDPDNFYELKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVGVSAGGHTLGRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPTSAQPLPAPETVHATGPAGSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTAGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQSVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDVEEEGRPGTFHVGGAPAPNASHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEESVVGGLSGGTLSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES	172780	158850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_159315_159781_160589_161061_161210_165496_165573_165751_165809_166171_166290_167741_167847_167931_168178_168842_169147_170133_170248_172509
655249	SIRV2	+	650	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-67	140	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGGCCTACGTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
655261	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_95097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655270	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
655279	contig_10496_pilon	-	2385	11	Intergenic	novelGene_59422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	132.21909846917	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	540	917	52700	47968	TRUE	20	GTTCTCTTTCCAAAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIAEI	64727	37998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40830_47753_47979_50488_50736_52476_52561_52664_52722_55299_55444_55640_55782_56170_56259_64482_64573_64672
655281	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_93417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
655285	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_18463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
655290	contig_6227_pilon	-	1356	13	Intergenic	novelGene_49751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	403.816059267363	2	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	295	999	1214234	1202979	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKASSGTSTASTSGEWSWGSSWLRKLNLSLKAAPQ	1225026	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203186_1204465_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214375_1223755_1223838_1224857
655295	contig_11832_pilon	-	1347	12	Intergenic	novelGene_106920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1015.55863387742	7	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	170	715	88250	84828	TRUE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKTWMCWACPSAKTSSSPPTRPDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTMQSEGGCQQGGAGNPGVLQGQGEAGGVSRRGCLRGAAFCSYAPQAP	89451	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85056_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_86992_88178_88281_88490_88536_88646_88708_89418
655296	contig_4103_pilon	-	1395	3	Intergenic	novelGene_52027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_1	72.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	123	404	577318	543271	FALSE	20	CATAGGTCTCACATGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYSVAPKQVLRVPSGPEPSSPHRTSVQLVRGEERYSLQSLMNQGNPPPYPGPGPSAPYPPYPPQPMGGPYPPPQGYPYQGYPQYGWQGGPQEPPKTTVYVMERERKTQDTGCQAALAACWTALCCCCLLDSLD	619558	542279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_543381_577146_577338_619455
655318	contig_8317_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_20148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCTTGATGACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16748	16440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16700
655327	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655328	contig_9290_pilon	-	1725	12	Intergenic	novelGene_77551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.473484304131	2	39	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	128	1570	496936	478765	FALSE	30	TAAAGCCTAGAGTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATLNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNIKNPRSTVDTPPPGGRGRGRGRPH	497063	478609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478837_479910_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486675_487541_487663_489929_490037_491390_491545_496930
655341	SIRV6	+	688	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	8167	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
655342	contig_11307_pilon	+	1686	7	Intergenic	novelGene_105235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.8662957066518	574	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	191	913	75537	87762	FALSE	15	TTCTTTTTATTTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFWEPAGINQSQVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDNFAHRTEVRKALAKNKEWQEQFLIPNLPLIDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEGVYELVSFQMKPGGPALWGDAFQRAVNSHVNLNYAKLVGVFHTEYGVLNRVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	74024	88535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_75522_75576_76748_76960_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
655343	contig_12277_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_139710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTGGCTCAAATCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386862	384908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_384900_386900
655344	contig_14322_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_115920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
655346	contig_5153_pilon	-	3601	1	Intergenic	novelGene_74329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTGGGCACAGTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579249	575648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_575600_579200
655352	contig_8284_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_125680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAACTAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341708	341478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_341500_341700
655356	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655361	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655364	SIRV5	-	317	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTACATATACAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
655371	contig_16703_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_72795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAACACCGTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43036	44881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_43905_44410
655374	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
655378	contig_17829_pilon	-	2522	13	Intergenic	novelGene_157035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_12	75.1703158759419	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	55	1641	57091	29163	FALSE	15	TTTTTCTTTTTCCAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGSCAPREREAEGNGAGAVPAPPAIDFPAEGSDPKYDESDVPAELQVLKGPLQQPTFPFAVANQLLLVSLLEHLSHVHEPNQGRSRQVFKLLCQTFIKMGLLSSFTCSDEFSSLRLHHNRAITHLMRSAKEKVRQDPCDENSHIQKIRPREVAFEAQTSRYLNEFEEIAILGKGGYGRVYKVRNKLDGQYYAIKKILIKGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCPYVMVSVATKIFQELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACTDILQKNTDWTNRNGKGMPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKVVSVAFYLFSGLILQFQIVHEKYNT	57145	28281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_29324_29537_29653_36213_36315_39444_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439_44521_45061_45162_45846_45885_47172_47307_48431_48591_56973
655383	contig_2550_pilon	+	2591	13	Intergenic	novelGene_135709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAACAAAAATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743436	1801521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1744032_1748639_1748740_1752725_1752898_1769461_1769632_1770653_1770759_1771466_1771537_1772087_1772199_1776277_1776427_1777046_1777229_1777997_1778206_1778369_1778663_1779819_1780055_1801320
655392	contig_2867_pilon	-	1433	2	Intergenic	novelGene_135245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTTTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305810	1285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1305688
655398	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
655405	contig_1813_pilon	+	2108	6	Intergenic	novelGene_105476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	128.058736523519	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102754	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_113656_113850_149935_150119_152059_152225_153457_153502_154854
655408	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
655409	contig_7457_pilon	+	1072	3	Intergenic	novelGene_31672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTCCCAGCAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174111	1176078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174971_1175539_1175642_1175967
655417	contig_9014_pilon	-	2025	11	Intergenic	novelGene_106736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	79.2280884535276	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	81	782	46682	43800	TRUE	50	AATAATTAAAATCCATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51621	41566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_43743_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
655426	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_97248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655427	contig_5526_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_111691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	107	490	203019	202636	NA	25	ATGGTGCTGCCGAGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGCCFLSFKRWSYCPLGFKGRGYLLGFKEWGYHHHHSGGSDCCLGGPRKGLLSKAEWVGYCAGGTGEWGYPGPRMWGRWRSESGKWVTPRSEEPLPIIQRMWPMPRGQSWVHCPDVSRKQGITFKP	203125	200734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_200700_203100
655446	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_89244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
655450	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655451	contig_7333_pilon	+	2353	13	Intergenic	novelGene_142771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_12	94.3471721297935	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	282	1823	185614	217535	FALSE	15	AATATGGCCCTTGCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLARKPLLSSRLRLSLFNTCSRQISDIHLSRFHDRGRAVDLEKFCSETIDIIQPALVLATGDLTDAKTKDKLGSRQHEVEWQTYQGILKKTRVMEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRVLAFSSSSITSVAVKIDGVHLGEAVHLSGPIFILKWNPRNYSNGTHNIEVIVQDSAGRRKTVHHVFSVEEDLHLTFDPLASFILLTDHYIMARVLFVLIVLIQLTILIIFRYRGHPKLKGPPGFVNLTSFSLHVLSKINIFYYSVLLLTLYTVLGPWFVGEITLGKLGCCFSFGIFVDGHFLQGSLTFIVGILQLVFFNVPLMTYLSWSLLQRCFGHNFRSHLHQGKYLKIIPVHLLMLLLYVWQVYSCYFLQVTYGTLAFFFSPLRTWLTLLTPVLIRCVWTLNPSELGTFTVQLKSHLSS	184207	218065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_202680_202841_203505_203620_206388_206474_212390_212496_214311_214431_217208
655454	contig_6102_pilon	+	1717	11	Intergenic	novelGene_31748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	122.441373726368	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1069	1461	228034	228987	FALSE	15	TCTCACTAGGCTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	219749	229243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_219872_220090_220190_220361_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_226980_227973_228161_228274_228396_228586_228648_228903
655455	contig_3601_pilon	-	1735	5	Intergenic	novelGene_132866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	28.9395922569756	384	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	875	1207	169167	144563	FALSE	30	CTAACTTGAAAACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	188478	144034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169200_187636
655458	contig_1618_pilon	-	1830	8	Intergenic	novelGene_141794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	306.217409761131	759	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	104	1408	353751	317005	FALSE	30	GATGAAAACTGCCTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPSAPPGGGRRRRAEVASGELPDVEKLGRRRGRKMDSVEKGATTSVSNPRGRPSRGRPPKLQRNSRGGQGRGVEKPPHLAALILARGGSKGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEVRLISERACSKQTLSALKLDCKTEVNISDKLAIVDEWRKEMGLCWKEVAYLGNEVSDEECLKKAGLSGVPADACSTAQKAVGYICKCNGGRGAIREFAEHIFLLMEKVNNSCQK	353854	316582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_327214_327369_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
655461	contig_1154_pilon	+	2132	9	Intergenic	novelGene_87092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	216.801608619493	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	504	1820	439267	446056	FALSE	50	AAGAAGAGAAAAAGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNEHYCIV	330773	446368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330874_331888_331963_389032_389099_389755_389836_434841_434975_439216_439505_442410_442505_445028_445995_446037
655462	contig_8843_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_156650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACACCACTACTTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68070	66284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_66300_68100
655468	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655471	contig_17493_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_122179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	532.80192275262	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	166	831	92066	119222	FALSE	15	TGCTAATGTGTTTGGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGKEQLLRLDNK	49960	119873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119116
655480	contig_11720_pilon	+	1264	11	Intergenic	novelGene_43953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	397.285086556241	62	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	10	456	262271	264322	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGGLHGWSSREKALSSRWARKGSPGRPCRGCSGY	262261	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266510_271928_271961_272096
655486	contig_7457_pilon	-	2271	5	Intergenic	novelGene_31573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	8.55862138431185	410	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	282	857	924001	922396	FALSE	0	GTTTCCCTTCCCTCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCKVVVCGQASVGKTSILEQLLYGNHVVGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVTIVVLGNKCDLQEQRRVDPDVAQHWAKSEKVKLWEVSVADRRSLLEPFIYLASKMTQPQSKSAFPLSRKNKGSGSLDG	925118	920981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_922636_923245_923488_923907_924016_924302_924384_924932
655487	contig_4402_pilon	-	2193	4	Intergenic	novelGene_140858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	387	junction_1	105.884633236157	272	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	467	844	624811	612372	FALSE	10	TTTGCTTGTTTTGTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAIDDSSASISLAQLTKVYIYTFLKI	625277	611022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_612447_617131_617169_619559_619660_624645
655488	contig_16098_pilon	+	2780	6	Intergenic	novelGene_46188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	65.2484482574107	536	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	349	990	666319	668774	FALSE	35	TTACATCTGTACATAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGENVFLFVPNLIGYARIVFAIISFYFMPCCPLTASSFYLLSGLLDAFDGHAARALNQGTRFGAMLDMLTDRCSTMCLLVNLALLYPRATLLFQLSMSLDVASHWLHLHSSVVRGSESHKMIDLSGNPVLRIYYTSRPALFVLCAGNELFYCLLYLFSFSEGPLVGSVGLFRMGLWITAPIALLKSVISVIHLITAARNMAALDAADRAKKK	665970	670564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_666362_666456_666592_667323_667478_667951_668034_668416_668499_668628
655519	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_97759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655523	contig_10205_pilon	-	1641	12	Intergenic	novelGene_143119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_11	65.7402853961476	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	88	1524	256249	229163	FALSE	70	ACAGCTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPPGPNPYLRTWITAAACPSAPDAPSAIMAPGQLALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDVSLNISAMNINNFSRSVYNIINLYIYQKPKPNPLQLSRYRLIATLQDRVELPHRVSRKQLVDLSCQPFG	256336	229045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
655527	contig_5918_pilon	+	3363	1	Intergenic	novelGene_99497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAATCAAAACCACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237980	241343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_238000_241300
655530	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655534	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
655550	contig_5302_pilon	-	2541	7	Intergenic	novelGene_81519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_5	194.383141129974	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	245	1156	1451551	1410580	FALSE	85	ATTAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLRPRYGRPSCGRRASRPEESSRLRPLFQGARCSRRDQHVPPLVPLSQSTRLALRAPAPPGSVSCLAGRTRARARAVAGAMSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNAKNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVRYMEEERNFTTEQVTAMLLSKLKETAENVLKKPVVDCVISVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRAKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVLVNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDVDVSGTMNR	1451795	1409194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1410829_1418836_1418971_1419563_1419664_1428240_1428364_1430204_1430346_1436323_1436382_1451444
655565	contig_5947_pilon	+	1883	7	Intergenic	novelGene_101610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	220.747215912983	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	20	625	988829	1006156	FALSE	35	ATACAAGGAAGGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETKHFPMDHSLQEFKQKEECTIRGRSLIQVSIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSICTF	988809	1007414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_988848_990802_990932_992359_992402_993750_993972_995830_995931_998186_998264_1006138
655566	contig_5935_pilon	-	3277	8	Intergenic	novelGene_102712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_5	27.9226336398943	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	421	1980	1049311	1028550	TRUE	30	ACTTGCCTTTCTATATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVAAHSCHLLQQLHEQRIQGLLCDCMLVVKGVCFKAHKNVLAAFSQYFRSLFQNSSGQKNDVFHLDIKNVSGIGQILDFMYTSHLDLNQDNIQVMLDIAHCLQVQNVLNLCHTFLKSTTLDQPPGIPCNSTFSPQSALTPDANCVINENYPPQLLQECSPDAQHNKVADEPHSSAAPSVNLHNSSGEIPKQAPDTLDSSCTELPFKQPNYYYKLRNFYSKQYYKQATCPNHERIIEQPFAFSTSTDLNAVENPPCAVSHPECILESSEHLPSNFLAQPLSESAPDPESDCTCPQPAKQMRLKKAIHLKKLNFLKSQKSAEQTSEPKSNDDVTKRIGSTSENLIEKASSQSTEEKESEELASSENFSCMNETERLEDPAVLEDQSQALQSQRQYACELCGKPFKHPSNLELHKRSHTGTPIQYSQAEGKEVMQSQTPLPALFFVRNLLNVTFVGNISLRQVTCRLTYVGILVKNRTSARSVERGLPPLGTSSVTSSSTQEKNHTCATSVAEGLVTSVI	1057181	1020627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1041487_1041535_1045113_1046294_1049159_1049331_1056780
655568	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655576	contig_7426_pilon	-	1822	6	Intergenic	novelGene_27543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	321.36122977111	8	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	159	641	1100389	1087105	FALSE	40	TCAATATATGTCAAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWPAANHSERAGGLHQAGGQDLRWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102833	1085923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1100318_1100420_1102705
655584	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655591	contig_12644_pilon	-	1132	8	Intergenic	novelGene_44692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACAGCTCTGCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680614	2677632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677692_2678043_2678195_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
655596	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655597	contig_14322_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_116383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671661	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
655604	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
655605	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
655614	contig_13244_pilon	+	1631	2	Intergenic	novelGene_86917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	518	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	181	1437	219847	221103	FALSE	20	CAGACTACTCTTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSFTFLRPFARFLVPFTLHRKRKDVCSTVLQKYMSSKVPAVSYPNKERTLPPEQLELDGWKITMKSSVQEEGISAVSNSKDEDPLAATRELIEMWRLLGREVPEHISEEDLKTVMESPSKSSKRKYLKYLYVKEKMKKAKQIKKEMKAAAKEEAKKDKLLETTEDDKQQNFLFLRLWDRNIDIAMGWKGAQAMQFGQPLVFDMAYENYMKPKELQNAVSQLLESEGCNRRNVDPFHIYFCNLKTDGDYYRELVKRYGEKWDKLLLTATEKSHVDLFRKENIIYLTADSPNVMTTFKHDKIYIIGSFVDRNMQPGTSLANAKRLKLATECLPLDKYLQWETGTKNLTLDQMMRILLCLKNTGSWEEALKFVPRRKHTGLLEVSQYSREFVNQLKKSKTFNTFPKGSLNIRTKKRWLK	217219	221297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_217370_219816
655615	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655628	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	101	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655633	contig_10324_pilon	+	2024	6	Intergenic	novelGene_7765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1068.03925021508	14	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	146	637	75827	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNMAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	75681	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_75902_76009_76077_76201_76271_76440_76530_78365_78451_79273
655657	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_96104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655658	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
655665	contig_9647_pilon	+	2991	1	Intergenic	novelGene_127388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTTTTTTTAACCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108654	111645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_108700_111600
655666	contig_9647_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_127389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCATACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111700	112271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_111700_112300
655667	contig_7963_pilon	-	2010	4	Intergenic	novelGene_58323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1690.16922229699	33	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48904	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_40232_43546_43819_48741
655676	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_95813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
655677	contig_12622_pilon	-	1544	10	Intergenic	novelGene_5953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2504.83170623162	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	18	854	1590968	1588838	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKARRRVSFRREGRAPGTRLSSRPRHSGRRPLRRRRIVVVGQGRRGSYPLWKCRWRSLPLSLHLRGPLIHRLHRRRPLRRHALVQHHGRLRHRPQVWLLPQ	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583674_1586782_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589226_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
655689	contig_8801_pilon	+	1818	9	Intergenic	novelGene_66326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_8	107.392969974761	709	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	16	1011	935739	944080	FALSE	30	GATTCCTATCTTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPQKDVVIKSDAPDTLLLEKHADYIASYGSKKDDYEYCMSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGEIDTRFSFCAVATLSLLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSESHAGQIYCCTGFLAITSQLHQVNSDLLGWWLCERQLPSGGLNGRPEKLPDVCYSWWVLASLKIIGRLHWIDREKLRSFILACQDEETGGFADRPGDMVDPFHTLFGIAGLSLLGEEQIKPVNPVFCMPEEVLRRMNVQPELVS	935723	944887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_935742_936730_936839_938901_939100_939696_939803_940884_940938_941018_941130_941744_941871_942886_943037_943939
655694	contig_10923_pilon	-	1686	10	Intergenic	novelGene_66167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTCCTCTATGGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42834	13797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_13861_21648_21846_22990_23114_29346_29573_30139_30317_32868_33010_36523_36684_37384_37540_38580_38756_42565
655698	contig_3382_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_124062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATGTTGACCACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261806	262360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_261800_262400
655701	contig_10494_pilon	+	2303	10	Intergenic	novelGene_102223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_9	52.1971571053112	199	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	155	1942	1254686	1303944	FALSE	15	GGGAGTGATCATTCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLVTLPLRRLAWAWASGWPAPLKHRGRGLLHTASTTCPDSSAPVFTRALAFGDRTALVDQHGHHTYKDLYQRSLRLSQEICRLRACTSGDLGEERISFMCSNDASYIVAQWASWMSGGVAVPLHSKHPAAQLEYFIQDSRSSVVMAGPEHLELLGTVASKLGVPLLPLLPDIYSGAAEGLVGGEAPAPSWKEWGWKERGAMIIYTSGTTGLPKGVLSTHCNVSSMVTGLVDKWTWTPDDVILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTGDTVMFKDGRYWIRGRTSVDIIKSGGYKLSALEIEQHLLAHPSITDVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLRDGHSLSQQELREWARGVLAPYAMPSELLVVEEIPRNLMGKINKKELLCQFYPRDPGPPAGVQISGRAG	1240302	1304305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1240418_1254646_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283905_1284033_1297703_1297839_1298214_1298327_1303781
655708	contig_18794_pilon	+	2095	14	Intergenic	novelGene_54641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	382.034912745174	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	359	1663	145406	172468	TRUE	20	AATATATTTGGGTGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEEDCHSESVRAEDDEKESPAETDLQAQLQMFRAQWMFELAPGVGSSSLETRPCRGSARGSLLKADTKGKQELAKEEKARELFLKAVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDNDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESGQTHISVLPMEVLMYIFRWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRGCIKLVPYTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYIRFFPDGHVMMLTTPEEPQSIVPRLRTKNTRTDAILLGHYRLSQDTDNQTKVFAVITKKKEEKPLDYKYRYFRRVPVQEADQSFHVGLQLCSSSHQRFNKLIWMHHSCHITYKSTGETAVTAFEIDKMYTPLFFARVRSYTAFSERPL	145047	172951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_145409_152183_152268_156095_156252_159021_159080_160494_160595_163117_163246_164050_164166_166480_166600_166781_166873_167941_168038_168360_168455_169970_170123_172359_172593_172643
655712	contig_6677_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_114170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	1334	1882	421390	421938	NA	35	TATCAAGTAATATGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINYSLQYELHLNIKKTKTLTSGPISNIMENGEKTEVVKDFILLGSTINAHGSSGQEIKQSTALGKSAAKDLFQVLKSKDVTLRTKVCLTQAMIFLIVSYACKNWTMNKEDERRIDTFELWCWLTILNISWTARRMKKHVLEELQPECSLKARMARLCLTYFGPAIRRDKSLKKDIMLGKV	420056	422200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_420100_422200
655717	contig_12270_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_113829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	2	331	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14410	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
655718	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_93617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655724	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
655733	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
655735	contig_3095_pilon	+	1210	5	Intergenic	novelGene_75065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	62	850	147241	151876	FALSE	15	GATGGGTCTTAGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPLLWPFLEDQ	147179	152236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151148_151848
655737	contig_11171_pilon	-	1248	6	Intergenic	novelGene_48591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAACCGACAGCCTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251952	212051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_212218_235061_235392_236866_236980_239234_239335_249979_250051_251484
655746	contig_6127_pilon	-	1257	3	Intergenic	novelGene_157047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAGAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22716	11975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_-_12123_20643_20734_21696
655753	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_97232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655757	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
655759	contig_13625_pilon	-	1920	9	Intergenic	novelGene_150153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	114.669566036503	269	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	56	1042	43661	29843	TRUE	20	GTCATGCCTTATTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43716	23707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_28998_29587_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
655760	contig_14322_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_115838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671892	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
655763	SIRV7	-	362	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-19	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114757	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
655777	contig_5084_pilon	-	3580	8	Intergenic	novelGene_64491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_3	34.7498348256242	37	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1042	3129	169	3297	130204	94738	FALSE	30	GCAACTTTGAAAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKQQIILANQDGGTMAGAAPTFFVILKQPGNGKTDQGILVTNRDACALAGSVSSPEKSKGKICLPADCTVGGITVTLDNNSMWNEFYHRSTEMILTKQGRRMFPYCRYWITGLDSNLKYILVMDISPVDNHRYKWNGRWWEPSGKAEPHVLGRVFIHPESPSTGHYWMHQPVSFYKLKLTNNTLDQEGHIILHSMHRYLPRLHLVPAEKATEVIQLNGPGVHTFTFPQTEFFAVTAYQNIQITQLKIDYNPFAKGFRDDGLNSKPQRDGKQKNSSDHEGNSVPSSPGHRVRVTEGEGSEIQPSDLDPVLRGHETSGKDLEKPSLNIKQDLLGFMDTDSAPEVTQLKQEVSESLVANSFEDSSHVASPLDLNGPLNVVIKEEPLDDYDYELGECPEGVTVKQEETDEETDVYSNSDDDPILEKQLKRHNKVDNLEADHPSSKWLPSSPSGVAKAKMFKLDTGKMPVVYLEPCAVTKSTVKVSELPDNMLSTSQKDTSSVLAELDYLPTYVENSNGTGFCLGKESDNGFRKYSPDFRVIQKYPLFKEPQWKYPDISDSISTEGTYDNSSKGSSGDSFSGKEDLSRKRTTMLKIATAPKSVNASQNTSSNIPGKRGRPRKLKLSKAGRPPKNTGKSLTSTKNTPVGPGSTFPDVKPDLEDVDGVLFVSFESKEALDIHAVDRPTEEPSSLQASTTNDSGCRTRISQLEKELIEDLKSLRHKQVIHPGLQEVGLKLNSVDPTVSIDLKYLGVQLPLAPATSFPFWNLTGTNPASPDAGFPFVSRTGKTNDFTKIKGWRGKFHSASAARSEGGNSEGSLKNRSAFCSDKLDEYLENEGKLMETSMDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQVSVSCFSGSVLVLG	138923	94454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_95442_96630_96736_97148_97281_107959_108056_108174_108254_109367_110320_129143_130270_138820
655789	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-5	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114743	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
655798	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655801	contig_14133_pilon	+	2285	6	Intergenic	novelGene_119920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.064210946896	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	297	695	143029	146688	FALSE	15	CCCTTGTGAGGCCGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136634	148278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666
655803	contig_2969_pilon	-	1592	15	Intergenic	novelGene_157057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_13	59.0108948778589	46	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1578	15	1592	956212	758023	FALSE	10	ATCTGGTTTTTGGTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRPMNRREKELEAKFIIQMEKSKTTITNLKIPEGGTGDTGRERTKTFTYDFSFYSADTKSPDYITQEMVFKTLGTDVVKSAFEGYNACVFAYGQTGSGKSYTMMGNSGDSGLIPRICEGLFSQINETTRWDEASFRTEVSYLEIYNERVRDLLRRKSSKTFNLRVREHPKEGPYVEDLSKHLVQNYGDVEELMDAGNINRTTAATGMNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANPLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLKMLLAQGNQIALLDSPTALSMEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKEQTLALRKEGIGVVLDSELPHLIGIDDDLLSTGIILYHLKEGQTFVGREDASTEQDIVLHGLDLESEHCIFENIGGTVTLIPLSGSQCSVNGVQIMEATHLNQG	956226	758022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_758163_759831_759884_760751_760872_862784_862845_866552_866619_873646_873823_875530_875663_875845_876015_877462_877606_880937_881048_881786_881885_884195_884313_890627_890742_892781_892852_956201
655808	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
655815	scaffold_16539_pilon	-	1809	12	Intergenic	novelGene_68368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_11	242.950731324768	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	117	1592	502141	490096	FALSE	10	GGGGATGCATGCTGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502801	489878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
655819	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
655829	contig_15304_pilon	+	890	3	Intergenic	novelGene_30487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCAAAGAAGACAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52881	54297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493_53636_53989
655859	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
655867	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_17545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
655869	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
655875	contig_9177_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_32683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCTAAGATTTCATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403097	400765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_400800_403100
655876	contig_18869_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_56369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
655879	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
655885	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_96025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655891	contig_15327_pilon	-	1882	6	Intergenic	novelGene_70716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	322.170762174348	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	284	880	963897	960518	FALSE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	964180	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791
655892	contig_5033_pilon	+	1371	9	Intergenic	novelGene_29064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	916	1245	534581	540653	TRUE	25	CAGTCCTGACAAACGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGSFEHTFSKAWIISSSVLLLSMSLTTSFTMYSHTSQYTLSFAWARSFLMGSTSSRAGMTFSMATLAGIRGCMGISFSSSQNPTSPQISLGCICIIIWTAISEYWLM	531730	542210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_532160_533381_533498_533797_533878_534199_534356_534446_534633_534969_535069_536506_536637_540604_540662_542092
655895	contig_5965_pilon	+	2267	4	Intergenic	novelGene_154665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	38.3869190682914	207	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1852	2166	235969	236283	FALSE	50	AAATTAAAAAAGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNISHGGKCNQLSFRLALSKQLSECLKRQKRGRPLFWVLDKPGKTGVPDEVRLQKEGKHFPVNTSSRRCRQCSTMKKHRRTKFMCGHCQVPLCITLCFAKFHE	217321	236384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_217423_221319_221485_221670_221771_234483
655900	contig_4659_pilon	-	1826	4	Intergenic	novelGene_118161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	614.712037371068	205	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGGAGTCCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91131	65525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_67021_68541_68752_90900_90924_91033
655905	contig_15021_pilon	+	2713	17	Intergenic	novelGene_26983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	116.456386015323	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	138	2333	336727	353345	FALSE	45	CTTTATAAAAGCCAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIKDQYKVSVRIPPDSEKSNLIRIEGDPQGVQQAKRELLELASRMENERTKDLIIEQRFHRQLRGPKNEVEKCTKYMQKMVADLVENSYSISVPIFKQFHKNIIGKGGANIKKIREESNTKIDLPAENSNSETIIITGKRANCEAARSRILSIQKDLANIAEVEVSIPAKLHNSLIGTKGRLIRSIMEECGGVHIHFPVEGSGSDTVVIRGPSSDVEKAKKQLLHLAEEKQTKSFTVDIRAKPEYHKFLIGKGGGKIRKVRDSTGARIIFPTAEDKDQDLITIIGKEDAVKEAQKELEALIQNLDNVVEDYMLVDPKHHRHFVIRRGQVLREIAEEYGGVMVSFPRSGTQSDKVTLKGAKDCVEAAKKRIQEIIEDLEAQVTMECAIPQRFHRSVMGPKGSRIQQITRDYGVQIKFPDREENPVHSVEPAMQENGDETAEGRGAKEADPSSPRRCDIIIISGRKEKCEAAKEALEALVPVTVEVEVPFDLHRYIIGQKGSGIRKMMDEFEVNIQVPAPELQSDTIAITGLLANLDRAKAGLLERVRELQAEQEDRALRSFKLSVTVDPKYHPKIIGRKGAVITQIRLEHDVNIQFPDKDDGSQPQDQITITGYEKNTEAARDAILKIVGELEQMVSEDVPLDHRVHARIIGARGKAIRKVMDEFKVDIRFPQSGAPDPNCVTVTGLPENVEEAIDHILNLEEEYLADVVDSEALQVYVKPPAHEESKAPSKGFVVRDAPWTANSSEKAPDMSSSEEFPSFGAQVAPKTLPWGPKR	336589	353725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_336730_338549_338597_338795_338866_339781_339869_340026_340159_343846_344066_346167_346390_346511_346731_346943_347083_348988_349144_349427_349533_349880_350016_350611_350756_351924_352111_352592_352710_352984_353114_353258
655910	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_116424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
655913	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655914	contig_3307_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_86886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATATAGAAATTGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127617	128838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_127600_128800
655916	SIRV4	+	302	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	215	433	215	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
655918	contig_11855_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_67087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGCCCATTTGCCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2334995	2334349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2334300_2335000
655922	contig_19564_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_29639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	298	897	44	940	13097	12201	NA	10	GTTTGTTGAATGTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	13140	12027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12000_13100
655923	contig_12250_pilon	-	1515	8	Intergenic	novelGene_80647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	182.771296813191	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	61	795	379717	377491	TRUE	25	GAATCAGTATCTGATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNVQAQLRPPLKRIRCPWNFCFLQTQTTRCCSPSSTAGVWLGRPRCTASTAALWLSPRAPRSAWSKWFSPSLTHWSPHSAC	380582	375687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
655925	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_93525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
655927	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
655941	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_93903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	596	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
655948	contig_3252_pilon	+	3729	18	Intergenic	novelGene_61504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	104.828645811624	507	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	906	2721	83	2803	561225	739459	FALSE	35	GTCTGAGAAGCCAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWDWRRQSGGCRLRCSGFSVLALFAAEMTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKSAAGEFADDPCSSVKRGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGTEQDLGIQYKALKPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKANRDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGSGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSIQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI	535250	740385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_535331_561222_561330_563191_563388_595569_595737_596521_596642_604358_604629_607038_607243_675240_675322_676492_676646_705294_705388_718126_718284_725574_725776_726326_726479_730457_730569_731781_731964_732097_732204_733961_734097_739171
655954	contig_17440_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_7666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3600	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
655967	contig_7202_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_18637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
655975	contig_17936_pilon	+	2059	11	Intergenic	novelGene_29932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1047.56038489435	2	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	203	754	79133	106417	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTPTCHLLSLAAQKN	50602	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50673_68282_68391_79108_79300_90973_91161_95142_95298_106374_106472_111026_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125842
656002	SIRV6	+	1088	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
656007	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656017	contig_5968_pilon	-	1318	8	Intergenic	novelGene_112192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	442.451611559308	2039	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	395	1153	638341	622680	FALSE	20	AGTCTTGACTACTTGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732375	622514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700504_700743_732230
656020	contig_8354_pilon	-	1855	7	Intergenic	novelGene_24130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	638.918204641425	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	77	1030	513617	500805	FALSE	10	TGACTGTGACTTGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRDLPAADVHHPGGDGGHGARQRQGGPGLLHLPPVQWEGYLSAAAPLYAEAYYQASSQELQCHPPLREHLRGGDAHLRGGVTPPLPGPPRPHLSSFWTPFLRCDVSRHSFPALPHLPVPAPWPLGGDPHLC	513693	499979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500910_500951_501091_501670_501820_502359_502471_503634_503824_505824_505966_513497
656021	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656028	contig_6710_pilon	-	596	2	Intergenic	novelGene_89056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	15	CCTGATTTAGTGGTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656034	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
656040	scaffold_19766_pilon	-	1509	6	Intergenic	novelGene_34344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	721	junction_1	242.410065797607	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	216	950	622205	597156	TRUE	75	ACCAATAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGKSLSPSFPNSHP	622420	596424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153
656044	contig_7275_pilon	+	2238	6	Intergenic	novelGene_111246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	18.8997354478839	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	437	874	409102	409539	FALSE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	401684	410903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_402438_402473_405425_405485_406427_406555_408460_408563_409092
656052	contig_6344_pilon	+	1850	9	Intergenic	novelGene_157114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	77.3429861073388	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	207	1262	1176029	1215531	FALSE	5	GCTCTGTGTTTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALSNPGTLDLASLTCLLSEKAKEFLVENRVQTFYQQELEMVESLMALANQPVIHSACSNLVDFKNDTASQAIHSIFKNAIQLLQEKGLVFQKEDGFDNLYYVTREDKELHRKIHRIIQEDCQKPNHVEKGCHFLHILACARLSLSPGLSEAVLRQVLELLEDQSDIVSTMEHYYMAF	1175371	1216119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1175515_1175965_1176162_1179726_1179823_1195076_1195254_1196152_1196277_1198753_1198926_1204896_1205020_1208082_1208156_1215373
656064	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656067	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656069	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
656077	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656080	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_93543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656081	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
656084	contig_15720_pilon	+	941	5	Intergenic	novelGene_41907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	278503	279803	TRUE	15	TGGTGCCCCTGAGAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278500	281926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446
656087	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_94296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656088	contig_14925_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_55148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29828	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
656098	contig_18194_pilon	-	2282	2	Intergenic	novelGene_55940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	0	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	259	987	5370	4642	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	7162	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034
656100	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656103	contig_4413_pilon	+	1309	8	Intergenic	novelGene_116978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	77.3966723959059	1606	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	290	1030	126062	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDIRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	125772	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
656108	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_93899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657185	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657186	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656120	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
656143	SIRV7	-	310	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33258	1	39	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114699	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
656147	contig_14202_pilon	-	1856	2	Intergenic	novelGene_157134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4393	junction_1	0	93	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGATTTGTTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88601	86147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_87487_88084
656161	contig_990_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_76134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCCACCCCGATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629133	1629877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1629100_1629900
656177	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1180	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
656178	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656185	contig_7457_pilon	+	2718	13	Intergenic	novelGene_31561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	52.0807999383863	151	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	73	2106	859493	867405	FALSE	30	TTTATGGCTATATGTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRPYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDKAKVVVLVNRVHLVTQHREEFSRMLDGRWAIATLSGDMGPRAGFGHQARSHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELSDFSLLVVDECHHTHKDTVYNIILSRYLEHKLRRVWPLPQVLGLTASPGTGGASMLSGAIDHVLQLCANLDTWRIMSPQEHQPQLQEHIRQPCKQYDLCQQRSQDPFGDLLKKLMDQVHDYLEMPELSRDFGTQMYEQQVVELSREAAEAGLQERRVCAIHLRRYNDALLIHDTVRAVDALDALQDFYDRERATKIQVLLAERWLLALFDAHKNELTRLATHSPENPKLELLEHILQKKFGSSDNPRGIIFTRTRQSAHSLQLWLQQQPRMQTVDIRAQLLIGAGNSSQGIHMTQRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFSIYYTVSQKPVVIDRDFKDWSPGGTISCRNCGEAWGLQIIYKSVKLPVLQVRSMLFETPRGRLQAKKWSRVPFPVPDFNYVQHCAQNLRDLSL	859194	868017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_859661_859839_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862199_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_865537_865729_866783_866881_867222
656195	contig_11512_pilon	+	344	2	Intergenic	novelGene_43239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	4011	4566	FALSE	15	CTGCTTATAGTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAY	4000	4567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
656197	contig_3825_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_77947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1676	junction_3	772.057136630588	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAAGGTATGCATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12982	15675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_14198_14390_14471_14780_15302_15498
656200	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656201	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656203	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	508	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656206	SIRV5	-	478	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTACAGTAAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
656208	contig_10541_pilon	-	1973	9	Intergenic	novelGene_144647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	209.053222888335	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	373	1053	312553	266448	FALSE	85	ACCGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALFSHL	394551	265527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_266464_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_374167_374310_394487
656226	contig_6544_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_142097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGCTGTTGAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104695	103442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_103400_104700
656227	contig_7202_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_17492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGCCAGACGCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
656232	contig_854_pilon	+	1440	6	Intergenic	novelGene_36220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1321.10447732191	4	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	346	681	556203	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHPLLAVQPLLSLWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543481	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556248_557591_557752_562271_562405_563029
656233	contig_13428_pilon	-	2216	3	Intergenic	novelGene_143454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11.5	314	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	700	1101	152370	151969	FALSE	25	TGTTAAGTTTTGGATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILDFVPGDTDDTPGKSPSTRRMLEGHSGEMLVFIAIVLPEAHCQGASPVHFPRPRSSPLISGCVISPPAPEPLCSCRWPWRCLHTCSGSPGWATSLQASGSCRDCCCPNFTCSFPSNCQKSWAVLPVRAGS	157521	150853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_152685_152993_153193_157335
656239	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_89068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656263	contig_12113_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_134746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227525	229668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_227500_229700
656267	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656270	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_95692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656276	SIRV6	-	700	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8633	496	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGGCTACATGAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11180	1862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2474_2610_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035
656280	contig_10930_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_37092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1195	junction_3	7333.62426089584	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTTTTGTGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339418	342106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340639_340994_341098_341522_341625_342020
656283	SIRV6	+	293	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10531	2	1294	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11531	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
656292	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
656296	contig_4364_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_3929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533064	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
656310	contig_2703_pilon	+	2234	13	Intergenic	novelGene_101815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.7626204707615	150	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	220	1848	1112069	1144948	FALSE	20	AACTCCTTGTGACATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDVITKYSALHAKPGGLILQYGTAGFRTKAEHLDHVMFRMGLLAVLRSKQTKSTIGVMVTASHNPEEDNGVKLVDPLGEMLAPSWEEHATCLANAEEQDMQRVLIGIIEKEAVNLQQDAFVVIGRDTRPSSEKLSHSVIDGVTILRGQFHDYGLLTTPQLHYMVYCRNTSGQYGKATIEGYYQKLSKAFVELTKQASCSGDEYRTLKVDCANGIGALKLREMEHYFSQGLSVHVFNDGTKGKLNHLCGADFVKSHQKPPEGMEMKSNERCCSFDGDADRIVYYYRDADGHFHLIDGDKIATLISSFLKELLLEIGENLNIGVVQTAYANGSSTRYLEEVMKVPVYCTKTGVKHLHHKAQEFDIGIYFEANGHGTVLFSKVAEMKIKQLAKELEDNKRKVAKMLENIIDLFNQAAGDAISDMLVTEAILALKGLTIQQWDALYTDLPNRQLKVKVADRQVINTTDAERQAVTPPGLQEAINGLVKKYRLSRAFVRPSGTEDVVRVYAEADSQESADSLAHEVSLAVFQLAGGVGERPQPGF	1111223	1145334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1111441_1112066_1112273_1113658_1113844_1115799_1115868_1131020_1131155_1132005_1132202_1134417_1134576_1135866_1135951_1139440_1139540_1141092_1141207_1142192_1142316_1143687_1143862_1144858
656311	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91683	0	-91677	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTGAATGCAAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
656319	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACAGTCAGGACTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
656323	contig_3948_pilon	-	1413	9	Intergenic	novelGene_53314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	411.984147146465	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	230	853	1494311	1471793	TRUE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPQRQAGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKVSWSLHPWCVRLLTSAWHGLLRTMSIQLEKGPSSPSSGQLLKPSILAPSPLSQTSGPLVFC	1510994	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473289_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494218_1494313_1510766
656325	contig_9363_pilon	-	1863	10	Intergenic	novelGene_6813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	619	969	1624964	1624253	TRUE	25	AGGGGCAGGAAGTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHQHPSQVQEIAVMWVLHLHGTPGVAASPHRPGLTIPHYLARTHNCEGDAFLHLCILPLKVFILIRITVRELVDVDLLLLQLVPDLRGDRCRESEKHGQSETEHERQILPGQRQ	1625963	1622232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1622284_1622465_1622557_1622653_1622742_1622984_1623107_1623396_1623736_1624049_1624443_1624571_1624673_1624904_1625060_1625337_1625433_1625535
656332	contig_13481_pilon	-	3195	1	Intergenic	novelGene_119313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	842	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256633	253438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_253400_256600
656334	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_17513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
656335	contig_14322_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_115980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671607	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
656336	contig_7440_pilon	-	1170	9	Intergenic	novelGene_61155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	260.705503154421	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	6	716	71121	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	71126	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070
656357	contig_15835_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_157152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAAGAAAGCTAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9682	8431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15835_pilon_-_8400_9700
656366	contig_6740_pilon	+	1073	5	Intergenic	novelGene_142640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	53.6772763839597	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAAATAGTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10143	46955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_10227_11303_11447_19527_19605_44182_44288_46290
656371	contig_15325_pilon	+	1361	5	Intergenic	novelGene_157169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	644.858269311947	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	493	888	94466	95831	TRUE	25	TTGAAATATTGTTGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGRFSLFEEKFVTRPW	93227	96608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94567_95094_95233_95674_96245_96548
656382	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_95044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656383	contig_7695_pilon	-	2280	13	Intergenic	novelGene_41636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	176.166646956795	6	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	21	1235	791407	716166	FALSE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLKKLVMLKEMDKDLNSVVIAVKLQGSKRILRSNEIILPMSGLVETELQLTFSLQYPHFLKRDANKLQIMLQRRKRYKNRTILGYKTLAVGLINMAEVMQHPNEGALVLGLHSNVKDVSVPVAEIKIYSLSSQPIDHEGIKSKLSDRSPDIDNYSEEEEESFSSEQEGSDDPLHGQDLFYEDEDLRKVKKTRRKLASTSAITRQPNIKQKFVALLKRFKVSDEVGFGLEHVSREQIREVEEDLDELYDSLEMYNPSDSGPEMEETESILSTPKPKLKPFFEGMSQSSSQTEIGSLNSKGSLGKDTTSPMELAALEKVKSTWIKNPDDSLTETDTLEITDQDMFGDISTSLIVPEKVKTPLKSSKPDLQGSASPSKVDVVHTPRQKRESCPPRPQQVSPCPPSSPEGHLVF	791427	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716241_739768_739806_739990_740107_743270_743352_748526_748621_748969_749131_750021_750082_753251_753333_753419_753512_753758_753904_758792_758919_759647_759738_791350
656385	contig_11855_pilon	-	3003	16	Intergenic	novelGene_67030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.745122884972	227	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	120	1943	1937414	1910482	FALSE	20	AAGTCTGTTTCATCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVRRFGTATEAATEPAGATVPTAAAAAARIGTIGPQPPAMPRRKRNAGSSSDGTEDSDFSTDLEHTDSSESDGTSRRSARVTRSSARLSQSSQDSSPVRNLQSFGTEEPTYSTRRVTRSQQQPTPVTPKKYPLRQTRSSGSETEQVVDFSDRETKNAADHDESPPRTPTGNAPSSESDIDISSPNVSHDESIAKDMSLKDSGSDLSHRPKRRRFHESYNFNMKCPTPGCNSLGHLTGKHERHFSISGCPLYHNLSADECKVRAQSRDKQIEERMLSHREDDNNRHATRHQAPTERQLRYKEKVAELRKKRNSGLSKEQKEKYMEHRQTYGNTREPLLENLTSEYDLDLFRRAQARASEDLEKLRLQGQITEGSNMIKTIAFGRYELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSISVFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKNSFLNYNVSCILTMPQYMRQGYGKMLIDFSYLLSKVEEKVGSPERPLSDLGLISYRSYWKEVLLRYLHNFQGKEISIKEISQETAVNPVDIVSTLQALQMLKYWKGKHLVLKRQDLIDEWIAKEAKRSNSNKTIPFTLDFILL	1937533	1909421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1910513_1911056_1911116_1911748_1911856_1912484_1912632_1914058_1914153_1915280_1915422_1915657_1915748_1917914_1918107_1919633_1919745_1922355_1922455_1923983_1924074_1927210_1927294_1931559_1931800_1933180_1933358_1934848_1934997_1937399
656390	contig_5057_pilon	-	1265	8	Intergenic	novelGene_151518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	533.839194621644	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	139	732	523331	507037	FALSE	30	ATCTCTTAAATATTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFEDASSGLRDSDRAFWVQQLGRKTFSGAGGPQDVRTGTIILGTWYMVVNLLMAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523546	506503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523328_523368_523444
656409	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656411	contig_2537_pilon	+	1783	12	Intergenic	novelGene_33410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_11	171.616379807354	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	88	909	205895	233721	TRUE	30	ATGATGAGGTAAAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGPGRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADGKFLLWGFDSLRLKHSKLVGWCMDYLWLLRNSKMIFLFYV	205807	235580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480
656417	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656418	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_93270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTGGTTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
656426	contig_11590_pilon	-	2630	1	Intergenic	novelGene_125600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749554	746924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_746900_749600
656427	contig_5690_pilon	+	598	6	Intergenic	novelGene_119715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	274.853124413749	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	79	564	1044729	1088260	FALSE	40	CGAAAAACATGTGGCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVGH	1044650	1088294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077686_1086452_1086568_1087638_1087791_1088251
656430	contig_11512_pilon	+	1831	9	Intergenic	novelGene_43265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.3292000769773	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	344	1693	358011	471553	FALSE	10	TTGGTGACTCTGACTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLMECYWEVAEDEAGRYGIKSWARPGSSDVSGNWGLMDQVAALSWVQTHIREFGGDPQRVSLAADRGGADVASIQLLTTRAVNARLFRRAVLMGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357667	471691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_358090_358498_358702_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
656438	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656441	contig_753_pilon	+	2278	14	Intergenic	novelGene_112884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	62.4419256817103	10	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	12	1703	218165	243501	FALSE	25	GGTTATTCAAGTTTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGHDLFRRLGAGAKFDVKRFSSDAARFQLGKRKRDFNSSEVLQGLDFFGNKKSVPGKYGASRTHQELQDEEKQEEKLIERKRKQNKKKRKMMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIVGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSKQKKKMIKKPLERESISTTPKYFLEKAKDKRKKVTG	218153	244076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_218252_219571_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236184_236308_236440_236592_236760_236840_238494_238588_243482
656443	contig_10082_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_63861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGGCTCAGGACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196909	197454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_196900_197500
656458	contig_10352_pilon	-	2440	9	Intergenic	novelGene_49603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1200	1664	34297	32965	TRUE	10	GCCGCCTCTCAACTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPASPQPLLPQGESQPGLEALARHLCIRNGAAATCSTECMSSAVPLAHGAGGRGAHGAARDCCLLQPGGGRVYFSVSDSCKTCWSSASSSCSRSSRSSSSLAESSMASCKSLSKRLVSLGVPGHRPSELVRRLSWMAPLILGIIGMCLADPSI	35496	16208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_16266_22744_22817_23719_23783_24829_24964_25655_25810_26498_26611_29267_29432_32944_33015_33882
656474	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656484	contig_15047_pilon	+	1271	6	Intergenic	novelGene_52253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	127	402	3242	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2719	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
656508	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	1093	13	-1093	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGTTTCGGTTCGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
656510	SIRV4	+	225	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1546	632	1091	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2546	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
656513	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656519	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656520	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656524	contig_17198_pilon	+	2604	2	Intergenic	novelGene_62353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	346	junction_1	0	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	57	587	708294	715670	FALSE	40	AAAAAAAGATTTTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSFRAQDGTRTPAVWLCLMCLQGLGKSLTQGGYDMVQKLFLDFFRRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEQQEEKREIKRRLTRKVRRFSRPDGCGWRGCGPPTTPWASVGLGGMQLPGPLEGGVPALLLNVRTCSSLTCRTPPGHCGLVSLGTPAPSGLQPSLWLDSGTSTYLKKWIQWHFVFNYSFQFKNSL	708237	717687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_708433_715278
656526	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_96787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656528	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_89086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656533	contig_854_pilon	-	1795	7	Intergenic	novelGene_36174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.414679685543	2	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	822	1394	471014	470442	FALSE	25	AGCTCATGATCCAACTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	509288	470040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471229_488597_488655_491436_491556_493019_493197_495173_495239_497487_497571_509182
656534	contig_12923_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_30190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATTTGAACCACCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508401	507884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_507900_508400
656541	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_90549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653845	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656548	contig_12756_pilon	+	1767	10	Intergenic	novelGene_153201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	111.70110027421	379	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	375	1181	47123	64000	TRUE	25	GTTGTTTGGATTTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAGFATNSNQKTKPVAVESIPTHCLPTGQSRTAP	46748	66931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_63902_64092_66436
656556	contig_9389_pilon	-	2065	3	Intergenic	novelGene_84053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	68.5	258	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCACACGGTTCTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748567	743340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_745152_746766_746919_748465
656558	contig_753_pilon	-	2192	12	Intergenic	novelGene_112939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	91.5467635547831	361	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	231	1931	841832	731406	FALSE	20	CGCCGACTGAGTTCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQPLALQLEQLLNPRPREADPEADPEEATAARVIDRFDEGDDEEGDFLAVGSIRKLASASLLDTDKRYSGKTTSRKAWKEDHWEQALPGSSDEEIPDKEGSGDGDSEGLGLEESDEDHMSAAEEQESGDDGENGLARRKRSRHRSAKTPGFSVQSISDFEKFTEGMDDIGSSEEEEGEEEESGMEEGDGEIDFEGESEEDRAENRNSEDDGVVMTFSGVKVSEEVEKGRAVKNQIALWDQLLEGRIKLQKALLTTNQLPQPDVFPIFKDKGGPEFASALKNSHKALKALLRSLVDLQEELLFQYPDTRYLVDGTKPKAESEEEISSEDDELVEEKQRRRAPPKRKLETDDYPSFMAKRFADFTVYRNRTLQKWHDKTKLASGKLGKGFGAFERSILTQIDHILMDKERLLRRTQTKRSVYRVLGRPEPTAEPVPESLPGQPEILPQAPANAHLKDLDEEIFDDDDFYHQLLRELIERKTSSLDPNDQVAMGRQWLAIQKLRSKIHKKVDRKASKGRKLRFHVLSKLLSFMAPIDHTTMNDDARTELYQSLFGKLNPPGDSHRN	842062	731144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_731470_754678_754751_764070_764152_766291_766360_800800_800885_802202_802368_802884_803084_804441_804557_837241_837380_837855_838288_840540_840733_841741
656563	contig_9354_pilon	+	1378	4	Intergenic	novelGene_108048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	80.4832625802133	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATATTACAGTAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111612	117853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_112119_115831_115906_116127_116202_117129
656569	SIRV5	+	379	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1152_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
656575	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656580	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656581	contig_14322_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_116112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
656585	contig_15434_pilon	+	1424	9	Intergenic	novelGene_56689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	492.317923195977	1546	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	702	1244	31167	33302	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26566	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_29080_29589_29650_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
656590	contig_8681_pilon	+	1397	6	Intergenic	novelGene_157193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	69.0871912875317	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	128	679	54812	104297	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISQSRISHWLLQQGSDLSEQKKRAFYRWYQLEKTSPGATLSMRPAPIPIEDPEWRQTPPPVSATSGTFRLRRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEIANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIEAAILESHGIDVQSPGGHSNSDDVDGNDYSEQDDSTSHSDHQDPISLAVEMAAVNHTILALARQGANEIKTEALDDD	40536	105015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_40650_54797_54952_99493_99577_101047_101144_102008_102104_104159
656593	contig_12270_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_114134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTCCCTGACCGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656596	contig_9290_pilon	+	1893	3	Intergenic	novelGene_77563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	2.5	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1125	1499	501445	502040	FALSE	30	GCAACTGTGTCTTAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLPSTQVMVWKGVARTLSFSLITTSSRGCSFLSKTRVVQEHGGRAVIISDNAVDNDSFYVEMIQDSTQRTADIPALFLLGRDGYMIRRSLEQHGLPWAIISIPVNVTSIPTFELLQPPWTLW	498237	502434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_498437_500519_501699_501919
656598	SIRV7	-	298	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91624	4	-91618	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTAGTAGAGTGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
656600	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656604	contig_11752_pilon	+	1442	9	Intergenic	novelGene_37642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1564.71339228627	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	33	1028	84194	96485	TRUE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQSKIRQEFLSDQGGQL	84161	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88670_88776_92873_93060_94223_94414_96442_96572_100956_100976_105597
656606	contig_11850_pilon	-	1316	5	Intergenic	novelGene_125193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	941	junction_2	806.619334010784	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	512	970	184660	181211	TRUE	35	GTATAAAAATGTATTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	185171	179686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182664_182765_183240_183373_184501
656616	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656621	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
656625	contig_7707_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_72170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAGAGATAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515900	515546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_515500_515900
656637	contig_14651_pilon	-	2202	12	Intergenic	novelGene_157217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.3501825331583	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	760	1275	106188	87171	TRUE	45	TAAATTGAATTGAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDVATNVLQAKVIAAAGNEQKCKLAMQRGAQSSVNYSQGSLKEAVRKLVGSGGVNVVIDTVGGDVFLEALRSLAWEGRIVVVGFAGGTIASVPANVLLLKSISATGMSWGQYKNKNFSLFSSILSSVLRYCQQGRIQPYIGAEFKLEEVNDAFLHVTRRKSTGKVLLSLK	112667	84607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_84883_86518_87240_97825_98055_100098_100281_106152_106235_107093_107204_107563_107696_107844_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
656641	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656647	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	444	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656648	contig_5023_pilon	-	2161	2	Intergenic	novelGene_7386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642792	640130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_641516_642016
656650	contig_7357_pilon	+	2332	9	Intergenic	novelGene_36894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	74.3853984327569	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1065	1943	260068	273311	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	259003	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
656662	contig_9197_pilon	+	1390	3	Intergenic	novelGene_154351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_1	14	3343	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGTTGAAAGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52286	93162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92373
656663	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842797	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
656671	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_90999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656680	SIRV5	-	297	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
656681	contig_12864_pilon	-	1121	6	Intergenic	novelGene_76413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	500.798402553363	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	98	523	251936	242831	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252146	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245849_251926_251999_252111
656690	contig_211_pilon	-	2110	3	Intergenic	novelGene_129867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	1	329	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	649	969	150748	150428	FALSE	15	CTGTCGAGTTGACTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPTPKSGYMDQAQEGLQLLAQAALQMGAIAAMLVTESEEAEKVAALVQTMQVNLNQTILHTQRTQEVIRSLLIEPQMPAVFRSVGRRARRTRAHPTPSHLWQDL	153236	149286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_151097_152558_152676_153053
656693	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	23	367	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14431	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
656694	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_94867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656697	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	40	TTTAACTTTAATCATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
656708	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656714	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
656717	SIRV7	-	171	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76969	0	43750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
656721	contig_2227_pilon	+	1781	2	Intergenic	novelGene_142346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTAGCTCAGCATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261041	263008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_261538_261723
656730	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	268	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656732	contig_7622_pilon	-	2530	9	Intergenic	novelGene_132426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	288.157834354716	36	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	656	1072	280545	274465	FALSE	30	ACTAATCAATTTTTGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGM	296615	273006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_274674_276552_276758_280542_280606_280692_280751_282438_282530_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529
656752	contig_16724_pilon	-	1826	8	Intergenic	novelGene_105290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	704.850888848276	1563	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	290	1006	569099	541872	FALSE	25	GGTATGAACCTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575944	541051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
656755	contig_2419_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_137132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCAGCACGTAGTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149399	151539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_149400_151500
656756	SIRV5	+	468	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-141	878	-27	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8174	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
656758	contig_14322_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_115684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	30	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGCTGGTGTAAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671891	671270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
656763	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656773	SIRV3	+	966	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5343	-1	3284	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7287	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
656775	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656776	contig_7025_pilon	+	2444	2	Intergenic	novelGene_104367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGGGGAAACAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46946	49589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_48432_48630
656787	contig_18184_pilon	+	2910	4	Intergenic	novelGene_123853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_2	30.5759527879163	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	275	2380	48717	62430	FALSE	25	GTAAACCTTCTCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGDSPSLVAGGLFIIHTGGKTYQCKEYIETFSEVPSFDIYHRLYSKEKSVTCSECGKGFRYISGLRNHHRVHMGKNYYMLDGCGKEVSQSSHLQTYLNAHTLEKPHKCEECGKRFRHRATLNVHYKGHTGVKPYNCEECGRGFMYPSHLREHQRIHTGERPFRCDTCGKNFHRRAALNTHCMVHTGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSIRSNLQTHRRIHTGEKSYNCEECGKVFRQAVHLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHSKEKPYKCEECGKYFGTRQNLQVHFRIHKGEKSYNCVECGKCFRQSAHLLTHQRVHSGEKTFKCEECGKYFRNRSNLQTHHRIHTGEKYFNCVSGPYSWGFSSLCRNSKSGLLL	37568	62960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37780_48653_48732_55969_56097_60466
656788	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
656795	contig_6710_pilon	+	559	2	Intergenic	novelGene_93045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATACACAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657792
656800	contig_12622_pilon	-	1674	14	Intergenic	novelGene_6026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	341.769914644652	9	56	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	317	1300	1690387	1685486	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVQSCAIPAVPTAAAPVLGAPKRGSSPAGRDPVPPRARQAAEFPPILRLPPRLRLQAPALLVGGPTFQPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCILLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691277	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687858_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690866_1691072
656801	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656803	contig_14441_pilon	+	863	4	Intergenic	novelGene_100406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.537421698773	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67564	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67726_121809_121872_125517_125902_126489
656804	contig_7202_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_18608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGCACGCTGAGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
656809	contig_18869_pilon	-	197	2	Intergenic	novelGene_56421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAACACGGAGAGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79418	75634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_75766_79352
656816	contig_9345_pilon	-	2322	4	Intergenic	novelGene_24718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	4.92160768674447	210	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	57	713	1015290	1012741	FALSE	0	CTCTGCTGGCTGCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVRGWERLLYCVAAAGAMSRVSVPCHVKGTVALQVGDVRTSQGRPGVLVIDVTFPSAAPFELQEIVFKNYYTAFLSIRVRQHTSIHTPAKWVTCLRNYCLMPDPHSEEGAQEYVSLFKHQMLCDMARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEVSPTLGKNHLRMALVSSTGPGGPLSARIWGWTQGPPLSLCHLPAGYLLLDHGI	1015346	1011131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012975_1013434_1013549_1013799_1013977_1015158
656826	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	59	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
656836	contig_5482_pilon	-	2102	4	Intergenic	novelGene_144478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	82.4028046987614	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497983	483509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_485350_494097_494178_497265_497370_497905
656844	contig_2100_pilon	-	1289	10	Intergenic	novelGene_50676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	833.95707027504	6	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	84	1094	1182812	1170114	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTAQTRTAGPSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185494	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170201_1173314_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
656847	contig_12250_pilon	-	1058	10	Intergenic	novelGene_80714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	361.013833051202	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	360	365	399874	399869	TRUE	25	CCCATCAACCCAAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEGSRKGLSGRRGSEKPRASPTLLQPLTRVEVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPHM	401199	398583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399883_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401101
656849	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656853	SIRV6	+	1033	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	162	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	40	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	162	656	1733	10736	TRUE	45	TATGGGGAAAGAGCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1465	11326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
656860	SIRV4	+	215	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1556	632	1101	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2556	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
656861	contig_6102_pilon	-	2924	11	Intergenic	novelGene_32024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	112	junction_1	65.3103360885549	488	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	120	1520	545300	514588	FALSE	25	TTCTTGAGCCTGCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTAAARFFGAKHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNLYREGSSIGAIDTKLDWSHNFTNMLGYTDAQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQEVLVWLTQLQKEVGKDVSDEKLRDYIWNTLNSGRVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPNDPMFKLVAQLYKIVPNILLEQGKAKNPWPNVDAHSGVLLQFYGMTEMNYYTVLFGVSRALGVLAQLIWSRALGFPLERPKSMSTDGLIKSVDSKSG	545419	513183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514759_515065_515276_515614_515717_515835_515966_516535_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_545258
656863	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
656864	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
656883	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_97519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
656885	contig_14970_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_45092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGAACTGTCCTCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229613	227555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_227600_229600
656887	contig_8284_pilon	+	1274	10	Intergenic	novelGene_125704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	427.346102542219	83	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	233	1000	426599	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425061	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425283_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
656888	contig_6497_pilon	-	2277	5	Intergenic	novelGene_35582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	76.637131992266	230	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAATGTATTTACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282914	270632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_272299_273713_273898_274374_274569_281124_281185_282741
656894	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656900	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
656901	contig_5988_pilon	-	1625	4	Intergenic	novelGene_15938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	3	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	96	1451	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
656907	contig_11677_pilon	+	2319	12	Intergenic	novelGene_85898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	104.321578475104	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	318	1346	465595	468268	TRUE	15	TTTATGCCCACCCCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKELLAVACEQFLGKNVQDIKNVVLQTLEGHLRSILGTLTVEQIYQDRDQFAKLVREVAAPDVGRMGIEILSFTIKDVYDKVDYLSSLGKTQTAVVQRDADIGVAEAERDAGIREAECKKEMLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVHRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKGEAERMKLKAEAYRKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIASPLTKVDEIVVLSGDNSKVASEVNRLLAELPACVHALTGVDLSKVYP	452030	469539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_452165_458896_458979_464465_464558_465585_465710_466156_466276_466393_466508_466607_466728_466816_467032_467449_467634_467997_468150_468258_468551_468848
656908	contig_5758_pilon	+	2629	4	Intergenic	novelGene_119139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.0530980618818	344	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	742	1143	667401	667802	FALSE	30	TTTAAAACTGTGTACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCACFSALWECWLGSEPAEGCGCCRRGLGRPVFWCDVALSAHHIESHGMVFLHGVIMLHFKLNLQMLSCLLSVPALAGPMHRVNCLRRAKVLSVLRNSSMDGAEFTLLPLSHRVVAFAEAMAESTASPGCWD	652332	669288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_652360_662397_662515_662912_663018_666908
656911	contig_5023_pilon	+	1097	6	Intergenic	novelGene_7222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2710.81822334143	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	88	606	607279	647811	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTHTHTHIQPDVTGKMNTSWMRLG	580841	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611774_647737
656913	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_17633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
656914	contig_6710_pilon	+	515	2	Intergenic	novelGene_97772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCACAGTGATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653399	657174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653884_657143
656922	contig_6589_pilon	+	1349	8	Intergenic	novelGene_26030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	990.541472207633	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	326	835	1726977	1730048	TRUE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGESYYEPYR	1725377	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725798_1726965_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730018_1730152_1731406
656923	contig_7078_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_130123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAATAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52591	54027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_52600_54000
656942	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
656956	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	453	1	222	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724
656964	SIRV7	-	422	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33145	2	-74	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114812	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
656967	contig_17281_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_105198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	738	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACATGGTACTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2242	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2200_3500
656971	scaffold_12124_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_22417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	99	392	1509112	1509405	NA	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1509013	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1509000_1510600
656972	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	94	11	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
656977	contig_9363_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_6484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGCGTATTTAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370315	368628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_368600_370300
656994	contig_16461_pilon	-	277	2	Intergenic	novelGene_139216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTACACTCTCACCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929	433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
656998	contig_10940_pilon	+	3313	14	Intergenic	novelGene_49293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_12	87.784229824708	506	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	826	2481	1	2481	996290	1057794	FALSE	35	ACAAAGTTGGTTTAAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGRQDGGGGGSSVRSLEARRVPLKRAAMALHSPQYIFGDFSPDEFNQFFVTPRSSVELPPYSGTVLCGTEAADELPDGQEYQRIEFGVNEVIEPSDTLPGTPSYSISSTLNPQAPEFILGCTTSKKIPDDLDKEANYSSIEYQYPGSPLALDTSSNVEAEVLENDGVSGGLGQRERKKKKKRPPGYYSYLKDGSDGSISTDTLVNGHAHPAVPNNVSTEDAEFMGDMPPSAAPRTCNSPENSLDFVSDSLPDRPFPRALDSHARTAGQPELCHLTNFEQACLSAEAGGDGLLRTAVAQPYVGTDTTENLGVANGQILESSDEGPAANGVELHMESTDSEPAQPQSVSPPADLVASAAGSALTSQPAKSWASLFHDSKPSSSSPMAYVETKYSPPATSPLVSEKQVEVKEGLVPVSEDPVAIKIAELLETVTLIHKPVSLQPRGLINKGNWCYINATLQALVACPPMYHLMKFIPVYSKAQRPCTSTPMIDSFVRLMNEFTNMPVPPKPRQALGDKIMRDIRPGAAFEPTYIYRLLTVIKSSLSEKGRQEDAEEYLGFILNGLHEEMLNLKKLLSPNNEKLTVSNGPKSHLVNEEEQEEQGEGSEDEWEQVGPRNKTSVTRQADFVQTPITGIFGGHIRSVVYQQSSKESATLQPFFTLQLDIQSDKIRTVQDALESLVARESVQGYTTKTKQEVEISRRVTLEKLPPVLVLHLKRFVYEKTGGCQKLIKNIEYPVDLEISKELLSPGVKNKNFKCHRTYRLFAVVYHHGNSATGGHYTTDVFQIGLNGWLRIDDQTVKVITQYQVVKPTAERTAYLLYYRRVDLL	996289	1058626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_996395_1016193_1016263_1025108_1025170_1031399_1032441_1041374_1041467_1041956_1042067_1042451_1042508_1042721_1042826_1043938_1044039_1046223_1046402_1049234_1049401_1052683_1052829_1054301_1054368_1057606
657011	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTCGGAGGCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
657013	contig_15039_pilon	-	1541	6	Intergenic	novelGene_110144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_5	511.353106962302	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	158	781	200602	185257	FALSE	45	AAGGAAAACCAGAATGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLINSGRRGRRRRGRSELGFGGLTCPHSPAATGGGGQRVRRREPPPGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260918	184496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_260778
657034	SIRV7	+	249	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCTAATTTGGCACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147693	147942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
657039	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657042	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	51	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657044	contig_12620_pilon	+	2713	14	Intergenic	novelGene_98800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	46.9737431378286	166	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	107	2410	165660	385145	FALSE	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLTGALRSFSNVTKQDNYNEEVADLKTKRSKLYEKNLDLGLTWKKIVKFLNENLDKNEVQTVNEDLKDILQAAKQIVGMENGREAVESGAAFLFKTFYLKNFVGHKETKAIKQMFGPFPSSSATAACNATSRITSHFSEVNLTALVRMTEEENREGVLFGKNIAFSFDMHDLDHFDELPINGDAQKIISLDYQKFLNERFQERCTPEVKPVEKANGSFLWCEVEKYLNATLKGMTEAPRIEDLCCTLYDMLASVKSGDELQNELFELLGPEGLELIEKLLQNRIMIVDRFLNSSNDHKLQALQENCKKILGENAKHNYGCQVTIQSEQEKQLMKQYRREEKRVARREKKAGEDGEVSGEGLMCFDPKELRMQREQALLNARSFPVLSRPREMGIEKIRYPHVYDSQAEAMKTSAFIAGSKMILPEGIQRDNNKIYEEVKIPYSQPMPVGFEEKPVYIQDLDEIGQLAFKGMKKLNRIQSIVFETAYNTNENMLICAPTGAGKTNIAMLTILHEIRQHLQQGVIKKNEFKIVYVAPMKALAAEMTKYFSRRLEALGIVVKELTGDMQLSKSEILRTQMLVTTPEKWDVVTRKSVGDVALSQIVRLLILDEVHLLHEDRGPVLESIVARTLRQVESTQSMIRILGLSATLPNYLDVAMFLHVNPYIGLFYFDGRFRPVPLGQTFLGIKSANKVQQLNNMDEVCYESVLKQVKAGHQVMVFVHARNATVRTAMSLLERAKNNGHIPFFLPTQGPDYGHAEKQVRNK	156589	385448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_156661_165624_165750_168525_168677_184216_184777_238339_238461_249886_250095_250788_250931_251701_251828_283081_283283_283739_283881_319915_320081_334713_334891_337499_337572_384995
657047	contig_20596_pilon	-	3373	1	Intergenic	novelGene_157231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTTCTATCCACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83379	80006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_80000_83400
657050	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657051	contig_7057_pilon	-	3024	7	Intergenic	novelGene_123369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	10.1324561023804	95	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	894	2351	1064401	1062944	FALSE	30	CTACAAGTACTCTTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMGNHSSILTKRQLILESNPIIQVGRLSVIMKCLFSIRRWKLQHSHLDIMNMRSLSLKRGGLITHNRAYRGGNPSEYSKRRRATNIEKKHTCTECGKSFCRKSVLILHQGIHTEEKPYQCHHCGNAFRRKSYLVDHQRTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGERSYECSECRNAFRLKSHLIRHQRTHTGEKPYECNECGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKPYICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICNECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYICSECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECSQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCNECGKCFRQKTNLIVHQRTHTGEKPYICNQCGKSFSYKRNLIAHQRTHKGENTEVQ	1093105	1062270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1064663_1068397_1068485_1071545_1071673_1081335_1081484_1089797_1089872_1092086_1092185_1093007
657067	contig_14322_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_116457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
657069	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
657070	SIRV2	-	379	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3846	451	2667	-451	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGTATTTATAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2065	1486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973
657072	contig_8453_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_125121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAGAAAAAAAAAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185249	187444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_185200_187400
657086	contig_4964_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_157253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACATATTCAGCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115106	116031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_115100_116000
657087	contig_13612_pilon	+	1549	2	Intergenic	novelGene_157276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	259	693	31532	31966	TRUE	35	TGGTCAACTCATGACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWEFSQQKFHFSITVPKLKSQTCLLIYSKIALMVFRAGLIVCRPEWTCHRNGHSTRCPYQVSTLGSFSAMVPILTSEPCLCRPHSLVCSSLPLHIPLVTQDLFMPLLSSAHLLKANKARDGNTKDKSLIFKGLLYASSEVPGH	31273	33558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_32626_33361
657092	contig_4732_pilon	-	2270	10	Intergenic	novelGene_75455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	84.5221864364618	374	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	70	2085	684664	676533	TRUE	0	GCCCTGCTTTGTGTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEHQDFWSLQAKFQASQPEPSEFPKKPPKLEFNKLPKKFPQPESGEHPKKPSQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKFPPLEACPFPKKHEFSAGPKKASQPEFNAGPKKASQPEFSAGPKKFPPLEACPFPKKPEFSEAPQKPLQPEPSNPTRLPSEPKFSALPRKPWPPESSEATLKPPQLEVGTFSKKPPQPESGVHPWKPLLQPELSEAPQTPPLRPEPSEPHPHPSKPELGAFPKKGLQPQLGNCPRKSPEPKFSDLTRTASDPKFGVFPKKPQQPERQALLKKTPQAELGTLPRTSSEPEVNLLPSKFLQPEGHRPSHSFSQHDAGSLPRKHPQARFFGDFPQRPPLPNSVSESSLPTATGGLSPRFPLSPGFGARLAGQLRPGALLAHSGGVRLGLGPGHPPRRRPLPPVSSLGPPPIKPPLPPGPPDMQSFQRPSMEAATALWRSHSATVINFQAQQPKAIPQEPDQIYEVSDTYDNAGLEDSSPSPRSRDEVPAPQQVPRKPPQDPEPRKEKAPQTQQLPPMDQKTLKQMRKAEKAEREFRKKFKFEGGDCDSDEDDDRPQRQDPPWGRQAPGDPAWGDPGGDRVHQQGGDAVPRHQGQIRLRPQDSSAPPGNGGV	684733	676222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_676391_676515_676551_676633_676668_676740_676905_677041_677151_677261_677320_680440_680524_680593_680661_680750_682231_684661
657097	contig_18272_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_7081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATAAAATTAAAATCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530589	530005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_530000_530600
657098	SIRV5	-	381	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTTTCAGTAGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
657099	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
657100	contig_6710_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_92923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
657103	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657115	contig_12620_pilon	+	2737	14	Intergenic	novelGene_98799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	61.6909648808397	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	130	2433	165660	385145	FALSE	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLTGALRSFSNVTKQDNYNEEVADLKTKRSKLYEKNLDLGLTWKKIVKFLNENLDKNEVQTVNEDLKDILQAAKQIVGMENGREAVESGAAFLFKTFYLKNFVGHKETKAIKQMFGPFPSSSATAACNATSRITSHFSEVNLTALVRMTEEENREGVLFGKNIAFSFDMHDLDHFDELPINGDAQKIISLDYQKFLNERFQERCTPEVKPVEKANGSFLWCEVEKYLNATLKGMTEAPRIEDLCCTLYDMLASVKSGDELQNELFELLGPEGLELIEKLLQNRIMIVDRFLNSSNDHKLQALQENCKKILGENAKHNYGCQVTIQSEQEKQLMKQYRREEKRVARREKKAGEDGEVSGEGLMCFDPKELRMQREQALLNARSFPVLSRPREMGIEKIRYPHVYDSQAEAMKTSAFIAGSKMILPEGIQRDNNKIYEEVKIPYSQPMPVGFEEKPVYIQDLDEIGQLAFKGMKKLNRIQSIVFETAYNTNENMLICAPTGAGKTNIAMLTILHEIRQHLQQGVIKKNEFKIVYVAPMKALAAEMTKYFSRRLEALGIVVKELTGDMQLSKSEILRTQMLVTTPEKWDVVTRKSVGDVALSQIVRLLILDEVHLLHEDRGPVLESIVARTLRQVESTQSMIRILGLSATLPNYLDVAMFLHVNPYIGLFYFDGRFRPVPLGQTFLGIKSANKVQQLNNMDEVCYESVLKQVKAGHQVMVFVHARNATVRTAMSLLERAKNNGHIPFFLPTQGPDYGHAEKQVRNK	156585	385449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_156680_165624_165750_168525_168677_184216_184777_238339_238461_249886_250095_250788_250931_251701_251828_283081_283283_283739_283881_319915_320081_334713_334891_337499_337572_384995
657121	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657126	contig_12270_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_114139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGGGCATCTGGGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14419	13966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
657129	contig_15063_pilon	+	1270	4	Intergenic	novelGene_14316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	8	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	311	1132	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34848	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
657139	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_16884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657143	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657146	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
657149	contig_6316_pilon	+	1947	14	Intergenic	novelGene_134696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_5	166.760821530817	855	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	288	1625	144118	157164	FALSE	35	TTTTTTTTGAGTAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPLEASHSVEEDTHPSHYLEARSLNERDYRDRRYIDEYRNDFCEGYVPRHYHRDIESGYRVHCSKSSGLSRKSSLKRKHNRHCSSHHSRSKSHRRKRPRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136264	157486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_144111_144171_145291_145515_146617_146709_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
657150	contig_5643_pilon	+	1127	8	Intergenic	novelGene_39027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	565.359990065929	88	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	143	529	631341	634861	TRUE	10	TGTGTAGCCTCTACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSERWYHGHMSGGAGRDTATGQG	631198	641603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635421_641130_641244_641412
657160	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657175	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
657180	contig_1450_pilon	+	2608	3	Intergenic	novelGene_27424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	208	1158	422303	423253	TRUE	35	CCCAAGTTTTTTCAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419703	425071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419902_422293_424550_424917
657181	contig_3612_pilon	-	2456	1	Intergenic	novelGene_87836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTGTTCTCTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970026	967570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_967600_970000
657183	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
657188	contig_11846_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_105985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCCTTAAGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343573	345901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_343600_345900
657194	contig_20006_pilon	-	1115	4	Intergenic	novelGene_157305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	184	junction_2	429.176990167098	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	384	797	54562	52390	FALSE	35	GAAATCGTTAACTTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLRGPSRSNVVKILREYLEVEWEVKKGSKRSFSRDVMKGSNLKVPQQNNFSDCGVYVLQYVESFFENPILNFELPVNLANWFPPPRMRTKREEIRNIILKLQEDQCKEKKKHKDTYSIESSLGEGTEQYVSSIPD	56569	52071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20006_pilon_-_52600_54252_54404_54509_54579_56202
657197	contig_2646_pilon	-	2302	9	Intergenic	novelGene_69621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	479.986181441716	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	1057	2148	2072023	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2073079	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070772_2071068_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890
657200	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657203	contig_14986_pilon	+	1747	2	Intergenic	novelGene_59736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	229	1278	151004	152053	FALSE	15	GCATAATGTGTCTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150355	152522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150537_150956
657218	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
657219	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657220	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657227	contig_15486_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_157307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATACACATATACGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15307	14272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_-_14300_15300
657239	contig_9345_pilon	-	863	2	Intergenic	novelGene_24591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	2045	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	215	652	945468	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945682	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
657248	contig_8978_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_49405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	330.732333682708	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	62	1015	339807	347248	FALSE	25	TATAGATTTTCATTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331601	347800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341026_343405_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
657272	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
657275	contig_4364_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_4586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2075983	2077577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2076000_2077600
657276	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
657281	contig_5286_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_157337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGAACACTGACTACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502107	501208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_501200_502100
657293	contig_14838_pilon	-	1490	3	Intergenic	novelGene_151907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.5	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	393	1298	109967	109062	FALSE	10	CATTGTGGTCTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112892	108869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110129_111361_111461_112760
657295	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
657296	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_89069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657298	contig_11752_pilon	+	1297	9	Intergenic	novelGene_37601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1344.81020384848	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	107	967	84194	96565	TRUE	35	ATATAAAGATGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHACWHLLFGWQGD	84087	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94284_96530_96572_100956_100976_105597
657301	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657305	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657318	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
657320	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_16629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27851	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657321	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657326	contig_14546_pilon	-	2626	1	Intergenic	novelGene_157438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506636	504010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_504000_506600
657333	contig_3602_pilon	-	1628	10	Intergenic	novelGene_60668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	353.664031127821	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	286	837	1113579	1107817	TRUE	15	ACTTTTGCATGAGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRSC	1139446	1106038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108574_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1139295
657339	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657341	contig_7182_pilon	-	1260	5	Intergenic	novelGene_117153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2399.13197844554	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	215	862	889318	887056	FALSE	45	AAAAAAAAGTTGCAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889992	886657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_889792
657351	contig_10609_pilon	+	2157	11	Intergenic	novelGene_123920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_6	643.939756499007	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	186	875	386471	406947	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQEVKLTVWIRMATLLSMWLQDTVMSF	361235	421343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314
657361	contig_6589_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_25804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672590	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_672600_672800
657364	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_94256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657366	contig_17440_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_7644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3501	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
657367	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657370	contig_8354_pilon	-	1469	2	Intergenic	novelGene_24138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTCCGTGTTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536320	534804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_535851_535897
657373	contig_10780_pilon	-	2099	9	Intergenic	novelGene_155427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_8	69.6132171358284	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	12	1031	113602	94897	FALSE	25	GTACATTTCAGTGAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAMEDDYPPVEERRRLQEELSEFVESCCRTLEEVTASLGWSLDQLDPGEEETAEDEVVICPYDSNHHMPKSSLAKHMVSCRLRKLDYTKEEEDEMYNPEFFYENVNIPSITLNKDSQLQIIKQARTTDGKDGDCSNQRIYSSLPIEVPLNHKRFVCDLTQADRLAIYDFVVEETKKKRSSSQIIENDSDLFVDLAAKVNQDNSRKCPKSYLEILAEVRDYKRRRQSYRAKNVHITKKSYTEVIRDVINVHMEELSSQWQEEQEKAEDGAIKKEERRSASVDSWQSGGSYLDAECSRHRRDRSRSPHKRKKSKDKDRNLDSRRRKERDGERHRSHKRRKQKI	113613	93828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_-_94946_97504_97670_98429_98519_102076_102199_102784_102974_108010_108086_108921_108983_109208_109323_113446
657374	contig_14322_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_116244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCGGTCTCACAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
657384	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657385	contig_12270_pilon	-	212	2	Intergenic	novelGene_114147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCTCCTAAGCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	14000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
657388	contig_13244_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_86912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAATCTTGCAGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180517	182981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_180500_183000
657390	contig_19402_pilon	-	1984	2	Intergenic	novelGene_80844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCTCATTAACTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146717	144678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_144794_144848
657420	contig_13760_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_61277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATACTTACTTGTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88166	87100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_87100_88200
657421	contig_14513_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_70357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19054	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11955_18842
657428	contig_4891_pilon	+	1150	7	Intergenic	novelGene_124571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.572985425359	220	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	244	795	707907	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVALGPGEHGFQCSERCQPLPASRLSLPLEAGDDGVPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	702899	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_703008_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
657430	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
657436	contig_12923_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_30128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	356	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	226	498	151486	151214	FALSE	15	TCTACTGGATCTGTCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTSDPLSPERRSHQTNPAAHLTGANASLTGSGGPLLWETQLGQAFLRGLDYHDGALVISEAGYYYIYSKVQLGGMGCPQGLAGNLPVTHGLYKRTPRYPKELELLVSRRSPCGRAASSRFWWDSSFLGGVVHLEAGEEVVVRVPDERLVRLRDGTRSYFGAFMV	152942	149439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_151642_152872
657441	contig_6593_pilon	+	2845	1	Intergenic	novelGene_49854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246112	1248957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1246100_1249000
657443	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
657453	contig_7870_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_109068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCTTGTAAGGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703562	701151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_701200_703600
657463	contig_8978_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_49477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	73	441	1717627	1717259	NA	30	CAATGCTACTTCACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKIQYIKNTGCSTYLWKAVVREIYTLKCTHLYVKKAGSLKRSTHLTKLKTKKKRSKTHITNQELPRQRCKTSMHTLLRIIDEGLKGDNHMICQYPPPQLLEAVLVDIENSSTPASTWPHR	1717699	1715544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1715500_1717700
657464	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657467	contig_7677_pilon	-	1290	11	Intergenic	novelGene_78273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	196.574566004862	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	59	1276	524311	479264	FALSE	5	TGCTCTTCTTCCTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDPDNYIAYYRRATVFLAMGKSKAALPDLTKVIELKMDFTAARLQRGHLLLKQGKLDEAEDDFKKVLKSNPSENEEKEAQSQLRKADEMQHLRSQALYAFESADYTAAITFLDKILEVCVWDAELRELRAECFIKEGEPRKAISDLKAASKLKLGDHELSLSEVRECLKLDQDHKRCFAHYKQVKKLNKLIESAEELIRDGRYADATSKYESVMKTEPSVSEYSIRSKERICHCFSKDEKPVEAIRICSEVLQIEPDNVNALRDRAEAYLIEEMYDEAIQDYETAQEHNENDQQIREGLEKAHRLLKQSQKRDYYKILGVKRNAKKQEIIKAYRKLAMQWHPDNFQNEEEKKKAEKKFIDIAAAKEVLSDPEMRKKFDDGEDPLDAESQQGGGGNPFHRSWNSWQGFNPFSSGGPFRFKFHFN	524369	479249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_-_479422_484998_485148_486070_486204_494728_494850_494938_495045_503107_503228_503609_503636_503683_503792_505647_505801_521580_521656_524242
657476	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
657477	contig_6325_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_143360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCCAGCAACAGACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404334	406583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_404300_406600
657478	contig_4857_pilon	-	1721	5	Intergenic	novelGene_48840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCCTAAGAACAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411062	1331394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1405451_1405553_1407010_1407075_1409427_1409753_1409986
657479	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
657481	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657486	contig_12638_pilon	-	3176	4	Intergenic	novelGene_33144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200439	196097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_198149_198734_198841_199333_199417_199503
657489	SIRV7	-	337	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	15	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114723	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
657499	contig_10437_pilon	+	2786	5	Intergenic	novelGene_38148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	167.166832834746	2	153	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAGCGTTGCAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156723	164085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859
657503	contig_9682_pilon	+	941	3	Intergenic	novelGene_125281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	359	junction_1	81.5	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	186	323	10767	10904	FALSE	5	GTTTTGTCGTCTTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKSGTGFVELKLGNLRLVNLQCGVK	2375	11522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756
657505	contig_6418_pilon	-	1341	13	Intergenic	novelGene_81102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	359	junction_12	319.32037204037	3352	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	68	1087	106563	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118015	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
657507	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657520	contig_7887_pilon	+	1891	5	Intergenic	novelGene_124924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	106.073088010107	66	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	275	868	580030	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLSWAGNQGRQQQVQRKTEAGSGGSHQSLGPPQLWPPVRTRIKVGYSLAQSPPAHIPPLRACLWRPWAQNPRWTQNLTWPPRPLQASPRQMVKNWLGRWMEKSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	575160	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_575232_577973_578059_579911_580066_584657_585122_585612
657524	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657525	contig_5196_pilon	-	2013	5	Intergenic	novelGene_38663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_4	248.863793067614	113	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	47	808	14523	9642	FALSE	25	ATACTTAATTGTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16052	8436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
657540	contig_6946_pilon	-	1618	2	Intergenic	novelGene_59794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTCCCAATAAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454056	452387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_453220_453270
657560	contig_5020_pilon	+	1259	6	Intergenic	novelGene_27892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1231.947628757	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	152	889	122915	125717	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTAPTDRAVALSCSPRGPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGVLLYHCHRLPCRRSQDEIHELCPGPVQQRWPLCPYHAPEGGAPGLLQRVHALLSSLGFLECGDVRHL	118507	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_122821_123041_123152_123364_124167_124367_124948_125091_125657
657573	contig_10460_pilon	-	3868	1	Intergenic	novelGene_157466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAACAGTGGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68224	64356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_64400_68200
657577	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657581	contig_8241_pilon	+	2837	23	Intergenic	novelGene_157489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	34	junction_4	61.9308465311602	292	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	67	2454	235014	263139	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEGSNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNMEPYTVSGMARQDSSSEVGENGRSMDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYSFIKDRRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQTNPYTDVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPNNDRLSILTKLVKKGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASLNATKLKHPYYPCMAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQWLVEYFISSEGRELIKIFLLECSVREVRVAVATILEKTLDSALLYQDELKSLHQLLEVLLALLDKDVPENCKNCAQYFFLFNTFVQKQGIRAGDLLLRHSALRHMISFLLGANRQNNQIRRWSSAQAREFGNLHNTVALLVLHSDVSSQRNVAPGIFKQRTPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFLSEGKPYLLEVMFALRELTGSLLALIEMVVYCCFCNEHFSFTMLHFIKNQLETAPPHELKNTFQLLHEILVIEDPIQVERVKFVFETENGLLALMHHSNHVDSSRCYQCVKFLVTLAQKCPAAKEYFKENSHHWSWAVQWLQKKMSEHYWTPQSNVSNETSTGKTFQRTISAQDTLAYATALLNEKEQSGSSNGSESSPANENGERHLQQGSESPMMIGELRGDLDDVDP	234567	263522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_234612_234991_235134_235343_235464_235892_236114_236483_236609_237910_238053_238568_238720_239733_239830_240460_240565_242233_242348_244610_244708_247050_247168_247709_247803_249368_249472_251712_251835_252832_252947_255162_255229_257325_257393_258969_259049_260702_260779_261182_261270_261641_261753_263076
657582	contig_3122_pilon	+	2863	2	Intergenic	novelGene_64396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCAGCCAATATGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394952	403680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_397699_403563
657586	contig_7753_pilon	+	2502	1	Intergenic	novelGene_41498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGATGTGGACATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220560	1223062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1220600_1223100
657592	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_18827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGCAGGTGCGCCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
657595	contig_15063_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_11916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	226	1401	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
657599	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_17764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657603	contig_7380_pilon	+	2988	19	Intergenic	novelGene_157512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_17	71.8144900953444	195	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	116	2272	139473	280130	TRUE	35	GCAGCTATTTTTAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVLYAGGIPVSDAGGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFAPQEAYSHLKNILEQINALTGALFTSKVLEERAERETESQGNSSSEQGEQVYDWSTGLENTDDSHLYFSPDQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFAEIYSQKIGIKKEVLLKTLWGDYYINMKAKRIMKVDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKEKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQISAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVEKLMCTGSQTFDSLPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQAEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSVLETNPKGEELRAGNEEQVESMTPKPVPQEESNQESFVAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPVEFLQRVPLGFSAPPDDLPPVPHMAYCTLENLYLLMGRELEDLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPHLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERSGLCCLVKERRPSTSRRNERRDGHVHHQGCAACCRKLWLC	138591	300336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_155567_155702_157165_157304_159811_160027_167053_167178_168704_168782_169532_169670_170631_170755_173428_173529_177572_177725_177966_178137_193986_194126_255947_256080_259679_259828_280006_280192_299681
657604	contig_9345_pilon	-	2019	8	Intergenic	novelGene_24514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	100.115647414092	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	321	548	669169	668852	TRUE	65	TCAATAAAAATTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEGKKMLQQGPLAQPALEPSAFRGTIP	669650	667037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_669025_669114_669206_669289_669490_669566
657613	contig_11253_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_126828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACCATTTAGCTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152769	153906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_152800_153900
657629	contig_16666_pilon	-	1004	3	Intergenic	novelGene_61739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	889.5	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	29	307	59688	55794	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCLMINNVCTI	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55826_58152_58264_59552
657632	contig_13680_pilon	-	1910	14	Intergenic	novelGene_149595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_4	171.412406253898	595	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	173	1624	396643	373091	FALSE	35	TTTAGAGTCCAGACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCRALRKETWRWLGPRLPLLFVVPPPPPPPPLPLLPLISSVGRGDRGGGWRKRRRRMEEGGGGARSLVPGGPVFLVLCGLLEASGGGRALPPLSDDIPFRVNWPGTEFSLPTTGVLYKEDNYVIMTTAHKEKYKCILPLVTGGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKYIRQYHEEKETGQKVNIHEYYLGNMLAKNLLSDKDQEAEEREKSKEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILTPLLCNHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKPIAVGSQPTLTVGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFHGGVGWWKYEFCYGKHVYQYHEDKDSGKTSVVVGTWNQEEHIEWAKKNTARAFHLQDDGTQTVRMVSHFYGNGDICDITDKPRQVTVKLKCKESDSPHAVTVYMLEPHSCQYILGVESPVICKILDTADENGLLSLPN	396815	372804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_373163_374990_375067_375277_375356_376956_377082_380016_380077_380902_381065_385130_385261_385352_385577_388075_388111_388790_388855_388993_389072_389620_389702_390827_390933_396481
657635	contig_3601_pilon	-	1655	3	Intergenic	novelGene_132890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAATGAACAGATGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188313	180152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_180639_180875_181368_187636
657645	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
657647	contig_10437_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_38263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401913	404061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_401900_404100
657650	contig_6710_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_97615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653389	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
657658	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	82	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657660	contig_1076_pilon	-	1971	5	Intergenic	novelGene_101087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	470	junction_2	154.856990478312	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1218	1739	54398	50922	FALSE	10	GGCAGTTTTGTGACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	55615	50689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272
657667	SIRV7	-	353	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33216	0	-3	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
657680	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657683	contig_11986_pilon	+	2751	21	Intergenic	novelGene_69076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	132.303628068168	679	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	1232	2599	10521	22021	FALSE	15	GGGTTTTGCAAACTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAYLFTMGVAFFITCITLVYSMSHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCYAVWQVKPSSMCGPFQTLDTMYEAGKVWVRRLERAGPRVSWLSWVHHYLLENTFFIFLVSALLLAVIYLNIQVVKGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYEKKERSSAPAQIRDAQETL	5093	22173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_5198_7345_7459_7589_7760_7878_7976_8286_8446_9123_9234_9356_9454_9787_10046_10397_10589_11809_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17285_17442_17620_18573_18653_21266_21335_21981
657693	contig_15029_pilon	-	505	5	Intergenic	novelGene_128199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.7354552767919	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	219083	211781	TRUE	15	CTTTTGGGTATGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKWAHRVWDILDVKPIALYEALTLDYSSKFLRETKHSFVFLDIAIDYYPVGRLIFELYCDACPKTCKNFQVLCTGKAGFSASGLRLHYKGSVFHRLVQNAWLQGGEI	219084	190266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_190396_211729_211789_215527_215676_215774_215838_218978
657694	contig_6233_pilon	-	1452	9	Intergenic	novelGene_74779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	280.237817531824	749	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	314	1153	149777	143464	TRUE	15	GCTTTGGAGTGATTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250356	136675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
657701	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	0	35775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
657712	contig_3818_pilon	-	2572	8	Intergenic	novelGene_99202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTAAAGCCCGCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133098	103968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_104176_105295_105415_109007_109130_109883_109964_125830_125994_126081_126197_131000_131122_131453
657728	contig_5696_pilon	+	2027	16	Intergenic	novelGene_117532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	57.487235298127	100	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	64	1614	635115	657250	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGQSGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSEKNTRICYLETHITALGKSAAKDLFKMLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSVAASACESWTINKEDRRRIDAFALWCWQRVLNIPWTTRRINKSLLEEVQPEFSLEMRMARICLTYSGHVIRRDQSLEKDIMLGKCMMSGIKV	632373	657663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840_652953_656828
657729	contig_8242_pilon	+	2141	10	Intergenic	novelGene_80190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	444.086689346034	1701	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	759	1514	30913	37065	FALSE	20	CAAATACGGGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIFGRFLEAIENNKYGWFWVCPGGGDMCMYRHALPPGFVLKKDKKKEEKEDEISLEDLIERERSALGPNVTKITLESFLAWKKRKRQEKIDKLEQDMERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3425	37692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702_30935_31986_32157_33656_33804_33959_34062_35060_35185_36874
657738	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	70	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657745	contig_15025_pilon	+	2275	7	Intergenic	novelGene_155973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	33.4302756993318	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	222	785	57827	92556	TRUE	20	CATTTTCTTATGGCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDKNQTCAAGQDSMPYMICLIHILEEWFGVEQLEDYLNFVNYLLWVFTPLILLILPYFTIFLLYLTIIFLHIYKRKNVLKEAYSHNLWDGARKTVATLWDGHAAVWHGYEVHGMEKIPEEGPALIIFYHGAIPIDFYYFMAKIFIHKGRTCRVVADHFVFKIPAHYSYVYTKYSRRISIIRRNKIV	48292	99382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_48403_57127_57169_57756_58152_70993_71162_89957_90019_92546_92687_98022
657746	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657757	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
657767	contig_5217_pilon	-	2028	3	Intergenic	novelGene_135794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_1	21.5	1033	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCCTGTATGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688507	685583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_686584_687315_687391_687554
657768	contig_11708_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_138985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372775	370867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_370900_372800
657772	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
657773	contig_1516_pilon	+	1445	10	Intergenic	novelGene_49967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1429.90357095233	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	792	653	1444	353572	359482	FALSE	15	CCATGGGCAGCGTGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAMFHRKLFEELVRASSHSTDLMEAM	335180	359483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_350125_350235_352897_353030_353507_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359386
657785	contig_11428_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_138488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTTGGCTTTTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56422	56673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_56400_56700
657787	contig_18869_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_56191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73713	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
657788	contig_20550_pilon	+	970	10	Intergenic	novelGene_142603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	214.865734705693	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	73	936	3777	19340	FALSE	20	TTTTTTTACTTCAGCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDGSWTSPSSTTHWEGMPSPFKDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQVSFIFVKRELGLGGKMGKPRRNN	3704	19374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_11580_11644_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169
657790	contig_13004_pilon	-	2588	2	Intergenic	novelGene_112668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651482	647941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_649940_650892
657792	contig_854_pilon	+	1022	5	Intergenic	novelGene_36206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2668.79789184194	58	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543466	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557011_563142
657794	contig_7202_pilon	-	233	2	Intergenic	novelGene_18612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCTTCACCAATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29981	28584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
657797	SIRV7	-	333	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-14	-20	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114752	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114687
657800	contig_11720_pilon	-	2074	8	Intergenic	novelGene_43883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_3	56.5609658434406	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1352	1672	109299	108190	FALSE	25	TCCCAGAGACATGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAAVGYLDGTLAIYDLSTQTLRHQCQHQSGIVQLLWEAGTAVVYTCSLDGIVRLWDARTGRLLTDYRGHTAEILDFALSKDASLVVTTSGDHKAKVFCVQRPDR	113355	107787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109022_109209_109301_109767_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112686_113170
657801	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
657805	contig_11171_pilon	+	1457	7	Intergenic	novelGene_48599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	567.705444946781	47	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	82	1239	212165	251735	FALSE	15	AGATGGCTCCACCTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTLLVLHLLSARPCPGGVMHSILFNPALSLQGSCGSSHLTDEDTEHTEAGRTCSAVTLRSTHASRAKPTTCPSRGAPSPRRDCTDLKMKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212083	251953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239336_248691_248838_249980_250068_251407
657807	contig_7806_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_157550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286322	284062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_284100_286300
657809	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_95848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657810	contig_5280_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_52651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274852	275159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_274900_275200
657811	contig_9653_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_48245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAATGTCCTCTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836874	838980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_836900_839000
657850	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657857	contig_18869_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_56040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73554	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
657858	contig_14322_pilon	-	170	1	Intergenic	novelGene_116606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCGCTCCTCAGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
657860	contig_5628_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_157571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1693	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	338	640	278930	278628	NA	20	CTTAACTTGCGGCTTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCPRKLLRSISTACRQSPTNSSFSGRSSPPCHILKGGEASVSGFPSTSDTSHQAGQCLIQEQHLQLIPDPRPLEAASQWVGGGGGERLHSRHPRPQLP	279267	277489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_277500_279300
657866	contig_3948_pilon	-	2141	14	Intergenic	novelGene_53307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_13	416.954923563715	2	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	320	1819	1494302	1468245	FALSE	20	TTCATCAACAGGTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1511000	1467922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490839_1491191_1491232_1494194_1494313_1494783_1494859_1510766
657868	contig_1813_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_105499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATTCAGGACTGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309110	310772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_309100_310800
657869	contig_17440_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_7619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCCGCTACCAACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3065	3309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
657884	SIRV4	+	214	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1557	632	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
657890	contig_10196_pilon	+	2061	7	Intergenic	novelGene_132142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_4	218.487731666766	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	12	809	1034566	1047133	FALSE	35	TTTAAGTTAAACAGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKVSGRRLVSWGSRKRRS	1034554	1048385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980
657894	contig_14322_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_116515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCTGTAAGTATGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674889	672794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
657898	contig_5003_pilon	-	2844	7	Intergenic	novelGene_120220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	52.5124323903926	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	32	715	187425	170425	FALSE	65	GAGGAAAAAAGAATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVALAGLEVMAWVPVESAVEELMPRLLPVEPCDLTECFDPSVPPRTPQEYLRRVQLEAAQCPDVVVAQIDPKKLKRRQTVNVSLSGCQPAPEGYSPTLQWQQQQVAQFSAIRQSVNKHRSHWKSQQLDSNVIMPKSEDEDGWKKFCLGERLCSEGIVGPATNESPGIDYVQIGFPPLLSIVSRMNQATVTSVLEYLSNWFGERDFTPELVVLHLFIFIMQAKLYILICKMFLYVHI	187456	168295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_170578_173399_173445_175625_175740_182730_182791_183049_183140_186854_186940_187288
657902	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657912	contig_2100_pilon	-	1137	10	Intergenic	novelGene_50746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1111.86549945975	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	140	997	1182812	1170065	FALSE	20	CCATAAGAGTGCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLLETVAV	1185478	1169924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170087_1174233_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1183610_1183683_1185420
657913	contig_11932_pilon	-	2369	3	Intergenic	novelGene_85420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	25.5	97	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	250	636	362661	360996	FALSE	30	CCCACCAACGTAATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTSGLSISGLNPLPNPSYLLPSRIFSSTTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIGESFEEILEETVISTKKTEKSNIEESTISSQKI	423311	359262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_361306_362584_362710_423110
657919	contig_12919_pilon	-	2424	1	Intergenic	novelGene_75894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATGTTGTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721750	719326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_719300_721800
657921	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-1	31	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTATTAGCCTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
657922	SIRV6	+	299	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	1	1289	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
657925	contig_2278_pilon	+	1471	2	Intergenic	novelGene_118111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATAGATGCCACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939329	941449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_940518_941166
657942	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_114012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	3	347	14437	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
657948	contig_3837_pilon	+	2341	10	Intergenic	novelGene_104017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_7	211.399977808144	167	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	522	1226	67539	123213	TRUE	65	AGATTAATAGAAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATILDRLHSLQINSSLSTYSLVDSVGNTKTFDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKNR	67017	129469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_75761_75846_77748_77816_88997_89221_121918_122015_123204_123366_124345_124469_128629
657949	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCCATGACGACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
657952	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
657969	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
657971	contig_16970_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_157593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	93	404	25134	24823	NA	35	TAAGTGTTACCCTAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNQKAPGTSIFQSLYQTHHMAMTYYNMPRRLSQHRAPRWSLLGCSVPYSLASGAGLVLRDQDRKPNGFLKSDSTPCNNLRLFHSQTHSHIHRPCFYLDEVQ	25226	24613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_24600_25200
657978	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
657979	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
657987	contig_7202_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_19058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGCTGGTTGCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29915	30115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
657999	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
658000	contig_20641_pilon	+	983	8	Intergenic	novelGene_52802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1226.78038884267	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	119	982	14767	56522	FALSE	20	ACCACTATGTGGGAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPQLSSSWRIFCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSD	14535	56523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14573_14685_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
658008	SIRV6	+	512	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1617	-122	225	70	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATTCGCATGGAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2741	11401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
658028	SIRV6	+	608	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	1422	0	36	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
658032	contig_18869_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_56268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
658034	contig_5643_pilon	+	1838	8	Intergenic	novelGene_38921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	38.7477451615193	351	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	189	1016	386563	391299	FALSE	20	CATGCCCTGAACTGGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELAESDFASTFRLLTVFAYGTYADYLAEARNLPPLTEAQKNKLRHLSVVTLAAKVKCIPYAVLLEALALHNVRQLEDLVIEAVYADVLRGSLDQRNQQLEVDYSIGRDIQRQDLSAIARTLQEWCVGCEVVLSGIEEQVSRANQHKEQQLGLKQQIESEVANLKKTIKVTTAAAAAATSQDPEQHLTELREPVPGTNQRQPSKKGSKGKGLRGSAKIWSKSN	385992	392121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_386138_386519_386725_388242_388319_388568_388658_389808_390012_390678_390785_390942_391095_391259
658035	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCGCATCCCCCTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
658038	contig_15687_pilon	-	2784	12	Intergenic	novelGene_129150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_7	44.4609588234907	300	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	42	1091	247912	205671	FALSE	35	GCACATAAAACTGGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIWTYDIDSGLWTMHLMEGELPTSMSGSCGACINGKLYIFGGYDDKGYSNRLYFVNLRTRDGTYIWEKISNFEGQPPTPRDKLSCWVYKDRLIYFGGYGCRRHNELQDCFDVHDASWEEQIFWGWHNDVHMFDTKTRTWFQPEIKGGVPPQPRAAHTCAVLGNKGYVFGGRVLQTRMNDLHYLNLDTWTWSGRIPTTGENPKHRSWHTLTPIADDKLFLFGGLSAENIPLSDGWIHNVMTNCWKQLTHLPKTRPRLWHTACLGKENEIMVFGGSKDDLLSLDTGHCNDLLIFQTQPYSLLRSCLDCIGKNVIILESQISLLPPKLLQQVFKKITFWTAANHREEQRAQTEETENKYQWISSN	248413	203977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_205858_214304_214358_216565_216651_220875_220949_223354_223468_228405_228465_229057_229142_236024_236109_240857_240937_247263_247383_247798_247917_248376
658040	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658041	contig_12790_pilon	-	1963	11	Intergenic	novelGene_35216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGAGAAGCGGCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313340	305931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_305984_306041_306137_307244_307339_308741_308825_309574_309754_309871_309936_310058_310152_310366_310492_311027_311078_311896_312032_312347
658042	contig_13457_pilon	+	2278	15	Intergenic	novelGene_118321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	197.443107279654	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	97	2001	52406	57730	FALSE	25	ACAATTCCCGATGGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRICNRRDAVEWFVQVLWWLAEVASGYVGTGYMEGDGSDPEPPDAGEDSKSENGENAPIYCICRKPDINCFMIGCDNCNEWFHGDCIRITEKMAKAIREWYCRECREKDPKLEIRYRHKKSRERDGSERDSSEPRDEGGGRKRPAPDPDLQRRVGSGTGVGTILARGSASPHKASPQPLVPTSSQHHQQQQQQIKRSARMCGECEACRRTEDCGHCDFCRDMKKFGGPNKIRQKCRLRQCQLRARESYKYFPSSLSPVTPSEPLPRPRRPLPTQQQPQPSQKLGRIREDEGAVVSSAVKEPPEATATPEPLSDEDLPLDPDLYQDFCAGAFDDHGLPWMSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52309	58007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53413_53513_53615_53935_54172_54259_54440_54805_54833_54909_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56786_57381_57502_57583
658043	SIRV2	+	257	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	340	-74	-340	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTTGCACTGTTGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
658046	contig_12270_pilon	-	244	2	Intergenic	novelGene_114132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCTGACCGGTTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14419	13952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658049	contig_11292_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_109382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	14.6562462982701	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	74	940	6987	12447	FALSE	30	CCAACTGAAAGCCTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAGGSITGLKFNPLNTNQFFTSSMEGTTRLQDFKGNTLRVFTSSGTCNFWFCSLDVSAGSRVVVTGDNAGQVVLLNMDGKELWNLRLHKKKVTHVALNPCCDWLLATASVDQTVKIWDLRQVRGKSSFLSSLPHRHPVNAACFSPDGARLLTTDQNSEIRVYSASQWDCPLGVIPHPHRHFQHLTPIKATWHPRYNLIFVGRYPDPNFKSCTPHELRTIDVFDGSSGNMMCQLYDPEYSGIISLNEFNPMGDTLASVMGYHILIWSQEEAGIQKRETVTKVCAKQGLGATNGNKSCEKRQLSVKGLKVYKS	6913	12698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_7061_8364_8465_8555_8734_9051_9195_10733_10899_11038_11085_12286
658053	contig_14441_pilon	+	1473	5	Intergenic	novelGene_100646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	4	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	865	1287	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111389	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_113143_113209_116578_116957_117220_117344_117539
658055	contig_9696_pilon	-	1052	4	Intergenic	novelGene_68829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	26.3860232362177	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	29	628	577481	549873	FALSE	60	AGAGAAAACTCGAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRADVCSKMEFCSGRRAVLQLLRAVAPADRPALLQWMRTTRDFDEFIQDNNDVMLKSIAEDLRNCLPLEAMLSSEHLALQKIQQQPEPTVHFDAFLYDEDFIDSLCEEGRMSRNYCMVCGSHQTAPLGFISHSFSLTELKFIYHHVLPDLSGKVLVDVGSRLGAVLYGVKSGLRTYSAFEKYFLLLAAALPATIQGDRLALFIRVTE	577509	549448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_550115_552616_552756_564332_564455_577384
658057	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658063	contig_8907_pilon	+	2466	1	Intergenic	novelGene_85793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAAATTAAACTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105361	107827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_105400_107800
658070	contig_6710_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_93432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
658080	contig_987_pilon	-	1767	12	Intergenic	novelGene_72283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_11	261.424356583077	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	120	1097	945034	916735	FALSE	5	TGGTCTTTTTGACTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEVIDKYTAVVKMIDSGDKLKLDQTHLETVIPAPGKRILVLNGGYRGNEGTLESINEKSFSATIVIETGPLKGRRVEGIQYEDISKLA	945153	916064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_916798_920068_920170_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_945029
658086	contig_11285_pilon	-	2345	20	Intergenic	novelGene_5686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	467.506878495326	1	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	505	2145	790656	784262	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLLLLLPDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQATGSVYPAVSRFVQRICPSLRGARPQPAQRGSTSADAAASGLGGEGHSYLVDSGRRAGWSAAAHAAGPSHVEGRLLQAESPAPGRGR	798515	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785805_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791287_796657_796727_798342
658091	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658093	contig_5649_pilon	+	2257	10	Intergenic	novelGene_82278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_1	89.1703875997596	552	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	291	1379	126523	150217	FALSE	50	GAAAACTTGAAAAGTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSGKDFHQTQFLIQECASLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFGLALLNSSSSDLRGFAAQFIKQKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGAFGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYSEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGKDKSDGAQAHTWNVEVLIDVLKELVSTCDHGFRVMIIV	94482	151095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_94599_126348_126625_145420_145529_146103_146203_146616_146686_146773_146829_147492_147697_148627_148797_149785_149913_150061
658094	contig_13481_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_119344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369640	367773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_367800_369600
658095	contig_12270_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_114102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	14409	13911	FALSE	20	CTTTCACCATCAGCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDF	14435	13909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658097	contig_15787_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_143977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCAATAATCAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67885	67071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_67100_67900
658114	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	97	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658127	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKNAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653876_657793
658137	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_97187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658144	contig_2278_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_118145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCTTGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430192	1428087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1428100_1430200
658160	contig_17863_pilon	-	2493	2	Intergenic	novelGene_157620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	108	1865	7031	5190	FALSE	20	CTTCTATGTTTATTAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQCGKTFSRIPNLTVVKRNPTEVNPFGCSVCEKAFMDPSSHNHRTRCHTGCNTCQFIACGETCSCNTPMRTLNGKKSHKCEVCGKGKDFICISTLKNSVTTLTSEKHYNCNEYGKDFCIFSSFCTRVSGHKGERKECCKTCSHSLSLILHNRGKPYECRECEKTFSWPSHLTTHMGTHSGEKHYECKECGKAFSRPSALTAHVSTHSREKPYECKECGKAFSWPSCLTTHMRTHSGEKPYECKECGKAFSWPSRLTTHMRTHSGERPYECKECGKGFSQSSHLTNHVRTHNGHRPYECKECGKAFSQASTLSSHIATHSRKKPYECKECGKAFSDSSAMSSHMRTHSGVRPYECKECGKAFRYSSNFTSHIRTHSGERPYECKQCGKVFRQASNLITHRRIHSGERPYECKECGKAFNCSSHLTNHMRTHSGDKPYECTECGKAFSQASSLTTHIRTHNGERPYKCKECGKSFSQASSLTKHIRTHAGVRPYICKECGKAFRCYSYLTSHIRIHSGLRPYECKECGKAFSCCSVLTNHIRIHSGERPYECKQCGKAFRQASGLMIHGRIHSGERPFQCKECGKAFRDSSTLRRHTKTHIGGLTNVRNVRKPFAHHTSLHI	7138	4561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17863_pilon_-_6413_6496
658168	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_90325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658171	SIRV6	+	503	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-42	8798	1	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAGTATCTGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
658180	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658185	contig_9921_pilon	+	2881	1	Intergenic	novelGene_23742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAATGTTTGTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208561	211442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_208600_211400
658196	contig_12019_pilon	+	2721	15	Intergenic	novelGene_87726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	61.584395386348	222	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	253	1935	606598	620414	FALSE	5	TGAGTTTCTCCCTCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGLQTVTLSDGTTAYIQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVAVQKESLSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPKEGYDPSALEAVQLEDGSTAYIHHPVAMPSDSTILAVQAEVGLEDLAAEDDEGFSADTVVALEQYASKVLHDSQAPHNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFRCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	586965	621200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_587035_594436_594524_606501_606671_611574_611656_611769_611848_613067_613268_615363_615481_615814_615891_616485_616612_616741_616922_617737_617972_618078_618210_618950_619119_619648_619763_620309
658200	contig_6589_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_25954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCAACGTCAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296019	1296266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
658201	contig_10949_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_146686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGAAACATTCACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30715	30220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_30200_30700
658204	contig_9345_pilon	-	1466	5	Intergenic	novelGene_24358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	82	729	144517	142100	TRUE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	144598	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141445_141702_142414_142567_142781_142955_143072_144512
658209	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	632	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
658211	contig_11850_pilon	-	1225	8	Intergenic	novelGene_125216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	1201.63492367521	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	106	840	286397	282879	TRUE	25	TTCTGTGTCAGGTACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286502	281433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282374_282480_282857_282950_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
658212	contig_4486_pilon	+	1606	9	Intergenic	novelGene_38635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	396.905215385235	669	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	222	962	1016066	1037335	FALSE	40	AGCAAATAGTTGTGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQGPDPNIEESPKRKNITYEELRNKNRESYEVTLTQKTDPSVRPMQERVPKKEVKVNKYGDTWDE	1014075	1037979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029856_1033761_1033915_1037297
658215	SIRV5	+	368	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-38	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
658218	contig_3095_pilon	+	937	4	Intergenic	novelGene_74971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3476.64407151494	146	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	77	508	147241	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147164	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149879_151011_151163_151848
658219	contig_15304_pilon	+	157	1	Intergenic	novelGene_30684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTAGTGGTTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105504	105661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_105500_105700
658225	contig_3095_pilon	+	1131	5	Intergenic	novelGene_75121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	7	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	25	702	147241	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147216	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151064_151163_151848
658228	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658230	contig_6175_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_16281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565930	568048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_565900_568000
658247	scaffold_13505_pilon	-	943	3	Intergenic	novelGene_111448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_2	123	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532729	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376
658255	contig_13211_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_123145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATATAAATTTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239512	241380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_239500_241400
658270	contig_9852_pilon	-	2425	12	Intergenic	novelGene_138468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_8	12.1014991216682	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	235	2277	321634	297702	FALSE	35	TTCTATAGAATTGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNRCSPLACASPLPPPRLVAGSGPGNSASRRGISSGWWLLTAERKKERAYYRTGGAVFSRPPGATPSPDPACRCRAAAMNSGAMRIHSKGHFQGGIQVNNEKNRPSLKSLKTDNNKLEKSKYKPLWGKVFYLDLPSVSISEKLQKDIKDLGGRVEEFLSKDISYLISNKKEAKFAQTLGRISPVPSPESAYTAETTSPHPSHDGSSFKSPDSVCLSRGKLLVEKAIKDHDFIPSNSILSNALSWGVKILHIDDIRYYIEQKKKELYLLKKSSTSMRDVGKRVCTQKTRTGRLKKPFVKVEDMCRFYRPFYLQLTNMPFINYSIQKPCSPFDVDKPPSIQKQTHVKLRIQTDGDKHDGTPIQLHLKEKKKKGYCECCLQKYEDLETHLLCEQHRNFAQSNQYQVVDDIVSKLVFDFVEYERDTPKKKRIKYSVGSLSPLTTNVLKKTELKEQLELPHIPQKDFRENNNIQAIEQNFLYKETQEAEQELVFISEPTTCPSSEPRGLYEKKTDKCPILNTAENDIKQNFTNTNLPSHKNKQECILDVSENKLIINESNLEELKVNCCQCRLQTPIQVSNFSKDNSASQLKQKSDIVLFPAKDLMVKDLNSIFGHDSGLTATNSSQEHLTIQAKTPSHNPPGESSECNLKNMDSLPPGKIHRKVKLLLGRKKKENLEPNVELDKKRTEFRITQEENRICSSPVQSLLDLFHTSEEKSEFLGFTSYPENSGTCDALDIWEEENSNNLLSMFFSSPSNSTFTGF	321868	297553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_298699_300720_300846_303702_303818_304294_304424_305727_305774_306538_306570_307458_307536_307750_307821_309131_309183_310643_310824_320319_320496_321588
658271	contig_10311_pilon	-	1944	10	Intergenic	novelGene_50433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1195.40592826593	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	258	1061	70287	66744	TRUE	10	AGTTGCTTTGGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLRSLQLFSRELLFLVLKIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71546	65125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_66652_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70496_71497
658272	contig_6102_pilon	-	2432	6	Intergenic	novelGene_32038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	155.918440217955	603	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	311	859	555780	553797	FALSE	30	TCGGTAACAAATTACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVPYARSEAHLTELLEEVCDRMKEYGEQIDPSTHRKNYVRVVGRSGESSELDLQGIRIDSDISGTLKFACESIVEEYEDELIEFFSREADNVKDKLCSKRTDLCDHALHISHDEL	556928	552223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554643_555412_555529_555692_555806_556643
658278	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658280	contig_10674_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_6442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGAACAAATAGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222436	221393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_221400_222400
658294	contig_7179_pilon	+	2015	16	Intergenic	novelGene_78184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGAGGGGGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181050	1222974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1181242_1182103_1182215_1183677_1183861_1185471_1185571_1194851_1194961_1196693_1196847_1198792_1198917_1200011_1200077_1200813_1200914_1206353_1206443_1206549_1206723_1209852_1209990_1210038_1210062_1215617_1215710_1218677_1218895_1222825
658301	contig_14322_pilon	+	2096	11	Intergenic	novelGene_115627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	126.678688026045	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	61	507	240212	246279	TRUE	10	CTTGACACCTGTCTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNKKRLAYAIVQFLHDQLRHGGLSSDAQESLEVAIQCLETAFGVTVEDRDLALPQTLPEIFEAAATGKEMPQDRRSPERTPPSEEDLAEAERLKTEGNEQMKVENFEAAVHFYGKAIELNPANAVYFCNRAAAYSKLGNYAGGRAGL	232554	252266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_232579_240175_240312_240814_240922_241270_241356_244262_244363_246224_246331_246654_246794_247065_247129_247603_247642_247920_248011_251058
658314	contig_9516_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_106146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1002	1382	596140	595760	NA	0	CTGCCTGCCTCCTCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKWGNKAQRGSPLLSSPRVPSKKKKRITNTSIKPRLSEEGKPSTAALPGNPLQGLGPPRATVTTSGLPPSPILPALPPAESQSHFTLGVGCGPQSALLRTCSISGKKIYVLYVAIFPRAPVFFSF	597141	595663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_595700_597100
658316	contig_13051_pilon	+	1747	15	Intergenic	novelGene_140094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	101.104613431549	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	658	1677	136187	245480	FALSE	25	AGTGTGGCTTTTGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60122	245550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112491_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
658324	contig_8978_pilon	-	1820	8	Intergenic	novelGene_49413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAGGTTTCGGACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348125	342487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_342670_343350_343447_343639_343838_344176_344263_344695_344795_345355_345397_345631_345737_347112
658333	contig_9243_pilon	+	1820	8	Intergenic	novelGene_60319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGACAAATCGCGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19185	64626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_20209_20952_21260_25151_25222_27303_27384_32836_32915_34500_34630_47681_47765_64576
658335	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658342	contig_20614_pilon	-	1477	5	Intergenic	novelGene_107581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	154	570	286462	281372	TRUE	35	GAAGAAACCTCTTCAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKVRALYSDRRVRHSKVKGYTVSIATESPITKPLGFCQAHSSWFRRNTFPLMRTTQDAQVQCGRVAGGAAWSALLEVPGECVQQLLLLHPTLQPIHPAGFLQHGHSELTQCALVDVGLQLLFRYLHLGPFVSRIFIILFSLGSFSLGIVIWWVDQLLKLIHQGAQSFIHCFNLGQRQIYCLFGLHQIQS	286615	276012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_276730_278153_278287_281314_281418_284640_284753_286203
658349	contig_18506_pilon	+	1793	10	Intergenic	novelGene_67946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.099184923812	1402	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	598	1428	28506	55293	FALSE	10	GCTAATCCTTTCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCDPTIMGIGPVPAINGALKRTGLSLKDMDLVEVNETFAPQYLAVEKSLDLDPSKTNVNGGSIALGHPLGGSGSRITAHLVHELRRRGGKYAVGSACIGGGQGIALIVQNTS	11149	55658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_25013_25181_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_44530_44661_48546_48618_53815_53971_55208
658353	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658361	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
658362	contig_5023_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_7307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCCTCACTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592893	590796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_590800_592900
658375	SIRV7	-	938	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	6	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48374	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78988_114680_114961_147608
658376	contig_2444_pilon	+	2231	12	Intergenic	novelGene_83765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	296.705073813115	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	67	1788	231271	243030	FALSE	50	GTAATAAAAACTTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRLQIAGPGPGEGAGVAHTCEMLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	230164	243473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230229_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
658382	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658387	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_115733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671626	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
658399	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658412	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	4	342	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14412	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658416	contig_8452_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_48030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397729	395549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_395500_397700
658419	contig_18869_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_56286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTGGCTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
658420	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658428	contig_11386_pilon	+	3187	5	Intergenic	novelGene_82795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	145.179845364293	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	83	1072	71390	86721	FALSE	25	GTAAATGCCTCATTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPASAWSPNLGFLGCAGPCDCPQLDGAMAPTFLLLLLWLQGGISGPPAQDTYTKVQHWEGETLSVQCPYKNRKNRVEGKVWCKVRRKKCEAGFTRVWAQRPHYLLQDDIQAKVVTITMAALRRQDSGRYWCMRNSSQILYPLMGILLEVFPAPTTERNTPLTHLSNILKGGIVLATGRTPTSDPDAPFTTGMTVFTPGLLTLASILPSTAPETTGPTPMARHSFTGTTPTTTGRRRTTGSQTVTESPSSSWTSSVVPVRISTESMPPSTRSPTTGMCHTGRSLLNKLPPIRHQDSDPTVLAVVLALLPVPVLLVIFYGLWKRRHVGSYSLCNGPARHWRDAPGPEPPWKLTWPETT	71307	88836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_71442_82443_82765_84450_84869_86229_86337_86629
658433	contig_5210_pilon	+	1914	10	Intergenic	novelGene_65471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	141.64117417694	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	32	877	803815	812511	TRUE	15	GAGTGTATGTCTGGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRAGGRPLTMPGKHQHFQEPEVGCCGKYFLFGFNIVFWVLGALFLAIGLWAWGEKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	803783	814071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807349_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474_812963_813485
658435	SIRV7	-	221	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35819	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78919	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70893_70988_78841
658437	contig_6364_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_51759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGAGTGCCTCAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642470	643480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_642500_643500
658444	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658455	contig_6568_pilon	+	2118	12	Intergenic	novelGene_152858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	28	junction_3	31.3352968143958	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	152	1894	148823	181774	FALSE	55	AATTAAAAGAGAAACTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDEEKVSPPVLPHDSDRGSSVSSDLQEEYEELLRYAVVTPNIESSTSQLSHPKGDVVQDVKIPTIIGDILHNQGSNLVVRETGMEVGKGCDLNTSGHSKTDGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	144066	181998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148907_153348_153491_157598_157683_160247_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
658464	contig_14643_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_99121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCCCCTACGTGACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27219	28540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_27200_28500
658465	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658479	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658484	contig_9706_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_20831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCTAGGAGCACTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2203	2503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2500
658489	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658491	contig_15063_pilon	+	951	3	Intergenic	novelGene_13711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7060	junction_1	1101.5	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	201	950	34808	36129	FALSE	40	TGAAACAGACCATGTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSP	34607	36130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839
658494	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658500	contig_16322_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_87560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTAAGACATTCCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148450	150491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_148400_150500
658503	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
658506	contig_8671_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_126242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCAGCTGCACCTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197287	195604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_195600_197300
658510	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658512	SIRV2	-	618	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4255	34	3080	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
658514	contig_13216_pilon	+	1847	8	Intergenic	novelGene_47484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	942.633046961801	2	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	926	1366	260572	261012	TRUE	15	TAGTTTTGTGTTCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229636	261550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258554_260518_261316_261372
658520	contig_9471_pilon	-	3254	1	Intergenic	novelGene_21731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210471	207217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_207200_210500
658521	SIRV7	-	289	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91633	4	-91627	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAAGTATAAAACTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
658526	SIRV7	-	230	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91685	11	-91679	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGGCTGAATGCAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
658527	contig_12644_pilon	+	1648	3	Intergenic	novelGene_44698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	38.5	520	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	62	364	2681962	2683295	TRUE	20	CACACTTTGGGGTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRLQELRKEEETLLRLKAALHDQLNRLKVIPRLPPIPAVLPRDHLSYTLRVQLPPLPEPRPPGFTRTPALCGAHQHFPPKPLGGARMLLPVPSLVWPC	2681900	2685552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2682260_2683290_2683381_2684353
658529	contig_20029_pilon	-	1529	6	Intergenic	novelGene_138897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	370.355828899722	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	819	1370	7242	5156	FALSE	10	AGCATTGTCTTTTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYQKKKFPYGYIQALKCRVLELPYQDKDLSMVILLPDDIEDDSTGLQKIEEQLTLENLSEWTKPENLHTMEVNVSLPRFKLEETYDLNSYLARLGVQDLFNSSKADLSSMSGARDLFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIANFCMLVPEETFNADHPFFFFIRHNPSKSILFCGRFSSP	12286	4996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_-_5561_7095_7493_9501_9620_10088_10227_11528_11706_12151
658537	SIRV6	+	269	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2050	558	32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
658544	contig_4812_pilon	-	1251	6	Intergenic	novelGene_103649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	6972.1678522537	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	246	728	82334	79235	FALSE	30	AGTTGGAAGCTAAGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82717	78711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82480
658552	contig_12919_pilon	-	2546	2	Intergenic	novelGene_75919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840450	837190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_839293_840006
658564	contig_9424_pilon	+	1405	3	Intergenic	novelGene_143764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_1	18	580	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	27	401	6557	15488	FALSE	15	TACCATTTTGTCCATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLHVVEPMPVLGPDVEAYCLRCECKYEERSSVTIKVTIIIYLSILGLLLLYMVYLTLVEPILKRRLFGHSQLIQSDDDIGDHQPFANAHDVLARSRSRANVLNKVEYAQQRWKLQVQEQRKSVFDRHVVLS	6530	16492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_6641_8475_8611_15332
658565	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658568	contig_6215_pilon	+	2037	9	Intergenic	novelGene_21222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGACAGCATCGGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227385	238698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228369_229806_229951_230071_230215_231669_231760_231861_232035_233716_233857_234069_234147_235190_235362_238582
658574	contig_7457_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_31545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1140	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGAGTCTTGCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773085	774521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_773100_774500
658578	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658583	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658585	SIRV2	-	615	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	34	3083	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
658593	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658594	SIRV6	+	584	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	893	549	-305	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	22	354	2002	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1980	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
658596	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658606	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_116021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
658609	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
658614	contig_14924_pilon	+	1941	9	Intergenic	novelGene_104154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	41.0850870146334	109	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	44129	53721	FALSE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLGQYASCGQWCDEFFAGSLWFLLM	44109	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47173_53119_53149_53695
658615	contig_7992_pilon	+	2368	8	Intergenic	novelGene_115546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	94.797313317651	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610096	647114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_610135_611209_611309_614478_614555_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235
658616	contig_9578_pilon	+	2589	5	Intergenic	novelGene_68009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	45.8986655579441	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	222	1124	1319409	1326867	FALSE	45	TAGTTAATTGCTAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKVSGQEQSSRGQRILSIPIWPPNLGISQNCVYEVQQVPKVEKTDDNLTQTQLEETEVIVTPEKLSSNLQHHFSLSSVYSHYFPDTGIPEVTTCHSRSALTVDYIFYSADKEEAAQESGAAVGLVGGLKLLARLSLLTEQDLWTVNGLPNEHSSSDHLPLLAKFRLEL	1319187	1328332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1319811_1320954_1321082_1321486_1321545_1324878_1325043_1326715
658623	contig_13968_pilon	-	2532	3	Intergenic	novelGene_106867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_1	18	313	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	331	1353	28659	27637	FALSE	15	AGCTTTTGCTGAAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVINMTVSSASNNTCGDTIDDFRNQVYSTLYSVISIVGFFGNGFVLYVLIKTYHEKSAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVAYYVHKGIWLFGDFLCRFSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFFRCVAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMRRSYKDEKNNTKCFEPPQDSQAKNYVLILHYVSLFFGFIIPFVIIMVCYTMIILTLLKNSMKKNLSSRKKAVGMIIVVTAAFLISFMPYHIQRTIHIHFLHNETQPCDSVLRMQKSVVITLSLAALNCCFDPLLYFFSGGNFRRRLSTFRKHSLSSMTYVPKKKSSMPEKGEEICIV	70232	26457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_28692_34419_34505_70019
658629	contig_6050_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_123126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGTAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385711	383274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_383300_385700
658632	contig_3193_pilon	+	3150	11	Intergenic	novelGene_126304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	604	1584	47224	94212	TRUE	0	GGTGTTGCCCCGCGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRRLTPHQLHVQKVVHSSTRAQLVLATAGHLDHPEDDEYLLHWSCSHCLPYLAPGTSMAVLGPGGHTRNSAAGSRSPVSTIALCVVGAPALSALDAPVFPQAGLDHHRLEAVEPHQQRPVLLQKRLHAVPFLRLQVLLMKELPIKDVPGHEVTHVQRETTRTVDEHQCGEATDEEGAQLHSPGVDVVKLEAQGLCDQSLQILQAKSVHLHKEVDKEAAQRPEGALNSLQVLLHGGEVEASQEHIKAPGLHVWPLGQPQHLQARSSSWDTHRQRPDKVWVLQGVPGVDEPLLHLPGQAVGAVFTVPQQECIDALAHRAVDEGLAR	46620	113240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_47327_50393_50445_61022_61123_62913_63023_64886_65096_79050_79107_80131_80306_81724_81831_94139_94323_96885_98273_113171
658637	contig_3975_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_54935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACATTTTATTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2335528	2336908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2335500_2336900
658639	contig_11429_pilon	+	1112	7	Intergenic	novelGene_60462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1028.31778756483	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	71	493	46162	48509	TRUE	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRELQRQLRQLR	45421	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47531_48475_48530_48899
658641	contig_10451_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_138301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	149	535	107251	106865	NA	65	ATGTTAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLYIKNTKILTTGPTSNIMINRGKVEVVKDFILLGSTINTHGSSSQKMRQYIALGKCAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVHLTQAMIFSIACYTCKSWTMNKEDQRRIDAFEYGVSKEH	107399	106109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_106100_107400
658642	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658650	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	355	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658653	contig_6270_pilon	+	2128	11	Intergenic	novelGene_99894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	166.287822765228	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	126	1694	1195735	1222846	FALSE	50	TAATTGAGTAGTGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLNDLKCRLSKAGQEHLLQFWNELEEAQQIKLYEELQAMNFEELNFFFQKAIEGFNQSSDQEKVDARMEPVPREVLGSATRDQDQLQAWESEGLFQISQNKVAVLLLAGGQGTRLGVAYPKGMYDVGLPSHKTLFQIQAERILKLQQLAEKYHGNKCIIPWYIMTSGRTMESTKEFFAKHKYFGLKKENVIFFQQGMLPAMRFDGKIILEERSSVSMAPDGNGGLYRALAAQNIVEDMEQRGIWSIHVYCVDNILVKVADPRFIGFCIQKGADCGAKVVEKTNPTEPVGVVCRVDGVYQVVEYSEISLATAQKRSSDGRLLFNAGNIANHFFTVPFLRDVVNIYEPQLQHHVAQKKIPYVDSQGQLIKPDKPNGIKMEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRSATNGKSETITADVNHNLKDANDVPIQCEISPLISYAGEGLENYVADKEFHAPLIIDENGIHELVKNGL	1187507	1223280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1187584_1195685_1196015_1205315_1205521_1208027_1208204_1209532_1209706_1214260_1214455_1215539_1215681_1216884_1217074_1218207_1218259_1221864_1221932_1222753
658657	contig_4336_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_152364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTCCCCTCCGCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365858	366839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_365900_366800
658658	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
658659	contig_9668_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_58198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510675	508107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_508100_510700
658667	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_90586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658669	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_94837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658675	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658686	SIRV2	-	623	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4250	34	3075	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
658693	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658696	contig_709_pilon	+	2562	12	Intergenic	novelGene_57629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.7210859828708	457	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	587	1492	2691473	2701317	FALSE	15	GACTTTGTGATGAGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681021	2702387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681044_2686053_2686113_2686157_2686218_2688679_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
658700	contig_9363_pilon	-	2380	9	Intergenic	novelGene_6688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	376.491699775706	595	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	141	956	1283701	1275445	TRUE	25	CTACAGTCGGCATAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRRHESQGELSSGTEAPGTQEGPTHDGTPLTEPGTSELREPLPTQLRPPLSESALAFVVALGASSSEEVELQLQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRQVEELCQRVYSRGDSEPPSEVAQARTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEVESRLWKQPSWLKT	1283924	1271726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272942_1275152_1275255_1275337_1275479_1281143_1281277_1281845_1282053_1282733_1282876_1283009_1283178_1283569_1283763_1283845
658701	contig_11815_pilon	-	1119	6	Intergenic	novelGene_50915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_5	161.285585220751	1363	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	193	678	201922	190956	FALSE	25	GACACAGGATGTGTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQFGPSALINLSNFSSIKPEPASTPPQGSMANSTTVVKIPGTPGTGGRLSPENNQVLTKKKLQDLVREVDPNEQLDEDVEEMLLQIADDFIESVVTAACQLARHRKSSTLEVKDVQLHLERQWNMWIPGFGSEEIRPYKKACTTEAHKQRMALIRKTTKK	217134	190514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_190992_192707_192797_196139_196255_199989_200068_201754_202007_217026
658707	contig_3095_pilon	-	1133	5	Intergenic	novelGene_75209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1322.24288615973	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	2	946	255481	246561	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKASVFCRAPALTPEDILTGIASCSSVMSASSLLRVLAACVCLVPLGDLSPSVVLAQLPGHLL	255482	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246746_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
658709	contig_17440_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_7654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3553	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
658710	contig_6710_pilon	-	497	2	Intergenic	novelGene_98005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	25	TCTTCTTTAACTTTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658720	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_97068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658724	contig_9656_pilon	-	1272	11	Intergenic	novelGene_121919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	345.678810458495	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	33	653	446594	438023	TRUE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHR	446626	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_437980_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
658731	SIRV2	-	642	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	3	2972	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
658739	contig_3095_pilon	-	1158	7	Intergenic	novelGene_75252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1110.34160159035	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	66	824	255481	246716	FALSE	30	ATGAATTATCTGTACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255546	246381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253694_253732_253806_255384
658741	contig_11815_pilon	-	1768	3	Intergenic	novelGene_50906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	157	333	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	299	331	155616	155584	TRUE	30	AAATGCATATCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSRRLVCLFFPESRLAVYPRPSPAIPAPRRHHPVTRRGCLLSVRDVERDTRAGPAGLAGLRPHSQLRGPEPTRLRLSPASPCAALRSHLTDVLNEDFRMIEIDGLSGE	156956	153849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_155255_155551_155640_156681
658742	contig_14341_pilon	+	1027	6	Intergenic	novelGene_111839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2344.85985935194	8	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	587	976	550058	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_549016_549806_550151_550355_550485_551481_551581_551668
658748	contig_5039_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_64953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGTGTAGTAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1630686	1632482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1630700_1632500
658753	contig_12019_pilon	+	1130	5	Intergenic	novelGene_87637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.4313863316944	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	459	782	5225	8336	FALSE	25	TGTGATGTTATGGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2044	8684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_5400_6114_6226_8298
658756	contig_3602_pilon	-	1332	7	Intergenic	novelGene_60639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	214.911157354744	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	238	675	1123707	1106687	FALSE	10	TGAGTCTCTTTTCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLRQSGKHVQNGQKLECCRKRFLPGGPAASAAPEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139508	1106029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1119221_1119277_1123651_1123732_1139295
658758	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_89623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
658764	contig_9706_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_20841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2234	2736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
658771	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658772	contig_17144_pilon	-	1299	10	Intergenic	novelGene_29418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1514.14555622374	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	205	1281	174597	166092	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHSLLYLLPVILVS	174917	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166132_168203_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
658777	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658784	contig_1532_pilon	+	1685	5	Intergenic	novelGene_37376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAATTTTGCCCAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12363	28938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13518_15732_15889_17971_18111_27255_27379_28825
658790	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658791	contig_7440_pilon	+	1393	11	Intergenic	novelGene_61168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAACCTAGGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53823	74556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_+_54325_56284_56407_56648_56709_58967_59064_59972_60069_65874_65929_66358_66442_69429_69520_71069_71184_72914_73007_74471
658797	contig_2476_pilon	-	2397	3	Intergenic	novelGene_157631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	34	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGACCAGAGAATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412036	358123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_359920_411258_411343_411519
658800	contig_7378_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_120238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTTTTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177356	177658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_177400_177700
658803	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658804	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658813	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_17165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658816	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91670	1	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
658829	contig_17440_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_7612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCGCTACCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
658831	contig_7151_pilon	-	1889	12	Intergenic	novelGene_40675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	150.359733927594	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	570	1427	12708	4371	TRUE	25	TCTGAGTTTCTCAACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREAQVQAQTLSPTSSPYLWSSASFWGPFSSWSLSSWELSCTDGEQSSESYLVLKVLSMRLCTRILMITFYNQRRRTCWTTQENCLMSH	18279	1832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5920_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13570_13625_13676_13782_13876_18160
658833	contig_5487_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_157649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCCTGAGTTAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200290	200717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5487_pilon_+_200300_200700
658840	contig_7171_pilon	+	1462	8	Intergenic	novelGene_101350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	102.773577164879	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	70	825	1321960	1325806	TRUE	20	AGAACCTGGTGACCTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGGLPGPPLWRPPDAYSRSSVRMAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKVTLGLGGRPHCPPLLAGPEPTAPFSSSAPSPSSQPSMGAALVQVSLQPHPGRSLWLGPFWLLSFRLSQWPTASDVWLLRLDPHMQAHVPRWRG	1321890	1328781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
658841	contig_500_pilon	-	1206	8	Intergenic	novelGene_31033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTCTGGGCCCCGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499588	1485756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485803_1494306_1494462_1495348_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498076_1498880_1498972_1499275
658842	contig_8020_pilon	+	2795	6	Intergenic	novelGene_114437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	8.23164625090267	146	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	103	1341	317370	331625	FALSE	10	GGTACCTGGCCTAGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPAAGLSESPVPGPRHEFGALNLHVGPESPAHAMGLCLCPNRAALLPGGLLYLLLLLMLLADPGLLARRHPPVVLVPGDLGNQLEAKLDKPTVVHYLCSKKTDSYFTLWLNLEMLLPVIIDCWIDNIRLIYNGTSRATQFPDGVDVRVPGFGQTFSLEFLDPSKSSVGSYFHTMVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317267	333079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_321514_321672_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
658843	contig_8259_pilon	+	2512	4	Intergenic	novelGene_148857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	92.1845974119321	1674	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	92	418	57950	63870	FALSE	40	GCATAATGAAGGAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSSSSAGGVSGSSVTGSGFSVSDLAPPRKALFTYPKGAGEMLEDGSERFLCESVFSYQVASTLKQVKHDQQVARMEKLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTPS	53107	65964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53172_57922_58092_62754_62830_63760
658852	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658855	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
658871	contig_16098_pilon	-	1152	12	Intergenic	novelGene_45783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	304.373411377734	4390	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	563	886	34695	31519	TRUE	5	TGTAGCTCTCTTGGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAHPPFSFLLREVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36360	31093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35522_35603_35720_35749_35907_36011_36295
658875	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_96908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658879	contig_6710_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_89145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653678	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
658885	contig_17274_pilon	+	2166	19	Intergenic	novelGene_26534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_1	298.898993013846	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	58	1818	131715	208251	FALSE	20	TTGAACACTGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKVIIT	131657	208599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197
658886	contig_9415_pilon	+	310	3	Intergenic	novelGene_109843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	35.5	54	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTTAATATTTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1952292	1956536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1952355_1953653_1953770_1956404
658887	contig_5945_pilon	-	1436	8	Intergenic	novelGene_104563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.013069318928	12	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	68	796	249708	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPELNAASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249775	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_215924_216030_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
658890	scaffold_12124_pilon	-	2374	2	Intergenic	novelGene_22430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	104	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	66	2048	1674282	1672300	FALSE	25	TTACATTTGGTTTAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGEIFESHGTKGHNKQGRYLSMLPIFKRSHTVENLCESNEGNKCGKIFSRMPDLNVLKRTASEINPFECCESGKAFMDHSSHNPRNVSHTGCSTCQCKECGEACSCPSHLTTPMRTVNRKKPRKCKVCGKDLICTSTLQNPVTTLTGEKRYECNECGKYFCNFSSFWTHLKGHNRACEQYCKTYSDQFLILRKKLHHRGKLYECKDCGKVFKYNSSLTQHMNVHSGERPYECEKCGKAFRHSGSLSTHIKTHSAVRPYKCKQCGKAFSYSSVLTTHMRTHSGERPYECKECGKAFSYYSSLTSHKNSHSGERPYECKQCGKAFSHSSALTTHGRIHSGEKPYECKQCGKVFRQASNLTTHRRIHSGQKPYKCKECGKAFSQSSSLTMHKRTHSGEKPYECRECGKAFRNLSNLTSHIKSHSGERPYQCKQCGKVFSHSSSLTKHKRTHSGERPFECKQCGKAFSDSSYLTKHIRTHSGERPYKCKECGKAFTRSAHLTLHIKTHSGERPYECKQCGKAFSQLSNLTSHIKTHSGERPYECKECGKAFSQSYHLTSHIRTHSGEKPYVCKECRKAFSCSSGLTRHIRTHSGERPYECKQCGKAFSRSSSLNTHIRTHSGEKPYECKECGKAFSHFSSLYAHMRTHSGEKAYERKECGKAFRQAAHLMQHVRTHSGETTLCQK	1675096	1671973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1674284_1675032
658893	contig_9594_pilon	+	1719	3	Intergenic	novelGene_73955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	592	junction_2	610.5	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	468	905	319775	322067	FALSE	10	TGGGATTTTTTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGEVPSLFPAC	319307	322881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_319904_321480_321659_321936
658894	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
658895	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_113873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	16	345	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14424	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
658903	contig_8978_pilon	-	1090	6	Intergenic	novelGene_49337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	900.560492138091	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	28	774	194082	190787	FALSE	30	ATAAGAATGTCTGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHHVTP	194109	190470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190802_192302_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
658905	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658907	contig_10500_pilon	+	2683	20	Intergenic	novelGene_41162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTAAAAGCCCGTGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254500	1290751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1254544_1258136_1258273_1260918_1261003_1261086_1261267_1262166_1262314_1262391_1262527_1262785_1262950_1268146_1268272_1268411_1268585_1268665_1268773_1268810_1268849_1270049_1270261_1272017_1272105_1275637_1275833_1278008_1278154_1278498_1278730_1282878_1283033_1283520_1283629_1284882_1284955_1290603
658912	contig_18156_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_101451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36204	38080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_36200_38100
658916	contig_7091_pilon	+	1776	11	Intergenic	novelGene_131766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103.272890924966	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	131	1300	349798	435147	FALSE	35	CTAAGTGATCCAAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349667	435623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354371_400029_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
658924	contig_14814_pilon	-	613	3	Intergenic	novelGene_137715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3809	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCGCGGGCCGGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283810	279407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_279520_282887_282990_283411
658934	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_16523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27833	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
658935	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
658946	contig_14666_pilon	-	1292	6	Intergenic	novelGene_39533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	961.517633743656	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	259	870	458202	449808	FALSE	15	CTGAGCCTGAGTGTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	459132	449385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_459031
658947	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
658954	SIRV7	-	326	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33230	13	11	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
658960	contig_5947_pilon	+	1800	8	Intergenic	novelGene_101520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	419.830383631781	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	153	1040	509741	544858	FALSE	25	AATTTTTTTCTGTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASSLPPSLLPLPSSSFPSSPPPPRTAGRGTRAGQQPESITPTVELNALCMKLGKKPMYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGAYPPRYFYPFPVPPLLYQVELSVGGQQFNGKGRTRQAAKHDAAAKALRILQNEPLPERLEVNGRESEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFEVARESGPPHMKSFVTKVSVGQFIGEGEGKSKKISKKNAAIAVLEELKKLPPLPTVERVKPRIKKKTKSIVKLHTGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALNGNDTRSWFR	476422	545618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_476537_509702_509842_511128_511295_523233_523333_536193_536407_537648_537793_539875_540010_544827
658961	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
658976	contig_10426_pilon	-	2377	7	Intergenic	novelGene_144665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_6	54.6801304558307	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	25	537	104586	73615	TRUE	30	CATTTCATAGAACATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGKHKCIENVSRQNCPICLEDIHTSRVVAHVLPCGHLLHR	104610	68366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_69031_72438_73678_73789_73835_76253_76333_96657_96774_97008_97129_104496
658982	contig_10002_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_157651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAGTGATATTTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293310	291210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_291200_293300
658987	contig_2933_pilon	+	3261	3	Intergenic	novelGene_111322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_2	34.5	192	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	208	681	535183	535656	FALSE	50	ACAATAAACTTCCTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALWKDSGIREAFSRRSEFQLGESVKYFLDNLDRIGQLNYFPSKQDILLARKATKGIVEHDFVIKKIPFKMVDVGGQRSQRQKWFQCFDGITSILFMVSSSEYDQVLMEDRRTNRLVESMNIFETIVNNKLFINVSIILFLNKTDLLVEKVKTVSIKKHFPDFRGDPHRLEDVQRYLVQCFDRKRRNRSKPLFHHFTTAIDTENIRFVFHAVKDTILQENLKDIMLQ	464843	538236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_464904_532923_532975_535086
658988	contig_19640_pilon	-	1247	2	Intergenic	novelGene_134859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATCAAAGGATTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46571	45105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_45170_45388
658989	contig_6445_pilon	+	2442	1	Intergenic	novelGene_76970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1488	1850	56064	56426	NA	50	AAAAAACCCAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASTGGSPAASSLQRNLTAKVVKGLSNHPCGLHCTDGETEPARRDWPQVELGTESKLPSPSPVFAAWHVNWLLGPKPRGLGEEGSCSGPLSLTSGPSLCKTICSDHVVSRGTWRRLVPG	54576	57018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_54600_57000
659001	contig_5495_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_157670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544818	546298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_544800_546300
659008	SIRV7	-	278	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69006	2	35787	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78951	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
659009	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659012	contig_14041_pilon	-	1873	13	Intergenic	novelGene_144029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_3	30.5762934676887	348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	130	1296	80924	38213	TRUE	35	TTTAAAAATGTGGGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRCQCVCPSLLHCLPSPLPPPPLPESSQPPALRVADTSLDRNFMNKHQKPVLTGQRFKTRKRDEKEKFEPTVFRDTLIQGLNEAGDDLEAVAKFLDSTGSRLDYRRYADTLFDILVAGSMLAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVVLYIKEEMKRNDLPETAVIGLLWTCIMNAVEWNKKEELVAEQALKHLKQYAPLLAVFSSQGQSELILLQKVQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKGSPRLTTGFHCEDSIVSRF	104602	26417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_26871_30653_30777_38211_38272_41195_41335_42583_42731_44660_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73055_73233_80866_80932_104480
659014	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_94275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659019	contig_7695_pilon	-	1451	4	Intergenic	novelGene_41562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	192.147512777727	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	78	1028	380076	375835	TRUE	30	TAAATGGTTTTTCAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRHLLPTSGAAAASAAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381082	373575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376429_379719_380089_381017
659021	contig_14322_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_115677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTGGTGTAAGATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
659029	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_94310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
659044	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659045	SIRV5	+	349	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	7	-97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGCGACAATTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2264_2316_3298_3405_3483
659047	contig_12019_pilon	+	1428	4	Intergenic	novelGene_87782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1243	junction_2	816.730473697821	120	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	994	1395	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764786	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_765922_766639_766813_767133
659064	contig_12977_pilon	+	1406	13	Intergenic	novelGene_122780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	700.745912106045	51	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	190	846	10887	54031	TRUE	5	TATTTCTCCTTGGCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEPQWPT	10697	58794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
659067	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659072	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659076	contig_18869_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_56055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATCCTAAGCAGCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
659088	contig_10734_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_51412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	0	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	88	327	2091217	2079501	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRKEVGGARSCYGAEFPGRADRVEAVAAMKAGATSMWASCCGLLNEVMGTGAVRGQQAGFAGGTGPFRFTPNPDFSYPPAATEGPDIVCKACGLSFSVFRKKVSWMR	2091304	2077080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2079735_2091211
659097	contig_7396_pilon	-	1969	15	Intergenic	novelGene_79612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3011.93572918392	2	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	133	1518	255163	246385	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257486	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
659104	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659108	contig_8616_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_72562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	229	633	436208	431223	TRUE	5	AGGGGGTGGGGTCCTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPISPETKHHASCIFAPAKETAIPLLHPPHREGKLLASEDPDSRNGAAIVGSKEDDTGKGILPQLVQSLKHSCDEVAAHEGLGELFREAVLGIPQGPAILIKVLPKIRQCHRQCVLIGVLALKFIQHKAYLLGR	436436	425760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_425788_426885_427045_427754_427820_427981_428124_428647_428796_431121_431243_435729_435897_435990
659119	SIRV4	+	437	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	867	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2322	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2800
659120	SIRV5	-	227	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATAAACTGCTCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10864
659122	contig_16724_pilon	-	1345	6	Intergenic	novelGene_105297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	751.091206179383	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	285	614	560992	541872	FALSE	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	568181	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568103
659133	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659137	contig_11386_pilon	+	1886	8	Intergenic	novelGene_82752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	459.951505873284	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	576	1280	17940	27749	TRUE	15	CCACTCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7876	32453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11261_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_27700_27893_31990
659138	contig_9471_pilon	-	2327	8	Intergenic	novelGene_21716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	222.734215180885	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	261	1292	153444	126302	FALSE	15	GCCACCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQKLFFIQIYVVSEDQQEVSSLLEVDGAGMNIVESKVRQPGPCMVHREADFLWSLCRADVALLEQSPCSPSVYLQCLSQKLQQERKRPLLDLHIELHSKVYDWNSRVSAKEKYSVWLQHTLRKKLILSCK	166992	125266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_128295_128545_147806_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_161599_161730_166912
659146	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659157	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
659159	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	11	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
659164	contig_3095_pilon	+	1244	5	Intergenic	novelGene_75058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
659167	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659170	contig_15720_pilon	+	970	8	Intergenic	novelGene_41873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	568	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	278497	279803	TRUE	20	GATCGAGCAGCCCACCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278494	283997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281844_282624_282750_283785
659179	contig_14925_pilon	-	1674	5	Intergenic	novelGene_55286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1031.13781207945	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	75	488	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129471	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114661_114779_115150_115208_115821_116101_129432
659183	SIRV5	-	418	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACACTTCGCACGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
659184	contig_15897_pilon	+	3084	19	Intergenic	novelGene_49501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	81.6969709458582	217	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	29	1747	42395	95331	FALSE	15	AGGATTTTTAGTCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELVQGQSAPVGMKAEGFVDALHRVRQIAAKIDSIPHLNNSTPLVDPSVYGYGVQKRPLDDGVGNQLGALVHQRAVITEEFKVPDKMVGFIIGRGGEQISRIQAESGCKIQIASESSGIPERPCVLTGTPESIEQAKRLLGQIVDRCRNGPGFHNDIDGNSTIQEILIPASKVGLVIGKGGETIKQLQERTGVKMVMIQDGPLPTGADKPLRITGDPFKVQQAREMVLEIIREKDQADFRGVRSDFSSRMGGGSIEVSVPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGISPERAAQVMGPPDRCQHAAHFINELILTAQERDGFGGLSVARGRGRGRGDWSMGTPGGVQEVTYTVPADKCGLVIGKGGENIKSINQQSGAHVELQRNPPPNTDPNLRIFTIRGVPQQIEVARHLIDEKVGGTSLGAPGAFGQNPFSQPPATPHQNTFPPRSSGCFPNIAAKVNGNPHSTPVSGPPAFLTQGWGSTYQAWQQPTQQVPSQQSQPQSSQPDYSKAWEDYYKKQSHAASAAPQASSPPDYTMAWAEYYRQQVAFYGQTLGQAQAHSQEQ	42366	96668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_42479_55974_56081_68438_68473_70925_70976_71383_71456_72738_72797_74873_75037_78114_78214_79705_79811_80242_80346_81355_81457_83615_83758_87940_88102_88857_88932_89261_89343_89579_89657_92659_92732_94120_94249_95322
659186	contig_401_pilon	-	1576	4	Intergenic	novelGene_42867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	370.155222695681	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	250	1371	1724288	1721973	TRUE	40	AGTGCTCTACAGAAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728707	1721721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1721827_1721872_1722981_1724174_1724346_1728515
659207	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659212	contig_6589_pilon	+	2498	5	Intergenic	novelGene_26314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	21	junction_4	51.2560971982846	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	48	704	2353549	2354298	TRUE	40	ATTTGAAAATGTTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSQRVSGPAPPTAEMPLLLLLLLSLLWGIECVGSQGSQAGAGASTNPRSPRWYRDLVDGYQLQVQKSVTVQEGLCVFIPCIFSYPPDGWKDSDPVLGYWFQEQAYNFNHEQVAPVATNNPYRKVDSQTRDRFQLLGEPWNRSCSLVIRDAQRRDTATYFFRVERGNTVKFSFKKYTLALEVTGLTQKPDVYVPETLEPGRPVTLLCVFPGDFEGCPAPKFSWTGVAVSPPRS	2353501	2359824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2354054_2354146_2354433_2354880_2354981_2355976_2356059_2358346
659215	contig_9218_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_157690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTTTTGTTATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370843	372059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_370800_372100
659219	contig_6048_pilon	-	3043	9	Intergenic	novelGene_73217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	40.8241273636069	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	171	1904	1645874	1609163	FALSE	65	TCTCCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661959	1608023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1661879
659222	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659233	contig_15991_pilon	-	877	6	Intergenic	novelGene_70874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	20	808	105009	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105028	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
659235	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
659249	contig_8693_pilon	+	1961	6	Intergenic	novelGene_150860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	12.5602547744861	257	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	52	645	1056255	1073759	TRUE	10	CTTTCTGGCCCAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPTGARGEKPQRRRAAQMPGGAGLIAAAVTALVAALLLLRQEDSGSGAGSREPPPRLLWAEEVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAEGFVRVDRDYVLKSAELAKAGGVQTFQLAVLSRSR	1056203	1077284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1056390_1056608_1056852_1061608_1061717_1073651_1073791_1075676_1075739_1076061
659253	contig_16461_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_139213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTCACCATCAGCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940	427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
659255	contig_15326_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_157692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10652	12164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_10700_12200
659260	contig_8330_pilon	-	2497	12	Intergenic	novelGene_71739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	40.1725616651938	636	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	807	1430	519774	515388	FALSE	15	CTGCCTATTCTGGCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	527616	514320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520117_520304_520379_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_527544
659267	contig_2100_pilon	+	1289	10	Intergenic	novelGene_50695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAGCCACCTCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1185526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172369_1175560_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1180280_1182721_1182824_1185422
659274	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
659282	SIRV4	+	336	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1435	632	980	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
659283	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
659286	contig_2799_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_85490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538479	539787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_538500_539800
659288	contig_16999_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_85014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTGTTTTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359985	360731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_360000_360700
659290	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659293	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659302	contig_15498_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_42632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.023036003822	2	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	609	1391	682266	686124	FALSE	55	AAAAAAAAAATTGCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675016	686734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675095_679255_679550_681329_681424_682123_682274_682834_682999_683984_684101_684485_684723_685866
659307	contig_14322_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_116196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671619	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
659308	SIRV5	+	438	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3244_3405_3483
659309	contig_9206_pilon	+	3190	3	Intergenic	novelGene_137495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	481	2	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	331	2250	318283	320202	FALSE	30	CCAAATGAATCATGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEFESQWGYDQRNYKGMTTTQNKNLSGTKEQHNKSWNNLHLEQSISVRKSMYQYLKHDKSFIRNLLKLKYNIGYAANKSIKYFENRLGLNFPSYLDELQRFQTEEKIYECSQVEKSIKNCSSISSLQRFPPIVKTNICNKNGKDFLSPLPTQLQTTHIREKPYKCNECGKTFSQCSVLTKHERIHSEHRPYKCNECGKAFKQFSNLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFNQNSHLVSHCRIHTGEKPHKCNVCGKVFNQNSHLASHCRIHTGEKPYKCMKCGKAFNKRSYLWDHERIHTGEKPYNCTECGKAFRQWSSLRIHRRIHTGEKPYKCNECGKAFKQCSHLTKHQNIHPGEKQHKCNVCGKTFIHGSGLVKHQRIHTGEKPHKCNECGKAYIQSSSLVEHRRIHTGETPYKCNECGKTFTVRSSLTKHKRNHTGEKPYKCNECGKAYTKFAHLTRHQKIHSEKKHCESDVGGSAFIHSSTLGGCQRAHSREKPYKCNECGKSFNWSSRLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKAFSQNSNLTTHQIIHTGEKPYKCNECDKDFKQYSSLIRHQNIHPGEKPYKCSMCNKAFIRHSHLWGHEKIHTGERTYKCIECGKTFRQWSDFRIHQRIHTGEKP	305309	321142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_305433_307266_307334_318142
659312	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_92006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	200	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657496	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657497	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659318	SIRV4	+	332	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1439	632	984	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2439	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
659326	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_16421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659334	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_18479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659340	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
659345	contig_2054_pilon	+	2352	2	Intergenic	novelGene_51659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTTTCCAGGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10286	19109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16913
659350	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_96087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659356	contig_15859_pilon	-	3501	6	Intergenic	novelGene_50192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	133.358164354493	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	89	1384	349672	341031	FALSE	35	TTTTTATATATAATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352692	338913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352636
659361	contig_2204_pilon	+	1580	7	Intergenic	novelGene_71651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	50836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
659362	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659366	contig_7744_pilon	+	2412	8	Intergenic	novelGene_62576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_7	101.641828124497	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1407	1976	889342	890785	FALSE	20	GCTAAAAGCGTCGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	887750	891221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
659367	contig_10324_pilon	-	2052	2	Intergenic	novelGene_7917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	66	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTTAAACAGTTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892309	890074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_892059_892241
659374	contig_15021_pilon	-	1542	10	Intergenic	novelGene_26989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	116.726651246025	346	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	28	1110	428082	389550	FALSE	30	CTCAGGTGCAAGATGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAERGSGQQQSQEMMEVDRRVESEESGDEEGKKHSGGIVADLSAQSLKDREEHSEVDAGEEQELPVDMEAISLDGDAEDVDLNHYRIGKIEGFEVLKKVKTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRAIENIDTLTNLDSLFLGKNKITKLQNLDALTSLTVLSMQSNRLTKIEGLQSLVNLRELYLSHNGIEVIEGLENNNKLTMLDLASNRIKKIENISHLTELQEFWMNDNLIESWSDLDELKGARSLETVYLERNPLQKDPQYRRKIMLALPSVRQIDATFVRF	428109	389117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_389727_411764_411852_416003_416109_417090_417208_419336_419500_420184_420316_420895_420962_421592_421649_426120_426250_428030
659375	contig_15498_pilon	-	2438	4	Intergenic	novelGene_42626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	18.4451137763426	4	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	73	1131	543957	534858	FALSE	30	TTTGAAACCAAGTGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGRPSLCQFILLGTSSVVTAILYSVYRQKAQVSHELKGAKKIHLGEDLKSILLEAPGKCVPYAVIEGAVRSVKETLNSQFVENCKGVIQRLTLQEHKMVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	544029	533550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535588_537666_537788_538368_538457_543837
659376	contig_2646_pilon	-	1943	8	Intergenic	novelGene_69636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	493.932326191699	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1056	1799	2071097	2069499	FALSE	15	TTATCTCCAAGGTCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2072464	2069354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071477_2071662_2071765_2071890
659401	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	8	364	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14416	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
659405	contig_5988_pilon	+	1975	15	Intergenic	novelGene_16049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	537	854	1042639	1043971	TRUE	20	GTGAGCTACATCTACTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSPLFFSLMTPCFREIFQAGPSRDRSTSIWLSLVALPRVISRERIRYRTMRPRSTASVWLSKSGELMPVMLSTSTCHLCSSCSSCRISRFWRRSATVSSGPLT	1041987	1052670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1042435_1042549_1042678_1042846_1042933_1043068_1043151_1043344_1043444_1043959_1044044_1046369_1046509_1046787_1046896_1047861_1047979_1048113_1048265_1048856_1048996_1049349_1049491_1050008_1050127_1051476_1051541_1052598
659409	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659411	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_89082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659423	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
659427	contig_15286_pilon	-	2073	9	Intergenic	novelGene_124432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAACAACAACAACAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26027	7913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_-_8182_8427_8554_10756_10932_11417_11528_15370_15473_16535_16633_17060_17189_22662_22766_25063
659428	contig_10861_pilon	+	1197	5	Intergenic	novelGene_39441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.4011138460315	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	329	955	2433965	2478785	FALSE	20	CTGCACGATTGCCATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFVIRTPRVQNSPQKKDPGAKMYKQATIESLKRVVVVEDIKRWKTILELPDQTKENLVEALQELKKKIPSREVLKSTRIGHTVNKMRKHSDSEVACLAREVYTEWRTFMEKHSDRPSIEVRSDPKTEMFRKNAQKLLSEALELKMDHLLVENIERETFHLCSRLINGPYRRTVRALVFTLKHQAEIRAQVKNGLLPVSTFVKNHKK	2433200	2479027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2433486_2433921_2434067_2451185_2451328_2469337_2469532_2478596
659430	contig_10861_pilon	+	1665	2	Intergenic	novelGene_39445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	10	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACCCACTTGTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2507965	2526622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2508105_2525096
659449	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_16657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659453	contig_8156_pilon	-	2483	3	Intergenic	novelGene_98947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	14.5	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	919	1422	441382	403839	FALSE	50	GAGAACAAACTATTGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWVRAVLCQSQPWVRQ	442300	402777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_404004_404665_404810_441187
659454	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659473	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	632	1085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
659483	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
659501	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_97516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659514	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659516	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
659517	contig_6496_pilon	+	2288	13	Intergenic	novelGene_103488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	89.6187526878908	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	317	1699	452626	465152	FALSE	15	GTTCTCTCAGCAGTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTELFNYIDENQDRYVKKLAEWVAIQSVSAWPEKRSEIRRMMEVAAADITKLGGSVELVDIGKQKLPDGSEIPLPPVLLGKLGTDPKKKTVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLEERDGKLYGRGSTDDKGPVAGWMNALEAFQKTNQEIPVNVRFCLEGMEESGSEGLDKLIFAQKDTFFKDVDYICISDNYWLGKRKPCVTYGLRGICYFFIEVECSDKDLHSGVYGGSVHEAMTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRPIRRRGNYCSGDLLAPSF	450309	465741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_450461_451306_451439_452592_452686_453536_453681_455572_455736_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461545_462836_463002_463278_463421_463637_463786_465094
659529	contig_6710_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_96347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTCAGGGTGATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	653759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
659533	contig_14322_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_116363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
659540	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
659541	contig_20614_pilon	-	1382	4	Intergenic	novelGene_107586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.71708159548	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCAGTGTGGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302066	292137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_293189_293252_293369_295570_295693_301973
659543	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659544	contig_5671_pilon	+	898	5	Intergenic	novelGene_79469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1953.16414760767	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	6	476	370430	531275	FALSE	40	ACCTATACACACTATGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKVCLQMKKEPHRKEFFKICLWILTMRLMKCLLRKAIKTMNPKPKKYLCSQFPEIC	370424	531697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392930_521218_521303_531205
659546	contig_6233_pilon	+	2022	6	Intergenic	novelGene_74757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_1	188.92961652425	39	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	104	790	113021	126041	FALSE	10	ATTGCTCTGTATCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKL	112917	127273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119756_123348_123485_125129_125231_125888
659551	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659565	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659580	contig_18869_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_56019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73534	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
659581	contig_1861_pilon	-	1373	10	Intergenic	novelGene_77662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_7	73.27691432395	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	225	1265	99858	87440	FALSE	15	ATCATGCCTCCCACTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	102867	87331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825
659585	contig_3584_pilon	+	1147	4	Intergenic	novelGene_108174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	658.72047688429	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	30	998	527096	531381	FALSE	5	CTCATTTCTGTGCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527066	531530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_530602
659586	contig_19769_pilon	+	1012	5	Intergenic	novelGene_102290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	221	994	87249	89322	FALSE	10	GCTTGTTCTCCTGCCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87028	89340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
659589	contig_5445_pilon	+	1135	4	Intergenic	novelGene_135409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	1365.07541509211	339	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51583	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52273_52328_52580_52635_53127
659594	contig_1275_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_108844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	84	773	747279	747968	FALSE	25	GTTGCATGGTAGCATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746553	748099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
659621	contig_3627_pilon	+	532	3	Intergenic	novelGene_78499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	54	527	621315	634316	FALSE	20	AGGGTTTCCCCACCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621261	634321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
659623	SIRV6	+	441	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10307	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11394	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
659627	contig_6823_pilon	-	2055	14	Intergenic	novelGene_131225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_3	11.3981208873794	151	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	287	1651	320747	248884	FALSE	15	GTTAGCCAGTTTCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLLSLIQSPEPICARSPDLIANPRIHSGPPPSGLLILAPSLRPPSVSVQFASCTVPKIQTRLSPRPGSAPRPNHVLRSPQTQTRLEPKEARLSGMFLAPRRLCSFGSSAKFLKTIYPSNILGLPTSAKMSLKLKNARRIEGLDSNMWVEFTKLAADPSVVNLGQGLPDISPPIHVKEELSKVAAIDGMNQYTRGFGHPSLVTALSCLYEKFYPNKINPNKEILVTVGAYGSLFSAIQGLIDEGDEVIIIMPFFDCYEPMVRMVGATPVFIPLRSKPVDGKKWSSSDWTLDPQELASKFSSKTKAIIVNTPHNPMGKVYTKEELQVIADLCIKYDTLCISDEVYEWLVYTGNKHFKIATFPGMWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325680	248479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288707_288803_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_320648_320750_325396
659638	contig_9937_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_129214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAATATAGAAGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165938	165051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_165100_165900
659640	contig_12969_pilon	-	1882	4	Intergenic	novelGene_61674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.3541565040626	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	110	1879	392592	388664	FALSE	70	CATTCAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSKILLKLLTLEDVAVNFTWEEWQLLDPTQKELYWDVMLENYNNLISMGYQASKPHALSKLEQGEEPWIIEDEICSIVCPEMRKVDSHLKQHFQNQIFLKRIEQCTEQNAFENIIHLSKTHFPLMQNHDMFGLYRKTLKSNLSVASQNRTSEIKNPADFHRDRKNLLHGKHEQFHAEIKFPETAKCISTKSQVFKNQRTHSIEKPHACVECGKAYVKKSQLIYHQSIHQGENLHGCGQCGKSSRNFTFSKHQKTDTGEKPYIASEYGKSSTVKSSLTVHQQSHMGEKCYICSECGKGFTMKRYLIAHQRTHSGEKPYVCKECGKDFTVKSNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFTMKRYLVVHQRTHTGEKPYICNECGKGFTVKSNLVVHQRSHTGEKSYICNECGKGFTVKRTLIIHQRTHTGEKSYICNECGKGFTTKRTLVIHQRTHTGEKPYVCNECGKAFSQKICLIQHERCHTGNTPFVCTECGKSYSHKYGLITHQRIHTGEKPYECSECGKAFTTKSVLNVHRRTHTGERPYGCSDCEKAFSHLSNLVKHKRMHTREMCKFSQGESSFNRESKLITSK	392701	388660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_390187_390516_390613_390896_391024_392568
659642	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_93527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659643	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
659650	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
659651	contig_15063_pilon	+	1911	7	Intergenic	novelGene_13043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	3769.79772519546	6	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	426	1661	34808	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	30091	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
659655	contig_20693_pilon	+	1800	13	Intergenic	novelGene_60259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	588.219695115883	1	54	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	2	1315	19372	34284	FALSE	25	TTATTATGTATAGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTKMSQKVYIH	19370	34769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26227_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33001_34254
659659	contig_6710_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_97865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCCAAAGATGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653404	653832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
659668	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659677	contig_14441_pilon	+	1100	6	Intergenic	novelGene_100521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	376.400531349253	1308	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	485	913	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111135	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112608_112665_113185_113209_116578_116963_117220_117344_117539
659682	contig_14158_pilon	+	1757	5	Intergenic	novelGene_136115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	117.559293550106	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	135	605	18010	25162	TRUE	15	GTTCCTGTCTTTTACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	17875	26476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21301_24096_24236_25090_25959_26120
659690	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
659693	contig_9471_pilon	+	1726	12	Intergenic	novelGene_21771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	804.336141236469	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	739	1515	413930	417296	FALSE	30	TGTGCTTATCAAATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406877	417507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412832_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
659696	contig_10299_pilon	+	2800	15	Intergenic	novelGene_79711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	105.947715253076	3	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1781	2638	337976	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320531	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334341_334435_334782_334909_335174_336815_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
659704	contig_13097_pilon	+	2174	17	Intergenic	novelGene_107693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	606.859526064311	4	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	256	1353	184733	243884	TRUE	40	GAATATGAATGAGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPHYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGK	184477	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191674_195140_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215279_215382_225265_225360_226996_227161_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264255
659706	contig_3948_pilon	-	1460	12	Intergenic	novelGene_53416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_11	165.766588863592	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	119	1123	1975635	1933521	FALSE	20	GAAGCACTGGCTTTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975753	1933183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
659710	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_16424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659721	contig_6027_pilon	+	3338	1	Intergenic	novelGene_74415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104728	108066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_104700_108100
659724	contig_18363_pilon	+	2769	1	Intergenic	novelGene_157715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271312	274081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_+_271300_274100
659740	scaffold_17542_pilon	-	3707	1	Intergenic	novelGene_139235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	268	807	17	823	427003	426197	NA	35	TAAACTTGACTGGATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRSNMGPFGNTVTPEVHVFTNVHADACANNIAQRSQSVPLTVMMQTAFPNALQKQTNSKKITNVLLSKLDSDNDDAVRGLGMNNLPSNYTARMNLTQILETSTVFPSANPQNMIDSSTSVYEFQTPSYLTKSNSTDQITFSPGDNRAQSDLVEQRLDFSSTVKDLLSGDSLQTSQQLVGQVASDLANSASDFSSDIRLSSELSGSINDLNTLDPNLLFDPGRQQGQDDEATLEELKNDPLFQQICSESMNSMTSSGFEWIESKDHPTVEMLG	427019	423312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_423300_427000
659745	contig_7342_pilon	+	2724	12	Intergenic	novelGene_71126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGTAGGGGAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76601	83003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_76791_76885_77083_77208_77271_77666_77774_77843_77891_78712_78786_79009_79055_79142_79230_80345_80450_80855_80981_81073_82560_82801
659752	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_95023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659753	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	76	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659757	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
659764	contig_15063_pilon	+	1052	3	Intergenic	novelGene_14389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	94	915	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35177	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
659767	contig_3862_pilon	+	2157	2	Intergenic	novelGene_137405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	1651	2157	478241	478747	FALSE	30	CACGGAACAGGAGGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAREILETGNATGQGDPGDGMPPAREILETGNATGQGDPGDRECHRPGRSWRQGMPPAREILETGNASGQGDPGDRECQRPGRSWRQGMPAAREILETGNATGQGDPGDRECQRPGRSWRQGTPAAREILETGNATGQGDPGDRECYRPGRSWRQGMLPARKTWMEE	475998	478747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_476074_476665
659771	contig_8702_pilon	+	3311	10	Intergenic	novelGene_157726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	39.6596632472956	4	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	53	1891	47137	50874	FALSE	45	TAAAATGAATACTTACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWGWAGVKVAASPHAGMAEDEPDAKSPKTGARAPPGHAETGEPTTLLQRLRGSISKAVQNKVEGILQDVQKLSDNDKLYLYLQLPSGPSTGDKSSEPSTLSNEEYMYAYRWIRNHLEEHADTCLPKQSVYDAYRKYCESLACCRPLSTANFGKIIREIFPDIKARRLGGRGQSKYCYSGIRRKTLVSMPPLPGLDLKGSESPEMGPEVTPAPRDELVEAACALTCDWAERILKRSFSSIVEVARFLLQQHLISARSAHAHVLKAVGLAEEDEHAPRERSSKSKNGVENLEAGAQKKPEKPTQPPKELEPRAGAGASVRGERKKNVVETPAPAASNPQVNALVARLPLLLPRTPRSHLQPIRVSPPILAPRLPSGPLKVATLPLPSRGGGPPAAVPIINMILPTVPALPGPGRAPPVGLTQPQCTDNKEVGIGGDPGPQDKGVKRTAEVAVSEASGQDPPAKAAKQDIEDTGADAKRKRGRPRKKSGGSKERNSTPEKSAAALDSAQPSRLTLETWGSGRESNSAGGSERPGLMGEARKGTVLAQGREDGAISKGVRGSSSRHTKEAEDKILLVAPKVSVIKGSRSQKEALRLVKGEEETAAQGNKDLKGHVLQSCLPHECKDPKATPP	46228	52294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_46268_47123_47253_47471_47506_47909_47993_48254_48375_48555_48676_48797_48880_49182_49385_49628_49730_49893
659773	SIRV5	-	348	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTCTGCAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8364_8434_8590_10863
659774	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659779	contig_8550_pilon	+	1344	12	Intergenic	novelGene_72369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	25.5070886274372	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	168	1343	164974	184011	FALSE	50	TATTTTATAAGTATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPNINWKDIMKVDPDDLPRQEEVADNLLIFLSKVEINEIKSESQESLIHLFRVTQSLMKMKAQEVELALEEVEKAGEEQAKFENQLKSKLMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRDEIRQLEKQLEQKDRELEDMEKELEKEKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENEQLRQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSKKNYELVQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDDYNRMKAIVHQTDNVMDQLKKENEHYRLQVQELTELLKVKNEEDDPVMVAVSAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQKMLHNLREKLKNAQLDADKSNVMALQQGIKERDSHIKMLTEQIEQYTKEMEKNTFIIEDLKTELQRNKGNS	164211	184012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_164351_164945_165076_165234_165313_166346_166417_166722_166770_169394_169539_177885_177940_178681_178835_179229_179413_179982_180073_182584_182708_183879
659794	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	632	988	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
659796	contig_500_pilon	+	1223	7	Intergenic	novelGene_31083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_5	984.654832359487	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	395	808	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1494245	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
659801	contig_6137_pilon	+	2273	5	Intergenic	novelGene_59319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	72.3787779670257	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	125	484	1686492	1693045	TRUE	35	AAAATTGACTCCCTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTNLAAGIPSSKVKYSRLSSTDDGYIDLQFKKSPPKIPYKAIALATVLFLIGAFLIIIGSLLLAGYISKMGADRAVPVLIIGILVFLPGFYHLRIAYYASKGYRGYSYDDIPDFDD	1684003	1695157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684103_1686466_1686588_1688000_1688124_1692904_1694679_1695001
659802	contig_14923_pilon	-	2630	14	Intergenic	novelGene_157741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_12	56.6434921866634	549	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	40	1569	216009	183547	FALSE	15	TCCAAACTGTGTCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSWSRVCCSLAKRGHFSRISHGLQGVSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCVEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHLAHGKDFASRGIEMSEVRLNLEKMMEQKNTAVKALTGGIAHLFKQNKVIHVNGYGKITGKNQVTASKDDGSTQVIDTKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTVVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVTAVEFLGHIGGIGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGKAELITCDVLLVCIGRRPFTQNLGLEELGIELDSRGRIPVNTRFQTKLPNIYAIGDVVAGPMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF	216048	182485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_183613_183702_183793_185802_185941_186469_186660_186990_187162_188340_188532_194638_194741_195171_195316_195630_195732_205384_205455_206019_206089_206585_206666_213503_213583_215970
659811	contig_6740_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_142680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAAAAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617108	616452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_616500_617100
659831	contig_18406_pilon	-	3335	1	Intergenic	novelGene_88050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGTTCATTAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45425	42090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_42100_45400
659837	scaffold_13505_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_111671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGACGCAGGGACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870451	869654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_869700_870500
659841	contig_5832_pilon	-	2069	2	Intergenic	novelGene_134174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGCGGCCGCGCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570817	565681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_565750_568816
659846	contig_13481_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_119355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAAAAAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430016	429388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_429400_430000
659850	contig_5020_pilon	+	1411	8	Intergenic	novelGene_27806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1010.31179264985	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	365	793	122915	124183	TRUE	35	TAAAGCAAGCTCAACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEREYGAGPYAPWPFLSQLTTAPWFTHRCWHR	118460	126068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123406_124133_124363_124444_124547_124909_125056_125877
659852	contig_6842_pilon	-	1266	4	Intergenic	novelGene_130719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	307.21111091018	2434	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	80	361	433953	431912	TRUE	50	TAAAAACAATGAGTGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESVLLGCRALRQLLHSRLPAPLGPAMPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYRHDVPSTHLLAQ	434032	428941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431949_432547_432658_433818
659856	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
659859	contig_17440_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_7632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3452	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
659882	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
659892	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659915	contig_13608_pilon	-	2312	15	Intergenic	novelGene_52382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_7	210.484814518428	10	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	107	1957	470234	382381	FALSE	55	AGAAAATTTTGTAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETKTKLITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVSFKMLYCYCFIKSK	470340	382025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
659923	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659924	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_97117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
659926	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_16463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27818	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
659929	contig_12566_pilon	+	1728	9	Intergenic	novelGene_85985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	34.9928564138454	340	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	119	1069	5720	20878	FALSE	10	CTCTGTGGCTCAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVKVKVQPPDADPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPHIEAQQRAVAINRLLSMGQLDLLRSNTGLLYRIKDSQNAGKMKGSDNQEKLVYQIIEDAGNKGIWSRDIRYKSNLPLTEINKILKNLESKKLIKAVKSVAASKKKVYMLYNLQPDRSVTGGAWYSDQDFESEFVEVLNQQCFKFLQTKAETARESKQNPMIQRNSSFASSHEVWKYICELGISKVELSMEDIETILNTLIYDGKVEMTIIAAKEGTVGSVDGHMKLYRAVSAIIPPTGLVRAPCGLCPVFDDCHEGGEISPSNCIYMTEWLGF	5601	21537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5782_6777_6896_10514_10583_11005_11074_12274_12388_18152_18297_18516_18625_19493_19686_20800
659930	contig_10689_pilon	+	922	4	Intergenic	novelGene_118625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1784.12431056683	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	92	505	57608	61167	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTNFRFRHTFPVATLGISETFS	51270	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_61099
659931	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
659939	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659944	contig_12922_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_157774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTTTGTAACCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67260	65444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_-_65400_67300
659946	SIRV7	-	326	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56096_70893_70988_78841_78964_114680
659952	contig_5482_pilon	-	2472	11	Intergenic	novelGene_144486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAACAGACCGACAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565789	504033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_504336_539003_539089_541031_541139_543298_543456_544274_544409_551223_551378_557429_557549_559639_559738_559892_559999_561773_561851_564656
659965	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
659975	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_94868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
659979	contig_19362_pilon	+	1563	11	Intergenic	novelGene_157800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_1	250.805283038456	118	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	683	1561	132435	146380	FALSE	45	ATGTACATAATCTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKFELHPRIKQLIGKGLIKAAVTTGAWILTGGVNTGVAKHVGDALQEHASRSSRKICTIGIAPWGVIENRNDLVGRDVVAPYQTLLNPLSKLNVLNNLHSHFILVDDGTVGKYGAEVRLRRELEKTINQQRIHARIGQGVPVMALIFEGGPNVILTVLEYLQESPPVPVVVCEGTGRAADLLAYIYKQTEEGGSLPDAAEPDIISTIKKTFNFGQSEAVHLFQTLMECMKKKELITVFHIGSDEHQDIDVAILTALLKGTNASAFDQLILTLAWDRVDIAKNHVFVYGQQWL	78403	146382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_78663_120660_120741_124368_124408_128521_128721_132329_132544_134314_134440_140214_140387_141539_141715_143195_143320_144350_144424_146279
659984	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	64	513	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGTTTTATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
659999	contig_12270_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_114055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	16	327	14409	13875	FALSE	25	AGTTTATTACTGTCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14424	13872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
660003	contig_18970_pilon	-	3086	1	Intergenic	novelGene_157822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTTTCTATATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39152	36066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_36100_39200
660008	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660012	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660021	contig_10135_pilon	+	569	4	Intergenic	novelGene_106646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4231.1064221496	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCTCCCTTGCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116637	119944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119626
660022	contig_10135_pilon	+	382	2	Intergenic	novelGene_106664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7039	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTCATTCATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119625	120168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_119641_119801
660025	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660026	contig_5062_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_157856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702267	702907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_702300_702900
660029	contig_9839_pilon	+	1640	6	Intergenic	novelGene_88558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_2	156.688736034215	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	16	1053	255906	266616	FALSE	80	TTAAAAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSGISTKVQTVLPFGLTLKAYEIWMSSGTKSDQINL	255890	267203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322
660032	SIRV4	+	167	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1604	632	1149	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2604	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
660038	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_18111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27852	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660042	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
660050	contig_11224_pilon	+	2637	7	Intergenic	novelGene_124455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_5	277.450295848944	709	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	156	1277	211461	218076	FALSE	15	TCCCTACATTTTCCCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSASSHLNKGIKQVYMALPQGEKVQAMYIWIDGTGEGLRCKTRTLDSEPKCVEELPEWNFDGSSTFQSEGSNSDMYLIPAAMFRDPFRKDPNKLVFCEVFKYNRKPAETNLRHTCKRIMDMVSNHHPWFGMEQEYTLMGTDGHPFGWPSNGFPGPQGPYYCGVGADKAYGRDIVEAHYRACLYAGIKIGGTNAEVMPAQWEFQIGPCEGIDMGDHLWVARFILHRVCEDFGVIATFDPKPIPGNWNGAGCHTNFSTKAMREENGLKYIEESIEKLSKRHQYHIRAYDPKGGLDNARRLTGFHETSNINDFSAGVANRGASIRIPRTVGQEKKGYFEDRRPSANCDPYSVTEALIRTCLLNESGDEPFQYKN	208439	219436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_208582_211447_211627_213404_213567_215415_215563_215808_215937_216144_216345_217757
660058	contig_15434_pilon	-	1144	7	Intergenic	novelGene_56703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGCCACAGACGAGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33482	26922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_27010_28952_29004_30390_30588_31080_31265_32182_32354_32950_33061_33138
660068	contig_9871_pilon	+	2369	10	Intergenic	novelGene_75723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.2028036770981	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	558	1688	608305	616625	FALSE	20	TGCTGTTGGGTTGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGLIECYLASNSIREAMVMANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLSREQKYEDGIALLRSALANQSDCVLHRILGDFLVAVNEYQEAMDQYSIALSLDPNDQKSLEGMQKMEKEESPTDATQEEDVDDMEGSGEEGDLEGSDSEAAQWADQEQWFGMQ	597964	617306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602081_602294_603275_603396_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_614614_614766_616435
660070	contig_6795_pilon	-	2890	8	Intergenic	novelGene_27687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_7	94.5945159561567	34	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	384	941	119175	74533	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPRECTTRLHLIYAAFSLGLMLASFRFSF	134278	72583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
660071	contig_15658_pilon	+	2736	1	Intergenic	novelGene_157872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	637	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	909	266	1174	71512	72420	NA	45	ATAAAGAATTCAATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSQLCKLFIGGLNVQTSESGLRGHFEAFGTLTDCVVVVNPQTKRSRCFGFVTYSNVEEADAAMAASPHAVDGNTVELKRAVSREDSARPGAHAKVKKLFVGGLKGDVAEGDLIEHFSQFGTVEKAEIIADKQSGKKRGFGFVYFQNHDAADKAAVVKFHPIQGHRVEVKKAVPKEDIHSGGGGGGSRSSRGGRGGRGRGGGRDQNGLSKGGGGGYNSYGGYGGGGGGYNAYGGGGGGSSYGGSDYGNGFGGFGSYSQHQSSYGPMKSGGGGGGSSWGGRSNSGPYRGGYGGGGGYGGSSF	71246	73982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15658_pilon_+_71200_74000
660076	contig_12626_pilon	+	2338	2	Intergenic	novelGene_80428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115214	125943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_116586_124976
660077	contig_5643_pilon	+	2294	12	Intergenic	novelGene_38985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	23.6608265017053	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	87	1391	599543	605319	FALSE	20	TGATTGTGTCTGAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRHSCSLCASAAVATGRACSPEEILGIMSIERIWAREILDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKQRYLGKGVLKAVDHINTTIAPALISSGLSVVEQEKLDNLMLELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAERELPLYRHIAQLAGNSDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFRDAMRLGAEVYHTLKGVIKDKYGKDATNVGDEGGFAPNILENSEALELVKEAIDKAGYTEKIVIGMDVAASEFYLDGKYDLDFKSPPDPSRYITGDQLGALYQDFVRDYPVVSIEDPFDQDDWAAWSKFTANVGIQIVGDDLTVTNPKRIERAVEEKACNCLLLKVNQIGSVTEAIQACKLAQENGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEELGDEARFAGHNFRNPSVL	598245	606222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_598317_599527_599628_600099_600196_600345_600405_600706_600777_601284_601419_601664_601888_603119_603318_604190_604393_604643_604753_604911_604971_605249
660092	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660098	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_96105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660101	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660103	contig_5331_pilon	-	1592	6	Intergenic	novelGene_112779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.67557217191	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	43	834	253336	248930	TRUE	5	CAGTGTCTTTGTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253378	247936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_248176_248410_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253103
660105	SIRV7	-	325	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	8	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114730	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78841_78964_114680
660106	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660109	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
660110	contig_13894_pilon	+	1179	10	Intergenic	novelGene_62111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2509.7943745393	11	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	27	806	520713	526523	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKVLGRRATITALRSTRRSTRLARATLSRMAN	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525752_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
660126	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_90330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660133	contig_14871_pilon	+	2372	11	Intergenic	novelGene_63702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	771.070269171364	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	122	1540	201945	233218	FALSE	25	CCAGAGCAGCGCACAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDRKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKQVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	194868	234050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224428_227361_227475_227652_227827_230155_230300_233056
660154	SIRV3	+	283	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4525	2187	2466	34	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTTCTTTTCAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6469	6752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6800
660155	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660157	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660164	contig_9014_pilon	-	2073	9	Intergenic	novelGene_106714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.3840165131683	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	60	761	46682	43800	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51600	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42142_43158_43194_43275_43397_43480_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
660170	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660171	SIRV7	-	245	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91679	2	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
660177	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
660179	contig_10042_pilon	+	1141	7	Intergenic	novelGene_79094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	223.319962286302	33	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	10	765	6321	53705	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKYMCGQLWPSLLYSKVVLFPGGLGQSEMEPSTTG	6311	54081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45914_53602
660182	contig_5499_pilon	+	1608	4	Intergenic	novelGene_57025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	184.717802787567	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834868	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_834946_835345_835449_839385_839446_839911
660187	contig_16761_pilon	+	1432	10	Intergenic	novelGene_146894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	87.4479033623399	804	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	39	1019	17825	63186	FALSE	20	CGCCTCCCTGTCTACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGPSACADLLAMALRLLRLAPVSASARGLAAGAQRMGGIHTSAQCKLRYGPLAFILGDKASKKLTEHSRVITVDGNICSGKSKLAKEIAEKLGLRHFPEAGIHYADTTTGDGKLLDVEFSGNCSLEKFYADPKSNDGNSYRLQSWLYASRLLQYADALEHLLSTGQGVVLERSIFSDFVFLEAMYNQGYIRKQCVNHYREVKKITASEYLPPHVVIYVDVPVPEIQSRIQKKGDPHEMKITSAYLQDVENAYKKTFLPEMSENCEVLQYSAWEAQDAEKVVEDIGYVKLEKGPWLKQDDRTFYHLRMLSHDRSPPERPRLPQIQRAARPEVRAWVQC	17786	63599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_17900_22928_23098_24266_24483_25683_25771_26902_27025_30882_30963_38402_38458_39772_39859_47136_47190_63148
660188	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91674	11	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
660190	contig_14871_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_63713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	3	434	214647	215078	NA	25	GCCCTGTAAACTTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFVDVGPGALVLASPSSHNTCSPGLLPCESQLLFFQLCFPVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRSAHPSPTGSAPPAVRVEHIRGSSLRPPDPWESGGGCQKLGSTSHPVSNSPWYLACPLTLWPLFTRL	214644	216579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_214600_216600
660192	contig_14483_pilon	-	977	5	Intergenic	novelGene_133749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	998.078497664387	7719	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	54	299	96442	62331	TRUE	20	TGGAAATCTGGTTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDQSEGGGVGAGRSLATMAYSGLTVPLIVMSVFWGFVGFLVPWFIPKGPNRGVIITMLVTCSVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYLKYHWP	96495	53118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53621_53958_54101_62296_62425_87781_87830_96338
660208	contig_9668_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_58235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCATGTGTGTGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578885	578174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_578200_578900
660211	contig_3942_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_128629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176947	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176962_178331_178490_179045_179177_179714_179825_179974
660219	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
660225	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_93556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660231	contig_18869_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_56195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73730	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
660237	contig_10253_pilon	+	1576	10	Intergenic	novelGene_76868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	115.054361815793	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	132	1574	35544	100307	FALSE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELRASGRGRGAEEAVRSSGCSLFRSCCLPPASSASSQERRGGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPTE	16263	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16392_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
660239	contig_15304_pilon	-	1200	6	Intergenic	novelGene_30415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1530.17784587283	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	198	1061	54100	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54297	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49845_50061_52986_53138_53233_53320_53491_53813_53991
660242	contig_1813_pilon	+	2293	3	Intergenic	novelGene_105467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	15	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	240	365	97352	97935	FALSE	10	GCGGCTGCTGTGAGGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSAGQAGRQAGEPARRTQGDPALWGCDLAARGGLELFQPGRPRVPFPKNFQQVCTKILTRLFRVFVHVYIHHFDSILSMGAEAHVNTCYKHFYYFIQEFSLVDQRELEPLREMTERICH	90464	99863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_90597_97244_97448_97905
660245	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
660248	contig_12032_pilon	-	1643	9	Intergenic	novelGene_139277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	125.294403306772	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	203	907	110443	98722	TRUE	25	GTAGATAACTTGGCAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRGAVIQMLRGCQPSLVQHGAWG	122393	96450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_98697_98787_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_122278
660254	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
660256	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660258	contig_6056_pilon	+	1309	10	Intergenic	novelGene_157881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	91.4222330254409	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	159	1103	278357	312153	FALSE	20	TATGATTTTGGAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRNGIRHCSYASSRNHLYIDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQKALDYGTKLVGGTTPGKGGKMHLDLPVFNTVKEAKEKTGATASVIYVPPPFAAAAINEALEAEMPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267064	312359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_278257_278358_281057_281162_287112_287230_291373_291587_291720_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
660264	contig_6102_pilon	+	2728	8	Intergenic	novelGene_32395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	20.743329392499	187	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	56	802	1782772	1791778	TRUE	35	TCCTTAACAGAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSAPPATVSPATAGPGQGFGFASKTKKKHFVQQKVKVFRAADPLVGVFLWGVAHSINELSQVPPPVMLLPDDFKASSKIKVNNHLFHRENLPSHFKFKEYCPQVFRNLRDRFGIDDQDYLVSLTRSPPSESEGSDGRFLISYDRTLVIKEVSSEDIADMHSNLSNYHQYIVKCHGNTLLPQFLGMYRVSVDNEDCYMLVMRNMFSHRLPVHRKYDLKGSLVSREASDKEKEPLKRRCISWVSLTS	1782716	1793893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1782946_1785536_1785635_1786298_1786396_1786744_1786889_1789812_1789960_1790138_1790178_1791730_1791835_1792023
660268	contig_4315_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_46827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	656	985	371005	371334	NA	25	TGCTCACATGCACAGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQKGIAPPQETPVWEVPQNHSKSAWQGPPGEIAQRLVPQVGTRSPGSGGALSKATLWTGQPPGPPCWTVTPDLPGQTRLCFSLVSAWIPVRSLDLLRKVSRQLFLDR	370349	371782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_370300_371800
660277	contig_14322_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_116382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
660280	contig_5057_pilon	-	1434	8	Intergenic	novelGene_151515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	532.609670607369	286	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	195	887	523430	507037	FALSE	10	TACTCTTGTCATTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKRSRSDRFYSTRCCGCCHVRTGTIILGTWYMVVNLLMAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523885	506489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523328_523487_523747
660284	contig_9345_pilon	+	1415	3	Intergenic	novelGene_24661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	1039	1413	947931	952483	FALSE	15	CGTGTCTGGGTAGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVLAARFHKTRHPDFFFPRLACRAALVAISKTSLTPSLVFAEHSMYPKAPILFAMSLPSSGFTGSCFILASSRLVCSSFRRSFLFPTRMMGTLGQKCLTSGVHFSGMFSKLSGLSMEKHISIT	946892	952485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474_949607_952439
660290	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_18393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
660308	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_17319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660309	contig_20819_pilon	+	2203	14	Intergenic	novelGene_55666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	27.6916666592472	1	28	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	987	1787	56845	62069	TRUE	20	TGGAATAGTGTGTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGAAEPNFDGLENNPYRSRKQRQEWEVKALLEKVPAELICLDPRALAEVDVVTLEQEKKERIERLVRSKPLHAHPQTHHSECPAFLTPTSSAYHGPVPGSAAQQASAATVPCP	54809	62595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_56288_56394_56523_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61409_61556_61652_61826_62220_62329
660315	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660317	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	426	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660318	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_115851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671626	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
660322	contig_1435_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_115512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTGCTTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564961	565944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_565000_565900
660323	contig_615_pilon	+	1891	3	Intergenic	novelGene_80032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	146.5	391	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	35	328	8806	25566	FALSE	5	TCTTGGATTTGTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCQEIKPEERSMIFVTKCPCDECVPLIKGAGIKQIYAGDIDVGKKKADISYMRFGELEGVSKFTWQLNPSGAYSCEQKEPERKENGVLRPIPLDEEQHQNKKLCLGNR	8771	27129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_8965_22345_22407_25492
660328	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
660332	contig_8284_pilon	+	1154	8	Intergenic	novelGene_125701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	587.251084915723	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	241	717	426599	461170	FALSE	20	TGATTAAGCTATCGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDRMRMYRASLR	425053	461607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425283_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_461139
660334	SIRV4	+	333	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	632	983	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
660346	contig_13780_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_149043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTGCTAGGGCTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575613	574460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_574500_575600
660355	contig_12709_pilon	-	1777	10	Intergenic	novelGene_147417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.1877230492064	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	21	1085	110619	73650	TRUE	30	ATCTGTTAGTAATGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGFRAMGRLVALSLLGISLALLGERFLALRNRLKASGEVESVDLPNCHLIKGIEAGSEDIAILPNGLAFFSVGRKHPGLHSFAPDKPGGILMMDLKEKKLRALELRISRGFNLASFNPHGISTFIDDDDTVYLFVVNHPESKNTVEIFKYEEEENSLLHIKTVKHELFPSVNDVVAVGPAHFYATNDHYFSDIFLKYLETYLNLRWANVVYYSPNEVKVVAEGFDVANGISISPDEKYIYVADMLAHEIHVLEKHTNMNLTQSKVLKLDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPSSEILRIQNILTEKPTVTTVYANNGSVLQGSSVASIYDGKLLIGTLYHRALYCEL	110639	71612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_71925_73269_73809_74443_74573_75355_75438_86035_86237_87708_87836_88734_88901_94625_94682_102694_102766_110545
660363	contig_11978_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_63143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTATGCTAAAAGTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2014863	2016481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2014900_2016500
660368	contig_16831_pilon	+	2137	6	Intergenic	novelGene_134784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	84.1769564667196	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	100	546	20751	128859	FALSE	25	AAGGAGATTTGTGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLYNSSGRDLRRALFSLKQIFQDDKDLVHEFVMAEGLTCLIKVGAEADQNYQNYILRALGQIMLYVDGMNGVINHNETIQWLYTLIGSKFRLVVKTALKLLLVFVEYSESNAPLLIQAVSAVDTKRGIKPWSNIMEILEEKDGVDTELLVYTMTLVNKPRRSPGRFMRMLLQMEILCSKR	10850	130450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_10920_20720_20827_96149_96245_116899_117012_126176_126272_128790
660372	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_94895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660373	contig_3095_pilon	-	1273	6	Intergenic	novelGene_75250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1193.29040891143	1548	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	74	904	255481	247316	TRUE	20	TTATCTGTACTCTGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGNKSALIQLGAGKEV	255554	246376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247299_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
660385	contig_3155_pilon	-	1942	13	Intergenic	novelGene_26434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	808.620224003003	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	52	1674	332640	295308	TRUE	40	AAAATCTTTCAGATCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESKAGGAAGLFAKQVQKKFSRAQEKVLQKLGKTVETKDERFEQSASNFFQQQAEGHKLYKDLKNFLSAVKVMHESSKRVSETLQEIYSSEWDGQEELKAIIGNNDLLWEDYEEKLTDQVVRTMENYIAQFSEIKERIAKRGRKLVDYDSARHHLEAVQNAKKKDEAKAAKAEEEFSKAQIVFEDLNQELLEELPILYNSRIGCYVTIFQNISNLKDVFYREMSKLNHNLYEVMSKLEKQHSNKVFVVKGLSSSSRRSLVISAPLRTSTASSPLTSPISPSALSLKSERESISAAEEERAPDPAQEEDNSEMEEEPLKDKEIEGGGAKASSSEEEEPLPAYNGPTQTQPSPTTEGGESQEEVFSCSPAPSSGRALIPSEQPSSSFPEVVLQTHTTSEGSEQPKRASLSRTSAPPSRPPPPRASPSPRLSSGSIPSSPTTSEGGSPTSSRAFFGAGTPSPRTSIEVSPDPELPEKPERNPEAREKETTHHLNPEELCTSPTLMISQGQGLELQVSTVAGESSVIAPEPQEEVSTSQNAQL	332691	294841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295070_295267_295338_295600_295676_299936_300694_306112_306196_307222_307299_308408_308495_309008_309117_310332_310429_310991_311087_311678_311734_321619_321701_332559
660388	contig_11171_pilon	+	1470	10	Intergenic	novelGene_48539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1833.05658517255	59	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	50	961	41803	65316	TRUE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTLTHTRTRAHVHTRTRTHYRAEAASTSLLHIQHWTRVWKER	41753	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64909_65191_65408_65540
660398	contig_10753_pilon	+	1937	12	Intergenic	novelGene_105138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	232.653397365663	760	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	220	1605	303228	308720	FALSE	25	AGTAATGGGTTTTGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNFGNEELDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVSSSDDKDAFYVADLGDILRKHLRWLKALPRVTPFYAVKCNDSRAIVKTLAAIGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPQRIIYANPCKQVSQIKYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLKTSRLLLERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGFPGSEDVKLKFEEITSVINPALDKYFPSDSGVKIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLKEQTGSDDEDESSEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTCDGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWQLMQQIQSHDFPSEVEEQDVSTLPVSCAWESGMKRHPATCASASINV	300040	309052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_300106_302980_303104_303196_303330_303639_303814_304000_304174_304627_304763_304893_304976_305150_305235_307473_307637_307721_307835_307920_308136_308575
660404	contig_11378_pilon	-	2044	3	Intergenic	novelGene_112243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	29.5	31	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1427	1834	344036	341973	FALSE	20	GCATGTATTTTATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIILILLSRFISNKYLVKRQSRDYDVEWGYAFDVHLNAFYPLLVILHFIQLFFINYVILTDTFIGYFVGNTLWLIAVGYYIYVTFLGYSALPFLKNTVILLYPFAPVILLYGLSLALGWNFTHMLCSFYKYRVK	345462	341762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_342110_343679_343782_343867
660406	SIRV7	-	348	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33211	10	-8	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114746	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
660409	contig_12786_pilon	-	1439	9	Intergenic	novelGene_103405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_8	493.621423132141	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	442	1377	614067	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629627	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_629303
660414	contig_6710_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_97585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
660417	contig_18869_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_56211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73742	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
660422	contig_7171_pilon	-	1880	24	Intergenic	novelGene_101307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	116.187792063429	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	40	1764	1075756	1057742	FALSE	5	GCCTCTGCTGTTATCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDDGPGDEGQLSPGVLVRCASGPPPRTPHLGLPPATYSPHLSAHSEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075795	1057625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061155_1066135_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
660423	contig_6710_pilon	-	492	2	Intergenic	novelGene_98032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660429	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660432	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
660437	contig_17440_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_7628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCTCAGCCCGATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3400_4000
660443	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_96247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660446	contig_4531_pilon	-	2122	9	Intergenic	novelGene_47901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	21.3950928953347	141	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	155	1516	369728	344511	FALSE	35	AAGGGACTAAAGTTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLAGFKDPALYTSWLEPDNAFNVWKTQRAFNKYEKSAALVSNSQFLVKPLDVIVGKAWNMFASKAYIHQYTKFGIEEEDFLDSFTLLEQVITSYYNL	370872	343904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_344614_345825_346010_348653_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370754
660449	contig_7202_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_18680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACCTGTCCATGGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
660454	contig_11338_pilon	+	1693	11	Intergenic	novelGene_6155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	447	1475	6086	13398	FALSE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	744	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9899_13275
660456	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_93008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
660459	contig_6735_pilon	-	1569	13	Intergenic	novelGene_15736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	3	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	114	1376	564868	542177	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDSWTLILWSCLILHECFL	568311	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542231_543090_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
660461	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
660462	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_94896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660479	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660481	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660495	contig_2733_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_128566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTTGTTGATTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592867	591838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_591800_592900
660496	contig_9389_pilon	+	1562	7	Intergenic	novelGene_83900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	114	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	57	647	159587	167479	FALSE	25	AAAGTGGCTGGAGAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPSGPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNP	159530	168394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166152_167472
660505	contig_11512_pilon	+	343	2	Intergenic	novelGene_43246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	4	342	4011	4572	FALSE	25	ATAGTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAA	4007	4573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
660508	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660510	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_89219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
660519	contig_6047_pilon	+	2775	17	Intergenic	novelGene_24196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	534.747308168774	2	163	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	1522	2523	119315	123624	FALSE	25	CCAAATACCCAGTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105099	123876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118091_118316_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
660522	SIRV4	+	348	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	429	173	-429	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCTCGTCATGGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
660527	contig_3822_pilon	-	1782	3	Intergenic	novelGene_133325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	251	249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	100	450	306185	299545	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGLCFV	320821	298212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_299696_305985_306208_320744
660528	contig_12479_pilon	+	930	8	Intergenic	novelGene_56825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	164.450476386277	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	239	928	92999	119112	FALSE	35	GTATGACTAATTCAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEASKAYESSESSDRFMTEKQQEEAEWESINVLLMTHGLKALSLVGRTDLKDLIIFDKQSSQRMRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQ	76400	119114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_76423_78775_78935_92941_93068_95744_95836_95957_96082_96398_96580_110726_110897_119057
660531	contig_546_pilon	+	2026	2	Intergenic	novelGene_117177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGTAATTCTTTTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61163	70009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_63107_69926
660541	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
660546	contig_4065_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_133415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAACTAATCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888070	888456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_888100_888500
660547	contig_15777_pilon	-	2557	10	Intergenic	novelGene_75743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_9	109.04206912704	92	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	106	2319	259057	205161	FALSE	10	TACCAGTGTTTTGTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRPSPSPASPPSNSRTSLVQVKTKTSFSGHSSASSTSKPFKTPKDNLLTSSSKQHTVFSAKGSKDKQCIPVPVVSLEKIPNLVKADGANVKMNSATTTAVTSSSTSSSAVSSPPLFKPVLMSKQVPPSPEKILNGKGILSATIDKKQQNGTKSSNKPYRRLSEREFDPNKHCGVLDPETKKPCTRSLTCKTHSLSHRRAVPGRKKQFDLLLAEHKAKSREKEVKDKEHLLTSAREILPCQSGPAQESLPGSSGNSGPESKVASPAKSRPPNSILPRPSSANSISSNASSNHSGYTPEPPLAPVGGDLASRLSSDEGEMDGAEESEKLDCQFSTHHPRPLAFCSFGSRLMGRGYYVFDRRWDRFRFALNSMVEKHLNSQMWKKIPPAADSPMPSPAAHITTTVPASVLQPFSNPSAVYLPSAPISSRLTSSYIMTSAMLSNAAFVTSPDPSALMSHTTAFPHVAATLSIMDSTFKAPSAVSPIPAVIPSPSHKPSKTKTSKSSKVKDLSARSNESPSNKKRKPQSSTSSSSSSSLSLQTSLSSPLSGPHKKNCILNASSALNSYQAAPSYNSLSVHNSNNGVSPLCAKLEPSGRTSLPGGPADSVRHVGAVGGGSDSCPLSVPSLALHAGDLSLASHNAVSSLPLSFDKSEGKKRKNSSASSKACKITKMSGMNSVHKKNPPSLLAPVPDPVNSTSCRQVGKNSSLALSQSSPSSISSPGHNRQKTTNRTSRIRTLP	272914	204922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_205203_206905_206981_210067_211020_215408_215531_219618_219812_230740_230998_231845_231929_235217_235502_258851_259075_272826
660550	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_93649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660571	contig_9785_pilon	+	1007	2	Intergenic	novelGene_157889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTAGTTCAGTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194967	215071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_195154_214250
660572	contig_9785_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_157893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCATTCTCTCCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215123	216173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_215100_216200
660573	contig_1443_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_28210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2	421	344893	344474	NA	30	GAGCCCTGGTGATAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRKRFYCLEYSAAKLGKVSNLKIWRPGPFFASFLLPSFKTHRDPKERKIISLCPNSYLANSSNTFLLPSVGTRESNRRKEKAEEIITEPVPSEGKSDRKFKRSYLSAQEPNDREGLSAEGGHRQQRRTCTGQHCCSCS	344894	344233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_344200_344900
660575	contig_14133_pilon	-	940	6	Intergenic	novelGene_119951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1619.06768234067	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	44	496	209116	208182	TRUE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209450	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207601_208128_208389_208585_208728_209012_209131_209421
660579	contig_5316_pilon	+	1979	9	Intergenic	novelGene_61239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	332.320980943124	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	195	1274	453918	544272	FALSE	75	ATCTTAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLG	451829	544977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_451882_453775_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132
660581	contig_14029_pilon	+	1578	4	Intergenic	novelGene_151937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	168.374582404827	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	31	366	131703	133382	TRUE	45	CACACAAGAAAGTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLRYRIYLNIHLFSNSTFMIPISVFKMHTN	131672	135618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_134162_134258_134319_135245
660589	contig_15449_pilon	-	2029	2	Intergenic	novelGene_33649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	0	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	309	617	161103	160795	FALSE	60	AGTAATAAAAAAAATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFTFQVSRPYKILYINCYMTLIAHPILRQHTPPFRPDSPCQFNQLLTLSAFPSHLWTEAAPLVSCIYLTKRHTLHEYHFMFHSPVQSLSEDLASEIVLVLG	162937	159382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_161351_162876
660594	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660595	contig_6175_pilon	-	2749	3	Intergenic	novelGene_16361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_2	39.5	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	877	1179	1745513	1745211	FALSE	80	AGATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPSQLMISHLPLGSTLIMTAQLAFSFIPVPRSQVRPADLTRCYSSSPAAGLCLSQVHLPSAPKTPLCTCAPTPSPSHVAMPRLWGSPRACAVKCHLLL	1793706	1743640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1746156_1770748_1770887_1793610
660601	SIRV2	-	293	2	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2962	-360	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCAGGCATTAACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1649_1730
660607	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660615	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660617	contig_3111_pilon	+	2585	5	Intergenic	novelGene_129982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	29.5381109754839	812	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	12	695	160148	162091	FALSE	35	GTTATTCCAACTAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAARRLPEMGLSALLMLALCAAGARALYFHIGETEKRCFIEEIPDETMVIGNYRTQMWDKQKEVFLPSTPGLGMHVEVKDPEGKVVLSRQYGSEGRFTFTSHTPGDHKICLHSNSTRMALFAGGKLRVHLDIQVGEHANNYPEIAAKDKLTELQLRARQLLDQVEQIQKEQDYQRYREERFRLTSESTNQRVLWWSIAQTVILILTGIWQMRHLKSFFEAKKLV	160136	163981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_160308_160632_160734_160956_161083_161357_161505_161941
660619	contig_2114_pilon	+	181	1	Intergenic	novelGene_104236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAAAGTACTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152469	152650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_152500_152600
660621	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660626	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_89084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660643	contig_6102_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_32062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTCTACTTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590453	588686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_588700_590500
660644	contig_6102_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_32058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTTAAAAGAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588597	587355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_587400_588600
660648	contig_7744_pilon	-	2169	11	Intergenic	novelGene_62510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_8	84.3087184103756	389	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	10	1281	825057	821469	FALSE	15	CTCAGCAACTTTGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVMAAVAVAVREDSGSGMKAELSSRSGAVGREMTQEEKLQLRKEKKQQKKKRKEEKGTEPETGSTVSAAQCQVSAARELPGPTNPLVSPGEKVPVGRSKAELRAERRAKQEAERALKQARKGEPVGPPPQDCPSTPGETPSGAKRLPEHTQVDDPTPLRRLVKKPEQQQVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQYMSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVRAGERDSKVGSKRAQKYNLTFPRL	825066	820580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823221_823417_823501_823760_823968_824167_824304_824625_824670_825026
660652	SIRV7	-	339	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33224	6	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114733	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
660666	contig_233_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_14694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAAAGGTACTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124308	126993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_124300_127000
660672	contig_7457_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_31471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1386	1742	511886	512242	NA	45	AAAAAAAAGAGGCTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSWVELVIEICMQSTACNTEFKKQQQKNRTKLLWVLRAALEFRAVAHWKKLWCPKRSRGRLITSIRVFIFQGEDWSEASEVFKTRAGRGGRREGPHHWILPLPCPLNGWRAGHAE	510500	512902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_510500_512900
660682	contig_6365_pilon	-	2572	3	Intergenic	novelGene_134001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.5	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	260	760	12349	11849	TRUE	35	TGTAATTAATAAATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKGNRGTPSLQPTTSLNRALLWSYLIYPFPTLRLSSHNNGETSNVNQFTIYVFPFSVMSIDVFWKVYFGFIKEQKAEKK	17700	9800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10131_10366_12368_17459
660686	contig_8617_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_73483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATATGAATTCCGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62989	62741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
660692	contig_16098_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_46241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTGAAAGTTTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802935	802296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_802300_802900
660693	contig_16098_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_46240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	381	746	800552	800187	NA	60	AAGGGGTAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPPPLCAEGLLVTDSMGVALVGGGYRVAGSRAKVIQGSGGWGRRGSAFKPQTPFLGDSGGLSVLSCSPAVDSRPLPKQTHPRSCPLWRPRLPSPSASGSSLSNPSRVALGGTEHERFLG	800932	799981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_8e+05_800900
660701	contig_18145_pilon	+	2118	11	Intergenic	novelGene_37312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	26.3076034636377	292	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	54	1853	66694	73109	FALSE	25	AATATGTGTGTCTGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKVSVLLFLAWVCFLFYAGISLFTSGFLLTRLELTNHSSCQEPPGPEPLPLGHRGEPGACWMASRFSRVVLVLIDALRFDFAQPQSSHMPGEPSASLPFLGKLSSLQRILEIQPHRGRLYRSQVDPPTTTMQRLKALTTGSLPTFIDAGSNFASHAIVEDNLIKQLTGAGRRVVFMGDDTWKDLFPGAFSQAFFFPSFNVRDLHTVDNGILEHLYPTMDSGEWDVLIAHFLGVDHCGHKHGPHHPEMAKKLSQMDQVIQGLVERLENDTLLVVAGDHGMTMNGDHGGDSELEVSAALFLYSPTALFPSVPPEEPEVVPQVSLVPTLALLLGLPIPFGNIGEVMTELFSGNKDSQPHTSAMAQASALHLNAQQSFLLLHLLAAGIPITTPGPFTVPWQAVSAWALMATQTFYSTGHQPVFPAIHWHAAFIGFPEGHGSSIWLPAFLVGANTFASHLLFAVGCPLLLLWPFLCESHGPQKRRQTPRNEAETRVRPEEEEEEEPLMEMRLRNAPHHFSAALLQLGLKYLFVLGVQILACALAAFILRRHLMVWKVFAPKFIFEAVGFIVSSVGLLLGIALVMRVDGAVSSWFKQLVLAQQR	65890	73374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_65914_66663_67205_67820_67965_68158_68283_68601_68762_68949_69130_70849_70902_71494_71702_71918_72140_72755_72827_72979
660703	contig_17440_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_7641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3499	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
660705	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
660717	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_89611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653779	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660724	SIRV4	+	199	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1117	0	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
660728	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_18368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660730	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660739	contig_5954_pilon	-	1381	7	Intergenic	novelGene_28648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	508.403929524109	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	312	1022	947127	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960572	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_960463
660750	contig_14322_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_115678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTGGTGTAAGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
660751	contig_7202_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_16642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATCTTCCGCAGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
660755	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660756	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660757	contig_5551_pilon	-	2011	2	Intergenic	novelGene_134284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	75	junction_1	0	633	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTTCTTGAAAAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834246	795292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_797237_834179
660764	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
660770	contig_4364_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_20	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261640	260077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_260100_261600
660784	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660785	contig_10940_pilon	+	1938	4	Intergenic	novelGene_49179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	826.82565675399	38	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	191	355	173172	174120	TRUE	15	TGTTGAAATTTCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDRPQDRARSHLGGKGRLQGPEAAASSPDAWRGPRRRREASLEASLPPRPAGALGVQTLLQQMQDKFQTMSDQIIGRIDDMSSRIDDLEKNIADLMTQAGVEELEGENKIPATQKS	172584	176220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172754_173150_173218_174001_174123_174639
660792	contig_14467_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_138288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	623	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGTCATTCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391490	397409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_391943_397268
660793	contig_4232_pilon	-	2318	11	Intergenic	novelGene_63470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	360.522468093183	2	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	16	462	620488	614837	TRUE	5	TCTCTGCTGGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620503	607746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_608345_608587_609042_610283_610366_611352_611466_611657_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
660810	contig_18055_pilon	-	1632	4	Intergenic	novelGene_117793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_3	75.4070435849478	393	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	29	709	39456	5259	FALSE	35	TAGAAATGCTTGAACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVESGSVLALRRHRLGTPAPLSRPVYSAFSQGDSWGEGEVDEEERCDQVARDLRAEFSVRGSSEPRKDSLLPLDRDGSPVLPNKRNGIFLATAASRAPARRWPVQVLSVLCSLIFAALLAFLLAIVYLIVKELHAENLKNEDGVDTGLLGFWSLLIISVTAGFSCCSFSWTVTYFDSFEPGMFPPTPLSPARFKRLTGHSFHMGYSMAILNGIVAALTIAWCLM	39484	4335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_5353_21760_21894_37098_37153_39056
660818	contig_14528_pilon	-	1583	8	Intergenic	novelGene_111274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	124.401423969801	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	199	1356	197057	190953	FALSE	0	CCTTGGTTCTTTGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	201766	190725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197061_201011_201104_201663
660825	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660829	contig_16098_pilon	-	1354	9	Intergenic	novelGene_46128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1954.21614720583	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	547	1149	457605	456273	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGTRRRTQVLVTNAVFALAVHPPLSAAAALKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460265	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458775_460169
660834	contig_11855_pilon	+	2934	1	Intergenic	novelGene_67093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2392666	2395600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2392700_2395600
660837	contig_21388_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_136640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCATATCTCTACACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22031	23142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_+_22000_23100
660844	contig_4213_pilon	-	1981	4	Intergenic	novelGene_124832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_3	43.5660418215839	151	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	77	475	185273	179356	TRUE	20	AGTGTGTTTACTTGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEDCSITENSSLHLEKGKQGNATSSHFTTHDKGSLQIPVPCAVVNVVFITILIVALIALSVGQYNCPGQYIASVPLDSHVSPCSDDWIGYQKKCYLISTLTNSWTSAQSSCSKQGATLALIDSEKEMVRS	185349	176588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_177635_178895_179568_181348_181472_185209
660851	contig_14341_pilon	+	2186	5	Intergenic	novelGene_111779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	63.6725019140916	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	133	1788	316386	328668	FALSE	20	TATTTCTGTGGCAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGWETTVESKELTPTPDASEQEPTHSLKVDESSKGGPMSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	313710	329066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_313766_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327742
660860	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660862	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
660865	contig_10940_pilon	-	2750	4	Intergenic	novelGene_49292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACACTTGCATCGGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033909	996289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_996393_1016191_1016260_1025102_1025175_1031402
660869	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660889	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660898	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660902	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
660904	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
660906	contig_5549_pilon	-	1602	8	Intergenic	novelGene_81635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_7	636.509422473823	90	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTTTGTACCGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445635	441736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_442936_443118_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
660907	contig_20641_pilon	+	530	4	Intergenic	novelGene_52866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_3	1999.83816011863	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAGAAAAAATCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14740	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_23896_23982_26859
660927	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
660929	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
660934	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
660952	contig_14838_pilon	-	1609	2	Intergenic	novelGene_151914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	300	1427	110956	109062	FALSE	15	GTGTCCAATGCATTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	111255	108879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110129_110895
660953	contig_6127_pilon	-	2850	2	Intergenic	novelGene_157050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGAGTAAAAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22724	18911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_-_20734_21696
660954	contig_500_pilon	+	1259	10	Intergenic	novelGene_31028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1110.22084334048	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	197	844	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485754	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493684_1495423_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
660955	SIRV4	+	493	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	451	6	-451	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTCAAATTGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	2320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
660981	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
660984	contig_3787_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_102409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAGCACTCAAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551978	553010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_552000_553000
660985	contig_3787_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_102411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACCACTAGGGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552821	553785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_552800_553800
660986	contig_6102_pilon	-	1949	2	Intergenic	novelGene_32370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	355	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1246	1752	1715667	1715078	FALSE	25	TAAAGGGACTTTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAESLSFSFGTLSSWELEAWYEDLQEVLSSDESGGTHVSPPANEKEESKTFTTLDPACLAWLTEEPGPAEVTSSSQSPQSPDSSRSSLAQEEEEEDQRRPRKRKQSGQSQARAGKQRLKEKEQENERKVAQLAEENERLKQEIERLTREVEATRRALIDRMVNLHQA	1716912	1714880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1715447_1715529
660987	contig_5799_pilon	+	2252	16	Intergenic	novelGene_50311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_7	228.762603781494	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	112	2043	605554	717769	FALSE	30	GTAAAATTGGTATACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEENMTELLSSGLKNDYNKETFTLKHKIDEQMFPCRFIKIVPLLSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	605442	717978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
660994	contig_8681_pilon	+	1471	7	Intergenic	novelGene_157192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	78.8030244766447	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	128	631	54812	102439	TRUE	5	TGCCTTCTGCCTTTGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISQSRISHWLLQQGSDLSEQKKRAFYRWYQLEKTSPGATLSMRPAPIPIEDPEWRQTPPPVSATSGTFRLRRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEIANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIAILESHGIDVQSPGGHSNSDDVDGNDYSEQDTWQVRNGEEEEGRSSEGGREAEKVEEERRI	40536	104990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_40650_54797_54952_99493_99577_101047_101144_102014_102104_102343_102449_104159
660997	contig_17500_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_157920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1595	1918	240520	240197	NA	30	ACCCGGTCAGCATCATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTGQLHVSRPAAKSEVELSLQGTAAGEHFGRAPCRPLHRGTSQFSLTEALQVLPPIGCTRVSAQLKYLQLPLLLAAIECVPTYRDPVHDIMKCCVGLCHPHSEPL	242114	240111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_240100_242100
661001	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661002	SIRV7	-	376	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-24	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114762	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
661006	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
661008	SIRV6	+	1083	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	5	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	20	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	45	TATGGGGAAAGAGCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
661010	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_89604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653774	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661017	contig_7527_pilon	+	1815	2	Intergenic	novelGene_139574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	50	junction_1	0	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94329	96205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_94907_94967
661024	contig_9017_pilon	-	2259	5	Intergenic	novelGene_130333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	52.878989211217	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	239	580	218109	217768	FALSE	30	CAAAATGATCTTATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	224290	216088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218123_218614_218722_219573_219605_220072_220138_224268
661025	contig_10135_pilon	+	1583	14	Intergenic	novelGene_106634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	77.642329698089	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	26	1015	106830	114536	TRUE	15	CTTCTGGTATATCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVCSGNKMAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSNHLTVFK	106804	116067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_113992_114509_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
661026	contig_8415_pilon	+	2280	13	Intergenic	novelGene_141690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_8	20.4469163662614	143	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	38	1426	231693	261192	FALSE	75	AAACAAAAATAAATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFAIFAVTFLLALVGAVLYLYPASRQAAGIPGITPTEETDGNLPDIVNSGSLHEFLVNLHERYGSVVSFWFGRHLVVSLGTVDVLKQHINPNKTSDPFETMLKSLLRYQAGSGGASENHMRKKLYENGVTNSLQSNFAVLLKLSEELLAKWLSYPESQHVPLCQHMLGFAMKSVTQMVMGSTFEDDQEVIRFQKNHGTVWSEIGKGFLDGSLDKSTTRKKQYEDALMQLESILKKIIKERKGRNFSQHIFIDSLVQGNLNDQQILEDSMIFSLAGCIITANLCTWAICFLTTSEEVQKKLYEELDEVFGKSPITPEKIEQLRYCRQVLCETVRTAKLTPISARLQDIEGKVDQFIIPRETLVLYALGVVLQDPSTWPSPHKFDPDRFDDESVMKTFSLLGFSGTQECPELRFAYMVTTVLLSVLLRRLHLHSVEGQVIETKYELVTTSREEAWITVSKRY	231655	262046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_231765_237871_237922_238826_238994_241140_241284_244869_245038_246303_246383_249579_249696_250517_250573_253232_253354_255464_255577_256798_256864_260793_260884_261041
661028	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_94388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657164	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657165	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
661029	contig_15063_pilon	+	1211	5	Intergenic	novelGene_10302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	586	1074	36064	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35075_35872_36158_36266
661047	contig_7816_pilon	+	1949	14	Intergenic	novelGene_66501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1138.03897043329	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	86	1393	170169	207920	TRUE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNRLALPWAVPHATGRCPSAALLQPFSRGPLTTFAWRPSPRATSTSVVLTAACPLGKTGPLRWPWRIWPCSGQSPHQLSFTQVMEFLQRKQWN	170083	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196834_207500_207661_207803_207935_209066_209157_209336_209379_210627_210751_211482
661052	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661061	contig_11338_pilon	+	3138	9	Intergenic	novelGene_6329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	51.3552273386069	934	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	355	1878	277296	287319	FALSE	30	ATTTCTAGCAAATTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGLFDLGVSGCSALPAQDPAWLQQESTEVMTPGLLTTCSQEPVTFEDVAVVFTQEEWVFLDSAQRSLYREVMLENCRNLAAVGYQLCKPSVFSPWGQIEELWTTERGLFQGICPEPQLQLQESIPNQDIFGEIPSIVMKRELPQPGGKLYKCNEFEKCFNSIELHFQYQRIHTEEAPYECKENGQSFQSCHLIVPEKICSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLTRHEKTHTSEKFFECQECRKAFKYSSNLRRHMRIHTGEKPFECNQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFDCNQCGKAFREHSSLKTHMRTHTKEKPYECNQCGKPFRTSTHLSVHKRIHTGEKLYECSTCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYACQECGRAFSEPSSLRKHTRTHTGKKPYMCQECGRAFGQSSHLIVHVRTHTAGKPYACNQCDKAFRHSSSLTVHKRIHSGRENVRNIGLPVSVPHLYGGPFAS	271838	288579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_271919_274838_274960_275068_275186_277259_277342_283213_283297_283878_284006_284430_284527_285052_285130_286224
661062	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
661070	SIRV5	-	355	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGCAATCTCTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
661076	contig_7457_pilon	-	2371	9	Intergenic	novelGene_31446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	31.6659813522335	259	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1339	2061	475867	474462	FALSE	5	TGTATTGTGTCTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEEDKVSSSNFRQQMLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVEKAWNLLQKRIPKMPSGP	478236	474151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_476410_477048_477761_478152
661080	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661081	contig_2046_pilon	-	2965	16	Intergenic	novelGene_151556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_15	50.9044420676843	100	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	169	1899	53659	15125	FALSE	10	ATAGGTTCTTGTTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEKRALRTCSPAAAAPSPSPNAPSLRRGKVKSCRTETSRKQRRRRDLAGIFYCDCIMENQLAKSTEERTFQYQDTLPSLPVPSLEESLKKYLESVKPFANEEEYKKTEEIVKKFQNGVGEKLHQKLLKKAKGKRNWLEEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAYIEHYWPPKEGTQLERGSITLWHNFNYWQLLRKEKLPVQKVGNTPLDMDQFRMLFSTCRVPGITRDSVMNYFSTESEGCSPSHVTVLCRGRVFVFDVMHEGCLITPPEICRQLTYIHKRCHSEPDGPGIAALTSEERTQWAKAREYLIGLDPQNLTMLEKIQSSILVYGMSDGSPHVTPEDYSQVTAMILTGDPTVLWGDKSYNLISFSNGVFGCNGDHAPYDGMIIINVSRYVDEKIFENEGKWKASDLDIVVYAFTPFGKKLTKKKMLHPDTFVQLALQLAYYRLHGRPGCCYETAITRYFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPYAHLHERRQKMLQAFAKHNEMMKDCSNGKGFDRHLLGLSLIAKEEGLPVPEIFTDPLFSKSGGGGNFVLSTSLVGYSRTRGLVVPMVHNGYGFFYNIRDDRFVVSCTAWKSCAETDAEKLVQLVFHAFHDMMQLMNTAQL	61881	14058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_-_15246_26067_26188_26314_26409_26499_26579_28131_28256_32938_33070_33796_33881_38541_38644_40137_40264_40376_40471_42474_42584_43710_43836_44005_44188_45848_45974_53544_53681_61734
661094	contig_57_pilon	-	1741	14	Intergenic	novelGene_44897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGGCATGGACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120444	99378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_99416_100635_100734_102980_103132_104958_105075_105860_106029_106705_106875_107570_107636_109430_109537_113307_113464_114649_114767_115010_115110_116994_117092_117796_117935_120220
661098	contig_1450_pilon	+	2825	22	Intergenic	novelGene_27376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	558.773856065423	1	136	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	1274	2695	345706	355748	TRUE	45	AATTATTTTCTGCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNVPRLPQHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244387	355932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339450_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350502_351248_351414_352392_352474_354170_354324_355589_355788_355841
661099	contig_8447_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_69455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCATTTGGCTACATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239960	240268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_240000_240300
661103	contig_4531_pilon	-	2160	9	Intergenic	novelGene_47922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_4	60.5907119532359	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	189	968	422163	417962	TRUE	30	AATTCATATACGCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQANCSQLHSPPGTAGSEDIAASQCVHTTRLTEEGSCLHSGDVHIQINSIPKECAENQSSRNIRSGVRSCTHGCVHSRLRSHSHSEVRQPDDTAMESGEHGSNSFSEFRYLFKWLQKSLPYILILGVKLVMQHITGISLGIGLLTTFMYANKSIVNQVFLRERCSKIQCAWLLVFLAGSSVLLYYTFHSQSLYYSLIFFNPTLEHLSFWEILWIVGITDFVLKFIFMGLKCLILLVPSFIMPFKSKKFFDCRPLSDCIM	423597	412742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413495_414172_414275_416925_416992_417689_418004_418433_418588_419856_419958_421469_421547_421757_422218_423463
661107	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661108	contig_15354_pilon	-	2543	2	Intergenic	novelGene_65711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	409	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	366	1508	224900	223758	FALSE	35	AAAAGCTTCACAGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227716	222722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224922_227372
661112	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_89245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
661115	contig_10775_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_157942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGTTGTCACCCCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70405	71133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_+_70400_71100
661117	contig_5696_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_117505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313038	314143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_313000_314100
661121	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661123	contig_8866_pilon	-	2030	14	Intergenic	novelGene_77874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_12	85.6543901747775	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	503	1933	931899	912690	FALSE	60	AAATAAAAGTTCTAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDYVPAQPPLSQNPDPSPTRSSEPSGPESPEAKALFDKVASQGEVVRKLKAEKASKDEVDGAVQGLLQLKAEYKSLTGVEYKPISATGAEDKDKKKKEKENKSEKQNKLLKQNDGQRKDSPKTPGSGQSSGGPGEGQGPKKQTRLGLEAKKEENLADWYSQVITKSEMIEYYDVSGCYILRPWAYSVWEIIKDFFDAEIKKLGVENCYFPIFVSQGALEKEKTHIADFAPEVAWVTRSGKTELAEPIAVRPTSETVMYPAYAKWVQSHRDLPIRLNQWCNVVRWEFKHPQPFLRTREFLWQEGHSAFATFEEAAEEVLQILDLYARVYEELLAIPVVKGRKTEKEKFAGGDYTTTVEVFVSASGRAIQGGTSHHLGQNFSKMFEIIFEDPKSPGEKQFAYQNSWGLTTRTIGVMTMVHGDNMGLVLPPRVACVQVVVIPCGITNALSEEDKEALITKCNDYRKRLLRVNICVRVDLRENYSPGWKFNHWELKGVPIRLEVGPRDMKSCQFVAVRRDTGEKLTVTENEAETKLQALLDDIHVNLYTRASEDLKTHMVVANTMEDFQKALDSGKIAQIPFCGETDCEDWIKKTTARDQDLEPGAPSMGAKSLCIPFKPLCELQPGATCICGKTPAKYYTLFGRSY	936376	912592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_912841_912937_913003_917539_917619_920825_920987_924675_924850_925525_925724_926761_926918_928906_929009_929261_929342_931270_931344_931707_931918_932407_932460_934654_934918_936207
661133	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
661139	contig_7051_pilon	+	2391	7	Intergenic	novelGene_64370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	25.9015229067499	204	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	337	1551	354304	384724	FALSE	25	TGTTGGACAGTTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKLVPDRARTNPGTLLLGHFCGRDRKKRWILSVAMWGGRSLCSSGGRFLEVLESGCRRTLADCPRLASAANSENNLSWILQIKPWVSTEYRTMKLQSYRMTFASMNKMKSYRYPVTRPYSTSQTTVDSNEVKTFRALAHKWWDEQGAYAPLHSMNDLRVPFIRDNLLKTVADHQPGKPLSGMKILDVGCGGGLLTEPLGRLGASVIGIDPVDENIKTAQHHKSFDPVLAKRIEYRACSLEEIVEETVETFDAIVASEVVEHVVDLETFIQCCCRVLKPGGSLFITTINKTQLSYALGIIFAEQIAGLVPKGTHTWEKFVSPEKLESILESNGLSVQTVTGMLYNPFSGFWHWSENTSLNYAAHAVKSKVEEPPAPAEPVLNEETEELRANISANPGVHEELKK	353967	385564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_354515_368164_368292_371433_371587_374005_374106_376003_376247_378973_379134_384503
661140	contig_15304_pilon	-	1525	5	Intergenic	novelGene_30608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	196.159373979425	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	281	1387	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	71754	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104_66402_71647
661141	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
661143	contig_8210_pilon	-	2354	2	Intergenic	novelGene_30232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAATGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24392	21195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_21862_22704
661146	contig_18916_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_136875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTATCAAGGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28905	27343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_27300_28900
661147	contig_5041_pilon	-	2521	3	Intergenic	novelGene_27113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	605.5	26	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	32	349	620136	605325	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPGASDYSAMLPGSLSIIIDRYTMTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGKN	620167	603152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_605439_616559_616729_620101
661156	contig_11933_pilon	-	2290	13	Intergenic	novelGene_107259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	82.1889337644268	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	203	1519	269902	121298	TRUE	10	TTTACCCTATGGTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNLSDTLKKLKITAVDRTEDSLEGCLDCLLQALAQNNMETSENIQGSGTLQLFANLLTPQSSCTAKVANIIAEVAKNEFMRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSHSLQAQLINMGVIPTLVKLLGIHCQNAALTEMCLVAFGNLAELESSKEQFASTNIAEELVKLFKKQIEHDKREMIFEVLAPLAENDAIKLQLVEAGLVECLLEIVEQKVDSEKEDDIAELKTASDLMVLLLLGDESMQKLFEGGKGNVFQKVLSWLPSNNHQLQLAGALAIANFARNDGNCIHMVDSGIVEKLMDLLDRHVEDGNVTVQHAALSALRNLAIPVINKAKMLSAGVTDAVLKFLKSEMPPVQFKLLGTLRMLIDAQAEAAEQLGKNVKLVERLVEWCEAKDHAGVMGESNRLLSALIRHSKSKALLRKI	270104	115670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_116334_121189_121319_135963_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158485_162881_163011_207803_207930_214256_214380_245558_245670_269898
661160	contig_6674_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_148041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAAGTGGATTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488056	486159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_486200_488100
661179	contig_5686_pilon	+	2001	12	Intergenic	novelGene_45271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1619.40248648171	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	36	1079	93843	211484	FALSE	20	AAATCAGGTGTCGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYAT	93807	212406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_211474
661200	contig_8616_pilon	+	1289	8	Intergenic	novelGene_72593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	967.00146676967	2	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	261	1214	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426956	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427092_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
661205	contig_6633_pilon	+	1599	8	Intergenic	novelGene_143172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	60.8896626728065	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	156	1217	89350	105616	FALSE	25	GCTGCTAGATATTACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALTEANGTFAIRLLKILCEENPSHNVFFSPLSISSALAMVFLGAKRNTAAQMAQALSLDMEKDIHQGFQSLLTEVNKPGTQYLLRTANRLFGEETYDFLSTFKESCLRFYHAELEQLSFAKAAERSRKHINTWVSKKTEGKIRELLPGNSVDPQTRLIFVSAVYFKGRWNEEFNKTYTRKMPFKINQKEQKPVQMMFQEATFKISYVKEVQAQVLELPYAGEELSMVILLPDDNVDLSMVEKNLTFEKFVAWTKPDCMSSTEVEVLLPRFTLEEDYDMEYVLQNLGVVDAFQQGKADFSAMSAKTDLFLSKFVHKSFVEVNEEGTEATAASFFIRHNTANSILFCGRFSSP	86847	105998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_86994_89340_89518_99627_99766_100129_100248_101916_102060_103843_104000_105211_105487_105552
661208	contig_6710_pilon	+	538	2	Intergenic	novelGene_97436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGATGGCTCTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
661209	contig_5643_pilon	+	1427	10	Intergenic	novelGene_39001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	825.491742710944	11	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	681	1259	634983	641424	FALSE	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRPQP	631168	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_641412
661214	contig_18869_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_56320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
661216	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_17185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
661223	contig_8674_pilon	-	2252	11	Intergenic	novelGene_102945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	46.0734196690456	129	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	964	1878	723870	707008	FALSE	20	TCCTGCTCTTCTGTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727564	706633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636
661226	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	34	3407	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
661229	SIRV4	+	373	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	106	471	106	-471	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCAACTGTCGGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	2300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
661234	contig_11507_pilon	+	3767	14	Intergenic	novelGene_103353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_9	76.9591453900808	131	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	177	2069	50559	76902	FALSE	30	TTTAAGGACTGAAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKPLNSQKEPSACKDGEDCQENGVLRKGVPAPGDKVETDQISNEYSAVASPGTGDDTQHSTPAATTALVAEVHQVERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYLELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYTICIIAFYIASYYNTIIAWALYYLISSFTNQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSQDNITWTLHSTSPAEEFYIRHVLQIHQSKGLQDLGGINWQLTLCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWVDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFISGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDECPHIWAKRREWFVLGVVITCFFGSLVTLTFGGAYMVKLLEEYATGPAVVTVVLIEAIAVSWFYGVNQFCSDVKEMLGFSPGWFWRICWMAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQHNYPRWSVILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLITTPGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNVV	35785	78600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_35847_50443_50902_53617_53753_54725_54946_56396_56536_57442_57578_57919_58024_60375_60504_63121_63235_64368_64501_65902_66003_67762_67864_73913_74082_76827
661238	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661248	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661258	SIRV7	-	236	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69050	0	35831	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78907	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
661266	contig_9527_pilon	+	1350	6	Intergenic	novelGene_134072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.271380684191	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	220	870	486523	487885	FALSE	35	CTTACATAATATTCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484902	488365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_485081_486481_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
661271	contig_5063_pilon	+	882	5	Intergenic	novelGene_109996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	20	TATAATTTCTCTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
661289	contig_8273_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_113089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAGACCAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268784	269919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_268800_269900
661311	contig_12270_pilon	-	232	2	Intergenic	novelGene_114145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACGGTACATCTAACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
661317	contig_12733_pilon	+	1917	2	Intergenic	novelGene_129587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_1	0	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTAGAGATTTGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278999	281022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_279718_279823
661325	contig_5429_pilon	-	2413	4	Intergenic	novelGene_127779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_3	511.266618855129	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	223	1089	119158	111060	FALSE	55	TAACAGTAAAACAACACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREPGPRGRRRPYSSGRRGLQPSSPLLGWACPQARRVRRRRERGSCPLEDNVSAEVVPWPFLPGASAPAPQVQKMNNLSFSELCCLFCCPPCPGKIASKLAFLPPDPTYTLMCDESGSRWTLHLSERADWQYSSREKDAIECFMTRTSKGNRIACMFVRCSPSAKYTLLFSHGNAVDLGQMSSFYIGLGSRINCNIFSYDYSGYGASSGKPTEKNLYADIEAAWLALRTRYGIRPENVIIYGQSIGTVPSVDLAARYESAAVILHSPLTSGMRVAFPDTKKTYCFDAFPNIDKISKITSPVLIIHGTEDEVIDFSHGLALFERCQRPVEPLWVEGAGHNDVELYGQYLERLKQFVSQELVNL	158511	109735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_111280_113955_114136_118691_119162_158292
661328	contig_6837_pilon	+	1923	11	Intergenic	novelGene_149812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29.8536429937788	2	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	169	699	11753	15241	TRUE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLNFSGGRKVLILRSGAVYVCARGITHPAPLTEDPNAVQEGKTSVEKAELDHGGSAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11314	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11475_11744_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15471_15617_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
661342	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661343	contig_17470_pilon	-	1168	5	Intergenic	novelGene_110486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	133.825212497496	1043	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	30	374	167807	165368	TRUE	5	CTCATGTGGCGCCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTELRQWEEQGELLLPLTFLLLVLGSLLLYLAVSLMDPGYMNVQPQPQEELKEEQMAMVPQATPPSALQILPGAAATEGPALP	167836	164350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_165006_165228_165397_165582_165662_166040_166178_167707
661344	contig_10434_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_82048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAATTTAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148202	150141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_148200_150100
661346	contig_6710_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_95799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653672	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
661350	contig_6375_pilon	+	2195	16	Intergenic	novelGene_73005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	878	1282	329675	330860	TRUE	35	TACAACCGCGACAGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARKEVYSPGMLTPSSFRKCWAPSRHSGDSSLSAKEPRSSLTIMSAFSGATHSRMSEETTVTWLPHSSNCQFSSVTTAFGFFSTAYSFIRRSACLAARREAFTRGPRPAPSTISTHWTLVSFSSSGTRSSRHL	327211	333821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_327753_328724_328790_328998_329117_329277_329372_329615_329724_330332_330508_330593_330714_330799_330865_330969_331049_331223_331388_331853_332016_332240_332289_332425_332541_332992_333127_333301_333389_333701
661354	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	634	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661356	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661357	contig_9239_pilon	+	1439	5	Intergenic	novelGene_137163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	93.8253030903711	951	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	261	803	100978	110044	FALSE	5	TCATGTCTTGTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQSNRGTESKKMSSELFTLTYGALVTQLCKDYENDEDVNKQLDKMGYNIGVRLIEDFLARSNVGRCHDFRETADVIAKVAFKMYLGITPSITNWSPAGDEFSLILENNPLVDFVELPDNHSSLIYSNLLCGVLRGALEMVQMAVEAKFVQDTLKGDSVTEIRMRFIRRIEDNLPAGEE	100717	110680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_107248_107347_107581_107682_109271_109455_109924
661358	contig_12864_pilon	-	1238	7	Intergenic	novelGene_76419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	131	640	251936	242831	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252179	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251926_251999_252111
661359	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661366	contig_12479_pilon	-	2296	22	Intergenic	novelGene_56863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	133.615704401036	1	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	212	2014	537841	451002	FALSE	20	CTACAATTTTTTGCCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKENMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	594000	450719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773_537846_548942_549020_557947_558020_593942
661369	contig_1521_pilon	-	1207	6	Intergenic	novelGene_145438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	158.02860500555	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1185	21	1205	191760	160443	FALSE	25	TAAGGTTTCTGACACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREENDGCIGRDRREHLFYRIIPCVHDFGARSAQQYLWNIETKGKRDREKDTREERDYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDMRDSRDMRDYSRDSKDSRDPRDSRSTRDAHDYRDRESRDAHRKEETYQEESRSYGRNHLREESSRAEVRSDSRNESRSEIRNDRMGRSRGRGPELPEK	191780	160440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160741_160785_160907_162691_162803_163669_163981_179059_179258_191614
661370	contig_14322_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_116340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671868	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
661376	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661381	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661382	contig_5479_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_133570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1478	1807	113628	113299	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVSIAGNAKEQSWNRPPYCWQRKAFLPWPFLLSPSPARVPGLSLLLLKSHSAPPASPSRVPLLLLFTLRLNFLIESLVGEEEGFRKRTGEVLRHEAFITLHPIIPVF	115105	112861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_112900_115100
661394	contig_16121_pilon	+	1935	4	Intergenic	novelGene_6883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	922	junction_3	148.155323900291	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	6	1412	57746	62826	FALSE	5	TGTGCTCCTTGATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	57740	63349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_58202_58867_59396_60693_60856_62565
661407	contig_7733_pilon	+	2159	6	Intergenic	novelGene_147128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	51.8057911820677	33	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	380	694	92170	107199	FALSE	45	CAAAAACAAAACTTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGPTPRNHHLSGTPHGRVHRHPLARGCPPEGSERLAEMGLRG	86561	108664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_92135_92193_93204_93373_106056_106176_107194
661413	contig_15304_pilon	-	1146	4	Intergenic	novelGene_30671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	4	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	408	1004	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
661420	contig_10940_pilon	-	1683	4	Intergenic	novelGene_49177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACACTTCCGTTTGTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176047	172541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_172628_173149_173218_174001_174121_174637
661421	contig_2062_pilon	+	1733	2	Intergenic	novelGene_139024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTAGTAGAACTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165198	1167113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1165423_1165604
661422	contig_3382_pilon	-	2020	13	Intergenic	novelGene_124024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	460	junction_1	223.204860435928	964	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	110	1105	344734	224870	TRUE	45	AGACAAAACTGAGAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344843	176562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
661425	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
661426	contig_15236_pilon	+	2168	7	Intergenic	novelGene_141576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	381.577864487272	20	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	82	1362	419232	450343	TRUE	20	GAGAAGTGTTCTTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	419150	452548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_450884_452282
661428	contig_11512_pilon	+	378	2	Intergenic	novelGene_43230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	26	376	4011	4584	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSAG	3985	4586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
661433	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_93574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661439	contig_6375_pilon	-	2056	15	Intergenic	novelGene_73002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_11	43.9784269934286	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	73	1668	333124	327598	FALSE	10	CCCCACTGCCCGCTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVTLENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKDDGVSIPGEYTSFLAPISSSKLYNEVRACREKDRDPEAQFEMPYVVRLHNFHQLSAPQPCFTFSHPNRDPMIDNNRYCTLNFPVEVNTVLHGFAGYFETVLYQDITLSIRPETHSPGMFSWFPILFPIKQPITVREGQTICVRFWRCSNSKKVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGRSYTIGL	333371	327209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328788_328997_329115_329275_329370_329613_329724_330332_330509_330594_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302
661443	contig_9197_pilon	+	1402	3	Intergenic	novelGene_154372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	80384	80812	TRUE	25	CTTAACGTTTTGTTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLEPGGRAASSSSPLSEAQPKDPGKVAIQITRAQLQDHLRLVPGRATRKGDPGKGSQRSPRRSRRSSRGQKPARGGAARRLRVRPGSGCPARARSRSLLAPRLLPSSPPPLLPPPQPRRDHVGGDRERPHRGPGGDPGVQL	80381	93156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80892_81723_81833_92373
661449	contig_6710_pilon	-	592	2	Intergenic	novelGene_93004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2	385	657535	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657536	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661452	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661454	contig_9414_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_131079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAACTAGTGCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384582	386674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_384600_386700
661459	contig_6494_pilon	-	997	7	Intergenic	novelGene_108550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	913.705763483093	33	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	566	919	3457	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3528_5445_5660_6395_6490_6751_6883_8256
661471	contig_8552_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_80088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510675	510393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_510400_510700
661476	contig_2867_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_135247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGTGTGTGTGTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286308	1285015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285000_1286300
661477	contig_14441_pilon	+	759	3	Intergenic	novelGene_100718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	151	579	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116577	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
661488	contig_7457_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_31258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGGACAACTGATTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20651	18520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_20002_20112
661489	contig_15042_pilon	-	776	6	Intergenic	novelGene_115428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	266.311847276834	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	138	776	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_31311_31450_35276_35376_42985
661495	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_94545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661496	contig_5526_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_111709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAAGAAAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380117	382298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_380100_382300
661499	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661505	contig_14322_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_116593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGGCGGCCACAGCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
661509	contig_13740_pilon	+	1811	5	Intergenic	novelGene_34725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	30	junction_1	536.708952785399	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	139	660	170866	176906	FALSE	15	CTTTATGTGGTTAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTQAEAQRAAPPSPFLFGCGLSCRRAGPETPQTRDLEQLGGGEQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	166351	178057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
661510	contig_18869_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_56292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATTTGGCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73736	73354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
661531	contig_17386_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_157951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515122	514821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_514800_515100
661532	contig_19564_pilon	-	2109	4	Intergenic	novelGene_29624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	1	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	142	1470	15529	12201	FALSE	15	CCACCTACTGGTTTGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15670	11561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14049_15472
661533	contig_12257_pilon	+	2347	5	Intergenic	novelGene_152107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	28.9946115683587	64	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	170	1909	151413	162361	FALSE	25	TTTTATTGTGTTATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLTASSILSLKTLRHLFRGTGRSFPWSAASLPAV	148854	162799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149449_149522_151405_152947_157405_157514_162263
661537	SIRV6	+	406	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	30	1153	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
661542	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
661545	contig_15304_pilon	-	1061	3	Intergenic	novelGene_30530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
661550	contig_7202_pilon	-	416	2	Intergenic	novelGene_18585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCATGACATCAAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30081	28501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
661564	contig_6375_pilon	-	1609	2	Intergenic	novelGene_73041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGATAGACGAATAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501218	498116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_498675_500167
661566	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_94279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661567	contig_15063_pilon	+	1650	6	Intergenic	novelGene_14133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	3	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	178	1413	34808	39515	FALSE	25	GTGTATATATTCTCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34630	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
661574	contig_13409_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_128459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	13	318	114639	114944	NA	50	TTTACAAATTGAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVLVMHRSSLALGASRRAGTSGPKDMLCSWCCFLGGMRFPCVSACFSLLYLQRDWLKTLPNLVDFINITAANPPYYIIVIEFTTHKEITSDYKILDNHTILGIMA	114626	116021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_114600_116000
661575	contig_13409_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_128460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116171	117444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_116200_117400
661579	contig_6048_pilon	+	1565	10	Intergenic	novelGene_73265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_7	46.0469433041361	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	274	552	1974298	1976872	TRUE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSR	1972113	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
661584	contig_12638_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_33272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846842	847297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_846800_847300
661588	contig_6233_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_74808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTTGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161838	159619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_159600_161800
661605	contig_11677_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_85872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATGTTTATAAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112338	112985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_112300_113000
661607	contig_13504_pilon	+	2449	1	Intergenic	novelGene_157956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACAGGTGTGGCTCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52596	55045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_+_52600_55000
661611	contig_1008_pilon	+	2313	1	Intergenic	novelGene_121577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669053	671366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_669100_671400
661612	SIRV6	+	927	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	42	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	206	700	1733	10736	TRUE	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
661615	contig_15063_pilon	+	1750	7	Intergenic	novelGene_13057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3061.18386685064	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	999	1535	36064	39515	FALSE	35	CACTTGTGGCCATGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVK	30198	39730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_34926_35037_35380_35843_36158_36266_36600_38975_39077_39506
661616	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
661630	contig_7378_pilon	-	1406	9	Intergenic	novelGene_120300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	23.0729143152745	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	13	810	740005	648505	FALSE	50	AAAAAAGAATAGAGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSKMKVSEENFFNVPAFLTVSGQLHLEVMSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMVEAEISFVESLQDLMQVMEGLFKTTLMMVLSNCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLIMSYTEAVEILKKASQNFTFTPEWGADLHTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLVLKPFYMRDNEDSPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGSLREERLGLTEAYQWYLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFTHSCLL	740017	647908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_648650_652564_652592_654966_655035_670656_670795_672133_672201_695658_695697_695807_695907_700436_700570_739922
661636	contig_14030_pilon	-	1566	8	Intergenic	novelGene_62230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	592.204322158893	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	84	566	395000	337410	TRUE	20	CCCTTGGTGCATAGGACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRREDQVPETQGSQRGSNHQPRLNYREMPSLRFVASFSRRPWRRRGRRELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	395083	336213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337115_337310_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_394937
661642	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
661644	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
661645	contig_13894_pilon	-	1943	8	Intergenic	novelGene_62201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	223.294625541947	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	109	1293	766610	750013	FALSE	35	ATAAGGTAGATCTCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKVLIGLPGHRKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766718	749362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753070_753240_761484_761600_762021_762299_763800_763958_766578
661656	contig_17936_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_29986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCCTTTCCTTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165647	166596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_165600_166600
661667	contig_7202_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_16445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27805	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
661668	contig_15105_pilon	+	3158	1	Intergenic	novelGene_150996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792393	795551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_792400_795600
661672	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
661677	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
661686	contig_6445_pilon	+	1411	8	Intergenic	novelGene_77075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.6195991441463	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	48	860	727272	740867	FALSE	15	AATCCAGCTTTGTTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATGKTFRRRRADSESEEDEQDSEEVRLKLEETREVQNLRKRPNGVSPFQVKTGGMVDMKKLKERGKDKISEEEDLHLGTSFSAETNRRDEDADMMKYIETELKKRKGIVEHEEQKVKPKNAEDCLYELPENIRVSSAKKTEEMLSNQMLSGIPEVDLGIDAKIKNIISTEDAKARLLAEQQNKKKDSETSFVPTNMAVNYVQHNRFYHEELNAPIRRNKEEPKARPLRVGDTEKPEPERSPPNRKRPSNEKATDDYHYEKFKKMNRRY	727224	741418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_727355_727707_727768_736475_736542_736935_737014_737748_737947_738626_738764_738856_738956_740775
661693	contig_6163_pilon	+	1247	6	Intergenic	novelGene_103776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	15	TTCTTGCTTACGTGACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
661696	contig_10437_pilon	-	2293	7	Intergenic	novelGene_38125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	135.944126594552	208	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	891	1340	129345	125797	FALSE	85	AAATGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDGQQVLTVPAGQVAEETVIEEEEEEVEKLPTTKKPRMGEMADSVEERKEGSERALLQQQLQEAHRRAQEYRHQLLQKEQEAERYRLRLEAMARQQPNGVDIAVVEEVAEVDAVVVTEGEVEGRGTEMTGAPETLEPHSGVSMETVSS	148968	124843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_126097_126207_126339_129326_129513_141318_141496_142008_142177_143555_143696_148730
661705	contig_18108_pilon	-	2452	17	Intergenic	novelGene_33524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_16	303.871580606018	1	91	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	60	2255	297156	266909	FALSE	20	TTTTGGAGTGTGTTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQLSTPGTSSRRRKRLSSSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335421	266711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297158_335363
661712	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
661714	contig_15304_pilon	-	907	4	Intergenic	novelGene_30663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	169	765	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	106986	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
661719	SIRV4	+	294	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	679	975	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTTAATTTGCACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
661720	contig_6710_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_91743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
661723	contig_14322_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_116444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
661726	contig_4125_pilon	-	1713	7	Intergenic	novelGene_25057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_3	160.570251153679	472	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	110	1234	368015	355996	FALSE	35	TTCATTCTTTGGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCLVMATWLASPCSRALCCLWLLGMLLLANVSTRPANHSAVRERATNREENEILPPDHLNGVKMEMDGHLNKEFHQEVFLGKARDEFEEDSEPRRSRRKLMVIFSKVDVNADRKISAKEMQRWIMEKTAEHFQEAVRENKLHFRSVDPDGDGRVSWDEYQLKFLVSKGHNEREIAERIKNNEDLKVDEESESVRWLRFTGLPSAQEVLENLKDRWYQADNPPADLLLTEEEFLSFLHPEHSRGMLQFMVKEIVRDLDQDGDKRLSLPEFISLPVGTVENQQAQDIDDNWVKDRKREFEELIDANHDGIVTPEELEEYMDPMNEYNALNEAKQMIAIADENQNQHLEPEEILKYSEFFTGSKLVDYARSVHEEF	371404	355516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_356173_356655_356832_357155_357315_359746_359903_360792_360930_367695_368065_371344
661727	contig_16148_pilon	-	1391	7	Intergenic	novelGene_50363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	450.355045121809	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	177	1085	78573	59018	FALSE	55	AATAAAAACAATTGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	88968	58711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_88827
661730	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_97466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661737	contig_10299_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_79674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	53.7111616788251	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	175	696	184255	185364	TRUE	50	AATTCACAAAACTTGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	183917	187671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_186207_186389_186528_187233
661738	contig_500_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_31131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCAGAAAGAAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764251	1765362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1764300_1765400
661746	contig_2100_pilon	-	1115	9	Intergenic	novelGene_50747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1036.88523201703	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	113	562	1182812	1174387	TRUE	20	CCATAAGAGTGCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPGAA	1185523	1169924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170195_1173272_1173374_1174204_1174403_1176293_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
661753	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_3026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
661757	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661767	contig_7870_pilon	-	883	7	Intergenic	novelGene_108937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	544.14287849996	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	240	731	496465	292663	FALSE	55	ACAATAAGAAGCTCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKHLYPVPKMCWDSSQRRL	497931	292510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_292719_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
661768	contig_15066_pilon	-	2673	3	Intergenic	novelGene_149526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	1.5	690	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	17	358	67357	66814	FALSE	40	TTACAAATATTTAGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEVTMAAALARLGLRAVKQVRVQFCPFEKNVESTRIFLQAVSSEKVRATNLNCSVIVDVRHDGSEPCVDVLFGDGHRLIMRGFHLTAQEMLTAFASHIQARGAAGSGDKPGPGTGRG	67373	64498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_66951_67054_67168_67265
661769	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-84	875	30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
661770	contig_11845_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_148144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTAGGCCAGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34916	34364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_-_34400_34900
661776	contig_10196_pilon	+	1161	9	Intergenic	novelGene_132137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	390.850175099104	8440	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	15	971	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWRPRSPVLTCRDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034551	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043788_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
661779	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
661792	contig_3948_pilon	-	1587	2	Intergenic	novelGene_53213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGAGTGTCATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840828	839146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840273_840367
661793	contig_15304_pilon	-	1130	4	Intergenic	novelGene_30685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	8	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	408	1004	106308	105631	FALSE	15	CCCTGGGGTCCTGCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
661798	contig_6589_pilon	-	1536	5	Intergenic	novelGene_25873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_4	1075.30330023673	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	677	1048	956805	955674	FALSE	10	GCAGATGGCTCTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQVSIRPQPLLPLHPRSVALSSPPAPNPQA	959136	955185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955831_956001_956127_956715_957360_957758_957846_959101
661810	contig_12644_pilon	+	1083	9	Intergenic	novelGene_44655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5117.05443681959	3	25	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	46	795	2675526	2680331	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPQTQGG	2675480	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677655_2678765_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680143_2680311
661812	contig_14322_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_116063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
661828	contig_6270_pilon	+	1619	9	Intergenic	novelGene_99807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	338.254342174642	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	863	1201	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27376	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_36422_36638_37410_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_47302
661830	contig_2799_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_85535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCTGATATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689571	688623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_688600_689600
661834	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
661835	contig_9871_pilon	+	1022	8	Intergenic	novelGene_75708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1896.52500696427	9122	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	183	785	574372	584180	FALSE	10	CGTCTGTATTGCTTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIALKNVTLFFPLLTYPYPLKLQAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLKKLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDEVMRAYLQQLRQETGLRLCEKVFDPQNDKPSKWWTCFVKRQFMNKSLSGPGQ	572891	584417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_574242_574438_575068_575175_579914_579992_581756_581826_582912_583040_583534_583630_584117
661836	contig_19564_pilon	-	1384	2	Intergenic	novelGene_29635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	158	1204	15529	12201	FALSE	10	GAATGTCTCCTCTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15686	12020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13191_15472
661855	contig_14925_pilon	-	966	6	Intergenic	novelGene_55120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1757.73938910181	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	238	300	29608	28017	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGSYKYVFGAGTRLKVLTNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAWPGVTTRILHVMKPSTKAASTLAQELSVMPR	77409	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29642_29681_29828_77351
661857	contig_9127_pilon	-	261	3	Intergenic	novelGene_103016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAATATAAAAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201845	197536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_197639_198068_198143_201760
661869	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
661877	contig_12270_pilon	-	745	2	Intergenic	novelGene_113156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	142	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	393	743	14409	13836	FALSE	20	CTGGTACCACAGTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14801	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
661878	contig_4857_pilon	+	2567	23	Intergenic	novelGene_48659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	107.600539185721	277	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	63	1160	1015035	1084195	TRUE	20	CAGGAGACCCCTTCGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWNQVQQLEIKFLEQVDQFYDDNFPMEIRHLLAQWIENQDWEAASNNETMATILLQNLLIQLDEQLGRVSKEKNLLLIHNLKRIRKVLQGKFHGNPMHVAVVISNCLREERRILAAANMPVQGPLEKSLQSSSVSERQRNVEHKVAAIKNSVQMTEQDTKYLEDLQDEFDYRYKTIQTMDQVDKNSVLMNQEILTLQEMLNSLDFKRKETLSKMTQIINETDLLMNSMLIEELQDWKRRQQIACIGGPLHNGLDQLQNCFTLLAESLFQLRRQLEKLEEQSTKMTYEGDPIPLQRTHLLERVTFLIYNLFKNSFVVERQPCMPTHPQRPMVLKTLIQFTVKLRLLIKLPELNYQVKVKASIDN	1012031	1109803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039_1077126_1077750_1077903_1079777_1079937_1080626_1080720_1083743_1083804_1084191_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107876_1107986_1109518
661883	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
661887	contig_7411_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_136973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGCATTCAAAGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105720	108310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_105700_108300
661888	contig_6710_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_89261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTGTCTGGTCGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
661897	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
661905	contig_7457_pilon	+	2423	12	Intergenic	novelGene_31564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	55.376845714814	134	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	54	1811	859493	867405	FALSE	30	TTTATGGCTATATGTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRPYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDKAKVVVLVNRVHLVTQHREEFSRMLDGRWAIATLSGDMGPRAGFGHQARSHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELSDFSLLVVDECHHTHKDTVYNIILSRYLEHKLRRVWPLPQVLGLTASPGTGGASMLSGAIDHVLQLCANLDTWRIMSPQEHQPQLQEHIRQPCKQYDLCQQRSQDPFGDLLKKLMDQVHDYLEMPELSRDFGTQMYEQQRLRPGSRSGECVQSICGATMTRCSSTTQSAPWTPWTRCRTSTTGSAPLRSRCCLPSAGCWRCSMRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFSIYYTVSQKPVVIDRDFKDWSPGGTISCRNCGEAWGLQIIYKSVKLPVLQVRSMLFETPRGRLQAKKWSRVPFPVPDFNYVQHCAQNLRDLSL	859213	868017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_859661_859839_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862177_862427_862620_864042_864193_864279_864442_865537_865729_866783_866881_867222
661907	contig_9833_pilon	+	1796	11	Intergenic	novelGene_68529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	472.69592763213	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1084	1410	254790	259941	FALSE	5	CTGCTCTTCACTCCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	230791	260327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248758_248817_249384_249497_250051_250181_252221_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
661914	SIRV4	+	205	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1566	632	1111	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
661924	contig_6199_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_126407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1392	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAGTGTGTCTTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682786	680872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_680900_682800
661934	contig_18500_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_157960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49066	48813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18500_pilon_-_48800_49100
661940	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661948	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661950	contig_6837_pilon	+	2379	6	Intergenic	novelGene_149809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	33.724768346128	11	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	177	299	11753	11875	TRUE	60	GAGAGAGGAAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWLNFSGGRKVLILRSGAVYVCARGITHPAPLTEDPNAVQEGKTSVEKAELDHGGSAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGK	11306	15959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11475_11744_13257_13422_13599_15141_15273_15420_15471_15617
661954	contig_14326_pilon	+	2750	10	Intergenic	novelGene_120720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	989	1423	441913	443033	TRUE	0	TGTCTCTTCCTCCTCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVIGSYPARLHTAQRQPLTWTPCGVSCLIYPRISLPLETIPQQPQPGRDLKGAQSLPKTNLLSCFQLEVEVLGGLKDEHDGGAQVEFTQVLALAHGDALLVGVRHEAEVVVGAFAVPRAVCVQVPVKVNADGTHVGGSHGSQ	440924	493218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_442290_442975_443140_443412_443558_443792_443932_444094_444330_445732_445899_447413_447629_473562_473739_487115_487194_493151
661968	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
661971	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
661981	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_89189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
661983	contig_7202_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_16439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27796	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
661995	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662001	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_97606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662003	contig_7093_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_157966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	81	500	63712	64131	NA	20	TCAGCGAGTCAATTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLINNLQYADDTTLLAESEEDLKHLTMKIKDCSLQYRLHLNIKKTKILTTGPMSNIMINGEKIEVVTDFTLLGFTINTRGSSSQEIRQHIALGKSAKGFFKVLKSKNVTLKNKVQLTKASYAYESWTMNKEDRQRIDAFELCCWRRTLNIPLTARRTNKSFLEEI	63631	65523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_63600_65500
662015	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662022	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662028	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_90638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662031	contig_5047_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_158002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTAACCTCGCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268367	1269519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1268400_1269500
662039	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_93645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662044	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4149	-1	2970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
662054	scaffold_19766_pilon	-	1828	4	Intergenic	novelGene_34339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_1	221.901379495987	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	555	1082	621659	597156	FALSE	50	ACAAAAGTACCTAGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGKSLSPSFPNSHP	622213	596409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_597247_598328_598360_605098_605300_621454
662056	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
662061	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_93506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662084	SIRV7	-	405	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	58901	0	-58895	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGAGAGAACAATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	114932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_114989_147608
662085	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662087	contig_7744_pilon	+	2116	17	Intergenic	novelGene_62542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	221.844742655196	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	926	1573	887347	890685	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPS	879798	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887181_887339_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890680
662095	contig_8576_pilon	+	1412	7	Intergenic	novelGene_88785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	680.934896545428	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	15	1139	893619	915483	FALSE	25	AAGTTAGTTTTTTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRVGTTT	893604	915756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915465
662098	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662100	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662106	contig_7391_pilon	-	1846	7	Intergenic	novelGene_112162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.18978360255	646	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	70	480	457964	443049	TRUE	10	TTGTCTGTGTGTCATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTGKAARQRLEGRGGGAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKVLKKVSKYIQEQNEKIYAPQGLLLTDPIERGLRVIEITIYEDRGMSGR	458250	438702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_439129_439190_440116_443033_443094_444144_444247_451552_451706_457853_457987_458203
662114	contig_8822_pilon	+	2870	1	Intergenic	novelGene_117941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCATACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217516	220386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_217500_220400
662121	contig_14322_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_116100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
662128	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_11250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	34808	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
662132	contig_13740_pilon	-	1525	11	Intergenic	novelGene_34646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4537.22188679372	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	174	1058	165243	157474	TRUE	30	GTATCTAAATACTTGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGNGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165416	155102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160669_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
662133	contig_7909_pilon	+	3040	1	Intergenic	novelGene_155919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1565	2008	538404	538847	NA	55	TGAAAAAAAAAAGATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELNWSLCFAILGRCALEQIILCTAYLPFVFRLVNSRTPGTTLKKSKGNVLRRVYTREITNPVVWPSDSRGDFSLIVYESQIFLVWFGLKHLLVRLSGMVVQAVYCRATHSSSSFFSTHCLLNHCQCGTPEDWFIIPMDNSGFGTCL	536839	539879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_536800_539900
662140	contig_20819_pilon	+	2474	9	Intergenic	novelGene_55610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	38.1633004337937	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	111	2285	22116	25305	FALSE	0	TTGTTTTCCTGTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQLSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	21114	25494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22063_22323_22476_22550_22594_23309_23427_23643_23798_24004_24175_24654_24809_25033_25245
662147	contig_990_pilon	-	3461	5	Intergenic	novelGene_76168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCACACACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1929654	1918508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1919793_1920669_1920814_1924245_1924331_1925989_1926108_1927824
662152	contig_5916_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_158021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	434	751	239371	239688	NA	60	GAAAAATAATGAATATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSKILSILSLSDIQLVQMNYSKVPVEQFWGLIHESGQSFLLHSMATGSALLLSAGLECVYGPLHTCDHSGEDITQSTLLLEQGLVTSSLKNILVLDLGVEAGS	238937	241147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_238900_241100
662153	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662157	contig_8486_pilon	-	2426	14	Intergenic	novelGene_139289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	22.7853373385854	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	158	2212	60945	55211	TRUE	10	GGTTAGATGTGCTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRWHFLLDKERVRLLRAEHCNPDPLSREEGRQRGGWGWGLRQGSTLARGTGAMAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHDWIPTDWPVPPDWQNLRPSPNLRPSPISRASQNPGASQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPDSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAETRAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGAASANFAANFGAIGFFWVE	61603	54810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55017_55202_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58865_59479_59738_60034_60203_60900_60975_61475
662164	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662168	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662186	SIRV2	+	663	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
662189	scaffold_12124_pilon	+	1754	9	Intergenic	novelGene_22073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	556.579452998402	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	148	957	846536	857868	TRUE	20	ATGTATTACTGTATTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKQIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRHSDIWSDWSETLHFGLPEQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVVLMLIFSRNSVRQTLFLPIPQVKSLLTPNAEIAWEGNHQPPDTQEPEFLIVEEMG	844270	858721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852322_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858348_858403
662192	contig_3825_pilon	+	2667	4	Intergenic	novelGene_78034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	35.6121078036982	283	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	12	962	1935817	1939987	FALSE	45	GGAAAGAAAAGAGCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPARVVLPRLLGAGAWPKSLWLDFLRKPTPEGSRLSSRTFGSAPAPAVSEPEDCSDFSDRIIKEPLKQPDFFNVKELFSVKSLFDARVHLGHKAGCRHRFMEPYIFGNRLGQDIIDLEQTATHLQLALNFTAHMAYRKGIILFVSRNRQFTHLIENTARSCGEYAHTRYFKGGLLTNAPLLFGPSVRLPDLIVFLHTLNNVFEPHVAVRDAAKMNIPTVGVVDTNCNPCLVTYPVPGNDDSPSSIHLFCRLFQTTISRAKEKRRQVEALYRLQGLQAAESRGPVDPPSPGTRTGVQSRDATALHLPDTDSSQASS	1935805	1941692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1935860_1936308_1936435_1937596_1937727_1939335
662198	contig_5947_pilon	+	453	3	Intergenic	novelGene_101493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCAGGCCAGTGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394528	400027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_394570_397104_397324_399834
662202	contig_10460_pilon	-	2322	5	Intergenic	novelGene_157471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	33.7444439871218	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	15	971	97739	86867	TRUE	50	AAAAGAGGCAAATAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERD	97753	82820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_83887_86273_86445_86752_86874_95896_96065_96957
662203	contig_15123_pilon	-	2242	11	Intergenic	novelGene_110909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	188.080009570395	515	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	59	1921	227275	217521	FALSE	10	GTGCTGAGCTGCCTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAAQQLRAEKASYAEQLSMLKKAHGLLAEENRGLGERANLGRQFLEVELDQAREKYVQELAAVRADAETRLAEVRQEAQNAARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEELSKKLADHDQASKMQQQKLKMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRGLEQLQKENKELRAEAERLGQELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLAITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPVSQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKAKH	227333	217199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_217920_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219374_220063_220293_221228_221476_222752_222911_223020_223240_224870_224940_226981
662207	contig_15727_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_158077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTACCGGCTTGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13132	11008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15727_pilon_-_11158_12862
662208	contig_7562_pilon	-	1554	12	Intergenic	novelGene_140880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	70	junction_1	96.5333839398373	690	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	94	1416	143632	125717	FALSE	10	TTTCTTGTCTGTTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQSELGACEGEQVTLSPPIHLLERPASRHIMKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIKISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVVSNPVLWTPGTAQIGEGIENSWGDLEDSEKEDEDEGGSDEAIILDNVKMDTGVDISNIGSQDAPIVLSDSEEEEMIILEPDKSPKKIRTQTIGVKQEKAASKKPMKKRKKKRAVN	143725	125578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_125802_126240_126320_128841_129027_129846_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_141978_142093_142214_143084_143180_143566
662209	contig_7202_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_17197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGGATTTCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
662212	scaffold_13505_pilon	-	1909	5	Intergenic	novelGene_111566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAGAGCCCAGAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635974	608577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_608883_608976_609103_609532_610098_623353_623420_635127
662214	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1954	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
662220	contig_2636_pilon	-	1929	2	Intergenic	novelGene_52077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	0	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63163	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644
662225	SIRV5	-	356	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
662232	contig_7004_pilon	-	792	2	Intergenic	novelGene_126480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	36	452	403202	402786	TRUE	20	TAAGACTGCGGTCCGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCWKWSYGVGRWELSRYHTRVALVLLLLPLTHHLPLRTDVRSWSQYDQQVRLICLIQKCNEVPAAIKVIDPRLWLMVVPGHVTGGRKRLTGPKVGRCQRGLRAQALQGISRKQLEKGPARPFPPFAWEHWSSNPSPC	403237	402263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_402353_402534
662237	SIRV7	-	205	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91719	2	-91713	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTAGTCATCTTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147800_148000
662243	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_18415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662247	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
662250	contig_8978_pilon	+	1928	9	Intergenic	novelGene_49406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	360.155153197896	3	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	59	1156	339807	347264	TRUE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLHSIVQLLELNSLQTSVADTNKFAV	331604	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344250_347186_347474_347578
662265	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662269	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	62	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
662273	contig_6320_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_158081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGGCTTGTGTGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41751	42026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6320_pilon_+_41800_42000
662290	contig_18096_pilon	+	1720	12	Intergenic	novelGene_58044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	589.742638924208	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	46	1533	40382	78932	FALSE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQPSFCLAFN	40336	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_78905
662291	contig_8017_pilon	-	2045	15	Intergenic	novelGene_65359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	1644	2045	975276	959695	FALSE	25	ATCCTTAAGGTCTCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKQNDFFLLKAPEQRTGVIHTNAEDSVFSNSFFVNRTSKYFIHHLHAIANSENRFANSEYRGVKPGRIFCIHGIRSSRDDDSTESLLFDGECRCLQGEDFRLHEQLPHPSVYDFPILSASIQDDYSSFVGVVA	1001888	959694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_959846_963942_964057_971097_971196_975237_975342_978439_978635_978873_979039_981556_981709_982216_982391_984483_984590_986960_987077_989658_989784_993534_993651_997248_997382_1000525_1000698_1001764
662300	contig_14322_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_116077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
662307	contig_15185_pilon	+	2004	9	Intergenic	novelGene_99406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_6	99.2569267104317	321	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	32	1138	203689	209244	FALSE	10	GCTCTCTCTGATCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAGPQAPPPPGTPSRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCNTREIADKLIELKAEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDICRCFAGDTLLAIRAPSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAWSSPPVAVPVPPPEDLLQGPPVVSTPPPLPKPTLAQPQEASCPSSPQLATPAPVPSSIEGQGVTGPAAESTALDTRPLQSSALLDSSSNSSSSGPNPSTSFEPIKADSTGVLELPKELSEIFDPTPECMSSELLEELMSSEGGWSRMLGSGCGQEVGGSWVGPWLQASA	203657	210110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_203824_204298_204409_204551_204714_205023_205068_205819_205882_206098_206397_206924_207042_208882_208931_209113
662308	contig_15236_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_141584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTCTGTATCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429850	429656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_429700_429800
662311	contig_5894_pilon	+	2788	1	Intergenic	novelGene_83009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247126	249914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_247100_249900
662319	contig_9481_pilon	-	3316	7	Intergenic	novelGene_149691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	73.8431144762703	313	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	41	745	600300	572764	FALSE	15	GAACCAGCGTGTGGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKSQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNYTFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKSGGKWIIRLRKGLASRCWENLILAMLGEQFMVGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKDNSSFRNTKITL	600340	570192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_572804_585236_585374_585465_585619_587035_587141_591476_591612_592669_592785_600280
662320	contig_14289_pilon	+	2328	3	Intergenic	novelGene_110574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	12	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1492	1851	82127	84192	FALSE	35	TCAGATGGTGTGATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLLSEEQSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIQNMVGSCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSSYEPELFPGLIYRMIKPRIVLLIFVSGKVVLTGAKVRAEIYEAFENIYPILKGFRKTT	80635	84669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_82312_83282_83378_84112
662321	SIRV7	-	1611	3	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	111695	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	53	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCGTAATTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3043	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2232_2279_2635_3008
662325	contig_14287_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_24062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	80	370	33748	33458	NA	40	GACTGCAGAATGATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTARSYSNFRRGRFFGKLGVWVGGRVMTHHPILTTTLKKRIIVILSQMRKNQSSERLDNGSEVTQLSYRSLISECRFVCPLPPTVTLRSGGWRTAQMGYKPPLGSAWVPSCLRPGHLTPEGR	33827	33138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_33100_33800
662332	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662333	contig_10196_pilon	+	1064	8	Intergenic	novelGene_132160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	451.746361922489	13	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	331	921	1039045	1050653	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTDQQPQVCPPRGAPQRRHSGETGLGQGEVRDRGAHSAVHHCRGVHLQPLHASEGEECAGARGGDGPRDHHEGRPQREGPVQGAAGLSGRRGRWRRLGRELF	1034594	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038576_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1047007_1047083_1050131_1050212_1050506
662334	SIRV7	+	383	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78839_78963_114679
662335	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
662336	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662339	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662342	contig_7057_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_123391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTAGGTGCCATCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211475	1210967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1211000_1211500
662356	contig_13542_pilon	+	3183	6	Intergenic	novelGene_131493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	317.780427339382	33	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	81	812	346638	488167	FALSE	40	CCCCTGTTAACGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQVESPAYNQLPVLTGASLSWPYAEMSELLSHRRVLGQPLCLALCPPQA	346557	490538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906
662368	contig_14209_pilon	+	2502	13	Intergenic	novelGene_88308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	204.911498511485	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	87	1028	32366	37893	TRUE	15	CTTAGGGGAGCCTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTGVYIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPAIWGSFPSPTPMASTAALTSASVWLIAASSATRCPPHPSTPIRKPWAVPQGTGLGPGPS	32279	41009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37419_37712_38394_38557_38783_40142_40344_40418_40859_40901
662370	contig_9424_pilon	-	349	5	Intergenic	novelGene_143787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1699.04487874806	192	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	280461	277472	FALSE	15	TATGGTCTGAGTGTAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSLFP	280483	277471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277481_278586_278762_279552_279629_280079_280144_280458
662371	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662373	contig_5715_pilon	-	2176	11	Intergenic	novelGene_127972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	104.192562114577	49	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	388	792	630764	602242	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSTLAVEELGFERFHALIHKRSFRSLSELKDSVLDQYSMWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVGSYLKSPKYPIWIVGSETHLTVFFAKLPIVMTGECTHTR	645380	599653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_601022_602225_602284_605207_605289_612406_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631757_635159_635331_637616_637678_645335
662385	contig_14687_pilon	-	1663	2	Intergenic	novelGene_107894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1665	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTGGCTTGTTCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421712	415339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_416700_421409
662386	contig_2890_pilon	-	3051	8	Intergenic	novelGene_60278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	213.184599512694	8	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	103	699	316048	307251	FALSE	10	CTTGCTATCTCTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIFEWIYNGFSSVLQFLGLYKKSGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHEQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTGKGNVTLKELNARPMEVFMCSVLKRQGYGEGFRWLSQYID	320475	304898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_307368_308618_308751_312123_312228_315241_315308_315746_315867_315990_316065_319978_320010_320420
662407	contig_10734_pilon	-	2383	10	Intergenic	novelGene_51439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	72.2372633910105	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	797	1660	2226326	2216993	FALSE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2227122	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
662409	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662413	contig_12312_pilon	-	2817	1	Intergenic	novelGene_64006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1228	1725	491269	490772	NA	50	AGAATAAAAAACCCAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKQQRTHVVLCDDSGLQGKPRRCGLLCLCQDRRFCLDTAASPVSVPSSARSTRSGPTILPNTISAEQCKTEREWVVAGKPPQALEQRTMCSCPPVRVGAGRNPLHFAPSPSEWLCHPLCREARRVGSWLSWLWGGRTNRSTMETPERARHCSRNKTLSSPETKS	492496	489679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_489700_492500
662418	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662432	contig_10482_pilon	+	2397	12	Intergenic	novelGene_152843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	293.778153213926	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	87	1178	157875	195194	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFRRAGRLKRGGSIRTEVGSFLVESAIAMDRSGFGEMLSPVIREAEVTRTARKQSAQKRVLIRASQDENFANTTPRNQVIPRTPSSFRQPFTPPNRSLLKQPDVSCVLGTGGRSPRLTQSSGLLGNLSMVTNLDDSNWATAFSSQRSGLFTEPHNMTEDITLSAVMLREDDPGEAASMSMFSDFLQSFLKHSSTTVFDLVEEYENICGSQVNILSKIVSRATPGLQKFSKTASMLWLLQQEMVTWRLLASLYRDRIQSALEDENMFTVTALNASEKAVVEALFQRDSLVRQSQLVVDWLESIAKDEIGDFSDNIEFYAKSVYWENTLHTLKQRQLTSYIGTVRPLVTELDPDAPIRQKMPLDDLDREDEARLLKYIFTLIRAGMTEEVNHV	157788	196413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_157883_160180_160273_160903_160991_162002_162119_165592_165732_173062_173167_176056_176185_177914_177964_182397_182470_182804_182894_193384_193464_195065
662436	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGCAAATAAACGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
662437	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662440	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
662458	contig_10982_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_87862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGCTTGTGGACCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84122	85815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_84100_85800
662459	contig_10982_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_87864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGACCATGAAGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86662	87558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_86700_87600
662460	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662464	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_19059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
662466	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_116273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
662469	contig_11427_pilon	+	1672	2	Intergenic	novelGene_78975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	587	1624	93223	94260	FALSE	20	TCACATTGTTTCGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92418	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_92733
662471	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662485	contig_5988_pilon	-	2392	11	Intergenic	novelGene_15872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	226.079720452764	3	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	426	1583	394282	387963	FALSE	25	AAGGCTGTGTCTAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQNRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERSFLSTRRRAVMCWPNPWRRWGTMLVHCMVEKARSSESLHCPTSRLGPRIFWWLQTWLVVVSTSKMCLWLSTMIWPKTLKITSTGLAVQDEQARVVWPSLSSPKRTLLCSMS	395176	387153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390386_390694_390806_391212_391456_392440_392619_393678_393825_394138_394359_394460_394609_394837_394951_395088
662494	contig_5337_pilon	-	2172	3	Intergenic	novelGene_136561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.5	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	228	1571	322179	320836	TRUE	45	TAAAGTAAAGGCTAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	330301	319699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_319987_320521_322308_330202
662502	contig_12270_pilon	-	338	2	Intergenic	novelGene_114064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	27	338	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14435	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
662514	contig_12644_pilon	+	1043	8	Intergenic	novelGene_44665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5447.13960136278	11	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	193	747	2677375	2680331	FALSE	30	GAGAAATATGTGTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPSQTQGG	2675487	2680627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677384_2678764_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680182_2680311
662535	contig_6710_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_89123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653656	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662539	contig_13403_pilon	+	3001	15	Intergenic	novelGene_158082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCACTGCGCGTTCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	42976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_4833_6592_6653_8416_8670_20109_20218_20316_20430_21174_21480_22777_22951_23291_23324_30683_30784_30864_30970_33045_33212_35542_35680_36819_37181_41705_41824_42835
662552	contig_5799_pilon	+	2830	5	Intergenic	novelGene_50315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	38	junction_4	286.929869480331	2	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	215	451	619664	667945	FALSE	50	GAAGTACTCTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSWGPSFNFSIWYVELSGIDDPDVVQPCLNWYSKYREQEAIRLCLKHFRQHNYTEAFESLQKKTKIALEHPMLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTERS	612812	670324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_667934
662555	contig_1331_pilon	-	1554	4	Intergenic	novelGene_37813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	63	539	169924	160009	FALSE	25	TAAATGCTGACTCCGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169986	158993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
662557	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662568	contig_9807_pilon	+	2043	9	Intergenic	novelGene_32840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	562.436760333995	2	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	154	942	109130	156743	TRUE	20	TTAAATATCTTTTCTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAVSTDLHSLCLWWHGHDGVRLDPE	108976	159751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140401_156690_156770_158676
662586	contig_12923_pilon	-	1039	9	Intergenic	novelGene_30137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_6	175.320376382781	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	159	1001	168895	162599	FALSE	15	CACCTGTCTGCCAGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	169053	162560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872
662590	contig_17964_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_33924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGACTAATTAATAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458370	460549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_458400_460500
662615	contig_11572_pilon	-	3524	20	Intergenic	novelGene_100030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_16	51.6107313456	86	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	138	2471	245250	134069	FALSE	30	GACGTTTTAGAAAATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKISLLKEPKHQELVSCVGWTTAEELYSCSDDHQIVKWNLLTSETSQIVKLPDDIYPIDLHWFPKSLGIKKQTQAESFVLTSSDGKFHLISKLGRVEKSVEAHCGAVLSGRWNYEGTALVTVGEDGQIKIWSKTGMLRSTLAQQGTPVYSVAWGPDSEKVLYTAGKQLIIKPLQPSAKVLQWKAHDGIILKVDWNSVNDLILSAGEDCKYKVWDSYGRPLYSSQPHEHPITSVAWAPDGELFAVGSFHTLRLCDKTGWSYALEKPNTGSVFNIAWSVDGTQIAGACGNGHVVFAHVVEQRWEWKNFQVTLTKRRTMQVRNVLNDAVDLLEFRDRVIKASLNYAHLVVSTSLQCYVFSTKNWNTPLIFDLKEGTVSLILQAERHFLLVDGGGIYLYSYEGRFISSPKFPGMRTDTLNAQTVSLSNDTIAIKDKADEKIIFLFEAATGKPLGDGKLLSHKNEILEIALDQKGLTNDRKIAFIDKNRDLYITSVKRFGKEEQIIKLGTMVHTLAWSDACNILCGLQDTRLTVWYYPNTVYVDRDILPKTLYERDASEFSKNPHIVSFVGNQVTIRRADGSLVHISISPYPAILHEYVSSSKWEDAVRLCRFVKEQTMWACLAAMSVANRDMTTAEIAYAAIGEIDKVHYINSIKNLPSKESKMAHILMFSGNIQEAEIVLLQAGLVYQAIQININLYNWERALELAVKYKTHVDTVLAYRQKFLETFGKQETNKRYLQYAEGLQIDWEKIKAKIEMEITKERERSSNSQSNKGIGVKY	252671	133015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_134180_143476_143601_152951_153125_153686_153777_156397_156570_157847_157996_158411_158548_170052_170118_174872_175037_178262_178338_180854_180974_189891_190072_212134_212273_213936_214027_219367_219478_233191_233261_235371_235483_242638_242859_245211_245300_252583
662622	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662631	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662641	contig_15304_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_30543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	25	ACCAGAAGCAGCCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
662644	SIRV7	+	261	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147696	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
662651	contig_1076_pilon	-	1197	10	Intergenic	novelGene_101101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	319.529669790683	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1182	14	1195	64446	51357	FALSE	15	TGTATGTTTTTGTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAI	64459	51354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378
662653	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_89190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662658	contig_7057_pilon	+	1950	6	Intergenic	novelGene_123372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	80.0139987752143	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	406	1389	1130430	1145980	FALSE	25	CGTTTTCACTGCAACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRGVRGGWCPDLVSRCEPKKLSPKRDIYETVSSQWAIMEQLKNLSPERSIFRDIWECKSHFERQQGQQEGCFRQFMINHENMSIFSPHTLLTQEFFNRVKISECKQCRENFSCHLFFSHHKITHSKAKLYECKECTEIVNTSYLVKQWRTQNNDKYNEYKECWKAFIHCSQFKQHLRINNCEKRYECKECGKAFNYGSEHTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKQCGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKDF	1119054	1146541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1119183_1121265_1121357_1129312_1129440_1130370_1130467_1144923_1145858_1145967
662659	contig_7057_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_123377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTATCTTGGTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146993	1147830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1147000_1147800
662660	SIRV2	-	581	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	34	3117	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
662661	scaffold_17542_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_139233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	934	1257	420366	420689	NA	30	CAGTAATTTTGTGACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQFYSVRHGVAMSCFFGGGKGVITGVPEWCKGLSAQLVTERLAVGTHSEAPWKKGPVICFRKTTALNSMECSSTLLTWGPHESESTRQQLVFIIIGAETICIYNTQ	419432	421995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_419400_422000
662662	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
662663	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662666	contig_12644_pilon	+	1207	10	Intergenic	novelGene_44646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4826.63823144888	4	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	513	1127	2679113	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678115_2678762_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680179_2680333
662684	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
662687	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662689	contig_18869_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_56346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACAACTAAAATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
662690	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
662695	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662696	contig_854_pilon	+	1622	15	Intergenic	novelGene_36454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	413.162714401274	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1533	88	1620	1453661	1465473	FALSE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDSAFSGVTEGIKYQSV	1451243	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464677_1465424
662706	contig_16643_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_158127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTAGGGCAAAAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250365	248244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_248200_250400
662714	contig_7657_pilon	-	2231	14	Intergenic	novelGene_30011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	5.53097784992232	193	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	441	1520	132524	124409	FALSE	15	TCACCTGGTGTGTCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYCLFQALATFFQVPYTALTMLLTSNPRERDSATAYRITMEMAGTLMGATVHGLIVSGAHEPHRCEDARLPLPDGVSPDAIHLYSIAAAVVAVTYPVCTGLLCLGVKERPDRSAPASGQGLSFLAGLGLTVRHPPYLKLVVSFLFISAAVQVEQSYLVLFCTHASRLHDHVPRLVLTILVSAVLSTPLWEWVLHRFGKKTSAFGICVMVPFAILLAAVPIAPVAYIVAFVSGVSIAVSLLLPWSMLPDVVDDFQLQHQHGPGLETIFYSSYVFFTKLSGAGALGISTLSLEFVGYKAGACEQAEEVVVTLKVLIGAVPTCMILTGLCILLVSPTLKVPSQDPSRQLSLRRRTSYSLA	137916	123697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_124434_126028_126206_126600_126745_127031_127142_127367_127449_127769_127854_128328_128451_128564_128656_131439_131571_131684_131764_132488_132614_133180_133217_134602_134729_137727
662731	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662757	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
662758	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_96617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662760	contig_12864_pilon	-	1301	7	Intergenic	novelGene_76420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	625.775718608512	6907	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	194	703	251873	242831	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252179	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
662761	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662766	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662769	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
662770	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662773	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662774	contig_4315_pilon	-	2786	17	Intergenic	novelGene_46720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.540435739653	2	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	9	2108	163741	147905	FALSE	20	CTTGTACTACTACCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRANNSWFQSIIRQDLRSYLGDGPLQHYIAVSSPTNTTYVVQYALANLTGMVINLTREQCQDPSKVPNENKDLYDYSWVQGPLNSNETDRLPRCVRSTARLARALSPAFELRQWSSTEYSTWTESRWKDIRARFITLMVGFGVLIFSLIVTYCINAKADVLFITPREPGAVSY	163749	147226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149258_149442_149668_149824_150078_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
662779	contig_14807_pilon	-	781	7	Intergenic	novelGene_124671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
662781	contig_13966_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_158162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTAAATATTAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523353	524207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_523400_524200
662785	contig_8978_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_49476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGAATTTCCCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715468	1717690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1715500_1717700
662794	SIRV6	+	194	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	90	499	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
662798	contig_15134_pilon	-	2294	17	Intergenic	novelGene_140215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.4592039565119	520	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	80	2125	216759	184409	FALSE	35	TTATATGTAAGAATTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSCWSDPVVVVVVVVVVWLTAGEAIMTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKSNCTRIVQSHRQIRIEGQVCRRAQEKIWWLISIFTEIIVFDFHL	221853	184239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187354_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216766_221780
662799	contig_5023_pilon	+	1731	11	Intergenic	novelGene_7345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1625.85300996123	2	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	113	1144	611764	631518	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKRIVTMQWNWGRIKLSFPWLALLDKISMKETAL	609619	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_609687_611718_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631419_631550_647745
662806	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662809	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_89264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
662811	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
662813	contig_11896_pilon	+	2412	1	Intergenic	novelGene_88016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCTGGATAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147334	149746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_147300_149700
662816	contig_10940_pilon	-	1834	5	Intergenic	novelGene_49171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCGGCTTCTTCTCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176214	172511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_172628_173149_173218_174001_174036_174081_174121_174637
662817	contig_18869_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_55991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTTTCTTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
662821	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662825	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662829	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662830	contig_7963_pilon	+	1123	6	Intergenic	novelGene_58401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1368.22503996967	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	399	944	57173	63007	TRUE	30	AGCACTGGTGTGTATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLALNQDPELDDTPKVEPLYLSQNRGLTRSYLPSEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51413	63229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57138_57564_57782_57934_63003_63062_63104
662848	contig_4865_pilon	-	2131	4	Intergenic	novelGene_158164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	84.5589866437756	252	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTGTCTTGAAATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53015	20768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4865_pilon_-_22463_22974_23117_49262_49399_52856
662854	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_93552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662867	contig_5686_pilon	+	1391	2	Intergenic	novelGene_45368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACGCTTAGCCATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132849	134299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_134094_134152
662877	contig_2867_pilon	-	1595	3	Intergenic	novelGene_135254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCCTATGTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305811	1285020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286369_1286645_1305794
662883	contig_19812_pilon	-	1886	10	Intergenic	novelGene_101003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.3125339978833	412	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	14	811	67090	50202	FALSE	0	CTTCGTGTTTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKPGTMIEWGNNWARAIKYRQENQEAVGGFFSQIGELYVVHHLWAYKDLQSREETRNAAWRKRGWDENVYYTVPLVRHMESRIMIPLKISPLQ	67103	49126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_50267_51992_52077_53251_53347_53730_53763_54056_54141_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
662892	contig_14322_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_115710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
662895	contig_2733_pilon	+	2254	7	Intergenic	novelGene_128541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	444.570735529104	126	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	235	813	504770	594670	FALSE	70	CCAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEKSEEGEPNQHLLCDRHSILDPVAGSQDLSDKLSN	504535	596111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_504816_544501_544574_560425_560494_570777_570861_571294_571388_578069_578182_594565
662896	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
662906	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
662917	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662918	contig_6710_pilon	+	574	2	Intergenic	novelGene_95764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTGACTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	657524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
662919	contig_4678_pilon	-	2266	15	Intergenic	novelGene_126054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	52.4747266669919	5	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	350	1117	577200	573763	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKVPASACTWSPHTHHI	578006	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
662925	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
662929	contig_13571_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_128112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGTGTATGTTTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115686	117615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_115700_117600
662930	contig_2455_pilon	-	2020	15	Intergenic	novelGene_119185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	66.9207572812953	25	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	19	1917	177497	142765	FALSE	30	CAACTATCTTGTAAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQVAQCSARLLLEKEIKFLTAEIDRLKNCGYLEASPDLEQLRAENLKLKYRLNILRRSLQAERNKPTKNMININSRLQEVFGCAIKAAYPNLENPPLIVTPSQQPKFGDYQCNSAMGISQMLKTKEQKVNPREIAENITKHLPPNECIEKVEIAGPGFINVHLRKDFVSEQLTSLLVNGVQLPALGENKKVIVDFSSPNIAKEMHVGHLRSTIIGESMSRLFEFAGYNVLRLNHVGDWGTQFGMLIAHLQDKFPDYLTVSPPIGDLQAFYKESKKRFDTEEEFKRRAYHCVVLLQSRNPDIIKAWKLICDVSRQEFNKIYDALDISLIERGESFYQERMNDIVKEFEDKGFVQVDDGRKIVFVPGCSIPLTIVKSDGGYTYDTSDLAAIKQRLFEEKADMIIYVVDSGQSMHLQAVFAAAQMIGWYDPKVTRVSHAGFGVVLGEDKKKFKTRSGETVRLIDLLEEGLKRSMDKLKEKERDKVLTPEELKAAQTSVAYGCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAQETKIILDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDYIYELATTFTEFYDSCYCVEKDRQTGKVLKVNMWRMLLCEAVAAVMAKGFDILGIKPVQRM	177515	142661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142875_143681_143884_144397_144536_157119_157226_160387_160498_161079_161259_162887_162993_164823_164954_166622_166744_167936_168059_168494_168596_169668_169778_170985_171175_175412_175548_177455
662932	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
662942	contig_5832_pilon	+	2242	7	Intergenic	novelGene_134147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	420.290640179177	101	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	243	692	343259	347555	FALSE	20	CAGCAGACTGTGAGCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRNPREALISGWLFFRYLAIGVYVGLATVAAATWWFLYDAEGPHVTFYQLRNFLKCSKENPLFADDVDCKVFESRFPTTMALSVLVTIEMCNALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLAAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISLPVILLDEALKYLSRNHMDGILRTVSQAWNGQLLTTSRTPDHTGLASLVSRCGRKGPEVNAGSRAESPMLTSD	338062	349105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_338132_338702_338789_343171_343309_343766_343885_344414_344533_344907_345008_347491
662943	contig_7202_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_17717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTTGGTCACGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
662946	contig_2867_pilon	+	1409	4	Intergenic	novelGene_135252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGAGCCTCGAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285020	1289389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1286132_1286690_1286779_1288011_1288149_1289316
662947	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
662948	contig_4055_pilon	-	1805	14	Intergenic	novelGene_158174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_13	18.8214909268649	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	191	1063	947242	929489	TRUE	25	TCGGGAAGCAGTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLEGRDDALLPDFPKGPLQAYRARASFSWKELLLFLEGEETVRFKRTVFSALENDPLFAQRGRADLPLERYRELTFLRCKRVFEYNFLSAEEMLQMPQKVSALVNCLGMYDWSLAVKYSLHMLIFSSAIYSLGSERHFKYIAKIFSMEIFGCFALTELSHGSNTKAIRTTAHYDPSSEEFIIHSPDFEASKFWVGNMGKTATHAVVFAQLHTPGGQCHGLHAFIVQIRDPKTLLPMPGVMVGDIGRKLGQNGLDNGFAMFHKVRISRQDLLNGVGDVTPRGHLRHSV	953819	911929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_912007_915635_915750_916016_916140_918911_919033_921018_921142_922878_923062_929487_929586_937112_937202_938570_938715_941848_941939_942811_942887_945114_945349_947098_947257_953643
662951	contig_11337_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_107195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220872	222488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_220900_222500
662952	contig_13456_pilon	-	3015	18	Intergenic	novelGene_153302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	112.833527128645	387	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	159	2723	385591	364619	FALSE	10	ATGGCGTGCGGACTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAKSAGARRKPPGAQAGARGVKAKPNPNPFEVKVNRQKFQILGRKTRHDVGLPGVSRARAIKKRTQTLLKEYKERDKSNVFRDKRFGEYNSSLTPEEKMTKRFALEQQRHHEKKSIYNLNEDEELTHYGQSLADIEKLNDVVDSDSDTEERGTLSAELTAAHFGGGGGLLNKTASQQSEEGDKAKSRKELIEELIARSKQEKRERQAQRENALELTEKLDQDWKEIQTLLSHKTPKSENKEKKEKPKPDPYDVMVRELGFEMKAQPSNRMKTEEELAREEQERLTKLEAERLRRMFGKDEDETMKKPKHVSADDLSDGFILDKDDRRLLSYKDGKMNIEEDVQEEGSREAGGSESEGEEDPSGEDTEQSDSPDGHSDLDSNAESEEDGESPEKGQLPAPRERCSHGDQKARVDRAELPYTFAAPESYEELKSLLSGRSVKEQLLVVERIQKCNHPSLAAGNKAKLERLFGFLLEYVGDLAARDPPDLRVIDKLVVQLYNLCQLFPEAASDAMRFVFRDAMHEMEEMLETKGRAAFPGLDVLIYLKIAGLLFPTSDFWHPVVTPALVCMSQLLTKCPVLSLQDVVKGLFVCCLFLEYVSLSQRFVPELINFLLGILHIAAPNKPALGYTLVHPFRALGKNSELLLVSNREDAATWQRKSLPLHWASGLKTLTTTETNHARLSCLAVCLALVKRCMLLYGALPAFQDIVQPLRAVLTEHLAHRGHPQDLQELCQSALAEAENQKPHCRPLVCEKSRPVPLKLFTPRLVKVLEFGRKQGSTREEQERRRLIHKHRREFKGAVREIRKDNQFLARMQLSETMERDAERKRKVKQLLNSLATQEGEWKALKKKKFKK	385749	364326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_364719_364947_365104_365359_365479_366322_366471_367018_367179_368838_368993_369465_369568_370244_370381_372061_372148_372968_373100_373987_374259_375353_375486_378034_378158_378731_378867_379326_379467_380455_380598_381070_381206_385396
662953	contig_6533_pilon	+	1923	10	Intergenic	novelGene_114654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_6	118.546755895441	332	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	457	1374	215442	236125	TRUE	25	ACATAATTCCTGTGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDDLQFEEFGDAASSLVANSDDTTISIEDPGETPKHQPGPPRGSGREEDDELLGNDDSDKTELLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQIFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDLYGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKVSIAATVIYAYAWLVPLALWGFLMWRNSKVMNIVSYSFLEIVCVYGYSLFIYIPTAILWIIPQKAVRWILVMIALGISGSVLAMTFWPAVREDNRRIALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTATANQTVTAAKSS	214592	246781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_215001_215393_215473_220467_220632_224459_224541_224786_224875_227139_227257_230502_230670_231042_231226_236038_236134_246240
662958	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
662966	SIRV2	+	462	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	131	-70	-131	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGACTCTAATACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
662971	contig_15063_pilon	+	990	3	Intergenic	novelGene_14407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4631.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	25	486	35271	36299	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKERWPSMHQPST	35246	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36264
662974	contig_3975_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_54710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTATTGTACTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1400524	1400015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1400000_1400500
662985	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
662986	contig_18869_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_56001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTGTTCAGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
663002	contig_2793_pilon	-	1116	7	Intergenic	novelGene_142866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_6	540.875345055484	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	232	711	85184	79566	FALSE	10	TCCTAGACTGTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118500	79160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_118301
663005	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663007	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_95702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663008	contig_10953_pilon	+	420	4	Intergenic	novelGene_42567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2797	junction_3	1672.18366880622	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	105	383	423231	426254	FALSE	10	CTTCGCGTACTCTGTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	422580	426291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_422657_423202_423365_425213_425291_426186
663009	contig_12270_pilon	-	289	2	Intergenic	novelGene_114123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGACAGACTTCACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663016	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663023	contig_4783_pilon	+	3719	1	Intergenic	novelGene_108375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACTGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172350	176069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_172400_176100
663034	contig_14322_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_116535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674880	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
663035	contig_665_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_158223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGATGGCAAGTAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346947	345630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_345600_346900
663036	contig_665_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_158221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344795	344022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_344000_344800
663039	SIRV5	+	2059	1	FSM	SIRV5A	SIRV504	2473	1	414	0	414	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_11500_13600
663063	contig_6027_pilon	-	2336	18	Intergenic	novelGene_74437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.391057973797	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	834	2219	283869	262180	FALSE	5	CTCTGTCTGTTCTCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNVSRTDLDMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTF	290904	262062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262181_263455_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265867_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_289209_289339_290862
663067	contig_17440_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_7664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3598	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
663073	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	23	346	14409	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14431	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663074	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663081	contig_18869_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_56340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
663086	contig_8317_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_19472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
663092	contig_14441_pilon	-	941	5	Intergenic	novelGene_100533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	117788	116936	TRUE	10	CAGTGCTGGCTGCTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117790	111195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111403_116551_116700_116750_116961_117218_117343_117538
663097	contig_12622_pilon	+	2798	16	Intergenic	novelGene_5870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	123.33163962801	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	238	1965	1191880	1212133	TRUE	40	AATAAATACTCTTTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSSVTGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1191642	1213437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1191970_1193172_1193325_1195670_1195750_1199073_1199125_1203275_1203399_1203770_1203906_1205405_1205511_1205604_1205714_1206107_1206245_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932_1212873_1213343
663100	contig_11512_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_43231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	1	369	4584	3991	FALSE	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTISSISTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLKPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNFPTGTRPRATGTRGTESVAPSCCPACL	4584	3989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_4057_4281
663101	contig_10958_pilon	+	1741	12	Intergenic	novelGene_5367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	178.023909620855	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	10	1464	803771	814710	FALSE	20	ATACTCTCCGTGAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPLSVFGDRSTGEAIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLK	803761	814987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_814709
663111	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2302	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663115	contig_5961_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_144164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAACAACACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230156	230425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_230200_230400
663116	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
663119	contig_5059_pilon	-	1724	10	Intergenic	novelGene_140712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	118.262211281897	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	53	754	231713	179716	FALSE	15	GGGGGAAGGTCCTTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESAERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSREQGRMKKTRYKGKISPWD	231765	178745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_179773_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_231639
663121	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	196	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
663125	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_95000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663129	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663131	contig_14441_pilon	+	1450	6	Intergenic	novelGene_100367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	381.089700726745	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	837	1265	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23073	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_26886_27198_113163_113209_116578_116963_117220_117344_117539
663132	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663133	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663138	contig_11328_pilon	+	875	7	Intergenic	novelGene_88405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	2328.27638322143	1671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	37	681	643683	647167	TRUE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGSIMENEDWSISRITKQETQDQSTQDSASCYSTCLATQASAYCSEEAAH	643646	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_646488_646535_647064_647223_647899
663143	contig_2867_pilon	-	1613	4	Intergenic	novelGene_135253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.80679300992	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	8	445	1289415	1286189	FALSE	10	TATTCCTATGTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKLLAQGHLLPARVPPLPTILPPFPISLPCHLLPVLGSGPVEATCP	1289422	1285020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286711_1286781_1288013_1288149_1289316
663157	contig_4797_pilon	+	2198	4	Intergenic	novelGene_6913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_3	2038.72525531683	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368346	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_370026_370914
663158	contig_1813_pilon	+	1982	11	Intergenic	novelGene_105475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	410.375973955591	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	79	843	128315	150078	TRUE	30	TTTAAAAGGGAGGGGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLSVSGGARERSPGESAVVKERRKEMGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSLWG	102754	155788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_154854
663159	contig_12074_pilon	-	2100	6	Intergenic	novelGene_53740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	511	junction_2	129.584875660704	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1053	1847	33593	30226	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGLLSEEGILGFLLFLFKWQVSLPGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	34645	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340
663174	contig_3774_pilon	-	1332	11	Intergenic	novelGene_142040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	166	junction_9	116.585762424063	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	136	1140	210407	144743	FALSE	5	TGCCTGTGTGTTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRASCAGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210542	144550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
663178	contig_5880_pilon	-	2120	11	Intergenic	novelGene_151121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	58.1260698826267	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	135	1580	224452	157805	FALSE	50	TAAAGCAAAATAAGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISSGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYVICPDLKIDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVETYGTMLRNIFDFNALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMKTGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVANATKISLYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDMEALMFDRSFVGKQFSAGDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRNQGLRLIFTDGSRIIFRLSGTGSAGATIRLYIDSYEKDIAKIHQDPQVMLAPLISIALKVSQLQERTGRTAPTVIT	224586	157264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_157895_161111_161247_164537_164722_167818_167955_177259_177376_180301_180457_181729_181921_184511_184638_186266_186414_187133_187297_224449
663187	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663192	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_16862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663195	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	24	356	14385	13830	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14408	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663206	contig_15629_pilon	+	2455	12	Intergenic	novelGene_122434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	100.122156793548	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	179	1618	89415	106629	FALSE	10	TGTCCGAATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWVLAILTLLQDSITAHLSKTHWGLENEALIVPCPKNPNSEHPVDWYSKTNRSITTQKKYRVFASKNFLKFLPTKVDDSGIYTCIIRSPTSNWTRSVNLTIYKKQPDCIIPDYLMYSTVTGTPKRSQIFCPTTQYYNWTAPLEWFKNCKPLQGLRYYRSESYLLIDNANSNDAGDYTCKWVHNEKGVSYTVTATRTLRFGEGKAFPVVPVITAPPPNDTKEVEIGKTVNITCLACMGKGLQILASIKWQVNGSSISDLGEARIHQEQVQSQSSRDELTCLKRILRITDVKEEDFSLKYECLALNLRGVTTRAVRLRRKNPIDHQSIYCTVAGFSVLLILTSVLAILLKVFWIDFILLWRDIVRPYKTRNDVSRVDVSIKTQVYFTRNSILYTVLPMHISIHVKGDHLPAEHHPHSFLCRQMERSTMLMLSIHATTGISLRGPVLWRTSFTRFCLMFWKISVDITYAYMGETCYLEKM	69478	107466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_69559_89316_89476_89952_90161_91520_91696_91787_91951_93239_93312_95352_95495_95589_95736_102174_102322_102680_102833_103346_103515_106623
663210	SIRV2	+	327	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	270	-74	-270	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGTTCTATCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
663217	contig_5816_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_158259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATGTAAAGGTGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332218	331691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_331700_332200
663218	contig_8020_pilon	-	2892	9	Intergenic	novelGene_114395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	67.6941651843052	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	108	719	152275	150432	TRUE	35	ATGGCACCTTCAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTP	153230	147226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_149185_149828_149962_150255_150433_150901_151044_151127_151231_151580_151708_152036_152321_153168
663219	contig_998_pilon	-	2045	9	Intergenic	novelGene_153797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	78.3593485169447	45	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	363740	335033	FALSE	55	AAAAAAGAATGAAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERVS	363751	333685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672
663235	contig_19342_pilon	+	855	5	Intergenic	novelGene_41065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	7	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAATCCTGTGTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3234	6775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3699_4285_4365_5016_5059_6209
663238	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657188	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657189	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663240	contig_11720_pilon	+	1429	12	Intergenic	novelGene_43992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	366.73531789075	2	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	147	1145	263924	272176	FALSE	40	AAAATATTTATTGAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGEGVKFKMGQKRIPRQTLQRLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGAELHHDGHLRGTVRDGGLPEAAVVSLCPRPPHPLLRHPAHRASGRLQGSEGSVRPQRPAQRAAEPAASLCCAAHPHVHQHACLHARVCQWLAEQGHHFLHHGANLCHQSLLRGQLPAQSPPPCLLWSCSPAGRSLPGTYHLPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	262956	272460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_263872_263996_264105_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266233_270102_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
663243	contig_7457_pilon	+	1623	6	Intergenic	novelGene_31548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	364.74177166867	668	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	176	826	840844	844700	FALSE	0	CTTGCTCTTGTCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPGTPLGGEERSLSEPRRRVTPPPRSRLGDPLATKCLFAKLRPPAPTLTGTTTEGRAMAGRGGAARPNGPASGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFARAKNWVKELQRQASPNIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNEIFMAIAKKLPKNEPQNAAGAPGRNRGVDLQENNPASRSQCCSN	820278	845497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_820365_840754_841010_842546_842699_842968_843092_843987_844082_844584
663244	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663246	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663248	contig_6048_pilon	-	2232	16	Intergenic	novelGene_73287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.791843453368	1	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	321	1847	1987473	1978861	FALSE	25	TGGAATAAAGTTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRRGPLRNLPTAYPRTPTDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGLWTTSRS	2049063	1978475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978886_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985788_1987413_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
663249	contig_15866_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_63642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCATGCACCCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484684	485567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_484700_485600
663260	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663265	contig_16775_pilon	-	1735	2	Intergenic	novelGene_107787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAATGAAAAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175352	173541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_175169_175244
663269	contig_9332_pilon	-	2146	10	Intergenic	novelGene_60703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	407.358822018799	2	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	708	1712	68236	41510	FALSE	40	CATAATTGTATTTGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRQIFHVLDLMRMDMVNFTIRSLRPHLQRQLVDYERTKFQEILEETPSALDQTTEWIKESINEELLSLSEATLTPGAEGSSKPTLSPTLVLNNSYLKLLQWNYRKKELPETLMTDGARLQELTEKLNQLKIIACLSLITNNMVGAITEGLPELANRLKRISAVLLEGMSKETFNLKEVLNSIGVQTCVEVNKTLEERGLSTLNAEVQANLVGQFSSIEEEANPIWSLIDKRIQLYMKSLLCLPSPPKCMPPIPGGLAVIQQELEVLGSHYANIVNLNKQVYGPFYANILRKLLFSEEAVGKTETLSPTN	86304	41075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66121_68156_68330_69417_69537_73753_73890_76408_76601_86137
663270	contig_5018_pilon	-	1564	7	Intergenic	novelGene_47021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_6	141.999315334813	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	159	917	1395426	1392342	FALSE	0	GCCCTGTGGTCTGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTLGLDRGANAVFFSWLPQAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1395584	1391694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340
663274	contig_6361_pilon	-	2344	2	Intergenic	novelGene_23883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1442	junction_1	0	59	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1406	1759	81698	79135	FALSE	55	TGTGAAAAAAAAAGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHVSDLAQMKWGHLCISIRWL	83103	78549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_79369_81578
663281	contig_3382_pilon	+	2041	9	Intergenic	novelGene_124106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCGAAGCGGCGGCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672488	725161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_673521_677152_677347_687601_687724_689133_689310_692724_692869_694302_694414_696444_696548_712957_713053_725097
663284	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663308	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_17937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27895	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663312	contig_9848_pilon	-	1357	4	Intergenic	novelGene_79938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	877	junction_1	282.873744903191	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2	442	105109	104044	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVHPVPWEDRAGARWKLLEPCQHLPKSFLGKVFEALGAHRARSKQDRSPEREGGREEGACSVGGAFLADEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	105110	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841
663313	contig_10861_pilon	-	1610	11	Intergenic	novelGene_39333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	257.641301036926	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	108	1007	1492200	1490156	TRUE	10	AGTTTGGGCTTGGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493806	1489331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489721_1489941_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
663316	contig_854_pilon	+	814	2	Intergenic	novelGene_36319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2407	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	298	372	563279	563353	FALSE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAHEAAETLLQHPLGVALQPSQPDGSDPPGLLRKARWCPSWPRSPLPVVFFSSWLQSLVDVFFVLEAGVNLQALRPNPLCSRLPRGKKGSPRIQYATLMLLQSLLAASCGSIYPFTLVPPSA	562356	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_562405_563029
663319	contig_14855_pilon	+	2016	7	Intergenic	novelGene_146036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	38.6584042896525	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	265	903	650839	654448	TRUE	5	TCCCCTGGTTGGTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648575	655651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_655160_655249
663322	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
663324	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663331	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663334	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_96086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663336	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_115760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671655	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
663340	contig_3975_pilon	-	1827	5	Intergenic	novelGene_54921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	207.539755227764	1638	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	96	590	2262603	2239007	FALSE	45	CAAAGTAAATGTGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRDDPAARMSRSSGRSGSMDPSGGVGPPRGALVRGTPVRGTITRGTTVTRGVPPPPTVRGAPTPRARTAGIQRIPLPPPPAPETYEEYGYDDTYAEQSYEGYEGYYSQSQGDSEYYDYGHGEVQDSYEAYGQDDWNGTRPSLKAPPARPVKGAYREHPYGRY	2262698	2237769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2239105_2241779_2241839_2242857_2242926_2243441_2243636_2262527
663353	SIRV2	+	295	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-67	295	-67	-295	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGCTAAACCATACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
663358	contig_7202_pilon	-	145	1	Intergenic	novelGene_16428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27767	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
663369	contig_14441_pilon	+	1175	6	Intergenic	novelGene_100412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.223608922637	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	62	988	75468	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIIKPILPLALGEATLPYCTMAIRLLCWVALHLLVARTGKKITLECSQTLGHDYMYWYRQDPGRELQLMHYFYSVNSTEKGELSSRWTVSRRRKEHFSLVLESASPAESSRYLCASSSCATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	75406	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_75517_75665_75910_113152_113209_116578_116963_117220_117344_117539
663370	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
663383	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663386	contig_10904_pilon	-	1926	9	Intergenic	novelGene_22496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	595	junction_7	212.295637025352	1050	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	198	875	336807	310785	FALSE	25	TGTATATAGGCTAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRRTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLAEDPKVNTRAPCEAAYVPTKEPLGACELQP	337004	309733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_310878_315357_315390_315486_315525_315742_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
663392	contig_6710_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_96334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653688	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
663404	contig_5643_pilon	+	828	8	Intergenic	novelGene_38876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2871.43348969017	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	150	653	236700	238020	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHPQQQH	236420	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237754_238002
663407	contig_13744_pilon	-	3387	15	Intergenic	novelGene_77179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	25.2579548996803	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	28	2088	710923	652974	FALSE	20	CGAGTTAATGTTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDALLPATPQPLEKEGDGYFRKGCNPLAQTGRSKLQNQRAALNQQILKAVRMRSGAENLLKAATNHKVREQVRLELSFVNSDLQMLKEELEGLNISVGVYQSTEEAFTIPLIPLGLKETKDVDFSVVLKDFILEHYSEDSYLYEDEIADLMDLRQACRTPSRDEAGVELLMSYFIQLGFVESRFFPPTRQMGILFTWYDSLTGVPVSQQNLLLEKASVLFNIGALYTQIGTRCNRQTRAGLESAMDAFQRAAGVLNYLKETFTHTPSYDMSPAMLSVLVKMMLAQAQECVFDKICLPGIQNEFFMLVKVAQEAAKVGEVYQQLHTAMSQAPVKENIPYSWASLACVKAHYYGALAHYFAATLLIDHQLKPGADEDHQEKCLSQLYDHMPEGLTPLATLKNGHQRRQLGKSHLHKAIVHHEESVREASLCTKLRNIEVLQEVLSVAQQRSRLKYSQHQEADDLVNLIDAPDVVSKTEQEVEIIPPQFSKVTVTDFFQKLGPLSVFSANKRWTPPRSIHFTVEQGDLGFTLRGNSPVQVHFLDPYCSAALAGAKEGDYIVSIQEVDCKWLTLSEVMKLLKSAGKDDIEMKVVSLLDSTSSMHNKSATYSVGMQKTYSMICLAIDDDDKTDKTKKISKKLSFLSWGTNKNRQKSASTLCLPSVGVARPSVKKKLPSPFSLLSNDSSLY	710950	651674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_653235_658048_658205_659458_659606_659833_659911_661947_662143_664034_664155_666584_666742_667136_667325_670048_670216_671246_671372_671750_671829_678113_678190_680941_681071_693137_693254_710854
663409	contig_11512_pilon	-	306	2	Intergenic	novelGene_43252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2	304	4560	4033	FALSE	30	AACAGAGTCTGTGGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLKPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNFPTGTRPRATGTR	4561	4030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_4057_4281
663412	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663423	contig_14322_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_115762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
663427	contig_6710_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_90681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCATCAGCCCCTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
663430	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_116042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
663433	contig_13828_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_158294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGAGATACTAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296018	296896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_296000_296900
663434	contig_15866_pilon	-	3387	2	Intergenic	novelGene_63610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTCAAAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369852	366345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_369653_369772
663437	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663446	contig_9833_pilon	+	2161	9	Intergenic	novelGene_68526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	202.513849835017	16	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	50	1021	230823	252607	FALSE	10	AGTACTCTTGCCCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKERAPTSSCRMLTWTGPWSRPTSPCSSTRASAAVPAPEPSCRRMCMLSFWSEALPRPRHGWLATPLIARLSRGHRMAVPVEEPDTQDHDHLWAL	230773	253747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251857_251891_252272_252458_252546
663447	contig_8138_pilon	+	1416	6	Intergenic	novelGene_52464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	168	650	280295	306552	TRUE	10	TTCTTAGTAGTGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280127	307936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_307015_307632
663451	SIRV7	-	896	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-15	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
663461	contig_2755_pilon	+	3059	7	Intergenic	novelGene_158300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_1	21.2681295212657	97	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	308	2599	250631	283022	FALSE	25	TACCAGTGCCATGAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLSSPDSALLQGGRTDKEGLTPLVPSASFQESVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPVQRDLFRDVTLENYTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWTVEPGVPVGTSRDWETRPENSGSASELDISDEKPSPAAIVEKVRRDYHGSSNFLKTFESEGSPEGEQTNEWTLPREIKITEKKIPTWKKGLVSNEYGKSINMSSNPVTQEISSEGSPPKCNEHKTGVKQNLNPIKKEKSCKCNECGKAFSYFSALIRHQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEAPSLTQHQRIHTGEKPYKCDECGKSFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECNECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCNECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCDKAFSQSSHLTQHQQIHTGEKPYKCSECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGDKPFGCNDCGKAFRYRSALNKHQRLHPGI	249830	283482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_+_249896_250186_250285_250486_250638_255856_255946_276975_277103_277447_277544_281049
663473	contig_11115_pilon	+	2423	16	Intergenic	novelGene_102791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_15	140.368942433859	77	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	57	1928	150114	157736	TRUE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRRCCLPLPRELSNLIIMRGPRASPRPLNLSQLSFHRVCRDEITQLSHLGQGTRTNVYEGLLRVEGEGPEEDKEDSGDPPVPSRGRGQELRVVLKVLDPSHHDIALAFYEVASLMSQVSHVHLAFVHGVCVHGSENILVTEYVEHGPLDVWLRREKGHVPVAWKVAVAQQLASALSYLEDKNLVHGNVCGRNILLARPGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGTLSREERVERIPWMAPECLPGGANSLSTAADKWGFGATLLEICFDGEAPLQGRGPSEKERFYQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	149980	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_150017_150093_150198_150303_150487_150567_150656_151655_151784_152659_152796_152878_153034_153729_153881_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967
663477	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663480	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663481	contig_817_pilon	+	1584	2	Intergenic	novelGene_132452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAAAATCTGCCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556857	567742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_556865_566165
663482	contig_6227_pilon	+	2768	1	Intergenic	novelGene_49683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCAGAAAGGTGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867918	870686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_867900_870700
663486	contig_10904_pilon	-	3448	8	Intergenic	novelGene_22444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	16.7222203388553	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	970	2913	184	3096	96368	71076	FALSE	55	GAGAGAGAATAAAAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAECVLHLLVAYLEELEAVDLKKFKLYLGTKAELGEDKIPWGRMETAGPLEMAQLLTAHHGSGEAWLLALSIFERINRKDLWERGQREDLVKDALPGAPSSLGRQSGSPVKVSPSTPRKDPRETYLNYVRRKFQLMEDRNARLGECVNLSHRYTRLLLVKEHSNPMRAQEKLSAMGRRHAGTVAHQASPIRVETLFEPDEERPEPPHTVVLQGAAGMGKSMLAHKMMLDWAEGRLFQGRFDFLFYINCREMNQKAKRSLQDLISSCWPEQSVLLPELVRVPERLLFIIDGFDELKPSSHNPQGPWCFHWQEKWPTELLLGSLIRKKLLPELSLLITTRPKALEKLHHLLEHPRHVEILGFSEAERKEYVYKYFHNVEQAGQVFNFVRDNEPLFTMCFVPMVCWVVCTCLKQQLEGGGLVRQTSRTTTAVYMLYLLSLMQPKPGTPTHQTPPNQKGLCSLAADGLWNQKVLFEEQDLQKHGLDGADVSAFLNINIFQKDINCEKFYSFIHLSFQEFFAAMYYILDGEESGLGPEKNVSRLLADYGSSDRSFLAPTVRFVFGLLNKETRSYLEKNLCWKVSPHIKMELLKWIQSKAQSEGSTLQQGSLEFLSSLYEIQEEEFIQQALSHFQAITVSHIATKMEHMVSSFCVKHCRSVLVVHLYGAAFSADDDGVKWTSGSQTLLAQSPEKNLLPNAYSENLAAALCTNPNLIELVLYRNALGSRGVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKMCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLW	96551	70723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_85934_87631_93272_93354_96091
663487	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663488	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663489	contig_6710_pilon	+	544	2	Intergenic	novelGene_96958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
663499	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1571	632	1116	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2571	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
663500	contig_9243_pilon	-	3044	1	Intergenic	novelGene_60333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCCTGCTTGATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60121	57077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_57100_60100
663503	contig_15666_pilon	-	2404	6	Intergenic	novelGene_70217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	108.474144384733	709	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	756	1754	132068	129088	FALSE	45	AGTAAAAATGATCTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132823	128437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130018_130298_130515_130795_131446_131711_132007
663508	contig_8045_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_35364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	26	667	116067	118722	FALSE	25	ACTGTTGTCTCATGTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116041	119221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
663518	contig_14322_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_116297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGCAATGCGGCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
663521	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
663522	contig_11512_pilon	+	343	2	Intergenic	novelGene_43238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	4011	4566	FALSE	15	GCTGCTTATAGTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAY	4000	4566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
663524	contig_6163_pilon	+	2348	5	Intergenic	novelGene_103858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_4	28.4374313185984	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1807	2199	507023	507858	FALSE	35	GCAATTTAGAAGGCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADEKSSDMSPVEETWQALPEESQAGEQFGSQEARSFVLDKTTKEEDDAYDFSTDYV	505134	508007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_506862_506943_507081_507166_507337_507598_507666_507760
663525	contig_15304_pilon	-	1107	4	Intergenic	novelGene_30688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	402	998	106308	105631	FALSE	25	TAAAGCACCCAGCTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106526_106931
663529	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663531	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663541	contig_14322_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_115984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671618	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
663549	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	29	385	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14437	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
663550	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_93548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663551	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663555	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
663556	contig_10354_pilon	+	2065	5	Intergenic	novelGene_50843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	487.515320272092	2	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	172	756	432370	475186	FALSE	30	CATATAGTTAATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVQLILISTLKKSLQRTSPNPPSTVLMLHKAECISLWNKIVTHVF	432198	476495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472046_475056
663559	contig_14441_pilon	+	1036	5	Intergenic	novelGene_100438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.651485960052	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	428	856	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82061	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112107_112154_116637_116963_117220_117344_117539
663570	contig_14618_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_136838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	469	783	1176337	1176023	NA	85	TAAAAAAAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGSGKKRTEDRPWDLVGRRSSEKSVRNSKEQKPDGMTLGVRQCSLRFSISVSPTVFQVLAGHRGLRGSETSGQKKLEGLRSLAFLLGWKSSEHIYIIYIYSEN	1176805	1176020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1176000_1176800
663571	contig_165_pilon	+	2034	15	Intergenic	novelGene_117058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	312.206172068316	12	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	110	1324	45144	71673	TRUE	5	CCTTGTGGAGTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLQQEEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	44800	72441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_44878_45111_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622_71916_71973
663578	contig_16110_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_126789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTACTCAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80578	78451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_78500_80600
663580	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663587	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_93691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663591	contig_13699_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_158316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTTCTTATCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51875	52441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_51900_52400
663595	contig_9146_pilon	-	713	6	Intergenic	novelGene_79495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1491	junction_5	1262.74453473377	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	19	672	147490	142549	FALSE	25	GACAATGTTTGCACCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147508	142507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
663596	contig_2537_pilon	+	1752	8	Intergenic	novelGene_33421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	158.392305523278	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	134	793	228542	233721	FALSE	85	AGAAAAAAAAAACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADGKFLLWGFDSLRLKHSKLVGWCMDYLWLLRNSKMIFLFYV	205923	234680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548
663603	contig_11978_pilon	-	2980	1	Intergenic	novelGene_62892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAACCTGGCCTGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756522	753542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_753500_756500
663606	contig_6710_pilon	+	560	2	Intergenic	novelGene_94474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
663607	contig_6871_pilon	+	1881	2	Intergenic	novelGene_21577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	124	1071	134070	135017	TRUE	50	CAATTCATTAAAAGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	133946	135951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_135731_135854
663608	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_18820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCCAGAACTACAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
663614	contig_4071_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_151872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTGATGAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92495	91790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_91800_92500
663620	contig_18145_pilon	+	1823	10	Intergenic	novelGene_37364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	628.961048078496	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	168	914	96213	98826	TRUE	55	GTAAAAGGACAATAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNLCYFS	95969	101236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97273_97514_97550_97824_98038_98231_98409_98808_98983_100326_100482_100638
663627	contig_8978_pilon	-	1570	7	Intergenic	novelGene_49339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	902.543889360635	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	194	526	193675	193127	TRUE	35	GAATAAGAATGTCTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGIWKEGVKSPGILWGTGVYGVVLFHHKAT	194068	190472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191642_192260_192444_192867_193398_193613_193768_193967
663629	contig_15114_pilon	-	1923	12	Intergenic	novelGene_121100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	589.582454856299	108	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	110	1783	56240	31647	FALSE	30	ATTTTTTTTGAAAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRGGAVRAPRHPWGSRASPQVAEDVTGVAGSGPRTMLAFLGTTALVLVAGAPWALLAAAGGEDLESPQNVEVSIIDDVFLLKWNSSESVGNVTFSADYQTPGMHNWIELPGCQYITGTTCDFSSVKLSVFEKIQLRIRAEKGNRTSPWHEVGSFIPFRKAQIGPPKVHLKAEDKAIIVNISPPGTKDSLMWAMDILSFTYSVVIWKNSSSVDERTETVYPGGKIYKLSPETTYCLKVKARLRLHRKVGSYSPVYCVNTTVENKLPSPENIEVDVKDQSYVLKWDYTYENMTFQAQWLRAYFKKILGNHSDKWQQIPGCENVRATQCVFPQKVFSKGAYFLRVQASDGNKTSFWSEEKRLDTEMQTVILPPVISMKSVDNSLHIYIGAPRETENKSTSQHYPLIYEIIFWENTSNAERKILQKKTDFIVPNLQPLTVYCVKARAVIEDEKWNKSSVFSDILCEKTKPGNTSITWIIAGVCTALFSIPVAIYVVKGLLRCINYVFFPSCKPPPNIDQCFSEQSLKNLLLSASEEQTERCFIIENSYSLVTVEETSQVDEDHKQYSSQTSRDSGNYSNEDENSGSKTSRRGSGSG	56349	31506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_31668_35028_35242_39509_39656_40366_40518_42847_43003_43108_43309_43981_44097_45363_45506_45615_45774_46802_46982_50036_50158_56167
663630	contig_13780_pilon	+	2511	1	Intergenic	novelGene_149058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGAGAGTCTGGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607424	609935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_607400_609900
663636	contig_9706_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_20849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2316	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
663642	contig_8357_pilon	+	1548	3	Intergenic	novelGene_39724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	130.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTTACTGATTTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500723	510941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_500930_507469_507568_509697
663645	contig_14322_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_115847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671616	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
663647	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	220	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
663656	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663665	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663675	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663676	contig_6735_pilon	-	838	7	Intergenic	novelGene_15780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	991.510407857068	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	40	654	564868	542177	FALSE	25	TCACCCTTATGCTGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEILHECFL	568237	541992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542201_543788_543894_544851_545064_554257_554374_564157_564232_564784_564869_568198
663684	contig_7080_pilon	+	1977	10	Intergenic	novelGene_100097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	70	882	488513	540726	TRUE	30	TATCTTTATATTAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460812	542173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540931_541282
663686	contig_6847_pilon	-	2246	11	Intergenic	novelGene_143894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	249.745970938472	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	101	1636	266491	232193	TRUE	45	TATTATAAAATGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQVRSGRCSPSPDPSPIPSGAGVRVRPTTAFTMVLLAAAVCTKAGKAIVSRQFVEMTRTRIEGLLAAFPKLMNTGKQHTFVETESVRYVYQPMEKLYMVLITTKNSNILEDLETLRLFSRVIPEYCRALEENEISEHCFDLIFAFDEIVALGYRENVNLAQIRTFTEMDSHEEKVFRAVRETQEREAKAEMRRKAKELQQARRDAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTSAMITETIIETDKLKVAPAPTRPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIMSSNMGKRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	266591	230349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_230671_231903_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024_245190_246080_246287_246422_246603_247231_247496_266488
663687	SIRV6	-	929	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8784	-138	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTTCATTGGGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11331	1682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
663695	contig_3252_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_61493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281269	282718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_281300_282700
663716	contig_12270_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_113913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13857	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
663720	contig_5549_pilon	+	2236	12	Intergenic	novelGene_81609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.498685176647	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	186	1961	334039	369342	FALSE	65	AAGAAAGAAAAATGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW	304377	369617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_304443_321063_321153_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
663727	contig_12932_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_158345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1237	1548	9146	8835	NA	80	AAGAAAAAAGAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHLYISRPSGFLLSLDPAAASCRLISRSWDLSCQLICQTWDSLICTACEWEPCSLTFRSWACQLLQLCDLGEASTLIHGLGTF	10382	8239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12932_pilon_-_8200_10400
663728	contig_5690_pilon	-	2342	11	Intergenic	novelGene_119674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_9	21.4497086227296	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	109	1113	281981	233881	FALSE	35	ACAAGATAAGGGTTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEPIRSSRCCRRRSRCDRRSGVQRAQRWDISHTVSEMSSTAAFYLLSTLGGYLVTSFLLLKYPTLLHQRKKQRFLSKHISHRGGYCHDLGVLPLIDLACGKIEGAGENLENTMAAFQHAVTIGTDMLELDCHITKDEQVVVSHDENLKRSTGVNVNISDLKYCELPPYLGKLDVTFQRACQCEGKDNRIPLLKEVFEAFPNTPVNIDIKVNNSMLIKKVSELVKQYEREHITVWGNASYKIVEKCYKENSDIPILFSLQRVLLILGLFFTGLLPFVPIREQFFEIPMPSIILKLKEPHTMSRCQKFLIWLSDILLMRKALFDHLTARGIQVYIWVLNEEQEYKRAFDLGATGVMTDYPTKLKDFLLNFSA	282089	232651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_234004_234406_234459_235740_235801_238496_238631_245763_245854_246370_246490_252192_252239_253436_253573_271501_271545_277048_277109_281839
663731	contig_14322_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_116557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
663740	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663741	contig_1337_pilon	-	2230	12	Intergenic	novelGene_84244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	45.8180014426464	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	219	1571	450056	428635	FALSE	45	CAGAACTTCTTTAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKKRNTPHRGGSGGGGTGAAAATAVAAGSQHRNVQPFSDEDASIETMSHCSGYSDPSSFAEDGPEVLDEEGTQEDLEYKLKGLIDLTLDKSAKTRQAALEGIKNAMSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGKSDEQCAAAALACVLCIQLGPGIESEEILKTLGPILKKIICDGTTSIQARQTCATCFGVCCFIATDDITELYSTLECLENIFTKSYLKEKDPNGICSTPTTVLHISSLLAWTLLLTICPINEVKKKLEMHLHKLPSLLSCDDVNMRIAAGISLALLFELARGMDNDFFYEDMESLTQMLRALATDGNKHRAKVDKRKQRSVFRDILRAVEERDFPTETVKFGPERMYIDCWVKKHTYDIFKEVLGSGMQYHLQSNEFLRNVFELGPPVMLDAATLKTMKISRFERHLYNSAAFKARTKARSKCRDKRADVGEFF	450274	427975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_428725_431514_431611_432042_432172_434959_435095_439321_439431_439518_439698_439779_439831_442539_442698_444397_444523_445308_445394_445524_445630_449965
663742	contig_13707_pilon	-	2087	9	Intergenic	novelGene_43568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_2	505.257592100307	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	195	1061	273826	270728	FALSE	55	CTTGAAAAATATTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	274245	269701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271895_272363_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147
663743	contig_10749_pilon	-	1005	3	Intergenic	novelGene_133486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	763	junction_2	11.5	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	65	493	168321	166985	FALSE	25	GGTGAGTGACTCAGCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKVSVPLEPW	169052	166472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_167395_168302_168346_169012
663755	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	314	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663767	contig_253_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_129634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1362	1742	222463	222083	NA	80	ACAATAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPILSPKSLLKLVYLCVYVCVHTIYIHTYIYCKSVLKSYLLLKDHCSSSPLLGPKEGPGRPSVLSGSSPSEEGRFRDGGCFSFHSLSLERSLSEQGIIPRRRQYCLPRGRDWLLKQMDTTHFTQY	223824	221612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_221600_223800
663780	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663782	contig_8616_pilon	-	1191	3	Intergenic	novelGene_72599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGGATGTAAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436577	430490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_430621_431029_431243_435729
663791	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
663796	contig_11752_pilon	+	1142	6	Intergenic	novelGene_37623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1871.42709182057	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	94	498	84194	94226	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIK	84100	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87477_94223_94410_96442_96592_105597
663799	contig_5480_pilon	+	1669	8	Intergenic	novelGene_107227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	179.051355077536	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	15	1211	79527	103657	FALSE	35	TGATTGAGATTCTATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTLKMTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYFIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKGVLGRTGLSAEVVPSGYELRAAQPCSPWMASGPKSHSPIDQE	79512	104115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89896_92284_92469_96168_96353_101482_101551_103528
663808	contig_7202_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_17227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGATTTCACCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
663819	contig_5217_pilon	-	1640	4	Intergenic	novelGene_135742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_2	62.403703593795	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTGGAGACCTCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530933	528955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_530283_530375_530460_530597
663822	contig_18869_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_56296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73539	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
663823	contig_10345_pilon	-	2276	7	Intergenic	novelGene_158376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGGAAAAAAAAAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19237	11655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_11736_11829_13253_14117_14231_14652_14745_16895_16975_17171_17230_18806
663829	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
663834	contig_6710_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_89746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACTATGCACACTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
663835	contig_13481_pilon	-	1947	4	Intergenic	novelGene_119427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	28.9405520948643	456	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	203	718	903143	894741	FALSE	10	AGTTTGAGCCTTTCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLLRALEKLRKLRKEAAARKGVCPPASADETFEHHLQRLRKLIKKRSELYEAEERALRVMLEGEQEEERRRELEKKQRREKEKILLQKREIESKLFGDPDEFPLAHLLEPFRQYYLQAEHSLPALIQIRHDWDQYLVPSDHPKGNSVPQGWVLPPLPSNDIWATAIKLH	903345	893511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_894865_895947_896036_896489_896727_903076
663839	contig_14711_pilon	-	1725	2	Intergenic	novelGene_68871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	561	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	132	1484	32270	30918	FALSE	20	TGTTGATTTGATTTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTAYLAFVVLLASCLGLELSRCRAKPPGRACSNPSFLRFQLDFYQVYFLALAADWLQAPYLYKLYQHYHFLEGQIAIFYVCGLASTVLFGLVASSLVDWLGRKKSCVLFSLTYSLCCLTKLSRDYFVLLVGRVLGGLSTALLFSAFEAWYIHEHVERHDFPSEWIPVTFARVAFWNHVLAVVAGVAAEAVASWMGLGPVAPFVAAIPLLALAGSLALRNWGENYDRQRAFSRTCAGGLRCLLSDRRVLLLGIIQALFESVIFIFIFLWTPVLHPHGAPLGIIFSSFMAASLLGTSLYRIATSKRYRLQPMHLLSLAVLIVVFSLFMLTFSTSPGQESPVESFIAFLLIELACGLYFPSMSFLRRKVIPETEQAGVLNWFRVPLHLLACLGLLVLHDSDRKTGTRNMFSICSAVMVMALLAVVGLFTVVRHDAELRVPSPTGEPYAPEL	32771	30676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_32289_32658
663843	contig_5018_pilon	-	1927	12	Intergenic	novelGene_47119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	44.1142393757671	192	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	348	1427	1434082	1429090	FALSE	20	ACCCCACGACCTTTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRILLANRNEVFHREVISEMGELGMLGPTIKGYGCAGASSVAYGLLARELERVDSGYRSVMSVQSSLVMHPIYAYGSEKQRQKYLPRLAKGELLGCFGLTEPNHGSDPGSMEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAGAFGCLNNARYGITWGVLGAAEFCLHTARQYTMDRIQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGKAITGIQAFKAGK	1434769	1428589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1431777_1432207_1432425_1432505_1432636_1433362_1433534_1433804_1433868_1434048_1434223_1434388_1434425_1434511_1434630_1434716
663844	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_16828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
663848	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91673	11	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
663859	SIRV4	+	323	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	648	977	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
663862	contig_1428_pilon	-	2422	5	Intergenic	novelGene_158405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGACCAACAACATAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158444	127591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_128471_132953_133121_140933_141039_155714_155776_157234
663868	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_93009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
663876	contig_15304_pilon	-	1014	3	Intergenic	novelGene_30467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	194	835	54100	53061	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPLPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54293	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53314_53532_53813_53991
663880	contig_10235_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_46432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.272098859923	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	13	741	210483	212152	FALSE	30	AGTGTAACATTTTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRGKRSFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210470	213478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210547_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
663892	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	254	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663899	contig_9463_pilon	+	1895	2	Intergenic	novelGene_83809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	538	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCCACAGGGGCAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31380	33318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_32246_32288
663910	contig_14322_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_116484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAAGGTACGGAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671376	671638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
663912	contig_17440_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_7588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2979	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3000_4000
663920	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663922	SIRV7	-	250	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69034	2	35815	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78923	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
663923	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
663925	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
663928	contig_11512_pilon	-	2206	8	Intergenic	novelGene_43274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	441.251605766865	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	194	1024	396169	367967	TRUE	35	AACCCTTGGAACCTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396362	366010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366169_366942_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
663931	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
663935	contig_14322_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_115979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671598	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
663939	contig_10017_pilon	-	2346	15	Intergenic	novelGene_156988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_14	391.195531515317	500	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	78	1238	337686	304016	FALSE	20	ATGAATCGGCCCTGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHCRRRREVRSRGPRARPGDKNIQMADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKKDPSQPAECKQQ	346601	302907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_304055_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346541
663947	contig_3948_pilon	-	2487	7	Intergenic	novelGene_53198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	323.524041696372	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	70	822	866476	840803	FALSE	20	TGTCATGTCTTCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869637	839137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842640_847881_847965_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
663956	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
663962	contig_6710_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_95859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACAGAAGCACTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
663966	SIRV4	+	187	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1584	632	1129	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2584	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
663967	contig_11258_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_67835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCCAGGGGCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345044	345588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_345000_345600
663969	contig_7426_pilon	-	1610	11	Intergenic	novelGene_27476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	88.5137842372588	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	145	1083	649816	638050	TRUE	30	TTGGGTTTTTAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMILIKCLRHVRHRAGSYGS	650131	637252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_637994_638107_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047
663973	contig_10864_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_107097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAGAGAACCAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980448	978514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_978500_980400
663977	contig_10861_pilon	-	1910	9	Intergenic	novelGene_39324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_5	260.179745560641	995	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	109	825	1492200	1490608	TRUE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQVRGEVGGGWWVGELCPHDFSFSLPSRVGPCPSTLPSPAPTLWLASWH	1493807	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
663978	contig_19721_pilon	+	2367	2	Intergenic	novelGene_99158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2	415	146515	146928	TRUE	15	CACAGCTGCCCCACGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPGVAGLLNLYSNFQKNLLLKNHQPTIQLNCLQITWQIKLTYFHLNLFYQSSEALAPNPKQNFLIFQRSSIGFWYYKFKLSTAICYVLFKNGIIFLLIKNIIPGHWLVLSRCGPYWRFFPSINLIPNTIILHYRHSA	146513	152086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_148736_151941
663980	contig_6217_pilon	+	2919	5	Intergenic	novelGene_109681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	67.2272266273122	148	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	768	2000	1016733	1017965	FALSE	30	CAATTTAAGTCACTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSHTHSPSEQISQPVQPLPEPLPSLHPSASPSSPPSLQNHKYNTTSTSYSPLASLPLKADTKGFCNINLLEDLPLQEPQSPHKLNPGFDLAKGSAGKVNLPKELPADAVNLTIPASLDISPLLGFWQLPPPATQNAFGNSTLSLGPGEPLPHRLSCLGQQQQEPPLAMSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	877363	1018884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_877532_964389_964428_981681_981756_1008903_1009387_1016728
663981	contig_5467_pilon	+	2054	9	Intergenic	novelGene_111935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	373.386863721797	1253	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	743	1375	13537	15166	FALSE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPRILLWAQNFSVTYNGQTEDLTSLTFGAQELNLTGSFWNSSAAGLALTYEQLFGTMVTFKFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCQYVSSLTKNGNLLVPHTQPSAWDVTLRDFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTSLLMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPAISLTQIV	8232	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8818_11418_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14740_14956
663993	contig_8674_pilon	-	1451	5	Intergenic	novelGene_102952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	11.9869720947369	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	661	1086	713904	707008	FALSE	10	TTCAGGTTATCCTGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	714564	706642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788
663995	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_16712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664003	contig_14142_pilon	-	2525	8	Intergenic	novelGene_120614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_7	61.5337969189722	62	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	186	533	598441	592004	TRUE	60	AAAAAAAGCAATAGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKE	598626	589673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_590754_590850_590947_591055_591101_591232_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
664013	contig_18869_pilon	+	2097	2	Intergenic	novelGene_55978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAAACACCCACCGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51301	59841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_53328_59770
664028	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664044	scaffold_6394_pilon	+	1134	8	Intergenic	novelGene_110994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	994.210362497776	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	25	513	398216	405113	TRUE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKPWPVLRRA	398191	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405085_405201_405302_405501_405717_405864_406086
664045	SIRV6	+	1078	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	1	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	763	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
664058	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_18834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCCCTCGCAGGTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
664067	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
664080	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664084	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664089	contig_12257_pilon	-	671	4	Intergenic	novelGene_152089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116296	114426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_114811_115480_115596_116043_116152_116232
664091	contig_12312_pilon	-	2053	7	Intergenic	novelGene_64029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	136.405543223955	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	445	1029	574936	573769	FALSE	60	AAAATAAATTAAGATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLTKSPIANTTEPPAVRASEERLCNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQNLFSVFSFSHITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLIVVKQEDKLEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS	575982	572744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_573910_574028_574119_574351_574544_574774_574955_575051_575282_575684_575804_575905
664092	contig_5945_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_104583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTGCAATTCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277275	279037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_277300_279000
664093	contig_16103_pilon	-	1531	14	Intergenic	novelGene_118746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	102.317466276904	1050	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	51	1181	321023	314512	FALSE	0	GGTGCTCGGTTTTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGDRGRGRGGRFGSRGGPGGGFRPFVPHIPFDFYLCEMAFPRVKPAADETSFTLFQASILSLVTKINNVIDNLIVAPGTFEVQIEEVRQVGSYKKGTMTTGHNVADLVVILKILPTLEAVAALGNKVVESLRAQDPSEVLTMLTNETGFEISSSDATVKILITTVPPNLRKLDPELHLDIKVLQSALAAIRHARWFEENASQSTVKVLIRLLKDLRIRFPGFEPLTPWILDLLGHYAVMNNPTRQPLALNVAYRRCLQILAAGLFLPGSVGITDPCESGNFRVHTVMTLEQQDMVCYTAQTLVRILSHGGFRKILGQEGDASYLASEISTWDGVIVTPSEKAYEKPPEKKEGEEEEENTEEPPQGEEEESMETQE	321073	314161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314673_314804_314896_315104_315220_315294_315357_315757_315846_316318_316398_316881_316999_317322_317389_318032_318136_318474_318564_319153_319206_319791_319835_320330_320391_321018
664096	contig_12125_pilon	+	1420	3	Intergenic	novelGene_76227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291	5077	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAACGAACCAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384621	386709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_384737_384885_385184_385702
664103	contig_18869_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_56294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATTTGGCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73747	73354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
664106	SIRV7	-	289	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35774	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70887_70988_78841
664112	contig_9345_pilon	-	1036	2	Intergenic	novelGene_24678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2016	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	124	306	949484	947957	FALSE	5	TTCCCGTTTTGTCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	949607	947226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475
664118	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664128	contig_12622_pilon	-	1793	11	Intergenic	novelGene_5972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1914.68847596678	2	78	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	275	1003	1588902	1586655	TRUE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKNLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1589580	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585667_1586269_1586407_1586528_1586840_1587628_1587778_1587887_1588042_1588434_1588609_1588835_1588991_1589098_1589228_1589523
664140	contig_12570_pilon	-	2254	5	Intergenic	novelGene_79388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	26.0240273593462	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	45	1040	300289	282529	FALSE	35	GTACAGTTAACATTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVGEPRSRLGGVGCRKRGLGWVLQGDTEMGQPHPCLHRAYILDWNRNTSR	300333	281314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_282875_283523_283699_284049_284255_293908_294088_300198
664141	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91669	4	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
664155	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91671	2	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
664159	SIRV6	+	344	4	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	4712	552	-1182	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTAGCCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7817	11272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7924_10724_10819_11031_11109_11205
664164	contig_1244_pilon	-	1585	13	Intergenic	novelGene_38026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	948.239461522715	1	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	919	1335	924306	923081	FALSE	15	AGCTGAATTGTCTTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQVWAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHVKCCQRLL	947638	922830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923107_923245_923331_923428_923539_923722_923827_924214_924349_924583_924715_927057_927227_928774_928871_931625_931688_933736_933856_934499_934566_946446_946620_947578
664175	contig_14785_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_158414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCACAAATTACAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82159	81565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_-_81600_82200
664181	contig_14415_pilon	+	1145	4	Intergenic	novelGene_77607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	18	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	5	CTTCTTTGTCTGTTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	38685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
664190	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1425	641	970	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2425	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
664191	contig_9415_pilon	+	1552	8	Intergenic	novelGene_109754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	263	junction_1	652.222323432488	903	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	348	782	1505573	1517528	FALSE	5	TTTGGTGGTCCTGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMDQTLKALMAAEDKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEEKVAHAKEENLSMHQMLDQTLLELNNM	1495525	1518298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1495692_1503364_1503499_1505525_1505645_1506854_1506926_1507180_1507257_1508229_1508293_1508784_1508855_1517445
664201	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664205	contig_5917_pilon	+	2040	14	Intergenic	novelGene_122168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	713	1135	730427	739091	TRUE	15	CCTATACTTGTTTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTRVPVLLTHMMFSGLRSRWTMPCLWMYSTPSEICFMYLMHSRSVSSKSSSMMRSNSSPPDTLSRTMTMLAFSSKASTHWTSLWWCRQFMMPISCRIFSFSFAEYALKNFPAQIFPVFFSTSRNTCPNFPDPSLSSMS	706586	792909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_706868_710938_711066_713668_713821_727576_727704_730401_730621_737113_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760865_781976_782066_792827
664210	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
664212	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
664224	contig_3602_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_60515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	970.262388243931	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	24	473	161745	169451	TRUE	10	CTGACTTGGCTCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161721	171128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_169676_169744_170039_170923
664226	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
664227	contig_2069_pilon	-	1023	3	Intergenic	novelGene_23477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	470	12	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509833	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509218_1509535
664230	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_115914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
664239	contig_4952_pilon	+	2861	1	Intergenic	novelGene_145547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACATTTGGGTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603543	606404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_603500_606400
664241	SIRV5	-	366	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCTCAAGATGCGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
664258	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664259	contig_7229_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_39802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACTGAGATAAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874017	875429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_874000_875400
664269	contig_846_pilon	-	1566	4	Intergenic	novelGene_136100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.203830762666	557	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	198	578	214365	212487	TRUE	25	CGTGTTAAATATGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSGVGEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	214562	211430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212341_212408_212690_213134_213244_214296
664278	contig_2636_pilon	-	1615	4	Intergenic	novelGene_52082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	177.69074258385	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	121	399	85555	62451	TRUE	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85675	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_62624_81113_81216_85551
664282	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664285	contig_20727_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_152576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTGCTGTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25646	26357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_+_25600_26400
664287	contig_5083_pilon	-	2196	5	Intergenic	novelGene_151701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_4	250.925287685399	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	251	1360	1646782	1640219	FALSE	60	TTTAAAAAAATAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHTIKKLIKENKKHQELILDICSEKDNLREELKKRTETEKQHMSIIKQLESKIEELNNEVKASKDKLVAQDIAAKNAIQQLHKEMAHRMEQASKKCEEARQEKEAMVMKYVRGEKESLDLRKEKEILERKLRDANKEFEKNTNKIKQLSQEKGRLHQLYETKV	1656594	1639382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1640438_1641769_1641899_1643849_1643977_1646147_1646844_1656405
664291	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	92	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664292	contig_12425_pilon	+	1694	7	Intergenic	novelGene_46651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_6	121.079519325111	809	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	47	1504	173715	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPDLGGRLRAPLGSMEEKPYAEPAILMAAAACSTKAMSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173668	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
664295	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	421	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664298	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664306	contig_11978_pilon	+	1197	3	Intergenic	novelGene_63101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5399	junction_2	483.5	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	785	1111	1830693	1831883	FALSE	20	CCTCTCAGCTTTTTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829908	1831969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830785_1831161_1831273_1831759
664311	contig_2069_pilon	-	1263	5	Intergenic	novelGene_23431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	897.482590360392	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAATGCTGCCTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331521	1327101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
664314	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664315	contig_5684_pilon	+	2813	10	Intergenic	novelGene_80989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	48.3850298244313	232	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	152	1414	82611	96956	FALSE	5	AGTGTTTGTCCTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFSAFKRSREVNSTDWDSKMGFWAPLVLSYSRRQGVVRLRLRDLQEAFQRKGSVPLGLATVLQDLLRRGELQRESDFMASVDSSWISWGVGVFLLKPLKWTLSNMLGDNKVPVEEVLVAVELLKEKAEEVYRLYQNSPLSSHPVVALSELSTLCASSCPDERTFYLVLLQLQKEKRVTVLEQNGEKIVKFARGPHAKVSPVNDVDVGVYQLMQSEQLLSCKVESLSQEAERCKEEARRACGAGKKQLALRSLKAKQRTEKRIEALHAKLDTVQGILDRIYASQTDQMVFNAYQAGVGALKLSMKDVTVEKAESLVDQIQELCDTQDEVSQTLAGGVTNGLDFDSEELEVELDLLLQDTTKEPLDLPDNPHETFYTNSVPSPRISDAELEAELEKLSLSEGGLVPSSKSPKRQLEPTL	82459	98355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_82820_85404_85577_93558_93745_93881_94016_94905_94955_95200_95321_95611_95711_95930_95992_96479_96660_96903
664318	contig_12464_pilon	-	2139	3	Intergenic	novelGene_68729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTTCATCCCAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379001	375169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_376348_377992_378677_378724
664330	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664333	contig_990_pilon	+	2006	7	Intergenic	novelGene_76051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	58.5560035825154	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	288	779	882997	890739	TRUE	20	GTGCTTTTGTTCCAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	880858	895955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893389_895049
664341	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664351	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664353	contig_953_pilon	+	3041	2	Intergenic	novelGene_130002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAAAAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274007	277960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_276033_276944
664359	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
664360	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
664369	contig_4857_pilon	-	2575	1	Intergenic	novelGene_48815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257939	1255364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1255400_1257900
664373	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664380	contig_6374_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_158437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAACAAGAAGCTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86535	87014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_86500_87000
664384	contig_6710_pilon	+	573	2	Intergenic	novelGene_93966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCAAGAGCACAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653884_657472
664385	contig_610_pilon	-	1170	3	Intergenic	novelGene_76736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	904.5	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	447	482	214218	214183	FALSE	30	GTCAAAGTGGATTCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	235133	213494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998
664390	contig_3018_pilon	+	2014	13	Intergenic	novelGene_78949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	45.8859546411899	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	327	1028	1362096	1399306	TRUE	5	CCTTGGTTCTGATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKLSHLCSSEDGCCTQITCDTLNDFVRLFKQVTKAEGLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANVLPGFLRLQELTDRNVTVIFLSEIIWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILCHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQQDDTDPGQLKGLSAYTHVELPYYSKFILIAAYLASYNPARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKVFFSSYRQAIISLDQNLFH	1354409	1439601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1354505_1356662_1356864_1362065_1362141_1365533_1365646_1368023_1368155_1384570_1384620_1384708_1384800_1388934_1388988_1389909_1390023_1395834_1395886_1399249_1399378_1429642_1429756_1438799
664397	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_93650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664406	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664411	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664414	contig_5643_pilon	+	1883	8	Intergenic	novelGene_38752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	165.038029012734	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	615	1487	159445	163341	FALSE	20	GGCAAAGCTTCTCCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHAELAPEPPGHCADCRNELNWPPCPGEKAGAMEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157284	163737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_157451_158841_159073_159227_159501_160367_160415_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297
664416	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	35	3085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
664420	contig_8330_pilon	+	1854	13	Intergenic	novelGene_71760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	227.011869488996	220	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	61	1533	648213	658351	FALSE	20	GCTTGTGGAGAGCTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREHEGRLRYLSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDCYGSSRSHHRRRSREREPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVFMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	644819	658672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_644880_648212_648365_649087_649305_651159_651257_651531_651599_653909_654027_654809_654977_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
664422	contig_14687_pilon	-	1236	4	Intergenic	novelGene_107920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1127	junction_3	591.747130678862	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATGAAGGAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528077	458122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_458516_459962_460088_523429_523544_527473
664424	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
664425	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664441	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
664459	contig_6710_pilon	-	508	2	Intergenic	novelGene_97975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664466	contig_4413_pilon	+	766	4	Intergenic	novelGene_116991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	156.462988168661	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTGCTTCGTCATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141035	152637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_141251_142574_142691_151580_151609_152230
664467	contig_2414_pilon	-	139	1	Intergenic	novelGene_158495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTGTGCCTAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362626	362487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_362500_362600
664469	contig_5988_pilon	-	1650	4	Intergenic	novelGene_15978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	874.727513127501	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	691	1587	652858	651962	FALSE	10	GCCTTCTTGTTAGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652935_653128_653422_653549_653773_655456
664471	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
664472	contig_4469_pilon	-	3426	1	Intergenic	novelGene_21925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551725	548299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_548300_551700
664473	contig_401_pilon	-	2638	12	Intergenic	novelGene_42788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.598389890286	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	91	1104	1129059	1118774	TRUE	35	AGTGTGACTAGAGCGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSLSRAPSRGGVNFLNVARTYIPNTKVECHYTLPPGTMPSASDWIGIFKVEAACVRDYHTFVWSSVPESTTDGSPIHASVQFQASYLPRPGAQLYHFRYVNRQGRVCGQSPPFQFREPRPMDELVTLEEADGGSDILLVVPKATVLQNQLDESQQERNDLMQLKLQLEGKVTELRSQVRELETTLASARQEHTELMEQYKGLSQSHGELTEERDILSRQQGDHMARILELEDDIQIISEKVLMKEVELDRVRDTVKALTREQEKLFGQLKEVQAGKEQSEAELQIAEQENRRLNLELQEAKARQEEQGAQAQRLKDKVAQMKDTLSQAQQRVVS	1131707	1113891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407_1116556_1118577_1118779_1119016_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127679_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
664481	contig_14341_pilon	+	2541	3	Intergenic	novelGene_111786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	23	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1032	1889	344878	345735	FALSE	30	GGTTACAAGTGATAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVISVENLSAVAPSFLYTSERILEKSPMSVIVVGNLSARAMTSLYIRELILERNLMNVSSVGNLSPRVLNLLGISELTLEKNNIHVTNAENPSGGTLTLLSIKEFILEGNLMSVLIVESPSAKALTSLHIKGLTLERNPMNVTSVESPSFEALNLLGICKFILERSCVNAVNVEKPSLGVLTLLSIRELILERHLLNAVSVEKPSQGALISFPIREFTLGKSHMNVKTVGSPSGRDLSLCISEPILERNLTNAVIVEKLSARGPPLLCIREHTLERNPISVVCV	334314	346387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_334465_337529_337611_344077
664486	contig_13457_pilon	+	1724	13	Intergenic	novelGene_118334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_9	53.6834212976616	111	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1536	189	1724	60777	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59222	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
664491	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_93553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664493	SIRV5	-	319	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATATACAGATTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
664494	contig_6710_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_95257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
664495	contig_17158_pilon	+	2871	3	Intergenic	novelGene_141162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_2	232.5	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	358	870	205254	210068	FALSE	75	TTGAAAACAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEETIEDEIDARNDAAALASCVDAEAKTHETQETFDKCAGDAGCQLNEVRNELLLVTQERENFKRQCHTLTDQVKVLQQRILELNDKYVKKETCHQSTETDAVFLLESVNGKSESPDYMTSQYQQALEEIERLKKQCSALQHVKAECSQCCNSESKSEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSVERDQYKREVELLEMEKSQIRSQCEELKTEIEKLKSTSQQIGTVSTSSNIEESINYADGESLKLRSLRINVGQLLAMIVPDLDLQQVNYDVDVVDEILGQVVEQMSEISST	204896	212069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_205458_207378_207534_209914
664497	contig_12464_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_68686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTCGTGACACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212896	213533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_212900_213500
664523	contig_11292_pilon	+	1201	7	Intergenic	novelGene_109384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	14.6562462982701	254	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	74	940	6987	12447	FALSE	15	GCCTCTGACTGGATCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAGGSITGLKFNPLNTNQFFTSSMEGTTRLQDFKGNTLRVFTSSGTCNFWFCSLDVSAGSRVVVTGDNAGQVVLLNMDGKELWNLRLHKKKVTHVALNPCCDWLLATASVDQTVKIWDLRQVRGKSSFLSSLPHRHPVNAACFSPDGARLLTTDQNSEIRVYSASQWDCPLGVIPHPHRHFQHLTPIKATWHPRYNLIFVGRYPDPNFKSCTPHELRTIDVFDGSSGNMMCQLYDPEYSGIISLNEFNPMGDTLASVMGYHILIWSQEEAGIQKRETVTKVCAKQGLGATNGNKSCEKRQLSVKGLKVYKS	6913	12708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_7061_8364_8465_8555_8734_9051_9195_10733_10899_11038_11085_12286
664533	contig_8712_pilon	+	1397	4	Intergenic	novelGene_58812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	577.82407934134	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	159	479	315133	321793	TRUE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	314974	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684_322307_322861
664534	SIRV4	+	242	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-1074	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGGTGCCCAATTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1700
664552	contig_7202_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_17843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCCAATTCTTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
664555	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664556	contig_11752_pilon	+	1266	7	Intergenic	novelGene_37655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1541.15004857484	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	134	973	87165	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQESDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85563	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85692_87159_87547_88670_88776_92873_93060_96442_96572_100956_100976_105597
664564	contig_11564_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_158557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGACCTATGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56924	56679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_56700_56900
664591	contig_9389_pilon	+	2123	6	Intergenic	novelGene_84089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGCGACAAAGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243298	1264820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1244104_1244943_1245668_1246246_1246396_1247296_1247423_1256301_1256530_1264729
664596	contig_12622_pilon	-	1524	13	Intergenic	novelGene_6033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	427.346723659164	131	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	25	1182	1691275	1685455	FALSE	15	ACCCTGTCTTCTCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKDQPPTA	1691506	1685112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685477_1686901_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
664615	contig_14322_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_116233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
664618	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
664619	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664622	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
664632	contig_11285_pilon	-	2194	3	Intergenic	novelGene_5496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.5	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	19	507	508510	506838	FALSE	0	TTTGGCTTTGCTTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPFPKMASKVGSRRWMLQLIMQLGSVLLTRCPFWGCFSQLMLYAERAEARRKPDIPVPYLYFDMGAAVLCASFMSFGVKRRWFALGAALQLAISTYAAYTGGYVHYGDWLKVRMYSRTVAIIGGFLVLASGAGELYRRKPRSRSLQSTGQVFLGIYLICVVGWGTVG	508528	505150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_507009_507875_508057_508373
664634	contig_6102_pilon	-	1693	13	Intergenic	novelGene_32386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_12	146.399828286177	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	361	1311	1733603	1728861	FALSE	0	CTGTGTGGCCTCTGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGK	1736767	1728478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1736563
664636	contig_11512_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_43229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	26	367	4011	4575	FALSE	15	GTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAY	3985	4576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
664639	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664642	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664643	contig_854_pilon	+	1955	15	Intergenic	novelGene_36519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	3002.8578938425	1	47	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	165	1655	1649514	1685202	TRUE	45	TCTGTTTTAAAAGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDVSLLLHQREAAAALQPHHVHPGAGGVPARRHRVELH	1612781	1715951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684092_1685104_1685244_1686944_1687013_1715760
664645	contig_11855_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_67089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAGGTACAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2342681	2344153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2342700_2344200
664650	contig_9939_pilon	-	1635	11	Intergenic	novelGene_158605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	31.8905942246299	107	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	1	1635	387441	351452	FALSE	35	GTAAGTGGGATTAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHGARKHIIQMTGFKMEEKEALGKLLLKLDCIFIKSEKYKDCTHLIAERLCKSEKFLAACAAGKWVLTKDYVIHSAKSGRWLDETTYEWGYKIEKDSHYSPQMQSAPKRWREELKRTGAPGAFHRWKVVLLVRSDKRSDSLVRVLEAGKANVILPKSSQSGITHVIASDARIKAEKEKDNFQAPFYPIQYLGDFLLEKEMQNHDEDINISSILTEHPKKEKFRDSSKDLKFVKTRNSMGRHTSGNQKEVKNYEDIQRSYILRKRCKKEKEQEEDSTKDVERDKIKSTLRKYLYRDQKEVKNSVFADYTKKVKTKVIKTDVEIMEVKNALKKHIYRAQVKNAEFPRGVLNLIESLIEGQFFKEAIEELSSLQAHYIPPVCLLHALLENILQDNMGTFSGRYFHILSALLHLHPPWKSLAMSRYYLELFQCPTCMKGAWSLVEVLIRSCLFNENFCHQISENIIGSKVLHLTLLKFFFNLVESEVRHLTQKLYDWSDSQSLKITGKAILLELFWSGSETSALLTKPVNMLLEWTIYSHKEKYKSND	387441	351451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_351618_352216_352349_356934_357099_358156_358316_364273_364397_365258_365409_366289_366437_378362_378526_385775_386017_387093_387170_387327
664652	contig_5727_pilon	+	1449	5	Intergenic	novelGene_7949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1168.75425132917	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	281	688	177743	179323	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168152	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168291_177600_177751_177921_178134_178221_178344_179257
664658	contig_8616_pilon	+	1628	14	Intergenic	novelGene_72478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	562.556684849304	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	240	1433	320431	330877	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQPLLGLTSAVPFWLQRVSCLRRRSQNSSPHVERKSRSPRPVMAPGKMQLC	318068	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318324_318424_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330497_330596_330720_330850
664660	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_97304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664661	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664662	contig_8616_pilon	+	1409	10	Intergenic	novelGene_72573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	18	1331	425778	436516	FALSE	5	TTTCATGTCCTGCCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
664669	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_17691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664672	contig_12622_pilon	-	1378	8	Intergenic	novelGene_5954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2445.21309951522	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	18	629	1590968	1586566	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYLQLAPRVPPLLALLRPPPLALLRPPRCLWIQRTMHATCTSLTP	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586697_1589580_1589691_1590000_1590234_1590830
664676	contig_6710_pilon	-	472	2	Intergenic	novelGene_98175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664683	contig_8617_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_73484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAACTATATGAATTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62976	62744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
664703	contig_1450_pilon	-	2630	1	Intergenic	novelGene_27333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192940	190310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_190300_192900
664709	contig_15039_pilon	-	1874	8	Intergenic	novelGene_110121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	513.386197472334	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	354	1100	202841	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260883	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198673_200448_200620_202795_202966_208401_208526_260778
664710	SIRV5	-	332	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGACCTGGCTCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
664721	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	51	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
664723	contig_5954_pilon	+	2332	6	Intergenic	novelGene_28487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	539.101103690208	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	45	1649	344839	365383	TRUE	5	TGGCTCCTGGTGCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARLPAAGSPVSRNMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYSQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGMVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIADNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPNLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESQMPTQAVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLIPPSKRRHE	344794	367089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_345243_348617_348716_360707_361121_364255_364421_364858_365572_366594
664724	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664733	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_95872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653827	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664734	contig_6069_pilon	+	970	3	Intergenic	novelGene_8032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	282	junction_2	42	1028	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	444	761	192334	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLVLALQVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	191890	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_192446_193297_193402_193545
664739	contig_5515_pilon	-	1721	9	Intergenic	novelGene_52343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	444.103573927299	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	117	1220	99142	68158	FALSE	30	AAAGTGTACTTTTATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTLSAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99258	67656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68799_68913_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
664743	contig_5261_pilon	+	2061	12	Intergenic	novelGene_102483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	74.6658672723835	200	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	267	704	727549	755051	TRUE	15	TGACTTGCTCTGTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCVERYLKFIELPLSQRKFCQRCQQLLLPDDWGEHCEHQVLGDISVTQLKRPSQLLYPLENKKTYAQYLFADRSCRFFVDLLSSLGFRRVLCVGTPRLHELIRLKASDDKKSNIKSILLDIDFRLPLKSAEHFYKKMKAKESLW	725506	777002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_725588_726457_726577_727482_727566_741987_742264_743265_743347_754987_755139_757577_757679_766880_767003_767408_767485_769513_769566_770082_770228_776228
664754	contig_5643_pilon	-	2031	14	Intergenic	novelGene_39151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	71.6976722984627	360	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	477	1622	663500	658287	TRUE	15	TCACTGCTAGTATTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTITAVLTTFCFQMVYLLAGYYYTATGNYDIKWTMPHCVLTLKLIGLAIDYFDGGKDQNSLSSEQQKYAIRGVPSLLEVAGFSYFYGAFLVGPQFSMNHYMKLVQGQLTDMPGKTPNSIIPALKRLSLGLVYLVGYTLLSPHITEDYLLTEDYENRPFWFRCMYMLIWGKFVLYKYVTCWLVTEGVCILTGLGFNGFDENREAKWDACANMKVWLFETTPRFTGTINSFNINTNAWVARYFFKRLKFLGNKELSHGLSLLFLALWHGLHSGYLICFQMEFLIVIVERQAASLIRESPVLSNLASTTALQPFFYLVQQTIHWLFMGYSMTAFCLFTWDKWLKVYKSIYFLGHIFFLSLLVILPYLHKAMVPRKEKLKKME	708346	657025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_657423_658274_658404_658503_658663_658740_658889_659576_659744_659840_659928_660723_660833_661998_662178_662608_662647_662798_662893_663452_663560_664488_664597_699781_699861_708116
664759	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1428	632	973	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2428	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
664762	contig_12864_pilon	-	2357	7	Intergenic	novelGene_76408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	591.407008751165	2	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGCTGCCCCTCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252144	242230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245885_246348_248963_249843_251887_251999_252111
664765	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	70	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664769	contig_9471_pilon	+	1831	11	Intergenic	novelGene_21778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_3	685.989540736592	4	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	709	1443	413930	417129	FALSE	40	AAATTTATATGAATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKVSLGHCLNGEKRISTLLLWWRNKIIINDSKQGC	406922	417517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936
664771	contig_8616_pilon	-	968	5	Intergenic	novelGene_72429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	487.928529602441	2444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	29	628	255468	253726	TRUE	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQGSFSGRCPLYGVAALNGSSLALSRPSAPSLCYFVAGVSGLLALYCLLLLLFWVYSSCIEDSHRGPIGLRIALAISAIAIFLVLVTACILRFGTRSLCNSIISLNITSSCPEAQKISWTPPGTAVQFYSNLHNAEVRPWDMKGLGRSRDTLDISVCSQGCCEQLRRSC	255496	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253722_253907_254087_254223_254302_254491_255372
664773	contig_11173_pilon	+	2201	3	Intergenic	novelGene_156909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	6	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGACATTTCTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452120	456761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_453062_453732_453818_455586
664778	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_17593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27818	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
664779	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
664781	SIRV7	+	253	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147704	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
664784	contig_14322_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_116113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
664786	contig_7157_pilon	-	452	4	Intergenic	novelGene_131317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	233.248079663406	233	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	8	451	1019968	1004602	FALSE	40	AATCCAAAAAGGTGGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERRRHKKRIQEVGEPSKEEKAVAKYLRFNCPTKSTNMMGHRVDYFIASKAVDCLLDSKWAKAKKGEEALFTTRESVVDYCNRLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKE	1019975	1004600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_1004795_1010536_1010643_1011511_1011621_1019932
664789	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
664795	contig_12000_pilon	+	2315	11	Intergenic	novelGene_43167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	500.559526929615	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	45	668	417192	492333	TRUE	50	AAATCAGACAAATCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGSMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELVTCSKIP	416909	588420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488473_488596_490220_490304_490573_490689_492310_492414_558472_558606_584748_585374_587611
664801	SIRV7	-	347	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	1	2	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
664819	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
664829	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664836	contig_9415_pilon	-	2754	6	Intergenic	novelGene_109755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	352	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	2457	2753	1505540	1495544	FALSE	10	GGCGGGCTGCGCGGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFMPLSLSSAAFSASSSFCKAVARRSCARSNSSSTSWMRLFRDATSASAVSLSFLSWSSSRCKLPARSSAASACSCRPRIFLRTASSELLPAMVRTGG	1518289	1495542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1495692_1503364_1503497_1505523_1505643_1506852_1508291_1508782_1508853_1517443
664837	contig_16098_pilon	-	1401	12	Intergenic	novelGene_45772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_11	239.006967635909	4109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	63	641	36010	32102	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLQAGGWAPEERRRGVEARMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLGE	36357	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
664848	contig_7593_pilon	-	3451	1	Intergenic	novelGene_127276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1502	1840	36045	35707	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGLCCLQCCISLSLPTPPSRDPRPKGCAGSWLFVLGGGGILSFSPLEWLISSPVGWQKDQSPWWAVIALSAQSRPITWVGVNKTMARKATQKQSITLHCHLPRSCSVFAS	37546	34095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_34100_37500
664855	contig_6898_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_35796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGGGTACCTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127704	126556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_126600_127700
664859	contig_14807_pilon	+	1454	5	Intergenic	novelGene_124727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	634	junction_4	171.075275829092	831	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	76	417	75260	76086	TRUE	0	CGTGTTGGCTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCSALPGRPAPRPSPPRGPGAGRAMEDYTVLSDAELVAMLRQYNIPHGPVVGSTRKLYEKKIFEYETQRRRLSPSNSSASSFSYRFSDFDSTSSDSDKYDLPKKEDALFYQSKGKAGRGGAGRHLTSLSWSLVSGRA	75184	77672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_75342_75435_75544_75934_76343_76791_76842_76941
664861	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
664864	contig_9727_pilon	+	1193	6	Intergenic	novelGene_86315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	262.934516562584	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	38	385	309192	310863	TRUE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPVASMKSPRVGSCFVSGAFSPQINGCSGGLL	308428	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310769_311014_312912_312991_314078
664872	contig_16098_pilon	-	983	6	Intergenic	novelGene_46076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2153	junction_1	1571.29406541233	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	171	773	457605	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	457908	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851
664875	contig_10205_pilon	-	2017	16	Intergenic	novelGene_143111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_15	62.9219622495463	626	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	145	1923	256249	220058	FALSE	20	TACTCTCGGATCCATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRPRHVSRQVTAQPAPAPGEPPPGPNPYLRTWITAAACPSAPDAPSAIMAPGQLALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDLPESAVRDLIIATIAVKYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	256393	219963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
664877	contig_15384_pilon	+	2222	20	Intergenic	novelGene_85140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1384	1887	125615	126560	TRUE	25	GCCCGGAAGTGCGACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSHEHYTHVSRGPECLSRGHILRDPLEHRDVAALNIQHTEHRGAFGNHVFSPVFIKHKLIHLDGLVWLLQPGHFILTGTDVQGFGLKEGLSLGALLLCHIQQVGLRMRPGQAAKAVWSSYTGPCFSSADKLKLLSFRFFSTYFQELLLFSRACASSLAQHSLHGA	118778	127984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_119047_119136_119247_119332_119423_119545_119747_120305_120381_120460_120546_121025_121168_122517_122566_123182_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125495_125571_125668_125763_125897_126057_126229_126315_126385_126482_126582_126999_127131_127726_127854_127928
664893	contig_7202_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_16555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
664898	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGGTACCCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664899	contig_8110_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_158621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	506	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	70	627	462475	461918	NA	30	AGGACAACTCAGCCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELSELYEESNDLQMDVMPGESDPPQMEVGSGNREPSPSPSRPGAPPQLEEEGPMEEEEAQPMAETGGLADGRSRGERPGQAAAPDLESEDEGEEFDDWEDDYDYPEEEQLSGAGYRVSAALEEANKMFLRTSRAREAALDGGFQMHYEKTPFDQLAFIEELFSLMVVNRLTEELGCDEIIDRE	462544	460478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_-_460500_462500
664906	contig_9673_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_119162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGACAACTGTTAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71784	74496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_71800_74500
664913	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
664915	SIRV5	+	373	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTCCACTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3280_3405_3483
664916	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_114023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	23	343	14409	13866	FALSE	20	ACTGTCAGTATGGTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14431	13864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
664921	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
664922	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
664923	contig_12786_pilon	-	1444	9	Intergenic	novelGene_103425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	780.2861654547	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	811	1365	600902	590932	FALSE	20	CCAGAATCTCCTTTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRGRQAFSWPQTHMRCSRSTSSGHRYWWAIS	629576	590852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_590994_592760_592935_593215_593426_600793_600909_602806_602956_604600_604719_614020_614079_628731_628938_629303
664924	contig_4180_pilon	-	2292	12	Intergenic	novelGene_8303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGCAGCAGCAGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822445	733070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_733321_735136_735213_769422_769562_790789_790890_802491_802659_810962_811041_811145_811211_811812_811993_813450_813616_814802_814969_820000_820095_821633
664954	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_17830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
664957	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
664965	contig_10766_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_151208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCTAAGGACAAGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158063	158662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_158100_158700
664969	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664971	SIRV5	-	409	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
664972	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
664975	contig_12270_pilon	-	295	2	Intergenic	novelGene_114089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGCAGCTTCCAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14419	13901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
664981	contig_3797_pilon	+	1504	6	Intergenic	novelGene_120079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	195.449635456299	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2	331	317850	327179	TRUE	40	GCAGAATAGTCTTTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLAAAFLVTLLLQLVPAGLFPGCPLFQDLIRYGKTKGARPPRPAACQAFDIPKRYFSHFYIVSVVWNGFLLWCLIQPLFLGAPFPNWLHGLLRILGASQFQAKPLAPLE	317848	333368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318011_326308_326452_327153_327300_328171_328370_331619_331755_332648
664994	contig_13894_pilon	-	1920	3	Intergenic	novelGene_62176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.5	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	451	1038	696390	695803	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSKPLSWQRGNRPREEDDFLQVSWLITRAAGARSWVGRGQKVGRGTDGQTDKHTQKSLTLGAILSTSPDTRLYPGKREREADTVRYAVSPTTTHRTVRPKGPQSQIPTADGCPPTHTHSLRTLQQILANLETLTFGCHMTTPDHHPYESTGGHPPKQLLEQKLGAAGPVSPCHAWGNRPGRGYARPEITVSQSW	701359	694815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_695540_695644_696753_701271
665010	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_116352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671894	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
665014	SIRV4	+	296	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	636	1016	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
665017	contig_18869_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_56363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCTACAACTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73539	73365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
665019	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
665023	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
665025	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665029	SIRV7	-	341	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	11	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
665038	contig_3975_pilon	-	1945	11	Intergenic	novelGene_54871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_7	152.695906952348	13	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1220	1873	2096423	2091957	FALSE	15	TGGTTTCTGGTCAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099581	2091884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2097367_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364_2099458_2099552
665042	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_95885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665045	SIRV4	+	311	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1460	632	1005	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2460	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
665057	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_116080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
665062	contig_14441_pilon	+	837	5	Intergenic	novelGene_100476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	222	650	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLCASSESTYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	87305	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_87335_112110_112154_116578_116963_117220_117344_117539
665063	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665078	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
665091	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33216	10	-3	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114741	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
665100	contig_12137_pilon	+	2398	5	Intergenic	novelGene_158622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	141	junction_1	34.9383385409209	852	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	105	836	358583	374959	FALSE	60	TGAGAAGATAGAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPECFNMKIIGGREVSPHSMPFMASIQYDGTHVCGGVLIHQQWILTAAHCQLHFAKGKSPKVVLGAHSLSKNEASKQIFEIKKLIPFSRFKSDPKSNDIMLIKLHTAAKLDKNVQLLHIRFKNDIRAGTKCQVAGWGTTEPDSLSPSDTLQKVTVTVISRKLCNSQSYYNHNPIITKDMVCAGDTKGQKDSCRGDSGGPLICKGVFCAIVSGGHKCGEAKKPGIYTLLTKKYEAWIKSKLAS	358478	376521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12137_pilon_+_358596_358875_359024_371703_371855_372605_372876_374809
665120	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	125	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665122	contig_3751_pilon	-	2089	6	Intergenic	novelGene_158635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	169.894084652762	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	46	939	171742	112709	FALSE	45	AAGAAGAAGATTATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QITYITRSSFCSKIIMSRSRQPPLVTGISPNEGIPWTKVTIRGENLGTGPPDLIGLTICGHNCLLTAEWMSASKIVCRVGQAKNDKGDIIVTTKSGGRGTSTVSFKLLKPEKIGILDQSAVWVDEMNYYDMRKDRNKGIPPLSLRPANPLGIEIEKSKFPQKDLEMLFHGMSADFTSENFSAAWYLIENHSNTSFEQLKTAVNNLKKQANKKNEGSLAYVKGGLSTFFEAQDALSAIHQKLEADGTEKVEGSMTQKLENVLNSKFCLSTQNYLWTLKQDLIQHLDLISHNKAVSYILVFISKYFMNIKGQQH	171787	111558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_112942_125272_125398_127350_127465_150782_150910_153409_153587_171624
665126	contig_15498_pilon	-	2105	8	Intergenic	novelGene_42640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1657	1980	681352	675445	FALSE	20	CCGCTGGAGCCGCAACGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLEEPAEMFHIILIAKGKAGGWAMLSSVSPCGMMSGPLPVSSPLLSAPSEFWGTVGTVASYTAALQPLPMDRPIRYSSSRKPWQRLLSNRPGSSLFFWVKIAWIS	686727	675319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_675456_679259_679549_681328_681429_682088_682274_682831_682994_683979_684120_684490_684721_685864
665136	contig_15970_pilon	-	1504	14	Intergenic	novelGene_144048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	144.390824013064	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	172	906	220872	190542	TRUE	45	AGAGATTTTTTAGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKEIDWQPYFTTRIVDDFGTHLRVFRKAQQKVTEKDDQVKGTAEDLIDTFFEVEVEMEKKICRDLVCTSPKDEEGFLRDLCEVLLYLLLPPGDFQNKIMRYFVREILARGILLPLINQLSDPDYINQYVIWMIRDSNCNYEAFMNIIKLSDNIGELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDISTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKVRNKYCETGSKLWETLHSPPGQHSCRQCCTTIFYGLHAANWRSSTSFLLDDSGRVPGYSPTAARGFIKSSERWKTSNQPNQRSFTSSCCWNL	221134	162332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_162393_167394_167568_172368_172439_178244_178283_183964_184098_185045_185151_190522_190717_201786_201887_206501_206595_206961_207101_211533_211618_219477_219567_220817_220920_221010
665146	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1431	641	976	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
665148	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665152	contig_1154_pilon	-	1613	8	Intergenic	novelGene_87243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	20	junction_2	33.6536985868036	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	568	1143	1857843	1850911	FALSE	10	CCAGTCTGCGGCTCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKLADWKDFLLVKSRRNITMVSYLEDFPGLVHFIYVDRTTGQMVAPSLSIHDKTTSELGKGPLAAFVKTKVWSLIRLARRYLQKGYTTLLFREGDFYCSYFLWFENEMGYKLQIIEVPVLSDDSVPIGMLGGDYYRKLLRYYNKSHPAEAVKCYELLALHLSVIPTDVVVQQAGELARRLWEASRIPLL	1860214	1850440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840
665158	contig_4783_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_108350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAAAAAGAAGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93821	91670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_91700_93800
665159	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91679	0	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
665165	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665175	contig_5954_pilon	-	2279	1	Intergenic	novelGene_28478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCTGAATTCAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275598	273319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_273300_275600
665186	contig_14537_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_158655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAATTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67178	64809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_64800_67200
665188	contig_13403_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_158093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTCAAACACATCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70829	71506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_70800_71500
665193	contig_15092_pilon	+	1852	4	Intergenic	novelGene_57795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	266.814958767724	3	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	133	582	325159	351050	TRUE	25	GTGCAGATAACTGGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLDVYPCVFETSELQEQAGE	325026	352385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348356_350992_351236_351300
665194	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665211	contig_1939_pilon	+	2110	2	Intergenic	novelGene_144893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGTTTAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995625	1010686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_995978_1008928
665213	contig_12125_pilon	+	3347	2	Intergenic	novelGene_76242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	26	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	102	779	569653	570330	FALSE	70	AAGAAAAAAGAAAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRDGRLGSHLPSLPSLNLKASRSLSLPEHGPKLPLGTAEDQHSLESVDSGIPTLEIGNPEPVPCSVAHTQRKPSEPEAIPERASQSACPLPSCALPAPTGAEREQGVRKSSTFPRTGYDAVRLCSPTARALSRSDAASVCSVSSLGTELSATLSVSNEDLLDLVTSSSSAIVALENDDDPPFTDVTLGSTKEASGPAQQDGAEEPEEGSKSGLLGPLSHFLAR	557814	572898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_557854_569590
665217	contig_7202_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_18590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAGGTGGCCGAATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30079	28521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
665223	contig_11872_pilon	-	641	2	Intergenic	novelGene_143155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	118	junction_1	0	307	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCTCAAAAGCAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97359	95498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_96020_97239
665226	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665235	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665237	contig_8617_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_73469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62722	62987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62700_63000
665256	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_89615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653780	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665257	contig_2646_pilon	+	1390	10	Intergenic	novelGene_69694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	87.1394511723438	504	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	39	1178	2412283	2449537	FALSE	10	TCAGAGGGTGTGTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRGWARRGWGCGQAWAPLLGGRSCEELSAALASPRLLGRRFNLFVQQKCGFRKAPRKVEPRRSDTGTSGEAYKRSSLIPPVEETVFYPSPYPIRTLIKPLFFTVGFTGCAFGSAAIWQYESLKSRVQSYFDGLKADWLDSIRPQKEGDFRKEINKWWNNLSDGQRTVTGIIAANVIVFCLWRVPSLQRTMIRYFTSNPASKVLCAPMLLSTFSHFSLFHMAANMYVLWSFSSSIVNILGQEQFMAVYLSAGVISNFVSYVCKVATGRYGPSLGASGAIMTVLAAVCTKIPEGRLAIIFLPMVTFTAGNALKAIIAVDTAGLVLGWRFFDHAAHLGGALFGIWYITYGHELIWKNREPLVKIWHEMRTSGPKKGGGSN	2412244	2449749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2412408_2423862_2424059_2424581_2424723_2428026_2428076_2436009_2436106_2436677_2436828_2438764_2438836_2446645_2446748_2446882_2446981_2449425
665269	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665273	contig_9345_pilon	-	1615	3	Intergenic	novelGene_24389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	483.5	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	31	624	176056	142100	FALSE	10	GGAACTGCTTCCCTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176086	141108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_175989
665274	contig_8330_pilon	-	2073	8	Intergenic	novelGene_71961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	316.024153042331	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	353	1057	2056084	2038853	TRUE	30	CACAAGGATAATCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056547	2032055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2033066_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056297
665275	contig_14722_pilon	-	1381	18	Intergenic	novelGene_110217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	145.964730062249	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	530	1381	105003	58252	FALSE	25	GTACCCAGCCGAGCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTRYGFSRQSKTEKAEDKKTALSAGFSAGERAEAHEEDELRAAEEQRIQSLMTKLTATAAEESRLTASSVGQIVGLCSAEIKQIVSEYAEKQSELSAEDSPEKLGASQLHHRKIISLNKQILQKTKHLEELQASHANLQAKYSEAKKTLTELKSYSEKLDKEQAALEKIESKADPSILQNLRALVAMNENLKSQEQEFKAHCREEMTRLQQEIEALKAERAPGGDEKTPSSGEPHGALTSVMTCDEDLDRRYNMEKEKLYKIRLLQARRNREIAILHRKIDE	151988	58251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_65720_65803_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93304_93356_93643_93737_96619_96657_104992_105108_120663_120721_127092_127192_140864_140960_142940_143055_151928
665276	contig_3818_pilon	+	1521	12	Intergenic	novelGene_99298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.531274318738	35	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	984	1364	987053	990624	FALSE	25	TTTATTGAGTACATGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961571	990781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_967284_967375_968211_968350_973411_973538_976245_976480_978585_978621_982960_983056_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
665286	contig_10013_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_125035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20682	20288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_20300_20700
665304	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_18967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
665309	contig_6710_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_95868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGCACTTGCTGTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
665311	contig_610_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_76787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGGGTTCTGGATAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270540	269340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_269300_270500
665317	contig_12624_pilon	-	1295	5	Intergenic	novelGene_61144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	108	482	955789	948779	TRUE	55	TTTTGTAAAAATGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGKWRRQPVGSCWAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDERNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955896	947531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947583_948016_948842_950590_950768_952913_952985_955725
665325	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91675	1	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
665329	contig_10774_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_158684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGCAAAGGACATAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47535	45249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_45200_47500
665331	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	635	971	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
665336	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_94254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665351	contig_12624_pilon	+	1485	5	Intergenic	novelGene_61149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACCCCTGCCCAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947750	955841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_948654_948700_948842_950592_950770_952917_952987_955646
665355	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665357	contig_6954_pilon	+	2482	8	Intergenic	novelGene_64446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	177.498375962677	10	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACAGATTGTTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503467	540279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_503504_522187_522262_523173_523298_526001_526075_526368_526475_530993_531117_532197_532318_538453
665374	contig_18869_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_56067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCAGCCGGTCATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
665376	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_94255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665377	contig_9633_pilon	+	2765	4	Intergenic	novelGene_139612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	19.1543438647449	380	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	898	1602	611421	614111	FALSE	10	ATCCTGTCTCGTGTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAPAPVPARLGRAATPGAGPAGALGSPKSNTLYGAPGNLDTLLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKAQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLRITSTALLVLVLFLLWKHWDSITYLLEHVLLPS	602431	615274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_602643_610734_611678_612985_613122_613799
665378	contig_4640_pilon	+	2774	11	Intergenic	novelGene_147961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_10	134.705938993053	168	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	96	2606	124943	148494	FALSE	20	TATTGTGTTTGTGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKGGRGPHRGHGGGGKGAMKRLKLVVEEFVQTTCEGEAPGGFKGPLPGSRAEGRGGPSGFRPGGKRSRKELKKEKRQLRKARRFQWTAGPAQGPGPGSRGGAQETIGPQSEKKEERVHPTESRDPPPPKKLRPPQAKASAPKAQANPKGTPGKTKPSAAATAAARKRALLEANEEEDREIRKLERCLGLNKRKKKGDSTSSSVPLSFARDGLDYILGALGSGKNSGLYESSSEEEEEDTGQTLPESDLESDTEEDSEEEEDVEEEEEAAVDRGTQEKRGKRKKRVRFAEDEKSESSSEDGDAADQSLCDSGEKYTLPHVRRAEETMDTQKKEELERLKKQVKGLINRLSEPNMASISGQLEELYMANSRKDMNDTLTGVLMSACVTGAVMPTRLMMEHVLLVSVLHHTVGIEVGAHFLEAVVRKFDDVYKNGSEGKECDNLFSILAHLYNFHVVQPLLIFDILKKLIGTFTEKDIELILLMLKNVGFSLRKDDALSLKELITEAQKKASGAGSKFQDQTRIRFMLETMLALKNNDMRKIPGYDPEPVEKLRKLQRALVRSVGSGTETRLRVSWESVLNAEQVGRWWIIGSSWSGAPMIDSSDMQQKQLVGTVSSKILDLARKQRMNTDIRRNIFCTIMTSEDFLDAFEKLLKLGLKDQQEREIVHVLMDCCLQEKTYNPFYAFLASKLCEYERRFQMTFQFSIWDKFRDLENLPASNFSNLLHLVAHLLRTKSLPLSILKVIEFSELDKPRVHFLRKVLYMLLMETEVEDLGLIFARVSDNPKLGMLREGLKLFISHFLLKNVHVHTSAEEASLLRERADLATKFLQGKSSLRM	124847	148662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_125864_127758_127884_129705_129902_134814_135139_140863_140975_141810_141973_142723_142846_144769_144903_145687_145820_147875_147986_148319
665380	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665383	contig_7057_pilon	+	1467	11	Intergenic	novelGene_123309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_1	736.707296013824	3030	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	173	976	936984	943233	FALSE	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	935989	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
665400	contig_9706_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_20820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACCAACCCCATATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1789	2044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
665403	contig_8597_pilon	-	2469	4	Intergenic	novelGene_158718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	526	junction_3	139.035566992367	85	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	119	502	108557	104979	FALSE	85	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHR	148940	103011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_105159_107805_107944_108491_108593_148857
665406	contig_6842_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_130687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCAAAACAGAGCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366178	365827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_365800_366200
665407	contig_6842_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_130686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTCTAATATAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365727	365287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_365300_365700
665410	contig_8452_pilon	-	2374	7	Intergenic	novelGene_48029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	299	junction_6	109.327362641848	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	84	935	550776	380533	FALSE	75	CCATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARSPGLAATASPPPSPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGFLAPVFALFVPFYCSIPRVQVAQILGQFSITNKTLIYILGLQLFTSGSYIWIVAISGLISGMCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQVKNNNNHYIFKNTQ	550859	379093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
665414	contig_15570_pilon	+	2295	13	Intergenic	novelGene_137831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	84.4225483308024	104	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	733	1968	452558	492015	TRUE	25	GAAGTTGTTTATGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQVLNIISILWKLSKQHDETHKLESWLRRNYLVDFKHHFMSHFPYALQEITKHKRKETNKSIKHCTILSNNVDHLLLNLTLSDIMVSLANASTLQKDSSWIEMIRKFVTETLEDGSKLNSKQLNRLLGVSWRLMQIQPNREATETLIKAVYTLYQQRGLLLPVRTLLLKFFSKIYQKEELRTYRVRYRSKVLSRWLAGLPLQLAHLGSRNPELSTQLIDIIHTAAARANKELLKSLQANALRIYDPQEGTVVVLPAESQQRLVQLVYFLPSLPADLLSRLSRCCIMGRLSSSLAAMLIGILHMRSSFSGWKYPVKDRLMSDVDYFSFLFSTLTGFSKEELTWLQSLRGVPHVIQTQLSPVLLYLTDLDQFLHHWDVTEGQTVGGLCLHPGCPASSSQVDAAEPAGEQSGA	445936	493577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_446068_449891_450081_451303_451544_452385_452630_454134_454248_460705_460945_461704_461841_463717_463894_465781_465960_472481_472571_474156_474291_491916_492128_493362
665416	contig_8254_pilon	+	2534	2	Intergenic	novelGene_48381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	0	67	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4	315	72814	74975	FALSE	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKVKI	72810	77194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_72865_74714
665417	contig_12622_pilon	-	1233	8	Intergenic	novelGene_5930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2140.53941323019	9	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	18	821	1590968	1585459	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWSSYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWAPSLSRTRGPSFLQSWTLPLRTRSPRRFSSSLVSSGARCGCTQARRRWARGGWTSWAWVRRWITSPASFLGARVRRCYSAGNDSGGST	1590985	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586257_1586364_1587923_1588042_1588434_1588480_1589998_1590234_1590830
665420	contig_6795_pilon	-	2589	9	Intergenic	novelGene_27655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	104.975517979194	29	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	222	728	129029	70657	TRUE	35	TAAACTGGAGAAGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAENKSTDSRVCEGKRCFHHPNRFKIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVLSGCSRDSEGKRGI	134321	44525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70702_71982_72054_74615_74765_110795_110852_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
665423	contig_11855_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_66893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAATAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659490	661881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_659500_661900
665425	contig_15031_pilon	-	2323	10	Intergenic	novelGene_138389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	256.3122131645	207	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	701	1639	101153	68789	FALSE	30	TTTTGGGAGAGTTCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQPVWKPYPNQDSDLLVLSGTDSELHIPRVCEFCQAVFPPSITSRGDFLRHLNSHFNGKT	161622	68104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68966_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101150_101276_101742_101862_102970_103080_129450_129599_160544_160701_161576
665427	contig_2892_pilon	-	1720	3	Intergenic	novelGene_118996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	88.5	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTTTGGGCAACACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187838	88555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_90117_100483_100568_187763
665428	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146684	1	-91650	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGATTTCTTGAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
665433	contig_15172_pilon	+	1083	9	Intergenic	novelGene_158731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	432.397603485496	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	30	884	210646	237132	FALSE	15	CCAGCTTTTTCAGCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQPHSPTAAMEAIKKKMQMLKLDKENAIDRAEQAEADKKAAEDKCKQVEEELMHLQKKLKGTEDELDKYSENLKDAQEKLDLTEKKASDAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	210616	237331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_210760_215068_215195_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
665434	contig_8616_pilon	+	2089	10	Intergenic	novelGene_72408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_7	108.973776435514	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	434	1501	215071	237101	FALSE	15	CTAGCCATGTCGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRKRYGSKNTDQGVYLGLSKTQVLSPATAGSGSRDIAPLPPPVALVPPPPDTMSCRDRTQEFLSACKSLQSRQNGIQANKPALHAVRQRSEFTLMAKRIGKDLSNTFAKLEKLTILAKRKSLFDDKAVEIEELTYIIKQDINSLNKQIAQLQDFVRAKGSQSGRHLQTHSNTIVVSLQSKLASMSNDFKSVLEVRTENLKQQKSRREQFSRAPVSALPLAPNHLGGGAVVLGAESCASGDVAINMIDSRTSQQLQLIDEQDSYIQSRADTMQNIESTIVELGSIFQQLAHMVKEQEETIQRIDENVLGAQLDVEAAHSEILKYFQSVTSNRWLMVKIFLILIVFFIIFVVFLA	214637	237689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_215296_216320_216392_216556_216613_216728_216800_219806_219924_220007_220065_220243_220326_221061_221169_221372_221495_236941
665435	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665455	contig_15063_pilon	+	943	3	Intergenic	novelGene_14421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1339	junction_1	2322.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	55	801	35349	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35294	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35836_36158_36266
665459	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
665469	contig_6056_pilon	+	1264	9	Intergenic	novelGene_157875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_8	47.2043430205315	4120	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	24	1058	267033	312153	FALSE	20	TATGATTTTGGAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWECHWWMTAVLGAAAVIMASGSSGLAASRLLTRYFLVQRNGIRHCSYASSRNHLYIDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQKALDYGTKLVGGTTPGKGGKMHLDLPVFNTVKEAKEKTGATASVIYVPPPFAAAAINEALEAEMPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267009	312359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287230_291373_291587_291720_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
665475	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_93507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665479	contig_10982_pilon	+	2458	6	Intergenic	novelGene_87879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	250.400159744358	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	394	927	182307	201769	FALSE	45	GGCACCAATTATAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	142014	203300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
665481	contig_10019_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_86698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400652	400004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_4e+05_400700
665486	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665498	contig_5020_pilon	+	1388	9	Intergenic	novelGene_27878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1073.98678268171	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	352	774	122915	124498	TRUE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSKALWMPTRPLPGRKGFRDSGKGPLPMLLVMPLSTVLSW	118473	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123331_124297_124363_124444_124547_124909_125091_125657_125722_125765
665526	contig_14441_pilon	+	927	5	Intergenic	novelGene_100496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	467.18431855104	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	339	887	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92564	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92708_121825_121872_125517_125902_126159_126283_126514
665527	contig_15067_pilon	-	1877	5	Intergenic	novelGene_154335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.3884158286023	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATACGGTGGTTGCCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93924	90594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_91173_91259_91720_91758_92279_92840_92941_93705
665528	contig_12790_pilon	+	1996	11	Intergenic	novelGene_35201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.652714226144	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	171	635	307252	310094	TRUE	25	GTTTAATTGTTTATAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRARHSIAEVGRAPERCRAESSRSRAKPRPALPRGSATQASSPRRAGTLGRWRANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKVMWGFQPRYLLRWTQQLHPA	305923	313329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306051_306100_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309913_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
665531	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665532	contig_4538_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_153073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGGAATGGGATTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73388	75917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_73400_75900
665538	contig_7091_pilon	+	2345	16	Intergenic	novelGene_131772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	326.309845937194	651	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	107	1669	349798	435147	FALSE	15	CACGTGGCCTTGGACTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKDYHEEKKVLNGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349691	435823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
665541	contig_2487_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_148435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	958	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCTGTCCTTTATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16119	2118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_3614_16085
665551	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665552	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665580	contig_2793_pilon	-	1153	8	Intergenic	novelGene_142865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	596.050264967097	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	110	748	118367	79566	FALSE	10	TCCTAGACTGTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118476	79160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80869_81622_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
665583	contig_15596_pilon	+	2612	15	Intergenic	novelGene_139534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	404.83927271782	4	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	432	884	141919	148653	TRUE	35	GATTCCTAGCAAATCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLSLTAFKFLGKNEDGKGRCPFDPAQSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRHSSQSPLRTEYAIPWLNEPSFVFTDVIRRNPNDTEGEDDKVYFFFMEVSVEYEFMFKLMIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSNLVFNMLQDVFILRGPWLKEPVFYGVFTPQL	126127	180708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_126164_128203_128350_136550_136614_138346_138446_141831_141926_142805_142920_144894_145047_148473_148662_148732_148844_154935_155102_155198_155243_159169_159368_172119_172330_178772_178871_179815
665584	contig_9132_pilon	-	1107	4	Intergenic	novelGene_121370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	25.3026129524645	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	148	822	106098	97662	FALSE	10	TTTCCTTTCTCCAACTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTRVRSPNPIHEGHPHVPSLHGRQGKGGRPGAQDWSISQSSRLLIAEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW	106245	97376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786
665590	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
665595	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	6	2962	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
665600	contig_5718_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_110406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCATCACCGTCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365375	1366054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1365400_1366100
665602	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665605	contig_9150_pilon	+	1778	4	Intergenic	novelGene_140904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGAAGGTCAAAGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46246	57769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_+_47803_49155_49249_53473_53513_57679
665609	contig_1535_pilon	-	1952	6	Intergenic	novelGene_127246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_5	319.042943817913	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	91	720	134584	129144	TRUE	0	TTGCTTTGCTGGGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	134674	127063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_134578
665614	SIRV4	+	337	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	10	-969	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGTTGTTGACCTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	1802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1800
665627	contig_8729_pilon	-	1459	6	Intergenic	novelGene_40154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	317.625313852659	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	96	791	770454	765591	FALSE	25	ACAGTAGTTTATGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYCASVAGLSRWPRARARVYLGSPDPRPVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770610	764922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438_769569_770383_770464_770524
665633	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665634	contig_3018_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_78940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1452	1898	681279	680833	NA	60	AATTAAATAAAAATGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANLKVGSSNPPDTPWKLYGVAVNQNRLNSNRFGFGFGDCCREKNIIRFSKAKRKFYSAYIQKGKSGKRTTMLPEPRLPKSKEILQNKVGKRTSMLLEPCLPESRDYYRIGKNGKTNKNAATAMSAQVQRTVTEPSVYINITNGQNH	682730	679996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_680000_682700
665638	contig_12270_pilon	-	297	2	Intergenic	novelGene_114115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCACTTTCACCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665639	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665646	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665649	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_95586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	657532	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657533	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665656	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665663	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_113547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	10	345	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14418	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665666	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_17546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
665680	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_115898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
665683	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91679	0	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
665694	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665700	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665710	contig_1624_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_138380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGATCTCAGCATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206310	205875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_205900_206300
665711	SIRV7	-	306	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91618	2	-91612	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGAGTGACACCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147600_148000
665713	contig_7870_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_108976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTACATGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386759	385954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_386000_386800
665714	contig_6504_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_158785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGCAAAAGGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244163	245822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_244200_245800
665725	SIRV7	-	290	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	2	35775	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
665726	contig_17819_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_158789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGATGTGCAGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2042	4070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17819_pilon_+_2000_4100
665730	contig_5031_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_133219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	219	545	102496	102170	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTFSTVKIPGSWFLEEARCPRANFLQCLGAWQLSLGAWQLSLGVWRIQPMAQVLKVTLDNNMPGSALALLFLPSLAAFCTWHSAGLMELIISPPDSCELLQCSCNSE	102714	100885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_100900_102700
665731	contig_11720_pilon	+	1627	12	Intergenic	novelGene_43950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.630986263686	3	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	13	1371	262271	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGEQVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262367_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
665734	contig_7368_pilon	+	3384	12	Intergenic	novelGene_158804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	34.1336701515751	147	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	37	1431	106470	203509	TRUE	35	TAAAAATGTGAGTGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWTWLQLTELRGMEASRYRRGPGGDSAFEDETMKLRQLKLDNQRALLEKKQRKKRLEPLMVQPNPEARLRRSKPRGSEEQTPLVEPHTPHNDVILHGIDGPAAFLKPDTQDLETKLHVLSVGSSAMEEDTEESFDGESMLDTASKPDLQEILQKHGISGSLNFDEEETDGEEEEGKKLRSHSPNSETGRPSSASSQKSTTDTGASGTATQQADNQLGEVENLEEFAYSPAPRGITVKCRITRDKKGMDRGLFPTYYMHLEKDENRKIFLLAGRKRKKSKTSNYLISTDPTDLSREGESYIGKLRSNLMGTKFTVYDHGVSPTKAQGLVEKAHTRQELAAICYETNVLGFKGPRKMSVIIPGMNMNHERIPFRPRNDHESLISKWQNKTMENLIELHNKAPVWNDDTQSYVLNFHGRVTQASVKNFQIVHENDPDYIVMQFGRVADDVFTLDYNYPLCALQAFAIGLSSFDSKLACE	106433	205674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_106511_170890_170943_179270_179431_180356_180534_186954_187089_187465_187664_189565_189679_200356_200472_202097_202197_202625_202798_203375_204928_205139
665739	contig_17311_pilon	-	1749	3	Intergenic	novelGene_57863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	16132	junction_2	2056.5	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	39	350	126865	123312	FALSE	10	AGGTGTCTTGCTTTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARVGVFPLFHSC	126903	121912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_123555_123642_123709_126862
665740	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665741	contig_5769_pilon	-	2997	2	Intergenic	novelGene_138757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACAGCGACTAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142120	138486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_141445_142081
665778	contig_5945_pilon	+	1037	7	Intergenic	novelGene_104530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAGTAGAAAATGAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2614	55430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_2733_12606_12652_16216_16339_16867_16942_32029_32206_53536_53564_54955
665783	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
665787	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
665791	contig_15063_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_12469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	7	1416	28164	36661	FALSE	40	AGTTGTATGTTTATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28157	36758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
665797	contig_854_pilon	-	1673	8	Intergenic	novelGene_36140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.823104402639	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	63	620	509201	471077	FALSE	0	GTGCCTGGGGCTCTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARQSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTGAR	509263	470023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471079_486987_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
665799	contig_14441_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_100487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	642.343901270963	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	700	1053	116876	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	92176	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92725_116555_116963_117097_117344_117539
665800	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
665804	contig_7286_pilon	-	2177	2	Intergenic	novelGene_108713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6700	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGCATGATTGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290374	286898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348
665811	contig_15105_pilon	+	1763	5	Intergenic	novelGene_150942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	278.467682146421	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	963	1334	325240	333995	TRUE	5	GTGCTTTTCTCATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGEIREQTGDSLVHAALVTESAAVGSAEANAFSVLQHLLGAGPHVKRGSNATNSLYQAVAKGVHQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQAEAAGDVLKAAYNQVKTIAEGNLSDTVIQAAK	324277	338650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_325450_327725_327807_333914_333996_336811_336966_338375
665830	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
665840	contig_11337_pilon	-	1117	3	Intergenic	novelGene_107179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCATCCGTGTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169446	160816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_160887_162027_162320_168691
665841	contig_12977_pilon	+	1616	15	Intergenic	novelGene_122791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	681.620461900633	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	230	1225	12793	57283	TRUE	5	TCTATTTCTCCTTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	12563	58792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_12802_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
665843	contig_10904_pilon	-	1505	6	Intergenic	novelGene_22712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	261.505946395106	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	30	1046	662714	647372	FALSE	20	CACATCCGAGTGTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSADVMVFYEVSAYLAH	662743	646912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_647419_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662408_662445_662665
665844	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
665846	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
665847	contig_14441_pilon	+	868	4	Intergenic	novelGene_100623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.064333633354	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	360	866	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111215	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_113154_113209_116578_116963_117523
665848	contig_18869_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_56366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
665850	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
665857	contig_6589_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_26231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	435	1055	2060671	2061291	NA	0	GTTTCTGTCTCTGTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKAPPAFLSVLPGSSAAGLVSTPALPLSALSTLLLPLGPLHLPYLIHPVLVPGTTHTFPIPSMGAPGLPAPHSCPHHFLQDAVTLDPVKQGPVAPCPHLSGGSVCTVSHLAQPLFCKPLLAPEIPGLCWNLLSWTCPWWGWSAVAATLEARASPTLLTFLETLCCVASCRGRHCFPAPWGTEHCRVTGGRDPGLNPALVWCGIF	2060236	2061819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2060200_2061800
665858	contig_17274_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_26480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGTATAAAGGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24167	23643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_23600_24200
665860	SIRV7	-	352	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78843_78966_114680
665863	contig_15219_pilon	+	1817	10	Intergenic	novelGene_40822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	360.37202999123	2	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	121	873	19617	24135	TRUE	80	GACATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRW	19496	25918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23890_24130_24314_24453_24588_25218_25325_25392
665866	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665877	contig_11096_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_143469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACCTCTCTCAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213132	210544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_210500_213100
665882	contig_14441_pilon	+	1476	3	Intergenic	novelGene_100726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	326	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	741	1436	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120395	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126496
665884	contig_10354_pilon	+	2051	5	Intergenic	novelGene_50851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	2	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	161	868	432370	475314	FALSE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432209	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
665888	contig_8102_pilon	+	518	4	Intergenic	novelGene_85329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	26.1321428300262	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	39	479	517	102631	102669	FALSE	30	ACAAATCTCAGGTGTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAYVVLSHAVSPIAKYYPNNETESILGRIIRVTDEVATYRDWISKQWGLQNRPEPSCNGNDVTLIVDTQQLDKCNNNLSEENEALGKCRSKTSESLSKHSSNSSSSPVSSSSATQSSSSDVDSDATPCKTPKQLLCRPSPGNRVGSQDVALESSQAVGKMQSTQTTNTSNSA	100115	102670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_100188_100289_100394_100495_100684_102516
665889	contig_8102_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_85330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	808	1128	104862	105182	NA	25	TCAAGAACTTTTAGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFCADTEAPLSSLRINSQLFSLVLLPGPWAVTCVCFLCIFFFFLPNGGGNKPESRPIPVAHSCCREASAPPGVCMLSPLALCAPCACWPHLSVFFKFMLNCCGRE	104054	106528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_104100_106500
665891	contig_14322_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_115877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
665896	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_96875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665897	contig_5020_pilon	+	1602	8	Intergenic	novelGene_27862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	359	1288	122915	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118466	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
665898	contig_17311_pilon	-	328	4	Intergenic	novelGene_57858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8737.01079062831	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTATAATTCAAGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126903	119253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_119265_123344_123555_123642_123709_126862
665901	SIRV7	-	369	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	13	-32	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
665911	contig_12270_pilon	-	284	2	Intergenic	novelGene_114116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTTCACTTTCACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14424	13917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
665920	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665922	contig_9325_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_158814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACACGCAAGCCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43829	44690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9325_pilon_+_43800_44700
665937	contig_6217_pilon	+	2337	3	Intergenic	novelGene_109694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.5	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	532	1764	1016733	1017965	FALSE	25	GCATTTTAAGTTTAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSHTHSPSEQISQPVQPLPEPLPSLHPSASPSSPPSLQNHKYNTTSTSYSPLASLPLKADTKGFCNINLLEDLPLQEPQSPHKLNPGFDLAKGSAGKVNLPKELPADAVNLTIPASLDISPLLGFWQLPPPATQNAFGNSTLSLGPGEPLPHRLSCLGQQQQEPPLAMSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	981711	1018538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_981760_1008907_1009387_1016728
665938	contig_3751_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_158642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196457	197479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_196500_197500
665942	SIRV4	+	326	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	635	987	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
665953	contig_13823_pilon	+	2818	2	Intergenic	novelGene_145267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTTGCAATACTTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278003	282300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_279748_281226
665959	contig_15720_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_41927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	381	695	281649	281963	TRUE	20	ATCGAGCAGCCCACCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVLYSHPGTFRFQTILEITTHTVNVRGRVGMNLKRAFSPMPSLYLDSILADTQRIPKLDGFISGARDNLPVVRRKGHTQHILGMAYKSACGGAPEREEFVTF	281268	283998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_282750_283785
665960	contig_13481_pilon	+	1763	7	Intergenic	novelGene_119401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	292.385400152303	933	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	101	883	613420	634757	FALSE	5	CTTCTCTGCTCCAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGVKEGRERPRGARTADKAGWIKKSGGGLLSLWKDRYLLLCHAQLLVYENEDEQKCVETVELGSYEKCQDLRALLKRKHRFILLRSPGNKVSDIKFQAPSGEEKESWIKALNEGINRGKNKILDEVKVDKSCALEHVTRDRVRGGQRRRPPTRVHLKEVASAASDGLSRLDLDVLDSGPPVFTPSDDGSVAQPQEKFQPLMPPTKTSSAPETPSVGDRVETSAGERASTPTSASTETHAESQDGVCCWVSGSFSTQTD	613319	635637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_613429_620292_620443_624607_624725_628959_629065_630645_630745_632842_633096_634707
665964	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
665966	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
665969	contig_19342_pilon	+	1185	5	Intergenic	novelGene_41078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	335	661	5208	6238	FALSE	30	CCTGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGNGFVVLQAATVPRALMCLSQPKGEILNGLHGGGVEAEGT	3241	6762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3331_3637_3846_5170_5293_5413_5534_6116
665976	contig_6576_pilon	-	2060	11	Intergenic	novelGene_42272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	524.90312439535	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	123	1496	339439	322526	FALSE	60	GTAATAAAATGAGAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRPESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339561	321961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332114_332233_337921_338049_339398
665977	contig_19564_pilon	+	973	5	Intergenic	novelGene_29574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_4	215.140070651657	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	199	567	7722	9682	FALSE	15	TGTTACAGTGTAGCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAKTKQQIEEQRVQVQVVERAQQVAVQEQEIARREKELEARVRKPAEAERYRLERLAEAEKSQLIMQAEAEAESVRMRGEAEAFAVEARARAEAEQMVKKAEAFQLYQEAALLDMLLEKLPQVAEEISGPLTSANKITLVSSGSGTIGAAKVTGEVLDILSRLPESIERLTGVSISQVNHNKPLQTA	7323	10088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_7509_7708_7755_7878_8017_8469_8635_9649
665978	scaffold_9100_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_83323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGATATTTTCACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861260	859187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_859200_861300
665979	contig_19974_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_130481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTACTCTGCACACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274224	274889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_274200_274900
665986	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
665989	contig_11677_pilon	-	926	5	Intergenic	novelGene_85920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	14089.3831372243	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598055	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_596017_597208_597397_597749
665995	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666007	contig_15744_pilon	+	764	5	Intergenic	novelGene_83590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	23534	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	56	550	149562	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149506	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
666012	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
666020	contig_20670_pilon	+	2775	6	Intergenic	novelGene_144826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	70.2925316089839	17	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	956	1336	23598	26681	TRUE	20	AATGCTAATTTGTCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMGIAIC	22642	28353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_23675_23884_24028_24115_24211_26468_26518_26664_26744_26976
666022	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666031	contig_6710_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_95713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
666037	contig_17989_pilon	-	1124	2	Intergenic	novelGene_150809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	184	492	201557	201249	FALSE	10	CCCCAGGCCTGGGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITATAPATTTVSRREGGPIHLLPRGGRTDSTEATGSRDFGVRQAWAPGLALPWEPPEVELWLLGLSFYLQSGESTPQLSGLLRLWRGCESSAWHRVNSAQ	202424	200616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201663_202346
666038	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666039	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
666041	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666042	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666044	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_98010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	25	CTCTTCTTTAACTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666047	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666057	contig_19812_pilon	-	1952	10	Intergenic	novelGene_101004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_9	15.6284008644598	418	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	23	877	67090	50202	FALSE	0	CTTCGTGTTTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLLRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKEYLEFRKERSQMLQSRRNQLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKPGTMIEWGNNWARAIKYRQENQEAVGGFFSQIGELYVVHHLWAYKDLQSREETRNAAWRKRGWDENVYYTVPLVRHMESRIMIPLKISPLQ	67112	49126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_50267_51992_52077_53251_53347_53730_53763_54056_54198_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
666058	contig_14322_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_116394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671862	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
666061	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
666064	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666065	contig_11281_pilon	-	1062	11	Intergenic	novelGene_125467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	918	junction_2	870.295145338637	254	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	43	1062	972015	844672	FALSE	25	AACTCTTTGACTTCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKNLPTYPGPNKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIRKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLEMRLSEVITDTGVVCHKLATRIFECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPYRSEAKKTKVKKKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRG	972057	844671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558_859632_860043_860125_886942_887020_900630_900726_925832_925937_971938
666077	contig_9579_pilon	-	2024	4	Intergenic	novelGene_150597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.257238647936	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	199	339	827925	827641	TRUE	35	GTAGCAAGACTGATACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNGIDLTPVQDTPVASRKEDTYVHFNVDIELQKHVEKLTKGAAIFFEFKHYKPKKRFTSTKCFAFMEMDEIKPGPIVIELYKKPTDFKRKKLQLLTKKPLYLHLHQTLHKE	831705	825866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_826419_826507_827738_827881_828000_831581
666078	contig_8710_pilon	-	2478	2	Intergenic	novelGene_73547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTTGAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520830	516368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_518757_520740
666080	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_18426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27855	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
666081	contig_9721_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_155988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCATCCCTGTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361275	361000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_361000_361300
666087	contig_3111_pilon	+	2368	14	Intergenic	novelGene_129986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_7	24.7297822509118	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	14	1651	170278	179558	FALSE	10	CATTGTCGAGTCCTCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQMLGFEHMGLDPRLLQAITDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELAKQAQSMIQQLATYCARDIRVADVSAAEHSASQRAVLIEKPDVVVGTPSRILSHLQQDNLKLHDSLELLVMDEADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELVLHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPVCVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGRRRGRGAKGDRASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARADNPGVVLTFMLPTEQAHLGEIEELLSGENGAPVLLPYQFRMEEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEVKEELLRSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPLHPAVVKPHLGNVPDYLVPPTLRGVVRPHKKRKKASFSSRKVKKGKTQNPLRSFKHRGQKPRSATKS	170264	180275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_170335_170471_170634_171443_171605_171747_171919_172045_172137_173110_173356_173662_173783_174349_174464_174560_174656_175819_175894_176028_176119_176859_176966_178866_178944_179483
666088	contig_7202_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_18517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27800
666089	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27891	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
666090	contig_16461_pilon	-	328	2	Intergenic	novelGene_139204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	1	327	926	374	FALSE	30	ACAGTTATGGTAGCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQDGATDSVPHVPVALGLCGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQ	926	372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_645_870
666092	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
666096	contig_2036_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_131854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAATAAAATGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655820	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_653400_655800
666102	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666106	contig_9146_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_79480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATGATATTTTTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108237	107235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_107200_108200
666110	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666115	contig_7963_pilon	+	1342	6	Intergenic	novelGene_58517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	309	junction_1	98.1032109566247	1928	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	272	1063	194098	200117	FALSE	20	CTGGTGGGAATATTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	193826	200396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
666116	contig_7753_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_41494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGATAATCAGAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194585	1194131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1194100_1194600
666127	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666131	contig_5145_pilon	+	3273	15	Intergenic	novelGene_131404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	51.11571506426	164	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	258	1739	718851	750624	FALSE	0	TCTTTTGGTTTGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGNPLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDITLGKIWDLADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHDVSLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMAAVPPAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPAVLPPSLVPPAKRKKTVFPGAVPVLPASPPPRDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHGVKQAQPVVSWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVKDIFMHSGLTQSLLAHIWALADTRQMGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGLDPPQVLSPDMVPPSERGTPVQDGSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTNEVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSLKMQIQSQESDLRSQEDDLNRAKAELGRLQQEEAQLEQSIQAGRAQLETILKSLASTQDEINQARSKLSQLHESQQDARRGLPPTEEVLNGAPGLTDLTERGGFGATVQVE	715249	752158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_715291_715812_715903_716421_716470_718772_718869_719044_719108_724140_724267_725568_725629_726482_726717_729680_729839_733079_733237_733632_733719_735692_735766_745681_745844_748661_748860_750477
666138	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666139	contig_9272_pilon	-	2069	8	Intergenic	novelGene_125984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_7	12.3734409448757	223	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	46	858	744632	729683	FALSE	25	ATGATCTGATGGAGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRAGGMSAELGIGFALRTVNERVQQAVARRPRDLPAVQPRLVAVSKTKPADMVIEAYSHGQRTFGENYVQELLEKASNPKILSSCPEIKWHFIGHLQKQNVNKLMAVPNLFMLETVDSVKLADKVNSSWQKKGSPERLKVMVQVNTSGEENKHGLPPSETIAMVEHINAQCPSLEFVGLMTIGSFGHDLSQGPNPDFQVLLSIRKELCKTLNIPIDRVELSMGMSMDFQHAIEVGSTNVRIGSTIFGERDYSNKPAMDKSAADLKASEH	744677	728471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_729800_730708_730808_731432_731576_734120_734256_738823_738900_739424_739461_739537_739646_744533
666142	scaffold_9100_pilon	-	1501	11	Intergenic	novelGene_83298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	334.973790019458	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	119	1261	789881	746337	FALSE	20	TTTGTTGCATAAATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMYKYRDLTVRETINVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPNVSASYPPYQATGPPNTSYMPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	796461	746096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274_749478_768983_769076_774460_774528_777866_777994_781780_781945_783998_784065_786207_786293_789872_789984_796445
666145	contig_7202_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_18085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27797	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
666146	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTCTTTTGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
666157	contig_8044_pilon	+	2351	12	Intergenic	novelGene_132360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	103	junction_9	68.7015343820375	55	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	120	1658	237684	289662	FALSE	40	ATGCCCAGCAAATGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTDSSLLLEDYSSKLSSKANRAKKSLLSGEEKENLPSDYMVPIFSGRQVHVSGITDTEEERIKEAAAYIAQRKLLASEEGITTAKQSTASKQSMVSKQSTSTLQQEKAVEKKSRKVAIREKAEHLSLRKTLEETEAYHKKLNEDSLLHAPEFNIKPRSHTVWEKESVKLHCSVSGWPEPRLTWYKNQVPINVHANPGKYIIESRYGMHTLQINACDFEDTAQYRASAMNVKGELSAYASVVVKRYKGEFDDTCFHARVSTLPLSFAVTPYGYASKFEIHFDDKFDVSFGREGETMSLGCRVVITPEIKHFQPEIQWYRNGAPVFPSKWVQTHWSGERATLTFSHLNKEDEGLYTIRVRMGEYYEQYSAYVFVRDADAEIEGAPASPLDVMCLDANKDYIIISWKQPAVDGGSPILGYFIDKCEVGTDTWSQCNDTPVKFARFPVTGLIEGRSYTFRVRAVNKNGIGLPSRVSEAVAALDPAEKARLKSRPSAPWTGQIIVTEEEPTEGIIPGPPTDLSVTEATRSYVVLSWKPPGQRGHEGIMYFVEKVRL	237564	290355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_237707_241425_241676_242276_242435_259234_259328_261222_261312_261424_261488_266713_266879_270386_270549_276776_276919_280693_280894_286102_286160_289525
666158	contig_14925_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_55113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	1543.31088896567	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	197	454	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIFGQGTTLQVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	73126	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_73082
666163	contig_9481_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_149656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161564	159900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_159900_161600
666168	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666169	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_95693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666174	contig_14684_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_99650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGAGGTCCTGGCGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62087	60226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_60200_62100
666187	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
666198	contig_14684_pilon	-	1813	3	Intergenic	novelGene_99644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTATTTGTTTGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63046	58704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_59309_60729_61782_62889
666219	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666230	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666234	contig_3147_pilon	-	2181	1	Intergenic	novelGene_142281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1545	1967	182183	181761	NA	25	TTACCCCAAGCCACGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSLLPGTEMISVKYPCSSSPADQFLAAMNCAICFQFGRQRKKATLDREAVVELQGSDGDQSCRPGHRRDCQERGKIEEGFSLGTGTDNGLCNVKGKHTQEKSSSCRSSPEGDDRRETPADICSSASQIFPFLTSPNFL	183727	181546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_181500_183700
666236	contig_11978_pilon	-	740	2	Intergenic	novelGene_62954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTGAAAAAAGGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044709	1041797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289
666245	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666250	contig_2940_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_81884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAACAAAACCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418117	415716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_415700_418100
666259	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_93660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666268	contig_4093_pilon	+	2805	1	Intergenic	novelGene_27644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTCGGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47037	49842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_47000_49800
666273	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666274	contig_5059_pilon	+	1882	7	Intergenic	novelGene_140746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	274.742101291779	3462	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	73	1833	414332	465601	FALSE	30	AATTAGGAATGCCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGVGAGKPGTNVDNRLETVLGNIMPAERKKPANMEEKESLLNNKEKDCSERRPVSSREKPKDDIKLTAKKEVIKVPEDKKKKLEEDKRKKEDKERKKKEEEKVKAEEELKKREEEEKQKYEEEERKKQEEQAKRQQEEEAAQLKEKEESLQLHQEAWERHQLRKELRGKNQNAPDNRPEENFFSRLDSSLKKNTAFVKKLKTITEQQRDSLSHDFNGLNLSKYIAEAVASIVEAKLKISDVNCAVHLCSLFHQRYADFAPSLLQVWKKHFEARKEEKTPNITKLRTDLRFIAELTVVGIFTDKEGLSLIYEQLKNIINADRESHTHVSVVISFCRHCGDDIAGLVPRKVKGAAEKFNLSFPPNEIISPEKQQPFQNLLKEYFTSLTKHLKRDHRELQNTERQNRRILHSKGELSEDRHKQYEEFAMSYQKLLANSQSLADLLDENMPDLPQDKPTPEEHGPGIDIFTPGKPGEYDLEGGIWEDEDARNFYENLIDLKAFVPAILFKDNEKGCQNKDASKDDSKEAKECKDNKELPSPDELELELENLEINDDTLELEGGDEAEDLTKKLLDEQEQEDEEASTGSHLKLIVDAFLQQLPNCVNRDLIDKV	408964	465650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_409019_414313_414694_420161_420942_431285_431447_443420_443619_459480_459631_465491
666275	contig_3627_pilon	+	1887	12	Intergenic	novelGene_78479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	193.65249612695	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	25	1095	432362	461493	TRUE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRRVMPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKEKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAVSGFCFLCCC	432337	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440238_444121_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
666279	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666280	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_97947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666282	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	84	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666285	contig_4626_pilon	+	1989	8	Intergenic	novelGene_158819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	9.17850194526229	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	22	732	45244	85382	FALSE	25	AAACACAGTTTCGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTEGSGKMASLDRVKVLVLGDSGVGKSSLVHLLCQNQVLGNPSWTVGCSVDVRVHDYREGTPEEKTYYIELWDVGGSVGSASSVKSTRAVFYNSVNGIILVHDLTNKKSSQNLYRWSLEALNRDLVPTGVLVTNGDYDREQFADNQIPLLVIGTKLDQIHETKRHEVLTRIAFLAEDFNAEEINLDCTNPRYLAAGSSNAVKLSRFFDKVIEKRYFLREGNQIPGFPDRKRFGGGTFKSLHYD	45222	86639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_45290_50119_50212_66617_66748_69645_69761_77296_77448_81518_81591_84375_84415_85316
666290	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_97757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666298	SIRV5	-	312	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCAAAGTACATATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
666308	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
666311	contig_3233_pilon	+	2272	8	Intergenic	novelGene_56567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	297.08426620151	7	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	740857	745088	TRUE	10	TTGTGTTGTCAGGCCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSGRSVPVLPPR	738721	748052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_745056_746424_746936_747016_747718
666322	contig_1146_pilon	+	2049	6	Intergenic	novelGene_84843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	164.952841745755	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	76	687	937672	944381	FALSE	25	TGTATACGGTAGCACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	937596	945743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262
666332	contig_10774_pilon	-	1922	5	Intergenic	novelGene_158680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.1800924563535	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	188	319	56149	38872	TRUE	75	TAATTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFPRRRPRRRRQQQRQRRWRLLGQYSGPPPFRTGSERGAGTEGGGGGQRLGGSQVRERGLLKMTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIERTNKKS	60920	24004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_24546_24688_25612_38732_38893_56038_56161_60744
666334	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
666338	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91674	0	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
666350	contig_7915_pilon	-	1894	4	Intergenic	novelGene_42985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	422.726336482074	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAACAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167315	142149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_143637_143972_144061_147960_148028_167063
666357	contig_10246_pilon	-	2196	2	Intergenic	novelGene_46882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	173	1660	78762	69226	FALSE	40	GAATAGAGGTAATGGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEITKNSLEKILLQLKCHFTWNLFNEESVSYDLEDRVGNQIEFLNTEFKATMYNLLAYIKHLDGQNETALECLQQAEELIQREHADQAEIRSLVTWGNYAWVYYHMGKFSEAQDYVDKVKQTCEKFSNPYSIECPELDGEEGWTRLKCGGKHNERAKVCFEKALEEKPNNPEFSSGLAIAMYCLDDKPQKQSPVDTLKQAIELSPDSQYLKVLLALKLQKMNREAEGEPLVEEALEKAPSQTDVLRSAAKFYKTKGDLDKAIELFLRALESMPNNGYLYHQIGCCYRKKIMQMQNTEEYVANGNREKIEELRECAVDYLKKALEKELNYPLAYAKLAELLAQRGQYREAEECYQIAFSKELTDTERQQLHQCYGNFQEYHMKSEDTGVQHDLEGLQISKKSAEKEKMKCQLQNTAGDQLLFNTANYWYHQGLIHKENGDVLQAVECYEKELGCLLRNAPSGIGSLFLPALELEEGSEEMGQSTHRSTPREPSNT	78934	68689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_70709_78757
666366	contig_9982_pilon	+	3320	1	Intergenic	novelGene_55743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAATTAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313969	317289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_314000_317300
666373	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_114059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	27	338	14409	13875	FALSE	25	CAGTTTATTACTGTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14435	13873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666376	contig_9272_pilon	+	2257	1	Intergenic	novelGene_125943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436150	438407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_436200_438400
666383	contig_12570_pilon	-	1852	6	Intergenic	novelGene_79383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	46.1718528976258	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	560	922	283531	280932	FALSE	35	TAAATGAAGGGATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300330	280001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283575_284049_284255_293908_294088_300198
666386	contig_14443_pilon	-	994	5	Intergenic	novelGene_126673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	973.994096491349	7932	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	90	422	39405	29670	FALSE	20	AGGCACTGCAGTGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSRLRSWKVAAPLPNYGTALRKGKR	39494	29097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_33982_34014_37689_37863_38988_39045_39371
666396	contig_7457_pilon	-	1248	4	Intergenic	novelGene_31710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	102	443	1176842	1174926	FALSE	25	TCAGAAACAGCTGGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPSLPDVPSPLPAFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176943	1174120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
666412	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666417	contig_10197_pilon	-	1996	8	Intergenic	novelGene_115254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.3480797261573	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	80	562	1055834	1049421	TRUE	10	TACTCGTGTGTGACTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDLLKPTEPRDQKFSIHVATWNVASAAPPLDLNDLLQLNNQNLNVDIYIIGLQEMNCGIRSLLYDTAFEDPWSSFFMDVLSPRSFIKVSCVRMQGLLLLVFAKHQHLPFIQILSTKSTPTGLFGYWGNKGGRQHLPEALRLLCKHHQLPPAPPSGQQ	1055913	1037779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1038976_1047803_1047849_1048627_1048740_1049339_1049517_1049868_1049986_1053301_1053411_1053739_1053848_1055781
666421	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666424	contig_10990_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_7520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCAAGCAGAAGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753868	752122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_752100_753900
666429	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73573	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
666430	contig_8027_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_158853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGACACCAACAGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463434	464088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_463400_464100
666432	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666433	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666434	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666438	SIRV2	+	283	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	314	-74	-314	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCGCAAGATACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
666442	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666445	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_18546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGTACCATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
666449	contig_7202_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_17514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
666450	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666458	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666459	contig_1964_pilon	-	3087	3	Intergenic	novelGene_130911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_2	207.5	102	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	111	464	158906	157969	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKKFWEPDDSTKDGQKGIFLGDDEWRETAWGTSHHSMSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGTFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDLKQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFK	166266	155345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_158143_158726_158915_166164
666464	SIRV7	-	905	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
666466	contig_2027_pilon	+	1970	14	Intergenic	novelGene_39948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	59	junction_6	87.9891063725316	48	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	225	1919	639829	648685	FALSE	15	GTGTACCATGTGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLTAQSFSTDGEPPPACTLSPTPAPLASTYVFSTTSAAGTRGGGDGAHRRNPSPASMSSGRKSPHSKSPSEQRERKSLADEKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVAQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQVGWVEGLDTLGRGL	638048	648736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643195_643448_643533_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505
666475	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666477	contig_8588_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_146507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375427	373007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_373000_375400
666480	contig_10311_pilon	-	1455	11	Intergenic	novelGene_50453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1037.59539802372	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	34	1071	71526	65517	FALSE	25	ACTTAAAAGTTGCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLS	71559	65132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65523_67227_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
666481	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCCCTCGCAGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
666500	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
666501	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
666502	contig_10642_pilon	-	1417	2	Intergenic	novelGene_78729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCTTGGAAACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274771	1104527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1104596_1273422
666512	SIRV7	+	358	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACTTAATCCTATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78972_114683
666515	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666521	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
666524	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGTACCATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
666527	contig_5020_pilon	+	1176	6	Intergenic	novelGene_27845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1084.68380646159	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	363	806	122915	125717	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYSRLLYHCHRLPCRRSQDEIHELCPGPVQQRWPLCPYHAPEGGAPGLLQRVHALLSSLGFLECGDVRHL	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123265_124944_125091_125657
666529	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	967	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
666540	contig_9345_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_24690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCGGCTCCTGGCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947365	948121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_947400_948100
666541	contig_3866_pilon	-	1462	13	Intergenic	novelGene_112439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	57.6258887615242	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	44	1228	306133	280333	FALSE	20	GTTTAATTTTGGAAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCGFAGETGPRCIIPSVIKRAGMPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVVIESVLCPSHFRETLARVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCNVDTSAAKEQSLPSVMGSIPEGVLEDIKVRTCFVSDLKRGLNIQAAKFNIDGKTERPTPPPNVDYPLDGEKILHVLGSIRDSVVEILFEQDNEEKSVATLMLDSLMQCPIDTRKQLAENLVVIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKALGSKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMMFDVGKAQPPLMKRAFSTEK	306176	280098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_280515_281901_282104_283220_283303_286371_286446_286525_286606_289280_289317_296309_296390_296662_296731_298513_298622_301032_301142_302814_302898_303817_303891_306125
666545	contig_10861_pilon	+	2528	8	Intergenic	novelGene_39312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	33.2455306187531	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	268	927	1472615	1481530	FALSE	30	AGAACCATCCCAGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADHAEVLKGIQTFPGINYPVLIPNLKGFQTAVAAGAKEVSVFGAASELFTRKNINCSIDESLQRFDEVLKAAQALSIPVRGYVSCVLGCPYEGKISLAKVAEVAKRMYSMGCYEISLGDTIGVGTPGVMKDMLSAVMHEVPVAALAVHCHDTYGQALANILMALQMGVSVVDSSVAGLGGCPYAKGASGNLATEDLVYMLTGLGIHTVSQPAPWWRQP	1462219	1483131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1462294_1468878_1468963_1471804_1471914_1472614_1472711_1473380_1473530_1478105_1478170_1479888_1480078_1481368
666565	contig_15063_pilon	+	1012	4	Intergenic	novelGene_14449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_2	2733.91566967397	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	207	758	36064	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	35857	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266_36600_38975_39092_39506
666566	contig_13780_pilon	-	2321	15	Intergenic	novelGene_149025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	292.900205893142	502	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	304	1998	515426	469484	TRUE	15	GCCTTCATGTGAGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDDESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGGISSGKRQRQQRPGRRWL	544200	468637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482_469541_490695_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162_513394_515177_515440_543910
666574	contig_20819_pilon	-	664	7	Intergenic	novelGene_55684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	1661.14598997198	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAATAGTTTATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70262	65421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_68115_68275_69625_69725_70232
666591	contig_14575_pilon	+	2353	25	Intergenic	novelGene_101874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_17	121.70130072116	7	58	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	1644	2351	51080	63892	FALSE	65	GAAAAAATTGAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKE	17127	63894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_33862_33922_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
666592	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666595	contig_14814_pilon	+	1058	3	Intergenic	novelGene_137706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.5	49	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCCCCTGCCCCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279318	283982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279538_282721_282992_283413
666597	contig_7051_pilon	+	1905	7	Intergenic	novelGene_64369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	41.6573322877658	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	397	1065	374061	384724	FALSE	25	TGTTGGACAGTTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILDVGCGGGLLTEPLGRLGASVIGIDPVDENIKTAQHHKSFDPVLAKRIEYRACSLEEIVEETVETFDAIVASEVVEHVVDLETFIQCCCRVLKPGGSLFITTINKTQLSYALGIIFAEQIAGLVPKGTHTWEKFVSPEKLESILESNGLSVQTVTGMLYNPFSGFWHWSENTSLNYAAHAVKSKVEEPPAPAEPVLNEETEELRANISANPGVHEELKK	348238	385564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_348313_368164_368292_371433_371587_374018_374106_376003_376247_378973_379134_384503
666600	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666601	contig_18613_pilon	+	977	7	Intergenic	novelGene_80216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1856.16881416176	14932	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	418	717	28443	31105	FALSE	5	TATGGTCTTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23702	31365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28155_28272_28436_28639_30137_30195_31058
666609	contig_7230_pilon	+	3620	1	Intergenic	novelGene_52529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40432	44052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_40400_44100
666614	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666620	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666626	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666627	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	29	367	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14437	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666629	contig_8453_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_125134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	205	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGCCAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225278	222914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_223072_223173
666631	contig_14925_pilon	+	948	4	Intergenic	novelGene_55076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	790	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGGGTCAAGAGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25789	29827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568
666636	contig_16907_pilon	-	2042	18	Intergenic	novelGene_87470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.1901919759658	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	73	2037	524752	480612	FALSE	25	TTTTATCTCTGTATACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLWFQFKKTPAACFSSRLLPQPSEMSAIPAEESDQLLIRPLGAGQEVGRSCIILEFKGRKIMLDCGIHPGLEGMDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVHKGSKKLEMHVYSKRLEIMLQDIFGEDCVSVKDDESLREMVELAAQRLYEALTPVH	524824	480606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_480686_482806_482842_485631_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502228_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520295_524702
666639	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666660	contig_5698_pilon	+	1083	3	Intergenic	novelGene_55003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	365	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCATTCATACTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7890_19860
666662	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
666663	contig_6710_pilon	+	549	2	Intergenic	novelGene_97582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653387	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
666668	contig_12270_pilon	-	389	2	Intergenic	novelGene_113137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	31	387	14409	13830	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14439	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
666679	contig_253_pilon	+	1441	7	Intergenic	novelGene_129730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	203.391863160747	1607	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	77	568	582199	583908	TRUE	5	GCCACGGCCTCTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKEAAGGRAAGAGPELQGRTGGAAMSDTEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECEWSRIRVLPRQETLQHQTVENLH	582122	585397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_582254_582710_582843_582967_583230_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
666692	contig_13547_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_104865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTAATGACTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68827	67373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_67400_68800
666695	contig_15353_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_151975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGTTGGAAGACGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475482	475726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_475500_475700
666699	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666705	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	159	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666716	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666721	contig_8284_pilon	-	3264	11	Intergenic	novelGene_125677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	47.8715990959149	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	55	1110	389183	336801	FALSE	10	TCCTCCTTGGTTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATATAVVAEEDTELRDLLVQTLENSGVLNRIKAELRAAVFLALEEQEKVENKTPLVNESLKRFLNTKEGRLVASLVAEFLQFFNLDFTLAVFQPESSTLQGLEGRENLARDLGIIEAEGTVSGPLLLEVIRRCQQKEKGPASGEKSSETSQSDTSISLSEPKSKSSRHLPAQETKIGSFLSNKSLDVKDKAGICPDEDDMEGDSFFDDPIPKPEKTYGWRSEPSKQGGSLASLSDAPPLKSGLSSLAGAPSLKDSESKRGDAVLTDLKLVGDKIGSLGLGTGEEDDYVDDFNSSSRRSGNSQLSIGEETEEGLSVEADDISASDKLDDLTQDLTVSQLSDVADYLEDVA	389237	334646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_336876_340850_340948_347191_347232_352660_352730_354347_354461_359450_359675_378229_378368_378811_378901_379280_379336_387208_387263_389081
666726	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
666727	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666733	SIRV6	-	421	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
666737	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666744	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666747	contig_5467_pilon	+	1915	4	Intergenic	novelGene_111945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1441	junction_3	193.165444344709	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	773	1111	21047	21610	FALSE	15	ACCTGAGCCTGGCTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISYAHNVAAQGKYIAIASTTVETSEPEKEIEPALELLEPIDQKFVAISDLYEPIDDGSESQVFCSCSYDATTHFETTCNDIKDIYKRMVGSAFDFENMKRKQNDVFGEADQ	20037	22414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_20796_21032_21178_21312_21368_21457
666751	contig_4114_pilon	-	1446	5	Intergenic	novelGene_15589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGGAAACCCGAGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250457	218244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_218360_222874_223040_234092_234228_247833_247998_249590
666760	contig_10800_pilon	-	1760	5	Intergenic	novelGene_152619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	116.113091423836	505	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	142	762	457582	429975	FALSE	15	TACTTTTTATGCCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSSEVRREEEHLLQARRPGARSQEFPWTRSSSGSSVCVLQPQKTSRMAANKNKSQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVQIEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRAKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL	484014	428976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_430095_432709_432888_436425_436635_457468_457632_483922
666762	contig_15264_pilon	+	2050	2	Intergenic	novelGene_158863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTATGTTTGTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10543	16482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_11928_15816
666763	contig_6576_pilon	-	1575	15	Intergenic	novelGene_42233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	100.685102154779	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	393	1367	252452	229096	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261363	228768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_256018_256085_258751_258854_261240
666768	contig_10642_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_78678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACATTTTGTGCGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194997	194543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_194500_195000
666787	contig_854_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_36104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1704	junction_1	1106.20462242149	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	52	438	94569	91450	FALSE	15	AAGTGCGTGGCCTTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVCISFEEADLSIKLPDGYTFKFPNRLNLETINYLEAEGDFKV	94620	91449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91870_92043_93127_93208_94560
666798	contig_4364_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_1226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532899	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
666802	contig_7870_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_109051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641134	643578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_641100_643600
666807	contig_10011_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_68080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGAGTATTGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322211	319850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_319800_322200
666814	contig_6005_pilon	-	2658	1	Intergenic	novelGene_158906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAGAGTCAAAAAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367215	364557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364600_367200
666817	contig_13241_pilon	-	2733	1	Intergenic	novelGene_158911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGTTTTATTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182185	179452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_-_179500_182200
666827	contig_12873_pilon	+	1680	5	Intergenic	novelGene_27221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1321.15259811272	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	623	1114	17896	19855	FALSE	35	GACTTTAAGCCAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16753	20421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17261_17780_18014_18984_19264_19611_19703_19851
666834	contig_17005_pilon	-	1971	4	Intergenic	novelGene_129899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	39.2031744746377	124	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	270	1091	21134	19387	FALSE	10	TATTTGGGTTGAGGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDTWPSMVGGICKLHGIEDQDNNQKTCVSMLPIFNRRHMVENLCENNEDSPCGQTFSQIPNLSVLKRTPMEAYPSECLECGKSLMDHSSLKHHISSHSGCSASQHKECGEDCSCPSYLSTPMRTLTGEKRHECKECGKAFSQSSHLTSHIRSHSGERPYECKECGKAFGHSSNLTIHMRTHSGERPYECKECGKAFHKSSNLTIHMRIHSGERPYVCKECGKTFNRSSHLTTHIRSHSGERPYECKECGSTFHHSSSFTRHMRYSQWRETL	38453	18506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_-_20117_21042_21194_22201_22325_38366
666836	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666838	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
666839	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666841	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_95034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666842	contig_7733_pilon	+	2333	9	Intergenic	novelGene_147133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	53.0636410360239	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	172	975	92170	107305	FALSE	45	TCAAAAACAAAACTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKGCKVVGAAGSDDKVAYLKKVGFDVAFNYKTVESLEETLKKASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86769	108663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_92135_92193_93204_93373_96814_96933_97575_97732_100923_101033_106056_106176_107194
666844	SIRV7	-	353	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33214	2	-5	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114743	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
666845	contig_5020_pilon	+	1508	7	Intergenic	novelGene_27826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1054.56273192047	16	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	319	1188	121762	125772	FALSE	5	TCCTCCCTCTCTTGTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQVPSPRFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124267_125644
666847	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	632	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
666861	contig_4442_pilon	+	1893	15	Intergenic	novelGene_127947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_14	200.545633261879	167	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	6	1139	255566	359739	TRUE	25	GTATTGCAGCAACCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKSPVPTATSFLPTQRLQLGRAGPGLSQLPLWCLPAKHSSGVSPGCEILSRGCISAGAEHSRDERGRGHS	255560	397548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_358957_359094_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
666869	contig_6829_pilon	+	2671	10	Intergenic	novelGene_123760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	32.6057633321034	327	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	551	1867	18745	59222	FALSE	50	CTATTAAAGATGGCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCTCTWRNWRQWIRPLAVVIYLVSIVVAVPLCVWELQKLEVGIHTKAWFIAGIFLLLTIPISLWVILQHLVHYTQPELQKPIIRILWMVPIYSLDSWIALKYPSIAIYVDTCRECYEAYVIYNFMGFLTNYLTTRYPNLVLILEAKDQQKHFPPLCCCPPWPMGEVLLFRCKLGVLQYTVVRPFTTIVALICELLGIYDEGNFSFSNAWTYLVIINNMSQLFAMYCLLLFYKVLKEELSPIQPVGKFLCVKLVVFVSFWQAVVIALLVKVGVISEKHTWEWQTVEAVATGLQDFIICIEMFLAAIAHHYTFSYKPYVQEAEEGSCFDSFLAMWDVSDIRDDISEQVRHVGRTVMGHPRKKFFPEDQDQNEHTSLLSSSSQDAISVASSMPPSPMGHYQGFGHTVTPQTTPTAATIPDEMFNDTTGEKKELSDKFVAS	18194	60026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18868_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898_52974_54349_54444_56463_56577_57944_58045_58565_58738_58956
666874	contig_6710_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_98026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	20	TCCTCTTCTTTAACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666878	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666886	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
666892	contig_9571_pilon	-	2363	4	Intergenic	novelGene_136239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	7.11805216802087	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	75	839	352858	130939	FALSE	15	CAGTGATTTATGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSSTEKSRFFKPDYEAWLRIQRAERGGVIFHDVAVLTDKLFPIVEAMQKHFSAGSGTYYSDSIFFLSVAMHQIMPKEILRIIQLDLDLKYKTNIRELFEEFDSFLPGAVIGIAREMQPVYRHTFWQYRHENPKTRVGGPPPKGLPGFNSGVMLLNLDAMRQSPLYSRLLEPARVQQLADKYHFRGHLGDQDFFTMIGMEHPELFHVLDCTWNRQLCTWWRDHGYRDVFEAYFRCEGHVKIYHGNCNTPIPED	352932	129414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_131336_223025_223159_321690_321839_352771
666894	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91671	0	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
666895	contig_8954_pilon	-	1382	5	Intergenic	novelGene_130321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	77.5983247241846	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	365	670	662592	655638	FALSE	50	AAATTTAAAGCTATAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPLSVLRSMLSKVVCSSEQGTLFACISVLETLGGVLAVSAFNGIYSATVAWYSGFTFLLSAALLLIPAISLCIVKCTNWNEGSYVPLVQEESGEDASDR	682493	654925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_655723_658639_658797_662528_662613_671322_671547_682373
666902	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666903	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
666910	contig_12357_pilon	+	1303	10	Intergenic	novelGene_6069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	940.741079031727	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	117	1061	26079	42221	TRUE	25	ACACCCAGCTTTTCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQVSLEDQDTCELSLSYSSGQLSA	25962	51209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35211_42171_42251_46433_46568_51130
666911	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	20	875	20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8335	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
666912	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666918	contig_3747_pilon	+	1627	2	Intergenic	novelGene_24764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTCTACAGCTAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200981	205040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202515_204946
666919	SIRV2	+	547	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	-25	1	25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACCTGGAGGATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1700
666923	contig_20614_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_107591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACCAGTGTGGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293113	292139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292100_293100
666930	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666938	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
666942	SIRV7	-	323	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33233	13	14	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114724	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
666946	contig_9705_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_41758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACACACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488170	486821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_486800_488200
666948	SIRV6	+	545	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	29	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101335	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
666949	contig_11846_pilon	-	1302	6	Intergenic	novelGene_105944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	113.828994548841	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	193	705	260073	254604	FALSE	10	ATCTGTGCTGGCTAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKR	263867	254006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263714
666957	contig_546_pilon	-	3062	2	Intergenic	novelGene_117258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	276	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1613	2020	762880	762473	FALSE	50	ATTACAAATTTACTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKGTEAGWCSGQVRESTGGAYEMRSEIIQALIGLQDFFIDPEKLIAASYLFHLSSVPLASDSELSSRIIMKGSLEGNTAKFAPFIVQGPVQASPFCWFLLELFLPHTPTHIPSNSFLPSALNPHSKVSKIFLLV	766077	761430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_763981_765565
666959	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
666960	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666963	contig_7513_pilon	+	2200	12	Intergenic	novelGene_88954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1319	1663	154315	164703	TRUE	55	CAAAACTTCACAAACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRTIARQDDHHQLQAGIGVLQVPEHGLHAVCALGVLAEARLALDGHAGVSGDLSELLREGLQVDFGALALGGEAGDGPHLDLDARVKLLVSHVPDTLHGGGNRFVPAPRRG	145968	168531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_146766_146950_147150_147982_148084_152142_152282_154232_154334_161088_161258_163894_164031_164682_164807_164928_165051_166134_166279_167530_167619_168451
666964	contig_11115_pilon	+	1889	5	Intergenic	novelGene_102847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	681.09044002981	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	827	1801	171704	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	166299	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_166520_171097_171981_172339_172595_172714_172964_173047
666969	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666971	contig_14322_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_116477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671890	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
666974	contig_2067_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_158931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTCTGTTTTGGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601497	601842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_601500_601800
666980	contig_14273_pilon	-	2827	21	Intergenic	novelGene_21162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_20	40.5449133677703	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	830	2493	21	2513	313162	275621	FALSE	20	ACAAGGTTTTGTTGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEESLRVVRCGGSELNFRRAVFSADSKYIFCVSGDFVKVYSTATEECVHILHGHSDLVTGLQLNPSNHLQLYSCSFDGTIKLWDYIDGILIKTFTVGHKLHALFTLAHTKDSVFVTINKEKPDIFQLVSVKLPKSSSQEIEAKETAFVLDYINQSPKCIAFGNEGEYVAAVRDFYLSVYFFKKKTTSRFTLSSSRNRKHAKNNFTCVACHPKEDCIASGHKDGKIRLWRNFDDDKKYTYTCLHWHHDMVMDLAFSVTGTSLLSGGRESVLVEWRDATEKNKEFLPRLGATIEHISVSPAGDLFCTSHSDNKIIVIHRNLEASAVIQGLVKDKNIFTGLIIDPRTRALVLNGKPGHLQFYSLQSDKQLYNLDIVQQEYISDNDLIQIELRKAAFGCQGHWLATVEQRQEKETELELQMKLWAYNKKTQGFVLNTKVSMPHEDHITALCFCNAEKFENPTLVTASKDGHFKVWILTDDSDIYKKAVGWTCDFVGSYHKYQATNCCFSEDGSLLAVSFEEIVTIWDSETWELKCTFCQRAGKIRYLCFGRWTCSKYLLGATENDILCCWNLLSCALEWSTKLNVRVMEPDPNSENIAAISQSSVGSDLFVFKPSEPRPLYIQKKISREEVHWGVFVPRDVPESFTSEAYQWLNRSQFYFLTKSQSLLTFSAKSPEEKLTPTSKQLLAEESLPTTPFYFILGRHRQQQDEKLNDALGNELVQLPLTENIPAISELLHTPAHVLPSASFLCSMFINSLLLSKETKSAEEIPDDVDMEEEKGSDDTDEENDFTEKAQDTNDIDLGEDIIHQLSKSEEKELRKLRKVDYSWVTTL	313182	275306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_275826_276208_276301_276672_276820_279440_279501_280222_280393_281543_281640_282520_282616_283481_283663_284135_284294_285172_285349_286402_286519_286608_286669_287688_287848_298858_298948_299825_299946_301011_301083_303482_303608_304462_304554_305437_305504_307741_307872_313076
666981	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
666983	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
666987	contig_7657_pilon	-	2156	14	Intergenic	novelGene_30012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	18.5373443646784	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	467	1447	132524	124409	FALSE	20	AATCACCTGGTGTGTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYCLFQALATFFQVPYTALTMLLTSNPRERDSATAYRITMEMAGTLMGATVHGLIVSGAHEPHRCEDARLPLPDGVSPDAIHLYSIAAAVVAVTYPVCTGLLCLGLVVSFLFISAAVQVEQSYLVLFCTHASRLHDHVPRLVLTILVSAVLSTPLWEWVLHRFGKKTSAFGICVMVPFAILLAAVPIAPVAYIVAFVSGVSIAVSLLLPWSMLPDVVDDFQLQHQHGPGLETIFYSSYVFFTKLSGAGALGISTLSLEFVGYKAGACEQAEEVVVTLKVLIGAVPTCMILTGLCILLVSPTLKVPSQDPSRQLSLRRRTSYSLA	137853	123699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_124434_126028_126206_126600_126745_127031_127142_127367_127449_127769_127854_128328_128368_128580_128656_131439_131571_131684_131764_132488_132614_133180_133306_134602_134729_137727
666992	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
666995	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCATCCCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
667002	contig_3942_pilon	+	959	7	Intergenic	novelGene_128693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	362.784447786224	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	51	785	426591	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426540	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
667003	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667011	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667018	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667019	contig_10436_pilon	-	2035	5	Intergenic	novelGene_108471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	49.4033146661234	418	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	222	1433	100451	96819	FALSE	5	GCCCTTATTGTCCTGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAMAEPSPEDPPPTLKPETQPPEKRRRTIEDFNKFCSFVLAYAGYIPPSKEESDWPASGSSSPLRGESAADSDGWDSAPSDLRTIQTFVKKAKSSKRRAAQSGPTQPGPPRSTFSRLQAPDSATLLEKMKLKDSLFDLDGPKVASPLSPTSLTHASRPPVPLTPVPLSQGDLTQPPRKKDRKNRKLGPGAGAGFGVLRRPRPAPGDGEKRSRIKKSKKRKLKKAERGDRLPPPGPPRAPPSDTDSEEEEEEEEEEEEEEIVAVVGGEAPAPVFPTPPEAPRPPATGPPEGAPPTDSESKEVGSTETSQDGDASSSEGEMRVMDEDIMVESGDDSWDLITCYCRKPFAGRPMIECSLCGTWIHLSCAKIKKTNVPDFFYCQKCKELRPEARRLGGPPKSGEP	100672	96216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_97034_97134_97973_98574_98668_98822_98855_100417
667032	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667040	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667044	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_95004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667051	contig_5145_pilon	-	1831	7	Intergenic	novelGene_131448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	83.3126641033643	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	13	423	941252	936187	TRUE	40	TGACTCAAAATACACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	941264	922869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152
667064	contig_14405_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_85649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTACCTTGTTAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485626	484261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_484300_485600
667072	contig_2770_pilon	-	1415	5	Intergenic	novelGene_107473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1985.46203690728	4	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	192	533	746670	743833	FALSE	40	AGACCATTAACTTAAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750725	742950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_750608
667075	contig_740_pilon	-	1529	4	Intergenic	novelGene_158945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	38.3086877294897	530	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	133	489	223680	215349	FALSE	20	TTAATAGACTTTGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAGLGEGVPPGNYGNYGYANSGYSACEEENERLTESLRSKVTAIKSLSIEIGHEVKNQNKLLAEMDSQFDSTTGFLGKTMGKLKILSRGSQTKLLCYMMLFSFFVFFVIYWIIKLR	223812	214308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_215505_217429_217487_219941_220067_223661
667076	contig_7963_pilon	-	1082	6	Intergenic	novelGene_58329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
667079	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667082	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667091	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667096	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667100	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_89220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
667103	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73595	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
667110	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667115	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667129	contig_19564_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_29611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	6	542	12737	12201	NA	60	AATGAAAAAAAGAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	12742	11348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11300_12700
667130	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667131	contig_11896_pilon	+	1629	2	Intergenic	novelGene_88037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	347	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCTCGCAAGTTGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158537	173242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_160084_173159
667137	contig_13051_pilon	+	1666	14	Intergenic	novelGene_140102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	108.433711651337	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	198	1559	112343	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESELDLNDIIQEMHVVATMPDLYHLLVELNAVQSLLGLLGHDNTDVSIAVVDLLQELTDIDTLHESEEGAEVLIDALVDGQVVALLVQNLERLDESVKEEANGVHNTLAIVENMAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	111911	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_112105_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
667143	contig_10263_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_135815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTTCAAAATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46353	48001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_46400_48000
667145	contig_10793_pilon	+	1317	12	Intergenic	novelGene_83414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2732.13664154983	5	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	40	966	146975	163940	TRUE	25	GCAACATTTTTTTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130962	165013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789
667163	contig_2332_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_58640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATCCTTTTTATGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191156	192108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_191200_192100
667165	contig_11986_pilon	-	3209	3	Intergenic	novelGene_69261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	33	21	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTTGATCCTCGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843967	839895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841749_841860_841950_842700
667174	contig_9516_pilon	-	1891	15	Intergenic	novelGene_106179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_14	93.763924136033	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	385	1716	898344	877957	FALSE	35	ACCTGATTCTTCTAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTGIRSESETESEASEITIPQSSAAVPQVPVEGEDYGKGVIFYLRDKVVVGIVLWNIFNRMPIARKIIKDGEQHEDLNEVAKLFNIHED	913207	877781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878565_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_898505_898631_899602_899703_913084
667180	contig_7057_pilon	+	248	2	Intergenic	novelGene_123367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAGAAAGTTTGAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015837	1029175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1015917_1029006
667181	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_16638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27856	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667186	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667193	contig_6710_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_94929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACACTACAGAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
667197	contig_10003_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_88259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750464	747822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_747800_750500
667210	contig_5063_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_109987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	35	CAAATATATAATTTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
667222	contig_3410_pilon	-	2253	7	Intergenic	novelGene_58907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.859235912831	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	111	1106	57649	14837	FALSE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIAPLVFFYLTPASQEACRGRGTQDSHPASKDRASACMLRLRDSPSEQTGWGWPSSRWFCVGRGRQPLQRIQVPHLTQDP	57759	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15071_30365_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
667224	contig_15304_pilon	-	752	3	Intergenic	novelGene_30531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	198	713	54100	52925	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53608_54095
667229	contig_6975_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_74303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCATAGCAACCCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513846	512133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_512100_513800
667230	scaffold_13505_pilon	-	1171	5	Intergenic	novelGene_111436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	273.333587398256	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535128	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_534958
667231	contig_5515_pilon	-	1337	8	Intergenic	novelGene_52340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	307.312710509696	36	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	359	1096	71189	67874	FALSE	45	TCAACCGATCAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPLRPLSSLPPPPPPVSPPADVPCCPLHSIIPAFHRGLGQGCRR	99289	67632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68002_68171_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75528_88998_89139_99118
667234	contig_14322_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_115969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
667246	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667249	contig_19892_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_158950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	71	379	24296	24604	NA	25	TAAATGTCCGTCTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGCREWESAQGQLVESGSTDRIIFSTNRGAKRDAEEDEGERGQWAGVVDVSDGLVFSRGGCSEGSLRDPTIPAAGSSSLLHDQVLPVVGAERYPPQPPSAL	24225	24952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_24200_25000
667250	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667259	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_89199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653712	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
667261	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667264	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667270	contig_11285_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_5649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	588.91908400051	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	76	387	767827	768327	TRUE	15	CAACTGTCTCTTGACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTGTKGRPRTSFHLPVRRSLPGCPRNTCRGWVLTVVWREPGRCQPLFSILGFALWSLSGVP	767751	770193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_767836_768024_768527_768610_768865_769412_769653_769740
667275	contig_3153_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_104671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTCAGTTGGATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208249	206375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_206400_208200
667296	scaffold_6394_pilon	+	1143	8	Intergenic	novelGene_110991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	325.062568545484	29	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	30	1043	398216	406119	FALSE	20	CATAGTTTTGATTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398186	406219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
667298	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_97235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667304	contig_12019_pilon	+	2751	15	Intergenic	novelGene_87724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	58.7849765619393	207	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	257	1972	606598	620414	FALSE	10	TTCCACCTGAGTTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGLQTVTLSDGTTAYIQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVAVQKESLSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPKEGYDPSALEAVQLEDGSTAYIHHPVAMPSDSTILAVQAEVGLEDLAAEDDEGFSADTVVALEQYASKVLHDSQAPHNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFRCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQVTLITQDGAQQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	586961	621193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_587035_594436_594524_606501_606671_611574_611656_611769_611848_613067_613268_615363_615481_615814_615891_616485_616612_616741_616922_617737_617972_618078_618243_618950_619119_619648_619763_620309
667313	contig_7457_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_31707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAACAGCTGGCTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174802	1174119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174100_1174800
667326	contig_7359_pilon	+	2438	12	Intergenic	novelGene_139877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	21.7343084842664	4	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	929	1318	417818	423877	TRUE	35	ATAAGGCGTGCCAATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQFCC	402234	425119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_403997_404119_411146_411253_414157_414262_415308_415532_416422_416514_416691_416765_417644_417859_421711_421917_423580_423713_423865_424070_424191
667327	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667352	contig_8878_pilon	-	1337	5	Intergenic	novelGene_147869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_4	222.241282168728	364	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	76	549	231110	228630	FALSE	45	TCAAATAACCTAAGCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQVCFLIYKVMIVR	231712	227841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231121_231647
667353	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_93907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGGCTTCTGCTGTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
667362	contig_1516_pilon	+	2124	11	Intergenic	novelGene_49976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1089.74450675376	2	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	88	1323	347241	362233	TRUE	25	ACAGCTGAAGCACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGGLVQVLQWGHNRPHQVWQVCSPGGQVPPPRPHHCCDPEPPDSSSGPPVPRHLPRAV	335194	363721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356174_356372_356452_360071_360125_362116_362299_362985
667367	contig_5217_pilon	+	3050	19	Intergenic	novelGene_135722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_10	35.9004109471304	184	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	391	2124	301848	307662	FALSE	20	GAATGTGTCTATTGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEVGVLLPADVSPSHLPRCVHRWEQVVDLTYSHRLGSKPQPAEPYTEAVQRLLYVPPTWTYECDEDLIHFLYDHLGKEDENLGSVKQYVESIDVSSYTEEFNVSCLTDSNADTYWESDGSQCQHWVRLTMKKGTIVKKLLLTVDTTDDNFMPKRVVVYGGEGDNLKKLSDVSIDETLIGDVCVLEDMTVHLPIIEIRIVECRDDGIDVRLRGVKIKSSRQRELGLNADLFQPTSLVRYPRLEGTDPEVLYRRAVLLQRFIKILDSVLHHLVPAWDHTLGTFSEIKQVKQFLLLSRQRPSLVAQCLRDSESSKPSFMPRLYINRRLAMEHRACPSRDPACKNAVFTQVYEGLKPSDKYEKPLDYRWPMRYDQWWECKFIAEGIIDQGGGFRDSLADMSEELCPSSADTPVPLPFFVRTANQGNGTGEARDMYVPNPSCRDFAKYEWIGQLMGAALRGKEFLVLALPGFVWKQLSGEEVSWSKDFPAVDSVLVKLLEVMEGMDKETFEFKFGKELTFTTVLSDQQVVELIPGGAGIVVGYEDRSRFIQLVQKARLEESKEQLAAMQAGLLKVVPQAVLDLLTWQELEKKVCGDPEVTVDALRKLTRFEDFEPSDTRVQYFWEALNNFTNEDRSRFLRFVTGRSRLPARIYIYPDKLGYETTDALPESSTCSSTLFLPHYASAKVCEEKLRYAAYNCVAIDTDMSPWEE	301092	308588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_301254_301331_301468_301754_301871_301956_302071_302213_302297_302734_302901_303129_303212_303808_303992_304118_304172_304336_304402_304563_304668_304921_305042_305157_305248_306232_306440_306715_306846_306944_307020_307141_307224_307332_307405_307577
667370	contig_10377_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_115409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACAGATTGAACTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248683	250591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_248700_250600
667378	contig_9290_pilon	-	1624	11	Intergenic	novelGene_77541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.688571721561	1	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	407	1285	486144	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497059	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486151_487529_487609_489998_490037_491390_491545_496930
667393	contig_8452_pilon	+	2078	3	Intergenic	novelGene_48035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	73	912	432928	433820	FALSE	0	TGCTTGGTTTTCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLD	423957	434986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_433766_433818
667394	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667398	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667415	contig_9582_pilon	-	3217	12	Intergenic	novelGene_106854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_9	12.8404062652959	348	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	54	1568	828141	771024	FALSE	5	GGCTCCTTCGTGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPVVGQELQAGVAVGMSTGRPEPGPEGLSRHHGALASDHQPPPTAPVSWSLPRWRAYVAAAVLCYINLLNYMNWFIIAGVLLDVQKCFQISDSNVGLLQTVFIGCLLLSAPVFGYLGDRHSRKAMLSFGILLWSGAGFSSSFISPQYSWLFFLSRGIVGAGTASYSTIAPTILGDLFVKDQRTRVLAIFYIFIPVGSGLGYVLGSAVTELTRNWRWALRIMPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDSLIFGALTVVTGIIGVILGAEAARRFKKVNPRAEPLICASSLLATALCLYLALVLVPTTLLPFYVFLALGELLLSCNWAVVADILLSVVVPRCRGTAEALQITVGHVLGDASSPYLTGLLSSALRAGRPDSYLQHFLSLQQSFLCCAFVITLGGGCFLLTALYLERDQAQAGQPGTGTSDSKDVESQGLLSGAEGPLEGP	828194	769374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_771098_772219_772392_772508_772608_782168_782235_808680_808871_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817393_817921_818059_824373_824440_827951
667421	contig_14513_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_70397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	138	302	18880	12143	FALSE	10	GGCAGTGCGCAGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19017	11667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
667429	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667436	contig_14530_pilon	-	2759	1	Intergenic	novelGene_108447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAGAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15969	13210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_13200_16000
667439	contig_19564_pilon	-	1077	2	Intergenic	novelGene_29618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	54	374	13097	12070	FALSE	60	AGCCAAAAATAAATGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNRRGGLRQSPITSGFSAPSAFFFNCPFLLPQNLHFLPLSPPPPLPLRGF	13150	11366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12218_12924
667448	contig_19737_pilon	-	2499	2	Intergenic	novelGene_158973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTGCACCACTGATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48797	46004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_47280_47573
667450	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667453	contig_10436_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_108504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAGCTGAACTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103411	101603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
667454	contig_8879_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_158995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385817	387301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_385800_387300
667457	contig_12019_pilon	+	824	6	Intergenic	novelGene_87794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1273.73915697053	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	390	791	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	765231	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_765486_765558_765687_765772_765922_766639_766813_767133
667459	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_17694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667465	contig_14514_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_137448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	60.0057288931649	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTAGATGATCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8382	36308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_8430_24699_24764_30105_30203_34833_35470_35586
667469	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667482	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91679	1	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
667492	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
667496	contig_9668_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_58136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	304	621	292409	292092	NA	20	CCTGGGTTACAGTAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVSEVGISYYHFTLFSIGKQIEIRDFFEVVLQCPFSNSLGVKRHLQWRQRLDSKLQCPVTSFVGVNRKLRQQQRQKLSILDLKSLNQVLKLSNSSVIIRGYTL	292712	290926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_290900_292700
667503	contig_11631_pilon	+	2243	5	Intergenic	novelGene_104185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_4	38.0353454039792	1015	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	434	979	100987	105478	FALSE	20	CCACAGCCCCATGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRFLTSQQLFKLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGLRILFRMYTDEGRASAWEEVQHRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKISDNRFKAHASFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQC	99057	106742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_99443_100938_101108_102544_102684_103717_103836_105310
667507	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_18673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTCCATGGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
667511	contig_10923_pilon	+	1731	11	Intergenic	novelGene_66203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	776.749515609762	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	42	491	21667	29438	TRUE	50	TAAAGAGCAAACTGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAHSVGSPFLGTGINMDLFQSVGQETTSLVMTSFSGTRSWRRNRTIPTVYSRL	13837	42817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23106_26049_26116_29348_29579_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37395_37540_38578_38742_42554
667514	contig_3745_pilon	+	2735	4	Intergenic	novelGene_85080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	16.8588914885357	1	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTGTAAACTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364257	372811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_368691_368991_369179_369328_370637
667520	SIRV5	-	330	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTATTTGACCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
667521	contig_4924_pilon	+	2409	2	Intergenic	novelGene_84772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243264	251760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_244150_250236
667530	contig_13412_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_80022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACAAGTTCTAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517794	519672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_517800_519700
667535	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667538	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667540	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667543	contig_15787_pilon	+	2076	1	Intergenic	novelGene_143985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACTTTCACCTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76798	78874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_76800_78900
667546	contig_8616_pilon	+	1460	10	Intergenic	novelGene_72553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	64	1377	425778	436516	FALSE	10	TGTCCTGCCTTCTTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425714	436599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
667559	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667562	contig_10354_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_50873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475054	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_475100_476500
667563	contig_15327_pilon	-	1514	9	Intergenic	novelGene_70725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.636479911511	29	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	30	824	967479	960518	TRUE	25	GATCTGTTTGCTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967508	959517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_959864_960173_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
667566	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667570	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667591	contig_18869_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_56002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTGTTCAGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
667603	contig_9919_pilon	-	2350	14	Intergenic	novelGene_137993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	78.3290737018015	324	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	49	1332	866377	850569	TRUE	25	TATGTCTTACTGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRKATGGGSLGRTLIRRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILLNGIPKKQVNRGAGETNTAESENSDFDEAGIPYDETERLPGRGSPSLSEGASSDEDDSEYEDCQEEEEEDWQTCSEEDSNFEESRGQDWKKSCTVDSDTQDRRTPQKRQTHNFSHLVSKQELLEIFKQLHTGKTVKDGQLTVGLVGYPNVGKSSTINTILGNKKVSVSATPGHTKHFQPL	866425	834858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026_843107_845428_845553_850459_850578_850743_850846_853096_853511_855898_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
667610	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_96890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667617	contig_12644_pilon	+	1139	8	Intergenic	novelGene_44674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4935.17421068354	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	388	1050	2678073	2680545	FALSE	20	ATGTGTTGGAGTGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2676935	2680634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677026_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678824_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
667626	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667661	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667668	SIRV7	+	273	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147684	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
667671	contig_15304_pilon	-	1005	3	Intergenic	novelGene_30449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	138	962	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54237	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
667678	contig_14450_pilon	-	1985	7	Intergenic	novelGene_48982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	435.969959464589	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	149	1300	1310917	1042825	TRUE	80	AGAAAAAAAAAAAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRTPTVNPPYSFSCLIFMAIEDSPTKRLPVKEIYNWILEHFPYFANAPTGWKNSVRHNLSLNKCFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQDPDIDAATAMMLLNTPPEIQAGFPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1311065	1041627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042080_1042591_1043375_1065853_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
667686	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667688	contig_12603_pilon	-	1238	7	Intergenic	novelGene_105793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	250.452534868829	1377	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	283	924	587941	577174	FALSE	20	CAGGTGAGGATTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGICCGKEILIFRSYVRCLSLDHRYPLTNYTFGTKEPLYEKDSSVAARFQRMREEFDKIGMRRTVEGVLIVHEHRLPHVLLLQLGTTFFKLPGGELNPGEDEVEGLKRLMTEILGRQDGVLQDWVIDDCIGNWWRPNFEPPQYPYIPAHITKPKEHKKLFLVQLQEKALFAVPKNYKLVAAPLFELYDNAPGYGPIISSLPQLLSRFNFIYN	591059	576859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_577196_578477_578593_579305_579382_582716_582807_586750_586815_587666_587979_590814
667693	contig_233_pilon	-	931	5	Intergenic	novelGene_14543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1413.1596689688	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	129	491	91606	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSDRGVVEGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	94768	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92169_94740
667696	contig_7230_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_52559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	245	547	140070	140372	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLHQTQSSTNRWCLATTTDCSDRDHNGGSWTELQKNVEQNSNSKKKETRFTGLTRDWRNTESMDPVRSFSSVMKLLLRFTLHPKIRKVYKTKQD	139825	141422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_139800_141400
667704	SIRV4	+	175	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1592	636	1137	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2592	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
667710	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667714	contig_5954_pilon	-	1887	10	Intergenic	novelGene_28740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	227.562174382907	360	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	25	1548	1258441	1249935	FALSE	90	AGAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKGSGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1258465	1249595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1254060_1254319_1254916_1255079_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369
667717	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667721	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667722	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667723	contig_8907_pilon	-	824	5	Intergenic	novelGene_85810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	9	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179867	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178749_179100_179544_179839
667724	contig_20890_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_147049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTTTGTGATGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37714	36247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_36200_37700
667726	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667727	contig_10496_pilon	-	1928	10	Intergenic	novelGene_59424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	123.996415718807	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	944	1576	47882	38747	FALSE	30	TCTAGAAAGTTAAGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	56288	38394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50572_50705_50736_52473_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170
667728	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667729	contig_11056_pilon	+	1761	8	Intergenic	novelGene_130362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	153.605644028958	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	227	973	347973	369990	FALSE	25	ATAATGTAGAGTCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDEDVKMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPITQTEVQQGQQQFSQFTDGQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294514	370778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_347924_347997_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_368561_368622_369870
667730	contig_15087_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_37240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAATGGGGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174387	172608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_172600_174400
667731	contig_7056_pilon	+	3054	4	Intergenic	novelGene_43601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	103.383858615464	192	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2405	2842	718292	718729	FALSE	30	TGGTGCAGAAAATGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQRAGPPILPQASAGVRQLPHSAPAALLLHRLLRTTLTSILQEWAEAALEQCQTLCISGKHQGFGKFIVSPRESRERIKSSPGLLALRKVTQWNWKLGASPFCIVWSYLFWIETLLSLCYITGFVQMELHGFATIIILNISED	706592	718941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_708832_714542_714592_716858_716937_718253
667737	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667742	contig_8658_pilon	-	1165	5	Intergenic	novelGene_55811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	1167.68403260471	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	62	814	55624	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISREVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55685	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_55528
667745	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667746	contig_17440_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_7605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGAATTCCGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
667747	contig_7171_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_101206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGGCTGCTAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57531	55428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_55400_57500
667749	contig_17432_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_159013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108341	108063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_108100_108300
667750	contig_12873_pilon	+	1946	4	Intergenic	novelGene_27224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2397	junction_1	433.996159737234	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	620	1375	17632	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	17012	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_18014_18984_19264_19611_19703_19851
667751	contig_6589_pilon	+	1824	16	Intergenic	novelGene_25721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	68.5009651189107	1	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	88	852	460735	478086	TRUE	25	TGATCTGGAGGAGTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVEEAVLHPSSGHPYLCWLWCPPGQV	451703	509756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_467000_467196_470064_470142_474991_475059_478009_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483961_490437_490525_505399_505459_506884_507045_509406
667762	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667763	contig_14441_pilon	+	764	3	Intergenic	novelGene_100712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	116728	117610	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116576	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
667764	contig_19098_pilon	+	2689	15	Intergenic	novelGene_65850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	27	junction_14	73.3304305238714	552	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	20	2245	445644	477552	FALSE	15	ATATTTGCTCATTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVERTDELVREYLLFRGFTHTLRQLDAEIKADKEKGFRVDKIVEQLQQLMQVYDLAALRDYWSYLERRLFSRLEDIYRPTINKLKTSLFRFYLVYTIQTNRSDKAQEFFAKQAAELQNQAEWKDWFALPFLPSPDTNPTFATYFSRQWADTFIVSLHNFLSVLLQCMPVPVILSFDAECQRTNQVQEENEVLRQKLFALQAEIHRLKKEEQQAEEDEALVQHKLPSYVSSMDRLGDSELAMVCSQRSAALSQSPRVGFLSSLLPQSKKSPSRLSAAQAPPQAQSTAKREATVSQAAKGKDPASGAKDGKGLFSGLAAGESSWPQYRQRRLQDHGKERKELLSTTTSQAAWQSAEKKPEMGGTETEPGPEPVEVPMRGPEGSRPEQPFIVLGQEEYGEHHSSIMHCRVDCSGRRVASLDVDGVIKVWSFNPIMQTKASSISKSPLLSLEWATKRDRLLLLGSGVGTVRLYDTEAKKNLCEININDDMPRILSLACSPNGASFVCSAAAPSLTSQVDMSAPDIGSRGVNQVPGKLLLWDTKTMKQQLQFSLDPEPIAINCTAFNHNGNLLVTGAADGVIRLFDMQQHECAMSWRAHCGEVCSVEFSYDENTVYSIGEDGKFIQWDIHKSGLKVSESSLPADATGPFVLSGYSGYKQVQAPRGRLFAFDSEGRYMLTCSATGGVIYKLGGEEKVLESCLSLGGHRAPVVTVDWSTAMDCGTCLTASMDGKIKLTTLLAHKL	445624	477996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_445767_447666_447847_448381_448589_450244_450329_451485_451617_452513_452680_459110_459270_460418_460595_461612_461764_464097_464193_464354_464524_468886_468996_470207_470321_472101_472300_477387
667765	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667775	contig_11720_pilon	-	2182	6	Intergenic	novelGene_43964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1355	1825	266214	264001	TRUE	10	TGAGTGCGGGAGCGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMRNPKKASSFLNPRGVVEVADLAQVLACHHAQPGCQSLAEQAQHRGPHQYPEQLWGRQGALQPEGPVLGSPSRWYCLIRTFLGRGWRDGARRPPPTQTPHPLQGLPGDPFLAHLELNAFSLELHPCRPPWRNEQTEGLHTLYPHDPPPQPPGPN	268926	262263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_262356_262914_263051_263871_264422_266164_266238_266451_266608_267751
667776	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	63	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667777	contig_15063_pilon	+	1691	7	Intergenic	novelGene_10392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3677.25655965906	3	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	237	1328	34808	38987	TRUE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27132	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
667782	contig_6589_pilon	-	2015	13	Intergenic	novelGene_26267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_10	51.4394871021605	92	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1500	1958	2228821	2227865	FALSE	15	CAAGCTTGGCCAGCGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHLTAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233721	2227807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
667793	SIRV7	-	922	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	36	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78840_78966_114680_114961_147608
667794	contig_8616_pilon	+	1247	5	Intergenic	novelGene_72473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_3	497.046967096672	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	358	831	320431	323904	FALSE	30	CCCTGAGAAATGCAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVSMGAGERFH	318051	324320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789
667797	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667802	contig_12050_pilon	+	1493	11	Intergenic	novelGene_62631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_6	223.109860830937	814	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	77	973	357478	363452	FALSE	5	GCCCTCTGTCTGTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAERAVLEEEFRWLLHDEVHAVLRQLQDILKEASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKQTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	357401	363972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360847_362033_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
667804	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667808	contig_19769_pilon	+	781	6	Intergenic	novelGene_102273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1462.15192097128	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	32	556	87249	88911	TRUE	10	TTGTTCTCCTGCCACTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAPEGRPCLPQV	86998	89342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88033_88878_88958_89163
667809	contig_6837_pilon	+	1864	10	Intergenic	novelGene_149844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	24.9686222840875	157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	27	1349	146184	183609	FALSE	5	TCCTGTAGTTGGCCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REAESGWEMMADEEEEVKQILQKLQELVDQLYSFRDCYFETHSVEDAGRKQQDVREEMEKTLRLMEEVAGSVQGKARVLMLTGKALNVTPDYSLRAEELLSKAVKLEPELVEAWNQLGEVYWKKGDVAAAHTCFSGALTHCKNKVSLQNLSMVLRQLRTDTGDEHSRYVMDSVRQAKLAVQMDVHDGRSWYILGNAYLSLYFNTGQSPKISQQALSAYAQAEKVDRTASSNPDLHLNRATLHKYEESYREALEGFSRAAALDPAWPEPLQREQQLLEFLDRLTSLLESKGKVKTKKLQSMLGSLRPAHLGPCGDGRYQSASGQKVTLELKPLSVLQPGVNSGAVVLGKVVFSLTTEEKVPFTFGLVDSDGPCYAVMVYNMVQSWGVLIGDSVAIPEPNLRLHRIQHKGKDYSFPSVRVETPLLLVVNGKPQGSSSQAAATVASRPQCE	146157	184124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_146235_149729_149863_150907_151120_151543_151695_152093_152186_154954_155012_155503_155651_155824_156040_181248_181394_183489
667814	contig_1836_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_71063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924327	926693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_924300_926700
667831	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_17687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27857	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667832	contig_13004_pilon	-	1597	8	Intergenic	novelGene_112691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	31.4227267292646	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	147	782	832347	819670	FALSE	35	GTTACTTGATAGAAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGRHGGSSRGRQLRNDISEIGRSAKSYCEHTARTQPTLSDIVVTLVEMGFNVDTLPAYAKRSQRMVITAPPVTNQPVTPKALTAGQNRPHPPHIPNHFPEFPDPHTYIKTPTYREPVSDYQVLREKAASQRRDVERALTRFMAKTGETQSLFKDDVSTFPLIAARPFTIPYLTALLPSELEMQQMEETDSSEQDEQTDTENLPLHISTDDSGAEKENTSVLQQNTSLSGNRNGEENIIDNPYLRPVKKPKIRRKKSLS	836497	818854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_819683_819974_820115_827778_827922_829552_829701_830675_830801_831944_832008_832343_832443_836446
667833	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667836	contig_14508_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_79061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGAGACAAAGATGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95187	92801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_92800_95200
667837	contig_14508_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_79060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCCTCCTCTTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92801	92014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_92000_92800
667852	contig_11337_pilon	-	2310	15	Intergenic	novelGene_107185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_6	136.646814967698	311	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	43	1110	220072	196353	TRUE	25	GATTGCTTTGATTTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKVSQIEEIDTDVVMKLADQMRMLNFPQWFDLLKDIFSKFIIFLQRVKATLNIIHSVVLSVLDKNQRTRELEEEISQGKNAAKDNSLDTEVAYLIHEGMFISDAFTEGELTPTAVDATSQRNASPNSEPCSSDSVSEPECTTDSSSSKEQTSSSVTPGGVDIMVSEDMKLTDLELGKLANNIQELLYSASDICHDRAVKFLMSRAKDGFLEKLNSTEFITLSRLMETFILDTEQICGRKSMSLLGALQSQANKFVNRFHEERKTKLSLLLDNERWKQADVPAEFQDLVDSISGGKITLPEKKSGATEERRPAEVLIVEGQQYAVVGTVLLLIRIILEYCQCVDNIPSVTTDMLTRLSDLLKVLNMTEAS	220114	174259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_174892_181343_181439_183804_183913_194769_194851_194963_195086_195654_195743_196278_196380_196641_196748_199470_199535_207832_207946_208725_208908_209561_209692_212683_213028_217853_217951_220067
667859	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667862	contig_7045_pilon	+	1989	7	Intergenic	novelGene_77451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	276.028631767713	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	28	840	323324	364311	TRUE	20	CCATTAGCATATTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRERGVGGMSAFSEAALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEVRNLFLL	323296	365682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364701_364922
667863	contig_10479_pilon	-	2470	4	Intergenic	novelGene_147111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTCCCTGGGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157258	128801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_128856_134282_134408_135146_135483_155303
667874	contig_3825_pilon	+	1097	8	Intergenic	novelGene_77919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1326.44636498566	30	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTGGGGGTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12209	15689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13433_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
667876	contig_3822_pilon	-	1902	2	Intergenic	novelGene_133324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_1	0	244	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	218	568	306185	299545	FALSE	85	AAAAGAAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGLCFV	306402	298210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_299696_305985
667878	contig_14322_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_115857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
667887	contig_16666_pilon	-	1065	4	Intergenic	novelGene_61761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	766.601591441082	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	29	436	59688	55761	FALSE	45	AATGCAAACATGGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRACVYNIFQFA	59716	55131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55789_56584_56664_58098_58264_59552
667889	contig_10312_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_159030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATAGCTGTGGTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549743	547617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_547600_549700
667890	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667895	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667897	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
667899	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_96480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667902	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667906	contig_11429_pilon	+	1049	6	Intergenic	novelGene_60444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1039.55113390347	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	110	463	46162	48529	FALSE	40	ATCTGAAAATCGATACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEVVGTRAMGAAGMTVGLEDMDMDMEGPETIAAEARVVMTATLEGITETITTTKMRHAHVM	45382	49485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46584_47457_47552_48443_48530_48899
667907	contig_854_pilon	-	1698	3	Intergenic	novelGene_36165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1302	1628	470426	470100	FALSE	10	CAACTCGTGCCTGGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLSLEVGKHLVMILHHQGSGLVSAGASSRSLAEHLRNSADPSLGDELHLCCPVWPIKGQPGIVEGELGRESGGQRSSPASGTHWLCDFGPLLVVSDPRLPPPPLSG	471921	470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470621_470683_470841_470971
667909	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667910	contig_6710_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_89606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653775	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
667913	contig_12790_pilon	+	1871	8	Intergenic	novelGene_35219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	231.64998227005	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	273	1001	309644	312473	FALSE	15	AAGGGGTGTGGCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305931	313343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
667923	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
667935	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_95706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653851	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
667936	contig_2867_pilon	+	2455	6	Intergenic	novelGene_135230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	12.7906215642556	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1239	1889	1204485	1219398	FALSE	45	CTAAATGAAGTTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVKCDLTAKDMLLALGELAQRDHGALDCCVVVILSHGHQASHRQFPGAVYGTDGYSVSIERIVNIFNGTGCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASASSEDWASGSNPESDAAPFQEGPGSSDQPDAVASLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDTRSGSWYIEILDGVLEQWADSEDLQTLLLRVADAVSEKGIYKQMPGYFNFLRKKLFFKT	1203246	1219964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1204518_1204997_1205088_1208274_1208423_1216965_1217146_1217752_1217863_1219308
667946	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
667950	contig_12270_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_114083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	4	303	14409	13887	FALSE	25	TGAAGATGCCGCAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQ	14412	13884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
667953	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
667964	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
667976	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
667988	contig_5057_pilon	-	1201	4	Intergenic	novelGene_151522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_3	314.308058368785	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	105	605	523430	510939	FALSE	30	GTACAGAGGGAAATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKRSRSDRFYSTRCCGCCHVRTGTIILGTWYMVVNLLMAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLVSVSANKTGSKIHEVKYLNYNSESD	523534	510342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_511140_511243_511321_514151_514273_523328
667993	contig_10732_pilon	-	1517	4	Intergenic	novelGene_114756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_3	26.1916017074176	1939	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	29	709	576361	573306	FALSE	10	TCACGGTCTCCTTCCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGGGGGDMESGAYGAAKAGGSFNLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576389	572497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574129_574368_576262
667995	contig_12923_pilon	-	1807	16	Intergenic	novelGene_30131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	183.495637247562	637	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	925	1767	168895	162599	FALSE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	174782	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169304_169487_169647_170317_170482_172032_172190_172858_172958_174586
667998	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_90354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668002	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_89545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668012	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668017	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668028	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668029	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_14049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	7	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	194	1369	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34614	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
668035	contig_5954_pilon	-	1183	5	Intergenic	novelGene_28644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	596.010224325053	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	165	824	946886	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	959942	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946908_959799
668038	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
668041	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1574	632	1119	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2574	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
668042	contig_15405_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_112096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCTTCATCACCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41074	41591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_41100_41600
668045	contig_5125_pilon	+	2500	8	Intergenic	novelGene_43431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1605.0582035349	1	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	331	1458	35654	58893	FALSE	25	GCCATGTACTGATTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25993	59935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26091_26311_26502_35610_35768_49981_50105_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
668051	contig_6513_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_117756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGTGATAAGAACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105894	106693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_105900_106700
668053	contig_990_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_76009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATATTATTTGCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363693	363279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_363300_363700
668058	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668075	contig_6710_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_98115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	TCGTCCCCCCTTCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668090	contig_10019_pilon	-	2214	20	Intergenic	novelGene_86692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_19	183.278680681207	239	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	620	2164	424619	343818	FALSE	15	GTAAGCCTGGTTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVQKCTIFIVDEDCSDSFSSVFHMECEELEKSSDTLIRERDANKINYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTSENIGHVNQQHIGSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKKEENTGKIKAFNRNDEQFLEAFVIFCGLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETRELQSLAAAVVPSAQTLKITDFNFSDFEMSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFQMKHEVLCSWILSVKKNYRKSVAYHNWRHAFNTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGVNNSYIQRSEHPLAQLYCHSIMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAILATDLALYIKRRGEFFELIRKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAELVATEFFDQGDRERKELNIEPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCFPLLDGCRKNRQKWQALAEQQEKTLINGESSQAKRN	459924	343767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_343956_345993_346078_346820_346896_353291_353356_356540_356619_358653_358755_363543_363632_372728_372824_375233_375360_381408_381556_398218_398279_400566_400743_411377_411466_412900_413010_422404_422473_424571_424710_432453_432544_434548_434621_451982_452266_459840
668097	contig_12079_pilon	+	2979	1	Intergenic	novelGene_67476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAGGCTTACAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600157	603136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_600200_603100
668101	contig_3818_pilon	-	2537	6	Intergenic	novelGene_99290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	22.7543402453246	142	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	152	1432	925321	920089	FALSE	20	TGACTTTTCTATTTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSPTARHQEPVTFEDVAVIFTEEEWRHLVPIQRDLYKEVMLENYRSIVSLGLPVPQPDVIFQLKRGEEAWIVDLRGSEERECPENISLDGETKPEIQDTSEEEISKGTLRERLGSKGPLCPKFEVHVPEDRLETEKENPAVETCKKFFSQEKILQQGSIPPKKIFTKERDQECRDCGKTFFDHSSLIRHQRTHTGEKPYECHECGKVFSHRSSLSRHRMSHTGESPYECNVCGKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFKCSECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECNQCGKAFSQKSILTRHKLIHTGRKPYECNECGKAFYGISSLNRHQKAHTGEPRYQCNECGKAFFDRSPLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFECGVCGKVFSSKSSVIQHQRRYAKQGID	934468	918983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_921096_921605_921720_923957_924085_925288_925360_933841_933918_934431
668102	contig_18869_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_56080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73582	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
668104	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668106	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	22	342	14385	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14406	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668116	contig_13992_pilon	+	1973	8	Intergenic	novelGene_147658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_7	189.34839932392	2012	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	125	844	690047	704020	FALSE	45	TAACTGAATTATTAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACRPRSPPRYGDASPHFPARWSLGRKRRADGKRRKSEDCDPSASPDDHERRRADHRLESFTTPEGPKPRSRCSDWASAVEEDEMRTRVNKEIARYKRKLLINDFGRERKSSSGSSDSKESVSAVPADLETDESVLMRRQKQINYGKNTIAYDRYIKEVPRHLRQPGVHPKTPNKFKKYSRRSWDQQIRLWKVALHFWDPPAEEGCDLQDIHPVDLGEMETESTESSSESQTSSQDNFE	689922	705149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_690091_690257_690393_693546_693652_697446_697507_697804_697943_698839_698990_700379_700462_704014
668119	contig_5690_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_119672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	163	531	171403	171035	NA	45	CTTCTCATACAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTWSFAQHRIENCRVLDIQPFQEVAYDQEPVVLKEEVQAALKVLGKNKAPGIDKIPVEMFQQMDATLEALTCLCQEILKTTTWPTDWKRFVFVPIPKKGDPTECKNYRTVSLILQTSKIC	171565	169333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_169300_171600
668124	contig_4364_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
668128	contig_13456_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_153268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGACAGGCAGTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42698	42400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_42400_42700
668136	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668138	contig_8820_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_79328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437518	437086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_437100_437500
668139	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668142	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668145	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
668146	contig_8377_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_35110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	281	340	162010	161951	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFFQGASDWTQTSNNELFNCLYYPGTPDVTSDNGISSSLSLLSLRATSEAHLTLGLETRDGPLVGVNGLCLTTSQKLGGSNPSNGTTEERPIKMCFHKYYSQENHMELSSTL	162290	160076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_160100_162300
668155	SIRV5	+	396	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-66	875	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8249	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
668159	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
668161	contig_15449_pilon	-	1490	6	Intergenic	novelGene_33663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	118.870686041597	690	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	117	1187	196078	191270	FALSE	15	GAGATGTGGCAGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLPIPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196194	190966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193152_195024_195209_195339_195567_196069
668165	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
668166	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
668167	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668175	contig_6365_pilon	-	2546	4	Intergenic	novelGene_133995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	93.5746879354787	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	161	661	12349	11849	TRUE	45	GTGAACCAATGTAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKGNRGTPSLQPTTSLNRALLWSYLIYPFPTLRLSSHNNGETSNVNQFTIYVFPFSVMSIDVFWKVYFGFIKEQKAEKK	17687	9730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_12368_17459_17529_17614
668176	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668178	contig_14322_pilon	-	467	2	Intergenic	novelGene_115711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671897	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
668184	contig_15456_pilon	+	1391	4	Intergenic	novelGene_139505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	751	junction_1	372.157971237424	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	76	375	131507	142098	FALSE	30	AATTAATTTGCATTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCEKCEKKLGTVITPDTWKDGARNTTESGGRKLNENKALTSKKARFDPYGKNKFSTCRICKSSVHQPGSHYCQGCAYKKGTFLLIPFFYSHQTCFIQC	131431	143114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_137564_137620_141935
668193	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_97217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668201	contig_5031_pilon	+	2851	1	Intergenic	novelGene_133200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55694	58545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_55700_58500
668204	SIRV2	-	227	2	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-1029	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTATGGTGTCATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4801_5790
668206	contig_14925_pilon	-	1435	5	Intergenic	novelGene_55187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_4	1475.88894822747	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	264	902	103374	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	103637	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_103145
668215	contig_5728_pilon	+	1724	2	Intergenic	novelGene_126702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATCGAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346489	351687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_346874_350347
668217	contig_4900_pilon	+	2176	9	Intergenic	novelGene_159046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	32.8193445242284	101	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	309	1304	523110	550942	FALSE	30	CTACCCCATGCAGCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHKAEEFFSRVTDSEMDEMDTSDTQWGWFYLAECGKWHMFQPDTNIQCSVSSEDIEKSFKTNPCGSISFTTSKFSYKIDFAEMKQVNLTTGKQRLVKRAPFSISAFSYICENEAIPMPPHWENVNTEVPYQLIPLHSQTHEYNEVASLFGKTMDRNRIKRIQRIQNLDLWEFFCRKKAQLKKKRGVPQINEQMLFHGTSSEFVEAICIHNFDWRINGIHGALFGKGTYFARDAAYSSRFCKDDIKHGNTFQIHGVSFQQRHLFRTCKSMFLARVLIGDYINGDSKYMRPPSKDGSYVNLYDSCVDDTWNPKIFVVFDANQIYPEYLIDFH	496234	551814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_496420_521434_521547_523098_523236_524545_524667_530162_530239_538771_538845_538928_539060_549072_549225_550625
668230	contig_990_pilon	+	2569	11	Intergenic	novelGene_76107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	132.309674627368	160	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	273	1316	1394324	1426527	FALSE	15	TCAATTAGTTGGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSGKKTFSSEEEEANYWKDLAMTYKQRAENTQEELREFQEGSREYEAELETQLQQMETRNRDLLSENNRLRLELESIKEKFEMQHSEGYRQISALEDDLAQTKAIKDQLQKYIRELEQANDDLERAKRATIMSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKENLLESVQRLKDEARDLRQELAVQQKQEKPRTPMASAVEAERTDTAVQATGSMPSTPIAHRGLGSTFNTPGTFRRGLDDSTGGTPLTPAARISALNIVGDLLRKVGALESKLASCRNFVYDQSPNRTSGPPSGWGSKNRDSIDKRTSSTSVPLGDKELGKRLEFGKSPSNISSPSLPSAQGVVKMLL	1384847	1427780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1384889_1389389_1389501_1393808_1393887_1394281_1394410_1398793_1398948_1403513_1403663_1420070_1420208_1421750_1421931_1423458_1423551_1425254_1425407_1426433
668231	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
668235	contig_233_pilon	-	1531	11	Intergenic	novelGene_14669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1341.8082426338	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	144	1091	108727	91657	TRUE	20	TCCAGCATGGGACGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEQSASSLRTPATWSSSSKMPTTLLLPAAPVPSA	109971	78511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78612_78984_79142_91473_91694_99779_99842_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
668240	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668257	contig_15304_pilon	-	1040	3	Intergenic	novelGene_30508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	176	1000	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54275	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
668258	contig_11832_pilon	-	2069	14	Intergenic	novelGene_106933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_13	907.11889971759	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	964	1620	86997	84249	FALSE	10	CATGAGTGTGTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92499	83799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
668260	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_89253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
668262	contig_20116_pilon	-	2592	4	Intergenic	novelGene_159080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.5685424949238	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	240	1394	7632	6478	TRUE	20	GCAGGCAGTGTTGTCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLLMRSQPYRLCSVRKMLPTPKYRPFLACFTYTTDGQSNKENKRTVEKLCKFSVDIRKIRRLKGWVLLEGDTYTEEIVNILQELGADETAIASILERCPEAIVYSPATVNTQKELWQLLCKNEEELVKLIEQFPESFFTVKDQENQKLNVQFFQELGLKNVIISRFLTTAPNIFQNPVEKNKQMIRILQESYLNLGGSEVNMKVWLLKLLSQNPFILLNSSASIKETLECLQEQGFTDSEILQLLSKLKGFLFQLCPRSLQNSISFSKNAFKCTDHDLKQLVLKCPALLYYSVPVLEERIQGLLKEGISIPQIKETPMVLELTPQIVQYRIRKLNSLGYRIKDGHLANLNGTKKEFEANFGKIQAKKGRPLFNPVAPLNVEE	15717	5232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_5512_5558_7691_12696_12821_15660
668271	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
668276	contig_19851_pilon	+	975	7	Intergenic	novelGene_29847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3181.21203317226	1	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	174	689	53637	56177	TRUE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006_56302_56369
668298	contig_8020_pilon	+	2574	9	Intergenic	novelGene_114392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	940	1353	147966	149145	TRUE	10	TCCAGGGCTGAGCTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGKVATTVSPGAMWREDFESDHLDDNLSVQCVGVTIGFWSGTRSCLWCRRGRTERQELPSCSSGNSSSKGLCHLFSSPYLFHLSEDPQQIFTKDTLKFPLTPATSQKLLYQHRVCGHILQPLSTGRPRRNHYQSR	147026	153296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_148204_148296_148433_149105_149185_149828_149917_150258_150433_150547_150621_150904_151044_151127_151708_153168
668300	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668302	scaffold_880_pilon	+	2337	10	Intergenic	novelGene_121397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAATTCAGCATCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271356	298370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_271880_272250_272381_275216_275286_275388_275458_277109_277160_281388_281446_286467_286511_289337_289431_291222_291266_297110
668313	contig_12270_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_114073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	27	335	14409	13878	FALSE	20	CGCAGTTTATTACTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14435	13875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668314	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668320	contig_9468_pilon	+	1008	7	Intergenic	novelGene_59505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_6	194.559688070839	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	157	708	355153	356943	FALSE	30	CAAAAACTTAGTCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQEQEEKQKLAEDAEMKSLEEKMGCLLKFSGDLDDQTCREDLHNLFSNHGEIKWIDFVRGAKEGVILFKEKAKEALDKAKDASNGNLQLRNKEVTWEVLEGEVEKAALKKIMEDQQESLNKWKSKGRKFKGKGKGNKVTQAGSAKGKVQFQGKKTKFDSDNECDENGAAGSVKRAREETDREEPASKQQKTENGSGDQ	352161	357243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_352206_354706_354779_355112_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
668321	contig_14513_pilon	-	1199	5	Intergenic	novelGene_70321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	198	773	18880	11714	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSPSRVYFFYHVIIDNLKLLDKLRKPYFVTATRNSTTTQGQSRGVTHGSLEYRFLF	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11877_11985_12158_13087_13136_14952_15001_18735
668338	contig_10494_pilon	-	2192	13	Intergenic	novelGene_102134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	446	787	438255	405726	TRUE	10	CTGCGCAGGCGCTGCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEAAETVGAGVGVCESEGALCHLTGSGWPRAPAASQAAWRAAGSQLSVQQQYGQSLVPAGHTGPGCHCPGEVTHRHLLRWGPMRPQQSAGHPAAPAHPVQHDVSVGCPRCPA	438700	344565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_344645_361705_361857_366492_366587_369321_369523_379613_379732_381404_381579_393359_393602_396402_396565_403609_403746_405677_405741_408170_408209_437782_437927_438110
668347	contig_10861_pilon	+	1407	10	Intergenic	novelGene_39323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGCCGCCCCCGCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489330	1493799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1489721_1489941_1490213_1490299_1490471_1490574_1490674_1490750_1490826_1490957_1491032_1491110_1491155_1491637_1491707_1492088_1492224_1493720
668349	contig_12120_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_21444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTGAGTAGCGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250818	251619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_250800_251600
668355	contig_20670_pilon	+	2696	5	Intergenic	novelGene_144827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	40.5670740872447	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	956	1501	23598	27158	FALSE	20	AATGCTAATTTGTCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMVAINLIVQHIQDILNGDICKWHRGGSNGRSYKRTFSEPGDHPGVLTSGKRSHLESSSRPH	22642	28353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_23675_23884_24028_24115_24211_26468_26518_26976
668357	contig_3942_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_128711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1171	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	684	983	429508	429999	FALSE	20	CTGAGAGGCCTCAACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQVSWAGSSGIRWVGGESPSRTPTHSCPLQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	428824	430229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_429607_429798
668362	contig_15039_pilon	-	1935	6	Intergenic	novelGene_110146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_5	489.213000644913	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	623	1309	202841	185257	FALSE	10	GCTGTTTGCATTTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	203463	184630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795
668370	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668374	contig_6710_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_97892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	35	CTTTAATCATACTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668383	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	311	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668385	contig_8273_pilon	+	3440	13	Intergenic	novelGene_113085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	2807	3439	186302	195284	FALSE	30	CAGGGCCCAGCAGAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSAVIHGLPQGSQFGLAVAAGAQGGRGCLRQVSPLGQNLLQGQDITLLLLWLSEQFAEHIPVSVGCSLAVRVHITLGGCRNSIPVHGSYQGISATLQQQTNQLKISYSGCELEGRFRVVLLTMFHRPFHLRPGVQQELNYRNMSMQHSKSQSRPMAGLGVDGWIFMRSTDNLHIQVSSGIQQHLNHCLVPTDAGVHQGGHALRSLMVLIP	133766	195285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_135881_141453_141568_145017_145094_153681_153761_156320_156422_163704_163811_184228_184406_186262_186488_187217_187351_187464_187562_189480_189579_191932_192030_195262
668395	contig_13954_pilon	+	2159	8	Intergenic	novelGene_130054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	71.0673724614287	529	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	41	1381	60851	89637	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKINDNAEAGWTLGYMLNLTNMIPAELPQPKPFSRPTYISLMVAFSLVLAIVFILGSIIFHKSSYFQK	60810	90415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_89436
668401	contig_1443_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_28179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	119	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1	411	344884	344474	TRUE	20	GAGCTGCCCATGTAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRFYCLEYSAAKLGKVSNLKIWRPGPFFASFLLPSFKTHRDPKERKIISLCPNSYLANSSNTFLLPSVGTRESNRRKEKAEEIITEPVPSEGKSDRKFKRSYLSAQEPNDREGLSAEGGHRQQRRTCTGQHCCSCS	344884	343652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_343741_344118
668403	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668407	contig_2310_pilon	+	1590	11	Intergenic	novelGene_71594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_7	245.920088646698	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	58	1425	106097	134479	FALSE	15	GCCAGATTTGTCGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGDDYESEAAYDPYAYPGDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106039	134644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
668411	contig_5551_pilon	-	1506	3	Intergenic	novelGene_134270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	29.5	831	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	25	411	649761	641997	FALSE	5	CTCTGAGTGTTTTCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTLTADKMAASILGSLLRTVRQMVPLSASGQVRGYYVDWKMLRDVKRRKMAYEYADERLRINSLRKNTILPKDLREVADEEIAALPRDSCPVRIRNRCVMTSRPRGVKRRWRLSRIVFRHLADHGQLSGVQRAIW	649785	640901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_642180_644974_645134_649716
668415	contig_16098_pilon	-	1966	11	Intergenic	novelGene_45867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_7	44.5156152378017	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1355	1702	247137	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	251629	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250765_251545
668421	contig_8156_pilon	+	1418	7	Intergenic	novelGene_98942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACAATAATAAATACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395324	441459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398544_403289_403537_403887_404006_404667_404810_438156_438289_441186
668422	contig_6102_pilon	+	1916	14	Intergenic	novelGene_31864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.323002235217	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	758	1393	380930	394738	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRT	370752	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_370898_379393_379487_379617_379795_379955_380039_380167_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393828_394730
668426	contig_11846_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_106020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	15	317	540017	540319	NA	55	AAAAAGGCAAGAGTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSCMTPLGKDSWKLVSGFLQTLPHVSFSFADFALYPYTIINFSPDYDDILSPVSPSRESLKVGGGSGAPQQTKYVLDHNGIKLEISNRKICGNLQIFENQLTK	540002	540664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_540000_540700
668458	contig_8122_pilon	-	2288	7	Intergenic	novelGene_40218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	20.0034719208664	55	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	863	1636	417204	410811	FALSE	25	TAGGTACAATTGTGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLLRKTFDLYANVRPCVSIEGYKTPYTDVNIVTIRENTEGEYSGIEHVIVDGVVQSIKLITEQASKRIAEFAFEYARNNHRSNVTAVHKANIMRMSDGLFLQKCREVAENCKDIKFNEMYLDTVCLNMVQDPSQFDVLVMPNLYGDILSDLCAGLIGGLGVTPSGNIGANGVAIFESVHGTAPDIAGKDMANPTALLLSAVMMLRHMGLYDQAAKIEAACFATIKDGKSLTKDLGGNAKCSDFTEEICRRVKDLD	418066	410158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_410895_412594_412748_413862_413948_415255_415321_415463_415567_416413_416548_417054
668467	contig_15327_pilon	-	1779	8	Intergenic	novelGene_70724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	315.747962004831	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	15	779	967479	960518	FALSE	25	GATCTGTTTGCTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPAEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967493	959517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960722_960767_961481_961608_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
668475	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
668481	contig_15063_pilon	+	1195	3	Intergenic	novelGene_14348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
668485	contig_5676_pilon	-	3956	6	Intergenic	novelGene_159088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_2	31.9161401175017	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	142	2085	433802	243969	FALSE	10	TTTCATTAGTTTTTGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLYFWSAQCDIPACLRNDVKGLQLKTSDTTSHKPLKVLDLRRTQAKAMALSLEEFVHSLDLRTLPRVLEIQSGIYFEGSIYEMFGNECCLSTGEVIKIIGLKIKKIIAEICEHIEGCQSSQPFELPMNFPGLFKIVADKTPYLTMEEITRTIHIGPSRLGHPCFYHQKDIKLENFIIKQGEQIMLNSVEEINGEMMVNCGVIRNHQNHSFTLSFSQEGEFYECEDEHIYTLKEIVEWKIPKNRTRTVKLTDFSNKWDTTNPFPKGFYGSLILKPVYEIQGVMKFRKDIVRILPSLDVEVKDITDCYDANWFLQLLSSEDLFEMTSKEFPIVAEVIEGPQGKQLPRNVLQPGKTIVIHKKYQASRILASEIRSNFPKRHFLIPTSYKGKFKRRPREFPTAYDLEIAKSEKEPLHVVATKAFHPPYDELSSVSVGDQFLVHHSQTTEVLCQGTKKVVNVLACEKILKKSYEAALLPLYMEGGFVEVIHDKKQYQVSELCTQFRLPFNVKVSVRDLSIEEDILAATPGLRLEEDITDSYLLISDFANPRECWEIPIGRWTMTVQLVSNLFRDTESFLVRTLVEEITEEQYYMMRRYESSFLHPPPRPPKHPSAVETKSTLLTQTEKRTMDLPKSPKSHRVDISKKPHSNQAGLDSKVPVGCQNDLANLGRERSKSGATAKADTSVTTEISQNEKHQK	433943	242097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_-_244001_258815_258970_346532_347582_369938_370398_394942_395102_433711
668486	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668490	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_95824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668497	contig_10235_pilon	+	1438	5	Intergenic	novelGene_46331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	300.987541270399	71	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	110	472	109120	110311	FALSE	45	AGTGAGAGTCAAACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGRPLRRPVGQASWQKKAKPASFVCLLTSASICGAMSQIRDLQGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKKKYMEFDLNGNGDIDIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKM	109010	111277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_109553_109932_109975_110144
668515	contig_10299_pilon	-	2099	17	Intergenic	novelGene_79724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1435	1740	337017	335997	TRUE	30	TGCCCACACAGAGGCAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKLSGGNLSRKHFPKEAALSRLFCMSGQCSCPAASMHCCTAWVSCPSSWISRRYSSAFWLSFSYSFWASNSSAPGAIEAILKISSLATGDLMQELMAAA	340534	333954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_333999_334455_334565_334643_334758_335904_336029_336181_336263_336731_336865_336957_337102_337396_337539_337702_337836_337922_338030_338118_338219_338301_338415_338730_338809_338904_339075_339156_339253_340014_340122_340230
668518	contig_9468_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_59489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	41	499	319740	320198	NA	65	TAAAAATAAAAATAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGGLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRWKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319699	320253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319700_320300
668522	contig_14142_pilon	-	2285	4	Intergenic	novelGene_120615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_3	40.8357142163028	58	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592295	589686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_590947_591055_591101_591232_592067_592149
668533	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668534	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
668536	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668543	contig_11702_pilon	-	1185	8	Intergenic	novelGene_141957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	101.926343954037	2252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	139	852	319845	289501	FALSE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321162	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
668556	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
668559	contig_2278_pilon	+	2165	1	Intergenic	novelGene_118106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761607	763772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_761600_763800
668568	contig_8587_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_159098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	847	1278	71511	71080	NA	45	AAAAAAAACCCATTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKEGQADIMCFRMEDHTTTYEAVLPKTSSLNLIKPLAPTATSQEIQRAQDGVLSDTKGKQSPSPDGGNLCRTNNWGSAAHCKEEKRDGGNRDFKRDVKDYVKTLSRYKFKQFKKLRHLTDTGNLNTEYLTILRNYGFFQVW	72357	69333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_69300_72400
668579	SIRV1	-	228	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3989	5569	3569	-120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAAGATGTCGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
668586	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
668604	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668626	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_18180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
668637	contig_6710_pilon	+	568	2	Intergenic	novelGene_96569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653366	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657470
668641	contig_7025_pilon	+	2240	4	Intergenic	novelGene_104407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	123.717419953699	110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	166	486	353982	394857	FALSE	60	GAAAGAAAAAAATTAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKV	344053	396611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_344161_353923_354090_362626_362755_394772
668647	contig_1090_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_131100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTGCTGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167801	169493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_167800_169500
668648	contig_14840_pilon	+	2626	12	Intergenic	novelGene_66236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_9	65.8254641877837	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	168	1241	27480	36614	TRUE	35	ATTTTATGGAAGAGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYKPVVIQTYPVLGEKITQDTLYWNNYKTPVQIKEFGAVSKVDFSPQPPYNYAVTASSRIHIYGRYSQEPIKTFSRFKDTAYCATFRQDGKLLVAGSEDGGVQLFDISGRAPLRQFEGHTKAVHTVDFTADKYHVVSGADDYTVKLWDIPNSREILTFKEHSDYVRCGCASKLNPDLFVTGSYDHTVKMFDTRTNESVISVEHGQPVESVLLFPSGGLLVSAGGRYVKVWDILKGGQLLVSLKNHHKTVTCLCLSSSGQRLLSGSLDRKVKVYSTASYKVVHSFDYAASILSLALAHEDETIVVGMTNGILSVKHRKSEAKKDASSRRRRPAYRTFIKGKNYMKQRVFVYFCLFF	22524	38788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_+_22609_27396_27570_28757_28851_28968_29154_30141_30321_31610_31737_33400_33537_35490_35576_36434_37487_37668_37803_37978_38038_38468
668654	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668666	contig_14925_pilon	-	945	4	Intergenic	novelGene_55172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	155	412	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29829	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
668677	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_94874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668678	contig_14925_pilon	-	1005	5	Intergenic	novelGene_55182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	1557.05892630947	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	215	472	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGGSQRNLIFGKGTKLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	79649	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_79587
668687	contig_16310_pilon	-	1978	13	Intergenic	novelGene_70034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1049.29610003829	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	128	1585	66135	56545	FALSE	15	TGCCAGACTTGTGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGRGGFGGRGGHGRGGRGGFGGRGRGGFGGRGGFRGGRGGGGDHKPQGKKTKFE	66262	56151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56622_56971_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62147_64900_64955_66117
668690	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668692	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
668702	contig_8616_pilon	+	1350	9	Intergenic	novelGene_72579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	906.057798584064	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	13	1275	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKPASAVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425765	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427969_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
668703	contig_4951_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_122121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAATCCAACATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24745	26887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_24700_26900
668704	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668705	contig_9345_pilon	-	866	2	Intergenic	novelGene_24593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	1948	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	218	655	945468	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945685	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
668708	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668715	contig_3602_pilon	+	1164	7	Intergenic	novelGene_60506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	382	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	101	550	161745	169451	TRUE	15	TACCTGACTTGGCTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161644	171125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_169808_170867
668722	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668724	contig_14029_pilon	+	3175	10	Intergenic	novelGene_151954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	46	junction_1	75.8757919396505	180	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	276	1256	141999	145191	FALSE	30	ATTTTGGTGAATTTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSPSGNHQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG	136842	147110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_137099_141979_142111_142444_142542_143256_143313_143409_143461_143613_143723_143802_143849_144218_144318_144684_144766_144861
668728	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
668729	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91679	1	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
668734	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671636	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
668741	contig_11720_pilon	-	1730	13	Intergenic	novelGene_43906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.566232756397	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	110	958	124674	117647	FALSE	45	AGAAATTAAAACCCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISQEL	134652	116874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117660_118199_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134579
668743	contig_1406_pilon	-	2059	3	Intergenic	novelGene_25446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	14.5	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	59	1432	585881	484814	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPTRTFGDARPIFSTCSTTGCRSSPPVLPVSCRDPRQLQRLRDKLLSVAEHREIFPNLHRVLPRSWQVLEELHFQPPQAQRLWLSWWDSARLGLQAGLTEDRLQSALSYLHESGKLLYFEDSPALKEHVFHNLTRLIDILNVFFQRDASLLLHKLLLGTSGDGEADGESASLVGLPAPSQDLLRATQLHHYVEGFLLHGLLPAHAIRLLLKPHVQAQQDLQLLLELLEKMGLCYCLNKPKGKPLNGSTAWYKFPCYVQNEVPHAEAWINGTNLAGQSFVAEQLQIEYSFPFTFPPGLFARYSVQINSHVVHRSDGKFQIFAYRGKVPVVVSYRPAKGVLQPDTLSIASHASLPNIWTAWQAITPLLEELNVLLQEWPGLLYTVHILCSKCLKRGSPNPHAFPGELLSQPRPEGVAEIICPKNGSERVNVALVYPPTPTVISPCSKKNVGEKHRNQ	585939	484186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484848_498646_498774_584668
668749	contig_12270_pilon	-	167	2	Intergenic	novelGene_114151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGCGAGCAGCAGCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	14045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668751	contig_7963_pilon	+	1764	3	Intergenic	novelGene_58506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	148.5	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	55	756	145910	149236	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIRVCWVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWGEALVPGSLVLLRGEK	145855	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907
668752	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
668754	scaffold_17907_pilon	+	802	8	Intergenic	novelGene_150756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	159.754275596707	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	18	800	19269	55231	FALSE	20	AGGCAGTGATCCTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGLVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTSDQDTLISGILRVLEKDSEVIVDWRPLDDALDSSSILYARKDSSSVVEWTQAPKERAHRGMEHLNNYEAEWDMVNTVSFKKKPHTNGDAPSHRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQSREGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLIDSLEKYVVLCDSPQDKRTLLVNCQNKSLSQSFENLLDEPAYGLIQAGLLDRRKLLWAIHHWKKIKKDPYTATMVGFSKVTNYIFDSL	19251	55233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_19299_33766_33866_34290_34366_41628_41768_46177_46389_53576_53680_54803_54855_55156
668755	contig_15236_pilon	+	3135	6	Intergenic	novelGene_141527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_5	66.9758165310435	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	84	1454	55474	115394	TRUE	35	TACCCAGCATCAAATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVVEKSLEGPLAPSTDEAAQKTGDLVEILNEDKVKFDDTGLSLILQNGLETLRMENALTDVILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFCNDLKEKREKRIVIKGVDAEIMHTLLDYTYTSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISERTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTRDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELDSENKKWVEFACVTLKNEVYISGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGRWRHKMAVLGGKVYVIGGFDGLQRLNNVETYDPFHNCWSEVEAISMSNFLCISGSKL	55390	119015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_82174_82341_100925_101376_109866_110105_115137_116475_118414
668757	contig_10627_pilon	+	1174	6	Intergenic	novelGene_59926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_5	113.513699613747	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	10	690	105394	109221	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	105384	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108139_108453_108573_108962_109005_109122
668760	contig_17993_pilon	-	2107	7	Intergenic	novelGene_61943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1401	1754	103270	102681	FALSE	75	CTTGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIILGQSFSTRSVIPQLVIVTPTRFLDFNTRTCTWSSSITGSLVLVDLSAIRFRFMAWRGFVLATSRKGKRKIYGSALLSLFQQSTFNCTCTNSNKATPKSTTQFLNEYNRTAISN	114562	102327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_102935_103170_103275_106490_106657_108273_108421_109018_109123_109722_109839_113699
668772	contig_8772_pilon	+	1730	9	Intergenic	novelGene_21105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4663.13206841711	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	120	1460	15355	23150	FALSE	10	ACTCTTGCTGTGTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTLGVAIYYQQE	15235	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_21998_23113
668783	contig_10235_pilon	-	471	2	Intergenic	novelGene_46614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609135	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_608603_608742
668785	contig_8576_pilon	+	1790	7	Intergenic	novelGene_88801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	464.903454732509	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	154	996	902723	916262	FALSE	70	AAACAGCAACAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPS	893657	917056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914243_916257
668788	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	8	340	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14416	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668791	contig_13894_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_62066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	144	1055	287445	286437	FALSE	20	AGGCCCTCACTGATGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQ	288183	286435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
668798	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668815	contig_19342_pilon	+	1240	6	Intergenic	novelGene_41110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.09838667696593	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	360	821	4349	6183	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGASGSDSAQGSYVSLTA	3634	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4246_4365_5016_5293_5413_5534_6133_6186_6353
668816	contig_18869_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_56398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGCATTTATCACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
668818	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668824	SIRV7	-	1643	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	32	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCGTAATTAGTGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114706	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1690_1905_2676_2993_3112_43028_43078_114680
668826	contig_7151_pilon	+	2353	3	Intergenic	novelGene_40695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTATGCAATCTTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17452	41418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_18482_18573_18879_40399
668853	contig_19769_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_102246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	47410	47078	NA	35	GAGATATTTGCACTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLPETSHEAVPGWAGTQVSLGRWCVCFQEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLGEAVRRTPSTGSSAPTCPDLLGHRGLALRRSGAKWALGA	47412	47003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_47000_47400
668855	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
668858	contig_2114_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_104244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	412	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159700	158050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_158000_159700
668861	contig_7051_pilon	-	1786	9	Intergenic	novelGene_64342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAGAACAAGACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347607	321861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_330163_331794_331924_334316_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338836_345519_345538_346863
668862	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
668876	contig_3818_pilon	+	1716	13	Intergenic	novelGene_99295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	131.947801126893	689	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	957	1559	982979	990624	FALSE	25	TTTATTGAGTACATGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKEGRKKSVRVLVAVGNGRGAAGFAVGKAAERMDAFRKAKNKAVNFLHYIERYGDHTIFHDVSLTFKRTHIKMKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961419	990781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_967284_967375_968211_968350_973411_973538_976245_976480_978585_978621_982960_983052_986166_986214_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
668879	contig_12638_pilon	+	2141	10	Intergenic	novelGene_33369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	86.8802212215541	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	129	1427	1515842	1538931	FALSE	55	AGAAAGTGGGTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515713	1539645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
668882	contig_1867_pilon	+	1425	6	Intergenic	novelGene_54510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5479.67599772103	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	153	527	194973	218890	TRUE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEVLCDSSEHFNCYATQKSVGVTH	194820	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215665_218822_218898_219457_219609_220857
668887	contig_10134_pilon	-	2068	4	Intergenic	novelGene_16232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.0999286732875	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	49	666	39679	33586	FALSE	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFETQVFQDIYPGNLCLLQPLTVLLLLADLPKAVVNLEPPWINVFQGDYVTLKCHGAHTPGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSGHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQERPSKLNGQQEQL	39727	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33627_34922_35153_38554_38817_39594
668889	contig_5033_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_28958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1121	1456	451758	451423	NA	45	AGTATCTCCTAAGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	452878	451116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451100_452900
668895	contig_14925_pilon	-	690	3	Intergenic	novelGene_55064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
668899	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
668917	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668918	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
668922	contig_12080_pilon	-	1828	16	Intergenic	novelGene_128378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	202.848120523706	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	49	1335	177526	166885	TRUE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPTCIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTVRNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQNSRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPSDLLTYDRTDEADAEERGPEENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI	177574	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166508_166586_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_170834_171180_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
668926	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668928	contig_5018_pilon	+	950	6	Intergenic	novelGene_47140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	456.32023842911	1996	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	72	464	1498209	1499440	TRUE	5	ATCTGTGTCGGTGTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYSSLQ	1497676	1500524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499427_1499588_1500185
668930	contig_4364_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_4277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533076	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
668932	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
668952	contig_3469_pilon	-	1707	17	Intergenic	novelGene_34163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_16	85.77286502735	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	193	1620	413507	380499	FALSE	30	TAGCCCTCTTAGGAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSGQILANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427873	380411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444_427548_427792
668964	contig_6691_pilon	+	2127	9	Intergenic	novelGene_60145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	57.5802429223775	227	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	234	1427	303965	330967	FALSE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCHFPLFLLATVTLPPVYSELSPLFLEELGSNLGIQVFNQIVKSRPHENVVVSPHGIASILGMLQLGADGKTKKQLTAVMRYSVKRAGKLLKKINKSIVSKKNKDIVTVANAMFVENGFKTEVPFVTKNEDVFQCQVQNVNFEDPDSACDLINVWVKNETSGMIDDILSPDHIRGQLTRLVLVNAIYFKGLWKSRFQPENTKKRLFVASNGTSYPVAMLAQLSVFLCGSTSTPNGLWYNFIELPYHGDSISMFIALPTESSTPLSAIIPYINTKTIDSWMSIMVTKRVQVVLPKFTAVAETDLKDPLKAFGITEMFDPLKANFSKITRSENLHVSHILQKAKIEVSEDGTKASAATSAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHSPTGAILFMGQINKP	255618	331667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_255822_303934_304224_309856_310085_317424_317623_322967_323167_323976_324078_326610_326698_329120_329205_330929
668971	contig_9290_pilon	-	2793	4	Intergenic	novelGene_77558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_3	252.883372328036	30	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	130	540	496936	487519	FALSE	70	CCCAGGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLVWSTG	497065	485265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_487663_489929_490037_491390_491545_496930
668981	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_96602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
668982	contig_14923_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_157761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTCCTTATCCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369790	369484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_369500_369800
668983	contig_10042_pilon	+	1468	14	Intergenic	novelGene_79207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	85.6467217513056	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	239	1204	1054190	1090129	FALSE	15	CTAAATTTCTTCCTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1029011	1090393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1032175_1032335_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
669008	contig_11855_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_67071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTACTTTAGCACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2046878	2045491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2045500_2046900
669010	contig_14513_pilon	-	682	2	Intergenic	novelGene_70401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	50	TAACAGCAACAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
669011	contig_6191_pilon	+	3121	9	Intergenic	novelGene_107816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	51.8807225759241	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	113	2140	17002	43956	FALSE	40	GCACTAGATGCCTAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSKGAGAAASDEKPGRIASLSLLFQKSFAQILPQWKKGNTEGECLPHKCSGIDTLNENYSWQISVTDNDFKIFKNHESQLCEILQDKFDCISTVVSPALEGHIKSLQVFRKMLTSQVALSVWKDDLTRHVVDAVVNAANEHLQHMGGLALALVKAGGPEIEEDSRRFIGRYGKVPTSRIAITRAGRLPCKEIIHAVGPQWIARDGQRCVEELKMAIINILEYVNCTNLDIKAVAIPALSSGIFQFPLDLCTRIIVSTIKLYFIKKQVVGNLKEIHLVSNEDPTVAAFKTASENILGRNQLESLAFSAEMAENKSMLPSHNSFSVSQWTREEKRENGLKANSPAINLMGSNMEKMREAEAWIHRLLKLQGHHVIENNHIFYLGTKEHDILSRLQKTSSVSISEIIDSGKAKLEIKGARADLIEVVMKIEHVLCDIQEEMAKRREQDLWSLLGQWTGQQPKKQDEMKGNSNRVKFPVMFSTQALQDKKKQFEKCGFQVIKVEKINNEVLNTVFQAKKKMMAGRSRNVLVSHGLFHRVPHQFCNMVCRVGFQRMYQMPCESRYGAGIYFTKNLKNLADQIRKTPATDKLIYVFEADVLTGSFCQSCQLNIVPPPLSPGAIDGYDSVVDNVSSPETFVIFSSTQAVPQYLWTCSQDEVWSRDYSSGQMMLSSQSYWG	13027	44937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_13052_16913_17017_17825_17968_20223_20982_26888_26950_34944_35326_36068_36212_36849_37025_43603
669014	contig_9807_pilon	+	1352	8	Intergenic	novelGene_32912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	469.739267670733	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	103	1128	140826	158783	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKVRMRTGEQLGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	140723	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_140985_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
669018	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669021	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669032	contig_8153_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_34810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	255.125731530336	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1164	39	1202	140789	167674	FALSE	25	ATGATATTCTTTTGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQEVAASHIPRLSKVNLFTLLSLWMELFPVAETQRHKSQKKEEGKHGSLGDNEDRTRVPTDKKQVKRTGLVVVKNMKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTEDHKTGVGAVIWAEGKSRNCDGTGALYFVGCGYNAFPVGSEYADFPHMDDKQKDREIRKFRYIIHAEQNALTFR	140750	167675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_140811_140987_141086_148680_148756_153002_153181_158353_158924_164642_164693_167503
669040	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669052	contig_17311_pilon	-	765	5	Intergenic	novelGene_57839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8998.45232178845	281	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	36	359	126865	121854	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARDGAEEKKMWEPSEL	126900	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_121530_121899_123344_123555_123642_123709_126862
669056	contig_8853_pilon	+	2824	15	Intergenic	novelGene_159161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_13	97.1771998118144	155	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	832	2499	1	2499	29254	98872	FALSE	80	GACAAAAAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYMMVMDHHLAALHHNQNMSQEEMINIHSSMFLEHQILPGLSIMNLLSFLLCVPVQFFGGWYFYIQAYKALKHKTANMDVLIVLATTIAFAYSLVILLVAVYERAKVNPITFFDTPPMLFVFIALGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATVVTLDSDNILLSEEQVDVELVQRGDIIKVVPGGKFPVDGCVIEGHSMVDESLITGEAMPVAKKSGSTVITGSINQNGSLLIRATHVGADTTLSQIVKLVEEAQTSKAPIQQFADKLSGYFVPFIVIVSIATLLVWIIIGFLNFEVVDTYFPGYNRSISQTETIIRFAFQASITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGAQNGILIKGGEPLEMAHKVKVVVFDKTGTITHGTPVVNQVKVLVESNRISRSKILAIVGTAESNSEHPLGAAVTKYCKQELDTETLGTCIDFQVVPGCGISCKVTNIEGFLHKNNWKIEENNIKNAALFQTDGSNEPSSTSSSKIIDVQLSNALNAQQYKVLIGNREWMIRNGLIINNDVDDCMTEHERKGRTAVLVAVDDELCGLIAIADTVKPEAELAVHILKSMGLEVVLMTGDNSKTARCIASQVGITKVFAEVLPSHKVAKVKQLQEEGKRVAMVGDGINDSPALAMANVGIAIGTGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASFDLSRKTVKRIRINFVFALIYNLVGIPIAAGVFMPIGLVLQPWMGSAAMAASSVSVVLSSLFLKLYRKPAYENYELHTRSQIGQKSPSEISVHVGIDDNSRISPQLSLLDRIVNYSRASINSLLSDKRSLNSVVTNEPDKHSLLVGDFREDDTAL	29253	99197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_+_29425_30330_30565_31713_31806_33232_33361_34376_34532_34641_34777_37578_37774_39453_39637_42368_42586_77216_77364_85033_85177_88169_88374_96828_96947_97296_97400_98598
669064	contig_15063_pilon	+	913	3	Intergenic	novelGene_14423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4631.5	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	409	771	36299	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35310	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36277
669084	contig_5479_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_133592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTGATGGGTAAACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264914	263268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_263300_264900
669095	contig_7057_pilon	-	809	9	Intergenic	novelGene_123336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGAAAAACGAGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943706	938655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_938752_938903_938960_939050_939117_941034_941105_941206_941285_941402_941523_942970_943028_943204_943305_943540
669097	contig_15449_pilon	-	1812	8	Intergenic	novelGene_33672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	146.387938613222	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	97	702	196078	192964	TRUE	35	GTAAACTTAAGAGATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLREAAPAER	196174	190976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192250_192551_192987_193081_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
669098	contig_13780_pilon	-	3518	1	Intergenic	novelGene_149086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667404	663886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_663900_667400
669115	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4254	41	3079	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
669117	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669120	contig_15434_pilon	+	1763	4	Intergenic	novelGene_56704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_3	174.624040600244	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	6	671	28981	32387	FALSE	15	TGATTTGTTTGTGACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIGMNYLERSCL	28975	33479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_29080_30409_30590_31082_31265_32182
669138	contig_4385_pilon	-	2949	18	Intergenic	novelGene_141503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	56.6569840428384	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	80	2797	344282	323422	FALSE	45	GAAAATGAAAACACCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFRIHHDVNELLSLLRIHGGDGAEVYIDLLQKNRTPYVTTTVSAHSAKVKIAEFSRTPEDFLKKYDELKSKNMRSLDPLVYLLSKLTEDKETLQYLQQNARERAELMAGAAASSAPSFSVPASAAKISTQELEELRRQLGSVATGSTLQQSLELTRKMLRDKQSKKNSGQHLPVFPAWVYERPALTGDFLTSSGVGTDAALPIGALPLTSQESAIVEDLLYVLAGVDGRYITAQPLIGRQSRTFLVDPNLDLSVRELVNRILPVAASYSTVTRFIEEKSSFEYGQVNHALAAAMRTLVKEYLILITQLEQLQRQGSLSLQKLWFYIQPTMRTMDILASLATSVDKGECLGGSTLSLLHDRSFNYTGDSQAQELCLYLTKAASGPYFEILEKWIYRGIIDDPYSEFMVEEHELRKEKIQEDYNDKYWDQRYTVVQPHIPSFLQKMADKILSTGKYLNVVRECGHDVTCPVAKEITYTLKERAYVEQIEKAFNYASKVLLDFLMQEKELVAHLRSIKRYFLMDQGDFFVHFMDLTEEELKKPVDDITPPRLEALLELALRMSTANTDPFKDDLKIDLMPHDLITQLLRVLAIETKQEKVLVSAEPTELTLSGLEAFSFDYVVKWPLSLIINRKALTRYQMLFRHMFYCKHVERQLCSVWLSNKAAKQHTLPSAKWFAGAFTLRQRMLNFVQNIQYYMMFEVMEPTWHILEKNLKSASNIDDVLGHHTSFLDNCLKDCMLTTPELLKAFSKLMSVCVMFTNCMQRFTQSMKLDSELGRLTLEHGTMLGPPTEAERAEESARKKLAKKHLAEHMDAPQVTSGFEATISKFDKNFSAHLLDLLARLSIYSTSDCEHSMASVISRLDFNGFYTERLERLSAERSQKAAHHTPAPRGPPAAAPRIAVAAQ	347692	323269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_323558_324951_325116_325777_325907_326726_326871_327802_327924_328907_329037_329215_329389_333687_333869_335676_335858_336823_336970_337794_337985_338299_338500_338818_339027_340004_340165_342229_342407_343266_343396_344132_344322_347652
669142	contig_5684_pilon	-	923	2	Intergenic	novelGene_81025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6312	junction_1	0	35864	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361798	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361315
669143	contig_17074_pilon	-	2652	12	Intergenic	novelGene_145145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	169.104251672997	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	27	2477	281636	239509	TRUE	15	CATTGTCACAGGCTGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRISPGDMGRRRATGGEPRRRELRGQKVKDQNPARREEEEADVLEDEKPPKKTLLSKISQGKKRRGCSDPRGPADDGPTKKKVAKVTAKSRHLKVVKDEAVSDGEDFRNFPAAHKKAHHPKREATIDKDSSEGEDEDESEGDWEEVEELSEPVPGDVGENAVFSKSVLPMNPVEIEIETPEQAKTRERSEKVKMEFETYLRRMMKRFTKEVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNRICSQPDLRAIALSIIPTRFTKVPQRDVDVCYLSNLVKWFIGTFTVNADLSYNEQDGLQTTLERRFAIYSARDDEELVHIFLLILRALDLLTRLVMSLQPIPLKLSAAKGKKPSKQRSIEGPGSSSETPSHVPENHTKPKASKGTKQEETFSKDTGNPGAKGKRGKAATGRKKQRAPSSSEETGKGEEQQENQRKRRGRERHMTSRVSYKEESGSDKANSDSDFELSSGEAHSPSDEDSDPDFLRQKRAPAPKRTKAGSKSDSQTSRQSCPNPAASSSSSSNKRGKKIPSGVEEVEGGKAAGVDQWLEVFCDKEEKWVCVDCVHSVVGEPLTCYRYATKPVTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPAWMTMTRKCRVDAKWWAETLRPYQSPFVDREKKEELEFQTKHLDQPLPTAIGTYKNHPLYALKRHLLKYQAIYPETAAILGYCRGEAVYSRLQMSHPRGGKGRPQYHQEEELRAEHILWTQGSCTETESYNARDGARQREAVVAEKRRQRNQETGMRRHRGLPGPWSEAVTVGMPIHRARELMPSGRGLLAEAGAPRHLLAELKSFVMLEQGRSQAEVLRAIEKPACRHS	281662	239125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_239208_239415_239930_246242_246404_247627_248498_249342_249433_257668_257790_258271_258430_260179_260265_261810_261935_264317_264437_267691_267891_281533
669149	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_18107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27841	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
669155	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669159	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	886	-18	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
669160	contig_14666_pilon	-	1960	13	Intergenic	novelGene_39523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	833	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	492	848	448746	447597	TRUE	15	CCAGCAGGTTCACGGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAFRFNGACDAVVFQDGEEELHEVRGVRGGDDIQHLSDKVANEGNVSVQLLQALPDVADHRKDITAAQQVNHPVQQGLLQLQLLHHVQLRVLGLKELDQQLQDLGVQELVAGADLIQ	449327	441153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_441178_441958_442065_443648_443752_444229_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446218_446553_446740_447492_447607_447968_448065_448151_448293_448636_448767_448856
669168	contig_9981_pilon	-	1771	6	Intergenic	novelGene_121050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	76.3900517083213	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	22	432	256353	255669	TRUE	15	CCTGTGATTTTGTGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGCRAAMAANTESWEEDTLRSFVRTLEKRDGTVLRLQQYGSGGVGCVVWDAAIVLSKYLETPGFSGDGDHALSQRSVLELGSGTGAVGLMAATLGADVVVTDLEELQDLLKININMNKQLVTGSVQAKGEKQKTSLLHRTTY	256374	249453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080_253186_254386_254507_255642_255714_255892_255993_256087
669172	contig_1594_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_138796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAACACTTTTATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199906	199212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_199200_199900
669177	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669178	contig_3469_pilon	+	1555	11	Intergenic	novelGene_34185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_10	121.630136068328	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	47	1234	456854	478983	FALSE	10	CTCCCTGCCAAGCTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVMRILQEGVGPKKLDSLTTGFGFPVGAATLMDEVGVDVAHHVSEDLGKAFGERFGGGSVELLKQMVSKGFLGRKSGKGFYIYEKGVKSKNLNSDMDSILASLKVPPKPDV	456321	479304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_456351_456836_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474168_474310_477210_477280_478004_478201_478864
669181	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1452	641	997	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2452	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
669182	contig_14467_pilon	+	1967	7	Intergenic	novelGene_138222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101343	129288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_101439_101493_101579_101861_101963_102555_102726_107245_107421_111573_111755_128128
669183	contig_9199_pilon	-	3073	17	Intergenic	novelGene_65648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	170.261552012631	211	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	10	2493	166391	157210	FALSE	15	ACATCACTGCCTTTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNIMEAMLQLFRAQLLPKAMVEVEDFVDPNGKISLQREETPSNRGESTVLSFVSWLTLSGPEQSSMRGPSTENQEAKRVALDCIKQCDPEKMITESKFLQLESLQELMKALVSVTPDEETYDEEDAAFCLEMLLRIVLENRDRVGCVWQTVRDHLYHLCVQAQDFCFLVERAVVGQLRLAIRLLRREEISGQVLLSLRILLLMKPSVLSRVSHQVAYGLHELLKTNAANIHSGDDWATLFTLLECIGSGVKPPAALQATARADAPDAGAQSDSELPSYHPNDVSLDRGYTSDSEVYTDHGRPGKIHRSATDADVVNSGWLVVGKDDIDNSKPGPGLNRPGSSPLVNQYSLTVGLDLGPHDTKSLLKCVESLSFIVRDAAHITPDNFELCVKTLRIFVEASLNGGYKSQEKRSKSHKYDSKVNRFKKKSKEGSVLRRPRTFSQHATRGGHSDDDEDEGVPASYHTVSLQLLDLMHTLHTRAASIYSSWAEEQRHLETGGQKIEADSRTLWAHCWCPLLQGIACLCCDARRQVRMQALTYLQRALLVHDLQKLDALEWESCFNKVLFPLLTKLLENISPADVGGMEETRMRASTLLSKVFLQHLSPLLSLSTFAALWLTILDFMDKYMHAGSSDLLSEAIPESLKNMLLVMDTAEIFHSADARGGGPSALWEITWERIDCFLPHLRDELFKQTVIQDPMPMEPHAPKPVASAHLTPAAGDTKTPGHPPPPEMPSEPGACDFEKPEGPRATSSSSPGSPVVSSPSKLSPTPDGPPPLAQHPLILQPLASPLQVGVPPMTLPIILNPALIEATSPVPLLATPRPTDPMPTSEVN	166400	156629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_157491_157998_158128_158289_158471_158611_158726_158999_159102_159305_159437_159543_159695_160539_160734_160865_161113_161246_161408_162084_162311_164826_164981_165233_165329_165471_165544_165738_165863_165952_166018_166334
669190	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669195	contig_18869_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_56255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	62	307	73707	73462	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73768	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
669205	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
669206	contig_14925_pilon	-	945	4	Intergenic	novelGene_55163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	20	AAAGGCTGTGCTCCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
669209	SIRV2	-	606	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4265	36	3090	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGCTCTATAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	1036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
669210	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669212	contig_6503_pilon	+	2388	9	Intergenic	novelGene_145802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	3.53332350627564	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	101	1093	1437289	1464228	FALSE	25	TATATGCCATGGCTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGQKLMRAVRVFEFGGPEVLKLQSDVARPIPKNHQVLIKVHACGVNPVETYIRSGTYSRLPPLPYTPGSDVAGVIEAVGDNVSAFKKGDRVFTTGTVSGGYAEYAVAADHMVYSLPEKLDFKQGAAIGIPYFTAYRALFHSARAKAGETVLVHGASGGVGIATCQIARAYGLRVLGTAGTEKGQNIVLQNGAHEVFNHKDVNYIDEIKKSVGDKGINVIIEMLSNVNLSNDLKLLSHGGRVIIVGSRGPIEINPRDTMTKESSIIGVSLFSSSTEEFQQSAAALQAGMETGWLKPVIGSQYPLEKVAQAHENIIHGSGTAGKMILLTC	1429577	1465523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_1429672_1437282_1437400_1438750_1438904_1447298_1447463_1451943_1451996_1457257_1457408_1463302_1463405_1463527_1463624_1464063
669216	contig_13787_pilon	-	2589	6	Intergenic	novelGene_40630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_1	388.524182001584	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	323	922	205032	174955	FALSE	30	TTAAGAAATTTTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQVRTKSN	205354	173287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
669220	contig_6589_pilon	+	1385	9	Intergenic	novelGene_26026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	918.583284193654	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	112	708	1725483	1729051	TRUE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLPIQWFLGRKDVAICSQKVTALEILWSSSTLHTWSGRCKKWCWRRSRTTAPTRRRRRPRRAGTTCSSSCAAAAGILRRTGSRSSA	1725371	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1727932_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
669221	contig_16103_pilon	+	2864	3	Intergenic	novelGene_118730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_2	151.5	86	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1903	2349	297648	300704	FALSE	35	AAAGAGCAGCGTAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKNKQPMPVTIRASMQQQQQLASARNRRLAQQMESRPSVQAALKLKQKSLKQRLGKSNIQARLGRPIGALARGAIGGRGLPIIQRGLPRGGLRGGRATRTLLRGGMSLRGQCCVPAYLIVVKPYPPSLFTWAASGHICFTSLSLNLY	294831	301219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_297792_300401
669224	contig_8122_pilon	-	2933	18	Intergenic	novelGene_40189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_17	85.5280362378265	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	113	2455	116849	78831	FALSE	30	GTATATGCTTAAAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSAGCAFEYLIETLNDSSHKYFNIPKLGGTKYDALPYSIRVLLEAAVRNCDGFLMKKEDVMNILDWKTKQSNVEVPFFPARVLLQDFTGIPAMVDFAAMREAVKILGGDPKKVHPACPADLTVDHSLQIDFSKCAIQNAPNPGGGDLQKAGKLSPLKVQPKKLPCRGQTTCRGSCDSGELGQNSGKFSAQIENTPILCPFHLQPVPEPETVLKNQEVEFGRNRERLQFFKWSSRVFKNVAVIPPGTGMAHQMNLEYLSRVVFEEKDFLFPDSVVGTDSHITMVNGLGILGWGVGGIETEAVMLGLPISLTLPEVVGCELTGSSNPFVTSIDVVLGITKHLRQAGVAGKFVEFFGSGVSQLSIVDRTTIANMCPEYGAILSFFPVDNVTLKHLEHTGFDKAKLESIEIYLKAVKLFQNDQTSSGEPEYSQVIQINLNSIVPSVSGPKRPQDRVAVTDMKSDFQACLNEKVGFKGFQIAAEKQNDTISIQYEGSEFKLSHGSVVIAAVISCTNNCNPSVMLAAGLLAKKAVEAGLHVKPYIRTSLSPGSGMVTHYLSSSGVLPYLSKLGFEIVGYGCSTCVGNTAPLSEAVLNAVKQGDLVTCGVLSGNKNFEGRLCDCVRANYLASPPLVVAYAIAGTVNIDFQTEPLGTDPTGKNIYLHDIWPSQEEVHQVEEECVILSMFKALKEKIEKGNKRWNSLEAPDSVLFPWDLKSTYIRCPSFFDKLTKEPVALQPIENARVLLYLGDSVMTDHISPAGSIARSSAAAKYLTNRGYVHGF	116961	78352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_78993_79090_79196_81317_81443_81881_82039_82391_82477_83499_83636_84804_84965_86110_86228_88379_88481_90452_90625_94324_94465_94776_94961_95625_95696_97966_98186_99091_99230_101133_101300_114499_114587_116830
669227	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAATCTCTCTCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
669231	contig_20844_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_78589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCCCAAATTCTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189658	190881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_189700_190900
669232	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669235	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669239	contig_7202_pilon	-	398	2	Intergenic	novelGene_18604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAGAAACTGATGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
669248	contig_16098_pilon	-	1959	5	Intergenic	novelGene_45781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	477.694724693501	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTAGCTCTCTTGGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33890	31093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_32099_32529_32642_32796
669250	contig_6217_pilon	+	2841	1	Intergenic	novelGene_109599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	865	1164	299927	300226	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDEELKQGLPCSPLLSPGHGSPIFQANLTPVKRTVFIQYSHILISRFRVIACGYKGCSLLQGGSLAKNPIQGLPVNHGFWPGTGPPREWDTVNTIMG	299062	301903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_299100_301900
669257	contig_9698_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_82500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGGTCCATTAGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215394	216338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_215400_216300
669262	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669267	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669268	contig_20615_pilon	-	3088	5	Intergenic	novelGene_146910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.59807621135332	52	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	520	2589	143210	120960	FALSE	15	GATCTTGCATTTGGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRMLYRDVMMETFRNLASVVFQNLHDGETLFSEHVMVRFMKSTWSAVLGEISESYGNKDQHKNQKRYLRSHTVENLCESNKGNHCEETFSRIPNQTVLKGNPPEVNPFECCECGKTFMDHSSHNYHARSHTGCNTYQTKQCGEACSFLSHLTTSLGTLTGKKPHKCKVCGKDLICFSTLKNPVTTLTGEKRYEYSECGKDFCGLSSFWTHVTSHKREYKECKTIRRPSSLFLHKKFCSRDKPYDCKECGKAFSKVSSLTQHIRSHSGERPYECMECQKAFSQLSHLTTHIRTHSGQRPYECKECGKAFNEASSLRTHIRTHTGERPYKCKECGKTFRQSSHLTKHIRTHSGERPYECKQCGKTFSCSYHLSEHIRTHNGERPYKCKQCGKAFSQSSHLTEHIRIHSGERPYECKECGKGFRCSSVLRTHIRTHSGERPYECKECGKAYRLVSHLIKHTKTAHSGEKPYECKECGKAFRHPSHLTKHIRTHSGERPYECKQCGKTFSQSSQLTTHIRIHSGEKPYECKECGKSFRCSSVLTTHIRIHTGDRPYECKECGKAYRQVSHLIKHTRTVHTGERPFECKECGKTFSDSSNLPRHIRTHNVERPYECNECGKAFSEASSFTEHIRTHTGERPYECKECGKTYRQVSHLIRHTRTTHWRKTI	151451	120460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_122752_123313_123462_124420_124548_143207_143454_151175
669270	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_93278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTGGTTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
669271	SIRV7	-	286	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91640	0	-91634	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCACGAAGTAAGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
669277	contig_2204_pilon	+	1414	6	Intergenic	novelGene_71676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_2	127.27513504216	47	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	73	792	14884	50221	FALSE	45	AAAAAAAATCTTTCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	14811	50843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
669281	SIRV4	+	324	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	641	983	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
669283	contig_11594_pilon	+	2505	4	Intergenic	novelGene_80885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74184	81019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_76013_76864_76972_79697_79836_80587
669289	contig_15042_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_115429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	286.87486383439	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	138	623	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_31311_31450_35276_35376_42985
669292	contig_10765_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_122966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTAAATGGTTAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395660	394531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_394500_395700
669295	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669301	contig_4402_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_140829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTAGGTGCTGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520315	519254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_519300_520300
669304	contig_6102_pilon	-	1849	8	Intergenic	novelGene_32387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	244	junction_5	124.075684605019	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1037	1471	1731759	1728861	FALSE	5	TACTCTGTGTGGCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGK	1733196	1728482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732541_1732738
669310	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669322	contig_10734_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_51166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	364	1095	45	1139	998765	999859	NA	10	CCACTTGTGTGTTTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHAINKISNQTATIISSVLWGITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGEPDNNRSTSMELTEDQNTSRNAPEALMVNSSEPWSPQHLTPTSP	998720	1000716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998700_1000700
669331	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669333	contig_18869_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_56365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73739	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
669342	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669348	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669352	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_89079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	180	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669362	contig_10011_pilon	-	1756	8	Intergenic	novelGene_68109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1114	1635	332188	328311	TRUE	5	GTGTCCCGGATTCTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEVDLLFHLWRGGPWLRDGHCLGPGDLTDELIKKSNVLGHAAAVLFPDLANGLTQLLQPGHKELLLFLQKLAQLLHLMPNLLLLGFSLFLMLQLPVNLLLEFQGDFLDGAHLVASVLLTQAADEADKLPVVLTEEQAGLLHVTLTRGRRLGAEAVQQLLLWERGLAPGATG	334180	326375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_326407_328220_328528_328964_328994_330804_330997_332104_332228_332412_332446_332993_333043_333188
669365	contig_7345_pilon	-	2228	4	Intergenic	novelGene_159176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	151.112173198882	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	152	547	139698	118500	FALSE	45	AAAAAGATGTCAAGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNR	140194	116818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_118620_119857_120024_139588_139770_140114
669367	contig_10475_pilon	-	1791	2	Intergenic	novelGene_148721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	217	1251	26008	24974	FALSE	20	TCTGGGATGAGGAGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHTPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPESTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQTPTEAESSMDDD	32190	24433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_26084_32049
669370	contig_2646_pilon	-	3159	10	Intergenic	novelGene_69683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2318	2644	2336068	2330193	TRUE	15	CCACAGCGCGCAGGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISVRKRPRTNSKLYCRLDSAAWAYSKRCFTIKAGPLKPASCVIIRHTMDRMSLVRQKIHTTLRREAASGPTSFSSSCHSLSSLLQFTSEDSYLDKGHTSSIKSSPFL	2343766	2309553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2309646_2313141_2313327_2329775_2329936_2330114_2330268_2330948_2331100_2335967_2336200_2336351_2336527_2337665_2337815_2341167_2341314_2342050
669374	contig_9668_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_58248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGAAAATTTAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603169	601035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_601000_603200
669377	contig_3095_pilon	+	1033	4	Intergenic	novelGene_74994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3781.26057757933	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	68	679	147241	151893	FALSE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVMAFLRRSMKKILL	147173	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150653_151848
669379	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669382	contig_11386_pilon	+	1662	7	Intergenic	novelGene_82764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	286.749261357181	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	714	1343	17940	20925	TRUE	70	TCCAGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	7893	23411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11416_13558_13752_17844_18037_19625_20050_20816_21022_23188
669385	contig_7179_pilon	-	1794	5	Intergenic	novelGene_78151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	7.56637297521078	303	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	170	712	1041245	1039605	FALSE	35	TGCAAAAGGGCACTCTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASLPWLSSTLRGAGVENEWKAAREASFEVAREPLTADFRFRQLWHEDSVFRPSGKMRPLTEEETRVMFEKISKYIGENLQLLVDRPDGTYCFRLHNDRVYYVSEKILKLAANISGDKLVSLGTCFGKFTKTHKFRLHITALDYLAPYAKYKVWIKPGAEQSFLYGNHVLKSGLGRITENTSQYQGVVVYSMSDIPLGFGVAAKSTQDCRKVDPMAIVVFHQADIGEYVRHEETLT	1041414	1038522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1039725_1039917_1040059_1040747_1040887_1040984_1041072_1041189
669388	contig_1443_pilon	+	1588	14	Intergenic	novelGene_28239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	65.2835417881289	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	636	1454	538444	541708	FALSE	40	AATGGAAATGAATTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535997	541842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538070_538351_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
669389	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669400	contig_4336_pilon	-	3313	22	Intergenic	novelGene_152347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_21	53.112553230452	159	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	6	2117	258460	163972	FALSE	15	CCATCCATAGCTTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSLAENSVTTVVYNAYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENCQTVVIVGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDPLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSAIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDAEKFRDFFNQNETSDPTRDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQSPVPDYIKSTVETVMKIHQTEGDGDILAFLTGQEEVETVVSMLIEHARELARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVPRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFMKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRNRSGKCYRLYTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVIPPNQKSQAIRVHRRFAVEEGDHLTMLNVYEAFIKHNKNSQWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPKKSSEGDPDPVLRCIVSGFFANAARFHSSGVYRTTRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVVYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLLELAPHFYQQGTHLSLKAKRTKVQDL	258465	162775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_164017_169860_169973_172360_172433_178479_178562_181938_182069_183593_183672_185998_186094_187219_187316_192788_192844_196603_196729_203089_203301_205128_205288_206158_206256_207362_207476_216912_216973_219034_219105_219935_219998_222271_222377_237735_237814_249444_249538_251449_251584_258420
669404	contig_12301_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_110029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127862	126139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_126100_127900
669409	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
669410	contig_7050_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_153632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	870	1169	778889	778590	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHINQRLHQPETRRTRWRLATTNEHPDREHNRGSLMQNSNSRKKTRLNGLTETGGALESMAPGLSITPELKQFPRPTLQTGVGLDCGTQSDTCEGCAS	779758	777897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_777900_779800
669412	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669415	contig_20600_pilon	+	2330	6	Intergenic	novelGene_137108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.3161023668953	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	361	978	112324	117548	FALSE	25	ATAAAGGTTTCAGCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111248	118900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111553_112267_112446_113990_114161_114959_115025_116232_116332_117386
669421	SIRV4	+	144	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1617	642	1162	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACCGTCTTCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2617	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
669422	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669424	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669427	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669435	contig_9345_pilon	-	1605	13	Intergenic	novelGene_24426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_12	92.4149383667669	571	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	27	1469	277583	266016	FALSE	0	GCTGCGTTGTCCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPDVSKKMAASAVCRAAGAGARALLHARGSPALLRAPALRGTATFAQALQNVPETQVSLLDNGLRVASEQSTQPTCTVGVWIDAGSRYETEKNNGAGYFVEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLADIVQNCSLEDSQIEKERDVILRELQENDASQRDVVFDYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSRHYKAPRMVLAAAGGVEHRQLLDLAQKHFSSVSGTYAEDTVPTVEPCRFTGSEIRHRDDALPLAHVAIAVEGPGWANPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGKHLSSPLASVAAANKLCQSFQTFNICYAETGLLGAHFVCDRMTIDDMMFFLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLSEWESRISEVDARVVRDVCSKYFYDQCPAVAGFGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF	277609	265879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_266081_266519_266596_266946_267036_267348_267435_267540_267702_267828_267973_268204_268321_269831_269912_270476_270676_270897_271028_272003_272091_277095_277237_277514
669436	contig_6550_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_110660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATAGGTTTCCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65809	64889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_64900_65800
669439	contig_14744_pilon	+	1017	6	Intergenic	novelGene_66059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	4102.12815011916	5	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	443	976	1383399	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382037	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
669445	contig_12270_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_114133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCTGACCGGTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14406	13953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669456	contig_6954_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_64442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493951	491834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_491800_494000
669459	contig_19769_pilon	+	905	6	Intergenic	novelGene_102260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1486.43016653996	41723	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	416	871	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87655_87804_88040_88841_88958_89163
669462	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669465	contig_8616_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_72397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTGGTGACGCAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205530	207017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_205500_207000
669466	contig_8616_pilon	+	1152	10	Intergenic	novelGene_72400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	23.5597480545752	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	9	872	207076	212427	TRUE	10	CTTGACCTTGAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIMAAAAARWNHVWVGTETGILKGVNLQRKQAANFTATGQPRREEAVSVLCWGSSGETQILLGCVDATVRRFSTEEGIFQGQRHCPGGEGTFRGLAEADGNLITCVDSGILRVWCDNDKEVSSDPLLELKVGPGVCKMRQDPAHPHVVATGGKENALKVWDLQGSEEPVFKAKNVRNDWLDLRVPIWEQDIQFLPESQKLVTCTGYHQVRVYDPASPQRRPVLEATYGEYPLTAMTLTPGGKAPPGLSEGAGRQCPSVAVPPFKAPTSLLRPGPSLEGTQDPEPTGSGA	207067	213393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_207140_207220_207328_207415_207538_209039_209116_209234_209382_209537_209640_211720_211822_212282_212429_212563_212621_213171
669480	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	644	966	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
669487	contig_11978_pilon	-	2028	6	Intergenic	novelGene_62863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.966452881468	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	263	766	603912	600051	FALSE	15	GATTGTTGTTGCAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENQEQEEVITVRVQDPRVQNEGSWNSYVDYKIFLHTNSKAFTAKTSCVRRRYREFVWLRKQLQRNAGLVCCFLPRSGRRNSPSPPPSEEKDHLEVWAPVVDFEAPSLESPTLPALSSPSHCDFARPDEGTSAGQPARRVMGGDQLASLSHAVPLDPGQLETVLEK	607171	598788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600343_602843_602945_603271_603359_603888_603944_604905_604966_607000
669494	contig_2054_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_51673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCATTAAGAAACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71185	72040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_71200_72000
669496	contig_10749_pilon	+	913	5	Intergenic	novelGene_133509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	42.3460446795211	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACGTACCAGACCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300476	301962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301599_301727
669504	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_91999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657185	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657186	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669510	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669511	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669520	SIRV4	+	457	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	32	461	32	-461	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGAAGAGTACCTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
669530	contig_7285_pilon	-	1511	8	Intergenic	novelGene_143415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	97.8186577086313	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	402	896	370123	356016	FALSE	45	AGTAAAGATTGGTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAATGHKVALVDQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTWNQACTSWLPKCPWECSLVRHSLTPHSLLSVHFLL	380010	355400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356125_356183_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
669534	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669549	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669558	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_89267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
669559	contig_2219_pilon	+	3353	4	Intergenic	novelGene_67168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_1	364.002136745865	155	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	213	1040	88766	178816	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALRPARLWALLALWLCRTAPAHALQCRDGYEPCVNEGICVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCAPGFTGEDCQYSTSHPCFMSRPCLNGGTCHMLSWDTYECTCQVGFTGKLCQWTDACLSHPCANGSSCTTVANQFSCECLAGFTGQKCETDINECDIPGRCQHSGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQHCDSPYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECSCLPGKEPPECLLCVCGGAYNHTGGGWWV	88553	181129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_88839_141276_141359_174596_174857_178403
669561	SIRV7	-	247	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69039	0	35820	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78918	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
669569	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_93816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCACAGTGATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
669578	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669582	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669591	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669592	contig_12357_pilon	-	1680	8	Intergenic	novelGene_6137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAGAAAGAAACCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53929	30947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42249_46434_46568_51129_51238_52758_52842_53167
669602	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669604	SIRV7	-	220	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69056	4	35837	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78901	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
669605	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669606	contig_16098_pilon	+	736	3	Intergenic	novelGene_45996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAAAGTACCGGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348289	349464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174
669611	contig_12638_pilon	+	1611	10	Intergenic	novelGene_33380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	121.433109158911	11	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	94	1164	1515842	1539233	FALSE	20	GGATTTTGAGCCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPLAPAASLILFRVWQGALRKPSQSPGHDGGARRHLQETMSSGVLELLTQSVFRQ	1515748	1539680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524437_1530092_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1538903_1539069
669614	SIRV4	+	232	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1539	632	1084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
669616	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_97131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669617	contig_8978_pilon	+	2386	11	Intergenic	novelGene_49384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	376.017087377688	1	115	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	83	1495	339807	347248	FALSE	15	AATTTCCTGTGCTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLVSNSEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQDLMRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDARAGDTDGPDGYGRCYGHKQQRCHAPCSCASWYPSASRTCHYDARWNLRIGNKLTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	331580	348139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341144_342383_342670_343350_343447_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345358_345397_345627_345748_347121
669620	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
669623	contig_6589_pilon	-	1471	8	Intergenic	novelGene_26202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	105.107913447979	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	498	1385	2031410	2028014	FALSE	15	TCATTGCATGTATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAVPPILRQTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGWEFEVTAFYRGRQVFQQAVFCPGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVADLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2033642	2027927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031446_2031618_2031718_2032516_2032690_2033452
669633	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669642	contig_15952_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_154071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCTTAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312590	312247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_312200_312600
669644	contig_13044_pilon	+	1894	2	Intergenic	novelGene_100015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	742	junction_1	0	13	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTTGCCTACCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439137	441368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_440878_441214
669652	contig_21277_pilon	+	3204	1	Intergenic	novelGene_159200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13863	17067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21277_pilon_+_13900_17100
669656	contig_4686_pilon	+	2448	1	Intergenic	novelGene_118538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCAGCCCTGGTGGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495736	498184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_495700_498200
669668	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669672	contig_8156_pilon	+	1675	6	Intergenic	novelGene_98944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396489	441765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_396954_398418_398545_403289_403537_403887_404006_404667_404810_441187
669673	contig_9345_pilon	+	846	2	Intergenic	novelGene_24528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAATAATACCGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700359	704392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_700613_703799
669684	contig_1596_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_131593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATATACCTACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104259	106440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_104300_106400
669685	contig_10923_pilon	+	1648	9	Intergenic	novelGene_66210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1004.61074551291	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	19	990	21667	36616	TRUE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMVPSVHLRRCVMWPTSTGPSPLWMRSML	21648	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30319_32870_33047_36532_36682_37383_37540_38578_38742_42558
669686	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669690	contig_12622_pilon	+	2021	10	Intergenic	novelGene_5879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	61.5878375038048	87	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	311	1531	1221335	1229143	FALSE	20	GCCACCTTGAGTTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWALDVAFVWKAVLTLGLVLLYYCFSIGITFYNKWLTKVEGPHTAKCSRTEKHHPQRGQVWGAGGGRLTRLVLCFGSMQSFHFPLFMTMLHLAVIFLFSALSRALVQCSSHRARVVLSWTDYLRRVAPTALATALDVGLSNWSFLYITVSLYTMTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGLHLSTSEKIFRFQDTGLLLRVLGSLFLGGILAFGLGFSEFLLVSRTSSLTLSIAGIFKEVCTLLLAAHLLGDQISLLNWLGFALCLSGISLHVGLKALHTRGDGGQKPLKGLGSSPDLELLLRSSQQDEEDNEEEQYFVAQGQQ	1220409	1229633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1220486_1221100_1221455_1221869_1222144_1222950_1223015_1223758_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227159_1227336_1228537_1228668_1229012
669699	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669705	contig_13780_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_149144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCAGCAGATGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963649	965165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_963600_965200
669709	contig_2890_pilon	-	1267	12	Intergenic	novelGene_60290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	569.732357056966	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	152	943	360787	336651	FALSE	25	CTGAAACTCTGTTTAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACKLLRPQTPLTKDVFHMVVEVPRWSNAKMEIATKDPLNPIKQDVKKGKLRYVANLFPYKGYIWNYGAIPQTWEDPGHNDKHTGCCGDNDPIDVCEIGSKVCARGEIISVKVLGILAMIDEGETDWKVIAINVDDPDAANYNDINDVKRLKPGYLEATVDWFRRYKVPDGKPENQFAFNAEFKDKDFAIDIIKSMHDYWKALVTKKTDGKGISCMNTTVSESPFKCDPDAAKAIVDALPPPCESACTIPTDVDKWFHHQKN	370865	336326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_336683_337286_337330_338549_338620_341426_341513_341986_342115_351451_351579_352504_352592_355560_355681_356537_356592_360742_360816_368254_368314_370801
669715	SIRV5	-	220	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGTAACCTACCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
669730	contig_12740_pilon	-	2483	2	Intergenic	novelGene_159203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_1	0	354	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	181	498	31787	29777	FALSE	40	TTTTTAAAAAGATCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKLFSPPPTSTPGKPPNKSQNKSKSPQGLATEETLSASVTSQPTHPKENVIPLLVTSNSDQFLTTPDGDEKDITQENSELKHRSSKKDLLEIDRFTICGNRID	31967	27791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_30007_31699
669732	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
669745	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669751	contig_8138_pilon	+	1696	5	Intergenic	novelGene_52477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	4	459	280295	306552	TRUE	10	CTTCTTAGTAGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280291	307935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306827_306972
669755	contig_821_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_149399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAATACAACCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169504	171769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_169500_171800
669759	contig_11328_pilon	+	755	6	Intergenic	novelGene_88390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2420.13293849739	13	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	78	734	644338	647995	FALSE	50	ATAAATAAGGTCATACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSTGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643643	648016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643653_644269_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
669767	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669768	contig_9469_pilon	-	2790	1	Intergenic	novelGene_159218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGATATCTTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20127	17337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9469_pilon_-_17300_20100
669769	contig_2027_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_39881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59575	58755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_58800_59600
669770	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669779	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	886	-20	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
669783	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
669784	SIRV6	+	564	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	10	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
669800	contig_3797_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_120085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAAATTCCTTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327569	327905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_327600_327900
669806	contig_15087_pilon	-	2695	19	Intergenic	novelGene_37148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.495115311729	1	120	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	619	1983	66689	38999	TRUE	20	CAGCATTCCATGACTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89790	33329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33907_34018_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
669807	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669809	contig_5247_pilon	-	1628	6	Intergenic	novelGene_81825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	167.863515988436	1203	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	82	834	416518	343451	TRUE	15	TGTATATCAGTGGTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPK	416599	342101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343331_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_416448
669817	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
669824	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_18428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
669835	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669837	contig_4392_pilon	-	2690	1	Intergenic	novelGene_117293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCAAAGAAAACACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77996	75306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_75300_78000
669845	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669848	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_19085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGCCATGACGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
669859	SIRV6	+	371	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTGGATGCAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845
669871	contig_2069_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_23321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	672	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGAGCTGTGCTGTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525752	524232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_524200_525800
669876	contig_10494_pilon	-	1867	10	Intergenic	novelGene_102169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	82.1765638994536	127	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	67	1269	923195	915313	FALSE	5	CCCCCGGTCTCAGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEPLVIVTSTAPVNIAVIKYWGKRDEELVLPLNSSLSVTLHQDQLKTTTTAAISKDFTEDRIWLNGTEVDVGQPRLQSCLREIRRLARKRRSTDDGDAPPLSLSYKVHIASENNFPTAAGLASSAAGYACLAYTLARVYGVEGELSEVARRGSGSACRSLYGGFVEWHMGERADGKDSIAQQVAPELHWPELRILILVVSTEKKLMGSTVGMQTSVKTSALLQFRVTSVVPARMAEMIRCIRERDFPGFGQLTMKDSNQFHATCLDTFPPISYLNDTSRHIMHLVHRFNTHYGQTKVAYTFDAGPNAVVFTLDNTVAEFVAAVRHCFPPESNGDKFLKGLPVRPVPLSDELKAALALDPTPDGVRYIIATKAGPGPQILDDTHLHLLGSDGLPKPAA	923261	914714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_915394_916136_916246_917054_917171_917609_917829_917971_918047_918660_918861_919992_920140_920415_920531_921205_921277_923125
669877	contig_10940_pilon	+	2267	2	Intergenic	novelGene_49199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	722	1171	432293	434508	FALSE	60	AACTAAATCTTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPAAPCNLPSSSVRSLVQLVLSFTFLKWGCFSLSPVSKTATLTLAPVYPICQSTSACRVWATCRGMALSSRLLECLPVACQNPEPRERLARRRGRDDCHFWLHLVSLHGTRGSARSKEEKDQNRRNSYTKLYLLGKTNHSEHRHDCL	431571	435604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_432432_434197
669879	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
669884	contig_11978_pilon	+	1576	12	Intergenic	novelGene_62795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	73.535396547884	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	141	1196	299759	587379	TRUE	10	GCCATGTCTGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPGEKLEYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299618	589574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547786_564821_564923_587277_587387_589201
669888	contig_17440_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_7643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3500	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
669892	contig_6710_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_89114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653640	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
669893	contig_13547_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_104887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCCTCAGATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110394	108151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_108200_110400
669896	contig_6102_pilon	+	2310	21	Intergenic	novelGene_31738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_17	135.094957344825	8	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	224	2050	216236	228987	FALSE	25	ACTAGGCTATCTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSSSPTTIHAAPRALTTPEQIPGRKKLKGSLFTPYFWPAPSATPAKAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLDLSNLSLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	210272	229247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221660_227983_228161_228274_228396_228586_228648_228903
669897	contig_14745_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_147853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	493	834	65285	65626	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPCLAALYLNDNFCSNVFKLVFFIFNLGNWVVRLVMMQVKCNRMPCWETYNEKYFLLNRLKEDGSGSAYDKESMAIIKLNNTTVLYLKEVTKFLALVCILREESFERKGNGI	64792	65717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_64800_65700
669909	contig_6494_pilon	-	738	6	Intergenic	novelGene_108559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	606.596604012914	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	308	661	3457	2635	TRUE	20	ACATGGCCTGACTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	6841	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751
669914	contig_4654_pilon	+	1876	7	Intergenic	novelGene_103049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCAGGCCCGCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413193	440372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_414321_415912_416081_424962_425129_428134_428250_430574_430702_434568_434654_440284
669919	contig_14513_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_70312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
669932	contig_13740_pilon	-	1381	9	Intergenic	novelGene_34681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5007.12372369357	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	65	898	165243	157286	FALSE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGFTV	165307	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_158288_158394_160074_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161922_162031_165237
669945	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
669948	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669950	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671647	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
669962	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
669970	contig_7202_pilon	-	309	2	Intergenic	novelGene_18618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	156	152	307	29911	28592	FALSE	35	CAAATATTTTCTTCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGARQPSPNQQLPASLLPPPHSSALGRHKAPAAAPAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNF	30062	28589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
669972	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
669983	contig_17819_pilon	-	1564	5	Intergenic	novelGene_158791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_2	64.8594634575403	969	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	115	771	16597	8905	FALSE	20	TAATCTGTTTCTAAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHYLEAAARKLQASCPGQARYLLWAYSSSNDAKNTFEETCPYCFQLLVLDNSRVRLKPKPKLTPKIQKLLNREAKNYTLSFKEAKIVKKYKDSKSVLLITCKTCNRTVKHHGKSRSFLSSLKSSPSTPVTKPILKTPAKKTPSSANLNHDMSGSKAKSPASIFRTPASGQSTPTFSSSKNISKTKKHFSQLKMLLSHQESQTTPKMDFRNFLSSL	16711	8111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17819_pilon_-_9062_10999_11200_14193_14394_16397_16421_16520
669984	contig_12512_pilon	+	2421	6	Intergenic	novelGene_24187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGGGCGGCTGAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589947	599935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_591263_591590_591850_592234_592342_593334_593482_595425_595506_599422
669993	contig_14441_pilon	+	1446	4	Intergenic	novelGene_100737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	376.549539311304	75	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	251	763	121136	126062	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	120732	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120819_120971_121239_125517_125902_126036
669995	contig_9995_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_47700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATATCTTGAGTGGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297187	295729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_295700_297200
669998	contig_18850_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_142406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGATGACTGGATAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147687	148890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_147700_148900
669999	contig_18850_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_142407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCTCTGCATTCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148890	149959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_148900_150000
670001	contig_17440_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_7667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3603	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
670006	contig_4769_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_118033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCTGACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392689	1391673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1391700_1392700
670007	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670013	contig_9206_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_137484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTTCATATATTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131136	131736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_131100_131700
670023	contig_1939_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_144859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTTTGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210398	212772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_210400_212800
670031	contig_8980_pilon	+	2243	3	Intergenic	novelGene_74009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGGCAAACAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630352	644711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_631671_642234_642351_643902
670038	contig_6691_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_60185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCCCTCGAATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453438	454152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_453400_454200
670042	contig_6710_pilon	-	268	2	Intergenic	novelGene_98318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATAGTCGCTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657174	653645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670051	contig_19986_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_159229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAACCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47113	47584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_+_47100_47600
670055	contig_12871_pilon	+	2387	2	Intergenic	novelGene_140367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	20	junction_1	0	680	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	68	769	10115	10816	FALSE	30	TTCACAAATTGTGGGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPQQVSALPPPPMQYIKEYTDENIQEGLAPKPPPPIKDSYMMFGNQFQCDDLIIRPLESQGIERLHPMQFDHKKELRKLNMSILINFLDLLDILIRSPGSIKREEKLEDLKLLFVHVHHLINEYRPHQARETLRVMMEVQKRQRLETAERFQKHLERVIEMIQNCLASLPDDLPHSEAGMRVKTEPMDAGDGNSYTGQNEQQRENSGHRRDQIIEKDAALCVLIDEMNERP	4302	12434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_4353_10097
670056	contig_7428_pilon	-	2364	7	Intergenic	novelGene_77718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	52.7596752580352	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	74	1447	428586	424970	FALSE	25	TGGATATCATGTGTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDSGRRCRTWRDARLGDSDLLALMFDEPEWTEEAPVATALAPVATGPRPAAAVQTKGLKHRQLLATLRALEAASLPQQPPSLPGSDSEEEEIEKKKKRRKKASFASASAEVEEKRKKKRQKQASYGSDSEDEEVERKKKSCKQALLGSGSVEEEKRKSKCQKQAPSSRAQHLDSGDQTDSKAQKGSATNDPHKPSPGSASPQPPHALSRKQWRNRQKNKRRHKNKFRPPQPPAQAPALAPTEEAEAPPAPRPDSHEARAGALRARMAQRLDGARFRYLNEQLYSGPSSAAQRLFQEDPEAFLLYHRGFQNQVKKWPLQPVDRIIRDLRQRPASLVVADFGCGDCRLALSVRNPVHCFDLASLDSRVTVCDMAQVPLEDESVDVAVFCLSLMGTNIRDFLEEANRVLKPGGLLKVAEVSSRFEDVRAFLGAVTKLGFKVVSKDLTNSHFFLFDFQKTGPPRVGPKAELSGLKLQPCLYKRR	428659	424052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_425090_425312_425410_425492_425600_425793_425924_426013_426468_426871_427239_428487
670060	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_94825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
670062	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_94890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670063	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_95043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670077	contig_3382_pilon	+	1647	2	Intergenic	novelGene_124022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAAAAAATTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166772	168497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_167234_167311
670078	contig_2854_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_120791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAGAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40054	42762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_40100_42800
670083	contig_16643_pilon	+	1852	5	Intergenic	novelGene_158136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	43.0312386528671	258	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	68	1396	306545	318119	FALSE	20	ACCCCTGTGTTTCAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLEAEGPRPPATPCECVKPALEKGNLLTEPIGYLESCFSTKNGTPRQPSICSLSQACLKIRKSIFNNPEHSLMGLDQFSHVWILFVFHKNGRLSCKAKVQPPRLNGAKTGVFSTRSPHRPNAIGLTLAKLEKVEGGAIYLSGIDMVHGTPVLDIKPYIADYDSPQNLIEPLGDVNLQDNKHKPKTSFEFRSSGVTDNCDQQQLSGCVEPHPCTSTKEKPTCPEDRTSEEIHVEHDDTAKIRHSLKHGEEIAAGYGSESRSDQSLSVAEKQVGSCHQEKSFSEEGTDKRSRRGQEAAILRGNSVQTEPGALRYPSGAADEARHSVVPAWVRDAPVTTLEVRFTPHAEMDLRHLSSDVGQTAFKYFQSAEEAKHAIEAVLSADPRSVYRRKLCQDRLFYFTVDIAHVTCWFGDGFAEVLRIQHASEPVQMTDPAESLVSLGS	306477	318575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306621_310794_310970_314690_314849_315641_316302_317859
670086	contig_12841_pilon	-	2998	1	Intergenic	novelGene_55872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGACAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445169	442171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_442200_445200
670087	contig_12000_pilon	+	1269	7	Intergenic	novelGene_43149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	677.162892761655	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	112	744	417192	669310	FALSE	20	TATATCACATGTTGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLSVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELASTADTCRQTQNRQRRIMTNRKRSAGNP	416842	669835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_669224
670091	contig_15063_pilon	+	1547	5	Intergenic	novelGene_10307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	2	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
670095	contig_20493_pilon	-	2204	8	Intergenic	novelGene_86394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.087070732083	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	852	1610	49119	38009	TRUE	35	TCAGAAAACCTGATTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWSMTLSAST	49970	36419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36853_37459_37566_37953_38037_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978
670100	contig_5217_pilon	-	2123	14	Intergenic	novelGene_135738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_4	84.5880375388539	304	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	846	1844	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533520	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766_531863_532688_532777_532869_533000_533128_533246_533343
670101	contig_5018_pilon	-	2123	6	Intergenic	novelGene_46974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.2481578437062	159	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	295	1758	579914	548103	FALSE	10	TATTTGGTTTGAGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLPQKKLYRDVMMETFRNLASVVSQNLNNGEKSSSEHIIVRFMKKNTWSSMLGEISELHGNKDPHKNERIHLRRHTVENLCESNEVIQCGKTFSWIPNLTVVKRNLPEVNPFECCECGKAFMDHSSNKYRTRSHIGCSHQHCKQCEACSCLSHLTTTMKTITGKKLQKYMVCGKDCISTLKNSVTTLTGGKHYECNECGKHFCSFPSFCAQVRGHKHECKECKTCSPSSLILHKKIYNRDVPYECKECGKAFSRSSALAKHIRTHSGERPYECKECGKAFSFSSALTLHVRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSAVAQHIRTHSGEKPYECKECGKAFSYYSRLTAHIRAHSGEKPYECKECGKAFSRSSRLTAHIRAHSGEKTYECKECGKAFSCSSVLAQHTRTHSGERPYECNECGKAFSSSSALIKHIKTHSGERPYECKECGKAFSCSSYLTQHTRTHTSLNL	600069	547737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_548120_548497_549664_550247_550399_558599_558727_579911_580147_600007
670106	SIRV7	-	938	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	49	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAATCCTAAGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680_114989_147611
670115	contig_5324_pilon	+	2055	10	Intergenic	novelGene_102056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_3	25.2254036172728	216	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	215	1408	406487	414398	FALSE	35	AGATAAAATGTAGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIRLELGRQNFHPLNRRSFLLLKLTAIVFVVLLFCEFLIYYLVIFQCNWPEVKTPAHGRDQGTPEPVLKAMFLADTHLLGEVRGHWLDKLRREWQMERAFQTALWLLQPELVFILGDIFDEGKWSSPQAWADDVARFQKMFRHPRHVQLKVVAGNHDIGFHYQMNTYKIKRFEKVFNAENLFSWKGINFVMVNSVALEGDGCSICSESEAKLIEISHKLNCSRKQAPPSGPCGAGQQLPASAPVLLQHYPLYRRSDANCSAEDAAPPEEKNIPFKEKYDVLSREASHKLLWWLQPRLVLSGHTHSACHVIHSGGVPEVSVPSFSWRNRNNPSFIMGSITATDYSLSKCYLPLEGTVLATYCGAAVVLLALLLAHFELLALPFLFGWNLLRKHKVI	393336	415045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_393450_406385_406768_408320_408430_410056_410161_410923_410999_412611_412721_412860_412930_413009_413133_413664_413806_414215
670119	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_90582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670121	contig_15687_pilon	-	2170	9	Intergenic	novelGene_129147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	44.8664685483491	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	132	641	195341	190393	TRUE	20	TTTAACACTGGGGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRVSI	198876	187392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_188191_189274_189348_189734_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198808
670125	contig_18869_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_56290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTCATCCAAGCACTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73354	73586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
670126	contig_854_pilon	-	1528	10	Intergenic	novelGene_36421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	133.206606442774	705	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	128	436	1081689	1074162	TRUE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQRQLLGTPKPQGGWTEVRGKLSLAWGHETLCHLFPWTLTAMIQPQQLRAESDFEQLPDDIPISANIADIEEKRGFTSHFVFVIEVKTKGGSQVPHLPPLPPVLCLADQAGGAVRAREQDQPLHLQPPHPPSQSLHGCEEGDS	1081816	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069909_1070596_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
670139	contig_11989_pilon	-	2244	15	Intergenic	novelGene_68447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_7	298.938504699272	40	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	19	1608	226870	56107	FALSE	30	GCCTCTCAGGGTGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAVSSALAFLRYLKLYTDSSFHFIWGQIITDEGNDQNLLPACRTVLLDQRVLNMVNKGKKWHEMKMEV	226888	55470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
670140	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_95029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670141	contig_16385_pilon	+	1873	16	Intergenic	novelGene_86193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_8	143.183735885827	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	35	1693	3004	36650	FALSE	10	GTGATTGGGTTTCTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2969	36830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
670145	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670148	contig_9807_pilon	+	1508	11	Intergenic	novelGene_32884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	534.127662642556	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	90	809	109130	151770	TRUE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLEEVLQHRPRLRA	109040	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140347_151732_151820_154095_154270_156624_156770_158676
670152	contig_6230_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_102105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGCAAAGGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164406	167022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_164400_167000
670153	contig_16098_pilon	-	1198	7	Intergenic	novelGene_46080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1934.83855915681	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	118	516	458816	456936	TRUE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTSTWKAPC	460244	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456622_456721_456961_457856_457907_458405_458618_458704_458838_460148
670154	contig_11512_pilon	+	1049	2	Intergenic	novelGene_43309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACCTTTTATTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376198	403312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_377114_403178
670164	contig_8106_pilon	-	1689	2	Intergenic	novelGene_139744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	48	299	131724	128965	FALSE	45	TGATTCTTATAAAGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELCGVRGHGWSTVLEMLCVERPLLSPPGRPSYGTSSEARTWRRCRPPPLASRASTTTTTATPAASPAWVKLLCRHMTTTASPQTMARAPQSWPAWAPA	131771	127574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_129015_131522
670167	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_16464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27818	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
670175	contig_6102_pilon	+	1453	9	Intergenic	novelGene_32267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	39.5740998002481	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	71	1102	1444370	1449029	FALSE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444299	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446536_1447950_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
670179	contig_5896_pilon	+	1830	5	Intergenic	novelGene_159241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	16.2076370887307	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	58	1434	111338	118599	FALSE	20	TCAAGTCTGAGTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAAMPLKARQQEVVTFEDVAVYFTRTEWAGLSPTQRALYRHVMLENYGNLTFLGYPVPEPSLISLLEGGDLPWGLETQDDPPAERTKDICKDAETSIPSESTSTQRISGERDMISCGLQKNVLQGTDFPETCELEKHQKIPTLENIGGKVERVHYARKPFRCEECGKCFSYFSYYVRHQRVHTGEKPFECNECGKAFNGNSSLMRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNSFTSSSEFIIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLIRHQKIHTGEKPYECNECGKSFRRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFECVDCRKAFSAKEQLKRHFRIHIQESSYVCDECGKDFTSKRNLLQHQKIHTGEKPYEYSKYEKTFRTSSQLGRHEHVQPGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW	111069	118995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_111099_111309_111374_114893_115021_115561_115676_117499
670184	contig_7318_pilon	+	2525	8	Intergenic	novelGene_152233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.123942569749	206	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	171	863	331708	343304	TRUE	30	TTGTTATCTATAAGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKDFETWLDNISVTFLSLTDLQKNETLDHLISLSGAVQLRHLSNNLETLLKRDFLKLLPLELSFYLLKWLDPQTLLTCCLVSKQWNKVISACTEVWQTACKNLGWQIDDSVQDTLHWKKVYLKAILRMKQLEDHKAFETSSLIGHSARVYALYYKDGLLCTGSDDLSAKLWDVSTGQCIYGIQTHTCAAVKFDEQKLVTGSFDNTVACWEWSSGARTQHFRGHTGGGI	326392	355742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_326434_326535_326645_331687_332198_340980_341177_343297_343432_345626_345714_346358_346529_354464
670189	SIRV7	-	327	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33221	21	2	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
670195	contig_7816_pilon	+	1556	12	Intergenic	novelGene_66517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_5	922.712144972276	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1410	145	1554	183050	211598	FALSE	35	TGGCATTGACAAGGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKM	182046	211600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
670198	SIRV5	-	466	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCACGGGTGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
670200	contig_7744_pilon	+	1456	11	Intergenic	novelGene_62521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	92.1359864548049	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	124	912	825487	830496	TRUE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEVRPA	825363	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829381_830494_830537_830626
670201	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
670205	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670216	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
670218	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_97587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670221	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670226	contig_8330_pilon	-	1552	7	Intergenic	novelGene_71977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	308.928659510034	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	183	887	2056084	2038853	FALSE	30	TTTCTTAAATGGAAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056558	2038187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056390
670235	contig_11370_pilon	-	2117	8	Intergenic	novelGene_98766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	99.3082194432042	552	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	477	1355	217758	215829	FALSE	10	TTTGGAGCCCCGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDRSGQGKVYGLIGRRRFQQMDVLEGLNLLITISGKRNKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDMEGCGHYRVVKYERIKFLVIALKSSVEVYAWAPKPYHKFMAFKSFADLPHRPLLVDLTVEEGQRLKVIYGSSAGFHAVDVDSGNSYDIYIPVHIQSQITPHAIIFLPNTDGMEMLLCYEDEGVYVNTYGRIIKDVVLQWGEMPTSVAYICSNQIMGWGEKAIEIRSVETGHLDGVFMHKRAQRLKFLCERNDKVFFASVRSGGSSQVYFMTLNRNCIMNW	218341	215066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_215913_216319_216460_216563_216724_216804_216955_217036_217138_217311_217447_217649_217794_217900
670238	contig_7051_pilon	+	2186	12	Intergenic	novelGene_64346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	477.525110758543	1	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2007	179	2185	331836	347553	FALSE	55	TAGATAGAGATAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRS	321869	347554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338679_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
670241	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
670255	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670256	scaffold_9100_pilon	-	1567	10	Intergenic	novelGene_83295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_9	278.248800647421	997	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	139	1314	796487	746337	FALSE	10	TTTCCTCTTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETINVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPNVSASYPPYQATGPPNTSYMPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	796625	746083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274_749478_768983_769076_774460_774528_777866_777994_781780_781945_783998_784065_786207_786293_796445
670258	contig_11978_pilon	-	1885	14	Intergenic	novelGene_62884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	111	junction_8	85.0464544133618	250	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	69	1595	729777	721097	FALSE	15	GCCATTACTTATTCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVADHHQHVPIDIQTSKLLDWLVDRRHCNLKWQGLVLTIREKINAAIQDMPENEEIAQLLSGSYIHYFHCLRIVDLLKGTEASTKNIFGRYSSQRMKDWQEIVALYEKDNTYLVELSSLLVRNVNYEIPSLKKQIAKCQQLQQEYNRKEEEGQAGAAEMREQFYHSCKQYGITGDNVRRELLALVKDLPSQLADIGAAAQSLGEAIDLYQACVGFVCESPTEQVLPMLRYVQKQGNSTVYRWRTGTEPSVVERPHLEAPPEQVEEDAIDWGDFGAEAASEGIDYGISAQAAGIDWGISLDSDSKEAGSDGIDWGDDAAVSQITVLEAGTQAPEGVARGPDALTLLEYPETRNQFIDELMELEIFLSQRAVEMSEEADILSVSQFQLAPATLQGQTKGKMVTMVSMLQDLIGQLTSLRMQHLFMILASPRYVDRVTELLQQKLKQSQLLALKKELMVQKQQEALQEQAALEPKLDLLLEKTRELQKLIEADISKRYNGRPVNLMGTSL	729845	720806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_721163_721268_721441_721813_722020_723327_723417_724025_724105_724509_724621_725025_725171_725394_725532_725771_725951_726577_726627_726994_727096_727351_727484_729505_729555_729765
670261	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670266	contig_7513_pilon	-	2149	10	Intergenic	novelGene_88977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	89.3905289539483	191	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	128	1081	295239	269761	FALSE	35	AGAGAAGTCCTTGCGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRAQEIPMWQPNMEDSAALDMRGIGQVLPAHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLSRGSVDRDDGGLQGPTGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPCHLGSLASLSSPGDSYNEGVKLQPQEISPRPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPVLPASTHREIEMAQKLLNSDLGGLINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLAQTRPH	298978	268692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279737_280088_280129_282426_282490_290337_290470_291263_291402_295215_295303_298914
670269	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	23	367	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14431	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670275	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670286	contig_12638_pilon	+	2715	16	Intergenic	novelGene_33257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	225.377510462384	3	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	239	1948	830585	861300	FALSE	30	ATTTTAAATGACTGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLDEVPNLSSLVSNFDQQQLANFCRILAVTISEMDTGNDDKHTLLAKNAQQKKSLSLGPSAAEINQAALLSIPGFVERLCKLATRKVSESTGTASFLQELEEWYTWLDNALVLDALMRVANEESEHNQGASEENGLPHTSTRTQLPQSMKIMHEIMYKLEVLYVLCVLLMGRQRNQVHRMIAEFKLIPGLNNLFDKLIWRKHSASALVLHGHNQNCDCSPDITLKIQFLRLLQSFSDHHENKYLLLNNQELNELSAISLKANIPEVEAVLNTDRSLVCDGKRGLLTRLLQVMKKEPAESSFRFWQARAVESFLRGTTSYADQMFLLKRGLLEHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	812884	862067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_812943_815113_815162_826236_826366_830581_830790_836185_836372_845396_845540_850769_850902_852617_852677_854778_854881_855928_856013_857044_857136_858213_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162
670292	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670295	contig_1532_pilon	-	1867	8	Intergenic	novelGene_37444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	341.927250885271	35	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	58	1269	51365	41713	FALSE	10	CCATTTGTTTGTTGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPEQRFLSDSTSENSKIETMQDLHVANAIFALNFFKHLANTSPTQNLFFCPWSISSTMAMVYLGARGNTADQMAQVLQFNKVGGHKIIPVTPRKFTSCEIRQWIQKATYPDAILQSLISAINSSSGGYLLESINQLFGEKSTRFNEEYVKLCKKYYSTEAQAVDFLEHAEEARKKINSWVKTQTKGKIPNLLPEGSVDRETRMVLVNAVYFKGKWKTPFQKKLNGLYPFRVNATERKPVQMMYLHERLNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDGVADVSTGLELLEGEITYDKLNKWTSKDTMVEDDVEVYLPQFKLEKRYELKPILRSMGISDAFSKGQANFLGMSERNDLFLSEVFHQAAVDVNEEGTEATAGTGAIMTGRSGHGGPQFVADHPLLFFIMHRMTRSILFLGRFSSP	55493	41114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_42118_42429_42595_43684_43828_44479_44598_45389_45483_47118_47239_51197_51375_55445
670302	contig_11473_pilon	+	2322	10	Intergenic	novelGene_159253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	101.560539629703	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	113	1015	117661	137192	FALSE	55	TAGAGGAAAGCAAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILEGSGVMNLNPSNNLLHQQPAWTDSYSTCNVSSGFFGGQWHEIHPQYWTKYQVWEWLQHLLDTNQLDASCIPFQEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGTAGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEETDPSIMNTWKEENFLYDSNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQNHPAKSHTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGIFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN	94683	138499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_+_94718_102785_102861_117657_117758_122003_122250_124870_124934_127740_127810_127925_127995_135095_135159_136794_136991_137092
670303	contig_13894_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_62169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCGTTTAGTCTGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528173	527485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_527500_528200
670304	contig_13894_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_62164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCAGACCCCACACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527533	525219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_525200_527500
670306	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670312	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670322	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1458	635	1003	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2458	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
670323	contig_6710_pilon	-	587	2	Intergenic	novelGene_89060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GTTTTGCTCTCCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670324	contig_7457_pilon	-	2032	3	Intergenic	novelGene_31516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	173	610	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGATGGTATGGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692782	673515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_675452_676860_676887_692712
670325	contig_14101_pilon	+	2263	5	Intergenic	novelGene_122761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46.6442654567526	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	90	1103	260068	273778	FALSE	25	CAAAATCCCCTGTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257210	274938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260262_260402_260825_264602_264833_273610
670326	contig_9919_pilon	-	1027	2	Intergenic	novelGene_137994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGTCTTACTGACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839705	834859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208
670327	contig_6102_pilon	+	1583	13	Intergenic	novelGene_31773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	239.035562207802	151	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	165	1136	350018	356809	TRUE	15	TCCATCGTCTTCAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQVNLLPSLNLQFCSCPMAPCG	349853	357635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356567_356746_356875_357038_357093_357307
670328	contig_6710_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_96080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAACTGTTCCAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
670330	SIRV7	-	397	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33166	6	-53	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114791	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
670345	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670359	contig_10042_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_79168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725014	722321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_722300_725000
670360	contig_6048_pilon	-	1938	14	Intergenic	novelGene_73285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	88.8343315477663	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	100	1572	2006289	1978823	FALSE	15	CTGTATTTGCCTGAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049092	1978456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979273_1980532_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
670366	contig_9011_pilon	-	904	2	Intergenic	novelGene_159316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTGTTTAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509442	508069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_508880_509348
670376	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_89262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653730	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
670380	contig_5649_pilon	-	1672	8	Intergenic	novelGene_82457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	98.6099303688373	60	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	164	1072	1570696	1564135	FALSE	15	GTGGAGACTCCTGTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573697	1563534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
670386	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670391	contig_8631_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_121950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691216	689663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_689700_691200
670403	contig_12270_pilon	-	333	2	Intergenic	novelGene_114072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	23	331	14409	13878	FALSE	20	CGCAGTTTATTACTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14431	13875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670406	contig_18869_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_56081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCGGTCATCCAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
670408	contig_5093_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_135089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTTGAATGATCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570912	572336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_570900_572300
670414	contig_9146_pilon	-	1178	4	Intergenic	novelGene_79489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4271	junction_1	313.853823016738	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	629	1135	146356	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	146984	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303
670417	contig_7356_pilon	+	1690	5	Intergenic	novelGene_60391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCACTGACGCCACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432519	457913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_432962_433130_434072_435515_435620_437471_437532_457770
670421	contig_4315_pilon	-	2279	1	Intergenic	novelGene_46874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAGAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879266	876987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_877000_879300
670423	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670424	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_90341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670426	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670435	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
670436	contig_8658_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_55818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGGTCATGGCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5701	55612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_6236_6700_6808_13102_13267_30045_30252_32586_32688_34540_34626_36521_36672_55526
670441	SIRV6	-	338	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCGAATTTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
670446	contig_14882_pilon	-	1642	9	Intergenic	novelGene_115026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	412.099730041164	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	582	1208	317252	310014	FALSE	25	ACAACATCTTATTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGEVSGLRANFISYLIFLFCFC	363647	309579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321739_363416
670451	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670452	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670456	contig_3380_pilon	-	2374	4	Intergenic	novelGene_60078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	33	junction_2	102.032674505115	908	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325070	59115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_61224_84891_84950_226563_226680_324978
670458	contig_15087_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_37292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCTGCAAAATCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302115	303727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_302100_303700
670467	contig_8712_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_58834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGAAAACTAGATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335368	334102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_334100_335400
670470	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	856	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670472	SIRV6	-	285	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-53	457	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGTTTCTTGACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1873	1087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
670477	contig_6048_pilon	+	2102	6	Intergenic	novelGene_73191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	221.987747409626	1140	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	30	590	1449652	1477565	FALSE	5	ACCCGCGTTTCTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLGSRKAAMASSAASSVRPPRPKKEPQALVIPKNAAEEQKLKLERLMKNPDKSVPIPEKMSEWAPRPPPEFVRDVMGSSAGAGSGEFHVYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDAEFQKRLERNRIAAEEQTAKRRKKRQKLKEKKLLTKKMKLEQKKQKEGSSLSQEQQSSSSEEASGTEEEEEDEPSFIMRR	1449622	1479077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1449778_1450546_1450626_1451714_1451816_1456961_1457048_1457767_1457836_1477464
670479	contig_12644_pilon	+	3427	1	Intergenic	novelGene_44501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	938	1240	1052802	1053104	NA	85	AAAACAAACAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFLLSKSDDITPLLKILYRLSIFCMNLPCVYLSGHSPLHSLCSSTTGVPSWHTSLPIWGLTPLCPYNLVLNITSSERTMFPCCISTEVTVFLLHGTLQL	1051864	1055291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1051900_1055300
670481	contig_12886_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_135457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	709	1017	248211	247903	NA	35	ACTCCTAAATGAGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLSLRKVHTVGKRKNQDSNHFLFDFEQQPATLPVAETLTPGDLMWVTVELGSIGFSMVDFAEVDCQNFLLRCLHTSLKLSVSPLSLQTQLTGSDSSIKSI	248919	246609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_246600_248900
670482	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670484	contig_7070_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_104054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAATTAAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209525	211463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_209500_211500
670494	SIRV7	+	1752	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	89	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTCTTGCTGAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	43050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1816_1864_2679_2996_3111_43027
670501	contig_7909_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_155937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAAATAAAATACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970119	971049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_970100_971000
670502	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670503	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670518	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_91995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670520	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670537	contig_14322_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_115644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGTTTATTACTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388494	386407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_386400_388500
670538	contig_6062_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_5272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	712	1020	668197	668505	NA	65	GACTTAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYQDWRKIVNLQYADDTALLAENEEDLKHLLMKIKHYSLQYGLHLNIKKTKILTIGPISNIMINVEKMEVVPWIHKQCPWKQQPRNQMMYCIGQICCKRPL	667485	669763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_667500_669800
670541	contig_3394_pilon	+	2730	1	Intergenic	novelGene_152725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTTTGCTTTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567694	570424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_567700_570400
670546	contig_9345_pilon	-	931	2	Intergenic	novelGene_24583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	26153	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	280	717	945468	944755	FALSE	5	CTGTGTGTGTTTCCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945747	944540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
670551	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_94798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
670554	contig_9345_pilon	-	1549	6	Intergenic	novelGene_24351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.324843141873	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	376	1215	142974	141438	FALSE	10	TGCTTCCCTCGTTCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHNLAQLGFDPLGGGPTAPWSLCHAHWGLVISKHLRHSPTHLTDCSQGQFQHLTAVSLHCLCTLPGTTWRARAAHGSGCLWGSFPALVGLALAISGQDGLCPPTDSGLLPALFFFLVKYSAPCSVSNMCDSC	176108	141103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141830_142197_142414_142567_142781_142955_143086_173643_173789_175989
670555	contig_6870_pilon	+	2293	1	Intergenic	novelGene_104005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540585	1542878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1540600_1542900
670556	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670560	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670566	contig_3601_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_132897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	588	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAGGGAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188427	186676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_186700_188400
670569	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670571	contig_11720_pilon	+	4021	19	Intergenic	novelGene_44046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_1	59.2799385214856	78	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1166	3501	249	3749	569260	588257	FALSE	20	GTTTCTACCTTCAGAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGTEQYSIGLRRGNSFKQSGPSGAVHASPVEKPSEGKVWSQAHQQVKPIWKLEKKHVGTLSTGLGPGLLGVPPQPAYFVCPSTLCSSGNTAVIAGHSNSCYLHSLPDLFSSTLLYRRSNYRHKPYQQLESFCLRSSLSEKRPFSLPQKSVPVSLTASKTTFSTVSPMASSSVDPYLSSLEAAGENSLGKSLASAISGKIPSPLSSSSYKPMLNNNSFMRPNSTKVPLSQAPEGLKLVSTPKIQIVSWHHSGGTGDCTSQPIEHKVPKSNGTVLNDATAPTTMSIPSSLDTFIASVASPQYNRNNSAMRTEPHLSGLDDDSDSQAQTKEVRFTEAVRKLTASSFGKIPGQGYQFEQSCFVNPSFQWSLLNKNRRWESPMVGQQFPQEDAGADSRILPGASDTLGSDSTVFCTKRISIHLLASPANGLNHSPTCGSAIDSPPLGGDRTPLPPSPPQPLGVADVATHLSSIHLGQPMKEPKEDRQLDSPGRDIGSATDLQPDQVEAEDVEEDLVDGLEDCCSHDENEEEEGDSECSSFSAVSPSESVAVISRSCVEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSASFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSHFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWENSSRQKWIVKPPASARGMGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYSPSVKSLGNKFMHLTNYSVNKKNVEYQANADETACQGHKWALKALWNYLSQKGINSDIIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYNCHELFGFDVMLDENLKPWVLEVNISPSLHSNSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPSAEDILSSSSSSSSSTTSLTSTPRDKFRMAPEHFTAQKMKKAYYLAQKIPDQDFYASVLDVLMPDDVRVLVEMEDEFSRRGQFERIFPSRISTRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHSNKLKGVDLLRSWCYKGFHTGVVSDSAPVWSLPTSLLTVPKGDVMLNAFCKSEIGNLGKPNSSKDIEDTSKEPSLSSQMLPLIKYSGQTSRLSASPISQSTSDFLLAAVSP	548948	588529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_549099_569161_570741_571808_571919_572281_572346_579804_579930_580391_580503_580873_580951_581674_581867_581961_582045_582287_582417_582793_582917_583219_583319_583639_583775_584231_584370_585660_585764_586645_586857_586988_587060_587459_587546_588094
670575	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670580	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670582	contig_11855_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_66899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730531	728105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_728100_730500
670586	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
670587	contig_12327_pilon	+	2024	5	Intergenic	novelGene_140619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	798.729733702208	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	129	674	168930	171003	FALSE	15	TTCATGAGCTTTTCAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148591	172353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168896_169078_169396_169508_170312_170438_170841
670588	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1116	0	-1116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGACGAGCCACCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
670589	SIRV4	+	312	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	200	438	200	-438	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTCCAATTGCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
670595	contig_18420_pilon	+	1189	2	Intergenic	novelGene_109337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74668	76858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_75144_76144
670601	contig_8452_pilon	-	2576	16	Intergenic	novelGene_47970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	372.867125573351	1	115	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	200	1957	124678	75102	FALSE	15	TCTTCCTTGCATCATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPRNSRHECEAAGVVSTSVAAAVAAVAAPAGGGPRPASGRCFLPAGPGARQLLRGRKKERRVQGGMLFPPGLIFAKHQKENAHLKILVRYYLGKELNLHHTRFEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	145852	74482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116574_124564_124680_145654
670602	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670607	contig_8435_pilon	+	749	2	Intergenic	novelGene_72021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCTGCTTGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96755	98015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_97164_97674
670608	contig_12586_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_121805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACGACCTCCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57278	55153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_55200_57300
670609	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
670610	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670611	contig_14796_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_159370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCATGTACAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141149	141424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_141100_141400
670614	contig_18869_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_56162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73597	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
670615	contig_7410_pilon	-	2325	1	Intergenic	novelGene_106042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAGAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37845	35520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_35500_37800
670619	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670627	contig_11328_pilon	-	3680	7	Intergenic	novelGene_88379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	31.4218607554253	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	75	902	615581	590049	TRUE	60	TCAGAAAAGTTGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWLPAAARGPSRLQGSRPQCLRAAMGASHWWDQLRAGSSEVDWCEDNYTIVPAIAEFYNTISNVLFFVLPPICMCLFRQYATCFNSGIYLIWTLLVVVGIGSVYFHATLSFLGQMLDELAILWVLMCALAMWFPRRYLPKIFRNDRGRFKAVVCVLSAVTTCLAFVKPAINNISLMTLGFPCTALLIAELKRCDNVRVFKLGLFSGLWWTLALFCWISDRAFCELLSSFHFPYLHCVWHILICLAAYLGCVCFAYFDAASEIPEQGPVIKFWPSEKWAFIGVPYVSLLCASKKSPVKIT	615655	587084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_589856_590041_590236_593081_593220_598060_598199_605470_605613_606316_606432_615473
670632	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670633	contig_6710_pilon	-	586	2	Intergenic	novelGene_93001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670634	contig_17386_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_157948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATACATGCCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435741	433648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_433600_435700
670639	contig_13481_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_119343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGATGCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367439	365556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_365600_367400
670641	contig_8576_pilon	+	1309	5	Intergenic	novelGene_88804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	271.945766652103	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	60	857	902723	913464	FALSE	45	AAAGAAAAAGGAGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIK	893751	913916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245
670646	contig_8606_pilon	-	645	5	Intergenic	novelGene_159396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_1	115.337548092544	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	158	595	155240	48194	FALSE	25	TGAAAGTGTTTGCTTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKAPGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPREHPFVLQSVGGQTLTVFTESSSDKLSLEGIVVQRAECRPAASENYMRLKRLVFFNFKMIRDSSFWD	155397	48143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_48328_120223_120369_121436_121456_142027_142102_155174
670647	contig_8606_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_159395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGAGTATGGAGGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47646	46000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_46000_47600
670654	contig_19606_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_148270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43282	45084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_43300_45100
670663	SIRV6	+	231	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	66	486	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
670670	contig_3529_pilon	-	2845	11	Intergenic	novelGene_105334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_10	50.3523584353305	181	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	109	2523	480805	470105	FALSE	20	ATACTAGTTTATGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLSQLRSRPPGPARSLRTAHDIDGPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVIMAIGIKMEGLECHVFIGGIPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPASVRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVTSYPLAHKIFEEKAQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAVAKLKQFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMKIAQKCNLNLFPLPDPIPPGLMEECLDWDVEVTAAVHTYGLASVPTQALKKQIKKIERTFQTPKAHGNQMASSRVTSGSALSAKSKSNTKQKLPVKSHSDCVIIEKVASPKEPGCAIPPEEQVKDSTQTPVENSTDSQHQVKEDLPVSLPKIPCLSSFKTYLPCTLTYAELVEDYERYIKEGLEKPVEIIRHYTGPGDQTGNLQNGFVRERVAEERMQILASSSQSGDSESDSDSYSSKTSSQSKGNKLYLEGSSDTHLKASESTPVDGCISLEQPLNGNDTPNLEEYQESPEIQVKARHKEGANQRAKQSRRNPPRRSSYRLQTEPQEDGWYDCHRETHPSFFDACQDYEEYWRAYYRAWQEYYAAASQSYYWNAQRHPNWMAAYHMNTIYLQEMMRGNQR	480913	469782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_471271_474167_474270_474387_474494_474846_474930_476426_476486_476587_476727_476882_477026_477142_477258_477852_478022_480030_480126_480567
670679	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_95888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670690	contig_10487_pilon	+	2359	5	Intergenic	novelGene_159413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	7.87400787401181	115	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	562	1149	220938	245004	FALSE	35	AAATATTTGGTTTATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFSKNHGVVVQPTYKDRVNITHPGLRNTTLTFWNTTLEDEGCYMCLFNIFGSGKISGEACLTLYVQPTVSLHYKFFEDHLNLTCSATARPAPVISWKVAGSGIENSTESVSHPNGTTSVTSILQVKDPESYVGREVICEVLHLGTVTDVRETVSKGFWFSVPLLLSILSLVILLVLISILLYWKRRWNQDREP	210120	246214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10487_pilon_+_210554_220809_221137_223552_223826_225614_225723_244996
670691	contig_9919_pilon	-	2310	14	Intergenic	novelGene_137991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	79.1781004927065	334	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	20	1072	866377	853180	TRUE	25	TATGTCTTACTGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRKATGGGSLGRTLIRRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILLNGIPKLSLKTLISMRLEFHTMRLNVSQAGVLPHLVKVPPVMKTTVSMRTVRRRRKKTGRHVRKKTATLKSPVARTGRKAVLWILILRTGEPHRRGRHTILAI	866396	834858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026_843107_845428_845553_850459_850604_850743_850846_853096_853474_855898_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
670700	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33226	0	7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
670707	contig_14322_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_116347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671887	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
670708	contig_6589_pilon	-	1433	5	Intergenic	novelGene_25815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_4	55.6433958345463	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	91	729	747015	732935	FALSE	5	CTCCTTGTTCTATCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFRFLGDLSHLLAIILLLLKIWKSRSCAGISGKSQVLFAVVFTARYLDLFTNYISLYNTCMKVVYIACSFTTVWMIYSKFKATYDGNHDTFRVEFLVIPTAILAFLVNHDFTPLEILWTFSIYLESVAILPQLFMVSKTGEAETITSHYLFALGVYRTLYLFNWIWRYHFEGFFDLIAIVAGLVQTVLYCDFFYLYITKVLKGKKLSLPA	747105	732230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_732970_736851_737105_745387_745547_746140_746242_746924
670711	contig_675_pilon	+	2416	2	Intergenic	novelGene_136352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	502	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	168	770	211006	211608	FALSE	45	AACTACCAATAAACTACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSTRVVPPACQPVLTHLDTNSNSGGVLQLNHLGRKVQTRNEEIISTWDTYLQLEMGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	210389	213254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_210468_210916
670713	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670717	contig_401_pilon	+	1429	12	Intergenic	novelGene_42810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	1526.89489373988	488	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	83	1195	1711949	1715475	TRUE	10	TCTTATGTTTTTGGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYNNGGGGGGFGGGSGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711866	1718331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1714325_1714476_1715077_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
670720	contig_8462_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_159417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTCTAGAACTAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223608	224657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_+_223600_224700
670726	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670732	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	192	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670735	contig_4364_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_2686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532949	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
670741	contig_10000_pilon	-	1692	7	Intergenic	novelGene_139308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	310.206741097324	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	107	817	192773	159846	FALSE	15	TTTCCAAGAGTGTGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCFAGLLILSPLTVISDSSRPADSGKAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	194701	158970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_192582_192801_194622
670773	contig_6227_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_49635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTAGAAACAGATCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355905	355403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_355400_355900
670775	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670778	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_94667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
670779	contig_14441_pilon	+	798	4	Intergenic	novelGene_100660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	192	620	116728	117610	FALSE	10	GGCGCTGCCTACGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112111	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
670781	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670788	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_95844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670794	contig_6233_pilon	-	1487	12	Intergenic	novelGene_74781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	298.473333111205	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	307	1194	149777	143464	TRUE	30	CACAAAGCTTTGGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250159	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
670795	contig_675_pilon	+	2548	2	Intergenic	novelGene_136348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	358	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	283	885	211006	211608	FALSE	30	TCGAGGCACTAGGAGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	209572	213271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_209766_210916
670797	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670800	contig_13740_pilon	-	1714	11	Intergenic	novelGene_34674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3987.53262181013	2	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	255	1193	161951	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGENLQTVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165412	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161723_161922_162031_165237
670811	contig_5502_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_154980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGCCCAGGGACAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370490	371040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_370500_371000
670812	SIRV1	-	170	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3934	0	3660	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6706	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
670820	contig_7356_pilon	+	1146	13	Intergenic	novelGene_60336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_11	50.8928613199664	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1086	59	1144	30625	85450	FALSE	10	CTCCTTTGTTACTCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELKLGELLHDKLFGLFEAMSAIEMMDPKMDAGMIGNQVNRKVLNFEQAIKDGTIKIKDLTLPELIGIMDTCFCCLITWLEGHSLAQTVFTCLYIHNPDFIEDPAMKAFALGILKICDIAREKVNKAAVFEEEDFQSMTYGFKMANSVTDLRVTGMLKDVEDDMQRRVKSTRSRQGEERDPEVELEHQQCLAVFSRVKFTRVLLTVLIAFTKKETSAVAEAQKLMVQAADLLSAIHNSLHHGIQAQNDTTKGDHPIMMGFEPLVNQRLLPPTFPRYAKIIKREEMVNYFARLIDRIKTVCEVVNLTNLHCILDFFCEFSEQSPCVLSRSLLQTTFLVDNKKVFGTHLMQDMVKDALRSFVSPPVLSPKCCLYNNHQAKDCI	27107	85452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_27147_30605_30721_31773_31849_35275_35444_51694_51762_51840_51885_53368_53420_54075_54160_54991_55107_72157_72337_74719_74780_78790_78898_85410
670824	contig_15063_pilon	-	1274	4	Intergenic	novelGene_14285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	783	1106	35891	35108	TRUE	25	AGTACCTGAGAGCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35390_35849_36156_36264
670826	contig_14322_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_116398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671881	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
670835	contig_12566_pilon	+	2490	20	Intergenic	novelGene_86006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	115.140285385088	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	550	1758	54121	75427	TRUE	25	TTTTATATCTAACTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRTVSEVWPV	44370	86474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54028_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72611_75399_75483_78929_79092_80117_80201_82709_82866_83210_83277_86264
670836	contig_7333_pilon	-	1676	9	Intergenic	novelGene_142756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_2	67.5166646095614	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	124	1224	170084	125082	FALSE	15	AATCACGTGTGCCCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEEGGAERMEVSTELPQGPQQLASWWDQQADFYTAFMHRLAQLVPEIYFSEMDPDLEKQEESVQMSIFTPLEWYLFGEDPDVCLEKLKHSGAFQLCGKVFKSGETTYSCRDCAIDPTCVLCMDCFQNSAHKNHRYKMHTSTGGGFCDCGDTEAWKTGPFCVSHEPGRADTTKENSRCPLNEEVIVQARKIFPSVIKYIVEMTIWEEEKELPPELQIREKSERYYCVLFNDEHHSYDHVIYSLQRALDCELSEAQLHTTAIDKEGRRAVKAGAYAACQEAKEDIKSHSENVSQHPLHVEVLHSEVMAHQKFALRLGSWMNKIMSYSSDFRQIFCQACLREEPGSQNPCLISRLMLWDAKLYKGR	170207	124629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_125198_125537_125662_125898_125962_132524_132664_135310_135442_149685_149797_151937_152017_156508_156766_170003
670844	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGTAATTTGGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670867	contig_9871_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_75680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	610	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	57	174	223	396	507374	507547	NA	15	TCTGTGTATTCCTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNEKLLCNGKTRKREWQVAGYLFCTNYSQSLYLKSKESCIQKGFVGRNTFILGLTTSLLLFGVFNYFWSEVHSLMIWIYFALIFQCLHLIPGKSNAGEVTGFPLLSFNLSNTIVAELDWWFYTTHLISFYF	507151	509079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_507200_509100
670870	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670873	contig_8241_pilon	-	1832	9	Intergenic	novelGene_157502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.4332739684896	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	6	998	638569	621198	FALSE	10	TTTGCATGTTGGGTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMERLGVDAVSDDAMDSFLEKFQSQPYRGGFHEDQWEEEFEKIPLFMKKAPSEIDPKENPDLACLQSIIFDDERSAEEQAKTYKDEGNDYFKEKDYKKAVISYTEGLKKKCADPDLNVVLYTNRAAAQYYLGNFRSALHDVMTARKLKPCHLKAIVRGALCHLELKNFAEAVSWCDEGLQIDAKEKKLVDTRAKADKLKRTEQRDIRKAKLKEKKEQNQNETLIQAVKARNIRLISEAAGEDEDSASEGLGELFLDGLISENPYGARMSLDDQGRLSWPVLFLYPEYGQSDFISAFHEDSSSTLRMRRGQNYTRCLLRAPCCTRCSIPGTL	638574	620363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_621209_623391_623475_625693_625912_628198_628286_629875_630001_631482_631561_636647_636810_637739_637858_638458
670874	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
670875	contig_7963_pilon	+	1051	6	Intergenic	novelGene_58578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	193.560946474231	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	71	694	254848	257391	FALSE	10	TGAGTCTGTGTTGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRSDVGHYSFSKRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGDRERNVQIEMAHGTTTLAFKFQHGVIVAVDSRASAGSYIANLRVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNRMCRSER	254777	257748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_255753_255911_256024_256447_256578_256972_257178_257368
670876	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670879	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670886	contig_10734_pilon	+	2373	2	Intergenic	novelGene_51299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	945	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	340	393	1368958	1369011	TRUE	45	GAGGAATGAGGCAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSVTSFFRYRCGSVGGQGRREAARRVLQPGAGRRPFLRALPSSAEPAAVSRRPEKSGVPAPARGRTPPAPLVRSKVRLPRAVYQGFRLLQARYPNLRLSSRPPVGPWKSRRRMREGERERGEVEGRPGR	1368618	1378710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369602_1377320
670890	contig_7657_pilon	-	2196	14	Intergenic	novelGene_30009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.0446376928539	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	439	1197	132524	126718	TRUE	15	TCACCTGGTGTGTCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYCLFQALATFFQVPYTALTMLLTSNPRERDSATAYRITMEMAGTLMGATVHGLIVSGAHEPHRCEDARLPLPDGVSPDAIHLYSIAAAVVAVTYPVCTGLLCLGVKERPDRSAPASGQGLSFLAGLGLTVRHPPYLKLVVSFLFISAAVQVEQSYLVLFCTHASRLHDHVPRLVLTILVSAVLSTPLWEWVLHRFGKKTSAFGICDGAFCNLVGCRAHSTCGLHRGLCVWREHCCVLAATLVHAARCGR	137825	123697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_124434_126028_126206_126631_126745_127031_127142_127369_127449_127769_127854_128328_128451_128564_128656_131439_131571_131684_131764_132488_132614_133180_133306_134602_134729_137727
670899	contig_12270_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_113661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14410	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
670900	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_89256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
670903	contig_6710_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_92930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
670916	contig_6589_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_25974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAGCAGCTACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297285	1297577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1297300_1297600
670917	contig_14322_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_116357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTCTTGGGGACAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671364	671585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
670920	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_17851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
670922	contig_7179_pilon	-	2636	1	Intergenic	novelGene_78109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGGGAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673672	671036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_671000_673700
670934	contig_9345_pilon	-	2488	23	Intergenic	novelGene_24533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	185.822190180926	1	102	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	389	2164	729379	724349	TRUE	5	GTCTGTGTTATCTGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRL	730176	723445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724143_724334_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729416_729778_729826_729871
670942	SIRV7	-	233	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69052	1	35833	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78905	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
670945	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
670949	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
670950	scaffold_8345_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_107032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	249.462851514437	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	85	1035	785045	797396	TRUE	15	CTGCTCTAGAGTGACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRREEENTEARCQGPGRARIPEGEEGKMKTLIPLLLLGLLLTGEKGQVLGEETISANELQEMSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVGNFQNY	779485	798054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779534_785008_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_797376_797559_797797
670960	contig_2379_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_159435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTTAAGATTGTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53954	55314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2379_pilon_+_54000_55300
670961	contig_5009_pilon	-	1699	3	Intergenic	novelGene_119250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	16	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTATCTGCTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50494	43061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_44622_47700_47792_50446
670963	contig_7031_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_132795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312870	315579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_312900_315600
670964	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
670965	contig_11386_pilon	-	1475	2	Intergenic	novelGene_82842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1005	junction_1	0	17294	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	353	562	250817	250608	TRUE	35	GAAACACATTTTCACATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLLYRERLPVNFFKFQFRNVEYSSGRNKTFLCYVVEVQGKGGQVQASRGYLEDEHAAAHAEEAFFNTILPAFDPGLRYNVTWYVSSSPCAACADRIIKTLSKTKNLRLLILVGRLFMWEEPEIQAALKKLKEAGCKLRIMKPQDFEYVWQNFVEQEEGQSKAFEPWEDIQENFQYYEEKLADILK	251169	246706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_247600_250587
670968	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
670976	contig_8027_pilon	-	2230	8	Intergenic	novelGene_158828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.053822440065	9	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	127	1362	256451	217693	FALSE	30	TTATGCAAATGTGAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEHCGTFSSAGISGGSGDSAMDSLQRLQPNYMSVCLFAEESYQKLAMETLEELDWCLDQLETIQTYRSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEYISNTFLDKQNDVEIPSPTQKDREKKKKQQLMTQISGVKKLMHSSSLNNTSISRFGVSTENEDHLAKELEDLNKWGLNIFNVAGYSHNRPLTCIMYAIFQERDLLKTFKISSDTFVTYMMTLEDHYHSDVAYHNSLHAADVAQSTHVLLSTPALDAVFTDLEILAAIFAAAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDESVLENHHLAVGFKLLQEEHCDIFQNLTKKQRQTLRKMVIDMFLGNIFHFTTVTFTTRKDTLLTTFYFFPLLSSPTPQLPLHLISACFKQYFLSSGVSLFCRKQNKVEQTRG	256577	216824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_217906_222904_223060_225032_225133_227010_227176_227316_227416_228641_228821_234676_234771_256220
670977	contig_9848_pilon	-	2291	4	Intergenic	novelGene_79991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	793	junction_3	472.040487905669	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	18	443	149215	134550	FALSE	75	AAAAAAAAAAATTCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRRQMADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGDWYF	149232	132701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_134664_134747_134813_136653_136842_149156
670980	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
670996	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671000	contig_5981_pilon	+	1872	6	Intergenic	novelGene_35484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	232.84810499551	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	93	611	23508	37856	TRUE	30	AAATGAAGGCCTGTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASACAAAACGSGFAPSAPPPSFLRAARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGAKPIMTALTRRAAATTAPECSVPISRCRRQVRRWTCPPRLPG	23415	39171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28147_37725_37957_38010
671009	contig_7775_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_37486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1930	2337	181157	180750	NA	30	TTGGTCAGTTAGAAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLGGEKENGRRIDAFELWCWRRILNIPWTTERMNKSVLEEAQPECFLEARMARLHLTYFGHFIRRDQSLGKDIMLGKVEGQQKRGRPSMRWVDAVATTVGSRITTIVSMAQDRAVFHSLVLRVTMNWNRLDGT	183086	180349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_180300_183100
671011	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671016	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671024	SIRV7	-	351	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-29	-20	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114767	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70986_78841_78964_114680
671025	SIRV6	+	470	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTCAAGTCGTAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	2544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_1845_2026_2470
671028	contig_821_pilon	-	2073	2	Intergenic	novelGene_149398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	0	161	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAAAAGCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264116	169497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_171366_263911
671039	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671055	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671062	contig_11285_pilon	+	1622	9	Intergenic	novelGene_5631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	516.051338894688	4	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	56	1336	766124	769878	FALSE	25	GTGTGTGCTCCAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766068	770164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766136_767316_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
671067	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671068	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_98094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671069	contig_3307_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_86893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAACGGATGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148380	146541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_146500_148400
671078	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
671080	contig_2834_pilon	+	1132	2	Intergenic	novelGene_27968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	214	669	213515	213970	FALSE	30	ATAAACATGTCCTGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEGYPETQGNRNEVHNGQIRSPPDGMMAEELEVILKPAPRVQVSLEPVGLPPESLDEVSVEDLEAIPQRNPPNPADSLQRFRQFRYEDAAGPRDVLRHLQELAGQWLRPDIHTKEQIVEMLVQEQFQAVLPEELRARVQRYRPGVRITG	209568	214433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_209750_213482
671099	contig_10460_pilon	-	2358	5	Intergenic	novelGene_157472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	13.9171656597168	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	20	1456	97739	83727	FALSE	65	AAAAAAAAGAGGCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERYLKLFTFLPLSEINHIMQLHVKEPEKRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLESAKRCTQALYHNSIDALEVMSDEELKELFKEASFSELVLDPGTSVLDTCRKANAIPNGPRGYRMITEGGVSINHRQVTNPESVLVVGQHILKNGLSLLKIGKRNFYIIKWLQL	97758	82824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_83887_86273_86445_86752_86909_95896_96065_96957
671120	contig_10867_pilon	-	1482	5	Intergenic	novelGene_159455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	2608.63799472062	78	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTAGGTCTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91409	86779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87840_88193_88256_88603_88683_90943
671121	contig_7318_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_152239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	708	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATTCTATAGTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357034	359433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_357000_359400
671124	contig_6842_pilon	-	1144	4	Intergenic	novelGene_130709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	311.720316238059	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	78	584	433953	429481	FALSE	30	CCAGGACTATCGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	434030	428920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547_432658_433875
671126	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671127	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671133	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	127	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671137	contig_12270_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_113762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13853	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
671142	SIRV2	-	415	4	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1751	-727	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTGGTTAACAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2981	1762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2063_2667_2803_2881
671146	contig_16461_pilon	-	316	2	Intergenic	novelGene_139208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	11	316	919	395	FALSE	20	GTTGCAGTTTATTATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAED	929	394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
671148	contig_18869_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_56020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73535	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
671155	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671162	contig_19012_pilon	+	2076	7	Intergenic	novelGene_159492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	104.63746938836	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	254	892	103403	115367	FALSE	45	AATTTCTTTATAAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIGKSRNVYDRCGPEAGFFKAIKLEYSRLVKLAQEDTPPETDYRLHHVVIYFIQNRAPKKIIEKTLLEQFGDRNLSFDERCHNIMKVAQAKLEMIKPEEVNLEEYEEWHQDYRKFRETTMYLIIGLEHFQRESYIDSLLFLICAYQNNKELLSKGLYRGHDEELISHYRRECLLKLNEQAAELFESGEDREVNNGLIIMNEFIVPFLPLLLVDEMEEKDILAVEDMRNRWCSYLGQEMESNLQEKLTDFLPKLLDCCTEIKGFHEPPKLPAYSTHELCERFARIMLSLSRTPADGR	92976	116551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_93038_101339_101519_103389_103469_105769_105850_109643_109768_114682_114879_115194
671179	contig_7171_pilon	-	2257	17	Intergenic	novelGene_101266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	50.983453198072	293	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	157	1893	916504	901469	TRUE	15	GACACGGCCCTTGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGDRGAGPAPTGPPSQDLPQPPREISKVMASMALGVLNDRGCSEDELLEKCIQSFDSAGNLCHGDHVLNMVLAMHSWVLPSAHFAARLLTLYQEATGNTQELRQLQICHLVRYWLTRHPQAVHQEPQLEEVIGRFWATVDQEGGSAQRNLGGSSNLLSPGGPGPPPTTSSPGLGKKRKVSLLFDHLETEELAEHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVFQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPAQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCHKSLLPSPFKAPLVVEWAPSVTPKPDRVTLAQHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDFERLSGSFPFACHGLHPPPCQGPGSFSREELTGYLLRASAVCSKLGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFFWGGNQARLPLPGLWALLPQTLQRPGEGGV	919881	899210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_899382_901155_901269_901388_901524_901626_901665_902352_902498_905383_905503_905646_905752_905828_905910_908204_908481_909890_910008_911141_911316_914111_914266_914383_914516_915033_915096_915221_915329_916332_916520_919740
671186	contig_11256_pilon	+	1139	4	Intergenic	novelGene_150887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	47.8353658104777	235	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	64	378	7654	19710	FALSE	20	TGTTTTTGTTGAGTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QACGLSPRDVTTIKLLNETRDMLESPDFSTVLNTCLNRGFSRLLDNMAEFFRPTEQDLQHGNSMNSLSSVSLPLAKIIPIINGQIHSVCSETPSHFVQDLLMMEQVKDFAANVYEAFSTPQQLEK	7590	20471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_7665_12761_12885_18368_18466_19626
671190	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	176	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671193	contig_14575_pilon	+	1846	17	Intergenic	novelGene_101861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	145.137811665327	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	146	637	17236	26356	TRUE	30	TCACGTTAACTGTTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVTNIT	17090	59926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_32691_32850_33862_33926_42757_42849_44947_45006_47302_47376_51064_51146_59252_59376_59882
671194	contig_4891_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_124575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719638	719232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_719200_719600
671195	contig_7066_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_42212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACCTCTTAAGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113728	1115946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1113700_1115900
671205	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
671211	contig_12270_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_114086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	31	321	14409	13896	FALSE	20	GCTTCCAGGCTGAAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTIS	14439	13894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
671213	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671215	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671231	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671232	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_93963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	337	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671233	contig_19098_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_65803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATCTAAAGTACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251639	253592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_251600_253600
671245	contig_6710_pilon	+	548	2	Intergenic	novelGene_96163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAGCCACAGTGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
671246	contig_7915_pilon	+	2241	5	Intergenic	novelGene_42977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_4	233.666963860962	73	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	856	1575	129893	137758	FALSE	20	ACTTGGGTCTATCATCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	129037	138424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701
671251	contig_17440_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_7602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGCCCTAACTATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
671261	contig_8354_pilon	-	2034	16	Intergenic	novelGene_24114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	97.4441378431766	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	59	1879	327570	240654	FALSE	25	CAAATTGGGTCATTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGADRYTALPGRRASAGAAMITSAAGIISLLDEEEPQLKEFALHKLNAVVNDFWAEISESVDKIEVLYEDEGFRSRQFAALVASKVFYHLGAFEESLNYALGAGDLFNVNDNSEYVETIIAKCIDHYTKQCVENADLPEGEKKPIDQRLEGIVNKMFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQSPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAVSDVNDDVRRAAVESLGFILFRTPEQCPSVVSLLSESYNPHVRYGAAMALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVVIMSPSRYSPGLGTPICLLWLASLSLPSSGSGFLFHTSCHWLILLPVSLALTRT	327628	240498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_240822_256652_256770_259837_259953_296384_296450_297453_297550_299402_299600_300179_300292_305548_305628_306065_306155_307296_307426_315101_315246_317291_317498_320772_320943_321129_321204_322339_322384_327554
671264	contig_15063_pilon	+	584	3	Intergenic	novelGene_8703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3096	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	247	582	34808	35255	FALSE	35	CCAGATCAACAGCATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQT	27122	35257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037
671272	contig_18156_pilon	-	2075	15	Intergenic	novelGene_101449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1245	1553	35653	29517	TRUE	10	TATCTTCTTTCAGTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLTGIYKVLNFCHCEFYLTLISPDRGEISFLNEFPIWAAAKGNFPWLNSKSRLKFRKIPCAVSGLKYPGMFPPGPMKVLNIKLKGTGGDRSFPVVGDFTL	63111	17561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_-_17627_19317_19421_22026_22171_23411_23499_23891_23971_29472_29618_32199_32354_35599_35759_37461_37630_42648_42757_43544_43688_48926_49014_58941_59052_61695_61791_62683
671273	SIRV6	+	912	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1678	0	249	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2765	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
671275	contig_5967_pilon	+	1396	5	Intergenic	novelGene_44427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	133.477526198233	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	160	645	584680	599922	FALSE	20	TGAATTACAGTCCCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAEFGRIAVEFLRRGSNPKIYEGAARKLNVSSDTVQHGVEGLTYLLTESSKLMISELDFQDSVFVLGFSEELNRLLLQLYLDNRKEIRSILSELAPELPSYHSLEWRLDVQVLWIQQRPRHGFALGNIISSKSCGAHEEEMTVLRPLSLASRSLRQQIKPAVTIKLHLNQNGDPTTKVLQTDPSTLLHLVQQLEQALEEMRTNHCRRVVRNIK	583476	600673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_583556_584599_584683_585187_585362_589242_589354_599724
671277	contig_12157_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_135898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	365	700	114832	115167	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIILGKAHEHTHTHTHTHTHTNILYIVQIRNYFTGIMSSKENTDLRGRKGVQSVLCRGLLRKKSQARMFMEHVWEVLGTITRHIFLKLFGMADKYSVMAWVPILENPNTL	114467	116934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_114500_116900
671286	contig_7744_pilon	-	1635	13	Intergenic	novelGene_62507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_10	275.691390971056	527	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	19	1593	825057	820619	FALSE	15	GCAACTTTGCTGCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAVAVREDSGSGMKAELSSRSGAVGREMTQEEKLQLRKEKKQQKKKRKEEKGTEPETGSTVSAAQCQVSAARELPGPTNPLVSPGEKVPVGRSKAELRAERRAKQEAERALKQARKGEPVGPPPQDCPSTPGETPSGAKRLPEHTQVDDPTPLRRLVKKPEQQQVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQYMSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	825075	820576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823221_823417_823501_823760_823968_824167_824304_824625_824670_825026
671290	contig_15066_pilon	-	1607	11	Intergenic	novelGene_149545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	147.814106228059	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	689	1288	113488	112104	TRUE	10	AAGGTCTCTTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYNLLPCEFRDPWSLWSHVMPSPQTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKALDACLMMMTSQAF	114653	111683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112149_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113022_113269_113369_113438_113512_113709_113895_114094_114463_114541
671298	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671307	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671309	contig_4442_pilon	+	1876	15	Intergenic	novelGene_127930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_14	174.691448104412	217	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	92	1621	151365	397305	FALSE	15	CCAGTTGTGTCTTCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVCLSRDLFHFVSELSCTLENAEFPAYCFMMDYTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI	151273	397560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_151381_255560_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
671310	contig_3386_pilon	-	2825	4	Intergenic	novelGene_34491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	9	junction_1	13.4412301024373	61	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	94	588	336673	334239	TRUE	25	AATACTTCTTGTTGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPSGDIPQIPCSSKVCRRLFGPVDEEQLRRDCDALMADCLQEARARWNFDFVTETPLEGNYAWEPVQGLGLPKFYLPPGPRGAWDDLGGGKRPCTSTVLLQGMAQGDHVDLSLSCTLVPHSPERPEVSPGGPGAPRGRKRGQTSMTDFYHSKRRLVFSKRKP	341907	331906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_332338_332432_334289_336228_336685_341825
671312	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
671319	contig_15570_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_137856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAACTGCCCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675091	673814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_673800_675100
671322	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_114041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
671325	contig_1331_pilon	-	1242	4	Intergenic	novelGene_37822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3961.68359272783	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169997	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166491_166549_169860
671345	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_17695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671349	contig_6691_pilon	+	2710	5	Intergenic	novelGene_60182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	143.203308271841	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	92	556	446044	525974	FALSE	20	TCAGATATTTGAGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVRRAGARAPLSPLRPRALRSPGRRGRATMIHFMLLFSRQGKLRLQKWYTTLPDKERKKITREIVQIILSRGQRTSSFIDWKELKLVYKRYASLYFCCAVENQDNELLTLEIVHRYVELLDRYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKQSAVTAIEDSDMLQETMEEYMSKPAF	445952	528128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_446047_502292_502472_504696_504806_514516_514655_525938
671362	contig_7066_pilon	+	1831	9	Intergenic	novelGene_42187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	68.7094198418237	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	215	1483	994581	1003261	FALSE	40	AAAGTGCACACTTAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKDCPLQFHDFKSVDHLKVCPRYTAVLARSEDDGIGIEELDTLQLELETLLSSASRRLRVLEAETQILTDWQDKKGDRRFLKLGRDHELGAPPKHGKPKKQKLEGKVGHGPGPGPGRPKSKNLQPKIQEYEFTDDPIDVPRIPKNDAPNRFWASVEPYCADITSEEVRTLEELLKPPEDEAEHYKIPPLGKHYSQRWAQEDLLEEQKDGARAAAVADKKKGLMGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993673	1003609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997150_998459_998602_998707_998806_1000032_1000119_1000875_1001062_1003068
671364	contig_9345_pilon	-	1174	11	Intergenic	novelGene_24501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	348.758498104347	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	171	884	670952	667476	TRUE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVFQ	671880	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667577_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_670974_671731
671377	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671380	SIRV5	+	327	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-18	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10874
671401	contig_17753_pilon	+	2253	5	Intergenic	novelGene_105056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	276.820338848142	79	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1122	1568	131420	133179	FALSE	35	TTTTGAAAGTGAGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLIPEAKWMEPRGAFWRERRLRPPALVPALLQRALPTPSIHAQPTKAQ	45480	133864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_74923_75173_96134_96221_130836_131726_133038
671411	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671414	contig_2414_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_158465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185456	183347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_183300_185500
671415	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	463	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671419	contig_11631_pilon	-	2166	17	Intergenic	novelGene_104199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	61.3745863020681	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2040	127	2166	241681	165454	FALSE	25	CTTCGTTTTCAGGTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENLDEFIEERKAKLAKDKAELESDPPYMEMKGKASEKLSENSRILISMAKENIPPNNQQTRGSLGIDYGLSLPLGEDYERKKHKLKEELRQDYRRYLTQKNFLSTVETDPSTLGVSLPIGERLSAKERLKLERNKEYNQFLRGKEESKETFRQVEKSTESKSERNKKSVCQVKPDLPSQVQASCKNSEGPRRDVLTPSEAYEELLNQRRLEEDRYRQLDDEIELRNRRIIKNTHEEGSISSKKHQRLANKANIPDRRFRRFNEDRVLDRQYYRPDHDPEVSEEMDERFRYESDFDRRPLRVYANDRIYGNRRGNMPPMEYDGDFTEQSNIRISSAGNKSSRDNVPNERSKSANTRDVYSPFVGMVFGGEDRELVQRRKEKYRLELLEQMAEQQRNKRREKDLELSVAASGAQDPEKSPDRLKQLSVTPRHFEETIPPERPRVAFQTPLPPAPSVPPIPSVHSISSQNEDLCNGLNSTLGEMVPPRIAPLPPPPLLPPLATSYRTPYDDAYYFYGARNPLDPSLAYYGSGMMGMQPAAYVNAPVTHQPAQSVVNMVGQNEMKTTGDRAVNSGLFFEDKPKPSKQSLQSYQEALQQQIREREERRKKEREEKEEYEAKLEAEMRSYNPWGKGGGGAPLRDAKGNLISYMQTQSSPFARGNMFGEPPTELQIKQQELYKNF	253124	165453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_165555_176482_176631_178697_178828_186069_186149_186503_186626_188740_188944_190902_190961_191898_191993_196675_196759_197826_197926_205542_205983_206681_206781_208084_208166_216406_216511_239674_239775_241582_241707_253023
671420	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671426	contig_10904_pilon	+	1904	14	Intergenic	novelGene_22578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	194.017384690471	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	90	1589	439135	453964	FALSE	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQRKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTASSVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKSEKSGIMST	438386	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448434_449228_449357_449456_449530_451494_451624_451716_451816_453838
671427	contig_5389_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_142999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	18	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTATTTTTTAACAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88962	91785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_89490_90601_90714_90964
671430	contig_4857_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_48906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506516	1506895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1506500_1506900
671438	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671447	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671460	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_96056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671464	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671471	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_95690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671475	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671478	contig_9900_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_159511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	181	525	136345	136689	NA	30	TTTAAAAATGTATCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFVLSIKFLLSVVLTPRNPNTLMLSAIFIEPPPWHPGTTEISTKAKHLKLKVLQNQAQPLPPAASSPHMAIHGDSPARSPGSLSCSLTSSSLLSCSITKVLSVPCRCLFFFHI	136164	137215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_136200_137200
671482	contig_14441_pilon	+	1407	7	Intergenic	novelGene_100371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	102.118259331468	7	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	798	1220	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHEEGVLKAALEGSQELLALRHV	25700	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_25950_26652_26708_26886_27189_112111_112154_116578_116963_117220_117344_117545
671484	contig_11258_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_67828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAAGTTATCTCCGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330719	329373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_329400_330700
671487	contig_14513_pilon	-	1264	4	Intergenic	novelGene_70226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	146	562	18880	11982	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19025	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
671489	contig_20356_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_159526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAACCTCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32315	31958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_32000_32300
671497	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671498	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91679	4	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
671504	contig_15047_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_52281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACAAAATAAAGATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78506	77190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_77200_78500
671505	contig_15047_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_52279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTTGATTTTATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75924	75283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_75300_75900
671510	contig_6710_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_94340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
671515	contig_10629_pilon	+	1599	4	Intergenic	novelGene_52955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	238.245438338049	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	83	1045	447968	452372	FALSE	20	AACATTTTTGTGTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATVSAQKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447885	452926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_451857
671519	contig_546_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_117237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTGTCAACTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154712	156461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_154700_156500
671521	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671522	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	49	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671525	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	50	AAAAATGAAAATGCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671534	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_98186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
671536	SIRV6	+	781	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	552	11	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
671544	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671545	contig_7202_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_17595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCAAAGAGATACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
671547	contig_16098_pilon	+	1382	8	Intergenic	novelGene_45836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	65	469	201479	202163	TRUE	20	ACACACCTGTGCCTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEAEKSVGCLRLLLAVATTAHVSLIFAVAILLISEVATIGTLLVVKDSLIILHQAAQLLSQLQRQVLLGSGLSAMHHHCLCWLVQGGHQLLINDHLANDGVHSGQVQLKHVRQCLHADGVIDTAVGEEVGPK	201414	213299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_201585_201675_201836_201935_202025_202113_202182_202273_202430_204666_205033_212685_212899_213139
671562	contig_18869_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_56033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73545	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
671574	contig_15304_pilon	-	1411	4	Intergenic	novelGene_30619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	173	1279	66228	64554	FALSE	5	CCTGGAGCCCTGGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66400	64421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
671578	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671579	contig_18272_pilon	-	3452	2	Intergenic	novelGene_7064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTCTAACAGCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515539	509195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_509741_512632
671582	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1547	632	1092	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
671587	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671590	contig_7840_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_69039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGCAAGGAAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376430	375785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_375800_376400
671596	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	530	51	530	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10767	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
671597	contig_12427_pilon	+	3088	24	Intergenic	novelGene_40491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	166.843496615688	600	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	874	2625	94	2718	397813	419950	FALSE	30	ATGACAGCTGCTTCTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAPVEPSPGSCSEAYLLSLAVLYRTPAGPAMLKKLDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEHLGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNYRGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397719	420320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_399599_399672_399853_399934_401068_401145_401423_401517_401946_402034_403281_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
671607	contig_5485_pilon	-	1364	2	Intergenic	novelGene_37701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	200	559	85850	85491	FALSE	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASSGEPETEPAAAAQRAGSPRAPTQLCSQLPPVSALGPSPGFTYPPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88079	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85908_87937
671609	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
671610	contig_12724_pilon	-	1536	7	Intergenic	novelGene_146867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	60.3047814577473	701	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	95	880	541481	448483	TRUE	30	ACTTTGATTACAGTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSGPPGLSRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQVFVGKVLKKLFPDVPSGQEKLAPATLASEKPPEKVRPKKANLRGVQPLTDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEKMLKASVRKMLKVPMKRQMVS	541575	440556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445867_448443_448550_448595_449011_497701_497837_522974_523122_541459
671611	contig_12250_pilon	+	2107	14	Intergenic	novelGene_80557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	70.4408770513493	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	76	615	272853	274101	TRUE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNCTCLQILCPQPSPALHPGIGVSVRLKVGRDVQKGPLN	272628	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275537_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
671620	contig_11318_pilon	-	2047	15	Intergenic	novelGene_48136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1145.32225435749	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	266	1456	49795	15006	TRUE	65	TTAATAAGAAAATAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDRERERERERERGAGSHK	58290	13523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_13555_14072_14348_14720_15026_21461_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071_52142_58143
671626	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
671630	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671631	contig_8317_pilon	-	466	2	Intergenic	novelGene_19350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGACTTCAAGTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16776	16208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16278_16379
671632	contig_11396_pilon	+	941	7	Intergenic	novelGene_71429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	464	junction_3	401.664626550836	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	141	887	1782334	1789745	FALSE	20	TCAACGATGGGTGGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782193	1789799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
671637	contig_15105_pilon	+	1687	15	Intergenic	novelGene_150939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	200.355105668278	570	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	489	1496	317971	338459	FALSE	5	GTGCTTTTCTCATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYTVECLRDDVDILMEFLLNVATSPEFRHWEVAALQSQLRIDKAVAFQNPQARVIENLHAAAYRNALANSLYCPDYRVGKVTPEELHYYVQNHFTSARMALVGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKALYRGGEIREQTGDSLVHAALVTESAAVGSAEANAFSVLQHLLGAGPHVKRGSNATNSLYQAVAKGVHQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQAEAAGDVLKAAYNQVKTIAEGNLSDTVIQAAKNKLKAGYLMSVESSDGFLDEVGFQALVAGLYVPPSTVLQQIDSVAAADVKNAAVKFVSGKKSMVASGNLGHTPFVDEL	312475	338650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_312541_315198_315301_315576_315661_315757_315908_316439_316505_317948_318006_318254_318380_321025_321124_323169_323228_324221_324318_325249_325450_327725_327807_333914_333992_336811_336966_338375
671644	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671645	contig_6102_pilon	+	2235	19	Intergenic	novelGene_31838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	497.309675735599	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	89	2143	370803	395166	FALSE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIHFGNQEHLDSGALGTSGPIFCSSA	370714	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379655_395086
671649	contig_9594_pilon	+	1608	10	Intergenic	novelGene_73952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	481.330101558864	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	447	1175	316203	322451	FALSE	15	GATTTTTTTTCCTGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	307476	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_307530_310433_310590_310705_310851_315265_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
671654	contig_10135_pilon	+	1550	14	Intergenic	novelGene_106633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	77.642329698089	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	29	1009	106830	114563	TRUE	15	CTTCTGGTATATCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAVCSGNKMAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDC	106801	116067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114005_114558_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
671658	contig_15087_pilon	-	2189	22	Intergenic	novelGene_37187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1083.34697427309	1	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	129	1520	158925	116874	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRDQL	181168	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116886_127641_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141778_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158913_158952_181066
671664	contig_11978_pilon	+	751	5	Intergenic	novelGene_63090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3707.56675597352	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	304	669	1830113	1831883	FALSE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829092	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829903_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
671676	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	153	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671677	contig_8570_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_120174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGTTAAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432168	431720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_431700_432200
671679	contig_11978_pilon	+	826	6	Intergenic	novelGene_63070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3345.97947393585	83	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	378	743	1830113	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827919	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829205_1829891_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
671682	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671684	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
671685	contig_6710_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_94831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATCCACCTTCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
671686	contig_12270_pilon	+	375	2	Intergenic	novelGene_113253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	13839	14364	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13837	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
671688	contig_14450_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_48953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAATGAAGTTCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571257	570692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_570700_571300
671698	contig_4315_pilon	+	2726	16	Intergenic	novelGene_46730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1142	1684	149804	154015	TRUE	55	AGAAGACAAAAAGTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRPVTQVGPQVLPDDRLEPGVVGSNQEPIEKAGNRLGISLNCVDEGGSSCKLVQCTSQHRGHMCQGLGSICHKVQVLFRAQPFRVAHINVLSSVVNALVIAVMKGSRVVSKNHTRDVVSSKEPLQRRWRERLGLVQLPEEDSRDSSSTALQCGQKVLRYLVPYRLIFLRHGVCVQPEL	147234	162091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_148028_149228_149442_149668_149822_150076_150165_150423_150521_150634_150739_152924_153096_153950_154031_154214_154320_154975_155147_155380_155480_155797_155949_156694_156841_157302_157419_157836_157968_161983
671717	contig_6589_pilon	+	1487	3	Intergenic	novelGene_26149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8827.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	758	1363	1885859	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWRIGFEELCLPHTYQILSHLCRPSVPTKSSRPSSKTKRGSCWEKLARRSSRVITRTSVWVSRHPRRYRDSSEEKIRPLCPSTCAQTKLPCPYLNGIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885101	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886149_1886590_1886783_1887705
671719	SIRV7	-	334	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33225	10	6	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114732	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
671721	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_96516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671724	contig_10196_pilon	+	1080	10	Intergenic	novelGene_132149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	372.973073532456	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	6	890	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEHYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034560	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038356_1038397_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
671727	contig_17440_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_7610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAATTCCGCTACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
671728	contig_10940_pilon	-	698	2	Intergenic	novelGene_49275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2259	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCAGGGTCCCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893222	875051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147
671731	contig_20199_pilon	-	603	4	Intergenic	novelGene_82528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	78	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	55	390	43987	41055	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44041	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40785_40979_41250_42110_42171_43906
671734	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671742	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671751	contig_7202_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_16437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27786	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
671762	contig_4364_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_3424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
671772	contig_15063_pilon	+	1021	3	Intergenic	novelGene_14399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	64	879	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35207	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35845_36158_36266
671776	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671783	contig_14925_pilon	-	938	4	Intergenic	novelGene_55201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	30	GAAGAGCAAAGGCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
671784	contig_602_pilon	-	2922	2	Intergenic	novelGene_134977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596526	593566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_595443_595480
671785	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671795	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_96073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671798	contig_5882_pilon	+	338	3	Intergenic	novelGene_159559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGGTGAAGGGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14121	17223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5882_pilon_+_14219_15483_15596_17094
671799	contig_6102_pilon	-	758	4	Intergenic	novelGene_32108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	186.122420883556	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	26	598	818976	816763	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS	819001	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916
671804	contig_12270_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_114000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
671807	contig_1379_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_134586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCCCTTTATACGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429691	428035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_428000_429700
671808	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671826	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671830	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671840	contig_5018_pilon	-	2538	1	Intergenic	novelGene_46956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1540	1845	309655	309350	NA	75	CAAAAATAAAATGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHGCLSSSHHISSPGNLHMSFQWGQHSKVTRDVGTFFVSKTVLHPWLLPTKYQSLRQPKTPTDSSKVPSRVPSFLLHIPTPLCNEKFEIPKNCTGHKLG	311194	308656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_308700_311200
671842	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671843	contig_8820_pilon	-	2467	1	Intergenic	novelGene_79319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1880	2197	299931	299614	NA	95	AAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENVSLGLMQMTSGDQENHICDILRWSPWDRMVQGGKGSVKLWGKPTYKEQDKSQQSKRQTRESTRSPTGREWEGGRSWCPGSLLAPVSCDSPLLPRRCGDRLTG	301810	299343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_299300_301800
671844	contig_20378_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_159579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAAGAAAAAGTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120030	120895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_120000_120900
671846	contig_13680_pilon	-	1681	13	Intergenic	novelGene_149593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	184.023605822731	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	69	1208	396643	375317	TRUE	35	TTTAGAGTCCAGACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLISSVGRGDRGGGWRKRRRRMEEGGGGARSLVPGGPVFLVLCGLLEASGGGRALPPLSDDIPFRVNWPGTEFSLPTTGVLYKEDNYVIMTTAHKEKYKCILPLVTGGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKYIRQYHEEKETGQKVNIHEYYLGNMLAKNLLSDKDQEAEEREKSKEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILTPLLCNHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKPIAVGSQPTLTVGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFHGGVGWWKYEFCYGKHVYQYHEDGVTLLWEWRYL	396711	372804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_373163_374990_375067_375277_375356_380016_380077_380902_381065_385130_385261_385352_385577_388075_388111_388790_388855_388993_389072_389620_389702_390827_390933_396481
671856	contig_7004_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_126510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATATGCAGGAGGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454662	454180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_454200_454700
671860	contig_4093_pilon	-	1639	5	Intergenic	novelGene_27638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3703	junction_3	741.614244402034	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	15	752	69245	41737	FALSE	20	TTGAGATGATGGCTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	69259	40849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951
671863	contig_12250_pilon	-	1266	9	Intergenic	novelGene_80716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_8	317.977495272857	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCATCAACCCAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401260	398585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401003
671870	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_93509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671877	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671885	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
671890	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671897	contig_14219_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_54286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1618	2019	587548	587949	NA	85	TAAAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVFLNEFLCLGAYGSPSLWYVQITSTGLPHSRHLCRLGLWFFTRGTVFKNLAQHVIKIWIKFMYYFLNLNANINKTVLRPTFCRKFSINPMFSPLRERVLLKRKLSASSTAGGITNWCGHCGEPFGGSSKS	585930	588510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_585900_588500
671899	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671906	SIRV4	+	279	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1489	635	1034	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2489	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
671907	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671909	contig_13780_pilon	-	2659	5	Intergenic	novelGene_149085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_4	80.2756968203952	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	13	807	685300	665726	FALSE	40	AAAAAAATTCTAGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRR	685312	663873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243
671918	contig_7308_pilon	+	2127	3	Intergenic	novelGene_159628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_2	132.5	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1623	2078	616824	617480	FALSE	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHLFLSKTESGHMCDRQDACLAMEMVHFKTLIFDIKCCTRVKEYDYLINAVSCTFLEPALVAKSSILLDVKPWDDETDMAKLEECVRSIQADGLVWGSSKLVPVGYGIKKLQIQCVVEDDKVGTDMLEEKITAFEDYVQSMDVAAFNKI	614654	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_617125_617325
671919	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671923	contig_4868_pilon	-	1703	11	Intergenic	novelGene_136755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.2585784298899	289	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	64	1485	94423	43926	FALSE	30	TTTAACAACATCTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIEEVKSTTKTQRIASHSHVKGLGLDESGLAKQAASGLVGQENAREACGVIVELIKSKKMAGRAVLLAGPPGTGKTALALAIAQELGSKVPFCPMVGSEVYSTEIKKTEVLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPCETENPMGGYGKTISHVIIGLKTAKGTKQLKLDPSIFESLQKERVEAGDVIYIEANSGAVKRQGRCDTYATEFDLEAEEYVPLPKGDVHKKKEIIQDVTLHDLDVANARPQGGQDILSMMGQLMKPKKTEITDKLRGEINKVVNKYIDQGVAELVPGVLFVDEVHMLDIECFTYLHRALESSIAPIVIFASNRGNCVISSLSKRCMGDTSDFGLCRGTEDVISPHGIPLDLLDRVMIIRTMLYTPQEMKQIIKIRSQTEGINISEEALNHLGEIGTKTTLRYSVQLLTPANLLAKINGKDSIEKEHVEEISELFYDAKSSAKILADQQDKYMK	94486	43707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_44086_45068_45161_49060_49215_60478_60678_62074_62139_63938_64089_64898_64989_68467_68620_80677_80811_89877_89965_94282
671926	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
671927	contig_7396_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_79527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAAGCCATCCACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211957	212950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_212000_213000
671928	contig_6361_pilon	-	2063	6	Intergenic	novelGene_23892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	30.0958468895627	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTATTTGGACTTCGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129160	121261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122886_123928_124009_126515_126587_128203_128256_128770_128816_128969
671930	contig_15047_pilon	-	2956	1	Intergenic	novelGene_52283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTGGGAGGGCAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81532	78576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_78600_81500
671931	contig_10196_pilon	-	2501	4	Intergenic	novelGene_132098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	227.924451420982	30	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	81	416	912067	911732	TRUE	10	TTCCCGTGTTGCCTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLALQNPTTTVPRTPAPQTSPAVVPHMDPASRCTPDLTEYPPPPLVPIPWLCPMGVSLGSSASLVSLHPGPYLLGPPPPPHLLHREPHSQSCPLEAPPPHPWPPASLSIRSLWVAIICDLGLLGLSLPTVLCGVGSR	912147	908885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_909044_909341_909482_909590_909762_910115
671938	contig_7151_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_40806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568897	567417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_567400_568900
671939	contig_6445_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_77040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCATGTACAACAGAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577953	576756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_576800_578000
671940	contig_7428_pilon	-	2617	14	Intergenic	novelGene_77694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	71.7272117080281	292	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	92	2215	243098	226280	FALSE	10	GTCTGCCCTGCTGAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETTAKPEPRSLSRLRHLGLGPRRAGSSKAMSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP	250481	225877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226448_226528_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_243113_250404
671945	contig_6871_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_21601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	612	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423025	425160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_423000_425200
671953	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_89178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
671962	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_97369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
671965	SIRV7	-	195	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91731	0	-91725	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGCATTGAAGGTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147800_148000
671971	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_98015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
671975	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671976	contig_18145_pilon	+	2070	7	Intergenic	novelGene_37366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	223.025409613643	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	117	857	97254	98555	TRUE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKAGAR	96202	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_96304_97238_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98983_100326_100482_100638
671981	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
671983	contig_10602_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_159636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTTATGTTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21440	19305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_19300_21400
671987	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
671989	contig_14322_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_115783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671882	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671651_671817
671992	contig_8452_pilon	-	2199	9	Intergenic	novelGene_48024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	209.695463708684	66	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	738	1157	380814	331967	FALSE	60	TAAAAAAGGAAAGTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVISNTWSLTCTHALNFTQF	550859	330924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509199_509284_509599_509728_550745
671997	contig_10019_pilon	-	1646	2	Intergenic	novelGene_86683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1460	junction_1	0	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTGGTCTGACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261507	258357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356
671998	contig_12270_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_114007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	11	334	14409	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14419	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
672000	contig_10345_pilon	+	1405	13	Intergenic	novelGene_158362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	641.766588540309	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	68	1108	11670	24141	FALSE	25	ACAACTGGTATGTCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4371	24438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
672008	contig_2755_pilon	+	3317	6	Intergenic	novelGene_158301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	18.4651022201341	5	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	594	2885	250631	283022	FALSE	45	CTGCTTCCTAATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLSSPDSALLQGGRTDKEGLTPLVPSASFQESVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPVQRDLFRDVTLENYTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWTVEPGVPVGTSRDWETRPENSGSASELDISDEKPSPAAIVEKVRRDYHGSSNFLKTFESEGSPEGEQTNEWTLPREIKITEKKIPTWKKGLVSNEYGKSINMSSNPVTQEISSEGSPPKCNEHKTGVKQNLNPIKKEKSCKCNECGKAFSYFSALIRHQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEAPSLTQHQRIHTGEKPYKCDECGKSFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECNECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCNECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCDKAFSQSSHLTQHQQIHTGEKPYKCSECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGDKPFGCNDCGKAFRYRSALNKHQRLHPGI	249835	283454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_+_250285_250486_250638_255856_255946_276975_277103_277447_277544_281049
672012	contig_348_pilon	+	885	8	Intergenic	novelGene_67595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	10.9637622024857	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGGACAAGGTACCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314460	342979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320458_320539_320655_321708_321784_342880
672013	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672014	contig_12969_pilon	-	2888	5	Intergenic	novelGene_61659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	6.13901457890434	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	260	2254	190622	174020	FALSE	45	AGAAAAGATAATCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQEQKKMVMAQESLTVSDVFVKFTWEEWQILDPAQKDLFWNVMLENYSNLVSIGCRVSKPDVLSRLEQEQPWTILDESHSGIFSETWRVDDHLLGHLQNESKVDRMEQCYEHNTLENIVRRQRNQFPLRENNGMFDLHGKAVKSNLTLPAFNQSRSNAIKNSAELNGYEKTFLPADHEQCCTEVKFRESQKSSSTKSQLIQHQKTHKTEKPHVCSTCEEAFIRKSFLTEHQIIHTGEKPCRCSLCGETFFKKFKLIEHHHTTHKGQKPYKCTECDKAYLRKSHLNKHQETHMGEKSYICSECGKGFMHKVGLTVHQRTHTGEKPYICSTCGKGFIRKDDLTVHQQTHTGEKPYICTTCGKGFIRKNVLAVHQRTHTGEKPYICTTCGKGFIQKYDLTVHQRTHTGEKPYLCSACGKGFIQKRDHTIHQRTHTGEKPYICSTCGKGFIRKGNLTVHQRTHTGEKPYLCSACGKGFIRKRNLTIHQLTHTGEKPHVCSECGKGFIHKVDLTVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIRKNDLTLHQRIHTGEKPYICRECGKGFTRKGNLIIHHRVHTGEKPYVCDECGKAFSQKMCLIAHQRFHTGMTPFLCSECGKFYSQKSSLIVHQKIHTGEKPFKCGECEKAFDKKPKLIVHQRSHRRDTIWLQ	204883	173385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_175759_185008_185102_185371_185499_190586_190795_204796
672015	contig_9727_pilon	+	1182	6	Intergenic	novelGene_86308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	302.086345272341	47	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	384	713	310056	314189	FALSE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308420	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309463_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078
672018	contig_20157_pilon	+	1314	9	Intergenic	novelGene_145866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	768.854627026462	2315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	544	1170	48801	53749	FALSE	20	CGCCATCTTATGTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHLTVDTSLQNGRMSIKAYVSTLMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVDLIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSADNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIALNEKLVNL	40957	53893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_41335_42961_43045_48495_48567_48788_48869_49551_49690_51049_51142_52576_52714_52849_52964_53671
672023	contig_2636_pilon	-	785	5	Intergenic	novelGene_52062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	197.216093410249	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	208	507	62513	59826	FALSE	25	AGTCATGGATCGAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	66286	59547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_65799_65869_66258
672024	contig_14744_pilon	+	904	6	Intergenic	novelGene_66073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	10	TAACTTGTGTCCTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
672026	contig_7308_pilon	+	2323	2	Intergenic	novelGene_159629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	576	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1618	1998	616824	617204	FALSE	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHLFLSKTESGHMCDRQDACLAMEMVHFKTLIFDIKCCTRVKEYDYLINAVSCTFLEPALVAKSSILLDVKPWDDETDMAKLEECVRSIQADGLVWGSCEFTLCFWASGICVWFQPLPISDFCN	614659	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367
672027	contig_20493_pilon	-	1695	13	Intergenic	novelGene_86400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	65.7822586686985	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	60	1688	54655	36446	FALSE	10	ACGTGGCCTTTTTACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQWSQGLNVKDSELCLAHSQ	54714	36438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36504_37391_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457
672030	contig_6496_pilon	-	1776	7	Intergenic	novelGene_103476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.0991956566762	54	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATGGATTTGAAGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285229	246326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247025_247116_247790_249540_249576_250694_250719_263148_263179_264936_265066_285042
672031	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672032	contig_14142_pilon	-	1829	19	Intergenic	novelGene_120592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	135.220590239399	32	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	82	1737	598441	584636	FALSE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHHQLPCWTTSPPAHLASRACSPQQPEMTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFNQARLDDSPRAPGQGSGHLAIGSAATSGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGSQENATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598522	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586333_588581_588616_588714_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
672039	contig_17936_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_29969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTTTCTAAGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108703	107138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_107100_108700
672045	contig_10235_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_46339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCAGTCAGCTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109598	111323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109600_111300
672053	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672054	contig_11512_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_43211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	30	359	4011	4563	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCA	3981	4563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
672057	contig_13780_pilon	+	2109	3	Intergenic	novelGene_149140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	37.5	287	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	28	513	944618	964240	FALSE	15	GCTTCAGTTTCCATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPGARPGGMHGGGAAGRLQTPPEQRAVFCRMETDCNPMELSSMSAFQEDSELNGFEGTDTKDMRLEAEAVVSDVLFAVNNMFISKSLRCADEVAYINVETKEGSRYCLELTEAGLRVVGYAFDQVNDHLQTPYHETVYSLLDTLSPAYREAFGNALLQRLEALKRDGQS	944590	965836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_944673_962203_962473_964078
672059	contig_12312_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_63981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290209	288441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_288400_290200
672062	contig_13905_pilon	+	1339	3	Intergenic	novelGene_130429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	213	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	595	906	228815	229126	FALSE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRHSSTSKTSVSNHVYLWPPRMSLYLVFCDCPAAEIISLILTLWSLYYEINRRFECAFSNYVHPPLAIPTTPHLENQHSEPVFSTLTTHRSHWKCSIILFRV	223087	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_223186_226255_226376_228438
672065	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672066	contig_5020_pilon	+	990	5	Intergenic	novelGene_27812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	710	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	624	365	988	122915	126085	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEPQAMASAQPGPASLFLLPFPLYLSSFPSSCHHIPSLPHILTPPLYLISPFSLSPGGIDPTLAPARIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPPIKQAQP	118460	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_125798
672071	contig_11815_pilon	+	2040	5	Intergenic	novelGene_50929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	91.7506811963813	2	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	160	1902	294886	322920	FALSE	50	GAATTTCACAAAAGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASSLLEQRPKGQGNKVQNGSVHQKDGLNDDDFEPYLSPQARPNSAYTAMSDSYLPSYYSPSIGFSYSLGEAAWSTGGDTAMPYLTSYGQLSNGEPHFLPDAMFGQPGALGSTPFLGQHGFNFFPSGIDFSAWGNNSSQGQSTQSSGYSSNYAYAPSSLGGAMIDGQSAFASETLNKAPGMNTIDQGMAALKLGSTEVASNVPKVVGSAVGSGSITSNIVASSSLPPATIAPPKPASWADIASKPAKQQPKLKTKNGIAGSSLPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVAKAPSQALVQNIGQQAIQGSPQPLGQQANNSPPVAQASVGQQTQPLPPPPPQPAQLSVQQQAAQPARWVAPRNRGSGFGHNGVDGNGVGQSQAGSGSAPSEPHPVLEKLRSINNYNPKDFDWNLKHGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDAAYRSMNGKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSAVDYNTCAGVWSQDKWKGRFDVRWIFVKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEESVKKERQGRGK	294726	323058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_294913_295412_295438_296009_296090_299063_300651_322896
672079	contig_15118_pilon	-	1837	10	Intergenic	novelGene_74621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	763	1326	395308	393615	TRUE	0	GGCCGTGTCCTCCCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELTLKARGRRAPAWVQFFLRVFTMISMRQRKRRVVMPIPRNAPLEKAVETSPLSGNNRTVTLWAPWSFRTSQWSPRPRLSPSESLRELLAQGPAELEVTMTEALLLFPSTSQFPTLQCREGVGQALAEQLQRRPSVFQEQEGLSTWGGSVLFAWDTITLRFSGGYCTETSSERCWEPSLFSARQV	399368	392474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_392551_392641_392926_393223_393276_393416_393459_393557_393680_393942_393989_394461_394747_395047_395141_395233_395342_398639
672080	contig_5500_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_159648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1590	1895	650328	650633	NA	20	GTTGTTAGTTGTCATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRTDTVAATVGSSIKTIVSMAQDRAAFRSVVHRVAMGQNRLDERNNNNIGQIPEQPSLLRRSRFQFAETPLGGSRTAPKGFLGCHIYGSSQPGLSCQPLS	648738	650661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_+_648700_650700
672089	SIRV3	+	168	2	ISM	SIRV3A	SIRV303	2018	3	15	3113	15	-2009	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTTTTTGTTCTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978	4709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4568
672093	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91672	6	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
672095	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCTTTCATTTGTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
672098	contig_8801_pilon	+	1492	3	Intergenic	novelGene_66295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	814	1485	545418	711458	FALSE	35	GTTTACCAAATATGATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFEKVRWAEFQAALPHCCSTSDWQRCVQGWLAGTGRGGSRSSAVGPVQGLKESRTCCKHMMLCNSAKPGVRQSPCHHTHPLVLCVLAHQSWVQLSRKQMSRFTWLHRSSVLPPCPPGQPHPDEGVRGASTRSARSRRLALGASRRRWSKRKRVSSRRVPSASSRFSWASSTSAKPKESTPSQTTVRGSWKGSPAARRKAPCGLLQLLCLNLFHLGSPSFFY	544604	711465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_545804_545895_546121_711397
672099	contig_18869_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_56343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
672103	contig_12638_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_33306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACCACTCAGGGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280296	1282342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1280300_1282300
672119	contig_6434_pilon	+	600	5	Intergenic	novelGene_61908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3014	junction_4	243.234840226477	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	276	599	924065	925691	FALSE	30	TGTATCATGAGAACATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRN	919742	925692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547
672122	contig_10727_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_159656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	995	1402	96944	96537	NA	30	TTATGAGACATTTGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASADVLAMSKIEIKLSDIPEGKNMAFKWRGKPLFVRHRTQKEIEQEAAVEMTKLRDPQHDLERVKKPEWVILIGVCTHLGCVPIANAGDFGGYYCPCHGSHYDASGRIRKGPAPLNLEVPSYEFTSDDLVVVG	97938	96259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_-_96300_97900
672126	contig_18869_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_56077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
672128	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73578	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
672141	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672144	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
672162	contig_4180_pilon	+	2521	1	Intergenic	novelGene_8417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	140	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCAGTATATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888305	890826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_888300_890800
672171	contig_762_pilon	-	2163	5	Intergenic	novelGene_135945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	34.3911325780353	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	83	712	266669	256695	FALSE	10	AGGTACCTGGGTGCGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGEEPRRRLVLIDTRYLSWIHDEM	266751	255243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_256905_257514_257668_259724_259837_263903_264056_266666
672180	contig_18162_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_122339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAATCCTGTGTTTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	16217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_16200_16600
672182	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672185	contig_709_pilon	+	2503	11	Intergenic	novelGene_57630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	28.6707167681591	545	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	526	1431	2691473	2701317	FALSE	15	CTTTGTGATGAGCGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681021	2702389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2686056_2686096_2688679_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
672189	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672201	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
672203	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
672204	contig_5968_pilon	-	1191	8	Intergenic	novelGene_112188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	445.1555105482	1880	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	14	985	732362	622720	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGKMASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAEPR	732375	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622731_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
672208	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_95904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672216	contig_6710_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_95894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
672217	contig_6102_pilon	+	2790	21	Intergenic	novelGene_31879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	538.404067592361	1	127	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	15	1841	370803	393075	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGVAPQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370788	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378995_392993_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393833_394745
672226	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	632	975	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
672228	contig_15741_pilon	+	1161	7	Intergenic	novelGene_159673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	329	685	49935	50385	TRUE	5	CTGGGCGCTGAGCTGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSTEMHHFSPFLLKIYYKKTQLGEGHVSLSVLRAGEGAAEGPAEALSARTAGGRHCRVLSPTISRLCCCSWARSRAFSFFSSSICCLKSSFSTCSRSASLKVSCMRWLVWRSSRM	49606	61302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_+_50195_50288_50418_50651_50749_60115_60172_60469_60558_60680_60837_61255
672230	SIRV7	-	372	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-30	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114768	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
672235	contig_6199_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_126369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGTAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215186	217334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_215200_217300
672244	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_90414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672245	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	643	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672247	contig_6138_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_159695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTCTCCTACCTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630256	629710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_629700_630300
672254	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672255	contig_14209_pilon	+	1938	13	Intergenic	novelGene_88317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	204.439936167081	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1130	1558	38057	40625	FALSE	20	TTCACTTAGGGGAGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32297	41005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_34195_34248_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418
672258	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672263	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672264	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672267	contig_6589_pilon	-	1737	17	Intergenic	novelGene_26254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_14	53.3344034723367	396	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	112	1677	2233261	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWKILYPEIPRKLRELETKGYKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233763	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2230878_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
672271	SIRV2	+	616	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-63	-30	-63	30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGATATGGTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	1661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
672276	contig_10904_pilon	+	1539	4	Intergenic	novelGene_22481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	866.912913734707	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	525	989	149604	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	146152	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097_149372_149426_150552_151517
672278	contig_12624_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_61086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTTTACCACACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886057	883483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_883500_886100
672279	contig_13074_pilon	-	2375	1	Intergenic	novelGene_153429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGGAAAACATCAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409376	407001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_407000_409400
672283	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
672284	contig_19744_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_120414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	950	1366	271418	271834	NA	25	ATCCTATCCTGTAGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFFLYEEEFDPFFRYETPATHLYFGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	270468	273221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_270500_273200
672291	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
672295	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672296	contig_13547_pilon	+	3002	1	Intergenic	novelGene_104895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183795	186797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_183800_186800
672300	contig_5799_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_50278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1428	1727	297936	297637	NA	85	AAAAAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNEDARRIDAFELWCWRRILTIPWITRRMNQSVLEEVQPECSLEARMMGLRLTCFGHIIRRYQSPEKHIMLGKVGGQQKRGRPLMKWIDTVAGTMAHA	299363	296367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_296400_299400
672308	contig_10106_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_73906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTACGAATGCCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185831	187661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_185800_187700
672312	contig_9609_pilon	-	2307	7	Intergenic	novelGene_23123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	85.9101597923992	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	852	1553	523112	521564	TRUE	25	ACCTCTATTGAGTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGSGQKMVSSGGGYLGAGRASW	523963	520724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950
672314	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	3	362	14437	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
672318	contig_4496_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_66695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGTGGAAGAAAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960587	961568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_960600_961600
672323	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_90576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653859	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672324	contig_7202_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_18071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCAGCTGTTGTCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27950	27627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_28000
672327	scaffold_16539_pilon	-	836	5	Intergenic	novelGene_68394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_4	32.889017923921	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	178	699	796029	794915	FALSE	15	CTGCTTCATTTCTTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK	796206	794777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795469_795639_795760_795838_795923
672329	scaffold_19766_pilon	-	1304	7	Intergenic	novelGene_34320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_2	272.21850904497	1722	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	211	1080	622205	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622415	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153
672338	contig_6710_pilon	+	548	2	Intergenic	novelGene_96976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGATGGCTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
672342	contig_6589_pilon	-	1692	15	Intergenic	novelGene_26249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_11	56.4186248014767	4	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	70	603	2233261	2230760	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKDFVPRDSAEAP	2233721	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
672345	contig_6375_pilon	-	2194	7	Intergenic	novelGene_73025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.761674582896	860	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	8	1750	497798	463569	FALSE	25	CACTTTATATCCATCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEEASAESEDEMIHPEGVASLLPPDFQSSRERPELELSRHSPRKSSSVSEEKGESDDERPRKGERRSPRVRQARAAKLSECSQTAEEEEDQEAPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEEEEEEEEENEVQKSREAPILKQFEEEEEEEEMSRAKPEEVMDERPKTIRSQEEEGLEKGGRVTRSQEETRRSHLARHQQEKEMKTASPLEEKEREIKSSKGLEGNSKSPSPPQLTEDLEKVPLILQREQTASEEETLPPLLTKEPCSPSPNIQLRSEEEVDPVEGPAPPVLVQLSPPNADAEARELLVAQHTVRLVGGLSPLLSPTDTKVESPAEKMPEESVLPLVHKSTLAESSIQKGLETEPEKSAQPLPLKIEELAPPKGTDSWSGRNVESTAGRGTGKERGKGNETGGIEIEIGKGTGNEAGREIAETPSATAGAGVGAHLCGTGVGAASWKKTRESCRHQPPYPKGVKATEE	497805	463124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_463856_481615_482547_483232_483322_489768_489889_490309_490422_496143_496210_497660
672346	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_114016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
672348	contig_9696_pilon	-	2772	4	Intergenic	novelGene_68793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	24.4994331000173	114	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGAGATGTGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323904	319733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_322250_322337_322415_322674_322840_323890
672350	contig_1719_pilon	-	1363	5	Intergenic	novelGene_87321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_2	64.0561277318572	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	283	588	461239	458348	FALSE	30	ATATTTGGCATTTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAVTQHAPYFKGTAVVHGEFKELSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVDETLRLVKAFQFVEAHGEVCPANWTPHSPTIKPSPTASKEYFEKINQ	463193	457572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_458761_458928_461153_461258_462091_462228_463065
672351	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672354	contig_9014_pilon	-	2232	10	Intergenic	novelGene_106704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	87.8053402577416	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	43	1257	46682	42276	FALSE	5	TTTCTTCTTCCTTATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRLQAISASLCLCLLHFMLLLHQVQGA	51583	41300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42355_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
672362	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672366	contig_16204_pilon	+	1831	5	Intergenic	novelGene_154531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	47.0764006695499	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	87	734	454855	461345	FALSE	15	CCACCCACCCGTGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHRPLPQVTGLPEVVQEFGLSIQEPGQFMDSVPFDGILGLAYPTLGIRGTTPFFDNLWRQGLVSQGLFAFYLTNEEKNSSVVMFGGVDPAYYKGELNWVPVTRPFFWQFTVSSISMNGAVIGCDSGCHAILDTGTSLVTGPPEPIFNIQRIINARQSYGGEYIMDCEAINTLPDIIITINGVDYPLPASAYIRQEHTGICYSNFLATPGNLSREIWILGDVFLRLYFSVFDRENNRIGLAPAA	454768	462442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_454992_457373_457491_459323_459469_459559_459659_461195
672373	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
672378	contig_19564_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_29573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_4	215.140070651657	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	199	567	7722	9682	FALSE	25	TGAATGTTACAGTGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAKTKQQIEEQRVQVQVVERAQQVAVQEQEIARREKELEARVRKPAEAERYRLERLAEAEKSQLIMQAEAEAESVRMRGEAEAFAVEARARAEAEQMVKKAEAFQLYQEAALLDMLLEKLPQVAEEISGPLTSANKITLVSSGSGTIGAAKVTGEVLDILSRLPESIERLTGVSISQVNHNKPLQTA	7323	10084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_7509_7708_7755_7878_8017_8469_8635_9649
672381	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672389	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672390	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672395	contig_13224_pilon	-	3039	1	Intergenic	novelGene_104091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233220	230181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_230200_233200
672396	contig_14341_pilon	+	783	6	Intergenic	novelGene_111840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	2240.68003963083	28034	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	118	732	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548709_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
672400	contig_6364_pilon	+	1932	4	Intergenic	novelGene_51863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.2245562832516	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAATAAAGTTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485566	2489279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486060_2487586_2487738_2487843_2489125
672408	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_92158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672412	SIRV5	-	417	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
672413	contig_15327_pilon	-	1351	7	Intergenic	novelGene_70715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	326.225254489389	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	502	1203	961905	959664	FALSE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPVGGHSPAQLSVHIPFLAQAQPQPRSHGLPFPFLSLVILLPPLCDFNVGCQGLGGIRPRPRWLRESPSASLRVFLEFVSLAFSHFFSSRRGFSDWNWRGHVHPIMSPGLPGGWEKGPFPLRFLPGW	964151	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960043_960548_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963787
672425	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
672433	contig_19890_pilon	-	2619	5	Intergenic	novelGene_138542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	118	junction_4	91.2205431906651	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1501	2511	102103	95869	FALSE	20	TTCAATTTGAACTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEWVKQQAEREAEKEQKRLERLQRKLAEPKHCFSSPDYQQQCHEMAERLEDSVLKGMQAASSKMVSAEISERRKRPNKSRTSGGASAEKRKCFWLGMDGLASAEGSSSESSDDDSDPAPSTSGTCCQSPRNGSDGVEMAAEFPIGCHRPEVLSADSGSPEKLQKNSVIDSGKDTSKDSRAKLEETWTEEQTERKMPIETEEAQENKEAESKAARAGPNGEEETKEMTDGERAAKVARGQDRENIPVAKLEESESGDTVSHFRHIGQGTVDLLAFSSAAELELLGLDQLKSELMALGLKCGGTLQERAARLFSVRGLAREQIDPALFAKPLKGKKK	107300	95760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_-_96091_98236_98742_101036_101152_101934_103461_107157
672438	contig_7622_pilon	-	1986	15	Intergenic	novelGene_132422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	219.471396490638	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	207	1754	297961	269125	FALSE	40	TTAAAAAAAAGTTGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	306643	268892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276757_280692_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
672441	contig_3986_pilon	-	1815	14	Intergenic	novelGene_52706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	122.91551916691	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	449	1732	55958	35282	FALSE	15	TGGGTCTCAGCTTCTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108508	35198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56058_57911_57964_60545_60655_93430_93507_108396
672442	contig_8617_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_73490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCTCACCAGTCCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63600	63438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63400_63600
672447	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672450	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
672452	contig_16310_pilon	-	2068	4	Intergenic	novelGene_70050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	403	junction_1	1253.77891015743	139	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	186	995	66135	62066	FALSE	45	GGTATGTAGGAAATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEGNQSSV	66320	60992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_62275_63077_63538_64831_64955_66117
672453	contig_2480_pilon	-	1571	5	Intergenic	novelGene_63509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	34.9526465378517	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	624	1523	133035	123268	FALSE	25	CATATGGATACTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQGGGDTTGERTSLWNEMGRNHTFIILHLVLQGMVYTEYTWEVLGYCQELEFSLYYLLLPYLLLFVNLFFFTLSCVTNPGTITKANELLFLQVYEFDDLMFPKNVRCPTCDLRKPARSKHCRVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQYLFLLFPRIIFFLGFVLVLSFLLGGYLCFALYLAATNQTTNEWYRAGRAPRQHCRHEAQPLSAEPQVFQNIHSHGVWSNLREVFLPATRYEKKKK	133658	123219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123556_127197_127443_128835_128962_130073_130253_132973
672454	contig_6434_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_61919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933879	936377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_933900_936400
672455	contig_5769_pilon	+	2524	1	Intergenic	novelGene_138770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCCACAGAATGATTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269885	272409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_269900_272400
672460	contig_10196_pilon	+	1166	9	Intergenic	novelGene_132132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	364.821874344179	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	20	979	1034566	1050606	FALSE	10	TAACCCCTGCCTGTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVRPLGQPGIVPGREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034546	1050793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050473
672461	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_93990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	527	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672463	contig_20786_pilon	-	1414	2	Intergenic	novelGene_159697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATATTTTCACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38895	28785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20786_pilon_-_30152_38847
672464	contig_6710_pilon	-	430	2	Intergenic	novelGene_93407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728109	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653766_728090
672465	contig_16303_pilon	-	1606	8	Intergenic	novelGene_34091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.581097514345	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	31	945	47976	37300	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEP	48006	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33221_35366_35764_35980_36029_37169_37302_37439_37701_38579_38856_40433_40731_47897
672469	contig_5472_pilon	-	2391	11	Intergenic	novelGene_130035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	75.6005952357519	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	130	2061	449707	417222	TRUE	55	TTGAAGTACATAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINLTIDIYIYLLSNARSLCGKQRSKQLHFLCSPKYYWRVSHISPQRGFHTSKVRCKWTKSEARSCSKHCCWPSNHGLHSGILKLSTSAPKGLTKVSIRISRIKSTLHSISKAVFGSQNEMISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKVAAVSTVVNKGVTPKAFVFRNYGHFPGINSHYLGGCQYKLWQAIRASSAAPGYFAEYALGNDLHHMDIQFCQHRLLKRLSFPHLMDFGPLSKIR	456256	402471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_417215_417312_421983_422179_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449801_456220
672470	contig_16098_pilon	-	2138	15	Intergenic	novelGene_45870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_3	49.3916046737186	12	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1527	1874	247137	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253598	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247189_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563
672477	contig_7171_pilon	+	2128	13	Intergenic	novelGene_101417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAAACCTGTCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451009	1457289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1451471_1451553_1451617_1452050_1452143_1452224_1452326_1453349_1453463_1453538_1453625_1453709_1453752_1454004_1454118_1454323_1454375_1455041_1455147_1455379_1455451_1456379_1456429_1456508
672480	contig_9609_pilon	+	1309	6	Intergenic	novelGene_23059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	848.135460878744	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	55	579	449884	455537	FALSE	65	AAAAAAAATACCAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYSATLDSVQGQPGSALGCWGWPPGDKALPAIPPQLQRLGGGVATGLPNRSPPLSEVPGTASVTPFLGVCSGF	435709	456267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_452724_452801_455396
672484	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672486	contig_12000_pilon	+	2397	10	Intergenic	novelGene_43163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	634.228860044685	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	245	694	488478	584749	TRUE	65	GGAACATTCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGCVLRKPVVKNPPILLGATLRVSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416879	588442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_584748_584940_586886_587849_587891
672488	contig_9363_pilon	+	1288	10	Intergenic	novelGene_6826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	277.743686796938	70	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	28	705	1622283	1625005	TRUE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKARSAL	1622255	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624987_1625066_1625343_1625435_1625537
672494	contig_8616_pilon	-	1809	10	Intergenic	novelGene_72377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	57.4245613558657	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	173	1792	185319	178743	FALSE	35	TTTCTGGCTTCAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGLTEYLDYVSTLKVKGIVLGPVHNNQKDDLAETNLQQIDPAFGSNKDFESLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	185491	178725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184266_184441_184901_185142_185195
672496	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672505	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672507	contig_2027_pilon	+	1857	14	Intergenic	novelGene_39950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	2	junction_7	98.1002988734145	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1139	1807	643723	648685	FALSE	15	GGTGTACCATGTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQVGWVEGLDTLGRGL	638054	648735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643301_643448_643533_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505
672510	contig_16098_pilon	+	1287	8	Intergenic	novelGene_46121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	835	1287	457627	458798	FALSE	10	TGGGTGTTGGTGGGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPNFQHTAPFGKVSSVLLILGTALRQPIQPLGGGLAICSCQGYHTLVNLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASCGLICSQDALARSHNAMSDFKKLLLLLRGQC	456065	458798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456363_456452_456663_456827_457002_457098_457182_457556_457718_457850_457909_458407_458621_458707
672511	contig_14441_pilon	+	1111	5	Intergenic	novelGene_100353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	490.603391243885	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	85	1071	67440	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGFPPGAAISGSSWAVLQLLSPSSPGSMDTEVTQTPRQLVITTKQRATMDCVPIRQHNRVYWYRQKLGEELKFLTYLQNKEALDKSGLPDGRFSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSGIPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	13242	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_13277_67389_67709_125497_125902_126159_126283_126514
672535	contig_7202_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_18119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTTGGTCACGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
672542	contig_10986_pilon	-	1417	11	Intergenic	novelGene_71458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	189.665600465662	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	81	1190	80340	67011	FALSE	20	GCTCTCATTCAGATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGARIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80420	66783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
672545	contig_6069_pilon	+	1872	8	Intergenic	novelGene_8076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	100.173930373778	451	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	577	1083	563804	564879	TRUE	25	GAGCAGTGTAGAGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIDCDEAARGNPAGAGGSHDDRL	560855	566835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563414_563702_563990_564439_564695_564813_564896_565907_566043_566197
672546	contig_14441_pilon	+	1179	4	Intergenic	novelGene_100494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.355747555753	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	495	1139	92707	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92212	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92708_121187_121239_125517_125902_126496
672547	contig_5419_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_15534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGGTGATCACTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400680	400020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_4e+05_400700
672549	contig_11885_pilon	+	2344	5	Intergenic	novelGene_159703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTCGAGCCCAACGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32167	66996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_+_32937_35061_35212_51741_52927_57075_57182_66862
672558	contig_6902_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_135564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTAGCAGCTGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288923	287977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_288000_288900
672566	contig_9484_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_105671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGTGTATATAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139909	141229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_139900_141200
672567	contig_17964_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_33866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTGGCTGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134975	134195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135000
672570	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672573	contig_14755_pilon	-	2000	14	Intergenic	novelGene_129400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	117.917180845123	1	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	124	1671	1044700	972909	FALSE	5	CTTCCCTCTCACTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEDQEVVVVKEPDEGELEEEWLKEAGLSNLFGESAGDSQESMVFLSTLTRTQAAAVQKRVETVSQTLRKKNKQYQIPDVRDIFAQQIESKEKAPDGTESQSVRTNENKHQGEDDQASSFLVDKKELSPLVPEEPTASETDINLEVSFAEQAVNQKESSKDRTQKSKGNDAQLPNFRLPKDKTGTTRIGDLAPQDMKKVCHLALIELTALYDVLGVELKQQKAVKIKTKDSGLFGVPLTVLLEQDQRKVPGTRIPLIFQKLISQIEEGGLETEGLLRIPGAAVRIKNLCQELEAKFYEGIFNWESVKQHDAASLLKLFIRELPQPLLSAEYALNLLVILLPDANRDTLKALLEFLQRVIDNKEKNKMTIMNVAMVMAPNLFMCHALGLKSSEQREFVMAAGTANIMHLLIKYQKLLWTIPKFIVNQVRKQNTENHKKDKKAMKKLLKKMAYDREKYEKQDKNPNDADVPQGVIRVQAPHLSKVSMAIQLTEELKASDVLARFLSQESGVAQTLKKGEVFLYEIGGNIGERCLDDDTYMKDLYQLNPNAEWVIKSKPS	1047744	972579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_973001_974423_974486_978243_978369_990236_990378_991781_991989_996958_997013_998677_998813_1003320_1003399_1009356_1009449_1011606_1011773_1030734_1030914_1037715_1037780_1044547_1044784_1047704
672579	contig_14441_pilon	+	1239	4	Intergenic	novelGene_100542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.532723798746	4	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	393	788	125667	126062	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGESRTGGTGRPGLARAVAWASVACRQPGFVLLGKGSLSAIPPSLSDCGLSSGK	111195	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_122140_122188_125517_126283_126514
672584	contig_602_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_134970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566276	568504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_566300_568500
672592	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672594	SIRV4	+	150	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	672	1126	-40	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTGCACATGCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2700
672595	contig_2332_pilon	-	2908	10	Intergenic	novelGene_58657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	14.3759057685652	21	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1289	1633	325389	324589	TRUE	20	TTCACTTGGCTTTCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTCTRGCRFCSVKTARKPPPLDANEPFNTAKAIAEWGLDYVVLTSVDRDDMPDGGAEHFAKTVSHLKERNPKILVECLTPDFRGDLKAIEKVAVSGLDVYAHNVETVPELQR	330589	317958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_318169_320365_320478_321258_321330_322403_322550_323852_324722_325094_325153_325235_326307_327167_327262_329104_329278_330485
672609	SIRV4	+	201	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1570	632	1115	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2570	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
672612	contig_5018_pilon	-	1579	8	Intergenic	novelGene_47022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	185.955008822356	36	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	78	932	1397263	1392342	FALSE	0	GCCCTGTGGTCTGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397340	1391694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395463_1397203
672613	contig_12479_pilon	-	1628	17	Intergenic	novelGene_56871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	123.624415443512	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1602	27	1628	593987	474366	FALSE	40	CTGGAAGGGGAACATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRVGRFKMACLLETPIRMSVLSEVTASSRHYVDRLFDPDPQKVLQGVIDMKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLI	594013	474365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_474426_475590_475741_479005_479099_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773_537846_548942_549020_593942
672615	contig_15897_pilon	+	1781	5	Intergenic	novelGene_49547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	232.090903527045	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	27	437	653846	658466	TRUE	35	AAAGTTTTATATGTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSDKHRVMPDRHLEFQGTLPSELQTPLLELDGRWLRCCSSVWQPSYFWGIPWVWRGASIRFSPSLYKPSGLDGRQSVRRGYRGCQRRRIRVWEQQQHHIFWHPCESKCSYFWITVSTDFWFWDTERWILWFWIRWRSIQLWNI	653819	660369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_653923_654118_654291_657390_657531_658444_658470_659028
672617	SIRV7	-	360	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33207	2	-12	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114750	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
672619	contig_3837_pilon	+	2042	10	Intergenic	novelGene_104011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	68.7757134854456	256	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	564	1604	67539	134174	FALSE	10	GATTTCAGTGTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAEIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDAHRFEKISNIIKQFKLSCSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLERVDGPKQCLLMR	66975	134612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_77748_77816_88997_89221_121918_122015_124345_124469_128629_128722_133150_133267_134076
672626	contig_11630_pilon	+	2212	5	Intergenic	novelGene_147174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_1	128.931183194757	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAGGAATGAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77630	146258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_97081_97254_131895_131998_144489
672628	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_93526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672634	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672638	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
672642	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_97612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672645	contig_5968_pilon	-	1756	7	Intergenic	novelGene_112197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_6	237.576654296391	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	38	1123	732362	625651	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGIVSQCRNLVSFLCPLRKLKTMRNPEAEKYTKKATVFKMVE	732399	625017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
672652	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
672658	contig_14925_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_55233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54556	52971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_53000_54600
672659	contig_13176_pilon	+	1556	10	Intergenic	novelGene_159708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	47.9238078414549	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	29	1201	2931	109676	FALSE	20	TGTGTTTGTATTTAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNENYKQIAMCILYHISMDDRFKSMFAYTDCIPQLMKMLFECSDERIDLELISFCINLAANKRNVQLICEGNGLKMLMKRALKFKDPLLMKMIRNISQHDGPTKNLFIDYVGDLAAQISNDEEEEFVIECLGTLANLTIPDLDWELVLKEYKLVPYLKNKLKPGAAEDDLVLEVVIMIGTVSMDDSCAALLAKSGIIPALIELLNAQQEDDEFVCQIIYVFYQMVFHQATRDVIIKETQAPAYLIDLMHDKNNEIRKVCDNTLDIIAEYDEEWAKKIQSEKFRWHNSQWLEMVESRQMDDSEQYLYGDDQIEPYIHEGDILERPDLFYNSDGLIASEGAMSPDFFNDFHIQNGDVVGQHSFPGSLGMDGFGQSVGILGRPTTAYGFRPDEPYYYGYGSR	2902	110031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13176_pilon_+_3006_10069_10179_12568_12682_13069_13236_14031_14158_23394_23494_29858_29945_54098_54289_61540_61641_109567
672666	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
672668	contig_13295_pilon	-	326	3	Intergenic	novelGene_31243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCGTGGAATTTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134781	101929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_102009_134268_134421_134686
672669	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672678	contig_7870_pilon	-	3187	1	Intergenic	novelGene_109045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628983	625796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_625800_629000
672681	contig_8120_pilon	+	3298	1	Intergenic	novelGene_159718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52167	55465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_+_52200_55500
672689	contig_16098_pilon	-	1416	9	Intergenic	novelGene_46072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_8	77.099671691908	838	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	161	1084	453637	445488	FALSE	10	GTTTTCGGGTCTGTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	454018	445155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668_446796_446887_447062_447714_447817_448030_448082_449233_449286_453539_453702_453922
672702	contig_13894_pilon	-	1389	4	Intergenic	novelGene_62043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	447	1094	287445	286507	FALSE	10	TACTTCTGCAGGTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCKSKGGEIG	288486	286211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286535_286728_287123_287219_287538_288132
672703	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1840	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672704	contig_10734_pilon	-	1878	5	Intergenic	novelGene_50998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.04597870247	3	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	87	692	320632	311551	TRUE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320718	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310583_310793_311676_315844_315953_318838_319032_320452
672708	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672709	contig_14744_pilon	-	1064	6	Intergenic	novelGene_66137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_5	86.7585154322041	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	69	1016	1601809	1592883	FALSE	20	CCATTGAGGTTGTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGRCLYSTLASFLFFTHIFHFFVTLCYILGNFF	1604753	1592834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
672710	contig_4847_pilon	+	1336	10	Intergenic	novelGene_156154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	36.3158299667354	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	143	1093	82326	92768	FALSE	35	TATTGTCATTTCAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASGDLEKWTPVADFTHHAHTASLSAVAVNSRFVVTGSKDETIHIYDMKKKIEHGALVHHNGTITCLKFYGNRHLISGAEDGLICVWDAKKWECLKSIRAHKGHVTFLSIHPSGKLALSVGTDKTLRTWNLVDGRSAFIKNIKQNAHIVEWSPKGEKYIVVTMNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	79763	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85410_85532_85605_85681_86203_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
672712	contig_19825_pilon	-	1827	2	Intergenic	novelGene_59694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAACAAAATGGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82266	77841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_77955_80552
672717	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
672718	contig_5602_pilon	-	1660	4	Intergenic	novelGene_133039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_3	42.1610668218388	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	468	635	612297	612130	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSGAGRTSRPGRTSDSPWFLSGSETLGRLAGNTLGSRWSSGVGGSGGGSSGRSSAGARDSRRQTRVIRTGRDRGSGLLGSQPQPVIPASVIPEELISQAQVVLQGKSRSVIIRELQRTNLDVNLAVNNLLSRDDEDGDDGDDTASESYLPGEDLMSLLDADIHSAHPSVIIDADAMFSEDISYFGYPSFRRSSLSRLGSSRGNFAFISF	620417	611104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_612306_612901_613062_613246_613437_620308
672722	contig_5690_pilon	+	1332	9	Intergenic	novelGene_119736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	486.16226714956	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	44	346	1044729	1087719	TRUE	45	CAAAAGAGAAATTTCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGIPRPSWAVGEKITLAKMY	1044685	1105961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077722_1087662_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
672730	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672732	contig_20241_pilon	+	492	6	Intergenic	novelGene_159733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	17.1277552528053	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	89	418	213603	218220	FALSE	20	AGCTGAGTCATGAGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGRWRSWTLGGTVRWSTAGNEIFFRLYVMVAQEYFALNTEAGSHMAVLSCRHINWCYYSVHRHRHQSDHECGKLEISKPRMAATQRLGKDVIGSKTGETVSKRRKGAKNTETAAKVALMKLKMHADGDKSLPQDPLH	210057	218294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_210125_213581_213625_216096_216137_216616_216748_217495_217618_218205
672742	contig_6975_pilon	-	1319	9	Intergenic	novelGene_74262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_7	436.757638027087	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	456	1097	163040	159453	FALSE	25	ACTGATGTTGATACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGGDGYDGGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169973	159230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163009_163195_164402_164538_169807
672743	contig_7379_pilon	-	1125	11	Intergenic	novelGene_150040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACTGAGGGCAGGGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639397	584662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_584765_604799_604940_605199_605380_621143_621220_623247_623319_628427_628508_630650_630745_634803_634903_637858_637946_638650_638713_639263
672747	contig_6710_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_95035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTTCCAAAGATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
672749	contig_9014_pilon	+	2124	9	Intergenic	novelGene_106742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	10.0117118915798	143	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	217	1446	70242	75056	FALSE	35	AATACTTCAGGTGCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAFPELPLPLLVNLIGSLLGFVATLTLIPAFRGHFIAARLCGLDLNKSRRQQIPESQGVISGAVFLIILFCFIPFPFLNCFVEEEQCKTFPHHEFVALIGALLAICCMIFLGFADDVLNLRWRHKLLLPTAASLPLLMVYFTNFGNTTIVVPKPFRPILGLHLDLGILYYVYMGLLAVFCTNAINILAGINGLEAGQSLVISASIIVFNLVELNGEYRDDHIFSLYFMIPFFFTTLGLLYHNWYPSRVFVGDTFCYFAGMTFAVVGILGHFSKTMLLFFMPQVFNFLYSLPQLLHIIPCPRHRMPRLNTKTGKLEMSYSKFKTKSLSFLGTFILKVAESLRLVTVHQSESEDGTFTECNNLTLINLLLKVFGPMHERNLTLLLLLLQILGSAVTFSIRYQLVRLFYDV	70025	75734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_70403_70721_70846_71017_71232_71415_71563_73262_73348_73955_74145_74502_74591_74756_74913_74990
672751	contig_10861_pilon	-	500	5	Intergenic	novelGene_39365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1504.41057810027	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	407	457	1581647	1581171	FALSE	25	AATGTACATTACTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1584602	1581127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584525
672753	contig_1276_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_159768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167747	169721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_167700_169700
672766	SIRV6	-	771	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8614	-126	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTGGTTTCGACTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11161	1670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
672773	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672774	contig_15236_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_141672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAGTATGATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746993	745746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_745700_747000
672781	contig_10235_pilon	-	1846	7	Intergenic	novelGene_46275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_5	358.271312462125	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	972	1658	20866	14151	FALSE	20	TGAAACAGTGTGCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	21837	13962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850
672783	contig_15135_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_119848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	666	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23071	25466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_23100_25500
672784	contig_13740_pilon	-	1390	9	Intergenic	novelGene_34671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4672.10067180706	7	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	169	885	165243	157458	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGADIELLPI	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157487_158640_158701_160678_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
672785	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672788	contig_7202_pilon	-	293	2	Intergenic	novelGene_18595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGAAGCTGCAGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29996	28539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
672793	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_92159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
672796	contig_14925_pilon	-	1414	5	Intergenic	novelGene_55129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	1778.50391832574	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	280	726	103374	28039	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFA	103653	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611_29828_103145
672797	contig_12790_pilon	+	2595	1	Intergenic	novelGene_35275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTCACATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372704	375299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_372700_375300
672801	SIRV7	-	269	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69017	0	35798	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78940	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
672806	contig_8254_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_48385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74598	77188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_74600_77200
672810	contig_8330_pilon	-	1272	3	Intergenic	novelGene_71861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	282	46	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCACCACCATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908598	904095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_904412_904827_904897_907711
672812	contig_7816_pilon	+	1640	11	Intergenic	novelGene_66459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	202.961080012893	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	281	1423	127339	148859	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSAPSGHKHLTVEELFGTSLPKEQPMVVGLDSEEVEKLPGDASQKEPSPFLPFSFEHSGGAPQRSPLLNQPVPELSHTCLVASQSPFRAPLSVTSTAGTSLASVDLLQKLRLTPQHDQIQTQSLAKGSVAPSFPPAAGQLATPESFIEPPTKTAVARAAASASLSNMVLSPLQSMQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKNDSGFLSTLHEVYLQVLTKNKENLSL	94468	149076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_143942_144129_144371_144702_146636_146703_148224_148444_148778
672813	contig_6069_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_8006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	722	1072	70039	69689	NA	30	TCCATTATAACTGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLHPPFQAAQCGPSVPEESSGPGGGGPALPYPAPGPLPQENVPDGTTAKSGSGMLHLCSHLGMDVQACSHSPLYYKGLSSRIQDKEGGSCHAVPPRGASCSRSSQSSLERGRTL	70760	68460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_68500_70800
672819	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
672830	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672831	contig_3721_pilon	+	3057	11	Intergenic	novelGene_123796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	222.10738393849	1	132	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	84	1520	63865	102235	FALSE	5	TTTGCTTTCTTGGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATEEVKASAYYLRSRQRRQPRPQEATEMKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSDSSYKTNGNSKMSELEAASVQQKANFSEEETEEDDPDSSESDVTAGKFRSGDSVESGDQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63781	103772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81611_81696_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
672839	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672842	contig_15185_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_99441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_7	224.515623746149	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	62	1117	472420	429911	FALSE	5	CATCTGTGTGCTGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472481	429454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
672853	contig_15063_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_14320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	297	953	35271	36496	FALSE	25	GTGTCTGAGGAAGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILN	34862	36496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
672857	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
672858	contig_14415_pilon	+	1712	5	Intergenic	novelGene_77614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	198.39024043536	51	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	TRUE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805_38217_38472
672862	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672871	contig_2069_pilon	+	1699	7	Intergenic	novelGene_23451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	352.07973370941	568	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	239	1633	1433269	1439381	FALSE	15	TGAGTTGAGGCCTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGRATQKAWLVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1431972	1439447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432060_1432935_1433064_1433245_1433305_1433701_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
672873	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672876	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672883	contig_13201_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_130881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGGTTTTGTGCTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152753	154747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_152800_154700
672887	contig_10000_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_139338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	757	1128	301037	300666	NA	80	AAACAAAAAACAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGQSHNTERHGLAKLTHTVWWDTIQSRTRKYTLINHFETACSQTCLPSLPLKWNKKKCIICIYSSTGVSGGSRVEFLPSMQETRVRFPASAPHVQPPPVIGCLRVAMMLNRFQRSFQTKMD	301793	299461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_299500_301800
672897	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
672910	contig_1867_pilon	+	1525	6	Intergenic	novelGene_54514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5651.21854470343	3	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	134	877	194973	220943	FALSE	25	ACTAAAGGACTGTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194839	221591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213636_215651_215811_218786_218898_219457_219609_220857
672911	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_90432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672917	contig_18637_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_81861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATTATCAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217530	217854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_217500_217900
672932	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
672936	contig_16846_pilon	-	1085	5	Intergenic	novelGene_82962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	17	junction_1	3312.7083613714	608	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	100	618	555239	551492	TRUE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558749	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551107_551269_551665_552661_552824_555055_555278_558688
672946	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_96891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672950	contig_5033_pilon	-	2156	6	Intergenic	novelGene_29070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_3	1758.01642768206	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	25	756	566787	542081	FALSE	15	AACCTGTTTCTCCCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVVNL	566811	540680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
672951	contig_5236_pilon	-	1941	6	Intergenic	novelGene_100913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	12.0233106921513	162	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	191	1630	447928	445307	FALSE	0	TTTGTTGGGCTGTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDIDRNQTEKLLKRVQELEEEVQRLKKEQVNKDSSRKEDSSGSKKAKRAFDFSAHGRRHVALRIAYLGWGYQGFASQENTNNTIEEKLFEALTKTRLVESRQTSNYHRCGRTDKGVSAFGQVISLDLRSHFPKDKDSEDLSLKDEVNDSAKEIRYTHILNRVLPPDIRILAWAPVEPTFSARFSCLERTYRYFFPRADLDIVIMNYAAQKYVGTHDFRNLCKMDVANGVINFQRTILSAQVQLVGQSLGDERWEEPFQLCQFEVTGQAFLYHQVRCMMAILFLIGQGMEKPEIIDELLNIEKNSQKPQYSMAVEFPLVLYDCKFENIKWIYDREVQEFNVTHLQQLWANHAVKTHILYSMLQGLDSAAVPCGKGPEMDGVIKWRNVKPPVIKQTSAFVEGVKMRTYKPLMDRPKCQGLESRIQHFVRRGRIENPHLFHEEETKAKRDCADILEEENTILEKPTKRICVDTEIKRIT	454866	444995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_445618_445761_445953_446893_447460_447556_447971_454609_454705_454813
672965	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
672967	contig_14322_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_115986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671622	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
672972	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
672975	contig_13718_pilon	+	2130	7	Intergenic	novelGene_142901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_1	176.95832842791	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	233	1156	253838	273278	FALSE	30	ATAAGTCTTTGCTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSNHYRSEDLLDVDTAAGGFQQRQGLKYCLPLTFCIHTGLSQYIAVEAAEGRNKNEVFYQCPDQMARNPAAIDMFIIGATFTDWFTSYVNNVVSGGFPIIRDQIFRYVHDPECVATTGDITVSVSTSFLPELSSVHPPHYFFTYRIRIEMSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLEMGPDEYEEMEEEEEEEEEEDDDSADMDESDEEDEEERRRRVFDVPIRRRRCSRLF	253605	274252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_254030_255157_255204_256435_256521_257368_257492_262552_262669_263921_264113_273107
672976	contig_8978_pilon	-	1257	7	Intergenic	novelGene_49328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.039190574312	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	28	909	194082	190773	FALSE	40	TGAAGCAAAAGAATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISPYCPPPCYTLKPES	194109	190424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190819_191625_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
672979	SIRV6	-	268	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-78	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1898	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
672986	SIRV5	+	400	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6	7477	-5	-84	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTTGGTAGAGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
672988	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_93005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657812	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
672996	SIRV2	-	366	3	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	5	-673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5902	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4480_4687_4801_5790
673010	contig_11285_pilon	-	1725	13	Intergenic	novelGene_5533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.619040328327	3	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	521	1171	744458	742269	TRUE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQVFLSPKPYTGSTMSW	745259	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741411_741527_741656_741737_741819_741892_741968_742192_742316_742640_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744754
673013	contig_1143_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_86626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCACCTTACCTGCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261768	1263799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1261800_1263800
673016	contig_12624_pilon	+	697	2	Intergenic	novelGene_61075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	196	606	867618	868158	FALSE	30	TGATTAAATCAGACGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNLTCPAPCTHHCVLTPQSQAVVFHLVPGGFHATFRKGHQLIAIPRPVAQPSMFRQELQFLRHIVQYLAVGEPELSLHDHSVLVVHLECVGHGHTELYFLREEEEAKRTHEHLRPPLCNISWITIALCLVQGVL	867422	868249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_867769_867898
673028	contig_14441_pilon	+	862	5	Intergenic	novelGene_100453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	249	677	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLCQQVHFRVALFWCVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82333	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112073_112154_116578_116963_117220_117344_117539
673032	contig_13778_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_70848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAAAAGTGCGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244104	243019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_243000_244100
673033	SIRV5	+	435	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
673034	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673035	contig_20710_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_159778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGTTGAGAAGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17720	15776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20710_pilon_-_15800_17700
673040	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673044	contig_13780_pilon	+	2511	1	Intergenic	novelGene_149059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGAGAGTCTGGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607424	609935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_607400_609900
673045	contig_12624_pilon	+	1839	4	Intergenic	novelGene_61137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCCGCTCTGGGGCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947494	955888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_948841_950589_950767_952912_952987_955646
673048	contig_11512_pilon	+	351	2	Intergenic	novelGene_43221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	26	349	4011	4557	FALSE	15	TGCTTATGCTGCTTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	3985	4559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
673051	contig_4783_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_108416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAAAAAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395178	397410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_395200_397400
673053	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673054	contig_14322_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_116181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671881	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
673055	contig_3077_pilon	+	1542	10	Intergenic	novelGene_26705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3688.4782000303	5	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	403	1086	13867	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11391_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449_17634_17675
673057	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673058	contig_7088_pilon	+	2297	8	Intergenic	novelGene_159789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	123.402278945648	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	441	1745	689656	712826	FALSE	45	AAAACATAAATGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYLNPWRRPLLSCSWSKLCLLKQCLFTMKLRSPEFQSLFTEGLKSLTELFVKENHELRIAGGAVRDLLNGVKPEDVDFATTATPAQMKEMFQSAGIRMINNKGEKHGTITARLHEENFEITTLRIDVLTDGRHAEVEFTTDWQKDAERRDLTINSMFLGFDGTLFDYFHGYEDLKNKKVRFVGRAKQRIQEDYLRILRYFRFYGRIVEEPGDHDPETLEAIAENAKGLAGISGERIWVELKKILVGNHVNHLIHLIYDLDVAPYIGLPANASLGEFDKVSKNAEGFSPKPMTLLASLFKVQDDVTKLDLRLKISKEEKNLGLFIVKNRKDLIKATDSSEPLKPYQDFIIDSRESDATTRVCELLKYQGEHSLLKEMQQWSIPPFPVSGHDIRKAGISSGKEIGALLQQLREQWKKSGYQMEKDELLSYIKKN	688657	713378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_689098_689655_689804_698510_698705_701957_702097_706157_706285_710886_711081_712085_712340_712577
673060	contig_10658_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_130085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAATTTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282432	280826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_280800_282400
673079	contig_9883_pilon	+	451	3	Intergenic	novelGene_87592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_2	324	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	49	450	84022	96094	FALSE	65	GCAAAGAGAAAAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLEQWEKDDDIEEGDLPEHKRPSAPIDFSQIDPGKPESILKMTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPGKGGG	83973	96095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84049_94067_94301_95952
673085	contig_15327_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_70558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570159	568758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_568800_570200
673089	contig_8284_pilon	+	1217	10	Intergenic	novelGene_125691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	430.785845222942	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	176	943	426599	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	424441	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_424606_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
673091	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_94297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	653858	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653859	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673097	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_97216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673107	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_94709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673108	contig_5331_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_112795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACGTGAAAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456477	454690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_454700_456500
673109	contig_14142_pilon	-	1313	10	Intergenic	novelGene_120531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.505661968841	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	9	1046	355495	349302	FALSE	5	ACTGCCTGTTTGGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLVSRGKFGEDPKKH	355503	349034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349317_350105_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
673110	contig_13702_pilon	-	2570	7	Intergenic	novelGene_102609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	97.6992266545078	496	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	310	1188	151513	144255	FALSE	10	TTGGCATGTAGGTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	158905	142872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151585_158667
673118	contig_4519_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_123648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCATTGATATAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16874	15936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_15900_16900
673134	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
673153	SIRV4	+	298	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1473	632	1018	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2473	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
673154	contig_17440_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_7601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGTCCTAGCCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
673155	contig_12270_pilon	-	338	2	Intergenic	novelGene_113935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
673165	contig_5791_pilon	-	2987	1	Intergenic	novelGene_35866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1554	1904	1080744	1080394	NA	50	AAAAAAAAATTATTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFVFFLPYKDDLSLIRKNRMALFQHLTCVLPILDSLLTARVINEQEHDVIKQKRQTPLQARELIDTILVKGNSAATIFRHFLHENDPVLYKNLFGKCWKIIWGKFLGELKICSH	1082297	1079310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1079300_1082300
673169	contig_11105_pilon	+	2078	3	Intergenic	novelGene_159811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209916	213477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_210074_211203_211735_212087
673170	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
673172	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673175	contig_8852_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_159839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCAACTTCTATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54572	52492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_-_52500_54600
673182	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673183	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673185	contig_14322_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_116180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671880	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
673190	contig_15021_pilon	-	2962	10	Intergenic	novelGene_26991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	134.278961517331	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	17	787	428082	418766	TRUE	10	CTGAGGTGTATGGTGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAERGSGQQQSQEMMEVDRRVESEESGDEEGKKHSGGIVADLSAQSLKDREEHSEVDAGEEQELPVDMEAISLDGDAEDVDLNHYRIGKIEGFEVLKKVKTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRGFPGTVDKLASGAHTTQSPLSTMPAAQTTRGIRCCPSSPETSGRWTEEISEKLSGVP	428098	389418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_389727_411764_411852_416003_416109_417090_418940_419336_419500_420184_420316_420895_420962_421592_421649_426120_426250_428030
673191	contig_12886_pilon	+	2590	2	Intergenic	novelGene_135456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	921	1277	246222	247591	FALSE	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLGPFSRVLGHVQTCFRSGTSHATYRWSCVEEHTSFCPSPEVSSEELSLCKVVPGNQHEHCTNQDPFTTQTADLSGIAPRGQRFSKLVNGGGLHPALIYSSLSLSKKHSVWVTNPV	245301	248904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_246511_247523
673198	contig_567_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_34019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTCACAAAAGGAGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654813	657398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_654800_657400
673206	contig_5988_pilon	-	933	9	Intergenic	novelGene_15894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_7	55.4340824763971	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	33	827	555058	530705	FALSE	20	TGATTATGGAGGGGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVTSSDSSLALEGEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGEKLGRRREGSWEVRVAQGKSAPCSPQPGE	555090	530598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532541_549379_549429_555049
673207	contig_9571_pilon	-	2715	1	Intergenic	novelGene_136272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGAAGATCTCTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417976	415261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_415300_418000
673228	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
673231	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673233	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673234	contig_7119_pilon	-	1305	6	Intergenic	novelGene_40999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	367.533617510018	2766	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCCTGAAGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196836	187966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196293_196379_196690
673235	contig_10689_pilon	+	715	2	Intergenic	novelGene_118641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAAGCTTTCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58307	61577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_58374_60928
673243	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673248	contig_20779_pilon	+	1869	4	Intergenic	novelGene_112359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	153.47602056637	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1827	41	1867	8301	94520	FALSE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENDRNVRQSQEGFWKRSPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLS	8260	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_94395
673252	contig_6418_pilon	-	2065	8	Intergenic	novelGene_81187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170798	1158791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1158916_1160477_1160574_1163364_1163567_1164845_1164976_1165154_1165356_1165906_1166098_1168537_1168640_1169779
673258	contig_14220_pilon	-	1751	8	Intergenic	novelGene_159862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_3	355.783011146412	549	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	204	1292	422880	325890	FALSE	40	TTATAATCTAGAAGTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTDEEYLQAYGGQQGMQKQEDYVAEDKLDEITDSQVAPETEEGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVVVIFPILLW	423083	325430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_326126_331917_332090_355341_355462_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
673259	contig_2636_pilon	-	1635	4	Intergenic	novelGene_52058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	177.69074258385	105	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	123	401	85555	62451	TRUE	25	ATCGAATTTGGTAGATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_62624_81113_81216_85551
673260	contig_7202_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_17706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGTTGGTCACGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
673270	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4814	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673274	contig_9482_pilon	+	2608	6	Intergenic	novelGene_44330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	242.28957881015	20	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	10	420	1253592	1259896	TRUE	30	TCATACTGAAGATTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGAPREAPQGESRSPCVPPTSFEADPLKKRRWGLFLTGVVGGTLAAVYAVATPFLMPALRRVCLPFVPATPSQVENVVKILRCGRGPLVDIGSGDGRVVSDARAVTGFGTRIVAKISLTFLMRFCNRLPNRTL	1253582	1275869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1253605_1259498_1259949_1262354_1262493_1264833_1264885_1272800_1274242_1275363
673277	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673282	contig_10437_pilon	+	2707	3	Intergenic	novelGene_38347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	26	251	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	126	479	523324	526539	FALSE	20	AAGCAATGTGTGTTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKQEEENPSEETGEEKQDKQEKEGILPERAEEAKLKAKYPSLGQKPGGSDFLMKRLQKGQKYFDSGDYNMAKAKMKNKQLPSAGPDKNLVTGDHIPTPQDLPQRKSSLVTSKLAG	523198	528767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_523381_525030_525157_526368
673290	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673306	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
673307	contig_7340_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_159889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGGGAAAGATGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87192	84532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_84500_87200
673312	contig_10011_pilon	+	2525	1	Intergenic	novelGene_68032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATACGAAAATACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118016	120541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_118000_120500
673324	contig_3081_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_133967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTATCTGCTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178850	1179394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1178800_1179400
673331	contig_14890_pilon	-	2029	3	Intergenic	novelGene_122512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	898	junction_1	364.5	1319	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1050	1484	367836	366814	FALSE	15	TTTTGTCTGTTTGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	368885	366268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777
673339	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	280	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673341	SIRV7	-	338	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33230	1	11	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
673349	contig_7457_pilon	-	1300	4	Intergenic	novelGene_31684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	10	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	145	486	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176986	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
673350	contig_7816_pilon	+	1483	10	Intergenic	novelGene_66500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1372.62068888515	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	87	893	170169	207920	TRUE	40	GAGAAAAATGAATTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGGKTGPLRWPWRIWPCSGQSPHQLSFTQVMEFLQRKQWN	170082	211757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181089_195755_195950_196744_196910_207503_207651_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
673351	contig_12965_pilon	-	3407	5	Intergenic	novelGene_65199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_3	176.713574747386	44	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	386	2446	313082	307208	FALSE	60	ACTTGGAGACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSRSRSDDGGEEASFQDHNHHENERRWQQERLHREEAYYQFINELSDEDYRLMRDHNLLGTPGEITSEELQQRLDGVKEQIASQPDLRNRENGTNTRDSEVPRESSNEDSLLEWLNTFRRTGNATRSGQNGNQTWRAVSRTNPNSGEFRFSLEIHVNHENREFEIHGEDYASIPLTDISRDHTRNRHQRSNSPVARRTRSQTSVNFSGNSSNTPRTRLGSRGQNSIEVSYSTLGRLRNGVRGSVGVPRTRTPRANSSDHTDQAGDGELRQREGQRFGAAHVWENGARTNVTVRNTNQRLEPIRLRSSFSSRSRSPIQRQSGTADHNSQRESRPSQRTIRRSARRRGITHGFLQHDRESRGTTYTPFSNSRLVSRITVEEGEESSRSSTAVRRHPTITLDLQVRRIRPGENRDRDSIANRTRSRVGLAENTVTLESNSGGFRRTISRLERSGIRTYVSTITVPLRRISENELVEPSSVALRSILRQIMTGFGELSSLMEAESESEIERSGQHLPEMHSDLGDLGTVNDSSPHNEGSSEDWQAQEDSTGMRGENDTMQPHAQNSDSRGDRQLRNANNLVETGTLPILRLAHFFLLNEGDDDNRSRGLTKEQIDNLSTRNYEHSSIDSELSKICSVCISDYVTGNKLRQLPCMHEFHIHCIDRWLSENCTCPICRQPVLGSSIANSG	315874	306246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_308971_311954_312060_312889_313102_314850_314934_315591
673352	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673353	contig_14357_pilon	+	2262	5	Intergenic	novelGene_121644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	36.8264510915727	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	78	623	58167	66150	FALSE	35	GGAGGAGAGGACAGCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNVFEKLFKSLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELTRMLAEDELRDAVLLVFVNKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRQRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLKNQK	55927	67789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_55986_58147_58315_61803_61915_63904_64030_65988
673360	contig_14209_pilon	+	1849	13	Intergenic	novelGene_88336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	211.590931332659	2	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	75	896	32406	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPECDHELVMTQALTSLPRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32331	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33831_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40848_40901
673362	contig_11564_pilon	-	4016	1	Intergenic	novelGene_158596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1206	3621	174	3794	218095	214475	NA	15	ACTGTACTATTGTTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEYVTFSKLEDCHLQDRDLYPCPGTDCSRVFKQFKYLSVHLKAEHQNNDENAKHYLDMKNRREKCTYCRRHFMSAFHLREHEQVHCGPQPYMCVSIDCYARFGSVNELLNHKQKHDDLRYKCELNGCNIVFSDLGQLYHHEAQHFRDASYTCNFLGCKKFYYSKIEYQNHLSMHNVESSNGDMKKSVNLEEPATGEKQDCIDQPHLLDQSDKSHLPEDLLFCAGSASSQIDTETAENLKENSDSNSSDQLSQSSSASMNEELIDTLDHSESMQDILLSHEKVFVPSSLKEKCSSVAVCFDGNKFTCGFDGCGSTYKNARGMQKHLRKVHPYHFKPKKVKTKDLSPCSGNEHNQTTEKFDAEHKPSSDTSSDSPDEGLDHNIHTKCKREHQGYSSEASICASKRPCTEDTMLELLLRLKHLSLKNSITHGSFSGSWQGYPSSGAKSLQSVSSISDLNFQNQDENVPSQYLAQLAAKPFFCELQGCKYEFVTREALLTHYLKKHNYSKEKVLQLTMFQHRYSPFQCHICQRSFTRKTHLRIHYKNKHQIGSDRITHKLLDNEKCDHEGPCSVDRLKGDCSVELGGDPSSSSEKPHCHSKKDECSSETDLESSCEETESKTSDISSPVGSHREEQEGREGRGSRRTVAKGNLCYILNKYHKPFHCIHKTCNSSFTNLKGLIRHYRTVHQYNKEQLCLEKDKARTKRELVKCKKIFACKYKECNKRFLCSKALAKHCSDSHNLDHVDEPKVLSEAESVARFSCNQPQCPAVFYTFSKLKHHLMEQHNIEGEIHSDYEIHCDLNGCGQIFTHRSNYSQHVYYRHKDYYDDLFRSQKVANERLLRSEKVCQTTHTEGNEHQNTRRSFSTKAKKCGLIKDKKTPISFKTRAEALHMCMEQSEHTQYPCMVQGCLSVVKLESSIVRHYKRTHQMSSAYLAQQMEKLVVCVKYGTKIKEEPPSGVEPCIKQEENRSCESEHTKHSHSLGNSSAPDQNTDSPHPGGRDGGQKGCTESNPVFDADTLLYRGTLKCNHGSETTSLEQCNIVQPPPCKIENSIPNPSGTESGTYFTSFQLPLPRSKDSETGQHSSGQENTVKNPTNVPKENFRKHSQPRSFDLKTYKPMGFESSFLKFIQESEEKEDDFDDWESSEHLTLSNSSQPSNDFTGNVVANNMVNDNDPEVDIPHSSSDSAIHENLTAIPPLIVAETTTVPSLENLRVVLDKALTDCGELALKQLHYLRPVVVLERSKFSTPILDLFPTKKTDELCVGSS	218268	214252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_214300_218300
673364	contig_12837_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_57384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGGCATATTTAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382059	380917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_380900_382100
673370	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673373	contig_5649_pilon	+	1991	8	Intergenic	novelGene_82272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_6	153.44652728131	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	166	939	25982	34768	FALSE	45	GTTACAATAAAATCACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	23254	35820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
673381	contig_6361_pilon	-	2023	4	Intergenic	novelGene_23895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	15.6914697279198	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTCTCTTATTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128458	121268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122886_123928_124009_126515_126587_128203
673388	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_96244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673396	contig_11370_pilon	-	2031	9	Intergenic	novelGene_98749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_8	77.6542819167108	409	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	794	1852	152557	149209	FALSE	35	AAGGGAGATCAGCCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPAAFPLPVVVATVLWGAAPIRGLIRATSDHNTSMDFADLPALFGATLSQEGLQGFLVEAHPANACSPIAPPPPAPVNGSVFIALLRRFDCNFDLKVLNAQKAGYGAAVVHNVNSNELLNMVWNSEEIQQQIWIPSVFIGERSSEYLRALFVYEKGARVLLVPDNSFPLGYYLIPFTGIVGLLVLAMAAVMVVRCIQHRKRLQRNRLTKEQLKQIPTHEYQKGDQYDVCAICLDEYEDGDKLRVLPCSHAYHSRCVDPWLTQTRKTCPICKQPVHRGPGEEDQEEAAQGEEEGDEEGEPRDHPATERTPLLGSSPTLPTSFGSLAPAPVFPGPIGAPLSPSPSSSSATILV	153350	149029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_149517_149592_149674_150368_150463_150595_150702_150924_151016_151133_151222_151328_151455_152309_152391_152473
673398	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
673399	contig_18194_pilon	-	1796	5	Intergenic	novelGene_55958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.879784214393	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTTCCAAAGAAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20413	3615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5040_5406_5501_7034_7155_18866_18976_20364
673400	contig_5649_pilon	+	2051	10	Intergenic	novelGene_82388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	34.6189129783485	285	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	140	1075	1086027	1096594	FALSE	20	GGTATCTGTCCTTGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFGISAGQCVIVVWDRSSPVKALKDLVGKLQALTGSEGRVSVENINQLLQSAHEESSFDIILSGVIPGSTTLHSAEILAEMARILRPGGCLFLKEPVETAVVNNSKVKTASKLCSALTLSGLVEVKELQRESLSPEGIQSVQEHLGYQSDGLVSVQITGKKPNFEVGSSSQLKFSIAKKSPSVKPAVDPAAATLWTLSVNDMEDDSLDLIDSDELLEPEDLKKPDPASLRAASCGEGKKRKACKNCTCGLAEELEKEKSKEQKSSQPKSACGNCYLGDAFRCASCPYLGMPAFKPGEKVLLSNSNLHDA	1082100	1097570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1082159_1085761_1085817_1086000_1086184_1086660_1086814_1088284_1088362_1089885_1090052_1091407_1091482_1092355_1092472_1095901_1095984_1096483
673411	contig_10235_pilon	-	1708	2	Intergenic	novelGene_46618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	0	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610456	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537
673412	contig_15459_pilon	-	1830	6	Intergenic	novelGene_106377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	154.150056762883	7	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	25	528	20238	17983	TRUE	35	AATGAACTTTGGCTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLSRGDRMGNSALRAHVETAQKTGVFQLKDRGLTEFPSELQKLTSNLRTIDLSNNKIESLPPMLIGKFTLLKSLSLNNNKLTVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQVPR	20262	15508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_17791_17995_19068_19338_19909_20049_20154
673416	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673424	contig_10135_pilon	-	2025	8	Intergenic	novelGene_106624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	47.9774606945165	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	467	1534	88066	84292	FALSE	10	GGACTTTGTCTCATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89582	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88862_89057_89502
673432	contig_10734_pilon	-	2024	14	Intergenic	novelGene_50975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	36.4386490958295	154	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	80	1021	282131	265942	FALSE	15	TTTTTGTAATTTTTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRRRKSELADSRRFPDSRWRCAEAAMVSDEDELNLLVIIVDTNPIWWGKQALKGSQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNRLAVIASHIHESRFLYPGKNGRLGDFFGEAGNPPSEFNPSGSKDGKYELLTAANEVIAEEIKDLMTTSDIKGQHMETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPIHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKSTSAVIM	282210	264938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_265966_266444_266503_266582_266620_266733_266870_267699_267769_270919_270974_271980_272056_273753_273783_273933_273964_275096_275160_276523_276691_278456_278564_279918_279999_282118
673438	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673439	contig_2596_pilon	+	1370	4	Intergenic	novelGene_53435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	154.612059325555	1740	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACTAAAATACCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9094	11472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_10223_10378_10454_10666
673446	contig_7318_pilon	+	2749	8	Intergenic	novelGene_152210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.8250425615826	214	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	783	1619	177513	196994	FALSE	15	CATACAGTGTGTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSASSPRPAPDENEFPFGCPPTVCQDPSEPKALCCDACLSEDMRNSEDQSCPKCRGDDPHSASPGNLLSQEKDHPEMAETRVGCPFAGVGCSFKVVELQQTLAQKDQALGKLEQSLHLMEEASFDGTFLWKITNVTRRCHESACGKTISLFSPAFYTAKYGYKLCLRLYLNGDGSGKRTHLSLFIVIMRGEYDALLPWPFRNKVTFMLLDQNNREHAIDAFRPDLNSASFQRPQSETNVASGCPLFFPLSRLQSPKHAYVKDDTMFLKCMVETSA	173981	198124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_174016_175913_176028_176878_177653_179648_179734_189349_189416_192041_192220_195385_195535_196775
673454	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673456	contig_11931_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_159904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACCTCTCCTCCCTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323194	325234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_+_323200_325200
673457	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
673469	SIRV5	+	391	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCGACAATTCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2270_2316_3298_3405_3483
673474	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27908	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
673481	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
673484	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673485	contig_15407_pilon	-	3033	1	Intergenic	novelGene_123039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTCTGTGTGAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180578	177545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_177500_180600
673491	contig_2027_pilon	+	2230	16	Intergenic	novelGene_39910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	397	junction_3	137.014094976474	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	47	2035	126391	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	126344	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
673492	contig_20823_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_159908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACATTCTAGTAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30784	30146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_-_30100_30800
673493	contig_20823_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_159907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAGAGAAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30045	28453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_-_28500_30000
673494	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673495	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
673498	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	78	486	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACACGAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
673505	contig_7202_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_18697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTACGTCTACCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
673507	contig_6227_pilon	-	1129	9	Intergenic	novelGene_49729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	309.406690296121	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	24	473	1224979	1203660	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVTSSSRSRPSTLYGRGCITRSSWPTSWPRLRP	1225002	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204199_1222055_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
673513	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673517	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673529	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673534	contig_5961_pilon	-	3170	1	Intergenic	novelGene_144142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185873	182703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_182700_185900
673535	contig_7428_pilon	+	1659	12	Intergenic	novelGene_77728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	125.997310741339	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	191	814	432562	434032	TRUE	35	TTATTATGAAAACAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPPLHWACREGRSAVVEMLIMRGARINVMNRGDDTPLHLAASHGHRDIVQKLLQYKADINAVNEHGNVPLHYACFWGQDQVAEDLVANGALVSICNKYGEMPVDKAKAPLRELLRERAEKMGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSIQMCSQC	429282	435366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433254_433360_433445_433547_433634_433779_433856_434006_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
673540	contig_12402_pilon	+	2975	5	Intergenic	novelGene_133377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	18.6731759484026	253	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	574	2265	636636	661788	FALSE	10	ATGGTCTGTGAGTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVVFEDVAVEFTQEEWALLDFSQRKLYRDVMMETFRNLDSVFKQDDNGQTFMKNDSSSSMLGKICEFHGIEHQYNNQGRHVRIFTVESLCESKDGKVNKGEEGNQCGKTFTSIGNLTSLKRTEGNPFECLECGKAFMDNSSFKHHIRSHTGYKPYHCKECGEDCRCPYLKPRLREKLCKCKDYGKPCSCSLSLTSHLRTHNGERPYECKECGKAFSYLSSLIRHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLATHIRTHSGERPYECKECGKAFTCSSSLTTHMRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRSHSGERPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIRTHSEERPYECKQCGKAFKQFTQLTTHIRTHSEERPYECKECGKAFKQFVQLTRHVRVHSGEKPYECKECGKSFSQFSYLTGHIRAHNGYRPYECKECGKAFIRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFFRSSHLTDHVRSHSGEKPYECKECVKAFSCFSSFRKHVRTYHGNRPYDSKECEKAFSQFSHLTDHIRSHSGENLQCSELLSYGPSNHGLVTPTK	626631	662498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_626958_636388_636639_658759_658884_659869_659994_660347
673545	SIRV5	-	447	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGATGTCCTGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
673554	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	473	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673557	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_90551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653846	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673563	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673580	contig_14711_pilon	+	2469	8	Intergenic	novelGene_68878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.642834293024	187	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	207	1367	63306	67289	FALSE	15	TAGGATGTGGCTCCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSCEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKKKKEVKEEGSPDSYELSPQLEELINKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLWDKFSELATKCIIKIVEFAKRVPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKVDKLQEPLLEALRLYTRRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGPMPPLIQEMLENPEMFEDDSSQPGPHPKASSEDEVPGGQGKGGQSPQPDQGP	59452	68391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_59627_63273_63423_63802_63945_64602_64764_64976_65154_65703_65909_66294_66454_67089
673583	contig_12427_pilon	-	1879	2	Intergenic	novelGene_40431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCCAATGACGCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230083	227583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_228132_228752
673584	contig_14483_pilon	-	2669	9	Intergenic	novelGene_133765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_8	22.2429764195352	309	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	259	855	176162	130173	FALSE	25	GGCTGATTTTCAGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFDIYRKVPKDLTQPTYTGAIISVCCCLFILFLFLSELTGFITTEVVNELYVDDPDKDSGGKIEVSLNISLPNLHCELVGLDIQDEMGRHEVGHIDNSMKIPLNNGVGCRFEGQFSINKVPGNFHVSTHSATAQPQNPDMTHVIHKLSFGDTLQVQNVQGAFNALGGADRLNSNPLASHDYILKIVPTVYEDKSGKQRFSYQYTVANKEYVAYSHTGRIIPAIWFRYDLSPITVKYTERRQPLYRFITTICAIIGGTFTVAGILDSCIFTASEAWKKIQLGKMH	201874	128358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_130281_146434_146558_149883_149985_156673_156735_162235_162341_176063_176189_181508_181604_194323_194397_201810
673589	contig_7045_pilon	+	2282	6	Intergenic	novelGene_77447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	254.990666495854	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	129	524	323324	362199	TRUE	20	CCATTAGCATATTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFSEAALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALWR	323195	365682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362086_362189_362260_363879_364007_364111
673590	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673594	contig_11656_pilon	+	2573	15	Intergenic	novelGene_53999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	118.28987656583	11	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	574	1785	520424	528195	FALSE	25	TACTTTCCATACACGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLRYKPQFPAPGWNVEKQKAVCEATFLTLLRFA	464933	528983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484838_510876_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001
673595	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673598	contig_12570_pilon	+	1755	7	Intergenic	novelGene_79356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	843	1244	190479	196329	TRUE	15	TGGAGCCTGTGCCTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVNVLLGRLLQLGNGDGLTHNSGDGLGVGHQPPGVRGEEASTMEDARGKANVLLELLLDPSAPGALLKDHLLIHFILPKGVGGNQVSSMAQGQFHKALAVAQSDGILAWHGAQRLGCAPHYDDDGIAAPIL	189636	211466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_190544_194619_194823_196195_196373_197887_198079_204962_205016_205423_205535_211353
673601	contig_18613_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_80230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3591	junction_2	801.5	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTAATAAAGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28569	31338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_28639_30137_30195_31058
673610	contig_9239_pilon	+	1755	4	Intergenic	novelGene_137167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	104.05554072492	940	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	107	592	100978	109517	FALSE	5	TCATGTCTTGTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQSNRGTESKKMSSELFTLTYGALVTQLCKDYENDEDVNKQLDKMGYNIGVRLIEDFLARSNVGRCHDFRETADVIAKVAFKMYLGITPSITNWSPAGDEFSLILENNPLVDFVELPDNHSSLIYSNLLCGVLRGALEMVSAALGLLGHLKCSSGMVNV	100871	110680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_107248_107347_107581_107682_109271
673611	SIRV2	+	660	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
673630	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_93484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
673632	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
673637	contig_3111_pilon	+	1593	5	Intergenic	novelGene_129981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	29.5381109754839	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	16	699	160148	162091	FALSE	25	TAGTAGCTGTGTTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAARRLPEMGLSALLMLALCAAGARALYFHIGETEKRCFIEEIPDETMVIGNYRTQMWDKQKEVFLPSTPGLGMHVEVKDPEGKVVLSRQYGSEGRFTFTSHTPGDHKICLHSNSTRMALFAGGKLRVHLDIQVGEHANNYPEIAAKDKLTELQLRARQLLDQVEQIQKEQDYQRYREERFRLTSESTNQRVLWWSIAQTVILILTGIWQMRHLKSFFEAKKLV	160132	162985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_160308_160632_160734_160956_161083_161357_161505_161941
673638	contig_709_pilon	-	1427	8	Intergenic	novelGene_57655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	97.6624758219526	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	113	1093	3772541	3762534	FALSE	20	TGTTGGATGTTTTTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSNEFKLNQPPEDGISSVKFSPNTSQFLLVSSWDTSVRLYDVPANSMRLKYQHTGAVLDCAFYDPTHAWSGGLDHQLKMHDLNTDQDNLVGTHDAPIRCVEYCPEVNVMVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPKST	3773015	3762199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3762544_3764736_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806_3769959_3771705_3771776_3772346_3772592_3772953
673651	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_96337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
673655	contig_14273_pilon	-	2252	8	Intergenic	novelGene_21148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCCGAGGCTGCCGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151400	127918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_128271_128777_128846_135359_135514_137928_138052_139057_139183_147780_148027_148889_149540_150866
673656	contig_11328_pilon	+	1708	9	Intergenic	novelGene_88454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	265.598851654144	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	89	1459	830591	857309	FALSE	40	AATCTTGAATCAGAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSELGVRSRRTLSSFLLSVGSLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829367	857558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829431_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
673657	contig_14322_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_116518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTAATTTATTTTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	672806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
673662	SIRV4	+	179	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1592	632	1137	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2592	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
673665	contig_10863_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_59341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCCACTATATATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115460	116954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_115500_117000
673668	contig_15304_pilon	-	1062	3	Intergenic	novelGene_30520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
673674	contig_19825_pilon	-	2418	4	Intergenic	novelGene_59678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	220.001515146298	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	21	362	70117	19838	TRUE	30	AATTTTGAGTTTTTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRWFWCVSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCNNVCGWYWTCCIILQLDALYFQI	70137	15368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_46551_46722_70015
673676	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
673679	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	632	1014	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
673688	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673689	contig_9706_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_20833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTCATAGGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2464	2214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2200_2500
673706	contig_10642_pilon	-	1902	4	Intergenic	novelGene_78662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	362.721503207197	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	456	719	172833	170349	FALSE	10	CTGTGTCCCATGTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARATDSVLNGHRSKGLCDSAKKEDLPELAGQALSAGPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCHGSEVMD	181182	169165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170377_172597_173129_177948_178084_181157
673711	contig_18869_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_56061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73576	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
673718	contig_20610_pilon	+	1613	3	Intergenic	novelGene_67646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	208	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTACAATGAGACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49821	53407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_50029_51483_52513_53030
673726	contig_3469_pilon	+	1734	12	Intergenic	novelGene_34183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	172.27980316483	4	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	236	1372	456854	479914	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPFVRQQVYKKVEEKVQKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLYESQKFGELAMTKESKALMGLYHSQVQCKRNRFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTVLKDATLAGLDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLNLKHKVLKEVEAVIPDRCVFASNTSALPINKIAAVSKRPEKYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTTASAATVGLKQGKVVIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVISSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	447288	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_447382_456227_456351_456834_456956_459872_459930_461697_461808_464112_464248_467209_467382_471277_471365_474183_474310_477210_477267_479534_479681_479768
673730	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
673733	contig_7820_pilon	+	1905	5	Intergenic	novelGene_159913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	72.9554658678841	198	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	107	1006	24543	28800	FALSE	30	CTGTAATATCACAGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVLSAADYYFFTPYAYPATWPEDDIFRQAISLLIVTNVGAYILYFVFASLSYYFVFDHSLMKHPQFLKNQVYREIKCTVQSLPWISIPTVALFLVEVRGYSKLYDDIGEFPYGWIQLIFSIISFLFFTDMLIYWIHRSLHHRLVYKHIHKPHHIWKITTPFASHAFHPVDGFLQSLPYHIYPFLFPLHKVVYLTLYIMVNIWSISIHDGDFHVPKILRPFINGSAHHTDHHLFFDYNYGQYFTLWDRIGGSFKNPSSFEGEGPLSYVKKMTEEKCNSHVGNGCKNEKLFNGECTKIE	12896	29699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_+_12995_24534_24753_25526_25660_27726_27828_28344
673736	contig_500_pilon	+	1554	10	Intergenic	novelGene_31027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1042.24522599584	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	733	1146	1496587	1498065	TRUE	10	GCGGGCATGTTTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485753	1499582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1494168_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
673738	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_94971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673744	SIRV4	+	184	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1587	632	1132	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2587	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
673749	contig_3948_pilon	-	1379	10	Intergenic	novelGene_53411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	195.122437028904	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	284	1039	1953292	1933521	FALSE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975851	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1975575
673758	contig_5084_pilon	-	2427	8	Intergenic	novelGene_64552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	284.694680709861	1	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	305	643	544756	533474	TRUE	30	AAAATCACGTGTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPSQLPQPPLLPEELLTRGWGLGPPRYYGTKSSRRSRRRLAHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQVLRMMVGVNISDEQLGSIADRTIQEADQDGDSAISFTEFVKVLEKVDVEQKMSIRFLH	580083	531590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_531834_531932_533528_533674_533798_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570282_579956
673765	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673768	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_89157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653692	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
673775	contig_1076_pilon	+	2451	4	Intergenic	novelGene_101130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	116.176111524224	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	449	760	973982	982857	FALSE	20	TGCATGGCTATCTCTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMITSYACES	945663	984548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980865_982831
673777	contig_4924_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_84765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCGTTGAATGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228651	230561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_228700_230600
673779	contig_6364_pilon	+	1778	11	Intergenic	novelGene_51746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	118.752221031861	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	105	1280	573392	694889	FALSE	60	AAAAAAAAAAACCACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNTGRLAGCTLFITGASRGIGKAIALKAAKDGANIVIAAKTAQVHPKLPGTIYTAAEEIEAAGGKALPCVVDVRDEQQISDSVEKAVEKFGGIDILVNNASAIALSSTLDTPTKKVDLMMNVNTRGTYLTSKACIPYLKKSKIAHILNLSPPLNLNPLWFKQHCAYTIAKYGMSMCVLGMAEEFKGEIAVNALWPKTDAAYSIFKKPKNFTGNFIIDENILKEEGIQNFDVYAVKPGHSLMPDFFLDELPGAVNMKMESPDAAPAIKEGKQAPQPKGGSPVEETFRIVKETLSEDAVKATQAVYQFELSGDDGGTWFLDLKSKGGNVGRGEPLDRADVVMSMSTEDFVKMFSGKLKPTMAFMSGKLKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARL	573287	695387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_573409_581820_581985_648683_648783_655971_656087_660441_660546_661701_661801_674554_674672_676819_676892_682957_683105_685567_685697_694776
673781	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
673785	contig_5331_pilon	-	2441	15	Intergenic	novelGene_112839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	184.369969665034	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	172	1629	813351	792123	TRUE	15	TGCTTTTGGCAGTCACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYTPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVSCCSC	835934	778690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779069_790625_790720_791290_791551_792042_792136_797679_797854_798194_798311_799347_799444_799920_800042_802651_802874_804438_804630_805851_806098_806907_807044_809720_809827_813314_813378_835789
673789	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
673796	contig_7694_pilon	+	1851	13	Intergenic	novelGene_159932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	37.7701381164186	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	364	1566	197227	217511	FALSE	15	TCTGTGGTTGAGAAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLVRTQVIGIDGSETAAPLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYRNHIVLQENAQHATRFIALANVGNPDKKKYLYAFSIIPMKLMDAAELVKQPPDVTENPYRKSGKDTTIGKQTPAPEEESACQFFFDLNEKQGRKRSSTGRHGKSSPHPKQPCKPPQPPGSCWFCLASPEVEKHLVVSVGTHCYLALAKGGLSDDHVLILPIGHYQSVLELSTEVVEEVEKYKATLRQFFKSRGKRCVLFERNYKSHHLQLQVIPVPLSCCATDDIKDAFISQAQEQQIELLEIPEHSDIKQIAQPGAAYFYVELDTGEKLFHRIKKNFPLQFGREVLASEAILNIPDKSDWRQCQISKEEEETLARRFRKDFEPFDFTLDN	185801	217796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227_199347_200220_200306_201896_202038_202967_203083_203644_203725_209965_210176_213862_213983_214447_214546_217366
673806	contig_500_pilon	+	1312	7	Intergenic	novelGene_31081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1290.31779031369	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	484	897	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1493642	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1493786_1494191_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
673816	contig_8476_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_121358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCGCTAGCATGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233357	231353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_231400_233400
673827	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673834	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673841	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	19	369	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14427	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
673842	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_93696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673843	contig_5050_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_110285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	550776	550426	NA	25	AACTATAATCTGCCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLFSQLNQTLSAAPSSVWHRGAPRSGRVGARVHRHHRASWYSFFSVPVLAPLFWVLSSSRVSIRGEADALGRSSPFPFGDFIVGTPILLVGYQRRGEDVRAALGSFRCSLGRDHC	550777	549106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_549100_550800
673844	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673847	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_93450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
673848	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673849	contig_10487_pilon	+	2434	6	Intergenic	novelGene_159412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	8.84081444212014	126	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	427	1236	210542	245004	FALSE	35	AGTGTCAACTCTAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLVHGRLFYHLSTYNLIWVMVAVVLCRAQGLVVTQDEKERLNTPASLRCSLQTDQEVLIVTWQKVKATSPENMVTFSKNHGVVVQPTYKDRVNITHPGLRNTTLTFWNTTLEDEGCYMCLFNIFGSGKISGEACLTLYVQPTVSLHYKFFEDHLNLTCSATARPAPVISWKVAGSGIENSTESVSHPNGTTSVTSILQVKDPESYVGREVICEVLHLGTVTDVRETVSKGFWFSVPLLLSILSLVILLVLISILLYWKRRWNQDREP	210115	246202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10487_pilon_+_210554_218899_218982_220809_221137_223552_223826_225614_225723_244996
673850	contig_6175_pilon	+	1383	2	Intergenic	novelGene_16332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516663	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1516771_1521776
673860	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673865	contig_14807_pilon	-	849	5	Intergenic	novelGene_124684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13282	junction_2	4207.32399364489	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	24	665	39773	37336	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKVSSAPALPSPPHPAPPCPWIPDSVLCLPRSTSPRSGVLPSLMLMNLKTW	39796	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
673866	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	109	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673871	contig_2730_pilon	+	2031	4	Intergenic	novelGene_135368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_3	173.013165844555	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291654	392471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685
673874	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
673875	contig_8156_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_98922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAATGCTTGGCGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243361	242199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_242200_243400
673882	SIRV4	-	232	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTTCCATTGTTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
673889	contig_14868_pilon	+	1492	10	Intergenic	novelGene_150461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_3	87.073404537653	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	443	1492	209016	252472	FALSE	50	GTAAGAGATGACAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQ	203070	252472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
673894	contig_10765_pilon	+	1577	4	Intergenic	novelGene_122868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_3	199.823811282729	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	534	1214	19059	34736	FALSE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMEE	18525	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_19517_28914_29040_32032_32122_34727
673896	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673915	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673916	contig_5372_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_149707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152784	154990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_152800_155000
673920	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
673921	contig_10930_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_37107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_2	6125.60557720622	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTTTTGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339425	342105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339921_340505_340639_340994_341625_342020
673925	contig_9272_pilon	+	2211	2	Intergenic	novelGene_125981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	900	1694	664479	666113	FALSE	35	GGACTTTGCAAAATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIVKLLGLDVPSLCLADLVKTYCSSFKLFQASPSVPAKYVEDKEKMLSRTLQLVELANETWLVTGRHPLPVITAAAFLAWQSLQPSGRLTCSLARFCKLANVDLPYPASSRLQELLTVLLRMAEQLAWLQILKLNKRSVVKHIGDLLQHRHTLVRKAFRDAAGEREAYERELQGQRQGEEEVGNSSLDLPVRKRPPSPALLLPPCMLKPPKQLRPTPAVCTVTGDENISDSEIEQYLRTPEEVRDFQRAQAASQAAKSVPNPL	663579	666630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_664556_665395
673927	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_91313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
673928	contig_2093_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_153014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGATAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461492	1463442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1461500_1463400
673932	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
673940	contig_18272_pilon	-	2196	2	Intergenic	novelGene_7068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCCCACACAGGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515553	511958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_512713_514111
673955	contig_10437_pilon	-	2199	14	Intergenic	novelGene_38448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	23.5409752302852	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	91	1506	1030186	986480	TRUE	25	GATACAAGTGATTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERLDSQNREVMKHLKAICFLRPTKENVDYLIQELRRPKYSVYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVTEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLVLDRCDDTVTPLLDQWTYQAMVHELLGINNNRIDLSRVPGISKDLREVVLSAENDEFYANNMYLNFAEIGSNIKNLMEDFQKKKQKEQQKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNVKRLLQNPRVTELDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMVDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKTSGYHCVCHWRSHV	1030276	950944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_951551_986392_986525_1007555_1007664_1007873_1008033_1017987_1018156_1018559_1018674_1019086_1019222_1021496_1021608_1022051_1022190_1022311_1022381_1023404_1023485_1027648_1027710_1029382_1029518_1030093
673962	contig_13894_pilon	+	955	8	Intergenic	novelGene_62112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2827.89905428473	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	27	899	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_525653_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
673968	contig_11752_pilon	+	1497	8	Intergenic	novelGene_37625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1591.40041011247	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	707	1201	92915	105606	FALSE	35	ATATAAAGATGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTNLSFFIQHE	84103	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88771_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105575
673972	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
673973	contig_12873_pilon	+	1336	5	Intergenic	novelGene_27200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1321.15259811272	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	271	762	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16009	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16271_17886_18014_18984_19264_19611_19703_19851
673974	contig_10861_pilon	-	2111	3	Intergenic	novelGene_39287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	915	2	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	144	566	1355171	1354749	TRUE	5	TTTTCTCCCCAGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERYNIPVPQSRNVSKNQQQLNRQKTKDQNSQMKIVHKKKERGHGYNSPAVAWQAMQNGGKNKVHFPNNQNWNSSLSSPSLLFKSQTNQNYAGAKFSEPPSPSVLPKPPSHWVPVSFNPSDKEIMTFQLKTLLKVQV	1355645	1353152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1354502_1354552_1355190_1355520
673979	contig_3948_pilon	-	2187	6	Intergenic	novelGene_53222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	282.866046035928	2	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	54	557	866476	852399	TRUE	20	AGTGCATGCTCTGTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAGKRKITISK	869621	839387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842658_852396_852636_856565_856712_866355_866480_869571
673981	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_96353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
673989	contig_15304_pilon	-	801	3	Intergenic	novelGene_30489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	198	758	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53633_54075
674005	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674008	contig_987_pilon	+	2160	6	Intergenic	novelGene_72340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.407811011567	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	923	1378	1295567	1304627	FALSE	20	GTTGTTAAGAACTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNINRPLTMKKEGIQTRNRKMSSKSKKCKKVHDTLEDFPKSSSFNPAALSRHMSSLSHISPFSHSSHMLTTPTPMHPPSSLSFGPHHPSSMVTAMG	1285763	1305409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1285917_1286367_1287010_1289450_1289484_1295472_1295612_1300073_1300200_1304342
674009	contig_10044_pilon	+	2624	5	Intergenic	novelGene_156374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	14.9248115565993	98	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	245	2113	9485	25515	FALSE	15	TATAGCCTGTCAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQKKMVEAQESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLYRDVMLENCRNLVSVGCQVNKPDALSRLKREQPWTVLDENHSGIFSEIMNIDDHLLGHSQKESKVNSKEQCYEHNALVDIVHRHKNHFPLRENHAMFDLHERAVKSNLTLPSVNHSKCDEIKNSAELTGDEKTFLHDAQEQFCLEMKFPESQKSNSTKSQLIQHQKTHKTEISHVCSERGKAVISKSFLTEPQVIHTGEKRYRCSLCRETFFKKFKLIEHHHTTHKGQKSYKCMECGKAYLHKSQLNNHQKAHLAEKPYICHDCGKGFIQKTHLTIHQRTHTEEKPYICDECGKSFNQKGHLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGDLTIHQRTHTGEKPYICSECGKNFSHKGNLIIHQRIHTGEKPYICGECGKQFSQKSRLIAHQRFHTGKMPFSCSENGKSYSQNATFIRHLKIHAGEKPFQCSECSKAFETKLEVIEHQRSHTGETPYCCKECGQTFTCTSSFYSHKRKHKREKGVDSIKLEDSSTTSQISSHTSELMQEKSPVNTATVQMPSLAPETSVNISGLLTNMNLVLVGEPVARCEPSADNREFVRQRNLVNAVNLVVPSVVNYVLFYDK	3951	26026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_4021_9309_9521_16094_16222_16476_16570_23902
674016	contig_9127_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_102992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	273	614	11483	11142	NA	60	AAAAAAAAAAGGCCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKDYSLQYGLHLNIKKTKIFTTGPTNNTMINREKTEVVKDFISLGSMINAHKSSSQEIKWHIALSKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVCLPQAMIFSITSQACKSWTMNKED	11755	10020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_10000_11800
674022	contig_1986_pilon	+	2242	11	Intergenic	novelGene_64136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	480.438299888758	637	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	18	1478	353521	381302	FALSE	30	TCTCCATGCAACAGCCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPEKILFPEKQSHRKYRAALKKEKRKKRRQELARLRDSGLSQKEEEEEEDAFIEEHQLEEEKLLETERQKLHQEWLLREQKAQEEFRIKKEKEEVARKRQEELERKLKAEWEEQQRKEREEEEQKLQEKREREEAVQKMLNQAENELENGTTWQNPEPPLDVRIMEKDRAFCPFYSKTGACRFGDRCSRKHSFPTSSPTLLIKSMFTTFGMEQCRMDDYDPDASLEYSEEETYQQFLEFYDDVLPEFRNVGKVIQFKVSCNFEPHLRGNVYVQYQSEEECQAALSLFNGRWYAGRQLQCEFCPVTRWQMAICGLFETQQCPRGKHCNFLHVFRNPNNEFWEADRDMYLSPDRTSSSFGKNSERRERMSHRDDYYGRPRRRRSPSSDHSYKRNGKSERKRSSSHRGKKSHKHVSKSRERHSSRSRGRKRDHCRSRSRRSRSRSLRSRRNRTQSHRSRSQSSSRSRSWGGRRSSSRDRNTHSPRSK	353503	382066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_353562_353956_354037_359046_359135_363080_363190_365359_365447_368524_368564_369130_369250_375730_375945_377026_377083_377810_377921_380784
674029	contig_6589_pilon	+	2051	15	Intergenic	novelGene_25728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	67.7587632708862	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	82	921	460735	477886	TRUE	30	TAAGTTCCTCTGGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQDLLVLSQMPPVFTRHLQTWVPDNSRVIYSILSPPSFHCHHPPKER	451709	509785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_477749_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_505399_505459_506884_507045_509406
674033	contig_3233_pilon	+	2513	2	Intergenic	novelGene_56584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	844	junction_1	0	57	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACATAGAAAATAAACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744795	748011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_747016_747718
674034	contig_6361_pilon	+	2233	3	Intergenic	novelGene_23874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTCCAAGCTTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59175	65301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_60214_62559_62823_64369
674038	contig_12019_pilon	+	1122	5	Intergenic	novelGene_87626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.4313863316944	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	460	783	5225	8336	FALSE	10	TCTCTTTCCTGTGATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_5400_6114_6226_8298
674046	contig_14744_pilon	+	808	7	Intergenic	novelGene_66071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4471.39194087131	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	104	787	1383156	1386652	FALSE	50	TAAATAAGTGATACATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383028_1383106_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
674049	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674052	contig_10042_pilon	+	1992	11	Intergenic	novelGene_79199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	95.3891503264391	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	85	987	1032206	1090129	FALSE	15	GGTATATTCTTTTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLTWNRAGGALSGPLSSHQIGLLPSHCVFIPLSEVTHLAGKDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028990	1091134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1032175_1032335_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
674053	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674055	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674056	contig_4103_pilon	-	2295	4	Intergenic	novelGene_51961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.6653333119993	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	748	1722	161777	160803	TRUE	20	CTACAACCGGCCATGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEDGGLPGLGRPRQARWTLMLLLSTAMYGTHAPLLALCHVDGQVPFRPSSAVLLTELTKLLLCAFSLLVGWQTWPQGAPPWRQAIPFALSALLYGANNNLVIYLQRYMDPSTYQVLSNLKIGSTALFYCFCLRHRLSTRQGLALLLLMAAGACYAAGGLQDPRNTFPGPPTAAAAGPMPLHITPLGLLLLILYCVISGLSSVYTEMLMKRQRLPLALQNLFLYSFGVLLNLGLHAGSGPGPGLLEGFSGWAALAVLSQALNGLLMSAVMKHGSSITRLFVVSCSLVVNAVLSAALLRLQLTAAFFLATLLIGLAVHLYYGSH	164188	159881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_160348_160695_162403_162988_163088_164165
674064	contig_12622_pilon	-	2385	13	Intergenic	novelGene_5908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2306.03376432832	2	117	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	18	1544	1590968	1586655	TRUE	20	TTATATGTACATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1583538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585561_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589104_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
674065	contig_8357_pilon	-	1803	11	Intergenic	novelGene_39697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	77.1922275880156	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	683	1528	318016	312261	FALSE	15	GTTCTGCCAAGTCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333196	311985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318037_318967_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332989
674069	contig_15063_pilon	+	792	3	Intergenic	novelGene_13920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3530	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	198	488	34808	36494	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLLWPPTIMSPAPRCPSLRPRASTSPTAS	34610	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35126_36409
674071	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_115910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
674074	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_97132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674084	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674085	scaffold_19766_pilon	+	2491	2	Intergenic	novelGene_34309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	68	367	559276	559575	TRUE	60	TTTTTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHCLKHQVYCAVLTFKTQPLLPMGDSRGKDFHSTCVPTCQSSPSNPQSVYLWSTEMQLGTRAEEKWESLSVGEEEERARECDNPTSHTLGEQRSANSPCHPAQQAGGEEDDGNSNTAGLAA	559208	561824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_559805_559929
674091	contig_12270_pilon	-	237	2	Intergenic	novelGene_114141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCGGGCATCTGGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14427	13967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674095	contig_2219_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_67193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGCATGCTATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192693	194077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_192700_194100
674097	contig_13740_pilon	-	1520	7	Intergenic	novelGene_34623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4065.23141681039	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161608	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574
674102	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674104	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	GGAAAAAGAATAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674107	contig_14034_pilon	+	1667	4	Intergenic	novelGene_72635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	9.62635271879577	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	53	391	152621	157240	FALSE	30	ATCACTTGATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKADVKGKPCEDHCILQHSNRCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152568	158516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_156941_157012_157102
674112	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
674118	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674119	contig_11052_pilon	+	553	3	Intergenic	novelGene_115466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCTCGACTTGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103047	107796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
674123	contig_10074_pilon	+	2284	5	Intergenic	novelGene_57150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	53.8533889370019	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	131	637	467237	514079	FALSE	70	TAAATTGAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGEGEAARSEVRVRTVRGRVEAAGRLPLAGAAFSKERIQLFSMFPLIAENKRVAWLLLSTGTCPRCIFRFCAVDFHAPYKLPYKELLDELQKFLETEKDTLIMEVPNPPLKKIRLEESEDAIDNLNQNGEGRISVIGDGSIASKNSNINVCNVCLGILQEFCEKEFIKKVCRKVEASGFEFTNLVFSVSFPPQLSVREHAAWLLVKQEMG	464073	515726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_464189_467221_467363_478322_478578_479301_479389_514040
674126	contig_9668_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_58237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCTTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584488	581680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_583462_584112
674130	contig_12873_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_27222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGGATGACATGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20426	16791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_17021_17734_18012_18982_19275_19809
674136	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674138	contig_7411_pilon	-	2185	4	Intergenic	novelGene_136964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	2.62466929133727	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	114	1418	97125	86221	FALSE	20	GTTAATTTTGTACTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRWGPWAAEPRVWPGLGPSQLCHFRFCCSPRSLLRAMFQGSVTFRDVAIDFSQEEWEWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLVSESNSEINEISPKNDIYENDSYQYLIMERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	97646	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_87390_95331_95459_97116_97174_97581
674140	contig_10135_pilon	-	2313	9	Intergenic	novelGene_106621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44.6764409392691	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	619	1431	88066	84806	TRUE	5	ATCTCTGTTCTTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIAL	89582	83788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84812_85950_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88862_89057_89502
674141	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674153	scaffold_19766_pilon	-	1420	9	Intergenic	novelGene_34322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_7	421.443279101708	1413	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	327	1196	622205	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623653	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_622561_622736_623580
674157	SIRV1	-	169	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3935	0	3661	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6705	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
674158	contig_5423_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_85311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGAGGAACTTCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768758	767911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_767900_768800
674171	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674172	contig_12050_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_62604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1762	2118	310693	311049	NA	55	ATAAAAGGTTGCAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICPSEPLPGEPGHTVSPYLSQLLNALLQGRGQAFGEGGGLPEFRVRPQPKGSAFIIHIMEGASFRRLTEQPLQVQIGQRAHGSGRLQQVVVRGGAKERQQGVGGALQGPQALSFCG	308931	311457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_308900_311500
674187	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
674194	contig_7356_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_60352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCCATTTAATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96027	96363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_96000_96400
674196	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_95851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674200	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674208	contig_5643_pilon	+	1273	9	Intergenic	novelGene_39127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCACCGGAAGTGCGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646196	651406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650570_650869_650970_651242
674212	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_97222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674221	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674225	contig_13863_pilon	+	1859	11	Intergenic	novelGene_42030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_10	666.917806030098	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	24	1097	98341	118962	TRUE	40	GGTTAGTAAAAGTTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98317	120331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
674227	contig_14528_pilon	-	1579	8	Intergenic	novelGene_111268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.68324469193	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	279	743	197057	192810	TRUE	0	GTTCTTTGCCTCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNGGGCVPRSSGAVAPLAGRLGPCRAPTRQPARGACHHPAAFRGRSRYIPVPHALGLGAAAGRSVSLQALPQSPGAADLQVFSTGDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSLHPV	201859	190720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192827_195071_195273_196725_196892_196976_197075_201038_201104_201663
674229	contig_12270_pilon	+	376	2	Intergenic	novelGene_113291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	13839	14387	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGTRPRATGT	13838	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14139_14363
674236	contig_16650_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_61959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTGTCAAATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244361	243708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_243700_244400
674238	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674242	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	98	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674243	contig_12270_pilon	-	338	2	Intergenic	novelGene_113936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674256	contig_7271_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_159955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479978	481659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_480000_481700
674257	contig_14666_pilon	-	387	3	Intergenic	novelGene_39657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTGCTGTTGGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492443	488762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
674259	contig_10848_pilon	-	2366	7	Intergenic	novelGene_133526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	32.142477951908	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	7	1497	59334	40251	FALSE	35	ACCTCATAAGAGCCTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWRGSAYAGFLALAVGCVFLLEPELPASALRSLWSSLRLGPAPSLPGPASPEGRLAAAWDALIVRPARRWRRVAVGVNTCVDVVLSGVKLLQALGLSPGDGKDHAILHSRNDLEEAFVHFMGKGAAAERFFSDKAAFQDIAQIASELPGAQHYVGGNAALIGQKFAAHSDLKVLLCGPVGPKLHELLDDNVFVPPESLQEVDEFHLILEYQAGEEWGQLKAPHANRFIFSHDLSNGAMNMLEVFASSLEEFQPDLVVLSGLHMMEGQSKELQKKRLLEVVTSISDIPTGVPVHIELASMTNRELMNNIVHQVFPAVTSLGLNEQELLFLSQSASGPHSSLSSWSGVPDVGMVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	59340	39381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40803_43630_43730_44390_44588_48151_48273_49522_49586_52607_52834_59101
674268	contig_2161_pilon	+	2756	11	Intergenic	novelGene_114917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	61.3005709598206	99	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	52	1227	804160	826242	FALSE	10	TTTGCTGTCCTTTGGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRFRRRSCRESAVGLLAMCGWTCSPLCLWLLLLLLSPALGRQESGSKWKVFIDQINRSLENYEPCSSQNCSCYHGVIEEDLTPFRGGISKNMMVEVVRRKLGTHYQIIKNRLYRENDCMFPSRCSGVEHFILELIGRLPDMEMVINVRDYPQVPKWMEPAIPVFSFSKTSEYYDIMYPAWTFWEGGPAVWPIYPTGLGRWDLFREDLARSAAQWPWKKKNSTAYFRGSRTSPERDPLILLSRENPKLVDAEYTKNQAWKSMKDTLGKPAAKDVHLVDHCKYKYLFNFRGVAASFRFKHLFLCGSLVFHVGEEWLEFFYPQLKPWVHYIPVKTDLSNIQELLQFVKANDDVAQEIAERGNQFIINHLQMDDVTCYWENLLTEYSKLLSYNVTRRKGYDQIIPKVLKTEL	804108	827771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_804242_805105_805197_806232_806377_810900_811037_813340_813463_819159_819220_820660_820761_823273_823333_824736_824905_825578_825636_826085
674270	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	719	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674282	contig_15063_pilon	+	1457	4	Intergenic	novelGene_14141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	170	1345	34808	36661	FALSE	70	AAAATTAGAAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34638	36773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
674284	contig_14357_pilon	+	3053	1	Intergenic	novelGene_121680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1504	1908	561347	561751	NA	30	ATTGAGCCAATTCACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAPATQAYLPQTQQSKLSPILGSLYLFSSPGMFFLKIFTGLTPPSRHLGLSSNATSSERPSLAIPPYLKQPPPFHNHHFQSPYPVLLLFTALVTWPSVNYSISVSCIRIKPHENGNILLAAVSSETKTVPGLE	559843	562896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_559800_562900
674285	contig_2074_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_155330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_2	3	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1450	1986	135231	131358	FALSE	45	GTGAACACTGATCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQKEMHRFLYDQELACTVLKIEYSGNALALLILPDPGKMKQVEAALQPETLRKWDQLLLPSLLDLHLPRVSISGTYNLEEILPRIGLTNIFNLEADFSGITGQLNKTISRVSHKAVVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNATAAPHAHFNRPFLLLIWDVTTQSLLFLGKVVNPAAG	136680	131191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2074_pilon_-_131562_133442_133591_135046
674290	contig_14441_pilon	+	795	4	Intergenic	novelGene_100447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	181	609	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCTSVPAVKDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82360_116578_116963_117220_117344_117539
674294	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674302	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674303	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674305	contig_4105_pilon	+	2546	10	Intergenic	novelGene_21467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	113.633915125136	1	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	84	1328	60529	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKVGTGADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58733	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71189_72381_72502_72595_72769_73131
674320	contig_6129_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_159969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84206	85755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_+_84200_85800
674327	contig_9706_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_20793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAATCAACATGAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1744	2062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1700_2100
674331	contig_7202_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_18229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGGTTGGTCACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
674342	contig_5643_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_39173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	63.5440005035881	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	42	629	784100	775251	TRUE	50	AAAACGATAGCAGGATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGENNPGHLEAQTE	784141	771738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_773342_775224_775288_775431_775562_776619_776810_783328_783558_784098
674358	SIRV2	-	577	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4279	51	3104	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
674364	contig_18869_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_56277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73685	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
674365	contig_12638_pilon	+	1962	9	Intergenic	novelGene_33396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	115.115634798232	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	17	1225	1515842	1538931	FALSE	20	TGGTGCCTGAAAGGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515825	1539668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521329_1524405_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
674368	contig_10626_pilon	-	2468	7	Intergenic	novelGene_138209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	104.733656905929	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	2068	2466	303295	281237	FALSE	40	GGGTGAAGAAGATCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISCMRPHQELKKKEETEGETEYKFEWQKGAPREKYAKDDMNIRDQPFGIQVRNVRCIKCHKWGHVNTDRECPLFGLSGINASSVPTDGSGPSMHPSELIAEMRNSGFALKRNVLGRNLTANDPSQEYVAS	311882	281234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_281252_282448_282556_301020_301139_301971_302021_302382_302448_303250_305246_311765
674371	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	85	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674373	contig_1867_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_54537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTTCAGGTGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336679	335587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_335600_336700
674378	contig_12008_pilon	+	1418	7	Intergenic	novelGene_24995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	551.984425102335	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	5	TCCCTGTTTGCCATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	40311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34659_39596
674379	contig_8795_pilon	-	1749	5	Intergenic	novelGene_146889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_4	37.5865667493055	306	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	10	1188	201651	173562	FALSE	10	TTGGTGTTTGTGATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGRARALCFSAPSLPRTGSATRVALRRLPFGLGGGPGRHPPRAMLLLSWWPVLLWMLGPPARALEEDGGHVWSEERPAHSLQAGAVYLSEEEPPHGPMGQDMPAEEADAVAGQDNDGDHMVMLSVIPGKAEDKLSSEPSSGTCGAGVEEDSRCNLRESLFSLNNAGTNFPDREEEYYTEPEVAESEHAPAEESNNTESLKSPKVNCEERNMTGLENFTLKILNMSQDLMDFLNPNGSDCTLVLFYTPWCRFSASLAPHFNSLPRAFPTLHFLALDASQHSSLSTRFGTVAVPNILLFQGAKPMARFNHTDRTLETLKIFIFNQTGIEAKKNVVVTQADQVGPLPSTLIKSVDWLLVFSLFFLISFIMYATIRTESIRWLIPGQEQEHAE	201660	173000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_173759_175266_175398_177498_177663_180241_180724_201446
674380	contig_6589_pilon	-	1960	2	Intergenic	novelGene_26287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	2290246	2273718	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHGGGKGRRRRPRLKKDGCSPRDWGTGLQFKGPWNGFQRVYGDVHCCCRHHHCHRLCLESETTGSIRAPQYCAHCRNRSVWPRCSLGGPYQPRPDLCPAGEPDQ	2290246	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273980_2290193
674387	contig_9752_pilon	+	1536	3	Intergenic	novelGene_122051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	42	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	91	348	341951	348670	FALSE	35	TCAATGTTTTCATTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSWPTWKTARIPASSPLTPGAQAPRRGGDKMFSLKKWNAVAMWSWDVECDTCAICRVQVMDACLRCQAENKQEDCVVVWGECNHSFHNCCMSLWVKQNNRCPLCQQDWVVQRIGK	341860	349858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_342042_346964_347013_348551
674388	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674389	contig_8069_pilon	+	1720	12	Intergenic	novelGene_136773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	102.453779137249	2	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	687	1268	429472	467153	TRUE	50	TCTTTGAAAAGAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRTRDFPWTTTFSMLYVDNPVGTGFSFTDDPRGYAVNEDDVARNLYSALIQFFQLFPEYKENDFYATGESYAGKYVPAIAHYIHTLNPMAELKINLKGIAIGDAYSDPESIIGGYAAFLYQIGLLDEGQQKYFQNQCDECLKHIKQGNWTKAFEILDRLLDGDLTDEPSYYENVTGCTNYYNFLQCTHSQK	411123	513395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_411583_411726_411846_429363_429479_430568_430628_432622_432703_440137_440205_455951_456075_456429_456562_465445_465545_467138_467276_486785_486969_513248
674395	contig_10855_pilon	+	2321	4	Intergenic	novelGene_124381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	27.8128667266709	286	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	39	1646	793116	810112	FALSE	25	TCCATTATGTTTCTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGTRGDLQKPDMDSVVFEDVAVNFSRAEWALLSASQRNLYKDVMLETFWNLASVDWCIQVKTTGSSPQQDLFGSEISNDEKRKKFMQKDSSSDLEKKGKLHNIEDQPQIQKKHLRERVSGHRGQKTAACEVCGKTFIRFSSLKLHLKRHSGEKPYECKECGKAFSYYSSLHGHEKTHSEQKTYECRQCGKGFSCPKYFQQHVKMHSGEKPNECKQCGKVFICPKYFQKHVKMHSGEKPYECKQCGKGFMVLSYLESHVRTHTGEKPFECKQCGKAFNWPNSLQAHMKTHSDEKPYECNQCEKTFMHSSSLKLHLRRHSGEKPYECKECGKAFNCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFTFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTCYSALHGHEKTHSEQKPYECKQCGKGFRCPKYFRIHVKMHSGEKPYECKECGKVYSMSANLRQHMSTHTGEKPYECKQCGKTFPWFASLRQHMRMHSGEKPFECKECGKAFPWRNSLRLHMRMHSGEKPYECKQCGKAYKYPESLKEHLRKHTGEKP	793077	810787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_793119_806095_806223_808283_808465_808815
674398	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674406	SIRV4	+	182	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1578	643	1123	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2578	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
674418	contig_1406_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_25502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCTTTACACTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420980	1420433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1420400_1421000
674421	contig_5643_pilon	+	1919	7	Intergenic	novelGene_38751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	164.438860640935	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	422	1390	159302	163341	FALSE	25	TCTCAGTTGCTCTGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157273	163870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_157390_158841_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297
674431	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674435	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	4	339	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14412	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674436	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674437	contig_12201_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_159989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTGAAGGGTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177534	176325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_176300_177500
674438	contig_5136_pilon	-	2706	25	Intergenic	novelGene_126627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	477.307720157785	9	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	138	2438	331458	257412	FALSE	45	TGCATATGGAGAACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTQSGMRSSLGIVVKDFETIGQNKLIGTATVPLKDLIGDQSRSLPYKLTPLLNERGQETGATIDLVIGYDPPSAPHPNDPSGTSMPGMEGEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDDFSSSGTGAASYTANTGETDVGFVPTFGPCYLNFYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELSTFLEKTAADKKLESISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAIFDGNFYYYLPWAYTKPVVTLTSHWEDISHRLDAVNTLLLMAERLQSNIEALKSGIQSKIPANQLANVWWRLIDEVTEDTRYTLPPLEGKSNVTILDTQIQKLRSRSLSQIHEAAVRMRSGDIDVKSALAEVEDWLYKLKQLTEEPQNSLPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLK	360213	257143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_257415_257705_257862_258803_258997_261534_261642_267825_267951_269302_269481_274623_274741_276091_276217_277000_277040_279607_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_305916_306005_307058_307168_329056_329108_331432_331489_360106
674446	contig_15498_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_42713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATTTTTTCTATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986797	987547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_986800_987500
674452	contig_6418_pilon	-	1530	14	Intergenic	novelGene_81103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	439.190770103811	72	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	56	682	106563	73366	TRUE	15	ACTACTTTGTTCACCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIWGRSQLSAPGPASFEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQKLLVVSCSRKEI	118003	68209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_73202_73405_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
674453	contig_14871_pilon	-	2138	10	Intergenic	novelGene_63710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAACAGTTCCATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234030	201998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_202054_213478_213694_214766_214875_218965_219086_219645_219820_224357_224432_227363_227472_227649_227825_230164_230296_233052
674459	contig_5779_pilon	+	2705	16	Intergenic	novelGene_106492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGCTCGCAGCGCTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182494	358754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_183659_184755_184823_186319_186456_192962_193120_193833_193935_195522_195632_195921_195981_197652_197805_197995_198073_225515_225626_226484_226602_227920_228045_232245_232317_349588_349632_357794_357867_358608
674460	contig_10437_pilon	+	2333	10	Intergenic	novelGene_38179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_8	132.31033478666	279	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	500	1897	201902	208508	FALSE	5	GGTCTGTTGTTTGCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHHKPEQPTSGEARTTEAVTSENHEVLSGPEEHPQDKDAGDANGAAGEQEPVDQASLPAQDQENLESPPPEASSSQVEPAHGTQTEVETVGACPRPQGLPLSPRARQPELDFYCVKWISWKEERTPIITQSTNGPCPLLAIMNVLFLQWKVKLPPQKEVITSDELMAHLGDCLLSIKPQEKSEGLQLNFQQNVDDAMSVLPKLATGLDVNVRFTGVSDFEYTPECSVFDLLGIPLYHGWLVDPQSPEAVNAVGKLSYNQLVEKIITCKHSSDTNFVTEGLIAEQFLETTAAQLTYHGLCELTAAAREGELSVFFRNNHFSTMTKHQSHLYLLVTDQGFLQEEQVVWESLHNVDGDSCFCDSNFHLSHSLVRGPEAEGGSGSPEKQRQVDQDYLIALSLQQPQGTLGLSDLELAQQLQQEEYQQQQAAQPVRTLVPSPQGRGSASGRPAGERRQRPKQESDCALL	198721	208944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_198867_201547_202355_202737_202796_204217_204283_204597_204757_205264_205368_205962_206106_206907_207100_207432_207577_208427
674461	contig_3948_pilon	+	2517	3	Intergenic	novelGene_53389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	163	junction_2	28	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	344	1045	1813956	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813353	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434
674466	contig_7078_pilon	-	1814	7	Intergenic	novelGene_130181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_5	287.306311567753	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	1321	1812	776286	773196	FALSE	75	TGAAAGAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKK	779249	773193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_777418_777870_777976_779165
674479	contig_8310_pilon	+	2789	21	Intergenic	novelGene_75560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	351.695393771371	1	81	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	92	2194	272460	324814	TRUE	20	CTCATTGCCATCGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215099	328429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739_324848_327867
674487	contig_8538_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_5082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGTCAAGGTCTTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842900_843100
674488	contig_11978_pilon	-	2596	8	Intergenic	novelGene_62896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.599171830225	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	181	936	760226	755586	FALSE	20	TCAACTGTACTTCGTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGPMRKNYRGDLEAFEEAHLTSLDPIKQFAAWFEEAVQCPDIGEANAMCLATCTRDGKPSARMLLLKGFGKDGFRFFTNVESRKGKELDSNPFASLVFYWEPLNRQVRVEGPVKKLPEEEAECYFHSRPKSSQIGALVSHQSSVIPDREYLRKKNEELERLYQEREVPKPEYWGGYVLYPRVMEFWQGQTNRLHDRIVFRRLPAGDSPLGTMTHPCIRALQSLSSQFCQLAGLVVCDSGIENHKCEVIP	760406	753925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_755693_755836_755962_756175_756247_756550_756680_757157_757212_757922_758023_759049_759175_760181
674489	contig_2646_pilon	-	2408	17	Intergenic	novelGene_69674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	77.9143911209604	397	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	16	1497	2215518	2209692	TRUE	5	CTCCGTTTCTTTCCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVAGRVNKRGGGGPGGGGGGGGGPRGTEEEPPPPLQAVLVADSFNRRFFPISKDQPRVLLPLANVALIDYTLEFLTATGVQETFVFCCWKAAQIKEHLLKSKWCRPTSLNVVRIITSDLYRSLGDVLRDVDAKALVRSDFLLVSGDVVSNISITKALEEHRLRRKLEKNVSVMTMIFKESSPSHPTRRHEDNVVVAVDSATNRVLHFQKTRGLRRFSFPLGLFQGSGDGVEIRYDLLDCHISICSPQVAQLFTDNFDYQTRDDFVRGLLVNEEILGNQIHMHVTTREYGARVSNLHMYTAVCADVIRRWVYPLTPEVNFTDSTIQSCTHSRHNIYRGSEVIGSNCSITNSVIGPGCHIGDNVVLNQAHLWRGVRVAAGAQVCQSVLCDNAEVKERATLKPRCVLTSQVVVGPDITLPEGSVISLHPPDAEEDEDDSQFSDDSGAGREEEKAKLKGYNPAEVGVAGPGLPLESCRCECGGRGGATAKSVGT	2215533	2207240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2207599_2207748_2207860_2208216_2208343_2208912_2209037_2209331_2209423_2209590_2209699_2209859_2209963_2210068_2210211_2210454_2210601_2211490_2211548_2211604_2211804_2212072_2212151_2212425_2212507_2212592_2212771_2212859_2213046_2213913_2214039_2215338
674490	SIRV6	+	804	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	533	139	360	-78	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	40	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	70	561	1733	10736	TRUE	30	GAGCTATTGTAAGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1663	11192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
674492	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_96860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653719	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
674494	contig_8616_pilon	+	2160	20	Intergenic	novelGene_72418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	199.751438340538	2	80	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	811	1626	245421	250503	TRUE	30	AAGAGTGACATTGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTMLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTWLCYHCSGWKVSGFFASLHPDVHCCSRQQFRAVYRK	239596	251924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243885_244040_244576_244661_244771_244877_245002_245078_245172_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245973_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249911_250005_250485_250669_251430_251492_251616
674502	contig_5988_pilon	+	1267	5	Intergenic	novelGene_16013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	181.258792890166	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	126	1133	779480	786797	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIAGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKRRG	779354	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783665_783803_785838_786473_786786
674512	contig_8558_pilon	+	2846	17	Intergenic	novelGene_123156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_3	26.8642420328585	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	296	1999	435273	612149	FALSE	45	ACAAGACATATATTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKRVFGQTTIHQQIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTAIDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTLAGNRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGTLPFNLAEAQRQKTSGDTARPILLQVAESAYRFGLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASLANEDGQISPGSLLLAGAVAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRITLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSASTSTAISGGP	390345	612996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_390448_426563_426618_435133_435277_507338_507479_527471_527619_529415_529555_530297_530392_530592_530678_544235_544321_544814_544974_558872_558926_560307_560389_582513_582655_598745_598885_611350_611510_611603_611695_611962
674517	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674519	SIRV4	-	223	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTCCAAAAAGATTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
674530	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674533	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674534	contig_6710_pilon	-	445	2	Intergenic	novelGene_98201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674535	contig_18420_pilon	-	1487	12	Intergenic	novelGene_109372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	235	junction_11	295.838352108905	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	112	1368	129249	109372	FALSE	25	TCTGCAGTTACCCTAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	135196	109252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_135121
674540	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674545	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_94291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653841	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674553	contig_17964_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_33870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTCTCTGGCTGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135199	134197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135200
674556	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674559	contig_6710_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_97730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
674560	contig_253_pilon	+	1371	7	Intergenic	novelGene_129727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	216.713071953575	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	584	1030	584418	585056	FALSE	5	GCCACGGCCTCTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK	580225	585397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_580318_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
674563	contig_4857_pilon	-	1871	8	Intergenic	novelGene_48829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAACAGAATTCTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411069	1331388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331549_1343174_1343263_1380974_1381107_1405459_1405553_1407010_1407075_1409427_1409753_1409986_1410180_1410253
674564	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674566	contig_2894_pilon	-	1224	4	Intergenic	novelGene_86530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	7.87400787401181	1453	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	278	934	136491	133851	FALSE	15	GATTGGGTTGAGCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCRSEVLEVSVEGRQVEEALLAVLHTVLLHRSTGKFHYKKEGTYSIGTVGTQDVDCDFIDFTYVRVSSEELDRALRKVVGEFKDALRNSGGDGLGQMSLEFYQKKKSRWPFSDECIPWEVWTVKVHVVALATEQERQICREKVGEKLCEKIINIVEVMNRHEYLPKMPTQSEVDNVFDTGLRDVQPYLYKISFQITDALGTSVTTTMRRLIKDTLAL	140049	133560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_134256_136239_136566_139540_139665_139970
674568	contig_8435_pilon	+	1911	4	Intergenic	novelGene_72020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.6197984758922	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	370	1521	94334	97099	TRUE	20	CACTTTTGACCATGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLPQEEHLGPPTQLPRADPFHGQPSAAPGLAGGEGCHLGQVPTSSDQVSGVGAVQQQHLQPE	93964	98000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_95303_96570_96685_97030_97164_97674
674571	contig_11285_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_5516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	363	698	636512	636847	NA	10	TGTGGAGCCTCCTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLIYQGRLLQDPARTLRSLNITDNCVIHCHRSPPGSAVPGPSASLAPSTTEPPSLGVNVGSLMVPVFVVLLSVVWYFRINYRQFFTAPATVSLVGVTVFFSFLVFGMYGR	636149	637720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_636100_637700
674581	contig_19098_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_65812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGAGGGTAAGGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302218	301817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_301800_302200
674585	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674586	contig_11752_pilon	+	1024	6	Intergenic	novelGene_37624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_3	1161.53061087515	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	91	1023	84194	94390	FALSE	35	CTAGTCCAATATGTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSS	84103	94391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223
674587	contig_9471_pilon	+	1763	2	Intergenic	novelGene_21801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTTCCTTTAGGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410809	415531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412453_415411
674589	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674598	contig_9389_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_84124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	136	453	1443876	1444193	NA	45	AATAACAAGGTGATCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIPSVRTANIGMRAKWEACVVKVTRIFQQILEGQPHSNVAESTSSFVMIILQSKSQVGSPWVVEKVKITSWKAVSLNPPRCALKDRPGDLLLRGHSTENPVEQI	1443740	1444337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1443700_1444300
674613	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674614	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674624	contig_12635_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_60848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551558	553649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_551600_553600
674631	contig_11978_pilon	-	887	6	Intergenic	novelGene_63078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4381	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGCCGAAAGGAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831966	1827933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1827949_1829077_1829187_1829999_1830121_1830661_1830811_1830989_1831272_1831755
674632	contig_6163_pilon	-	2271	2	Intergenic	novelGene_103859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATACTCCTAAGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507993	505627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_507664_507758
674637	contig_15063_pilon	+	1718	7	Intergenic	novelGene_10954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3585.75820279183	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	233	1471	34808	39515	FALSE	10	TCTCCTTATACTGCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27136	39762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
674639	contig_16846_pilon	-	959	2	Intergenic	novelGene_82966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9069	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	29	331	552791	551492	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	552819	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661
674640	contig_987_pilon	-	1400	12	Intergenic	novelGene_72289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	273.239307216704	446	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	59	865	945143	922618	TRUE	35	ATTGTAAAGTGTTTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFRLARTWVSKVTGGVVAMGKSDFLTPKAIANRIKSKGLQKLRWYCQMCQKQCRDENGFKCHCMSESHQRQLLLASENPQQFMDYFSEEFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEYC	945201	916464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_916798_920068_920170_921710_921811_922616_922627_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_945029
674641	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674647	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674649	contig_10078_pilon	+	984	8	Intergenic	novelGene_160007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	421	junction_6	510.032331908318	324	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	786	199	984	211491	221211	FALSE	55	TAAGTAATATAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLWMCKIRNQKKLSPPVVETLPTVDLHEDSSSVVVNSENIENISGSSTSEITPVSKLDEIEKSGTIPIARPTETEQSETNCGDGEALDANAPAEQPSFVSPPESLVGQHIENVSSSHGKGKITNSEFESKVSASEQDGGDPKSALNASDNLKNESSDYKNPGEIDPSSVASPKDPEDIPTFDEWKKKVMEVEKEKSQSMHPSSNGGQHATKKVQKNRNNYASVECGAKILAANPEAKSTSAILIENMDLYMLNPCSTKIW	209598	221211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_209709_211402_211514_215793_215950_217307_217446_217669_217821_218985_219110_220543_220669_221142
674654	contig_8462_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_159418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGGGATGGGATGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226807	227871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_+_226800_227900
674662	contig_1948_pilon	+	1640	3	Intergenic	novelGene_31141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	494.5	1512	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	271	1044	122946	123719	FALSE	5	CGTGTTGTTGTTCTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSKKTYNSFQDELEDYIKVQKARGLEPKTCFRTMREDYLETFGYKEEVDSRPKYRMSDQRLPSETVQTYPGSYNIPQTLENQLPQRLPAHDSRLRLGSPSYCQFTTDYSSEKPVPLNLSQQEYNCGSYSGESAVYKHLSSENSTSAHQASHKQLHQKRKRHPEEGREKPEEERPKHKKKKSCEEMDLDKHQSIQRKKAEVEAVSVSTEKLKNRKEKKSREVSSKKEERKRRKEKKDQGQERTEEEMLWDQSILGF	103632	124315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_103771_119535_119646_122923
674668	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_114069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674669	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_95020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674673	contig_15087_pilon	-	1341	12	Intergenic	novelGene_37212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_5	229.073664574636	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	12	827	136618	113497	TRUE	25	GCCTTTCTCTGTAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	136629	110657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585
674674	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
674676	contig_1948_pilon	-	1273	4	Intergenic	novelGene_31181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	286.591850702159	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	8	478	552044	544410	FALSE	40	TATAATAGAAGTGTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGMAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552051	543614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551992
674679	contig_6361_pilon	-	2078	4	Intergenic	novelGene_23943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	991	junction_3	907.965858388959	23	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1388	1690	359506	354939	TRUE	30	TTGGTTCATAAGCAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTNFQLWWRQSGGTCTLFFMYPGLCGAFCTSLLAHQIASDMNECCLCGTSVAMRTLYRTRYGIPGSICDDYLVTLCCLQCSLCQMRRDIKRRIATRTF	368242	351612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351991_354928_355044_359308_360814_368162
674680	contig_5643_pilon	+	2041	2	Intergenic	novelGene_39059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	838	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	345	743	631651	632049	FALSE	45	TGGAAAAGAGAAGGAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLTPQPPASSVARHRCSYPWPQHFLCPCVSPIPVCTSYSGPSADPPPCPHFYSCTHGPHCLVLCRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSER	631219	633347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435
674684	SIRV4	+	286	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	211	453	211	-453	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTCTTCAAATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	2318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
674686	SIRV5	+	362	4	NNC	SIRV5A	novel	2085	17	NA	NA	1	-195	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2069_2273_2305_3293
674688	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674691	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
674694	contig_10541_pilon	-	2072	13	Intergenic	novelGene_144638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	212.932631495399	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	349	1611	312553	196882	FALSE	35	AAATGATTGGAAGATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEIVNVHKEIQLSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQDIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSKTYEKKSDIVLLLSQKQTLEELKQSIQQLRCTESKFAAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMVLQFLIPF	394527	196420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_196909_234189_234380_243494_243618_259379_259500_260014_260153_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_374167_374310_394487
674699	contig_6946_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_59792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTGTCTCGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452134	453305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_452100_453300
674701	contig_8693_pilon	+	2000	6	Intergenic	novelGene_150859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	13.3206606442774	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	199	684	1056400	1073759	TRUE	10	CTTTCTGGCCCAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTRRLRGVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAEGFVRVDRDYVLKSAELAKAGGVQTFQLAVLSRSR	1056201	1077284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1056427_1056608_1056852_1061608_1061717_1073651_1073791_1075676_1075739_1076061
674703	contig_6710_pilon	+	519	2	Intergenic	novelGene_97712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATACACAGTGGTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653395	657827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653880_657792
674708	contig_1719_pilon	+	952	8	Intergenic	novelGene_87296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_1	34.0497834809862	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	411	950	415052	424116	FALSE	30	GTCAGAGAGCCAGGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQARRNAEVAVEAAAAPEDGCDRGGGHSADARSRAHRDHLSTIEKDTNGEVLWVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRILCRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLEVSNRPDLYDVFVNLADSEITIAPLAKETMTMGKLHKEIGQLIVQSAEDPE	406721	424118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898_409116_411266_411347_415050_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422086_424045
674714	contig_2798_pilon	-	756	2	Intergenic	novelGene_120050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1720	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGAACCCTGTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193428	169896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_170519_193294
674719	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674730	contig_9706_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_20859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
674734	contig_4868_pilon	-	1678	11	Intergenic	novelGene_136753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	31.3574552538946	312	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	66	1436	94423	43926	FALSE	15	CCTTTTTGTTGAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIEEVKSTTKTQRIASHSHVKGLGLDESGLAKQAASGLVGQENAREACGVIVELIKSKKMAGRAVLLAGPPGTGKTALALAIAQELGSKVPFCPMVGSEVYSTEIKKTEVLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPCETENPMGGYGKTISHVIIGLKTAKGTKQLKLDPSIFESLQKERVEAGDVIYIEANSGAVKRQGRCDTYATEFDLEAEEYVPLPKGDVHKKKEIIQDVTLHDLDVANARPQGGQDILSMMGQLMKPKKTEITDKLRGEINKVVNKYIDQGVAELVPGVLFVDEVHMLDIECFTYLHRALESSIAPIVIFASNRGNCVIRGTEDVISPHGIPLDLLDRVMIIRTMLYTPQEMKQIIKIRSQTEGINISEEALNHLGEIGTKTTLRYSVQLLTPANLLAKINGKDSIEKEHVEEISELFYDAKSSAKILADQQDKYMK	94488	43683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_44086_45068_45161_49060_49164_60478_60678_62074_62139_63938_64089_64898_64989_68467_68620_80677_80811_89877_89965_94282
674740	contig_7286_pilon	-	1137	6	Intergenic	novelGene_108701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3944.42312131952	5	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	479	1075	291382	286948	FALSE	15	GATTAATTGCCTTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292101	286885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291782_292022
674758	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674761	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674762	contig_7904_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_160033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	828	1214	532617	533003	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENHRILEIMALPSSHTFFGENHRILEIMALPSSHTFFEDTIQSIISSSPLRNHSGCTSSKTDLFILLAVHGIVSILSQHHNSKALIPHWSSLFIVQLLNAHEVTENTMAWVRCTLVLKVTTLLFNT	531789	533594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_531800_533600
674764	contig_8616_pilon	+	2875	2	Intergenic	novelGene_72381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_1	0	6	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATAAAGCCTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156
674768	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_18094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
674777	contig_10042_pilon	+	2463	5	Intergenic	novelGene_79233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	161.490711807212	33	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	186	680	1187799	1212831	FALSE	35	TATAGATGTTCTAGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSVGGAQLTSLFPLPASVVAREAPSALLHGVHRGARVSGGGGEPVGSGSWSGGSGPRCRMATAGRMNIQLLLEAADFLERREREAEHGYASMLPYNNKDRDALKRRNKSKKNNSSSRSTHNEMEKNRRAHLRLCLEKLKGLVPLGPESNRHTTLSLLTKAKLHIKKLEDCDRKAIHQIDQLQREQRHLKRQLEKLGIERIRMDSIGSTVSSERSDSDRGKTSA	1187613	1214614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187872_1188564_1188665_1194072_1194103_1210580_1210696_1212654
674790	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674791	contig_14322_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_116360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
674792	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674793	contig_6847_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_143887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATATGTGTGTGGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115706	115954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_115700_116000
674795	contig_10311_pilon	+	1858	11	Intergenic	novelGene_50467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACGAGAATACTGCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65221	70496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65920_66643_66756_67182_67260_67491_67585_67826_67959_68264_68407_68641_68754_68868_69038_69807_69947_70223_70360_70448
674796	contig_13894_pilon	+	1027	9	Intergenic	novelGene_62090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2411.45832109431	29	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	27	800	520713	526936	TRUE	20	AGTGACACCTGCGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRKAAWWEPRSEC	520686	528168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525686_526898_526948_527459_527580_528072
674797	contig_753_pilon	-	1886	15	Intergenic	novelGene_113020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1170.73199019124	1	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	807	1886	1413335	1372808	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGMMSLRMFPQHLPRGNLRMQQEYHAFP	1502379	1372807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1373006_1375808_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413387_1415056_1415165_1416768_1416901_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
674804	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674810	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
674814	contig_9197_pilon	+	1245	4	Intergenic	novelGene_154360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	149.455307329278	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52552	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_81723_81833_92373
674819	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_16745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27872	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674822	contig_10953_pilon	+	1252	7	Intergenic	novelGene_42577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4307	junction_6	14096.2444693219	8	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	85	672	455261	463828	FALSE	5	TTGTCCTCAGCCTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455176	464408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817
674824	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	586	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674829	contig_15063_pilon	+	1420	6	Intergenic	novelGene_9572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3793.00870550016	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	242	1114	34808	36494	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLGPGDPGDCLLRESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLREASTSPTAS	27129	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34611_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36334_36466
674832	contig_11328_pilon	+	1038	5	Intergenic	novelGene_88402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3456	junction_4	1401.49801551768	10	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	38	403	643683	645033	TRUE	40	TAAATCATCTTTACACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGKAYF	643645	648034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645376_647064_647223_647899
674834	contig_7051_pilon	-	2719	1	Intergenic	novelGene_64320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	177	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCTTGGTAATTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224942	222223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_222200_224900
674838	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674839	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674840	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674843	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674849	contig_5258_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_100251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACATCCTACCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334791	334586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_334600_334800
674855	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674857	contig_18869_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_56018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73532	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
674858	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
674859	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
674868	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146684	1	-91650	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGATTTCTTGAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
674875	contig_11386_pilon	+	1436	5	Intergenic	novelGene_82776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	448.438122821867	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	315	974	17940	31994	FALSE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	16639	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_16859_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990
674876	contig_12427_pilon	-	2132	6	Intergenic	novelGene_40544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1207.39017720039	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	151	774	522337	506035	FALSE	30	AAAGATCATCTGATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578125	504676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577983
674877	contig_8174_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_160045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGCTTCCGTAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215331	213386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_213400_215300
674878	contig_8174_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_160044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCCCTTTTGCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213285	212455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_212500_213300
674880	contig_16703_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_72788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCGTGTCTTGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42420	44827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42400_44800
674882	contig_6079_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_160089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTTGGAAACCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418523	418135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_418100_418500
674885	contig_10104_pilon	-	2923	1	Intergenic	novelGene_160153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGCCGTCCTTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615513	612590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_612600_615500
674891	contig_12427_pilon	+	1302	4	Intergenic	novelGene_40414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	152.639007683707	6955	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	669	1202	209839	210372	FALSE	30	TTATCTAAGCTCAGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	206962	210472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_207139_208379_208743_209618_209737_209827
674895	contig_6589_pilon	+	2193	11	Intergenic	novelGene_25942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	275.404084937025	423	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	14	1060	1228758	1258176	FALSE	40	AAACACCAGATTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHAAMPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTESEPLS	1228744	1259309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228890_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256783_1258157
674903	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4265	34	3090	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
674906	contig_12638_pilon	+	2195	13	Intergenic	novelGene_33166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	209.315883030622	15	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	144	908	269238	270918	TRUE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWPLRGSASQSLFSTSVGENPVHPSRCDAQTMTVMAHMTLLALSTLAWPSSSQSRPSLNVSTLRSSRKRKATRTLELSVSRLAR	235650	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270225_270430_270501_270604_270692_270827_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
674909	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	15	AATGCCTTGCACCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674911	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
674914	contig_8729_pilon	-	1389	5	Intergenic	novelGene_40163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_3	150.47653471555	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	89	841	770511	765591	FALSE	30	CATAACCTACATTATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFTPTNQIRLTNVAVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770599	765042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438_769569_770383
674915	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
674921	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674924	contig_7202_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_17302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCTCATGCAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
674925	contig_13284_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_160154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	25	324	299144	298845	NA	25	ACAGGAGACGGTGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLHQFLSMFPLLVRLVKKIFGKILQSHIIAVEVVRHGQVDVAGVELQVDLAVDGGLRVLTSSGAPARGMRSSCRRSRRDGGGCEALERRRGPWSVRGRCCEEVVEG	299168	298782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13284_pilon_-_298800_299200
674927	contig_8866_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_77838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	475	783	614884	614576	NA	50	ACAAACTTCAGAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFSSTFKYVFRSSTSKLKEMDPIVNLKKAQEIYSFLCVLRPLDSVYFLHFFQINSWTHDFKFRGLSCLEVEKNLLSILFENVTNSRFKNKLMVIFLTFQTL	615358	614254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_614300_615400
674931	contig_6304_pilon	-	3181	1	Intergenic	novelGene_122246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75080	71899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_71900_75100
674933	contig_10734_pilon	-	2173	14	Intergenic	novelGene_50976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_11	29.5358572569906	24	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	606	1184	276533	265938	FALSE	35	ATAATTTCAATTTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSDIKGQHMETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPIHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKQSSCK	282159	264948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_265956_266444_266503_266582_266620_266733_266870_267699_267769_270919_270974_271980_272056_273753_273783_273933_273964_275096_275160_276523_276911_278456_278564_279918_279999_282118
674936	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
674939	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674948	contig_5988_pilon	+	1113	2	Intergenic	novelGene_16026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	105	995	785923	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	783782	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_783803_785838
674953	contig_11932_pilon	+	2351	2	Intergenic	novelGene_85393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAACAGAATCACTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116893	119352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_117255_117362
674956	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_17771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
674968	contig_6062_pilon	-	1233	7	Intergenic	novelGene_5251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	177.471750490669	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	180	1073	569670	541389	FALSE	30	ACTGTGTCATAAATTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	597706	541228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597599
674975	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674985	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
674994	contig_9706_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_21041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAACAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644784	646945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_644800_646900
674999	contig_11594_pilon	+	1668	10	Intergenic	novelGene_80933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	448.707278994026	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	140	880	543478	567363	TRUE	20	CTTCAATGTCTGTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMKMEMVMEMEQLERRRKRRRRRTKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQEGRRSVCH	540513	568827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549011_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_567337_567457_568132
675001	contig_5574_pilon	-	1986	11	Intergenic	novelGene_155833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1271	junction_1	445.701705179597	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	5	1441	141980	78496	FALSE	50	AACAAAATCATGGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCIKSKRKDNLNDDGVDLKTQPVRNTDRTIYVRDPTSNKQQRPVSESQLLPGQRFQAKDPEEQGDIVVALYPYDGIHPDDLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLSTKREGFIPSNYVAKVNTLETEEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGTIYLAISIQAAYMRKQVELHEGIKKKTCLFNT	141984	77950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363_131517_132909_133060_133571_133676_134201_134301_136858_136965_137531_137578_141848
675002	scaffold_6394_pilon	-	994	7	Intergenic	novelGene_111025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3003	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTGGTAGGCAGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406279	402201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_402242_402863_402971_403237_403372_405024_405198_405299_405498_405714_405870_406092
675016	contig_14822_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_145435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTAGTGTCTGGGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321977	322563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_322000_322600
675021	contig_247_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_160155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	509	907	3655	3257	NA	35	TCAGGTGAAGGCTTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASKILLKLIQNRLQQYVNRELPEIQDEFRRGRGTRDIIAMLDGSWLKAENTRKMCFIDYEKAFDCVDHNKLCITLQRIGIPEHLTVLMRNLCIDQEAIVQTEQGDTVWFKVRKSVSGLHSFTTLIQSVC	4163	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_247_pilon_-_2300_4200
675026	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675028	contig_15087_pilon	-	2579	17	Intergenic	novelGene_37151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	448.745734659395	1	112	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	588	1055	66689	54480	TRUE	20	TCAGCATTCCATGACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQVCYCDSRQAARGGRLGCSREEGEDAGAAAH	89759	33330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34036_40484_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52528_52665_52917_52984_54478_54569_58871_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
675032	contig_16643_pilon	+	2043	4	Intergenic	novelGene_158137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	56.4170974872768	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	106	987	306589	316333	TRUE	20	TTAGAGCAACTGCCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVREAGSGERILFVFHKNGRLSCKAKVQPPRLNGAKTGVFSTRSPHRPNAIGLTLAKLEKVEGGAIYLSGIDMVHGTPVLDIKPYIADYDSPQNLIEPLGDVNLQDNKHKPKTSFEFRSSGVTDNCDQQQLSGCVEPHPCTSTKEKPTCPEDRTSEEIHVEHDDTAKIRHSLKHGEEIAAGYGSESRSDQSLSVAEKQVGSCHQEKSFSEEGTDKRSRRGQEAAILRGNSVQTEPGALRYPSGAADEARHSVVPAWVRDAPVTTLEVRFTPHAEMDLRHLSSGEPGAFTFYF	306483	318294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306621_314690_314849_315641_316955_317859
675035	contig_11370_pilon	-	732	4	Intergenic	novelGene_98715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCCACCTCCCCCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148543	145665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145673_145768_145966_147425_147616_148205
675038	contig_1694_pilon	+	2862	18	Intergenic	novelGene_144937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_16	41.8589657108322	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	240	2513	504163	772310	FALSE	60	AAATGTCATAAAACAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKIPKESKKVNISSSLESEDISLETTVPTDDISSSEERDGKIKITRQLIERKELLHDIQLLKIELSQKNMMIDNLKMDYLTKIEELEEKLNDALHQKQLLTLRLDNQLTFQQKDARKYQELLKQEMETILLRQKQLEETNLQLREKAGDIRRNLRDFELAEEQYMKLKAFPEDQLSIPEYVSIRFYELVTPLRKEICELQVKKNDLAEELSANKRQLKQLTETYEEERRICSELQNRCQRLALELADTKQLIQQGDYRQENYDKVKSERDAVEQEAAELRRKHEILEASHKAQVKERSELSKEVATLQQTVTLLQKDKEYLNRQNMELSVRCAHEEDRLERLQAQLEEAKKSREEMYEKYVTSRDHYKTEYENKLRDELEQIRLKTNQEIDQLRSASREMYERENRNLREARDNAVAEKDRAVMAEKDALEKHDQLLARYRELQLNEESKVTEFLHQSKLKSFECERVQLLQEETARNLTQCQLECEKYQKKLEVLTKEFYSLQASSEKRITELQAQNSEHQARLDIYEKLEKELDEIIMQTAEIENEDEAERILFSYGYGANVPTTAKRRLKQSVHLARRVLQLEKQNSLILKDLEHQKDQGTQLSQELDRANSLLNQAQQPYRYLIESVRQRDSKIDSLKECIAQLEKDVSNLNKEKSALLQMKNQMALDLEQLLNHREELAAMKQILVNMHTKHHEGSLLLTKKDSKTVTENQKSQTLDVPKEHEDNIFIPKPTLFTKKEAPEWSKKVKMKT	502728	772659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_502922_504116_504415_511220_511322_513612_513812_522468_522589_557155_557290_567211_567321_567599_567782_569200_569327_586221_586321_616111_616278_621268_621420_628749_628841_646386_646490_698762_698894_707991_708077_749008_749183_772259
675044	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675048	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
675062	contig_20641_pilon	+	900	2	Intergenic	novelGene_52878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2741	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	2	604	54868	56882	FALSE	20	GATCTCTGTGAAAGCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	54866	57178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_54968_56379
675064	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675071	contig_18972_pilon	-	853	2	Intergenic	novelGene_160156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATATTGGGAGATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2071	839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18972_pilon_-_931_1309
675084	SIRV2	-	432	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2999	1	-369	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTATGAACGTTAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	4034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
675086	contig_12270_pilon	-	299	2	Intergenic	novelGene_114110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTTTCACCATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
675087	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675096	contig_19769_pilon	+	1016	5	Intergenic	novelGene_102298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1890.82473738313	5	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	14	553	87249	88080	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGEWQVASRWLVGG	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88139_88740_88962_89172
675097	contig_15449_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_33647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1672	1995	128604	128173	FALSE	55	AAATTTTGTATAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLHYMISSEEGRVKILLSLTAWEKWSVRKYHCYCFLLQTIRNYIELQTSQEHGASSLAKLHATLIFILKLRTGFVRRHFVFQQLTVKTGHTCKFIVPACTATHRS	130275	127821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_128439_128546
675102	contig_13216_pilon	+	1936	8	Intergenic	novelGene_47485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	936.779263089818	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	244	1311	243106	260918	FALSE	25	TAAAACTTAGTTTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESLHNTEKHYHLIWLR	229640	261543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243114_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430_260805_260872
675114	contig_12644_pilon	-	2001	13	Intergenic	novelGene_44492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	573.838972767332	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	4	693	1151228	1062639	TRUE	55	AATTAAAAGAATTGTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQIRIFLGPNVTSQCRSIIRNQLSAGRSLPTQSLCESEYKTLQPSRLSSTY	1151231	1025987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1030083_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037220_1043221_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063376_1068362_1068405_1068674_1068750_1123231_1123677_1151204
675117	contig_7189_pilon	+	2076	6	Intergenic	novelGene_117659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	224.345626210987	513	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGATTCTTCGGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537683	590649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_537788_541128_541194_562190_562239_580573_580718_585140_585214_589007
675120	contig_10940_pilon	-	2001	6	Intergenic	novelGene_49239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1001.13203924358	3	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	144	572	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917143	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875016_875062_875418_875469_875675_893147_893306_916664_916748_916923
675125	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675133	contig_10299_pilon	+	2117	20	Intergenic	novelGene_79713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103.20973455774	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	650	1987	336845	340377	FALSE	40	TACTGATTGTAAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSLLRAASFGKCFLDRFPPDSFVRMCQDLRVLNAVRDYHIGIPLTYSQYKQMTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320535	340507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334978_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_335993_336733_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
675137	contig_7357_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_36844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGAAAAAGATACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158116	158681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_158100_158700
675138	contig_6028_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_156611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAACCCAGGAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413324	414690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_413300_414700
675140	contig_9225_pilon	-	2480	3	Intergenic	novelGene_160157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	9	59	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATCAGTGATTTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26174	19423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_21737_25587_25700_26119
675141	contig_9242_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_155072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTCCTACAACTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667658	665480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_665500_667700
675143	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675147	contig_17066_pilon	+	2782	7	Intergenic	novelGene_130944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	128.459678066267	99	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	247	1200	165828	266684	FALSE	50	TAAATGGTTTTGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTLRSVSTGPSRPSKICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPPQQQRPPPPPPPQSPEEGTTYIAPATEPSVNTALVPQLSTISRALTPSPAMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKMHQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTVMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRMNYIKELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESQALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK	95951	268266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_96094_165723_165841_200598_200950_202742_202888_235006_235138_242565_242724_266528
675151	contig_8320_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_152274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGAAAGAACAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554449	552575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_552600_554400
675153	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675154	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675161	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675165	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675166	contig_5871_pilon	-	1653	3	Intergenic	novelGene_160180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAACTGAGTACCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412090	400533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_402040_408454_408559_412047
675167	contig_2100_pilon	+	1227	9	Intergenic	novelGene_50749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAGCCACCTCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169925	1185526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170175_1174203_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178828_1180192_1180292_1182732_1182824_1185424
675168	contig_10341_pilon	+	1074	5	Intergenic	novelGene_47212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	859	junction_2	130.746653876877	5458	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	204	590	63271	64998	FALSE	30	CAAAGTCAGATGGCCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGKAGKDSGKAKTKAVSRSQRAGLQFPVGRIHRHLKSRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGVIPHIHKSLIGKKGQQKTV	63067	65482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_63760_64039_64154_64484_64615_64936
675187	contig_12786_pilon	-	1259	7	Intergenic	novelGene_103391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	684.331161711118	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	349	1197	604678	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	610801	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_610493
675188	contig_610_pilon	-	1454	4	Intergenic	novelGene_76737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1334.73950850177	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAAGTGGATTCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252613	213494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235280_252475
675189	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675200	contig_14322_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_116012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671632	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
675201	contig_12414_pilon	+	1638	2	Intergenic	novelGene_59542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	FALSE	30	ATGTACAGTCTTTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
675204	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	69	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
675214	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675231	contig_14209_pilon	+	1722	11	Intergenic	novelGene_88314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_10	220.581866888464	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	72	869	32366	37768	TRUE	30	GTGGCTGTGTTCCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKLASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32294	38913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38271
675235	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675240	contig_4644_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_160191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGTGTTACATCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30177	30778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4644_pilon_+_30200_30800
675249	contig_7293_pilon	-	1314	3	Intergenic	novelGene_54237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGAGGAGGAAGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330722	329149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_329637_329739_329881_330036
675256	contig_1107_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_126531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCATAGTTTTCATTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58131	55986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_56000_58100
675257	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	119	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675259	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675269	contig_9481_pilon	+	3569	4	Intergenic	novelGene_149662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1629	1991	350526	356324	TRUE	10	CACCTCGTGAGTTTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLLKNLINWDLLGPSSAFSSSCHFVQPQSWTVGCCSDWSEILNGVYCGSSPTQSPPAAAAAAAAAAAVAVAVAVAVAAAAAAAAAAAADAAGWLSVWHGARGTAWQTPWPQKYLLNRP	348897	358021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_350545_354521_354674_356132_356453_356571
675276	contig_9197_pilon	+	1292	2	Intergenic	novelGene_154374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	348	junction_1	0	2473	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1	411	80402	80812	TRUE	15	TGTGTTGAGTTTTCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAASSSSPLSEAQPKDPGKVAIQITRAQLQDHLRLVPGRATRKGDPGKGSQRSPRRSRRSSRGQKPARGGAARRLRVRPGSGCPARARSRSLLAPRLLPSSPPPLLPPPQPRRDHVGGDRERPHRGPGGDPGVQL	80401	93175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80892_92373
675279	contig_15825_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_160194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTCTAGCAGTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40847	42276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_40800_42300
675280	contig_15825_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_160195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43340	44893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_43300_44900
675300	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675301	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675306	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675307	contig_8823_pilon	-	3133	2	Intergenic	novelGene_53081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1046	1369	84669	84346	FALSE	30	AGAAGTTCATGGTACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGKLKKELAQYQQSQGVDTSLRLQEEVESLRTELQKAHSERKVLEDAHTREKDELRKVHWRPGAWGLGGGLANTALLSEVVSSSSCKIAVDVLGSCAHRLSHPSV	85981	82581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_85371_85637
675311	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675312	contig_12644_pilon	+	1260	10	Intergenic	novelGene_44611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5772.8763119939	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	625	1188	2679113	2680545	FALSE	45	AAGAGGCAGTGAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKATLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678833_2679073_2679188_2679512_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680413
675323	contig_16510_pilon	+	2599	5	Intergenic	novelGene_139086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	14.7139389695622	35	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	532	930	289563	292515	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPALRRRKGLSRTSKPEPSAAPEDPLNWFGILVPHSLRQAQASFQEGLQLAADMASLQIRINWGRSQLRGLQEKLRQLEPGAA	288823	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289322_289529_289634_289736_289820_291155_291288_292402
675324	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
675326	contig_19352_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_122429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1832	2155	414941	414618	NA	25	TCAGATGGGGAAGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTTTRAANMGIQGQGFCVERNQESVSHSPLFFIPISPLAPESPGYSTEYGKNLIFASVRIHSKKKRKQVGECRCEESCDSRNPLEDHCVEANTAQESLAIFHCYS	416772	414371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_414400_416800
675327	contig_401_pilon	-	2150	14	Intergenic	novelGene_42940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	142.777146663839	14	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	191	1792	2248554	2223125	TRUE	40	GTAAAATCCTATATTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRKFLYHHNSTYSDSSGFTEEPNSRVFSKEDMHPGLSGKPHVKRRDQSGR	2262037	2196684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2196916_2198421_2198461_2199247_2199289_2223077_2223185_2225535_2225622_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
675328	contig_12644_pilon	+	1285	10	Intergenic	novelGene_44666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	5077.03729830647	4	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	325	1221	2678073	2680545	FALSE	35	CTTGATCAAAGAGGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675488	2680609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677672_2678046_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679933_2680152_2680229_2680311
675347	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675349	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675355	contig_14925_pilon	-	738	4	Intergenic	novelGene_55101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1732.40532850203	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57686	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_57638
675357	contig_16382_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_160233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATAGGTGTGTCTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251869	250036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_250000_251900
675358	contig_16382_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_160232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	786	1097	248892	248581	NA	30	CGAGGTTGCAATACACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDFKGLMEILLEVIIFHSIGEAVLKKFPKCLGLFYTAKQPALDLLIDDRENGDTWNPWRIPKLHFSPSVMFPFLTLLPELLTGNSMDRFVCFSAHLRPPFF	249677	247708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_247700_249700
675359	contig_6710_pilon	+	563	2	Intergenic	novelGene_94494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGATGGCTCTAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
675367	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_93570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675370	contig_14566_pilon	+	1163	8	Intergenic	novelGene_148833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	395	junction_2	260.480168856186	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	227	1162	88884	125249	FALSE	30	GTAAGCATCTCAGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESVPYTLIMNCQHPKEINRNIT	66750	125250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_88762_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
675381	contig_17074_pilon	+	1541	8	Intergenic	novelGene_145130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	203.165258961712	2	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	379	627	220965	223655	TRUE	30	GTGTCACCTAAACTCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPSLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	215404	225320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_215412_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452_223668_224001_224838_225254
675386	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_90587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675403	contig_11978_pilon	-	2087	7	Intergenic	novelGene_62865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	49.6065071896375	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	224	826	603273	600051	FALSE	20	AGATTGTTGTTGCAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPELPGKSTFFGSSDEFIEKRRQGLQHFLEKVLQSVVLLSDSQLHLFLQSQLSVPEIEACVQGRSPMTVSDAILHYAMSNCGWVQEERQGSSHLAKGDQPKSCCFLPRSGRRNSPSPPPSEEKDHLEVWAPVVDFEAPSLESPTLPALSSPSHCDFARPDEGTSAGQPARRVMGGDQLASLSHAVPLDPGQLETVLEK	607194	598789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600343_601085_601299_601508_601605_603271_603359_603888_603944_604905_604966_607171
675404	contig_14322_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_115720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAGTTTATATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
675405	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675409	contig_4847_pilon	+	1672	10	Intergenic	novelGene_156150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	66.3483139607338	1381	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	61	1230	79702	92768	FALSE	45	AAAAGATTTTCATACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVAGCYEQVLFGFAVHRESEASGDLEKWTPVADFTHHAHTASLSAVAVNSRFVVTGSKDETIHIYDMKKKIEHGALVHHNGTITCLKFYGNRHLISGAEDGLICVWDAKKWECLKSIRAHKGHVTFLSIHPSGKLALSVGTDKTLSFLFCRTWNLVDGRSAFIKNIKQNAHIVEWSPKGEKYIVVTMNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	79641	93210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85410_85532_85605_85681_86188_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
675410	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675411	contig_8341_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_160245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTCTCATGAAACAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90777	92353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8341_pilon_+_90800_92400
675412	contig_5643_pilon	-	1542	9	Intergenic	novelGene_38927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_8	91.6336967223303	577	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	218	961	416375	412705	TRUE	10	GTAGGGTTTTGCCTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRFMRDVEPEDPMFLMDPFAIHRQHMSRMLSGGFGYSPFLSITDGNMPGTRPASRRMQAGAVSPFGMLGMSGGFMDMFGMMNDMIGNMEHMTAGGNCQTFSSSTVISYSNTGDGAPKVYQETSEMRSAPGGIRETRRTVRDSDSGLEQMSIGHHIRDRAHILQRSRNHRTGDQEERQDYINLDESEAAAFDDEWRRETSRFRQQRPLEFRRHEASGGGGRRAEGPPRLAIQGPEDSPSRQSRRYDW	417171	411861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_412418_412679_412893_413501_413662_413835_413965_414363_414418_415036_415073_415925_416053_416325_416404_416982
675413	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675414	contig_12074_pilon	-	1793	13	Intergenic	novelGene_53765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	301.554065080653	3	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	23	1120	45831	32709	TRUE	50	TTAAAAATACATATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDLLESSWK	45853	29983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33110_33193_33340_33417_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
675416	contig_11292_pilon	-	1438	12	Intergenic	novelGene_109407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	265.602324992313	954	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	567	1364	165314	161842	FALSE	5	TGCCACCTGTCTGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167452	161767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165987_166347_166476_167109_167194_167413
675421	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	1	35774	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
675423	contig_3948_pilon	-	1561	12	Intergenic	novelGene_53412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_11	165.766588863592	869	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	94	1221	1975758	1933521	FALSE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975851	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
675427	contig_9389_pilon	+	1596	3	Intergenic	novelGene_84117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	553	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	101	841	1408796	1424594	FALSE	10	TCATATTTGGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQRGARAPVDFLPPLGHCAWDASPGPEPWSPRMSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVGTPFPKNFLQAVKKILSRLFRVFVHVYIHHFDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVRGDAAGVLGSGHTGMTKENHVPGPAEPPCPPPRPHWVQLSPRICPLARSGSS	1408695	1425349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1409217_1418063_1418228_1424438
675428	contig_6434_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_61841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGATGAGATTTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736894	736002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_736000_736900
675429	contig_6898_pilon	+	1350	5	Intergenic	novelGene_35717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	712.952312570764	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	113	427	59668	126743	FALSE	15	TGTTCTATTTCAGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITPWYWLA	59555	127666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114353_126721
675434	contig_11752_pilon	+	1145	9	Intergenic	novelGene_37639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1350.74997108088	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	52	855	84194	105616	FALSE	25	AAAGATGTCCAGTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84142	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87277_88712_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
675446	contig_11512_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_43232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	20	361	4011	4575	FALSE	15	GTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAY	3991	4576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
675457	SIRV4	+	253	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1514	636	1059	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
675459	contig_11986_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_69089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTGTTTTGGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26325	25309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_25300_26300
675460	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
675463	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675465	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675470	contig_16310_pilon	-	1586	11	Intergenic	novelGene_70048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1126.27538817112	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	44	1585	66135	58532	FALSE	50	AAAGAGAAATTGAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCN	66178	58530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62263_63134_63538_64831_64955_66117
675475	contig_14415_pilon	-	1960	5	Intergenic	novelGene_77588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	230.510710163324	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	118	1401	19037	13005	TRUE	25	CACTGAAGAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQAPRDPSSGSWVPSLPQQGSSKGNTPNYSNKKALGAETMSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	23776	12391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_12612_12665_13232_16940_17037_18076_19097_23718
675476	contig_1309_pilon	+	1599	8	Intergenic	novelGene_73975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	214.398636913121	389	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	417	1163	294293	311149	FALSE	25	TTTGAATCGCTTGAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTVGSFLQEIQNEDKGVNTVAVFTADGSKIPASTLMGILLMNDFKLVINKITYDVQCPKQEKLSSEHATEMETMMSLVHRLFTAIHFDEYRKKKENHLLEKIDRLKKQLQPLEQLKARVEGRCEASISRLLWTGLALLSVQGGALAWLTWWVYSWDIMEPVTYFITFANTMVFFAYFLVTRQDYTYSAVSGRQFLHFFYKKSKRDHFDVEQYNKLKDDLDEAKEALKRLRHILYFRLPVEELNDKS	209400	311585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_209652_293631_293708_294203_294375_300418_300524_306112_306274_308166_308371_309390_309508_311071
675485	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675488	contig_19352_pilon	+	1666	4	Intergenic	novelGene_122354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	1321	1665	113293	123013	FALSE	10	TGGCGCGGCAGCTCAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTISPNFSLYRMVVLPAASNPTIKMRICFLPKRREKREEMVRPMAAAALAMGRSRRGFGRPRAFSFHTPGKLSQREEEELRKNESGRDCSPAGVSDEASGPGQKLAGRRPTRR	102869	123014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_104089_105885_105974_113279_113363_122738
675495	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
675496	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_96079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675499	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
675504	contig_9345_pilon	-	1341	6	Intergenic	novelGene_24693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	244	825	955353	947957	FALSE	20	TTTCATGTTAGTTACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001318	947440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
675512	contig_12270_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_113611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13850	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
675514	contig_20493_pilon	-	1750	14	Intergenic	novelGene_86413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	77.168608143728	60	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	706	1689	47052	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55245	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_47979_48051_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
675517	contig_2537_pilon	+	1676	14	Intergenic	novelGene_33422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	234.348726140739	13	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1086	591	1676	228542	239861	FALSE	70	CGACAGAAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRR	206284	239861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_206788_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846
675523	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675524	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675530	contig_5039_pilon	-	1547	3	Intergenic	novelGene_64962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	604	junction_1	232.5	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	496	861	1654771	1654406	FALSE	30	GAATAAATGTGGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALTSPALPALIRSMLKPQQLLWFFKQWALYQRTSWLMPLASGVPHVDRLRFYIIISDNFTLHQNVFLLLNVVNIWQFKTLCKKQSVQTSPGFDFCTMEIVFNHTGFWYVYIVYLSGVFV	1655854	1653719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654835_1655315_1655432_1655538
675545	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
675551	contig_1948_pilon	-	1332	4	Intergenic	novelGene_31174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	167.837884744641	289	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTATTCTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552056	543607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546900_548485_548594_551945
675559	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675560	contig_17281_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_105182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2237_2500
675561	contig_12635_pilon	+	1737	8	Intergenic	novelGene_60793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	59.5109319403432	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	160	999	118817	154217	TRUE	60	GAAATACAAAAAAAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLECAPQRGGVFGCSAVRRSRRAAPPEPGRRASPLLAASTPAAGVHLTVHTHTMTKKDKKSFNQSLAEWKLFIYNPTTREFLGRTAKSWGLILLFYLVFYGFLAALFSFTMWAMLQTLNDEVPKYRDQIPTPGLMVFPKPVTALEYSFSLSDSRSYEGYVRDLDNFLKSYDLEEQKNLTACPDGALFEQKGPVYSACQFPRHLLKECSGQNDTEYGYSRGSPCILVKMNRIIGLKPKGQPRITCTPKDERAALITTYPSGGHIDLKYFPYYGKKLHVGYRQPVVAVQASFNLNNTRKEATFDCIIDGSPNLKNKDDRDKFLGRVTFKITVNA	118657	155046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_118926_137419_137549_142097_142206_143686_143872_146769_146821_151190_151278_154046_154615_154705
675565	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675570	contig_753_pilon	-	2642	3	Intergenic	novelGene_113001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	22.5	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	446	850	1269225	1268821	FALSE	65	CTTTAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNRQLSHQDPTKANSRERGESDFQSYHTILFKMPRFQQRVTRHARNQERMAHTQKKSKSTQTDPNFLGRVTRHAKNREWMAHSQKKNKSTQTDPDRDQLSDYGAWSEHGIWSDKAWRRDTIKVLKEITAKLE	1270166	1267028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1269329_1269677_1269848_1269994
675577	contig_15273_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_140419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	142	453	33322	33633	NA	70	GATTAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESRWGCGPHLYISRCSGFFLSLDPVAASCRLISRSWDLSCQLISPTWDLSICTACEWEPCSPTCRSWACQLLQLCDLGEASTLIHGLGTF	33180	35174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_33200_35200
675585	contig_16666_pilon	-	1276	4	Intergenic	novelGene_61743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	34	399	59688	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSAEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGILAASFSVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59721	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56685_58200_58264_59552
675587	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675592	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675594	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675598	contig_9290_pilon	-	1641	11	Intergenic	novelGene_77549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	271.73258913866	4	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	430	1308	486144	478940	FALSE	25	AGCCTAGAGTTATCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497024	478606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486165_487608_487663_489929_490037_491390_491545_496930
675601	contig_16103_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_118949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976729	974223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_974200_976700
675604	contig_2114_pilon	-	1671	11	Intergenic	novelGene_104321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	80.0293071318251	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	8	1135	1169443	1139050	FALSE	30	TTTAATGACTACTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIMELGRCSYPVPRLLLLLLLLLSLNGGAVLSWPTEEGKEVWDYVTVRKDAHMFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169450	1138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143653_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
675611	contig_7457_pilon	-	1932	10	Intergenic	novelGene_31449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	33.7927598352658	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	949	1623	475819	474462	FALSE	10	ATGTATTGTGTCTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVEKAWNLLQKRIPKMPSGP	478232	474152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_475922_476355_476410_477048_477761_478152
675614	contig_10734_pilon	+	2184	10	Intergenic	novelGene_51173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	405.919471427463	2	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	125	1399	1123789	1142903	FALSE	30	TTTATTTTAATAAAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASDTERDGLAPEKMSPDRDKKKEQSDVSVSPRASKHHYSRSRSRSRERKRKSENEGRKHRSRSRSKEARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123664	1143688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
675615	contig_7066_pilon	+	1462	9	Intergenic	novelGene_42112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	135	junction_4	28.2212242824439	810	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	140	1108	567063	584840	FALSE	35	CTATCCTAACCCCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVINTVDTSHEDMIHDAQMDYYGTRLATCSSDRSVKIFDVRNGGQILIADLRGHEGPVWQVAWAHPMYGNILASCSYDRKVIIWKEENGTWEKTHEHTGHDSSVNSVCWAPHDYGLILACGSSDGAISLLTYTGEGQWEVKKINNAHTIGCNAVSWAPAVVPGNLIDQPSGQKPNYIKKFASGGCDNLIKLWKEEEDGQWKEEQKLEAHSDWVRDVAWAPSIGLPTSTIASCSQDGRVFIWTCDDASGNTWSPKLLHKFNDVVWHVSWSITANILAVSGGDNKVTLWKESVDGQWVCISDVNKGQGSVSTSVTEGQQNEQ	566923	585194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_567066_569662_569708_572365_572482_575163_575316_575791_575926_581092_581227_582053_582178_583105_583253_584726
675622	contig_6710_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_96603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCCACCTTCCACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
675627	contig_13004_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_112630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTATTAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220835	218204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_218200_220800
675632	contig_10962_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_103898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320901	323684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_320900_323700
675635	contig_5324_pilon	-	1839	4	Intergenic	novelGene_102047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	10.3387082795139	161	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	75	1412	93305	61671	FALSE	10	CACCTGTCTCTTCCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESWTADAAVVPRARRLLEHAASAMREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERISVYYNESSSQKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKECEHCACLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQNKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQEATVNDGEETFEDEEEIDE	93379	61243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_62732_91031_91143_92612_92722_93248
675640	contig_2892_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_119033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGAGTACTGTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322848	323169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_322800_323200
675650	contig_15185_pilon	-	1491	8	Intergenic	novelGene_99449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	332.885835673188	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	214	1038	444599	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472491	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444656_472334
675651	contig_14209_pilon	+	1700	13	Intergenic	novelGene_88321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	205.989667351437	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	68	865	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKLASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32298	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40730_40901
675653	contig_7202_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_19009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGACGACCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30096	29914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
675663	contig_9988_pilon	-	1524	7	Intergenic	novelGene_113064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	17.6894507169292	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	8	820	532674	244432	FALSE	15	TATAGGAGTTTTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWMIQKPHKAATFFGCIGVDKFGEILKTKAAEAHVDAHYYEQNEQPTGTCAACITGDNRSLVANLAAANCYKKEKHLDLEKNWLLVEKARVCYIAGFFLTVSPESVLKVARHASENNRIFTLNLSAPFISQFYKEPLMKVMPYVDILFGNETEAATFAREQGFETEDIKEIAKKAQALPKVNSNRSRTVIFTQGKDDTIVATESDITSFAVLVQDQREIVDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIHAGHYAASVIIRRTGCTFPEKPDFH	532681	243727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_244557_285008_285096_348842_348958_367853_367890_428008_428180_528981_529091_532504
675680	SIRV7	-	279	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35776	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78962	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56100_70893_70988_78843
675681	contig_11292_pilon	+	1178	7	Intergenic	novelGene_109381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	14.6562462982701	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	74	940	6987	12447	FALSE	45	CAATAAACCATATCCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAGGSITGLKFNPLNTNQFFTSSMEGTTRLQDFKGNTLRVFTSSGTCNFWFCSLDVSAGSRVVVTGDNAGQVVLLNMDGKELWNLRLHKKKVTHVALNPCCDWLLATASVDQTVKIWDLRQVRGKSSFLSSLPHRHPVNAACFSPDGARLLTTDQNSEIRVYSASQWDCPLGVIPHPHRHFQHLTPIKATWHPRYNLIFVGRYPDPNFKSCTPHELRTIDVFDGSSGNMMCQLYDPEYSGIISLNEFNPMGDTLASVMGYHILIWSQEEAGIQKRETVTKVCAKQGLGATNGNKSCEKRQLSVKGLKVYKS	6913	12685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_7061_8364_8465_8555_8734_9051_9195_10733_10899_11038_11085_12286
675687	contig_9258_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_104617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12580	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	12	404	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	97226	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_97376_99327
675688	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675720	contig_7151_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_40802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	531033	530692	NA	10	TTTCCTTCAGTTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKPRKEKENKQTNQNKTNQSQKSKKPWGVLPASTGREEFHSQWVFRSISGRSKDGAQSQVFERKDREVVRGKEEIYRSGKKQHQQPTKGTQGASQCGPVESKRHRGASRPRD	531034	529893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529900_531000
675724	contig_12074_pilon	+	2007	14	Intergenic	novelGene_53743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	233	553	30205	32275	TRUE	40	GAGCTAAAAGAGACTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSHYFLDRSTNCGALQCISGCYAFLLVFGFHGRKQKYFLDVVGVREEHGDSVNAHAPASRWGQPIFQGGTEVLIYEHGLIITSGLGLACSSKSCRCRMGSFNSV	29972	45846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_30324_30920_31067_32219_32344_32646_32734_33106_33195_33342_33514_33626_33791_34829_34950_35882_36015_36156_36286_36646_36742_40007_40173_41070_41230_45770
675730	contig_9706_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_21005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497669	500249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_497700_500200
675736	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675737	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675740	contig_6938_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_69066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGTAAAGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154509	156743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_154500_156700
675741	contig_3948_pilon	+	2162	15	Intergenic	novelGene_53175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	30.7544587774501	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	197	1990	346422	384260	FALSE	15	AAAGTGGTCCCTTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLQHVLRAQGSLRQGTLASVSWLLLRNCRAHSGLPSTACPSPERQEDGVPKDFSSRLATGPTFQHFLRSASTPQEKPSSPEVEDPPPYLTVDELLGRQRKVYLETYGCQMNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQGLKEVTLLGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRQKTRAYHRLQDDVPGEVKIRRLEELITVFREEATTANKTSVGCAQLVLVEGLSKRSATDLCGRNDGNLKVIFPDTEMEDVSNPGLRVRAQPGDYVLVKITSASSQSLKGHVLCRTTLKDSSAYCSPGWMATQS	343565	384432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343633_345535_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361249_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368963_371245_371396_379631_379773_384152
675742	contig_11855_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_66912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTGCTTTGATAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795245	793411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_793400_795200
675745	contig_17440_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_7639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3495	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
675749	contig_13894_pilon	+	218	2	Intergenic	novelGene_62168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5691	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527462	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_527580_528072
675751	contig_15859_pilon	-	1948	7	Intergenic	novelGene_50202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	153.021149591232	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	91	1536	349672	341031	FALSE	20	CTTTCAGAATACGTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQFSEGRPGGTVVKRSAANGRVGSSNLPATPLEKDVAVCLCKDYSLGNPMRQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352726	340618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_345578_345729_346153_346352_346510_346789_349503_349684_352647
675754	contig_8674_pilon	-	2134	12	Intergenic	novelGene_102950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	51.0115851369257	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	849	1763	723870	707008	FALSE	15	TTATCCTGCTCTTCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727579	706636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_726863
675755	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675767	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_89282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
675773	contig_15741_pilon	-	1335	7	Intergenic	novelGene_159663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	614.391840223593	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	412	696	60544	50297	TRUE	0	CCCGCCTTGTCTGTGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGGDGPGAEEQTAVAIASVQQAAFGDHNIQYQFRTENNGGQVTYRVVQVTDGQLDGQGDTAGAVSVVSTAAFTGGQQAVTQAVIQNPFSNGGSPAAEAVSGEARFAYFPASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPYGGGTRSTTGSSSFQKSFQIVMQTTARQERVKEGSCRRPATTSGSYARPTSACRRPSRRLSGCRWRTSS	61718	49563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50738_60466_60559_60681_60833_61333_61454_61592
675776	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
675780	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
675784	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
675787	contig_14925_pilon	-	952	4	Intergenic	novelGene_55084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	157	414	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29831	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
675796	contig_5728_pilon	+	1656	3	Intergenic	novelGene_126709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	90.5	1147	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	39	593	371873	408722	FALSE	35	CATGTGTATAATTAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGVAVPKLACMQRAAAASALGLFSRLQTPVPTMRTFSLSQPSQKVADPVWNLGRLNHVAIAVPNLEKASTFYKNVLGAQVSEAVPLPEHGVSVVFVNLGNTKMELLHPLGKDSPIAGFLQKNKAGGMHHICIEVDNINTAMMDLKKKKIRTTTEEAKIGAHGKPVIFLHPKDCDGVLVELEQA	371834	409785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_371937_392287_392626_408569
675800	contig_6065_pilon	-	1315	4	Intergenic	novelGene_132702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_1	92.672661676582	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	787	1155	498800	495700	FALSE	20	ACATCGGCTTTTTAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRPSNVHFPFFSGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	499586	495539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680
675804	contig_7357_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_36765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATATAAAATAAAATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62007	63643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_62000_63600
675807	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675808	contig_987_pilon	+	1907	13	Intergenic	novelGene_72284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1599	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGAACGGGGTGGCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916064	945194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_916797_920067_920169_921709_921813_922618_922690_927661_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933247_936244_936427_937202_937323_937404_937454_941073_941170_945029
675809	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
675819	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675824	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_94320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675825	contig_546_pilon	+	3134	8	Intergenic	novelGene_117184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	951.33491602536	1	177	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	101	1624	119834	152874	FALSE	10	CCAGCCTTGCCTTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	61183	154384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818
675827	contig_6048_pilon	-	2004	14	Intergenic	novelGene_73291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	88.8343315477663	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	155	1660	2006289	1978823	FALSE	25	CCTTGGAATAAAGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2049147	1978478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979273_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
675832	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	709	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675836	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
675845	SIRV7	-	400	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-62	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114800	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
675853	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
675857	contig_15939_pilon	-	2054	12	Intergenic	novelGene_160252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_11	99.8856370849572	332	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	128	1375	112544	30441	FALSE	15	AGTCGTCTTGGACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLLKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISSNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDASPAQPKHIGSIDPTCNVAEVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDQGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTL	112671	29761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_30472_35009_35150_36881_36996_40035_40147_41066_41169_42441_42519_50601_50680_65097_65188_67243_67429_69162_69235_73118_73261_112438
675860	contig_5954_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_28802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGCACAGTGGTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444750	1446756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1444800_1446800
675873	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675876	contig_14924_pilon	+	2283	12	Intergenic	novelGene_104157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	38.9273534031689	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	14	727	44129	52577	TRUE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGSHKPEGSRELELRP	44115	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695
675881	contig_610_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_76687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	478	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCTTCAGATTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53343	54894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_53300_54900
675889	contig_15991_pilon	-	825	5	Intergenic	novelGene_70867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	723.247321114983	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	388	756	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	103703	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583
675894	contig_6691_pilon	+	2320	10	Intergenic	novelGene_60144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	64.7046471130528	220	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	361	1620	285569	330967	FALSE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPADRTGPPQFCRLSLLEGTMSCHFPLFLLATVTLPPVYSELSPLFLEELGSNLGIQVFNQIVKSRPHENVVVSPHGIASILGMLQLGADGKTKKQLTAVMRYSVKRAGKLLKKINKSIVSKKNKDIVTVANAMFVENGFKTEVPFVTKNEDVFQCQVQNVNFEDPDSACDLINVWVKNETSGMIDDILSPDHIRGQLTRLVLVNAIYFKGLWKSRFQPENTKKRLFVASNGTSYPVAMLAQLSVFLCGSTSTPNGLWYNFIELPYHGDSISMFIALPTESSTPLSAIIPYINTKTIDSWMSIMVTKRVQVVLPKFTAVAETDLKDPLKAFGITEMFDPLKANFSKITRSENLHVSHILQKAKIEVSEDGTKASAATSAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHSPTGAILFMGQINKP	255614	331667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_255822_285415_285605_303934_304224_309856_310085_317424_317623_322967_323167_323976_324078_326610_326698_329120_329205_330929
675914	contig_9389_pilon	+	316	2	Intergenic	novelGene_84045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	14330	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCCGAGTCCAACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585717	586266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_585890_586122
675926	SIRV4	+	346	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	636	966	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
675930	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	2	349	14434	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
675935	contig_8558_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_123152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCTTGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379631	381163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_379600_381200
675941	contig_12654_pilon	-	1291	9	Intergenic	novelGene_129319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	164.783001247095	1944	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	489	1217	823900	808478	FALSE	10	GTCCTTGGTCTGTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISCSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827438	808403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_824066_827115
675942	contig_16022_pilon	+	1803	13	Intergenic	novelGene_160264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	18.5253205100479	264	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	573	1538	25217	34589	FALSE	10	TTATTGTGGCTGATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKPLALTEFLAKFDYYMPAIAGCREAIKRIAYEFVQMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVKPIAWNQPEGDVTPDDVVALVIQGVQEGERDFGVKVRTILCCMRHQPNWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVCPWSSYLTGAWKPETEHAVIRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKRSMGFTEEEFKRLNINAAQSSFLPEDEKEELLDLLYEAYGMAAPASAGCKVIPLKTSQQPF	6019	34854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_9978_10244_18661_18724_25158_25282_27588_27733_28513_28630_30098_30224_31023_31096_31177_31280_31547_31613_33208_33339_33982_34086_34545
675947	contig_15744_pilon	+	833	5	Intergenic	novelGene_83595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	27385	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	52	417	149562	152709	TRUE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDW	149510	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152712_153178
675950	contig_5018_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_47041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCCTAGGTGGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399084	1401440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1399842_1399928_1400009_1401117_1401262_1401349
675959	contig_6418_pilon	-	1249	12	Intergenic	novelGene_81108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	345.74700538911	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	94	999	106563	68463	FALSE	20	GCAACTACTTTGTTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118041	68212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71860_73026_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
675967	contig_8554_pilon	+	1600	4	Intergenic	novelGene_160271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_1	40.5407887880287	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTTAGATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39950	43796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40036_40173_40236_40399_41458_43401
675970	contig_6593_pilon	+	2302	10	Intergenic	novelGene_49843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_9	1075.47120881391	47	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	459	992	1195635	1258085	FALSE	65	TTTGAAAAGTAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGAFIPGVPVQPILLRYPNKLDTVTWTWQGYTFIQLCVLTFCQPFTKVEVEFLPVQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRSPC	1191014	1259395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1258073
675976	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
675979	contig_9656_pilon	-	1548	9	Intergenic	novelGene_121887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_8	96.8539493257761	66	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	598	1548	85878	70344	FALSE	30	AAGAGCCTTGTCAGATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLPSFHLKDALTTIGEKVCVEVSSCLSLCGFTPFTTDQETVLKGQIQAVASPEDPIRRIMDSRILTFLETYLASGHQKPFPTVPGGLGPIQKELEEVAVKFVRLVNYNKMVFSPYYDAILS	101177	70343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_70526_71786_71960_73707_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_97151_97333_101023
675981	contig_7963_pilon	+	1725	6	Intergenic	novelGene_58609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	93.1141235259185	34	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	52	807	293211	297210	TRUE	25	ACCTATTGCCATTGAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWSESQLLCSLGLTQDHTESIWGLCYLCTLLGHNTNSFP	293159	298888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815_297256_297588_297939_298192_298225_298397
675984	contig_7202_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_18183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
675986	contig_11656_pilon	+	1787	12	Intergenic	novelGene_54007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	182.812915253466	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	156	1217	465719	536764	FALSE	35	ATTAAATTGATTTCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPPSVTMLDTLSAHLEGLHRRDPAHFDAK	464949	537334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522706_536680
675992	contig_2867_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_135242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4996	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTTTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286782	1285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286295_1286733
675994	contig_9921_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_23719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATTGATACTGTGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99647	99918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_99600_99900
675996	contig_8617_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_73453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTGCATCCCCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62306	62057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62300
676000	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676001	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676002	contig_19579_pilon	-	1692	3	Intergenic	novelGene_59387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_1	88.5	19	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAAAAAAATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9168	7176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442
676003	contig_13112_pilon	+	1698	3	Intergenic	novelGene_98823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_2	68	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGTTTGGATCTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221945	227919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_222039_223786_223849_226376
676008	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_93604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676012	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
676014	contig_7321_pilon	-	2386	12	Intergenic	novelGene_53118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	121.765253087669	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	584	1486	175756	114374	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	208367	113473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_175746_175895_179272_179366_203985_204078_207655_207860_208311
676018	contig_6589_pilon	+	1855	3	Intergenic	novelGene_26038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2109	junction_1	389	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	1136	1855	1726632	1727487	FALSE	45	GAGAGACATTGAAATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLVSRAGKLVVVQQRAKRDRDRQELTETKRNNRQTGRQRGTERQKDTETDTKTDSERERRKQIESQRKTNQQGPRERDIGR	1725390	1727487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1727040_1727175
676028	SIRV5	+	1525	2	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	3	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCGTGACCGACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11136	13594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_11414_12346
676030	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
676035	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676042	contig_3900_pilon	+	2275	2	Intergenic	novelGene_84176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1534	1851	192348	192665	FALSE	80	GACCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNTEYIMDCQKKEQIYLGKSTARMLIRRMTRLCLTYSGHVIRRDQFLEKDIMLGKVEGQRKPGRPSKRWTDTVAATMGSSIPTIVRMVQDWAAVLLYIGSL	189542	193089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_190823_192094
676043	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676044	contig_6215_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_21225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATCTCCACAACTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241901	243023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_241900_243000
676048	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676052	contig_9014_pilon	+	2166	9	Intergenic	novelGene_106776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	9.76521249128763	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	355	1641	141410	145866	FALSE	40	ACTAAACACTGTCAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGYGYYRTVIFSAMFGGYSLYYFNRKTFSFVMPSLVEEIPLDKDDLGLITSSQSAAYAISKFVSGVLSDQMSARWLFSSGLLLVGLVNVVFSWSSTVPVFAALWFLNGLAQGLGWPPCGKILRKWFEPSQFGTWWAILSTSMNLAGGLGPILATILAQSYSWRSTLALSGALCVVVSFLCLLLIHNEPADVGLRNVDPTPSKGKKGSVKKDSTLQELLLSPYLWVLSTGYLVVFGVKTCCTDWGQFFLIQEKGQSALVGSSYMSALEVGGLVGSIAAGYLSDRAMAKAGPSIYGNPRHGLLLFMMAGMTVSMYLFRVTVTTDSPKLWILVLGAVFGFSSYGPIALFGVIANESAPPNLCGTSHAIVGLMANVGGFLAGWPFSTIAKRYSWSTAFWVAEVICAASTAVFFLLRNIRTKMGRVSKAE	140053	146391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_140212_141213_141558_142401_142635_142956_143201_143667_143827_144071_144158_144683_144798_145428_145568_145702
676056	contig_5019_pilon	+	2118	3	Intergenic	novelGene_109177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	37.5	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAGTTTTTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98144	173475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_98209_105662_105737_171495
676059	contig_2646_pilon	-	2700	21	Intergenic	novelGene_69638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	323.618058056098	1	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2676	25	2700	2078663	2069514	FALSE	30	AACTATGACCTCTAAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTPGFCSLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQVIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNP	2078687	2069513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071102_2071325_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073273_2073458_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
676062	contig_15063_pilon	+	1178	3	Intergenic	novelGene_14341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
676063	contig_5643_pilon	+	2188	7	Intergenic	novelGene_38922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	27.0477971992792	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	555	1382	386563	391299	FALSE	40	GGAATCTATCTACAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELAESDFASTFRLLTVFAYGTYADYLAEARNLPPLTEAQKNKLRHLSVVTLAAKVKCIPYAVLLEALALHNVRQLEDLVIEAVYADVLRGSLDQRNQQLEVDYSIGRDIQRQDLSAIARTLQEWCVGCEVVLSGIEEQVSRANQHKEQQLGLKQQIESEVANLKKTIKVTTAAAAAATSQDPEQHLTELREPVPGTNQRQPSKKGSKGKGLRGSAKIWSKSN	386008	392105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_386725_388242_388319_388568_388658_389808_390012_390678_390785_390942_391095_391259
676071	contig_4845_pilon	-	3025	2	Intergenic	novelGene_53721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	503	1597	1064773	1059594	FALSE	25	TATATTGTGTGTGGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRAPLKRSRILHMALMAASDPSGEAQASEEKPFLLRALQIALVVSLYWVTSISMVFLNKYLLDSPSLQLDTPIFVTFYQCLVTTLLCKGLSTLAACCPGYVDFPTLHLDLRVARSILPLSVVFVGMITFNNLCLKYVGVAFYNVGRSLTTVFNVLLSYLLLKQTTSFYALLTCGIIIGGFWLGVDQEGAEGTLSWVGTLFGVLASLCVSLNAIYTKKVLPVVDGSIWRLTFYNNANACVLFLPLLLLLGELQALRSFTHLGSAHFWGMMTLGGLFGFAIGYVTGVQIKFTSPLTHNVSGTAKACAQTVLAVLYYEETKSLLWWTSNMMVLGGSSAYTWVRGWEMKKVQEEPSPKEDEKSLLGV	1065275	1058165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1060154_1064238
676075	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676077	contig_13625_pilon	-	1769	10	Intergenic	novelGene_150156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	118.210525737185	213	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	87	1511	43661	27060	TRUE	30	TTAACTAAGTCATGCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43747	23715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
676078	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	658189	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658190	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
676085	contig_6102_pilon	-	879	8	Intergenic	novelGene_32199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1796.75054768664	3712	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	40	582	905250	895642	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTWFSVIVRTRLKRLLTPKNY	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895702_895837_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
676087	scaffold_12124_pilon	+	1777	11	Intergenic	novelGene_21994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	158.655727914248	285	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	557	1252	804014	813611	TRUE	5	GAGCTTGTTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKCSDGSLSTLDSYRGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKSCCRVISHSRRSHVCRAELCSIGFSRP	791835	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_813529_813765_813915_813998_815122
676093	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
676098	contig_5686_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_45325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACTCACAACAACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107409	108266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_107400_108300
676101	contig_1406_pilon	-	1980	7	Intergenic	novelGene_25660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_2	117.052220065329	460	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	167	901	2816214	2801670	FALSE	30	GTAGTTAGCATATAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL	2833279	2800590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2801743_2807650_2807770_2809673_2809836_2809957_2810048_2812762_2812937_2816097_2816308_2833206
676103	contig_8617_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_73433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATATGTCTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62551	62033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
676105	contig_12427_pilon	-	1849	4	Intergenic	novelGene_40521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1290.07321067019	2	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTGATTTTGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578146	504671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506143_520308_520440_522284_522346_577960
676108	SIRV4	+	195	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1576	632	1121	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2576	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
676116	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
676132	contig_4538_pilon	+	2805	1	Intergenic	novelGene_153075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96071	98876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_96100_98900
676137	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_91287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657164	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657164	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676147	contig_6446_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_149266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786623	789040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_786600_789000
676148	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676149	contig_1443_pilon	-	2249	9	Intergenic	novelGene_28383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	33.8341543414343	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	105	1418	1052337	1038249	TRUE	45	CATGTAAAATATTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTVMNG	1052441	1036668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038033_1038153_1038263_1038890_1039075_1039300_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
676150	contig_5217_pilon	-	1611	4	Intergenic	novelGene_135779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_3	2973.98344910585	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTATTCTATATCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560394	557650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558430_558674_559374_559858_559966_560368
676157	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
676158	contig_7202_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_18660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCATGGTGAGGCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
676162	contig_11720_pilon	+	1200	8	Intergenic	novelGene_43951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	378.800146542221	89	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	13	462	262271	270559	TRUE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDCPRAS	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264395_270542_270700_271268_271343_271806_271961_272096
676163	contig_10324_pilon	-	2033	3	Intergenic	novelGene_7768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATTCTGATACGGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80767	76482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_76527_78362_78451_78866
676168	contig_8435_pilon	+	2088	6	Intergenic	novelGene_72013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	857	2017	94862	97944	FALSE	10	TGTGAGCTGCTTGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91115	98015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_94336_94634_95334_96398_96685_97030_97164_97674
676174	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676178	contig_15354_pilon	+	1917	7	Intergenic	novelGene_65753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	60.9580912503737	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	252	812	642871	647385	FALSE	25	GAATCAAAGCTGCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSPSALLGGFGFRTPSRHQRLRSPMHTSLAALCCSCCL	639005	648490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_640818_640895_641713_641787_642858_643055_644182_644392_645018_645075_647273
676186	contig_16846_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_82961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	768	1130	552742	558746	FALSE	5	GGAGTGGGCGGGGCCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNMVKLMGPGASLIMPSRYSSVGFFPHRGQHVVQVLLVNEAVAVLVDHVEGLLKLLNLGLIKHCEDIGSGPLRPLLGGLGLGAFAGHLGFRRGGLLCRKGWCGEGALCVALPALRSGRC	550861	558748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_551358_551474_551671_552666_552826_555056_555278_558688
676189	contig_11512_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_43235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	15	347	4011	4566	FALSE	15	CTGCTTATAGTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAY	3996	4567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
676192	contig_6102_pilon	-	1232	2	Intergenic	novelGene_32055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCATTTCACCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581030	579749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_580259_580307
676193	contig_4180_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_8405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1396	1908	882236	881724	NA	10	TGCCCCCAGTTCGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTKELRQGLQEGNFTELPTGDRAPGNQGYMLSHLTPFFLYKASATCQRARVAQPERYQFTAAQIRHLGLQPPKTADREFGRATPWSSQQETELPVIRDTCFPTPHPSSLYVASTACHGCATEETLTHCCWGPRHPQQPAPLVRFVCLGFFVVVVASFSLPSFLSFLLLS	883631	881607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_881600_883600
676197	contig_5780_pilon	-	2029	10	Intergenic	novelGene_29802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	31.9026296373477	194	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	119	1555	135451	117335	FALSE	10	CGTTTCTTTCCACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQSSWSDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDSMFGYQFLNGCNPVLIQRCRKLPEKLPVTTEMVECSLERQLTLQEEIEQGNIFIVDFELLDGINANKTDPCTHQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQVPGDKNPIFLPSDAKYDWLLAKIWVRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQLICEYGLFDKANATGGGGHVQLVHRAMQELTYISLCFPEAIKARGMDSTEDIPYYFYRDDGLLVWEAIKKFTAEVIGIYYESDQVVEEDQELQDFVKDVYVYGLRGRKASGFPSSIKTREMLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFSQYDWCSWIPNAPSTMRAPPPTAKGVVTIEQIVETLPDRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLDTIVSVIAERNKEKKLPYYYLSPDRIPNSVAI	135569	116860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_117515_118059_118231_118619_118721_119105_119228_119544_119724_121292_121380_122016_122221_128336_128484_134216_134390_135378
676199	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91676	15	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
676202	contig_6576_pilon	-	1658	13	Intergenic	novelGene_42236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	94.4314860391149	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	374	1348	252452	229096	FALSE	30	GGAGTGGGAAATTGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261056	228785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_260886
676208	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_96242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676209	contig_10494_pilon	-	2076	12	Intergenic	novelGene_102135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	447	788	438255	405726	TRUE	10	CTGCGCAGGCGCTGCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEAAETVGAGVGVCESEGALCHLTGSGWPRAPAASQAAWRAAGSQLSVQQQYGQSLVPAGHTGPGCHCPGEVTHRHLLRWGPMRPQQSAGHPAAPAHPVQHDVSVGCPRCPA	438701	344565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_344645_361705_361857_366492_366587_369321_369523_381403_381579_393359_393602_396402_396565_403609_403746_405677_405741_408170_408209_437782_437927_438110
676217	SIRV7	-	355	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-22	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114760	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
676223	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_93705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
676230	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
676242	contig_6136_pilon	+	1570	6	Intergenic	novelGene_154108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	260.415514130783	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	482	1234	460760	494274	FALSE	30	GAACAATATGGGTATCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	460105	494610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460430_460602_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
676247	contig_15304_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_30439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCCTGCTTTTCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54288	52880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53270_54098
676263	contig_9113_pilon	-	2772	4	Intergenic	novelGene_68577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	11.2249721603218	227	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	6	380	130360	120496	FALSE	15	CTCCAACCCAGTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMGTAAGEAAYFQRGSLFWFTVIALSMGYYTWVVFWPQSIPYQSLGPLGPLTQYLVDHHHTLMRKGYWLAWLIHVGESLYAMVLCKYKGISNGRAQLLWFIQTFLFGIASLSILIAYRPKRQKQT	130365	118103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_120617_127828_127889_128025_128130_130270
676264	contig_9415_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_109720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGAAGTTATTTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450067	452090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_450100_452100
676266	contig_12057_pilon	+	1865	14	Intergenic	novelGene_131640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_12	34.4526087331672	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	144	1451	142219	161653	FALSE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	142075	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
676267	contig_6325_pilon	-	2053	8	Intergenic	novelGene_143344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_7	91.9733768044662	86	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	102	965	182776	116356	FALSE	35	CCCAGCCTAAACCAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAGVFSLVTLLLLEVKRNSYFYSVTRQLNKTPFIHLIMK	182877	115267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_116635_118233_118341_125704_125793_127615_127704_128782_128892_130009_130129_182201_182263_182763
676268	contig_19957_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_57719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCTGTCTGGAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226244	224768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_224800_226200
676269	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676271	contig_2450_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_160321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGGGAAGCTCGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794343	793303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_793300_794300
676272	contig_2450_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_160320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791191	789232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_789200_791200
676275	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676278	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	15	344	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14423	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676283	contig_10038_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_160328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	1290	1862	8784	8212	NA	80	ATGAACAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSKYWSLLITCPKYVRCSLAILASKEHSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILCQHHNSKTSVLLWSSLFTAPLLHAYEAVENTMAWVKCILVLKVTSLLFNTLKGSFATDLPNAMCLLVSLLLLPWALIVDPSKVKSLTTSVFSTFIIGALAAQQLRAMAANQKVSSSNSPAAPWKHYGAVILCPVGSL	10073	8112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10038_pilon_-_8100_10100
676285	SIRV7	-	292	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	0	35775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
676289	contig_9720_pilon	-	1206	3	Intergenic	novelGene_116782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	825	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGAGTCTGGCGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393998	391625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_392082_392393_392476_393330
676296	SIRV2	-	333	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4540	34	3365	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
676297	contig_7730_pilon	-	1309	4	Intergenic	novelGene_156242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	703.9679601295	12	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	38	379	43591	7854	TRUE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGVRGGGCNSEMAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKVRPSFRSPESPLSPTLFALNRPISGSPQTATAPRLLHFRSNLLIVSDKSSYFQAEGIYC	43628	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2445_4051_4177_7798_7931_43326
676299	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	721	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676301	SIRV2	-	613	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4259	35	3084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
676302	contig_6205_pilon	-	3072	1	Intergenic	novelGene_160338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	1899	2471	56171	55599	NA	45	CTCTAGTATACAGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLCFHTEKRVDTHLSHPLNPNGHHCGAWSGGTQSSPPGTIHHSCQLNVRAPCDISKIRGKTRSPHPPQRDNMALHCMWQGSRCTVSTPAWFHLTSVRTGFLIVGGGSPQPPTTNSFMLLSFGPYPPASTRSSSERELPASQRAGGQRGRHPHPALCDRPAIGTINQQFKQRQIPCDKRDREEDLKLCIP	58069	54997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_-_55000_58100
676305	contig_9839_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_88586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTAGCTTTCAGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331272	333349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331300_333300
676308	contig_5350_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_99334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142173	144758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142200_144800
676313	contig_6823_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_131241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGGAGAAGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422418	422666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_422400_422700
676316	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676329	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
676330	contig_846_pilon	-	1677	3	Intergenic	novelGene_136102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	101.5	684	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	241	621	214365	212487	FALSE	25	CGTGTTAAATATGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGKGSYSSRHTRKRRAGSGVGEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	214605	211430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212690_213134_213244_214296
676342	contig_3252_pilon	-	2273	5	Intergenic	novelGene_61484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1064	1363	221977	221678	TRUE	30	AACATCTATGGGCATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRKTQQYLGNSDSQKGHTGWGCGTLGLESETAMCEQCNFPVSTFSVEAAEKTVAGEFVILTTLVPSERPLLQQRILPFPVCVVSERPASQESLEFRCA	223040	217112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_217491_218476_218617_218888_219064_219567_219702_221594
676345	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
676348	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
676355	contig_14220_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_159856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCATAGTGTAAATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300463	302400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_300500_302400
676358	contig_20600_pilon	+	2377	6	Intergenic	novelGene_137109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	58.1535897430245	177	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	192	1010	111440	117548	FALSE	10	CCCTTGGCCTAATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIFIGEQHRLCAEWRAPTLPGTPPQIVAALDSPIPGFAEKHNFEKPNDSRALRLMTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111248	118915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111553_112268_112446_113990_114161_114959_115049_116223_116332_117386
676370	contig_1406_pilon	-	1704	5	Intergenic	novelGene_25532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	616.588750708282	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	122	688	2159494	2139992	TRUE	20	GCCTTGACCCAAATTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFG	2159615	2136592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139995_2143345_2143628_2147740_2147920_2159391
676378	contig_11855_pilon	+	2232	13	Intergenic	novelGene_67141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	855	1256	2710038	2713561	TRUE	35	AACAGCAACCGGGCAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKDLPLVYWKALVTNWTIQTKGLHVLLQGVILLIHIISKVHVAGGAFCDGGLVGGRTFLDYHNTGFHIQVLDFVVHLPGLKQALDMAKSQHLDPCNSAICCSPSSNIIFSLYFLLFSLQSFKYKLILTQSF	2709183	2731324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2710200_2710712_2710736_2711735_2711873_2713481_2713577_2716006_2716098_2716379_2716502_2717120_2717194_2718336_2718433_2718632_2718758_2719581_2719718_2719882_2719984_2723726_2723918_2731298
676385	contig_12644_pilon	+	1331	9	Intergenic	novelGene_44644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4181.7994631498	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	49	885	2675526	2679668	TRUE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYK	2675477	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679710_2680107_2680205_2680311
676392	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676395	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676399	contig_6047_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_24237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTATCATAAAGGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248775	246532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_246500_248800
676403	contig_6434_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_61876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTAAATAGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865150	866303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_865200_866300
676406	contig_12180_pilon	+	2819	1	Intergenic	novelGene_160350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87628	90447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_+_87600_90400
676420	contig_10404_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_138712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCAGGGATGGGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1236567	1237604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1236600_1237600
676421	contig_11512_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_43224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	26	352	4011	4560	FALSE	15	CTTATGCTGCTTATAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	3985	4561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
676423	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGGACTCGGAGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
676445	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
676449	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_114024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	31	351	14409	13866	FALSE	20	ACTGTCAGTATGGTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14439	13864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676452	scaffold_16735_pilon	-	696	2	Intergenic	novelGene_160366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGCTCTGATTAGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386126	385340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_386015_386104
676453	scaffold_16735_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_160365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCCCAGCATGGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384886	383661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_383700_384900
676455	contig_6109_pilon	-	2583	12	Intergenic	novelGene_160377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	36	junction_4	33.794224162967	148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	149	1573	618976	572019	FALSE	45	CAGCAGAACAAGCAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVMQKIIPHYSLARWLLCNGSLRWYQHPTEEELRILAGKQQKGKSRKDRKYNGHIESKPLTIPKDIDLHLETKSVTEVDTLALHYFPEYQWLVDFTVAATVVYLVTEVYYSFMKPTQEMNISIVWCLLVLSFAIKVLFSLTTHYFKVEDGGERSVCVTFGFFFFVKAMAVLIVTENYLEFGLETGFTNFSDSAMQFLEKQGLESQSPVSKLTFKFFLAIFCSLIGAFLTFPGLRLAQMHLDALNLATEKITQILLHINFLAPLFMVLLWVKPITKDYIMNPPLGKESIPLMTEATFDTLRLWLIILLCALRLAMMRSHMQAYLNLAQKCVDQLKKEAGRISTVELQKMVARVFYYLCVIALQYVAPLVMLLHTTLLLKTLGNHSWGIYPETISSLPVDGGLPSNSVYPELPAADGKMKVTVTQITVALSSLKNIFSPLLFRGLLSFLTWWIAACLFSTSLFGLFYHQYLTMA	648748	571008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_572297_573717_573815_575052_575228_577822_577937_580733_580875_581370_581432_586336_586489_602595_602753_607184_607283_609540_609625_618908_619013_648636
676457	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_89121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653654	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
676468	contig_13300_pilon	-	2047	4	Intergenic	novelGene_125801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	28.4370650149882	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAGCAATATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248913	244131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_247547_247917_248071
676478	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676485	contig_14925_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_55087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	1555.7699661261	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	209	466	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDTKVIFGAGTRLRVQPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	33232	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_33176
676487	contig_7688_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_160397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88795	87044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7688_pilon_-_87000_88800
676488	contig_116_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_154891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2311	2721	78392	78802	NA	45	CTAATCAAGTAAACTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKGKQFGRLSLKYLLKSLPNYFSVGESIVLKNRSCRFKVSFDVPHNYGRASLPNLCHLSQFLTYLRGGLGEVLVLHQHKCQFCWKNNSKYVFCHFKSYAQPINFKYTGGVNYLRNYFCVTRISRLWVHFLSHGQ	76081	79045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_76100_79000
676495	contig_2323_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_151849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTGTTGTAAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113018	112714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_112700_113000
676503	contig_5217_pilon	-	1853	9	Intergenic	novelGene_135797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_4	107.157521317918	92	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	45	695	702107	687641	TRUE	10	GCTGATGCCTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANRQTRLNARIGKMKRRKQDEGQREGSCLAEDDAVDIEHENSNRFEEYEWCGQKRIRATTLLEGGFRGSGFVMCSGKENPDSDADLDVDGDDTLEYGKPQYTEADVIPCTGEEPGEAKEREALRGAVLKQVWAQAWVGVIKGWESLRPGFTQYPPSGLSHLSSGLTSSFLSSSFPLVEALPAHASRLSSLNGPVMQRCHPPATVRAASRRPCRRPARIATSRKSPKIQL	705308	685586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_686584_687315_687391_687554_687664_692311_692394_692523_692810_693013_693111_701508_701642_702077_702122_705278
676505	contig_7286_pilon	+	1153	7	Intergenic	novelGene_108715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	205	303	288412	288510	TRUE	10	GAGGACCTGCTTCTTCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286908	293142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288676_289112_289419_290757_290857_291315_291493_292020_292106_293124
676513	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676516	contig_5217_pilon	-	1814	11	Intergenic	novelGene_135799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_10	155.921422517882	110	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	40	891	705510	686512	FALSE	15	CAGCTGATGCCTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGHGVPLEQPPAAMPRARSGRRSRGAGGREETFLRVRANRQTRLNARIGKMKRRKQDEGQREGSCLAEDDAVDIEHENSNRFEEYEWCGQKRIRATTLLEGGFRGSGFVMCSGKENPDSDADLDVDGDDTLEYGKPQYTEADVIPCTGEEPGEAKEREALRGAVLNGGPPSTRITPEFSKWASDAEMPSTSNGESSKQEAMQKTCKNSDIEKITEDSAVTTFEALKARVRELERQLSRGDRYKCLICMDSYSMPLTSIQCWHVHCEECWLRTLGAKKLCPQCNTITAPGDLRRIYL	705549	685588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_686584_687315_687391_687554_687664_692311_692394_692523_692580_692722_692810_693013_693111_701508_701642_702077_702122_705278_705322_705456
676521	contig_14536_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_69266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13488	13232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_13200_13500
676524	contig_15063_pilon	+	1194	3	Intergenic	novelGene_14347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	236	1057	35271	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35035	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
676529	contig_5964_pilon	-	2778	5	Intergenic	novelGene_80366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	80.6628786989406	255	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	895	1401	116254	115748	FALSE	20	TGGATTGTGCCTTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFRVRTNPLKVMDMRKNSMLTHSLLKKRKLTIVISPMTVVNVEKRSARSHISLDIIKLIQARSLMNVSSVGKPFLRVHTLLHTRELILEKNLMSVTSVEKTSAISPPSLDIINFILERNPMNAWIVGNPTLRNHTSLSIRESIQEKNLMNVMNVGKLLLQSQSLCNM	129527	114370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_116633_122054_122151_128252_128312_128908_129199_129456
676533	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676549	contig_10951_pilon	+	495	4	Intergenic	novelGene_61619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3.2659863237109	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCTTTCAATTTCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130475	159705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_130664_159183_159306_159393_159537_159663
676551	contig_13464_pilon	+	2439	3	Intergenic	novelGene_125235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	4.5	240	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTATTTCCAAATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233068	245366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_233153_233717_233859_243152
676554	contig_8616_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_72596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1864	junction_1	624.06377879188	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	22	900	428707	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	428685	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
676561	contig_5423_pilon	-	2003	3	Intergenic	novelGene_85229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	88.5	487	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATATTGGAGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501367	497047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854
676562	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	52	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676563	contig_7728_pilon	-	1331	9	Intergenic	novelGene_64703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	356.697679239717	24	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	256	1068	736028	713693	FALSE	25	TTTTTCTAACTGATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	752188	713429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736064_751968
676566	contig_1244_pilon	-	1408	7	Intergenic	novelGene_37979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	873.02954321909	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	131	847	933681	923211	TRUE	35	CACATTTAAATGATGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPWTVLSVQFSSVYPQVPRYRWQTPAAKDQGQCRAEGHWQVDGYLSPGVRCSCHPYCRREVVPLLTAILISLVSFFRPSMLPRSSLMLKASCCYDRQPPNLAGPSTMVALPLCGGAVASSEGNVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	933811	922437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_922554_922765_923331_923428_923552_923726_923827_924210_924409_927036_927168_933636
676572	contig_14397_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_134647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82485	81107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_81100_82500
676595	contig_9363_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_6729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATTTTGCTATATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458053	1458768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1458100_1458800
676597	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	2	358	14434	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14367
676602	contig_3270_pilon	-	1998	14	Intergenic	novelGene_104453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	80.635933963425	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1914	85	1998	68067	50433	FALSE	60	AAAAAGAAATTTAAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEK	70786	50432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62391_62441_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68075_70709
676604	contig_12270_pilon	-	307	2	Intergenic	novelGene_114095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	27	305	14409	13908	FALSE	25	CACCATCAGCAGCTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14435	13905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676611	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
676613	contig_16934_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_132525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165875	167862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_165900_167900
676616	contig_5428_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_160410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCAAAAACCATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159533	157259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_157300_159500
676626	SIRV4	+	220	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1548	635	1093	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2548	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
676628	contig_12570_pilon	-	2357	4	Intergenic	novelGene_79376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.0891052899423	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	274	597	284107	283433	TRUE	25	TGAAGGGATTCTATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSRSQAEVSAWWSSRPCLCHGSAGCRLWQSCSGSSPSCFWLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	300324	279997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281009_282683_283699_284049_284255_300198
676630	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
676631	contig_14341_pilon	+	832	6	Intergenic	novelGene_111832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2243.00641104746	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	181	795	548758	551737	FALSE	5	GGGGTGGCCCCGCCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548646_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
676636	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_115999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
676638	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	228	-4	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGTGGCATATGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
676655	contig_10892_pilon	-	429	2	Intergenic	novelGene_116733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAAACCCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155705	20461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_20473_155287
676657	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676660	contig_18869_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_56390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73741	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
676665	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676670	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_18348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
676675	contig_6227_pilon	-	2291	3	Intergenic	novelGene_49807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	19.5	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	901	1422	1291269	1290748	FALSE	45	AAAGCTAGGCTATTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVEYLLCLT	1331884	1289878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1292061_1308695_1308751_1331830
676678	contig_5189_pilon	-	2117	9	Intergenic	novelGene_34834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1053.56216445685	1	117	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	19	978	247733	199237	FALSE	10	TCTCTAATGTTTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEIQNHSSSSLPTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_247694
676681	contig_5649_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_82277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTGTAGCCATGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94474	126931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_94599_126348
676682	contig_5649_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_82287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTTTTTTTGTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127692	129460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_127700_129500
676686	contig_7368_pilon	+	2077	3	Intergenic	novelGene_158803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	2.5	218	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	215	940	102624	104451	FALSE	15	CTTTTGTCAGGATATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRKKRSRRSQKAPLLFHQQPLEGPKHRCGSPQLRISRTRQVPSKPIDHNTITSWVLPQFDTTAQSCFQVYRKRHHQDQARHSSRKSTTSKFPQLTFESPQSSSSSVTLGIPLIREPPKQSEKDISRTPLVPILSSQSYGELSVHTLQSPPYVFIPPDIQTPGSSSVKETPISPDQKENRLPGCALHTSIPKSPEPGPILVKDTPQEKYGIKVTWRRRQNLLACLRKRGKLSRSQFLVKN	98549	105588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_98680_102539_102792_103893
676693	contig_11126_pilon	+	2548	14	Intergenic	novelGene_138103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	79.4277610836994	285	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	834	2189	137800	193136	FALSE	45	AAAAGGATATATTCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQTLKATFQYKPQNTDELNLSPGDYIFVDPTQQKEASEGWVIGISRWTGCRGFLPENYTERANESDTWVKHRTYTFSLAMDLNSRRDGEASSRRNGEFHPPQTSRSLSSVQALQATILRRSVLVVRHGERVDQIFGKSWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRRNGIKDFENDPPLSSCGIFQSRLVGEALLDSGIRITSVFVSPALRCVQTAKHILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEVGKNIPTLMTLEELKEANFNVDANYRPAFPLSSLIPAESYEEYVQRCSASVERITSICSQDLGVTVVISHGSALDSCTRPLLGLPPRESGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENTKEGKWELVDPPVKTLTHGSNSAFNWRNWILGS	117711	193495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121539_133274_133430_137634_137834_143405_143576_145083_145293_158694_158822_162964_163065_167736_167860_169695_169789_187422_187568_187870_187978_189682_189793_192998
676702	contig_20550_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_142618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAACCACTGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11046	10006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_10000_11000
676703	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676704	contig_2444_pilon	-	1733	6	Intergenic	novelGene_83781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	95.6564686782865	194	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	310	897	262092	245651	FALSE	25	GTTACTTGGTTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTLPLHTSVVPKEIHARTFFKITAPLINKRREYSERRILGYSMQEMYDVVSGVEHYKHFVPWCKKSDIISKRSGYCKARLEIGFPPVLERYTSVVTLVKPHLVKASCTDGRLFNHLETIWRFSPGLPGYPRTCTLDFSVSFEFRSLLHSQLATLFFDEVVKQMVAAFERRAYKLYGPETNIPRELMLHEVHHT	279866	244814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_245819_247146_247249_254209_254403_261967_262118_272581_272671_279671
676707	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_94105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657833	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657835	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
676710	contig_6287_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_160434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAGGAAATTTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189880	191386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_+_189900_191400
676711	contig_14176_pilon	+	2317	13	Intergenic	novelGene_74840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGCACGGGCGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224808	232494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_225464_226900_226958_227104_227243_227656_227734_228428_228652_228927_229055_229151_229257_229406_229637_229735_229915_230200_230316_231183_231369_231790_231966_232443
676712	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676715	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	23	346	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14431	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
676719	contig_6842_pilon	-	1745	1	Intergenic	novelGene_130795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCCTCTGCTCTATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476602	1474857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1474900_1476600
676730	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_95698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676735	contig_6589_pilon	+	668	4	Intergenic	novelGene_25802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	2097.78841216702	1126	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	20	382	669670	672560	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSPAAMSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTRAGGKCSLLEGPP	669650	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_669748_670000_670104_671046_671188_672519
676739	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
676742	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676752	contig_7202_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_18386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27638	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
676761	contig_15991_pilon	-	868	6	Intergenic	novelGene_70872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	20	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	11	799	105009	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105019	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
676762	contig_8354_pilon	-	2516	22	Intergenic	novelGene_24107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	102.526319833023	1	66	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	49	2061	327570	256751	TRUE	75	GGAAAAAGAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRYTALPGRRASAGAAMITSAAGIISLLDEEEPQLKEFALHKLNAVVNDFWAEISESVDKIEVLYEDEGFRSRQFAALVASKVFYHLGAFEESLNYALGAGDLFNVNDNSEYVETIIAKCIDHYTKQCVENADLPEGEKKPIDQRLEGIVNKMFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQCLIFLDDPQAVSDILEKLVKEDNLLMAYQICFDLYESASQQFLSSVIQNLRTVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEKESESMETEEKTVSALVGKTPEASPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAATLMMMSEGQQWNLLGSFCSGPLNSARVLFRYCQRVTTLMCVTELQWPWGSAALVQETRRQLIC	327618	231418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_231463_232863_232957_240651_240807_247603_247669_256652_256770_259837_259953_296384_296446_297453_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296_307426_308574_308636_312425_312653_315101_315246_317291_317498_320772_320943_321129_321204_322339_322384_327554
676763	contig_15063_pilon	+	1492	4	Intergenic	novelGene_14131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	178	1350	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34630	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
676765	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676766	contig_6272_pilon	-	2891	1	Intergenic	novelGene_160466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2113	2499	583964	583578	NA	70	TTTAAAAAAAAACAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGRSLHGLRPLPCPGKCHKALLALSIRAWRHLILAASFLPKGTQLSSSVGREAHHTVSWWSLLVVSPAAVSLPPPIAIFSVTTLSLSSSPSVSWFQELVSAGIPGPKGSVLGCSSLVVVGSSLSCL	586076	583185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_583200_586100
676771	contig_15063_pilon	+	881	4	Intergenic	novelGene_13710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3951.08955437189	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	202	762	34808	39651	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPRPAFPDHLCCTLYVFLGFEL	34606	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_35872_39582
676778	contig_4364_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
676779	contig_3602_pilon	-	1643	11	Intergenic	novelGene_60656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	286.835510353931	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	134	847	1123679	1107817	TRUE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSGAGALTGPLPDPFVHLALELGMSLGGADGLRSATHLKRSC	1139376	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108574_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
676781	contig_12414_pilon	+	1365	2	Intergenic	novelGene_59576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	42	839	370898	374054	FALSE	30	GATAAACTTAGTGTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSHRGVEEQAVTMDGISFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370856	374580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373271
676784	contig_12786_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_103426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1418	junction_3	78.7626533044409	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	490	1095	600902	590909	FALSE	15	TTGTCCAGAATCTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	601391	590856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793
676786	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_89241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
676790	contig_1443_pilon	-	2102	10	Intergenic	novelGene_28283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	340.915687777549	3	103	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	511	1086	776427	749336	TRUE	25	AAGAACCTGGTTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKCMR	809526	747978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749343_750365_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_789176_789314_805505_805718_809399
676795	contig_6557_pilon	+	2058	4	Intergenic	novelGene_33033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	88.7280489285472	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	75	431	637549	638944	FALSE	20	TGGGTAGTAGGATTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSGLVPSRFLTLLAHLVVVITLFWSRDSNIQACLPLTFTPEEYEKQDIQLVAALSVTLGLFAVELAGFFSGVSMFNSTQSLISIGAHCSASVALSFFIFESWECTTYWYIFVFCR	637474	640571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_637636_637821_637890_637991_638093_638843
676803	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676809	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_19050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
676811	contig_12250_pilon	+	1938	16	Intergenic	novelGene_80551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	71.5625600436429	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	216	1334	272853	276000	TRUE	10	CCTGCTGCCTCTGCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNCTCLQILCPQPSPALHPVHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWAARKAGAGTWPWMSSYSGVSCRWRSLRCYSPNLNPVRSCRSWSLRTNGACSPSSC	272488	278473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_274040_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
676821	contig_9177_pilon	-	3575	1	Intergenic	novelGene_32760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	2006	2431	1310223	1309798	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAAACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNNNWNRKNYRLKPWNGRLGRGVVSSFRSLMWEIGLLAGLWSVTYVQSSVVGHHLCVGHLCFQVCSKSNEARDLVAMQHVRCPCFLRERFDFQQGFDPYFFPFQSTQILKIRVCSSFPSSTMTEPGRSGLKPREILENKQ	1312228	1308653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1308700_1312200
676822	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676823	contig_2689_pilon	+	2521	1	Intergenic	novelGene_100845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGATTCCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298935	301456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_298900_301500
676825	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676827	contig_12005_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_160472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTGACTCATTGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187213	186412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_186400_187200
676837	contig_11304_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_156693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317839	319354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_317800_319400
676840	contig_10399_pilon	+	2425	12	Intergenic	novelGene_114492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	132.361138837576	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	20	1297	350005	370791	TRUE	15	TGGGACCTTCGTTTGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAEGSAGRQSELEPVVSLVDVLEEDEELENEACAVLGGSDSEKCSYSQGSVKRQALYACSTCTPEGKEPAGICLACSYECHGSHKLFELYTKRNFRCDCGNSKFKNLECKLFPDKAKVNSGNKYNDNFFGLYCICKRPYPDPEDEIPDEMIQCVVCEDWFHGRHLGASPPESGDFQEMVCQACMKRCSFLWAYAARLAVTKISAEDDGLVLNVDGKGDQEVIKTENGDHQDSILKEDVPERGKDAIKDIKAEQTSEPCTSSSSESDLQTAFKNQSLNTESQSGCKFQELKAKQFIKKDTATYWPLNWRSKLCTCKDCMKMYGDLDVLFLTDEYDTVLAYENKGRIDQASDRRDPLMDTLNSMNRVQQVELICEYNDLKTELKDYLKRFADEGTVVKREDIQQFFEEFQSKKRRRVDGMQYYCS	349985	371958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_350155_352534_352669_353146_353208_354087_354184_360424_360479_360706_360813_362055_362265_362422_362573_363084_363248_364274_364337_370698_371566_371604
676842	SIRV5	-	257	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
676848	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
676864	contig_6445_pilon	-	1750	11	Intergenic	novelGene_77127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	169	504	1489200	1488660	TRUE	10	CGCCGCCGCCGCCCAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRGPTLPLLPILPSGSRLSQEGQYTVPEDCQRHLAALLLSPFLLLATKIQVLSACQGCTPQLDDQGQGQEGVSLPTLSSWVTNRQVAGLHPDSPAQARTGRGLGGGLLS	1489368	1470226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1470356_1475864_1476008_1476814_1476945_1481291_1481426_1481643_1481738_1483951_1484019_1486455_1486561_1487367_1487468_1487984_1488227_1488557_1488810_1489014
676872	contig_8729_pilon	-	979	4	Intergenic	novelGene_40076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	775	junction_3	414.769815680939	7532	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	253	693	73296	69771	FALSE	20	GATGTGGTGTCTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPASRSPQMRAAPRPAPVAQPPVVAPPSAVGSPAAAPRQPGLMAQMATTAAGVAVGSAVGHTLGHAITGGFSGGSNAEPSRPDITYQEPQGAQPAYEQQQQQQFGPCHYEMKQFLECAQNQSDLKLCEGFSEVLKQCRFANGLA	73548	69484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_69782_70467_70631_71387_71638_73279
676878	contig_11363_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_160491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATATTTCTCTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161794	161489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_161500_161800
676880	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
676887	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676889	contig_11145_pilon	-	891	7	Intergenic	novelGene_160520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	405	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	116	889	215710	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284087	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
676891	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
676896	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_98117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTCGTCCCCCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676900	contig_15293_pilon	-	2313	2	Intergenic	novelGene_146521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	94933	94628	TRUE	10	GTTTGCCAGAGCTGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLGTPGPFSLGLQPGPCGITWAEIISLEGWKKSESPRLSPTGRSPVWLHLGSVCLRGSLRKPHLPRPLQGAHQRQLAVPSELENALPSPGLVQGVSCYGL	94933	92216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_92401_92804
676904	contig_19076_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_74219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128412	126505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_126500_128400
676915	contig_9424_pilon	-	1084	4	Intergenic	novelGene_143774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1715	junction_3	1522.66695855222	2063	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	446	781	279584	277512	FALSE	5	CCTGTTCGTGTTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280480	277208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552_279629_280079
676920	contig_10733_pilon	-	989	8	Intergenic	novelGene_109965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	50.5552839443503	2242	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	99	716	299663	296615	FALSE	5	TCGGTGCAGCTTGTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLVLLYSGVSVAFWATMLVVGTCYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGGVKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFTATNPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLCNLFCGVCVGIVGSGAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQTSRVKMGD	299761	296341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_296642_297291_297483_297867_297920_298037_298108_298312_298391_298518_298603_298831_298881_299596
676925	contig_18869_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_56015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73530	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
676929	contig_6102_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_32186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTTGCAGAACACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891716	892826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_891700_892800
676930	contig_8322_pilon	-	2481	1	Intergenic	novelGene_143257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCTCTCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306718	304237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_304200_306700
676931	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676932	contig_11989_pilon	-	2637	1	Intergenic	novelGene_68455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGGAAGGAGACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85948	83311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_83300_85900
676934	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_98082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
676943	contig_7188_pilon	-	2893	24	Intergenic	novelGene_108526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	87.761189970444	215	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	597	2741	142728	95694	FALSE	40	GAATCTAGTGAAAATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLDMVCMDPLVDENDDILNMVIVIHSLLDICLVISSIDSAFHANTWKFIIKQSLKHQSVIKNQLKHKDIITSLCEDILFSFHSCLQLAEQMTQSDTQDNADYRLFHKTLKLCRFFANSLLHYTKEFLTFLSDSCCTLHQLYLQVHSKLPPSLYATTISKAQQEEIAGAFLVTLDPLITQLLTFQPFIQVVLDSQLDLPCELQFPQCLLLVAIMDKLPSQPEDVQVLWCTEGQLSEATARVSLLKAIFYSFEQCSGELSLPVRLQGVKTKGQAQVAVTLYQHVCVHLCTFIASAHPSLFPELDAALLNAVLSTKMITSLLAMDAWCFLARYGTAEICAHHVTIVAHLIKSCPGECYQLTNLSILLRRLFFFMAPPHQAEFIQKFSPKEAENLSLWQYISFQALSADLRKQTADEVTRTGTTQCREWLSSGRTLGELESLNTALSALLTVCNSAGEALDIGQQTEITEVGSQLWAFLNKQVTGQPYVQQTFSLLLPLLGFFIQTLDPQLISQVLTLQTSLLKLEPPDHACLAVLDFVSSLGKLFIPQAIQDKILPNLSCIFALLLADRNWLLEQHTLEAFTLFAEGTNHEEIVPQCLSSEETKNKVVSFLEKTGLIDETDAARVERVKQERGIFSEPFVKVTAEEARWSSLQPCAKRARHEPPLEEEYRAAVQTAAGALEAIELLLQKSPAPDWLLMKMEVLQGKIQKLKRCSL	150964	95541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_95883_96717_96838_97866_97948_98777_98883_103531_103646_107538_107635_108800_108921_110232_110419_116646_116737_118458_118511_118866_118950_119795_119983_121158_121289_121556_121706_126169_126235_132550_132632_138282_138422_141087_141173_142655_142785_143595_143737_144252_144358_145966_146056_147049_147091_150800
676953	contig_12654_pilon	-	1423	11	Intergenic	novelGene_129300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	463.664803494939	355	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	239	946	764461	759069	FALSE	10	GTCTTTGCTTTCTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWLQRCWAGIASSPSSWPRPPAAPWRSTYRRGQKTAEDRCIPLLDQREIILFNIFYEFFTICTSIVTEDKEGHLLHGRNMDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788134	758591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_775941_775989_788041
676954	contig_1618_pilon	-	1498	6	Intergenic	novelGene_141792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	344.904624497846	393	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	96	890	353751	317189	FALSE	30	TGAAAACTGCCTCCTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPGGGRRRRAEVASGELPDVEKLGRRRGRKMDSVEKGATTSVSNPRGRPSRGRPPKLQRNSRGGQGRGVEKPPHLAALILARGGSKGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRE	353846	316580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
676958	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_96003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
676964	contig_12528_pilon	+	2061	2	Intergenic	novelGene_81282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256979	260932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_258002_259893
676965	contig_13305_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_146771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68764	68100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_68100_68800
676966	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
676969	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676973	contig_16594_pilon	-	1459	4	Intergenic	novelGene_53897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	314.023353696292	520	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATATCAGCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306574	240028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_240137_242309_242430_272662_273670_306350
676977	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_97860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
676984	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
676987	contig_5280_pilon	+	2339	8	Intergenic	novelGene_52617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	769.504558340055	2	111	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	17	547	38385	42929	TRUE	15	TGCATATTGCTTCATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVQISWCDF	38368	79495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41774_42902_42989_47324_47500_56299_56392_78029
676988	contig_14322_pilon	+	2228	11	Intergenic	novelGene_115630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	120.692543265937	418	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	559	1008	246326	249230	TRUE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALSSLNKHSEAVAHYRRALELDPDNETYKSNLKIAELKLREVPSPTGSVGTFDIAGLLNNPSFMSMASNLMNNPQVQQLMSGMISGSPNPLGTPGTSPPQNDLASLIQAGQQFAQQMQQQNPELIEQLRSQIRSRTPSASNDDQQE	240173	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_240312_240814_240922_241243_241356_244262_244363_246224_246331_246654_246794_247065_247129_247603_247642_247920_248011_249115_249238_251058
676994	contig_12638_pilon	+	1735	11	Intergenic	novelGene_33236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.1915312940997	9	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	159	1682	737593	764546	FALSE	5	GTCCATTGTGTCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737172	764599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737323_737584_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750630_751923_752021_753484_753610_759266_759412_762088_762211_764045
676995	contig_17074_pilon	-	1616	8	Intergenic	novelGene_145149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	170.022447497562	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	633	1253	249384	246351	FALSE	20	CTTCACTCTGCAACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQPIPLKLSAAKGKKPSKQRSIEGPGSSSETPSHVPENHTKPKASKGTKQEETFSKDTGNPGAKGKRGKAATGRKKQRAPSSSEETGKGEEQQENQRKRRGRERHMTSRVSYKEESGSDKANSDSDFELSSGEAHSPSDEDSDPDFLRQKRAPAPKRTKAGSKSDSQTSRQSCPNPAASSSSSSNKRVSDKTPGPAFAHCHWHI	264409	245987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_246404_247971_248498_249342_249433_257668_257790_258271_258430_260175_260265_261810_261935_264317
676999	contig_10235_pilon	+	2231	5	Intergenic	novelGene_46433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.824626938253	1	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3	515	210473	211834	TRUE	50	ATGAGTGAATGAAAACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPNHGPGSAAVAALRNSRGPEGPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSSPSLSSVPPT	210470	213683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210722_211046_211193_211285_211800_211924_212056
677010	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGCAGTATATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
677016	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
677019	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_95107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677021	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73594	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
677022	contig_7521_pilon	+	847	2	Intergenic	novelGene_160548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATTAAGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298073	383702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_298761_383542
677024	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677044	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677049	contig_7411_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_137030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	81	386	362532	362837	NA	25	TTTAGAATCAGCTACCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCSSPLIHSPSFLWSARVLSASGGAGAALGAGMRQWTGDGELTCQRGRQKKISKRCTLPDGEESKQERVMGRCTGEVTPEPTPEDEKEPPWEDLGGYIG	362451	364046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_362500_364000
677050	contig_7411_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_137032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	385	774	364381	364770	NA	15	CTCTCCATTTTTATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQTNICSASDGSSQAIFTCPERPGRHTRTEPPGWQKVPGTAKENTCESDSPLGSGRYPTHLPSTPLTLISLSCGRRGSLSKAHLCLCSECYPACLFRDSTPQNCLSFLPIPQAAPHLHLKMVTLLLA	363996	364987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_364000_365000
677051	contig_14895_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_106700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATATAATGCTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182710	182090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_182100_182700
677061	contig_15087_pilon	-	1288	12	Intergenic	novelGene_37170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_3	171.978232333904	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	27	758	134824	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	134850	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811
677071	contig_8310_pilon	-	1943	5	Intergenic	novelGene_75606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCCAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328433	315874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320710_324736_324847_327786
677072	contig_6129_pilon	-	2742	16	Intergenic	novelGene_159959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	33.4998507459362	23	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	321	2345	71114	1908	FALSE	45	AAATATTAATGCGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGVVPEQPQNVSCIQKGEHGTVACTWDRGRDTHLYTAYTLQLNGPKNLTWQKQCTDHYCDHLDLGINLKPESPESSYTAMVTAINRLGSSSSFPSIFTFLDIVKPLPPWDIRIKFLNASVRRCTLHWRDEGMVPLNRLKYRSIDGGSWNMVNVTNAKGKHDLLDLKPYTEYEFQIASKLHLHKGIWSDWSESLRTQTPEEEPTGMLDVWYMKQHINYNKQQISLFWKNLSVSEARGRILHYQVALQEVAGGKVTLQNITEHTSWTWVIPRTGSWTATVSAANSKGSSLPARINITDLCGAGLLAPHHVSAHSEGVDNMVVTWKPPGKAVQEYVVEWRELHPEGSTQPPLNWLRSASSSVSALISENIKPYVCYEIHVYALSGDQAGCSSIWGSSKHKAPLNGPHIHAITEEKGGILISWNRIPAQEQMGCILRYRIYWKERDSDSQPQLCEIPYRISQNSHSINSLQPRVTYILWMTALTAAGESPRGNEREFYLQGKANWSAFVAPSICIAVITVSIFSVRYFRQKSTILTLASILKLTSWSNGCRNYNYKKKRGRCPHFLFKELSRSHS	74165	1510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_2044_2687_2779_5038_5177_11727_11887_11976_12076_17221_17414_30500_30721_43587_43668_57707_57859_59140_59284_60543_60729_61675_61791_68775_69064_71086_71199_73242_73293_73979
677073	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677075	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_97675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677080	contig_10311_pilon	+	1594	10	Intergenic	novelGene_50469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTAGGATACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65233	69949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65694_65770_65920_66643_66756_67182_67260_67490_67592_67831_67961_68263_68407_68641_68754_68868_69038_69807
677081	SIRV4	+	283	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	247	420	247	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACTTTCCACTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702	2351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
677083	contig_9195_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_155678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACATAGCATATAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281872	280852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_280900_281900
677084	scaffold_12510_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_151409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCACAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621036	621666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_621000_621700
677085	contig_2310_pilon	-	2657	7	Intergenic	novelGene_71603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1453	1812	123283	122924	TRUE	35	AAAGGCGAAACGAGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISVTAGSAFGQQTAKPRSSNISSQLAFIPNHQRRAAAQCLRDGDSSPPPVLSPHLEQGASTGYSQAVAISRTALTSTRVHLQLTVDVGLVHQGMKDIEDTVNIPDFWIGTKEVNLLL	124735	106065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118428_122874
677086	contig_7151_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_40699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	263	580	28797	28480	NA	15	GGCAGTTTCCCTTTCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNQLDGNGFGFGLVELFLYVWCEALFCIKLVQVEVKGIPLSKPDKNLCICVQLQGAGQVWDSGRSIYISYAERTKELWAKCSESQGFPSSAVTRKDSLSLFSF	29059	27785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_27800_29100
677098	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	66	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677100	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677101	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
677104	contig_6710_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_89143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653675	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677108	contig_5023_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_7116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCCTGCAGAGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110553	112448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_110600_112400
677109	contig_6062_pilon	-	1272	8	Intergenic	novelGene_5249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	164.509661027639	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	218	1111	569670	541389	FALSE	25	CTGTGTCATAAATTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598215	541227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597863_597929_598135
677110	contig_1337_pilon	-	2236	13	Intergenic	novelGene_84242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.6935101219388	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	228	1580	450056	428635	TRUE	30	GCAACACCTGCAGTCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKKRNTPHRGGSGGGGTGAAAATAVAAGSQHRNVQPFSDEDASIETMSHCSGYSDPSSFAEDGPEVLDEEGTQEDLEYKLKGLIDLTLDKSAKTRQAALEGIKNAMSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGKSDEQCAAAALACVLCIQLGPGIESEEILKTLGPILKKIICDGTTSIQARQTCATCFGVCCFIATDDITELYSTLECLENIFTKSYLKEKDPNGICSTPTTVLHISSLLAWTLLLTICPINEVKKKLEMHLHKLPSLLSCDDVNMRIAAGISLALLFELARGMDNDFFYEDMESLTQMLRALATDGNKHRAKVDKRKQRSVFRDILRAVEERDFPTETVKFGPERMYIDCWVKKHTYDIFKEVLGSGMQYHLQSNEFLRNVFELGPPVMLDAATLKTMKISRFERHLYNSAAFKARTKARSKCRDKRADVGEFF	450283	427692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_428322_428607_428725_431514_431611_432042_432172_434959_435095_439321_439431_439518_439698_439779_439831_442539_442698_444397_444523_445308_445394_445524_445630_449965
677111	contig_5479_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_133577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATAAATTCCCAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155005	155305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_155000_155300
677114	SIRV7	-	292	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91632	2	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
677127	contig_5463_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_144778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43373	41169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_41200_43400
677150	contig_3233_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_56586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTAGTAATACTGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748033	749338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_748000_749300
677151	contig_14030_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_62249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGAGAAAAACCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380682	381551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_380700_381600
677158	contig_3975_pilon	+	2821	11	Intergenic	novelGene_54764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	98.8150292212677	6	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	230	1303	1968046	1984755	FALSE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961322	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965912_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722
677160	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677175	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677176	contig_16121_pilon	+	2003	5	Intergenic	novelGene_6852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.590613765258	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	122	1492	57782	62826	FALSE	20	TCTGTAGTTAAATGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	63337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33713_57776_58202_58867_59396_60693_60856_62565
677177	SIRV7	-	369	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-22	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114760	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56095_70883_70988_78841_78964_114680
677181	contig_12644_pilon	+	2038	8	Intergenic	novelGene_44443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	303.762796824585	946	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	141	890	335374	375164	TRUE	0	TTTTTTTGGGGGTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDKRIHLELRNRTPSDVKELVLDNCRSIEGKIEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSVANLPKLNKLKKLELSDNRISGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDLFNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYDEDAQVVEDEEDEEEEEEGEEEDVSGEEEEDEEGYNDGEVDDEEDEEDLGEEERGQKRKREPEDEGEDDD	335233	376353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_335428_367593_367744_367994_368118_370700_370900_372113_372212_374741_374806_375102_376037_376077
677182	contig_6888_pilon	+	3150	18	Intergenic	novelGene_147057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	76	junction_17	106.15311784901	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	86	2479	5189	72602	FALSE	65	TTTTATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRQQLQCCPCAAPLPRRAAHCCHGGTKMAALAYNLGKREINHYFSVRSAKVMALVAVLLLAACHFASRRYRGNDSCEYLLSSGRFLGEKVWQPHSCMMHKYKISEAKSCLIDKHIAFIGDSRIRQLFYSFVKIINPQFKEEGNKHENIPFEDKIASVKVDFLWHPEVNGSMKQCIKVWTEDSVAKPHVIVAGAATWSIKIHNGSSEALSQYRMNITSIAPLLEKLAKTSDVYWVLQDPVYEDLLSENRKMITNEKIDAYNEAAVSILNSSTRNSKSNVKMFSVSKLIAQETIMESLDGLHLPESSRETSAMILMNVYCNKILKPIDGSCCQPRPPLTLMQKLAACFFTLSIIGYLIFYIIHRNAHRKNKPCTDLEGGEEKKNIMNIPVSPLEILLQSFCKLGLIMAYFYMCDRADLFMKENKFYTHSSFFIPIIYILVLGVFYNENTKETKVLNREQTDEWKGWMQLVILIYHISGASTFLPVYMHIRVLVAAYLFQTGYGHFSYFWIKGDFGIYRVCQVLFRLNFLVVVLCIVMDRPYQFYYFVPLVTVWFMVIYVTLALWPQIIQKKANGNCFWHFGLLLKLAFLLFCICFLAYSQGAFEKIFSLWPLSKCFELKGNVYEWWFRWRLDRYVVFHGMLFAFIYLTLQRRQVLSEGKGEPLFSNKVSNFLLFISVVSFLTYSIWASSCKNKAECNELHPSVSVVQILAFILIRNIPGYARSVYSSFFAWFGKISLELFICQYHIWLAADTRGILVLIPGNPMLNIIVSTFIFVCVAHEISQITNNLAQIIIPKDNLSLLKRLACIAAFFCGLLILSSVQDKSRH	5103	73273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_5322_16178_16276_17088_17210_27315_27361_28380_28444_33314_33360_33781_33906_43521_43737_45982_46406_47403_47494_58955_59076_60099_60257_61662_61743_63995_64098_65627_65769_66328_66407_70369_70463_72335
677183	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
677184	contig_15327_pilon	+	2131	19	Intergenic	novelGene_70501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	10.4623074196474	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	55	2025	427355	445997	FALSE	15	GAGTCCAGCCAGGGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELDGEPIVTSIPGVNSKKKQLCFDWGPGEMLVCETLFNKKEKSEAVPGCPFIYIIRKDVDVYSQILRKLFNESHGIFVGLQRIEEELTGKSRKAQLVRVSKNYRSVIRACMEEMHQVAIAAKDPASGRQFSSQVSILSAVELIWNLCEILFIEVAPAGPLLLHLLDWVRLHVWEVDILSAEVLGSENPSKHERFWNLVTILVLQGQLDEARQMLSKEADASPASAGTCKVLGDLMRTMPILSPGNTQTLTELELKWQHWHEECERHLQDGTFASSPHLETLCKIMLGDEEALLGQKELLSNWYHFLVTRLLYSHPTVKPTELHFYAQSSLDLFLGGDSSPEPLDNILMAAFEFDIHQVIKECSIALSNWWFVAHLTDLLDHCKLLQSHNLYFGSNMREFLLLEYASGLFAHHSLWQLGVDYFDHCPELGRVSLELHIERIPLNTEQKALKVLRICEQRQMTEQVRSICKILAMKAVRNNRLGSALSWSIRAKDAAFATLVSDRFLRDYCERGCFSDLDLIDNLGPAMMLSDRLTFLGKYREFHRLYGEKRFVDGASLLLSLMTSQIAPRSFWMTLLTDALPLLEHKQVIFSAEQTYELMRCLEDLTAGRPGHGEPDGQGVQDDDIETTKVEMLRLALARNLARAIIKEGSLEGS	427300	446103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_427388_430560_430655_432411_432575_433557_433629_434459_434504_436289_436360_437492_437615_438050_438186_438266_438390_438601_438734_438943_439051_441749_441834_442048_442115_442316_442469_443233_443352_443433_443535_444967_445120_445425_445528_445895
677185	contig_14041_pilon	-	1869	13	Intergenic	novelGene_144026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_11	27.0630693422277	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	178	1437	80924	26842	FALSE	15	TGTGGGCTTATATTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKHQKPVLTGQRFKTRKRDEKEKFEPTVFRDTLIQGLNEAGDDLEAVAKFLDSTGSRLDYRRYADTLFDILVAGSMLAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVVLYIKEEMKRNDLPETAVIGLLWTCIMNAVEWNKKEELVAEQALKHLKQYAPLLAVFSSQGQSELILLQKVQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKADVLSEEAILKWYKEAHVAKGKSVFLDQMKKFVEWLQNAEEESESEGEEN	104560	26409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_26871_30653_30777_41195_41335_42583_42731_44660_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73055_73233_80866_80932_101534_101625_104480
677186	contig_20641_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_52775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCACCTCTCCTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5628	3707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_3700_5600
677187	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677188	contig_7839_pilon	+	1987	11	Intergenic	novelGene_45729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	429.445235158105	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	840	1148	1987	955026	956623	FALSE	45	GAGGCTGACAAGAACGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKA	950914	956623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953603_953754_953917_954047_954243_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428
677196	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
677197	contig_20819_pilon	+	2438	8	Intergenic	novelGene_55633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	586.835303530205	1	106	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	289	1236	30450	41330	TRUE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEASPGPP	29796	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30389_30643_40122_40522_40867_41203_41309_41400_41530_41569_42519
677199	contig_12050_pilon	+	1727	6	Intergenic	novelGene_62644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	181.388423004336	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	884	1213	362575	363452	FALSE	5	CTTGGAGCCCTCTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	359551	363966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362686_362766_362817_362918_363046_363410
677211	contig_11088_pilon	+	1188	3	Intergenic	novelGene_85053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	25	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	563	991	17314	17742	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	14665	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_16250_16348_17119
677220	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677234	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_94818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677244	contig_18869_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_55999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTGTTCAGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73545	73294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
677245	contig_12074_pilon	-	1407	10	Intergenic	novelGene_53742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	491.070259738869	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	15	1289	45831	30091	FALSE	15	TATTTAATGCCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALQEVEVKVDGGEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFSSDTRREMRN	45845	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30127_33353_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_45769
677246	contig_5018_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_47208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTACACCGGAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623992	1623610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1623600_1624000
677258	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677261	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677262	contig_6589_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_25965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACGTCAACCTCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296048	1296271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
677265	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_93706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677271	SIRV6	+	355	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10393	2	1243	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
677272	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
677277	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
677278	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_96605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677282	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_95826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653776	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677298	SIRV4	+	335	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1436	632	981	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2436	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
677301	scaffold_19766_pilon	+	2674	14	Intergenic	novelGene_34420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	145.237532437047	1	120	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	83	1678	843870	848686	TRUE	20	CACCACCTTCTAATCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKDYTLEKEKAKKFLQEFYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLR	843787	851574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_849045_849980_850150_850925_851036_851215
677306	contig_13547_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_104901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACAAAGCAAAATCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238480	240218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_238500_240200
677314	contig_8617_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_73394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62283	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
677341	contig_2069_pilon	-	717	3	Intergenic	novelGene_23479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	52	333	1509802	1508747	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509853	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
677349	contig_15123_pilon	-	2586	12	Intergenic	novelGene_110914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	176.139454518335	214	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	185	2275	227392	217521	FALSE	10	TCGCCCTTTAGTGCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQALSALQLEHTSTQALVSELLPVKHLCQQLQAEQAAAEKRHREELEQSKQAAGGLRAELMRAQRELGELVPLRQKVAEQERAAQQLRAEKASYAEQLSMLKKAHGLLAEENRGLGERANLGRQFLEVELDQAREKYVQELAAVRADAETRLAEVRQEAQNAARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEELSKKLADHDQASKMQQQKLKAQGSESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHYKLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRGLEQLQKENKELRAEAERLGQELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLAITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPVSQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKAKH	227576	217209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_217920_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219374_220063_220293_221228_221476_222752_222911_223020_223240_223326_223438_224870_224940_226981
677356	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_93447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677359	contig_11932_pilon	+	1780	3	Intergenic	novelGene_85401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	312	1283	241177	243522	FALSE	40	TCTTAATATAAAGGACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	238248	244019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_238346_240962_241732_243105
677362	SIRV7	-	382	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-30	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114768	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
677368	contig_9733_pilon	+	949	4	Intergenic	novelGene_160573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_2	213.582666795683	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	3	611	7658	12785	FALSE	20	TTTTGGGACGCTGAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIISLSMNSECNTPSKPTLESFNLELAAPKTPKAEQEELFSPGSTLPEVKLRRSKKRSKRGSVVFADEKAAAELELKRLSRKHEFMSDTNLSEHAAIPARTSVLSEMSFASQSMPTIPGLTFSVAGGPGLDEVSTSSRLSQTFLHLLDGDKKTLKRKKVNQFFKTMVRSQMGGRKGRCWEEEGREQDTKSRKWSEPSSVCV	7655	13123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_7723_9171_9344_10827_10949_12534
677369	contig_9797_pilon	+	1455	5	Intergenic	novelGene_65591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	440.017613283832	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	3	674	172546	191368	FALSE	5	TGGAGTTCTGCGTTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYPYGQGCPGAAGQAPGAPPGSYYPRPPPRWRAVWKRGTPWWRLWGSCTWGALWTTSWWRTLWTWGTDLCISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172543	192149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183874_188650_188734_189277_189422_191138
677370	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677377	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	658186	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658188	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
677378	contig_6102_pilon	-	2562	4	Intergenic	novelGene_32397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAGTGTAAGACAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788919	1782753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1782945_1785535_1785633_1786296_1786395_1786743
677380	contig_3727_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_146732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGTACGTAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300504	299890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_299900_300500
677383	contig_11370_pilon	+	1670	8	Intergenic	novelGene_98750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	59.0409750486379	285	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	451	1299	154251	155741	FALSE	25	CCCCCAAATCTGGAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	152553	156112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153003_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
677387	contig_7272_pilon	+	1528	11	Intergenic	novelGene_25360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGCCTGATCCGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604464	633134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_604614_604748_604812_604920_605071_606906_607027_609183_609235_609832_610304_616547_616618_617514_617708_620501_620566_632103_632193_633026
677388	contig_3774_pilon	-	1308	10	Intergenic	novelGene_142044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	144.077911021934	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	670	1116	175510	144743	FALSE	5	TGCCTGTGTGTTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210580	144550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
677395	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677396	contig_401_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_42775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079020	1080521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1079000_1080500
677399	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677404	SIRV6	+	400	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10348	2	1198	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
677418	contig_17440_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_7672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3653	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
677422	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
677425	contig_1666_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_160581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651281	653639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_+_651300_653600
677428	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677430	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
677432	contig_8617_pilon	+	136	1	Intergenic	novelGene_73491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTATAGGATTATCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63446	63582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63400_63600
677433	contig_14322_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_116405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671578	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
677442	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677450	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_93426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677459	contig_11003_pilon	-	2081	15	Intergenic	novelGene_105408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	92.1767379570798	227	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	37	1803	27839	13005	FALSE	20	ATTCTGTGTTCATGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRSFGGDVSWDKSLCIGATYDITDSCITHQIVDRPGQQTPIIGRYYVQPQWVFDSVNARLLLPVEDYFPGVPLPPHLSPFISEKEGDYIPPEKLKLLALQRGEDPGNLNESEEEEEEEENNEDDEEEEGGENEEEEDAEAALEKEEEARLAALEEQRMEGKKPRVMAGTVKLEDKQRLAQEEESEAKRLAIMMMKKREKYLYRKIMFGKRRKVREANKLAAKRKAHDEAVRSGKKAKKARPV	27875	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_13089_14043_14206_14320_14488_14988_15174_15307_15434_15827_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
677461	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677463	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677468	contig_7775_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_37470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102413	99695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_99700_102400
677481	contig_14034_pilon	+	2119	7	Intergenic	novelGene_72638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.61684396980704	117	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	33	680	152621	157240	FALSE	45	CAAGAAAAACTTCTTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGVATLEVAMATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKAERPGPLGSRREWHLQRREILQGTFWGWRVQYKFKDVKGKPCEDHCILQHSNRICVITLAGSHPVLQSGKTIKSISYQISTNCSRLQNKVSGKFKRGAQFLTELAPLCKIYCSDGEEYTISSCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152588	158679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_152806_152909_153843_153896_154464_154595_156785_156863_156941_157012_157102
677483	contig_10436_pilon	-	1040	3	Intergenic	novelGene_108500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_2	116.5	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	121	393	103480	102685	TRUE	20	AGCTGAACTGATTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTGGNLTQDPRLFPVGGSATSVGGGATYKLLLREHL	103600	101599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102868_103390
677498	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_94836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677499	contig_5039_pilon	+	2420	2	Intergenic	novelGene_65016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	49	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	1883	2419	1737643	1738179	FALSE	60	ATGTAAGAGAGAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQILRSHLIDASVIPNGMKILSYLGVIRNRMMSTHKSKKKISEYYRLLNLDEECSADDVRESFRKLAKQYHPDSGSNTADSATFIRIEEAYRNVLSRVIEKTNARQNKAEDMEEEDKFKYKTPQHRHYLSFEGIGLGTPSQREKQYRQFRADRATEQVMEYQRHKLYSQQFPDSVIVK	1735519	1738180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1735575_1735815
677500	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677501	contig_8263_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_83115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTAAAGAATGCAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192968	190509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_190500_193000
677502	contig_8978_pilon	-	1135	6	Intergenic	novelGene_49335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	530.237908867331	365	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	29	832	194082	190773	FALSE	25	TAAGAATGTCTGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194110	190469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_193215_193398_193613_193768_193967
677516	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_90588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677518	contig_10867_pilon	-	488	5	Intergenic	novelGene_159447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2670	junction_1	1604.69504501634	23	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	68	454	88226	86811	FALSE	10	TGTTAGGTCTTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	88641	86776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603
677522	contig_1443_pilon	-	619	2	Intergenic	novelGene_28207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	6	425	344893	344474	TRUE	20	CACTGGCCCCCATACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMHRKRFYCLEYSAAKLGKVSNLKIWRPGPFFASFLLPSFKTHRDPKERKIISLCPNSYLANSSNTFLLPSVGTRESNRRKEKAEEIITEPVPSEGKSDRKFKRSYLSAQEPNDREGLSAEGGHRQQRRTCTGQHCCSCS	344898	344193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_344204_344289
677523	contig_13292_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_142915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGCTTACAAACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6062	8546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_6100_8500
677524	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677533	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	394	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677539	contig_16098_pilon	-	1804	15	Intergenic	novelGene_45888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_8	40.9529346584937	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	229	1545	253301	244355	FALSE	10	GTTTACTTTCTTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253529	244095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255
677547	contig_12113_pilon	-	1159	7	Intergenic	novelGene_134761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	449	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGCACGCGGGGAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404061	365041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_365297_385658_385833_387195_387355_390704_390886_401493_401617_402853_402959_403899
677556	contig_1090_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_131165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATCCTGAAAACTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920050	918747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_918700_920000
677564	contig_6479_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_160595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAGAGCATAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6105	5769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_5800_6100
677568	contig_2161_pilon	-	2025	10	Intergenic	novelGene_114905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	33.4424141133441	142	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	361	1779	791304	760359	FALSE	30	GTATGGCTCTAGAATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRGPSRQQLSRSALPSLQTLVGGGCGNGTGLRNRNGSAIGLPVPPITALITPGPVRHCQIPDLPVDGSLLFEFLYKTVWWYPYNHPASCTSLNFHLIDYHLAAFITVMLARRLVWALISEATKAGAASMIHYMVLISARLVLLTLCGWVLCWTLVNLFRSHSVLNLLFLGYPFGVYVPLCCFHQDGRAHLLLTDYNYMVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHIWSENTIWPQGVLVRHSRCLYRAMGPYNVAVPSDVSHARFYFLFHRPLRLLNLLILIEGSVVFYQLYSLLRSEKWNHTLSMALILFCNYYVLFKLLRDRIVLGRAYSYPLNSYELKAN	792857	760112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763652_763774_765726_765915_766656_767006_773463_773619_778784_778869_782626_782680_782727_782850_791191_791379_792571
677569	contig_987_pilon	-	1815	10	Intergenic	novelGene_72294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_2	247.872727198635	294	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	44	973	945143	922605	FALSE	40	GACAAGCTGAAACTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTWVSKVTGGVVAMGKSDFLTPKAIANRIKSKGLQKLRWYCQMCQKQCRDENGFKCHCMSESHQRQLLLASENPQQFMDYFSEEFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKVRT	945186	921762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_945029
677570	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677572	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677581	contig_18800_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_110666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	643	1131	1860	2348	NA	15	CGATGTTGGCCTCCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQWTALYVMDVLGSGHNGLLQWPLGQHSPVARGPCCRWNRQALPGPQLSPAHFLASRKLTSLTWAGTRKRPSASLSSTHRMAPPPASSRLPTLAGSSAQSLKGMGPSVLPTSLEMPPRSPSSTSMWNNSAAHTSPSLHFWLLDDSGGCLSTLAWGLLAVLG	1217	2948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_1200_2900
677585	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	349	711	36299	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36268
677586	contig_12270_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_113131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
677589	contig_15063_pilon	+	1430	6	Intergenic	novelGene_10764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3599.786771463	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	233	1261	34808	36632	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	27136	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36511_36625
677594	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_97952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677600	contig_12148_pilon	-	543	3	Intergenic	novelGene_140330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	65	328	74235	70783	FALSE	60	ACTAAAATAGAGTATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVAPSFGFEYPSPFCLILRIMPPSSNKSSPLKSRSSISKKSVAFEGILGTLPAEPYAYSGLHSKWQISPFFMVATPMSHALITWPLQNFFYIVGVLVYICSRHLANY	74299	70567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_70852_73097_73241_74183
677602	contig_9706_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_20840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAAGAAATATGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2233	2732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
677605	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677606	contig_2646_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_69542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCCATCATTCCGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841703	839662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_839700_841700
677618	contig_7202_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_17629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
677626	contig_14322_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_116552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGCAGCGAGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
677633	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677637	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677640	contig_9161_pilon	+	1904	3	Intergenic	novelGene_160649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	3.5	431	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	42	470	94384	103223	FALSE	15	TATCTTTCTTTATGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPKGWQAGGELMEQRSGRGARPEAAGEEEEPEVKKRRLLCAEFASVASCDSSVAQCYLTENDWEMERALNSYFEPPVDESAVESRPQTVSELETCVDLTNEETTDSTSSQISPPENIQQEDDSMFSFITWNIDGLDLNNLPERARGVCSYLAL	94342	104657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_94549_94633_94720_103045
677657	SIRV7	-	334	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33234	1	15	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114723	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
677662	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
677687	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677691	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677695	contig_14666_pilon	+	1355	5	Intergenic	novelGene_39560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	89	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	121	1311	477340	485184	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKCTLC	477219	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484761_485169
677704	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677710	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677711	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
677712	contig_12724_pilon	-	1642	6	Intergenic	novelGene_146869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_5	43.4391528462515	582	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	70	1209	541481	440995	FALSE	30	TAAGTACTTTGATTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQVFVGKVLKKLFPDVPSGQEKLAPATLASEKPPEKVRPKKANLRGVQPLTDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKDTDEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDGVSKDSDSAVFMETTEELFEQLESHSLSPSDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDHVRVISTFFNYWITHILPQRNSE	541550	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445957_448443_449011_497701_497837_522974_523122_541459
677713	contig_12270_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_114054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTATTACTGTCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14092	13872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
677715	contig_5769_pilon	-	2394	3	Intergenic	novelGene_138756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	32	172	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1544	1966	117751	117329	FALSE	15	GTATACATTTTTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIRELTGCSSGSGMLRIQFSIRTASSQAGLQTCLSLAPQPLPCSGMCYKALLAPPVSSWRHSTLPVSLHGSASLAPPVPVGTPFCQQTPCLKALSFLIPGAGKPTMLSPGLLVLLPLYLCHYFSPSLVLPLSLSVSWI	126452	116900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_118948_121723_121790_126171
677716	contig_299_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_129434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCCACTGGAGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876574	877529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_876600_877500
677725	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_115961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
677731	SIRV2	+	626	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-72	-31	-72	31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGATATGGTGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1700
677740	contig_9146_pilon	-	717	6	Intergenic	novelGene_79493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1491	junction_5	1262.74453473377	30208	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	21	674	147490	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147510	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
677741	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_94121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677755	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677756	scaffold_12124_pilon	-	1414	5	Intergenic	novelGene_22071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGAGAGCCATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858981	837330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846884_858114
677757	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91672	0	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
677763	contig_10837_pilon	-	2651	1	Intergenic	novelGene_160658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCCTCCACTTTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92672	90021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_-_90000_92700
677777	contig_13924_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_147777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCAAGAGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36001	36877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_36000_36900
677781	contig_13740_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_34771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAAGAGACATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756473	757467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_756500_757500
677782	contig_15063_pilon	+	835	2	Intergenic	novelGene_14428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	226	714	36064	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35838	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
677783	contig_9732_pilon	+	1221	12	Intergenic	novelGene_98353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	83.3353277998241	17	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	112	612	221707	252588	TRUE	45	TATGAATATATTACCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLFSRWRTKPSTIEVLESIDKEIQALEEFSEKNQRLQKLWVGRLILYSSVLYLFTCLIVYLWYLPDEFTARLAMTVPVFAFPLIIWSIRTVLIFFFSKRTERNNEALDDLKSQKKKILEEVMEKETYKTAKLILERFDPDSKKAKEHEPPSAGAAVIARPGQGK	204988	285422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_+_205093_221699_221734_224507_224550_225346_225535_236232_236292_244065_244107_252362_252447_252528_252636_273059_273273_282539_282646_284045_284117_285250
677785	contig_6410_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_108632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	108.61962171828	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACATGTATATCACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301474	314637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_301640_306809_306947_310261_310369_312966
677788	contig_7548_pilon	+	2011	7	Intergenic	novelGene_117631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_6	131.951274677014	225	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	243	980	193023	211815	FALSE	30	AATTCAATTTCCTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIK	192780	212846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_211812
677790	contig_6677_pilon	+	3298	10	Intergenic	novelGene_114180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	37.0158457894207	5	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	2295	3092	481545	482794	FALSE	30	CACACATTATTTTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLAGIDEVKRILCSPKSDPSLGLLEDQAERPVNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKLQRAEHHGPEVPNTASFATSGPLIPEENKEQIQELPDSGTLTLVPSHQITAEYFEKTWLSLKVAHQQVLPWQGAVHPDTLQMALQVVNIQTIAMSRAGAQPWKAYLSAQDDTGCLFLTELLLEPEHVEMQISVKQNEARTETLNSFISVLETVIRTIGDIK	473777	483000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_473807_474112_474302_475740_475966_476662_476794_477180_477329_477795_478295_479323_479408_480555_481636_481825_482108_482369
677792	contig_7333_pilon	+	2237	14	Intergenic	novelGene_142774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	107.034032081711	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	154	1158	185614	206471	TRUE	25	AACCAATATGGCCCTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFCSETIDIIQPALVLATGDLTDAKTKDKLGSRQHEVEWQTYQGILKKTRVMEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRFAELYKSKSPHSGGNQKHVNGDAYKLRSVIVLPIISFPVKIDGVHLGEAVHLSGPIFILKWNPRNYSNGTHNIEVIVQDSAGRRKTVHHVFSVEEDLHLTFDPLASFILLTDHYIMVSRTSKA	184335	218061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_202492_202609_202721_202841_203505_203620_206447_206474_212390_212496_214311_214431_217208
677793	contig_17819_pilon	-	2855	3	Intergenic	novelGene_158792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	362	junction_1	2	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	101	430	16597	14164	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHYLEAAARKLQASCPGQARYLLWAYSSSNDAKNTFEETCPYCFQLLVLDNSRVRLKPKPKLTPKIQKLLNREAKNYTLSFKEAKIVKKYKDSKSVLVRLWFQYCE	16697	11738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17819_pilon_-_14394_16397_16421_16520
677802	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	853	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
677809	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27903	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
677810	contig_10494_pilon	+	2692	3	Intergenic	novelGene_102204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	11	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	24	434	1083273	1083683	TRUE	20	AGTCAGACTTGGAGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGPPKMAVCIAVIAKEVRTAGPGRGFVVSLRFPPRAHQGPRQGTQIWAPGPAGPLSPGPPFSSFLRRLPLSLALQDSLRNGLEEAVAERRRSEGVHREVPPSMPGTPSSAPDSQPRSGASQAPGLLPDLPSGTRLGAQEGP	1083249	1087190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1085270_1086225_1086314_1086606
677811	contig_14030_pilon	-	1794	8	Intergenic	novelGene_62234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	584.337196474496	75	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	477	908	389093	337410	FALSE	30	ATAACTTTGTGTGAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394741	336523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_389081_389175_394346
677812	contig_15304_pilon	-	739	3	Intergenic	novelGene_30466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	193	696	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54292	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53545_54044
677816	contig_9871_pilon	+	1326	4	Intergenic	novelGene_75683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.84447196547	3404	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	264	962	533622	540638	FALSE	30	CATTTATACTTTCTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGKGPFSVAYLVTRPAQPAGEGLGPVPRSSPRKGHAPSWQKAPPAGGLKLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	533358	541002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_533771_537739_537936_539747_539984_540520
677817	contig_6710_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_97951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACAGAAGCACTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653413	653805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
677824	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677825	contig_15248_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_149156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	367	1104	592	1695	183794	184897	NA	50	CTTGAACTAATAGAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAMPLVFQIPAGLPMVDRFQQSYKTKRDYEEGPGSLLLRKLARENLMNSSRTLSDKVSEDESLRLEGTPNTTGEELPPQSRVNLNDVNGVKLSGPSLADVAQLKKRRNSCKHPLITGMWNVQSMNLGKLEVIKNEMGCINIDILGITELKWTGIGHSESDNHMVYYAGNDKLKRNGVTFVVKKNISRSIPKYNTVSDRIIAIHLQGRPVNMTIIQIYAPTTNVKDEETEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNAEVGNREEGLVVGKYGPGDRNDTGDCMIEFCKATDFFIANTFFQQHKWRLYTWISPNGKHRIQINYICRKRRWRSSISSVRTRPGAYSGRDHQLLICKFKLKVKKIKTSL	183202	185440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_183200_185400
677833	contig_753_pilon	-	2399	2	Intergenic	novelGene_112990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	158	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	503	2017	1217742	1216228	FALSE	25	TTTCAGTGCGAATTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKQMKEAFVSNLNGTTILEVTQVLCLPAPYILCRGLLTILLQHFYPSSYTWRTQFFIDFVVLIVPLVAAFTILSSFLLLEQLTVIIFGAGLAYQIYHRRTCYARVPVQKILENFLKVGLESEYIPAISCFRIMNNVFTAVAILAVDFPLFPRRFAKTELYGTGVMDLGVGGFVFGTAMVCPEVRKKSNMEISRFYHLTKSLHSVCPLVFLGIGRLVTIKYIDYQEHLTEYGVHWNFFFTLVIVKLLTSLLLIIFPLNKSWIVAISITVLYQLALDFTPLKRLILYGTDGSGTRVGLLNANREGIISTLGYVTIYMAGVQTGSYLFKSRSHIKDWIKVIRCLLLTAVSLFLCLYIVQANIEAVSRRMANLAFCVWIVASSLIFLSSLLMGDIILSFAKFLFKGTLVPCSWKLIQSPATTKKHSESLVPEAERKGTSLCLITAINRNQLFFFLLSNITTGLINLMVDTLHSSPSWTLFVLYFYMLINCLTLFVLHLQDKTIKFW	1219135	1215845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1217757_1218647
677834	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_95741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677839	SIRV7	-	372	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33195	2	-24	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114762	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
677846	contig_9098_pilon	-	1503	12	Intergenic	novelGene_75794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	456.084612274651	3	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	453	1253	288130	264388	FALSE	25	ACAACTTGTAGTTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295261	264137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289195_289280_290711_290847_292840_292905_294101_294181_295200
677852	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
677855	contig_7202_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_16430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27772	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
677858	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677861	contig_5549_pilon	+	870	4	Intergenic	novelGene_81569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1678.16149401659	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	372	698	86768	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82078	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82299_86616_86819_91687_91835_96620
677863	contig_9436_pilon	-	2909	15	Intergenic	novelGene_60928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	86.2203217202941	1	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	18	1169	458965	445052	TRUE	15	ATTTATCAGTCTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGTLLPSLLGLLLLGLLLPASLTGGVGSLNLEELSEMRYGIEILPLPVMGGQSQASDVVIVSSKYKQRYECRLPAGAIHFQREREEEAPAYQGPGVPELLSPMKDAPCLLKTKDWWTYEFCYGRHIQQYHMEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADSKHYGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGEVEHRPGAAC	458982	441228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442257_442544_442658_442804_442970_443880_444071_444807_445087_445324_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446777_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458214_458392_458803
677874	contig_17440_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_7589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCCTCGCCCTAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3015	3287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3000_3300
677879	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
677883	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
677893	contig_12098_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_160668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	457	945	117453	116965	NA	80	AGGAAAAGAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLLPTHLEQRRMKNTKDTRKILAQETKKGHINERLHQPETRKTRWCLATTNDHPDREHNRALLTEQVKSGVQNPNSSKKTRLDCLTETGGTPEDMAPRLSVNPELKSFPKPTLQTKTDWTIRHKMILVKSVLLSSSRVMRLNGQLLSGGEMRRQRGTGAG	117909	115433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_115400_117900
677901	contig_6954_pilon	-	2028	7	Intergenic	novelGene_64410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_6	42.962839239924	415	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1920	107	2026	46863	18173	FALSE	80	CAAAATGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIGGNAREPSVSRKEPGLSWARQDGWRLSKGNRIMAADDDNGDGTSLFDVFSASPLNNDEGSLDIYAGLDSAASDFASKSCVPSRNCLDLYEEILTEEGTAKEATYNDLQVEYEKCQLQMKELTRKYKEIQTQNFSLKSENQSLKKNISALIKTARVEINRKDEEINNLHQRLSEFPHFRNNHKTARASDTVKTKDLKSRSPHLDDCSKTDPRVKSDVSRDLHHSASLPNLGKEGKSHSEKRSTSVLPPSIEKRCANGIWSRSHYHVGEGNSGEDNRREKKDIRHSQYSGGTDRIRKDFSTSCGSGELRNTETDQRLQGRSEKYGKGEPKAESKNSKFKSNTNSDYQSEHISSSREKEISRERSHIRVESQNDKRLERQSERSQNINKKDLKSQDKEERKVDQKTKSVVKDQDHRRRSEQTLLPHSRNEITKSHNSSKYHLEERRGREECKRDRSINNHSFQDGRCTSFLSSSRAYKHIDSKEVDGVQQWENVPLRAQRHRTEDKRKREQESKEESRHVRNEKKTTPTEHLQKTNKETKKTTTDLKRQNEPKNDKSEISKNETSERVNDRELAFKAESGPNERKGKDFKLSFMEKLNLTLSPAKKQPVSQDNQHKITDTAESSGVCDLQSLVQAKTMTCVPSVSEHITEETKSKLLEPKDALPAASELRINIPE	64075	18170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_19680_31423_31540_32424_32500_33020_33122_33755_33822_46808_46892_63997
677908	contig_6710_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_89801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
677914	SIRV4	+	520	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	430	0	-430	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGCTCGTCATGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	2341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
677924	contig_12357_pilon	-	1636	8	Intergenic	novelGene_6138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATGTGCCGATGTCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53922	30985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_31053_34112_34310_35032_35191_42112_42249_46434_46565_51127_51238_52758_52842_53167
677925	contig_6062_pilon	-	1190	7	Intergenic	novelGene_5254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_6	61.5710971154486	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	40	1125	597983	541389	FALSE	35	TAATCTGGCTCCAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCPGNLRPGILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598022	541323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597863
677933	contig_6710_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_94281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCACTTGCTGTGCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
677945	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
677948	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_93646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
677959	contig_11259_pilon	-	1970	7	Intergenic	novelGene_144527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	150.653483936556	324	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	256	681	153679	131887	FALSE	30	TTATTCAGACTCATGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGGLSASRRPVPLGPRRGPPPELEEDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLAVVIMGVVLQGANLYGYIRCKVGSRKNLTSMATSYLGKQFLRQNAGDDQTS	158993	130597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_158918
677960	contig_9482_pilon	+	1187	6	Intergenic	novelGene_44240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	167.799165671347	22	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	29	409	263283	285606	TRUE	15	GTACAGACTCGGGGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGNSLVLTA	263254	290381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_278052_278098_285421_285686_288767_288944_289858
677961	contig_7286_pilon	-	947	7	Intergenic	novelGene_108696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	4086.97792452511	21	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	57	881	293122	286948	FALSE	10	AATTGCCTTGTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFLGTPEEAGPLSVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFLFFFFLNRFLQAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293178	286881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291530_292022_292101_293119
677964	contig_6871_pilon	+	2177	4	Intergenic	novelGene_21553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	1	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	75	1139	121971	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121896	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134333_134404
677975	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91678	0	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
677979	contig_9054_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_160672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTTATCTCCGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255932	256284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_255900_256300
677980	contig_9649_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_160687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	219	599	24806	25186	NA	50	AAAAAAAAGCCACCTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDHFGLLMPQDQQAKKVVTILAGVIHPDYRGEIGLTLHNGGKEEYVWNTEDPLGHLLILLCPVMKLNGKLQQSNSNKTTNGPDPPGMKVWVTPPGKEPPAAEVLAEGKGNTEWVVGEGSFKYQL	24587	26724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_+_24600_26700
677982	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677990	SIRV4	+	380	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	915	-21	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCAATAACTTTAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2370	2750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2400_2800
677992	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
677994	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_113870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
677995	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_89248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
677999	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678003	contig_5935_pilon	+	1831	3	Intergenic	novelGene_102681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	299	883	775541	783172	FALSE	35	TTTTGTTTTCAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKAGPIPVHVMSSFEDVDTEETVTCLQMTLYHPGLLQTGIFQSIRFCHREKLSSSEVVKFGRNATICRYTFLDKQVSRVQFSLQPFKDFSSSVLSFEIKNMSKKTSLIVDSRELGYLNKTNLPYRCMVRFGDYQLLMEKEDGESLDFFETQFILSPRPLSQENICAATNPVPENGNCSTRSTSPTEMDENEA	775138	784120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_775412_775515_775553_782599
678007	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_17698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27863	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
678012	contig_20610_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_67631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2515	4118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_2500_4100
678013	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678014	contig_3509_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_160695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATGAGAATTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5909	8133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_5900_8100
678020	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678022	SIRV2	-	641	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	9	2967	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
678025	contig_10482_pilon	-	2985	1	Intergenic	novelGene_152826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGGTCTGAGCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115381	112396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_112400_115400
678031	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678032	contig_1786_pilon	-	2311	10	Intergenic	novelGene_142597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	196.701691796374	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	97	1233	79935	55555	FALSE	5	TTTCTAGGTTTGTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVSRRVSRLVGLSGPESAVASEGPWTWTDGAMPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQNFEDKASKWEDKKTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGR	80031	54476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_62794_62834_68182_68321_79932
678035	contig_5084_pilon	+	2643	6	Intergenic	novelGene_64632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	233	361	1327376	1327504	TRUE	15	GCTGACCTTTTGGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLCLIKRQQPLCGLNQISHSVQRNVHRQPQLELSPPTQAGPVPATQSQLLAVPWPGVHGGHGRACRRAPRGCCQDSMEHVLHMCSDLCPAGGAQQHKCSEMLYSQISMLPGWDFGPKA	1327143	1335610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1328435_1329068_1329144_1329243_1329350_1330179_1330841_1333776_1333871_1335194
678045	contig_7629_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_153548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGATTTGAATTTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219323	217396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_217400_219300
678051	contig_9434_pilon	-	1590	5	Intergenic	novelGene_150468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	18.060661671157	507	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	125	805	47190	35087	FALSE	20	CTGAGAGTCTGTGACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANTSVDVFSKVLEHQLLQTTKLVEEHLNSEIQKLDQMDEDELERLKEKRLEALRKDQQQKQEWLSKGHGEYREIPSERDFFQEVKESKKVVCHFYRDTTFRCKIIDRHLAILSKKHLETKFLKLNVEKAPFLCERLRIKVIPTLALVKDGKTQDYVVGFTDLGNTDDFTTETLEWRLGCSDILNYSGNLMEPPFQSQKKFGTNFTKLEKKTIRGKKYDSDSDDD	49722	34301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_35205_37712_37968_42142_42262_47001_47221_49628
678067	contig_6710_pilon	+	515	2	Intergenic	novelGene_97774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653399	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
678068	contig_14446_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_160710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATTCTACAATGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240105	239857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_-_239900_240100
678072	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_94882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678073	contig_8878_pilon	-	1095	7	Intergenic	novelGene_147861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	412.806014437236	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	106	756	231110	228170	FALSE	35	AAGCAAGTGAACTCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	247466	227830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231121_247371
678078	contig_12250_pilon	-	1192	9	Intergenic	novelGene_80706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_8	255.178368989223	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401104	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400562_401003
678085	contig_7744_pilon	-	1890	12	Intergenic	novelGene_62512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_7	294.010288232873	457	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	903	1856	822865	820619	FALSE	30	TAAACTCAGCAACTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	825078	820584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822957_823128_823501_823760_823968_824167_824304_824625_824670_825026
678086	contig_19342_pilon	-	827	3	Intergenic	novelGene_41128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGGCCTCACGGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6780	5070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_5292_5412_5580_6341
678089	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678090	contig_6710_pilon	+	537	2	Intergenic	novelGene_97435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGATGGCTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
678091	SIRV7	+	404	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATGCGAAACCATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	114807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
678093	contig_9014_pilon	-	1987	10	Intergenic	novelGene_106734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	87.8053402577416	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	50	1264	46682	42276	FALSE	25	ATAGTGAACCCACCTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRLQAISASLCLCLLHFMLLLHQVQGA	51590	41552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42355_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
678095	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_96005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
678096	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678110	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
678118	contig_11285_pilon	+	1572	11	Intergenic	novelGene_5583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	592.138193329902	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	574	1335	767344	769878	FALSE	5	CTGTGGCCAGGTGCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763522	770115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767276_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_769421_769653_769740
678131	contig_15049_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_160724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1640	1990	227678	227328	NA	25	GTCACACGCCAAAGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWTQGHSEMLFCLVPFGVYGYSTNAVLILRLESSKLCPFCVCFLNLGLWLFGMTPAFSVIPLCLSCRRCIYLPRLPLPARIKTTFVNGSFPQKSVLRHRQVQGLNVPTWPSPQTF	229317	227037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_227000_229300
678136	contig_13894_pilon	-	1197	4	Intergenic	novelGene_62030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	725	1117	286682	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288304	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286826_287031_287123_287219_287538_288132
678139	contig_6871_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_21630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTTTGGCTACACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655453	653129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_653100_655500
678146	contig_2312_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_160741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAAGGATATATCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244960	243103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_243100_245000
678147	contig_5643_pilon	-	1374	9	Intergenic	novelGene_38908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	111	junction_4	301.862137407128	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1206	169	1374	284607	281601	FALSE	40	CAGCGGAAGAATGATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKKSKSKRKEEEEEDDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTVTEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDPEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNY	285326	281600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_281637_281751_281956_282595_282836_283046_283187_283393_283530_283784_283913_284161_284404_284527_284647_285197
678150	contig_18173_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_160759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAAATGTGGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12742	12392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_12400_12700
678152	contig_17470_pilon	-	1731	13	Intergenic	novelGene_110510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	71.1592501990352	13	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	98	1039	277165	270503	TRUE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKPSSAL	302587	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270450_270521_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_277162_277222_302546
678156	contig_500_pilon	+	1279	10	Intergenic	novelGene_31068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1041.59305814	3	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	148	864	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1491928	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494277_1495423_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
678157	contig_11292_pilon	-	1715	5	Intergenic	novelGene_109396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	394	junction_2	518.210562898905	1015	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	244	1038	124256	107816	FALSE	20	CTCTGCACCTGACAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGFPLVPPPTEDLVPYDADLYQRPTHDYYQYLSSDGDSHSDHYWDFHPHHVHSEFESFTENHFTELQSVQPPQLQQLYRHMELEQMHVLDTPMAPPHASLGHQVSYLPRMCVPYPSLSPAQPSSDEEEGERHSPPLEVSDGEADGLEPGPGLLHGETGSKKKIRLYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSSKHKEALAHRWGIQKGNRKKMTYQKMARALRNYGKTGEVKKVKKKLTYQFSGEVLGRGGLAERRHPPH	124499	107138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_108136_109382_109546_110339_110528_120962_121060_124229
678160	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678161	contig_18869_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_56056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73571	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
678162	contig_3602_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_60533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACTATCTTAGTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228931	227725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_227700_228900
678166	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
678171	contig_16103_pilon	+	2003	6	Intergenic	novelGene_118735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_3	96.2662973215445	479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	290	1036	296045	303376	FALSE	10	TCCAGCCTGGACTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSAPKVVLKSTTKMSLNERFTNMLKNKQPMPVTIRASMQQQQQLASARNRRLAQQMESRPSVQAALKLKQSLKQRLGKSNIQARLGRPIGALARGAIGGRGLPIIQRGLPRGGLRGGRATRTLLRGGMSLRGQNLLRGGRAVAPRMGLRRGGVRGRGGPGRGGLGRGAMGRGGIGGRGRGMIGRGRGGFGGRGRGRGRGRGALSRPVLTKEQLDNQLDAYMSKTKGHLDAELDAYMAQTDPETND	294841	304343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_296110_297637_297792_300404_300589_301382_301521_303170
678172	SIRV6	+	441	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	1	75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
678175	contig_15221_pilon	-	1055	4	Intergenic	novelGene_133071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	84.856742022462	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	255	479	182332	140516	FALSE	15	GATGTCACCTTTTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEGVVSPSDLDLVMSDGLGMRYAFVGPLETMHLNAEGHV	190693	139939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_140527_149435_149542_182224_182420_190526
678176	contig_12923_pilon	-	1688	16	Intergenic	novelGene_30132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	182.976671251343	591	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	233	1648	174592	162599	FALSE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQNNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	175335	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172893_172958_174586_174747_175257
678179	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678181	contig_4847_pilon	+	1039	6	Intergenic	novelGene_156159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	325.684264280607	8637	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	247	594	101069	109628	FALSE	10	CATTTTCTGTGGTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKEPSPLVPLHWLGFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLLMVAKLGFTVFTRPHQS	99460	110073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_101400_101478_102278_102381_108569_108658_109570
678184	contig_6710_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_95839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
678189	contig_11413_pilon	+	816	3	Intergenic	novelGene_103133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2074	junction_2	1568.5	21263	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	17	460	87465	88388	TRUE	5	CTCAGTGTCCTCCCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGVRSSDPSSLYPIPRLSSEFLALFFGYLRTRSPVCPDFYAALVPSRR	87448	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88508_90624
678191	contig_6027_pilon	+	2769	5	Intergenic	novelGene_74447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	175	585	262788	263198	TRUE	35	AAGTGCTGAACGAAGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKEACPPGANPLSKTFTTKASSVQLEEDLWLSLDCSLARFSATCTLRRPSPSLSRVRGYSLGLRIPDGSIRTALSPEFPVRSGNWEHFPSFPSLGEEEPIPLLSLSVPEVSTSAPHPSPATGLGKGADEESLGHS	262613	267291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_263490_263777_263898_264178_264269_265057_265158_265708
678192	contig_4989_pilon	+	2705	2	Intergenic	novelGene_160780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	939	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACCAGGCTTTGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77269	91409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_77430_88864
678198	contig_513_pilon	-	1364	10	Intergenic	novelGene_80170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.150218515268	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	144	1313	453421	449054	FALSE	40	ACCATGAAGCTGCAAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSLSPSPNKTI	454715	449002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449083_449721_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
678199	contig_7202_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_18113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCGCAGGTTGGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
678211	SIRV2	-	592	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4281	34	3106	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
678213	contig_7182_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_117113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166509	163910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_163900_166500
678220	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_89522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678228	contig_14925_pilon	-	946	5	Intergenic	novelGene_55215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	118	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	12	428	32665	27020	TRUE	50	AAGTAATTTGGAAGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAMTDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	32676	25809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_32658
678232	contig_7285_pilon	+	1962	10	Intergenic	novelGene_143386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	241.27766904595	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	10	966	220216	342186	FALSE	20	TACCCTTTTTTCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGGKRNSFPACKAKAATPGPLLEMEAC	220206	343182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_220225_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_342106
678246	contig_3588_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_72883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116510	114935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_114900_116500
678247	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	319	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678250	contig_12709_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_147393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29930	27736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_27700_29900
678253	contig_18145_pilon	+	2237	11	Intergenic	novelGene_37343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	641.120924631227	2	108	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	218	1303	86893	98834	TRUE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGAVANETGAFFFLSPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVARC	86675	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86906_94968_95005_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97296_97824_98038_98231_98539_98826_98983_100326_100482_100638
678260	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678268	contig_5671_pilon	+	1016	6	Intergenic	novelGene_79444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2296.68700523167	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368856	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392848_531205
678279	contig_8616_pilon	+	2417	5	Intergenic	novelGene_72549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	5.21416340365355	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	778	2379	421424	424565	FALSE	35	ATACAAATGCACTCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	420646	424603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
678284	contig_17470_pilon	+	1677	8	Intergenic	novelGene_110479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1162	junction_1	2210.79184262756	549	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	354	1187	142219	147189	FALSE	80	TTAAAAAAAGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPAAKVSKKELNSNHDGADETSEKEQQEAIEHIDEVQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSALLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSKSTEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWPNPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDDDDEEEEGLEDIDEEGDEDEGEEDEDDDEGEEGEEDEGEDD	141865	147679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_142292_143892_143951_144618_144762_145162_145267_145372_145487_146100_146272_146403_146551_147165
678285	contig_3269_pilon	-	1346	8	Intergenic	novelGene_117029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_7	356.883906122116	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	99	1004	238182	167315	FALSE	45	TGAATTTACAGACGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRSSVVLEKTKVVEPLDYENVVTQRKTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVISRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLYKANVNSTITVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKDEKNLKESKGCIYLDACNDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQEKKETVETAQGQIFFDDSLLK	238280	166972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_167528_170005_170141_187440_187537_188192_188263_191236_191320_191725_191816_191896_192014_238080
678289	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678293	contig_15114_pilon	-	1616	7	Intergenic	novelGene_121117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	220.381991601451	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	295	1011	112655	100551	TRUE	50	AAAAATGGTAAACTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGSPSQQRRGHGADSRDLAGRLPAADSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125295	91649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_92034_100329_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_125212
678297	contig_4754_pilon	+	2116	15	Intergenic	novelGene_35963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	220.457455750352	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	495	1295	409328	415758	TRUE	15	ATAGCTGGTTGTCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKGCCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGWSSLMRSSTPCAWPGWWIMP	380161	420817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410352_410486_410533_411004_411140_414446_414611_414900_414962_415752_415898_416938_417082_420159_420252_420370
678304	contig_13542_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_131516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1374	1703	443640	443969	NA	85	AAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSVHYIHLGGPHQRAFVLAVPSAWNVPSPTTVSGACSSVVIHMSSLCRLLDHQMPTAPTSVSITVCFIALAPLENVSLTCISCFLFVSMVGTDLVRTGPRMSILSGH	442266	444693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_442300_444700
678307	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678308	contig_4364_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_4114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
678309	contig_11815_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_50916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGCTGCCTAATAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198120	196379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_196400_198100
678313	contig_1244_pilon	+	2046	6	Intergenic	novelGene_37952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	27.4488615428764	102	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	77	1072	874933	882516	FALSE	35	TATGACTCCAAGCAGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGVWGTAAPSFSGFTQSFRSHTLRRMEVTEGAGAPKPGEMRALKPCLLRRNHSRELHGVAVSCLEELRSKAYDTLAIDKSLAPVTLVLAEDGTIVDDDDYFLCLPSNTKFVALASNEKWTYNNSDGGTAWISQESFDVDETDSGAGLKWKNVARQLKEDLSSIILLSEKDLQVLIDVPCSDLAQELSQSCAAVQGLQNTLQQVLDQREEARQSRQLLELYLRALEKEGSILSKQEESKPAFVEEVDAADMGTSRETFSRIALTSQILTALKEKPAPELSLSSQDLELVTKEDPKVLAVALNWDKRKTETVQQACEQELSLRLQQVQSLRSLRSISAKKTSLPGELQNPKRAKPDST	874856	883490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_875069_876812_876975_878260_878404_880957_881148_881374_881527_882303
678314	contig_16400_pilon	-	1284	3	Intergenic	novelGene_150901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTGTTGTGACAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37963	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_-_3565_16875_17023_36874
678317	contig_20487_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_154386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTCCAAAATCTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21699	21407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_21400_21700
678318	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_97111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678321	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678325	contig_11292_pilon	-	1382	11	Intergenic	novelGene_109412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	279.172867592823	44	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	197	988	167479	163144	TRUE	5	CCTGCCACCTGTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELNDPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKVTSEPAGWVPAQHSSKGHCSH	167675	161769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163418_164658_164807_165245_165384_165646_165710_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
678326	contig_2733_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_128564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCATCCCATATGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589072	589434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_589100_589400
678329	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	131	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678338	contig_12837_pilon	+	1595	3	Intergenic	novelGene_57337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4393.5	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTTGACAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161425	167477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_161494_163874_163928_166003
678348	contig_9727_pilon	-	450	5	Intergenic	novelGene_86384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.2712359350988	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	69	440	598065	588567	FALSE	10	TTCCTCGAGGCTTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQTVSCMSLAHTPCEGLSPWLTPSETAMHWLCTRSG	622880	588556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_588672_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622824
678349	contig_11285_pilon	+	2171	9	Intergenic	novelGene_5564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	600.535789420581	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	46	585	766060	767321	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTAAVGERGLGRRCTMWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQDCLFSGFLLRRQGALLPPWYLL	763512	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767252_767836_768024_768410_769421_769653_769740
678350	contig_10299_pilon	-	2393	4	Intergenic	novelGene_79758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	33.1762967593833	231	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	608	1825	592066	580210	FALSE	0	CTGTGGGCTTCTTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622499	579641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580419_591057_592506_593399_593495_622426
678365	contig_6929_pilon	+	1331	10	Intergenic	novelGene_139376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5921.48613937122	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	136	1062	101756	132045	FALSE	5	TTGCCTTTGTGTATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSVAGAESGPQRALSSPTAAAGLVTITPREEPQLPQPAPVTITATMSSEAERSGGPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPGLPSLPSSGLVIQQEEYEIPAIKNEQKIGAEDLKCLLFAH	101620	132314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101775_101857_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130856_130944_130971_131948
678368	contig_8676_pilon	+	1980	9	Intergenic	novelGene_142224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	300.746752891864	60	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	90	1007	666237	672298	FALSE	10	CTGTTGAGTGGCTCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGSLLPPKQIRLLEATFLSNEVANVKELMARALELESQRWAQDVPPQRLDGHCHSELAIDVIQIVSQSQAKAESITSDLGVQIRQVLLLELAGFLRSYQRAFDDFLERYKQLKNYRANVIANINNCLSFRASVEQRWQTLQDTHSHLLVPLNEIKTHGFDSLLQNLFLDLKPLFKRFTQTRWSAPVEILEEILATVSERLPEFSELQDSVRKELMEAVHLHLVKEYIIRLSKRRLILKTAEQQQQLARHILSNADLIHCFCTQNGSSANWLSLALAWAGGGQACLLIPWTLHEFSIAAVTNDHKLSGLKQELIISQPGGQKSEMGLTGLKSRC	665731	673271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_665803_666218_666342_666550_666652_667206_667306_667814_667939_668983_669107_669414_669571_669677_669711_672121
678375	contig_9345_pilon	-	1187	5	Intergenic	novelGene_24360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	572.231323417375	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	49	546	173741	141746	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDRFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSHQGCRQHPTRRSTHHPTQPSPWAHLPTMRHLLGVPFSEPDTRCRQVGEIGILLSWVLILWAEVPQLPGASAMPTGGW	173789	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141884_142567_142662_142728_142781_142955_143072_173643
678378	contig_17522_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_160797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1919	2251	70489	70157	NA	70	AAAAAGTCAGAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSKQVYPQAVYPGGRQVLRCLLWEKVMQAMQALAEVAHFFMAALSGGSVPTCQLEPAIWLVLRCSVPAAIYSANIYTVYLMGDKFLLGPALQLALKRSTFATLRMEPG	72407	69862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_69900_72400
678379	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	7	2958	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
678381	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_95009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678384	contig_9982_pilon	-	2460	5	Intergenic	novelGene_55724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	34.7661832820343	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGATCAATAGTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304880	297809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_299644_301347_301605_302426_302597_302720_302789_304749
678385	SIRV2	-	529	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4344	34	3169	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
678386	contig_15123_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_110939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGTCTGTCTGTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339146	338687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_338700_339100
678389	SIRV6	+	619	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-321	-20	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	101	306	57	362	2021	10780	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPWYVWEEVRIIDERVEVEVVQQES	1964	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2035_2486_2621_2740_2840_10721_10819_11031
678395	contig_1076_pilon	-	1689	13	Intergenic	novelGene_101092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	222.086819860062	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	162	1472	79519	50922	FALSE	20	TTCTTTGTATTTTAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	79680	50704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51886_58880_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
678407	contig_9363_pilon	-	2057	15	Intergenic	novelGene_6783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	344	junction_2	376.092239283104	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	127	1959	1548961	1529869	FALSE	15	GCTCATTTGGTCTTAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILR	1549087	1529770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
678413	contig_16594_pilon	-	1339	3	Intergenic	novelGene_53875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_2	173	335	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	1023	1337	272836	165508	FALSE	15	GATGCCCGGTGCCCCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANA	306539	165505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_165649_272662_273670_306350
678415	contig_1143_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_86573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAATGATAATGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100586	102970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_100600_103000
678419	contig_16310_pilon	+	1145	5	Intergenic	novelGene_70088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	106	438	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285870	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
678421	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_93470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
678424	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	633	966	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTTATATGTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
678425	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678427	scaffold_19766_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_34471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAGAAAGAAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939775	937446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_937400_939800
678429	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10494	27	1257	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAAGTTTTTAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11494	11799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
678432	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678442	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678443	contig_15219_pilon	+	2100	8	Intergenic	novelGene_40823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	354.934774117092	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	119	949	19617	23972	TRUE	15	CCATTTGGAGCTCTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19498	25899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_24314_24458_24588_25218
678444	contig_10011_pilon	+	1979	4	Intergenic	novelGene_68064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1215	1904	241226	242933	FALSE	35	GTCACACGTCCTGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQLVLRFCLGRLLQKVWQFLFSKLSSSFLQEHLLPLHTDGHPLLWSLGGSVKLFHQVHNLLAVHWTSFPDPSLDLWGQDGQELFQHQQLQDLLLRVQLGLQPLPAELSKAAERLFGSRQLLITKLSKALSGELWIPAVIVQSRFLSLFELCYYVSLLFGGIRRVGLQAQSYLHFSCHCGIRETSLLGNSLDVLVHDPGEAFLNAILTPRGQNAETGPSHFPAFTPNF	235932	243008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_237092_241170_241353_242330_242836_242875
678449	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678454	contig_6065_pilon	-	3249	1	Intergenic	novelGene_132703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500113	496864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_496900_500100
678455	contig_15025_pilon	-	1678	7	Intergenic	novelGene_155968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	273.281549972836	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	150	1541	47985	32610	FALSE	20	TACAACAGTGGGTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFFEDLEEDYKIRCLCTRAFVEDRILCNLGLKGYYVKGNSNNAANMLSIGDQTTEEEGGDLSRGSAETHGSKDIVLDESELDSEAELMRSMGLPLQFGGTSMHKNFEVSMNAKNKVKRKKKKHQKKYLDEIMRESWREEYDEDDILASEGPSSVEQYENTRTCKIQSGKDVETENLPVENTLSLKLEITEKWEKYWNEYGGGLLWQSWQEKHTGQTLSSEPWNFPDTKEEWEQHYSQLYWYYLEQFQYWEAQGWTFDASQSCDTDTCESQTEVDSNSDENCVKVDLISFPSSSVTISNKSSSSSDKDHNEILDRICNIILNSEEVEQNQLESSENHDGLQELSEVSSRRECPASGQSEPCDGGTKKSNMTRTRNTNPPAQDSQESSGANTSKERPHTNDIDGDESEEDPPECKPTKLKRSHELDIDENPHSDFDENGCLLGFKHGSGQKLPQWHKRFALNY	48134	32472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_32650_34737_34825_36289_36408_38284_39105_39446_39638_41248_41314_47914
678458	contig_9871_pilon	+	2581	9	Intergenic	novelGene_75650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	190.089945815132	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	330	1139	391952	419187	TRUE	15	ATGAGTTTTGGTTTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384510	421024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384697_384866_384991_391932_391973_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121_419486_419880
678462	contig_18251_pilon	+	1126	6	Intergenic	novelGene_50150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	1040.76644834468	238	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	116	718	35708	54023	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKAVHSLSSITKLLGGAELYSQPRKLDSREWFQVLH	35592	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_48577_48794_53919_54027_54917
678466	contig_9272_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_125973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	883	1188	644125	643820	NA	20	TATAGCCTTGGGAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELRNCPSQRWQPARSTRRATGNTLCSHLQSNTLQHLSSCEIKEVRTRQPHASQQSIPLVRGLDVCTRPLSHYEYQENIKGSLLLWERSPGGTVVKALGC	645007	643748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_643700_645000
678476	contig_18081_pilon	-	1667	4	Intergenic	novelGene_23810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.2237131997884	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	65	319	205538	145983	TRUE	25	TATATCATATTTTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAGWDPDYPCTRTALLKVAQMVALLIAFTCVRTAVWTDYSAYSFFEVVTICDLIMILAFYLVHLFRLYRVLTCINWSLSVRERPGPVHSPPGPSAEGLRRTSEY	205722	144513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_145403_145523_146235_205535_205586_205705
678477	contig_9415_pilon	-	2641	1	Intergenic	novelGene_109938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCAGGGCTCCAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2460412	2457771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2457800_2460400
678479	SIRV1	-	231	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5571	3564	-122	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCAAAGATGTCGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
678483	contig_13760_pilon	-	1684	8	Intergenic	novelGene_61302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	253.385887853419	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	85	1401	194443	161782	TRUE	5	TCTTTCTTCTGTCTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRIGAERGTDFHSTPGTL	194527	161436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161583_161644_161834_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
678485	contig_6414_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_157015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGAAATGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76707	77580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_+_76700_77600
678486	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678508	contig_10372_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_112519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAGTCCAGCACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78674	77968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_78000_78700
678510	contig_12605_pilon	+	894	6	Intergenic	novelGene_64197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2654.62030429966	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	250	894	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPDPGRLPLPEVFLHRRVGRSIGSEQTRIAKGNAQTYRVSLGNLRGYYNQSDAGSHTLQEMYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4300_4427_4535_4795_5072_5728_6005_6124
678512	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_97219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678525	contig_1143_pilon	-	2889	1	Intergenic	novelGene_86591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144536	141647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_141600_144500
678526	contig_1836_pilon	+	2794	2	Intergenic	novelGene_71086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	155	1348	1098770	1113904	FALSE	15	CAACTTGTTTCTGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPNTAWLLGAAILLAATASCSHSTQGFNKSSKGRSLIGRSNGSFQVTGKGVTVKPGFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPVVYTIVFVVGLPSNCMALWVFVFRTQRKHPAVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWVYGDVLCKVLISFFYGNMYCSILFMTCLSVQRYWVIMNPMTHPRKKANIAIGVSLGIWLLILLVTIPLYVVKQTIYIPALNITTCHDVLPEEVLVGDMFNYFLSLAIGVFLFPAFLTASAYVLMIRVLRSSAMDENSGKKRQRAIKLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHYFLIKSRDQSHVYALYLIALCLSTLNSCIDPFVYYFVSKDFRDHAKNTLLCRSVRTVKQMQISLTSSRFSRKPSSYSTSSTSVKTSY	1098615	1115350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_1098852_1112792
678527	contig_3153_pilon	+	1524	3	Intergenic	novelGene_104691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336532	339071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_336733_337192_337325_337879
678532	contig_12019_pilon	+	2568	14	Intergenic	novelGene_87725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	54.4729453504024	50	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	257	1789	606598	620414	FALSE	10	TTCCACCTGAGTTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGLQTVTLSDGTTAYIQQAVKEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVAVQKESLSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPKEGYDPSALEAVQLEDGSTAYIHHPVAMPSDSTILAVQAEVGLEDLAAEDDEGFSADTVVALEQYASKVLHDSQAPHNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQVTLITQDGAQQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	586961	621193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_587035_594436_594524_606501_606671_611577_611656_611769_611848_613067_613268_615363_615481_615814_615891_616485_616612_617737_617972_618078_618243_618950_619119_619648_619763_620309
678538	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678543	contig_15039_pilon	-	1293	6	Intergenic	novelGene_110140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	578.273153449129	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	107	526	198517	185257	FALSE	25	ACCAGAATGCTCCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPSSVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	200538	184489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191227_191273_197516_197618_198506_198565_200479
678544	contig_7009_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_23649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCATGTAGAAGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468157	465297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_465300_468200
678545	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678547	contig_10000_pilon	-	2952	1	Intergenic	novelGene_139322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208693	205741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_205700_208700
678553	contig_11115_pilon	+	2221	7	Intergenic	novelGene_102813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	609.511940453635	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	1182	2156	171704	173241	FALSE	45	ATCAATAAAGCCTTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165331	173306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165436_165553_165690_166252_166520_171029_171981_172339_172595_172714_172964_173047
678560	SIRV5	+	340	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-10	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8305	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
678561	contig_17274_pilon	+	2214	6	Intergenic	novelGene_26459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_3	231.708955372899	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAAGAGAAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6960	42692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_28001_30127_30212_31277_31349_36255_36337_42655
678568	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	100	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678573	contig_18231_pilon	-	2881	1	Intergenic	novelGene_105905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTTACATGCAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494030	491149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_491100_494000
678574	contig_12279_pilon	-	1091	7	Intergenic	novelGene_50096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTACTGGCAGTTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77633	57539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57591_68281_68471_69358_69445_71631_71709_75029_75094_76926_77081_77163
678578	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678580	contig_7179_pilon	+	699	4	Intergenic	novelGene_78085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	40.8357142163028	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	10	489	576847	579810	FALSE	25	ATGTTCTGGAGAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGVSHLKQEPEKVKVSSSVRHPETPLLISGFHLPSKVIPYTSRALNTLFLPFVTPPHFICLQ	576837	580020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657
678581	contig_10923_pilon	+	1607	10	Intergenic	novelGene_66187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	883.18000066818	5	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	51	1172	21667	38586	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGG	13828	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36689_38578_38742_42554
678588	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
678599	contig_4857_pilon	+	1992	4	Intergenic	novelGene_48830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	48.5249076935409	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCCAGCCCTCAGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1339046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335236_1335517_1336704_1338119_1338905
678602	scaffold_16539_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_68305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	639	1142	97552	103848	TRUE	5	TGTGCCAGCCGCCCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVFVFGCCPLLGIKIPDGDGIPGGIGWLHLVGVPPVRPENEQPIKEWLDVGYHRPALREDLQQAAMHLDVPVLIQVIDTGDATPVAVGIVNVPHIPQPVAWVTRHHGLGAPVDDVATQPPGAVPDDRIHMGHESADAPAAWLVAFHPGNLVPTDASRRDSPLAH	96913	105786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_97561_97825_97886_98110_98250_98677_98799_103673_104741_105753
678607	contig_11678_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_160827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAATGGCTTCCTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61740	60211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_60200_61700
678608	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678609	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
678614	contig_13894_pilon	+	1195	9	Intergenic	novelGene_62131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2527.45442280865	7	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	155	844	521729	526545	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEIN	521574	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525788_526537_526580_526851_526948_527459_527580_528072
678621	contig_6710_pilon	-	474	2	Intergenic	novelGene_98131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	10	CACCCATCTCGTCCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678634	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_97938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	40	TTTAACTTTAATCATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678639	contig_2027_pilon	+	1935	11	Intergenic	novelGene_39915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	215.669214307467	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	33	884	129185	134499	TRUE	20	ACCCAGATGTGGCATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKVLGGGPGQGRGMG	129007	136677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136359
678640	contig_15905_pilon	+	2610	3	Intergenic	novelGene_154708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	493	junction_2	22.5	37	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2143	2466	133097	135820	FALSE	20	AAAGATTGTTTTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMDDCKVFSKQIAFFNDTVLKIIFVVLLCRGNGDIKFLTKGDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFLPYVGMVTIIMNDYPKFKYALLAIMGAYVLLKRES	130954	135964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_133309_134885_134944_135766
678642	contig_9807_pilon	+	2879	15	Intergenic	novelGene_32861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	633.286378943288	1	162	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	924	1511	140826	154138	TRUE	15	TCGTTGTGGATCACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPVSGLGLASLSCSAVRANRPRALGERGGNKWRGCRSRSKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGQHYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVRLSCSRIRRSASASTPTTSLRWWRYTLGVTWWPTGMSTSTPSWAPR	109023	159768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109558_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145199_147119_147279_148960_149034_151709_151808_154095_154270_156624_156770_158676
678646	contig_12050_pilon	+	2455	6	Intergenic	novelGene_62656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_3	163.971460931468	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1515	1943	362088	363452	FALSE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	359671	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
678654	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_93492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
678656	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678661	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678668	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678674	contig_1516_pilon	+	1204	6	Intergenic	novelGene_49966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1317.07697573073	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	106	567	347241	363092	FALSE	10	AGCACCTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDTMRVVPVP	335176	363729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353563_363065
678679	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	115	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678680	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_94210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678683	contig_6227_pilon	-	1727	18	Intergenic	novelGene_49743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	436.919057693503	1	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1	477	1224979	1214224	TRUE	15	AGGTTATGGCTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQDWKGYTGKTITDVINIGIGTSHGD	1224979	1202620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202941_1203000_1203044_1203147_1203215_1203300_1203365_1203583_1203660_1204170_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206634_1211210_1211265_1213149_1213222_1214096_1214244_1214354_1214410_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
678684	SIRV7	+	292	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAAATGCGATAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	78963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
678694	contig_6710_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_97685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678696	contig_19744_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_120357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGTTTTCAAAGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48761	47876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_47900_48800
678705	contig_7182_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_117161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGTATCTTAATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890135	887835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887800_890100
678709	contig_14333_pilon	+	2483	1	Intergenic	novelGene_49106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2008	2316	343490	343798	NA	65	AAACCAAAAAACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLIICRIHYLQPLKPIMKSDRCQFKMCGRIHSFSAFLGGEVSKSLKTLYYFLTDSSAYNTVLPFPSTLQLRTVEIVGFILLTIQKIPSPKFFLPHSAAHLL	341482	343965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_341500_344000
678712	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_93503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678714	contig_593_pilon	-	1529	6	Intergenic	novelGene_101977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1393	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1099	1452	151237	146164	FALSE	20	TCCCCCGAGGCGGAAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLFRWHKITLQESFTKKVVVHCFSNYLGNIIRLKLYKGIAFAISSLFTSGQFESCNSAKLGEICLELGFKKASRYVAHIDYSRSKFFFSPGSRAGGPAPPASETWPAPAGSATGAA	153154	146086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_146252_147446_147573_148889_149001_151208_151420_151589_151653_152301
678717	contig_4364_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCGATTTGCAACTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018396	1019197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1018400_1019200
678719	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
678721	contig_14441_pilon	+	1032	5	Intergenic	novelGene_100497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	482.515543791078	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92585	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92708_121641_121691_125517_125902_126036_126283_126514
678727	contig_10627_pilon	-	1285	12	Intergenic	novelGene_59946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_5	41.0699866283505	841	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	12	1232	172150	167896	FALSE	25	TAGGAGTCGTCTGTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK	172161	167842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_167950_168059_168147_168251_168363_168444_168544_168647_168839_168959_169087_169387_169619_169698_169756_169934_170033_170341_170412_171485_171558_172126
678733	contig_5229_pilon	+	3469	13	Intergenic	novelGene_117704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	41.4584798992384	111	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	487	2022	615733	649813	FALSE	15	TTAGACACTTGTTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAPAVRKFSPDLKLLKDVKISVSFTESCRSKDRKVLYTGVERGTRAECGFVLSPISGDVHACPFGGSVGNGVGIGGESADKKDEENELDQEKRVEYAVLDELEDFTDNLELDEEGAGGFTAKAIVQRDRVDEEALNFSYEDDFDNDVDALLEEGLCAPKKRRMEEKYGGDSDHPSDGETSVQPMMTKIKTVLKSRGRPPTEPLPDGWIMTFHNSGVPVYLHRESRVVTWSRPYFLGTGSIRKHDPPLSSIPCLHYKKMKDNEEREQSSDLIPSGEVSPVKPLSRSAELEFPLEEPDSMGADSAPPDEKDPLGAEAAPGALGQVKAKVEVCKDESVDLEEFRNYLEKRFDFEQVTVKKFRTWAERRQFNREMKRKQAESERPILPANQKLITLSVQDAPTKKEFVINPNGKSEVCILHEYMQRVLKVRPVYNFFECENPSEPFGASVTIDGVTYGSGTASSKKLAKNKAARATLEILIPDFVKQTSEEKPKDSEELEYFNHISIEDSRVYELTSKAGLLSPYQILHECLKRNHGMGDTSIKFEVVPGKNQKSEYVMACGKHTVRGWCKNKRVGKQLASQKILQLLHPHVKNWGSLLRMYGRESSKMVKQETSDKSVIELQQYAKKNKPNLHILNKLQEEMKKLAEEREETRKKPKMTIVASAQPGGEPLCTVDV	614753	651260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_615174_615666_615827_618716_618860_619024_619308_623925_624124_624380_624483_625334_625434_627359_627443_644908_645010_645373_645481_646460_646589_648261_648376_649729
678734	contig_7202_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_17700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCAGGTTGGTCACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
678738	contig_15498_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_42706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTGATTGCAATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916255	917806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_916300_917800
678741	SIRV5	+	406	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7476	1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTGGTAGAGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
678754	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678755	contig_7272_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_25373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTTTTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619401	618673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_618700_619400
678757	contig_14925_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_55374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	344	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129481	128117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
678762	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
678763	contig_15114_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_121216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATAGTGTTGATGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973785	971777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_971800_973800
678765	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678773	contig_9345_pilon	-	1750	7	Intergenic	novelGene_24407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	2	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	37	975	176056	142100	TRUE	30	AGCTCAGGCCCAGACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176092	141244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141389_141468_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
678786	contig_817_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_132456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGCTCACCTCCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567735	565972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_566000_567700
678802	contig_7963_pilon	+	1280	6	Intergenic	novelGene_58605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	100.560429593354	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	81	836	293211	298445	FALSE	20	CCTATTGCCATTGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWRAQSEYSWRKMLSGVGGFLFGIIFLLVGIVIHFRAQKAYVKTQLSDDEVSTGVLPPQPYQGPN	293130	298889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296893_297098_297827_297939_298192_298225_298397
678805	contig_5338_pilon	+	2089	5	Intergenic	novelGene_114569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_4	35.1523470055699	211	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	611	1825	358573	360655	FALSE	5	ACTGCCTGGCTGGCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCSMEPGARAPFTEITQHLEWILEQMPEPALLTKAPLTHNQGSLPRWGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPGSPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVAPLPLVPPSPLSSTHLPLVTTPETLVQPGTPVRRCRSLPSSPELPRRMETALPGSGPPPVGPSAEERMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSAQPWSSQSGPPLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSVPRETDEGLPCPGCCLGPFSFSFLSMCPRPTPAVARYRNLNCEAGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS	357962	360919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_358615_358848_358933_359087_359178_359324_359440_359771
678824	contig_13954_pilon	+	1914	9	Intergenic	novelGene_130047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	85.7962703152066	672	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	169	1509	60851	89637	FALSE	20	GAACTGGTGCAGTTGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRVKRFLSKNGLVILGFTFILSLIALLAVGLTQNKNTPENFKFGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKINDNAEAGWTLGYMLNLTNMIPAELPQPKPFSRPTYISLMVAFSLVLAIVFILGSIIFHKSSYFQK	35391	90042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_35521_60811_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_89436
678826	contig_3942_pilon	+	552	5	Intergenic	novelGene_128642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	40	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176953	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176962_178331_178490_179045_179177_179714_179825_179974
678827	contig_6102_pilon	+	1555	13	Intergenic	novelGene_31772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	245.202793055508	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	184	1293	350018	357373	FALSE	15	TCCATCGTCTTCAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKKASKTAENATSGETLEENEAGD	349834	357635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355768_356536_356595_356746_356875_357038_357093_357307
678831	contig_15063_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_14432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
678838	contig_11386_pilon	+	2115	6	Intergenic	novelGene_82760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	311.655835818937	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	366	995	17940	20925	TRUE	25	GTTTGTAAGTCCTGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	7887	35111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_13558_13752_17844_18037_19625_20050_20816_21022_34087
678842	contig_5586_pilon	+	2097	13	Intergenic	novelGene_143531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	421.387415766853	3	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	77	1645	368997	430164	FALSE	50	CAAAAATCAATCAGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVQCKDKEATKLTEERDCSLNQSSGYRYGTDPTPQHYPSFGVTSIPNYNNFHAAGGQGLTVFGGVNSSSHTGTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	298151	430616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_298217_368985_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_416925_416960_417014_429955
678844	contig_14811_pilon	-	1623	2	Intergenic	novelGene_74477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1013	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	10	768	375682	357434	FALSE	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	375691	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102
678845	contig_17440_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_7607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTCCGCTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
678846	contig_12873_pilon	-	1718	7	Intergenic	novelGene_27202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1363	1695	17114	16042	FALSE	45	GTAAGAGGGTGAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGCFLLHCHHLGGEQLPTEVAETAFHLQVFFLSLRKAGLWSLFSTNPTVHNKENLQNLKPWASYSASPFLSTYGFQLLYLSSASILFTFLNSTATEQVLCSTEKSFYF	20427	16018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16230_16290_16416_17094_17254_17731_18012_18982_19256_19607_19700_19849
678853	contig_7151_pilon	-	1408	8	Intergenic	novelGene_40717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	143.304584998641	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	264	1151	241851	236361	TRUE	25	GTTTATCTTAACAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHEGSWGTICDDSWDLSDARVVCRQLGCGVAVNATGSAHFGEGTGPIWLDELGCNGKESRIWQCRSHGWGRHNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSETSRQTCAGRLEVFYNGAWGSVGRSDMSPATVGVVCRQLGCADRGSISPASSDKTLSRPMWVDHVQCPKGPDTLWQCPSSPWNQRLASPSEETWITCASKIRLQEGTTNCSGRVEIWHRGSWGTVCDDSWNLEDAEVVCRQLGCGSALAALKEAEFGQGTGPIWLNEVTCKGTESSLWDCPARPWGHSDCGHKEDAGVRCTGIVETKESPNSTGHSFLIALGILGVILLALLIAFLMWTQKRRQRQRLTVSSRGENSVHQVQYREMNSCLKADDLDALNSSGGHYEVH	243566	231785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_232012_236329_236384_237543_237640_239450_239559_239753_239790_240225_240535_241535_241857_243308
678854	contig_6062_pilon	-	1281	7	Intergenic	novelGene_5247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	176.03976823434	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	227	1120	569670	541389	FALSE	25	CTGTGTCATAAATTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	597528	541227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597374
678857	SIRV2	-	590	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	59	3083	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTTATCTAAGGAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
678860	contig_10986_pilon	-	2791	12	Intergenic	novelGene_71487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	194.818033343175	2	114	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	102	710	80340	73884	TRUE	50	TTCATTAAAACATGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGGSDGNFLLTCNS	80441	66814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71629_72178_72321_72913_73181_73643_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
678880	contig_12923_pilon	-	1790	17	Intergenic	novelGene_30151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	196.003258502888	22	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	5	1546	236117	225749	FALSE	0	CCCGTTTCTTGCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAVSERRGLARGSPVEWGPRLLLLLLLAGCSGRIHRLTLTVRPAVRHPAEQLWLLHQRHPGGRPEPPSAGPPEDGSSNLLVLFLINTKDLQVQVRKYGDQKKLFIFPGLLPEVPSNPGPPKPGPSATPKVDSVAPSMINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVMIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236121	225504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232799_234511_234602_235980
678881	contig_10857_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_160863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	3	521	22140	21622	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRQKERHPPEWRARFQEDHLPRHAQLATCLPAPESPALARRPGVSIALWLNGPWPLTPWPRPPAAPPAPQDRGHSPPPPWASLSSGGVLRLNPGVRVCVRVRWPPGASRAGRLGASTPSLVSLPPSGLQVEVWSKWGSGWVLLLIYCCKRTKPPSGNVKQVAGAWGCPAGAG	22142	20180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_20200_22100
678884	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_96298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678890	SIRV4	+	303	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1468	632	1013	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
678892	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678903	contig_753_pilon	-	1786	4	Intergenic	novelGene_112970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_3	296.304273040775	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	911	1321	1186997	1184123	FALSE	10	CTCTTTGTCTCAGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGKKIVYF	1188985	1183657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205
678910	contig_13224_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_104135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACAGCTAAAGGGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401612	399788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_399800_401600
678912	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678918	contig_9633_pilon	+	1378	5	Intergenic	novelGene_139587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	68.5291908605377	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	71	544	7299	131868	TRUE	15	GATCTGTGTGTTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCFDAKINFDDNAEFRQKDIFAMDDKSENEPIENEAAKYDLKYIGLDGNIACFVNGAGLAMATCDIISLNGGKPANFLDLGGGVKEAQVYQAFKLLTADPKVEAILVNIFGGIVNCAIIANGIIKACRELELKVPLVVRLEGTNVHEAQNLLNNSGLPITSAIDLEDAARKAVASVAKK	7228	132867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_7393_9721_9865_107131_107253_131752_132068_132232
678928	SIRV7	+	238	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCGTTCAAATCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	78909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78840
678935	contig_5083_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_151642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCCCTGTTGAAAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223737	221887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_221900_223700
678939	contig_854_pilon	+	3550	5	Intergenic	novelGene_36495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2473	junction_1	2924.4093741301	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	175	846	1649514	1672957	FALSE	40	ACTGTCAGAAACAGCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQVSAGAFFSTAALWTFGGII	1612771	1675661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803
678950	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678951	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
678953	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678960	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678963	contig_7915_pilon	+	1990	7	Intergenic	novelGene_42953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_5	67.497325049878	135	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	223	1173	39717	54161	FALSE	70	AAAAAAGGTATTAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRSLSPLGGPETLPFHSGGQWCEQVEITEESSMPLDYHDHKEADSHPGVRYITEALIKKLTKQDNLALVKSLNLSLCKDGGKKFRYIENLEKCVQLEVLNLSYNLIGKIEKVDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVWLGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQNVSKLKPLQDLTSVILVENPIVALPHYRQFTIFHLRSLESLEGQPVTTQDRQEAFERFSLEEVERLERDLEKKVMETEELKSKQTRFLEEIKNQDKLNKSLKEEALLQKQSYEELESDLNTKNELVSPYFAFPWQY	35874	54978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_35976_39595_39847_41330_41462_44610_44742_46251_46394_48108_48296_53931
678971	contig_3975_pilon	-	1119	10	Intergenic	novelGene_54873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	156.012424323225	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	216	1049	2097890	2091957	FALSE	20	CATGGTTTCTGGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHTGAVWCVDADWDTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099444	2091886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473_2097540_2097850_2098026_2099364
678980	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_97085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
678981	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678982	contig_9527_pilon	+	2149	9	Intergenic	novelGene_134045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	61.5360666601303	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	109	1182	412633	419761	TRUE	20	TCCCCCCCACAGGGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APWGRGEGEDELLSVLNFPEHRHTPCSRGSPSTAAPMEFPLAQICPQGSRQIPSPTFSTFLPTDLTRRSCQGLGLLSQPRSQALEAEEVQPSPRALAIEAPVSGHLGGCSPPSAPTLPQVSLQAQGTASNPEGAGKAEEVPGEGGLNLQAETRAWFQKTQAHWLPQHGAAPAWFHGFITRKEAERLLETKPQGCYLVRFSESAVAFVLTYRSRTCCRHFLLAQLRDGRYVVLGEDSAHARLQDLLRHYTGSPLSPYGEKLTEPCARQTPEPIGLPLRTEETDSGSKTQDPDPHYSTVLKQGHAPALLKKEGAGESKEPSQQPRPKPPIPAKPQLCPEVYTGLAPRPRPAPPRKPSNPIYHELDEPIAFYAMGRGSPGGSPQQHLCRGGGALKK	412524	422800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_412667_413212_413428_414398_414584_415418_415509_415644_415814_419182_419333_419530_419832_421698_421870_422074
678983	contig_4845_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_53626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCATCTGGCTGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222147	223435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_222100_223400
678986	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
678987	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	660	966	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
678993	contig_4519_pilon	-	3182	1	Intergenic	novelGene_123658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATACATGGAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61002	57820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_57800_61000
678994	contig_7963_pilon	+	1358	6	Intergenic	novelGene_58606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_5	29.0241278938748	679	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	81	914	293211	298445	FALSE	20	CCTATTGCCATTGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWRAQSEYSWRKMLSGVGGFLFGIIFLLVGIVIHFRAQKAYVKTQLSDDEVSTGVLPPQPYQGPN	293130	298889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815_297098_297827_297939_298192_298225_298397
678996	contig_11338_pilon	-	2293	12	Intergenic	novelGene_6295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_3	207.093223708032	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	623	2215	228022	196726	FALSE	35	CTCATTATACATATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	228644	196647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965
678997	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	114	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
678998	SIRV2	-	611	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	48	2958	-48	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGCGTAATTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
679003	contig_9363_pilon	-	1459	9	Intergenic	novelGene_6610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_7	1022.83166228613	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	148	1173	786587	774790	FALSE	40	GGAAATTTCATATACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGESRFCVLKAAPETAPHPNTHSPLETRTSQPLVS	787913	774503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
679006	contig_6710_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_97603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679007	contig_10581_pilon	+	1074	4	Intergenic	novelGene_41354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	418.197986073051	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	24	596	74587	87429	FALSE	10	TTCCGCCTTTGGGCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHERAQVGGGDKGEEKSSLKLNQCHKMKGNFQTAVLYPSASKSNLRPCFLKAQNCFLMTPFVKGLKERREVRLWD	74563	87907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85194_87206
679012	contig_8122_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_40268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCACTTTCAGCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748843	747578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_747600_748800
679018	contig_5916_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_158040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACTGCAACCCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339853	341888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_339900_341900
679019	contig_3560_pilon	-	1886	7	Intergenic	novelGene_149498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	29.6727521848281	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	283	597	206585	198131	FALSE	5	AGTCCTTGCTGTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRDATRGRAFALVSQAYTSIIVDDFAAFVGLPVEEAVKGILEQGWQADSTTRMVMPKKPVAGAADVSSNRFIPLSEPAPVPPIPNEQQLARLTDYVAFLEN	211011	196841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_198211_199031_199080_199798_199862_203206_203315_206569_206703_207915_207965_210895
679022	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1536	636	1081	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2536	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
679023	contig_12570_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_79347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTATAGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191280	189332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_189300_191300
679024	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
679026	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679028	contig_11855_pilon	+	2561	17	Intergenic	novelGene_66888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	70.3730017478294	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	225	2111	676574	727434	FALSE	35	TGCTGCAGAAATATGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDGYDSCSEDTSSSSSSEESEEEVAPLPSNLPIIKNNGQVYTYPDGKSGMATCEMCGMVGVRDAFYSKTKRFCSVSCSRSYSSNSKKASILARLQGKPPTKKAKVLQKQPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSMEGFSWGNYINSNSFIAAPVTCFKHAPMGTCWGDISENVRIEVPNTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFENDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDFSQKVSESMQYPFKTCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESEDRTDDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDTPPHLFAKVKEVDQSGEWFKEGMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQSSRESQSGSSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQESNGSANFYIKQEP	645218	727884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_645331_646208_646273_676525_676728_679840_679975_681245_681361_682427_682511_694126_694245_711191_711327_711601_711691_711906_712142_712738_712795_713127_713233_716703_716852_717594_717678_718075_718311_718797_718876_727315
679041	contig_513_pilon	-	1726	8	Intergenic	novelGene_80176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	394.121756800704	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	472	1263	452196	449687	FALSE	35	AGTGTTCTCAATGCGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454697	449223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453243_453443_454593
679042	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679048	contig_14711_pilon	+	2693	9	Intergenic	novelGene_68877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	111.585169265454	209	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	300	1643	58444	67289	TRUE	15	CATAGGATGTGGCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDCMETFAPGPRRLYGAAGPGAGLLRRATGSSCFAGLEPFAWPQPASLQSVETQSTSSEEMVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSCEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKKKKEVKEEGSPDSYELSPQLEELINKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLWDKFSELATKCIIKIVEFAKRVPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKVDKLQEPLLEALRLYTRRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGPMPPLIQEMLENPEMFEDDSSQPGPHPKASSEDEVPGGQGKGGQSPQPDQGP	58144	68389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_58595_63273_63423_63802_63945_64602_64764_64976_65154_65703_65909_66294_66454_67089_67561_67610
679052	contig_20487_pilon	-	2354	7	Intergenic	novelGene_154379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	80.0617816994406	359	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	27	839	22178	8358	FALSE	10	TACCCCTTGTCAGTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPLPKLLAATTPARSRRVLLPLLLLLLPTGALRGWEAEERPRTREEECHFYAGGQVYPGEPSRVSVADHSLHLSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFRSINTEVVACSIDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN	22204	6842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8409_12726_12762_13744_13876_15072_15196_17370_17488_18175_18294_21940
679053	contig_12019_pilon	+	703	3	Intergenic	novelGene_87651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACATGAAGTGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5407_6169_6226_8298
679059	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679060	contig_3942_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_128613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	498	800	142516	142818	NA	35	ATGAGCTCATGAACCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPLLDKPFPPLTAWKAPTSLPCDPEGQDKKGCIGGRAEAWVPQVQSATHLNPSLLAPLTPTQTDIQAARKSKFPAEAGALLGFLQQIRWGSRSLESHI	142018	143331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_142000_143300
679078	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679083	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679088	contig_2069_pilon	+	1994	8	Intergenic	novelGene_23280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	337.872938319984	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1230	1784	341330	347331	FALSE	30	CCCATACACATTTACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGKEDSEKLQHMPRII	334112	347541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_335002_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_347284
679092	contig_1639_pilon	+	2292	16	Intergenic	novelGene_74896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_14	153.123856911833	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	419	1813	289050	312997	FALSE	25	TTATAAATTGTTGTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQSES	286794	313476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827
679093	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679095	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27892	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
679101	contig_9646_pilon	+	3059	1	Intergenic	novelGene_117448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242512	245571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_242500_245600
679106	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_97343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679112	contig_5684_pilon	-	1697	5	Intergenic	novelGene_81007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	187.311238317406	293	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAAAATTTGAGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326663	312070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_313062_315407_315614_316149_316350_317643_317745_326464
679113	contig_5684_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_81006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCTTCTGCTGATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312020	311670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_311700_312000
679118	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_93549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679136	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679139	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
679141	SIRV7	-	340	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	12	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114726	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
679152	contig_7870_pilon	+	2417	2	Intergenic	novelGene_109059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1148	1486	670094	670432	FALSE	75	AAAAAAAAAAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASYTKQISNKWYVMKLLIFFSLLRSAQQMKNKLLHFFLFEKRMAKNEFISTLVFSGPTKGEKKKEVWEGIRQHFSKLQHKNTNHNSNENKTKKNTQNTKKYEASEHVEES	668638	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_669151_669458
679155	contig_665_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_158187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAAATTCATTCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84863	84416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_84400_84900
679159	contig_9091_pilon	+	2581	4	Intergenic	novelGene_32445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_3	94.7781034252579	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	55	351	80431	85913	TRUE	20	GCCACACCCATTCTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INGTVGGSKLATKLYVEVMLSCPLFKDYLCKDDFKTSKGGAHCFPELRVGVFEEIVPMGISPNMISYKKPGIHLSPGEFHKEVEKFLTLASQEQSDTILLDCRNFYESKIVSMNQA	80376	90169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_80482_81360_81467_85773_87271_89296
679160	SIRV5	+	410	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7479	2	-86	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
679164	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679172	contig_14441_pilon	+	839	4	Intergenic	novelGene_100778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	531.527568010875	132	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	251	799	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	122499	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_122601_125517_125902_126159_126283_126514
679173	contig_4891_pilon	-	2655	9	Intergenic	novelGene_124606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	43.4626276242015	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	317	1084	1045458	1031913	FALSE	15	CAATGGCGTTCTGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRRKRARGAKEHGAVAVERVSKSPGETSKPRPFAGGGYRLGAAPEEESAYVAGERRRHSGQDVHVVLKLWKSGFSLDNGELRNYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKPKGAFKAFTGEGQKLGSTAPQVLNTSSPAQQAENEAKASSSISINESEPTTNIQIRLADGGRLVQKFNHSHRISDIRLFIVDARPAMAATSFVLMTTFPNKELADESQTLKEANLLNAVIVQRLT	1053885	1030341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1032076_1034013_1034179_1040319_1040458_1040851_1040962_1042044_1042138_1042773_1042845_1045430_1045506_1051070_1051169_1053714
679174	contig_15720_pilon	-	1594	3	Intergenic	novelGene_41926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4703	junction_1	16.5	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	97	432	283894	282523	TRUE	35	TCACAGAAAGCACTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGRGGSGCAAGLSELSGAILVAAATPAPVAAMTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTQVPAHLALGPWGKAGQK	283990	281129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_281556_281786_282750_283785
679176	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679180	SIRV5	+	373	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	12	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
679183	contig_3942_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_128676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	37	junction_2	34.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTCCAGCCACTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404722	405834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_404796_404916_405099_405790
679184	contig_3942_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_128677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	513	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	210	389	406144	406323	NA	25	GAGGAGGTCTAATGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIPPSPLACPPVPAPPPRSPSPLPGHPPTPARSPCLRRGQSADKLGTGERLDGELGRRGRGPDAELVVMRRLHLSERRDSFKKQEAVQEVSFDEPLEEATGSPTSVPQIAVEGAEAIPGAPGPTGKD	405934	407845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_405900_407800
679187	contig_8017_pilon	-	1877	4	Intergenic	novelGene_65378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_3	60.1793615416079	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	66	575	1511273	1497417	FALSE	25	GAAACTCAGAGTGCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLYPSDG	1511338	1496114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1497568_1503095_1503195_1509748_1509876_1511140
679195	contig_12638_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_33227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATAAAACACTGTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618134	619852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_618100_619900
679197	contig_3721_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_123785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATCACATTGAATTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41053	40270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_40300_41100
679205	contig_8322_pilon	-	1920	7	Intergenic	novelGene_143281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	22.2086069401532	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	28	1146	569032	556238	FALSE	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGTAPPNSFYRALYPKIIRDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIR	569059	555463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560072_565004_565192_568827
679206	contig_9653_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_48334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054135	1056156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1054100_1056200
679213	SIRV4	-	301	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCATCGTATGTTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
679215	contig_7428_pilon	-	1851	11	Intergenic	novelGene_77729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	363	782	435008	434100	TRUE	35	TACAAGAGAGAAGCGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGMVGRRPSSATFMPISMLERSAKGTSRVTSSQRSTAKLHMSAERLFVSSGFFCRASGATQAGAYMRPGHWKENLTSAMLIRAVMSSSIITLRLLSACRGMRGSNVCRKAMPLAISNANFTAWLWSTTKLVPSCSTL	435370	429282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_429463_432552_432719_432891_432988_433154_433252_433358_433445_433547_433885_433992_434126_434211_434333_434428_434528_434639_434771_434965
679219	contig_5229_pilon	-	1507	10	Intergenic	novelGene_117716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.1729413394606	2	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	68	829	657076	655819	TRUE	25	CCTCCAGAATCACTGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGCGQDNSRALDSPMAPASQEEEGAGVAAVAGPGLYSYIREDLFTSEIFKLELQNVPRHASFSDVRRFLGRFGLQPHKTKLFGQPPCAFVTFRSAAERDKALRVLHGALWKGRPLSVRLARPKADPMAKKRRREGEGEPPATHIADVVTPLWTVPYAEQLEQKRLECEQVLQRLAKEIGSTNRALLPWLLTQRHKHNKACCPLEEVRPSPLQTEYRNKCEFLVGVGVDGADNTVGCRLGRYKGGTCAVAAPL	657613	652560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652637_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655474_655590_655758_655942_656197_656307_656546_657083_657552
679220	contig_4469_pilon	-	3457	16	Intergenic	novelGene_21922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAGAAGACCAAGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594880	518154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_518243_519771_519884_522734_522830_525561_525686_527063_527169_529296_529493_536316_536440_542766_542945_547094_547259_553343_553534_555655_555754_556484_556625_557413_557581_560483_560644_584182_584344_593524
679229	contig_15384_pilon	+	2623	9	Intergenic	novelGene_85125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	35.0169601764631	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	649	1083	84070	84679	FALSE	30	TTCGTAGCGCGTAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIGQPKDFLTGMCLFLQSLRQKQPERLCSGPGIVGNVLVDPSARIGQNCSIGPNVSLGPGVVVEDGVCIRRCTVLRDAHIRSHSWLESCIVGWRCRVGQWVRMENVTVLGEDVIVNDELYLNGASVLPHKSIGESVPEPRIIM	82483	86219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_82598_82707_82842_82959_83041_83130_83180_83318_83463_83665_83784_84061_84190_84280_84464_84547
679238	contig_6630_pilon	+	1187	2	Intergenic	novelGene_30721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTCATGTTGAGCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721653	731872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_721739_730770
679243	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679244	contig_9516_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_106145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	294	653	585191	585550	NA	25	TTTATAGAGTGATTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGCQGSRRGDLGLAGPFLCGYLFPGPTLCPLKLHHLLGGAMETKTSSFLYLRALSALVVVSCCRVGPNSWQPHAQWKEMLPDSSSPRSVVGWTIVIHRVCIGLFSEVDHQSILACQLH	584897	587196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_584900_587200
679247	contig_4105_pilon	+	2588	11	Intergenic	novelGene_21468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_10	100.106992762744	1	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	84	1370	60529	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58733	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
679249	contig_14923_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_157760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367748	369485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_367700_369500
679250	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679251	contig_14341_pilon	-	1032	6	Intergenic	novelGene_111885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	737.9633053208	252	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	440	955	728949	727088	FALSE	15	GACTCTGTGATGACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLQDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	730662	727010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728034_728948_729290_730563
679260	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679261	contig_1959_pilon	+	1742	15	Intergenic	novelGene_160931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	42.3050149002962	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1719	23	1741	16307	46080	FALSE	30	GTCAGTGCAAACACTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLSTEVMWRCSGLRRLTGRCANHKVWRWRSSKACERALQYKVGEKIHGFTINQVTPIPELFLTAVKLSHDNTGARYLHLAREDKNNLFSVQFRTTPMDSTGVPHILEHTVLCGSQKYPCRDPFFKMLNRSLSTFMNAFTASDYTLYPFSTQNPKDFQNLLSVYLDAAFFPCLRELDFWQEGWRLEHEDPADPQTPLIFKGIVFNEMKGAFTDNERIFSQHLQNRLLPDHTYSVISGGDPLCIPDLTWEQLKQFHATHYHPSNARFFTYGNFQLEKHLKQIDEETLSKFQKIEPSTIVPAQKPWDKPREYQITCGPDSLATDSSKQTTVSVSFLLPGITNTFEAFTLNLLSSLLIGGPNSPFYKALIESGLGTGFSPDVGYNGYTREAYFSVGLQGIAEKDIQTVRNIIDRTIDEVIEKGFEDDRIEALLHKTEIQMKHQSTSFGLTLTSYIASCWNHDGDPVELLKLGNQMAQFRQRLKESPVFLQEKIKQYFKNNQHKLTLSMKPDDKYYEKQTQMETEKLQQKVNSLSRKDKERIYEKGLELRTQQSKTQDASCLPALKVSDIERTIPFTELDVTLA	16284	46081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1959_pilon_+_16345_23211_23315_25750_25858_26207_26360_27072_27188_27263_27361_28772_28934_33348_33476_33746_33836_34735_34865_35490_35605_35811_35909_36495_36631_37863_38003_45964
679263	SIRV5	+	418	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	876	25	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	141	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
679274	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679278	contig_14441_pilon	+	826	5	Intergenic	novelGene_100420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.651485960052	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	229	657	116728	117610	FALSE	10	AGCCTGCTTGGCGCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPWAPCVPLCQHPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81878	117779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_82331_82353_116537_116963_117220_117344_117539
679279	contig_14807_pilon	-	866	6	Intergenic	novelGene_124669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13282	junction_2	3828.04437800818	23	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	39	680	39773	37336	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKVSSAPALPSPPHPAPPCPWIPDSVLCLPRSTSPRSGVLPSLMLMNLKTW	39916	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
679288	contig_7179_pilon	-	2176	17	Intergenic	novelGene_78180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_5	63.5090729246617	381	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	26	2056	1222971	1181125	FALSE	20	TGGATAGTGATTTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFRVHRVRFFNYVPSGIRCVAYNNQSNRLAVSRTDGTVEIYNLSANYFQEKFFPGHESRTTEALCWAKGQRLFSAGLNGEIIEYDLQALNIKYSMDAFGGPIWSMTASPSGSQLLIGCEDGSVKLFQITSDKIQFERNFDRQKSRILSLSWHPSGTHIAAGSIDYISVFDVKSGSATHKMIVDRRYMGVSKRKCIIWGVTFLSDGTVISVDSAGKVQFWDSATGTLVKSHLIANADVQSIAVSDQEDSFVVGTAEGTVFHFQLVSVTSNSNEKQWVRTKPFQHHTHDVRAVAHSPTALISGGTDTHLVIRPLMEKVEVKNYDAALRKITFPHRRLISCSKKRHLLLFQFAHHLELWRLGSTVATGKNGDILPLSKNADHLLQLKTKGPENIICSSISPCGSWIACSTASRFFLYRLSYERDSISLQRVPKMPAFLRSALQILFSEDSTKLFVASNQGSLHIIQLSEGCFKHLHTFQPQSVSPDGNWLAASGTSAGVRIYGLKELKPHCTVPAYNFPVTALGIAPNTNNLVIAHSDQQVFEYSIPDKQYTEWSRAIQKQGFHHLWLQRDTPITHISFHPKRPMHILLHDAYMFCIIDKSLPLPNDKTLLYNPLSLTNESDVIRRRTAHAFKISKKYKPLLFMELLDERTLVAVERPLDDIIAQLPPPIKKKKFGT	1224289	1181004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1181242_1182103_1182215_1183677_1183864_1185474_1185571_1194851_1194929_1196691_1196849_1198794_1198918_1200012_1200078_1200814_1200912_1206351_1206444_1206550_1206723_1209852_1210065_1215621_1215712_1217115_1217201_1218689_1218882_1222812_1222974_1224266
679292	contig_5928_pilon	+	2315	19	Intergenic	novelGene_40376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	32	junction_1	32.3331424202077	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	31	2100	252024	339464	FALSE	35	ACCCAGAATGGAACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSVSKGCFVFKPNFKKRKISVPVEDYFNKGKSVSEDSKLRFETYQLIWQQMKSETEQLQEELNKNLFDSLIEFLQKSHSGFQKNSTDWSCQIKLREIPTAALVLGVNVTDHDLTFRSLTEALQNNVTPYVVSLQAKDCPDVKHFLQKLASQLMDCCVDVESKEEESVQVTQKKTYYSVGFLSSWYRNVTQKTDPKLPSKKRTLSSEWQCPPVVLILKDMESFTTKVLQDFIIIISQHLHEFPLILIFGIATSPIIIHRLLPHAVSSLLCIELFQSVSCKEHLTIVLDKLLLTTQFPFKLSEKVLQVLTNIFLYHDFSIQNFIKGLQLSLLEHFYSQPLSVLCCNLPEAKRRINFLSHVQCENIRRLPSFRRYVENQASEKQVALLTNERFLKEETQSLLENLHVYHTNYFLVLRCLHKFTSSLPKYPLGRQIRELYCTCLEKNIWDSEEYASALQLLRMLAKDELMIILQKCLDVFKSSSGKQFGSTAKRIEEFLAQFQSLDAEAKEEEDASGSQPKGLQKTDLYHLQKSLLEMKELRRTSKKQTKFEVLREKVVNFIDSLVREYLLPPETQPLHEVVYFSAAHTLREHLNAAPRIALHTALNNPYYYLKNEALKSEEDCIPNIAPDICIAYKLHLECSRLINLVDWSEAFATVVTAAEMNANSTVSEEMNEIIQYPFKTSCIVSK	251993	339679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_252048_257799_257855_269044_269143_270201_270347_273365_273471_274968_275121_276355_276490_278851_279012_280227_280342_283038_283173_283668_283733_296735_296853_297697_297778_321799_321934_325165_325246_326408_326510_336413_336556_338271_338389_339350
679297	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	911	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679302	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
679312	SIRV7	-	258	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91667	1	-91661	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGACAAAACCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
679315	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
679317	contig_20641_pilon	-	2127	2	Intergenic	novelGene_52778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTCTGACTCTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14056	4862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_5228_12294
679318	contig_12312_pilon	-	2376	10	Intergenic	novelGene_63990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	26.3354429534716	323	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	119	1423	440934	436461	FALSE	10	GACTTTGGCTCTCCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVPLACLLLCALLVRDSDGSGELPRGSGASNCGCLNGGTCVSYKYFSNIQRCNCPKKFHGEHCEIDTSKTCYEGNGHSYRGKANMDTRGRPCLAWNSVSVLLKTYHAHRPDALQLGLGKHNYCRNPDHQKRPWCYVQVGLKQLVQECQVYDCSLGESPISPPEKSEFQCGQKAVKPRFKIVGGEFTTIENQPWFAAIYRKHRGGSVTYLCGGSLITPCWVVSATHCFINYQKKEDYIIYLGRSRLNSNTPGEMKFEVKELILHEDYSSETLAHHNDIALLKIRSNTGQCAQPSRTIQTICLPPQNDDARFGASCEITGFGKENPTDYIYPEQLKMTVVKLVSHKVCQQPSYYGSEVTHKMLCAADPQWETDSCQGDSGGPLVCSNEGRLTLTGIVSWGRGCALKDKPGVYTRVSRFLPWIHTHIGEEENGLSL	441052	435507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_436641_437328_437478_437806_437948_438602_438752_438972_439193_439378_439471_439630_439806_440124_440233_440379_440414_440877
679322	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_97307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653884_657472
679323	contig_8823_pilon	+	2086	6	Intergenic	novelGene_53058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.6489804071848	143	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	187	780	64423	84686	FALSE	10	TACCTGTGCGTCTGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIRKCFFPIPGFFRLMEGRENAGDLREEKAKRGGTRGWEEEKDLLQAIVSRARTWVCRLPLLLHSQVKSLEERHRRFQTPGPEPWTDGSICEHMTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	51778	85992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_76219_76301_76878_76985_80778_80833_84353
679339	contig_15066_pilon	-	1977	9	Intergenic	novelGene_149542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_6	156.400727300099	141	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	118	795	114591	113263	TRUE	5	AGGTCTCTTTTGCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRY	114708	111682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112847_112954_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
679341	contig_9437_pilon	+	3598	12	Intergenic	novelGene_141743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	131.767952812623	265	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	377	1087	527782	558005	FALSE	25	ATTTTTTTTATTGTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPEPETTKKTEEEDVECEEDLALACDSESPVKALETDISENKTETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQVKMVLSKLYENKKIANATHNIYAYRIYCEDKQTFLQDCEDDGETAAGGRLLHLMEILNVRNVLVIVSRWYGGILIGPDRFKHINNCARNILLEKNYITLPEESSKAVGKNKKVKKDKKRSEH	524067	560516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_524191_525312_525442_525697_525741_526424_526478_527753_527817_535608_535695_538464_538588_549658_549757_551903_551978_554779_554871_557035_557171_557936
679345	contig_2770_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_107435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAAGGAGTTGAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742934	743808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_742900_743800
679347	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679348	contig_7457_pilon	-	1892	4	Intergenic	novelGene_31280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_3	2158.13334980848	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161032	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_160767_161010
679351	contig_9345_pilon	-	984	2	Intergenic	novelGene_24594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	222	773	945464	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICSGASAPGAWSCSASRATSLAIRCSGRGGAEVAWVIEELLVAVGRLSPPLAAPGPSRPSLSQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945685	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945204_945361
679363	contig_10904_pilon	-	1723	8	Intergenic	novelGene_22781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	189	junction_6	197.347926469048	800	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	40	882	773328	757834	FALSE	5	GTGGTTTCTGATTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGIPRSKGEEQNPQERFGPGVDVLKSTPDMATVNGLPENDRKMDTSAPTAGNPQEVTYAQLDHWALTQGAAPAVSPQFTEPMAKSSMYASLTKR	773367	756992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759452_759496_759593_759723_769599_769885_772375_772412_773216
679364	contig_6710_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_89154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653688	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
679374	contig_13093_pilon	-	2364	6	Intergenic	novelGene_105220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	93.4815489816039	12	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	234	1694	80341	59026	TRUE	30	ACCATAACTCAGGCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQQIKSHQTPEDTLR	80574	57461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57847_58740_59071_59573_60773_77589_77717_80070_80127_80307
679390	contig_1150_pilon	-	3265	3	Intergenic	novelGene_61458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_2	40.5	664	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1026	3081	134	3214	335413	332333	FALSE	20	ACTACTCTTCTGTCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPTLQRSRLCRQRVERTSAEKRKQNKSSKYALPEKLRLWIRENMIVQSSLLICLFLLISGSCEFFAEANYSRSYPCDERKQNGSVLADCNSRRLQEVPQTVGRYVTELDLSDNFIKHITNESFQGLQNLTKINLNHNAVNNDGMNITDGAFLHLKNLRVLLLEDNQLHQIPAGLPKSLKELSLIQNNITVVTKKNTSGLKNLESLYLGWNCYFGHDCKKIFDIENGTFERLTHLKVLSLSFNDLSHVPPKLPRSLTELYLSNTNIQNIGQEDFKELKNLTILDLSGNCPRCFNAPFPCKPCYGNSSIQIHPLAFQTLTQLRYLNLSSTSLQKIPATWFYNMSQLKVLYLEFNYLVHEIASGAFLRYLPSLEILDLSFNYARTEYPQYINISENFSKLMSLQVLHLRGYVFQELRKEDFLPLLGLPNLKAINLGINFIKQIDFTIFQHFHKLSIIYLSENRISPLVNDIRQDYTNSSSSQSHILKPRSTHTEFDPHSNFYHDTRPLVKPQCSIYGKALDLSLNSIFFIGQKQFEAFGDIACLNLSANGNGQVLHGTEFSAVPHVKYLDLTNNRLDFDDDKALTELVELEVLDLSYNAHYFRIAGVTHRLGFIKNLTQLKVLNLSHNSIYTLTEYNLTSMSLEELVFSGNRLDLLWNDEDDRYWHFFTFLRNLTRLDLSFNNLRRIPNEAFSNLPQSLTELYINNNMLHFFNWTLLQQFPHLRLLDLSRNKLSTLTNSLSTFTSSLQTLLLRQNRISHLPSGFFSEARGLVHLDLSSNLIKMINKSTLQTKTATNLAVLELGGNPFDCTCDIGDFRRWMDENLNVSIPRLTDVICASPGDQRGKCIVSLELTTCVSDAIAAIFFFFTFFVTTMVMLTAVAHHLFYWDVWFIYHMCLAKIKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVLNELRYHLEESEDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTIFVLTKKYAKNWNFKTAFYLALQRLMEENMDVIIFILLEPVLQHSQYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQSLKNVVLTENDSRYNNLYVDSIK	349738	332281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_335420_346557_346616_349669
679391	contig_8153_pilon	-	2885	7	Intergenic	novelGene_34796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAACTTACCTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39350	26397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_26996_27082_27259_29108_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001
679393	contig_1301_pilon	+	1553	12	Intergenic	novelGene_47332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACAAAATGAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270308	322913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_270402_278296_278465_279344_279452_283357_283450_284683_284903_292184_292306_296602_296756_296904_297006_297694_297771_305266_305410_309750_309911_322793
679394	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679401	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679407	contig_15629_pilon	+	2311	3	Intergenic	novelGene_122469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	117	644	154510	160967	FALSE	40	CTTTACTTTTGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDIDGKTYDAFVSYLRECRPESYEEHAFAVEVLPSVLEKHFGYKLCIFERDVLPGGAVVDEVHSLIEKSRRLIIVLSQSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVSDFMFLPQSLELLKSHQVLKWKADKSLSYNSRFWKNLRYLMPAKKIKPGRDESEVLPVLSWT	154393	162634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_154523_158393_158553_160611
679410	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679419	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679425	contig_15304_pilon	-	1071	3	Intergenic	novelGene_30431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	199	1023	54100	52925	FALSE	10	CCTGCTTTTCCATCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54298	52876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
679426	contig_14553_pilon	+	1715	4	Intergenic	novelGene_125002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_3	135.534333493604	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	101	394	6238	14299	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLS	6137	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_6387_13796_13937_14294_14424_22455
679429	contig_1076_pilon	-	1719	14	Intergenic	novelGene_101096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	320.959231682728	3	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	178	1719	79519	51354	FALSE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAIS	79696	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60181_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
679430	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679438	contig_5574_pilon	-	1660	7	Intergenic	novelGene_155827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	640.353461422327	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	80	871	131406	59952	TRUE	30	AGTAAAAATGCCGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	131485	58944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_59230_59447_60155_78596_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363
679440	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
679443	contig_14441_pilon	+	1126	5	Intergenic	novelGene_100489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4878036686951	37	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	411	1124	113653	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	92180	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92270_92385_92701_113646_113711_116578_116963_117523
679446	contig_14322_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_116058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
679449	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679456	contig_12010_pilon	+	3282	2	Intergenic	novelGene_160945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	860	1180	184964	185284	FALSE	10	TTCCCGGCCAGTCCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECSLEGRMARLCLMYFGHVIRRDQSLEKDIMQDKVEGQQKRRRPSMRWTDRVAATMGSNIITIVRMARDRAVFRSIVHRIAESEPNNNNNKFKSL	183300	187386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_183420_184223
679462	contig_8683_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_150263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTTTGGTGTTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627378	627978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_627400_628000
679482	contig_9011_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_159334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAGATACCAAGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633876	634624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_633900_634600
679485	contig_9481_pilon	-	1895	3	Intergenic	novelGene_149682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_2	29.5	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATGAATTTAGCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481960	452831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_454595_477024_477091_481894
679494	contig_5062_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_157850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATATATTCCAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667737	666307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_666300_667700
679495	contig_5062_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_157849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666257	664676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_664700_666300
679499	contig_12884_pilon	-	1452	4	Intergenic	novelGene_105020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	23	1096	1238234	1233498	TRUE	45	CCAATAAAGCAATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAVRMGIVGPEFKDKLLSAERAVTGYKDPYSGKLISLFQAMKKGLILKDHGIRLLEAQIATGGIIDPEESHRLPVEVAYKRGLFDEEMNEILTDPSDDTKGFFDPNTEENLTYLQLMERCITDPQTELCLLPLKEKKRERKTSSKSSVRKRRVVIVDPETGKEMSVYEAYRKGLIDHQTYLELSEQECEWEEITISSSDGVVKSMIIDRRSGRQYDIDEAITKNLIDRSTLDQYRSGTLSITEFADMLSGNASGFRSRSSSVGSSSSYPLFSGVDPRGQHFSVFPGPPADSVGLAGWGSPGQPCLPACSEKPLPHGKMGLQSAGPAGPSPLFCSCGCRLSWGPFSALRLGLSVPP	1238256	1232940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1233016_1233216_1233757_1234927_1235741_1238232
679500	contig_13292_pilon	+	2168	20	Intergenic	novelGene_142922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_16	207.839406361174	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1992	177	2168	148568	548794	FALSE	60	CAAGAAAATTTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLSETRHPLQPEEQEVGIDPLSSYSSKSGGDANKNGRTSSTSDSDGTFNSYRKEWEELFVNNNYLATIRLKGINGQLRSSRFRSICWKLFLCVLPQDKSQWISKIEELRAWYSNVKEIHITNPRKVVGQQDLMINNPLSQDEGSLWNKFFQDKELRSMIEQDVKRTFPEMQFFQQENVRKILTDVLFCYARENEQLLYKQGMHELLAPIVFILHCDHQAFLHASESAQPSDEMKTLLNPEYLEHDAYAMFSQLMETAEPWFSTFEHDGQKGKEALMTPIPFARPQDLGPTIAIVTKVNQIQDNLLKKHDIELYMHLNRLEIAPQIYGLRWVRLLFGREFPLQDLLVVWDALFADGVSLSLVDYIFIAMLLYIRDALISSNYQTCLGLLMHYPPIGDVHSLILKALFLRDPKRNPRPVTYQFHQNLDYYKARGADLMNKSRTNAKGAPLNINKVSNSLINFGRKLISPAVAPGSAGGPVPGGSGGSSSTAGIPTRTSAEAPKPHLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRLMKSESMPVQLNKGDVVTGSDAQVYVPVQTLTDLQGQSSKNISSSPSIESLPGGREFTGSPPSSATKKDSLFSNISRSRSHSKTMGRKESEEELEAQISFLQGQLNDLDAMCKYCAKVMNTHLVNIQDMIV	66992	548794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_67134_148532_148665_241658_241726_262862_262972_264453_264544_264639_264715_265803_265872_288559_288663_295514_295604_297098_297150_297247_297318_302678_302852_373571_373715_389668_389776_426697_426784_445078_445390_449612_449679_471397_471562_516722_516823_548771
679513	contig_7887_pilon	+	1715	11	Intergenic	novelGene_124894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_9	87.5774514358576	277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	103	1653	337184	341054	FALSE	15	CCCGTGCTGTCTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLTVLLLLQAVSWASGARPCIPQSFGYSSVVCVCNATYCDSLDPLTLPALGNFSLYESTRSGRRMELSTGTVQTSRTGTGLLLTLQPEQKFQKVKGFGGAMTDAAALNILALSPAVQNLLLKSYFSEEGIEYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADITNDFQLHNFSLPEEDTKLKIPLIHRALEMTQRPISLFASPWTSPTWLKTNEAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLRFWAVTAENEPTAGLLSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPILANSTHRDVHLLILDDQRLLLPGWAQVVLADPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPAKATLGETHRLFPTTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGTQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDSPIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASAKNDLDTVALVRPDGSAVVVVLNRSSKDAPLTIADPAVGFLETMVPGYSIHTYLWRRQ	336574	341116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_336644_337150_337239_337503_337696_337808_337956_338262_338397_338619_338793_339030_339269_339579_339805_340204_340369_340720_340838_340948
679521	SIRV4	+	323	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	638	987	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
679522	contig_8631_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_121944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1260	1586	669379	669705	NA	40	ATCCCAGAATGACTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHHPEPRRTRWCPATTDCCDRDHNKRFLTEQEKNVEQNSDSQKKTRLTGLTEAWGTPETLAPGHPANSELKPHVKPTFQPKIRQAYKTNNYACEDVLLSSVKYT	668119	670546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_668100_670500
679524	contig_3426_pilon	-	2310	20	Intergenic	novelGene_57946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	383.909009302755	72	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	57	1214	443332	385096	TRUE	40	GTGCAGGAAGAAGCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPGVQGRGTRLGPSPFHMAEEEHLRKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPIPFPKEALAHEKFTQELKYVIQRFAEDPRQEVHSCLLSVRAGKDGWFQLYSPGGGSL	443388	367001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367348_368707_368800_377192_377264_378652_378759_379664_379812_381350_381399_382220_382362_382859_382977_385067_385177_388422_388472_388767_388795_390086_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_443308
679526	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_94784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
679527	scaffold_2602_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_127708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTTGGCTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78286	78837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_78300_78800
679533	contig_5954_pilon	-	1984	15	Intergenic	novelGene_28696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	320.655459129246	1	77	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	636	1811	956264	945449	TRUE	15	AGCGGGCCCGCGGGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRRDPGHCQQPADPLRPGRG	960587	945153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945507_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947549_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956413_956500_956705_956942_959766_959941_960474
679534	contig_7411_pilon	-	2307	5	Intergenic	novelGene_137025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	45.1469821804293	152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	841	1263	358572	356649	FALSE	25	GTACCAATTGTGCATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAIETTDIISKHLPGVCRVSTDLLREGAPIEPDPPVSHWKPEAVQYYEDGARIEAAFRNYIHRADARQEEDSYEIFICHANVIRYIVCRALQFPPEGWLRLSLNNGSITHLVIRPNGRVALRTLGDTGFMPPDKITRS	360664	355604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_356800_357904_358039_358263_358353_358523_358650_359901
679546	contig_8375_pilon	+	2114	10	Intergenic	novelGene_141264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	114.585242408339	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	214	1743	19906	64643	FALSE	35	CATACACAGAAACCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLGVLLTLLFCSSLEGQENSFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	19692	65014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_19940_20025_20053_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37291_51088_51140_59731_59755_64613
679550	contig_12201_pilon	-	1229	9	Intergenic	novelGene_159975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	296.748183440101	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	47	475	138975	125046	TRUE	25	TTAATTTTTGTCTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFEVGGIKAALQAVRMVGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLTVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYPIVAATVSVHLVEGLPLFC	139021	110300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329_124453_124992_125106_130805_130980_132873_132971_138877
679555	contig_8617_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_73481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATGAATTCCGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
679556	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679564	contig_5063_pilon	+	884	5	Intergenic	novelGene_109998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	15	TAATTTCTCTTGACTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
679566	contig_12869_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_75342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTATTATCCTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69976	68228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_68200_70000
679569	contig_14530_pilon	+	2430	8	Intergenic	novelGene_108440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	10.2180312812844	78	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	51	947	9663	35285	TRUE	50	ATTTGTAGAGGAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYELFSHPAERGYRAGLCSKAALFLLLAAVFTYIPPLLVAFRSHGFWLKRSSYEEQPTVRFQHQVLLVALLGPERGGFLAWSTFPAFNRLQGDHLRVPLVSTREEDKNQDGKIDMLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNVTTILMDPNPIWLVGRAAEAPFVINAVIRYPVEVIAVPIRVGSFGKHIWSSKRVKRTLVQAIPSSLVPSRVTCSPAG	9612	36854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10058_23780_23910_24255_24400_26701_26784_33247_33354_35158_35298_35383
679573	contig_4364_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_1134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCGGTGAAGCAGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
679574	contig_3975_pilon	-	2779	10	Intergenic	novelGene_54767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	133	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1875	2531	1975875	1968100	TRUE	35	CTGTGGAAGATATACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAAFGTGPWAAQVPQVRWQGWQSVSRGRCFHCSLMESPLLESQLGSLDSLHRGSGVQLFLQATWKFWSRGPLLLLEMWVKRPQAPLPPPSQALQRCSVLPAASGHPSGPAPEFDGLYRSTDARILNEKQLLGPSWCRGPGWKGCLQGALRSPPSSPPSRTGKARRQTIPGAHLVHCSRLLDLTAGYRGELGAIIGLSCARGRAHQGDDITFNGFVR	1986273	1961599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1961653_1965796_1965908_1968015_1968183_1970744_1970799_1972853_1972970_1973384_1973446_1973615_1973696_1975612_1976093_1983154_1983259_1984720
679579	contig_1532_pilon	-	2089	8	Intergenic	novelGene_37401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1451.09601083218	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	143	790	32217	15878	TRUE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTVDHK	35473	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17967_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
679585	contig_18671_pilon	-	2679	2	Intergenic	novelGene_150002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	0	251	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	147	896	56979	56230	FALSE	15	TATGTTGTGTTCTCTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDRLANSEANTRRISIVENCFGAAGQPLTIPGRVLIGEGVLTKLCRKKPKARQFFLFNDILVYGNIVIQKKKYNKQHIIPLENVTIDSIKDEGDLRNGWLIKTPTKSFAVYAATATEKSEWMNHINKCVTDLLSKSGKTPSNEHAAVWVPDSEATVCMRCQKAKFTPVNRRHHCRKCGFVVCGPCSEKRFLLPSQSSKPVRICDFCYDLLSTGDMARCQPTRSDSYGQSLKSPLNDVSDDDDDDDSSD	77803	54446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_-_56994_77671
679592	contig_11396_pilon	+	2416	8	Intergenic	novelGene_71351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.9268388878926	592	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	367	1227	509705	511723	FALSE	0	CTTTCTGCTCCTCGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPGRRSWAYTSCSGSTSPTRRWCLQATGRASPASCTAPLRVYSEQAEATEFPGPSLGSKSLPRKTPREGKPNRNLRYKSTLKKARQFELSQHTVILCTCSCAASVSLRKLNIRQVLVDEAGMATEPETLIPLVHFSKAEKVVLLGDHKQLRPVVKSEHLQNLGLERSLFERYHADAYLLDTQYRMHKDICAFPSTEFYKRKLKTWQGLRRPPSILGHADRESCTVIFGHLQGCEQSLLVSTDEGNENSKANLEEAVEVVRIAKQLTLDRTVNPKDIAILTPYNAQVAEITKRLLQEGVTGVTVSSITKSQGSEWRYVLVSTVRTCPEGEIDQRPTKSWLKKFLGFVVDPNQVNVAITRAQEGLCLIGDHLLLRCCPLWRRFLDFCHSQQSLVPAHLVRVRRRPAVSR	508876	512912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_508991_509134_509251_509568_509762_509941_510077_510227_510447_511027_511185_511275_511444_511598
679594	contig_16098_pilon	-	933	5	Intergenic	novelGene_45952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1657.28035875044	48	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4	501	352350	350466	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGAVAGWWDEAGGLVR	352353	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348434_350018_350076_350236_350643_350765_350889_352152
679598	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	45	TACTAATATTTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679599	contig_1865_pilon	-	2018	10	Intergenic	novelGene_103234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	76.945066182807	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	96	1307	87883	41886	FALSE	20	ATTTGGATTAATGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGLGSSGLFNNVGLQVQQQQQRNLALHEYLSMELLQEAGVSIPKGHVAKSPDEAFAIAKKLGSKDVVIKAQVLAGGRGKGTFESGLKGGVKIVFSPEEAKAVSSQMIGKKLFTKQTGKKGRICNQVLVCERRYPRREYYFAITMERSFQGPVLIGSSQGGVNIEDVAAETPDAIVKEPIDIVEGIKKEQAVRLAQKMGFPHNIVDSAAENMVKLYRLFLKYDATMVEINPMVEDSDGAVLCMDAKINFDSNSAYRQKKIFDLQDWTQEDERDKAATEANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIKLHGGTPANFLDVGGGATVLQVTEAFKLITSDKKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGTRVDDAKALITDSGLKILACDDLDEAAKMVVKLSEIVTLAKQAQVDVKFQLPL	87978	41174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52489_52962_53084_56299_56443_56538_56701_68472_68612_72073_72203_76048_76212_76399_76500_87792
679603	contig_4103_pilon	-	1684	18	Intergenic	novelGene_51910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	509.964528246038	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	44	721	91854	82760	TRUE	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTQMTLSSASSPKSSPT	91897	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82807_84694_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
679604	SIRV7	+	344	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTCTACCACTTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114680
679605	SIRV7	+	259	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCGCTAATTTGGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147681	147940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
679610	scaffold_6394_pilon	+	957	6	Intergenic	novelGene_110995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1396.53823434949	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	20	799	398216	406119	FALSE	10	TACTGTGTTTTGATTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNGEAGAGAGRRAGPCGRVAGLARGRGFARGRGHSPVLPSNSPPPAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398196	406277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398405_402081_402243_402864_402935_405319_405501_405717_405864_406086
679613	contig_12250_pilon	-	1033	10	Intergenic	novelGene_80693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	191.243300536254	604	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	62	340	401239	400074	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLPCAHSSLLARRKAPSPAMATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEASWGELGRAS	401300	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401200
679617	contig_15039_pilon	-	1588	7	Intergenic	novelGene_110123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	581.710600060049	731	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	142	585	200602	187835	TRUE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRGRRRRGRSELGFGGLTCPHSPAATGGGGQRVRRREPPPGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGPRAEGLVPLECDPPCGFSTRYSTAAT	260902	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_191223_191273_197516_197618_198506_198613_200448_200620_260778
679618	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679624	contig_10246_pilon	-	2144	2	Intergenic	novelGene_46880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	0	298	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	94	1515	45123	37933	FALSE	20	ACGCTGGTCTCCATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNADEHCIKERLEQLRCHFTWALLIVDTGMPDLENRILDEIEFLDTKYNAGIHNLLAYVKHLKGQNEEALESLKKAEELIQQEQADRSHLRSLVTWGNYAWVYYHMGRLAEAQAYLDRVENTCKKCGNGSRYRIECPEMDCEEGWALLKCGGQNYGRAKACFEKALEVDPENPEFSTGYAITIYRLDDVTIETQRKGYSLQPLRQAIRLNPEDVYIKVLLALKLQDVGKEDEGEKYIEEALAGTSSQTYVFRHVGRFYRRKGSLDKALQFLEKALQATPTSVFLHHQIGLCYRAQVIQIKGGTNKQLRGQERKKANRMIKSAIFYLESAVEQKPTFAIAYIHLASMYIEAGDYGKAEDVYQKALSIKPLEEDHEQEIHLHYGRFQEFQRKSEVDAITHYLKAIKIEKESFSRNRSIDSLEKLASKKLQRKASDVEGLSLLGFIHKLKGKINEALEYYERALRLTGDLNPMF	45216	37303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_39350_45118
679626	contig_13215_pilon	+	2383	5	Intergenic	novelGene_145879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	71.3477399782222	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	837	1313	27022	35589	FALSE	30	TCTATCATTTTGTTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLETLETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETEAE	26185	36659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_27188_27729_27768_29075_29223_32859_32954_35557
679627	contig_1275_pilon	+	912	2	Intergenic	novelGene_108820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	90	779	747279	747968	FALSE	25	TGCATGGTAGCATAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
679629	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_16623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
679635	contig_13787_pilon	-	2093	9	Intergenic	novelGene_40617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	758.986979054977	2	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	236	580	205032	179649	TRUE	20	TATACATGTCTTTTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEVF	205267	157978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_158818_158980_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179656_179760_179838_183751_183890_189120_189184_204972
679637	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679639	contig_1575_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_45167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGTCAAAAGACACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78289	77676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_77700_78300
679640	contig_6136_pilon	+	1377	6	Intergenic	novelGene_154107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_3	158.688373865258	601	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	13	1035	460110	494274	FALSE	10	TATGGGTATCGGCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDELLLPRLPELFETSKQLLDEVEVATEPTGSRIVQDKVFKGLDLLEKAAEMLSQLDLFSRNEDLEEISSTDLKYLLVPAFQGALAMKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	460097	494616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460680_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
679647	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_90628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679648	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679662	contig_6445_pilon	+	2805	14	Intergenic	novelGene_77117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	58.7112077644445	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	199	2106	1395023	1408718	FALSE	20	TGGTGAAGAGGTGGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFAAGGKMLSFAARTMVKPLGFLKPSSLTKVSGRFKAHQDALPRLPVPSLQRSLDHYLKALQPIVSEEEWTLTKQLVDEFRAPGGVGDRLQKGLERRAKKMENWLSEWWLKTAYLQYRQPVVIHSSPGVALPKQDFVDLQGQLRFASKLIEGVLDFKAMIDNETLPVEYLGGKPLCMNQYYQILSSCRMPGPKQDSVIDFSKTKKPPMHITVVHNNQFFELDVYHSDGTPFTSDQIFTQLEKIWNSSLQTNKEPVGILTSNHRNSWAKAYNTLIKDKVNRESVRSIQKSIFTVCLDAPMPRVSEDVYRSHVAGQMLHGGGSKLNSGNRWFDKTLQFIVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPVIALVDHVIAFTKKPEFVRSPMVPLPMPKKLRFNITPEIKSDIEKAKQNLSIMIQDLDITMLVFHHFGKDFPKSEKMSPDAFIQMALQLAYYRIYGQACATYESASLRMFHLGRTDTIRSASMDSLTFVKAMDDSNVTDHQKVELLRKAVQAHRAYTDLAIRGEAFDRHLLGLKLQAIEDLVSMPDIFMDTSYAIAMHFNLSTSQVPAKTDCVMFFGPVVPDGYGVCYNPMEAHINFSVSAYNSCAETNAARLAHYLEKALLDMRALIQSHPRAKL	1394824	1409417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1395077_1397402_1397667_1401090_1401210_1402447_1402502_1403117_1403284_1403663_1403839_1404457_1404637_1405235_1405337_1405677_1405798_1406075_1406199_1406298_1406435_1406654_1406718_1407663_1407802_1408502
679666	contig_13300_pilon	-	2188	4	Intergenic	novelGene_125813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	26.9196334794266	30	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	250728	248617	TRUE	20	TTAAACATTGTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250730	244157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_248782_250575
679675	contig_10126_pilon	-	2230	2	Intergenic	novelGene_105762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACCAGGGCTTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168954	166671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_168132_168184
679680	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679698	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_16726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27870	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
679701	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
679709	contig_9609_pilon	+	2020	9	Intergenic	novelGene_23162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	125.839121003764	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	304	780	825683	828402	FALSE	10	ACTTCCCACTGGTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSDDAKQLIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSALATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGGSLASQGCNNQ	821377	829642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825673_825715_826058_826184_827134_827221_827502_827584_828249
679710	contig_14666_pilon	+	1762	4	Intergenic	novelGene_39555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3229	junction_3	238.484101496655	2	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	125	1480	477340	484940	FALSE	50	TCCCTTTATTAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477215	485222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861
679716	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679718	contig_1309_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_73963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117866	120190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_117900_120200
679720	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679724	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	641	1113	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
679725	contig_18194_pilon	-	1919	5	Intergenic	novelGene_55951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	128	532	18897	4739	FALSE	10	CCTAAGCTCTTGCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTVKALARGGEDRVS	20413	3351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_4782_5296_5501_7034_7162_18866_18976_20364
679729	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
679735	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679736	contig_5423_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_85226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485198	483666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_483700_485200
679739	contig_14467_pilon	+	2134	11	Intergenic	novelGene_138279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	247.994435421442	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	381	1625	369732	387086	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGNKPTLTLGTNTNTSNFGTYKKQV	352192	387595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_354734_354961_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889_385028_386924
679741	contig_15518_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_127587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	585	803	15096	37386	TRUE	35	GGTAGGTTCAGGATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
679756	contig_7202_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_18580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAATGAATAGATGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
679758	contig_14341_pilon	-	871	6	Intergenic	novelGene_111823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGCGCGCCGCGGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551785	547736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_547804_548745_549002_549946_550151_550356_550483_551479_551579_551666
679765	contig_18272_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_7080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATTCACTGTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530589	529926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_529900_530600
679766	contig_8520_pilon	-	883	4	Intergenic	novelGene_85441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	38.3086877294897	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	387839	215717	FALSE	30	TATTTATGTGTTTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLVSGHLDSWDVGQGAMDDGGGAFISWEALSLIKDLGLRPKRTLRLVLWTAEEQGGIGAFQYYQLHKANISNYSLVMESDLGTFLPSGLQFTGSDKARAIMEEVMRLLQPINITQVFRNAEGTDINYWIQAGVPGASLLDDLFKYFSFHHSHGDTMTVMDPKEMNIAAALWAVVSYVVADMEEMLPRS	387892	215405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_292468_292671_321751_321844_387778
679770	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	648	1110	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
679777	contig_9668_pilon	-	2216	6	Intergenic	novelGene_58232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	696.494192366311	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	122	712	605373	578038	FALSE	55	ATAGAAACTGTGAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKYLSPWNPWMVQTVNMLGC	669987	576533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_578095_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_669866
679780	contig_8420_pilon	+	2419	14	Intergenic	novelGene_69343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	279.916153971931	1	129	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	5	1642	10943	51079	TRUE	20	CAGATCATATTTTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVVISHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10938	59220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_27001_29028_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
679781	scaffold_9100_pilon	+	1198	6	Intergenic	novelGene_83288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	443.459581021766	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	58	816	649053	654411	FALSE	40	AAACAATGCAACTATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRGDPKRAAVLKSLVVPLHCLGYKRILVGGLHVVLFIWSVIKAVKL	648995	654793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653422_654276
679785	contig_20602_pilon	-	1762	12	Intergenic	novelGene_133719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	296.929131428543	6	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	433	1419	24960	10026	FALSE	10	CTTCTTATTTTTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29557	9682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26218_26336_26429_26558_28884_28949_29483
679786	contig_20842_pilon	-	2086	6	Intergenic	novelGene_160975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	115.87130792392	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	937	1404	235273	147747	FALSE	65	AAACGAAAAAAAAGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPWKILMAAPLFFLLALHTSASPAYNDQPTTSHSGSRVCVGCVVVVSVIEQLAQVRNSTAQAAMERLCSYLPEKLFLKSTCYLVIHIFGSDIIKLLSADMNADVVCHTLEFCKQDAGRPLCHLYPPPKVAWELTLKKARHIVGKSQTLAKGRA	236209	147064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_147765_147843_147904_173524_173625_187148_187216_207155_207252_235146
679788	contig_7428_pilon	+	1871	12	Intergenic	novelGene_77722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	117.223456880333	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	718	1614	433375	435117	FALSE	35	AAAACAGGCTGGTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSRDFNEECPRLRIFSHPNVLPVLGACQSPPAPHPTLITHWMPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	428844	435374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_428900_429283_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433445_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
679793	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_115945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671626	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
679798	contig_12622_pilon	-	1332	8	Intergenic	novelGene_5931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2445.21309951522	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	18	581	1590968	1586566	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQRTMHATCTSLTP	1590985	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586605_1589536_1589691_1590000_1590234_1590830
679803	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679805	contig_16578_pilon	+	2397	2	Intergenic	novelGene_148636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATAAAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133974	136462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_135794_135884
679806	contig_12923_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_30200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCTTAGGTAAGACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534608	533811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_533800_534600
679813	SIRV7	-	279	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91647	0	-91641	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAATTAGCACGAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
679816	contig_821_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_149413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235907	238282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_235900_238300
679817	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679818	contig_13592_pilon	-	594	4	Intergenic	novelGene_33721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90.0900783783776	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309001	264233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_264461_266470_266679_298294_298362_308909
679819	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679820	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679821	contig_12644_pilon	+	1409	10	Intergenic	novelGene_44649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4641.51974100863	3	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	353	1324	2678073	2680545	FALSE	25	AAATATGTGTTGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675533_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
679824	contig_6069_pilon	+	1772	12	Intergenic	novelGene_8024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	123.711006879503	4617	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	109	1563	171996	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTAVEGPPLRRAAGALPGFSGCVFLRRAHFSQLEQMLENTAVRAQKQLILLHREEGPEPARTVEWLNMRSWCSGHLHLCCPRRVFSRRSMPKLVEMYERVFQRPPDRHSDFSRLARVLTGNAIALVLGGGGARGCSQVGIIRALAEFGIPVDMVGGTSIGAFMGALYSEERNYSRMRIRARQWAEDMTSVVNMVLDLTYPITSMFSGAGFNSSICRVFKDRQIEDLWLPYFTITTDITASAMRVHRDGSLWRYVRASMSLSGYMPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADVARSMGAKVVIAVDVGSQDETDLTNYGDALSGWWLLWKRWNPLATKVKVLNMAEIQTRLAYVCCVRQLETVRSSDYCEYLRPPIDSYGTLDFGKFDEICEVGYQHGRTVFDIWVRSGVLDKMLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	171887	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_172170_172421_172541_187715_187873_189103_189221_189403_189474_189793_189911_190478_190628_191492_191646_191883_191992_192360_192446_193297_193402_193545
679826	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
679830	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_89283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
679833	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679837	contig_4364_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_4552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCAACTCAAGGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533200_1533300
679839	contig_8673_pilon	-	2258	7	Intergenic	novelGene_129929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.969926569903	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	385	1050	338208	324321	TRUE	45	TATTTAAAGTAAAATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	350751	323008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_323263_323366_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_350387
679840	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	846	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
679841	contig_12019_pilon	+	2315	9	Intergenic	novelGene_87736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	139.68603187148	56	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	7	1008	623205	637915	TRUE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623198	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637992_641782_641874_642082
679851	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_91251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679856	contig_4125_pilon	-	2724	19	Intergenic	novelGene_25033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	80.429038580065	308	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	914	2287	58191	50223	FALSE	15	CATCTGGTTTTTTGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLWGTGEETLRVLAFLVLVKVCRHKKDAFLGPILKRMYITYVKNCKFTSPSALPTITFMQRTLTEVLALDSGAAYQHAFLYIRQLAVHLRNAMAMRKKETYQSVYNWQFMHCLHLWCRVLGTLCPSGALEPLIYPLAQVIIGCIKLVPTARFYPLRLHCLRALTLLSESTGTFIPVLPFLLEVFQQVNFNKKPGRMSAKPINFAVILKLSNVNLQEKVYRDGLLEQLCDLTLEYLQGQAHSIAFPELVLPAVLQLKSFLRECKVANYCRQVRQLLEKVQENVEYVRCRRQAVSFGVSDQPTVDAWEKQTRAEGTPLTKYYSHWRKLRDREIQLEISGKERLEDLNFPEIKRQRTEKRKEEDRKEFKDLFDLDSDDEEDVSGLSGTGAPGSLRVRHGAEEEEDDEDGGSSSGSEEEVSDLDDGGADAEAGLGPGELQRLAQGPEDELEDLQLSEED	62304	49785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_50330_50564_50670_51064_51201_52120_52235_52322_52467_53652_53755_54129_54244_56303_56416_57281_57422_57610_57800_58080_58195_58685_58797_58876_58957_59446_59538_59641_59763_60313_60449_60537_60713_61960_62105_62251
679859	contig_6589_pilon	+	2582	5	Intergenic	novelGene_26183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	33.3944231871131	15	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1711	2034	1903744	1911490	TRUE	30	ATAATATGATTTTCGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901832	1913555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1903448_1903648_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
679862	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_93530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679865	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_93652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679868	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
679869	contig_16510_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_139075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAAAAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237802	240198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_237800_240200
679872	SIRV4	+	342	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1429	632	974	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
679873	contig_4732_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_75494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	75	659	774215	774799	NA	40	AATGTCCCGGAGACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYICLIVGFFTLFPSFLSPAHLALCATHTTSQQAKPHHLAEEPLAHSLTGSAHSHLPNPNAPSFHLLFSFVFLLHFFLPLYFLPFSAFTHPLSSTHYIFSFPSAYLYHVLSAKPPSGIDAVPWSPPCTDPQIHPVVHGLCRNYPSPSLHPRWTHPAAPSLSDQLCPPGQVVRVIASTGKQATKHTQPACPDITK	774140	774860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_774100_774900
679875	SIRV5	-	338	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCTCTCTGCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8454_8590_10868
679876	contig_12638_pilon	-	129	2	Intergenic	novelGene_33062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCAGGAACCTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40753	39931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_39962_40654
679878	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	45	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
679879	contig_10437_pilon	+	1565	8	Intergenic	novelGene_38249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	126.599964535572	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	185	1021	397110	407700	FALSE	20	TCTCTTGTCTTCAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396419	408244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397108_397230_398632_398718_398955_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
679884	contig_2940_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_82002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGATTCTTCTAAATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176877	1176180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1176200_1176900
679885	contig_2940_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_82003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGCCTTATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177751	1177035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1177000_1177800
679898	SIRV6	+	865	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	172	-100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	5	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	92	424	1673	2560	TRUE	40	ATGGACGAAGAACCTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1475	11170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029
679906	contig_5020_pilon	+	1125	5	Intergenic	novelGene_27802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	80	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	368	811	122915	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118457	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123356_125657
679911	contig_12464_pilon	-	2490	5	Intergenic	novelGene_68717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.1969355656461	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACTTTAACTTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382175	375067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_376346_377990_379024_381087_381156_381583_381619_382099
679913	contig_7457_pilon	-	480	5	Intergenic	novelGene_31286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	34	444	160764	157884	FALSE	55	AAAAAAAAAAATGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161041	157847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
679918	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679923	contig_6163_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_103797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	439	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCAGTCTTGAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73653	73276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_73300_73700
679924	contig_13831_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_160987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAATGGATCTCTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65971	63351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_63400_66000
679930	contig_16148_pilon	-	2607	12	Intergenic	novelGene_50356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	445.259493474227	1	123	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	970	1941	111433	74773	TRUE	20	TTTGCAAAGCTTCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNTKFHKRMAMPQ	151735	58689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74808_74850_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_88989_89192_89311_111370_111453_150785
679931	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
679936	contig_15063_pilon	-	825	4	Intergenic	novelGene_10596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	87	410	35891	35108	TRUE	25	CTGAGGTAGTCACATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	35977	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27156_34599_34924_35035_35380_35839
679938	contig_9706_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_20847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2301	2734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
679939	contig_15063_pilon	+	1677	7	Intergenic	novelGene_9439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	241	1476	34808	39515	FALSE	10	CTTTGTGGTGTAGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27128	39716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
679943	contig_6217_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_109591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCAGAACAAAATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260465	262965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_260500_263000
679949	contig_7839_pilon	-	1526	9	Intergenic	novelGene_45676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	116.092568129919	766	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	157	1200	100162	96094	FALSE	25	GAACTGTAGCTACTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAPAGGARNGAGPEWGGFEENIQGGGSAVIDMENMDDTSGSSFEDMGELHQRLREEEVDADAAAAEEEDGEFLGMKGFKGQLSRQVADQMWQAGKRQASRAFSLYANIDILRPYFDVEPAQVRSRLLESMIPIKMVNFPQKIAGELYGPLMLVFTLVAILLHGMKTSDTIIREGTLMGTAIGTCFGYWLGVSSFIYFLAYLCNAQITMLQMLALLGYGLFGHCIVLFITYNIHLHALFYLFWLLVGGLSTLRMVAVLVSRTVGPTQRLLLCGTLAALHMLFLLYLHFAYHKVVEGILDTLEGPNIPPMQRVPRDIPAVLPAARLPAAMLNATAKAVMVTLQSH	100318	95767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_96243_96375_96500_96695_96810_97013_97146_97303_97397_97532_97579_98949_99057_99252_99451_100081
679951	contig_1337_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_84236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGAATGTAATACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180250	179001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_179000_180200
679952	contig_2646_pilon	+	2377	6	Intergenic	novelGene_69685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_5	173.601382482974	683	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	107	733	2313200	2333563	FALSE	20	ACCTCCTGGTATTTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDIDIGKEYIIPSPGYRNVSQRTSTSGQQREREESKYKRSRPVECQDALETAARAEGLSLDVSVHSQLRILDEEHPRGKYHHGLSVLKPIRTTSKHQHPVDNAGLFSCMTFSWLTSLARVAYKKGELLMEDVWPLSKYESSDVNCRRLERLWQEELNEVGPDAASLRRVVWIFCRTRLILSIVCLMITQLAGFSGPNFQDGCVLRSE	2309597	2335207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2309649_2313144_2313329_2329777_2329936_2330114_2330271_2330951_2331100_2333527
679964	contig_9333_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_120327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATGTAGAGCATAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260321	260008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_260000_260300
679968	contig_15327_pilon	-	1775	10	Intergenic	novelGene_70717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	284.398954695862	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	359	1087	965138	960518	TRUE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967491	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_959860_960173_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_966318_966599_967420
679969	contig_12312_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_64030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	11	334	572794	573117	NA	25	AAAAATTTTTTTTTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGPEQGHPRLGAGKSSHLQPSPCPAPASWGWKINCQALCQYQIRVVSGQDRTELQLASASLPSNSQLGEAVNFSSGSSEWDVGWLCEVLQIDDQAPYRIIQCWDLS	572783	574606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_572800_574600
679973	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679976	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679981	contig_9345_pilon	+	2693	2	Intergenic	novelGene_24480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	0	56	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1675	2130	630632	631087	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKCLVKTVFTDVYFDLILQHLFPCWDHSLQWLNSSPFGHIPQVAFGLDSGSEHREYHCPVLLRTVLALSVTHASLMSCIAPPSAGPALATTLSPFDPPALPIQFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGVSACCSLGPWIAGEGGLAW	628342	631650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_629160_629774
679989	contig_7428_pilon	+	2289	7	Intergenic	novelGene_77686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	312.471687606342	1035	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	71	1171	221272	223939	TRUE	10	GCCCTCTGTGACTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTRSVLSPSEACGLLLGSTCGHWDVFSSWNISLPAVPKPPPRPPSPPAPGAPVSRILFLTDLHWDHDYLEGADPDCVDPLCCRQGSGLPPTSRPGAGYWGEYSKCDLPLRTLESLLSGLGPAGPFDMVYWTGDIPAHNVWQQSRQDQLRALTTITALVRKFLGPVPVYPAVGNHESTPVNGFPPPFIEGNHSSSWLYEAMAKAWEPWLPAEALQTLRIGGVLCPVPTPPASASSLSI	221201	225742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221406_221453_221584_222563_223337_223875_224050_224356_224434_224643_224790_224957
679991	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_93605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
679992	SIRV6	+	786	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-383	72	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	109	330	100	429	2002	10736	TRUE	40	CATTCGCATGGAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1902	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
679995	contig_6418_pilon	+	2619	1	Intergenic	novelGene_81253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTATGATGCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461429	1464048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1461400_1464000
680002	contig_165_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_117071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAAGCCCCATCCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71733	69902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_69900_71700
680011	contig_8354_pilon	-	1892	6	Intergenic	novelGene_24125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_5	484.701145036815	2614	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	67	870	513617	500999	FALSE	10	CTGTGACTTGGGGGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	513683	499976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_501091_501670_501822_502359_502471_503634_503824_505824_505966_513497
680013	contig_11986_pilon	-	1580	7	Intergenic	novelGene_69201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1229.83978179635	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	122	1252	792566	734311	FALSE	20	AAAAGGTGTTTGTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPRRPRSPSPSASTALCRGLPPASLTTASWAGALRFEVELMSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	794706	733982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734792_755635_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
680019	contig_9696_pilon	-	1204	6	Intergenic	novelGene_68763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	384.551999084649	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	16	555	150836	136377	FALSE	5	CTTCTGTCTGTATTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVQDTMNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAAQVTKKKKKKRYRIPTNDELLYDPEKDNRDQAWVDAQRRSYHGFGIQSPRQQQPVPNSDAA	150851	135727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_138030_138092_139913_140032_140957_141057_146412_146595_150762
680020	contig_3747_pilon	-	1294	8	Intergenic	novelGene_24873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCCCAATAACTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201341_201489_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203125_203225_203271_204891
680027	contig_3397_pilon	+	3206	1	Intergenic	novelGene_154580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133461	136667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_133500_136700
680028	SIRV6	+	348	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	525	0	359	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
680030	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	19	357	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14427	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680031	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_90355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680035	contig_13542_pilon	+	1900	8	Intergenic	novelGene_131494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	947.078644666679	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	78	812	346638	500967	FALSE	20	GGGCCACTGCACCCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLR	346560	502055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886
680036	contig_19564_pilon	-	557	4	Intergenic	novelGene_29653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	68	394	28660	28010	TRUE	40	TTCAAGCTGAAGGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEVVAAGLQGSHESHSPKRRKMLSSLRFRARLRASRRLKPKFFSCSGSVTTYSSGGKKQPALWDWCSQSRERMGIPRPRAHRNLTVRRIRSVTKCEASVTEPARLPPRASTARSPRASTTPVKSTCRGG	28727	21532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_21556_27869_28207_28443_28569_28655
680042	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680047	SIRV7	+	1725	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTCTCTTGCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031	43048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1906_1943_2679_3015_3111_43027
680050	contig_6710_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_93718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
680058	contig_16385_pilon	+	1848	16	Intergenic	novelGene_86188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	211.375747583933	1	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	966	1667	24785	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4057_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22427_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
680064	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680067	contig_10792_pilon	-	2675	12	Intergenic	novelGene_161001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	28.537346850912	104	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	220	1845	219828	92213	FALSE	35	GCATATATGTATATGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAIIENMSTKKLCIVGGILLVFQIIAFLVGGLIAPGPTTAVSYMSVKCVDTHKNHHKTKWLMPWGPNKCDKIRDFNEAITKEIQANDIVFSVHIPLPSMEMSPWFQFMLFILQLDIAFKLNNQIRENAEVSMDVSLAYRDDMFAEWTEMAHERVPRKLKCTFTSPKTPEHEGRYYECDVLPFMEIGSVAHKYYLLNIRLPVNEKKKINVGIGEIKDIRLVGIHQNGGFTKVWFAMKTFLTPSIFIIMVWYWRRITMMSRPPVLLEKVIFALGISMTFINIPVEWFSIGFDWTWMLLFGDIRQGIFYAMLLSFWIIFCGEHMMDQHERNHIAGYWKQVGPIAVGSFCLFIFDMCERGVQLTNPFYSIWTTDVGTELAMAFIIVAGICLCLYFLFLCFMVFQVFRNISGKQSSLPAMNRVRRLHYEGLIFRFKFLMLITLACAAMTVIFFIVSQVTEGHWKWGGVTVQVNSAFFTGIYGMWNLYVFALMFLYAPSHKNYGEDQSNGDLCVPSDEERQPTTTITHVDGPTEIYRLTRKKAQE	220047	91382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_92323_102219_102374_111253_111338_112633_112778_114739_114804_115152_115251_116733_116903_120172_120310_121596_121759_128375_128501_172883_173157_219722
680077	contig_16846_pilon	-	1057	4	Intergenic	novelGene_82947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3812.94558051908	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	86	427	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552701_555109_555278_558688
680106	contig_3948_pilon	+	2369	4	Intergenic	novelGene_53380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.8954011539622	1	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	328	897	1814088	1860572	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813325	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1813895_1814070_1814520_1860434
680107	scaffold_4805_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_161021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATCTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416702	415334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_415300_416700
680111	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680112	contig_5765_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_141369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGACAGCGCTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491536	492144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_491500_492100
680116	contig_6710_pilon	-	151	1	Intergenic	novelGene_98333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCACAGAGCAGGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653868	653717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653700_653900
680117	contig_6710_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_89103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653617	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
680118	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680124	SIRV2	+	621	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-35	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
680132	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680133	contig_593_pilon	-	2459	7	Intergenic	novelGene_101973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.129049019376	8	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	94	780	118610	110585	TRUE	30	AGCAATAAAGTTTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSEIFVELQGFLAAEQDIREEIRKVVQSLEQTAREILTLLQGVHQGAGFQDIPKRCLKAREHFGTVKTHLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGIEPDREKGFHLDVEDYLSGVLILASELSRLSVNSVTAGDYSRPLHISTFINELDSGFRLLNLKNDSLRKRYDGLKYDVKKVEEVVYDLSIRGFNKETAAACVDK	118703	108844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_109741_109801_110819_113012_113093_113732_113849_116125_116223_117343_117438_118544
680135	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680138	contig_11429_pilon	+	1155	7	Intergenic	novelGene_60464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_3	760.773820235394	784	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	65	535	46162	48504	TRUE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45427	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899
680147	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
680151	contig_15245_pilon	+	2614	1	Intergenic	novelGene_145228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101396	104010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_101400_104000
680161	contig_5302_pilon	+	1623	8	Intergenic	novelGene_81482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	225.776754465872	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	59	814	318333	337399	FALSE	45	GTAATTAACATCACTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPKAMEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306727	338208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318292_318354_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
680164	contig_4180_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_8322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTCCCTTCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787416	788260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_787400_788300
680165	contig_4180_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_8323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788877	791135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_788900_791100
680171	contig_12270_pilon	-	292	2	Intergenic	novelGene_114108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTTTCACCATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14428	13913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680183	contig_18869_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_56006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTGATCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
680185	contig_16643_pilon	-	2271	4	Intergenic	novelGene_158131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	953	1507	298102	297548	TRUE	45	CAAACACACACAATTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFRSRFLLVYFRRLFFRPRCSLVYFRRMFFRSRFLLVYFRRLFFRPRCFLVYFRRMFFRSRFLLVYFRRLFFRPRCFLVYFRRMFFRPRCFSDGFRRGSSRHSHFFICFMREVFRFSCSWVCFCRKVFRHSSILYFRKEAFILSHFLVWFRIPFLGFSRFLVCFKRVAFRHIWFRVYFRRASF	300827	289156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_289321_291218_291318_297046_298363_300135
680187	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_89196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
680194	contig_4385_pilon	-	2775	16	Intergenic	novelGene_141504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	55.5141623572059	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2589	42	2630	344282	323422	FALSE	65	ATAAAGGGAAAATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFRIHHDVNELLSLLRIHGGDGAEVYIDLLQKNRTPYVTTTVSAHSAKVKIAEFSRTPEDFLKKYDELKSKNMRSLDPLVYLLSKLTEDKETLQYLQQNARERAELMAGAAASSAPSFSVPASAAKISTQELEELRRQLGSVATGSTLQQSLELTRKMLRDKQSKKNSGQHLPVFPAWVYERPALTGDFLTSSGVGTDAALPIGALPLTSQESAIVEDLLYVLAGVDGRYITAQPLIGRQSRTFLVDPNLDLSVRELVNRILPVAASYSTVTRFIEEKSSFEYGQVNHALAAAMRTLVKEYLILITQLEQLQRQGSLSLQKLWFYIQPTMRTMDILASLATSVDKGECLGGSTLSLLHDRSFNYTGDSQAQELCLYLTKAASGPYFEILEKWIYRGIIDDPYSEFMVEEHELRKEKIQEDYNDKYWDQRYTVVQPHIPSFLQKMADKILSTGKYLNVVRECGHDVTCPVAKEITYTLKERAYVEQIEKAFNYASKVLLDFLMQEKELVAHLRSIKRYFLMDQGDFFVHFMDLTEEELKKPVDDITPPRLEALLELALRMSTANTDPFKDDLKIDLMPHDLITQLLRVLAIETKQEKVLVSAEPTELTLSGLEAFSFDYVVKWPLSLIINRFAGAFTLRQRMLNFVQNIQYYMMFEVMEPTWHILEKNLKSASNIDDVLGHHTSFLDNCLKDCMLTTPELLKAFSKLMSVCVMFTNCMQRFTQSMKLDSELGRLTLEHGTMLGPPTEAERAEESARKKLAKKHLAEHMDAPQVTSGFEATISKFDKNFSAHLLDLLARLSIYSTSDCEHSMASVISRLDFNGFYTERLERLSAERSQKAAHHTPAPRGPPAAAPRIAVAAQ	344323	323276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_323558_324951_325116_325777_325907_326726_326871_327802_327924_329215_329389_333687_333869_335676_335858_336823_336970_337794_337985_338299_338500_338818_339027_340004_340165_342229_342407_343266_343396_344132
680195	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	60	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680206	contig_2867_pilon	+	3178	1	Intergenic	novelGene_135201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCATTTGTGGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885116	888294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_885100_888300
680208	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671637	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
680211	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_89061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653300_653900
680212	contig_15063_pilon	+	778	2	Intergenic	novelGene_14452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	153	641	36064	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35911	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
680213	SIRV2	-	259	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	400	2958	-400	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCCAAGAAGCGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
680216	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
680219	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
680229	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680231	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680232	contig_2636_pilon	-	727	3	Intergenic	novelGene_52063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	69.5	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	123	299	85555	62451	TRUE	25	AGTCATGGATCGAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMRKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62442_62624_85551
680237	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680238	contig_1275_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_108773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421995	419864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_419900_422000
680239	contig_7744_pilon	-	1758	12	Intergenic	novelGene_62504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	98.7044172439667	264	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	604	1494	823133	820841	FALSE	15	GCAACTTTGCTGCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSSVIHPAMVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELGKEAQEGRREVSRGPEKTGEGEGRLKYHLFSKRT	825061	820576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822894_823128_823221_823406_823501_823760_823968_824167_824304_824625_824670_825026
680242	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671661	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
680248	contig_12624_pilon	-	1659	4	Intergenic	novelGene_61113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	58	363	952979	948779	FALSE	20	ATTTTACTTTTCTAATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955836	947482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952999_955798
680249	contig_9895_pilon	-	1156	6	Intergenic	novelGene_144714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	34.7390270445216	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	179	655	492175	488899	FALSE	35	TACATGTATGTAGCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTFHSSLSLTSLDFCLGQHRSTGGIIRHGAKLLYAFAEATVPKVTVITRKAYGGAYDVMSSKHLRGDTNYAWPTAEIAVMGAKGAVEIIFKGHENVEAAQAEYVEKFANPFPAAVRGFVDDIIQPSSTRARICCDLDVLANKKVQRPWRKHANIPL	534034	488397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_489021_490090_490191_491240_491340_491759_491862_492121_492230_533910
680251	contig_12520_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_161072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495467	496155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_495500_496200
680252	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680254	contig_9609_pilon	-	1768	9	Intergenic	novelGene_23116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_8	88.8734177074338	731	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	398	1333	523112	521244	TRUE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERSERDPWSMRGLPEGRKTLYISQEPWFEGRQGIPSEQNHVALPVQARLPGGDGLGGHSGH	523954	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523297_523741
680260	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680266	contig_12414_pilon	+	2362	2	Intergenic	novelGene_59641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCACTTACGTTGGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754824	759645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_756664_759122
680275	contig_7025_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_104411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATATTTTGTGCTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386788	389209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_386800_389200
680277	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680285	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680289	contig_15063_pilon	+	1201	3	Intergenic	novelGene_14337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	238	1059	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35033	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
680290	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680296	contig_753_pilon	+	1949	2	Intergenic	novelGene_112989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCAGCAAATATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211535	1213621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1211751_1211887
680297	scaffold_9205_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_161105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGACCTGGCAGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274496	273998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_274000_274500
680300	contig_15354_pilon	-	1861	3	Intergenic	novelGene_65712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.5	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	429	1130	224459	223758	FALSE	25	TGCTATGCTCTTTGAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227737	223026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224591_224747_224922_227614
680306	contig_754_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_161110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGCAAGTGGGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158061	156399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_754_pilon_-_156400_158100
680309	SIRV6	+	1035	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	0	162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3366	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
680315	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680321	contig_12728_pilon	-	2190	3	Intergenic	novelGene_155810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	11.5	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAACCTGATCACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192119	189245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_189980_190221_190285_190726
680323	contig_15084_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_116692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATAAACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191321	189492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_189500_191300
680325	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680326	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680327	contig_12425_pilon	-	1081	8	Intergenic	novelGene_46702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	539.356608395974	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	3	872	210361	204225	FALSE	25	TCTGGAGTAGACAGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	210363	204015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302
680328	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	413	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680329	contig_14838_pilon	-	1597	4	Intergenic	novelGene_151906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_3	65.2192882171797	889	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	60	1403	112817	109062	FALSE	10	TTGTGGTCTCTTCATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCSVPTASQGLPPPLRSRTMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112876	108867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110129_110895_111007_111351_111461_112760
680330	contig_3975_pilon	-	2071	14	Intergenic	novelGene_54801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	322.054499412314	1	111	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	40	1476	2052412	2016131	FALSE	10	CTCTACTCTCCCGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052451	2015535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023274_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
680334	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680335	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680336	SIRV5	-	330	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAATGTATTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
680343	contig_7165_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_116854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	766	1194	341367	340939	NA	65	AGAAGAAAGATCTAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCLTTEYNKIDETKTDRIVRRNSWRLCYPLISNLLIQQAENQYSYVELNSIISHLDLIDIYRIFHLTTVECTFFLSSHGTFTKIDYILGCKTHLNKFEKIQIIQGLLSDHNEIKLEIIDRKTTRKSPDSWRLNNTFLNNM	342132	340066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_340100_342100
680352	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680353	contig_8616_pilon	+	1013	8	Intergenic	novelGene_72569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	997.457175184244	280	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	18	938	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLLISTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428728_435718_435900_435993_436119_436357
680357	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
680359	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680363	contig_5229_pilon	+	2500	6	Intergenic	novelGene_117701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	74.6281448248581	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	99	455	581989	593146	TRUE	25	TGCATGAACTCTTTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLAANRDEFYHRPSKLASFWGDNNEILSGLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPDNCQTRPSWTRARSMCSPF	565420	598106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_593087_593193_596107
680365	contig_14405_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_85637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1637	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415065	412817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_412800_415100
680366	contig_6823_pilon	-	2021	15	Intergenic	novelGene_131222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	22.8603792351638	29	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	404	1615	305325	248884	FALSE	20	TAGCCAGTTTCACTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVEFTKLAADPSVVNLGQGLPDISPPIHVKEELSKVAAIDGMNQYTRGFGHPSLVTALSCLYEKFYPNKINPNKEILVTVGAYGSLFSAIQGLIDEGDEVIIIMPFFDCYEPMVRMVGATPVFIPLRSKPVDGKKWSSSDWTLDPQELASKFSSKTKAIIVNTPHNPMGKVYTKEELQVIADLCIKYDTLCISDEVYEWLVYTGNKHFKIATFPGMWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325553	248477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288707_288803_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_313855_313947_320648_320750_325396
680367	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680368	contig_3386_pilon	-	1313	8	Intergenic	novelGene_34494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	810.004006036957	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	584	1153	406716	396549	FALSE	60	AAATAGTAACAAATAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTNLQEGEASLAAGAGPFLETGEERDLCLGREITSRLDPSLDLVADLGQMKGNRRPVCKRSSDVQEKTSFDRTSYAPWPV	412211	396388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_396575_404855_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406842_407702_407838_409398_409607_412096
680373	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
680375	contig_2069_pilon	-	2768	3	Intergenic	novelGene_23409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAAAAAATAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240514	1237365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1238029_1238369_1239827_1239866
680380	contig_1532_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_37374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGAGGTCGTAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12363	13396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_12400_13400
680394	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680404	SIRV5	-	366	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAAGATGCGTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	8277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8451_8590_10863
680409	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680411	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_97018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680412	contig_18850_pilon	+	911	4	Intergenic	novelGene_142445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	7.40870359029762	353	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	188043	189703	FALSE	15	GGAATTGGGTCTGTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKAPPGERRSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPAERRRPSPQPSPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHKRRRETPSPRPVRHRSSRSP	188041	190244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_188174_189191_189306_189414_189529_189693
680415	contig_11752_pilon	+	1141	7	Intergenic	novelGene_37628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1585.70149215488	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	87	863	84194	94236	TRUE	30	GGCTGGCAAGGCGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQDSV	84107	96547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94225_94410_96442
680418	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680421	scaffold_6394_pilon	+	672	6	Intergenic	novelGene_111021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1159.02552172073	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	24	371	402184	405754	TRUE	10	ACTGTGTTTTGATTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTPG	402160	406278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405063_405743_405864_406086
680431	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680432	contig_3789_pilon	+	1748	9	Intergenic	novelGene_79855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	220.280502995612	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	87	827	445610	472684	FALSE	30	AAGTTTTTTGAAGGCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVITGLAMDMQLLMIPLIMSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHKLGLWD	445523	473605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465169_465197_465816_465913_467056_467110_468585_468697_472202_472305_472662
680438	contig_14322_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_116475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671882	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
680439	contig_6589_pilon	+	1211	7	Intergenic	novelGene_26053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_1	831.120077566012	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	233	874	1726977	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPQCLPVANGVAHTDHNNYSNNNSSHFSSTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725893	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
680443	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680444	contig_2730_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_135380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACAGATGGTTTAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320650	319526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_319500_320600
680445	contig_2730_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_135379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAATAAAAGGGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319259	316959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_317000_319300
680447	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680451	contig_14925_pilon	+	1155	4	Intergenic	novelGene_55311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGCTACAGAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112094	130947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_112882_115796_116101_129436_129480_130926
680454	contig_5083_pilon	+	3273	1	Intergenic	novelGene_151694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383763	1387036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1383800_1387000
680455	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680456	contig_6589_pilon	+	1257	8	Intergenic	novelGene_26052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	811.385662849394	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	9	791	1725483	1731351	FALSE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEASTP	1725474	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731336
680457	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
680459	contig_7333_pilon	-	2347	5	Intergenic	novelGene_142821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	56.3443652905949	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	186	2276	406076	394458	FALSE	20	TGTCTCCTAGCTTAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGFPFPKSGVVSRPEQGEPWILDPLVSKERELPRGSHTGEGRMPADLLPSRSERRSWVEQDHWGFEDENVAGVHWGYEETKTLLAILSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATPQDSDSSSAPVLFRSPGGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407220	394386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_402472_403175_405092_405298_405761_406195_407153
680462	contig_6710_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_89546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGGTGATGTCTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
680468	contig_8464_pilon	+	1607	12	Intergenic	novelGene_125396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	292.271355857096	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	120	1508	869643	892583	FALSE	20	AGTGAACTTTGGTGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHSFCSPGNIGKLLGPLPMHPAAEDNYGYDACAILCLPCIPNILVIATESGMLYHCVVLEGEEEDDQTSEKSWDSRADLIPSLYVFECVELELALKLASGEDEPFDSDFSCPIKLHKDPKCPSRYHCTHEAGVHSVGLTWIHKLHKFLGSDEEDKDSLQELATEQKCFVEHILCTKPLPCRQPAPIRGFWIVPDILGPTMICITSTYECLIRPLLSTVHPASPSLLCTREDVEVAESPLRILAETPDSFEKHIRSILQRSVANPAFLKSSERDTAPPEECLQLISRATQVFREQYILKQDLAKEEIQRRVKLLCDQKKKQLEDLNYCREERKSLREMAERLADKYEEAKERQEDIMNRMKKVLHSFHSQLPVLSDSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQRKMEKVLSPQKPTITLSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF	869523	892682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_869853_870352_870501_872708_872808_884660_884752_887827_887930_889834_889994_890865_890989_891109_891176_891319_891401_891694_891822_891981_892101_892519
680475	contig_401_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_42896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAAAAAAAAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1811178	1810694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1810700_1811200
680476	contig_12139_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_146469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAGAGGAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103782	104836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_103800_104800
680488	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680491	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680492	contig_3721_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_123808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98361	96440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_96400_98400
680494	SIRV4	+	179	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1588	636	1133	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2588	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
680500	contig_13097_pilon	-	1580	14	Intergenic	novelGene_107725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	717	1064	245495	225296	TRUE	30	TTGATGTTAAGATTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFYCWYKRWRWSAWWRRKTLEVVQLLDIPFDPAIPLLGIYPGGGIRGGAVLTVGGGGRNGGGGRWVGGAPGGKNGGGLLKLLSTSVADLSERTCMLLFSFARRLPSTLLIVIV	264561	195173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_195201_195747_195856_196262_196400_205978_206082_215270_215380_225263_225358_226994_227152_230745_230790_241872_241895_243882_243937_245486_245544_253985_254198_263404_263544_264244
680502	contig_6102_pilon	-	1325	9	Intergenic	novelGene_32131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	360.310955113774	1	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	321	1325	821069	817400	FALSE	20	GTGTCTCGTGCGCGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDIIAILGMDELSEEDKLT	822089	817399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_817454_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
680516	contig_14441_pilon	-	1014	3	Intergenic	novelGene_100773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	169	417	126577	126329	TRUE	25	GAGCACAGGGGCACAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGLKKRQSQSPRGRGQGCSQGPPFSDGASAPITACLPARSPIVTAVKGCQGWGQALRSLCTHV	126745	122143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_122186_125515_125900_126157
680518	contig_8907_pilon	-	874	5	Intergenic	novelGene_85812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	28	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCATCCTTGCCTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179858	173354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178812_179100_179544_179839
680519	contig_12125_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_76201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79318	77624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_77600_79300
680521	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_89169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653698	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
680524	contig_8045_pilon	-	2395	2	Intergenic	novelGene_35473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1118	junction_1	0	3525	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	722	1990	587441	586173	FALSE	40	ATATTACTATCAATTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQWRRRHCCFAKMTWNAKRSLFRTHLIGVLSLVFLFAMFLFFNHHDWLPGKAGFKENPVTYTFRGFHSTKSETNHSSLRNIWKETVPQTLRPQTATNYNNTDLSPQGVTGLENTLSANGSIYNEKGTGHPNSYHFKYIINEPEKCQEKSPFLILLIAAEPGQIEARRAIRQTWGNESLAPGIQITRIFLLGISIKLNGYLQRAILEESRQYHDIIQQEYLDTYYNLTIKTLMGMNWVATYCPRIPYVMKTDSDMFVNTEYLIHKLLKPDLPPRHNYFTGYLMRGYAPNRNKDSKWYMPPDLYPSERYPVFCSGTGYVFSGDLAEKIFKVSLSIRRLHLEDVYVGICLAKLRIDPVPPPNEFVFNHWRVSYSSCKYSHLITSHQFQPSELIKYWNHLQQNKHNACANAAKEKGGRYRHRKLH	592615	585767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_587569_592021
680526	SIRV1	-	892	4	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3215	0	2795	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	48	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7571	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552
680531	contig_17440_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_7662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3582	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
680533	SIRV7	-	171	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76969	0	43750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
680542	contig_7202_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_18577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCGTGAATCAGTCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	28103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28115_29812
680547	contig_12852_pilon	-	1779	8	Intergenic	novelGene_141452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573125	558416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_558965_560763_560920_561118_561411_562499_562639_563419_563663_563830_563922_565487_565632_572959
680563	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680572	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680574	contig_15021_pilon	-	3093	13	Intergenic	novelGene_26962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	449.794829771185	1	178	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	52	888	269638	249355	TRUE	35	ATACTTTTGCTCACAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEQLTCRTSRR	279811	239892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251284_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
680575	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680588	contig_14209_pilon	+	1658	11	Intergenic	novelGene_88345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	217.253676608706	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	905	1333	38057	40625	TRUE	40	ATAAAGCTTGAATTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32351	40993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
680598	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680601	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680606	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680610	contig_383_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_126155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1031	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	747	23	769	416831	416085	NA	30	ATTGAAATATTGTTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIEEKKKKVPAVPVTLKKKRRNFAELKIKHLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANKFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVDGGDAGNREDQINRLIRRMN	416853	416024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_416000_416900
680611	contig_17366_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_161117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTACTGCTACATCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33680	31921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17366_pilon_-_31900_33700
680612	SIRV4	-	296	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAACCATCGTATGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2768	2472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
680614	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
680619	contig_1213_pilon	-	1952	13	Intergenic	novelGene_76474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	201.605155908496	2	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	570	1472	82743	71277	FALSE	20	AATGTTTTAGTTTCGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQRNENRDISEVIALGVPNPRTSNELQYDQRLFNQSKGMDSGFAGGEDEIYNVYDQAWRGGKDMAQSIYRPSKNLDKDMYGDDLEARIKTNRFVPDKEFSGSDRRQRGREGPVQFEEDPFGLDKFLEEAKQHGGSKRPSDSSRPKEHEHEGKKRRKE	101784	70796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_71476_71553_71718_73622_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84345_85432_85529_92927_93090_96621_96776_101761
680623	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680627	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680634	contig_16098_pilon	-	1574	9	Intergenic	novelGene_46137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	276	1370	458816	456273	FALSE	5	GGGGGAGTCTGTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460402	456068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
680646	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_114013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	23	343	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14431	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680663	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680670	contig_3916_pilon	+	2017	3	Intergenic	novelGene_141860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAGAAGTAAAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48434	86481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_+_50176_62071_62141_86274
680676	contig_7457_pilon	-	3129	1	Intergenic	novelGene_31590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	773	1096	946693	946370	NA	35	AAATGAGGAAGCTCTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQEPERGTFSYSLVYLHHYCHLWPIFSLTMSNIESIQRKTASQELFPNLPRIPVSVKSTPTHGDPMYYRVELLHRVFLVAIFTEADLQAFLPWCHWVGSYQQPLG	947465	944336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_944300_947500
680680	contig_13224_pilon	+	2162	7	Intergenic	novelGene_104094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	482	junction_6	268.21555386169	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1053	1934	242339	250897	FALSE	50	GGAAACAAACATTAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEDIRLEPDLYEACKSDIKNYCSTVQYGNAQIIECLKENKKQLSTRCHQKVFKLQETEMMDPELDYTLMRVCKQMIKRFCPEADSKTMLQCLKQNKNSELMDPKCKQMITKRQITQNTDYRLNPVLRKACKADIPKFCHGILTKAKDDSELEGQVISCLKLRYADQRLSPDCEDQIRIIIQESALDYRLDPQLQLHCSEEISSLCAEEAAAQEQTGQVEECLKVNLLKIKTELCKKEVLNMLKESKADIFVDPVLHTACALDIKHHCAAITPGRGRRKSLPTQFCVHSDLI	241286	251125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_242438_245181_245320_246693_246818_247551_247695_247891_247994_249058_249167_250729
680689	contig_11656_pilon	-	2397	12	Intergenic	novelGene_53990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	137.531724364277	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	73	1623	382728	372983	FALSE	35	AAATATATTTTTCACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QESHARFRRGARSYRVTCRDEQTQMTYLQHESWLRPTVRSNRVEYCWCNSGRSQCHSVPVRSCSEPRCFNGGTCRQALYFSDFVCQCPEGFTGKRCEIDTKATCYEDQGVTYRGTWSTVESGAECINWNSSALALKPYNGRRPGALKLGLGNHNYCRNPDRDSKPWCYIFKAGKYTSEFCSTPTCDNGENKDCYFGKGLDYQGTHSLTTSGTTCLKWNSMILLGKIYTAWKSNAQALGLGKHNYCRNPDGDAKPWCHVLKDHELTWEYCDMPQCSACGLRQYKQPQFRIKGGLYTDITSHPWQAAIFAKNRRSPGERFLCGGTLINSCWVVSAAHCFQERFPTHHLKVVLGRTYRLVSGEEEQKFEVEKYVVHKEFDDNTYNNDIALLQLKSDSLHCAQESNTVRPACLPEAGLQLPDWTECELSGYGKHEATSPFYSERLKEGHVRLYPSSRCTSEHMFNKTITNNMLCAGDTRSGGNEANVHDACQGDSGGPLVCMKDNRMTLVGIISWGLGCGQKDVPGVYTKVTNYIDWIQDNMRP	384560	372208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_373142_374456_374624_375761_375903_376101_376239_376342_376539_378102_378189_378740_378916_381003_381096_381237_381413_381790_381902_382616_382755_384514
680691	contig_10176_pilon	-	1447	10	Intergenic	novelGene_72735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	35	ATTCACATTTAAGTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
680698	contig_5210_pilon	-	2062	10	Intergenic	novelGene_65441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCGTCCGCACCGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618291	565740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_565823_591286_591358_606726_606861_608378_608456_610961_611101_613061_613146_613241_613337_614669_614847_616478_616651_617260
680699	contig_17753_pilon	+	2298	10	Intergenic	novelGene_105051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	293.477279495785	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1047	1553	131420	137949	TRUE	20	TTATTGATTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLR	45460	144358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96221_130836_131726_137748_137950_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093_143328_144193
680700	contig_5947_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_101582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTACCATGTTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842216	844524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_842200_844500
680702	contig_11677_pilon	-	963	5	Intergenic	novelGene_85925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	14089.3831372243	1854	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598063	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_596035_597197_597397_597749
680710	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_93498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
680720	contig_5280_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_52653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCCATCCCAGCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276921	277190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_276900_277200
680725	contig_15687_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_129154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAGTTACCTACAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250368	250994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_250400_251000
680728	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680731	contig_13349_pilon	-	2825	19	Intergenic	novelGene_161127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	179.783580458475	4	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	78	1982	290967	229085	FALSE	35	AGCAAACCCCCAACATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSEGSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKNEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTTEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVRDQQIAFPTLSPTAESWSGMCPKMQFSLEQWPLACGSWPGRAGTPWLQEPERQHAAPWLSCLEEGGFLALRLKYLLSTREGPV	294295	228241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_229133_229200_229409_234531_234638_235549_235685_236844_236985_237663_237774_238053_238114_270978_271111_271521_271620_274916_274992_276017_276123_276597_276674_277015_277139_281507_281674_283361_283484_285319_285461_286030_286084_290960_291022_294272
680743	contig_10496_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_59406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAAATCTCTTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31994	32531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_32000_32500
680745	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680746	contig_5684_pilon	-	2483	1	Intergenic	novelGene_81059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATGTAGTAACTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411138	408655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_408700_411100
680747	contig_10011_pilon	-	1937	2	Intergenic	novelGene_68049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	0	233	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATGAATTCTTCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212678	193079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_194845_212506
680748	contig_3627_pilon	+	1904	7	Intergenic	novelGene_78537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	287.45748477915	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	443	808	670480	676255	FALSE	40	AAAAAAGTTTGCAGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	642268	677351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_667857_668023_670408_670520_672027_672097_673913_674057_676141
680757	contig_5791_pilon	-	2498	9	Intergenic	novelGene_35868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	393.179328519443	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	141	1730	1088908	1080104	FALSE	35	CTGTGAGGAGCAATTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESDDLSLIRKNRMALFQHLTCVLPILDSLLTARVINEQEHDVIKQKRQTPLQARELIDTILVKGNSAATIFRHFLHENDPVLYKNLFVHQDIKYIPTEDVSGKTVLML	1094415	1079335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080169_1080455_1080711_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1088925_1090667_1090729_1094352
680763	contig_10857_pilon	-	1826	2	Intergenic	novelGene_160862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	184	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1	492	22149	21512	FALSE	85	AAAAAAAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELQRQKERHPPEWRARFQEDHLPRHAQLATCLPAPESPALARRPGVSIALWLNGPWPLTPWPRPPAAPPAPQDRGHSPPPPWASLSSGGVLRLNPGVRVCVRVRWPPGASRAGRLGASTPSLVSLPPSGLQVEVWSKWGSGWVLLLIYCCKRTKPPSGNEPC	22149	20177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21524_21669
680775	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680783	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680787	SIRV6	-	268	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTAGCTTCTTCGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
680789	contig_10263_pilon	-	2631	13	Intergenic	novelGene_135823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_12	61.8079462708657	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2382	250	2631	749756	536736	FALSE	50	AATCTGAAGCACAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSARSVGKVEPSNQSPGRSPRLPRSPRLGHRRTNSTGGSSGSSVGGGSGKTLSMENIQSLNAAYATSGPMYLSDHENVGSETPKSTMTLGRSGGRLPYGVRMTAMGSSPNIASSGVASDTIAFGEHHLPPVSMASTVPHSLRQARDNTIMDLQTQLKEVLKENDLLRKDVEVKESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQDELRIQRDLNQLFQQDSSSRTGEPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELFLLRKTLEEMELRIETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEAEMHVHHLESLLEQKEKENNMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKDSKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGALSTEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKVEQLKEELSSKEAQGEELKKRAAGLQAEIGQVKQELSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQEMAEEKGTQAGEIHDLKDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALAEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDLKDLKEKVSLLQGDLSEKEASLLDLKEHASSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKMESQLKKAHEATLEARASPEMSDRIQQLEREITRYKDESSKAQAEVDRLLEILKEVENEKNDKDKKIAELERQVKDQNKKVA	791172	536735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_536767_583052_583247_591313_591455_592453_592595_593946_594085_624400_624569_642889_643058_646220_646305_647597_647754_659920_659996_692554_692972_749087_749912_791078
680792	SIRV2	-	594	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4260	53	3085	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
680793	contig_6589_pilon	+	1425	9	Intergenic	novelGene_26021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	918.583284193654	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	115	744	1725483	1729051	TRUE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLPIQWFLGRKDVAICSQKVTALEILWSSSTLHTCGRHESESTGSWSGRCKKWCWRRSRTTAPTRRRRRPRRAGTTCSSSCAAAAGILRRTGSRSSA	1725368	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1727965_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
680795	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680798	contig_6164_pilon	-	3289	2	Intergenic	novelGene_121263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	162	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	75	2216	268036	265895	FALSE	25	TCTGAGTTTTGCAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLKPYWKLQKKELPLEISKETLRTPMSHQRGAVNDETCRASSVKPSVFPSASLGKASSRKPLGIISPNVLCSMSGKSPVESSLSIKTKKNVPPATIHQGEEGEGPLDIWAVVKPGNTKEKIAFFAAHQCSNRIGSMKIKSSWDIDGRATKRRKKSGDLKKAKIQLERMREVNSRCYQPEPFACGIEHCSVHYVSDSGDGVYAGRPLSVIQMVAFLEQRASALLASCAKNCTNSPAVVRFSGQSRGVSPSSEPFSAPGACEEPTERGHPEVGEPQSEPVRVLDMVARLESECLKQQSQREPGSLSRNNSFRRNVGRVLLANGTQADEGKTKKGTLEPPDTQVAPVGSVSEDCGPSRADQCSPKGDQAWDGTPRGCPSLPAGVNFHMDGAEMEPGQQTAMKNSNRYDVEMTEELVGSPFPPRTCPQATELPADAVGCMSRELVPLTSQNPDQRRKESSCISITVSKAEKDQPPSLNPCGDPLPGMLFFLPPAQQELDCSLLNENTRESSEASQLEDAAEVDSASEEKNVSAEPFVLPASSVQSTLPVLEVSSWKKQVSHDFLETRFKIQQLLEPQQYMAFLPHHIMVKIFRLLPTKSLVALKCTCCYFKFIIEYYNIRPADSRWVRDPRYREDPCKQCKKKYVKGDVSLCRWHPKPYCQALPYGPGYWMCCHRSQKGFPGCKLGLHDNHWVPACHTFNRAIHKKAKGTETEEEY	354030	264821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_268047_353966
680799	contig_9848_pilon	+	1321	12	Intergenic	novelGene_79920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	183.008738444664	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	355	1056	80009	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58888	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_60189_60263_75091_75162_77678_77721_78015_78123_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
680804	contig_18869_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_56217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73745	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
680806	contig_6710_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_96466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
680807	contig_6576_pilon	-	1568	14	Intergenic	novelGene_42226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	90.8858442574559	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	34	1284	261331	229096	TRUE	15	CCTAAAGCTGTGCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGRGRCESGKMAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261364	228692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261258
680815	contig_14142_pilon	-	1888	12	Intergenic	novelGene_120601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	134.147692137379	6	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	72	419	598441	592004	TRUE	30	CCTTCATAAGTAATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCWTTSPPAHLASRACSPQQPEMTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKE	598512	584544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585592_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
680817	contig_4232_pilon	+	1789	8	Intergenic	novelGene_63174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	43.0196917417015	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	52	567	117183	119151	TRUE	20	GACTGATTCTTACTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLLLGVLQRRSVLGVTMTSELDIFVGNTTLIDEDVYRLWLDGYSVSDAVALRVRSGILEQTGATAAVLQSDTMDHYRTFHMLERLLHAPPKLLHQLIFQIPPSRQALLIERYYTFDEAFVREVLGKKLSKGTKKDLDDISTKTGITLKSCRRQFDNFKRVFKVVEEMRGSLVDNIQQHFLLSDRLAR	117131	121339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117670_117881_118009_119046_119160_119630_119765_120102_120212_120280_120691_120778
680821	contig_5302_pilon	+	2150	3	Intergenic	novelGene_81500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	6	797	342315	355700	FALSE	25	TCCATGATTTTATTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342309	357053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
680827	contig_9011_pilon	+	3273	3	Intergenic	novelGene_159279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	57.5	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	320	790	172037	190435	FALSE	35	AGTTACAGAAATTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKRDSEIAVIVQDTETVPSVMDGEEYQAGQFAQGLRLQCFRVVLGYLSDLNEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFISKPILAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLRPSVGTKEAMVPMEVWT	171717	192918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_172165_188379_188498_190210
680828	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680841	contig_14005_pilon	+	1867	2	Intergenic	novelGene_154721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	154	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTCTAAAGCCTCAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774	18784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_892_17034
680846	contig_5136_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_126629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAGATGGGTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266840	266266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_266300_266800
680847	contig_15047_pilon	+	1243	6	Intergenic	novelGene_52243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	3	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	349	384	3482	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRSADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2575	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2751_3308_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
680848	contig_12864_pilon	-	1605	7	Intergenic	novelGene_76384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	576.478871155647	2366	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	72	638	223293	217842	TRUE	20	TGTATTTGCACTTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRSLSLPFPTVCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223364	214842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215792_217823_217908_218501_218546_219172_219329_219914_220137_220625_220650_223238
680849	contig_16882_pilon	-	694	2	Intergenic	novelGene_148208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4752	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATTCTGTCTTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183245	181936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659
680860	contig_14441_pilon	+	1164	5	Intergenic	novelGene_100385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.891959540887	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	138	1124	47111	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPLLCLVVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVITTKQRATMDCVPIRQHNRVYWYRQKLGEELKFLTYLQNKEALDKSGLPDGRFSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSGMYFCASSPSTYERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	46973	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47160_67434_67737_122144_122188_125517_125902_126496
680862	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680867	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680877	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
680884	contig_8617_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_73417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62571	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
680889	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
680919	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_18778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
680921	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
680927	contig_8538_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_4817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842770	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
680930	contig_5020_pilon	+	1160	7	Intergenic	novelGene_27870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1237.29832251114	69	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	395	847	123325	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQSSSSTPKALNALLPIGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118468	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122885_123256_123364_124428_124547_124909_125091_125657
680931	contig_16650_pilon	-	1221	2	Intergenic	novelGene_61980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGTTAACATCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255976	254431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_254640_254963
680933	contig_13074_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_153443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536670	538915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_536700_538900
680949	contig_10017_pilon	-	2723	23	Intergenic	novelGene_157000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	25	junction_12	39.7754284797009	320	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	74	2569	414343	359979	FALSE	10	AGCCCGACCCTCTCTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSGEQAPDYRWILSIGDEAVRLEALNEHLSTRSYVQGHALSQADVDAFRQFSAPPTDLRLFHVVRWFRHVEAVLSGPHSPGQPCGLQASKGRRGQPQWSPPTGTESGKLRLYNSLTRNKDVFIPQNGKKVTWYCCGPTVYDASHMGHARSYISFDILRRVLKDYFKYDVFYCMNITDIDDKIIRRARQNHLFERYREKQPQAAQLLEDIRAALQPFSAKVKETTDPNKRQMLERTQRTVELAAEPLEKAVQAKLPAEEISSCAEVLLEAAKDLLSDWLDSRFGSEVTDNSIFSKLPKFWEEEFHKDMAALNVLPPDVLTRVSEYVPEVVNFVQRIVDNGYGYASNGSVYFDTVKFASSEKHSYAKLVPEAVGDQKALQEGEGDLSVSAEHLSEKRSPSDFALWKASKPGEPSWPCPWGKGRPGWHIECSAMAGTLLGASMDIHGGGFDLRFPHHDNELAQSEAYFENDCWVRYFLHTGHLTIAGCKMSKSLKNFITIQDALKKHSARQLRLTFLMHSWKDTLDYSSNTMESALQYEKFMNEFFLNVKGLLRAPVDVTGQFEKWEEEEAELNKNFYDRKAAVHEALCDNVDTRAVLEEMRALVSQCNLYMAARKAARRRPNRALLESVARYLTHLLKIFGAIEEDSTLGFPVGGHGAGLDVEATVMPYLQALSEFREGVRRIAREKKVPEVLQLSDTLRDDVLPELGVRLEDHEGLPTVVKLVDRATLLTEREEKRRGEEERRRKKEEAARKKREHEAAKLAKMRIPPSKMFLSESDKYSKFDDTGLPTHDAEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLHQEYLQTVQNGSVQ	414416	359824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_360114_360435_360520_361207_361268_362791_362860_363404_363486_367782_367865_368899_368969_369696_369887_370272_370371_370796_370901_371003_371134_371455_371585_372135_372249_381993_382116_385023_385113_385335_385477_391388_391539_392560_392660_392825_392923_394200_394290_395116_395209_403794_404044_414318
680953	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
680957	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680965	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
680966	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_93689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
680970	contig_14441_pilon	+	1440	6	Intergenic	novelGene_100328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	374.877793420736	6	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	298	1254	6011	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	5713	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6899_113154_113209_116578_116963_117220_117344_117539
680972	contig_11720_pilon	+	1366	10	Intergenic	novelGene_43934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.808594641961	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	13	1128	262271	272210	FALSE	60	AAAAATCATTCAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262328_266197_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
680976	contig_14513_pilon	-	1174	3	Intergenic	novelGene_70392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	184	552	18880	11982	FALSE	5	GCCACCTTCCTTGCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
680978	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
680979	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
680984	contig_12079_pilon	-	1471	4	Intergenic	novelGene_67447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	601.983573050147	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGCGGAGGCTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638744	579725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580964_601782_601879_609185_609274_638695
680995	contig_8978_pilon	-	2296	11	Intergenic	novelGene_49396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCGCGCGACCGCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348138	331588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_331653_339796_339964_340939_341130_342364_342568_343329_343447_343638_343835_344179_344259_344690_344795_345355_345395_345625_345737_347112
681015	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_16510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
681016	contig_12301_pilon	-	1878	9	Intergenic	novelGene_110026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	280.069606303504	1	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	385	1032	115919	102891	FALSE	50	TGACAAATAAAGTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136712	102044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116166_129132_129265_130605_130698_136643
681022	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
681026	contig_513_pilon	-	1891	9	Intergenic	novelGene_80172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	531.113688394491	1	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	290	1366	453017	449542	FALSE	35	TTTGGCCAAAACCAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRVMEAHHEGNPCPLVEMFICPQEMMDILLKTAIPAEITQVLVIQEIMRHHQEIIHTVIMVIPVHVMTIHPEAIVIEMAMVVTVTIQIIQVEVPTETPMRVMVTHVVLHLHEGPRHLMVEAVAMMITAAHVTDMVEVETVTQAAEVISTQVAVIGLADKKEGFPLLWKGGTLLHVIPTAVQAAEHQEVVAVEEADLIEGEAEADTKNKQNFGPKSLFKETKQKVETCSVITTQGLLKGKIVLLLKIFLLSSPP	454678	449016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451104_451621_451775_452192_452358_453013_453117_453312_453421_454596
681039	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
681041	SIRV6	+	927	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	61	540	11	6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	197	688	1733	10736	TRUE	30	GCCTAATTGTTGGTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1148	11285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
681044	contig_5023_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_7103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23176	20496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_20500_23200
681045	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681048	contig_4496_pilon	-	2242	2	Intergenic	novelGene_66619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCCGTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591754	589361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_590035_590185
681053	contig_9014_pilon	-	2058	10	Intergenic	novelGene_106719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90.4101764183657	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	43	1497	46682	41867	FALSE	15	ACTCATTTCTTCTTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHLAQSSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51583	41305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42927_43128_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44541_44790_45016_46504_46693_51551
681054	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681055	contig_6589_pilon	+	967	7	Intergenic	novelGene_26111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3546.64655774374	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	49	459	1878483	1880585	FALSE	30	TTTGTAAACAAGATTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGNCRRWRRGRSWYLMAEAISWAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876578	1881093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878504_1879270_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
681061	contig_10904_pilon	-	1514	7	Intergenic	novelGene_22744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	356.179612929582	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	280	1263	662171	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662773	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662323_662445_662665
681062	contig_4950_pilon	+	2938	8	Intergenic	novelGene_150641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_6	24.2655378372418	120	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	94	1410	269895	274786	FALSE	25	TCACCCTAAAGATTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNRSPASAHKSYSRSAVPAPTKRRNSVLWSEMLDISTKESLTTKEIKRQEAIYEMSRGEQDLIEDLNLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDAYIPLHEDLLARIGDATKPDGTVEQIGHILVNWLPGLNAYKVYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLIKEILRHTPKDHPDVQLLEEALLIIQEVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELKNKNGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSDKAKNIFRVRFQDPSPGQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRTAIAPFQQAASPTELKDLPELNEECEENNLSASNIKAQRRVSTVSSVIQVEVDEHASECGSSVQTAADTKSVKAHRTQSGFRKAREKTQLSGKRKETLV	269801	276314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4950_pilon_+_269952_270359_270423_270891_270989_271126_271204_271910_272169_272628_272800_273815_274003_274379
681065	contig_5954_pilon	+	2832	32	Intergenic	novelGene_28497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	131.667311650751	274	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	931	2469	411743	420257	FALSE	25	AAAGATGGTTTGATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRPALEVQVLDSPDEAMGTIKRAPFLGPSLPEPPAEDSLSSPPGTPPLPPPGPDSPPLLPTTWATMKHQADLERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGSTFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSLAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHILPLEAGLRPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTVLVSFQRCVRIVNLQGEPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLGTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIVLESIPTDNPGAHSNLYILTGHQSSY	408282	420620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_408384_408506_408565_408783_408875_408957_409023_409302_409359_409667_409716_409807_409851_410239_410313_410389_410522_410598_410662_411009_411092_411179_411289_411733_411813_411904_411964_412495_412540_412619_412659_412745_412780_412879_412986_413066_413156_413233_413276_413351_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_418055_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
681067	contig_6710_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_98013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
681072	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681082	contig_233_pilon	-	1027	6	Intergenic	novelGene_14584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1601.7037678672	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	121	588	104176	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	104296	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91502_99779_99870_101673_101770_104152
681085	contig_18869_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_56361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73363	73779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73800
681086	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
681091	contig_5999_pilon	+	1621	2	Intergenic	novelGene_45652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTACACGATAAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273151	275325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_274020_274572
681092	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
681098	contig_7457_pilon	-	1616	5	Intergenic	novelGene_31608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	146	1408	962606	956489	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962751	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955549_956415_956939_958234_958375_960225_960896_962603
681102	contig_6589_pilon	-	2713	6	Intergenic	novelGene_25692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	10.0319489631876	152	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	38	805	151092	145009	FALSE	45	CAAACCAAGGTTAGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPCSPWRLHSLMGHTSVVCTQMASSMTWTAADILATPMQRGLLTPCGAGPRPRLPQLPSTRPSTPHRPLSATPRVSLSAMDPRPTALQGGLDPVPSLEALGPGLPAYPTDEFTSQTLSPPAAYAPYPSPVLSEEEDFVLNSPALEVSDSESDEALLTGTAEGRGSDAGARKKLRLYQFLLGLLTRGDMRECVWWVEPGAGVFQFSSKHKELLARRWGQQKGNRKRMTYQKLARALRNYAKTGEIRKVKRKLTYQFDSALLPAARRA	152104	143100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_145308_146978_147136_148483_148700_148982_149056_151069_151098_152072
681107	contig_10500_pilon	+	2751	1	Intergenic	novelGene_41193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378625	1381376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1378600_1381400
681109	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_96872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681111	scaffold_12124_pilon	+	1799	10	Intergenic	novelGene_22052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	577.037153520646	3	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	240	731	846536	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCSTRSSQPDSALEQHQSIAIKSCRTSLRVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829623	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857899_858274
681119	contig_21203_pilon	+	1284	8	Intergenic	novelGene_84483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.091010899667	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	562	1284	105918	122153	FALSE	15	ATTTTCAGGTGAGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNI	53917	122153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54091_93205_93353_102795_102902_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
681124	contig_10013_pilon	+	1909	19	Intergenic	novelGene_125079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	225.110562684426	664	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	102	1847	471720	479307	FALSE	10	GTCCGCAGCCATCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGSPSVCLSARPSGQVLIVDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVEDINKRREPIPSLEAIYLLSPMEKSVQALIADFRGTPTFTYKAAHVFFTDTCPEPLFSELGRSRLAKALKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAGERTRQLEVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEHDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWMELRHMHIADVSKKVTELLRTFCDSKRLTTDKANIKDLSHILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDAMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHCSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGPSSRLERKERLEPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRKLWPFVSDPAPTPSSQAAVSARFGHWHKNKAGVEVRAGPRLIVYVVGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKTLDQKLEDIPLP	470321	479369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_470387_471683_471734_471936_472056_472615_472693_473247_473327_473411_473516_473893_474043_474229_474315_474393_474525_474618_474727_475078_475137_475264_475331_475428_475510_475838_475978_476437_476548_477338_477435_478243_478330_478470_478629_479221
681126	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681129	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681130	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681137	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681138	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
681147	contig_7919_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_28091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAGAAGTATTTCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134865	1137544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1134900_1137500
681149	contig_7744_pilon	-	1875	5	Intergenic	novelGene_62497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.6068271731824	224	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	351	947	807379	796423	FALSE	20	TTCTTTTACACGTCATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTYGVGCIALGEAGPVGSMTVVDSPGQEVLNQLDVKASPEMTNAEASIEMSLPTPLPEFEDSPDKKRFPLEQESLSRLEQQDLSSEMSKVSKPRASKPGRKRGGRTRKGPKRPQQPNPPSAPLVPGLLDQSNPLSTPMPKKRGRKSKAELLLLKLFTGTFQPKPGLLRMAGIWGAVRAGSDPFCPWTHLPTGPPYAA	813598	795494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_796553_806739_806960_807132_807404_812401_812512_813382
681156	contig_2113_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_161160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	743	1060	561024	560707	NA	5	GCCGCCTCAGCTTTCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGELAAETAGLQVSLLLYPEIPGNQMVSILPQIQTGIALMQMRSVYSYRPCTQTAAPLQRPGTRGALSHCSPALQRIKSANSLSCSFVLRNKNSVRLRRIARAT	561766	560469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_560500_561800
681160	contig_5649_pilon	+	2181	8	Intergenic	novelGene_82248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	159.811240696833	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	104	1126	12779	34768	FALSE	50	ACAATAAAATCACTGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12675	35823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21184_25897_26060_26789_26895_28305_28451_28928_29095_33635_33787_34645
681162	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_93644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681166	contig_12250_pilon	+	1094	3	Intergenic	novelGene_80683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	754	junction_1	113.5	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGGTGTGCGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393238	394994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_393317_393885_394775_394867
681167	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681178	contig_2365_pilon	+	2060	13	Intergenic	novelGene_103737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_11	390.023387831493	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	84	1175	130213	212142	TRUE	75	TAAAAAAAGAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEE	116851	220240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_212137_212255_219467
681181	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681187	contig_14322_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_115787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671895	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
681193	contig_8823_pilon	+	2256	7	Intergenic	novelGene_53052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	41.7509148269698	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	654	962	84378	84686	FALSE	35	TTAAAAGCCCAATACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	51757	85980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_67524_67642_76219_76301_76878_76985_77800_77899_84353
681197	contig_6760_pilon	+	1866	12	Intergenic	novelGene_150799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1209	1604	411835	425160	TRUE	10	CGCCTCCTGCTACCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSYPIVFIPKDCIRVATSLPILPRPRIPRVFPFSSVPMNFFRSHLPFFIEAVAWGICLARHMIIPQVSSAALRLFPLGVFMTRTPFLVAASRSTLSTPVPALPTTWSFSAALMTSAVTLVAERMIRPSQS	402433	435391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_402772_403801_404004_405690_405810_407059_407192_409108_409266_411084_411231_411720_411855_418731_418831_418930_418985_423118_423186_425004_425162_435130
681198	contig_10986_pilon	-	1371	10	Intergenic	novelGene_71460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	190.580400064878	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	312	1151	74333	67011	FALSE	25	CCCGTAAGCTCTCATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80403	66790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_76171_76245_80189
681199	contig_383_pilon	+	3207	17	Intergenic	novelGene_126081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_7	45.0780139730002	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2490	62	2551	21066	65197	TRUE	25	CCCCAAATGTCATGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETIRSLGQAEGRKPAESTEEMASCLKADWNRRFQTLVFRAAHLLCFSTLICELMDQREVAAWTYHHSTTAYPWNVSRAFCQKYYTDLVAIQNKNEIAYLNDVIPYYNSYYWIGIRKINKVWTWVGTKKTLTEDAENWADNEPNNKRNNQDCVEIYIKSSSAPGKWNDEPCWKKKRALCYTASCQDMSCSKQGECIETIGNYTCSCYPGFYGPECEHVRECGEVDLPQHLLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCPKGYTLKGPSKLECLASGNWTSKPPQCVATQCPPLEIPEQGSMACLPPEKELQHQSSCSFRCEEGFALVGPEEVRCTASGVWTAPAPVCKAVQCRLLEAPSKGTMDCAHPLAAFAYGSSCKFECQPGYRVRGSDTLRCIGPGQWTAPMPACEAIACDPMESPVHGSMDCSPSSQGFQYNTSCSFRCAEGFLLRGAKMAQCSDLGQWTAPAPVCQALQCQDLLTPNKAQVNCSHPFGAFRYQSACSFTCDEGLVLVGANVLQCLVTGNWSAVPPECKAITCTPLLSPQNGTMTCIQPLGDSSYKSTCQFSCDEGFSLSGPERLDCTSSGHWTGSSPTCEAIRCPQLSPPEWGSMDCSGAHGQFTVSSTCHFSCSMGFKLKGSKNVECTTSGKWTAPPPTCEGIASASTSEMRCPALITPGQGKMSCTHNLGNFGLNTTCYFGCNAGFTLTGDSPLQCRTSGQWTAVAPTCRAVKCSELHIIKPMMMNCSNPRGNFSYGSACTFHCPEGQILSGSAKTACLENGHWSTTMPTCQGPLTIQEALTYFGGAVASATGLLMGGTLLALLRKCFRQKDDGKSPLNPQSHLGTYGVFTNAAFDPSP	21004	67113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_21069_34860_34952_37371_37759_39957_40066_40538_40725_41553_41740_42327_42514_44073_44260_46204_46391_50118_50305_56324_56511_57351_57562_58597_58784_59493_59611_64043_64075_65142_65199_66458
681207	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681212	contig_12970_pilon	+	1422	3	Intergenic	novelGene_50544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	48.5	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	598	1173	610964	611539	FALSE	15	GGTCGCCCATGTCCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSIKCVLVGDSAVGKTSLLVRFTSETFPEAYKPTVYENTGVDVFMDGIQISLGLWDTAGNDAFRSIRPLSYQQADVVLMCYSVANHNSFQNLKNKWIGEIRSNLPCTPVLVVATQTDQREMGPHRASCINAIDGKKLAQDVRAKGYLECSALSNRGVQQVFECAVRTAVNQARRRNRRRFFSINECKIF	558451	611788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_558738_610329_610426_610748
681225	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	658186	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658188	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
681236	contig_10569_pilon	+	2727	2	Intergenic	novelGene_44084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCCCAGCAAGCAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348445	357036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_348863_354726
681238	contig_5959_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_150214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1910	2260	428350	428000	NA	75	AACACAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCEQKRHTGALRDSLQVPLGQCWQPQDCLLPQLGPQRKGDVQQSPQPTSDKASILCCFKLLKSWSCLLAQHDLAYLDMHRYKCLNIHNCLASTANIKTCSHGAITSYHAKKNSIK	430259	427787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_427800_430300
681254	contig_8898_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_137242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1538	1852	291654	291340	NA	15	TTATTCCCTGTCCTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKSVRDDKTNELWPKPLTTKHAPLPPYFKLNSPEKNNGGWNTGSLLVLHLPPPPTEQARAQLWMCPSPGQYGRLSHERALTQNGRSTALGVRKVDLSSNYGS	293191	291316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_291300_293200
681255	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	39	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681261	contig_11338_pilon	-	1814	11	Intergenic	novelGene_6183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	157	579	13454	8911	TRUE	35	ATTCACATCTGGGGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCTWPPSFSMPARKIAEPTKRHMQRCRCTVVRELWMGRTSRKVRMHNSRQTSEKASPTLVIKASVGSCTL	13610	755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_887_2630_2783_4524_4665_6081_6129_6246_6327_7358_7534_7613_7740_7971_8187_8741_8921_9811_10009_13238
681262	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681267	contig_5479_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_133620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1828	2163	429503	429838	NA	25	TCCCTGCTAGAGAAGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSEMRHSRQADEGVDFVPFSSVYSFGCPECGVCRDLNQNIRLRSYTDRQIAKSHLGHIAWESICFSHFPCVHPPLENSFKLQIRQGSLYMIGLDKFLSQVRFLNDLPGA	427675	429860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_427700_429900
681269	contig_8843_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_156634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCAGCCTACCAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7255	9101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_7300_9100
681270	contig_5482_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_144449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCCAGCAGTCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286435	285811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_285800_286400
681271	contig_6740_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_142645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	54.7783412186483	31	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	221	460	19602	46422	FALSE	35	TATCTTAGTTGCTAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHKDEFTIIPVLVGALSESKEQEFGKLFSKYLADPSNLFVVSSDFCHWGQRFRYSYYDESQGEIYRSIEHLDKMGMSIIEQLDPVSFSNYLKKYHNTICGRHPIGVLLNAITELQKNGMNMSFSFLNYAQSSQCRSWQDSSVSYAAGALTVH	11300	46926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_11447_19527_19605_44182_44288_46290
681272	contig_9098_pilon	-	2573	11	Intergenic	novelGene_75782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.045830554974	2	134	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	297	1007	288130	264456	FALSE	55	GTTGCATCACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPVCASHDNHCSRMVHVIFLCLLFSDLYSKFPYGWKPIYKD	295239	262889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265562_265642_266737_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292840_292905_294101_294181_295200
681273	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
681277	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681281	contig_7815_pilon	+	1634	11	Intergenic	novelGene_134412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	63.6585422390428	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1113	520	1632	911965	933798	FALSE	25	GTAAGTACTCTTTCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIENPGHSEKQYESSSSSTRSDSSSDNEQDFVSSILPGNKPNAAGISPQLHKKSIMRKKAGHKVNPKHNDKEQAIVDVAERLDNCRLDSQEKAAACVLPSQNVNAQISSNNPLQEKLKASENKYSSSEVTLVGISKKSAEHFKRKFAKSNQVSRSASSSVQVSPEVAKTNLLKVLKETLIEWKTEETLRFLYGQNYASVCLKPPSVCLIEAEELDEDDLNSDPVSHPLVLRESQNSLDEALPFRGSDTAINPLPSYENLKKETETLNLRIREFYRGRYVLNEESSMSQDSEERNLTFPLMDSSSQNQIRKRIVLEKLSKVLPGLLGPLQITLGDIYTQLKNLVRTFRLTNRNIIHKSAEWTLIAMVLLS	879759	933800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_879780_880670_880717_891955_892055_892263_892330_893856_893946_906021_906139_909891_909928_911918_912847_914980_915064_918056_918138_933731
681293	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681302	contig_14441_pilon	+	1346	5	Intergenic	novelGene_100380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4878036686951	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	637	1131	116728	117560	FALSE	15	ACACAGCCTGCTTGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAETVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMKES	30693	117775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_31117_113646_113711_116578_116963_117095_117344_117548
681305	contig_3095_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_75020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	64	417	147241	150489	TRUE	15	GGTCTTAGGTGGAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNAQHPHLFR	147177	152240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150463_150696_150996_151163_151848
681306	contig_3147_pilon	+	2310	10	Intergenic	novelGene_142267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_5	37.4989711793027	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1073	2143	60358	83545	FALSE	60	GGAAAAAAAAATTGTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS	59285	83712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_60455_60549_60600_62108_62202_63668_63849_66431_66573_68233_68408_75870_75958_81622_81737_83158_83240_83491
681310	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_95997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653701	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
681313	contig_4125_pilon	-	1683	7	Intergenic	novelGene_25059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	126.964233808843	473	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	122	1204	368015	355996	FALSE	35	TTCATTCTTTGGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCLVMATWLASPCSRALCCLWLLGMLLLANVSTRPANHSAVRERATNREENEILPPDHLNGVKMEMDGHLNKEFHQEVFLGKARDEFEEDSEPRRSRRKLMVIFSKVDVNADRKISAKEMQRWIMEKTAEHFQEAVRENKLHFRSVDPDGDGRVSWDEYQLKFLVSKGHNEREIAERIKNNEDLKVDEETQEVLENLKDRWYQADNPPADLLLTEEEFLSFLHPEHSRGMLQFMVKEIVRDLDQDGDKRLSLPEFISLPVGTVENQQAQDIDDNWVKDRKREFEELIDANHDGIVTPEELEEYMDPMNEYNALNEAKQMIAIADENQNQHLEPEEILKYSEFFTGSKLVDYARSVHEEF	371416	355516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_356173_356655_356832_357155_357315_359788_359903_360792_360930_367695_368065_371344
681316	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681331	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	210	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681334	contig_9706_pilon	+	2006	12	Intergenic	novelGene_20898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	678.334896201691	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	310	1161	231608	357572	FALSE	30	TTTAAAATGACTTCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTVSTFVL	91225	358417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500
681335	contig_16362_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_161162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAAAATTCATCCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98176	97626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_97600_98200
681358	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681362	SIRV7	-	307	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91615	4	-91609	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTGACACCAAGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147600_148000
681365	contig_16525_pilon	+	1595	3	Intergenic	novelGene_133824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52	1864	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	61	747	156877	158494	FALSE	25	TGGACTGGAATCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTAIYESLPSLSPDLAGTRGGTESSLGWPSWGPWSSSDSSPAGVAPRLPGRSTSLVEGRACAWVPPPPGFAPLAPRPGPELSPSPTSPTATPATSSRYKTELCRTFSESGRCRYGAKCQFAHGLSELRQANRHPKYKTELCHKFYLQGRCPYGSRCHFIALQLPATTAWGPSALALCLLCCPWDPCAPKGPHPNLLPLLSQSNSQPLGALGWPGSEPLCTLPGIRP	156816	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_157685_158143_158288
681368	contig_8617_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_73410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGTGTTCTTGAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62027	62472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62000_62500
681375	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681380	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
681384	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681387	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681396	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681397	contig_11629_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_161196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTCTGCCAGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255782	256944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_255800_256900
681401	contig_9839_pilon	+	1247	9	Intergenic	novelGene_88560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	324.779925488014	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	16	1104	255906	269584	TRUE	30	AGACGGATCTAATCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSLQWRRLHGAHTSPPFSA	255890	269884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267623_269528_269648_269804
681402	contig_6710_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_90044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTACAGAAGCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
681411	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_16654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
681417	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_17599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27821	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
681419	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_95591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	657823	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVAPSWIFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653861_657801
681424	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
681425	contig_2689_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_100837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTTGCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230304	232502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_230300_232500
681430	contig_17440_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_7676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3703	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
681436	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_94546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681437	contig_12644_pilon	+	1137	9	Intergenic	novelGene_44685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_8	3972.40007544243	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	194	1135	2678055	2680497	FALSE	45	GCCAGCAGAAAAACCGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKK	2677309	2680499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
681438	contig_5229_pilon	+	2003	10	Intergenic	novelGene_117693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	61.6839815531303	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	118	987	556709	596228	FALSE	20	CATGGATTTCAGAGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLPCCMVLWLSQLISAQGMGHEECPVLPSLLVLAANRDEFYHRPSKLASFWGDNNEILSGLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPGIYGLSNALLDTPWRKLSFGKQLFQEVVEQSQALSKDALIAQLLDVLNNEEAQLPDPAIVDQGKEYVQPILSKYAAVCVRCPDYGTRTNTVILVDAEGHVTFTERSMLDKDPTCWETSTYEFKLQS	532720	597244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_532745_555745_555838_556707_556804_565421_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_591290_591445_593087_593193_596107
681439	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	79	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681447	contig_21079_pilon	+	1792	5	Intergenic	novelGene_161209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	10.8021988502342	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAGAAATAAATAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21079_pilon_+_130_1379_1436_2159_2305_3119_3215_5270
681448	contig_8930_pilon	-	1144	8	Intergenic	novelGene_161212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_5	9.79379228628721	89	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	204	1142	171852	140471	FALSE	30	GTAAGAGACCTCTCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVTEPDLKNNRVLDELVKNLNFARSHLLKFALESPPTSPASSSSKNLAVKVRTPVASRHSLKLGSKLMDNFLIREIGSSTSELLIRENESKFNHQKEASTSAENKEIPSVEKTAPGHSSDVAETPSTSTSKQVTKVDCPVCGVNIPENHINKHLDSCLSREEKKESLRSSVCKRKPLPKIVYNLLSDRDLKKKLKQHGLSIQGNKQQLIKRHQEFVHMYNAQCDALHPKSAAEIVQEIENMEKTRMRLEASKLNETIMVFTKDQTEKEIDEIHSIYRKKHQNEFQLLVNQAKKGYKKNVEMSKKKVAKKEDESTEKLLPVCMGQEDNEMKFSDMTSITNQFPQSELGSPGKLVPDRSDDSSNCTDIQEEASFPPESDSCN	190124	140468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8930_pilon_-_140644_143492_143631_156972_157034_158510_158588_163896_164082_168638_168739_171647_171983_190051
681453	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681455	contig_17198_pilon	+	1397	9	Intergenic	novelGene_62397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	91.0266959468485	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	163	978	1063432	1096458	FALSE	25	CACTTGGTAATTGATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1061723	1096877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1061799_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
681464	contig_14322_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_115915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671651	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
681467	contig_14101_pilon	+	1962	4	Intergenic	novelGene_122765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	47.7935374524864	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	58	1212	260068	273778	TRUE	40	AAAGTATTTGAGTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	260010	274920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_260825_264602_264833_273610_273782_274173
681471	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681472	contig_2214_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_144271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTACTATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337097	335414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_335400_337100
681488	contig_7843_pilon	-	2084	4	Intergenic	novelGene_152001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	33.8657480190367	347	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	222	602	115284	112946	FALSE	25	TATCAGAGTGTGAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSAAIFITLLGLLGYLHFVKIDQEALLIIDSLGIQMTSSYASGKESTTFIEMDKVKDIVINEAIYMQKVIYYLCILLKDPVEPHGISQVVPVFQSAKPRLDCLIEVYRSCQEILAHQKATSTSP	122806	111463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_113039_114507_114592_115080_115286_122586
681489	contig_5023_pilon	+	2160	10	Intergenic	novelGene_7159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_6	100.572803922775	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1214	1774	387259	405576	FALSE	65	AATGAAAAAAATGCAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	368645	405962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
681490	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681493	contig_10235_pilon	-	1854	19	Intergenic	novelGene_46389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_13	74.8023733696224	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	589	1608	182616	177880	FALSE	10	CTGGCTGGCTGATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192424	177633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184904_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_191199_191257_192265
681496	contig_6313_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_149319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCATGTAGTAGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5967	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6313_pilon_+_6000_7800
681498	contig_14322_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_116411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671631	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
681503	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681509	contig_11171_pilon	+	1498	7	Intergenic	novelGene_48587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	592.114290769386	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	976	1281	251430	251735	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212048	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_223862_224016_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
681514	contig_9471_pilon	-	1662	5	Intergenic	novelGene_21724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_4	195.796290822886	368	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	190	918	153444	147722	FALSE	15	TTAACCTCTCTATGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGVSLEQLCGIAA	167051	146977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_166912
681516	contig_11720_pilon	+	2050	16	Intergenic	novelGene_43976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	359.20558025856	2	91	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	876	1811	266455	272210	FALSE	55	AAAATCATTCAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWHVLIRERFFGTCSCPRVRAAARRSCCRPWASWAPSSCPTTSTCTPPWLSLERLTAPAGQTAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262277	272449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267788_267867_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
681518	contig_15328_pilon	-	2426	14	Intergenic	novelGene_161214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	44.5168673571034	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	113	2245	162154	137528	FALSE	5	GTTTTGGTGTTTGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVWSAWCGKCAKGKGSSPLWAQRIVVAWLNRAEWDQVMVYLFCEDHTLQRYALNRITVWRSRLGNDLPLAVASTADLVRCKLMDVTGGLGTDELSLLYGMALVRFVNLISERKTKFVKLPLKFLAQEVNIPDWIVELRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRESWELEEDREETDEEDQEEDKNIVVDDITEQRPEPKEDVKGAELDVRADGESKEVDSHQEKALRRKELYERVRELLVSYEEEQFKVLEEFRHLPQAIKVWNNLSPRVECILAELKSITRENSDAVLDAFLDDGFLIPTFEQLAALQIDYEDGQTEVQRGEGTDPKSHKNVDLNDILVPKPFSQFWQPLLRGLHSQTFTQALLERMLSELPALGDSGIRPTYILNWIIELIVANTKTGRNARRFSASHWEVRKSWRLFSCPASLDWPRVVESCLGSPCWASPQLLQLIFIAMGSVLPDEDQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASTIGNSPYTLDSLYWSLKPASSSFESEGKAQEQGSLNHDKEDEKNEKEVLEEQVEEEEDDDQEEDEEDDDEDDDEEDRMEVEAFSPREESPTAENARLLAQKRGALQGSVWQVSSEDVRWGTFPLGRMPSQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLDQRLEPPMCKTGTLGLSCGIGSANYSNSSSNFEGFLWSQGQLHGLKTGLQLF	162266	137346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15328_pilon_-_137652_139547_139699_145098_145563_150972_151121_151469_151677_151923_151975_152344_152431_154237_154348_155118_155166_155433_155710_159181_159264_160049_160120_161144_161271_161963
681519	contig_10951_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_61638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTTTCCTGACGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285917	284526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_285250_285292
681522	contig_12340_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_122109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTAAACTTTCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62877	64015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_62900_64000
681524	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_96693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657169	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGPSWNSNDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653877_657142
681526	contig_20646_pilon	+	2238	10	Intergenic	novelGene_145015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_6	198.94654657737	103	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	52	1119	25749	38504	TRUE	15	CCAGAGACCCTTCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGSVCFCFSIEN	25697	41030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_25752_31252_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_39278_40684
681528	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681529	contig_16541_pilon	-	1944	4	Intergenic	novelGene_126746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_3	183.381205870903	705	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	28	351	424096	423773	TRUE	40	ATTGAAAGACTGTGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLFARAVLMFFHITATFHKGQSLLRKEYDLFRIQTALFNLSSEDSSPISRRTTNQRQARPLKTLNLNRESEKLQVPECCAASGPDRLSDKDAVPSEIGAGLALHAGTQKSQNRIG	424123	399335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_400610_402577_402722_406168_406222_423650
681531	contig_12148_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_140326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGCCCAGCACCGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47264	49764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_47300_49800
681536	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_97359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681539	contig_7457_pilon	+	2254	14	Intergenic	novelGene_31578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_13	161.141600415955	367	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	470	1954	927933	953888	FALSE	0	TTCTGGCTCTTTGCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASECDVVMAATEPELLDDEEAKREAESFKEQGNAYYAKKDYNEAYNYYTKAIDMCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRNAKALKAKKEDGNKAFKEGNYKLAYELYTEALGIDPNNIKTNAKLYCNRGTVNSKLRKLDDAIEDCTNAVKLDDTYIKAYLRRAQCYMDTEQYEEAVRDYEKVYQTEKTKEHKQLLKNAQLELKKSKRKDYYKILGVDKNASEDEIKKAYRKRALMHHPDRHSGASAEVQKEEEKKFKEVGEAFTILSDPKKKTRYDSGQDLDEEGMNMGDFDANNIFKAFFGGPGGFSFEASGPGNFFFQFG	927463	954188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687_946842_947373_947539_948394_948487_951589_951664_952018_952166_952384_952538_953360_953424_953850
681555	contig_12080_pilon	-	2104	13	Intergenic	novelGene_128381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	220.873392593032	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	109	645	177474	171125	TRUE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	177582	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_175950_177471
681556	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
681557	contig_7733_pilon	+	2168	8	Intergenic	novelGene_147139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_6	47.3949967220773	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	322	1272	91112	107305	FALSE	20	TTAGTATTTGCAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNTIKASGLEFLIDCGMLSFVEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKGCKVVGAAGSDDKVAYLKKVGFDVAFNYKTVESLEETLKKASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	90790	108201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_97575_97732_100923_101033_106056_106176_107194
681564	contig_6102_pilon	-	1883	8	Intergenic	novelGene_32161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_7	319.848816327531	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	272	754	867239	839973	FALSE	15	GTTGTCCTCCTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867510	838843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
681566	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
681572	SIRV4	+	215	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1556	632	1101	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2556	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
681574	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_89567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653768	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681578	contig_14220_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_159872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCGAGTGATTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359346	357704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_357700_359300
681581	contig_8452_pilon	+	757	5	Intergenic	novelGene_48095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGACAACGTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962613	991093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_963082_968669_968752_972861_972935_981638_981737_991057
681585	contig_15741_pilon	-	1572	10	Intergenic	novelGene_159666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_9	609.244725707551	2143	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	2	1042	62201	50105	FALSE	5	CCCATGTGGCCCCCGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMLDPGLDPAASATAAAAASHDKGPEAEEGVELQEGGDGPGAEEQTAVAIASVQQAAFGDHNIQYQFRTENNGGQVTYRVVQVTDGQLDGQGDTAGAVSVVSTAAFTGGQQAVTQVGVDGAAQRPGPTAASVPPGPAAPFPLAVIQNPFSNGGSPAAEAVSGEARFAYFPASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	62202	49574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681_60833_61252_61454_61592_61712_61823_61871_62139
681587	contig_10861_pilon	-	1868	9	Intergenic	novelGene_39345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	260.179745560641	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	109	825	1492200	1490608	TRUE	25	TGTGTCCTGGATTCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQVRGEVGGGWWVGELCPHDFSFSLPSRVGPCPSTLPSPAPTLWLASWH	1493807	1489372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
681588	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
681594	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681602	contig_10299_pilon	+	1863	12	Intergenic	novelGene_79666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.952802732201	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	528	1796	184255	187611	FALSE	35	AAAACTTGATACATTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRATSERHEVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGLIFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCKVPTSVFGEKLREQVEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	182366	187678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182542_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185355_185714_185834_186084_186207_186389_186528_187233
681617	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681618	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
681628	contig_10500_pilon	+	2230	10	Intergenic	novelGene_41163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCTTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258240	1271054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1258275_1260918_1261003_1261086_1261267_1262166_1262314_1262391_1262527_1262785_1262950_1268146_1268272_1268411_1268585_1268665_1268849_1270049
681633	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681634	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681641	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681642	contig_854_pilon	+	1825	15	Intergenic	novelGene_36437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	446.494835082224	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	415	1719	1455725	1465350	FALSE	30	TAAAGTATCAGTCTGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451190	1465456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453732_1454100_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
681644	contig_12570_pilon	-	1921	5	Intergenic	novelGene_79382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	41.105808591974	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	620	991	283414	280932	FALSE	35	TAAATGAAGGGATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTIFWAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300328	280001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283397_283699_284049_284255_300198
681648	contig_9807_pilon	+	2263	15	Intergenic	novelGene_32865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	537.072169550911	1	84	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1128	1733	147193	157176	TRUE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	109025	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_126623_126772_128536_128718_139399_139483_140300_140382_140723_140965_145123_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_157171_157384_158676
681649	contig_12427_pilon	-	1112	5	Intergenic	novelGene_40472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2452	junction_4	1844.52900492239	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	70	603	316061	314393	FALSE	15	CGTGTGTTAATGTCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAASESPLLRVRSDAKEDITAAMSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325908	313883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325856
681651	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681654	SIRV7	-	296	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91628	2	-91622	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAAACTAGTAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
681658	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
681661	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681662	contig_10346_pilon	-	1350	6	Intergenic	novelGene_161220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_5	23.3066514111315	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	88	1080	277815	266910	FALSE	15	GTATTTTGTCCCAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVRCLRGGSRGAEAVHYIGSRLGRNLTGWVQRTFQSTQAATASPQNSCAADDKATNPLPKDCPVSSYNEWDPLEEVIVGRAENACVPPFTVEVKANTYEKYWPFYQKHGGHYFPKEHLQKAVAEIEEMCNILKLEGVTVRRPDPIDWSLKYKTPDFESTGLYGAMPRDILLVVGNEIIEAPMAWRARFFEYRAYRSIIKDYFQRGAKWTTAPKPTMADKLYDQDYPIDSVADRHKLAAQGKFVTTEFEPCFDAADFIRAGRDIFVQRSQVTNYLGIEWMRRHLAPDYRVHVISFTDPNPMHIDATFNIIGPGLVLSNPDRPCHQVREF	277902	266639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10346_pilon_-_267090_267229_267368_268345_268537_269329_269526_275714_275934_277746
681665	contig_13216_pilon	+	1703	5	Intergenic	novelGene_47483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	555.983531680571	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	47	1174	229682	261012	FALSE	25	TTTAAAACTTAGTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSELSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229635	261541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_260430
681668	contig_4232_pilon	-	2043	8	Intergenic	novelGene_63480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	388.572426469307	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	1122	1823	614173	607970	FALSE	10	AGATCTCTGCTGGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINLAEEEASASCPVHPGAESQGHHVDIPFFPCTLASSW	620499	607749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_608081_611712_611787_611936_612075_613618_613698_613873_614983_615283_615392_615783_615945_620456
681669	contig_14704_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_82675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAAATAAAAAATTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7142	7528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_7100_7500
681670	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
681674	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681681	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681687	contig_10774_pilon	-	2024	6	Intergenic	novelGene_158677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.5162968752036	129	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	87	653	56149	25495	TRUE	70	AAAAAAAAAATGAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGAGTEGGGGGQRLGGSQVRERGLLKMTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDVPMVLVGNKCDLPSRTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQGVDDAFYTLVREIRKHKEKMSKDGKKKKKKSKTKCIIM	60819	23995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_24546_24673_25612_38732_38893_42281_42461_56038_56161_60744
681696	contig_11908_pilon	+	462	4	Intergenic	novelGene_133227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	109.900965519973	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	66	401	692429	747340	FALSE	30	TGGAAGCAGTCGTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTVRSPFSPPPSLRVARPETKMAAATVAAGAASVELVIGWCIFGLLLLAILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYMLLFH	692363	747401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_698010_698188_706180_706242_747323
681697	contig_14638_pilon	-	2101	3	Intergenic	novelGene_71560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	161	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	84	467	262373	254386	FALSE	10	TGAAGTGGTGTGTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAAPTWMLPKCGGTTESSFIRSPSRSYRSPWGSEPDRTRMRTARAPACVPTPPPDGLRISPPGTPATVTLC	262456	252751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254595_258223_258365_262339
681698	contig_12250_pilon	+	2022	17	Intergenic	novelGene_80555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	69.9820289431508	222	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	178	1947	272853	278399	FALSE	10	CTGCTGCCTCTGCCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRILPSDAFQTAWRVVCYYCTATGLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272526	278474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277657_278249
681700	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681704	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
681709	contig_13428_pilon	+	3424	2	Intergenic	novelGene_143445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	815	junction_1	0	38	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78098	83556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_80115_82148
681718	contig_6710_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_97586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTCGGCATTATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653388	653737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
681724	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
681725	scaffold_16539_pilon	-	1537	10	Intergenic	novelGene_68395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_5	36.8383187509292	467	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	24	1067	800534	795635	TRUE	10	TCCTGCTTCATTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVRVRDGQGEVWCRTCGKEGLEGGGYHDGRKAQSEPAHPDAR	800557	794779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795469_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
681726	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1188	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681728	contig_3956_pilon	+	1383	9	Intergenic	novelGene_15169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1770.62206141655	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	347	949	1286130	1290447	TRUE	40	GAATAATAAATTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLANPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1281661	1290984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282764_1285066_1285173_1285712_1285827_1286092_1286224_1286409_1286606_1287276_1287517_1290374_1290657_1290759
681739	contig_10023_pilon	-	1409	5	Intergenic	novelGene_123523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_4	425.392392386136	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	23	568	458219	457237	TRUE	30	AAACACTTGCAGAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAIVTKMEAFLESRSGLWAGGPALGQFYRIPPSPSSFVDVASAPYGGPSTRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGERLIGVHITCLTAQLVPA	458241	456018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_457436_457682_457890_458079
681744	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_93422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653699	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
681747	contig_18869_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_56357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
681751	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681753	contig_14441_pilon	+	1146	4	Intergenic	novelGene_100434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.537421698773	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	663	1106	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81901	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82365_121821_121872_125517_125902_126496
681759	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_97961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681761	contig_11076_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_161222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTGCTATGATGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517434	518797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11076_pilon_+_517400_518800
681774	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681775	contig_854_pilon	+	1948	15	Intergenic	novelGene_36478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2718.7444318498	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	1256	1948	1680888	1689395	FALSE	20	ATTGCCACGCTGCTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDN	1612767	1689395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672902_1677527_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680814_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338
681777	contig_15559_pilon	-	3210	7	Intergenic	novelGene_141890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_6	21.9652503337026	267	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	528	2372	142292	104768	FALSE	15	GTGAACCTTGCCCGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFQGPQCGSHTSRTPEDGSSSGPSTNFDKSRLRNRPVKPSVRISSQIYSQDFESQIVASDHTYYNSKLEPCVKNKNRSKISNKDQLTKLGKTLGSGRVESNQSEVSQSFSGERGNAKTQRNQTQTVLANADTSTPLECSADTLSKIRQEVGPPLPPLLAPLVATPPRTLQPVSPLMSSCSPSSPASPLGQISPLCDIPVSPMMSPLPEDAGHTPPACASPSPSTMPPSERILSSPLQFCATTPKHALPVPGRLPPLAPGHPAVAGAQENSVKILDTMYPELSARARTLNILKGNIQLNRGPPADPKSLPGPVSAITGFKAITSTSTAFVKTGGSATSDCTQDKARDLGAQRDSSGKRTLSASTLQSAKRLRLDSGSSESETREAGTEGIGRNLRRNCPQTEVVPANGERSCFVPTVNTVSQLPLNAKETVESQDKTIANALRKIAGSSFDLLPVIRSHVYVGNISKKPVMRDQEKEVVFEFSTTKKHLAERLLHSILSELNVQKTSTEDHNYIHALCRVYVGICRQLGDLERARLFCYSILKEDFPESDKLTLFIANMWHDVFISQSVINKAMQLVARQRAKGEVLNCLRAFLNWEKNAPVDVGFMVSKLLLTIQLCPKTEFQSSEKFGEDLSDNTWEYIFAIDLLCCHQKWIWTHDNIISKELWPVMDKWIKYRKGHVNVGYTPDIIIASVLRLIGRLGQLGLKEGFPSAVKNISSVIGMFIQHAQDEDIPWGVQLAAVYALCDLSPSNPTEISKILEAWRKEASQSIPAAIVSYLEEAGTLCMEEHS	142819	103929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_104950_106900_107000_112049_112157_116183_116375_121691_121853_139802_139975_141359
681779	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
681780	contig_5549_pilon	+	1940	10	Intergenic	novelGene_81618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	28.1113306974296	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	120	1664	334270	369342	FALSE	65	AGAAAGAAAAATGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW	334150	369618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
681781	contig_3270_pilon	-	2542	7	Intergenic	novelGene_104466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_1	173.934534300185	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	202	1254	118006	106331	FALSE	45	CCTAGAAACTAGAATCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NATLQAEKQALKTQLKQLETQNSNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESMIKEREDLKSLYDSLVKDHEKLELLHERQASEFESLIAKHGTLKFAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAEEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSSECLHTCDL	119133	105042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_106575_106714_106808_110361_110508_115231_115419_117395_117540_117767_118046_118971
681782	contig_6048_pilon	-	1947	10	Intergenic	novelGene_73269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	108.196437722332	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	302	1576	1982709	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERFRSKTQPITELLFSPPSPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	1984442	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982853_1983748_1983848_1984383
681802	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681805	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_89254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
681806	contig_5968_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_112204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGGACAAATTTCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667934	669993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_667900_670000
681809	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681815	contig_9706_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_20864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2460	2733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
681819	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681823	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681825	contig_9527_pilon	+	2248	4	Intergenic	novelGene_134081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	98	junction_3	20.0055547841649	298	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	414	1463	495471	499603	FALSE	25	GAACAATTGTGTGGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLLLNLDFGEPPPKKALEGNSKHQNFVKKRRFLERKGLLSKKKQPPGKVARLHSDSPKKEETAKVDGTWKVPPLPKKKKTAASSSGSEQSLDKKATVPWLTPAPSQEGHSVAAKVDLLGEFQSALPKIKTHLVCSQKKHPQKNPPQKNASQNSTPAHSENNCPGVSQEMPRKMVAVDCEMVGTGPKGHVSSLARCSIVSYDGDVLYDEYILPPCHIVDYRTRWSGIRKQHMVNATPFKIARSQILKILTGKIVVGHAIHNDFKALQYFHPKSLTRDTSHIPLLNRKADCPENTTMSLKRLTQKLLNRDIQVGKSGHSSVEDAQATMELYKLVEVEWEQHLAQNPPED	494398	500388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_494708_495366_496206_498389_498591_499489
681826	contig_8658_pilon	-	935	4	Intergenic	novelGene_55798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1385	junction_2	691.780954413237	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	189	584	13203	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	30172	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045
681827	contig_7345_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_159175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGAGTTTCTCGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116700	119067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_116700_119100
681830	contig_12178_pilon	+	1466	9	Intergenic	novelGene_156537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	20.0296654989543	292	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	77	1222	8264	64734	FALSE	45	TATAAATGGTATCCATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETASVCSGSLDGVEYSRRKEKGIVKMTMPRTLAFCYLSLLWQRETITLSDLLRFVEEDHIPYINSFQHFPEEMKLYGRDKGIFAIESWPDYEDIYKKIIEVATFLDLPRFPDITEDCCLHPNILCMKYLMEVNLPDEMHNLTCQVVKLTGIGEVDFLTFDPIAKMAKTVKYDIQAIAIIIVVLKLLFLLDDNLEWSLSNLAEKHNEKNKEDKPWFDFRKWYQVMKKTVDEKKQKWEEARAKYLWKSEKPLYHSSIDKSVVYKRREMVVNLQKQFSTLVDSTPTVEKKSPSSFQFNWSEEDTDRTCFHGHSLQGILKKKGQLLTTKNSLYWLSTQKFCKSYCKHVTTYEESNYSLSYQFILNLFSFLLRIKTSFLHEEVSLVEKRLFKAKYSKIKKKSSRSKKVRRY	8187	64978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_8347_14071_14172_36645_36794_40503_40682_41472_41520_46023_46115_51584_51656_57564_57788_64529
681835	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681838	contig_8269_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_106221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGATTCCGACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265767	266231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_265800_266200
681840	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681844	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681845	contig_12142_pilon	-	1264	5	Intergenic	novelGene_147805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAAGGAGAACAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99915	94351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_94423_96208_96289_96970_97058_97696_97826_99018
681847	contig_5502_pilon	+	1905	8	Intergenic	novelGene_154970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_7	530.292834003929	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	81	944	357713	439183	TRUE	25	TATCCTTTAGATTTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVPKVEEIEEDCY	357632	443491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_439147_439210_442556
681851	contig_14322_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_116534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTGAGCGCCCCGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
681855	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
681856	contig_8616_pilon	+	1280	8	Intergenic	novelGene_72471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	635.362374506687	41	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	371	1207	320431	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318038	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_330882
681859	contig_4315_pilon	-	2271	4	Intergenic	novelGene_46869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	23.1708629293104	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	375	1025	880689	851911	FALSE	70	AGATTTAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVPASSVASHLGTTSRSYFYFTTATLAVCLVFAVATIMVLVVQRTDSISSPPDNSPLKGGNCSEDILCMLKRAPFKKSWAYVQVSKHINQTKLSWNADGIVDGVKHKDGNLVIQFPGLYFIICQLQFHVTQCPENSVDLKLELLVNEMVKKQALVTVCESGVKTRNIYQNLSQFLLEHLQVNTTISVRVDKFQFVDTDTFPLENVLSIFLYSSSD	881063	850664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_852309_855434_855507_870361_870405_880551
681867	contig_6710_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_89263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTGTCTGGTCGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
681870	contig_12270_pilon	-	416	2	Intergenic	novelGene_113159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	65	415	14409	13836	FALSE	20	GCTGGTACCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14473	13834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
681878	contig_3774_pilon	-	2098	12	Intergenic	novelGene_142028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	168.072200148656	26	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	141	1610	210407	106701	FALSE	20	ACATGCCCACTGGCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRASCAGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQATVSMCDLEFGSGKVKEQSMSGWWHVPWCKQFVQPCLVELLGSTLFIFIGCLSVIQNQQNTRTLEPALAQGLALSLVVAILGNISGGHFNPAVSLVAVLIGGLNLILLFPYWICQLCGGLIGAALAKALSSEEKFWNASGAAFVTVQEPGQVVGAVVAEVILTILLALVVCMGVINEKTQDTLAPFFVGFSVIVAILAGGTVSGACMNPARAFGPAVMANHWDFHWIYWLGPLLGSLFVGVLVRVFSGNGKTTLILKGW	210547	106212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_106750_107996_108132_109809_110025_112486_112614_115855_116110_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
681889	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
681892	contig_1867_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_54609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCCGGCAAGAGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516535	518052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_516500_518100
681894	SIRV7	-	453	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33114	2	73	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114843	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
681895	contig_14441_pilon	+	1103	5	Intergenic	novelGene_100394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	487	840	116728	117335	TRUE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	47279	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47571_113162_113209_116578_116963_117216_117344_117539
681898	contig_7378_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_120303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666625	668529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_666600_668500
681902	contig_8866_pilon	+	1499	8	Intergenic	novelGene_77870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	419	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAATGAATAAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912477	929209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_912840_912936_913003_917539_917619_920825_920989_924677_924848_925523_925723_926760_926920_928908
681905	contig_3018_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_78881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACACTAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566813	566134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_566100_566800
681907	contig_3825_pilon	-	1413	2	Intergenic	novelGene_78024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2961	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1	516	1470962	1468691	FALSE	45	ACAGAGACAGAGAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGMCWVVVWAADLLLFLNQIPRWAMPQVALREGAWVLALLTALLAADTQGSAEVREAPGEQPCPNSSWRLSGRAWAEQRCPVLIRLRSLWTLTGLPIPRSSAFSPEP	1470962	1467793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1469125_1470880
681908	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
681917	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681918	contig_6710_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_97077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGACTGTCGGTTTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	653855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
681921	contig_14814_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_137752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAGAAAAAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404501	403606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_403600_404500
681932	contig_5171_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_161224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_7	51.7071818325194	168	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	42	1238	15871	157548	FALSE	25	TTGAATTGTATGCATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEHIDYCGYAVLPMAVEQDMLIAVEPVKTQTIRLINTNPLYPDFSTSVNNIQIDKTKPQWHNYFLCGFKGIQERFCLSNLTGMNCLVDGNIPPSSGLSSSSALVCCAGLVTLTALGMSLSKVELAEICAKSERYIGTEGGGMDQSISFLAEEGTAKLIEFSPLRATDVKLPSGAVFVIANSCVEMNKAATSYFNIRVTECRLAAKLLAKYKSLQWDEVLRLEEVQAKLGVSLEEMLLITEDALHPEPYSPEEICSCLEISLEELRTQILSPNTQDVLHFKLYQRAKHVYSEAARVLQFKKICEEAPDNVVQLLGELMNQSHVSCRDMFECSCPELDQLVDICRKFGAQGSRLTGAGWGGCTVSIVPADKLSSFLANVQEAYYQRSDRSSALGTQSLFATKPGGGALVFLEA	15829	157905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_15957_22610_22702_25641_25789_85609_85709_87854_88008_100600_100812_143662_143865_157340
681933	contig_12624_pilon	-	1426	7	Intergenic	novelGene_61048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1165.79872476627	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	256	1065	903621	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903876	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874130_903447
681937	contig_7057_pilon	+	1088	9	Intergenic	novelGene_123335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_8	584.216301980696	232	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	132	602	938907	943233	FALSE	5	TGGCATCTGCCTCCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	938319	943719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
681945	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681946	contig_6710_pilon	-	263	2	Intergenic	novelGene_98326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCTCAACCGAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657519	653666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
681947	contig_6710_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_93443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653716	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
681952	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
681961	contig_12477_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_84387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTGGATATGATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20484	22661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12477_pilon_+_20500_22700
681962	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
681964	contig_4136_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_161243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54766	52411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_52400_54800
681969	contig_9995_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_47729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACTACGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501162	503408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_501200_503400
681971	contig_4964_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_157262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGACAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152492	153393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_152500_153400
681975	contig_2940_pilon	-	1895	6	Intergenic	novelGene_81889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_4	154.227883341502	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	591	1004	454239	453111	FALSE	20	TAATGGCTGTTAAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	458550	452219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236_454471_455835_455883_458238
681977	contig_18869_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_56044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73557	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
681980	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
681982	contig_4884_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_63776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTTTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67354	65803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_65800_67400
681983	contig_7202_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_18739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTCAACCGCCAGATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
681984	contig_7707_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_72213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACATGCATGATGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760915	758712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_758700_760900
681986	contig_3529_pilon	-	1331	8	Intergenic	novelGene_105347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	490.822342022622	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	216	617	541814	529100	TRUE	5	CATTTGGTTTGTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRAEPERNRGREEGGGGGGGGGGAGPGGLSVFKETTSCTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621514	525454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550550_550582_621426
681989	contig_13366_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_99786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTACCACTGTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120747	121565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_120700_121600
681992	contig_3122_pilon	+	1654	3	Intergenic	novelGene_64398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGGGTGGCAGATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409326	413437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_409420_409903_410027_411999
681993	contig_17281_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_105183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2900
681994	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
681995	contig_12837_pilon	+	1489	7	Intergenic	novelGene_57299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2989.68333979072	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	286	669	129778	166049	FALSE	20	TGAGTTAGCTGCCTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPVSIKNFKILLLIIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128558	166869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128713_129646_129802_153829_153894_153981_154049_161404_161494_163874_163969_166003
681997	contig_2646_pilon	-	2175	2	Intergenic	novelGene_69546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGTTTCTGTAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847714	845428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847267_847377
681999	SIRV6	+	1071	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	17	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	198	689	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1147	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
682002	contig_3588_pilon	-	1682	18	Intergenic	novelGene_72859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.705882352941176	1	24	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCAACGGCTTCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140849	84407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_84654_90119_90184_96162_96211_111722_111789_112221_112252_112911_112952_116933_117122_120008_120129_122108_122180_122283_122402_125602_125712_127433_127476_131415_131546_134069_134131_136021_136115_137168_137249_138771_138920_140821
682008	SIRV6	+	322	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	15	1252	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
682024	contig_9345_pilon	-	565	4	Intergenic	novelGene_24334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8982	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	257	565	120090	117914	FALSE	20	CCTTATGTGCCTATACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKQEWKQGSPSPQSQCTAYFLPDFLIPPVARGPFPAAFAFNSSSFFCSSFCFCLKALSSSSISLLCFLGCFRGFFLPPSRPDMAPTAPSPAPPPETELPTPP	120346	117913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_117986_118095_118152_118233_118323_119998
682030	contig_12270_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_114093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	27	308	14409	13905	FALSE	25	ACCATCAGCAGCTTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTF	14435	13904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682031	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682032	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGAGGCCGCCGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
682038	contig_8538_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_4619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGTACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732935	731007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_731000_732900
682050	contig_5586_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_143592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTGAAAGAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522438	524387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_522400_524400
682051	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682055	contig_1443_pilon	+	1626	13	Intergenic	novelGene_28220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	49.2806588159425	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	26	1324	536007	541541	FALSE	35	ATGGAAATGAATTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRFASGFMVAASGLKYLLTLGGWRRGRGVVPQSRALAILVPGMSQVDNKSDFLEKKPHRQHPGILQLPHVRLPQALANAAQLLLLESSVSNVEKQVQALTNYLWSRHLPVEPEELQRRAMHLEKKFLENPDRAQAEEKLHGAVLSALRRTTYHWQELRYNEKLSLVYMAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535981	541843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
682056	contig_9424_pilon	-	932	4	Intergenic	novelGene_143782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2181.79289168844	7	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTTGAAACACCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280128	277221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279339_279629_280079
682059	contig_17440_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_7690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3808	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3800_4000
682060	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	4	342	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14412	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682061	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682079	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
682080	contig_9995_pilon	-	1908	8	Intergenic	novelGene_47657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	93	junction_1	38.8618694604259	383	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	20	1006	141594	120161	FALSE	45	AAACATTGCCCAAGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARVSKMEGALLALFALRLLLLLALPTAGWLTTGVSEPLSQAPKDSIRVNVTTLTDDGQVSKEQVVLNITYGSGQVYVNDFPVNNGVTRISCQTLIVKNENLENVEEKGYFGIVSVRILVHEWPMTSGSSLQLIVIQEEVVEIDGKQAQQKDVTEIDILVKNQGILRHSNYTLPLEESMLYSLSRDSDILFTLPNLSRKESAGSLQTTSQYLIRNVETTIDEVALPGKLPETPLRAEPPSSYKVMCQWMEKFRKDLCRFWSSVFPVFFMFLNVMVAGIIGAAVVITVLKVLFPACEYKGILQLDKMNVIPVTAINLYPDGPEKKAENLEDKTCI	141613	119258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_120273_123666_123831_125378_125510_126524_126682_127651_127804_136103_136201_136370_136431_141480
682086	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
682087	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682091	contig_16098_pilon	+	1111	7	Intergenic	novelGene_46038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCCCGTAGGGGCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348305	350595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349499_349870_350075_350235_350421_350511
682098	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682102	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682105	contig_8210_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_30229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTCTCCATAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20525	20126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_20100_20500
682112	contig_7420_pilon	+	745	2	Intergenic	novelGene_85865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGAAGAAATACATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318354	320172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_+_318440_319512
682113	contig_12414_pilon	+	2899	11	Intergenic	novelGene_59607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	85.7100344183807	20	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	129	815	527729	591484	TRUE	0	TTTTGTTTTGTTTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527600	600657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846
682119	contig_8885_pilon	-	1801	6	Intergenic	novelGene_115554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.586157515486	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	58	447	75477	49174	TRUE	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75534	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_46492_46631_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
682121	SIRV6	+	334	1	Genic_Genomic	SIRV6A	novel	NA	NA	NA	NA	1267	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11504	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_+_11500_11800
682122	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_89556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682123	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1748	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682124	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682125	contig_6975_pilon	-	1300	9	Intergenic	novelGene_74270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.135254213291	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	165	998	164514	159537	FALSE	30	AACCACTGATGTTGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVMKHNGPNDASDGTVRLRGLPFGCSKEEIVQFFQGLEIVPNGITLTMDYQGRSTGEAFVQFASKEIAENALGKHKERIGHRYIEIFRSSRSEIKGFYDPPRRLLGQRPGPYDRPIGGRGGYYGAGRGSYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMGI	169948	159234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159541_159842_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_163709_163849_164402_164538_169807
682129	contig_8581_pilon	-	1879	11	Intergenic	novelGene_22826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	500.940964585649	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	63	1853	386058	306366	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSGHRESLSGHTSATKLCVCGTSHSNIVSVLHSVCLVGGGGNPVGKCLVSIWVKGTDRPTMPSLESPIAFVSHVV	386120	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306587_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
682135	contig_20602_pilon	-	1999	5	Intergenic	novelGene_133715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	495	junction_1	102.680024834434	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	953	1651	19906	10026	FALSE	15	TATTTTTTTTTTTATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKLKLTGLALICFLLVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	20858	9677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759
682139	contig_5286_pilon	+	2274	2	Intergenic	novelGene_157362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAATAGGAGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553553	556376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_554841_555389
682140	contig_10263_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_135810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7464	7673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_7500_7700
682143	SIRV4	+	348	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	634	966	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTTATATGTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
682149	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682150	contig_7045_pilon	-	2377	17	Intergenic	novelGene_77481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	134.326968159785	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2277	101	2377	587396	529654	FALSE	60	GCTGAAAAAAAAGAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGMEKMTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQFTQALLQLCNRSYFLLVPGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKNYMDYLSRLYEREIRDFFEVAKIKMTGTTKESKKFGLHGSSGKLTGSTSSLNKLSVQSSGNRRSQSSSLLDMGNMSASDLDVADRTKFDKIFEQVLSELEPLCLAEQDFISKFFKLQQHQSMPGTMTEAEDLDGGAFSRQHNSGTPLPVSSEKDMIRQMMIKIFRCIEPELNNLIALGDKIDSFNSLYMLVKMSHHVWTAQNVDPASFLSTTLGNVLVTVKRNFDKCISNQIRQMEEVKISKKSKVGILPFVAEFEEFAGLAESIFKNAERRGDLDKAYTKLIRGVFVNVEKVANESQKTPRDVVMMENFHHIFATLSRLKISCLE	587496	529653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_529764_533133_533318_536679_536909_537447_537525_538831_538940_539488_539653_546188_546295_552563_552714_567408_567463_568441_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585481_587380
682153	contig_4952_pilon	+	2622	1	Intergenic	novelGene_145531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATATCTGCCTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456515	459137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_456500_459100
682155	contig_2093_pilon	+	3641	1	Intergenic	novelGene_152990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365019	1368660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1365000_1368700
682160	contig_2027_pilon	+	2175	7	Intergenic	novelGene_39916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	403	junction_3	162.41450742536	15	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1385	1987	134766	136487	FALSE	25	TAACCCAGATGTGGCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	131697	136675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_132495_132618_132809_134368_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
682161	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682171	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682172	contig_11512_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_43217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTTATAGTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3984	4566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4000_4600
682176	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682177	contig_9609_pilon	-	3227	24	Intergenic	novelGene_22940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_20	19.162127897435	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1006	3021	132	3152	81393	72930	FALSE	35	TGCTTATTGAAGACATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLEISKLLDEELYSRQLYVLDSVAMQRIQGAKVLLSGLRGLGAEVAKNLVLMGVGSLTLHDPHPTCWSDLTAQFFLSERDLGKSRAEASQEPMSQLNGAVQVRVHTGAITEGLLLDFQVVVLTASELEEQLRVSNFCHQHGVCFVMADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLMAAIQHISQGSPGVVTLREADVHYFQDGDLVTFSGIEGMVELNGCTQPIRVQEDGTLEIGDTTTFSHYLRGGAVTEVKKPKTVSHESLATALLQPRVVARSPKEVHRAHCLHQAFRALHEFQACTGQLPKPWHTGDAETVVRLAQALGPLQRIQEEPLDEALVRAVALCSTGDLSPMAAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALECLPEDGEPLPSPEDCAPRGCRYDGQIAVFGAGFQEKLSCQHYFLVGAGAIGCELLKGFALMGLGASDSGSITVADMDHIERSNLSRQFLFRPQDIGSPKAKVAAEAASRLNQGLRVTPLTHPLDHTTEHIYGDSFFSRVDGVAAALDSFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTQGTRGSAAVFMPHVTEPYRAPASAATSEDAPNPVCTVRFFPSTVEHTLEWAKNEFEGLFRLSAETINRHQQASTSLADMDGPQVLTLLQPVLGVLRVRPQTWQDCVAWARGHWQLCFHDSIIQLLRCFPPEKVLEDGTPFWSGRKQCPQPLEFDANQDMHLLYVLAAANLYGQMHGLPGSKDQTALRGLLKLLPLPSSQHLAPIFASDLELAQASTKFGPEQLKELHKALEDWNKGPPLRPLLFEKDNDNNFHVDFVVAAASLRAQTYGIPPASRAQSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLMGLELYKVVGRSTPLRAFRHSYLHLAENHFSRWVPCAPAIQTFRHLTWTCWDRLKVPAGKPERTLESLLAHLQEQHGLQVRMLLYGPAVLYSTRWPPDKQAQHLPLKVTELVQQVTGQVPEPRQQVLVLELSCEGEEEDTAFPPLHYEL	81524	72854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_73060_73491_73593_73672_73766_75368_75561_75654_75748_76026_76110_76589_76774_77020_77096_77180_77365_77454_77520_77616_77823_77902_78069_78149_78306_78385_78467_78623_78732_78930_79102_79453_79601_79693_79792_79988_80119_80220_80312_80614_80722_80855_80991_81087_81257_81337
682180	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682181	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682185	contig_7202_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_16655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTCCGCAGGTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
682188	SIRV2	-	643	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	0	2974	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
682195	scaffold_12124_pilon	+	2028	2	Intergenic	novelGene_22018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	0	171	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1012	1335	813271	813594	TRUE	5	GAGCTTGTTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDQAAFRSVLHAEQSGRRRRVELDQNHLLLAATLGLSNLLMAGTPGFGQAAMTAMYPFPSLCPKDLEFYKDSSRASPCILLLLLVAVESFPTQGDPTCAEQSCAP	812259	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_813998_815122
682201	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_94897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682221	contig_11978_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_62999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTCCAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517288	1520055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517300_1520100
682222	contig_1856_pilon	-	2333	6	Intergenic	novelGene_84875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	356.783744024304	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1723	2178	260083	227472	FALSE	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLTFLFVILHVYKALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSDIKEQIKKGRKQAHMGEDRCHAT	287206	227316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_227543_259395_259735_260037_260191_271176_271560_285227_286292_287038
682228	contig_4128_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_161263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGTAGTTAAGTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48820	45982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4128_pilon_-_46000_48800
682229	contig_15666_pilon	-	1354	5	Intergenic	novelGene_70215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	153.637560511745	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	23	349	132068	130743	TRUE	35	CTGAGTTAATACAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILSPSEMLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQME	132090	128425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130515_130745_131446_131711_132007
682231	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_92004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657493	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657495	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682237	SIRV2	-	435	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4425	47	3250	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
682242	contig_5758_pilon	-	1733	8	Intergenic	novelGene_119059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	978.782584100665	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	141	1082	113963	59684	FALSE	40	CTTTTGACCTTCAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEIGSPPRFFHMPRFQHQAPRQLFYKRPDFAQQQAMQQLTFDGKRMRKAVNRKTIDYNPSVIKYLENRIWQRDQRDMRAIQPDAGYYNDLVPPIGMLNNPMNAVTTKFVRTSTNKVKCPVFVVRWTPEGRRLVTGASSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSPVRAMTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILREVSAVLTFRLIIARQRHKLAFQHFPNWSLEGLRSALRKEDFWSNTHLLEMCNVCESTEGSQTSSWEKTSSSF	179131	59032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_59902_91145_91244_92931_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
682248	SIRV4	-	345	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACGATTGCCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
682254	contig_5649_pilon	+	1655	4	Intergenic	novelGene_82391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_3	26.5120517668642	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	345	671	1091464	1096594	FALSE	20	TCCTTGAAACTTGGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDSLDLIDSDELLEPEDLKKPDPASLRAASCGEGKKRKACKNCTCGLAEELEKEKSKEQKSSQPKSACGNCYLGDAFRCASCPYLGMPAFKPGEKVLLSNSNLHDA	1091119	1097578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1091482_1092355_1092472_1095901_1095984_1096483
682255	contig_3956_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_14718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222762	225353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_222800_225400
682256	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682258	contig_1516_pilon	+	2702	1	Intergenic	novelGene_49927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	38	355	117572	117889	NA	10	CTTGGCTCTTGGTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGDVHNEQTLAVCCLCHKCLLICKKQKNGQCNAVFLLQQKIFTSSFYHLAKKNKPEKEERSTPFKPHIYRWCPTYYVFELTTNRSYNCLFPHRGEADAWFQGI	117534	120236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_117500_120200
682259	contig_11978_pilon	+	386	4	Intergenic	novelGene_63063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6655	junction_1	2463.59822662345	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	28	384	1827946	1830785	FALSE	15	AGCATACCCTCTTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHM	1827918	1830787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663
682271	contig_14357_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_121665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTCTAACCCATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488851	489094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_488900_489100
682279	contig_91_pilon	-	2232	10	Intergenic	novelGene_127095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	326.9349238678	1148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	218	1216	344064	310980	FALSE	20	CACTTACTTTGCATACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLGGGSALDLLEPGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGTPFWMAPEVIKQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPHSELHPMKVLFLIPKNNPPTLEGNYSKPLKEFVEACLNKEPSFRPTAKELLKHKFIIRNAKKTSYLTELIDRYKRWKAEQSHDDSSSEDSDTETDGQASGGSDSGDWIFTIREKDPKNLENGALQPSDLERNKKDIPKRPFSQCLSTIISPLFAELKEKSQACGGNMGSIEELRGAIYLAEEACPGISDTMVAQLVQRLQRYSLSGGGTSSH	357543	309963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_311017_314489_314627_317393_317460_318497_318622_321982_322129_325296_325483_334662_334821_335110_335220_344028_344086_357347
682301	contig_5799_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_50342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTTCCCAGTGGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718571	720885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_718600_720900
682304	contig_8377_pilon	-	1996	2	Intergenic	novelGene_35077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAAATGGAGTTGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132901	128408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_128932_131428
682307	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_95581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682314	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_94715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682316	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682317	contig_401_pilon	+	1255	11	Intergenic	novelGene_42816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_9	1414.42898725952	1072	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	61	1023	1711949	1715475	TRUE	5	TCTCTTATGTTTTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711888	1718329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
682326	contig_5916_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_158065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTGTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694993	695606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_695000_695600
682327	contig_10324_pilon	-	1446	14	Intergenic	novelGene_7726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGGGCGGGAGGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74695	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_51883_67801_67917_68038_68126_68713_68796_68961_69076_69378_69438_69528_69654_69771_69856_69948_70060_72926_73061_73143_73241_73325_73422_73582_73666_74485
682328	contig_5084_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_64593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922548	923096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_922500_923100
682329	contig_14822_pilon	+	1157	5	Intergenic	novelGene_145415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_4	414.334707694154	3880	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	44	430	183396	186229	TRUE	25	AAGACTTTGATGTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FISCLVSLRSGDNKMSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFR	181675	190342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181708_183384_183502_185583_185738_186102_186594_189979
682330	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682331	contig_2377_pilon	-	1595	1	Intergenic	novelGene_67875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAGTAAAGAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29086	27491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_27500_29100
682339	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91672	0	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
682341	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682352	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_97953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682354	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682355	contig_6710_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_93431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
682359	contig_20844_pilon	-	1223	10	Intergenic	novelGene_78602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_9	262.97209165167	474	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	532	1113	206899	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209179	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208371_208934_208982_209120
682364	contig_13481_pilon	-	2106	5	Intergenic	novelGene_119288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	19.6341539160719	68	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	74	469	187687	184147	TRUE	35	GACAAGCCAAGTTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTKADRAPGTYRKVVASRAPRKVLGSSTSATNSTSPSSRKAENKYAGGNPVCVRPIPKWQKGIGEFFSLSSKDSEKENRIPEEAGSSGLGKAKRNLNSINPASPETTSSASTRIYNQCRNAGKYRNPIT	187760	177727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_179342_184123_184253_184763_184927_187277_187359_187641
682372	contig_6050_pilon	+	2180	2	Intergenic	novelGene_123113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGATCAAAACGTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324044	326302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_325855_325932
682373	contig_9049_pilon	+	1715	8	Intergenic	novelGene_83132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1469.82804769671	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	46	738	88356	112652	TRUE	45	TTAAAAAAATTTGGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88310	113672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112939_112981
682376	contig_18869_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_56089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73584	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
682385	contig_10734_pilon	-	1813	9	Intergenic	novelGene_51437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	72.0728797815101	447	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	107	868	2226326	2218369	TRUE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKVAPLNPLCSHPGLGQEPSPYPLSAPTYP	2226432	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
682387	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682388	contig_18869_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_56203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73739	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
682390	SIRV6	+	773	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-44	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	112	339	158	496	2002	10736	TRUE	35	TGTATATGCGGTAAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1844	11226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
682391	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682404	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
682417	contig_10235_pilon	+	2215	6	Intergenic	novelGene_46437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	217.401379940423	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	7	711	210483	212152	FALSE	20	TTTTATATTACTGCCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADWPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210476	213656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211031_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
682421	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682428	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682429	contig_7695_pilon	-	2127	7	Intergenic	novelGene_41639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_3	71.2148548798322	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	4	711	725272	716614	FALSE	5	CTGCTCTGTTGGGGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMLTCRHKFPDEDSYQKFIPFIGVVKVGLVEDSPSTTGDGDDSPVVSLTVPSTSPPSSSGMSRDATATPPSSPSMSSALAVMGSPNSPYGDVIGLQVDYWLGHPSERRRDGDKRDASSKNTLKSVFRSVQVSRLPHGGEAQLSGTMAMTVVTKEKNKKVPTIFLSKKPREKEVDSKSQVIEGISRLICSAKQQQTMLRVSIDGVEWSDIKFFQLAAQWPTHVKHFPVGLFSGSKAT	725275	715197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716730_716884_717005_718112_718340_720165_720302_720516_720560_724655_724699_725249
682430	contig_3975_pilon	+	2062	7	Intergenic	novelGene_54765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	102.462052596179	9	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	6	314	1961329	1976001	TRUE	10	GCTGGAAGGTGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSLAQNAGLQPE	1961323	1986273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968104_1975969_1976095_1983156_1983261_1984722
682434	contig_4812_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_103623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCTATCTTTATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75386	74265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_74300_75400
682438	contig_14322_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_115921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
682445	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682450	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	691	1054	-59	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGACTAGCCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2700
682456	contig_848_pilon	+	1641	11	Intergenic	novelGene_83340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1110	1412	559122	566326	TRUE	20	AGCGACGTCGAATCGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFNRQYHGLFKGFFGSFKTSNIAPLHIWSLYNNGNLEAGSVVSFFQDHQILLPHHCHSPYPQLDLVVPLSLASVVFSLSFSGIPLVFLLYQDILYTLP	549088	571615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_549439_551874_552014_552744_552965_555055_555142_555810_555957_556435_556593_559110_559229_563376_563448_566201_566360_567558_567673_571533
682463	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682464	contig_11258_pilon	+	2956	15	Intergenic	novelGene_67755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	35.0579694861211	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	8	1492	58476	95823	TRUE	20	TATGCAGTCAGCCTCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAARVEYIVPWWVVWLHSVPHLGLRLQPVNSTFNPRDESYQESLLFLGLVAAVGLALNLIFLAVYLVCLCCCRRDDGVQTKQRNSCCVTWTAMLAGLVCCAAVGVGFYGNSETNDGVYQLIYSLDNANHTFSGIDSLVSGTTQKMQLDLEQHLARLSEIFAARGDYIQTLKLMQQMAGNIMGQLSGLPAWRDVTAELTKVADQTGYVEYYRWLSYLLLFVLDVVICLTACLGLAKHSKCLLASMLCCGVLTLLLSWASLAVDTAAAVGTSDFCVAPDAFILNVTQGRISTEVTRYYLYCSQSVSSPFQQVLTVFQRSLTTMQIQAAGLLQFAVPLFPTAEKDLLGIQLLLNSSEASLHQLTALLDCRGLHKDYLDALTGVCYDGIEGLLYLGLFSLLAALAFSTMICVGPRAWKHFATRDRDYDDIDDDDPFNPQARRIAAHNPPRGAASQLLQLQQRPGQPDQPAAPGPDHLQRPSLRVHEPSGTLRWEPPL	58468	102218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_58605_69853_70027_74243_74356_80362_80584_85695_85792_86388_86462_91419_91490_91737_91794_92498_92592_92790_92884_94256_94400_95062_95250_95784_95864_100609_101661_101845
682472	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682478	contig_13215_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_145896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAGGATTTCATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159942	158839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_158800_159900
682481	contig_2342_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_132754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161227	162721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_161200_162700
682490	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682500	contig_9390_pilon	+	1154	2	Intergenic	novelGene_153086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGTGTTAATCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811720	823860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9390_pilon_+_811874_822859
682503	contig_18869_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_56298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73547	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
682509	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	625	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682518	contig_8156_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_98926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAGACAGAGTCACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290021	290857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_290000_290900
682520	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682526	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73744	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
682528	contig_12837_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_57387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	478	852	391232	391606	NA	65	TAAAAAAAAAAACTGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLRYGLHLNIKKTQILTTGPISNIMINGEKIEVVKDSILLGSTINTHGSSSQEIKGCTTLGKSTAKDLFKVLKSKDVTLRTKVCPIQVMVFSITSYACESRTMNKEHRRRTVAFEICVGEEY	390754	392409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_390800_392400
682533	contig_5935_pilon	-	2051	13	Intergenic	novelGene_102662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	86.8451287573971	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	767	1792	422187	412799	FALSE	35	TTTTGAACATTATTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSNENVCKLKRSRTTSEGSDVEVTEAQKPPSKKKKKREKAEVSNLPEVRTGKRKRSAFADTECLAPRSKVKKLTQKENIKKEVKEVTKENKDLEVSTEEEKDTRDIKDGSLLKAKRKHKKKHKERHKMGEEVIPLRVLSKSEWMDLKKEYLALQKASMASLKKTISQIKSESEMETDHGEPNKSGMKNEKTNSEECRPQEVNAMGPQFVSGVIVKIISAEPLPGRKQVRDTLAAISEVVYVDLLEGDTECHVRFKTPGDAQAVINAYTEIKKKHSWKLEVLSGDHEQRYWQKILVDRQAKLNQPREKKRGTEKLITKAEKIRLAKTQQASKHIRFSEYD	431599	412539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_412880_415238_415331_415558_415719_418976_419093_419846_419999_421668_421814_421907_422262_422333_422428_422509_422646_422846_422922_422997_423099_423647_423851_431516
682535	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	886	-21	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
682545	contig_6088_pilon	+	3050	23	Intergenic	novelGene_161268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	114.664692628277	222	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	186	2975	113669	217263	FALSE	45	TTACTTTAAAGTGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPTQIEAELYYLIARFLQSGPCNKSAQVLVQELEEHQLIPRRLDWEGKEHRRSFEDLVAANAHIPPDYLLKICERIGPLLDKEIPQSVPGVQTLLGVGRQSLLRDAKDCKSTLWNGSAFAALHRGRPPELPVNYVKPPNVVNITSARQLTGCSRFSHIFPSSAYQHIKMHKRILGHLSSVYCVAFDRSGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHSAEISDMAVNYENTLIAAGSCDKVVRVWCLRTCAPVAVLQGHSASITSIQFCPSTKGTTRYLTSTGADGTICFWQWHVKTMKFRDRPVKFTERSRPGVQISCSSFSSGGMFITTGSTDHVIRIYYLGSEIPEKIAELESHTDKVVAVQFCNNGDSLRFVSGSRDGTARIWQYQQQEWKSIVLDMATKITGSNLPSGEDKVSKLKVTMVAWDRYDTTVITAVNNFLLKVWNSITGQLLHTLSGHDDEVFVLEAHPFDQRIILSAGHDGNIFIWDLDRGTKIRNYFNMIEGQGHGAVFDCKFSPDGNHFACTDSHGHLLLFGFGCSKYYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPTKFQRLVPGRENCKDEQLIPQLGYVANGDGEVVEQVIGQQTSDQDESILDGIIRELQREQDLRLINEGDVPHFPVNRSYSVNGALRSPNMDIHSSPNIGLRRSGQIEGVRQMHNNAPRSQMATERDLVAWSRRVVVNELNHGVSRVQEECRTAKGDIEIGLYTVEKKKKPSYTTQRNDYQPSYGRSLRRTQRRRQHTYQTRSNIEHNSQASCQNSGVQEDSDSSSEEDETVGTSDASVEDPVIEWHSESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQATRKICSSSEEENLKPLEERQKKPKQTRKKVCNFACFVILHVLFLFVCFAFNT	113483	217338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_113700_113825_113885_114087_114118_114521_114582_125989_126141_127919_128019_169054_169216_170536_170759_175407_175509_176007_176079_176691_176793_178989_179031_179694_179800_181039_181194_194332_194468_195521_195651_196588_196815_199130_199299_205700_205885_208469_208564_210876_211027_216373_216451_217022
682558	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
682567	contig_6227_pilon	-	1230	10	Intergenic	novelGene_49756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	362.217893634668	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	32	874	1224979	1202979	FALSE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSA	1225010	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202982_1203600_1203700_1204139_1204217_1204370_1204460_1214154_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
682571	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682577	contig_17274_pilon	+	2489	6	Intergenic	novelGene_26589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGGAAAAATATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243060	254034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_243105_246141_246196_246241_246310_246873_247034_251738_252231_252363
682590	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682591	contig_12279_pilon	+	1114	5	Intergenic	novelGene_50116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3417	junction_2	1076.55570571151	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	9	611	68297	77128	FALSE	20	TGACTGAGATCTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKMTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	68288	77631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
682605	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682606	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	38	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682610	SIRV7	-	899	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAATCCTAAGAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56080_70872_70988_78841_78964_114686_114961_147608
682614	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682616	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682623	contig_10159_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_30909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTATCCTTGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046687	1048750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_1046700_1048800
682632	contig_14441_pilon	-	1505	7	Intergenic	novelGene_100525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	15	CCCCCGCAGCTGTCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111391_112110_112152_112399_112665_113865_114049_116562_116961_117218_117343_117538
682636	contig_17106_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_127679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCCTTCAATGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104809	105252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_104800_105300
682654	contig_2100_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_50625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	256	744	843947	844435	NA	25	TACGGATCATGCTGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNGTSGLEEDSLTTCVNADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSFQCGLHLNIKEIKILSTRLISNIMINGEKTEVVKDFILLGSLINTYGNSSQEIKRRITLGKSAAKNLFEVLKSKDVTLKTKVRLTQAMLFSTASYACKSWTMNKDYGRRIDTFELWCW	843691	845528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_843700_845500
682658	contig_17281_pilon	+	615	2	Intergenic	novelGene_105187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGTAATGTTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2140_2380
682661	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91673	0	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
682662	SIRV7	-	479	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	45	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114871	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
682663	contig_16846_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_82859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATAAAGTCAAATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131756	130436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_130400_131800
682667	contig_2940_pilon	-	2439	1	Intergenic	novelGene_81953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	447	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTAACGTGGTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986213	983774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_983800_986200
682668	contig_7202_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_18664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCATGGTGAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
682677	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682679	contig_8617_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_73392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62251	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
682683	contig_10159_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_30807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATATTGTTTCGTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407018	405060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_405100_407000
682689	contig_9875_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_154406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGCCGTGAAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71246	70398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_70400_71200
682693	contig_7471_pilon	-	234	2	Intergenic	novelGene_161287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	182	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGTGGGTATTTTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40226	38432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_38524_40083
682698	contig_1982_pilon	-	2063	2	Intergenic	novelGene_151305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTGCCAGGAGCGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99119	96912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_98344_98487
682705	contig_12270_pilon	+	386	2	Intergenic	novelGene_113121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	13827	14364	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAAISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13826	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
682709	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682716	contig_3426_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_57943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	950	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368577	366956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367000_368600
682718	contig_15991_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_70957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	364	1095	1141	2235	182386	181292	NA	25	AATCTTCTCAGTGTTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYPGPPALMDYTLQPNVTETDYYYPDVFSSPCDGELIQRGSNFLLAIFYCFLFVFSLLGNSLVILVLITRKKLKSITDVYLLNLALSDLLFVLSFPFLTHYRLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFFSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYAMKVRTASVGTALSLVVWLTAITATSPLLVFYQVASEDGSLQCYSSYNQQTLKWKIFTYFEINILGLLIPFTILIFCYISILHQLRGCQNRNKTKAIRLVLIVVIASLFFWIPFNVVLFLTSLHGMHILDGCVMSQQLIYATHVTETISFTHCCVNPVIYAFMGEKFKKHLSEIFQKSCSYVFVCIRKRVSKEGWERSSSFHQQSSRSSSIDYIF	183526	181122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_181100_183500
682721	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682752	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682753	contig_8284_pilon	+	1017	9	Intergenic	novelGene_125707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	444.932227985342	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	90	743	426599	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFCMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425065	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_457896_457943_458480_458556_461139
682757	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
682760	contig_12000_pilon	-	1689	8	Intergenic	novelGene_43169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	1356	1688	449734	416982	FALSE	40	AAGCAAACCCACGTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQREQAVDIQHAGDAPVTHVHFRLVLLAALLHQLFQRLRHGLYQTTTTKHVGNGEEGAGTERKNPPAATPQSSPALESRHRRADPDAARGMGKVGQGNGKGPAPFWPGSR	669971	416980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_417301_449720_449772_484101_484221_488474_488596_490220_490304_490573_490685_558468_558606_669224
682766	contig_4350_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_136377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGATTATTAGTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241608	239404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_239400_241600
682774	contig_7580_pilon	+	1434	6	Intergenic	novelGene_108596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	316.938227419792	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	198	1034	103420	109647	FALSE	15	TTTTCATGGGCTGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96446	110047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_106952_107190_108145_108248_109428
682776	contig_11120_pilon	+	1110	2	Intergenic	novelGene_161290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	189	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGAGTTTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22769	54016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11120_pilon_+_22846_52982
682781	scaffold_12124_pilon	+	1647	11	Intergenic	novelGene_22045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	453.503472974574	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	142	1257	836073	857234	TRUE	30	TCAGCGGTTCAAACCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRHSDIWSDWSETLHFGLPEQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVAGEEPPHSKR	829603	858182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852462_854703_854781_857201_857236_857793
682792	contig_14322_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_115758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
682798	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
682800	contig_6102_pilon	-	2281	7	Intergenic	novelGene_31999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	86.2090482490092	143	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	365	1318	455625	449540	FALSE	5	CTTTTGCTGTTCCTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYDVTRFQGDVDEDLICPICSGVLEEPVQAPHCEHAFCNACITQWFSQQQTCPVDRSVVTVAHLRPVPRIMRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKTSAEHKHQLAEQKRDIQLLKAYMRAIRSVNPNLQNLEETIEYNEILEWVNSLQPARVTRWGGMISTPDAVLQAVIKRSLVESGCPASIVNELIENAHERSWPQGLATLETRQMNRRYYENYVAKRIPGKQAVVVMACENQHMGDDMVQEPGLVMIFAHGVEEI	473578	448576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450747_450852_451251_451388_452090_452363_455535_455649_470683_470869_473422
682802	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	240	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682803	contig_7695_pilon	-	1224	4	Intergenic	novelGene_41550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	192.147512777727	1409	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	76	789	380076	375828	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGEPSSLNICCRPQELLLPQLLLQQQLLLLLLQLPLHITGGIGAPCVALQPQSPLLERATVTGMRARCPKLRQPRGIPCTTWLGMSGSSMRIGRGTQPFKA	381080	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376112_379646_380089_381017
682806	contig_6823_pilon	-	2082	13	Intergenic	novelGene_131221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_7	21.7426552094162	193	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1111	1674	282988	248884	FALSE	15	GCCAGTTTCACTTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325532	248475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288995_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_320648_320750_325387
682815	contig_5350_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_99350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAATCAAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172431	172731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_172400_172700
682818	contig_18869_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_56293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATTTGGCTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73746	73354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
682819	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
682820	contig_12128_pilon	-	1315	8	Intergenic	novelGene_131985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_7	58.7036834362171	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	176	829	410049	393395	FALSE	10	TATGGGCATTTTGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLAPSKSTVYVSNLPFSLTNNDLYRIFSKYGKVVKVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNMLGEREPPKKKEKKKKKKISEPEEQIEEVEESDNEGEDPALDSLSQAIAFQQAKIEEEEKKWKPSSGNPSTSDDSRRPRIKKSTYFSDEEELSD	411667	392908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_393527_394327_394404_394488_394602_396936_397045_397580_397693_404592_404622_409965_410052_411494
682829	contig_6902_pilon	+	2322	5	Intergenic	novelGene_135556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_4	14.9080515158756	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	1653	2321	283781	295292	FALSE	30	CAAAGGGGTACTTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFNHENYGLSI	278405	295293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_282377_283952_284527_284691_294102_294246_295100
682834	contig_12951_pilon	-	2075	4	Intergenic	novelGene_68166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_3	159.112119798168	621	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	10	453	326206	296988	FALSE	35	GCATTAATATTTAAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTGSGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	326215	295365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_307070_307220_326184
682837	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682839	SIRV2	-	539	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4258	110	3083	-75	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAATGTTGCTTAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	1110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
682840	contig_12566_pilon	+	2368	4	Intergenic	novelGene_85988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	25.7725090401036	33	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	102	353	5720	10586	TRUE	80	ATAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGDILRRFARFFGLLFRDTVLISPARARICSLMAEVKVKVQPPDADPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPHIEAQQRAVAINRLLSMGQLDLLRSNTGLLYRIKDSQNAG	5618	13802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5782_6777_6896_10514_11074_12274
682841	contig_13145_pilon	+	1758	9	Intergenic	novelGene_116621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	1052.53716531769	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	69	953	35323	72617	FALSE	25	CAAGGACTAATCTCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDERSRRREAH	35254	73422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324_57389_72589
682844	contig_12622_pilon	-	1065	6	Intergenic	novelGene_5935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2460.1989675634	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	57	899	1590968	1583714	FALSE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPMK	1591024	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583722_1588841_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
682849	contig_11720_pilon	-	1338	6	Intergenic	novelGene_44007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	174	524	272327	271841	TRUE	30	AAATCAAACCCGTTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272500	269640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_269906_270031_270151_270547_270800_271265_271408_271804_271958_272093
682851	contig_8594_pilon	+	2671	1	Intergenic	novelGene_140021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	339	1017	1653	2669	187465	188481	NA	35	TCAAAACTCACCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVNLEGDMQIDCVNESKHTEPPFPESFASVDSTPVSSLQKGTKPIQALLAKNIGNKVTLTNQLPPSTGRSAPAVEKPVLSPPRASSIKPASTCHASTKGPLQMVYKMPCGQWLPVDLHNSSVKIQMQPMVDPKTGEKVMQQVLILPKNFVIQHKEGKAVAKEIPPLQQKGTEQLCSSLPHTANVNSSLTSVLVNSTGTVSAQLPSPVFNKTIASLSNASSARPQPLSPITSISNLLTPPVKTSQNEAGKPKNAVSTATFPQPIASPTISSTVQPVVSATTLSGSTNPGSSLNSFVQQAADSFEAKQELQTVCIRDSQSILVRTRGGNTGVVKVQTNP	185812	188483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_185800_188500
682854	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682856	contig_15067_pilon	-	1609	3	Intergenic	novelGene_154330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92939	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_91173_91259_92190_92840
682866	contig_10324_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_7807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCTTTCTTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157409	157756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_157400_157800
682867	SIRV2	-	278	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	381	2958	-381	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGCGACTAAAAGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
682876	contig_1719_pilon	-	1445	6	Intergenic	novelGene_87323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	105.359195137397	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	365	670	461239	458348	FALSE	30	ATATTTGGCATTTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVDETLRLVKAFQFVEAHGEVCPANWTPHSPTIKPSPTASKEYFEKINQ	467766	457572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_458761_458928_461153_461258_462091_462228_466480_466617_467692
682880	scaffold_19766_pilon	-	1210	8	Intergenic	novelGene_34328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	421.219899911712	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	327	989	621659	596625	FALSE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPGVRRSLILDHPHSPGGFTPNSVNPPGIPSSGLLSFLHTSACLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622371	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622186_622232
682889	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682892	contig_6102_pilon	+	774	6	Intergenic	novelGene_31960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1222.8278047215	615	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414484_414613_414788_414877_414956_416018
682897	contig_4732_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_75509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGGCAATAATTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106919	1107715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1106900_1107700
682901	contig_8554_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_160287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGAAGGAGTGGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100167	102807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_100200_102800
682903	contig_5280_pilon	+	1623	8	Intergenic	novelGene_52616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	689.364037000919	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	37	603	38385	41836	TRUE	55	AGGAAAAACATGCTAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTG	38348	78688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41847_47278_47508_56218_56333_62043_62065_78042
682910	contig_6270_pilon	+	1290	6	Intergenic	novelGene_99819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	167.060946962478	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	534	872	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCLTFRACSVSFPHASPSLCSSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37335	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_47302
682911	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	19	357	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14427	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
682912	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_93533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653769	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682916	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_17718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27869	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
682917	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682920	contig_11115_pilon	+	661	5	Intergenic	novelGene_102787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_2	88.6072796106505	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	254	661	135422	140360	FALSE	30	CAAGCAGAGCATGGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCQWGGTARGSKPNGDGAQSMVTGEGLRVHLHWAGPGGGEPWVTFNEASLTAEEVCIHIAHKIGITPLCFNLFALFDTQAQVWLPPNHILEVPRESSLILHFRMRFYFRNWHGMNPQEPTVYRCGPPGAEAPSG	133757	140360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_133788_134641_134846_135402_135618_139973_140098_140272
682938	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682939	contig_1244_pilon	+	1961	6	Intergenic	novelGene_37954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	27.4488615428764	81	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	29	1024	874933	882516	FALSE	35	GGGGGTATAAAGGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTEGAGAPKPGEMRALKPCLLRRNHSRELHGVAVSCLEELRSKAYDTLAIDKSLAPVTLVLAEDGTIVDDDDYFLCLPSNTKFVALASNEKWTYNNSDGGTAWISQESFDVDETDSGAGLKWKNVARQLKEDLSSIILLSEKDLQVLIDVPCSDLAQELSQSCAAVQGLQNTLQQVLDQREEARQSRQLLELYLRALEKEGSILSKQEESKPAFVEEVDAADMGTSRETFSRIALTSQILTALKEKPAPELSLSSQDLELVTKEDPKVLAVALNWDKRKTETVQQACEQELSLRLQQVQSLRSLRSISAKKTSLPGELQNPKRAKPDST	874904	883453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_875069_876812_876975_878260_878404_880957_881148_881374_881527_882303
682945	contig_5899_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_146965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54015	52554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_52600_54000
682964	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
682974	contig_5935_pilon	-	519	4	Intergenic	novelGene_102671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACACTTCTTCAAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506299	491943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_492064_493369_493510_504649_504795_506185
682976	contig_1244_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_38076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294091	1296211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1294100_1296200
682978	contig_10627_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_59930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.3882614949568	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	270	533	108135	109221	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQSARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	106081	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_106093_107876_108139_108453_108573_108962_109005_109122
682980	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
682981	contig_14322_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_116103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671651	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
682982	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
682983	contig_3463_pilon	+	3939	1	Intergenic	novelGene_62010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531178	535117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_531200_535100
682988	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
682990	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
682993	contig_12948_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_126225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCCCCTTAAAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367798	369434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_367800_369400
682999	contig_9871_pilon	-	2087	2	Intergenic	novelGene_75693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAAGGATCGCCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541008	538384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_539984_540520
683002	contig_12586_pilon	-	1823	12	Intergenic	novelGene_121790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	113.714009836334	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1677	146	1822	33020	6698	FALSE	20	GTCAGTATTGTTTCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEERQNLHTFRNYVRKTLDPTYILSYMSPWFREDEMQYIQTEKNNKGTMEAASLFLNILEEHRLLLRRLQPEFKTRINPLDILPEISQCLINQECEEIIQVCSNKGMIAGAEKMVECLLRSDKENWPKVLKLALEKEEYNFNELWIVEKGVEDVETKDLQNDEMETSEVQIFYQEEPEYQNLGQSSCPPSSEVSYTNLYSPVKPRNYQLELALPAKNGKNTIICAPTGCGKTFVSILICEHHLKKFPQGQKGKIVFFAIQIPVYEQQKSVFSEYFERLGYTVAGISGATSEEVPVRQIIENNDIIILTPQILVNNLKNGTIPSLSVFTLMIFDECHNTSKHHPYNMIMFNYLDQKLDGSSDPLPQVVGLTASVGVGDAKNITEAVAYICKLCASLDTSVIATVKDNLEELEEVVYKPQKCFRKVETWTTNKFKCIISQLMMETENMAKNVFEELGTLTLENLSHIQSRKFGTQKYEQWIVAVQKACMVLQMPDKNEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARVKDALDYLKDFFANVRAAGFDEIEQDLTSRFE	33165	6696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_6833_7823_7982_9668_9789_11291_11455_13721_13981_14755_14910_15292_15401_17557_17684_18757_18906_19884_20002_23832_23916_32914
683005	contig_12622_pilon	-	1527	13	Intergenic	novelGene_6040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	435.277019073295	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	45	1160	1691275	1685486	FALSE	20	CTTAAAACCCTGTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691526	1685118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688876_1690347_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
683006	contig_4812_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_103638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	5768.8650145029	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	406	771	82334	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQ	82739	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81179_81286_81547_81739_82268
683011	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683014	contig_7202_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_18597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTGATGAAGCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30070	28544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
683016	contig_4732_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_75419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	250.184931600606	468	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	63	719	596758	608641	FALSE	25	CTTCCTGGACAGAAACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRIVSQKQIADRAAHDESPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL	596695	609479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607378_607825_607907_608495
683017	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
683018	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
683022	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683024	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683026	contig_19851_pilon	+	902	5	Intergenic	novelGene_29830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3442.53485821132	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACAATGTACACACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53685_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
683028	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683032	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683033	contig_4213_pilon	+	3248	2	Intergenic	novelGene_124785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	0	145	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCTCAGATGGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12820	22217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193
683034	contig_11335_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_104925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGAAAAAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406741	404444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_404400_406700
683037	contig_13004_pilon	+	2070	9	Intergenic	novelGene_112701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	322.339858495657	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	928	1542	943766	952167	FALSE	15	TGACTTCTCTAGAGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837794	952695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_926989_927531_927669_929250_929376_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951
683038	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	381	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683047	contig_10196_pilon	-	2626	3	Intergenic	novelGene_132101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	242	43	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	103	438	912067	911732	TRUE	5	CCAGGTTTCCCGTGTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWTPHCTPGLALQNPTTTVPRTPAPQTSPAVVPHMDPASRCTPDLTEYPPPPLVPIPWLCPMGVSLGSSASLVSLHPGPYLLGPPPPPHLLHREPHSQSCPLEAPPPHPWPPASLSIRSLWVAIICDLGLLGLSLPTVLCGVGSR	912169	908891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_909044_909341_909762_910115
683057	contig_9239_pilon	-	169	1	Intergenic	novelGene_137172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAATAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145403	145234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_145200_145400
683063	contig_4686_pilon	-	1795	3	Intergenic	novelGene_118490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_2	4.5	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	716	1060	364531	353841	FALSE	25	AAAATATTTTGTCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTSGRSTPNQQRTPRGKCSLSQPGPSVNSPHSRSTKGGFDSSLSEPQPAQSRRAFLLRVLRAALPLQLLLLLLIGLTCLVPMSEEDYSCALSNNFARSFHPMLRYTNGPPPL	365246	353105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_354082_363015_363075_364486
683064	contig_11171_pilon	+	2997	6	Intergenic	novelGene_48563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	115.120111188272	1	171	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	59	883	70574	105722	FALSE	25	TTTCTGAATAAATGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEAAE	70515	107836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_105710
683069	contig_14322_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_115792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671615	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
683076	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683078	contig_7202_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_17564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27625	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
683079	contig_18869_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_56331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73548	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
683080	contig_7963_pilon	+	1359	7	Intergenic	novelGene_58514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.26066849983	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	283	1074	194098	200117	FALSE	25	GGAATATTGTTTATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	185510	200402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_185704_194008_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
683082	contig_15732_pilon	-	3398	1	Intergenic	novelGene_88879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTTTATGAATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192022	188624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_188600_192000
683084	contig_15063_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_12632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	3	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	4	1416	28164	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28160	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
683086	contig_20199_pilon	-	472	3	Intergenic	novelGene_82604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	58	393	43987	41055	FALSE	15	CTGTTGAAGGTGCCGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44044	40975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
683087	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683088	contig_1264_pilon	+	2199	10	Intergenic	novelGene_161320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	519	1280	141750	144077	TRUE	10	GGCGGCCGCCGCTGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIFANQVLLKHSQAIPLHTVYGCFCAATAELNTCNRDHHRNAKLKIFTIWLLIPEIEHEHLEKNPLKMLSSELTIEYPISFWLTLVSMDTHSWPTISAHSSSEVITASLGLHKYNCLIFLFGHYFLHELDQFVVFFTFHADIHNLEDVVVGTQLQIAHIDLSVITKKILSKLSYFFWPGCTPHQGLSIRLSGQQFYGFGVQSPYQAFCLPHPIQGKYIGEDLSFLTPGNLSGVREWLCKSQHLSPSLESGDL	141231	152903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_142036_142291_142403_143248_143427_143510_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148370_152545
683108	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683109	contig_6063_pilon	-	1829	13	Intergenic	novelGene_27584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	577.924224896502	2	65	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	493	1407	36264	17150	FALSE	25	TCCTTGTGAAGCTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70265	16727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36293_45739_45811_48191_48356_52947_53047_70135
683110	contig_7051_pilon	-	1559	4	Intergenic	novelGene_64300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	112.810559001461	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	24	434	231129	189287	FALSE	40	TAGACACCCATCTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNR	231152	188161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_189291_217573_217734_217824_217999_231056
683116	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683120	contig_7594_pilon	-	2257	5	Intergenic	novelGene_55401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	91.5761295316634	94	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	692	1876	387647	381704	FALSE	75	AAAAAAAAAAATTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLEKNALIIYSKLKQICREHGHTCIEEAELTSKLSDRMSFDDAWQSLKFLKDSGVVTYEKGCVFPYDLYQAERDIASSICHLMMRPPWDLHVDVKKVLASLQARKPENSECADVLNESKLDETRLENSVHILDTQDNSDHDGENELNAEISEVQLDRDQVTALEMICANAVTVISGKGGCGKTTIVSHLFKHIEQLEEREVKKACEDFEQDQDVSEEWVTFTEQSQLEAGKAIEVLLTAPTGKAAGLLRQKTGLHAYTLCQVNYSFYLWEKNKMMKDKPWKFSSIRVLVVDEGSLVSVRIFKSVLNLLCEHSKLSKLIVLGDIRQLPSIEPGNLLKDLFETLKSRNCAVELKTNHRAESQLIVDNATRYDVTKILYFLSVVLEIKGKTYVCV	397215	381322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_381922_383014_383193_386858_387729_391785_392194_397013
683122	contig_12113_pilon	-	1391	2	Intergenic	novelGene_134755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCCATCCAAGGCACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340102	326490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_326502_338722
683123	contig_7396_pilon	-	1601	15	Intergenic	novelGene_79644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2902.34727313558	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	119	1507	255163	246442	FALSE	10	TTTTTATCTGCTTCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257472	246347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
683124	contig_5620_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_161330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTGTAAGAAAGATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126004	128283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_126000_128300
683131	contig_18859_pilon	-	3434	4	Intergenic	novelGene_150525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1318	1677	38069	37710	TRUE	15	GGACTGCCTGTTCCGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDTGSIKRWKEYSESLYQKELVDVQPVQEAAYDQKLLVLKEEVQAALKALARNKAPGIDGIPTEMFQQMDTALEVLCQEIWKTATWPTNWKRSYLCLFQRKVIHPHEEIIKQYH	39386	28845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_29055_33256_33391_34320_35211_37185
683132	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	1	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
683134	contig_18869_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_56262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73568	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
683148	contig_11816_pilon	-	1422	13	Intergenic	novelGene_98514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_8	252.303209892824	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	27	1139	1086647	989430	TRUE	80	CAAAAAAAAATGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLSKTNLYIRGLPPNTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPNGRPWHREGEAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQVQSPSWMQPQPYILQHPSAVLTPSMEHTMSLQPASVISPLAQQMSHLSLGSTGTYMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEEASGQQQVAVETSNDHSPYTFQPNK	1086673	986033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986310_989422_989508_990796_990878_992054_992166_995414_995466_999066_999161_999284_999335_1000393_1000501_1015122_1015203_1017129_1017288_1027665_1027758_1033126_1033186_1086495
683161	contig_1227_pilon	+	3311	2	Intergenic	novelGene_161370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	111	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTATGAAGATTCATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71902	79778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1227_pilon_+_71952_76516
683165	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_94980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683170	contig_5515_pilon	-	2001	6	Intergenic	novelGene_52356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.385150172513	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	181	756	161205	160096	FALSE	20	GGCAAAGAGTCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDVEEEGRPGTFHVGGAPAPNASHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGGSQGAPFPHCGLPLTLCCLQCPPLSPRPAAAAAASAWKRSPDQASPLPWGFPTQERRTS	166214	158850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_160275_160335_160589_161061_161210_165496_165573_165751_165809_166171
683173	contig_5696_pilon	-	2339	9	Intergenic	novelGene_117593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	410.368260681793	9	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTAGTTTTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773094	752156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_753185_756907_756959_762282_762394_763244_763344_764527_764684_764836_765050_765887_766008_767338_767784_772978
683178	SIRV4	+	179	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1592	632	1137	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2592	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
683183	contig_9839_pilon	+	1762	6	Intergenic	novelGene_88506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_1	1517.8511916522	704	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	92	667	52079	61360	FALSE	35	TCCATCTAAAATATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45345	62455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
683186	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683188	contig_11512_pilon	+	1481	9	Intergenic	novelGene_43261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	14.6714007511212	460	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	105	1343	358531	471553	FALSE	10	TTGGTGACTCTGACTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVAALSWVQTHIREFGGDPQRVSLAADRGGADVASIQLLTTRAVNARLFRRAVLMGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357612	471691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_357685_358498_358702_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
683191	contig_14445_pilon	-	3027	2	Intergenic	novelGene_137365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328506	321721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_323426_327183
683203	contig_5947_pilon	+	2276	2	Intergenic	novelGene_101510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	52	1230	419031	420584	FALSE	30	GAAAATCAATGGTCCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAELKCGHSQQVECGQVDAIKYGLPVKCTTKCGTILDCGHPCLGSCHSCFEGRFHEHCQQPCKRLLICSHKCQEPCIGECPPCQRTCQNRCVHSQCKKKCGELCSPCVEPCVWRCQHYQCTKLGSAEEIAASQERLKDLLEKKNLFYLWLPEEFLMLKKKLAQKNLSVKGLGLVENCISFYDRLAGLWDSLKRVHVLEQNNVSTRLNQVHEWLAKKRLSFTSQELGDLQSEIQRLTYLVNLLTRCKMAEGKVKGSIAEEVCSVRKILMNTCKFTQEDEQLVQKKMEALKASLPCSGLGISEEERVQIVNAMGYPRGHWFKCPNGHIYAISDCGGAMQRGTCPDCKAVIGGVNHTLESSNQLASEMDGAQYAAWSETANNLMNYEEIQRLM	418979	421630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_419406_419780
683205	SIRV4	+	212	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1559	632	1104	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2559	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
683208	contig_12297_pilon	-	2831	1	Intergenic	novelGene_161379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCTTAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735171	732340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_732300_735200
683211	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_94816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
683213	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683221	contig_12414_pilon	+	1130	3	Intergenic	novelGene_59560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	90	605	370898	374054	FALSE	30	TGATAAACTTAGTGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370808	374579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373352_373894
683222	contig_20794_pilon	-	1381	10	Intergenic	novelGene_161387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	77.191120835252	170	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	334	1314	23881	276	FALSE	20	CTACCTGCTGTTATACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLETKITKWNLQLRKNKHEAVVIKESSRQKAIALKKASKAYKQRLEHFTGNIENLTSQIRDQEAKLSETISASNAWKNHYEKIIIEKTELEVQIETLKKQITNLLEDLKKMEDHGKTSCEEIVRKLHSIEYENETLNLENTKVKTMLAALKEKTASVENELIELQEVENQQKTLIEVYKTQVQKLQEAAEIVKSRCENLLHENNQITKNKNKKLEKMRGQMESHLKELERIRDSLTAAEWRLHQSQQSLQHYKGKCADQAQTIRELQGQFDGNHSLLTKLSLEEENYLIQLKCENLKQKLEQMDAENKELEKKLASQEECLKHSNLKFKEKSSEYIALARQLEAALEEGRQKVSEEIEKMSTRERALQIKILDLETELRKKNEEQNQLVCKFSSKAQHQEVCLKEIQHSLEKSENENESIKNYLQFLKTSYVTMFG	30443	208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20794_pilon_-_405_2779_2906_5415_5579_5660_5747_7140_7300_9366_9472_10708_10820_23779_23916_25076_25187_30254
683224	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_93781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683228	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
683231	contig_15354_pilon	+	2309	8	Intergenic	novelGene_65757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	53.6435704727158	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	684	1202	642871	647385	FALSE	30	ATCAAAGCTGCCTCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFPSALLGGFGFRTPSRHQRLRSPMHTSLAALCCSCCL	639029	648492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_639245_639699_640818_640895_641713_641787_642855_643055_644182_644392_645018_645033_647273
683244	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683254	contig_9389_pilon	-	1360	6	Intergenic	novelGene_83874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	509.289151661411	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	182	430	38585	36611	FALSE	0	CCTCGGGCTGGGCGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWWRWRTRRAARKRRRRWRRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45842	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38886_45779
683257	contig_5684_pilon	+	2149	5	Intergenic	novelGene_80991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	48.6434733546033	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	361	756	95318	96956	FALSE	15	ACCCCAAGTGTTTGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFNAYQAGVGALKLSMKDVTVEKAESLVDQIQELCDTQDEVSQTLAGGVTNGLDFDSEELEVELDLLLQDTTKEPLDLPDNPHETFYTNSVPSPRISDAELEAELEKLSLSEGGLVPSSKSPKRQLEPTL	94957	98349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_95321_95611_95711_95930_95992_96479_96660_96903
683264	contig_6589_pilon	+	973	5	Intergenic	novelGene_25763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	543	junction_1	1636.09342260765	12942	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	390	881	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
683267	contig_16461_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_139205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	919	374	FALSE	35	AACAGTTATGGTAGCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQ	929	373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
683273	SIRV7	-	928	5	FSM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	10	11	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	157	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147608
683287	contig_9297_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_69843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	391	726	681041	680706	NA	15	TGTTTTTATGTAGCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAWDRKSLQVAIQDTTAGLYSPGTTEEEGESGIGRGNGMCDSFPLGITTSSALRSEELDGTLLPLLNILIKDSIRRILIKNGKMQNRISNSHTLDFLEPWRVAEPLKLLP	681431	679664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_679700_681400
683291	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
683296	contig_7171_pilon	-	1822	16	Intergenic	novelGene_101397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	107.53323000615	568	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	309	1316	1422156	1409817	FALSE	5	CTCAGCTGTCTGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAVIGAEHPGQTEPTSSPPGRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYANLEKYHLPYPEAIFEIGYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFIRLLKEKGLLLRCYTQNIDTLERVAGLEPEDLVEAHGTFYTSHCLSPLCRQEYALNWMKEKIFSEVIPKCEKCQSVVKPDIVFFGENLPAHFFSCMQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1437478	1409310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413044_1414806_1414937_1421053_1421123_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422191_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
683300	contig_8177_pilon	-	2279	4	Intergenic	novelGene_86496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.183067086119	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	56	334	41361	39318	FALSE	65	TGTTACAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLTHLYLRGNALADKGIKMLCEGLMNPNCKLQMLELDNCNLTSHCCWDLSTLLTSNQSLRELSLGNNDLGDLGVVLLCEVLKQQNCFLNTLRLCEMYFNYELTIVFEPSW	41416	37372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_39348_39389_39418_40643_40815_41311
683303	contig_3151_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_139197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242310	243667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_242300_243700
683304	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	24	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121198	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
683315	contig_2646_pilon	-	1446	9	Intergenic	novelGene_69651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	352.760342690331	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	85	957	2178950	2172056	FALSE	20	CGATGCGGTAGCTCCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEIGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC	2180999	2171566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175161_2178911_2178992_2180956
683316	contig_1239_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_150422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATAATTTGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684973	687024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_685000_687000
683318	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_93600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683326	contig_9871_pilon	+	1515	8	Intergenic	novelGene_75621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_7	274.545041098609	290	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	180	1193	331361	352392	FALSE	20	CAGTCTCAATTTGGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRVASGLNPSIQKASNYRNNTVLYE	331181	352714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364_351426_352321
683339	contig_2940_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_82001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTTTTGCAGTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176102	1175737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1175700_1176100
683340	contig_3602_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_60575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	462	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAAAGCCTGCCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626598	624310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_624300_626600
683341	contig_3386_pilon	+	3716	7	Intergenic	novelGene_34592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAGACAAGAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516208	531521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_518912_520330_520444_521996_522198_523519_523639_523992_524092_528527_528803_531315
683342	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683343	contig_11448_pilon	-	3050	1	Intergenic	novelGene_66403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAGAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473902	470852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_470900_473900
683345	contig_5445_pilon	+	990	4	Intergenic	novelGene_135402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	1298.21903647523	474	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	492	830	52520	53758	FALSE	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCFLPVIPLPVLFLSNTELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51574	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52273_52635_53127_53240_53646
683347	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683348	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_97074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683354	contig_9871_pilon	+	830	3	Intergenic	novelGene_75692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_2	222	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	201	464	539838	540638	FALSE	25	TTTATACTTTCTTCATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	537825	541004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_537936_539747_539984_540520
683365	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
683367	contig_8435_pilon	+	2540	5	Intergenic	novelGene_72007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	64.5387480510739	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	786	2474	94334	97944	FALSE	10	CATGCTGTGAGCTGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	90957	98010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_95334_96398_96685_97030_97164_97674
683373	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_95843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683374	contig_15063_pilon	+	3345	1	Intergenic	novelGene_14473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1009	1353	45328	45672	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGQAADTLCKVCHLTACAASRELHVPDLEHAACPSHPEASGSHLRMWVGHNASWKWLKSSQSLNSGSEWTRRAGQAQGWRRRKWKKGVTMEEMRQRGQHSLHSGGLALQLRP	44319	47664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_44300_47700
683376	contig_10904_pilon	-	1569	6	Intergenic	novelGene_22633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	335.213961523085	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	441	896	505074	499813	FALSE	25	CACAAGACTACTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	516220	499139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505101_514027_514181_514793_514925_515034_515114_516169
683377	SIRV2	+	567	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-60	16	-60	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTCCTACTAGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
683379	contig_6902_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_135585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACACCAAAAATCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440572	438718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_438700_440600
683380	contig_6902_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_135584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438664	436402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_436400_438700
683392	contig_18613_pilon	+	1059	5	Intergenic	novelGene_80225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_2	1250.90314872895	176	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	165	653	24385	31105	FALSE	25	CGAAGGTGGTATCATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	24220	31511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
683395	contig_12019_pilon	+	1418	5	Intergenic	novelGene_87791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1458	junction_3	666.998266489501	43	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	937	1392	766528	767304	FALSE	15	ACTGTCACCTCTGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPQCSSGRAMSTHVWKVVRHWPVPKHLMTYSLSSPAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764797	767330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_764823_765184_765260_765343_765425_765772_766813_767133
683398	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683408	contig_7202_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_19032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
683412	SIRV4	-	336	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACGATTGCCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	2426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
683413	contig_4974_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_161398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40980	39523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_39500_41000
683416	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_16950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27882	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683417	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683427	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	597	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
683434	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683440	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_96914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683442	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683448	contig_2257_pilon	-	1698	5	Intergenic	novelGene_122495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTTGAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331956	290276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_291572_292340_292458_299385_299478_310266_310333_331828
683456	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683457	contig_14727_pilon	+	2466	2	Intergenic	novelGene_56638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	631	junction_1	0	9	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	833	1282	163116	170145	FALSE	25	ATGTTTGTACCACCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDRNGGRRLRQWLIEQIDSNMYPGLIWENDEKSMFRIPWKHAGKQDYNQEVDASIFKAWAVFKGKFKEGDKAEPATWKTRLRCALNKSPDFEEVTERSQLDISEPYKVYRIVPEEEQKCNYPPSAPSLPKQGSGVEVSAHRVRASGFS	162283	171329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_163290_169869
683459	contig_9696_pilon	-	1494	7	Intergenic	novelGene_68758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	355.56371518415	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	77	937	150836	136106	TRUE	40	TTTAAAACAGAGTCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAAQVTKKKKKKRYRIPTNDELLYDPEKDNRDQAWVDAQRRSYHGFGIQSPRQQQPVPNSDAVLNCPACMTTLCLDCQRHESYKTQYRAMFVMNCSVNKEEILRYKTPENRKKRWGHKKMRSSQEDTAKWAETEAEEIYHPVVCTECSTEVAVYDKDEVFHFFNVLASHS	150912	130889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_131406_136064_136383_137980_138092_139913_140032_140957_141057_146412_146595_150762
683464	contig_14822_pilon	-	1821	8	Intergenic	novelGene_145396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	104.446451469113	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1030	1734	55511	53461	FALSE	15	TCCACACTGCTTACTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHRVAGWADRAGAWHLCPHSGGCPTLRQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69714	53373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_56220_56390_56511_58467_58558_69603
683465	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_113455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
683470	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_93493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
683477	contig_10235_pilon	-	1898	19	Intergenic	novelGene_46391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	72.9215712636224	505	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	633	1652	182616	177880	FALSE	10	CTGGCTGGCTGATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192439	177633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_191199_191257_192265
683478	contig_13828_pilon	-	2448	10	Intergenic	novelGene_158278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	29.3030146344479	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	158	1297	323602	50314	TRUE	40	AATAAGCATATCTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRYMPKHKITHLKKMLSLERNNGAAPSMALPSQQEQRGSESVLKNFTGESGLCGAVSGLGTIQQESLGSSLMQLSDLNQSNSSDDSNSYQEEKKQNPTLNPSDTLGGVDDQQRPLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMRLKELGLKFHVSVLGETFTDVPGWKLRIVVVTHFVPRIWFIPKYSQLNICILHLNSFQKGSRISARDQIL	354308	44200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_45335_50296_50389_51088_51160_72609_72720_115165_115529_246998_247173_250617_250786_323423_323628_326949_327017_354243
683479	contig_11370_pilon	-	1879	8	Intergenic	novelGene_98748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_7	82.9568365759801	359	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	562	1317	152557	149588	FALSE	30	GAGATCAGCCTCACACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPAAFPLPVVVATVLWGAAPIRGLIRATSDHNTSMDFADLPALFGATLSQEGLQGFLVEAHPANACSPIAPPPPAPVNGSVFIALLRRFDCNFDLKVLNAQKAGYGAAVVHNVNSNELLNMVWNSEEIQQQIWIPSVFIGERSSEYLRALFVYEKGARVLLVPDNSFPLGYYLIPFTGIVGLLVLAMAAVMVVRCIQHRKRLQRNRLTKEQLKQIPTHEYQKGDQYDVCAICLDEYEDGDKLRVLPCSHG	153118	149025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_149674_150368_150463_150595_150702_150924_151016_151133_151222_151328_151455_152309_152391_152473
683481	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683485	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-67	267	-67	-267	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTATCACTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
683488	contig_5419_pilon	-	2542	9	Intergenic	novelGene_15473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	77.6674602069618	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	11	790	79704	70724	TRUE	25	AAAGGTGATGTCTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESEYESVLCVKPDVSVYRIPPRASNRGYRASDWKLDQPDWTGRLRITSKGKIAYIKLEDKVSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSRYFVIRIQDGTGRSAFIGIGFTDRGDAFDFNVSLQDHFKWVKQESEISKESQEMDTRPKLDLGFKEGQTIKLSIGSITTKKGGASKPRTAGPGGLSLLPPPPGGKITIPPPSSSVAISNHVTPPPIPKSNHGGSDAGQLGEKEKTSRYPFRFGFSCSCYNTSTSSSFCKQ	79714	68646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_70369_70693_70797_71910_71942_72459_72644_72723_72833_73654_73737_74407_74513_74670_74772_79609
683490	contig_5779_pilon	-	1122	2	Intergenic	novelGene_106430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	182	403	94343	94011	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNERAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94080_94190
683491	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683496	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683497	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_16470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
683500	contig_14441_pilon	+	1162	5	Intergenic	novelGene_100532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	3	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	557	985	116728	117610	FALSE	10	TGGCGCTGCCTACGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112997_113209_116578_116963_117220_117344_117539
683508	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_89180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653705	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
683511	contig_5324_pilon	-	2438	3	Intergenic	novelGene_102068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	99	752	444540	443729	FALSE	50	AAATAAATAACTACAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQMADEAGLDLNMELPQGSSVIAESALRVTGLSRLLECSLCIREILLTGNSEYARMLKCSLRCVCLSAYSAVQNDRLSSLSSEFYSSYNLR	444638	442042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443952_444028_444076_444156
683515	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683518	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
683529	contig_91_pilon	+	2572	2	Intergenic	novelGene_127147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205004	1209292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1206214_1207929
683531	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683540	contig_15744_pilon	+	882	5	Intergenic	novelGene_83598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1568.37899995505	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	215	670	152116	153378	FALSE	5	CAGTTGTGTCTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINCNFLLQLFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149517	153590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152014_152177_152263_152353_152532_152706_153245
683546	contig_8122_pilon	+	2852	15	Intergenic	novelGene_40204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.1594873865845	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	436	2289	384937	408439	FALSE	25	CTATTTGATTGTATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYQALDKYGNLSALGFKRQGKWERISYFQYYLLSRKAAKGFLKLGLERAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFAGGIVTGIYTTISPEACQFIAHDCRANVIVVDTQKQLEKILKIWKHLPHLKAVVIYQEALPKKMANVYTMEEFMELGNELPEEALDTIISAQQPNQCCVLVYTSGTTGSPKGVMLSQDNITWTARYSSQAGDIHPAEIQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLQEVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLSCPGSDLKPFMTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKSFYGAAPMTTETQHFFLGLNIRFYAGYGLSETSGPHFMSSPYNYRLYSSGKVVPGCRVKLVNEDAEGIGEICLWGRTVFMGYLNMEDKTCEAIDADGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMEVPIISNAMLIGDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSEPTDNLTEQAVEFCQRVGSKATTVSEIVGKKDEAVYQAIEEGIQRVNLNAAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGHTMKLKRLIVLEKYKDIIDSFYQEQKK	351727	409002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_351874_371332_371432_372465_372567_384847_385069_385515_385605_385968_386090_397038_397120_397208_397359_397709_397887_398618_398801_399768_400000_400769_400988_405891_406032_406570_406818_408353
683547	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683552	contig_6589_pilon	-	1563	4	Intergenic	novelGene_25871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1584	junction_3	865.754519993334	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGATGGCTCTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957780	955185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_957360_957758
683556	contig_6710_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_94778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653694	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
683559	contig_6344_pilon	-	2568	5	Intergenic	novelGene_157102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	62.4439748894959	137	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	298	996	993996	991066	FALSE	5	TTTGTGTGTGTGTATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSNSAVILPSTPQACEIPPSPHTNSSRKQPMSATLRERLRKTRSSFNSCYSVAKRLKVENEESDQIFSEKPVSSTEENRLEFQESFKHIDSDFEESTYLKNTFKNISVCESKSLDIGSCNALQNDFVNENLPIQGLKEEKAKLVKQVQEKEDFLRRLKLVKMYRSKNDLSQLQLLIKKWRNCSQLLLYELQSAMSEENKKLSLTELIDHYGLDDKLLHYNRSEEEFIGV	994921	989493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991258_992459_992871_993900_994023_994403_994521_994767
683570	contig_6277_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_80401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGCAGCATTAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317383	316620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_316600_317400
683571	contig_6277_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_80400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAAATTGGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316569	315441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_315400_316600
683575	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683576	contig_8616_pilon	+	1988	6	Intergenic	novelGene_72383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	60.1065720200379	31	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACCTTGAGTGTAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_196640_196862_196914_197236_198858_198952
683577	contig_14923_pilon	-	2371	15	Intergenic	novelGene_157742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_13	79.8521912597243	591	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	260	1696	207290	183547	FALSE	25	TTATTCTGAGTCAGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIENIILIDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCVEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHLAHGKDFASRGIEMSEVRLNLEKMMEQKNTAVKALTGGIAHLFKQNKVIHVNGYGKITGKNQVTASKDDGSTQVIDTKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTVVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVTAVEFLGHIGGIGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGKAELITCDVLLVCIGRRPFTQNLGLEELGIELDSRGRIPVNTRFQTKLPNIYAIGDVVAGPMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF	216090	182871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_183613_183702_183793_185802_185941_186469_186660_186990_187162_188340_188532_194638_194741_195171_195316_195630_195732_205384_205455_206019_206089_206585_206666_207265_207351_213503_213583_215970
683581	contig_10404_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_138705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1327	1692	1211131	1211496	NA	30	TGTCACTTTAAGGACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWWFHFEVQELQVRGGVQGESLRMAGLGCKGVRGAPWRAEQGSRRGGGAEGPACPMPPTAQDGAGRSEEEPAHPLAPFRPSPPGSHSPEATQECQGSTQQRRSPSKFHDSGKDSPGQLTD	1209804	1211945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1209800_1211900
683582	contig_8822_pilon	+	2861	3	Intergenic	novelGene_117931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGGGTCGGCATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74419	104596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_77172_103707_103778_104557
683585	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_97163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683589	contig_3832_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_161433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97484	97850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_97500_97800
683590	contig_5041_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_27092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTTTAAATGTTAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553872	554135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_553900_554100
683592	contig_16492_pilon	-	2114	2	Intergenic	novelGene_100266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTGCTTAAGATTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126677	50856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_51351_125057
683597	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_2951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
683603	contig_6494_pilon	-	966	7	Intergenic	novelGene_108575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	942.679411158546	16	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	30	425	8286	3393	TRUE	40	TAAAAGACACATGGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRVAIHHGEWSQGLRGRGVWETPRTEG	8315	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2953_3238_3473_5598_5660_6395_6490_6751_6883_8256
683605	contig_15570_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_137846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGATGTCAAAGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578963	580348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_579000_580300
683607	contig_9150_pilon	-	1706	5	Intergenic	novelGene_140905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.63467438331	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCATTTGCAGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59192	46246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47412_47538_47801_49153_49253_57679_57770_59102
683615	contig_10626_pilon	-	1377	5	Intergenic	novelGene_138199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_4	62.7495019900557	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	144	719	197995	84134	FALSE	45	ATTTAAAACAATTACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAVVRAARRRGGLALSLLLPPGLPLPAVLIFRCRWDPESSPVPSTMPPKKGGDGIKAPPIIGRFGTSLKIGIVGLPNVGKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYVSKNLQLL	199472	83475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
683620	contig_18168_pilon	-	1396	7	Intergenic	novelGene_122072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	147.59337910474	738	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	27	608	27110	25294	TRUE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRNCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCMPQRHR	27136	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_26019_26241_26483_26754_27040
683623	contig_8636_pilon	-	2139	8	Intergenic	novelGene_141941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	11.6233403467474	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1234	1677	500291	495810	FALSE	20	TATGGTGTCAGGACTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLRLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCTLEERIEFSELDKKEKIREKFVEALKTEFAGKGLRFSRGGMISFDVFPEGWDKRYCLDCLDQDSFDTIHFFGNETSPGGNDFEIFADPRTVGHSVVSPQDTVQRCRELFFPETAHEA	506498	495347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_495933_496317_496434_497330_497407_499954_500055_500262_500355_500521_501474_501871_501990_506398
683625	contig_13977_pilon	-	3869	26	Intergenic	novelGene_80955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	87.4523870457519	3	161	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	17	1342	203033	172878	TRUE	25	CAGCCCTTGAATGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAEQQQFYLLLGNLLSPDNVVRKQAEETYENIPGQSKITLLLQAIRNTTAAEEARQMAAVLLRRLLSSAFDEVYPTLPSDVQTAIRSELLMIIQMETQSSMRKKICDIAAELARNLIDEDGNNQWPEGLKFLFDSVSSQNMGLREAALHIFWNFPGIFGNQQQHYLDVIKRMLVQCMQDQEHPSIRTLSARATAAFILANEHNVALFKHFADLLPGFLQAVNDSCYQNDDSVLKSLVEIADTVPKYLRPHLEATLQLSLKLCADTNLNNMQRQLALEVIVTLSETAAAMLRKHTNIVAQTIPQMLAMMVDLEEDEDWANADELEDDDFDSNAVAGESALDRMACGLGGKLVLPMIKEHIMQMLQNPDWKYRHAGLMALSAIGEGCHQQMEGILNEIVNFVLLFLQDPHPRVRYAACNAVGQMATDFAPGFQKKFHEK	203049	154934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_-_155610_156535_156678_158052_158282_159330_159521_160091_160215_161212_161269_161359_161472_162555_162729_163631_163731_166254_166377_166462_166596_169176_169261_170053_170273_172707_172882_172971_173061_173149_173275_177085_177193_181307_181396_183918_184040_184128_184252_189143_189249_189448_189546_190693_190797_192585_192779_195786_195868_202943
683626	contig_4531_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_47887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGACATTCCTGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302007	302627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_302000_302600
683627	contig_4531_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_47888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATCTCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303133	304093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_303100_304100
683629	contig_8617_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_73448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62484	62046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
683630	contig_11752_pilon	+	1452	9	Intergenic	novelGene_37641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	41	1159	84194	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84153	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
683632	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
683637	contig_16870_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_155527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGTGTATATTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229880	227947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_227900_229900
683647	contig_8320_pilon	-	1659	8	Intergenic	novelGene_152271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_7	32.3412922387691	343	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	435	1337	558034	539063	FALSE	20	TATAGCTCTATTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSNGAKQDSHNKARTSPYPGSKVERSQVPNEKVGWLVEWQEYNPVEYTAVSVLAGPKWADPQISESNFSPKFNEKDGHVERKSQNGLYEIENGRPRNPAGRTGLVGRGLLGRWGPNHAVDPIITRWKRDSSGNKITHPVSGKNILQFVAIQRKDCGEWAIPGGMVDPGEKISATLKREFGEEALNLLQKSSAEKREIEEQLQKLFSQEHLVIYKGYVDDPRNTDNAWMETEAVNYHDETGEIMDSLTLEAGDDAGRVKWVDISDKLKLYASHSQFIKLVAEKREAHWSEDSDPGCPGL	563546	538740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_539242_542124_542210_543282_543430_545318_545431_551376_551464_555377_555474_557837_558078_563155
683654	contig_19076_pilon	+	2394	4	Intergenic	novelGene_74207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	107.369559104162	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	660	1856	102295	146641	FALSE	60	ATTGAAGAAAAAGGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATSTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNEQIFSVAPGSESSNGTVSNVQYQVIPQIQSTDGQQVQIGFTGSSDNGGINQESGQIQIIPGSNQTLLASGTPPANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQITWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADGYPVLPAPCVKETFSSSFNGLQSFVKDIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRYAHTNHTLIFLRSVNIITLIFKILHAMLLNMENYSLRDHFGCVSV	94420	147179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_94504_101718_103079_124492_124574_146309
683662	contig_1275_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_108867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	203	664	747507	747968	NA	20	TAGCATAATTGTGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747304	748108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
683663	contig_5928_pilon	-	2250	7	Intergenic	novelGene_40360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAGCATCAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183573	171326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_171987_172169_172329_172517_172671_177704_177771_179819_179998_180455_180594_182677
683665	contig_3077_pilon	+	1749	9	Intergenic	novelGene_26621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3944.28687312422	1	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	157	1254	9719	17590	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9562	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17042_17449
683667	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_97373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683673	contig_14666_pilon	-	383	3	Intergenic	novelGene_39659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	305	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492440	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
683674	contig_1008_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_121611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGGAACATTGTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773095	775556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_773100_775600
683677	contig_7202_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_19103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCGTCTCTTCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
683679	contig_8658_pilon	-	1328	6	Intergenic	novelGene_55810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1196.29451223351	6	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	57	788	55624	13066	TRUE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGNQPYVCGQRPLFKA	55680	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6193_13020_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
683689	contig_21007_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_161519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	TAGTAAGCAAGAGTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
683694	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683696	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683703	contig_8568_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_156936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAATAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74895	77146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_74900_77100
683704	contig_16666_pilon	-	1618	8	Intergenic	novelGene_61722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	252.69260183157	301	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	838	1140	30779	24486	FALSE	10	TAGATCCTGTTTCTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47966	24007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_45890_45987_47556
683708	contig_16103_pilon	-	2095	5	Intergenic	novelGene_118789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_4	13.9709520076479	83	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	213	1187	578119	575288	FALSE	20	GTTTCTGTAAGTCTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWGEPELLVWRPEAVASESPVPVGLEVKLGALVLLLVLTLICSLVPICVLRRPGANHEASTSRQKALSLVSCFAGGVFLATCLLDLLPDYLAAIDEALGALHVTLRFPLQEFILAMGFFLVLVMEQITLAYKEQSGPPPREETRALLGTVNGGPQHWHGGPGVPQASGVSAAPSALRACVLVFSLALHSVFEGLAVGLQRDRARAMELCLALLLHKGILAVSLSLRLLQSHLRAQVVAGCGILFSCMTPLGIGLGAALAESAGPLHQLAQSVLEGMAAGTFLYITFLEILPQELAASEQRILKVILLLAGFALLTGLLFIQV	578990	574379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_575945_577627_577759_577932_578151_578689_578780_578899
683713	SIRV6	+	309	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10516	1	1279	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11516	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
683716	contig_12427_pilon	+	2298	18	Intergenic	novelGene_40403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	31.5820456198824	119	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	153	1811	21783	60048	FALSE	15	TAATTTGTGCTTACCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQTLLGCYIYVDSRKIDQEGEIPKETLEKLKSLGLFGMQVPEEYGGLGLSNTMYARLGEIIALDTSITVTLAAHQSIGLKGIIIAGNEEQKTKYLPRLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRTRATLSEDKKHYILNGSKIWITNGGLADIFTVFAKTQIVDSNNLIKDKITAFIVERNFGGVTNGKPEDKLGVRGSNTCEVHFENTKVPVENVLGEVGGGFKVAMNILNSGRFSMGSSVAGMLKKLIEMTAEYACTRKQFNKNLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMAYLTAGLLDRPGLPDCSVEAAIVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYMRDYPYERLLRDARILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRVLTSRINEIKQGNVSTIVETVGRRLRDSLSRTVDLGLTGKLGVVHPSLEDSANKLEENVYYFGRTVETLLLRFGKTIVEEQMVMKRVANILINLYSMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANIFCVEAYHQNLFTLSQLDKYSPENLDEKIKKVAQQVLEKRTYICAHPLDRTS	6187	60535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_6284_21726_21820_33630_33733_36185_36293_37394_37496_39300_39380_43868_44044_46431_46506_48983_49060_50697_50769_51046_51167_52617_52747_55689_55770_56575_56703_56999_57078_57996_58126_58843_58917_59947
683718	contig_1450_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_27339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGGTCCCTTGTCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217897	218601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_217900_218600
683723	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
683729	contig_8660_pilon	-	842	4	Intergenic	novelGene_136506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.687069721852	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	TRUE	50	TCATCTCAAACACAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308210_308251_308731_310288_310437_315231
683733	SIRV4	+	282	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	217	451	217	-451	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTCAAATTGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
683736	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683737	contig_14322_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_116448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
683739	contig_262_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_140616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGCCTACCCTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41031	38645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_-_38600_41000
683744	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683753	contig_1406_pilon	-	1368	4	Intergenic	novelGene_25538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	638.647703267528	531	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	133	558	2159494	2137428	FALSE	10	GGCTTCAGTCTCATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARRHSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDAGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159626	2136617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2159391
683756	contig_610_pilon	+	1933	9	Intergenic	novelGene_76844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	218.987870668674	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	78	1514	350131	375649	FALSE	45	AGGCTGGAAATAACCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYDLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSRPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350053	376068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_363794_364137_366326_366510_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
683760	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	233	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683765	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683766	contig_19564_pilon	-	1743	4	Intergenic	novelGene_29623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	846.389324654375	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTCTACACTTCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15698	11444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12321_13117_13259_13554_14055_15472
683768	contig_7513_pilon	+	2339	13	Intergenic	novelGene_88949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	692	1033	146654	148011	TRUE	50	ATACTTTTAAAATCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKVHGAQRVLVDLHCLGQGLVVASVALPRGVASFRTVVFLVHQMVPSPKGYQVSVVSRCRDGHRARAAHIGVTQLVGEDLQLVGGEPIVIPQDMVVGGPACFTWMPAWLHR	145962	168517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_146766_146950_147149_147979_148084_152142_152282_154234_154432_159574_159662_161125_161258_163894_164037_164689_164807_164928_165051_166134_166279_167530_167619_168451
683771	contig_7870_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_108957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAAAAAAAAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343137	341049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_341000_343100
683775	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
683778	contig_10196_pilon	+	1123	5	Intergenic	novelGene_132104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.222440293453	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	33	317	922274	924513	TRUE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922241	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701_925768_925858
683781	contig_10235_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_46357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTTGGTTTCTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130796	130275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130300_130800
683784	contig_14638_pilon	-	2190	5	Intergenic	novelGene_71563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	140.166641894568	2	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	39	341	277550	254604	FALSE	10	TTCTGAAGTGGTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSIAQ	277693	252754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258231_258365_262339_262459_277509_277556_277660
683785	contig_3986_pilon	-	1680	14	Intergenic	novelGene_52686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	115.301970402497	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	472	1680	55958	34082	FALSE	25	TGAGTCTGATATTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISDTLVLFHNKVT	153895	34081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_34113_35387_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56058_57911_57964_60545_60655_153684
683786	contig_2933_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_111341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	838	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTCCAGGCAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734696	733636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_733600_734700
683791	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_96947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683807	contig_10286_pilon	-	3394	2	Intergenic	novelGene_98399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	0	936	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	181	543	383530	382865	FALSE	25	AAAGCTGGTACTTCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	383710	380013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_383107_383409
683809	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683810	contig_1865_pilon	-	1970	10	Intergenic	novelGene_103238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	103.411201246334	14	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	14	811	93228	56560	TRUE	20	GATTTGGATTAATGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDSEMAACMFYGRQFAAAALRSHGSRTALQAAAQGLGSSGLFNNVGLQVQQQQQRNLALHEYLSMELLQEAGVSIPKGHVAKSPDEAFAIAKKLGSKDVVIKAQVLAGGRGKGTFESGLKGGVKIVFSPEEAKAVSSQMIGKKLFTKQTGKKGRICNQVLVCERRYPRREYYFAITMERSFQGPVLIGSSQGGVNIEDVAAETPDAIVKEPIDIVEGIKKEQAVRVWMLKSILIVIQPIARRRSLTYRTGPRKMKGTKLQLKQISTTLA	93241	41175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52489_52962_53084_56299_56443_56538_56695_72073_72203_76048_76212_76399_76500_87792_87974_93138
683815	contig_9197_pilon	+	926	3	Intergenic	novelGene_154361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTGTGTTGAGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52667	93171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80883_92456
683818	contig_19564_pilon	-	1949	2	Intergenic	novelGene_29614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	255	1100	13046	12201	FALSE	65	GGAAATGAAAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15695	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13078_15472
683821	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
683822	contig_8570_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_120173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAACTGCTCCATAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429098	426796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_426800_429100
683824	contig_14322_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_116550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGCGAGAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
683827	contig_10068_pilon	-	1809	6	Intergenic	novelGene_148716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	59.8611727248974	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	601	1383	57243	51110	FALSE	15	GGCAGATATCTTCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSGSARNCPSELSTPTRVSLREKIVAIVSCCQVFSDSWQLYV	59888	50683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_51586_54327_54436_56355_56498_57186_57276_58180_58368_59507
683828	contig_1861_pilon	-	1937	16	Intergenic	novelGene_77663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121.452578765907	1	57	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	137	1831	112534	87440	FALSE	15	TCATCATGCCTCCCACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGAEGRECVYLVNPVLVLSFSLRSPPESVGRKLADLNLPAFKLIIMMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMESTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115213	87333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89443_89637_94311_94434_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
683836	contig_6361_pilon	-	876	5	Intergenic	novelGene_24007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4287.0236980334	3432	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	118	447	420979	419370	TRUE	20	TCAAGACTGTGCTTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPVSHFQYCIIQICNHTQNNCYKYSCHLMVSFI	436382	410938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419326_419591_420870_421003_436288
683837	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
683843	contig_15304_pilon	-	865	3	Intergenic	novelGene_30447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	793	822	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54097	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
683844	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683846	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683849	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
683853	contig_15063_pilon	+	857	2	Intergenic	novelGene_14445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
683857	contig_14513_pilon	-	1888	3	Intergenic	novelGene_70246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1446	15	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1008	1340	13096	11833	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	15920	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12160_13090_13136_14952
683859	contig_6102_pilon	-	2571	9	Intergenic	novelGene_32384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	170.23201079703	4	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGGCCTCTGCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733347	1728476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1731671_1731756_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184
683860	contig_16022_pilon	+	2011	14	Intergenic	novelGene_160262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	20.3690797112688	31	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	782	1747	25217	34589	FALSE	15	ATTATTGTGGCTGATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKPLALTEFLAKFDYYMPAIAGCREAIKRIAYEFVQMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVKPIAWNQPEGDVTPDDVVALVIQGVQEGERDFGVKVRTILCCMRHQPNWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVCPWSSYLTGAWKPETEHAVIRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKRSMGFTEEEFKRLNINAAQSSFLPEDEKEELLDLLYEAYGMAAPASAGCKVIPLKTSQQPF	6006	34853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_9978_10244_16326_16523_18661_18724_25158_25282_27588_27733_28513_28630_30098_30224_31023_31096_31177_31280_31547_31613_33208_33339_33982_34086_34545
683862	contig_6710_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_94315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
683865	contig_14925_pilon	+	1600	5	Intergenic	novelGene_55351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	569	877	112682	113033	TRUE	40	CACTCAAGAGGTTTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFCLQSTRKTRKAENLVLFRPPSPVLVWWVGHAQDAGIRMSVWDKYDAELGKTAYFPHGEWIGEPVRSTLYFWSQRKSKGTEHCFQSVPGVGVKNESYIPL	112113	129488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_112843_112885_113280_114672_114795_115796_116100_129436
683869	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_115919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
683871	contig_16122_pilon	+	1424	3	Intergenic	novelGene_134504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	296.5	1884	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	51	950	133474	137601	FALSE	10	AGCAGTCTTGCTTGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVALSFFLGGRVRATVACCGFAIRGVAGPGPVGREPDPDSDWEPEERELQEVESALKRQKKAVRFQKMRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133423	138075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_133638_134049_134161_136976
683878	contig_19851_pilon	+	835	6	Intergenic	novelGene_29826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	177	692	53637	56177	FALSE	45	GAAAGGCAGTCTAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53460	56320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
683886	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683888	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683889	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683890	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683901	contig_10627_pilon	+	1851	5	Intergenic	novelGene_59902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	48.1475596474006	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	185	946	29280	31949	TRUE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGEWEPRGLERAFTPSPLGEEPCPVFCWLGDRDQDLHI	24157	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515_32538_32744
683906	contig_1443_pilon	+	535	2	Intergenic	novelGene_28203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCTAATGAGTGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344148	344890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344156_344362
683907	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_89228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653720	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
683912	contig_11171_pilon	+	2653	4	Intergenic	novelGene_48573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	68.1974258230389	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	24	680	70574	105888	FALSE	15	TACCTTTGAGCTGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGRVNSVSSSNPPAEVDPDTILKALFKSSGASVTTQPTEFKIKL	70550	107861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88441_105761
683915	contig_4442_pilon	+	1772	14	Intergenic	novelGene_127946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_13	177.036719355054	207	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	9	1517	255566	397305	FALSE	15	CCAGTTGTGTCTTCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI	255557	397560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
683916	contig_1516_pilon	+	1883	15	Intergenic	novelGene_49940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	94.7221500721226	380	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	352	1695	220281	238082	FALSE	25	TGAACATGGATTATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKKQYKAEKNTLTVFVATPGCHQLPSLESVENYTLTINDEQCFLLSETVWGALRGLETFSQLIWRSADGTFFINKTDIVDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSRILDTLDVMAYNKFNVFHWHLVDDPSFPYDSVTFPKLARKGSYNPATHIYTVQDVKEVIEYARLRGIRVVPEFDTPGHTLSWGAGVPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPILNSTYEFMSTFFLEISSVFPDFYLHLGGDEVDFSCWKSNPDVQAFMKKKGFGDDFKQLESFYIQMLLNIVSAYGKGYMVWQEVFDNKVKVQPDTIIQVWREEAPVTYLKELELITQAGFRALLSAPWYLNRITYGPDWKEVYMVEPLAFDGSPEQKALVIGGEACMWGEYVDSTNLVPRLWPRAGAVAERLWSNSRVTDLEFAFTRLTNFRCELLRRGVQAQPLSVGYCEQEFEET	208401	238270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_208678_220205_220288_226522_226616_227739_227806_230161_230209_230728_230840_231704_231807_232280_232414_233368_233550_234537_234625_234901_234975_235702_235887_236105_236197_236844_236950_238018
683917	contig_4686_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_118581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCATCCAAGAAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768319	770229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_768300_770200
683918	contig_13674_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_140295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGTGCTAATTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383	2327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_400_2300
683928	contig_7202_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_17956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27902	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
683932	contig_12050_pilon	+	2053	9	Intergenic	novelGene_62611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	358.868969820462	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	20	880	321302	342475	FALSE	50	TGTGTGTGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKYALRWNCCLWHGSARGG	321282	343648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346
683933	contig_14638_pilon	-	1328	4	Intergenic	novelGene_71559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.792255694712	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	56	457	262373	253895	TRUE	10	TGAAGTGGTGTGTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAGTAPVPNSQWARVGNAPSEEMALVAKAGEGLGRSERATPACRYRARSTEHRFITSYFTGRCFSYNLGKPFSFVVY	262428	252751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_253556_253827_254110_258211_258365_262339
683941	contig_10523_pilon	-	2334	8	Intergenic	novelGene_120917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	1433	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	283	1266	39240	15001	TRUE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39522	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13137_14342_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
683944	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	28	372	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14436	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
683952	contig_16714_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_161564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTGGCGTCAAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710629	712795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_710600_712800
683953	contig_16775_pilon	+	2109	16	Intergenic	novelGene_107776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	308.655464159563	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	76	1194	130489	172810	TRUE	40	ATAATAGTACATTTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASACGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDTDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDK	130413	174735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144973_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159041_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168120_172805_172867_173216_173325_173984
683959	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683964	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
683969	contig_8138_pilon	+	1476	5	Intergenic	novelGene_52430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	48	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	206	661	280295	306552	TRUE	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280089	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_307068_307637
683975	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
683978	contig_2646_pilon	-	2877	21	Intergenic	novelGene_69625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	316.146659004962	1	106	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	167	2143	2078053	2070703	TRUE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVVQKQMAFMLGRHGVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQVIGCAGHRPYRHGGGDWCRDGAANLWPLAEIWGAHPPAGCPFGTGPDFCLKSTTQHPGYPKQVFS	2078661	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071127_2071325_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074999_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
683982	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
683989	contig_7945_pilon	+	2932	10	Intergenic	novelGene_161592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	29.0134068626519	153	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	177	1520	433878	524517	FALSE	20	CCCAGAAGTCTGCGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASSSNDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQPPTRVTIKMECNPNQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHIPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYSLPDVDILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGGAAFIFPNTSVYPEATQRITTRPDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSNCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHTHSQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPASHMPSHLGTYY	367106	525929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_367205_433799_434018_465816_465969_499460_499665_500474_500556_502439_502512_513319_513389_514010_514068_515597_515646_523996
683997	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_94822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
684007	contig_8248_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_125029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACCACTGTCTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176015	175209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_175200_176000
684012	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684020	contig_16541_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_126732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGGAATTGTGGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301195	300526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_300500_301200
684024	contig_18869_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_56391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73742	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
684025	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684027	contig_9668_pilon	+	1922	9	Intergenic	novelGene_58117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	405.329013734522	4	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	25	1362	214129	359314	FALSE	35	GAGGTCTCCATGTGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214104	359874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214240_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
684028	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
684032	contig_854_pilon	-	2669	6	Intergenic	novelGene_36094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	33.4149667065523	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	35	676	81381	76639	FALSE	10	CTCCTGTGTATGCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSCAAGGLPAMGRNKKKKRDGDDRRPRLVLSFDEDKRREYLTGFHKRKVERKKAAIEELKQRLKEEQKKLREERHQEYLKMLAEREEALDEADELDQLVTAKTESVQYDHPNHTVTVTTVSDLDLSGARLLGLPPPEQGAGAEEEEVSPVEKPTKALPRKSKDPLLSQRISSLTASLHAHSRKKVKRKHPRRAQDSAKKPPSATRTSKSQRRRLTGRARHGRD	81415	74645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_76805_77237_77333_78514_78658_79167_79217_79451_79558_81298
684039	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_19099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCGCCGCCATGACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
684046	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGGTACCCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684048	contig_7333_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_142758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGTAAAGGAGAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133352	134449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_133400_134400
684060	contig_8330_pilon	+	2410	9	Intergenic	novelGene_71862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	26.8642420328585	350	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	692	1576	923753	929265	TRUE	20	GAGGCTGTGGGGTGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGSWGPTAKWPYSWLAVTHWPRSQRTSHMQSCGWGPTPGGDAKILDNHISQKTLGQWIAENRDSLGSKVKDSFNGQLPFLFKVLSVKTALSIQAHPNKELAEKLHLQAPEHYPDANHKPEMAIALTSFQGLCGFRPVEEIVTFLNKVPEFQFLIGDNAATQLKQSMSHNSRAVASALRNCFSHLMKSEKKVVAEQLNLLVKRISQQVAAGNNMEDICGELLMELHQQYPGDIGCFAIYFLNLLILKPGGGHVSGGQHAPCLPERRLCGVHGMLRQHGACWPDTQVHRRANSV	910516	930419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_910734_914659_915104_923722_923851_924644_924847_925609_925752_926085_926269_928093_928269_929180_929390_929709
684062	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
684066	contig_8921_pilon	+	2340	4	Intergenic	novelGene_161630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	14.6969384566991	127	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	240	1028	211227	216972	FALSE	25	TCTTAAGAGTTCTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATLRDLAQGSVTFEDVAMYFSQEEWGLLDEAQRHLYHDVMLDNFGLISSLGWCGAENAEAPSEQSVSVGIVSQAGTPKSGPSTQNVHLCETCVPVMKEILYLADPPGIYRGQKLYTCGACGKHFWLSTDLHHHQKEHIGEKPFSKNMDTASFVNSYRLHVSEKPFICGVVGKDFPTDVSLFQPHSTPRGAKLHSGTDCGEAFHNGKTHYKCGECGKTFSRKRTLVQHQRVHTGEGLYECSECGKPFSYKHTLVQHQPSG	210987	218284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_211260_214869_214997_216294_216912_216960
684072	SIRV7	-	354	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-28	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114766	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
684076	contig_13800_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_153726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTAATTTTCTATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105973	105501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_105500_106000
684077	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684083	contig_6691_pilon	+	2789	5	Intergenic	novelGene_60167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	16.8133131773604	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	352	774	399534	408909	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVNREEAPQWLESDSCQKCEQPFFWNLKQMWDTKTLGLRQHHCRKCGQAVCGKCSSKRSSYPIMGFEFQVRVCDSCYDSIKDEDRTSLATFHEGKHNISHMSMDVARGLMVTCGTDRVVKIWDMTPVVGCSLATGFSPP	399182	410924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_399555_403137_403240_406509_406641_407926_408036_408849
684088	contig_17440_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_7647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3519	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
684092	contig_12624_pilon	+	2004	15	Intergenic	novelGene_61047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	909	1373	874107	884727	TRUE	55	GAAAGAGTAAGGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGEVSSWRLLLRMDPQLNGFKVVAGNKPLLPVEHDRGPVIIPLLQDKDDVPWHDLELLWCLRYKLKPHTVSLPFQSPEDLWGFGSGWRLSCLQRGKPRETVLIHHRPCPGNPSWPAEPLVSHLVETACPWGSPLAHTASASGFVDFGMSGL	862027	903856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_862487_863804_863946_867661_867769_867898_868021_874027_874139_875121_875186_875385_875527_877416_877463_878881_878926_882979_883085_884694_884838_888728_888805_900249_900335_903449_903533_903579
684102	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684103	contig_6375_pilon	-	2339	17	Intergenic	novelGene_73004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_11	43.8104938913042	206	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	47	1951	334545	327598	FALSE	10	CCCCACTGCCCGCTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGGAGGSRVSSGRDLNCVPEIADTLGAVARQGFDFLCMPVFHPRFKREFTQEPAKNRPGPQTRSDLLLSGRDWNTLIVGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVTLENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKDDGVSIPGEYTSFLAPISSSKLYNEVRACREKDRDPEAQFEMPYVVRLHNFHQLSAPQPCFTFSHPNRDPMIDNNRYCTLNFPVEVNTVLHGFAGYFETVLYQDITLSIRPETHSPGMFSWFPILFPIKQPITVREGQTICVRFWRCSNSKKVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGRSYTIGL	334591	327209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328788_328997_329115_329275_329370_329613_329724_330332_330509_330594_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302_333389_333701_333821_334444
684110	contig_5779_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_106514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTAAGGAAAAGCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259981	260541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_260000_260500
684119	contig_9594_pilon	+	2132	10	Intergenic	novelGene_73946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	455.473868014889	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	171	1331	307498	322067	FALSE	25	TGTCGATTTAAACTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGEVPSLFPAC	301237	322868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301389_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936
684126	contig_7410_pilon	-	2606	1	Intergenic	novelGene_106126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGCCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647293	644687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_644700_647300
684128	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_96507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684130	contig_14790_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_127915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183792	186132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_183800_186100
684135	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
684138	contig_10627_pilon	-	2114	9	Intergenic	novelGene_60069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	28.3325673916078	302	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	5	1147	1364009	1349383	FALSE	50	AGAAAAAAAACCTTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMADSYSEGVPAVRNGKREQFGSRFLSDPARVFHHNAWDNVEWSEEQAAAAEKKVRENSAAPRVPQEKQVDYEINAHKYWNDFYKIHENGFFKDRHWLFTEFPELAPSQNQNHLKGLLSEDKRNEIPACRSSEDGPGLTAEEQHKCSSSSLRDKTQVSSVEKNVTQELSHLRICADEFPGSSATYRILEVGCGVGNTVFPILQTNNDPGLFVYCCDFSSTAVELVQSHSEYDPSRCLAFVHDLCDEDQSYPVPRDSLDIIILIFVLSAIVPDKMQKAINRLSKLLRPGGMMLLRDYGRYDMAQLRFKKGQCLSENFYVRGDGTRVYFFTQDELDTLFTAAGLEKVQNLVDHRLQVNRGKQLTMYRVWIQCKYRKPLLSNTG	1364013	1348415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1349538_1350439_1350506_1352336_1352444_1354139_1354280_1356035_1356097_1360070_1360121_1361234_1361594_1363587_1363683_1363899
684140	contig_8561_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_161646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTATTGTGCTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245319	244938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_244900_245300
684151	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684152	contig_16098_pilon	-	762	3	Intergenic	novelGene_45997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	377.5	27	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	301	639	349190	348413	FALSE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349490	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172
684154	contig_6576_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_42299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454818	452847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_452800_454800
684157	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_93425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653705	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
684158	contig_1244_pilon	-	1501	14	Intergenic	novelGene_37996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1175.1816528349	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	59	1324	948448	922962	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRPLCFQDHLLCSRLHAATTGSHRIWLDPQLWWHCPYVEGRLHHQNVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYGTDHVRDSCEAAP	948506	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923003_923296_923331_923428_923552_923726_923827_924215_924349_924588_924715_927036_927101_928767_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
684159	contig_11989_pilon	+	1546	4	Intergenic	novelGene_68427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	4.08248290463863	185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	366	398	44424	44456	FALSE	60	AAAAAAGGTTGGAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVYPTCRNTSGILGFSVTVGTQATKYNSEVVDKKIEEFLSSFEEKIENLTEEAFNTQVTALIKLKECEDTHLGEEVDRNWNEVVTQQYLFDRLAHEIEALKSFSKADLVSWFKAHRGPGSKMLSVHVSMVK	42182	45604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_42265_42838_42930_43215_43333_44348
684163	contig_990_pilon	-	2503	2	Intergenic	novelGene_76127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	30	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2121	2468	1588008	1587615	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLLWSPFFSPHNKRNLSARGLAFPLTRHSEWCAQGLAFPLTRHSECSARGLAFPLTRHSECSARGLAFPLTRHMSGVPGALPSLSPGTVSGVPRALPSLSLGTVSGHRGSGLL	1590128	1587579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587737_1587782
684170	contig_10058_pilon	+	1690	4	Intergenic	novelGene_67701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	68.6893166527534	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	400	777	52117	52990	FALSE	40	TAAAATTCTTCAGAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVRPQPST	51717	53903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_52188_52314_52374_52522_52618_52837
684180	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684183	contig_6823_pilon	-	2032	15	Intergenic	novelGene_131219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	24.4412039183751	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	362	1624	305376	248884	FALSE	15	GCCAGTTTCACTTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKLKNARRIEGLDSNMWVEFTKLAADPSVVNLGQGLPDISPPIHVKEELSKVAAIDGMNQYTRGFGHPSLVTALSCLYEKFYPNKINPNKEILVTVGAYGSLFSAIQGLIDEGDEVIIIMPFFDCYEPMVRMVGATPVFIPLRSKPVDGKKWSSSDWTLDPQELASKFSSKTKAIIVNTPHNPMGKVYTKEELQVIADLCIKYDTLCISDEVYEWLVYTGNKHFKIATFPGMWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325427	248475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288707_288803_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_320648_320750_321788_322006_325387
684194	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684195	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684196	contig_5041_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_27016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	1500	2021	229414	228893	NA	80	GCTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEEIGGKVIRMARTLNLELAIIDVEQLIDQERELTDQDLMDFEGQRNAKEERNNEEAEGRKTSKIFTVKGLAGVFSKLNQGLQLLENMDPNADCFAKVVRQIREAVRCYYEIYEEKKKRAIQTSLTNFLTRNTIPIPRIIQMIQKLPQVELLPQLTKCQCHPTLLHHWSKFL	230913	228570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_228600_230900
684207	contig_15720_pilon	-	1030	8	Intergenic	novelGene_41885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	8	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	41	988	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTQTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283934	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281925_282573_282750_283785
684215	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684217	contig_14322_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_116000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671630	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
684219	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_98155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
684222	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
684224	SIRV6	+	149	2	ISM	SIRV6A	SIRV611	454	3	164	228	164	-228	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACCACATGGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640
684227	contig_14326_pilon	-	2545	5	Intergenic	novelGene_120691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	84.5192285814299	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	18	677	177636	176933	TRUE	35	AAGCCAGAAGGTGGGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRELEMHTISSKVFGDILDFAYTSRIVVRLESFPELMTAAKFLLMRSVIEICQEVIKQSNVQILVPPARADIMLFRPPGTSDLGFPLDMTNGAALAANSNGIAGSMQPEEEAARAAGTAIASQASLPVLPGVDRLPMVAGPLSPQLLTSPFPNVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSMFGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLLHRPSSSKAGREWATHL	177653	160258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_161639_169072_169245_175279_175344_176680_176986_177029
684229	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684232	contig_13645_pilon	-	1918	4	Intergenic	novelGene_146156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_3	17.7200451466693	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	879	1184	10212	9907	FALSE	10	TTTGTGATTGTACTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVCYQVKLRNRTLFSFYNVFLQTTVNSKSMPILNRGKRCVDFVLLHQYFRNICLPFPQLHEPAVVYSCGFHACTPLSITLQEKHRMEFRLRKIPLCFKKL	19940	9172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_10495_15103_15159_15278_15389_19509
684233	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684243	contig_5549_pilon	-	785	5	Intergenic	novelGene_81596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	80	556	96842	91727	TRUE	10	CCGACAGTGCTGTTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLQENMIGSWHPLAHCAKRAAPAPTSQRHSRLGSVAEVLLARWELFGENSFREKLFSFLFRDGWKDHHTVSILPINRGGNPLFCCQLERDNYSENLIKVPSSGSWIEDRQLQFLIRTKNKHHTSRHRHALFILLRWVQHAQEDGKVSILIIDDGKR	96921	82216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_82250_86661_86817_91685_91834_93263_93410_96618
684251	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684255	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
684256	contig_6589_pilon	-	1814	16	Intergenic	novelGene_26255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_13	54.8484781516822	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	115	1146	2233261	2229137	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWKILYPEIPRKLRELETKGYKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLVRPPPPFLPSGSPLAPLLTSALTPSSPSTSA	2233766	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2230878_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
684267	contig_6440_pilon	+	2792	5	Intergenic	novelGene_161651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	184.158050326343	1409	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4	453	9806	12306	TRUE	5	TCACCTCTTCTGTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPDEQREGLQEELIDIILLILERNPQLHYYQGYHDIVVTFLLVVGERLAASLVEKLSTHHLRDFMDPTMDNTKHILNYLMPIIDQVNPELHDFMQSAEVGTIFALSWLITWFGHVLSDFRHVVRLYDFFLACHPLMPIYFAAVVDRVTS	9802	15055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_9991_10165_10268_11195_11342_12289_12400_12809
684268	scaffold_6394_pilon	+	1189	8	Intergenic	novelGene_110997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	325.062568545484	11	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	19	1032	398216	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398197	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
684269	contig_16667_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_153249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAGAAAGTGGACGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2677	4433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_+_2700_4400
684278	contig_10438_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_161683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95402	93336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_-_93300_95400
684279	contig_16846_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_82879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTTTATATATTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233427	232491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_232500_233400
684280	contig_16156_pilon	-	2123	9	Intergenic	novelGene_137069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_5	25.5819760769179	194	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	38	1228	160245	99837	FALSE	30	TTTCTGTGTAAAAAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKAVESIQAEDESAKLCKRRIEHLKEHSSDQPAAANVWKKKRMDRMMVEHLLRCGYYNTAVKLARQSGIEDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160282	98941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_123176_123381_133371_133555_160176
684281	contig_11850_pilon	-	1766	9	Intergenic	novelGene_125186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	967.366269827515	451	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	239	865	186097	181211	TRUE	15	TATATGTGTGTGTGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKRGEGKSVRRCFLFLFSAAGESGSVPRKSGRRRKQAREKRRSFCSHAIDASKNEEDEGHSNSSPRHTEAATAQREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	198206	179131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195775_197694_197727_198061
684286	contig_15991_pilon	-	812	5	Intergenic	novelGene_70871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.11105072247	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	375	743	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	104993	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102344_104959
684288	contig_10159_pilon	-	2681	11	Intergenic	novelGene_30793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	120.617618945161	8	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	854	2113	353226	317967	FALSE	65	GTCAAAAAGTGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642155	317398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_431854_431937_456756_456901_597817_597913_606778_606838_640836_640898_641956
684291	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684300	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_16536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
684303	contig_14744_pilon	+	955	7	Intergenic	novelGene_66048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	3746.09742116898	28	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	56	919	1382976	1386652	FALSE	10	TTTAACTTGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382001	1386688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
684333	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684337	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684338	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684341	contig_3825_pilon	-	1071	9	Intergenic	novelGene_78022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	865.652752262707	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	36	659	1470962	1462265	FALSE	35	GAATACTGTTTTTAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGDQGPPGIPGKAGPKGERGPHGEKGEPGHSEYCRTAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQRPGQ	1470997	1461852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462280_1463749_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
684346	contig_16098_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_45898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	323	969	33	1001	257155	258123	NA	25	GAGAGAGGAGGCTGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVDQARLEEMVQAEEAKEEKGSGWATEAQLPQDKEAKGAEGDADLETTPEARPEKVFTGQRSEEEAQRGQEALRVEWGGLECEITEGQEPELMGGAPSPTKKPEGGQGAKENLWRALALGKEETERNLEGDSRYLEYIQPDVQVSEAEAWGNERRRDVERGNIQEKAEAEEVEEEAAGGQALEAEAERGPESELLEILEAEVERKKAKDTGCGTEEEEALEAENQEPGGGCGAGAGAGQSLEDSEAREAEDGEVEVAVPQGADRAPRRGWRLEEVALSHQESKDMQTRSSLATKIVEDKAALDVKEAKVEEGPEGEAGDAWEREFKRIWDSE	257122	258125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_257100_258100
684356	contig_500_pilon	+	1366	9	Intergenic	novelGene_31037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1203.05642012335	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	538	951	1496587	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485758	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492755_1493617_1493721_1494244_1494468_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
684357	contig_8594_pilon	-	1942	8	Intergenic	novelGene_140048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	250.20872919078	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	323	1144	496028	461703	FALSE	40	CATTGATGTCTATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	525399	460904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_495973_496043_511293_511438_525235
684368	contig_10235_pilon	-	1470	4	Intergenic	novelGene_46624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	73.8030411899733	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	401	826	610325	609176	FALSE	20	CTCTGGACTGAAGGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKRAQEGEEDGEQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSALLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610725	608531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609714_609988_610056_610280
684373	contig_7202_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_17081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684386	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	241	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
684390	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_96710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCTCTAACACTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	657186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
684391	contig_12644_pilon	+	1187	8	Intergenic	novelGene_44629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4910.39956809701	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	412	1098	2679113	2680545	FALSE	20	ATGTGTTGGAGTGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2678700_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
684394	SIRV6	+	666	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	510	513	337	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
684405	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684407	contig_10734_pilon	-	1791	7	Intergenic	novelGene_51017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.834822960929	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	81	638	320632	311551	TRUE	35	TTTAAAAACAGCCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320712	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_310199_310373_310439_310497_311676_315844_315953_318838_319032_320452_320480_320527
684420	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684423	contig_7428_pilon	-	1879	13	Intergenic	novelGene_77688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	77.6210076804813	348	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	114	1463	236801	226280	FALSE	10	GCTGTATGCATTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRSLSRLRHLGLGPRRADSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQASTSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP	250461	225863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226448_226528_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_250404
684424	contig_11978_pilon	+	1411	12	Intergenic	novelGene_62793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	73.535396547884	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	141	926	299759	564917	TRUE	10	TTGCCATGTCTGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTNQMNCPSRGVTSSEF	299618	589572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547668_564866_564923_587277_587387_589201
684426	contig_6710_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_96626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCACACTACAGAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
684428	SIRV6	+	936	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	540	0	367	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	35	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	63	554	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1670	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
684430	contig_10581_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_41432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727349	729627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_727300_729600
684441	contig_5690_pilon	+	2286	10	Intergenic	novelGene_119673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	1951	2286	253530	282089	FALSE	10	CCCAGTTGGTGCCAGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQFQHISSNCNCMLKGCHCILQIFSSTSAVRDVFTQESLLLSLVQQGWVFEQQERGYQVPSQGGEKVKRSGGRHLRHRVRNIPPLGPLNSAAAVATAAATAAATASDRLA	232647	282089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_234002_234404_234459_235740_235801_238496_238631_245763_245851_246367_246490_252192_252238_253435_253573_271501_271547_281841
684443	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684449	contig_20615_pilon	-	2069	5	Intergenic	novelGene_146916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	38.7620948866286	111	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	233	1207	211769	196027	FALSE	20	GTATTTGGTTTAAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMENFRNLASIVSRKLNDGNKLSSELIMLRFMKNNTWSSMLGEISESHGTRDQHKNQGRHLRMLPVFNRSHTVENLWESNEGNQCGKTFSWIPNLTVLKRNSPELNPFECCECGKAFIDHPSHKHHTISHTGCSTCQCKECAETCGCPSHLFTPMRTLIAKKLYKCKLCGKDLSCMSVLKNSVITLSGEKRYECNECGKHFCSFSSFWTHVRGHKHECKECCKTYSRPSSLILHEKFHIRNMPYECKECGKAFSQSSTLTQHIRTHMERDLMNVRNVGKPLVRPQPSLDI	212001	195164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_196101_196773_197388_197722_197874_198848_198976_211760
684453	SIRV2	-	614	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	45	2958	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
684454	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684458	contig_12414_pilon	+	1687	2	Intergenic	novelGene_59554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	93	1151	370898	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
684462	contig_3797_pilon	+	1938	6	Intergenic	novelGene_120088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	63.5893072772459	332	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	230	1201	346123	393714	FALSE	0	CGGTGCTTGTTTTCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQGNGRASAARLLLLLLVPLLWAPAGVRAVVDEDLSHRNKEPAAPAQQLQQQPAAVQGPEPARAEKGVTPAAPVHTNNEDPATQGNLGFIHAFVAAISVIIVSELGDKTFFIAAIMAMRYNRLTVLAGAMLALGLMTCLSVLFGYATTVIPRVYTYYVSTALFAIFGIRMLREGLKMSPDEGQEELEEVQAEIKKKDEELQRTKLLNGPGDVETGTSTTIPQKKWLHFISPIFVQALTLTFLAEWGDRSQLTTIVLAAREDPCGVAVGGTVGHCLCTGLAVIGGRMIAQKISVRTVTIIGGIVFLAFAFSALFISPDSGF	345893	394451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_346327_379351_379578_386444_386621_387159_387343_392785_392892_393637
684472	contig_2069_pilon	+	715	3	Intergenic	novelGene_23504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	983	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACGGCCAGGAGACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508365	1509854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
684478	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684484	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684492	contig_12270_pilon	-	292	2	Intergenic	novelGene_114120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGACTTCACTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
684494	contig_10734_pilon	-	1747	6	Intergenic	novelGene_51054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	207.169881980948	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	29	967	437052	419688	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRFGNSSSKRLRGITVINTKDGENVFTGQSKIYTYMSPNKCSGMRSPLQEENSVAHHEVKCQGKPLAGIYRKREEKRNTGNAIRSPVKSEEQKIKDARRGPLAPFPNQKSEAAEPPKTPASSGDATSAAIAKPSLKKPIKGKQAPRKKAQGKTQQNRKLTDFYPVRRSSRKSKAELQIDLIDGKGRGVIATKQFSRGEFVVEYHGDLIEITDAKKREALYAQDPSTGCYMYYFQYLSKTYCVDATRETNRLGRLINHSKCGNCQTKLHDIDGVPHLILVASRDIAAGEELLYDYGDRSKASIEAYPWLKH	437080	418907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_419899_420740_420932_427399_427488_427836_428057_431288_431446_436980
684503	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684509	contig_7695_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_41532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATCTTTTTGTGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359419	360070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_359400_360100
684513	contig_6364_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_51799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTTCCCAGCACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413582	1411232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1411200_1413600
684529	contig_10500_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_41181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAACAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329344	1327145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1327100_1329300
684530	contig_9871_pilon	+	2456	10	Intergenic	novelGene_75725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	105.318564365453	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	67	1353	598042	611807	TRUE	40	TACTACTTAATACAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGKTEDMDEAWESTHVEAGSPKASLGQRFPNAVVRENRLGGFKNPDGRSHHS	597975	615338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611962_613744_613970_614614
684532	contig_1244_pilon	+	1498	9	Intergenic	novelGene_38024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAAGACAGGGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922808	947654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_923337_923437_923551_923725_923817_924199_924348_924582_924718_927043_927209_934503_934564_946437_946618_947576
684533	contig_7457_pilon	-	2211	4	Intergenic	novelGene_31627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.180399094818	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	59	802	960838	956932	TRUE	10	TCCTGGCCTTGCCCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEW	960896	955472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956097_956146_956939_958250_958375_960225
684534	contig_13954_pilon	+	1609	10	Intergenic	novelGene_130045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.861138154841	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	115	1575	7979	89637	FALSE	75	GGAATGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLANWMSVSRMGKDPETMSYKEQVSKEFGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKINDNAEAGWTLGYMLNLTNMIPAELPQPKPFSRPTYISLMVAFSLVLAIVFILGSIIFHKSSYFQK	6683	89671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_6757_7937_8060_60811_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_89436
684539	contig_5247_pilon	-	1435	6	Intergenic	novelGene_81823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	282	junction_5	73.9443033640861	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	10	768	416518	342767	FALSE	15	TATATCAGTGGTTTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPNSS	416527	342099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_416448
684545	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684553	contig_16525_pilon	+	1712	2	Intergenic	novelGene_133829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	51	1019	156877	158630	FALSE	55	AATAAAAAGAATCAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTAIYESLPSLSPDLAGTRGGTESSLGWPSWGPWSSSDSSPAGVAPRLPGRSTSLVEGRACAWVPPPPGFAPLAPRPGPELSPSPTSPTATPATSSRYKTELCRTFSESGRCRYGAKCQFAHGLSELRQANRHPKYKTELCHKFYLQGRCPYGSRCHFIHNPSEDLATPGHPHVLRQSISFSGLPSGRRASPPPAGLPGPSLSSYSFSPSSSPPPPPGDLPLSPSAFSAAPGTPVPRRDPTPTCCPSCRRATPSLWGPLGGLARSPSAHSLGSDPDEYASSGSSLGGSDSPVFEAGVFGPPQPLAASRRLPIFNRISVSE	156826	159323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_157685
684558	contig_8978_pilon	-	246	4	Intergenic	novelGene_49449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_3	146.61590030492	350	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCATCTGTACCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614570	1612653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1612730_1614047_1614096_1614189_1614250_1614508
684565	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2339	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
684568	contig_6710_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_98157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684576	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
684577	contig_401_pilon	+	1273	11	Intergenic	novelGene_42831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1574.40385225647	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	56	715	1711949	1714945	TRUE	10	GTGTTTAGTTTTGTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDDKMEMQG	1711893	1718311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1712992_1713231_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1714922_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
684578	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684582	contig_2890_pilon	-	2802	4	Intergenic	novelGene_60281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	283.785521516201	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	71	520	315767	307184	FALSE	20	AAACTTGCTATCTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQHYIRVGLKIPGDLLIFATRRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTGKAPWKCSCAVCSRGKAMAKVSAGSPSILTDVWTVKINKFYFSGLILFTASS	315837	304901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_307337_308618_308751_312123_312228_315706
684584	contig_513_pilon	-	1709	9	Intergenic	novelGene_80175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	430.623657472508	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	188	1246	453108	449687	FALSE	35	AGTGTTCTCAATGCGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454690	449223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453395_454593
684585	contig_10475_pilon	-	2242	3	Intergenic	novelGene_148746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_2	133.5	406	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	154	441	266553	263186	FALSE	45	ATTTAAGATACTCATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAPRAPPVHRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRT	268729	261384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_263254_266333_266556_268578
684586	contig_14744_pilon	+	2706	27	Intergenic	novelGene_65967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	836	1477	701279	709378	TRUE	20	CCTCAGGATGCGATGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLARCADWKCLQGRGLTIQDSMNRCPFSRDIPLTCEGRLTGHPLPGHPRQQLEHGVQHIAVTLLQFKQPQQLEGTKDYYEIERLHVEGQSQQSQEGEYRDREVEQVPSRGQILNGAQAGNFQEQLYSQLTRKKDDVTPGHVFGEEVPTFQHECFHQDPDTIDGHHQLHMKYWKALDFTRILIPLKMRNAVLGSSSNQCSLFFFAFHFKAATS	694610	752325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_694731_695155_695238_695434_695577_696897_696979_697161_697232_697848_697897_699217_699334_701102_701412_701640_701715_702818_702926_704152_704223_704998_705063_705151_705205_707707_707756_708809_708874_709349_709402_710550_710674_710890_711010_712802_712904_713165_713224_713712_713746_715241_715332_716364_716497_717492_717605_719366_719545_723195_723326_752195
684590	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684591	contig_20675_pilon	-	2345	3	Intergenic	novelGene_161686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	135	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	184	1197	28172	18925	FALSE	30	TTTGGGATGATTCATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMAGGRDSEDMEVDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKISRKRLNPDGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYNAKISLREALCGCSVNVPTMDGRTIPMSLNDIVKPGMRRRIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEFEVSFPDTISSSSKEILRKHLPAS	28355	17776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20675_pilon_-_19159_20480_21050_27961
684597	contig_1331_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_37819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	418	462	160053	160009	TRUE	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169909	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159624_159810_160214_160867_160949_166406_166534_169860
684603	scaffold_6394_pilon	+	1035	8	Intergenic	novelGene_111008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1012.08390795165	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	30	866	398246	405843	TRUE	35	ATGTAAAATTTTACCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALPRPATWRRCTWMRRPSAGCTTRTRWPWRSSQTGSAGSQRMP	398216	406235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405407_405717_405864_406086
684604	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684609	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684611	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684613	contig_9482_pilon	-	1470	9	Intergenic	novelGene_44295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.366323783283	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	75	1211	1244459	1236396	FALSE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALYEAAACHRNLDWQKATDITCNTDGSDDSEDR	1245388	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1238271_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325
684614	contig_5018_pilon	+	2210	18	Intergenic	novelGene_47203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	551.605276101342	10	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	699	1448	1598004	1606352	TRUE	20	TTTTTAAGGCGTGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMGSDFQYENANVWFKNLDKLIQLVNTQQASGSRVHVLYSTPACYLRELNKANLTWSVKQDDFFPYADGPHNFWTGYFSSRPALKRYERLSYNFLQVCQQLEALAGPAANPGPYGSGESVPLREAMAVLQHHDAVSGTSRQHVADDYARQLAEGWGPCEVLLNNALARLSGSKENFTFCRELNVSVCPLSQTAAHFQVTIYNPLGRKVDWMVRLPVQEGVFSVRDPNGLTVPSEVLTLPGSDSQEYPA	1595320	1608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1595356_1595526_1595701_1596050_1596245_1596895_1597015_1597282_1597429_1597973_1598091_1600267_1600351_1600430_1600552_1600631_1600711_1600895_1601006_1601161_1601270_1601654_1601772_1602713_1602751_1606344_1606376_1606789_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
684616	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684617	contig_13901_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_146665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTGAAACCTGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271268	271509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_271300_271500
684618	contig_3948_pilon	+	2109	15	Intergenic	novelGene_53176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	31.8718735961759	128	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1203	1934	361433	384260	FALSE	0	GTGGTCCCTTTTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRQKTRAYHRLQDDVPGEVKIRRLEELITVFREEATTANKTSVGCAQLVLVEGLSKRSATDLCGRNDGNLKVIFPDTEMEDVSNPGLRVRAQPGDYVLVKITSASSQSLKGHVLCRTTLKDSSAYCSPGWMATQS	343565	384435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343633_345535_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355808_361279_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368963_371245_371396_379631_379773_384152
684620	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_96047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684623	contig_20641_pilon	+	1355	6	Intergenic	novelGene_52844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1162.06702044245	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	172	1080	38688	56882	FALSE	85	ATTAAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLSSSWRIFCSLSRPPPTWWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14542	57157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14603_38576_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
684631	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
684632	contig_6344_pilon	+	1858	10	Intergenic	novelGene_157118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	67.9538696106537	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	146	1270	1176029	1215531	FALSE	5	GCTCTGTGTTTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGCVCVSHVSFPVARSHPEKQKVHGQTLNGSDAEPFRVAWKPQPSLQMQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGVDDSTGVINCICWKKLSDIRSSSAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALSNPGTLDLASLTCLLSEKAKEFLVENRVQTFYQQELEMVESLMALANQPVIHSACSNLVDFKNDTASQAIHSIFKNAIQLLQEKGLVFQKEDGFDNLYYVTREDKELHRKIHRIIQEDCQKPNHVEKGCHFLHILACARLSLSPGLSEAVLRQVLELLEDQSDIVSTMEHYYMAF	1175499	1216119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1175582_1175965_1176162_1179726_1179823_1183172_1183242_1195076_1195254_1196152_1196277_1198753_1198926_1204896_1205020_1208082_1208156_1215373
684638	contig_854_pilon	+	1341	11	Intergenic	novelGene_36445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	534.082914911159	488	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	444	848	1455725	1464275	TRUE	10	GTCTCTTTCCTTTATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTALTGVRNWTRREVPSLPRS	1451228	1465475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453786_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458433_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
684639	contig_9098_pilon	+	2028	13	Intergenic	novelGene_75831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1643	2014	349581	350571	FALSE	30	ACGGGACCCAGGAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFERNHKKIFKEVLSSNKPGQRELPGPFRFLYSFLCIGLGRTCSEPGQLVAEEPENPAYRWSFHLLGLWGMKCLPFLQHSLATESLRKGILLQSSTTTLPCRATHCLPNRGEWLPCCALSG	333469	350585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_333555_335373_335848_336317_336558_337031_337114_337543_337586_340613_340751_343622_343769_345158_345301_346964_347036_347759_347821_348541_348661_349537_349710_350328
684643	contig_4103_pilon	+	3602	1	Intergenic	novelGene_52001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224060	227662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_224100_227700
684646	scaffold_15568_pilon	+	2943	1	Intergenic	novelGene_122586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	540	1623	189	1811	92909	94531	NA	20	TGTTACTCATTTGTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEKPYKCLECGRGFSQKSGLLLHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLIRHQRTHSGKKPYMCLECGRDFSQKSGLLFHQMTHSGEKSYVCSLCGRGFKWKTLLLMHQRRHSGEKPYVCSECGREFSYKSDFIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFSLKSNLITHQRTHSDEKPYVCSECGRGFNQKSHLLVHQRTHSGEKPYVCSECGRGFNRKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRDFNQESSLLMHQRTHSGEKPYVCSECGRGFIQKSGLLHHQRTHSGEKPYVCSECGRGFKQKSGLFYHQRTHSGEKPHVCKECGRSFSQKSVLIRHQRRHSGEKPYVCLECGRGFSQKSDLLLHQGTHSGEKPYVCSECGRGYNCKSILLIHQRTHSGEKPYVCKECGRGFTQKSHLITHQRTHTGEKPYVCLECGRGFSQKSGLLLHQGTHSGEKPHVCKKCGRSFNRKSILLMHEKTHSGEKPYVCSECGRGFNRKSHLFMHQRTHSGEKPYVCGECGRGFNHKSNLIPHQRTHSGEKPYVCLECGRGFIQKSHLFTHQRTHSGEKPYKCLECGRGFNQESSRLMHQKTHSGEATCVQGVWARL	92720	95663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_92700_95700
684647	contig_18869_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_56083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCGGTCATCCAAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
684651	contig_5643_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_38950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471266	470883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_470900_471300
684662	contig_2278_pilon	+	2483	1	Intergenic	novelGene_118109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1191	1559	769907	770275	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARKAQVIKLDFLQFKEEGGLFLGKTKYCWQKEYAFLRPEELDGAWLPPMTTLTENTIQSLMEQEKGGVQNSNSSKTTRLNGLTETGGTLESMAPGFSISPEVKQFPRPTLQTGIGLDCGT	768716	771199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_768700_771200
684669	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657182	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657184	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684671	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684672	contig_18869_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_55968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCTACTCTCAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39215	37330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_37300_39200
684673	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684675	contig_13481_pilon	+	1345	5	Intergenic	novelGene_119306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	193.999194585957	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1128	216	1343	283783	469441	FALSE	55	AAGGAAATGTATTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSSGASGGKGVDANPVETYDSGDEWDIGVGNLIIDLDADLEKDQQKLEMSGSKEVGIPAPNAVATLPDNIKFVTPVPGPQGKEGKSKSKRSKSGKDTSKPTPGTSLFTPSEGAASKKEVQGRSGDGASAGGLVAAIAPKGSEKAAKASRSVAGSKKEKENSSSKSKKERSEGVGTCSEKDPGVLQPVPLGGRGGQYDGSAGVDTGAVEPLGSIAIEPGAALNPLGAKPEPEDGENECRPLKKVKSEKMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSL	248564	469443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_283655_284530_414927_415154_466806_466879_469358
684676	contig_13481_pilon	-	2983	1	Intergenic	novelGene_119342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363723	360740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_360700_363700
684682	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
684683	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_96429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684684	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684685	contig_405_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_135311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCACACAGATATAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426046	425067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_425100_426000
684687	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
684696	contig_17194_pilon	+	2453	8	Intergenic	novelGene_155359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	67.1774986623543	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	201	1199	190975	288575	FALSE	75	TGAAAATAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCESPDADDYFEHSPLSEDRFSKLNEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLTSSSTLADSSMLSPPQATLHRNVSPGAPQRPPSTGNAGGMLNTSDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLIGTTGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLNTQRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTGEPALLPFMCFISLP	75910	289829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_190807_190996_232839_233044_256239_256372_259309_259530_260448_260509_272282_272471_288401
684699	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684702	contig_7291_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_106314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	947	1330	209172	208789	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFTKPDVLLQELVPPDNMPKYVRRSLATLTSKEYSGCTASKTDLFILLAVHCIFSILNQHHNSKASILLWSSLFIVQLLHAHEVIENTMAWVRCTLVLKVTSSLFNTLKRSFAADLPSAICHVIS	210118	208611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_208600_210100
684703	contig_11629_pilon	+	2578	1	Intergenic	novelGene_161200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCAGCATCCTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429553	432131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_429600_432100
684711	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684712	contig_11253_pilon	+	2640	10	Intergenic	novelGene_126826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTTTTTGTCCAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147385	179224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_148278_155134_155346_160223_160378_168355_168584_169822_170092_170630_170772_173596_173723_174676_174929_176019_176257_179094
684719	contig_5954_pilon	+	1920	12	Intergenic	novelGene_28712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	883	1629	967090	971249	TRUE	45	AAACAATGAGAAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHSLGVVPFLKTLIAFVLLLQSQVRVYVGQPLLLLQDFLCLLALLEHIWGSVLCQRLVVEMDGIFVLFFFEVGVANSSISCLIGDISHVGGIQILGSVVMLQGCVKIFLLVGIIPQFFFFQYLLLILWKIFFHRLRFGLLFGRWWWWRCRNLFLFIHTAQVDSKEDTERGHDPWILQFRAQVRRLVSELLYQFPVGRITEQCPCPGITLQLLVEIGHVERVHEFPLCQPGLHILQTLFELSVICFMF	962099	972253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_962569_963008_963181_963384_963490_963688_963725_966989_967115_967266_967364_967973_968094_968539_968665_970051_970222_970882_971028_971184_971323_972035
684724	contig_3018_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_78939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAGATGAAGGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677770	679290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_677800_679300
684727	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684732	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684735	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684738	contig_10163_pilon	-	2693	15	Intergenic	novelGene_82625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACGACTGGGCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186593	87370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_87461_120847_120956_122442_122540_123475_123627_126724_126862_146582_146821_149646_149811_152146_152323_155411_155482_165094_165194_175171_175227_181217_181286_183288_183355_183869_183967_185516
684740	contig_19564_pilon	-	1166	5	Intergenic	novelGene_29638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.43123896188	14	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	141	857	15529	12334	FALSE	10	TGTTGAATGTCTCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIVGWDLSGWGLIALLQFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEAHFRAVHRHVPSEGLPPLVHR	15669	12024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12399_12919_13259_13554_13666_13945_14099_15480
684747	contig_9345_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_24679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.2670273047588	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	160	351	955353	948121	FALSE	5	TTCCCGTTTTGTCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRPPPAARRRSSVLSLVRRRRLLSDPPALPSSRLAERRPRREEAGLGVAAKVMAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQSR	1001313	947226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949476_949557_955251_955356_1001156
684748	contig_9995_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_47692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCCCTTTAGGGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293455	295224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_293500_295200
684757	contig_14209_pilon	+	1713	11	Intergenic	novelGene_88327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	241.508177915366	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	897	1325	38057	40625	FALSE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32319	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35260_35355_35503_35664_37048_37218_37300_37366_37771_37812_37909_38078_40142_40344_40418
684770	contig_8357_pilon	-	1674	11	Intergenic	novelGene_39699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	81.9106830639325	15	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	599	1444	318016	312261	FALSE	15	GGCTTAGTACTCTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	332759	312030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318080_318980_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332666
684771	contig_15491_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_75927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCGAACCCTGGTCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21730	24623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_21700_24600
684778	contig_5643_pilon	-	2765	17	Intergenic	novelGene_38910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	56.422755549069	70	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	1363	2547	319239	312955	FALSE	5	ACCTGTGTGGCCTCTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPISSHVTATERQAFQPWPERLSNNVEELLQSSLSLGGQEQVSDRKQEQGQEHKQEQGQEHKQEEGQEQEEQQEEQEEEAKQEEGQGTEEALETVSGLQTDPESKFQPESLPSNPSSFTPRVREVESTPMMIENIQELIRSAQEMDEMNEAYDEDSWKNANRGSLLQLPHVEAMLVLCYSIVESPCITTPTAKAWQFMEEEILGFGKPVCDNLGRRHTPTCALCDFCSLKLEQCHSEANLKRQLCDSSHKTAFISPLLSSQSVSIGTQAGPKQAGRFYGLDLYGGLRMDFWCGRLATKGCEDSRVAGWLQTEFLSFQDGDFPTKICDTDYVQYPNYCAFKSQQCLLRNQDRKISRMRCLQNETYNVMTQAKSEDIVLRWSQEFSTLTLGQAG	333037	312736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_313078_313591_313676_314778_314947_315067_315248_317357_317491_317978_318445_319208_319327_319800_319896_320107_320327_323031_323273_323382_323445_323709_323858_324116_324227_324394_324510_324687_324855_326560_326633_332991
684779	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91667	2	-91661	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGACAAAACCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
684782	contig_16098_pilon	-	1371	9	Intergenic	novelGene_46157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1537.56418057101	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	120	986	458816	456579	TRUE	20	CTTTCTAGCCTACTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAASSLEARVRRRHPSTSTPSTSAPC	460246	456102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456653_456830_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
684783	contig_15304_pilon	-	843	3	Intergenic	novelGene_30521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	198	803	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53594_53991
684784	contig_7457_pilon	+	1630	14	Intergenic	novelGene_31581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_13	161.141600415955	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	13	1497	927933	953888	FALSE	15	ACCTCTGTCTGTGTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGKMAAASECDVVMAATEPELLDDEEAKREAESFKEQGNAYYAKKDYNEAYNYYTKAIDMCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRNAKALKAKKEDGNKAFKEGNYKLAYELYTEALGIDPNNIKTNAKLYCNRGTVNSKLRKLDDAIEDCTNAVKLDDTYIKAYLRRAQCYMDTEQYEEAVRDYEKVYQTEKTKEHKQLLKNAQLELKKSKRKDYYKILGVDKNASEDEIKKAYRKRALMHHPDRHSGASAEVQKEEEKKFKEVGEAFTILSDPKKKTRYDSGQDLDEEGMNMGDFDANNIFKAFFGGPGGFSFEASGPGNFFFQFG	927920	954021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687_946842_947373_947539_948394_948487_951589_951664_952018_952166_952384_952538_953360_953424_953850
684790	contig_6102_pilon	+	2520	15	Intergenic	novelGene_32361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	110.290178481077	1	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1308	2030	1711936	1714324	TRUE	35	TATACAAAGCTGAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQVRKLKTILFLTQQQPQCHLLSVSK	1701573	1714918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1701724_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706625_1710802_1710970_1711137_1711234_1711374_1711498_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714599_1714702
684795	contig_11720_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_44003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	138	488	272327	271841	TRUE	20	CTGGTGGCACAGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272464	269391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_269906_270031_270697_271265_271340_271803_271958_272093
684809	contig_5515_pilon	+	2913	3	Intergenic	novelGene_52322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	321	632	60641	60952	TRUE	15	CTGAGACTGGGCACGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGTGPKINEFDTAPAEVHQDVFVLDVTVDNSTGMAVPNGCHYLGKEAAASALTQWALLCDVVKEILGRQRPLEDQHDALWCLKPVKQANHTRVPTTCTHLP	60320	64036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_62880_63554_63667_63794
684823	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684840	SIRV7	-	265	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-1	-14868	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGCCCACAGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114739	70905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_70988_78841_78966_114680
684841	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684843	contig_4068_pilon	+	2823	20	Intergenic	novelGene_161702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAACCCGATCTCGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33974	113743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_34469_37087_37294_42831_42994_61060_61146_63826_64070_78188_78271_78366_78396_80957_81054_83470_83531_83831_83961_85996_86201_86292_86354_87764_87837_94686_94722_96362_96416_98704_98789_102797_102904_108101_108276_109190_109303_113407
684846	contig_12050_pilon	+	1828	7	Intergenic	novelGene_62641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	226.854885089321	1035	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	664	1308	359783	363452	FALSE	5	GCCCTCTGTCTGTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKQTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	359119	363972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362033_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
684847	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684849	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68999	2	35780	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78958	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
684850	contig_6958_pilon	+	1481	2	Intergenic	novelGene_69945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGCTCCGTAAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148619	154554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_149971_154424
684851	contig_16883_pilon	+	1798	15	Intergenic	novelGene_161748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	101.681901947561	318	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	60	1502	516203	580149	FALSE	25	TTAAAATTCTGGCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAVSGRAEGGSRGGGRPGMAAAAAGAAAWAAHEKQFPPALLSFFIYNPRFGPREGEEENKILFYHPNEVEKNEKIRNVGLCEAIVQFTRTFSPSKPAKSLHTQKNRQFFNEPEENFWMVMVVRNPIIEKQSKDGKPIVEYQEEELLDKVYSSVLQQCYSMYKLFNGTFLKAMEDGGVKLLKERLEKFFHRYLQTLHLQSCDLLDIFGGISFFPLDKMTYLKIQSFINRMEESLNIVKYTAFLYNDQLIWSGLEQDDMRILYKYLTTSLFPRHIEPELAGRDSPVRAEMPGNLQHYGRFLTGPLNLNDPEAKCRFPKIFVNTDDTYEELHLIVYKAMSAAVCFMIDAAIQPTLDFCRRLDSIVGPQLTVLASDICEQFNINKRISGSEKEPQFKFIYFNHMNLAEKSTIHMRKTPSVSLTSVHPDLMKILGDINSDFTRVDEDEEIIVKAMSDYWVVGKKSDQRELYVILNQKNANLIEVNEEVKKLCATQFNNIFFLD	516143	580445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_516317_517266_517365_517457_517552_517827_517906_518292_518341_519492_519577_526114_526291_529884_529967_532608_532671_532957_533070_556651_556686_557588_557707_578279_578439_578743_578872_580093
684854	contig_233_pilon	+	2099	10	Intergenic	novelGene_14506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	102	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	342	701	78477	91502	TRUE	15	TCGGCCCGCTGGAAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALCVSITWMR	78135	107431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91476_91677_92138_92359_93766_94015_94731_94914_98310_98454_104160_104303_105453_105628_107316
684861	contig_4114_pilon	-	2091	8	Intergenic	novelGene_15581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	51.0685813392148	223	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	29	700	205384	185379	TRUE	30	TGGCATGAGTTTCTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPARAPAPVMASSSLLATFAARLLRPAQSCRPRHRSLHLSAVRDEAVVISGRKLAQQIKQEVRQEVEQWVASGNKRPHLSVVLVGENPASHSYVLNKTRAAADVGISSETILKPASISEEELLNLISKLNNDDNVDGLLVQLPLPEHIDERKVCNAVSPDKDVDGFHVINVGRMCLDQYSMLPATPWGVWEIIKRTGIPTLGKNVVVAGRSKNVGMPIAMLLYLIDTHPKSS	205412	180437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_181661_184673_184800_185336_185419_186465_186536_187196_187350_187763_187887_190049_190235_205283
684862	contig_13145_pilon	+	2070	8	Intergenic	novelGene_116618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1339.22735872866	3	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	77	796	35323	48850	TRUE	55	TAGTAAGAACAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKTHTESRNGYVKSE	35246	58554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35393_37925_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48808_48895_57324
684864	contig_16510_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_139084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTCTTTTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280189	280926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_280200_280900
684867	contig_12638_pilon	+	2151	8	Intergenic	novelGene_33215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.5925163494667	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	361	795	529211	574233	FALSE	20	CTGCCCCTGGAATGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLVRMKQEGRSGKYMCRIIVHFMWEDVEQRGKVMGVNPYILKKNMVLMTDSFYAAILGYDEGILSDDHGLAAALWRTFFNQKCEDPRQLELLVEYVRKQMQYLDSMNGEDLLLTGEVSWRPLVEKNPQSILKPHSPTYNDEGL	438462	575589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_438522_474483_474589_487758_487846_490168_490277_529209_529319_564798_564877_569794_569909_574098
684875	contig_513_pilon	-	1429	10	Intergenic	novelGene_80173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.150218515268	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	899	1387	450839	449064	FALSE	50	AAAAGTTTGGCCAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIPVHVMTIHPEAIVIEMAMVVTVTIQIIQVEVPTETPMRVMVTHVVLHLHEGPRHLMVEAVAMMITAAHVTDMVEVETVTQAAEVISTQVAVIGLADKKEGFPLLWKGGTLLHVIPTAVQAAEHQEVVAVEEADLIEGEAEADTKNKQNFGPKSLFPLPQ	454734	449021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449083_449656_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
684876	contig_11855_pilon	-	2008	12	Intergenic	novelGene_67024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.2658530246242	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	92	1315	1650193	1632810	TRUE	20	GAATGAGACTGTGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGWTRLGRAGRELCARCDRVGARAAAAAAMRWVRVLLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHHTLNQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINASNPKQPVHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLTLPPIKVMLALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTPQPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS	1650284	1631866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1632535_1632784_1632951_1633555_1633670_1634425_1634534_1634745_1634845_1634931_1635009_1636705_1636784_1636973_1637064_1637740_1637926_1638425_1638498_1647836_1647979_1650075
684880	contig_12873_pilon	+	1947	8	Intergenic	novelGene_27185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1290.32835561578	2	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1057	1380	19035	19855	FALSE	35	ACTTTAAGCCAAATTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15985	20422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_17257_17734_17814_17945_18014_18984_19264_19611_19703_19851
684884	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
684885	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684887	contig_7580_pilon	+	1497	7	Intergenic	novelGene_108594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	314.053958562679	2383	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	204	1097	103420	109647	FALSE	15	TTTTCATGGGCTGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96440	110047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_105320_105378_106952_107190_108145_108248_109428
684889	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
684894	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684899	contig_16322_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_87496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31143	32684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_31100_32700
684900	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684901	contig_12352_pilon	+	2716	9	Intergenic	novelGene_57454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	228.353207772521	2	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	235	897	238274	284811	FALSE	50	AACTTAAGACTAATACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	230011	286630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_237953_238083_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
684910	contig_19606_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_148278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAAAAAAAAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64895	62235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_62200_64900
684920	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	120	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
684924	contig_7816_pilon	-	1512	10	Intergenic	novelGene_66524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	63	416	211694	209366	TRUE	25	CATCTCCCAGCAGGGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYIYHSSQYIFEHLCQQLSGMCRIPTLHPIAPLGLGDQAPHGLHNGVLVNAKHLQQLIWLPASWYLADGQAGDSDARLAHDSTAHCLTYATFVIMVLHREDPALGGAGAVENEFSIQGLDGERIQHADVNLVFTFLQ	211756	192925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_193098_194857_194972_195757_195948_196742_196909_207502_207660_207802_207933_209064_209149_209282_209383_210625_210749_211480
684939	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
684940	contig_3797_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_120099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTGATAATCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384781	383541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_383500_384800
684952	contig_4156_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_88096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292994	295044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_293000_295000
684961	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
684962	contig_4654_pilon	-	2551	5	Intergenic	novelGene_103050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	874	junction_2	252.654284547086	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1221	1829	430591	414178	FALSE	30	ATGGGCATAAAGTACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQCDSPHVVKYYGSYFKNTDLWIVMEYCGAGSVSDIIRLRNKTLTEDEIATVLQSTLKGLEYLHFMRKIHRDIKAGNILLNTEGHAKLADFGVAGQLTDTMAKRNTVIGTPFWMAPEVIQEIGYNCVADIWSLGITAIEMAEGKPPYADIHPMRAIFMIPTNPPPTFRKPELWSDNFMDFVKQCLVKSPDQRATATQLLQV	431811	413455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_414322_415913_416082_424963_425129_428134_428250_430574
684977	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
684983	contig_6842_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_130671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCCAACCTTTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304074	301518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_301500_304100
684984	contig_8616_pilon	+	1708	11	Intergenic	novelGene_72404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.612544097875	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	215	1120	215233	237101	FALSE	15	CTAGCCATGTCGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCRDRTQEFLSACKSLQSRQNGIQANKPALHAVRQRSEFTLMAKRIGKDLSNTFAKLEKLTILAKRKSLFDDKAVEIEELTYIIKQDINSLNKQIAQLQDFVRAKGSQSGRHLQTHSNTIVVSLQSKLASMSNDFKSVLEVRTENLKQQKSRREQFSRAPVSALPLAPNHLGGGAVVLGAESCASGDVAINMIDSRTSQQLQLIDEQDSYIQSRADTMQNIESTIVELGSIFQQLAHMVKEQEETIQRIDENVLGAQLDVEAAHSEILKYFQSVTSNRWLMVKIFLILIVFFIIFVVFLA	214268	237689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_214387_215136_215296_216320_216392_216556_216613_216728_216800_219806_219924_220007_220065_220243_220326_221061_221169_221372_221495_236941
684987	contig_18869_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_56342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
684992	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
684996	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
685003	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	246	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685008	contig_5549_pilon	-	3043	1	Intergenic	novelGene_81664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCCCCATGAAATTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473434	470391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_470400_473400
685010	contig_9363_pilon	-	1819	12	Intergenic	novelGene_6647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_11	49.0238599354968	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	270	1508	955882	952785	FALSE	0	CTCGTGGGCCCTGTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILASVLGSGPRGGPPLWPLLGPALSLRASSTSVTDTHHVEMARERSKTVTSFYNQSAIDVAAEKPSVRLTPTMMLYSGRSQDGSHLLKSGRYLQQELPVRIAHRIKDFRSLPFIIGCNPTILHVHELYIRAFQKLTDFPPIKDQAEEAQYCQLVRQLLDDHKDVVTLLAEGLRESRKHIENEKLVRCFLDKTLTSRLGIRMLATHHLALHEDKPDFVGIICTRLSPKKIIEKWVDFARRLCEHKYGNAPRVRINGHVAARFPFIPMPLDYILPELLKNAMRATMESHLDTPYNVPDVVITIANNDIDLVIRISDRGGGIAHKDLDRVMDYHFTTAEASTQDPRISPLFGHLDMHSGSQSGPMHGFGFGLPTSRAYAEYLGGSLQLQSLQGIGTDVYLRLRHIDGREESFRI	956744	952473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_952930_953021_953181_953658_953749_953833_953963_954310_954385_954558_954658_954740_954861_954939_954988_955286_955398_955492_955562_955687_956043_956635
685012	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
685018	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_96881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685019	contig_5744_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_149350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	583	1122	694543	694004	NA	60	AAAAAAAAACCAAACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLVWCSEGSLDLGAFQDSAEVRIDHLVHGKVVVTRGRQLYAKCHTAHLTCKKDFQSKCRNVPHAYQEQVSKCSVCLHKQSNSRDVSEGLDDTIVLIIDNAWSPALDTTLISHFVLASSQSLKGTDVFGIIPGLKFLKKQNSLLGLLVGFSFIIFDHQRKLRNFLNMMTFRHDQCRQG	695125	693626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_693600_695100
685020	contig_835_pilon	+	1832	4	Intergenic	novelGene_152131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_3	44.3796750276019	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	127	606	70975	223667	FALSE	40	TGTATATTGCCACCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEILEYSSDSGKEDDSENVLFIDSESPHKCSVDFGTDARQYMERLVEPWTKSTETILYTPQKQKNKFPRTPEDSTKKKKLIRGGLAERLNELQNRERSAISFWRHQCVSYPKTLEGRKSGVLVVKILELHEECTMQVAICEQLEDLQASSPSPGVAPGPGACLKILFTKDTASNLKGRPQDIVHIYPPCDGPEGSALLAN	70848	224893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_88205_88307_164341_164562_223630
685026	contig_14322_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_116237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671657	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
685027	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685029	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
685030	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_93904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685031	contig_2377_pilon	-	2824	7	Intergenic	novelGene_67879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	12.6677631104399	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	397	1056	143468	138701	FALSE	10	CTTCTTGTTAATGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERMRQLQESLLRDEGASPEEMESRFELEKSESLLVTPSADILEPSPRPDMLCFVEDPAFGYEDFTRQGAEAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQRLYPEGGQLLDEKFQAAYSLTYNTMAMHSGVDTSMLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEVNQLLERNLKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALRAITRYMT	144554	136932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_138788_139468_139614_141919_142111_142493_142613_143350_143502_144089_144305_144406
685032	contig_10937_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_67295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTAATATAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33202	34513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33200_34500
685033	contig_10937_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_67303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAAACTGGGAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34616	35077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_34600_35100
685037	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685045	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
685054	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685059	contig_9633_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_139591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCACTTCCTTGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31593	29211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_29200_31600
685062	contig_8617_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_73474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCGCTACCAACCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
685065	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
685069	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685073	contig_19362_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_157806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGTTGCAGAGGCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89093	88197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_88200_89100
685076	contig_15105_pilon	-	1391	6	Intergenic	novelGene_151030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1026.91097958879	27	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	37	687	839916	831627	TRUE	50	GGAAGGAAGGGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQVRYANVLLGLLWILQSTSVWLLNYFINGIKASQKRYEN	839952	828936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831740_832197_832309_836187_836548_839849
685077	contig_6102_pilon	-	2572	8	Intergenic	novelGene_32000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.0920248030785	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	329	868	455625	450749	TRUE	25	AAAACTTTTGCTGTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYDVTRFQGDVDEDLICPICSGVLEEPVQAPHCEHAFCNACITQWFSQQQTCPVDRSVVTVAHLRPVPRIMRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKHTCEQSAVSTPTFRTWRKQLNTTRF	473542	448580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450263_450401_450492_450828_451288_451388_452090_452363_455535_455649_470683_470869_473422
685078	scaffold_19766_pilon	-	2400	14	Intergenic	novelGene_34288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.9737684044966	33	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	154	1065	433431	423818	TRUE	20	GGAAAATGCCTCTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAESRADAAGCSASVRVAERAEVAEEAGRRQWLKGLRRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVIFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTSLVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGSASAPVQGSVPEGKPLRTLLGDPVPSLSAAASASNQSVSQSQARIAQPRSSQAPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQAAPAFAAFPAFAGQTPSHGGFANFDAFGSSPSSSTFGNIPPAGQAPFQAQPTPTASRMLTGSYSFGSSQVTPFGVSPLAPASQPNSLTDMSSILGPGVSAGGIPPHSVFGMAGPVPALQSATTGGSGGTGFAFGAFTNPFTAPAARPPAAFH	444470	420192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_420485_420604_421404_421755_421842_422623_422753_423788_423874_424063_424147_424376_424501_428662_428696_429374_429501_430421_430588_431159_431314_432416_432533_433377_433472_444357
685079	contig_7744_pilon	+	2031	17	Intergenic	novelGene_62558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	243.264484409459	1	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	102	716	882687	885326	TRUE	35	GCTGCTGTAATAAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGESQIVLSSGSDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQRNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFHKYWADTKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHSCDPPHHPWEPDL	879818	891195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879900_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887181_887346_887446_889021_889155_889339_889488_889804_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
685081	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_93434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
685084	contig_15866_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_63603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGCAGCAATAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314135	316104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_314100_316100
685085	contig_5698_pilon	+	2074	6	Intergenic	novelGene_55038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	876.039633806599	2	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	164	559	11149	19370	FALSE	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRLLLHVLKATSFNLKTSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	7880	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8025_11129_11210_11811_11871_17147_17220_18789_18853_19229
685086	contig_14322_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_116239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
685088	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91670	4	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
685090	SIRV7	-	268	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91654	4	-91648	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTTCTTGAATTAGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
685092	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685095	contig_9609_pilon	-	1424	11	Intergenic	novelGene_23119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_9	87.0241920387659	643	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	153	1295	523819	520853	FALSE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSCRIECIFFSEFHPTLGPKITYQVPEDFISRELFDTVQVYIITKPELQNKLITVTAMEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523971	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523120_523204_523297_523741
685098	contig_10235_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_46459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	16	393	217208	217585	NA	20	ACTCTCCTCTTGAATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRIQMLVPCTLRLVQPWGQHPQEPNSGPHTVQKTPLTRDSPPTATPTPAVLRSRLGSLPPGGRVGGDESLSLQALRIRSSGFWWWWWGGPRVSELMYYDPAGARRSGGSRALSKRDRAGLPEATPIPPC	217192	218676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_217200_218700
685103	contig_2710_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_161811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	219	530	1244832	1244521	NA	50	TAAAAGCCAAATTCAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILILAVFYPFVDLIDNFNQTHKYAPLIIIGLHLALGIFSFTLDTWSTSRGDTAEILGSGAGIACGSHVIYNMGVVFDPSLDILPLTRPPITVTLFGKAILRILIGMAFVLIVRVVMKKITIPLACKIFSIPCDDVRKARQHMEVELPYRYITYGMVGFSITCLVPYIFFFIGIS	1245050	1242660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1242700_1245000
685105	contig_12079_pilon	-	2199	5	Intergenic	novelGene_67507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	502.294734194974	1	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	281	1429	868372	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKALVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872354	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862312_867333_867410_868246_868414_871484_871684_872314
685106	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	855	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685111	SIRV7	-	359	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33209	1	-10	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114748	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
685113	contig_9121_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_134461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1372	1674	190648	190346	NA	15	ACTCCTGTCTACCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRNHVGCLEWPQDLMVYCKRIRHQGMLVLKISHGKRILLTNEESMKSPLGSSMWESFCQAKTSSVTLGGSKKKKKSFLWFPGSSVWRLLQEVWGRFVLL	192019	189844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_189800_192000
685114	contig_10689_pilon	+	1031	5	Intergenic	novelGene_118624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1603.15462448262	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	96	614	57608	61101	TRUE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51266	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928_61212_61277
685115	contig_6902_pilon	+	1365	2	Intergenic	novelGene_135574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCACATCAGTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434419	461408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253
685123	contig_6674_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_147991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTGTATATATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94125	92266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_92300_94100
685129	contig_6710_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_89124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653659	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
685130	contig_6710_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_91279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_654800
685132	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_89223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653719	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
685142	contig_16884_pilon	-	2928	1	Intergenic	novelGene_161823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1378	1740	80511	80149	NA	75	AAGTACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFRHRTIPINASFSFLCFGLGVSLSGFRVEVVDGVMLHLLDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCPECSRFQVKVKGIRLLSASWETHSLFSGFDSWNTSRPPSIIVINLIC	81888	78960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_79000_81900
685145	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
685146	contig_12270_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_113273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	1	300	14138	13839	NA	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14138	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
685150	contig_14322_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_116223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671889	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
685151	contig_8394_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_27318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	322	966	918	1883	33434	32469	NA	45	AAAACCAACTTGGGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	34351	32466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_32500_34400
685153	contig_10765_pilon	+	1819	4	Intergenic	novelGene_122854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.54247233265651	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	277	1653	18095	34929	FALSE	25	TGTATTTTAAATGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVCQVFLLHRRWMPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRERNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15623	35095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_17961_18137_18248_19382_34727
685155	contig_8729_pilon	+	1954	14	Intergenic	novelGene_40054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	137.409636794599	192	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	113	1663	33998	43845	FALSE	25	TGTTACCTACTTTGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRARLFQKGAELAFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAELADVLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVLKLILFLLQGIDPFSLDALAKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSLDDLNPDCLGYAGLVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAIRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAIAAALMKYKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKVQAEHSESGELVGVDLNTGEPMVAAEAGIWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG	33885	44136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_36925_37784_37959_38491_38596_39239_39351_40001_40087_40239_40353_40956_41054_41327_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
685162	contig_1076_pilon	+	1745	11	Intergenic	novelGene_101132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	116.28503773057	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	391	1518	973982	996806	FALSE	15	TCCACTTGTGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNEALEEQLGQAFDQVNQLQHELSKKDELLRIVSIASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLDMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEEISSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELRLHLQASKDAQRQLTVELHELQDRNRECLGMLHESQEEIKELRSRSGPAAHLYFSQLYGDFSGPYKR	945721	997033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980865_988168_988246_989739_989857_990860_991071_991716_991796_993263_993395_993833_993909_995092_995231_996791
685163	contig_6418_pilon	-	1699	11	Intergenic	novelGene_81111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.291520997096	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1082	1453	73056	68463	FALSE	35	AGAAGCAACTACTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118020	68216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73631_78222_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
685164	contig_14638_pilon	+	2166	5	Intergenic	novelGene_71581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	365	730	253154	253519	TRUE	65	CTATAAAAATAAAAAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLQPVTVNTVKLCVWSQESRTLPLGTLWEGRERMMGSEIYCVSCRTPIFQKKKFLLYAACAGGRARGPAGDRPLLLRVAPGTEDTGSSDCQAPCTSGTITSALAPGLGPRGHLPQPRSQ	252789	277696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_+_254614_258223_258365_262339_262458_277508_277555_277659
685169	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685172	contig_12540_pilon	-	2321	7	Intergenic	novelGene_148089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	365	886	966536	965193	TRUE	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQAPLPSRLALLAAAGGFLVIFSWQFLGRGGLLWNWGLCLWVGDHCGGPITGLWLRLRHGQGLRDLRRHVPKLLLPTGLLSGFPCGKLCLSFLFFCLPLLQDHLAEAFALQVAPAEALQADDALSPVPVGPPLQVAPPCGLKEHGCLCPLQRPPDSVGTPAGLDGDGCPFHL	966900	957768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_958769_960891_960973_961435_961552_963672_963792_965073_965226_965306_965472_966212
685175	contig_10299_pilon	-	1896	16	Intergenic	novelGene_79721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	1419	1895	337017	320562	FALSE	25	ATGACTGGTGCAGGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKLSGGNLSTLSRLFCMSGQCSCPAASMHCCTAWVSCPSSWISRRYSSAFWLSFSYSFWASNSSAPGAIEAILKISSLATGTSCRNSWLLREKMRTPSSSGTRYESSSSTRYWMLSGASPTTISRLSQATTMALSLLRGSPVKGRVPERVPVRRVAV	340539	320560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_320620_335754_335837_335940_336030_336183_336263_336731_336872_336988_337102_337415_337539_337702_337838_337922_338032_338121_338222_338305_338415_338732_338809_338904_339075_339156_339253_340014_340122_340230
685176	contig_12733_pilon	+	1760	5	Intergenic	novelGene_129585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_4	26.1091459071338	2855	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGAGACTGACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278979	281787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_279341_279639_279718_279823_279902_280327_280397_280613
685179	contig_19851_pilon	+	949	6	Intergenic	novelGene_29842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	174	689	53637	56177	FALSE	30	ATTCTTGTGAGTCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
685181	contig_1331_pilon	-	1229	1	Intergenic	novelGene_37862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	762	1070	265464	265156	NA	15	GTTGGTGGTTTGAACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIHFLALFGCSLDLSFPMLCSIAYKTAGSMSPKTGEKTSLITSKSIIRLMFTEFWYECCVWDELWLSEFESLFYHLLAPQMSVSLLIIDDNKSTQAQKGLL	266225	264996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_265000_266200
685186	contig_9753_pilon	-	1636	6	Intergenic	novelGene_41315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_5	287.512364951492	168	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATCTGTTGTCTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93372	69099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93282
685194	contig_18342_pilon	+	1185	8	Intergenic	novelGene_154551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	199.182922798853	2587	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	306	1055	36154	63358	FALSE	15	TTGATGACTTCTTTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVYLGFENKKERDSSTFSAAMTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASGIVFIMPSNAYVAETAPTATLSGDSLPPTEQ	26102	63488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36055_36204_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655_60758_63265
685195	contig_3986_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_52731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCAGGACATCAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153905	151577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_151600_153900
685198	contig_20951_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_43097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAACCCTAAGGCCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28871	28721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
685199	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685200	contig_10523_pilon	-	1521	9	Intergenic	novelGene_120918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	541.94463220425	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	228	1295	39240	12953	FALSE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLGKGRIGVERMNTGKGRGEKNPPQRKTKETGEREPRQRRPIKLFWC	66994	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13091_15054_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_66781
685202	contig_5928_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_40371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGTATTATTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221663	221858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_221700_221900
685218	contig_10109_pilon	+	391	7	Intergenic	novelGene_131320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	137.75945218629	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	4	390	76478	200831	FALSE	30	TCAAGTCCCTGTATAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMDCRTKENPERTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFANQEVLQSVPKFCFPFDVERVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGKICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELESDLNET	76474	200832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_76495_78820_78886_138208_138253_177077_177128_179109_179230_195960_196031_200810
685222	SIRV1	-	170	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3934	0	3660	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6706	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
685223	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685226	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685230	contig_15063_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_12013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	218	1390	34808	36661	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27149	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
685241	contig_9112_pilon	+	1517	4	Intergenic	novelGene_60200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	194.18605053459	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	286	1137	108641	114303	FALSE	10	AGGTGTTTGTATGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108355	114683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251
685245	contig_19778_pilon	+	1653	9	Intergenic	novelGene_143738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_8	301.87818321303	514	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	51	1178	530	16019	TRUE	30	TTATTCACATACATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	479	18624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_537_5643_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920_16025_18154
685251	contig_15732_pilon	+	1419	1	Intergenic	novelGene_88866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGGTTAAGCACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101215	102634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_101200_102600
685252	contig_15732_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_88867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAGGTACAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103578	105648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_103600_105600
685257	contig_9706_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_20829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2185	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
685258	contig_10235_pilon	-	1086	6	Intergenic	novelGene_46485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	925.890576688196	1344	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	11	418	222843	219577	TRUE	35	AATGAAAATTTAGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDSESFIILG	222853	217926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219594_220080_220197_220354_220481_220677_220788_222804
685261	contig_12624_pilon	+	1853	13	Intergenic	novelGene_60976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_7	133.852115743043	120	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	923	1654	95386	99508	FALSE	75	AAAAAAAGAACCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVIEAYSGLTKKKEGETLEPYKVNLSQDLEHQLQNVVQELNLEIVPPPEDPSVPVLLNIDKLAHFEPSQRQNQMGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAYATPEQISTDLKNELMYQLEQDRNLQGILQERELLPVKKFENEILDAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQVSSKPSIRCVFYG	66555	99707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_94415_94553_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342_98505_98647_98726_99274
685262	contig_13004_pilon	+	976	2	Intergenic	novelGene_112750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAATAAAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977649	983984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_977827_983185
685263	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685265	contig_11328_pilon	+	862	3	Intergenic	novelGene_88425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3456	junction_2	1043.5	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATCATCTTTACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644805	648033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645376_647064_647223_647899
685267	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_93625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685268	contig_12019_pilon	+	1248	6	Intergenic	novelGene_87620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.2011952048953	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	589	912	5225	8336	FALSE	10	TCATCTCTTTCCTGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	423	8672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_539_2029_2300_4168_4266_5118_5400_6114_6226_8298
685273	contig_10109_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_131330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178021	176038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_176000_178000
685277	SIRV2	-	958	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3109	-1	1930	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2802	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
685279	contig_14744_pilon	+	1100	7	Intergenic	novelGene_66060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4841.85562453992	7	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	514	1059	1384415	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLQPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382037	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383559_1384410_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
685287	SIRV5	+	456	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-131	880	-17	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
685288	contig_9455_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_161840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAGAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311637	312506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_311600_312500
685291	contig_1443_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_28216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344364	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344400_344900
685292	contig_5041_pilon	-	1182	6	Intergenic	novelGene_27105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	845.714987451446	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	108	743	616721	590161	FALSE	10	GTATTGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKFLASLWA	636087	589721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_590185_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
685293	contig_4364_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_18	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261597	260073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_260100_261600
685294	contig_5988_pilon	-	1169	2	Intergenic	novelGene_15960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	104	1000	652858	651962	FALSE	25	AGAAAGGTTTTTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786048	651792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652872_785958
685303	contig_5780_pilon	-	2056	11	Intergenic	novelGene_29799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	39.3732142452201	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	85	1581	183256	117335	FALSE	10	GTTTCTTTCCACATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSYTVTVATGSQWFAGTDDYIYFTLVGTAGCSEKHLLDKPFYNDFERGAVDSYNVIVDEELGEIQLVKIEKRKKLPEKLPVTTEMVECSLERQLTLQEEIEQGNIFIVDFELLDGINANKTDPCTHQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQVPGDKNPIFLPSDAKYDWLLAKIWVRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQLICEYGLFDKANATGGGGHVQLVHRAMQELTYISLCFPEAIKARGMDSTEDIPYYFYRDDGLLVWEAIKKFTAEVIGIYYESDQVVEEDQELQDFVKDVYVYGLRGRKASGFPSSIKTREMLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFSQYDWCSWIPNAPSTMRAPPPTAKGVVTIEQIVETLPDRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLDTIVSVIAERNKEKKLPYYYLSPDRIPNSVAI	183340	116859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_117515_118059_118231_118619_118721_119105_119228_119544_119724_121292_121380_122016_122221_128336_128484_134216_134302_175573_175645_183106
685304	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685306	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685312	contig_9482_pilon	-	1351	8	Intergenic	novelGene_44298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	123.560775758824	26	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	12	776	1253164	1240999	TRUE	5	CTTTCTCTTCTGCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKASRSRRAPDGPRR	1253175	1236136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236290_1238982_1239102_1239796_1239917_1240815_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
685321	contig_12644_pilon	+	677	4	Intergenic	novelGene_44694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4495	junction_3	4472.19232840251	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	166	597	2679886	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2679506	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
685322	contig_8242_pilon	+	2031	10	Intergenic	novelGene_80184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_6	421.032710379938	1852	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	124	1404	3532	37065	FALSE	20	CAAATACGGGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGADPKSVVCAFFKQGQCTKGDKCKFSHDLTLERKCEKRSVYIDARDEELEKDTMDNWDEKKLEEVVNKKHGEAEKKKPKTQIVCKHFLEAIENNKYGWFWVCPGGGDMCMYRHALPPGFVLKKDKKKEEKEDEISLEDLIERERSALGPNVTKITLESFLAWKKRKRQEKIDKLEQDMERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3408	37692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702_30795_31973_32157_33656_33804_33959_34062_35060_35185_36874
685327	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685332	contig_9011_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_159289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGCTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324753	327334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_324800_327300
685333	contig_5797_pilon	+	3147	15	Intergenic	novelGene_56922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	97.887299837046	385	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	36	1898	197252	273501	FALSE	45	TGACTGACCACTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDISCHYKNYPMHVFAYRVHTHHLGKVVSGYRVRNGQWTLIGRQSPQLPQAFYPVEHPVDVSFGDILAARCVFTGEGRSEATHIGGTSTDEMCNLYIMYYMEAKHAVSFMTCTQNVAPDMFRTIPREANIPIPVKSDVIMTHGHHKETENKDKPSLPQQPKREEEEVLDQDFHVEEALDWPGVYLLPGQVSGVALDLKNNLVIFHRGDHVWDGNSFDSKFVYQQRGLGPIEEDTILVIDPNNAAVLHSSGKNLFYLPHGLSVDKDGNYWVTDVALHQVFKLDPNSKEGPLLILGRSMQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	197216	274750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_197292_197612_197690_198193_198298_207428_207614_208950_209023_230464_230595_250787_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_273319
685338	SIRV7	-	320	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-2	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
685340	contig_5286_pilon	-	2405	2	Intergenic	novelGene_157364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCACTTGGTTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556592	553588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_554803_555401
685344	contig_15859_pilon	-	2524	1	Intergenic	novelGene_50220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATGGCTACTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379894	377370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377400_379900
685350	contig_3627_pilon	+	2529	15	Intergenic	novelGene_78469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	158.767655293347	209	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	117	2321	432362	483447	FALSE	15	TACTGTCTCTTTTCACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD	432245	483655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
685351	contig_5196_pilon	-	1596	4	Intergenic	novelGene_38667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_3	169.340551027278	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	46	741	14457	9642	FALSE	25	TCCTATTCCAGCTAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	14502	8786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231
685352	contig_2367_pilon	-	1635	3	Intergenic	novelGene_65328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	764	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	101	304	213194	193573	FALSE	30	CTCGGTACTTTTAGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKPRQSKSSKHEP	213294	192241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193609_208552_208634_213107
685355	contig_19564_pilon	-	1649	4	Intergenic	novelGene_29634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	135	1469	15529	12201	FALSE	10	GAATGTCTCCTCTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15663	12020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
685356	contig_5346_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_161861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCCAAGGCAGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403431	404877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_403400_404900
685361	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_94802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
685364	contig_3243_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_147528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	319.109992792454	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	258	806	20577	33428	FALSE	60	AAGAAAAAATATTCAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPGSSSQPPPVTAGSLSWKRCAGCGGKIADRFLLYAMDSYWHSRCLKCSCCQAQLGDIGTSCYTKSGMILCRNDYIRLFGNSGACSACGQSIPASELVMRAQGNVYHLKCFTCSTCRNRLVPGDRFHYINGSLFCEHDRPTALINGHLNSLQSNPLLPDQKNACLHLRFCSSQVDPMCLQ	17578	34132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_17833_20573_20813_28044_28142_28539_28696_33368
685365	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685367	contig_14925_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_55146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	26	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
685369	SIRV7	-	252	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69034	0	35815	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78923	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
685375	contig_10749_pilon	+	2511	1	Intergenic	novelGene_133496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221028	223539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_221000_223500
685389	contig_6163_pilon	+	1176	6	Intergenic	novelGene_103780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.4961416150619	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	555	1040	12879	16461	FALSE	15	TGACGAGTCCTTCTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10855_10938_12771_13041_13678_13842_16300
685391	contig_10436_pilon	-	909	4	Intergenic	novelGene_108501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	55	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	124	477	103480	102032	FALSE	20	AGCTGAACTGATTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103603	101599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
685392	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_90331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685393	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685397	contig_10311_pilon	-	2058	9	Intergenic	novelGene_50486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	48.2880355264117	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	161	1042	223053	206995	TRUE	10	ACTTTTCCTTGACTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAEEGGKLAVAAVRVGDPRGEAASQGGVGWRADAAAEAAVRRAWARVRDRETMAPQNLGTFCLLLLYLIGAVIAGRDFYKILGVPRSASIKDIKKAYRKLALQLHPDRNPDDPRAQEKFQDLGAAYEVLSDSEKRKQYDTYGEEGLKDGHQSSHGDIFSHFFGDFGFMFGGTPRQQDRNIPRGSDIIVDLEVTLEEVYAGNFVEVVRNKPVARQAPGKRKCNCRQEMRTTQLGPGRFQMTQEVVCDECPNVKLVNEERTLEVEIEPGVRDSMEYPFIGEGEPHVDGEPGDLRFRIRVVKHPIFERRGDDLYTNVTISLVESLVGFEMDITHLDGHKVNKLIFLSC	223213	205061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_205509_206425_207137_208714_208773_209402_209486_210604_210748_214686_214820_216356_216455_219891_220049_222985
685399	contig_6056_pilon	+	1416	10	Intergenic	novelGene_157876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	93.8321327467434	7	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	586	1218	291464	312153	FALSE	30	GATTTGAATATGATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267021	312351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287240_290636_290799_291373_291587_291720_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
685403	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_18320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
685417	contig_6710_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_95903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654691	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_654700
685421	contig_14322_pilon	-	254	2	Intergenic	novelGene_116530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTCCTGATGTCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674873	672882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
685424	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_95072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685426	contig_4103_pilon	+	2168	9	Intergenic	novelGene_51994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGGAAAAACACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215505	223755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_216019_216559_216654_218864_219025_219249_219429_220916_221126_221552_221700_222228_222380_222873_222984_223150
685431	contig_14513_pilon	-	1211	2	Intergenic	novelGene_70370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	20	CATTAGAACTCTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12129_18691
685435	contig_3077_pilon	+	729	5	Intergenic	novelGene_26629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5021.56003523805	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1	492	9601	17848	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRREQGGRVGLWHSKGLRASTVRHRISTHLLINENAY	9600	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9608_11276_11479_12013_12071_13019_13141_17743
685436	contig_15752_pilon	+	2280	10	Intergenic	novelGene_148762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_7	44.497190922574	398	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	246	1283	197335	201492	TRUE	25	TCAAAGCCTGTGTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVPPPTPWPSLNAGAGSGPDLGVWPPQTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEVSWPLLEHGERAPGGAGLLPSLTDVCR	196641	203975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201812_202782_202944_203458
685437	contig_9345_pilon	+	981	2	Intergenic	novelGene_24684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGACAGAAATGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947231	949557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474
685445	contig_7202_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_18161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCTTTGATGGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27629	27890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
685447	contig_19851_pilon	+	940	5	Intergenic	novelGene_29844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_3	3637.01205490166	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	174	587	53637	56177	FALSE	20	ATTGTTCCGTGTAAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55840_55882_56006
685458	contig_14454_pilon	+	1990	2	Intergenic	novelGene_161868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	262	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	65	1021	26039	36657	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNATCNNWMTAKAALEKYYLSVFYSIEFVVGMLGNTAVVFAYLFCLKNWKSSNIYLFNLSISDLVFLCTLPMLIRSYASEEWVYGNILCKSNRYMLHANLYTSILFLAFISIDRYLMMKHPFRQHLMQKKGFAISISLAIWVLVTLELLPMFVFISPSETANSTTCEDYASSGDPRYSLIFSLCLTFTGFLIPLSVMCFFYFKIALFLKHRSRQLATTLPLERPLRLVVMAVIIFSVLFTPYHIMRNVRIASRLESWHCSECTKDIISTLYIVTRPLAFLNSAINPVFYFLMGDHFREMLITTLRHQFKFLTTFRR	25974	37626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14454_pilon_+_26042_35703
685471	contig_6839_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_161879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAACAGAAAAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298906	301271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_+_298900_301300
685477	contig_8712_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_58840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	596	979	485256	485639	NA	70	AAATAAATTATATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMVRLRLTYFGQFIGKDQLLEKDILFGKTKGQRKRGKLSMRWIDTIVTIVDSNILTIMKMSQDQATFCSVVHKASVSRASLITTNSNNKIKKQDCMRSVLTMIADVESRLSGAVEVGCSPETIALR	484660	486102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_484700_486100
685486	contig_6048_pilon	+	2035	7	Intergenic	novelGene_73261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	47.7507998769538	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	28	408	1972099	1976378	TRUE	30	GAGCTGGGGGCCTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPACSPAAMHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAK	1972071	1978269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976314_1976701_1976778_1977307_1977409_1977868_1977950
685493	contig_12279_pilon	+	1096	6	Intergenic	novelGene_50089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2028.94469121265	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	111	605	68405	77128	FALSE	25	AGCTGTATATTCTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57534	77619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68356_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
685495	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_96013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
685496	contig_9272_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_125918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGAGTCCTTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321533	318877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_318900_321500
685498	contig_10324_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_7864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461522	461848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_461500_461800
685500	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
685507	contig_2069_pilon	-	1372	2	Intergenic	novelGene_23527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	0	26	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGCATTGTGTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509871	1508369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942
685508	contig_3380_pilon	-	2398	5	Intergenic	novelGene_60080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_3	14.1664215665072	900	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGCGAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325055	59119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_61224_84891_84950_226563_226680_307841_307885_324978
685511	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685512	contig_9345_pilon	-	763	3	Intergenic	novelGene_24592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1159	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	115	552	945468	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVPELYRRHVCSSRRGRSRPRGGSPALGGTTVRDYTQMNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945682	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390_945498_945597
685513	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685518	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685523	contig_14333_pilon	+	2754	3	Intergenic	novelGene_49155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCGACCTCAGCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440830	446930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_443250_445733_445822_446683
685530	contig_11631_pilon	-	3015	17	Intergenic	novelGene_104179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCAACCAGAGTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93174	58609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_59069_59901_60052_67278_67408_68312_68472_68721_68871_73825_73918_79190_79234_79421_79591_80186_80339_80463_80639_81512_81672_82818_82950_86021_86153_87080_87215_87294_87436_88997_89070_92604
685531	contig_6325_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_143356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGGGTGACCAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386725	384335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_384300_386700
685536	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	361	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685549	contig_15456_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_139499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120843	121299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_120800_121300
685550	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685564	contig_10674_pilon	+	1791	10	Intergenic	novelGene_6435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	220.787479516188	186	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	23	1720	198581	251406	FALSE	20	CTTTCTGTGTTCAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPQESAAMADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRLRRDEEGNEMKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKKKKMMIEVQNVKTLYIFYCTVCFINMM	198558	251477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782_211888_223316_223412_224014_224161_224946_225032_236829_236925_237452_237588_238936_239073_251319
685569	contig_10011_pilon	+	1674	3	Intergenic	novelGene_68119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_2	62.5	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	795	1238	333300	333743	FALSE	15	AGTGTGGCTGGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCILVVGSPTFLSGRQDWEVEVGGKTGWVLGVCKASTSRKGSVALSPENGYWVVMTTMRNEYQASAFPPTHLWSKEPPWRVGIFLDYEAGDISFYNVTAKSHIYTFTCCSSSGPLQPVFSPGTQDGRKNTDPLIICPVCVQGPH	331806	334179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_332229_332413_332481_332994
685571	contig_10323_pilon	+	2387	2	Intergenic	novelGene_123638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	946	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	321	680	523023	523382	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWTVKLSWLLKIKQHPSKETSTSPGCSRWGHAPGAGHLPQPLGDTVEKSKRCGGLRVSAAFSFKLFCRWRLSRKSLQSQKPVLLLSRASYMSLGKFLNLLNIGLHYKGQGRVMRNQAT	522702	525981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_523952_524843
685579	contig_15063_pilon	+	1087	3	Intergenic	novelGene_14384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	131	952	35271	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35140	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
685580	contig_9482_pilon	-	1754	11	Intergenic	novelGene_44319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	122.186906008786	2	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	16	750	1253164	1240847	TRUE	20	TAAACAGCCTTTCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKAKV	1253179	1236144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240855_1241036_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
685583	contig_9955_pilon	-	1311	5	Intergenic	novelGene_21285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	716.307676560848	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	210	956	49317	45240	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49839	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47737_48794_49202_49243_49380_49692
685585	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685589	SIRV6	+	674	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	2	-11	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2474	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3162_10721_10819_11031
685596	contig_9706_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_20870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2493	2739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
685604	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685605	contig_9290_pilon	-	1799	13	Intergenic	novelGene_77537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	390.493091061374	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	738	1460	483241	478940	FALSE	30	GAGTTATCTTTGCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKVVGYIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	497002	478600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480059_480817_480962_481339_481372_481410_481438_482141_482331_483136_483316_486126_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
685609	contig_8263_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_83106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAGAACAGCTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157514	156445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_156400_157500
685615	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_97906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
685616	contig_12090_pilon	-	1867	6	Intergenic	novelGene_80476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_3	81.5426268892535	29	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1106	1663	54528	51792	FALSE	15	GCCCATTCTGTTATTTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTMVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVLRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTTGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR	56597	51587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_53617_54231_54363_54465_54755_55718
685625	contig_14661_pilon	-	2697	3	Intergenic	novelGene_47443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	27.5	78	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70868	65809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_68317_69358_69466_70785
685626	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685628	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_96365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653847	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685630	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
685636	contig_13894_pilon	-	1375	8	Intergenic	novelGene_62205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	225.40720521595	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	105	851	766610	751249	TRUE	55	AAAAAGATAAATTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLGATTSPATSRGAPAIAMPGN	766714	749796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751315_753139_753240_761484_761600_762021_762299_763800_763958_766578
685638	contig_2310_pilon	+	1268	11	Intergenic	novelGene_71613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	463	junction_7	80.9783304347527	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1254	14	1267	106097	127633	FALSE	15	AATTCCTGTCACCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGDDYESEAAYDPYAYPGDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCP	106083	127634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456
685639	contig_17493_pilon	+	1893	8	Intergenic	novelGene_122185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_5	426.359817381459	1267	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	148	867	92066	119222	FALSE	35	AAATAAAGGTATGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGKEQLLRLDNK	49978	120248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119116
685641	contig_14925_pilon	-	817	5	Intergenic	novelGene_55108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1702.13579070531	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	211	468	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAGNKLIFGTGTLLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	67880	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26134_27014_27127_27995_28041_29569_29828_67822
685643	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
685650	contig_18545_pilon	-	2126	3	Intergenic	novelGene_161880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCCATTTTGACTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249823	213856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_215744_239581_239762_249764
685651	contig_10962_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_103906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTGTATCTGTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356441	353827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_353800_356400
685653	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685655	contig_7457_pilon	-	2475	4	Intergenic	novelGene_31577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	8.52447456836295	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	258	743	924001	923096	FALSE	35	ATTTATAAATTACTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCKVVVCGQASVGKTSILEQLLYGNHVVGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVCGLGLWWEPQWGECALGWLWEAWNDFIFHSFARSWVTRVEATGGCLHP	925094	921363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_923488_923907_924016_924302_924384_924932
685656	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	909	-23	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
685668	contig_3334_pilon	-	2517	7	Intergenic	novelGene_137674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	177.636958116516	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	926	1531	756437	727584	FALSE	40	CGGAAAAAAAATTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYKFKSVLSFLIDETGVSAVQFGNSSTSVLATLAALAEASAPLSNSSETPVATEEVVTAESVDGAIQQVVSSGGQQVITIVTDGIQLGNLHSIPTSGIGQPIIVTMPDGQQVLTVPATDIAEETVISEEPPAKRQCIEIIENRVESAEIEEREALQKQLDEANREAQKYRQQLLKKEQEAEAYRQKLEAMTRLQTNKEAV	778620	726597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_727737_733508_733625_738712_738896_756283_756890_761716_761912_763122_763291_778510
685670	contig_4891_pilon	+	987	7	Intergenic	novelGene_124548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_4	477.85585925279	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	141	956	701017	756631	FALSE	15	CACCACTCTCCTGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700876	756662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
685675	contig_11281_pilon	-	1801	8	Intergenic	novelGene_125464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	471.123840905327	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	590	907	844638	841018	FALSE	50	GAAAACTGACAGAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPIVNGQCDPYATVTLAGPYRQKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQGESLFLRIHLRWLKITTAPH	860109	840123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853802_860039
685679	contig_9195_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_155663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	87	440	1841	2194	NA	35	ATCGACTTGACAGCAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYLTLRVPGLTFVSDLVFRVFAVVLLSMVLCYWPWILSRVGNSAAPLKDGGAPLKDGSRLLTLNVCHSPVLPIIHSHTSGPERAHYPSSESPSAEFRALIFPVLGTTLNHPNCKTLGLFLFRFALLAMTELVRTGSKSCFENST	1754	2595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_1800_2600
685681	contig_9609_pilon	-	2353	6	Intergenic	novelGene_23111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	105.819468908136	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTATTGAGTACCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523949	520722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521862_521982_522081_522171_522309_522740_522806_522950
685685	contig_6589_pilon	+	1113	7	Intergenic	novelGene_26024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	875.192693068218	36	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	114	776	1725483	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKLGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725369	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729135_1731406
685686	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7048	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685693	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685698	SIRV4	+	313	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1458	632	1003	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2458	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
685702	contig_9014_pilon	-	1427	13	Intergenic	novelGene_106758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.9159952580998	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	142	1002	85778	78549	FALSE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNGDAAETTEENSPKMRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLTKSHSFPHPV	85919	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78585_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_85745
685715	contig_5261_pilon	+	1624	9	Intergenic	novelGene_102486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	82.0220054314694	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	261	974	755045	776352	FALSE	15	TGACTTGCTCTGTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTDPPFGGLVEPLAITFKKLIALWKEGQSQDDSHKELPIFWIFPYFFESRIRQFFPSFCMLDYQVDYDNHALYKHGKTGRKQSPVRIFTNIPPNKIILPTEEGYRFCPLCQRYVSLENQHCEHCDSCTSKDGRKWNHCFLCKKCVKPSWIHCSICNHCAVPDHSCEGPKDGCFICGELDHKRTTCPNISLSKRANKAVRKQKQRKSNKMKLETTKGQSMNHTSVTRKKKRRERAHQ	742141	777002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_742264_743265_743347_754987_755139_757577_757679_766880_767003_767408_767485_769513_769566_770082_770228_776228
685717	contig_13206_pilon	+	1814	1	Intergenic	novelGene_161911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228449	230263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_228400_230300
685720	contig_18184_pilon	+	3382	3	Intergenic	novelGene_123894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	5	120	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	91	2421	692490	695489	FALSE	50	GAAGGAATACTCAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTFKDVAVVFTEEELELLDSDQRKLYRDVMLESFRNLVSAGQQPFKSGKISHLEQDKETWVTEREAPADAYPGDKHEKDMEYIQEKELKVLLHKELSYWKLWEQVTGELTGSQDHRGNLQGKDFQFLEDASRCQGWEGKSKGFQIENVVDSLQGNGPISVENQGFPAWKAVSPVPIQEPWALVNEPWNVQGSCKKVTTEDTLYKCDWDDYGFSWISHCRDDHYPPEGEKPYECDEYQTHCVDKAILYHQNSSENGFKSEEGANGFRDDSNPPTHPQIHLEEKPYKYQEEVRQSAYPDRHQSIPLGGVSSTSVECSQGSRQSVDPLKVYTGETPYKCDICGKQFRYKSVLLIHHGLHTGKKPYECEECGKTFGQSSNLLVHQRVHTGEKPYKCSRCGKDFNYSSVLQVHQSLHTGEKPYTCNECGEGFCANSALRKHQHVHLGEKLDSCGEYGKELARSSHLSSHQKTHTREKAYQCDECGKSFSYNSYLQAHQRIHTGQRIYECDVCGESFSYSAGFLMHQKLHTGEKPFKCECGKGFGRSWDLQVHQRVHTGEKPFTCLECGKGFWRISDLHSHKKVHTGERPYVCDVCGKGFIFSSDLLIHQRVHTGEKPYKCAECGKGFSYSSVLLIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFRCTSNLHKHQRVHTGKKPYTCDECGKGFSYSSNLRTHQRLHTGEKPYKCLECGKGFRFSSGLLSHERVHTGEKPYRCDTCGKSYSQVSHLYGHQRVHTGEKPYRCEECGKGFSQSSSLQVHQRVHTGERPYKCEECGKSYTQSSRLRNHQRVHFK	692399	696450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_692524_692764_692861_693288
685726	contig_12250_pilon	-	1265	8	Intergenic	novelGene_80657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	179.134426778168	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	79	1008	379717	375947	FALSE	30	AGGAATCAGTATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380600	375689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
685728	contig_12425_pilon	-	1632	5	Intergenic	novelGene_46654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGAAGCTTGCAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198553	178602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_179336_181624_181816_186764_186943_190680_190834_198176
685729	contig_9481_pilon	-	2397	2	Intergenic	novelGene_149653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAAAAAAAAAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157481	153779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_154294_155598
685732	contig_12270_pilon	-	269	2	Intergenic	novelGene_114130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCGGTTCAGTGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14439	13947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
685750	contig_16917_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_161921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26423	28978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_26400_29000
685751	contig_3861_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_57897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATTTCCAATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150510	148201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_148200_150500
685755	contig_19744_pilon	+	3076	1	Intergenic	novelGene_120378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAGAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149553	152629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_149600_152600
685759	contig_15039_pilon	-	1437	5	Intergenic	novelGene_110126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_3	517.286429359982	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	146	337	200602	197580	TRUE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRRGRRRRGRSELGFGGLTCPHSPAATGGGGQRVRRREPPPGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPALYQISHFYQNL	260906	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_200448_200620_260778
685760	contig_3382_pilon	-	3065	1	Intergenic	novelGene_124232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTGTTCTCTGGAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1971975	1968910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1968900_1972000
685763	contig_12098_pilon	-	2434	2	Intergenic	novelGene_160669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	415	903	117453	116965	FALSE	80	AGGAAAAGAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLLPTHLEQRRMKNTKDTRKILAQETKKGHINERLHQPETRKTRWCLATTNDHPDREHNRALLTEQVKSGVQNPNSSKKTRLDCLTETGGTPEDMAPRLSVNPELKSFPKPTLQTKTDWTIRHKMILVKSVLLSSSRVMRLNGQLLSGGEMRRQRGTGAG	117909	115433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_117613_117654
685764	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685766	contig_6589_pilon	+	1380	6	Intergenic	novelGene_26089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	61.2339774961581	231	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	215	466	1867977	1872172	TRUE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPGGANS	1866756	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872155_1872787_1874884
685775	contig_12270_pilon	-	328	2	Intergenic	novelGene_113178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	2	328	14434	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14121_14392
685778	contig_6497_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_35610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTCTTTGGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512395	511914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_511900_512400
685779	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_97229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685784	contig_10235_pilon	-	1951	10	Intergenic	novelGene_46270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	357.031277808168	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	172	1005	25335	19534	TRUE	20	AACAGTGTGCGTCTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27169	13959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15043_19105_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
685788	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685789	contig_14326_pilon	-	2797	1	Intergenic	novelGene_120709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2347	2691	302426	302082	NA	20	TTATGCCCAGCAGCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTEPGTQEVFFGQLWNELTLYIPPQEHLAGGCLLPILGGAPLWLIHHLLCEWRVTHSQLSKTDEKVSLNIQVDLGPYFEKHAKYKALFFNLFGVHWRYFEGMSPHCRICTNA	304772	301975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_302000_304800
685800	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
685801	contig_14322_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_115985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671621	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
685806	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
685811	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
685813	contig_9839_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_88602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTGCGTAGAGTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567152	568542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_567200_568500
685814	contig_5794_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_69740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430053	432486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_430100_432500
685815	contig_500_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_31101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	170	490	1523812	1523492	NA	60	AAGAAAATAAGGCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKQNPMVKPNKVGTGSVLGAGLGQLTLAQTPPWHCPKQKSSTHNFPGRLPSLSVLCSLTLLLSMPVLEFPDCAGRATNGQHLLRSVALPQRGCSPPAPRPSFPA	1523981	1521565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1521600_1524000
685822	contig_6589_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_25962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTCCTGGTTAACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296046	1296278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
685823	contig_1443_pilon	-	2266	17	Intergenic	novelGene_28252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	52.3581043750631	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	389	1462	560906	553931	FALSE	15	ATCCTTTGTCTGGGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYALTHPDTVEGLVLINIDPNAKGWMDWAAHKLTGLTSSAPEMILGHLFSQEELSGNSELVQKYRNIVVHAPNLENIELYWNSYNNRRDLNLERRGDITLRCPVLLVVGDQAPHEDAVVECNSKLDPTQTSFLKMADSGGQPQLTQPGKLTEAFKYFLQGMGYMASSCMTRLSRSRTTSLTSAASIDGNRSRSRTLSQSSESGTLPSGPPGHTMEVSC	563173	553126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554592_554842_554891_555155_555208_555499_555545_556763_556868_557043_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_561750_561837_562937
685824	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_95241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657164	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657165	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685827	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
685829	contig_500_pilon	+	1531	10	Intergenic	novelGene_30962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	496.208463759107	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	129	1241	1452302	1480676	FALSE	15	TACTGAATGTGTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446842	1480966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
685845	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
685848	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685852	contig_11328_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_88455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_5	279.863231903422	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	84	716	830591	839255	TRUE	40	TAATCTTGAATCAGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELD	829368	857557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_839250_839386_848758_849050_857174
685856	contig_6494_pilon	+	2380	2	Intergenic	novelGene_108537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1379	1717	2746	3553	FALSE	20	TTAGTTTACATCCCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQGLLRANLTTWVPRQHDLHFDAQHTLSEQHMSHSCVNVVVNRVPTVNHQAIHKFHGFSPLSSEFPRHHDLAALGSTLHDESQHTIAGPLKQRPIRVINKDRPYQPQRPH	1367	4216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_2826_3294
685859	contig_6102_pilon	+	2259	1	Intergenic	novelGene_32399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1006	1323	1792617	1792934	NA	50	AAAATAAATTATTGTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVQACIHMMKYGQSCTQRWGEESSAGWLLMDVGPKRTFGIMQGVGEDLYQGLTALFPQPTSSPTHLYFWAQEPRAGQSVEAWVKVFNCCCSSPKPHILSGAGTL	1791611	1793870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1791600_1793900
685864	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
685869	scaffold_16539_pilon	-	1983	11	Intergenic	novelGene_68392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_6	38.0047365469095	448	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	46	1302	800534	794915	FALSE	30	CATGTGACTTCTAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRIWQGHTAAGLVTMEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK	800579	794233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795469_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
685870	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	525	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685871	contig_12790_pilon	+	1955	9	Intergenic	novelGene_35210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	305.583228229234	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	216	1088	307252	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEGLCSWGLACSWSSQSGSRQVWMGRGTCSMSLGSSPPLSNLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305928	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310519_311898_311988_312384
685872	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685873	contig_19378_pilon	+	1730	3	Intergenic	novelGene_73785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCACTAACTGGGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16023	19150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_17040_18062_18337_18710
685877	contig_10235_pilon	-	1619	16	Intergenic	novelGene_46397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	80.8932355364499	6	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	796	1377	179858	177880	FALSE	10	TCTACTGGCTGGCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192457	177637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179882_182382_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_191199_191257_192265
685885	contig_14322_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_116451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	114	237	350	671606	671875	FALSE	40	CGGCAAACTCAAGGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVELL	671369	671877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
685887	contig_18869_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_56091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
685888	contig_4847_pilon	+	245	2	Intergenic	novelGene_156151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCAGTAAAGATGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79674	82291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82157
685891	contig_15886_pilon	+	2795	12	Intergenic	novelGene_144332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	109.225749998844	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	387	1577	39186	57173	FALSE	60	GAGGGAGGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEQVKVLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHHHIASVEKLALTTSGCPLVIQCKNFRIVHFIVPRERDCHDIYNSLLQLSKQAKYEDLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANREYKICETYPRELYVPQIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQNKEAAICRCSQPLAGFSARCLEDEHLLQAISKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSLQKLLEVSGTKGLSVSDFYSGVESSGWLRHIKAIMDAAIFLARAIMVENASVLVHCSDGWDRTSQVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGHLDGDPKEISPVFIQFLECVWHLTEQFPQAFEFNEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWPFLLNDQEKYLNPLYSSKSQRLTVLEPSTVSFNFKKLSSAKIRKQMASPPRNCYIQFILNHLVSKPPCVLRSSL	31593	58391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_31713_37261_37425_39081_39240_39413_39543_42099_42235_47133_47267_48006_48117_49435_49562_51964_52015_52461_52663_54529_54662_57052
685894	contig_12270_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_113448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	8	322	14385	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14392	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
685899	contig_7416_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_134321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGTATGGTAGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88774	86889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_86900_88800
685900	contig_6589_pilon	-	649	4	Intergenic	novelGene_25786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	192	647	672646	668316	FALSE	5	TCCCACTCTCCTGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFYFLEDSRGRGLRGAAEGPGAGNAGCSLPLPQVDVDDAAGQGKGEGHPGQGKAVAEAAPRRVMLQDLLGVDGIDQGSSEYCHAILADITAGPSFGAAVPCAVVPQIQGFLAGKSPPGLGVQSGHEKQDEDEDVKGRDHQQEDGHSCRGALAGGESGSGVPTSGTGTGETPESYWCRRLETWTPGSSSPLQSWNLCLLSFSLSLLLPRLSFSCPC	672837	668313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_668404_669547_669746_669995_670103_672583
685901	contig_2365_pilon	+	2213	17	Intergenic	novelGene_103734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	417.893223316375	13	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	182	2122	130213	261701	FALSE	10	TTTTTGCTTCAGATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEGMQPLMYSVQEALNARPWWIRVGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVSFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICQFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRVIITDYS	116753	261792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_248941_249030_254096_254242_256889_257044_258064_258246_260405_260536_261545
685910	contig_6163_pilon	+	1825	11	Intergenic	novelGene_103854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_6	49.4889886742495	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	476	1288	503044	507375	TRUE	35	GCAATTTAGAAGGCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRQKEQEKKRKLETNPGVEPSSGEAVKEEFEQGKAKNKAKSGKQNPKKLYCEELKKVIEASDVVLEVLDARDPLGCRCPQVEEAIVKGGQKRLVLVLNKSDLVPKENLESWLNYLEKELPTVVFRASTNWKDKGKLIKVKKKAAPFKSEVCFGKDGLMKLLRGFQETCGKAICVGVIGFPNVGKSSIINSLKQERTCSVGVSMGLTRNMQVVPLDKQITIIDSPSIIVSPLNSATALAMRSPASIEVVKPVEAASAILSQADARQVVLKFTVPEYKNPLEFFTSLAQRRGLHQKGGSPNVEGAAKLLWSEWTGATLGYYCQPPTSWTCSSHFNESVVADMKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADVSVFSTSCLKLK	500564	508007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_500653_500876_500961_501720_501854_502645_502759_502986_503105_503528_503617_504844_505020_506718_506862_506943_507081_507166_507666_507760
685911	contig_12886_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_135447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1262	1738	227280	226804	NA	25	CCCATAACTGTGACTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTTIKKEELGVEYTLWTRGLCPENFLDPGDRDRAVTPETVRSSHRETAAAEPGNQHETVQWASQPTEQGGCSGHADPWSERAEHLRAEGLLTEWDSSGYLSAELKSFVTLDQAGQRPGLRRLREEPVLRGPRGALHGQEELRELSCTEGRLCLHNS	228541	226236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_226200_228500
685914	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685915	contig_990_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_76026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725098	722872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_722900_725100
685921	contig_8658_pilon	-	1028	5	Intergenic	novelGene_55823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1474.34951758394	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	371	685	30055	6049	FALSE	25	ACTCTGAAGCAGTGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55623	5705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_30045_30246_34540_34626_55528
685923	contig_8045_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_35410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTAGAATTCTGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119415	118674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_118700_119400
685926	contig_8357_pilon	-	2403	19	Intergenic	novelGene_39746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	290.332738018695	2	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	506	1756	795947	762891	FALSE	35	CAAAAACTTTATCTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818269	762243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802217_806917_806995_808080_808163_808770_808821_818245
685932	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685934	contig_720_pilon	-	1841	6	Intergenic	novelGene_155162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	120.208152801713	29	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	428	832	164155	162408	FALSE	15	TGTCCTGCTGTGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVPNTSSCPQAYSELQTLSPSERQCVETVVNMGYSYECVLRAMKKKGDNIEQILDYLFAHGQLCEKGFDPLLVEEALEMHQCSEEKMMEFLQLMSKFKEMGFELKDIKEVLLLHNNDQDNALEDLMARAGAS	190646	161398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_162549_163166_163269_163993_164177_179283_179520_183857_183983_190601
685935	contig_3975_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_54947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATACAAAAAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2350243	2350797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2350200_2350800
685937	contig_8866_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_77844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGGAAGATTGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637082	639031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_637100_639000
685945	contig_12724_pilon	+	1983	10	Intergenic	novelGene_146851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	30.7563102026877	238	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	56	1129	104653	178229	FALSE	15	GTTAACTTTGTTCTGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTSGNNSATRPPPVRRTMPFLGQDWRSPGWSWIKTEDGWKRCESCSQELERENQYNINHNIILNSEDEEIFNNEECEYTSKKRKKDHFGNDTNTQCFYREKWIYVHKESTRERHGYCTLGEAFNRLDFSSAIQDIRRFNYVVKLLQLIAKSQLTSLSGVAQKNYFSILDKIVQKVLSDHQNPRLIKELLQDLSSTLRILIRGVGKSVLVGNINIWICRLETILTWQQQLQNLQMTKQVNNGLTLSDLPLHMLNNILYRFSDGWDIITLGQVTPTLYMLSEDRQLWKKLCQYHFAEKQFCRHLIISEKGHIEWKLMYFALQKYYPTKEQYGDTLHFCRHCSILFWKDSGHPCTATDPDSCFMPVSPQHFIDLFKF	97144	179083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_97193_104645_104784_131760_131865_133210_133261_135162_135256_152854_152949_153693_153879_159773_159957_164795_164940_178139
685946	contig_19647_pilon	-	1419	6	Intergenic	novelGene_144003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_4	288.959097451525	15	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	711	806	74086	73991	FALSE	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAGGKKGARKSKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQKLNLIHSEITNLAGFEVEAIINPTNADIDLKDDLGNTLEKKGGKEFVEAVLELRKKNGPLEVAGAAVSAGHGLPAKFVIHCNSPIWGADKCEELLEKTVKNCLALADDKKLKSIAFPSIGSGRNGFPKQTAAQLILKAISSYFVSTMASSIKTVYFVLFDSESIGIYVQEMAKLDAN	112662	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_94938_95039_102559_102668_112495
685954	contig_14341_pilon	+	822	5	Intergenic	novelGene_111833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	2137.68687779572	78	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	78	722	548758	551679	FALSE	5	GGCCCCGCCTACCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKVGRVGRVRVLRWGMGGGLWHPELTIYLLPGLI	547738	551779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481
685957	contig_4388_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_161976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATCGAAGAAAGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907081	905957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_906000_907100
685958	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_94891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
685959	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
685967	SIRV6	-	293	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCGAACTTTGACGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
685971	contig_4519_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_123652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTGAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30999	33390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_31000_33400
685974	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
685979	contig_15744_pilon	+	609	5	Intergenic	novelGene_83596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	50	298	149562	153280	FALSE	5	AGTTGTGTCTGTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGWMASMWSLGK	149512	153591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152558_153245
685980	contig_4364_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
685987	contig_11259_pilon	-	3093	12	Intergenic	novelGene_144542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	40.5548297355079	55	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	161	2524	233894	176080	FALSE	60	GGAAAAAGAAACTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLDSRFKNAPYFSCEKRNDLVPVCQKCETCILAWKIFSTKEWFRRISEVSQRRFLVSILKQLNSLYLLHYFQNILQTTQGKDFIYNRSRIHLNKKEGKIVKSSLNQMLDKTVEQKMKEILSWFGSSTHRTKANYTLLLLQMCDPKLLLTAADVVKVLFLRERSTVVGLNQNSTDVFFFPKKDFNPKSETSHVCWTARTRQTSFPLSKAPGKESLSENVGEGAPVTEGQWKSSLQCISEMNRLFSRKSGVPKAGGLPFDQLVDLGAVRDLSSGFSQYRDFIRHLPIHVSKYILSMLDKNTLNKCASVSQHWAALAHQVKMDLSMHTFIQSQVALLQLSIPVPKMADDGKRMRVKNQKWKLRTKTDYNLWTAYQNQETLSVQMEERNVYCGTYNIRILSDTWDRNRVIHYSGGDLVAVSSNRKIQLLDIIQVKEIPIEFRGHAGSIHALFLCEEEKFLLSGSYDLSIRYWDLKSGTCVRIFNGHQGTITCIDLYKNRLVSGARDCQVKVWDLDTGKCLKTFKHKDPILATRINDTYIVSSCERGTVKVWHFATAQLVKTLSGHEGAVKCLCFDEWHLLSGSADGLVMAWSMVGKYERCLMAFKHPKEVLHVSLIFLRVISACADGKIRIYNFLNGNCLKVMKANGRGDPVLSFFIQGNRMVINTESNIIMFQFENIKWQYSQDRVKQKKNKDKEEEKEDNSLADAVSKSSIQAHSLRDSASSKQIVGQEALSSKPHRSRVLLKAAMLSTGKRVKSQAISVVTSRVDDVCQDWFLCGIFWPMRGFLMI	234054	175510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_176468_179912_180072_206384_206528_207456_207606_213355_213478_221297_221499_223916_224027_226913_226995_228410_228539_228625_228827_229787_229965_233389
685988	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
685989	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
685990	contig_5918_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_99602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAGAAAGACCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2089317	2089965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2089300_2090000
686009	scaffold_8345_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_107024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGAAGAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600504	602700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_600500_602700
686016	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686019	contig_9267_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_162014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAAAGTGGTCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341286	343591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_341300_343600
686021	contig_6914_pilon	+	1986	11	Intergenic	novelGene_151735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	57.8827262661323	270	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	290	1438	126550	129956	FALSE	5	TGTGTGATCTGTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWTVHLEGGPRRVNHAAVAVGHRVYSFGGYCSGEDYETLRQIDVHIFNAVSLRWTKLPPVRPATRGQAPVVPYMRYGHSTVLIDDTVFLWGGRNDTEGACNVLYAFDVNTHKWSTPRVSGTVPGARDGHSACVLGKTMYIFGGYEQLADCFSNDIHKLDTNTMTWTLICTKGNPARWRDFHSATMLGSHMYVFGGRADRFGPFHSNNEIYCNRIRVFDTRTEAWLDCPPTPVLPEGRRSHSAFGYNGELYIFGGYNARLNRHFHDLWKFNPVSFTWKKIEPKGKGPCPRRRQCCCIVGDKIVLFGGTSPSPEEGLGDEFDLIDHSDLHILDFSPSLKTLCKLAVIQYNLDQSCLPHDIRWELNAMTTNSNISRPIVSSHG	124105	130504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_124336_126490_126704_126882_127060_127214_127331_127512_127585_127715_127930_128008_128096_128249_128359_128472_128547_128667_128747_129889
686022	contig_15500_pilon	-	3131	1	Intergenic	novelGene_128984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTTCCCCTAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218423	215292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_215300_218400
686027	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
686038	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
686039	contig_4876_pilon	-	2100	3	Intergenic	novelGene_137880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	123	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	161	670	93277	88481	FALSE	70	AGATGGAAAGAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEMWTPELAILRGFPTKAERQQWKQEGIVGSESGSFLQLLLEGSYESIFLNSVTQNILNAMTIAEEGIDSYLEKQIVTFLDYSTDLEKSERQQLIFLLGVSSLQLFVQSNWTGPPVDLHPQDFLPSVLFQQFSEVCFLNILYTYYSAIHSLCTNLYKLELIVSGKET	93437	87050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_88713_91581_91760_93177
686042	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	126	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686043	contig_6102_pilon	-	2272	8	Intergenic	novelGene_31998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	97.9014498235395	129	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	356	1309	455625	449540	FALSE	5	CTTTTGCTGTTCCTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYDVTRFQGDVDEDLICPICSGVLEEPVQAPHCEHAFCNACITQWFSQQQTCPVDRSVVTVAHLRPVPRIMRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKTSAEHKHQLAEQKRDIQLLKAYMRAIRSVNPNLQNLEETIEYNEILEWVNSLQPARVTRWGGMISTPDAVLQAVIKRSLVESGCPASIVNELIENAHERSWPQGLATLETRQMNRRYYENYVAKRIPGKQAVVVMACENQHMGDDMVQEPGLVMIFAHGVEEI	473460	448576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450747_450852_451251_451388_452090_452363_455535_455649_470683_470869_472780_472890_473422
686044	contig_16622_pilon	+	1662	9	Intergenic	novelGene_48416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGCAAGAGCTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108204	121950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_108469_110033_110147_110891_111029_112144_112699_112975_113041_113602_113741_115155_115294_115420_115436_121712
686051	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_97511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686052	contig_7151_pilon	-	1307	4	Intergenic	novelGene_40798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	1109.62526206924	86	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAATCTTGTCATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549680	529766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529924_530062_530179_535501_536494_549638
686057	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686071	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_18431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
686073	contig_2100_pilon	-	1508	12	Intergenic	novelGene_50753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1049.54634828105	2	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	664	1233	1174340	1170268	TRUE	25	TGTAGCCCATAAGAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185495	1169930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170145_1170206_1170338_1171934_1171988_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175647_1175855_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
686075	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
686077	contig_1406_pilon	-	1032	3	Intergenic	novelGene_25553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	362.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAACCCAAGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2141040	2136638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978
686080	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686086	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	464	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686090	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686092	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686100	contig_2377_pilon	+	1471	9	Intergenic	novelGene_67895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	471	junction_8	518.901348403528	2238	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	8	769	197521	224342	FALSE	15	CCATTGATGTACTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEAVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	197513	225044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
686102	contig_6410_pilon	+	2083	8	Intergenic	novelGene_108630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	122.460155952532	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	111	659	300693	313081	TRUE	40	TTACATGTATATCACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVPQMVTVGFTPTGSSRTVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299821	314637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306345_306397_306809_306947_310261_310369_312966_313498_313629
686103	contig_3320_pilon	+	3051	3	Intergenic	novelGene_133054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_1	5	92	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAGAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103711	116097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_103771_109909_109941_113136
686106	contig_19769_pilon	+	588	4	Intergenic	novelGene_102299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1783.8991625712	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	14	571	87249	89339	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRADRTTPGNQDCAGERELGLGTQ	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88033_89273
686109	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686110	contig_3132_pilon	-	2307	11	Intergenic	novelGene_127453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_9	18.8862383761299	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	166	1134	369684	361121	FALSE	35	CAATGAACTGTCTGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAWALPRESGDAQWLVNVGNLQHWEVLRASRAGSEFADKLILPLSLKSTVLCLSRMEADLSGFNIDAPRWDQCTFLGRVKHFFNITDPRTVLVPEQELDWAKMMVEKSRMGAVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNIIGRMSFQVPGGMIITGFMLQFYRTMPAVVFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNLLTKRAPPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIQGICVKDKNHSEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMAAPGMILLPVLMEQLEKLHFMKKVKVLHAPLQVMLSGCSLIFMVPVACGLFPQTCELPVSYLEPKLQDTVRAKYGELVPYVYFNKGL	369849	359947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_361221_362047_362096_363923_363974_364326_364377_365018_365086_365467_365529_366805_366892_367360_367437_367926_368026_369184_369356_369523
686111	contig_14441_pilon	+	1141	5	Intergenic	novelGene_100334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.164847644484	66	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1047	93	1139	6011	117792	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRAPGIAEKKEEQGPNLLGDGVVRGQLWRMLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTCATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLA	5918	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_113153_113209_116578_116963_117523
686116	contig_1172_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_162027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579232	576796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_576800_579200
686117	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686119	contig_5482_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_144500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	394	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593846	592239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_592200_593800
686120	contig_7286_pilon	-	736	6	Intergenic	novelGene_108681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5155.81971756189	24	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	20	304	293122	289354	TRUE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDPSSGDP	293141	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289377_291315_291497_292022_292101_293119
686127	SIRV4	+	219	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1552	632	1097	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
686136	contig_10013_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_125060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	182	559	278232	278609	NA	20	GCTCTGCCTGAAGGGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLLECLRQRVQAHLRGQGAGGRVCLQTWQINSKAETSCCGSIMDPKIQSVSQPSELLQGGVSSCPAHPPGAEQGRVAESAGQKLVLSRANRARSEVPGGAFPRRPQSRRCSGGLRVAHCSAFI	278050	279920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_278000_279900
686144	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
686152	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686153	contig_5210_pilon	+	1971	14	Intergenic	novelGene_65482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	382	711	1101259	1104674	TRUE	55	TGAAATACAAAGACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKDLMGESFMSRCARELCISLLQPASSIPSEETLKAPVSEDVVFISASADCCSDCSKTLRSRPSFWPFSLVLLSRCCCFPSATGHTLSLPEGPSPWSPLASWRQEST	1100877	1204115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_1101363_1101906_1101953_1103096_1103161_1104558_1104728_1107303_1107390_1141824_1141976_1147988_1148104_1152587_1152662_1154692_1154758_1161383_1161625_1161932_1162036_1162764_1162895_1173674_1173761_1203959
686157	contig_8122_pilon	+	1698	10	Intergenic	novelGene_40248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1030.13053230173	4	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	502	1023	742073	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720456	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720656_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732398_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
686158	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686161	contig_8138_pilon	+	2093	4	Intergenic	novelGene_52423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	506.288455329568	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGTGGTGGTGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280076	307942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280357_288507_288616_304973_305101_306364
686163	contig_7362_pilon	+	2412	6	Intergenic	novelGene_147549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	36.9356196644919	240	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	117	1115	373689	424882	FALSE	20	GTTCTGGCTGGTATAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVFLVTLYEYSPLFYIAVVFTCFVVTTGLVLGWFGWDVPVILRNSEETQFSTRVFKKQMKQVKNPFGLEITNPSSASITTGITLTTDCLEDSLLTCYWGCSVQKLYEALQKHVSCFRISTPQALEDALYSEYLYQEQYFIKKDSKEEIYCQLPSDTKIEDFGTVPRSRYPLIALLTLADEDDREIYDIISMVSVIHIPDKTYKLSCRILYQYLLLAQGQFHDLKQLFMSANNNSTPSSSTSPEEKSTDRSLLEKAGLSESEVESPEETSKDCVVCQNGPVNWVLLPCRHTCLCDGCVRYFQQCPMCRQFVQESFALCSQKEQEKDKLKTP	373572	426179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_373793_401898_402039_410771_410950_411106_411255_424030_424139_424561
686164	contig_14441_pilon	+	1208	6	Intergenic	novelGene_100469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	386.865351252862	110	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	593	1021	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	85415	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85489_85573_85862_114078_114161_116578_116963_117220_117344_117539
686165	contig_14785_pilon	+	2560	1	Intergenic	novelGene_158415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCATGTTCCCTGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120982	123542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_+_121000_123500
686168	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2874	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686169	contig_5200_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_140174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACCATTTTATGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483101	482020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_482000_483100
686174	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686175	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
686177	contig_4555_pilon	-	2407	3	Intergenic	novelGene_149882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	79.5	131	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	53	388	45599	41195	FALSE	25	TGAGTTTTATCAAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSIISLSKNHFNSPEKEMKLALTRLYLDKATLIWNGNVVTGLDALANFFEMLPSSEFQVNMLDCQPVHEQATPSQTTVLVVTSGIVKFDGNKQHYFNQNFLLSAHSTLNNTVWKIASDCFRFQDWASS	45651	39175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4555_pilon_-_41377_42439_42585_45590
686183	contig_17427_pilon	+	1847	9	Intergenic	novelGene_30293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	202.243317256714	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	199	951	151357	175576	FALSE	40	AAAGTTCGCTCAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147951	176472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148054_151260_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
686185	contig_8122_pilon	+	3177	2	Intergenic	novelGene_40229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_1	0	70	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	176	769	577009	578321	FALSE	25	ATTTCAGAATTGTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGSYKNRHSSGDPSAEGPSSGGSISKLSSEMQLQVQSQQEELERLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCDGVPKDTLELLHQKDDQILGLTSQLEKFNLEKENLQQEVRKLKSKVGEVNEQLGMLMETIQAKDEVIIKLSRQLSECEGNPSSPAALPGSPSTTLASRDQLELDRLNVRAKVGCRLLG	576833	580729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_577171_577889
686189	contig_10453_pilon	-	2301	9	Intergenic	novelGene_162040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	15.2801955157648	127	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	348	1286	240719	222789	FALSE	25	CAATGTTTTTGTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWANLKLWFKQKISKEEFDLEAHRLLTQDNVHSHNDFLLAILTRCQILVSTPEGAGSLPWTGGSAAKPGKPKGKKKLSSVRQKFDHRFQPQNPLSGAQQFVAKDPQDDDDLKLCSHTMMLPTRGQLEGRMIVTAYEHGLDNVTEEAVSAVVYAVENHLKDILTSVVSRRKAYRLRDGHFKYAFGSNVTPQPYLKNSVIAYNNLIESPPAFSGPCAGQNPASHLPPDDAEQQAALLLACSGDTLPASLPPVNMYDLFEALQVHREVIPTHTVYALNIERIIMKLWHPNHEELQQDKIHRQRLAAKEGLLLC	242119	221773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_-_222942_223372_223536_228922_229075_230734_230945_232346_232445_236247_236314_236568_236661_240714_240776_241828
686192	contig_6710_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_97388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
686193	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_89080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686195	contig_16578_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_148637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134268	136470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_134300_136500
686204	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686206	contig_11493_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_143721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTACCACCAGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317603	316596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_316600_317600
686207	contig_7840_pilon	-	2898	9	Intergenic	novelGene_68956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2240	2605	298021	238082	TRUE	15	CCACCCCGTTTCATACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSFTLVLDSHETMTDPAPSGAITTDVREGSIKVPIWGTERNFFYCLVNYEVLVFSSTTLSPSADTHRTALTAFFPVAFNLFTASSQMCIPLDSSTSTWPRYLTGKLHFPVRTPSSSVCH	302868	130617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_130707_183030_183150_237996_238138_263073_263151_292102_292173_295137_295281_298001_298207_299238_299530_301105
686211	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	46	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686215	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
686217	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686218	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686226	contig_13863_pilon	+	1683	11	Intergenic	novelGene_42015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	651.131446022998	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	63	1112	98341	118962	TRUE	30	AAAATTTTTTTCTAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLIFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98278	120140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99352_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
686230	contig_4486_pilon	+	2308	6	Intergenic	novelGene_38637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	248.485492534273	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	203	580	1016066	1028013	FALSE	40	CCCCAGCAGCAGACAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPG	1014094	1029741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876
686232	contig_12427_pilon	+	1934	15	Intergenic	novelGene_40493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	239.541963006101	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	205	1692	399297	419950	FALSE	15	GCCTGCAGGGGGAGGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPHPHQDPLSHKPDIWPASRQPQWPWTEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397736	420192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_407751_407796_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
686235	contig_10948_pilon	+	1902	8	Intergenic	novelGene_124974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	41	junction_7	22.6147865660627	163	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	151	1344	137961	156359	FALSE	40	TGAGTAATAAGATTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVTVAGLPARLTLSVLTGAGRFSILGSGVATRKDLPEVLRRGFSDSRPQPLPCPDIRESSSCVSKCRLDYKRYVISRRLAETLAQILQGKRKTPQLVLECNPGPGILTQALLETGARVIALESDKTFIPHLESLGKNLDGQLDVVHCDFFKLDPRNGSLVKPPIMISQMLFQNLGIRAVPWSAGIPLKVIGIFPIKSEKKALWKLIYDLYSCTSVYRYGRVELNMFISEKEYQKLKARPKNPNLYQALSVLWQVACDIKLLHMEPWSSFDLHTQNGQLEKTKRRELSELIQQNLCFIRMTPRRNLFTENLTPINYDVFFHMLKQCFGKRNAKLVDHLHSLSPVDAKDILTLIRKHENVKITNICPEDFKLLFETIECSKDYNCKWLCDDIMEDRIM	137810	156917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_138271_139024_139114_146844_146999_147337_147487_148692_148783_151275_151339_154420_154582_156181
686236	contig_13992_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_147662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1932	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	748	1170	703315	703737	NA	45	TAACTGAATTATTAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNRELSGYFLKIGIQGGQSRQEHDSGPVIGDVKFDSTFRQNLPDFSVYKDRIFVYIYNKTLGFLVCFKIVVKTYPKIFTSTASTLNISVTLIAFFMFCHHYLCPFPKHSITININSRKTLVLIGKMFWAGNRFKLSNL	702567	705149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_702600_705100
686238	contig_3975_pilon	-	1116	12	Intergenic	novelGene_54880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	170.043212786856	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	396	1049	2096423	2091957	FALSE	25	ATACATGGTTTCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099571	2091889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097311_2097367_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364_2099458_2099552
686241	contig_7202_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_17999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGCAGGTAATGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
686250	contig_10135_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_106654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGTGTCGTAGACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116661	117859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116700_117900
686251	contig_3975_pilon	-	1167	10	Intergenic	novelGene_54882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_9	124.175503041282	92	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	540	1100	2096243	2091957	FALSE	25	ATACATGGTTTCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099590	2091889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096498_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364_2099458_2099552
686267	contig_5280_pilon	+	1790	2	Intergenic	novelGene_52633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1383	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATTTATTTATGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61258	79026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_62065_78042
686268	SIRV7	-	245	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91679	2	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
686270	contig_7146_pilon	-	2975	1	Intergenic	novelGene_162053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1590	1967	149135	148758	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNSVTNKLLIKMIYLIDCNSPETLTSLLSYQRQQKGGRIVKPYNEALVCMSPLLVILFSKDRICSLIHTKSEFRYSYEIFNSSSHIIKQNYLSNVYHIPRIQRIFKPMKYIPFHNHLFCHSIEL	150724	147749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_147700_150700
686273	contig_16503_pilon	+	1849	10	Intergenic	novelGene_162060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_2	91.0653001361599	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	190	987	123420	146861	FALSE	30	ACAACTCAGCCTGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPVYEEGCMEKVQAWLQENMGVILGVCVGVAVIELLGILLSICLCRHIHSEDYSKVPKY	92051	147723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_115699_115775_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145653_146335_146420_146783
686276	contig_19013_pilon	+	1191	4	Intergenic	novelGene_162084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	19.6015872373189	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1113	77	1189	37798	59575	FALSE	20	GGAGAGGCACTTGTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDQEFTQLCKLPPQPSHPHCINNTYRSTQHSQALLRGLLALRDSGILFDVVLVVEGKHIEAHRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSELELSLNNVQETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFELSRLTEQLDTYILKNFVAFSRTDKYRQLPLEKVYSLLSSNRLEVSCETEVYEGALLYHYTPEQVQADQISLHELPKLLETVRFPLMELEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALLYHRNESLQPSLQGPQTELRSDIQCVVGFGGIHSTPSTVLSDQAKYLNPLLGEWKHFTASLAPRMSNQGIAVLNNFVYLIGGDNNVQGFRAESRCWR	31251	59577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_31289_37758_38025_53913_54080_58855
686279	contig_11370_pilon	+	864	2	Intergenic	novelGene_98744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6306	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146957	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_147574_148300
686284	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTGGCTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
686297	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_113871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
686300	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_96508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686305	contig_7870_pilon	-	1145	8	Intergenic	novelGene_108887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	20	TTTACCTATATGTGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
686319	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686324	contig_6888_pilon	+	2252	8	Intergenic	novelGene_147064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	60.6273326923406	167	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	168	1040	60145	72602	FALSE	55	TAAAACTATCAATTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRPYQFYYFVPLVTVWFMVIYVTLALWPQIIQKKANGNCFWHFGLLLKLAFLLFCICFLAYSQGAFEKIFSLWPLSKCFELKGNVYEWWFRWRLDRYVVFHGMLFAFIYLTLQRRQVLSEGKGEPLFSNKVSNFLLFISVVSFLTYSIWASSCKNKAECNELHPSVSVVQILAFILIRNIPGYARSVYSSFFAWFGKISLELFICQYHIWLAADTRGILVLIPGNPMLNIIVSTFIFVCVAHEISQITNNLAQIIIPKDNLSLLKRLACIAAFFCGLLILSSVQDKSRH	59653	73814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_59776_60099_60257_61662_61743_63995_64098_65627_65769_66328_66407_70369_70463_72335
686326	contig_12970_pilon	+	2690	1	Intergenic	novelGene_50506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAATAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22531	25221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_22500_25200
686332	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_96010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
686333	contig_4857_pilon	+	1621	4	Intergenic	novelGene_48820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	59.3352059629582	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTTAATTGAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331354	1339926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335236_1335517_1336704_1336828_1338905
686337	SIRV7	-	948	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12657	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680_114989_147608
686339	contig_9516_pilon	-	1382	9	Intergenic	novelGene_106172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	99.7882132318241	714	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	367	1191	884684	877957	FALSE	25	TTAAAATCTGTTCTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTGIRSESETESEASEITIPQSSAAVPQVPVEGEDYGKGVIFYLRDKVVVGIVLWNIFNRMPIARKIIKDGEQHEDLNEVAKLFNIHED	889997	877765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878565_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790
686343	contig_12125_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_76232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATACTTACCATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385368	386666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_385400_386700
686345	contig_3604_pilon	+	2435	4	Intergenic	novelGene_139991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_3	786.041700901139	50	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1431	1802	49018	49389	FALSE	75	CCCAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLCAPVLLGPVFQNIFSYSSKCPEAPHSASRPSPEGTQLSLWVSEPSSAKCLEAPHSASKPPAQRRSLGTPTLASLLCGLGSPPCHLVLVSWFCCSRFSATASRCLVCCLWCDSSLSSGLGR	45379	50022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47925_48032
686347	contig_5799_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_50274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGCAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277532	278196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_277500_278200
686350	contig_8284_pilon	+	1266	11	Intergenic	novelGene_125694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	493.762331491579	5302	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	507	992	441556	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425048	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_440634_440753_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
686351	contig_6440_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_161655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTTTCACATTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19478	17631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_17600_19500
686353	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_95073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686361	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686366	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686379	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_89515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686384	contig_14029_pilon	+	1665	3	Intergenic	novelGene_151945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	135	177	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	6	341	131703	133382	TRUE	15	TATTTTGTTTGGATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLRYRIYLNIHLFSNSTFMIPISVFKMHTN	131697	135633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_134319_135245
686385	contig_10300_pilon	+	1145	5	Intergenic	novelGene_152920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	16.8133131773604	155	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	180	566	56973	177331	FALSE	65	GTTTAAAAAAAAAAACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQRLLEILDTEKELLKEKIKEALIEQSQEQKEILEKCLEEERQRNKEALVSAAKLEKEAMQDAVLKAIEEERKNLEKAHAEERELWKTEHAKDQEKVSQEIQKAIQEQRKVSQETVKAAIIEEQKRSEKAVEEAVKRTRDELIEYVKEQKRLDQVIRQRSLSSLELFLSCAQKQLSALIATEPVDIE	33503	177910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_33599_33693_33763_56957_57135_112044_112159_177220
686387	contig_9272_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_125959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACACAAAGGGGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488543	490211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_488500_490200
686390	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686393	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686396	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_95046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686397	contig_8020_pilon	+	2906	11	Intergenic	novelGene_114393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	817	1296	147966	149853	TRUE	15	TGAGGGTTGTGCACTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGKVATTVSPGAMWREDFESDHLDDNLSVQCVGVTIGFWSGTRSCLWCRRGRTERQELPSCSSGNSSSKGLCHLFSSPYLFHLSEDPQQIFTKDTLKFPLTPATSQKLLYQHRVCGHILQPLRELAGPVVITTNPDELGSNDCPDVVEVVCHSGHVG	147149	153710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_148204_148296_148436_149106_149185_149828_149993_150258_150433_150547_150621_150904_151044_151127_151262_151582_151708_152036_152320_153167
686398	contig_9258_pilon	+	1131	2	Intergenic	novelGene_104603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12580	junction_1	0	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	589	981	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96649	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_97376_99327
686399	contig_20241_pilon	+	2126	8	Intergenic	novelGene_159736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.8461497791618	130	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	182	829	216469	221924	FALSE	25	TCAAATTAATGTTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTDKHTSYPCSFKDCTEKELVPVICPYCEKNFCLRHRHQSDHECGKLEISKPRMAATQRLGKDVIGSKTGETVSKRRKGAKNTETAAKVALMKLKMHADGDKSLPQTERIYFQVFLPKGSKEKSKPMFFCHRWSIGKVIDFAASLASLKNDNNKSTAKKLRLCHITSGQALPLDNILGTWMAKEDCPLHNGGNIILEYLNDEELFLKNVDSYLE	213400	223221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_213478_213581_213625_216096_216137_216447_216576_216655_216748_217495_217618_221499_221656_221753
686402	contig_10235_pilon	+	704	5	Intergenic	novelGene_46273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAGCTTCGTCTCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13961	17585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_14156_14479_14638_14779_14931_15027_15138_17494
686403	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	414	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686412	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_96663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686416	contig_10263_pilon	-	2956	1	Intergenic	novelGene_135831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAAAGGGAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861776	858820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_858800_861800
686417	contig_9505_pilon	+	1320	12	Intergenic	novelGene_121844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	211.374642919678	1183	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	51	719	530637	597995	TRUE	10	GCAACGCCTCTGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSASSAKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530586	632885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
686418	contig_8357_pilon	-	1786	12	Intergenic	novelGene_39701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	76.725441598141	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	213	1556	325435	312261	FALSE	15	GGCTTAGTACTCTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSLADYCGTILAFLCVDPALIRETQEKRFKDPGLVDQLVKADSEWRRCRFRADNLNKLKNLCSKTIGEKMKKKEPVGDDESISENMLNLDDLTADTLTSLKVSQIKKVRLLIDEAILKCDAERIKLEGERFENLREIGNLLHPSVPISNDEDADNKVERIWGDCTVRKKYSHVDLVVMVDGFEGEKGAVVAGSRGYFLKGVLVFLEQALIQYALRTLGSRGYTPIYTPFFMRKEVMQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333196	312030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318125_318967_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332989_333083_333142
686429	contig_20844_pilon	-	1011	10	Intergenic	novelGene_78611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	375.202990327392	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	325	906	206899	204834	FALSE	15	TCATCCTCCACGTGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCVDKILQCRRETLIRSPAGPTRWKRRERTVTPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209163	204728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208930_208982_209120
686430	contig_16686_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_162097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAAGAAGCCAGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162711	162218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_162200_162700
686431	contig_6589_pilon	-	1017	7	Intergenic	novelGene_25907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	224.044948367262	720	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	246	869	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFDPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178553	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1177927_1178132_1178424
686432	contig_987_pilon	+	1969	2	Intergenic	novelGene_72344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_1	0	62	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	257	1144	1286769	1290097	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTGRTLLSPGWDSFPPASPLCLIQGREKRASSRAPQGS	1286512	1290922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1287010_1289450
686435	contig_14205_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_162115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACAGTCATCACAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23325	24051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14205_pilon_+_23300_24100
686441	contig_15327_pilon	-	2029	18	Intergenic	novelGene_70794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.625714040509	1	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	50	1975	1204638	1185925	FALSE	10	CCACTGTTACCTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLQRLQENVEKTLSCLDHVISYYHVASDTERIIREGPTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNSPDSPELNKVKLLFERGKESLESEFRSLMTRHSKVVSPVLILDLISGEDELEVQEEVPLEHLPEGVLQDVIRISRWLVEYGRNQDFMNVYYQIRSSQLDRSIKGLKEHFRKSSSSSGVPYSPAIPNKRKDTPTKKPAKRPGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204687	1185870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186275_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190125_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192732_1197067_1197236_1199990_1200214_1202992_1203099_1203288_1203474_1204300_1204367_1204578
686446	contig_16541_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_126730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGATTCTAATGAATTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292443	292185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_292200_292400
686453	contig_15327_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_70486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACAGAGCTGGAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384347	385051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_384300_385100
686463	contig_6735_pilon	-	2070	11	Intergenic	novelGene_15821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	49.1165959732553	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1935	134	2068	633176	603642	FALSE	60	AGAAACCTATGAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQLAKNSTEMEEFVRVKQQLKEKEELISTLQTQLSQTQAEQAAQNLRVLQRKLEEREEALSGRAQVVDLLQQELNAAEQRNQVLLQQLQQMEAEQNTLRNTLETERQDSKILMEKMELEVAERKLSFHNLQEEMNHLLEQLEQADQAQAELESQYRSLEQKHKAEMEEKTLHILSLQKTEQELQSSCDTLKDQNSKLLQEKREQSVQSAQAIQQLEDQLHEKSKEISQFLTKSTLQKHETASQTSFPDVSHEGVQVIQRQLLMNLAVTEEKIASLQQRVVELENEKGALLLSSMELEVLKAENEKLSSQITLLEAQSRAGKADKEDSQISMVDNTRLNKSNSSTEESGQDVLENTFSQKHRELSVLLLEMKEAQEEIAFLKMQLQGKKTEGDPEDLGQKEVKQMESEGIPPVEMKVLLEDTGQDFPLMSDEESSLPAVKKEEQASNKHQNTTSEEMPFNDTKMELKSTKQDAIDKSPAVIPDISQCQQDELKRLKSQISELEISFHKA	645398	603639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_604182_605595_605670_608598_608714_614988_615135_616300_616704_618882_618997_622573_622700_629168_629301_632682_632836_633044_633198_645286
686465	contig_10986_pilon	+	1929	12	Intergenic	novelGene_71457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGCCCCGCAGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66382	80425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_67028_67210_67339_67428_67543_70645_70760_71487_71629_72178_72309_73921_74008_74225_74357_74984_75047_75474_75542_76169_76243_80187
686467	contig_8452_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_48061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATTCAGGGCACCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483971	481931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_481900_484000
686468	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686474	contig_5047_pilon	+	2983	1	Intergenic	novelGene_157980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2231	2593	845440	845802	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKSVQLLTERLVVQTHQLLRRRKPLAICSCKDSSLKTPGGQFYSVTHGVAMGQNPLDSIQQRQQGAGGRSGLPHGSSPGAALQPQHHAQDLQPSRNNLQASLFLLASPPVSPRAQLTNL	843209	846192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_843200_846200
686478	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686480	contig_7333_pilon	+	2230	12	Intergenic	novelGene_142770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_11	87.6068415004556	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	282	1391	185614	217222	FALSE	25	AACCAATATGGCCCTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLARKPLLSSRLRLSLFNTCSRQISDIHLSRFHDRGRAVDLEKFCSETIDIIQPALVLATGDLTDAKTKDKLGSRQHEVEWQTYQGILKKTRVMEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRVLAFSSSSITSVAVKIDGVHLGEAVHLSGPIFILKWNPRNYSNGTHNIEVIVQDSAGRRKTVHHVFSVEEDLHLTFDPLASFILLTDHYIMARVLFVLIVLIQLTILIIFRYRGHPKLKGPPGFVNLTSFSLHVLSKINIFYYSVLLLTLYTVLAGVF	184207	218061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_202680_202841_203505_203620_206388_206474_212390_212496_217208
686485	contig_11115_pilon	+	1899	9	Intergenic	novelGene_102796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	168.215449647171	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	416	1174	155012	157736	FALSE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANSLSTAADKWGFGATLLEICFDGEAPLQGRGPSEKERFYQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	152927	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_153034_153729_153881_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156152_156388_156507_157401_157513_157601
686491	SIRV2	+	660	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
686494	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91669	0	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
686499	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686502	contig_4392_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_117350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	896	1273	684339	684716	NA	65	GATGAGAAATAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSIWLGHDSQYCVVVLHFVIVILHSRGLGWDCNTLTKVTSLIQCKGGFRGVWPAPAFILQEMKGKKAKSWGPHTTKKAVPGAEHVLWTWGPCAEKLLVQGKIDEKADRDRKPSSGADALNLDF	683443	685593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_683400_685600
686503	contig_3818_pilon	+	2086	9	Intergenic	novelGene_99247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_8	376.660137756838	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	288	1721	451314	455535	FALSE	20	AGGAAACCGTTTTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFYRVASSILLVAVRVTLGPSSIDCSWFSVPTHHDHLLPSALRCLPPRPQDFFKKFLYEPLPVESHLDHCTHDHFNAETVTKTVENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	451026	455900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
686518	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
686520	contig_8617_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_73415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62544	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
686523	contig_6227_pilon	-	3531	2	Intergenic	novelGene_49824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383186	1379361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1380549_1380842
686525	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
686527	contig_10629_pilon	-	3025	17	Intergenic	novelGene_52938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	310.493401449612	31	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	48	1631	383003	363534	TRUE	25	GGAAAGTTTCAATTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCR	383050	358048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_359122_359288_359400_360253_360328_360849_360986_363533_363644_364297_364492_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372183_372258_372880_373047_374990_375096_377674_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
686534	SIRV5	+	390	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTAGAGGTCGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1143_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
686538	contig_5467_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_111963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAAAGCGTGGCTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123114	120404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_120400_123100
686551	contig_12046_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_83450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTTAAAAAAACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115919	113241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_113200_115900
686555	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686558	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_97894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686559	contig_7534_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_162123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81499	81006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_-_81000_81500
686565	contig_3942_pilon	-	2239	3	Intergenic	novelGene_128848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_2	23.5	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1447	2127	1384496	1383816	FALSE	40	AAGAATCCAGTACCCGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVQVWARDTELEQGFQPGMRGLSSQQLCGPLLRRRAPPTSLPHRVSQSWSQALCRPQTAGQPYTLSGCPEGTPAGIGNQAMQPHPVPSTPSTQGGQSGSLTGLLTGISAHLCCEAATSSIRLCQECGDFLSLCSSLGAWPCLSLAGTLSLHHLGLPQEPLACLPPKPCPLPSPTRTEPLEGAPGPCIPWPGPATWLLSPASAQSRCSSCSSAYLLSLSLLIRCLC	1386316	1383703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1385122_1385238_1385367_1385623
686570	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686571	contig_6871_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_21649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	1760	2071	733367	733056	NA	25	TCTGAATCCTACACATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYCGSLHVVLPASILSHLQFILSTTTRSLFLSYSDHIVARSKFFNVFQCLQDNVQTQKQEIKKPFMIWHQPIIVMLISASSKYSVLLLTLFSLPKKSYHNIAT	735126	733053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_733100_735100
686573	contig_4180_pilon	+	2087	12	Intergenic	novelGene_8305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	187.148679127515	1	79	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	591	1547	811036	821915	FALSE	75	AAAAAAAAGAAAGAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPEQNLNRNNNILLPSQQFCNQVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733220	822455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_791893_791965_802493_802660_810963_811043_811147_811213_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
686576	contig_12270_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_113179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14435	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
686581	contig_1639_pilon	+	2187	13	Intergenic	novelGene_74887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	221.898187364286	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	996	1943	289050	309304	FALSE	15	GGTATATTTATGGGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSQ	280057	309548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_286379_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145
686587	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
686596	contig_7870_pilon	-	802	6	Intergenic	novelGene_108945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_1	354.065304710868	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	240	734	496465	295191	FALSE	5	TCGTTTTAGTGTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAISKYLTYRSSWWNDLALWNY	497931	295122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
686598	contig_5782_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_162139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGTGGCAATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147710	1147151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_1147200_1147700
686603	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_92160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	101	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686608	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686609	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
686610	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686611	contig_7619_pilon	-	2409	3	Intergenic	novelGene_162152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_2	44	422	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	246	428	30763	30104	FALSE	20	GGTGCCAGAGGACAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INGGVLVASRCCASLWAQPGFGLCTSPVPVVLFALFPRAGIDEGSPLFRLRLPLAFPAARVSDDSQVTLKSASCFLNTSLKMEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKVTLHTLFRRF	32343	28122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_30232_30708_30809_32143
686612	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_90564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686614	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
686615	contig_13460_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_162189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAACAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284527	286883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_284500_286900
686617	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
686618	contig_6217_pilon	-	2306	3	Intergenic	novelGene_109656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.5	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	95	910	739958	739095	FALSE	45	ATATAAACGTATATATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKAREAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797209	737698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739623_739670_739964_797120
686625	contig_15383_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_162203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCTGATGTCCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105020	104415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_-_104400_105000
686633	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686636	SIRV4	+	650	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1753	0	1298	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2753	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2800_3400
686639	contig_9345_pilon	-	1681	9	Intergenic	novelGene_24462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_8	21.7654399220415	345	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	67	972	547180	516935	FALSE	10	GCAGTGTGTGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERGGLETGYGLADLTDQGGGIMADRPKPISPIKNLLAGGFGGMCLVFVGHPLDTVKVRLQTQPSSPPVQPPMYSGTFDCFRKTLIREGITGLYRGMAAPIIGVTPMFAVCFFGYGLGKRLQQKSPEDVLSYPQLFAAGMLSGVFTTVIMTPGERIKCLLQIQASSGETKYTGTFDCAKKLYKESGIRGIYKGTVLTLMRDVPASGMYFMTYEWLKNIFTPEGKSVNELSVPRILVAGGFAGIFNWAVAIPPDVLKSRFQTAPPGKYPNGFKDVLRELIRNEGVASLYTGFTAVMIRAFPANAACFLGFEVAMKFLNWITPNL	547246	516225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_516998_517339_517465_517924_518035_518400_518474_519266_519385_529031_529123_531970_532099_535632_535726_547075
686640	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91671	2	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
686643	contig_10135_pilon	+	467	5	Intergenic	novelGene_106652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1047.8066376961	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	57	314	116715	119864	FALSE	20	ATGGAACCTCCTGCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116658	120017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801
686646	contig_11594_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_80935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATTGTTTAACTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550166	551270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_550200_551300
686648	contig_10354_pilon	+	1571	2	Intergenic	novelGene_50872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472003	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_472134_475056
686650	contig_9146_pilon	-	902	5	Intergenic	novelGene_79488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2044.50316397407	7	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	353	859	146356	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	146963	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146463_146717
686651	contig_9363_pilon	-	1258	8	Intergenic	novelGene_6835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	748	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	625	978	1624964	1623645	TRUE	30	GCGAGCTATGGGGACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHQHPSQVQEIAVMWVLHLHGTPGVAASPHRPGLTIPHYLARTHNCEGDAFLHLCILPLKVFILIRITVRELVDVDLLLLQLVPDLLLEGLGFLRHQGICFANDWDDVDLLMHSP	1625969	1622990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1623107_1623396_1623539_1623622_1623736_1624340_1624443_1624571_1624673_1624904_1625060_1625337_1625433_1625535
686654	contig_11498_pilon	+	2681	9	Intergenic	novelGene_65541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	31.4759332665451	187	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1324	1737	334400	341504	FALSE	10	CACCCTGCACTGCCTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKETFKYFLRGYRYVILDIPLLFETKKLLKYMRHTVVVYCDRDTQLKRLMQRNKLNRQDAEARISAQLPLKDKARMARHVLDNSGEWSITKRQVVLLHAELEHSLEYLPLRLGVLTGLAGIASLLYLLTRYLLPAP	312587	342448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_313017_313099_313275_314177_314289_320988_321093_321164_321283_333209_333426_334229_334434_337797_337886_341212
686658	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686661	contig_8254_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_48380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCTTAATAACTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69214	68880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_68900_69200
686664	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686665	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_18747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGCCGCCGTCAACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30085	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
686667	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_95015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686679	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
686680	contig_18637_pilon	+	2209	8	Intergenic	novelGene_81844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	86.0991360263841	723	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	27	1010	141663	177073	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWLAVFTAMAAAGLSAWLALQPGARTLRAFSTAVSPATRTPRPRLRATENIKTPRSERLIRRKTLPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDFCTEWPAALDSDEKCEKHFPIEVDTADYVLAGPSIRNPKARVVTLRVKLSSLNLDDHAKKKLIKLVGERYCKTTDVLTIKTDRCPLKRQNYDYAVYLLTVLYHESWKTEEWEKNKTEADMEEYVWKNSSSEKNILETLRKIKAAEKNMEVNKEEFLGTKEVEDYKKSVVSLKNEGENENTISQYKESVKRLLNLA	141636	178272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141775_147071_147125_148222_148391_149544_149606_153201_153342_160263_160374_161804_161875_176803
686689	contig_5643_pilon	+	2021	16	Intergenic	novelGene_39065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	880.988661801173	1	88	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1423	1809	640257	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631222	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632010_634788_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635719_636200_636255_636430_636581_637793_637901_638045_638190_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
686694	contig_3825_pilon	-	1160	6	Intergenic	novelGene_78003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	954.565115641673	135	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	36	872	1470962	1462075	FALSE	10	TTTCTTGTATGCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470997	1461786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1469010_1469125_1470880
686698	contig_9535_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_124474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268959	270236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_269000_270200
686699	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686700	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
686702	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
686705	contig_15123_pilon	-	1608	9	Intergenic	novelGene_110910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	199.456135528592	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	405	1289	221237	217521	FALSE	15	TAGTGCTGAGCTGCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKAKH	223109	217201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_217920_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219374_220063_220293_221228_221412_222769_222911_223020
686708	contig_6710_pilon	+	1667	10	Intergenic	novelGene_89046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.515844004431	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	76	864	568310	602644	FALSE	10	TTTTGACTCTTTGTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSFGGSSSTSTSGGSASRVFPAPSTMSKAEEAKKLAGRAAVENHVRVSSSRIAAWGWPRIFQHSSAHRVCENNQVLGIGSGSTIVHAVQRIAERVKQENLKLICIPTSFQARQLILQYGLTLSDLDRHPEIDLAIDGADEVDADLNLIKGGGGCLTQEKIVAGYASRFIVIADFRKDSKNLGDQWHKGIPIEVIPMAYVPVSRAVTQKFGGVVELRMAVNKAGPVVTDNGNFILDWKFDQVHKWSEVNTAIKMIPGVVDTGLFINMAERVYFGMQDGSVSMREKPFC	568234	603447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_568388_573919_573980_574267_574329_575648_575705_584580_584641_587685_587751_594844_594914_595689_595832_597741_597842_602546
686717	contig_3077_pilon	+	1931	8	Intergenic	novelGene_26795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	781.093503509336	2	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	251	1174	473998	481630	FALSE	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFVMA	467360	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481130_481617
686721	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686727	contig_13894_pilon	-	648	3	Intergenic	novelGene_62181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCAAGGCGGGCTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701382	696703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_696753_700618_701107_701271
686732	contig_3095_pilon	+	870	4	Intergenic	novelGene_75097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2952.89654407329	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	54	464	147241	151151	TRUE	15	CTTAGGTGGAGTTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147187	152243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147275_150473_150696_150996_151163_151848
686735	contig_17194_pilon	+	3213	1	Intergenic	novelGene_155378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCCCAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275118	278331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_275100_278300
686736	contig_1406_pilon	-	1406	3	Intergenic	novelGene_25597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCTGCAAAGCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2187469	2179478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2179551_2185143_2185418_2186409
686745	contig_2710_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_161799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103894	1105436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1103900_1105400
686751	SIRV2	+	662	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-73	143	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCCTACGTGAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1650_1726
686760	contig_11933_pilon	+	2067	7	Intergenic	novelGene_107238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	82.0096539032651	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	137	730	74969	89168	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFLGIAFLGIGLWAWNEKGVLSNISSITDLGGFDPVWLFLVVGGVMFILGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGIIFFLELTAGVLAFVFKDWIKDQLYFFINNNIRAYRDDIDLQNLIDFTQEYWQCCGAFGADDWNLNIYFNCTDSNASRERCGVPFSCCTKDPAEDVINTQCGYDARQKPEVDQQIVIYTKGCVPQFEKWLQDNLTIVAGIFIGIALLQIFGICLAQNLVSDIEAVRASW	55059	90505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_55115_74887_75035_79766_79938_82931_83058_85042_85091_85207_85325_89102
686762	contig_14441_pilon	+	766	3	Intergenic	novelGene_100714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116576	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
686767	contig_10312_pilon	-	1357	4	Intergenic	novelGene_159033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	34.2669260690571	102	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	238	1356	611685	583018	FALSE	40	CAACTATGACCAAGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGIKKSLTEEYLYLDLSHQTEGCIFPLHTSVTVFLLLYCDCKIFKVCLVLTRESTDISQIKNVLPQDVETQIISREELPSIVQNCCLPAAVERPGNFCRAGLAVVLRHIIQKSYEADPSKKEILELLGFKKTCLKACAEVSQWTRLCELTIPSAIENFIRESSEQPSAIPVEILQLEKKLSEPVRVHNDDKLRRQKLKQQKAAGVGLSLAKDKTKSKACNQEASEELDSPSKSLELEVAFSKLTAQEDPASANREPSHIRKVKASDLPPLEHVFAEGLYFTLADIVLLPCVHHFLVIICKKHSEKLVEFPLLASWYQRIQEVPKVKTAASKCGIQFLDLPELLTTSNEQHPNLSEVPGVEEQSDPSFIGGPR	620047	583016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_583249_610177_610646_611265_611707_619831
686771	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686775	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_19060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATGACGACCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
686778	contig_6497_pilon	+	2112	4	Intergenic	novelGene_35583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATGTGCTTTACAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270640	282951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_272298_273712_273897_281123_281185_282741
686781	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
686788	contig_17796_pilon	-	1556	11	Intergenic	novelGene_33759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAGCAAAGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42428	8152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_8243_11783_12044_13724_13830_13905_14010_15232_15320_16867_17089_18021_18198_20415_20617_34897_34980_40842_40953_42308
686792	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686793	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686796	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_96007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
686809	contig_8616_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_72423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTCACGCAACTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249603	251473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_250669_251430
686810	contig_7870_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_109018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544507	542886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_542900_544500
686813	contig_3627_pilon	-	2111	9	Intergenic	novelGene_78449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAAAAAACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310753	294384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_294465_297721_297894_298388_298434_300292_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304726_309358_309490_309605
686826	contig_15821_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_25029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAATTCTGAGCACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166406	166051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_166100_166400
686827	contig_15821_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_25028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAAAACTCACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164350	163188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_163200_164400
686829	contig_6102_pilon	-	1024	9	Intergenic	novelGene_32200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1699.81166236145	70	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	195	914	898273	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLIPPEPVSGGMPFQPVLVNMPIPKSAGIPAPAPSAKQPILKNNKGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_898131_898359_905180_905253_906085
686830	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
686831	contig_14513_pilon	-	1095	4	Intergenic	novelGene_70271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	9	401	18856	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	18864	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
686835	contig_4315_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_46751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGTAACTAATACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224014	226252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_224000_226300
686840	contig_1925_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_162213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	428.015639615075	40	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	420	1052	254564	284492	FALSE	35	TATTTCTTTACTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGKAINVFISANRLIHQTNLILQTFKTVA	225053	284894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225352_254442_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713_279797_284410
686842	contig_7840_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_68995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTTAGTTGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256524	257589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_256500_257600
686843	contig_7840_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_68996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGGTGGCTGGGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260949	261405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_260900_261400
686845	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686846	contig_9415_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_109766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCTTTTTTTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598308	1596428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1596400_1598300
686847	contig_5217_pilon	-	2196	15	Intergenic	novelGene_135740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_14	97.1586384240133	328	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	919	1917	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533760	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766_531863_532688_532777_532869_533000_533128_533246_533343_533452_533618
686848	contig_15087_pilon	-	2666	19	Intergenic	novelGene_37150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.978586596142	1	106	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1132	1983	52941	38999	TRUE	20	CAGCATTCCATGACTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89806	33329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33592_33732_34121_38965_39056_40455_40648_41133_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54483_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66728_69120_69205_71087_71169_72506_72642_73969_74142_89687
686849	contig_6837_pilon	-	2092	15	Intergenic	novelGene_149840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_14	27.1113538983962	161	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	40	900	106337	98492	TRUE	10	CCAGTGACTCCTTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARRRRTNSGGARASVALNEIKRVNNGNITTEDSPPAKKTRRCQKQGVRKEPVAGGKTDNYDKTEDKKESVKTLLLKGKAPVDPECTVKVGKAHVYCEGNDVYDVILNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGKTGQHSLVTCSGDLTKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQGEEETKEEESLKSPWKPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMVEMKYDTKKAPLGRTSDSALHSLFVFPSFFNGIFHHHYDCTE	106376	95303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_95572_95689_95815_96053_96153_96483_96584_96761_96890_97159_97295_97375_97440_98218_98747_99760_99864_100474_100551_101365_101463_103060_103112_103734_103806_104284_104450_106294
686850	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_93905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
686851	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686859	contig_1986_pilon	+	2495	19	Intergenic	novelGene_64119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	18.424771972055	212	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	131	2098	73750	127795	FALSE	15	TGTGGACATTTGCCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLTQQPGTCETICCCWKEDNWGWVPATSRLTLALWTGATEQAEMDDNMDQKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTKTNLSYYEYDKMKRGSRKGSIEIKKIRCVEKVNLEEQTPVERQYPFQIVYKEGLLYIYASNEESRSQWLKALQKEIRGNPHLLIKYHSGFFVDGKFLCCQQSCKAAPGCTLWEAYADLHIATKEETHRPPIFPESVLKIPRAVPVLRMDVPSSSTTVAQYDRDSKKNYGSQPNVSMQYVPREDYPDWWQVRKLKSNEDFAGSNQRERNVVTQSTSKMSWGIPESSSSEEGENLDDHDWFAGNISRSQSEQLLRQKGKEGSFMVRNSSQMGMYTVSLFSKAVKDKKGAVKHYHVHTNAENKLYLAENYCFDSIPELIHYHQHNSAGMITRLRHPVSTKANKVPVSASLGSGIWELKREEITLLKELGSGQFGVVQLGKWKEKYDIAVKMIKEGSMSEDEFFQEAQTMMKLSHPKLVKFYGVCSKRYPIYIVTEYITNGCLLNYLKNHGKGLEPSQLLEMCYDVCEGMAFLESHQFIHRDLAARNCLVDSDLSVKVSDFGMTRYVLDDQYVSSVGTKFPVKWSAPEVFHYFKYSSKSDVWAFGILMWEVFSLGKQPYDLYDNSQVVVKVSQGYRLYRPQLASDTVYQIMYSCWHELPEKRPTFQQLLSSIEPLREKDKP	73619	128192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_73753_81381_81529_82368_82474_84492_84575_90402_90523_92210_92276_96595_96772_100061_100134_101059_101114_105475_105531_107030_107111_110227_110356_112342_112418_113373_113546_116779_116997_117953_118019_119860_119980_124031_124190_127720
686861	contig_7963_pilon	-	1945	4	Intergenic	novelGene_58610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCCAGGAAACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298759	293239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296367_296891_297937_298190
686868	contig_9345_pilon	-	1406	6	Intergenic	novelGene_24692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	3	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	270	851	955353	947957	FALSE	30	CCACTTAATGTATGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001344	947401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
686880	contig_9594_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_73917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGGAAAGGAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128695	130309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_128700_130300
686882	SIRV5	+	393	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-65	877	49	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8250	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
686884	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686885	contig_10135_pilon	-	1918	9	Intergenic	novelGene_106614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	39.6514107567436	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	893	1414	86218	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89576	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_87900_88500_88681_88920_89057_89502
686887	contig_15114_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_121078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGAGAGCGAATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9816	10833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_9800_10800
686888	contig_8020_pilon	-	2718	5	Intergenic	novelGene_114385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	29.456535777311	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	265	591	150417	149105	TRUE	25	GAATAAACCCTGTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEGSWGLHGETASLAGTSKLPGFLLLLQGLAGIESLAGPLGSCGQGVATCQTASWPSCRAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQ	150796	146883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_149185_149828_149914_150255_150433_150547
686896	contig_12057_pilon	+	2039	19	Intergenic	novelGene_131630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	46.4058851099675	1	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	24	1418	99524	151859	TRUE	15	CTTCTTATCCTCTTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRKPPRVRANHRDFQLRNLRIIEPNEVTHSGDPGSETDGRMAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYK	99500	161792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_114853_114943_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151860_155464_155642_156319_156397_157622_157722_161524
686897	contig_11096_pilon	-	2668	1	Intergenic	novelGene_143489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGAATCGTTCCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331142	328474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_328500_331100
686902	contig_5403_pilon	-	2227	16	Intergenic	novelGene_87974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	84.003015818878	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	833	1855	433348	424565	FALSE	40	TATTCACATAAGTTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	458236	424192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434677_438923_439010_439918_440041_441204_441329_449848_450040_453795_453877_458132
686904	contig_15304_pilon	-	950	3	Intergenic	novelGene_30514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	189	305	54100	53702	TRUE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVA	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53710_53991
686907	contig_11341_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_162228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGACAGCAACTGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556488	556018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11341_pilon_-_556000_556500
686917	SIRV2	-	627	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
686924	contig_14441_pilon	+	1508	6	Intergenic	novelGene_100329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	597.418915000186	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	111	1040	5836	117123	TRUE	10	TGGCGCTGCCTACGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSLTVGRWMQVAPLVRSPPGGRSEHPPQEGPWHCREEGRAGSQSPGRWCGERPALEDAGAASARGARAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	5725	117787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6644_6913_113162_113209_116578_116963_117097_117344_117539
686929	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
686935	contig_20199_pilon	+	858	4	Intergenic	novelGene_82558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTCCACCCCCAAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40646	44185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_41933_42080_43909_43949_44114
686936	contig_1450_pilon	+	1878	15	Intergenic	novelGene_27357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	491.23204646011	2	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	228	1835	244426	355901	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLDAFRVGSVPALSPERGELGPTWH	244198	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347057_355831
686944	contig_3270_pilon	-	2576	15	Intergenic	novelGene_104446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	81.1027629816969	333	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	277	2328	67935	48840	FALSE	25	CTGGTGTACCACTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEKKKKFKLIRNGHVIWKGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMVCYEEKEVLVKTSWDPGF	78136	48591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_50386_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68012_70709_70822_78048
686945	contig_3956_pilon	+	1190	8	Intergenic	novelGene_14866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1451.1488481861	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	84	1103	1281682	1290925	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKGRHFSVDRN	1281598	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285799_1290888
686950	contig_9807_pilon	+	1399	6	Intergenic	novelGene_32878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	707.872756927401	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	98	553	109130	158783	FALSE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVITY	109032	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128604_158771
686953	contig_5779_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_106440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94298	93303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94300
686955	contig_11378_pilon	-	1295	2	Intergenic	novelGene_112334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_1	0	182	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACTGGTCTTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247737	1245911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1247066_1247596
686956	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
686961	contig_6578_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_162241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTTTTAAAGATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184615	184328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_184300_184600
686962	contig_6494_pilon	-	1207	3	Intergenic	novelGene_108568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1265	junction_1	785	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	779	1132	3457	2635	TRUE	25	ACACATGGCCTGACTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	4235	2105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297
686969	contig_12270_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_114098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	27	305	14409	13908	FALSE	25	TTCACCATCAGCAGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14435	13907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
686971	contig_3270_pilon	-	2821	11	Intergenic	novelGene_104459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	211.715941771044	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	261	1799	110438	92759	TRUE	30	TACTTTTGAAATATTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSTMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTGNSSTGFRSKQLVKNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGQTSTGNSNNNASLHEVKAGAVTSQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKTREALDSRAHHKIRTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQDNLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGRTPGDFCDRRTTKPEQFVRPGSRMTEDTHFTGPPGKSTAGTQGRIKSVKETSLPRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDGRPPASVDSAAATADSGVHAAPNVDKVQESRISKSRSREPQSS	115422	91205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_92193_92723_92824_96704_97168_97364_97634_99787_99869_100976_101049_101651_101856_106359_106575_106714_106808_110361_110508_115231
686972	contig_3095_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_75079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	3	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	15	ATTGGATGGGTCTTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151199_151865
686973	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686976	contig_14142_pilon	-	2154	11	Intergenic	novelGene_120591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	160.248432129616	7	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1021	1326	591064	589263	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKELVAWSWKDISSNGPAMHLRPGADAGSSFRATSWYIRRSTRIL	592299	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585568_588783_589273_589369_589422_590496_590568_590685_590754_590850_590947_591055_591101_591232_592067_592149
686983	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
686984	contig_6589_pilon	-	1322	9	Intergenic	novelGene_25890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	226.068020737122	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	560	1174	1177213	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTQALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178069	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176156_1177206_1177382_1177535_1177785_1177927
686987	contig_5445_pilon	+	1372	3	Intergenic	novelGene_135418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	1308.5	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51685	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52273_53240_53646
686991	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_18481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
686993	contig_8259_pilon	+	1362	5	Intergenic	novelGene_148861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.913495227788	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAATGGTAGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53190	64668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53266_57919_58092_59908_60041_62754_62830_63760
686998	contig_15063_pilon	-	1514	4	Intergenic	novelGene_13323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	799	1125	35891	35108	TRUE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36798	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35836_36156_36264
687000	contig_12270_pilon	+	386	2	Intergenic	novelGene_113122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	13827	14364	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAAISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13826	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
687017	contig_6361_pilon	+	2993	3	Intergenic	novelGene_23879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1647	1964	75501	81638	FALSE	60	AAAAGTTAAACATAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRCGQLSSIWINISMHYETWRWRIFSMRIILLSWNSWHLCVASSWSRPALGQLVPLVRNFGRFVSWYRLSLCSTKSVTKLHNICLVGVFRKKSQGCSNTALSC	73854	82667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_75584_79193_79368_81577
687020	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687021	SIRV6	+	460	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	346	8735	173	56	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCTTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
687024	contig_4364_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_3401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGTGAACGGCGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
687028	contig_500_pilon	+	1731	8	Intergenic	novelGene_31073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1151.30880270398	8	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	974	1402	1494461	1498956	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLARSRCSAGVRPSAPSSAQPAWMVA	1492078	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492731_1493615_1493721_1494244_1494468_1495358_1495462_1496522_1496730_1496821_1496860_1498882_1498974_1499277
687040	contig_10235_pilon	+	1168	6	Intergenic	novelGene_46403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	62.5952074842795	669	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	86	985	194955	198156	FALSE	40	TGTGATGTCATCTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCGLLSRLCFLPGDARSQGKRTWQVLPMAVLFLLLLFLCWPLKAAAENIQAIYVALGEAMELPCPSPPTLHGDEHLSWFRSSAAGSSTVLVAQAQVARPAPDQGKLGRESRPKLLGNYSLWLERTKEGDAGRYWCAVLGQHYTYQNWRVYDISVLRGSQLSARTADGSPCSVLLCSVIPPRRLDSVTWLEGKGPVRGRVQSFWGEGAALLLVCPGEGLPEPRGRRPRIIRCLLPQNKGISFSLAASVDASPAVCAASTGWDMPWILMLLLAAGQGVIILTLSIVLWRHRTQRASCRNASIPQFKPEIQVYENVHLACLSPPAPKTR	194869	198339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_195013_195500_195831_195950_196215_197088_197245_197415_197483_198131
687043	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
687047	contig_14266_pilon	+	2541	6	Intergenic	novelGene_162247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	40.0229933912995	483	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	209	850	121123	150132	FALSE	20	TAATTTTTATTATTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLFKKKTVDDVIKEQNRELRGTQRAIIRDRAALEKQEKQLELEIKKMAKIGNKEACRVLAKQLVHLRKQKTRTFAVSSKVTSMSTQTKVMNSQMKMAGAMSTTAKTMQAVNKKMDPQKTLQTMQNFQKENMKMEMTEEMINDTLDDIFDGSDEEEESQDIVNQVLDEIGIEISGKMAKAPSAARSLPSASTSKATISDEEIERQLKALGVD	120914	151823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14266_pilon_+_121157_136685_136778_143994_144190_147306_147410_149501_149609_150021
687054	contig_6710_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_97336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
687056	contig_9345_pilon	-	1906	6	Intergenic	novelGene_24721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	8.17312669668102	233	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	64	705	1015290	1012336	FALSE	5	TGACTCTGCTGGCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVSVPCHVKGTVALQVGDVRTSQGRPGVLVIDVTFPSAAPFELQEIVFKNYYTAFLSIRVRQHTSIHTPAKWVTCLRNYCLMPDPHSEEGAQEYVSLFKHQMLCDMARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEGLPDPGRVSSEVQQMWALTEMIRASQTSTRIGRFDVDGCYDLNLLSYT	1015353	1011134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012975_1013434_1013549_1013799_1013977_1015158
687058	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_95860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687059	contig_6710_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_91760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
687060	contig_6102_pilon	+	434	4	Intergenic	novelGene_31786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7954	junction_1	2053.07785207153	93208	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360094	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864
687067	contig_13300_pilon	-	2014	5	Intergenic	novelGene_125812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	24.0351305384431	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	250779	248617	TRUE	10	ACATTGTTTTTTTTTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250780	244153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247029_247267_247440_247547_248782_250575
687068	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	29	361	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14437	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687075	SIRV2	-	481	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	34	3217	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
687076	contig_8020_pilon	+	2196	19	Intergenic	novelGene_114406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	52.4325551495078	3	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1104	1715	196507	202853	FALSE	30	TGGGGAATTTAGTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETIQRPLDRLFCSVVTVAEQKYQSTLWDKSKKLAEQAAAIVCLRSQGLPRGSAG	167181	203334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_167903_169128_169206_171004_171097_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194950_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_202483_202558_202768
687080	contig_1618_pilon	-	1625	9	Intergenic	novelGene_141793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	316.550154004069	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	375	1202	341041	317005	FALSE	30	ATGAAAACTGCCTCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSWGGGVGGRWTRWRRGPLPLSPTLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEVRLISERACSKQTLSALKLDCKTEVNISDKLAIVDEWRKEMGLCWKEVAYLGNEVSDEECLKKAGLSGVPADACSTAQKAVGYICKCNGGRGAIREFAEHIFLLMEKVNNSCQK	353782	316581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_327214_327369_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491_353574_353707
687081	contig_9272_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_125976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGAATTTCTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652550	654668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_652600_654700
687082	contig_16125_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_155216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTAACAAAATCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64903	66938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_64900_66900
687083	contig_9848_pilon	-	1537	10	Intergenic	novelGene_79954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	506.2252463084	6	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	69	311	110549	107125	TRUE	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTR	113888	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_107100_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
687085	contig_8743_pilon	+	1625	5	Intergenic	novelGene_149490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	8.78564169540279	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	152	562	82855	84266	TRUE	45	AAACCTTCTAGAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPLRGLAWGKGRGRVSKLSWTHFSPSKIQPEKYTTFLPNPCHVCPQKQVAMEKLREAQKQWQLQQEKRLQHLAEVRDRQRGTQQEVDRLYQELRSLKHQAGQEQDKLQRHQAFLQLLYTLQNKTLLPGAEAEPQPLQGVPLRQDLLEDKAQQLTGPQHQNTGDNIAGDRGVTPQLFPWPHSLPNGL	82703	86580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8743_pilon_+_82900_83482_83614_83691_83888_84227_84304_85554
687093	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687094	contig_5815_pilon	+	2360	5	Intergenic	novelGene_141213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	164.70788536072	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	48	689	561980	568075	FALSE	15	AGTATGGTCTGTGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREGKEVSEMGKVTSGMAAGYFY	561932	569746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_567037_567804
687095	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
687098	contig_9424_pilon	-	1710	4	Intergenic	novelGene_143778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	882	junction_3	1561.30095326515	56	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	20	424	280461	278500	FALSE	20	AAACACCTGTTCGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWAAEMPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSVSKFGICCLYRFVLSPEVYSILSQLPTR	280480	277213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_278762_279552_279629_280079_280144_280458
687099	contig_7744_pilon	+	1871	16	Intergenic	novelGene_62548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	207.610468586405	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	633	1436	887347	890785	FALSE	20	TGCTAAAAGCGTCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879803	891220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882902_883088_883102_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
687101	contig_10642_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_78641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTCAGCAAATCGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16423	16769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_16400_16800
687102	contig_10068_pilon	+	2668	9	Intergenic	novelGene_148708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2345	2662	58330	61145	FALSE	35	GAGGCCGAGGTGAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRNFPLNSAQAWQSLPACFQGMRKMLFSSFSHTSPGYLPLSIWSISHWRSFPLPQLTELMPNSPPRPLPSRFMPRRRRLRRAFARALAPGSELRVASGPDFKW	43423	61151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_44810_47646_47762_51231_51586_54327_54438_56356_56500_57188_57275_58179_58376_59670_59889_61091
687103	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
687107	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_113984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	15	338	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14423	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687110	SIRV7	-	159	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76981	0	43762	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70976	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
687111	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_95065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687112	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687113	contig_7895_pilon	+	2146	9	Intergenic	novelGene_154456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	67.4902770775169	66	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	24	743	725295	781677	FALSE	30	AGGAATGGTCTATTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKQRVGMKRQRASSQRKPARIPSGKAGAESGFLMEVCVDSVESAVNAERGGAGRIELCSGLLEGGTTPSMGVLQVVKQCVQIPVFVMIRPRGGDFLYSDREIEVMKTDIRLAKLYGADGLVFGALTEDGHIDKELCMSLVAICRPLPVTFHRAFDMVHDPVAALETLLTLGFERVLTSGCDSSALEGLPLIKRLIDQAKDRIVVMPGGGITDRNLQRILEGSGATEFHCSARSARDSGMKFRKRE	725271	783080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725356_728162_728235_731583_731644_736187_736398_737188_737225_739538_739673_744310_744339_759397_759504_781664
687115	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	51	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687118	contig_12270_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_113898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	8	334	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14416	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687121	contig_16385_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_86202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGTGATTGGGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34927	36826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_34900_36800
687128	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687130	contig_1535_pilon	+	2562	4	Intergenic	novelGene_127231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	6.53197264742181	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTAACAACTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53444	107420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_53709_98843_99032_102092_102864_106081
687131	contig_7357_pilon	+	1735	14	Intergenic	novelGene_36886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.140355887518	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	253	1275	256833	273311	FALSE	45	AAAGATTGAATTTAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250831	273771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250940_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
687139	contig_12464_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_68722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	379209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_376344_377988
687142	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687154	contig_19957_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_57698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1301	1603	127317	127015	NA	25	TGCAGTCTAAACTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKAPQLGSGRAGTQREAPLSKDGRRHGKWVHCKVKNAEKPLPAWCFSLLLRNFLTEGPALVMPLPDHLERGYFLPHDSAILTFYNELENNLFFNITSSF	128617	126451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_126500_128600
687155	contig_8978_pilon	-	2395	4	Intergenic	novelGene_49312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	6.12825877028341	162	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	118	606	143795	137942	FALSE	20	CCTCTGTTTTCCTGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTAVADTRRLNSKPQDLTDAYGPPSNFLEIDIFNPQTVGVGRARFTTYEVRMRTNLPIFKLKESCVRRRYSDFEWLKNELERDSKIVVPPLPGKALKRQLPFRGDEGIFEESFIEERRQGLEQFINKIAGHPLAQNERCLHMFLQEEAIDRNYVPGKVRQ	143912	136152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_138045_138414_138540_139110_139207_143630
687162	contig_19577_pilon	-	2570	4	Intergenic	novelGene_119838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	25.9529488797623	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	64	327	41848	40657	FALSE	25	CTTATTTTAATGAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPSSFVSEFPEASRKLTISPMNKGSTTRTSKNTVFSTESGSPTGPPHQHYTEANLVRICLGAVILVLLVGILAEDWHSRKKLLVHRVRAVQRPLPPLLQTQKLHQSG	46602	38413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_40851_41350_41399_41826_41887_46577
687163	contig_9345_pilon	-	1398	6	Intergenic	novelGene_24372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.426231186611	7	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	120	695	176056	141808	FALSE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REFREPAGRGEEAGGLGGLLRPRHRRDPGLSVRPPVRLAMAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMTHAAGKWVKLGSCSVGF	176175	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141862_142670_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
687166	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687171	contig_9239_pilon	-	2389	15	Intergenic	novelGene_137179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_6	123.058908243	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	110	2062	279021	179970	FALSE	65	TTGCAAAAAAAAGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSLYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA	279130	179642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_180079_180650_180851_188345_188448_191868_192004_192335_192531_203069_203161_205039_205200_212054_212240_218398_218533_218860_218984_234936_235057_235500_235649_235788_235877_240383_240519_278993
687178	SIRV5	+	398	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1144_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
687180	contig_18637_pilon	+	2049	6	Intergenic	novelGene_81848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	87.2077978164797	35	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	110	349	148247	149860	TRUE	40	TATTACCCAGCAAATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATRTPRPRLRATENIKTPRSERLIRRKTLPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDHSTRCCNKQN	141742	154881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141775_147071_147125_148222_148391_149544_149606_149825_149881_153201
687183	contig_16846_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_82925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483582	483806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_483600_483800
687190	contig_18592_pilon	-	1650	2	Intergenic	novelGene_114776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAATAGGAAAAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	4903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_6494_12737
687191	contig_10135_pilon	+	1155	7	Intergenic	novelGene_106673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	188.681978177273	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	12	521	222438	270079	TRUE	25	TTGACTCTCCTTGAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESKMAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMEQFWSKNTGSNRPLSPHITIYSWSLPMVMSVCHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGNFESHLELVKSLCLGPAVIYTAKFALVSPLMYHTWNGIRHLMWDLGKGLKIPQLYQSGVAVFILTVLSSLGLAAM	222426	270830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222458_227989_228047_233654_233757_246597_246660_265108_265273_269974_270207_270323
687193	SIRV7	-	373	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-56	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114794	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70988_78841_78964_114686
687194	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687197	contig_3153_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_104661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCTATAGGATTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174857	174010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_174000_174900
687198	contig_7593_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_127330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537856	536251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_536300_537900
687205	contig_18869_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_56188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCATGAAATGTAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73700
687213	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
687219	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687222	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687223	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_97308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687225	contig_15063_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_13186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	202	1368	34808	36661	FALSE	55	AAATAAAAATATCAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLLTISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35848_36158_36266
687228	SIRV4	-	666	4	FSM	SIRV4A	SIRV403	670	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15118	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13829_15019
687233	contig_11417_pilon	+	2313	1	Intergenic	novelGene_103255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCACTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235667	237980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_235700_238000
687234	contig_610_pilon	-	1004	2	Intergenic	novelGene_76722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3263	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	275	310	214218	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	220747	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517
687235	contig_3155_pilon	+	1384	5	Intergenic	novelGene_26356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1116.30674547814	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	245	754	259780	261405	TRUE	20	CCTCACTCCAAGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSDSEQEEDEKNNRPRRRAEPEPQRQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPWLPSQCCSARSHAGSQRPRNSAEGKLLHGWLRWWLHHLVRSQGHLCAGKDITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	258074	262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258152_259209_259329_259731_259978_261093_261806_262321
687252	contig_9482_pilon	-	1743	12	Intergenic	novelGene_44318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	157.927172252077	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	6	1523	1253164	1236365	FALSE	20	TAAACAGCCTTTCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVELSKSQDDEIGDGTTGLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253169	1236144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242568_1244312_1244364_1244429_1244471_1245325_1245387_1253059
687257	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_94383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687269	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
687273	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_94288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687274	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687275	contig_8312_pilon	+	1858	2	Intergenic	novelGene_152900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGTCTCTGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278078	280276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_279630_279969
687280	contig_9888_pilon	-	753	2	Intergenic	novelGene_162262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAGGTACTTCACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56878	55517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_56005_56612
687283	contig_14101_pilon	+	1567	4	Intergenic	novelGene_122759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.178422814186	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	101	1291	260068	273778	FALSE	35	AACTGATTACTTATTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMQMDPELAKRLFFEGATVVILNMPKGTEFGIDYNSWEVGPKFRGVKMIPPGIHFLHYSSVDKANPKDVGPRMGFFLSLQQRGLTVLRWNTVQEEVDLSPAPEAEVEAMRANLQELDQFLGPYPYATLKKWISLTNFISEAMMEKLQPESRQICAFSDVLPVLSMKHTKDRVGQNLPQCGTECKSYQEGLARLPEMKPRAGTEIRFSELPTQMFPDGATPAEITRHSMDLSYALETVLSKQFPSSPQDVLGELQFAFVCFLLGNVYEAFEHWKQLLNLLCRSEEAMVKHHTLYINLISILYHQLGEIPPDFFVDIVSQNNFLTSTLQVLAPRRVRIKAGVFFSSACSVAVDATLRQKAEKFQAHLTKKFRWDFDAEPEDCAPVVVELPEGIETG	257199	274054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_257244_260011_260825_264602_264869_273610
687284	contig_6710_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_95803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTGCTGTCCTGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
687286	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
687292	SIRV6	+	645	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	803	138	-352	-77	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	69	401	2002	10736	TRUE	30	AGCTATTGTAAGTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1933	11193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
687294	contig_4136_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_161250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148686	147087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_147100_148700
687297	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687299	contig_19459_pilon	-	1038	6	Intergenic	novelGene_59886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4836.35537982891	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	174	512	16240	7917	TRUE	25	TATTTTATTAAGTTTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANEGKTSSIHKF	19137	6711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7111_7789_7948_12630_12704_15503_15702_16203_16265_18988
687300	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687301	SIRV1	-	212	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3596	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
687307	contig_3334_pilon	-	2552	8	Intergenic	novelGene_137673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_4	168.066192013621	119	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	3	1190	778618	727584	FALSE	20	TGTTCAGTGTAGGCTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHARIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQIAMQNQINTNPESPDTVTIHAATPQFIIGPGGVVNLTGLVSSENSSKATDETGVSAVQFGNSSTSVLATLAALAEASAPLSNSSETPVVATEEVVTAESVDGAIQQVVSSGGQQVITIVTDGIQLGNLHSIPTSGIGQPIIVTMPDGQQVLTVPATDIAEETVISEEPPAKRQCIEIIENRVESAEIEEREALQKQLDEANREAQKYRQQLLKKEQEAEAYRQKLEAMTRLQTNKEAV	778620	726221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_727737_733508_733625_738712_738899_756283_756398_756741_756890_761716_761912_763122_763291_778510
687308	contig_12635_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_60795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133104	131272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_131300_133100
687309	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_114070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687310	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
687311	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	182	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
687318	contig_18869_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_56124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
687320	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_93015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
687321	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687325	contig_13547_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_104877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86929	87387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_86900_87400
687328	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687329	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687332	contig_10734_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_51401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1353	1694	2051663	2051322	NA	60	CAGAACTTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGTKKDIAKRKTAAPREVFGKTKAQLSKTQGKPGSIRFKCYKNQKQQRLISGGLRRQGIWALTETEKWAVGRQKGPPRVDSNMTRAGKRARDAAAVGRGWGVAGRGTRWVR	2053015	2050310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2050300_2053000
687333	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687334	contig_14273_pilon	+	2249	8	Intergenic	novelGene_21138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_1	471.402380224827	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	316	2046	128229	151187	FALSE	65	ATACGAAAAAGAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRARDQNRRGGCCGSLANYLTSAKFLLYVSHSLSTWGDRMWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127913	151390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873
687336	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687341	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687343	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687344	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687349	contig_14273_pilon	+	1787	7	Intergenic	novelGene_21151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	608.800300226236	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	938	1786	148927	151100	FALSE	20	AAACTCTGGGCAGCCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQ	127934	151101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128250_135364_135521_137935_138052_139057_139185_147782_147971_148891_149549_150873
687352	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687354	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687355	contig_9785_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_157896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAACCCTGATTTAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230828	230260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_230300_230800
687356	contig_9785_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_157895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229853	227607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_227600_229900
687363	contig_15062_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_162293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43480	41219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_41200_43500
687366	contig_12327_pilon	+	1990	5	Intergenic	novelGene_140626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	620.554993534014	14	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	104	649	168930	171003	FALSE	25	CTTAACTATTTCATGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148621	172344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841
687367	contig_10674_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_6459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCTTTCCACCCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336324	337320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_336300_337300
687370	contig_1813_pilon	+	2720	22	Intergenic	novelGene_105522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	46.853851994388	292	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	148	2124	490666	498847	FALSE	10	TAGGGATGTGTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDWKASPLIKPFGARKKRSWYLTWKYKLTNQRALRRFCQTGAVLFLLVTVIVNIKLILDTRRSITEASEDPEPEQDYDDALGRLEPPRRRGSGPQRVLDVEVYSSRSKVYVAVDGTTVLEDEAREQGRGIHVIVLNQATGHVMAKRVFDTYSPHEDEAMVLFLNMVAPGRVLICTVKDEGSFHLKDTAKALLRSLGSQAGPALGWRDTWAFVGRKGGPVLGEKHSKSPALSSWGDPVLLKTDVPLSSAEEAECHWADTELNRRRRRFCSKVEGYGSVCSCKDPTPIEFSPDPLPNNKVLNVPVAVIAGNRPNYLYRMLRSLLSAQGVSPQMVTVFIDGYYEEPMDVVALFGLRGIQHTPISIKNARVSQHYKASLTATFNLFPEAKFAVVLEEDLDIAVDFFSFLSQSIHLLEEDDSLYCISAWNDQGYEHTAEDPALLYRVETMPGLGWVLRRSLYKEELEPKWPTPEKLWDWDMWMRMPEQRRGRECIIPDISRSYHFGIVGLNMNGYFHEAYFKKHKFNTVPGVQLRNVDSLKKEAYEAEIHRLLSGAEILDHSKNPCEDTFLPDTEGHTYVAFIQMEKDDDFTTWTQLAKCLHIWDLDVRGNHRGLWRLFRKKNHFLVVGVPASPYSVKKPPSVTPIFLEPPPKEEGAPGAAE	490065	499443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_490162_490614_490786_491372_491488_491617_491737_492391_492458_492533_492648_493677_493796_493985_494085_494287_494416_494806_494878_495109_495186_495377_495462_495549_495592_495802_495862_496169_496243_496325_496455_496538_496665_497642_497708_497890_497936_498165_498302_498569_498680_498765
687376	contig_6710_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_96930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
687383	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687384	contig_5832_pilon	+	1864	3	Intergenic	novelGene_134176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	24	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1290	1604	570227	570541	FALSE	30	ACAACGCTGGGATTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPWQMGRHHFLRAAKMLENDRRGQASPHSLPWPQARSCPVSKLCSACAPCSSPHCPVGNVLHTLPEALWRFTRGSRAGSRFTPSHPLPRRRWPPQGSPAYRI	568157	570801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_568938_569380_569459_569795
687385	contig_10494_pilon	-	2447	4	Intergenic	novelGene_102194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	28.9942523039768	21	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1768	2172	1057350	1056579	FALSE	30	TTAAAAGTACCAGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLCHVAATQHPSSHPGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1059306	1056303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057477_1057665
687392	contig_12270_pilon	+	334	2	Intergenic	novelGene_113830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCCCTGCCTGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13855	14412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
687403	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687408	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687409	contig_14666_pilon	+	2295	7	Intergenic	novelGene_39527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	72.0572688907927	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1217	1888	446586	448893	FALSE	30	TAAAAAAGTCTTTTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFQNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	444993	449300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_445704_446079_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
687410	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	302	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687411	contig_12450_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_162319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGGTTGACTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348042	345948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_345900_348000
687414	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687418	contig_6710_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_89144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653675	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
687420	contig_12301_pilon	-	2031	9	Intergenic	novelGene_110022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	241.623124669391	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	110	646	136698	114923	TRUE	25	CAAATTTGTGTCATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGNWDERVTFSSFGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNE	136807	102019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114926_115790_115929_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
687422	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
687426	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687427	contig_10531_pilon	+	937	3	Intergenic	novelGene_114526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_1	157.5	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	164	652	466144	468097	FALSE	15	TGGTTTTTAACCCTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPLQWARYHWQRLIGGANRDDNERPYNYSSLLACGGKTSQTPKLAGKHRVVVPHLQPFKDEYEKFSGAYVNNQIRTTKYTLLNFVPRNLFEQFHRAANLYFLFLVVLNWMPLVEAFQKEITMLPLVVVLTIIAIKDGLEDYRKYKIDKQINNLVTKVYSW	429191	468382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_429318_466106_466434_467898
687429	contig_3077_pilon	+	983	6	Intergenic	novelGene_26643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3763.93069011638	72	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	70	561	9676	17661	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKWGQRCHTP	9606	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_17634
687434	contig_13211_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_123148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAAGGAATATTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288956	291059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_289000_291100
687435	contig_16776_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_130537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTAAAAAGAAACTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96301	95683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_95700_96300
687436	contig_15304_pilon	+	1019	3	Intergenic	novelGene_30559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	142	597	53036	53666	TRUE	40	AGCAAAGAAGACAGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHQAGEIITLLPGLGLHAQHTGHGKGDSFLAWLLPWGPGQVVVLGQLLGPVPPAHQHVLGAESTHHACQCHQFVQRQLLRRWWQQVDLGWEAVPFFGNGGRLGPSLGVGGSAGEVLPTLPGLPAARKDAGHAIAATGVSLRCLLYGICPT	52894	54298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53496_53787_53996
687442	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687443	contig_7171_pilon	+	2630	19	Intergenic	novelGene_101322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	328.701297852437	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	56	2404	1094397	1172617	FALSE	25	GAAGGGTTCCTAAAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSVGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNCWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKQRDYETATLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQRICDQWDALGSLTHSRREALEKTEKQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADKEREAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDQALLEEQSKQQSNEHLRRQFASQANIVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLDHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKPQP	1094341	1172843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1094559_1143023_1143139_1143292_1143413_1146846_1146934_1147899_1147988_1149761_1149841_1150885_1150968_1151796_1151883_1156322_1156416_1158263_1158495_1159643_1159792_1163553_1163705_1166391_1166501_1166701_1166843_1166923_1167107_1167194_1167330_1168339_1168520_1169379_1169527_1172605
687446	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687448	SIRV5	+	778	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	3	-3	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTTGGTACGGCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	2395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1407_2012
687450	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
687460	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_93557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687461	contig_7815_pilon	+	2461	2	Intergenic	novelGene_134411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	0	112	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGTTACAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879706	883058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_879780_880670
687464	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687473	contig_9609_pilon	+	1638	10	Intergenic	novelGene_23066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	962.58368884201	7	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	160	1071	449884	454609	TRUE	65	GAAAAAAAATACCAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	442271	456266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_442393_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455713_456153
687480	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687483	contig_755_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_119757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGAAACTGAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75606	75307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_75300_75600
687488	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	9	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1848	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
687498	contig_12528_pilon	-	1432	9	Intergenic	novelGene_81334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	489.052256282496	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	749	1285	959940	933323	FALSE	15	CTTTTTGTGAAGTCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968153	933175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956166_959917_960131_964909_964971_967656
687500	contig_5485_pilon	-	1785	4	Intergenic	novelGene_37709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	550.638417354498	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	301	999	86314	85491	FALSE	45	TAAAAGCATTTAAGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	87943	84704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_86861_87780
687512	contig_3081_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_133952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	738	1250	591013	590501	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTNFEVRANIKFLTNSSGQLPKSLKLCNKFMGMLPHIKRQFFYGSNVLTKVERTSKMSQEREDLSEGYGDCFWDSKGIILIDFLQGHRAYYEEDLRKLTTALVRKRPGKLRRGIFLHHDNAPAHSLRVARADLQEVHWETLPYPPYRPDLAPSDLLLFPKLKEHLKGT	591750	589193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_589200_591800
687516	contig_10196_pilon	+	1065	3	Intergenic	novelGene_132105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	157.5	3932	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	409	783	925908	926282	FALSE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGQAGGSSWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	922241	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701
687519	contig_15354_pilon	-	1959	3	Intergenic	novelGene_65714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	258	1238	224900	223758	FALSE	25	GTAACTGGAATGCTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGEAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227608	223036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224562_224723_224922_227372
687520	contig_10241_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_142845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTTGAAATGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142637	143349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_142600_143300
687529	contig_12970_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_50550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGCCAATCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569713	570157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_569700_570200
687533	contig_5039_pilon	+	1876	2	Intergenic	novelGene_64892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGGAGAATGAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579178	585829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_579973_584747
687539	contig_20314_pilon	-	2546	1	Intergenic	novelGene_125648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCAGTATGCAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11965	9419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_9400_12000
687549	contig_6710_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_89099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653606	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
687553	contig_12644_pilon	+	1172	8	Intergenic	novelGene_44690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4495	junction_7	3944.58169842002	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	95	1084	2678055	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677598	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
687558	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687568	contig_14882_pilon	-	2064	16	Intergenic	novelGene_115017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	316.687606325224	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	549	1976	317252	295835	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363656	295746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321739_363416_363468_363509
687569	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_93724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687570	contig_6710_pilon	+	538	2	Intergenic	novelGene_97108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTGGCTTCTGCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
687571	contig_11072_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_140175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGTTGGAACAGAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49381	48764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11072_pilon_-_48800_49400
687577	contig_10982_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_87870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGATACTCCTCATAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117306	115229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_115200_117300
687578	contig_8658_pilon	-	1366	7	Intergenic	novelGene_55826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1117.15751649741	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	67	1032	55624	6049	FALSE	40	AATTTACAGACTCTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55690	5714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13136_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
687579	contig_7286_pilon	-	851	6	Intergenic	novelGene_108688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3944.42312131952	17	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	187	783	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293146	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291533_293110
687582	contig_6027_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_74418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108016	110575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_108000_110600
687584	contig_7279_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_145989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90167	91482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_90200_91500
687585	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
687596	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687599	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687617	contig_6710_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_97742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAATATTTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653690	653398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
687618	contig_10057_pilon	-	3072	1	Intergenic	novelGene_162329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	311	799	29203	28715	NA	15	TGGACAGTCCTTCCCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCGDSNPDSCMASLELGKVLSVPPASEEERAFKQSLHHFRLWLLWTSVFRPLTSHHDCPVPLPPAAYAEQSSKAEVRQEAAQYGKVCVQSPDVLGTFYLAASSDHEHHSGLPHPNLGVEDNLIAGNFREGLSPSHSNLFYPTALKGRFYYLHFTNEAQRVK	29513	26441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_26400_29500
687625	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_97228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687626	contig_6589_pilon	+	1487	7	Intergenic	novelGene_26079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.9773358019058	168	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	76	462	1865997	1868041	TRUE	15	TTTTCTACCAGCTCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVGPPLALLSLSRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDVSHRWEGPGMEVGARDSRSPPFRGPGRGLRGALAAGPGPALDDTPQDSGWVPDVHPAGGCGH	1865921	1875174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867457_1867928_1868073_1868906_1869046_1872155_1872787_1874950
687630	contig_6440_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_161676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTAATGTGGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111994	113850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_112000_113800
687632	contig_9199_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_65630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	39.5181920132994	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	86	709	120933	122011	FALSE	30	AAGATTCACCGGCCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKVLVVEENTDEGKEEVLPLVNISAHRQQVLRRSCCQGWMYSWRCSPPVQWGRPNGRWPKLGGTWKRLCRCW	115809	122398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667
687633	contig_7396_pilon	-	1484	15	Intergenic	novelGene_79645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3584.8761086383	1	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1236	247	1482	255163	247195	FALSE	30	GAACAGGTCAGTTTAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISEFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLL	257472	247192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_248951_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257271_257381
687635	contig_5696_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_117606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	466	1401	326	1726	864538	863138	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVIFPDTLSIRKMFPFPVSFKSISLSLMALTSFTTFSLGDISLPVSSKSVSTSLIVLTSSGVSSHGDISLLPVSSKSPFPSSEAAIISGMFCLGETSLSVSSKSVSTSPTVLTSSGAFSHGDISLPVSSKSASLSSEAAIISGMFCLGETSLSVSSKSVSTSPTVLTSSGASSHGDISLPVSSKSAFPSSEAAIISGIFFLGETSLLVSSKSVSTSPTVLTSSGASSHADISLPVSSKSASLSSEAAIISGNFFLGETSLSVFFKPFSTSPTVLTSSGASSCRDVSLLSGSLKSASLSSEATIISGNFFLGETSFSVFFKPFSTSPTVLISSGAFSHGDISVLSVSSKSVSISSRASITSDSFSLGEISLPVSVKLVSISIVMSIISAIFSLREMSLLPVSFTSVSISLVVLASTGIFSLGEVSSLAISPKSDSISPGSRIFSGTSSLEKISLLPVPLSIIGFGF	864863	862161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_862200_864900
687636	contig_179_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_162350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACACTAGGTACTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130217	131341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_179_pilon_+_130200_131300
687639	contig_4364_pilon	+	2148	8	Intergenic	novelGene_66	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	38.7740708648005	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	76	654	703017	707465	TRUE	25	ATATTAGTGTGATTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGCRSIGCGPAAGSLSPPSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPESPRDVSQSSDSDPDAGGHS	701284	709034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_701336_702992_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707467_707541
687658	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687660	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
687667	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
687671	contig_3386_pilon	-	3144	3	Intergenic	novelGene_34591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	24.5	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	282	599	522114	518751	FALSE	75	CATAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCAKKGERECHIVVLTDEDSVDWDEDHPPPMGEEYSQILYSSKLYRFFKYIENRDVAKTVLKERGLKNIRIGIEAPLYPDVMGKGRRKESPCGFPVCSKQIPH	522395	516205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_518840_520332_520444_521996
687672	contig_14209_pilon	+	1827	13	Intergenic	novelGene_88318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	231.442157400553	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	69	863	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRLVAPRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32297	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33920_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35775_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
687678	contig_14483_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_133738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	22.8958996814325	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	300	1496	14197	11524	FALSE	25	TTTGTAATACTTGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPFGDAFRSHTFSEQTLMSTDLLANSSDPDFMYELDREMNYQQNPRDSFLSLEDCKDIENLESFTDVLDNEGALTSNWEQWDTYCEDLTKYTKLASCDIWGTKEVDYLGLDDFSSPYQDEEVISKTPTLAQLNSEDSQSVSDSLYYPESLFSVKQNPFPSSFPGKKITSRAAAPVCSSKTLQAEVPLSDCVQKASKPTSSTQIMVKTNVYHNEKVNFHVECKDYVKKAKVKINPVQQTRPLLSQVHTDAAKENTCYCGAVAKRQEKKGMEPLQGHATPALPFKETQELLLSPVPQDGPGSIAAGESSSLSASTLVSDSSQKKEEHNYSLFVSDNMGEQPTKCSPEEDEEDEEDVDDEDHDEGFGSEHELSENEEEEEEEEDYEDDKDDDISDTFSEP	39257	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_12610_14086_14213_16422_16616_39166
687679	contig_15410_pilon	-	2224	7	Intergenic	novelGene_130588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_6	260.665174761289	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	156	566	89172	87704	TRUE	25	TTAAATGGTGTGCTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNESVDPTLAIPVIQKGCIPSGEGADSELQAETVPEEADYEAVPVEAYGLAMLRGMGWKPGEGIGRTFNQVVKPRVNSLRPKGLGLGANLTEAQALASTGPHRLPKPDEEQEKEKEDQPQGLVPGGAVVVLSGPHRGVYGKVEGLDPDNVRAMVRLAAGSRVVTVSEYCLRPVSQQEFDKNSSDLSK	91316	85335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_85697_85793_85880_86394_86465_86562_87845_88121_88336_89116_89227_91215
687683	contig_7457_pilon	-	2219	9	Intergenic	novelGene_31445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	29.8202951024969	8	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	88	1005	477748	475920	TRUE	5	TGTATTGTGTCTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFRSGLLVLTTPLASLTTRLAPILTSAAQLVNHTLYVHLQPGLSLEGPAQPESSPVQATFEVLDLITHLYAGASVHGHLDVRVLLTNIRAKSAFLPPQFSSVQNLAHPPEVVLTDFQTLDGSQYNPVKQQLERYATSCYSCCPQLASVLLYPEYGSRAVSLEPQDAPSSSTIKPASPVARSPKQPVRGYHRGAVGGTFDRLHNAHKVLLSVSCILAQERLVVGVADKDLLKSKLLPELLQSYEVRVERLSEFLVDIKPSLTFDLIPLLDPYGPAGSDPSLEFLVVSEETYRGGDGRQPLPPRE	478227	474151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475766_475922_476193_476410_477048_477761_478152
687695	contig_10902_pilon	+	1324	8	Intergenic	novelGene_65690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	316.765348032713	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1290	35	1324	168491	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGFELQPQDGGPRVALAPGETVIGRGPLLGITDKRVSRRHAILEVVGGQLRIKPIHTNPCFYQSSGKSQLLPLKINLWRWLNPGDCFSLLVDKYIFRVFSTHSETEMECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	168456	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_168587_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
687706	contig_6270_pilon	+	1192	9	Intergenic	novelGene_99821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	150.179684045479	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	343	738	39429	45668	TRUE	20	AATTGCTGGGTTACTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRQWDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37416	47674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37427_37536_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
687712	contig_15304_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_30433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1714.5	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	186	668	54100	53260	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSASHPRSTCCHHRRRSWR	54285	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53313_53491_53813_53991
687713	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_94950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
687717	contig_9197_pilon	+	1367	3	Intergenic	novelGene_154353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160	3840	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52340	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92354
687718	contig_7457_pilon	-	1707	10	Intergenic	novelGene_31381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	51.5739909567786	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1039	1515	437993	437249	FALSE	15	CAAGTCACGGGTCTCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	442450	437056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438030_438414_438517_438999_439115_439569_439651_439898_439968_441329_441498_441683_441797_442096
687726	contig_17440_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_7657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3562	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
687728	contig_12464_pilon	-	1736	4	Intergenic	novelGene_68682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_3	785.556278484659	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	167	574	242417	222547	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLDPSSSHCGAHGAV	242583	181170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_182194_192378_192464_222492_222589_242051
687731	SIRV7	-	339	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33228	2	9	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114729	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
687738	contig_5954_pilon	-	2486	1	Intergenic	novelGene_28555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGATTTTTCAGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748492	746006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_746000_748500
687744	SIRV7	-	434	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-84	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114822	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70877_70988_78841_78964_114680
687748	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687756	contig_3269_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_117016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	497	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102356	104177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_102400_104200
687758	contig_13760_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_61358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGGTTGTGGCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358489	358961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_358500_359000
687761	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687763	contig_9706_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_20857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360	2739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
687770	contig_8656_pilon	+	2136	1	Intergenic	novelGene_162353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593290	595426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_593300_595400
687772	contig_15410_pilon	-	1501	12	Intergenic	novelGene_130577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	93.7919272636761	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	476	1342	56848	54277	FALSE	25	AAGCAATTCTTCCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVALVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59283	54117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_56829_57005_57295_57401_57488_57564_57669_57742_59216
687773	contig_15304_pilon	-	761	2	Intergenic	novelGene_30446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	193	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	689	718	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53814	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
687778	contig_5003_pilon	+	2456	3	Intergenic	novelGene_120194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_1	17.5	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGTATCTGCAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81532	87852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_82693_85517_85583_86621
687782	contig_6048_pilon	+	1856	11	Intergenic	novelGene_73250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	71.0746086869284	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	840	1634	1976465	1978064	FALSE	45	AAAGGAAGAAGGCACAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRGCSAYCLHASHQSVPGAAASLLKWRGGRTPSIQPAPRVCPPLRFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972009	1978286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974327_1975328_1975406_1976314_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
687783	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687784	contig_9708_pilon	+	1724	15	Intergenic	novelGene_67273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	125.222903297297	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	16	1551	768056	803598	TRUE	40	AATGTGACATCTGGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768040	804868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458_803677_804773
687789	contig_14209_pilon	+	2014	9	Intergenic	novelGene_88331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_8	130.244961514832	10	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	41	859	32366	37768	FALSE	40	TCCAATAAAACTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32325	38923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712
687793	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687794	contig_11285_pilon	+	1659	9	Intergenic	novelGene_5645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	538.521224628148	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	119	1246	767306	769760	FALSE	35	CCAATAAAGTTTGTACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLVTWLRPAASCPRAPTPWPRRPLHGRLIGQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQVRHLLYR	767097	770173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_767179_767268_767405_767763_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769657_769740
687798	contig_12414_pilon	-	1197	2	Intergenic	novelGene_59594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374352	372665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_373374_373863
687803	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
687805	SIRV2	-	283	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4590	34	3415	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
687812	contig_19640_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_134861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51704	50185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_50200_51700
687817	contig_10904_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_22484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	68	532	149604	150068	NA	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	149536	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_149500_151600
687825	contig_10235_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_46426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	182.923993778837	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	18	659	210483	212121	FALSE	5	CATGGTCCTTGGCTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210465	213261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211834_211918_212047
687828	contig_12540_pilon	-	2363	3	Intergenic	novelGene_148090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1085	1501	961653	958651	FALSE	55	TTCAACATGAGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAYVRACLRLSINVCTSARVPVCVHLPVHTCVQYLEGVLGAVARPPDAHSLQHARVAQLLQHQLLVEAQLLLLSVRADAADEEGLCLAQCFQELVKGCLELCADAGWLLLLVQVQERFGGTVMQGHANDELQGLGVQ	962737	957788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_958769_960891_960973_961435
687834	contig_835_pilon	+	1587	3	Intergenic	novelGene_152125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	277	junction_2	3	168	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	135	581	70975	164565	FALSE	65	TTCACTATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKSTEILEYSSDSGKEDDSENVLFIDSESPHKCSVDFGTDARQYMERLVEPWTKSTETILYTPQKQKNKFPRTPEDSTKKKKLIRGGLAERLNELQNRERSAISFWRHQCVSYPKTLEGRKSGVLVVKILELHEECTMQVAICEQLEDLQASSPSPGVAPGPGACLKILFTKDTASNLKGRPQDIVHIYPPW	70840	165571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_88205_88307_164341
687837	contig_6533_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_114625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTATGTGCTGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25189	25824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_25200_25800
687843	contig_10734_pilon	+	1902	13	Intergenic	novelGene_51280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	90.8020970756366	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	32	1603	1336726	1361646	TRUE	30	TGTCTGATAAGGTAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLSYGRVNLNVLREAVRRELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSEDRRGPARDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESESAFKECYLESDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNSYVEDCIAQKHPLIKVLRLICLQSVCNSGLKQKVLDYYRREILQTYGYEHILTLYSLEKAGLLRPQAGGRNNYPTIRKTLRLWMDDVNEQNPTDISYVYSGYAPSQRAASPAALPARLAEHRGGTPHSPRTPL	1336694	1362877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438_1339505_1339941_1340070_1341846_1342034_1346894_1347012_1347328_1347504_1352397_1352592_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1361514_1361685_1362616
687845	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_97381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
687846	contig_5935_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_102716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAACAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042399	1043517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1042400_1043500
687847	contig_5894_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_83021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAACTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296410	294774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_294800_296400
687848	contig_9297_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_69820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434327	431769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_431800_434300
687855	contig_13565_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_162374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTGAACTGCCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99758	101696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_99800_101700
687856	contig_18173_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_160761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTAGCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29902	30650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_29900_30600
687860	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	4	351	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14412	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687862	contig_14326_pilon	+	2625	7	Intergenic	novelGene_120649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5277443105271	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	145	600	35413	45955	TRUE	20	TTTATATTATTTTGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKGPSASTSPENSSAGGPSGSSNGAGESAGQDSTFECNICLDTAKDAVISLCGHLFWSCLQWLETRPNRQVCPVCKAGISRDKVIPLYGRGSTGQQDPRERRPLPVLRDRGQSQRTEGDFKDSDLEMVASRCLLELGHFPLGYLPQHLT	17915	50722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_35354_35593_40599_40722_42116_42174_45858_45977_47357_48791_50151
687863	contig_12873_pilon	+	1830	6	Intergenic	novelGene_27175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	1104.4616788282	2	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	765	1256	17896	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15974	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
687864	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687868	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	206	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687869	contig_2062_pilon	+	1347	11	Intergenic	novelGene_139064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	107.099439774445	161	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	51	1151	1457889	1485745	FALSE	15	TCTGGAGGGTATATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYSGSPAEAPPSKSPSMPSLNQTWPELNQSSEDTAIVYPVPIRMTPSKIHMQEMELKRTGSDHNNPTSPLLVKPPDLSEENKLNSSVKFASGNTVADGYSSSDSFTSDPEQIGNNVNRQRSHSGTSPDNTAPPPPPPRPQPSHSRSSSLDMNRTFTVTTGQQQAGVVAHPPAVPPRPQPSQAPGPIVHRPVDADGLITHTSTSPQQIPEQPNFADFSQFEVFTASSVNEEQDDEAEKHPEALPVEKSSDPASSLRGAKTESKIEEKTAASAPANVSKGTTPLAPPPKPVRRRLKSEDELRPEVDEHTQKTGVLAAVLASQPSIPRSVGKDKKAIQASIRRNKETNTVLARLNSELQQQLKDVLEERISLEVQLEQLRPFSHL	1457838	1485941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1457937_1467831_1467920_1471350_1471453_1473690_1473764_1475077_1475197_1476070_1476136_1478133_1478320_1479438_1479535_1481454_1481604_1482965_1483072_1485676
687871	contig_5779_pilon	-	999	2	Intergenic	novelGene_106434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94524	93294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94059_94289
687877	contig_3986_pilon	-	1918	13	Intergenic	novelGene_52702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	126.159373413155	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	114	1559	60653	35282	FALSE	35	ATAAGCCCAGCTTACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	108508	34922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52946_54777_54869_55923_56018_57911_57964_60587_60655_108396
687878	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
687880	contig_8242_pilon	+	1955	5	Intergenic	novelGene_80186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_4	62.3713676297065	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	120	689	3532	30830	FALSE	70	GATAAAAAGAAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGADPKSVVCAFFKQGQCTKGDKCKFSHDLTLERKCEKRSVYIDARDEELEKDTMDNWDEKKLEEVVNKKHGEAEKKKPKTQIVCPFLELSCYY	3412	32096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702
687882	contig_3948_pilon	+	2176	4	Intergenic	novelGene_53368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.593714361347	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	191	757	1813956	1860572	FALSE	30	TGTGAAGGTGAAAGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812398	1861991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812478_1813844_1814263_1814397_1814520_1860434
687890	contig_6915_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_162425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAGCACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274278	274017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_274000_274300
687894	contig_8570_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_120158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTGGGAAAAATTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343818	342000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_342000_343800
687901	contig_9871_pilon	-	1949	5	Intergenic	novelGene_75635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACAAAACCCCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352503	344445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_344792_348534_348638_349786_350011_350217_350348_351357
687902	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
687911	contig_6589_pilon	+	1391	10	Intergenic	novelGene_26043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1009.35547213843	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	360	785	1726977	1729051	TRUE	20	ATTCCCTGCGTTTTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLPSIANTFLSCPLCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCGTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLPIQWFLGRKDVAICSQKVTALEILWSSSTLHTCGRHESESTGSWSGRCKKWCWRRSRTTAPTRRRRRPRRAGTTCSSSCAAAAGILRRTGSRSSA	1725407	1731800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725983_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1727965_1728198_1728304_1728996_1729201_1730088_1730152_1731406
687912	contig_15146_pilon	+	2271	10	Intergenic	novelGene_116970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	130.217576708947	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1062	2165	624438	628786	FALSE	30	TGGTTAGATAATTTAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFSTEIAKFLKVAPGTLVVMQPERFQSRFEPKSHVMDIQGSTEASAIRDHVVQHALPLVGHRRVATEAKRYTRRPLVVVYLSVDFSFDYRVATQFWRSKVLEVAKDFPEYTFAIADEDDYASEVKDLGLGESGEDINAAVLDEGGRRFAMEPTEFDADALREFVTAFKKGKLQPVIKSQPAPKNNKGPVKVVVGKTFEDIVLDPSKDVLIEFYAPWCGHCKQLEPVYTALGKKYRGHKGLVIAKMDATANEATSDRYKVDGFPTIYFAPSGDKQNPIRFEGANRDLEHLSQFIEEHATQLGRAREEL	615072	628892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621840_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625893_626792_626950_627221_627456_628370
687924	contig_12623_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_138170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACAATTTTTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141321	142773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_+_141300_142800
687930	contig_9146_pilon	-	491	3	Intergenic	novelGene_79486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4271	junction_1	231.5	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	104	448	143366	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	143573	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479
687931	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
687935	SIRV7	-	372	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-25	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114763	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56091_70877_70988_78841_78964_114680
687940	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	34	3249	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
687941	SIRV2	-	647	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	3	2967	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
687947	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1437	632	982	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
687948	contig_5623_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_154788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	636	1034	96583	96981	NA	10	TTGGTGTGTCAGTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTFGSWRAASRRGEDEMAQAPCLSSRAVLAKECGQGSSGLSATPLYPLPEASSRGSSWKGNRWLPAVRPHRVADISLPRSPKPTEKLKLGSQTWKAFGPPNPNPKPAPARLPQLLLLGPQGPILHSEALI	95947	98149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_95900_98100
687968	SIRV7	-	230	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69055	1	35836	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
687987	contig_1596_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_131597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121461	122822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_121500_122800
687988	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
687993	contig_6361_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_24038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATCTATAAGCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687662	685164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_685200_687700
687999	contig_9955_pilon	-	1395	11	Intergenic	novelGene_21347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	51.6530734806749	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	639	1244	109887	86976	FALSE	40	AGGCTAAAAACTTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	127942	86824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113672_113807_118303_118491_127291_127338_127812
688012	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688016	contig_15039_pilon	-	3590	1	Intergenic	novelGene_110149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTATGTGAATTACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195950	192360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_192400_196000
688018	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688025	contig_9363_pilon	-	1953	11	Intergenic	novelGene_6536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_8	99.1455495723333	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	213	1547	639011	634178	FALSE	5	GCTGGTGCCGTGTCTCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSGAAKERPPEPLTPPLPYDHQTQTGSGESLGASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAASAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNITDEIMSQFPSTKAAAGEQKEDQSEDKKRPNIPPSPSPVPAKPSATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPTQPPVPSSVNEGSPSPPEPTSKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGLCNQPIQHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCREPFGDEGFHERDGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG	640233	633771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_634445_634661_634811_635148_635231_635484_635659_637745_637941_638052_638159_638273_638362_638520_638664_638765_638819_638933_639050_640059
688026	contig_11986_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_69090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATAAATGTTTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26320	25317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_25300_26300
688032	contig_1009_pilon	+	2780	1	Intergenic	novelGene_121780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	2263	2643	310177	310557	NA	5	CAGTTTCCTGTTTCCGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSYYTWLLFLENSHGFPTRPSALKVPLPLSWIPHRREDRARPTLGLTEALLMMTAQFLPVLRFDIKLFSLGKRGVKREREGEGKGRERGRLGGGLGAAGLVGNACHSSICAHIAGIFHPPGKGN	307914	310694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_307900_310700
688034	contig_15327_pilon	-	1693	7	Intergenic	novelGene_70718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.882476260908	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	17	691	967479	960518	FALSE	25	TCTGTTTGCTGAAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967495	959515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_961524_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
688041	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688053	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
688057	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
688062	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
688063	contig_8616_pilon	-	1822	10	Intergenic	novelGene_72375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	57.4245613558657	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	780	1772	183576	178743	FALSE	10	GTGAGGTATTGTCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	185457	178692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184266_184441_184901_184969_185008
688065	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688069	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688072	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688075	contig_8617_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_73440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62507	62037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
688076	contig_1516_pilon	+	2609	23	Intergenic	novelGene_49947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_19	52.6776608289816	104	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	461	2050	294451	325041	TRUE	25	CTGGATATGAACACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKGQFWNDDDSEGDNESEEFLYGVQGSCAADLYRHPQLDADIEAVKEIYSENSVSIREYGTIDDVDVDLHINISFLDEEVSTAWKVLRTEPIVLRLRFSLSQYLDGPEPSIEVFQPSNKEGFGLGLQLKKILGMFTSQQWKHLSNDFLKTQQEKRHSWFKASGTIKKFRAGLSIFSPIPKSPSFPIIQDSMLKGKLGVPELRVGRLMNRSISCTMKNPKVEVFGYPPSPQVSGHCKNIPTLEYGFLVQIMKYAEQRIPTLNEYCVVCDEQHVFQNGSMLKPAVCTRELCVFSFYTLGVMSGAAEEVATGAEVVDLLVAMCRAALESPRKSIIFEPYPSVVDPTDPKTLAFNPKKKNYERLQKALDSVMSIREMTQGSYLEIKKQMDKLDPLAHPLLQWIISSNRSHIVKLPLSRQLKFMHTSHQFLLLSSPPAKEARFRTAKKLYGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVNASYTKLQEEELGNSSFKAPIALRFIQAINLSGDFTVSAGGIDHLSRNGKRTAQDALQG	291589	326515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_291853_294253_294454_295129_295208_296183_296279_296705_296767_297006_297098_297540_297608_300556_300707_301707_301859_302435_302490_304171_304268_304858_304952_305754_305881_306835_306902_307828_307897_309115_309165_309411_309525_310249_310323_323569_323686_325001_325082_325478_325543_325725_325811_326145
688079	contig_4812_pilon	-	1159	6	Intergenic	novelGene_103647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	7905	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	114	632	82626	79235	FALSE	30	GGAAGCTAAGTATTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82739	78707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
688087	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_96278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688095	contig_15002_pilon	-	1863	2	Intergenic	novelGene_162429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGGAAGATACAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24275	21796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15002_pilon_-_21896_22511
688096	contig_20742_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_150658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112244	110349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_110300_112200
688097	contig_8538_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_4682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAAGATCAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843097	842741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
688102	SIRV6	-	296	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTTTCCATGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
688107	contig_10446_pilon	+	2351	4	Intergenic	novelGene_162520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	43.5303214884624	342	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	129	1208	1248779	1256234	FALSE	15	GAACGCTGATGTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLPRGFEPPAPEHWGQRSLAELREMLKRQERLLRNEKFICKLPDKGKKISDSVGKLKAAIAEREELRGRSGRFPPVRLDCDVRQTVTAGVDVDTAKAQNSDQILDTSPLVPGCRSVHNSKSSETASPEQGTGHLFHSGGEETAEAGGTVSRHTAPSGRASAEDGEPPPRHRVSSGSDQVIVDRLQRMTIADQGEHRSEDSASTDDLRGLRSRTRKKPHYMEVLEVRAQNPVPPPHKFKTNVLPSQVWSGSASQCRGGEPLVSSEEKRRRDKKHLDDITAARLLPLHHMPTQLLSMEESLALQKQQKLNYEEMQAKLAAQKLAERLNIKMQNCNPEGEALKKYREARDEDGQSSDDGL	1248650	1257377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1248892_1250747_1251363_1254281_1254490_1256090
688108	contig_10003_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_88272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTCCAGCCCAGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802056	801626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_801600_802100
688110	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_96070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688111	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688120	contig_3986_pilon	-	1904	12	Intergenic	novelGene_52703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	121.180079098208	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	416	1552	55958	35282	FALSE	35	AATTTTAATAAGCCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKEKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153865	34929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57897_57964_60545_60655_153684
688124	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_95704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688125	contig_6710_pilon	+	518	2	Intergenic	novelGene_97726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653396	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
688127	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688137	contig_13542_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_131515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAATGCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432752	435096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_432800_435100
688138	contig_16185_pilon	-	1740	7	Intergenic	novelGene_144753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	98.494782715747	142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	146	901	127403	98932	FALSE	40	TTATTACCATAAATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLVKVFRIPNKTSLRSLGGTNVCSELLT	134408	98092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_99013_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
688143	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_95861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688148	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_94834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688156	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688157	contig_13377_pilon	-	929	5	Intergenic	novelGene_162526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.0033332592625	69	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	79	585	10902	3799	TRUE	20	TTGTAGCACTGGTGTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPQFLFTVSVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRALALTSLLSLQRAGAIKADHVSTYAIFIQTHSPSGEYMFEFDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGQAFFFDAQAGPTYIASLKTLLNYMIQLSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVQLGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIEGVGESIFLPNPDS	10980	28	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13377_pilon_-_250_3675_3816_4165_4328_4646_4893_10820
688158	contig_3077_pilon	+	1123	5	Intergenic	novelGene_26736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1150.33112080827	62	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	83	625	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWSDLGFPCRLCSPGAAPVLHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10144	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
688162	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4561	34	3386	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
688165	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688166	contig_15353_pilon	-	401	3	Intergenic	novelGene_151990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGACATCACACAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533812	532973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_533167_533265_533353_533691
688168	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
688173	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
688178	SIRV4	+	329	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1438	636	983	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
688188	contig_10058_pilon	-	2089	10	Intergenic	novelGene_67731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACGCTTCACGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101638	72552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_72663_97060_97132_97296_97404_97628_97786_98058_98259_98434_98538_98695_98813_99355_99405_99530_99653_100585
688191	contig_5643_pilon	+	1320	10	Intergenic	novelGene_39011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	805.445770296728	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	653	1312	634983	641584	FALSE	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPYHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631196	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636177_636255_636430_636581_641488
688196	contig_8674_pilon	+	2311	2	Intergenic	novelGene_102932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTAGTTACCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446915	449889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_448547_449209
688198	contig_6497_pilon	-	2320	2	Intergenic	novelGene_35591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACACAATATATGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351378	348027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_348666_349696
688203	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688207	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688209	contig_4769_pilon	-	2275	3	Intergenic	novelGene_117972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_1	9	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	9	311	437505	423617	FALSE	80	AAAAAATAAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVMASTEASRSLPKSRRDPEGRALRQDKFSVLLPTYNERENLPLIVWLLVKSFTESVINYEIIIIDDGSPDGTREVAEQLEKIYGSDKILLRPREKKLGLGK	437513	421652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_423659_433960_434061_437344
688212	contig_7898_pilon	-	797	5	Intergenic	novelGene_47523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6110	junction_4	1301.24197884175	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	71	727	284247	282118	FALSE	15	AGCCCTCTGCACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	284317	282047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229
688214	contig_3861_pilon	+	1689	10	Intergenic	novelGene_57888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	630.640591427126	821	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	273	1196	147714	176828	FALSE	35	CCCTTTGTAGCAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTAGAEELGGTGEVGEGEEVEEAAGEVGGAGEVGEVEAVREEAEEEAKEEPVNFSVDQPEEN	141735	177321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147726_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171836_176648
688218	contig_6608_pilon	-	2254	2	Intergenic	novelGene_162547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTATCATTGACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402048	398565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_400628_401856
688221	contig_14551_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_162549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164559	164327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14551_pilon_-_164300_164600
688229	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688230	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_97347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688231	contig_6327_pilon	+	2346	13	Intergenic	novelGene_147478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	219.796117648455	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	1372	2346	32757	59520	FALSE	50	GAGGAAAAAGAGTTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQENQLYYDPSTGIYYYCDVESGRYQFHSRVDLQTYQTCSMRQSKDKKLKKKRKDPESATSEEKDLNLEDKKVSSVEHMSCSEGEDFANVKKKAKRDIHYKNSSPKFTVPVSGNSIESPFNENTYNSTSFKVEKIIETDSEPEEGEITDSQTEDSYDEDITSEDGITAENTEDEDEEKIWPPCIRVIVIRSPVLQIGSLFIITAVNPATIGREKDMEHTLRIPEVGVSKFHAEIHFDHDLQSYVLVDQGSQNGTIVNGKQILQPKTKCDPYVLEHGDEVKIGETVLSFHIHPGSDTCDGCEPGQVRAHLRLDKKDESFAGPALSK	17219	59520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_17235_20376_20480_21489_21693_24031_24197_29411_30171_32630_32763_33670_33857_44196_44528_45811_45924_49725_49778_56660_56763_57608_57775_59500
688241	contig_10980_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_162551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104670	106990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_104700_107000
688243	contig_12864_pilon	-	1565	7	Intergenic	novelGene_76389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	486.298490869777	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	66	608	223293	217842	TRUE	25	TGGGCCATAATGTATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223358	214852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215792_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
688254	contig_5643_pilon	+	2078	15	Intergenic	novelGene_39058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	764.021987208991	1	119	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	631	1722	634983	641052	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQAAGAG	631218	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641034_641244_641433
688256	contig_16098_pilon	-	2033	17	Intergenic	novelGene_45875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_16	51.0504881832681	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	374	1282	253301	247493	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	255217	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
688258	contig_14970_pilon	-	1714	7	Intergenic	novelGene_45103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	140.197479768123	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	358	1107	291083	255496	FALSE	10	TCTCGATAGCTGCCTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKDREEMAMCCWEH	315755	254888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_255535_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
688260	contig_13894_pilon	+	1124	7	Intergenic	novelGene_62129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1241.39424304556	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	155	967	521729	527409	FALSE	30	GAAAGCATTCATGGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLVVGCE	521574	527566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_527391
688263	contig_6710_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_97468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688273	contig_3529_pilon	-	1530	6	Intergenic	novelGene_105388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_4	305.829756564007	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	72	890	790139	778588	FALSE	40	TAAAAATATGTATGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVTDSPVGVRGTLRPPPGSFLIMLSRVVLSAAATAAASLKNAAVLGPGVLQATRIFHTGQPSLAPVPPLPEYGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYMLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYKEVKNRLDYHISVQNMMRRKEQEHMINWVEKNVMKSISTQQVHEVYKFWGCTDTSLRSLWQGGFSLETVGDPVVHFFWNMVT	790210	777947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_778894_784507_784634_785190_785355_786999_787146_789784_789822_790099
688277	contig_14575_pilon	+	2050	20	Intergenic	novelGene_101865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	118.111103148606	2	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	1353	2048	41622	63928	FALSE	75	AAAAAAATTAGCAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEKKLKRKIQKEE	17090	63930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
688286	contig_15134_pilon	-	1955	17	Intergenic	novelGene_140220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	117.347757088706	4	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	169	1002	216759	199503	TRUE	30	ATTGAAGGACAAGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQI	221843	184501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188025_188949_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_205922_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216766_218006_218106_221780
688287	contig_6427_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_162589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1393	1740	1303379	1303032	NA	35	CACACACCCCCACACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRESINHTQSWAALGGCSLQRRQTQSGSDSTAFTSSGRLTSRGLRLRLPPSAGKQPQHVFTVTAITKGPGRHLQTGTTSQLGRGVVLPSDAPILGHVFREYFRKFLNQQAFKFL	1304771	1302658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1302700_1304800
688292	contig_10428_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_162590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAATATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42863	41431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_41400_42900
688293	contig_18869_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_56326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	67	312	73707	73462	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73773	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
688294	contig_6488_pilon	+	2296	3	Intergenic	novelGene_44776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_2	9.5	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1647	1964	268646	268963	FALSE	35	AAATATGTAAGCATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRQSRACAQWPTRGVYKALLRQAIISYTNLALFTLTPFSMEARLPTASSCSRANHEPQSIRRRFEKWHKARCLIFLGRAGPSFYPHQTVLFERPQVLQQKETGN	265003	269295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_265538_266260_266366_267638
688302	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688308	contig_11986_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_69148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	1456	2001	302638	302093	NA	30	TAATCATGTTAGCATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEEGWVLQAGKQCPRGKGRGEAGGPDVHGGEGAGLHCVQRGHMAPLLEEGRACSPSVCRGEGMWPHCAWREGNAVPLCAEGRACGPTMCRGEGMQPHCAWKEGNTAPLCAEERARSPTVHSALGSLPLAALLNFHSHLLGRPLSPFHRKLGNRDAGVGGFPRTGRAASKWRSWNQPSPA	304093	301807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_301800_304100
688313	contig_11338_pilon	-	1851	14	Intergenic	novelGene_6294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	258.730812111922	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	26	1417	250534	204357	TRUE	40	ATTGGAGGAAATATTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWVTYTKGMRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERSWSFGF	250559	196629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204379_206701_206941_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_244695_244747_250509
688314	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688315	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688316	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688317	contig_7457_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_31444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGTCACGGCCCTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473191	470931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_471292_471559
688318	contig_8377_pilon	+	2033	19	Intergenic	novelGene_34923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3224.31801813946	1	103	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	100	1398	68257	164610	TRUE	30	TGGAGATGTGGTTGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVRLCFL	68076	180433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164639_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
688326	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688330	contig_13744_pilon	-	1526	13	Intergenic	novelGene_77208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	77.4279234729521	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	43	1176	1167590	1050039	FALSE	5	GGCCCTCGGGGCACGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVLSRSLSFLTCRMGTAALPVLRTCSVNIATVLTSQSPSVLLTLRGVNTDSSSVCREASFEGISKFNVNNTILHPEIVECRVFKTDMELEVLRYTNKISSEAHQEVMKAVKVGMKEYEMESLFEHYCYSRGGMRHSSYTCICGSGENSGVLHYGHAGAPNDRTIQDGDMCLFDMGGEYYCFASDITCSFPANGKFTADQKAIYEAVLRSCRAVMSAMKPGVWWPDMHRLADRIHLEELARIGILSGSVDAMAQVHLGAVFMPHGLGHFLGIDVHDVGGYPKGVDRIDEPGLRSLRTARHLEPGMVLTVEPGIYFIDHLLDEALADPARACFFNREVLQRFRGFGGVRIEEDVVVTGSGMELLTCVPRTVEEIEACMAGRDKAFTPFSGPK	1168111	1049688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1050177_1050622_1050815_1054042_1054228_1064637_1064787_1075193_1075272_1076753_1076823_1129486_1129534_1130576_1130653_1145459_1145505_1165457_1165520_1167403_1167452_1167545_1167613_1168091
688332	contig_13366_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_99774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCTCCCTCAGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59631	60235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_59600_60200
688333	contig_13366_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_99775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGGACGGCATCGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61093	61466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_61100_61500
688334	contig_14447_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_162601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTGACATTGACTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108373	108191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14447_pilon_-_108200_108400
688335	scaffold_9100_pilon	-	1454	9	Intergenic	novelGene_83296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_8	286.57893218972	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	185	1204	784035	746337	FALSE	20	AAATTTCCTCTTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPNVSASYPPYQATGPPNTSYMPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	796600	746086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274_749478_768983_769076_774460_774528_777866_777994_781780_781945_783998_784065_796445
688339	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_97335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688342	contig_9014_pilon	-	1680	13	Intergenic	novelGene_106763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	54.9840254579051	13	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	156	818	83127	79637	TRUE	10	GAAGGTTTTGTTTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQVCLTGEARILTCPSLSQPRS	83456	78129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_83319
688343	contig_15063_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_10702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	588	1400	35271	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVSPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35033_35371_35839_36158_36266
688348	SIRV6	+	583	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10242	1	1005	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11242	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11800
688350	contig_11292_pilon	+	2024	2	Intergenic	novelGene_109471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457582	459720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_458639_458752
688352	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688376	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_89229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653720	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688383	contig_7728_pilon	+	1224	9	Intergenic	novelGene_64705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACTGAGGTTCGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713429	752200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_713815_716036_716171_724821_724914_724993_725106_726477_726578_729257_729336_730499_730551_735944_736057_752040
688388	contig_14220_pilon	-	1256	7	Intergenic	novelGene_159867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_2	384.059638019352	124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	165	1094	422880	331841	FALSE	20	TTTATTGTTTTAGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTDEEYLQAYGGQQGMQKQEDYVAEDKLDEITDSQVAPETEEGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLGNFFCLSPIFLHPHFSFLHSSIMIN	423044	331678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_332090_355341_355462_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
688393	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_97014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688394	contig_9481_pilon	+	1459	11	Intergenic	novelGene_149625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	267	299	80949	80981	TRUE	25	ACCAGCTTACTGACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHVGLRLLRVLVLHLLEKLAEAFSFRVSKDIFLPHGLLLLRFHHNHQLVKKLLRLDELQDFLVAVVLVLRTILGLLNDQFPSLNVDLEMQFLRNPQGL	75976	170861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_76051_76969_77077_80863_80983_81951_82031_82197_82275_89061_89152_100007_100148_105417_105592_114796_115084_149697_149748_170599
688395	contig_8269_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_106265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399408	399827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_399400_399800
688398	contig_11720_pilon	+	1185	10	Intergenic	novelGene_43952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	357.689740721318	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	13	963	262271	272244	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSWPQSTWDLPSTWSGPVALPTEPPSWLTAPTNTSCMGSLMRSRRREGQLDEPPHGGRHLAC	262258	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266512_271926_271961_272096
688401	contig_12270_pilon	-	301	2	Intergenic	novelGene_114111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	29	301	14409	13914	FALSE	25	TTCACTTTCACCATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTD	14437	13913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
688405	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688408	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688409	contig_12790_pilon	+	1865	10	Intergenic	novelGene_35229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262.557271823986	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	848	1177	310475	312473	FALSE	15	TTGCCCTGCACTCACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305935	313161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307343_308753_308842_309578_309756_309877_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
688420	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688421	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
688423	scaffold_15568_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_122570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTGGAGTATCTTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20713	21647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_20700_21600
688424	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	232	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688425	contig_10766_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_151193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTACTCCCAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120276	122609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_120300_122600
688431	contig_3956_pilon	+	1088	5	Intergenic	novelGene_15005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1455.28940420797	50	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	81	893	1281682	1290816	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284213_1290561
688435	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_97350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688436	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688446	contig_8254_pilon	+	2661	3	Intergenic	novelGene_48361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	119	59	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	133	444	72814	74975	FALSE	95	AAAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKVKI	14887	77192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_15020_72813_72865_74714
688452	contig_12756_pilon	+	1784	8	Intergenic	novelGene_153203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	95	junction_1	74.4983221287567	329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	364	918	47123	60272	TRUE	30	AACAAAGTTGTTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMVMCF	46759	66925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60535_61922_62038_66436
688459	contig_9463_pilon	+	1329	9	Intergenic	novelGene_83825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	194.145402984464	40	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	560	928	222660	223028	FALSE	10	TTGGCTCTGAAGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185912	223429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961_222048_222566
688462	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688465	contig_3233_pilon	+	2032	9	Intergenic	novelGene_56543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	305.055322851446	9	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	1146	1907	742531	747909	FALSE	25	ACCCACTCCCCAATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVSLRPRPSRPSTLRQETIWAQLPLRGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738500	748034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740817_740917_741759_742613_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
688466	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688473	scaffold_16539_pilon	-	1835	12	Intergenic	novelGene_68358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	360.183607907077	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	905	1525	494596	490096	FALSE	10	CAGCCTGGGCCTGAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLLWPTWHAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	508847	489785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491959_494567_494769_498735_498832_498948_499070_500563_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_508811
688479	contig_5918_pilon	+	1247	8	Intergenic	novelGene_99503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	50.4574987853487	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	115	807	258126	283157	FALSE	35	CCGTCAAAGTAGGCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHPRTSLETKEYPDTEIQKNQVLSLEEWQEKWVNHNIPFHQEEGHQLLKKHLDTFLNGRSKLRVFFPLCGKAVEMRWFADLGHSVVGVEISELGIREFFTEQNLSYSEELITQIPGAKVFKSSSENISLYCCNMFDLPRANIGQFDRIWDRGALVAVNPADRQRYADIMLSLTRKRFRYFACVVSYDPTKHPGTVCSIHCLDSVDVFEERHRSWGIDYIFEKLYLFTEK	251292	283597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_251359_258077_258266_259400_259494_264231_264365_268811_268865_269818_269894_277826_277913_283044
688490	contig_12123_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_144593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGGCATTTAGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76022	76697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_76000_76700
688495	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688497	contig_18420_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_109350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAATGAACAGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98980	97335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_97300_99000
688500	contig_1948_pilon	-	1447	5	Intergenic	novelGene_31176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	153.183509229943	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTATTCTAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552077	543607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544359_544439_544576_546754_546900_548485_548594_551770
688520	contig_10777_pilon	+	1428	10	Intergenic	novelGene_101159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	272.645883478511	62	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	258	1004	8328	50625	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSGKMVES	6467	51049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560
688522	contig_3382_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_124069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTTGTTTCCATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302500	301558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_301600_302500
688523	contig_2768_pilon	-	2423	16	Intergenic	novelGene_57505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	463	912	791569	786975	TRUE	15	CGGAGCCTCTTCAGCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFLRNNIILLQCLIIGLCFFQEIPNEDIFEESRRFKSMLESLFQGRDKSTLSTEQQRQAASLFLRLMEVLHNAIDCLPNGLLDLPSVQLYVISNTFLGICRICVSPNSPEMQIHGLAVKMEPPSFLLGTIRMWYGIRTVVKTLVKQK	792907	749659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_749797_754343_754562_763841_764077_770252_770407_771088_771181_775787_775920_778478_778631_779794_779881_781763_781857_782341_782465_786885_787010_788189_788329_790134_790220_790771_790897_791503_791677_792552
688526	contig_5643_pilon	-	1378	3	Intergenic	novelGene_38715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_1	146.5	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCTCCTGGAGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33069	31244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32687_33009
688534	contig_12528_pilon	-	1665	10	Intergenic	novelGene_81324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	577	junction_4	414.848417951115	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	324	1199	966228	933323	FALSE	30	GAAAAGGTTTATATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	967934	932856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
688538	contig_17549_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_162608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTTTGGTTCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441408	442433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_+_441400_442400
688539	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
688546	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688548	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688549	contig_11115_pilon	-	2560	13	Intergenic	novelGene_102790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	771	1631	157691	154394	TRUE	45	GGTACATGCATGAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCLEDGDEVLEGRAEGGLCLPAVLHEVIDLTGTCLGPWQPLPLFQQLSEPQHRHLSLGETYELDEFRGGALAGVAAGQQLIQGDPERPDVRRIVELALLQALWGVPEHGAVPVLAHAVVLVAFRHGLGQAKVPDLDQPVIVQEHVAGSQVSVDIVLRVQVSHALADLLGEEQQLSQPHTVPGQVVSEAAQGHVLHDQLHRLLACVLAAALVLDDVLVVERAQDVDLAPPTRMELGAAACLEGLHGHHLASAVVSRVVAVQADLAEVTLAQIPNLFQIALVENRGV	158461	134638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_134804_135401_135617_139972_140096_140270_140418_140744_140830_153727_153881_154352_154449_154949_155141_155461_155583_156006_156179_156385_156506_157400_157511_157599
688550	contig_5832_pilon	+	1246	3	Intergenic	novelGene_134170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	27	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	66	362	565712	569933	FALSE	15	CAGGGGTCTCTGCTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFVNQRGRGRLDFRCGLQGVEMSYIPGQPVTAVVQRVEIHKLRQGENLILGFSIGGGIDQDPSQNPFSEDKTDKVNGWDMTMVTHDQARKRLTKRSEEVVRLLVTRQSLQKAVQQSMLS	565646	570817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_565751_568817_568938_569795
688552	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
688558	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688560	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_96500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688565	contig_15134_pilon	-	2044	16	Intergenic	novelGene_140214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	116.225910287776	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	173	766	211182	203349	TRUE	30	TATGTAAGAATTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKSPEGPQVKNSCHRSKFCLYAYPRLN	212167	184236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_193837_193888_194694_194801_194917_194989_199386_199509_203346_203428_204639_204768_205886_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055
688566	contig_9440_pilon	-	1953	6	Intergenic	novelGene_59103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.9542031573	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	43	726	1716626	1700693	TRUE	30	TCATTCTTTACAAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716668	1698804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699126_1699786_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1716475
688568	contig_3270_pilon	+	412	4	Intergenic	novelGene_104435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5433.3939260425	84	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	301	378	46649	46726	FALSE	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPIRIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44122	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44133_45124_45211_45934_46067_46576
688570	SIRV6	+	277	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10545	4	1308	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11545	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
688578	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	592	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688585	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688586	contig_13744_pilon	+	3044	20	Intergenic	novelGene_77183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.5787039081626	186	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	933	2802	10	2811	718904	760922	FALSE	15	GAATTTTTCTATTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPDSDSDEDLVSYGTGLEPLEEGERPKKPIPLQDQTVRDEKGRYKRFHGAFSGGFSAGYFNTVGSKEEGWTPSTFISSRQNRADKSVLGPEDFMDEEDLSEFGIAPKTIVTTDDFASKTKDRIREKARQLAAAAAPIPGATLLDDLIAPAKLSVGFELLRKMGWKEGQGVGPRVKRRPRRQKPDPGVKIYGCALPPGDSEGSEDDDDDYLPENVTFAPKDVTPVDFTPKDNVHGLAYKGLDPHQALFGTSGEHFNLFSAGLERASNLLGDVGLSKGRKLGISGQAFGVGALEEEDDDIYATETLSKYDTVLKDEEPGDGLYGWTAPKQYKSQKESEKDLRYIGKILDGFSLASKSLSSKKIYPPPELPREYRPVHYFRPVVAATSENSQLLQVLSESSGKALCDPGTHSRHQLNASKRGDLLGETPIQGSATSVLEFLSQKDKERIKEMKQAAELKAAQLKAKSLAQHALSGRPQPSSPDLGHCSRHMASSGRTATVRASNFKPFAKDPEKQKRYEAFLVNMKQGHKDALERCLDPNMTEWERGRERDEFARASQLYVSSHSTLSSRFTHAKEEDDPDQVEVPRDQENDISDKQSAVKMKMFGKLTRDTFEWHPDKLLCKRFNVPDPYPDSTLVGLPRVKRDKYSVFNFLTLPETASLPAAQASSEKVQQHRGPDKSRKPSRWDTSKEEKKEDSISEFLSLARSKVGTPKQEPSPLVNKEEEHATESLSNKMVNKGADSQSEGEVSRPSMDLFKAIFASSSDEKSSSSEDEQGDSEDDQAGVGEADFKHSEETDLVETSSVAPTSEPAPQAPAPSFSIQKMHIDEREEFGPRLPPVFCPNARRTLEIPQKEKHKKNKEKPKTKKEHRRRKEKKKKHRKHKHKGKQKNKKSEKSSSSEGTESSDSGSDEEGTADVSPQELLRRLKRLPLKRQ	718894	761155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_718977_726876_727012_728355_728445_729891_730053_730689_730788_731378_731438_731809_732053_733057_733206_735926_736007_739294_739500_741273_741571_742564_742744_743023_743152_743963_744101_744461_744629_749301_749519_751190_751299_753453_753552_757762_757912_760891
688589	contig_10135_pilon	-	2027	9	Intergenic	novelGene_106620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	42.190046219458	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	397	1524	88066	84292	FALSE	5	ATCTCTGTTCTTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89570	83788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86261_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88920_89057_89502
688590	contig_5643_pilon	+	1648	7	Intergenic	novelGene_38755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	160.638742386622	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	140	1252	157978	163341	FALSE	20	GGCAAAGCTTCTCCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKKLTGWCWPARGVRRASLLFSNRGPCKHWGPGEGSGCGGPRAASMGTEEAWCLLLCLALSRAAEAKPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157838	163737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_159333_160576_160859_161443_161747_163000_163085_163297
688591	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCAACCGCCAGATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
688594	contig_6270_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_99853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGTTTTGCTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457445	459605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_457400_459600
688595	contig_3602_pilon	+	2117	9	Intergenic	novelGene_60590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	52.1714421403127	211	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	92	1132	694698	775960	FALSE	0	TTTTTTGTTGTTGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKEEAGGGISEEEAAQYDRQIRLWGLEAQKRLRASRVLLVGMKGLGAEIAKNLILAGVKGLTMLDHEQVSPEDPGAQFLIRTGSIGRNRAEASLERAQNLNPMVDVKVDTENIEKKPESFFTQFDAVCLTCCSRDVLVKVDQICHKNSIKFFTGDVFGYHGYTFANLGEHEFVEEKTKVAKVSQGVEDGPDTKRAKLDSSETTMVKKKMVFCPVKEALEVDWRSEKVKAALKRTTSDYFLLQVLLKFRTDKGRDPSSETYGEDSELLLQIRNDVLDSLGVSPDLLPEDFVRYCFSEMAPVCAVVGGILAQEIVKALSQRDPPHNNFFFFDGMKGSGIVECLGPK	694606	776945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_694796_712232_712345_717281_717456_719540_719684_721914_722015_734171_734278_759162_759308_771438_771509_775867
688600	contig_16252_pilon	+	515	3	Intergenic	novelGene_162609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTTGCTCATCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17387	39654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16252_pilon_+_17602_28507_28581_39426
688602	contig_4413_pilon	+	1839	8	Intergenic	novelGene_116986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	115.519589292051	29	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	180	848	126767	151646	FALSE	20	ATATTGCTTCGTCATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLMTHRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPGIVHLMSLLHLT	126064	152637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_126606_126810_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580
688603	contig_753_pilon	-	2028	8	Intergenic	novelGene_112964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_7	244.604303531484	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	917	2026	1186997	1181591	FALSE	55	TTAAATAAATAAAATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCDEHIQKLGSCITDPGNRETSGNTMHTVFHRDKTKDAHPESCCSSEKGGQPLPWFEHRKNVPQFAEPTETSFGPDSGKGAKSLVELLDESECTSDEEIFISQDEIQSFMANNQSFYSNREQYRQHLKEKFNKYCRLNDHKRPICSGWLTTAGA	1188985	1181588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1181789_1182478_1182728_1183227_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188199
688604	contig_14722_pilon	-	2081	22	Intergenic	novelGene_110211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	133.960413146009	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	106	837	151970	93337	TRUE	45	AACAAACTCACCATCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGALHFTPVAAPRPGTASFGPSAGLGPAARQPSWIMGFPKGPEGQGLPEVETREDEEQNVKLTEILELLVAAGYFRARIKGLSPFDKVVGGMTWCITTCSFDVDVDLLFQENSTIGQKIALSEKIVSVLPRMKCPHQLEPHQIQGMDFIHIFPVIQWLVKRAIETKEEMGDYIRSYSVSQFQKTYSLPEDDDFIKRKEKAIQTVVDISDVYKPCRKYRRQRGAEELLDEESRIHATLLEYGRLRTRRRHFLRGSLQEKELKPTRKMSSELLKSSAFSH	152075	37638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37892_45772_45887_47982_48068_49475_49514_51668_51752_58190_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93304_93356_93643_93737_105006_105108_120663_120721_127092_127192_136353_136466_140864_140960_142940_143055_151928
688621	contig_18869_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_56244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73746	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
688625	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_16984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
688628	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688629	contig_8020_pilon	+	2400	18	Intergenic	novelGene_114457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	37.499711648257	222	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	634	2367	406644	431592	FALSE	20	CACATGGGCTATGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCRANILVTELFDTELIGEGALPSYEHAHRHLVQENCEAVPHRATVYAQLVESRRMWSWNKLFPIHVQTSLGEQVIVPPLELERCPGAPSVYDIQLNQVSPADFTVLSDVLPMFSVDFSKQVSSSAACHSRQFEPLVSGRAQVVLSWWDIEMDPEGKIKCTMAPFWAHSDPEGLQWRDHWMQCVYFLSQEEPVIQGSALCLVAHHDDYCVWYSLWRTRSRSSPVCLFISWPSPEKNGGDLHQVRPVCDCQAHLLWNRPRFGELNDQDRTDQYVQALGTVLKPDSICLCVSDGSLLPMLAWHLGAKQVFTVECSAASHRLMKKIFKANHLEEKINIIEKRSELLTPADLGGKKVSLLLGEPFFTTSLLPWHNLYFWYVRTAVDQHLVPSAIVMPQAASLHAMVVEFRDLWRIRSPCGDCEGFDVHIMDDMVKRALDFRESREAEPHPLWEYPCRSLSEPQRILTFDFRQLVPQQPVRAEGAIELRRPGRSHGAVLWMDYHLTPDSTVSTGLLRPAGDKGDCCWNPHCKQAVYFFSTSLDPRVPLSSPQSVTYTVEFRPHTGDITMDFRLSDDLGSVH	382261	431625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396_388434_401951_402102_403939_404133_406635_406749_413007_413250_413715_413897_416561_416690_417035_417217_423111_423196_423586_423635_424287_424378_427026_427189_428340_428416_430050_430212_431062_431160_431412
688635	contig_10354_pilon	+	2328	4	Intergenic	novelGene_50834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_3	492.117420495917	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	250	627	432370	463958	FALSE	35	GAAACTGTATTATGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKALLPFLAGVAGSADVDVQDCSLQMNRRPVIY	432120	465659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_463863
688639	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	46	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688650	contig_13744_pilon	-	1722	15	Intergenic	novelGene_77205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	70.1747454427815	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	196	1356	1185402	1050039	FALSE	5	CTGCCTCTTCCTCCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKIHSKEHFKEKYAVDDVWYTDEIATVLTSQSPSVLLTLRGVNTDSSSVCREASFEGISKFNVNNTILHPEIVECRVFKTDMELEVLRYTNKISSEAHQEVMKAVKVGMKEYEMESLFEHYCYSRGGMRHSSYTCICGSGENSGVLHYGHAGAPNDRTIQDGDMCLFDMGGEYYCFASDITCSFPANGKFTADQKAIYEAVLRSCRAVMSAMKPGVWWPDMHRLADRIHLEELARIGILSGSVDAMAQVHLGAVFMPHGLGHFLGIDVHDVGGYPKGVDRIDEPGLRSLRTARHLEPGMVLTVEPGIYFIDHLLDEALADPARACFFNREVLQRFRGFGGVRIEEDVVVTGSGMELLTCVPRTVEEIEACMAGRDKAFTPFSGPK	1197389	1049672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1050177_1050622_1050815_1054042_1054228_1064637_1064787_1075193_1075272_1076753_1076823_1129486_1129534_1130576_1130653_1145459_1145505_1165457_1165520_1167403_1167452_1173954_1174019_1185394_1185474_1187667_1187768_1197365
688652	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688655	contig_5770_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_74163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	374	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCTTTTTTCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260860	254287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_256152_260836
688656	contig_6710_pilon	+	551	2	Intergenic	novelGene_96185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
688657	contig_6199_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_126409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTACCCAGCCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687686	685926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_685900_687700
688658	contig_16098_pilon	+	1540	10	Intergenic	novelGene_45809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.5221474988286	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	424	1374	151768	153863	FALSE	25	ATAGCAGACTAGCTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150443	154029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150502_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
688670	contig_2209_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_140996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97032	98483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_97000_98500
688674	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688675	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_89265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688683	contig_998_pilon	-	1657	14	Intergenic	novelGene_153792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_5	398.277563705865	619	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	96	1229	365529	330554	FALSE	35	TGGAAAACTAGTCTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTGMLHGIGKFIVEIICCRFRLGAYKPVNSITFEDDHTDNHLPLLENNTH	373662	330125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330869_332165_332329_335041_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
688690	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688693	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688697	contig_14882_pilon	-	2229	15	Intergenic	novelGene_115012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	124.713733430294	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	703	1953	316452	295835	FALSE	25	TGCATGGTGTTAGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363561	295558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_317013_317224_317321_321323_321410_321541_321739_363416
688702	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688703	contig_8650_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_162619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCATAGAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200223	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_200200_201400
688707	contig_5217_pilon	-	1936	14	Intergenic	novelGene_135748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	102.388054036921	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	709	1707	531324	529231	FALSE	20	GACATTTATTTATTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533444	529001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766_531863_532688_532777_532869_532948_533137_533246_533343
688712	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688719	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_90395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688723	SIRV7	-	238	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91673	15	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
688725	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_97365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688731	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_93441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688735	SIRV6	+	1277	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3	31	3	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	35	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTTAGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3108	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
688743	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688744	contig_5041_pilon	+	1822	5	Intergenic	novelGene_27107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCCTCTGCAGACCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593847	636077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_595122_598400_598586_605334_605437_616557_616729_635987
688749	contig_91_pilon	-	2030	9	Intergenic	novelGene_127096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	337.200515272441	2	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	153	1100	344064	310894	FALSE	20	CACTTACTTTGCATACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAIKIIDLEEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGGSALDLLEPGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGTPFWMAPEVIKQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPHSELHPMKVLFLIPKNNPPTLEGNYSKPLKEFVEACLNKEPSFRPTAKELLKHKFIIRNAKKTSYLTELIDRYKRWKAEQSHDDSSSEDSDTETDGQASGGSDSGDWIFTIREKDPKNLENGALQPSDLERNKKDIPKRPFSQCLSTIISPLFAEILSEWRRNFIPLKFLWHLGFWFFLFSSSSSFLKKSTRALC	380854	309963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_311017_317393_317460_318497_318622_321982_322129_325296_325483_334662_334821_335110_335220_344028_344086_380723
688752	contig_8801_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_66296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	917	1330	546210	545797	NA	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	547126	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_545100_547100
688760	contig_6710_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_89134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653664	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688763	contig_152_pilon	+	1550	7	Intergenic	novelGene_162643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.778089043111	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722948	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723835_724562_724613_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
688765	contig_10235_pilon	+	1787	9	Intergenic	novelGene_46590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	51.0794418039195	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	115	855	567174	571582	TRUE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRSWWERRWLGCRASVPKGGGIVISLTGLLIIPFSGGSMLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSRRGETSGVS	567059	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_571554_571628_581262_581318_581506
688781	contig_9706_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_21016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCTTTGCGCCGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563130	562311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_562300_563100
688782	scaffold_14325_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_162662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGACTTTTGGCTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241353	239865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_239900_241400
688789	contig_19769_pilon	+	864	4	Intergenic	novelGene_102308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_1	94.0224559465568	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	378	833	87859	89322	FALSE	15	CCACTTAGCTGTGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87269	89353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87609_87820_88040_88841_88958_89163
688790	contig_16666_pilon	-	1352	4	Intergenic	novelGene_61740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
688795	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
688800	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_96863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688805	contig_16883_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_161745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364016	364763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_364000_364800
688809	contig_12250_pilon	-	1596	9	Intergenic	novelGene_80654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	178.447427482158	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	68	1339	379717	375947	FALSE	30	AGGAATCAGTATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKISQRWRSSRSLGPEAQPGWRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380525	375689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380459
688810	contig_9354_pilon	+	2022	10	Intergenic	novelGene_108042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_7	74.600334292436	477	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	65	1330	96289	117180	FALSE	10	TTTATTAGCTTTTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKFPLMAIGLEVAMIVLFGVFVQYENVQNSGQPSNTSSPAVMNSFFRLYPLFQHVNVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGFNFFIAALGLQWGTIIQGLLNDHGEKFHISIHSLISADFSTTTVLVSFGAVLGKISPIQVLIMTILEIAVFNGNEYLFAEIFQATDIGGSMVIHAFGAYFGLAVAGILYRSNQIWEHHNKQSDIHSDLFAMIGTLFLWIFWPSFNSTLAVPEEKQNRAIINTYFSLAACVLTSYAFSSLVERRGKLSMAHIQNATLAGGVAVGTCADMEINPYGSMIIGSIAGIVSVIGFKFLTPFFATTLRIQDTCGVHNLHGLPGIVGGLASIVVIAMGASDVSTTAMQAATLVTSIGTAVAGGLITGLILKLPIWEQPPDEDCYDDCVYWEVPTVDDSLSLSRFQPM	96224	117872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_96446_104932_105117_105984_106136_108697_108846_109396_109564_111077_111216_111996_112119_115831_115906_116127_116202_117129
688820	contig_3584_pilon	+	1057	4	Intergenic	novelGene_108171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	659.158217392119	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	31	906	527096	531381	FALSE	10	CATTTCTGTGCTCTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527065	531532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528795_530613
688823	contig_10042_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_79113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTACTAGTTTAGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6353	8405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6400_8400
688826	contig_6710_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_98161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688827	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688828	contig_5189_pilon	-	2344	11	Intergenic	novelGene_34854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1199.20936037041	2	145	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	111	1013	244235	204937	TRUE	25	GAATTACTTCTCTAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKVKYCPLWRLNHVQGFWTSLAKRFEKNCRCQAEIK	247751	198105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200432_200512_204911_205038_205692_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
688830	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688833	contig_8019_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_126985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAATGTTACATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102240	103801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_102200_103800
688842	contig_9481_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_149652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAGTGAATGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154419	153768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_153800_154400
688848	contig_6434_pilon	-	1626	6	Intergenic	novelGene_61821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	123.440025923523	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	134	436	338983	337884	TRUE	40	TGAAAGGTTTAATTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHQDRSDPCSHKQENTRSNYSLVIQKTRNPGGSMVSAHLLTESLVVRTHLATLWEKDLAICFHKDYSLENPMRVLALVRPDISRHLPHPPLYCQKSNI	347900	334488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_335573_337777_337965_338274_338439_338925_339022_343386_343463_347881
688858	contig_13481_pilon	+	2652	1	Intergenic	novelGene_119490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	413	772	1326813	1327172	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSYRPIKVMPITITQAINGIIFFMANARRKITITILIQGYPRGMLQKMPPAELFRSEAGLQRFSEVTRLIFTQHLPSKAFLTSFDTNHHYLHFTDRKSTCKGEEMLNDSQINGKTAK	1326400	1329052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1326400_1329100
688860	contig_4531_pilon	-	2337	7	Intergenic	novelGene_47904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	30.8472941366914	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	199	1356	369728	348571	FALSE	50	CCCAAAAACAACAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLGKRKLRCTFYIDDDNKGSLDLFLRKEK	370788	347589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370626
688861	contig_6533_pilon	+	826	3	Intergenic	novelGene_114610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	30	TAACTATGTGCTGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
688862	contig_4604_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_19176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCGCTCCCTCTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374173	373781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_373800_374200
688870	SIRV7	-	335	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33234	0	15	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114723	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
688871	contig_7179_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_78093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTGGACTTCCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597502	596948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_596900_597500
688873	contig_5797_pilon	+	2458	1	Intergenic	novelGene_56965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	16	639	554356	554979	NA	45	AAAAGGGTGATGTAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVPKMEVDINGESRSTLATLPLPVGEANSPGKAEAEKPRCSSTPCSPMRRTVSGYQILHMDSNYLVGFTTGEELLKLAQKCTGGEESKGEAMPSLRSKQLDAGLARSSRLYKTRSRYYQPYEIPAVNGRRRRRMPSSGDKCTKSLPYEPYKALHGPLPLCLLKGKRAHSKSLDYLNLDKMNIKEPADTEVLQYQLQHLTLRGDRVFARNNT	554340	556798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_554300_556800
688876	contig_14441_pilon	+	871	4	Intergenic	novelGene_100566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	109.83725334431	34	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	388	831	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGCSYERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111385_122137_122188_125517_125902_126496
688877	contig_9807_pilon	+	1364	8	Intergenic	novelGene_32919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.044353364731	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	221	826	147193	157176	TRUE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	145053	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_145202_147120_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_157171_157384_158676
688878	contig_15304_pilon	-	996	3	Intergenic	novelGene_30555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	189	962	54100	52925	FALSE	25	CCACCAGAAGCAGCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53762_53991
688881	contig_5988_pilon	-	1666	8	Intergenic	novelGene_15876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	182.6696583498	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	196	1110	392452	387838	TRUE	20	GTGAAATTTCTGTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	393707	387222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_387694_387752_388062_388498_388674_390323_390433_390653_390806_391212_391456_392440_392619_393678
688883	contig_14474_pilon	+	2850	1	Intergenic	novelGene_144208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAATTAGGCTTTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51377	54227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_51400_54200
688885	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688886	contig_11335_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_104917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAGCAGATAATTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334942	337297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_334900_337300
688889	contig_16237_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_162666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_-_0_1400
688892	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688898	contig_401_pilon	-	1735	5	Intergenic	novelGene_42859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	146.286320276368	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	392	1513	1724288	1721973	TRUE	5	TACTTCTGTGTCTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728755	1721704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1721827_1721872_1722981_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
688905	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688906	contig_4301_pilon	-	440	5	Intergenic	novelGene_65087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	385.608852984472	66	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCATACTTATTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441954	426028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_426127_432023_432087_432714_432825_434847_434914_441851
688909	SIRV4	+	210	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1558	635	1103	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2558	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
688911	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
688912	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688916	contig_3948_pilon	-	2691	2	Intergenic	novelGene_53309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1341	junction_1	0	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1870	2370	1472054	1468245	FALSE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSWFHRSARLWKIVVLRRADFGSCCPCLVPSPSRDSALAAPHTLPDLDMSNPTGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1473923	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756
688918	scaffold_12124_pilon	-	1725	10	Intergenic	novelGene_22072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	794	1102	857198	847715	TRUE	35	CTGCAATTCCACCTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWCWVLTFFWMSS	858974	837381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846898_847601_847752_852322_852461_854702_854801_857162_857252_857814_857970_858389
688920	contig_1443_pilon	-	2254	9	Intergenic	novelGene_28388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	38.0714788260188	3	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1058	1609	1039450	1038088	TRUE	20	TAAATCCTGGCTCTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGRAMELGRECLNLWGYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVSSSGAQFNRWSIKNNCLLSY	1052412	1036814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038263_1038441_1038481_1038886_1039075_1039300_1039518_1040132_1040329_1041265_1041667_1041753_1041972_1052237
688924	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
688927	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
688931	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688932	contig_5020_pilon	+	1093	5	Intergenic	novelGene_27897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	966.774889775278	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	229	708	122915	125701	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQGSCPPFFAWVPGMW	119469	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124267_125657
688933	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688938	contig_2596_pilon	+	1213	5	Intergenic	novelGene_53436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	148.195816405187	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	99	458	9838	10726	FALSE	15	ATACCCATGTGGTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEDWGLVVDWDHHLPPPAAKAVVESLPRTTIRGSQAELKCPVCLLEFEEEETAIKMPCHHLFHSNCILPWLSKTNSCPLCRHELPTDDDTYEEHRRDKARKQQQKHRLENLHGAMYT	9100	11481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_9953_10112_10223_10378_10454_10666
688947	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688950	contig_7644_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_64262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAGATCTGAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197041	197493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_197000_197500
688951	contig_2646_pilon	-	2308	4	Intergenic	novelGene_69561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_3	75.1842182021378	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	96	512	877063	869399	FALSE	45	CCAGCAAGGAAACCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWPRQRRRQRRRQLWGLRLGLCRPPLLLGPGMYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGEVVRNVSASLDLLLPLSS	877158	867602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_869525_869942_870077_874678_874735_876962
688952	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
688956	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_98020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
688958	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
688960	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	80	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688964	contig_9235_pilon	+	2327	3	Intergenic	novelGene_156210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	247	1284	46042	47278	FALSE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAARCRARCADPEVSQRSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTKSCPAASVPVETLLANSNDPSLLEWNSAAVSRTTPPTPRRTMGTTQRPLCPLEMSTLLPKTESCQPMGGCSYVATTPVFGKILWASTAAREELLPARRREGENMRSLELVGRVSSWEQCTGKGGDRVLAWNIFPPSWSFDFALSQRSSIVRLLKGSSGPSSKTNVPM	43966	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44017_45845_46576_46774
688966	contig_6102_pilon	-	974	6	Intergenic	novelGene_32280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	506	835	1448758	1448249	TRUE	15	ATGTGGCTGAGATCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPSSIKSTTLRKSSSRNCREVKAGAPSRRPPGVMALWSPGQVFLLAVIDTSSNTRSARAPSRPLGRRSTSTRWLSVPPKTPVSSLALAGHQPWPERFSEPAGSIPGT	1449379	1446988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1446997_1447952_1448072_1448236_1448336_1448419_1448580_1448675_1448782_1448897
688971	contig_13348_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_162675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTTTTCTTTATCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32795	31962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_32000_32800
688972	contig_15122_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_162703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGTGAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455825	456968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_455800_457000
688975	scaffold_7386_pilon	-	1572	12	Intergenic	novelGene_136588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_11	63.2945364712266	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	14	1309	309042	296776	FALSE	10	AGGGAGCCTCTCTCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKRIWAALSAPWRIGSLMGQTRSLPCLPTFTLSSWGAGQEEASRDPPRPLEAPNPAPLAPSVRTPAAGHTPRLRERAPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEIQPGPSESSTAYLLMYRRESLGPTRV	309055	296512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_296783_297337_297386_297863_297890_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308577_308800_308864
688977	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
688997	SIRV5	-	475	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGACTACAGTAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
689004	contig_13612_pilon	+	1825	10	Intergenic	novelGene_157290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	117.936999293984	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	176	988	51083	55134	TRUE	10	CCTGATCGTGTGATTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLAAHWKLRPQL	49383	57415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53707_55102_55301_56237_56371_56877
689005	contig_14727_pilon	-	1862	9	Intergenic	novelGene_56662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGCTCAGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348842	336569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_336761_338200_338269_340708_340864_340947_341009_341740_342055_344069_344849_345231_345288_346086_346234_348751
689009	contig_6227_pilon	-	1200	10	Intergenic	novelGene_49737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.135328584387	97	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	53	871	1224979	1202949	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDVTMD	1225031	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202960_1211206_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
689018	contig_5696_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_117612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTTGTCTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934573	937141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_934600_937100
689021	contig_7202_pilon	-	124	1	Intergenic	novelGene_16426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27746	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27700
689026	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689030	contig_8848_pilon	+	2133	2	Intergenic	novelGene_140449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATAAATGTCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44695	58635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_45020_56826
689033	contig_6227_pilon	-	1771	16	Intergenic	novelGene_49747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	340.00969920806	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	595	1473	1211228	1202920	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMDQHFRTAPLEKNAPVLLALLGIWYINCFGCETQAMLPYDQYLHRFAAYFQQGDMESNGKYITKSGARVDYKTGPILWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1224983	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211292_1213149_1213222_1214096_1214150_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
689037	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689043	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689048	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
689056	contig_11656_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_54030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	774	1178	495606	495202	NA	75	TCCAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSPSKDVWIFTNNKNDQACWSDRDWRNRESMASRHTFNSVLKSLLRFTLQPKMRQVYRANNNTCEERALWFSQVYKTNGCTSPKAKRRQEGTGKLDERTRGTRGGEGNSVDTSQGWQLMSQNNLCINYLMRN	496379	494654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_494700_496400
689057	contig_17144_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_29143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1409	1801	73934	74326	NA	25	GTACTGTAAAACCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRKITLRPEELDGAWLPLLTALIAITTDGASQSGRKTAEQKIKFSKKTKLTGLTETEGTLETMVLGHPSELELKPFLETTFQPNHRQAHKIKQPRRTCSLEQSILRAQKGNICPRAKMKRQEGVENQD	72525	74774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_72500_74800
689064	contig_19769_pilon	+	825	6	Intergenic	novelGene_102288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1482.9142389228	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	28	825	87249	89356	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRALWQVGSPTLTLLSFFCSPWSILLEVATTSTLASPPPSAGMPLPAAKWVLLLLAGPDDSGEPRLCRRKRTRVGDSIKLVLLP	87002	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88898_89113
689067	contig_5954_pilon	-	2060	13	Intergenic	novelGene_28643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	434.933990841011	1	117	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	241	1701	956264	945083	FALSE	15	GACCATCCGTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILRLPNRRALRLRASFSQPLFQAVAAICRLLSIRHPEELSLLRAPEKKEKKKKEKEPEEEVYDLSKVVLAGGVAPALFRGMPAHFSDSEQTEACYNMLSRPQPPPDPLLLQRLPRSGSMLDKTQLHSRWLDSSRCLMQQGVKAGDMLWLRFKYYSFFDLDPKTDAVRLTQLYEQARWDLLLEEIDCTEEEMMVFAALQYHINKLSKSGEVGEPVGRDSGLDDLDAALSNLEVKLEGSAPTDVLDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRRLLTRVVPQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	956799	944723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946363_946692_946908_947097_947205_947435_947561_947661_947712_947795_947931_948088_948197_955828_955932_956121_956291_956379_956500_956705
689070	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689071	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689073	contig_5954_pilon	-	1718	14	Intergenic	novelGene_28703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	198.831765585676	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	52	1695	975610	962114	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTRSGRVRFNGVPGRAMEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEFRVSVPSLLLLSRLLSHSWLFLFGTVGMCGEGRVFFPASGPNCLHIVNSTSLQ	975661	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962276_963085_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
689085	contig_4857_pilon	+	1557	5	Intergenic	novelGene_48846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	95.6935212018034	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	54	398	1331453	1407681	TRUE	55	AAAAAATCTAAAATATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDCSNNNNRITSISKGKISQANQSDEHKN	1331399	1411052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1407599_1407777_1409988
689091	contig_9373_pilon	-	3804	1	Intergenic	novelGene_162730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298675	294871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_294900_298700
689092	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689095	contig_9843_pilon	-	2459	10	Intergenic	novelGene_114335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_9	20.8528057146476	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	318	1658	302693	250148	FALSE	10	GATTCTGTGTGGCTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQVGTRAQSERIRTYNFTQDRVTDHRIAYEVRDIKEFLCGEKALDQLIQRLLQSADEEAMAELLDKNLKSAK	305676	249346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_250262_254201_254301_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_305367
689102	contig_7457_pilon	-	1032	5	Intergenic	novelGene_31717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1881.64507479493	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	139	480	1176842	1174926	TRUE	20	CAGCTGCCCAATGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176980	1174230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174686_1174828_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
689104	contig_7867_pilon	-	2636	1	Intergenic	novelGene_162749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTAAAAAAGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271048	268412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_268400_271000
689108	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689109	SIRV2	+	562	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-12	-27	-12	27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTGGAGGATATGGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1700
689118	contig_12019_pilon	+	1061	5	Intergenic	novelGene_87788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1243	junction_3	731.849198947433	6527	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	627	1028	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764791	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_764823_765184_765260_765343_765922_766639_766813_767133
689124	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_97917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689125	contig_8452_pilon	-	1805	6	Intergenic	novelGene_47972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	337	junction_4	389.836170717906	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	549	1187	86044	75102	FALSE	15	GTCTTCCTTGCATCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	92102	74483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579
689126	contig_5917_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_122174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745722	745270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_745300_745700
689129	contig_4418_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_98372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTGTTACCGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777146	779152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_777100_779200
689130	contig_10863_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_59334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATTATTCTATTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86411	83516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_83500_86400
689131	contig_6433_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_162755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGAAAAAAACAAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138497	136264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_136300_138500
689132	contig_3410_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_58942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	404	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTGTGGGGTTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219196	216814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_216800_219200
689134	contig_14925_pilon	-	985	5	Intergenic	novelGene_55200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	1552.7624576863	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	198	455	29675	27020	TRUE	25	AGAGCAAAGGCTGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APHFGAGTRLRVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	80712	25797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_80667
689137	contig_5864_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_162782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTTTAGTTAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115069	113915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_113900_115100
689138	contig_5864_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_162783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGGAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115802	115539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_115500_115800
689140	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	31	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689142	contig_14289_pilon	-	1260	5	Intergenic	novelGene_110564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	254.700804867201	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	512	1042	58752	51652	FALSE	20	AGAGTCTGCGCGCCATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVTPCFPVFRTCSEGAGVMARPPHPHLCPEGGHVHCPPPPPPPHGGQGGSQAVQVLGDLRSSVGLSASPSPDSLLFLSRLDLRTCRTWSTSHCLWTGP	66614	51433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_52053_58622_58831_61113_61293_64645_64754_66468
689144	contig_6654_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_85767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCAAATTGAGGTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619191	619717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_619200_619700
689145	contig_16622_pilon	-	1451	8	Intergenic	novelGene_48422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1033.41455024257	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	524	1282	121443	108374	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCGLVLLQCGGEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	121966	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115273_121406
689148	contig_11422_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_99037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1500
689155	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	15	2958	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
689156	contig_8978_pilon	+	1652	8	Intergenic	novelGene_49414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	359.002529693776	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	296	763	344181	347248	FALSE	15	TTAATTTCCTGTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQEELRRMEELHNQEVQKRKQLELRQEEERRRREEEMRRQQEEMMRRQQEGFKGTFPDAREQEIRMGQMAMGGAMGINNRGAMPPAPVPAGTPAPPGPATMMPDGTLGLTPPTTERFGQAATMEGIGAIGGTPPAFNRAAPGAEFAPNKRRRY	343411	348137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_343447_343638_343836_343969_344028_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345738_347113
689159	contig_9389_pilon	+	1273	7	Intergenic	novelGene_83913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	200	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	39	629	159587	167753	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRLGELGEPS	159548	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166132_167726
689165	contig_16122_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_134545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCTTTGTGCAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238439	238133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_238100_238400
689169	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689181	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_93686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689182	contig_13894_pilon	+	874	8	Intergenic	novelGene_62141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2637.61378708027	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	104	529	521729	526523	TRUE	50	GATCTCAATAAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSGSPAAGTPRSYPARPTEGCARLPVLGPGILPVWPSLWHVLGRRATITALRSTRRSTRLARATLSRMAN	521625	528145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523499_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
689184	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
689185	contig_8453_pilon	-	3137	1	Intergenic	novelGene_125136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232090	228953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_229000_232100
689190	scaffold_19766_pilon	-	2472	13	Intergenic	novelGene_34290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	42.5643303979074	70	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	111	1022	433431	423818	TRUE	40	GAAAAGGAAAATGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSASVRVAERAEVAEEAGRRQWLKGLRFDHRVKSISMTTFTEPEVIFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTSLVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGSASAPVQGSVPEGKPLRTLLGDPVPSLSAAASASNQSVSQSQARIAQPRSSQAPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQAAPAFAAFPAFAGQTPSHGGFANFDAFGSSPSSSTFGNIPPAGQAPFQAQPTPTASRMLTGSYSFGSSQVTPFGVSPLAPASQPNSLTDMSSILGPGVSAGGIPPHSVFGMAGPVPALQSATTGGSGGTGFAFGAFTNPFTAPAARPPAAFH	444439	420197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_421404_421755_421842_422623_422753_423788_423874_424063_424147_424376_424501_428662_428696_429374_429501_430421_430588_431159_431314_432416_432533_433377_433454_444351
689192	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
689195	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	50	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689198	contig_9972_pilon	+	1052	7	Intergenic	novelGene_162785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_3	213.310936324314	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTATCTTGTGTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171375	363444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_171569_227926_228065_286292_286369_338441_338519_353868_354107_361319_361590_363384
689199	contig_6001_pilon	-	2401	16	Intergenic	novelGene_128042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	84.677584597893	386	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	88	1620	712446	665184	FALSE	30	GCTCAGTCTCCACGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDAFRAVKKRIVGNKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVEGVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNLIQSWADAFRSSPDLTGVVAVYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETPSGQYAVGTDTSQQVDSNQHTAPLSTPAVPPSDTPIAPTPEQIAKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRILELIPRIADEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFERFRTGQTAKAPSEAESATDLIDMGPDSAAPSHLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLNASGQLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAMEGSSEKSLSDWMVRQGMIPVTQACLMEDIEHWLSTDVGNDAEEAKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPPGAAPRKKTQEKDEDMLFAL	712533	664402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_665339_665419_665460_666180_666241_667688_667743_670983_671060_673821_673943_675050_675145_675511_675546_677380_677515_680179_680297_684568_684716_684905_685041_685405_685556_686461_686541_692449_692535_712394
689200	contig_12915_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_148350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTCACAGTGACCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107720	110279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_107700_110300
689202	contig_18108_pilon	+	2932	1	Intergenic	novelGene_33482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCCAACTGTGTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240972	243904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_241000_243900
689204	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_96040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689205	contig_17964_pilon	+	2513	1	Intergenic	novelGene_33921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412336	414849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_412300_414800
689211	contig_6048_pilon	+	1434	11	Intergenic	novelGene_73253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	61.8052586759412	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	64	864	1972099	1977815	TRUE	25	TATTCCAAGGGTCAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPGLRLRPLTSVPPACSPAAMHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVVLAAF	1972035	1978468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977798_1977868_1977950
689213	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_89191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
689215	contig_6589_pilon	+	1109	7	Intergenic	novelGene_26046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	783.782211813687	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	345	707	1728220	1731419	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCPLCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCGLVLHIPADLVQGPGHLRNPHHGPRPLRLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGELSDRVSFLCSSAS	1725437	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1726999_1727198_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1731377
689217	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	502	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689220	contig_18822_pilon	+	1866	14	Intergenic	novelGene_111722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_13	78.1018906649755	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	85	1635	140694	224029	FALSE	30	TTTCTCCATAAATACGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLVHTLSLLLMPLLLGSARGLHNASQRMFKIDYSQNCFLKDGQPFRYISGSIHYHRVPSFYWKDRLLKMKMAGLNAIQMYIPWNFHEPLPGQYQFSDDHDVEHFIQLAHEMGLLVILRPGPYICAEWDMGGLPAWLLEKECIVLRSSDPDYLAAVDKWLGVLLPKIKPLLYQNGGPIITVQVENEYGSYFTCDYDYLRFLQNRFRYHLGDEVLLFTTDGARETLLQCGTLQGLYATVDFGAGSNITAAFEIQRKTEPRGPLVNSEFYTGWLDHWGQPHSRVSTEAVTSSLYNMLALGANVNMYMFMGGTNFAYWNGANTPYAAQPTSYDYDAPLTESGDLTEKYFAVRDIIRKFEKVPDGPIPPSTPKFAYGKVALKKLKTVGEALNILSPSGPTKSIYPLTFVQVKQYFGFVLYRTTLPKNCSDPTPLSAPINGVRDRAYVSVNGVPQGILERNQVFTVNITGEAGATLDVLVENMGRVNYGRYNNDFKVGQADHPGTRVIGLASVILWQRC	140609	224260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_140769_165852_166023_168082_168234_169619_169681_170801_170897_175770_175952_181160_181220_182824_182947_183091_183133_191145_191259_209335_209411_212481_212572_221549_221664_223825
689224	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689228	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
689230	SIRV7	-	215	1	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	15	146688	15	-91651	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCGATTTCTTGAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147903	147688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
689232	contig_6954_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_64443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGCCCCCTCCCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496755	494146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_494100_496800
689233	contig_13244_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_86966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3731	junction_2	510.933133263705	100	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGATTGTGCTCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299441	296050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_297392_298566_299281_299397
689235	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_96081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689243	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689246	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689248	scaffold_12124_pilon	+	1671	2	Intergenic	novelGene_22411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	186	479	1509112	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508779	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508789_1508935
689249	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689250	contig_4156_pilon	-	2732	17	Intergenic	novelGene_88080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_16	86.5332306111357	8	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	238	2463	433791	161269	FALSE	30	GGAGAGACTTTATCGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKTEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGKSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYEVICQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQEDLLLFSCAGAHPRHQRICPCRDFIKGQVALCKDCL	434834	160999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_161468_169170_169329_182021_182097_187879_187997_196659_196807_209648_209799_272130_272265_299446_299581_305919_306055_310022_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550_433925_434730
689253	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689254	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
689257	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	298	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689265	contig_2596_pilon	+	1762	2	Intergenic	novelGene_53432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCATGTGGTTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9082	11483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821
689274	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689275	contig_610_pilon	-	1398	5	Intergenic	novelGene_76724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1326.68277576066	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	27	704	252557	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252583	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235182_235235_235302_252475
689281	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
689283	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
689284	contig_5400_pilon	-	3316	1	Intergenic	novelGene_162812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124594	121278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_121300_124600
689285	contig_3426_pilon	-	2773	21	Intergenic	novelGene_57919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	192.510908781814	2	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	913	2532	196454	145330	FALSE	60	GAATAAAAGCAATGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	214151	145088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196622_203772_203863_205426_205532_206870_207040_209112_209234_210469_210556_212649_212769_214096
689286	contig_13244_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_86904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50981	53273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_51000_53300
689294	contig_4486_pilon	+	1291	8	Intergenic	novelGene_38639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	403.240243375523	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	192	758	1016066	1029872	TRUE	25	TGCAACAGCTCTCCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQGRNFS	1014105	1037802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029901_1037297
689296	contig_4364_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGCGACTGGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
689299	contig_18869_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_56084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
689300	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689304	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	892	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689306	contig_7606_pilon	+	1441	1	Intergenic	novelGene_162836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAACAACAGCAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108617	110058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7606_pilon_+_108600_110100
689312	contig_8770_pilon	-	2893	10	Intergenic	novelGene_162837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	33.2599191553771	118	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	152	1114	208748	193092	FALSE	45	TAAAGGGAACAATATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESHVPAQVVAAIDVNTVANEVYKYNFPHTLLLAKTIEGITLEEFDRLSFNMILMSPPCQPFTRIGLQGDKTDPRTSSFLYILDILPRLQKLPKYILLENVKGFEVSSTRDLLIQTIENCGFQYQEFLLSPTSLGIPNSRLRYFLIAKLQSEPLPFQAPGQVMTEFPKTGSENPQKHAIDAEKNTEEKKIEPSICLDGNTQCSGKETILFKLETTKEIDRKHQQNSDLSVQMLEDFLEHDIDINQYFLPPKLLQRYALILDIVKPTCRRSTCFTKGYGRFIEGTGSVLQTAEDVQIENIYKSISNLSEEEKITKLLTLKLRYFTPKEIANLLGFPPQFGFPEMVTVKQRYCLLGNSLNVHIVAKLIKILYQ	221092	191312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8770_pilon_-_193193_197815_197946_199043_199102_201148_201493_202924_203009_204470_204541_205531_205598_206173_206246_208710_208788_220980
689319	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689321	contig_14322_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_115836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671880	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
689327	contig_18647_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_162844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGAGTTAATTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82285	81796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_-_81800_82300
689328	contig_7165_pilon	-	2644	16	Intergenic	novelGene_116886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	928	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2013	2423	960864	940198	TRUE	15	GGGGCGGTGCTAGACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMIFPPNFCKVFNFCPLFFHVLFSSTSKHLRSHWVCRHSIFIDHDLKMFIKWNGPIWKFNSQGPLVHLLKPKSQNTICHTSLNQLPAHEQSSRTSGTVIVDIDYRNSSQSQTVIDSPLPTGRITLNISNTCLFHG	1064309	909570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_909697_929444_929504_940161_940233_944645_944778_945961_946029_951357_951483_960812_960879_965882_965969_967103_967255_968382_968530_973682_973791_1016713_1016868_1043580_1043675_1053992_1054120_1060241_1060325_1063261
689329	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	91	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689330	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689331	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_95871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689346	contig_12520_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_161082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATTATAATAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556878	559395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_556900_559400
689351	contig_3018_pilon	-	2006	4	Intergenic	novelGene_78821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	749	junction_1	713.113361722151	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	253	1263	546302	543790	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDDETYRNGYKPIYSPVTPVTPGTPGNSMHFENISSPESSPEIKRRTYSQEGYDRSSTMLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLIDGSCTPQNPPQKKKVSLLEYRKRQREARKSGSKAENFPLVSVSPHPSGNLNSTGDGCANSSENGEQGENTASLPLPTPAAAYATSEETSNNCPAKEASASEKNEPEVQW	546554	543046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_544078_545134_545699_545829_545887_546200
689354	contig_4364_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_4202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAGTGTTCCAGCGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
689362	contig_16103_pilon	+	1610	6	Intergenic	novelGene_118935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	26.4166614090426	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	713	1471	808998	810767	FALSE	50	CCTAAACTGACTAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDEDEDDEEEEEGGGATWGYGSPRFGDPQPPEEFGFSFSPEGGMRFHRNFGFDDLIRDFNSIFSEMEAWTLPSRPPELPGPESETAGERRRREETLRDSMLKYPDSHQPRIFGGVLESDAGTESQKPGPDWGSQRPFHRFDDMWPVTPHPRAREDNDLDSQVSQEGLGPVLQPQPRSYFKSVSVTKITKPDGTVEEHRTVVDSEGRTETTVTRQEADGSPRDDQESPRPSALDDTSSILDLFLGRWFRFR	808285	810906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_809233_809406_809595_810016_810069_810214_810322_810437_810529_810681
689368	contig_12150_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_6967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATACTACACTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115694	115379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_115400_115700
689371	contig_6795_pilon	-	2160	12	Intergenic	novelGene_27767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_11	36.925880641591	271	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	49	813	504815	489374	TRUE	35	AGGAAAAAGCTGGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EITGAATAAGPILTAAMGILEKISEIEKEIARTQKNKATEYHLGLLKAKLAKYRAQLLEPSKSASSKGEGFDVMKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVSGACAQDLQG	504863	482770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504751
689375	contig_9651_pilon	+	905	5	Intergenic	novelGene_162848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	66.758426434421	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAAAAGAAAAGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30596	49643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_30691_37837_38159_46583_46643_46960_47054_49305
689377	SIRV4	-	270	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1253	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
689379	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689390	contig_9345_pilon	-	1491	14	Intergenic	novelGene_24497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	290.173055894003	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	759	1448	669169	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671875	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669383_669596_669655_670161_670369_670728_670798_670910_671013_671225_671275_671731
689394	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689398	contig_5815_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_141235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	13274.5	285	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	1041346	1045638	FALSE	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKSKFARSHKAI	1041344	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493
689399	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_96730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689400	contig_8616_pilon	+	2461	9	Intergenic	novelGene_72546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	22.8332953162701	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	816	2417	421424	424565	FALSE	20	ATGCACTCCAGTTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410624	424609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412203_419217_419485_419891_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
689403	contig_13403_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_158101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCTGCTTTAATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155932	156280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_155900_156300
689404	contig_8452_pilon	-	879	6	Intergenic	novelGene_48096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1257.8822520411	9427	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	26	574	991128	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGTTQSVSQDDVTQVHHALDSLGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991153	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_989696_989760_991058
689405	contig_7202_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_16795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
689425	contig_10861_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_39181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGGATTGAATTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277585	278404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_277600_278400
689432	SIRV4	+	229	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	632	1087	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
689434	contig_15304_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_30687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCACCCAGCTCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105670	105520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105500_105700
689441	contig_7378_pilon	-	2000	13	Intergenic	novelGene_120244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_6	41.6689999346703	198	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	20	1597	338876	296978	FALSE	25	TAATTTTTGGGTCATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCGAVAMAALGNLTGRRWFSALALGVTLLKCLLIPTYHSTDFEVHRNWLAITHSLPISQWYYEETSEWTLDYPPFFAWFEYVLSHVAKYFDQEMLNTHNLNYSSSRTLLFQRFSVIFTDALFVYAVHECCKWIDGKKASKELTEKPKFILSVLLLWNFGLLIVDHIHFQYNGFLFGLMLLSIARLFQKRHLEGAFLFAVLLHFKHIYLYVAPAYGVYLLRSYCFTANKPDGSIRRNSFSFVRFISLGLIVCLVSALSLGPFLALNQLPQVFSRLFPFKRGLCHAYWAPNFWALYNALDKVLSIIGLQLKLLDPKKIPKASMTSGLVQQFQHAVLPSVTPLATLICTLIAILPSIFCLWFKPQGPRGFLRCLILCALSSFMFGWHVHEKAILLAVLPMSLLSVGKAGDASIFLILTTTGHYSLFPLLFTAPELPIKILLMLLFTIYSISSLKTLFRKEKPLFNWMETSYLLGLGPLEVCCEFIFPFTSWKLKYPFIPLLLTSVYCAVGITYAWFKLYISVLTDPLVLKTKKQ	338895	296574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_297210_297956_298030_298341_298440_301021_301162_302258_302399_305894_306016_310799_310904_311174_311302_313391_313460_314835_314946_317308_317503_331125_331205_338784
689445	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689446	contig_15687_pilon	-	1983	12	Intergenic	novelGene_129144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	38.3595430819313	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	321	1421	198511	187944	FALSE	25	GGCTTCTTACCCCAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGNEDLRADDFPGPAFESYESMELACPAERSGHVAVSDGLHMFVWGGYKSNQVRGLYDFYLPREELWIYNMETGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRDARMNDLHYLNLDTWEWNELIPQGICPVGRSWHSLTPVSSDHLFLFGGFTTDKQPLSDAWTYCISKNEWIQFNHPYTEKPRLWHTACASDEGEVIVFGGCANNLLVHHRAAHSNEILIFSVQPKSLVR	198831	187381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_188001_188102_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190333_190404_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198358
689450	contig_16846_pilon	-	1099	5	Intergenic	novelGene_82950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	362	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	92	610	555239	551492	TRUE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558741	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551113_551253_551665_552661_552824_555055_555278_558688
689451	contig_5671_pilon	+	1126	6	Intergenic	novelGene_79451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	1821.29448470037	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	145	567	370430	531238	FALSE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	369128	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_369248_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
689459	contig_5690_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_119748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089606	1090212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1089600_1090200
689466	SIRV7	-	424	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33145	0	-74	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114812	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
689474	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689479	contig_4892_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_162854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31773	34118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4892_pilon_+_31800_34100
689482	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689488	contig_11656_pilon	+	2999	1	Intergenic	novelGene_53972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGATTGCTGTGATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166115	169114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_166100_169100
689493	contig_1406_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_25487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTGAAAAAATAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325598	1327303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1325600_1327300
689496	SIRV2	-	612	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4261	34	3086	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
689497	contig_16951_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_98619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAGGAAGATAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38281	36762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_36800_38300
689499	contig_9112_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_60211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	531.590694676521	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	227	1204	108641	114455	FALSE	35	CTTGTGGTAACAGAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDSPSHEETPLRERRGESCGLKGVKAETRPWKEGCVFQPKHAILHPTQLPPGPLLGRSFEG	108414	114649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114277
689503	contig_14522_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_147331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGAGTAGTTAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140334	138949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_138900_140300
689506	contig_17989_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_150811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCCCAGGCCTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203356	200619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_202346
689507	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	369	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689519	contig_14353_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_82099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACATTAATCAAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80005	79081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_79100_80000
689522	contig_6027_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_74420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTGGCTCTAGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116898	114378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_114400_116900
689527	contig_14275_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_162885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490056	491481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_490100_491500
689528	contig_614_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_132601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAAAAAAAAGCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184736	185089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_184700_185100
689533	contig_12917_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_162889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTGCATTATAGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38462	38038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_-_38000_38500
689538	contig_12270_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_113107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	ACAGTGCTTCAGCCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
689540	contig_18168_pilon	-	1253	7	Intergenic	novelGene_122065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	164.736911467952	1518	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	189	869	26220	23837	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27098	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26590_27036
689555	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689556	contig_8415_pilon	+	2358	13	Intergenic	novelGene_141694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	24.3873544189515	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	837	1919	241158	261192	FALSE	30	TCTATTTCTTGGATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLLRYQAGSGGASENHMRKKLYENGVTNSLQSNFAVLLKLSEELLAKWLSYPESQHVPLCQHMLGFAMKSVTQMVMGSTFEDDQEVIRFQKNHGTVWSEIGKGFLDGSLDKSTTRKKQYEDALMQLESILKKIIKERKGRNFSQHIFIDSLVQGNLNDQQILEDSMIFSLAGCIITANLCTWAICFLTTSEEVQKKLYEELDEVFGKSPITPEKIEQLRYCRQVLCETVRTAKLTPISARLQDIEGKVDQFIIPRETLVLYALGVVLQDPSTWPSPHKFDPDRFDDESVMKTFSLLGFSGTQECPELRFAYMVTTVLLSVLLRRLHLHSVEGQVIETKYELVTTSREEAWITVSKRY	231985	261631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_232588_237871_237922_238826_238994_241140_241284_244869_245038_246303_246383_249579_249696_250517_250573_253232_253354_255464_255577_256798_256864_260793_260884_261041
689557	contig_3469_pilon	+	1740	2	Intergenic	novelGene_34211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGCGAAATGAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543500	545430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_545006_545195
689563	contig_2227_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_142348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAACCCAAATTATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263024	261463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_261500_263000
689565	contig_9682_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_125303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGTAGTTTAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30587	32906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_30600_32900
689571	contig_8045_pilon	+	3453	1	Intergenic	novelGene_35464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTCCACATACTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516049	519502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_516000_519500
689572	contig_8045_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_35411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138636	136366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_136400_138600
689573	contig_12570_pilon	-	1401	3	Intergenic	novelGene_79375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	58.5	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	42	581	300289	280817	FALSE	25	GAAGGGATTCTATTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSWGSLSRCGRYCDPLRRRWTICTSATSRSCATSLRPTSSSSTSPLTSTWSSAEHQKAGHSHGRHCGAQLEVLCSEQASWRCWLNVFPEPS	300330	279996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_293908_294088_300198
689575	contig_9363_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_6546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGTGTCAGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754397	753383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753400_754400
689581	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_97324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653723	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
689587	SIRV6	+	696	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	87	0	87	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10324	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
689588	contig_4364_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533310	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
689589	contig_18869_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_56232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGTCATCCAAGCACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73350	73585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
689592	SIRV1	-	154	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3950	0	3676	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6690	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
689596	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
689599	contig_15135_pilon	-	908	2	Intergenic	novelGene_119869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1119	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGGCGACAAGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54839	53383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_53472_54019
689600	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689601	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
689610	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689613	contig_8873_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_162907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAACCACATGACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396033	395106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_395100_396000
689619	contig_12790_pilon	+	1484	6	Intergenic	novelGene_35233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	302.742530874009	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	207	617	307252	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSIQAIPCAP	305937	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309891_312443
689623	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
689625	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689628	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689632	contig_1948_pilon	-	2239	4	Intergenic	novelGene_31158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.9977776790036	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	110	412	462875	461730	FALSE	30	TAAATTATTTTTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSPQLSSLGKSDSSFSESSGLFYKDEALEKDLNDMSKDINLMLSAYAKILSERAAVDASYIDEIDGLFKEANTIENFLIQKRELLRQRFMEIANTLHR	465550	459902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_461875_462608_462661_462769_462882_465447
689637	contig_15752_pilon	-	2747	1	Intergenic	novelGene_148763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGCGTCTCAGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203947	201200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_201200_203900
689638	scaffold_13505_pilon	+	2103	5	Intergenic	novelGene_111572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	222.141846575561	9	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGTGGTCTCATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608622	635984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610099_613391_613529_623354_623423_635129
689645	contig_3525_pilon	-	2412	1	Intergenic	novelGene_135142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAAAAAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605386	602974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_603000_605400
689647	contig_7963_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_58515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	249.425419714992	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	244	999	194098	200117	FALSE	10	TATCCATGTCTTTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSQHTF	185549	200413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_185704_194008_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_200100
689650	contig_6589_pilon	+	462	6	Intergenic	novelGene_25877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	1	462	955229	959137	FALSE	30	AAAGAACAGCGCTGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVAESRTVPQPLGGVQGQLVKGEDLAPSLEDAAPGPAAHAQRAHLQLGHLLNPHIICYGPYDHSCLVFPARKLHLPDHPRKGQRRPVGAAHEQPLQHNLVEGRVGSSGQKPVQLDQQPQVDVLALGLLAPNLPVFVVADVNSHDCTPCSARSGK	955228	959137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_955239_956004_956124_956712_956815_957251_957360_957758_957845_959100
689667	contig_7078_pilon	+	2006	4	Intergenic	novelGene_130110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	188.25691665027	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29745	220805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_106254_106398_182312_182515_219233
689673	contig_4857_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_48858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCACCTCCTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341371	1341176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1341200_1341400
689678	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689692	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
689701	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689707	contig_14220_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_159869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTTGTGTCTGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334844	334088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_334100_334800
689712	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689713	contig_7020_pilon	-	1850	14	Intergenic	novelGene_57042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	226.631729527007	7	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	187	1395	49643	39492	FALSE	10	GTTCTCTGCTATCTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCQILENRNGSLKPGSSHRKTKKPLPPTPEEDQILKKPLPPEPTAAPVCTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGEEYFILEESNLPWWRARDKNGEEGYIPSNYVTEAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAEQLLKQEGKEGGFIVRDSSKAGKYTVSVFAKSAGDPQGVIRHYVVCSTPQSQYYLAEKHLFSTIPELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQGVVKVSDFGLSRYVLDDEYTSSVGSKFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYSLGKMPYERFTNSETAEHIAQGLRLYRPHLASERVF	51975	39036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_39497_42172_42302_43260_43380_44004_44070_45083_45301_45811_45984_46835_46911_47791_47920_48094_48175_48471_48527_49076_49140_49542_49731_51550_51619_51944
689716	contig_10252_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_162919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGAAGCAAGAGTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131248	131694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_131200_131700
689722	contig_3111_pilon	+	2298	14	Intergenic	novelGene_129988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28.1861941109746	161	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	257	1597	171522	179558	FALSE	25	TCATGGCGCACGCACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQLATYCARDIRVADVSAAEHSASQRAVLIEKPDVVVGTPSRILSHLQQDNLKLHDSLELLVMDEADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELVLHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPVCVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGRRRGRGAKGDRASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARADNPGVVLTFMLPTEQAHLGEIEELLSGENGAPVLLPYQFRMEEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEVKEELLRSEKLKTYFEDNPRDLQLLRHDLPLHPAVVKPHLGNVPDYLVPPTLRGVVRPHKKRKKASFSSRKVKKGKTQNPLRSFKHRGQKPRSATKS	170274	180259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_170335_170471_170590_171443_171605_171747_171919_172045_172137_173110_173356_173662_173783_174349_174464_174560_174656_175819_175894_176028_176119_176859_176966_178866_178944_179483
689730	contig_7963_pilon	-	953	6	Intergenic	novelGene_58334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	14	319	48841	40217	TRUE	10	CCAATGTTGTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRSSLK	48854	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43627_43819_48741
689735	contig_9706_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_20851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2328	2734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
689739	contig_10050_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_119609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	78.8895148644961	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	74	1240	100426	131179	FALSE	10	TTTCCTGTTTTTGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRASAFLPLRPFSRLPLSSGSAEVSAAAILLLAAPHGTVRTKNNIQRYFGTHSVIYNKKDEQSIPTHEISEETSKSQDSVKENTKKDLLNIIKGMKIELSTVNVQTTKPPNRRALKNLEATIGRLQKATENTTKKRNENLSPELVAAASAVAESLPFDKQTTKSELLRQLRQHEEDSRAQKDGKRRWKVSVSNIISDMKVAKSATARVSTRPEHQIQFDEGSDNYFEHQRSADLRKSLRKNIFKGKRLNIFDIKAAEEVPETEISPSIWDVEFAKQLATVSQQPFQNGFEEMIQWTKEGKLWEFPVNNEAGFDDDGSEFHEHVFLDNYLEDFPKQGPVRHFMELVTCGLSKNPYLSVKQKIEHIEWFRNYFNEKKDILKESDIQFS	100352	131252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_100551_106951_107240_113259_113422_114461_114603_117560_117638_120902_121047_130949
689745	contig_18184_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_123875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTAACTGTATGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309708	312136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_309700_312100
689748	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
689751	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
689756	contig_12270_pilon	-	321	2	Intergenic	novelGene_114006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	22	321	14385	13863	FALSE	15	TGTCAGTATGGTTATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14406	13862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
689769	contig_14300_pilon	+	2225	11	Intergenic	novelGene_133132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	33	404	392240	392611	TRUE	15	CTCTCCTTCCCACCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METAWEGNDFNIQKREVEFGRTGVHLMAKRNGRSPVGRASVLSLSSAGEPGDVFWVSALAGSFAGNAQHCLHRDRKSPCSFHCTWLSPFGSSFMKWGPASCHANSFVVLWGSNEIQSGGDSEN	392207	430519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_392995_394190_394344_396027_396159_398864_399068_399605_399880_400885_401005_402565_402726_422707_422836_427259_427353_429716_429861_430486
689770	contig_12032_pilon	-	1773	8	Intergenic	novelGene_139267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	104.852082400272	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	125	1054	122805	98385	TRUE	15	ACTTGGCAGTCTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRVRLQKRTWPLEMPEAEPTLGQLRAHLGQALLPTCGYSSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDQSLVFVFPL	122929	96443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98414_105114_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122683
689772	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689777	contig_16411_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_77325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAGAAACAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153246	154327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_153200_154300
689789	SIRV1	-	172	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3932	0	3658	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6708	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
689792	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689793	contig_16098_pilon	-	1142	13	Intergenic	novelGene_45779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	269.879641383587	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	462	875	35038	31519	TRUE	5	GTAGCTCTCTTGGCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36289	31092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_35965_36070
689805	contig_14666_pilon	+	1303	5	Intergenic	novelGene_39586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	86	1261	477340	485198	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSVHTLLTFLF	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484732_485169
689809	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689813	contig_12884_pilon	-	1866	12	Intergenic	novelGene_105017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_11	87.4906370433313	523	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	50	1126	1137687	1126202	TRUE	0	GCCCCGTCGTCCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIALQVNGQQGGGSEPAAAAAVVAAGDKWKPPQGTDAIKIENGQSTATKLGLPPLTPEQQEALQKAKKYAMEQSIKSVLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAVTMGFGDPLSPLQSMAAQRQRALAIMCRVYVGSIYYELGEDTIRQAFAPFGPIKSIDMSWDSVTMKHKGFAFVEYEVPEAAQLALEQMNSVMLGGRNIKVGRPSNIGQAQPIIDQLAEEARAFNRIYVASVHQDLSDDDIKSVFEAFGKIKSCTLARDPTTGKHKGYGFIEYEKAQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLRVGKAVTPPPCPCSHLPHLEASHPLLLWLPLPPQPRSLHRKQWREQQCWARWPRQDWCRLP	1137736	1125194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1125630_1125739_1125976_1126132_1126269_1126358_1126552_1126627_1126842_1126918_1127012_1127087_1127250_1129376_1129428_1130257_1130348_1130454_1130551_1132650_1132738_1137663
689817	contig_9113_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_68612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	526	930	421855	421451	NA	35	TTCCAGTAGGCATCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSNFPRPRSHTSGIPGSFAFLFSFLFFPSPSPFCFSPFQRLSSLHSNSKLPSTLFCLYLFGSCSSLLSPIPISAPHITISPLHPAYMHRALNIIPPSKTGKAYQNVPCTDYQPALVTIVSATNNPSQQLLFS	422380	421207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_421200_422400
689819	contig_13428_pilon	+	1563	12	Intergenic	novelGene_143432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_11	295.228416961881	66	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	743	1111	50306	54609	FALSE	50	AAAAAAACATGGACTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYK	40733	55061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921_51995_53267_53389_54327_54413_54605
689822	contig_6589_pilon	+	600	4	Intergenic	novelGene_25970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	14235	junction_2	3315.92383641254	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	96	599	1296229	1297394	FALSE	25	GGCTCACCCTCAAGCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQIRQNYSSEAEGNVNLLVNLHLKASYTYLSLGYYFDRDDVALEGVEHFFRELAKEKREGAERLLKLQNQRGGRAVFQDVPKPPAKEWNGILDAMEAALALEKSLNQALLDLHAVATAHTDPHLCDFLENHFLDEEVKLLKKMGDHLTNVRRVASPQAGLGEYLFE	1296133	1297395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1296641_1296969_1297096_1297265
689824	contig_8140_pilon	+	1455	9	Intergenic	novelGene_86438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	217.643487152729	579	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	91	993	555480	739118	TRUE	5	GTTGTGTGGTTTTTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQGCPRCKTTKYRNPSLKLMVNVCGHTLCESCVDLLFVRGAGNCPECGTPLRKSNFRVQLFEDPAVDKEVEIRKKVLKIYNKREEDFSSLREYNDFLEEVEEIVFNLTNNVDLDNTKKKMEIYQKENKDVIQKNKLKLTREQEELEEALEVERQENEQRRLFIQKEEQLQQILKRKNKQAFLDELESSDLPVALLLAQHKDRSTQLEMQLEKPKPIKPVTFSTGIKMGQHISLAPIQKLEEALYEYQPLQIESCGPKVPELEMLGRLGFLLPFCLLGLVTGLLYLVTLMVLLGCPLAG	555389	823615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_555569_662788_662942_664649_664724_676299_676404_682875_683017_687699_687826_738431_738554_739024_739135_823169
689828	contig_3818_pilon	+	1607	12	Intergenic	novelGene_99297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	132.698128805307	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	852	1454	982979	990624	FALSE	25	TTCATTTATTGAGTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKEGRKKSVRVLVAVGNGRGAAGFAVGKAAERMDAFRKAKNKAVNFLHYIERYGDHTIFHDVSLTFKRTHIKMKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961434	990777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_968211_968350_973411_973538_976245_976480_978585_978621_982960_983052_986166_986214_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
689830	contig_18869_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_56221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	68	313	73707	73462	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73774	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73800
689833	contig_15866_pilon	+	1503	11	Intergenic	novelGene_63634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	592.749154364643	17	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	176	829	601021	633133	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	459014	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581475_581685_581705_601010_601094_608107_608230_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
689834	contig_10324_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_7778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79928	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79900_80800
689837	contig_2933_pilon	-	1880	3	Intergenic	novelGene_111354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.5	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	112	786	850204	849453	FALSE	5	TCTTTCCGCGTACTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKF	874188	848358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_849454_849530_850290_874162
689840	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689842	contig_14467_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_138226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	575	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	9	308	127000	127299	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMCHSFKIYQLMVSKMCPRNNKNKNVAKEVRAIFFHIVLFHTFKRCRLNCSDTSAWALSKLNAWTGKRSASDPACQLLLWTGSCLHRILLLAPSTDANSS	126991	129287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_127000_129300
689845	contig_10235_pilon	+	2103	3	Intergenic	novelGene_46446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCAGTACATGAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210516	213673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210855_211784_211924_212047
689846	contig_6710_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_89208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCTGTTCTGGAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
689847	contig_11512_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_43245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	4584	4056	FALSE	5	TGCCCTGCCTGCCTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTISSISTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLKPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNFPTGT	4585	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_4057_4279
689848	contig_9609_pilon	-	1496	10	Intergenic	novelGene_23139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	101.348683047959	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	632	1297	522751	521023	TRUE	25	ATTCATTTTAACCTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDEREADPVWAYEEPHPAAAEVPCAGVSGGAEPPCPALHGLSQLR	523912	520738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521423_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_523120_523204_523297_523741
689849	contig_1618_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_141789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTTCTTCTCATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209462	211584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_209500_211600
689857	contig_10549_pilon	-	1931	4	Intergenic	novelGene_110583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	11.3137084989848	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATAGCCCTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109483	76502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_78154_78596_78707_103831_103941_109422
689864	contig_13148_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_162937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229533	228421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_228400_229500
689866	contig_5217_pilon	-	2317	8	Intergenic	novelGene_135747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	123.790639585469	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	858	1478	531324	530116	TRUE	15	ATTTATTTATTGGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPGKAGVQYVGMMVGILWLAGQGQVLTASPPMTAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRK	532371	528998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531872_531944
689868	SIRV4	+	339	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	200	411	200	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
689874	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689883	contig_18145_pilon	-	2472	18	Intergenic	novelGene_37354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	10	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGGCCGGCGGCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100872	86880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_86910_90460_90569_90761_90933_92019_92164_92691_92822_93350_93475_94897_95010_95953_96085_96162_96290_96653_96766_97166_97335_97433_97548_97822_98036_98229_98373_98414_98540_98826_98989_100333_100486_100665
689884	contig_5145_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_131454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	455	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTGTGTGTCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956125	948694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949817_955790_955930_956037
689895	contig_5317_pilon	+	835	4	Intergenic	novelGene_76498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3310.14242728147	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAGTTTGCTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33649	43810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36851_43408
689898	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1874	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689900	SIRV6	-	233	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTATACGCACTTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
689905	contig_1406_pilon	-	2182	12	Intergenic	novelGene_25645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	90.8628973547646	319	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	152	1384	2738405	2714321	FALSE	35	ATCTTACAAAATTTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTAVHSEFMHDRVDYGFESCENKFNWSVIKEKRDAYVSRLNTIYQNNLTKSHIDIIHGFAVFTCDPTPTVEVNGKKYTAPHILIATGGVPSRPPESQIPGASLGITSDGFFQLEELPSRSVIVGAGYIAVEIAGILSALGSKTSLMIRYHKVLRNFDSIISSNCTEELENAGIEVLRYSQVKEVKKTSSGLELSVITSAPGRKPAVTTIPDVDCLLWAIGRDPNSKGLNLNKLGIQTDDKGHIIVDEFQNTSVKGIYAVGDVCGKALLTPVAIAAGRKLAHRLFEYKQDSKLDYDNIPTVVFSHPPIGTVGLTEDEAINKYGKENVKTYSTTFTPMYYAVTKRKTKCVMKMVCANKEEKVVGIHMQGIGCDEMLQGFAVAVKMGATKADFDNTVAIHPTSSEELVTLR	2750452	2713522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2714471_2716485_2716620_2718051_2718184_2719401_2719514_2725046_2725206_2727377_2727465_2730051_2730152_2733834_2733890_2734764_2734913_2737807_2737878_2738319_2738419_2750314
689906	contig_710_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_162950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACACTAATATGCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353969	355143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_354000_355100
689907	SIRV7	-	356	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33203	10	-16	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114754	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
689919	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_94803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
689920	contig_13888_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_151823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAAAAGTTTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375826	376914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_375800_376900
689921	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
689934	contig_5684_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_80984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGGGCACATCTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35342	33885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_33900_35300
689935	contig_10437_pilon	+	2451	21	Intergenic	novelGene_38230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_20	139.912651322173	8	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	31	2352	318795	392342	FALSE	5	CCTTCCCTCACCCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGTYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGDSSVGPVSMNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPTCTDMSNICQPTEFISRHNIEGTFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTTVKNSSQEPRSALSGTIQRPQLGPTANLSLEMGSGQLAPRQQQQTELEVVPGRDGLAGYNHPQVSVQPVTAPGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYSNISADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPSTPRPAENFRNSGLAPSVTIVQSSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPPWTPSTRPGFSAQQVASQATAKTRSPQFAVGNFQAPSSFSPMSLPGAPTTSPGAAYPSLTNHGSSFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWSQWQGQQPHQRSSSGEHHVQQPTAQQAGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPSFSE	318764	392441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_349796_349909_355625_355671_360481_360527_366332_366547_369227_369442_371770_371874_373765_373832_374209_374296_375720_375798_376665_376801_379153_379229_380474_380627_387220_387332_387492_387563_387716_387841_388029_388133_388508_388657_389963_390124_390570_390738_392252
689938	contig_3612_pilon	+	1665	2	Intergenic	novelGene_87834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	838	1500	965462	969861	FALSE	80	TGGAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEVSL	964624	970026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_965998_969734
689941	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91679	0	-91673	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAAATAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
689946	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
689949	contig_15105_pilon	-	1118	6	Intergenic	novelGene_151031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1026.91097958879	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	39	575	839916	831664	TRUE	50	GAAAAAATCTCAGCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQ	839954	829134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831667_832201_832309_836187_836548_839849
689951	contig_10581_pilon	-	1806	9	Intergenic	novelGene_41427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	35.8181169242606	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	207	1097	661227	653221	FALSE	30	GTTTCTGATTGCATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDTGSDYLTPWQLSQVVDGGGVGIIEESKHTNLTKGDFVTSFCWPWQTKVILDGNVLEKVDPQLVDGHLSYFLGAIGMPGLTSLFGIQEKGHVTPGANQTMVVSGAAGACGSLAGQIGHLLGCSRVVGICGTNEKCLLLTSELGFDAAINYKKGNVAEQLRELCPAGVDVYFDNVGGDITDAVISQMNQNSHIILCGQISQYNKDVPYPPPLPPAVEAIRKERNITRERFLVLNYKDRFEPGILQLGQWFKEGKLKIKETVINGLENMGAAFQSLMTGGNIGKQIVCISEEFTL	679005	652511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_653298_654394_654435_655397_655486_656603_656726_658051_658262_659060_659232_661044_661237_668633_668714_678888
689960	contig_18511_pilon	+	1887	10	Intergenic	novelGene_126875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	342.204544997994	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1659	228	1886	47371	59947	FALSE	30	TATTTAATTGTGCTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLT	35411	59948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
689963	contig_4059_pilon	-	1614	3	Intergenic	novelGene_140584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	6.5	355	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	319	1137	176601	169738	FALSE	30	TTATTGTAGTGCAGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKKGVVAASGSETEDDDSMDIPLDLSSSAGSGKRRRRGNLPKESVQILRDWLYEHRYNAYPSEQEKALLSQQTHLSTLQVCNWFINARRRLLPDMLRKDGKDPNQFTISRRGAKISEASSVESAMGIKNFMPALEESPFHSCTAGPNPTLGRPLSPKPSSPGSVLARPSVICHTTVTALKDVPFPLCQSVGVGQNTDIQQIAASNFTDTSLMYPEDTCKSGPSTNTQSGLFNTPPPTPPDLNQDFSGFQLLVDVALKRAAEMELQAKLTA	176919	169260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_170314_171094_171322_176585
689965	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_90396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
689972	contig_2444_pilon	-	2059	11	Intergenic	novelGene_83773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAGCATTAAAGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243495	231397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_231443_232596_232849_234419_234501_235498_235598_236017_236112_238918_239088_240845_240948_241446_241693_242125_242300_242566_242742_242873
689973	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
689977	contig_567_pilon	-	2237	3	Intergenic	novelGene_33981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1505	1828	406071	405748	FALSE	15	CAGGACCTGGCAGCGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGLEEESLTTCFMQMTQPSLLKSEEDLKHLLMKIKDNSLQYGLHLNIKKTKIVTIVPISNIMINGQKTEVVKDFILLGSNQHPWKQQSKNKKMHCTGQICCKRSL	416778	405338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_406127_413931_414111_415508
689982	contig_2933_pilon	-	2285	9	Intergenic	novelGene_111366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	221.747463345131	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	24	674	947440	940580	TRUE	20	AACATTTGTGCTCGCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVDVVEMKEPIIAFAWEPNGSKFAVLHGEAPRISVSFYHVKSNGKIELIKMFDKQQANTIFWSPQGQFVVLAGLRSMNGALAFVDTSDCTVMNIAEHYMASDVEWDPTGRYVITSVSWWSHKVDNAYWLWTFQGRLLQKNSKDRFCQLLWRPRPPTLLSQDQIKQIKKDLKKYSKIFEQKDRLSQSKASKELVERRRTMMEDFRKYRKMAQELYMEAWTPMN	947463	938199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_939713_940481_940601_941394_941473_941930_942009_942507_942634_943585_943725_944598_944678_946245_946369_947433
689985	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91667	2	-91661	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGACAAAACCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
689991	SIRV2	+	430	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	167	-74	-167	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTATGCTATAAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
690005	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690009	contig_14822_pilon	+	1287	7	Intergenic	novelGene_145404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	508.568715995084	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	410	1009	183396	190065	FALSE	20	AGACTTTGATGTTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	118353	190343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_118619_171024_171158_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
690010	contig_15410_pilon	-	1797	3	Intergenic	novelGene_130564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	189	767	53472	51304	FALSE	25	TAAAAGCTGTTTTATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAARPPSVPHGAAGSTGYCSWTARVAGPAISSCRMSEVRLPPLRALDDFVLGSARLAAPDPGDPQRWCHRVINNLLYYQTNYLICLGFGLAMAGYVRPLHTLLSALVVAVALGVLVWAAETRAAVRRCRRSHPAACLVAVLAVGLLVLWAVGGACTFLLSIAGPVFRESPLPWDVPGTASACARHQARLALGMATPPLQSAFPGIAPSFLGTRPSRYRLSEPHSCF	54721	50273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_51704_53293_53571_54631
690011	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
690013	contig_19237_pilon	+	1467	4	Intergenic	novelGene_162952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_2	72.2910782877113	660	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	68	592	23905	44811	FALSE	15	TTTACTGTTTCATGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRQRRSPCYPGRAPVGSSRRKMAAAAELLLLEKSLGLSKGNKYSAQGERQIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVKQANKEYLLGSTPEEKAVVQQWLEYRVTQVDGHASKDDVRTLLKDLNLYLEDKVYLTGYHFTLADILLYYGLHRFIVDLTVQEKEKYLNVSRWFCHIQHHPGVRQQLPSVVFIKNRLYTSSH	23837	45686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458_28660_35765_35862_44670
690016	contig_5718_pilon	+	1597	10	Intergenic	novelGene_110442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	365.248300458269	11	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	13	1119	1617860	1631112	FALSE	25	TTCAAACTTCTTGAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKSITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPVFPTQDEEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR	1617847	1631590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477_1625616_1628563_1628635_1629215_1629346_1630980
690018	contig_15459_pilon	-	2255	5	Intergenic	novelGene_106378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	45.6145535986049	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	925	1380	19296	16392	FALSE	30	GAATTTTCAATGAACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQISQISVKISCCPRLKVLRLEENCLELSMLPQSILSDSQICLLAVEGNLFEIKKLRELEGYDKYMERFTATKKKFA	20576	15516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_19068_20049_20154_20261_20510
690022	contig_11293_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_134686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCATACAGCGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163156	164231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_163200_164200
690023	contig_4754_pilon	+	2126	14	Intergenic	novelGene_35962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	169.13255891521	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	515	1069	409328	411131	TRUE	50	CACAGAGAAATAAAGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKGWCWRPKHISEWPTRSWCQTPTNMSSRPWPRLSWASLPSWAKTTQLSTSCPSSWRS	380141	420794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410383_410996_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
690027	contig_18869_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_56038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAGAATTTTCTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
690028	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_93573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690029	contig_8241_pilon	-	666	6	Intergenic	novelGene_157506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.3115730557729	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	105	461	765011	752876	FALSE	5	CCCCCTTGTGGTATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGELSIGQLLKWIDTTACLSAERHAGCPCVTASMDDIYFEHTISVGQVVNIKAKVNRAFNSSMEVGIQVVSEDLCSEKQWSVCKALATFVAHRELSKVKLKQTTPRTEEEKTEHSVAAERRRMRLVYADTIKDLLANFPIQDGCVLISFEM	767277	752670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_752905_756041_756178_756651_756751_757958_758020_764979_765050_767211
690038	contig_13283_pilon	+	957	3	Intergenic	novelGene_154027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	10.5	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	292	603	158163	161305	FALSE	55	CAAATTAGTTTTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESTGEGVREQRSRRAKLRTNRRSLHRRQQLCGVWFEAFYLNPESPGAGLTRSSRSDVSRDHAGCSVGTRVGGFRNSSQQHQVCVSPQDGRLLPEFNMAEPPLIFECNHACACWRNCRNRVVQNGLRTRLQLYRTHNMGWGVRALQDIPLGTFVCEYVGELISDSEADVREEDSYLFDLDNKVQCSGWGIKADYVRPENV	157871	161659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_158252_159865_159953_161169
690042	contig_16578_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_148685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTCTTCTCTTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307342	308387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_307300_308400
690044	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
690045	contig_13206_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_161915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1507	1827	243853	243533	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARTWGNWNHYPLLVGMQNVQLWRKTVQWFIKTLKIELPYDLEIPLLGIYPKDLKAETQTETCTPVFTAALFTIAKRWKKPKSSTDEWLNEVWYIHTMEYYSSSC	245359	243243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_243200_245400
690048	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690051	contig_6048_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_73159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGGAACATCAATCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157888	1156324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1156300_1157900
690055	contig_3095_pilon	+	1244	5	Intergenic	novelGene_75059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
690056	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
690061	contig_10674_pilon	+	2713	1	Intergenic	novelGene_6463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1810	2157	350227	350574	NA	50	CAGCAAAATACACACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKIRVITANLSRLWSNMNFHSLLVKSIQWYNYLENCWAVSTKTQNTHSTIPLLIETRMNTHTHTHTHTHTHTPKDMYKNVHSSIICNTQSWKQPKCSPTVEEINKLHYNHIIEE	348417	351130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_348400_351100
690079	contig_8386_pilon	+	2143	2	Intergenic	novelGene_82237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1200	1643	77741	78184	FALSE	15	TACATTACTTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLITFSNRISEIASSKSKTGIPSDLLKSFNTIIVLKNFFIGEKYYQSLLLQENHLVIFLQKSLVKIMQGLNETSSTPVVLLEPSSESPEELVKLTDRWTPPPEFLSIGLEWDTKLMFLSDVASLGTTPLQLSFMWLQKMQIYHVNED	76012	78684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_76632_77160
690081	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690084	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_93610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690089	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
690090	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690103	SIRV4	+	329	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	173	-441	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1886_2258
690105	contig_15031_pilon	-	699	4	Intergenic	novelGene_138410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	376	junction_3	166.657999774655	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	105	470	129549	101704	FALSE	40	AAATAGAAGCGCTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVDCTARFIPYKK	161631	101474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_101862_102970_103080_129450_129599_161576
690106	contig_7202_pilon	-	919	4	Intergenic	novelGene_17490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_2	11452.731416081	568158	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	205	756	29911	27786	FALSE	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHLCDFIETHYLHEQVKSIKELGDYVTNLRKMGAPASGLAEYLFDKHTLGDSDGDN	30115	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28169_28486_28634_29797
690119	contig_7457_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_31303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168959	167393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_167400_169000
690126	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	140	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690127	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690132	contig_3123_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_162978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGATCTAGCTCAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178760	177760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_177800_178800
690134	contig_14441_pilon	+	812	4	Intergenic	novelGene_100689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	448.223406597895	30	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	197	625	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	114113	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114161_116578_116963_117220_117344_117539
690139	contig_11413_pilon	+	773	4	Intergenic	novelGene_103122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	153	653	87465	90735	FALSE	20	AACCTACTCAGTGTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87312	90855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
690140	contig_14209_pilon	+	2492	9	Intergenic	novelGene_88348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	192.880751696482	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1711	2106	40155	40625	FALSE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	34069	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35820_37100_37218_37300_37421_37712_38783_40142_40344_40418
690144	contig_10753_pilon	-	1174	2	Intergenic	novelGene_105147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	26	664	330074	327426	FALSE	30	TCGCAGAGTAAGATGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQNSKLRPEVLQDLRENTEFTDHELQEWYKGFLKDCPTGHLTVDEFKKIYANFFPYGDASKFAEHVFRTFDTNSDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISRSEMLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTDKIFRQMDTNNDGRGWGWAVCARTRACACVYAAVWGAKMCLGPVSPLRSLSPSLLAPPLTGLI	330099	326915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_327687_329696
690146	contig_9471_pilon	+	1941	2	Intergenic	novelGene_21686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	221	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1398	1706	51749	52057	FALSE	25	TCTCTAAATTCAGGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVQLGLLPSVPSVPDHMPLPDLVERQSILYGIVTVSFFHLLLMLPSLFNIFPHRILQYCNSRWNFFIQFFQLEKCQTCSSFLVFYLQVFAHVIIILYFVF	50306	52292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_51083_51127
690147	contig_14048_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_146342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTCACTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591936	590893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_590900_591900
690150	contig_5217_pilon	-	2154	10	Intergenic	novelGene_135737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_4	97.1102212011094	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	877	1875	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	532405	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766
690155	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690157	SIRV7	-	240	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146679	1	-91645	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTGAATTAGCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
690159	contig_18869_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_56449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAAGATATTTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139491	141713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_139500_141700
690162	contig_13216_pilon	+	2001	7	Intergenic	novelGene_47470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	890.114490139081	2	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	549	1499	246066	261012	FALSE	35	TTTTTCAAGATCTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229605	261514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245966_246135_256120_256296_258447_258573_260430
690167	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
690170	contig_6513_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_117736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	503	853	41276	40926	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRSWSLLITCPKYVRHSLAILASKEHSGCTSSKTDLFVLLAVHVFNIFRQHHNSKVSILLRSSLFIVQLSHAYDAIENTMAWVRRTLVFKVTSLLFKTLKKSFAADLPNAMVF	41778	39631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_39600_41800
690173	contig_253_pilon	-	1167	6	Intergenic	novelGene_129681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	853.101306997006	25	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	64	462	421711	420586	TRUE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGESWSRGGPASGRGGARQPVFLSLSHCWPPEPRPFKSSCPAILWTGEHPILQLRK	421774	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420252_420841_420948_421056_421318_421355_421710
690175	contig_6048_pilon	-	1719	4	Intergenic	novelGene_73313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	30.4667396060396	259	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	21	1202	2122086	2102483	FALSE	5	CCTGACTGTGGTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAASGPGCRSWRLCPEVPSATFFTALLSLLVSGPRLFLLQPPLPPSGLSLRSEALRNWQVYRLVTYIFVYENPVSLLCGAIIIWRFAGNFERSVGTVRHCFFTLVFTVISAVIYLSFEAVSSLTKLGEVEDARGFTPVAFAMLGVSSVRSRMRRALVFGMVLPSALVPWLLLGISWLIPQTSFLSNVCGLVIGLTYGLTYCYSIDLSERVALKLDQKFPFSLMRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2122106	2101965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104907_2119275_2119684_2121899
690177	contig_3866_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_112443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATAACCTTGACTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298167	296755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_296800_298200
690178	contig_14925_pilon	-	742	4	Intergenic	novelGene_55094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42967	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_42915
690181	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_94879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690191	contig_14029_pilon	+	2459	3	Intergenic	novelGene_151949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	202.5	16	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	17	316	131739	133382	TRUE	35	CAAGAAAGTTATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLRYRIYLNIHLFSNSTFMIPISVFKMHTN	131722	135622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_134162_134258
690197	contig_7391_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_112149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338312	341043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_338300_341000
690202	contig_15859_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_50211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAGGGTTTCCTAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377365	379367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_377400_379400
690214	contig_12512_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_24175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGTTAAGAGCTACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581126	582089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_581100_582100
690221	contig_9727_pilon	-	1497	13	Intergenic	novelGene_86374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_4	234.204445351112	418	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	69	1262	598065	578319	FALSE	45	TAATATGGAAAGAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622880	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622824
690222	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690225	contig_8017_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_65366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACACATATTGTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010088	1010727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1010100_1010700
690226	contig_10988_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_104733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTAATTACTATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127235	126459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_126500_127200
690232	contig_13215_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_145888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTGTTTTCCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111263	109867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_109900_111300
690240	contig_11986_pilon	-	2339	5	Intergenic	novelGene_69263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	48.422618681769	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTTTTGATCCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845862	839899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841749_841860_841950_842700_842855_845153_845244_845705
690249	contig_5590_pilon	+	2695	7	Intergenic	novelGene_163049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	12.5698050899765	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	546	1628	384207	387285	FALSE	20	AGTTCTGCAGTCCCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELVVTALLAPSRLTLKLLRALMWSLVFSAALVAAAVYSCIALTHVLCRPRRGCCGRPRCVFPACLSDPSLGEHDFLTLQSSGLRLHYVSAGRGNGPLMLFLHGFPENWFSWRYQLREFQSRFHVVAVDMRGYRPSDAPGDVDCYTTDLLMVDIQDVILGLGYSKCVLVGHDWGGFLAWNFSIYYPALVERLVVASAAPMSVYQDYSLRHISQLFRSHYMFLFQLPWLPEKLLSMSDFQILKTIFTHSKTGIPRVTLHEIEAFLYSFTQAGGLVGPLNYYRNIFRNFPLEPQELSTRTLLLWGEKDIYLEPGLVGAVGSRFVPGRLEAHILPDVGHWVPQSNPEEMHQYMWAFLRDLLD	383661	388352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_384450_384559_384646_385099_385258_385395_385525_386645_386750_386836_386974_387059
690251	contig_11978_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_63131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAATAAAAGGAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1956726	1955225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1955200_1956700
690252	contig_15188_pilon	-	1435	3	Intergenic	novelGene_163081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	13	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	232	807	168843	166353	FALSE	5	TGTTGATTGTTTTCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLCVCVVGRYIYAVAGRDYHNDLNAVERYDPATNSWAYVAPLKREVYAHAGAVLEEKMYITCGRRGEDYLRETHCYDPGSNTWHSLADGPVRRAWHGMATLLNKLYVIGGSNNDAGYRRDVHQVACFSCTSGQWSLVCPLPAGHGEPGMAVLDNKIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGLAACVLTLPRSLLLEPARGTPDWNPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED	182246	165724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_166731_168645_168880_182051
690256	contig_5968_pilon	-	1338	8	Intergenic	novelGene_112191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	445.1555105482	2418	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	27	1172	732362	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGIVSQCRNLVSFLCPLRKTYSLSPFPKCTGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732388	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622813_625723_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
690258	contig_6031_pilon	-	2310	3	Intergenic	novelGene_56734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAAAAAAAAGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160670	156773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_157314_157966_158046_158979
690259	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690260	contig_16098_pilon	-	2006	16	Intergenic	novelGene_45887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_15	49.8831523551679	5	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	306	1271	253301	247263	TRUE	10	TACTTTCTTGTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRW	255466	244092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_255417
690262	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_89215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653717	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
690263	contig_6489_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_128925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTGCTGGTAGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131797	130242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_130200_131800
690264	contig_19825_pilon	-	2443	6	Intergenic	novelGene_59683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_1	46.4353313760115	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	54	434	38143	17388	FALSE	30	TTACAATCTGAATTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFNGGVTLGMVLLCEAATSDMDIGKRKIMCVAGIGLVVLFFSWMLSIFRSKYHGYPYSFLMS	38196	15378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_23163_23239_36715_36780_37429_37520_38098
690269	contig_3975_pilon	-	2723	5	Intergenic	novelGene_54899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_4	3.56195171219375	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2132	2584	2113987	2112185	FALSE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPPRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGKECSFEQLEHVREMQEKLARLHFSLDVCGEEEEEEEEDGVTEGLPEEQKKTMADRNLDQLLSNLEDLSNSIQKLHLAENTEPEEQSAV	2117424	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2112988_2113492_2113684_2113803_2116039_2117344
690270	contig_10319_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_147253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAAACTTGCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220432	219880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_219900_220400
690295	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690296	contig_1339_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_163093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATACCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37171	38386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_37200_38400
690300	contig_6954_pilon	-	1923	8	Intergenic	novelGene_64411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.7441046850138	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	59	1006	46863	19090	FALSE	75	AGCAAAATGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLSWARQDGWRLSKGNRIMAADDDNGDGTSLFDVFSASPLNNDEGSLDIYAGLDSAASDFASKSCVPSRNCLDLYEEILTEEGTAKEATYNDLQVEYEKCQLQMKELTRKYKEIQTQNFSLKSENQSLKKNISALIKTARVEINRKDEEINNLHQRLSEFPHFRNNHKTARASDTVKTKDLKSRSPHLDDCSKTDPRVKSDVSRDLHHSASLPNLGKEGKSHSEKRSTSVLPPSIEKRCANGIWSRSHYHVGEGNSGEDNRREKKDIRHSQYSGGTQRLTKGYKDALKNMVKVNQRLKAKIQSLKVTQIRIIKVNTLALLVRKRYLEKGHTFE	64027	18172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_19269_19323_19680_31423_31540_32424_32500_33020_33122_33755_33822_46808_46892_63997
690310	contig_6710_pilon	-	760	2	Intergenic	novelGene_92001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657375	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690314	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690316	contig_2100_pilon	-	1050	6	Intergenic	novelGene_50661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1030.08492853745	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	5	661	1176796	1170308	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYPLELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQVKNYMEEKQG	1176800	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170317_1172317_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1176333_1176418_1176765
690320	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690327	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690329	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690334	contig_5050_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_110270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTTGGATGTTTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508269	506886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_506900_508300
690340	contig_2341_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_84341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTCCAGAAGAGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13660	12002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_12000_13700
690341	contig_2341_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_84340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACGAAGAAAAAAATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11086	9953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_10000_11100
690350	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
690357	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_93601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690369	contig_5551_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_134251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAACCTATACATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510763	509042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_509000_510800
690377	contig_8122_pilon	+	1407	6	Intergenic	novelGene_40260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1017.90286373504	1008	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	307	732	742073	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	737299	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_737594_742060_742110_744080_744127_744610_744784_745062_745148_748083
690404	contig_14986_pilon	+	2116	2	Intergenic	novelGene_59731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	820	1650	151223	152053	FALSE	20	ACTGCATAATGTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150268	152519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150994_151128
690405	contig_19737_pilon	+	2301	12	Intergenic	novelGene_158958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	590	junction_8	233.225142174142	893	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	74	1282	15929	50890	FALSE	15	TATTTTGCCTTATGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFGSLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE	15855	51909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_16055_21809_21912_35434_35528_37367_37499_38872_38933_40063_40173_41152_41207_47230_47282_47575_47696_47781_47910_48698_48801_50757
690412	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
690413	contig_6069_pilon	+	1908	9	Intergenic	novelGene_8078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_5	87.5953052394933	496	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	26	1459	560908	566386	FALSE	25	GAGCAGTGTAGAGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELEAATMTVCNQTWNELQTRAPEEMSRLPHYCAGAMFVWQLMSYGYGFDEPAFRGVTFRKKAGDTAIGWALGYMLNLTNMIPADPPGLRKGSEFGSWVVLLLLFAAMLLAALVLLLRQVCSAK	560882	566835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564469_564695_564775_564896_565907_566043_566197
690414	contig_16122_pilon	-	2080	15	Intergenic	novelGene_134553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	96.3332068120535	376	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	48	1160	291639	283247	TRUE	5	GTGCTTGGCATGTGCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRRPQEQLPARYSTMGFSSELCSPQGHGAVQRLQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMFLQDSGAQSRGMAPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKSYSEQWQQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQARRKYQEASKDKDRDRAKDKYVRSLWKLFAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLMLPSLLQSLQDLHQEMACILKEILQEYLEISSLVQDEVMAIHQEMAAAAARIQPEAEYEGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGELLEPGELQLNELTVESVQHTLTAVTGDLAEATETVLSRQKVVTQLQYELQNEEQNTHPRERVQLLSKKQALQEALQGLQAS	292134	280582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_281504_282123_282282_282524_282649_282739_282835_283182_283255_286183_286240_286371_286495_286657_286778_286852_286991_288662_288847_288978_289076_291084_291259_291426_291649_292096
690419	contig_2646_pilon	-	2058	13	Intergenic	novelGene_69633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	379.987243937945	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	88	969	2074147	2071292	TRUE	10	CAAGGTCCCTCTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQVMWALSARRGRL	2074663	2069347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614
690425	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690426	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	224	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690435	contig_8140_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_86427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTACCTGGGCTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159047	161234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_159000_161200
690439	contig_15629_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_122443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGGCGAAATCAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83604	84820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_83600_84800
690440	contig_15629_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_122444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTCTCCCAGCAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85117	86712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_85100_86700
690441	contig_13966_pilon	+	2968	4	Intergenic	novelGene_158155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	39.0412886854702	127	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGATCACGATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432872	441057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_435315_435755_435883_437287_437436_440806
690443	contig_12864_pilon	-	1224	7	Intergenic	novelGene_76433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	726.104675649455	10	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	172	630	251873	242831	FALSE	20	GAAAGAGTTGCTGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEI	252157	242236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242837_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
690445	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690461	contig_8617_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_73478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTCCGCTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62980	62737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
690464	contig_15741_pilon	-	676	2	Intergenic	novelGene_159668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGGTATTTAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50374	49604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288
690467	contig_5050_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_110267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502680	501707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_501700_502700
690469	contig_17014_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_163164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACACACGCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19529	19177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_-_19200_19500
690470	contig_2940_pilon	-	2968	4	Intergenic	novelGene_81954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	6.0184900284226	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	82	2031	1145442	987483	FALSE	30	GAAATGGTGTGGATACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSGGEQFYEDPDPGGKSQDAEARKQTDSEQKLSKMTHNALENINVIGQGLKHLFQHQRRRSSVSPHDVQQIQADPEPEMDLESQNACAEIDGVPTHPTALNRVLQQIRVPPKMKRGTSLHSRRGKPEAPKGSPQINRKSGQEMAAVMQSGRPRSSSTTDAPTSSAMMEIACAAAACLPGEEVTAERIERLEVSSLAQTSSAVAPSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVEQNGIPRQPKDVFRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGLSSFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNISNLKDSLEEGQVEDGGKTLGVISNFQSSPKYGSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEHYQRDYSLIMQALQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAVLLVFVSTVANCVVPLMKTRSRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR	1145523	986545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_987798_989516_989653_1006006_1006942_1144878
690474	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	60	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690479	contig_8544_pilon	-	3388	1	Intergenic	novelGene_55937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175278	171890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_171900_175300
690481	contig_14202_pilon	-	2147	2	Intergenic	novelGene_157131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3227	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTTCTTTTAGATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88611	86100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_88214_88577
690485	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690487	contig_5020_pilon	+	1598	8	Intergenic	novelGene_27855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	828.976797390762	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	360	1214	122915	125701	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYSSCPPFFAWVPGMW	118465	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125087_125657
690497	contig_8616_pilon	+	1326	10	Intergenic	novelGene_72558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	637.770596165528	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	19	1041	425778	436066	TRUE	10	ACCTTTTCATGTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPLSVLPHPFRNVSAIGQAEEECLCQCHPLWNQQ	425759	436590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435793_435966_436119_436357
690499	contig_9727_pilon	-	3119	14	Intergenic	novelGene_86277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	287.654481264791	590	47	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	259	2337	163331	137693	FALSE	5	TGACTTGTGCTGTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQIIKEVLAVSNSILELPCPHLSALASYRWSHGIAAVPEASSTVYNGSLLLLLRDGVGGLYQCWATESGFSYPVVSYWVDSQDQPLALDPELAGIPRERVETPLTRVGGGAALAAQWSYWPQFLTVTVILALVLSGALIVLLASPLGALRARGKVQGCGTLLPGEKSSLSKEQSFRPPKEHRTSASDMDTDNNQLGTEVA	165431	136910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_138286_138719_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141373_156044_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_165202
690502	contig_11846_pilon	-	1463	12	Intergenic	novelGene_105940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	76.4442215492084	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	619	1401	254636	248626	FALSE	15	CAGTGTCACTGTAGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263838	248563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_258037_258083_259908_260113_263659
690513	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690514	SIRV4	-	955	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	5	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	233	39	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15117	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13923_14823
690519	contig_8570_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_120156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTTCTCACCAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331595	332000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_331600_332000
690521	contig_8317_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_20672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGCAGACTTGGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16500_16800
690526	contig_13245_pilon	-	387	3	Intergenic	novelGene_148824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	551	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	161	355	26010	25454	FALSE	25	GTAAATTTTGTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26454	25421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356
690528	contig_15039_pilon	-	1601	14	Intergenic	novelGene_110103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	41.1444273909049	283	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	129	1388	169493	121358	FALSE	45	AAAAAATGGCCATTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIPVAEDSDFPIHNLPYGVFSTKTNPRPRIGVAIGDQILDLSVIKHLFTGPVLSKHQDVFDQTTLNSFMGLGQAAWKEARALLQSLLSASEARLRDDMELRKSAFISQASATMHLPATIGDYTDFYSSRQHATNIGIMFRGKENALMPNWLHLPVGYHGRASSVVVSGTPIRRPMGQISPDDSKPPIYSTCKLLDMELEMAFFVGPGNKLGEPIPVSKAHEHIFGMVLMNDWSARDIQKWEYVPLGPFLGKSFGTTISPWVVPMDALMPFAVPNPVQDPRPLPYLCHDQPYTFDINLSVALKGEGMSRAATICRSNFKHMYWTMLQQLTHHSVNGCNLQPGDLLASGTISGPEPESFGSMLELSWRGTKPIELGNGQTRKFLLDGDEVIITGHCQGDGYRVGFGQCTGKVLPPFTPA	169621	121144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_121438_134004_134123_134849_134952_137891_137939_140603_140680_142436_142568_143556_143657_145457_145511_145619_145718_153248_153340_160156_160207_160720_160843_163620_163732_169412
690532	contig_14446_pilon	+	2045	4	Intergenic	novelGene_160711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	3.09120616516523	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	62	562	284856	287486	FALSE	10	TTCTGCTTATATTTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVFFSANPKELKGTGHSLLDNKTQKKRPKTFGMDVKAYLRSMIPHLESGMKSAKSKDILSADEVIQWSQSLEKLLANQTGQDVFGNFLKSEFSEENIEFWLACEDYKKTESELLHYKAEKIYKAFVHSDAAKQVSIKFIIISLCVKELTYRNNIQHTQQNEILF	284794	288969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_+_284954_285313_285395_285816_285879_287226
690544	contig_8310_pilon	-	1605	4	Intergenic	novelGene_75607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326109	315880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320623_325597
690547	contig_7362_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_147545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAGTAGTTGAGCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323340	324388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_323300_324400
690548	contig_10354_pilon	+	2030	5	Intergenic	novelGene_50848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.65915858467	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432204	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432465_432933_433034_434101_434164_471873_472041_475056
690553	contig_5260_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_144424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAATAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550483	552794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_550500_552800
690555	SIRV4	+	320	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1442	641	987	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2442	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
690558	contig_7151_pilon	-	1788	11	Intergenic	novelGene_40676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.263710237128	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	59	1408	18221	3223	TRUE	25	TCTGAGTTTCTCAACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGVKAD	18279	1832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3236_4626_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13620_13804_13876_18160
690565	contig_11720_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_43913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	163	468	190742	185276	FALSE	20	AGCCTGCCCTCAAGTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPARLTHTSLATLAHPSPHSSSAPPSYPISPAPQLLRFLNLCPPLQSPQFSGFSMTPLRSLFFRLGSPTPCPFLSPPAAPAPWSLCSARPPFRTRHPTGARLHKPDSEEQPLTARHEQAAEDSPSAAAAGAHEQDKDEDQQPKAGDPQPQRRPAG	190904	185184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_185280_190440
690573	contig_18794_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_54654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314080	313624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_313600_314100
690574	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690575	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
690582	SIRV5	-	358	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTGCAATCTCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8584_10853
690584	contig_5643_pilon	+	1350	7	Intergenic	novelGene_38972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	650.308324309836	258	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	407	910	551251	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549628	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549903_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
690592	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	34	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
690593	contig_11227_pilon	-	2015	6	Intergenic	novelGene_163195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	17.4539393834171	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	288	1124	297894	279312	FALSE	40	TAACAAAAGTTGATCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQRKGLQARILSFEEEEKLKRDQALVSDFKQQKLEKEAQKNWDLFYKRNSTNFFKDRHWTTREFEELRSCREFEDQKLTVLEAGCGVGNCLFPLLEEDLNIFAYACDFSPRAVEYVKQNPSYNTERCKVFQCDLTKDDLLEHVPSESVDVVMLIFVLSAIHPDKMHLVLQNVYKVLKPGKCVLFRDYGLYDHAMLRFKAGSKLGENFYVRQDGTRSYFFTDEFLAQLFMDTGYEEVVNEYVFRETVNKKRRSVCAQSFPSEQIPEASKELSTHLP	299171	278420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_283410_291670_291842_296562_296698_297669_298045_299034
690605	contig_3612_pilon	+	2487	7	Intergenic	novelGene_87805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	94.2114937550379	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	146	625	833026	845871	TRUE	60	TAAAGAGAAAGAAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSAADGQGTAITHALISASTLCQVEPVGRWFEAFVKRRNRNASASFQELEDKKELSEESEDEELQLEEFPMLKTLDPKDWKNQDHYAVLGLGHVRYKATQRQIKAAHKAMVLKHHPDKRKAAGEPIKEGDNDYFTCITKGKKMFYSKKFLIVVIT	832880	858314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_833090_835401_835593_840192_840269_845722_846227_847756_848997_857644_857877_858279
690606	scaffold_19766_pilon	+	2493	4	Intergenic	novelGene_34450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.2077936060494	220	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	276	1364	875730	878773	FALSE	30	AAGGAGAGATTGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYGNVFSLDGENDQEISEDTGSHGVLLGRFQKGISQGLKFEEAYEQEVGLKRQLENSGERLNRKIKDFGQVTAEEKLTPMRDRSEKYSDFGNSFTVSSNLISHQRLPMGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNVMGMNKSSPRVTAELNIKEST	870003	879902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_870072_871238_871353_875636_875764_877718
690607	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
690608	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27894	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
690609	contig_593_pilon	+	1623	5	Intergenic	novelGene_101979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_4	947.714454622277	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	42	710	146142	151704	FALSE	10	GGCTTGCCTACCGTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRELRVEGLGGWDMADFDGPAKPLLSLNPQEQAKFQKQVAQVRRRATQQKKLTPGVVYVGHIPRGLFEPQLKAYFSQFGTVTRLKLSRSKKTGNSKGYAFVEFESDDVAQIVAETMNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQVKLYLSYYMLGIRDR	146100	152617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148891_149001_151208_151421_151590
690610	contig_8978_pilon	+	2137	11	Intergenic	novelGene_49392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	307.716574139256	2	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	76	1071	339807	344751	TRUE	15	AATTTCCTGTGCTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGDAGAVRKRCGGNRKK	331587	348139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_343840_344705_344796_345356_345397_345627_345738_347113_347423_347576
690612	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	23	349	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14431	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690614	contig_9848_pilon	+	1291	10	Intergenic	novelGene_79912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	164.045386673594	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	142	1026	58917	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFAREGNVPNIIIAGPPGTGKTTSILCLARALLGPALKDAVLELNASNDRGIDVVRNKIKMFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58775	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_77678_77721_78015_78123_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
690616	contig_9345_pilon	-	2321	8	Intergenic	novelGene_24477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAAATAAGGGTGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631641	621967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_622153_622809_622931_625729_625779_625870_625894_627997_628149_629013_629160_629774_631026_631246
690619	contig_3004_pilon	-	1682	13	Intergenic	novelGene_127488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGAGGCTATCGCGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287244	275525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_275549_277769_277917_278895_279281_279691_279868_280774_280831_281228_281606_284100_284153_284373_284413_285295_285349_285713_285747_286375_286449_286736_286872_287111
690622	contig_6710_pilon	+	532	2	Intergenic	novelGene_97416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCACAGTGATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
690624	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_89183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
690628	contig_5419_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_15528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAGAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283666	282134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_282100_283700
690629	contig_14526_pilon	-	2828	5	Intergenic	novelGene_111207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	76.0706908079584	203	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	92	733	333175	321403	FALSE	0	TGGTCTTGTTTTTTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTVKGFEALIEKEWISLGHRFALRVGHGDDNHADADRSPIFLQFIDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTLSLWSYINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLAIRMELQKRVEDLQREVATRSISSSSERGSSPSHSATPVHTSV	333266	319307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_321568_324671_324849_326121_326236_327773_327867_333082
690633	contig_5039_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_64888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGTCCTGCGGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573495	572450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_572400_573500
690639	contig_4519_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_123719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACTAGCCTTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682579	680026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_680000_682600
690646	contig_14041_pilon	-	1048	10	Intergenic	novelGene_144034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.9851815253987	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	110	862	80924	42731	TRUE	20	CAGTCAGAGCTGATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLLHCLPSPLPPPPLPESSQPPALRVADTSLDRNFMNKHQKPVLTGQRFKTRKRDEKEKFEPTVFRDTLIQGLNEAGDDLEAVAKFLDSTGSRLDYRRYADTLFDILVAGSMLAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRNEY	104582	41295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_41335_42583_42743_44741_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73055_73233_80866_80932_104480
690657	contig_8570_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_120154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2004	2339	329259	328924	NA	20	CCAGCGGTTCTGCAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPATAPITLWTNPSFLLTQVPRFQPLPPSAWSPLTPSHALHPPVKPFLKCASLPPCVSLSSLSLSLPLFPSPSLSLPHSLSHTYSLNSSSSLHLIIPASPIRRCSGGTNS	331262	328882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_328900_331300
690661	contig_6589_pilon	-	2340	3	Intergenic	novelGene_26305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	248	1273	2274190	2273165	FALSE	50	AAGTTTATTGTGAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290212	2272097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2274316_2274707_2274793_2290175
690662	contig_14142_pilon	+	2038	6	Intergenic	novelGene_120489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	18.1151869987588	4	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGCTTGGTAAGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307853	312793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308279_308517_310041_311187_311231_311321_311380_312644
690664	contig_9848_pilon	-	1714	11	Intergenic	novelGene_79949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	518.707046414448	4	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	101	343	110549	107125	TRUE	5	GCAGTCGTTCTCCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTR	113920	98496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104611_104841_104905_105852_105909_106409_106441_107062_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
690667	contig_12270_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_114021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	11	331	14409	13866	FALSE	20	ACTGTCAGTATGGTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14419	13864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690668	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_89286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
690671	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
690674	contig_7202_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_18311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
690677	contig_5200_pilon	+	1926	17	Intergenic	novelGene_140159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	68.1890753713526	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1239	688	1926	262919	480959	FALSE	30	TAAGGAAATAGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASFKAFRSLQPCECHQIKSLQYSNTGDMILVVSGSSQAKVIDRDGFEVMECIKGDQYIVDMANTKGHTAMLHTGSWHPKIKGEFVTCSNDATVRTWDVDNPKKQKSVFKPRTMQGKKVIPTTCTYSRDGNLVAAACQNGSIQIWDRSLTVHPKFHYKQAHEPGTDTSCVAFSYDGNVLASRGGDDTLKLWDVRLFNKPLFSASGLPTMFPMTDCCFSPDDKLIVTGTSVQRGCGSGKLVFFERRTFQRVYEIDITDASVVRCLWHPKLNQIMVGTGNGLAKVYYDPNKSQRGAKLCVVKTQRKAKQAETLTQDYIITPHALPMFREPRQRSTRKQLEKDRLDPLKSHKPEPPVAGPGRGGRVGTHGGTLSSYIVKNIALDKTDDSNPREAILRHAKAAEDNPYWVSPAYSK	187483	480959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_187556_187662_187729_189054_189139_194501_194623_202480_202678_248426_248487_262831_262966_294935_295090_314553_314631_388264_388440_444645_444746_447912_447998_449683_449823_474225_474327_476123_476204_478133_478251_480795
690681	contig_18168_pilon	-	1500	5	Intergenic	novelGene_122083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	185.009965947783	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	281	856	25980	24651	TRUE	35	GTTGATGGAAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSAHLCIPSLGTCVLTLTHMRTDFSP	26573	23466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24935_25038_25315_25964_26171_26483
690692	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	20	358	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14428	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690701	contig_9354_pilon	+	1823	10	Intergenic	novelGene_108045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.8609960987029	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	70	1131	104980	117180	FALSE	10	TTTATTAGCTTTTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLKKYGFSSVGFNFFIAALGLQWGTIIQGLLNDHGEKFHISIHSLISADFSTTTVLVSFGAVLGKISPIQVLIMTILEIAVFNGNEYLFAEIFQATDIGGSMVIHAFGAYFGLAVAGILYRSNQIWEHHNKQSDIHSDLFAMIGTLFLWIFWPSFNSTLAVPEEKQNRAIINTYFSLAACVLTSYAFSSLVERRGKLSMAHIQNATLAGGVAVGTCADMEINPYGSMIIGSIAGIVSVIGFKFLTPFFATTLRIQDTCGVHNLHGLPGIVGGLASIVVIAMGASDVSTTAMQAATLVTSIGTAVAGGLITGLILKLPIWEQPPDEDCYDDCVYWEVPTVDDSLSLSRFQPM	96415	117872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_96438_104932_105117_105984_106136_108697_108846_109396_109564_111077_111216_111996_112119_115831_115906_116127_116202_117129
690703	contig_18168_pilon	-	1408	7	Intergenic	novelGene_122078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	155.97052784278	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	27	1031	27110	23837	FALSE	35	GAAGAAATATGTGGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRNCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27136	23459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26205_26483_26754_27040
690707	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_97223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690709	contig_6842_pilon	-	2880	1	Intergenic	novelGene_130814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1738736	1735856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1735900_1738700
690713	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_97504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690716	contig_4232_pilon	-	1762	3	Intergenic	novelGene_63453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTAGAATTGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546377	542772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_543242_544579_545292_545796
690717	contig_20786_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_159700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAACTCACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76948	76647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20786_pilon_-_76600_76900
690720	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	4	354	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14412	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690722	SIRV6	+	1033	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
690727	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_94807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
690729	contig_12050_pilon	-	2482	17	Intergenic	novelGene_62666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	148.260275782153	124	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	767	1528	467666	453328	TRUE	5	TCTCCATGTGTTCTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSFSVKPLKQKQIVDRVSYLLQEIYGIENKNTRETKPADDENSDNSNECVVCLSDLRDTLILPCRHLCLCNSCADTLRYQANNCPICRLPFRALLQIRAVRKKPGALSPVSFSPVLAQSVDHDEHSCPFKKSKSHPASLASKKPKRETSPDSVPPGYEPISLLEALNGLRAVSPAIPSAPLYEEITYSGGAQTPCPRPAARLLGSIRSQTAAIRRASHGTGLLTVPCGPHRPPSAKRTKRSSQRTRTPLPR	511536	441466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_442247_451585_451676_452504_452548_453286_453411_454853_455083_456700_456767_458809_458920_461651_461812_465467_465537_467621_467670_470434_470485_471184_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
690740	contig_19790_pilon	+	2105	4	Intergenic	novelGene_109490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	21.6384431561566	460	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	310	495	39658	42330	FALSE	20	TTTATAATCGTTTGCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCLFVTVGTTSFDDLIACVSAQDSLQIIKSLGYSRLVLQIGRGTVVPEPFSTESFTLDVYRYKDSLKEDLQKADLVISHAGAGSCLETLEKGKPLVVVINEKLMNNHQLELAKQLHKEGHLFYCTCSTLPGLLQSMDLSTLKCFPPGQPEKFSTFLDKVVGLQK	36394	43940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_36473_37405_37569_39589_39729_42215
690749	contig_8260_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_163255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200797	198541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_198500_200800
690759	contig_6110_pilon	+	2236	14	Intergenic	novelGene_163279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_10	44.018285603322	112	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	19	1827	639575	660697	TRUE	10	TTCTGGAACTTTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLTVRDPAVDRSLRSVFVGNIPYEATEEQLKDIFSEVGPVVSFRLVYDRETGKPKGYGFCEYQDQETALSAMRNLNGREFSGRALRVDNAASEKNKEELKSLGTGAPVIESPYGETISPEDAPESISKAVASLPPEQMFELMKQMKLCVQNSPQEARNMLLQNPQLAYALLQAQVVMRIVDPEIALKILHRQTNIPTLIAGNPQPVHGAGPGPGSNVSMNQQNPQAPPAQSLGGMHVNGAPPLMQASMQGGVPAPGQIPTAVTGPGPGSLPPGGGMQAQVGIPGSGPVSLERGQVPMQDPRAALQRGPLPANVPTPRGLLGDAPNDPRGGTLLTVTGEVEPRGYLGPPHQGPPMHHVPGHDNRGPPPHEMRGGPLTEPRPLMAEPRGPMMDQRGPPLDGRGGRDPRGMDARGMEARAMEARGLEARAMEARAMEARAMEARAMEARVMEVRGMEARGLDTRGPVPGPRGPMPGGIQGPGPINMGAVGPQGSRQVPVMQGAGMQATGMQAAGMQAAGMQAASMQAAGMQAAGMQGAGMQSGGQPGGFSPGQNQVTPQDHEKAALIMQVLQLTADQIAMLPPEQRQSILILKEQIQKSTGAP	639556	663671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_639633_640931_641011_641371_641542_642408_642546_643026_643147_643260_643399_645971_646096_650974_651038_654369_654512_655294_655471_655749_656028_659700_659902_660574_660701_663265
690761	contig_8930_pilon	-	2313	13	Intergenic	novelGene_161211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	17.3485510121803	217	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	97	1599	204494	92642	FALSE	35	AATGGATTTTTTAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLAEPQWPPGLAVMKTIDDLLRCGICFEYFNIAMMIPQCSHNYCSLCIRKFLSYKTQCPTCCVTVTEPDLKNNRVLDELVKNLNFARSHLLKFALESPPTSPASSSSKNLAVKVRTPVASRHSLKLGSKLMDNFLIREIGSSTSELLIRENESKFNHQKEASTSAENKEIPSVEKTAPGHSSDVAETPSTSTSKQVTKVDCPVCGVNIPENHINKHLDSCLSREEKKESLRSSVCKRKPLPKIVYNLLSDRDLKKKLKQHGLSIQGNKQQLIKRHQEFVHMYNAQCDALHPKSAAEIVQEIENMEKTRMRLEASKLNETIMVFTKDQTEKEIDEIHSIYRKKHQNEFQLLVNQAKKGYKKNVEMSKKKVAKKEDESTEKLLPVCMGQEDNEMKFSDMTSITNQFPQSELGSPGKLVPDRSDDSSNCTDIQEEASFPPESDSCNSSSSDIIRDLLEEEEAWEASHKSDLQDTEISPRQTGRKRAAENAETEPRNKHNRN	204590	91927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8930_pilon_-_92745_109319_109383_140468_140644_143492_143631_156972_157034_158510_158588_163896_164082_168638_168739_171647_171983_190051_190123_191811_191874_200510_200593_204443
690762	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690765	contig_8138_pilon	+	1772	6	Intergenic	novelGene_52461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	517.821590897869	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTTCTTAGTAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280122	307932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364_306910_307230
690766	contig_11016_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_163294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137630	134928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_134900_137600
690781	contig_4232_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_63483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_3	193.823218423387	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1	543	614149	611887	TRUE	10	GAGATCTCTGCTGGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKCKLRCRRWWASWSGPG	614149	607750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_612075_613618_613698_613873
690783	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
690792	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690793	contig_8617_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_73496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCAGTGAAATTGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63854	63634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63600_63900
690799	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690801	contig_10235_pilon	+	1815	2	Intergenic	novelGene_46512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	206	1453	297036	298948	FALSE	15	TGTTAATTTTTCTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDRGRWPWSWWLWSSGSPRRLCIWPHH	296830	299310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_298207_298871
690804	contig_14441_pilon	+	1172	6	Intergenic	novelGene_100467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	380.031893398436	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	8	910	85423	117335	TRUE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALPLACALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASSFATAPREKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	85415	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85882_113165_113209_116578_116963_117216_117344_117539
690805	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690806	contig_17989_pilon	+	1738	8	Intergenic	novelGene_150810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1344	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTTTATAATGCCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200618	207162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_201214_201519_201665_202348_202465_204529_204664_204858_205018_205678_205846_206644_206877_206972
690819	contig_7909_pilon	+	2115	3	Intergenic	novelGene_155877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	28.5	228	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	146	877	115008	155354	FALSE	15	ACCTGATTTTTTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLYPKGGEKLQFDYGVYLLNKNIAQLRYQHGLGTPDLRQTLPNLKNFMEHGLMVRCDRHHTSSAIPVPKRQSSIFGGADMGFPGGIPSPDKGPRKRASSENERLQYKTPPPSYNSALAQPVTAIPSMVASERKTTSLSSSLDTSLDFSKENKKKGVDLDNSLNAGHVSVNTSQEPTEEAPSGHPATVNGALLPSEQAGATNAQLPGEFHPVSEAELCCTVEQAEEIIGLEATGFTSGNQLEAFNCIPVDSAVAVECDEQVLGEFEEFSRRIYALNENVSSFRRPRRSSDK	59793	156592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_59873_114941_115034_154648
690820	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
690823	contig_9014_pilon	-	1286	12	Intergenic	novelGene_106750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	65.3644582069967	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	108	1028	82349	78380	FALSE	5	TGTTTGTTTTTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83148	78121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82396_83087
690828	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
690834	contig_2596_pilon	+	2825	12	Intergenic	novelGene_53497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	109.684219918699	6	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	367	2178	994680	1027378	FALSE	20	CCAGCCCGACACGCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRKAFLVEHNLVLAERKSPEISEQVVQWPAIMYKSLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDVLKPIQDVNNLRLSLSDNQNVSKEFQALIVKHLDESHLLQGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATIVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIHVEVIHDKFVTCGNSTRIGAVKRKSSENNGNLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTVVFKEILLGCTAATPSSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEELSSCLNIKPEILRTKPDVCKAGLLSSKFSQIGTGDLKTLSEPKSSCTQLKTNTDQENRLESVIQPSAGPLKECLPTKASSKAELEIANIPELQKYLEHIPSTSNVRVALSNKPEEKACVNSDSPNNCVGKKVEPSTLGCRSQNLKESSVKVDKESCCTRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDTEAIGLWLPLIKNVVGTDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHSKSIS	993804	1028025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_993982_994490_994707_1003261_1003418_1007578_1007690_1010584_1010688_1011349_1011475_1011727_1011801_1011907_1011997_1019132_1019297_1021945_1022473_1025546_1025752_1027146
690837	contig_11978_pilon	-	1299	6	Intergenic	novelGene_62915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.72046505340853	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	837	1178	857181	856840	FALSE	20	GACTATGTCTCTCAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHKEHRQQAALTEHLLRMETQLALTDLPLLPEEPMARDSNLPVPPEQEKTPTEPASSPQTYSATKMPCPLVSLGQQGTAQAQEGARAAVAPKASLTGVRSTTKTMTKKIKN	860263	856718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_857208_857483_857633_857945_858016_858224_858613_859617_859727_860169
690838	contig_8020_pilon	+	2320	20	Intergenic	novelGene_114403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	54.9850647059747	23	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	247	1416	173375	200428	TRUE	20	CAGACTTTTGTCCTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRIPKKAFRGRRHFLKAQAVLSGLCVLSQG	167174	203350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_169128_169206_171004_171097_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_200340_200429_201309_201398_201924_202085_202483_202558_202768
690849	contig_11594_pilon	-	1958	5	Intergenic	novelGene_80937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGGATTTTTCTAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567483	559577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_561096_563007_563102_563558_563656_566671_566776_567338
690850	contig_11594_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_80936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559577	559030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_559000_559600
690851	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690859	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	71	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690860	contig_3787_pilon	-	2955	3	Intergenic	novelGene_102418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	666	junction_2	89.5	18	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2516	2926	562283	559769	FALSE	35	TTTGCAAGTGAAATTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARFEEHKNEKDMVKATQLLREAEEEFWHCQHPQPYIFPDSPGGTSYERYECYKVPEWCLDDWHPSEKAMYPDYFAKREQWKKLRMESWEREVKQLQEETPPGGPKTEALPPARKAGDLPPLWWHIVTRPREQPM	564798	559739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559901_561481_561596_562118
690861	contig_6048_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_73223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATTTTGATGATACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635853	1636758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1635900_1636800
690864	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
690868	contig_10609_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_123956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATTAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500336	503076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_500300_503100
690873	contig_12250_pilon	-	1450	9	Intergenic	novelGene_80649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	180.240421035349	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	227	1192	379067	375947	FALSE	25	GGAATCAGTATCTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGQPAQPAQDGIRQGTLHPKASELGGGAGGEREVSWVKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380554	375688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379181_379636_379719_380523
690874	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690877	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690878	contig_2067_pilon	-	3595	28	Intergenic	novelGene_158916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_5	23.8700183866242	86	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	964	2895	89	2983	508282	372546	FALSE	20	CCAGGCTATGTGAGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLPCVWASCRLVQHDLLVLCGRLPPRDFDMQKIKSLMTRQGLKSPPESLSDLGAIESLRVPGKEEFRELREQATDPQAEQELINSIEQVYFSTDSFDIVKYELEKLPPVLSLQELEEYRDKLKQQQAAVSKKVADLILEKQPAYVKELERVTSLQTGLQLAAVICTNGRRHLNIAKEGFTQASLGLLANQRKRQLLIGLLKSLRTIKTLQRTDVRLSEMLEEEDYPGAIQLCLECQKAASTFKHYSCISELNSKLQDTLEQIEEQLDVALSKICKNFDINHYTKVQQAYRLLGKTQTAMDQLHMHFTQAIHNTVFQVVLGYVELCAGNTDTKFQKLQYKDLCTHVTPDSYIPCLADLCKALWEVMLSYYRTMEWHEKHDNEDSTSASEGSNMIGTEETNFDRGYVKKKLEHGLTRIWQDVQLKVKTYLLGTDLSIFKYDDFIFVLDIISRLMQVGEEFCGSKSEVLQESIRKQSVNYFKNYHRTRLDELRMFLENETWELCPVKSNFSILQLHEFKFMEQSRSPSVSPSKQPASTSSKTVTLFEQYCSGGNPFEIQANHKDEETEDVLASNGYESDEQEKSAYQEYDSDSDVPEELKRDYVDEQTGDAPVKSVSRETLKSRKKSDYSLNKVNAPILTNTTLNVIRLVGKYMQMMNILKPIAFDVIHFMSQLFDYYLYAIYTFFGRNDSLESTGLGLSSSRLRTTLNRIQESLIDLEVSADPTSTLTAAEERKEKVPSPHLSQLVVLTSGDTLYGLAERVVATESLVFLAEQFEFLQPHLDAVMPAVKKPFLQQFYSQTVSTASELRKPIYWIVAGKAIDYEQMLLLMANVKWDVKEIMSQHNVYVDALLKEFEQFNRRLNEVSKRVRIPLPVSNILWEHCIRLANRTIVEGYANVKKCSNEGRALMQLDFQQFLMKLEKLTDIRPIPDKEFVETYIKAYYLTENDMERWIKEHREYSTKQLTNLVNVCLGSHINKKARQKLLAAIDDIDRPKR	508370	371933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_372666_373871_374062_375869_375992_379191_379351_380407_380505_381780_381930_391340_391422_393265_393388_411029_411137_413912_414032_415494_415672_418836_418928_423353_423453_423788_423884_431438_431531_434319_434453_451433_451575_453987_454087_455451_455495_474705_474789_475931_475968_476048_476167_476857_476929_478253_478308_480926_480999_482101_482225_496221_496291_508249
690879	contig_8617_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_73487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCTCAAAACTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62800_63000
690880	contig_10196_pilon	+	1020	8	Intergenic	novelGene_132152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	396.135206767609	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1	729	1034566	1050210	TRUE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGERKCTVVMNTPSTTSSLPATWSPTTPPFRRNWPGPRRSTGSGSPQCRPPLQRSSPTTPSCE	1034565	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044948_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
690883	contig_3015_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_163311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	102	425	153461	153784	NA	55	AAAGGATATAAACAGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLELFKFIVCLFDISKQKLLLNSCFIMSFLECLALPSSHHLPTSPVKGRDKSHLCCQLYGNSQYESNPPNVGMTLVFTFPLLYPHHQLPTWHFLSDHSHQELGQS	153359	154141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_153400_154100
690886	SIRV7	-	356	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	26	-32	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
690887	contig_12654_pilon	-	1276	9	Intergenic	novelGene_129328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	166.327237697258	161	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	625	1212	817780	808478	FALSE	15	CTTTTACAGAGTCCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827466	808413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823669_823887_827115
690891	contig_7202_pilon	-	481	3	Intergenic	novelGene_18579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGCAATGGAGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30099	28136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
690895	contig_15063_pilon	+	975	3	Intergenic	novelGene_13115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7060	junction_1	1101.5	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	202	975	34808	36153	FALSE	15	AAGGGTGAGGCCCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKP	34606	36153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839
690897	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690898	contig_9807_pilon	+	1280	11	Intergenic	novelGene_32895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	503.052969377977	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	371	1135	140826	158865	FALSE	40	CGTGTGGAGCATAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGVIPRPESRSKMHTGYTTSAAWPGWTSTRWSQPPTTPPSKSGQSPTEAHPLGPTGSGTRTSLQQNVFFLSMFL	109121	159010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109642_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151794_156740_156770_158676
690899	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690900	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_97358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690901	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690908	contig_3900_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_84190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAACAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243007	242449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_242400_243000
690910	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690911	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
690919	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_97218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690920	contig_3077_pilon	+	2637	8	Intergenic	novelGene_26828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	112.396528379825	28	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	168	1073	492543	521016	FALSE	20	TGCCTAGGAGAGTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPDLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQFLFHSDTMGIPC	490524	522580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_490635_492485_492726_496881_497036_498360_498579_503787_503938_507593_507709_517678_517725_520976
690922	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
690928	contig_12411_pilon	+	2823	1	Intergenic	novelGene_145673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGATTTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181284	184107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_181300_184100
690931	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690932	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690935	contig_14618_pilon	-	1290	6	Intergenic	novelGene_136853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2466	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCCAGAGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354421	1279740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327380_1344835_1344943_1348517_1348598_1350876_1351054_1353798
690941	contig_8330_pilon	+	1912	8	Intergenic	novelGene_71865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	19.1673617146972	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	192	1076	923753	929265	TRUE	20	GGCTGTGGGGTGAAGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGCAGHSGLRGGFRRTTFPVKLWAHGGGGGCCREERTCGKPGLVLGGWPLSECSHFPVWCSSMPGGSWGPTAKWPYSWLAVTHWPRSQRTSHMQSCGWGPTPGGDAKILDNHISQKTLGQWIAENRDSLGSKVKDSFNGQLPFLFKVLSVKTALSIQAHPNKELAEKLHLQAPEHYPDANHKPEMAIALTSFQGLCGFRPVEEIVTFLNKVPEFQFLIGDNAATQLKQSMSHNSRAVASALRNCFSHLMKSEKKVVAEQLNLLVKRISQQVAAGNNMEDICGELLMELHQQYPGDIGCFAIYFLNLLILKPGGGHVSGGQHAPCLPERRLCGVHGMLRQHGACWPDTQVHRRANSV	922873	930421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_923035_923722_923851_924644_924847_925609_925752_926085_926269_928093_928269_929180_929390_929709
690942	contig_4847_pilon	+	1974	9	Intergenic	novelGene_156149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	38.4861988250334	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1133	1738	86730	92768	FALSE	35	CTCAAAATATTGTCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	79641	93004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85410_85532_85605_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
690943	contig_5590_pilon	+	2302	8	Intergenic	novelGene_163046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.3512781198564	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	152	1234	384207	387285	FALSE	15	GTTCTGCAGTCCCACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELVVTALLAPSRLTLKLLRALMWSLVFSAALVAAAVYSCIALTHVLCRPRRGCCGRPRCVFPACLSDPSLGEHDFLTLQSSGLRLHYVSAGRGNGPLMLFLHGFPENWFSWRYQLREFQSRFHVVAVDMRGYRPSDAPGDVDCYTTDLLMVDIQDVILGLGYSKCVLVGHDWGGFLAWNFSIYYPALVERLVVASAAPMSVYQDYSLRHISQLFRSHYMFLFQLPWLPEKLLSMSDFQILKTIFTHSKTGIPRVTLHEIEAFLYSFTQAGGLVGPLNYYRNIFRNFPLEPQELSTRTLLLWGEKDIYLEPGLVGAVGSRFVPGRLEAHILPDVGHWVPQSNPEEMHQYMWAFLRDLLD	383180	388353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_383246_384120_384450_384559_384646_385099_385258_385395_385525_386645_386750_386836_386974_387059
690944	contig_11413_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_103155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAGTTCAAATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306646	307437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_306600_307400
690946	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690953	contig_10143_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_163338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAGTGGGAGAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197386	197141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_197100_197400
690955	scaffold_6394_pilon	+	1478	7	Intergenic	novelGene_110985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2426	junction_6	314.592726129091	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	660	1322	403262	406119	FALSE	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398174	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
690958	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
690961	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
690966	contig_6163_pilon	+	354	4	Intergenic	novelGene_103850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	63.5732298656876	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCTGGTGTTGAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498886	500610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_498972_499595_499655_500280_500419_500538
690973	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
690974	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690981	contig_7202_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_16636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27855	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
690982	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
690983	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
690990	contig_2062_pilon	-	3372	1	Intergenic	novelGene_139039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACAGTATTTCCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204699	1201327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1201300_1204700
690992	contig_7622_pilon	-	1892	13	Intergenic	novelGene_132423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	225.661065907849	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	401	1666	295663	269125	FALSE	55	GTAACATTAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKEKGYATDESTVSSVQGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	297969	268898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276757_280542_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296569_296647_297075_297170_297399_297549_297946
690997	contig_7359_pilon	+	2072	9	Intergenic	novelGene_139850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.3006331568337	354	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAGCATGTCCTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38596	56648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_38653_41423_41667_42571_42680_45589_45718_46227_46272_48347_48446_49060_49087_51537_51581_55322
690998	contig_2069_pilon	-	729	3	Intergenic	novelGene_23512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	4121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	68	349	1509802	1508747	FALSE	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509869	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
690999	contig_15104_pilon	+	2044	9	Intergenic	novelGene_163352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	55.1339278484673	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1205	1810	630631	631236	FALSE	25	TTTATAGTCTTTAATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHKNQDAEEKIKEEQSLLSTYALPSCYPTKELTDIYDIKPFPKVTDTKKTEDLYWRQLALKPQPIPYAKANNYIHYEHFKSDQYTMCQDPTSLSKPGILQNKQGTAAFTLEQVFGKPEEHQLALNMENSEETRPILGWIPRVGVAKPQTNLLDLKNSFSKSGVRKHFHKSILDDHKDLRDKEHSGMKHQFYGHNSYYFYN	586352	631470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_586463_587163_587323_595072_595250_607434_607507_609950_609981_616639_616822_619364_619454_626900_627076_630420
691000	contig_8241_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_157504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	71	544	636293	635820	NA	65	GAATAAATCCAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPKALGKNPFLRLLTSGGCRQSWHSLACSYITAIFASVFICSLPCVSVVSSHGLIGHHSLDLEPTLILHDFILTDYIYKDPISKWSHSKVPGGHKFWGDVNIWEHIALGRYAAKDLFEVLKSKYISLRTKVCLTQVMLFLVASYAFDSRTMNKED	636363	634623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_634600_636400
691003	contig_2100_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_50744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATAAGAGTGCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170211	1169924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1169900_1170200
691009	contig_15449_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_33620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	306	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTTCCCAGTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58736	61138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_58700_61100
691013	contig_16846_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_82916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATTTCTAGGGTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474683	474884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_474700_474900
691018	contig_16378_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_163372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2009	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	77	496	17265	16737	FALSE	25	CTTCCTTCTCAGTATAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLEAVVFSFLWAVGLGQWKLEQPDMSISKAASKSAHITCNVAVEDFENAYIGWFRLKPNQGVEYLIYIHSTTTPNYASLGGKSKKLEASKNSRSSTSILKINSVEKEDEAMYYCAWYIHGIRVAKIPYTRTIFKSVHT	17341	16734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16378_pilon_-_17114_17222
691027	contig_9243_pilon	-	2091	10	Intergenic	novelGene_60311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	239.582713364737	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	217	810	41481	20056	FALSE	45	GAATTGTATAGATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64625	18774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34652_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
691028	contig_17470_pilon	-	1809	13	Intergenic	novelGene_110513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	60.1435204785649	3	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	87	1322	277215	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIGASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302626	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271368_271417_271531_271609_272831_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
691034	contig_7361_pilon	+	2938	11	Intergenic	novelGene_163377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	10.5451410611713	53	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	825	2478	11	2488	167868	285342	FALSE	35	TGTGAAATAATTGTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGKFASLPRNVPVNHQFPLASSMDLLSSKSALVEHRTDAYQDVSIHGTLPRKKKGPPPTRSCDNFSHMGTLPHCKSPWQNSPLTQDVIQENPLQDWKGETFTFRDQHLLDPTLEYVKFSKDRHAMDRTPERLKKELEEELLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKIIRTVLRLSEAYSRVQYQFERESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEERYGISPGRASEGSLSEEWPEVTKRLSLTMGGMPGREQSLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDKRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSTGVDTNPCPNSPVFRTGSEPTLSPALVRRVSSDIRVGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKAPFLKFPPSPSTWLNSEAHYCELNPAFAISCDRAARLPSCAQDSYVELLRARQNGALGPRNSGTSYLILDDDDRVRPWEPPAAQMDKGQEDEGEFVKPLLETDSSFRPNNFESKLLPPENKPLETAMLKHVKELLTNHDPKVIAQHMLQMDCKVARILEVSEEMQRNMGVSSGLELITLPFGHQLRLDIIERHNTMVIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSRIIQVAVELKDSMGDLYSFSAIMKALEMPQITRLEKTWTTLRHQYTQTAIRYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARLMAEAADTYRMNAEKILEGFLPDEEMSEIFKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTVLSRKLEPPPVKQTEP	167857	285792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_168185_201104_201145_258430_258560_260692_261136_265194_265299_266371_267025_272871_272988_277290_277463_280595_280708_280936_281150_285163
691035	contig_10437_pilon	+	968	7	Intergenic	novelGene_38315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	1018.31505711914	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	142	936	439767	451175	FALSE	25	GATGAACTGCTTTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431126	451207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
691040	contig_12919_pilon	+	4466	30	Intergenic	novelGene_75881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCACGCGTGCGGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643123	683920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_644148_644517_644573_644666_644745_645113_645268_646904_647023_648263_648357_648907_649113_649691_649735_652476_652741_654779_654880_665193_665345_665702_665809_666746_666926_667152_667228_667850_667944_669620_669714_669991_670061_670790_670900_671132_671305_671989_672105_673447_673602_674447_674587_675459_675553_677549_677738_678654_678740_678839_678977_679888_679986_682512_682592_683331_683444_683834
691042	contig_7593_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_127311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCGTGTGTTCATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264173	261452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_261500_264200
691050	contig_2892_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_119029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301336	299595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_299600_301300
691055	contig_6233_pilon	-	1216	9	Intergenic	novelGene_74791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	299.566535806321	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	199	1041	149777	136863	FALSE	35	TTAAGCCACAAAGCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELSLCCEEAQATWRSHV	250154	136687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_200462_200546_250135
691060	contig_6958_pilon	-	1892	5	Intergenic	novelGene_69924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	369.979982566625	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	401	859	160965	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	189995	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149784_149846_149939_154425_154590_160928_161061_189690
691064	SIRV5	-	397	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGGTAATTTCGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8460_8590_10863
691068	contig_15456_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_139496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATTCCAACTCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109485	110381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_109500_110400
691076	contig_17518_pilon	+	1672	10	Intergenic	novelGene_117353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	13.1402688962847	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	91	1200	7084	86154	FALSE	20	TGATGCTGTCATGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCVAIQEANQLREEKTHLEKQSRELQAKCMELENEKFEAIVRARNSIQLLEEANLQKNQALLEEKQKEEDIEKMKETVSRLVQDAAIRTRKEVANTRKQYNVQISRLTEELSALQMECAEKQGQIERAIREKKAVEEELEKIYREGRGNESDYRKLEEMHQRCLVSERSKDDLQLRLKTAENRIKQLEITSSEEISRCQEMIQKLQNVLESERENCGFVSEQRLKLQQENEQLQKETEDLRKIALEAQKKAKLKISKMEHEFSIKERGFEVQLREMEDSNRNSTVELRHLLVTQQKATNRWKEEAKKLTESAEIRISNLKSELSRQKLHTQELLSQLETANEKVVENEKLILEHQEKANRLQRRLSQAEQRAASASQQLSVITVQRRKTASMMNLENI	6993	86626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_7174_9924_10024_14763_14836_19104_19180_21024_21171_22695_22889_28149_28347_78821_78901_81350_81447_86091
691089	contig_7718_pilon	+	1343	8	Intergenic	novelGene_129406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	93.7987424309764	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	46	696	257538	284723	FALSE	15	TATTCTGTCTCAGCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALTWRPGRCFLTENMWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252818	285370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_252859_257532_257721_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
691092	contig_4654_pilon	-	629	2	Intergenic	novelGene_103044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1082	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAATCAGATCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408839	385729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_385793_408273
691101	contig_14925_pilon	+	853	4	Intergenic	novelGene_55221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGGGTCAAGAGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25884	29827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568
691103	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691106	contig_7594_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_55417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	694.785713367798	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	127	585	539088	554556	FALSE	20	ATAGTGTTTTGTGATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPGTRLVSVVVSVVSARPGWLAVLSPPWPAQTLGTPPSPSRMTSTMAAAWPLPACTSEWTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	538961	555177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
691107	SIRV6	+	1054	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	28	-1	24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	42	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
691108	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691110	contig_6076_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_81768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTCAAGCTAAAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423622	424204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_423600_424200
691115	SIRV2	-	456	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4407	44	3232	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
691116	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
691118	contig_10626_pilon	-	1788	9	Intergenic	novelGene_138204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	101.143153500373	2536	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	288	1478	303295	279002	FALSE	35	GAATGGCTATAATTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISCMRPHQELKKKEETEGETEYKFEWQKGAPREKYAKDDMNIRDQPFGIQVRNVRCIKCHKWGHVNTDRECPLFGLSGINASSVPTDGSGPSMHPSELIAEMRNSGFALKRNVLGRNLTANDPSQEYVASEGEEDPEVEFLKSLTTKQKQKLLRKLDRLEKKKKRDRKKKKLQKSRSKHKKHKSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSIETSESSSESDDKQKKIQKQKRKKNKCSGYNSSDFEEKDKSKKRKLYEELSSSHSNKEKDREKPRFLKRESSGKNSKWSHSNSDRKSKSRNYSPKKRGSERNERSSRSQSRDEKGRRSRSRSHSSYKQREIRKWTQCSPSEEQNRNDTRSRGTDTHRGEKMHRENSGDKHTKVTQRERSRSREKIKRDYM	311928	278691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_279723_281165_281252_282448_282556_301020_301139_301971_302021_302382_302448_303250_303325_305150_305246_311765
691119	contig_9706_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_20802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATGAATTCCGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
691121	contig_17198_pilon	+	3813	5	Intergenic	novelGene_62354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_4	47.4940785782817	765	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	38	472	708294	726517	FALSE	0	TTTCCTTGGCTCTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGTRTPAVWLCLMCLQGLGKSLTQGGYDMVQKLFLDFFRRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEQQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEELRERKILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKAAIRKELNEFKSTEMEVHELSRHLTRFHRP	708256	729858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_708433_715278_715341_720513_720655_725211_725289_726501
691124	contig_20332_pilon	+	1416	3	Intergenic	novelGene_156182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_2	297.5	138	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	320	376	643318	643374	TRUE	60	TAAAAAAAAAATCTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIGHFVGEAAAPPLLSRLPICRRRLFLRLLLSLFLPPPGFRRRKRCSRIPTPGRSFSLFISVFSPLQPPDTVIRAGPVGILSPHRPHISIACPLSRTSNLSTPLLMQLRVTTYSRQGLKITFI	641966	644857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_644035_644477
691127	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691129	contig_18869_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_56259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAATTTTCTCCTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73352	73556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
691132	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_94866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653768	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691136	contig_1443_pilon	+	801	3	Intergenic	novelGene_28180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	97	501	344128	344592	FALSE	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344473_344532
691146	contig_10531_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_114531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAGGCTCTTCTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470056	468503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_468500_470100
691147	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691150	contig_15732_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_88911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTAATGAAGCTAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305421	307282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_305400_307300
691152	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	282	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691153	contig_3948_pilon	+	1986	9	Intergenic	novelGene_53229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_7	48.2953155078213	651	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	133	735	933984	966763	FALSE	30	TATTTCTTCAAATGGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLYCTQDPVPEAVGGDMQQLNQLGAQQFSALTEVIFHFLAEPKEVERFLAQLSEFATTNQISLGPLRSTVKSLLLVPNGALKKSLTAEQVRADFITLGLSEDKATYFSEKWKQNSQTLAQWAIGQTLMINQLIDMEWKFGVTSGSSELDKVGSIFLQLKLVVKKGNQTENLYIELTLPQFYSFLHEMERVRASMECFS	933851	968014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_934068_940742_940797_940893_940997_964583_964641_964723_964762_965227_965319_965633_965684_966104_966154_966686
691154	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691155	contig_4797_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_6894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAATGAAATACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272983	272231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_272200_273000
691159	contig_4838_pilon	-	1171	8	Intergenic	novelGene_144782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.0922732478596	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	733	1122	239656	217653	FALSE	30	GGCGAGAAGCGGGCGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTCSHLTVPEILRYHDELSVQSVQCRGSGFVLHLLSVKEISRPGPEVLGLPQSTIATSGQRRRLPWPRPLVSPISPPGSASSGSRAIETLILAALDLPTNEDVQNRDHRRGQIIIPKPLPSPSHRGLV	255598	217603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_217917_222261_222377_239645_239695_241059_241195_244326_244394_248314_248427_251005_251071_255283
691162	contig_13608_pilon	-	1666	12	Intergenic	novelGene_52360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	72.1870847632149	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	18	1076	470234	369353	FALSE	15	TGTGTTTTGTTTCTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKETDVAFIPTSGLSGENLITRSQSNELIKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCVTGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470251	368762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400637_470191
691163	contig_14441_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_100717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	116728	117610	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116576	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
691164	contig_18613_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_80212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2336	junction_2	1118.98045112504	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	675	974	28443	31105	FALSE	10	GTATATGGTCTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23699	31362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28639_30137_30195_31058
691165	contig_9727_pilon	-	2116	12	Intergenic	novelGene_86372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	244.270443539076	10	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	42	950	598065	582998	TRUE	45	TAATATGGAAAGAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVVGRWSFSSSFCTVFCRAWDIAA	622855	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598076_622824
691172	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691173	contig_12638_pilon	-	451	5	Intergenic	novelGene_33208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	202.704834673473	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	17	451	333499	327089	FALSE	30	TACGGTGCTGAGACGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLVPMEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESC	333515	327088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_327157_332668_332789_333007_333096_333202_333274_333411
691174	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691181	contig_15866_pilon	-	2808	1	Intergenic	novelGene_63601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAACTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284697	281889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_281900_284700
691182	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691185	SIRV6	-	1265	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	72	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATACGAGCAGTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11774	3107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3162_7102_7451_7806_7919_10711_10825_11038_11104_11201
691190	contig_10627_pilon	+	467	3	Intergenic	novelGene_59927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	220	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	294	446	109532	109684	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSAGLPDPPPTPTPGPQLSRKGLDWKGHKAVIWSRSSQDKLDQTSGVLLGSRSCLGWGRQRLVWNLQMDSEQTSSLRSLARAMTPNSAPDGPPRAVSLSPSASHPGPPRPQTHYTME	105412	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_109337
691197	contig_6557_pilon	+	2125	5	Intergenic	novelGene_33037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	56.1487978499985	825	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	115	465	656776	658829	FALSE	20	GGTGGTGTCTGTTATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATAATAPPAAPAGEGGPPAPPPNLTSNRRLQQTQAQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNLKMMIILGVICAIILIIIIVYFSS	656661	660489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_656778_657302_657424_657908_658068_658163_658216_658812
691198	contig_1443_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_28205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	102	407	344287	344592	NA	25	CTAATGAGTGAGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344185	344894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344200_344900
691199	contig_7391_pilon	-	1958	6	Intergenic	novelGene_112165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.606172692507	14	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	179	589	457964	443049	TRUE	25	ACAAATTGTCTGTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRPVVTAWVRGSGTGEALGCFGLWVGQRAWRAGVPGPGQGSDPWLVSLRTRSAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKVLKKVSKYIQEQNEKIYAPQGLLLTDPIERGLRVIEITIYEDRGMSGR	458142	438707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_439585_439638_440116_443033_443094_444144_444247_451552_451706_457853
691200	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_97075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691201	contig_4232_pilon	+	937	4	Intergenic	novelGene_63185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	83	583	146362	149200	FALSE	30	GTGTATAAATGGAATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146279	149554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
691202	contig_14353_pilon	-	1343	6	Intergenic	novelGene_82075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	484.20714575479	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	423	470	79992	79945	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVPCNPPTGLLPSPQATSCALQVGGDFSPSLSLMFNLHPHPAPKLHPF	88585	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80078_83897_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547
691208	contig_4832_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_163410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTACTGGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457903	456194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_456200_457900
691212	contig_15991_pilon	-	1757	6	Intergenic	novelGene_70916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_5	2547.93888466737	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	71	610	105108	101983	TRUE	15	TCTAAAGGTTGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	106352	100381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_102271_103583_103703_104975_105142_106315
691213	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
691216	contig_19559_pilon	-	2062	15	Intergenic	novelGene_163434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	25.2430026675407	202	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	242	1732	94417	79836	FALSE	35	ATAAACAACCTGTACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSGIVNLGTSENKLCFDLLSWRLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGEAFLIPTPYYGAITQHVYLYGNVRLVYVYLDSEVTGTDTRPFQLTVEKLEMALQGAHSEGVKVKGLILINPQNPLGDIYLPGELQEYLGFAERHKLHVIVDEVYMLSVFEESAAYSSVLGLERLPDPQRTHVMWATSKDFGMSGLRFGTLYTENQDVAIAVASLCRYHGLSGLVQYQMAQLLQDRDWINQVYLPENHARLKAAHTYVSEELRALRIPFLSRGAGFFIWADLRQYLSEGTFEEEMLLWRRFLDNKVLLSSGKAFGCKEPGWFRFVFSDKAHRLCLGMQRVRQVLEGKSQVAEDPPSSQTQEPSS	96037	79505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_79925_80050_80205_80321_80465_81870_82013_82126_82173_83811_83902_84589_84691_85656_85735_86258_86357_88369_88437_88896_88967_90108_90180_91357_91418_94135_94418_95796
691219	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691237	contig_7019_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_149477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCCCAAATCCTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344702	1344371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1344400_1344700
691238	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691240	contig_5649_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_82404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTAGAGAAAACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248862	1250827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1248900_1250800
691245	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691252	contig_11396_pilon	+	1066	7	Intergenic	novelGene_71427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	464	junction_3	401.664626550836	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	193	939	1782334	1789745	FALSE	40	AACCTTTTTTAAAAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782141	1789872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
691262	contig_17936_pilon	-	1575	2	Intergenic	novelGene_29982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	307	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTTGTAGTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162140	160231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161506_161839
691263	contig_12057_pilon	+	2409	21	Intergenic	novelGene_131628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	49.0423031677755	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	31	837	99524	145746	TRUE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRKPPRVRANHRDFQLRNLRIIEPNEVTHSGDPGSETDGRMAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVAVQSARIRCGAQSGIFLLRNHRTRDNHALH	99493	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_114853_114943_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142239_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155646_156319_156397_157627_157722_161524
691269	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_93508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691272	contig_6418_pilon	-	917	9	Intergenic	novelGene_81096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	444.852784637795	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	154	663	77025	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	106567	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77064_103065_103129_106515
691278	contig_4644_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_160189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACACAGTGTTACATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30173	30776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4644_pilon_+_30200_30800
691285	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
691292	contig_8259_pilon	+	1202	5	Intergenic	novelGene_148854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	100.115870370286	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGCTCCAAATTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53099	64569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53172_57922_58092_60690_60768_62754_62830_63760
691294	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691295	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691300	contig_10569_pilon	+	3948	1	Intergenic	novelGene_44085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTTTAAACCATTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357244	361192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_357200_361200
691307	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73573	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
691308	contig_990_pilon	-	2092	22	Intergenic	novelGene_76027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	151.158894339263	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	165	1928	862451	725789	FALSE	5	CGTCCTATCTTCTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWKYPKGIHVETLETEKKERYIVISKVDEEERKRREQQKHAKELEGLNDAVGFSRVIHAIANSGKLVIGHNMLLDVMHTVHQFYCPLPADLNEFKEMTTCVFPRLLDTKLMASTQPFKDIINNTSLAELEKRLKETPFNPPKVESAEGFPSYDTASEQLHEAGYDAYITGLCFVSMANYLGSFLSPPKIHVSARSKLIEPFFNKLFLMRVMDIPYLNLEGPDLQPKRDHVLHVTFPKEWKTSDLYQLFSAFGNIQISWIDDTSAFVSLSQPEQVQIAVNTSKYAESYRIQTYAEYVGKKNEEKQIKRKWTEDSWKEVERKRLNTQCISCALQNHCYRTNSFTATGTVVKRNLSPSLEEAGLEDSASGEVSDAELEKTDSCAETLSEGRKKAKKLKRMKKELSPAGQHWILLKFWSCIVFKCSRNSYLGEKL	865433	725624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_726066_746125_746316_803705_803781_808861_808949_811850_811907_829146_829217_829886_829998_833877_833954_834528_834572_835681_835726_840429_840508_844875_844933_848178_848260_849297_849341_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355
691311	contig_11427_pilon	-	3187	3	Intergenic	novelGene_79023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99	4	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	1693	3186	818300	816807	FALSE	35	ACTGGGAAGATGAGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINKIPEREKTGSPSPSNQLKDSPTFKKLDESLIFKSEFIGHDSHDSIKELDSLSKGKYDQLRTYHPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTETLLMSSDDSVTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDATCMQHSKSESPFRETEPPVSPHQDKLVTLPVMVIDYSKTVVREPVDKRVSCCKTKDSDVYYTSNDSNPSLCHSEAENIEPSVTKISSNSFMNVHLESKTVICDNRNLTDQNSKFGCEEYKQSVGSTSSTSVNHFDDLCQPVGSSSIASSLQSLPPEIKADSLTHLRCAENTSPVLDAVLMSKTSTEFLKHTGEETIVEVGSGLPDSRRGFSSWENRHNNGLSEKCLQETQEEGNSRLPDRRRRSEISLDEGGRRHVRTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYTVKCDSSGHASEIVSTIHEDYSGSSESSSDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHCSD	821493	816805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_818746_818788_820020_821477
691315	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691322	contig_9112_pilon	+	1128	3	Intergenic	novelGene_60226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_1	23	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	724	741	114286	114303	FALSE	20	TGTATGTTTTGTGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	111562	114690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_112128_113625_113750_114251
691323	contig_11720_pilon	-	1884	3	Intergenic	novelGene_43754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	31	522	16869	16290	FALSE	30	AACCTTTGTTGTGACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLASASDQTMADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAICPFSFSARPIVFPIPAS	18299	14927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16344_16431_16878_18277
691324	contig_9471_pilon	-	2801	11	Intergenic	novelGene_21717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	171.36499059026	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	243	1775	153444	126302	FALSE	25	TCTGTTAAAGCCACCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGLQNGRRKEQRMVVEQLGIQREPVKTSIQESGTFLPQHIPEERYRMQSKPLGICLIIDCIGNDKDLLQDTFTSLGFEVQYFRYLSVDGIIQILHQVACMPQHQNYDSFVCVLVSRGGSQSVFGVDQTRSGCPLDQIRRMFMGDLCPSLLGKPKLFFIQIYVVSEDQQEVSSLLEVDGAGMNIVESKVRQPGPCMVHREADFLWSLCRADVALLEQSPCSPSVYLQCLSQKLQQERKRPLLDLHIELHSKVYDWNSRVSAKEKYSVWLQHTLRKKLILSCK	166974	125275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_128295_128807_140993_141076_141797_141848_144789_144848_147757_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_161599_161730_166912
691327	contig_11518_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_109133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314979	313258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_313300_315000
691335	contig_1275_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_108873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGACTCCTTCTGGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748110	747475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_747500_748100
691342	contig_3018_pilon	+	1928	2	Intergenic	novelGene_78902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1478	1786	600066	624953	FALSE	20	CTCGCTCTGGGAAAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLMTFASGKFDYYGVLCIGIQNTGACQPQCSLQTSKCIHKSCDVHTADTRTPVICSTPRESLHTSAIRGPPIAVTADSGPGSTHPLPKQQRAASSPAIEE	598588	625095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_600196_624774
691345	contig_10689_pilon	+	902	3	Intergenic	novelGene_118638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_2	116	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	9	527	57608	61101	FALSE	20	CCAGCTCCTCCCACCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	57599	61476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_57792_58211_58374_60928
691348	contig_5832_pilon	+	3034	7	Intergenic	novelGene_134184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_1	6.07590871118606	80	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	15	1457	593358	621268	FALSE	15	TCATTCTGTCCAGAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMNARSITLGIDLGTTSVKAALLEAAPGEPSRFVVLASCARAARAEAVTQSAAAGPQGQEQDVSRTIQALHECLAALPRQQLREVRAIGVSGQMHGVVFWKTGQGCEWTEGEATPVFEPRVVSHLVTWQDGRCSSEFLASLPQPESHLSVATGFGCSTIFWLLKNSPEFLKSYDVAGTIQDYVVATLCGLPRPLMSDQNAASWGYFNTQSQSWNLETLKASGFPVHLLPDIAEPGSVAGRTSHAWFEIPKGTEVGVALGDLQASVYSCMAQRTDAVLNISTSVQLAASMPSGFQPVQTPDPLAPVAYFPYFDRTYLGVAASLNGGNVLATFVHMLIQWMADLGLEVEESTVYSHMIQAAAQQEDTCLTITPTVLGERHLPDQLASVTRISSSGLSLGHVTRALCRGIVQNLHSMLSFQQLKEWGVERVIGSGSALSRNEVLKQEVQRAFPFPWSFGQDVDAAVGAALVMLRRNLNQKEA	593343	622845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_593532_600469_600612_613230_613415_613938_614092_615282_615459_616993_617195_620855
691355	contig_9706_pilon	-	1309	3	Intergenic	novelGene_21056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCTCATTACTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737691	729600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_730166_730568_731149_737527
691358	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_96552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657490	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657492	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691361	contig_5033_pilon	-	1782	11	Intergenic	novelGene_29060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3992.05548683883	3	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	600	1118	534582	532125	TRUE	50	CACACAAAGCCAGGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	542861	531090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535075_536579_536625_540604_540662_542092_542237_542663
691365	contig_3866_pilon	-	2044	14	Intergenic	novelGene_112372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_13	79.1498466508437	75	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1893	150	2042	100395	73653	FALSE	60	AGAGAGAAAAGAAGTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGSEVSLEKKKKVQIPLRRLREVVSPNPGDNLALLKDDLPCVPPALSANKRLPVKTGTDLDGTLHGSSDLTSARNYHQPQLENLTMSESMKDFSKDVAAQVSPLYKTEESNRQKANDIFISQYTMGQKDALRAVLKQKAQSMPVFKEVKVQLLEDAGAEKDTVTQETRTSPSGIDSATTVAAATAAAIATAAPLIKVQSDLEAKVNSVTELLNKLQETDKQLQRVTEQQTNIQNKHEKLHCHDHEKQMNVFMEQHIKHLEKLQQQQMDIQTHFISAALKSSSFQPVSIPPSRAVDKYFVKPEHPNLGSRDVSSHNTFTFKQAPSREVEDMDFDKQKSSLETPAPRRFAPVPVSRDDKISKRENPVEEKENMEMSVHRGNVRLLEQILNTHDTLTRKNESSDKALLTVSNIGWNPERKDSIGTLPSQTFPSYEELGTTKVTIQKSDDVLPDFGQKKNETNGMLQSKESLIMSRLADQNSAKLQTTKTTRSVLKDAEKILRGVQNNKKVLEENLEAIIRAKDGDAMYSFINALSTSREMSEKIRIRRTVDEWIKTISAEIQDELARKDYEQKRFNPKNQRTKKAQNMSKDIKTNMQDKTVNNAIIPSKTSQKQIEEHFRNPPMRNMPASSLQ	101026	73650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_73866_75368_75442_75935_76151_76892_77026_81434_81559_85135_85304_87488_87643_90187_90410_91187_91363_94557_94628_95473_95550_99029_99101_100196_100490_100971
691366	contig_3866_pilon	-	565	3	Intergenic	novelGene_112371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	14	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	43	564	72644	67168	FALSE	30	GTCAGGGCTCATGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLKATTVKQDENYMLQIYGKPVYQGHRSTLKKGPYLRFNSPSPKSKPQRPKVIERVKGTKVKSIRTQTDFYTTKPAKVDSKIRHSLTTLPHVDQQQYLFSPSREMPTHSGTLEGHLIPMAILLGQTQSNSDTMPPAGVIISKPHPVTVTTSIPPSSRKPETGMKKPNIAVVEMKSEKKDPPHLTVQV	72686	67166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_67359_69623_69822_72511
691370	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_97918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691373	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691383	SIRV4	+	214	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1557	632	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
691384	SIRV2	-	581	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4253	73	3078	-38	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGAAGATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	1073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1700
691385	contig_14446_pilon	-	3307	1	Intergenic	novelGene_160715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGGAAGACATCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290479	287172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_-_287200_290500
691388	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691398	contig_12279_pilon	+	799	3	Intergenic	novelGene_50131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3924	junction_1	1165.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	95	301	75089	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	71673	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_71711_75031_75096_76928
691400	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	70	GGAAAAAGAATAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691407	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691414	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_94142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691415	contig_4782_pilon	+	1937	9	Intergenic	novelGene_73595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	383.389488640469	395	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	533	1081	78030	90707	FALSE	20	TCTTTGACAACTGTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRRRHTGSRANPDPNTCLGVFGLSLYTTERDLREVFSRYGPLSGVNVVYDQRTGRSRGFAFVYFERIDDSKEAMERANGMELDGRRIRVDYSITKRAHTPTPGIYMGRPTHSGGGGGGGGGGGGGGGGGRRRDSYYDRGYDRGYDRYEDYDYRYRRRSPSPYYSRYRSRSRSRSYSPRRY	64180	91563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_64367_75492_75572_76086_76221_77896_78063_83391_83581_88900_89017_89974_90107_90471_90540_90696
691419	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
691422	contig_13292_pilon	-	2524	21	Intergenic	novelGene_142925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGAAAAAGAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553782	66994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_67132_148530_148663_241656_241720_262856_262970_264451_264544_264636_264714_265802_265872_288559_288660_295511_295602_297096_297150_297247_297316_302676_302852_373571_373715_389668_389774_426695_426783_445077_445388_471395_471562_516722_516822_548770_548850_549662_549813_553566
691431	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691433	contig_5020_pilon	+	1045	6	Intergenic	novelGene_27866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1084.68380646159	205	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	358	735	122915	125772	FALSE	0	CCTTGGTGTCTCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118467	126082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123213_125013_125091_125657
691440	contig_1084_pilon	-	2544	7	Intergenic	novelGene_152388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	34	junction_6	82.1401241781384	199	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	141	971	565857	538640	FALSE	15	CTACCCAGTTTTCAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRRVPAPAAVAGWLLDVDYFRSSSFGRAGGSEGLNFLFWKLCIIIMRLVILDNYDLASEWAAKYICNRIIQFKPGQDRYFTLGLPTGSTPLGCYKKLIEYHKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGLPRNHPESYHSYMWNNFFKHIDIDPNNAHILDGNAADLQAECDAFEKKIKEAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSRTRLKTLAMDTILANAKYFDGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREVMILITGAHKAFALYKAIEEGVNHMWTVSAFQQHPRTIFVCDEDATLELRVKTVKYFKGLMHVHNKLVDPLYSMKEGN	569142	537066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_538702_546100_546276_551706_551892_559741_559925_560979_561082_565733_565896_569040
691441	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691443	contig_10904_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_22693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTACCATTACCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606951	606750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_606800_607000
691447	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691462	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_18542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
691466	contig_8045_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_35415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163254	161987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_162000_163300
691467	contig_15063_pilon	-	1080	4	Intergenic	novelGene_13060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	257	580	35891	35108	TRUE	25	AAGCCAGGATTGCATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36147	30204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_34924_35035_35380_35839
691481	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	60	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
691482	SIRV6	+	285	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	15	1289	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
691485	contig_1639_pilon	-	2657	9	Intergenic	novelGene_74917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	41.0957342676828	19	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1095	1514	339160	335791	TRUE	45	CAAAACCGAGTTGTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTTVNIGSISTADGSALVKLGNTTVICGIKAEFAAPPTDAPDKGYIVPNVDLPPLCSSRFRSGPPGEEAQVASQFIADVIENSQIIQKEDLCISQGKVRGVKKQWAFY	340254	331944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_332077_332460_332568_333095_333217_335007_335873_335959_336066_336879_336926_338135_338210_338868_338933_339112
691486	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_96646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691490	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91622	2	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
691494	contig_12092_pilon	+	3108	1	Intergenic	novelGene_163446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205671	208779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_+_205700_208800
691504	contig_16775_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_107807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACTAAGAAATGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235865	237220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_235900_237200
691508	contig_6445_pilon	-	279	4	Intergenic	novelGene_76902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	513.702897272992	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85320	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_42979_77838_77924_80504_80562_85287
691509	contig_15859_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_50214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGGGTTTCCTAGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377367	379368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_377400_379400
691510	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_97967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657161	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657163	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691511	scaffold_9100_pilon	-	1548	12	Intergenic	novelGene_83231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_6	26.5989498332435	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	23	1441	494220	468034	FALSE	25	CCATAATTATCTGGTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SADHRGGMDRNPSPPVLSWDEEKDEEVARGDCIGSTVYSKHWLFGVLSGLLQIINPENTKSSSDDEEQQIELDEEMENEICRVWDMSMDEDVALFLKEFNAPDIFMGVLAKSKCPRLREICVGILGNMACFQEICISISNDKNLGQVLLYCLYDSDPPTLLETSRLLLTCLSRTEVASVWVEMIRELPAIYDSICFIMSSSTNVDLLVKVGEVVDKLFDLDEKLMLEWIRNGAAQPLDQPQQDSEERPVFRIVPCILEAAKQLRSENLEGLDVYMHILQLLTTVDDGIQAIVQCPDAGKDTWSLLFDLGCHEFCQSDDPPIILQEQKTVLASVFSVLSAIYASQAAQEYLKIEKVDLPLIDSLTRVLQNVERCQKKPENSAESNTDETKKSDLMRDELHLKILKDISCEFLSNIFQALTKETMAQGLKEGHLSKQKCSCAFQNLLPLYSPAVEDFLKILHEVDKTLADDLEKSFPSLKV	494242	467926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_468121_468840_468934_470768_470966_481766_481956_482042_482126_484221_484403_484771_484888_485035_485096_486221_486302_487776_487861_492606_492721_494085
691512	contig_6557_pilon	+	2248	3	Intergenic	novelGene_33029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	108.5	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	159	482	637549	638160	FALSE	65	AATGTATTTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSGLVPSRFLTLLAHLVVVITLFWSRDSNIQACLPLTFTPEEYEKQDIQLVAALSVTLGLFAVELAGFFSGVSMFNSTQSLICILSTCAPFPPSPFPTRLPSAI	637390	639926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_637636_637821_637890_637991
691516	contig_50_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_122232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	178	486	129999	129691	NA	30	TGGGTCTAGAATTGTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILSQSSRLEFQIQGVSSKGRLSVSALEEGPCHQSSPALGASPHRNPRSKGQLCSWCCFLGGMRSPSLSAHLSLLYLKRDWLKTQSNLVDLINITAANPSH	130176	127874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_127900_130200
691521	contig_7342_pilon	+	2220	3	Intergenic	novelGene_71161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_2	8.5	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	286	786	429165	435082	FALSE	10	GTACACTCTGCCTCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLLQRYWDIPDGTECHRKTYASTSIGGATGLVASAYSLTLSPPGSFFEGVARAGRYTFTAAAIGAIFGVTSCVSAQVREKPDDPLNYFIGGCAGGLTLGARSEWTPLHRPTDPPPRSIQNLRATGDSGAGGYRMLPHRGAIATQAPVFLYLGYHPSAIVTAAA	428879	436516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_429262_434295_434389_434771
691523	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
691525	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_95391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657493	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657493	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691528	SIRV2	-	638	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	12	2967	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
691537	contig_10456_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_163466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44010	46538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_44000_46500
691547	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691548	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691549	contig_14441_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_100519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.064333633354	588	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	456	962	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111133	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113160_113209_116578_116963_117523
691551	contig_11285_pilon	+	1318	7	Intergenic	novelGene_5617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	520.390051361049	40	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	12	1001	766060	769878	FALSE	15	ACTGTCTCTTGACTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAAHRPQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766048	770195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_769407_769653_769740
691552	contig_15066_pilon	-	2236	4	Intergenic	novelGene_149553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	59.0160053620108	37	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	46	459	114591	114099	TRUE	5	TTCCCCAGCTCTGGCCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWRRLWPGTPKAASMEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFRPRCSERVRTGLGLRPCSHYRLRLQVRRADHVCGAGARGPAGGLRTPRSPCQSPHFQPRDTFRPQHSQPAHQL	114636	112086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_112149_112275_112847_112954_114463_114541
691567	contig_17440_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_7681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3712	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
691568	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91670	2	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
691577	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691578	SIRV2	-	657	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	0	2960	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
691579	contig_10861_pilon	+	1491	2	Intergenic	novelGene_39381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_1	0	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	63	422	1685906	1686383	FALSE	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRLRELVPGVPRGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIQTAELTPELVISNDKRSFCH	1685843	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686206_1686323
691582	contig_13982_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_163481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATACCGGTTTTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359283	360454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_359300_360500
691587	contig_11677_pilon	-	285	3	Intergenic	novelGene_85955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_2	18631.5	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAATAACACACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598065	595828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_595892_597212_597397_598027
691588	contig_6842_pilon	-	1115	3	Intergenic	novelGene_130712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	190	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	93	368	433953	429668	FALSE	30	CCAGGACTATCGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGCSESVLLGCRALRQLLHSRLPAPLGPAMPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYRPPPLCLAGL	434045	428920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_432547_432658_433818
691598	contig_8617_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_73467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATATCCCCTAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63026	62717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
691604	contig_8729_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_40084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160856	160437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_160400_160900
691605	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_97523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691606	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691610	contig_16103_pilon	-	2282	6	Intergenic	novelGene_118896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_3	72.815932322535	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1094	1474	761606	759680	FALSE	25	CTGTATGATTAATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	766604	758871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_762261_762483_762602_765904_766007_766385
691616	SIRV7	-	343	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	6	1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
691618	contig_9668_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_58126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCTAACTCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244880	242575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_242600_244900
691623	contig_11631_pilon	+	2062	4	Intergenic	novelGene_104186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_3	41.6839963961657	964	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	271	816	100987	105478	FALSE	40	AATCAAAACCTGTGTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRFLTSQQLFKLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGLRILFRMYTDEGRASAWEEVQHRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKISDNRFKAHASFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQC	100716	106724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_101108_102544_102684_103717_103836_105310
691624	contig_12032_pilon	-	1619	7	Intergenic	novelGene_139279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	75.5946794130087	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	418	1203	117404	101140	FALSE	10	TTATTCTTTACGTGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRRQCQGDASGRERGAGVAFAEVPAARTHGPASRGLRPPPDSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRGDFHNDMLTRKCSFLPRS	122403	100723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122278
691631	contig_7182_pilon	+	1215	5	Intergenic	novelGene_117146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	484	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	749	1213	888276	891408	FALSE	20	ATTACTCTCCAGCCAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRPGCSPLILGRYSEQNKKKAERRPLGCIGILELLFCFPFRRDIGFHFSFITGLVFHLSEHFLENSEKLTEASGCFFLCSSRQVCTKNAYDDILPLGFLGSPLPMFSNFSSARHRVAQCRPALPGPALSLWSSMYCNGCESGSQTQPPHSLRSV	886590	891410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_887232_888168_888344_888812_888912_889168_889333_891274
691632	contig_5686_pilon	-	2644	2	Intergenic	novelGene_45383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAAAGACCACCGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166462	161263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_163236_165790
691640	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_93442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
691643	contig_990_pilon	+	2496	10	Intergenic	novelGene_76106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	123.313612036872	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	199	1242	1394324	1426527	FALSE	15	CAATTAGTTGGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSGKKTFSSEEEEANYWKDLAMTYKQRAENTQEELREFQEGSREYEAELETQLQQMETRNRDLLSENNRLRLELESIKEKFEMQHSEGYRQISALEDDLAQTKAIKDQLQKYIRELEQANDDLERAKRATIMSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKENLLESVQRLKDEARDLRQELAVQQKQEKPRTPMASAVEAERTDTAVQATGSMPSTPIAHRGLGSTFNTPGTFRRGLDDSTGGTPLTPAARISALNIVGDLLRKVGALESKLASCRNFVYDQSPNRTSGPPSGWGSKNRDSIDKRTSSTSVPLGDKELGKRLEFGKSPSNISSPSLPSAQGVVKMLL	1384843	1427781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1384889_1389389_1389501_1394281_1394410_1398793_1398948_1403513_1403663_1420070_1420208_1421750_1421931_1423458_1423551_1425254_1425407_1426433
691645	contig_8580_pilon	+	1827	9	Intergenic	novelGene_156085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	55.0282597853139	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1349	1735	267640	273102	FALSE	5	CGATTTTTTGTGTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEACRVQQYPFTADQDIPETDWEVYLREAANAIVSQQSPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	252941	273194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262176_262275_266363_266940_267326_267666_267739_267839_271126_271197_272910
691646	contig_9216_pilon	-	2471	1	Intergenic	novelGene_163510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGTCACAGTCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593799	591328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_591300_593800
691647	contig_5684_pilon	+	1248	2	Intergenic	novelGene_81066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	475	825	443051	443401	TRUE	30	TATACAGCTTTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWLVLTFLGGNYKCVWRGRDRCIPEELSCCPSSSHRSMVILITWQCHHRGRKPKTKGKIPDLLQASKISWFLKPGQMRPPDGVCHLPRRVISLQAFSGNLPYAGLSDFLFPCLSS	442576	447535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_443445_447155
691656	contig_15613_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_147202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	745	1224	111749	111270	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSVGAIMWHVIARDYGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVIFNCSCRDVIGWTSGLMSIKVFYERGECILLSAVDNCAEDVREIVQRLGVSTCFVFSTTLISSTPGS	112493	110838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_110800_112500
691663	contig_4797_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_6948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTATTAATTTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661308	659692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_659700_661300
691664	contig_14322_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_116343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	108	243	350	671606	671869	FALSE	25	GCTCCTCGGCAAACTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVE	671363	671871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
691671	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691672	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
691674	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1568	632	1113	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2568	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
691680	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_89575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691681	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691684	contig_10197_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_115247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGGTAAGACTGCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992142	991492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_991500_992100
691685	contig_10197_pilon	-	2160	2	Intergenic	novelGene_115246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991378	987398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_989350_991169
691691	contig_21027_pilon	+	1357	4	Intergenic	novelGene_127565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_3	361.564194392457	855	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	120	656	1763	8128	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILKCPLSHLISLILLLFHSEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1643	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_5261_6365_6482_7912
691696	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
691699	contig_3130_pilon	+	3014	2	Intergenic	novelGene_103563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACAACTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72370	76196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_73982_74793
691700	contig_11370_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_98735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	13648	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	101	523	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145730	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
691706	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691709	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691711	contig_10106_pilon	+	2260	2	Intergenic	novelGene_73897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACACAATTCCATCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162503	165446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_164584_165266
691712	contig_7411_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_136963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATACTTGTTTTCATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80717	82277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_80700_82300
691713	contig_15236_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_141614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATCTATAGAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604273	603330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_603300_604300
691714	contig_762_pilon	-	1880	5	Intergenic	novelGene_135940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	50.9478900446329	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	96	536	266669	257494	TRUE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVRSWRK	266764	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_257668_259724_259837_263903_264056_266666
691717	contig_17427_pilon	-	1868	6	Intergenic	novelGene_30384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1102	junction_5	884.346447948992	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	30	554	188879	184278	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDV	204690	182963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
691721	contig_10774_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_158673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTATGACAATGGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16767	15078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_15100_16800
691725	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691726	contig_5526_pilon	+	2408	7	Intergenic	novelGene_111697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_6	41.3497951089912	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	155	598	294351	333703	FALSE	40	AACATCATTAGCTTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRIQKELSDLQRDPPAHCSAGPVGDDLFHWQATIMGPPDSAYQGGVFFLTVHFPTDYPFKPPKIAFTTKIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTVSKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPDIAQIYKSDKEKYNRHAREWTQKYAM	294196	335513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_294375_324079_324144_324236_324269_326867_326946_328602_328709_332652_332747_333657
691730	contig_5643_pilon	+	1386	4	Intergenic	novelGene_38977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1237	junction_3	210.448726930496	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	449	952	551324	552476	FALSE	20	CACAAAGCCTTGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVIRVDIRDTLCQDRCLTKPVLLQLIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	550875	552910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_551535_551805_551892_552142_552231_552357
691736	contig_10434_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_82013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAAGGGTCTGCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78530	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_78100_78500
691737	contig_7758_pilon	+	2780	3	Intergenic	novelGene_163525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	99.5	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	595	1104	113199	166353	FALSE	40	TGCCCAAATATATTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPPTPKPRPPRPLPVAPGSSKTEADSEQQALTLPDLAEQFAPPDIAPPLLVKLVEAIEKKGNQTDRGNQLSRYNLLSWVLDSWAFVK	99574	168029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_99787_112816_113533_166177
691738	contig_7758_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_163541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168191	168557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_168200_168600
691742	contig_10042_pilon	+	2102	8	Intergenic	novelGene_79091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	257.798054171659	2	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	10	1476	6321	50063	FALSE	60	CAATAAAAATAAGTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKK	6311	50689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529
691750	contig_4103_pilon	+	2012	3	Intergenic	novelGene_51930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAACTATGGCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83046	85612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_84735_84825_84894_85356
691755	contig_10629_pilon	-	2038	11	Intergenic	novelGene_52920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	479.463700398685	1	79	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	62	331	256132	253855	TRUE	10	GCATCCCTTTCCACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTETSRPDSNIYKKPPIYKQSLWEAALRARLQRT	256193	245937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_248147_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254174_254228_254627_254689_255094_255140_256066
691759	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691761	contig_2596_pilon	-	2507	14	Intergenic	novelGene_53478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	111.319732483674	2	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1489	2337	665591	662746	FALSE	25	TGTTGCAGTAATATTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKYEFEKDMSEKLAEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	722633	662575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675476_675613_677542_677612_681149_681287_683631_683728_684095_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
691763	contig_4388_pilon	-	1351	1	Intergenic	novelGene_161983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301991	1300640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1300600_1302000
691770	contig_6710_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_94308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATCAGCCCCTGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
691771	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691780	scaffold_15027_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_163577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAAGCAGACAGCCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110138	111000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_110100_111000
691788	contig_16846_pilon	-	1200	4	Intergenic	novelGene_82970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	555239	551492	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558703	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
691791	contig_2854_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_120847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	140.482815630964	5	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	38	1756	356428	293609	FALSE	45	CCAGCCTATAGGAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTHEGVLLPGSTMRTSVDSARNLQLVRSRLLKGTSLQSTILGVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEAY	356465	293348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_293617_300455_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773_348009_356279
691795	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691796	contig_18506_pilon	+	1484	9	Intergenic	novelGene_67947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	221.637337502055	1136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	289	1119	28506	55293	FALSE	10	GCTAATCCTTTCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKDPVGGPSEPPYLLCGEWGSAQPETEPPPLPSSETASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQEICVKDAEVVLCGGTESMSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCDPTIMGIGPVPAINGALKRTGLSLKDMDLVEVNETFAPQYLAVEKSLDLDPSKTNVNGGSIALGHPLGGSGSRITAHLVHELRRRGGKYAVGSACIGGGQGIALIVQNTS	11291	55658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_44530_44661_48546_48618_53815_53971_55208
691797	contig_11720_pilon	+	1416	9	Intergenic	novelGene_43923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	399.592917855159	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	269	1168	266571	272210	FALSE	45	CAAAAATATTTATTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262253	272458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262433_266481_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
691798	contig_12057_pilon	+	2392	7	Intergenic	novelGene_131641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	29.9318670761893	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1397	1978	152906	161653	FALSE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	150487	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
691800	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_17563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
691807	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
691810	contig_1867_pilon	-	2379	12	Intergenic	novelGene_54588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	190.895194299415	18	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	909	1820	547888	493294	FALSE	25	TATGCCCTACTTACATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQITEVDSSTYYLTRLL	553374	492734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_493342_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885_551129_553162
691811	contig_12270_pilon	-	263	2	Intergenic	novelGene_114129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCGGTTCAGTGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14433	13947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691812	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691814	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691815	contig_10074_pilon	+	1404	4	Intergenic	novelGene_57201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_1	29.0095769627128	45	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGAACTGCCCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597048	612366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_597227_598229_598334_609693_609820_611370
691816	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
691820	contig_8447_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_69434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83703	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_83700_84500
691825	contig_19737_pilon	-	2900	8	Intergenic	novelGene_158977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	56.0622831486262	179	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	120	1172	88454	59808	FALSE	0	GTTTGTGGTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGTGSARGTRRCRRSAGCCPPLPRGRRGSGALALASAMIRQELSTSYQELSEELDQVVENSEQADEQEEETVTIQGPGVLPALDSESASSSIRFSKACLKNVFSVLLIFIYLLLMAVAVFLVYQTITDFREKLKHPVMSVSYKEVNRYDAPGLALYPGQAQLLSCQHHYEVIPPLRSPGQPGAMNCTTHRINYTDPFSKQTVKSALIVRGPQEVKKRELVFLQFRLNQSSEDFSAIDYLLFSSYQEFLQSPDKVGFMQACESAYSSWKFSGGFRTWVKMSLVETKEEDGREAVEFRQETSVVNYIDQRPAAEKSAQLFFVVFEWKDPFIQKVQDIITANPWNTIALLCGAFLALFKAAEFAKLSVKWMIKIRRRYHKRRGQATNHIS	88573	58079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_59970_61593_61702_65229_65375_68002_68146_71730_71883_73242_73453_82791_82889_88418
691829	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
691836	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
691843	contig_12841_pilon	-	1836	14	Intergenic	novelGene_55893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	94.172886460906	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	155	679	931768	918491	TRUE	0	GTTTTGTTTTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVNQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIESGAEAKKLPGVGTKMAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEGATKKERVRNRRRKWNVWLMSCVYSCLLCHETRRTGLCLATITECFDQRFY	931922	892125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_914691_914765_914862_914918_916588_916641_918375_918646_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
691853	contig_15036_pilon	-	1533	12	Intergenic	novelGene_107144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACAGCCGCCGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242220	10185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_10453_45992_46137_52670_52792_59888_59973_62278_62439_63997_64089_64866_65028_66511_66617_71032_71124_83422_83537_200612_200708_242120
691856	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691860	contig_18869_pilon	-	165	1	Intergenic	novelGene_56009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73513	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
691864	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
691866	contig_5643_pilon	+	284	2	Intergenic	novelGene_38884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237662	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_237762_238008
691867	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
691878	contig_6199_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_126403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGCCACTGAGCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565858	566209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_565900_566200
691881	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
691885	contig_5918_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_99606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCATTCCGACTCGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2092670	2091984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2092000_2092700
691888	contig_5419_pilon	+	2072	9	Intergenic	novelGene_15556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	31.5473354659312	33	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1260	2006	607255	608001	FALSE	20	TTTATGACCTCTTGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLDLGPNTYYNLGPELELALSLLEEPHVGGEGEGGGSSLPKMGKMLALQSVPWPQGVLYFNLLHVAKDWNNNSKKNLGLFLEILVKGHRDTEVNFQPEDTCARLRHLLHASLLVVTLNPEQCHPSPRKRRSAIPVPKASCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPRGFMANYCHGECPFSLTTSLNSSNYAFMQALMSAAHPDVPHAVCIPTRLSPISMLYHDNDDNVILRHYEDMVVDECGCG	539450	608067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539733_540053_540147_540911_541001_541812_541927_550898_551051_551753_551870_586830_586980_588112_588276_607153
691892	SIRV6	+	333	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10492	1	1255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11492	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
691894	scaffold_12124_pilon	+	1351	11	Intergenic	novelGene_22258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	2	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	195	572	1490385	1508039	TRUE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508722_1509479
691897	contig_4686_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_118552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTGAAAAAAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544209	543875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_543900_544200
691898	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
691903	contig_4604_pilon	+	1967	6	Intergenic	novelGene_19191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	112.955566485233	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	19	645	526638	548080	FALSE	5	TTTCTTGTATTGCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTGLVAGEAVVDALPYFDQGYEAPGVREAAAALVEEETRRYRPTKNYLSYLTAPDYSAFETDIMRNEFERLAARQPIELLSMKRYELPAPSSGQKNDITAWQECVNNSMAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNEKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	526619	549402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_535549_535621_540751_540914_545868_545950_547953
691906	contig_5050_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_110259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACGCACTCGGCTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296110	296987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_296100_297000
691915	SIRV4	-	816	4	NNC	SIRV4A	novel	592	4	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	39	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14619	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_14037_14578
691924	contig_6710_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_89156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653689	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
691925	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
691926	contig_6102_pilon	-	1893	9	Intergenic	novelGene_32385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	244	junction_5	119.092335500653	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1076	1510	1731759	1728861	FALSE	0	TGTGTGGCCTCTGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGK	1733520	1728477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732541_1732738_1732900_1733184
691927	contig_4531_pilon	-	2192	9	Intergenic	novelGene_47900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	28.9136645896019	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	223	1584	369728	344511	FALSE	25	GGGACTAAAGTTTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLAGFKDPALYTSWLEPDNAFNVWKTQRAFNKYEKSAALVSNSQFLVKPLDVIVGKAWNMFASKAYIHQYTKFGIEEEDFLDSFTLLEQVITSYYNL	370812	343902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_344614_345825_346010_348653_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370626
691942	contig_7708_pilon	+	2253	3	Intergenic	novelGene_61532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	248	junction_1	9	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	119	721	250654	255022	FALSE	60	AAAAAAAAAAAGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAVSLNQRVMCRRFSYIIC	249580	256554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843
691948	SIRV6	+	1066	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	21	1	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	194	685	1733	10736	TRUE	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1151	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
691949	contig_7285_pilon	-	1286	5	Intergenic	novelGene_143414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	114.671269287472	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	147	530	366735	356156	FALSE	40	GTAAAGATTGGTAATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAATGHKVALVDQTEDILAESRKGIEESLRKVAKKKFAENPKVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	380010	355399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_379879
691951	contig_7286_pilon	-	943	7	Intergenic	novelGene_108682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	4296.90331970466	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	279	875	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293142	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291432_292022_292101_292991
691959	SIRV6	+	672	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3110_3165_10737_10819_11031
691961	contig_2867_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_135219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTATGGAATAGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153353	1150936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1150900_1153400
691962	contig_7410_pilon	+	1595	7	Intergenic	novelGene_106082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	262.772821188866	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	143	556	405351	407457	TRUE	30	TAACTAGAATTTTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405208	412174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407879_408138_408410_410366_410421_411881
691963	contig_12969_pilon	-	653	2	Intergenic	novelGene_61668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTCCAGGTGAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311912	300208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_300759_311809
691964	contig_6552_pilon	-	2672	2	Intergenic	novelGene_163607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	0	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	51	434	201623	157596	FALSE	85	AAAAAAAAAGAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIGIFNGRRRSDQKTEMNLNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDISKIKCVEIVKNDDCVIPCQNKYPFQVSWYIFATVRCWPFSHAYCLTLRFLTLLRQLTFGFICHFNGNCFSS	201673	155357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_157842_201485
691965	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_93618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
691968	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691969	contig_1450_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_27386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276190	277072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_276200_277100
691986	scaffold_6394_pilon	-	2074	13	Intergenic	novelGene_111063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	34.5936731530814	257	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	120	1301	518212	501668	FALSE	15	CTGATCTGAGCCCTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLLDVLGLALACGFVHATLSKSDAKKAASKTLLEKTQLADRPVQERGLVVMDVRAEDVVLEYRSYCSARVQERHFDGAVLGYVTPWNSHGYDVAKTFGSKFTQVSPVWLQLKRRGREMFEVTGLHDVDQGWMRAVRKNAKGLRIVPRLLFEDWTYDDFRSVLDSEDEIEELGKTMVQVAKDQHFDGFVVEVWSQLLSQKQAGLVHMLTHVAEALHQARLLAVLVIPPSVTPGTHQLGMFTHKEFEQLAPVLDGFSLMTYDYSTAQQPGPNAPLSWVRACVQVLDPKSKWRSKILLGLNFYGMDYSASKDAREPIVGSRYIQMLKEHRPQLVWDSQAAEHVLEYKKSRGGRHIVFYPTLKSVQVRLDLARELGVGASIWELGQGLDYFYDLL	525709	500894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_501767_502099_502143_502334_502416_510408_510565_510748_510851_511977_512071_513471_513534_513800_513908_514609_514655_515506_515640_517036_517187_518101_518255_525632
691991	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
691996	SIRV7	-	332	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33236	1	17	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114721	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
691997	contig_9195_pilon	-	2088	15	Intergenic	novelGene_155690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	82.056258699972	117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	232	1344	823352	713413	FALSE	10	CCAGCTCTGGCTCATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGDTVWAPSILPHDFLGVLSQHPQPHFGRRMESKVSEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGETVKKMREESGARINISEGNCPERIVTITGPTDAIFKAFAMIAYKFEEDIINSMSNSPATSKPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGSKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAVTISGTPDAIIQCVKQICVVMLESPPKGATIPYRPKPASTPVIFAGGQAYTIQGQYAIPHPDLTKLHQLAMQQTPFPPLGQTNPAFPGEKLPLHSSEEAQNLMGQSSGLDASPPASTHELTIPNDLIGCIIGRQGTKINEIRQMSGAQIKIANATEGSSERQITITGSPANISLAQYLINARLTSEVTGMGAL	899666	712668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_713450_714955_715126_720319_720373_724678_724739_725276_725353_749734_749777_753331_753407_757399_757529_758193_758326_764841_764959_765335_765369_768133_768158_770862_771018_823342_823479_899561
691999	contig_5153_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_74387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATCTAGAATAGGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990344	990948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_990300_990900
692001	contig_3095_pilon	+	1177	5	Intergenic	novelGene_74992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	68	619	147241	151002	TRUE	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPTSSSVSLTNSPHQCSMLHGLKMENLSPQECQRQSSCPGKTTFSASSTISPSCPQWTSSMTARWITGVSTSRSSSTGS	147173	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149882_150463_150696_150996_151163_151848
692003	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_96906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692004	contig_4105_pilon	-	1756	14	Intergenic	novelGene_21509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_1	666.567601120776	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1737	20	1756	137447	100875	FALSE	25	GCCTCCGTAAGTGTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENP	137466	100874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
692008	contig_3818_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_99272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4177	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	459	1067	569243	569851	NA	20	CAGCAGCCTCCCAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSACVSPCPLHISELGRLLLSGASWEVSALVGAQAPQAWAEVFSPPAPLCFQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLRACGITAVLNVSASCPNHFEGLFRYKSIPVEDNQMVEISVWFQEAIGFIGKRSASAPAPGGHREAWATSLYPVFFPLTPLPCLPCRLGEEQRRPGASALPGRHLTLCHHLPGVPDAEPPCAAGRGL	568784	570608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_568800_570600
692014	contig_12622_pilon	-	1666	11	Intergenic	novelGene_6003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	2215.8038270569	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	18	1196	1590968	1586655	TRUE	10	AGATGTTCCCCGGGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590985	1585416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1587939_1588912_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
692015	contig_18869_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_56052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73567	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
692020	contig_2940_pilon	-	2124	2	Intergenic	novelGene_81898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	0	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTATTTTAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454516	452252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453602_453741
692024	contig_5461_pilon	+	2589	14	Intergenic	novelGene_156843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	62.0600015064635	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	11	1714	839776	884314	FALSE	25	ATGTTTAGTTCAAGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYNGNKTPRSQVFKPLELLWHSLDEWLVLIATELMKNKKDSTDITSILLKQKGQDHQDATSIPPFEPPGPESNENLSTGTRESKPDALAGKQEANADCQDVISMTANRLSAVIQAFYMCCSCQMPPGMTSPRFIEFVCKHDEVLKCFVNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYVNPDHLNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWDVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA	839765	885189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_839821_847665_848004_848497_848567_848812_848901_855694_855807_855902_856001_856180_856269_859943_860094_860622_860820_873609_873742_878380_878480_878768_878840_883585_883700_884211
692027	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	72	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692028	contig_10765_pilon	+	2160	5	Intergenic	novelGene_122899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	48.4632592795821	254	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	49	765	99687	117362	FALSE	20	TTACAGGTTTGTCTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQGRERGAPAAGPLPPMEDSFLESFGRLSLQQRQQPRPPPPRGTPPRRHSFRKHLYLLRGLPGSGKTTLARQLQLDFPRAVIFSTDDFFSQEDGTYEFNPDFLEEAHKWNQKRARKAMRNGVSPVIIDNTNLQAWEMKPYALMALENNYEVLFREPATRWKFNVPELARRNIHGVPREKIHRMKEQYEHGVTFHSVLHAEKPSWATGSQDRNTAAPSEGAGDWRACAEFPSRRAPGGFASDSFFSRRGGCHRGY	99638	118757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_99851_112536_112665_112950_113040_115931_116009_117103
692030	contig_15405_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_112090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTACTTAACCTATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22895	22324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_22300_22900
692032	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	77	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692034	SIRV7	-	290	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	2	35775	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
692042	contig_15787_pilon	+	1766	8	Intergenic	novelGene_143963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	689	junction_3	435.823358713137	2378	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	59	1180	56204	111562	FALSE	25	TTAATAGTTGTACACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRKPSNASEKEKHQKPKRSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQEYISTLLLNGYETIEDLKDIKESHLIELKIENPEDRMRLLSAAENLLDEETIQEQENEPVSLSSSPNISLNKSQLDDCPRDSGCYTSSENSDNGKEDVESKNLPNMIQKMTITEPSD	56145	112148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_96021_98169_98321_111359
692044	contig_6589_pilon	+	1747	15	Intergenic	novelGene_25741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	55.4949896616895	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	453	1430	467108	507033	TRUE	25	TGATCTGGAGGAGTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	460753	509756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406_509537_509580
692047	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_93473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692048	contig_16722_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_118285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAGAATAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101737	99805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_99800_101700
692053	contig_12270_pilon	-	247	2	Intergenic	novelGene_114138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCATCTGGGGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
692055	contig_6132_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_163615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCAGCAGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67334	65026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_-_65000_67300
692058	contig_8878_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_147871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	425.819079996292	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	523	909	228839	228170	FALSE	40	CTACAGTCACATCACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231704	227932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228956_230185_230404_230484_230570_231074_231121_231647
692059	contig_20175_pilon	+	2791	16	Intergenic	novelGene_142460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	21.6008230295874	157	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	13	2310	77985	123392	FALSE	20	GTTAAGAGGTGAGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFVTEVLAHSGRLEKEDLGTRISRLTRQVEEIKGEVCSMISKKYSEFLPSMQSAQDLVTQVDKLSDDIDQLKSRIESEVRRDLHVSTAEFTELKQQLERDSVVLSLLKQLQEFSTAIEEYNCALAEKKYVTAAQRLEEAQKCLKLLKSRRCFDLKMLKSLSMELTIQKQNILYHLGEEWQKLIVWKFPPSKDTNSLESCLQTELHLCSEQSHKEEKTPVPPISSVFLAFSILGELHTKLKSFGKMLLKYILRPLASCPSLYAVIESQPNIVIFRFESVMTDLEHPSPSEVFAKIRLVLEVLQKHLLDLPLEADLENEKTSKIILAEMLGNIIWEDLSECLIKNCLVYSIPTNSSKLQQYEEIIQSTEEFENALKEMRFLKGDTTDLLKYARNINSHFANKKCQDVIVAARNLMTSEIHNTVKITSDSKISVPALPSPDKDDKLDIQKVAKAQYNEVGNLEPENTLDQHSFSLPTCRISESVKKLMELAYQTLLEATTSSDQCAVQLFYSVRNIFHLFHDVVPTYHNNNCMFLAHHLLTLGHQFASRLAPILCDGTTTFVDLVPGFRRLGTECFLAQMRAQKGELLERLSSARNFLNMDDEENYSAASKAIRQVLHQLKRLGIVWQDVLPVNIYCKAMGTLLNTAISEIIGRITALEDISTEDGDRLYSLCKTVMDEGPQVFAPLSEESKNKKYQEEVPVFVPKWMSFKELMMMLQASLQEIGDRWADGKGPLAAAFSSSEVKALIRSLFQNTERRAAALAKIK	77972	123873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_+_78090_79911_80047_83322_83425_83620_83699_83851_84012_85782_85936_86356_86549_104396_104561_107787_107971_113608_113848_116006_116079_118239_118368_119171_119303_119841_119974_120775_120979_123271
692060	contig_13123_pilon	-	2171	5	Intergenic	novelGene_136894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGGAGCGCGCGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446216	434383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443548_444544
692066	contig_6589_pilon	-	1660	4	Intergenic	novelGene_26295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.7401153701776	5	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	115	795	2274715	2273019	TRUE	50	AAAAAAAATTGTGAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTDRERREDHLPAPRGGEGEARPEAARPGARFHPVTAEGAGGPAEPAGGGSQGAEWHYLPAACRRGAREDLQAGREHRRAAQAHGTGPQGHHRAPKHSRGPRRLQRPAAADLQDPQCAHGLAAVGRPKLSPAAAAGGGSQQGVRGTPQGAGAQLPDHLRLMGICGPRGQGMCSYDLVFDHLLVCFPFFLSSDCAVEQTVLWFDFRLSR	2290212	2272080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272183_2272255_2273640_2274655_2274793_2290175
692073	contig_7513_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_89035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTACGCCTGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719702	720163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_719700_720200
692075	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_96472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692077	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692078	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692079	contig_3948_pilon	+	1626	4	Intergenic	novelGene_53387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	92.8954011539622	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	356	1057	1813956	1860572	TRUE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813341	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434_1861002_1861904
692083	contig_4519_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_123717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1604	1924	674239	673919	NA	50	AGAGGCTAGAAAAAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHHLVHSVSYSSAVIKIRHHLPLSVSQPAQWRAPALLDLGQALGFCLSLPECCTHLQPWGSHYPARRDPHTGLARFSHLSDPRCCWQQAPEDCCLLSSQGNSTEV	675842	673402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_673400_675800
692087	contig_12479_pilon	+	2319	16	Intergenic	novelGene_56823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_8	147.420426746846	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	268	1887	92999	219853	FALSE	35	AGGACTAAATGGCACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEASKAYESSESSDRFMTEKQQEEAEWESINVLLMTHGLKALSLVGRTDLKDLIIFDKQSSQRMRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQRPTQHELRLYKQQVKNLEKALKKNIKLQELISQKKAEDPEKKGEESSKDNQQQALIDHRYFQVLCSINSIIHNPRAPVVIYKQSKGGPQHFNKDFVQDCAFEHLVPIIAMWADQLTSLKDLYKSLKILSAELVPWHNLKKQDENESIKVEDLLFIVDTMLEEVENKNKDNNVPNFQTLQAVVSHFQKLFDVPSLNGVYPRMNEVYTRLGEMTNAVRNLQELLELDSSTSLYVLVSTVGKLCRLIIDGVNEQVKQLLGPEELQSIINKLEEHEEFFPAFQAFTNDLLEILEIDDVDAIVPAVKKLKVLSY	76371	220285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_76423_78775_78935_92941_93068_95744_95836_95957_96082_96398_96580_110726_110897_119057_119115_165734_165810_195306_195416_209149_209321_212821_212969_213175_213345_213530_213646_216920_217001_219791
692089	contig_11386_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_82811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	426	1713	2138	106034	105609	NA	20	CCAAGTCTGCATCAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLPRVRTLPATSLWISSPDLPFELQTVTSSCLSLTFLQLLTNVHVPKPKLRLALSSNTSFSVTLATRLLPVRLAINLCTSIPHSPHLPDQTETCQSPSSPSPPSILCCPCALGSPQAGWCQSQAPSLVLLPFLQVPAPWAM	107746	105608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_105600_107700
692098	contig_11396_pilon	+	1070	7	Intergenic	novelGene_71439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	414.323310417789	1293	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	66	695	1782334	1789118	TRUE	35	TAAAAGAGAGCGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLERRWVPGLWTGHT	1782268	1789881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789079_1789265_1789652
692102	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692103	contig_8954_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_130276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACGGTAACCAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118091	120215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_118100_120200
692108	contig_6633_pilon	+	2434	7	Intergenic	novelGene_143169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	39.5642936665541	552	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	172	1299	89350	105616	FALSE	20	CTCAAGTTTGGTTATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALTEANGTFAIRLLKILCEENPSHNVFFSPLSISSALAMVFLGAKRNTAAQMAQALSLDMEKDIHQGFQSLLTEVNKPGTQYLLRTANRLFGEETYDFLSTFKESCLRFYHAELEQLSFAKAAERSRKHINTWVSKKTEGKIRELLPGNSVDPQTRLIFVSAVYFKGRWNEEFNKTYTRKMPFKINQKEQKPVQMMFQEATFKISYVKEVQAQVLELPYAGEELSMVILLPDDNVDLSMVEKNLTFEKFVAWTKPDCMSSTEVEVLLPRFTLEEDYDMEYVLQNLGVVDAFQQGKADFSAMSAKTDLFLSKFVHKSFVEVNEEGTEATAASAAVVVECCLEAGPRFCADHPFLFFIRHNTANSILFCGRFSSP	86831	106751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_86994_89340_89518_99627_99766_100129_100248_101916_102060_103843_104000_105211
692111	contig_8317_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_20145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAATCAGTACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
692116	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692117	contig_8617_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_73466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATCCCCTAATCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63014	62716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
692124	contig_13481_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_119277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131502	129051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_129100_131500
692127	contig_14405_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_85664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGGTATAATACCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732324	730434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_730400_732300
692130	contig_11171_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_48596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1142	junction_1	80.9775277469003	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	91	834	212165	251467	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212074	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
692137	contig_11117_pilon	-	733	2	Intergenic	novelGene_148573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATTTAGGACCACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20719	19046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_19169_20108
692138	contig_602_pilon	-	1799	5	Intergenic	novelGene_134980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	44.7381269165351	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	173	883	648836	643224	FALSE	25	CTTTTATACTGAAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTEDKISLLLHLLEEELDHQTDERKTTTKLGSDVQVHVTACVLSVCGWACSSSLEPMQLALITCSQCMRKVGLWSFQQIESSMPDLEVSFSLSSSPIPGPEGRPERFPLVPESPRRMMTRSQDATFSPGSEQAEKSPGPIISRTRSWDSSSPVDRSEPEAASPTTRSRPVTRSMGTGDTPGLEVPSSPLRRAKRARLCSSSSSDTSSRSFFDPTSQHRDWCPWVNITLGKETRENGGTNGSTPGEPGWKGVLNTLLAHTQASQPAEADCMSLSEKSRKVFRIFRQWESLCSS	649754	642307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_643293_646236_646438_646877_647091_648608_648853_649598
692142	contig_10437_pilon	+	1087	2	Intergenic	novelGene_38173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCAAAAGCGTTGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162875	164082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_163086_163205
692144	contig_14980_pilon	+	2949	3	Intergenic	novelGene_78228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_2	137.5	6	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	205	456	427074	428232	FALSE	40	TGCACAATAAATATGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQVSYVRPAEPAFLARFKERVGYREGPTLETKRIQPQLPDEDGDHSDKEDEQPQVVVLKEGDLSVEEVMKIKAEIKAAKADEEPAPTDGRIMYRKPVKRPSDEKYSGLTASSKKKKTNEDEVHKQESFKKNSQKQIKNSSLLSFGNEDENE	421866	430725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_421963_426965_427111_428017
692145	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
692148	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_89249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692149	contig_12150_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_6956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAATTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24983	24600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_24600_25000
692154	contig_4891_pilon	+	1120	6	Intergenic	novelGene_124554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	553.93082600628	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	136	765	701017	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700881	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_754711_754766_755867_756027_756579
692158	SIRV5	-	356	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGCAATCTCTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
692160	contig_12250_pilon	-	1139	10	Intergenic	novelGene_80699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_6	160.66213302348	4346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	80	766	401239	398949	FALSE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQEKVFELMTTLQTKLEGFHTQISKYFSERGDAVTKAAKQPHVGDYRQLVHELDEAEYRDIRLMIMEIRNAYVRRRG	401318	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
692164	contig_10451_pilon	-	3567	1	Intergenic	novelGene_138324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320557	316990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_317000_320600
692166	contig_10023_pilon	+	1618	4	Intergenic	novelGene_123519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGCGCTTGAGCCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456012	458242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_456131_456305_457435_457681_457889_458078
692172	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
692179	contig_10861_pilon	-	1617	10	Intergenic	novelGene_39335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	235.542400051927	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	101	796	1492200	1490156	FALSE	10	CTCAGTTTGGGCTTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493799	1489334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
692187	contig_11115_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_102815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	620.168167157551	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	267	1655	165608	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165341	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166501_171259_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
692188	contig_10861_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_39200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	84	422	367017	367355	NA	25	ATGGAATTTTGACTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPQDTAPSSAPSHLTPHSCPPATSPGMALLSPACPGLSWGPGLLGQGPAAFCPRSGPLVHRPLYPSTVLRLCASWAQACPCSYTNRVTGKPPPLRGVPLIVQMGQGPIQRTQEIAGRGGMRTHPSQFLQAWFPVIPSS	366933	369241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_366900_369200
692189	contig_10734_pilon	-	4296	2	Intergenic	novelGene_51410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_1	0	49	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGACGTGTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2077206	2072641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2075766_2076034
692194	contig_4812_pilon	-	1125	6	Intergenic	novelGene_103637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6286.47363789907	52	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	99	488	82626	80325	TRUE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANW	82724	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80330_81193_81286_81547_81739_82268_82343_82598
692199	contig_6470_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_145596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACAGAGTTGCTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947530	945217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_945200_947500
692204	contig_16220_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_163630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTGTCCGTGGAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153148	152500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_152500_153100
692212	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692219	contig_7165_pilon	+	2238	6	Intergenic	novelGene_116903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	34.140884581393	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	127	2103	1198317	1220946	TRUE	30	GTTAGCCCAGCTCAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRLLLRVWPRGLAVGPGAPCRPLSARSGPSQYLQSSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLDDGHFRKTEQFCKSFENGSGKELHEQLVAQDKKNKHTSYISGPWFDMYLAARDSIVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTFRAGLLEPEVFHLNPAKSDTDTFKRLIRLVPPSLSWYGAYLVSAYPLDMSQYFRLFNSTRIPKPGRDELFTDDKARHLLVLRKGHFYVFDILDKDGNIVSASEIKAHLKYILSDNSPAPEFPLTYLTSENRDIWAELRQKLVSDSNAETLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGTAAVHFEHAWGDGVAVLRLFNEVFQDSTQNPAVTPQSRPATTDSSVAVQKLSFKLSDALKTGITTAKRKFDETMETLTIDCIQFQRGGKEFLKKQKLSPDSVAQLAFQMAFLRQYGKTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASIFTMRCSEAFVREPSKHSAGELQQLMAECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRYLAAAKGIPLPELYLDPAYGKINHNILSTSTLSSPAVNLGGFAPVVPDGFGIGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAHEFLHCVEKALDDMFDALEGKSIKT	1198190	1222503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1210507_1210589_1211668_1211776_1216675_1217981_1220614_1220954_1222375
692221	contig_10609_pilon	+	2242	12	Intergenic	novelGene_123921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	517	junction_5	547.703017192093	57	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	186	1352	386471	420459	FALSE	75	AAAAAAAAAAAGCAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGIHSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVDCIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHYAAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRK	361235	421349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_400432_400512_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314
692224	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692230	contig_6233_pilon	-	1372	9	Intergenic	novelGene_74786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_1	260.153680542867	225	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	302	1141	149777	143464	TRUE	30	GCCACAAAGCTTTGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250344	136683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
692232	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_94972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692234	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692235	contig_14441_pilon	+	771	4	Intergenic	novelGene_100432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	14	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	157	585	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLHNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81888	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_116578_116963_117220_117344_117539
692239	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_96871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692241	contig_1301_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_47414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833725	835162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_833700_835200
692245	contig_17470_pilon	-	1898	10	Intergenic	novelGene_110528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	56.1129812669641	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	443	1327	274118	270259	TRUE	25	ACTATTCAAACTCTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKCPTSEAL	274560	269598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270283_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028
692251	contig_10982_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_87897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	272	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	105	839	286264	301739	FALSE	25	TAAGCAGATTCTGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVFILQLAVCILAFPMYLLNFLGIWSWICRTLFPHFLAWVSVIYNEKMASKKRELFSNLQEFAGPSGKLSLLEVGCGTGTNFKFYPPGCRVTCVDPNPNFEKFLIKSIAENRHLEFERFLVAAGENMHNVADGSVDVVVCTLVLCSVKSQEQTLQEVYRVLRPGGVFCFLEHVAAKPLTWNYFWQQILDPVWFLLFDGCSLTRDTWKTLERASFSKLKLQHLQAPLSWELVRPHIFGYAVK	286159	302525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_286762_301502
692252	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
692255	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692259	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692264	contig_15135_pilon	+	1908	6	Intergenic	novelGene_119854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTCGAAGAAAATCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24733	37352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_25374_28489_28628_28802_28899_31513_31711_34145_34359_36728
692265	contig_8674_pilon	+	2330	6	Intergenic	novelGene_102888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	9.28224110869784	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	853	1188	107480	107815	TRUE	35	ACAGATTTTAGGAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITLNCELNQLNPFPILTRNILDLEQDNWDLVVLGDMFYDEDLADSLHGWLKKCFWTHTTQILIGDPGRPQFSGHSIQNHLHKVVEYSLPEPTRQENNGLTTSTVWDFQP	101942	109634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_102005_102285_102509_103985_104428_106717_106835_107471_108030_108706
692266	contig_10549_pilon	+	2213	3	Intergenic	novelGene_110641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	9	317	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	37	822	516065	517058	TRUE	50	AAAGTTATGATTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIASVPKEESEDMDFLSGLELADLLDPRQPDWHLEPGLSSPGPLSSSGGGSDSGGLWRGDDDDEAAAAEMQRFSDLLQRLINGIGGCSSDSSCGEKRRRKSPGAGGGCSGGSSGNDSHQAATKSPRKAAAAAARLNRLKKKEYVMGLESRVRGLAAENQELRAENRELSKRVQALQEESRYLRAVLANETGLARLLSRLSGVGLRLTTSLFRDSPAGDHDYALPVGKQQQDLLEEDDSAGGVCLHVDKDKVSVEFCSACARKASSSLKIFFFR	516028	519538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_516835_517042_517121_518209
692270	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_93446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692271	contig_3818_pilon	+	2975	22	Intergenic	novelGene_99212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	37.6609170255029	44	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	878	2637	87	2723	200428	242026	TRUE	15	GGAAGTCTGTGCTACCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRGAERDFQTSARRMGTSLLFQLSVHERELDLVFLDHSYAKPWSAHPDASSARPTRMLFVTPRRQHESTIESDVPIDVETVTSTPVPLYDNQKARSVMNECERHVIFARTDADAPPPPEDWEEHVNRTGWTLAQNKLFNKILKALQSDRLARLANEGACNEPVLRRVAVDKCARRVRQALASVSWDTKLIQWLHTTLVETLSLPMLAAYLDALQTLKGKIPTLIDRMLVSSHTKTGAAGAEALSLLLKRPWDPAVGVLSHNKPSKLPGSPLILIASSGPSSSVFPTSRRHRFWQSQLSCLGKVIPVATHLLNNGSGVGVLQCLEHMIGAVRSKVLEIHSHFPHKPIILIGWNTGALVACHVSVMEYITAVVCLGFPLLTVDGPRGDVDDPLLDMKTPVLFVIGQNSLQCHPEAMEDFREKIRAENSLVVVGGADDNLRISKAKKKSEGLTQSMVDRCIQDEIVDFLTGVLTRAEGHVGSEPRDQDAEKKKKPRDAARRDLAFEAPERGSRPASPAAKLPASPSGSEDLSSVSSSPTSSPKTKVTPVTSAQKSSQVGSSQLLKRHMQRTEAVLTHRQAQVPISSEQTEEAEKDDLRVQLKRHHPSSPLPGSKASKRPKIKVSLLSHGDTGGGPCAPSQGGAAEVSGGKPITMTLGQASGAKELTGLLTTAKSSASSEGGLSGSPASSAVSSSPAPSALHTLQSRLVATSPGTSLPGATSASSLLQGLSFSLQDISSKTSGLPANPSPGPAPQAASMKLPTPMQSLGAITTGAGTIVRTIPVAPTLSSLGATPGGKPTAIHQLLTNGGLAKLASSLPGLAQISNQASGLKVPTTITLTLRGQPSRITTLSPVGSGAARSEEPASQPLPSGSQRLPPAP	198891	242396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_198927_200376_200643_203418_203590_214704_214796_214928_215115_222300_222433_223287_223405_223645_223748_223857_223930_225285_225361_225538_225697_228734_228799_229276_229478_229684_229842_233549_233742_234193_234276_235040_235175_235985_236096_236609_236833_237148_237283_242005_242056_242173
692274	contig_8617_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_73446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCACAAACATAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62539	62045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
692276	contig_19744_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_120421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTAGTTTTGCCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319557	317569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_317600_319600
692280	contig_5959_pilon	-	2171	2	Intergenic	novelGene_150176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATGACTTTGACATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109812	98843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_100881_109678
692281	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692282	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	632	1085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
692283	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692285	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692288	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_95005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692291	contig_6710_pilon	-	642	3	Intergenic	novelGene_96722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4151.5	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	2	448	657511	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKPSKGGFVEGASVRAITVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142_657230_657471
692299	contig_10775_pilon	-	792	3	Intergenic	novelGene_157936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_2	6.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	95	790	26002	7120	FALSE	40	GTAAGCCAACTACCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQGAESGGARAGAGAVGLKTLALDDSWCHSEMSSLSGKVQTVLGLVEPSKLGRTLTHEHLAMNFDCCYCPPPPCHEATSKETIMMKNLFWIQQNPYSHKENLQLNQETEAIKEELLYFKANGGGALVENTTSGISRDMQTLKWLAEETSVHIISGAGFYVDATHSSETRAMSIEQLTDVLINEILYGADGTNIKCGVIGEIGCSWPLTASERKVLQATAQAQAQLGCPVIIHPGRNRSAPFQIIQVLQEAGADISKTVMSHLD	79505	7117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_7384_25570_26042_79450
692300	contig_15039_pilon	+	983	3	Intergenic	novelGene_110168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	139	4482	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	266	793	329947	343905	FALSE	25	TATATAATCTGTGTCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGILIKKLLREQIVADMYTYKEISFFVAEFIVKNTAEWIRQNGGWENGFVKKFEPRSGWLTFLEVTGKICETLFLLKQYY	329334	344095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_329425_329771_330367_343797
692301	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692305	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_94311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692310	contig_16400_pilon	+	898	3	Intergenic	novelGene_150897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	17	2339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	172	366	16949	36995	FALSE	25	CTACGATAGCAGTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQYNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVMYLKEILREIGIQNVKGTHKNTWELKPEYRHYQGEEKSD	3464	37527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879_17024_36875
692315	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692329	SIRV4	+	242	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	289	419	289	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGACTTTCCACTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1744	2352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
692353	contig_12270_pilon	-	445	2	Intergenic	novelGene_113744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	112	444	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14520	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
692361	contig_8801_pilon	-	2194	7	Intergenic	novelGene_66246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	37.8755271323787	116	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	204	1871	199038	181046	FALSE	5	CTCCTCAGCTTCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEVYNLTQEFFRHGKPVNAESQNSVGVFTREEVRNRIRDDPDDPEATKRLKLAMIQQYLKVESCESSSHSIDEVSLSAFGEWTEIPGAHHIIPSGFMRVVELLAEGIPAHVIQLGKPVRCVHWDQASARPRGPEIEPRREGDHNHDPGEGDQGGEEPREDRRGEDEQWPVLVECEDCEVVPADHVIVTVSLGVLKREYTSFFRPGLPAEKVAAIHRLGIGTTDKIFLEFEEPFWGPECNSLQFVWEDEAESRTLTYPPELWYRKICGFDVLYPPERYGHVLSGWICGEEALVMEKCDDEAVAEICTEMLRQFTGNPSIPKPRRILRSAWGSNPHFRGSYSYTQVGSSGADVEKLAKPLPYTESSKAAPMQVLFSGEATHRKYYSTTHGALLSGQREAARLIEMYRDLFQQGT	218809	180722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_183962_184124_187078_187839_188002_188177_194487_194715_198830_199065_218632
692368	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_96474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692374	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671652	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
692377	contig_19185_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_163663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGCGTAGTGGTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162522	164133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_162500_164100
692381	contig_13547_pilon	+	2513	18	Intergenic	novelGene_104861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	362	688	63570	75879	TRUE	50	GCGGAACAGAAAAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVGCRRSGLLDESVPGIGIIARLCLQCLVPTMLSSCDWLRPPSLNSFGGKILNRVLSKIFLILFLPPETVFALTFLFPFSCDVCSISPGTSWIEWRLLFFSAILGI	52912	223740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_53008_54262_54506_63546_63705_75687_75931_84853_84962_88970_89177_91158_91268_93754_93917_98146_98303_98905_99063_101109_101249_103068_103245_114701_114835_163206_163349_176601_176674_196798_196883_221449_221507_223667
692386	contig_15063_pilon	+	752	3	Intergenic	novelGene_14382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	122	610	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPPSSSARPQASVPRRSHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35108	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35164_35997_36158_36266
692387	contig_8674_pilon	-	1495	12	Intergenic	novelGene_102947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_11	48.5859551858592	141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	207	1121	723870	707008	FALSE	20	TCCTGCTCTTCTGTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727698	706633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_727624
692388	scaffold_12124_pilon	-	2736	5	Intergenic	novelGene_22426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	24.4028686838249	20	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	461	2317	1659679	1645819	FALSE	30	CTTTCCTATTGTAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVVEDVAVVFSQEEWALLDLPQRKLYRDVMMETFRNLDSIVSGTLNDGERLSTEPTMMQLMKNNTWSSMLVEISESHGNKDQYKNQGRYLRSHTKENLCESEGSQCGKAFSWIPNLTGLKRNPLECRECGKAFMDHSACNHHTRSFTGCNACQYKECGEACSSLSHLTTTMRTLNGKKPHKCQVRGKGFICVSVLKNPVTTLTNEKRCECQKCVKDFCSFSSFWTHMRGQKHECKECCKTYGLSSLILNKKFYNRDKLYECRECMKAFSHKSSLMKHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTAHIRTHSGEKPYECKECGKAFSRSSHLTSHIRTHSEERPYECKQCGKAFSHNSSLTKHVITHSGEKPYECKECGRTFSRSSSLIAHVRTHSGERPYECKECGKTFGRSSALNTHKRTHSGEKPYECKECGKAFRHASVLTIHIRTHGGEKPYECKECGKAFSHSSALTVHKRTHSGEKPYECQKCGKAFSQSSKLTRHIRTHRGEVPFECKICGKVFRRTSPFTIHIRAHSGVRPYKCKECGKAFSYSSSLTMHKRTHSKEKPYEYKECGIAYSYSSALTMHTRTHSGEKLHEWNVRNAGKPLVVPHTSLHM	1664074	1645399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1647395_1648064_1648216_1649769_1649897_1659676_1659908_1663842
692390	contig_14322_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_115988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671624	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
692391	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_114056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	27	338	14409	13875	FALSE	25	AGTTTATTACTGTCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14435	13872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
692396	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692397	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692401	contig_11986_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_69183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACTACAAAAACACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582257	582487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_582300_582500
692402	contig_11986_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_69184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	200	553	582705	583058	NA	15	CCATCCCCTCCACTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLLGAAVQKKFESYSLGDTKHLMIPETQQPVTCLDHSAHLHCLGGGSVGGTGTLSSVCCGPLGSLRTLVTLPVPCVSRQTDPGTRACPVHLCTFPTEDRAGPRVAAGSNHYGLVSR	582505	583059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_582500_583100
692411	contig_16122_pilon	+	1604	3	Intergenic	novelGene_134544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_2	0.5	181	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	475	480	235781	235786	FALSE	5	GTTTTTTTTTTCACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAQVLEAADFAARKHRWQRRKDPEETPYINHPIGVARILTREAGITDIVVLQAALLHDTVEDTNTTLDEVELHFGAQVRHLVEEVTDDKTLPKLERKRLQVEQAPNSSLGAKLVKLADKLYNLRDLNRSTPKGTLPHLLSGKGEGCPPSGGTAYSDPM	234903	236910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_235007_235301_235358_235465
692415	contig_6740_pilon	+	999	4	Intergenic	novelGene_142647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	54.7783412186483	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	221	460	19602	46422	FALSE	40	AATAGTCTGATTTAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHKDEFTIIPVLVGALSESKEQEFGKLFSKYLADPSNLFVVSSDFCHWGQRFRYSYYDESQGEIYRSIEHLDKMGMSIIEQLDPVSFSNYLKKYHNTICGRHPIGVLLNAITELQKNGMNMSFSFLNYAQSSQCRSWQDSSVSYAAGALTVH	11300	46961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_11447_19527_19605_44182_44288_46290
692417	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
692420	contig_11978_pilon	-	291	2	Intergenic	novelGene_63012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592261	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189
692423	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692438	contig_14840_pilon	-	2116	11	Intergenic	novelGene_66230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	103.140923013128	435	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	716	1657	19511	11241	FALSE	10	GTTTGCATGCTGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSTNLDIGAQLIVEECPSSYSLSGMTDIKTEHPLDSNSEEGSAQGVAMGMKFILPNRFDMNVCSRFVKSLNEEDSKNIQDQVNSDLEVASVLFKAECNIHTSPSPGIQVRHVYTPSTTKHFSPIKQSTTLTNKHRGNEVSTTPLLANSLSVHQLAAQGEMLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNGADPQLLGKGRESALSLACSKGYTDIVKMLLDCGVDINEYDWNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	22457	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13215_13342_13764_13863_15810_15877_18220_18380_19222_19609_19916_19980_20648_20682_21935
692441	contig_7179_pilon	+	2201	5	Intergenic	novelGene_78159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_3	19.004933569997	307	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	68	1918	1041569	1048974	FALSE	20	CCGAGTGGCAATATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATATAAALGEVEDEGLLASLFRDRFPEAQWRERPDVGRYLRELSGSGLDRLRREPERLAEDRAQLLQQTRDLAFANYKTFIRGAECTERIHRLFGDVEASLGRLLDRLPSFQQSCRNFVKEAEEISSNRRMNTLTLNRHTEILEILEIPQLMDTCVRNSYYEEALELAAYVRRLERKYSSIPVIQGIVNEVRQSMQLMLSQLIQQLRTNIQLPACLRVIGHLRRMDVFTEAELRVKFLQARDAWLRSILTAIPNDDPYFHITKTIEACRVHLFDIITQYRAIFSDEEPLLPPAMGEHTVNESAIFHGWVLQKVSQFLQVLETDLHRGVGGRLDSLLGQCMYFGLSFSRVGADFRGQLAPVFQRVAINTFQRAIQEAVEKFQDEMNSYTLILIPAILGSSNIPAAMPVTQPGTLQPPMVLLDFPPLACFLNNILVAFNDLRLCCPLALAQDVTRALEEALAKATKVILAFHRAEEAAFTSGEQELFVQFCTVFLEDLIPYLNRCLQVLFPPAQIAQTLGIPPTQLAKYGNLGHVNISVIQKPLAFILPKRERVFCLDEKEVVPELTAAAPEIPVEEPSPESPECGPVSLESGLEEAESELQQGEPLPEELLQGEAL	1041501	1049257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1041919_1043119_1043328_1044698_1045527_1047702_1047872_1048678
692443	contig_11370_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_98758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	39.7198522991547	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	490	1338	154251	155741	FALSE	30	TGATACCACCCCCAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	153761	156104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
692447	contig_5020_pilon	+	1326	7	Intergenic	novelGene_27854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1118.16516370943	4	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	452	940	123186	125701	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKGSCPPFFAWVPGMW	118463	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122918_123098_123364_124167_124363_124444_124517_125657
692450	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692451	contig_10042_pilon	+	2226	14	Intergenic	novelGene_79198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	93.0346375657059	4	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	541	1023	1069335	1085540	TRUE	30	GGTGTCTTTAAAATGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKGSYELK	1028990	1091118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067530_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1085519_1085695_1090069
692455	contig_14322_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_116344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671885	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
692456	contig_12638_pilon	+	1425	9	Intergenic	novelGene_33393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	116.579372103301	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	66	1274	1515842	1540020	FALSE	25	GTTTACAAGGGCTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQREARPPSPWIFTPCRSAASMSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQKGLSAAWIVRATGNFLGLEVKRELISSSVISLVNSLFFLIQSFNRRIYHILFVFIPSALFFVFLFIFSFSPHYYFSLN	1515776	1540171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1539783
692458	contig_15991_pilon	-	1030	5	Intergenic	novelGene_70869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	723.247321114983	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	593	961	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	103908	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583
692460	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_96520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692465	contig_7202_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_16680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692466	contig_14202_pilon	-	2671	4	Intergenic	novelGene_157148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	43.4843522303011	137	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	347	1303	154582	152684	FALSE	20	GCCTTCTGAGAGGTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLTEEQRKKIEENRQKALARRAEKLAQQHQSTGSGSSITVNPSQSKQGSSQNPPRDSSKPVTRDVIFKQWNPTNSSNGDKRSHNSHKFRLSTPEPAEGIWKSQEEKPIACPSHRPPSQTTVTGVSPPLAQSSPEVPNQQHLGYKLGRGHAQASHKTKLTPFANTTHELLAVTVSSQETPASSPGQPPGDPELLAERVRPSTSGQTISDLHYGSGYVTPRTEGKRQQNLELSLHKEVSSQKGMCIQNGDRFQVKIGYNAELLAVFKSLPSRSYDPATKTWNFNMTDYSDLSKCARCRPSWREILVLQSFSRVADML	156301	151315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_152815_153756_154641_155111_155249_156150
692467	contig_709_pilon	+	2630	11	Intergenic	novelGene_57632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	27.258026340878	325	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	682	1587	2691473	2701317	FALSE	45	TAAAATAAAGCTTCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2683136	2702360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2683212_2686056_2686218_2688679_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
692468	contig_10953_pilon	+	374	4	Intergenic	novelGene_42560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2965.18880792888	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	192	181	372	423231	425271	FALSE	25	GAAGATTGGGCGGATTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGVWRGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSG	420003	425273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420022_422522_422657_423202_423365_425213
692471	contig_15866_pilon	+	1509	10	Intergenic	novelGene_63636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	701.920029914421	3	38	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	185	838	601021	633133	FALSE	15	TAAGTGTGGCTTGGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	459030	633804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581409_581475_600991_601094_608107_608230_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
692474	contig_1867_pilon	-	2969	1	Intergenic	novelGene_54621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATAGAAAAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562713	559744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_559700_562700
692482	contig_6436_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_134915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAATTAAATGCATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720346	719763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_719800_720300
692483	contig_6436_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_134913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTCCAAAAATAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718002	717561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_717600_718000
692485	contig_5649_pilon	-	2178	10	Intergenic	novelGene_82261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGTAGGTAAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35730	12697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_12868_21102_21264_23148_23281_25345_25400_25890_26059_26789_26893_28297_28443_28921_29031_33714_33779_34658
692488	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692491	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692492	contig_5549_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_81570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1335.25334674735	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	74	709	82155	96749	FALSE	25	GGCACTAAAATTTTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82081	96911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91796_93264_93412_96620
692493	contig_18145_pilon	+	2167	6	Intergenic	novelGene_37313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.630588376307	289	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	33	1907	66694	73109	FALSE	35	ACATAAATATGTGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKVSVLLFLAWVCFLFYAGISLFTSGFLLTRLELTNHSSCQEPPGPEPLPLGHRGEPGACWMASRFSRVVLVLIDALRFDFAQPQSSHMPGEPSASLPFLGKLSSLQRILEIQPHRGRLYRSQGQLLPPKLLAIPRLGPSTPAVPPRHNGMHALGLGVGLLLCTRLAGLFHRCPEETPACRSSPWLSPLATMVGGRAKNLWYGACVGALVALLASVRLWLRRYGNLKSPEPPVLFVRWGLPLMALGIAAYWALASGADEAPPRLRALVAGASVVLPRAVAGLAASGLMLLLWRPVTVLVKAGMGAPRTRTVLTPFLGPPTSQADLDYVAPQIYRHMQEVFRGQLERNNSQGPLTVAAYQLGSVYSAAMVTALTLLAFPLLLLHAERVSLVFLLLFLQSFLLLHLLAAGIPITTPGPFTVPWQAVSAWALMATQTFYSTGHQPVFPAIHWHAAFIGFPEGHGSSIWLPAFLVGANTFASHLLFAVGCPLLLLWPFLCESHGPQKRRQTPRNEAETRVRPEEEEEEEPLMEMRLRNAPHHFSAALLQLGLKYLFVLGVQILACALAAFILRRHLMVWKVFAPKFIFEAVGFIVSSVGLLLGIALVMRVDGAVSSWFKQLVLAQQR	66661	73369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_67066_70027_70902_71494_71702_71918_72140_72755_72827_72979
692496	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692501	SIRV6	-	603	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8234	-119	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCGACTGTCGCTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	1663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2611_2733_2826_3106_3164_10723
692509	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_96601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692511	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692512	contig_3410_pilon	-	2915	19	Intergenic	novelGene_58952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	23.6554485671606	83	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	767	2176	267758	254453	FALSE	15	CAGAGTGGGAGCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVRVRNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRRLKGIRDEALPTVLVGIFIEQPTPFLAEHGSKYQSVKLVGPEIRMASADARNMGTDLCRQDQSCTYYFSIDADVALTEPDTLRLLIEQNKNVIAPLTTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRIGVWNVPYISNIYLIKGSALRADLQQKDLFHYSKLDPDMSFCANIREQDVFMFLTNRHTFGHLLSLDSYQTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHENYTKALEGKLVEMPCPDVYWFPIFTEAACNELVEEMEHYGQWSHGDNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIHFEREWHKFLVEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLLHPGRLTHYHEGLPTTKGTRYIAVSFVDP	283165	253713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_254609_255350_255477_256317_256465_257658_257764_258380_258447_259093_259208_260225_260368_260658_260785_261235_261341_262897_262990_265836_265891_266463_266566_267683_267782_269580_269645_271188_271302_273136_273304_273743_273879_275006_275099_282993
692513	contig_6102_pilon	+	1502	9	Intergenic	novelGene_32276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	39.5740998002481	25	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	46	642	1444370	1448056	TRUE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAGQDSSSTGKGYGLWTPSLAGRSPTRLRTESTLPCSHHCRAAPITMPLLQ	1444324	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446567_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
692524	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692525	contig_7356_pilon	+	2378	21	Intergenic	novelGene_60338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_20	43.5631438259453	311	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	56	2056	30625	99027	FALSE	35	TCTTGACAAAAATGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKLGELLHDKLFGLFEAMSAIEMMDPKMDAGMIGNQVNRKVLNFEQAIKDGTIKIKDLTLPELIGIMDTCFCCLITWLEGHSLAQTVFTCLYIHNPDFIEDPAMKAFALGILKICDIAREKVNKAAVFEEEDFQSMTYGFKMANSVTDLRVTGMLKDVEDDMQRRVKSTRSRQGEERDPEVELEHQQCLAVFSRVKFTRVLLTVLIAFTKKETSAVAEAQKLMVQAADLLSAIHNSLHHGIQAQNDTTKGDHPIMMGFEPLVNQRLLPPTFPRYAKIIKREEMVNYFARLIDRIKTVCEVVNLTNLHCILDFFCEFSEQSPCVLSRSLLQTTFLVDNKKVFGTHLMQDMVKDALRSFVSPPVLSPKCCLYNNHQAKDCIDSFVTHCVRPFCSLIQIHGHNRARQRDKLGHILEEFATLQDEAEKVDAALHTMLLKQEPQRQHLACLGTWVLYHNLRIMIQYLLSGFELELYSMHEYYYIYWYLSEFLYAWLMSTLSRADGSQMAEERIMEEQQKGRSSKKTKKKKKVRPLSREITMSQAYQNMCAGMFKTMVAFDMDGKVRKPKFELDSEQVRYEHRFAPFNSVMTPPPVHYLQFKEMSDLNKYSPPPQSPELYVAASKHFQQAKMILENIPNPDHEVTRILKVAKPNFVVMKLLAGGHKKESKVPPEFDFSAHKYFPVVKLV	27110	99349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_27147_30605_30721_31773_31849_35275_35444_51694_51762_51840_51885_53368_53420_54075_54160_54991_55107_72157_72337_74719_74780_78790_78898_85410_85478_87954_88054_88639_88819_92129_92267_93104_93173_94544_94686_95116_95240_98019_98101_98967
692528	contig_17781_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_163680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGGGTATATCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415311	412920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_-_412900_415300
692529	contig_3837_pilon	+	1978	9	Intergenic	novelGene_104015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	215.901272286663	157	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	531	1214	67539	123281	TRUE	45	GGAAGAAGAAATGACTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKVTVNKDGHDALIRTNCGVKDGNI	67008	129186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_77748_77816_88997_89221_121918_122015_123209_123366_124345_124469_128629
692530	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692531	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_98051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CCCTTCTCCTCTTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692535	contig_6823_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_131229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292729	295493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_292700_295500
692551	contig_14208_pilon	-	2248	9	Intergenic	novelGene_129104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAACAGCCGTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344441	291854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_291985_325812_325890_328606_328712_332387_332502_337412_337560_338902_338972_340393_340536_340674_340746_343048
692552	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692554	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692563	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692566	contig_11417_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_103340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTTATTTGGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659818	661155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_659800_661200
692570	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692574	contig_3081_pilon	+	2010	2	Intergenic	novelGene_133941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_1	0	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	45	371	236110	240173	FALSE	40	TAACCCATAAGCCTAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGTSAEGAHLRARMQSACLLSDMESFKAANPGCFLEDFVRWYSPRDYIEEEVIDEKGNVVLKGELSARMKIPSNMWVEAWETAKPIPARRQRRLFDDTREAEKVIGVWISNTRMQINILAF	236065	241812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_236152_239888
692577	contig_19098_pilon	-	1267	3	Intergenic	novelGene_65786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	506.5	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	233	418	52529	50887	FALSE	30	GAATAGGTAACTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGELLVKYISLGPGPGVQEPVLGLRLELGARGSGLGARDSERSNLPNQTAPPSRGPPETRSLDLLLATSLECIWLRTMKFQTWPKNLKKLRRTWRPRRSHLAHEVTPLSVDTPIGPSLKVFSPLNQRLLFPSQPRQIL	64463	50037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_52524_52579_64280
692585	contig_15384_pilon	-	2346	21	Intergenic	novelGene_85143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	43.3236655882209	1	57	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	52	1662	127943	120294	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGRLRSRPSPGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLGE	127994	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119744_120280_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
692586	contig_18096_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_58049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTCCCTAGTGGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49943	51409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_49900_51400
692587	contig_5515_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_52337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_2	114	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	280	420	68690	68158	FALSE	45	TCAACCGATCAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	69057	67632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873
692588	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692596	contig_11417_pilon	-	2831	1	Intergenic	novelGene_103293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2279	2620	482310	481969	NA	30	ACCAGCCTCCCACAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICNYIYLPWDFAKEHKHQSKRNGPLIMKQINTLRLRPQDLEASEKRKTAAINSFHKESIGCCLWLTVFEYWQMNEPIPIALIPFCASQTTYPLHKPRGKGSQFIYKPKPVKN	484588	481757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_481800_484600
692598	contig_12120_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_21418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAATTTGGCCTTCCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53542	55142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_53500_55100
692600	contig_15293_pilon	-	1725	2	Intergenic	novelGene_146524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1121	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTTGCCAGAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94000	92219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_93003_93058
692603	contig_11012_pilon	+	2952	6	Intergenic	novelGene_163685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2473	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGCGCCGCCCCCGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406188	430479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11012_pilon_+_408916_420153_420184_421407_421448_425207_425266_430305_430361_430437
692606	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692607	contig_5928_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_40396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365407	366927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_365400_366900
692611	contig_8059_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_111101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCATTAAACAATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194286	193242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_193200_194300
692612	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692614	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692615	contig_12257_pilon	+	2042	6	Intergenic	novelGene_152109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_5	60.2660766932775	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	142	1914	151413	158899	FALSE	25	CCGTTCTATAGGAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPVPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLKLPRWRK	148882	159027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149449_149522_151405_152947_156678_156787_157405_157514_158876
692616	contig_7707_pilon	+	3120	21	Intergenic	novelGene_72177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_19	368.307544723157	558	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	927	2784	75	2858	531589	655929	FALSE	15	TTTGCTGCTGTTTTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKGGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFNIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGSSTPKSPGASNFSALPKISPSSLSNNYNNINNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNISDLCTALSALSGVPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEQVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMALPRNNTEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCYKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEETCKGQLTGHKKRLFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN	531514	656191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531644_542837_542969_553915_554043_575679_575826_583133_583196_598089_598177_612136_612282_635116_635291_637314_637474_637552_637778_639965_640050_640139_640235_640333_640526_641469_641586_641976_642250_642627_642699_643075_643192_644060_644211_645498_645603_652216_652306_655746
692619	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACGACCGCATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
692620	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692626	contig_14322_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_116597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCGGCGGCCACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
692628	contig_11227_pilon	-	2087	7	Intergenic	novelGene_163197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	41.8559036059033	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	287	856	297894	285075	TRUE	40	ATAAAATCAAAGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQRKGLQARILSFEEEEKLKRDQALVSDFKQQKLEKEAQKNWDLFYKRNSTNFFKDRHWTTREFEELRSCREFEDQKLTVLEAGCGVGNCLFPLLEEDLNIFAYACDFSPRAVEYVKQNPSYNTERCKVFQCDLTKDDLLEHVPSESVDVVMLIFVLSAIHPDKMHLVLQNVYKTRKQIQRDEITC	299170	278446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_283410_285014_285114_291670_291842_296562_296698_297669_298045_299034
692630	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
692633	contig_987_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_72306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGAAACCTCCAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970763	970497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_970500_970800
692634	contig_9807_pilon	+	1593	5	Intergenic	novelGene_32852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	747.984082384111	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	119	688	109130	158865	FALSE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGRENQMHTGYTTSAAWPGWTSTRWSQPPTTPPSKSGQSPTEAHPLGPTGSGTRTSLQQNVFFLSMFL	109011	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_158672
692642	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_18518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
692645	contig_5744_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_149324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292251	290607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_290600_292300
692647	contig_13863_pilon	+	1433	10	Intergenic	novelGene_42035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	896.019606818104	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	195	971	99254	118943	TRUE	35	CCTAGCTTATCCAATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQLHNLYYSNERCLPRQVHD	98395	120012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_118886_118965_119571
692649	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
692651	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692653	contig_9389_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_84094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTAGCTCTAACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358866	1360457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1358900_1360500
692660	contig_401_pilon	-	1331	7	Intergenic	novelGene_42770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	630.983029354462	4003	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTATCTCGTCAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086603	1078877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1078983_1079023_1079793_1081571_1081766_1081895_1081983_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
692668	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692671	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692673	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692676	contig_10437_pilon	-	2496	17	Intergenic	novelGene_38409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_13	288.54134777359	324	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	586	1773	786446	779194	TRUE	30	TTAAATTTGGGATGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQNPASDLQCLSHLWMSFLSRQSA	792982	773849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779261_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428_786576_787256_787353_788620_788752_789435_789628_792945
692677	SIRV2	+	449	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	142	-68	-142	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCTATTCGAATGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
692685	contig_10019_pilon	+	2824	19	Intergenic	novelGene_86691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	906	1226	343804	353301	TRUE	5	CGTTCTCTTTTTCTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEATQFLFAWLLSPLISVFSCCSARACHFCLFFLQPSSKGKQSSDTWVRASYSCKQMASMNPTCILGILFFFSLFIRSVGSMLSSFLSLSPWSKNSVATSSAIRC	342898	459944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_343955_345992_346077_346819_346896_353291_353356_356540_356618_358652_358754_363542_363632_372728_372824_375233_375358_381406_381555_398217_398277_400561_400742_411376_411466_412900_413012_422406_422472_424570_424708_432451_432541_434544_434619_459838
692688	contig_5302_pilon	-	1910	13	Intergenic	novelGene_81514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	230.445748616796	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	217	1872	1451551	1383630	FALSE	15	GCTTTAAGTTGTCAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCGRRASRPEESSRLRPLFQGARCSRRDQHVPPLVPLSQSTRLALRAPAPPGSVSCLAGRTRARARAVAGAMSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNAKNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVRYMEEERNFTTEQVTAMLLSKLKETAENVLKKPVVDCVISVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRAKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVLVNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDVDVSGTMNRGKFLEMCDDLLARVEPPLRSVLEQAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFSLKLEDTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKMRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKVISAFKNKEDQYDHLDAADMMKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVIKAKEIEAKIKELINICSPIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID	1451767	1383591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1383834_1384039_1384202_1386779_1386900_1388513_1388622_1389782_1389860_1407805_1407883_1410583_1410829_1418836_1418971_1419563_1419664_1428240_1428364_1430204_1430346_1436323_1436382_1451444
692691	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_93437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653712	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692693	contig_6885_pilon	-	2158	9	Intergenic	novelGene_83643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_6	193.17022124282	101	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	20	1456	314045	128411	FALSE	40	ACCCTGCTGCCCATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNSLQWVGSPCGLHGPYIFYKAFQFHLEGKPRILSLGDFFFVRCTPKDPICIAELQLLWEERTSRQLLSSSKLYFLPEDTPQGRNSDHGEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGLHAGSMKTEVLGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGEDEEETNVIVLSYPQYCRYRSMLKRIQDKPSSILTDQFALALGGIAVVSKNPQILYCRDTFDHPTLIENESVCDEFAPNLKGRPRKKKSCPQRRDSFSGVKDSNNNSDGKAVAKVKCEARSALTKPKNNHNNCKKVSNEEKPKVTIGEECRADEQAFLVALYKYMKERKTPIERIPYLGFKQINLWTMFQAAQKLGGYETITARRQWKHIYDELGGNPGSTSAATCTRRHYERLILPYERFIKGEEDKPLPPVKPRKQENSSQENDNKTKVSGTKRIKHENPKSKKEKENAPKPQQEASEVSCSPPWKSL	314064	127708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_128646_144722_144821_154941_154995_156958_157164_163851_163965_219234_219466_278049_278276_313336_313592_314024
692695	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692696	contig_10324_pilon	+	2149	17	Intergenic	novelGene_7909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_11	75.4983184829305	316	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	104	1714	824693	835840	FALSE	0	GTCCTTTGTGTCTGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSLLLLLPFCSAVEVKRPRGVSLSNHHFYDESKPFTCLDGSATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGNFHCTNTGYKPLYIPSSRVNDGICDCCDGTDEYNSGIVCENTCKEKGRKERETLQQMAEVTREGFRLKKILIEDWKTAREEKQKKLIELQEGKKSLEDQVEMLRTAKEEAEKPEKEAKEQHRKLWEEQQAASKAQQEKELVASTFQELDDDMDGMVSVAELQTHPELDTDGDGALSEGEAQALLGGDSQTDANAFYDRVWAAIRDKYRSEVLPTDQPAPTTDLTEPKEEQPPPVPSPPSEEDEEEEEAEEEEEEEEEEEEPEAQGEQPKEALPPLVPSPPSSPTEEDKMPPYDEQTQAFIDAAQEARNKFEEAERSLKDMEESIRNLEQEISFDFGPSGEFAYLYSQCYELTTNEYIYRLCPFKLVSQKPKHGGSPTNLGTWGAWAGPDHDKFSAMKYEQGTGCWQGPNRSTTVRLLCGKETVVTSTTEPSRCEYLMELMTPAACPEPPPEPPTDGQHDEL	824204	836275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_824276_824660_824778_824994_825112_825629_825726_825821_825880_826747_826866_828320_828451_831514_831600_832602_832682_833524_833612_833912_834090_834159_834257_834703_834774_834998_835089_835355_835431_835514_835615_835693
692697	contig_10042_pilon	+	1069	3	Intergenic	novelGene_79200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	14.5	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTAATTGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028995	1060956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991
692700	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692704	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	3	2963	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	244	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
692705	contig_11816_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_98540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTACTCCCATTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061512	1060726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1060700_1061500
692707	contig_6710_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_96861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692712	contig_3975_pilon	-	1405	11	Intergenic	novelGene_54822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.339173077089	2	25	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	454	1002	2063902	2056772	FALSE	10	CATCTCTCTGCTCCCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELHLSA	2079271	2056368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056788_2056960_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063920_2065275_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
692716	contig_3986_pilon	-	2105	13	Intergenic	novelGene_52699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.164499977466	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	145	1440	60653	35584	FALSE	25	GCCCAGCTTACATGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARVLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPV	108539	34918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35589_39678_39811_41346_41498_44833_44905_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396
692718	contig_6589_pilon	-	1989	3	Intergenic	novelGene_25948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	16	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTATTTCAGCTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296652	1280424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1281920_1290296_1290460_1296321
692719	contig_8594_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_140036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTCTTCATTTAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362748	363525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_362700_363500
692720	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692721	contig_9242_pilon	-	1829	18	Intergenic	novelGene_155059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	74.3788115827132	898	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	5	1624	411363	371258	FALSE	25	CAAATGGATTGTGTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRFPFACCLHTAKRSKFSAPWSRPAAFMSSLMINQPQYAWLKELGLREENEGVYNGSWGGRGEVVTSCCPANNEPIARVRQASVADYEETVKKAREAWKIWADIPAPKRGEVVRQIGDALREKIQMLGKLMSLEMGKILVEGVGEVQEYVDICDYAVGLSRMIGGPILPSERPGHVLIEQWNPVGLVGIITAFNFPVAVYGWNNAIAMICGNVCLWKGAPTTSLISVAVTKIIARVLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAKDEQVNLLSFTGSTQVGKQVALMVQERFGRSLLELGGNNAIIAFEDADLNLVIPSAFFAAVGTAGQRCTTTRRLFLHESIYDEVVNKLKKAYEQIRVGNPWDSDVLYGPLHTKQAVNMFLGAVEEAKKEGGTVVCGGKVMDRPGNYVEPTIVTGLAHDASIVHTETFAPILYVFKFKNEDDAFAWNNEVKQGLSSSVFTKDLGRIFRWLGPKGSDCGIVNVNVPTNGAEIGGAFGGEKHTGGGRESGSDAWKQYMRRSTCTINYSKDLPLAQGIKFQ	411367	371052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_371313_372640_372717_381994_382069_382271_382370_383654_383772_385125_385233_386411_386497_389018_389114_391417_391460_396071_396170_397611_397690_400726_400772_404304_404438_405214_405339_405660_405742_409048_409115_409695_409750_411171
692723	contig_16951_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_98634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCATTGCTGTGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82124	82576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_82100_82600
692726	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	0	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
692734	contig_6489_pilon	+	1554	5	Intergenic	novelGene_128915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_4	178.716780129903	1393	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	51	767	100350	208496	FALSE	35	TTACATAGAACTGAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQQMTSSQKALMLELKSLQEEPVEGFRITLVDESDLYNWEVAIFGPPNTLYEGGYFKAHIKFPIDYPYSPPTFRFLTKMWHPNIYENGDVCISILHPPVDDPQSGELPSERWNPTQNVRTILLSVISLLNEPNTFSPANVDASVMFRKWRDSKGKDKEYAEIIRKQVSATKAEAEKDGVKVPTTLAEYCIKTKVPSNDNSSDLLYDDLYDDDIDDEDEEEEDADCYDDDDSGNEES	100299	209283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_100527_166604_166692_179571_179670_203703_203839_208276
692736	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692742	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692763	contig_19330_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_163696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGCAGGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58648	60505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_58600_60500
692771	contig_14925_pilon	-	690	3	Intergenic	novelGene_55065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
692774	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692776	contig_14744_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_65957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	290	706	634747	634331	NA	15	CAGACTTCATTTGTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSRAAPAPPHVGLLTARMQLPVQATGSPPNTRILFTMRQWVKVQPLQGCPGQAVKWVRTSHFGSPFFMPSWSLSSCSWARLMLLPPQTMTTREARGGMELPFSLQLLNYVAVDCGQGCPTGGLHQDLLVICQRRET	635036	633214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_633200_635000
692780	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_95340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
692787	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692790	contig_7202_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_18562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGAAAACAGAATAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27692	27950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27700_28000
692791	contig_11115_pilon	+	1956	7	Intergenic	novelGene_102821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	502.906441486773	2	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	234	1871	165608	173241	FALSE	15	CCGGAGTCTGTGGCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165374	173326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
692793	contig_12050_pilon	+	1602	6	Intergenic	novelGene_62653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	150.576226543236	672	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	130	762	359783	363126	FALSE	5	CTTGGAGCCCTCTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKVGAGGLQVEGQGLTLTQTGLARWQGC	359653	363966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362686_362766_362817_362918
692798	contig_10609_pilon	+	2287	4	Intergenic	novelGene_123935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_3	48.8330489183981	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	218	835	386471	391134	FALSE	45	GAGAAGGAGGAAGAGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQV	386253	392586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_386639_386996_387085_389596_389740_390915
692801	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_93427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
692803	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692805	contig_4156_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_88107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCAATAAAAAATTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340068	341469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_340100_341500
692816	contig_4059_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_140602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAAGCCTACAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407424	407821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_407400_407800
692824	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
692834	contig_18869_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_56181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73628	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
692835	contig_12050_pilon	+	1357	8	Intergenic	novelGene_62639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	244.729504989171	11	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	35	307	359783	362367	TRUE	5	GCTTGGAGCCCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTVIC	359086	363965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359106_359767_359849_360750_360847_362084_362188_362359_362686_362766_362817_362918_363046_363410
692847	contig_7587_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_163706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTCCTGCACCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30317	28241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_28200_30300
692849	contig_14341_pilon	+	643	5	Intergenic	novelGene_111856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1893	junction_1	1721.05047863216	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	203	592	550058	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	548780	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
692854	contig_14925_pilon	-	977	5	Intergenic	novelGene_55103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1838.68803430598	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	192	338	29675	27121	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGDGTTLTVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMELQI	61661	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27133_28011_28041_29569_29828_61622
692866	contig_3095_pilon	+	1068	4	Intergenic	novelGene_75144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_2	1046.09570414098	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	37	660	149709	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149672	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150696_150996_151163_151848
692868	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
692872	contig_8462_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_159416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGTCCAGTGACAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223582	224680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_+_223600_224700
692877	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	151	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692878	contig_18869_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_56330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAAAATTTGGCTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73611	73356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
692888	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
692889	contig_11752_pilon	+	1063	7	Intergenic	novelGene_37587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1534.6126185096	20	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	109	1014	84194	105840	FALSE	50	ATATTACTGTGAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSHFAPHHPSLQLTGVVYIA	84085	105889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94302_105778
692891	contig_20759_pilon	+	2110	2	Intergenic	novelGene_163723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37751	42974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20759_pilon_+_39107_42219
692892	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
692895	contig_12837_pilon	-	1181	3	Intergenic	novelGene_57268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	6	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGTCTTGTCAATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60614	29171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_29365_30361_31213_60477
692896	contig_9424_pilon	-	794	5	Intergenic	novelGene_143785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1989.26299166299	43	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTGAGTGTAGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280477	277469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279263_279629_280079_280144_280458
692898	contig_11932_pilon	+	1936	3	Intergenic	novelGene_85399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	25	183	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	453	1424	241177	243522	FALSE	15	CTAGCTTGGTGTCAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	236033	244034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_236346_241036_241732_243105
692910	contig_14219_pilon	-	1640	5	Intergenic	novelGene_54387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	40.3384122146621	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	164	583	1116288	1107875	FALSE	55	AAATTTAAACAAGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAYCIKKLPRNPHKEEIIGNGEQQYVYLKDGDLIETEGATLRVIYTPGHTDDHMALLLEEENALFSGDCILGEGTTVFEDLYDYMNSLKELLKIKANVIYPGHGPVIYNAEAKILQYISHRNIREQQLLAIFRENFEKSFTVTELVKIVYKGIPENLHNMAKNNVSLHLKKLEKEGKIFSNKDPDKKWKAHL	1122846	1106817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1107919_1108569_1108652_1114015_1114165_1116143_1116323_1122717
692914	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
692919	contig_8616_pilon	+	1915	12	Intergenic	novelGene_72476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_8	545.030683797703	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	526	1854	320431	330999	FALSE	10	TCGTGCCAGCCACTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318055	331060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
692924	contig_5092_pilon	-	1878	3	Intergenic	novelGene_62312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGAAGACTTGCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451588	443418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_445021_447835_448014_451490
692927	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692934	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692937	contig_9345_pilon	-	2517	8	Intergenic	novelGene_24417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.8494732507789	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	157	657	204542	196247	TRUE	40	ACACACAAGAGTTTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	205292	194207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_195134_195312_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205
692939	SIRV7	-	341	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33222	6	3	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114735	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
692941	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4421	35	3246	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
692949	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
692957	SIRV6	+	706	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	547	223	374	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	56	547	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1677	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
692959	contig_405_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_135283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGGCAAAAATGCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125220	123517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_123500_125200
692966	contig_16411_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_77384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCATCATAATGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353082	354046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_353100_354000
692969	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
692970	contig_6710_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_89533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCAGGGTGATGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
692974	contig_11088_pilon	+	1194	3	Intergenic	novelGene_85029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1591.5	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	569	997	17314	17742	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	13140	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13242_14663_14937_17119
692982	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_17667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
692988	contig_3975_pilon	+	1105	11	Intergenic	novelGene_54877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3241	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	167	313	2092179	2093047	TRUE	15	GGCGCCACTTCCGGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRLIYFSESKTFCKQPRWRSSFLRLKLKLKILWIEVVDAHITIFSTAAIALAIRMEGNTVDRSEVTLDSSKLFFKGQMEEPGFKLANPGGGCGYIHGFLTTT	2091886	2099608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2092039_2092164_2092256_2092977_2093052_2093358_2093451_2093572_2093684_2096132_2096263_2096348_2096501_2097476_2097545_2097852_2097939_2099364_2099458_2099552
692989	contig_6710_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_96487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGAACTCATTCACTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653366	653783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
692997	contig_14142_pilon	+	2094	10	Intergenic	novelGene_120478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	217.516680217494	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	186	923	268562	270309	TRUE	15	CACCTGTGTGTCTGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLEDSVTLRHSVVVPYEPPEVWSALTVPLSTSTSCVTAPAWEA	261209	274994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_261367_268533_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_269877_269996_270242_270353_270673_270783_273397_273457_274034
693002	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693005	contig_7457_pilon	-	1697	8	Intergenic	novelGene_31436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.5086496913	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	367	504	471189	470916	TRUE	50	ACATAACAATAAATATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSVRWVQDDGASSLARRPLGQGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEPLTISSFCTRRRKSRRRRCPRYARTSRP	473218	468269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471138_471292_471559_471667_471948_472039_473151
693007	SIRV4	+	230	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1541	632	1086	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2541	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
693016	contig_2069_pilon	-	730	3	Intergenic	novelGene_23519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	5743	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	71	352	1509802	1508747	FALSE	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509872	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
693020	contig_11630_pilon	+	1986	3	Intergenic	novelGene_147167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	5	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCCTGCTAGTTCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77614	146281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895_131998_144489
693025	contig_7158_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_163734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166743	1167782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1166700_1167800
693027	contig_6458_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_163739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGATTAAATCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59576	61892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_+_59600_61900
693032	contig_663_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_163749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	609	junction_1	0	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAGTAGAAGCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103269	100146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_102194_103159
693035	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693037	contig_821_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_149406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTAAGTCCAATTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212632	210522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_210500_212600
693038	contig_14909_pilon	+	2147	16	Intergenic	novelGene_155706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	110.462582905807	180	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	488	1801	116717	137710	FALSE	10	GATTGTCTTTTGTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIYRPHKATAEEMTKYHSDEYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAGAVKLNRQQTDMAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNFPMRDGIDDESYGQIFKPIISKVMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLTVKGHAKCVEVVKTFNLPLLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDCEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTPEYMEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAVHEDSGDEDGEDPDKRISIRASDKRIACDEEFSDSEDEGEGGRRNVADHKKGAKKARIEEDKKETEDKKADVKEEDKSKDSSGEKTDTKGAKSEQLSNP	105422	138056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_+_105677_108702_108789_112655_112702_116615_116729_117845_117964_119445_119521_120070_120210_121369_121512_123937_124031_124110_124220_131058_131200_131427_131537_132125_132257_133084_133241_135806_135865_137679
693039	SIRV7	-	240	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91671	15	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
693044	contig_6578_pilon	-	2254	9	Intergenic	novelGene_162230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	22.0510770711999	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	176	1012	60760	55267	FALSE	20	AGAGTTTTGCGTGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGEEYDRESKSSDDVDYRGSTTTLYQPSAASCSAIQVHPPSSLPWLGSGQTSTGASVLMKRNLHNVKRMTSHPVHQYYLTGAQDGSVRMFEWTRPQQLVCFRQAGNARVTRLYFNSQGNKCGVADGEGFLSIWQVNQTASNPKPYMSWQCHSKAASDFAFITSSSLVATSGQSNDSRNVCLWDTLISPGNSLIHGFTCHDHGATVLQYAPKQQLLISGGRKGYVCIFDIRQRQLIHTFQAHDSAIKALALDPCEEYFTTGSAEGNIKVWRLTGHGLIHSFKNEHAKQSIFRNIGAGVMQIDIIQGHRIFSCGADGTLKTRVLPNAFNIPNRILDIL	62787	54024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_55477_56280_56499_57458_57512_58245_58338_59818_59897_60444_60573_60702_60764_61396_61536_62754
693050	contig_7622_pilon	-	1887	15	Intergenic	novelGene_132416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	219.721066215271	1	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	207	1634	297961	269125	FALSE	25	TAGGAAATGTTATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	306643	268871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276595_280650_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
693052	contig_14341_pilon	+	825	6	Intergenic	novelGene_111855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2244.17040351218	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	160	774	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547804	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547956_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
693055	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693056	contig_14553_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_124993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	62	718	5806	14424	FALSE	10	GAGTACCCCCCTCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWTPGLPSRHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	5744	14425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_13796
693059	contig_4364_pilon	-	1728	14	Intergenic	novelGene_128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	157.903873087694	641	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	40	1503	1097596	1092058	FALSE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMRKMATAFNTTVAALEDELTQLILEGLINARIDSHSKILHARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMNTNM	1097635	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093425_1093639_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1097563
693060	contig_4151_pilon	+	566	2	Intergenic	novelGene_65219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	294	566	455030	455805	FALSE	55	ATCCAAAACAATAACGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILTVELRTLSTGYEIDGGKLRYQLYHWLEKEVIALQRTCDYCSDVEELQSAFGETGDEFRLNEDAKDLPHETKVKQLRENFQERRQWLLKYQSLLRMFLSYCILHGSHGGGLASVRMELILLLQESQQETSEPVFPSPLSEQSSVPLLFACTASAKTVVANPLLHLSNLTHDILHAIVNFDSPPHPD	454736	455805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_455126_455628
693063	contig_16098_pilon	-	1133	8	Intergenic	novelGene_46150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1595.92812226258	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	230	1063	458816	456145	FALSE	20	ATTGAAGGGGGAGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGHSFLSLLPPS	460356	456074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456180_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
693072	contig_776_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_139950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039611	1037744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_1037700_1039600
693079	contig_11564_pilon	+	2721	1	Intergenic	novelGene_158594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	20	331	195780	196091	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTAGAKMRSCSLYSPRIPRSLVVLTHAAPTFPAARQSSLLSGLWSITAVRGLPCVDCSLCGIFPSGTIRLLIGAVWELTLSAPPLWPSGSREGWGRGADFPRLKMIPLD	195760	198481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_195800_198500
693085	contig_12277_pilon	-	2770	20	Intergenic	novelGene_139680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	69.1176683458168	142	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	434	2350	151721	119158	FALSE	35	TCAAGCAATGACCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKHLHHSVFLTFLRMSTHKESKDHFISASAFGEILYNNFLFDIPKILDLCVLFGKGNSLLLQKMIENIFTQQPSYYNDLDETMPTILQVFSNILQHCGLQGDRTCATPQKLEEKGRLSPSDMPLQELKDIVLYLCDTCTTLWAFLDIFPLACQTFQKHDFCYRLASFYETAIPELESAIKKRRLEDSKLLGDLWKRLSHSRKKLVEIIHILMNQICLLPILESSCDNIQGFIEEFLQIFSSLLQEKRFLRDYDVLFPVADDVSLLQQASSVFDETRTAYILQAVESAWEGVDRQKATEAKDPLVAEDPNKVAATVEPVSQTPSHPENSEDEECMGAAAALVPSVSGVELDSLISQVKDLLPDLGEGFILACLAHYSYDPEQVINNILEERLAPALSQLDRSLDRQAKPDPTPLLTSRHNIFQNDEFDVFSRNSVDLSRVHKGKRKEENTRSLLNDKRAVTAQRQRYEQYSVVVEEVPLQPGEGLPYHGDDYEDEYDDTYDDNQVGANDVDSDDELISRRPFTTPQVLRTRVSGEGQEDDEEEEEEEEAEEGAPKPDHFVQDPAVLREKAEARRMAFLARRGYRHDSSAAVAGSPRGHGQTRETTQERRKKEANKAARANHNRRTMADRKRSKGMIPS	162979	118737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_119330_120619_120700_123998_124105_124686_124818_124906_125001_132978_133099_134019_134235_135655_135837_137188_137264_137480_137550_137778_137887_138322_138398_142714_142828_143954_144066_145006_145075_150006_150137_151652_151824_152177_152338_157606_157705_162906
693089	contig_6710_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_94113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
693090	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693093	contig_8848_pilon	+	1919	2	Intergenic	novelGene_140451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATAAAATTTTATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49764	58615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_49895_56826
693094	contig_9848_pilon	+	3082	5	Intergenic	novelGene_79932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_4	116.346465352412	67	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	2108	2821	85672	95315	FALSE	15	TGGACAGTTTGGGAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTKLKCSPVYQVPLEYLPSGKRRGGIAGPCGLCSCFLVTKELRGHAIGCQGCLTLPVCSEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	83564	95576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
693096	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	316	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693097	contig_4364_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_1120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCGGTGAAGCAGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1532893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
693103	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693110	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10979	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
693111	contig_7898_pilon	+	1261	6	Intergenic	novelGene_47537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	187	513	283762	284308	TRUE	30	GAGAAAGAACTCCCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPKEKGEMFSMFSRVASLAPTLSPVLISCTSLWISMVPLEILVVMPKAWKKEVFSGPRPVFWAGTVTSHGAMAPARAAAGTLLARSMSLISVRSSLVNTKPTFPRM	282696	286096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_282800_283678_283866_283961_284104_284227_284318_284421_284598_285533
693113	contig_3469_pilon	-	1693	11	Intergenic	novelGene_34165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	101.940374729545	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	228	1223	413507	391452	FALSE	20	TATTGATATACTGCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLMVYSRTQKTPKNPQENYWN	427663	390981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_391512_392528_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444
693114	contig_10045_pilon	+	1664	4	Intergenic	novelGene_163751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5058680596133	107	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	270	611	9216	24808	FALSE	25	CACATATTGTTCTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLCLKECLAGGQSGGTRVSHHEALLLCFRALPEVELLRASQRSWSLAFRMRLQTDSVSGAGITIKRSLKICSLQVGHPHLLLSCSRLKTMRQFIVQDPPLDRKHQSPAEVFK	6941	25861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_7134_9138_9237_15996_16117_24607
693120	contig_10135_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_106589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30239	31250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_30200_31200
693121	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693122	contig_5514_pilon	+	1283	6	Intergenic	novelGene_75280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	327.845695411729	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	573	1115	66595	68726	FALSE	45	AAATAAATAGCAGTGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61082	68894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65505_66201_66389_66493_66640_67535_67662_68354
693123	contig_12644_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_44585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2081553	2081271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2081300_2081600
693128	contig_12393_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_147121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCCCCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23325	21604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12393_pilon_-_21600_23300
693134	contig_14322_pilon	-	151	1	Intergenic	novelGene_115687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTGCTGGTGTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671423	671272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
693137	contig_12050_pilon	+	1432	11	Intergenic	novelGene_62632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	206.244999939392	148	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	75	920	357478	363452	FALSE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAERAVLEEEFRWLLHDEVHAVLRQLQDILKEASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	357403	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
693145	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_89290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
693149	contig_18869_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_55969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAATCACCAGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49540	50312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_49500_50300
693150	contig_14353_pilon	-	1480	7	Intergenic	novelGene_82073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.834321352503	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	58	537	83931	80015	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNWTPPQPPSHQLCTPGRR	84541	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80069_80520_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505
693152	contig_253_pilon	-	2363	5	Intergenic	novelGene_129707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_1	34.7491007077881	23	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1644	2258	508925	507405	FALSE	10	TCTCTGGTCTGTTAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPGIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPDWIQLDQQITPLLLNYSQCKLVAEEYYEVLDHCSAILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALEPVVSRELRTLEARIRQKDEEDKARFRGIFTP	513635	507299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507611_507918_508061_508150_508328_508835_510450_513516
693156	contig_16666_pilon	-	1269	4	Intergenic	novelGene_61757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	62	406	59586	55974	FALSE	20	GGCTTTGTAACTCATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59647	55110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
693162	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_94259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693168	contig_1008_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_121591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCAAGAGGCAACCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708967	710114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_709000_710100
693172	contig_20199_pilon	-	782	4	Intergenic	novelGene_82564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	79	junction_3	1217.16911999388	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	44191	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44193	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906_43951_44118
693173	contig_6361_pilon	-	1487	8	Intergenic	novelGene_23865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	224.68926388709	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	435	1070	62823	55091	FALSE	15	CTTTACGTGTATGTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	119091	54673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73569_73775_109541_109610_118986
693174	contig_9074_pilon	-	1282	7	Intergenic	novelGene_156622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	131	junction_1	114.07551105396	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	143	655	67533	61565	FALSE	45	CTACTATAAAATGATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRVLVVSSIVAGESQKPELKAWQGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	70890	60937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_61607_62803_62887_63085_63194_64807_65004_67449_67537_70247_70311_70814
693181	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_91285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657161	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657163	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693184	contig_18869_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_56200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73736	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
693190	contig_4644_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_160190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGTTACATCCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30175	30779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4644_pilon_+_30200_30800
693194	contig_12299_pilon	+	2610	1	Intergenic	novelGene_29733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACCTAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94894	97504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_94900_97500
693197	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693200	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693216	contig_7396_pilon	+	1951	3	Intergenic	novelGene_79653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	44	340	252467	252763	TRUE	5	TTGCTTTTTTGTTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETLALYCIGHWRSWMLALGMGIQSEVVKYGTRLATSTFLGIANQGFHMGVQGRMGQRHGGQRRGKSIQYMGNGDIWPKKQGEGKGGKAINFNLIQTILILSINETSLSCSED	252423	255405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_253979_254604_254699_255103
693219	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
693220	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	214	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
693227	contig_12605_pilon	+	890	4	Intergenic	novelGene_64219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2045.334365493	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	127	300	4395	4829	TRUE	15	GGTAGAGAGGGGTGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	4268	6234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_4535_4795_5034_5728_6005_6124
693233	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693235	contig_10581_pilon	-	2520	2	Intergenic	novelGene_41344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	107	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAGTGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74110	71477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_73651_73763
693236	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
693266	contig_14322_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_115976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671563	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
693269	contig_12969_pilon	+	3609	4	Intergenic	novelGene_61707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_3	6.97614984548545	17	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	175	1536	622578	630779	FALSE	20	GTATGGTCTGTAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGTLSFEDVAVGFTWEEWQLLDLSQKDLYKDVMLENYNNLVSVGYQGTKPDSVFKLEQGETPWIVEGGIHSGTSPEEIWAIDHMQRHPENQNELKSLERCLQNFTLGDNFGLRKNLAFLTQRHNTFDSHCRSLQSHLDFVIQNKRDIGKDSDEFSGYGKSSVHMKHDNTFPGIKYHGCVKPSSAKSQLSGHPKTYTEEQPHKCSECGKVFSKRPLLLYHQRIHTGDKPYVCSECGKAFTWESRLKRHQRSHIGEKLYGCNECGKSFSQKAYLIVHQRLHTGEKPHECSDCRRTFAFKSALTKHQRIHTGERPYECSECEKAYRCKSELIQHQRTHNRERPYECSECKRTFLFEAALTNHQRIHTGERPYECSECEKAFRSKYKLMQHKQTHTRGRPYGCSECGKSFTHMSFLIKHKKTHSKEKVINSLKVGRPSSGSHSTLYKSELIQK	622403	632852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_622593_624408_624536_626968_627065_629655
693270	contig_17074_pilon	+	1849	8	Intergenic	novelGene_145150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	894	1298	248217	257702	TRUE	15	CTTGTGGGCAGCTGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRSRPRRFLWFSCCSSPLPVSSLEEGALCFFLPVAALPLFPLAPGLPVSLEKVSSCLVPLLAFGLVWFSGTWLGVSEELPGPSMDLCFEGFFPFAADNFRGIGCRDITSRVRRSRARRISKNIWTNSSSSRAE	246099	264414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_246404_247627_248497_249341_249435_257670_257788_258269_258428_260177_260265_261810_261935_264317
693273	contig_15219_pilon	+	2725	7	Intergenic	novelGene_40821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	361.710596410384	1	155	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	122	736	19617	23770	TRUE	65	CCTGACATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVIYAGSRCCASHQSPYNCYIRSA	19495	25915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23259_23346_23495_23702_24298_24453
693287	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_93991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	160	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693288	contig_1637_pilon	-	2087	9	Intergenic	novelGene_142385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_8	56.8977976287308	142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	48	638	625756	495287	FALSE	40	GTATTGCACAAAGAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHAFQEHDIFGKKVRRVPGSSGHLHKTEDGDWEWSDDEMDEKSEEGKAAFSQEKSRRVKEENPEIAMNASSIPEQIQSLSVQDSQGQPNASEDYREASCVVNLVLRLRNSRKELNDIRFEFTPGRDTADGVSQELFSAGLVDGHDVVIVAANLQKIVDDPKALKTLTFKLASGCDGSEIPDEVKLIGFAQLSVS	625803	493837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_495362_507769_507835_549867_549937_554903_554957_613865_613934_615898_615962_625272_625303_625405_625529_625711
693291	contig_12566_pilon	+	1900	10	Intergenic	novelGene_85989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	56.8799906235342	173	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	102	353	5720	10586	TRUE	15	CACTCTGTGGCTCAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGDILRRFARFFGLLFRDTVLISPARARICSLMAEVKVKVQPPDADPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPHIEAQQRAVAINRLLSMGQLDLLRSNTGLLYRIKDSQNAG	5618	21535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5782_6777_6896_10514_10612_11005_11076_11869_12034_12274_12388_18152_18297_18516_18625_19497_19686_20800
693292	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
693299	contig_4336_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_152348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTTCTTATCAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192801	191121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_191100_192800
693303	contig_2487_pilon	+	2885	1	Intergenic	novelGene_148469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155527	158412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_155500_158400
693305	contig_19769_pilon	+	744	5	Intergenic	novelGene_102316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	255	710	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87312	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
693307	contig_10446_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_162454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGATTTTTATTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466626	466974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_466600_467000
693308	contig_10446_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_162455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	859	1176	468930	469247	NA	75	GTACAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIYCTCLKLVLTFFLHQGVYFLCIMVRLWICSLVVGCGRHSYSDLEDVLPSVGVEGEALLGQSIAGKLVERIARMEIVKVFKSPLPPLEFKYVELDCDIEFNFQ	468071	469910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_468100_469900
693312	SIRV4	-	219	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAATGTCCAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
693314	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693315	contig_4769_pilon	+	1983	2	Intergenic	novelGene_117979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	5	1387	437809	439191	TRUE	15	GCAGTTCTACTCTGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMAANEEVLALRAEVTQREEELSSLKQRLAAALLAEEESEPERLVPVSPLPPKAALSRDEILRYSRQLVLPELGVHGQLRLATASVLVVGCGGLGCPLAQYLAAAGVGRIGLVDYDVIEMSNLARQVLHDEALAGRAKALSAAASLRRLNSAVECVPYAQALTPATALDLVRRYDVVADCSDNVPTRYLVNDACVLAGRPLVSASALRFEGQITVYHYDGGPCYRCVFPQPPPAETVTNCADGGVLGVVTGVLGCLQALEVLKIAAGLGPSYSGSLLLFDALRGHFRCIQLRKRRPDCAVCGERPTVTDLQDYEAFCGSSATDKCRSLHLLSPKERVSVTDYKRLLDSGASHLLLDVRPQVEVDICRLPHALHIPLKHLEQRDAESLKLLGEAVRERKQGTQEGAALPVYVICKLGNDSQKAVKILQSLTAAQELDSVTVQDVMGGLMAWAAKIDETFPLY	437804	441956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_439692_441860
693317	contig_12802_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_114236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33816	31515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_31500_33800
693319	contig_8914_pilon	-	2369	2	Intergenic	novelGene_112881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	239	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	345871	344910	FALSE	40	ACAACTTCAAATGGTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRGAPLSRHLRFARERRGEKAAGEAWRRRRGEKGGERVTVVSPGAEENRPTLPRCLLGLGEGHLGDRYEPARLLSLSKGSKDSAPLTAFSCCPPAALGEDLERDFLWDAPAAATIQKGRG	345871	342906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_345161_345756
693324	contig_11115_pilon	+	2002	6	Intergenic	novelGene_102800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_3	99.9291749190395	211	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	27	710	154256	156185	TRUE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEQLPTSCAPQKSGPAGKGPVLASSSTSFLDLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFW	154229	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156507_157401_157513_157601
693327	scaffold_12124_pilon	-	1611	11	Intergenic	novelGene_21987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACGGCACAGACCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815343	791831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_791951_800002_800146_802988_803111_803837_803971_804058_804234_807297_807442_809810_809948_810645_810744_813527_813762_813912_813995_815119
693333	contig_14441_pilon	+	1284	7	Intergenic	novelGene_100603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	357.331623130236	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	670	1098	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111202	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111994_112040_112401_112665_113185_113209_116578_116963_117220_117344_117539
693334	contig_16029_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_163761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATCATGGCCCAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45761	46254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16029_pilon_+_45800_46300
693348	contig_9177_pilon	-	3093	8	Intergenic	novelGene_32637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	42.4389116789038	44	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	133	708	39805	38569	TRUE	35	GCTTAAAGTTCCCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISAWQSPILEDRSLPAWYKSALFNELYFLADGGTVWLEVPEDSLMEELEEGMRQLRPVLREYGRFGYLEGQEYRMYNTYDVHFYASFALVMLWPKLELSLQYDMALATLREDLTRRRYLMSGLIAPVKRRNVIPHDIGDPDDEPWLRVNAYVIHDTADWKDLNLKFVLQVYRDYCLTGDQGFLRDMWPVCLAVMESEMKFDKDNDGLIENGGYADQTYDGWVATGPRLGDRGYQA	40144	35995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_38001_38095_38212_38304_38704_38823_38976_39077_39186_39396_39502_39729_39903_40109
693351	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_18700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCTACGTCTACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
693352	contig_7202_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_18559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATCCACTTCAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
693358	contig_6710_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_96059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACAGAAGCACTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
693361	contig_16411_pilon	-	1842	2	Intergenic	novelGene_77347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCATATTTTCAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237954	234830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_235999_237280
693363	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693368	contig_10446_pilon	+	3431	1	Intergenic	novelGene_162498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939228	942659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_939200_942700
693370	contig_1009_pilon	-	2355	9	Intergenic	novelGene_121775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	82.0189574122958	2	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1139	1534	305255	301449	FALSE	50	TAACTAAGAGAAAGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356435	300627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_333727_333844_356347
693380	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693383	contig_7457_pilon	-	487	5	Intergenic	novelGene_31283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	35	445	160764	157884	FALSE	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161042	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
693384	contig_14711_pilon	+	1428	9	Intergenic	novelGene_68909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	350.343380663885	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	801	1049	89183	90138	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRGSRPHPGHCAGLHRRHCGSGAGPGPGLPYLSGNL	84072	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86182_88694_88864_89105_89326_90032_90194_90489
693385	contig_10159_pilon	+	2037	6	Intergenic	novelGene_30787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1078	1434	352738	353094	TRUE	20	CTTCCTTCCGATCTAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRDHHCGENKTGKCIKKGQKSLAPLHGVLGALWFWHGDLDHLLPIPIWHPVGFDLDVEAAVKGGEVCANAEVPVGMAILVCFHVVLHFQGLYHVQEPLPIVRGNSAQGGFFEILLR	317388	462008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_318144_318826_318997_352585_353442_431855_431939_456758_456901_461977
693392	contig_14208_pilon	-	3827	1	Intergenic	novelGene_129091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTTTCTTTGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184394	180567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_180600_184400
693393	contig_5643_pilon	+	1700	6	Intergenic	novelGene_39105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	925	junction_5	604.526790142505	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1105	1488	640361	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDCHPCPGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	637095	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_637901_638045_638201_640216_640538_640636_640729_641102_641244_641412
693395	SIRV4	+	203	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1113	0	-1113	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGAGCCACCGTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
693397	SIRV4	+	371	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	876	-69	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGAGTCAGGTTAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2331	2702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2700
693411	contig_16185_pilon	-	1530	8	Intergenic	novelGene_144754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	122.105842344639	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	216	953	127403	98932	FALSE	15	TATTGTGTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLVKVFRIPNKTSLRSLGGTNVCSELLT	134384	98354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_99013_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127364_127464_129327_129422_134323
693412	SIRV7	-	557	2	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	0	58715	0	-58715	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAAGTGGTAGAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	114752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_114961_147608
693423	SIRV6	+	284	4	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	4769	555	-1125	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7874	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7924_10724_10819_11031_11109_11205
693426	contig_1717_pilon	+	3043	4	Intergenic	novelGene_146122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	5.71547606649408	582	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	34	387	269120	274361	FALSE	20	CTTACAGGTTTTTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAARSTFGAGMAAVAAAGSGTPREEEGPGGEAAAPQPQAPTNAPGARLSRLPLARVKALVKADPDVTLAGQEAIFILARAAELFVETIAKDAYCCAQQGKRKTLQRRDLDNAIEAVDEFAFLEGTLD	269086	277017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_269333_269889_269975_270668_270711_274347
693438	SIRV4	+	220	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1542	641	1087	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2542	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
693440	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693441	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693442	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693443	contig_405_pilon	-	3054	12	Intergenic	novelGene_135313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	98	junction_1	34.2195149967321	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	59	1636	465423	450908	FALSE	50	TAAGATTGAAACTGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGDHCHRAQEYARSKLAECMPLPSLVVCPPTLTGHWVDEVGKFCSREYLNPLHYTGPPTERIRLQHQVKRHNLIVASYDVVRNDIDFFRNIKFNYCILDEGHVIKNGKTKLSKAVKQLTANYRIILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTERQFAARYGKPILASRDARSSSREQEAGVLAMDALHRQVLPFLLRRMKEDVLQDLPPKIIQDYYCTLSPLQVQLYEDFAKSRAKCDVDETVSSAALSEETEKPKLKATGHVFQALQYLRKLCNHPALVLTPQHPEFKSTTEKLAAQNSSLHDIQHAPKLSALKQLLLDCGLGNGSTSESGTESVVAQHRILIFCQLKSMLDIVEHDLLKPHLPSVTYLRLDGSIPPGQRHSIVSRFNNDPSIDVLLLTTHVGGLGLNLTGADTVVFVEHDWNPMRDLQAMDRAHRIGQKRVVNVYRLITRGTLEEKIMGLQKFKMNIANTVISQENSSLQSMGTDQLLDLFTLDKDGKAEKADTSTSAKASMKSILENLSDLWDQEQYDSEYSLENFMHSLK	465567	449489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_451052_452323_452495_453000_453161_454809_455022_456987_457141_458596_458723_460772_460904_460990_461133_463102_463233_463370_463449_465292_465461_465546
693447	SIRV4	+	315	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1456	632	1001	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2456	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
693449	contig_3948_pilon	-	797	3	Intergenic	novelGene_53323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	670.5	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	135	482	1473220	1468245	FALSE	40	CAAAGACTTCATCAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQRAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1473354	1467929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473207
693451	contig_15118_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_74558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	291	75	365	155346	155636	NA	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERKRRRGKERGETDRHREQGEERMKNRKERDRASERNREKEIEICKEKHKQRESQTEAVRDTQTLREREKDTEREKSEKIGETSREKEREAWKKKVRETKRQTLRGRLTRTHKEAGGNRQ	155271	155637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_155300_155600
693453	SIRV6	-	942	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8635	414	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCTGAAGGCGGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11182	1130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2025_2465_2615_2733_2828_3105_3164_10723_10825_11035
693454	contig_8122_pilon	+	1929	13	Intergenic	novelGene_40241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_12	997.54544243469	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	130	1083	720281	755589	TRUE	50	ATCATTTATAAACATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKQDPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGKMRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKSHAERIHVGVEATAPAKSHHM	720151	756789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_755522_755665_756018
693456	contig_10300_pilon	+	1186	3	Intergenic	novelGene_152921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0.5	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	18	404	56973	177331	FALSE	25	AGCCATTTTTAGGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKEAMQDAVLKAIEEERKNLEKAHAEERELWKTEHAKDQEKVSQEIQKAIQEQRKVSQETVKAAIIEEQKRSEKAVEEAVKRTRDELIEYVKEQKRLDQVIRQRSLSSLELFLSCAQKQLSALIATEPVDIE	56955	178113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_57135_112044_112159_177220
693463	contig_8597_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_158720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120245	117760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_117800_120200
693471	contig_1372_pilon	-	2312	6	Intergenic	novelGene_140505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	55	junction_3	80.0809590352164	285	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	245	1201	431763	401441	FALSE	30	CCCTGAAAGTATCTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGLWRVAGNQLQQEGYSEHGYLTREQSRRMAASNISNANPRKQVQGGIDIYHLLKTRKSKEREGFINLEMLPPELSFTILSYLNATDLCLASCVWQDLANDELLWQGLCKSTWGHCSIYNKNPPLGFSFRKLYMQLDEGSLTFNANPDEGVNYFMSKGILDDSPKEIAKFIFCTRTLNWKKLRIYLDERRDVLDDLVTLHNFRNQFLPNALREFFRHIHAPEERGEYLETLITKFSHRFCACNPDLMRELGLSPDAVYVLCYSLILLSIDLTSPHVKNKMSKREFIRNTRRAAQNISEDFVGHLYDNIYLIGHVAA	451429	400329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_401629_403090_403288_407184_407304_427654_427782_431437_431772_451193
693472	contig_5779_pilon	+	1716	2	Intergenic	novelGene_106501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1183	1533	208389	208782	FALSE	20	AGGTTGTCGCCTTTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRQTVIWGTGYLLEIEASGETKQHQTVLCNTLLSPWGSWPLTTTARAGPAYGGSVQCKHLFLYSWAKLGLEQMARRSWRPDSGLEPGPRAQQRLRLSDADCCSLTLNNKGTAFT	207206	208965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_208540_208582
693473	contig_7234_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_145947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGAGCACTAGGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458268	457836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_457800_458300
693479	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	128	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693486	contig_11631_pilon	+	1375	9	Intergenic	novelGene_104203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	465.025251330506	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	134	832	257411	268122	TRUE	20	GAAAATTTCCTTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQLLGNKLQMSCLF	257277	283589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257554_260336_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_268082_268169_273509_273622_281390_281540_283353
693487	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693491	contig_11883_pilon	+	2558	1	Intergenic	novelGene_163782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCTTCAGGCTGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125372	127930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_125400_127900
693492	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693493	contig_6102_pilon	-	2201	2	Intergenic	novelGene_32122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	0	4	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1270	1584	818108	817223	FALSE	10	TCAGATCTGTCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGKILSTEQNTEWQRN	819377	816605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_817472_818042
693494	contig_8660_pilon	+	956	5	Intergenic	novelGene_136491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAGAAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292195	315366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_292580_292941_292978_308477_308734_310291_310435_315229
693497	contig_12250_pilon	-	1109	10	Intergenic	novelGene_80707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_9	300.200961497379	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	41	418	401239	400074	TRUE	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVSTEGSRKGLSGRRGSEKPRASPTLLQPLTRVEVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEASWGELGRAS	401279	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401101
693501	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_97671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
693510	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693513	contig_3825_pilon	+	686	7	Intergenic	novelGene_77922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	823.312702170661	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	20	685	12232	15271	FALSE	45	GGACCAACTACAACGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAI	12212	15272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231
693523	contig_11512_pilon	+	337	2	Intergenic	novelGene_43243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	9	335	4011	4560	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	4002	4562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
693528	SIRV7	-	305	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	13	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114725	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56114_70893_70988_78841_78931_114684
693531	contig_12977_pilon	+	1481	14	Intergenic	novelGene_122777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	612.365169316247	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	192	1124	10887	57321	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMICRMG	10695	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54097_57306_57378_58495
693536	contig_18804_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_163797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	0	188	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTTGCTTCCAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43328	47151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_45248_46995
693543	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693544	contig_15888_pilon	-	1206	8	Intergenic	novelGene_84423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1651.77054047084	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	262	621	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCGGGGGWWRRGRRTDAAIWRRRCSLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259785	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251872_251996_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254240_259708
693545	contig_753_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_112985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCCATAGTCAGAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1203580	1203213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1203200_1203600
693555	contig_4364_pilon	+	1634	7	Intergenic	novelGene_178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	864.625111440405	44	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	87	701	1268714	1270037	TRUE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1267019	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1270045_1270150
693556	contig_3627_pilon	+	2181	10	Intergenic	novelGene_78541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	222.123144579813	8	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	15	683	642322	673867	TRUE	40	AAATGAGTTGTATTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLTMSFLGGFFGPICEIDVVLNDGETRKMAEMKTEDGKVEKHYLFYDGESVSGKVTLAFKQPGKRLEHQGIRIEFVGQIELFNDKSNTHEFVNLVKELALPGELTQSRSYDFEFMQVEKPYESYIGANVRLRYFLKVTIVRRLTDLVKEYDLIVHQLATYPDVNNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIQHMELQLIKKEITGIGIL	642307	677765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_660439_660516_661658_661816_667857_668023_670412_670520_673856_674029_676168_676228_676288_676762_676960
693559	contig_1301_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_47415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837284	837863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_837300_837900
693562	scaffold_19766_pilon	-	1437	3	Intergenic	novelGene_34369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	8.5	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	31	567	678336	677545	FALSE	5	CTGATTTGGGCCTTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQDLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHW	678366	676674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677670_677786_678138_678275
693564	contig_5063_pilon	+	869	5	Intergenic	novelGene_109983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	40	GTCACTCCAAATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
693566	contig_1982_pilon	+	1751	11	Intergenic	novelGene_151325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_9	19.4907670449369	337	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	90	1280	249995	269851	FALSE	45	AAGGAAAGAGTAATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLVLDNGAYNAKIGYSRENVSVIPNCQFRSKTARLKTFTANQIDEIKDPSGLFYILPFQKGYLVNWDVQRQVWDYLFGKEMYQVDFLDTNIIITEPYFNFTSIQESMNEILFEEYQFQAVLRVNAGALSAHRYFRDNPSELCCIIVDSGYSFTHIVPYCRSKKKKEAIIRINVGGKLLTNHLKEIISYRQLHVMDETHVINQVKEDVCYVSQDFYRDMDIAKLKGEENTVMIDYVLPDFSTIKKGFCKPREEMVLSGKYKSGEQILRLANERFAVPEILFNPSDIGIQEMGIPEAIVCSIQNLPEEMQPHFFKNIVLTGGNSLFPGYRDRVYSEVRCLTPTDYDVSVVLPENPITYSWEGGKLISENDDFEDMVVTREDYEENGHSICEEKFDI	249905	270322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_250063_252487_252606_253111_253181_254228_254353_255455_255592_255682_255740_259471_259571_259666_259746_265429_265602_267302_267442_269721
693572	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693577	contig_5848_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_163809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333200	332273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_-_332300_333200
693578	contig_14829_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_163816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAATTAAAAAATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90945	91361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_90900_91400
693581	contig_12201_pilon	-	399	2	Intergenic	novelGene_159983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCACTAACTCTCATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139108	134650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_134819_138877
693583	SIRV4	-	308	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCGTGAACGTCGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	2459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
693587	SIRV7	-	283	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91643	0	-91637	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGCACGAAGTAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
693590	contig_15327_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_70433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTGAATCAGAATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50890	51269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_50900_51300
693593	contig_7744_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_62445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTTAATAAGGGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38697	41371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_38700_41400
693594	contig_6742_pilon	+	2363	7	Intergenic	novelGene_144548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.2789666604026	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	658	1572	26826	47227	FALSE	30	AGTAGAGTCACTCCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEQWRHLDSTQKEYYWDLMLEAYGKMVSGDISSPKSDLANSAEHGQELARLHLDAGENIPMPTCTGDRQENDKEKVNLEHYRDQEPPNVSCDISGEAPSQAPVSGFFTGDEPRHFGEVAQGNLQVEGRGEQHSPQERSSGKQPGQHVLNPHPGDLSVLWLKEKPEAPPERSAETSHDPEAPYLHRVWENLLQEFSACVSPENSHWREVFSVPHLQKKPFCGVQTL	18173	48018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_18199_25618_26125_26699_26974_27402_27495_41061_41147_41800_41909_46745
693596	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693604	contig_15326_pilon	-	1669	13	Intergenic	novelGene_157696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	241.888906433419	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	4	510	158391	82020	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAASSQGNFEGNFESLDLAEFAKKQPWWRKLFGQESGPSAEKYSVATQLLIGGVTGWCTGFIFQKVGKLAATAVGGGFFLLQLANHTGYIKVDWQRVEKDMKKAKEQLKIRKSNQIPTEVKSKAEEVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEVG	158394	14318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_14835_15801_15972_19883_19928_20501_20634_41216_41292_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83621_83742_113977_114110_122931_123008_149766_149918_158372
693607	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7480	2	-87	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCACTTTGGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
693615	contig_11572_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_100062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAAAGAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266530	268848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_266500_268800
693629	contig_18096_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_58057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78686	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_78700_79100
693631	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693637	contig_177_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_41852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	166	396	419983	419753	NA	30	AAGCAACTAATGGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNNRNLLSHSSGGWESKIRVSAVLTPSETLRENLFHVSVLASGSSRCFFAPSCSVMWHPSLCLSVCVYLLLFYKYTSHIRLGPTLHQYDLMLTKLITFSKNLFPNMLTFSDTRVRTSTYLFGGHNSIYNNI	420148	419100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_419100_420100
693641	SIRV6	+	503	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10242	81	1005	55	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11242	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11700
693644	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
693647	contig_10253_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_76873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71107	70843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_-_70800_71100
693653	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693656	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693660	contig_2215_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_163855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAACACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201171	202420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_201200_202400
693665	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91668	4	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
693675	contig_12427_pilon	+	2398	18	Intergenic	novelGene_40405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_13	34.621032869558	97	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	150	1304	21783	56462	TRUE	40	AGTATAAGACGTCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQTLLGCYIYVDSRKIDQEGEIPKETLEKLKSLGLFGMQVPEEYGGLGLSNTMYARLGEIIALDTSITVTLAAHQSIGLKGIIIAGNEEQKTKYLPRLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRTRATLSEDKKHYILNGSKIWITNGGLADIFTVFAKTQIVDSNNLIKDKITAFIVERNFGGVTNGKPEDKLGVRGSNTCEVHFENTKVPVENVLGEVGGGFKVAMNILNSGRFSMGSSVAGMLKKLIEMTAEYACTRKQFNKNLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMAYLTAGLLDRPGLPDCSVEAAIVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYMRDYPYERLLRDARILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRVLTSRIK	6190	60521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_6284_21726_21820_33630_33733_36185_36293_37394_37496_39300_39380_43868_44044_46431_46506_48983_49060_50697_50769_51046_51167_52617_52747_55689_55770_56458_56703_56999_57078_57996_58126_58843_58917_59947
693677	contig_2703_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_101742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAGAGGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526997	527522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_527000_527500
693692	contig_3529_pilon	-	1619	8	Intergenic	novelGene_105351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	493.457315731543	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	730	1131	541814	529100	TRUE	60	ATTTAAAAAAATTATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	570011	525680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544883_550520_550582_569430
693698	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
693702	SIRV6	+	1022	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	348	0	175	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3508	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	149	640	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1478	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
693704	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
693707	contig_12765_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_106562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCCTTGCAGAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133295	135830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_133300_135800
693710	contig_7870_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_108932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGACAAATATTTACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282089	284048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_282100_284000
693717	contig_1090_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_131139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483558	481451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_481500_483600
693718	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693719	contig_15304_pilon	-	953	4	Intergenic	novelGene_30537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1490.4765084436	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	198	857	54100	52983	FALSE	20	CAGAAGCAGCCCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPPGLHREDHRPLGR	54297	52886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53025_53131_53320_53491_53813_53991
693721	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
693725	contig_16541_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_126763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAACAACCCAGACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472216	474951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_472200_475000
693727	contig_1274_pilon	-	3402	1	Intergenic	novelGene_137798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	635	1908	105	2012	423124	421217	NA	45	AATACATAGTTAACCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGEIKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVQSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNAVESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVISWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLYQGGPGGGGSGASGGPTIEEVD	423228	419826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_419800_423200
693728	contig_7202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_16425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
693729	contig_6589_pilon	+	2070	17	Intergenic	novelGene_25738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	68.5963908944924	2	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	780	1700	475017	507033	TRUE	30	GGAGTCTACCATCTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTFSNELPSLCKICLCFLRCHLCSPVTCRHGFQTIQGSSTLSCLHPPFTVTTPPKRVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457290	509765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_460733_460874_463619_463770_464582_464635_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_477749_477883_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
693733	contig_6726_pilon	+	1375	12	Intergenic	novelGene_86231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	668.875360537286	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	174	1232	297568	333034	FALSE	15	TCTTATTGTGAATTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287826	333177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
693735	contig_7820_pilon	+	1972	5	Intergenic	novelGene_159914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	124.544168871931	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	177	1076	24543	28800	FALSE	40	ATACTGTAATATCACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVLSAADYYFFTPYAYPATWPEDDIFRQAISLLIVTNVGAYILYFVFASLSYYFVFDHSLMKHPQFLKNQVYREIKCTVQSLPWISIPTVALFLVEVRGYSKLYDDIGEFPYGWIQLIFSIISFLFFTDMLIYWIHRSLHHRLVYKHIHKPHHIWKITTPFASHAFHPVDGFLQSLPYHIYPFLFPLHKVVYLTLYIMVNIWSISIHDGDFHVPKILRPFINGSAHHTDHHLFFDYNYGQYFTLWDRIGGSFKNPSSFEGEGPLSYVKKMTEEKCNSHVGNGCKNEKLFNGECTKIE	13009	29696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_+_13178_24534_24753_25526_25660_27726_27828_28344
693736	contig_5643_pilon	-	1638	9	Intergenic	novelGene_38929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	101.286721735872	486	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	320	1063	416375	412705	TRUE	25	AACTAAGTAGGGTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRFMRDVEPEDPMFLMDPFAIHRQHMSRMLSGGFGYSPFLSITDGNMPGTRPASRRMQAGAVSPFGMLGMSGGFMDMFGMMNDMIGNMEHMTAGGNCQTFSSSTVISYSNTGDGAPKVYQETSEMRSAPGGIRETRRTVRDSDSGLEQMSIGHHIRDRAHILQRSRNHRTGDQEERQDYINLDESEAAAFDDEWRRETSRFRQQRPLEFRRHEASGGGGRRAEGPPRLAIQGPEDSPSRQSRRYDW	417181	411867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_412418_412679_412893_413501_413662_413835_413965_414363_414418_415036_415073_415925_416053_416325_416496_416982
693737	contig_18538_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_163889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGCATTGTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14886	12487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_-_12500_14900
693738	contig_14546_pilon	+	2487	11	Intergenic	novelGene_157433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	204.979901453777	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	1776	2486	526551	533753	FALSE	25	TCCGTCTGAATGTGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVLKFSCESNDLEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKSEPVLEETAPEDGQKSSSPAPADIAQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQRDQRVREQRINIPPQRGSRPIREAGEQGDVEPRRIVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKDFFQNYGNVVELRINSGGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRVSPIMFRGE	498478	533754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_498559_514548_514662_517685_517768_518157_518332_523716_523808_525315_526782_528373_528476_528722_528835_529060_529190_529581_529698_533732
693742	contig_5125_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_43451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTATCTTATTACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51643	52476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_51600_52500
693747	contig_12427_pilon	-	2100	5	Intergenic	novelGene_40556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1316.77294929688	2	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	454	870	510486	505932	FALSE	50	GATGCCAATAAAATTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSRPVPGILKTFPLLCWETRLTSKTDKWPQSEHRPGATAKIIFPTSRPVPRRPLTWSRRSRRLHGMHLNRKQRWSCTMNSPNPSSWTRMTGPRPRRKAAVAEGAVRVEHRVLHKPRTHLGLQTQAPLASSKQNIN	578133	504701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510641_522219_522346_577960
693749	contig_8491_pilon	+	1791	7	Intergenic	novelGene_154217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.100621499442	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	346	906	288066	294819	FALSE	35	TTATTCTGGAAAGACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDADSDVALDILITNVVCVFRTRCHLNLRKIALEGANVIYKRDVGKVLMKLRKPRITATIWSSGKIICTGATSEEEAKFGARRLARSLQKLGFQVIFTDFKVVNVLAVCNMPFEIRLPEFTKNNRPHASYEPELHPAVCYRIKSLRATLQIFSTGSITVTGPNVKAVATAVEQIYPFVFESRKEIL	264326	295704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_264617_288010_288201_290189_290273_290436_290501_291970_292075_292172_292268_294739
693757	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
693758	contig_3584_pilon	+	1122	4	Intergenic	novelGene_108189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1094.12989275598	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	283	969	530695	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	528427	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_528481_528774_528877_529647_529683_530602
693767	contig_10734_pilon	-	1667	4	Intergenic	novelGene_51026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	93	698	320632	311551	FALSE	35	TGAATTTTGTTTTATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320724	310581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
693771	contig_6805_pilon	-	2608	11	Intergenic	novelGene_163892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_7	35.7211421989835	125	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	774	1910	440075	421495	FALSE	30	AATCATTTGCAGTTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTSLQVGQMIVSLPESCLLTTDTVIRSYLGTYVTKWKPPPSPLLALCSFLVSEKHAGDQSPWKPYLETLPKTYTCPVCLEPKVVNLLPRPLRAKAQEQRAHVQEFFTSSRDFFSSLQPLFSEAVESIFTYSAFLWAWCTVNTRAVYLRHRQLGCFSAEPDTCALAPYLDLLNHSPGVQVKAAFNEETRCYEIIAASSCRKHEEVFICYGPHDNHRLLLEYGFVSTRNPHACVYVSRDVLVKYLPSTDKQMNKKIAILKDHGFIENLTFGWDGPSWRLLTALKLLCLEAGEFTCWKKVLLGEIISDTNEKTSLDITRKICCYFIEESNAMLQKVSHMKDKEVALVNQLTLVETLWTEELKILQASAAILSNLQTTFT	448236	420796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_421630_421958_422083_425011_425093_425979_426062_432822_432998_434586_435017_436785_436875_440054_440093_442511_442599_446227_446383_447722
693786	contig_5643_pilon	+	1084	11	Intergenic	novelGene_38810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2938.09826928917	10	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	143	1084	236108	238195	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPAGCGLTLLTNLRFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTNSTRGRERPSQLLGSPCPNSIQHTENLPSSTQLPSVPPEEGVRGLESPTLSCTINKVYCTQP	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233629_235986_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237762_238008
693787	contig_3601_pilon	-	1934	2	Intergenic	novelGene_132889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1420	1920	180664	180164	FALSE	35	AATGAACAGATGTGTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTLIPSRSSIRERQSSIPVLCRRCSGVLSVSCYLRVSPGSSWLTGPPGAGLALWDHASCRSHLPAPGFPASWPPVSSVTETCALCGHLPPSLPPSTLGRPSCLNSDLPVPTSSPSTLFLSDRVYLFAHCWASPQEHKPQEGRGFIWFSAVSAYQKHSPSMVGFQ	188352	180149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_181368_187636
693788	contig_17936_pilon	-	1276	4	Intergenic	novelGene_29991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_2	26.59991645768	985	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	134	1030	272759	270267	FALSE	20	CTGAAATGCAGTTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDAALSFAKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQITAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGVLSFWRGNLVNVIRYFPTQALNFAFKDKYKEIFLGGVDKRTQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKAAAEREFRGLGDCLLKIYKSDGIKGLYQGFNVSVQGIIIYRATYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIFISWLIAQTVTSVAGLTSYPFDTVRRRMMMQSGRKGTDIMYTGTIDCWRKIARDEGGRAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKFT	272892	270020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_270425_270820_270962_271185_271673_272648
693789	contig_2733_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_128551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGTGAGCGTTACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544534	544987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_544500_545000
693798	contig_5031_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_133172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTGATTCTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22058	20306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_20300_22100
693799	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693802	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
693806	contig_1406_pilon	-	2877	3	Intergenic	novelGene_25447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	156	1274	586902	585784	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALEELDVSSNRLRGLPEDISALRALKILWLSGAELGFLPSSFCELASLESLMLDNNGLQALPAQFSCLQRLKMLNLSSNLFEEFPAALLPLAGLEELYLSRNQLTSVPSLISGLGRLLTLWLDNNRIRYLPDSIVELTGLEELVLQGNQIAVLPDNFGQLSRVGLWKIKDNPLIQPPYEVCMKGIPYIAAYQKELAHSQPAVQPRLKLLLMGHKAAGKTLLRHCLTEDRVEGNQGGGDKEKSSPPSPPPVSKGIEVTSWPADASRGLRFIVYDLAGDESYEVIQPFFLSPGALYVLVVNLATYEPCRFPTAVGSFLHRVGARVPHAVVCIVGTHADLCGEWELEEKCLDIHRQIALQEKHDAEGLSHLAQVVDEALARDFELRSASPHAAYYGVSDKNLRRRKAHFQYLLHHRLQILSPRAAC	587057	484186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484609_498707_498774_584668
693809	contig_3077_pilon	-	1668	6	Intergenic	novelGene_26898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	79.411837908463	453	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	287	856	1558953	1544006	FALSE	15	TTTCAAGTCCCCTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRSRLGLDGASEPPGSPGHSRRCAGPWRIVDDCGGAFTMGTIGGGIFQAIKGFRNSPVGVNHRLRGSLTAIKTRAPQLGGSFAVWGGLFSMIDCSMVQVRGKEDPWNSITSGALTGAILAARNGPVAMVGSAAMGGILLALIEGAGILLTRFASAQFPNGPQFAEDPSQLPSTQLPPSPFGDYRQYQ	1559239	1543193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1544092_1547626_1547738_1548638_1548768_1552947_1553012_1553147_1553248_1558873
693824	contig_10734_pilon	+	2212	17	Intergenic	novelGene_51423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	82.0510273777849	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	521	2209	2122602	2156004	FALSE	10	GGGTGACGCGGGCTGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLSEEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2116935	2156007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120924_2121028_2122421_2122615_2123924_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
693826	contig_12270_pilon	-	222	2	Intergenic	novelGene_114140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCGGGCATCTGGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14412	13967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
693827	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693829	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_93539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653775	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693832	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	85	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693835	contig_8914_pilon	-	1421	5	Intergenic	novelGene_112873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_4	2214.2975607402	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	626	1384	267637	264566	FALSE	5	TTTGTGATGCTGTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVTIFKALNNFSIIFMHENYFCRLDFFMVLNVNKTIGSCFVEIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268965	264528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_268180_268882
693838	contig_343_pilon	+	447	2	Intergenic	novelGene_163908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	0	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	128	445	348681	349742	FALSE	20	GTATGGGCCTGCTTAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNELPFHRPRTHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGPEEFEADGLSDKSSHSGQGAVNCESAPQGNSELEDVENKARKVKKPKEKEKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKRKGFGAML	348553	349744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_+_348763_349506
693841	SIRV5	+	423	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7466	2	-73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
693842	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
693843	SIRV6	+	701	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	238	222	-103	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTAGTAAATTTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
693844	SIRV6	+	238	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10587	1	1350	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11587	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
693849	contig_13982_pilon	+	2533	12	Intergenic	novelGene_163487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382876	548133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_383344_388758_389607_413476_413600_414278_414441_428842_428981_434214_434368_436806_436878_459707_459849_463745_463909_477515_477580_483748_483831_548012
693855	contig_6233_pilon	-	1475	10	Intergenic	novelGene_74805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	301.756258437456	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	227	1114	149777	143464	TRUE	30	CAACCTGCTCTGAGATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250269	141558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
693857	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693866	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693871	contig_2100_pilon	-	1146	9	Intergenic	novelGene_50669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.544656871545	3	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	78	899	1182812	1170166	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISP	1185488	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170170_1174251_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
693874	contig_2596_pilon	+	1550	3	Intergenic	novelGene_53433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	179	1738	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATGTGGTTCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9082	11484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_10454_10666
693875	contig_19899_pilon	+	1532	4	Intergenic	novelGene_102507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	24.7969532178631	544	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	453	1058	134511	135116	FALSE	10	TGCGTTGTTCTTTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFVILGNKVDISERQVSAEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAARRVLATEDRSDHLIHTDTVNLHRKPKPSSSCC	115525	135590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_115674_130681_130771_131207_131390_134477
693882	SIRV1	-	218	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3882	4	3608	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6758	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
693883	SIRV7	-	282	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91642	2	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
693884	contig_17623_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_163910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15087	17002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17623_pilon_+_15100_17000
693885	contig_15629_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_122470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAACTTTACTAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162639	160521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_160500_162600
693888	contig_5415_pilon	+	1985	6	Intergenic	novelGene_146134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_2	51.2460730202813	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	1236	1985	142755	146474	FALSE	25	TGCTGATTTGTGATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCCFGCMSVLANYFVFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSHFARVLEEEENKPNPVTQRVKMIMSLGLVLVHAHSRWIADPSPQNSTAENSKVSLELDENVSKRIEPNVSLWQFYLSKMVSMDIEQVITLSLALLLAVKYIFFEQAETESTLSLKNPITSPVVNQKKVPDNCCRRESPLVRNNQKFHATGEEAGINRERKGDFFFYALHSPFLQ	140562	146474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_141768_142724_142831_145035_145143_145266_145384_145901_146063_146185
693890	contig_7272_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_25320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	346	660	497074	497388	NA	50	AAAGATGAACATCTCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTNKLIFSKSSRLEVQIQGVSSRGGLSLSALEEGPCHRSSPGLGDSLHRNPGSEGCALLPALLSWWYEVPLSLCSLLSFISRKRWAQDTIRSCRSSLALLTS	496728	498475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_496700_498500
693891	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
693893	contig_7744_pilon	-	1562	14	Intergenic	novelGene_62506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	283.248777265649	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	567	1520	822865	820619	FALSE	15	GCAACTTTGCTGCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	825066	820576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822957_823128_823221_823417_823501_823760_823795_823921_823968_824167_824304_824625_824670_825026
693897	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
693898	contig_11427_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_78973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	345	1038	906	1943	93223	94260	NA	15	CATTGTTTCGTGTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92317	94311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92300_94300
693902	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
693903	contig_20157_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_145868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAACGCCATCTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52869	53888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_52900_53900
693904	contig_12019_pilon	+	1135	4	Intergenic	novelGene_87787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1243	junction_2	836.740634180562	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	711	1112	765864	767304	FALSE	10	GTTACTGTCACCTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764791	767327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_764823_765184_765922_766639_766813_767133
693920	contig_5145_pilon	+	1406	4	Intergenic	novelGene_131374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.2449811847516	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	264	701	553862	554299	FALSE	15	CCTTTTGCTTATACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLRSSVPDYFKNVFGTFRQPAQKVQVCGGWNNVLQDASGFPAMPFLSFRFVSKILSLRPLNWNAVHLRSVRSCDKITSLVDEKNILDCFIALESLFQQAFTRYLFLDIFLFLFNNHLFVYNCTGVFVIFTWGSEQIAWHVSVT	543993	555004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_544058_544683_544740_550233_550325_553809
693928	contig_5643_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_39156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAGATATTGTTGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676096	675500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_675500_676100
693931	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4556	34	3381	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
693935	SIRV7	-	341	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	10	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
693936	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	294	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
693937	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693942	contig_9233_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_78268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCCAAACTCGTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806399	804705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_804700_806400
693950	contig_13592_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_33751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGACCCTAATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360134	361669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_360100_361700
693956	contig_5935_pilon	-	2951	8	Intergenic	novelGene_102709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	29.0994073857885	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	204	1466	1049311	1031054	TRUE	15	TAATACTGTGTGTTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVAAHSCHLLQQLHEQRIQGLLCDCMLVVKGVCFKAHKNVLAAFSQYFRSLFQNSSGQKNDVFHLDIKNVSGIGQILDFMYTSHLDLNQDNIQVMLDIAHCLQVQNVLNLCHTFLKSTTLDQPPGIPCNSTFSPQSALTPDANCVINENYPPQLLQECSPDAQHNKVADEPHSSAAPSVNLHNSSGEIPKQAPDTLDSSCTELPFKQPNYYYKLRNFYSKQYYKQATCPNHERIIEQPFAFSTSTDLNAVENPPCAVSHPECILESSEHLPSNFLAQPLSESAPDPESDCTCPQPAKQMRLKKAIHLKKLNFLKSQKSAEQTSEPKSNDDVTKRIGSTSENLIEKASSQSTEEKESEELASSENFSCMNETERLEDPAVLEDQSQALQSQRQYACELCGKPFKHPSNLELHKRSHTGR	1057393	1020612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1045190_1046294_1049159_1049331_1056780_1056941_1057369
693957	contig_21007_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_161509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256	900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
693960	contig_14643_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_99132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74181	74501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_74200_74500
693961	contig_9668_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_58131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGCCATCCTCACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280019	279067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_279100_280000
693966	contig_18869_pilon	-	181	1	Intergenic	novelGene_56013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73529	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
693967	contig_11978_pilon	-	2131	13	Intergenic	novelGene_62885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	108.694621915407	242	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	468	1844	727394	721097	FALSE	15	TTGGCCATTACTTATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENEEIAQLLSGSYIHYFHCLRIVDLLKGTEASTKNIFGRYSSQRMKDWQEIVALYEKDNTYLVELSSLLVRNVNYEIPSLKKQIAKCQQLQQEYNRKEEEGQAGAAEMREQFYHSCKQYGITGDNVRRELLALVKDLPSQLADIGAAAQSLGEAIDLYQACVGFVCESPTEQVLPMLRYVQKQGNSTVYRWRTGTEPSVVERPHLEAPPEQVEEDAIDWGDFGAEAASEGIDYGISAQAAGIDWGISLDSDSKEAGSDGIDWGDDAAVSQITVLEAGTQAPEGVARGPDALTLLEYPETRNQFIDELMELEIFLSQRAVEMSEEADILSVSQFQLAPATLQGQTKGKMVTMVSMLQDLIGQLTSLRMQHLFMILASPRYVDRVTELLQQKLKQSQLLALKKELMVQKQQEALQEQAALEPKLDLLLEKTRELQKLIEADISKRYNGRPVNLMGTSL	729746	720809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_721163_721268_721441_721813_722020_723327_723417_724025_724105_724509_724621_725025_725171_725394_725532_725771_725951_726577_726627_726994_727096_727351_727484_729368
693971	scaffold_13609_pilon	-	2686	1	Intergenic	novelGene_124414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACGCCTGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637080	634394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_634400_637100
693978	contig_8020_pilon	+	2274	18	Intergenic	novelGene_114462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	39.9168686319967	1	35	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	121	2253	387453	431592	FALSE	20	GTGGCTCAAGGGCACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFCGRANPTTGSVEWLEEDEHYDYHQEIARSSYADMLHDKDRNVKYYQGIRAAVSRVKERGQKALVLDIGTGTGLLSMMAVTAGADFCYAIEVFKPMADAAVKIVEKNGFSDKIKIINKHSTEVTVGPDGDMPCRANILVTELFDTELIGEGALPSYEHAHRHLVQENCEAVPHRATVYAQLVESRRMWSWNKLFPIHVQTSLGEQVIVPPLELERCPGAPSVYDIQLNQVSPADFTVLSDVLPMFSVDFSKQVSSSAACHSRQFEPLVSGRAQVVLSWWDIEMDPEGKIKCTMAPFWAHSDPEGLQWRDHWMQCVYFLSQEEPVIQGSALCLVAHHDDYCVWYSLWRTRSRSSPVCLFISWPSPEKNGGDLHQVRPVCDCQAHLLWNRPRFGELNDQDRTDQYVQALGTVLKPDSICLCVSDGSLLPMLAWHLGAKQVFTVECSAASHRLMKKIFKANHLEEKINIIEKRSELLTPADLGGKKVSLLLGEPFFTTSLLPWHNLYFWYVRTAVDQHLVPSAIVMPQAASLHAMVVEFRDLWRIRSPCGDCEGFDVHIMDDMVKRALDFRESREAEPHPLWEYPCRSLSEPQRILTFDFRQLVPQQPVRAEGAIELRRPGRSHGAVLWMDYHLTPDSTVSTGLLRPAGDKGDCCWNPHCKQAVYFFSTSLDPRVPLSSPQSVTYTVEFRPHTGDITMDFRLSDDLGSVH	382291	431613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396_388434_401951_402102_403939_404049_406635_406749_413007_413250_413715_413897_416561_416690_417035_417217_423111_423196_423586_423635_424287_424378_427026_427189_428340_428416_430050_430212_431062_431160_431412
693987	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_89619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
693988	contig_14553_pilon	+	1103	4	Intergenic	novelGene_124986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	130.199846390078	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	180	1103	5787	14424	FALSE	10	TGAGTACCCCCCTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	2462	14424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_2601_5745_5835_6138_6387_13796
693991	contig_14441_pilon	+	797	4	Intergenic	novelGene_100667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	183	611	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112120	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
693994	contig_14209_pilon	+	1485	13	Intergenic	novelGene_88326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	181.90244638267	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	55	873	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRSPPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32311	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40490_40884
693996	SIRV5	+	410	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	886	23	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
693997	contig_13224_pilon	+	1986	9	Intergenic	novelGene_104136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_6	75.2209246154287	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	223	1350	405072	413151	FALSE	15	TGGAAATTCCGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVVKTNTNTEKTDEEEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPTNRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFSESLECPLPGAFSRPGGGEKRGVFL	403570	413787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_403626_404568_404705_405040_405134_408438_408542_409052_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882
694000	SIRV5	-	272	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8577_10842
694002	contig_17427_pilon	+	2210	12	Intergenic	novelGene_30405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	139.142058331384	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	731	1711	356572	367940	FALSE	35	ATTAGCAGCAGTTATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPSVPPVYGLEVSDVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGRKPAATPIKMPCNETENKRSYHVCDLCDRIIIGDREWAAHTKSKSHLYQLKKRRRLDSDAVTTLGSQSISPERDKELKEKGSSGRNDQELKSSI	331924	368439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351803_352477_352700_355635_355829_356562_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365288_367770
694003	contig_3004_pilon	+	1665	13	Intergenic	novelGene_127493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	207.945038144431	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGCTCGAAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277844	287267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_277919_278875_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_284415_285297_285349_285713_285751_286379_286451_286738_286875_287113
694004	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
694015	contig_6677_pilon	-	2533	1	Intergenic	novelGene_114200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCTCAAACATTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583578	581045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_581000_583600
694022	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_91996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	38	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694024	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
694027	contig_7182_pilon	-	2131	2	Intergenic	novelGene_117157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2351	junction_1	0	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	14	313	889318	888811	FALSE	55	CTCCTTTTAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPP	889331	886992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888961_889168
694028	contig_18342_pilon	+	1151	8	Intergenic	novelGene_154562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	176.810633164411	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	141	962	36952	63358	FALSE	35	TTTAATGAGTCAACAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMKASIRSAWNLKHQVSSYLGICTFSPQVYETIFCAQSKNQHSGRHRKGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASGIVFIMPSNAYVAETAPTATLSGDSLPPTEQ	26185	63547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_58551_58690_60655_60758_63265
694029	contig_8122_pilon	+	1389	7	Intergenic	novelGene_40251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1052.16660066529	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	83	721	727090	748168	FALSE	30	TTTCAAAGAGTAATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLWLTENGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	727007	748836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_727113_737511_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
694031	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694033	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_94787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694039	contig_11978_pilon	+	2139	2	Intergenic	novelGene_63003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACCACTAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527943	1530307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1528814_1529038
694040	contig_9548_pilon	-	1877	10	Intergenic	novelGene_141065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.0270385642416	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	167	1252	149554	142966	TRUE	55	GTAATAAAACCGAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLPRDLLTGEQFIQLRRELASVNGHSGDDGPPGDDLPSGVEDITDPAKLITEIENMRHRIIEIHQEMFNYNEHEVSKRWTFEEGIKRPYFHVKPLEKAQLKNWKEYLEFEIENGTHERVVVLFERCVISCALYEEFWIKYAKYMENHSTEGVRHVFSRACTIHLPKKPMVHMLWAAFEEQQGNINEARNILRTFEECVLGLAMVRLRRVSLERRHGNMEEAEHLLQDAIKNAKSNNESSFYAIKLARHLFKIQKNLPKSRKVLLEAIERDKENTKLYLNLLEMEYSGDLKQNEENILNCFDKAIHGSLPIKMRITFSQRKVEFLEDFGSDVNKLLNAYDEHQTLLKEQDSLKRKAENGSEEPEEKKAHTEDTTSSSTQMIDGDLQANQAAYNYSAWYQYNYQNPWNYGQYYPPPPT	150200	142297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_142670_142712_143023_143282_143404_143639_143715_146521_146707_147553_147823_148184_148312_148621_148787_149467_149576_150055
694045	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694046	contig_10734_pilon	+	2776	1	Intergenic	novelGene_51272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAATAAAAAATAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330359	1333135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1330400_1333100
694047	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694050	contig_8461_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_163941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545041	543396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_543400_545000
694051	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694054	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694056	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694057	contig_15371_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_151480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAAATGCTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229132	231327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_229100_231300
694058	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
694059	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694062	contig_6589_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_26055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	873.065416920303	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	60	701	1726977	1731484	FALSE	35	CCCAAAGATAAATTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLSLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1726029	1731717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1726040_1726927_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
694064	contig_6277_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_80386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1164	1496	41715	41383	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIPPRKLLLTDWLLTADLIMEKITLDQISSRKSLHHYITTKLHPNYRESWPSQSDTQPYLTITHTHTRTHSGRTGWQEDEEETDVPFLPSIIISLNEHISMHYQKSSS	42878	40749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_40700_42900
694065	contig_13272_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_163943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4352	2295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_-_2300_4400
694066	contig_5480_pilon	+	1480	10	Intergenic	novelGene_107216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	151.929077020972	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	68	1222	79527	103586	FALSE	25	TACTTGTGAAGAATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSGKPGETQVISYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKYDGYTSCPLVTGYNRVILAEFDYNGQPLETFPFDQSKERLSMYLMKADFMPFLYWNMMLRGYWGGPAFLRKLFHLGMS	53836	103844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_53887_79509_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89900_92438_92469_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
694069	contig_5896_pilon	+	1929	6	Intergenic	novelGene_159239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	32.0037497802992	183	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	148	1533	113263	118599	FALSE	20	TCAAGTCTGAGTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAHRLIRPQTLLTKEVVTFEDVAVYFTRTEWAGLSPTQRALYRHVMLENYGNLTFLGYPVPEPSLISLLEGGDLPWGLETQDDPPAERTKDICKDAETSIPSESTSTQRISGERDMISCGLQKNVLQGTDFPETCELEKHQKIPTLENIGGKVERVHYARKPFRCEECGKCFSYFSYYVRHQRVHTGEKPFECNECGKAFNGNSSLMRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNSFTSSSEFIIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLIRHQKIHTGEKPYECNECGKSFRRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFECVDCRKAFSAKEQLKRHFRIHIQESSYVCDECGKDFTSKRNLLQHQKIHTGEKPYEYSKYEKTFRTSSQLGRHEHVQPGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW	111040	118995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_111099_111309_111374_113237_113308_114893_115021_115561_115676_117499
694070	contig_20460_pilon	+	1824	2	Intergenic	novelGene_163950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	1131	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	11075	16690	FALSE	20	TCATGTTGTCTTTTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKRRRNGNKEDNHHSPVSKRSKRNLGFQDSPDAESSSSDNERSSSSINIPERASRPESSLNQSGAELNPNIPQSFYEEAALCQGPYFHINQILKEAHFHSLRQRGQSSPTR	11072	18173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20460_pilon_+_11180_16456
694072	contig_8330_pilon	-	2197	6	Intergenic	novelGene_71943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	97.1711891457545	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	907	1602	1366408	1359303	FALSE	35	TGGTCATATTCTATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEKDSRIRFGFLTVTNLSVENMNHYKKTVLEIHNAEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASLIDFLRVVRNQQRLAVSSMGARSKAQSPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEREGMVPSSHNLLAVEGQ	1368481	1358707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1359518_1360338_1360547_1361015_1361167_1362354_1362434_1366365_1366992_1368158
694079	contig_14443_pilon	-	1051	3	Intergenic	novelGene_126670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1757	junction_2	49	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGCAGTGTGGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39253	29095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_37689_37863_38988
694087	contig_2768_pilon	-	2394	6	Intergenic	novelGene_57489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1673	1996	678775	672741	TRUE	15	GGAGTGACGTTCTTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVYSYFCFSFLWKMAGRMERTAKIIRKNTEYQETASPAVVSWYSVVPALIAIKEGGATPKSANKKNFQWHIYHRRSNINKPIRQKWCYSQKYNVVNEMISVTFNLL	680447	664612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_664689_668729_668859_671911_671998_672633_672748_677122_677260_678595
694093	contig_9363_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_6787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCTTGGAATTCCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540759	1541260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1540800_1541300
694096	contig_7202_pilon	-	431	2	Intergenic	novelGene_18587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	28	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATCGTCCTTCATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	28510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
694103	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671657	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
694105	contig_14814_pilon	+	2168	10	Intergenic	novelGene_137749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCCGCTGGGCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399059	419074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_399167_401483_401596_402160_402251_404264_404447_405639_406945_407717_407782_408365_408451_409637_409704_411519_411596_418993
694111	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_16390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
694115	contig_17440_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_7669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACAAACATAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3614	3997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
694117	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
694133	contig_14441_pilon	+	718	4	Intergenic	novelGene_100427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	189.033212837204	8	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	210	716	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGLQATLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	81883	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81901_111996_112040_116578_116963_117523
694134	contig_11082_pilon	+	2009	6	Intergenic	novelGene_142056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	56.0728098101031	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGTGCGCAGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137133	144318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_+_137180_138136_138265_140169_140241_141681_141781_142596_143202_143258
694136	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
694139	contig_11028_pilon	+	2677	7	Intergenic	novelGene_163960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	109.456231739754	74	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	593	1213	864128	921548	FALSE	20	TCCCAATTGCCTCTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISQHQFYLDRKQSKSKIHAARSLSEIAIDLTETGTLKTSKLANMGSKGKIISGSSGSLLSSGSQESDSSQSAKKDMLAALKSRQEALEETLRQRLEELKKLCLREAELTGKLPVEYPLDPGEEPPIVRRRIGTAFKLDEQKILPKGEEAELERLEREFAIQSQITEAARRLASDPNVSKKLKLALAFKKKKKNFVFFNVCVIQE	858107	923012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_858609_864036_864176_870587_870730_887714_887849_891949_892073_896438_896536_921471
694145	contig_18251_pilon	-	2285	8	Intergenic	novelGene_50156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1861	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATATATGCACGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56245	35628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_35797_37146_37240_44810_44912_48248_48335_48575_48792_50694_50878_53918_54027_54915
694146	contig_15327_pilon	-	1622	8	Intergenic	novelGene_70736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	309.010137869492	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	5	358	967479	962843	TRUE	35	CCCCCGATGCACTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGLCLLQVDLYSRGRH	967483	959659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961841_961950_962807_962889_963787_963928_965036_965146_967420
694150	contig_6589_pilon	-	913	7	Intergenic	novelGene_25863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1120.07961026587	39	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	34	669	959104	955427	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQVTLLLEVLHSSQCLSQHLPALGAYIPPSLKPTQVESLQGNRRLVSHP	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955567_955756_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
694151	contig_18869_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_56336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAAGCAGCCGGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73358	73575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
694162	contig_7202_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_17748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
694165	contig_4105_pilon	-	2540	3	Intergenic	novelGene_21512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	413	junction_2	254	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	21	407	137447	119311	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNVSVKVLGN	137467	117177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_119547_121847_121986_137434
694176	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694180	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_93713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694187	contig_10581_pilon	-	2253	10	Intergenic	novelGene_41408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	93.0090928781949	1	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	209	676	633234	627471	TRUE	0	TTCTTTGGCTCCTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDELESKPELLVQFVQNTSIPLEQGLVESETKDITCLSLLPVTEASECSRLMLPDDTPNHTNSSKEVPSSAVLRSLQVNVGPDGEETRAQTVQKSPEFLSTPESPNLLQDLQPNDSTSFILLNLTRAGLGSSAEHLVFVQDEAEDSGNDFALQ	649704	609108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620102_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
694190	contig_1719_pilon	-	1422	6	Intergenic	novelGene_87320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	106.26118764629	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	38	637	467728	458356	FALSE	30	ATTTGGCATTTTTAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGKLLRASVACHMSAIPWGVSASAALRPAASGRKCLTNALWSGSHPAKRAFSTSSSYLAPAVTQHAPYFKGTAVVHGEFKELSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRSSQAQLLPKNTLRK	467765	457570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_461153_461258_462091_462228_463065_463208_466480_466617_467692
694191	contig_15185_pilon	+	1804	10	Intergenic	novelGene_99408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_6	100.345083598895	307	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	909	1064	209119	209372	FALSE	10	TCTCTCTGATCTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCNTREIADKLIELKAEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDICRCFAGDTLLAIRAPSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAWSSPPVAVPVPPPEDLLQGPPVVSTPPPLPKPTLAQPQEASCPSSPQLATPAPVPSSIEGQGVTGPAAESTALDTRPLQSSALLDSSSNSSSSGPNPSTSFEPIKADSTGVLELPKELSEIFDPTPECMSSELLEELMSSEVFAPLLRLSPPPGDHDYIYNLDESEGVCDLFDVPVLNL	203761	210112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_203824_204298_204409_204551_204714_205023_205068_205819_205882_206098_206397_206924_207042_208882_208931_209113_209159_209256
694192	contig_14822_pilon	-	1381	9	Intergenic	novelGene_145391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	101.599397143881	433	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	314	1288	58551	53461	FALSE	10	CTGCTTACTTGTCTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSESGQVKEAIKYALSVGYRHIDCAAVYGNEAEIGEALKENVGPGKVLREHLFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPHAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69910	53367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_55429_56070_56220_56390_56511_58467_58558_69603
694200	contig_9656_pilon	-	1216	11	Intergenic	novelGene_121913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	352.178875005302	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	65	526	446594	440947	TRUE	25	CTATAGTCTGTACATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVSYFTTL	446658	430421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_440959_441171_441308_442128_442268_443248_443382_446552
694201	contig_6137_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_59149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAGAACTATGCTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105042	1105714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1105000_1105700
694202	contig_14441_pilon	+	1121	4	Intergenic	novelGene_100509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.355747555753	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	386	1081	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	108136	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_120975_121239_125517_125902_126496
694203	contig_14341_pilon	-	969	6	Intergenic	novelGene_111887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	796.290248590299	210	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	415	900	728004	727088	FALSE	20	GCTCTGAAGACTCTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	730598	727018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_728985_729350_730563
694205	SIRV6	+	404	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	74	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2625_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
694207	contig_8160_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_136406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTGGCCTAAAGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78142	79219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_78100_79200
694211	contig_6710_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_95995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694212	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91669	2	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
694214	contig_11572_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_100047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCTGACATTTAACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225120	224008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_224000_225100
694215	contig_11572_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_100046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223855	222394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_222400_223900
694216	contig_15304_pilon	-	1427	4	Intergenic	novelGene_30616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	10	GGAGCCCTGGGCTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
694217	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_89620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694225	contig_6919_pilon	+	1078	9	Intergenic	novelGene_163992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	20.3638773321782	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	58	1077	75495	117794	FALSE	30	GTGAGTGGCATGAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGSRQRLKGSGGSGGDTAVSTADKLRDLLCSREAGAIEHRTELSGNKAGQVWAPEGSTAFKCLLSARLCAALLSNISDCDETFNYWEPTHYLIYGKGFQTWEYSPVYAIRSYAYLLLHAWPAAFHARILQTNKILVFYFLRCLLAFVSCICELYFYKAVCKKFGLHVSRMMLAFLVLSTGMFCSSSAFLPSSFCMYTTLIAMTGWYMDKTSIAVLGVAAGAILGWPFSAALGLPIAFDLLVMKHRWKSFFHWSLVALILFLVPVVVIDSYYYGKLVIAPLNIVLYNVFTPHGPDLYGTEPWYFYLINGFLNFNVAFVLALLVLPLTSLMEYLLQRFH	75437	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_75629_76830_76970_77810_77946_81058_81130_100082_100172_105353_105490_110120_110209_110383_110490_117672
694226	contig_16666_pilon	+	1161	4	Intergenic	novelGene_61764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	688	1017	55959	58267	TRUE	25	GGGAAGTCACACCACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPQLNSTTLNVLSEILVLTMLLPCHPCSNALWIADNPLRASYSLSDIILQQNIARYATGINCSWGFAIITPVAAIDLKNPVISAFASRIVVCSFGVVTTLPSGQTHP	55271	59695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_56040_56583_56664_58098_58271_59554
694227	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694230	contig_10196_pilon	-	3176	5	Intergenic	novelGene_132193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	63.8846616959032	13	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	47	637	1152936	1143844	FALSE	20	CTCAAAAGTCTTTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQGSESEGFRAGSRAMKPPGGDSSNLFGSPEEVVPSSRPNRMASNIFGPTEEPQNIPRRTNPPGGKGSGIFDESTPVQTRQRQNPPGGKTSDIFGSPVASTSPLAHPNKPKDHVLLREGEDPKPDLAATVSTPAREGPGEKGGTRGTDPTTEPELTAKVDSHEPRLGPRPRSHNKVLNPPPEASPASPSTKRGRGFPSSHTETQERGYPIL	1160031	1141304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1144098_1145035_1145085_1149127_1149271_1152791_1152941_1159989
694231	contig_9995_pilon	+	1491	5	Intergenic	novelGene_47723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	77.244740921308	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	872	1219	610635	610982	FALSE	20	CCTTCTTCTATTATATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSFAILASKEYINPGKLEIVKNEMERINIDILGMSELKWTGIGHFELDSHMVYYVGNDKLKRNGVAFVVKKNFSRSILKYNAVSDKILSICIKERPVIKDYYSNLHTSHEGQR	485851	611254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_486036_502881_503029_586002_586155_606460_606635_610420
694233	contig_4832_pilon	+	2047	15	Intergenic	novelGene_163394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	316.718095537366	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	176	1486	263405	295025	FALSE	20	GATTGTTTAACACTTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFTIKPHQRVWIMVRQYVVQVIFSVTFAFSCTMFELIIFEILGVLNSSSRYFHWKMNLCVILLILVFMVPFYIGYFIVSNIRLLHKQRLLFSCLLWLTFMYFFWKLGDPFPILSPKHGILSIEQLISRVGVIGVTLMALLSGFGAVNCPYTYMSYFLRNVTDTDILALERRLLQTMDMIISKKKRMAMARRTMFQKGEVHNRPSGFWEMIKSVATSAPGSENLTLIQQEVDALEELSRQLFLETADLYATKERIEYSKTFKGKYFNFLGYFFSIYCVWKIFMATINIVFDRVGKTDPVTRGIEITVNYLGIQFDVKFWSQHISFILVGIIIVTSIRGLLITLTKFFYAISSSKSSNVIVLLLAQIMGMYFVSSVLLIRMSMPLEYRTIITEVLGELQFNFYHRWFDVIFLVSALSSILFLYLAHKQAPEKHMAP	247970	295586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_248091_263349_263410_263908_263949_264470_264575_265796_265904_266329_266432_275886_276008_279287_279369_284328_284439_286314_286404_287347_287441_291614_291711_293618_293709_294615_294682_294818
694237	contig_9471_pilon	+	2233	2	Intergenic	novelGene_21684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCATTCTGGCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45195	49228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_47097_48896
694240	contig_6673_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_164011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATTGAGCCTAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50569	49771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_49800_50600
694242	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_94808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694250	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_97237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694260	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_93435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694263	contig_5423_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_85189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196177	194833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_194800_196200
694266	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
694280	contig_15047_pilon	+	1108	4	Intergenic	novelGene_52259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3636.88587790281	6	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	277	306	4384	4413	TRUE	20	TTCCAGAATCTGCATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCGDQACGGWDLPEVGSHCGALWRGAKIHMSCAARGAD	3247	21656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3441_4300_4434_4552_4676_20997
694285	contig_7534_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_162121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64484	61697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_-_61700_64500
694295	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_96076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694301	contig_3095_pilon	+	1183	5	Intergenic	novelGene_75124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	11	775	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147230	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
694310	contig_4315_pilon	+	2588	20	Intergenic	novelGene_46745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_12	150.777706898291	1	85	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	41	2422	190489	225537	FALSE	30	AAACGTCTCAAGTTGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWVARNRFAVLDRMHSLLIKNLKNEITKKVQVPNCDEIFYAGTGNLLLRDADSIILFDVQQKRTLASVKISKVKYVIWSADMSHVALLAKHAIVICNRKLEALCNIHENIRVKSGAWDESGVFIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFKLALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEIALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMMKIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDPEKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGSIASKGKGGALAADIDIDTVGTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLDLPPELDVPTGAGGGAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	190448	225703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_190498_191180_191321_191897_191984_192100_192240_207189_207353_207427_207575_214651_214842_214960_215057_216250_216340_216527_216652_218708_218799_218980_219091_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
694315	contig_8284_pilon	+	1098	11	Intergenic	novelGene_125695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	410.594800259331	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	107	751	426599	461267	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTG	425048	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139_461211_461260
694316	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	192	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694320	SIRV7	-	286	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69000	0	35781	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78957	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
694321	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694338	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694341	contig_2078_pilon	-	2696	10	Intergenic	novelGene_100156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	20.2929167232264	131	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	918	1256	358028	352385	FALSE	20	TAACACTTTCCTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLFVTVPVSHPVLTIRAPRTQTAVGDVVELHCEAQRGSPPILYCFYHEDVTLGNISVLSKGGASFSLSLTEEHSGSYHCTADNGLGTQHSYSVSLSVRVPVSRPVLTLWTPRTQTVVGDLVKLHCEAQKGSPPILYWFYHEDVTLGNISVLSGRGAFFNLSLTTEHSGNYSCEANNSLGAQLSHVVTLNVKVPVSSPVLTVRAPGAQAVVGDVVELHCEAWRGSPPILYQFYHEDVILGNSSVCFRGGVSFNLSLTIEHSGNYSCEADNGLGAQRSEAVTLSIRVFTGSRSGSVATQVTRGLLSMMGLAAVALLFCYWLLRKAGRKSTSDPTRSPSNSDPQEPTYHNVPAWIELQPMYSNVNLKGGEVIYSEVRSSRKEKTCAVTSAPRLLKDQDSSVIYSQVKVSSTPASSAAHR	372024	350944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_352454_352530_352563_355919_355989_356192_356276_357272_357301_357970_358088_361704_361984_365599_365879_367422_367702_372003
694348	contig_11363_pilon	+	2832	1	Intergenic	novelGene_160482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTCCCTACCTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135883	138715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_135900_138700
694349	contig_4797_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_6931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGATAACAACATTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656185	657549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656200_657500
694354	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
694355	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694357	contig_12019_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_87712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTATTTTCTGAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285963	283355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_283400_286000
694365	contig_11978_pilon	+	516	4	Intergenic	novelGene_62985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_3	20.4993224820291	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	19	513	1495411	1497699	FALSE	20	GTTAGTACGCATATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATLQRAACGAGLNQRRDFFSWLTQWFSKAPAKAVVAQKTPIKVELVAGTMYRWCVCGRSKKQEASGPKASDLNIGKILPRLSWSPKPPSFPPIPSQSSSSRKPFPFLSSYDSFGHLLQPAIFSAWLPGSQEPFVPARTFPIFFLFFLNCTLDEGLQNKLASH	1495392	1497702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1495450_1495809_1495843_1496425_1496546_1497396
694366	contig_5059_pilon	-	2161	5	Intergenic	novelGene_140718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.146327643514	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	62	355	231713	214097	TRUE	20	GTAATCTGACTGGGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFRESAERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTVRTEQPLREDSLTLSHEG	231774	211110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_211833_213012_214187_214730_214789_226820_226893_231639
694372	contig_2380_pilon	-	2394	1	Intergenic	novelGene_117903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCTACTAGAACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501277	498883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_498900_501300
694374	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694378	contig_366_pilon	+	3103	2	Intergenic	novelGene_51546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	120	2081	33092	35053	FALSE	15	CTGGTGTTCATGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAASHLNLDALREVLECPICMESFTEEQLRPKLLHCGHTICRQCLEKLLASSINGVRCPFCSKITRITSLTQLTDNLTVLKIIDTAGLSEAVGLLMCRSCGRRLPRQFCRTCGLVLCEPCREADHQPPGHCTLPVKEAAEERRRDFGEKLAHLRELMGELQQRKVALEGVSKDLQARYKAVLQEYGHEERRVQEELARSRKFFTGSLTEVEKSNSQVLEEQSYLLNIAEVQAVSRCDYFLAKIKQADVALLEETAEEEEPELTASLPRELTLQDVELLKVGHVGPLQIGQAVKKPRTVNMEDSWAMEAAASAASTSVTFREIDMSPEEVVASPRSSPAKQRGPETATNIQQCLFLKKMGAKGSTPGMFNLPVSLYVTSQGEVLVADRGNYRIQVFTRKGFLKEIRRNPSGIDSFVLSFLGADLPNLTPLSVAMNCHGLIGVTDSYDNSLKVYTLDGHCVACHRSQLSKPWGITALPSGQFVVTDVEGGKLWCFTVDRGAGVVKYSCLCSAVRPKFVTCDAEGTVYFTQGLGLNLENRQNEHHLEGGFSIGSVGPDGQLGRQISHFFSENEDFRCIAGMCVDARGDLIVADSSRKEILHFPKGGGYSVLIREGLTCPVGIALTPKGQLLVLDCWDHCIKIYSYHLRRYSTP	23267	36075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_23304_33008
694383	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694387	contig_4232_pilon	-	1413	2	Intergenic	novelGene_63264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	0	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCACTGGTGTGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462947	460883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_460964_461614
694391	contig_3942_pilon	+	490	5	Intergenic	novelGene_128767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5574.63857012273	55	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	38	451	793521	795466	FALSE	20	AGCAGTAACTGGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGVHPAPGAASARRHHRAFSAPACPEVQLRQDDLPQVLRSPAPPCCQLPQEEVRPHQQPAPQKEGQIRAPLSRFPCFLLMASSQAP	792277	795505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793850_795075_795179_795313
694402	contig_4364_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_3426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
694403	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	130	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694406	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1547	632	1092	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
694408	contig_11752_pilon	-	1323	8	Intergenic	novelGene_37620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCAGACTTTACTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105902	84098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_84196_87159_87335_87422_87544_88668_88775_92872_93056_94218_94410_96442_96586_105595
694419	contig_5671_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_79468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_4	418.042088192086	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	19	441	370430	531238	FALSE	30	GTTATCTCATTGCATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370411	531784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
694422	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694427	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694428	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694429	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
694440	contig_7457_pilon	+	2222	11	Intergenic	novelGene_31338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	280.237060361402	1	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	517	1608	285206	290630	FALSE	20	CTGCAGTCTGATAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280852	291244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281241_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
694441	contig_4125_pilon	+	1954	7	Intergenic	novelGene_25214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	61.5261913515067	96	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	285	1040	1702282	1711283	FALSE	20	CTCAGTGGCATTGAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1701997	1712197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1708051_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
694442	contig_10674_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_6443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAACTTTAGTTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222751	223262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_222800_223300
694444	contig_11304_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_156699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAACATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360174	362545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_360200_362500
694445	contig_15991_pilon	+	964	7	Intergenic	novelGene_70929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGCCGGAAATGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100455	106362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100544_100885_101046_101154_101288_102023_102271_103581_103705_104975_105140_106313
694448	contig_10658_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_130078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197193	199654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_197200_199700
694455	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694456	contig_2444_pilon	+	2151	11	Intergenic	novelGene_83772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	310.43717560885	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	3	971	231301	241481	TRUE	40	AGTTAATAACTGTATTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIIAEDVDGEALSTLVLNRLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGIWRRGIDPES	231298	243492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239090_240847_240943_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
694460	contig_15787_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_143987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAGTAGAAAGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79833	82173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_79800_82200
694462	contig_9833_pilon	+	1546	12	Intergenic	novelGene_68531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_6	420.282647907609	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	30	1220	230823	254740	TRUE	40	ACACCGAAGTGAAAACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAFRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230793	258589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256954_258491
694469	contig_11677_pilon	+	2050	6	Intergenic	novelGene_85900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	117.491446497181	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	112	798	466629	468297	FALSE	5	CCCCTGCATTGTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVHRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKGEAERMKLKAEAYRKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIASPLTKVDEIVVLSGDNSKVASEVNRLLAELPACVHALTGVDLSKIPLIQKATGAQV	452074	469549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_452165_466607_466728_466816_467032_467449_467634_467997_468148_468258
694477	contig_14142_pilon	-	1734	8	Intergenic	novelGene_120565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	124	junction_2	119.71019427035	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	9	1352	446745	443954	TRUE	25	CCCTTACAAGCACATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLRSVPRLREAAGSHGLGWGSPPSSLQTSPRLGFLSLTAV	446753	443039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_443216_443747_444194_444641_444775_445000_445222_445364_445527_445868_446151_446345_446520_446613
694480	contig_7467_pilon	-	1484	12	Intergenic	novelGene_69468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	192.692321015946	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	238	1437	92058	67563	FALSE	20	GAGTAAACGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKRDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133047	67515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68433_70843_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132844
694484	contig_7202_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_16454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGCTTGTCAAAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
694488	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
694489	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	17	364	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14425	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
694494	contig_9177_pilon	+	3130	19	Intergenic	novelGene_32652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	55.9521676231439	2	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1740	2375	105101	106963	TRUE	40	AAAAAGTCATGGTGTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPQW	57896	109424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_74357_74573_99894_100009_100303_100440_100685_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
694495	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
694496	contig_14925_pilon	-	835	5	Intergenic	novelGene_55223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	1827.12922025236	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACTCTTCTTCCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74827	25915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611_29828_74772
694500	contig_5643_pilon	+	1717	4	Intergenic	novelGene_38966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	878	junction_1	350.971033942499	4002	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549595	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551892_552142_552231_552357
694504	contig_14219_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_54310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACAGTTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669604	672101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_669600_672100
694505	contig_1450_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_27448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785917	785387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_785400_785900
694518	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694522	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694532	contig_14513_pilon	-	1295	4	Intergenic	novelGene_70266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
694535	contig_3787_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_102410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553798	551981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_552000_553800
694536	contig_18274_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_164035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	379	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	192	704	31716	32228	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGGFTCHCFPHYELVEGECVEPVDPCFGVNCEYQCQPVGHTDYRCVCAEGFAPSPLDPHRCQMFCNQTACPADCDPNNLDSCHCPDGYILDDGSMCTDIDECHNGDCPGECRNLPGSFECICGPDSALAGLVGTDCDPVTVNDSEDSGSGEPPASSGPSTTSGPPPSGPLHSGVLTGISIASLSLIVALLALLCHLRKKQSATRAELEYKCAAPAKEVMLQHVHTEPTPQKL	31524	33963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_+_31500_34000
694537	contig_12761_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_164043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATTCTCCTTAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	28318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_27900_28300
694540	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_113304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	2	346	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14410	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
694546	contig_8538_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_4955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842802	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
694547	contig_7202_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_18578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	50	313	28496	29923	FALSE	30	CTCAACGAAGAACGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIQSALPIIIVWFLDVMKDDSATSLVLQLHQFLSVLPLLVRLVKKIFGKILQSHIITVEVVRHGQVDVGGVELQVDLAVDGGLRVLTVVLAHLRGGCGRHGGG	28128	30096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28169_28486_28634_29797
694549	contig_10904_pilon	-	1859	9	Intergenic	novelGene_22623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.082285767075	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	424	1179	510205	499813	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	515996	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499880_500155_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
694550	contig_5549_pilon	-	1772	6	Intergenic	novelGene_81641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_5	705.612754986756	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTTATTTCAATTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_442936_443118_443683_443958_443989_444483_445003_445604
694556	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694566	contig_15353_pilon	+	1389	11	Intergenic	novelGene_151987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4869.86201960589	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	664	1176	533056	543258	TRUE	15	CTAGTTGTACATCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLMRRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRMGYMDPRERDMRMGGGGAMNMGDPYGSGGQKFPPLGGGGGIGYEANPGVPPATMSGSMMGSDMVRMIGVG	531192	544849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_531233_531813_532116_532207_532447_532973_533171_533269_533355_533693_533812_534315_534365_534444_534567_543234_543283_543791_543881_544749
694570	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694574	contig_6710_pilon	-	470	2	Intergenic	novelGene_98149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	20	CCTTGCAGCTACCCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694577	contig_15304_pilon	-	1207	2	Intergenic	novelGene_30571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3429	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	196	726	54100	53391	FALSE	25	CTCGAATAAACTCCGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGGLEPWLAEHIPKPSPTPAPLAWGSLPSLQSGN	54295	52909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53813_53991
694581	contig_11396_pilon	-	2178	7	Intergenic	novelGene_71273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	723.121109420053	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	144	737	249053	232299	FALSE	0	CCCTCTTCGGCTTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249196	230857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245816_249034
694583	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_93540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653779	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694585	contig_12050_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_62698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	407	1075	615892	617876	TRUE	10	GCGAGGCGGCCTGACGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHREPVFQGLFGQHGASLVQFTEYLHVVLKGLVGLRHDPLFGLQVQVQGIHPGPVELLELLGVVHILKQVELGPLPRAGEFQSPLGHLLQHLAPREVPHVAGVGMGHQQLRLILPHIVDPIHILLGGRGALHLLLPVLTKEVLHVLGQCLLPVQLHGEVQGGEGRVVLVAVHFLLEGRVCKVKCSGGQLKELLLDVAFQEVFDKLGVFCPVVCFLGPFLQEL	615485	659696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_615964_616873_617368_617773_617892_619131_619260_659607
694596	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_96949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694604	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_97226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694605	SIRV2	+	295	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-61	289	-61	-289	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACCATACTTATTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	1342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
694610	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694619	contig_3861_pilon	+	2011	10	Intergenic	novelGene_57885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	836.96083068371	1174	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	278	1507	147714	176828	FALSE	50	AATAAAATGTTTTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQLIEGDEEEEEKIDEAIEEEDDEDEEEEEEVEEVEEVEEVEEVEGVEGGRDIEGVGEVEGAGEVGGAREDGGAEELGGTGEVGEGEEVEEAAGEVGGAGEVGEVEAVREEAEEEAKEEPVNFSVDQPEEN	141730	177332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147726_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171890_176396
694622	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694623	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
694624	contig_10196_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_132024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGTTCGCTGGCGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313404	311775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_311800_313400
694644	contig_7357_pilon	+	2303	8	Intergenic	novelGene_36895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	62.636951994027	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1301	1840	269181	273311	FALSE	30	GATTGAATTTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	259937	273774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_260110_263525_263630_268156_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
694650	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694657	contig_6837_pilon	-	1440	5	Intergenic	novelGene_149803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_4	72.9349024815966	519	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	232	1188	10764	8936	FALSE	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRGKKGAVAEDGKEPKTEPEAKKSKAAAKKNEKEATGEGTVLYEDPPDRTTSPSGKSATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDWVKEEAPDILCLQETKCSDKKLPAELQDLPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSRQCPLKVSYGIGEEEHDQEGRVIVAEFDAFVLVTVYVPNAGRGLVRLEYRQRWDEAFRKFLKDLASRKPLVLCGDLNVAHEEIDLRNPKGNKKNAGFTPQERQGFGELLQAVPLADSFRHLYPDTAYAYTFWTYMMNARSKNVGWRLDYFLLSQSLLPVLCDSKIRSKALGSDHCPITLLLAL	11304	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_9454_9593_9787_10310_10499_10706_10833_11141
694663	contig_14508_pilon	-	198	5	Intergenic	novelGene_79042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_1	560.835314508635	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAGATTATCAAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63423	37042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_37085_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387
694672	contig_10861_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_39390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTTAAAATCAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1889759	1890748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1889800_1890700
694678	contig_15063_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_11523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	4	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
694685	contig_7165_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_116851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314246	316256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_314200_316300
694687	contig_10451_pilon	+	2616	5	Intergenic	novelGene_138298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.79122409491	947	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	178	762	103898	151833	FALSE	10	GTGTGCTTTGGCGTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQGLDWLLVPLQQLVSWGAAGAMVFGGVVPYIPQYQDIRRTQNADGFSTYVCLVLLLANILRILFWFGRHFESPLLWQSIIMILTMLLMLRLCTEVRVTNELNLKRRSFALRPAPLLALEQLLRLCAVRAGLLRRGGLRHLPMHRLDPLCGDAGLPGCVHRGHAGRAAAVPQPPPPVHRGDEHQDGADVDQR	103380	153687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_103435_103774_104101_111508_111641_140302_140520_151800
694695	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694699	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_96625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694704	contig_5999_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_45644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCTACTTTCTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250013	249619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_249600_250000
694706	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_93454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694714	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_93803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
694715	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694719	contig_6069_pilon	-	1518	5	Intergenic	novelGene_8048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.92078264374	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	477	1376	360921	360022	FALSE	10	GGACCTCCGCCTCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362323	359879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360991_361048_361083_361559_361671_361753_361863_362170
694726	contig_7426_pilon	-	2019	5	Intergenic	novelGene_27472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	106.092824922329	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	990	1355	642502	641055	TRUE	45	TAAAAAAGTTTCCAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAEVQACVPRRCHPHPSHLPCN	643491	637243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641012_641189_642075_642179_642373
694727	contig_15063_pilon	+	1337	4	Intergenic	novelGene_14247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	30	1202	34808	36661	FALSE	25	TTCACAAGATGCTGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34778	36796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
694732	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
694734	contig_19402_pilon	+	1643	4	Intergenic	novelGene_80750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2025	junction_3	2171.54389522498	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	10	930	23458	47478	FALSE	20	TTATGGTGAAATGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNIMTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGKWICPFLQLFLSFSWSEDFLLFSDSESL	23448	48191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346
694735	contig_7171_pilon	+	1652	9	Intergenic	novelGene_101355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	103.772512617745	516	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	21	686	1321960	1325907	TRUE	25	TTTATGTGTTTGGAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKVTLGLGGRPHCPPLLAGPEPTAPFSSSAPSPSSQPSMGAALVQAWTSSPPVTSATVPRTRSSR	1321939	1329211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
694736	contig_14220_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_159842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	397	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAACCAAAAACTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233050	235331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_233000_235300
694737	contig_14322_pilon	-	286	2	Intergenic	novelGene_116527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCTGAAGATCCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674883	672860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
694744	contig_1275_pilon	+	921	2	Intergenic	novelGene_108837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	10	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	87	776	747279	747968	FALSE	20	TAATTGTGTCTGTCGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746550	748113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
694750	contig_9345_pilon	-	2214	6	Intergenic	novelGene_24507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_4	117.225253252019	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	6	323	669651	669257	TRUE	35	AAAAAGTAATGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLVSCCTGGVLA	669656	667022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_669490_669566
694759	contig_11003_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_105445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCACCTTGCCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368095	369544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_368100_369500
694760	contig_3818_pilon	-	2308	6	Intergenic	novelGene_99292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.2854212434946	5	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	79	819	925321	920483	FALSE	25	TCTGAACTAATGACTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSPTARHQEPVTFEDVAVIFTEEEWRHLVPIQRDLYKEVMLENYRSIVSLGLPVPQPDVIFQLKRGEEAWIVDLRGSEERECPENISLDGETKPEIQDTSEEEISKGTLRERLGSKGPLCPKFEVHVPEDRLETEKENPAVETCKKFFSQEKILQQGSIPPKKIFTKERDQECRDCGKTFFDHSSLIRHQRTHTGEKPYECHECGKVFSHRSSLSRHRMSHTGESPYECNVCGKAFFDRSSLT	934471	918993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_920486_920631_921096_921605_921720_923957_924085_925288_925360_934431
694761	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694765	SIRV6	+	781	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
694770	contig_16310_pilon	+	1056	4	Intergenic	novelGene_70082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3315.7579659693	75	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	176	349	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285800	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288682_289600_289633_289879
694771	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694775	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_90305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694777	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_94842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694779	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
694780	contig_5690_pilon	+	1594	11	Intergenic	novelGene_119733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	443.653299322793	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	48	1112	1044729	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086427_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
694785	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694790	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4592	34	3417	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
694791	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694799	contig_8617_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_73475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62734	62987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62700_63000
694800	contig_12050_pilon	-	1804	7	Intergenic	novelGene_62729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	154.685074335639	56	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	131	616	696748	687356	TRUE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGGSTMDSSAGGEARREAGEDKEGFLSKLKKMFTS	697298	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687342_687460_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697194
694805	contig_2036_pilon	-	1630	5	Intergenic	novelGene_131816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	302.635506839498	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	112	1077	661441	585381	FALSE	40	TAAACTTTCATGTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLRICLPWEPHPATTPQRGSTQQQPSSPPAPPPLALLFSHCMSVSQPVEPGSPDSCSAPCTFSWSGRLPLCPDPTSAFALRASSAACT	661552	584827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_585641_631747_631872_636558_636731_647832_647936_661134
694806	contig_15410_pilon	+	2266	17	Intergenic	novelGene_130633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	62.4066490347783	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	995	1999	229509	233096	FALSE	25	CTAAGCTGAGGCATGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSEKFAFHLEPEAQTAQVSDMLASSQRPEQDTWAAQEQELESLREQLEGMNHNIEEVKANMRTLGISLVQVETECRQSELSTAEQEQALRVKSRAVELLPDGAANLAKLQLVVESSAQRVIHLAGQWEKHRVPLLAEYRHLRRLQDRRELESSRRLAEIQELHQSVRAAAEEARRKEEVYKQLVSELETLPRDVSRLAYTQRILEIVGNIRKQKEEITKILSDTKELQKEINSLSGKLDRTFAVTDELVFKDAKKDDAVRKAYKYLAALHENCSQLIQTIEDTGTIMREVRDLEEQIETEMGKKTLSNLEKIREDYRALRQENAGLLGRVREA	210388	233363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_210553_211571_211750_226511_226645_227415_227523_227655_227723_227809_227990_229343_229539_230094_230158_230251_230372_230974_231095_231175_231293_231397_231500_231582_231691_231968_232065_232319_232380_232459_232535_232982
694811	contig_5039_pilon	-	2615	2	Intergenic	novelGene_64988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3387	junction_1	0	70	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	21	326	1686270	1682821	FALSE	70	AGCACAAAAATAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGADAMATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETSTPIEGNQAGDSAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPGKLEIISYLKNFVLRFFFEI	1686290	1680531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1683050_1686193
694812	contig_14681_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_134210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_1	0	14	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69706	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_71167_72461
694818	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694822	contig_6418_pilon	-	1101	10	Intergenic	novelGene_81094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_9	419.649353921716	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	179	847	81719	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	82065	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_81995
694828	contig_14133_pilon	-	820	7	Intergenic	novelGene_119930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1881.42998954401	27572	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	39	542	209116	207561	TRUE	25	GTAGTATCATTGTGGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTANLGSCEGVWLPCLATALAPFPRV	209445	206554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_207544_207636_208205_208389_208585_208728_209012_209131_209421
694832	SIRV7	-	189	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69095	2	35876	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78862	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
694833	contig_8617_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_73420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62696	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62700
694837	contig_2069_pilon	+	1570	7	Intergenic	novelGene_23457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	348.823578458924	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	748	1503	1436445	1439381	FALSE	15	GAGTTGAGGCCTCTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432100	1439448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432232_1432938_1433064_1433701_1433913_1436052_1436267_1436378_1436748_1437870_1438000_1439057
694841	contig_11961_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_153693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTATTAGAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114777	116300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_+_114800_116300
694847	contig_15752_pilon	+	2081	13	Intergenic	novelGene_148760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_12	69.4520218088238	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	115	1578	196075	203462	FALSE	25	CATCTTCGCATCAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDLASAGVACPYGAIESLYRKHCLEQGKQQPEPQEAGMAEEFLLTDNSTMWQMVEELGCLELEAEAKMENFQAAVLGQPSVLTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEFMTSRVNWVVQSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTR	194045	203965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_194087_196001_196123_196336_196424_196724_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201812_203458
694850	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694865	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694868	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
694869	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_97746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	45	TACTAATATTTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
694882	contig_6488_pilon	+	602	6	Intergenic	novelGene_44759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	236.578612727355	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAACAAGCCAATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193652	197427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_193754_194625_194731_195275_195391_195496_195688_196117_196165_197384
694885	contig_12312_pilon	+	2691	11	Intergenic	novelGene_64018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2099	2407	549114	549702	TRUE	30	AGAACGAACTCAGCGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGAAALDLPTSTVLARAPPLALARRLPLEDEEPRESEEELLMLSLSCPRPQEVGAQPPRSGLRLRVGELSDVVSGALLSMLAMPVCFFLGRPGEPQPRPL	545410	550082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_545885_546013_546196_546449_546573_546726_546911_547032_547190_547426_547918_548477_548702_548850_549138_549315_549547_549648_549813_549908
694894	contig_4857_pilon	+	1509	7	Intergenic	novelGene_48825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	94.0273305421827	48	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCCTACTTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331381	1411065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1343177_1343254_1405453_1405556_1407013_1407076_1409428_1409547_1409988_1410271_1410366
694908	SIRV7	-	256	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69004	20	35785	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78953	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
694911	contig_12425_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_46709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTTTCTTTTACCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230794	231023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_230800_231000
694912	contig_14546_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_157424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTGATCATGGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159241	162080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_159200_162100
694914	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_95100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
694915	contig_14341_pilon	+	948	5	Intergenic	novelGene_111841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1976.03281539047	73	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	78	488	548758	550243	TRUE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGEVVPRGQAGVPFTHFKASGCIVAWMLALSLV	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550485_551481_551581_551668
694927	contig_4232_pilon	-	2169	9	Intergenic	novelGene_63469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	399.296079839259	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	64	342	615808	614837	TRUE	5	TCTCTGCTGGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	615871	607746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_611392_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783
694930	contig_9002_pilon	-	2010	12	Intergenic	novelGene_116725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_10	65.2609510774796	32	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	443	1879	328393	316878	FALSE	40	TTAAATTGAAAACATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKAPSPEKAEQESERLLKELYLFDVLRADRTTAAHGLELRVPFLDHRFSSYYLSLPPEMRIPKHGIEKHLLRETFEDSNLIPKEILWRPKEAFSDGITSVKNSWFRILQDYVEHQVDDTMMAAASEKFPFNTPKTKEGYYYRQIFERHYPGRADWLTHYWMPKWINATDPSARTLTHYKSAAKA	337881	316746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319052_319154_319664_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331541_331878_337775
694945	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694948	contig_13905_pilon	+	1360	4	Intergenic	novelGene_130425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	61	381	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218453	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_229063_229210
694951	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_90342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
694952	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
694959	contig_4125_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_25113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTTCTGACAAAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796298	798440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_796300_798400
694960	contig_11317_pilon	-	2349	12	Intergenic	novelGene_164079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	81.6945530620004	23	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	59	574	116228	93738	TRUE	75	AGGAAAAAAAAAAAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAGAGVYLSHCGVATAASMAALSSAAALRLCATVILLDMVFSKSVVPDLDDSFKESRKDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGIEMKNMGSPVKVGKMDATSYASLAAEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKDDIIDFAHRVSGALIRPLPSKQMFEHVQRRHRVFFVYVGGESPLKVRHDFIF	116286	85213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_85686_86014_86069_86261_86320_88311_88411_91703_91771_92712_93862_96938_97020_98307_98354_105084_105209_106414_106455_115120_115176_116182
694972	contig_18869_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_56396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCAGCCGGTCATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73383	73578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
694974	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
694976	contig_10904_pilon	-	1233	6	Intergenic	novelGene_22743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	374.60998384987	261	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	236	982	661760	652201	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662764	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662310_662445_662665
694983	contig_8729_pilon	+	1412	6	Intergenic	novelGene_40066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	32.5416655996585	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	22	420	45249	50401	TRUE	25	TATTGGTGGAGATTCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQTWLMK	45227	51519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_50383_50430_50555
694987	contig_10793_pilon	+	1225	12	Intergenic	novelGene_83363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	3272.91435576388	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	132	980	146975	163940	TRUE	15	TGTCTCGAGTTGTGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKKEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	165142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_160424_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054
694990	contig_12090_pilon	-	2096	7	Intergenic	novelGene_80478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_3	79.5125776214053	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1105	1911	55822	51792	FALSE	15	TAGATTTATTCCTCCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVVKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTMVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVLRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTTGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR	56926	51606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_53617_54231_54363_54465_54577_54657_54755_55718
694991	contig_4486_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_38647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTTAACTCAAGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025360	1023236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1023200_1025400
694996	contig_7135_pilon	+	2280	5	Intergenic	novelGene_136945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	47.9322438448275	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	144	1796	245976	268922	FALSE	30	ACTTAAATATAGCCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHHVSTIKPRRIQNQNVIYRLERRRISSGKAGTHWHQVRVFHQNVFPNFTVVNVEKPPCFLRKFSPDGRFFIAFSSDQTSLEIYEYQGCQAAEDLLQGYEGEILSNGNDQRSVNIRGRLFERFFVLLHITNVAANGEHLNRECSLFTDDCRCVIVGSAAYLPDEPHPPFYEVYRNSESVTPNPRSPLEDYSLHIIDLHTGRLCDTRTFKCDKVVLSHNQGLYLYKNILAILSVQQQTIHVFQVTPEGTFIDVRTIGRFCYEDDLLTVSAVFPEVQRDSQTGMANPFRDPFINSLKHRLLVYLWRRAEQDGSAMAKRRFFQYFDQLRQLRMWKMQLLDENHLFIKYTSEDVVTLRVTDPSQASFFVVYNMVTTEVIAVFENTSDELLELFENFCDLFRNATLHSEVQFPCSASSNNFARQIQRRFKDTIINAKYGGHTEAVRRLLGQLPISAQSYSGSPYLDLSLFSYDDKWVSVMERPKTCGDHPIRFYARDSGLLKFEIQAGLLGRPINHTVRRLVAFTFHPFEPFAISVQRTNAEYVVNFHMRHCCT	233917	269406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_234051_245965_247059_251198_251387_264805_264998_268732
694998	contig_17875_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_143183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATCTGTAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105116	106084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_105100_106100
695012	contig_8636_pilon	-	2238	8	Intergenic	novelGene_141940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	13.1366444943687	19	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1390	1776	500026	495810	FALSE	20	TATGGTGTCAGGACTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVSPIGRSCTLEERIEFSELDKKEKIREKFVEALKTEFAGKGLRFSRGGMISFDVFPEGWDKRYCLDCLDQDSFDTIHFFGNETSPGGNDFEIFADPRTVGHSVVSPQDTVQRCRELFFPETAHEA	506497	495347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_495933_496317_496434_497330_497407_499954_500155_500262_500355_500521_501474_501871_501990_506398
695029	contig_14643_pilon	-	2181	9	Intergenic	novelGene_99122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	499	junction_3	126.026720876963	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	12	848	43635	35191	TRUE	35	AGGCCCAGCAGCACATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSLEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEIAMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGKIKYFFSLQ	43646	27219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_27249_28761_28858_29238_29452_29640_29798_34352_35409_40986_41117_41617_41844_42998_43123_43496
695031	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695037	SIRV4	+	216	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1555	632	1100	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2555	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
695041	contig_7025_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_104391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCACCTGCCAAAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65709	65382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_65400_65700
695042	contig_8538_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_4754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
695048	contig_6710_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_98203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695049	contig_16303_pilon	-	1323	7	Intergenic	novelGene_34105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	720.294769907123	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	48	884	47976	35759	TRUE	30	AAAGCCATCCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48023	33141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33219_35396_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_47897
695050	contig_9150_pilon	+	2175	2	Intergenic	novelGene_140897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	174	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	129	629	21006	21506	FALSE	25	CCTAAGACTCTTTTATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPCKENEEEPQSAPKTTEEPPPVEHPPEKHSPKEDEEEEEELSSEEQSSEEEEFFPEELLPELLPEMLLSEERPQERLSRKYLFEERPPMEQPPCGVGKHKLEEGSFKERLARSRPQFRGEIHGKNLSNEEMIKVAEEMEEMKRVRNKLLIMHWKAKRNRPYPI	20530	23052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_+_20627_20973
695052	contig_13995_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_164085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCAGGAGAAGACAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24884	26081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_+_24900_26100
695063	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695066	contig_15851_pilon	-	2258	1	Intergenic	novelGene_164090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTTTGTGTATCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11676	9418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15851_pilon_-_9400_11700
695068	contig_11548_pilon	+	2097	4	Intergenic	novelGene_66740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1760	junction_3	320.569285282709	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	186	581	63836	96229	FALSE	30	GTCTTTTAAGTGACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSK	63650	97745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086
695079	contig_9011_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_159362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTATTTTGGTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792624	791513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_791500_792600
695081	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695086	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695090	SIRV7	-	165	2	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	76969	0	43750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
695091	SIRV4	+	208	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1563	632	1108	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2563	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
695098	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_89610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653777	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695099	contig_11512_pilon	-	1801	8	Intergenic	novelGene_43285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	441.251605766865	26	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	176	1006	396169	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396344	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366360_367518_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
695100	contig_6278_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_119820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491069	493317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_491100_493300
695101	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_95967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695105	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695107	contig_6929_pilon	+	1023	7	Intergenic	novelGene_139390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5877.14524426802	7	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	361	624	127755	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	102602	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127074_127718_127787_130707_130971_131948
695108	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
695117	contig_6823_pilon	+	500	4	Intergenic	novelGene_131204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	243	junction_3	42.4447353102308	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	65	499	63101	79189	FALSE	30	GATCATCGTTCATGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQTTELAFDNAKPVISPLELRMEELRHHFKIEFAVAEGAKNVMKLLGSGKVTDRKALSEAQARFNESSQKLDLLKYSLEQRLNELPKNHPKSSIIIEELSLVTSPTLSPRQSMISTPNQYSTLSKPAALTGTLEVRLMGCQDILENVPGRSKAASVALPGWSPSET	62372	79190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_62405_63068_63215_63307_63522_79082
695120	SIRV7	-	245	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91670	11	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
695126	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_96293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695128	contig_15062_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_162301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATTAATACTTAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103880	104501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_103900_104500
695129	contig_10904_pilon	+	2231	2	Intergenic	novelGene_22478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1839	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	131	1099	149100	150068	FALSE	10	TCTTTTTCTGGTCATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	146097	151200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097
695138	contig_1009_pilon	+	2453	14	Intergenic	novelGene_121719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	84.1026422763864	180	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	295	1833	99747	213490	FALSE	15	TCCTTTTAATGTGTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSAQLSTTERVIKAVPFPPTQRLTLKEVFENGKPKIDVLKSHLVKEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECRIKYSEDVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITCLDDIKKLDRFKEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGSEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDEESLEGGTTVRKEIIKNKIRAIGKMARVFSILREESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIQTATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPRKDSVHTDGPVKLVTPVHPNAAHRSAPGKKTQ	99452	214110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_99796_142330_142529_143089_143215_169778_169891_179433_179580_181526_181667_183899_183978_184062_184158_188479_188606_189335_189411_204164_204247_204874_204973_212107_212138_213305
695139	contig_11816_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_98589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375058	1377030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1375100_1377000
695167	contig_5770_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_74156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAGTCTTAGCTGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191284	193515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_191300_193500
695169	contig_12270_pilon	-	333	2	Intergenic	novelGene_114080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	27	332	14409	13881	FALSE	20	ATGCCGCAGTTTATTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAE	14435	13879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
695175	contig_18869_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_56274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73640	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
695176	contig_8616_pilon	+	1648	7	Intergenic	novelGene_72497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	403	junction_4	419.894298868444	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	546	1109	326962	330137	TRUE	15	CACTTCCTTGACTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVRGRDPFSSLLVTLL	326416	331070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330292_330467_330546_330638_330720_330844
695178	contig_16098_pilon	+	2084	19	Intergenic	novelGene_45879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTTCCTCTCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244090	255231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_244475_244573_244717_247052_247150_247269_247325_247419_247486_247564_247612_248284_248396_249225_249378_249456_249516_249984_250080_250222_250291_250691_250763_251543_251648_251726_251849_253026_253102_253254_253381_253565_253743_254222_254296_255172
695185	contig_16098_pilon	+	1266	4	Intergenic	novelGene_46231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	502.51721916324	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	97	495	766291	767278	TRUE	25	GAATCTTTATTGTATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSGNCPVPSWHEQGRATLNGERGALELTNSEMPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	765541	768122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290_766596_767184_767603_767675
695191	contig_9121_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_134481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288740	289978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_288700_290000
695193	contig_7202_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_16377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27806	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
695202	contig_3627_pilon	+	995	3	Intergenic	novelGene_78507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	9	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	3	476	621315	634316	FALSE	25	TTGTTTATTAGAGGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621312	634835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
695205	contig_7695_pilon	-	2767	18	Intergenic	novelGene_41594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	33.0577768308236	1	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	985	2370	517170	504301	FALSE	5	TCTTTGCCATGTGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525167	503903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520384_521064_521203_521999_522090_524166_524445_525015
695207	contig_7594_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_55405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCATTCTCTACATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445279	442807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_442800_445300
695208	contig_8671_pilon	-	2260	6	Intergenic	novelGene_126288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	34.3255007246799	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	18	698	1006869	944424	FALSE	70	AGATTGAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTAKPMAAAGKLSTFRLPPLPTIREIIKLFRLQALKQLSQNFLLDLRLTDKIVRKAGNLTNAYVYEVGPGPGGITRSILNANVAELLVVEKDTRFIPGLQMLSDAAPGKLRIVHGDVLTFKIENAFPGSLKRQWEDDPPNIHIIGNLPFSVSTPLIIKWLENVSCRNGPFAYGRTQMTLTFQKEVAERLTASTGSRQRSRLSVMAQYLCSVQHLFTIPGQAFIPKPENVIP	1006886	942861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_944439_974244_974365_986850_987003_988546_988656_1003442_1003595_1006736
695209	contig_7963_pilon	+	1304	7	Intergenic	novelGene_58513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.26066849983	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	224	1015	194098	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	182706	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_182819_193986_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
695214	contig_9678_pilon	+	1394	4	Intergenic	novelGene_146358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_1	439.669825614126	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGATAAAACCTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210446	213296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_211452_212327_212419_212586_212692_213103
695219	contig_12926_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_164095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCAAACTATGTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180206	178705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12926_pilon_-_178700_180200
695222	SIRV4	+	279	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1492	632	1037	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2492	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
695225	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695226	SIRV2	-	189	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	0	3699	0	-1069	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAAAACTTGTCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5788
695228	contig_7286_pilon	-	848	6	Intergenic	novelGene_108708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3662.83472736622	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	53	790	292049	286948	FALSE	20	GATTGATTAATTGCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292101	286889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022
695230	contig_10926_pilon	+	1862	2	Intergenic	novelGene_137512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	674	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGTGTGAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293216	295162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_293647_293730
695231	contig_10902_pilon	+	2082	10	Intergenic	novelGene_65660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	470.816417264131	51	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	74	1126	79192	110079	TRUE	20	CTTTTGATGTGATAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPRGPRALRGHLRVFPSVCPSDMEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDLSKTAVDGTSENPFLDNPDAFYYFPDSGFFCEENSSDDDVILKEEFRGIIIKQGCLLKQGHRRKNWKVRKFVLREDPAYLHYYDPAGGEEPLGAIHLRGCVVTSVESNSDGKKSDEENLFEIITADEVHYFLEAATSKERIEWIKAIQLASRTGK	79118	112048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102_100288_102136_102242_107118_107203_108075_108146_109942_110798_111810
695232	contig_2596_pilon	-	1313	7	Intergenic	novelGene_53518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.26058530567	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	33	698	1120571	1054899	TRUE	15	GGTCTTATTGTAGGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRASQIQIAMGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAASEDEEEEEALEAMQSRLATLRS	1120603	1054169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1054690_1054803_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
695234	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695236	contig_6885_pilon	+	2376	1	Intergenic	novelGene_83692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268897	271273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_268900_271300
695239	contig_14142_pilon	-	1801	17	Intergenic	novelGene_120596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	131.903610640498	45	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	173	1183	598441	589168	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSK	598613	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586362_589161_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
695247	contig_6496_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_103511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACAACCATGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757341	755139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_755100_757300
695249	contig_10460_pilon	-	2637	4	Intergenic	novelGene_157473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_2	8.17856276425687	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	17	1297	97739	86270	FALSE	40	AAACAAAAGTCTGTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERYLKLFTFLPLSEINHIMQLHVKEPEKRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLESAKRCTQALYHNSIDALEVMSDEELKELFKEASFSELVLDPGTSVLDTCRKANAIPNGPRG	97755	84929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_86445_86752_86909_95896_96065_96957
695253	contig_1694_pilon	-	2851	16	Intergenic	novelGene_144928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_7	36.2691175642431	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	75	1934	492084	473418	FALSE	25	TTACTCAGCTTACTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQDEDDVEKEEERETILKTAVNEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASALEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVKNLGDAGDKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKYREDLRHLCVCSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLRCNVDRLAFSCIWEMSHNAEILKTRFTKSVINSKASLTYAEAQMRIDSATINDDTTTSLRGLNKLAKILKKQRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAAKSKNLEIRTDTAKSLADSLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADSTYPELTDKHKLADLCKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEGYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPKPWLVYDDEIPSLKIEDTVFHIFDKVKVRIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISTDISNMDINEPERKKKKLQK	493304	472500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_473496_474184_474308_475090_475250_475355_475525_475632_475848_480662_480820_483493_483581_486346_486475_488085_488171_488259_488325_490029_490132_490400_490518_490897_491045_491722_491861_491994_492109_493254
695256	contig_13744_pilon	+	2034	14	Intergenic	novelGene_77181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	42.5649521076788	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	13	1032	718904	739311	TRUE	30	TTTGGCTAGATCAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPDSDSDEDLVSYGTGLEPLEEGERPKKPIPLQDQTVRDEKGRYKRFHGAFSGGFSAGYFNTVGSKEGWTPSTFISSRQNRADKSVLGPEDFMDEEDLSEFGIAPKTIVTTDDFASKTKDRIREKARQLAAAAAPIPGATLLDDLIAPAKLSVGFELLRKMGWKEGQGVGPRVKRRPRRQKPDPGVKIYGCALPPGDSEGSEDDDDDYLPENVTFAPKDVTPVDFTPKDNVHGLAYKGLDPHQALFGTSGEHFNLFSAGLERASNLLGDVGLSKGRKLGISGQAFGVGALEEEDDDIYATETLSKYDTVLKDEEPGDGLYGWTAPKQYKSQKDLSTP	718891	744534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_718977_726876_727012_728358_728445_729891_730053_730689_730788_731378_731438_731809_732053_733057_733206_739294_739500_741273_741571_742564_742744_743023_743152_743963_744101_744461
695257	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
695262	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695263	contig_5226_pilon	-	619	6	Intergenic	novelGene_140499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_4	74.3101608126372	3	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	140	619	18252	9400	FALSE	20	GTAAGAGGCTCAGCCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDHPIPRVFQNRFSTQYRCFSVSMLAGPNDRSDVEKGGKIIMPPSALDQLSRLNITYPMLFKLTNKNSDRMTHCGVLEFVADEGICYLPHWMMQNLLLEEGGLVQVESVNLQVATYSKFQPQSPDFLDITNPKAVLENALRNFACLTTGDVIAINYNEK	28433	9399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_9473_11337_11469_15533_15656_17708_17742_18131_18265_28306
695264	contig_18859_pilon	-	1728	9	Intergenic	novelGene_150543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	40.5383691704538	256	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	221	1633	161698	97303	FALSE	25	CATGCTTGTAAATGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPAAGEHVKPFTPEKAKEIIMSLQQPAIFCNMVFDWPARHWNAKHLSEVLHGKQIRFRMGMKNTNTVPQFETTCSYVEATLEEFLNWNCDQSRGSGPFRNYDHSQFWAYADYKYFVSLFENKTDVFRDVIWSDFGFPGRNGRESTLWIGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQVQGRKRWHLFPPEDTPFLYPTRIPYEESSVFSKISVVNPDLKCFPQFRKAQRHTVTLNPGQVLFVPRHWWHYVESIDPITVSINSWIELEEDHQARVEEAITRMLVCALKTAEDPDNTKAWLNPTEIEETSHEINCRYLNEAVSALFDHYRTSKKVDIEALGTNGEHTKTEGLNVHNHMEVEQPHSQNLTTGTVKQEAASPFGPDLVPVMPSSEEPSTERGRIFESDGNSLDGEHFGKSHCTKRQRMMYKSKNAIVEQIASNSTVAPSQTFISTDDLLDCLVNPQVTRIVAQLLIQGRTL	168689	97207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_97828_97942_98054_111646_111731_114358_114531_118430_118568_131869_132052_148363_148550_161682_161746_168516
695268	contig_10733_pilon	-	1917	5	Intergenic	novelGene_109966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	51.4805788623244	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTGAAATAAATGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299746	296371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_297483_297867_298391_298518_298603_298831_298881_299596
695269	contig_709_pilon	+	2193	8	Intergenic	novelGene_57635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	28.0800604685668	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	218	601	2691473	2696617	TRUE	30	TGAAAATGTTGACTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIYVWDIEGRKYFDFLSAYSAVNQGHCHPKIVDALKSQADKLTLTSRAFYNNVLGEYEEYVTKLFNYHKVLPMNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLHGSVYC	2691255	2702377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695649_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
695271	contig_10986_pilon	-	1601	12	Intergenic	novelGene_71486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	165.483763653894	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	86	799	80340	72175	TRUE	50	TCATTAAAACATGTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR	80425	66813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72077_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
695272	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_113612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	2	349	14434	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVPHVPVGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14373
695274	contig_5039_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_65045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1327	1674	1809038	1808691	NA	70	CCAAAAAAAAAAACAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLELWRQAGSSGLVSLYHLVGFLTTVHHITVLHPRGLPTLLFSYDAVCPCHWHPRAGQGCPVLEAWPLRHGSQPRLSVCSNEKYMDHASATWNLLSSVSPTPQAIVSSCVKRNS	1810364	1808334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1808300_1810400
695280	SIRV4	+	236	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1535	632	1080	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
695283	contig_5167_pilon	-	1223	7	Intergenic	novelGene_164097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	20.597329924046	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	169	831	395989	292618	FALSE	20	AGCTTATATGAGTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTARSLPAVQSDERLQPLLNHLSHSYTGQDYSTQGNVGKISLDQIDSLSTKSFPPCMRQLHKALRENHHLRHGGRMQYGLFLKGIGLTLEQALQFWKQEFIKGKMDPDKFDKGYSYNIRHSFGKEGKRTDYTPYSCLKIILTNPPSQGDYHGCPFRHSDPELLKQRLQSCQISPGGINQILDLVKGTHYQVACQKYFEMIHNVDDCGFSLSHPNQFFIESQRILNGGKDIKKESVQPETPQPKPSVQKTKDVSSALDSLNSSLEVDMEELEDYFSK	425231	292225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_292843_305083_305153_340050_340134_345711_345839_395830_396017_398807_398881_425163
695285	contig_3948_pilon	+	2717	1	Intergenic	novelGene_53249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1639	2043	1210725	1211129	NA	45	GGCCACCCAAGAAGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTERNTLVAAPHYRGLSAHHLLNLPVHPHLYFIIFLSRLLTLPLDAAHSWACILSDKLYQAASQPEEDTLPTKNQAGGRFSASLQSWRTGSTKPNWKNDRSCLKANLVSILQKNLQKPSVKGLESYVLHAEMY	1209086	1211803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1209100_1211800
695287	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_98084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695290	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_16735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
695291	contig_13292_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_142972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491509	493303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_491500_493300
695297	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
695299	contig_6710_pilon	+	565	2	Intergenic	novelGene_94525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTACTCCAAGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
695301	contig_5814_pilon	-	1917	3	Intergenic	novelGene_143043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	535	849	149864	149550	TRUE	15	TGGGAGACCTTGAGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPYLGRLFHLNKSWSPSATHTDLHVPRVYRSYSWTSLVFSSPAGIDAVCLEPSLLADRFSILLASLMSDLRMPSLRRAWMVGMGFMAGLSSRAKRTSLCPARK	150398	138118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_138176_144692_144783_148628
695302	contig_10058_pilon	-	1904	10	Intergenic	novelGene_67694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	149	388	53697	53458	TRUE	15	ATGGGCAGCCGCTCATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAPSGPLPVVLPGSGDFCIGLARQAPLPWGSSHCEASLLPHPAKACSSDMPGPHLNLSSKERKNRGSAGVLEQARALPVSRPSAGHSKQAQDKSSSLVCPVSSIETGHALCKKSTWAQGLLVGGGRGC	53845	48266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_48330_50193_50289_50685_50736_50882_50971_51317_51420_51655_52188_52314_52372_52520_52616_52835_52964_53151
695311	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	172	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695315	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_89087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695316	contig_7165_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_116850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTCCCAGGGATACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311656	313824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_311700_313800
695318	contig_14467_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_138231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTACATCTAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175320	176352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_175300_176400
695321	contig_15893_pilon	+	1884	3	Intergenic	novelGene_128498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	685	junction_1	180	51	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	25	1164	22021	32130	FALSE	40	TTCACATACACTATTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLQLPRNMIENSMFEEEPDVVDLAKEPCLHPLEPDEVEYEPRGSRLLVRGLGEHEMDEDEEDYESSAKLLGMSFMNRSSGLRNSAASYRQSPDGSCSVPSARTMVVCAFVVVVAVSVIMVIYLLPKCTFTKEGCHKKNQSMGLIQPFATNGKLFPWAQIRLPTAIKPLRYELNLHPNLTSMTFRGSVTISVQVLQATWNIILHSTGHNISRVTVMSAVSSQEKQVEILEYPFHEQIAIVAPEALLEGHNYTVKIEYSANISTSYYGFYGISYTDENNEKKYFAATQFEPLAARSAFPCFDEPAFKATFIIKIIRDEQHTALSNMPKKSSVLIEDGLVQDEFSESVKMSTYLVAFIVGEMKNLSQDINGTLVCDCGNCLEACFTSKR	21996	32850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_22839_30313_30453_31947
695322	contig_9696_pilon	+	1799	14	Intergenic	novelGene_68833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_12	613.622477080736	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	268	1668	593219	619064	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKMGGIKGLFKGKKNDKLIIRYQIERKEGNRESKN	577936	619195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614244_618819
695323	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695334	contig_7396_pilon	+	1994	2	Intergenic	novelGene_79650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	59	355	252467	252763	TRUE	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGTETLALYCIGHWRSWMLALGMGIQSEVVKYGTRLATSTFLGIANQGFHMGVQGRMGQRHGGQRRGKSIQYMGNGDIWPKKQGEGKGGKAINFNLIQTILILSINETSLSCSED	252408	255028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_253979_254604
695338	contig_13542_pilon	+	2604	14	Intergenic	novelGene_131466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.935979848213	103	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	784	2046	98824	157981	FALSE	30	CCACTCATTTAATATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAATIIGSAGAAALGSVAGIAVMTSLFGAAGAGLTGYKMKKRVGAIEEFTFLPLTEGRQLHITITITGWLASGKYRTFIAPWAALARSREQYCLAWEAKYLMELGNALETILSGLATMVAQEALKYTVLSGIVAALTLPASLLAVANVIDNPWGVCLHRSAEVGKHLAHILLSRQQGRRPVTLIGFSLGARVIYFCLQEMAQEKDCQGIIEDVVLLGAPVEGEAKHWEAFRKVVSGRIINGYCRGDWLLRFVYRTSSVQLRVAGLQPVQLDDRRVENVDLSSVVSGHLDYAKKMDVILKAVGIRTKPGWDEKGLLLAPGSLPQEEPRQGASPSSSLGETSHQDEQAQGLTPEDTPKVATSTNPSQAEVPAGLDQPEGASPPATINPIESPHVCSHIVGPNPLGCPDCASQTQGPCPGLD	39583	158539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_39602_55460_55572_56310_56501_69679_69855_87806_87963_97444_97543_98788_98933_99790_99911_106490_106656_107573_107711_111055_111141_137725_137844_148115_148234_157570
695342	contig_5954_pilon	+	2483	1	Intergenic	novelGene_28806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTTTCCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454118	1456601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1454100_1456600
695343	contig_5217_pilon	-	1798	10	Intergenic	novelGene_135798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_4	118.149727146072	867	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	58	873	702107	686512	FALSE	10	GCTGATGCCTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFLRVRANRQTRLNARIGKMKRRKQDEGQVCPLCNRPLAGSEQEMSRHVEHCLSKREGSCLAEDDAVDIEHENSNRFEEYEWCGQKRIRATTLLEGGFRGSGFVMCSGKENPDSDADLDVDGDDTLEYGKPQYTEADVIPCTGEEPGEAKEREALRGAVLNGGPPSTRITPEFSKWASDEMPSTSNGESSKQEAMQKTCKNSDIEKITEDSAVTTFEALKARVRELERQLSRGDRYKCLICMDSYSMPLTSIQCWHVHCEECWLRTLGAKKLCPQCNTITAPGDLRRIYL	705321	685586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_686584_687315_687391_687554_687664_692311_692391_692523_692580_692722_692810_693013_693111_701508_701642_701999_702122_705278
695344	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695350	SIRV4	-	859	4	NNC	SIRV4A	novel	592	4	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	40	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14619	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13823_14321
695352	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
695359	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695361	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695363	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695366	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695369	contig_6102_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_32225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3343	junction_5	1038.07001690637	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	40	609	905250	895751	FALSE	30	TAAGCATCCAAGCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVYQEMFYIFNPFRIAVYLC	906122	895468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
695370	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	427	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695379	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_97789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695383	contig_13481_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_119418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	189	671	740605	740123	NA	65	AAAAAAAAAAATATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFVVGDKRICFQYPCSGLISVLGSTLCLFIIRFIFLGLLWEAFWPRSLLNTLTSLPESTPSSSVIPSVTPLSLTKHGLQTGKKVNIRPKFLLFLFSRIWEMLDFGVSWFGGRKGGGQWWLSSRIFAFHAGDPGSIPSQGTSRAATTICHWRLVCCFDAE	740793	739838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_739800_740800
695390	contig_15410_pilon	-	1382	11	Intergenic	novelGene_130579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	77.2865447539221	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	202	1224	57724	54277	FALSE	25	CAAGCAATTCTTCCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59272	54118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55188_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57564_57669_57870_59216
695393	contig_15034_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_143628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAGGTATGTCTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13705	11679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_11700_13700
695395	contig_10626_pilon	-	430	3	Intergenic	novelGene_138208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_2	5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	22	429	282520	279473	FALSE	50	TTGAAGAGAAAGACAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSGFALKRNVLGRNLTANDPSQEYVASEGEEDPEVEFLKSLTTKQKQKLLRKLDRLEKKKKRDRKKKKLQKSRSKHKKHKSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSIETSESSSESDDKQKKIQKQKRKKNKCSGYNSSD	282541	279471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_279723_281165_281252_282448
695407	contig_4857_pilon	+	1650	6	Intergenic	novelGene_48845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_5	94.3588893533619	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCTACTTTTTATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331397	1411067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1343177_1343254_1405453_1405556_1407013_1407076_1407599_1407777_1409988
695408	contig_7428_pilon	-	2302	14	Intergenic	novelGene_77692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	45.4657683831974	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	94	693	243098	236798	TRUE	15	GCTGAGCTGTATGCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGETTAKPEPRSLSRLRHLGLGPRRAGSSKAMSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTTARVPASCLACGTVQPVMRTQAGLPYPRAAPPMAPRRTQIPSGTPTPSRRIPTCQLDG	250483	225868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226448_226528_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_236177_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_242499_242676_243113_250404
695413	contig_11171_pilon	+	1895	10	Intergenic	novelGene_48529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	38	1030	31058	65045	TRUE	10	ACCTGCAGCTGTGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	31020	65957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_65355_65401
695415	contig_5690_pilon	-	2122	4	Intergenic	novelGene_119721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGGCGGCTGGGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087222	1044681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1044776_1073767_1073889_1077643_1078719_1086390
695417	contig_4847_pilon	+	1488	10	Intergenic	novelGene_156152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	65.5610167216788	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	640	1245	86730	92768	FALSE	35	TATTGTCATTTCAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	79681	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85410_85532_85605_85681_86133_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
695422	contig_3382_pilon	-	2284	9	Intergenic	novelGene_124104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_8	632.884418752745	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	251	1399	725157	673341	FALSE	15	GAACTGTTGGCTCTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDIASRDRDRNSRDRSPRDRDRKDKNRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI	725407	672455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_673519_677153_677346_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303_694415_696445_696545_712955_713051_725096
695424	contig_10689_pilon	+	1853	2	Intergenic	novelGene_118634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3742	junction_1	0	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	880	1263	57608	58411	FALSE	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGKSEITFNYKVI	56728	59001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_57792_58211
695426	contig_8520_pilon	+	2468	1	Intergenic	novelGene_85460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGTATTATAGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359466	361934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_359500_361900
695427	contig_546_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_117194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1070	1432	73701	74063	NA	40	GATGGATAAAGGTTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSFLITCPKYMRRSLTILASKEHSGCTSSKTDLFVLLAVHGIFTILRQHHNSKASILLQFSLFLVQLSHAYEAIENTMAWVRCTLVLKVTSLILNTLKRSFAANVPNAIRCLIS	72631	74477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_72600_74500
695429	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_94292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653841	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695433	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695435	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
695437	contig_11364_pilon	-	1980	7	Intergenic	novelGene_65150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	101.507662546015	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	722	1099	64396	61299	FALSE	5	TTTGTGGTTTGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	67948	60417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64315_64454_64874_65189_66590_66616_67011_67048_67659
695443	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
695444	contig_12080_pilon	+	2796	1	Intergenic	novelGene_128367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCCATTCTTATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114789	117585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_114800_117600
695446	contig_8138_pilon	+	1377	5	Intergenic	novelGene_52445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	198	653	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280097	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306983_307644
695449	contig_7945_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_161603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCATATTGTTCTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422390	421661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_421700_422400
695454	SIRV7	-	1072	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112839	5	112661	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	43	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2077	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2100
695459	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695463	contig_18869_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_56375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACATCCTAAGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73372	73568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
695467	contig_6589_pilon	+	1281	8	Intergenic	novelGene_26020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	794.182572953898	5	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	389	844	1727185	1730119	TRUE	35	TTTGGTAAAATAGCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEVGRASRSGCGTTSSP	1725368	1731811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725718_1726907_1727044_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729244_1730081_1730152_1731406
695469	contig_6227_pilon	-	1290	9	Intergenic	novelGene_49740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	309.406690296121	31	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	100	990	1224979	1202920	FALSE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCTLRPLLAVRRPPVLPLPSGRFLSVCPTCLAMAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQVMPFTGTRMIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1225078	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204229_1222000_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
695470	contig_9482_pilon	-	1774	11	Intergenic	novelGene_44323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	155.978716496835	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	868	1557	1240827	1236365	FALSE	20	CTTTAAACAGCCTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253172	1236147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239842_1240815_1240966_1241040_1241234_1242405_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
695474	contig_6375_pilon	-	2365	17	Intergenic	novelGene_73007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	45.9680595631358	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	385	1980	333124	327598	FALSE	20	CAACCCCACTGCCCGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVTLENWQFEEWGSQVTVVSSDMREWVAPEKADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLKDDGVSIPGEYTSFLAPISSSKLYNEVRACREKDRDPEAQFEMPYVVRLHNFHQLSAPQPCFTFSHPNRDPMIDNNRYCTLNFPVEVNTVLHGFAGYFETVLYQDITLSIRPETHSPGMFSWFPILFPIKQPITVREGQTICVRFWRCSNSKKVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGRSYTIGL	334561	327212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328788_328997_329115_329275_329370_329613_329724_330332_330509_330594_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302_333448_333701_333821_334444
695475	contig_5222_pilon	-	2025	14	Intergenic	novelGene_58999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	34.8239868362541	199	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1109	1894	203491	193280	FALSE	10	TCTGATTTCTTTTTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQEQIIQVKELSKGVESIVAVDWKHPRITSFITPEPSLASQPIQEGSREQPYHPPDIRSLYCVPAGMTLLFQESGHKKGSFLEGSEVRTIIINYAKNNDLVDADNKNLVKLDPVLCDCILEKNEKHTVLKLPWDSLLTRCLEKLQPAYQVTFPGQEPIVKKGKICPIDIILAQRASNKKVTIVRNLEAYGLDPCSVAAILQQRCQASTTVTPAPGAKDSLQVQIQGNQVHHLSQLLLDEYQLPRKHIQGLEKAPKPGKKK	217051	193148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_193351_195007_195183_199851_199973_201671_201768_202692_202783_203139_203290_203408_203513_203905_203953_205664_205783_206159_206536_211807_211899_212402_212487_215489_215681_216871
695478	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695479	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	18	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695483	contig_7887_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_124921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	719	1096	572572	572949	NA	50	TAAAATGACTTGAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSGRVAQGSTHVPPCSSGVIVSVSGSWFLFPVASHPHGGRKGPEVGRQKTAWIAQFSGNLPVEISRGAGNQSLAAQSHFLGGCPWRPRAVAAGEKGLEENLEGRDVPSVDDCCHLTPVPNTRV	571853	574309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_571900_574300
695500	contig_11512_pilon	+	1559	9	Intergenic	novelGene_43262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	13.2988486343743	404	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	188	1426	358531	471553	FALSE	25	AAGCATTGGTGACTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVAALSWVQTHIREFGGDPQRVSLAADRGGADVASIQLLTTRAVNARLFRRAVLMGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357616	471686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_357772_358498_358702_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
695506	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_94271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695515	contig_15087_pilon	+	2369	4	Intergenic	novelGene_37277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1217.16647268244	1	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAATCCTCCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284617	303733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289427_301228_301399_301788
695516	contig_233_pilon	-	2020	11	Intergenic	novelGene_14652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1368.12783028488	1	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	135	1607	105485	78579	FALSE	35	GAAATAAACTTTCCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	105619	78165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104272_104309_105461
695517	contig_14925_pilon	-	749	4	Intergenic	novelGene_55155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1731.93712998545	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67883	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_67822
695518	contig_12793_pilon	-	1869	2	Intergenic	novelGene_164109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAACCCATGTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130551	128634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_129201_129248
695519	contig_10581_pilon	+	1179	5	Intergenic	novelGene_41348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	362.990616269898	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	113	562	74587	87224	FALSE	15	CATTAACTTGTGGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSIKLVVEWELLDDKGQRLFCWKIPLEIIS	74474	87841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85207_87087_87174_87223
695523	contig_15866_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_63669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAATGATGTAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604392	604741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_604400_604700
695526	contig_7457_pilon	-	2882	10	Intergenic	novelGene_31318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	83.7416662520317	356	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	345	926	267206	263970	FALSE	20	CAAACCTGAGCTGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLPVPDPILLTNSHDGLDGPTYKKRRLDECEEAFQGTKVFVMPNGMLKSNQQLVDIIEKVKPEIRLLIEKCNTVKMWVQLLIPRIEDGNNFGVSIQEETVAELRTVESEAASYLDQISRYYITRAKLVSKIAKYPHVEDYRRTVTEIDEKEYISLRLIISELRNQYVTLHDMILKNIEKIKRPRSSNAETLY	268659	262013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_264051_264699_264787_264908_264964_265061_265130_265265_265335_265570_265684_266212_266262_267146_267276_267686_267724_268421
695533	contig_8954_pilon	+	2528	3	Intergenic	novelGene_130314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	379	junction_1	127.5	13	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	874	1284	623271	632345	FALSE	80	AAAAAAAAAAACCAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFSFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQMEFKAVQQVQRLPFLPSSNLSLDILRGTDETIGFEDILNGKYPSAPFYGDPAMYRATRESKTDKILVLVELAACWIQLCLFTAIG	622397	633589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_623346_627018_627121_632111
695536	SIRV6	+	307	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10518	1	1281	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11518	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
695544	contig_13707_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_43517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCCAGCTAATGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116843	115462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_115500_116800
695550	contig_16103_pilon	-	2112	9	Intergenic	novelGene_118781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_6	183.28325073503	613	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	326	1306	548732	546663	FALSE	10	CCTGCTGCCTCTTATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLPAAPQPPAPRHLSCPLSCLPQPATALWTAFCAPRERPGSTASESSASLGSEWDLSESSLSSLSLRHSSERLSDTAGSFQPPSLEILLSSCSLCRVCDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTLDSRPSAPSPKPAPAGASGSKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHVGGPSRRVEGGAWAYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPTTHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGLVLASCGGPLPPQAPPPWLNPDPASVQVRLLWDVLTPDPGSCPPLYVLWRVHSQIPQRVVWPGPVPASLSMALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLDTLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAALGKDHVDIAAFDKKYKSAFNKLASSLGKEELRQRRAQMPSPKAIDCRKCFGAPLEC	549633	545856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_546809_546901_546967_547050_547217_547306_547425_547959_548197_548398_548541_548625_548796_549258_549382_549494
695552	contig_165_pilon	+	2092	5	Intergenic	novelGene_117069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	497	junction_4	330.696235237113	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1007	1327	63734	71673	FALSE	10	CTACCTTGTGGAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	62643	72438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
695555	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	74	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695568	contig_7004_pilon	+	1461	4	Intergenic	novelGene_126468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_2	97.3390409285446	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	56	1402	392109	395731	FALSE	5	TCCTTGCACGGTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRNGPYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	392053	395790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394061_394364_394514_394759
695569	contig_12841_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_55842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAGCCAGAGGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214301	216472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_214300_216500
695570	contig_1274_pilon	+	2680	1	Intergenic	novelGene_137802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGCATGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434247	436927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_434200_436900
695573	contig_17274_pilon	-	1647	4	Intergenic	novelGene_26526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGGAAGTCTGAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168033	131641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_131747_163816_163980_165066_165235_166822
695577	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695578	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_114060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	31	342	14409	13875	FALSE	25	CAGTTTATTACTGTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14439	13873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
695580	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	193	741	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPTFGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121828	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
695581	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695586	contig_10324_pilon	+	1437	9	Intergenic	novelGene_7837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	89.2412460692924	36	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	84	887	283476	295997	FALSE	15	TCCAAGGCCTCTCTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPGSNYTQTTRLEHIGESWLPKVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTCLFEVLAVRLVEITMKHLSRLELLLCYCAENPMFSFTPCEMGLNVLFTNEDTENGFRRGFDHLGCSV	283392	296547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287031_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_294813_294971_295950
695587	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695589	contig_8330_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_71889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGACCTTTTAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063942	1066093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1063900_1066100
695591	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
695597	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_90326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695602	contig_18869_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_56388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73735	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
695603	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695608	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695611	contig_11572_pilon	-	2075	5	Intergenic	novelGene_100066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGTCATCTATTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286287	282553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_282617_283276_283451_283881_284065_284193_284424_284862
695616	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
695627	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695628	contig_10523_pilon	-	1558	9	Intergenic	novelGene_120934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	541.94463220425	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	234	1217	39240	15001	TRUE	15	CAAGTGCCCTTGTTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	67000	12746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13039_14951_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_66781
695629	contig_15118_pilon	-	2057	7	Intergenic	novelGene_74562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	31.614430600949	136	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	881	1591	216747	214422	FALSE	10	TCTCTGTGGCCCTTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIPLPILEGQSLRLVCVADSNPPAELSWFQGSQALNASPVFNMSDLELPPVRTGNEGEFTCQAQNSLGSQQVSLCLSLLSPTDSPQLPHPSCSWEVEGLHCSCSARAWPAPSLRWRVGDQLVEGNSSNASVTVTSSSTGSWANSSLSLHKGLSPGLGLYCEAGNDHGNQSVTVLLLAENSFCCTCFTKVKEGSWPLVLTLIRGAVMGAGFLLTYGLTWIYYTWCAGTQRSRAD	219000	213955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_214456_214591_214728_216123_216418_216500_216759_217488_217537_217967_218247_218458
695634	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695638	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_93637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695639	contig_3825_pilon	-	1454	5	Intergenic	novelGene_77971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.4938581634557	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	65	523	30077	27914	TRUE	10	CTTATACTGTGTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFGIIALQTIAYSILWDLKFLMRNLALGGGLLLLLAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	30807	26803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_27106_27284_28181_29179_29367_30072_30117_30782
695640	contig_15063_pilon	+	1402	4	Intergenic	novelGene_14161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	783	1271	36064	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34661	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34913_35049_35384_35866_36158_36266
695645	contig_16525_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_133830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1816	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1	735	156827	158630	FALSE	25	TGGACTGGAATCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAPTFGRALPDRPHAPPWISLPSLSPDLAGTRGGTESSLGWPSWGPWSSSDSSPAGVAPRLPGRSTSLVEGRACAWVPPPPGFAPLAPRPGPELSPSPTSPTATPARPGHPWAPPRAAPEHQLLRPALGPPSVTTTGRPPRPFPVLLLLLALQLPATTAWGPSALALCLLCCPWDPCAPKGPHPNLARSPSAHSLGSDPDEYASSGSSLGGSDSPVFEAGVFGPPQPLAASRRLPIFNRISVSE	156826	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156886_157687_157948_158159_158398_158452
695646	contig_12250_pilon	+	1892	15	Intergenic	novelGene_80560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	60.678308668396	29	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	37	1176	272853	275577	TRUE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGGAACGLYPLQQPPSLPSSHECPLLPPALFLRPPGRLVPGLGHG	272816	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
695651	contig_10042_pilon	+	2219	1	Intergenic	novelGene_79174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTTTAAATCACAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783197	785416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_783200_785400
695653	contig_7056_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_43686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCTGCTGCCTGGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860799	860295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_860300_860800
695656	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	138	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695663	contig_2161_pilon	-	2171	10	Intergenic	novelGene_114911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.7274174134854	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	375	1517	791304	764808	TRUE	40	CCATAAACAAGGTGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRGPSRQQLSRSALPSLQTLVGGGCGNGTGLRNRNGSAIGLPVPPITALITPGPVRHCQIPDLPVDGSLLFEFLFFIYLLVALFIQYINIYKTVWWYPYNHPASCTSLNFHLIDYHLAAFITVMLARRLVWALISEATKAGAASMIHYMVLISARLVLLTLCGWVLCWTLVNLFRSHSVLNLLFLGYPFGVYVPLCCFHQDGRAHLLLTDYNYMVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHILAQAFKPRN	792871	760207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763654_763774_764657_764839_765726_765915_766656_767006_773463_773619_778784_778869_782626_782850_791191_791379_792571
695664	contig_19076_pilon	+	2218	6	Intergenic	novelGene_74212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	268.907865262435	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	634	1014	152334	155254	TRUE	10	TTTCTTTTGAGTTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADGYPVLPAPCVKETFSSSFNGLQSFVKDIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	102852	156673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_103079_124492_124574_146309_146503_152200_152398_154937_156152_156366
695665	contig_8580_pilon	+	2180	8	Intergenic	novelGene_156090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	53.9833685650743	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1703	2089	267640	273102	FALSE	5	CCGATTTTTTGTGTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEACRVQQYPFTADQDIPETDWEVYLREAANAIVSQQSPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	253047	273193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262103_262275_266363_267666_267739_267839_271126_271197_272910
695674	contig_5696_pilon	+	2929	1	Intergenic	novelGene_117609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCCTGACCCTAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922655	925584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_922700_925600
695678	contig_11285_pilon	+	2029	13	Intergenic	novelGene_5628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	487.519800167701	1	99	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	9	776	766060	768082	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPSAAPTTCTAAPRTLCAT	766051	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767829_768024_768149_768428_768527_768610_768681_768758_768857_769085_769320_769421_769653_769740
695682	contig_8980_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_74011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGAAAGGACAGAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647222	647829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_647200_647800
695683	scaffold_7386_pilon	+	2197	1	Intergenic	novelGene_136614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719306	721503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_719300_721500
695688	contig_13481_pilon	+	2010	13	Intergenic	novelGene_119291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_1	36.2524903359142	226	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	33	1781	190790	242440	FALSE	45	AAAAGTCTAAATCTTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPSWFRLGKMAMAGAASREPLLSWCTEELRKTFSLDVSEEIMQYVLSIESAEEIREYVTDLLQGNEGKKGQFIEELIIRWQNNDQESISDPLQQYFKKDEILDGQRSGDQIKKSRRKGRNRQEVPSSFAEPDTAVEVKTPFDLAKAQENSSSLKKKTKFVNLYTREGQDRLAVLLPGRHPCDCLGQKHKLINNCLICGRIVCEQEGSGPCLFCGSLVCTREEQDILQRDSNKSQKLLKKLMSGTENSGKVDISPRDLLPHQKSRIKSGLEKAVKHKDKLLEFDKTSVRRTQVIDDESDYFASDSNQWLSKIERETLQKRQEELRELRHASRLSKKITIDFAGRKILEEENPLAEYHSKLDETIQAIANGTFNQPLTKSGRSSAEPLGILVNPNMDQPPPQWVDQTGAASQKRSLHLAGSELELSSHQHRMRIQDREFQEGFDGGWCLSMHQPWASLLVRGIKRVEGRTWYTPHRGRLWIAATAKKPSPQEVSELQATYRLLRGKDLEFPCDYPSGCLLGCVDLTDCLSQKQFKEQYPDISQESDSPFVFICTNPQEMIVKFPIKGNPKIWKLDSKIHQGAKKGLMKQNKAI	190757	242669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_190891_196375_196546_197209_197347_205538_205752_207198_207278_210021_210152_211669_211886_214285_214413_217712_217901_220528_220654_221894_221987_236494_236598_242372
695693	contig_2703_pilon	+	2099	15	Intergenic	novelGene_101809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	48.7917273014722	188	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	271	1920	916181	1093511	FALSE	5	TTCTGTTTCATTTCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPRFVSQHIQVLRVIKNFERLTSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFISIHDKGHIASILNAWPEDVVKAVVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGVNPQECLPVTLDVGTENEELLKDPLYVGLQQRRVRGRAYDDFLDEFMEAISSKYGMNCLIQFEDFANTNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITGNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMAMEKEGLPKEKAIEKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEVFAQEHEEMKNLEAVVQKIKPTTLIGVAAIGGAFTEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKLTKGRAVFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRHIEDKVFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIREVSLKIAEKIVEDAYQEKTATVYPEPPNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEAQKMQTKVDW	891432	1093690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_891595_916072_916190_920477_920612_925472_925623_961796_961873_964306_964469_992657_992762_1045766_1045877_1058253_1058352_1060124_1060239_1077592_1077699_1078589_1078733_1082164_1082339_1089683_1089783_1093340
695701	SIRV7	-	292	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91634	0	-91628	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAGTATAAAACTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
695705	contig_18869_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_56204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73739	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
695706	contig_12250_pilon	-	990	7	Intergenic	novelGene_80725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_3	174.055945667542	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	65	628	401239	399347	FALSE	30	GAGATCCGAAACGCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401303	398984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
695708	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695711	contig_13593_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_156127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	67	318	71970	72221	NA	50	ACATTAACAGCATGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVSPSILSFLLSGLSTPLESSMPPAPMYNIPFSVTSLAWALTGPQPQLWPSLPHPPAQPPGHSHCDLGFTHHGHLGLGQPGSLALASPNCVVMASSPLPKLAPF	71903	72611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_71900_72600
695717	contig_9921_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_23739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAGAGGAAAAAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195518	197595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_195500_197600
695718	contig_17768_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_140404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGGAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94242	96519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_94200_96500
695719	contig_1107_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_126578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604570	606152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_604600_606200
695721	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695724	SIRV6	-	286	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8218	-163	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCTTAGTTGGCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10765	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723
695732	contig_10732_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_114702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGCAAAAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107668	109957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_107700_110000
695734	contig_10990_pilon	-	1572	10	Intergenic	novelGene_7397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_7	109.969692794576	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	28	1233	42338	29709	FALSE	10	CCCTCCCCCAGGTGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPVAWAGLIVLLMIQWGSASKLVCYFTNWSQDREGVARFLPKDVDPNLCTHLIYAFAGMDNNHQLSVIRWNDKTLYKDFNGLKKMFTSMVATANNRRTFINSAIKFLRKYDFDGLDLDWEYPGSRGSPASDKQRFTALVQELGDTFRQEAQSSGKERLLLSAAVPSARVYVDAGYEVDKIAQNLDFINLMAYDFHGTWEKITGHNSPLYKRQGESSAAAEVNVDFAVRYWLQRGAPANKLILGMPTYGRTFTLASSSDTGVGAPATGPGTPGPFTKEGGVLAYYEVCSWKGATKVRIQDQKVPYAFQGNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWTLDLDDFTGSFCNQGRHPLIRTLRQKLSLPYVLSGTREPEVLTADKPSETERGHSPGEDTF	42365	29369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_29813_30612_30740_32140_32255_32553_32740_34277_34402_35098_35224_35445_35612_37682_37888_40672_40703_42313
695736	SIRV7	-	349	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-6	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114744	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
695741	contig_11986_pilon	-	1415	2	Intergenic	novelGene_69204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	721	1089	734679	734311	FALSE	25	GAAAAAGGTGTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	794731	733984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_735311_794642
695751	contig_6445_pilon	+	1321	9	Intergenic	novelGene_77129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	232.359601426324	631	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	43	768	1470295	1488812	FALSE	10	GCTGCCTGGCCTACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQGGETDPLLSLPLVIQL	1470252	1489365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1485815_1485840_1486472_1486500_1488761
695758	contig_13481_pilon	-	1609	4	Intergenic	novelGene_119387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	269.171981371679	12	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	10	318	536852	536125	TRUE	40	AAAAATCATCCAGAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPCEWCVLMMGLLSPIVDDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVSPWGVGREE	536861	526084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536062_536339_536757
695759	contig_9515_pilon	+	1261	8	Intergenic	novelGene_73826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	341.89197482389	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	751	1140	68341	72530	FALSE	0	TTTCCTTGGCTCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	66062	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_66248_66350_66501_66581_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
695767	SIRV3	+	231	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4596	2168	2537	53	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTGGACGAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6540	6771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6800
695769	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695772	contig_7035_pilon	-	2516	9	Intergenic	novelGene_83542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_7	29.1694939105909	405	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1515	1000	2514	777106	773698	FALSE	5	CAGCTTGTCTGGTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVQGLQRLLEQARSPGELLRWLGQNPTKVRAHHYPVALRRLGQLLGSQPRPPPVEQVTLQDLSQLIIRNCPSFDIHTIHVCLHLAVLLGFPSDGPLVSALEQERRFRLPPKPPPPLQPVFRGGQRLEAALSCPHFLRHPRQHLIRSLAEARPEELTPHVMVLLAQHLARHRLREPQLLEAIAHFLVVQEAQLNSKVVQKLVLPFGRLNYLPLEQQFMPCLERILAREAGVAPLATVNILMSLCQLRCLPFRALHFVFSPGFINHISGTPHALIVRRYLSLLDTAVELELPGYRGPRLPRRQQVPIFPQPLITDRARCKYSHKDIVAEGLRQLLGEEKYRQDLTVPPGYCTDFLLCVSSNGAVLPVRTQDPFLPYPPRSCPQGQAAWNPTTQDPTQRVVLMLRERWHFCRDGRVLLGSRALRERHLGLMGYQLLPLPFEELESQRGLPQLKSYLRQKLQALGLRWGPEGGGEGKHSGLRWPPHGGQTVCTLAPILVLIKGPFLP	778105	773695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_773905_773980_774096_774171_774308_774390_774483_774702_774863_774962_775177_775690_775831_775985_776166_776835
695775	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695782	contig_3252_pilon	+	1771	11	Intergenic	novelGene_61503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	116.389002916942	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	94	1671	561225	718315	FALSE	45	TTTTCATTTTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISFSEWDWRRQSGGCRLRCSGFSVLALFAAEMTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKSAAGEFADDPCSSVKRGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGTEQDLGIQYKALKPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKANRDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGSGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSGNEVVPQRSI	535239	718415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_535331_561222_561330_563191_563388_595569_595737_596521_596642_604358_604629_607038_607243_675240_675322_676492_676646_705294_705388_718126
695785	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695787	contig_6576_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_42316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACATTACTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536890	539488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_536900_539500
695790	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695794	contig_19145_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_164138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85441	87957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_+_85400_88000
695796	contig_16846_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_82954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3692.9805289901	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	91	537	555122	551362	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPDLRAGSATHRAPSPHQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHAPIPSPCPRPHKTLTGDPSSEG	558745	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551432_551516_551665_552661_552824_555055_555156_558688
695801	contig_6418_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_81235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTAAAAATGTGAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425832	1424105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1424100_1425800
695802	contig_11978_pilon	+	2475	2	Intergenic	novelGene_62991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517253	1520059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683
695804	contig_12414_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_59660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	664	972	772963	772655	NA	15	GTTGGGTCTGCACCTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRILGKSSETWKGRKKYVRQQLYRVGWNQALFVFRAVGKRSFCGCCFLNSFHSYVRECQLVSACMVLQIEYNIPFLINSFYKHTYWCVCVICSINQLKTL	773626	772277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_772300_773600
695805	contig_9290_pilon	-	2042	9	Intergenic	novelGene_77566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.1861038983065	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	694	708	504305	504291	TRUE	15	CTCTGCAGGAATGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	508643	502894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504212_504273_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550
695815	contig_614_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_132630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	29.191418069167	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	22	456	588714	619956	TRUE	15	TCTGTTAATTGATTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGQRCSMGVGVSVLLLLDVGKAQVLATGESAVTETGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSRCQIRHHRDCSGSSHICGLPGPEDLHVPQARV	588692	641291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619242_619493_619859_619971_621721_621753_634039_634064_640090
695816	contig_10235_pilon	+	1178	5	Intergenic	novelGene_46552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_4	30.2851035989643	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	189	1127	427994	429472	FALSE	20	CATGTGAGCTCAAGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMGEKPLALGLKTCSLLRKDPPCAAVTTAVQELLRLAQAYPAGPPTLDPVNDLQLKDVSVVEGGLRARKLEELIRGAQCVHSPRFPAQYLKLRERVQIQKEMERLRFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLQTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSALRPEEIAALLSGLVCQSSGDSGDQLPSTLKQGVERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ	427805	429523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_428261_428418_428530_428609_428829_429038_429180_429271
695817	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695824	contig_9594_pilon	+	1781	11	Intergenic	novelGene_73949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_10	395.189182544259	2	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	93	1346	301335	322451	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301242	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
695833	contig_16870_pilon	+	2541	1	Intergenic	novelGene_155478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	747	14	760	22055	22801	NA	15	CTACTTTGTAGAGTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKIYMNQVCDDTVTSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEHQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENQDIILKLLIIFENINDNFKWEENEPTQNHFSEGSLFFFFKEFQACADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE	22041	24582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_22000_24600
695838	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	13	1117	13	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
695843	contig_12938_pilon	+	1487	8	Intergenic	novelGene_99716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	987.698437824842	1	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	193	678	79083	85512	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGSVGDVLCADLELPD	51950	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52052_78130_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84606_85468
695844	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	66	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695849	contig_6205_pilon	-	3089	1	Intergenic	novelGene_160337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	1899	2471	56171	55599	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLCFHTEKRVDTHLSHPLNPNGHHCGAWSGGTQSSPPGTIHHSCQLNVRAPCDISKIRGKTRSPHPPQRDNMALHCMWQGSRCTVSTPAWFHLTSVRTGFLIVGGGSPQPPTTNSFMLLSFGPYPPASTRSSSERELPASQRAGGQRGRHPHPALCDRPAIGTINQQFKQRQIPCDKRDREEDLKLCIP	58069	54980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_-_55000_58100
695852	contig_7963_pilon	+	2233	5	Intergenic	novelGene_58386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1291.70882458083	7	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	68	1159	51450	64131	FALSE	15	CTACTCATTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPLMAPDNSQGVHRKWDPMRGPESNFNRSGCITRLLHQPGGGSYQEVLIDKGLCASRSILVITSNDSYDLLLKRLRQFLLNDPMGIEHDQSSPSHQLPDSFSHHQFHHELHL	51382	65205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63800
695855	contig_20819_pilon	-	1698	3	Intergenic	novelGene_55681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_1	435.5	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACATCTTCCTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67311	65409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65743_65860_65963_66048
695866	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
695869	contig_2596_pilon	-	1335	7	Intergenic	novelGene_53521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.26058530567	1143	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	47	712	1120571	1054899	TRUE	10	CTTGGTCTTATTGTAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREGKPGRASQIQIAMGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAASEDEEEEEALEAMQSRLATLRS	1120617	1054172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1054784_1054886_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
695877	contig_15689_pilon	+	3154	6	Intergenic	novelGene_164164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGGTCGTAGATGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215455	225919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_216610_218035_218140_219863_219923_220089_221676_223383_223435_225719
695891	contig_7202_pilon	-	574	3	Intergenic	novelGene_18575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	34	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	203	574	29911	28058	FALSE	35	AAGAACGACCCCCATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATD	30113	28057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
695897	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_95818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
695899	contig_9609_pilon	+	1580	10	Intergenic	novelGene_23055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	799.528194207892	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	16	1032	435659	454609	TRUE	70	TAAAATGTAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435643	456253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455634_456080
695911	contig_9833_pilon	+	1905	9	Intergenic	novelGene_68534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	202.513849835017	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	20	979	230823	252564	FALSE	35	AGAAAGTAGATTAGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQNGSAS	230803	253490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250160_251805_251891_252272_252458_252546
695914	contig_3380_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_60114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGGCTCCTTGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436779	434488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_434500_436800
695918	contig_835_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_152162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTCCCCTAAGCCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246585	247076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_246600_247100
695921	contig_8317_pilon	-	2960	12	Intergenic	novelGene_20744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_8	27.5656991312581	126	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	109	2196	70020	35384	FALSE	15	TTGTCATGGTCATGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLQSRARRVAGSLGSLIKQHLSLARFSGESGAPRSPHFDVVVIGGGHAGTEAAAAAARCGSRTLLLTHRVDTIGQMSCNPSFGGIGKGHLMKEVDALDGLCSRICDQSGVHYKVLNRRKGPAVWGLRAQIDRKLYKQNMQKEILNTPLLTVQEGAVEDLILTEPEPEHAGKCRVSGVVLVDGSTVYAESVILTTGTFLRGMVVIGLEMHPAGRLGDQPSIGLAQTLEKLGFVVGRLKTGTPPRIAKDSINFNILNKQMPDNPSIPFSFINETVWIKPEDQLPCYLTHTNSRVDEIVLENLHLNSHVKETTRGPRYCPSIESKVLRFPNRVHQVWLEPEGMDSDLIYPQGLSVTLPAELQEKMITCIRGLEKAKMIQPGYGVQYDYLDPRQITPSLETHLVQRLFFAGQINGTTGYEEAAAQGVIAGINASLRVSRKPPFVISRTEGYIGVLIDDLTILGTNEPYRMFTSRVEFRLSLRPDNADSRLTFRGYKEPGCVSQQRYERASWMKSSLEEGISVLKSIEFSSTKWKKLIPEASISIGRSLPLRALDVLKYEEVDMELLAKAVPEPLKKYTECRELAERLKIEATYESALFHQQQEIEEVQRDEALQLPKDLDYLTLRDVSLSQEAREKLHFSRPQTIGAASRIPGVTPAAIINLLRFVKTTQQRQAAMDELSKTGQFLRETDKLQEREL	70128	34619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_35546_39680_39842_44499_44619_51340_51513_51595_51801_52629_52761_52981_53173_53273_53387_56482_56773_64086_64205_64292_64493_69794
695925	contig_10904_pilon	-	1955	5	Intergenic	novelGene_22436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	20.597329924046	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	2	766	78169	61644	FALSE	0	GCCCGTCCTGCGCTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLWLFGMDLSKMTHGALAALRVKKPYLDIGC	78170	60454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_61732_71079_71251_73007_73179_75004_75176_78005
695926	contig_5482_pilon	-	2392	7	Intergenic	novelGene_144445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_6	170.761448290363	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	171	1739	302713	271235	FALSE	55	TTTATTAAAAGAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSRSPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDDDKSEACNEDLTAATDEKSIERVSLSAESLLKAATSVRGGKNSSPLNCSRAEKGVARVVNISSPGHDASSRSPTTTASVPATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAASPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQLAQCQLQTKSSLTGSGSINIVGTPLAVRALTPVSLAHGTPVMRLSVPAQQASGQTPPRVISAVIKGPEVKSEAVAKKQEHDVKTLQLVQDEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK	302883	270581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_271863_272267_272619_274810_275004_288090_288178_291323_291462_293196_293311_302655
695930	contig_18869_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_56370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAATTAGTCCAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73370	73746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73700
695932	contig_2987_pilon	-	2232	4	Intergenic	novelGene_125870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.6421435969889	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1821	2141	603709	603389	FALSE	10	TGTCTCCTGCGTCTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPQRGKMESRPQGEMENWHGLGEVWVQVRVAVCVSTLSFLLPSSWVGYQYPGYRGYQYLLEPGNFKHWNEWGAFQPQMQAVRRLRDRQWHREGSFPAPATELPK	610765	603297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_604936_606079_606213_609862_610037_610478
695935	contig_12270_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_113185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	31	381	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14439	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
695938	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695939	contig_12301_pilon	-	1853	9	Intergenic	novelGene_110016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	279.803837536228	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	169	978	130603	102891	FALSE	15	TTTGTGTCATTTCAGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKLALPSSSIISYPLENVIPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136696	102015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116176_129128_129186_130599_130737_136661
695941	contig_12464_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_68649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGCTTGCCTACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97169	96836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_96800_97200
695943	contig_3975_pilon	+	2027	13	Intergenic	novelGene_54784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCCGTCTACCCTCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2015530	2052442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2016161_2016944_2017119_2017369_2017503_2017591_2017701_2018296_2018427_2018508_2018610_2019773_2019868_2021001_2021147_2021604_2021737_2023268_2023338_2027088_2027211_2044821_2044930_2052362
695948	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695953	contig_17819_pilon	-	1568	4	Intergenic	novelGene_158790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	206	junction_2	63.9374694525831	359	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	104	772	16509	8905	FALSE	10	TCTGTTTCTAAGCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEAGSGKREASGEEAFLCPLTSLFLSSSWAYSSSNDAKNTFEETCPYCFQLLVLDNSRVRLKPKPKLTPKIQKLLNREAKNYTLSFKEAKIVKKYKDSKSVLLITCKTCNRTVKHHGKSRSFLSSLKSSPSTPVTKPILKTPAKKTPSSANLNHDMSGSKAKSPASIFRTPASGQSTPTFSSSKNISKTKKHFSQLKMLLSHQESQTTPKMDFRNFLSSL	16612	8108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17819_pilon_-_9062_10999_11200_14193_14394_16397
695957	contig_16050_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_164169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCAGACATCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93412	92270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16050_pilon_-_92300_93400
695958	contig_16050_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_164168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACATATTACTAAGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90861	90548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16050_pilon_-_90500_90900
695959	contig_3424_pilon	+	2005	5	Intergenic	novelGene_55516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_4	49.5044189946716	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTTGACTAGTCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220034	245123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_220288_223230_223295_232342_232485_237579_237794_243791
695960	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
695961	contig_12644_pilon	-	588	5	Intergenic	novelGene_44688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTGGAAAAAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2679592	2677583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677693_2678054_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506
695965	contig_11989_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_68469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGCCCCAGGTTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221448	222348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_221400_222300
695966	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
695969	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
695973	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
695974	contig_7840_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_69048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATGGTTGTAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409800	411206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_409800_411200
695975	SIRV7	-	920	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48026	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
695976	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_97658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
695978	contig_14450_pilon	+	2107	9	Intergenic	novelGene_48936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	74.6331653824223	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	66	1391	512549	525931	FALSE	25	CTTTCTCTTTTATCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRPSLPPSKQANKNLILKAISEAQESVTKTTNYSTVPQKQTLPVAPRTRTSQEELLAEVVQVQSRPPRISPPIKEEETKGDNIEKSQGNNLNDNLLLITLFS	512483	526647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523323_523742_523844_525728
695981	contig_16187_pilon	+	1787	5	Intergenic	novelGene_101066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCGAACGCCCCCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40164	53091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_41590_41667_41738_41957_42112_47819_47904_53037
695989	contig_4364_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_3649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACATCAGCTAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
695995	contig_8452_pilon	-	722	2	Intergenic	novelGene_48086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3190	junction_1	0	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968923	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669
696003	contig_10299_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_79732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACAGAAGAGTCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354157	353406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_353400_354200
696007	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_17821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
696009	contig_17518_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_117354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2252	2554	38516	38214	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKALKVTAGQLALWQLMCVADGILAHCVGTRYHLDSQQLHPLHISTFSFSEVWVMLRVPASLAGHPWPQLEVVRDRRGFQFVLTSYTLFLLSSTSSFPF	40767	37715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_37700_40800
696010	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_18143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
696013	contig_9571_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_136299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCAAGCTAGCCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565545	564987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_565000_565500
696014	contig_9571_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_136298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATCTACTGATGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562576	561743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_561700_562600
696015	contig_17436_pilon	+	2044	15	Intergenic	novelGene_164179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	27.1639955282949	7	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	931	1776	100517	152520	FALSE	35	TCAGATGTAAAATTATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYNAPPLKEWIDTIQEHDLSETNVYLIGSTPGRFQGNQKDNWGHFRLRKLLREHTSPIPKAETWPIVGQFSSIGSMGADESKWLCSEFKESLLMLGKEGKALGKSAAPLHLIYPSVENVRTSLEGYPAGGSLPYSIQTAEKQNWLHSYFHKWSAETSGRSHAMPHIKTYMRPSPDFSRIAWFLVTSANLSKAAWGALEKNGTQLMIRSYELGVLFLPSTFGLDSFNVRPKFFSGSQELTASFPVPYDLPPELYGSKDRPWIWNIPYVKAPDTHGNMWVPS	68791	152788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_68813_77834_78415_81547_81592_82800_82857_86293_86391_89607_89643_100419_100588_101058_101138_106653_106840_107459_107509_110438_110506_112318_112427_128543_128647_140932_141042_152446
696016	contig_7707_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_72159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTACCTCTACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240001	238025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_238000_240000
696024	contig_9481_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_149649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1301	1702	150064	149663	NA	55	GATTGCAAATGAGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFRTDETAAKPRCRPHVHFQMALLACSLSSLNAGGGGQEASSASVQDWLTSGLISNSEKGQLQDLDTSCPGSSSYVSNSCLFLVTRKMDFSAHVLMKPLISFRYRNCVYTYRILPNEDKFSVQVSPLDIDI	151364	149326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_149300_151400
696025	contig_401_pilon	-	363	4	Intergenic	novelGene_42780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_3	334.939795585217	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	52	363	1083727	1081571	FALSE	25	TAAGATAAGTTGGTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCTWSSSSATAPHPLKMYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSFQTTAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYAR	1086595	1081570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
696028	contig_19960_pilon	-	768	5	Intergenic	novelGene_164190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACAAATCCATGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60190	37663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_-_37997_41228_41338_44033_44142_51749_51858_60080
696029	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696044	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696046	contig_2069_pilon	-	2902	1	Intergenic	novelGene_23346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCCAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731377	728475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_728500_731400
696052	contig_7730_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_156275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGAAAGGGAGGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187942	187707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_187700_187900
696057	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696059	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696068	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696072	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
696073	contig_3948_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_53292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTTACTTACTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444351	1441897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1441900_1444400
696074	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	143	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696076	contig_15498_pilon	+	1771	2	Intergenic	novelGene_42643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGCCGTTCTTAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676513	680869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_676677_679261
696077	contig_10777_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_101178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCATCTTAGAGCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460645	460096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_460100_460600
696078	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696079	contig_5770_pilon	-	1893	14	Intergenic	novelGene_74143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_6	218.230132045381	203	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1560	333	1892	209985	16699	FALSE	30	TAAGTAGTAATCTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNSSRIGDLSKNEYLKKLSGTESVSENDPFWNQLLSFSFPAPTSSTELKLLEEATVSVCKSLVENNPRTRNLAALIKVFLSRTKELKLSAECQNHIFIWQTHNALFIICCLLKVFICEMSEEELQLHFTYEEKSPGSYSSDSEDLLEELICCLMQLITDIPLLDITYEISLEAVSTMVVFLSCQLFHKEVLRESISHKYLMQGRCLSYTSKLVKTLLYNFIRQEKPPPPGAHVFPQQSDGGGLLYGLASGVATGLWTVFTLGGVGSKQQTPELSSPLANQSLLLLLVLANLTDAPDAPNPYRQAIMSFKNTQDNSPFPSSVPHAFQINFNSLYTALCEQQTSDQATLLLYTLLHQNSNIRTYMLARTDMENLVLPILEILYHVEERNSHHVYMALIILLILTEDDGFNRSIHEVILKNITWYSERVLTEISLGSLLILVVIRTIQYNMTRTRDKYLHTNCLAALANMSAQFRSLHQYAAQRIISLFSLLSKKHNKVLEQATQSLRGSLSSNDVPLPDY	228796	16697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_16802_89484_89580_90848_90963_93202_93329_96398_96578_102707_102888_155406_155550_157273_157400_173776_173850_186030_186165_187626_187721_190672_190726_209845_210038_228516
696081	contig_6589_pilon	+	1240	9	Intergenic	novelGene_26050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	890.19912624929	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	316	957	1726977	1731484	FALSE	15	CGCAAGATTGTTTTCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCGTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725451	1731767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725983_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
696082	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696085	contig_11285_pilon	+	1695	10	Intergenic	novelGene_5595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	554.144185007637	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	35	1066	766060	769479	TRUE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCHTAAQQGIPAM	763523	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766141_767289_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769310_769445_769653_769740
696086	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696088	contig_13510_pilon	-	2974	6	Intergenic	novelGene_164195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	4.60434577328853	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	153	1067	81058	42093	FALSE	40	TATTCCTTCTTAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLRRMLGIGKLLWVLFLIPYLGIWSIHGGKLCNEQLYIKRGSIYFVSPGDPFKLECPVTYCANRPNVTWCKFKGTHCSPLQDERQERTSWEEGKNISTFILYFEHVLASDNGSYRCIADILSGVVTSHSVTIYVTAQTQNNSEHLLINATSASGPPSQNEMVDRKWLLYGLLPLGALSSLLITCFCLFCCLRKRQEKRKKSFDPTGREIHMAAVPQPFGSEQTEAGTRQNSQTQPSETGIYDNDPWFRAQEGPEVYSNPCLEENKQNIVYASLNHSVTGKNPRPARDVKEAPTEYAAICVRS	81210	40185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_-_42369_46168_46216_50988_51133_52750_52787_61958_62283_80970
696099	contig_1996_pilon	-	1542	8	Intergenic	novelGene_131937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	352.808672205876	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	319	1047	509679	508483	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTCSSSFARRVSPTCWRHCPRPRPQGSAPAGEWGARSAHSWGDSAELADTSLCRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511075	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509712_509829_509957_510732_510828_511011
696102	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696103	contig_57_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_44908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGAAAAAGATTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127308	129529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_127300_129500
696104	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	116	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696105	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696109	contig_14525_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_149766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTGGTTTTTAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146740	145738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_145700_146700
696110	contig_14525_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_149765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCAACTTTACAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145684	145336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_145300_145700
696111	contig_14525_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_149764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCTAGTGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145182	143615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_143600_145200
696114	contig_9656_pilon	-	1321	13	Intergenic	novelGene_121922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_7	505.115828300797	66	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	53	1252	446594	430496	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKRVGYILEEKVICFHDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSCSARIEGLGSICHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	446646	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_430794_430831_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440269_440309_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
696118	contig_6445_pilon	+	2451	5	Intergenic	novelGene_77080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	34.8317384004876	213	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	489	827	753260	757071	FALSE	15	GCCTTGTGTGCTTAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLAPLAVRAVEPISLGLALASVLTGYISYPRLYCLFAECCGQKRSLSREALQKDLDNKLFGQHLVKKVIVNAVFGFISNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVTACARSVFIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAIFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREEIKLKDMEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIDRNLIDYFVPFLPPGIQTPENVHPS	749452	758695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_749606_750316_750583_753190_753367_753450_753579_756967
696119	contig_8145_pilon	+	3239	4	Intergenic	novelGene_118642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	15.5777619273972	135	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	57	2318	16361	23764	FALSE	30	AATAATGCCTATTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHIVNRIAPQDEKPTTNSMLGVWIGDTAIPCTPSVAKGKSRAKISCTKLKTQNQEEELMKLAKQFDKNMEELDVIQEQSNRNQDFIPMISETETFNDYKDNVEMQSVPETDTVIMKKPMKENTEVSTADDQNSSHKSFDQSVEAAFNAIFDGSTQKSCGQLSQDLPDTFLNTSTTTFGNKSTLEEAIVTSETLIPVTLQNKTPESLPSRVDTPIMTKSCMTSCTEEPETFNKHVDPFATSDFEEDWEKLLRNEPFVIQNVEMPELLPVPKTTQGAVHKGVYTFDSKNGKSKSRTNTNLDARLSDSESLQDLPSRTYNRELIDAEKHKFLPDSNDKSNQLLSSGNKMKFEKSFNKIIIQDKIQDCALASNITKIKEDIHTKFIPTINASEKKSALNTGYFNEQKHKPISNHSFKTPANADLFGSVPSASKTKSGNKPNQTKAPDLGSFLDDWNDPSFANEIIKACHQLENTWETDDVDDDLLYQACDDIERLTQQQDIRKESKSKTSETVVEINNSSRPGAKNMFATSNQRSQLVQSKHLNLGSVTVQTSSLTDHSQIDKSVKMEKGETSGNSPSILGATTNLTMYSRSSNDEIDNLRVSWNNTDVPIKVNSSKLVFAGSSSLNVSSGHMSSEIPTTNKKLNSQHLSYRAGTDDTRTDLNRTVKFSKYTFTKMKNSQTHSQYNQNCTIGSMSDTKMTQSLEESRTPPVNPLREEVFQQQSLTKISESLKQPSKDEEEKNRKYSPEEIQRKRQEALVRRRAKARASSLSAAPT	13647	24685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_13680_16336_16450_16693_18748_23645
696122	contig_11752_pilon	+	1219	9	Intergenic	novelGene_37603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1060.98936728885	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	252	932	87505	105616	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPATSKRQPSVTQLLACPGHAVATGNVWKTSIITPATAIWGTMGPSVSLCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84087	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87262_87464_87547_88667_88776_92881_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
696140	contig_6735_pilon	-	1351	10	Intergenic	novelGene_15727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	861.031293791863	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	636	1145	543914	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHSPQAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDP	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542193_542571_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543919_552693_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
696144	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
696147	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696149	contig_5423_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_85286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTATTGGCCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570096	571102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_570100_571100
696150	contig_3095_pilon	+	986	4	Intergenic	novelGene_75024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2952.89654407329	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	103	582	147280	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_150413_150696_150996_151163_151848
696154	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696157	contig_15787_pilon	-	1178	4	Intergenic	novelGene_143993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCATTAGCGACCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111879	90467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_90766_95811_96019_98167_98319_111357
696158	contig_9297_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_69897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATATTTTCACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950602	950375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_950400_950600
696160	contig_6871_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_21681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120958	1121618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_1121000_1121600
696161	contig_9074_pilon	-	1984	17	Intergenic	novelGene_156625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_1	211.972202997822	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	36	1814	111461	61565	FALSE	25	CTGAATAAAGTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPERQIPFHDVRFPPPVGYNKDINESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKPATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKESAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKRAHMLIDMHFRSLRTKLSLILRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKNGKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIIPPNSLPSSNSRVGPNPSEEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRVLVVSSIVAGESQKPELKAWQGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSGTNSEASNASETESDHRDELSDWSLAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	111496	61394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_61607_62803_62887_63085_63269_64807_65004_67449_67537_70247_70311_70814_70950_71841_71952_76158_76238_76326_76498_78722_78840_78924_79019_79641_79791_80067_80140_82886_82981_88322_88376_111410
696168	scaffold_14325_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_162665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATATTAAATAAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517399	516969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_517000_517400
696170	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696173	contig_9955_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_21336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78490	80131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_78500_80100
696175	contig_13894_pilon	+	1226	9	Intergenic	novelGene_62137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2851.96901006568	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	502	1173	524877	528117	FALSE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521581	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523507_523625_524848_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
696176	contig_6102_pilon	-	1610	9	Intergenic	novelGene_32111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	346.851913646155	5	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	15	965	822105	818228	TRUE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVSQCLPYWAEFPLLWAISLPWLLTWVPCRKESPPPRRDLSPPYRLSMCLLMT	822119	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818256_818916_819040_819845_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
696181	contig_5084_pilon	-	3682	23	Intergenic	novelGene_64661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_19	10.6574189423329	56	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1063	3192	163	3354	1630525	1570407	FALSE	25	TTAAATTTGTGCTTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMKEGGALSEAVSLDGDEWELSKENVQPLRQGRIMSTLQGALAQQECTWNTAVQQQKRAFESEIRFYTGNDPLDVWDRYINWTEQNYPHGGKESNMSTLLERAVEALQGQERYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFKKADTIFQEGLQRKAEPLEKLQSRHRQFQARVSRQTLLALEKEEEEEVSGSSVPQRSTLADLKSKGKKTARAPISRVGAALKASNQNRGLQNPVPQQMLINSRITVFDENADAASRAELSKPAVQPWVAPPVPRAKENELQAGPWNTGRPLEYRPHGSAASAAAAPSVLPSFAPYVEETAQQPVMTPCKIEPSINHVLSTRKPRKEEGDPLQRVQSHQQESEGKREKMMYCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVFRKKLKEQREAELLTNAKKRAEMQKQIEEMEKKLKEIQTTQQERVGDQQEERLPAKETAEPRIASESQETPGMVLSSSLCPVNSCAREPSLAENICQEQPRSKGPSIPFSIFDECLPSEKKNISPPTDPPGALAQRRPLTILKTSESITSNEDVSPDVCDEFTGMEPLSEDAIITGFRNVTICPNPEDTCDFARAAHFVSTPFHEIISLKNLPSGPERLLQEEDLDVKTSDDQQTVCGAVYNQTLSVKKLSPIIEDSHEATHSSGFSGSSASVTSTSSSIKCLQIPEKLELTNETAENPTQSPWCSQHRRQLLKSLPELSASAELFVEDKPMPILEIGREIELGNEDYYIKEEYLICEDYKLFWVAPRNSAELTIIKVSSLPVPWDFYINLKLQERLNEACDRSCSSYQYQDGCIVWHQYINCFTLQDLLRHSELITHEVTVLIISNLLTKVEKLHEAEIVHGDLSPRTLILRNRIHDPYDFNKKNQALKIVDFSYSVDLSVQQDVFALSGFRTVQILEGQKMLATCSSPYQVDLFGIADLAHLLLFKEHLQVFWDGSLWKLSQNISELKGGELWNKFFVRILNASDESTVTVLRELAAEMNGLFDTVFQSHLNKALWKVGKLISPGALLFQQDRQASLPQVPA	1630687	1570078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1570639_1572004_1572112_1573083_1573256_1575758_1575902_1577344_1577495_1579566_1579668_1584025_1584167_1585078_1585216_1587572_1587848_1589782_1589889_1590013_1590075_1591204_1591255_1591811_1591928_1592445_1592559_1597488_1597719_1602124_1602217_1602379_1602595_1604380_1604551_1619044_1619242_1620137_1620283_1620713_1620774_1624574_1624722_1630493
696182	contig_11846_pilon	+	1271	6	Intergenic	novelGene_105945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTAACCCGCAGTAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254064	263838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_254652_254821_254996_257437_257519_258037_258080_259904_260113_263659
696184	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696185	contig_4759_pilon	-	2094	4	Intergenic	novelGene_106339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	528.096792474848	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	196	798	650121	587401	FALSE	50	TTCTAAAAATAAAATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPKTDCRSPVGLDCCSCCLDLAHRSELQGDSSGENNNPGSPTVNNFRQLQEKLIFENLNTDKLNSIMRQDSLEPVLRDPCYLINEGICNRNIDQTMLSILLFFHSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	651215	586104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587632_588757_588810_649801_650228_651126
696192	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_95074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696193	contig_7308_pilon	+	3466	1	Intergenic	novelGene_159614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1860	2159	551528	551827	NA	80	TGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDPSLTFPTNRFIGQELVCCFKILTKCFKVLTKPVAIESILTPGDLMCFRVELSSIEFSVAVILQNRSLGRPNSLCLSTNLKVGSSNPLVGATGRNAW	549668	553134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_549700_553100
696198	scaffold_13505_pilon	+	1901	3	Intergenic	novelGene_111575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	4	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGCAATGTGGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612546	635980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_613529_623354_623423_635129
696202	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696203	contig_10324_pilon	+	1608	9	Intergenic	novelGene_7836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	90.546949147942	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	88	444	283476	286399	TRUE	15	AGGTGTTTCCAAGGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPAPDLC	283388	296540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_286382_286645_287031_287092_287181_287272_288007_288036_288683_288797_290728_290767_295950
696207	contig_854_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_36761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATACAGACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1749149	1749398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1749100_1749400
696213	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_93694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696214	contig_14618_pilon	-	1553	7	Intergenic	novelGene_136850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2782	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCCAGAGGGGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354597	1279737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327380_1344835_1344943_1346054_1346137_1348515_1348598_1350876_1351054_1353798
696218	contig_6544_pilon	-	2039	5	Intergenic	novelGene_142079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	301	junction_1	122.088850842327	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1224	1733	75261	70864	FALSE	20	ATAAATGTTTCCTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPAATFEKHGEHLSRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLRTTGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGGAYAGITGNPSGWHGSSRGHDGMSQRSGGGTGNHRHWNGSFHSRKGSAFQEKPPLEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFVSMKLWMCN	107180	70557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_71184_71956_72087_75201_75317_75995_77031_107047
696219	contig_4103_pilon	+	1894	13	Intergenic	novelGene_51895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	42.694652280272	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	50	1579	53913	65973	FALSE	20	TGAAGCCTGCCAGTGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERAALEELVRLQGERVRALKQQKAKAEKIEEEVAKLLKLKAQLGPDEGKQKFVLKTPKGTRDYSPRQMAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53863	66288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
696224	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696226	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_91314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	123	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696234	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696235	contig_6929_pilon	+	1118	8	Intergenic	novelGene_139387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	6009.1988022446	4	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	465	788	127176	131989	FALSE	5	TTTGTGTATCTTTCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENSSNKKNMKFQQ	101881	132319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130847_131953
696238	contig_14415_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_77595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGCTCCACCTCACAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22770	22269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_22300_22800
696244	contig_6823_pilon	+	2441	1	Intergenic	novelGene_131258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACCACAAGTGTTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506106	508547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_506100_508500
696245	contig_5009_pilon	-	1414	4	Intergenic	novelGene_119252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	133.576445029304	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAGTATCTGCTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50483	43062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43540_43812_44622_47700_47792_50446
696246	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696250	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696264	contig_854_pilon	+	1415	7	Intergenic	novelGene_36230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2810.57461503278	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	130	675	543614	562402	TRUE	45	AATAAATTTATTGATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGGRWLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543484	563767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545935_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
696271	contig_12301_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_110028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGCTAGATGGTACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124933	125171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_124900_125200
696273	contig_6677_pilon	+	2618	11	Intergenic	novelGene_114179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_5	34.578750700394	7	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	192	2408	474189	482794	FALSE	20	CATTATTTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLGSEDVVKELKKAMCNPHIQADRLRYRNVIQRVIRHMTQGLDMSSVFMEMVKASATVDIVQKKLVYLYMCTYAPLKPDLALLAINTLCKDCSDPNPMVRGLALRSMCSLRMPGVQEYIQQPILSGLRDKASYVRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIVVVNCLRSLEEILKQEGGVVINKPIAHHLLNRMSKLDQWGQGEVLNFLLRYQPRSEEELFDILNLLDSFLKSSSASVVMGTTKLFLILARNFPHVQKDVLVQVKGPLLAACSSESRELCFAALCHVRQILHSLPGHFSTHYKKFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQVLEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIARTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTAVVQTFRDLVWLCPQCTEAVCQALPGCEENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVENVKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLAGIDEVKRILCSPKSDPSLGLLEDQAERPVNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKLQRAEHHGPEVPNTASFATSGPLIPEENKEQIQELPDSGTLTLVPSHQITAEYFEKTWLSLKVAHQQVLPWQGAVHPDTLQMALQVVNIQTIAMSRAGAQPWKAYLSAQDDTGCLFLTELLLEPEHVEMQISVKQNEARTETLNSFISVLETVIRTIGDIK	473691	483004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_473807_474112_474302_475740_475966_476662_476794_477180_477329_477797_478295_479323_479408_480555_480660_481427_481636_481825_482108_482369
696281	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	63	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696282	contig_6589_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_26200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	63.4019365284339	1219	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	228	815	2032681	2030536	TRUE	15	CATTGCATGTATGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRGVGLRMEDWDLCGGGVPAPFLGSLPFSTGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033671	2027926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031718_2032516_2032690_2033452
696283	contig_821_pilon	-	2358	3	Intergenic	novelGene_149396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	109	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTGCCTTTATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264116	160516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_162483_171178_171366_263911
696284	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696287	contig_18919_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_156032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTTAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131886	132167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_131900_132200
696294	contig_10135_pilon	+	1037	7	Intergenic	novelGene_106581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	35.0507568471147	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	45	1031	25097	27694	FALSE	20	TGACTTCTGTGAGTTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFGSDPANGFGCIFMLGFIIRPRHQLLPLLLCPGLRIPRLSVLCAQPRPRAMAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKGSVVAAYRKTHLCDVDIPGQAPMHESDSTMPGPSIEPPVSTPAGKIGLAICYDMRFPELSLALAQAGAEILTYPSAFGFVTGPAHWEVLLRARAIETQCYVVAAAQCGRHHQKRESYGHSMVVDPWGTVVARCSDGPGLCLARIDLSYLRQLRQHLPVFQHRRPDLYGSLGHPLS	25052	27700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25099_25663_25763_26029_26285_26387_26492_26718_26853_27021_27148_27427
696298	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696303	SIRV1	-	220	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3882	2	3608	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6758	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
696304	contig_11396_pilon	+	2017	7	Intergenic	novelGene_71283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGCAGCGCCGGGAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230969	249116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_232395_232978_233030_238733_238830_242971_243040_243744_243890_245692_245843_249034
696308	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_94498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657496	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657497	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696309	contig_998_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_153784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAGAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316268	313673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_313700_316300
696310	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_94730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	55	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696311	contig_4865_pilon	-	2209	5	Intergenic	novelGene_158166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	29.7689015585056	266	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	28	540	52988	22442	FALSE	40	TTAAGAAGTGTCTTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRRAARPGMEECGDSEPTPGCSGLGSGGARSRGGGSCDSWAPEDAWMGTHPKYLEMMELDIGDATQVYIAFLVYLDLMESKSWHEVNCVGLPELQLICLVGTEIEGEGLQTVVPTPISASLSHNRIREILKASRKLQGDPDLPMSFTLAIVESDSTIVYYKLTDGFMLPDPQNISLRR	53015	20772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4865_pilon_-_22463_22974_23117_49262_49399_49713_49796_52856
696316	contig_12790_pilon	+	1889	10	Intergenic	novelGene_35244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	313.182587851453	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	434	814	309644	311077	TRUE	35	TACACGTGTGTAAATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEERESPSLAKMLRARPRGSHVGIPAPIPSPMDSAAPPCLMTTAATQLRATWGRTWRWNGPSLQRSHRVLSVALSLTGASQWKSCLTAPVICTTSRCRPCPPPLKLQQMRTRRGNYLRTS	305952	313289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308832_309578_309671_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312031_312348
696321	contig_6102_pilon	+	791	2	Intergenic	novelGene_31791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	0	3934	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360097	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591
696324	contig_5331_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_112768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTAAGTGTTTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242235	245130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_242200_245100
696325	contig_6497_pilon	+	1280	4	Intergenic	novelGene_35576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACATCCGCCTTGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196465	202269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_197275_199572_199712_201385_201575_202126
696326	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696327	contig_8377_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_35164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGATGCTCATAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349476	349920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_349500_349900
696328	contig_8377_pilon	+	1150	4	Intergenic	novelGene_35165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTTATGTGTGGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351075	425534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_351273_352215_352635_381078_381243_425164
696333	contig_1230_pilon	+	1222	6	Intergenic	novelGene_28862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	736.047444123	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	66	986	405241	408754	FALSE	25	CACCATATAGTTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEEVD	404460	408990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406722_408743
696334	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696336	SIRV6	-	807	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8739	489	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGTAAGGTAGGCTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11286	1869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
696340	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
696349	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
696351	contig_12638_pilon	-	783	4	Intergenic	novelGene_33316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	706.95450112908	16	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGCCGTGCTGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325642	1298306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534_1303703_1310487_1310678_1325582
696352	contig_12570_pilon	-	1977	6	Intergenic	novelGene_79380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	24.6787357860973	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	40	1044	300289	280932	FALSE	30	ATGAAGGGATTCTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300328	279998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_293908_294088_300198
696356	contig_7919_pilon	+	1933	4	Intergenic	novelGene_28074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	107.951635261146	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	446	763	1068397	1079967	FALSE	80	AAAAAATTAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFL	1066938	1081137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1067292_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847
696357	contig_5005_pilon	-	1875	7	Intergenic	novelGene_84320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	486.049723107969	5	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	43	816	540029	512817	TRUE	30	AACGTGATTGTTCATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNIYLVRQRISRLGQRMSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	540071	511647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_511944_512053_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649_539722_539978
696358	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696361	contig_10500_pilon	-	1200	7	Intergenic	novelGene_41284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	774.713710562381	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	178	978	1640040	1628610	FALSE	35	AAAACCATCCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKA	1640217	1628387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628615_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
696362	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696363	contig_11512_pilon	+	341	2	Intergenic	novelGene_43210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	30	341	4011	4560	FALSE	15	GCTTATGCTGCTTATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	3981	4560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4297
696367	contig_7426_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_27565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGTTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211203	1211528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1211200_1211500
696373	contig_12250_pilon	-	1189	8	Intergenic	novelGene_80656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	191.783147096412	109	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	73	702	379717	376326	TRUE	30	AGGAATCAGTATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSVMSAWSSSKQPTSAETSSGISRAWAPCPSSKLP	380594	375689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377361_378505_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
696381	contig_7744_pilon	+	2653	17	Intergenic	novelGene_62459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	113.712888863796	2	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	13	1908	400981	407857	FALSE	10	TTTAGATTTCCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALKALDVAALQKELDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKAAGSLELFFDHCLFTMLQELDKTPGESLHGYRICIQAILQEKPKIATTNLGKFLELLRSHQSRPAKCLTIMWAIGQAGFASLTEGLKVWLGIMMPVLGIKSLSPFAIAYLDRLLLMHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLDFAYMPNNSLTPSLQEHLCQLYPRLKVLAFGAKPEATLHTYFPSFLSRATPSCTPEMRKELLSSLTECLTVDPLSASVWRQLYPKHLLHSSLLLDHLLKSQERIPKKVWKSLQETIQSFRLTNQDLLRKSTSNNQDVITCEAACKALLQQAWGPRLPWTRLLLLVLVFAVGFLCHDFRSHSSFQASLSGRLLQSSGFLPAGQQACAKLYSYSLQGYSWLEETLLTWSSHLFTMARPSLQLAWTHTNATVSFLSAHCASHLAWFGNGLTSLAQRIQTQLPDALSQLLHSLTELLLLLYQNVLLPLWHLLLEGLARAQEHCHKACRGEVTWDCMKTQLSEAAQWTWTYLQDITPPWPLASVLGRPSETAGCRRTAM	400968	408602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_401131_401634_401786_402086_402222_402436_402520_402945_403052_403158_403241_404091_404194_404555_404698_405079_405172_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652_407735_407785
696382	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696383	contig_3747_pilon	+	2605	6	Intergenic	novelGene_24972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	94.1585896241017	174	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	56	742	245371	255293	FALSE	25	TGTCTAGTGAGCCAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQGYGRVNVVEALQEFWQMKQSRGADLKNGALVVYEMVPSNSPPYVCYVTLPGGSCFGSFQFCPTKAEARRSAAKIALMNSVFNEHPSRRITDEFIEKSVSEALASFNGNKEEADNPNTGIGAFRFMLESNKGKSMLEFQELMTVFQLLHWNGSLKAMRERQCSRQEVLAHYSHRALDDDIRHQMALDWVSREQSVPGALSRELASTERELDEARLAGKELRFHKEKKDILMLAAGQLGNMHSSNC	233587	257156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_233608_245335_245500_248204_248346_253831_253928_254631_254710_255050
696384	contig_5988_pilon	-	1750	12	Intergenic	novelGene_15888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.8023868361298	212	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	228	1157	532502	529925	FALSE	25	CATGGTATTGCAATGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAERFTDLWWWMRLMWSRELYLCLTSCRPWCSQVERRSPELGEGIRQH	554967	529331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530063_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532541_549379_549429_554827
696386	contig_1301_pilon	+	1167	2	Intergenic	novelGene_47348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACAAAATGAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308863	322913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_309911_322793
696400	contig_6710_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_89315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGGCATTATCCACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
696402	contig_16510_pilon	+	2234	5	Intergenic	novelGene_139088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	9.14808723176599	287	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	23	565	289339	292515	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAELRAESDSLLLQLLRDLEELEAKREALNARVEEGWFSLSKARYAMGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAETPEEVGPREPALRRRKGLSRTSKPEPSAAPEDPLNWFGILVPHSLRQAQASFQEGLQLAADMASLQIRINWGRSQLRGLQEKLRQLEPGAA	289316	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289450_289529_289634_289736_289820_291155_291288_292402
696403	contig_14727_pilon	+	1545	4	Intergenic	novelGene_56627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	341.854744981939	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	42	422	47396	54270	FALSE	20	AATCCTTTGTGGAAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYGE	46217	55393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51531_54130
696407	contig_11932_pilon	+	2652	3	Intergenic	novelGene_85398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_2	14.5	159	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1172	2143	241177	243522	FALSE	20	GGACTAGCTTGGTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	236012	244031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_236346_240338_241732_243105
696412	contig_7293_pilon	+	820	2	Intergenic	novelGene_54248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11140	junction_1	0	156	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTTTAAAAATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335638	336581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_336241_336363
696413	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696415	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1573	638	1118	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
696419	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696420	contig_14322_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_116508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCCGCATGTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
696427	contig_9505_pilon	+	1247	12	Intergenic	novelGene_121839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	219.713637821206	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	169	642	560359	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	516254	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_516313_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
696428	contig_8156_pilon	+	1709	6	Intergenic	novelGene_98929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395195	441755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398545_403291_403537_403887_404006_404667_404810_441187
696435	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696436	contig_9848_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_79993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATTTTTAAAATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135347	132731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_132700_135300
696439	contig_10354_pilon	+	1900	6	Intergenic	novelGene_50855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	413.516916219881	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCATATAGTTAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432239	476491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432911_433030_434101_434164_471873_472041_475056_475127_475257
696443	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696444	SIRV6	+	519	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8750	-4	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
696447	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696448	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696457	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696458	contig_17198_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_62380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCAGTGGCTCCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949862	950254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_949900_950300
696461	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696463	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696466	contig_13244_pilon	-	2686	2	Intergenic	novelGene_86913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183374	180517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_182905_183075
696467	contig_6127_pilon	+	1259	3	Intergenic	novelGene_157048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	331	junction_1	45.5	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	15	473	11991	21933	FALSE	30	CTGTATAGACTTATTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPEMELLKFVRPENTTVSSRPSVEQLSSLIKTSLHYPESFNHPFHLKSLCLVPVTLLLSNCSKTDVDVIVDLRHKTTSPEALEIHGSFTWLGQTQYKLQLKSQEIRSLQLKACFVHTGVYNLGTPRVFAKLSDQVTVFETSQQNSMPALIIISNV	11976	22719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_+_12125_20645_20736_21698
696471	contig_6938_pilon	-	1519	8	Intergenic	novelGene_69067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	400.335879389458	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	97	630	169148	155784	FALSE	30	ATTCTTGTTTATATATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLCIPIGRRPGAFGPRGRGASAAHVRHRALEMAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGKLIENVDPEKAVQLYQQTANVFENEERLRQAVELLGKASRLLVRGRRGETRGVS	169244	154894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_155809_157629_157701_157886_157954_158074_158185_162374_162406_163983_164090_165469_165538_169092
696473	contig_2204_pilon	-	1380	3	Intergenic	novelGene_71681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGCTCGCTCATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51211	38810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_38837_48659_48716_49913
696474	contig_6227_pilon	-	1888	18	Intergenic	novelGene_49727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	404.64778139713	1	72	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	12	761	1224979	1211255	TRUE	10	GGTTATGGCTTCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNLRSTLLPCLPTRPK	1224990	1202619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203345_1203561_1203673_1204131_1204217_1204370_1204465_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212627_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
696475	contig_12622_pilon	-	1446	10	Intergenic	novelGene_5940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2452.04448834835	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	57	1445	1590968	1583550	FALSE	40	AGAAGCGAATTTATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPPPPTFLFCWNISNKFGFSNL	1591024	1583548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583609_1586683_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588547_1588947_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
696479	contig_13807_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_154570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTGGCAGTGAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8633	9690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13807_pilon_+_8600_9700
696481	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_90556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696482	contig_17518_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_117365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTTCTAGGTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150415	151289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_150400_151300
696483	scaffold_19766_pilon	-	1281	8	Intergenic	novelGene_34332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	112	junction_7	390.521890473217	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	191	1060	622205	596625	FALSE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623691	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_623580
696486	contig_9414_pilon	-	801	3	Intergenic	novelGene_131089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTAGAACCAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545474	535719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_536242_536363_536452_545283
696487	contig_5023_pilon	+	2167	10	Intergenic	novelGene_7139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	260.410691783309	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1351	1767	388228	405576	FALSE	40	AACTAAAAATCTGTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	323648	405976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_373062_373209_375332_375398_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
696491	contig_13044_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_100014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGTCCTTTTGCCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438835	441363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_438800_441400
696492	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696495	contig_5649_pilon	+	3467	12	Intergenic	novelGene_82275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	28.4456855215934	82	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	304	1695	43582	51752	FALSE	5	TGAGCTGTGTGGCCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLNINSNPGEWGWSTDAGERARLLQSPCVDTAPKGDGEASSGGTDRGTTSTLGAIFIVVNACLGAGLLNFPAAFSTAGGVAAGITLQMCMLVFIISGLVILAYCSQASNERTYQEVVWAVCGKLTGVLCEVAIAVYTFGTCIAFLIIIGDQQDKIIAVVAEGPEGASSGPWYTDRKFTISLTAFLFILPLSIPREIGFQKYASFLSVVGTWYVTAIVIIKYFWPDKEMTPGDILTRPASWVAVFNAMPTICFGFQCHVSSVPVFNSMRQPEVKTWGGVVTAAMVIALAVYMGTGICGFLTFGAAVDPDVLLSYPSEDMAVAVARAFIILSVLTSYPILHFCGRAVVEGLWLRYQGTPVEEDVGRERRRRVLQTLVWFLLTLLLALFIPDIGKVISVVGGLAACFIFVFPGLCLIQAKLSEMEEVKPASWWVLVSYGVLLVTLGAFIFGQTTANAIFVDLLA	39700	53524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_39726_40331_40454_43425_43852_44524_44724_44927_45073_45937_46037_46639_46698_46913_47029_48311_48460_48999_49200_50096_50152_51649
696496	contig_10159_pilon	-	2814	11	Intergenic	novelGene_30897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	206.031162691472	406	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	289	1200	1041017	1004067	FALSE	5	CTTACTTTTTGGTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQIGVKNVKLSEYEMSIAAHLVDPLNMHVTWSDIAGLDDVITDLKDTVILPIKKKHLFENSRLLQPPKGVLLYGPPGCGKTLIAKATAKEAGCRFINLQPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHEATAMMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1056741	1002452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1038415_1038537_1040930_1041030_1047673_1047711_1050916_1051092_1056677
696497	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696504	contig_8616_pilon	+	1776	13	Intergenic	novelGene_72477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	590.511760161378	3	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	537	1499	322373	330654	TRUE	15	GTGCCAGCCACTTCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTGSAV	318059	331062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322227_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330090_330236_330292_330467_330546_330640_330720_330850
696506	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
696507	contig_299_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_129424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	712	1023	836332	836643	NA	55	CTTAAAAAGCTAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEDPYLTPYTETNSKRIKDLNIKQKTIKIMEEKVESMLGTLLYGLNRIQIITNSIQTPKDKLDNWDLLKCKHLSSSKDVTKRVKENLQTGKKILAMTYPTKV	835620	836941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_835600_836900
696511	contig_8696_pilon	+	2646	6	Intergenic	novelGene_153339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.5292625324827	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1504	2079	1009934	1016099	FALSE	35	GTATTGAACATTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSPANIGQPRKTTLSPAQLDPFYTQGDSLTSEDHLDDTWVTVFGFPQASASYILLQFAQYGNILKHVMSNTGNWMHIRYQSKLQARKALSKDGRIFGESIMIGVKPCIDKSVMENSDRCALSSPSLAFTPPIKTLGTPTQPGSTPRISTMRPLATAYKASTSDYQVISDRQTPKKDESLVSKAMEYMFGW	1006526	1016666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_1008022_1009925_1010068_1012248_1012319_1013309_1013439_1014875_1015041_1016021
696512	contig_11285_pilon	-	1507	12	Intergenic	novelGene_5542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_11	288.125116303019	1072	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	129	1184	744458	741540	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745450	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
696513	contig_7919_pilon	+	2078	4	Intergenic	novelGene_28062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_2	65.1067499487487	138	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	590	907	1068397	1079967	FALSE	80	AAAAATTAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFL	1035995	1081138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1036493_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847
696515	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696516	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696519	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696520	contig_9921_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_23740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAGAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197795	199563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_197800_199600
696528	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696530	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_97513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696532	contig_13300_pilon	-	1974	5	Intergenic	novelGene_125815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	25.5831976109321	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	176	373	248830	248633	TRUE	25	GGAAAAGAGGGTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSGISQNHWGAPSLKTKTQEACSQNVRRGARARAWRSPLSRSWFCSPLLIPHLGEPMERQQWNFLLFSLTPLADTLPLLLSCPEGEIPLVSHVRSRDSTSSLRQPGAAQQAKGLLLVSAAA	249005	244179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_247440_247547_247919_248071
696536	contig_6837_pilon	+	1639	9	Intergenic	novelGene_149820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	24.8080128184424	31	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1074	1484	15658	17185	FALSE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11626	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
696544	contig_16098_pilon	-	1389	8	Intergenic	novelGene_46085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1821.92941013372	11	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	136	816	458816	456727	TRUE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCLPAWAYTPIWSDFQSSF	460262	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456766_457073_457176_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
696552	contig_8538_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_4607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTATCCACGTGCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689113	687058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_687100_689100
696554	contig_5217_pilon	-	2124	9	Intergenic	novelGene_135736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_4	100.854784219689	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	847	1845	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	532287	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477
696556	contig_8538_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_4903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
696560	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696565	contig_501_pilon	+	1366	6	Intergenic	novelGene_134905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	23.7200337267888	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	617	1366	793438	808589	FALSE	30	GTACGTTGTTTCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIRHSEQTLRTALISKTPALVLQYENLDAGERRLMNEAFQPNSALFEPITLHSQSDWITSHPEAPQDFEQFFNDAKRKTPSPEKCNIYIQSIGSLGNTRIISEEYIKWLKGYCEAFFYGLTVKLLEPIPVSATRCSFRVNDNTKNLQIHAGDILNFLKRKKPENAFCVVGITMIDLYPRDSWNFVFGQASLTDGVGIFSFARYGSDFYSSHYEGKVKKLEKSSSSEYSVFDNYYIPEITSIFLLRSCK	791759	808589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_792286_792607_792698_793437_793721_794083_794258_794349_794479_808425
696574	contig_15063_pilon	+	847	2	Intergenic	novelGene_14447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	217	705	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35847	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
696575	contig_20951_pilon	-	165	1	Intergenic	novelGene_43093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGAAGATGACCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28867	28702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
696578	contig_15888_pilon	-	1290	9	Intergenic	novelGene_84424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	330	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	60	869	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259785	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251731_252019_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
696579	contig_12046_pilon	-	2618	17	Intergenic	novelGene_83480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_16	61.4872636710238	123	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	587	2458	440574	377837	FALSE	70	TCAAAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWVCLFYVFCF	459470	377676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_378029_378820_378997_379312_379437_382569_382702_383556_383690_387355_387421_389900_390009_390220_390352_391727_391822_404547_404629_404711_404858_408214_408357_410629_410807_417122_417223_440503_440614_442835_442912_458999
696580	contig_12270_pilon	-	282	2	Intergenic	novelGene_114096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACCATCAGCAGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14412	13907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
696584	contig_20507_pilon	-	2829	2	Intergenic	novelGene_164208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147199	123455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_-_125992_146906
696588	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_97659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696589	contig_8678_pilon	+	1111	2	Intergenic	novelGene_164213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACAATTCAAAATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152709	153889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8678_pilon_+_153656_153724
696597	contig_7093_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_157965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACCTAAAAGTACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50565	49873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_49900_50600
696600	contig_6607_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_164219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAAACCCCCAGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454240	453019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_-_453000_454200
696601	contig_8616_pilon	+	2612	9	Intergenic	novelGene_72538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	13.7840487520902	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	247	2607	412280	424565	FALSE	45	CACACGCTAAAGGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCRNESGSPRPCELAAAPWSLEGPSLDAHLGGRKHRHLVELRAARKAQGLRSVFVSGFPRDVDSTQLSEYFQAFGPVASVVMDKDKGVFAIVEMGDVGAREAILSQPQHGLGGRRLRVRPREQKEFQSPAFRSPRGAAPDSHQLARALAEVPDVEAQMVKLVGLRELSEAERQLRSLVVSLMQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	409687	424570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_409758_412103_412295_419168_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
696604	contig_1964_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_130901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGCTGTTCATATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108547	106188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_106200_108500
696606	SIRV5	+	428	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
696608	contig_14811_pilon	-	1658	2	Intergenic	novelGene_74479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1013	junction_1	0	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	24	803	375703	357434	FALSE	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	375726	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102
696613	contig_11250_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_127156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	441	788	113302	112955	NA	40	GCTAATTATTCTCAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLELRSTLFTSIILCPIVQSRLCLKSWLREWFQFWANGESGGHVFWGPSSLRLLSLVFLLEFEFCIPLFSGSLRDSLLCSLSWRSLVVAGHLLVLLVSGWWSLWLCGPFCLLG	113742	111667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_111700_113700
696617	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696623	contig_6375_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_72953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	829	1146	201288	200971	NA	65	TAGCTGCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYLSIPPACVKRRVSAAPTFTPLPLVLFHRGLAPTSFEALYEAFPWSQFVRVMYNTLGDFKYSAYCWNPEAGHLAQRKHIGGEPIHENCLGENKEKVLRSGISG	202116	200805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_200800_202100
696625	SIRV4	-	170	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAAATTAAAGCGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625	1455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1500_1600
696630	contig_2069_pilon	-	1495	9	Intergenic	novelGene_23350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_1	78.7241028846947	662	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	120	1121	917868	902710	FALSE	20	ACTTAGTCTGTGTATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEQEEERFDGMLLAMAQQHEGGVQELVNTFFSFLRRKTDFFIGGEEGMAEKLITQTFNHHNQLAQTARREKRARQETERREKAERAARLAKEAKSEASGPQIKELTDEEAERLQLEIDQKKDTENHENQLKNGSLGSPGKQETEEDEDEEEDEKDKGKLKPNLGNGADLPNYRWTQTLSELDLVVPFHVNFRLKGKDLVVDIQRRHLRVGLKGQPAIIDGELYNEVKVEESSWLIEDGKVVTVHLEKINKMEWWSRLVSSDPEINTKKINPENSKLSDLDSETRSMVEKMMYDQRQKSMGLPTSDEQKKQEILKKFMDQHPEMDFSKAKFN	917987	902335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_902762_903176_903296_903390_903475_904376_904572_904664_904788_905563_905630_905723_905928_915433_915512_917787
696632	contig_7009_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_23681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTCACGCCTTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538274	539872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_538300_539900
696636	contig_13093_pilon	-	2627	5	Intergenic	novelGene_105223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.591380854511	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	233	2443	80341	57737	FALSE	25	TCCAAGAATGGTTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQNGRCSNNKLYLLLYQKTLRERAVWGRVCGRNFILVSVLN	80573	57552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57855_58896_60773_77589_77717_80070_80127_80307
696639	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696643	contig_5167_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_164100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACTCAGTGGAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311465	310819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_310800_311500
696644	contig_5261_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_102468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATTAATTTTATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537540	537158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_537200_537500
696645	contig_8663_pilon	-	1964	3	Intergenic	novelGene_58002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	250	junction_2	6.5	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGGCGGCTGGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74399	65465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_67307_71141_71209_74343
696647	contig_4202_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_147073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACATAAATATGTTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172053	170134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_170100_172100
696648	contig_14513_pilon	+	1263	4	Intergenic	novelGene_70345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	86	313	11375	11602	TRUE	30	GGGGAAAGGTCTGCATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLNLLFLYIKNKVQNSSSKEGGFREYKMEGFKVVIWLRNTLSGHGRSPWVVQMVKCSSANQRVGDSSPLRSASVERPCDLLLKSSHENPVEHSSTLTQMGSP	11289	19034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12158_13087_13136_14952_15001_18735
696654	contig_14322_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_115822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTCTTGAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671649	671353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
696659	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_96664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696660	contig_10134_pilon	-	1498	3	Intergenic	novelGene_16192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35009	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32606_32792_33731_34874
696664	contig_10734_pilon	-	2400	2	Intergenic	novelGene_51341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	338	349	1693605	1693594	FALSE	30	TTTAAATTACCTACAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQSGGGSEHLLEPEGSEVVELSPSEIPNLDQNGSEEQQPSDELVEKTDQTPEREVGPEKGGWRKGKRVSCYLNPEGKAAAPKESLVSTSTEDALFRKDDSARVFPLLPGAAVMKY	1696954	1691542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1693624_1696635
696665	contig_7202_pilon	-	401	2	Intergenic	novelGene_18589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGGCCGAATCGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30083	28518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
696669	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696674	contig_6710_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_98247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653503	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
696675	contig_8538_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_4706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
696678	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696685	contig_19006_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_145589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1302	1709	82474	82067	NA	50	AAAAAAGGCTTGAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIRDSTDLINQDRIYLLLCNVQGQAFSHTRFITQPSLLALDSCNLLPQIHSRFFWLYIRSWIKCLALWGRTVILRAQPGLTPGVSGPCIMTPWGIFNYFQEKKLLQLLISSRLEQKRKKGTKDLKKKLYNLQY	83775	81210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_81200_83800
696686	contig_34_pilon	-	2003	3	Intergenic	novelGene_40023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1680	junction_2	128	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225967	213625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_214152_215288_215458_224659
696688	contig_854_pilon	-	2359	9	Intergenic	novelGene_36430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	136.061968878155	6	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	204	539	1074160	1068926	TRUE	45	CAAAGGCAAGGTTGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGFSKG	1081785	1064606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1068944_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074182_1075837_1075892_1081657
696690	contig_7285_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_143404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAGAAGTTATTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306589	304619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_304600_306600
696693	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
696699	contig_6375_pilon	+	1864	8	Intergenic	novelGene_72946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	50.5677964797392	654	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	18	890	196329	200635	TRUE	20	CACACTGCTTCTGGTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLMCGRREILLLLRSQRQFHRVAGPSHWPQKPLTSRLPFPAGQNYGRPHYVLAAAGPRCLSTSAVSFAEAQVQASPPAVPVTPSPTAVTEVAPGETADVVQAAAEQSFAELGLGSYTPVGLIQNLLEFMHVDLGLPWWGAIAASTVLARCLVFPLIIKGQKEAAKIHNHLPEIQKFSTRIREAKLAGDQAEFYRACSEMTLYQKKHDVKLFRPLILPLTQAPIFLSFFIALREMANLPVPSLQTGGLWWFQDLTVSDPTYVLPLVVTATMWAVLEVSPGWPVPGLQS	196311	201775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_196392_196745_196905_197540_197758_199548_199693_200148_200235_200431_201182_201262_201344_201428
696700	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696702	contig_10331_pilon	-	1889	18	Intergenic	novelGene_54098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_17	222.061059591391	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	81	1727	365368	304759	FALSE	20	TGATTTTCTGATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKIPSGSVNLRSHILDSGYIMSDTLTLDVFGRRVEVNGEHATVRFSGVVPPTAGLWLGVEWDNPERGKHDGSHEGTVYFKCRHATGGSFIRPNKVNFGVDFLTAVKNRYVLEDGPEEDRKEQIIIGNKLVETVGFDSIIKQQSQLSKLQEVSLRNCAVNGAGGKGGIAETCPNIRKLDLSRNLLSSWDEVILIADQLKHLDVLNLSENKLQFPSGAPSLTGTFSAMKVLVLNRTGITWAKVLQCVPGWPALEELYLESNNIFISERPTDVLQMLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQWSFINELDKLQSLHSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	371645	304596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312168_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_318866_320092_320196_321424_321525_325324_325414_332861_333045_350131_350217_355498_355627_365333_365391_371587
696704	contig_15952_pilon	+	1362	4	Intergenic	novelGene_154082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	12.2565175405668	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	570	1172	538445	539422	FALSE	30	AGAGATCACAGTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLARAGVSCCELAEKDFLAVSPSDQRYRQVQYILLDPSCSGSGMLTRQLEEPGACAPSKKRLHALAGFQQRALCHALTFSSLQRLVYSTCSLCQEENEDVVRNALQNSAGTFRLVPVLPSWPHRGLGTFPGAEYCLRASPETTLTGGFFIAVLERKEVSSSASHTEAPGPELTASPTPKRKKKRRKLVAGASTLPGT	537875	539612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_538581_538774_538986_539092_539234_539307
696705	contig_14704_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_82712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116458	114108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_114100_116500
696708	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_97180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696710	contig_8683_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_150271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAACACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718119	716520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_716500_718100
696715	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
696717	contig_15092_pilon	+	1461	3	Intergenic	novelGene_57796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	3	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	130	696	325159	351165	FALSE	20	TATTAGACATTTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325029	351930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
696719	contig_17144_pilon	+	1538	4	Intergenic	novelGene_29111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	449.964689972693	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	38	1096	5087	10337	TRUE	70	AGAGAAAATGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKSIKFL	5049	11720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_10321_10714_11654
696722	contig_12270_pilon	-	219	2	Intergenic	novelGene_114143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTACATCTAACCGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14419	13977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
696740	contig_8357_pilon	-	2443	20	Intergenic	novelGene_39748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	283.352965481379	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	553	1803	795947	762891	FALSE	50	ATAATTACAAAAACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818368	762250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_795955_796004_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808821_818245
696755	contig_8520_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_85446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAACCTCAGGCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239870	241892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_239900_241900
696765	contig_14322_pilon	-	2021	4	Intergenic	novelGene_115617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	36.3593179253957	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	103	1557	98357	85882	FALSE	30	GCAACACTCAGGGCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVIFEDVAVDFTLEEWALLDPAQKKLYRDVMLETFRNLASVDDETPCKTSGSVSQQDISGEKKFNEHRITKFTRNDSWASILRKISEDLTIEDQHDNHGRNVRNHMFERLCESTERNQCGEICQIPNLTLYEKMPTRVKTYESSECGKVFMHHSSLKMHIADHTGHKPYQCQECGKAFSCPSYLRTHMRSHSGERPYACKLCGKAFSYLHSFRRHERTHSKEKPYECKECGKAFKWPLSLQTHMSTHTGEKPYECKQCGKTFKWPLSLRTHMSTHTGEKPYECKQCGKAFIWPTSLCTHRRTQCGEKPYECEQCGKTFSWAISFQRHVRVHTGETPYECSQCGKTFKWPISLRTHMTTHTGEKPYECKQCGKAFSQISHLREHVRMHTGEKHYECKECGKAFKWSSSLLKHMRMHSGEKPYECEQCGKTFKWPLSLRTHMSTHTGEKPYECKQCGKAFIWPTSLHTHRRTQCGEKPYKIIVL	98459	85417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_87023_87771_87956_88405_88533_98354
696769	contig_15628_pilon	-	1760	14	Intergenic	novelGene_147699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	119.785310911059	258	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	121	1239	189985	116737	FALSE	15	TCAAGGTTTTCTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTLGFPPLGAPGGSGTAHVRGPVLFLTRLRLRGRRALAVMETSLLRQCPLLLPQNREKTVYEGFISAQGRDFHLKILLPEDLQMKNARLLCSWQLRTILNGYHQIIQQRMQHCPDLVSFMMELKMILEVALKNKQELHAPPPPPQFYSRLIHELGTLGWDKVVYMDTGFSTFKLKAQDASGREHLITLKLKAKYPAESPDCVVDFPVPFPISWTPQSSLKSIHSQFLAALDSLKAFWDVMDEIDEKTWVLEPEKPTRSATARRIALGTNTSINIEVDPRHPTMLPECCFLGADHVVKPLGIKLSKNIHLWDPENTLLQNLKDVLETDFPARAVLDRPDFTMDCGICYAYQLDGVIPDQVCDNPQCGQPFHQTCLYEWLRGLLTSRQSFNIIFGECPYCSKPMTLKMSGRKP	190105	116215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_116773_118317_118390_120619_120737_122051_122134_122219_122266_122539_122624_125203_125355_141277_141347_147271_147369_159259_159361_167407_167465_173238_173300_176265_176325_189898
696773	contig_9706_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_20799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAACTTATATTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	1979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
696777	contig_12635_pilon	-	1419	11	Intergenic	novelGene_60802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	486.508211647039	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	249	1298	227344	173427	FALSE	65	AAGAAATAAATAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSGTRTSSPFQCHEKWNGQLAKCTSCSGGLGSEEQSSVLKV	262856	173305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_173437_174075_174187_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_262709
696779	contig_16578_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_148619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTTTAATAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68874	69609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_68900_69600
696780	contig_5878_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_145735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGGTTCGAACCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366369	366660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_366400_366700
696781	contig_5878_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_145736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTGGAAGTCCAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367217	367773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_367200_367800
696787	contig_3095_pilon	-	1062	6	Intergenic	novelGene_75216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1206.16274192167	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	38	334	255493	248714	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTTITHFPLFSIMSEKMALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQRP	255530	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248723_253626_253806_255384
696789	contig_8268_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_146999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAATTTTTGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69452	69159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_69200_69500
696793	contig_11422_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_99107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGTGAGAAGCGTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538	953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1000_1500
696799	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696802	contig_7091_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_131787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419948	417260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_417300_419900
696805	contig_3602_pilon	-	1596	11	Intergenic	novelGene_60671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_10	198.705712046735	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	77	964	1139393	1106687	FALSE	65	GAAAATAAAAAACAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139469	1106054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
696811	contig_21373_pilon	+	1676	9	Intergenic	novelGene_164223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	40.847085269331	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	819	1337	78794	83850	FALSE	15	GAGCTGGATGTGATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVEEGLVKAIGVSNFNHLQIERILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLVQYCESKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLDDPRIKAIANKHGKTVAQVLIRFPMQRNLIVIPKSVTPERIAENFQVFDFELSSSDMSTLLSYNRNWRVCALVSCANHKDYPFKAEF	70741	84189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21373_pilon_+_70881_76624_76793_77377_77495_78399_78914_79390_79498_79791_79874_80497_80582_81710_81794_83807
696812	SIRV7	-	377	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33186	6	-33	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114771	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
696813	contig_4103_pilon	-	1582	14	Intergenic	novelGene_51908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	382.833240381277	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	220	954	85413	80996	TRUE	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	85632	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362
696820	contig_13800_pilon	+	2180	16	Intergenic	novelGene_153709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	345.557880663846	1	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	858	1850	131988	162575	FALSE	45	AAAAGAAAACACCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94533	162905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_95759_95829_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125219_125892_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
696821	contig_5023_pilon	+	1153	6	Intergenic	novelGene_7264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2710.81822334143	112	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	79	573	607279	611823	FALSE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLW	580850	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611824_647724
696828	SIRV6	-	300	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGACGCAAGAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
696830	contig_5988_pilon	-	1600	4	Intergenic	novelGene_15970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	83	1438	655459	651962	FALSE	40	ATTAAGAAGAAAGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655541	651799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
696834	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696835	contig_5894_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_83014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	370	708	266120	265782	NA	10	TCCGGGGGCCATACCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQFYFVLQECYELELTRQQWVWFSVLKPFSSLFSFTSILQNCHHKQKKFIIYSPVCVRKINGVQQAGQPPALKKLNSEAGTNTHVSSNGHTYLMTEPQATHRQTNGTWSWE	266489	265092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_265100_266500
696850	contig_17493_pilon	+	2123	7	Intergenic	novelGene_122189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.29416327612	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	410	802	118558	156476	FALSE	0	TGGGTTTTGTTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADEDAFAEECRRRGQNALPSQPAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGFKEGGKRKKQKQREEQKKKKSTKGNH	49996	157797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50066_104373_104472_116052_116185_118447_118590_119116_119188_146410_146618_156393
696854	contig_9696_pilon	-	1295	3	Intergenic	novelGene_68773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	776	junction_2	201.5	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	47	409	150836	140950	FALSE	25	TACTTAGCCATATCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLPAGVLCGLVQDTMNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETVGSSSGNGKVGTASPKYYDDVYFDSDSEDEDKAGE	150882	140063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_141057_146412_146595_150762
696857	contig_3832_pilon	-	2108	10	Intergenic	novelGene_161419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	39.5608610674118	601	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	89	1222	47110	13517	FALSE	30	TTGCTTTATATATTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRARFPRRRRETGLLWKVVVNAWPAGLRGMGTPPGLQTDCEALLSRFQETDSVRFEDFSELWRSMKFGTIFCGRMRNLEKNMFTKEALALGWRYFLPPYTFQIRVGALYLLYGLYNTQLCQPKQKIRVALKDWDEVLKFQQDLINAQHFDAAYIFRKLRLDRAFHFTAMPKLLSYRMKKKIQRAEVTEEFKDPNDRVMKLITSDVLEEMLNVHDHYQNMKQIISADKSKPNKALSLIKDDFFDNIKNIVLEHQQWHKDRKNPSLKSKIKDGEEKREREGDSQESERCERAASLAKIKSKAFSVVAQASKSRRHRQIRLDSSDSDSASGQGQIKATKRKRNKEALKSAGKKVSSRNKGDMQNVNKEDKSLSLSMPVITEEEEEQNETFSKREFTVPKRRTLNKVPGI	47198	12630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_13567_18838_18941_29730_29882_34243_34307_35039_35115_36798_36958_42637_42743_44435_44577_44735_44896_46982
696858	contig_9815_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_164241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTTGAAAGGGAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64419	63961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_64000_64400
696862	contig_9696_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_68752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56775	54764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_54800_56800
696865	contig_6027_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_74411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGAGCATAATTCTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7644	6806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_6800_7600
696871	contig_15353_pilon	-	1935	13	Intergenic	novelGene_151984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1583	1933	529722	529372	FALSE	20	ACGTGAAGGCCACTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWRLLMRRWRWLLLWRRLLRRYLLLLLLLLLYLVGRRWWDRGLWATLARARPHGPAVLSKAHAGRRGAEVVEPAAATASSAPVKAASATAATPEPIPRHVCDQGAVEAKAKKTLR	544852	529369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_529871_530221_530271_531043_531243_531836_532116_532207_532304_532973_533167_533265_533353_533691_533812_534315_534363_534442_534566_543233_543281_543789_543878_544746
696873	contig_5954_pilon	-	2707	1	Intergenic	novelGene_28749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCAGCATTTTCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301233	1298526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1298500_1301200
696874	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
696877	contig_9901_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_126924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGTTTTCACTGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126602	126312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_126300_126600
696885	contig_8330_pilon	+	2185	10	Intergenic	novelGene_71759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	267.689473683572	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	968	1294	657181	657697	FALSE	10	TACCGGTGTGTCCGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKVSFWLPLAELMPQRPQAPGRHTAETGQAVKGCLLVPVLWEAAPETAVCWQWRFWQTAPEGP	644803	658588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_644880_648212_648365_649087_649305_651531_651599_653909_654027_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420
696886	contig_11855_pilon	+	2030	7	Intergenic	novelGene_67102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.679388163754	12	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	667	1416	2445507	2446256	TRUE	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440084	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440113_2440253_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2444464_2444587_2445373_2446560_2446851
696892	contig_19579_pilon	-	1421	5	Intergenic	novelGene_59389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	758.22502431666	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	88	408	13090	8694	TRUE	65	TTAAATAAAAAAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHSTS	13177	7177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8683_8825_12900
696893	contig_16666_pilon	-	1178	3	Intergenic	novelGene_61746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	434.5	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	21	302	59688	55974	FALSE	10	ATACCTTGTCTGTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADFLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59708	55097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_59552
696895	contig_14441_pilon	-	1204	2	Intergenic	novelGene_100795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	586	891	136334	136029	FALSE	20	GTCCTTGTTCTTAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAQSSLQWRRLVPARVTLQPAERLRLAYTPSSPKSCRSTLGGGGAGSPCGRCGAVGMRMQTLPYRAGESPASTLAEDSRNSAQPWFPGKAVLVGLQVKFC	137414	135715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_136866_137360
696896	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
696897	scaffold_9205_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_161107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAAAATATTGTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289309	288808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_288800_289300
696903	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_93647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
696906	contig_7816_pilon	+	1704	12	Intergenic	novelGene_66506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1193.34429023703	2	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	837	1604	196907	211658	FALSE	45	AGAAAAATGAATTGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170100	211758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181088_192896_193089_194850_194970_195755_195868_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
696912	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	212	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696913	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696918	contig_6217_pilon	+	2403	4	Intergenic	novelGene_109684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	20.8219969156552	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	249	1481	1016733	1017965	FALSE	20	TTTAAGTCACTCTTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSHTHSPSEQISQPVQPLPEPLPSLHPSASPSSPPSLQNHKYNTTSTSYSPLASLPLKADTKGFCNINLLEDLPLQEPQSPHKLNPGFDLAKGSAGKVNLPKELPADAVNLTIPASLDISPLLGFWQLPPPATQNAFGNSTLSLGPGEPLPHRLSCLGQQQQEPPLAMSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	877399	1018887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_877532_964389_964428_981681_981756_1016728
696921	contig_3571_pilon	-	1266	9	Intergenic	novelGene_88711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	34.7704526142528	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	461	778	41961	40251	TRUE	20	GATATATGTGTCGGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCR	100115	31495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_31562_33384_33490_36653_36877_38625_38701_40231_40416_41808_42004_45517_45659_49302_49434_99969
696923	SIRV4	+	350	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	184	416	184	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTCCACTCTTAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639	2355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
696930	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696934	contig_18231_pilon	+	881	7	Intergenic	novelGene_105887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	496	879	258743	277184	FALSE	50	AAAAAAAAGCCACGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFSHKVFNSIRTCSSTPSSRNMSLTSLMTSSITDLYNLGTVFVFAEFAISTHNTNKRGGNPEKQDKNKTKREKTKPKHPEGDRSHRTIGEKFLKSDPEGVERRAVRGGGGNTPPGAKNLENRLSKK	246955	277186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_246987_249439_249577_250801_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_276922
696936	contig_20058_pilon	-	3598	1	Intergenic	novelGene_109276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATACAGTTTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22667	19069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_19100_22700
696941	contig_6589_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_25816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	138.505189433465	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	6	674	746750	732935	FALSE	20	TAATACCTCTCTCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGADNLVGSSPGHQFRPHRTDLGSPGVPGLGSGSCGRLGGISGKSQVLFAVVFTARYLDLFTNYISLYNTCMKVVYIACSFTTVWMIYSKFKATYDGNHDTFRVEFLVIPTAILAFLVNHDFTPLEILWTFSIYLESVAILPQLFMVSKTGEAETITSHYLFALGVYRTLYLFNWIWRYHFEGFFDLIAIVAGLVQTVLYCDFFYLYITKVLKGKKLSLPA	746755	732251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_732970_736851_737105_745387_745547_746140_746242_746629
696942	contig_8284_pilon	+	1115	10	Intergenic	novelGene_125710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	432.759220825942	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	188	841	431923	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGQQESWLRGNEGEASAAEVAPSCAARRLHGTGAPSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425172	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425283_426635_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
696943	contig_7457_pilon	-	1426	4	Intergenic	novelGene_31281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_3	1288.1563914715	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161040	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_159269_160683_160767_161010
696945	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696949	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
696951	contig_10299_pilon	+	1925	16	Intergenic	novelGene_79710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.772128577929	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	911	1768	337976	340377	FALSE	15	TTTGACATGCTTGTCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320531	340534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334014_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336731_337010_337922_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
696952	contig_14133_pilon	-	919	5	Intergenic	novelGene_119957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3618	junction_3	320.839815951824	29912	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	386	880	208493	206601	FALSE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209454	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208728_209012_209131_209421
696957	contig_21373_pilon	+	1232	9	Intergenic	novelGene_164224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	44.7660585711988	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	367	885	78794	83850	FALSE	5	TGTGATCTCCTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPGKVGEAVKVAIDVGYRHIDCAYVYQNENEVGEAIQEKLKEKVVKREDLFIVSKLWCTYHDKSLVRGACKKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKAGEDNFPLDETGSVIPSDTDFLDTWTAMEELVEEGLVKAIGVSNFNHLQIERILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLVQYCESKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLDDPRIKAIANKHGKTVAQVLIRFPMQRNLIVIPKSVTPERIAENFQVFDFELSSSDMSTLLSYNRNWRVCALVSCANHKDYPFKAEF	76624	84197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21373_pilon_+_76793_77377_77495_78399_78478_78790_78914_79390_79498_79791_79874_80497_80582_81710_81794_83807
696959	contig_5988_pilon	-	2193	9	Intergenic	novelGene_16137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	78.2063576379824	88	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	20	946	1622355	1590227	FALSE	35	AAATGAGTCTGAGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAAGALSLLWGWLWSERFWLPQNVSWADLEGPGDGYGYPRARHILSVFPLAAGIFSVRLLFERFIAKPCALHVGIQDSGLYQAEPNAILEKVFMSITKYPDEKRLEGLSKQLDWDVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDTRQCWHSYPYQLLTSGLYYYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLATIGLITFSYINNMVRVGTLVMCLHDASDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFVVTRLGIYPFWCQRMIAVMWRAAQRKKM	1622374	1588979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1590282_1593386_1593494_1593600_1593730_1594950_1595044_1595762_1595814_1598961_1599020_1599715_1599847_1600464_1600571_1622158
696960	contig_12837_pilon	+	2026	7	Intergenic	novelGene_57324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	2580.38392922879	1	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	232	588	153893	166049	FALSE	20	CAAGTGCTATCTGTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	130410	167487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_130579_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
696962	contig_4847_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_156172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTTCTGCTCTCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102194	103253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_102200_103300
696965	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696976	scaffold_17907_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_150761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37301	37010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_-_37000_37300
696978	contig_13504_pilon	+	2153	7	Intergenic	novelGene_157953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	16.3401346383682	89	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	46	1329	13154	25389	FALSE	20	TGTTTCTGACCCAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGASGGLERSRDRRRSSDRSRDSSHERTESQLTPCIRNVTSPTRQHHVEREKDHSSSRPSSPRPQKASPNGSSSSAGNSSRNSSQSSSDGSCKTPGEMVFVYENAKEGARNVRTSERVTLIVDNTRFVVDPSIFTAQPNTMLGRMFGSGREHNFTRPNEKGEYEVAEGIGSTVFRAILDYYKTGIIRCPDGISIPELREACDYLCISFEYSTIKCRDLSALMHELSNDGARRQFEFYLEEMILPLMVASAQSGERECHIVVLTDDDVVDWDEEYPPQMGEEYSQIIYSTKLYRFFKYIENRDVAKSVLKERGLKKIRLGIEGYPTYKEKVKKRPGGRPEVIYNYVQRPFIRMSWEKEEGKSRHVDFQCVKSKSITNLAAAAADIPQDQLVVMHPTPQVDELDILPMHPPSGNNDLDPDGQNPML	13108	26213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_+_13308_15000_15287_17597_17701_19376_19498_20929_21128_24036_24148_25078
696980	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
696981	contig_15350_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_164264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	783	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACGAGGATCCAGGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259225	258125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_258100_259200
696994	contig_10205_pilon	-	1799	10	Intergenic	novelGene_143121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	71.4842640026461	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	97	1113	256249	232772	FALSE	70	TAGAAAGAAAAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGEPPPGPNPYLRTWITAAACPSAPDAPSAIMAPGQLALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVF	256345	232085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
696996	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697000	contig_6084_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_127039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	667	1101	325122	325556	NA	65	TTTTAAACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKIKNFSMNYTSAKRKQVFTTESIGNIMINGENIEVVKDFILLDPTMNAHGTSSEEMKRLILWANLLQKTSLKCYFEDYDEPDLSHGIFSYLINACKSWTMNKEDWRKIDAFGLWCWQRILTLQELPEEPINLSWNQYSQNAP	324455	326219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_324500_326200
697001	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697003	contig_9199_pilon	+	1367	7	Intergenic	novelGene_65635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	40.3130114093315	813	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	73	696	120933	122011	TRUE	25	AAAGTGTGAGTGCATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKVLVVEENTDEGKEEVLPLVNISAHRQQVLRRSCCQGWMYSWRCSPPVQWGRPNGRWPKLGGTWKRLCRCW	115822	122835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_122293_122367_122429_122506
697008	contig_57_pilon	+	2361	8	Intergenic	novelGene_44905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_7	386.485947681286	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	1100	2215	120229	147529	FALSE	15	TTCACTGGCGTGTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQLMKLLGWTHCASFTENWLPIMYPPDYCIF	119129	147675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325_145446_147439
697019	contig_12886_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_135466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAAATAGATAAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285556	285234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_285200_285600
697021	contig_12079_pilon	+	1431	7	Intergenic	novelGene_67460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	699	1076	581000	600786	TRUE	15	ACCCTCCCGATCTGGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNSSIVCSFLIFYLKIVDSVHLQVLRDLQILQHSAVSKHPAVLGMPHLDAVLPLVPCELVLVHHSLGDQALGAEVPRLVYLFVVVSKLGLYRIGPQEHRSLRGGSRSHRSESLPSLGGRRASG	580301	638774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581021_598057_598155_599466_599548_600607_600886_601785_601877_609187_609274_638695
697029	contig_16119_pilon	-	1473	7	Intergenic	novelGene_164271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	92.4765736101131	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	204	701	85327	76525	TRUE	10	TTTATCTTTGTCTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKQRGLRRRWGRDVTRAQAAPVAARAAAAAAAVTSEPPESLQIGDSDPFLPEVLRSSSWCNKELKTMEERKVKRRSPKSFSAHSTQVVNTKKSAIPVSKSTGFSNPATQSTSQRPKLKRVTKEKTRPQGGEGKGAQSTPIQHSFLTDVSDVQEMERGLLSLLNDFHSGKLQAFERSEQRHMGTSYHQESSAGSRAHPLDLRFLRREAPRSQRKTDDMDFPPELMEKAFPWS	87360	67785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_68347_72574_72598_73733_73889_76491_76701_78145_78310_85169_85370_87199
697034	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697035	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697038	contig_16510_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_139069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCATAATCGTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232040	230748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_230700_232000
697042	contig_6710_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_95549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTGACTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
697043	contig_8848_pilon	-	2689	1	Intergenic	novelGene_140454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGTAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54123	51434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_51400_54100
697044	contig_4131_pilon	+	2382	6	Intergenic	novelGene_127868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7.81280999384984	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	433	1098	204305	205978	TRUE	35	CTATTATACTGACAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVGAGNREGICFLRSPVAPGDGGDRDLPTPLVSVMRLGVLSESHTLQVILGCEVQEDNSTWGFWKYGYDGQDHLEFCPETLDWRAAEPGAQATKLEWEVNKIRAKQNRAYLERDCPEQLRQLLELGRGVLDQQVPPSLVKVTHHVTSEVTTLRCQALNFLPQNITMRWLKDKQPLDAKEVEPMDMLPNGDGTYQGWMAVAVPPGEEQRYTCQNLRLLAP	198387	210763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_198477_203961_204711_205538_205775_205954_206069_207966_208000_209602
697048	contig_5928_pilon	-	1906	20	Intergenic	novelGene_40362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	27	junction_1	49.6284254174791	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	33	1769	251809	185346	FALSE	30	CTTAAGTTTTTATCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGFRRSIAYQLSRVLDLPPENLIKSISAVPISKKEEVADFQLSVDSLLENNSDHLRPDIQDQAKRLAEKLKCDTVVSEISTGQGTVNFKINRELLTKTVLQQVIEDGSKYGLKSELFSDLPQKKIVVEFSSPNVAKKFHVGHLRSTIIGNFIANLKEALGHQVTRINYLGDWGMQFGLLGTGFQLFGYEEKLQSSPLQHLFEVYVQVNKEAADDKNVAKSAHEFFQRLELGDLQALSLWRKFRDLSIEEYIRIYKRLGVHFDEYSGESFYREKSQEVLKLLDRKGLLQKTIKGTAVVDLSGKGDPSSICTVMRSDGTSLYATRDLAAAIDRMDKYNFDTMIYVTDKGQKKHFQQVFQMLKIMGYDWAERCQHVPFGVVQGMKTRRGDVTFLEDVLNEIRLRMLQNMASIKTTKELENPQETAERVGLAALIIQDFKGLLLSDYQFSWDRVFQSRGDTGVFLQYTHARLHSLEETFGCGYLNDFNPACLQEPQSVSILQHLLRFDEVLYRSSQDLQPRHIVSYLLTLSHLAAMAHKTLQIKHSPPEVAGARLHLFRAARCVLANGMKLLGITPVSRM	251841	185208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_185433_185856_185921_187388_187464_188605_188702_189140_189251_189332_189401_193156_193282_193780_193858_195102_195164_198667_198764_199904_200012_201202_201362_214487_214565_217593_217678_220326_220383_221490_221589_229383_229468_230831_230935_249346_249421_251773
697049	contig_4232_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_63460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	696	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGATGGTTTCCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557518	555914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_555900_557500
697058	contig_10082_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_63920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAACAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615783	617703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_615800_617700
697059	contig_8138_pilon	+	1904	6	Intergenic	novelGene_52401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	530.894490459263	9	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	207	662	280295	306552	TRUE	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	279918	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280101_280270_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306833_306972
697065	contig_1275_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_108869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	174	635	747507	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747333	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
697068	contig_9501_pilon	+	2785	1	Intergenic	novelGene_164280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418880	421665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9501_pilon_+_418900_421700
697074	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
697075	SIRV6	+	763	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	573	8	-30	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTTCAACAAGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	10758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
697076	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697080	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697084	contig_4531_pilon	+	1388	6	Intergenic	novelGene_47885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	164.763345438238	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	408	728	303716	330172	FALSE	30	ATCATTCCAAAATTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIQKIFVIVTFSKHIVEQMVAFIGAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	296834	330832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_297056_301983_302065_303610_303728_310531_310594_328808_328912_330028
697085	contig_11186_pilon	+	2031	3	Intergenic	novelGene_98870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTCTGACACCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234331	266663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_236218_239965_240037_266589
697088	contig_3571_pilon	-	2429	10	Intergenic	novelGene_88706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	57.8243402122986	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	257	1783	49349	30354	FALSE	70	AAAGAAAAAGAAGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAANFYAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWTVVTPMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFNSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	72933	29707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_31449_31562_33384_33490_36653_36892_38625_38763_40254_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_72761
697093	contig_7870_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_109047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACACTAGCAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634912	634605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_634600_634900
697096	contig_13244_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_86948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	1565	2344	279888	279109	NA	55	AAAAAAATCAGTAACTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVAILARHLFMSEVLEICESVHKLMEEKQLTVYKKGEVQTVASTQDLPEQNGVRIAPPVASSEGTTATLSTELEDCEIVLVVNGELPEAEQNGELGRQNEPQVSSEAEAALSPVQCITDCHPEMESVDLATKNNQVKLETSSSREDSTVSNIPPKLSKDSVISSSPENSDMGNDISTEDVCAEDTPEHRQNLAQPLKDQENLVTLTAKADLGPDDDTYRSRLRQRSVSEGGYIRLHKGMEKKLQKRKAVPKSAVQQV	281452	278518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_278500_281500
697103	contig_8617_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_73470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACCAACCCCATATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
697107	contig_10017_pilon	-	2053	19	Intergenic	novelGene_156998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	39.2074256005444	299	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	42	1898	414343	359979	FALSE	5	GCCCGACCCTCTCTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSGEQAPDYRWILSIGDEAVRLEALNELAAEPLEKAVQAKLPAEEISSCAEVLLEAAKDLLSDWLDSRFGSEVTDNSIFSKLPKFWEEEFHKDMAALNVLPPDVLTRVSEYVPEVVNFVQRIVDNGYGYASNGSVYFDTVKFASSEKHSYAKLVPEAVGDQKALQEGEGDLSVSAEHLSEKRSPSDFALWKASKPGEPSWPCPWGKGRPGWHIECSAMAGTLLGASMDIHGGGFDLRFPHHDNELAQSEAYFENDCWVRYFLHTGHLTIAGCKMSKSLKNFITIQDALKKHSARQLRLTFLMHSWKDTLDYSSNTMESALQYEKFMNEFFLNVKGLLRAPVDVTGQFEKWEEEEAELNKNFYDRKAAVHEALCDNVDTRAVLEEMRALVSQCNLYMAARKAARRRPNRALLESVARYLTHLLKIFGAIEEDSTLGFPVGGHGAGLDVEATVMPYLQALSEFREGVRRIAREKKVPEVLQLSDTLRDDVLPELGVRLEDHEGLPTVVKLVDRATLLTEREEKRRGEEERRRKKEEAARKKREHEAAKLAKMRIPPSKMFLSESDKYSKFDDTGLPTHDAEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLHQEYLQTVQNGSVQ	414384	359823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_360114_360435_360520_361207_361268_362791_362860_363404_363486_367782_367865_368899_368969_369696_369887_370272_370371_370796_370901_371003_371134_371455_371585_372135_372249_381993_382116_385023_385113_385335_385477_391388_391461_403978_404044_414318
697111	contig_3627_pilon	+	2424	7	Intergenic	novelGene_78488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	15.9791530856092	269	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	15	1880	517909	542958	FALSE	40	CACTAATAAGAAACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVPWAEVREKFQAALALSRVELHKNPEKEPYKSKYSARALLEEVKALLGPAPEEEDERPQADDALNAENHSLGLPAEVVEAEGPVAQRAVRLAVIEFHLGVNHIDTEELSAGEEHLVKCLRLLRKYRLSHDCISLYIQAQNNLGILWSEREEIETAQAYLESSEALYNQYMKEIGSPPLDPTEHFLPEEEKLTEQERSKRFEKVYTHILYYLAQVYQHMEMFEKAAHYCHNTLKLQLEHNAYQPIEWAINAATLSQFYINKLCFMEARHCLSAANVIFGQIGKISATEDSTEAEGDVPELYHQRKGEIARCWIKYCLTLMQNAQLSMQDNIGELDLDKQSELRALRKKELDEEESVRKKAVQFGNGELCDAISAVEEKVRYLRPLDFEEARELFLLGQHYVFEAKEFFQIDGYVTDHIEVVQDHSALFKVLAFFETDMERRCKMHKRRIAMLEPLIVDLNPQYYLLVNRQIQLEIAHTYYDMMDLKVAIADKLRDPDSHIVKKINNLNKSALKYYQLFLDSLRDPNKVFPEHIGEDVLRPAMLAKFRVARLYGKVITADPKKELENLAASLEHYKFIVDYCEGHPEAAQEIEVELELSKEMVSLLPTKMERFRTKMALT	517894	543502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_518335_528832_528932_533034_533115_533432_533617_536351_536437_538190_538307_542082
697116	contig_14357_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_121642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39829	41834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_39800_41800
697119	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697120	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697123	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
697126	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697127	contig_7513_pilon	+	2463	2	Intergenic	novelGene_88961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	363	674	152268	154532	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENLLELPLRDAVAVEDDAGGLEARGLVELDEQLAHHGGQVLDDLLPVLLHPHGGAVTVGVGVHAAHDLGGQAGLVMVPRVPRPGCVGGRACLHPVVHTMVT	151905	156321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_152282_154234
697131	contig_4845_pilon	-	2359	18	Intergenic	novelGene_53630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.0081782925132	76	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	483	1925	265176	228128	TRUE	25	AAATTTTTTTCTGTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDLSSQDRKDLDKFIKFFALKTVQVIVQARLGEKICTRSSSSPTGSDWFNLAIKDIPEVTHEAKKALAGQLPAVGRSMCVEISLKTSEGDSMELEIWCLEMNEKCDKEIKVSYTVYNRLSLLLKSLLAITRVTPAYRLSRKQGHEYVILYRIYFGEVQLNGLGEGFQTVRVGTVGTPVGTITLSCAYRINLAFMSTRQFERTPPIMGIIIDHFVDRPYPSTSPMHPCNYRTAGEDTGLTYPSVEDSQEVCTTSFSTSPPTQLMVPGKEGGLPLAPNQPAHGAQADQERLATYTPSDGAHCAATPSSSEDTETVSNSSEGRASPNDVLETIFVRKVGAFVNKPINQVTLTSLDIPFAMFAPKNLELEDADPMVNPPDSPETGSPLQGSLHSEGSSGGSSGNTHDDFVMINFKPAFSKDDILPMDLGTFYREFQNPPQLSSLSIDIGAQSMAEDLDSLPEKLAVHEKNVREFDAFVETLQ	284101	225846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_226206_228052_228206_230043_230173_230552_230670_230890_230969_231554_231670_233978_234116_245973_246068_246923_247023_247373_247471_248206_248248_252334_252476_253656_253704_263479_263600_264064_264146_265107_265190_283256_283371_283746
697138	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697147	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697148	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697149	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697151	contig_14441_pilon	+	920	4	Intergenic	novelGene_100346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.107647738325	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	326	358	112112	112144	TRUE	10	AGCCTGCTTGGCGCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTSGVLTMISPSARGPS	6602	117779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6913_112096_112154_116578_116966_117613
697153	contig_16103_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_118899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1667	2047	759613	759233	NA	45	AAAAACTGTATGATTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEDSQWGLSPPEYSVQAGPSSGHLAPQAQTPPAKAPVCTELTPGGPFLWAISQQQLKLFSPSSTFSGVQFSCYSKCFCQAFFKNPHLVLIWFVHLPCSGHLLPEVRVEMRGLVASVMCPVVVHG	761279	758876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_758900_761300
697160	contig_7138_pilon	+	2182	2	Intergenic	novelGene_121005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGTTAGTACTACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357147	360363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_358930_359963
697163	contig_7457_pilon	-	1233	4	Intergenic	novelGene_31714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	104	445	1176842	1174926	FALSE	45	TTAAATAAAACATGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAPSLPDVPSPLPAFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176945	1174137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
697165	contig_15732_pilon	+	3172	1	Intergenic	novelGene_88854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29995	33167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_30000_33200
697166	contig_3077_pilon	+	1761	10	Intergenic	novelGene_26619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3716.252526337	8	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	591	1268	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9557	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10209_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17455
697172	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_97065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697173	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697175	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697179	contig_14666_pilon	+	1374	12	Intergenic	novelGene_39489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1082.90396237872	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	2	1036	303800	323175	FALSE	35	AAAAGATGTGACTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLGNSKTEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGDSEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	303798	323513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_303939_307502_307576_315320_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322346_322697_322746_323028
697180	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697181	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	252	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697184	contig_18869_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_56205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73739	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
697190	contig_18081_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_23796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGACAGGAAAGCTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120735	119884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_119900_120700
697194	contig_20614_pilon	-	1473	3	Intergenic	novelGene_107590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	679	junction_2	23.5	2026	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCAGTGTGGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302093	292137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_293369_295570_295693_301973
697197	contig_6589_pilon	+	609	5	Intergenic	novelGene_25794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1866.63989564136	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	30	521	669670	672754	FALSE	10	ACGGGCCCTGACTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668537	672842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669658_669748_670000_670104_671046_671188_672584
697199	contig_5671_pilon	+	1136	7	Intergenic	novelGene_79427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2210.19595033764	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	207	578	370430	531238	FALSE	30	CATATATATTTTATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368838	531796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521269_521303_531205
697202	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_95464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697203	contig_6137_pilon	-	1806	2	Intergenic	novelGene_59295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	93	305	1591628	1591416	TRUE	10	GAGTGTGTGTGGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENLAHFLLPLVWTTCEEGDPPLLPGWCLRSMDSECLLVTLSGPYFPLATGCALHTAEGLQPFLYGRTFQGPRRVWEMDTFSAADNSTSLRPKLSAHTLTM	1591720	1589242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1589767_1590438
697204	contig_12503_pilon	-	2550	1	Intergenic	novelGene_143817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAGAGAGATCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75895	73345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_73300_75900
697211	contig_12299_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_29727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGTCAAGAAAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67326	69280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_67300_69300
697212	contig_299_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_129486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGTAAAGAGAGTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401654	1400859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1400900_1401700
697213	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	23	364	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14431	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
697223	contig_4989_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_160776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAACGAGCTCTCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23551	22904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_22900_23600
697225	contig_16123_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_164287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGAACATTATTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249357	250104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_+_249400_250100
697236	contig_20493_pilon	-	2317	7	Intergenic	novelGene_86406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	35.1255684018858	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1657	2256	43387	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	47530	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931
697238	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697239	contig_15991_pilon	-	922	7	Intergenic	novelGene_70881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2812.56026108281	16	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	13	759	105108	100539	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGGRLVRGRAGALCAHSAVPY	105120	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_100944_100990_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
697240	contig_6397_pilon	-	2469	19	Intergenic	novelGene_146244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	99.3876467222544	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	211	1884	554772	437797	FALSE	5	GTTGTTGGGGTTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	601717	437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455606_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554855_601589
697244	contig_8330_pilon	-	2485	9	Intergenic	novelGene_71852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	236.694423254964	2	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	113	409	916108	902290	TRUE	20	AAGTCTGGTCCTAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSEVDKCSNNCSSHTAPWVLTASSSPAFGGTSPANPPGHSLCSPGRPASPAGRAEQESG	916220	894863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904823_904897_916051
697247	SIRV7	-	340	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33229	0	10	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
697248	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
697255	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697257	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
697259	SIRV6	+	256	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10489	5	1339	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11576	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
697271	contig_12250_pilon	-	921	11	Intergenic	novelGene_80701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	292.535621762547	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	85	576	401239	399175	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDDHSSNQAGRLPHPNLQVFL	401323	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399345_399477_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
697272	contig_5744_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_149331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1761	2078	316784	316467	NA	60	AAAAAAAAACACAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLLASWTEKKQRRKSAATLCIFNIVFSPFVLLFIVFSTLLSSPLLPLFTLPVFLVGFPRPIQSWPGAVGTAACVCADTVYYYQMVPSLAAALQSAMAAGSLGK	318544	316414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_316400_318500
697275	contig_3382_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_124012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128354	126641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_126600_128400
697276	contig_16461_pilon	-	327	2	Intergenic	novelGene_139211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	27	326	919	401	FALSE	30	AAGATGTTGCAGTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQA	945	399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
697280	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
697282	contig_4654_pilon	+	2507	1	Intergenic	novelGene_103034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGCAGGAGCAGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22991	25498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_23000_25500
697284	contig_12635_pilon	-	1368	10	Intergenic	novelGene_60815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	456.2375112446	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	178	951	252849	189700	TRUE	15	TCTACCTTTTGTTATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLKFSAFVSNISFVAFPAPNTNSPTKILPKTLGPINVNVGPQMIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIRLNIFLILTTPLRSTMT	253026	180237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192654_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_252818
697285	contig_8228_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_81787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGCAGTATATATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184360	187113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_184400_187100
697289	contig_12977_pilon	-	1712	7	Intergenic	novelGene_122812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_6	229.546412639265	1248	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	139	900	93850	68817	FALSE	40	AACAAGTAGTTTTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRRWGLRGAPRRPCSSQPGGAVAIAAWLGERSPARRAGPQRAASTMGQCGITSSKTVLVFLNLIFWGAAGILCYVGAYVFITYDDYDHFFEDVYTLIPAVVIIAVGALLFIIGLIGCCATIRESRCGLATFVIILLLVFVTEVVVVVLGYVYRAKVENEVDRSIQKVYKTYNGTNPDAASRAIDYVQRQLHCCGIHNYSDWENTDWFKETKNQSVPLSCCRETASSCNGSLAHPSDLYAEGCEALVVKKLQEIMMHVIWAALAFAAIQLLGMLCACIVLCRRSRDPAYELLITGGTYA	93988	68004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_68910_76187_76272_76557_76711_77707_77810_79526_79602_79843_80036_93787
697292	contig_233_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_14480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTCTCTTGGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13101	11719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_11700_13100
697293	contig_12015_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_164291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAATTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6507	8099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12015_pilon_+_6500_8100
697295	contig_13349_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_161129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	200	499	230357	230058	TRUE	30	AAGGGGCAGGTACCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLSFRSIILAVLWRPWVAVATAGLILRVLPPALSSPPACGSTPALPCCLCKCWTRRQDHTNPQLCTELESGFLEFSIWESPIWEFICSVFCLPVWHL	230556	228595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_229182_229270
697296	contig_992_pilon	-	2973	1	Intergenic	novelGene_164303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383717	380744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_380700_383700
697306	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_97677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697311	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_97337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697314	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	166	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697316	contig_21203_pilon	+	1010	7	Intergenic	novelGene_84490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	202.60998384965	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	49	1008	102802	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	93213	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_93256_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
697321	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697322	contig_15062_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_162310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327611	330114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_327600_330100
697328	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697333	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697340	contig_20614_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_107595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTCCAGTTTAAACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293555	292151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292200_293600
697345	SIRV4	+	133	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	705	1110	-73	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACAGCGAGTCAGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2700
697346	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697349	contig_10311_pilon	-	1875	11	Intergenic	novelGene_50456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	951.474350678987	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	65	1237	70470	65773	FALSE	25	TCACTTAAAAGTTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSGAEGEFGHVCREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71558	65134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70496_71519
697351	contig_5196_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_38683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCTTAGTTACAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165459	165050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_165000_165500
697352	contig_5196_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_38682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTGAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163639	162183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_162200_163600
697353	SIRV4	-	308	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATGTTCGTGAACGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
697359	contig_8317_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_20622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16462	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
697360	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697365	SIRV4	+	337	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1434	632	979	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2434	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
697372	contig_8616_pilon	+	971	8	Intergenic	novelGene_72576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1001.50183143484	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	16	897	425778	436516	FALSE	10	ACCTTTTCATGTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425762	436590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_427991_431055_431238_435726_435900_435993_436119_436357
697376	contig_15970_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_144057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	90.8167798372085	47	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	172	1095	220872	184977	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKEIDWQPYFTTRIVDDFGTHLRVFRKAQQKVTEKDDQVKGTAEDLIDTFFEVEVEMEKKICRDLVCTSPKDEEGFLRDLCEVLLYLLLPPGDFQNKIMRYFVREILARGILLPLINQLSDPDYINQYVIWMIRDSNCNYEAFMNIIKLSDNIGELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDISTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKEINTVKLAANFGKLCTVPLDSILVDNVALQFFMDYMQQTGGQAHLFFWMTVEGYRVTAQQQLEVLLSRQKDGKHQTNQTKGLLRAAAVGIYEQYLSEKASPRVTVDDYLVAKLADTLNHEDPTPEIFDDIQRKVLYIVFTILPFLKKYTFLCAHN	221134	184720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_185151_190522_190717_201786_201887_206505_206595_206961_207101_211533_211618_219477_219567_220817_220920_221010
697380	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697385	contig_8317_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_19665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAACAGCAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16759	16401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
697387	contig_14142_pilon	-	1659	16	Intergenic	novelGene_120588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	133.915894003164	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	181	1566	598441	584636	FALSE	30	TTCATAAGTAATTTATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGSQENATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598621	584542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586336_589383_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
697388	contig_10437_pilon	-	2900	3	Intergenic	novelGene_38381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644480	638984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_639043_640108_642860_644389
697392	contig_14481_pilon	+	2703	4	Intergenic	novelGene_153853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	24.0739601136904	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1461	1242	2702	204419	205879	FALSE	25	AGCCCCAGACTTTGGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQKQLFCDEKRTTLQKDNDVKNEIVDTIRLIPKPSISESSCHYELRNVKIDLPKINIPNGVLLKHEVDKYRKLFQSKPQTARKSISIKTVSCVEECMLLHKSEITEEEGIKMSAKILNFNCSKCRDNTRYSPNDLQKHFQMWHRGELPSYPCEMCSFSANDFQVFKQHRRTHKSTLVKCVICNNENVYTLLDLTKHFTSTHCINGNFQCERCKFSTQDVGTFVQHIHRHNEIHYKCGKCHHVCFSKGELQKHLNVHSGTFPFTCQYCSYGATRREYLIRHVITLHKEHLYAKEKLEKDKYEKRMGKTSAGLKLILKRYKIGASRKTFWKRKKISNGSDRSIEKNTQVIKKTNKTQTKSKDQSCLVQEHLNEKKDERVHCEKSDKPTELQSEKSTLLSTGQCNRAEEGLNSTSGSLKTSSVQGPTVLMVKNNKITIPANYSAKFMGFKMVDGKQHIVIKLLPANKQNLYSPGLQSGASKDSTANL	184486	205880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_184537_187153_187240_197918_198064_203458
697395	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
697396	contig_14450_pilon	+	1861	2	Intergenic	novelGene_48922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	469	1266	21705	22562	FALSE	45	GCGAAAAAGAGGAAGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNTLWITLRRMGIPKHLIVLMRNLYADQEAVIRTSPYLFHLYADQIIREAGLYEEGRGIRTGGRLIHNLQYADDTTLLAESEEDLKHLLVKIKDHSLQYGLYVNIKKTKILTAVPISNIMINRENTEVVKDFILLGSTINIHGSSSQEIKRHIASGKSAAKDLFIVLKSKDITLKTKVCLTEAMVFSIASYACERWTMNKEDHGRMDAFELRCWRRILNIPGLPEERTNLSWKYSQNAP	21236	23157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_21885_21944
697397	contig_4103_pilon	-	1939	6	Intergenic	novelGene_51905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	7.47261667690776	242	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	89	769	74485	70482	TRUE	40	TGAGAAACGAAGATTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSCEKSAEHGSYGEDPDSAEAPTRFRDTPEDIVLQAPASGLALHPARDLLAAGDVDGDVFVFSYSCQEGETKELWSSGHHLKSCRAVVFSEDGQKLVTVSKDKAIHILDVEQGRLERRISKAHGAPINTLLLVDENVLATGDDTGGVRLWDQRKEGPLMEMRQHEEYIADMALDPAKKLLLTASGDGCLGVFNIKRRRFELLSEPQSGDLTSVTLMKVQLDTVE	74573	69224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_70163_70249_70606_70699_70880_70997_71086_71171_71273_74297
697399	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_96089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697401	SIRV4	+	215	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	648	1085	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
697402	contig_9011_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_159275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCACTCAGCATAATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137391	136534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_136500_137400
697403	contig_9011_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_159277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTATAAAAAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140117	140802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_140100_140800
697404	contig_10437_pilon	+	2306	10	Intergenic	novelGene_38180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	140.147541303204	244	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	500	1870	201902	208508	FALSE	5	GGTCTGTTGTTTGCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHHKPEQPTSGEARTTEAVTSENHEVLSGPEEHPQDKDAGDANGAAGEQEPVDQASLPAQDQENLESPPPEASSSQVEPAHGTQTEVETVGACPRPQGLPLSPRARQPELDFYCVKWISWKEERTPIITQSTNGPCPLLAIMNVLFLQWKVKLPPQKEVITSDELMAHLGDCLLSIKPQEKSEGLQLNFQQNVDDAMSVLPKLATGLDVNVRFTGVSDFEYTPECSVFDLLGIPLYHGWLVDPQSPEAVNAVGKLSYNQLVEKIITCKHSSDTNFVTEGLIAEQFLETTAAQLTYHGLCELTAAAREGELSVFFRNNHFSTMTKHQSHLYLLVTDQGFLQEEQVVWESLHNVDGDSCFCDSNFHLSHSLVRGPEAEGGSGSPEKQRQVDQQPQGTLGLSDLELAQQLQQEEYQQQQAAQPVRTLVPSPQGRGSASGRPAGERRQRPKQESDCALL	198721	208944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_198867_201547_202355_202737_202796_204217_204283_204597_204757_205264_205368_205962_206106_206907_207100_207459_207577_208427
697412	contig_11448_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_66391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414288	416765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_414300_416800
697420	contig_6710_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_97960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653413	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
697424	contig_10642_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_78754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATGATAGCAGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453258	1452803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1452800_1453300
697425	contig_10642_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_78753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGATGTCCTCCGCCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452646	1451715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1451700_1452600
697429	contig_1719_pilon	-	2909	2	Intergenic	novelGene_87252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	327	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCCTTGTTATGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92118	89174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_91010_91044
697437	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
697438	contig_10638_pilon	-	2479	11	Intergenic	novelGene_164309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_10	10.8577161502776	82	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	11	1258	533710	434965	FALSE	10	TTTTGGTATGCTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASILRRGFLLARKAALPQFSTAGKRCLLSAAYVDSQKWEAREKEQCHLADLASLMDKTYERKLPVSSLTISRFVDNISSREEIDHAEYYLYKFRHSPNCWYLRDWTIHTWIRQCLKYGAQDKALYTLINKVQYGIFPDNFTFNILMDYFIKKENYKDALSVVFEIMMQEDFEVPSTQLLSLYVLYHSLEKKTDFSWEEERNFGASLLLPGLKQENSVGLSSQLYGYALLGNVELRQGLRAVYHNMPLMWKPGYLNRALQVMEKVASSPEDIKLCREVLDVLDVVLQALTSPADGSSEEQSQEGEDHQGAEDLVENLDTKETERSKLPQYLERFKALHSKLQALGKVESESLLTLTTQLVKDKLPTCEAEDIANYEQKLQQWHLERVQLIQREQEQREKARQEHQARTAAKASA	533720	433743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_435205_437703_437875_440008_440152_441757_441861_453423_453540_454431_454511_456866_456982_505490_505550_510629_510701_528491_528570_533637
697439	contig_10404_pilon	+	1131	6	Intergenic	novelGene_138666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	11	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	66	515	1085448	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085382	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
697440	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_94878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697443	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	440	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697444	scaffold_16539_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_68420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCCAAATCATTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956924	956120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_956100_956900
697448	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_89194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
697451	contig_3469_pilon	-	2069	16	Intergenic	novelGene_34162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	88.73090404889	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	235	1191	413507	385286	TRUE	60	AACCTTAATAAAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSGKSSGHGL	427670	380050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383854_384228_384317_385139_385188_385267_385314_392535_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444
697452	contig_4125_pilon	+	1229	8	Intergenic	novelGene_25202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	221.487089041878	149	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	92	682	1510873	1518074	TRUE	30	TGAGATTATTTTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505627	1518705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984_1518298_1518381
697454	contig_5826_pilon	+	967	6	Intergenic	novelGene_71527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_5	53.8092928777177	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	110	613	221337	228733	FALSE	35	AATTTGAGTGTAAAATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDCQIKKRSASLNSKPSSLRRVSIVSLPRNTGNVGTMAGMENNDRFSRRSSSWRILGSKQSEHRPSLCRFISTYSWADAEEEKCEVKTKDNSEPPGEETVERTRKPSLSEKRNDPSKWDGSSIYGTIASWATNLKTSFRKANKALWISAAFTVLFAALMSFLTGLFFQKPVDATPTQSGDSWMSLEHALWPFTRLQHNGPPPV	219136	229087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_219183_221155_221219_221336_221387_221686_221789_226859_226968_228489
697465	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697466	contig_7050_pilon	-	2754	1	Intergenic	novelGene_153630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719285	716531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_716500_719300
697468	contig_11978_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_63149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2079821	2077516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_2077500_2079800
697474	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
697477	contig_5247_pilon	+	2222	15	Intergenic	novelGene_81807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	209.954477573262	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	831	1886	154801	161215	FALSE	15	GAATTGTTCCTGTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	147211	161551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154017_154784_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
697486	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697492	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697493	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697498	contig_2087_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_65571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTTTCTGTGTGTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71428	70212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_70200_71400
697499	contig_11285_pilon	+	2108	13	Intergenic	novelGene_5607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	522.681779915424	1	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	451	1794	767140	769878	FALSE	15	TCAACTGTCTCTTGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQVNKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766616_767053_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769657_769756
697504	contig_11720_pilon	-	1679	13	Intergenic	novelGene_43893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	171.566232756397	62	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	95	1042	124674	117501	FALSE	5	CCCTGTATGGCTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFPSSFSMCIYCLSGWR	134615	116863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117549_118135_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134557
697509	contig_18869_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_56199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73735	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
697511	contig_990_pilon	+	2182	8	Intergenic	novelGene_76045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	48.4001180636104	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	297	788	882997	890739	TRUE	15	TGGACCTCACACTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870403	895985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_880895_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893438_894961
697514	contig_1244_pilon	+	1346	7	Intergenic	novelGene_38011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACCTGCCAGTGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922789	928888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_923330_923427_923551_923725_923827_924214_924347_924582_924715_927038_927231_928762
697515	contig_3602_pilon	+	983	7	Intergenic	novelGene_60496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	163	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	122	571	161745	169451	TRUE	10	CTGACTTGGCTCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161623	171128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_169676_170940
697519	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
697521	contig_327_pilon	-	2898	4	Intergenic	novelGene_164317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	39	junction_3	33.95094500403	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	621	1829	23541	22333	FALSE	35	TAACCATGTGATAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSEESCNQRTQKRKIYHVCLQEGRQIFIQVHKITQIDDQVHQCLECERNFCENLALIMCERTHTGEKHYRCDMCEKTFIQSSDLVSHQRIHTYEKPYKCSKCEKSFWHHLALSGHQRTHAGKKFYTCDICDKNFGQSSDLLVHQRSHTGEKPYLCSECDKCFSRSTNLIRHRRTHTGEKPFKCLECEKAFSGKSDLISHQRTHTGERPYKCNKCEKSYRHRSAFIVHKRVHTGEKPYKCGACEKCFGQKSDLIVHQRVHTGEKPYKCLECMRSFTRSANLIRHQATHTHTFKCLEYEKNFSCNSDLIVHQRIHMDEKPHQWSTCESGFILGMDFVAQQKMRTHTEELHYKYSVCDKSFHQNSALLQHQRIHIGEKPYVCNVGEKNVELNPPHASEASQMS	43478	21263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_327_pilon_-_23725_24555_24631_42306_42396_43205
697522	contig_19564_pilon	-	2575	5	Intergenic	novelGene_29694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	4.65698400254929	82	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1137	1676	138056	137265	FALSE	15	GCATTTTCTTTAATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLLFRGQAMGVLPGEASTKSKETLEGSKAGLSSRIPAHPRMDHRLWKTNPTALSADTLPKRAIVDTKTSVPSTTQASMDLLCETVPSRPGWNEPSDLAAIISLWPCDGYCEAPAQHPESATHPPPSTTSLFGVQRCVSSLVRSVRSSDRASRDSSLGPHLCSLQLPPGSSSPLPNDC	141610	136365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_137658_137909_138201_138538_138726_140133_140198_140869
697524	contig_5643_pilon	-	739	5	Intergenic	novelGene_39115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.965856457279	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649511	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_649392
697527	contig_6876_pilon	+	1772	4	Intergenic	novelGene_147020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.3398435016663	27	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	136	1221	133885	142234	FALSE	10	TCTTGGGTGACTAGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTITVLTAFLLSQFPYNCILLVQTINAYTMIISNCTISTNIDICFQVTQTVAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSFTFLCPAGGSVIPHLL	126378	142785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_133860_133906_140423_141439_142184
697528	contig_7695_pilon	-	1780	13	Intergenic	novelGene_41668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	155.321418534456	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	200	931	906566	903701	TRUE	60	AAAGAAATGAATATGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKDAARSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVKKEKEKEPEKLDKLENSMAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQVEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQPENPGAELTHP	907350	896356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901674_901959_902068_903699_903809_903914_904005_904635_904786_905766_905995_906230_906312_906491_906633_907217
697529	contig_10451_pilon	-	2159	4	Intergenic	novelGene_138330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.265317909217	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	48	509	575149	460351	FALSE	55	AGAAACAAAACCCTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPRLPDPQVPARPDMTGLGPDQEFDFEFLFEFDQSDEGATAATGEHYSYASSGISSGLPLSTAHPVLPAPCHDLHFLPAEKHCDVTSAQHKPEAPRPFFCHLYKVQPQHRPQPPRTPAARWRGPHHSGSAKTQSCPLKCSPSVISRHAAAAVNEIIRNDLSSTNIHS	575196	458700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_460401_494915_495146_564545_564637_575058
697530	contig_4896_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_164319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATCTGTACACAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18293	18934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4896_pilon_+_18300_18900
697534	contig_6230_pilon	-	1621	6	Intergenic	novelGene_102109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	14.2407864951343	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	129	851	175095	166056	FALSE	10	TACTGTCTTGACTTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182130	165285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175110_182016
697540	contig_10354_pilon	+	2160	5	Intergenic	novelGene_50833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_4	230.693926014536	3	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	285	992	432370	475314	FALSE	30	GAATTTTTCCATTCATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432085	476482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_471873_472041_475056
697542	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697544	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697549	contig_11594_pilon	-	2906	3	Intergenic	novelGene_80884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	0.5	80	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	839	1252	79830	75839	FALSE	35	ACAAATCTGTATCCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEKRKLLMDHIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNVRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIGHGI	80668	74184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_76014_76865_76972_79697
697554	contig_4336_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_152363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAACACACTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365412	367465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_365400_367500
697555	contig_19890_pilon	-	1350	7	Intergenic	novelGene_138540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	120.751351499223	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	101	1237	103426	95869	FALSE	15	TTTGAACTGTCCTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSLTPVMLRALGAQIEKTTNREACRDLSGRRLRDVNHEKAMAEWVKQQAEREAEKEQKRLERLQRKLAEPKHCFSSPDYQQQCHEMAERLEDSVLKGMQAASSKMVSAEISERRKRPNKSRTSGGASAEKRKCFWLGMDGLASAEGSSSESSDDDSDPAPSTSGTCCQSPRNGSDGVEMAAEFPIGCHRPEVLSADSGSPEKLQKNSVIDSGKDTSKDSRAKLEETWTEEQTERKMPIETEEAQENKEAESKAARAGPNGEEETKEMTDGERAAKVARGQDRENIPVAKLEESESGDTVSHFRHIGQGTVDLLAFSSAAELELLGLDQLKSELMALGLKCGGTLQERAARLFSVRGLAREQIDPALFAKPLKGKKK	107223	95755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_-_96091_98236_98742_101036_101152_101934_102105_102422_102519_103397_103461_107157
697559	contig_5434_pilon	-	2446	12	Intergenic	novelGene_74676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	133.614160183915	5	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	170	1426	353164	325255	FALSE	5	TGTTTTCATCTTGTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAKKIIIKDGGTPQGIGSPSVYHAVIVIFLEFFAWGLLTAPTLVVLHETFPKHTFLMNGLIQGVKGLLSFLSAPLIGALSDVWGRKSFLLLTVFFTCAPIPLMKISPWWYFAVISVSGVFAVTFSVVFAYVADITQEHERSMAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQIMKFSPESVAAFIAVLGILSIIAQTIVLSLLMRSIGNKNTILLGLGFQILQLAWYGFGSEPWMMWAAGAVAAMSSITFPAVSALVSRTADADQQGVVQGMITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	379604	324234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326885_331417_331516_333049_333163_345064_345137_345931_346046_347592_347812_350267_350383_352241_352370_353137_353201_363117_363214_379567
697562	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697563	contig_3277_pilon	+	2254	10	Intergenic	novelGene_74724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	503	junction_9	582.597398204851	218	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	148	1278	240775	265230	FALSE	45	AAGTAAATGGAAAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPR	188829	266206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618_263687_265054
697571	contig_7027_pilon	+	1576	3	Intergenic	novelGene_164327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	70.5	156	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6008	41806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_6174_33153_33249_40490
697572	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
697576	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_93016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697581	contig_233_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_14685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGGATTTTCAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96281	97919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_96300_97900
697587	contig_18869_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_56405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCCAAATGAAGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73418	73759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73800
697590	contig_15543_pilon	-	2513	1	Intergenic	novelGene_164347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGAGCTGAAGCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56274	53761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_53800_56300
697593	contig_11493_pilon	+	2436	1	Intergenic	novelGene_143650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTACCCAAATTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97397	99833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_97400_99800
697594	contig_7050_pilon	+	1422	13	Intergenic	novelGene_153628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	267.973568348323	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	68	901	714322	846716	FALSE	30	GCTATTTCTATATAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAPEDPPRESSERAGQGLVRTGAYTLITPNENRRSQLRRIAEKELEDLEKWKEQNRAKPVNLVPRQLGGSQSEAEVRQKQQLQLMQSKYQQKLKREESVRIKKEAEEAAIRKMKAIQREKSNKLEEKKRLQENLRRDAFREHQQYKTAEFLSRLDKDLPNRSTCQVALRDPQYSTWKLPVLPQDSSWARSRSYKDSLKEEENRKLQKMKDEQHRKSELLELKRQQEEEERTKTRQTEHRRVNNAFLDRLQGKSQPGGLEESGGYWNMNRGNSWDM	714254	847237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_714324_714443_714507_732208_732268_734460_734545_738683_738758_739460_739545_760439_760514_799721_799816_808115_808149_810822_810907_830795_830870_834426_834527_846707
697597	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697598	contig_2414_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_158458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCCTGCGCCATGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157273	157612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_157300_157600
697599	contig_15114_pilon	+	1161	3	Intergenic	novelGene_121082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.5	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTATTGTTGTAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24347	31504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_24450_24562_24722_30604
697600	contig_5019_pilon	+	2046	2	Intergenic	novelGene_109188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	163	333	171583	171753	FALSE	35	AGATTAAAATTGTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105661	173466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495
697603	contig_8284_pilon	+	1040	8	Intergenic	novelGene_125714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	696	junction_6	302.488589766251	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	113	766	431923	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	431810	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
697606	contig_1734_pilon	-	2426	3	Intergenic	novelGene_164384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	21	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAATGTTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645552	615342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_617407_641855_642027_645361
697607	contig_14536_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_69310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	471	851	209006	208626	NA	75	GAAAAAACAAAAACACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDAEKAFDKVQHPFMIETLNKIGIEGKFLNIIKDIYRKPTANIILNEGSLKAFPLRTGMRRGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRLEEEIKDIQIGREEVKVSLFADDMLLYTENPKVSKENYWN	209476	208323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_208300_209500
697611	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697614	contig_19851_pilon	-	809	5	Intergenic	novelGene_29877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGTGAGCCACATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	53925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53978_54059_54144_55648_55751_55838_55880_56001
697621	SIRV2	-	480	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	35	3217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
697624	contig_8616_pilon	+	953	8	Intergenic	novelGene_72570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	1001.50183143484	256	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	18	878	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428030_431115_431238_435726_435900_435993_436119_436357
697630	contig_14909_pilon	+	2031	14	Intergenic	novelGene_155705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	93.4502367335799	208	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	219	1685	105625	137710	FALSE	10	GATTGTCTTTTGTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYSQGGGKKKVCYYYDGDIGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKATAEEMTKYHSDEYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAGAVKLNRQQTDMAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNFPMRDGIDDESYGQIFKPIISKVMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLTVKGHAKCVEVVKTFNLPLLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDCEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTPEYMEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAVHEDSGDEDGEDPDKRISIRASDKRIACDEEFSDSEDEGEGGRRNVADHKKGAKKARIEEDKKETEDKKADVKEEDKSKDSSGEKTDTKGAKSEQLSNP	105406	138056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_+_105677_116615_116729_117845_117964_119445_119521_120070_120210_121369_121512_123937_124031_124110_124220_131058_131200_131427_131537_132125_132257_133084_133241_135806_135865_137679
697631	contig_16098_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_46163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGAGGTATTGTTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460265	458201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_458200_460300
697633	contig_5935_pilon	-	2911	8	Intergenic	novelGene_102708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	22.2802191027222	115	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	114	2411	1049311	1021110	FALSE	10	TACTGTGTGTTTCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVAAHSCHLLQQLHEQRIQGLLCDCMLVVKGVCFKAHKNVLAAFSQYFRSLFQNSSGQKNDVFHLDIKNVSGIGQILDFMYTSHLDLNQDNIQVMLDIAHCLQVQNVLNLCHTFLKSTTLDQPPGIPCNSTFSPQSALTPDANCVINENYPPQLLQECSPDAQHNKVADEPHSSAAPSVNLHNSSGEIPKQAPDTLDSSCTELPFKQPNYYYKLRNFYSKQYYKQATCPNHERIIEQPFAFSTSTDLNAVENPPCAVSHPECILESSEHLPSNFLAQPLSESAPDPESDCTCPQPAKQMRLKKAIHLKKLNFLKSQKSAEQTSEPKSNDDVTKRIGSTSENLIEKASSQSTEEKESEELASSENFSCMNETERLEDPAVLEDQSQALQSQRQYACELCGKPFKHPSNLELHKRSHTGEKPFECNICGKHFSQAGNLQTHLRRHSGEKPYICEICGKRFAASGDVQRHIIIHSGEKPHLCDICGRGFSNFSNLKEHKKTHTADKVFTCDECGKSFNMQRKLVKHRIRHTGERPYSCSACGKCFGGSGDLRRHVRTHTGEKPYTCEICNKCFTRSAVLRRHKKMHGKADMESRSAPEGFSRVIEAPDLDRSQSSDSFSQDMSVTLMPLSVKLPVHPAENSTTEFDSHSAGPYCKLRPMIQSHGISDQEKLSLDPVKLAKPQMQPTAHPAYAYGDVEASAVDEPLPADSMSIIRSSLAALDNHCSDALGSRAPSTAYRNSEGQFFSSMTLWGLAMKTLQNESELDQ	1057463	1020609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1041487_1041535_1045190_1046294_1049159_1049331_1057369
697635	contig_6823_pilon	-	1992	15	Intergenic	novelGene_131220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	27.4895156266486	42	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	499	1584	303648	248884	FALSE	15	GCCAGTTTCACTTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQYTRGFGHPSLVTALSCLYEKFYPNKINPNKEILVTVGAYGSLFSAIQGLIDEGDEVIIIMPFFDCYEPMVRMVGATPVFIPLRSKPVDGKKWSSSDWTLDPQELASKFSSKTKAIIVNTPHNPMGKVYTKEELQVIADLCIKYDTLCISDEVYEWLVYTGNKHFKIATFPGMWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325427	248475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288707_288803_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303739_305320_305380_320648_320750_321788_322006_325396
697639	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
697642	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_96615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697649	contig_11829_pilon	-	2271	1	Intergenic	novelGene_128138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAGTTGTGGAATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169609	167338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_-_167300_169600
697652	contig_18108_pilon	+	338	2	Intergenic	novelGene_33458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	385	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGGTTTAACAATGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108160	110441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_108449_110391
697656	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCGCATCCCCCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
697663	contig_2550_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_135681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGCATCATGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368780	1367677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1367700_1368800
697664	contig_2550_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_135679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366628	1366431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1366400_1366600
697665	contig_9463_pilon	+	1877	9	Intergenic	novelGene_83822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	231.42030890784	3	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	72	470	216051	219267	TRUE	15	CGGTGCCGCTGTGACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVLIFLCSLLAPVVLASATEQEKEKDPFHYDYQTLRIGGLVFAVVLFSVGILLILSRRCKCGFSQKPRAPGDEEAQVENLITANGTVQNAWQTTSRLTCMWPHEVAVTLHSLHLRSSVPVTPTEPQKAEN	185911	223346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_218893_219005_219238_219290_221961
697671	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
697686	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697687	contig_14508_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_79066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCTATCAGAAGTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141905	143839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_141900_143800
697688	SIRV7	+	251	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTATAGCCTCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70902	114726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_70987_78841_78963_114680
697695	SIRV4	-	864	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	8	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17774	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15114	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13904_14892
697696	contig_817_pilon	-	1731	1	Intergenic	novelGene_132462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCACCCTTCAGCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602195	600464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_600500_602200
697697	contig_817_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_132461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595833	594967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_595000_595800
697699	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_89235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
697707	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697715	contig_3233_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_56511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGATCACAATCAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99558	97273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_97300_99600
697719	contig_14322_pilon	+	230	2	Intergenic	novelGene_116532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCGCGCCGCCGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672891	674858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_672934_674670
697720	contig_13149_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_116924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAGATCAGATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35625	35927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13149_pilon_+_35600_35900
697722	contig_13149_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_116925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTCAGACTGTCTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36428	38079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13149_pilon_+_36400_38100
697723	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	658186	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658186	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
697724	contig_6102_pilon	-	1651	8	Intergenic	novelGene_32173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_7	319.848816327531	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	302	784	867239	839973	FALSE	35	TTCTAATAAACTGTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867540	839105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
697726	contig_13300_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_125790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	285	858	200	1057	158476	157619	NA	10	CCCTTGCACATGCGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSHTHSETPQAHTLTLTQTLPRPKERPSGARTPKASGGPLPGPGLHGISTSLPCRYLYSRRLNISMSSVKCFHQLASTYGAERLQDYCARLFTIVLLQDPSFRTPLDLHAYALATGDALLEALCVQFLAWNFEALTRAKAWPSTPLALLRTLLSRSELAVSSELALLKAVGAWGWENRASHEVIAGLLEEIRFPMMLPMDLFELQFNMSLFRDHEPLFRKKVLQALEFHTVPLRLLAQYRGLNFSEDTYRPRLYMAPTWSASVSGNIQNSWLAEKSRRVASIPSTHTTLLTPRPPLTIDITPIDLSRHPSTPASSSTTCSSPGLSPTSPPSRAAGTTGSRVPPTRSLPWA	158675	157059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_157100_158700
697729	contig_8259_pilon	+	1348	5	Intergenic	novelGene_148856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	101.165705651668	1630	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAATGGTAGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53107	64668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53172_57922_58092_59908_60041_62754_62830_63760
697739	contig_5549_pilon	+	1017	6	Intergenic	novelGene_81577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400.89234418638	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	62	325	82155	90721	TRUE	20	AATTTTCTTGGGATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKGAR	82093	96919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_90709_90821_91687_91835_93264_93412_96620
697740	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	153	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697741	contig_19564_pilon	-	1478	6	Intergenic	novelGene_29628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	960.222557535491	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	723	1295	12839	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15665	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12328_12393_13016_13125_13259_13554_13666_13945_14055_15472
697745	contig_3956_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_14733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAACAGAATATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426541	425303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_425300_426500
697749	contig_3942_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_128668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1107	1475	236665	236297	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHRKEKTKILTSGPICNIMNLEKIDVVKDFILLGSTINTHGNSSQEIKRCVALGKSAARDLFKALKSKDVTLRTKVCLTQAVLFSITSHACESWTMNKEDRRRIEAFELWC	237771	235527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_235500_237800
697753	contig_6710_pilon	-	247	2	Intergenic	novelGene_98322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCGAGTACAAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657496	653659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697754	contig_6710_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_94779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
697758	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_16530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
697759	contig_5286_pilon	+	2639	1	Intergenic	novelGene_157384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAACTGGAAAGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628576	631215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_628600_631200
697768	contig_12837_pilon	-	1330	2	Intergenic	novelGene_57367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATACACATTGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305201	295337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_296044_304577
697769	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91685	0	-91679	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGGCTGAATGCAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
697785	contig_11258_pilon	+	1866	6	Intergenic	novelGene_67787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	172.194076553173	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	25	621	279290	292582	FALSE	30	AAATTGTGATTTTGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279265	293827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
697786	contig_3837_pilon	+	2245	11	Intergenic	novelGene_104013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	205.458243932922	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	561	1265	67539	123213	TRUE	70	AAAAATAAAATATAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATILDRLHSLQINSSLSTYSLVDSVGNTKTFDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKNR	66978	132644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_75761_75846_77748_77816_88997_89221_121918_122015_123204_123366_124345_124469_128629_128722_132031
697791	contig_9283_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_164396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6238	3932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_-_3900_6200
697792	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91678	2	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
697798	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
697801	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_89426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697809	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_96476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
697812	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
697813	contig_2894_pilon	-	1203	4	Intergenic	novelGene_86528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	27.1334152332916	1377	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	257	913	136491	133851	FALSE	15	GATTGGGTTGAGCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCRSEVLEVSVEGRQVEEALLAVLHTVLLHRSTGKFHYKKEGTYSIGTVGTQDVDCDFIDFTYVRVSSEELDRALRKVVGEFKDALRNSGGDGLGQMSLEFYQKKKSRWPFSDECIPWEVWTVKVHVVALATEQERQICREKVGEKLCEKIINIVEVMNRHEYLPKMPTQSEVDNVFDTGLRDVQPYLYKISFQITDALGTSVTTTMRRLIKDTLAL	139997	133560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_134256_136239_136566_139540_139665_139939
697819	contig_6710_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_93232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACAGTGGTTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657794
697822	contig_16098_pilon	+	1739	9	Intergenic	novelGene_45810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	66.220748259137	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	79	1032	150572	152636	TRUE	15	GACTAGCTTGTGTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGTGSLGTQGLTPG	150493	154035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152878_152983_153104_153689
697826	contig_12624_pilon	+	1747	4	Intergenic	novelGene_61138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCAACCCCTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947497	955838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_948841_950589_950767_952912_952987_955685
697827	contig_9363_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_6785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATAGGTTAGAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536650	1536205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1536200_1536600
697838	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_92009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697849	contig_8628_pilon	-	2215	6	Intergenic	novelGene_164435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGATCTTGTGTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668169	646151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_646371_651941_652143_653086_654270_666373_666540_667579_667637_667780
697854	contig_12425_pilon	+	966	5	Intergenic	novelGene_46655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_4	146.274570585594	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	13	819	179275	198400	FALSE	70	TGAAAAGAATATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	179262	198547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
697856	contig_12638_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_33143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAAGGTCTCCAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195209	194174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_194200_195200
697859	contig_18869_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_56198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73734	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
697860	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697863	contig_5945_pilon	-	1316	6	Intergenic	novelGene_104573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.414492481843	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	190	765	235639	216153	FALSE	20	TAGGTTTTCTATATGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDSTRYCRRELGASYTVESGLMKIFFLLQNSPEPVLSWDRLYCDSKLSPAKETYDLY	249746	215601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249672
697872	contig_253_pilon	+	1448	6	Intergenic	novelGene_129733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	349	junction_3	95.0486191377865	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	29	967	582199	584892	FALSE	45	AATAAAGGTCAAAGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQVGRGSDGLSCAPSRWVWG	582170	585373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_582254_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700
697875	contig_7720_pilon	-	1657	15	Intergenic	novelGene_155779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	114.042263021662	12	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	132	950	860670	799033	TRUE	5	TCTCCGAGGCTCCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDRGFQCRPADGEHRSNTGPSKIVVFHYPRDR	905276	795752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796075_798647_799077_800535_800584_802424_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_860593_860723_905197
697880	contig_18869_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_56334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73568	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
697882	contig_11846_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_105930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	427	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	44	505	190518	190979	NA	10	GGCTGGCTTCAGTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKEPSSLSGKEKSPMPAACASPLATQPSPCAELPQTAPPPSGSPALPGRLEDFLESSTGLPLLTGGHEGPEPLSLIDDLHSQMLSSSAILDHPPSPMDTSELHFAPEPSGTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLNLAPLSTTAPSLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL	190474	191920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_190500_191900
697883	contig_3004_pilon	-	3195	10	Intergenic	novelGene_127489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGAGGCTATCGCGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287267	275525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_275549_277769_277917_278895_279282_279700_279868_280774_280828_281227_281636_284100_285747_286375_286449_286736_286873_287111
697886	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
697887	contig_6069_pilon	-	1581	4	Intergenic	novelGene_8044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_3	76.6347759759816	544	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	99	1436	362227	360022	FALSE	5	CCTCCGCCTCTCCATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362325	359876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_361083_361559_361671_361753_361863_362170
697894	contig_6361_pilon	-	1029	5	Intergenic	novelGene_23873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.801794085024	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	59	520	62823	55221	FALSE	20	TCCCTCCATGTCAGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATEKLDDASKRLEFLYDKLKWFTQHCKEH	64430	54711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55253_56678_56729_60097_60214_62559_62824_64372
697896	contig_3004_pilon	+	735	3	Intergenic	novelGene_127530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	9	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATAGCTGAGGACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470026	567382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_470059_514582_514662_566758
697897	contig_8616_pilon	+	2090	11	Intergenic	novelGene_72421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_8	151.87968922802	39	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1051	1806	248212	251655	FALSE	10	TTTGTGCCCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTSTLLCFSVSGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASPEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNDWDYTRSAQVFTQLKAEGKIPEVAFMK	246824	251939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249312_249356_249931_250005_250485_250669_251430_251492_251616
697898	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_97112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697899	contig_18392_pilon	+	2917	6	Intergenic	novelGene_143088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_4	24.8965861113527	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	207	1598	45611	53432	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRKRAPPVRMDEEKQQQLCWNMHEDRRNEPLTLSDDEQPCPGSDSSFSHCIILDDSLKEEVAHRDKKRCTEPASVSNSVDREETVGSFPPLFIKLNIVIAPYHLDNSWKAFLGELTLQLLPEESLVENFSQRSFTLMSSESSNQLLVYVHSECGDAEKEEKGLNEPVSICEKGIQVESSFSSELLEDLGWLQKKRRIKLYQRPEGNRVIKVGIYLLEAGLAKLDFMSDAHSRMKKFNQLMKKVMEKLYNFIVPDVLDEDEEDSESEPEGQDIDELYHFVKRTHQQETEPIQVDVQHPALTPVLRPYQREAVNWMLQQEHFRSAPASENALHFLWREIVTPEGLKLYYNPYTGCIIREYPSAGPQLLGGILADEMGLGKTVEVLALILTHTRQDVKQDALTLPEVGGGLYGLGKQGTYVLKEHHMLNICLALKSILSVYSATNNLHYLLVNFSWAQNVGFL	32932	54751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_33107_45578_46250_48962_49093_49715_49935_52194_52274_53107
697901	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
697916	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91674	2	-91668	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAATTGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
697919	contig_5758_pilon	-	2900	1	Intergenic	novelGene_119127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572288	569388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_569400_572300
697924	contig_10923_pilon	+	1353	8	Intergenic	novelGene_66171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	791.447988415756	142	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	73	789	21667	37418	TRUE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLWCSGVCAAP	13806	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30289_37383_37540_38578_38742_42554
697925	contig_18251_pilon	-	1319	3	Intergenic	novelGene_50176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	133.5	364	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTATGACTTTAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153087	143697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_144796_150023_150091_152933
697931	SIRV7	+	280	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTATCCTCTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
697934	contig_10235_pilon	-	2077	2	Intergenic	novelGene_46386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAACTGTTTGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172879	168609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_169084_171276
697940	SIRV7	-	907	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	6	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	142	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
697941	contig_4519_pilon	-	2889	1	Intergenic	novelGene_123699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2398	2730	547519	547187	NA	40	AAAAAGGAGACCCTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMAMGNSYSRAPCGVRLKQTPSETTSLLSCYPLPILLASFCLLLRPPLQGEPDPLLEIIFQSNNRQAYKVNNNTVKNVFLRTINHTRPKGQYLPKSKAHKAGRGRKDG	549916	547027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_547000_549900
697945	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697946	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
697948	contig_7035_pilon	-	3001	1	Intergenic	novelGene_83515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAACTAGAAAATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247687	244686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_244700_247700
697961	contig_9389_pilon	+	877	7	Intergenic	novelGene_83903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1067.12725732845	26	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	42	482	159587	164590	TRUE	45	GAAAAAAAGTGGCTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKVRPREGQRPVQGHTAS	159545	168389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164593_165770_165933_166074_166081_168164
697962	contig_14333_pilon	-	1358	5	Intergenic	novelGene_49146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	159.477858964811	308	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	63	632	446908	441204	FALSE	25	CCTGGTTTTAAAAACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIW	446970	440477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441205_441682_441821_443131_443248_445731_445820_446681
697963	contig_12250_pilon	+	1896	15	Intergenic	novelGene_80559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	67.34968145312	237	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	481	1374	275119	278399	FALSE	40	AGAACCACTGAAAATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272794	278921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272856_273020_273132_273484_273565_274376_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
697966	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697971	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
697981	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
697984	contig_5649_pilon	+	2457	10	Intergenic	novelGene_82254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_8	140.481798829845	1	118	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	95	1387	12779	34768	FALSE	30	TAGACCCAACCACTGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12684	35838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
697989	contig_5125_pilon	+	2159	11	Intergenic	novelGene_43504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_8	495.526346423679	133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	63	1475	1087611	1127980	FALSE	35	TTGATTTGTAATTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKAKHTERSRSSDLVPGSRDMAFNFGAPSGTSGTAAAPAAPAGGFGGFGTTSTTAGSAFSFSAPTNTGTTGLFGGTQNKGFGFGTGFGTTTGTSTGLGTGLGTGLGFGGFNTQQQQTTLGGLFSQPTQAPAQSNQLIHTASALSAPTLLGDERDAILAKWNQLQAFWGTGKGYFNNNNAPVEFTQENPFCRFKAVGYSCMPNNKDEDGLVVLVFNKKETDIRGQQQQLVESLHKVLGGNQTLAVNVEGIKTLPDDQTEVVIYVVERSPNGTSRRVPATTLYAHFEQANIKTQLQQLGVTLSMTRTELSPAQIKQLLQNPPAGVDPIIWEQAKVDNPDSEKLIPVPMVGFKELLRRLKVQDQMTKQHQTRLDVLIKQEIQRKSGYAIQADEEQLRVQLDTIQCELNAPTQFKGRLNELMSQIRMQNHFGAVKSEERYYIDADLLREIKQHLKQQQEGLSHLISIIKDDLEDIKLVEHGLNETIHTRGGVFS	1087548	1128664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1087678_1091825_1091910_1092002_1092144_1098902_1099130_1100702_1100891_1101756_1101954_1103604_1103660_1104087_1104182_1125790_1125911_1126191_1126303_1127851
697991	contig_846_pilon	-	1791	4	Intergenic	novelGene_136107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	39.8357739838062	401	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	295	666	220442	217175	FALSE	15	GTACAGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAGTCSTFQSDLDFCPDCGSVLPLPGVQDTVTCTRCGFSINVRDFEGKVVKTSFVFHKLGTTVPSLVEEGPEFQGPVIDRRCSRCGHEGMAYHTRQMRSADEGQTVFYTCTNCKFQEKEDS	220736	216049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_217200_219682_219793_219984_220086_220306
697996	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_96731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
697998	contig_4426_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_15370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1448	1774	131825	132151	NA	20	GAGCTGAGGGCTGGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQWTQPAAAEAPCRSADQREKSSVLEGGIRFHPQSRSKPTSCFCSLRTVATGCTASCCCPPVLLQNVITQIPRTPLFNMSTHLTVGPKLPKYPDSMPSDLSKGSLL	130377	132495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_130400_132500
698001	contig_8865_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_164449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGACTTTTTTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371947	373027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_371900_373000
698003	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698004	contig_5020_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_27947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173335	175315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_173300_175300
698005	SIRV4	-	289	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGTTCGTGAACGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2751	2462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
698010	scaffold_7386_pilon	-	1648	12	Intergenic	novelGene_136593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	73.5033591181579	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	153	1238	308755	297870	TRUE	30	AAGACCCCAGTGTCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTRSLPCLPTFTLSSWGAGQEEASRDPPRPLEAPNPAPLAPSVRTPAAGHTPRLRERAPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEDLRLLHFSLFILIHHSQHPASPEADPARAF	308972	296981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_297890_298259_298333_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308577_308800_308864
698011	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	741	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698014	contig_6710_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_92554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAGCACAGTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
698016	contig_6946_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_59783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTGCTGAAGATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439703	440509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_439700_440500
698017	contig_12864_pilon	+	1705	8	Intergenic	novelGene_76417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGCAGGAAGTGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242232	252164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242914_244584_244767_245704_245913_246327_246348_248834_248979_249536_249840_251884_251999_252111
698021	contig_11186_pilon	+	2584	7	Intergenic	novelGene_98877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCCTCTCCCGTCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234353	286000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_236218_238538_238586_239957_240085_266594_266727_280493_280609_285290_285395_285805
698022	SIRV4	-	195	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACCTATTATTAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
698031	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_97355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698033	contig_4392_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_117299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGGAATCATCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115839	114950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_115000_115800
698036	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_96342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698037	contig_6710_pilon	-	209	2	Intergenic	novelGene_98332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGAGCAGGACAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657514	653715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698038	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698039	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_93494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698041	contig_6710_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_97391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
698043	contig_12079_pilon	-	2227	14	Intergenic	novelGene_67406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	855	1178	571921	560217	TRUE	10	GCTCTCCTGTTTCATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLCCTVSKVPRGQRNEHFSQKHPPSEHTQMPHRHLQPPCCQLGRVHLVLQSLLKGRICCVLLDSSLAFALGGSVRQQIDLYIPRIALFLLFLPIGKVLTGLDAYL	579193	491062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_491299_494627_494835_510895_510984_532318_532393_535181_535256_539078_539202_545522_545659_560105_560285_566062_566167_571769_571931_575134_575242_576379_576502_577601_577807_578782
698045	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657823	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698047	contig_5084_pilon	+	1528	4	Intergenic	novelGene_64637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	1327329	1327661	TRUE	30	GTCAAGGACGGACTGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERAGGLRGAAVRTAWNTSSTCALISALQEALSSTSVLRCYILRFPCYQGGISALKHEALEEGRAAGEGPPHRLLGADASRIGQKQRQAPPRSQKEKRLQSSSKWEGKC	1327147	1330239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1328435_1329068_1329144_1329243_1329350_1330179
698051	contig_14621_pilon	+	1597	3	Intergenic	novelGene_105835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	74	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116085	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824_126256_126687
698053	contig_5696_pilon	+	721	7	Intergenic	novelGene_117499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	83.3419995493802	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACGAATCTGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273626	296067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_273651_277202_277252_277624_277700_279528_279586_289658_289723_291302_291467_295779
698057	contig_2750_pilon	-	1274	4	Intergenic	novelGene_164479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	39.0924829375447	400	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGCCTTATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158274	146195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_147336_148578_148630_151848_151879_158221
698058	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	53	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698061	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
698062	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698063	contig_6233_pilon	-	1504	11	Intergenic	novelGene_74797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	310.525425690071	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	286	1140	172935	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVATMSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	200485	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_172929_173008_176316_176404_199837_199941_200462
698065	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_96691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	653885	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653887	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698066	contig_6228_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_164497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTATCCTTAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210353	209265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_209300_210400
698067	contig_2036_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_131858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTTAATTTCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691990	691037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_691000_692000
698071	contig_7549_pilon	+	2147	4	Intergenic	novelGene_164523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.4991582276861	168	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	175	849	692328	764308	TRUE	30	ATGTCTGTGAGGAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLENDGAPSESIFDLDYASWKIRLTLGIAGFFFYLGVFVVCHQLSSSLTGTYRALAAKEKVFWNLAATRAVFGVQSTVAGLWALLVDPVLHADKAVNQQNWCWFNVATATGFFFFENVAVHLSNLFFRTFDLFLAVHHLFAFLGFLGSAINLKAGHYLAMTTLLLEMSTPFTCVSWMLLKVKCSAAKQKVGSSSPPTGAMEERPGNLLLKNQSLKTLWRTVLL	679678	766503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_679727_692201_692871_764176_764352_765248
698074	contig_10311_pilon	-	1635	10	Intergenic	novelGene_50485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	51.1760457081337	388	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	171	1247	223053	205444	FALSE	5	CCTTGACTCCTGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSGLAEEGGKLAVAAVRVGDPRGEAASQGGVGWRADAAAEAAVRRAWARVRDRETMAPQNLGTFCLLLLYLIGAVIAGRDFYKILGVPRSASIKDIKKAYRKLALQLHPDRNPDDPRAQEKFQDLGAAYEVLSDSEKRKQYDTYGEEGLKDGHQSSHGDIFSHFFGDFGFMFGGTPRQQDRNIPRGSDIIVDLEVTLEEVYAGNFVEVVRNKPVARQAPGKRKCNCRQEMRTTQLGPGRFQMTQEVVCDECPNVKLVNEERTLEVEIEPGVRDSMEYPFIGEGEPHVDGEPGDLRFRIRVVKHPIFERRGDDLYTNVTISLVESLVGFEMDITHLDGHKVHISRDKTTRPGAKLWKKGEGLPNFDNNNIKGSLIITFDVDFPKEQLTEEAREGIKQLLKQGSVQKVYNGLQGY	223223	205055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_205509_206425_206586_207024_207137_208714_208773_209402_209486_210604_210748_214686_214820_216356_216455_219891_220049_222985
698080	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698089	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698093	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698096	contig_15304_pilon	-	1425	4	Intergenic	novelGene_30610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.275554691886	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	186	1034	66228	64808	FALSE	10	AGCCCTGGGCTGTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGVCPPRSTCSRHPRSRGTRTGSPSPV	66413	64416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64888_64988_65310_65396_65721_66104
698105	contig_12638_pilon	+	1957	15	Intergenic	novelGene_33087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	580.38884309028	16	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	748	1869	182987	199604	FALSE	20	GCAAGGGTCTACTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170773	199692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178367_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
698108	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698112	contig_11846_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_106019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAGCCCTGGTGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533954	534948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_534000_534900
698126	contig_6137_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_59285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTTGTAGGCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352649	1354579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1352600_1354600
698129	contig_3602_pilon	-	1430	9	Intergenic	novelGene_60662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	345.401193360706	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	82	777	1139393	1106687	FALSE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGPPASWMLVTPSRRLIPKNITGLSRPSCVPAGPVHNCRQAPHLHRRDLRDRAGGHREGHSPLRAVCRLLQRRGVQQLSQQVSAEGGRLRRTAGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139474	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110948_1111744_1111795_1111892_1111949_1112148_1112267_1119159_1119212_1139295
698130	contig_5515_pilon	-	1223	3	Intergenic	novelGene_52326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	202	60	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCTCTGTTCTATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99229	67219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68747_99141
698131	contig_9895_pilon	-	1614	6	Intergenic	novelGene_144712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	34.7390270445216	47	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	179	655	492175	488899	FALSE	5	CTATTCTTTTTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTFHSSLSLTSLDFCLGQHRSTGGIIRHGAKLLYAFAEATVPKVTVITRKAYGGAYDVMSSKHLRGDTNYAWPTAEIAVMGAKGAVEIIFKGHENVEAAQAEYVEKFANPFPAAVRGFVDDIIQPSSTRARICCDLDVLANKKVQRPWRKHANIPL	534034	487939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_489021_490090_490191_491240_491340_491759_491862_492121_492230_533910
698132	contig_6710_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_92999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698137	contig_10196_pilon	-	1919	9	Intergenic	novelGene_132301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAGCAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374623	2348153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495_2352597_2363946_2364011_2364367_2364477_2365371_2365516_2368747_2368926_2372226_2372340_2373407_2373585_2374266
698139	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_97238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698145	contig_2215_pilon	+	496	2	Intergenic	novelGene_163838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	309	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCGTGGAGAAATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105661	148264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_105716_147822
698147	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_97194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698148	contig_14322_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_116500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTCAAAGCCCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671386	671619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
698151	contig_14618_pilon	+	1525	11	Intergenic	novelGene_136787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	56.9885076133776	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	174	1178	298711	312071	FALSE	10	CCTGCCAAGCCCTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFGTTSGFGTGGTSMFGSTTTDNHNPMKDIEVTSSPDDSIGCLSFSPPTLPGNFLIAGSWANDVRCWEVQDSGQTIPKAQQMHTGPVLDVCWSDDGSKVFTASCDKTAKMWDLNSNQAIQIAQHDAPVKTIHWIKAPNYSCVIYPMAVVATAERGLIVYQLENQPSEFRRIESPLKHQHRCVAIFKDKQNKPTGFALGSIEGRVAIHYINPPNPAKDNFTFKCHRSNGTNTSAPQDIYAVNGIAFHPVHGTLATVGSDGRFSFWDKDARTKLKTSEQLDQPISACCFNHNGNIFAYASSYDWSKGHEFYNPQKKNYIFLRNAAEELKPRNKK	295951	312418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_301268_301362_305016_305104_306087_306145_307516_307625_308389_308497_308603_308680_310016_310212_311984
698153	contig_15092_pilon	+	1455	5	Intergenic	novelGene_57763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTGTTGGCAAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260527	264318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_261599_261879_261979_262978_263072_263305_263379_264199
698156	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698158	contig_9423_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_99166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAGCTCTTTAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10331	9881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_9900_10300
698159	contig_9423_pilon	-	3346	1	Intergenic	novelGene_99165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCAGCCCAGCAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9881	6535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_6500_9900
698167	contig_12464_pilon	-	2194	2	Intergenic	novelGene_68700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	0	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	641	1522	344529	337140	FALSE	25	ACTTAACCTTCAAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	345169	336467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406
698184	contig_13044_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_99997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAGAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185833	187462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_185800_187500
698185	contig_19179_pilon	+	2224	2	Intergenic	novelGene_142367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22414	25156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_22997_23514
698188	contig_7816_pilon	+	1216	9	Intergenic	novelGene_66516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1359.51116559409	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	29	1105	181046	211658	FALSE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKPDPEQEEDPGDSPAGGRPLSGHCQHPHAHPAQLQSGGQATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	181017	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_181082_195834_195950_196748_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
698193	contig_6919_pilon	-	2212	2	Intergenic	novelGene_163989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTCTCTATCCCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68662	64882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_66249_67816
698195	contig_7622_pilon	-	1831	15	Intergenic	novelGene_132424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.050329809786	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	207	758	297961	292351	TRUE	45	GAATAGTATATGTAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGEC	306643	268909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269233_274520_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_282434_282526_288428_288539_292279_292357_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
698202	contig_2069_pilon	+	924	3	Intergenic	novelGene_23539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	129	512	1508564	1509023	TRUE	10	GACGCCGCCGCGCTCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERWLQLEEKGPGLGGRGSKVRRLSMTGNWSQGPSWPGEGWGRRGECGDGVQWGTMGGLGSGQLQELLQCVLFHSLHEELIVLGGYLHDTPPSLQPPGPYPTVLVPVDNLGRGGLGVACQGSHLIP	1508435	1509870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508818_1508893_1509190_1509624
698203	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	350	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698205	contig_10399_pilon	-	2241	2	Intergenic	novelGene_114486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	509	1570	331739	330678	FALSE	40	GGAATGCTAATGAAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRLLEDWCRGMDMNPRKALLIAGIPLTCNEAEIQEALQAGLASLGQYRLLGRMFRREENRVVALIGLTEETSLAVVPKEIPGKGGAWRVIFKPPDPDNEFLKRLNEFLEGEGLTVAEFTSALGYGNDPFDLDQNLVPQVGAPMLAEALDEALQPALQYLKYRKLKVFSGSDPPEPGEEGFDSWLFHTTQMMKTWQVSDAEKRRRLLECLKGPAFDVIRVLKINNPFITVPECLQALEQVFGVIDNPRELQVKFLTTYQKAEEKLSAYILRLEPLLQKLVERGTIEKEVVNQARLDQILAGADDRTLRRKLDLPEDGPAPGLLQLLTLIKEEEAAEDEEEALLQAGLEGNFT	332452	330006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_331864_332068
698207	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698211	contig_10629_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_52957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	256.180925649562	736	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	74	958	447968	452372	FALSE	5	TTTTTGTGTGGCTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGRDKVTFTFEAGRRCFSGEGNFEFETQQGNEIFLALEEAISAQKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447894	452930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449033_450574_450732_451751
698212	contig_9345_pilon	-	1317	5	Intergenic	novelGene_24341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	762.455695434168	31	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	104	349	176056	143043	TRUE	10	TCCCTCGTTCTTCATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGRGEEAGGLGGLLRPRHRRDPGLSVRPPVRLAMAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDRAGSGRPWPLA	176159	141099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141889_142688_142781_142955_143077_173643_173789_175989
698219	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698221	contig_401_pilon	-	2059	13	Intergenic	novelGene_42936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	136.301417413352	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	207	1787	2248554	2198457	TRUE	25	TCCTATATTACACCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRSATNVFLLQKTLLPLPPRMTLMR	2262053	2196678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2196916_2198421_2198461_2199247_2199315_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
698231	contig_3394_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_152669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTAATATTTTTTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378200	375933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_375900_378200
698232	contig_13547_pilon	-	2061	16	Intergenic	novelGene_104872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	344.1311765398	226	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	36	1469	223705	89997	TRUE	30	GTAATCGCCATTCAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTVL	223740	75850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_75929_84852_84962_88970_89175_89795_90006_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
698235	contig_16846_pilon	-	1189	4	Intergenic	novelGene_82951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3812.94558051908	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	95	559	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGENFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558744	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552765_555050_555278_558688
698238	contig_15031_pilon	-	2108	9	Intergenic	novelGene_138391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	259.868235842705	230	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	94	1182	129549	70793	TRUE	25	CTTTTGGGAGAGTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQ	161620	68105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68973_70733_70796_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_161576
698245	contig_7594_pilon	+	2515	5	Intergenic	novelGene_55408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAAGGAGTTGTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449140	468582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_450841_453157_453329_453415_453474_453915_454117_468197
698247	contig_3960_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_138045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATACCTGTTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699392	696750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_696800_699400
698248	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	878	-23	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
698249	contig_15146_pilon	+	1581	8	Intergenic	novelGene_116975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	125.499491827575	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	14	1420	615265	628786	FALSE	0	TTCGGGGTTTGCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAMRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTASAVASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSRRSPPIPLAKVDATAETDLAQRFGVSGYPTLKIFRRGKPFDYNGPREKYGIVDYMVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFPAPKNNKGPVKVVVGKTFEDIVLDPSKDVLIEFYAPWCGHCKQLEPVYTALGKKYRGHKGLVIAKMDATANEATSDRYKVDGFPTIYFAPSGDKQNPIRFEGANRDLEHLSQFIEEHATQLGRAREEL	615251	628947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625782_628399
698252	SIRV4	+	341	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	641	966	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
698255	contig_990_pilon	+	2864	2	Intergenic	novelGene_76097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	789	1121	1364785	1365117	TRUE	60	AAAAGTACCAGAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCDFLDGILQPNVTFSSDSSSTRRTNIMPERAHGNTTWPVAPSVFPVLRELLGISLENLDNKCYIDNYSGLQGPRLLKQLPIITLLVRISSVCLSLGFFLNTGKRRSQR	1363996	1367059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1365837_1366035
698263	contig_10813_pilon	+	1796	8	Intergenic	novelGene_87024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	48.6721644457768	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	293	1219	66160	85000	FALSE	30	TATTGAAACTTTGACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGPGYGEEEEPLHTVLGKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	65867	85577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_66217_67998_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
698267	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698268	contig_14322_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_115707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
698270	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	1	1156	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
698278	contig_15410_pilon	+	1290	10	Intergenic	novelGene_130569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	536	1006	55201	57526	TRUE	10	CGCGGCCCGGCTTACTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGADEVPGFVLARSTSCRLPHLCPGKTSSCFSRLGQRSQSPRGCPGCQIQTAFGDCWGRSTRRCGSSARSQSLSWRIRTASTGLVKVNSSTSLSLESLPSRASSQISTEISENLGLLPPPTRASRLERCSISTRPMLPTCSWSRCPFSINGSTL	54115	59263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_54387_54855_54961_55041_55247_55354_55441_56117_56209_56334_56440_57295_57401_57488_57563_57668_57870_59216
698281	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698282	contig_8885_pilon	-	1961	4	Intergenic	novelGene_115560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_3	58.0019156771759	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	183	350	75477	58218	TRUE	30	TAGAAAACTCATTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATSASKEQTGSEKNKHALGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKVVLRQDFPAAGRRNPDEAEPPGGLSDPGE	75659	45839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_58183_58308_75399
698284	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698290	contig_19812_pilon	-	1809	9	Intergenic	novelGene_101007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	13.7198533155424	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	13	390	67090	54130	TRUE	15	GTAAACTTCGTGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQEKPVAP	67102	49131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_50267_51992_52077_53251_53347_53730_53763_54056_54151_59837_59923_60121_60168_60346_60475_66992
698297	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_94826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698302	contig_18194_pilon	-	2390	3	Intergenic	novelGene_55949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	20	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	84	1100	18897	4642	FALSE	10	CCTAAGCTCTTGCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKAKSPSSLDADWSAVTKISQSTAGTMNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	18980	3351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866
698307	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
698312	contig_12837_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_57351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238368	240897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_238400_240900
698320	contig_8064_pilon	+	1346	5	Intergenic	novelGene_164551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34.3037898780878	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	632	952	117228	118276	TRUE	20	ATCCACTGTGAGTCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	22889	119199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_22939_24134_24639_117149_117382_118109_118295_118823
698324	contig_2757_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_164602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAGAGATCAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492963	492208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_492200_493000
698328	contig_9609_pilon	-	1496	10	Intergenic	novelGene_23117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_9	86.1984503312338	769	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	402	1367	523112	520853	FALSE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLLYYGVVTLVSILQYSNVYCPTPKVQDLVDDKSLQEACLSYVTKQGHKRASLRDVFQLYCSLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523958	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523297_523741
698330	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698338	contig_7457_pilon	+	2345	18	Intergenic	novelGene_31647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	175.555628069033	6	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	105	1916	1005828	1040226	FALSE	15	CCCTTAATATCCTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTEAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1001574	1040655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1018886_1036649_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
698339	contig_12078_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_74081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87621	89101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_87600_89100
698344	contig_14142_pilon	-	1506	4	Intergenic	novelGene_120552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	254.738209846021	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	79	1065	440197	432882	FALSE	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARIYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	440275	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_433408_437036_437192_437299_437525_440116
698347	contig_5429_pilon	+	2263	5	Intergenic	novelGene_127791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	47.5572023987955	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	65	544	159373	199101	TRUE	40	TAGCTACTGATGATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVLDLPCNFSSGREVVVVSAMSSQKGNVARSRPQRHQNTFSFKNDKFDKSVQTKKINAKFHDGVCQHCKEVLEWRVKYSKYKPLSKPKKCVKCLQKTVKDSYHIMCRPCACELEVCAKCGKKEDIVIPFIKEPEKTDNIENNRGSNCRSSSCIRNEDESDGGLDFDIDLDGTEEDNQVN	159308	202404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_159475_186132_186240_198157_198272_198944_200530_202113
698348	SIRV5	-	353	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCTGGCTCTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8450_8590_10858
698351	SIRV7	-	1032	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	3	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCAAGCGTAATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147915	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1080_2490_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
698353	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698354	contig_14923_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_157740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTAAATAGGTAATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181690	180534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_180500_181700
698357	contig_5967_pilon	+	1744	7	Intergenic	novelGene_44384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGACAACACCGCGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387739	517636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_388811_412509_412604_423962_424103_465403_465551_482504_482553_488459_488581_517513
698358	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698363	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	657809	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657810	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698364	contig_18869_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_56173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGACACCCCGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
698373	contig_8636_pilon	+	2723	1	Intergenic	novelGene_141909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1375	1680	334645	334950	NA	10	GAATTGTGGGCTGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVFVPPSACSVSSLPARQWYLVPSQSAYLERVQLWDSFRRAPSSQEPGRDRKEICAEAGILGRRSARVSLPSSLAQELHPCRRTEVVPAWFLLQKHAPL	333270	335993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_333300_336000
698375	SIRV7	-	287	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68993	0	35774	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
698382	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698383	contig_6630_pilon	-	2415	10	Intergenic	novelGene_30704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	709.397570886909	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	621	1430	374404	364010	FALSE	80	AAAATTAAACAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVLINLVMLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEVINFKSQGLGVGHV	384187	363024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370595_372520_372710_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379916_380096_384123
698385	contig_8594_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_140028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAAACCAAATCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319279	321256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_319300_321300
698391	contig_6063_pilon	-	1660	14	Intergenic	novelGene_27588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	496.434696897813	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	652	1566	36264	17150	FALSE	40	TATATTTTATGAATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70262	17055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45712_45811_48191_48356_52947_53066_70135
698397	contig_5389_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_143010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACAATACCGTGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257456	257719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_257500_257700
698398	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGEKFGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14350
698401	SIRV1	-	216	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3886	2	3612	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
698403	SIRV6	+	442	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-439	591	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGGTCTTGTGGTCGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1846	3131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2621_2740_2829_3106
698405	contig_10749_pilon	-	1189	11	Intergenic	novelGene_133447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1268.86390129123	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	458	808	145238	136250	FALSE	20	CTGGATGCCACAGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157648	135868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146541_153575_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
698406	contig_817_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_132467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAAGCAGGTCTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649820	647543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_647500_649800
698409	contig_4103_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_52005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAATCAACCAAGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253399	253907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_253400_253900
698411	contig_14322_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_116361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671629	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
698415	contig_5988_pilon	-	1672	12	Intergenic	novelGene_15890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_10	50.3209533604784	223	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	60	1055	555058	529953	FALSE	20	TTTTCATGGTATTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVTSSDSSLALEGEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	555117	529335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532541_549379_549429_555049
698416	contig_13744_pilon	-	1899	15	Intergenic	novelGene_77207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_14	54.5113730878095	741	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	67	1548	1197382	1050039	FALSE	5	GCCCTCGGGGCACGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGPSFWLGNETLRVPLALFGLNRRRLCERLRKNSAVQAGSVVLLQGGEETQRYCTDTGVLFRQESFFHWAFGVTEPGCYGVIDVDTGKSTLFVLRLPASYATWMGKIHSKEHFKEKYAVDDVWYTDEIATVLTSQSPSVLLTLRGVNTDSSSVCREASFEGISKFNVNNTILHPEIVECRVFKTDMELEVLRYTNKISSEAHQEVMKAVKVGMKEYEMESLFEHYCYSRGGMRHSSYTCICGSGENSGVLHYGHAGAPNDRTIQDGDMCLFDMGGEYYCFASDITCSFPANGKFTADQKAIYEAVLRSCRAVMSAMKPGVWWPDMHRLADRIHLEELARIGILSGSVDAMAQVHLGAVFMPHGLGHFLGIDVHDVGGYPKGVDRIDEPGLRSLRTARHLEPGMVLTVEPGIYFIDHLLDEALADPARACFFNREVLQRFRGFGGVRIEEDVVVTGSGMELLTCVPRTVEEIEACMAGRDKAFTPFSGPK	1197448	1049687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1050177_1050622_1050815_1054042_1054228_1064637_1064787_1075193_1075272_1076753_1076823_1129486_1129534_1130576_1130653_1145459_1145505_1165457_1165520_1167403_1167452_1173954_1174019_1185394_1185523_1187583_1187768_1197365
698419	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_94811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698423	contig_6871_pilon	-	2489	14	Intergenic	novelGene_21658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	11.0833314795864	59	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	266	1186	784881	782676	TRUE	30	TAAGAGTTCTGCCTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKVKI	787709	780346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781196_781300_781389_781511_781573_781760_781878_781977_782059_782347_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_787449
698424	contig_3866_pilon	-	1948	14	Intergenic	novelGene_112438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.1349567036635	2	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	56	1312	306133	280280	FALSE	15	TTAATCTTTTCTTTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPVHSGVCVRITFLRPSMPLYEGLGSGGEKTAIVIDLGEAFTKCGFAGETGPRCIIPSVIKRAGMPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVVIESVLCPSHFRETLARVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCNVDTSAAKEQSLPSVMGSIPEGVLEDIKVRTCFVSDLKRGLNIQAAKFNIDGKTERPTPPPNVDYPLDGEKILHVLGSIRDSVVEILFEQDNEEKSVATLMLDSLMQCPIDTRKQLAENLVVIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKALGSKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMMFDVGKAQPPLMKRAFSTEKL	306188	279643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_280285_280334_280515_281901_282104_283220_283303_286371_286446_286525_286606_289280_289317_296309_296390_296662_296731_298513_298622_301032_301142_302814_302898_303817_303891_306056
698425	contig_9921_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_23726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTCCATATCTAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119303	118139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_118100_119300
698432	contig_11028_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_163965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAATACAACTCCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937007	936047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_-_936000_937000
698436	contig_1225_pilon	+	2150	3	Intergenic	novelGene_44111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	738	junction_1	293.5	2358	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	116	481	147032	148934	FALSE	25	ATTGGCGCAATATTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134408	150603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007_147173_148709
698440	contig_2455_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_119230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATAAAGCCTGTCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440217	1439882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1439900_1440200
698444	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	712	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698451	contig_13300_pilon	-	1314	2	Intergenic	novelGene_125764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCCGTTGGACAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46716	44744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45951_46608
698453	contig_5696_pilon	-	1208	2	Intergenic	novelGene_117559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATAATAATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704713	693019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_693193_703678
698455	contig_10424_pilon	-	2031	20	Intergenic	novelGene_56810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.027662570205	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	31	1947	347192	307490	FALSE	55	ATATTATCGAAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAEGGAKLKMADKTPGGSQKASSKTRSSDVHSSGSSDAHMDSSGPSDSDLPSRTRPKSPRKHNYRNESTRENLCDSPHQNLSRPLLENKLKAFSIGKMSTAKRTLSKKEQEELKKKEDEKAAAEIYEEFLAAFEGSDGNKVKTFVRGGVVNAAKEEHETDEKRGKIYKPSSRFADQKNPPNQSSNERPPSLLVIETKKPPLKKGEKEKKKSNLELFKEELKQIQEERDERHKTKGRLSRFEPPQSDSDGQRRSMDAPSRRNRSSGVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENKGL	347222	307405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_307503_308733_308815_309753_309834_310862_311026_312294_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323828_324272_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
698457	contig_15188_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_163085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACTTCTTAAATCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176223	177151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_176200_177200
698458	contig_15188_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_163086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCAGGCACCATTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177704	178151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_177700_178200
698462	contig_17936_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_29989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_2	4	912	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	65	700	272759	271148	TRUE	5	GTTTTTGCTTGCTTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APESKPVFVRLLLSPASFFFNMTDAALSFAKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQITAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGVLSFWRGNLVNVIRYFPTQALNFAFKDKYKEIFLGGVDKRTQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKAAAEREFRGLGDCLLKIYKSDGIKGLYQGFNVSVQGIIIYRATYFGVYDTAKGKFAMYFEAVFS	272823	270010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_270425_270820_271673_272648
698477	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698481	contig_18869_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_56085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
698482	contig_5671_pilon	+	965	5	Intergenic	novelGene_79425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2248.47574758991	10	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	90	401	370430	531238	FALSE	20	TATTTTATTATTTTTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368835	531802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_392844_392919_521218_521303_531205
698483	contig_7357_pilon	-	2311	2	Intergenic	novelGene_36911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	175	534	438662	438303	TRUE	80	TAATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRGHGAQAMSSAEPHGSRAQKFRCWDRERDDGIHGKENLLNQWLTEAFSDHHIYNSHSWPRNVFVTVGVWLEHSEGWGASQELRSERSLQARSGLSHRTWSGLRVLFTACWEASGRL	438836	436321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_437121_437324
698485	contig_10235_pilon	+	2562	16	Intergenic	novelGene_46346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	162.072603757973	492	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	779	2380	125852	129123	FALSE	50	AAAATATTTCCAAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGPSPLNAVSSGGPPGSEPSEPLRRRPPAPHDGDRKELPQEQPLPPGPIGTERSQRTDRGPEPGPLRASHRPGPPVQFGTSDKDSDLCLVVGDSLKAEKELTSVPEAIPISRDWELLPSASASASAEPQSKSLGSGHCVPEPTSSGQRLYPEVFYGSPGPPGSQVSGGAIDSQLHPNNGGFRPGTPSLHTYRSHPLYLPPGPATPSALLSGVALKGQFLDFSALQAAELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDPPLLQVRQDLPSPSDFYSTLQPGGQNGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVMNFGSLPPAPPPAPPSLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPPSLGRAELHSVELKPFQDYRKLSSNLGGPGSSRTPPAGRSFSGLNSRLKAPPSTYSGVFRTQRIDLYQQSSPPDALRWMSRPWERTGPPSQEGPSRRAEDPGSRGDKNPGLPPPR	124181	129305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_124393_124778_125051_125198_125332_125586_125717_125819_125906_126115_126350_126642_126784_126902_126972_127088_127263_127462_127546_127732_127944_128036_128133_128283_128497_128611_128707_128804_128896_128982
698486	contig_1146_pilon	+	2211	7	Intergenic	novelGene_84845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	226.944682442416	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	74	685	937672	944381	TRUE	15	GAATCTTGTGTCCTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHNLFLTYLLVTFALLLPGLNQHGIISKYIGMAKREINKLLKQKEKKNE	937598	945951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943817_944262_944992_945035
698487	contig_8020_pilon	+	2765	8	Intergenic	novelGene_114443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	7.78014217382292	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	496	1314	328663	331625	FALSE	20	TAAGGTACCTGGCCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317455	333076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_320934_321051_321514_321672_321945_321991_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
698488	contig_13496_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_107622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTCTCAGTTTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218724	218081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_218100_218700
698489	contig_9771_pilon	-	2661	2	Intergenic	novelGene_156911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAATGTTTTGACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336562	332003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728
698500	contig_5551_pilon	+	2530	6	Intergenic	novelGene_134257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	383	junction_5	113.422043712852	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	136	831	591065	613622	FALSE	30	TGACATCTTTCATTGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLEQENDDLAHELVTSKIALRNDLDQAEDKADVLNKELLLTKQRLVETEEEKRKQEEETAQLKEVFRKQLEKAEYEIKKTTAIIAEYKQICSQLSTRLEKQQAASKEELEVVKGKMMACKHCSDLFSKEGALKLAAISRENQGIDTDDEKDLLKKQLREMELELAQTKLQLVEAKCKIQELEHQRGALMNEIQAAKNSWFSKTLNSIKTATGTQPLQPPPQATQPPKESA	590929	615321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_591146_598375_598481_601551_601636_605381_605454_612219_612418_613466
698503	contig_6823_pilon	+	3195	4	Intergenic	novelGene_131260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCTTCAGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508503	513179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_509790_510282_511810_512425_512476_512847
698505	contig_19769_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_102321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACTGTTGGCCACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87404	88919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87400_88900
698510	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698518	contig_3529_pilon	-	1421	5	Intergenic	novelGene_105382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_4	649.16311509512	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	709	1248	785346	777431	FALSE	20	AAGGTGTTTCTCATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYKEVKNRLDYHISVQNMMRRKEQEHMINWVEKNVMKSISTQQEKETIAKCIEELKLLAKKAQAQPVM	787699	777257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713_778894_784507_784634_785190_785355_786999
698519	contig_13982_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_163475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTATTGTACACATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343847	343289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_343300_343800
698520	contig_2834_pilon	-	2272	1	Intergenic	novelGene_28015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298265	295993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_296000_298300
698524	contig_4301_pilon	-	2049	6	Intergenic	novelGene_65123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	198.675011010444	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	594	935	543732	542107	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNVRTSDTSFLAFLSPLGSLLLPTHFPLQFGDR	575606	540992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_542416_543699_543840_546046_546164_547294_547521_551248_551329_575543
698527	contig_17440_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_7655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3557	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
698529	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698531	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698532	contig_11986_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_69189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGGAAATTAACAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618016	618475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_618000_618500
698542	contig_4336_pilon	-	2376	2	Intergenic	novelGene_152354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	295	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTAATAACACCTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307287	302940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_305189_307159
698547	contig_6050_pilon	-	901	4	Intergenic	novelGene_123117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	20.8219969156552	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	630	270	899	360564	357698	FALSE	35	AGAGGAGGAGAGTGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPREAAELSLQVTQEPVGLQIVKVEEDEHIWRQESSFQRKETHTREIFRQRFRHFCYQETPGPREALSQLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPRELQSWVREQHPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVPVSSQEMPLKETEPMETAQESPYLKLPLANQLKNESSQSNHPLQDNEMAKRFRTTEEILEYFFSLPDNEDA	361534	357695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_357772_359749_359892_360150_360691_361391
698553	contig_18869_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_56401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTCCAATCCAAATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73396	73754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73800
698555	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698557	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698558	contig_8254_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_48369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTGTACTTCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37220	37616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_37200_37600
698561	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698563	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698564	contig_987_pilon	+	1092	9	Intergenic	novelGene_72297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	420.523761962389	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	58	951	945420	968357	FALSE	35	TTCACTTTTTAAAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRASLAGVSAWALQPQWTQVRNMATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL	945362	968498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945476_956426_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_968353
698575	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
698578	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698579	contig_6919_pilon	+	2117	5	Intergenic	novelGene_163990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	22	junction_3	6.65206734782504	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	13	1890	68780	72708	FALSE	15	AGCATTTTGTTCTTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVEVMAPRRLLLVGEGNFSFAAAQSETLDPSTTSIIATCLQHPADLARDPLAGENLQRLRERGTEVRFGVDCTQLADAFELHDREFDRIYFNFPHCGRKAGVAKNRELLAKFFQSCADVLAEAGEVHVALCRGQGGTPADKPRREWHNSWQVVAMAALGGLILSDVHPFSCEAVPGYKCTGYRSQDKTFHVEGALNHIFTRSLPFECFQPRIFRIRLGDQWFSFPEPEALTGKLNRGFLEAPSCHPIRTINEKLIAELGKAFSLKRLKCPFPLLSQGDTSVLTSWNYDIVSAAFWISLLEDNSNSESLTDGTTQDMEEFLLSFSELSLPGDPERDDKEEAHEGIYGQAKVCLRPSLLVHVQTVIQAPDFLPGSLYILSGPVFKKCLILPFTMPAFHETLLILEFNQNLKDGCLQSLLDHLKHILDSLLTQTLLEGSKLSSSVEFVLQQNGKDYMISVKSHNFDPDGAKDLIIGSVTTSTISIIHKERCFVFVSMNLDLLAMLVCGISDWRMLWTSDNRFLKNFVSGKIEPFKSYSLYPPCYAHDISFWLDEKKGFDELEFHTVAREVSQDTVISIQFLSRFQHPKTEQVSLCYRLIYQSCDKALTKQQVASMQSQFRKEIQQRLRVIPR	68767	72935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_68955_69207_69365_70608_70813_70994_71154_71525
698581	contig_14322_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_116263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671633	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
698582	contig_16869_pilon	-	2350	11	Intergenic	novelGene_137584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_10	60.1269490328588	138	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	98	1669	83930	35850	FALSE	30	TAATGTCACTAGCCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVSLVVVVVGGWTAVYLTDLVLKSSVYFKHSYEDWLENNGLSISPFHIRWQTAVFNRTFYSWGRRKARLLYQWFNFGMVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRAYKRLDGSMECCNNHSLTDVCFAYRNNFNKRLHTCLPARKAVEATQVCRTNKDCKKGSSSSFCIIPSLETHTRLIKVKHPPQIDMLYVGHPLHLHYTVSITSFIPRFNFLSIDLPVVVETFVKYLISLSGALAIVNAVPCFALDGQWILNSFLDATLTSVIGDNDVKDLIGFFILLGGSVLLAANVTLGLWMVTAR	84027	35168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_36073_37295_37372_39061_39258_39616_39712_51938_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_83855
698583	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698588	contig_7202_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_16703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTTGGTCACGTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
698592	contig_10718_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_164619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113321	114518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_+_113300_114500
698598	contig_7202_pilon	-	402	2	Intergenic	novelGene_18605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAGAAACTGATGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
698600	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
698603	contig_9415_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_109815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTAGAGCTTCCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783735	1784897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1783700_1784900
698609	contig_9011_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_159348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739873	737689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_737700_739900
698613	contig_14711_pilon	-	1648	3	Intergenic	novelGene_68873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	128	1417	32270	30918	FALSE	20	CTTAACTGATTGTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTAYLAFVVLLASCLGLELSRCRAKPPGRACSNPSFLRFQLDFYQVYFLALAADWLQAPYLYKLYQHYHFLEGQIAIFYVCGLASTVLFGLVASSLVDWLGRKKSCVLFSLTYSLCCLTKLSRDYFVLLVGRVLGGLSTALLFSAFEAWYIHEHVERHDFPSEWIPVTFARVAFWNHVLAVVAGVAAEAVASWMGLGPVAPFVAAIPLLALAGSLALRNWGENYDRQRAFSRTCAGGLRCLLSDRRVLLLLHPHGAPLGIIFSSFMAASLLGTSLYRIATSKRYRLQPMHLLSLAVLIVVFSLFMLTFSTSPGQESPVESFIAFLLIELACGLYFPSMSFLRRKVIPETEQAGVLNWFRVPLHLLACLGLLVLHDSDRKTGTRNMFSICSAVMVMALLAVVGLFTVVRHDAELRVPSPTGEPYAPEL	32982	30686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_31453_31515_32289_32873
698614	contig_987_pilon	-	1767	12	Intergenic	novelGene_72285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	275.262129014184	179	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	19	951	945143	920155	TRUE	15	GAATGGTCTTTTTGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSDFLTPKAIANRIKSKGLQKLRWYCQMCQKQCRDENGFKCHCMSESHQRQLLLASENPQQFMDYFSEEFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEKEF	945161	916067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_916798_920068_920170_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_945029
698619	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
698627	contig_14353_pilon	-	2351	9	Intergenic	novelGene_82091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	457.8022908418	1	112	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	110	973	91016	80452	FALSE	35	AATCAAAGTATGGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDSRSSSRGPFFTAVETDFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCPIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104405	79073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82734_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88739_90961_91054_104333
698628	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698631	contig_7695_pilon	-	2099	3	Intergenic	novelGene_41574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	114.5	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	221	1435	390800	388811	FALSE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	397117	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793_390921_397017
698632	contig_6101_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_114270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAGAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113579	111622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_111600_113600
698635	contig_3410_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_58928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	19597	14940	FALSE	25	AACCTTTAGTTTGTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGTAQAESLPLSELPPAGLQSLASRALGVFLPDSGFPGGLQGKRDSGQPSSKQRQSFSLHVETAGQSQ	19597	13707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15141_19474
698639	contig_4754_pilon	+	2055	14	Intergenic	novelGene_35960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.342486106574	1	92	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	390	1622	409328	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	380130	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380213_401410_401451_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
698640	contig_4884_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_63803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAACAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260538	262298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_260500_262300
698644	contig_10235_pilon	+	1239	4	Intergenic	novelGene_46287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14487	18324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_14638_14779_14931_15029_15138_17494
698654	contig_12019_pilon	+	954	4	Intergenic	novelGene_87747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	208.135105693927	28	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	192	542	633175	642306	FALSE	45	CAGATTAACCAGTAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDNSSLKRLTRWGSQGNRTPSPISSERQKSLNGGDEAPIPASTPQEDKLDPAPEN	623226	642718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634007_642146
698657	contig_10949_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_146693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTTGCTTGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119847	120378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_119800_120400
698658	contig_12951_pilon	-	1378	2	Intergenic	novelGene_68167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGTGCATTAATATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296820	295370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_296025_296096
698661	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
698670	contig_13954_pilon	+	1495	6	Intergenic	novelGene_130055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	73.7628632849891	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	3	1112	67375	89637	FALSE	50	CTGATTAAAAAAAGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVNTTYADVKEKYLSEYCFSGTYVLTLLQVYNFTDYWKHIHFMHKINDNAEAGWTLGYMLNLTNMIPAELPQPKPFSRPTYISLMVAFSLVLAIVFILGSIIFHKSSYFQK	67372	90020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_67534_68453_68694_70041_70303_82875_82993_87182_87315_89436
698682	contig_16098_pilon	-	884	8	Intergenic	novelGene_45782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_7	190.770189773252	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	205	618	35038	31519	TRUE	5	TGTAGCTCTCTTGGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	35242	31093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007
698685	contig_1948_pilon	-	2735	9	Intergenic	novelGene_31135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	11.7792189893897	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	317	1420	65876	43620	FALSE	15	TAGATATGGCTTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGLGWLLAAVAAPTPAGDVEKHVGCSQGGGFPCRSGSKTNLVDFVCHTCFKRQEKLHRCGQCKFAHYCDRTCQKDAWLNHKNECSAIKRYGKVPNENIRLAARIMWRVEREGTGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKELRADVDTFLEYWPPQSQQFSMQYISHIFGVINCNGFTLSDQRGLQPVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGKIELRALGKISEGEELTVSYIDFLNVSEERKKQLKKQYYFDCTCEHCQKGLKDDLFLGVKDDPKPSQEVVKEMTQLSKDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLQKQEPVFSDTNLYVLRMLSIVSEVLSYLQAFEEASHYARRMVDGYMKLYHPNNAQLGMAMMRAGLTNWHAGNIEVGHGMICKAYAILLVTHGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALSNQPMQVMAEPSKEPAPALFHKKQ	103469	42304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_43779_45221_45391_45926_46091_50192_50286_55474_55665_63027_63159_65678_65893_68566_68744_103346
698686	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698687	SIRV7	-	238	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91673	15	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
698688	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698689	contig_6648_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_164620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGTAGATAAACAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85442	87176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6648_pilon_+_85400_87200
698690	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1008	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698693	contig_7744_pilon	-	1678	13	Intergenic	novelGene_62508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	293.121834263881	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	685	1638	822865	820619	FALSE	15	CAGCAACTTTGCTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	825061	820578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822957_823128_823221_823417_823501_823760_823968_824167_824300_824625_824670_825026
698697	contig_6277_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_80387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGACCAGTCCCTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50477	49374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_49400_50500
698699	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698700	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
698701	contig_211_pilon	+	3511	17	Intergenic	novelGene_129859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	969	1334	78490	80552	TRUE	15	ACTGCCAGGCCATGTCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKTRVREEGRKHGRNAWQNFSDEKDDSLRHHDLVVILHLAQGSLDLHWREGLFCVPVDGFCKMIHAHRLGMSFPENLQEGYLECLQPGFTQLHLLGFFSLLWFCHLWSVYFEAFPPLCH	77521	98564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_78754_79996_80070_80523_80608_81081_81185_82162_82306_86086_86237_87062_87192_87565_87739_90156_90368_90933_91074_91424_91569_92394_92498_92979_93222_95860_95992_96864_97075_97505_97619_98434
698702	contig_5479_pilon	+	3692	1	Intergenic	novelGene_133561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCCATTCATTCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65356	69048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_65400_69000
698704	contig_14970_pilon	-	1600	6	Intergenic	novelGene_45130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	132.930959524108	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	309	1052	291083	268709	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315706	268160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
698709	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657172	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
698712	contig_9843_pilon	-	2308	10	Intergenic	novelGene_114336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	18.2073109722305	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	168	1508	302693	250148	FALSE	15	AGATTCTGTGTGGCTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQVGTRAQSERIRTYNFTQDRVTDHRIAYEVRDIKEFLCGEKALDQLIQRLLQSADEEAMAELLDKNLKSAK	303906	249347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_250262_254201_254301_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_303747
698716	contig_6375_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_72943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1070	1453	29302	28919	NA	20	CCTATCTCAATCTGCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTSPLPKEERSPSLWHREGMAQCDSFTIIIWLTLGLERMEWHYAILHVLFWDGEPKASSGFCLQPSAWGQECSFSLWSCPGDRLRLCLAATLVNEGKDRRGTQTGRRERLSLAFSSSSRQSSSIN	30371	28307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_28300_30400
698720	contig_9186_pilon	-	1273	11	Intergenic	novelGene_85343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	69.332820510924	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	142	1155	302315	274201	FALSE	20	ATTTCTGCAGCAGCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKDVGVLPCCSGHADSLRSLVFLGSGITAIATSVFHGPPRCQLHHAVMPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRPFLPYPLPHFAYKLIARLFEISPFEPWTTRDKMERVHLTDMKLPHLPGLEDLGIQATPLEAKAIEVLRHHRAYRWLSSEMEDVKLTKTVNI	310748	274082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_310678
698722	SIRV2	-	311	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	348	2958	-348	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAGTGATAGAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
698727	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_97363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698728	contig_9833_pilon	+	1607	11	Intergenic	novelGene_68524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	464.083710121353	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	53	862	230823	254740	TRUE	15	CACTCCTTGGGTAACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230770	260335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250165_252420_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258582_259908
698729	contig_15325_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_157182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_2	577.982428366123	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	876	1229	95198	96243	TRUE	30	ATTGAAATATTGTTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	94039	96607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94117_94399_95233_95674_95785_96034_96245_96548
698736	contig_10235_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_46606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCTGCATACAGTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599424	599173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_599200_599400
698740	contig_15182_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_136440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268972	270502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_269000_270500
698744	contig_7333_pilon	+	2181	13	Intergenic	novelGene_142775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	102.648131443728	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	154	1338	185614	217222	FALSE	15	AATATGGCCCTTGCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFCSETIDIIQPALVLATGDLTDAKTKDKLGSRQHEVEWQTYQGILKKTRVMEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIRFAELYKSKSPHSGGNQKHVNGDAYKLRSVIVLPIISFPVKIDGVHLGEAVHLSGPIFILKWNPRNYSNGTHNIEVIVQDSAGRRKTVHHVFSVEEDLHLTFDPLASFILLTDHYIMARVLFVLIVLIQLTILIIFRYRGHPKLKGPPGFVNLTSFSLHVLSKINIFYYSVLLLTLYTVLAGVF	184335	218065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158_198315_202492_202609_202721_202841_203505_203620_206388_206474_212390_212496_217208
698747	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_89234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653723	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698748	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	306	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698754	contig_5549_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_81639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_8	708.931491312807	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTTTATTATATAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445635	441752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442535_442879_442936_443118_443363_443637_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
698756	contig_9955_pilon	-	1146	5	Intergenic	novelGene_21297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_1	711.594117106093	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	210	977	49317	45056	FALSE	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVCLADVR	49839	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45080_45284_45360_47590_47737_48794_49380_49692
698760	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698767	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698769	contig_13565_pilon	+	2749	4	Intergenic	novelGene_162394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_2	32.3968448395142	69	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196962	200461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_198733_199214_199293_199471_199589_199677
698781	contig_10042_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_79142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88259	89584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_88300_89600
698782	contig_16109_pilon	-	2471	1	Intergenic	novelGene_80324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATACAAACTCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217600	215129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_215100_217600
698783	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698785	contig_15545_pilon	+	849	2	Intergenic	novelGene_120119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTGAGAGATTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9188	27770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
698786	contig_8617_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_73428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
698794	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698802	contig_3900_pilon	-	2988	2	Intergenic	novelGene_84200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535805	532763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_533148_533201
698804	contig_6414_pilon	-	1993	12	Intergenic	novelGene_157008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_1	374.630330189002	661	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	463	1788	85578	44945	FALSE	10	GCTCTGTGTTATTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTANAPGRKSWGKGKWKSKKCKYSFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSHPLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNRPFISQKIHFPDFSTRDIHRNYVDCVRWLGDLILSKSCENAIVCWKPGKMEDDIDKIKPSESNVTILGRFDYSQCDIWYMRFSMDFWQKMLALGNQVGKLYVWDLEVEDPHKAKCTTLTHHKCGAAIRQTSFSRDSSILIAVCDDASIWRWDRLR	86040	44739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095_46170_47136_47296_57068_57175_59286_59421_63319_63412_67557_67640_69124_69251_70319_70386_72834_72928_74835_74989_85464
698805	contig_2379_pilon	+	1756	4	Intergenic	novelGene_159433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.79869268479038	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	425	532	195058	195402	FALSE	30	CAGTTACACAGTTTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLRTDLSQFENDYSAVSDSVFQLLDGLIAFYSSPKIPFSSFWTEAVCILGRLFCDCNLSNHILKKCSKKLEEFEKTLLQVILRNNHINRFQVQHYISQSLITLGSCSFLRRSIVSLLLSEVNSFTDDLETIIQVQASYDVMRYENIFFLFWVLEQLLQKETEEGSTSIFNFFIVL	24500	196626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2379_pilon_+_24772_91228_91361_195036_195140_195376
698806	contig_9014_pilon	-	1365	13	Intergenic	novelGene_106756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	72.275466484524	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	189	1109	82349	78380	FALSE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83197	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83087
698807	contig_18869_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_56239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73672	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
698808	contig_16594_pilon	+	1990	2	Intergenic	novelGene_53885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208896	223720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_209124_221957
698810	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698814	contig_6710_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_97323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653722	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698819	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_96637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698820	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698823	contig_14855_pilon	-	1997	6	Intergenic	novelGene_146043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACAGAGCTGCAGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655658	648629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_648807_650805_650906_652346_652422_652778_652923_654021_654203_654338
698825	contig_7695_pilon	-	1547	4	Intergenic	novelGene_41547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	186.190464011691	9	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	65	1498	380076	373606	FALSE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRHLLPTSGAAAASAAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARWDVWGLKFRAAVVHENTPFVVPCLRDVLGSVRSVPQEPWTLIYLLSSDPLCLAFPLSCPFTCSSIRSFLFVFCSPAGLTVYRNWWGLCCLLPASCFQWVLDMGNNLGESVTASGSSFWPKGLWQVDV	381069	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375883_376521_379664_380089_381017
698826	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698829	contig_5718_pilon	+	1681	10	Intergenic	novelGene_110440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	71.4118640072338	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	14	949	1617860	1629221	TRUE	30	GATTCAAACTTCTTGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIVIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQSTKAMPIFLPQV	1617846	1631588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1622890_1622963_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1629182_1629346_1630980
698831	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	121	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698837	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_18549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGTACCATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
698849	contig_8330_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_71719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117632	115171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_115200_117600
698861	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
698863	contig_6710_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_90011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACTACAGAAGCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
698864	contig_12270_pilon	+	377	2	Intergenic	novelGene_113180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	13836	14364	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13835	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
698876	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
698880	contig_7695_pilon	-	1517	5	Intergenic	novelGene_41551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	166.785041295675	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	329	1075	379725	375835	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRHLLPTSGAAAASAAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381080	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376521_379664_379933_380030_380089_381017
698883	contig_13645_pilon	-	1746	6	Intergenic	novelGene_146157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	51.6782352639871	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	89	466	23717	10453	FALSE	10	TTTGTGATTGTACTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLEQAEDLKAFERRLTEYIHCLQPATGRWRMLLIVVSVCTATGAWNWLIDPETQKVSFFTSLWNHPFFTISCITLIGLFFAGIHKRVVAPSIIAARCRTVLAEYNMSCDDTGKLILKPRPHVQ	23805	9172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_10495_15103_15159_15278_15389_19509_19584_22530_22603_23692
698888	contig_18055_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_117830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	727	1035	78006	78314	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVAE	77279	79268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_77300_79300
698889	contig_10297_pilon	-	1351	5	Intergenic	novelGene_112562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_1	117.103319765069	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	762	1202	751997	730242	FALSE	50	CACAGTGAAAGAAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELPQERLLIAELAVSASEFMFEETRSYVKQRKAFGKTVAQIQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDSCLQLHESKRLDSATASMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIARDIIQDK	752758	730092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_730336_733901_733989_736234_736363_750933_751048_751979
698899	contig_8705_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_164621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	75	530	60814	61269	NA	50	AAATTTGAAAACCTAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILISDKIDFKTNSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRTTKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTIKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTRHPTTAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQNFEITQSIFSDHNAIKVENNNRKNKEKKSTT	60739	61779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8705_pilon_+_60700_61800
698902	scaffold_16539_pilon	-	1286	10	Intergenic	novelGene_68399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	75.6195807159384	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	60	1151	800534	794915	FALSE	10	TCCTGCTTCATTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGRGGRIWQGHTAAGLVTMEEIGILDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK	800593	794779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795469_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799414_800513
698904	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698906	contig_10581_pilon	-	2017	10	Intergenic	novelGene_41405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	86.6467213516337	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	616	1158	627511	612550	TRUE	25	GCTCCTTGTTTTGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFIVGAGMCTSESIIYKWEQLGVRNRSKLRCLLKDPHVPCLQCPM	649684	609101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615300_619649_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
698907	contig_9673_pilon	+	1540	12	Intergenic	novelGene_119155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	636.952441884903	126	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	352	1191	114479	183902	FALSE	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEIDSKKYYKYSKEKTLKWLEKKVNQTIVALKTNKINVGARVQSAAFFPGDQASSDKEEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKKIKLSDEPVEAKEDYTKFNTKDLKTEKKNSKMTAAQKALAKVDKSGMKSIDSFFGAKNKKKDLKL	58950	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_84698_84875_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
698908	contig_19851_pilon	+	859	5	Intergenic	novelGene_29875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_4	1044.69780319478	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	94	522	53949	56177	FALSE	20	ACTGCCCTTTGATTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53855	56514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
698909	contig_3132_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_127414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTGCAAAAGTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208164	207152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_207200_208200
698916	contig_12654_pilon	-	2127	8	Intergenic	novelGene_129317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	174.939756394443	574	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	177	494	827177	817652	TRUE	10	GTCCTTGGTCTGTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFLKSRWKRGGLLQQKRPLPPLRALSESSFCLRWCNFLPARAQSGGFRAVLESFASTMAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEGLCPVEAGEGKKPPKVRIL	827353	808403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812398_812723_815567_815683_816771_817837_823815_823887_827115
698918	contig_7004_pilon	+	1276	3	Intergenic	novelGene_126463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	124.5	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	59	1213	392109	395731	FALSE	10	TGCACGGTTTCTTGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	392050	395794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394018_394759
698920	SIRV7	-	339	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70988_78845_78966_114680
698930	contig_9332_pilon	+	2667	3	Intergenic	novelGene_60727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_2	15.5	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAGAGAATGGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540510	568380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_540594_542273_542305_565827
698934	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698936	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
698937	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_89179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
698938	contig_6589_pilon	-	937	4	Intergenic	novelGene_26156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGAGCCACAGCTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887951	1885103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1885136_1885926_1886060_1886256_1886781_1887703
698940	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	222	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698941	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
698942	contig_11258_pilon	+	1844	9	Intergenic	novelGene_67776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	193.980508041401	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	675	1055	285721	292688	FALSE	40	GATGTCAGAAGAGCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFLLP	278951	293477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279344_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450_292493_292676
698953	contig_1867_pilon	-	1308	3	Intergenic	novelGene_54493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	592	junction_2	32.5	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACATTAGAAGCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13114	6646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_6779_10434_10522_12025
698956	contig_9014_pilon	-	1681	5	Intergenic	novelGene_106720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	93.2362590412121	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	724	1122	42265	41867	FALSE	10	TTACTCATTTCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	44619	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_43128_43397_43480_43559_44086_44240_44420
698957	contig_846_pilon	-	1410	4	Intergenic	novelGene_136098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.9688792038494	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGTTAAATATGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214505	211430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212149_212199_212690_213134_213210_214378
698965	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_89661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698974	contig_6914_pilon	+	1676	7	Intergenic	novelGene_151740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	65.9949493016953	405	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	13	780	130915	134195	FALSE	40	AAACATAAATGGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTELMPKVSPRGRAAAQAPRGARCGGEDSGGLEPGAAIRDLRKGTSNMSFEELLALQSQVGTKKYKQLIAGTSIRKQDSRPSVKNACVADKHKPLEMSAKARVPFLRQVVPVSKKVTRDPRFDDLSGEYNPEVFDKTYQFLNDIRAKEKEIVKKQLKKHRSGEEREKLQLLLQRIEQQEMAQQDRKQQQELRLALKRERRAQAQQGHRPYFLKKSEQHQLALAEKFKELKRSKKLESFLSRKRRRNAGKDRRHLPLSRE	130902	135091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_131033_132473_132622_132756_132824_132904_133010_133356_133432_133529_133648_134058
698975	contig_13041_pilon	-	2861	1	Intergenic	novelGene_127724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255669	252808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_252800_255700
698978	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
698979	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
698980	contig_10990_pilon	+	152	1	Intergenic	novelGene_7516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752020	752172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_752000_752200
698981	contig_7359_pilon	+	2027	9	Intergenic	novelGene_139851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.3006331568337	350	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAGCATGTCCTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38600	56648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_38653_42172_42375_42571_42680_45589_45718_46227_46272_48347_48446_49060_49087_51537_51581_55322
698982	contig_5586_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_143586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGTTCACTTTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428001	426806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_426800_428000
698987	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
698989	contig_6710_pilon	-	586	2	Intergenic	novelGene_93002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
698992	contig_12635_pilon	+	1817	7	Intergenic	novelGene_60804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTCCGCTGAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179260	206912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_180435_180644_180751_189585_189751_192585_192742_197106_197174_201014_201085_206833
699003	contig_14577_pilon	+	1665	12	Intergenic	novelGene_164624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.8523829164198	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	87	944	35117	47072	FALSE	25	CTATAAAGTTGTATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNTGIGQHILKNPLVVNSIIDKAALRPTDVVLEVGPGTGNMTIKLLEKAKKVVACELDPRLVAELHKRVQGTSLASKLQVMVGDVLKTDLPFFDACVANLPYQISSPFVFKLLLHRPFFRCAILMFQREFALRLVAKPGDKLYCRLSINTQLLARVDHLMKVGKNNFRPPPKVESSVVRIEPKNPPPPINFQEWDGLVRITFVRKNKTLSAAFKSSAVQQLLEKNYRIHCSVHNTIIPDDFSIADKIQQILTNTGFSDKRARSMDIDDFIRLLHGFNAEGIHFS	34633	47793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_34715_35111_35186_36950_37038_39007_39070_40311_40406_40490_40541_41876_42001_42138_42232_43245_43311_43961_44026_45445_45553_47029
699004	contig_7933_pilon	+	2297	2	Intergenic	novelGene_164668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAAATAATTTAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116424	131537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_117680_130495
699006	contig_1301_pilon	-	1363	11	Intergenic	novelGene_47336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	624.952606203062	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	393	1361	305285	278297	FALSE	35	AAGTCACAGATACATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSWASEKPAFQHKHYYKDYNGFFLSRHTKQ	322911	278294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_278382_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305397_309747_309912_322794
699009	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699011	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
699016	contig_7467_pilon	+	1474	2	Intergenic	novelGene_69478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	315	629	77771	78085	TRUE	45	GTGTAAAAATTTTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYLKQKTHMIISTDAEKVFDKDQHPFFIETLNKTGIEGKFLSIIKGIYTKPTANIIFNREAESIPHENENKRRIPLSPLLFNIVLEVLVRAVRQEKEIKGVMV	77456	82370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_78420_81859
699017	SIRV4	+	273	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1498	632	1043	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2498	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
699021	contig_15304_pilon	-	1081	4	Intergenic	novelGene_30611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	216.813796199002	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	177	845	66228	64654	FALSE	10	GAGCCCTGGGCTGTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATPPGDQQV	66404	64417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64678_65112_65310_65396_65721_66104
699022	contig_6710_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_89417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCCACCTTCCACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
699026	contig_3825_pilon	+	1044	7	Intergenic	novelGene_77942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1242.76127366978	12	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	338	406	13831	14024	TRUE	10	GTATGCATGTTTGTGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVMYMASGLPRCTRQCACTPTDKG	12976	15682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13832_13956_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
699028	contig_5280_pilon	+	2221	9	Intergenic	novelGene_52579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	792.018534742085	1	121	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	37	471	38343	41026	TRUE	20	TTGTCTCACGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRYSLRSSKSLTANRIISQRVPLWNMSVVWVTRKTNLYLET	38306	79149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40904_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_58927_59034_78042
699037	contig_3382_pilon	-	2123	2	Intergenic	novelGene_124041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203063	200790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_201331_201480
699038	contig_2637_pilon	+	2118	7	Intergenic	novelGene_100019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_6	42.8978113919839	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	186	572	38745	46591	FALSE	45	AACTAAGTACTGGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLFNLKFAARELNRNAKKCDKEEKAEKAKIKKAIQKGNTEVARIHAENAIRQKNQAINFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQIIFYYNVASS	13292	48137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_13391_38657_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322_46396_46558
699048	contig_4131_pilon	+	2277	6	Intergenic	novelGene_127869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	9.64572444142999	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	14	826	198401	209649	FALSE	15	CTGATGTTGTACTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSREMGAGARPALLLLMLLRAVAPQGRRPRSHSLRYLFMGASEPDLGLPLFEALGYVDDRLFVSYDHESRHANLRPLWVWNGASSQLRLQLSQNLKGWDHMFTVDLWTIMDNHNHSTVPPSLVKVTHHVTSEVTTLRCQALNFLPQNITMRWLKDKQPLDAKEVEPMDMLPNGDGTYQGWMAVAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLTATWEPSSPGTLVIGIISGIAVCVIIFFIGILFKILKKRHVSRRTMGDYVLAEVNLTQMKGKQQKTTY	198387	211100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_198477_203961_204226_205538_205818_205954_206069_207966_208000_209602
699049	contig_1076_pilon	+	2734	14	Intergenic	novelGene_101137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	88.4834755408431	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	356	2350	973982	1005524	FALSE	40	AAAATGATTTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNEALEEQLGQAFDQVNQLQHELSKKDELLRIVSIASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLDMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEEISSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELRLHLQASKDAQRQLTVELHELQDRNRECLGMLHESQEEIKELRSRSGPAAHLYFSQLYGDFSGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSVFKQKAQQKRVFDTVKAANDTRGRSLPFPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESSLQQTEDKTLLNQDSTSEEVPRNTQEMGQPGPSGDNDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAQEWERKIQILADQNEGLSGCGTPTKSLATLCTDQSEITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLHHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLPEDAIYHLSDLEEDEEEGITFQVQQPLQVEQEPSVSKPVTGIFLLPITSAGGLDTAEKNAWLNIA	945756	1005908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980865_988168_988246_989739_989857_990860_991071_991716_991796_993263_993395_993833_993909_995092_995231_1000199_1000280_1000586_1000791_1003260_1003560_1005225
699052	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699062	contig_17875_pilon	+	2444	8	Intergenic	novelGene_143176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	83.708678505534	304	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	68	1036	39073	80150	FALSE	5	TTGTTTGTTGGCAGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELATRSQIPKEVADIFNAPSDDEDFVGFRDDVPMETLSSEESCDSFDSLESGKKQDVRFHSKHFTEELRKIFIEDTDSETEDFEGFSQSDLNVKSDPEIMLVESDLSDDRKASLLSEEDEEEEKATPRRSRPRRSSIGLRVAFPFPTKKLANESDKKNSSSEPLHSSSCLQDNKKTVLGRQKSCRQWKQREDSASESEDDSRDEGQESSDALLKRTMNIKENKAMLAQLLAELNSMPDLFPVRTPNSALKKKTVRRAFSEGQIPRRTNPTRSARGICNCSYCRKRDGRCATGILIHLAKFYGYNNVKEYLESLQKQLVEDN	39005	81558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_39097_65210_65352_70946_71085_73534_73910_75808_75881_75994_76067_79166_79283_80119
699064	contig_11855_pilon	-	2306	12	Intergenic	novelGene_67021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	42.0064930045994	193	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	80	997	1650193	1634530	TRUE	5	ACTGTGGCCTGGCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLGRAGRELCARCDRVGARAAAAAAMRWVRVLLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQELPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHHTLNQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINGPVLAQLLQRAFLDLPDKHPTPNSQFTWSMFPPTSTTCFLSSSRMPCGQQWKAMNPALLSPRSRSCWPWERKICPSK	1650272	1631859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1632951_1633555_1633670_1634425_1634534_1634745_1634845_1634931_1635009_1635410_1635464_1636705_1636784_1636973_1637064_1637740_1637926_1638425_1638498_1647836_1647979_1650075
699066	contig_10404_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_138628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAATAAATAACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25507	26806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_25500_26800
699074	contig_8712_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_58759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	340	690	272653	273003	FALSE	30	GCTACGGATTGTAGACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRSDSNWFGFLVFLLFTVPFLTPTGILPPALLWLREGCACCEGQGPREGTCHLLSLLSPLQEGCRASPGSQKQQLFSCEEPPASTGVPRVFEGRADLSYVPPLPLPLPTILQQ	240211	274294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_240396_272497
699075	contig_8712_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_58760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275560	275947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_275600_275900
699076	contig_7412_pilon	-	1809	8	Intergenic	novelGene_76323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1210.57491823227	3	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	147	1475	375758	364533	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMVRPQPVRADEGTRSSGVSDAAPDHAGADGVGGGGSCSLQHLCGPHLDDL	377818	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364682_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375806_377249_377315_377784
699078	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_96905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	653858	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653859	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699080	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_95810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699081	contig_2987_pilon	-	1860	7	Intergenic	novelGene_125858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	202.58660699398	407	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	216	1349	545821	535508	TRUE	10	TTTGTCTGTGCCTTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSVRRLLLVAGCALALVLAVQLGQQVLECRAVLAGPRSPRRVMRPEQEELVIVGTNHVEYRYGKAMPLIFVGGVPRSGTTLMRAMLDAHPEVRCGEETRIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQVNQNSTSSHLGSS	593502	533287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_535550_538273_538325_539478_539678_544979_545901_553777_553850_593438
699084	contig_14322_pilon	-	435	2	Intergenic	novelGene_115719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTTATATTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671882	671291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
699085	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	432	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699087	contig_10732_pilon	-	1882	3	Intergenic	novelGene_114752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_2	1.5	1762	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	540	1073	573947	573306	FALSE	10	CACGGTCTCCTTCCATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSECGALEQGFPELESLPLPSSPQLLSGDPCLRVSFPPGVPPGSPESPCFLTGLTRLLLSAALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576381	572496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_574368_576262
699089	contig_11285_pilon	-	1393	13	Intergenic	novelGene_5540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.670882640838	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	126	1307	744458	741303	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGPFLSLGPQAPLRLSSCSFSFLRLKDHHFPTPKFKTKSVSLCLL	745447	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741433_741543_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
699091	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699092	contig_7165_pilon	+	1330	4	Intergenic	novelGene_116889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	665.200387519096	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGTAAAATAACTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016749	1064299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582_1043677_1060246_1060327_1063263
699099	contig_11702_pilon	-	1175	8	Intergenic	novelGene_141953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	101.926343954037	2336	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	129	842	319845	289501	FALSE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321152	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
699100	contig_12427_pilon	-	1982	10	Intergenic	novelGene_40442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_9	104.800339270019	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	82	849	306166	278863	FALSE	15	AACCTCCCTGTCTGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNAEKAMTALARFRQAQLEEGKVKERRPFLASECTELPKAEKWRRQIIGEISKKVAQIQNAGLGEFRIRDLNDEINKLLREKGHWEVRIKELGGPDYGKVGPKMLDHEGKEVPGNRGYKYFGAAKDLPGVRELFEKEPLPPPRKTRAELMKAIDFEYYGYLDEDDGVIVPLEQEYEKKLRAELVEKWKTEREARLARGEKEEEEEEEEEINIYAVNEEESDEEGGQEKGGEDGQQKFIAHVPVPSQQEVGGEL	306247	277729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_278968_282489_282612_283580_283704_287213_287332_290078_290192_293584_293628_293811_293878_295025_295078_295631_295655_306163
699104	contig_10246_pilon	+	2703	10	Intergenic	novelGene_46893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	203.187075510036	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1166	1978	194712	195524	FALSE	10	CGAGTATTGGCTCCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGWNSSELQVFCNSSQRFLQPLWDCVRNPDALTQSPFFLVIFGITTYVVFCLPFVVLDVLYPWVPALRRYKIHPNFSPTARQLLPCLGQTLYQHVLFVFPVTLLHWASSPDRLLTEAPELLELACHVLVCLLLFDAEFFAWHVLHHKVPWLYRTFHKVHHQNSSSFALATQYMSVWELFSLGFFDAVNVKLLGCHPLTVLVFHVINIWLSVEDHSGYNFPWSTHRLVPFGWYGGVVHHDLHHTQFNCNFAPYFTHWDRLLGTLRLAHAK	140716	196249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_194595
699111	contig_5231_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_65887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1715	2032	209445	209128	NA	30	GAATGTGGAAAACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	211159	208840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_208800_211200
699117	contig_21412_pilon	-	3484	5	Intergenic	novelGene_142858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_2	61.3534840086527	5	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	287	637	57833	50354	FALSE	20	AACTCTTGGTATCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVYVVLPLEIKTDAYVRGYVGEEIKLKCTFTSTSDVTDKLTIDWTYRSASSSRTESIFHYQSFTYPTTSGRFRDRISWVGNVYKGDASISISNPTMKDNGTFSCAVKNPPDVHHNIPATELTVTERSFGTMLSSVALLSILVFIPSAVVVVFLLVRMGKKSAGLKKRSKSGYKKSSIEVSDDTDQEEGENCMGRLCVRCAECLDPDYEDTY	61893	47506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_50381_53352_53417_55920_56087_57739_57951_61724
699118	contig_5084_pilon	-	2564	3	Intergenic	novelGene_64633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	4.5	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	130	732	1330509	1328977	FALSE	30	GTAAACCCATCTGCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHHTGPAAGTPGLRRKEHTYWAVGAATGSGDKFRMLLFSSLEHQFLTFPSLPQTFPVGLCCLYRQWWDNTVPPQCLSSSGRLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGEWPHPTAGLFSFLEATVSSPFLTLAQARHS	1330638	1327144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1329145_1329244_1329350_1330179
699125	contig_500_pilon	+	1534	10	Intergenic	novelGene_30948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	523.83488586989	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	690	1238	1466134	1480676	FALSE	5	ATGTGTTTTTGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446807	1480972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461559_1464077_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
699126	contig_1275_pilon	+	837	3	Intergenic	novelGene_108839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	85	699	747279	747968	FALSE	20	GGTAGCATAATTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746552	748106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747404_747478
699127	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699131	SIRV1	-	259	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	2	3569	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
699135	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699141	contig_11285_pilon	+	1121	7	Intergenic	novelGene_5570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	604.496668495553	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	23	847	767746	769878	FALSE	0	GTGCGTGCGTGTGTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDRPQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763529_767733_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768744_769410_769653_769740
699142	contig_14744_pilon	+	2409	13	Intergenic	novelGene_66127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	516	950	1587758	1588767	TRUE	30	TTAGGATCCTCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGRRRGHNCCRKAAAKAETFSTASPLTSAAMHRRQEPGEGSRRHHSLLLFLCIPSSLLLGAFRLCSSIMVAGSCGGDPGVPATFTPTTRSVSPCRPSGGGGHKVFWHMPRGHGPIMAVSIPSPAVRVVELQYARRAGLAPRL	1587242	1604740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1587843_1587969_1588082_1588336_1588408_1588600_1588883_1589734_1589856_1590809_1591038_1591679_1591755_1592979_1593186_1593917_1594334_1596802_1596863_1596972_1597113_1601765_1601820_1604696
699143	contig_2703_pilon	+	3105	13	Intergenic	novelGene_101804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	36.700268694142	4	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	276	1727	761416	780858	FALSE	40	AAAAAAAGCCTCTGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDARICAFLWRKKWLGQWAKQLCVIKDTRLLCYKSSKDHSPQLDVNLLGSSVIHKEKQVRKKEHKLKITPMNADVIVLGLQSKDQAEQWLRVIQEVSSLPSEGMSEGNQCVPDTQRLSCQKLEIAEKYLLAAEYGGCIDGHPEVPETKDVKKKCSAGLKLSNLMNLGRKKSASLEPSERALETSSYLNILVNSQWKSRWCSVKDSHLHFYQDRNRSKAAQQPLSLVGCEVVPDPSPDHLYSFRILHNGEELAKLEAKSSEEMGHWLGLLLSESGSKTDPEEFTYDYVDADRVSCIVTAAKNSLLLMQRKFSEPNAYIDGLPLQERQEELYDDVEMSELTAMLDPTEEDTLGPDAPCASKPDRVYLDLTPIKSFLHSSGSIQAQATSPSLPCLDDPAEAFPVTLGTTVDTTHLESVSPRPKAASPIPVPDCTPVNSATALKNRPLSVMVTGKGTVLQKAKETVNRLKSWIKCEKSSPVEAEKA	761140	782236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_761512_762750_762931_766149_766240_767835_767921_768661_768767_771102_771315_773183_773330_774063_774176_774800_774978_777393_777448_777564_777688_779925_779953_780813
699148	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699152	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
699153	contig_11816_pilon	-	2373	8	Intergenic	novelGene_98451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.0995626366713	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCGCCGCCGTTAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477230	400505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_400655_420881_421047_429946_430137_430904_431075_432830_433937_437136_437306_442779_442889_476915
699156	contig_1443_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_28209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	59	364	344287	344592	NA	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344228	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344200_344900
699158	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_92016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699162	contig_1443_pilon	-	2830	8	Intergenic	novelGene_28389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	32.5124779813812	2	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	131	1084	1052337	1039483	TRUE	20	AGGGTTAAATCCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRSLGRERDESSINTLMSL	1052467	1036819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1039518_1040132_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
699168	contig_12603_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_105786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTGACAGAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552518	552883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_552500_552900
699170	contig_12120_pilon	-	1838	6	Intergenic	novelGene_21400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	613.200260926233	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	520	1137	63614	21562	FALSE	0	GTTTGGTTTTTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFWLCFNCCIAEQPQPKRRRRIDRSMIGEPTNFVHTAHVGSGDLFSGMNSVSSIQNQMQSKGGPARILFPPGTLLCSSHLKDRLHFMGIVSMDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEFKK	156973	20860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_21985_24317_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_156911
699173	contig_13905_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_130422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	68	388	218514	226369	TRUE	45	GAAGTATGCATAAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218446	229539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_228649_229009
699175	contig_12279_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_50095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2265.21422827952	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	67	510	68297	77128	FALSE	15	TGAGATCTTCATTTCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDEKTFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57536	77635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68424_71657_71711_75031_75096_76928
699182	contig_9471_pilon	+	1525	11	Intergenic	novelGene_21793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	619.594230121618	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	542	1318	413930	417296	FALSE	20	CTTTTGTGCTTATCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406971	417503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407181_410633_410795_412237_412329_412753_412821_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
699183	contig_9463_pilon	-	1029	9	Intergenic	novelGene_83829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAGAGTCCCGAGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223424	185938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_185975_216042_216108_216586_216626_216768_216845_217424_217460_218618_218670_219237_219288_221959_222551_223338
699186	contig_9706_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_20963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCTCGACTACTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310790	312845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_310800_312800
699196	contig_5671_pilon	+	1183	6	Intergenic	novelGene_79461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2140.86113515099	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	236	661	370430	531275	FALSE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKKICLWILTMRLMKCLLRKAIKTMNPKPKKYLCSQFPEIC	369987	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521252_521303_531205
699200	contig_6710_pilon	-	477	2	Intergenic	novelGene_98124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CCCATCTCGTCCCCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699203	contig_13542_pilon	-	1618	9	Intergenic	novelGene_131502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGCAACAGAGCCCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506341	346588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_346639_417044_417134_453981_454101_464615_464734_487357_487499_487903_488021_499868_499935_500886_500959_505495
699216	contig_10541_pilon	-	2496	11	Intergenic	novelGene_144643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	255.373138759737	35	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	214	1473	312553	234166	FALSE	70	AAAAAGAAAGAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEIVNVHKEIQLSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQDIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSKTYEKKSDIVLLLSQKQTLEELKQSIQQLRCTESKFAAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMVSERVIQ	350499	233142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_234380_243494_243618_259379_259500_260014_260153_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_348836_348885_350466
699217	contig_15666_pilon	-	1632	6	Intergenic	novelGene_70218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165.264152192785	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	22	621	132068	130288	TRUE	40	CTTAGTAAAAATGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILSPSEMLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKAEEA	132089	128440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129361_130025_130298_130529_130795_131446_131711_132007
699218	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	224	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699219	contig_5125_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_43488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTATGCATTACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326267	324547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_324500_326300
699220	contig_10734_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_51038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTCCAAGGTCAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386250	387534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_386200_387500
699225	contig_5643_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_39157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAATAAATCAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678859	680630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_678900_680600
699232	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_94143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699238	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699242	contig_14441_pilon	+	1019	7	Intergenic	novelGene_100466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	358.258480554039	15	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	8	760	85423	117335	TRUE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALPLACALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASSFGPRRLCSGNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKIGRRRVGRDPAQARHPERQCRGLGPCRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	85415	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85866_112596_112665_116578_116729_116883_116963_117220_117344_117539
699243	contig_10861_pilon	+	1526	9	Intergenic	novelGene_39310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	34.0401876463688	292	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	295	1020	1472615	1482629	FALSE	15	CCATCCCAGTATTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADHAEVLKGIQTFPGINYPVLIPNLKGFQTAVAAGAKEVSVFGAASELFTRKNINCSIDESLQRFDEVLKAAQALSIPVRGYVSCVLGCPYEGKISLAKVAEVAKRMYSMGCYEISLGDTIGVGTPGVMKDMLSAVMHEVPVAALAVHCHDTYGQALANILMALQMGVSVVDSSVAGLGGCPYAKGASGNLATEDLVYMLTGLGIHTGVNLQKLLEAGTFICQALNRKTSSKVAQATCKL	1462192	1483135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1462294_1468878_1468963_1471804_1471914_1472614_1472711_1473380_1473530_1478105_1478170_1479888_1480078_1481368_1481495_1482527
699246	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699256	contig_3153_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_104710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAGAACAACTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495621	494683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_494700_495600
699257	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699259	contig_11285_pilon	-	1804	17	Intergenic	novelGene_5688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	367.882576162218	34	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	25	1614	798530	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798554	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787132_793853_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
699261	contig_3132_pilon	-	2150	11	Intergenic	novelGene_127450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	25.3260735211758	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	25	873	369684	361218	FALSE	40	CTGTCTGCAAAGTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADLSGFNIDAPRWDQCTFLGRVKHFFNITDPRTVLVPEQELDWAKMMVEKSRMGAVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNIIGRMSFQVPGGMIITGFMLQFYRQMALSYFTATTTAVATAVGMNLLTKRAPPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIQGICVKDKNHSEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMAAPGMRAFKDILSLEKDALGLEVHDLLCDYSLTTSPHGTTGEAAFHEESQGPACPIAGHAVWVLPHLHGASGMRALPTDM	369708	359940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_361221_362047_362096_363923_363974_364326_364377_364592_364669_365018_365086_365467_365529_366805_366892_367360_367437_369184_369356_369523
699262	contig_16510_pilon	+	1984	4	Intergenic	novelGene_139090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.2703943940144	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	108	398	289563	292598	FALSE	5	CTTCGGCCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAELRAESDSLLLQLLRDLEELEGWFSLSKARYAMGAKSVGPLQFASRMEPHYYVRTSETQDGPQKLWMVRAVAEPPDSHQLGSKPAPGAPRETQAARAWGRLSQGSEHSDMTALHPAFFLYRLPLLHLS	289339	294184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_289414_289529_289634_289736_289789_292430
699268	contig_6674_pilon	-	2759	8	Intergenic	novelGene_147985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2079	2552	68904	54690	FALSE	80	AAAAAAAAAAGAAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEQDSAHFWVLVLAFIHYGLFCHGVNEAHVEILLRPYSIAVEELEPVVNPVIGLFAVGFLFPSPRTPQRLSSRSPRAGPVCRRGPGRSGRSWISADWKAAASQSEPGPDPPRSAPLCWRPAPRRPASTSAPRSCRCPAALPSCCFHSVGCFPESQT	344119	54482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_54824_56741_56900_57435_57501_58126_58182_68842_68917_80495_80802_227523_227577_342412
699269	contig_14041_pilon	-	2095	13	Intergenic	novelGene_144028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	32.3164689696549	257	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	591	1667	66278	26842	FALSE	30	AAAATGTGGGCTTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVIHSKQNNKIPEVAAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVVLYIKEEMKRNDLPETAVIGLLWTCIMNAVEWNKKEELVAEQALKHLKQYAPLLAVFSSQGQSELILLQKVQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKADVLSEEAILKWYKEAHVAKGKSVFLDQMKKFVEWLQNAEEESESEGEEN	104577	26413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_26871_30653_30777_41195_41335_42583_42731_44660_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_66226_66530_73055_73233_80866_80932_104480
699273	contig_8248_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_125031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGTGACTCTCATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190396	190111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_190100_190400
699277	contig_5770_pilon	-	608	6	Intergenic	novelGene_74177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2103.27348673443	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	19	573	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264950	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
699281	contig_3846_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_137148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTACACTCCCTATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187346	187888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_+_187300_187900
699284	contig_3837_pilon	+	1854	9	Intergenic	novelGene_104020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	77.4802394162537	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	497	1414	67539	134174	FALSE	5	TTTCAGTGTCTGCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKVISHYQCKEQRDAHRFEKISNIIKQFKLSCSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLERVDGPKQCLLMR	67042	134614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_77748_77816_88997_89221_121918_122015_128629_128722_133150_133267_134076
699286	contig_6589_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_25967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCAACCTCCTGGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296048	1296275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
699290	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_96467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699292	contig_3948_pilon	+	2166	3	Intergenic	novelGene_53366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.5	1	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	250	951	1813956	1860572	FALSE	20	AGCGTGTCTATATTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1812330	1861787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812469_1813844_1814520_1860434
699293	SIRV1	-	217	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3887	0	3613	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6753	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
699301	contig_11171_pilon	+	1255	6	Intergenic	novelGene_48592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	733	1038	251430	251735	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212055	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212207_235133_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
699303	contig_15063_pilon	+	1527	5	Intergenic	novelGene_12519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	6	1418	28164	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28158	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
699309	contig_6544_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_142104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGAAAATGGACAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119627	121406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_119600_121400
699313	contig_16650_pilon	+	2052	3	Intergenic	novelGene_61964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	971	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTCATCAAAGCTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244585	256000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_254128
699314	contig_9363_pilon	+	1547	11	Intergenic	novelGene_6808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	278.62024334208	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	219	638	1622283	1623712	TRUE	10	GGCCACGCGAGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVQCPDA	1622064	1625968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623501_1623696_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
699316	contig_14840_pilon	-	1476	7	Intergenic	novelGene_66235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	41.9986772278472	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1013	1471	15841	11241	FALSE	30	ATTGTCAGAAAATGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNGADPQLLGKGRESALSLACSKGYTDIVKMLLDCGVDINEYDWNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	19197	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13215_13342_13764_13863_15810_15877_18220
699321	contig_5815_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_141200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGGTTGAAAGAGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343042	340953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_341000_343000
699327	contig_10734_pilon	+	1693	2	Intergenic	novelGene_51162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	71	1171	998765	1000258	FALSE	10	GTCTGGGGTTGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHAINKISNQTATIISSVLWGITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGLKMAMFPTFPLSRVRGIEKPIGTCDSLASLLHLPETWMVLSSWGNI	998694	1000780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_999723_1000115
699336	contig_15114_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_121094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATTTTATTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29593	31497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_29600_31500
699342	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
699349	SIRV7	-	965	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9281	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70849_70988_78841_78964_114680_114989_147608
699352	contig_18420_pilon	-	1347	7	Intergenic	novelGene_109355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	530	junction_1	213.880353365043	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	4	924	119901	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	119904	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704
699354	contig_7202_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_18574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	49	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	192	578	29911	28043	FALSE	30	GTGAGTATTGGAAACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPH	30102	28042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
699356	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699357	contig_3426_pilon	+	1809	2	Intergenic	novelGene_57980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATTTTATATGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594153	596084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_594961_595082
699358	contig_14441_pilon	+	695	3	Intergenic	novelGene_100661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	191	694	116728	117792	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLA	112112	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117523
699359	contig_4232_pilon	+	953	3	Intergenic	novelGene_63225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	835	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	25	474	148279	149200	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	148254	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_148539_148806_148884_149087
699360	contig_10734_pilon	-	1856	11	Intergenic	novelGene_51444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	80.1164777059002	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	273	1136	2226326	2216993	FALSE	15	TAATCCGTGTGTGTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234583	2216272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2234332
699362	contig_7202_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_18602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAACCACGGCGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28547	30081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28634_29797
699373	contig_2278_pilon	-	2149	10	Intergenic	novelGene_118113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	150.724177814237	48	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	90	1100	999076	940418	TRUE	25	TTCTACTCTCAAGACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFTAARARVPRFPGSHCREWPLTLVARGRMKALSMDRAAVARVGAVASASVCALVAAVVLAQYIFTSKRKTGRKTKIIEMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	999165	939329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_939974_940012_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_998923
699375	contig_9345_pilon	-	1872	6	Intergenic	novelGene_24634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2191.90085542207	3	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001346	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949473_949607_952439_952561_955201_955356_956381_956552_1001300
699378	contig_7050_pilon	+	1570	12	Intergenic	novelGene_153627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_8	257.40738525433	500	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	80	1033	714322	846716	FALSE	15	TGGTTTGTTCTTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRSRVVGSGLGATPASRPASDPSARRQELGPPPSQRRGLESAPEDPPRESSERAGQGLVRTGAYTLITPNENRRSQLRRIAEKELEDLEKWKEQNRAKPVNLVPRQLGGSQSEAEVRQKQQLQLMQSKYQQKLKREESVRIKKEAEEAAIRKMKAIQREKSNKLEEKKRLQENLRRDAFREHQQYKTAEFLSRLDKDLPNRSTCQVALRDPQYSTWKLPVLPQDSSWARSRSYKDSLKEEENRKLQKMKDEQHRKSELLELKRQQEEEERTKTRQTEHRRVNNAFLDRLQGKSQPGGLEESGGYWNMNRGNSWDM	714242	847253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_714507_732208_732268_734460_734545_738683_738758_739460_739545_760439_760514_799721_799816_808115_808149_810822_810907_830795_830870_834426_834527_846707
699382	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699384	contig_8317_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_19542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
699385	contig_7091_pilon	+	2046	16	Intergenic	novelGene_131773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_12	335.912620913369	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	100	1578	349798	435147	FALSE	35	ATGACTTACTAAGTGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKDYHEEKKVLNGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349698	435615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_380737_380768_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420877_420945_421228_421316_431521_431687_435092
699386	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657172	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
699388	contig_9150_pilon	-	1807	4	Intergenic	novelGene_140906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_3	80.6570242170857	28	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	279	1148	47776	46907	FALSE	25	GCAAATCATTTGCAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRKQGSQTRGQQSAEEDNFKKPTRSNMQRSKMRGAASGKKTAGPQQKNLEPALPGRWGGVALQRTPPSGSVRKTRKNKQKTPGNGDGGSTSEAPQPPRKKRARADPTVESEEAFKNRVEVKVKIPEELKPWLVEDWDLVTRQKQLFQLPAKKNVDAILEEYANCKRSQGNVDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILMAHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLGYLHDFLKYLAKNSAALFTASDYKVASAEYHRKAL	59167	46247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47801_49153_49253_57679_57770_59102
699389	contig_14618_pilon	-	2097	3	Intergenic	novelGene_136784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.5	150	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	253	1446	39212	24996	FALSE	20	CCGTAACTCAGGCTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKEKPHMCKECGQGFRWKSGLLIHYRTHSGEKPHVCKECGLSFNQESSLLLHERTHSGEKPHVCEQCGRGFNHQSALIRHQRTHSGEKHYLCLECGRGFSRKSGLFLHQRTHSGEKPHMCKECKRSFRRKSDLLIHQRTHSGKKPHVCKDCGQGFNWESSLPLHQRIHTGEKPHVCKECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLIGHQWKHTDKKPYVCSECGKGFTQKSSLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFTQKSVLLNHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHLRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSILLTHQGTHSGEKPYLCKECGRGFNRESSFLLHQRTHSG	39703	24344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_26173_39195_39390_39628
699402	contig_6364_pilon	-	2154	2	Intergenic	novelGene_51781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	146	1384	1102801	1091390	FALSE	10	CATGGTATGTGGTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPETSCPWMGHLPRLQVRTWIEPVVASTQVAASLYDAGLLLVVKEYYDAGGSSNHSASPSTRGAVEDQQQRAISNFYIIYNLVMGLTPLLSAYWLGWLSDRYHRKISICVPLLGFLLCRLGLLLKVLLDWPLEVMYAAATLKGLCGGFSAFWSGVMALGSLGSSEGRRSVRLVLIDLILGLAGFCGSMASGHLFKQIAGRARQGLVLTACSVSCATFGLFYSLLVLKVPESVAKSNKALTTVDTVSGMVGTYRTLDPDQSEKQSVVGHPPPLGKGKPPKAIIALLFVGAIIYDLAVVGTVDVMPLFVLRAPLSWNQVQVGYGMAAGYIIFITSFLGVLIFSRCFRDTTMIMIGMVSFGSGALLLAFVKKTYMFYIASWPINKFHGRNSKTSQKNEGADLWELKTPAMARPP	1102946	1090619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1091500_1101672
699404	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699405	contig_11978_pilon	-	2637	3	Intergenic	novelGene_63128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_2	67	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1979597	1923343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1925588_1940593_1940656_1979266
699406	contig_15732_pilon	+	3148	1	Intergenic	novelGene_88927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400692	403840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_400700_403800
699412	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699415	SIRV6	-	721	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAGAACGTACCAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11329	10300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
699416	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_97462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699419	contig_11720_pilon	+	2403	7	Intergenic	novelGene_44020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	131.150570804027	781	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	44	829	276923	280969	FALSE	5	TCCTGCCTCTGTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRARVRPERSAPGPMDSSAVITQISKEEARGPLRGKGDQKSTASQKPRGRGILHSLFCCVCRDDVEALPPHSGAPLLVEENGAVPKQTPVQYLLPEAKAQDSDKICVVIDLDETLVHSSFKPVNNADFIIPVEIDGVVHQVYVLKRPHVDEFLQRMGELFECVLFTASLAKYADPVADLLDKWGAFRARLFRESCVFHRGNYVKDLSRLGRDLRRVLILDNSPASYVFHPDNAVPVASWFDNMSDTELHDLLPFFEQLSRVDDVYSVLRQPRPGS	276879	282543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_276990_278462_278612_279036_279142_279264_279322_279968_280062_280146_280333_280840
699421	contig_7440_pilon	-	1113	8	Intergenic	novelGene_61154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	274.881495802635	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	150	659	66382	54265	FALSE	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	69519	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429
699424	contig_7286_pilon	-	742	5	Intergenic	novelGene_108673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	2556.68744423326	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	78	674	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	291459	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315
699427	contig_7356_pilon	-	1797	10	Intergenic	novelGene_60420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_6	310.251869006816	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	790	1488	489008	482300	FALSE	45	AGAGTACAATAAGGGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTVRGRDGYVTIVVKADIDEESIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEGTDKIQLKMELNVQF	492291	481990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811
699428	contig_5018_pilon	+	1655	6	Intergenic	novelGene_47124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	101.264801387254	855	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	163	1227	1448095	1450559	FALSE	10	GCTGTTAGCCTTTTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALCPLLLAVLMGVPAGTLTCYGDSGQPVDWFVVYKLPAKSGPGDAAGRGLRYKYLDAGSGGWRDGAGLISSSAGAVGRSLLPLYRSNASELAFLLYNDQPPKSSRVWDSSSRGHTKGVLLLDQEGGFWLVHSVPRFPPPASSAAYSWPYSARRYGQTLLCVSFPLTQFLTIGRQLSYTYPLVYDYKLEGAFAQKFPNLEEVVKGHHIRHGPWNSSVTLTSQAGATFQSFAKFGNFGDDLYSGWLAAALGSNLQVQFWQNSAGILPSNCSGAQQVLDVIQTAFPGPAGPTFSATEDHAKWCVAPKGPWACVSDMNRNVREEHRGGGALCAQLPALWKAFQPLVKTWEPCKEPW	1447932	1450987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1448190_1448327_1448509_1448609_1448689_1448986_1449152_1449244_1449443_1450212
699431	contig_14528_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_111287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	63.2156801926723	505	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	276	746	250227	247022	FALSE	15	CCACGGTCTTCTTGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQFRSYVWDPLLILSQIVLMQTVYYGSLGLWLALVDGLVRSSPSLDQMFDAEILGFSTPPGRLSMMSFILNALTCALGLLYFIRRGKQCLDFTVTVHFFHLLGCWFYSSRFPSALTWWLVQAVCIALMAVIGEYLCMRTELKEIPLNSAPKSNV	250709	246086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_247263_248485_248554_250065_250305_250511
699436	contig_5372_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_149706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATATTAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148779	151201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_148800_151200
699437	contig_8269_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_106261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382427	384779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_382400_384800
699438	contig_998_pilon	-	2703	14	Intergenic	novelGene_153795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_13	404.634424822554	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	1449	2582	365529	330554	FALSE	75	ATGGAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTGMLHGIGKFIVEIICCRFRLGAYKPVNSITFEDDHTDNHLPLLENNTH	373629	330432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330869_332165_332329_335041_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_366956_373607
699439	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699441	contig_7513_pilon	+	2393	3	Intergenic	novelGene_89027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	24.5	692	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	449	826	690156	690812	FALSE	10	CATCCACGTCTGTCCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSFLGFQLIPEQEQLWAACAAYSKVYIWSLQDLAQAPQRIPLQDCTEVSCMIRVKRQIWVGGRGLSQGQPKGKVYVIDTETKTVDKELVAHADAVTTLCSAEDRYVLSGSGREEGKVAIWKVE	689707	692379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_690195_690278_690417_690611
699442	contig_57_pilon	+	3184	10	Intergenic	novelGene_44917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	27.2274371422162	256	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	298	1755	294280	319950	FALSE	20	CTTTTACTCATGTGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHKPERKSPEENLQGAVNSFCTSASGAPLGPKGDGHYPWSCPVTHTREKIYAICSDYAFLNQATSIYKTPNPTCSSCLPDSTSLAAGNNSSRYIGIPSSVSEIIYNEENSLENLSSSLGKLPLAWEIDKSEFDGMTTNLKHKSGNVKKQISKKKTSDKKGRHQRECPQHSPLEDIKQRKVLDLRRWYCISRPQYKTSCGISSLISCWNFLYSTMGAGSFPPITQEEALHILGFQPPFEDIRFGPFTGNTTLMRWFRQINDHFHVKGCSYVLYKPHGKNKTAGETASGALSKLTHGLKDESLAYIYHCQNHYFCPIGFEATPVKANKAFSRGPLSSHEVEYWILIGESSRKHPAIHCKKWADIVTDLNTQNPEYLDIRHLERGLQYRKTRKVGGNLHCIIAFQRLNWQRFGLWNFPFGTIRQEPQRPPPAQGIARSESEDSISKKQRGRLGRSLSTSFHQDSPWKKMSGVHERRNSGCQGYSDYD	286743	321379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_286880_294118_294713_298992_299120_304959_305056_305333_305439_305657_305753_315055_315189_315681_315769_318640_318738_319665
699444	contig_2069_pilon	-	1145	7	Intergenic	novelGene_23430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	846.916842959738	425	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	98	370	1331269	1327936	TRUE	15	GGAATGCTGCCTCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEEEARTTPGSTKARAPLHPRVQRLRPAAVATMPKRKAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1331366	1327099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327447_1327507_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
699448	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699450	contig_14744_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_65933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166489	168245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_166500_168200
699464	contig_6710_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_96638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAAGCACTTGCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
699466	contig_4071_pilon	+	2287	4	Intergenic	novelGene_151890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	36.6878726556883	32	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1407	2246	338050	343578	FALSE	15	CCAAGTTCACTGGTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRPTLTKELTFSSNIGQHDLDTKSKQIQQWIEKNYQVQITIKKGKNVEDPENKMEAIFNQILQTMPGIATFSSKPQAVKGGRAVMCVLRHLSTKEENMYREAQKTQKGDILNKENRNDRPPDVLHQ	336078	343619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_337484_338048_338513_342301_342460_343359
699468	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699473	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	35	3402	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
699477	contig_5628_pilon	+	3537	1	Intergenic	novelGene_157564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95003	98540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_95000_98500
699481	SIRV4	+	227	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1544	632	1089	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2544	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
699484	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699487	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699492	contig_7963_pilon	+	1365	7	Intergenic	novelGene_58516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	195.929125507726	2027	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	285	1076	194098	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	185570	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_185704_193946_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
699493	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
699498	contig_7963_pilon	-	1931	7	Intergenic	novelGene_58544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.186466104126	18	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	43	702	245666	240504	TRUE	65	ATGAAAACTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRGAPAGDLPGAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245708	239206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_239607_239674_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_245606
699499	contig_9871_pilon	+	2002	3	Intergenic	novelGene_75661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_2	74	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	934	1332	416286	419187	FALSE	0	CCCTCCTCCTGTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	415352	419857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_416506_418632_418746_419121
699502	contig_1084_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_152386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATGAAGGCAGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534228	534635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_534200_534600
699503	contig_10948_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_124978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAAGTAGCTGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150733	151971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_150700_152000
699505	SIRV4	+	321	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1430	652	975	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
699506	contig_2703_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_101761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTCCACCCACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584945	582708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_582700_584900
699511	contig_7285_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_143409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCTTCAAATGGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323251	322602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_322600_323300
699512	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699519	contig_11145_pilon	-	978	8	Intergenic	novelGene_160513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	74.5514477884027	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	109	951	215710	59515	FALSE	25	GTGAGTGGGGAGCTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFSRQEEWLQACDGSCFWPRGLGNC	284080	59487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_59582_73373_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
699533	contig_6056_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_157877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	93.8321327467434	19	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	588	1220	291464	312153	FALSE	30	GAATATGATTTTGGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267041	312356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287230_290621_290809_291366_291587_291720_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
699534	contig_11964_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_164719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGTTTTCCCAATTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216241	217032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_216200_217000
699536	contig_6710_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_92556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAGCACAGTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
699538	contig_8020_pilon	-	1877	6	Intergenic	novelGene_114389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	53.1089446327076	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	114	722	150417	148058	FALSE	30	TCAAGTTTCTGAGAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	150999	146902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150901
699539	contig_15456_pilon	+	989	3	Intergenic	novelGene_139507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	787	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATTTATTTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131450	143130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_141935_142040_142317
699541	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
699542	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_116459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTCCAAATTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
699543	contig_12279_pilon	-	1026	7	Intergenic	novelGene_50085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	295	597	77185	75050	TRUE	40	GGCAGTTAGAACAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77554	57532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57597_68290_68479_69364_69445_71631_71709_75029_75094_76926_77362_77436
699544	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91671	2	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
699545	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
699548	contig_1076_pilon	-	1724	14	Intergenic	novelGene_101104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	215.262465362828	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	99	1349	75421	54305	TRUE	15	CTGTATGTTTTTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNFKRLIVYGKNLKRQRKQIKSFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKQAFLPDTSWLSAPACPPGGCGHGGAGQRPSSRKGTLCSYCCRSYHLVNNAQDNRIVDFLLLFLECWQPKLFWLSVMMLLVRIPVLRWELRTEPN	79565	51355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_54492_54675_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_75351_75429_79474
699549	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699552	contig_7229_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_39827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATGAACTAGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906724	905077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_905100_906700
699554	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699558	contig_9848_pilon	-	1326	11	Intergenic	novelGene_79944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	560.863655445778	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113883	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99119_99245_99394_104028_104127_104820_104905_105852_105909_106511_106548_106837_106876_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
699563	contig_11903_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_164734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTTCTTTCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86606	88625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_+_86600_88600
699564	contig_19558_pilon	+	2242	2	Intergenic	novelGene_164750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_1	0	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	83	700	153889	166034	FALSE	60	TGAAAAGGAAGGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAASTACDRRRQTGRGKRGDSPAGAEMWPLVGALLLGSACCGSAQITFNITKSAEFTVCNTTVVIPCFATNVETKLLTDLYVKWKFKGKDIFTYDGAQGQSSTPSSGFKSAKITPTELLHGIASLKMKKSDAELGNYTCEVTELTREGETVIELKYRVGKTCLKASFLFCSNLILLERRQNGARNSFESKSRLLIINVDVMFSSSKIMSFLVCSPTFHSKTHLLFVNLYIV	153806	167576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_153935_165462
699565	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
699573	scaffold_19766_pilon	-	1113	7	Intergenic	novelGene_34321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_6	411.865168066768	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	227	889	621659	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVHSQSQLRQCVSPSSSHRAVSPDNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623651	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_623580
699577	contig_15741_pilon	+	1333	6	Intergenic	novelGene_159659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2508	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	381	737	49935	50385	TRUE	30	TCAGCAACAACTTGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSTEMHHFSPFLLKIYYKKTQLGEGHVSLSVLRAGEGAAEGPAEALSARTAGGRHCRVLSPTISRLCCCSWARSRAFSFFSSSICCLKSSFSTCSRSASLKVSCMRWLVWRSSRM	49554	61003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_+_50195_50288_50418_50651_50749_60115_60172_60469_60558_60680
699580	contig_6028_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_156610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAATAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410422	412308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_410400_412300
699581	contig_11396_pilon	+	966	7	Intergenic	novelGene_71431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	464	junction_3	401.664626550836	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	125	871	1782334	1789745	FALSE	35	GTGTCCGACAGTAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGESAAAAHECALLRRNAGGVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782209	1789840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
699583	contig_6279_pilon	-	2810	1	Intergenic	novelGene_164767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99149	96339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_96300_99100
699587	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_95030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699591	contig_1090_pilon	-	884	2	Intergenic	novelGene_131108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCCGTGGAAAGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307170	306237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_306464_306512
699593	contig_6062_pilon	-	1936	6	Intergenic	novelGene_5258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGTCCTGCGGCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726352	652567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_652698_661999_662941_710264_710404_711935_712068_715123_715282_725916
699605	contig_6445_pilon	+	1410	9	Intergenic	novelGene_77074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	325.642993744684	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	58	777	727272	738922	TRUE	35	AAAATTCTATCACTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLGFSAAKRPWDLGDVATMPATGKTFRRRRADSESEEDEQDSEEVRLKLEETREVQNLRKRPNGVSAVALLVGEKVQEETTLVDDPFQVKTGGMVDMKKLKERGKDKISEEEDLHLGTSFSAETNRRDEDADMMKYIETELKKRKGIVEHEEQKVKPKNAEDCLYELPENIRVSSAKKTEEMLSNQMLSGIPEVDLGIDAKIKNIISTEDAKARLLAEQQNKKKDSETSFVPTNMAVNYVQHNRSYGETKKNPKPGP	727214	741375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_727355_727707_727768_736269_736322_736470_736542_736935_737014_737748_737947_738626_738764_738881_738956_740775
699607	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699612	contig_9471_pilon	+	1603	11	Intergenic	novelGene_21783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	891.870080224693	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	679	1065	413930	414943	TRUE	25	TTATATGAATCTGCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILGL	406947	417521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412753_412821_413715_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414953_416203_416273_416936_417028_417152
699624	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_95874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699626	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699630	contig_9706_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_20828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCATTCTATTTCTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2184	2494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2500
699631	contig_8617_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_73455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCTGCATCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62326	62059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62300
699634	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_96294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699635	contig_3601_pilon	+	2613	1	Intergenic	novelGene_132927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAGATTAGAGTATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357397	360010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_357400_360000
699639	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	970	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699646	contig_9752_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_122004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39215	36819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_36800_39200
699649	contig_15691_pilon	-	1371	12	Intergenic	novelGene_60758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	580.695835091455	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	155	1213	69383	27919	FALSE	20	CCCTCCTCTTGTACAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRVT	114436	27760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69411_114309
699653	contig_15185_pilon	-	1593	2	Intergenic	novelGene_99443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	676	junction_1	0	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431157	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179
699655	contig_6710_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_89167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653697	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699661	SIRV7	-	287	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	68993	0	35774	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
699670	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699676	contig_3382_pilon	+	1999	9	Intergenic	novelGene_124196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAAAAGCTACTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378832	1397894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1379615_1380460_1380607_1382389_1382467_1383485_1383591_1391044_1391179_1392175_1392503_1393795_1393972_1395002_1395079_1397718
699677	contig_17440_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_7684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3735	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
699681	contig_6954_pilon	-	2928	1	Intergenic	novelGene_64451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATTGTGTTGTGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686321	683393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_683400_686300
699687	contig_1264_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_161313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGGTTTGGTAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136706	136354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_136400_136700
699690	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699692	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
699694	contig_13021_pilon	-	1605	10	Intergenic	novelGene_8250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	561.993365805929	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	106	1152	236115	210494	TRUE	25	TAAAGCTATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236220	208078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_208136_209348_209717_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
699696	contig_3004_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_127558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836449	839047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_836400_839000
699699	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699700	contig_12802_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_114264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGGTCTCTAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293789	293073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_293100_293800
699704	contig_3270_pilon	-	2466	27	Intergenic	novelGene_104515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_15	36.3351631734362	184	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	1177	2265	437936	420708	FALSE	30	GTAAATGTTTGTACATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHYEFPPYATNEIGKVTGVNRRELGHGALAEKALYPVIPRDFPFTIRVTSEVLESNGSSSMASACGGSLALMDAGVPISSAVAGVAVGLVTRTNPEKNDIEDYRLLTDILGIEDYNGDMDFKIAGTSKGITALQADIKLPGIPIKIVMEAIQQASVAKKEILQIMNKTISKPRASRKENGPVVETVQVPLSKRSKFVGPGGYHLKKLQAETGVSISQVDEETFSVFAPTPSAMHEARDFITEICKDDQEHQLEFGAVYTATITEIRDTGVMVKLYPNMTAVLLHNTQLDHRKIRHPSALGLEVGQEIQVKYFGRDPADGRMRLSRKVLQSPATAVVRTLSDRSSIVMGEPVSQSSSNSSSS	464588	420506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_420870_422493_422542_424493_424573_425765_425822_425908_426016_426922_427007_427308_427393_428848_428913_429004_429077_430087_430195_435740_435795_436724_436815_436897_436965_437921_437959_439743_439815_447578_447676_450808_450867_451237_451290_453303_453491_454382_454497_456300_456349_456446_456511_458208_458259_459167_459274_460219_460295_460917_460979_464417
699708	contig_15327_pilon	-	1524	6	Intergenic	novelGene_70480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	187.411845943633	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	84	395	390867	381607	TRUE	10	TTATGTACTGCTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKVSVT	390950	372574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_374889_375577_378885_379059_381602_381720_382830_382974_390811
699710	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699712	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699715	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
699722	contig_15354_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_65744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGATTCAGGAGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627380	626714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_626700_627400
699726	contig_12626_pilon	+	738	3	Intergenic	novelGene_80463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	617	junction_1	53.5	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	10	504	181139	185106	FALSE	55	ATAAGATACTAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLMMQVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVSF	181129	185340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_181295_183342_183523_184947
699728	contig_7912_pilon	-	2196	5	Intergenic	novelGene_129570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	5.24404424085076	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	205	1617	215789	198155	FALSE	15	CTTTAATCTGGGAGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAQGPVIFEDVFVYFSQEEWGLLDEAQRLLYRNVMLENFALIASLGIASSRLHKVTQLEQGEEPWMPDQVDMIPAPARTAQRGPGPGCWHGVEEEETPSEQSVSVEGVSQIRTPMAGPCTQKTHHCDICGSILKDILHPAEHQGSKARQKLYMCWACEKQFWFSANLSQHQKQHSGEKFIKRDECRDPGKSCRVYMPEETYTYREGGKDFPTTTGLLQPEVPHSGVKPHKNTQCGGTFCTGQRHCKCSKCRKAFSPKDSLVQHQRIHTLDRSYECSECGNFFSCNSNLVRHQKVHTGARPYICSKCGKAFNCKDTLVRHQRIHTGERPYECSECGKLFSQSSDLFKHQTVHTGERPYECSECGKFFRQISGLTEHRRVHTGERLYQCGECAKFFSSKSNLIRHQEVHTGARPYVCNECGKEVQSQTHTCSAPENSHWRQDFSAANVENHFTKATIWRKGLAVLSPCST	215993	197575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_198300_198628_199632_200203_200327_200856_200984_215774
699731	contig_13048_pilon	-	2173	2	Intergenic	novelGene_138928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473295	456174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_458156_473103
699743	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699749	contig_6217_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_109596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTAATAAAAAGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285569	286291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_285908_286072
699754	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699760	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699765	contig_14362_pilon	-	1784	6	Intergenic	novelGene_142520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	57.807957929683	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	312	1154	40212	37574	FALSE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	42266	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37729_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056_40233_41975
699766	contig_6589_pilon	+	827	5	Intergenic	novelGene_25790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	2105.04588726707	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	183	545	669670	672560	FALSE	10	ACGGGCCCTGACTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTRAGGKCSLLEGPP	668494	672842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672519
699767	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699770	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699774	contig_6283_pilon	-	2132	10	Intergenic	novelGene_100210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	195.183927186894	541	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	803	1234	613298	611758	FALSE	20	CTTGTCATGAATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	620858	610859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613409_613720_613788_614873_614938_615007_615211_615323_615452_615526_615664_620765
699777	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
699780	contig_8576_pilon	+	1371	6	Intergenic	novelGene_88781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.568480033463	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	134	931	902723	913464	FALSE	55	TTTATTTAAACGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCGINSNGGGCSSRNNSHTISSRSGSGGGGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIK	893598	913904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893692_893770_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245
699782	contig_17989_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_150813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_1	340.078943041171	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	380	1024	205841	201145	FALSE	40	ATTAAAAAACCCCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVGGLSWDTSKKDLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDSTSVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKKAMAMKKDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKSNKRRGFVFITYKEEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVYQQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGSGGQGSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY	206220	200626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_202346_202465_204529_204662_204856_205016_205676
699784	SIRV7	-	327	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	23	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114715	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
699794	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699795	contig_11563_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_142297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTCCAAACTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95141	95436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_95100_95400
699798	contig_6364_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_51758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTCAGTGTTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641459	642177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_641500_642200
699801	contig_1406_pilon	-	2300	3	Intergenic	novelGene_25642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_1	45.5	379	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCTATTATGAATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2719258	2713511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2714471_2716485_2716620_2718051
699806	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699815	contig_1443_pilon	+	1701	13	Intergenic	novelGene_28221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_4	59.3723537421996	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	273	1559	536254	541708	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVDNKSDFLEKKPHRQHPGILQLPHVRLPQALANAAQLLLLESSVSNVEKQVQALTNYLWSRHLPVEPEELQRRAMHLEKKFLENPDRAQAEEKLHGAVLSALRRTTYHWQELRYNEKLSLVYMAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535981	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
699819	contig_5515_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_52352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	830	1201	121510	121881	NA	60	TTCTAACACACACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCCSLTPSRRLLRQFQGLTTPTPLPWKGYPSSPASAPHQAPPTHLSFLQAPFKPALSSIHGVYLSLKFFHCLLEILQLPCSGLGGSRLSWARQAQEWAPHSHQPLAHQQNCGPHSGQSWRRM	120680	121888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_120700_121900
699822	contig_10765_pilon	+	2063	6	Intergenic	novelGene_122855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_1	100.670551801408	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	133	1893	18249	34929	FALSE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15634	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
699827	contig_8661_pilon	-	1134	10	Intergenic	novelGene_137941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	631.793058790458	506	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	111	884	315977	306492	FALSE	55	AAATCAAATAAGAATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQARWGEEKERQI	316087	306241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_306524_307650_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
699828	contig_8248_pilon	+	1619	8	Intergenic	novelGene_125012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_3	49.7413719315486	121	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1042	1617	52643	53218	FALSE	25	ACTTTATATTTTGCTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSKQEAEEGEVVMNIPHMEDEVVMNKEEGEVDVVAMTTVVEGEEEEISIKEAGQMEGVEEEVATKMVVIEIQVSSPVAIMVATVVATKVVVMVASRHLRIQEVDTRVVDTSRTIDTKMVGTMVIEAVVVEGEVVVEAGAVAEAREEVGEEEGARIITKGVNLNSTSSMEVTSIIILDLDKEDIILVEAT	35966	53220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_36082_39422_39572_41844_41980_45887_46073_47135_47217_47780_47898_52295_52464_52551
699829	contig_8878_pilon	-	1003	7	Intergenic	novelGene_147857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	425.819079996292	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	276	662	228839	228170	FALSE	25	GCAAGTGAACTCATCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231709	227828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230338_230404_230484_230570_231074_231121_231647
699836	contig_7428_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_77713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341529	339372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_339400_341500
699839	contig_3469_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_34232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGATTGAGTCCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627778	628787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_627800_628800
699843	contig_14441_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_100664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	506.723461729045	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	190	450	116728	117123	TRUE	10	CACAGCCTGCTTGGCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	112113	117776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117097_117344_117539
699844	contig_14362_pilon	-	1668	6	Intergenic	novelGene_142525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	48.9407805413849	744	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	196	1038	40212	37574	FALSE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	45485	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37729_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056_40233_45310
699852	contig_12644_pilon	+	1551	3	Intergenic	novelGene_44701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	255	320	2682226	2683318	TRUE	25	CACTTTGGGGTCTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQELRKEEETLLRLKAALHDQLNRLKVIPRLPPIPAVLPRDHLSYTLRVQLPPLPEPRPPGFTRTPALCGAHQHFPPKPLGGARMLLPVPSLVWPCRLKSWPFNQ	2681971	2685554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2682264_2683290_2683381_2684385
699854	SIRV6	+	390	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10435	1	1198	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11435	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
699855	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699856	SIRV4	-	792	4	NNC	SIRV4A	novel	570	5	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGATATTTAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15121	8323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13856_14922
699862	contig_12622_pilon	-	2512	3	Intergenic	novelGene_5840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463812	455345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_457347_460453_460535_463382
699865	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_90684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
699867	contig_12050_pilon	-	868	5	Intergenic	novelGene_62675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.938046612434	28	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCAGCAATATCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461686	446068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446292_446563_446994_456696_456767_458809_458920_461651
699868	contig_11318_pilon	-	1839	5	Intergenic	novelGene_48168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	7.84219357067906	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	333	995	164074	160482	FALSE	5	GTGGTGTGTTGCTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSFQIPSAWSCAWSLNTQANNCFSTGLSRQVLLTNVVTGHQQLFGTSSDVLAQQFAVLAPLLFNGCRSGEIFAIDLRSQSQGKGWKAMRLSHDSAVTSVQILQEEQCLMASDMAGKIKLWDLRTTKCLRQFEGHVNEYAYLPLHVHEEEGIVMAVGQDCYTRIWSLHDAHLLRTIPSPYPASKEDIPSVAFSSQLGGFRGGPGLLMAVRKDLYYFSYS	164406	159637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_160676_162217_162333_162700_162875_163763_163862_163992
699873	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
699875	contig_4103_pilon	-	2685	3	Intergenic	novelGene_51960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48	325	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	786	1760	161777	160803	FALSE	15	AACCGGCCATGGTTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEDGGLPGLGRPRQARWTLMLLLSTAMYGTHAPLLALCHVDGQVPFRPSSAVLLTELTKLLLCAFSLLVGWQTWPQGAPPWRQAIPFALSALLYGANNNLVIYLQRYMDPSTYQVLSNLKIGSTALFYCFCLRHRLSTRQGLALLLLMAAGACYAAGGLQDPRNTFPGPPTAAAAGPMPLHITPLGLLLLILYCVISGLSSVYTEMLMKRQRLPLALQNLFLYSFGVLLNLGLHAGSGPGPGLLEGFSGWAALAVLSQALNGLLMSAVMKHGSSITRLFVVSCSLVVNAVLSAALLRLQLTAAFFLATLLIGLAVHLYYGSH	164193	159877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_162403_162988_163088_164132
699882	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_93458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699887	contig_9197_pilon	+	794	3	Intergenic	novelGene_154354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_1	14	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTTCTGTGTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52364	92644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92373
699890	contig_6291_pilon	+	2415	1	Intergenic	novelGene_164788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377831	380246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_377800_380200
699900	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
699911	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699913	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699914	contig_10011_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_68113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAATATGGTTTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329707	329452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_329500_329700
699916	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	134	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699918	contig_6710_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_95797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653584	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
699921	contig_1443_pilon	-	2111	8	Intergenic	novelGene_28387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	36.1465271993234	16	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	114	1274	1052337	1038257	TRUE	30	TAGTATGTGATCTTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQGHGVGQRMPEPLGL	1052450	1036791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038263_1038441_1038481_1039300_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
699923	contig_6710_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_97838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657161	653562	FALSE	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657161	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699931	contig_14637_pilon	-	2487	7	Intergenic	novelGene_114551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	494	junction_6	64.8759500037486	14	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	27	647	391450	363936	FALSE	20	GATGCGTTTGTGTAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSERSRVRMDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLAIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFLKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESENQTKGVKLSHREEGHDGGACGGYCSVV	391476	362095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_364112_369328_369396_369469_369589_371424_371498_377829_377892_389892_389949_391382
699932	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
699933	contig_11173_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_156893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTATGAAATCATTACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9509	10603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_9500_10600
699935	contig_4857_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_48759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAACATCATAGTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209586	1210658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1209600_1210700
699939	contig_10642_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_78733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTAGGGCCCCCCATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273007	1275425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1273233_1273422
699942	contig_2689_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_100843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	25	351	271555	271881	NA	30	CCACCAGGGCTACTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSLVVPQKIKHRTTIKKKKNYRMTQQFYSELYTKRPDNSDTETCTPMFTAALFPVIKRWKQPKCPSTDEWISKMETIHTMEYYSAIKRNEVLKHVTTWMDLENIMK	271530	272784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_271500_272800
699945	contig_5063_pilon	+	861	5	Intergenic	novelGene_109981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	55	582	9407	57319	FALSE	40	AAAGGATTGTCACTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
699947	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
699949	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
699950	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_90343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699952	contig_20719_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_140556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCACAAGTAGGTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2625	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_1500_2600
699956	SIRV1	-	165	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3939	0	3665	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6701	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
699961	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_94796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699964	contig_18145_pilon	+	1986	5	Intergenic	novelGene_37308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	23.6682804614108	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	464	1009	58238	59279	FALSE	20	GGAACTATCCTCTTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHVRYPWVGVGDRIDSERGSFIQS	57774	60256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130
699969	SIRV2	-	608	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4265	34	3090	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
699970	contig_4364_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	830.773711668827	56	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	79	603	1268714	1270358	FALSE	15	GGAGCCAGTGTCCCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYCCFCLCCGPGGPGHTSLSVPRFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1267027	1271073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269696_1270231
699972	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
699973	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
699977	contig_7396_pilon	+	1865	4	Intergenic	novelGene_79651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	59	355	252467	252763	TRUE	15	CGCACTGTACTTGTAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGTETLALYCIGHWRSWMLALGMGIQSEVVKYGTRLATSTFLGIANQGFHMGVQGRMGQRHGGQRRGKSIQYMGNGDIWPKKQGEGKGGKAINFNLIQTILILSINETSLSCSED	252408	257495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_253979_254604_254699_255103_255193_257383
699981	contig_1406_pilon	-	1422	7	Intergenic	novelGene_25554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	562.414857753796	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	61	1083	2159494	2137428	TRUE	50	AATAAAACCCAAGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159554	2136638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2136786_2137235_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391
699982	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
699983	contig_14575_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_101900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAACTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45207	47680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_45200_47700
699986	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4550	34	3375	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
699988	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_93677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653840	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
699993	contig_12427_pilon	-	1533	5	Intergenic	novelGene_40549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1196.91465339012	5	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	237	680	522337	505535	FALSE	45	AGAACAAAGATCATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVSWCPRFITGSHPV	578188	504681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505576_510393_510617_520312_520440_522284_522346_577960
699996	contig_5935_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_102748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	826	1191	1308937	1309302	NA	25	TTCTATACTAGGCTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGRQPCDHGVMLQLQAKECLGPPEAWRDKKGYSTLSLQRDHGPARNLNLDSTSRTETIHFVLVNHPVCGTLLWQPQDIITAGVVIPIWQRGKMRSERVTGHGEGSQPSESLGKSTDRGF	1308111	1310443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1308100_1310400
699997	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
699998	contig_753_pilon	+	3338	1	Intergenic	novelGene_113002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAGCTTTTTTTAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279527	1282865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1279500_1282900
699999	contig_5928_pilon	+	3569	6	Intergenic	novelGene_40358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_3	36.1076169249647	19	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1919	2797	172112	182805	FALSE	25	TGAATTCTATTTGATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFNSLPHHPPLSPAFCFQSETHSLGKFKTSLRENVLGSPKELMKLSVPSLVYAVQNNMAFLALSNLDAAVYQVTYQLKIPCTALCTVLMLNRTLSKLQWVSVFMLCGGVTLVQWKPAQATKVVVEQNPLLGFGAIAIAVLCSGFAGVYFEKVLKSSDTSLWVRNIQMYLSGIVVTLVGVYLSDGDEIKEKGFFYGYTYYVWFVIFLASVGGLYTSVVVKYTDNIMKGFSAAAAIVLSTIASVMLFGLQITFTFALGTLLVCVSIYLYGLPRQDTTSIQEGERASKERVIGV	170193	183577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_172331_172519_172673_177706_177774_179822_180000_180458_180594_182677
700005	contig_11989_pilon	+	2796	25	Intergenic	novelGene_68422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	71.820329449413	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	555	2423	15442	44804	FALSE	45	AAATAAAGATAGTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKLGPEKRIFEEIQKIEDNEFHYQEQTDPVEYVENMCENMQLYPLQDFLTGDQLLFEYNPEVIGEALNQLVPQKANLVLLSGANEGKCELKEKWFGTQYNMQDIENSWAELWNSNFELNPDLHLPAENKYIATDFTLKAFDCPETEYPVKIVNTPQGCLWYKKDNKFKIPKAYIRFHLISPLIQKSAANVVLFDIFVNILTHNLAEPAYEADVAQLEYKLVAGEHGLIIRVKGFNHKLPLLFQLIIDYLADFSSTPAVFTMITEQLKKTYFNILIKPETLAKDVRLLILEYARWSMIDKYRALMDGLSLESLLSFVKEFKSQFFVEGLVQGNVTSTESMDFLKYVVDKLNFIPLEQEMPVQFQVVELPSGHHLCKVRALNKGDANSEVTVYYQSGPRSLREYTLMELLVMHMEEPCFDFLRTKQTLGYHVYPTCRNTSGILGFSVTVGTQATKYNSEVVDKKIEEFLSSFEEKIENLTEEAFNTQVTALIKLKECEDTHLGEEVDRNWNEVVTQQYLFDRLAHEIEALKSFSKADLVSWFKAHRGPGSKMLSVHVVGYGKYELDDDNTPSCEDSNSSYGEVMQLTTFPTSPLLADSTIPITDIRAFTSRLNLLPYHKIVK	5505	45177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_5630_8016_8075_9885_9960_11362_11433_13597_13675_15209_15331_15411_15471_15733_15789_27065_27171_28716_28841_29391_29479_30708_30829_31634_31687_32621_32773_35469_35598_37169_37333_39014_39047_39296_39436_41345_41394_41686_41740_42180_42265_42838_42930_43215_43333_44348_44439_44603
700008	contig_15974_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_164808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGAGATGTATCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126972	125484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_125500_127000
700012	contig_16620_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_156002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTGCTAATCAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21515	23425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_21500_23400
700015	contig_6427_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_162588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	793	1194	1301151	1300750	NA	45	TATGTATCTGGAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWIWTCSLLDCERINFSLLKPSTRGISVTAALDDYDGGRHLGFVLSAKTQQHLWTPFSASTKSPARDVRTQRSFHGSVAGTWNPFHTTSALCLPLARRPLSAQMFRHCPGTMRPPGPGWTLRLRRNRCSGSL	1301943	1299338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1299300_1301900
700021	contig_9482_pilon	-	1769	4	Intergenic	novelGene_44220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	35.863940416834	466	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	400	1182	209792	203095	FALSE	30	GTAATAATGCCATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLNDPPNWNIRPNSRAEGGDGSRWNYALLVPMLGLAAFRWIWSRESQKEIEKEREVFHQRTAAFQRDLEAKYHAIISENRRAVAQLSLELEKEQNRTASYREALISQGRKLVEEKKLLEQERARVMQEKRQLQPLRSAYQSCLEREEDWQRRARLLLKEFEDALTERQNIYCSLVLPRSKRLEIEKSLLVRASVDPVAADLEMVTGLTDIFRHDTYCGDVWNTNKRQNGRLMWLYLKYWELIVELKKFKRVEKAILEK	211932	202507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_203757_209671_209803_210412_210628_211758
700022	contig_14666_pilon	+	1386	11	Intergenic	novelGene_39491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	964.577052391358	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	187	1044	315481	323175	FALSE	25	GATGTGACTCTTGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGPAQRGEGAARGQQEDREAAAEGQAGLPGHAPPAAAGEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	303822	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_303939_315323_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322434_322677_322746_323028
700023	contig_6740_pilon	+	983	4	Intergenic	novelGene_142646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	54.7783412186483	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	221	460	19602	46422	FALSE	45	GGGCTACACAACTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHKDEFTIIPVLVGALSESKEQEFGKLFSKYLADPSNLFVVSSDFCHWGQRFRYSYYDESQGEIYRSIEHLDKMGMSIIEQLDPVSFSNYLKKYHNTICGRHPIGVLLNAITELQKNGMNMSFSFLNYAQSSQCRSWQDSSVSYAAGALTVH	11300	46945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_11447_19527_19605_44182_44288_46290
700024	contig_16122_pilon	+	1974	20	Intergenic	novelGene_134525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	49.5479286137866	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	341	1867	142082	162835	FALSE	45	AAACTTTTATGATTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDVDLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGSFPNCYGIGRCAKMSHELWRKLEEEEDGETKGRRPEIGHVFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGLVDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDRSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGFLSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLPGDTLTAVESKVSKLVTDKAAGRITDAFSSLAKRSNFRAISKKLNLIPRVDGEYDLKVPRDMAYVFSGAYVPLSCRIIEQVLERRSWQGLDEVVRLLNCSEFAFTDMTKEDKASSESLRLILVVFLGGCTFSELSALRFLGREKGYRFIFSVKILEEKNDCETNY	141741	162942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154264_154339_154658_154746_154915_155007_157754_157818_158440_158515_159013_159116_159311_159388_159494_159612_159913_159930_162786
700025	contig_11572_pilon	+	1965	3	Intergenic	novelGene_100059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	2.5	18	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1326	1739	265181	266311	FALSE	55	CCTAGTGACAAAACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHICQYYIYDLQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKVKNKAVKDAEK	263855	266537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_265322_265592_265721_266166
700029	contig_8702_pilon	+	2935	10	Intergenic	novelGene_157733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	108.354356934397	262	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	152	2248	66903	84628	FALSE	30	AAAGTCCTTAGTTAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLEKVKLLHGGVAICSRGTPLELVNGDGVDSKIRCLDDPSTQIREEEDEMGTTVASGTAKGSRRRRQNNSAKQSWLLRLFESKLFDISMAISYLYNSKEPGVQAYIGNRLFCFRNEDVDFYLPQLLNMYIHMDEDVGDAIKPYIVHRCRQSINFSLQCALLLGAYSSDMHISTQRHSRGTKLRKLILSDELKPAHRKRELPSLSPAPDTGLSPSKRTHQRSKSDATASISLSSNLKRTASNPKVENEDEPIRLAPEREFIKSLMAIGKRLATLPTKEQKTQRLISELSLLNHKLPARVWLPTAGFDHHVVRVPHTQAVVLNSKDKAPYLIYVEVLECENFDTTSVPARIPENRIRSTRSVENLPECGITHEQRAGSFSTVPNYDNDDEAWSVDDIGELQVELPEVHTNSCDNISQFSVDSITSQESKEPVFIAAGDIRRRLSEQLAHTPTAFRRDPEDPSAVALKEPWQEKVRRIREGSPYGHLPNWRLLSVIVKCGDDLRQELLAFQVLKQLQSIWEQERVPLWIKPYKILVISADSGMIEPVVNAVSIHQVKKQSQLSLLDYFLQEHGSYTTEAFLSAQRNFVQSCAGYCLVCYLLQVKDRHNGNILLDAEGHIIHIDFGFILSSSPRNLGFETSAFKLTTEFVDVMGGLDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGSQLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQMLVEQMVDGSMRSITTKLYDGFQYLTNGIM	66751	85315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_67503_74326_74555_76058_76287_77868_77979_78542_78648_78876_79001_79759_80026_82473_82607_82864_82986_84446
700033	contig_1406_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_25544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	616.588750708282	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	83	604	2159494	2137423	FALSE	15	GAATTCTGGGGCTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESLVVLPVSSSIVLQHVEWSCLLTTSWRRRELFSRFKLRYRNQDSIGIWWYQKTIR	2159576	2136626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139972_2143553_2143628_2147740_2147920_2159391
700038	contig_6102_pilon	-	521	4	Intergenic	novelGene_32205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1195.35248172058	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCAGTGGGTGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896281	894891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895946_896141
700050	contig_13894_pilon	+	835	8	Intergenic	novelGene_62113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2827.89905428473	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	27	779	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522836_525762_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
700051	contig_7744_pilon	+	1208	7	Intergenic	novelGene_62487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	375.168258548378	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTTTGTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670964	675233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671369_671777_671897_673753_673826_674032_674105_674198_674321_674595_674694_674912
700055	contig_12270_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_114101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	14409	13911	FALSE	20	TTTCACCATCAGCAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDF	14435	13908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
700057	contig_13481_pilon	+	3027	2	Intergenic	novelGene_119413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	54	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAATTTACACAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655328	660481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_655620_657745
700059	contig_5690_pilon	+	1428	12	Intergenic	novelGene_119725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	506.646240707597	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	152	1150	1073823	1105490	TRUE	30	ATTGCTCCCATTAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAAASQAWPRASPHYGSSTAQHPGLHVRRQRADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073767_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450_1105688_1105861
700063	contig_8538_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_4745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
700064	contig_9848_pilon	-	1502	10	Intergenic	novelGene_79964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	563.671101894634	2	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	97	438	110549	105907	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEAQLRPNSLLLQEAGTDQMQPT	113916	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_105852_105909_106409_106473_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
700066	contig_11986_pilon	-	1534	8	Intergenic	novelGene_69216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1512.79163489631	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	75	1091	751619	734510	FALSE	25	TACCTCACTCTTGGTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	751693	734066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744281_751566
700068	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_95024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700072	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700078	contig_4151_pilon	-	2104	7	Intergenic	novelGene_65301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGACTATTATGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828598	791007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_792142_792938_793046_799585_799670_803049_803150_804390_804534_811593_811720_828188
700079	contig_19076_pilon	+	208	2	Intergenic	novelGene_74203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCAGCAGCAACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93024	93840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_93157_93764
700080	contig_8658_pilon	-	1381	7	Intergenic	novelGene_55804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1009.17865393376	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	569	1030	30055	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55653	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13260_30045_30246_32581_32750_34540_34626_55528
700082	scaffold_880_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_121524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTACATTCCGAGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579322	579560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_579300_579600
700084	contig_8631_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_121988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	896	1240	855444	855100	NA	70	GCAAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEPIVAATRLIHLLLRSSSTLLTLYFTEYDILLQGLVSPDNMSKLREMKFLILASEEHSGCTSSRTELFVLLAVHSIVSVLCQHHNSKASILQSSLFIIQFLNAYEAMENTMD	856339	854305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_854300_856300
700088	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_97160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700090	SIRV4	+	221	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1547	635	1092	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
700094	contig_14322_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_115833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671856	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
700096	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_97174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700099	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_94989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700101	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700102	contig_7182_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_117107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTTCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131542	133438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_131500_133400
700104	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700106	contig_15063_pilon	+	873	5	Intergenic	novelGene_9108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	331.303014625584	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	295	621	34860	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWCANSNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27126	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34880_36417_36600_38975_39092_39506
700113	contig_14333_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_49099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTATGTTAGCCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303086	302164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_302200_303100
700114	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13875	FALSE	25	AGTTTATTACTGTCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASVAGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14435	13872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14144_14360
700116	contig_3132_pilon	+	1799	2	Intergenic	novelGene_127413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_1	0	249	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	247	654	22969	23874	FALSE	20	CTTTGACCCCTTCCTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMPHESTVEHTHVDINEMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	22722	25019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_23131_23628
700119	contig_1535_pilon	+	2438	7	Intergenic	novelGene_127228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11.130538571376	48	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52575	107534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_52734_53569_53709_98843_99032_99653_99714_102092_102166_102496_102864_106081
700128	contig_4797_pilon	+	1196	5	Intergenic	novelGene_6907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_4	1790.90680592263	155	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	36	458	368372	371016	FALSE	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLFRCRTAAIMGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWK	368336	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368844_369855_370026_370914
700132	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700137	contig_12050_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_62707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCACAGTTCATTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639559	637139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_637100_639600
700140	contig_2219_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_67194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGCCAGAGCAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196274	194791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_194800_196300
700142	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
700146	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_97138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653856	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700153	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_95622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACACAGTGGTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
700155	contig_10734_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_51050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAAAAACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414188	412689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_412700_414200
700157	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700160	contig_11855_pilon	+	2009	6	Intergenic	novelGene_67103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	151.685991442849	22	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	799	1296	2445507	2446439	FALSE	35	GAAGGAGGAAGAGGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSD	2440090	2447152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2445497_2446004_2446438
700173	contig_9239_pilon	+	1391	6	Intergenic	novelGene_137164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	147.074130968026	891	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	351	755	107345	110044	FALSE	5	TCATGTCTTGTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYNIGVRLIEDFLARSNVGRCHDFRETADVIAKVAFKMYLGITPSITNWSPAGDEFSLILENNPLVDFVELPDNHSSLIYSNLLCGVLRGALEMVQMAVEAKFVQDTLKGDSVTEIRMRFIRRIEDNLPAGEE	100839	110680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_106533_106608_107248_107347_107581_107682_109271_109455_109924
700175	contig_6048_pilon	+	1353	12	Intergenic	novelGene_73256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	61.1601339392833	752	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	365	1108	1974298	1978064	FALSE	5	CTTGAGGTGTGTGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972047	1978309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974029_1974209_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
700178	contig_14322_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_116572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674881	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
700179	contig_12622_pilon	+	2569	14	Intergenic	novelGene_5806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	156.770212120428	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1665	2342	446467	449749	FALSE	45	TTTAAATTGATGTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDGKLLYQFPVS	349709	449976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405874_408752_408809_412056_412135_413373_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207
700184	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700193	contig_13571_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_128125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAGATGATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272161	273433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_272200_273400
700199	contig_7695_pilon	-	2784	20	Intergenic	novelGene_41603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34.3520151057875	1	120	16	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1352	2392	514638	504301	FALSE	15	CACCATCTTTGCCATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPSQAPASPLASISHDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525572	503908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506328_510463_510632_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514589_514780_516932_516988_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_522017_522090_524166_524445_524575_524637_525015_525168_525549
700204	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700207	SIRV2	-	831	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3846	-1	2667	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	669	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2065	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973
700211	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700214	contig_13021_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_8286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGAGGAAATGGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263334	261593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_261600_263300
700218	contig_4364_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_1052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
700219	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700220	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_95583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700222	contig_10235_pilon	+	2091	5	Intergenic	novelGene_46443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	246.948754805526	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	2	538	210482	212121	FALSE	30	CCTCAGTACATGAGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGPGSAAVAALRNSRGPEGGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWSSSLHPSALFPPHSSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPGAEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210480	213674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210851_211046_211193_211273_211789_211924_212047
700228	contig_14513_pilon	-	1199	2	Intergenic	novelGene_70359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	184	348	18880	12143	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19063	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
700230	contig_6881_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_164842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCCACGAAAACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91962	89351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_89400_92000
700236	contig_15991_pilon	-	789	6	Intergenic	novelGene_70908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3186.46251507844	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	355	723	101267	100445	FALSE	20	AAAGGTTGTGTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106353	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102180_105001_105142_106315
700239	contig_5871_pilon	-	1354	9	Intergenic	novelGene_160167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	97	junction_2	573.531821261907	59	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	418	1164	342910	259468	FALSE	25	ACATACTTTTTAGATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIATLDMSSDQIAANLQAIINDVCRHRPLSLGPFVVRAFLRSSTSEGLLLKIEPLLPKEVETKESNKETA	431885	259277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_259587_260970_261053_311832_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113_364226_431665
700242	contig_9935_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_164853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	688	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	21	344	6268	5726	FALSE	35	AGCAGGATTATAGCAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSSYLHWYQQKPGQAPKLLIYKATNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDAAVYYC	6288	5724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_6001_6219
700246	contig_3942_pilon	-	1747	9	Intergenic	novelGene_128735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	261.22783996925	472	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	87	1331	771119	753542	FALSE	25	ACAGTCCACTGGCTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVPEARRQRLGAGRGALDPRRGSRSWSMASCAEPSAMGPEPAAPLPARVPPLEDFEVLDGVEDAEEEEEEEEEEDDLSELPPLEDMGQTLTEEPEQPGALAREFLAAMEPEPAPAPAPDEWLDILGNGKLRKKTLVPGPPGSSRPAKGQVVTVRLQTSLENGTRVQEEPELVFTLGDCDVIQALDLSVPLMDVGETAMVTADSKYCYGPQGSRSPYIPPHAALCLEVTLKTAVDGPDLEMLSGQERVALANRKRECGNAHYQRANFVLAANSYDLAIKAITSSAKVDMTFEEEEQLLQLKVKCLNNLAASQLKLDHYRAALRSCSLVLEHQPDNIKALFRKGKVLAQQGEYSEAIPILRAALKLEPSNKTIHAELSKLVKKHAAQRNTETALYRKMLGNPSRLPAKCPGKGAWSIPWKWLFGATAVALGGVALSVVIAARN	772607	753125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_753629_754051_754184_754611_754690_756284_756458_757053_757275_757492_757582_757667_757838_770824_771121_772522
700247	contig_17470_pilon	+	875	6	Intergenic	novelGene_110498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	20.8480214888608	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	32	478	229562	233735	FALSE	30	GAACATGATTTGGGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLHKSRGFGFFGFPSRIADFQDVLKEPTIALEKLRELSFSGIPCEGGLRCLCWKILLNYLPLERASWTSILAKQRELYSQFLREMIIQPGIAKANMGVSREDVTFEDHFFEEGTVILQLKKDHSRAGVKKNCIPGAWRKPCSTCKY	229530	234132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_229585_230688_230793_232362_232404_232992_233055_233201_233302_233618
700249	contig_11396_pilon	+	2645	10	Intergenic	novelGene_71350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_3	68.3641303681079	606	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	197	1456	509105	511723	FALSE	0	CTTTCTGCTCCTCGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREALRKQFTVIQGPPGTGKTVVGLHIVFWFHKSNQALVPAGNRQSVPCILYCGPSNKSVDVLAGMLQSWREELKPLRVYSEQAEATEFPGPSLGSKSLPRKTPREGKPNRNLRNITLHHRIRQAPNPHAEALRAFDSRVQEGNIFSEEDVTVYKSTLKKARQFELSQHTVILCTCSCAASVSLRKLNIRQVLVDEAGMATEPETLIPLVHFSKAEKVVLLGDHKQLRPVVKSEHLQNLGLERSLFERYHADAYLLDTQYRMHKDICAFPSTEFYKRKLKTWQGLRRPPSILGHADRESCTVIFGHLQGCEQSLLVSTDEGNENSKANLEEAVEVVRIAKQLTLDRTVNPKDIAILTPYNAQVAEITKRLLQEGVTGVTVSSITKSQGSEWRYVLVSTVRTCPEGEIDQRPTKSWLKKFLGFVVDPNQVNVAITRAQEGLCLIGDHLLLRCCPLWRRFLDFCHSQQSLVPAHLVRVRRRPAVSR	508697	512912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_508748_508879_509024_509102_509251_509372_509490_509568_509762_509941_510077_510227_510447_511027_511185_511275_511444_511598
700250	contig_9197_pilon	+	1089	3	Intergenic	novelGene_154368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	173	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80226	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80358_80734_80892_92373
700253	contig_9706_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_20832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATCCCCCCACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2205	2716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
700254	contig_9468_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_59468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178261	176142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_176100_178300
700255	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700256	contig_5201_pilon	-	2002	3	Intergenic	novelGene_82164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAAAGCCCCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206056	202535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_203575_203833_203960_205219
700258	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_92065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700260	contig_1719_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_87254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATGCCATGTCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92105	89702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_89700_92100
700261	contig_7426_pilon	-	1526	10	Intergenic	novelGene_27464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	52.1109926556341	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	157	1272	649816	637491	FALSE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	650143	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047
700264	contig_20779_pilon	+	1869	4	Intergenic	novelGene_112360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	153.47602056637	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1827	41	1867	8301	94520	FALSE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENDRNVRQSQEGFWKRSPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLS	8260	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_94395
700265	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700267	contig_6589_pilon	-	1102	6	Intergenic	novelGene_25861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_5	991.637030369479	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	33	611	959104	955674	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQVSIRPQPLLPLHPRSVALSSPPAPNPQA	959136	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
700273	SIRV4	+	232	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1539	632	1084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
700274	contig_10235_pilon	-	1535	6	Intergenic	novelGene_46523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.962643408084	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	82	1116	331785	328104	FALSE	10	TGTAGAGGCTCTGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRKCLMGEVSWGSLLHRGHLPGQGQHLWDFLSCTPAIGVRGPGLSLKDHGSIEGSAGGYLKGSSTFL	331866	327684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328265_328498_328761_328943_329127_329952_330027_331063_331257_331623
700275	contig_19459_pilon	-	667	4	Intergenic	novelGene_59882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4458.03596516074	1058	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTATTCCTGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19134	6678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6950_15512_15702_16203_16265_18988
700277	SIRV2	-	373	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4500	34	3325	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
700281	contig_10354_pilon	+	2510	6	Intergenic	novelGene_50858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	489.542398572381	1	165	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	90	443	432370	454358	TRUE	25	TATAGTTAATGTTTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTLVFFSQLSMCESKEKPFFKLVHGLGKEETSKEAKIRAKEKRNRLSLLLQRHEFHEKTHSSTSGHLAKHTRVSPEEAVKWGESFDKLLSHKAGQGIRKTEEESTPLNCGVGEEY	432280	476497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_434101_434164_454287_454818_471873_472041_475056
700285	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27884	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700295	contig_16622_pilon	-	727	3	Intergenic	novelGene_48429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1704	junction_1	126.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGTCTCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111243	108205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891
700297	contig_14684_pilon	-	1816	4	Intergenic	novelGene_99649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.0292851327566	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTCTATTAAAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64620	58733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_59300_60705_61782_62953_63097_64589
700304	contig_7864_pilon	+	2598	17	Intergenic	novelGene_164855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	30.8220700148449	122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	65	2182	44457	65615	FALSE	20	TGCTCTCAGGGGAGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRGQYGFLHLVTVEETVLGLMEKPRGIEETPSSEPMEEEEEDDLELFGGYDSFRAYNSSVGSESSSYLEESSEAENEDREAGELPTSPLHLLSPGTPRSLDGSGSEPAVCEMCGIVGTREAFFSKTKRFCSVSCSRSYSSNSKKASILARLQGKPPTKKAKVLHKAAWSAKIGAFLHSQGTGQLADGTPTGQDALVLGFDWGKFLKDHSYKAAPVSCFKHVPLYDQWEDVMKGMKVEVLNSDAVLPSRVYWIASVIQTAGYRVLLRYEGFENDASHDFWCNLGTVDVHPIGWCAINSKILVPPRTIHAKFTDWKGYLMKRLVGSRTLPVDFHIKMAESMKYPFRQGMRLEVVDKSQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLYEDGDSDDDFWCHMWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSERRSDMAHHPTFRKIYCDAVPYLFKKVRAVYTEGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATICKVLLDGYLMICVDGGLSTDGLDWFCYHASSHAIFPANFCQKNDIELIPPKGYEAQTFNWEAYLEKTKSRAAPSRLFNMDCPNHGFKVGMKLEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQWVDCESPDIYPVGWCELTGYQLQPPVATEPTTPLKAKEATKKKKKQFGKKRKRIPPTKTRPLRQASKKPLLEDDLQAAGKISSEPVPDEIVAAQVKEEHLDTATPDKAASPKLPVPIEDIKQETDD	44392	66031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_+_44481_47086_47325_48635_48770_51220_51345_52168_52249_53759_53878_54318_54454_54753_54843_60835_61068_61473_61551_61738_61844_62557_62706_63093_63177_63532_63768_64258_64325_64987_65105_65502
700305	contig_13244_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_86954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTTCTTGAGCAGCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291612	288405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_288400_291600
700306	contig_6710_pilon	-	486	2	Intergenic	novelGene_98065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700308	contig_6007_pilon	+	1344	10	Intergenic	novelGene_87910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_2	33.8464214786967	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	122	1012	58451	80410	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	58329	80742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
700310	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
700314	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	75	GAAAAAGAATAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700321	contig_7695_pilon	-	1752	13	Intergenic	novelGene_41669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	155.069787156908	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	226	1617	906566	896494	FALSE	55	GGAAAGAAATGAATATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSESSGDREKDAARSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVKKEKEKEPEKLDKLENSMAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDVTAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQPENPGAEGKPPVDETGKPLYGDVFGTNAAEFQTKTEEEEIDRTPWGELEPSDEESSEEEEEEESDEDKPDETGFITPADSGLITPGGFSSVPAGMETPELIELRKKKIEEAMDGSETPQLFTVLPEKRTATVGGAMMGSTHIYDMSTVMSRKGPAPELQGVEVALAPEELELDPMAMTQKYEEHVREQQAQVEKEDFSDMVAEHAAKQKQKKRKAQPQDSRGGSKKYKEFKF	907376	896358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901674_901959_902036_903716_903809_903914_904005_904635_904786_905766_905995_906230_906312_906494_906633_907217
700325	contig_10354_pilon	+	1485	2	Intergenic	novelGene_50861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCATTCATATAGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434110	476488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_434164_475056
700330	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
700331	contig_16098_pilon	-	1213	13	Intergenic	novelGene_45770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	293.086828241886	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	446	943	35345	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTTVIPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36352	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35246_35325_35603_35720_35749_35907_36011_36295
700337	contig_12270_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_113132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	31	390	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
700338	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_89174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653702	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
700347	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700357	contig_2487_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_148479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTATTTCTCCTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186440	186835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_186400_186800
700367	contig_6136_pilon	+	1823	6	Intergenic	novelGene_154104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_3	158.688373865258	685	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	462	1484	460110	494274	FALSE	20	CAATATGGGTATCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDELLLPRLPELFETSKQLLDEVEVATEPTGSRIVQDKVFKGLDLLEKAAEMLSQLDLFSRNEDLEEISSTDLKYLLVPAFQGALAMKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	459648	494613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460680_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
700370	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700373	contig_7078_pilon	+	1374	6	Intergenic	novelGene_130199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	92.3644953431783	219	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAAATTTCTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951255	982393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_964001_964443_965325_965478_975279_975387_982119
700374	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700382	contig_5643_pilon	+	3088	20	Intergenic	novelGene_38963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_19	37.7753968796925	144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	42	2549	535274	548036	FALSE	10	CTTGTGTCCTGTTTGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSEEALLSVLPTIRVPKAGDRVHKDECAFSFDTPESEGGLYICMNTFLGFGKQYVERHYNKTGQRVYLHLRRTRRPKEEDTTTGTGDPPRKKPTRLAIGVEGGFDLTEEKFEYDEDVKIIILPDYLEIARDGLGGLPDIVRDRVTSAVEALLSADSASRKQEVQAWDGEVRQVSKHAFNLKQLDNPARIPPCGWKCSKCDMRENLWLNLTDGSILCGRRYFDGSGGNNHAVEHYRETGYPLAVKLGTITPDGADVYSYDEDDMVLDPSLAEHLSHFGIDMLQMQKTDKTMTELEIDMNQRIGEWELIQESGVPLKPLFGPGYTGIQNLGNSCYLNSVVQVLFSIPDFQRKYVDKLERIFQNAPTDPTQDFSTQVAKLGHGLLSGEYSKPALESGNGEQVIEQKEVQDGIAPRMFKALIGKGHPEFSTNRQQDAQEFFLHLINMVERNCRSSENPNEVFRFLVEEKIKCLATEKVKYTQRVDYIMQLPVPMDAALNKEELLEYEEKKRQAEEEKLPLPELVRAQVPFSSCLEAYGAPEQVDDFWSTALQAKSVAVKTTRFASFPDYLVIQIKKFTFGLDWVPKKLDVSIEMPEELDISQLRGTGLQPGEEELPDIAPPLVTPDEPKAPMLDESVIIQLVEMGFPMDACRKAVYYTGNSGAEAAMNWVMSHMDDPDFANPLILPGSSGPGSTSAAADPPPEDCVTTIVSMGFSQDQALKALRATNNSLERAVDWIFSHIDDLDAEAAMDISEGRSAADSISESVPVGPKVRDGPGKYQLFAFISHMGTSTMCGHYVCHIKKEGRWVIYNDQKVCASEKPPKDLGYIYFYQRVAS	535232	548575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_535385_538205_538332_538905_538973_539162_539297_539445_539592_539856_540042_540490_540586_541291_541486_542249_542322_542641_542730_542870_542997_543499_543654_543988_544164_544781_544871_545512_545636_546216_546361_546440_546587_546804_546959_547260_547346_547942
700385	contig_13026_pilon	-	1264	4	Intergenic	novelGene_146301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	64.0017360875642	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	829	1134	7416	6268	FALSE	40	CTTTACTCAATAAACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSSSSEGRTCVVWPPVPPTPSLWCEQGRQQQQQLLVVKGRTRQPGPFRENAALEEVVGRPTQGPATFPPHRCARPGIPKQTRKKNSTKQQAHLNLLVQR	13266	6137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667
700389	contig_5229_pilon	+	1886	5	Intergenic	novelGene_117720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	370	junction_3	61.5482534276969	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	93	731	658024	666404	FALSE	20	TCAGAGGTCAGGACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKDSHEDRDTTENVDESNHDPQFEPIVSLPEQEIKTLEEDEEELFKMRAKLYRFASENELPEWKERGTGDVKLLRHKEKGSIRLLMRRDKTLKICANHYITPLMELKPNAGSDRAWVWNTHADFADECPKPELLAIRFLNAENAQKFKTKFEECRKEIEEREKKGDVVLYMGGGGCLADSLCIRLQSQAGCFFCLPEKPSRLLRAPRPV	657931	667559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_658039_660570_660705_662746_662905_664881_665011_666201
700390	contig_14970_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_45024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171355	168889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_168900_171400
700392	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700398	contig_17171_pilon	-	1375	6	Intergenic	novelGene_147386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	70.6784266944306	544	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	71	706	350839	334259	FALSE	15	GATGCAGATGGCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTSSPDSTVSARPRCDRCPGRAKMQLRLWLLLTVQLAALPGSSAFHQTPESKMVQIHETVTLSCDMKTSTTTRVYWLRQRQDPSPKSHPEFLPLAIWDPVKKAVFGEGVEQEKLNVSYNRTWSTLSLTRVETSDSGTYFCMTIGNPQLIFGKGTRLSVVDALPTTAQPTKKTKLKKKVCRIPKLPSQKGSSCSSLTLGLLVAGVLVLLVSLSVAIHLYFLRRRARLRFMKQFCR	350909	333589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_334272_337314_337352_338784_338875_343889_343980_347342_347706_350796
700404	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700406	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700411	SIRV4	+	343	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1424	636	969	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
700416	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTGGCTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73582	73353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
700417	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
700418	contig_6546_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_140982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10149	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597582	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_599365_599577
700419	contig_5758_pilon	-	1490	5	Intergenic	novelGene_119097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	111.326939686672	1248	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCTCTTGTAGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231438	212895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_213895_214879_214976_219676_219803_220514_220696_231350
700421	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700422	contig_12344_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_164867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	118904	118572	NA	30	CTAGAATCCAGAGTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSRRAATSSTCRPPSRSRCCCPAPSSWPEAYSCFPAAAADSPGSGGAGRRQEPPSSRCPRTTALPRRQATCEVPAPLGTRQAIRRPEHSESRFSGQWVVRSLSSREATC	118906	116092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_-_116100_118900
700424	contig_5815_pilon	+	409	4	Intergenic	novelGene_141234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	11895.13684943	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	1041346	1046025	FALSE	10	GCCTTCGTGCGATTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1041344	1046055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
700431	contig_5918_pilon	-	2217	2	Intergenic	novelGene_99628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	563	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1574	1894	2238859	2233976	FALSE	15	TTGATTGAGTGCTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGMFSGHTECAGEVIERNGQKLKLFYGMSSDTAMKKHVGGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAARLKELSRRATFIRVTQQHNTLFS	2240432	2233652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2234157_2238719
700432	contig_10082_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_63851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTCCCTCCCCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137056	135532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_135500_137100
700440	contig_4678_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_126022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGATGTACATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320119	322244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_320100_322200
700448	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700451	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
700452	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	10	2958	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
700457	contig_9345_pilon	-	990	9	Intergenic	novelGene_24494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.479992103125	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	44	922	671829	667858	TRUE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLNSCVQSIRIRTALWCPSHR	671872	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667027_667798_667918_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
700458	contig_5988_pilon	-	2759	4	Intergenic	novelGene_15869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	79.6673640136843	28	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1415	2068	390799	387838	FALSE	30	TGTCTAGTTCTAACTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	392213	387146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390433_390653
700464	contig_8538_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_4692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
700472	contig_8671_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_126244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404690	402478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_402500_404700
700475	contig_12119_pilon	+	3380	1	Intergenic	novelGene_88667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322559	325939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_322600_325900
700485	contig_6533_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_114641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106838	106161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_106200_106800
700488	contig_11855_pilon	-	1963	16	Intergenic	novelGene_67000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_15	22.5372777612756	414	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	9	1856	1361095	1316223	FALSE	0	TTTGGTCTTTTGCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVCVGMLRLGRLCAGSPGALGARAVLTRGWREAILQGVRFRSSGDPDGSGALPIGGLSYVQGHTRVSLISKTVGRCLDATAQRLPDREALVVIQENVRLTFAQLKEEVDKAASGLLSIGLRKGDRLGMWGPNSYAWVLIQLATAHAGIILVSVNPAYQATELEYALKKVGCKAIVFPKQFKTQNYYNILKQICPELERAQPGALKSQRLPDLTTVISVDEPLPGTLLLKEVVEAGSSEQHMAQLRYTQQFLSCHDPINIQFTSGTTGSPKGATLSHYNIVNNSNMIGERLKMHLKKPEDLRLVLPNPLYHCLGSVGGTMVSVMHGTTLILSSPSFNSKMVLEAISKERGSFLYGTPTMYVDILNQPDLSSYDISAMSGGVIAGSPAPPELIRVIINKLNMKELVIAYGTTENSPVTFMNFPEDTVEKKAESVGRVMPHTEAQIVSTENSGLMELNKPGELWIRGYCVMLGYWGEPQKTEEVVGQDKWYRTGDIAVMDKEGFCKIVGRSKDMIIRGGENIYPAELEDFFHKHPQVQEVQVVGVKDERMGEEICACIRLKSGENATAEEIKAYCKGKISHFKIPRYIVFVNKYPLTISGKIQKFKLREEMEQHLKL	1361103	1316115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1316274_1316566_1316636_1316837_1316949_1317037_1317180_1318165_1318318_1319576_1319685_1326334_1326412_1326748_1326841_1327129_1327288_1327471_1327568_1328168_1328335_1328439_1328559_1329119_1329174_1329417_1329547_1329950_1330147_1360967
700493	contig_5019_pilon	+	1999	3	Intergenic	novelGene_109181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.5	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	171583	171753	TRUE	25	TTAAAATTGTGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTAEEERVATRGKSSEVEGNQPLETGKENSSSVTVADSETGNKAGQTLENSSFMAELLSDVPFTLAPHVLAVQGPISDLPDHLLSYDVSENLSRFWYDFSLENSVLCDS	105659	173469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495_172657_172708
700496	contig_5039_pilon	+	1312	13	Intergenic	novelGene_64946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_12	69.3855472462866	347	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	73	1122	1617844	1641782	FALSE	25	TTAACGTCTGAAGGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRAKGSKVAVAKLQAFGAARRQVTMKGLYFQQNSTNEEITFVFQERENLPVTEDNFVKLQVKACALSQINTKLLAEMKMEKDFFPVGREIAGIVLDVGSKVSFFQPDDEVVGILPLDSEDPGLCEVVRVHEHYLVPKPEKVTWTEAAGTVGDGVRAYTALHYLSHLSPGKSVLIMDGASAFGIIAIQLAHHRGAKVISTACSLEDKQCLERLRPAIARVIDVSNGKAHVAESCLEETGGLGVDIVLDAGVRLYSKDDGPTVKLPLLPHKHDIITLLGVGGHWVTREENLQLDPPDSHCLFLKGATVSFLNDEVWNLSNVQQGKYLCILKDVMEKLSTGVFRPQLDEPIPLYEAKVSMAIVQKNEGRKKQVVQF	1607248	1641972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1607315_1617837_1617910_1619956_1620035_1622007_1622081_1625157_1625203_1626528_1626598_1633305_1633440_1634411_1634524_1636690_1636790_1637898_1638021_1638816_1638923_1641120_1641167_1641682
700497	contig_11986_pilon	+	2129	12	Intergenic	novelGene_69195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	129	653	734107	736946	TRUE	35	TGAAGGTAGTATTCAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGRKENADISNRVGGKPKDLLVPGEGTAASQSGRYGKDRQCELENHSGGPSPFTESMRGFTQQETLSASVPGCAFSSERLITLFGDKTAPLFNQLKKNQISRLGLGEVAAIQSSTNISGQMWTVRRSVFFAAVSKIAIWKPWSWSGTGWRRWWQRSAVRTRCGWTPGWSWSP	733978	755782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_734526_736172_736274_736941_737121_738284_738538_740666_740802_743116_743255_744138_744308_745285_745359_747986_748076_751503_751695_753184_753227_755570
700498	contig_366_pilon	+	1850	6	Intergenic	novelGene_51558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	191.90143303269	245	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	60	1544	636436	649345	FALSE	0	CTTCTGCCTTGGCTTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARAAPLLAALAALLAAAAAGGDAPPGKIAVVGAGIGGSAVAHFLQQHFGPRVQIDVYEKGTVGGRLATISVNKQHYESGAASFHSLSLHMQDFVKLLGLRHRREVVGRSAIFGGEHFVLEETDWYLLNLFRLWWHYGISFLRLQMWVEEVMEKFMRIYKYQAHGYAFSGVEELLYSLGESAFVNMTQRSVAESLLQVGVTQRFIDDVISAVLRASYGQSAAMPAFAGAMSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	636376	649651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_636524_641061_641269_643249_643425_645173_645386_647843_647985_648683
700499	contig_7513_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_88934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCACTCCTGAGGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42836	44582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_42800_44600
700500	contig_414_pilon	-	1661	4	Intergenic	novelGene_115111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.68178700572909	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	845	1621	373842	373066	FALSE	50	CAGAATGAAAAAGAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384209	373025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376676_376898_379930_380011_383938
700503	contig_5954_pilon	-	1737	9	Intergenic	novelGene_28737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	224.582077145528	335	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	25	1386	1258441	1249935	FALSE	50	AAAAAAAAATCCCAGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1258465	1249583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1254060_1254319_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369
700510	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_90557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700512	contig_2596_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_53506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTGCTTATTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023261	1021508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1021500_1023300
700514	contig_990_pilon	+	2039	8	Intergenic	novelGene_76048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	51.1368711580669	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	223	714	882997	890739	TRUE	15	TGGACCTCACACTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870477	895985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_880895_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893303_893438_894961
700519	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_93782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700526	contig_3111_pilon	-	3131	23	Intergenic	novelGene_129961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.934487889802	1	104	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	939	2820	92	2911	100196	16088	FALSE	15	CCCACCCCCAACTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTFQQIRCYTAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYYAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGSAYQSPLPLSRGSLSTIARAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGKESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIREKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCNVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLD	100287	15867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16095_16630_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22889_23185_23256_24064_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964_40056_40855_41003_41524_41680_48564_48681_63172_63276_65402_65595_100154
700527	contig_12468_pilon	+	757	7	Intergenic	novelGene_164875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	454	756	46721	71008	FALSE	45	CTAGAAAGTAAGAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKEILAIQHWQKVGPGSVLATFCIVEENAYTLVIFLQHIINHSKNVLNCLFFGDMSHQIYKRFSTLAAFSLKYILLLFRCSLHFKSLNKFTIFSRNHLP	10789	71009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_+_10986_26892_26988_40622_40677_43865_43970_46716_46831_54402_54494_70906
700528	contig_6523_pilon	+	2840	2	Intergenic	novelGene_164886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1460	1789	266393	266722	TRUE	45	GGAAGGCAGGAAACACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYVVNALVLTSVVQTPRDSRTDSRRICVVWDCWGSIKERLRHWRMCRLTRCGERKGVRNWVEDSKISDSPLKTGHSAFDLYRQAHRVRLQQSAGASDGHRGRVLLPEL	264933	268728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6523_pilon_+_267222_268176
700531	contig_7171_pilon	+	1248	9	Intergenic	novelGene_101357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	110.437765279817	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	187	753	1322494	1325907	TRUE	15	CAAGGCCTTATCTTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKVTLGLGGRPHCPPLLAGPEPTAPFSSSAPSPSSQPSMGAALVQAWTSSPPVTSATVPRTRSSR	1321948	1328740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322088_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
700533	contig_14450_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_49066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTTTTGTTTTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483104	1483500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1483100_1483500
700535	contig_8259_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_148893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324407	326655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_324400_326700
700538	contig_11855_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_66941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	343	1029	1176	2204	1003891	1004919	NA	70	CTAAAAAAAGAAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQPSQPPLPPPPPPPQQQQQQKTSALSPNAKEFIFPNMQGQGSSTNGMFPGDGSLNLSPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSNQQFQPVMA	1002715	1004921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1002700_1004900
700544	contig_13283_pilon	-	2655	1	Intergenic	novelGene_154014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43397	40742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_40700_43400
700553	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700556	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700562	contig_15185_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_99444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431157	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_429500_431200
700564	contig_14526_pilon	+	2199	3	Intergenic	novelGene_111209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTGAGTACCGAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322154	338449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_323752_336822_336913_337937
700569	contig_12709_pilon	-	1215	9	Intergenic	novelGene_147397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_8	531.244397029277	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	58	1122	59003	29115	FALSE	15	AACTGTGTGTCTGGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLVALTLLGVGLALIGERLWALRRRMNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59060	29021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
700570	contig_8597_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_158716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATGCTACTATTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102565	101341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_101300_102600
700571	contig_8597_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_158715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAAGAAAATGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100579	100002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_1e+05_100600
700577	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	459	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700580	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700582	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700585	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_16651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27860	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700587	contig_18251_pilon	-	2053	4	Intergenic	novelGene_50163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTATAAACCTAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55313	46997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_48335_48575_48792_53917_54029_54924
700600	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
700604	contig_152_pilon	+	1482	6	Intergenic	novelGene_162646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	126.693961971358	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722954	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723823_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
700606	SIRV7	-	347	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-14	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114752	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70893_70988_78841_78964_114686
700611	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700612	contig_10299_pilon	+	2766	23	Intergenic	novelGene_79717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	90.1050809878927	1	118	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	13	1245	320559	336895	TRUE	30	TAAAGTTGGAATGCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320546	340520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338433_338754_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
700613	contig_7979_pilon	+	2658	2	Intergenic	novelGene_125529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426355	466465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_428417_465868
700622	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700623	contig_5770_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_74190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10893	junction_2	1942.09955653669	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	594	965	263708	261935	FALSE	50	AAGTAAAAGAAGAATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRRPSFSSQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265091	261907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_264062_264766_264808_264892
700626	contig_8330_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_71720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTCATCATGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138556	139692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_138600_139700
700630	contig_12050_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_62781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1284	1586	946188	946490	NA	45	AAAAACAACCCATTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAEITSHTRYKPPEIDLCSMLQSDREETLRGLSKQQLPPQGKPSISRLKRMVFRKNSSWHHLLLLLGAVESLPTHSYPTYNRTKHCPVLYHPHNRYYA	944904	947071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_944900_947100
700631	contig_14441_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_100513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	463.155121602543	45	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	417	845	116728	117610	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	110775	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111043_116578_116963_117220_117344_117539
700640	contig_2867_pilon	-	2819	1	Intergenic	novelGene_135159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	277	756	501153	500674	NA	30	GGGCTTAGAAAGTTTACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLMRRSHLLVTMQNMPSTVHGEAAWDTGLEAWLPSALRVFRSSPMTCELVNRPGISQSRAHHHARIITRIKHRQTSQPAISLFRGKKEAKQKPLPGGFRPQRSRLLKVGFFFRLFFFKKSSNTVPKIVHGFSSCYKTQTLKSSQFADLAGRRVSPVLP	501429	498610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_498600_501400
700641	contig_7513_pilon	-	1845	7	Intergenic	novelGene_88975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	68.9768479676736	310	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	94	774	283162	269761	FALSE	25	GAAGTCCTTGCGTAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAFQVEKPDVRLSRGSVDRDDGGLQGPTGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPCHLGSLASLSSPGDSYNEGVKLQPQEISPRPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPVLPASTHREIEMAQKLLNSDLGGLINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLAQTRPH	283255	268689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279737_280088_280129_282426_282490_283141
700642	contig_3132_pilon	+	1866	15	Intergenic	novelGene_127407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	56.4195743279488	4	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	404	1477	13928	23874	FALSE	15	TATGTAGTCTTCTGTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVYKSPEYESLGFELTVERLVSIGYPQELLGFAYDSTFPTRGLVFDTLYGNLLKVDAYGNLLVCAHGFNFIRGPETREQYPNKFIQRDDTERFYILNTLFNLPETYLLACLVDFFTNCPRYASCDTGFKDGDLFMSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	7465	24263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_7589_8405_8502_12587_12680_12806_12865_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953_23131_23676
700643	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700646	contig_5918_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_99481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164872	162712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_162700_164900
700647	contig_15039_pilon	-	1698	7	Intergenic	novelGene_110135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_6	448.77747517252	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	305	928	200602	185257	FALSE	25	AGAATGCTCCTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	222256	184486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_222093
700652	contig_7527_pilon	-	1991	3	Intergenic	novelGene_139572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAGTAAGAAAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96217	89787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_90036_94413_94907_94967
700654	contig_9852_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_138477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTCTTTTTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351674	353482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_351700_353500
700655	contig_9807_pilon	+	1386	6	Intergenic	novelGene_32896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	673.331537951402	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	6	542	109130	158783	FALSE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109124	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126713_156657_156770_158676
700657	contig_5574_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_155849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	601	948	134863	135210	NA	30	TGGTTAATCCACCCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQILSRELVRNANYQQGIELEPTSSKHWLKYLVSTETDVVKKEKENHKTLPTGKVHPHALSLNKRAREEAGASTGRTKWASEGGRNGMGPRSLSYVRLQIPTSRSNLQDTKGNYN	134262	136420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_134300_136400
700658	contig_5574_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_155850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136868	137484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_136900_137500
700659	contig_10674_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_6466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTAAGTGAGAATAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389062	391165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_389100_391200
700660	contig_12746_pilon	+	2248	7	Intergenic	novelGene_152204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	17.7709188157381	171	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	183	1721	770909	785951	FALSE	20	TCTCATTTGTGTCTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSNPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPRRLWQWISIQVLGQEISEKMESPSCQVREAESHHEVVPQELGLQSSASEPADQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEHWRHLDSTEKEHYWDLMLETYGKMVSGGDRQESDKENLNLENYRDQEPPDAPCDISGEAPPQASVSGFFSEDEPSQFGEGEHLPEAQGNLQGEGRGEQLSPQERSSGKQPGQHLPNPHPGDLSLLWLEEKPEALQKGQLRPPMTQKLPTCKECGKTFYRNSQLVFHQRTHTGEKYFQCHTCKKAFLRSSDFVKHQRIHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLRHHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSRCGKSFSWSSSLDKHQRSHLGKKPFQ	751805	786478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_751825_753035_753091_770800_771296_771969_772157_772559_772652_779295_779381_785163
700661	contig_12113_pilon	-	968	6	Intergenic	novelGene_134739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	184.531840071029	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	32	529	231875	211148	FALSE	30	AATAGAGATGAGCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFQATISAPHMHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	231906	210708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872
700667	contig_1938_pilon	+	3615	4	Intergenic	novelGene_114885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	87.342238731708	167	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACAATATTGATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203259	305018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_+_203394_213151_213321_261539_261622_301788
700669	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700672	contig_500_pilon	+	1509	10	Intergenic	novelGene_30951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	606.298199051291	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	147	863	1452302	1466286	TRUE	0	TGTTTTTGGTTTTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQ	1446824	1480975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466287_1468833_1468874_1469149_1469324_1477837_1477929_1480634
700673	contig_3018_pilon	-	2001	16	Intergenic	novelGene_78837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	649.763669857485	1	81	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	709	1545	583440	566833	TRUE	30	AAGCTTTTGCCAGACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPSHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRREA	625069	550974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551002_561489_561574_562778_563044_566752_566844_567985_568081_569956_570088_570209_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583617_585063_585174_600004_600194_624772_624902_624965
700676	contig_8885_pilon	-	1293	6	Intergenic	novelGene_115562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.586157515486	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1	390	75477	49174	TRUE	30	TTAGAAAACTCATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75477	45840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_46256_46838_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
700690	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700691	contig_5935_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_102759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGAAAGTTTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1379291	1379952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1379300_1380000
700694	contig_15070_pilon	+	2872	1	Intergenic	novelGene_164898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGAAGAGAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489987	492859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_490000_492900
700699	contig_2438_pilon	+	2102	9	Intergenic	novelGene_112078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	67.9282709922754	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	577	1443	348967	359325	FALSE	15	TTTTTCGTGGATTCCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEAKDQAFKMEKEAIMDAVTTRKKIMKQKEMVCKNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQILEKRLIQKELETEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELDRKRREERIRGRRHIVEQMQKNKEERSLLAEQREQEKEQMLEYIEQLQEEDLKDMERRHQEKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMVATWFLMPWDF	320565	359984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_320737_322408_322604_346411_346538_348882_349026_351267_351413_351706_351878_353064_353244_355300_355431_359142
700704	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_97303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700706	contig_10734_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_51084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGCAAGAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528592	527119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_527100_528600
700707	contig_10479_pilon	+	2892	1	Intergenic	novelGene_147096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGACAAAACTCAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26525	29417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_26500_29400
700710	contig_10196_pilon	-	1856	8	Intergenic	novelGene_132303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374627	2348156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495_2352597_2364367_2364477_2365371_2365516_2368747_2368926_2372226_2372340_2373407_2373585_2374266
700714	contig_14925_pilon	-	973	5	Intergenic	novelGene_55217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1562.64461330784	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	207	464	29675	27020	TRUE	35	CTTCATTAAAAGTAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSYQLTFGKGTQLIIQPYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	82682	25818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_82628
700715	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700719	contig_10372_pilon	-	2225	2	Intergenic	novelGene_112517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGCTCTAACAACACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52572	49640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_49743_50449
700723	contig_12046_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_83504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGCAGCTGCTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959563	957577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_957600_959600
700726	contig_2100_pilon	+	2800	1	Intergenic	novelGene_50614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793856	796656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_793900_796700
700730	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_96662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700731	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700736	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700737	contig_12503_pilon	-	1340	2	Intergenic	novelGene_143835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAGAACTGCCCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173684	168774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_169134_172703
700738	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	33	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700743	contig_18869_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_56381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
700753	contig_7391_pilon	-	1572	6	Intergenic	novelGene_112168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	129.606172692507	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	175	468	457964	444174	TRUE	35	GATTTCCAAGTAAACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVVTAWVRGSGTGEALGCFGLWVGQRAWRAGVPGPGQGSDPWLVSLRTRSAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKVLKKVSKYI	458138	439100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_443033_443094_444144_444178_444220_444247_451552_451706_457853
700754	contig_1406_pilon	-	1592	6	Intergenic	novelGene_25540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	615.223991729841	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	329	784	2147757	2137428	FALSE	10	GGGGCTTCAGTCTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMMYSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159557	2136619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143326_2147740_2147920_2159391
700755	contig_6980_pilon	-	2069	3	Intergenic	novelGene_36077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	31	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGCAGTTTTCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377830	374597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544
700763	SIRV5	+	257	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAAGGTCGCCGTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270
700770	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
700773	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700777	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700780	contig_12079_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_67497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAACAAAGTGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839664	840055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_839700_840100
700782	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700789	contig_14322_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_115820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTCTTGAAGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671871	671352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
700790	contig_9199_pilon	-	1910	14	Intergenic	novelGene_65652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	98.6476606247992	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	165	1103	182028	173797	TRUE	30	AGATCCACGGGAACTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSEIEPNVFLRPFLEVIRSEDTTGPITGLALTSVNKFLSYALIDPIHEGTAEGMENMADAVTHARFVGTDPASDEVVLMKILQVLRTLLLTPVGAHLTNESVCEIMQSCFRICFEMRLSELLRKSAEHTLVDMVQLLFTRLPQFKEEPKNYVGTNMKKLKMRAGGMSDSSKWKKQKRSPRPPHHVTKVTPGSELPTPNGTTLSSNLTGGMPFIDMPTPISSASSEAASAVVSPSTDSGLEFSSQTTSKEDLTDLEQAGFPGYSTAADPVSNELGVPEQPDPQQEVVQVEKAQSASVESIPEVLEECTSPADHSDSASVHDMDYVNPRGVRFTQSSQKEGGYNFGPLWPSLYPRALPFPHLPHQPT	186138	170877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_170927_171241_171383_171979_172170_172404_172600_173227_173327_173663_173876_174313_174487_175002_175227_175570_175719_179452_179508_180733_180795_181306_181416_181938_182058_186003
700792	contig_4125_pilon	-	1366	8	Intergenic	novelGene_25258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	306.192149888042	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	44	1348	3031212	3018244	FALSE	40	CTGAAATTAGGGTAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDYISPLDDLAFDMYQDPEVAQIIRKLDERKHDAVQKERYDYAKKLKQAIADLQKVGERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAKVYQQLELHNLMDAELMRRPFDLPLQPLVHPGSPRHQKPKPSLPQQEERLTEKRAMEPLLQEQPSSRSRSVPPQHAAVGQVLPSPDPRPKIDVEMLPYDERPLPAIRKQQGETHMEYELSDPDVSEAQKGGISGEPEPLTEKALREASSAIDVLGETLVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRSTFLQMTTTRAKTFSTKQFLRDLLK	3031255	3018225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3018322_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3026849_3027048_3028987_3029216_3030519_3030676_3031086
700793	contig_4125_pilon	-	1124	8	Intergenic	novelGene_25250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	40.7325773447109	7	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGTCATTTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3017869	3006070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3006175_3007670_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760
700795	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700802	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_97254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700812	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_90841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
700813	contig_5153_pilon	+	1500	8	Intergenic	novelGene_74407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	295.323758693708	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	368	949	1015039	1022324	FALSE	25	CCAGGTCTGGAATATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISRGPSREPWPLSYTHPS	1014671	1022875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022273
700829	contig_15304_pilon	-	733	3	Intergenic	novelGene_30468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	194	355	54100	53260	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKLPPTPRLGPNLPPFPKTQGTASHPRSTCCHHRRRSWR	54293	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53546_54052
700836	contig_6710_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_90795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
700839	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
700841	contig_5482_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_144515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1714	2052	755227	754889	NA	55	AAAAAAAAAGCCAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDNKESSSPRDRKGHINQRLHQPETRRTRSCPATTNDCPDREHNRESQMEQNGGVQNSNSSKRTRLNGLTETGGTSESMAPGLYEPRAKTISKANSSDRDWTGLWDIK	756940	754430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_754400_756900
700843	contig_6914_pilon	+	1773	8	Intergenic	novelGene_151741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	45.3710327438653	425	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	230	868	132485	134195	FALSE	20	TGGTTTTCAGTATACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEELLALQSQVGTKKYKQLIAGTSIRKQDSRPSVKNACVADKHKPLEMSAKARVPFLRQVVPVSKKVTRDPRFDDLSGEYNPEVFDKTYQFLNDIRAKEKEIVKKQLKKHRSGEEREKLQLLLQRIEQQEMAQQDRKQQQELRLALKRERRAQAQQGHRPYFLKKSEQHQLALAEKFKELKRSKKLESFLSRKRRRNAGKDRRHLPLSRE	130914	135100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_131033_131266_131367_132473_132622_132756_132824_132904_133010_133356_133432_133529_133648_134058
700844	contig_7066_pilon	+	2182	8	Intergenic	novelGene_42178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	6.86309265683675	132	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	305	1336	946606	954480	FALSE	5	TTCTTTTGTGATTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQQETPPVASPVLSRHQLQPRGSSKRSGPPRDQPFPGLLRLEDLSREELVDVLRAAVVDQKGPLVTVNKPQGLPVTGKPGDLTLLSVLPELSQSLGLGERELQVVRAPGKDCSGLVLLSSCPQTVSRIQKFFTHSRRVQRPTATYCAITDGIPATSEGKIQAALKLEHIDGVDLVVPVKPPSRKDILEGVKRTVSHFRVMATGSGCALVQLQPLTVFPSQLQVHMILQLCPVLGDHTYSARVSTVLGQRFLLPAERTKPQKQVLDEALIRCLRLTPSQAAQLPLHLHLHCLLLPGPRPQDTPIELLAPLPPLFLQDPTVPGAPPTIVIPLSLMPTGREAGDL	946301	955326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_946793_947711_947757_947892_947993_949560_949669_949754_949840_950062_950187_953289_953430_954237
700845	contig_10958_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_5484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGCTTGATTGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900459	901583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_900500_901600
700847	contig_18869_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_56000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTGTTCAGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
700851	contig_10494_pilon	+	2288	2	Intergenic	novelGene_102210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	124	junction_1	0	32	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTTGGAGTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084591	1087194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1086687_1087001
700852	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	298	-74	-298	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATGCTAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
700857	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657172	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
700866	contig_18506_pilon	+	1475	9	Intergenic	novelGene_67949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	250.336648335796	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	413	832	28506	48576	TRUE	15	TCAGCTAATCCTTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRGVGLRAAGDRAAAFALLRGVFIVAAKRTPFGAFGGLLKDFTATDLTEFAAKAALSAGNVSPETIDSVIVGNVLQTASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQEICVKDAEVVLCGGTESMSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASVLSLLSMGH	11334	55655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_25013_25181_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_48546_48618_53815_53971_55208
700877	contig_14925_pilon	-	684	3	Intergenic	novelGene_55190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAAAGGCTGTGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
700878	contig_10263_pilon	-	2528	2	Intergenic	novelGene_135856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	0	328	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	427	936	924831	923052	FALSE	70	ACATAAAAATAAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKRKQEESSLKQQVEQQSSASQVGIKQLPSTSSAGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQLQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQAHSTGTIPGHTASVVQAQSQPHGVYPPSSVVSKCIKE	925257	921459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_923264_924533
700879	contig_1443_pilon	-	1268	11	Intergenic	novelGene_28315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	547.560371100758	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	250	984	776417	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTRQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809532	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776260_776399_776462_805197_805224_808694_808741_809399
700880	contig_2069_pilon	-	1219	3	Intergenic	novelGene_23503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	470	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	64	462	1509802	1509252	TRUE	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREVSASQAPSRAPSSGILGSPAAQRELPAPILCHADSHSPHPHYQAAPTTSLSCLLHRRVRVGWGWTLTTPPSRAALPPLRSAPGSPHPEPYLASPILTLSHSWWFLASPYTTSLTPK	1509865	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509587_1509738
700882	contig_12270_pilon	-	258	2	Intergenic	novelGene_114126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTCTGGGACAGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14410	13929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
700884	contig_2100_pilon	-	1196	8	Intergenic	novelGene_50760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	849.207505710531	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	146	895	1182812	1170268	FALSE	10	ATGTCTTCAGTGGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGTGSVIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185556	1169966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1175549_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
700888	contig_14516_pilon	+	2187	14	Intergenic	novelGene_153910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	101.555243368431	35	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	535	1632	378795	422609	FALSE	65	TGAAAAAAAAAATATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	211372	423164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_211427_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472
700892	contig_7322_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_164916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235804	236771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_235800_236800
700895	contig_9982_pilon	-	1797	15	Intergenic	novelGene_55755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	241.501901374186	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	37	1398	353538	343153	TRUE	25	CCTCAACTGTCCGATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRQQKLSWPNRSHHMERHVLDLNSTLLRSLLRHLKLFRGHWQKILVLRPVK	353574	339709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343381_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
700897	contig_5023_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_7164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTGCAGTGAGGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402342	403044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_402300_403000
700899	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700905	contig_6189_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_164945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGGCCCATATTCAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96151	94383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_94400_96200
700909	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700915	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700916	contig_14322_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_116541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAAAATGGCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674683	674887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_674700_674900
700917	contig_5643_pilon	+	1184	7	Intergenic	novelGene_38736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_2	264.803700880482	1263	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	187	984	152580	157107	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152393	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
700923	contig_7202_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_17511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27900	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
700934	contig_8823_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_53068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70292	66721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_68111_68941
700942	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_17610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
700947	contig_12638_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_33181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	573	2101	2673	244439	245011	NA	25	CAATCCCAGCGATACCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVIRLQGLPIVAGTMDIRHFFSGLTIPDGGVHIVGGELGEAFIVFATDEDARLGMMRTGGTIKGSKVTLLLSSKTEMQNMIELSRRRFETANLDMPPANASRSGPPPSSGMSGRVNLPTTVPNFNNPSPTVVTAATSVHESSKNIQTFSTASIGTAPPNMGGSFGSPTFSSTIPSTASPMNTVPPPPIP	242338	245012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_242300_245000
700948	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
700954	contig_6191_pilon	-	1572	2	Intergenic	novelGene_107819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTCTCTACCTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45060	36861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_36976_43602
700961	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
700962	contig_10861_pilon	-	1330	11	Intergenic	novelGene_39325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	260.553641310192	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	112	807	1492200	1490156	TRUE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493810	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489648_1489949_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
700969	contig_12074_pilon	-	2138	15	Intergenic	novelGene_53767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	321.798176387826	1	104	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	100	1869	43217	30263	FALSE	65	AATAAAAATTTTAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRRLRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKSCHETRRQEGKHSSH	45853	29993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30311_30921_31066_32217_32345_32647_32722_33106_33193_33340_33494_33627_33791_34829_34950_35882_35991_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41218_43067_43229_45765
700974	SIRV2	-	585	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4288	34	3113	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1619	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
700975	contig_13245_pilon	-	437	5	Intergenic	novelGene_148818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4577.58465241223	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	118	435	26752	25419	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSIMV	26869	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25424_25500_25637_25998_26073_26356_26457_26749
700976	contig_7657_pilon	-	2157	14	Intergenic	novelGene_30013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	5.15212370758165	4	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	386	1465	132524	124409	FALSE	40	AATCCCTGTAATACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYCLFQALATFFQVPYTALTMLLTSNPRERDSATAYRITMEMAGTLMGATVHGLIVSGAHEPHRCEDARLPLPDGVSPDAIHLYSIAAAVVAVTYPVCTGLLCLGVKERPDRSAPASGQGLSFLAGLGLTVRHPPYLKLVVSFLFISAAVQVEQSYLVLFCTHASRLHDHVPRLVLTILVSAVLSTPLWEWVLHRFGKKTSAFGICVMVPFAILLAAVPIAPVAYIVAFVSGVSIAVSLLLPWSMLPDVVDDFQLQHQHGPGLETIFYSSYVFFTKLSGAGALGISTLSLEFVGYKAGACEQAEEVVVTLKVLIGAVPTCMILTGLCILLVSPTLKVPSQDPSRQLSLRRRTSYSLA	137819	123716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_124434_126028_126206_126600_126745_127031_127142_127367_127449_127769_127854_128328_128451_128564_128656_131439_131571_131684_131764_132488_132614_133180_133217_134602_134729_137685
700983	contig_1867_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_54566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	766	1725	449145	448186	NA	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449910	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448000_449900
700985	contig_6364_pilon	+	1858	12	Intergenic	novelGene_51756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_5	103.225101053975	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	72	1382	638966	694889	FALSE	30	CTGCTTGTGAATACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNTGKLAGCTLFITGASRGIGKAIALKAAKDGANIVIAAKTAQAHPKLPGTIYTAAEEIEAAGGKALPCVVDVRDEQQISDSVEKAVEKFGGIDILVNNASAIALSSTLDTPTKKVDLMMNVNTRGTYLTQSSALLELDTNMIVCSVTRSKACIPYLKKSKIAHILNLSPPLNLNPLWFKQHCAYTIAKYGMSMCVLGMAEEFKGEIAVNALWPKTAIHTAAMDMLGGAGIESQCRKVDIIADAAYSIFKKPKNFTGNFIIDENILKEEGIQNFDVYAVKPGHSLMPDFFLDELPGAVNMKMESPDAAPAIKEGKQAPQPKGGSPVEETFRIVKETLSEDAVKATQAVYQFELSGDDGGTWFLDLKSKGGNVGRGEPLDRADVVMSMSTEDFVKMFSGKLKPTMAFMSGKLKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARL	638894	695365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_638983_647333_647498_648683_648783_655971_656087_658024_658082_660441_660546_661701_661801_674476_674672_676819_676892_682957_683105_685567_685697_694776
700987	contig_15066_pilon	-	1489	12	Intergenic	novelGene_149539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_9	138.536148577943	320	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	109	1341	114591	111830	FALSE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114699	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
700991	contig_3153_pilon	-	2463	1	Intergenic	novelGene_104702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGTATCTCAGCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452412	449949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_449900_452400
700992	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
700997	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
701000	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
701003	contig_14289_pilon	+	1684	8	Intergenic	novelGene_110572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_7	7.77226886213454	190	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	245	1207	75661	84192	FALSE	35	TCAGATGGTGTGATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQNNSLPPYAQGLASPQGAMTPGIPIFSPMMPYGTGLTPQPIQSTNSLSILEEQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQAAAAAQQSTSQQAPPGATGQTPQLFHSQTLTTAPLPGTTPLYPSPMTPMTPITPATPASESSGIVPQLQNIVSTVNLGCKLDLKTIALRARNAEYNPKRFAAVIMRIREPRTTALIFSSGKMVCTGAKSEEQSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIQNMVGSCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSSYEPELFPGLIYRMIKPRIVLLIFVSGKVVLTGAKVRAEIYEAFENIYPILKGFRKTT	72540	84669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_72633_75508_75715_75911_76298_78983_79072_80612_80705_82143_82312_83282_83378_84112
701005	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701014	contig_11752_pilon	+	789	5	Intergenic	novelGene_37671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_2	660.219423752437	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4	501	92915	105616	FALSE	30	ATAAAGATGTCCAGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	92911	105904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
701018	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	176	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701021	contig_7366_pilon	+	2537	3	Intergenic	novelGene_164972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	120.5	283	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATCTTTTTATGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51810	61053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7366_pilon_+_51838_57495_57604_58651
701023	contig_5247_pilon	-	1548	8	Intergenic	novelGene_81824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	215.199385478221	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	232	882	376451	342767	FALSE	15	GTATATCAGTGGTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPNSS	416531	342100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_409244_409305_409344_409395_416448
701025	contig_14720_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_164987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200587	198540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_198500_200600
701026	contig_5718_pilon	-	1898	4	Intergenic	novelGene_110374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	88.1967497511482	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	183	1481	1159699	1144526	FALSE	25	TATTTGAATAATTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFREERRLTYTFLIICFLTLRLCTSQNCPTKSLEDVVIDIQSSLSKGIRGNEPIYTLTQKDCINSCCSTKNISGDKACNLMIFDTRKTTRQPNCYLFFCPSEEACPLKPAKGLMSYRIIRDFPPLTRTDLPRQELAQEDSLLLDRSSQAAASTPSHLTAHSKPPDTFWKDRVSQKFGSSDHLEKVFKIDQTSTQLPVYEEKGQSQSSQFSPKQKIVHLLLENVTVFPTTEAAVSPPTVFVTPNPTVLQPTIPSMRPALTSQPQLVTAPPPVTTITSQPPILVSTNLTQAMIPRQASMTTTAVPTTPFQAPKDLKVTSEVVPSREMSNLPLNVGDARNFTTLPRSNVDSSFANKTAAQENGKGSPGSSSQNNVPQSQSGFPFEKWLLMGTLLFGVLFLVIGLGLLGRMLSESLRRKRYSRLDYLINGIYVDI	1166217	1144108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1145461_1156414_1156556_1159476_1159800_1166135
701031	contig_10324_pilon	-	1634	6	Intergenic	novelGene_7921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	15	junction_5	15.4220621189256	376	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	315	1298	929627	927701	FALSE	15	CCTAGCGTGTGCCCCGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWTALLTLVLQASLVLPLAESAAPALRFVAVGDWGGVPNAPFYTAREVASAKEIARTVQTLGADFILSLGDNFYFSGVQDVNDKRFQETFEDVFSARSLHNVPWYVLAGNHDHLGNVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKVPRTNVSLAIFMLDTVTLCGNSDDFLSQQPERPRDLMLARTQLSWLKKQLAAAKEDYVLIAGHYPVWSIAEHGPTRCLVKQLQPLLATYGVIAYLCGHDHNLQYLQDEKGVGYVLSGAGNFMDPSKRHQRKVPNGYLRFHYGVEDSLGGFAYIEISPKEMSVTFIEASGKSLFKTSLPRRPRP	931647	927364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_927944_928538_928885_929014_929143_929360_929628_929916_930004_931420
701032	contig_8452_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_48091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1552	junction_3	670.11557875406	127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982015	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637
701033	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701036	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_98081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701041	contig_546_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_117259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1626	2033	762880	762473	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKGTEAGWCSGQVRESTGGAYEMRSEIIQALIGLQDFFIDPEKLIAASYLFHLSSVPLASDSELSSRIIMKGSLEGNTAKFAPFIVQGPVQASPFCWFLLELFLPHTPTHIPSNSFLPSALNPHSKVSKIFLLV	764505	762465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_762500_764500
701043	contig_15304_pilon	-	1610	4	Intergenic	novelGene_30617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	210.353670437829	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	272	1117	66228	64912	FALSE	10	GGAGCCCTGGGCTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	71745	64418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104_66402_71647
701049	contig_12250_pilon	-	1431	6	Intergenic	novelGene_80712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_2	155.171646894657	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAACCCAAGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401254	398582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401200
701050	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701053	contig_9345_pilon	-	2737	5	Intergenic	novelGene_24419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	63.6140707705457	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1768	2388	195186	194566	FALSE	50	TTTTTAAAAACACACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPCVCRAPVFFWAQRGRLGSGVQLRYTAGQTDPATCRPAGYGAGSEGGWTCSRVPGCLQVDLGEARPQDLEAYFVPGTFPGLFLTVQPTLPSPPGLCSLQVPALLRGVRVPGPGWWSLCLVCSSSCGQTRVERCPGPGQGRPLGLLLEPQAPLSMEGAALRVSEGPLLTPGPENHAPAFGTWELWPLLLCPLDFGDFWSAGHAHL	202085	194216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_198455_198521_199399_199463_199598_199686_201653
701054	contig_14621_pilon	+	1771	3	Intergenic	novelGene_105838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116090	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824_125702_125954
701056	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
701057	contig_5261_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_102490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGATGTACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774758	775896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_774800_775900
701059	contig_17440_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_7633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3456	3995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
701063	contig_10451_pilon	-	2583	6	Intergenic	novelGene_138329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	125.222042788001	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	55	852	517650	460351	FALSE	15	GCTCACTGCCCCACCGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKVIFVEKAPDGHHVWEMEAKTDREMCKPNSLVVEIPPFRNQRITSPVQVNFYVCNGKRKRSQYQHFTYLPANVPIIKTEPTDDYEPVQTCGPVTQGLSPLSKPYYSQQLLLPPDPGACLVAGFTSCQQRSTVMSPPPSTSPKLHDLSSATYTKCSPSTGHSHLGLQQPAGGAPTTQEVPRPRAVPSSAPHPSSHATLQPQPCSPTSPSAVGHQQHQPPKVHRHESPTTQPLSLPELHEDSSHNLAPIPVTVKREPEELDQLYLDDVNEIIRNDLSSTNIHS	527529	458619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_460401_494608_494805_494915_495299_512712_512846_517614_517671_527495
701064	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
701067	contig_3335_pilon	-	2237	2	Intergenic	novelGene_165006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTCAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400176	397387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_398024_398575
701072	contig_10158_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_150776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAACGACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138772	136152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_136200_138800
701075	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701077	contig_2867_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_135255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	598.48240366781	7	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	132	806	1289430	1285763	FALSE	15	CTATATTCCTATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPAAASSTPTPSSRSSPGSRSRTWRRCSSSEYDAGRDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEIERIVATGQIETQGAFPPALPALSACVCIVEKERFLPWPRDPGPWHPVLTSRPQVLGPSRAGRGDSCANLPHRPTLCQGNAMGPWAGEAQGGKNTTTQYPPQNSLRVLGGSPRE	1305549	1285023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286108_1286699_1286781_1288013_1288149_1289316_1289465_1305452
701078	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701079	contig_3975_pilon	-	2133	16	Intergenic	novelGene_54807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.169171104302	1	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	313	1269	2044892	2017628	TRUE	20	TGAGATACTATTTTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNDTMTTLNTLDQISNFTSVLPI	2052451	2015587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2015879_2015955_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017693_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2048328_2048515_2052363
701085	contig_14322_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_115916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAATGCGGCTGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671355	671651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
701089	SIRV7	-	240	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69046	0	35827	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78911	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
701093	contig_14322_pilon	+	382	2	Intergenic	novelGene_116449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	144	238	381	671606	671905	FALSE	20	AAGCCGGGCCCGCGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVELLLGKLKDNCEA	671368	671906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
701098	contig_9839_pilon	+	1432	8	Intergenic	novelGene_88556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_2	320.471846004657	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	18	1172	255906	269866	FALSE	25	GGTTCCTCACACTAACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKGAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	255888	270126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
701099	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701105	contig_3095_pilon	-	921	5	Intergenic	novelGene_75013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151928	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995_151157_151840
701120	contig_9995_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_47791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTCTCTATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777388	775487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_775500_777400
701123	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
701127	contig_11989_pilon	-	2270	16	Intergenic	novelGene_68446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_12	272.873890286337	44	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	18	1634	226858	56107	FALSE	30	GCCTCTCAGGGTGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAVSSALAFLRYLKLYTDSSFHFIWGQIITDEGNDQNLLPACRTVLLDQRVLNMVNKGKKWHEMKMEV	226875	55470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
701128	contig_6837_pilon	+	1946	9	Intergenic	novelGene_149825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	30.5856890555044	17	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	9	440	11753	15096	TRUE	15	TTGTTTTGTATGTTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQKVQWPC	11744	17330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15075_15273_15420_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
701129	contig_7744_pilon	+	3437	23	Intergenic	novelGene_62495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	21.1030529302091	125	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	973	2922	235	3156	689365	698213	FALSE	5	TCCTGCTTCCTCGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAKTLERIKAIVHAVGQELQVTGPFNLQLIAKDDQLKVIECNVRVSRSFPFVSKTLGVDLVALATQVIVGEEVEPVGLMTGTGVVGVKVPQFSFSRLAGADVVLGVEMTSTGEVACFGESRCEAYLKAMLSTGFKIPKKNILLTIGSYKNKSELLPTVRLLESLGYSLYASLGTADFYTEHGVKVTAVDWHFEEAVDGECPPQRSILEQLAENHFELVINLSMRGAGGRRLSSFVTKGYRTRRLAADFSVPLIIDIKCTKLFVEALGQIGPAPPLKVHVDCMTSQKLVRLPGLVDVHVHLREPGGTHKEDFASGTAAALSGGVTMVCAMPNTRPPIVDAPALALAQKLAEAGARCDFALFVGASSENAGTLGPVAGSAAGLKLYLNETFSELQLDSVAQWMEHFETWPSHLPIVAHAERQSVAAVLMVAQLAQRSVHICHVARKEEILLIKAAKARGLPVTCEVAPHHLFLCLDDLERLGPGKGEVRPELVSHQDMEALWENMAVIDCFASDHAPHTLEEKCGPRPPPGFPGLETMLPLLLTAVSEGRLSLDDLLQRLHHNPRRIFHLPPQEDTYVEVDLEHEWTIPSHMPFSKAHWTPFEGQKVKGTVRRVVLRGEVAYIDGQVLVPPGYGQDVRKWPQGVVPQLTPSASAASEITTTPERPRRGIPGLPDGRLHLPPRIHRASDPGLPAEEPKEKPSRKAAEPELMGTPDGACYPPPPVPRQASPQNLGTPGLLHPQTSPLLHSLVGQHILSVQQFTKDQLSHLFNVAHTLRMMVQKERSLDILKGKVMASMFFEVSTRTSSSFAAAMARLGGSVLSFSEATSSVQKGESLADSVQTMSCFADVVVLRHPQPGAVELAAKHCRRPVINAGDGVGEHPTQALLDIFTIREELGTVNGMTITMVGDLKHGRTVHSLACLLTQYRVSLRYVAPPSLRMPPSVRAFVASRGTKQEEFKTIEEALPDTDVLYMTRIQKERFGSAQEYDACFGQFILTPHIMTRAKKKMVVMHPMPRVNEISVEVDSDPRAAYFRQAENGMYIRMALLATVLGRF	688652	698494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_688749_689226_689395_690008_690192_690305_690411_691172_691413_691601_691684_691981_692149_692306_692472_692605_692738_692959_693162_693382_693574_693661_693803_693998_694101_694719_694817_695436_695482_695588_695759_695868_695944_696498_696712_696992_697119_697321_697478_697592_697695_697917_698013_698110
701134	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_97345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701136	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_16669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
701137	contig_10037_pilon	+	1610	7	Intergenic	novelGene_148949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_6	178.927049069974	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	332	943	128005	445150	FALSE	15	CTGACGTTGTAGCCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFQLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERSAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFKRYDFHPVCADLQAQILQCYRQHTHQTLSCSALAAQYMHCVNQAKQGTLEKGG	127673	445817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_378523_378595_425456_425593_445126
701138	contig_11720_pilon	+	1692	13	Intergenic	novelGene_43994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	373.957959609841	2	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	77	1438	264322	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVPPRQTYLSEKISIPDAEPLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262990	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263052_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266604_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
701142	contig_16204_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_154495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	107	475	251852	252220	NA	25	ATTACGGGGGACTCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLIIVWFEEDFRGFFSLRFTDYLRAKVLRVHPASMDPESLDSMRIRNSFLHFSPFDQDTSTVSLIKTFSNGRQPPSSSSGLMAKETVSHLEGFLRTDRFKSGCLSHHGPAPRGLPCSCPARQDQEQRQSPAGGSIQSHLFITCLVPGPVLALRYAI	251745	252332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_251700_252300
701147	contig_8330_pilon	-	1799	9	Intergenic	novelGene_71743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	43.7691029723023	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1065	1688	519774	515388	FALSE	10	GCTCTCTGCTTTGTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	527585	515276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_520465_524730_524851_526013_526227_527544
701148	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701152	contig_2646_pilon	+	1994	9	Intergenic	novelGene_69513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_7	154.371912924599	2	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	451	1017	566553	573396	FALSE	45	TTTAAATAAACTCAGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554002	574373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
701153	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701154	contig_401_pilon	-	1392	5	Intergenic	novelGene_42768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	576.838094702491	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCGTCAATTAGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086597	1078872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1081766_1082304_1082487_1083684_1083759_1086575
701155	contig_5954_pilon	-	1422	9	Intergenic	novelGene_28663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.570416512062	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	516	1406	947127	944742	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSEDQMSLQDDGPCFQTGVSFWLFIIIFFIL	948125	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944832_944898_945180_945395_945527_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947712_947795_947931_948098
701158	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_93487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
701173	contig_6217_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_109699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	410	1233	157	1389	1016733	1017965	NA	80	AGAAAAAAAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSHTHSPSEQISQPVQPLPEPLPSLHPSASPSSPPSLQNHKYNTTSTSYSPLASLPLKADTKGFCNINLLEDLPLQEPQSPHKLNPGFDLAKGSAGKVNLPKELPADAVNLTIPASLDISPLLGFWQLPPPATQNAFGNSTLSLGPGEPLPHRLSCLGQQQQEPPLAMSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	1016576	1018641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_1016600_1018600
701174	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	15	353	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14423	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701180	contig_9345_pilon	+	1584	14	Intergenic	novelGene_24500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	146	544	667249	667898	TRUE	10	GGCCGCAGGCGCCTGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPELGQTLGTNVLTGVLDARNQVGDEFVDGSFVLHSPRHSLGHLDFVSFTEISVLAAEMLVHGIKRTHATVLLQPDPIREKVFTRGLSSSSQEGAHHDSCGGPKGQGFGNMAHILYSSISDDWDTKAPCVF	667017	671876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_667085_667170_667255_667333_667481_667570_667716_667797_667945_668951_669025_669114_669209_669292_669489_669565_669628_670151_670354_670729_670793_670903_671012_671224_671282_671737
701182	contig_15039_pilon	+	1508	3	Intergenic	novelGene_110169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	1.5	103	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	562	990	329947	332136	TRUE	20	TAAACTACGTGTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGILIKKLLREQIVADMYTYKEISFFVAEFIVKNTAEWIRQNGGWVH	329385	344074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_330367_332127_332378_343797
701183	contig_7914_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_165022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAGAAAAAAAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110067	112051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_110100_112100
701184	contig_13787_pilon	-	1682	2	Intergenic	novelGene_40605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATGCTGTTTTTGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205307	129647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_131118_205095
701188	contig_16776_pilon	-	1222	5	Intergenic	novelGene_130507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_4	347.760244277577	874	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	303	830	57717	35073	FALSE	10	CAACCCTGTCTGTTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGSMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	58019	34680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_57706
701191	contig_8660_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_136487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTCTGTCATTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252791	254109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_252800_254100
701193	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
701197	contig_14322_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_116506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGCAATGCGGCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671389	671648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
701198	contig_12414_pilon	+	1730	3	Intergenic	novelGene_59661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGGAGGAAAACGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774146	784134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_774353_781926_782108_782791
701204	contig_5317_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_76619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGGCAACTAACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881756	884019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_881800_884000
701205	contig_2636_pilon	-	1766	4	Intergenic	novelGene_52089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	177.69074258385	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATAAGCCATGGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85836	59567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_62624_81113_81216_85551
701206	contig_6842_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_130813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGAGAATAGTTTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1727260	1727516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1727300_1727500
701207	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701210	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
701214	contig_5918_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_99512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGAGGCATATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465846	467220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_465800_467200
701220	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	16	363	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14424	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701223	contig_4301_pilon	-	2029	8	Intergenic	novelGene_65083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	366	junction_1	161.495182211579	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	60	755	441884	421030	FALSE	20	AGGTTTATGTGGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFKPKLQLVAHWPSKAFAMALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDQETYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQVSVGVLLVSWSVVTLKGHREYMSIQ	441943	419755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_421196_422457_422553_424140_424210_424761_424852_432023_432091_432714_432825_434847_434914_441851
701227	contig_593_pilon	-	2800	1	Intergenic	novelGene_102007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379033	376233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_376200_379000
701239	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_91252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701240	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91678	0	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
701242	contig_15384_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_85113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGACAAAAAGGCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72922	72008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_72000_72900
701243	contig_2932_pilon	-	2559	1	Intergenic	novelGene_47961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333137	330578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_330600_333100
701248	contig_5084_pilon	+	2230	4	Intergenic	novelGene_64640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGCACCAGCCGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327561	1330760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1329144_1329243_1329350_1330179_1330411_1330449
701255	contig_14933_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_165044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGCTAAGTGTGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11236	11924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_+_11200_11900
701259	contig_19402_pilon	+	2924	1	Intergenic	novelGene_80826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGCAAGAAAACGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108372	111296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_108400_111300
701265	contig_9706_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_20939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACCTGCCCTGCACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243392	241477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_241500_243400
701266	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
701267	contig_10990_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_7502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744108	741655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_741700_744100
701268	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	259	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701273	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701274	contig_3382_pilon	-	1524	9	Intergenic	novelGene_124028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	290.442523358753	102	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	682	1320	224882	176852	FALSE	10	TTTGGCGTTCATTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEIVGQAFIFLIAGYEIVTNTLSFATYLLAIHPDCQEKLLREVDRFYEKHAVLEYHTLQEGLPYLDMVIAETLRLYPPAFRFTRESAKDCELLGQRIPAGAVLEMAVGALHRDPEYWPQPEAFDPERFTAEARRQRRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLRVLRKFRFQACAETQVPLQLESKSALAPKNGVYIKIVPRQAGRPP	344854	176647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184044_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231398_309844_309943_344645
701287	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_95017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701288	SIRV7	+	212	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTCGCCTGACTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	78896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
701291	contig_16369_pilon	-	1980	3	Intergenic	novelGene_98695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	27	302	16597	13251	TRUE	15	GTTTTTTCTTAATTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTPPYQWMSLCSLTPPSTKSTTAWMTSLQVATVFWRDRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKQAFQDRYFMIGGMLLTCVVMVLVVHYLT	16623	10714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_12100_12957_13413_16483
701296	contig_5981_pilon	-	2569	6	Intergenic	novelGene_35509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.2229380286455	25	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1350	1799	51396	50947	TRUE	10	GCTCGTCTAGTGGTCGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	57734	49895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_50450_50730_52013_52888_53002_54269_54426_55447_55624_57446
701298	SIRV3	+	226	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4596	2173	2537	48	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGGTGGACGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6540	6766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6800
701302	contig_5696_pilon	+	2373	1	Intergenic	novelGene_117544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAGAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658611	660984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_658600_661000
701303	contig_5765_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_141407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAACAAAAAAAAACCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838187	840340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_838200_840300
701304	contig_18822_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_111731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTTGTACTCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151661	149642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_149600_151700
701306	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701312	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701315	contig_12977_pilon	+	1245	12	Intergenic	novelGene_122788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	764.28962317905	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	194	850	48712	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGTGHWTVLLALGPRTALPGAGEQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10782	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10857_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
701317	contig_9440_pilon	-	2117	5	Intergenic	novelGene_59091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	492.227272202587	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	57	620	1716626	1700693	TRUE	10	CATTACTTTGTCTTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716682	1698655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1699809_1700348_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1716475
701318	contig_10904_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_22439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAACTGAAAGACTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66793	66478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_66500_66800
701329	contig_19559_pilon	-	2115	14	Intergenic	novelGene_163436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_13	28.6988031418585	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	454	1884	94417	79836	FALSE	35	GGAGAAACCAGAAGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGEAFLIPTPYYGAITQHVYLYGNVRLVYVYLDSEVTGTDTRPFQLTVEKLEMALQGAHSEGVKVKGLILINPQNPLGDIYLPGELQEYLGFAERHKLHVIVDEVYMLSVFEESAAYSSVLGLERLPDPQRTHVMWATSKDFGMSGLRFGTLYTENQDVAIAVASLCRYHGLSGLVQYQMAQLLQDRDWINQVYLPENHARLKAAHTYVSEELRALRIPFLSRGAGFFIWADLRQYLSEGTFEEEMLLWRRFLDNKVLLSSGKAFGCKEPGWFRFVFSDKAHRLCLGMQRVRQVLEGKSQVAEDPPSSQTQEPSS	95815	79604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_79925_80050_80205_80321_80465_81870_82013_82126_82173_83811_83902_84589_84691_85656_85735_86258_86357_88369_88437_88896_88967_90108_90180_94135_94418_95362
701331	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701334	contig_7342_pilon	+	1600	10	Intergenic	novelGene_71231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	289.566896682478	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	50	721	716998	729446	TRUE	70	GAAAAAAATAATACACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTTVTLF	716948	735343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727601_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756
701342	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701345	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	527	55	527	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
701348	contig_20493_pilon	-	2448	11	Intergenic	novelGene_86399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	81.0079625715892	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	890	1489	43387	37388	FALSE	30	TTTACCCTCTCAGAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	54666	36428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46948_47119_48978_49107_49197_49252_54457
701353	contig_7593_pilon	-	2693	2	Intergenic	novelGene_127329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1114	1446	534676	534300	FALSE	25	AGAGGGAGTCGCCTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLRYKEVKLLVQGYRDFKRQFWDLNLQREPASRVATLHPPQWTASLIHLHNNPVRRNHSFHFHKKPGTGLMGNLSQVTQPARGSGKIQTQAAWLTCAMTPLNDSVSHS	535789	533052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_534490_534533
701358	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_89576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701361	contig_16525_pilon	-	550	5	Intergenic	novelGene_133853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	51	491	181436	178157	FALSE	15	TTCGAGGACTGTGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181486	178097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
701365	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_94883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701366	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701369	contig_1618_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_141788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAATATTTTTTCACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209392	209160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_209200_209400
701371	contig_17274_pilon	-	1977	10	Intergenic	novelGene_26470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	492	911	70605	70033	TRUE	30	TGAAGCACCAGCTCTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEDQRRIDALELWCWQRILNTPRTSRTNKSVLEEVQPECSLEVRMVRLCLAYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVERVSKKEEGLQQDGLTQWLQQWAQTLFSGWCWTRQCFALLYRDGLHNKQGTRGLTCAYLLICCYR	71096	6992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_7084_26182_26360_27831_28000_30126_30210_42653_42710_47229_47294_51701_51784_54320_54383_69749_70047_70199
701375	contig_8942_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_143195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTCTGGTGAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335491	333107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_333100_335500
701378	SIRV4	-	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAACGATTGCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
701380	contig_6735_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_15832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTCCCCATAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671543	673399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_671500_673400
701385	contig_13760_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_61367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	628	1041	419401	418988	NA	60	AAAAAAAAGCAGGCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPDQKRKECGTEIHILTEFRLPGSIETRETPESIALSKSIALSKSSKHKPKLSPELISKLKNYLAKLLYFYKNSAAPSTFVCQLCPPPARYFHKRHYANFFTCCCISSWICFHEDYSQENPMEQFFVLLNFLLCFR	420028	418119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_418100_420000
701386	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701387	contig_12622_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_5898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	258	509	1540833	1541084	NA	25	TAAAAGCTGTGCTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALPSAPPTPAVTSTSQQELQAKILSLFNSGTVAANSSSASPSVIAGSAQNQNFSTAANSQPQQRSQASGSQPPNILGQAGSARNMGPRPGAPSQGLFGQPSSRLASASKMASQRPVSSTGINFDNPSVQKALDTLIQSGPALSHLVSQTTAQVGQPQAPLGSYQRHY	1540575	1542430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1540600_1542400
701388	contig_8020_pilon	+	2238	19	Intergenic	novelGene_114409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_16	53.6389680073069	2	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	269	1648	173375	202533	TRUE	30	TGGGGAATTTAGTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETSDFSKTQMTSYPSAFRIKLQHFNMEHETPHMPFHLKSHPLSPLLQPHHLVPLPDSTPPRSSVLLCCYCC	167203	203334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_167903_169128_169206_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_201924_202085_202483_202558_202768
701391	contig_13481_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_119505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGTGACCCTACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409117	1409776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1409100_1409800
701405	contig_5643_pilon	-	1247	4	Intergenic	novelGene_38925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_2	85.8111621850885	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	196	666	413958	412705	TRUE	10	GTAGGGTTTTGCCTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGGNCQTFSSSTVISYSNTGDGAPKVYQETSEMRSAPGGIRETRRTVRDSDSGLEQMSIGHHIRDRAHILQRSRNHRTGDQEERQDYINLDESEAAAFDDEWRRETSRFRQQRPLEFRRHEASGGGGRRAEGPPRLAIQGPEDSPSRQSRRYDW	414153	411861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_412418_412679_412893_413501_413662_413835
701406	contig_12654_pilon	-	1288	9	Intergenic	novelGene_129325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	167.062862420108	1825	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	228	836	827177	812546	TRUE	15	TTTTACAGAGTCCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKVIMTFFCRLICVIPCFSASNMPV	827404	808412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812398_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
701409	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701417	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701421	contig_3077_pilon	-	1873	8	Intergenic	novelGene_26886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.91372543633873	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	49	1200	1492738	1488388	FALSE	25	CTCCAATAAAGTGCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATCEISNVFSNYFSAMYSSEDPTLVSAPPAANFGADDVVLTLSNTQMPLQGTEKASWSGEQPQFWSKAQVLDWISYQVEKNKYDASSIDFSRCDMDGATLCNCALEELRLVFGPLGDQLHAQLQDLSESRLLVRGGLTSKQAASSSDELSWIIEPLEKDGMSDELSWIIELLEKDGMAFQETLGDMGPLDQASPFVQELLEDCPYYPSSYGAGAPSPGSSDVSTAGTGTPQSSHSSDSGGSDVDLDPTDSSKLFPTDGFPDYKKGDPKHGKRKRGRPRKLSKESRECLEGKKSKHAPRGTHLWEFIRDILIHPELNEGLMKWENRHEGVFKFLRSEAVAQLWGQKKKNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNSSGWKEEEVAGSRN	1492786	1487714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1488503_1489481_1489678_1490664_1490782_1490909_1491003_1491194_1491303_1491505_1491650_1492089_1492357_1492626
701432	contig_10404_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_138724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1026	1379	1365178	1364825	FALSE	20	TATGTGCCTTGACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIVKNEMEHINIDILGISELKWTDVGHFQLDNPMVYYAGNDKLKRNGVSFIIKKNISRSILKCSAVSDRIISLILQGRSVNTNIIQIYASTTKAKDEEMEDFYQLLESEID	1367479	1364452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1366125_1367400
701441	contig_504_pilon	-	2406	2	Intergenic	novelGene_54446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	233	736	245879	245376	TRUE	30	TTTGAAGGAACTCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVEQWEGLGQGLRPERHEESHLQMPTLDGPGSKFSPSLQEIWTATIMRCSQSLGMMASLFTLTMPEGKCDFLCPHTPLLQPFFLCSCSGKPNAPRVRSLHCHVPCLLLSLFTISFFLLIFAKYHMILLQPKSTSVPPSEKFSIIFYQTIRSWRQRTWLYSGAGPL	246111	240384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_241471_244791
701444	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701451	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701452	contig_9945_pilon	-	2863	1	Intergenic	novelGene_104813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTTTCATTTTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81200	78337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_78300_81200
701453	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_95001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701454	contig_5718_pilon	+	3137	1	Intergenic	novelGene_110334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGCCAGTGGGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560173	563310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_560200_563300
701455	contig_12638_pilon	+	1705	10	Intergenic	novelGene_33233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	33.7638860322683	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	86	1177	737245	764074	FALSE	10	CATTGTGTCTTTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNNQRSSRPQA	737159	764602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759361_764045
701460	contig_5264_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_165059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGGCAAAGACGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160530	161691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_160500_161700
701461	contig_2463_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_43025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATGACACACAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516932	515516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_515500_516900
701463	contig_20460_pilon	+	1884	3	Intergenic	novelGene_163951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	4	1461	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	11075	16690	FALSE	20	TCATGTTGTCTTTTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKRRRNGNKEDNHHSPVSKRSKRNLGFQDSPDAEIVSVTKNNKECQLRGTKVCVSSSSDNERSSSSINIPERASRPESSLNQSGAELNPNIPQSFYEEAALCQGPYFHINQILKEAHFHSLRQRGQSSPTR	11072	18173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20460_pilon_+_11180_15513_15574_16456
701464	contig_6227_pilon	-	2372	4	Intergenic	novelGene_49666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1121	1450	498231	497902	TRUE	30	TGGTGAGCAGACAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDANKIPRRFSQTFANTEEDTKDQRREGACPKSPRKLGPKMALPTKNEAQIAHQTVVTPKSPALLGRLAQYRYSRTVSSFRVSPWVVGFRSWRSSSFSCRDTKSLPSV	499351	488693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_488771_493466_493610_495118_495272_497352
701466	SIRV7	+	349	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCACTTAATCCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78963_114680
701472	contig_10196_pilon	+	2210	10	Intergenic	novelGene_132295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_9	245.548365907819	11	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	564	1037	2364371	2369190	FALSE	15	TACTTGGAGTTGTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKKVAELVPGTGPYL	2346709	2370363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497_2352597_2363547_2363643_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2369145
701479	contig_12265_pilon	+	1772	12	Intergenic	novelGene_149438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	52.8348432491005	228	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	97	1755	19703	50211	FALSE	45	ATTAAAATGACTGAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRTLREVSAGLKKGQITPTELCQKCLSLIKKTKFLNAYITVTEEVALKQAEESEKRYAKGQSLGDLDGIPFAVKDNFSTSGIETTCASNMLKGYVPPYNATVVQKLLDQGALLMGKTNLDEFAMGTQDQGSKLEMEAAPSGGLLCRVGEGSGSTDGVFGPVKNPWSYSKQYREKRKQQPHGENEDSDWLITGGSSGGSAAAVSAFTCFVALGSDTGGSTRNPAAHCGLVGLKPSYGLVSRHGLIPLVNSMDVPGILTRCVDDAAIVLGVLAGHDPKDSTTVQDPVKPFMLPSLTDMSKLCIGIPKEYLVPELSSEVQSLWTKAADLFESEGAKVIEVSLPHTSYSIVCYHVLCTSEVASNMARFDGLEYGHRCNIDVSTEAMYAATRREGFNDVVRGRILSGNFFLLKENYENYFIKAQKVRRLIANDFVNVFNSGVDVLLTPTTLSEAVPYLEFIEEDNRTRSAQDDIFTQAVNMAGLPAVSIPVALSNQGLPVGLQFIGRAFCDQQLLTVAKWFEKQVQFPVIQLQELMDDCSAVFESEKLASVSLKQ	19606	50228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_19727_29717_29878_30194_30294_32260_32358_34568_34644_36604_36782_40100_40277_40364_40478_42478_42672_43407_43526_46662_46869_49990
701480	contig_8452_pilon	-	956	5	Intergenic	novelGene_48104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_4	889.024887165708	14013	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	64	651	991230	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGRAQALTSPSCTVWAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991293	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
701482	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701484	contig_19342_pilon	+	1128	4	Intergenic	novelGene_41095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	6	353	3263	4218	TRUE	15	AATCCTGTGTTTGCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPSIGL	3257	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4203_4365_6149
701485	contig_5690_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_119749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090279	1091788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1090300_1091800
701486	SIRV5	-	261	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCTTCCGACCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10860
701496	contig_12761_pilon	+	3695	1	Intergenic	novelGene_164041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	773	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	669	2010	98	2107	24025	26034	NA	10	CTATGAGTCTCTGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDDKGCGRPLRALVRCLPVPQRPVHGLAEARTMDLHTAVYNAARDGKLQLLQKLLSGRSREELEELTGELANGGTPLLIAARYGHLDVVEYLVDRCGASVEAGGSVHFDGETIEGAPPLWAASAAGHLDVVRSLLRRGASVNRTTRTNSTPLRAACFDGHLEVVRYLVGEHQADLEVANRHGHTCLMISCYKGHREIARYLLEQGAQVNRRSAKGNTALHDCAESGSLEILQLLLGCNARMERDGYGMTPLLAASVTGHTNIVEYLIQEQPGQEQAAGVGEEARPELPRKGPSSTSRGYLQPQGAYCSSASPEEPLNGESYESCCPTSREAAVEALELLGATYVDKKRDLLGALKHWRRAMELRHQGGEYLPKPEPQQLVLAYDYSREVNTTEELEALITDPDEMRMQALLIRERILGPSHPDTSYYIRYRGAVYADSGNFERCIRLWKYALDMQQNNLEPLSPMTASSFLSFAELFSYVLQDRATKGSLGTQIGFADLMGVLSKGVREVERALQLPKEPGDSAQFTKTLAIILHLLYLLEKVACTPEQEHLKHQTVYRLLKCAPRGKNGFTPLHMAVDKDTTNVGRYPVGRFPSLHVVKVLLGCGADPDSRDFDNNTPLHIAAQNNCPAIMNALIDAGGPHGCHQCLQEDRLRAAGREAPGQEHRAALQPREPPVPGRQSPGEKQDPLQGLHPGRARGLH	23927	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_23900_27600
701507	contig_14553_pilon	+	1467	3	Intergenic	novelGene_125006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_2	63	330	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13795	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_13937_14294_14424_22455
701509	contig_14202_pilon	-	2081	3	Intergenic	novelGene_157130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4393	junction_2	465.5	285	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTGCTCTGCCACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88601	84792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084
701511	SIRV4	+	302	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	638	1008	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
701512	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701515	contig_3584_pilon	+	2026	3	Intergenic	novelGene_108154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	160.5	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAACGGTTTGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350997	368895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_351654_352275_352364_367613
701517	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701518	contig_16098_pilon	-	1211	8	Intergenic	novelGene_46146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2087.44558281755	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	410	1012	457605	456273	FALSE	15	TTGAAGGGGGAGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	458765	456073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457687_457851_457907_458405_458618_458704
701519	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701520	contig_9895_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_144717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526060	528335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_526100_528300
701521	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701522	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	986	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701525	contig_938_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_143920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATAACCTGGGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102687	104605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_102700_104600
701530	SIRV5	-	350	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTCTCTGCAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
701533	contig_16122_pilon	+	1592	3	Intergenic	novelGene_134509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.5	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	419	1114	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133480	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_133536_133726_134161_136976
701546	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701548	contig_4364_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_2954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
701550	contig_5050_pilon	-	1325	8	Intergenic	novelGene_110275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	185.539918142942	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	208	1005	648165	507209	FALSE	20	AGAGACTTGGATGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRHRFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	648372	506888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_648148
701553	contig_5210_pilon	+	591	2	Intergenic	novelGene_65455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619781	622181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_620133_621941
701561	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_97845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701564	contig_9243_pilon	-	1559	11	Intergenic	novelGene_60322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	231.307500959221	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	4	864	64617	20056	TRUE	20	TCATGACCATGTCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64620	19267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_19621_19713_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
701566	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701569	contig_7342_pilon	-	1836	5	Intergenic	novelGene_71220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1121	junction_1	426.858875976593	192	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	104	739	716514	698761	FALSE	70	GAAGAGAAAGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAVPSEAAPFCARSRDSTGPVLCEVGGGARAPGMAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQVNCCTSQ	716617	697663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
701571	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	294	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
701573	contig_5917_pilon	-	3144	2	Intergenic	novelGene_122152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	0	183	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATTTGAAATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540745	532262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_535318_540656
701575	contig_9415_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_109921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGAATCATGGCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2186747	2184589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2184600_2186700
701577	contig_5196_pilon	-	2038	5	Intergenic	novelGene_38666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	274.813118318613	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	76	519	14523	10137	TRUE	40	TTGAGAAAATACTTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRVLWSELEGEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTCESLALPVPFTFC	16081	8444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11759_11875_14231_14542_16024
701581	contig_6589_pilon	+	1170	3	Intergenic	novelGene_26138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	8044	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	681	1046	1886541	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGLLGSPVQQLPIPSIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885069	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886783_1887705
701586	contig_14577_pilon	-	2017	1	Intergenic	novelGene_164650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1140	1550	81061	80651	NA	85	AAAAAAATAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPWRRCSLKFKCRQALAARISIAACRAGMWCWPWVATRSSGKLLDSTIADEGTWTLEDRKMVRIVLTKTKRDVANCWTSLIESEYAADPWVQDQMQRKLTLERFHKENPGFDFSGAEISGNYTKGGPDFSNLEK	82200	80183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_80200_82200
701589	contig_10496_pilon	+	2617	7	Intergenic	novelGene_59437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_6	33.772112097936	8	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	145	579	199627	218345	TRUE	30	TATTCCTCTGTGTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METETKTLPLENASILSEGSLQEGHRLWIGNLDPKITEYHLLKLLQKFGKVKQFDFLFHKSGALEGQPRGYCFVNFETKQEAEQAIQCLNGKLALSKKLVVRWAHAQVKRYDHNKNDKILPISLEPSSSTEPTQSNLRAAQLPA	195399	221139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_195528_199610_199740_209283_209411_214098_214186_216071_216158_218323_218405_219160
701592	contig_7744_pilon	+	1499	12	Intergenic	novelGene_62513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTCACTGGGCCGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820584	825084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_820822_820948_821128_821548_821725_821878_822006_822224_822329_822501_822577_822776_822894_823128_823219_823415_823500_823759_823968_824625_824670_825026
701600	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701601	contig_18081_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_23848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	182	721	435960	435421	NA	80	AAAAACTAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLNQLCMLQVEPASLVCPCPASLPWGRQHPSALSSPLQNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQGSPHLPSPPPLPSHSGLPDCPRQWPLGHPAHSELKPLSKSTFQTKIRQAYETNHNTREERAS	436141	435200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_435200_436100
701605	contig_8616_pilon	+	1023	7	Intergenic	novelGene_72552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1076.65495349666	167	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	145	948	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWLISTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425633	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428087_435718_435900_435993_436119_436357
701606	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701609	contig_3602_pilon	-	2000	8	Intergenic	novelGene_60549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	14.8172541453592	230	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	361	1302	331905	318133	FALSE	45	AAAGATAAATTGGACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAALPAWTRALLAAWAPGRCSFFLVTTLLSSALGVGLALALQPGAAFAAINASVGVLGDGKPAPSKEVLDSFLDLVRNIFPSNLVSAAFRSYATHYEIRKVAGDQNETLVKVPLGGEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLINFFNSFNDATMVLVSWIMWYAPVGILFLVASKIVEMEDVGTLFASLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIMTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEEKNGVSRHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLNQQPLDLVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVSLPVHDLSLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDAFGAGLLQNYVDRTESRSLVPELIQVKSETPLPQLLSAPPEEGNPLLKPCLGAAGDADTFEKESVM	337236	317434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_318371_320683_320819_320973_321169_321998_322233_331765_331933_333674_333735_334189_334233_337006
701615	contig_18869_pilon	-	178	1	Intergenic	novelGene_56012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73526	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
701620	contig_11378_pilon	-	1317	3	Intergenic	novelGene_112332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	2.5	143	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	114	425	1247699	1246678	FALSE	40	AAACGATGTTGATAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLLRGAGALAAQALRARRPNGVAAVRSMASGGGVPTDDEQATGLEREVLLAARKGLDPYNILPPKAAAGTKEDPNLVPSITDKRIVGCICKYLGSVFLSV	1247812	1245785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1246813_1246991_1247066_1247596
701625	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701626	contig_15304_pilon	-	1030	3	Intergenic	novelGene_30573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	30	CTCACCCCTCGAATAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
701631	contig_13760_pilon	-	1878	9	Intergenic	novelGene_61296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	246.696169406823	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	88	1713	194443	161598	FALSE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHLQPPMCGSREWAAAEASSRQARSYGEKLKELSENGVSEGDWGRAFTAPQGHCDHPRMFWVQLQDLPCSSKALHGCWALSHLLQAQRVSLQEEPELLFLPPASASHLPAEVPCC	194530	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161801_167235_167375_167582_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
701632	contig_10500_pilon	-	1278	7	Intergenic	novelGene_41221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	772.976803590437	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	176	1015	1640040	1624864	FALSE	40	TCCTATATAAACATCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKVFWDMLTTPGKYNG	1640215	1624600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1624908_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
701635	contig_15066_pilon	-	2601	4	Intergenic	novelGene_149537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	106.611444038621	14	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	61	474	114591	114099	TRUE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCGGARRWRRLWPGTPKAASMEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFRPRCSERVRTGLGLRPCSHYRLRLQVRRADHVCGAGARGPAGGLRTPRSPCQSPHFQPRDTFRPQHSQPAHQL	114651	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_114463_114541
701636	contig_13067_pilon	-	2120	5	Intergenic	novelGene_141333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.775466367045	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	227	583	75166	36326	TRUE	20	GCTCACATGTCAGAGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDKEFMWALKNGDLDEVKDYVAKGEDVNRTLEGGRKPLHYAADCGQLEILEFLLLKGADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVKLLLSKGADKTVKGPDGLTALEATDNQAIKALLQ	75392	33243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_33529_35073_36413_52559_52644_53605_53720_75094
701646	SIRV5	+	377	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
701647	contig_15114_pilon	-	1316	5	Intergenic	novelGene_121122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.9829941970784	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATCCACTGTGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125318	94771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94801_95959_96447_97687_98332_123654_123705_125212
701650	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_94665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701651	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5901	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701652	SIRV2	-	588	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	71	2958	-71	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCTTAGGACTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
701653	contig_6589_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_25959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAAGCGGAGGGCAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296036	1296259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296000_1296300
701654	SIRV2	-	537	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4278	92	3103	-57	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTATGGTCTTGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629	1092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
701655	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701661	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701662	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
701665	contig_14341_pilon	+	2580	3	Intergenic	novelGene_111757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	1	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	445	1857	218687	220099	FALSE	35	ATGCAATGTTATTGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGTHGKRQKPDSNADEKTYAKEKPYECRECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECGKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCNQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKGFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECQDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYECRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG	205517	220822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_205566_207547_207623_218365
701666	contig_5286_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_157381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGACTGCCTGTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606323	607660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_606300_607700
701674	contig_8729_pilon	-	1655	5	Intergenic	novelGene_40157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	351.635020298036	1332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	570	1004	768761	765591	FALSE	30	ACTCTTATTTTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALSQLGALWRPPGLSYLTPRALCGRYCASVAGLSRWPRARARVYLGSPDPRPVSSHHVDLHPYQPDTSDQCGCGADEARREALRNRLLQKQGRRLAQRRVSHPLLAALGEVGSPLRSLPLVQSNGEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770685	764939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438_769569_770306
701680	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_95576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701682	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_95036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701683	contig_20602_pilon	-	2060	6	Intergenic	novelGene_133723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	292.636019655818	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	953	1510	19906	16186	TRUE	45	CCAAATAAATTCTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKLKLTGLALICFLLVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVTLEECILPIMALKILYICGHKMPAGVDTDL	20858	9793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_16104_16282_17104_17275_19179_19325_19759
701691	contig_5935_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_102698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGCTAAAAATCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862316	864317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_862892_863552
701694	contig_9150_pilon	-	1670	5	Intergenic	novelGene_140902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.63467438331	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	293	1006	47776	46907	FALSE	15	TCATTTGCAGTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRKQGSQTRGQQSAEEDNFKKPTRSNMQRSKMRGAASGNEAPQPPRKKRARADPTVESEEAFKNRVEVKVKIPEELKPWLVEDWDLVTRQKQLFQLPAKKNVDAILEEYANCKRSQGNVDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILMAHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLGYLHDFLKYLAKNSAALFTASDYKVASAEYHRKAL	59181	46242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47499_47654_47801_49153_49253_57679_57770_59102
701695	contig_10973_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_150306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_700
701696	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_114022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	19	339	14409	13866	FALSE	20	ACTGTCAGTATGGTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14427	13864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701699	contig_5832_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_134169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	328	660	565124	564792	NA	70	GAAAATAAAAGAATAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVAKREGPPFISEAAVRGNAAVLDYCRTSVSALSGATAGILGLTGLYGFIFYLLASILLSLLLILKAGRRWNKYFKSRRPLFTGGLIGGLFTYVLFWTFLYGMVHVY	565451	563586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_563600_565500
701700	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
701703	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_94913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701709	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_97190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701715	contig_10324_pilon	+	1389	9	Intergenic	novelGene_7840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	89.0890530592845	923	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	79	786	283476	295944	FALSE	15	TCCAAGGCCTCTCTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPGSNYTQTTRLEHIGESWLPKVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTICLTHETPWIKEMLSWLLITQRRMQIWDADTIFLP	283397	296547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287031_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_291409_291501_295927
701720	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
701724	contig_11512_pilon	+	1275	8	Intergenic	novelGene_43323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.374444997605	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	619	1140	455957	471553	FALSE	15	GCATTGGTGACTCTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLLAATELAPTHGNCCEDKEIRSGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	410536	471688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_410609_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
701725	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701727	contig_12080_pilon	-	2151	6	Intergenic	novelGene_128423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	26.5149014706825	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	55	591	590008	577487	TRUE	50	CAAATAAAATGTGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLIILENYSQASEWAAKYIRNRIIQFNPGPDKYFSLGLPTGSTPLSCYKKLIEYYKNGDLSFKYVKTFNMDEYVALPREHPESYHSFMWNNFFKHIDIDPENTHILDGNATDLQAECDAFEEKIKAAGGIELFVGGDDPHHGCSQGVCVVQGHRGGCEPYVDRVCLPAASLRSVCVR	590960	575084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_576598_577439_577615_585176_585360_586384_586487_589884_590015_590912
701728	contig_8674_pilon	+	1441	3	Intergenic	novelGene_102916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	722.5	227	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACATATGAAGCCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427059	460931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_460249
701729	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_17800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
701733	contig_2069_pilon	+	2091	14	Intergenic	novelGene_23248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	325.633147492024	2	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1047	1763	341330	343975	TRUE	0	CTTTGCTGGGTCTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323992	344412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333888_334103_334697_334805_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766_344183_344291
701735	contig_4783_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_108391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251551	249066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_249100_251600
701736	contig_10861_pilon	-	2453	18	Intergenic	novelGene_39415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_7	124.094366369734	449	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	141	2138	2226766	2191815	FALSE	5	CCTATCTTTTTTGTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAKAEKEKKLPPPPPQAPPEEENESEPEEPSGVEGAAFQSRLPHDRMTSQEAACFPDIISGPQQTQKVFLFIRNRTLQLWLDNPKIQLTFEATLQQLEAPYNSDTVLVHRVHSYLERHGLINFGIYKRIKPLPTKKTGKVIIIGSGVSGLAAARQLQSFGMDVTLLEARDRVGGRVATFRKGNYVADLGAMVVTGLGGNPMAVVSKQVNMELAKIKQKCPLYEANGQAVPKEKDEMVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNVLNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVNLKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAETQGKLEEKLQELEANPPSDVYLSSRDRQILDWHFANLEFANATPLSTLSLKHWDQDDDFEFTGSHLTVRNGYSCVPVALAEGLDIKLNTAVRQVRYTASGCEVIAVNTRSTSQTFIYKCDAVLCTLPLGVLKQQPPAVQFVPPLPEWKTSAVQRMGFGNLNKVVLCFDRVFWDPSVNLFGHVGSTTASRGELFLFWNLYKAPILLALVAGEAAGIMENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSRWRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAGEHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSPSM	2249208	2191499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2192001_2192692_2192840_2193530_2193659_2195435_2195551_2195962_2196151_2197701_2197835_2200721_2200834_2202114_2202189_2202978_2203114_2208661_2208753_2209068_2209212_2218122_2218218_2219415_2219498_2222263_2222371_2223158_2223252_2223883_2223963_2226676_2226811_2249112
701737	contig_6137_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_59314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACGTCACTAGACAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680193	1682456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1680200_1682500
701738	contig_3081_pilon	+	1888	2	Intergenic	novelGene_133929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCCACCAGCAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183474	185418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_183536_183591
701740	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_93529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701741	contig_4924_pilon	-	3308	1	Intergenic	novelGene_84761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCACTATTAGATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211349	208041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_208000_211300
701748	SIRV7	-	279	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91632	15	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
701751	contig_1996_pilon	-	850	3	Intergenic	novelGene_131934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	346	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509477	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508873_509388
701755	contig_6710_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_95870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTGTGCCCAACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
701757	contig_5779_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_106507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	701	1096	220172	220567	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRILKLSPSDYSNLTTCLCSVLLSPLTQPHRSPGGRVVKHLAVNQKVSCSNPPAAPWEKDTAVCFRKYYSLGNPMGQFYSVLQGHYSLGNPMGQFYSVLQGHYSLGNPMGQFCSVLQGCYELEWTGQWWV	219471	221888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_219500_221900
701758	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701763	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
701775	contig_6397_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_146220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15057	16201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_15100_16200
701776	contig_21394_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_128437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCCCAGAGGGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25006	23475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21394_pilon_-_23500_25000
701780	contig_12123_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_144594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76622	78719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_76600_78700
701785	contig_15267_pilon	+	1338	5	Intergenic	novelGene_151065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	17.1828402774396	158	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	22	567	22	18778	TRUE	30	TCCTGTAATAAACTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGISLPFMLCDSPGLEEKEEAGLCIDDISHILKGCIPDRYQLNPQKPITPSHSTFITSPSLKERIHCVAYVLDVNSVNHLPCKMVKKFKRVQKEVLHLGIAHVALLTKVDNWDEILQDDFLNMNRSMTYESQIMHVSKMLNIPISNILMVGNYASECELNPLKDVLILSVLRQMLRATDDFLEDLPLE	0	19706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_124_1665_1838_18229_18331_18607_18783_18939
701787	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
701789	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_96882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701790	contig_18328_pilon	+	1704	8	Intergenic	novelGene_132552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	195.654109622683	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	79	1176	15119	48007	FALSE	70	AAAAAAAAAAAATGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYSTAEECSADSDLNFLIPVAVGVALGFLIIVVFISYMIGRRKSRTGYQSV	15040	48535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291_28457_47864
701792	contig_5954_pilon	-	1619	11	Intergenic	novelGene_28403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.5395352130301	216	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	69	713	41040	38145	TRUE	10	CATCTGGCTCTGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELPSPSQLQGPQGPPKHPLPRMAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVHSAQGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGQHLGGL	41643	16004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16390_35373_35535_35645_35721_36230_36317_36623_36708_38029_38200_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_41576
701794	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701798	contig_8487_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_111918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAATCTTGCTTCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218729	220677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_218700_220700
701799	contig_762_pilon	-	1421	6	Intergenic	novelGene_135942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	36.3670180245783	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	100	729	266669	256695	TRUE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGEEPRRRLVLIDTRYLSWIHDEM	266768	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_256905_257514_257668_259724_259837_263903_264056_266666
701801	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_89291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
701802	contig_10958_pilon	-	2110	6	Intergenic	novelGene_5350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.74804314527997	13	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAATGATAAAGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770857	764760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_764969_766459_766559_766694_766872_767187_767288_768752_769749_770327
701808	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701810	contig_7202_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_17621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27831	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
701813	contig_7744_pilon	+	970	7	Intergenic	novelGene_62485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_2	338.672613136771	3476	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	67	753	670988	675017	FALSE	5	CTTGTTTTGTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRGPGGPTSLVPCAAALLLALGVERALALPEICIQCPGSVQNLSEVALFCKTSKLTLHARCCLDQKGTILGLDLQNCSLKDPGPKFFQAHTAIIIDLQANPLKDDLVNTFHGFTQLQTLILPQNVSCPGGISAWNTITSYSDNQTCQGQRNLCNSTGDPEMCPENGSCAPDGPGLLQCLCADGFHGYKCTRQGLFSLIVFFGILGSTTLSISILLWETQRRKAKAS	670921	675234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671087_671777_671897_673753_673826_674032_674105_674198_674321_674595_674694_674912
701816	contig_11986_pilon	+	2384	18	Intergenic	novelGene_69077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	141.001828253871	41	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	365	2233	7957	22021	FALSE	15	CGGGTTTTGCAAACTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTIGRSRGAIISQYYNRTIRLRRRSSRPLLSAMGRSARPSLRSHDLELDPMAYQEEEKRSLLVRELQGLTGAQRDHMLRRMPLSLAEKRCLREASETARETWRGQQGRRGVWSCCSQFKYGCVLALHNLGLGLLSGLHALTPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLPLLAFIVGVQAAFPPSPPHPTPAFTGLELLTGGGYFTHTVMYYGYYSNTTLNQQCAPPLDGNQCTRGEGGLPYNMPLAYLFTMGVAFFITCITLVYSMSHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCYAVWQVKPSSMCGPFQTLDTMYEAGKVWVRRLERAETL	7342	22172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_7459_7589_7760_7878_7976_8286_8446_9123_9230_9356_9454_9787_10046_10397_10589_11809_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17285_17442_17534_22009
701823	contig_1813_pilon	+	2721	13	Intergenic	novelGene_105477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	344.431254227732	96	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	260	1024	128315	150078	TRUE	10	CCGTGGTATTCTTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSLWG	102754	156302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_113656_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
701824	contig_15188_pilon	+	2982	1	Intergenic	novelGene_163070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	15	350	19232	19567	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWCRCACILIPRFSTSAPPPFATLTPGDGELGLHLCPDALQLHDQYGTPTSLLRLMPLPDLPDTLTNSSPTLIIHSSQKVEITPCPPTDERINKMWYILHNGMLFSHRKE	19217	22199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_19200_22200
701825	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
701830	contig_14838_pilon	-	1552	5	Intergenic	novelGene_151915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.19499805836	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	75	1370	112817	109062	FALSE	15	GTGTCCAATGCATTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSPPVCSVPTASQGLPPPLRSRTMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112891	108879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_109530_109577_110129_110895_111007_111351_111461_112760
701831	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701837	contig_14326_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_120667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTATCTCTTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62640	64452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_62600_64500
701839	contig_3956_pilon	+	2276	3	Intergenic	novelGene_14716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCAGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216436	225347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_217174_219227_219357_223937
701854	contig_2453_pilon	+	2072	13	Intergenic	novelGene_147765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	54.2775787554636	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	147	1937	56543	62827	TRUE	5	GTTTCTGGGTTTATTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	56309	63153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56427_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
701855	contig_17144_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_29229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2105.97360295103	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	266	1066	174965	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPWACPLRGLGCLQERVWSVS	176203	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166336_172678_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
701857	contig_11386_pilon	+	1896	7	Intergenic	novelGene_82746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	452.330999748341	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	782	1441	17940	31994	FALSE	30	AAAGCCACTCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	7825	32449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11416_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990
701858	contig_12270_pilon	-	249	2	Intergenic	novelGene_114137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCATCTGGGGTCCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701863	contig_16633_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_165080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTACTTCAGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114182	115019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_114200_115000
701869	contig_9739_pilon	-	2363	3	Intergenic	novelGene_165091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	29.5	254	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	81	404	194001	192154	FALSE	15	GAGTGGCTGAAGCCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEETRVNQLFAQAKACKVLVEKCTVSMQDIQAHLAQGHVAIVLVNSGVLHCDLCSSPVKYCCFAPRGHRCFCRTPDYQGHFIVLRGYSRAAGCIFYNNPAYADRMCSTSVSNFEEARTSYGTDEDILFVYLDS	195751	190194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_192246_193769_194012_195681
701870	contig_12624_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_61018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGGAAAGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838440	838874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_838400_838900
701871	contig_9189_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_165139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595978	593430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_593400_596000
701873	contig_18869_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_56341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
701874	contig_5429_pilon	+	3197	1	Intergenic	novelGene_127780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109997	113194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_110000_113200
701884	contig_7004_pilon	-	2006	5	Intergenic	novelGene_126508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	66.4130070091695	178	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	171	704	434925	433470	FALSE	45	CAATCAATAAAGCATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGAHCSEPSCQRLDFLPLKCDACSGIFCADHVAYAQHQCGSAYQKDIQVPVCPLCNVPVPVARGEPPDRAVGEHIDRDCRSDPAQQKRKIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSR	435095	432167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434599_434870
701885	contig_13901_pilon	+	2725	15	Intergenic	novelGene_146625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_14	134.606228439452	54	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	576	2132	64511	138343	TRUE	60	CCTTTGAAAATATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFPNILPPAGDGGLTSSQSEFQKMLIDERLRCEHHKTNYQTLKAEHTRLQDEYIKSQNELKRLLNEKQTHQEKFQLLLEELREELVEKTKDLEEMKLQVLTPQKLELLRAQIQQELETPMRERFRNLDEEVEKYRAEYNKLRYEHTFLKSEFEHQKEEFGRILEEGKIKYESEIARLEKDKEEVHNQLLSVDPTRDSKRVEQLVREKIHLCQKLKGLEAEVTELRAEKENSGAQVESVQRIQVRQLAEMQATVRSLEAEKQSAKLQSERLEKELQSSNEQNTLLISKLHKAEREVNILTSKVKELKHSNKLEITDIKLEAARAKSELERERNKIQSELDGLQSDNEILKSAVEHHKVLLVEKDRELIRKVQAVKEEGYQKLVALQDEKLELENRLADLEKMKVEHDVWRQSEKDQCEEKLRASQMAEESARRELQSIRLKLQQQLVNIENAEKEKNENSDLKQQISSLQIQVTSLAQSENDLLNSNQMLKEMVERLKQECRNLRSQAGKAQLEVEK	2253	153458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2704_64385_64660_65112_65264_90152_90246_93293_93426_104847_105100_107190_107323_119255_119371_120602_120748_120858_121009_135113_135190_138181_138361_140174_140305_150067_150172_153116
701886	contig_10801_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_74050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACATCTTATTACTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325421	323068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_323100_325400
701891	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_97137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653846	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
701892	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	TGCTTATAGCTGCTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
701896	contig_5337_pilon	-	2752	3	Intergenic	novelGene_136567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22	39	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	830	2493	66	2558	384110	361687	FALSE	20	AAGTAGGGTTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGPSVLLSLRRPGIRGAATTMSHLKMRSTEDEESTEKYENFGNAESKWPKIEGLHKDYVQEPKVGETCDWDYKVENQLEKTEGKRMKEEKSVIREKIGKAKNMAHVKTEQENEASEKSLHLSSKYVVHNTVSVEQKNSERGKCMENINGNSYSSLQQKTTTVKKSHKCDECGKSFKYNSRLVQHKIMHTGEKRYECDDCGGTFRSSSSLRVHKRIHTGEKPYKCEECGKAYMSYSSLINHKSTHSGEKNCKCDECGKSFNYSSVLDQHKRIHTGEKPYECGECGKAFRNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDICGKTFSNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDECGKAFITCRTLLNHKSIHFGDKPYKCDECEKSFNYSSLLIQHKVIHTGEKPYECDECGKAFRNSSGLIVHKRIHTGEKPYKCDVCGKAFSYSSGLAVHKSIHPGKKAHECKECGKSFSYNSLLLQHKTIHTGERPYVCDVCGKTFRNNSGLKVHRRIHTGEKPYKCDVCGKAYISRSSLKNHKGIHLGEKPYKCSYCEKSFNYSSALEQHKRIHTREKPFGCDECGKAFRNNSGLKVHKRIHTGERPYKCEECGKAYISLSSLINHKSVHPGEKPYKCDECEKAFITYRTLINHKKIHLGEKPFKCDVCGKSFNYTSLLSQHKRVHTREKPFECDRCEKVFRNNSSLKVHKRIHTGEKPYECDVCGKAYISHSSLINHKSTHPGKTPFTCDECGKAFFSSRTLISHKRVHLGEKPFKCVECGKSFSYSSLLSQHKRIHTGEKPYVCDWCGKAFRNSSGLTVHKRIHTGFRGRHREREAAAVTLKTARDGVQQQQQERQQRQMAAVGLAAPLS	384175	361492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_361824_370768_373124_384109
701912	contig_8330_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_71835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	196.895302127806	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	83	382	855707	856687	TRUE	45	AGATGGAATCGTAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	855624	857776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968_856979_857326
701914	contig_1008_pilon	+	2095	3	Intergenic	novelGene_121596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100	383	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	51	314	750514	750777	TRUE	30	ACACATACTGTTTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVELKSFGALAPAGQMRAGRPKGTRKQKLKRQGTQEAEQPQSQKVGPPPLEFLRVESPLRWTRRMGPPKFEGRVAVPVGLKGRAEAQDQGASTQNPESVANT	750463	770530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_768733_769309_769575
701928	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_93707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701931	contig_14322_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_116588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGCCACAGCAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
701939	contig_13112_pilon	-	2254	5	Intergenic	novelGene_98845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.899651790446	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACTTTATTGTCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664319	659844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_661385_661433_661890_662445_662567_663701_663781_664261
701945	contig_7512_pilon	-	1973	15	Intergenic	novelGene_153193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	135.848880626036	637	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	69	1019	140730	115200	TRUE	15	CTTCGAGAGTGCCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKIKVLQKLGKADETKDEQFEQCVQNFNKQLTEGTRLQKDLRTYLASVKAMHEASKKLNECLQEVYEPDWPGRDEASKIAENNDLLWIDYHQKLVDQALLTMDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSKLNQNLNDVLISLEKQHGSNTFTIKAQPSDGAPAKGNKSPSPPPDGSPAATPEIRVNHEPEPAGMAAPGATLPKSPSQAHRSLHLPNIPRPRRSSRSRSSACLMTRLSPRSA	140798	105712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_109049_109140_115185_115305_116678_116827_120235_120319_121698_121775_122012_122099_126699_126808_128472_128569_128951_129047_129306_129362_134475_134557_140712
701947	SIRV5	+	249	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	263	156	149	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8464	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
701949	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
701950	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701958	contig_15063_pilon	-	1378	4	Intergenic	novelGene_13205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	782	1156	35891	34829	FALSE	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVLDFAHQVLIGALVDLDGR	36782	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34889_35116_35380_35839_36155_36264
701965	contig_8801_pilon	-	1590	3	Intergenic	novelGene_66301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	65.5	635	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	304	906	547914	545797	FALSE	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549463	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738_547949_549194
701971	contig_10436_pilon	+	1760	7	Intergenic	novelGene_108511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.7333646616265	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	221	937	111967	117322	FALSE	35	GTATCCAGAACCAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSLLALRGFVLLRDSVECEGRSLLKALIKKSALCGEQVHILGCEVSEEEFREGFDFDINNRVVYHNLFRDPLNWSKTEEALPGGPLGALRALCRRTHPGPVTIALDSLSWLLLHLPCTTLCQTLHALSHRDFCPDGSSSVEQVCVLGLLHEELHGPGLVGALSSLAQAEVTLSGMLSQTSASIVYRRPRQRPTRQTQCFSILPDFSLNLQGVLPLESQPHPGPPTTQVSKRDRARE	111658	118145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_111755_111842_112013_112254_112316_112401_112483_114548_114770_116488_116671_117196
701974	contig_11292_pilon	-	2078	5	Intergenic	novelGene_109445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.0654422009392	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	19	1623	329190	325468	TRUE	40	ATCTATCAGGAAATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPASGMKGGNADSWQREKSAIMESPEEPGASMDENYFVNYTFRDRSHSGRVAQGIMKLCLEEELFADVTISVEGREFQLHRLVLSAQSCFFRSMFTSNLKEAHNRVIVLQDVSESVFQLLVDYIYHGTVKLRADELQEIYEVSDMYQLTSLFEECSRFLARTVQVGNCLQVMWLADRHSDPELYTAAKHCAKTHLAQLQGTEEFLHLSHHLLTDIISDGVPSSQNPTEAIEAWINFNKEEREAFAESLRTSLKEIGENVHIYLIGKESSRTHSLAVSLHCAEDDSITVSGQNSLCHQITAACKHGGDLYVVGGSIPRRMWKCNNATVDWEWCAPLPRDRLQHTLVSVPGKDAIYSLGGKTLQDTLSNAVIYYRVGDNVWTETTQLEVAVSGAAGANLNGIIYLLGGEENDLDFFTKPSRLIQCFDTETDKCHVKPYVLPFAGRMHAAVHKDLVFIVAEGDSLVCYNPLLDSFTRLCLPEAWSSAPSLWKIASCNGSIYVFRDRYKKGDANTYKLDPATSAVTVTRGIKVLLTNLQFVLA	329208	324918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_325290_325383_326329_326793_326901_327643_328262_329171
701975	contig_5083_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_151706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCAAAGTTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650241	1651181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1650200_1651200
701976	contig_12622_pilon	-	1402	10	Intergenic	novelGene_5944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2452.04448834835	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	153	800	1590194	1588038	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTARRPTLVRHHRQLRPGPALRLLSHPS	1590943	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583608_1586624_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588509_1588929_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
701977	contig_11417_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_103271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	272	664	290510	290118	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSMHNGTAIVENSVVVPQKTETRTTTCPAVPLLGIYPRDLRAATQTDIYTPMFTAALFTIPHKWKQPKYPSTDEWINKTWYIQRLEYYSARKKNEALIYATTWMELEDIMLSEISQSQKDKYCMTSLI	290781	288944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_288900_290800
701978	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
701985	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
701987	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_18331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
701989	contig_6735_pilon	-	1086	10	Intergenic	novelGene_15704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	852.115146105397	3	17	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	83	583	564868	547309	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKGLLPWLRWPLWGGEG	568280	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542314_545892_545945_546577_546634_547243_547355_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
701990	contig_6589_pilon	-	747	8	Intergenic	novelGene_25864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1158.34188319656	31482	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	34	534	959104	955569	TRUE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQST	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955471_955578_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
701993	contig_1450_pilon	+	1464	13	Intergenic	novelGene_27377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	578.221909295116	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	16	1422	244462	355901	FALSE	85	GCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAFRVGSVPALSPERGELGPTWH	244446	355943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347061_355832
701995	SIRV7	-	269	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69007	4	35788	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
701998	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702000	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_95771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653774	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702001	contig_19459_pilon	-	826	5	Intergenic	novelGene_59830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6898.34712086888	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	149	490	11335	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	12642	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584
702005	contig_21388_pilon	-	877	5	Intergenic	novelGene_136622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	800.075152720043	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28400	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22603_26756_26851_27534_27649_28352
702007	contig_14925_pilon	-	1400	4	Intergenic	novelGene_55267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1014.14178276785	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGCTTGATTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129479	112090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_129436
702017	contig_6589_pilon	-	2018	7	Intergenic	novelGene_26210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	144.231777204455	12	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	290	901	2031410	2029937	TRUE	30	TTACAATCATTGCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAVPPILRQTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGWEFEVTAFYRGRQVFQQAVFCPGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVAGD	2032504	2027933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2029180_2029589_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032429
702022	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_89287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702025	contig_2455_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_119190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTCATCCTCATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160479	158798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_158800_160500
702026	contig_327_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_164318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGAGCGCTGTTAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40235	41940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_327_pilon_+_40200_41900
702032	contig_10437_pilon	-	2341	18	Intergenic	novelGene_38377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_8	14.8365955486442	154	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	22	2169	636504	622563	FALSE	10	GGTACGTGTCTTCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFQTWLRLRLPELHACGLRTVHEAAVPTPPHWLLERLGLFEELWAAQVKRSASKAQEEQRTIKVSLPGGQKVDAVAWNTTPYQLAGQISSALADTAVVAEVNGEPYDLDRPLETDSSIRFLTFDSPEGKAVFWHSSAHVLGAAAEQLLGAVLCRGPSTECGFYHDFFLGKERTVQGSELPVLERICRELAAAAQPFRRLEASRGQLRQLFKDNPFKLRLIEEKVTGPTATVYGCGTSVDLCRGPHLRHTGQIGGLKLLTNSSSLWRSSGAPETLQRVSGISFPSAEGLWAWAAWREEAELRDHRRIGKEQELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYHALMAFIRAEYTRRGFSEVKTPMLFSTKLWEQSGHWEHYREDMFALQPPGPDRPASSPSDHPTLALKPMNCPAHCLMFAHRPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCAPDQLEAEIRGCLDFLRSVYSVLGFSFRLALSTRPPGFLGESRLWDQAEHVLQQALKAFGEPWDLRPGDGAFYGPKIDVHLQDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFGLRYRGQAGALERPVLIHRAVLGSVERMLAVLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGPEQEGYAREVQQSLQAAGLVGDLDADSGLSLSRRVRRAQLAHYNFQFVVGQKEQSRRTVNIRTRDNRRLGERSLTEAVGRLLELQNTRVSNAEEML	636525	622390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_622712_623594_623710_624262_624336_624510_624613_624789_624891_628568_628647_628825_628964_629511_629675_630162_630363_630630_630730_630908_631056_632199_632279_632537_632603_632727_632846_633400_633526_634961_635086_635389_635587_636429
702036	SIRV7	-	341	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33226	2	7	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
702040	SIRV6	+	242	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
702047	contig_11982_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_100262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGTGGCCTTAGCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125679	126205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_125700_126200
702048	contig_7744_pilon	+	1702	5	Intergenic	novelGene_62490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	397.640776958299	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1140	1487	674176	675017	FALSE	0	TTCTTGTTTTGTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCVVFRILPQNVSCPGGISAWNTITSYSDNQTCQGQRNLCNSTGDPEMCPENGSCAPDGPGLLQCLCADGFHGYKCTRQGLFSLIVFFGILGSTTLSISILLWETQRRKAKAS	670972	675232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671897_673753_673826_674032_674321_674595_674694_674912
702049	contig_854_pilon	+	1361	6	Intergenic	novelGene_36269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2912.83797009034	7	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	94	588	543614	562402	TRUE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGGRWVGTWQNFLTAFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543520	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543664_556082_556183_557010_557065_557591_557752_562271_562405_563029
702060	contig_14536_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_69300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATATTAATAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109936	110845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_109900_110800
702061	contig_9482_pilon	-	1283	9	Intergenic	novelGene_44288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.560720187487	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1269	14	1282	1253164	1236137	FALSE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLLVIVTSFVRHVGAVMEQLSGNRSFTCLKTCNFRDTVSIIVCIRSIKGSLNS	1253177	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236290_1238978_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
702062	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
702067	contig_14925_pilon	-	1148	5	Intergenic	novelGene_55212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	1561.35558089757	15	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTTGGAAGAGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53365	25807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_53147
702069	contig_6589_pilon	-	1610	15	Intergenic	novelGene_26257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_11	55.8175325392973	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	123	1550	2233261	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233774	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
702076	contig_4114_pilon	+	2156	11	Intergenic	novelGene_15570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_10	59.7113054621987	6	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	124	789	38602	39912	TRUE	0	TGCTTCCTGTGTGGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRLRAFLQGGQEASDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGAQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKANEQIYGTSSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEIMDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLERKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKSGAFPGARLPNSPCR	38366	44567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_38394_38505_38656_38812_38975_39054_39187_39379_39506_39720_40326_42253_42388_42499_42693_42957_43038_43574_43665_44110
702078	contig_4364_pilon	+	878	3	Intergenic	novelGene_189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267044	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268786_1270331
702080	contig_6102_pilon	-	2312	6	Intergenic	novelGene_32039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	147.048291387557	450	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	195	743	555780	553797	FALSE	40	TTAATCGGTAACAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPPERPHTPRPGSAFASGRSYSPPDLSWSRGAARHASLGPSESGRGPRSLEPLLWWSDPVTLKMKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVPYARSEAHLTELLEEVCDRMKEYGEQIDPSTHRKNYVRVVGRSGESSELDLQGIRIDSDISGTLKFACESIVEEYEDELIEFFSREADNVKDKLCSKRTDLCDHALHISHDEL	556906	552227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554643_555412_555529_555692_555806_556737
702081	contig_11512_pilon	+	372	2	Intergenic	novelGene_43233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	20	370	4011	4584	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSAG	3991	4586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
702082	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_94797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653721	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702088	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	896	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702092	contig_4114_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_15631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCCTCCTTTCCACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475745	477474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_475700_477500
702096	contig_15105_pilon	-	830	5	Intergenic	novelGene_151032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	704.723704724057	35	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	29	646	839916	829338	FALSE	30	TACTTTCACAATTTACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKRRALYNQQRL	839944	829153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829371_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
702097	contig_10311_pilon	-	1781	12	Intergenic	novelGene_50462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	957.915384727441	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	31	522	71526	68720	TRUE	45	AATTGTATATTCACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIMDQNVCFG	71556	65144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65540_65581_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68747_68920_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
702102	contig_17493_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_122193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACACTCTATTGTGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55262	56793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_55300_56800
702104	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_94832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702106	contig_13145_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_116644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCCAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167030	170135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_167000_170100
702112	contig_4103_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_52024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGCGCTTGTTCCTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530213	529476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_529500_530200
702120	contig_17274_pilon	+	1417	14	Intergenic	novelGene_26524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	374.573508953139	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	78	1394	131715	185976	FALSE	5	TGCCTTTTTTCTTTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDPAHTGNKPIWGKHYKIRHKSN	131637	185999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_185908
702122	contig_8661_pilon	-	1176	10	Intergenic	novelGene_137929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	568.981936834944	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	115	861	315977	301399	FALSE	15	GTAGCACTGTTTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316091	301083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_313805_313886_315937
702126	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702128	contig_4364_pilon	+	415	3	Intergenic	novelGene_363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	81	413	1530895	1531306	FALSE	45	CAAGGCCAACAGGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLN	1530444	1531308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
702131	contig_6837_pilon	-	1465	4	Intergenic	novelGene_149799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	76.4475128583149	480	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	117	584	10764	9565	FALSE	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRGKKGAVAEDGKEPKTEPEAKKSKAAAKKNEKEATGEGTVLYEDPPDRTTSPSGKSATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDWVKEEAPDILCLQETKCSDKKLPAELQDLPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSRQCPLKVSYGIGETLLIPHA	11189	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_9787_10310_10499_10706_10833_11141
702133	contig_1996_pilon	-	1531	7	Intergenic	novelGene_131903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	558	944	254222	251586	FALSE	15	GTGTTTAGAACGGCTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMGRSSLTLSMASGQSRRNLRQNSSMELISEPWTCRKAALYWTRSREQAAVYSLGVTQSLMYAFSRACIVFTTAKSSAMLSYLSRSRAFLYSFTSCTAPATLTSQARSRWDPMEHAGGSGGAAEISA	255564	250998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_251682_252336_252377_252584_252677_253943_254050_254169_254271_254881_255146_255319
702138	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702143	contig_10451_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_138316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	433	924	255595	255104	NA	80	AGATTAAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGMWNVQSMNLGKLEVIKNEMERININILGISELKWASGRFESDNHMVCYAGNDKLKRNGITFIVKKNISGSVLKYSTVSDRIIPMSLQGRPVNPTIQIYAPTIKAKDEETGDFYQLLQSLEKDIMLGKVEGQRKRGRLSTRWIDTVTATMD	256027	254515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_254500_256000
702144	contig_4812_pilon	-	789	6	Intergenic	novelGene_103677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6286.47363789907	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	114	635	82626	79235	FALSE	45	TTTTTCCTTAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQKFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82739	79080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80342_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
702155	contig_9706_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_20869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2491	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
702157	SIRV5	-	347	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGCTCTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
702162	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702163	contig_7410_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_106041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAGAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37836	35517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_35500_37800
702164	contig_7457_pilon	-	2400	9	Intergenic	novelGene_31319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	67.547090055753	340	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	96	677	267206	263970	FALSE	20	ACAGACCCTCGTGCGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANFFPKKLLELDSFLKEPILNIHDLTQIHSDMNLPVPDPILLTNSHDGLDGPTYKKRRLDECEEAFQGTKVFVMPNGMLKSNQQLVDIIEKVKPEIRLLIEKCNTVKMWVQLLIPRIEDGNNFGVSIQEETVAELRTVESEAASYLDQISRYYITRAKLVSKIAKYPHVEDYRRTVTEIDEKEYISLRLIISELRNQYVTLHDMILKNIEKIKRPRSSNAETLY	267558	262246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_264051_264699_264787_264908_264964_265061_265130_265265_265335_265570_265684_266212_266262_267146_267252_267508
702168	contig_11702_pilon	+	1047	6	Intergenic	novelGene_141988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_1	224.948349627198	6039	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	206	727	381109	384186	FALSE	5	TCTCTGCTGTGTTCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAPLGALALLLLSGLSCCSAEACAEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	380903	384506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382657_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
702174	contig_16122_pilon	+	2213	19	Intergenic	novelGene_134516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	47.7423641364075	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	387	1490	142082	158453	TRUE	20	CTCTAATGTAGTATGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDVDLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGSFPNCYGIGRCAKMSHELWRKLEEEEDGETKGRRPEIGHVFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGLVDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDRSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGFLSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSPRGHPHSSGEQSEQAGDRQGCRKDY	141695	160280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154264_154339_154658_154746_154915_155001_157750_157818_158440_158515_159013_159116_159311_159388_159494_159612_159913
702179	contig_5981_pilon	-	2162	3	Intergenic	novelGene_35511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	63.5	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	801	1250	51396	50947	TRUE	25	CTAAACATTTTGCAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	53072	49979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_50596_50650_52013_52888
702187	contig_6533_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_114650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1365	1730	192967	192602	NA	40	TAGTGGAGACTTGATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHIEILTKYIQTALNDSVRGLQEINTEIAMMRKVVLQNRMALDILNVVQGGTCAIIKSDCCVYIPDNSANITPYVNHMQHVVSCLNDPVPSLTDIIRNWFSSWVDSGKNCYFILEILYSS	194331	192201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_192200_194300
702190	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	880	-21	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
702194	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
702195	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
702196	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_18824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCCAGAACTACAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
702200	contig_3846_pilon	-	608	5	Intergenic	novelGene_137140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	43	junction_4	390.260409854753	675	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTATTAATTCACCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160231	148768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_149077_152512_152588_153913_153985_158531_158609_160154
702209	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
702212	contig_10500_pilon	+	1819	5	Intergenic	novelGene_41293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAACTAGCAGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632113	1640221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637065_1639868
702220	contig_7870_pilon	-	3110	1	Intergenic	novelGene_108978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTTCCTATTTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397791	394681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_394700_397800
702221	contig_5495_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_157666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAACCATCTGTACAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516118	517126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_516100_517100
702237	contig_1786_pilon	-	2282	9	Intergenic	novelGene_142596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_4	184.943910416104	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	91	1188	79935	55555	FALSE	10	GGTGTGTGGTGATGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRRVSRLVGLSGPESAVASEGPWTWTDGAMPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGR	80025	54460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_68182_68321_79932
702239	contig_4782_pilon	+	1858	8	Intergenic	novelGene_73593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	378.416248518555	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	161	1012	64331	90707	FALSE	40	AAAGTTAATTTCTTTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVEENNFEGRESRSQSKSPTGTPARVKSESRSGSRSPSRVSKHSESHSRSRSKSRSRSRRHSHRRYTRSRSHSHSHRRRSRSRSYTPEYRRRRSRSHSPMSNRRRHTGSRANPDPNTCLGVFGLSLYTTERDLREVFSRYGPLSGVNVVYDQRTGRSRGFAFVYFERIDDSKEAMERANGMELDGRRIRVDYSITKRAHTPTPGIYMGRPTHSGGGGGGGGGGGGGGGGGRRRDSYYDRGYDRGYDRYEDYDYRYRRRSPSPYYSRYRSRSRSRSYSPRRY	64170	91553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_64367_76086_76221_77896_78063_83391_83581_88900_89017_89974_90107_90471_90540_90696
702241	contig_6914_pilon	-	1877	10	Intergenic	novelGene_151734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGAAAGATTCTGCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130504	124101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_124334_126488_126702_126880_127059_127510_127586_127713_127930_128008_128095_128248_128357_128470_128548_128669_128744_129886
702242	contig_2069_pilon	-	986	2	Intergenic	novelGene_23525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGCATTGTGTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509854	1508369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1509212_1509710
702243	contig_5316_pilon	+	1566	4	Intergenic	novelGene_61261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_3	75.5115885146114	9	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	762	1454	540895	550408	FALSE	40	AAAAAAGTCAGGTACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	540133	550520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_541000_543405_543536_544132_544269_550086
702254	contig_14322_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_116589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGCCACAGCAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
702258	contig_6546_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_140989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4615.59099381891	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597666	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598483_599163_599365_599577
702262	contig_14519_pilon	-	2018	9	Intergenic	novelGene_66824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_7	138.02666182662	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	498	947	280959	272654	FALSE	20	TTGACTCACTATTTTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDVKPLGVIWGKFSEFYSKKNTIMFDDIGRNFLMNPQNGLKIRPFMKAHLNRDKDKELLKLTQYLKEIAKLDDFLELNHKYWER	287163	271582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_283632_283842_287112
702263	contig_14215_pilon	-	990	2	Intergenic	novelGene_59351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACACATTTCTTTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25968	24479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_24662_25160
702264	contig_7744_pilon	+	1850	14	Intergenic	novelGene_62522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	85.0826260433813	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	123	1460	825487	830740	FALSE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825364	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830494_830537_830626
702266	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
702267	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702269	contig_11072_pilon	+	2084	5	Intergenic	novelGene_140176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	29.8778764305631	249	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	132	599	51022	67946	FALSE	10	TACTTGATTTTTCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRNPPPQEYESDDESYEVLDLTEYARRHHWWNRVFGHSSGPMVEKYSVATQIVMGGVTGWCAGFLFQKVGKLAATAVGGGFLLLQLASHSGYVQIDWKRVEKDVNKAKRQIKKRANKAAPEINNIIEEATEFIKQNIVISSGFVGGFLLGLAS	50890	69431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11072_pilon_+_51050_51699_51857_55113_55190_66272_66402_67868
702271	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
702275	contig_8587_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_159105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATGCAATTGTAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113576	115947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_113600_115900
702276	contig_19825_pilon	-	2408	4	Intergenic	novelGene_59684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	220.001515146298	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	26	367	70117	19838	TRUE	35	AACTTTTACAATCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRWFWCVSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCNNVCGWYWTCCIILQLDALYFQI	70142	15383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_46551_46722_70015
702278	contig_18184_pilon	+	2389	4	Intergenic	novelGene_123848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	57.5866496874251	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1872	518	2389	48717	62196	FALSE	20	GAGTGTGGGAAGTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGDSPSLVAGGLFIIHTGGKTYQCKEYIETFSEVPSFDIYHRLYSKEKSVTCSECGKGFRYISGLRNHHRVHMGKNYYMLDGCGKEVSQSSHLQTYLNAHTLEKPHKCEECGKRFRHRATLNVHYKGHTGVKPYNCEECGRGFMYPSHLREHQRIHTGERPFRCDTCGKNFHRRAALNTHCMVHTGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSIRSNLQTHRRIHTGEKSYNCEECGKVFRQAVHLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHSKEKPYKCEECGKYFGTRQNLQVHFRIHKGEKSYNCV	37542	62196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37997_48653_48732_55969_56097_60466
702279	contig_1532_pilon	-	1899	7	Intergenic	novelGene_37380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1486.2470259759	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	497	1150	18064	13113	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32210	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27291_27379_28825_28964_29444_29505_32049
702283	contig_11130_pilon	-	2487	5	Intergenic	novelGene_53093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	729	junction_4	827.675170281192	25	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTCATGTTGAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
702285	contig_854_pilon	-	1336	7	Intergenic	novelGene_36289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGCGGTGGTGATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563793	543582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543633_545931_545993_556080_556164_556974_557063_557589_557751_562270_562407_563036
702286	contig_14322_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_116152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	249	305	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671357	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
702294	contig_5928_pilon	+	2501	20	Intergenic	novelGene_40378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	32.4873723603631	133	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	16	2154	252024	340108	FALSE	25	AATTGGTTTAGCAGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSVSKGCFVFKPNFKKRKISVPVEDYFNKGKSVSEDSKLRFETYQLIWQQMKSETEQLQEELNKNLFDSLIEFLQKSHSGFQKNSTDWSCQIKLREIPTAALVLGVNVTDHDLTFRSLTEALQNNVTPYVVSLQAKDCPDVKHFLQKLASQLMDCCVDVESKEEESVQVTQKKTYYSVGFLSSWYRNVTQKTDPKLPSKKRTLSSEWQCPPVVLILKDMESFTTKVLQDFIIIISQHLHEFPLILIFGIATSPIIIHRLLPHAVSSLLCIELFQSVSCKEHLTIVLDKLLLTTQFPFKLSEKVLQVLTNIFLYHDFSIQNFIKGLQLSLLEHFYSQPLSVLCCNLPEAKRRINFLSHVQCENIRRLPSFRRYVENQASEKQVALLTNERFLKEETQSLLENLHVYHTNYFLVLRCLHKFTSSLPKYPLGRQIRELYCTCLEKNIWDSEEYASALQLLRMLAKDELMIILQKCLDVFKSSSGKQFGSTAKRIEEFLAQFQSLDAEAKEEEDASGSQPKGLQKTDLYHLQKSLLEMKELRRTSKKQTKFEVLREKVVNFIDSLVREYLLPPETQPLHEVVYFSAAHTLREHLNAAPRIALHTALNNPYYYLKNEALKSEEDCIPNIAPDICIAYKLHLECSRLINLVDWSEAFATVVTAAEMNANSTVSEEMNEIIHARFIRAVSELELLGFIKPTKQKTDHVARLTWGGC	252008	340455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_252048_257799_257855_269044_269143_270201_270347_273365_273471_274968_275121_276355_276490_278851_279012_280227_280342_283038_283173_283668_283733_296735_296853_297697_297778_321799_321934_325165_325246_326408_326510_336413_336556_338271_338389_339350_339428_340002
702298	contig_1516_pilon	+	1408	8	Intergenic	novelGene_50001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1372.74903692093	30	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	313	1407	347241	363729	FALSE	5	GCACCTGTTTCCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIDLLPRPLSLSHSHLVVCALGTCVSCTPLSCRCRQTLHPPPSIFPTTAATSRPVAIEPTCMSINNS	336251	363730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356085_363532
702303	contig_7870_pilon	-	1551	6	Intergenic	novelGene_108939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_5	499.441287840723	211	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	31	765	497901	295191	FALSE	70	GGGAAAAAAAAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFSRSQQYQEMSSFYSQILSSSHWIGSTLSKMQLTDCKIIRPNCYFQPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAISKYLTYRSSWWNDLALWNY	497931	294404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496626_497821
702307	contig_5684_pilon	+	1818	5	Intergenic	novelGene_81073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	27.0832051279017	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	876	1376	446539	447039	TRUE	20	AGGGTTGGCAAAGTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	445663	462693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_447058_458264_458374_459116_459218_461577_461700_462601
702311	contig_15744_pilon	+	918	5	Intergenic	novelGene_83607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	1543.5	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	390	704	152344	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149986	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_150265_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
702317	contig_401_pilon	-	2120	14	Intergenic	novelGene_42937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_3	130.264319364162	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	208	1848	2248554	2198457	TRUE	25	TCCTATATTACACCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRKFLYHHNSTYSDSSGFTEEPNSRVFSKEDKTLLPLPPRMTLMR	2262054	2196678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2196916_2198421_2198461_2199247_2199289_2225535_2225622_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
702319	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
702324	contig_7378_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_120267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAATAACCTAGGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483429	481534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_481500_483400
702327	contig_13633_pilon	+	1735	12	Intergenic	novelGene_15323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	422.934983182995	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	342	1436	22853	49142	FALSE	20	TCTCTGATTCTGTGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLRYFYSHLLVFQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	20254	49441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23766_28324_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
702330	contig_18145_pilon	+	1939	9	Intergenic	novelGene_37365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	618.372258433381	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	11	1036	96213	98857	TRUE	30	AAAATGGAGTCTGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKMLIWNSWLR	96202	101261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98525_98826_98983_100326_100482_100638
702334	contig_11978_pilon	-	598	5	Intergenic	novelGene_63098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGGGGTCCAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831970	1829157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1829187_1829999_1830121_1830661_1830785_1831161_1831272_1831755
702337	contig_11386_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_82775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	475.936802527394	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	395	1054	17940	31994	TRUE	25	TTAAAGCCACTCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	16559	32447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_16859_17844_18037_19625_19980_20816_21022_31990_32183_32370
702338	contig_14530_pilon	-	1869	7	Intergenic	novelGene_108446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35822	13197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_14027_23779_23910_24255_24400_26701_26783_33246_33354_35158_35298_35383
702340	contig_3233_pilon	+	1238	10	Intergenic	novelGene_56573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	275.447156097988	1	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	663	1136	743801	747909	FALSE	55	CACATAGAAAATAAACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738744	748011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743607_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
702343	contig_6919_pilon	+	2305	4	Intergenic	novelGene_163991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_2	7.31816613336672	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	647	2074	70727	72708	FALSE	10	TTTTGTTCTTCAGTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGGLILSDVHPFSCEAVPGYKCTGYRSQDKTFHVEGALNHIFTRSLPFECFQPRIFRIRLGDQWFSFPEPEALTGKLNRGFLEAPSCHPIRTINEKLIAELGKAFSLKRLKCPFPLLSQGDTSVLTSWNYDIVSAAFWISLLEDNSNSESLTDGTTQDMEEFLLSFSELSLPGDPERDDKEEAHEGIYGQAKVCLRPSLLVHVQTVIQAPDFLPGSLYILSGPVFKKCLILPFTMPAFHETLLILEFNQNLKDGCLQSLLDHLKHILDSLLTQTLLEGSKLSSSVEFVLQQNGKDYMISVKSHNFDPDGAKDLIIGSVTTSTISIIHKERCFVFVSMNLDLLAMLVCGISDWRMLWTSDNRFLKNFVSGKIEPFKSYSLYPPCYAHDISFWLDEKKGFDELEFHTVAREVSQDTVISIQFLSRFQHPKTEQVSLCYRLIYQSCDKALTKQQVASMQSQFRKEIQQRLRVIPR	68836	72939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_69365_70608_70813_70994_71154_71525
702344	contig_7963_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_58574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	146.391598119564	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	515	997	255965	257509	FALSE	10	TGAGTCTGTGTTGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254699	257748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_256024_256447_256578_256972_257178_257420
702348	contig_8291_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_99944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTAAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205461	207431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_205500_207400
702351	contig_9871_pilon	+	2447	7	Intergenic	novelGene_75619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	161	junction_1	245.605826930515	719	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	216	1187	331361	351454	FALSE	20	CAGTCTCAATTTGGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK	331145	352714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364
702352	contig_10003_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_88227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607738	609986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_607700_610000
702353	contig_7707_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_72226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGACATCTTTAGCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868123	865583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_865600_868100
702354	contig_19459_pilon	-	1292	8	Intergenic	novelGene_59841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	2	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	171	956	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19134	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
702362	contig_21027_pilon	+	1198	4	Intergenic	novelGene_127570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	649.644176111474	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	30	497	1763	8128	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILKCPLSHLISLILLLFHSEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLENGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1733	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_5261_6365_6482_7981
702365	contig_18272_pilon	-	2090	8	Intergenic	novelGene_6996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.700741088454	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	163	852	262678	122634	TRUE	70	GTAAATAAAAAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSNSK	262840	121287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122131_122238_122644_128529_128600_157860_157927_168460_168669_172689_172796_184338_184551_262660
702369	contig_15410_pilon	-	1639	11	Intergenic	novelGene_130566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_10	56.0531890261384	583	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	213	1295	57724	54277	FALSE	35	TAAAAGGCCCTTAATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59283	53932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57564_57669_57870_59216
702373	contig_854_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_36129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	623	1195	471014	470442	NA	0	CCTGGGGCTCTGTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	471636	470020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470000_471600
702376	contig_19899_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_102528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATACTTGCTTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168548	169309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_168500_169300
702379	contig_8617_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_73418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62581	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
702383	contig_14202_pilon	-	366	4	Intergenic	novelGene_157137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3227	junction_3	857.886679903328	51706	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	29	307	88580	86210	FALSE	20	TTACCTTGATTTGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSDLVCGAMAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSCMKTVAGGAWTYNTTSAVTVKSAIRRLKELKDQ	88608	86150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084_88214_88577
702386	contig_5649_pilon	-	1796	7	Intergenic	novelGene_82461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.494326104143	47	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	97	1011	1573807	1566511	TRUE	15	GTGGAGACTCCTGTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEDVHCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYL	1573903	1563534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1566490_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
702387	contig_12250_pilon	-	1385	8	Intergenic	novelGene_80697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	265.815648869049	5	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401310	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399366_399445_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400562_401200
702388	contig_11417_pilon	+	2802	8	Intergenic	novelGene_103279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.7627475439071	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	9	1127	350502	360844	FALSE	20	TCGTTTGACTGACCGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMEASEDWLVKSLRLYGDFHAFDLSGATRVLEWIDDKGVFVAGYESLKKNEILHLILPLRLSVKENQGLFPERDFKVCHGGFSDKPVFDLKHVPETRLLVTSGRPGCSLQVWQIAEDSDVIKAVSTIAVHEEEGSLWPRMAVFFSVAPEVLHGTRLSSLRITDLESQKTTYTSGVGDSEVLSSLQVLGADTFAFCCTSGRLGLVDIRQKWAPSENLGSGPRSGGGRWCAEVRGMGQYPGPSIASLGSNGQLCLLDPRDLCHPVSSVQCPVSTPSPDSELLRVTWAPILDNCLAISGFDGTVQIYDVTSWSGVGSQVEPLFTHRGHIFLDANELDTAPLVTTHTWHPCKPRTLLSAANDASLHVWDWVDLRASC	350493	362519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_350543_351102_351171_351484_351574_352706_352796_353409_353475_358398_358564_358920_359287_360608
702389	contig_19851_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_29880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1558	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAAGGGACACAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	54059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_54144_55648_55751_55838_55880_56001
702394	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_94287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702396	contig_4686_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_118502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGGAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387348	386365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_386400_387300
702398	contig_16411_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_77285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGGAAACGATTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43700	42686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_42700_43700
702399	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702402	contig_5125_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_43461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGGACAGAGGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	58617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_58600_60000
702404	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	96	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702405	contig_960_pilon	-	2065	1	Intergenic	novelGene_108254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGGTTTGAAGAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564372	562307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_562300_564400
702417	contig_6958_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_69955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	924	1280	178003	178359	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYYCWHNSSGRGSGWGVFPKKIVRKSRSRAAVGEGLFLLYVVRGGGRRTQARAPPSMGQHQVSGLGCHSTRPANTQALGASGGGDVSGPPGLAGLVLKSLSKSEENLRVSWGPSENV	177079	178415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_177100_178400
702418	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_98070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702419	contig_5602_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_132988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCCCTACCAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17052	18018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_17100_18000
702423	contig_3382_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_124060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245085	244375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_244400_245100
702426	contig_7426_pilon	-	2399	16	Intergenic	novelGene_27469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	82.6111103638945	68	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	18	1730	668289	641055	TRUE	30	AAGTTTCCAGACTAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPGWMMAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAEVQACVPRRCHPHPSHLPCN	668306	637238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641012_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
702431	contig_4071_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_151882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237467	235464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_235500_237500
702433	contig_4103_pilon	-	1229	4	Intergenic	novelGene_51878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	563	junction_3	129.416639836872	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	59	430	43906	40734	FALSE	90	AGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	43964	39934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_41930_42374_42449_43898
702434	contig_13894_pilon	-	1190	9	Intergenic	novelGene_62147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGGTGCCGGCTGCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528174	521651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_521769_522677_522844_523486_523623_524835_525023_525635_525797_526475_526577_526847_526946_527457_527578_528070
702435	contig_7428_pilon	-	2213	13	Intergenic	novelGene_77742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	175.848814484362	1	88	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	942	1601	440620	438797	FALSE	45	TCCAAAGATTACTGCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAAARGLTLLFASGDSGAGCWSVSGRHQFRPSFPASSPYVTTVGGTSFQNPFRITNEIVDYISGGGFSNVFPRPSYQEEAVSQFLKSSPHLPPSSYFNASGRAYPDVAALSDGYWVVSNSVPIPWVSGTSASTPVFGGLLSLINEHRILNGHPPLGFLNPRLYQQHGAGLFDVTHGCHESCLNEEVQGQGFCSGPGWDPVTGWGTPNFPALLKTLLNT	443860	438184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440337_440577_440767_441021_441115_441303_441483_441615_441744_441950_442102_443221_443359_443641_443714_443825
702436	contig_15596_pilon	+	2657	1	Intergenic	novelGene_139547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198101	200758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_198100_200800
702439	contig_4125_pilon	+	1498	8	Intergenic	novelGene_25203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	221.487089041878	1184	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	91	681	1510873	1518074	TRUE	25	ACCTTTTACTAAGTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505628	1518931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984_1518447_1518486
702449	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702450	contig_10940_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_49214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869785	867669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_867700_869800
702455	contig_8683_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_150269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCCTGCCCCTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709949	707846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_707800_709900
702459	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_96984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657496	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657496	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702468	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_97055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702471	contig_5954_pilon	-	972	5	Intergenic	novelGene_28816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	657	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTCCTCCCTCCTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1557201	1530515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1530586_1530812_1530894_1542641_1542743_1547933_1548202_1556749
702474	contig_14924_pilon	+	1479	7	Intergenic	novelGene_104150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	45.5902645552998	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	65	1063	44129	54484	FALSE	35	GTGGTGTCAAAATAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSRWLILGPALSQVGKVKSVRIFAGSRILLGSLEAWGLGPLSSGTSGGGLKSSAVDQPLEERCWTCCCRHWPLGTRRRQGRGRTLLWVLLRARNFTWYLMVSSGIRLEAQRLFCLTTPFYRHHFNVRGRITSGCLGVLPCHLLWTTGPSVPS	44064	54900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46814_54032
702476	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702479	contig_12019_pilon	+	750	3	Intergenic	novelGene_87675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	108	431	5225	8336	FALSE	55	TAAACATGAAGTGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5117	8655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
702482	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702488	contig_12479_pilon	-	3518	1	Intergenic	novelGene_56882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTGTTTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541686	538168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_538200_541700
702490	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
702497	contig_6630_pilon	+	1368	4	Intergenic	novelGene_30720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.501788255231	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTGTTGAAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721560	731973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_721739_726527_726597_730770_730937_731018
702507	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	80	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
702508	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702511	contig_4413_pilon	+	1426	8	Intergenic	novelGene_116985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	111.09032912225	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	560	1147	129556	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	126052	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126481_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
702514	contig_4426_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_15455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAACATATTCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899728	901433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_899700_901400
702515	contig_9646_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_117434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	746	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACATAAACAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182432	180658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_180700_182400
702516	contig_10569_pilon	-	2697	1	Intergenic	novelGene_44082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGATATTTTGTATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341772	339075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_339100_341800
702517	contig_15596_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_139521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATTTCCTTCACCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92196	94025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_92200_94000
702525	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702532	contig_5039_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_64826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAAGGCCTCGAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257600	258951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_257600_259000
702534	contig_14807_pilon	-	720	8	Intergenic	novelGene_124672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6927.56527009516	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	40	672	39773	37198	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYTVPLDQCPPVI	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37235_37295_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
702535	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702537	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702538	contig_19990_pilon	+	1818	9	Intergenic	novelGene_30752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	103.110301982877	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	247	888	59343	76077	TRUE	20	TCCCCAGCTCTTAGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNATPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEDLLSQLRDIRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINIKTGNLNAAIIKNGSSTWRKARKTL	39525	82801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_39634_59204_59376_62749_62813_64728_64826_64991_65069_69960_70219_75963_76134_80027_80215_82114
702539	contig_11338_pilon	+	1678	10	Intergenic	novelGene_6161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	574.680780955828	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1527	150	1676	2634	13595	FALSE	35	TTCTCTATCAAAAGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMNVPWSKTRVTTPPTASTPWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKMWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCILQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIK	745	13597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9951_13275
702545	contig_8674_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_102933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACTCAGATTAGTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452172	449953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_450000_452200
702546	contig_18869_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_56209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73741	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
702547	contig_16098_pilon	+	1620	9	Intergenic	novelGene_45788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACGCCGCCTCTCCTCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31099	36309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_31344_31502_31589_31682_32173_34565_34660_34733_34805_34989_35072_35214_35304_35567_35618_35895
702548	scaffold_13505_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_111578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1236	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAGAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620824	622828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_620800_622800
702549	contig_5732_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_119593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCCACCCAGCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290837	290117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_290100_290800
702560	contig_14191_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_153766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGAAGGAAAGACTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41150	42012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_41200_42000
702566	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_94823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702568	contig_7963_pilon	+	1122	6	Intergenic	novelGene_58500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	181.16622201724	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	97	831	145917	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALRLPSGEEVWGSGSAGLVAPSPLSGVKIWIMSRTRELRCYSCYNFYGYCPTPGPPLKLLPQCGGMACKTTRSCTPCTARTELFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145820	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148058_148098_148271_148907_149187_149419_149546_149948
702571	contig_12327_pilon	+	1593	6	Intergenic	novelGene_140625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	774.105264159856	6	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	105	650	168930	171003	TRUE	15	CATGAGCTTTTCAGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148620	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841_171087_171495
702572	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
702573	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
702575	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
702576	contig_9668_pilon	-	1676	13	Intergenic	novelGene_58073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_12	213.163669512419	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	170	1675	79257	44375	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLSSTVQPQVTVPLSHLINAFHSPKNTPISVSVSVPQNQHRDVVTEHDAPSSEPVLNLRDLGLSELKIGQLDQLVDSLLPGFFKGKKISSHWRTSHVSAQSFFENKYGYLDIFSTLRSSCLYRQHPRTLQSICSDLQYWPVLIQSRGFKTLKSRTRRLQSTSERLAETQHIAPSFVKGFLLRDRGSDVESLDKLMKTKNIPEAHQDAFKTGFAEGFLKAQALTQKTNDSLRRTRLFLLVLLLLGIYGLLKNPFLSVRFRTTTGLDSAVDPVQMKNVTFEHVKGVEEAKQELQEVVEFLKNPQKFTVLGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVAGEADVPFYYASGSEFDEMFVGVGASRIRNLFREAKANAPCVIFIDELDSVGGKRIESPMHPYSRQTINQLLAEMDGFKPNEGVIIIGATNFPEALDNALIRPGRFDMQVTVPRPDVKGRTEILKWYLNKIKFDQCKSNFTVQTLLLSKISIHPVCGPYLINVSFICP	79426	44373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_44586_45889_45953_47221_47355_48099_48253_50599_50691_58436_58520_60703_60788_61207_61359_63113_63224_64448_64548_67109_67273_72039_72172_79224
702577	contig_6710_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_97962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653413	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
702581	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702582	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702583	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702584	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_90572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702585	contig_10689_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_118635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAGAAATCAGAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59004	56729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_56700_59000
702590	contig_5671_pilon	+	926	5	Intergenic	novelGene_79423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1916.01500516045	25	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	243	368	392910	531238	FALSE	30	CATATATATTTTATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDDQNGAGERGRATVNGDAGQCSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368828	531796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368895_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
702593	contig_15327_pilon	-	695	4	Intergenic	novelGene_70698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	130	540	901528	900904	FALSE	25	ACAGACCTCAGTGATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902157	900748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
702605	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_97080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702606	contig_4426_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_15361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	303	746	85788	85345	NA	20	TTATTTTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDAGNQSEWGFEEAKGGDQQISKVKFGLYKHQKKLVCSFLLSSGPQSLWSGKYFTIHRLLLKSGNFGLLKFLKNGPSDALRMSCSLLSPLSPCGPSCKPHTPEILLLTQCGGALVAQWLITQLLTKWVLVPTHQPLAGRCGSLLP	86090	85234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_85200_86100
702609	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_91994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657184	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702610	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702613	contig_4223_pilon	-	3118	17	Intergenic	novelGene_117269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	95	junction_9	103.680096932825	97	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	85	1983	302064	156597	FALSE	60	TCTGAAAAAAAATTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQPRSLRRGSRSPPTSPEPREGETLSPGMQREEGFNTKMADGPDEYDTEAGCVPVLHPEEIKPQSHYNHGYGEPVGRKTHIDDYSTWDIVKATQYGIYERCRELVEAGYDVRQPDKENVTLLHWAAINNRIDLVKYYISKGAIVDQLGGDLNSTPLHWATRQGHLSMVVQLMKYGADPSLIDGEGCSCIHLAAQFGHTSIVAYLIAKGQDVDMMDQNGMTPLMWAAYRTHSVDPTRLLLTFNVSVNLGDKYHKNTALHWAVLAGNTTVISLLLEAGANVDAQNIKGESALDLAKQRKNVWMINHLQEARQAKGYDNPSFLRKLKADKEFRQKVMLGTPFLVIWLVGFIADLNIDSWLIKGLMYGGVWATVQFLSKSFFDHSMHSALPLGIYLATKFWMYVTWFFWFWNDLNFLFIHLPFLANSVALFYNFGKSWKSDPGIIKATEEQKKKTIVELAETGSLDLSIFCSTCLIRKPVRSKHCGVCNRCIAKFDHHCPWVGNCVGAGNHRYFMGYLFFLLFMICWMIYGCISYWGLHCETTYTKDGFWTYITQIATCSPWMFWMFLNSVFHFMWVAVLLMCQMYQISCLGITTNERMNARRYKHFKVTTTSIESPFNHGCVRNIIDFFEFRCCGLFRPVIVDWTRQYTIEYDQISGSGYQLV	302148	155461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_156736_158208_158304_159999_160158_161437_161522_162387_162482_165303_165367_166934_167058_182559_182663_184028_184172_193631_193758_200478_200642_201495_201561_210425_210571_211161_211240_236437_236561_242200_242305_301971
702615	SIRV6	+	1029	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	33	-8	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	50	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	125	378	175	552	1733	2794	TRUE	40	TGACTATGGGGAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEVWDTSWDVSLGLWD	1170	11322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2750_2829_3106_3165_10724_10819_11031
702618	contig_14814_pilon	+	256	2	Intergenic	novelGene_137707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTTGCTACTGAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279380	280776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_280661
702619	contig_6831_pilon	+	1401	5	Intergenic	novelGene_165142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	8.78564169540279	122	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	46	441	29871	52927	TRUE	15	TCCTGTGGTCGTTCAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAQLERKREEKRVRKMKELEKQKRIERNQQLEALAKEHYGRVVLRKKGLEPWKRLRMQSKQNIQVAKEHHCLAIQRKCLLAWFWCSQDSLARKAAWADRLYSQILQRRAIRSWLQENFQDHVPDMEAVCKMYERGEIERRKESAAP	29825	53988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_+_29874_43438_43583_48317_48471_52831_53166_53266
702620	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
702629	contig_18869_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_56053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73567	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
702631	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_89246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702633	contig_10019_pilon	-	1646	3	Intergenic	novelGene_86681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	730	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTCTGACTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261681	258353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356_261418_261595
702636	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_97078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653855	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702637	contig_12790_pilon	+	1670	9	Intergenic	novelGene_35175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	25.5633404507314	18	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	152	1300	8971	15437	FALSE	20	ACAGTGTTTGGAATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAEPESRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGETGIGKSTLMNTLFNTTFETEEASHHEECVRLRPQTYDLQESNVQLKLTIVDAVGFGDQINKDESYRPIVDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNAHLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHSRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVKETELELKEKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQAFHATSQQPLRKDKDKKKASGWSSIYSVTIP	7523	15807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_7646_8941_9138_9488_9676_10725_10888_11495_11593_11832_12002_12213_12347_12489_12681_15394
702638	contig_9471_pilon	-	1748	5	Intergenic	novelGene_21722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	223.844812314246	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	276	1004	153444	147722	FALSE	15	TTAACCTCTCTATGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGVSLEQLCGIAA	164972	146977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_164747
702649	contig_2783_pilon	+	1694	8	Intergenic	novelGene_119655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	51.0122034219184	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	67	1023	736910	767347	TRUE	20	GGATATTCTTCTCTGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLGAPSQFVDVDTLPSWSDSCEDELNSSDAEAEKLQEDAIRSPFPYNKDINGKVVLWKGDVAILNCTAIVNTSNESLTDKNPVSESIFMLAGPDLKEDLQKLKGCRTGEAKLTKGFNLAARFIIHTVGPKYKSRYRTAAESSLYSCYRNVLQLAKEQSMSSVGFCVINSAKRGYPLEDATHIALRTVRRFLEIHGENIEKVVFAVSELEQATYQKLLPLYFPRSLKEESRSLPHLPTDIGNAEGEPVVPERQIRISEKPGAPEDHQEEEDEGLRVDLSFIGSHAFARMEGDIDKQRRLILQGQLSEAALQKQHQRK	736843	769451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_737086_738327_738468_756019_756174_756672_756762_762009_762087_764256_764417_767186_767597_769029
702652	contig_4364_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_3408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
702655	contig_15152_pilon	-	2067	7	Intergenic	novelGene_126969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	472.912870763033	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	786	1433	204362	203318	FALSE	30	TTGTACTGTTAACTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	206532	202683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512_204638_204985_205254_205925_206075_206295
702656	contig_7996_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_165159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1490	1837	313283	312936	NA	35	CACCCTCACTTGTGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGHRFNSVLKSLLRFTLQPKIGQVHKTNNNTHSSTMYTRLTGHSGPGARMRRQEGAGKLDECKSGEPKVKRGRVLTCHGVVNQCHTTICVFYNEKLICSVNHYLKHNKQTKNL	314772	312574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_312600_314800
702660	contig_7202_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_17707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGTTGGTCACGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
702670	contig_10479_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_147116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGCAATTTATCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155221	157253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_155200_157300
702674	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
702675	contig_9516_pilon	-	1908	16	Intergenic	novelGene_106171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	104.091284724301	1	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	16	1635	913190	878376	TRUE	35	AAAATCTGTTCTCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVAEMFWCRALAASALRQKLTPLVRTVCVRSPRQRNRLPGNLFQRWHVPLELQMTRQMASSGASGGKIDNSVLVLIVGLSTIGAGAYAYKTIKDDKKRYNERISGLGLTPEEKQKRATTPASEGEPVPQVRVPSHVPFLLIGGGTAAFAAARSIRARDPGARVLIVSEDPELPYMRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERRCPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVAGDAACFYDIKLGRRRVEHHDHAVVSGRLAGENMTGAAKPYWHQSMFWSDLGPDVGYEAIGLVDSSLPTVGVFAKATAQDNPKSATEQSGTKWWWGSCCGTSLTECQ	913205	877763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878029_878367_878432_880053_880179_881621_881765_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897045_898245_898381_898505_898631_899602_899703_905481_905625_913084
702677	contig_401_pilon	-	2712	11	Intergenic	novelGene_42942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_7	124.986399260079	231	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	191	1909	2248554	2225413	FALSE	40	GGGAATTAAGAGTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRKFLYHHNSTYSDSSGFTEEPNSRVFSKEDVLPPTSSSCSLALQTPEFSGTKVEWYSGKKAGWRDLESTS	2262037	2224609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2225622_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
702679	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
702682	contig_17936_pilon	-	1808	6	Intergenic	novelGene_29978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_3	78.0076919284246	607	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	198	656	167355	161377	FALSE	35	TGTAGTCAAGGTATAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSAPVYSGLVLSRRQSDPRLRRGSADPVGASSSPASASSASSASLASAGSRDPGVCPTLDPTRDMSTPARRRLMRDFKRLQEDPPAGVSGAPSENNIMVWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLTIEFTEEYPNKPPTVRFVSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWRDC	167552	160224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161506_161839_161929_162755_162846_166658_166685_167090_167172_167311
702691	contig_14954_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_165164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGTAAGAAAAGTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39368	38536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_38500_39400
702692	contig_6710_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_96109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCATCAGCCCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
702699	contig_18145_pilon	+	1401	7	Intergenic	novelGene_37322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	383.847047084585	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	258	1049	86893	100912	FALSE	20	ATGGAGTCTGAGTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMLFPGVGALAQEGPGVRPWPASFFSLNSSATVRLWMGVSVAKNTK	86635	101264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93434_100777
702703	contig_14871_pilon	+	2411	10	Intergenic	novelGene_63711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	689.920786292183	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	121	1413	213505	233218	FALSE	5	CTGTCTGTGTGGCCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	206431	234216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_206528_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
702706	contig_12427_pilon	+	2530	1	Intergenic	novelGene_40502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAATAAATTCTTCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407048	409578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_407000_409600
702710	contig_17066_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_130957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	224	595	268493	268864	NA	20	CCTTTACTTTAATCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIIRYSVSSHSFPKPKNCSRRSPGPGEGSIGMDTSLQGSSCRQHYLVFPETPALCKGKPGNAVLKGRSFSYILCSFRNLIYRQIFQRSQLTCTAVGKPHLEGDEDSMQIESFWDGKGLQRRL	268269	269232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_268300_269200
702712	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702714	contig_3424_pilon	+	2388	3	Intergenic	novelGene_55475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	154.5	1	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	127	2211	163695	170678	FALSE	40	ATCAACCTGGTAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGSPAPRFGCSRGAWAPAEPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149877	170855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701
702718	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_95809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702719	contig_3817_pilon	-	3137	13	Intergenic	novelGene_78307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_1	36.472497248688	166	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	117	1613	165128	151911	FALSE	0	CTTTTTGGCTTGCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPTLPSYWCSRRLLGQQLARQQEQADRLRQQWDQNSRYFQLSDICSSKQAEWSSKTSYQRSMHAYQREKMKEEKRRSLEARRERLRQLMLEEQDLLAKELEDLRLSMNSRERRIRERHGNLKSAREEQRKLIAEQLLYEHWKKNDPKLREIELDLHKKHVINSWEAQREEKKQQEATEEEEKKRYENEYETARREAMERMKAEKERRQLEEKLQAEVLLQQMEELKVKEMEATKLKKEQENLLKQRWELERLEEDRKRMAALRQKAELGRFLRHQYNVQLNRRTQQIQEELEADKRILQALLEKEDENQRIHLARREQALADVAWMKQVIEEQLQLEREREAEQQMLLRDEAKEMWEKREAEWARERSARDRLMNEVLTGRQQQIQEKIEQNRRAQEESLKHREQLIRHLEEARESARREKEESEELKSAWKQELEAQVVERQLQAQEEDQQEEEEEEEARQAEQLTDALLQQEAKMMAEQGYWPKTYRHPKIAWN	166551	150386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_151944_153063_153208_153723_153910_156354_156437_157226_157400_158371_158439_158628_158742_159622_159797_160471_160541_161333_161391_162147_162359_164940_165129_166435
702720	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
702725	contig_4857_pilon	-	1793	2	Intergenic	novelGene_48796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTTTTTACCATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242141	1237520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1238988_1241815
702730	contig_11285_pilon	+	2217	5	Intergenic	novelGene_5500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGCCCCCAGTGAGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518322	539351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_519985_520825_520955_522390_522501_537224_537362_539172
702731	contig_7963_pilon	+	2291	3	Intergenic	novelGene_58603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_1	0	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	81	836	293211	297210	FALSE	40	AAACTGTACAGAAATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWSESQLLCSLGLTQDHTESIWGLCYLCTLLGHNTNSFP	293130	298665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815
702733	SIRV6	+	195	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	74	514	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
702735	contig_12923_pilon	-	1764	12	Intergenic	novelGene_30082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.138882718155	8	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	53	1609	93727	45496	FALSE	20	ATGAGGTTCTACTGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRVGSWKNIRGLRGTSFSPERDSLS	101220	45340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45569_57106_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
702736	contig_12201_pilon	-	1308	9	Intergenic	novelGene_159973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	293.528293993952	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	376	1107	132930	110501	FALSE	25	TAATTTTTGTCTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQLLITVAFNQPVKLYSMKFQGPDNGQGPKYVKIFINLPRSMDFEEAERSEPTQALELTEDDIKEDGIVPLRYVKFQNVNSVTIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	139074	110299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329_124453_130805_130980_132873_132971_133558_133697_138877
702742	contig_7202_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_17219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGGATTTCACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
702745	contig_10263_pilon	-	2487	11	Intergenic	novelGene_135824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_6	64.8771146090823	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1758	728	2485	749303	583109	FALSE	45	GGAGGTGGAAAATGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQTQLKEVLKENDLLRKDVEVKESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQDELRIQRDLNQLFQQDSSSRTGEPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELFLLRKTLEEMELRIETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEAEMHVHHLESLLEQKEKENNMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKDSKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGALSTEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKIGQVKQELSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQEMAEEKGTQAGEIHDLKDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALAEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDLKDLKEKVSLLQGDLSEKEASLLDLKEHASSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKMESQLKKAHEATLEARASPEMSDRIQQLEREITRYKDESSKAQAEVDRLLEIL	791197	583106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_583247_591313_591455_592453_592595_593946_594085_624400_624569_642889_643058_647597_647754_659920_659996_692554_692972_749087_749912_791078
702746	contig_12886_pilon	-	2429	2	Intergenic	novelGene_135449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	83	403	232717	232397	TRUE	20	CATCAGTGTTCAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TETNSRGIPVCPRSQCLHGHDRLEPEQMHLVVVEGPLFQEPRFVQSGHHPDKNELGGSHVSRALKCLLASVLRTSYPSTDVRPGLPVLLPTYLGRDTGPLKLRDSWACAGRALHTSLTAAGIFCPTQLDACSS	232799	228592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_230590_232367
702747	contig_3948_pilon	-	1267	7	Intergenic	novelGene_53328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	488.414924924381	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	106	963	1485208	1468245	FALSE	35	TATATGGATGCCAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASTSPPGAPSAPCRIWWTTTRGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1485666	1467940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485248_1485600
702748	contig_8020_pilon	+	2281	18	Intergenic	novelGene_114401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	47.597432398547	235	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	454	1782	173375	202853	FALSE	20	GACTTTTGTCCTGGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETIQRPLDRLFCSVVTVAEQKYQSTLWDKSKKLAEQAAAIVCLRSQGLPRGSAG	167150	203352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_168035_169128_169206_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_202483_202558_202768
702752	contig_14441_pilon	+	780	4	Intergenic	novelGene_100748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	192	740	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
702756	contig_5039_pilon	+	2532	1	Intergenic	novelGene_64969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666110	1668642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1666100_1668600
702758	contig_17382_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_165189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGCGGCCTGCATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30844	28476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_-_28500_30800
702760	contig_10058_pilon	+	1748	10	Intergenic	novelGene_67733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	160.299796292316	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	14	769	72602	98788	TRUE	20	CAAGATTCTTGTTGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILFVMATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAGNCPCNTHPPWGPDFWHLVCL	72588	100513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98545_98727_98827_99357_99407_99532_100011_100099
702761	contig_7753_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_41479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAACAAATTTTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992780	992162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_992200_992800
702763	contig_610_pilon	+	2588	4	Intergenic	novelGene_76795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	110.581292370013	263	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	25	834	296008	306570	TRUE	20	GGTGAGCAAGTCTATCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAALPSLQEPLVARRFRPLVPMGTLFMQKLEATRKLPGWEEGGSCSNIRVIFPS	295983	310906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306733_309314
702764	contig_12000_pilon	+	1683	11	Intergenic	novelGene_43150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_7	573.330759684146	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	112	732	417192	492333	TRUE	20	TATCACATGTTGCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELVTCSKIP	416842	669837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_492310_492414_494931_495057_558472_558606_669224
702766	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
702767	contig_8581_pilon	-	2022	9	Intergenic	novelGene_22831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	618.640596388566	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	494	1270	319208	307094	FALSE	35	AAGACTCGAGTCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	326186	306341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323436_324120_324166_326006
702770	contig_10331_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_54109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATAAATGACCTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305268	306372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_305300_306400
702771	contig_10541_pilon	-	2379	5	Intergenic	novelGene_144652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	262.592364702403	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	213	656	312553	295100	FALSE	60	AAAAAAAAGCATTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVCLFILEFLFFKFAEIFHTV	394533	293376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_394487
702775	contig_7338_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_156790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAATGAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124391	123472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_123500_124400
702776	contig_9177_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_32757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTAAGTAGCTCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301007	1298948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1298900_1301000
702777	contig_4686_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_118551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCCACCCAGAGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535254	534336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_534300_535300
702778	contig_4686_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_118550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGCCTGGTGGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533783	532900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_532900_533800
702781	contig_18869_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_56352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	54	299	73707	73462	NA	35	TTCTACAACTAAAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73760	73362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
702782	contig_8044_pilon	+	1623	11	Intergenic	novelGene_132373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_9	126.607464234934	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	399	1097	371779	386963	FALSE	20	CACCACCAGAGTGTTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLYCSTQFHTSCFQFLAYKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFAEYLSWEVTSDCNVLLKCKVANIKKETNIVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAFKELMTEVCKTIALSATDLKIQSTAEGIRLYSFVPYYLDDLKVSWSQNGTAVKYTDRVKSGVTGEQIWLQINEPTPNDKGKYVMELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	365247	387489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
702794	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702796	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_95855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702798	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702799	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702800	scaffold_9100_pilon	-	2704	1	Intergenic	novelGene_83306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAAAAGGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793948	791244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_791200_793900
702801	contig_5020_pilon	+	1293	7	Intergenic	novelGene_27846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	992.341465088169	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	676	978	124540	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123245_124444_124547_124909_125091_125657
702803	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
702808	contig_12864_pilon	-	1178	8	Intergenic	novelGene_76436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	675.839342097314	3	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	174	683	251873	242831	TRUE	20	TGAAAGAGTTGCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252159	242237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242503_242600_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
702810	contig_9345_pilon	-	2613	21	Intergenic	novelGene_24430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_16	8.16026960338934	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	124	2343	298993	290883	FALSE	25	CCAGACTAACCCAGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPRRDYHVERPLLNQEQLEELGHRGSVPPTHQWRSWFQCSQARARAVLFQYLPILAWLPRYRVRDWLLGDLLSGLSVAIMQLPQGLAYALLAGLPPVFGLYSSFYPVFIYFLFGTSRHISVGTFAVMSVMVGSVTESLAPDEAFFQDSNTTVNEAARDAARVQLASTLSVLVGLFQVGLGLVHFGFVVTYLSEPLVRGYTTAASVQVFISQLKYVFGLQLSSRSGPLSLIYTVLEVCWKLPQSVVGTVITAVVAAVVLVALKLLNDKLRRYLPLPLPGELLTLIGATGISYGVDLKQRFGVDVVGVIPTGLVPPVAPSLELFAKLVGNAFAIAVVGFAIAISLGKIFALRHGYRVDSSQELVALGLSNLIGGIFQCFPISCSMSRTLVQETTGGNTQVAGAVSSLFILIIIVKLGELFQDLPKAVLAAVVIVNLKGMMMQFKDLCSLWKANRVDLLIWLVTFVATILLNLDIGLAVAVVFSLLLVVVRTQLPHYSVLGQVPDTDVYRDVAEYSEAREVPGVKIFRSSVTMYFANAELYSDTLKQRCGVDVDHLISRKKKLLRKRELKLKRLQKKQPQKQAASFKGTSFSVNVNAGLGDTEINNVEDPKVMESTEDELDSTEASNQEDAKAPDVSILKALGLPQPDFHSLILDLSALSFVDTVCLKSLKNIFHDFREIEVEVYMAACHAPVITQLEVGNFFDASVTKQHLFATVHDAVVFAIQHPRSRSVDPALVTKL	300939	290612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_290898_291135_291273_291548_291604_291785_291963_292758_292852_293314_293417_293500_293594_294519_294590_294772_294880_294971_295068_295399_295478_295971_296086_296313_296462_296546_296630_296984_297138_297216_297382_297571_297736_298328_298440_298654_298795_298874_299034_300856
702813	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702814	contig_6418_pilon	-	1173	11	Intergenic	novelGene_81115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	405.389886405668	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	302	985	81719	68411	FALSE	35	TATGTTAGAAGCAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFNKTPRVTTRKRCCTCVAGTTEAETARVPSSDAPCASS	103126	68222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69652_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028
702817	contig_19851_pilon	+	1096	6	Intergenic	novelGene_29833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4236.96506476039	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTAATTGTTCCGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_54606_54717_55650_55741_56004
702822	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702823	contig_8386_pilon	-	2007	3	Intergenic	novelGene_82244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	12.5	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	59	475	93747	90003	FALSE	10	CACTATTGTGTTTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLYSPCGRRRRGPQRGVAMAELQQLRVQEAIDSMVKSLERENIRKMQGIMFRCSASCCEDSQASMQQVHQCIERCHAPLAQAQALVTSELEKFQDRLARCTMHCNDKAKDSMDAGSKELQVKQQLESCVTKCVDDHMHLIPSMTKKMKESLSSIAK	93805	88470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_90192_92686_92828_93660
702824	contig_11109_pilon	-	1310	2	Intergenic	novelGene_165197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGAAAGAGATGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142687	130426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11109_pilon_-_131127_142077
702830	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702833	contig_9706_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_20834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAAACTTCATAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2693	2218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2200_2700
702837	contig_18869_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_56125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAAGCACTACCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
702838	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671642	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
702839	contig_13526_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_165202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAGTGAAATCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168648	166601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_-_166600_168600
702840	contig_8615_pilon	+	2192	18	Intergenic	novelGene_165207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_15	113.319892004341	51	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	530	1858	27209	101123	TRUE	70	CAAAAGAAAAAAAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQVPPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLFQESLEHIETYEKQICDKLLVEEIKGEMLLKLGRLKEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQLSSLGPFLPHGTLEERLQIYEEISKQHPRAISPRRLPLNLVPGEKFRELMDKFLRVNFSKGCPPLFTTLKSLYYNTEKVSIIEELVTNYEASLKTCDFFSPYENGEKEPPTTLLWVRYFLAQHFDKLGQYSLALDYINAAIASTPTLIELFYMKARIYKHIGNLKEAAKWMDEAQSLDTADRFINSKCAKYMLRANMVKEAEEMCSKFTREGTSAMENLNEMQCMWFQTECISAYQRLGKYGDALKKCHEVERHSPSKWTTGGKEPLMRPLRQSSAALSCGVSRHHCSHADRSIKPQAS	13833	107480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_14124_23318_23404_25714_25820_26957_27001_27202_27233_29227_29363_43082_43237_52424_52545_53617_53645_55001_55098_60417_60525_89003_89077_94892_95063_95392_95546_100245_100375_100982_101128_106274_106489_107364
702843	contig_17790_pilon	+	2499	7	Intergenic	novelGene_128481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	169.797919107783	4	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	343	1353	122776	129991	FALSE	25	ATAGTATCTTTTTCTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRNVMILTNPVATKKNISINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGSEGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELTPREVKEMEQFVKKYKNEALGVGDVKLPQEMDAQGPNRTYIPGGDRSTTAAVGAMEDKSAEHKRTQYFCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDKLWHPACFVCSACSELLVDMIYFWKNGKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQNWHLKHFCCFDCDNILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNSFSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKMMS	80255	131137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_80402_113272_113359_122665_122887_123770_124107_124999_125216_125625_125785_129802
702844	contig_15047_pilon	+	975	5	Intergenic	novelGene_52269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3251.26752205967	9	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	372	548	4573	21237	FALSE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGMTKPCSSGGDSAQGSDVSLTASKV	3421	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4434_4552_4676_20992_21062_21232
702847	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
702851	SIRV6	+	450	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10295	5	1145	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11382	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
702854	contig_2290_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_165233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGATTTCTAACTCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121450	121128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2290_pilon_-_121100_121400
702855	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702856	contig_11335_pilon	+	676	2	Intergenic	novelGene_104909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTTTCTCTTACGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317595	339237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_318174_339139
702863	contig_10129_pilon	+	2511	14	Intergenic	novelGene_128169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_11	85.91932365606	423	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	265	2106	608285	650130	FALSE	20	ATTTCTGAGGTTTGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLKKCWASLHESSLNTLVQMLRTAIISQLSYWTDTSQSQCNAKALLGMMKEVYKVNKANSRLPENAFNINELSNSLNFYIERCRVISRNKNPVPADNLSPLIFTDFPFAFNFLSKMKLLEADSFIKMQGSIEKAYQEHMQMFIQRKSEFPSPPKFILKVRRSHLVEDALRQISQVEVNDLRKALVIEFTEEIVSEAGGVRSEFFHCVFEEMTRPEYGMFMYPEDGSYMWFPAKPKVEKNRYFLFGVLCGLSLFHLNVVNLPFPLALFKKLLGQKPSLEDLKELSPLLGKSLQEVLNDEADDLGELYIFFSIYWDKNHVDLIPNGVSIPVDQTNKNDYASKCVDYIFNTSIKEVYEEFQRGFYRVCDEEIIQYFQPEELMSAIVGNTDYDWENFEKNAMYDQGYHKSHPTILMFWKAFHKLTLDEKRKFLFFLTGSDRLNVEGIRKSGIVFRCPETFSENDGPRSVTCYNILDLPKYSTMERVEEALQIVINNCRGFGSPKITFQ	608020	650535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_608335_608643_608738_611511_611702_614301_614457_620225_620340_620664_620773_626277_626449_626856_627001_637583_637751_639693_639758_640707_640779_647340_647525_647610_647714_649903
702866	contig_2438_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_111994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	423	1272	124	1395	176662	177933	NA	25	GCCTGAGTTATTAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSKHWGEWFLNLRVLPAGVFGVAFLARVALVFYGVFQDRTLHVRFTDIDYQVFTDAAGFITKGRSPYLRATYRYTPLLGWLLTPNIYLSELFGKFVFISCDLLTAFLLYRLLLLKGLGRRQACGYCVFWLLNPLPMAVSSRGNADSIVASLVLMTLYLIEKRFVACAAVFYGFAVHMKMYPVTYILPIVLHLLPERDNEEGVRQSRYSLQGRLYEFLKRLCSWAVLLFVAVAGLTFFALSLGFYYKYGWEFLEHTYIYHLTRRDIRHNFSPYFYMLYLTAESKWSFSLGIAAFLPQFVLLSAVSFAYYRDLIFCCFLHTAIFVTFNKVCTSQYFLWYLCLLPLVMPLVRMPWKRAVALLMLWFMGQALWLAPAYLLEFQGKNTFLFIWLAGLFFLLINCSILIQIISHYKEEPLAERIKYD	176538	178597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_176500_178600
702877	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702886	contig_2988_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_136536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36065	35067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_35100_36100
702889	contig_14441_pilon	+	1355	7	Intergenic	novelGene_100545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.444324231476	3	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	753	1178	116728	117610	FALSE	10	TGGCGCTGCCTACGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSASHLFTGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111387_112110_112154_112454_112665_113048_113209_116578_116944_117204_117344_117539
702890	contig_5649_pilon	+	2051	4	Intergenic	novelGene_82334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	60.337937209244	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	230	802	480530	493855	FALSE	20	AAATTTGTCCTATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNTFQSGFLSILYSIGSKPLQIWDKKVRNGHIKRITDNDIQSLVLEIEGTNVSTTYITCPADPKKTLGIKLPFLVMIIKNLKKYFTFEVQVLDDKNVRRRFRASNYQSTTRVKPFICTMPMRLDDGWNQIQFNLSDFTRRAYGTNYIETLRVQVPAPFPAGASGRGREAVLSLTLPGGPSDTVVCVSG	480300	495104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_480614_492102_492183_492851_492964_493558
702896	contig_8238_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_165243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	92	406	424531	424845	NA	20	GGAGTATTGAGTATCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHILIMHVQKLHNKKLNAIKPVIYLKQYDNGITMEYTNFHCSIIHNNQRCKQPKCPSIDEWINKMWHIHTREYYSVIKRNEILIHAMTWMNFENIMLNEVSQT	424439	424962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_+_424400_425000
702905	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_97332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
702908	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
702913	contig_11171_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_48614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAGAATAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239274	241020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_239300_241000
702915	contig_10642_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_78724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	473	850	946502	946879	NA	20	ATGGCTAGAGTTTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEQSSYNLHIFSIKLVSAFLCLGTLDSTSGLCLEPILSSEITNRNHRNVKNVALNRPQKGHLLMRAETRRRSVSLFILSWECACCATQIFFFCVRRLKFIATLRVSSKDPKSDTSIDFGVTNKF	946029	947952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_946000_948000
702916	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702921	contig_10235_pilon	-	2318	18	Intergenic	novelGene_46577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.5778412294393	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	13	1908	546922	537592	FALSE	50	TAAATAAACAATTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLNPEDWGLRNCTLYTGLDEVAEEQTQLFRCLEQDVPFDSSSLDVGMDASPPEPPWDPLPLFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSDVQTKIEPVSPSSSINSEASLLSADSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAHQPLYLSHP	546934	537181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537621_538330_538410_538548_538661_538883_538946_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811_545904_546165_546245_546384_546465_546831
702922	contig_1076_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_101120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAGGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627282	626450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_626400_627300
702923	contig_9098_pilon	-	1401	9	Intergenic	novelGene_75793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	459.01741184295	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	349	1149	288130	264388	FALSE	20	AACTTGTAGTTTTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295263	264135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289023_289280_295200
702925	contig_253_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_129664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	111.952487131819	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1057	1902	391384	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNKADTVPAGAWGPAGDKNDEGKKGQGFLAGAWALPHPQPSRSPHFPVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395606	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390206_390353_390436_390689_390857_391020_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
702932	contig_15304_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_30561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	25	CCGTGCTCCACCAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
702935	contig_10581_pilon	+	1004	4	Intergenic	novelGene_41352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_3	169.146878974064	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	24	473	74587	87174	FALSE	20	CAGTGTTTCATTGGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSIKLVVEWELLDDKGQRLFCWKIPLEIIS	74563	87705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85207_87087
702937	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702941	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702942	contig_14925_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_55157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	1562.21493399596	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	209	466	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVGGVLHFGSGTQVIVKPHIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	70979	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_70923
702943	contig_17440_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_7671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATTGGTTTCTGCTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4010	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3600_4000
702945	contig_4891_pilon	+	1310	7	Intergenic	novelGene_124555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	544.777222561867	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	136	744	701017	754769	TRUE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFG	700881	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754770_755867_756027_756579
702947	contig_4180_pilon	-	2123	10	Intergenic	novelGene_8304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGGGTGGGGGGTCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822585	733200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_733326_735137_735214_790789_790882_802491_802659_810962_811075_811818_811993_813450_813616_814802_814969_820000_820095_821633
702948	contig_6241_pilon	-	1770	6	Intergenic	novelGene_156402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.2167713307986	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	520	927	195215	182242	FALSE	55	AAAAAAAAAGATGGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365526	181398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182408_194973_195247_219950_220075_293626_293710_365087_365246_365403
702956	contig_7285_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_143412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1043	1546	356301	356804	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCVYYYASALPGQDWQSLEKRSPILMWESLSGVAPTQATTAEAQGGLSWPSHISPRASAATWWRGCLSRPFLVITNVRLQFTRGPRTQAEPLNSWFDSSVNSFQNACLKSAFATTGIFCILIKCRLSRFSVLSNTQVFFVKHDNNELHLTAVVLSNELHVTSPQF	355258	357060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_355300_357100
702959	contig_1225_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_44117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAATATATGTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142148	144237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_142100_144200
702962	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
702971	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
702972	contig_2537_pilon	+	1846	10	Intergenic	novelGene_33403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	28.0295258787525	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	51	1805	47272	158746	FALSE	30	CTACAACCTTGTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASQAGINLGTAVSGGMYQPATIFMGRQMSAISSIGDFSTEQKSPQPTKNFSIPNPHSCRQTTQSSNVTDSCVVQTDSDTQCLNKPDKTDGKTSLQIGEETPVTADVLSEGEETHCLEIGSNTRHSNLSESKKSAELHSPLQEGLSPENRTTDLKCDSSSRSEGSEEEILTREHIEVKEERARLPVSPITVSEYCAFENKCSQENRSAWEDFLDHLPQGDPESQRTFGKTQEEQEEESLSSSSDLTVSVSEDDLILKSPEPQPNPYDKMEGKDGIKALKLIHSEEERDTLFTKKKNSILQSLSSPNSKKESSTNSPTRELCNHTDIQTEEDLETCGTAVLHQLQELLVGGGSSEKQVRSEQPPHSDLLRAQLSQHVTILNEQDSSLTEEIAKPFEVSTVRNEHQRMKATALLKKALTEECADRSSIHSDESSCSLPSILNDNGGIKEANLGLWLNSVPTGEQEVSSSCRDESKEESVATKIPVTETKAYQLLKRSTLQDNTHQTEDRFHKAGVSTSQLSGLNVGSGTFKTKTTNKIASEANFSSSEGSPLSRHENKRKLTTTLKSKDFWGESDDSNSEIEAALRPRNHNTSTDDFDDFYD	47221	158787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_47864_48770_49087_86987_87105_100139_100288_121460_121627_122499_122566_139079_139185_141607_141705_156611_156656_158642
702973	contig_19564_pilon	-	1464	6	Intergenic	novelGene_29669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	52.5067614693574	417	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	145	912	70080	67069	TRUE	45	CTAAAGTGAATATATGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQSCRGTTRRLSPCLRAYQTRPQNQLSPRALPFPPLWPHSTTTTSPSFPLLWSPPHPCPSTWPLLQAPSLPLPQVQALSSPWVVLPPGNGEEGLGPELHRGCLDGLRSLFEGPPCPYPGALIPFQAPGTTHSSPATPSGDPSMEEHLAVMYEKLRQELPNLFLHSHDYTLYSSDVEFINEILNIRTKGRTWYILSLTLCRFLAWNYFAQLRLEVLQLTRHPENWTLQARWRLVGLPIHMLFLRFYKRDKDELYR	70224	66082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_66367_66452_66523_66870_67274_67454_67544_68286_68689_70008
702982	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
702985	SIRV7	-	272	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69001	7	35782	-7	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
702986	contig_91_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_127092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTTGTAATTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309667	307356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_307400_309700
702989	contig_2036_pilon	+	3124	2	Intergenic	novelGene_131851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGGGAAGAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645228	661551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_647934_661132
702990	contig_1786_pilon	+	1674	8	Intergenic	novelGene_142580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	232.42431289452	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	40	1041	26683	55695	FALSE	70	ACCTAAAAATAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSRFRPRWPQRIMATLRSRVLLWRPLICSRGVEQFSLCARTQPITLLQRLPQPCGAGSPYRRVASEAAASGNSEIKKPTFMDEEVQSILIKMTGLNLQKIFKPAVQELKPPTCKLMTQTQLEEATTQAVEAAKVQLKMPPVLEERAPINDVLAEDKILEGSETAKYVFTDISYNIAHRERFIVVREPSGTLRKASWEERDRMIQVYFPKEGRRILTPIIFKEENLKTMYSQDRHADVLNLCIAQFEPDSTEYIKVHHQIYEDIDKHGKYDILRSTRHFGGMAWYFVHEKKIDGLLIDQIQRYLVDDATSLVQLYHMVHPEGLSAQEAKEQAAEGLNLITVGLLDL	26643	56328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_26849_27764_27932_29190_29356_31212_31357_31691_31776_35614_35761_38646_38756_55674
702991	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
702995	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
702999	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_95807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
703003	contig_7593_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_127274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGAGCAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24376	25663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_24400_25700
703009	contig_1225_pilon	+	1374	5	Intergenic	novelGene_44128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	225	542	250814	274411	TRUE	5	GCTTTCCACTCTGGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250589	276790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274601_274846_274910_276210
703010	contig_6710_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_98177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	15	CCCTATTTCAGCCTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703013	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703020	contig_5201_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_82184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGCAACTCCACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319290	318967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_319000_319300
703021	contig_11422_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_99052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2130	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2100
703022	contig_6593_pilon	+	1478	13	Intergenic	novelGene_49838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1048.72474145189	1	46	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	85	627	1180755	1194228	TRUE	20	TAGCCCAAGGGGATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRCAEAAAVAATVPDAGVGDAGLRPPMVPRQASFFPPPVPNPFVQQTHIGTASRLRIFLLGIILLPIRALLVALILLLAWPFAAISTACCPEKLTHPITGWRRKVTEPALKFLGRALFFSMGFIVTVKGKIASPLEAPIFVVAPHSTFFDGIACVIAGLPSMVSRNENAQVPLMGSKYL	1180670	1273765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1180926_1191011_1191152_1193996_1194230_1195531_1195645_1198315_1198377_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238592_1238742_1266389_1266450_1273656
703024	SIRV4	+	182	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1583	638	1128	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTCTTCTTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2583	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
703025	contig_13481_pilon	-	1509	4	Intergenic	novelGene_119388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	50	343	536852	527468	TRUE	40	AAAAATCATCCAGAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPQTLRLEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536901	526084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
703029	contig_9121_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_134482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACCAGTGGTACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292357	290655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_290700_292400
703033	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703036	contig_1009_pilon	+	1445	9	Intergenic	novelGene_121778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	992	1396	305254	356392	FALSE	25	TCAGCCAGTCTCCAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLGKTLPNFFKGSITVFWIWFTFSWLKASIRFMAVSRAVTIFKNSWSCSQRGLESKSKDIFTADFDMARSASVLFFMSFCSLLVWSSSCWSLPYSLSKSLSTVLGMICFLGCPILKGIQLIVPKLALGRPKP	300851	356441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_301599_304761_304893_305140_305282_312519_312565_313140_313276_319034_319096_319490_319530_326886_326938_356346
703043	contig_1735_pilon	+	1605	9	Intergenic	novelGene_106891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	561.381874818737	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	9	1439	126256	137764	TRUE	10	GCAACCTGTCCGGCTCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	126247	139774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
703046	contig_6710_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_97079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653855	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703049	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703050	contig_10861_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_39443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCCAGGTTGGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444202	2443517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2443500_2444200
703055	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703056	contig_5201_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_82174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAAAGTTTTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255574	253094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_253100_255600
703057	contig_15066_pilon	-	1486	12	Intergenic	novelGene_149546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	151.316208785848	191	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	49	1170	114591	112104	TRUE	10	TTCAAGGTCTCTTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKALDACLMMMTSQAF	114639	111686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112149_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
703059	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703061	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_95808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
703062	contig_2799_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_85553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTCTACTCTGTCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714704	713331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_713300_714700
703063	contig_383_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_126108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCTCTAAAAGTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127756	125814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_125800_127800
703064	contig_383_pilon	-	2070	1	Intergenic	novelGene_126106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGACATGGCGCTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125867	123797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_123800_125900
703068	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	56	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703070	contig_9345_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_24456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGATCTTCAAAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456777	457151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_456800_457200
703071	contig_9345_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_24455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452681	453135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_452700_453100
703077	contig_8617_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_73398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62318	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
703078	contig_7057_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_123204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421855	420690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_420700_421900
703081	contig_9706_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_20984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGTCCACCCAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389604	388727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_388700_389600
703082	contig_9706_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_20985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394015	392384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_392400_394000
703086	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703091	contig_4857_pilon	-	2528	8	Intergenic	novelGene_48648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	92.6807115084594	1	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	883	1317	443714	441598	FALSE	35	TGTTAACAGACCTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCGWISANPSPLLEKPLWNPKHGLNINLCGKTGQRCVSGFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448598	440386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_443592_443746_444432_444537_444997_445070_447620_447760_448062
703092	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_90749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703097	contig_120_pilon	-	2854	6	Intergenic	novelGene_165245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	39.0005128171413	115	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	63	1079	93977	17201	FALSE	10	ATTCCTTATCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLTRLKANSEGKLAKQICKVVLDHFEKQYSRELGDAWSTTRDILTSPSCWQYAVLFNRFNYPFELEKDLHLKGYHTLFQGSLPYCPESVKCYLSRTPDRMPSERHQMGILKKYYLLNAASLLPVLALELRDGEKVLDLCAAPGGKSVALLQCAYPGYLHCNESDSLRSRWLRQTLESFIPQPVVNVIKVSELDGREMGDAQPEIFDKVLVDAPCSNDRSWLFSSDSQKAACRISQRRKLPLLQIELLRSAVKALRPGGLLVYSTCTLSKAENQDVISEILNSYSNIMPVDIKGMAQTCSQDFTFAHTGQECGLLVIPDKGKAWGPMYVAKLKKLCTV	94039	15425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_17472_55676_55799_56541_56697_79123_79468_93000_93111_93962
703101	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703103	contig_500_pilon	+	1070	9	Intergenic	novelGene_31030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1026.14989615309	25	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	196	516	1492663	1497925	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPEMSRPWPLKHCRCWPLPSSQKIVWWQRATTAFRCCSPTTAPRGR	1485755	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494266_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
703108	contig_15185_pilon	-	1606	8	Intergenic	novelGene_99451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_7	224.515623746149	4	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	98	1153	472420	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472517	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
703117	contig_18869_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_56327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	73776	73462	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73779	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
703118	contig_15245_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_145227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCCCAGGAGAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97465	99078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_97500_99100
703134	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_14038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1339	junction_2	2482.46387463924	153	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	195	1370	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266
703138	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703140	contig_15304_pilon	-	1035	3	Intergenic	novelGene_30569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	193	1017	54100	52925	FALSE	30	GAATAAACTCCGTGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54292	52906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
703142	contig_16322_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_87515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	479.834693757479	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	188	601	37060	32956	TRUE	15	GCTTTTTAAATCCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57615	31811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_31945_32014_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
703143	contig_6710_pilon	-	698	2	Intergenic	novelGene_95673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2	496	657968	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RITFLSDSFRNVLGSIIIASGQSLAQLSEREAQFLYRREVKRNHCVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657969	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703145	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
703146	contig_9737_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_165257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAATAATAATGAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15640	16874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9737_pilon_+_15600_16900
703149	SIRV2	-	658	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	-1	2960	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
703158	contig_12270_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_114099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	27	305	14409	13908	FALSE	25	TTCACCATCAGCAGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14435	13907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
703160	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_91299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703161	contig_8310_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_75539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	500	847	170165	169818	NA	40	AAAGGTTAAGTATCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVSRNISCLTPWFILFLMHLDTAGKPPPECTLYLSRMFSSLLLLQGDRSSSAGRASTAPVVALVGAALTAQGAQIPPPRNQAAGNEARTAPALLKITPKHQIHSEILTEIPGR	170664	169774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_169800_170700
703167	contig_1666_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_160589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCACTCTTGTAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727818	726077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_726100_727800
703170	contig_4364_pilon	-	2589	25	Intergenic	novelGene_32	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_18	65.2155480566815	197	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	265	2163	358338	283469	FALSE	20	CACATTTGTGTGTTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDHLVTAKINHWDRVIRELSAKALRNLAWRAPEYCAAQVFPKLLSLTQSPDLHTRHGAILACGEVTCALHRLAAQGGRSVTDYLDEKALEGLKQIHQQLYDHQLYRGLGGELMRQAVCVLIENLSLSKMPFKGDAIIDGWQWLINDTLRNLHLVSSHSRQQVKEAAVLALAALCGEYYLKEPGEADPAVVDALIRQYLAELQSPEEMTRCGFALALGALPSFFLKGRLQQVLAGLRAVTHISPKDVSFAEARRDSLRAIARICQTVGVSAGGVPDKVLCEANVPQIYSTLLDCMNDYTTDSRGDIGACVREAAMTSLMELTLLLGRSQPQLIGASVCERVLCYVAQQASEKIDRVRAHAGNVLLTLLHFDSPPLPHVPHREELEQIFPRSDVATMNWNSPSQVFPRITQFLGLPAFRYHVLLGLAVSAGGLTESTVKYSMQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	370017	283042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_314033_314111_314271_314370_314455_315013_315155_315840_315933_317038_317158_320223_320306_321422_321500_322870_322934_341505_341538_342347_342371_344982_345044_349101_349220_355492_355567_358294_358376_360982_361069_368137_368168_369906
703173	contig_12622_pilon	-	1780	11	Intergenic	novelGene_5903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2632.55764609248	1	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	83	1042	1590968	1586574	TRUE	15	TACATGTGTGTGTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVTDSVSSSSLKPPGAQLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDRTVSPASFRSPSRAAPTLPAPPTAAPTANSGAPPPPATTFGSSGRCMQRVHL	1591050	1583531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585402_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586616_1588467_1588584_1588862_1589010_1589110_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
703174	contig_14441_pilon	+	697	3	Intergenic	novelGene_100682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	191	697	116728	117795	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	113669	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113711_116578_116963_117523
703178	contig_12786_pilon	-	1241	7	Intergenic	novelGene_103412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	613.211332974929	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	871	1182	593240	590909	FALSE	20	GAATCTCCTTTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629618	590849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
703179	contig_5797_pilon	+	1585	7	Intergenic	novelGene_56924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.528021201635	24	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	309	896	257550	273501	FALSE	20	GCTGTCAGTGTATTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	208948	274190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_209023_255466_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_273319
703180	contig_12624_pilon	-	1813	4	Intergenic	novelGene_61110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	762.261110119098	1	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955854	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950788_952938_952985_955644
703181	contig_14704_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_82687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGATTTGTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66352	68259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_66400_68300
703185	contig_2596_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_53492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATGCAAGTGTATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740881	742359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_740900_742400
703186	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703187	contig_10159_pilon	-	1990	11	Intergenic	novelGene_30790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	144.083309234623	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	891	1415	338223	317967	FALSE	80	AGTGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	629228	317391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_431854_431937_456756_456901_577727_577806_597817_597913_606778_606838_626384_626594_629099
703188	contig_10019_pilon	-	1743	2	Intergenic	novelGene_86684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1460	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAATTTGGTCTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261605	258358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356
703189	contig_2219_pilon	+	1917	1	Intergenic	novelGene_67216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTATAGTGCTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384898	386815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_384900_386800
703190	contig_1244_pilon	-	2153	1	Intergenic	novelGene_37904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214945	212792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_212800_214900
703191	SIRV2	+	286	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	311	-74	-311	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCGCAAGATACGCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
703195	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_97019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTGACTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
703198	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
703199	contig_11309_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_149850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39664	37329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_37300_39700
703206	contig_7366_pilon	+	1699	4	Intergenic	novelGene_164971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	137.744530038603	140	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATCTTTTTATGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51808	61053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7366_pilon_+_51838_57495_57604_58651_59830_60669
703209	scaffold_12124_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_22195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACCTGAAAGGCTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306832	1306271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1306300_1306800
703212	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703214	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_94306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703216	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703220	contig_8320_pilon	-	1399	8	Intergenic	novelGene_152272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	37.5450749508005	350	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	175	1077	558034	539063	FALSE	20	TATAGCTCTATTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSNGAKQDSHNKARTSPYPGSKVERSQVPNEKVGWLVEWQEYNPVEYTAVSVLAGPKWADPQISESNFSPKFNEKDGHVERKSQNGLYEIENGRPRNPAGRTGLVGRGLLGRWGPNHAVDPIITRWKRDSSGNKITHPVSGKNILQFVAIQRKDCGEWAIPGGMVDPGEKISATLKREFGEEALNLLQKSSAEKREIEEQLQKLFSQEHLVIYKGYVDDPRNTDNAWMETEAVNYHDETGEIMDSLTLEAGDDAGRVKWVDISDKLKLYASHSQFIKLVAEKREAHWSEDSDPGCPGL	563560	538740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_539242_542124_542210_543282_543430_545318_545431_551376_551464_555377_555474_557837_558078_563429
703221	contig_6710_pilon	+	569	2	Intergenic	novelGene_92306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACTCCAAGAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
703224	contig_7457_pilon	+	1362	7	Intergenic	novelGene_31580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	416	junction_6	129.358245023483	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	14	823	927933	946898	FALSE	35	AACTAGCGTATGAACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGKMAAASECDVVMAATEPELLDDEEAKREAESFKEQGNAYYAKKDYNEAYNYYTKAIDMCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRVSSRHQICVGKEAYPLGL	927919	947437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687
703226	contig_5961_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_144146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195031	196524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_195000_196500
703227	contig_16098_pilon	-	1123	8	Intergenic	novelGene_46083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1971.56774871043	6	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	311	913	457605	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNAPPNPGVGDERCVRSRSPPAALRRCSPQVHPSSVLGTCHHQHHQQVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460261	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457913_458814_458838_460148
703228	contig_5928_pilon	+	1681	8	Intergenic	novelGene_40353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	49.9697867899867	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	24	707	141775	180521	TRUE	25	AATTCTATTTGATCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRGCRGTMAAPKENVNLLFKLYCLIVMTLVAAAYTIALRYTRTSDKELYFSTTAVCITEVIKLLLSVGILANETHSLGKFKTSLRENVLGSPKELMKLSVPSLVYAVQNNMAFLALSNLDAAVYQVTYQLKIPCTALCTVLMLNRTLSKLQWVSVFMLCGGVTLVQWKPAQATKVVVEQNPLLGFGAIAIAVLCSGFAGVYFEKVLKSSDTSLWFLQALEASTLLLWSSTQITS	141751	183579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_141791_156187_156366_172170_172331_172519_172673_177706_177774_179822_179870_180458_180594_182677
703229	contig_2940_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_82004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTCTACTACTGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179590	1178991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1179000_1179600
703238	contig_5020_pilon	+	906	2	Intergenic	novelGene_27831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2686	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGGTTCTTTAACACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118462	120241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438
703246	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_17679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27846	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
703249	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_96082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703253	contig_10581_pilon	-	2095	3	Intergenic	novelGene_41343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	102	junction_1	2.5	119	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGTGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74123	71475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_73095_73534_73651_73763
703255	contig_5389_pilon	+	2016	2	Intergenic	novelGene_143007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	114	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGTAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254597	256797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_254838_255021
703259	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	9	341	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14417	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
703260	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703263	contig_6710_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_97592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653388	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
703264	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703266	contig_6503_pilon	-	3162	2	Intergenic	novelGene_145760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_1	0	169	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	122	370	134980	134732	FALSE	35	GCACCCTCCATCTAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAKRTLRSIGGWCWWGKSDLSYQRARRETLVRDSHTYLRMPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGK	139867	131939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_134982_139747
703267	contig_366_pilon	-	2181	5	Intergenic	novelGene_51634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_1	143.318482757808	69	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	862	1374	1409405	1406847	FALSE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWDLEPTRRPTFKQICFLLREQAKVDRKEQDYANLTSSSSSGSSSGGSGSSEPEESSSEHLACCEQGDSSQSMLQPNNYQFC	1410266	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1407006_1407102_1407212_1408086_1408187_1409179_1409292_1409372
703268	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-72	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
703277	scaffold_19766_pilon	-	1295	9	Intergenic	novelGene_34336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.382429897666	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	315	1112	622205	596588	FALSE	30	AGTACCTAGAGAATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKVRRPNEWDGPLHLNQD	623671	596404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596631_596911_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
703278	contig_8544_pilon	+	1380	4	Intergenic	novelGene_55919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	341.493777395724	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAGAGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83414	91501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_87136_87322_90458
703282	contig_5419_pilon	+	1968	1	Intergenic	novelGene_15496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCAGAATTGAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238776	240744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238800_240700
703293	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703296	contig_15498_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_42711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	1031	1720	984557	985246	NA	80	TATAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAAAGTMTGVGGGEAGGVGGDGEKEGTVEGVMGAGVHSTFISSGGFSRISNSRVNGSTSCFTISTMLSVAGNFSPTPFISLIRSVLEISGISLGATLQGFLHISSSISSVGEGSDVSVQDVGLGIGNVSSFGEESSHLSSTAVVNIGWLLRAAEIGEAIVLRAIGETVVGDTGRGSSGVDSTAVSSDVWPACSFFSPLRTSLRTGEGDFNTGSGFGFSSREEKIKEF	983526	985730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_983500_985700
703297	contig_13245_pilon	-	1090	2	Intergenic	novelGene_148814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	272	541	26597	26328	TRUE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEEDAVVVEGWLALALLLLTHRCSLSPRNKSVRKQRRSHGENGDGAARVGAPAACVLSPSRGPQPRGCLFWGRGLRKRRSFIQQRGFNDQMFYYHDIRKNSGREFLTVMEEPEEVNELGSIIDTLFAPMFSHLCNRQAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKGQYSSLRAR	26868	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998
703299	contig_4301_pilon	+	1785	4	Intergenic	novelGene_65092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	298	junction_1	70.039671298169	408	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	205	594	459349	494757	FALSE	90	AGAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQ	449896	495948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450051_459298_459470_492399_492508_494596
703300	contig_3068_pilon	+	2067	7	Intergenic	novelGene_137606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	50.7794796699962	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	10	615	162547	187446	FALSE	50	TCCATAATGAAAAGTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGADGTGQMAAADTALCLFDVDGTLTAPRQKITKEMDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSHSLPSALSDVTAGAPTAPSTLESKGGNDHEIFTDPRTVGYTVTAPEDTHRICRELFC	162537	188898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162640_167639_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175319_181857_181932_187344
703301	contig_15410_pilon	+	2881	15	Intergenic	novelGene_130634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	71.7899785513839	16	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	103	606	210503	227695	TRUE	20	TCTGCAGTCTAAGCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEADRILIHSLRQAGTAVPPDVQTLRAFTTELVVEAVVRCLRVINPAVGSGLSPLLPPAMSARFRLAMSLAQACMDLGYPLELGYQNFLYPSEPDLRDLLLFLAERLPTDASEDADQPVTLLFSSEPLGAKSGTNWLCPGSLPSFALPSYSSSRAHPPRSLSVPAG	210400	233355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_210553_211571_211750_226511_226641_227415_227523_227655_227723_227809_227990_229343_230158_230251_230372_230974_231095_231175_231293_231397_231691_231968_232065_232319_232380_232459_232535_232982
703303	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703304	contig_10549_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_110616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACTAGAGAAGTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212228	212669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_212200_212700
703308	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_18279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703309	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703311	contig_2596_pilon	+	2044	14	Intergenic	novelGene_53445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.732510035596	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	959	1600	45320	61358	FALSE	30	ATACATTCCTGTTTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFTKKLPHPDLPAEEKEQLLHNAEYQETMVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA	25382	61802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_25483_25629_25699_28994_29065_32585_32681_33834_33972_36842_36996_42489_42717_44873_44952_45290_45359_45872_46062_48753_48897_58522_58659_60346_60434_61310
703314	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703326	contig_233_pilon	-	1694	4	Intergenic	novelGene_14476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	49.6655480858378	564	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	76	390	22361	13017	FALSE	20	TCTTGGCTTCTGTTAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKPKEGVKTENDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGTRAARRLSGCGV	22436	11712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_13110_14678_14751_18722_18852_22340
703335	contig_6589_pilon	+	1238	11	Intergenic	novelGene_26219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	157.771353546834	11	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	42	1103	2048791	2059863	TRUE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048749	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779_2059918_2059978
703339	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703342	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703352	contig_2854_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_120885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAACAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118017	1120112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1118000_1120100
703353	contig_15273_pilon	+	1003	3	Intergenic	novelGene_140439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	498	junction_1	7.5	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	42	311	144935	146076	FALSE	15	CTTTGCCTTTGTACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFKLELFLPEEYPMAAPKVRFMTKIYHPNVDKLGRICLDILKDKWSPALQIRTVLLSIQALLSAPNPDDPLANDVAEQWKTNEAQAIETARAWTRLYAMNNI	144893	146768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_145023_145197_145339_146035
703355	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
703357	contig_4874_pilon	+	1213	4	Intergenic	novelGene_78620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACACGTGTTTTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16482	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_16541_22213_22344_33128_33166_34859
703363	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703368	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_95245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703374	contig_10176_pilon	-	2620	5	Intergenic	novelGene_72740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	552	junction_3	77.4435278122065	5	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	75	647	274981	268548	FALSE	30	GGTTTAGTTATTTGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWN	275055	266574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
703385	contig_11117_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_148601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102238	104956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_102200_105000
703387	SIRV5	+	399	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGACAATTCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
703395	contig_13740_pilon	-	1494	9	Intergenic	novelGene_34672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4267.61212506479	4	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	254	973	161951	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGENLQTVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158689_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161924_162031_165237
703399	contig_14925_pilon	+	2532	1	Intergenic	novelGene_55239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGGAAGAAAGAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63490	66022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_63500_66000
703400	contig_14322_pilon	-	156	1	Intergenic	novelGene_116571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674845	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674800
703401	contig_3817_pilon	-	1918	9	Intergenic	novelGene_78341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	56.4954367626271	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	156	995	514602	469880	FALSE	5	CGTTGCTTGTGTTTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWSMARALPSLDIVVWSELPTGAGLGSSAAYSVCLAAALLTACEEIPNPLRDDDHVSRWTQKDLELINKWAFRGEKVIHGNPSGVDNAVSTWGGALRYQQGQISSLKKPPALKILLTNTKVPRRTKALVAGVRNRLIKFPEIVAPLLTSINAIALECERVLGEMAADPTPEQYLVLEELIDMNQHHLNALGVGHASLDQLCRVTMAHGLHSKLTGAGGGGCGITLLKPDVEQPAVEATKQALTGCGFDCWETSIGAPGVSVHLATSLDAPIRQALDGL	515689	468956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_470032_471989_472144_475299_475417_475814_475906_482218_482265_482895_483000_491023_491180_514582_514675_515606
703420	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_96897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703427	contig_5954_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_28534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAACAAAGACTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475385	474603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_474600_475400
703429	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703435	contig_6710_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_93409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653604	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
703436	contig_6612_pilon	-	420	2	Intergenic	novelGene_148157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	66	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTAGAGGTGTTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18175	16642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_18059
703437	contig_9698_pilon	-	2106	1	Intergenic	novelGene_82510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269047	266941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_266900_269000
703440	contig_18637_pilon	+	2163	8	Intergenic	novelGene_81847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.913006065623	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	214	672	148247	161831	TRUE	60	GGGTTAAATGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGLSAWLALQPGARTLRAFSTAVSPATRTPRPRLRKWFAASPRGATENIKTPRSERLIRRKTLPPRTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDFCTEWPAALDSDEKCEKHFPIEVDTADYVLAGPSIRNPKARVVTLRVKLSSLNLDDHAKKKLIKLVGERYCKTTDVPFKETEL	141665	178258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141802_147071_147125_148222_148391_149544_149606_153201_153342_160263_160351_161804_161868_176803
703443	contig_18184_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_123879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCTGGTGGTACAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541838	539936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_539900_541800
703444	contig_12624_pilon	-	1660	12	Intergenic	novelGene_61066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1295.11665768949	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	102	641	888866	875480	TRUE	15	GCTTTTCTGTATGTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTRPGKSTPGAAGPPCWGRRPSSPTPCRPASAMGKGEASPVPGLIYFLPLSCRYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQDPVSDPLQGSGRGGSPCAVSVCT	903763	862076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863920_867652_867769_867898_868051_874052_874086_875108_875186_875394_875552_878874_878935_882974_883077_884679_884815_888695_888867_903662
703448	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703453	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703455	contig_15543_pilon	-	2166	2	Intergenic	novelGene_164357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGACCTTACGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187358	184864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_185755_186082
703460	contig_19352_pilon	-	1250	3	Intergenic	novelGene_122368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	842	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTGTGTGTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123014	103141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_122835
703463	contig_14643_pilon	-	2659	3	Intergenic	novelGene_99124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	626	junction_1	37	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42971	34233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_35409_40986_41117_41617
703465	contig_500_pilon	+	1554	11	Intergenic	novelGene_30994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	920.890851295635	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	201	941	1492663	1496884	TRUE	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAAAGRYLHHRK	1485750	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496850_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
703471	contig_4392_pilon	+	2146	2	Intergenic	novelGene_117309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGCCTTTTGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273745	286776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_284738
703472	contig_6710_pilon	+	550	2	Intergenic	novelGene_97561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGACTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653386	657526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
703473	contig_3584_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_108116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	335	670	198493	198828	NA	55	CCTGGGGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITSPKYVRHSLAILASKEHSGRTSPKTDLFILLAVDGIVNILRQHHNSKASVLLQSSLFIVQLSHACEATENTMAWVRRTLVFKMTSLLFNTLKRSFAADLPNAMHRLIS	198158	200015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_198200_2e+05
703475	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703478	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703481	contig_16205_pilon	-	262	2	Intergenic	novelGene_156854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	529	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCATTTGTAAGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19656	16189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_16363_19567
703487	contig_6217_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_109593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTGCCCCATGACGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277328	276534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_276500_277300
703488	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	16	351	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14424	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
703490	contig_10734_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_51309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTTCTCACATTTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374724	1375181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1374700_1375200
703491	contig_9481_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_149702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801702	802924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_801700_802900
703502	contig_14923_pilon	-	1919	4	Intergenic	novelGene_157757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	325	junction_3	41.4273125150814	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	12	443	369808	360475	FALSE	25	AATTGGGCAAATGGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRIMDHTDNELQGTNSSGSLGGLDVRRRIPIKLISKQANKAKTAPRTPRTVNRMPAKASTGDEEGFDYNEEERYDCKGGEHFGNQRRFPGHLFWDFQINILGEKDDTPVHFCDKCGLPIKIYGRMVSITQLNSVFVNVNICVEVGF	369819	358998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_360625_361005_361107_364574_364743_369795
703505	contig_16010_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_165261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1471	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAACAGTCTCTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23284	25014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_+_23300_25000
703508	contig_5247_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_81818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	120	422	342763	342461	NA	30	AATTAGTTTATTGTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDERACMITELFKCKWKRFKLERLVSDVRMPACIPGNKRSGCKPFGKDVLRCKQLVPGKKKNGFMTTIMFNQTSWHCSPRWELFLAKWPTFTFETTSS	342882	341754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_341800_342900
703509	contig_8045_pilon	+	1350	5	Intergenic	novelGene_35348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	28	669	116067	118722	FALSE	40	AATAATGTCATTGAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116039	119403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
703512	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703513	contig_8682_pilon	-	2335	6	Intergenic	novelGene_165275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	381.474507667288	34	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	265	1116	133808	85753	FALSE	70	TTAAAAAAGAAAAGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQAVAGLLLLAAAGLGEAAAGHGLAFSEDVLSVFGANRSLSVPQLGRLLELLGSAPVKGAPELGQLHFNQCLSAEEIFFLHGFSNATQITSSNFSTICPAVLQQLSFHPCEAKSKHHTKPSLSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLVLTPMIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQVC	134592	84533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589_133987_134506
703514	contig_8980_pilon	+	1918	6	Intergenic	novelGene_74010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTGATGATAAACAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630371	652334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_631671_642234_642351_643902_643948_646924_647090_648806_648944_652178
703521	contig_8278_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_165308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268126	268585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_268100_268600
703522	contig_6842_pilon	-	2462	10	Intergenic	novelGene_130731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_9	15.6568132922743	18	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	114	1055	536822	529297	TRUE	25	TTAAGGCTTCTACCCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSVLKQQQQQPAAATSRNLPWVEKYRPQTLNDLISHQDILSTIQKFISEDRLPHLLLYGPPGTGKTSTILACAKQLYKDKEFGSMVLELNASDDRGIDIVRGPILSFASTRTIFKKGFKLVILDEADAMTQDAQNALRRVIEKFTENTRFCLICNYLSKIIPALQSRCTRFRFGPLTPELMVPRLEHVVEEEKVDISEDGMKALVTLSSGDMRRALNILQSTNMAFGKVTEETVYTCTGHPLKSDIANILDWMLNQDFTTAYRNIMELKTLKGLALHDILTEIHLFVHRGNLHHPLVWKLWADGMLGVKGG	536935	526785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_527152_528255_529443_529978_530109_530509_530592_531310_531471_532659_532734_533361_533442_534598_534736_535005_535071_536754
703525	contig_6048_pilon	-	1415	10	Intergenic	novelGene_73241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	323.253980335075	1613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	600	1229	1906523	1896861	FALSE	25	AGGTCCTCTCTGTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPATNNNLHNLMVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1916938	1896674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1906481_1906589_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
703532	contig_3942_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_128715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGGGTACCACTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516254	517738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_516300_517700
703539	contig_14322_pilon	-	167	1	Intergenic	novelGene_115699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671441	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
703543	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
703544	contig_12425_pilon	-	1512	6	Intergenic	novelGene_46674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	649.204128144608	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	261	563	206628	204225	FALSE	25	AAATTTGCTTTCTGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVNKHNTTWQKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	211080	203275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207692_211048
703545	contig_15744_pilon	+	830	5	Intergenic	novelGene_83591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1666.79850311908	20378	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACAGTTGTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149508	153587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152459_152706_153245
703547	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703556	contig_11378_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_112298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTTTGAGGCCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035638	1036255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1035600_1036300
703560	contig_8538_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_4694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
703568	contig_19076_pilon	+	1962	3	Intergenic	novelGene_74227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	356	20	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	153	533	152334	155254	FALSE	15	GTTTGTTGTATTCCTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	146362	156683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_146452_152270_152398_154937
703577	contig_1443_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_28343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTATATTATACATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809544	807930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_807900_809500
703578	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_89075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	TGTGGTTTTGCTCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703579	contig_8801_pilon	+	323	2	Intergenic	novelGene_66264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGACAGCTCTTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380197	414840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_380328_414647
703584	contig_1865_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_103244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGCCTTTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156554	155862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_155900_156600
703586	contig_8354_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_24081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCAATGCTTCCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128085	129310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_128100_129300
703592	contig_10299_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_79798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTACATTTGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786422	787217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_786400_787200
703596	contig_8801_pilon	-	2277	8	Intergenic	novelGene_66247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	42.6179036824398	105	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	198	1955	199038	181046	FALSE	5	GCTCCTCAGCTTCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEVYNLTQEFFRHGKPVNAESQNSVGVFTREEVRNRIRDDPDDPEATKRLKLAMIQQYLKVESCESSSHSIDEVSLSAFGEWTEIPGAHHIIPSGFMRVVELLAEGIPAHVIQLGKPVRCVHWDQASARPRGPEIEPRREGDHNHDPGEGDQGGEEPREDRRGEDEQWPVLVECEDCEVVPADHVIVTVSLGVLKREYTSFFRPGLPAEKVAAIHRLGIGTTDKIFLEFEEPFWGPECNSLQFVWEDEAESRTLTYPPELWYRKICGFDVLYPPERYGHVLSGWICGEEALVMEKCDDEAVAEICTEMLRQFTGNPSIPKPRRILRSAWGSNPHFRGSYSYTQVGSSGADVEKLAKPLPYTESSKAAHGSSSKQQPGHLLSSKCPELSRDPNRGSIKPMQVLFSGEATHRKYYSTTHGALLSGQREAARLIEMYRDLFQQGT	218803	180723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_181615_181706_183962_184124_187078_187839_188002_188177_194487_194715_198830_199065_218632
703597	SIRV2	+	246	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	341	-64	-341	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGTTTGCACTGTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
703599	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
703602	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703603	contig_7962_pilon	-	2795	2	Intergenic	novelGene_149307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	72	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	800	1576	408667	407891	FALSE	25	CTGACAGTGGACTGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRKKKKMMTRGQKQSLRLLSPRECQEVSPRLHGSHPSPKSTTPCKLPEGESAPPEPLATSTALPLKIFYIKQEPFEHKEELSGGGTHSGGTKEETKVFSGNTEKDGELEFLLPSGAGAPSGGGGPSWKPVDLHGNEILSGGGGPGGAGQAVHGPVKLGEAPPADGKRFGCLCGKRFAVKPKRDRHIMLTFSLRPFGCGICNKRFKLKHHLTEHMKTHAGALHACPHCGRRFRVHACFLRHQDLCKGQGWATAHWTYK	409825	406671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_409371_409729
703606	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
703608	contig_10159_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_30889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	117	749	993261	996587	FALSE	35	TCTCAAAATGAAGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPLWLFFFPFPDAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNENKKQTKKKTPGFLTLYEVWLVSRFLLMFYLVPVYSLIAQSLC	993144	997805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_993570_994447_994640_996455
703610	contig_10434_pilon	-	2486	2	Intergenic	novelGene_82066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1809	2162	189089	188736	FALSE	10	GGTCTCTACATGTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVLIHQVPLGNPMGQFTVSCRVAMSSDRLDGNGNCDRSTTQMQDVNRGTWYGVYGNSTIFAIFSINLKLFQNKNFVFQNGLVLLCRPRSLFLEALVLRCEITHLNVLPRSDLLAA	192016	188411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_189102_190220
703612	contig_7512_pilon	-	2273	13	Intergenic	novelGene_153195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	112.051668389582	122	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	800	1555	128508	108364	TRUE	15	CCACTTCGAGAGTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSKLNQNLNDVLISLEKQHGSNTFTIKAQPSDGAPAKGNKSPSPPPDGSPAATPEIRVNHEPEPAGMAAPGATLPKSPSQPGEASEVAGGTEPAAGGQEPRETAASETASSSLPAVVVETISATVNGAVEGGSGAGRLDLPPGIHVQGTGPA	140837	105715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_109049_109140_116678_116827_120235_120319_121698_121775_122012_122099_126699_126808_128472_129047_129306_129362_134475_134557_140712
703613	contig_7333_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_142766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAAGAAAGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166345	165762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_165800_166300
703614	contig_8161_pilon	-	1790	7	Intergenic	novelGene_156752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.0765376089501	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	84	1106	254276	230026	TRUE	35	TACTCTCATCAAAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVDSRKDLQGPVSWLKESGKKGILGRLMMLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254359	227080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227437_229697_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
703615	contig_18967_pilon	-	2319	14	Intergenic	novelGene_165330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	437.585765050862	202	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	9	1637	168887	131725	FALSE	0	CCCCTCCTCCTCGTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQEADGAGSAVVAAGGGGSGQVTSNGSIGRDPPAETQPQNPPPQPAPNAWQVIKGVLFRIFIIWAISSWFRRGPAPQDQVGPGGAPRVASRNLFPKDTLMNLHVYISEHEHFTDFNATSALFWEQHDLVYGDWTSGENSDGCYEHFAELDIPQSVQQNGSIYIHVYFTKSGFHPDPRQKALYRRLATVHMSRMINKYKRRRFQKTKNLLTGETEADPEMIKRAEDYGPVEVISHWHPNITINIVDDHTPWVKGSVPPPLDQYVKFDAVSGDYYPIIYFNDYWNLQKDYYPINESLASLPLRVSFCPLSLWRWQLYAAQSTKSPWNFLGDELYEQSDEEQDSVKVALLETNPYLLALTIIVSIVHSVFEFLAFKNDIQFWNSRQSLEGLSVRSVFFGVFQSLVVLLYILDNETNFVVQVSVFIGVLIDLWKITKVMDVRLDREHKLAGIFPRLTFKDKSTYVESSTKVYDDMAFRYLSWILFPLLGCYAIYSLLYLYRRPVRLRHQDARDVPDRLPAGRCGFLHLPLPTVDLPRRPHTGE	168895	131042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_131792_131968_132038_132766_132841_133101_133198_133472_133664_135794_135889_136631_136877_137493_137615_138447_138534_147780_147899_151331_151491_152549_152674_162006_162120_168815
703618	contig_3948_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_53346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCTGGTTTCCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503543	1505358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1503500_1505400
703625	contig_14023_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_165364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110762	109866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_109900_110800
703626	contig_14023_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_165362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109058	108006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_108000_109100
703628	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_93418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
703631	contig_4125_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_25234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATTCTAAAGAGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2229127	2227272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2227300_2229100
703633	contig_6027_pilon	-	2280	11	Intergenic	novelGene_74444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	107.360560728789	22	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	834	1226	283869	263860	TRUE	15	GCCCAGCATTCTTGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVECSRHQGQTEAVRKCHEWKIPA	290904	262515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_263491_263780_263899_264179_264210_280730_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_289209_289339_290862
703636	contig_3394_pilon	+	2347	2	Intergenic	novelGene_152717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCAAGAACCCGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543703	546116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_544706_544771
703638	contig_3077_pilon	+	1438	9	Intergenic	novelGene_26604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4121.99623968776	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	602	982	13867	17590	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9688_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15259_17449_17634_17675
703646	contig_11855_pilon	+	1493	9	Intergenic	novelGene_67059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	60.1331855134916	595	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	239	1312	2011129	2016987	FALSE	25	CAAGACAGAGTTGGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLPPVGDVRLELSPPPLPLPAVSGVPVGSSRRLMAASSSLVPDRLRLPLCFLGVFVCYFYYGILQEKITRGKYGEGAKQEKFTFALTLVFIQCVINGVFAKILIQFFDTARVDRTRSWLYAACSVSYLGAMVSSNSALQFVNYPTQVLGKSCKPIPVMLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2010890	2017168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011338_2012006_2012111_2012699_2012831_2013138_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
703647	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703648	contig_14133_pilon	-	1670	2	Intergenic	novelGene_119960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4448	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	394	705	208493	208182	TRUE	30	AAGCCTTTTCTCAAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	208886	206568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407
703650	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703659	contig_12157_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_135919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCATCTTCCCTGTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210247	212803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_210200_212800
703660	contig_1146_pilon	+	425	4	Intergenic	novelGene_84862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4430	junction_3	2017.99620085536	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	950989	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	950986	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_951113_951651_951732_956017_956104_957038
703663	contig_3825_pilon	+	1240	8	Intergenic	novelGene_78007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5368	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	867	1238	1465358	1470977	FALSE	15	CCACCACCGCTGGTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYQPLRAFPWVSSSLQVCGAVLQYSECPGSPFILCHVVTFGPCLSRDARWTLISSPSFGACFSLGPWGSRHPRAASENAELVGALQTHHLTWTGVSSLDSQGLEAQEQNEVDSGPQGHGGSAQ	1461792	1470979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1462325_1463666_1463796_1464669_1464806_1465288_1465419_1465864_1465900_1467906_1467974_1469009_1469116_1470874
703664	contig_18342_pilon	+	1094	7	Intergenic	novelGene_154552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_2	150.872370638968	2706	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	208	891	36952	63358	FALSE	30	AGCAGTTGAAAGTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASGIVFIMPSNAYVAETAPTATLSGDSLPPTEQ	26118	63561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655_60758_63265
703670	contig_7202_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_18496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27878	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703671	contig_6710_pilon	+	443	2	Intergenic	novelGene_98210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTCCAAGAGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653481	657514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
703672	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703674	SIRV7	-	282	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69002	2	35783	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78955	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
703682	contig_8616_pilon	-	1172	5	Intergenic	novelGene_72430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	424.372772453653	25	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255496	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302_254671_255243
703684	contig_9505_pilon	+	2467	7	Intergenic	novelGene_121866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	127.301479436284	32	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	235	798	652560	659077	FALSE	20	TCCCCAGGAAGCAGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECK	650559	660746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017
703685	contig_4689_pilon	+	1991	10	Intergenic	novelGene_165411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	507.529090572922	264	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	23	1336	1126336	1184633	FALSE	20	CCAGGTTCTCGATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDAASAVLSPRGCADGEDAKATEERVAETTGDHQEQFECQELLECQVQTGNSAEEEDAGLVAEAETVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFHRTRDSAEAIIHGLSSLTAYQLRTVYICQFLTRVAAGKTLDAQFESDERITPLESALMIWDSIEKEHHKLHEEIQNLIKIQAIAVCMESGNFKEAEEVFERIFDDPNSYTPLKRKLLTIISQKDAFHSIFQHFSYSHMMEKIKSYVNYVLNEKSSTFLMKAAAKVVETKRARTLTSQDKPNSNDSEMETPDNLDIGESVSDKQSAITESSEGPVSLLRSHKNLFLSKFNHGSQLQDPDEKEERMETLQSRRKKEDSRRSSKRKTRYTLNNQPVTSEKHRSRKKQAWLWEEDRNLRCGVRKYGEGNWTKILLHYKFNNRTSVMLKDRWRTMKKLKLICSDSEED	1126313	1185288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1126643_1134429_1134526_1140844_1140967_1142916_1143004_1159257_1159408_1160180_1160294_1163790_1163851_1165379_1165472_1170588_1170696_1184453
703688	contig_7562_pilon	-	1749	11	Intergenic	novelGene_140884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_2	91.1596950411749	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	66	1307	143632	126237	FALSE	40	ACCATCGGTGTTAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIKISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVVSNPVLWTPGTAQIGEGIENSWGDLEDSEKEDEDEGGSDEAIILDNVKMDTGVDISNIGSQDAPIVLSDSEEEEMIILEPDKSPKKIR	143697	125794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_126320_128841_129027_129846_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_141978_142093_142214_143084_143180_143566
703689	contig_2161_pilon	-	2157	8	Intergenic	novelGene_114895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	27.8465181203786	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	338	1372	566164	548061	FALSE	5	TTGGGTGCGCCATCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNLTFHLSYRVRLLLLFTICLTVVGWATSNYFVDAIQEIPKARDFVANFNKATVLDKEETLTNKAPVKKAEVRNCPPRSPYLIGRSKLVFRADLTLEEVQAENPRVHRGRYHPEECKALQRVAILIPHRTREKHLLYLLEHLHPFLQRQQMDYGIYVVHQAGNKKFNRAKLMNVGYLEALKEENWDCFIFHDVDLVPEHDFNLYKCEDQPKHLVVGRNSTGYRLRYKGYFGGVTALTREQFFKVNGFSNNYWGWGGEDDDLRLRVELHRMKIFRPGPEVGKYTMISHTRDRGNEVNIERMKLLHQVSRVWKTDGLTSCSYKLLSVEHNPLYINITVDFWSSP	578012	547275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_548194_550586_550692_553063_553187_558722_558911_561902_562136_565911_566313_574526_574631_577927
703694	contig_7057_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_123414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTACTTTTGTTTTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426782	1425276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1425300_1426800
703700	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
703701	contig_4103_pilon	+	1576	15	Intergenic	novelGene_51909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.159334874053	1	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	876	1319	82208	85369	TRUE	30	GCGCAGCTTGGCATAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISASGGFFSSSCTFVFLLELLVAGTLPQVGEDLGELADDNVICRQCGLGLHSGAISLAADKSGGNVRVSIFIIQVHHIGHAAWQEQLIPLVCFALEKHAVNIAAQTCFKFNLIFRILIFLGFLLGLFHQFLLLFLFAGNLSSLTF	77523	85795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_77716_77800_77837_79071_79180_79380_79470_80265_80324_80569_80652_80932_81017_81981_82211_82373_82411_82713_82825_83660_83826_84687_84735_84825_84894_85356_85477_85645
703709	contig_14441_pilon	+	1144	5	Intergenic	novelGene_100404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	329	958	67744	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	67415	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67753_111996_112040_116578_116963_117220_117344_117539
703720	contig_9197_pilon	+	1309	4	Intergenic	novelGene_154358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	162.870773587187	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAAGTGTGTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52450	93168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_75879_75957_80734_80892_92373
703721	contig_9290_pilon	+	1634	12	Intergenic	novelGene_77555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	41	304	478751	479909	TRUE	20	CGGGCCGTCCAGCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPACQPITGCRVMGGMSQWGRPRPRPRPPGGGVSTVERGFLMVSSTDTMRHAASEAAVRALIRTIAGSHTKASKLSAMSSLLMSTPYHMPPGHAEPAAY	478710	496985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_478985_479879_480056_480881_480958_481334_481437_482140_482330_483135_483304_486107_486266_486624_486678_487535_487667_489934_490027_491384_491545_496930
703723	contig_4604_pilon	+	1785	9	Intergenic	novelGene_19142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	1127.03449370461	10	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	339	1286	358980	380216	FALSE	25	GAAATGAATCTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIDCYLAGPMKFCT	348340	380715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365408_380178
703729	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703731	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703732	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703734	contig_9014_pilon	+	2085	8	Intergenic	novelGene_106743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	10.2499377798012	124	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	202	1221	70242	74602	TRUE	20	TTCCTATAGGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAFPELPLPLLVNLIGSLLGFVATLTLIPAFRGHFIAARLCGLDLNKSRRQQIPESQGVISGAVFLIILFCFIPFPFLNCFVEEEQCKTFPHHEFVALIGALLAICCMIFLGFADDVLNLRWRHKLLLPTAASLPLLMVYFTNFGNTTIVVPKPFRPILGLHLDLGILYYVYMGLLAVFCTNAINILAGINGLEAGQSLVISASIIVFNLVELNGEYRDDHIFSLYFMIPFFFTTLGLLYHNWYPSRVFVGDTFCYFAGMTFAVVGILGHFSKTMLLFFMPQVFNFLYSLPQLLHIIPCPRHRMPRLNTKTGKLEMSYSKFKTKSLSFLGTFILKVTG	70040	75544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_70403_70721_70846_71017_71232_71415_71563_73262_73348_73955_74145_74502_74913_74990
703742	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703744	contig_3161_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_84531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468585	471103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_468600_471100
703745	contig_10225_pilon	+	2124	13	Intergenic	novelGene_86826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	567.886303908332	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	878	1903	42629	47514	FALSE	30	AAACATCTTGATTCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTP	21307	47735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21601_34904_34930_35637_35785_37031_37096_40141_40306_40968_41053_41437_41533_42623_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46454_46861_47350_47512
703746	contig_10923_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_66220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	633.030678561474	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	92	859	33044	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCRQSCFHDPRYPSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	32882	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_32926_32995_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
703748	SIRV7	-	282	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91642	2	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
703749	SIRV7	-	417	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33142	10	-77	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114815	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
703751	contig_5649_pilon	-	2374	8	Intergenic	novelGene_82297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168098	155269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_156730_157503_157628_157819_157972_164097_164242_164587_164679_165469_165672_166772_166906_168030
703759	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27826	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
703765	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703767	contig_8138_pilon	+	1381	7	Intergenic	novelGene_52433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	384.470198238216	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	204	515	280295	305581	TRUE	30	CATACTGCGGAAGAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGESES	280091	307858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364_306949_307644
703769	contig_15236_pilon	+	2322	3	Intergenic	novelGene_141574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_2	90	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	99	1148	419232	428270	FALSE	20	GGGCGTATTTTTCTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPSSFHLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKVRSEHLHAEGSGIAFQGPPPGPCCNPTLHVPAEPNLRAFRALH	419133	429444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009
703776	contig_14569_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_165422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386917	385255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14569_pilon_-_385300_386900
703783	SIRV7	-	247	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91677	2	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
703785	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703797	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_96918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703804	contig_6079_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_160114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAATAGAAAAAGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493659	494108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_493700_494100
703807	contig_10311_pilon	-	1678	10	Intergenic	novelGene_50450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1008.79415854821	3	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	39	587	70321	68377	TRUE	25	ACTTAAAAGTTGCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQGCVAICHNAN	70359	65132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65608_65725_65918_67180_67261_67491_67574_67811_67962_68264_68410_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224
703808	contig_15449_pilon	+	1483	7	Intergenic	novelGene_33658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	119	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	215	520	191181	192061	TRUE	20	CCCCGCGACCAAGGACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLDLQLLKKVPVQNLGDHLRLRQGDSGSQKTSVRRGRGCSMPLMRSLGSWDSEEVLGEEGLGTTEVPTLPTVTSSLSSCRRCRRISWDSEKLLPSADSW	190966	196135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_191479_192053_192240_192895_193135_194659_194772_195026_195205_195335_195528_196071
703810	contig_5643_pilon	+	1315	6	Intergenic	novelGene_38737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_2	290.018344247394	995	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	177	956	152580	156948	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYP	152403	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823
703813	contig_6533_pilon	+	471	3	Intergenic	novelGene_114607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	30	AAGATTGTATTTGCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
703816	contig_414_pilon	-	2237	5	Intergenic	novelGene_115098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	63.3220933008377	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	193	699	338494	308659	TRUE	20	TTGATTTCTATTAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLYSRGRDAAREKRRKFGRTLLPGGLKLCDVLNIGHQQTPITGNDPFPVVTYSKGPNLQSSSSKMDDSTEQLLLSSCLAKREEMKVKECVPILPHKESPSAWFSKDGKLLSMTLLLTLLSSCLTVVSFYQVATLQAELLSLQAKLQSYQAEQLPAPSKAEAGAPAAAWRETPADTPGLQGILAPPAPGESNSSQGGRSKRAAQSLEETVTQDCLQLIADNETPTIRKGFIHG	338686	303810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_305215_308524_308676_318141_318199_337963_338052_338149
703818	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703820	contig_8138_pilon	+	1325	5	Intergenic	novelGene_52400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	392	847	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	279903	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306737_307644
703826	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703833	contig_6785_pilon	-	2284	6	Intergenic	novelGene_132588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	28.280028288529	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	73	951	733745	725999	FALSE	20	TTTCCACTTGTCTCTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDDLTRRGLYLSDIPLHDATRDLVLLGEQFREEYKLTQELEILTDRLQLTLRALEDEKKKTDTLLYSVLPPSVANELRHKRPVPARRYDNVTILFSGIVGFNTFCSKHASGEGAMKIVNLLNDLYTRFDTLTDSRKNPFVYKVETVGDKYMTVSGLPEPCIHHARSICHLALDMMEIAGQVQVDGESVQITIGIHTGEVVTGVIGQRMPRYCLFGNTVNLTSRTETTGEKGKINVSEYTYRCLMTPENSDPQFHLEHRGPVSMKGKKEPMQVWFLSRKSTGREETKQDDD	733817	724665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_726023_727366_727494_727815_727971_728489_728631_730158_730397_733551
703834	SIRV1	-	269	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3564	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6474_6557
703835	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
703840	contig_3424_pilon	+	2209	3	Intergenic	novelGene_55476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.5	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	69	2195	149955	170678	FALSE	25	CGAGGTTAGAAATTTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPALWLLSRSLGPCRAAPLERMRPAEPPGPAGAVKMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149886	170692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149995_163692_163803_168701
703843	SIRV7	-	383	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
703845	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91675	0	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
703846	SIRV7	-	290	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68996	0	35777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78961	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
703849	contig_10196_pilon	+	996	8	Intergenic	novelGene_132140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	438.112463429477	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	225	839	1039045	1050606	FALSE	60	GAGAAGAAATTTAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTVRPLALVTGQLGVSEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034553	1050763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038429_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046517_1050131_1050212_1050506
703851	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_97206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703854	contig_6387_pilon	-	1180	2	Intergenic	novelGene_165424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	557	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTTGGCATCCCTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74581	45572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_-_46698_74526
703855	contig_12270_pilon	-	389	2	Intergenic	novelGene_113104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	27	389	14409	13824	FALSE	25	AGTGCTTCAGCCTCGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWYH	14435	13823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
703856	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_97954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653847	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703869	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703870	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	107	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
703877	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_93606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703880	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_93656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703881	contig_7775_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_37488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCTCTACTTCACCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204949	206994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_204900_207000
703882	contig_14357_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_121671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAAATATATTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521673	523796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_521700_523800
703884	contig_13744_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_77142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82464	79946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_79900_82500
703885	contig_7171_pilon	-	2505	27	Intergenic	novelGene_101309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.593130419895	1	100	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	77	1204	1075756	1066810	TRUE	15	CATGACTTTAGCCTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTCLLPVPEAQVPFSIGRWSWG	1075832	1057635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057824_1060921_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066873_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
703887	contig_5961_pilon	+	1969	10	Intergenic	novelGene_144114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	498.76798832006	1	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	1487	1969	197721	202099	FALSE	65	ACAGAGAAGGAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEI	113743	202099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113819_144008_144178_151578_151697_155708_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197880_201775
703893	contig_10581_pilon	-	2279	5	Intergenic	novelGene_41366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.2016724367238	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	123	542	447439	325206	FALSE	35	GAATGAGTCAAAATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIERDDIDMLKELGSLTTANLMEKVRGLQNLAYQLGLDESREMTRGEVPQHSRETQEVAAACGRDVLGTVTMLPSRCSSDHAHLTASSGEAGGVYLQDRPPPRSWHSAPLRTLGSKRRICSTQGSLQLFNQLPDWRS	465235	323468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_325502_445557_445642_447399_447467_457310_457386_465215
703896	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	610	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
703900	contig_4364_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_3671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
703901	contig_7695_pilon	-	2790	19	Intergenic	novelGene_41607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_14	29.2479818866951	1	121	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	189	2402	524436	504301	FALSE	25	TAACCACCATCTTTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525580	503912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524442_525015_525168_525549
703905	contig_4701_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_165431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTGTCACATGGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71807	74263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4701_pilon_+_71800_74300
703907	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703912	contig_16869_pilon	-	2153	3	Intergenic	novelGene_137596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	17.5	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	101	574	83930	79150	FALSE	30	GTAGTATGTATGCCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVSLVVVVVGGWTAVYLTDLVLKSSVYFKHSYEDWLENNGLSISPFHIRWQTAVFNRTFYSWGRRKARLLYQWFNFGMVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVSTFFFL	84030	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_79400_80690_80840_83855
703914	contig_8631_pilon	-	3138	1	Intergenic	novelGene_121980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825982	822844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_822800_826000
703915	contig_6710_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_97957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCATCAGCCCCTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653413	653869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
703917	contig_10861_pilon	+	1870	5	Intergenic	novelGene_39266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	376.253488355922	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	221	607	1339531	1348775	FALSE	10	TGTTTTGGATTCCTTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRKPNCSWNTQYSSAYYTSRKI	1337594	1350038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1348714
703928	contig_6364_pilon	+	3596	6	Intergenic	novelGene_51841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	362.695795398844	136	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTCTTGTTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707899	1735342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1707951_1708166_1708251_1714424_1714537_1719467_1719512_1727359_1727483_1732160
703929	contig_15991_pilon	-	869	6	Intergenic	novelGene_70873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2882.23707560638	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	432	800	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105027	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103590_103703_104975
703930	contig_9548_pilon	+	2443	7	Intergenic	novelGene_141056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	159.008822256992	1543	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	9	683	127751	141662	FALSE	35	ATGGTAACTTCCAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKMAANVPQRAWTVEQLRSEQLPKKDIIKFLQSHGSDSFLAEHKLLGNIKNVAKTANKDHLVTAYNRLFETKRFKGTESINKVSEQVKNVKVNDDKPKETKSEETLEEGPPKYTKSVLKKGDKTNFPKKGDVVHCWYTGTLQDGTVFDTNIQTSSKKKKNAKPLSFKVGVGKVIRGWDEALLTMSKGEKARLEIEPEWAYGKKGQPDAKIPPNAKLIFEVELVDID	127742	143422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_127859_130889_130992_132207_132316_137204_137341_137799_137868_139965_140064_141607
703931	contig_16156_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_137092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673876	675086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_673900_675100
703933	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
703934	contig_9471_pilon	-	1809	6	Intergenic	novelGene_21835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTCAGTCATATCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417219	412736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414083_414633_415714_416192_416272_416936
703941	contig_15066_pilon	-	1746	11	Intergenic	novelGene_149536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	155.381755685795	387	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	56	733	114591	113263	TRUE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGARRWRRLWPGTPKAASMEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRY	114646	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112149_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
703942	contig_12886_pilon	-	3581	1	Intergenic	novelGene_135451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	232174	231791	NA	20	GTCCATCAGTGTTCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGSGQADLWEAELRFGEGAQHPSATYVPGICRGSALPRELLPATVPFSVPGLRPPVLLLPSLTVVCGQWSHLWKPCSLAASECGAGALCHPHRQPEPPLLEQTSSLPEEQLPSSPFFPVWGVTGHF	232176	228595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_228600_232200
703950	contig_5574_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_155847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATAAACCACACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125019	125463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_125000_125500
703956	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
703957	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
703969	contig_15304_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_30566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1714.5	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	198	803	54100	52925	FALSE	25	TCCGTGCTCCACCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLRNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53710_53813_53991
703970	contig_2009_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_165435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATTAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11290	9944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_9900_11300
703973	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
703977	contig_854_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_36109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAGTGTCTGTGTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106026	104670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_104700_106000
703980	contig_11285_pilon	+	1356	11	Intergenic	novelGene_5538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGCCAGTGCAGGAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741216	745400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_741655_741736_741819_741892_741972_742185_742299_742577_742681_742913_743061_743220_743286_743608_743744_743995_744099_744491_744519_745336
703981	contig_10642_pilon	-	2491	6	Intergenic	novelGene_78674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_5	552.581722462841	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	507	1256	222398	181154	FALSE	15	AGTTGGCTTAATTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVE	241354	179918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_181371_185224_185367_222007_222703_225746_225809_237047_237098_241264
703982	contig_11720_pilon	+	1107	6	Intergenic	novelGene_44006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	498.462837130312	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	549	851	271308	272210	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	269582	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_269907_270038_270153_270628_270700_271268_271343_271806_271961_272096
703983	contig_13740_pilon	+	1803	6	Intergenic	novelGene_34728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	959	junction_1	125.450229174761	20	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	101	652	167703	176906	FALSE	15	CTTTATGTGGTTAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	166411	178057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_167674_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
703986	contig_12884_pilon	-	1940	10	Intergenic	novelGene_105014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	80.7699063870807	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	46	1035	1137687	1126202	TRUE	15	GTCCTGTGTCTGACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIALGTDAIKIENGQSTATKLGLPPLTPEQQEALQKAKKYAMEQSIKSVLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAVTMGFGDPLSPLQSMAAQRQRALAIMCRVYVGSIYYELGEDTIRQAFAPFGPIKSIDMSWDSVTMKHKGFAFVEYEVPEAAQLALEQMNSVMLGGRNIKVGRPSNIGQAQPIIDQLAEEARAFNRIYVASVHQDLSDDDIKSVFEAFGKIKSCTLARDPTTGKHKGYGFIEYEKAQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLRVGKAVTPPPCPCSHLPHLEASHPLLLWLPLPPQPRSLHRKQWREQQCWARWPRQDWCRLP	1137732	1125186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1125630_1125739_1126269_1126358_1126552_1126627_1126842_1126918_1127012_1127087_1127250_1129376_1129428_1130257_1130348_1130454_1130551_1137663
703991	contig_14925_pilon	-	1863	7	Intergenic	novelGene_55338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.356567522122	2	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	314	727	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322012	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113179_113221_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129511_321808
703995	contig_5145_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_131407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAACGGCGCTTCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729465	730570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_729500_730600
703999	contig_14868_pilon	+	1591	12	Intergenic	novelGene_150458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90.5131377158783	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	534	1589	209016	252478	FALSE	45	TGACAAAAGATGACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVR	186067	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202600_203305_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
704002	contig_6589_pilon	-	2006	3	Intergenic	novelGene_26299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	124	927	2274715	2273165	FALSE	70	AAACAAAAAAAAATTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNTAGGPADSSDPLQQICKILNAHMDSLQWVDQNSALLQRRVEEASKVCEGRRKEQERSFRITFD	2290221	2272085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273877_2274623_2274793_2290175
704005	contig_5033_pilon	-	1123	9	Intergenic	novelGene_29005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2851.75478598266	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	29	1048	566787	531059	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPARRVWEWVLPGASAAALLPLLFGCSVCSVSGCQSTSHKARKTCCY	566815	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531193_536527_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
704006	contig_12250_pilon	-	1132	9	Intergenic	novelGene_80692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_1	269.171152568398	79	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	61	339	401239	400074	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLPCAHSSLLARRKAPSPAMATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEASWGELGRAS	401299	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398952_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401200
704008	contig_7594_pilon	-	2584	1	Intergenic	novelGene_55450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAAGCCGAAGGAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562180	559596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_559600_562200
704009	contig_6446_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_149267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGAATAGAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796633	796430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_796400_796600
704013	contig_8617_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_73393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62265	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
704024	contig_5640_pilon	-	2299	3	Intergenic	novelGene_27275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	658	1095	955018	954316	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIGLHCFLRSLQNTEDCYLSILLLRLHKVPFSIFHAFLRHHYLNCSFDVSSSFSSFSPLLVFPDASPLGSEVSSWTLLQLHHLEYIPLHSANLLPSFSSTVRILDKRVTTFVSPSAFFPIRSPNMLQRERRYFKRNLNVDTFI	955675	953111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_954476_954626_954701_954814
704033	contig_10923_pilon	+	1308	8	Intergenic	novelGene_66194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	791.447988415756	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	49	765	21667	37418	TRUE	60	AAAATAAAGAGCAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLWCSGVCAAP	13830	42813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30289_37383_37540_38578_38742_42554
704036	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_97070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704042	contig_1275_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_108791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTAATAAAGCATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465723	465121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_465100_465700
704044	contig_6102_pilon	+	1562	1	Intergenic	novelGene_32313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAGGAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578161	1579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1578200_1579700
704048	contig_6710_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_97418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
704049	contig_2547_pilon	+	2178	2	Intergenic	novelGene_165458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	343	junction_1	0	400	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	194	301	27396	27503	FALSE	65	TTTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REQILRVKEDENVPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRADQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKMEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL	13684	29380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_13863_27380
704050	contig_14553_pilon	+	967	3	Intergenic	novelGene_124994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	390	junction_1	6	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	43	966	5787	14424	FALSE	10	GAGTACCCCCCTCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	5744	14425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_6138_6387_13796
704055	contig_15570_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_137860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGTATAATAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698430	698908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_698400_698900
704058	contig_12250_pilon	-	1639	10	Intergenic	novelGene_80584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_9	29.8655423068785	106	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	202	1248	321794	315207	FALSE	30	TTAAAGTTCAGAAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHIDNDLKLDFKDVLLRPKRSTLKSRSEVDLTRSFSFRNSKQMYTGIPIIAANMDTVGTFEMAKVLCKFSLFTAVHKHYSLEQWKEFATQNPDCLEHLAASSGTGSSDFEQLEQILEAIPQVNYICLDVANGYSEHFVEFVKDVRKRFPQHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADVIKVGIGPGSVCTTRKKTGVGYPQLSAVMECADAAHGLKGHIISDGGCSCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMLAGHTESGGEFIERDGNKYKLFYGMSSEMAMKKYAGGVAEYRASEGKTVEVPFKGDVEHTIRDILGGIRSTCTYVGAAKLRELSRRTTFIRVTQQVNPIFSAES	322374	314815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_315397_315597_315758_316414_316458_316648_316756_316839_316922_317884_318059_318236_318321_321446_321567_321707_321829_322207
704060	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704064	contig_17194_pilon	-	2846	1	Intergenic	novelGene_155363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTGCGGAGACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86347	83501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_83500_86300
704065	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_17019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
704067	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704072	contig_1244_pilon	+	1962	7	Intergenic	novelGene_37953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	40.3347107202827	19	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	50	868	874933	881770	TRUE	30	AATATTTTTGTTTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSGFTQSFRSHTLRRMEVTEGAGAPKPGEMRALKPCLLRRNHSRELHGVAVSCLEELRSKAYDTLAIDKSLAPVTLVLAEDGTIVDDDDYFLCLPSNTKFVALASNEKWTYNNSDGGTAWISQESFDVDETDSGAGLKWKNVARQLKEDLSSIILLSEKDLQVLIDVPCSDLAQELSQSCAAVQGLQNTLQQVLDQREEARQSRQLLELYLRALEKEGSILSKQEESKPAFVEEVDAADMGTSRETFSRIALTSQILTALKEKPAPELSLSSQDLELIKHYPLVQRW	874883	883296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_875069_876812_876975_878260_878404_880957_881148_881374_881527_881734_881872_882303
704078	contig_13292_pilon	-	2412	2	Intergenic	novelGene_142927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1518	1832	77894	77580	TRUE	70	CCTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSLIILPSKEHSGCTSCKTDLFVPLAVHGIVNILHQHHNLNASTLLQSSLFTVQLLHAYEATKNVMAWVRYTLVLKVTSLLFNSFKRSLAADLPNAMRHLIS	79411	75114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_75237_77121
704082	contig_4442_pilon	+	1834	15	Intergenic	novelGene_127945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	213.026023609074	185	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	9	1586	255566	397305	FALSE	20	GCAGCAACCAGTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINEIRSRVEVPLIASSTIWEIKLLPKCATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI	255557	397553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_299400_299470_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
704083	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704084	contig_10494_pilon	-	1774	3	Intergenic	novelGene_102172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	18	247	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	181	1056	950060	939782	FALSE	10	CTGTTGTCTGTCCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSFLVKTHSSHRIPNYGQLETQREANGSCSTCGGLVVPLLLPDKETPSALGDTPRPQDCTPVISCLTLPLPHDEEVGETSSPRPLGVSLVDPGAGRAPSAPLRDSLNHLNLPPLLLLHTRWPPILGPGGDKSPEKLYGAAGTSRPPGCFECLDCHWPHHTVAGLARHQQLHCDLQPRHFFSCKHCDKEYASLGALKMHLRTHTLPCVCALCGKAFSRPWLLQGHIRTHTGEKPYTCSHCSRAFADRSNLRAHLQTHSDVKRYQCKGCAKTFSRMSLLVRHEESGCCPGP	950240	939063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_939964_944315_944934_949984
704085	contig_10904_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_22524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	299	391	348214	348306	NA	10	GTGTCCTTCTGTACTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTAAGGFELPTFQSAAKHLNIVPPGSIKHQSLPEGNFLSSQQGHYWYYRWDVSLPCGSIQFIVRTFSISFPSPLNISRSSNHCENKQTNAPISSKISLDMEEGELGWSPWLRTCVWSPGEILFLLFLLC	347915	348314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_347900_348300
704087	contig_2596_pilon	-	2505	13	Intergenic	novelGene_53466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.203426847041	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1287	2135	665591	662746	FALSE	20	GTACTTTGTCCCTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKYEFEKDMSEKLAEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	722560	662375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684184_694907_695036_696168_696243_722456
704089	contig_13457_pilon	+	1457	9	Intergenic	novelGene_118337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	66.900579220213	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	182	838	60777	70330	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRLWPL	59229	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68660_70314_70416_70761
704092	contig_9871_pilon	-	1314	5	Intergenic	novelGene_75690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTAACAATGAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540668	534837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_535501_537743_537934_539135_539212_539746_539984_540520
704093	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704096	contig_10019_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_86665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAAAAAATTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195728	194974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_195000_195700
704100	contig_6101_pilon	-	1941	6	Intergenic	novelGene_114266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	658	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCTCGGAGGGTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71673	57097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_57174_62157_62442_66344_66457_67724_67802_68641_68832_70471
704103	contig_13461_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_146604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAATATGAGTGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45712	47123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_45700_47100
704106	contig_3588_pilon	+	1679	13	Intergenic	novelGene_72856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	605.931027198824	17	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	186	1166	84577	140944	FALSE	5	TTATTTGGTGGTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEEEKATCAKAWMGTRQKRECKYVHQRPLPQPALPSMSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	84391	141457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112249_125689_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
704112	contig_19737_pilon	+	1088	4	Intergenic	novelGene_158987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	60.642852468824	94	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	645	968	112970	115443	FALSE	15	TGGAGCCATGATGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKGVVFDVTSGKEFYGRGAPYNALTGKDSTRGVAKMSLDPADLTHDITGLTAKELESLDDVFTRVYKAKYPIVGYTARRILNEDGSPNLDFKPEDQPHFDIKDEF	111347	115563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_111974_112951_113013_114363_114468_115266
704113	contig_9189_pilon	+	1968	1	Intergenic	novelGene_165129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGAAAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473639	475607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_473600_475600
704117	contig_6710_pilon	-	192	2	Intergenic	novelGene_98334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAACAGCTTCACAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657830	653726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
704119	contig_7202_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_18495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
704124	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704131	contig_12624_pilon	-	1469	13	Intergenic	novelGene_61074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	901.490197611094	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	205	1236	903590	867716	TRUE	30	GAAGGTAAGTCTACTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVPVPGLIYFLPLSCRYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSCPATGLGIAMSWCPFRKVA	903794	863774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_863949_867656_867777_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888847_903582
704132	contig_12270_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_114063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	11	322	14409	13875	FALSE	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDA	14419	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704133	contig_6710_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_93408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653598	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
704142	contig_6710_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_96604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCACCTTCCACTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
704155	SIRV7	-	258	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91666	2	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
704157	contig_4180_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_8407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883721	884463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_883700_884500
704159	contig_10951_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_61643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGAGGGGAGTGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302731	303868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_302700_303900
704160	contig_8829_pilon	-	2104	10	Intergenic	novelGene_140950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_4	108.249711316012	153	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	91	1110	143579	82673	FALSE	70	AAAAAAAAATTAACTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVTGVVTALVTKFTKLHCFPLLETALFFLMSWSTFLLAEACGFTGVVAVLFCGITQAHYTYNNLSVESRSRTKQLFEVLHFLAENFIFSYMGLALFTFQKHVFSPIFIIGAFVAIFLGRAAHIYPLSFFLNLGRRHKIGWNFQHMMMFSGLRGAMAFALAIRDTASYARQMMFTTTLLIVFFTVWIIGGGTTPMLSWLNIRVGVDPDQDPPPNNDNFQVLQGDGPDSARGNRTKQESAWIFRLWYSFDHNYLKPILTHSGPPLTTTLPAWCGLLARCLTSPQVYDNQEPLREEDSDFILTEGDLTLTYGDSTVTANGSSGSHTASTSLEGGQRTKSSSEEVLERDLGTEDQKVSSRGTRLVFPLEDNA	145683	81678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_82925_89409_89516_91602_91686_103423_103488_126972_127127_139460_139573_141881_141996_142088_142178_143533_143640_145653
704165	contig_14362_pilon	+	890	7	Intergenic	novelGene_142506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	123	junction_3	76.6369507628156	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	458	661	10276	18437	FALSE	15	TGTGTCTTGTTTTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYEDSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL	5418	18666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_5509_6338_6409_8660_8826_8930_9042_10254_10346_17259_17316_18359
704166	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704167	contig_15135_pilon	-	1661	6	Intergenic	novelGene_119853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	582	junction_1	215.313724597388	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	308	709	34251	28800	TRUE	10	TTGTGGAGTTCCTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNTNRFVFETPFTLSGKKHGGVEEQCKRRTVLTTSHFFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFR	44580	24731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_25374_28489_28905_31519_31711_34145_34357_36726_36874_44525
704168	contig_15412_pilon	-	1423	6	Intergenic	novelGene_165469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_1	140.885769331044	825	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	5	1111	137380	113296	FALSE	10	CTCTGTGTTCTTAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMWAVGRPGVTSVSPHTWFPADCRPRSRRSSGSFSVFMAGARGQGLEVVTVSLCSPSPPPSCSNSTMSLLSPLGHQSFPFDEDDGDEEDEEDVDEDDHDSEAKVASLKGMELQGCSSEVESEDTQEEQKQVRLPEGSLTPWEVWFVGKEKEERDRLQQKALEELNQQLEKRKKKEEHEKRKIIAEEKHKEWVQKKNEQKRKEREQKINKEMEEKAAKELEKELLQEKAKEKYQEWLKKKNAEECEKKKKEKEKEKQRQAELQEKKEIAEKKFKEWLENAKNKPRPAAKSYGYANGKLTGFYSGNSYPEPAFYNPIPWKPIHMPPPKEAKDLSGKKNKRPVISQPHRSSSLVIHKARSNLCLGTLHRVQR	137384	112983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_113511_115171_115314_116018_116178_126104_126213_132580_132717_137033
704172	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_16458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27815	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
704174	contig_6710_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_96139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
704175	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704178	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
704179	contig_11752_pilon	+	1169	6	Intergenic	novelGene_37619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	649.262227455132	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	106	546	87165	94249	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTACLPWSCSGHGECVENINN	84096	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88670_88728_94247_94410_96442_96592_105595
704185	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704186	SIRV1	+	242	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTACCCTAGTATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
704190	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704192	contig_16594_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_53901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTATTTTAGACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246345	248979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_246300_249000
704195	contig_5967_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_44422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	524	826	506363	506665	NA	70	TAAAAAAAAAACCCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLQAQFFLSESKMCKVQVQFRQIKYSSTFKINRYFISLSKAEVQLLLFSLSLSLPQLVFIDIYLSLVPLWDYSLWKFTTSMKFNWISQSSETEYELHS	505839	508246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_505800_508200
704196	contig_6361_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_23896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATGTCTCTTATTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123237	121269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_121300_123200
704202	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
704204	contig_14341_pilon	-	3018	4	Intergenic	novelGene_111870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_3	14.7648230602334	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	447	2138	615223	610167	FALSE	15	TTCTGGGAGTGCCATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPDQDRVTFEDIAVYFTWKEWGLLDEAQRHLYHDVMLENFSLVASLGLASSKSCVVAQLEQDREPWMPDTVDASPATAREAQRGPGPDYCCGVEEAPLEQRVSKEGLFQFGTPEEGSSTQKAKICDMCGPLLKDIWHLAEHQGTHSRQKVYLCGTWGRGFWINANLHQHKSGEKPLRWDKDRVLFVKSFSVPMSEKPFTCREFGKDVQDSHDLLQNQATHSEGKPFRSTEYREVFPHNSSLEQQQGVHTGQKPFKCSDCGKVFLKAFALLDHLITHSEERACRCPTSGSAFKKKSALADHQKSHTGETFYVCKDCGKAYTYLSLLRMHQKVHTGKTHYKCSECGKTFTRKHSLSQHQKIHTGERPYECRQCGKAFTRNFHVVRHQKVHNTERPYECRQCRRVFSCISSFIQHQKIHTGERLYECSECGKAFINSSHLARHQKVHNTERPYECSECGKVFRQTSKLVLHQRIHTGERPCKCNQCGKAFSFPSNLIQHQRIHTGEKPYECSECGKAFSQSSALIQHQKVHTRERPYECNECGKAFSYNSNLAKHRKVHTGKKAL	615669	609286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_611594_612253_612377_612884_613012_615208
704205	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
704206	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704207	contig_6344_pilon	+	2309	5	Intergenic	novelGene_157117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_4	21.2485293608758	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	600	1202	1176029	1196280	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGVDDSTGVINCICWKKLSDIRSSSAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALR	1175429	1197387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1176162_1179726_1179823_1183172_1183242_1195076_1195254_1196152
704211	contig_15087_pilon	-	1533	10	Intergenic	novelGene_37249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	585.529284673172	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	571	1020	223877	220722	FALSE	10	TTATTTAGCCTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRAEESILSRNYKKHIQDYGSPSPFWVQELESLHFVIEMKNERIHELDKRLIHMETVKEKNLMLEEKITTLQQENEDLHIRGRNQVVMSRQLSEDLLLTREALEKESQLRRQLQQEKEELLYRVLGADASPTFPLASVTPPKVSFLAT	258362	220208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_220900_221856_221955_222875_222996_223823_223926_224919_224994_231735_231824_234067_234175_236371_236442_242994_243105_258289
704215	contig_18506_pilon	+	1771	11	Intergenic	novelGene_67950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	248.178242398483	1327	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	413	988	28506	47107	TRUE	10	GCTAATCCTTTCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRGVGLRAAGDRAAAFALLRGVFIVAAKRTPFGAFGGLLKDFTATDLTEFAAKAALSAGNVSPETIDSVIVGNVLQTASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQEICVKDAEVVLCGGTESMSQAPYCVRNVRFGTKLGSDLKLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCDPTIMGIEFYCLKRKSLKTSSKDFF	11334	55658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11400_25013_25181_27183_27313_28454_28572_31643_31792_43557_43734_44530_44661_47051_47215_48546_48618_53815_53971_55208
704217	contig_15304_pilon	-	807	3	Intergenic	novelGene_30529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	235	768	54053	52925	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHVPCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54287	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53615_54037
704218	contig_9839_pilon	+	1365	10	Intergenic	novelGene_88561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	306.375747678291	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	16	813	255906	266458	TRUE	50	GAAAAAAAGCATGTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQMVSLETYIVQEKLCKPSLSHQTITMKVNGIANRLWTQYSRKFLREHSIFQLLQPRSYLP	255890	270002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261646_261727_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
704219	contig_5013_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_110094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTATGTATTTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185366	186650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_185400_186600
704228	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_94827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
704231	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_90705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704233	contig_10734_pilon	-	2025	4	Intergenic	novelGene_51022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	2	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	66	671	320632	311551	FALSE	30	ATATGCCCCAGGTTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGCGGSRDRSPGRGLGTSPTMVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320697	310196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
704245	contig_2069_pilon	-	1407	11	Intergenic	novelGene_23576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	52.486188659494	9	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	32	1405	2355156	2323357	FALSE	20	TATGCGCCACCTAGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVISRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKVYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATVTRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQNLLKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVA	2355187	2323354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2323468_2327485_2327579_2331938_2332146_2334824_2335011_2338434_2338624_2339359_2339510_2345269_2345354_2346426_2346529_2349531_2349643_2349812_2349908_2355110
704248	contig_13904_pilon	-	936	4	Intergenic	novelGene_165493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	214.100184233664	1657	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGTCTTAGTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124981	107544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_108074_108597_108731_111535_111636_124807
704258	contig_9720_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_116799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAGAGGGAACAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433380	432880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_432900_433400
704259	contig_1596_pilon	+	2515	1	Intergenic	novelGene_131592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1591	1950	103131	103490	NA	65	AACAAAACAAGGGAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLCLAYFGHVIRRDQSLEEDIMLGKIEGQRKRGRPSMKWVDTVAAAMGLGIRTIVRMVQEHAVFCFVVHRVAMSWNRLDGTWQQHRIIVEFWSLANRIHKEKKRGGSHQENNARKFL	101540	104055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_101500_104100
704260	contig_15859_pilon	-	1794	6	Intergenic	novelGene_50201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	158.588776399845	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	711	1352	344895	341031	FALSE	25	TCCTGCAGCTCTGAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352707	340588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346152_346352_346510_346789_349503_349665_352644
704262	contig_10057_pilon	-	2362	4	Intergenic	novelGene_162347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	97.993197042788	50	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	160	543	69324	52054	FALSE	30	AAGAAGGTGAGTACTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKSLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGKVKSLPSQSLCPCEWTIYRMKEAA	69483	50234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_52232_63462_63555_64855_64957_69311
704266	contig_5916_pilon	-	2092	5	Intergenic	novelGene_158074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_4	540.628569352379	869	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCCCACATAACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922934	898621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_900264_906485_906584_914232_914355_919315_919414_922802
704270	contig_6630_pilon	+	1465	3	Intergenic	novelGene_30719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_2	26	966	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTGTTGAAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721545	731973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_721739_726527_726597_730770
704272	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704274	contig_383_pilon	+	2868	14	Intergenic	novelGene_126084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	48.6441005745821	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	7	2211	37377	65197	TRUE	25	CCCAAATGTCATGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMDQREVAAWTYHHSTTAYPWNVSRAFCQKYYTDLVAIQNKNEIAYLNDVIPYYNSYYWIGIRKINKVWTWVGTKKTLTEDAENWADNEPNNKRNNQDCVEIYIKSSSAPGKWNDEPCWKKKRALCYTASCQDMSCSKQGECIETIGNYTCSCYPGFYGPECEHVRECGEVDLPQHLLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCPKGYTLKGPSKLECLASGNWTSKPPQCVATQCPPLEIPEQGSMACLPPEKELQHQSSCSFRCEEGFALVGPEEVRCTASGVWTAPAPVCKAVQCRLLEAPSKGTMDCAHPLAAFAYGSSCKFECQPGYRVRGSDTLRCIGPGQWTAPMPACEALQCQDLLTPNKAQVNCSHPFGAFRYQSACSFTCDEGLVLVGANVLQCLVTGNWSAVPPECKAITCTPLLSPQNGTMTCIQPLGDSSYKSTCQFSCDEGFSLSGPERLDCTSSGHWTGSSPTCEAIRCPQLSPPEWGSMDCSGAHGQFTVSSTCHFSCSMGFKLKGSKNVECTTSGKWTAPPPTCEGIASASTSEMRCPALITPGQGKMSCTHNLGNFGLNTTCYFGCNAGFTLTGDSPLQCRTSGQWTAVAPTCRAVKCSELHIIKPMMMNCSNPRGNFSYGSACTFHCPEGQILSGSAKTACLENGHWSTTMPTCQGPLTIQEALTYFGGAVASATGLLMGGTLLALLRKCFRQKDDGKSPLNPQSHLGTYGVFTNAAFDPSP	37370	67114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_37759_39957_40066_40538_40725_41553_41740_42327_42514_46204_46391_50118_50305_56324_56511_57351_57562_58597_58784_59493_59611_64043_64075_65142_65199_66458
704278	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704279	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704280	contig_15087_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_37243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200451	197883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_197900_200500
704283	contig_8330_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_71994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCCCCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2080672	2081379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2080700_2081400
704285	SIRV7	-	221	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69055	4	35836	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
704286	contig_15777_pilon	+	2871	15	Intergenic	novelGene_75738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	47	junction_14	35.3870724694652	114	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	112	2490	158747	182418	FALSE	45	AAAATTACTTTAGAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAASEGFAGVRVFAGRSRTAQATLAARGAEDAHTGEMLLASEIGEPPAAPCCTESGDERKNIEEKGNINTAALFGSEQVIESTDNGDLSSYVSAFIEKEVGNDLKSLKKLDKLIEQMTESKMQLEEQVLTISSEIPKRIQSALKNAEESKQSLNRLLEQETHLFTSINSHLLTAQPWMDDLGTMINQIEEIERHLAYLKWISQIEELSDNIQQYLMTNNVPEAASTLVSMAELDIKLQESSCTHLLGFMRATVQFWHKILKDKLTSDFEEILAQLHWPFIGPPQSQTVGLSRPASAPEIYTNLETLFCQLLKLQTSDELLTEPKQLPGKYSLPASSSVILPIQIMLTPLQKRFQYHFRGNRQTNVISKPEWYLAQVLMWIANHTQFLDEKIQPVLDKVGSSVNARLEFSRGLMMLVLEKLATDIPCLLYDDNLFCHLVDEVLLFERELHSVHGYPTTFASCMHILSEETCFQRWLTVERKFALQKMDSMLSSEAAWISQYKDITDVDEMKVPDCAETFMTLLLVITDRYKNLPTASRKLQFLELQKDLVDDFRIRLTQVMKEETRASLGFRYCAILNAVNYISTVLADWADNVFFLQLQQAALEVFAENNTLSKLQLGQLASMESSVFDDMINLLERLKHDMLTRQVDHVFREVKDAAKLYKKERWLSLPSQSEQAVMSLSSSACPLLLTLRDRLLQLEQQLCFSLFKIFWQMLVEKLDIYIYQEIILANHFNEGGAAQLHFDMTRNLFPLFSHYCKRPENYFKHIKEACIVLNLNIGSALLLKDVLQSAYGQPPATAALNEIGIYKLAQQDVEILLNLRTNWPNTGK	158635	182799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_158789_159223_159270_163774_163960_169720_169963_172458_172633_172730_172881_173433_173591_175157_175269_175364_175591_176330_176469_177758_177959_179622_179838_180649_180831_180907_181027_182225
704289	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704290	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_95695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704294	contig_9177_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_32774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAGTATATTGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366583	1368566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1366600_1368600
704301	contig_5196_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_38668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGGGGATTTGTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13410	13160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_13200_13400
704307	SIRV6	-	332	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTTAGCCGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
704313	contig_6795_pilon	-	1780	12	Intergenic	novelGene_27768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	44.6283088455436	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	74	1081	504815	483470	FALSE	35	AGGAAAAAGCTGGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLHRRLPAEITGAATAAGPILTAAMGILEKISEIEKEIARTQKNKATEYHLGLLKAKLAKYRAQLLEPSKSASSKGEGFDVMKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVCHRIHRSLASQFKYALVWGTSTKYSPQRVGLTHTMEHEDVIQIVKK	504888	482770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491513_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504751
704315	contig_5280_pilon	-	1803	7	Intergenic	novelGene_52628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCACAGCTACCTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79149	40894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_41075_41730_41837_42906_42995_47319_47506_56216_56336_62047_62062_78039
704316	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704318	contig_10779_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_165518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52850	54983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_52800_55000
704319	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	90	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704328	contig_15384_pilon	-	2345	21	Intergenic	novelGene_85149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	61.698034814733	1	87	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1256	2197	121620	118939	FALSE	25	TGAGGACACAGAGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	127994	118790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124747_124870_125455_125497_125573_125668_125757_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127721_127857_127931
704329	contig_1723_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_165526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAACTGAGAATATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17570	17814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_17600_17800
704330	contig_1723_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_165527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18273	20285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_18300_20300
704331	contig_6630_pilon	+	1599	7	Intergenic	novelGene_30736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGACGATGCCACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797311	807728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_798098_799295_799359_799668_799784_800694_800863_802840_802948_803730_803892_807529
704336	contig_14513_pilon	-	1308	5	Intergenic	novelGene_70389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	290	junction_4	1084.31046637944	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	36	647	19192	11982	FALSE	55	TATATATAGGAACAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAYDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19227	11320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735_19063_19179
704339	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
704340	contig_854_pilon	+	1188	5	Intergenic	novelGene_36198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1415.22162575337	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543457	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556135_562271_562405_563029
704341	contig_16310_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_70049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60622	62812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_60600_62800
704348	contig_11815_pilon	+	1152	7	Intergenic	novelGene_50897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	25.8521436893217	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	248	679	137027	142839	FALSE	65	TATAACAGAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVSVKIIRNRLTGIPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQPDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEGKKGVHSFIPL	126705	143312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_126748_134759_134860_135466_135520_136974_137107_139155_139276_142441_142605_142770
704350	contig_17936_pilon	-	1732	6	Intergenic	novelGene_29983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.3237131806901	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	174	587	167355	161377	FALSE	40	AAAATTTTGTAGTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVLSRRQSDPRLRRGSADPVGASSSPASASSASSASLASAGSRDPGVCPTLDPTRDMSTPARRRLMRDFKRLQEDPPAGVSGAPSENNIMVWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLTIEFTEEYPNIYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWRDC	167528	160231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161506_161839_161929_162800_162846_166658_166685_167090_167172_167311
704357	contig_10331_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_54147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGCCCTGTGGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417899	417445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_417400_417900
704358	contig_6589_pilon	+	874	5	Intergenic	novelGene_25757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	1651.76186237605	1503	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	291	782	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668235	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
704359	contig_8866_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_77916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGTACATATTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192149	1193043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1192100_1193000
704360	contig_11304_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_156711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	15	341	400783	400457	NA	25	AGTTTATTTATTTTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFPMPLARLHHQLLDFCSSVLSQNSTILFLLLRMKLSIFSYVLEPCLSRCFVNSSTMLVFCFVFLRVSRSLGALVVQWLRARLLTKRLAVRIHQLLLGNPVGQFSSVLEHC	400797	400259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_400300_400800
704362	contig_5005_pilon	+	2053	5	Intergenic	novelGene_84314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGGCTGAGGAGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511512	539750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_512952_515555_515742_520412_520619_521919_522041_539649
704367	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704381	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_89250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
704384	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	6	341	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14414	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704388	contig_1309_pilon	+	2565	6	Intergenic	novelGene_73969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	47.3624323699702	102	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1281	1784	174229	185096	FALSE	20	GACAATATGGGTTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQIKSQPLVHLMKMIHPNLYRIDRLTDEGAIHVNDRVVPQPPLQKLSAEKLTREGAFLMDCGYVFYIWIGKSCDNNFIEDVLGYPNFASIPQKMTHLPELDTLPSERARSFITWLRDSRPLSPLLHVVKDESPATTEFFQHLIEDRTEAAFSYYEFLLHIQQQICK	172346	185877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_173576_174177_174316_175086_175192_176245_176339_184630_184735_184981
704390	contig_11427_pilon	+	1316	2	Intergenic	novelGene_78970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	231	1268	93223	94260	FALSE	20	TCACATTGTTTCGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92297	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_93210
704391	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
704392	contig_16776_pilon	-	1251	5	Intergenic	novelGene_130504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	188.256971982447	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	402	719	43087	35212	FALSE	10	AACCCTGTCTGTTGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRRPQGRELHTSGFFSRRRAGK	57967	34679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_41422_41567_42702_42804_43076_43228_57706
704399	contig_6710_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_92664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCACAGTGACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
704404	contig_10058_pilon	+	1817	11	Intergenic	novelGene_67686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_4	90.8777200418232	78	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	208	1140	50283	53244	FALSE	10	CAGTTGTTTCTCGTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQQKAAETEEGTVQIQEGAVATGEDPTSVAIASIQSAATFPDPNVKYVFRTENGGQVMYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48211	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_51001_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
704406	SIRV6	+	523	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
704415	contig_13015_pilon	+	1458	10	Intergenic	novelGene_165562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_9	31.8670075915437	982	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	28	738	396085	416779	TRUE	45	TAATTGTGTAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLLSGGGSMAAGALEAAAVAVVEVGSARQFEELLPLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMTELAKEHPQVSFVKLEAEAVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQSIDRLDGAHAPELTKKVQRHASGSAFPPSTKEHPKEDLNLRLKKLTNAAPCMLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKVRADKSVPCEELSIRAYIS	396057	427358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411107_411310_416546_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
704418	contig_5936_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_53562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTGTAGTTTACAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168821	166757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_166800_168800
704419	contig_5936_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_53561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACTTTTTTGTGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166406	165969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_166000_166400
704424	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	246	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704426	contig_12270_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_113186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	31	381	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14439	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704438	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704439	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_94248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
704440	contig_12638_pilon	+	2182	14	Intergenic	novelGene_33167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	169.229230762238	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	25	1023	269238	271285	TRUE	30	CCAGGAAAGACCACTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDS	235651	274452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271746_273449_273584_273761_273999_274124
704441	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704447	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
704449	contig_8330_pilon	+	2137	7	Intergenic	novelGene_71866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	20.1714870272097	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	99	983	923753	929265	FALSE	20	GAGGCTGTGGGGTGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCREERTCGKPGLVLGGWPLSECSHFPVWCSSMPGGSWGPTAKWPYSWLAVTHWPRSQRTSHMQSCGWGPTPGGDAKILDNHISQKTLGQWIAENRDSLGSKVKDSFNGQLPFLFKVLSVKTALSIQAHPNKELAEKLHLQAPEHYPDANHKPEMAIALTSFQGLCGFRPVEEIVTFLNKVPEFQFLIGDNAATQLKQSMSHNSRAVASALRNCFSHLMKSEKKVVAEQLNLLVKRISQQVAAGNNMEDICGELLMELHQQYPGDIGCFAIYFLNLLILKPGGGHVSGGQHAPCLPERRLCGVHGMLRQHGACWPDTQVHRRANSV	922966	930419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_923035_923722_923851_924644_924847_925609_925752_926085_926269_928093_928269_929180
704450	contig_3822_pilon	-	1534	3	Intergenic	novelGene_133304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1601	junction_1	929	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	367	384	277086	277069	FALSE	40	AAAACCCTTAAACTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	277948	275918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901
704451	contig_10135_pilon	+	786	4	Intergenic	novelGene_106650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1039.5691415197	197	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	64	333	116715	119715	FALSE	20	TTCTATTCATTCATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSCALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTVSESASHHHHPQFQQVSRKGWNFE	116651	120168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619
704453	contig_5514_pilon	+	1451	6	Intergenic	novelGene_75282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	265.785326908767	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	63	1304	65296	68726	FALSE	20	ACCTGTGAGTCTATGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGLGALGTSEPLPQFVDPALVSSAPESGVFFPSGPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61095	68873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
704454	contig_14266_pilon	+	1812	5	Intergenic	novelGene_162245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	91.439529198263	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	265	783	121154	150132	FALSE	20	TTACTGCCTATATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEIKKMAKIGNKEACRVLAKQLVHLRKQKTRTFAVSSKVTSMSTQTKVMNSQMKMAGAMSTTAKTMQAVNKKMDPQKTLQTMQNFQKENMKMEMTEEMINDTLDDIFDGSDEEEESQDIVNQVLDEIGIEISGKMAKAPSAARSLPSASTSKATISDEEIERQLKALGVD	120889	151161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14266_pilon_+_121157_143994_144190_147306_147410_149501_149609_150021
704458	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	440	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704471	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1	351	14435	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRQAGAARWCHRLCSSCPCCSGPLVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14124_14360
704472	contig_6710_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_95798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653668	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
704475	contig_6710_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_93237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACAGTGGTTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657792
704478	contig_6710_pilon	+	579	2	Intergenic	novelGene_92734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
704480	contig_8885_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_115574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAAGCAAATATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68099	69658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_68100_69700
704481	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704484	contig_14925_pilon	-	1034	5	Intergenic	novelGene_55138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1684.30599580361	30	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	267	395	29675	27121	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPSPETQPPTSALTVTTSGSYKYVFGAGTRLKVLTNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGQCSLQI	276332	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27133_29558_29828_77351_77420_276286
704485	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704490	contig_7368_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_158796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTCATGTAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18202	19660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_18200_19700
704491	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704502	SIRV2	-	225	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4644	38	3469	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
704503	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704506	contig_4797_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_6945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAACTGGTGCACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657727	656461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_656500_657700
704507	contig_5816_pilon	-	1467	4	Intergenic	novelGene_158254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	171.277552528053	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	632	1138	309583	308998	FALSE	20	CAACTTGGCAGGACTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPCVQSRTALHRVFRSPGLSSEKPLHGFKLPTFRLVVALKSSHHPGTPSTELMSMNTCAEVHPCLYKCTHIHIKYICTRAQTHMFRKFTNALPDGCASEKESEDLEKQNAALRKEIKKLTEEMKYFTSVLNSHEPLCSVLATSVPSPPEVVYTFHQPHVSSPRFQP	333554	308668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_309199_309277_309839_330700_330806_333283
704510	contig_11708_pilon	-	2299	4	Intergenic	novelGene_138950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	33.0689515339624	316	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTGACTATAAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223605	219255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_220194_220322_220386_220642_221553_223217
704511	contig_7201_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_152511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAAAATTAAATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248430	249265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_248400_249300
704515	contig_11285_pilon	+	1146	6	Intergenic	novelGene_5573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	152.571819154128	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	40	828	766060	769878	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766141_768751_768857_769085_769320_769421_769653_769740
704516	contig_11370_pilon	+	830	3	Intergenic	novelGene_98713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	50	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	168	590	145831	148303	FALSE	20	ACAAAGTGCTGTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145663	148543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
704518	contig_2455_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_119231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	188	613	1445378	1445803	NA	60	GAAAAAAAAAGTATGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTGIKIGGTLINNLQYADDPTLLAESKEDVKHLLMKIKVYSFWYGLYLNIKKTKIQTNGPVRNIMINRENVEVVKDFILLGSIINAHGCSSQEIKQHIALSKSAAKDLFKVLKSKTVTLRTKVCLTQAMIFSISYAYES	1445190	1447176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1445200_1447200
704523	contig_3386_pilon	+	1472	11	Intergenic	novelGene_34550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_5	605.714660545706	671	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	328	1383	476337	506163	FALSE	65	GAAAAAAAGAAACAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRYRSENTPDPGFLT	470046	506252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996
704532	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	130	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
704535	contig_12250_pilon	-	1040	10	Intergenic	novelGene_80715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	196.261415489333	2684	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	79	642	401239	399347	TRUE	25	CCCATCAACCCAAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401317	398583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
704537	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_93468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
704549	contig_11285_pilon	-	1723	12	Intergenic	novelGene_5695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	485.613576266712	2	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	30	641	798530	795472	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSERCPCFGPPRS	798559	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787155_793844_793980_794596_794662_795284_795484_796100_796293_796415_796514_796604_796727_798342
704551	contig_11978_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_62813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAATGATAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393116	394168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_393100_394200
704552	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704554	contig_14744_pilon	-	2231	2	Intergenic	novelGene_66117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1110	1520	1588682	1586605	FALSE	40	GTACACAATGTGAAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWPLGMCQKTEERKANSSKVSVLRVAEFSITSQHIRAYQDHLAPEVILSFPAALVGGGEGRKNSPVSQLEHEAQGTSVTCLRPWSSFVAERASHPALKMVSLSERSPPPKKSAHCAITLYYNYTYNKTKSPGVD	1589791	1585893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1586981_1588647
704557	contig_15087_pilon	-	1466	16	Intergenic	novelGene_37195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1053.63351418898	11	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	81	1325	158925	110784	FALSE	15	ATGAGTGACGTGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGKGVSHLQLGLRKGSHPDGPGGGPARSQPCSCLSD	181120	110642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110881_134801_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
704560	contig_13901_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_146677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293189	294357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_293200_294400
704562	contig_16635_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_153155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCTCCGTATTTCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103697	101437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_101400_103700
704564	contig_1723_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_165531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCACAATGTGCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55164	53875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_-_53900_55200
704567	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
704576	contig_6189_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_164937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTATGAGCCTATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44369	46076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_44400_46100
704577	contig_13542_pilon	+	2524	1	Intergenic	novelGene_131511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCGACTCATGGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389876	392400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_389900_392400
704580	contig_6270_pilon	+	2223	10	Intergenic	novelGene_99896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	148.683855508555	542	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	242	1759	1195735	1222846	FALSE	10	TGTCTCTGGAGTGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLNDLKCRLSKAGQEHLLQFWNELEEAQQIKLYEELQAMNFEELNFFFQKAIEGFNQSSDQEKVDARMEPVPREVLGSATRDQDQLQAWESEGLFQISQNKVAVLLLAGGQGTRLGVAYPKGMYDVGLPSHKTLFQIQAERILKLQQLAEKYHGNKCIIPWYIMTSGRTMESTKEFFAKHKYFGLKKENVIFFQQGMLPAMRFDGKIILEERSSVSMAPDGNGGLYRALAAQNIVEDMEQRGIWSIHVYCVDNILVKVADPRFIGFCIQKGADCGAKVVEKTNPTEPVGVVCRVDGVYQVVEYSEISLATAQKRSSDGRLLFNAGNIANHFFTVPFLRDVVNIYEPQLQHHVAQKKIPYVDSQGQLIKPDKPNGIKMEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRLKDANDVPIQCEISPLISYAGEGLENYVADKEFHAPLIIDENGIHELVKNGL	1187538	1223310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1187731_1195685_1196015_1205315_1205521_1208027_1208204_1209532_1209706_1214260_1214455_1215539_1215681_1216884_1217074_1221864_1221932_1222753
704581	contig_8617_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_73482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATGAATTCCGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
704589	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704592	contig_5586_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_143581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGGTTTTGCTCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415373	416427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_415400_416400
704594	SIRV7	-	329	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33179	14847	-40	-14841	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCGATAAATAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114778	70878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680
704598	contig_11104_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_112458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324764	325092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_324800_325100
704601	contig_8317_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAATCTGTCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
704602	contig_8362_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_150680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	161	466	83750	83445	NA	30	AACTGCTCCCAAATCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKDAPLSALRGWRERGCVCQGLGVGWVDKTDMSFLDPSSLSLIPPSPAIFSPSSTKHKHGPALALPQTRAGSPSVTPVTPNCVSSILRLPSLRVTLLATS	83910	82737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_82700_83900
704603	SIRV7	-	304	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91622	0	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
704616	contig_1996_pilon	-	1583	9	Intergenic	novelGene_131939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	348.912215858087	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	315	1088	509912	508483	FALSE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511080	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732_510906_510983
704621	contig_299_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_129523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733348	1732903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1732900_1733300
704623	contig_19778_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_143755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTCATTTTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20494	20045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_-_20000_20500
704628	contig_5005_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_84306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAGAACATGAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498250	496327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_496300_498200
704629	contig_13300_pilon	-	2234	7	Intergenic	novelGene_125789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.5217059510411	61	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	189	1673	167148	157619	FALSE	15	CTTGCACATGCGTCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPQLLWIWLLVAGTHGLEDGSMRLMDGNMANEGRVEIFYRGQWGTVCDDSWDLTDASVVCRALGFENATQALGSAAFGPGAGPIMLDDLECTGTEPSLADCRSRGWLNSNCQHEEDASVTCTSKTISYPAVHILDFSSELSTALSGVFDSQQSCDLSIQVWARGEEALSVCAHTLILSTNPEARDLLRESGSNVTMEVDAECVPVVRDFIRYLYSRRLNISMSSVKCFHQLASTYGAERLQDYCARLFTIVLLQDPSFRTPLDLHAYALATGDALLEALCVQFLAWNFEALTRAKAWPSTPLALLRTLLSRSELAVSSELALLKAVGAWGWEIRFPMMLPMDLFELQFNMSLFRDHEPLFRKKVLQALEFHTVPLRLLAQYRGLNFSEDTYRPRLYMAPTWSASVSGNIQNSWLAEKSRRVASIPSTHTTLLTPRPPLTIDITPIDLSRHPSTPASSSTTCSSPGLSPTSPPSRAAGTTGSRVPPTRSLPWA	169280	157057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_158102_158143_158508_161631_161894_164504_164637_166209_166402_167096_167171_169114
704630	contig_3095_pilon	-	1155	6	Intergenic	novelGene_75258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	776.609296879712	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	63	833	255481	246716	FALSE	50	TTAAACATAATTATGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255543	246393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255411
704640	contig_14925_pilon	-	1523	6	Intergenic	novelGene_55334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1051.03195003768	1	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129483	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112285_112371_113277_114664_114779_115150_115208_115876_116101_129446
704641	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704644	contig_610_pilon	-	2542	1	Intergenic	novelGene_76650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1296	1646	17016	16666	NA	50	GAAGGTTTACAGAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQGEVEQFPFCVYRKHDVKKQLKPTTDSEWGSRRVGNSSPEVRAGEKIESITWLHNGASITFIKPSETGSLQIHVTDPKQKEQLNFTSSYSLQLSNLTMEDSESYSAQMASKLL	18311	15769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_15800_18300
704650	contig_3382_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_124089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGATACCTCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540681	542008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_540700_542000
704655	contig_17106_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_127661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGGTGTCGGCAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26013	24628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_24600_26000
704656	contig_7078_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_130193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	211.221447774605	257	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951229	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325_965543_975071_975387_982119
704657	contig_7396_pilon	+	1564	9	Intergenic	novelGene_79594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATGGCAACTGCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245933	250904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246475_247190_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249068_249741_249861_250230_250352_250847
704661	contig_10986_pilon	-	2244	11	Intergenic	novelGene_71472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_7	138.318798433185	1	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	81	956	80340	71463	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVCVAVLFL	80420	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
704667	contig_3862_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_137414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535890	538323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_535900_538300
704670	contig_19974_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_130449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACACCACTTATGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51289	48692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_48700_51300
704672	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
704675	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704676	contig_7171_pilon	-	1682	7	Intergenic	novelGene_101197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	308.397155556849	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1062	1439	47663	37659	FALSE	0	GTCCTTGCCCTGTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	49401	37415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47676_48352
704679	contig_8907_pilon	-	443	4	Intergenic	novelGene_85814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1806.20861352047	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	166	402	178678	173397	FALSE	15	CACCATCCTTGCCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179540	173355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391
704681	contig_6109_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_160370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499179	499574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_499200_499600
704684	contig_18184_pilon	+	1944	5	Intergenic	novelGene_123860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	66.3739406695128	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	280	1215	48717	62236	FALSE	15	CCTTCTCATGAGTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHDKKKPYKCEECGKGFCSKQNLHVHYRIHTGEKSYNCQECGKCFRQAAHLLTHQKVHIKKSHTNVKSVGSTSVLDKIFRFILESTKERNPTIVWSVGSVSGSLHIF	48437	62965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_48732_55969_56097_60466_60614_61168_61667_62087
704686	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704687	contig_10050_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_119636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	714	1112	274686	274288	NA	75	AAAAAAAAAAAACAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLSDYIYVKLKKRKLEAIQIQGLWTHTYQPSNGRLLEGKEHSSTSIWLLVVPSGEVGGLTTKWVIFVKTGAGYVGTSYTSLYAFWMFGIFHKVLRERQMENGQQTTGKTKLAPYICGSHHTGTHSSDELV	275399	273338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_273300_275400
704689	contig_6445_pilon	+	1795	11	Intergenic	novelGene_77132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	229.532764545718	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	277	1149	1476903	1488667	TRUE	15	AAGCTGCCTGGCCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASAAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS	1470309	1489363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559_1488774_1488823
704696	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704698	contig_15570_pilon	+	2557	15	Intergenic	novelGene_137832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	81.4907344175911	109	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	729	2192	452558	491978	TRUE	25	AAGTTGTTTATGAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQVLNIISILWKLSKQHDETHKLESWLRRNYLVDFKHHFMSHFPYALQEITKHKRKETNKSIKHCTILSNNVDHLLLNLTLSDIMVSLANASTLQKDSSWIEMIRKFVTETLEDGSKLNSKQLNRLLGVSWRLMQIQPNREATETLIKAVYTLYQQRGLLLPVRTLLLKFFSKIYQKEELRTYRVRYRSKVLSRWLAGLPLQLAHLGSRNPELSTQLIDIIHTAAARANKELLKSLQANALRIYDPQEGTVVVLPAESQQRLVQLVYFLPSLPADLLSRLSRCCIMGRLSSSLAAMLIGILHMRSSFSGWKYPVKDRLMSDVDYFSFLFSTLTGFSKEELTWLQSLRGVPHVIQTQLSPVLLYLTDLDQFLHHWDVTEAVCHSLLVIPARSQSFDVLQSAISKHLAGLTVIPDSTAGCVLGVICKLLDQACILSETLLPFLASCCYSLLYFLLTLEKGEAEHLRKRGTNCGGPVSPSWLSCLEFSG	445940	493578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_446068_449891_450081_451303_451544_452385_452630_454134_454248_460705_460945_461704_461841_463717_463894_465781_465960_472481_472571_474156_474291_484961_485043_486602_486785_491914_492128_493362
704701	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704703	contig_16185_pilon	+	2018	4	Intergenic	novelGene_144764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.4142135623731	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	107	385	163434	166726	FALSE	25	ACCATTCTCTGTAGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTRQPGGTFRNTNYLGGSSAPAAFCLLPRQERTRMSELEKAMVSLIDVFHQYSRKEGDKHKLKKSELKELINNELSHFLEEIKEQEVVDKVMETLDSDGDGECDFQEFMAFVAMVTTACHEFFEHE	160858	168359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_160882_162939_163022_163432_163572_166585
704709	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704711	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704723	contig_7695_pilon	-	2471	15	Intergenic	novelGene_41611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.9190867882804	1	130	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1705	2436	514768	510502	FALSE	30	CAGGTAAGCAAGCCCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEAAPTGARMPGSALTEARSVP	525580	510466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_510562_512065_512172_512295_512415_512505_512569_513892_513986_514288_514396_514584_514780_516932_516992_517077_517201_517279_517411_519632_519753_521064_521203_521999_522090_524166_525168_525549
704725	contig_6361_pilon	-	721	5	Intergenic	novelGene_23945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	991	junction_4	804.893277087093	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTTTGTGCTTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368236	351715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351991_354928_355044_359308_359434_360681_360814_368162
704728	contig_6048_pilon	+	1655	10	Intergenic	novelGene_73266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	74.3422183695023	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1004	1417	1977142	1978064	FALSE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1973960	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1974004_1974209_1974327_1975328_1975423_1976314_1976701_1976778_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
704739	SIRV4	+	330	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	632	986	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
704740	scaffold_6394_pilon	+	1670	10	Intergenic	novelGene_111058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	141.696685272747	437	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	171	932	464827	468063	FALSE	30	CTAGTAATGGAGATGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFNDKNETCGTICLKYLLFTFNCCFWLAGLAVMAVGIWTLALKSDYISLLSSNTYLATAYILVVAGVVVMVTGVLGCCATVKERRTLLRLYFILLLIIFLLEIIAGVLAYVYYQQLNAELKENLKHTMTKQYRQPGRQGVTSAVDKLQQEFHCCGSNNSKDWRDSEWIHSGEAGGRVVPDSCCKTVVDGCGQRDHASNIYKVEGGCITKLETFIQEHLQIIGAVGIGIACVQVFGMIFTCSLYKSLKLDHY	462275	468801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_462323_463520_463560_463962_464029_464808_464911_464995_465188_465563_465639_466503_466609_467023_467183_467308_467396_468003
704743	contig_3627_pilon	+	1160	3	Intergenic	novelGene_78504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	26	499	621315	634316	FALSE	55	AGCAGAAGTATAACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSYSVLVTMEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621289	634977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
704744	contig_11227_pilon	-	2290	8	Intergenic	novelGene_163194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_2	41.9912527334259	179	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	276	845	297894	285075	TRUE	20	GTTGATCCTGTAAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQRKGLQARILSFEEEEKLKRDQALVSDFKQQKLEKEAQKNWDLFYKRNSTNFFKDRHWTTREFEELRSCREFEDQKLTVLEAGCGVGNCLFPLLEEDLNIFAYACDFSPRAVEYVKQNPSYNTERCKVFQCDLTKDDLLEHVPSESVDVVMLIFVLSAIHPDKMHLVLQNVYKTRKQIQRDEITC	299159	278412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_283410_284651_284832_285014_285114_291670_291842_296562_296698_297669_298045_299034
704745	contig_3155_pilon	-	3750	10	Intergenic	novelGene_26449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_9	28.9038422837766	297	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	127	1971	382112	353200	FALSE	40	TATGACATTAGTAAAGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRLAMVGSAFVLFLFILQRDMSNREQVTEKPWLKSLVNQKDHVLDLMLGAVNNLRDSMPKLQIKAPEPQETMVSTNQSCLPGFYTLAELKPFWERPPQDPNSPGADGKAFQKSEWTPQETQEKEEGYKKHCFNAFASDQISLQRALGPDTRPPECLDQKFRRCPRLPTTSVIIVFHNEAWSTLLRTVYSVLHTAPAIFLKEIILVDDASTEEYLKEQLDQYVKQLQIVRVVRQQERKGLITARLLGASVAQAEVLTFLDAHCECFHGWLEPLLARIAEDETVVVSPDIVTIDLNTFHFSKPVQTGRVHSRGNFDWSLTFGWEILPPHEKQRRKDETYPIKSPTFAGGLFSVSKSYFEHIGTYDNQMEIWGGENVEMSFRVWQCGGQLEIIPCSVVGHVFRTKSPHTFPKGINVIARNQVRLAEVWMDGYKEIFYRRNLQAAKMAEEKSFGDISERLKLKEQLHCRNFSWFLHNVYPEMFVPDLKPTFYGAIKSLGTNHCLDVGENNHGGKPLIMYVCHGLGGNQYFEYTTQRDLRHNIAKQLCLHANDGTLGLRNCHFTGKNSQVPKDEEWELTQDQLIRNSGSGTCLTSKDKQPAMARCNPSDPHQHWLFI	382238	351420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_353314_354399_354553_356069_356172_356842_356975_357542_357744_359066_359185_363628_363864_364922_365073_379231_379405_381645
704750	contig_19564_pilon	-	2022	2	Intergenic	novelGene_29591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2046	junction_1	0	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	43	1161	13615	12201	FALSE	40	AAGAAACCTTTGCAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	13657	11339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554
704763	contig_6823_pilon	+	2427	2	Intergenic	novelGene_131228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292724	295493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_293475_293816
704764	contig_3018_pilon	+	2120	14	Intergenic	novelGene_78944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	43.4094309825049	222	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	108	1364	1350624	1438845	FALSE	5	CCTTGGTTCTGATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLENTRHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKLSHLCSSEDGCCTQITCDTLNDFVRLFKQVTKAEGLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANVLPGFLRLQELTDRNVTVIFLSEIIWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILCHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQQDDTDPGQLKGLSAYTHVELPYYSKFILIAAYLASYNPARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKTSNHLLGPKSFPLDRLLAILYSIVDSRVAPTANIFSQITSLVTLQLLTLVGHDDQLDGPKYKCTVSLDFIRAIARTVNFDIIKYLYDFL	1350516	1439601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1350645_1354411_1354505_1356662_1356864_1362065_1362141_1365533_1365646_1368023_1368155_1384570_1384620_1384708_1384800_1388934_1388988_1389909_1390023_1395834_1395883_1399266_1399378_1429642_1429756_1438799
704765	contig_12671_pilon	+	1539	3	Intergenic	novelGene_19235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1154	junction_2	90.5	234	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCTTCGTGTTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209366	212409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_210724_211053_211113_212286
704766	contig_6710_pilon	-	388	2	Intergenic	novelGene_98276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	10	CCATGTCTGGTCCTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704768	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	415	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704769	contig_16503_pilon	+	2123	8	Intergenic	novelGene_162067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	102.46233753065	428	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	92	1225	123420	146833	FALSE	10	GCCTGCCACAGGGGGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDADWGGSRCRWACSAEQKPEPTGSSRTSRMGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPVYEEGCMEKVQAWLQENMGVILGVCVGVAVIEVWVPSSPAPPHTLSSLIAPAPPTGPAALQLLEALLHPGPSTARFCDLRQGAVPLCASLCCLRHAVVVRLELRIHVFNPDQTCMLNWNVRCFSASWHGWGGGRGWAGPPPISLSLTPVSSSTAPGHTPVNLLVPAHPF	92074	147731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145653_146335
704772	contig_13899_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_165571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	155	1570	8988	14723	FALSE	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKNADEHCIKERLEQLRCHFTWALLIADTEMPDLENRILDEIEFLDTKYNAGIHNLLAYVKHLKGQNEEALESLKKAEELIQQEQADRSHLRSLVTWGNYAWVYYHMGRLAEAQTYLDRVENTCKKCGNGSRYRIECPEMDCEEGWALLKCGGQNYGWAKACFEKALEVDPENPEFSTGYAITVYRLDGFTKETQTNGLSLQPLRQAVRLNPEDVYIKVLLALKLQDVGKEAEGEKYIEEALASKSSQTYVFQYVGRFYRRKGSLDKALQFLKKALQATPTSAFLHHQIGLCYRAQVSQIKRATSSQPRRQDRENVNRMIKSAIFHLDSAVKQKPTFAVAYIHLASMYIEAGDYGTAEDAYQKALSIKPLEEDREQEIHLHYGRFQEFQRKSEVDAITHYLKAIKIEKASYARNKSIDSLEKLALKKFHRNALDVEGLSLLGFIHKLKGEMNEALEYYERALRLAVNSEL	8833	15125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13899_pilon_+_8993_13312
704775	contig_10013_pilon	+	2266	2	Intergenic	novelGene_125061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCATTTGTAGTATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278828	281197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_279326_279428
704777	contig_299_pilon	+	2132	5	Intergenic	novelGene_129430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	262.490356965737	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	314	868	864168	874689	FALSE	30	ATAAGCCCATTTCAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDIHNYKGRYSEGDAEKVKLYHSLHGNDWKKIGEMVARSSLSVALKYSQISNQVNHGTWSKTETQKLVKAVEQVILKKMSLQELKEVDSRLQEDPEGRLSIVREKLYKGISWVEVEAKVETRNWMQCKSKWTEVLTKRMTNGQRVFQGVNALQAKINLIERLYKINVEDSNEIDWEDLASAIG	863854	875953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619
704779	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_90559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653850	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704781	contig_7457_pilon	-	2628	1	Intergenic	novelGene_31363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	139	561	321396	320974	NA	35	GATTCCATAAACTACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGRKDPAATTLSSPPPPPNVLRTIAASHVLKPSNSAPHPSPGRLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRILPQALPQPTHIHFHTFPQAETSTPAPSPRQTRTRTGPWERGSMCS	321534	318906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_318900_321500
704791	contig_11933_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_107236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGACCAGATTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21039	19821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_19800_21000
704792	contig_7359_pilon	+	2788	4	Intergenic	novelGene_139856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.2736184954957	390	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1251	1820	48304	55681	FALSE	15	GTAGCATGTCCTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNSTKSFSMLSPARNWNPHACGSSHPRLAVNLISALITSICCYTGRERSREPDSTGYRQKYFLKDTSCEATSSIYYAFGNEVLGSNWKKLMRFIGLEENEIEMCDHENPGDVLEQHYKMLLRWRNRLGREASIFKLMAALHKMELNMSLETIINKLVADDILGRRETQNQKKPIALNSIPTQRPYRTE	47053	56649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_48446_49060_49087_51537_51581_55322
704795	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704798	contig_10734_pilon	-	1890	2	Intergenic	novelGene_50969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGGGGAGGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223084	217162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_217411_221442
704802	SIRV7	-	288	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91632	6	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
704803	contig_5569_pilon	+	2831	1	Intergenic	novelGene_86741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCTCAATAAAGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454411	457242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_454400_457200
704808	contig_19182_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_165578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATTGCTTATTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6897	4962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19182_pilon_-_5000_6900
704809	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704810	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704812	contig_6020_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_155554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGAATGTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280523	277686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_277700_280500
704816	contig_11677_pilon	+	2157	6	Intergenic	novelGene_85896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	117.491446497181	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	226	912	466629	468297	FALSE	15	ATGCCCACCCCTGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVHRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKGEAERMKLKAEAYRKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIASPLTKVDEIVVLSGDNSKVASEVNRLLAELPACVHALTGVDLSKIPLIQKATGAQV	451897	469542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_452102_466607_466728_466816_467032_467449_467634_467997_468148_468258
704817	contig_5698_pilon	+	1321	8	Intergenic	novelGene_55015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19729_20628
704820	contig_12299_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_29726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTTCCAACATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66984	66437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_66400_67000
704824	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
704828	contig_10940_pilon	-	1612	4	Intergenic	novelGene_49240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.326760020342	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	145	846	917000	874802	FALSE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGLSHHDLTLLIEPVLPSWFSSMPSCLLIRRQLSQEHCWSTLAFVRTHTYPGLDLLECAPGSLTPIPIKPVPLSSFSGMPSCLLLRRQLSQEHCWSTLAFVRPHTYPGLDLLECAPGSLTPIPIKPLLSSWFSAMPSYLL	917144	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875223_893184_893306_916664_916748_916923
704829	contig_8710_pilon	+	3387	4	Intergenic	novelGene_73509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	44.131117769161	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	60	395	347357	378354	FALSE	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPDSSALLTRSSPASEHSMAVKVQTTKRGDPHELRNIFLQYASTEVDGEHYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFGKE	347297	381346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_347369_348358_348413_368559_368703_378227
704831	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
704839	contig_10235_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_46460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1273	junction_3	729.136932727088	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220374	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354
704842	contig_10331_pilon	+	2230	4	Intergenic	novelGene_54070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_3	333.942443477249	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	486	1346	75211	89117	FALSE	40	TGTTACCAATAAGAAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGFRWNQVFVFELYYFYFFIDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGKIKV	74725	90001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_75416_79165_79384_83233_83465_88910
704843	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_97753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704846	SIRV7	+	351	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCCTCTACCACTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56111_70889_70987_78840_78963_114679
704851	contig_5967_pilon	+	1477	5	Intergenic	novelGene_44425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_4	67.5758832720668	711	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	79	678	583332	599922	FALSE	30	GGGGAAAGAGGCCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRLNADPEVARGGVGVAGRNYHPVKMLLDLSEEHKEHLAFLPQVDSAVVAEFGRIAVEFLRRGSNPKIYEGAARKLNVSSDTVQHGVEGLTYLLTESSKLMISELDFQDSVFVLGFSEELNRLLLQLYLDNRKEIRSILSELAPELPSYHSLEWRLDVQLASRSLRQQIKPAVTIKLHLNQNGDPTTKVLQTDPSTLLHLVQQLEQALEEMRTNHCRRVVRNIK	583253	600721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_583399_583477_583556_584599_584683_585187_585362_599724
704858	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704860	contig_3797_pilon	+	1312	5	Intergenic	novelGene_120080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	206.706766942933	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	346	834	328276	332908	FALSE	45	ATAATAATAGTATATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHCSLPPLGPGGGGPRVFADVKGAEPRVLSRARYFSHFYIVSVVWNGFLLWCLIQPLFLGAPFPNWLHGLLRILGASQFQGGELALSAFLVLVFLWLHSLRRLFECFYVSVFSNAMINVVQYCFGLVYYVLIGLTVLSQVPMDGRNAYVIGKNLLMQARWFHILGMLMFIWSSAHQYKCHVILGNLRKNKAGVVIHCNYRIPFGDWFEYVSSPNYLAELMIYISMAVTFGFHNITWWLVVTYVFFSQALAAFLSHKFYKSKFVSYPKHRKAFLPFLF	318173	333386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318272_326308_326452_328171_328370_331619_331755_332648
704868	contig_17836_pilon	-	2330	1	Intergenic	novelGene_165580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1018	1494	4133	3657	NA	20	GCAGTAGTGGCATGCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWKKRNIFSVDPVSLEVVGTNENLVWKRLDLGWWFLRTIILGLGVYHMEMAIRNLSDAFHLFALGTETALRAQQTSLNSLVEVVLDNRIVLDLLLAKSGGVCAIINKTCCVWINTTGEVEIGLDAIHKVTKWTDPNRDKKMHGAGSPAFFHPRDPG	5150	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17836_pilon_-_2800_5200
704875	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
704876	contig_7057_pilon	+	1089	6	Intergenic	novelGene_123350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	486.961846554738	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	653	1087	943281	943715	FALSE	5	CGTGGCATCTGCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	939095	943717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_939350_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
704877	contig_709_pilon	+	2170	10	Intergenic	novelGene_57631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.9144045167364	9	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	381	1100	2694618	2701317	FALSE	15	GACTTTGTGATGAGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681030	2702387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2686056_2686218_2688679_2688712_2691611_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
704880	contig_12293_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_165584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	19	324	6300	6605	NA	25	TCTACAAGCAAGGTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFDLCFFVRDLSILFPNILLILGVVEFYSDVQWCAEATCRELIEHMPSQPQIQGHHLESLKCPVLLLFLGAIEPIPTHSDPVYKEQNTARSCAILTIVAV	6281	7234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_+_6300_7200
704881	contig_7057_pilon	+	2130	3	Intergenic	novelGene_123200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1375	junction_2	349	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1595	2059	419617	425684	FALSE	25	GTAAGAGTGTGTGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCIILGPGLILLRSCPQPCCDFHTQKYGFVLSLSILLCLGLDGLTSPCLGTPESLPLPTHFPPGVTTMAEDIKIKIKNYRTAPFDSRFPNQNQTRNCWQNYLDFHRCEKAMTTKGGDVSVCEWYRRVYKSLCPMSWVSAWDDRRAEGTFPGKI	418022	425755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_419927_421272_421374_425630
704882	contig_6137_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_59270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTAGTTTTAGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336134	1336627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1336100_1336600
704884	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_94135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704887	contig_12790_pilon	+	1995	10	Intergenic	novelGene_35246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	301.576884531873	1	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	186	881	307252	311077	TRUE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLERSHRVLSVALSLTGASQWKSCLTAPVICTTSRCRPCPPPLKLQQMRTRRGNYLRTS	305958	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310144_310370_310494_311029_311080_311898_312019_312348
704891	contig_10311_pilon	-	2130	6	Intergenic	novelGene_50493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	420	815	254359	246435	TRUE	70	AGAAAAAAAAAAAACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQETTSLPNLVSRWVPSPIRPRVSKTLGFDSGVLSCCLFGARCREHEAVQLLAMPSVNQPFIKLVLHEHLELLPLILCQTSLLHSFLPDLYLLLSLSQCFLVYRRKTPRYLCCVPFHFKGNNKYIEFTRW	254778	238272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_238756_242426_242791_245816_245950_246099_246599_251298_251453_254281
704892	contig_13241_pilon	-	3458	1	Intergenic	novelGene_158908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162666	159208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_-_159200_162700
704897	contig_1380_pilon	-	1922	4	Intergenic	novelGene_138887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	112.671597525237	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161909	144061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_145615_148555_148645_155063_155139_161704
704903	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704908	contig_5023_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_7350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTGGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611320	613090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_611300_613100
704909	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704910	contig_8658_pilon	-	1285	7	Intergenic	novelGene_55824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1117.15751649741	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	55	945	55624	6049	FALSE	30	CAGACTCTGAAGCAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGCTDNMTLTVARSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55678	5708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6775_13167_13265_30045_30246_34540_34626_36521_36674_55528
704922	contig_233_pilon	-	1344	8	Intergenic	novelGene_14609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.95736454552	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	120	704	109959	101700	TRUE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLFPEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHESCQASMPCCSLWWDCSSSGLSCPRSAPSTRSAPAGSAWSWGLAAPGARRCPPHTVYPSGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNIWHTNWPRAISSPSSP	127006	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78665_99779_99870_101673_101749_104174_104309_105461_105730_108724_108814_109914_109976_126903
704923	contig_5586_pilon	+	1228	6	Intergenic	novelGene_143567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	664	junction_1	230.410069224416	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	77	775	391113	430164	FALSE	50	AAAAATCAATCAGGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	388569	430617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
704925	contig_5389_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_143016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	160	471	372851	373162	NA	35	GAGTGAGGTTCACACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFFICKTGNTRVIKQSSLQKFQEEMDTVMKDPYKVVMKQSKLPMSLLHDRIQPHVRCRMPLVVEFLGQTPPRSLSNVFVFCFSLGNSGFNAVVNNFLSLLF	372691	375188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_372700_375200
704926	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
704935	contig_14711_pilon	-	1782	2	Intergenic	novelGene_68872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	582	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	193	1545	32270	30918	FALSE	20	TGATTGTTGATTTGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTAYLAFVVLLASCLGLELSRCRAKPPGRACSNPSFLRFQLDFYQVYFLALAADWLQAPYLYKLYQHYHFLEGQIAIFYVCGLASTVLFGLVASSLVDWLGRKKSCVLFSLTYSLCCLTKLSRDYFVLLVGRVLGGLSTALLFSAFEAWYIHEHVERHDFPSEWIPVTFARVAFWNHVLAVVAGVAAEAVASWMGLGPVAPFVAAIPLLALAGSLALRNWGENYDRQRAFSRTCAGGLRCLLSDRRVLLLGIIQALFESVIFIFIFLWTPVLHPHGAPLGIIFSSFMAASLLGTSLYRIATSKRYRLQPMHLLSLAVLIVVFSLFMLTFSTSPGQESPVESFIAFLLIELACGLYFPSMSFLRRKVIPETEQAGVLNWFRVPLHLLACLGLLVLHDSDRKTGTRNMFSICSAVMVMALLAVVGLFTVVRHDAELRVPSPTGEPYAPEL	33047	30680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_32289_32873
704936	contig_10674_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_6469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGGACTGTAAAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405062	406170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_405100_406200
704937	contig_16098_pilon	-	1943	15	Intergenic	novelGene_45801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_13	32.4926993369908	197	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	436	1725	93929	89047	TRUE	20	TCCTATGAAGTAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKGPRPSSGSPTSSQAYVWAKRHLKTWEADPVCVPPRGSPNQSLNQDLTVAPGSELWLHCGVYPATEAKGPISWTHVHPKKPNISLLSLDMKEDSLTREMWVRRSLLGGNVLWLPQVTVKDADTYRCHHGNLTIELELKVTARPVWRWLMKTGGWNVPAVTMIYMLFCLVSLVGFLYLQSVLILRRKRKRMTDPTRRFFKVTGNGAQNQYGNVLSLPTTTSGTGRALRWAAGLGGAASPYGSPQNDYREDEASRTRSPQGADLKEEEGEAYEEPDSEEVSEFYENDDANNLAQDQLSQDGSGYENPEDGDLGSEDRTLGPEDEDSFSSAESYENEDEALASPVPRAVDFLSPHGTAWDPSREATSLGSQSYEDMRGILYAAPQLRSLRPQPGANHEEDADSYENMDNPDGPEPAWGGGGHMGTWSTR	94924	88663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_88872_89036_89139_89243_89337_89912_89970_90051_90109_90227_90318_90398_90510_90630_90745_91193_91274_91697_91747_92210_92319_93351_93646_93784_93989_94324_94594_94817
704938	contig_1706_pilon	+	1074	5	Intergenic	novelGene_155032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_1	240.954871293361	2000	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	34	759	14289	28937	FALSE	15	TTGTCATTTTTTTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALWGFLSVLLLLLSGDVQSSEAPGAAAEGSGGSGVGVGDRFKIEGRAVVPGVKPQDWISAARVLVDGEEHVGFLKTDGSFVVHDIPSGSYVVEVISPAYRFDPVRVDITSKGKMRARYVNYIKTSEVVRLPYPLQMKSSGPPSYFIKRETWGWTDFLMNPMVMMMVLPLLIFVLLPKVVNTSDPDMRREMEQSMNMLNSNHELPDVSEFMTRLFSSKSSGKSSSGSSKTGKSGAGKRR	14255	29252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_14522_17170_17291_23535_23675_26188_26270_28784
704945	contig_10861_pilon	-	785	5	Intergenic	novelGene_39433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	891.190636171633	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACAACTGTGCTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432883	2423656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2423810_2425542_2425638_2427135_2427242_2430777_2430911_2432585
704951	contig_1339_pilon	+	1653	2	Intergenic	novelGene_163142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9378	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	6	299	431340	431824	FALSE	30	TTTTTTTTAGGAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGERWRWVDPDLRSPSGPETQAAGVFLSLS	431334	433178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431421_431611
704959	contig_9708_pilon	+	2170	3	Intergenic	novelGene_67271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52	33	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAACCAAGCCAATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768037	778735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_777312_777592
704961	contig_18869_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_56143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
704968	contig_20493_pilon	-	1609	9	Intergenic	novelGene_86407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	38.0854302850841	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	358	1548	49119	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	49476	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978
704971	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
704972	contig_9653_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_48261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAACCCCACAACATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992059	992852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_992100_992900
704973	contig_9653_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_48262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993310	994481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_993300_994500
704975	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704976	scaffold_12510_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_151408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGGTTCTTATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618758	620592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_618800_620600
704980	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
704985	contig_12916_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_165589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATTATAACATGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41639	42863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12916_pilon_+_41600_42900
704987	contig_12852_pilon	-	1588	3	Intergenic	novelGene_141453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATATTTTATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562036	558450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_558965_560763_560920_561118
704992	contig_14530_pilon	+	3792	3	Intergenic	novelGene_108454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_2	9.5	4	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	109	474	59966	76215	FALSE	35	TGTACTTAAACATGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLWRRRYGKQSGPCVRVPAALRVLSPHFSAVNGGGMEHEGSGSSGGSAGLLQQILSLKLVPRVGNGTLCPNSTSLCSFPEMWYGVFLWALVSSLFFHVPTGLLALFTLRHHKYGGAIAGVYRAAGKEMIPFEALTLGTGQTFCVVVVSFLRILATL	59857	79533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_60099_72817_72920_76084
704995	contig_12970_pilon	+	1403	3	Intergenic	novelGene_50547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	43.5	602	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	579	1154	610964	611539	FALSE	15	GGTCGCCCATGTCCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSIKCVLVGDSAVGKTSLLVRFTSETFPEAYKPTVYENTGVDVFMDGIQISLGLWDTAGNDAFRSIRPLSYQQADVVLMCYSVANHNSFQNLKNKWIGEIRSNLPCTPVLVVATQTDQREMGPHRASCINAIDGKKLAQDVRAKGYLECSALSNRGVQQVFECAVRTAVNQARRRNRRRFFSINECKIF	566411	611788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_566679_610329_610426_610748
704997	contig_9036_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_155461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTGAAGAGAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171903	170902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_170900_171900
705001	contig_7513_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_88940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCCATGAAGGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127414	127000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_127000_127400
705002	contig_7513_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_88939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTCTCTCAGCAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125259	124139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_124100_125300
705005	contig_9482_pilon	-	2037	6	Intergenic	novelGene_44249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	313	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	937	1332	451047	436791	FALSE	80	GTTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQVQEDLLQQAAATFLGNGIQDHVHAGLTHSHALFCVTFQILPFQADYGLSKGLAVVDDRDHVLDVAVWVLPVPEVLLFVQLCFLFVSKKHNPSDTLSMGSTEAFRTQHGHHVATLIKTAEITPPDSMQ	457500	436085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_437028_437121_437273_451039_451163_454611_454775_455371_455498_456968
705007	contig_6842_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_130845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTGGTGGTAAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2093506	2093821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_2093500_2093800
705009	contig_11285_pilon	+	1801	3	Intergenic	novelGene_5513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.5	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	153	698	635700	636245	TRUE	25	GCCCAGTTAGGAAGGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDVTLIEGVGNEVTVVAGVVVLILALVLAWLSTYVADSSNNQLLGTIVSAGDTSVLHLGHVDHLMASQGTPEPTELPHSSEGNDEKAEEAGEGGGDSTGEPGAGGGVEPSLEHLLDIQGLPKRQAGPESGSPESPLRSEDSTCLPPSPGLINVRLKFLNDTEELAVARPEDTVGALKR	633656	637476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_633784_635674_636356_636483
705018	contig_9345_pilon	+	1139	6	Intergenic	novelGene_24694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGAACGACGTGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947670	1001346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474_949607_952439_952563_955199_955356_997013_997093_1001156
705027	contig_8461_pilon	-	926	4	Intergenic	novelGene_163930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	120.361492550105	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	24	548	480296	441187	FALSE	40	TATGAACTTATGAACGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AANQKEPMNLNFKVKEEPKEEEAVSATLPPSSYVFSPESQVSAPSIPEDTLQPQEGKGNVLRRDMSVKAASELLMKLSAESYKETPMVKIKEEPMEVDIQDPHVSISPSQNVGYSTLIGREKTEPLQKMPEGRVPPERNLFSQDISVKMASELLFQLSEKVSKEHNHTKENTIRTTTRFTR	480319	440808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_441200_447170_447229_449561_449802_480082
705029	contig_19012_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_159474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17891	20450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_17900_20400
705030	contig_6710_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_97770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705031	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705035	contig_5686_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_45206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCAGTGGCGTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83616	85080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_83600_85100
705036	contig_15327_pilon	-	2789	17	Intergenic	novelGene_70567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1389	2069	669204	667155	TRUE	15	AGGGCGGCGCTTGGCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRFPQQRDAEKQRVAKAGQPQDVGGTQKRGQLDQARQELDNHEHQLALQQEEEALTNAIGGMPSLLNEPDDADGLLLAEGQRAGQAVELARELQRGKAVRGLGHAGAGGVAKGLPGAPGRVQGVQGDADVALEEEAAVAQVGRAAQAAGHLPVLLHDLNHLTHGLRGTVGEEGHQQGHIVDVLQVGPHLVDPPGQLGPVAILQEAGDVAVRGLEANEVRVALLFH	671483	663693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_663746_664135_664228_664337_664558_666488_666675_666757_666897_667123_667241_667355_667457_667748_667855_668025_668216_668493_668573_668845_668924_669163_669257_669628_669777_669884_669980_670095_670193_670385_670556_670657
705038	contig_11855_pilon	+	1710	11	Intergenic	novelGene_67070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	106.897333923723	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	559	1335	2089364	2105965	FALSE	80	CAAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVKVPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNRVEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVENAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINYHASDVLETSGWKSMVVSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS	2034448	2106340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2034540_2086215_2086360_2086951_2087074_2089021_2089075_2089215_2089368_2089903_2090032_2097169_2097348_2100083_2100140_2100603_2100727_2104362_2104506_2105820
705040	contig_12270_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_114094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	23	301	14409	13908	FALSE	25	CACCATCAGCAGCTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14431	13905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705047	contig_6589_pilon	-	1310	8	Intergenic	novelGene_26203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	110.812214754401	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	214	708	2032681	2030536	TRUE	15	TCATTGCATGTATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033657	2027927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028763_2030189_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
705051	contig_8823_pilon	+	2211	7	Intergenic	novelGene_53054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	41.7509148269698	69	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTGTGCGTCTGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51758	85992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_67524_67642_76219_76301_76878_76985_77800_77899_84409
705052	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705056	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_3003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
705057	contig_6048_pilon	+	2446	2	Intergenic	novelGene_73359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	290	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	986	1903	3032126	3033043	FALSE	45	ATAATACAGACATGCGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGCDALNGTVGGSDLPLCRDLPLALWALSLLYLLVGLPLGLGYNALLVLANLYSRRSMSMPDVYFVNMAVAGLVLGALAPAYLLGPAHARWALWRLSSEAQVTLLTLFHVSALVTMYSTALLSLDCYIERALPRTYMSSVYNTRHVCGFVWGGALLTSFSSLLFHICSHVSSRLAECAEMRSTEAADAIMVLVGYVVPALAALYALALIARLRKEDTPLSRGDAGRLDSSMHRLLGVTVGTQLGLWTPYYVTLLGQVLVATRGEACGRALHGGPAPRQGCCPAPGLLQQLGDAPALPPHGQELP	3021509	3033586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3022462_3032092
705063	contig_14838_pilon	-	1742	4	Intergenic	novelGene_151912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	126.483200465516	892	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	647	1552	109967	109062	FALSE	10	TGCATTGTGGTCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112892	108871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110262_110895_111007_111351_111461_112760
705065	contig_14441_pilon	+	1009	7	Intergenic	novelGene_100433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	352.493025935739	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	133	441	82151	116621	TRUE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRLLCCVVLCLLGAGAEDAVVTQFPRHRVLGKGKELTLECSQKMNHLVMYWYRQVPGHGLQLIYYSTGTGSIEDGDVTEGYSVSRDKTQNFPLTLASTSPSQTAVYLCASSEGTARQPGAALWRGDAALCPRQPDQGEPAQGGRV	81889	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82368_113661_113711_116578_116712_116865_116963_117220_117344_117539
705067	contig_15384_pilon	-	2450	20	Intergenic	novelGene_85147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	62.2383053127208	2	86	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1370	2089	121620	119239	TRUE	20	GACACAGAGCCTGGTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIK	127965	118786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119340_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127733_127857_127931
705068	contig_10711_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_118427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGTATGTTCAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739825	739070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_739100_739800
705075	contig_6076_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_81729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATAATTTTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46519	44996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_45000_46500
705077	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705081	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705082	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705087	contig_14041_pilon	-	1820	12	Intergenic	novelGene_144027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_6	21.2361768360402	363	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	130	1389	80924	26842	FALSE	15	ATGTGGGCTTATATTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRCQCVCPSLLHCLPSPLPPPPLPESSQPPALRVADTSLDRNFMNKHQKPVLTGQRFKTRKRDEKEKFEPTVFRDTLIQGLNEAGDDLEAVAKFLDSTGSRLDYRRYADTLFDILVAGSMLAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVVLYIKEEMKRNDLPETAVIGLLWTCIMNAVEWNKKEELVAEQALKHLKQYAPLLAVFSSQGQSELILLQKVQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKADVLSEEAILKWYKEAHVAKGKSVFLDQMKKFVEWLQNAEEESESEGEEN	104602	26410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_26871_30653_30777_41195_41335_42583_42731_44660_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73055_73233_80866_80932_104480
705088	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	90	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657833	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657835	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705091	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_90312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653816	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705092	contig_5260_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_144428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTGTTTTTTTTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582562	581488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_581500_582600
705094	contig_8020_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_114367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGGGCTGTGTTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105182	104732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104700_105200
705095	scaffold_12124_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_22424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCTGCATTTGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643421	1643040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1643000_1643400
705096	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705099	contig_16098_pilon	+	2187	5	Intergenic	novelGene_46059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	501.169819023452	53	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	205	504	436826	437402	TRUE	15	GTTCCAGGCTCGCGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYVSQRPLTPG	435974	439230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436759_436943_437045_437090_437263_438605_438749
705102	contig_5967_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_44397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGTTCCCAGACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402130	401205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_401200_402100
705105	contig_16907_pilon	-	2095	18	Intergenic	novelGene_87467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	97.0953229053996	2	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	834	2054	505728	480612	FALSE	25	GTTAACTCTACTACTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVHKGSKKLEMHVYSKRLEIMLQDIFGEDCVSVKDGSVLSVTVDGKTANINLDTRTVECEEGSEDDESLREMVELAAQRLYEALTPVH	524840	480570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_480714_482744_482842_485631_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495154_499443_499597_502080_502228_503134_503294_505626_505818_512288_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520275_524713
705106	contig_6102_pilon	+	310	2	Intergenic	novelGene_31807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCAAATCGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360126	361214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360137_360914
705109	contig_9484_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_105674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTAAAAAACTATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160140	160836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_160100_160800
705110	contig_7909_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_155899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCCTTGGTGGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398441	400191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_398400_400200
705111	contig_18869_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_55985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAGTGGTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67617	65931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_65900_67600
705118	SIRV4	-	318	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1202	1	1202	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
705119	contig_10904_pilon	-	1952	9	Intergenic	novelGene_22620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	328.626854311999	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	459	1421	510205	499664	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSLWPHPRKAPGGVSCSSVPLPASLPNHHAFTWKFCEPACCRLPQKRVLERVLFPLATYLAPQ	515806	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499852_500069_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515739
705120	contig_11989_pilon	-	2535	16	Intergenic	novelGene_68440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	343.920119924509	1	91	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	36	1220	90274	54047	TRUE	30	AATTGTATCTAACCCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGESGGMVWIAMLTGEFYVILIYAEHLASKRK	91079	45686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047
705123	contig_2069_pilon	-	787	3	Intergenic	novelGene_23526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	388	786	1509011	1508371	FALSE	10	ATTGGCATTGTGTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALAGNPKATPPQIVNGDQYYSPLLPQPSPGHEGPCDQFPVILNLLTLEPLPPSPGPFSSNCSHLSSIQRQHSLPTSLKQQLQCRLSQPALRLPPCLVLADRYLCWCHQPGLCQRPRNPCPGSTQRQLNVPF	1509870	1508369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508706_1508947_1509171_1509642
705131	contig_15216_pilon	+	1901	3	Intergenic	novelGene_165590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	2.5	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	151	384	52127	55941	FALSE	20	CCTCCTACTGCATGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRLAPTVFCPVGPLLARRPRDGCQGRSRAGPPTGRALPQRRETRQPELQMSMPFLREPRCQSQCQASQNPHYSKLCPSDRGKAEEQQQTSVHRSKIKVDSGIPGESFKQVSTTAKKDFPLDPLEES	47520	57458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15216_pilon_+_47646_52101_52220_55800
705133	contig_960_pilon	-	1663	8	Intergenic	novelGene_108217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_7	42.8752342767444	136	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	63	1193	335554	294719	FALSE	75	TTAAAAAAAGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEGESRAWQPSPGKKPQGERMQSCRLLGAGPQLSTFCVLQKLSGTMFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRVNQKEEEPIPVIVSPHQTILASLGSRLTIPCKVFLGVGIKSTSTVWWTANDTIIDSAYPGGRVTEGLEKEYSENNENYIEVPLVFDPVIKEDLKTDFKCIVTNRMSLQTLRTTVKEGKYLGTLK	335616	294248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_294888_296943_297080_304259_304323_306536_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_335540
705136	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705138	contig_9471_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_21755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1167	1499	367197	366865	NA	50	ATTTGAAAAATCAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKNEQTSLGRRTARMLLAEATIVRLRHMYFGHVIRRDQSLEEDITLGKGDQQKRGRPSMRWIDIVAATVGSNIATFVSIAQDRAVFRSVTYRIAMSWNYNGNITLGC	368363	366411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_366400_368400
705148	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_89266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
705153	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	404	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705169	contig_7593_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_127270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGATTCAGAAAATAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3368	1911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3400
705171	contig_14322_pilon	-	165	1	Intergenic	novelGene_115698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671439	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
705175	contig_4223_pilon	-	2991	17	Intergenic	novelGene_117268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	34	junction_11	110.095342203928	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	774	1856	193712	156597	FALSE	60	TCTGAAAAAAAATTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINHLQEARQAKGYDNPSFLRKLKADKEFRQKVMLGTPFLVIWLVGFIADLNIDSWLIKGLMYGGVWATVQFLSKSFFDHSMHSALPLGIYLATKFWMYVTWFFWFWNDLNFLFIHLPFLANSVALFYNFGKSWKSDPGIIKATEEQKKKTIVELAETGSLDLSIFCSTCLIRKPVRSKHCGVCNRCIAKFDHHCPWVGNCVGAGNHRYFMGYLFFLLFMICWMIYGCISYWGLHCETTYTKDGFWTYITQIATCSPWMFWMFLNSVFHFMWVAVLLMCQMYQISCLGITTNERMNARRYKHFKVTTTSIESPFNHGCVRNIIDFFEFRCCGLFRPVIVDWTRQYTIEYDQISGSGYQLV	302062	155461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_156736_158208_158304_159999_160158_161437_161522_162387_162482_165303_165367_166934_167058_182559_182663_184028_184172_193631_193758_200478_200601_201495_201561_210425_210571_211161_211240_236437_236561_242200_242305_301971
705183	contig_11978_pilon	-	2354	8	Intergenic	novelGene_62887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_7	98.1506547120709	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1230	2075	725148	721097	FALSE	25	AGATTCTATTGGCCATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYVQKQGNSTVYRWRTGTEPSVVERPHLEAPPEQVEEDAIDWGDFGAEAASEGIDYGISAQAAGIDWGISLDSDSKEAGSDGIDWGDDAAVSQITVLEAGTQAPEGVARGPDALTLLEYPETRNQFIDELMELEIFLSQRAVEMSEEADILSVSQFQLAPATLQGQTKGKMVTMVSMLQDLIGQLTSLRMQHLFMILASPRYVDRVTELLQQKLKQSQLLALKKELMVQKQQEALQEQAALEPKLDLLLEKTRELQKLIEADISKRYNGRPVNLMGTSL	726617	720817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_721163_721268_721441_721813_722020_723327_723417_724025_724105_724509_724621_725025_725532_725771
705184	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	30	353	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14438	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705188	contig_1686_pilon	+	2718	15	Intergenic	novelGene_165593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1322	1822	286330	295227	TRUE	15	GCACCTGCTCAGCGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEQQAQRRPARREGVQEVPQAHARVSHEACIVGSSLLTAELLQPPPLSDVTGVVREGTQEGLFRDCSYFQAPGEDGLQRAALRDVRRQRCCTLLPCVLLNLQEDAVFSLVCELQPLEQALDLLLAVRTDHVEGISRLAGEVCFRNVQFQQQSGFYGIVGSKLNCL	275687	310258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_276386_277673_277857_277973_278067_279395_279515_284975_285163_286288_286335_287545_287729_292130_292214_293179_293341_295158_295281_296936_297318_299667_299785_301826_301983_307857_307988_310199
705189	contig_2636_pilon	-	902	5	Intergenic	novelGene_52072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	168.058025693509	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	116	631	85555	59826	FALSE	35	GTCAAGAAGTCATGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85670	59554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_81113_81216_85551
705190	contig_12270_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_114100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	27	305	14409	13908	FALSE	25	TTCACCATCAGCAGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14435	13907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705198	SIRV2	-	620	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	26	2971	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
705199	contig_6710_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_98123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653439	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
705203	contig_7230_pilon	-	2242	11	Intergenic	novelGene_52520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_8	81.6164811787423	945	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	162	1646	67617	15131	FALSE	20	ACTGTTAATCCTTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGTFVVSQPLNYRGGSRVEPADASGTEKAFEPATGRVIATFTCSGEKEVNLAIQSAKSAFKIWSQKSGMERCRILLEAARIIRERRDEIATVETINNGKSIFEARMDIDTSWQCLEYYAGLAGSMAGEHILLSGGSFGYTRREPLGVCVGIGAWNYPFQIACWKSAPALACGNAMIFKPSPFTPVSALLLAEIYTEAGVPSGLFSVVQGGAATGQFLCQHPDVAKVSFTGSVPTGTKIMEMAAKGIKPVTLELGGKSPLIIFSDCVMENAVKGALMANFLTQGEVCCNGTRVFVQKEILDKFTEEVVKQTQKIKIGDPLLEDTRMGPLINRPHLERVLGFVKLAEEQGAKVLCGGDLYEPEDPKLKGGYYMRPCVLTNCRDDMTCVKEEIFGPVMSILSFDTEAEVLQRANDTTFGLAAGVFTRDIQRAHRVVAELQAGMCFINNYNVSPVELPFGGYKKSGFGRENGRVTIEYYSQLKTVCVQMGDMESAF	67778	14534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_15226_17154_17268_20205_20348_23126_23215_23458_23648_28168_28310_28991_29189_32632_32768_43473_43604_65630_65777_67508
705204	contig_18272_pilon	-	2245	2	Intergenic	novelGene_7017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	757	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	183	416	262678	184335	FALSE	55	GTGTGTGTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALLQQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSR	262860	182505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_184551_262660
705206	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
705207	contig_18843_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_165621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	184.044152311341	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3	509	37271	46092	FALSE	45	AAATGAAATGTTTATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERHHRSSSGSSHSGSRSSSKKK	37268	46818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44351_46028
705208	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_94260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705214	contig_5321_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_153877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTCCACTTTGCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61738	62747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_61700_62700
705217	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705221	contig_2733_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_128547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAACTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524326	525811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_524300_525800
705222	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
705231	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_95707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705232	contig_4924_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_84719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTCCCTACAGTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105283	106014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_105300_106000
705243	contig_7286_pilon	+	639	5	Intergenic	novelGene_108672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	234	332	288412	288510	TRUE	35	ATCAATCTTAATGAACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQSCCIIFNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286879	291358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290859_291321
705250	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91676	15	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
705253	contig_10045_pilon	+	1536	4	Intergenic	novelGene_163754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5058680596133	112	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	9216	24808	FALSE	25	CACATATTGTTCTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLCLKECLAGGQSGGTRVSHHEALLLCFRALPEVELLRASQRSWSLAFRMRLQTDSVSGAGITIKRSLKICSLQVGHPHLLLSCSRLKTMRQFIVQDPPLDRKHQSPAEVFK	7589	25861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_7652_9136_9237_15996_16117_24607
705255	contig_12622_pilon	-	1418	12	Intergenic	novelGene_6050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	448.829681109247	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	46	1086	1691275	1685486	FALSE	25	GGATTGGCTGTAATTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691527	1685153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690027_1691179_1691276_1691482
705257	contig_3529_pilon	-	1884	2	Intergenic	novelGene_105384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2231	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGTAAGGTGTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780352	777263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713
705260	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_96362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705272	contig_15105_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_150930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGACAATTGGACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221538	220520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_220500_221500
705273	contig_15105_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_150931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCTCCCCACACTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222174	221458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_221500_222200
705275	contig_17075_pilon	-	2211	2	Intergenic	novelGene_131754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5743	junction_1	0	42	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACACTATCTGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91110	87996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995
705281	contig_3449_pilon	-	1608	10	Intergenic	novelGene_73710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	340	junction_6	183.040844123064	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	186	1034	328842	307815	FALSE	35	AAATGATTTCAAGTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLSVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVLEDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGSLLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLITLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFVCVLNI	347014	307240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_318314_318407_322018_322114_324625_324712_327360_327429_328710_328880_346866
705287	contig_3320_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_133060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCAGCCATTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123664	126025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_123700_126000
705289	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
705303	contig_12270_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_113934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	8	334	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14416	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705305	SIRV2	-	626	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4247	34	3072	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1700
705308	contig_8673_pilon	-	2055	12	Intergenic	novelGene_129912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	32.5208134244075	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	150	818	245309	231813	TRUE	30	TGCCAACTGCCAGCTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWRWATSAALLAPASFRRRARAAAAAAASAAWGGEARLRRPSEDSSVSMVQLSSSPSGYQSPSGHSEEGRGGNMKSAKPQVNHNQHGESQRAMSPLHSIISSAASPSQAYETYIDNGLICLKHKIRNIEKKKLKLEDYKDRLKNGERLNPDQLEAVEKYEEVLHNLEFAKELQKTFSGLSQELLKAQKKAQRREHMLKLEAEKKKLRTILQVQYVLQNLTQEHVQKDFRAGLHGAVYLPSKELDYLIKFSKLTCPERNESLRQTHERSTV	246453	216021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_216139_223384_223441_224483_224566_225761_225885_228515_229191_230094_230139_231672_231841_234831_235071_239890_239978_243495_243559_245057_245324_246318
705310	contig_15449_pilon	-	1462	7	Intergenic	novelGene_33664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	117.222011584856	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	194	1159	196078	191270	FALSE	15	GAGATGTGGCAGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQDVF	196271	190966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191281_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
705311	contig_4385_pilon	+	2446	2	Intergenic	novelGene_141524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	146	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1843	2316	473697	474170	FALSE	10	CATTCTCTCTGCTGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRQPATSSGPSAVGCWALSCWTETSWPAAWTADSQRGPVGLGSRVWLRSEACGGSGPLGQWLCRGLVAVSQRRLLSEGHVLCSARLYLALGHSGGRGAWTLGTPGGTVASLSHLASLAGWGLVLGDLGDSVSGQGRAWTSGTLRAGPWGPWGKWSC	470991	474300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_472807_473669
705316	contig_18869_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_56397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCATTTATCACATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73571	73388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
705320	contig_7333_pilon	+	1456	10	Intergenic	novelGene_142787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	131.429744646247	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	44	796	218455	225101	TRUE	20	TGAGTACCCTTCCGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTAASAAVVPTLAPPLEQLRQFAGELRLLMPRVRVGEALETTEEFNREKFWSRLNEAAVTVAGEATTLTAAFSRLPLPSPQDLIFCNTVWAACQQVPRLPRDNKAAALLMLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPRPLESKLQTVEMAWRHQTF	218411	237582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_222964_223026_223598_223676_224012_224321_225043_225167_230329_230391_236788_236836_237095
705324	contig_7708_pilon	+	2999	6	Intergenic	novelGene_61524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_3	50.6256851805484	8	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	206	1051	250654	264717	FALSE	30	ACCAACAGTAGTACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMGVPEKPHSD	249493	266665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187_257288_264687
705325	contig_854_pilon	-	1255	10	Intergenic	novelGene_36418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	106.867519231367	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	374	1084	1074160	1064774	FALSE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081752	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
705327	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_89571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653770	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705334	contig_15118_pilon	-	1324	7	Intergenic	novelGene_74632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1761	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	915	1322	451933	438474	FALSE	20	ACTCCGCAACCTCAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLPSSSRFTFSFSASLARIRATCRGPRRSASAAGTSTWMPRSAPIARAVRMVTWHCAGPQLTAMTSFNSFFSLSRTASSTAISQKGFMECFTPSVTTPVLSGFTRIFTAKSMTLLTPTSARSSAIFLLSLPGTG	458980	438471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_438557_448779_448944_449193_449347_451925_451989_452409_452589_457304_457771_458766
705338	contig_10235_pilon	+	853	6	Intergenic	novelGene_46362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGTCCGGGGCCGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130281	141265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_130459_130749_130897_131425_131534_131618_131739_140328_140457_141092
705339	contig_9468_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_59490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3525	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	40	498	319740	320198	NA	20	TAATATTGTGTTTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGGLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRWKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319700	320265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319700_320300
705343	contig_14483_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_133760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111235	113061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_111200_113100
705345	contig_11071_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_131044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198415	195742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_195700_198400
705346	contig_10801_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_74062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATTTCTGAATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366946	365035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_365000_366900
705347	contig_5033_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_29095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	16	378	754277	753915	NA	20	CCTGCTGTCAAGATTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVSVMRLPGQGSQPGSPKRLPASAGIFRTMEQPDPARPFGSTLESTPSQFSFGGNDAAPVSPINCFCFRSPVLTATVSRCSRSSSLPSLPLPCTHASLLWPLAPSGKRCFMSALCSLEQPAPLC	754292	752419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_752400_754300
705356	contig_10479_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_147095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATGAGGAGAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24968	23614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_23600_25000
705357	contig_19459_pilon	-	1221	9	Intergenic	novelGene_59852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8611.21791618352	16	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	205	942	16218	6947	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAKTVRQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHSRNPALLLT	16830	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6977_7056_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15694_16197_16265_16672
705358	contig_12250_pilon	-	1224	9	Intergenic	novelGene_80698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_5	169.536823065079	4041	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	79	642	401239	399347	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401317	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
705360	contig_9646_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_117488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578747	578009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_578000_578700
705365	contig_13894_pilon	-	1426	3	Intergenic	novelGene_62045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	594	1349	287240	286290	FALSE	10	GTACTTCTGCAGGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTTARVNELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287021_287215_287652_288128
705370	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705371	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705372	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_97795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705373	contig_10197_pilon	-	1044	5	Intergenic	novelGene_115215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1491.31106329297	3560	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	97	672	952331	909985	FALSE	15	TATTATTGCGCCTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEIFIVMILL	952427	909612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910009_918086_918268_920434_920542_923908_924109_952267
705375	contig_6635_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_127018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAATGGACTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414067	415319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_414100_415300
705376	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705377	contig_2537_pilon	+	1308	13	Intergenic	novelGene_33409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	266.713160009442	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	531	1289	232453	239846	FALSE	80	AGAAAGAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDENMWILYF	205803	239865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239822
705378	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705379	contig_15760_pilon	-	2314	2	Intergenic	novelGene_131055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1408	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTAATCTTGCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40355	30646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_30839_38233
705389	contig_8284_pilon	+	1196	11	Intergenic	novelGene_125706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	495.484369077371	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	274	927	431923	461340	FALSE	20	ATTAAGCTATCGGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425065	461609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431719_431790_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
705391	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705393	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705395	contig_3469_pilon	+	1926	16	Intergenic	novelGene_34159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGGAAGTCATTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380023	413495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_380537_383202_383366_383777_383853_384227_384317_385139_385192_385269_385348_385527_385564_392531_392650_393185_393374_393725_393907_395427_395517_403814_403915_408079_408126_408540_408641_413288_413334_413442
705396	contig_18869_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_56241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73722	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
705399	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1422	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705403	contig_14441_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_100396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAAATGTGTGCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64618	63079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_63100_64600
705412	contig_13216_pilon	+	1965	7	Intergenic	novelGene_47495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	684.919642488567	2	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	1	1428	229682	261012	FALSE	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSETVSQQVDNCNETQCWSSIPVSSLNAEYCVSAEGVADRWDVTTEKSKEYCITVPDNSTTYSLWIPVVSAVLFVLLIFIFVYCQIKKINPFKRKSITLPKSLLSVVKNATSETKPESKYVSFITSYQPIALENEKVISGEQLSPATISSMHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229681	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256120_256296_258447_258573_260430
705416	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705422	contig_8693_pilon	+	1831	5	Intergenic	novelGene_150861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	11.1803398874989	252	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	111	515	1056663	1073759	TRUE	10	CTTTCTGGCCCAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAEGFVRVDRDYVLKSAELAKAGGVQTFQLAVLSRSR	1056552	1077284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1056852_1061608_1061717_1073651_1073791_1075676_1075739_1076061
705423	contig_5791_pilon	-	1272	7	Intergenic	novelGene_35863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	381.447535346897	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	322	756	1083950	1079821	FALSE	30	AAATTATTGCTGTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094397	1079304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1094348
705426	contig_10074_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_57083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAAACAGTTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67495	65759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_65800_67500
705434	contig_5153_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_74342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	454	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	87	302	672093	672308	NA	60	TAAATAAATTTACAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKCLDSTTKTESFFKKTKAIRAIYTVKGMKRRGGCTWSWKTSNPLCRSSPQLLVGTEQCQVVCSHPCSVPTSPRRAGSWPRSVRTSQNVQLQSDLQMPS	672006	673848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_672000_673800
705435	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705436	SIRV7	+	163	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATCCTTTTTTCTAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	70982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883
705445	contig_2867_pilon	+	1809	11	Intergenic	novelGene_135161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_10	16.7812395251364	297	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	550	1389	544003	550083	FALSE	25	GCTCAGAGTCTATGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELNECLGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQELEQRLEADVLRFSVCDVVLRHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLLLENPKFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKQTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFTVFVHAKMAELQVKDLSLKLQGIPGHVFLLQLFHGQHTKHQFLLRARTESEKQRWISAMCPSSPKEDKEVISEREDCPQVQCVRTYKALQPDELTLEKTDILAVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRITSATSKLGEPPA	542326	550503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_542444_543211_543373_543480_543634_543884_544015_544157_544233_544596_544687_544867_545029_546957_547117_547608_547689_549409_549515_549925
705449	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705450	contig_6871_pilon	+	1441	11	Intergenic	novelGene_21521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	365.813340380036	1587	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	87	1385	54514	72153	FALSE	20	TGAGTTTTAATGGTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRPSYAPPPTPAPATQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTVGESTITASGKQLELARNGFRASSGITIPKPPKPPDKPLMPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	52491	72209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54467_54521_54695_54740_57960_58129_63387_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
705451	contig_19459_pilon	-	810	4	Intergenic	novelGene_59848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	11099.706782914	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2	475	15696	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSETKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15697	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10277_15503
705453	contig_3975_pilon	+	2625	1	Intergenic	novelGene_54867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTACAATGGTAGAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2091324	2093949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2091300_2093900
705457	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705458	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705459	contig_9505_pilon	+	1521	14	Intergenic	novelGene_121815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	46.0159478400837	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	130	1356	404142	447348	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVVFQHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404012	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419540_423399_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
705461	contig_14687_pilon	+	1810	2	Intergenic	novelGene_107948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	498	896	572992	582572	FALSE	35	CGCTTACAAAAATACCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAYTCESWTMNKEDRRRIDAFELWCWRRMMNIPWPSRRTNKSVLEEIQPECFLEGRMVRLHLTHFGHVIRKDQSLEKDIMLELHFISLKVTPSFHKGSGTYINNGIMAEGIIFTINSNNLKTITHLWKNP	572494	583486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_573242_582423
705465	contig_6710_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_95805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
705467	contig_10489_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_165635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATGATGAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485052	484088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_484100_485100
705468	contig_6241_pilon	-	2644	7	Intergenic	novelGene_156408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	134.652226948618	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	520	1794	195215	182261	FALSE	85	ACAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPVFEAVGRIYELRLMMDFDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMKKREEILEEIAKVTEGVLDVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLMPGRIQLWGHQIAVDWAEPEIDVDEDVMETVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYCRRRCCCRRCCCHHSHWVNASTFPGSPNNSSIHGGSKHSENSHCRDLRCQLRPICCCSGHSHDRHTTEEHGSHRCCLWRICRLYTSGLPCCCYSGSHS	365526	181410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_189892_194237_195247_219950_220075_293626_293710_365087_365246_365403
705472	SIRV4	+	307	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1452	644	997	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2452	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
705475	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705478	contig_7202_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_18645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
705481	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705485	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_19090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCCGCCATGACGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
705488	SIRV6	-	539	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9439	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11122_11215
705500	contig_9706_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_20882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2956	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_4000
705502	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705503	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
705508	contig_6364_pilon	+	2415	7	Intergenic	novelGene_51851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	251.468630692224	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	103	1272	1772471	1785208	TRUE	0	TTCTTGGCCCTTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLAKDMKNKLGIFRRRNESPGGPASGQGRQSDEVIQAHLRGSPQVG	1771076	1787719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1771179_1772470_1773440_1781110_1781176_1784680_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772
705511	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705516	contig_5502_pilon	+	1939	6	Intergenic	novelGene_154960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	459.645689634962	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	126	635	362755	379535	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HASSLAALPLSRCSAAQSRQPAAARQRHDRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVLVPVQQWTPPCCSVYTPAGTRTLCL	357628	381537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_362720_362896_363179_363343_377698_377826_379456_380730_381427
705517	contig_16098_pilon	-	1925	8	Intergenic	novelGene_45866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	47.910205124817	616	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1314	1661	247137	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	250634	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211
705522	contig_2487_pilon	-	1761	3	Intergenic	novelGene_148460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_2	175	188	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	342	719	221813	133309	FALSE	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGPRCKRRKQANPRRKNVVNYDNVVDTGSETDEEDKLHIAEEDGIANPLGQETSPASMPNHESSPHVSQALLPRDEEEDEIREGGVEHTWHNSEILQASVDGPGKCWKLLGPFLCHLKLISAT	224659	132266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_133629_221755_221898_224402
705525	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
705528	contig_13300_pilon	-	1877	6	Intergenic	novelGene_125810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	23.8377851320126	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	250785	248617	TRUE	20	TTTTTTCCCGGAATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250787	244144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247029_247267_247440_247547_247919_248071_248782_250575
705533	contig_6710_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_96463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653685	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
705537	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	19	351	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14427	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705539	contig_6710_pilon	+	1739	10	Intergenic	novelGene_89045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	204.694955217167	665	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGACTCTTTGTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568206	603447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_568373_573223_573343_574267_574329_575648_575705_584580_584641_587685_587751_594844_594914_595689_595832_597741_597842_602546
705551	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705555	contig_15327_pilon	-	2213	13	Intergenic	novelGene_70748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_5	93.9791643574965	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	40	2016	1064459	1043050	FALSE	55	AAACTGAAACGATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPDLRREREAASFNPELLTNILDGSAENTRRRREIENLILKDPDFQHEDPNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVQKMREFSIADPEEIMWFKNFVHRGQPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQKRFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLFTQGKGYGLHAFIVPIREIGTHNPLPGITVGDIGPKFGYDEMDNGYLKMDNYRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPVSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARSLSKACTIAIRYSAVRHQSEIKPDEPEPQILDFQTQQYKLFPLLANAYAFQFVGAYMKETYYRINEDIDRGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTTNAGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVTFTPTCTFEGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVYGMVSYLNDLPSQRVQPQQVAVWPTVVDINNPDSLTEAYKLRAARLVEVAAKNLQAEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFSEKLHKIQDKSIQTVLRNLCLLYSLYGISQKAGDFLQGSIMTEPQITHVNQRIKELLTVIRPDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKKSPLNKTEVKNQHLFYELKKS	1064498	1042852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1043299_1043418_1043563_1043657_1043764_1043877_1044058_1044474_1044666_1045131_1045295_1046422_1046593_1047041_1047158_1047299_1047420_1049071_1049180_1051354_1051516_1063935_1064096_1064350
705557	contig_4891_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_124604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1065	1373	959366	959674	NA	55	TTTTAAGAGGATAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRPVLRGTFTQIRLSFLSTYSSFVKWEEDEVSTLLNVPNAKPHPWHLSPGYSRELEGCYKGSLLFSNSKHYRWRWQVKGQERIHHVVAGKQEALTVGGITA	958301	961167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_958300_961200
705559	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705561	contig_7202_pilon	-	415	2	Intergenic	novelGene_18584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGACATCAAGGTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30077	28498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
705564	contig_18647_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_162839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	8	340	70332	18905	FALSE	25	GATGGGAGTACGGATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVMSCVSRVWSRANLHVEVLHNLQLKWHCNNGLKHSGCSNGLKHSNDCEDGTGPGSVSFCCTQGLYESEPTGRHLVGTLETEMAATVTALLPHNACFSATNIEAAAILLQANT	70339	18902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_-_19020_38289_38443_70267
705569	contig_8576_pilon	+	1521	8	Intergenic	novelGene_88795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_7	541.923482813293	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	5	1258	893619	915483	FALSE	35	ATAAACCTTGAAGTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRVGTTT	893614	915746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915465
705570	contig_11512_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_43223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	26	352	4011	4560	FALSE	15	GCTTATGCTGCTTATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	3985	4560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
705574	contig_15304_pilon	-	996	4	Intergenic	novelGene_30562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1305.10927596973	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	213	995	54100	52899	FALSE	25	CCGTGCTCCACCAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFFAPEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKGWSLLLSPTLTPRIN	54312	52897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52944_53005_53320_53491_53807_53991
705580	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_95018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705584	contig_16970_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_157613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAGGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180987	178866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_178900_181000
705589	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_94114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
705590	contig_8978_pilon	-	1394	8	Intergenic	novelGene_49332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	986.09713062173	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	33	479	194082	192981	TRUE	25	GAATGTCTGTCATGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLEI	194114	190466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190924_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_192989_193215_193398_193613_193768_193979
705591	contig_12119_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_88680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATTATATGAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374346	373274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_373300_374300
705592	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
705595	contig_15752_pilon	-	448	4	Intergenic	novelGene_148767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	11.4406682011537	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	15	446	226351	224674	FALSE	10	CCTGTCTGTTCTGAGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRVMPLQQEEEEEEEEGFYQELDDMLESITNRVIKSELEDFELDKSSDFSQTTDIGIRNNFCALLVMGVCEILIEYNFSISNFSKNKFEEVLSLFMCYKNLSDVLKEKASKGKAKMANKTNDSLLSMKFVSDLLTALFRDSTQSHEE	226365	224671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_224699_225363_225529_226032_226155_226231
705596	contig_12427_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_40483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320981	318665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_318700_321000
705598	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705602	contig_15045_pilon	-	1959	4	Intergenic	novelGene_130065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.220836791512	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	154	948	166837	157268	FALSE	15	TTTGATTGGACTCATGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNAVVILAFVVDKKLRHRSNYFLLNLAISDFFVGVISIPLYIPYTLYNWDLGDKLCTFWLIIDYLLCTASVYNIVLISYDRYQLVLNAVSYRAKQTEILKIVALMVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKECEPGFFLVWYIIAITSFFEFLVPVISVAYFNMYMYWSLWKRGSLGRRQSHPGLNSPDSSNDCGHSFKCRPFSRTSLPELKETEVPLRSEKQRRKSSFLHSFRTQVNTCTIASKMCSFSHSHSVTHQREVS	166990	156256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157277_157470_157987_164354_164519_166731
705603	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705604	contig_16211_pilon	-	2538	3	Intergenic	novelGene_150098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1474	junction_2	1312.5	55	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	439	972	205451	201359	FALSE	55	GTACAATAGTAGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEVWLCGYVWSGRKNFQFSITRC	205889	199792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_201599_204230_204405_205331
705613	contig_20332_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_156177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATTTGTCTATTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83346	81678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_81700_83300
705616	contig_7410_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_106120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTTGAGGTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609817	611331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_609800_611300
705620	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705622	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705624	contig_12270_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_114112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	31	303	14409	13914	FALSE	25	TTCACTTTCACCATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTD	14439	13913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
705630	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
705631	contig_12605_pilon	-	575	4	Intergenic	novelGene_64172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTTCCGGCAGGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5769	3868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_-_3952_4354_4532_4792_5066_5727
705636	contig_7356_pilon	-	514	4	Intergenic	novelGene_60395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	68	457	457848	433924	FALSE	35	CTTACTAAGGAAATCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457915	433866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
705637	contig_16098_pilon	-	1618	9	Intergenic	novelGene_46116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	1	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	316	1410	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460442	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
705638	contig_9014_pilon	-	1350	13	Intergenic	novelGene_106753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	96.7337410972338	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	371	1093	82177	78380	FALSE	5	TTGTTTGTTTTTGGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWRRTSKVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	85901	78122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82154_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_85745
705643	contig_9243_pilon	-	1970	8	Intergenic	novelGene_60308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	295.269575894604	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	315	686	32876	20056	FALSE	45	TTGTATAGATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRKPSVPSKKLLVSYNFTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64639	18771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27350_32824_32918_34503_34652_47702_47767_64578
705644	contig_17500_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_157917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTAACCAGTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234348	232471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_232500_234300
705653	contig_3942_pilon	-	1183	10	Intergenic	novelGene_128863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	13.5154232884755	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	232	1014	1491123	1486376	FALSE	15	CTCCAAGGACTTGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1492711	1486206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918_1492062_1492631
705654	contig_6710_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_97076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGATGGTGGGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	653837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
705659	contig_11338_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_6390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTATCACCAGCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309505	310735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_309500_310700
705662	contig_8538_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_4755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
705663	contig_12864_pilon	-	1275	6	Intergenic	novelGene_76425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	595.420993919428	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGAGTTGCTGCCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251993	242233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246190_246348_251954
705671	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705676	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705677	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705679	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705682	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
705687	contig_11720_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_43758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	901	1257	15844	16200	NA	25	ATCCGTGACAGAGCGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCQEVLANQATGSQDLEESIAKILANKGIDDGVEAAVEEAKNLSGIQGPANVVSTLTGLLDHPSPHQGVCDQNQVVGQPAKQEDEYDNKDDLHRPVLLLHVGLQQCAQGETIAEYHD	14943	16623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_14900_16600
705688	contig_19218_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_165643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTACAGAGTTCTGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5537	4527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19218_pilon_-_4500_5500
705691	contig_1719_pilon	+	1349	2	Intergenic	novelGene_87372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	609	1037	766116	771857	FALSE	35	GTACATATCACTCCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPDQGKTDDKDLPPEPTEKIKFCSLKPLTCVCVTHVAIATRTAFPSCIPLPFPLHKSTSTASFPLTQNHHLQEALSKPSMLTLAPSTLTEFRIYVEFALVAASIGKPSQIASYLCVFSLYICFLADAEQRGGLLDVNMPAL	765507	772169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_766173_771485
705692	contig_12790_pilon	+	1566	7	Intergenic	novelGene_35206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.063326200577	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	176	700	307252	312473	FALSE	15	TTATAAGGGGTGTGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305928	313339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306002_306041_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309731_311973_312035_312348
705694	contig_6286_pilon	-	1539	8	Intergenic	novelGene_165659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3245.48137368539	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	264	1238	364418	357787	TRUE	5	TTCCCGGTGGACTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPFKARVSSGYVPPPVATPFSLHSSPRPAAGATAPLPPWKAPSSSQPLSQAQALPQSQTQVPVPPQVRPQARPQVPPQVKLQAQAEPMSSADTQPRGPTAPKFSPVASRFTPVASKFSPGAPGAPGGPVSQPNQKVGSPEAPSSMGTVSPQPPSVTCAQQKEKPHVQEKQSPGSLPRPAPNQVRPPGAPGPLTLREVEELEQLTKQLMQDMEQPQKSSAGTSELCGRCCQPLARAQPVVRALGQLFHITCFICHQCSRQLQGQQFYSLEGSPYCEGCYTETLEKCSTCGQPITERMLRATGRAYHPNCFTCVLCACPLEGTSFIVDQANRPHCVPDYHRQYAPRCSVCGEPIMPEPGRDETVRVVALDKNFHMKCYKCEDCGKPLSIEADDNGCFPLDGHVLCRNCHTARA	364774	357439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_357683_357728_357886_358289_358411_359979_360159_360238_360409_360556_360678_364133_364662_364754
705705	contig_8628_pilon	-	500	5	Intergenic	novelGene_164404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	21.7140507506085	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	124	498	354164	335808	FALSE	55	AATCAATGTTAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERKGTAKVDFLKKIEKEIQQKWDAEKVFEVNASDLEKQSSKSKYFVTFPYPYMNGRLHLGHTFSLSKCEFAVGYQRLKGKSCLFPFGLHCTGMPIKACADKLKREIELYGCPPEFPDEEEEEE	354287	335805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_335889_338130_338212_338614_338703_340772_340892_354158
705711	contig_2069_pilon	+	648	3	Intergenic	novelGene_23498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGCAGGCCACTCATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508364	1509786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
705713	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705715	contig_13901_pilon	+	1205	5	Intergenic	novelGene_146623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	63.1441802543987	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	593	907	64511	86561	TRUE	50	AATCTAGATGAAGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFPNILPPAGDGGLTSSQSEFQKMLIDERLRCEHHKTNYQTLKAEHTRLQDEYIKSQNELKRLLNEKQTHQEKFQLLLEELREELVEKTKDLEEMKLQPRSI	2236	90233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2704_64385_64660_65112_65264_86546_86779_90152
705716	contig_14704_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_82706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCTGTCTTACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80656	80159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_80200_80700
705721	contig_7396_pilon	-	2025	16	Intergenic	novelGene_79631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3183.74859699834	1	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	195	1580	255163	246385	FALSE	15	AACCTATTTTTGGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257463	245939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
705722	contig_4125_pilon	+	1766	5	Intergenic	novelGene_25236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.798580360887	605	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	60	653	2792282	2795244	FALSE	5	ATGTGGCTGTTGTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAVAAAAAAVSGSRTGVAMLQLRDSVDSEDGEIQGVWLLTEVDHWNNEKERLVLITDQSLLICKYDFINLQCQQVVRIALNAVDTISYGEFQFPPKSLNKREGFGLRIQWDKQSRPSFINRWNPWSTNVPYTTFIEHPMADADEKTTSLCQLQSFKALLIQAVKKAQKECPLPGRANAVLILERPLLIETYVGLMSFINNEAKLGYSMTRGRIGF	2792222	2796357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2792315_2792665_2792701_2793073_2793251_2794232_2794387_2795049
705726	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705727	contig_6489_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_128916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_4	178.716780129903	1038	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	29	745	100350	208496	FALSE	15	GCACTTGGTTGCTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGAAAAAMAQQQMTSSQKALMLELKSLQEEPVEGFRITLVDESDLYNWEVAIFGPPNTLYEGGYFKAHIKFPIDYPYSPPTFRFLTKMWHPNIYENGDVCISILHPPVDDPQSGELPSERWNPTQNVRTILLSVISLLNEPNTFSPANVDASVMFRKWRDSKGKDKEYAEIIRKQVSATKAEAEKDGVKVPTTLAEYCIKTKVPSNDNSSDLLYDDLYDDDIDDEDEEEEDADCYDDDDSGNEES	100321	209297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_100527_166604_166692_179571_179670_203703_203839_208276
705728	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	971	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705736	contig_6710_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_97594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAAGCACAGCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653388	653886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
705740	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705743	contig_405_pilon	-	2434	6	Intergenic	novelGene_135287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_5	44.1696728536674	318	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	321	1157	190847	136762	FALSE	35	TAAAGAGTGGCCATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDQALQQMLDRSCWVCFATDEDDRTAEWVRPCRCRGSTKWVHQACLQRWVDEKQRGNSTARVACPQCNAEYLIVFPKLGPVVYVLDLADRLISKACPFAAAGIMVGSIYWTAVTYGAVTVMQVVGHKEGLDVMERADPLFLLIGLPTIPVMLILGKMIRWEDYVLRLWRKYSNKLQILNSIFPGIGCPVPRIPAEANPLADHVSATRILCGALVFPTIATIVGKLMFSSVNSNLQRTILGGIAFVAIKGAFKVYFKQQQYLRQAHRKILNYPEQEEA	191167	135484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_136879_137793_137961_138095_138280_150337_150469_165723_165927_190812
705746	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705751	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705753	contig_18869_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_56030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73544	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
705755	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_94824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
705756	contig_3095_pilon	+	1200	5	Intergenic	novelGene_75120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	31	804	147241	151848	FALSE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERLTMCVLL	147210	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151138_151825
705760	contig_18869_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_56197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
705762	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705770	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705771	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
705774	contig_14322_pilon	-	321	2	Intergenic	novelGene_116514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTATGCCGGGTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674844	672786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
705777	SIRV7	-	292	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91632	2	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
705778	SIRV6	+	566	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
705783	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_90727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705784	contig_14273_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_21166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTATCTATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313150	310647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_310600_313200
705792	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
705794	contig_18184_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_123846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACAGAGCTGAAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18061	17767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_17800_18100
705798	SIRV5	+	426	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7456	1	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
705805	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705806	contig_8377_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_35108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGTTACCCATCAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159363	157910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_157900_159400
705808	contig_15304_pilon	-	1086	3	Intergenic	novelGene_30427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	5	GCTGCTTGTCTGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
705810	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705815	contig_13224_pilon	+	2141	2	Intergenic	novelGene_104071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTCTTTTGTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93542	95720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_94727_94763
705817	contig_11338_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_6328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267158	269229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_267200_269200
705819	contig_14450_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_48949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCATTACATTGAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555234	554261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_554300_555200
705820	contig_14450_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_48947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	558	857	553258	552959	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKRGRHFCLNGSPIPSPTGPRRSPGWCKMVNGKNFSVLGKQRERRALAHPPSAGLPDTPITMSCPITMSGTLTWERGARVARLSPFSGSPKSFYVDI	553815	551598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_551600_553800
705828	contig_8864_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_135978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	396	707	109111	109422	NA	15	CTATTTCTTATTGTACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATGCHAFLSVPRGTAENTSHLLSCKCCFSFFPVFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA	108715	111003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_108700_111000
705837	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	80	AAAAAGAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705838	contig_13216_pilon	+	1904	7	Intergenic	novelGene_47490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_4	831.742481514294	2	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	929	1369	260572	261012	FALSE	15	ACTTAGTTTTGTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	229649	261547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_256211_256296_258447_258573_260430
705844	contig_12079_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_67487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGGCCTGCGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631524	633927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_631500_633900
705845	contig_6217_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_109688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914785	912602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_912600_914800
705847	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705849	contig_14666_pilon	+	1285	5	Intergenic	novelGene_39557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	125	1231	477340	485691	FALSE	30	GGAATCCATTAATGATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNSCPRHKNTWSQKKKQTEKSKAKEAPCSDLDF	477215	485745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484598_485597
705851	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4577	38	3402	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
705862	contig_7020_pilon	-	2265	3	Intergenic	novelGene_57064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	17.5	29	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	16	648	98420	92831	FALSE	15	AGCTTGCCTGGCCCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYWVIMVTGKFINRGQRLGCVLALSVLALVLWGVPGAKALDNGLAMTPTMGWLHWERFMCNVDCKQEPNSCVSEQLFMQMADLMVSDGWKDAGYQYLCIDDCWMAPTRDSKGKLQADPERFPGGIHRLANYVHSKGLKLGIYADVGQKTCAGYPGSFGYYDIDAKTFADWEVDLLKFDGCFCDSVDHLADGMVHSRDLAMSKGKNFAKVAEHPRN	98435	91213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_93086_94387_94563_98217
705863	contig_10801_pilon	+	1730	2	Intergenic	novelGene_74064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	581	919	369363	369787	FALSE	25	CATTTTATCTTTGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQCVSVPSTKFSLTLPWSMIVKEPLSIFKDQTVDCSSLIPLVCLLSSLDATKAPPSLWFSLVRWKLSISPRVLPSFHSSAVWQCNLVLTLRFSFGVGGEEHRCPSCIMILR	368782	370598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_369405_369490
705864	contig_10479_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_147107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAACTTTTCTTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104224	101769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_101800_104200
705865	contig_14017_pilon	+	2509	1	Intergenic	novelGene_165690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTGCCAGCACCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61139	63648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_61100_63600
705866	contig_12837_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_57270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTTCAGCTGTTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41478	42714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_41500_42700
705874	contig_17440_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_7656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3558	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
705875	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705878	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705881	contig_13760_pilon	-	2026	2	Intergenic	novelGene_61348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	394	junction_1	0	125	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTGTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355706	352847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387
705882	contig_5499_pilon	+	2135	13	Intergenic	novelGene_57006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	296.538771589072	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	74	691	803476	827994	TRUE	40	AAGAATTTGTAATGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSGEEAYDEMEHH	803402	841277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827953_828026_831323_831427_834914_834946_835345_835511_839385_839436_839991_840190_840335_840755_840830
705888	contig_7775_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_37459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56583	58507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_56600_58500
705891	scaffold_13505_pilon	-	1042	6	Intergenic	novelGene_111445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.064135738846	99	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	27	674	535595	531010	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTLPCLLCSQL	535621	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531041_531104_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
705892	contig_9784_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_165701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32729	34111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_32700_34100
705893	contig_9784_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_165702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAATCTACAATAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34464	34922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_34500_34900
705902	contig_10734_pilon	-	1509	3	Intergenic	novelGene_51082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	9.5	232	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	104	604	530044	527027	FALSE	15	CACCTCGGGTACATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASALFRFPVSLTRTRTVRPGLGLWETLTLLSREIAVTRVQMAGKKDCPALLALDESQLEEQFVKGHGPGGQATNKTSNCVVLKHIPSGIVVKCHQTRSVDQNRKLARKILQEKVDVFYNGENSLVYREKREAEKKKQERKKRAKETLEKKKLLKELWGLSKNAR	540323	526121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_527246_529762_530070_540245
705911	SIRV4	+	231	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1540	632	1085	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
705913	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705914	scaffold_13505_pilon	-	969	6	Intergenic	novelGene_111437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	356.804932701329	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	321	380	532469	531367	TRUE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSKLCLRQSSSSSCSLPLAWTISTGISTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLF	535578	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532411_532496_532707_532920_532978_532999_535516
705919	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705922	contig_17074_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_145208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTAATTTTCTACTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857007	857772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_857000_857800
705925	contig_3424_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_55533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259779	260932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_259800_260900
705927	contig_11096_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_143476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAACTAAAGTAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250249	252334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_250200_252300
705929	contig_2455_pilon	-	2084	15	Intergenic	novelGene_119186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.3221669811603	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	30	1922	177497	142824	FALSE	30	CAACTATCTTGTAAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQVAQCSARLLLQEKEIKFLTAEIDRLKNCGYLEASPDLEQLRAENLKLKYRLNILRRSLQAERNKPTKNMININSRLQEVFGCAIKAAYPNLENPPLIVTPSQQPKFGDYQCNSAMGISQMLKTKEQKVNPREIAENITKHLPPNECIEKVEIAGPGFINVHLRKDFVSEQLTSLLVNGVQLPALGENKKVIVDFSSPNIAKEMHVGHLRSTIIGESMSRLFEFAGYNVLRLNHVGDWGTQFGMLIAHLQDKFPDYLTVSPPIGDLQAFYKESKKRFDTEEEFKRRAYHCVVLLQSRNPDIIKAWKLICDVSRQEFNKIYDALDISLIERGESFYQERMNDIVKEFEDKGFVQVDDGRKIVFVPGCSIPLTIVKSDGGYTYDTSDLAAIKQRLFEEKADMIIYVVDSGQSMHLQAVFAAAQMIGWYDPKVTRVSHAGFGVVLGEDKKKFKTRSGETVRLIDLLEEGLKRSMDKLKEKERDKVLTPEELKAAQTSVAYGCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAYLLYAFTRIRSIARLANIDEEMLQKAAQETKIILDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDYIYELATTFTEFYDSCYCVEKDRGVCCCVKQ	177526	142661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142852_143689_143930_144362_144536_157119_157226_160387_160498_161079_161259_162887_162993_164823_164954_166622_166744_167936_168059_168494_168596_169668_169778_170985_171175_175412_175548_177452
705931	contig_16685_pilon	+	3109	1	Intergenic	novelGene_115046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCTGTTAGGTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449619	452728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_449600_452700
705933	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705934	contig_5686_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_45334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCTAACCAAGCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110887	112141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_110900_112100
705936	SIRV6	+	864	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-441	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	108	327	158	484	2002	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2021_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
705939	contig_5236_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_100904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTGAAAAACCAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87053	85972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_86000_87100
705941	contig_7744_pilon	+	1951	4	Intergenic	novelGene_62492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	49.3153120237518	15	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTGTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671000	675234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671897_673753_673826_674032_674694_674912
705943	contig_8045_pilon	+	2688	2	Intergenic	novelGene_35462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	0	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTATACACACTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509749	514974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_509894_512430
705946	contig_8617_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_73424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62457	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
705949	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
705950	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
705952	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
705956	contig_5236_pilon	+	2349	7	Intergenic	novelGene_100971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_3	29.6802403404465	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	654	1259	1037883	1040266	FALSE	20	ACTGAATTTCATCGTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADWFRQALLKKPKKLPVSPESTPSEVSQRTSRDSPPPVSLSSVKPPTSPPPPVGASSSGRWSKDYDVCVCHSEEDLAAAQELVSYLEGSAASLRCFLQLRDATPGGAIVSELCQALSGSHCRVLLITPGFLQDPWCKYQMLQALTQAPAAEGCTIPLLSGLTRASYPPELRFMYYVDGRGPDGGFRQVKEAVMRYLQTLS	1033000	1041356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1033055_1035954_1036231_1037125_1037175_1037401_1037524_1037730_1037890_1039046_1039626_1040246
705958	scaffold_13609_pilon	+	2011	19	Intergenic	novelGene_124403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	179.892946560509	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1758	253	2010	564647	608352	FALSE	40	TCAGCAATGCAGAATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDRTKLKKTPTEAPADCRALIDKLKVCNDEQLLLELQQIKTWNIGKCELYHWVDLLDRFDGILADAGQTVENMSWMLVCDRPEREQLKMLLLAVLNFTALLIEYSFSRHLYSSIEHLTTLLASSDMQVVLAVLNLLYVFSKRSNYITRLGSDKRTPLLTRLQHLAESWGGKENGFGLAECCRDLHMMKYPPSATTLHFEFYADPGAEVKIEKRTTSNTLHYIHIEQLDKISESPSEIMESLTKMYSIPKDKQMLLFTHIRLAHGFSNHRKRLQAVQARLHAISILVYSNALQESANSILYNGLIEELVDVLQITDKQLMEIKAASLRTLTSIVHLERTPKLSSIIDCTGTASYHGFLPVLVRNCIQAMIDPSMDPYPHQFATALFSFLYHLASYDAGGEALVSCGMMEALLKVIKFLGDEQDQITFVTRAVRVVDLITNLDMAAFQSHSGLSIFIYRLEHEVDLCRKECPFVIKPKIQRPSTIQEGEEMETDMDVADITMESSPGSSVSMEHRLDVELRASSSSSSTSISSGPGPRPGVQCIPQRAALLKSMLNFLKKAIQDPAFSDGIRHVMDGSLPTSLKHI	516121	608353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_516220_519634_519765_564622_564692_572408_572508_573273_573481_574895_575049_597826_597890_599966_600045_600933_600982_601066_601136_601747_601848_603362_603464_603749_603901_604031_604160_604788_604930_605128_605235_607157_607287_607733_607836_608314
705961	contig_9937_pilon	+	2208	3	Intergenic	novelGene_129221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	8.5	97	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	186	833	237766	251284	FALSE	30	AAGCCCTTTAGTTAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASETEKIHALLQPCSTESLISSLGLGILCLVADRLLQFPIIQQNDWLRALSDNAVHCMIGMWSWAIVIGVKKKTDLGEIVLAGFLASVIDIDHFFLAGSVSLKAALTLPRRPFLHCSTVIPIVALTLKFVMHLFKLKGSWCFLPWMLFISWTSHHIRDGIRHGLWICPFGKTSPLPFWLYVIITSSLPHICSFVMYLTGTRQMMSSKRGIHIDV	218553	252659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_218666_237692_238078_250948
705963	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
705965	contig_13457_pilon	+	1460	9	Intergenic	novelGene_118355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	65.2388639922554	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	549	1460	68797	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAPSITPAAQPAESRVWSMQGLSDQRRLWPLSSLPPPTPPRSQAPVEVRPAALPGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	67575	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68965_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
705969	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
705974	contig_15327_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_70542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGGAAAGGCCACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522268	521025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_521000_522300
705989	contig_4093_pilon	-	1191	6	Intergenic	novelGene_27642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	124	861	69245	41737	FALSE	35	GAAAACTGCCTACATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72547	41406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
705991	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
705994	contig_11594_pilon	-	2888	14	Intergenic	novelGene_80886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	66.7669265820069	118	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	253	2067	114812	75839	FALSE	40	CACAAAAAGTATTCTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTGLDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILARQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSSPDQGPNKVFDLCVVCGDKASGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCVINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQDSVQCERKPIEVSREKSSNCAASTEKIYIRKDLRSPLAATPTFVTDSETARSAGLIDSGMFVNIHQSGIKTESPVLMTPDKAESCQGDLSTLASVVTSLANLGKTKDISQNSNEISMIESLSNSDTSLCEFHQEIQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSEGVEGSVHLIAGDASINYIEKEGPLLSDSHVAFRLTMPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQENSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHSSLQQDKMSTEKRKLLMDHIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNVRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIGHGI	142348	75017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_76014_76865_76972_79697_79836_80587_80728_91100_91223_96888_97052_98584_98770_105033_105125_105221_105370_106404_106585_107801_107884_111145_111377_114758_114833_142116
705997	contig_15327_pilon	-	2292	5	Intergenic	novelGene_70451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	930	junction_4	836.978643694091	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1658	2218	293081	289810	FALSE	0	CTGTGTGTCTGCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFTEVFPRTLCFDLTYFIFQDPKMAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVKSCAEFLAVSKTRIGEYEKQLEKLRNIIPFDQMTIDDLNEAFPETRLDKTKYPYWPHQPIENF	294738	289735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_290158_291454_291527_292481_292579_292884
706004	contig_14925_pilon	-	683	3	Intergenic	novelGene_55195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAAAGGCTGTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
706007	contig_17281_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_105190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGGAGAGGCAGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2982	2049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_-_2000_3000
706010	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
706013	contig_5569_pilon	-	3146	21	Intergenic	novelGene_86749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	155.389920844307	4	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	19	1245	518064	489241	TRUE	50	AATTTTAACAAAATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAWLQVLPVILLLGAQPSPLSFFSVGPAPVAAADRSKWHIPLPSGKNYFSFGKILFGNTTIFLKFDGEPCDRSLNVTWYLKSADCYNEIFNFKAEEVETYLENLKEKRGLSGKYQTSSKVFQNCSELFKTQSFSGDFVHRLPLLGEKQEAKDNGTNLTSVGDKTVMHEPLKTWQDAPYIFIVHIGIPSSKESVKEKSLSTLFTMTVEVKGPYEYLTLEEYPLMIFFMVMCIVYVLFGVLWLAWSACYWRDLLRIQFWIGAVIFLGMLEKAVFYAEFQNIRYKGESVQGALILAELLSAVKRSLARTLVIIVSLGYGIVKPRLGVTLHKVVVAGALYLLFSGMEGVLRVTGAQTDLASLAFIPLAFLDTALCWWISFSLACLMDVHFPPWRWVSIDLSAKGFYHFC	518082	466269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487368_488235_488353_489177_489409_490831_490926_493479_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517923
706014	contig_4689_pilon	+	2660	2	Intergenic	novelGene_165395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1346	1654	1068575	1068883	FALSE	60	TTAAAAAAAAAAACTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYILAESEGNLKYLLMKIKHYSFQYGLHLNIKKTKILPTRPISNIMINRQKIEVVKNFILLGSTINAHGSSSQEIKGHTELGKSAAKELFQVFKKQRCHFKD	1066440	1069889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1067485_1068273
706016	contig_7171_pilon	+	1346	9	Intergenic	novelGene_101344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	99.4849234808974	379	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	489	1211	1302528	1315309	FALSE	20	AGAACCTGCTGACCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQPPGDDVARKSWYLRNIITRYQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1301680	1315444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301812_1302170_1302613_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874_1315026_1315204
706021	contig_14030_pilon	-	2098	3	Intergenic	novelGene_62235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	387	3	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACTTTGTGTGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345240	336524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339051_344182
706022	contig_7396_pilon	-	1687	13	Intergenic	novelGene_79627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2960.49881659418	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	22	1257	254680	246368	FALSE	5	CCTATTTTTGGTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLCEAVFWKVFLRLVKN	254701	245937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247197_247357_247718_247772_248231_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602
706024	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706028	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_97333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706029	contig_9389_pilon	+	897	4	Intergenic	novelGene_83906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1040.33082345099	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159546	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164252_167744
706032	contig_11038_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_165708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTCTAAGTTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206690	208213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11038_pilon_+_206700_208200
706034	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706037	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706040	contig_489_pilon	+	2626	4	Intergenic	novelGene_165710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_1	57.0048730860402	572	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	160	942	235427	239437	FALSE	15	TGATTGCAGTTTCAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDPCSVGVQLRTTNECHKTYYTRHTGFKTLQELSSNDMLLLQLRTGMTLSGNNTICFHHAKIYIDRFEDLQKSCCDPFNIHKKLAKKNLHVIDLDDATFLSAKFGRQLVPGWKLCPKCTQIINGSVDVDSEDRQRRKPDSDGRTAKALRSLQFTNPGKQTEFAPETAKREKRRFTKNTSAGSDRQVIPAKSKVYDSQGLLIFSGMDLCDCLDEDCLGCFYACPACGSTKCGAECRCDRKWLYEQIEIEGGEIIHNKHAG	225285	241121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_489_pilon_+_225382_235363_235853_238008_238137_239208
706041	contig_3575_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_141112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTCTTTATGTATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425754	426332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_425800_426300
706042	contig_10526_pilon	+	1309	9	Intergenic	novelGene_142566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_3	42.1735625125504	589	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	59	859	223370	315492	FALSE	5	CTTGCACTTGGTTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCFVPLRSPYENFSGEVTGMAAVRMGKLTAMPAGLICASIVVRAAKEESKKQLVKPEQLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKGSRFKKIAYPLGLATLGATVCYPVQSVIIAKVTGKKAYATSQQIYEAVKSWTKSNKKETLPEPKEKTKVGSYAEIEIPTKTAQVLKRSVPLPTELGSETKTKSELTSGATQFMPDPKLMDHGQSHPEDVDMYSTRS	223311	315942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_273809_273912_279949_280070_283141_283197_284658_284758_291360_291453_307400_307512_307714_307833_315403
706043	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706047	contig_14326_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_120726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTATGTCAGCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442708	440930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_440900_442700
706051	SIRV5	-	416	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCACACTTCGCACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
706052	contig_14341_pilon	+	601	5	Intergenic	novelGene_111859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1893	junction_1	1721.05047863216	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	161	550	550058	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	548822	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
706055	contig_17144_pilon	-	2567	6	Intergenic	novelGene_29164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	214.671283594243	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2207	2554	159487	157620	FALSE	15	CATTTCTTTCTGCCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	163837	157606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_160598_161422_161508_162014_162064_162875
706057	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706062	contig_12935_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_165725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCAAAAAAATACGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174623	175154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_174600_175200
706063	contig_7357_pilon	+	2841	8	Intergenic	novelGene_36856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1377	1925	197191	204428	TRUE	20	GAAGTCCACGGTCCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPESFPFLLIRKYPQRVQSQKGRETAQMCFIALKVHSSVLLKENSLLTSLCHVVVLIGIVFISLHIVSVYKRFNSLFQISRLYWKFQLIIQFRNQKIMTKSLSHLHYSYYSSINLVLSILKHSFRGANLFLNLFFHLNLIDLYSKQLVLELSIKNELVSIFDILSLRTFNQYTCFTTSQRL	195814	215824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_197437_199280_199436_204280_204452_204644_204750_206604_206722_213684_213792_214172_214225_215312
706068	contig_16098_pilon	-	1108	12	Intergenic	novelGene_45773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_11	238.414598255134	4632	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	63	479	36010	34731	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLQAGGWAPEERRRGVEARMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYL	36357	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
706071	contig_1331_pilon	+	1324	2	Intergenic	novelGene_37794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATATTCTCCCTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158940	160918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_160214_160867
706075	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706076	contig_18168_pilon	-	1145	6	Intergenic	novelGene_122076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	141.992394162504	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	20	382	27110	25275	TRUE	35	AAGAAATATGTGGTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNGDSPPHL	27129	23458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25298_26483_26754_27040
706078	contig_10861_pilon	+	1468	7	Intergenic	novelGene_39449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_5	58.5531572353039	286	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	988	1323	2600571	2605826	FALSE	5	CTGGAGCCTGTGTTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFAFGNALAQARHLYGNDPKVLEQPVVVQSVGTDGRVFQFLVFQLNTTDLTSSEGIKNLVWMDSDQLLYQHFWCRPVIKKKVLVEPVGPTGFQPETFRKFLALYLHGAV	2590888	2605971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2591285_2593602_2593787_2593879_2593996_2597706_2597894_2600466_2600625_2603659_2603864_2605748
706079	contig_7202_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_16681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGGTTGGTCACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
706083	contig_5947_pilon	-	2476	21	Intergenic	novelGene_101511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_20	78.1914317556598	439	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	77	2368	442078	423007	FALSE	50	AAAAAATTCTTTAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEELGLIGTIGEDEDVPLEPESDSGDEEEEGPIVLGRRQKALQKNRSADFNPDFIFTEKEGLYDGSWAMADVLSQLKKKRAATTLDEKIEKVRKQRKTQHKEARSAKSEKEKEAIESSEPEEQEDLEGKDKDGSEDEDSETDYSSADENILTKADTLKVKERKKKKGQEAGGFFEDASQYDESLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAAVTRVLVLVPTRELGIQVHSVTKQLAQFCSITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSSIEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVNSNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLGLMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNTIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEEERKMLKEIVKSAKAPVKARILPQDVILKFRDKIEKMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEALNQEPERSWFQTKEERKKEKIASALQEFDFALRGKKKRKKFMKDAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRSRRAKRARAMPEEEPARGPAKKQKQAKKSVFDEELTNTSKKALKQYRAGPSFEERKKLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK	442154	422898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_423026_423158_423234_423827_423916_424419_424544_424637_424733_425767_425871_426094_426202_427926_428105_428212_428295_429134_429289_430088_430231_430358_430459_431274_431426_432222_432397_434531_434638_435430_435518_435643_435685_435956_436123_436374_436435_438527_438675_441985
706084	contig_4962_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_107374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGCAGCAATGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108700	109145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_108700_109100
706085	contig_4962_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_107375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTTGACCATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109255	109775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_109300_109800
706086	contig_3095_pilon	+	707	4	Intergenic	novelGene_75147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3565.0399093917	58	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	77	298	149859	151151	TRUE	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149782	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150502_151054_151163_151848
706097	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_96470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653722	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706098	contig_8616_pilon	+	2201	20	Intergenic	novelGene_72414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	181.022350588932	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	745	1674	245168	250499	TRUE	40	TTTTTAAGATAAAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRYDGSQQALDLKGLRTDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAASLRIIEENIPELLSLNLSNNKLYRLDDLSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDRNPLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTMLPPCKGSYFGTETLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPVTPQNPNRSSLAEYFKDSRNVKKLKDPSLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDINSFVVDISAQTGSLALLPLQWMESLGILCEPSPGRSLLFPPAIQGCVS	239566	251913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_239702_243484_243666_243885_244027_244565_244661_244771_244877_244996_245078_245161_245232_245373_245463_245575_245684_245862_245973_247786_247824_248160_248230_248307_248364_248688_248797_248915_248975_249070_249187_249904_250005_250485_250669_251430_251492_251616
706103	contig_10134_pilon	-	2812	1	Intergenic	novelGene_16174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	399	1200	1269	2468	28070	26871	NA	10	TGCCTTCTTAGTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHFVEEFRRKHVKDLMGNKRALRRLRTACERTKHTLSSSTQATLEIDCLFEGLDFYTPITRARFEELCSDLFRSTLEPVDAKLDKAQIHDIVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFSGRELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMRDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQRNATIPTRQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTTIDRSTGKANKITIANDKGRLSKEDVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRVAAKNSLEAYVFHVKSSLQEEGLRDKIPEEDRRRAQGKCQEVLVWLERNQLAEKDEYEHQKRELEQMCCPIFSRLYGGPDIPRGSSCGAQACQGASSTGPVIEEVD	29338	26526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_26500_29300
706106	contig_14814_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_137696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACCCAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114401	114617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_114400_114600
706114	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706117	contig_854_pilon	+	1307	8	Intergenic	novelGene_36278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2969.37535518836	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	174	620	556108	562402	TRUE	50	TGCTTAAGGAGAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543547	563754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543624_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563401_563440
706120	contig_6710_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_97907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653409	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
706122	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706123	contig_6102_pilon	+	289	3	Intergenic	novelGene_31953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1378	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTATGAAGACTATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	414689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414194_414364_414613
706124	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706125	contig_13878_pilon	+	1432	12	Intergenic	novelGene_165747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	122.578630524072	464	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	106	1107	593402	673169	FALSE	0	TTCTTTTTGCCTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTGGGCVVWPGGCLAGAGLRAAVSRGCGGWTGADIMFRAAASGQLRRAASLLRFQSTLVIAEHANDTLAPITLNTITAAKRLGGEVSCLVAGTKCDKVAQDLCKVAGVAKVLVAEHDAYKGFLPEELTPLILATQKQFSYTHICAGASAFGKNLLPRVAAKLDVAPISDIIAIKSPDTFVRTIYAGNALCTVKCDEKVKVFSVRGTSFEAAATSGGSASSEKASSTSPVGISEWLDQKLTKSDRPELTGAKVVISGGRGLKSGENFKLLYDLADQLHAAVGASRAAVDAGFVPNDMQVGQTGKIVAPELYIAVGISGAIQHLAGMKDSKTIVAINKDPEAPIFQVADYGIVADLFKVVPEMTELLKKK	593296	673494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_593441_608666_608814_611981_612064_612165_612249_617105_617206_618282_618394_619031_619134_624412_624482_629845_629929_661225_661292_665211_665293_673130
706129	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706132	contig_7202_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_17648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
706136	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706137	contig_3424_pilon	-	4036	3	Intergenic	novelGene_55512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	12	134	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	301	792	216016	214423	FALSE	40	AACCAATATAAATTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCTAKKCGIRFQPPAIILIYEGEVKGKSRQRIMPVRNFSKFSDCSRAAEQLKNNPRHKSYLEQVSLRQLEKLFSFLRGYLQGQSLAETMEQIQRERTIDPEEDLNKLDDKELAKRKSIMDELFEKNQKKKDDPNFVYDIEVEFPQDEQLQSCGWDTESADEF	219839	211178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_214785_215886_216077_219599
706140	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706155	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706156	contig_6710_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_93559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCACTATGCACACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
706157	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706165	contig_6589_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_25685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	829	1191	95506	95144	NA	15	CCCAGCTGCTCAGCCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPTPISSADPSPYLRSMAPSPPGLLSQMYLKPHRRTQYLLPTPTSCSSSGATTCHLSNLPPCTASLHLKSPLLLHPRGSGPSSGLILHSWILAPATFLASQPPVSPIRPKRGLSDAHQS	96334	95102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_95100_96300
706168	contig_7870_pilon	-	1145	8	Intergenic	novelGene_108888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	20	TTTACCTATATGTGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
706169	contig_253_pilon	-	1473	10	Intergenic	novelGene_129660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	115.839927869836	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	483	1385	393089	389884	FALSE	5	GCATCTCTGGCTTTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395573	389795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390206_390353_390436_390689_390857_391020_391234_391717_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
706170	contig_4364_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_2753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532978	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
706172	contig_6710_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_98068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706176	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACAACTAAAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
706179	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_93474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706180	contig_12019_pilon	-	470	3	Intergenic	novelGene_87647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	372	386	5215	5201	FALSE	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVLPEELLSSLQLRIPEGDREEFLTFLIPEVDEQPHPKEEQTQNQAPDSTQHLALCRFRLCPPFRCERARQAWVLHLAGVNLSTLRNGFKHHRVWKVQSPFWIRPVETTPASSSWPFRNHVTSMWPG	8370	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6235_8303
706181	contig_7909_pilon	-	250	3	Intergenic	novelGene_155891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	35	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGATAATGTTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384400	376160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_376198_380026_380135_384295
706188	contig_5033_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_29106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAACAGTATTGCCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821508	820991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_821000_821500
706191	contig_12270_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_113444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13846	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
706192	contig_7051_pilon	+	1900	3	Intergenic	novelGene_64376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	9.5	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATGTTGGACAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375562	385559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_376247_378973_379134_384503
706204	contig_16594_pilon	-	2287	3	Intergenic	novelGene_53906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264572	255920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_256773_262574_263222_263784
706216	contig_7457_pilon	-	230	3	Intergenic	novelGene_31294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3527.5	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160699	157858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157903_159098_159269_160683
706220	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706227	contig_4769_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_117973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAATAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424257	421654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_421700_424300
706229	contig_3521_pilon	+	918	8	Intergenic	novelGene_165751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_4	30.4905472136489	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	224	916	4585	26317	FALSE	30	CCAGCATCTTAAGGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDITLLRQEVQDLQASLKEEKWYSEELKKELEKFQGLQQQESKPDGLVADSSAELQSLEQQLEEAQTENFNIKQMKDLFEQKAAQLATEIADIKSKYDEERSLREAAEQRVTHLTEELNREATIIQDLKTELLQRPGIEDVAVLKRELVQVQTLMDSMTLERERESEKLKDECKQLQAEYANSEATISQLRSELAKGPQEVAVYVHELQKLKSSVNELTQKNQILTEKLLKQELDYTQLEEKHNEESVSKKNIQASLHQKDLDCQQLQSRLSASETSLQRMQAELGEKGEATQKLKEELSEVETK	1517	26319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3521_pilon_+_1573_1665_1732_3629_3670_4522_4637_5270_5393_7715_7872_20276_20394_26071
706231	contig_3382_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_124037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1165	1722	185137	184580	NA	40	TACTGGAAGTAAAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPGWRPRISKAGPGLWAPLAPRVHPGPHHWMQMKGRVLQPHLPASCSTVFAPAPGTRSPHPSGVPQPHVPTCCSTVFAPAPGTRSPHPSGVPQPHLPACCSTVFAPAPGTRSPHPSGVPQPHVPACCSTVFAPAPGTRSPHPSGVPQPHLPACCSTVFAPAPGTRSPHPSGVPQPPSCILTGT	186301	184441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_184400_186300
706237	contig_9345_pilon	-	2164	6	Intergenic	novelGene_24522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	229.121277929397	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	51	1391	706868	673398	FALSE	30	CATGCTAGTGAACAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSLENTISFEEYIRVKARSVPQHRMKEFLDSLASKGPEALQEFQQTATTTMVYQQGGNCIYTDSTEVAGSLLELACPVTTSVQPQTQQEQQIQVQQPQQVQVQVQVQQSPQQVSAQQFSPQLTVHQPAEQPIQVQVQIQGQAPQPAAPSIQTPSLQSPSPSQLQAAQIQVQHVQAAQQIQATEIPEEHIPHQQIQAQLVAGQSLAGGQQIQIQTVGALSPPPSQQGSPREGERRVGTASVLQPVKKRKVDMPITVSYAISGQPVATVLAIPQGQQQSYVSLRPDLLTVDSAHLYSATGTMYFLLKTVDQHMKLAFSKVLRQTKKNPSNPKDKSTSIRYLKALGIHQTGQKVTDDMYAEQTENPENPLRCPIKLYDFYLFKCPQSVKGRNDTFYLTPEPVVAPNSPIWYSVQPISREQMGQMLTRILVIREIQEAIAVANASTMH	722218	672624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_673591_675089_675181_675486_675639_689578_690175_706559_706890_722189
706239	contig_12654_pilon	-	1897	8	Intergenic	novelGene_129321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	176.028986481297	27	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	161	769	827177	812546	TRUE	15	ACAGAGTCCTTGGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKVIMTFFCRLICVIPCFSASNMPV	827337	808408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_810412_812166_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
706244	contig_9807_pilon	+	1155	7	Intergenic	novelGene_32842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	646.794252877649	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	141	773	109130	156718	TRUE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKRTMFSTDTMRRSSAWLGPRTTSTLPLVAWT	108989	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128699_156624_156770_158676
706247	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706251	contig_2236_pilon	+	1861	15	Intergenic	novelGene_98679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_14	55.7366255578092	207	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	94	1647	41032	69291	TRUE	30	TAAAATGGTGTTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPEQPLPKSRGCQSSASFSPPRGDRTLLVRHLPAELTAEEKEDLLKYFGAQSVRVLSDKGRLKHTAFATFPNEKAAIKALTRLHQLKLLGHTLVVEFAKEQDQVHSLLSSSNTEKKKRSDDPVEDDKEKKEFGCLTIENGIAPNHGLSFPLNSCLKYMYPPPSSTILANIVNALASVPKFYVQVLHLMNKMNLPTPFGPITARPPLYEDYMPLHAPLPPASPQPPEEPPLPDEDEELSSKESEYESSDDEDRQRMTKLMELANLQPKRPKTIKQRHVRKKRKIKDMLNIPSSASHSNLHPVLLPSDVFDQPQPVGNKKIEFHISTGMPATFKKDLEKEQNCEEQNYDLPDAEVDTSNVGFGKIFPAPNLNITEEMKEDSDEMPSEFISRKELKKGRISREEMETLSIFRSYEPGEPNCRIYVKNLAKHVQEKDLKFIFGRYVDFSSETERIMFDIRLMKEGRMKGQAFIGLPNETAAAKALKEANGYVLFGKPMVVQFARSARPKQDSKEGKRKC	40938	72091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_41224_43195_43244_49203_49323_50578_50663_52493_52606_53481_53551_54643_54787_57723_57850_61109_61262_63781_63944_64983_65079_65166_65226_67930_68064_69231_69304_71889
706254	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706259	contig_709_pilon	+	2231	5	Intergenic	novelGene_57604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	17.9722007556114	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	5	817	2353742	2374525	FALSE	40	TAAGTACTTATGACAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTVVPGAGEMSAVAARSREGSPEEDGFGPSALGTREHWDAVYERELHTFQEYGDAGEIWFGEESMSRLIRWMEKQKIPLDASILDIGTGNGVFLVELAKFGFSNITGIDYSPSAIQLSGSIIEREGLSNIKLKVEDFLNLSTKLSGFHICIDKGTFDAISLNPDNAVEKRKQYVKSLSRVLTVKGFFLITSCNWTKEELVNEFSEGKWLYVVQMYAFLRFNAVIFFFFPCVLQCFTFIFVEIASFSSLLITLVILLTVYKAQRNNIG	2353737	2375939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2353861_2355012_2355079_2356273_2356389_2371166_2371275_2374120
706268	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706270	SIRV2	-	279	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	647	22	647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4085	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
706271	contig_20951_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_43085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAACTTGCGCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27294	27107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27100_27300
706281	contig_5586_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_143518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258979	260732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_259000_260700
706284	contig_18869_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_56005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTGATCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
706287	contig_5041_pilon	-	1696	3	Intergenic	novelGene_27063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	497.5	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCTCACGAAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533109	525065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532088
706291	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_97352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706294	contig_2703_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_101855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACAGTGAGCTAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416349	1418358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1416300_1418400
706296	contig_15304_pilon	-	1066	3	Intergenic	novelGene_30525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	202	1026	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54301	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
706301	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
706303	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
706306	contig_9272_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_125902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTGATGTATCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275373	274632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_274600_275400
706307	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706309	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706310	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706312	SIRV5	+	450	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-120	875	-6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
706314	SIRV4	+	335	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	204	411	204	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
706315	contig_18108_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_33453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCACTTCGTGCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95173	95727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_95200_95700
706316	SIRV5	+	435	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-105	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8210	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
706318	contig_18544_pilon	+	2110	9	Intergenic	novelGene_152747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTAGGAAAAATAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38722	63457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_39659_40190_40322_47684_47854_49128_49315_53228_53279_54684_54803_54895_55014_58023_58245_63276
706319	contig_5403_pilon	-	1668	12	Intergenic	novelGene_87975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	72.8815409295417	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	42	1325	450000	424565	FALSE	55	GGATTATGGCAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPWPEYINIRLEMYNKLKADPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNTLIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIYNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	450041	424221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247_433415_434618_434718_435798_435873_449978
706320	contig_5452_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_101021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467931	467322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_467300_467900
706328	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_98024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706329	contig_10323_pilon	-	931	2	Intergenic	novelGene_123534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAAAACACCCCGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223107	222005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_222417_222587
706334	contig_6710_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_93439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706335	contig_17075_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_131759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTGATGAGAAACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96199	98015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_96200_98000
706337	contig_7744_pilon	+	864	8	Intergenic	novelGene_62574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	182.817406396745	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	128	841	887179	891205	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APDTINNHVKTCREEQKNLHFFAPEYGEVTNVTTAVDIYSFGMCALEMAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQLLLLFLPSALCLLVLHRRGPGPSQQPPSSWGLVAELLAPAQPVWKGGPRPLGELNSTIPLGQTGGREGWCCSGGPRGPLDSPQLLL	886859	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889790_890944
706339	contig_20614_pilon	+	925	8	Intergenic	novelGene_107543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	1052.37858866358	9586	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	119	832	152671	155100	FALSE	25	GATAGTTTGTCTTCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGMKCIKFLLYVFLLAFCACAVGLIAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLVALVGCCGACKENYCLMITFAVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	151994	155193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152659_152737_153645_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
706342	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
706343	contig_3942_pilon	+	1193	4	Intergenic	novelGene_128624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1766	junction_2	528.882469615572	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176915	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179825_179974
706344	contig_14326_pilon	+	1352	9	Intergenic	novelGene_120697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.4913787977577	32	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCTACGTGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221788	249144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222991_223850_223967_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_248840
706349	contig_15063_pilon	+	980	3	Intergenic	novelGene_14409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	20	841	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35251	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
706350	contig_14925_pilon	-	993	5	Intergenic	novelGene_55180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	1543.31088896567	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	203	460	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRLIFGQGTTLQVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	73132	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_73082
706358	contig_16098_pilon	-	2200	19	Intergenic	novelGene_45862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	55.5679986065343	4	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	625	1935	253301	244355	FALSE	5	TTTCTTGTGTCATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVSPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	256452	244089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250755_251541_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255582_255692_256262
706359	contig_15304_pilon	-	1001	3	Intergenic	novelGene_30505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	137	961	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQSCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54236	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53807_53985
706362	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	125	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706363	contig_11720_pilon	+	2143	9	Intergenic	novelGene_43929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	266.112170897913	130	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	13	1167	262271	268041	FALSE	35	AAGTATATATATGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTGVGREM	262258	269017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753
706364	contig_5935_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_102749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312845	1314478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1312800_1314500
706365	contig_2100_pilon	+	1409	3	Intergenic	novelGene_50583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.5	136	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490446	493764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_490684_492505_492670_492756
706369	SIRV4	+	508	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	440	2	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCATTCCAATTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
706370	contig_11720_pilon	-	1795	7	Intergenic	novelGene_43899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	135.792018256679	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	35	556	121900	118106	FALSE	20	AAACCCTGTATGGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLSTMHPSECVLLSAQGQRFHFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	121934	116866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120814_121835
706375	contig_990_pilon	+	2085	6	Intergenic	novelGene_76050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	49.4020242500244	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTGAGATAAAAATAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880804	896262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_880895_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893438_894961
706376	contig_8880_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_165763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154389	152083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_152100_154400
706377	contig_6414_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_157007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	184	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTTATTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47111	44739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095
706386	contig_2332_pilon	+	1817	5	Intergenic	novelGene_58718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	29.1408218827129	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	685	1233	833054	857531	TRUE	35	CTAATAGCAAAATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRESMNVKASDFHLPCQHFNFTVASIVDPLEEYNITCNLNTHTRKSAIMVEDSAKENSINHSCRITEGLNSCIHVSLHLEMDIKSVICSMKITWYVLVLLIFILLIIFVIHKILEGHRRMQKWQSHKYKPTSVLLRESDSEKLRTLNVRVILGETMQRQPPTQVNMLLAPIPELEVTSAMYQ	832369	861242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_833307_839941_840062_842350_842435_857439_857546_860672
706390	contig_7171_pilon	+	1434	9	Intergenic	novelGene_101352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	98.6096312486767	55	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	231	1208	1322494	1328557	FALSE	20	AACCTGGTGACCTTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFSPITVRLPFQSSQSELSSPLHAVSSDWWATGYPPIFIGPTKCSPHLLLPRPSFCSATGT	1321904	1328783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322088_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325525_1325604_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211
706398	contig_7728_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_64734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTTTGCTGACCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852346	850077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_850100_852300
706399	contig_14530_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_108462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTATCTTTTTAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112520	111773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_111800_112500
706404	contig_13905_pilon	+	1316	3	Intergenic	novelGene_130430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	213	33	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	575	886	228815	229126	FALSE	25	TGATTCAATGACTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRHSSTSKTSVSNHVYLWPPRMSLYLVFCDCPAAEIISLILTLWSLYYEINRRFECAFSNYVHPPLAIPTTPHLENQHSEPVFSTLTTHRSHWKCSIILFRV	223107	229556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_223186_226255_226376_228438
706406	contig_7410_pilon	+	1750	7	Intergenic	novelGene_106097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	268.526224665922	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406201	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_406784_407069_407247_407429_407879_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411881
706409	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706410	contig_15859_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_50181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCCCATGGCTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287097	285823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_285800_287100
706411	contig_18869_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_56192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73721	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
706414	contig_3832_pilon	+	1282	2	Intergenic	novelGene_161457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGCCATCAAGAAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339304	347412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_340562_347387
706415	contig_5988_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_15896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACATTGGCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549677	552055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_549700_552100
706416	contig_7275_pilon	+	2634	3	Intergenic	novelGene_111248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	1.5	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	49	1272	405470	409539	FALSE	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQGSVSFTDVTVDFTQEEWEQLDPSQRILYMDVMLENYSNLLSVEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	405421	410901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_405485_406427_406555_408457
706418	contig_10235_pilon	-	1430	9	Intergenic	novelGene_46484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	895.236691816751	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	472	933	222843	219405	TRUE	35	ATGAAAATTTAGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224479	217925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223086_223370_223755_223780_224427
706419	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
706420	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657185	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657186	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706423	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
706424	contig_15063_pilon	+	1177	5	Intergenic	novelGene_14250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3981.51682779315	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	371	868	35271	36494	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLPS	34780	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35045_35380_35839_36158_36266_36330_36486
706425	contig_17144_pilon	+	1761	10	Intergenic	novelGene_29462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCACGCAGCCTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166074	183404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166432_173128_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179789_181795_181852_183158
706427	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706428	contig_14846_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_85369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCGACATTATACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40741	39075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_39100_40700
706435	contig_4426_pilon	-	1741	8	Intergenic	novelGene_15341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	514.181933973268	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	92	679	171430	10019	TRUE	25	CTGAGTTTATCTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRDWDARSRARRRPGPEDAEPWLRPSPEQMMAIRELKVCLLGDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERFHSLAPMYYRGSAAAVIVYDITKQDSFHTLKKWVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	171521	6425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_7038_9568_10117_25070_25181_71325_71433_72710_72783_97613_97696_110145_110226_171391
706436	contig_5481_pilon	-	2655	4	Intergenic	novelGene_144562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	40.2850951207626	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	44	1477	80010	49411	FALSE	35	AAATATTCATTTCACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSSQSRPRRGEGRMAADQATYKGSVMFSDVSVDFSQEEWECLDSSQRDLYRDVMLENYSNLVSMGLHIPKPQVISLLEQGKEPWMVGKELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIESCQREIMGLTRQSLEYSNFRDILVYRIDFERQLGYFSQEILTHECMPTFIQHTFLTLHQIINNEEKPYECKKCGRAFSQSSQFIQHQRVHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFVCKECGKAFSCNSYLLQHQRIHTGKKPYECKECGKTFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYKCKVCGKAFTKSSQLFQHVRIHTGEKPYACKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLHQHQRIHAGEKPFECLQCGKAFTQNSQLFQHQRVHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKTFSSGSDLVRHQGIHTDG	80053	48232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_50595_58314_58411_58716_58844_79983
706438	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706439	contig_1865_pilon	-	796	2	Intergenic	novelGene_103246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGCCTTTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158716	155862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_156551_158608
706440	contig_14744_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_65916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACAAATAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89050	91656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_89000_91700
706444	contig_8617_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_73401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62334	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
706455	contig_7435_pilon	-	2086	5	Intergenic	novelGene_165766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	19.904459299363	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	16	912	226064	209489	FALSE	20	TTTTCAACTTGTGGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEPVVPALPNSGGVGAGAPSGTVPVLFCFSVFARPSSVPHGAGYELLIQKFLSLYGDQIDMHRKFVVQLFAEEWGQYVDLPKGFAVSERCKVRLVPLQIQLTTLGNLTPSSTVFFCCDMQERFRPAIKYFGDIISVGQRLLQGARILGIPVIVTEQYPKGLGSTVQEIDLTGVKLVLPKTKFSMVLPEVEAALAEIPGVRSVVLFGVETHVCIQQTALELVGRGVEVHIVADATSSRSMMDRMFALERLARTGIIVTTSEAVLLQLVADKDHPKFKEVQNLIKASAPESGLLSKV	226079	208314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7435_pilon_-_209636_214209_214327_215936_216141_216246_216367_225755
706456	contig_6361_pilon	-	712	5	Intergenic	novelGene_23997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	275	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	89	427	420979	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436353	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
706460	SIRV5	-	364	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAGATGCGTAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
706464	contig_730_pilon	-	1711	13	Intergenic	novelGene_155617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	30.228183133552	2	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	549	1148	209819	207837	TRUE	20	CTATATCCCAATTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVEDSDMNCSP	214556	205808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_206363_207827_207870_208085_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211786_211927_212002_212277_212439_214383
706465	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706473	SIRV7	-	178	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69095	7	35876	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78862	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
706477	contig_14684_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_99658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280331	278318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_278300_280300
706479	contig_6710_pilon	+	536	2	Intergenic	novelGene_97578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACTCCAAGAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653387	657513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
706481	contig_15039_pilon	-	1946	9	Intergenic	novelGene_110136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	518.491667604215	2	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	490	1176	202841	185257	FALSE	25	AGAATGCTCCTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260858	184486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202966_208401_208526_222093_222255_260778
706484	contig_18156_pilon	+	1434	11	Intergenic	novelGene_101446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	143.054674862446	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	25	795	7355	35622	TRUE	45	ACATGGTAATTTTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTSLGCRLMPSPRLALLRVAGNALLLSLTSPLLPRPQSQPPLLSRRPLSTPARPRTSFSAVPSRSSMDGVGAEEVLAPLRLAVRQQGDLVRKLKEDKAPQVDVDKAVAELKARKRVLEAKELALQPQDDIIDRAKMEDTLKRRFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHVDKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQRIHNGRN	7330	49009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23501_23893_23971_35598_35762_37464_37630_42648_42756_43543_43691_48928
706485	contig_7165_pilon	-	2403	10	Intergenic	novelGene_116880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	505	864	737689	721853	TRUE	80	ACTATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAICWTWGSVCSCSLMLYRCCSPPSSISILQYLEAGFLLQTCCMAQTAHSWTPGVVKQPSNGKNGLKDLYATISHSGVGHFKIAECRSSRREFLWLWLNVQACSPLDIKWAIIPAAK	738193	698257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_699269_703813_703878_708006_708102_708335_708392_711872_712034_712144_712192_721747_721949_722082_722135_723299_723400_737577
706487	SIRV6	+	313	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10512	1	1275	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11512	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
706490	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706496	contig_18869_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_56288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTGGCTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73733	73353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
706501	contig_7718_pilon	+	1581	10	Intergenic	novelGene_129405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	90.5085767711315	18	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	284	985	257538	284723	FALSE	30	GTATTTGGAGGATGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252816	285319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_252859_253171_253343_254873_254936_257529_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
706508	contig_1545_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_149735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30372	28210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_28200_30400
706514	contig_20614_pilon	+	2015	2	Intergenic	novelGene_107611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATGAGGTGTGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480523	516826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_480532_514819
706515	contig_5640_pilon	-	2062	2	Intergenic	novelGene_27280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGATAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069931	1066269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1068266_1069865
706516	contig_9668_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_58223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	796	1194	552249	551851	NA	30	GTTTGTACAAATATGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFTIYRDCSHNLPNEVGAIIPILQVRKLRLSDLPMITEISGQEALNLEDISEAGRLNHCVILPPLWQIAHHLNISIQLQLWIKMTFSLKAGFPVCLNVNKNICFIFCVFYVIGISIAGKFLWDVCHCART	553044	551616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_551600_553000
706522	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
706530	contig_9029_pilon	+	2856	9	Intergenic	novelGene_155131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	10.9515980569048	82	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	13	1032	446710	464791	TRUE	25	TCTAGAAAGCTGGGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRAMAGLGVVCLLLWAAFWPPASPSGEEFWPGQSAADILSGAASRRRYLLYDVNPPEGFNLRRDVYIRVTSLLKTLLKTEEWVLVLPPWGRLYHWQSPDIHQIRIPWSEFFDLPSLNKNIPVIEYEQFIAESGGPFIDQVYVLQSYAEGWKEGTWEEKIDERPCLDQLLYSQDKHEYYRGWFWGYEETRALNVSCLSVQGSASIVAPLLLKNTSAWSVMLDRAENLLHDHYGGRGYWDTRRSMVFAKHLRAVGDEFRRHHLNSTDEADRIPFQEDWTKMKVKLGSSLGGSLPRRSPEKERLYLGAQRGCAQSGRSCEEDPQPHEDPPPREGVCGHRCCEEGI	446697	469561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_446841_448915_449167_451002_451148_452001_452113_460924_460992_463110_463237_464345_464528_464784_464909_467854
706531	contig_12353_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_165772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1070	1390	108161	108481	NA	65	AGGAAAAAAAAAAATGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPRGRKAGLDYHQEEETGTECILWTWDPCSETLLDPADRERARDSGTAVARVIEAGDGRNQETGMRRLRWGLPTHGAKSCNTCQRRTPAGYGSSKATAGPSSKG	107091	109478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_+_107100_109500
706532	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
706533	contig_10811_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_165803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	616	1050	367442	367008	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLHSGRRVEETQLEADSNCPGGKLTPGPRREGGDGGAGQAARDPLLAPLHCVTSASHLTSLHTSSSVKSGCLKPHRVLVRITGVNPHSTARSPCRALRAAHWVVNWTQVNDPQCGGWFTRQDSGARNTLASEDEGQEGRRGMR	368057	365622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_365600_368100
706537	contig_3469_pilon	+	1693	3	Intergenic	novelGene_34193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	27	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	846	1331	479341	479914	FALSE	0	GCCTCTGCCTGTTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVRASDYAEGKRGLPERVFSAEAEGQCYLSLELCHTNLSSHSAHAASALLPFHSSVPDVSSVDSSSDEDVQYRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYEAAYGKQFSPCQLLIDHANSPNKKFYQ	477831	480276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_478201_478864_479681_479768
706540	contig_12050_pilon	-	3101	18	Intergenic	novelGene_62668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	148.004792777535	506	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	783	1544	467666	453328	TRUE	15	TATCCTGTCCTGTACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSFSVKPLKQKQIVDRVSYLLQEIYGIENKNTRETKPADDENSDNSNECVVCLSDLRDTLILPCRHLCLCNSCADTLRYQANNCPICRLPFRALLQIRAVRKKPGALSPVSFSPVLAQSVDHDEHSCPFKKSKSHPASLASKKPKRETSPDSVPPGYEPISLLEALNGLRAVSPAIPSAPLYEEITYSGGAQTPCPRPAARLLGSIRSQTAAIRRASHGTGLLTVPCGPHRPPSAKRTKRSSQRTRTPLPR	511552	446058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_447397_448651_448697_451585_451676_452504_452548_453286_453411_454853_455083_456700_456767_458809_458920_461651_461812_465467_465537_467621_467670_470434_470485_471184_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
706541	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_114052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	31	345	14409	13872	FALSE	20	GTTTATTACTGTCAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14439	13871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
706543	contig_348_pilon	+	1914	9	Intergenic	novelGene_67603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	10.1972729197565	148	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	555	1481	320222	345268	FALSE	10	TATCTCTTCATTTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEKPEVNLCCPLRPPRQAMGCWSLSGVPCPPRDARFLSGAFQVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314470	345701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319673_319792_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342659_342990_345214
706545	contig_5967_pilon	+	2538	3	Intergenic	novelGene_44426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_2	0.5	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACCATTCAGAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583330	600310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_583399_583477_585362_599724
706549	contig_9656_pilon	-	1213	11	Intergenic	novelGene_121923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	351.34884374365	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	54	1103	446594	430537	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSGSNCMTHLMPGNKT	446647	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430583_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
706551	SIRV7	+	316	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTTATAGTTATGATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
706552	contig_11720_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_44032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAACTTGCTTCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439283	440684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_439300_440700
706556	contig_233_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_14541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	931.41733395938	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	416	778	91606	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	93889	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764
706561	contig_16098_pilon	-	1278	9	Intergenic	novelGene_46159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	134	1228	458816	456273	FALSE	20	CCCATACTCACTCTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460260	456222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
706562	contig_14450_pilon	+	1055	2	Intergenic	novelGene_48986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAACAAACAAAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042427	1065961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1043374_1065852
706565	contig_10907_pilon	-	1574	8	Intergenic	novelGene_144907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	168.112571614064	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	44	676	41010	16683	TRUE	40	GCTTGTGAAAAACAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIVQVLKLSAQFPIMSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITVRNIC	41053	14696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16878_28331_28400_30323_30495_36029_36127_36951_37051_41007
706571	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
706572	contig_1719_pilon	+	1652	9	Intergenic	novelGene_87304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	46.0434577328854	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	7	729	406779	418119	TRUE	50	AGAAAAAAAAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKMAATEAADTQLMLGVGLIEKDTNGEVLWVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRILCRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGSCRDQGRK	406772	426733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408918_409116_411266_411347_415050_415200_416229_416342_417989_418163_421977_422086_424045_424141_426056
706576	contig_3956_pilon	+	1157	7	Intergenic	novelGene_15006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2070.46890153468	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	350	691	1284763	1290491	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1284722_1284864_1285066_1285173_1285712_1285806_1290449_1290591_1290644
706577	scaffold_16539_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_68313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCACATTGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113529	113979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_113500_114000
706585	SIRV2	-	639	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	15	2963	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
706592	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_17588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27814	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
706597	contig_2161_pilon	-	2059	9	Intergenic	novelGene_114909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.6599849360523	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	342	1400	791304	764808	TRUE	30	AACAAGGTGATGTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRGPSRQQLSRSALPSLQTLVGGGCGNGTGLRNRNGSAIGLPVPPITALITPGPVRHCQIPDLPVDGSLLFEFLFFIYLLVALFIQYINIYKTVWWYPYNHPASCTSLATKAGAASMIHYMVLISARLVLLTLCGWVLCWTLVNLFRSHSVLNLLFLGYPFGVYVPLCCFHQDGRAHLLLTDYNYMVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHILAQAFKPRN	792838	760202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763654_763774_764657_764839_765726_765915_766656_767006_773463_773619_782626_782850_791191_791379_792571
706598	contig_8377_pilon	-	2166	2	Intergenic	novelGene_35119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCTTTCCATCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173630	167874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_169307_172896
706603	contig_5935_pilon	-	931	2	Intergenic	novelGene_102747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGGATTGTGAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308586	1307080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1307283_1307857
706607	contig_12038_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_165823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGAATTGGGTCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438159	438460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_+_438200_438500
706612	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_93479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706615	SIRV5	-	282	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACCTACCTTAGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8367_8450_8590_10863
706624	contig_2114_pilon	-	1813	13	Intergenic	novelGene_104316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	83.6076734250843	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	5	1270	1169443	1139050	FALSE	25	ACTACTGAGCATTCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMELGRCSYPVPRLLLLLLLLLSLNGGAVLSWPTEEGKEVWDYVTGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169447	1138506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167530_1167587_1169367
706626	SIRV7	-	272	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35790	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78948	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56095_70883_70988_78841
706630	contig_6191_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_107844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	559	1551	157784	158776	NA	5	GTTTGGCGTGGTTTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEESGDAKAESARSSSANPSKQMPEKPNYTLRFTLVGHTEAVSSVKFSPSGEWLASSSADKLIKIWSAYDGKYEKTLYGHSLEISDVAWSSDSSRLVSASDDKTLKIWDVRSGKCLKTLKGHSNYVFCCNFNPPSNLIISGSFDESVKIWEVKTGKCLKTLSAHSDPVSAVHFNCSGSLIVSGSYDGLCRIWDAASGQCLKTLVDDDNPPVSFVQFSPNGKYILTATLDSTLKLWDYSKGRCLKTYIGHKNEKYCIFANFSVTGGKWIVSGSEDNLVYIWNLQTKEIVQKLQGHTDVVISATCHPTENIIASAALENDKTIKLWMSDY	157225	158847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_157200_158800
706636	contig_19737_pilon	-	2793	8	Intergenic	novelGene_158978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	65.4712898598948	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	398	916	73354	59966	FALSE	30	TGAAAACAAGTTTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVFLVYQTITDFREKLKHPVMSVSYKEVNRYDAPGLALYPGQAQLLSCQHHYEVIPPLRSPGQPGAMNCTTHRINYTDPFSKQTVKSALIVRGPQEVKKRELVFLQFRLNQSSEDFSAIDYLLFSSYQEFLQRPALLTTSTRGQPPRKVLSCFLWSLNGRILSSRRSKI	88543	58088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_59970_61593_61702_68002_68146_71730_71883_73242_73453_82791_82889_86696_86774_88418
706639	contig_11285_pilon	-	1385	12	Intergenic	novelGene_5713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	416.179455094765	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	272	1210	788506	784252	FALSE	20	AGAGGCTAAGCCCCCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796183	784076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788584_795608_795746_796126
706640	contig_7963_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_58409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGATGATAGTAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58484	56558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_56600_58500
706643	contig_4832_pilon	+	2094	14	Intergenic	novelGene_163390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	50	junction_1	316.978971919358	259	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	156	1523	248049	295025	FALSE	10	CACTTTGGCCTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTQLDGVWLVGGCPRGGPRARAACARGSVARVCRGLGSREWRHEPSLHFTMSFLIDSSIMITSQILFFGCGWLFFMRQLFKDYEVRQYVVQVIFSVTFAFSCTMFELIIFEILGVLNSSSRYFHWKMNLCVILLILVFMVPFYIGYFIVSNIRLLHKQRLLFSCLLWLTFMYFFWKLGDPFPILSPKHGILSIEQLISRVGVIGVTLMALLSGFGAVNCPYTYMSYFLRNVTDTDILALERRLLQTMDMIISKKKRMAMARRTMFQKGEVHNRPSGFWEMIKSVATSAPGSENLTLIQQEVDALEELSRQLFLETADLYATKERIEYSKTFKGKYFNFLGYFFSIYCVWKIFMATINIVFDRVGKTDPVTRGIEITVNYLGIQFDVKFWSQHISFILVGIIIVTSIRGLLITLTKFFYAISSSKSSNVIVLLLAQIMGMYFVSSVLLIRMSMPLEYRTIITEVLGELQFNFYHRWFDVIFLVSALSSILFLYLAHKQAPEKHMAP	247893	295596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_248091_263349_263410_264470_264575_265796_265904_266329_266432_275886_276008_279287_279369_284328_284439_286314_286404_287347_287441_291614_291711_293618_293709_294615_294682_294818
706646	contig_13700_pilon	-	3950	21	Intergenic	novelGene_68263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_10	95.9997916664406	222	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	917	2754	3	2756	35214	24717	FALSE	10	TTCAACTTGTGTGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVIYHGHTLTTKIKFSDVLHTIKEHAFVASEYPVILSIEDHCSIAQQRNMAQYFKKVLGDTLLTKPVDIAADGLPSPNQLKRKILIKHKKLAEGSAYEEVPTSVMYSENDISNSIKNGILYLEDPVNHEWYPHYFVLTSSKIYYSEETSSDQGNEDEEEPKEASGSTELHSNEKWFHGKLGAGRDGRHIAERLLTEYCIETGAPDGSFLVRESETFVGDYTLSFWRNGKVQHCRIHSRQDAGTPKFFLTDNLVFDSLYDLITHYQQVPLRCNEFEMRLSEPVPQTNAHESKEWYHASLTRAQAEHMLMRVPRDGAFLVRKRNEPNSYAISFRAEGKIKHCRVQQEGQTVMLGNSEFDSLVDLISYYEKHPLYRKMKLRYPINEEALEKIGTAEPDYGALYEGRNPGFYVEANPMPTFKCAVKALFDYKAQREDELTFTKSAIIQNVEKQEGGWWRGDYGGKKQLWFPSNYVEEMVSPAALEPEREHLDENSPLGDLLRGVLDVPACQIAIRPEGKNNRLFVFSISMASVAHWSLDVAADSQEELQDWVKKIREVAQTADARLSEGKMMERRKKIALELSELVVYCRPVPFDEEKIGTERACYRDMSSFPETKAEKYVNKAKGKKFLQYNRLQLSRIYPKGQRLDSSNYDPLPMWICGSQLVALNFQTPDKPMQMNQALFLAGGHCGYVLQPSTMRDEAFDPFDKSTLRGLEPCAICIEVLGARHLPKNGRGIVCPFVEIEVAGAEYDNIKQKTEFVVDNGLNPVWPAKPFHFQISNPEFAFLRFVVYEEDMFSDQNFLAQATFPVKGLKTGYRAVPLKNNYSEDLELASLLIKIDIFPAKQENGDMSLFSGTSLRERGSDASGLLFHGRAREGSFEARYQQPFEDFRISQEHLADHFDGRERRAPRRTRVNGDNRL	35216	23522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_24760_24872_25061_25161_25251_25353_25516_25632_25748_26652_26802_26884_27110_27293_27391_28964_29123_29672_29743_30032_30130_30401_30506_31324_31403_32474_32656_32748_32869_32947_33149_33443_33632_33727_33830_33909_34033_34172_34342_35119
706647	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_91278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706652	contig_11370_pilon	+	1492	8	Intergenic	novelGene_98753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	50.2820615556454	438	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	175	1119	153583	155741	FALSE	30	CCCAAATCTGGAGCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAASPGASVMDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	153408	156114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153678_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
706656	contig_6710_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_97731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706660	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706663	contig_5260_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_144426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCACCAGAACTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569987	570393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_570000_570400
706664	contig_11512_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_43228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	26	358	4011	4566	FALSE	20	TGCTTATAGTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAY	3985	4568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
706668	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706669	contig_10904_pilon	+	1061	4	Intergenic	novelGene_22659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	1276.48849931713	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	136	654	530908	534035	TRUE	20	TTGGTGTTTATTATCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRYCLCRAAWVPLSYPLLSVGRSHCCPYFLCSLRRWHV	530772	535203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531005_531238_531362_533736_534186_534946
706672	contig_17796_pilon	+	1965	8	Intergenic	novelGene_33810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	462.81604755837	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	110	985	53527	110237	TRUE	80	AGTACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVFLFF	53417	111356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_110217_110765_110903
706673	contig_3825_pilon	+	1280	7	Intergenic	novelGene_77953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1305.35785855408	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	527	880	14814	17211	FALSE	35	ACCAATGTCAGAATTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEVPALGGRPPRVLADTQLPQSPPCAPLLATLTSGAAFVQRPVTSISTWPLRLSESNLNLSCP	12982	17611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_17025
706674	contig_3233_pilon	-	1506	7	Intergenic	novelGene_56531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	109.048409229826	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	217	666	706773	702290	TRUE	30	GGTTAGATTTTCAGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWFSTAVLIGLFVFEHFPTYMIGVGLFTNLVYFGLLQTFPFIMLTSPNFILSCGLVVVNHYLAFQFFAEEYYPFSEVLAYFTLCLWIIPFAFFVSLSAGENILPSTMQPGDDVVSNYFTKGKRGKRLGILVVFSFIKEAILPSRQKIY	713797	701326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_702089_702211_702406_702578_702682_703401_703470_705474_705629_706764_706845_713652
706676	contig_13571_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_128105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGTATACAATAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64952	66731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_65000_66700
706679	contig_5485_pilon	-	1546	5	Intergenic	novelGene_37702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.080902468334	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	154	1188	87935	85044	FALSE	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTSDFNNNYCVPGNSVF	88088	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_85091_85645_86133_86257_86366_86774_87027_87794
706680	contig_6233_pilon	-	1492	10	Intergenic	novelGene_74794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	302.493342442809	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	475	1317	149777	136863	FALSE	35	TTAAGCCACAAAGCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELSLCCEEAQATWRSHV	250353	136687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_166962_167024_199837_199941_200462_200546_250135
706682	contig_6710_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_89047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	195.347616719592	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTGACTCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568334	603444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_568373_574267_574329_575648_575705_584580_584641_585252_585331_587685_587751_594844_594914_595689_595832_597741_597842_602546
706683	contig_1275_pilon	+	886	3	Intergenic	novelGene_108860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	111	746	747279	747968	FALSE	20	TAGCATAATTGTGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGITLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746781	748108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746886_747272_747614_747667
706696	contig_10323_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_123622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475771	476208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_475800_476200
706700	contig_11258_pilon	-	1198	4	Intergenic	novelGene_67849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_2	119.15349577564	1821	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	365	985	360591	352060	FALSE	45	AAAGAATATTCAACACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVPAQQHPLPAPSLSEGALVLEHAQCCPLGEQASEGS	360955	351846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354741_355099_360530
706703	contig_8375_pilon	-	1674	1	Intergenic	novelGene_141291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCCACTGCCATCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129633	127959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_128000_129600
706711	contig_10904_pilon	+	991	2	Intergenic	novelGene_22609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCTGTTCATTGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499104	500812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_499592_500308
706712	contig_10904_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_22638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATGCTCTCCGGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500962	501367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_501000_501400
706713	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
706716	contig_11512_pilon	+	308	2	Intergenic	novelGene_43249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1	306	4023	4551	FALSE	10	TTACTGTGCTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	4022	4553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
706721	SIRV1	-	196	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	4008	5582	3588	-133	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAACACTACTATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
706723	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_94285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706733	contig_5189_pilon	-	2279	10	Intergenic	novelGene_34845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1235.26870171315	1	144	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244288	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230392_230485_235736_235826_244149
706734	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706735	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	237	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706736	SIRV6	+	786	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-352	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	89	270	69	338	2002	3109	TRUE	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPWY	1933	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2833_3106_3165_10721_10819_11031
706737	contig_5083_pilon	+	2515	11	Intergenic	novelGene_151693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_6	76.0883696763178	119	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	206	2383	1367951	1410618	FALSE	30	AATAAAACCCTGCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGTRSFSLSGLLPAQTSLEYALLDAVTQQEKDSLVYQYLQKVDSWEQDLSMPEFPEGLEWLNTEGPISVYKDLCGKVVVLDFFTYCCINCIHLLPDLHALEHTYSDKDGLLVVGVHSAKFPNEKVLDNVKSAVLRYNITHPVVNDADASLWQELEVSCWPTLVILGPRGNMLFSLMGEGHKDKLFLYTSIALKYYKDRGQIRDKTVGIKLFKDSLPPSPLLFPGKVIVDHVTDRLVIADTGHHRILVVWKNGQIQYSIGGPNPGRKDGTFSESTFNSPQGVAIMNNVIYVADTENHLIRKIDLEAEIVSTVAGIGIQGTDKDGGAKGEQQPISSPWDVVFGTSGSEVQRNDILWIAMAGTHQIWALLLDSGKLPKKNELKKDTCVRFAGSGNEENRNNAYPHKAGFAQPSGLSLASEEPWSCLFVADSESSTVRTVSLKDGAVKHLVGGERDPMNLFAFGDVDGVGINAKLQHPLGVTWDKKKSLLYVADSYNHKIKVVDPKTKNCLTLAGTGDASNISSSFTESTFNEPGGLCIGENGRLLYVADTNNHQIKVMDLETKTISVLPVIKSENSVVDGRFLLYKQKTLPKLPKSAPRISLSPVTASPGQTLQFKLRLDLPSGTKLTKEVPSCWFLTAEGNEWLFQGQLSSGEIENIFSQPTISLQIPGDCLSLEAIVSVSVFLYYCSTDSSACMMKGILFSQPLQITDTQQGCIAPVELRYVF	1367745	1410750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1368129_1369948_1370102_1384136_1384593_1390264_1390387_1392729_1392860_1399912_1400013_1402836_1403069_1403636_1403760_1404691_1404899_1405912_1406133_1410361
706746	contig_6445_pilon	-	2722	14	Intergenic	novelGene_77015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGGCCGCCTCCTCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666785	522178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614092_635367_635490_636695_636846_644515_644717_656008_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663
706750	contig_12327_pilon	-	2673	5	Intergenic	novelGene_140660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1459	1782	1072255	1061074	FALSE	55	AAGAGGATTAATGAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQTLSSSITFFSGEYIFCMVMNLTLIFSTSTKSGVGAKTPSSCGFLCRTSCRLSFSCFQEPSAMWKSFSMASTCPFKGFKMHLCMAFSSTTSIWSSGIRDSMGGV	1086360	1060182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1061116_1071973_1072277_1074347_1074483_1082227_1082389_1085219
706754	contig_9242_pilon	-	1687	18	Intergenic	novelGene_155062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	83.1817537218898	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	71	1039	411279	385191	TRUE	60	GAAAAAGAAATAAAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FACCLHTAKRSKFSAPWSRPAAFMSSLMINQPQYAWLKELGLREENEGVYNGSWGGRGEVVTSCCPANNEPIARVRQASVADYEETVKKAREAWKIWADIPAPKRGEVVRQIGDALREKIQMLGKLMSLEMGKILVEGVGEVQEYVDICDYAVGLSRMIGGPILPSERPGHVLIEQWNPVGLVGIITAFNFPVAVYGWNNAIAMICGNVCLWKGAPTTSLISVAVTKIIARVLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAKDEQVNLLSFTGSTQVGKQVALMVQERFGRSLLELGGNNAIIAFEDADLNLVIPSAFFAAVGTAGQRSVLGTHGILMFSMGHSTQNRR	411349	371094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_371313_372640_372717_381994_382069_382271_382370_383654_383772_385125_385233_386411_386437_389040_389114_391417_391460_396071_396170_397611_397690_400726_400772_404304_404438_405214_405339_405660_405742_409048_409115_409695_409750_411171
706755	contig_15732_pilon	+	2153	9	Intergenic	novelGene_88834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	374.838611104833	9	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	684	1238	85890	175381	TRUE	80	AAACCCATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWRARGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKE	11070	185789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_85812_85909_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_175379_175485_184977
706758	contig_14322_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_116027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671634	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
706760	contig_12951_pilon	+	602	2	Intergenic	novelGene_68127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	27	350	61341	64076	FALSE	30	TTATGTAATATCTTAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKMAEEEFPNTTHEGLNVTLHTTLVITTKLVLPTPAKPILPVQTGEQAQQEEQSSGMTIFFSLLVLGEGVHCCRLECLGALSVWLPMLLLFTLLSFFPLVFHFKR	61314	64328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_61367_63778
706762	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706763	contig_10437_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_38418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	53.8578375602536	1293	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	54	317	811018	799511	TRUE	35	TATGGCAATAGCAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAESARYCRVKASKSKAMAKHLKFIARTVMVQEGNVEGAYRTLNRILTTDGLIEDIKRRRYYEKPCRRRQRESYEICRRIYNTEMTRKINFLMRKNRADPWQGC	811508	795971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_796631_798983_799692_810935_811053_811489
706764	contig_10331_pilon	+	999	9	Intergenic	novelGene_54186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	51.8724396958539	520	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	25	999	604724	619952	FALSE	75	AAAGAAAAATTAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTRKCGFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKEATKKRKQDEVEEITPQIQKPHLQEPAKKKVKKKLSDADKKLANRESALACADLEEEEIHQEHGQKRRSSQSGGGVRAADTKVPNNVDHIVVNQRKKIQVNQEEERLKNERTVFVGNLPVTCNKKKLKSFFKQYGQIESVRFRSLIPAEGTLSKKLAAIKRKIHPDQKNINAYVVFKDESAATKALKRNGTQIADGFRIRVDLASESSSNTDAVHLALKLNNSELMGRKLRVMRSVN	604699	619952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605105_605366_605501_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_619868
706765	contig_11370_pilon	+	1430	2	Intergenic	novelGene_98710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	0	193	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	173	622	145831	147740	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGSGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRSEFLTFIPALPLRSLTYLLRFWFCFLCGSQCGGKQTSAPGC	145658	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422
706770	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
706783	contig_10159_pilon	-	2259	7	Intergenic	novelGene_30907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_6	144.100273729403	42	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	99	908	1051078	1016456	FALSE	35	TTCTTTTTTAAAAAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAEAFSRPLSRNEVVGLIFRLTIFGAVTYFTIKWMVDAIDPTRKQKVEAQKQAEKLMKQIGVKNVKLSEYEMSIAAHLVDPLNMHVTWSDIAGLDDVITDLKDTVILPIKKKHLFENSRLLQPPKGVLLYGPPGCGKTLIAKATAKEAGCRFINLQPSTLTDKWYGESQKLAAAVFSLAIKLQPSIIFIDEIDSFLRNRSSSDHEATAMMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPVGGLFCFSS	1056762	1015104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1038415_1038537_1040930_1041030_1050916_1051092_1056677
706784	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706787	contig_3942_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_128633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	112	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176950	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176962_178331_178490_179045_179177_179714_179825_179974
706788	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706792	contig_5780_pilon	+	1382	6	Intergenic	novelGene_29773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	6	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	281	1105	107519	113174	FALSE	25	GCAGCTGATCACCTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKPAGPSSGPCSPDPPLLAPGLSGRMAMHHVHIPDGSWLDLLEPGSACRSQGPEDWCLWAQQGEREAASSRFGLCSPRSHGRTRVLLISFGAVVWFMRSDLMLDIPGNPVKELFPLQAFTESSFLLWLAPLNLVWPSFQTCQRTYLTRDGRAPGS	73990	113451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110175_112711
706795	contig_14744_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_66101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATAAGAGTGTTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493290	1495067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1493300_1495100
706796	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
706797	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
706800	contig_1594_pilon	-	2460	1	Intergenic	novelGene_138806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCACACAAGAAAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405744	403284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_403300_405700
706801	contig_12427_pilon	-	1674	11	Intergenic	novelGene_40441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_10	103.182169002207	634	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	137	994	306166	278408	FALSE	5	CCTCCCTGTCTGCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNAEKAMTALARFRQAQLEEGKVKERRPFLASECTELPKAEKWRRQIIGEISKKVAQIQNAGLGEFRIRDLNDEINKLLREKGHWEVRIKELGGPDYGKVGPKMLDHEGKEVPGNRGYKYFGAAKDLPGVRELFEKEPLPPPRKTRAELMKAIDFEYYGYLDEDDGVIVPLEQEYEKKLRAELVEKWKTEREARLARGEKEEEEEEEEEINIYAVNEEESDEEGGQEKGGEDGQQKFIAHVPVPSQQEIEEALVRRKKMELLQKYASETLQAQSEEAKRLLGY	306302	277727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_278516_278880_278968_282489_282612_283580_283704_287213_287332_290078_290192_293584_293628_293811_293878_295025_295078_295631_295655_306163
706802	contig_9771_pilon	-	1523	6	Intergenic	novelGene_156910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	99.7244202790871	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	163	909	346973	332612	FALSE	20	TGTTTTGACATTTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLYYAFPYIILVLSLVTLAVYMSASEIENCYDLLVRKKRLIVLFSHWLLHAYGIISISRVDKLEQDLPLLALVPTPALFYLFTAKFTEPSRILSEGANGH	350136	331997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_339573_339756_341990_342198_346911_347067_350067
706803	contig_11720_pilon	-	1711	12	Intergenic	novelGene_43882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84.2164664607848	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	513	1358	110844	108190	TRUE	25	CCCAGAGACATGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASQPSLGEGEESESNSVESLGFCSVMPLAAVGYLDGTLAIYDLSTQTLRHQCQHQSGIVQLLWEAGTAVVYTCSLDGIVRLWDARTGRLLTDYRGHTAEILDFALSKDASLVVTTSGDHKAKVFCVQRPDR	113340	107786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_107956_108005_108266_108866_109022_109209_109301_109506_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112683_113170
706804	contig_9437_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_141715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCACATACAGAAGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106855	107162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_106900_107200
706809	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
706818	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	183	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706819	contig_6028_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_156593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAAAACTGGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326400	323563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_323600_326400
706824	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671639	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
706825	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	209	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706827	contig_10163_pilon	-	1328	8	Intergenic	novelGene_82617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	10.860901604999	4	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	390	1070	51815	48912	FALSE	15	TTATGTAGGCCTTTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAELQGSFTELRKALFQLSMKDASLLSTAQALLRWHDAHQFCSRSGQLTKKNVAGSKRVCPSNKIIYYPQMAPVVITLVSDGTRCLLARQSSFPKGMYSALSGFCDIGESLEEAVRREVAEEVGLELDRLQYSASQHWPVPNSSLMIACHATVKPGQTEIQMNLRELEAAAWFSHDEVATALKRKGPYTQQQDGTFPFWLPPKLAIAHQLIKEWLEKQSCSSLPA	65342	48653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_49113_49579_49735_50467_50580_50741_50868_51728_51825_53290_53426_56473_56620_65243
706829	scaffold_2602_pilon	+	1796	5	Intergenic	novelGene_127703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	365	junction_1	332.351752665756	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	646	1035	58275	68818	FALSE	20	GATAGATACTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	57448	69579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
706832	contig_2278_pilon	-	2096	11	Intergenic	novelGene_118115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.13373143415	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	238	1131	956893	940418	TRUE	30	TTAATTCTACTCTCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	999141	939333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_939740_939858_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_956857_956913_998923
706835	SIRV7	-	328	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	18	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114720	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
706836	contig_12886_pilon	-	3124	15	Intergenic	novelGene_135534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTACTTCCGGGGCGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885197	871432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_871556_871745_871850_872146_872364_872462_872602_872985_873409_874137_874298_874732_874891_875184_875383_876083_876252_876575_876682_877397_877529_883341_883462_883889_884030_884131_884203_884331
706838	contig_4654_pilon	-	1543	7	Intergenic	novelGene_103097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	833.549038749371	8	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	755	1129	497874	494476	FALSE	40	GTTGTACAGAAAGTTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515954	494061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_498805_499030_500118_500422_515793
706847	contig_17989_pilon	-	287	2	Intergenic	novelGene_150825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAACATCATAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261396	251296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_251487_261299
706852	contig_11338_pilon	+	2105	4	Intergenic	novelGene_6203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	300.812233793774	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	249	473	8903	10018	TRUE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRP	8099	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8189_8743_8924_9814_10022_11981
706853	contig_20614_pilon	-	2601	9	Intergenic	novelGene_107535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1845	2144	121022	99137	TRUE	15	TGTTATCCCCTCTACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVVTSCRNCIKQRETHLAIWHVRSRLGKQSISPLRLFTLISHQGCSGTFWVYFTSVSSVAPLPAELVTIPNRSFLFFSFSSSSDFLEIEETFKPNL	122866	69265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_69302_81155_81257_82947_82994_83220_83291_86601_86649_87518_87595_88008_88060_99106_99175_120760
706855	contig_6795_pilon	-	1737	2	Intergenic	novelGene_27692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCCCACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81069	79053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_80152_80430
706856	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706858	contig_6361_pilon	+	716	5	Intergenic	novelGene_23998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	756	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	359	715	415471	436352	FALSE	30	GTGAGAACCACAAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQTVITDGSRDAIFGPVVGPHCDTCSTQTAFIHVTSNLTCKALNAKCSTKTDFAIGEAITQASVPVGGLDWRTTPRLRHNDHLGRLHFQCRLLKGYALQEMSPGLGQNLTRRESHVK	410934	436353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411212_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
706860	contig_2739_pilon	+	1163	5	Intergenic	novelGene_165826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	151	525	16176	16550	TRUE	70	GAGAAAATATACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKTEISNNVTRSLELDSKTKEAFPVTRCRNPWTKSNRAHAGKCDQGMLQSTLTLSILCDGASTSCESSLHHHFCLENGSFGYGTCDTQVPQNQLFPTSCPHSHDPWFQGEDKSRKYLALTFE	16025	140097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_16711_37605_37740_116536_116594_135883_136049_139975
706868	contig_2310_pilon	-	1480	6	Intergenic	novelGene_71618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACATCTTTTATTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134637	122675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_123052_124479_124635_126506_126679_127455_127953_133365_133447_134438
706870	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
706876	contig_10988_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_104716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTCCCTATAGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14293	14590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_14300_14600
706881	contig_14513_pilon	-	683	2	Intergenic	novelGene_70278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	175	333	18880	18722	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11608_18691
706892	contig_10341_pilon	+	1143	4	Intergenic	novelGene_47215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	977	junction_1	97.6194425079121	336	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAGCTGTGTTATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63168	65372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_64154_64484_64615_64936
706899	contig_20029_pilon	-	1365	7	Intergenic	novelGene_138896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	360.453764950051	1017	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	66	1205	11696	5156	FALSE	5	GCATTGTCTTTTTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSAANTRFAVDLFRALNEDSPAGNIFFSPVSISSALAMVFLGAQGSTALQLSKTFHFDAVEEVHSRFQSLNADINKRGASYILKLANRLYGEKTYSFLPEFLESTQKMYGAELASVDFQLASEEARKQINQWVKGQTEGKIPELLASGTVNSMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTDAPFRLNKKDTKTVKMMYQKKKFPYGYIQALKCRVLELPYQDKDLSMVILLPDDIEDDSTGLQKIEEQLTLENLSEWTKPENLHTMEVNVSLPRFKLEETYDLNSYLARLGVQDLFNSSKADLSSMSGARDLFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIANFCMLVPEETFNADHPFFFFIRHNPSKSILFCGRFSSP	12760	4995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_-_5561_7095_7264_7349_7493_9501_9620_10088_10227_11528_11731_12729
706904	contig_3424_pilon	+	2497	10	Intergenic	novelGene_55578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_8	87.8868520623654	969	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	148	921	1099818	1107395	FALSE	10	GCACTTTCTCCTTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APYPGPGVPAGVPAVQQDEPGHQDSGVLPQESPVRSSLSEPREDDFGGNMAHLEYTGQSQDSEPPLGWEHTDSGGLPPPELKKPVKATQDEVKEPKKTVESWFSRWLPGKRKTEAYLPDDKNKSIVWDEKKNQWVNLNEPEEEKKAPPPPPTAFPRAAQNAPPGPGGTPRAAVNVFSRKAARTRARYVDVLNPSGTTRGEPVLAPAEFFAPLAPLPIPAHLFVPNPAPEEPPPAGVGDPGGQAPAGGQAQPEPTSETKAPSDQTPAGGPPGGAVPFYNPAQFAQVSAASGGSRTGRMGQRQQPALN	1098952	1108971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1099029_1099746_1099830_1100992_1101125_1102321_1102403_1102603_1102661_1102821_1102934_1103330_1103469_1103685_1103781_1105768_1105847_1107326
706905	contig_14815_pilon	-	1158	8	Intergenic	novelGene_127206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	297.57516628885	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	72	860	22749	17106	TRUE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23306	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_16737_17086_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702_22765_23250
706913	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
706917	contig_3004_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_127554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCATTTAGATCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817988	821051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_818623_820752
706929	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
706930	contig_17171_pilon	-	2058	7	Intergenic	novelGene_147370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.2414180285179	305	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	59	784	270859	266475	TRUE	20	TATTGGGTTGTGACATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPATALLLQLALLLHAAASAAQRPSTFRMSPLKVQGTLGKSVELECEVLLSNFASGCSWLFQRPDAATSPTFLLYISSSRPKPSSDRYSGSKTESRFKFTLHDFQVEDQGYYFCSVVSNHALYFSAVVPVFLPEKPVTTLAPRPPTPAPTKALQPKSLSPEVCRPSAGRPSAGGAVDSRGLGFSCDLYIWAPLAATCAVLLLSLIVAVICSHRNRRRVCKCPRPLVRPGGKPDLSEKYV	270917	264891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_265360_265668_266527_268720_268752_269338_269450_269671_269798_270365_270723_270810
706931	contig_19579_pilon	-	1017	7	Intergenic	novelGene_59403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_6	513.470355089323	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	15	854	13090	7943	FALSE	35	TGGAACCCATTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13104	7779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
706935	contig_5935_pilon	-	1720	2	Intergenic	novelGene_102669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431649	422263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_423851_431516
706937	contig_5003_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_120183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGAAGGAAGGAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8458	6310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_6300_8500
706944	contig_8606_pilon	+	2880	1	Intergenic	novelGene_159407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACCTGCCCTGCACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124873	127753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_124900_127800
706950	contig_9389_pilon	+	1972	8	Intergenic	novelGene_83884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGACCGGGCCCCCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35705	45473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_36712_37981_38043_38121_38205_38581_38669_38850_38973_39407_39535_40050_40205_45141
706959	scaffold_6394_pilon	+	1026	7	Intergenic	novelGene_111023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_2	344.857337653316	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	15	866	402184	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	402169	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
706964	contig_11338_pilon	+	996	4	Intergenic	novelGene_6172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	797.3716545975	7	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	2	784	747	13398	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEVSGARSLGRLPSRAVPACVLTAPPGPCPGGWQWLGSSVPRGAGPRPCSAAPTSQRSPPVRQQQSGHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	745	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_13057
706966	contig_5649_pilon	-	1898	7	Intergenic	novelGene_82414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGCAAAGTTCCGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341816	1301434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1301591_1311794_1311939_1312513_1312615_1313018_1313141_1325412_1325545_1333752_1333818_1340638
706972	contig_11056_pilon	+	2847	1	Intergenic	novelGene_130371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311081	313928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_311100_313900
706976	contig_18869_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_56246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73541	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
706982	contig_12837_pilon	+	750	6	Intergenic	novelGene_57293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	1385.10525231839	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	199	522	129778	161513	FALSE	20	TTATAGATTTCTGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKGKIRLK	128291	161741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128359_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387
706985	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
706987	contig_5084_pilon	-	1895	7	Intergenic	novelGene_64630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	38.6120303647566	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	132	731	1334273	1328304	FALSE	15	CCCATCTGCTTCTAAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLIQGMPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGGNGYINDFPMGRILRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH	1334404	1327139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330262_1330746_1330841_1333776_1333874_1334258
706992	contig_665_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_158190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAGCCTTCAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91828	90928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_90900_91800
706993	contig_665_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_158189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAATCTTACTGTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89714	88571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_88600_89700
706997	contig_1225_pilon	+	2082	3	Intergenic	novelGene_44114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	369	3	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCGCAATATTGCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134473	150604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_147007_147169_148709
706999	contig_19851_pilon	-	2437	15	Intergenic	novelGene_29809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_13	58.7460810677302	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	117	1439	36836	8752	FALSE	40	CACAAAAGGAGGTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAALRLYTLNKVLLTPGRGLAQGSQDPKNQGPLHIHEVRVKLREIVGASTNWRDHVKAMEERKLLHSFLAKSQKALPPRRMKDSYTEVLLPLGSQPELREKYLTVQNTVRFGRILEDLDSLGVLICYKHSKIQATQASPLSIVTALVDKIDMCKKSISPEQDIKFSGHVSWVGKTSMEVKMQMRQLHGDEYSPVLDATFVMVARDSENKGPAFVNPLLTESPEEEELFAQGELNKGRRIAFSSTSLLKVAPSAEERTTIHEMFLNTLDSKTISFRSRVLPPNAVWMEDSKLKSLLVCHPQERNIFNRIFGGFLMRKAYELAWATACSFGGSRPFVVAVDDIMFQKPVEVGSLLFLSSQVCFTQDNYIQVRVHSEVASLQSKEHTTTNVFHFTFMSEKEVPLVFPKTYGESMLYLDGKRHFNSMGAPVNLMGKNYRVEP	36952	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_8844_9296_9448_9598_9687_10131_10218_10391_10483_10630_10743_11862_11931_17803_17878_23177_23282_23843_23928_27405_27444_27708_27880_30130_30177_32061_32160_36816
707002	contig_11720_pilon	+	1565	9	Intergenic	novelGene_43794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2452.86819037938	2	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	405	1061	78465	95438	TRUE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKPIFTHGCGQKHPTSSRC	67819	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_78378_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95051_95383_95486_98299
707006	contig_4068_pilon	-	1060	2	Intergenic	novelGene_161691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	760	1059	7998	3758	FALSE	40	TGATAGACCACGCTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRKKLNEYENGELSFYGDLKTNQIEMDIQMAMLKHKIDDLTAKLETSSSKCLHLDAKNQALQQELLAVKAVQKKCEKLEKNKKKLEQEVVNLKSHLEIN	8757	3756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_3947_7887
707010	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_90287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707014	contig_2830_pilon	+	775	2	Intergenic	novelGene_165851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	165	junction_1	0	1746	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	167	478	695770	696081	FALSE	25	ACCGTATCTCAGTATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAESPSGRAAVAQEKENAEAGLTHRRGDRRLQLAPLPARAAPLGSLPPQEPTAAMETVQELSPLAKEMLGQKPKGKLVKLYVLGSVLAFFGIVLGLVETVCAPFTAARRLRDEEAAVASLQAALERQALRTQALQEKDKQQEAVQCSRGLSNRQHAS	695458	696378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_695594_695738
707015	contig_14441_pilon	+	970	5	Intergenic	novelGene_100555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	409.281916898365	19	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	189	734	113653	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111196	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111379_113646_113711_116578_116950_117247_117344_117539
707016	contig_9678_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_146368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCACCTTATTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238313	238858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_238300_238900
707031	contig_8020_pilon	-	1135	7	Intergenic	novelGene_114369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	95.7939049325281	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	774	1076	105876	104794	FALSE	20	AAACAGGGCTGTGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107191	104734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106507_106616_106715_106803_106892_107130
707032	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707033	contig_12414_pilon	+	1102	3	Intergenic	novelGene_59555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	93	566	370898	374054	FALSE	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373155_373739
707034	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	115	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
707039	contig_5988_pilon	+	1056	2	Intergenic	novelGene_15982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	195	938	786070	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	652703	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652790_785961
707047	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	252	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707048	contig_8045_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_35474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4034	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCGAAAATATTACCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592615	590399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_590400_592600
707050	contig_4364_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_3055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533024	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
707052	contig_5467_pilon	+	1995	9	Intergenic	novelGene_111929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	403.810579820539	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	210	1316	8717	15166	FALSE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRGYGGGGGPGAGGVAAGPSALADAVAATVAVSDGGGGGGGAAGAAGAVVEDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKNALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTAVRPSRVARDAAMVSGGLGRQLLEKATEADVTHPPVSYNDTAPPDPALGPELLCDLQWPDGGPDLPHFRGPGTQPDWLVLEQLCRRTRADLRATLRFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCQYVSSLTKNGNLLVPHTQPSAWDVTLRDFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTSLLMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPAISLTQIV	8230	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8388_8664_8792_11427_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14401_14507_14740_14956
707057	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707059	contig_9011_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_159349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1127	1606	742103	742582	NA	75	AACCAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWLSTQLLTKRLTVETHQLLHGRRIWQSSSVKIIALETLWGSSTLSYRVARSWNRLDSNGFLVYGMVFCKAVNSVHPAYLKGKSVTSSLTAESPNFLKCPEQTMRYLLSAVSCTLPLLSGSLLSLYESPPRSPPTHTRRACPLFCAATVPCVWSSSFT	740976	743228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_741000_743200
707061	contig_5372_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_149703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28974	30948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_29000_30900
707062	contig_11258_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_67806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292619	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_292600_293400
707070	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	195	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
707074	contig_12923_pilon	-	2046	15	Intergenic	novelGene_30063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.553561520241	1	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	53	2023	93727	45355	FALSE	10	TACTGATCTGTTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTLLIQSFDE	101220	45331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45382_51210_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
707079	scaffold_17542_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_139218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAGCGTAAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251129	253126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_251100_253100
707081	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	31	354	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707082	contig_12624_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_61023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATGAACTGGGAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850305	849809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_849800_850300
707083	contig_5482_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_144448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272649	273958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_272600_274000
707085	SIRV6	+	331	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	332	104	166	66	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAGCACTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
707086	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707087	contig_3797_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_120111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATTTTGTTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533788	535197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_533800_535200
707088	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
707092	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
707097	contig_6175_pilon	-	2174	9	Intergenic	novelGene_16351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_8	448.673722625919	88	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	226	1326	1719710	1693793	FALSE	70	AAGAAGAAGAAAATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKVGLLSYILPKSMNGVELKLRKTFSCLGNSAFCSFLYKFSGT	1793681	1692944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719717_1746007_1746156_1793610
707098	contig_15720_pilon	-	1088	8	Intergenic	novelGene_41897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	5	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	324	1046	282638	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLPSPAPGMEHCASGGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282588_282750_283785
707099	contig_7286_pilon	+	538	4	Intergenic	novelGene_108718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAACAGTAACTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286946	290861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758
707102	contig_7963_pilon	+	1276	5	Intergenic	novelGene_58518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	224.715792724944	1591	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	232	987	194098	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSQHTF	193866	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_200100
707111	contig_614_pilon	+	1723	6	Intergenic	novelGene_132626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	32.8	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	48	482	588714	619956	TRUE	25	AGGTATCTGTTAATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGVSVLLLLDVGKAQVLATGESAVTETGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSRCQIRHHRDCSGSSHICGLPGPEDLHVPQARV	588666	641286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619242_619493_619859_619971_621721_621753_640090
707112	contig_3077_pilon	-	1604	9	Intergenic	novelGene_26790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACAATGCGCAGCGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463989	457880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_457936_458245_458397_458532_458606_459128_459234_459481_459613_460308_460392_461297_461384_462230_462332_463170
707114	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	55	AATAAAAATGAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707117	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
707119	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2	370	14438	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIRQAGAARWCHRLCSSCPCCSGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14368
707125	contig_9014_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_106741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTCTCCCCTATGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57527	57059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_57100_57500
707126	contig_9014_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_106740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCCACTGGATAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57109	55290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_55300_57100
707127	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707128	contig_10733_pilon	-	1620	7	Intergenic	novelGene_109963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	48.4446992857721	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	80	733	299663	297229	FALSE	5	TCGGTGCAGCTTGTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLVLLYSGVSVAFWATMLVVGTCYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGGVKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFTATNPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLCNLFCGVCVGIVGSGAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQVLNPLRDPLYSCPQPAPPSF	299742	296341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_297483_297867_297920_298037_298108_298312_298391_298518_298603_298831_298881_299596
707130	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_16624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
707134	contig_3627_pilon	+	2371	14	Intergenic	novelGene_78470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	173.297432179476	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	109	2163	432362	483447	FALSE	15	TACTGTCTCTTTTCACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVENAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD	432253	483655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177
707135	contig_18184_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_123880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCTGCATAGAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542719	542224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_542200_542700
707139	contig_10235_pilon	+	838	3	Intergenic	novelGene_46453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_1	96	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	167	316	211879	212152	FALSE	30	CCACACCCATAGCATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVGSVAQGTKQEKTGGSRRLVYFPFRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	211581	212674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_211704_211834_211924_212047
707140	contig_10541_pilon	-	2455	5	Intergenic	novelGene_144653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	177	junction_4	241.132095541013	22	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	300	743	312553	295100	FALSE	80	ATGTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVCLFILEFLFFKFAEIFHTV	394512	293387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_295337_312346_312616_344086_344157_374167_374310_394487
707142	contig_3942_pilon	+	958	6	Intergenic	novelGene_128697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	486.436429556833	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	330	848	428152	430059	FALSE	30	GTTATGAGTCATTTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCMGTGEIKACGREACAPIWLVTSHPTALQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQVSCLHFFDCQLLAPG	426550	430169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429858_430016
707143	contig_3602_pilon	-	1373	8	Intergenic	novelGene_60651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.709908706191	19	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	128	718	1139393	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIKKTIQGDEEDLR	1139520	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106726_1111718_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
707144	contig_7695_pilon	-	1294	3	Intergenic	novelGene_41555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	94.5	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	449	880	380076	373971	FALSE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGGMCGG	397139	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_379664_380089_396703
707145	contig_12638_pilon	+	3185	3	Intergenic	novelGene_33192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	187.5	22	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271026	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_271069_271147_273584_273758
707151	contig_10235_pilon	-	1188	5	Intergenic	novelGene_46619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.1036970955921	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610479	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609692_609955_610056_610280_610312_610365
707152	contig_11338_pilon	+	1946	10	Intergenic	novelGene_6170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	561.607107513675	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	446	952	6086	7822	TRUE	30	AGCTGAATTTAACCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGNSSGQERELWDRKGSLWGEGHGEIQSMY	745	13609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_8189_8743_8924_9814_9929_13275
707157	SIRV7	-	331	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	11	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
707158	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
707159	contig_14322_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_115725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671543	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671500
707164	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_97673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707165	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_95585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707169	contig_8663_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_58004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAAATTTTCCATCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75492	74755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_75118_75353
707171	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
707178	contig_11752_pilon	+	1094	6	Intergenic	novelGene_37598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1871.42709182057	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	107	475	84194	94226	TRUE	40	TGTGAAATATAAAGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPSPK	84087	105896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87432_94214_94410_96442_96576_105593
707179	contig_299_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_129453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGGTCACTGCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963355	962838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_962800_963400
707185	contig_14266_pilon	+	1823	6	Intergenic	novelGene_162246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	83.9680891767819	438	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	477	794	147310	150132	FALSE	20	TTACTGCCTATATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVNKKMDPQKTLQTMQNFQKENMKMEMTEEMINDTLDDIFDGSDEEEESQDIVNQVLDEIGIEISGKMAKAPSAARSLPSASTSKATISDEEIERQLKALGVD	120909	151161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14266_pilon_+_121157_136685_136778_143994_144129_147306_147410_149501_149609_150021
707189	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_94932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707191	contig_11850_pilon	-	1896	8	Intergenic	novelGene_125224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	949.915893161933	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	105	1010	286397	282879	TRUE	10	GATTGTTCTTCTGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	281441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281782_282332_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
707194	scaffold_16539_pilon	-	1302	8	Intergenic	novelGene_68344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.554818403315	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	50	913	502141	490173	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHLPASALRIPRLPGMMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRMDGAACGASWRLCS	502190	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490219_494631_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111
707195	contig_5302_pilon	+	1738	9	Intergenic	novelGene_81481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	177.470420070501	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	496	885	328325	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306713	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319810_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
707197	contig_6710_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_96595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
707198	contig_18272_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_7079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530589	529533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_529500_530600
707201	contig_5041_pilon	+	1894	8	Intergenic	novelGene_27122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	70.0314798020526	247	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	82	1092	710834	841205	FALSE	5	CTTTCTTGGAGTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGRCTRSQPASQELVEVTTGRRGGGSMAASLRLRGAASSLHYWSRRRWPAMAGLPAVCSRSMASKTPVGFIGLGNMGNPMAKNLMKHGYPLIVYDVFPDACKEFQDTGEQVVSSPADVAEKADRIITMLPTSINTIEVYSGANGILKNVKKGSLLIDSSTIDPAVAKELAKEVEKMGAVFMDAPVSGGVGAARSGNLTFMVGGVEEEFAAAQELLGCMGSNVLYCGAVGTGQAAKICNNMLLAISMIGTAEAMNLGIRLGLDPKLLAKILNMSSGRCWSSDTYNPVPGVMDGVPSANNYQGGFGTTLMAKDLGLAQDSATNTKTPIFLGSLAHQIYRMMCAKGYSKKDFSSVFQFLREEETL	710752	842007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_710925_729266_729428_742654_742765_745409_745532_825377_825512_829621_829699_836408_836566_841046
707203	contig_8660_pilon	+	918	3	Intergenic	novelGene_136498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAGAAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308095	315366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_308734_310291_310435_315229
707207	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10497	15	1260	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11497	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
707211	contig_1380_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_138869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCCTGGACATGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53041	54102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_53000_54100
707213	contig_1443_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_28211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	205	504	344559	344260	NA	35	GTAAATGCTGGATTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGRVCRLRGVTGNNEELVQGSIAVAAVRIISCSEAAISHVNRPWALVAVVSAILADDSGQVTDSSHVLEGVMKKGVFRLTVLGIFVDNTHCPVAWERTW	344763	344257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_344300_344800
707217	SIRV7	-	920	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
707219	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_96598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
707222	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	4	354	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14412	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707224	contig_5954_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_28804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448213	1448584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1448200_1448600
707227	contig_5020_pilon	+	1450	7	Intergenic	novelGene_27809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1002.87032506147	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	365	1081	122915	125717	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGVLPCRRSQDEIHELCPGPVQQRWPLCPYHAPEGGAPGLLQRVHALLSSLGFLECGDVRHL	118460	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124367_124969_125091_125657
707239	contig_6175_pilon	-	2501	17	Intergenic	novelGene_16344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	399.965188914923	12	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	82	2001	1719710	1669605	FALSE	25	CAGTTCTTGTTATCTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTSSINGDLIELNSIGVILDMFFKYTWNNFLHTQVEICVALILASPFENTENGTLTDRDTTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCVVHSTDKGPNSTSVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSR	1746083	1669104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1669740_1670848_1670904_1672947_1673046_1677386_1677474_1683753_1683840_1685585_1685702_1688442_1688508_1689437_1689588_1691807_1691961_1693918_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719712_1746003
707240	contig_14704_pilon	-	1024	10	Intergenic	novelGene_82702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	359.551091855276	3150	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	105	848	111918	78683	TRUE	40	CATAAATTTATTTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHKLLRPQTRLTKGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRAQKNRLLGLMAECEAQSQMGLKRYELNKFFS	116435	77536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_78663_78780_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_111873_111947_116359
707249	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
707252	contig_11115_pilon	+	1106	3	Intergenic	novelGene_102856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_1	576	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	84	1016	171830	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQGEQRWGCGSGRASPGGGGACLHSALLRTDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	171746	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171981_172339_172595_172714
707255	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707258	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707262	contig_1154_pilon	-	2081	8	Intergenic	novelGene_87164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_6	84.3578383907458	550	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	13	600	914362	908613	FALSE	20	TGAGTAACTACTCTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAALMAPPVRYCIPGERLCNLEEGSPGSGTYTRHGYIFSSLAGCLTKSSENGALPVVSVMRETESQLLPDVGAIVTCKVSSINSRFAKVHILYVGSTPLKNSFRGTIRKEDVRATEKDKVEIYKSFRPGDIVLAKVISLGDAQSNYLLTTAENELGVVVAHSESGVQMVPISWCEMQCPKTHTKEFRKVARVQPEFLQT	914374	907131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_908720_909040_909126_909241_909293_909791_909826_910583_910673_911663_911739_914112_914229_914331
707263	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
707264	contig_7342_pilon	-	2516	22	Intergenic	novelGene_71123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	94.664391081206	1	109	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	87	1595	86720	77251	TRUE	40	CACAAGAGCCCAAAGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKLLSPPHLPNLSFAEPAPSP	86806	76113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77311_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
707269	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_89557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707271	contig_13608_pilon	-	2584	17	Intergenic	novelGene_52377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.071311974679	1	123	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	20	874	470234	410992	TRUE	40	GCATAACAGCAAAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGCWEEYSDGPYALSSG	470253	368776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382481_382986_383078_385449_385617_392468_392587_393164_393240_395252_395400_400592_400711_410883_411042_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
707276	contig_7870_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_108917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	424	783	218132	217773	NA	30	ACTGCTAAGTACTCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVTNAHKLNDLKVCEFIILQFWKSEIQNQFHWVKIQVPAALCSFWRLCFLPFPAFGGHSHCLTSGPTSHSLFSHSAHCHTAISLTLTFLLPSYKDPCDYFGPTWIIQDNLSISKFLI	218555	216812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_216800_218600
707279	contig_3382_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_124183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	191	622	966180	965749	NA	30	AACGCTGCTAAACAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWKKKPKPAAVKLTPTHGDPMCVTVELCSIGFSRAEFSEVDRQAFLPRHLWVDSNLQPFNWQSSTLTICTHTIATTMDSNISTIMLMVQDWATFYSVIRKAAMSQSQLDSNLQQPHEAKGGRDTQKLCSSNSYLLLLPPLSE	966370	964184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_964200_966400
707280	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
707281	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707282	contig_7707_pilon	+	2356	5	Intergenic	novelGene_72176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_4	124.840648428306	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	75	599	531589	583199	FALSE	50	CCAATTAAGAGTATAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKGGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFNIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGSSTPK	531514	584956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531644_542837_542969_553915_554043_575679_575826_583133
707283	contig_17790_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_128493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGATGGTGAGCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131108	128950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_-_129000_131100
707285	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707287	SIRV7	-	908	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	39	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATCCTAAGAGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
707292	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707294	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
707295	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	257	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707299	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_93692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707300	contig_4315_pilon	+	2439	13	Intergenic	novelGene_46728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1335	1724	150510	154287	TRUE	35	CAACAGGGAGGGAATGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGLGSICHKVQVLFRAQPFRVAHINVLSSVVNALVIAVMKGSRVVSKNHTRDVVSSKEPLQRRWRERLGLVQLPEEDSRDSSSTALQCGQKVLHLGRRGRELLHTCPSSTNESMFSNFTGNLPFSIS	147232	157429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_148028_149228_149442_149668_149828_150086_150173_150428_150521_150634_150739_152924_153121_154208_154322_154978_155137_155374_155482_155800_155951_156697_156846_157311
707303	contig_19899_pilon	-	1560	5	Intergenic	novelGene_102513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	2	junction_4	86.5130048027463	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	85	507	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLAWVSAAGSSWAPLLSGYCCRGHILKTMSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156620	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_156555
707312	contig_401_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_42853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1720787	1718470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1718500_1720800
707314	contig_2310_pilon	-	2288	8	Intergenic	novelGene_71602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1275	1634	123283	122924	TRUE	35	AAAGGCGAAACGAGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISVTAGSAFGQQTAKPRSSNISSQLAFIPNHQRRAAAQCLRDGDSSPPPVLSPHLEQGASTGYSQAVAISRTALTSTRVHLQLTVDVGLVHQGMKDIEDTVNIPDFWIGTKEVNLLL	124557	106065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118168_118358_118428_122874
707320	contig_7342_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_71134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	633	935	121786	121484	NA	35	TATACGGTTAATTGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSIASHACKSWTMNKEDQRTDAFELWCRPRILNIPRTARRMNKSILEEVQPACSLEARTERLHLTYFGHVMRRDQSLEKDIMLGRKRQQKRKLLDEMD	122418	120361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_120400_122400
707322	contig_4876_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_137892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACCTAGCAAAATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340950	339674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_339700_341000
707324	contig_6410_pilon	+	2075	7	Intergenic	novelGene_108627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	121.006083409977	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	119	616	300693	313081	TRUE	40	TTACATGTATATCACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299813	314637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310261_310369_312966_313738_313834
707325	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707328	contig_8375_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_141321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAAGTGTCTGATCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226041	228392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_226000_228400
707329	contig_4103_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_52009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCACAATGTGTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276057	274341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_274300_276100
707330	contig_5549_pilon	+	2220	12	Intergenic	novelGene_81604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	28.2491863409483	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	131	1960	304420	369342	FALSE	75	CACCAAAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLALPLAEEEAADGRRGREGCGREGSVRAGSALECGEGYFSWCMEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW	303557	369602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
707336	contig_7202_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_19092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCGCCATGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
707340	contig_10904_pilon	+	2624	1	Intergenic	novelGene_22665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1051	1461	533625	534035	NA	20	TGGAATTGGTGTTTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYSQYFVSGSSGLTATNTRLRPIRILNQCFLSLFPGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRYCLCRAAWVPLSYPLLSVGRSHCCPYFLCSLRRWHV	532574	535198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_532600_535200
707346	contig_6418_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_81217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATAATCTGGGTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356260	1358324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1356300_1358300
707347	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
707350	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707358	contig_6227_pilon	-	1144	10	Intergenic	novelGene_49746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	251.304203047096	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	382	846	1204208	1202920	FALSE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPCDFLIPVQTQHPIRKGLHHKILLANFLAQTEALMKGKTSEEARKELQATGKSAEDLEKLLPHKVFEGNRPTNSIVFSKLTPFILGALIAMYEHKIFVQGVIWDINSFDQWGVELGKQLAKKIEPELEGSTPVTSHDSSTNGLINFIKQQQA	1211265	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204229_1204452_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210
707359	contig_8987_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_165859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGGAAAAAAGGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201600	199498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8987_pilon_-_199828_201583
707360	contig_13831_pilon	-	985	4	Intergenic	novelGene_160993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_2	31.5946549628608	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	47	481	124477	105383	FALSE	25	AATTGGATTTATCTCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSWRRPVLKPVRGNGMLGFLSARQVGLDDPLLLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGSGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSGQPYYTCKAVCSVGRSHPDVHKYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKIWDTNTLQVSTLKPFQTAL	124523	104878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_105543_108169_108272_121195_121292_124400
707363	contig_11548_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_66804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAATTCTAACTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195869	196190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_195900_196200
707366	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707367	contig_3410_pilon	-	2898	19	Intergenic	novelGene_58951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	21.3489526154746	90	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	711	2159	267758	254453	FALSE	15	CAGAGTGGGAGCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVRVRNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRRLKGIRDEALPTVLVGIFIEQPTPFLLLFFQRLLRLHYPWKQMRLFIHNHEQHHKAQVEQFLAEHGSKYQSVKLVGPEIRMASADARNMGTDLCRQDQSCTYYFSIDADVALTEPDTLRLLIEQNKNVIAPLTTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRIGVWNVPYISNIYLIKGSALRADLQQKDLFLTNRHTFGHLLSLDSYQTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHENYTKALEGKLVEMPCPDVYWFPIFTEAACNELVEEMEHYGQWSHGDNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIHFEREWHKFLVEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLLHPGRLTHYHEGLPTTKGTRYIAVSFVDP	283112	253713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_254609_255350_255477_256317_256465_257658_257764_258380_258447_259093_259197_260283_260368_260658_260785_261235_261341_262897_263020_265758_265891_266463_266566_267683_267782_269580_269645_271188_271302_273136_273301_273743_273879_275006_275099_282993
707371	contig_1986_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_64128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1596	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCATGTGCTCGGCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274689	276925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_274700_276900
707372	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_95239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707374	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707375	contig_5039_pilon	-	2472	4	Intergenic	novelGene_65024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1787011	1774777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1776997_1781411_1781508_1784537_1784593_1786909
707377	contig_6710_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_97500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
707378	contig_8658_pilon	-	955	4	Intergenic	novelGene_55796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1123.09661205081	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	208	603	13203	6049	FALSE	20	CAGTGTGATGTCTGTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55674	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_55528
707379	contig_8065_pilon	-	2313	13	Intergenic	novelGene_107317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_12	26.6999791926677	103	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	125	1582	112224	90599	FALSE	50	CAATAAAATATGTAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTPTHTPVSRNVPSRFSGSTRWRGVSFTDSVESTPLPSIEDRLAVLCPSQELLEYFQKKMAECETENEDLLKKLELYKEACEGQHKLEWDLQQKEEEIAELQKALSDMQICLFQEREHVLRLYSENDRLRIREVEDKKKIQSLLALVGTDTGEVTYFYKEPPHKVTIPQKTIQAVNVPEQNASSTLKADPKVNKRRSAMREKGESPKQYQRNIQTLILQVEALQAQLEEQTKLSREQVEGLMEDRRIRIEEIQVQHQRNQEKIKELTKNLHHTQELLYESTKDFLQLRFENQHKEKSWMLEKDCLMSKIKQCRLQCKKKEDKTGKVWPVVHQSHHNQNEYIKTLKDKLVQEKKLSNMYQEQCIALEEEVARIREEECVRREIFKDRTNKMGKRLQVMTKRYEALENRRMLEVEGFKTDIKALRQKLKDLEQMLYKTTLNARADQDLAILCEVRDSNRRAHKIQGELKNLKSKVFGLENELRLC	117769	89867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_90746_91506_91660_91761_91888_93586_93807_97690_97840_98991_99084_99661_99735_101337_101435_106932_107076_110200_110421_112186_112241_114885_114941_117716
707390	SIRV7	-	894	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
707393	contig_14450_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_48920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15682	17422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_15700_17400
707394	contig_10734_pilon	-	1444	12	Intergenic	novelGene_51514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	629.939443501785	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	16	1398	2285163	2265543	FALSE	55	AAACTACAACAAAGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQVGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2285178	2265496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265894_2266010_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274506_2275750_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112
707399	contig_5967_pilon	-	1456	9	Intergenic	novelGene_44398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	403.600185053228	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	117	824	488569	403369	TRUE	65	AAAAAAAGAAAGAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGK	517618	401280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_401556_403011_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
707405	contig_7171_pilon	+	1420	11	Intergenic	novelGene_101336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	100.448046272688	927	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	73	672	1301684	1313349	TRUE	35	ATAAAGAACCTGCTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQDGGLPGPPLWRPPDAYSRSSVRMAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSVLSGIIYIDQAVCASPAFDATVPVTKNNKCLHHLESDSSPTFTDNCIGPSPVLGTMVTETTPSLPAWSSQLCREGKQVSTSPT	1301611	1315440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1304575_1304806_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874_1315026_1315204
707406	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	246	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
707407	contig_7091_pilon	+	2255	15	Intergenic	novelGene_131775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	310.103019419452	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	61	1593	349798	435147	FALSE	30	GAAGATGCTTCACACACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVPSQSFPAPGSQQRVASGGRSKVPLKPGRSLMDWIRLTKSGKDLTGLKGRLIDVTEEELKKHNKKDDCWICIRGFVYNVSPYMEYHPGGEDELMRAAGSDGTDLFDQVHRWVNYESMLKECLVGRMAVKPTLSKGMLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIGDYVSISSPEGNFKRSQIQKLEDLFLLAAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349737	435809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354396_368186_368288_372017_372100_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
707411	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
707414	contig_14322_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_116324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	243	299	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671363	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
707416	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707417	contig_12050_pilon	+	1327	5	Intergenic	novelGene_62720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	36.4443068256209	799	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	307	1215	666343	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHYVVYSGLENIKKLTGGKLAAGHFDGKGEVEEYFRDIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSLPMGDIPMDGMAVADLGPVVLSLLKAPEEYVGQNLGLSTCRHTVGEYTTLLTKHTGHAVHDAKTTPEEYEKLGFPGAQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	666036	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666392_668130_668370_679709_679960_681576_681768_682979
707418	contig_5033_pilon	-	704	2	Intergenic	novelGene_29077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	129	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGCTCGGTCCGCTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630352	628470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_629063_630240
707419	contig_5033_pilon	-	2798	1	Intergenic	novelGene_29075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	226	333	628245	628138	NA	20	GGTTTGTGGAACAGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARSATVALNGILKSDEGCKPRCRGAGVARRWQVLRQGGVGGGGQRRQLGPEGEEASLSTASPPYPPPPADLPLKMQSMCPTQVRITVSHRDGHVEEPLGWLAKFFSWPG	628470	625672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_625700_628500
707425	contig_10405_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_165866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337381	336020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_336000_337400
707431	contig_8020_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_114424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAACCCAGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243174	244148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_243200_244100
707437	contig_12279_pilon	+	752	2	Intergenic	novelGene_50133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6255	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTCTGACTGAGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75040	77625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_75096_76928
707440	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	19	354	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14427	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707445	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707446	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
707448	contig_3095_pilon	-	1223	5	Intergenic	novelGene_75219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	665.353806256491	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255540	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246733_247834_247970_248476_248759_253535_253823_255380
707450	contig_5018_pilon	+	999	5	Intergenic	novelGene_47154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_2	246.180827848149	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	153	749	1498209	1500271	FALSE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRVDPVPGRVEVGAAACAALTGPHTQHDLGKGRQKALLGALTRSGSQLSVMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498056	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
707458	contig_405_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_135338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAATTGGCACTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648860	650337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_648900_650300
707459	contig_405_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_135339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCATTCACATCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662962	663478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_663000_663500
707460	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707463	SIRV7	+	379	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70989_78843_78963_114680
707464	contig_5210_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_65456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	767	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	344	757	649197	648784	NA	10	AATGCTGTCTTTGGCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGPGLTPARSPSLSFGMNVRNSSFLIYSFGPKLRVGFGGVDFKNFFLFFGLMGAIGTTQDRVPPGRDARRLRLACVHASGWGWGWGWTGQAGVCAQLITAMHCTAHVPRADRDSLLFRAFPPPARARLPPAWASL	649540	647567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_647600_649500
707465	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707467	contig_1274_pilon	-	2450	2	Intergenic	novelGene_137792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121027	117450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_117726_118852
707470	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
707471	contig_10734_pilon	-	1895	12	Intergenic	novelGene_51442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	69.7832535737539	436	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	543	1172	2223190	2216993	FALSE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234393	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226017_2226169_2226275_2226348_2229766_2229915_2234332
707474	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_93568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707475	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_17613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27828	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
707483	contig_2890_pilon	-	1238	12	Intergenic	novelGene_60291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	476.03175461828	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	90	959	370865	336651	TRUE	20	TTGCTGAAACTCTGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGFSSEERAAPFTLEYRVFLKNEKGQYISPFHDIPIYADKDVFHMVVEVPRWSNAKMEIATKDPLNPIKQDVKKGKLRYVANLFPYKGYIWNYGAIPQTWEDPGHNDKHTGCCGDNDPIDVCEIGSKVCARGEIISVKVLGILAMIDEGETDWKVIAINVDDPDAANYNDINDVKRLKPGYLEATVDWFRRYKVPDGKPENQFAFNAEFKDKDFAIDIIKSMHDYWKALVTKKTDGKGISCMNTTVSESPFKCDPDAAKAIVDALPPPCESACTIPTDVDKWFHHQKN	370954	336329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_336420_336461_336683_337286_337330_338549_338620_341426_341513_341986_342115_351451_351579_352504_352592_355560_355681_356537_356592_368254_368314_370801
707488	contig_11416_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_145385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGAAATTAAGATTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911551	912525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_911600_912500
707490	SIRV7	-	291	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35775	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70995_78847
707494	SIRV6	+	229	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-29	395	-16	-225	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGGTATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
707497	contig_5084_pilon	-	1166	2	Intergenic	novelGene_64617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	978	188	1165	1117603	1114852	FALSE	15	CGAGTTGCAGCAGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKPFVDVCVASQSHLSTQLPPLPQEGQNIVNKDETILSRAEYKNLNIVIGNFSVPTCENEPTMLNNEKQFTIAYKKQLKENMQTTKCGTDTDCHSNSDLTKQVSQTHANLKEPSDTVIASDAPSFSRIKPNLNNLNGKTEDILDFQIVHTPPPPEPVLDLANKAPNDMSIAQATDKHIDIVSTNAKDDRNEENKNSHNGAEINSVSFMTVVKDKVRKCSLGIFLPRLPNKRNCSVTGMDEREEIPADTTDLNHLETQPVFSEDLGVGIVAAKLNLSPSQYINEENLPTYPEINSSDSISIETEEKTLIDTYQKEISPSENKAEETYTSQKRTWVQEEDDDIQNEKKIRKNEVRPSDTAQDQQIFDHHTEGDRDKSANIMLMKSLSRTP	1117790	1114850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1114930_1116703
707498	contig_5084_pilon	-	1095	12	Intergenic	novelGene_64616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	55.1682625255014	24	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	67	1095	1113257	1098397	FALSE	25	CTACTAACATGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPRQSNLPTKFTVNIPPTPEDLMLSQYVYGPKIQIYKEDCEALRQKIEELKLSALNQDKLLSDVNKNLWEKMRRCSDEELKSFGVYLNKIKSRFTKMTKVFTHQGKVALYSKLEQSAQNEREKLQIRMHEMDDILKKIDNCLTKVEIETKYLEDEEKDPIAKWDSEMRAAEKELEQLKIKEEELQRNLLELEVQKKQTLAQIDFMKKQTNRTEELLDQLSLSEWDIIEWSDDQAVFTFLYDTVELTITFGEAVVGLPFLNKDYRKIADLNFQSLLDEDKAPPSSLLVHQLIFQYIEEQESWKKKCTTQHQVPKMLQEISLVVSHCKFLGEEIEFLKRWGPNYNLMNTDVNNTEYVISQKLIKIFI	1113637	1098396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1098553_1098753_1098864_1099561_1099631_1102337_1102439_1104766_1104869_1105677_1105718_1105879_1105955_1109493_1109582_1110493_1110611_1111598_1111690_1113177_1113294_1113607
707501	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707509	contig_10300_pilon	-	3913	1	Intergenic	novelGene_152931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATATTCATACTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148833	144920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_-_144900_148800
707510	contig_9363_pilon	+	1405	10	Intergenic	novelGene_6825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	277.536695382702	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	489	1061	1623705	1625624	FALSE	10	GGCCACGCGAGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622253	1625968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623550_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
707511	SIRV7	-	861	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113050	5	112872	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1866	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_1900
707512	contig_9833_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_68491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	177	617	205190	205630	NA	30	AAGGGGCACACCAGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLAWDFAVKEGFRVFKKMPATKPLLRSFHTRASPQTLLSITGMRSYSSFPEPSPTCASKGALVISPEGLSQPVRELYHRLKQFIEQHVYPVEQELRSHQASADRWTPSPLIEDLKVKQQAEQCVFGYTGEILVCEFHPKCDDHA	205013	205918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_205000_205900
707515	contig_18420_pilon	+	737	2	Intergenic	novelGene_109339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75544	76854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_75572_76144
707517	contig_4538_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_153077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGAGAGAAGCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99727	98630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_98600_99700
707519	contig_5649_pilon	-	1857	7	Intergenic	novelGene_82273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1030	1392	34753	28991	TRUE	30	AATCTTTGCTAAAAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVGKVAHIAGGDSCHRDAAILCHVDGELLDQPLHLFRLEPCETKHADLVSDVLPAVRGALLLEVGDQLSPHANDAVCHAFHFLQPLFPQIRGGQNGRGNPGPIERRVGIHGTDQDLQL	35847	25905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_26060_26796_26893_28297_28456_28933_29093_33633_33784_34642_35589_35653
707520	contig_12270_pilon	-	287	2	Intergenic	novelGene_114121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGACTTCACTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707522	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_90543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653839	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707525	contig_12119_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_88638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATTCTGAAAAGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101457	100842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_100800_101500
707528	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_93528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707531	contig_6710_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_90800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
707535	contig_11978_pilon	-	1437	7	Intergenic	novelGene_63043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	9.08142181721685	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	80	610	1802644	1797886	TRUE	15	TCATCTCTTATCTCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSELWGLTRVPRGHRALALPGSGRAMGQLIAKLMGIFGNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLTNEVVHTCPTIGSNVEEIILRKTHFLMWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGFHTLCQASVAYS	1802723	1796552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1797846_1797926_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1801968_1802030_1802598
707540	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707545	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	59	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707546	contig_4364_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532768	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
707547	contig_10331_pilon	-	2099	18	Intergenic	novelGene_54101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_17	219.582696389386	9	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	356	1939	355598	304759	FALSE	25	AATGATTTTCTGATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTLTLDVFGRRVEVNGEHATVRFSGVVPPTAGLWLGVEWDNPERGKHDGSHEGTVYFKCRHATGGSFIRPNKVNFGVDFLTAVKNRYVLEDGPEEDRKEQIIIGNKLVETVGFDSIIKQQSQLSKLQEVSLRNCAVNGAGGKGGIAETCPNIRKLDLSRNLLSSWDEVILIADQLKHLDVLNLSENKLQFPSGAPSLTGTFSAMKVLVLNRTGITWAKVLQCVPGWPALEELYLESNNIFISERPTDVLQMLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQWSFINELDKLQSLHSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	365356	304598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312168_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_318866_320092_320196_321424_321525_325324_325414_332861_333045_350131_350217_355498_355627_364604_364909_365333
707548	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707559	contig_20819_pilon	-	2359	7	Intergenic	novelGene_55700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_6	33.166247903554	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	320	1720	123688	121091	FALSE	5	CTTGCAGTCTTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMARSLGAPHWVAVGLLTWAALRLLVAGHGGHGDLHDDLHEDFHGHSHGDSHEDFHHGHSHAHGHGHTHESIWHGHTHGHDHGRSHEDLHHGHSHGHSHESLYHRGHGHDREHSHGGYGESGAPGIKQDLDTVTLWAYALGATVLISAAPFFVLFLIPVESNSPRHRSLLQILLSFASGGLLGDAFLHLIPHALEPHSHHAMEQPGHGHSHSGQGPILSVGLWVLSGIVAFLVVEKFVRHVKGGHGHGHTHGHTHGSHVRGRQEYSSKEKQNSQEEEKDTGGARKKKGGSTGPKDGPVRLQNPEEETAGSDLRVSGYLNLAADLAHNFTDGLAIGASFRGGRGLGILTTMTVLLHEVPHEVGDFAILVQSGCSKKQAMRLQLVTAIGALAGTACALLTEGGAMGSEVSGSTGPGWVLPFTAGGFIYVATVSVLPELLREASPLQSLLEVLGLLGGVVMMVLIAHLE	124007	120451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_121364_121808_122006_122217_122359_122508_122662_122801_122856_123016_123186_123274
707560	contig_5324_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_102073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	107	706	444540	443941	NA	35	GCACACCAGACCCATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444646	442101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442100_444600
707569	contig_7171_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_101255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTGTGGGGTTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835115	835517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_835100_835500
707573	contig_5020_pilon	+	598	3	Intergenic	novelGene_27909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1524.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTGTCTCCTCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122835	126084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_122888_124971_125091_125657
707574	contig_7179_pilon	-	1697	4	Intergenic	novelGene_78153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	7.93025150224688	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATATACTGCTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041260	1038583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1039725_1039917_1040059_1040747_1040887_1040984
707576	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707578	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_96619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707579	contig_4732_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_75426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	370	711	609109	608768	NA	20	GGAGAGCTCGCTGGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVKNVHPARSPPQRLALQVSAWKVLWVGARGRLGQVAREGGKQPLLGVCHGKCKKRARPGRPPGLWPALCTLPLSPPTKGPPGTHEEQEQQVELLAFLRWARPGGTAQLRLL	609478	608767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_608800_609500
707583	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
707586	contig_10861_pilon	-	1635	10	Intergenic	novelGene_39338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	270.995193798208	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	91	807	1492200	1490608	TRUE	5	CTTCCTCAGTTTGGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQVRGEVGGGWWVGELCPHDFSFSLPSRVGPCPSTLPSPAPTLWLASWH	1493789	1489338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489693_1489941_1490207_1490294_1490469_1490572_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
707588	contig_7816_pilon	+	1837	15	Intergenic	novelGene_66505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1234.74992304069	1	68	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	69	815	170169	195761	TRUE	25	ACACATTCCTGAGAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAGTPSSWTDTAWRSCARPSARPSTSRQPSSPRPSRAGEFRG	170100	211688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193082_194850_194970_195755_195816_195886_195950_196797_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209149_209284_209379_210627_210751_211482
707592	contig_13765_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_165871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCACAAGAAAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16575	17074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_16600_17100
707596	contig_3818_pilon	-	2725	18	Intergenic	novelGene_99227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	19.79007475538	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	69	2279	400817	373549	FALSE	30	TATACCTGGTAGAGCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPCRVPINNAASETRGHPHSAASPSERTFAMPLPRKAPLNTPGTPILEDFPQNDDEKERLQRRRSRVFDLQFSTDSPHALASPSSRSIDSSATISKFTNTQITEHYSTCIRLSTENKITTKNAFGLHLIDFMSEILKQKDTEPTNFKVAAGTLDASTKIYAVRVDAVHADVYRVLGGLGKDAPEEVEGHGADGSASEVGTNKKAPKPKKKHSYRTIEQNVNNLNISEADRKCEIDPMFQKTAASLDECSAAGVFLSTLRCCDYRSELLFPSDLQVLSTGEPHELPDLGWVEMADLEAPLQQCAEDRQICPSLAGFQFTRWDSETHNESVSALVDKFKKNDQVFDINAETEEAECGDYPDGPLEDDFYASDEAEHTAAGNQEEFRSWKEPCQAQSCQKEVIPLGDGDIRTMCPLLSMKPGEYSYFSPRTMSMWAGPDHWRFRPPHKQDASSKSENKKKSTKKDFDIDFEDDIDFDVYFRKTKAATILSKSTLENQSWKSTTLPTDFLYETNNLVQLHLKPGVRFFQAAQEQRAGAEQYEDLRHYDYNNPNDTSNFCPGLQAADSDYEESDNLFVGPTGAFDLTLCPGHPPKTMQENNDTPEVQGLDIMTYGESELVAEPQKVNKIEIHYAKTAKKMDMKKLKQSMWSLLTEFSKKQADAEANHSEMGKEGAPEEVANEKLFSGLTKDLKKSLPPLMAQNLSIPLAFACLLHLANEKNLKLEGTEDLADVLVRQGD	400885	373102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_373609_374541_374618_375801_375894_377415_377533_378188_378372_379638_379750_381651_381775_382330_382438_383048_383198_387244_387451_388192_388285_389436_389627_392742_392868_393535_393669_393941_394035_395152_395244_395397_395642_400798
707600	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
707608	contig_14322_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_116007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAAAGCTGAAGGTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671357	671631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
707615	contig_6163_pilon	+	1668	2	Intergenic	novelGene_103833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	193	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	190	411	375051	378191	FALSE	10	GCTTTCCTCTCAACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPRRVPHSPGGGAESVEQRWACKTGRGLAGRSRPCLCAPSQGQEQLQSRLVPPYPSPRPWSSMFSRAPVRRVLQWVPGKERLGIYRFLPFFFVLGAAMEWIMIKVRVGQETFYDVYRRKASERQYQRRLEDAPGD	374861	379448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_375202_378120
707620	contig_14326_pilon	+	1502	10	Intergenic	novelGene_120700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	73.3329966322237	54	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	86	448	221889	226301	TRUE	15	CAGCTGGCTACGTGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGKSAGVCVSGDSKCGRSYRFFPPGLATMSSTLAKIAEIEAEMARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQACLIRG	221803	249142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_226280_226392_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_248840
707621	contig_6360_pilon	-	2139	3	Intergenic	novelGene_165883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1654	1980	79202	78876	FALSE	15	TGATTACTGAGTTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSIRVGCNILTQVTSLIQCKGSFPGVWPALPFILQETKGKGSEQRVGDLITTKKAAPGAEHLLWTWGSYVEKLLVQGKTDDKDLLPELIEKTFPWSWRPGFGFLAS	88939	78716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_80710_84122_84213_88883
707627	contig_14807_pilon	-	667	7	Intergenic	novelGene_124708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	39	665	39773	37265	FALSE	15	GGCCCTGCATTCATGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKW	39916	37262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
707628	contig_3986_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_52710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	194	562	60984	61352	NA	45	CAATTCTATAAAGTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSRKNLANISGGLGFSLNFAGGSVTWRSPGDTVVKVLGCQSEGKQFKPTFGRKMWESASKRFTALETLWDSSTLSHRVTMSCNRLDSSGIFCLVSFGKVTFPLWAHVCSFIKGKGFVRAP	60790	61608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_60800_61600
707629	contig_14925_pilon	-	1223	5	Intergenic	novelGene_55164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	1545.88849856644	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	260	688	51262	27020	TRUE	20	AAAGGCTGTGCTCCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	51521	25792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_51243
707631	contig_12270_pilon	+	338	2	Intergenic	novelGene_114065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	3	334	336	14431	14433	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGTCNQKQQGHEEQSLWHHLAAPACLM	13874	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14149_14371
707635	contig_7202_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_18483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
707636	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_89083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	161	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707638	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
707639	contig_9098_pilon	-	792	3	Intergenic	novelGene_75861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	137	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCAGTCACCCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350566	347388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_347832_348546_348660_350330
707641	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
707654	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707656	contig_6102_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_32007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	308	736	455407	455835	NA	90	AAAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEMGSQNTVASPCIPFSGPVSPISTSSTAIYCSTKPALRRTHLYWLLQDSTANRADKVFVNIPLEAGYIIPHVSSLKPKSWKRGKRGQFRRSLQICGQHELIAKMHILVQQIFTESLLCASHLGGKKADSGNLTLMGENIK	455099	457900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_455100_457900
707666	contig_2726_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_165896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTCCCATCACCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169934	172021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_169900_172000
707667	contig_10793_pilon	+	1315	13	Intergenic	novelGene_83359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3118.83490532389	2	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	134	1066	146975	163944	TRUE	20	GTTGTGTTGAGAAATTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVFLNK	130868	165150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163927_164068_164789_164820_165054
707671	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_98152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653800
707674	contig_665_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_158211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263292	264989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_263300_265000
707676	contig_12270_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_113520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13847	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
707677	contig_730_pilon	-	1669	13	Intergenic	novelGene_155616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	29.227080289044	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	126	1106	212398	207837	TRUE	20	CTATATCCCAATTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTSKDKRDVYYRLAKENGWRARSAFKLLQLDEEFQLFQGVTRAVDLCAAPGSWSQVLSQKIEGGHVVAVDLQAMAPLPGVLQIQGDITQLSTAKEIIQHFDGCPADLVVCDGAPDVTGLHDVDEYMQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVEDSDMNCSP	214281	205808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_206363_207827_207870_208085_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211836_211931_212002_212277_212439_214196
707682	contig_14618_pilon	-	1416	10	Intergenic	novelGene_136789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	847	1284	306114	296089	FALSE	20	CGACGACACCGCGCATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGFNRSVVLCNLYRLITVEVPHFGSFITRCCKYFASIITPANVKHGPGVHLLGFWNSLPTVLNFPTANIISPRSCNQKVPRQSWWAKRQTTNAVIGRRCYFNILHRVVIIRGCAAKHAGPTSSETRGRSKQTHFGPESRAAAGG	312420	295956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_296116_298701_298799_299301_299409_301268_301362_305016_305102_306085_306150_308392_308497_308603_308679_310015_310210_311982
707685	contig_10627_pilon	+	1172	4	Intergenic	novelGene_59925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.783962610924	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	307	558	108135	109091	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEVRSRFRGWTQPLCGPVVSGHLLLVWSGM	105371	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105379_107835_108139_108453_108573_108962
707689	contig_6063_pilon	-	1764	11	Intergenic	novelGene_27572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	548.835093630136	3	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	763	1332	26509	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDQKLSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	44715	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_26493_26558_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364
707690	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707693	contig_6842_pilon	+	838	6	Intergenic	novelGene_130827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	8.86791971095815	48	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	367	675	1783810	1956946	TRUE	45	AAAGGAGAGGAAGGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVPEVENPLAGEDRILKPDFWSTANNYIELHGFCPQDINKRLNLLLSRNQQDLLVLWPPVFFVPLPANQAPSPDTGILSQDVETPCGLGISEVPRKCSLI	1783443	1981296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1783857_1817911_1817965_1955418_1955503_1956821_1956963_1962130_1962184_1981202
707694	SIRV6	+	742	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10278	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
707697	contig_7202_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_17560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
707701	contig_11829_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_128143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	211	702	180369	180860	NA	65	AAAAAAAAAGATTACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSDADVQKQIKYMMAFAEQEANEKAEETDAKAEELSTEKGCLVQTQRLKIMEYYEKKENQTEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRVRDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLFIPVARAPNDCSLQETGFPAGKGCSAKSNPYVENHHQKRC	180158	181582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_180200_181600
707706	contig_5959_pilon	+	2639	2	Intergenic	novelGene_150172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATGTCATTTCCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83188	91273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_85735_91180
707716	SIRV2	-	499	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4367	41	3192	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
707718	contig_1813_pilon	+	1735	1	Intergenic	novelGene_105519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGTAAGGAAAGCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434604	436339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_434600_436300
707730	contig_5643_pilon	-	2223	5	Intergenic	novelGene_39171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	52.227267782261	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	68	1387	784100	772569	FALSE	40	ATAGCAGGATTCAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVSQWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVENNMQQQSVCHGDSGSVYVVWDDCAHHWVATGIVSWGIGCGKGYDFYTKVLNYVDWIKRVMEGKD	784167	771732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_773342_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
707731	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_97164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707732	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657839	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657839	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
707738	contig_14322_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_116521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCGAGGGAATAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	672842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
707743	contig_5690_pilon	+	1425	10	Intergenic	novelGene_119724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	462.927880152214	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	48	974	1044729	1105483	FALSE	25	TGAATAGCATTGCTCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDRLCPFILGIVGILHRVEED	1044681	1105934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1103602_1103632_1105450
707744	contig_513_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_80148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACTTAAACATTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446647	444554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_444600_446600
707747	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_94559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707748	contig_18364_pilon	-	2822	1	Intergenic	novelGene_102583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGCCTCTGCACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178161	175339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_175300_178200
707751	contig_854_pilon	-	1759	4	Intergenic	novelGene_36146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	152.772888810664	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1360	1686	470426	470100	FALSE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLSLEVGKHLVMILHHQGSGLVSAGASSRSLAEHLRNSADPSLGDELHLCCPVWPIKGQPGIVEGELGRESGGQRSSPASGTHWLCDFGPLLVVSDPRLPPPPLSG	473627	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470800_471005_471882_471991_472061_473586
707755	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
707756	contig_3747_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_24977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTCTTGAGGCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259198	260042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_259200_260000
707759	contig_5260_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_144358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	918	1256	110455	110793	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTCGYSSYIIILQHQSPVQISIHICVRYTVSKEFHTHLSSVPHYLLMHSVVKEFYSGHTFPFPHLFQGGCAISPCFLDSEGAPISHFLVCIIWLHLCFSHSFLSSSPGSG	109537	111145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_109500_111100
707760	contig_6102_pilon	+	2502	19	Intergenic	novelGene_31745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	184.349749788042	24	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	282	968	218430	220457	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRVQG	217106	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_217236_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_227023_227264_227330_227952_228161_228274_228396_228586_228648_228903
707762	contig_10855_pilon	-	1821	11	Intergenic	novelGene_124314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.9897719347476	161	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	45	1364	392415	325533	TRUE	35	AAAGAGACGTATTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPPTLRPARPLQTVPLWD	392459	317767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_317992_320127_320325_325496_325584_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_392385
707764	contig_4891_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_124589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAGATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933969	932990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_933000_934000
707765	contig_504_pilon	+	2706	10	Intergenic	novelGene_54409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	28.8367050051762	4	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	303	1388	98607	152696	FALSE	40	AATCAACAATGCATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTDTPGYDHPPCPACPQQSRPSRNPERACYTDVALPLYENLTIVEQPVNLSSLAQKYAEKATQFIQHASASGRPFLLYVGLAHMHVPLSVTQLSACPPGRRPYAAGLREMDSLLGQIKDKVDRTAKENTLLWFTGDNGPWAQKCELAGSTGPYTGLWQTRQGGSPAKQTTWEGGHRVPALAYWPGRVPINVTSTALLSVLDIFPTVVALAQASLPPDRHFDGLDASDVLFGRLQSGHKVLFHPNSGAAGKYGALQTVRLERYKAFYVTGGAKACDGSVGPEQHHELPLIFNLEDDSAEDVPLERGGTEYQTVLPQVRRVLADVLQDISEDNTSSADYTQDPSVAPCCNPYRMACRCQTT	94300	154014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_94517_95039_95088_98568_98681_102902_103041_116955_117153_118299_118381_129681_129791_135936_136058_142952_143044_152421
707768	contig_16103_pilon	-	2172	4	Intergenic	novelGene_118787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	11.3137084989848	392	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	280	1254	578119	575288	FALSE	15	GTCTGTATAGTGTCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWGEPELLVWRPEAVASESPVPVGLEVKLGALVLLLVLTLICSLVPICVLRRPGANHEASTSRQKALSLVSCFAGGVFLATCLLDLLPDYLAAIDEALGALHVTLRFPLQEFILAMGFFLVLVMEQITLAYKEQSGPPPREETRALLGTVNGGPQHWHGGPGVPQASGVSAAPSALRACVLVFSLALHSVFEGLAVGLQRDRARAMELCLALLLHKGILAVSLSLRLLQSHLRAQVVAGCGILFSCMTPLGIGLGAALAESAGPLHQLAQSVLEGMAAGTFLYITFLEILPQELAASEQRILKVILLLAGFALLTGLLFIQV	578937	574369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_575945_577627_577759_577932_578151_578689
707770	SIRV4	-	321	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
707773	contig_3787_pilon	+	1827	1	Intergenic	novelGene_102380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCCAGCCACAAAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413347	415174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_413300_415200
707777	contig_7815_pilon	+	2280	1	Intergenic	novelGene_134369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTGCATGTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317492	319772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_317500_319800
707778	contig_7840_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_68949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAGCTTGGAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26827	27710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_26800_27700
707784	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
707786	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707788	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707792	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
707798	contig_15449_pilon	-	1433	7	Intergenic	novelGene_33674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	154.029218007494	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	551	1141	193091	191270	FALSE	35	GGTAAACTTAAGAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196178	190977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193096_194669_194770_195024_195197_195401_195567_196069
707803	contig_10163_pilon	+	2258	7	Intergenic	novelGene_82622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	125.564945568242	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	132	1136	120881	149952	FALSE	65	CACCTAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMVKWKSQLCVRECMCVDVFVHSSRESQSSFIFKPV	87362	151074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_87463_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650
707805	contig_5479_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_133573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACTGCTGTTGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128173	128754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_128200_128800
707806	contig_2799_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_85577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGATGCAGAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768210	770391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_768200_770400
707811	contig_7707_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_72188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAAAATAAGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598130	599587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_598100_599600
707814	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
707816	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707820	contig_1532_pilon	-	1486	5	Intergenic	novelGene_37447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	257.65129050715	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	34	891	51365	41713	FALSE	20	CAACCATTTGTTTGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTSENSKIETMQDLHVANAIFALNFFKHLANTSPTQNLFFCPWSISSTMAMVYLGARGNTADQMAQVLQFNKVGGHKIIPVTPRKFTSCEIRQWIQKATYPDAILQTERKPVQMMYLHERLNIGYIEDLKAQILELPYAGDVSMFLLLPDGVADVSTGLELLEGEITYDKLNKWTSKDTMVEDDVEVYLPQFKLEKRYELKPILRSMGISDAFSKGQANFLGMSERNDLFLSEVFHQAAVDVNEEGTEATAGTGAIMTGRSGHGGPQFVADHPLLFFIMHRMTRSILFLGRFSSP	55469	41117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_42118_42429_42595_47118_47239_51197_51375_55445
707823	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707824	contig_11285_pilon	-	1909	12	Intergenic	novelGene_5586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	447	1181	769622	768472	TRUE	15	GCAGCAGTGGGTCGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSLGGWRQPQAPVERRQHV	770155	763523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_763547_766048_766189_766396_766442_766551_766706_767263_767402_767722_767839_768020_768088_768426_768511_768595_768855_769083_769320_769421_769647_769733
707827	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
707833	contig_17783_pilon	-	2650	11	Intergenic	novelGene_165905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_10	27.6494122903182	287	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	148	1437	48497	32833	FALSE	5	CATTCTCTTCTGTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKCKVVITVNQGLRGGRVTELKKIVDEAVRLCPTVRRVLVAHRTDSKVTMGELDVSLEQEMAKEDPECAPESMGSEDVLFLLYTSGSTGPPKGIVHTQAGYLLYAALTHKLVFDYKPGDIFSCVADIGWITGHSYIVYGPLCNGATSVLFESTPVYPDAGRYWEMVQRLQINQFYCAPTAVRLLLKYGDAWVKKYDRSSLRTLGSVGEPINHEAWEWLHNVVGDGRCTLVDTWWQTETGGICIAPRPSEEGAEIIPSMAMRPFFGIVPVILDEKGSILEGDDVSGALCFSQAWPGMARTIYGNHPRFMDAYFTAYPGYYFSGDGAYRTKGGYYQITGRMDDVINISGHRIGTAEIEDAMAEHPAVPETAVIGYPHDIKGEAAFAFIVLKVDADDSDMVVEELRSAVATKIAKYAVPDQILVVKRLPKTRSGKVMRRLLKKIVTGETQDLGDTTTLEDPSVITEILRAYQQYKDKRPSS	48644	31619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17783_pilon_-_33010_34362_34482_36704_36769_36916_37045_37743_37871_38207_38321_39451_39545_44718_44857_46180_46329_47942_48096_48467
707835	contig_8538_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_4735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	15	ATTTCATTGCACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
707836	contig_2069_pilon	-	1219	6	Intergenic	novelGene_23433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	921.421510493433	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330445	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1330316
707838	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
707842	contig_9848_pilon	-	1650	7	Intergenic	novelGene_79989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	571.414035529405	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	247	582	134242	130372	TRUE	15	GCACTTACCTGTGGGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRSADDKWRTLIPTTIGPTAASAAAEGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGMGGSRESRGGWDSRDDFNSGFRDDFLGGRGGSRPGDRRTGPPMGSRFRDGPPLRGSNMDFREPTEEERAQRPRLQLKPRTVATPLNQVANPNSAIFGGARPREEVVHKEQE	149238	129093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_129719_129928_130512_130796_130935_134184_134245_134566_134664_134747_134813_149156
707845	contig_12031_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_137557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226282	227075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_226300_227100
707849	contig_10953_pilon	+	2992	7	Intergenic	novelGene_42540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	169.355313534067	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	648	1529	182126	187483	FALSE	45	AAAAAACTTGACCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPSRFVMRDCLSRMTCQSQMSTKSTTHRIWRISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGKVHLPS	181478	188946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_182129_183136_183233_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328
707855	contig_6048_pilon	+	2284	15	Intergenic	novelGene_73275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	800	1231	1979510	1980559	TRUE	50	TGTTAGGAGAGAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPGPTMMTGVEALKGRRNWDLRTNMGTRAWWPFSSTGSLARSQLVATPLLTRSVLVLYSTTTAQMCTELGWTCGGRGNRVVAGLEPRQQLTQVVDGGPQGRVVLQNGQNMPPGLHHPAQVQLLALARGGGHLAQLFLLAGI	1978451	2006303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1978968_1979070_1979159_1979238_1979379_1979454_1979734_1980042_1980190_1980498_1980676_1982306_1982427_1982529_1982655_1983750_1983852_1984387_1984474_1984963_1985086_1985727_1985785_1987412_1987495_1993749_1993802_2006111
707856	contig_8064_pilon	+	1232	7	Intergenic	novelGene_164557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.7603908753184	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	515	835	117228	118276	TRUE	15	CACTGTGAGTCAGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101588	119202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_112219_112333_112784_112880_116026_116130_117149_117382_118109_118295_118823
707860	contig_5018_pilon	-	1744	2	Intergenic	novelGene_47121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	44	397	1431341	1430644	FALSE	20	ATTTCCTGGCATTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGGTRSLGVVGCRGLMSGEHGWQGGVGDSRLSPIPSCHQLAV	1431384	1429296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1430930_1431273
707868	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_95816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707871	contig_13224_pilon	-	2642	17	Intergenic	novelGene_104123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	251.160112963325	101	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	60	2258	387941	370411	FALSE	30	CATGTGCAATACTCGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRRGVSARLQEQLSRVTFKMDSTLTATEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPSHPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALELLTQEFGIPVERLYVTYFGGDEATRLEPDLECKQIWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAYLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNRETDGILKPLPRKSIDTGMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGTGARPYTGKVGADDADGIDMAYRVLADHARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRYSHEKLNANRGFFATLVDVVIQSLGDAFPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILDRKIQSLGDSKTIPGDTAWLLYDTYGFPVDLTGLIAEEKGLVVDMDSFEEERKLAQLKSQGKGAGGEDLIMLDIYAIEELRSKGLEATDDSLKYNYHSDSSGSYVFENAVATVMALRRDKMFVEEVFTGQECGVVLDKTCFYAEQGGQIYDEGYLTTPNKDVQREIADLGEALATAVVPQWQKDELREHLKSLKKIMDDLDRASKADVQKRVLEKTKQLIDSHPNQPLVILEMESGASAKALNEALKLFKTHSPQTAAMLFTVDSEAGKITCLCQVPQNAANQGLKASEWVQQVSGLMDGKGGGKDASAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQLHLGDLKN	390256	370026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_370597_371043_371158_371535_371623_371752_371873_373081_373130_377863_378016_378879_379025_379676_379802_380898_381050_381210_381320_381918_382065_382412_382558_383096_383289_384757_384904_385250_385440_387797_387963_390218
707873	contig_1107_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_126549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGAACCAGATAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178100	178479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_178100_178500
707878	contig_2054_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_51675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCCCCCATTTTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80020	78745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_78700_80000
707879	contig_12270_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_113641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707891	contig_16846_pilon	-	1079	4	Intergenic	novelGene_82943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3759.16217024781	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	42	560	555239	551492	TRUE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555280	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551342_551452_551665_552661_552824_555055
707893	contig_12032_pilon	-	1765	2	Intergenic	novelGene_139286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGCATAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114535	112689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_112764_112844
707895	contig_7171_pilon	-	2618	30	Intergenic	novelGene_101289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	111.469302813281	1	115	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	66	1226	1075756	1066885	TRUE	20	TGTTATCTTGTTTTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDII	1075821	1057617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1062999_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066102_1066174_1066538_1066622_1066696_1066892_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
707896	contig_7359_pilon	+	2094	9	Intergenic	novelGene_139879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.5913755930464	1	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	196	1692	414164	424725	FALSE	30	TGCCAATTATCAATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKSQPSAPKTKSPGSVSNGTAASQGQWGRAWEVDWFSLASVVFLLLFAPFIVYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQGLYLVYHPVQLSNLHAAGVLLLGLLGYYIFRMTNHQKDLFRRTNGRCLIWGQKPKVIECSYTSADGQKHHSKLLVSGFWGVARHFNYTGDLLGSLAYCLACGGGHLLPYFYIIYMTILLTHRCLRDDTAVPTSMAATGSATWPPCLTASCPAFSEGPSRGGAAEAAVESMWSRADGG	402250	425127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402319_403997_404119_414157_414262_415308_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_424191
707897	contig_960_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_108273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTCAACTCCAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957999	958624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_958000_958600
707902	contig_20199_pilon	-	821	4	Intergenic	novelGene_82585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.835978296108	88	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	160	462	43987	41171	TRUE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44146	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40821_40982_41250_41934_42078_43906
707905	contig_5981_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_35518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACCAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150355	152760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_150400_152800
707906	contig_8538_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_5083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842857	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
707908	contig_15084_pilon	-	1910	6	Intergenic	novelGene_116662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	27.7632851082144	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	454	948	12669	7486	FALSE	35	AATTGGAATCGACTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSIFTDIGKVDFRDPCSYQLIPTVPGLSPNSSASAAWLSSDGEALFALPSASGGISVLKLPPHAIPGMVSIVELKQFSNATITYRLDASSYQDQMCLMVADMLEYVPGLAAGTGHKLRLAYSPLLGTLPGGIHACSETRTGRFIILCLSAKYKNEVLASPTVS	19073	6523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_7557_9074_9220_10398_10476_12467_12691_18369_18482_18753
707911	contig_13697_pilon	+	2348	10	Intergenic	novelGene_165942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	131.253594894919	230	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	410	1204	624246	628041	FALSE	20	GCCCCTGTTTGGTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMDERTLLREAKEVSLEKLHQAVRQNGVMSGLMQMLLLKVSAHITEQLGMAPGGEFREAFKEASKVPFCKFHLGDRPIPVTFKRAIAALSFWQKVKLAWGLCFLSDPISKDDVEKCKQKDLLEQMMAEMIGEFPDLHRTIVSERDIYLTYMLRQAARRLELPRASDAEPRKCVPSVVVGVVGMGHVPGIEKNWSTELNIQEIMTVPPPSVSGRLSRLAMKAAFFSLVGYSLYWLGRRTVGLVLALPVAQDCLQRVSTVLPKK	613477	629185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_613516_614132_614214_619778_619842_623540_623708_624185_624327_626795_626907_626996_627137_627337_627511_627587_627700_627863
707912	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707913	SIRV6	+	386	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10436	4	1199	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
707923	contig_14441_pilon	+	1217	6	Intergenic	novelGene_100402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	375.45566982002	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	603	1031	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	67220	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67327_67434_67717_113143_113209_116578_116963_117220_117344_117539
707924	contig_8317_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_19714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
707925	contig_3745_pilon	+	2443	3	Intergenic	novelGene_85078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24	2	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATATGTAAATAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364178	372783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364360_369211_369328_370637
707929	contig_4952_pilon	+	1885	13	Intergenic	novelGene_145517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	166.096775672765	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1854	31	1884	332739	454409	FALSE	25	TTATTTTATAACTATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACRVPGASGTMRPGPGGCCCRRPTRANGCFANGEVPNGYVRSTAAAAAAAAGQIHHVTQNGGLYKRPFNEAFEETPMLVAVLTYVGYGVLTLFGYLRDFLRHWRIEKCHYATEREEQKDFVSLYQDFENFYTRNLYMRVRDNWNRPICSVPGAKVDIMERQSHDYNWSFKYTGNIIKGVINMGSYNYLGFARNTGSCQEAAARVLEEYGVGVCSTRQEIGNLDKHEELEKLVATFLGVEASMAYGMGFATNSMNIPALVGKGCLILSDELNHASLVLGARLSGATIRIFKHNNMQSLEKLLKDAIVYGQPRTRRPWKKILILVEGIYSMEGSIVRLPEVIALKKKYKAYLYLDEAHSIGALGPTGRGVVDYFGLNPEDVDVLMGTFTKSFGASGGYIGGKKELIDYLRTHSHSAVYATSMSPPVVEQIITSMKCIMGLDGTSLGKECVQQLAENTRYFRRRLKEMGFIIYGNEDSPVVPLMLYMPAKIGAFGREMLKRNIGVVVVGFPATPISESRARFCLSAAHTKEILDTALKEIDEVGDLLQLKYSRHRLVPLPRTVCGLSEPFPGTTFLWPSHVKDIASTTEGGHLHSKWRFVNSKNCFTSFLCYISPSKRKVAHFVFFSIKRN	332708	454410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_332868_355900_356096_381347_381503_384289_384439_386788_386914_398188_398283_399566_399673_400398_400619_407004_407132_442835_442972_445583_445714_454037_454109_454192
707930	contig_10638_pilon	+	2106	6	Intergenic	novelGene_164305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	47.0387074652355	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	93	1895	314408	403131	FALSE	65	AAGAAGGAAATTAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPSEIILSPAAKKRSGRSGTHRRSIAAGRMATVVVEATEPEPSGSLANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDILETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDTARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVIFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAELILPSGQEVDIPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSIQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPSVKQVKLKQRADSRESLKPATKPLPSKSVRKESKEETLDITKANLVEKPPKVESKEKVTVKKDKPTKTDTKT	314315	403342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_314592_322304_322407_390302_390386_392936_393078_401701_402984_403120
707934	contig_9940_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_125345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	195	542	145254	144907	NA	40	CAATCTCTCAAAATAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSLRKIFFKLRRFSLLPFLPCHVPPRLRRQKLFNLFIPCKRSLGGLVVKRLSANRKVGGSNTPALRRSKMWQSASIKITALETLWGSSTLSYRVTMSQNGLKGSGLYYVNAQI	145448	144046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_144000_145400
707937	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
707943	contig_6069_pilon	+	1477	6	Intergenic	novelGene_8082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.255741424881	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	27	800	563804	566005	TRUE	20	GCAGTGTAGAGTGTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENFIKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELEAATMTVCNQTWNEGEGVARRRPPLRTGASPPRTVRAVSRASPPPTLSTRIPAADPGAGGDVPPAPLLRRGHVRVAADELWLRL	563659	566837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_563677_563794_563990_564439_564695_564775_564896_565792_566043_566197
707944	contig_4469_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_21871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57374	58626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_57400_58600
707945	contig_13283_pilon	+	2553	1	Intergenic	novelGene_154008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTGATAGGTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8615	11168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_8600_11200
707946	contig_990_pilon	+	1992	18	Intergenic	novelGene_76165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	186.319311433756	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	196	1992	1905137	1929868	FALSE	25	ACTTTGATTTTTAATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFMFDSVLPGKYKISIMHEDWCWKNKSLEVEVLEEDVSAIEFRQTGYMLRCSLSHAITLEFYQDGNGPENVGIYNLSKGVNRFCLSKPGVYKVTPRSCHRFEQAFYTYDTSSPSILTLTAIRHHVLGTITTDKMMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHFPPLLRDSENYVVLLDSTLPKSQYDYVLPQVSFTAVGYHKHI	1903532	1929868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1903573_1903810_1903877_1905047_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911080_1911145_1911719_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919670_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769
707949	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
707951	contig_7176_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_107876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTATTGGGAAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661935	662581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_+_661900_662600
707953	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
707958	contig_5954_pilon	-	1880	12	Intergenic	novelGene_28710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	214.794731917485	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	95	1069	975610	967010	TRUE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREGYEALYRSHQTESTRCQTVQQPSCLLHQTP	975704	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967102_968363_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
707960	contig_11292_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_109472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457582	459720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_457600_459700
707961	contig_6929_pilon	+	430	3	Intergenic	novelGene_139406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4374.5	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126949	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_126986_130944_130971_131948
707965	contig_14704_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_82682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAATGAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26869	26563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_26600_26900
707969	contig_299_pilon	+	1375	8	Intergenic	novelGene_129467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	329.688535761019	327	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	33	968	1207529	1447686	FALSE	20	GTACCTAGGGCAAGGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGEASCGGGIMAEVISVGVNLEAFAQAISAIQALRSSVSRVFDCLKDGMRNKETLEGREKAFIAHFQDNLHSVNRDLNELERLSNLVGKPSENHPLHNSGLLSLDPVQDKTPLYSQLLQAYKWSNKLQYHAGLASGLLNQQSLKRSANQMGVSAKRRPKAQPTTLVLPPQYVDDVISRIDRMFPEMSIHLSRPNGTSAMLLVTLGKVLKVIVVMRSLFIDRTIVKGYNENVYTEDGKLDIWSKSNYQVFQKVTDHATTALLHYQLPQMPDVVVRSFMTWLRSYIKLFQAPCQRCGKFLQDGLPPTWRDFRTLEAFHDTCRQ	1207496	1448093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1207732_1209950_1210096_1285142_1285274_1358276_1358371_1409477_1409586_1419258_1419301_1445310_1445389_1447551
707974	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
707975	contig_9177_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_32821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667622	1668438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1667600_1668400
707978	contig_19076_pilon	-	2377	3	Intergenic	novelGene_74204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGAGACAGGGGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147179	94356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_94503_101717_103077_146307
707982	contig_10078_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_160005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	254	811	203798	204355	NA	70	GAAATAACAATAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSVKSDVMCFGHCANTVSYTGERPAGRSAGRPAKPLLRPRDCVKTLVQLALHGCRCFLATPAVRTHCPASRRAAPSSLVRPPLFCLHLLPLPPFLLLFLPPPQPQLLGGCYHGRGAVSGSGVVPRMGHRLCRHPPRWLWWHLLSSCLRRVQWDWQPRMGSRIPFPCHPRAGTDAGPGELVRNR	203544	204811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_203500_204800
707983	contig_16098_pilon	-	932	6	Intergenic	novelGene_46145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2153	junction_1	1571.29406541233	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	131	733	457605	456273	FALSE	15	TTGAAGGGGGAGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	457868	456073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851
707985	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_18208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCCAGCTGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27920	27630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
707986	contig_2933_pilon	-	1993	4	Intergenic	novelGene_111353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.86744175568088	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	265	1407	850204	848945	FALSE	5	TCTTTCCGCGTACTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874181	848358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_849374_849490_850290_860113_860274_874162
708003	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708004	contig_2078_pilon	-	731	1	Intergenic	novelGene_100158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACATGTGCCTTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381311	380580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_380600_381300
708005	contig_9919_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_137965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563603	564021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_563600_564000
708007	contig_2703_pilon	-	1595	1	Intergenic	novelGene_101824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATGAATAGACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165113	1163518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1163500_1165100
708009	SIRV4	-	272	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1251	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3907	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
708011	contig_2444_pilon	-	550	4	Intergenic	novelGene_83757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	54	362	229702	227685	FALSE	25	AATTTTTGTTTAGTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRWDRESRVPAAATRGMAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229755	227496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
708015	SIRV2	-	636	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	23	2958	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
708019	contig_10953_pilon	+	2679	10	Intergenic	novelGene_42534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_9	120.301883650575	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	62	1216	179555	187483	FALSE	45	AAAAAACTTGACCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLWRSSLLSRKPPQPPDALKMATSLGSNTYNRQNWEDADFPILCQTCLGENPYIRMTKEKYGKECKICARPFTVFRWCPGVRMRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMEREISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGKVHLPS	179493	188946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_179609_180035_180090_181091_181122_181995_182129_183136_183238_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328
708020	contig_5686_pilon	+	2504	1	Intergenic	novelGene_45377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTAGAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147544	150048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_147500_150000
708022	contig_9609_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_23004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGTGAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311644	312625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_311600_312600
708025	contig_12080_pilon	-	1692	15	Intergenic	novelGene_128382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.144683294274	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	4	1221	177349	166885	TRUE	5	TGTACCTTTTGCTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPTCIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTVRNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQNSRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPSDLLTYDRTDEADAEERGPEENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI	177352	166316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166586_166682_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_170834_171180_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280
708028	SIRV7	-	261	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91663	2	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
708029	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_96350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708043	contig_12250_pilon	-	1697	5	Intergenic	novelGene_80680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	432	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTAAGGGAAGTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394994	392133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_393020_393216_393314_393881_394381_394686_394775_394867
708048	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708050	contig_7428_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_77703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	925	1230	280409	280714	NA	35	AAATGTAGTCTGTATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLSSRVVASGPQPSEHRSEGGKGYGKVKAQSDDKRQNHSQTDRLTQGVGASPRTSGSCLVPFPPSAPFPEALVLERKQMSGCTVTNHSLLALDSKPKTD	279484	281749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_279500_281700
708054	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
708061	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708067	contig_13292_pilon	-	1722	2	Intergenic	novelGene_142916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12841	10819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_11017_11316
708074	contig_14322_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_115732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671625	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
708080	contig_10734_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_51167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	260	783	204	986	999077	999859	NA	20	CACAGTCTGGGGTTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHAINKISNQTATIISSVLWGITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGEPDNNRSTSMELTEDQNTSRNAPEALMVNSSEPWSPQHLTPTSP	998873	1000776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998900_1000800
708083	contig_7839_pilon	-	1040	7	Intergenic	novelGene_45699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	10.6770782520313	552	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTGGGTGTGTGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249641	228425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_228880_231906_231977_232135_232260_234883_234992_237435_237468_245753_245892_249527
708084	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
708085	contig_11328_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_88384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGAGATCCCTGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640832	640433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_640400_640800
708089	contig_6283_pilon	+	3432	20	Intergenic	novelGene_100203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_19	78.3622174208564	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	73	2556	568380	588463	FALSE	40	TGTGAATACTCAAATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRVALWAPQWFPKTLIFDSPREPAMAFLHLQQPSFLLASLKADCVNKPFAQRCQDLVKVIEDFPAKELHAIFPWLVENIFGSLDGVLIGWNLRCLQGRVNPVEYSIAMEFLDPGGPMMKLVYKLQAEDYKFDFPVSYLPGPVKASIQERVLPDSPLYHNKVQFPPSGGLSLNLALNPFEYYIFFFALSLITQKPLPLSLHVRTSDCAYFLLVDRYLSWFLPTEGSVLPPLFSSPGGSSPSPAPRTPAMPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHTKLEVLHYRLSVSSALHSPAQPGFQALHTYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFSNSLKPEQVSPSAHSHATSPLEEFKRAAIPRFVQQKLYLFLQHCFGHWPLDASFRAVLEMWLSYLQPWRYAPEKQAQSSDSQPRCISERWAPFVQENLLMYTKLFVGFLNRALRTDLVSPKNALMVFRVAKVFAQPNLMEMIQKGEQLFLEPELVLPHRQHRIFMTPTFTGSFLSSWPPAVTDTAFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEVRSLVLRLAQLITQAKQTAKSISDQSAESTAGRSFLSWLGFWPVDTNSSYPTNDLDEVGQDSVRKTDEYLEKALEYLCQIFRLSEAQLAQLTLALGTTQDENGKKQVPDCIVGENGLVLTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDSELQPIRSYEIAGLVRMLFRLSSAINCRFAGQMAALCSRADFLGSFCRYHLTEPALANRHLLSPVRQAHAASRAQVPRISLRFLGSYRTLFLLLLAFFVASLFCIGPLPCTLILILGYLFYATAMALLTEQGKPHQA	565521	589339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_565549_568334_568419_570594_570682_571550_571694_571836_571913_572480_572590_572742_572796_573522_573675_576600_576734_577535_577608_580719_580807_583268_583415_584154_584246_584746_584848_585567_585732_586395_586602_586978_587213_587530_587663_587830_587960_588133
708096	contig_15991_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_70948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTATGATGCCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126431	126028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_126000_126400
708100	contig_11227_pilon	+	1737	2	Intergenic	novelGene_163183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	509	973	135589	136553	FALSE	25	AGAACTGCCCCCATAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSLPLEHWRESCFIRFSKAWPSVAVLLWLLLLPPRPRLLLALSLVLFSAPSALSPRSASHSGEEAPLHSLRGPSTGNVIPNSDRDTGLGRSRLPGLATTGNWSGISDGLVGPELKLDTDWVSESSSDTKLLQLSSSKASEATRMRKNQSHGV	135080	137317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_135760_136259
708103	contig_14322_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_116095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
708104	contig_9808_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_165954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAATTCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40730	41218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9808_pilon_+_40700_41200
708107	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708110	contig_8538_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_5089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGTCTTACCGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842900_843100
708111	contig_9381_pilon	-	2114	6	Intergenic	novelGene_129363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_2	78.5722597358635	482	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	26	760	74659	19597	FALSE	55	GGATTTCAAAGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKISGLEIMDEDRLIEEVLDKFVNCHEQTYEEFLSTFTHLSKEDNGTKKGAFGTDSLENVFTSVKFAHKMEPNDHHLRNKTIFLRTLSQCSEEEQIMMDEGQKVGSSFQGDLNRAGKVKVDNFLDLEDLDMDEDIKPQMSKDLLLLPGEVEQYISTSAPSYIPSVDQILTPEVKPSTTTNRAGKPMEELLGDEVHPFSLDEEFDYDKVMLTPKFTSAEMDTIKQLSKQKKENPNGDLEEPHD	74684	18242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9381_pilon_-_19762_34777_34918_48899_48967_50275_50348_52639_52798_74526
708116	contig_8145_pilon	-	2791	7	Intergenic	novelGene_118655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_6	34.153656059377	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	78	764	843611	818273	TRUE	15	GCGAAGGCTTCGATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSLVSRLVFGPGPAVAVDGGGICWAMSAFEKPQIIAHIQKSLNYTVFDCKWVPCSAKFVTMGNFARGTGVIQLYEIQHGELKLLREIEKAKPIKCGTFSATSLQQRYLATGDFGGNLHIWNLEAPEIPVYSVKGHKEIINTIDGVGGLGIGEGAPEIVTGSRDGTVKVWDPRQKDDPVANMEPVQGENKRDCWTVAFGNAYNQEERVVCAGYDNGDIKLFDLRNMSLRWETNIKNGVMYILILFSFSEHVFNY	843688	811535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_812466_814455_814554_817273_818443_828182_828285_830586_830718_835079_835181_843428
708117	contig_14068_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_165960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGACAGAATAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31887	34229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_31900_34200
708119	contig_4812_pilon	-	1166	6	Intergenic	novelGene_103648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6286.47363789907	7	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	116	640	82626	79235	FALSE	25	TGGAAGCTAAGTATTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQPKFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82741	78708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80345_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
708122	contig_9113_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_68613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCCACCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430389	430665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_430400_430700
708127	contig_10940_pilon	-	1745	4	Intergenic	novelGene_49172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCCCTAGCGGCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176084	172516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_172628_173149_173218_174001_174121_174637
708128	contig_18342_pilon	+	778	6	Intergenic	novelGene_154554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_2	143.555703474296	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	188	778	36952	60757	FALSE	15	GTGAGTACTGAGTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASG	26138	60757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655
708136	contig_10733_pilon	-	2647	6	Intergenic	novelGene_109967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_2	5.03587132480567	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	171	1640	304620	302337	FALSE	10	TCCCCTTCCACTGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTFSSPAEASLQREAGAGGLLTPLADLDRVYELERVVGFVRDLGCQRVALQFPDQLLGDAGAVATRLEEITGSKMFILGDTAYGSCCVDVLGAEQAGAQALVHFGPACLSPPARPLPVTFVLGQRSVALELCAKAFEALNPDATAPVVLLSEPACAHALEALATLLRPRYLDLLVSSPALPLPTGYLNSVPEPLERFGRCFPLAPGRCLEEYGAFYVGGSKDSPGSDLDPDLSRLLLGWAPGQPFSSCCPETGQCQDESARAGRLRARRQYLVERARDAHVVGLLVGTLGVARYREALTHFRNLTQAAGKRSYVLALGRPTPAKLANFPEVDVFVLLACPLGALAPQPSGGFFRPVLAPCELEAACNPAWPPPGLAPHLTHYADMLPGSPFHVPLPPPDSELWDTPDVSLITGELRPAPTWKPPNAPGCSALTPRPQLELAESSPAALFLSSRSWQGLEPRLGQTPVTGAVSGRRGIAIAYEDEGNS	304790	301329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_302462_302543_302721_302807_303492_303686_303911_304142_304256_304473
708140	contig_6576_pilon	-	1445	14	Intergenic	novelGene_42229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	91.0173271754002	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	132	1229	258829	229096	TRUE	85	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKQYRLKNRASWNYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261347	228760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252534_258787_258854_261240
708144	contig_8866_pilon	+	532	3	Intergenic	novelGene_77888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	3	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	56	532	1032429	1043124	FALSE	45	ATTGAAATGAAAGTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRREERPRRSRGDLWRRVMRWQLRPLGPGAAALAAARNLWGPSCLPRRLGWQRTTGRLLVRSVTGASNQLPTPNSGKYRDTVLLPQTSFPMKLLGRQQPDMELEIQQKCGFSELYSWQRERKVKTEFCLHDGPPYANGDAHVGHALNKILKDIANRYHMMKGSKIHFVPGWDCHGLP	1032373	1043124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1032696_1035472_1035596_1043037
708146	contig_11564_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_158534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGATCTTATCAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38890	38382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_38400_38900
708149	contig_9668_pilon	+	1704	9	Intergenic	novelGene_58119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	387.366025226787	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	3	1325	214144	359314	FALSE	15	TGATGGTGCTGGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214141	359693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339309_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
708151	contig_10312_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_159023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	78	404	191511	191837	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFGYYILIGYMVSRDSLLVGSLSFHFFGQKETFNRAFRYYVLSLLTIGKEAISWKGYTDLDLLCHRTIAIGRRSLHTTVEESLRIFHNTTILDSRWLGKMAGGKLEA	191433	192379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_191400_192400
708155	SIRV4	-	265	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1258	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3900	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
708157	contig_10526_pilon	+	1445	11	Intergenic	novelGene_142568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	90.6620648341962	30	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	30	446	223370	288777	TRUE	5	CTTGCACTTGGTTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENFSGEVTGMAAVRMGKLTAMPAGLICASIVVRAAKEESKKQLVKPEQLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKVVRPVEYL	223340	315942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_273809_273912_279949_280070_283141_283197_284658_284758_288751_288822_291360_291453_307400_307512_307714_307833_309993_310089_315403
708158	contig_1372_pilon	-	1687	7	Intergenic	novelGene_140507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	95.076723404487	248	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	298	1254	431763	401441	FALSE	20	TCCTTTTCTCTCAAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGLWRVAGNQLQQEGYSEHGYLTREQSRRMAASNISNANPRKQVQGGIDIYHLLKTRKSKEREGFINLEMLPPELSFTILSYLNATDLCLASCVWQDLANDELLWQGLCKSTWGHCSIYNKNPPLGFSFRKLYMQLDEGSLTFNANPDEGVNYFMSKGILDDSPKEIAKFIFCTRTLNWKKLRIYLDERRDVLDDLVTLHNFRNQFLPNALREFFRHIHAPEERGEYLETLITKFSHRFCACNPDLMRELGLSPDAVYVLCYSLILLSIDLTSPHVKNKMSKREFIRNTRRAAQNISEDFVGHLYDNIYLIGHVAA	451401	401007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_401629_403090_403288_407184_407304_427654_427782_431437_431772_441785_441867_451193
708165	contig_15888_pilon	-	1214	4	Intergenic	novelGene_84389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	139.303824626446	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	54	413	43170	37213	FALSE	10	TGCTCCGACTTCCCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIHPSCMILQTAVPSNTPVDQIF	43223	36411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37277_42675_42774_42847_43021_43145
708167	contig_4654_pilon	+	2850	1	Intergenic	novelGene_103043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382248	385098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_382200_385100
708170	contig_2703_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_101678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCAATGCTCCTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183384	184445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_183400_184400
708171	contig_5649_pilon	-	1645	9	Intergenic	novelGene_82380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	63.2958085105167	310	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	20	976	1081983	1069132	FALSE	10	GCTTCCTGTTGCGTAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPASKMAAAAVCGAVGRAGWRLLQLRCRPVSRCRPPLAPRAFHASAVRLRSSDEQKQQTPPPLSPQHSETRGAEGPTPESSRSPPRYTDQGGEEEEDYESEEQLQHRILTAALEFVPAHGWTAEAIAEGAQSLGLSSAAANMFGNDGSELILHFVTQCNARLTRVLEEEQKLVQLGQAEKRKTDRFLRDAVETRLRMLIPYIEHWPRALSILMLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1082002	1068462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949_1073035_1073307_1073451_1076875_1077012_1078583_1078753_1081910
708174	contig_12414_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_59598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	873	172	1044	373182	374054	NA	45	TATTAAGTTGTTAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373010	374555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373000_374600
708178	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708180	contig_4392_pilon	+	2577	1	Intergenic	novelGene_117337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588320	590897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_588300_590900
708181	contig_7333_pilon	-	2402	2	Intergenic	novelGene_142777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1635	1952	199563	199246	TRUE	30	CCAAAAAATCTGCGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQEVISTFKFYYLRDTFCKEIATTDSDSSDGSGQSKLKTFWKGLTILGAIKNILDSWEEVKISTLTGVWKKLIPTLMDDFEGFKTSVKEVTADVVERSRFRSGA	201197	198690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_198806_198910
708186	SIRV6	+	425	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1614	65	222	-56	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTCGTCATTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
708198	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	58	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708200	contig_6028_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_156558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGTTCAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205638	203081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_203100_205600
708201	contig_5961_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_144165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242107	244494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_242100_244500
708203	contig_6102_pilon	-	1691	2	Intergenic	novelGene_31987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	158	388	419125	418292	FALSE	10	TTTCATCTTGTGGATGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLTATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ	419282	416988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_418369_418971
708207	contig_10482_pilon	-	2350	2	Intergenic	novelGene_152848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAACTAATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165462	160668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_161378_163821
708209	SIRV6	-	652	6	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-264	446	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTAAGCTTGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2811	1098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2615_2733
708210	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708212	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708218	contig_5092_pilon	-	2140	5	Intergenic	novelGene_62309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_4	284.380906532067	2	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	81	395	451516	444945	FALSE	45	TGAATAAATTGTTTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKMWAIGISVLVIVIIIIIVWNVSS	451596	443199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449498_451514
708223	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
708230	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_96563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708231	contig_5041_pilon	-	1540	11	Intergenic	novelGene_27095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	771.563639630588	38	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	101	1384	616721	572165	TRUE	45	CAATAAACACAGACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEERLKI	636080	570857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_570915_572065_572186_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
708234	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
708236	contig_10253_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_76872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64114	61834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_-_61800_64100
708237	contig_21232_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_165977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAACCTGTTACTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13136	11607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_11600_13100
708240	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708245	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708248	contig_4301_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_65133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAAGAAATTCTCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556601	557724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_556600_557700
708249	contig_7165_pilon	+	3624	2	Intergenic	novelGene_116848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	567	887	308349	308669	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVKDTEYTMDYQKNQQTCLGRSTARMILKVKMMRLRLTYFGHVIRRDQFLEDTTLGKVEGQQKRGRPSIRWIWAQHSNNVRMAHDQAVFHSVIQKVAVSWNQWH	307174	311406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_307455_308062
708252	contig_8045_pilon	+	1303	5	Intergenic	novelGene_35381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	4	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	10	651	116067	118722	FALSE	40	TAATACTTTTTAATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116057	119374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
708257	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
708258	contig_1406_pilon	-	1685	7	Intergenic	novelGene_25643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_6	67.9151840328967	439	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	85	876	2730069	2714321	FALSE	30	TTTGCTATTATGAATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSVIVGAGYIAVEIAGILSALGSKTSLMIRYHKVLRNFDSIISSNCTEELENAGIEVLRYSQVKEVKKTSSGLELSVITSAPGRKPAVTTIPDVDCLLWAIGRDPNSKGLNLNKLGIQTDDKGHIIVDEFQNTSVKGIYAVGDVCGKALLTPVAIAAGRKLAHRLFEYKQDSKLDYDNIPTVVFSHPPIGTVGLTEDEAINKYGKENVKTYSTTFTPMYYAVTKRKTKCVMKMVCANKEEKVVGIHMQGIGCDEMLQGFAVAVKMGATKADFDNTVAIHPTSSEELVTLR	2730153	2713511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2714471_2716485_2716620_2718051_2718184_2719401_2719514_2725046_2725206_2727377_2727465_2730051
708259	contig_14536_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_69319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68740	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	872	1249	249781	250158	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGMGFKKRAPRALKEIWKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKRIRNVPYRIRVWLSRKRNKDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	248909	250191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_248900_250200
708267	contig_18778_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_151775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCTGTCTCGGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56586	55752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18778_pilon_-_55800_56600
708268	contig_18778_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_151773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1032	1520	47364	46876	NA	70	AAAAAAAAAAGTCAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGGSVWHGAQHRRGPVWDRAQDGKMPSVGKVSVWDGVGGEGVSSGEAQLGMGPAWEGASVGQGGVSVGQGPAWERPQCGTMGGVGAGKMSAEASQRVGPSLFCLQPQVCAHQAPFPESRGSAPSPIHPASRCWPHESVTQRLHTACCTPPSVLSGVRFGPA	48395	45800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18778_pilon_-_45800_48400
708269	contig_2365_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_103753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	318	641	242645	242322	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLGRHQLNQVIKSLSSVRRQNGGIVVQLSAANLKVGSSNLPAVPQEKDVAVCLLKDHSLGNPSGEVLLCPIGLLRVGIDSTAKGFLVFGMGQNKILCHQNTTSLK	242962	240986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_241000_243000
708270	contig_14167_pilon	+	2255	4	Intergenic	novelGene_105527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	756	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	145	537	21790	22182	TRUE	35	TGTCACATGGAGAGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIKFQIRRQVRGHLISDAVARQVPGGGSPPKSFGAPISQGTQISVRAGLRDSSDGGVKACLAKGWPMGRDEGPRQTSVLSSQLPSSRGQGSGTDPGADDGAPSGCTSTWVGAGEEEESHWVTLGGNPA	21645	28390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_23487_24325_24349_26712_26939_28225
708277	contig_9482_pilon	-	1441	5	Intergenic	novelGene_44261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	14.1155942134931	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	314	745	747480	738770	FALSE	35	CTGTAAATGCAGACCGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVRLKQRRSIPMKPPDEVKVGDSLGDGGGSVLDFMSMKPYSDVSLDISMLSSLGKVKKELDHDEGHLGLDETTKLLQDLHEAQTERGGSRPSSNLSSLSNTSERDAHHLGSPSHLSVGEQPDVAHDPYEFLQSPEPAASTSS	747793	738073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738871_740661_740830_742838_742942_744776_744816_747459
708280	contig_15304_pilon	-	934	4	Intergenic	novelGene_30564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1490.4765084436	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	84	908	54100	52925	FALSE	25	TCCGTGCTCCACCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991_54125_54229
708291	contig_11846_pilon	-	1591	11	Intergenic	novelGene_105937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	112.654738027302	503	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	26	745	263830	254013	TRUE	25	GGTAACTCACAGCTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQTLGLPITDEQIQEMKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKGFHHHRANIHTESGY	263855	248394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263659
708292	contig_11656_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_53987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	160.5	1600	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAATTAGAGTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375986	372184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_373142_374456_374624_375761
708293	contig_12080_pilon	+	2273	13	Intergenic	novelGene_128410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	18.9668936717523	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	75	1643	484514	497042	TRUE	25	CTCATCACTGTAGCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLPGLLGRAFHRLPGPGLRELNHRSTSPGGPQATSSNLLVPVPSLDSSGPHVPRPGTSKGTRTHGWKDAFQWMSARVSPNTLWDALSWGTLTVLALQLARQTHFQASLPGAPWRAEPCSWRSPLDHFLSSPLWHPHCSLRRHILPSPEGPAPRHTGLREHRLGQEGPSAQPRSLSSHSSTQPRSLPSHSSWRAAGVQDSSEEDASSSSESKARLAQPQTTGEKQEQDKSKTLSLEEAATSVQQLFQLSVSIAFNFLGTENMRNGDYPTAFSYFQKAADCGYSKAQYNIGLCHEHGRGTPQDLSKAVLYYQLAASQGHSLAQYRYARCLLQDPASSGEPERQRAMSMLKQAADSGLKEAQAFLGVLFTKEPYLDEQRAVKYFCLAANNGDSQSRYHLGICYEKGLGVQRNLGEAVRCYQQSAALGNEPAQERLQTLFFMEAAALGPSNLAVTGLKSFSSPALCSLNTLLAGALRLPHAWSTGNLGLLCRSGHLRPNPRANSSAIPPHPHSLERSLVRLGFG	484439	498451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_484545_485620_485736_485829_485954_487377_487526_488472_488668_488946_489012_489110_489208_492136_492280_493300_493460_493553_493647_496096_496257_496803_497044_497822
708295	contig_9049_pilon	+	1790	8	Intergenic	novelGene_83146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1290.31983062577	2	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	209	604	90226	111592	TRUE	50	GAAAAGAAATAGTTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEVAALF	89334	113715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111575_111685_112569_112944_112995
708297	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	28	3	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
708299	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
708304	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708311	contig_5549_pilon	+	825	5	Intergenic	novelGene_81593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	180	653	86768	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82176	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
708314	contig_13004_pilon	+	2235	9	Intergenic	novelGene_112732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	320.525910614103	113	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	86	892	922526	929346	TRUE	15	TTCTCTAGAGTGTTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVVQAGSPGPSCYLNKDSGIKLTLASWIGWFCT	922440	952699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926989_927531_927669_929250_929376_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951
708320	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
708322	contig_13894_pilon	-	1268	4	Intergenic	novelGene_62057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	271	1200	287445	286290	FALSE	30	GTAGTGAAAGTACTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286913_287041_287123_287219_287538_288132
708326	contig_16098_pilon	+	1996	10	Intergenic	novelGene_45902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_8	53.4542610527108	206	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1363	1905	335192	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294675	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306428_306572_321945_322037_328159_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
708327	contig_6048_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_73146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031072	1028440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1028400_1031100
708332	contig_6344_pilon	-	1353	6	Intergenic	novelGene_157097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_5	101.678709669232	1617	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	549	1274	846988	836365	FALSE	20	ATTGGATCACCTTCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERSARSLAKGSEPPGPVPEGLIRIYSMRFCPFAKRTLLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFTKNPLGLVPVLENSQGQLICESAITCEYLDEAYPGKKLWPDDPYKKACQKMDFELFSEVPRLLKSIFSRRDKEDCSGLKEQLCKEFSKLEEVLTKKKTTFFGGYSVSMIDYLIWPWFEWLQAMELSECADHTPKLKLWMAAMWEDPTVSALRMDVKAFQGFFALYSQNSLEAYDYGL	847536	836285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_836519_837526_837634_839176_839276_842311_842535_846648_846758_846954
708334	contig_9515_pilon	+	926	7	Intergenic	novelGene_73829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_3	276.215746996598	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	72	803	66468	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	66396	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
708335	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
708341	contig_16578_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_148626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	6	21	323	343	110248	110268	NA	40	GATGTATTCAAAGCAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITPVFTEESIEGLNKGKCNWYHASSRNLEQFVEKRKIKSGNHPIFQQYQNLRKASESSEGQGFKTLTLLFIHGTLNGNSPSLCLTVGLKPPEDLHRGCPKPVSANSMPVLAQ	109925	110870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_109900_110900
708344	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708347	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	43	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708353	contig_8357_pilon	+	1411	3	Intergenic	novelGene_39720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	127	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATGCTTCAACCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499176	510931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_499256_507469_507568_509697
708356	contig_6489_pilon	-	3139	15	Intergenic	novelGene_128913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_13	13.7150297417223	97	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	271	2013	84801	80022	FALSE	15	CAAGTTCCTGGCTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLSRLQAACHRLKLWSELQDYGGDYVSAALGPLTTLLEQGLGSRLHLLAHSRPPVPEWDISQDPPKHRDSGSLTLGLLLSPEGLTSVLEMGPEADQPEAADFRQFWGSRSELRRFQDGAIREAVVWEAASMAQKRLIPQQVVTHLLALHADIPDTCVHYVGGFLDALIQGLKETSSTGEEALAAAVRCYDDLSHLLWGLEGLPLTVSAVQGVHPVLRYTEVFPPTPIWPAYSFYERLRERASLVPRPNKPCPAYVEPMTVVCHLEGSGQWPQDAEAVRRVRAAFQLRLAEILTQQHGLQCRATATHTDVLKDGFVFRVRVAYQREPQILREIRSPEGMISLRDTPASLHLERDTKQLPLLTSALHGLQQQHSAFSGVARLAKRWVRAQLLGEGLSDESLDLVAAALFLHPEPFSPPSSPQVGFLRFLYLVSTFDWKNNPLIVNLNNELTVEEQVEIRSGFLAARTRLPVMVIITPQDRKSSVWTQDGPSAQILRQLVVLAAEALPVLEKQLMDPWGPGDIRTVFRPPLDIYDVLIHLSPRHIPRHRQAVDSPAASFCRGLFSEPRPSLLMPVLGYDPPQFYLAQLREAFGDLALFFYDQHGGKVIGVLWKPTSFQPQPFKASSTKGRMVVSQGGELVMVPNVEAILEDFAVLGEGLVQNVEARSERWTV	85231	78895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_80172_80389_80492_80605_80801_81161_81252_81368_81494_82226_82325_82558_82712_83077_83242_83406_83562_83656_83775_83896_84038_84258_84335_84473_84623_84774_84898_85057
708357	contig_10765_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_122877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTGAAAGAGGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36791	39126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_36800_39100
708361	contig_4531_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_47873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACCCCTCCCCCCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204249	204552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_204200_204600
708362	contig_4531_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_47874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207151	207745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_207200_207700
708374	contig_5084_pilon	+	2263	2	Intergenic	novelGene_64680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	110	424	1773344	1773741	FALSE	10	TTCCACCTGTTTCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTLIVMQDTQPQTAAASRSWQVMCRAQEGWWFLFSWSSLHALGTFSVGECVHIPVYTWQRSPCCDPPVAARRRHACALRGAQGYEATHILTTECLQEVWEAG	1773234	1775580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1773565_1773647
708375	contig_9863_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_154000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGTCCCTGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52667	52046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_-_52000_52700
708381	contig_10765_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_122995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAATTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689894	688692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_688700_689900
708382	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708383	contig_11994_pilon	+	2119	12	Intergenic	novelGene_129348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	78.1534832374652	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	454	1704	95169	121888	FALSE	55	AGGAATAAAAAAGAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEASFTCATVK	93707	122303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93947_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236_108321_121859
708385	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_97020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708387	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	4	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
708388	contig_6735_pilon	-	966	7	Intergenic	novelGene_15692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1000.16294505779	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542294_543068_543292_543788_543835_554223_554374_564157_564232_564784_564869_568198
708389	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_94819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
708390	contig_13888_pilon	+	1105	7	Intergenic	novelGene_151794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	528.599538613327	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	7	462	337589	343145	TRUE	25	TCATATATGGCTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQERPNSRASTQP	337582	361986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_343109_343386_355083_355197_358600_358687_361679_361707_361809
708392	contig_7119_pilon	+	1838	15	Intergenic	novelGene_41013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	92.3165859464935	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1821	18	1838	198227	223424	FALSE	40	AAGATCCGAGGTGGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWRLKMATAAASSASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKAHGDTQHCRKALHRAVQCTSDYPEHVCEVLLTMERTEGTLEDWDIAVQKTETRLARVNEQRIKAAEKEAALAQQEEEKAEHRKKARAEKKALKKKK	198209	223424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217142_217268_217328_218346_218418_221063_221177_222163_222241_223325
708395	contig_1516_pilon	-	1595	10	Intergenic	novelGene_49960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	692	1309	355022	347990	TRUE	15	TCCCGGGTGCCGAGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPFSPRTFLTSWTSAALRIKDANTISTSCCTPNFRSWMSFSDTAGRSTAAPGRFTPFLLPKKPPFSTTVTSTFLLHLQRNKSVIHIDLAAHFHHFANILVVQPQDILVTLFHVRIIQSDLESGSLLQLHLSGAAALDEPSSDLRSFSVQGHSYWPVVNGVRSKAFRGRAHVPDGLCMVLMSSMREVQTSHIHSRLNHLLQCFH	363733	335163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_335267_347225_347394_347974_348066_352895_353030_353505_353696_354804_355063_356020_356154_356362_356523_359953_360086_363507
708409	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_95045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708410	contig_11978_pilon	+	2109	9	Intergenic	novelGene_62791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_8	61.0930386787235	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	141	1016	299759	547808	FALSE	15	TCTCCTAGCACTTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPGEKCHLLIVF	299618	548901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581
708417	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708418	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708419	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708423	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_98076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	GTCCCCCCTTCTCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708438	contig_10037_pilon	-	1245	7	Intergenic	novelGene_148950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	281	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGGGGAGCTCAGTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445817	137203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_137271_186796_186881_236069_236181_332380_332465_378522_378595_425456_425591_445124
708439	contig_12353_pilon	+	1246	6	Intergenic	novelGene_165767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	44.9292777596079	518	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	25	903	70691	78265	FALSE	50	AATACAGTATGATTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACIAGGYGAGVGLARNFRTARVLLRAPASVVCRAHMELVRPQSTGPSGPGTFQPPPKPVIVDKRHTQRQERRFLSPEFIPPRGRTNPLKFQIERKDMLERRKVLHIPEFYVGSILRVTTADPYASGKINQFLGICIQRSGKGLGATFILRNTIEGQGVEICFQLYNPRIQEIQVVKLEKRLDDSLLYLRDALPEYSTFDTNMKPVVQESDQEVPVNKLKVKMKPKPWSKRWERPQFNVKGIRFDLYLTEEQMKEAQKWGQPWLEFDMMREYDTSKIEAAVWDEIEASKKS	70666	78608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_+_70794_70985_71104_74409_74529_75178_75314_77732_77915_78043
708443	SIRV6	+	621	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	337	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
708447	contig_10437_pilon	+	1219	4	Intergenic	novelGene_38346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_3	120.211850035214	1080	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	130	495	523324	529218	FALSE	25	TATTCTGAAGCAGTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKQEEENPSEETGEEKQDKQEKEGILPERAEEAKLKAKYPSLGQKPGGSDFLMKRLQKGQKYFDSGDYNMAKAKMKNKQLPSAGPDKNLVTGDHIPTPQDLPQRKSSLVTSKLAGGQVE	523194	529942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_523381_525030_525157_526368_526536_529202
708449	contig_3960_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_138040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTTGTTCTGTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659352	661202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_659400_661200
708453	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708454	contig_10299_pilon	+	2482	22	Intergenic	novelGene_79719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	100.553930656745	1	113	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	4	945	320559	336791	TRUE	15	TTGACATGCTTGTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYRHLALFTDTGHIWMGTASLKEKLCEFNCNIRAPPKQMVWCSRPRSKERAIVVAWERRLMVVGDAPESIQQTSTFGRSRSWGS	320555	340535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335254_335378_335435_335741_335832_336748_336866_336958_337087_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338806_338906_339077_339158_339256_340026_340124_340232
708460	contig_2487_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_148476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACATCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177774	175204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_175200_177800
708463	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_90374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708466	contig_6710_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_96785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
708469	contig_5041_pilon	-	918	7	Intergenic	novelGene_27103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	365	junction_6	606.530960096478	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	101	916	616721	580910	FALSE	60	AAAGACAGAAAAGGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQ	636080	580907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
708472	contig_7426_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_27453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346532	344446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_344400_346500
708478	contig_6589_pilon	+	978	6	Intergenic	novelGene_26109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2007.80909451073	150	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	22	459	1876599	1880585	FALSE	15	GATTGGTGTCTTTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKVSLRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876577	1881104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879594_1880498
708480	contig_14603_pilon	+	2363	1	Intergenic	novelGene_165988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5522	7885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14603_pilon_+_5500_7900
708487	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708488	contig_6424_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_109258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6416	8830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_6400_8800
708493	contig_8660_pilon	-	921	3	Intergenic	novelGene_136496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	15	GTTTCCTGTCGTAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
708494	contig_16098_pilon	+	1592	10	Intergenic	novelGene_45812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	62.9557947989336	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	62	1420	150572	153863	FALSE	15	GACTAGCTTGTGTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150510	154035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
708496	contig_7253_pilon	+	2311	8	Intergenic	novelGene_140207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	52.5081140474149	197	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	198	761	201514	215768	TRUE	20	TAATTTTTCCACGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANEDQEMELEALRSIYEGDESFRELSPVSFQYRIGENGDPKAFLIEISWTETYPQTPPIISMNAFFNNTISSAVKQSILAKLQEAVEVNLGTAMTYTLFEYAKDNKERFMENHHPINSTTSISNIISVETPNIGPSSKKKDKKEQLSKAQKRKLADKTDHKGELPRGWNWVDVVKLSKTGSKDDE	201316	217585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_201538_204133_204215_207379_207490_207570_207719_209612_209731_212355_212406_215735_215810_216076
708497	contig_10451_pilon	-	2750	1	Intergenic	novelGene_138304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	11	36	285	320	125551	125516	NA	65	ATGTTGAAAGACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAERSSVIGLVGLFVPLPPLICRNLSSPLPISAPPGPSLLLPASLCSVRQQKWTEEGGNGLKCTLCQVLAPPLCGLSTVPVSLTTLGSAPLANRMNTCVLNRSCY	125835	123085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_123100_125800
708499	contig_9049_pilon	-	1250	3	Intergenic	novelGene_83157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGATTGGCATACTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113699	108276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_108722_111556_111675_113012
708502	contig_15888_pilon	-	1154	9	Intergenic	novelGene_84425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	31	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	62	871	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259787	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251679_252105_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
708504	contig_253_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_129693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCTATGGGGTCTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422663	422464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_422500_422700
708505	SIRV2	+	589	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-50	-16	-50	16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACATGGTAACCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058	1647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1600
708506	contig_8588_pilon	+	2879	21	Intergenic	novelGene_146503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_7	90.5593037738255	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2487	392	2878	346843	378259	FALSE	25	TATTTCACCCAGCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLTAQVTSGLLQFPEVTIQALGEDEITLESVLRGKFATGKSGLACLACGPQLEVVNSVTGERLSAYRFNGVNDQPPIVLAVKEFSWQKRTGLLIGLEEAEGSVLCLYDLGISRVVKAVVLPGRVTAIEPIINHGGASASTQHLHPSLRWLFGVAAVVTDVGQILLIDLCLDDLSCSQNEIEASDLEVVTGIPAEVPHIRENVMREGRHLCLQLVSPSGTAVSTLSYISRTNQLAVGFSDGCLALWNMKSMKREYFTQLEGGRVPVYAVTFQEPENDPRNCCYLWAVQSTQDSEGDVLSLHLLQLAFGDRKCLASGQILYEGLEYCEERYTLDLTGDMFPLRGQTSNTKLLACQSIEKFRSHGDREEGMNEALSPDTSVSVFTWQVNIYGQGKPSIYLGLFDINRWYHAQMPDSLRSGEYLHNCSYFALWSLDSVVSRTSPHYILDILVHERSLSRGVPPLYPPPEQFFNPSTYNFDATCLLNSGVVHITCTGFQKETLTFLKKSGPSLNEVIPDGYNRCLVAGLLSPRLIDIQPSSLSQEEQLEAILSAAVHTSSLGLLTGCIKRWITEEQPNSAANLRFVLEWTWNKVILTKEEFDRLCTPLFDGSCRFIDPQTIQSIQQCHLLLSNLNTVLSCFATEAQEVTERGLMDLSNKHMVTQLICQYAQMVLWFSHSGLLPEGLDDAVQLSRLCYNYPVIQNYYTSRRQKCERLSRGKWNPDCLMIDGMVSQLGEQVEKLWKRDEGGTGKYPPTSLHALLDIYLLDNVTEAIKHSVTIYLLLDIMYSFPNKTDTSIESFPTAFAISWGQVKLIQGFWLLDHNDYESALDL	330398	378260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_330783_346835_346964_348925_349180_352501_352683_357471_357680_359203_359321_360273_360359_361417_361569_363204_363338_363430_363613_364056_364119_364985_365115_369240_369332_370264_370355_372715_372857_373579_373685_374564_374659_376326_376451_376632_376690_377540_377688_378244
708513	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708518	contig_9609_pilon	-	2037	10	Intergenic	novelGene_23091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.5452535297753	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	229	1338	481425	477306	FALSE	0	TCTTCTGTGGTCCTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARKGNAPRKGSQRRGGGARSSAQADSGSSEDEAASEARSTTSECPSLLSVTAEDCLGGDAVDEQAQQEDLEDKLKEYVDCLTDKSAKTRQGALENLRLALASHLLPDFLLERRLTLADALEKCLRKGKGEEQALAAAVLGLFCVQLGPGPKGEELFHSLQPLLVSVLNDGTASPAARLHCASALSLGCYVAAADVQDLVSCLTCLEGVFSRACSVGGSTAPVAPASFHGLLCAALQAWALLLTICPSTHISHILDRKTLFMRRWRPSVVPCAPWPLTATSTGPRLTAGASAQLSALCCTLSRAASVRKRQSASGSRCSMWTAGPGAVSTPPSRMCWVLACTTTSRTMSYSVTSLVWALYWCWMLLL	481653	476606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477373_477447_477577_477649_477788_478265_478445_478528_478580_478748_478907_478988_479114_479222_479308_479392_479513_481367
708520	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	243	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708528	contig_15182_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_136465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGTCTGGCAATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569697	570207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_569700_570200
708531	contig_5095_pilon	+	2531	7	Intergenic	novelGene_74961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	42.0214892115398	9	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	76	762	461700	462965	TRUE	20	AGTAGAGGTAGGGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSLFLAALCLGIASAALKHDQSLDAHWNQWKSTYKKPYAVHEEDWRRAVWEKNMKMIELHNREYSQGKHGFTMAINAFGDMTNEEFRQVMNGFQNQKRNKGKMFHEPVFGNIPKSVDWTQKGYVTPVKNQGECGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSRPEGNEGCSGGLMDSAFQYVKDNGGLDSEESYPYLATVHGAPYLLVIPALWKAEHFQG	460812	466579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_460877_461688_461826_462111_462235_462340_462488_462674_462997_463551_464902_466191
708534	contig_5967_pilon	-	797	4	Intergenic	novelGene_44399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_2	115.20513105857	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	58	372	430724	403369	FALSE	25	TAACCACTGTGCCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGK	430781	402943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_403471_412498_412605_423963_424055_430708
708535	contig_5967_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_44396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATATTGAATTAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398655	397986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_398000_398700
708542	contig_7356_pilon	+	2752	5	Intergenic	novelGene_60367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGCCACAAGCTCCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340483	457920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_342832_343907_343999_435516_435620_437471_437532_457770
708543	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	278	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708545	contig_3095_pilon	+	1213	5	Intergenic	novelGene_75060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3027.6364853628	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	64	375	147241	150428	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMNLQK	147177	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149865_150413_150696_150996_151163_151848
708549	contig_7020_pilon	+	2239	2	Intergenic	novelGene_57051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	92	1441	102160	103509	FALSE	35	ATAATCTTACATAGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	73834	104307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_73853_102086
708550	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708563	contig_16071_pilon	-	2110	6	Intergenic	novelGene_165999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	43	junction_2	52.2164724967131	88	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	341	1822	73220	67547	FALSE	20	TGGTTGTCTTGTCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWELDKITYEIKKVWYGRTIIRSAYQLFYEAAQELLDGNVSIIEDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHIRAKRDRCGALELEGVEIHVQLDEKKNIHDLISKQPLEVHEMVAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFLELRECAKAKGFSIDTRSNKTLADSLGNAHDPSDPVVNRLLRSMATQAMSNALYVSTGSGAEAEFYHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIEENLFSNKDLEELCRHINNRNRAAQHSQKQSTELFQCMYFKDRDPETEERCISDGVIYSIRTNGVLVFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVLSCGPDSRSEWKPGSLQRFQNKITSATTGGDSLTFHLFDHVTVRISVQTSRCHSDTIRLEIISNKPYMIPNTELSHQSPLLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQDVKVNTIQEEYQEYCQTKGRSLYMLLEEIRDLALLDVSDDHGT	73560	67258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_67856_68115_68291_68847_68994_70475_70655_70757_70913_72702
708564	contig_5222_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_59012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCTTTATCTGTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343719	344710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_343700_344700
708575	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_95699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708580	contig_10765_pilon	+	2171	7	Intergenic	novelGene_122865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	215.855211246387	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	1051	2001	19059	34929	FALSE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15701	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_17961_18309_18420_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
708590	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_3004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
708593	contig_11855_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_67058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGAGGTTCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006725	2008515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2008136_2008231
708596	contig_6885_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_83638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120798	121828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_120800_121800
708597	contig_12566_pilon	-	2377	19	Intergenic	novelGene_86004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTCCAGCTCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86479	44366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_44457_47505_47730_50022_50083_52265_52350_54028_54266_54371_54460_56426_56566_56966_57126_59038_59153_63021_63150_65091_65168_69036_69123_69727_69853_75402_75478_78923_79090_80111_80199_82707_82864_83208_83274_86261
708598	contig_8663_pilon	-	1067	3	Intergenic	novelGene_57995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	394	junction_1	114.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	364	666	55181	53470	FALSE	20	GTTACTTTTTTTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDDGTVIHFNNPKVQASLSANTFAITGHAEAKPITEMLPGILSQLGADSLTSLRKLAEQFPRQVLDSKTPKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN	55544	53068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54145_54985
708599	contig_2069_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_23337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	395	814	607006	606587	NA	5	GGTGTGGCTGGTGGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSPTQSPPSTAAQALHWMQWPPHPSPSLPFPRPPWLSALELLLVVVDSSFLPSPSPQCLLGSSPPAAASGEKQPLFFPPSPPQPSPCLCQVPPLSQASEQPWRQEDHVKSFFTVLGRLVGEEVEGSGGGSGTISLLL	607400	606147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_606100_607400
708601	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708603	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
708604	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
708606	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708608	contig_8330_pilon	+	1373	2	Intergenic	novelGene_71732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	47	junction_1	0	337	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	667	999	459587	459919	FALSE	20	GGCAAGGACATGTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGLNSFFVLAVSVGTGLILLQYNSQGSDLKHTSLVFIRVSCLSRSAGSSTEYHPHAGTTSVTCRMKERPRITHWLLPASARKLHSSPPLTSHRSEQMTLLCLTSKEET	456954	460293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_457079_459044
708609	contig_5954_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_28803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTTTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447411	1448029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1447400_1448000
708612	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708614	SIRV4	+	162	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1609	632	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2609	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
708621	contig_14467_pilon	+	1973	11	Intergenic	novelGene_138276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	207.847636503281	101	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	213	1457	369732	387086	FALSE	80	AAAAAGGAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGNKPTLTLGTNTNTSNFGTYKKQV	352169	387602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_367941_367977_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889_385028_386924
708624	contig_10197_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_115283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGTCACGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190660	1193077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1190700_1193100
708625	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708626	contig_567_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_33966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACCTGCTACTCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332872	331083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_331100_332900
708629	contig_12357_pilon	-	1013	4	Intergenic	novelGene_6142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGCTGAACGCTGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53920	46497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_46565_51127_51238_52758_52842_53167
708637	SIRV7	-	285	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68999	2	35780	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78958	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
708644	SIRV4	-	317	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1206	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
708645	contig_6102_pilon	-	1957	7	Intergenic	novelGene_32209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_6	1584.45831087122	31	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	256	1851	899149	895000	FALSE	15	TGAACCCAGTGGGTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVTPPSSKGAPAAPSTKGVLTSPPVTPPPSKGASVLPPTTTPPKGAPPVPSTKKAPTPSPVTPPSSKGAPAAPSTKGVPTPSPVMTAPKGAPIPPPVTPPSSKGAPIPPPVTPPSFRGAPIPPPVTSPSSKGAPIPPPVTPPSSKGAPEIQSTKDVPTSLAVTPPKETPATPSPQSSPTPPASVTCPLEAIAPQPSKGLPTNKGPTAPKEALVAASPESASVITAPTQKGPSAKKGSVPSPSVCPDPAVKRGTGGPLSTVAAAPLLTVSSHSSPKTPKALPVSPTKGKDSVHAPNVPLALPPESKTSTPLATAASEKVLLKTGSVPVSPAPTPSVSLPLAPSAVPLLLPKQQFLPSSPGLVLESPCKPPAPADEDEMPPLIPPEPVSGGMPFQPVLVNMPIPKSAGIPAPAPSAKQPILKNNKGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	899404	894893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_898131
708646	contig_12019_pilon	+	634	3	Intergenic	novelGene_87649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	10	TTGCTTACAGGGCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
708647	SIRV6	+	341	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	536	1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
708648	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	52	506	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
708664	contig_7356_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_60412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATCGAAAAGAGAAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472340	471972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_472000_472300
708667	contig_8330_pilon	-	3204	26	Intergenic	novelGene_71915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	28.5657137141714	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1038	3117	7	3123	1280882	1269401	FALSE	30	GCCAGTGTGCAATAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALKHWRTTLERVEKFVSPIYFTDYNLRGRLYRDSCPVAALSSFLTPERLSYQQAVQQDFRPVQVGDHFGPTWWTCWFRVELTIPEAWVGQEVHLRWESNGEGLVWRDGEPVQGLTTEGEKTSYVLTDRLGEGDPRSLTLYVEVACSGLLGAGKGSMIAAPDPEKTFQVSRAELAVFHRDVYKLLVDLELLLGIAKGLGEDNQRSFQALYTANQMVNVCDPAQPETFPVAQALASRFFGQRGGESQHTIHAIGHCHIDTAWLWPFKETVRKCARSWVTAVQLMEQNPSFIFACSQAQQLEWVKNHYPGLYTRLQECACRGQFVPVGGTWVEMDGNLPSGEAMVRQFLQGQNFFLQEFGKMCSEFWLPDTFGYSAQLPQIMRGCGISRFLTQKLSWNLVNTFPHHTFFWEGLDGSRVLAHFPPGDSYGMQGSVKEVLKTVTNNRDKGRTNHSAFLFGFGDGGGGPTQTMLDRLERLCNTDGLPRVQLSSPGRLFSELESDAGQLCTWVGELFLELHNGTYTTHAQIKKGNRDCERILHDVELLSSLALARSTQFLYPAVQLQYLWRLLLLNQFHDVVPGSCIQLVVEDAMSHYEDIRSHGNGLLSAAAAALCAGEPGPEGLLVVNTLPWKRTEVLALPKPGGAHTLALVTVPSMGYAPAPAPTCQQPLLPQQPVFVVQETDGSVTLDNGILRVRLDPTGRLTSLVLVASGREAIAEGAVGNQFVLFDDVPLFWDAWDVMDYHLETRKLVLGQPGTLAVGTEGGLRGSAWFLLQLSPNSRLSQEVVLDVGCPYVRFHTEVHWQETHKFLKVEFPARVRSPQATYEIQFGHLQRPTHYNTSWDWARFEVWAHRWMDLSECGFGLALLNDCKYGASVRGNVLSLSLLRAPKAPDATADMGRHEFTYALMPHKGSFQDAGVIRAAYSLNFPLLALPAPGPAPAAAWSAFSLSTPAVVLETVKQAEANPLSRTLVLRLYEAHGSHVDCWLHTSLPVQEAVLCDLLEKRDPAGHLPLRDNRLKLSFSPFQVQSLLLVLQPPLD	1280888	1269319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1269528_1269604_1269715_1269802_1269952_1270109_1270190_1270289_1270400_1270755_1270900_1271017_1271175_1271276_1271382_1271629_1271725_1271899_1271998_1272148_1272305_1272428_1272515_1272657_1272780_1273097_1273222_1273584_1273731_1273831_1273928_1274064_1274182_1274309_1274403_1274761_1274873_1275077_1275185_1276335_1276526_1276837_1277016_1278550_1278622_1279795_1279920_1280386_1280513_1280787
708668	contig_4232_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_63497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTTCTGGTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724331	726096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_724300_726100
708670	contig_1154_pilon	-	2192	6	Intergenic	novelGene_87165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	81.1852203298113	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	20	334	914362	910580	TRUE	10	TTTCTGTTGTCTTGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTAALMAPPVRYCIPGERLCNLEEGSPGSGTYTRHGYIFSSLAGCLTKSSENGALPVVSVMRETESQLLPDVGAIVTCKVSSINSRFAKVHILYVGSTPLKNSFRGTIR	914381	908284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_908720_909040_909126_909241_910673_911663_911739_914112_914229_914331
708671	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708673	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
708679	contig_12977_pilon	+	1286	12	Intergenic	novelGene_122786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	839.438881851226	4	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	313	1107	48712	58627	FALSE	0	GCCCTGTTCTCTTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAFLSCCRRRRPGRGAWASPAGTGHWTVLLALGPRTALPGAGERALLQQTPNSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPGSPGCCMQVPRWRQPQLLPPPERPRPPPPEKSDAVYAAIAVQDGLRTPTAPAQDYRALYDYTAQNHDELDISAGDILQVVLEGEDGWWTVERNGQRGFVPGSYLEKL	10723	58806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10882_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_56950_57007_57242_57378_58495
708682	contig_20374_pilon	-	597	2	Intergenic	novelGene_166014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTCAGTACTAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5476	3692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128
708684	contig_13067_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_141350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63122	65569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_63100_65600
708686	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_95098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708687	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708688	scaffold_880_pilon	+	2057	7	Intergenic	novelGene_121440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_1	271.933457955353	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	2	892	420261	443657	FALSE	20	CAAATCTGTTGCCTTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELAQELEDFTDDDPDVVFTPKECRTLQPSLPEEGVELDPHVRDCVQTYIREWLIVNRKNQGSPETCRFKKTGSRKDFHKTLQKQTFESETLECAEPSAQTGPRSLRVLCDVSGKGPVTACDFDLRSLQPDQRLENLLQHISVEDFERQNEEARRTNRQAELFALYPSVDEEDAVEIRPVPECPKEHLGNRILVKLLTLKFEIEVEPLFASIALYDVKERRKISENFHCDLNSDQFKGFLRAHTPSVAASSQARSAVFSVTYPSSDIYLVVKVVKHHLSCIFSCSHGRVISSSCLG	420259	444822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_420365_424873_424946_433473_433598_437562_437776_439125_439212_441361_441429_443432
708691	contig_16666_pilon	-	1349	4	Intergenic	novelGene_61734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	12	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	26	472	59688	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59713	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
708693	contig_19342_pilon	+	877	4	Intergenic	novelGene_41127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	5	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	51	455	5070	6358	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGNGFVVLQAATVPRALMCLSQPKV	5019	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_6116_6186_6353
708695	contig_9668_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_58090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139267	141444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_139300_141400
708707	contig_7202_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_16499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27829	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
708709	contig_7380_pilon	+	2870	18	Intergenic	novelGene_157513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	78.5126882391176	157	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	111	1412	139473	177572	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLYAGGIPVSDAGGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFAPQEAYSHLKNILEQINALTGALFTSKVLEERAERETESQGNSSSEQGEQVYDWSTGLENTDDSHLYFSPDQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFAEIYSQKIGIKKEVLLKTLWGDYYINMKAKRIMKVDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKEKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQISAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVEKLMCTGSQTFDSLPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRYL	138596	300509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_155567_155702_157165_157304_159811_160027_167053_167178_168704_168782_169532_169670_170631_170755_173428_173532_177565_177647_194034_194126_255947_256080_259679_259828_280006_280192_299681
708715	contig_6612_pilon	-	971	2	Intergenic	novelGene_148172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	656	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	259	831	64524	61925	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIEVGVRQMLV	64782	61784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_62141_64167
708719	contig_3018_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_78899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAGACAGACTAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590981	591798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_591000_591800
708721	contig_10811_pilon	-	2312	2	Intergenic	novelGene_165802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	616	1263	367442	366666	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLHSGRRVEETQLEADSNCPGGKLTPGPRREGGDGGAGQAARDPLLAPLHCVTSASHLTSLHTSSSVKSGCLKPHRVLVRITGVNPHSTARSPCRALRAAHWVVNWTQVNDPQCGGWFTRQDSGARNTLASEDEGQEGRLDARGGVDMCRAERWQETERKDTYRKGTRDLSKESCQDRRSTEQRVTGGEGGEKRGQECRTVSKATDRANSTKTE	368057	365616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_366895_367023
708724	contig_16071_pilon	-	2543	5	Intergenic	novelGene_166002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	41.0814739268201	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	341	1378	73220	68808	TRUE	30	AAAGTGTAGAGTTCGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWELDKITYEIKKVWYGRTIIRSAYQLFYEAAQELLDGNVSIIEDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHIRAKRDRCGALELEGVEIHVQLDEKKNIHDLISKQPLEVHEMVAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFLELRECAKAKGFSIDTRSNKTLADSLGNAHDPSDPVVNRLLRSMATQAMSNALYVSTGSGAEAEFYHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIEENLFSNKDLEELCRHINNRNRAAQHSQKQSTELFQCMYFKDRDPETEERCISDGVIYSIRTNGVLVFIPRYVISNKMGKKKS	73560	67382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_67856_68115_68994_70475_70655_70757_70913_72702
708725	contig_10126_pilon	-	3017	1	Intergenic	novelGene_105745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGTCGTCCACACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162649	159632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_159600_162600
708729	contig_9871_pilon	+	2990	8	Intergenic	novelGene_75648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.410293433959	2	121	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	342	806	391952	416332	TRUE	25	CAAACATGAGTTTTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVPGVPLHEHRHLDLFYDGDFL	384493	421019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384726_384900_384991_391932_391973_408671_408945_413892_414001_416269_416506_418632_418746_419121
708735	contig_16846_pilon	-	1008	5	Intergenic	novelGene_82957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	583	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	97	615	555239	551492	TRUE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558746	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551000_551236_551665_552661_552824_555055_555278_558688
708743	contig_10904_pilon	-	1932	9	Intergenic	novelGene_22497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	595	junction_7	212.295637025352	904	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	209	886	336807	310785	FALSE	45	AAATATGTATATAGGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRRTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLAEDPKVNTRAPCEAAYVPTKEPLGACELQP	337015	309738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_310878_315357_315390_315486_315525_315742_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
708745	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_96606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708752	contig_11052_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_115456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	436	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	95	526	102902	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102807	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
708753	contig_15047_pilon	-	2363	7	Intergenic	novelGene_52280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	21.5516176242579	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	285	1130	84499	82103	TRUE	75	AATAAAGATAAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRGLHSLQETLDCEIQEDNGTWGFWDYRYDREPFLSYLPETQRWTVPQSLAQTLALEMKKTWDADRDKHKYYGHHVQGDICKRLWSYLDSGRDFMERIAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPAFMRKPRKRSMSQVHGMASEPPA	93348	77184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_78367_82051_82174_82700_82842_82958_83229_83873_84162_84423_84686_93250
708755	contig_10286_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_98414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAACATTAATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403751	403441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_403400_403800
708763	contig_2924_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_140282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCTTACGTCTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276497	278709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_276500_278700
708764	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708767	contig_1301_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_47402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAATAATAATGATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787638	786581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_786600_787600
708769	contig_5020_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_27936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAACTCCCTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152531	152010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_152000_152500
708773	contig_18214_pilon	-	3334	1	Intergenic	novelGene_166025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATAAACCCCAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250921	247587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_-_247600_250900
708774	contig_7963_pilon	+	1028	5	Intergenic	novelGene_58335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	266	601	39310	40190	TRUE	30	ACTCACTAAATGGAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEDTHSKGDESQHKPPNSGQHFVFGRIRLCLPLHGDRTIQAGVLHMAGIDIALLGGHFQHHQDLEGPVSIMDQIGGHNPSCFFMSIPEPPDLNAAWIEICHMADKQVVVL	38330	48893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284_39405_39949_40234_43550_43829_48787
708778	SIRV4	+	330	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1441	632	986	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2441	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
708779	contig_9955_pilon	-	1264	9	Intergenic	novelGene_21340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	44.0282224828575	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	221	1102	113790	86976	FALSE	25	TTGTTTAAGTGGTCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	128016	86813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113655_113807_127812
708780	contig_3426_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_57921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1627	1929	152324	152022	NA	50	ATATGAAAAGTGAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHELKAMHKQMIQGYGRLDPSEAPIRKEKKTWQVPKAQASGHLLAEGMGTKQTSPVARAGIADIGLLRHQNLEPIMQHFAGSFLGISPFRTFRTLDTEV	153950	151547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_151500_154000
708783	contig_9940_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_125356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAATCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250539	248721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_248700_250500
708787	contig_12638_pilon	+	2088	10	Intergenic	novelGene_33390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	115.918340776579	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	81	1343	1515842	1538931	FALSE	30	GAAAGGATTTTGAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515761	1539676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529491_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
708793	contig_9505_pilon	+	1377	10	Intergenic	novelGene_121855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	253.21356818131	167	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	48	668	530721	597995	TRUE	20	TTCATTGCCGCATTATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLGTICSSSSLSRDEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530673	621449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555983_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886
708800	contig_6710_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_90867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
708801	SIRV7	+	338	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAATCCTATGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	114744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
708810	contig_7050_pilon	+	1098	8	Intergenic	novelGene_153631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	234.840197511727	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTGTTCTTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734479	847253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_734545_738683_738758_760452_760514_799721_799816_810822_810907_830795_830870_834426_834527_846707
708813	contig_19851_pilon	+	1168	6	Intergenic	novelGene_29820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4236.96506476039	20	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53431	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_54606_54717_55650_55777_56006
708822	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708823	contig_14683_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_166031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	33.728079300982	272	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	171	821	20207	52585	FALSE	25	TGGACTTGGAGAATCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGIIGGTGLDDPEILEGRTEKYVDTPFGKPSDALILGKIKNVDCVLLARHGRQHTIMPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLREEIQPGDIIIIDQFIDRTTVRPQTFYDGSCSSARGVGHIPMAEPFCPKTREVLIETAKKLGLRCHSKGTVITIEGPRFSSRAESLMFRTWGADVINMTTVPEVVLAKEAGVCYASIAMATDYDCWKEHEEAVSVDKVLKTLKENANKAKSLLLTTIPQIGSMEWSETLHNLKNMAQFSVLLPRH	16530	53504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_18293_18353_20184_20353_40569_40673_44821_45062_49228_49352_52546
708827	contig_8418_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_166064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTAAATCTGTCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110384	1108699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1108700_1110400
708832	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1446	632	991	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2446	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
708836	contig_12709_pilon	-	1239	9	Intergenic	novelGene_147400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_8	531.244397029277	2121	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	83	1147	59003	29115	FALSE	15	CAACTGTGTGTCTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLVALTLLGVGLALIGERLWALRRRMNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59085	29022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
708839	contig_2703_pilon	+	1891	1	Intergenic	novelGene_101707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACAGAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526170	528061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526200_528100
708845	contig_8020_pilon	+	2268	18	Intergenic	novelGene_114458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_14	38.6369849884348	235	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	143	2233	387453	431592	FALSE	15	CATGGGCTATGACTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFCGRANPTTGSVEWLEEDEHYDYHQEIARSSYADMLHDKDRNVKYYQGIRAAVSRVKERGQKALVLDIGTGTGLLSMMAVTAGADFCYAIEVFKPMADAAVKIVEKNGFSDKIKIINKHSTEVTVGPDGDMPCRANILVTELFDTELIGEGALPSYEHAHRHLVQENCEAVPHRATVYAQLVESRRMWSWNKLFPIHVQTSLGEQVIVPPLELERCPGAPSVYDIQLNQVSPADFTVLSDVLPMFSVDFSKQVSSSAACHSRQFEPLVSGRAQVVLSWWDIEMDPEGKIKCTMAPFWAHSDPEGLQWRDHWMQCVYFLSQEEPVIQGSALCLVAHHDDYCVWYSLWRTSPEKNGGDLHQVRPVCDCQAHLLWNRPRFGELNDQDRTDQYVQALGTVLKPDSICLCVSDGSLLPMLAWHLGAKQVFTVECSAASHRLMKKIFKANHLEEKINIIEKRSELLTPADLGGKKVSLLLGEPFFTTSLLPWHNLYFWYVRTAVDQHLVPSAIVMPQAASLHAMVVEFRDLWRIRSPCGDCEGFDVHIMDDMVKRALDFRESREAEPHPLWEYPCRSLSEPQRILTFDFRQLVPQQPVRAEGAIELRRPGRSHGAVLWMDYHLTPDSTVSTGLLRPAGDKGDCCWNPHCKQAVYFFSTSLDPRVPLSSPQSVTYTVEFRPHTGDITMDFRLSDDLGSVH	382269	431627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396_388434_401951_402102_403939_404049_406635_406749_413007_413250_413715_413897_416561_416690_417077_417217_423111_423196_423586_423635_424287_424378_427026_427189_428340_428416_430050_430212_431062_431160_431412
708847	contig_6710_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_98158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708848	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3626	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708851	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708856	contig_15063_pilon	+	1669	6	Intergenic	novelGene_13593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	202	1437	34808	39515	FALSE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34606	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
708858	contig_3410_pilon	+	2626	11	Intergenic	novelGene_58962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_6	71.0611708318967	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1250	1942	417402	420802	FALSE	20	GATAGTCTGCACCCTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGEELTSEESVFEVFAHYLSGEPNRNGCKVTCLPWNDEPLAAETNLMKEELLRVNRQGILTINSQPNINGKPSSDPIVGWGPSGGYVFQKAYLEFFTSRETVEALLQVLKRYELRVNYHIVDVKGENITNAPDLRPNAVTWGIFPGREIIQPTVVDPISFMFWKDEAFALWIEQWGKLYEEESPSRMIIQYIHDNYFLVNLVDNEFPLDNCLWQVVEDTFELLNRPAPE	409974	421486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_410201_411486_411727_412569_412681_415336_415532_416261_416513_417025_417161_417310_417492_417819_418003_419144_419247_420163_420284_420604
708861	contig_11338_pilon	+	1824	11	Intergenic	novelGene_6181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	445	1470	6086	10018	TRUE	40	TCTATCAAAAGCTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRP	746	13600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10022_13249
708864	contig_1450_pilon	-	963	6	Intergenic	novelGene_27408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	44	535	355898	352449	TRUE	20	CCCAAACTGCTTGCGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVLSPARILKEAMTWSAVSVSAVSRDIKSMKAWNVTTPRRLGSTMLMMRANSASPWGSLPIS	355941	349033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_349077_350343_350524_351264_351413_352391_352470_354166_354326_355586
708865	contig_10404_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_138678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACACCTAAGCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091856	1091133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1091100_1091900
708870	contig_13481_pilon	+	1459	6	Intergenic	novelGene_119305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	171.168922412919	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1140	320	1459	283783	469453	FALSE	65	ATTGAAAAAGAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSSGASGGKGVDANPVETYDSGDEWDIGVGNLIIDLDADLEKDQQKLEMSGSKEVGIPAPNAVATLPDNIKFVTPVPGPQGKEGKSKSKRSKSGKDTSKPTPGTSLFTPSEGAASKKEVQGRSGDGASAGGLVAAIAPKGSEKAAKASRSVAGSKKEKENSSSKSKKERSEGVGTCSEKDPGVLQPVPLGGRGGQYDGSAGVDTGAVEPLGSIAIEPGAALNPLGAKPEPEDGENECRPLKKVKSEKMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKC	248562	469453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_251968_252071_283655_284530_414927_415154_466806_466879_469358
708871	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708876	contig_11978_pilon	+	917	6	Intergenic	novelGene_63056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4747.14935935241	21	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	514	915	1830693	1831965	FALSE	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLALRPAGLRPRKHASAVRSDSKPRKKRSSRLCPRRKRPRNKAAPLLLSVHNGLGNYIDQLFNKMSFYL	1827906	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830186_1830516_1830785_1831161_1831273_1831766
708877	SIRV6	+	690	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	54	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10727_11031_11109_11205
708883	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
708885	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_89621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653783	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708886	contig_12638_pilon	+	2294	9	Intergenic	novelGene_33234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	34.23813663154	6	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	83	1246	737245	753804	TRUE	65	TGGTAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQVGTVRKGGHFSMELTKQVILLYKSNKYFTCLNTLFWRVGLGTEERLELDRIKIWPGFFLRGALR	737162	755915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_754116_755178
708887	contig_5988_pilon	-	1719	13	Intergenic	novelGene_16047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	67.8613783139325	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	162	1361	1050018	1042346	FALSE	20	GGTAGTTTCTTTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLADRRQKREIRQLEQELHKWQVLVDSITGMSSPDFDNQTLAVLRGRMVRYLMRSREITLGRATKDNQIDVDLSLEGPAWKISRKQGVIKLKNNGDFFIANEGRRPIYIDGRPVLCGSKWRLSNNSVVEIASLRFVFLINQDLIALIRAEAAKITPQ	1052649	1041987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042433_1042547_1042676_1042844_1042933_1043068_1043152_1043345_1043426_1046440_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1052598
708891	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_94838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708892	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708895	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708900	contig_17059_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_166096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATCAATATTACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526133	526482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_526100_526500
708901	contig_17059_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_166097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527958	529574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_528000_529600
708905	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	806	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708909	contig_2257_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_122499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299720	302424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_299700_302400
708912	contig_15039_pilon	-	1679	16	Intergenic	novelGene_110104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	26.3910759327635	327	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	342	1529	163634	121358	FALSE	15	CCAACAGCCTCTCGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIRQSLLRYKREKPAEGQGDLIPPRKQRREQSMSFGLETTLNSFMGLGQAAWKEARALLQSLLSASEARLRDDMELRKSAFISQASATMHLPATIGDYTDFYSSRQHATNIGIMFRGKENALMPNWLHLPVGYHGRASSVVVSGTPIRRPMGQISPDDSKPPIYSTCKLLDMELEMAFFVGPGNKLGEPIPVSKAHEHIFGMVLMNDWSARDIQKWEYVPLGPFLGKSFGTTISPWVVPMDALMPFAVPNPVQDPRPLPYLCHDQPYTFDINLSVALKGEGMSRAATICRSNFKHMYWTMLQQLTHHSVNGCNLQPGDLLASGTISGPEPESFGSMLELSWRGTKPIELGNGQTRKFLLDGDEVIITGHCQGDGYRVGFGQCTGKVLPPFTPA	169593	121207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_121438_134004_134123_134849_134952_137891_137939_140603_140680_142436_142568_143556_143657_145457_145511_145619_145718_153248_153340_160156_160207_160720_160843_163180_163287_163620_163732_165562_165626_169412
708920	contig_18156_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_101454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61670	61214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_-_61200_61700
708926	contig_854_pilon	-	820	3	Intergenic	novelGene_36101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3331	junction_1	531.5	27	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	68	391	94569	91808	FALSE	15	GAACGAGCCTCGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVGWGLGPRGWALGGLRWTWA	94636	91378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_92043_93127_93208_94560
708928	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708929	contig_9389_pilon	+	1387	8	Intergenic	novelGene_83914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1116.00316362656	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	39	893	159587	167903	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANHLFLSRLDPELWGKGNQPPMVSGCIPSLPFSLKISLWFL	159548	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164507_165815_165933_166074_166222_167240_167357_167785
708930	contig_5698_pilon	+	3257	1	Intergenic	novelGene_55041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTGAGTTTTACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8213	11470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8200_11500
708931	contig_4364_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_3023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
708932	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
708938	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_89197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
708939	contig_10011_pilon	-	1838	4	Intergenic	novelGene_68114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1361	1735	332141	330730	FALSE	35	TATCTACCCCAAATATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGWSLSWPCGGVTESPGHTHLHKPPCWLALLGLQLTDELIKKSNVLGHAAAVLFPDLANGLTQLLQPGHKELLLFLQKLAQLLHLMPNLLLLGFSLFLGDGTGRGSGLCCGVNLCVQRVLTN	334203	330626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_331073_332109_332224_332411_332480_332993
708941	contig_18869_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_56050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73565	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
708952	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
708957	contig_6710_pilon	-	486	2	Intergenic	novelGene_98073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
708958	contig_7629_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_153600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTATTTAATACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410308	409209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_409200_410300
708959	contig_7629_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_153599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCCCTCTAATGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407952	407658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_407700_408000
708965	contig_11978_pilon	+	2802	1	Intergenic	novelGene_62843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCATCCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500945	503747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_500900_503700
708968	contig_15327_pilon	+	488	4	Intergenic	novelGene_70702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTACCAGCCCCCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900936	902154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_901035_901128_901281_901400_901518_902033
708972	contig_6654_pilon	-	2992	18	Intergenic	novelGene_85693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_10	81.3546212237736	10	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	475	2133	111686	99139	FALSE	75	TAAAAAAGAAAAAAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALEEEFTLSGVPLSAGPDGLLGVEPSDRTDQFLVTHSGRTVILYKVSDQKPLGSWSVKQGQIITCPAVCNFQTGEYIVVHDDRVLRIWNNEDVNLDKVFKATLSAEVCRIHSVQGTEPLVLFKKGAIRGLEALLAEPQQKIETVISDEEIIKWTKIFMVFKHPVLIFITEKHGNYFAYVQMFNSRILSKYTLLPGQEEKSAIQSFAASANRKFISLMSLSSDGCIYETLIPTHPSDREKNQVVVRSLLLKAVVSGDVRNGVALSVLDQDHIAVLGTPLSASKECLSIWNIKFQTLQASKDLLQGTSGQLWYYGENLFMLHGKFLTVIPYKCEVSSLAGALGKLKHSYEPGSHAVPHFVNWETSQEYGLGSQNSEQSRILRTRKVEVSLQPAVSASAQLLLTIKNDTEKHIEVELRKFLAIKQTPEFHTTIGDIVTGLLGRCKAEPSFYPRNCLMQLIQTHVLSYSLCPGLMEVALEKTDVQILQLCLQQFPDIPESVTCACLKIFLSIDDDSLQETDISTESVFDYSDTVRDEKMEEQTEIMENGFNPEEDNSNKEKPQGTTEETTLSPVTPKRAALLNAVLHSAYSEAFLLPHLKNIPAQHVTLFLQYLYFLYLKCSENATMTLPGIQPPTLNQIMDWICLLLDANFTVVVMIPEAKRLLINLYKFVKAQISVYSELNKIEVSFRELQKLNQEKNNTELYSIEVLELF	130791	98279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_99256_99423_99532_101466_101560_102065_102145_102576_102790_102940_103067_103179_103365_103822_103898_104401_104488_104966_105091_107018_107096_109212_109402_111222_111368_111644_111703_126505_126655_128623_128681_129399_129514_130653
708973	contig_12886_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_135464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAAAGATGTTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270221	273087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_270200_273100
708988	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
708990	contig_8262_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_166101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAAATGTTCCTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120166	118471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_-_118500_120200
708994	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
708995	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
708996	contig_1037_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_84588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGGGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143070	145609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_143100_145600
708999	contig_593_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_102026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502142	500704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_500700_502100
709002	contig_14513_pilon	-	1299	4	Intergenic	novelGene_70253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1373.54925487059	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	184	366	18880	14965	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRETLLLLKLHKLI	19063	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15003_18735
709003	contig_7909_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_155898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGAACATTTTAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398346	397578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_397600_398300
709007	contig_6735_pilon	-	1287	5	Intergenic	novelGene_15806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1756	junction_4	208.354265615082	207	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	88	555	564868	552772	FALSE	85	AAAAAAAAAAGAACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKVSDSSLPVLPTSNHAGHTNTRP	568285	552039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
709008	SIRV5	+	305	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-265	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGCTGTTTCGGGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
709010	contig_11145_pilon	-	865	7	Intergenic	novelGene_160516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	48	863	284014	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGRGGRVELWGLCMPLGCRAGSRRSLTMAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284061	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
709011	contig_12886_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_135518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAGGCACAAAGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651473	653788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_651500_653800
709012	contig_3193_pilon	-	2845	9	Intergenic	novelGene_126303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.8823384317286	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	910	2568	97267	46895	FALSE	20	CCTCAAAGGCGTCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDSESKQEVAMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVPMCTDPESRQEVPMCTDPESRQEVPMYTDPEFKLEVPMCTDPDIKQVTMSSDPEIKQQVTPCSDPEIKHEVTMVSDPEILEVARAHHVWGESYLVYNVMSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVDTLGLEDLQALIAQALCLQGKSTAQLVDLQLDHINPRAVQLGSLFVRGLTTLVFVNSACGFPLDMSDFMPWNIFDGKLFHQKYLQSEKGYSVEALLEQNRSLLMRFHSLKSVVVKACLRENRRIKSRQRWGSHHTGRAEPLWRSAPPSERGVDVASDVVSTCCVTCPHPAKTGHLQEESLLRHVLWGGGQRGGCRRHERLQHLSGPVNAEAATVVTTQNMPRPRPLSQGVCRWTVAHAQTCVQRQGTRAKEESSSLCVVLPWPGDPDHCP	98225	46617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47302_62913_63023_64886_65094_79015_79109_80133_80307_81725_81831_94139_94321_96883_97295_97343
709026	contig_18869_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_56322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73735	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
709034	contig_6710_pilon	+	518	2	Intergenic	novelGene_97902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAAGAGCACAGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653408	657518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653878_657469
709035	contig_3602_pilon	+	1259	7	Intergenic	novelGene_60513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	906.805565340957	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	58	351	161745	169216	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEATPRNDEPWREAD	161687	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168825_169175_169282_169422_170074_170940
709038	contig_14322_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_115966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671652	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
709041	contig_1275_pilon	+	920	2	Intergenic	novelGene_108825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	103	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	89	778	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746548	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
709042	contig_5671_pilon	+	1147	7	Intergenic	novelGene_79440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2227.61445023345	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	177	479	370430	521223	TRUE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQK	368852	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370420_370551_376738_376781_392775_392911_521218_521303_531209
709045	contig_10159_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_30809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCTTTAAAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414971	411947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_411900_415000
709049	contig_8954_pilon	-	2658	6	Intergenic	novelGene_130319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	74.9196903357188	81	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	187	1524	671463	655638	FALSE	35	CTGAGTAACCAGCTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTTPLTTQYVYRRIWEETSNYSIAFDSNISECEKNKSSPIFVLQKEVQKKVSLFSLQMDLSGLIPGVVSTFLLLSHSDHQGRKLPLVLSSVGALATSVWLCLLAYFALPFQLLIASTFIGALCGNSTTFWGACFAYIVDQCKEKRQKTIRIAIVDFILGLTTGLSGLSSGYFIRELGFVWSFLIVVLALTVNLIYILFFLGTPVRETPSQNVSMSCSEAFKNLFYRTYMLFKNISGKRKFLLCLLLFTMITYFLVIIGIFPVFILYELDSPLCWNEVFIGYGSALGSVSFVSSFLGIWIFSYCMDDIHMAFIGLFTTLGGMIMTAFAKTTLLMFLVRLLFIFMIVPLSVLRSMLSKVVCSSEQGTLFACISVLETLGGVLAVSAFNGIYSATVAWYSGFTFLLSAALLLIPAISLCIVKCTNWNEGSYVPLVQEESGEDASDR	682476	654503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_655723_658639_658797_662528_662613_664505_665377_671322_671547_682373
709050	contig_10437_pilon	-	1782	2	Intergenic	novelGene_38380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720849	638979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_639944_720031
709051	contig_18415_pilon	+	2163	8	Intergenic	novelGene_118310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	64.1970817570585	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	9	1043	280	49054	FALSE	30	CTTGAATGATTTGCATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGMTPLMHAAYKGKLDMCKLLLRHGADVNCHQHEHGYTALMFAALSGYKDIVWVMLEAGAETDVVNSVGRTAAQMAAFVGQHDCVTVINNFFPRERLDYYTKPQGLDKESKLPPKLAGPLHKIITTTNLHPVKIVMLVNENPLLAEAAALSKCYKVMDLICEKCMKQRDMNEVLAMKTHYISCIFQKCINFLKDGENKLDTLIKSLLKGRATDGFPTYQEKIVRESIRKFPYCEATLLQQLVRSIAPVEIGSDPTAFSVLNQAITGQVGFIDVEFCTTCGEKGASKRCSVCKMVIYCDQTCQKIHWFTHKKICKNLKDIYEKQQLKAAKEKRKEENDEKSLRGTNS	271	50174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_+_413_2117_2217_6425_6587_18367_18583_19426_19563_24154_24284_26318_26449_49022
709052	contig_11171_pilon	+	1854	10	Intergenic	novelGene_48571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	126.447275890969	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	24	1454	70574	106753	FALSE	30	ACACTGAGAGCCTCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKYNNRCLDGQPMKCNLHMNGNVITSDQPILLRLSDSPSVKKESELPRRVNSVSSSNPPAEFWQPKVHCQSSCFPFFLGYTKCPVPAVLAFWVSLLGGAALLPVPVWHGIHHTLGLVQMLAESTLHLLDFSDASRSLALWVWGII	70550	107153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710_105799_106498
709062	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
709063	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
709068	contig_16776_pilon	-	1340	7	Intergenic	novelGene_130533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_6	114.631898798817	628	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	42	971	129630	95984	FALSE	5	GCCGGCTGGGTATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLVQETGSHEEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEKDCFQLKEPACPENLNTWGKNPRDGLIGEMKWLSCKLQDCRASNASLDSPTGLGLLCSGSREEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEEDCFQLKEPSCPENLSTWGKNPQDGLIGEMKWLSCKLQDCRTSNASLDSPTGLGLLCSENTTILKSERKYNGLSSLGTAATAVSGSVGVVAFILLLVGLLSVTLKKWRHERLFKRQLRHQRNFLHQSLEPSCHADAIYSNVINLGPWKEEDFAIYANVPPFDRTRRTSPDQVEYASIVFH	129671	95614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96143_96385_96439_96955_97063_97348_97398_99707_99975_100905_101173_129602
709079	SIRV5	+	290	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	945	-30	-68	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGTTCGGTGAGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
709083	contig_6589_pilon	-	1916	13	Intergenic	novelGene_26258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_9	51.9524355112978	17	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	123	656	2233261	2230760	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKDFVPRDSAEAP	2233774	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228489_2228740_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
709096	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
709097	contig_9505_pilon	+	969	2	Intergenic	novelGene_121867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	149	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	200	514	652560	652874	FALSE	45	AACGAACAGAAATTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNSAVPRGGGEPGPGGGWGLHGRTGQALLRRCIAFPVVHWTPALPVSSALNLTHPPAPRTFHRAIPMPLSLTPLGEPCCC	650594	653329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544
709099	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91666	-7	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
709100	contig_12873_pilon	+	1820	6	Intergenic	novelGene_27168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	1104.4616788282	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	773	1264	17896	19855	FALSE	25	ACTCTATCTTGACTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15966	20411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
709103	contig_6710_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_94266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATGCACACTACAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
709105	contig_15063_pilon	+	1570	6	Intergenic	novelGene_14211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	2966.09646505302	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	100	1338	34808	39515	FALSE	30	TAAATGTGTATATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34708	39747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
709111	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709116	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
709117	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27889	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
709118	contig_7695_pilon	-	1328	2	Intergenic	novelGene_41644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	249	611	776764	776402	TRUE	20	CCATATCCTGTCACCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQLLICKFKLKLKKIRTSPREPKYDLEHIPPEFRDHLKNRVETLNTNHRRPEELLNDITDIIHEDSKKSLKRQERKKRPKWMSEETLKLALEHRAAKVKGRNDEVKELNRRFQRVAREDEIKYYNKTYKYLELENQKGRTRLAFLKLKELKKKFKPQFAILKASSGKILNDAGSNERRWKEYTQSLYKKELVDVQPFQEVA	777012	769824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_770211_776070
709120	contig_11548_pilon	+	174	1	Intergenic	novelGene_66810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTAAAGTTCATCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278273	278447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_278300_278400
709123	contig_3960_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_138029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGAAGATTTGTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531783	532899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_531800_532900
709125	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709129	contig_16303_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_34120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAGAAAAAAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40849	39919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_39900_40800
709131	contig_11413_pilon	+	2783	18	Intergenic	novelGene_103219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	185.214380602606	575	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	51	1805	829265	851369	TRUE	5	CATCTGCTGTGGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLPLPGTGPVEFTTPMKDYLPPPVDSDHKQGEPNDQPEWYVGAPVAYIQQIFVKSSVSPWPKNLLAVDVFRSPLSRAFQLVEEIRNHVLRDSSGTRSLEDVCLQVTDLLPGLKKLRNLLPEHGCLLLSPGNFWQNDRERFHTDPDIIGTIHQHEPKTLQTSATLKDLLFGVPGKYSGVSLYTRKRMVSYTITLVFQRYHAKFLGSLRARLMLLHPSPNCSLRAESLVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALAAVVTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSSESWSIMKNMATELGIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSDFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPPEACLPPAKPVGRPARHERQLAVRPSMPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVVYFLARTRLAQRLIMAGTVVWIGILVYTDPAGLRTYLTAQVTEQSPLGEGALAPMPVPSGVLPASHPDPAFSIFPPDTPKPAENQTSTGEPSGPMGPAEGVHDSPVPECRWLHLEPGAAGQPHRGGAEQWPPGGVGRH	829214	853578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_829337_839421_839580_840352_840574_840891_840998_841889_842063_842456_842584_844973_845087_846178_846274_847560_847660_847775_847995_848858_849138_851137_851214_851352_851439_852156_852240_852341_852509_852663_852745_852915_853123_853207
709132	contig_2215_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_163843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTCAAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126719	128644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_126700_128600
709135	contig_18800_pilon	+	1038	2	Intergenic	novelGene_110663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	709	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	9	335	782	2248	FALSE	10	TGTTGGCCTCCTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKRFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	773	2951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_893_2032
709136	contig_16907_pilon	+	1246	8	Intergenic	novelGene_87478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	35.535552763452	558	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	440	1042	530225	540528	FALSE	20	TGAAGTTATTTATTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKGKKRHSSSSSQSSEISTKSKSVDSSLGGLSRSSTVASLDTDSTKSSGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	524904	540732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525201_528591_528703_530192_530297_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
709137	contig_19851_pilon	+	776	5	Intergenic	novelGene_29869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3518.48777886182	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53560	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53614_54661_54717_55650_55753_55840_55882_56006
709139	SIRV7	-	245	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91675	6	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
709146	contig_8330_pilon	-	681	5	Intergenic	novelGene_71875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_4	390.159903116658	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	58	510	962626	950747	TRUE	30	CTGAAAATAGGTATTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAHTRLSFSLSLCAAIAVMLGAGLRRCAVAAAFRAGPRGLLHSAPAPSPAAAVQSVRCYSHGSHETDEEFDARWVTYFNKPNIDAWELRKGMNTLVGYDLVPEPKIIDAALRACRRLNDFASAVRILEVVKDKAGPHKEIYPYVIQELRPTLHELGISTPEELGLDKA	962683	947126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_947288_950736_950861_953221_953344_955449_955567_962526
709147	contig_4492_pilon	+	1934	5	Intergenic	novelGene_166114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	15.352117117844	469	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	115	654	394663	455596	FALSE	40	AGTTCTGTGAACTAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSHSADSVPYSVSSLALSAAGAGPCSFSAAQHLHIPTMAKTAMAYKEKMKELSMLSLICSCFYPEPRNMNIYTYDDMEVKQINKRASGQAFELILKPPSPVSEAPRTLASPKKKDLSLEEIQKKLEAAEERRKSQEAQVLKQLAEKREHEREVLQKALEENNNFSKMAEEKLILKMEQIKENREANLAAIIERLQEKERHAAEVRRNKELQVELSG	394548	456876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_+_394682_426611_426708_430567_430741_444213_444406_455536
709155	contig_10197_pilon	-	1958	4	Intergenic	novelGene_115265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.651803615609	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	860	1231	1107800	1107429	FALSE	30	ACCCCTTCGAACATACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDPGQGQFSYCWRQGLPWALFCCPQGALGLHRACRRSQEDPQQAGCLLKVSPFCLLPKQRSLPSTACPPHLGCMPTKPRLPEDKGLHCLQPPRLAPHLLPWPVRLPEEGRTHFLLLVLTPL	1114014	1106701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1108134_1109972_1110047_1112032_1112093_1113622
709157	contig_3866_pilon	+	2049	7	Intergenic	novelGene_112417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	61.2145589073565	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1709	2017	254285	254593	FALSE	5	GTGTATGTGCTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNHKSSNIGDMCEGALGHCIELGDVVGHFKFEGNICQSSSVSTCSHSTFILMPSSMKSWAVSGCCDKSKYCAKINVEQEVRLVASNLISKFEKLCSTHHCL	224222	254625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_224394_225367_225423_226925_227036_228056_228148_239657_239700_239790_239823_253077
709164	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68994	1	35775	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78963	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
709165	contig_4857_pilon	-	1833	5	Intergenic	novelGene_48643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	98.415890485226	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	242	616	445059	441598	FALSE	25	CAGACCTATAATTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKGCLTLYTGRGGELQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	447851	440380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444997_445070_447620
709174	contig_5928_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_40345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTGTGCTGTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3019	5367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_3000_5400
709180	contig_12964_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_131696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTCTAGTCTTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556450	555458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555500_556400
709183	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
709187	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709189	contig_14923_pilon	-	2087	2	Intergenic	novelGene_157755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	367	junction_1	0	117	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAGAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361440	358972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_360625_361005
709199	contig_15384_pilon	-	2077	19	Intergenic	novelGene_85145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	46.6085617101768	1	48	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	38	502	127943	125877	TRUE	15	ACAGAGCCTGGTTCTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRPSPGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDGGSVCVL	127980	118783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
709212	contig_6738_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_166138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCATTAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58119	55721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_55700_58100
709213	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709215	contig_16103_pilon	+	1470	2	Intergenic	novelGene_118812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACATCCTGTGTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604001	605575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_604067_604170
709221	contig_10003_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_88182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATTTAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442106	440441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_440400_442100
709222	contig_14441_pilon	+	1268	7	Intergenic	novelGene_100330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.228151525727	3	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	269	658	6011	113710	TRUE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTVATRRSTLERGRGSLS	5742	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_113659_113711_116578_116712_116865_116963_117220_117344_117539
709224	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
709238	contig_6446_pilon	-	2322	7	Intergenic	novelGene_149239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	11	junction_6	38.7789318516583	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	130	765	755040	504681	FALSE	10	CCTGTGTTAGAGTGTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYIRIVGTHNTVNKIFHIVAFECMFTNKTFTLEKGLIVPTENVATISDCASVIEGVSRSRNALLNGDTKNYDWDSGYTCHQLGSGAIMVQLAQPYMIGSIRLLLWDCDDRSYSYYVEVSTNQQQWTMVADRTKVSCKSWQSVTFERQPATFIRIVGTHNTANEVFHCVHFECPEQQSGQKEENGEDPGTGDTSLAEAPRHSSQGSSLPL	755169	503123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_504725_510179_510277_530676_530756_591664_591773_621183_621374_659798_659909_755032
709241	contig_2940_pilon	+	2554	3	Intergenic	novelGene_81902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	2	17	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453134	456994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_454855_455797_455928_456290
709247	contig_11338_pilon	+	1594	10	Intergenic	novelGene_6187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	524.66626664769	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	299	1594	6086	13589	FALSE	50	ATAAAAATTTCTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCMPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTL	2631	13589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9949_13249
709248	contig_5698_pilon	+	1568	5	Intergenic	novelGene_55043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2048	junction_4	183.364902584982	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	318	431	19257	19370	FALSE	15	GGCAGGTATTTGTGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	11133	20507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
709250	contig_12644_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_44495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAATTCACTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035915	1034956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1035000_1035900
709251	contig_12644_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_44494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAATGCTTTCAGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034822	1033760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1033800_1034800
709253	contig_14796_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_159369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125399	124792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_124800_125400
709257	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
709258	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709260	contig_9848_pilon	+	775	9	Intergenic	novelGene_79919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	139.33138330972	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	211	774	80009	90191	FALSE	35	AATACTTGAAACTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMA	58852	90192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_75091_75162_77678_77721_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104
709261	contig_11115_pilon	+	2211	10	Intergenic	novelGene_102864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	73.9315666221803	362	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	87	536	182087	184724	TRUE	10	GCAAGGCTGGCTGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQQRADGLALGGSHLRVSFCAPGPPGRSMLAALIAAQATALNRGKGLLPEPNILQLLNNLGPSASLQLLLNPLLHSNAGGKQGLLGAPPSHATAERASPVHGAAAAGPAVPGSEEAWHPGRLSPGPPPAWGPAGQPPPWRAVCRGGPAPGAATPEREAALPAQVPPAQPPHQRPPAP	182000	188148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_182120_182301_182432_182782_182879_183801_183890_184149_184195_184666_184765_185565_185641_186134_186268_186633_186718_186805
709263	contig_11719_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_154767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCCCATAGAGTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116840	115279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_115300_116800
709264	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	23	379	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14431	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
709269	contig_8020_pilon	-	2677	11	Intergenic	novelGene_114381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_10	53.3838927018253	8	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	165	1496	152275	148058	FALSE	0	CCCTGTCTCTCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQFWSAYVPCQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTPWAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	153287	146876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151258_151580_151708_152036_152321_153168
709270	contig_9375_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_136044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146525	148642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_146500_148600
709272	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709273	contig_6576_pilon	+	1971	3	Intergenic	novelGene_42412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	36	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	90	710	1301228	1303925	FALSE	40	ATACAATATTTCTCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPIRLYPSICAQTFVFTLVMLCSLHPHSVLLFPSPKKKEKISLYDLKCTFPSPSSPMNTGLSKCIYSCRLTKEGSYICPYMLDLFHLALCPPGPSIL	1295687	1305186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301555_1303631
709276	contig_10011_pilon	-	2016	8	Intergenic	novelGene_68043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.666553557267	972	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	117	845	194838	186602	TRUE	15	CATCCTATCTTTCCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTNNTAINFYENRDFKQHHYLPYYYSIRGVLKDGFTYVLYINGGHPPWTILDYIQHLGSALASLSPCSIPQRLYRQAHSLLCSFLPWSSISAKGGIEYSRTM	212616	184606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_185356_185704_185927_186401_186759_188132_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_212506
709277	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709278	contig_16703_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_72779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTATACTCAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32948	31339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_31300_32900
709282	contig_6710_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_94899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
709291	contig_1154_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_87125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGTACAGTAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446327	444617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_444600_446300
709296	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_97170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709299	contig_12000_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_43183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCCAGAGCGGAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536579	535769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_535800_536600
709304	contig_10331_pilon	-	1832	17	Intergenic	novelGene_54099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_16	223.359147101143	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	87	1670	355598	304759	FALSE	20	TGATTTTCTGATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTLTLDVFGRRVEVNGEHATVRFSGVVPPTAGLWLGVEWDNPERGKHDGSHEGTVYFKCRHATGGSFIRPNKVNFGVDFLTAVKNRYVLEDGPEEDRKEQIIIGNKLVETVGFDSIIKQQSQLSKLQEVSLRNCAVNGAGGKGGIAETCPNIRKLDLSRNLLSSWDEVILIADQLKHLDVLNLSENKLQFPSGAPSLTGTFSAMKVLVLNRTGITWAKVLQCVPGWPALEELYLESNNIFISERPTDVLQMLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQWSFINELDKLQSLHSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	371645	304596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312168_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_318866_320092_320196_321424_321525_325324_325414_332861_333045_350131_350217_355498_355627_371587
709305	contig_6557_pilon	+	2539	2	Intergenic	novelGene_32989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12783	junction_1	0	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434404	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_436772_439911
709308	contig_10437_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_38269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAAATTTAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414141	411779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_411800_414100
709312	contig_6589_pilon	+	1171	7	Intergenic	novelGene_26018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	651.148408582867	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	352	834	1728220	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725366	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1726987_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
709314	contig_6589_pilon	+	1380	11	Intergenic	novelGene_25732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	60.2494813255683	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	67	1239	460735	484044	FALSE	25	ATGGAGCACAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGKSQKRARVQDHGHVLLTQGQL	457290	484185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_467000_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843
709315	contig_13305_pilon	+	2227	18	Intergenic	novelGene_146777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	36.2889213555431	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1111	2160	175995	184637	FALSE	15	GTTTCAAGCTGTCACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVPAPACGTEPGKPQREGTKPKGPRTSPQELGKILQGVVVVLSGFQNPFRSELRDKALELGAKYRPDWTPDSTHLICAFANTPKYSQVLGLGGRIVRKEWVLDCHRMRRRLPSRRYLMAGPGSSSEDEGDSHSGSSGDEAPRLPHKPPQTTTKPPQAAGPSSPKRSPAPEETKPATPGAQEDSDAEGEPSEGQDNGAEDSGDTEDELRRVAKQRQQRQPPGQENEEDPYAGSTDENTDTEERPGSPTLPVPELPDFFQGKHFFLYGEFHGDERRKLIRYVTAFNGELEDYMSDRVQFVITAQEWDPSFEEALMDNPSLAFVRPRWIYSCNEKQKLLPHQLYGVVPQA	138600	184704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_138621_139031_139125_154914_155026_172847_173007_173987_174063_174163_174270_174485_174596_174671_174784_175278_175577_175968_176228_176565_176683_180626_180721_180885_181019_181600_181656_181737_181875_183844_183936_184340_184417_184523
709317	contig_12622_pilon	-	1615	12	Intergenic	novelGene_6039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	386.824452464931	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	209	1231	1690387	1685503	FALSE	20	CTTAAAACCCTGTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMPPTSPRLPSPCSPAS	1690866	1685118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685551_1685883_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690544_1690814
709320	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_97227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709321	contig_7992_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_115538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCCTATGTTAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589968	591997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_590000_592000
709323	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
709326	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709329	contig_2114_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_104327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAACAGTCTGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164224	1165712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1164200_1165700
709333	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
709341	contig_13044_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_100007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAGCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247193	246504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_246500_247200
709344	contig_7744_pilon	+	1292	10	Intergenic	novelGene_62556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	136.531731038052	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	286	855	889342	890785	FALSE	20	CTAAAAGCGTCGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879812	891222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882809_889108_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
709347	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
709348	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709349	contig_12414_pilon	-	2761	17	Intergenic	novelGene_59632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	836	1144	690313	683152	TRUE	10	GGAGCCCGCGCCCGGATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDLFSNRKASFTCLGWTSSQQCIRAIASESRIMLSSCRTVILHEDLVTPEPSLWRRRLYCSTMKSSDSLDICYLGFKLSCKEKISPDIVKGIDTINRILDS	696312	653053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_653122_655641_655787_657538_657650_659045_659297_660104_660253_660557_660709_661520_661669_663738_663890_678049_678186_679838_679947_681134_681298_683114_683244_684736_684899_690258_690395_690962_691121_693029_693170_695856
709360	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_93550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709373	contig_7202_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_16639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATCTTCCGCAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
709379	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	38	3262	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
709381	contig_1594_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_138839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACCAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645440	643184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_643200_645400
709384	contig_5999_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_45622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133318	135427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_133300_135400
709387	contig_1450_pilon	+	1157	6	Intergenic	novelGene_27406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.806296777269	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	260	961	350370	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	348966	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_349083_350226_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
709388	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	431	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
709389	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709390	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_18278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
709391	contig_14158_pilon	+	1758	5	Intergenic	novelGene_136122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	117.559293550106	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTGTTCCTGTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17982	26471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21152_21200_21301_24096_24236_25090
709394	contig_14744_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_66154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1679001	1676230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1676200_1679000
709399	contig_14441_pilon	+	913	6	Intergenic	novelGene_100549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.906497713021	15	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	376	651	116728	117335	TRUE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAALDPAQARHPERQCRGLGPCRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	111196	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111385_112115_112154_116578_116832_116905_116963_117220_117344_117539
709400	contig_665_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_158184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGACAGGAGATTATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66637	65034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_65000_66600
709404	contig_6227_pilon	-	3011	4	Intergenic	novelGene_49823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1135	junction_3	86.4111618304539	92	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	128	688	1409780	1378359	FALSE	65	AAAAAGCAATAGAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQGQPSFPF	1409907	1376035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
709406	contig_12079_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_67474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTGGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597980	598459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_598000_598500
709410	contig_13283_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_154016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48207	47470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_47500_48200
709411	contig_9225_pilon	-	1764	10	Intergenic	novelGene_160159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_8	24.1052220150544	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	22	1287	47449	20369	FALSE	25	GAATGTGTTAATGCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGARPPAMQAPKEETAAVLQGAGVGEEKEDVSQQAKERLNKTGNRQDNLGSTGCSKIRTMDLKFNNSRKYISITVPSKTQAMSPHIKSIDDIVVLGINLSRFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQELIFSVEGFKSYGWYLTLVQFGFYSIFGLIELQLIQDKRRRIPGKTYMIIAFLTVGTMGLSNTSLGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMLGGVFIQGKRYNVADVSAAVCMSLGLIWFTLADSTIAPNFNLTGVILISLALCADAVIGNVQEKAMKLHNASNSEMVLYSYSIGFVYILLGLTSTSGLRPAVTFCSRNPVRTYGYAFLFSLTGYFGISFVLALIKIFGALLAVTVTTGRKAMTIVLSFIFFAKPFTVQYVWSGLLVVLGIFLNVYSKNMDKIRLPSLQGLINKSVDERKSRMLAQTV	47470	19891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_20520_21666_21737_25587_25700_26119_26213_29397_29496_30632_30741_32028_32184_35968_36091_39243_39535_47383
709421	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
709424	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709425	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_96666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
709435	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	28	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709443	contig_1618_pilon	-	1644	9	Intergenic	novelGene_141796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	316.550154004069	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	401	1228	341041	317005	FALSE	40	AAACTTGATGAAAACTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRWTRWRRGPLPLSPTRGGDRPGAGRRSCSGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEVRLISERACSKQTLSALKLDCKTEVNISDKLAIVDEWRKEMGLCWKEVAYLGNEVSDEECLKKAGLSGVPADACSTAQKAVGYICKCNGGRGAIREFAEHIFLLMEKVNNSCQK	353757	316588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_327214_327369_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491_353584_353666
709447	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709456	contig_3602_pilon	-	2180	2	Intergenic	novelGene_60619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAACACCAGCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914919	912555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_913394_913577
709458	contig_7308_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_159598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488328	485617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_485600_488300
709465	contig_9708_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_67243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCAGTTTGCCAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19849	18037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_18000_19800
709466	contig_14745_pilon	+	2624	7	Intergenic	novelGene_147850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	45.9374574829735	203	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	45	1244	54406	75694	FALSE	15	AACCAGTTTTTCTGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLACQGAGGGGSSTMSLQYGTEDAPLAGSYGAADSFPKDFGYGVEEEEEEAAAAGGGVGAGAGGGCGPGGADSSKPRILLMGLRRSGKSSIQKVVFHKMSPNETLFLESTNKIYKDDISNSSFVNFQIWDFPGQMDFFDPTFDYEMIFRGTGALIYVIDAQDDYMEALTRLHITVSKAYKVNPEMNFEVFIHKVDGLSDDHKIETQRDIHQRANDDLADAGLEKLHLSFYLTSIYDHSIFEAFSKVVQKLIPQLPTLENLLNIFISNSGIEKAFLFDVVSKIYIATDSSPVDMQSYELCCDMIDVVIDVSCIYGLKEDGSGSAYDKESMAIIKLNNTTVLYLKEVTKFLALVCILREESFERKGLIDYNFHCFRKAIHEVFEVGVSSHRSCGHQTSAPSLKALTHNGTPRNAI	54361	77074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_54643_56794_56999_57986_58187_59711_59827_61815_61959_65463_65613_75542
709468	contig_7440_pilon	-	1293	10	Intergenic	novelGene_61169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	372.821077134268	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	343	852	66382	54265	FALSE	15	CCTTTCCCCTGAATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69531_72915_73011_74478
709472	contig_6710_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_98253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653509	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
709473	contig_6710_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_96069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCACTTGCTGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
709476	contig_10855_pilon	-	2038	4	Intergenic	novelGene_124392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.88561808316413	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	125	1234	907863	896213	FALSE	20	CATTCGTTTGTTGCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVLEDVAVNFTREEWALLNAAQKNLYKEVMLETFQNMASVGSCAQIKTRTSSPQQGIFGNELSNGEKIISFLTNDSWSNLEEKGKLHNIEDQPQIQETNLREHVSGHRGQKIPSCEVCGKTFRHSSSLKLHLRRHSGEKPYECNECGKAFNCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFSFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTCYSSLHGHERIHSKQKPYECKQCGKAFSCPKYFRQHVNMHSGEKPYECKQCGKVYSMSTNLQQHMITHSAERPYECTQCGKAFRWPTSLRLHMKTHSSEKPYECKQCGKAFIFPSCFQRHERTHSKEKPYECMHCWKAYKCLKSLQGHLRKHTGEQPSE	907987	895408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_897012_897368_897550_898822_898950_907860
709477	contig_15025_pilon	+	2471	8	Intergenic	novelGene_155974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	31.4389593222375	133	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	222	1214	57827	98127	FALSE	15	TTTTCTTATGGCATTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDKNQTCAAGQDSMPYMICLIHILEEWFGVEQLEDYLNFVNYLLWVFTPLILLILPYFTIFLLYLTIIFLHIYKRKNVLKEAYSHNLWDGARKTVATLWDGHAAVWHGYEVHGMEKIPEEGPALIIFYHGAIPIDFYYFMAKIFIHKGRTCRVVADHFVFKIPGFSLLLDVFCALHGPREKCVEILRSGHLLAISPGGVREALISDETYSIIWGNRKGFAQVAIDAKVPIIPMFTQNIREGFRSLGGTRLFRWLYEKFRYPFCPMYGGFPVKLRTYLGDPIPYDPKMTAEELAEKTKNAVQALIDKHQRIPGNIMSALLERFHKKQKIN	48292	99384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_48403_57127_57169_57756_58152_70993_71162_73538_73733_89957_90019_92546_92687_98022
709484	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709487	contig_11815_pilon	+	2437	1	Intergenic	novelGene_50881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAACAGTTCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38561	40998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_38600_41000
709489	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_94833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
709490	SIRV7	-	905	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70885_70988_78841_78964_114686_114961_147608
709491	SIRV4	+	332	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	650	966	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATAACTTTAACCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
709492	contig_10765_pilon	+	1953	6	Intergenic	novelGene_122852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	184.179912042546	4	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	151	1314	18249	28938	TRUE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPNSAWSES	15616	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19389_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
709495	contig_5696_pilon	+	2786	1	Intergenic	novelGene_117610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATATTTAATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931352	934138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_931400_934100
709496	contig_4900_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_159041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCTTCAAAAACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182582	181786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_181800_182600
709497	contig_2365_pilon	+	1991	5	Intergenic	novelGene_103744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	307.095567372764	187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	57	692	179760	212260	FALSE	80	ATGATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRKKSKEAEKSATSSQQMALRELASVETNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQV	179703	213559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_179788_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137
709498	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
709500	contig_9218_pilon	-	2332	11	Intergenic	novelGene_157679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCATTCGAGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304479	260766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_260880_264799_264989_265208_265309_279855_279996_280262_280305_290831_291001_291154_291298_292786_292895_295644_295779_302967_303096_303413
709506	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
709512	contig_5967_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_44413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTACATTATACTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444758	444152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_444200_444800
709518	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709523	contig_10734_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_51303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	369.463800662528	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	284	673	1377357	1388936	FALSE	10	AGTGTGGGTGTCTCTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCALFLRRQSRPRCPAALRSLASPLQPEVGRLPPPWSGRRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368726	1389498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368847_1369474_1369602_1377320_1377453_1378533_1378631_1388739
709526	contig_11338_pilon	-	2257	16	Intergenic	novelGene_6293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_13	213.913523545276	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	544	2082	227968	196726	FALSE	20	GATTTCTCTTTGCTATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	250594	196550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_244695_244747_249573_249784_250509
709527	contig_9424_pilon	-	989	6	Intergenic	novelGene_143770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1677.68824279125	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	20	505	280461	272692	FALSE	15	GTGCCGTGGAGTCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWAAEMPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGHYESESTPPQRVWFVVAVRPWACYRAEDSRPASPRFKSASGALVVQWLKCSTAN	280480	272207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_272736_274435_274560_278586_278762_279552_279629_280079_280144_280458
709544	contig_7396_pilon	-	1798	16	Intergenic	novelGene_79640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3000.14819337682	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	161	1453	254680	246442	TRUE	30	ATGCTCTTTTGTAAGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYDYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257073	245987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246056_246164_246476_247186_247357_247718_247802_248201_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254697_255105_255191_257014
709545	contig_16204_pilon	-	1747	8	Intergenic	novelGene_154482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_7	138.419504347016	736	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	659	1561	205576	197969	FALSE	25	CCATGGTCGAGGACAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAAFFGISANLVLYLNSKNFNWAGHQASRAALVFLGASYLLAPVGGWLADVYLGRYLALALSLLLYLGASGLLPATAFPDGRRSFCGEVPVTPIGPACPSSHCPHTPPSPYCAPTLYAALLLLALAASSVRTNLTSFGADQVTSLGRSATHRFFNWFYWSLNLGAVLSLLVVAFIQQNISFLLGYSIIVGCVGLAFFIFLFSTPVFIIKPPTGSQVSSMLKLALRNCCPQLCCRYSARDPQGAQLLPDQRSPQPGASPQEDVTNFQVLVKILPIMVTLVPYWMVYFQMQSTYVLQGLHLQIPNIFPVNPANSFTALRTQPNSYTIPEAWLLLANVVVVLILVPLKDRVLDPFLLRHKLLPSALKKMALGMFFGFTSVIVAGVLEMERLDYIHHNETVSQQIGQDLYYAAPLSIWWQIPQYLLIGISEIFASIPGLEFAYSEAPRSMQAAIIGIFFCLSGVGSLLGSSLLSLLSLPGGWLHCPEDFGNINNCRMDFYFFLLAGNPSCHILPISLDCWPL	210267	197782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_198070_198530_198687_200099_200259_202329_202499_203202_203314_204771_204920_205517_205808_209840
709547	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
709548	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
709561	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709563	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
709565	contig_4678_pilon	-	2322	14	Intergenic	novelGene_126055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_5	51.6807450438171	7	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	354	1430	577200	572868	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKGQGGACIGTDPAATAAPS	578010	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
709569	contig_3900_pilon	+	2198	3	Intergenic	novelGene_84187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1407	2120	232078	249214	FALSE	5	TTGTCTCCCTTCTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYLRDEKMPRITIHICHFSQSLSTEEVSLFYLCSLLRFFFPFSLSEKFFFSNKELGKCCQHATDYYVTYMLVTCTIPKICAFSFFLFLSFPLSSSALLHSLEGQVLSLREVEGRRRPPSQILSACSGGDPRPADRKRQWHRPRGPAGNEFRARQICCCCQTSRRRGLQRPEVSATAGTLLAPEPSLWSLEVRRLPRLVAGVAAVGPGGRVTAELPPDLRASLRPRPEALRDLGGGT	230671	249292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_232165_242268_242486_248804
709571	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
709580	contig_8954_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_130254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAATAAATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38943	37498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_37500_38900
709590	contig_14322_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_116354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671905	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
709596	contig_7398_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_166166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAAGACATATATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170774	168783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_168800_170800
709599	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
709604	contig_4783_pilon	+	2796	1	Intergenic	novelGene_108402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGCTAAAAGTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281726	284522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_281700_284500
709608	scaffold_19766_pilon	-	1281	5	Intergenic	novelGene_34368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	151.417469269566	1028	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	15	989	678396	676963	FALSE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLPVMRTETQVLSPVAPEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQDLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHWSVPRLLPPHTSPWTQRRAQPAGQTSRASLHIPYTTVNTNYFCPAALEMAHHHQQLSRWPPLPIPTTSQTQALAPWAPLPASAHSSFISVENVLYAQAGGSPPHSGPGSPNLIPFPDPLEPKPRRNA	678410	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677548_677670_677786_678138_678275
709609	contig_1146_pilon	+	461	5	Intergenic	novelGene_84854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4074	junction_1	2080.05076560646	231	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	30	422	950980	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	949779	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951113_951651_951732_956017_956104_957038
709610	contig_5445_pilon	+	820	4	Intergenic	novelGene_135410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1376.78909867206	29562	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51590	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53393_53646
709612	SIRV6	-	341	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACGATTAGGCGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11745	11404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11700
709617	contig_1275_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_108797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	19	318	506052	505753	NA	50	CACTACAAAAGAACTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFTFWLIIYDHLNTRNLQSLIIVLLILKLVRRHSSCSSSNNNSFVEDLPCFQNFTQVLTGNWVSFVCPSRTILVTCVYRCMCMYRQFISCFINKVDI	506070	504411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_504400_506100
709618	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709623	contig_7457_pilon	-	1275	4	Intergenic	novelGene_31711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	130	471	1176842	1174926	FALSE	25	TTCAGAAACAGCTGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176971	1174121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
709627	contig_10323_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_123562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGCTCTTAACCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358336	359766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_358300_359800
709628	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
709632	contig_7171_pilon	-	1754	16	Intergenic	novelGene_101415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_13	25.0631203165129	40	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	150	1412	1458213	1451349	FALSE	15	GAGCTTTGTGGATCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQELTQLGEQIQRLEEEKGAVAEAVRALLENQDKDQVQQHPQYQSLRARGREIRKQLNSLYPKEAQLKEQFYLRALRLPNQTHPDVPVGDESQARVLHVVGDKPAFSFQPRGHLEIGEKLDIIRQKRLSHVSGHRSYYLRGAGALLQHGLVNFTLNKLVQRGFIPMTVPDLLRGAVFEGCGMTPNANPSQIYNIDPSRFEDLNLAGTAEVGLAGYFMDHTVAFRDLPVRMVCSSTCYRAETDTGKEPWGLYRVHHFTKVEMFGVTGPGLEQSTQLLEEFLSLQMEILKELGLHFRVLDMPTQELGLPAYRKFDIEAWMPGRGRFGEVTSASNCTDFQSRRLHILFHTDDGELRFAHTVNATACAVPRLLIALLESYQQKDGSVLVPPALQPYLSTDRITAPAHVPLRYIGPNQPRTPSS	1462674	1451006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451621_1452054_1452148_1452232_1452327_1453350_1453461_1453537_1453626_1453710_1453757_1454009_1454119_1454324_1454373_1455041_1455148_1455380_1455445_1456373_1456429_1456508_1456650_1457388_1457419_1458123_1458220_1462531
709633	contig_7457_pilon	+	2465	13	Intergenic	novelGene_31566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	54.033682910652	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	165	734	859879	862434	TRUE	45	TAAAAACAGCTTCATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDKAKVVVLVNRVHLVTQHREEFSRMLDGRWAIATLSGDMGPRAGFGHQARSHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELSDFSLLVVDECHHTHKDTVYNIILSRYLEHKLRRVWPLPQVLGLTASPGTGGASMLSGAIDHVLQLCANLDTWRIMSPQEHQPQLQEHIRQPCKQYDLCQQRSQDPFGDLLKKLMDQVHDYLEMPELSRDFGTQIG	859535	867790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859661_859839_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862164_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_865537_865734_865911_866031_866783_866881_867222
709635	contig_5039_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_64995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688014	1689690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1688000_1689700
709636	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_94668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709637	contig_15036_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_107145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGAGAACAGGATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46056	45404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_45400_46100
709641	contig_1575_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_45174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATTTAAAATCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105362	104174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_104200_105400
709650	contig_10953_pilon	-	975	7	Intergenic	novelGene_42595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGGCCCCACGGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464251	459369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_459520_459698_459778_460338_460401_461121_461222_461548_461636_463463_463526_463816
709657	contig_6375_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_72939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	267.718394752563	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	103	810	22477	29870	FALSE	20	GCTGGCAGTGATGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHLAPHVYVTAEECGSQDPPVSPEQVSGPICILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDGCCCPTLCLSSGCLSQGHSSVSFLAPAFSQLGGLWACLCALG	20934	30373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_20997_22327_22359_22467_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28048_29741
709659	contig_12977_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_122809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTGACAACTATACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65084	65816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_65100_65800
709662	SIRV2	-	624	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	35	2958	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
709664	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709666	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
709669	contig_3155_pilon	-	2537	17	Intergenic	novelGene_26325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_6	24.3810889830623	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	10	1875	83803	48868	FALSE	10	GCTTTTCTTGAATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGCGSVGQSRECRELADLALAPGKWSCRRGGSLLGGCGAESYSKDTGTPVSIMVLGAEQKMPDDNASGDHGDTASLGAINPAYSNSSLTQSTGHSEEPFTTYFDEKIAIPEVEYSCFSFRKLWAFTGPGFLMSIAYLDPGNIESDLQSGAVAGFKLLWVLLLATIVGLLLQRLAARLGVVTGLHLAEVCHRQYPKVPRIILWLMVELAIIGSDMQEVIGSAIAINLLSVGRVPLWGGVLITIADTFVFLFLDKYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVTVKPSQSQVLKGMFVPTCSGCDTQQIEQAVGIVGAVIMPHNMYLHSALVKSRQINRANKREVQEANKYFFIESCIALFVSFIINVFVVSVFAEAFFGKTNEQVVQVCKNTSIAWTGLFPDNNSTLTVDIYKGGIVLGCYFGPAALYIWAVGILAAGQSSTMTGTYSGQFVMEGFLNLRWSRFARVILTRSIAIVPTLLVAIFQDVQHLTGMNDFLNVLQSLQLPFALIPILTLTSLRPVMSDFANGIGWRIAGGILVITVCSINMYFVVVYVQELGHVALYVVAAVVCVAYLSFVFYLGWQCLIALGMSFLDCGHTYHLGLTAQPELYLLNTVDADSLLSR	83812	48205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_48946_54610_54665_56516_56671_61109_61184_61623_61774_61928_62049_63201_63289_64439_64599_65464_65621_66761_66830_66955_67027_67553_67661_69829_69950_70306_70433_70992_71142_73248_73321_83682
709679	contig_14322_pilon	-	327	2	Intergenic	novelGene_116517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTACTCTGTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674863	672799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
709688	contig_7457_pilon	+	2261	7	Intergenic	novelGene_31517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACAGCCCCCCAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673517	678935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_673859_674074_675452_676860_676967_677220_677278_677986_678141_678612_678743_678839
709689	contig_6175_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_16325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	793	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494178	1492291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1492300_1494200
709691	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_97713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709692	contig_12939_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_166202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	105	344	46685	46446	NA	10	GCTTTAGTGTTGTCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVLCSSSEVVASVPSRRFEVRGPGGGARGRGELMGLGRRGSAGLRESRLDAREPRGWAFRRHKGAETRLPEARGPGTPDLGPGRTQVRRCGVGEVSGRPSDWGAWGPERHGG	46789	45217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45200_46800
709700	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	72	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709707	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	100	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
709708	contig_10531_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_114539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAGAAAGATGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498124	497077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_497100_498100
709719	contig_10500_pilon	-	1965	5	Intergenic	novelGene_41180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_4	191.386225993408	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	137	646	1345339	1327636	FALSE	15	ACATTTTTTCTCCTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGYGGF	1409680	1326316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1409548
709721	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709722	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
709723	contig_6031_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_56732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGATATATTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153805	155891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_153800_155900
709725	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
709727	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
709728	contig_7202_pilon	-	395	2	Intergenic	novelGene_18599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTGATGAAGCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30103	28544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
709731	contig_9727_pilon	+	1803	1	Intergenic	novelGene_86327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365298	367101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_365300_367100
709733	contig_11989_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_68466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAACAAAGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182305	182026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_182000_182300
709745	contig_9505_pilon	+	1278	12	Intergenic	novelGene_121860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	219.97730912284	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	14	673	536915	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLKMARPLRRTWKATWEDGDICQTREMSVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	536901	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_536991_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
709748	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
709751	contig_2078_pilon	-	2514	13	Intergenic	novelGene_100186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	67.9380334487899	2	111	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	726	2123	531872	505518	FALSE	5	CATTTTGTTTTCTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535423	505126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532518_533247_533475_535329
709754	contig_14142_pilon	+	1600	16	Intergenic	novelGene_120593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	624	968	589407	591104	TRUE	25	CCACACTTCTAGACAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNQRLLQVLNALLARLKRCPSMTRPPVPSFRLGSGSSPPSSFCFSSTCLCSMSLFSRAEFKTSCCNCAPSSLRYWPSRLSSSWPCWKWTAWASTKRSTNSMMSNFLLSSITLI	584543	598606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_584736_585024_585075_585460_585539_588574_588615_588713_588837_589169_589272_589368_589422_590496_590606_590677_590754_590850_590944_591052_591106_591238_591423_592013_592066_592148_592203_592408_592532_598388
709755	contig_9727_pilon	-	1500	13	Intergenic	novelGene_86376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	239.088663237906	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	72	1265	598065	578319	FALSE	45	TAATATGGAAAGAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEPACQGHPFTPAWRDFPSVGTMLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	624123	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_624064
709757	contig_10877_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_166214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTTTCTACCCTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77670	76367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_-_76400_77700
709758	contig_4759_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_106350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	39.9311908162028	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	20	475	991935	985547	FALSE	30	GAATTGGTAATTAAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERCVSNLMVCNLAYSGKLEELKETILADKSLATRTDQDSRTALHWACSAGHTEIVEFLLQLGVSVNDKDDAGWSPLHIAASAGRDEIVKALLGKGAQVNAVNQNGCTPLHYAASKNRHEIAVMLLEGGANPDAKDHFEATAMHRAAAKDT	991954	984480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_985555_987919_988008_988100_988248_989174_989274_991821
709760	contig_8330_pilon	-	1841	9	Intergenic	novelGene_71742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	32.7411724744243	14	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1107	1730	519774	515388	FALSE	10	GCTCTCTGCTTTGTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	526226	515276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_520465_521229_521313_524730_524851_526013
709761	contig_2069_pilon	-	1289	6	Intergenic	novelGene_23437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	7	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331453	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
709763	contig_9706_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_20954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCAGCTGAGCTCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290416	292018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_290400_292000
709764	contig_13760_pilon	-	1750	7	Intergenic	novelGene_61295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	255.436880657434	20	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	85	1401	194443	161782	FALSE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRIGAERGTDFHSTPGTL	194527	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161834_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
709765	contig_14191_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_153759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAGAAAACCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17393	16855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_16900_17400
709776	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
709783	contig_9515_pilon	+	1419	9	Intergenic	novelGene_73811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	290.291986627258	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	907	1296	68341	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57283	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
709798	contig_12450_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_162327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411477	409854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_409900_411500
709810	contig_165_pilon	+	2037	2	Intergenic	novelGene_117070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	497	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGGAGTGTTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68498	72442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_69716_71622
709811	contig_1406_pilon	-	1745	5	Intergenic	novelGene_25533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	752.576075888677	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	116	424	2159494	2143573	TRUE	15	CTTCAGTCTCATTCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDILHTDLEKLW	2159609	2136615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139844_2139972_2143216_2143606_2147746_2147920_2159391
709814	contig_7080_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_100114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATCGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519134	518633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_518600_519100
709819	contig_4769_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_117982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCCCAAACTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441870	442171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_441900_442200
709823	contig_14322_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671641	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
709825	contig_6048_pilon	+	167	1	Intergenic	novelGene_73186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCACTGAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354489	1354656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1354500_1354700
709830	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
709832	contig_7457_pilon	+	1172	4	Intergenic	novelGene_31713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCGGAGGGGCGGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174128	1176982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174971_1175539_1175642_1175967_1176015_1176801
709833	contig_13048_pilon	-	970	3	Intergenic	novelGene_138944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCGAACTTTTTTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531999	530420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_531157_531658_531725_531831
709838	SIRV4	-	405	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGAATTGTCTTAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2359	1593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
709842	contig_5988_pilon	+	1875	5	Intergenic	novelGene_15873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAAGGGATTACATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387158	391745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_388062_388498_388671_390317_390432_390652_390806_391212
709843	contig_7816_pilon	+	1212	9	Intergenic	novelGene_66497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1465.79555510822	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	433	1101	207600	211658	FALSE	20	TTGTCCCCAAAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYQSLPESPPPPLRLCILVFPIQEEDPGDSPAGGRPLSGHCQHPHAHPAQLQSGGQDSHPQGLRAGPGQAGPRQRPHHRPGWGHQEFHLLRAFQKGAPGPLHRVLHCRAEHGVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170079	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170146_195846_195950_196744_196912_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
709844	contig_16643_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_158133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACATGCTTAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298521	300813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_298500_300800
709845	contig_15474_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_136228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCATATGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39571	37546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_37500_39600
709846	contig_10135_pilon	+	1089	4	Intergenic	novelGene_106645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7039	junction_3	1038.77406376726	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	98	349	116715	119273	TRUE	30	TCATTCATTCATTTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLWSGNCSLSTYSCALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEVWILPPLDVNCFSDFQPFWDSSLGV	116617	120174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119641_119801
709856	contig_8772_pilon	+	991	6	Intergenic	novelGene_21126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5131.58644475566	6	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	309	578	20497	21997	TRUE	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESSSASSKLFFPESAGNQSGFTPSG	19202	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_19364_19996_20123_20475_20697_21483_21523_21966_22053_23063
709857	contig_9366_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_166241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCTAGCAACAGCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827412	825092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_825100_827400
709859	contig_18735_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_132682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTCCTCAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73729	74889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_73700_74900
709861	contig_7457_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_31266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAAGCCAACCAGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30200	28131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_28100_30200
709862	contig_7338_pilon	-	1885	9	Intergenic	novelGene_156788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	67.8489821220628	118	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	73	1575	123199	27469	FALSE	10	CTCTGTCTCATACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFICGLPCATRNCVFFRFNSLASWRKYNTLSVSLQGRRVQMSYIVNKYQGLRVSQRDRFTFLPGNFHFYRTFNNKITGCLESTKSKEIWRITCRCTSWNDSFSRRLLVKEVVVLPTFSVLYSVNGFPIREIRSFHTSPRFQAAPVPLLLIILKPVQKLLAVIVGRGIRKWWRALPPNKKELFKESVRKNKWKLFLGLSSFGLLFVVFYFTHLEMSPITGRSKLLLLGKEHFRLLSELEYEACMEEFKNDMLTEKDARYLTVKEVVCHLIECNKDIPGISEISWVFHVVDSPDINAFVLPNGQVFVFTGLLNSVTDIHQLSFLLGHEIAHAVLGHAAEKASLVHLLDFLGLIFLTMIWAICPRDSLAILGQWIQSKLQEFMFARPYSRTLEAEADEIGLLLAAKACVDVRASSVFWQQMEFADRLYGHPKLPEWLSTHPSHENRAEHLDRLIPQALKIREICNCPPLSGPDPRLRFKLSMKHFLEESEKEDLNSTVKKQK	137893	27158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_27610_53883_54034_101598_101674_105841_105971_109945_110054_110149_110324_120527_120757_122702_123219_137840
709863	contig_10003_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_88185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445652	447970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_445700_448000
709864	contig_10531_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_114530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACAAACAAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465909	465693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_465700_465900
709871	contig_10163_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_82645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTCTAAAGAATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163599	163196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_163200_163600
709886	contig_3525_pilon	-	1363	5	Intergenic	novelGene_135141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_4	60.673305497558	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	96	812	609659	602655	FALSE	45	TTCAATTCTAGGAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATPDWSAASFFCPGLCSVRCTPRKRVLARFMARFWVCAAGAGFFLTFLVLHSCFCGSPILRNFVFQISWTTENILYRLDVGWPKYSEHFTGTTFCVAVDSFNGLVYVAQRGDNMPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVKMQHSFVWDCV	609754	602103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_602786_605990_606192_608457_608606_608885_609039_609575
709887	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_94835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
709892	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
709905	contig_12638_pilon	+	2262	3	Intergenic	novelGene_33249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	7.5	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1417	2226	759225	764546	FALSE	30	TAAACAAATCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDCCPPDNHFSLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	757808	764582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_759412_762088_762211_764045
709909	contig_4519_pilon	-	2511	8	Intergenic	novelGene_123737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	27.5725388377491	9	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	503	1219	802412	763354	TRUE	25	ATGTGAAAATGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAVMIPGLLRGSVGTTCTRAALLRLTPRSLRHLTLTSVMKSKRKTDHMERTADVVRREVVSTAKVCGAANESPSVKRLHLLVAEKDFSFKAGQWVDFFIPGVSVVGGFSICSSPRLLEEERIIELAVKYTNHPPALWIHNQCTLDSEVALRVGGQFFFDPQPTDASRNLVLIAGGVGINPLLSILRHSADLLRERANKGSGFEIGTIKLFYSAKNTSELLFKVRGRGKRMFHSLP	810719	761378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_763639_768630_768773_788185_788293_801943_802008_802293_802421_804667_804820_810377
709911	contig_9054_pilon	+	2826	1	Intergenic	novelGene_160677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAGAAAAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462157	464983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_462200_465000
709915	contig_3386_pilon	-	1384	1	Intergenic	novelGene_34487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTTTGTTTACCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297229	295845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_295800_297200
709916	contig_11681_pilon	+	2761	3	Intergenic	novelGene_102966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	24	517	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	215	2581	163570	165936	FALSE	20	TGATATGTTGTTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	111110	166116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_111175_161361_161445_163502
709921	contig_12638_pilon	+	1589	13	Intergenic	novelGene_33156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	169.725431866359	66	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	56	1054	269238	271285	TRUE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDS	235620	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271286_273804_273999_274124
709922	contig_7594_pilon	+	1684	8	Intergenic	novelGene_55422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_6	728.098053499804	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	631	1014	561547	566248	FALSE	20	CCTACTGTCTTATTGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	538983	566918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_561539_561752_566069
709925	contig_7457_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_31544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTATCTAGCTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772639	774423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_772600_774400
709927	contig_7202_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_18564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTACCTTTACCTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28170	27716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
709928	contig_5827_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_129799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAGTCAGAACAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459438	458268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_458300_459400
709936	contig_19899_pilon	+	1382	4	Intergenic	novelGene_102506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	22.5289936649544	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	303	908	134511	135116	FALSE	10	TGCGTTGTTCTTTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFVILGNKVDISERQVSAEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAARRVLATEDRSDHLIHTDTVNLHRKPKPSSSCC	115520	135590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_115674_130681_130771_131207_131235_134477
709944	contig_5718_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_110345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAGAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603427	600841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_600800_603400
709955	contig_7318_pilon	+	1935	10	Intergenic	novelGene_152228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	68.8144759390452	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	17	1423	277723	314909	FALSE	15	TAGTTAAGTCTCCTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQALALLREMSRLEAPLEELRALHSVLQAVPLSELREQVAEMHLGPLFSLLNQNHREQTALCVSILERLLQAMEPVHMARNLQVDLQRGLTHPDDSVKILTLSQVGRIIENSDAITEILNNSELLKQIIYCIGGENLSIAKAAIRSLSRVSLTQAGLEALFESNLLDDLKSVMKTNDVVRYRVYELIVEISSVSPESLNYCTTSGLVTQLLRELTGEDVLVRATCVEMVTSLAYTHHGRQYLAQEGVIDQICERYPVFVEKVFEMTESQDPTMIGVAVDTIGILGSSVEGKQVLQKTGTRFERLLMRIGHQAKNASTELKIRCLDAISSLLYLPPEQQTDDLLRMAESWFSSLSRNPLELFRGISNQPFPELHCAALKVFTAIANQPWAQKLMFHSPGFVEYVVDRSVEHDKASKDAKYELVKALANSKTIAEIFGNPNYLRLRTYLSEGPYYVKPISTTAVEGGE	277706	315421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_277896_291587_291733_292820_292935_293282_293412_304922_305033_306903_306989_307846_307989_309165_309276_311753_311895_314651
709963	contig_12079_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_67496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAATAAAAAGAAATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827926	827583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_827600_827900
709964	contig_12079_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_67495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGTAGATTAGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827128	825424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_825400_827100
709967	contig_15407_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_123107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACATATAAATCAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601483	600530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_600500_601500
709980	SIRV5	+	478	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-151	878	-37	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8164	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
709981	contig_1986_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_64124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	106	318	262646	262858	FALSE	60	AAAAAAATACCTTGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQDGRAQELRVLAALRGNAQDTVVEFGSFDPSCLMSICPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQAIEADDDQVSSSHSLYPRKPKYTRITLGWAPNVASVFNIL	256909	264278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_256973_262603
709982	contig_4469_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_21892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1171	1479	299437	299745	NA	25	TGTATATTTTTTAGGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLVLQRGPEILVQEAVCMDKTSPGEFKVASILHLDPCCRVKSSQERLAVSSLLFSDQFYIYWLLLHNFRLLAVSIQASFRKIWDGSDNLYWEFSLLNIK	298266	300140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_298300_300100
709985	contig_12414_pilon	+	2974	10	Intergenic	novelGene_59649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTATCAAAATGCTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756052	784100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_756662_759119_759324_760678_760804_762804_762908_765744_765875_766736_766903_767635_767693_774262_774353_781926_782108_782791
709986	SIRV7	+	386	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCACTATGTGGCGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56090_70873_70989_78844_78965_114683
709992	contig_19744_pilon	+	1993	5	Intergenic	novelGene_120398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_3	103.717163478375	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	771	1289	215669	225076	FALSE	35	TGATAAAGTCTAACAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLEYEGLHKSEAITTPGVRFYNDPAGYAMNRYAYYVCYKCRKAYFGGEARCDAEAGQGDDYDPRELICGACSDVSRAQMCPKHGTDFLEYKCRYCCSVAVFFCFGTTHFCNACHDDFQRMTSIPKEELPHCPAGPKGKQLEGTECPLHVVHPPTGEEFALGCGVCRNAHTF	213283	225780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_213973_215587_215798_218459_218568_219217_219384_224960
709997	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
709998	contig_8594_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_140012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105267	103984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_104000_105300
710004	contig_5033_pilon	-	1550	6	Intergenic	novelGene_28947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1078.55707313058	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	123	830	477189	453092	TRUE	65	GGAAAGAAAAAAAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDK	477311	451090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451579_452859_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
710007	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTACCATTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
710008	contig_10446_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_162521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCAGCCATCTAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260396	1258396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1258400_1260400
710014	contig_8153_pilon	+	238	2	Intergenic	novelGene_34806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTACCTACTGACAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138307	148733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_148680
710015	contig_8898_pilon	-	2794	10	Intergenic	novelGene_137230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_6	44.9652815315314	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	65	2041	216812	202709	FALSE	40	AAAGCTTACAGTTTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLSTVAATTAASGPLVDYLWMLILGFIIAFILAFSVGANDVANSFGTAVGSGVVTLKQACILASIFETVGSVLLGAKVSETIRKGLIDVEMYNSTQQLLMAGSVSAMFGSAVWQLVASFLKLPISGTHCIVGATIGFSLVAKGQEGVKWSELIKIVMSWFVSPLLSGVMSGILFFLVRAFILRKADPVPNGLRALPVFYACTVGINLFSIMYTGAPLLGFDRLPLWGTILISVGCAVFCALIVWFFVCPRMKRKIEREIKSSPSESPLMEKKNSLKEDREETKLSLGDVESRNPVVPDVGCAAAPLRAVVEERTVSFKLGDLEEAPEQEKLPSMDLKEETSIDSAMNGAVQLPNGNLVQFNQAVSNQINSSGHYQYHTVHKDSGLYKELLHKLHLAKVGDCMGDSGDKPLRRNNSYTSYTMAICGMPLDSFRAKEGEQKGEEMEKLTWASADTKKRIRMDSYTSYCNAVSDIHSASEVDISVKGEMGLGDRKGSNGSLEEEWYDQDKPEVSLLFQFLQILTACFGSFAHGGNDVSNAIGPLVALYLVYDTGDVSSKVATPIWLLLYGGVGICIGLWVWGRRVIQTMGKDLTPITPSSGFSIELASALTVVIASNIGLPISTTHCKVGSVVSVGWLRSKKAVDWRLFRNIFMAWFVTVPISGVISAAIMAVFKYVVLRV	216876	201955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_202871_203878_203964_204522_204709_205342_205905_206009_206283_208466_208587_210933_211031_215999_216086_216263_216405_216547
710019	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_97833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710021	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710035	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710039	contig_266_pilon	+	2412	1	Intergenic	novelGene_166301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	665442	665783	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPLPNGPAAFCSLGKAIVPEAEPGQPKGKPYLAERLAPARRLRSPKAWSLTPPEEAEGAGKASSGAWLLSPGQVRTGTVASQAPSPSFSGYNISDGAPPTRRKLGEVRIASD	665440	667852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_665400_667900
710040	contig_2367_pilon	-	1314	2	Intergenic	novelGene_65323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACATAATTTAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213294	192228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193490_213241
710047	contig_11978_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_62938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGGCTCCATCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976808	978059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_976800_978100
710050	contig_11224_pilon	+	1982	7	Intergenic	novelGene_124456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	250.519072239132	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	201	1322	211461	218076	FALSE	70	AAAACAAAAAAATTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSITRPERSRSPSPAPSLSPRKLRCLEQREPEIKEEREQKSKKRRTKIEGNPGNITNLRWLGTSSTMATSASSHLNKGIKQVYMALPQGEKVQAMYIWIDGTGEGLRCKTRTLDSEPKCVEELPEWNFDGSSTFQSEGSNSDMYLIPAAMFRDPFRKDPNKLVFCEVFKYNRKPAETNLRHTCKRIMDMVSNHHPWFGMEQEYTLMGTDGHPFGWPSNGFPGPQGPYYCGVGADKAYGRDIVEAHYRACLYAGIKIGGTNAEVMPAQWEFQIGPCEGIDMGDHLWVARFILHRVCEDFGVIATFDPKPIPGNWNGAGCHTNFSTKAMREENGLKYIEESIEKLSKRHQYHIRAYDPKGGLDNARRLTGFHETSNINDFSAGVANRGASIRIPRTVGQEKKGYFEDRRPSANCDPYSVTEALIRTCLLNESGDEPFQYKN	209609	218736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_209797_211447_211627_213404_213567_215415_215563_215808_215937_216144_216345_217757
710054	contig_3975_pilon	+	1690	7	Intergenic	novelGene_54707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	36.2510536245347	464	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	68	772	1395865	1418855	FALSE	5	TCCCCTGTTGTGGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSVPADELSQEYRKGIRAVLLGPPGAGKGTQAPKLAENFCVCHLATGDMLRAMVASGSELGKKLKATMDAGKLVSDEMVVELIEKNLETPLCKNGFLLDGFPRTVRQAEMLDNLMEKRKEKLDSVIEFSIQDTLLIRRITGRLIHPTSGRSYHEEFSPPKEPMKDDITGEPLVRRSDDNEKALKIRLAAYHTQTAPLVDYYRKQGIHCAIDASQTPDVVFASILAAFSKATS	1395797	1419773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1395964_1407498_1407625_1410761_1410873_1411001_1411097_1415328_1415402_1416618_1416815_1418850
710065	SIRV7	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGCACATAGTAGTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147707	147951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
710066	contig_14133_pilon	-	2275	4	Intergenic	novelGene_119899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	28.9865869364129	240	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	73	564	97515	94836	FALSE	20	GCTTAACGGAGTTGGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REELPTIYKCPYQGCTAVYRGADGMKKHIKEHHEEVRERPCPHPGCNKVFMIDRYLQRHVKLIHTEVRNYICDECGQTFKQRKHLLVHQMRHSGAKPLQCEVCGFQCRQRASLKYHMTKHKAETELDFACDQCGRRFEKAHNLNVHMSMVHPLTQTQDKARPLETEPPGLPGALGTEEGQAVKPEPT	97587	93124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_95104_95375_95476_97049_97168_97509
710069	contig_567_pilon	-	2745	1	Intergenic	novelGene_33983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTAGGGTAAGCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420947	418202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_418200_420900
710070	contig_5261_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_102484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATGGTATCATGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729901	729459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_729500_729900
710074	contig_14441_pilon	+	1397	7	Intergenic	novelGene_100522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	356.624335494182	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	789	1217	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111136	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111387_111997_112154_112454_112665_113185_113209_116578_116963_117220_117344_117539
710076	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710077	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710078	contig_16846_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_82858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGACCTTAGGCGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116399	117215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_116400_117200
710079	contig_14890_pilon	-	1450	4	Intergenic	novelGene_122524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	665.413321845069	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	691	1137	367836	366588	FALSE	10	AACTGCTTTTGTCTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSMWTTKGLLKTNCIKCLLISLLLTFL	368526	366274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_366666_366879_367079_367168_367280_367777
710080	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710084	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
710089	contig_16666_pilon	-	1343	4	Intergenic	novelGene_61749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	22	468	59688	55974	FALSE	10	CATACCTTGTCTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59709	55098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
710102	contig_19514_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_166311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAATAAAAGGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10049	12629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_+_10000_12600
710103	contig_12622_pilon	-	1796	15	Intergenic	novelGene_6047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	367.834867564126	2	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	32	730	1691275	1688931	TRUE	30	GGACAGCTTAAAACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSCPLGA	1691513	1685124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686943_1687818_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688950_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
710106	contig_5690_pilon	+	1623	11	Intergenic	novelGene_119739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_1	379.517707096784	3	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	41	1141	1044729	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044688	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
710107	contig_16310_pilon	-	3038	6	Intergenic	novelGene_70053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_4	8.18290901819151	279	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	578	1378	119847	98346	FALSE	55	ACCCTATAAAAATAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSPKEIEDGEDGMSEDKDNGSRDEIVIPPKKGRKVATPPEKKVEGKKSLAPTFAEKLVSPSRKRATWAKRAKDRCATPEDRESRRESYEEEEDQDDRDARTLLIKNLPDKVTQHALKEVFEDAFQVRLVSKAGMSKRIACIEFKSQADAERALEEKQGTEIHGLAVVLDHTAEKRRGPENGDREQPLESRKTEDGTGKPRVSRKMGESLFLCGDKEYSYMFNMQSLSVSKECHLRLHYETNHSSNHNGYTEKMHNRKFNALKKD	120619	96685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_98575_99543_99700_108466_108591_116355_116570_119769_119875_120069
710108	contig_8156_pilon	+	1787	6	Intergenic	novelGene_98945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	339	662	398306	403374	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTADMTNQSHEYFLSTCCLFPTSGNGRHNSTFSPVPYLFKIMRACIVQGSRRRAWLSCTASTVLRATVSGFSGGKRLGNLNPHALEHLGAGVEGQHGGSTDAWTVQ	397967	441757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_398550_403294_403537_403887_404006_404667_404810_438156_438289_441186
710114	scaffold_12510_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_151365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195335	197606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_195300_197600
710116	contig_13457_pilon	+	1817	12	Intergenic	novelGene_118352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_8	56.0519239796297	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	126	869	60777	68762	TRUE	15	AGGTGGGGGTCAGTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59285	71293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
710121	contig_16103_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_118749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCGAATCCTCTCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315832	314866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314900_315800
710123	contig_1443_pilon	-	2299	9	Intergenic	novelGene_28329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	321.979327752575	1	110	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1388	1915	776427	749341	TRUE	15	TTTACCTAGGCGCTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGK	809526	748610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748988_749234_749343_750369_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_804491_805718_809399
710124	contig_11832_pilon	+	2350	14	Intergenic	novelGene_106960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.412700322936	131	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	752	2029	449058	459276	FALSE	20	TTTGAGCTGCATGTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPQRVVLGSGRECSAGPSSRSPALSGAPWAATASAWPPGPGCSPGRTTAYRCGWSGREEEFEQDVPNDLGPLQFVKLRKHHSLVDDAWFCDRITVQGPGACAEAAFPCYRWVRGQGILSLPEGTACLAGDNPLDVFQRHREKELKERQQIYRWATWKEGLPLTIAANSKDELPPNERFHEEKRLDFELTLKAGILEFTHKRVYTLLSSWNHLENFNQIFCSQKSVLAEKVHQCWQDDELFGYQFLNGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGTEELRAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVIQGEKQYLAAPLVMLKMEPNGKLLPMVIQLQPPNSSSSTPPLFLPSDPPLAWLLAKSWVRNSDFQLHQLQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLSELHPLFKLLVPHIRYTMEINTRARTQLISEGGIFDKAMSTGGGGHVVLLHRAGAQLTYCSLCVPDDLADRRLLGLPCALYAHDALRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDVVRGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQAQLCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDVRQACLQMTITWHLGRKQPDMVPLGHHKEKYFSSPKAKAVLKQFQTDLENLEKEITARNEQLDLPYEYLKPSRIENSVTI	446159	459597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_446335_446908_447108_448219_448302_448404_448528_448638_448743_448989_449151_450024_450169_451502_451713_455182_455270_455500_455671_456172_456295_458580_458682_458806_458978_459096
710125	contig_4989_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_160784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	452	754	92119	92421	NA	35	AATGGTAAATTTTATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLDLRSILFMSIILCPTVQSSLCLKSWLWAWFQFWANRESRGHVFWGPSSLRPLSLVFLLEFEFCTLLFSCSIRDTVLCSSGWSLVVAGHHLVLLVSG	91667	93663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_91700_93700
710128	scaffold_12124_pilon	+	1505	12	Intergenic	novelGene_21992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	146.885517910721	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	143	1327	799011	815200	FALSE	35	GATGACATAAATCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKRFLVMHALFPPIPKIKDKLNDNQETGLQVSWNELMPGTGKAENEEVITVEEVA	791833	815378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798987_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
710136	contig_14661_pilon	+	1802	16	Intergenic	novelGene_47437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCCGTCTGAGAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46033	70810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_+_46260_46801_46996_47430_47571_48278_48387_49116_49221_49761_49862_49948_50101_63314_63410_64388_64488_66232_66322_66528_66620_67392_67447_68172_68316_68998_69074_69358_69465_70784
710137	contig_7202_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_19006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACGACCGCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
710138	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_16392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710141	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	549	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710144	contig_19402_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_80808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAACACTGCCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64944	63954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_64000_64900
710145	contig_9366_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_166265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	320	963	162	1124	1031118	1032080	NA	45	AATAGAAATTAAACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLNLDTEDGKGDELDTLDNLETNDPNLDDLLRSGEFDIIAYTDPELDLGDKKSMFNEELDLNVPIDDNHCMSIEPKKKEPEDKTLVLSGKHSPQKKSTFSSEIKTEVLSPNSKEETKYDIEKSEGKGAVDIPCSQASTNTDLNDGEKASLQPCKPDLPEKRTNQETADSSISVQGSTLLPAEDVISSCGITGSTPVLSSLLASEKSDNSDIRPLGSPPPSLPASPSNHVSSLPPTLMTPPGHVLDNTVNSNVAVVSRVNHTFSQGVQVNPGFVQGQSASHSFGTGKSTNQTVPLTSQSSTSGMSGPQQLMIPQTLAQQNRERPLLLEEQPLLLQDLLDQERQEQQQQRKMQAMIRQRSEPFFPNIGRTLLESQ	1030956	1033400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1031000_1033400
710148	contig_4364_pilon	-	1484	2	Intergenic	novelGene_16	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261723	260065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_260877_261050
710150	contig_10581_pilon	-	1893	4	Intergenic	novelGene_41345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	102	junction_1	2.94392028877595	197	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1	465	74115	72920	FALSE	50	CGAGAATTTACCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAWGLSLAAAALRAVTAWPRGRLPAAFPRSQVLRKASSSSPQADEGQIHLTDNCVQRLLEITEGSEFLRLQVEGGGCSGFQYKFSLDTVINPDDRVFEQGGARVVVDSDSLAFVKGAQVDFSQELIRSSFQVLNNPQAQQGCSCGSSFSVKL	74115	71491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_73095_73534_73651_73763_73867_74044
710151	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710152	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
710153	contig_16315_pilon	+	2155	12	Intergenic	novelGene_166320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	9.28608663316672	22	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	563	1294	12175	13576	FALSE	15	GTCATTTTGGAGAGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGATVCTPQRPLCSQCPVQSLCRAHQRVKREQLSASQSLPHSPDVEECAPNTGQCQLCPPPTKPWDQTLGVANFPRKASRRPPREECSATCVLEQPGALGGSRLLLVQRPSSGLLAGLWEFPSVTMESSGQYQHEALLQELQSWAGPLPATRLKHLGEVVHTFSHIKLTYQVYGLALEGQIPVTTAPPGARWLTREEFHTAAVSTAMKKVFRMYEGQQPGACKVSLLALTSHFGLQELSVS	10201	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16315_pilon_+_10322_11104_11145_11251_11326_11459_11502_11736_11824_11894_12036_12116_12262_12341_12406_12593_12786_12890_13028_13122_13276_13477
710154	contig_5023_pilon	-	2975	2	Intergenic	novelGene_7118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACTCCACTTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113913	110715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_112165_112387
710156	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710158	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710166	contig_15720_pilon	+	1062	6	Intergenic	novelGene_41898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	20	GATCGAGCAGCCCACCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	283997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279872_281635_281929_282569_282750_283785
710167	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710168	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
710172	contig_4105_pilon	-	1720	14	Intergenic	novelGene_21508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	691.164474897941	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1707	12	1718	137447	100096	FALSE	35	ATCAAACCTCTGTCCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGKLNRPVHLCFLLVSLHPGTFES	137458	100093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100160_101430_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
710173	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710175	contig_14441_pilon	+	1262	7	Intergenic	novelGene_100625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	363.774846421367	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	648	1076	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111219	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111354_112576_112665_113185_113209_115357_115611_116578_116963_117220_117344_117539
710178	contig_5324_pilon	+	2088	10	Intergenic	novelGene_102057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	28.7788502588658	204	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	824	1441	412619	414398	FALSE	35	AGATAAAATGTAGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSVALEGDGCSICSESEAKLIEISHKLNCSRKQAPPSGPCGAGQQLPASAPVLLQHYPLYRRSDANCSAEDAAPPEEKNIPFKEKYDVLSREASHKLLWWLQPRLVLSGHTHSACHVIHSGGVPEVSVPSFSWRNRNNPSFIMGSITATDYSLSKCYLPLEGTVLATYCGAAVVLLALLLAHFELLALPFLFGWNLLRKHKVI	393358	415045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_393450_406385_406768_408320_408430_410056_410161_410923_410999_412556_412721_412860_412930_413009_413133_413664_413806_414215
710180	contig_16103_pilon	-	648	2	Intergenic	novelGene_118725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	164	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCGTGTCAGCTGGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211849	211065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_211602_211737
710181	contig_16103_pilon	-	597	3	Intergenic	novelGene_118721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	536	505	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	170	475	208768	207292	FALSE	10	TGAGGCTGCTGGTCTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	211065	207169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627_208784_210911
710183	contig_13366_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_99780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTTCCCTTAACGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70957	70716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_70700_71000
710184	contig_13366_pilon	-	3436	1	Intergenic	novelGene_99779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	208	303	69897	69802	NA	70	CCCATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSCILFLISVHYSDLRFVLLDELCYVCSGNPGGVVIKSNSCYPKGWQFESTRHSLETLWGSSVLSYRVSMSRNRLGGNGFVLFFWYVCSGELKSAFFPPY	70104	66668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_66700_70100
710185	contig_6048_pilon	+	1474	11	Intergenic	novelGene_73264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	59.2584171236458	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	442	1236	1976465	1978064	FALSE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRGCSAYCLHASHQSVPGAAASLLKWRGGRTPSIQPAPRVCPPLRFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972101	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974232_1974327_1976314_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
710186	contig_5799_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_50333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703910	706509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_703900_706500
710188	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
710197	contig_5988_pilon	+	2273	16	Intergenic	novelGene_16144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	386.292842284192	151	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2172	102	2273	1851404	1927551	FALSE	80	TAAAAAACAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFVEQVTSKGTGLNPNAKVWQEIPSENTDATPVTHGRESSWHETAATSGPHPEGSSELSDGMCKEYEVMYSTSCETSRSTAGIEESTDGMILGPEDLNYQIYDVSGESNSAISTEDLKECLKKQLEFCFSRENLSKDLYLISQMDSDQFIPIWTVANMEEIKKLTTDPDLILEVLRSSPMVQVDEKGEKVRPSHKRCIVILREIPETTPIEEVKALFKNENCPKVISCEFAHNSNWYITFQSDTDAQQAFRYLREEVKTFQGKPIMARIKAINTFFAKNGYRLMDSSVYSQPIQTQAQYPSPVFMQPVYNPHQQYSVYSLVPQSWSPSPAPYFETPLAPFPNGSFVNGFNSPGSYKTNAAAAVNMSRPFQKNRVKPHFRPSSGSEHSTDGSVSLGDGPLHRSNSRNFPTERHNPTVTGHQDQTYLPKETPTLQIEQNGDYGRGRKTLFRGRRRREDDRIPRPHPSPAEAKAPTPKFDLLASNFPPLPGSSSRTLAELSLESRMSDVVKGVYKEKDNEELRVSCPVPAEDEQTDCSSAQQLSISPPPTAELPALSTTQQEKDIIEESTVQKDSLNQTTSPVSSPACTKPSRPNTASPSNSNINATVAVALQEPRKLSYAEVCQKPPKEPSPVLVQPLRELRSNVVSSIKNEENGAPEKSVEKSHEKPEARATKDYSGFRGNIIPRGAAGKIREQRRQFGHRAIPQGVTRRNGKEQYVPPRSPK	1851302	1927551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1851422_1877459_1877608_1878230_1878387_1880822_1880899_1892881_1893019_1894581_1894686_1897778_1897890_1898655_1898710_1911267_1911481_1911971_1912079_1915434_1915648_1916229_1916279_1919624_1919787_1924655_1924775_1924889_1925059_1927215
710199	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_93551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710201	contig_6710_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_89149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653684	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
710202	contig_7391_pilon	-	1945	8	Intergenic	novelGene_112157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_4	36.9351334319054	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	195	866	425770	411653	FALSE	5	TGTAGTGCCCTGTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELDLMGQDSDGDSDEVVLTPAELIERLEEAWMNEKFAPELLESKSEIVECVIEQLDHMEENLRRAKKGDLKVSIHRMEMERIRYVLNSYLRCRLMKIEKFFPHILEKEKTRSDREPSCLSPEEFAFAKEYMANTETYLKNVALKHMPPNLQKVDLLRSVPKPDLDSYVFLRVKERQENILVEPETDEQRDYVIDLEEGSQHLIRYKTIAPLVASGAVQLI	426879	410573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_411750_411846_411938_415022_415112_415305_415404_419823_419938_420760_420848_425674_425790_426704
710207	contig_3270_pilon	+	780	5	Intergenic	novelGene_104440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4705.70741228139	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTGTTGAGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44134	46757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44307_44596_44652_45124_45308_45877_46067_46576
710209	contig_6735_pilon	-	1549	13	Intergenic	novelGene_15767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.753999080473	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	83	1234	564868	542303	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEST	568280	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542314_543158_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
710215	contig_18869_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_56332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTCTCCTTCACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73358	73558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
710216	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710220	contig_513_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_80139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTATTTTTACTTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334116	332803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_332800_334100
710223	scaffold_19766_pilon	-	1255	8	Intergenic	novelGene_34337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	389.510629652446	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	368	1036	622205	596625	FALSE	35	AAGTACCTAGAGAATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623724	596405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
710226	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_93597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710227	contig_5084_pilon	-	2081	8	Intergenic	novelGene_64639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_7	35.3027720481794	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	404	985	1333870	1328304	FALSE	25	ACTATGGCTAATTTGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGGNGYINDFPMGRILRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH	1335822	1327207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330262_1330746_1330841_1333776_1333874_1335200_1335506_1335727
710228	contig_12920_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_166349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGCATGCCAGGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213433	214143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_213400_214100
710230	contig_21162_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_152768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTCAGAGGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26768	26320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21162_pilon_-_26300_26800
710233	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710240	contig_7457_pilon	-	1158	6	Intergenic	novelGene_31359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	146	junction_2	53.2826425771095	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	21	545	321514	317540	FALSE	10	CTCCCACTGCCTGCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321534	316926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
710243	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
710244	contig_9332_pilon	+	1769	2	Intergenic	novelGene_60722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	18	800	151547	152329	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVADMEHVTLQTLTEKILQSEESISRLPGEIRRLEEELHQLKADSNRLEEDGVFRNSDAFEALQRTSQGLDSRLQSVEDGVQSMQSTSAQQTESLESLLSKSEEYEQRLSALQERVEGLGSSSEADKDGVDRTVRSLGEAQLSLHADVEELKRSVGELPSTVEALQKVQEQVHSLLSQDQAQAAHVPPQDYLDKLSSLDNLKSSVSQVESDLKMLRTAVDSLVAYSVKIETNENNLESAKALLDDLRNDLDRLFVKVEKIHEKI	151529	153378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_152894_152973
710245	contig_9363_pilon	-	1918	10	Intergenic	novelGene_6559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1120.99449894577	3	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	109	1083	786587	754221	FALSE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQVWIPHLPTGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGCMTQMSIA	787874	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754250_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781376_786541_786648_787826
710250	contig_6958_pilon	+	2370	9	Intergenic	novelGene_69993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_3	211.947185343425	23	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	249	980	737723	758638	FALSE	75	CCACAAAAAAAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVFSLFKNERSFICNYKEHWFTVRKLGKQWFNLNSLLTGPELISDTYLALFLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFEKQQQQQQQQQQQRQQQVDLPGPVSQPCERPTTSSGALGSDLGKTLSDPSSCL	728665	760028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_728730_737250_737416_737703_737749_739744_739812_743783_743872_750150_750284_750917_751082_752856_752954_758481
710251	contig_12250_pilon	-	1123	10	Intergenic	novelGene_80717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_9	296.149153278638	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	65	727	401239	399347	TRUE	30	TACCCATCAACCCAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVSTEGSRKGLSGRRGSEKPRASPTLLQPLTRVEVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401303	398585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401101
710256	contig_10074_pilon	-	2256	4	Intergenic	novelGene_57144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	40.7458245986288	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	22	1233	463495	446061	FALSE	25	GATAATGCTATTTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVEVEEMASQPPPPRKPWETRRIPGAGPGPGPGPTFQSADLGPTLLTRPGQPALTRVPPPILPRPSQQTGSSSVNTFRPAYSSFSSGYGAYGNSFYGSYSPYSYGYNGLGYNRFRVDDLPPSRFVQQAEESSRGAFQSIESIVHAFASVSMMMDATFSAVYNSFRAVLDVANHFSRLKIHFTKVFSAFALVRTIRYLYRRLQWMIGLRRGSENEDLWAESEGTVACLGAEDRAANSAKSWPIFLFFAVILGGPYLIWKLLSTQSDEVADNTNWASGEDDHVVARAEYDFAAISEEEISFRAGDMLNLALKEQQPKVRGWLLASLDGQTTGLIPANYVKILGKRRGRKTVELNKISKQQQSFTNTTVLKGTTAADSLDEQEAAFESVFVETNKVPAAPDSTGKSEDKQDL	463516	445037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_446360_447113_447240_450516_451212_463403
710257	contig_10627_pilon	-	1372	10	Intergenic	novelGene_59947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	41.1648297685845	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	4	711	171557	168907	TRUE	25	TATAGGAGTCGTCTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGNCGQEHEKQVEVWPGT	171560	167844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_167950_168059_168147_168251_168363_168444_168544_168647_169087_169387_169619_169698_169756_169934_170033_170341_170412_171485
710258	contig_7119_pilon	-	1086	6	Intergenic	novelGene_41008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	175.32415692083	575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	23	478	196804	190765	TRUE	15	TGTTTTCCTCTAGTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSRFSEGQSPMISQ	196826	188213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_190679_190803_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196690
710262	contig_7744_pilon	-	1715	9	Intergenic	novelGene_62476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	55.1407290484992	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	83	1123	489862	487677	TRUE	35	ACTGAAACCCTAAATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFLQLEQINGRLSASLLHSHDTETRATMNLALAGDILAAGQDAQCQLLRFQTHWQKGSNKAEKAGSKDQGPRQRKGAAPAGQKSGAETHCEGVELSVEDLQVVQTDFSADPLQKVVCFNHDNTQLATGGTDGYIRVWQVPSLKKVLEFKAHEGEIEDLALGPDGKLVTVGQDFKASVWQKDQLVTQLHWQENGPTFSNMPYRYQACRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	489944	487044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487561_487600_487772_487929_488090_488282_488356_488503_488678_488866_488992_489090_489172_489350_489572_489750
710263	contig_8464_pilon	+	2246	17	Intergenic	novelGene_125393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258.03597132958	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	312	2141	858759	892583	FALSE	10	CTTTGGTGTGGTCATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLELPKRWGKNSEFEGGKSTVNCSTTPIAERFFTSSTCLTLKHAAWYPSEMLDPHIVLLTSDNVIRIYSLREPQTPAKVIVLSEAEEESLILNKGRAYTASLGETAVAFDFGPLAAVSKNIFGQKGKDEVVAYPLYILYENGETFLTYVSLFHSPGNIGKLLGPLPMHPAAEDNYGYDACAILCLPCIPNILVIATESGMLYHCVVLEGEEEDDQTSEKSWDSRADLIPSLYVFECVELELALKLASGEDEPFDSDFSCPIKLHKDPKCPSRYHCTHEAGVHSVGLTWIHKLHKFLGSDEEDKDSLQELATEQKCFVEHILCTKPLPCRQPAPIRGFWIVPDILGPTMICITSTYECLIRPLLSTVHPASPSLLCTREDVEVAESPLRILAETPDSFEKHIRSILQRSVANPAFLKSSERDTAPPEECLQLISRATQVFREQYILKQDLAKEEIQRRVKLLCDQKKKQLEDLNYCREERKSLREMAERLADKYEEAKERQEDIMNRMKKVLHSFHSQLPVLSDSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQRKMEKVLSPQKPTITLSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF	857208	892688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_857424_858662_858833_859757_859884_864979_865067_867920_868098_869665_869853_870352_870501_872708_872808_884660_884752_887827_887930_889834_889994_890865_890989_891109_891176_891319_891401_891694_891822_891981_892101_892519
710264	contig_15063_pilon	+	983	3	Intergenic	novelGene_14410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	20	841	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35251	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
710265	contig_18113_pilon	+	2509	1	Intergenic	novelGene_137535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157798	160307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_157800_160300
710270	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710271	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710272	contig_9161_pilon	+	2068	7	Intergenic	novelGene_160647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	12.2882057274445	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	132	1220	94384	111738	FALSE	20	GTTTGCAGCCTATTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRSGRGARPEAAGEEEEPEVKKRRLLCAEFASVASCDSSVAQCYLTENDWEMERALNSYFEPPVDESAVESRPQTVSELETCVDLTNEETTDSTSSQISPPENIQQEDDSMFSFITWNIDGLDLNNLPERARGVCSYLALYNPDVVFLQEVIPPYCSYLRKRASSYEIITGNGEGYFTAIMLKKSRVKLKSQEIIPFPGTKMMRNLLCVHVSVSGNELYLMTSHLESTRGHAKERINQLKAVLKKMQEAPESDTVIFAGDTNLRDQEVTKCGGLPNNILDVWEFLGKPEHCRYTWDTQMNSNLGIPNTCKLRFDRIFFRAAAEEGHIIPRSLDLLGLEKLDCGRFPSDHWGLLCNLDIIL	94252	112586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_94549_94633_94720_103045_103220_105105_105198_108187_108307_109922_110094_111456
710277	contig_20561_pilon	+	2328	7	Intergenic	novelGene_166377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	24.0808822282093	157	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	94	654	102961	122799	FALSE	35	AATGTACTAATATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDKRVAPALVTLSSDPEFSVRIATIPAFGTIMETVIQRELLERVKMQLASFLEDPQYQDQHSLHSEIIKTFGRVGPNAEPRFRDEFVIPHLHKLALVNNLQIVDSKRLDIATHLFEAYSALSCCFISEDLMVNHFLPGLRCLRTDMEHLSPEHEVILTSMIKECEQKVENKTVQEPQGSMSIAASLVSEDTKTKFLNKMGQLTTSGAMLANVFQRKK	102652	124473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_102706_102920_102985_104390_104530_108216_108334_113947_114037_116153_116225_122678
710279	contig_12079_pilon	+	2202	15	Intergenic	novelGene_67407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_11	126.497983367002	2	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	76	1905	491184	578891	FALSE	40	CAGATTTCAATAAACGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	491108	579188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
710290	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_96501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710293	contig_12644_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_44672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5590.67170730753	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	22	462	2675526	2679214	TRUE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGNS	2675504	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2678720_2678846_2679073_2679226_2679529_2679665_2679878_2679963_2680290
710299	contig_2646_pilon	-	1952	17	Intergenic	novelGene_69639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	348.230072787733	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1938	13	1950	2078663	2069812	FALSE	5	AGTGTCCGTCCGCGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGGRDKGPLSQQPPVTAPGGADEKQSGKERRDAGDKDKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPL	2078675	2069809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074163_2075781_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
710300	contig_3948_pilon	+	1589	3	Intergenic	novelGene_53399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	81.5	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	593	1129	1860968	1861584	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTRRVTGAAVGTLGSSLPQAGRTGRRACCTGWRDWKAQSCLAR	1814460	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1814520_1860434_1861378_1861457
710301	contig_7708_pilon	-	2855	3	Intergenic	novelGene_61526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTTACCCTGGCGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257092	249516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_-_249667_250621_251075_254840
710302	contig_13924_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_147778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACCTCTTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38731	36896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_36900_38700
710307	contig_20951_pilon	-	171	1	Intergenic	novelGene_43095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCAATCGTGAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28881	28710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28700_28900
710315	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710321	contig_8674_pilon	+	2335	3	Intergenic	novelGene_102938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	439	525	460345	476156	FALSE	45	TTTAAACTTTAAACTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGNSEWRPVVVP	456162	477966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456506_460249_460403_476127
710323	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710324	contig_8660_pilon	-	542	3	Intergenic	novelGene_136492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	4.5	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGGTGTTAAATCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315366	292208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_292580_292941_292978_315231
710325	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	532	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710327	contig_16098_pilon	-	1216	6	Intergenic	novelGene_46125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1885.92326461073	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	574	915	457605	456369	FALSE	5	GGGGAGTCTGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGTLLTLAPLPS	458822	456067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456404_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457895_458405
710328	contig_4555_pilon	-	2593	4	Intergenic	novelGene_149879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	62.3556109922934	126	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	143	565	45599	41195	FALSE	30	TCAAATTTGTTTTAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDFKTYVDQACRAAEEFVNIYYETMDKRRRALTRLYLDKATLIWNGNVVTGLDALANFFEMLPSSEFQVNMLDCQPVHEQATPSQTTVLVVTSGIVKFDGNKQHYFNQNFLLSAHSTLNNTVWKIASDCFRFQDWASS	45741	39166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4555_pilon_-_41377_42439_42585_44849_44937_45590
710333	contig_14142_pilon	-	2006	9	Intergenic	novelGene_120467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	23.9605796048426	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	232	1164	259646	248099	TRUE	15	TACTAGAGTCTGTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYGASVSVSLSAWPAAAGRTRFTSGMHSLGSSGLPFAPTTTWYGPASPASALLLAKLSSLEDGWGLKRPVFSPLLPPG	259877	246243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248331_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
710339	contig_6048_pilon	-	2532	1	Intergenic	novelGene_73228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1759740	1757208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1757200_1759700
710341	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710356	contig_5918_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_99553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783388	781001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_781000_783400
710367	contig_3948_pilon	+	2449	4	Intergenic	novelGene_53385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	92.8954011539622	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	359	1060	1813956	1860572	TRUE	30	TGTGTTGACTCATTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813338	1862023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434_1861851_1861912
710371	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710376	contig_504_pilon	+	1998	5	Intergenic	novelGene_54410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	33.759257989476	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	40	678	124152	152696	FALSE	35	TCAACAATGCATTGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFLAKPLSSADGMRQRLLESAFSLCQRGSPAKQTTWEGGHRVPALAYWPGRVPINVTSTALLSVLDIFPTVVALAQASLPPDRHFDGLDASDVLFGRLQSGHKVLFHPNSGAAGKYGALQTVRLERYKAFYVTGGAKACDGSVGPEQHHELPLIFNLEDDSAEDVPLERGGTEYQTVLPQVRRVLADVLQDISEDNTSSADYTQDPSVAPCCNPYRMACRCQTT	124112	154016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_124195_129681_129791_135936_136058_142952_143044_152421
710379	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710383	contig_6576_pilon	-	1665	3	Intergenic	novelGene_42318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	51	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	376	429	556725	555376	FALSE	30	AATGTAGAAGCACCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGWADLQSPRAPARAQRRGESLWLQRPGWRPLPWLGLGWPSDLYSQHVFPGCASLDAFEQGQVFIGSKEQGYDVSDDLPKGIRGNHWKAGLTIVTPQRKFVFTCPTEKEQREWLRSLRDVLSCPMTPLNLLTTSTESGRSR	558410	554139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_555408_556703_556933_558242
710384	contig_13800_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_153754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCAAATGGTGCATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218014	216457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_216500_218000
710389	contig_6102_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_31797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360100_361200
710390	contig_16666_pilon	-	1489	8	Intergenic	novelGene_61721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_7	288.001700675251	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	705	1007	30779	24486	FALSE	5	TCCTGTTTCTGCCTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47961	24003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_45890_45987_47684
710391	contig_3975_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_54747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAGTAGGCTTATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743690	1745361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1743700_1745400
710392	contig_5229_pilon	-	2344	12	Intergenic	novelGene_117710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_9	28.5289471668038	185	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1181	1858	655501	652839	FALSE	10	GGATTGTTTCTGTGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657588	652352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655474_655590_655758_655942_656197_656307_656546_657083_657324
710393	contig_16098_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_45918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTTATTAAACAGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326957	326244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_326200_327000
710400	contig_14441_pilon	+	796	4	Intergenic	novelGene_100679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	411.860008578967	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	190	531	116728	117335	TRUE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVHRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	113168	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113209_116578_116947_117212_117344_117539
710405	SIRV4	+	214	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1557	632	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
710410	contig_14681_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_134211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAAATGGGGCACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76307	75027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_-_75000_76300
710419	contig_16622_pilon	-	1781	12	Intergenic	novelGene_48426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1232.66335983418	6	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	749	1612	115540	108374	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	128680	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_125231_125372_126021_126121_126271_126420_128337
710422	contig_1516_pilon	+	1875	14	Intergenic	novelGene_49939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_12	87.5314313791905	330	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	96	1685	208425	238082	FALSE	30	AACATGGATTATCTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSTLWFPLLLAAATAGPVTALWPWPQYIQTSDQRYALWPKNFDFQYHAGSAAQPGCSVLDQAFQRYRHLFFHTVSDSLTGRTEKQYKAEKNTLTVFVATPGCHQLPSLESVENYTLTINDEQCFLLSETVWGALRGLETFSQLIWRSADGTFFINKTDIVDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSRILDTLDVMAYNKFNVFHWHLVDDPSFPYDSVTFPKLARKGSYNPATHIYTVQDVKEVIEYARLRGIRVVPEFDTPGHTLSWGAGVPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPILNSTYEFMSTFFLEISSVFPDFYLHLGGDEVDFSCWKSNPDVQAFMKKKGFGDDFKQLESFYIQMLLNIVSAYGKGYMVWQEVFDNKVKVQPDTIIQVWREEAPVTYLKELELITQAGFRALLSAPWYLNRITYGPDWKEVYMVEPLAFDGSPEQKALVIGGEACMWGEYVDSTNLVPRLWPRAGAVAERLWSNSRVTDLEFAFTRLTNFRCELLRRGVQAQPLSVGYCEQEFEET	208329	238272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_208678_226522_226616_227739_227806_230161_230209_230728_230840_231704_231807_232280_232414_233368_233550_234537_234625_234901_234975_235702_235887_236105_236197_236844_236950_238018
710424	contig_5092_pilon	-	1900	5	Intergenic	novelGene_62313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	530.134122180416	2	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTGTTGAAGACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451611	443423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_444965_446111_446164_447835_447995_449415_449490_451537
710427	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
710432	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_95867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710439	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710444	contig_14513_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_70291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	271	357	12004	11918	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILHSPTPLRITPTSSSFSRVPSTWPSWDSVCSEERQSMAVERVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12108_18896
710445	contig_9363_pilon	-	1733	7	Intergenic	novelGene_6514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	22.0050499254653	90	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	349	1275	558677	543191	FALSE	5	TTTCTGTGGGGACCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVLLTARWKELLSFEDVAMFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDVPSTGNRKASRSACPGSEARYKMKKLTSMQTISEELVSYKVSVVKQEKAKKTSEKLFKSNDFVNNFRFALPTSGDEYKKGFFQNFNFIEDQNAQTKKQGKYDEYGKPFSQRSLLVRHKQILTGPKTYECSECGMVLRCETDFVQHQRLHTSENPFECNICGQAFKQMSALTVHKCHPPKKPHKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSREFNPYSTSVYP	571037	542732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_543844_544981_545096_547316_547444_558644_558723_560024_560063_567732_567830_570869
710449	contig_19851_pilon	+	897	6	Intergenic	novelGene_29834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4380.16054500289	21	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTTCCGTGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53508_53607_53703_53927_53980_54061_54146_55673_55772_56006
710453	SIRV4	+	364	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCGTAACAGTTTCCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
710456	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_18482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710458	contig_10042_pilon	+	1578	13	Intergenic	novelGene_79211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	104.638663982297	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	141	1097	1060566	1085540	TRUE	10	AATTTCTTCCTTGGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHKMEPSSYAAEPVSDSGLPALSPPSLRCVPPPAAAVIAPPGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKGSYELK	1059993	1090396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1060080_1060511_1060683_1062004_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1085519_1085695_1090069
710461	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710463	contig_3956_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_14721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243152	240856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_240900_243200
710466	contig_9091_pilon	-	1898	13	Intergenic	novelGene_32424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_9	77.5594753864557	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	344	1606	44206	18674	FALSE	35	AAACTGATTTGAAGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTTLLIELCKLQPGSLPQVLAQATEMLYMRLDTMNTTCVDRFINWFSHHLSNFQFRWSWEDWSDCLTQDPESPKPKFVREVLEKCMRLSYHQRIIDIVPPTFSALCPANPTCIYKYGDESSNSLPGHSVALCLSVAFKSKATNDEIFSILKDVPNPNQDDDDDEGFSFNPLKIEVFVQTLLHLAAKSFSHSFSALAKFHEVFKTLAESDEGKLHVLRVMFEVWRNHPQMIAVLVDKMIRTQIVDCAAVANWIFSSELSRDFTRLFVWEILHSTIRKMSKHVLKIQKELEEAKEKLARQHKRRSDDDDRSSDRKDGALEEQIERLQEKVESAQSEQKNLFLVIFQRFIMILTEHLVRCETDGTNVLTPWYKNCIERLQQIFLQHHQIIQQYMVTLENLLFTAELDPHILAVFQQFCALQA	44549	18381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_18788_24577_24692_25320_25450_28659_28775_31150_31255_32012_32107_33094_33198_34423_34547_37956_38061_40453_40529_40776_40840_43441_43507_44146
710467	contig_1856_pilon	+	2694	2	Intergenic	novelGene_84896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	717	1280	588737	589300	FALSE	25	CATAGTTTCCTGTGATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRVKALVHSSSPSPALNGVRKDFHDLQPETVCQEQTSSLKSADSQNGDLHLHLDDHVPVVIGLMPQDYIQYTVPLDEGMYPLEGSRSYCLDSSSPMEVSAVPPPGGGSSFPEDESQVDQDLGAAPDVFADQPVSGLLIGTTGVLLQSPRARHEDVPPTLTIATSNAESSNPKELQRTPWDRCPCI	558925	590714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_559066_588160
710472	SIRV4	-	264	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1256	1	1256	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
710473	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
710474	contig_14513_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_70262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
710476	contig_11117_pilon	-	2063	13	Intergenic	novelGene_148569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAATGAGGAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67977	17299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_17463_17971_18179_23060_23202_25464_25579_26753_26874_30424_30497_31253_31402_52756_52850_56436_56538_62957_63111_64073_64209_66066_66149_67443
710484	contig_6501_pilon	-	2058	7	Intergenic	novelGene_150576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGGCGCGCGTCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376226	316936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_-_317166_317538_317677_327304_327393_328501_328597_349813_349981_371291_371459_375052
710486	contig_7593_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_127366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGATTTCTTTGGGCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710566	709657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_709700_710600
710487	contig_5145_pilon	+	1529	11	Intergenic	novelGene_131350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	18.7467330487208	444	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	399	1352	52551	66748	FALSE	5	TTGCAGCCTTGGTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEVGKKPNLLQKSRGTSDLSGVGKSDLQSTMLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLDDLQKELATTHYLLGELGANHSEESVKVLDFLSELKDVTAKKDLELRRSFAQVLELSAEASKEAALINQDVWEEAQDPVAVSRWYFYHEGAGGEPHGGDLQNRPLLVNNEPCAP	36493	66925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514_52606_57458_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509_60652_65307_65450_66546
710488	SIRV7	-	288	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91636	2	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
710489	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
710490	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710499	contig_6361_pilon	-	1320	6	Intergenic	novelGene_23869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_5	138.037676016369	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	274	909	62823	55091	FALSE	20	ATCCTACTTTACGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	73786	54679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73569
710502	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710503	contig_1008_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_121620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAACCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117844	1119959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1117800_1120000
710509	contig_6102_pilon	-	2706	9	Intergenic	novelGene_32377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_6	126.025729019911	54	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733466	1728343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184
710512	contig_12786_pilon	+	2075	8	Intergenic	novelGene_103460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	56.1117689281393	180	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	39	881	753288	774492	FALSE	35	GAACATAATTTTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRRPRREGASPAMKFRAKIGDTACLNHFTRTSNMIAKLAKTCTLRISPDKLNFILSDKVTNGGVGMWCELEQENFFSDFQMEGISAEHNEIYVELTSENLSRALKTAQNARALKMKLTNKHFPCLTVSVDMLSVSSSSRVVTHDIPIKVIPRKLWKDLQEPTVPDSDVSIYLPVLKTMKSVVEKMKNISNHLIIEANLNEELNLKIETELVCVTTHFKDLGRPPLASESCSQSRNPEQMAEVRIDIKKLLQFLAGQQVNPTKAICNIVNHRIVHFDLLHEDVSLQYFIPALS	753249	775686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_753340_753981_754110_754193_754371_756134_756243_757367_757443_770025_770126_771511_771632_774409
710515	contig_6710_pilon	+	565	2	Intergenic	novelGene_91972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGATGGCTCTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
710516	contig_7457_pilon	-	1277	4	Intergenic	novelGene_31698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	5	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	126	467	1176842	1174926	FALSE	20	AACAGCTGGCTTGCCGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176967	1174115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
710525	contig_7816_pilon	+	1599	10	Intergenic	novelGene_66494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	784.427856292977	3	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	90	1499	170169	211658	FALSE	45	AGAAAAATGAATTGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESICPGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170079	211758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207622_211473
710530	contig_8330_pilon	+	1692	10	Intergenic	novelGene_71768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	240.12193404576	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	344	1453	651154	658351	FALSE	5	CCGGTGTGTCCGTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVFMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	650810	658590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_651257_651531_651599_653909_654027_654809_654977_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
710531	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_95840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710532	contig_11986_pilon	+	2575	2	Intergenic	novelGene_69192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2894	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	129	551	734107	734529	TRUE	20	CCCTCAGACACCCACCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGRKENADISNRVGGKPKDLLVPGEGTAASQSGRYGKDRQCELENHSGGPSPFTESMRGFTQQETLSASVPGCAFSSERLITLFGDKTAPLFNQLKKNQISRLGLGEVAAIQSSTNISGQMWTVRRSVFFAAVSKIAI	733978	737221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_736274_736941
710533	contig_6589_pilon	-	1682	14	Intergenic	novelGene_26264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	57.1975710164122	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	115	1305	2233261	2228348	TRUE	15	AAGCTTGGCCAGCGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYQGPTGSLP	2233766	2227806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
710534	contig_7760_pilon	-	2097	8	Intergenic	novelGene_138442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	26.6534831357049	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	132	950	265537	257665	TRUE	35	AAACGTCGTAGTGTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSASTPAVAVQTSNASDHQTASPPSGCPVHEGKMRGCPLSTKPSDSTCESKTYSLPAHQERAYEYVECPMKAAASENKENLDPSNLMPPPNQMPAPDQPFPLSTAREESSIPRADSQKKWVYPSEQMFWNAMLRKGWKWRDEDISQKDMYNIIRIHNQNNEQAWKEILKWEALHATECPCGPSLIRFGGKAKEYSPRARLRSWMGYELPFDRHDWIINRCGTEVRYVIDYYDGGEVNKEYQFTILDVRPALDSLSAVWDRMKVAWWRWTS	266226	256224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_256762_257054_257864_258608_258696_260544_260665_261241_261391_262297_262450_265425_265570_266127
710535	contig_19769_pilon	+	664	4	Intergenic	novelGene_102268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1626.49582436189	116	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	34	402	87249	87829	TRUE	15	CCACTTAGCTGTGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKVRNTGPGRVAGGGGPPGPCPHAASARRTSSTIRAAARPLPRWSSGTRIGLKSGQSSLLQPRASTQASSCTAARRPS	86996	89353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87609_87820_87954_89215
710537	contig_6847_pilon	+	2340	7	Intergenic	novelGene_143851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	314.719319394282	270	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	338	1126	77788	100031	FALSE	15	CTTTCCCTCTTAGTGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEVMSLHLERFYSVLCL	74041	101245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888
710539	contig_5153_pilon	+	1730	17	Intergenic	novelGene_74372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	302.10356254106	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	283	1503	1007835	1022174	FALSE	30	CTGCTAAAGTAGATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956683	1022401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_980940_981001_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
710542	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710558	contig_3529_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_105336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATATGTCACCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521550	524195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_521600_524200
710566	contig_9653_pilon	-	2281	8	Intergenic	novelGene_48300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1372.37103033325	1	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	495	950	1009606	1006903	FALSE	25	CCTAGGCTTAATATAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1016632	1005571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006960_1007013_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014137_1014247_1015777_1016036_1016595
710568	contig_6020_pilon	-	1594	8	Intergenic	novelGene_155558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	518.232081017683	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	327	794	349599	291981	TRUE	35	ACTGTGTAGACTATGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYHHRRYP	349925	288174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_288903_290009_290041_291939_292002_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
710569	contig_7333_pilon	+	1491	10	Intergenic	novelGene_142786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.745315525034	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	55	1119	218455	237210	FALSE	20	TGAGTACCCTTCCGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTAASAAVVPTLAPPLEQLRQFAGELRLLMPRVRVFHPADEAAVTVAGEATTLTAAFSRLPLPSPQETQRFCESIRVATEAIIAVYYSLPKDQGITLRKLVRDAVLDIVDGMAQLVEGLFITPTQSPENKDLIFCNTVWAACQQVPRLPRDNKAAALLMLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPSVDDLALSIYPPMCHLTVRINSAKLVSVLKKALEITKASHATPQPEDSWIPLLISAVDHCMNRIKELTQSELEL	218400	237582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_219124_219220_221833_221916_222679_222777_222951_223026_223598_223676_224012_224321_230329_230391_236788_236836_237095
710571	contig_7513_pilon	-	2130	2	Intergenic	novelGene_88945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCTTAAAGAAGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131768	129205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_131195_131627
710585	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710586	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_94144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710589	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710592	contig_7202_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_16779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27874	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710594	contig_4136_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_161261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATCCCAAGATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443588	444207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_443600_444200
710599	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
710600	contig_15182_pilon	-	2828	1	Intergenic	novelGene_136432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	371	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACCCAGATTAGGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245522	242694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_242700_245500
710603	contig_14133_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_119982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTAAAATTCCTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282626	280007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_280000_282600
710606	contig_11752_pilon	+	1174	7	Intergenic	novelGene_37650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1365.5842461501	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	40	852	85091	105606	FALSE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESSEGLVEHLQAMGLDGALLRFHGASWNRLLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQNNLSFFIQHE	85051	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_87159_87188_87299_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_105574
710609	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
710619	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710620	contig_14333_pilon	-	1598	4	Intergenic	novelGene_49148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	166.831918075915	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	332	775	445845	441607	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAGATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILLVIYRPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIWWFVDLILLITGGLMPSDGSNWCTVY	446986	440783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441821_443131_443248_445731_445872_446681
710630	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710633	SIRV4	+	341	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTGCACTGGGGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
710641	SIRV2	+	331	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	263	-71	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
710647	contig_18272_pilon	-	2195	2	Intergenic	novelGene_7067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCACACAGGGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515549	511955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_512713_514111
710656	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_96121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
710657	contig_12250_pilon	-	1724	6	Intergenic	novelGene_80644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	164.210352901393	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	401	1465	379717	375947	FALSE	25	GAATCAGTATCTGATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380117	375687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_379009_379194_379537
710661	contig_6929_pilon	+	3175	10	Intergenic	novelGene_139438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	7.84730825911537	54	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	100	1176	274947	288477	FALSE	15	TGGCATGCTGTTATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSWLSSCLITLIFLQLPAQGSGDASKFQLVWLGGTAELLCPLDLWPSLELTEVRWLRSPHSQLSQAIHVFRNGKDWDEDQMPEYKGRTELVRDTQQGNVTLKIRDVQPDDQGQYRCQIQIGNLTKEGSVTLQVAVLGSDPYIHVESYNAGWIHLVCRSVGWFPKPSAEWRDPQGTELPPLSQAHVLEEAKLFRITVFTRVRDSTLGNVTCIIHNSILGQEKTAAMVIAAPSPASVSFSTVALAVILPVLGLLIIGGIYLIWKQRRSKEKLLYEQVMEVENLLSDHAEEKGNYLYRVRDREQILVEKSCSKLRLEKGPAALCGRDPGSGHSASQTRPLPGPKMCEARRQKAACA	251360	290476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_251449_274935_275026_275801_276141_277058_277341_278812_278930_279695_279729_282096_282170_286359_286387_286477_286505_288377
710663	contig_11448_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_66448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAAGAGTATATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697657	695381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_695400_697700
710668	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14431	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
710671	SIRV6	+	420	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10405	1	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11405	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
710677	contig_6710_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_98160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710678	contig_12837_pilon	+	1863	2	Intergenic	novelGene_57366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATAAGATCTCAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292619	296212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_293296_295025
710679	contig_5084_pilon	+	2553	1	Intergenic	novelGene_64530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1753	2064	494507	494818	NA	75	AAAGAAAAAAAAATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYTVSSQSDERESPCRGGPHLYISRCSGFLLSLDPAAASCHLISCSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSLTCESWACQLLQLCDLGKASTLIHRLGMF	492754	495307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_492800_495300
710680	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91673	0	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
710684	contig_7513_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_88999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2091	2390	609454	609155	NA	70	TATTCTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLKGGTCPGRIYPSGNTFFSYSFFSPKLLVLCQTPNTPEERIKTTKVKMQISKLPAHLTSGSIWACFSPGTSHCKYSSSFSLLSKTCLTEKSLIHML	611544	609092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_609100_611500
710685	contig_12622_pilon	-	1158	6	Intergenic	novelGene_5975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2460.1989675634	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	18	890	1590968	1583825	FALSE	35	TAACCTTCAGAAGCGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHNSPLQTKPTSARTASSGA	1590985	1583556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583880_1588858_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
710694	SIRV7	-	920	5	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	36	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114961_147608
710706	contig_602_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_134947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467797	466117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_466100_467800
710709	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657839	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657841	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710713	contig_3414_pilon	-	2081	15	Intergenic	novelGene_80969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	386.287721888274	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	16	1686	101974	67173	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVCLHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65128_65308_65395_67032_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89931_95086_95204_95418_95642_98057_98187_101892
710715	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710716	contig_7963_pilon	-	564	4	Intergenic	novelGene_58343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2245	junction_2	415.315408923012	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	124	342	40037	38897	TRUE	55	TAAATAATCAAAATCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	40160	38344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949
710720	contig_14508_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_79052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGCCTCATGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67133	67685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_67100_67700
710724	contig_16594_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_53932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329908	327935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_327900_329900
710727	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	93	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710731	contig_8674_pilon	-	1731	14	Intergenic	novelGene_102949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	55.4721530437895	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	446	1360	723870	707008	FALSE	15	TTATCCTGCTCTTCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727575	706636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_726863_726959_727042_727120_727434
710732	contig_5698_pilon	+	1723	11	Intergenic	novelGene_55052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	32.6449077192753	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	63	926	44945	47577	TRUE	30	ATCTTGTTCTATGCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPTLCLTQSQVVKHLPKAHILACAPSNSGADLLCQRLRVHLPSSIYRLLAPSRDIRLVPEDIKPCCNWDAKKGDYVFPAKKKLQEYRVLITTLITASRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHSMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGGQLVLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGHSLLERLLSYNSLYKKGSSGYNPQFITKLLRNYRSHPTILDIPNRLYYEGELQACADVVDRERFCRWEGLPRQGFPIIFHGVMGKDEREGNSPSFFNPRRGCHSDFLLEAAPGPLL	44882	50403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_45140_45364_45469_45636_45735_45831_46049_47110_47229_47445_47640_47896_47972_48928_49055_49135_49225_49872_49995_50080
710734	contig_10923_pilon	+	1792	10	Intergenic	novelGene_66168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	774.588556653638	2	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	516	1676	29537	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13802	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23122_29407_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
710749	contig_6436_pilon	-	2701	17	Intergenic	novelGene_134918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	204	junction_7	312.948771516601	590	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	58	2109	930017	889530	FALSE	20	TCTGCCCAGAGTGGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSVWLLPLALALALGPAATLEGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKLIGTNKKYFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQLYTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLSAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVDRRVLTDELKHGMSLTSMYQNSDIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTVTNNMQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTLLESDGQFTLLAPTNEAFEKIPAETLNRILGDPEALKDLLKNHILKSAMCAEAIVAGMSMETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDTLATNGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLNTHLSGNERLTLLAPLNSVFKDGTPTIDAPTKDLLLNHMIKDQLASKNLYHGQTLDTLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIAAHDKRGRYGTLFTVDRMLTPPMGTVMDVLKEDPRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVFAPTDEAFQAMPAEELNKLLGNAKELANILKYHIGEEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVSSRNNTVYVNKEPVAEADIMATNGVVYAITSVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAFSKASQRSVRLAPVYQRLLERMKH	930074	888937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_889571_890043_890069_891142_891223_895574_895678_896884_897010_899580_899712_900553_900691_901655_901802_902409_902548_903409_903623_906545_906688_908670_908818_909090_909256_909645_909807_911150_911216_924733_924833_929883
710750	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710754	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710759	contig_1084_pilon	-	2162	8	Intergenic	novelGene_152389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_7	73.8564520553491	195	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	423	1253	565857	538640	FALSE	60	TAAAGCTTATAATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVILDNYDLASEWAAKYICNRIIQFKPGQDRYFTLGLPTGSTPLGCYKKLIEYHKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGLPRNHPESYHSYMWNNFFKHIDIDPNNAHILDGNAADLQAECDAFEKKIKEAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSRTRLKTLAMDTILANAKYFDGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREVMILITGAHKAFALYKAIEEGVNHMWTVSAFQQHPRTIFVCDEDATLELRVKTVKYFKGLMHVHNKLVDPLYSMKEGN	569155	537730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_538702_546100_546276_551706_551892_559741_559925_560979_561082_565733_565896_568478_568748_569040
710760	contig_5899_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_146960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCAGAAATTAAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35670	34053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_34100_35700
710762	contig_7594_pilon	-	1958	3	Intergenic	novelGene_55415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1378	1740	538851	538489	FALSE	65	ATTAAGAAAAAAAGACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERKVIPASSEVKRFSDFPSKAFLSTFTWRVAKSDCSDGPFNHQIPVSFTHYFNNHTGNTLLILLFYIIIIFIFLLTKNSISQSSSLTNYKKINSRWIMDLNVKSKTIKLQNDTGRISS	558908	538270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_539975_557079_557241_558815
710763	contig_11052_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_115467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105567	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_105600_107800
710772	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710773	contig_6059_pilon	-	1088	8	Intergenic	novelGene_44815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6197.79784459359	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	24	617	573183	569223	TRUE	25	ACATGATGTTATACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSK	573206	567790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568202_569162_569226_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
710778	contig_5718_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_110316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464330	461877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_461900_464300
710785	contig_10163_pilon	+	2206	8	Intergenic	novelGene_82626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	116.250784504704	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	113	1333	120881	152467	FALSE	30	AATTTTACTGCTTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRVNKFFLFLLTLFNLYNGFFFFFPFKITEMIIDMSVTPQIVLEMITSA	87381	153340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_87463_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146
710791	SIRV4	+	312	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1439	652	984	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2439	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
710793	contig_4093_pilon	-	1563	7	Intergenic	novelGene_27639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1838.02273743644	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	39	776	69245	41737	TRUE	45	AGGGAAATAACTTGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPTPDTEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72462	40860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41507_41595_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
710802	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_89523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710804	contig_3956_pilon	+	178	2	Intergenic	novelGene_15262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285710	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285774_1290900
710808	contig_14925_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_55225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAACAACATACTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28825	30127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_28800_30100
710809	contig_5551_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_134273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGATTGTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745308	746520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_745300_746500
710812	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
710814	contig_2646_pilon	-	1850	13	Intergenic	novelGene_69631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	138.696986869458	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	67	1698	2077238	2069499	FALSE	10	AAGGTCCCTCTCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2077304	2069346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071480_2071662_2071765_2071890_2071954_2075201_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145
710820	contig_11994_pilon	+	2160	11	Intergenic	novelGene_129349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	65.2509770041798	269	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	382	1623	95169	108340	FALSE	30	GCTGATGAAAAAGGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93717	108877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93885_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
710821	contig_14780_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_166383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTTACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80120	79808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_79800_80100
710824	contig_8674_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_102898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146755	148143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_146800_148100
710826	contig_5586_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_143523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273216	275538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_273200_275500
710832	contig_5514_pilon	+	1277	5	Intergenic	novelGene_75284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	158	junction_2	254.840513851311	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	142	1134	66040	68726	FALSE	15	TTGGACCTGTGAGTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEGLDTAASSTAPSTATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	65403	68869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
710833	contig_3817_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_78290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATTTCTGTACACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83110	85184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_83100_85200
710835	contig_17989_pilon	-	1356	7	Intergenic	novelGene_150808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	539.013192994589	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	52	825	206853	201145	FALSE	10	CAGGCCTGGGTGAGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAGEEQPMETTGATENGHEAAPEGESPAGVGAGSATGAVAGTAAPPAGNQNGAEGDQINASKNEEDAGKMFVGGLSWDTSKKDLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDSTSVEKVLDQKEHRLDGPEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKSNKRRGFVFITYKEEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVYQQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGSGGQGSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY	206904	200613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_202346_202465_204529_204662_204856_204898_204981_205016_205676_205846_206644
710838	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
710840	contig_10732_pilon	-	1446	4	Intergenic	novelGene_114754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_3	26.1916017074176	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	3	638	576316	573306	FALSE	10	TCACGGTCTCCTTCCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576318	572497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574129_574368_576262
710842	contig_7457_pilon	-	477	5	Intergenic	novelGene_31287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	34	444	160764	157884	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161041	157850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
710845	contig_5374_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_166392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAATGTGTGGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209886	211743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5374_pilon_+_209900_211700
710848	contig_9527_pilon	+	1899	8	Intergenic	novelGene_134088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	16	junction_1	18.5351293604378	585	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	121	1467	615826	625436	FALSE	20	TCAGCCCATGGATTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTPEVKSRGMKFAEEQLLKHGWTQGKGLGRKENGITQAIRVTLKQDTHGVGHDPAKEFTNHWWNELFNKTAASLVVETGQDGVQIRRLSKETTRHDRPKPNLLYQKFVKTATLTSGGEKPDKDLENCSDDDNQGPKTPKILTDEMLLQACEGRTAHKAARLGITMKAKLARLEAQEQAFLAHLKGQDPGAPQPQSDSKPPPKKKKKKQKEEAAAPVAERNGEEEHREQTDHSNRKSKKKKRRHQEEKVPEEREGTIENEEEEAAGTGGLGELKSREQTDQPLRKRKKKRWQQEEGGILAKGEGGKEAAGGVRTEEVENRAYTDPCSQSKKRRQREEEDSLKIEDEEGEAASGDGRTGEAASKACNDLGIRRSKKKRKRHREEEAVLDRKGEEDETGGGGGTREAESRTRTGPGSRDKKRKQQHPEEGRAVVSTGQRAKKKKEKKRD	612792	625868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_612856_615768_615905_616383_616458_616558_616652_616751_616839_618562_618655_618888_618940_624565
710850	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
710851	contig_10437_pilon	+	1401	9	Intergenic	novelGene_38289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1273.88656652584	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATATGCTTAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431116	451671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432200_439691_439815_441717_441863_443762_443966_445309_445476_446951_447055_451075_451396_451517
710852	contig_5445_pilon	+	1219	4	Intergenic	novelGene_135420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1341.9220046883	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	721	1059	52520	53758	FALSE	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCFLPVIPLPVLFLSNTELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51686	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51957_52069_52635_53127_53240_53646
710856	contig_10523_pilon	-	1355	5	Intergenic	novelGene_120947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	489	junction_4	421.693609152427	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	164	721	39240	20830	FALSE	35	AGAATCGACTCCACGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQVCLWRPPHRLPSREASMRPQENAFEAQVLGVF	95301	20195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
710864	contig_3975_pilon	-	1402	12	Intergenic	novelGene_54855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.332209431088	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	101	1342	2066301	2056443	FALSE	20	TGTTGAACGTTGTACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTASFLSPGDQELLEGWDFV	2079241	2056382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056495_2060055_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
710865	contig_17074_pilon	+	2497	7	Intergenic	novelGene_145169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	683.71056660614	3	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	301	1242	610974	635439	FALSE	35	TCTCTGGGAAGCTACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVLQGGPHACPSSHPGPGWRGH	563487	636694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_578712_578754_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238
710868	contig_12250_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_80567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	466	825	295884	296243	NA	30	CCCAGCAGCATACCTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLQTVFPPPSHLETPAPGIPACCYLHSCSSLLSLGHGMSPSPSLHSSSGLWPDPSLSITCVTVSPGSAAQPCMQCWNNLAQDTGDLTSDRHPGKWWAGGRQGVWHWPDGLDSSLVTS	295418	296611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_295400_296600
710870	contig_9345_pilon	-	1675	13	Intergenic	novelGene_24425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	94.2789522286567	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	16	1539	277583	266016	FALSE	0	GCTGCGTTGTCCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVSKKMAASAVCRAAGAGARALLHARGSVRLWPEREDAGHGDAGRGVSKHGRGSAPALLRAPALRGTATFAQALQNVPETQVSLLDNGLRVASEQSTQPTCTVGVWIDAGSRYETEKNNGAGYFVEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLADIVQNCSLEDSQIEKERDVILRELQENDASQRDVVFDYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSRHYKAPRMVLAAAGGVEHRQLLDLAQKHFSSVSGTYAEDTVPTVEPCRFTGSEIRHRDDALPLAHVAIAVEGPGWANPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGKHLSSPLASVAAANKLCQSFQTFNICYAETGLLGAHFVCDRMTIDDMMFFLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLSEWESRISEVDARVVRDVCSKYFYDQCPAVAGFGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF	277598	265879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_266081_266519_266596_266946_267036_267348_267435_267540_267702_267828_267973_268204_268321_269831_269912_270476_270676_270897_271028_272003_272091_277095_277237_277433
710871	scaffold_6394_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_111054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAAAGCCACCCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446586	447462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_446600_447500
710877	contig_2892_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_118973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATTTCTTTGCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8560	8337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_8300_8600
710878	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	29	361	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14437	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
710879	contig_10436_pilon	-	907	4	Intergenic	novelGene_108495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	121	474	103480	102032	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103600	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
710886	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710889	contig_16303_pilon	-	1994	8	Intergenic	novelGene_34067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.336400540705	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	104	1183	45428	35759	TRUE	25	CCTTGAAGTAAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARALQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45531	32995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33320_35271_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40719_45370
710893	SIRV1	+	252	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATGACTCAGGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
710898	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	145	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710900	contig_935_pilon	+	1968	11	Intergenic	novelGene_45554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAACCCCCCGGGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345104	377441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_345497_346641_346785_352424_352742_358166_358306_359242_359403_361934_362048_362131_362248_362613_362758_368077_368292_370637_370820_377393
710902	SIRV6	-	227	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACTAAAACCAGGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
710904	contig_9482_pilon	-	1406	9	Intergenic	novelGene_44311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	157.904045230007	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	188	1180	1245328	1236365	FALSE	0	GCCTTTCTCTTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253188	1236138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241040_1241128_1245325_1245387_1253059
710905	contig_17753_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_105100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGTGAGTAGGGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123343	125337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_123584_125021
710910	contig_4364_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_3403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
710911	contig_6501_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_150572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTCCTAAAGCTCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261063	262837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_261100_262800
710913	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAAAATTTGGCTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73586	73356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
710914	contig_12923_pilon	+	1767	10	Intergenic	novelGene_30107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	1426	1767	75852	101258	FALSE	20	AGTGCTGACGGGCACACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGPQPESILCFIHVYFKVFSFLFLSCWGFSLSRSTEHILHSTGRVGHLCVFHSCFTGQRGVPQALWASFRIRCCGTQVRLVRHLTQCSALCFPDSPAATVLATAARNRLPPRL	45435	101258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_45976_57250_57334_57447_57631_62785_62962_64467_64618_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93728_101168
710921	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710925	contig_7202_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_17757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
710927	SIRV6	+	340	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1667	0	-232	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2791	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
710933	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710934	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710935	contig_2078_pilon	+	1090	6	Intergenic	novelGene_100133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	105.976601191018	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	42	890	266439	345038	TRUE	50	CAAAGAGAAACTATAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKDQITEAQKQNQIHCCQVDSNP	266397	402015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_344973_345091_401867
710937	contig_20844_pilon	-	1058	11	Intergenic	novelGene_78607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	363.070571652399	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	30	1058	209140	204725	FALSE	15	CCTCCACGTGCTCCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAESWSLCRPPRARQENTCHQAYGTGPAAAGSPCSPTAEPMIMPPSALPICPRTRGRPICRNSSGPLAPSPASTWRRTRPPASPRALPSSASTAARMPPAPSLGCPASATTTSSSMSSGPSHQQTKPGATMAAAQALVSGPFATGGGFQQQDSKGNKKGSDH	209169	204724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206635_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
710938	contig_3948_pilon	+	1605	2	Intergenic	novelGene_53355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	36	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATAGCAGGCTCGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614416	1616670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1615085_1615733
710942	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_89534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
710947	contig_14687_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_107955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601596	600997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_601000_601600
710954	contig_10235_pilon	-	2259	13	Intergenic	novelGene_46395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	30.168968604622	7	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	998	2017	182616	177880	FALSE	10	TCTACTGGCTGGCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	183613	177637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532
710957	SIRV2	-	654	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	0	2963	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
710958	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
710959	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710960	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
710961	contig_11720_pilon	-	2064	11	Intergenic	novelGene_43898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_10	129.083074025993	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	62	823	124506	118106	FALSE	10	ACCCTGTATGGCTCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	124567	116864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472
710964	contig_14575_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_101893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTGAGCTCTTAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28996	29774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_29000_29800
710972	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
710987	contig_19352_pilon	-	1299	2	Intergenic	novelGene_122369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1684	junction_1	0	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATTGTGTGTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106239	103142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884
710989	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
710994	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711000	contig_14322_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_116101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
711002	contig_2332_pilon	+	1526	7	Intergenic	novelGene_58714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	28.5525830705385	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	27	941	808593	857531	TRUE	35	TAATAGCAAAATGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTALLKLFVAIVITIILILPEYFKTPKGNVLELSCLEVCLQHNFTYSLSVLNFSFMTLLQPVREGQIIRGIFLNQSSFQNFTKLCQDIMSEFKMCSSCLVCESKGNMDFISQEQTSKVLVMRESMNVKASDFHLPCQHFNFTVASIVDPLEEYNITCNLNTHTRKSAIMVEDSAKENSINHSCRITEGLNSCIHVSLHLEMDIKSVICSMKITWYVLVLLIFILLIIFVIHKILEGHRRMQKWQSHKYKPTSVLLRESDSEKLRTLNVRVILGETMQRQPPTQVNMLLAPIPELEVTSAMYQ	808566	861243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_808681_829351_829622_833045_833307_839941_840062_842350_842435_857439_857546_860672
711005	contig_10892_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_116756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170406	169044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_169000_170400
711008	contig_15407_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_123088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTGTTGTTGTTAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496829	494698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_494700_496800
711009	contig_6017_pilon	+	1938	2	Intergenic	novelGene_152539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGAAAGAGGGAGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440252	442545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_440808_441162
711010	contig_500_pilon	+	1420	10	Intergenic	novelGene_31046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1218.79203504591	3	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	600	1013	1496587	1498065	TRUE	10	CGGGCATGTTTGACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485768	1499583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492655_1492727_1493615_1493714_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499279
711011	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711021	contig_12923_pilon	+	1961	15	Intergenic	novelGene_30172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	134.355453015879	28	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1083	879	1961	311762	349180	FALSE	30	TGGGATAGTGTCATTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQSLNKMGCKETTLNKVMNG	310784	349180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344041_349125
711022	contig_5261_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_102488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751320	750325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_750300_751300
711024	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_98022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711025	contig_4891_pilon	+	1177	7	Intergenic	novelGene_124567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	538.435284463746	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	278	781	707907	756030	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSG	700989	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701132_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756031_756590
711027	SIRV6	+	320	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10505	1	1268	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11505	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
711033	contig_10940_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_49201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	614	1042	439812	439384	NA	25	AAGGTCTTCATAACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKLAIPRNPLNCLHVLGEARLQMVSVLSDSEHLCLWEMKKPRYFTSVRLTCDFPKDTWYPPLARKFKIVTESSSDSLPIRRSSTYWRTASWLRGGNCSRSWASTVPKIVGNFLKPCGSTSNRAISFLCPLPIRKQRSAGS	440425	439273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_439300_440400
711034	contig_10940_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_49200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAATGAAGAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439015	436247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_436200_439000
711036	contig_12638_pilon	-	1397	2	Intergenic	novelGene_33260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGCCTAGGAGTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823107	817608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_817685_821786
711042	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711048	contig_16907_pilon	+	2094	11	Intergenic	novelGene_87438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	108.88636278249	4	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	909	1436	413644	426888	FALSE	20	TGTCTTTATTCTACTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPEKVKPGEKHYNMEKSYPNEEKDAWDVKTLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKVCSFYFLTSVMPHLFL	392306	427546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_392526_402644_402778_403120_403173_407732_407864_408680_408770_412268_412438_413528_413683_415761_415852_417771_417886_426491_426637_426748
711062	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711066	contig_5013_pilon	-	2202	3	Intergenic	novelGene_110095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	359	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	35	331	216357	205704	TRUE	20	TGTTTAATCCTCCCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPARDLQKKLAMALRPGEYFWPAFGLRLLLMTMFQAVSAFGAEFSSEACRELGFSSNLLCSSCDLLGQFSLLQLDPDCRGCCQEEAQFETKKVLFSSISLPLDGLIEIR	216391	199754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_200686_204763_205926_216282
711067	contig_9363_pilon	-	1790	4	Intergenic	novelGene_6686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	120.36887748362	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1294	1599	1272901	1271913	FALSE	20	GTCGGCATAGCCAGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCLPSASTFSASSVCEAAMRHARGSAPSATQPLVPTTSTVSTSAEPVTQGTLEHLQALGAVPPAPPYPSGGRTSPEGKGQTSHWANFQSFQAEELHPATL	1276488	1271721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272010_1272692_1272942_1275152_1275255_1275337
711071	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711072	contig_5041_pilon	-	1746	8	Intergenic	novelGene_27097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1219	junction_7	382.301675942666	12	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	9	1304	616721	572758	FALSE	70	CAGAAAGAAAAAAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQVKQINFEFPS	616729	572315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559
711074	contig_20561_pilon	+	2256	6	Intergenic	novelGene_166372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	71.6770535108692	62	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	286	591	93295	94548	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIEIVGKINVTSTACVHEFSRFFWRLCRTFGKIFTNTKVKPQFQEILRLSEENIDSSAGNGVLTKATVPIYATGVLTCYIQEEDRKLLVGFLEDVMTLLSLSHAPLDSLKASFVELGANPAYHELLLTVLWYGVVHTSALVRCTAARMFEVCQQMPLLVQIIMIFFGRGRGNVKEKKKVLYLPFYVEVYFMALNSV	84228	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_84343_86357_86407_88076_88157_93252_93360_94307_95504_97788
711075	contig_10372_pilon	+	1508	9	Intergenic	novelGene_112511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	463	junction_1	267.277477539728	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1425	82	1506	28839	85596	FALSE	50	AAGACTCCAATTGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNVKKSSGAGGGGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEGKMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDSLFMMKELAGAK	28757	85598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_29028_48903_49152_78432_78580_81391_81549_82564_82687_83020_83159_84585_84674_85059_85192_85392
711076	contig_602_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_134979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	571	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAGCTAACAAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638441	640714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_638400_640700
711079	contig_6230_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_102097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTACTCATCAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120475	122339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_120500_122300
711080	contig_20889_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_127654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1149	1505	60395	60039	NA	70	AAAAAAAAAAAGGAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTGVLGLVKVRKASSGICELHTPQPKRDFSCFIQISFPPHRPDPSKDSCLLVPPDTVVLDECHLHSPQVFLLLLCENKWVQLTWCSWRKAYHEGRQGTAMNTSLTLSQYFGLQGLWR	61543	59686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_59700_61500
711081	contig_6316_pilon	+	1687	2	Intergenic	novelGene_134695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_1	0	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	177	305	140538	140666	FALSE	65	GGAAAAAATGAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGETAVPPFCGVFVAVVGGGRRRFDDSSRPKGLLLLQRCGIPNALTALIGIAEKAGGMKATVEVTNGRGGLTVAHKRTGIVKNHILSLKNLIGKLLLSY	136263	142048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479
711082	contig_1009_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_121733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169136	172719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_169100_172700
711088	contig_10013_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_125052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTAAAAAAAAAAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240695	239944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_239900_240700
711096	contig_15063_pilon	+	947	3	Intergenic	novelGene_14419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	60	803	35349	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35289	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
711097	contig_16948_pilon	+	203	2	Intergenic	novelGene_166412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTATGAACAATTAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327563	341158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_327651_341042
711098	contig_16948_pilon	+	2767	8	Intergenic	novelGene_166419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	96.1092065924838	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	26	1213	386778	405910	FALSE	25	GTAACCTGAATCCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLSALWGMKSVFDMKHSFTEDHYVEFSKHSQDRVIGTKGDIAHIYDIQTGNKLLTLFNPDLANNYKRNCATFNPTDDLVLNDGVLWDVRSAQAIHKFDKFNMNISGVFHPNGLEVIINTEIWDLRTFHLLHTVPALDQCRVVFNHTGTVMYGAMLQADDEDDLMEERMKSPFGSSFRTFNATDYKPIATIDVKRNIFDLCTDTKDCYLAVIENQGSMDSLNMDTVCRLYEVGRQRLAEDEDEEEDQEEEEQEEEDDDEDDDDTDDLDELDTDQLLEAELEEDDNNENAGEDGDNDFSPSDEELANLLEEGEDGEEEDSDADEEVELILGDSKYRADHQAKPGQRPGEAPSLGPAQLRGQHSRVLCPWLRTLHSQPLEEKQAVISDPLLAHPMCKQLAVTCYL	386752	407464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_386801_387339_387425_389838_390073_390728_390823_391220_391326_391539_391614_392145_392248_405439
711102	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_114042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	31	348	14409	13869	FALSE	25	ATTACTGTCAGTATGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14439	13867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
711104	contig_1836_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_71060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAAAAAAAGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910665	911707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_910700_911700
711107	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
711110	contig_5711_pilon	+	1430	4	Intergenic	novelGene_80285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_2	313.698723122822	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	988	1398	202949	206493	FALSE	65	CACCACCAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKTSEAKIKHFDGEDYTCITFQPDLSKFKMEKLDKDIVALMTRRAYDLAGSCKGVKVMFNGKKLPVNGFRSYVDLYVKDKLDETGVALKVIHELANERWDVCLTLSEKGFQQISFVNSIATTKVSTLLVSKSVAE	198528	206525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_199403_202165_202264_202933_203147_206280
711116	contig_6418_pilon	-	1149	12	Intergenic	novelGene_81100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	298.159145479487	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	56	895	106563	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118003	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69677_72407_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
711120	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_98090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711123	contig_6163_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_103785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6238057756947	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	175	828	9706	13721	TRUE	50	CATAGTTCTAAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRLKTRKSVTS	9531	16567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13691_13846_16318
711126	contig_7202_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_18614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCTTCACCAATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	28584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
711132	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711135	contig_546_pilon	+	2197	11	Intergenic	novelGene_117241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_8	54.2557831018961	520	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	8	814	432314	464115	FALSE	55	TGATTTTAAAAATAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSMAVFADLDLRAGADLNALRRLVENAAHLGYSVVAINHVIDFKEKKQEIEKPVAVSELFTTLPVVQGKSRPIKILTRLTIIISDPSHCNVLRATSSRVRLYDIVAVFPKTEKLFHVACTHLDVDLVCITVKEKLPFYFRRPPINVAIDRGLGFELVYSPAIKDSTMRRYTICNALNLMQICKGKNIIISSAAEGPLEIRGPYDVANLGLLFGLSESDAKAAVSTNCRATLLHGETRKTAFGIVSTVKKPRSSEEDDSSLPACKKAKCEG	432306	465498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_432396_434172_434229_434760_434818_435224_435300_436223_436296_449749_449840_457549_457667_458256_458287_458699_458738_459118_459199_464005
711137	contig_14441_pilon	+	1105	7	Intergenic	novelGene_100418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435.204070906205	9	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	13	579	81887	125725	TRUE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRLLCCVVLCLLGAGAEDAVVTQFPRHRVLGKGKELTLECSQKMNHLVMYWYRQVPGHGLQLIYYSTGTGSIEDGDVTEGYSVSRDKTQNFPLTLASTSPSQTAVYLCASSEGTATYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHRGQHGPRAAAGAQRR	81874	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82369_121191_121239_125517_125637_125677_125902_126159_126283_126514
711147	contig_20374_pilon	-	1434	11	Intergenic	novelGene_166009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	75.3880627155255	302	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	199	1326	20872	3786	FALSE	30	TATAGCTCTTATGACGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISNFPVLQMHKSQTAMRASQKDFESAVNQMKLLTKDPGNEMKLKLYALYKQATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLRDFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDIVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYMFPKIMGSAKAAEMLIFGKKLTAREACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAYSKLPPNAMRISKQLIRNVEKEKLHAINSEESSVLQGRWLSDECTNAIMNFLSRKAKL	23152	3677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128_5273_6728_6819_8068_8190_8942_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_20713_20877_22691_22825_23091
711151	contig_9436_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_60934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGATTAGAACTGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448106	447815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_447800_448100
711161	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
711162	SIRV6	+	693	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8193	18	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
711163	contig_12250_pilon	+	2307	6	Intergenic	novelGene_80613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.7111192451597	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	847	2235	351433	354698	FALSE	15	CTTCTCTTCTGATTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPFFLTWSVVNSVHWANGSTQALPATTILLLLTVWLLVGFPLTVIGGIFGKNNASPFDAPCRTKNIAREIPPQPWYKSTVIHMTVGGFLPFSAISVELYYIFATVWGREQYTLYGILFFVFAILLSVGACISIALTYFQLSGEDYRWWWRSVLSVGSTGLFIFLYSVFYYARRSNMSGTVQTVEFFGYSLLTGYVFFLMLGTISFFSSLKFIRYIYVNLKMD	349343	354770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349748_350178_350552_351363_351968_352256_352443_353491_353766_354304
711165	contig_14441_pilon	+	1205	5	Intergenic	novelGene_100381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	591	1019	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	30751	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_31145_112105_112154_116578_116963_117220_117344_117539
711166	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	585	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711169	contig_6710_pilon	+	563	2	Intergenic	novelGene_94696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGGTTCCTCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
711171	contig_12654_pilon	-	2625	7	Intergenic	novelGene_129250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	121.856017040148	282	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	266	1123	53099	34525	FALSE	20	TTTCTTATATGTATGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAATVDHSQRICEVWACNLDEEMKKIRQVIRKYNYVAMDTEFPGVVARPIGEFRSNADYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFMNEQGEYPPGTSTWQFNFKFNLTEDMYAQDSIELLTTSGIQFKKHEEEGIETQYFAELLMTSGVVLCEGVKWLSFHSGYDFGYLIKILTNSNLPEEELDFFEILRLFFPVIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVAEQLELERIGPQHQAGSDSLLTGMAFFKMREMFFEDHIDDAKYCGHLYGLGSGSSYVQNGTGNAYEEEAHTQS	54813	33022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_34654_35801_35913_38380_38526_40931_41094_50708_50903_52982_53194_54642
711179	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711180	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711181	contig_8616_pilon	-	1067	5	Intergenic	novelGene_72434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_4	418.349958168995	1372	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255523	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302_254668_255372
711182	contig_17936_pilon	+	300	2	Intergenic	novelGene_29988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAACCCTATGCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209783	225999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_209859_225774
711183	contig_15304_pilon	-	1047	3	Intergenic	novelGene_30539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	34	junction_2	1383	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	199	330	54100	53777	TRUE	20	CCAGAAGCAGCCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKFQAAPLYATQA	54298	52887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_54004
711185	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_95832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711188	contig_11281_pilon	+	1874	11	Intergenic	novelGene_125424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	252.705836893413	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	314	1261	215142	237909	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLHSKWKRNRKGEKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVAEFSAADNHILPNESAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEVERQRRLERIKQKQSQLQELILQQIAFKNLVQRNRQAEQQANRPPPSNSVIHLPFIIVNTSKKTVIDCSISNDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGSISGVFVTSSGSTSNGTRLSASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETPVSYVGEDDDDDDDFNENDDED	124348	238522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_124435_126602_126679_178695_178763_215057_215165_224868_225035_227028_227173_228437_228507_230872_231025_231738_231906_233428_233508_237761
711194	contig_19777_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_29707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	467	949	13413	13895	NA	15	CCCACCCACCGGCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPLPNTLKDFWRMVWEKNVYAIVMLTKCVEQGRVSILKTLVFFKKTLPQTFVPLFLETYFLSPIKEKLKKNYFVIAFLCEQTPMFSIPELLQLEFLNSRSWVSAVEKLPGSKQENAAYCLAPSLISCVSTSPSCVSATSCFICDRRDSNNSVIFKLSF	12946	13994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_12900_14000
711198	contig_6445_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_77023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTGGGGATACCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530760	529601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_529600_530800
711213	contig_5715_pilon	-	2339	4	Intergenic	novelGene_127982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	328	junction_2	17.2111075245674	67	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	200	634	659441	635131	FALSE	15	ATTTCCTTTATTCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSCKIHFYFLM	659640	633425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_635331_637616_637678_645335_645416_659347
711220	contig_10627_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_59916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCTCCAGGAATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33057	31195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_31200_33100
711227	contig_4496_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_66648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718961	720138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_719000_720100
711233	contig_2758_pilon	+	1592	4	Intergenic	novelGene_166432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	140.98305650759	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	85	1590	35671	58323	FALSE	25	TAAGATATTTGTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLEEKNATVVYNPKLQTPKTLQDAINDMGFDATLHNPNPLPVLTDSVFLSVSSSFAPPWDHIQSTLLKTKGVTDIKISPQQRTAVVTIIPSIVNANQIIELVPGVSLDTGTLEKKSGTCEDYSMAQGGEIMLKMKVEGMTCHSCTSTIEGKIGKLQGVQRIKVSLDNQEATVVYQPHLITVEEIKKQIEAVGFSVFIKKQPKYLTLGAIDIERLKNTPVRSSEGSEQRSPSYTNDSTATFIINGMHCKSCVSNIESALSTLQYVSSIAISLENRSANVKYNASLVTPETLRKTIEAISPGQYSVSITSDAESTPSSPSSSYHQKIPLNIVSQPLTQETVINIGGMTCNSCVQSIEGVISKKAGVKSIQVSLVNSSGIIEYDPLLNSPETLREAIENMGFDAALSDVNEPSVLITQPSSEMPLLASANEFYAKIMTPVHDKEETRTSSKCYIQVTGMTCASCVANIERNLRREEGIYSVLVALMAGKAEVRYNPAVIQPPMIAEFIRELGFGATVIENADEGDGILELVV	35586	58325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_+_36077_36813_37540_54893_55101_58156
711241	contig_6557_pilon	+	520	4	Intergenic	novelGene_32980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11115	junction_1	743.46889645768	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	40	477	435138	440040	FALSE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFAAIAEAAAAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434245	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435306_436630_436772_439911
711242	contig_13905_pilon	+	1344	4	Intergenic	novelGene_130427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	33	353	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218481	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_228872_229007
711243	contig_15105_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_150959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGCTAACTTCCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444497	445442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_444500_445400
711245	contig_15087_pilon	-	2306	7	Intergenic	novelGene_37231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1130	junction_6	903.114610666885	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	104	787	158925	147704	TRUE	50	TGTATTTTCAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDGEMGKRGHSGTSDINEGDCKVWNLRLSIHFSFSLSLIHPSFHPSLHPSLHPSIHPSIPPSLHPSIHPSIHPSNKHLLCAGPCARFWGYGGG	181143	144554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_145267_146896_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
711246	contig_7753_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_41463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTGGAGTTGTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544797	547261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_544800_547300
711247	contig_7753_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_41464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTGGAATGAATACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547723	549631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_547700_549600
711249	contig_6001_pilon	+	2876	2	Intergenic	novelGene_128047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2358	2774	718814	719230	FALSE	65	ATAAGAATAGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPFEPVSLISLISLCLTAVTKPGFFWFPWGLAQKIQGKLTKTCLGQPFNSGSCVVRHAKGPSAQIMESRSTDRLPDTATIPWRALKERDCNLNHTLVLPPMFWLIFSHGSLNPGQFYSHNTKLEVEMEGIYSDDSVI	716285	719332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_718281_718451
711251	contig_8885_pilon	-	1861	5	Intergenic	novelGene_115561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	40.0406043910428	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAAAACTCATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75415	45840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_48757_48903_49094_49264_58183_58308_75399
711263	contig_11978_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_62897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAAAATATGAGGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760291	759747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_759700_760300
711265	contig_13224_pilon	-	2632	5	Intergenic	novelGene_104100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	40.0835065831322	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	388	783	263277	262566	TRUE	5	CACTGTTGTGTTGTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGQGNPQIWRVVQGSSARAHVLSWYQQLKGSGPTFLLSQREGPPPTYGLGVNPRFLAELGLAQNGACRTVGNASPADEGICYCAMWFSGQCIFGEGTRLLYQERMLEAPREDTCGRDKLRVHALLNKLG	283300	260545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_262365_262535_262649_262964_263325_281780_282020_283199
711271	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_116098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671649	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
711272	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
711275	contig_6602_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_166442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAAGGGTCAGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374999	375703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_375000_375700
711277	contig_11978_pilon	+	864	6	Intergenic	novelGene_63057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3345.97947393585	48	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	416	781	1830113	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827912	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829191_1829846_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
711281	contig_5918_pilon	-	1279	8	Intergenic	novelGene_99631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	144.353449447344	181	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	83	958	2278672	2233976	FALSE	25	AATTGATTGAGTGCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVGTFEMAVVMSQHCLFTAIHKHYTLDDWKLFATKHPECLQHVAVSSGSGQNDLEKMSSILEAVPQVKFICLDVANGYSEHFVEFVKLVRARFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIKVGIGPGSVCTTRTKTGVGYPQLSAVIECADSAHGLKGHIISDGGCTCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMFSGHTECAGEVIERNGQKLKLFYGMSSDTAMKKHVGGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAARLKELSRRATFIRVTQQHNTLFS	2278754	2233654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2234157_2238719_2238880_2242340_2242384_2245739_2245847_2251202_2251285_2270159_2270334_2274350_2274435_2278627
711282	contig_14687_pilon	-	2763	1	Intergenic	novelGene_107978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAGCAAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805037	802274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_802300_805000
711284	contig_5916_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_158019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGATTGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214561	216115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_214600_216100
711287	contig_10768_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_166448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATATTATGTGCAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155847	156491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10768_pilon_+_155800_156500
711290	contig_9706_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_20920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACGACCAGCCTAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146070	147441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_146100_147400
711291	contig_9706_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_20921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAAAAACAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148245	149570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_148200_149600
711301	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711302	contig_18869_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_56240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73687	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
711303	contig_19242_pilon	+	2250	3	Intergenic	novelGene_166451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	5.5	179	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	65	904	7521	10029	FALSE	5	CCGTGATGGTGGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHVLLLGILLLQLPPPVPARCYTATRSECRRVRRFVPGTELAGESVDVTTLQRSGSFPVNTQRFARPDGTCTLCHSAQRPGTLWLLPLAFTDWSAQSSSCQHQVINTNAMSTQAVAREVAKSITNNWTVGLDVTPKTDSNVQVSVAGSHSKAAKFVAVKLHQDQYIFSRDLVECHFYSFHLVHTPPLHPDFKRAVKALPGDFNASTEPQYLSFISKYGTHFIQAVKLGGRISAITALRTCKLSLEGLTTNEVSDCLSVEAAVTIGRIAKLFSRSQGL	6158	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19242_pilon_+_6201_7498_8060_9728
711305	contig_5643_pilon	-	1882	7	Intergenic	novelGene_39174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.9295883145843	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	69	1250	784100	772543	FALSE	25	TAATTTTCAGTGATGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVSQWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNIN	784168	771910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_772550_772776_773342_775224_775288_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
711306	contig_14133_pilon	+	2587	7	Intergenic	novelGene_119919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.682975050633	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	298	696	143029	146688	TRUE	25	TCTGTGGAATTCTGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136633	148816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142261_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666_147797_148033
711307	contig_4059_pilon	-	809	5	Intergenic	novelGene_140597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1079.90702724818	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	107	553	422574	398089	FALSE	15	TATATCTGTATTTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHRRRWSTCAGQPGSGIGRRIKQPPCRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	436369	397832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411209_422462_422599_422642_422662_436306
711311	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711315	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671662	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
711317	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_97141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711319	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
711320	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	159	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711325	contig_6589_pilon	-	887	7	Intergenic	novelGene_25892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	150.233891722947	49	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	75	650	1178015	1158723	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKAFCLPSPWAAWVSQLRWGQLLCSWPPRPTSARA	1178089	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158825_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
711328	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711330	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711331	contig_15354_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_65733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTATAAAAAGAAGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579462	579957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_579500_580000
711332	contig_7202_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_16690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27867	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
711337	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711338	contig_13481_pilon	-	2823	9	Intergenic	novelGene_119268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	251.387866403691	46	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	478	1530	102105	33268	FALSE	60	GGATGCAATCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRSAHCSRPSGSSTSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTNEYVAIKLEPIKSRAPQLHLEYRFYKQLGSAGEGLPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDLFDLCDRTFTLKTVLMIAIQLLSRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRQGNKKEHVIHIIDFGLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGSLPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRNTPIEALCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYEYLRTLFTDLFERKGYTFDYAYDWVGRPIVSIFFLPCHFLPQTSIAPSHYLPVFLLKSMETFL	174301	31974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_33522_33796_33882_35757_35844_38516_38752_40090_40243_69962_70033_75727_75769_101975_102376_174094
711340	contig_5935_pilon	+	1668	3	Intergenic	novelGene_102663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTTCTACATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421948	423771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_422264_422336_422430_422511
711341	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_90652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711343	contig_9720_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_116787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	110	553	391741	392184	NA	15	TGCCTGCATTCTGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQVSLALGALSSTARTSQRRSGLSLIGPLSRRL	391631	393998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_391600_394000
711344	contig_15153_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_166455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCAAATTTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116818	118473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_+_116800_118500
711345	contig_10627_pilon	+	2380	12	Intergenic	novelGene_59978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	38.3912007824796	99	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	533	1654	268023	276127	FALSE	25	GTGAATCCACGGGAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYRPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFSHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFTDGMNELVIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSVKASHILISVDGKVYLSGLRSNLSMISHGQRQRVVHDFPKYSIKVLPWLSPEVLQQNLQGYDAKSDIYSVGITACELANGHVPFKDMPATQMLLEKLNGTVPCLLDTSTIPAEELTMSTSRSGANSGLSESLAPSTPRTSNGDSSSHPYHRTFSPHFHHFVEQCLQRNPDVRPSASTLLNHSFFKQIKRRASEALPELLRPVTPITNFEGSQAQDHSGIFGLVTNLEELEVDDWEF	245819	276853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_245870_245946_246298_255307_255388_267971_268075_268512_268635_269423_269533_269665_269790_271516_271689_272414_272520_275118_275361_275660_275704_275974
711355	contig_10345_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_158348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAACAAACGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4367	6425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4400_6400
711356	contig_15304_pilon	-	941	3	Intergenic	novelGene_30578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	744	198	941	54100	53006	FALSE	15	ACCATCGACCGCTTGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEK	54297	53005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
711361	contig_2636_pilon	-	787	4	Intergenic	novelGene_52069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	293.574522055304	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	116	391	85555	59950	FALSE	40	TCAAGAAGTCATGGATCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQILAFW	85670	59553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471_62624_81113_81216_85551
711364	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711367	contig_8156_pilon	-	1594	6	Intergenic	novelGene_98928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	97.948966303887	4	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	112	615	441382	403839	TRUE	20	GTCCCTTCTTTAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWVRAVLCQSQPWVRQ	441493	395195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403610_403814_404004_404665_404810_441187
711370	contig_17274_pilon	+	1412	5	Intergenic	novelGene_26498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_4	138.12765834546	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	745	1155	77922	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	76451	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
711372	contig_4754_pilon	-	2929	1	Intergenic	novelGene_35924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2113	2472	259776	259417	NA	45	CAAACCCAGCAGAGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKNAVCLLEFYRQEIGQRSYICCLSRKEKDHPWSNLEISRAAGRSMASRIFLDSKGGTMVSWISGGATASKVSKSWIFANSVPECGVVQCDGSLLCGLSSHGLATPTQVIGQDCEIR	261888	258959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_259000_261900
711373	contig_7695_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_41559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	166.785041295675	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	365	1111	379725	375835	TRUE	20	TCAACTTAGGGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRHLLPTSGAAAASAAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381080	373564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376521_379664_379996_380057_380089_381017
711374	contig_4364_pilon	+	2278	10	Intergenic	novelGene_51	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	55.5897672438212	184	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	60	686	583085	597752	TRUE	35	CTCTTTATCCATAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAASRAACGAEERRTDGGTMNLLPCNPHGNGLLYAGFNQDHGCFACGMENGFRVYNTDPLKEKEKQEFLEGGVGHVEMLFRCNYLALVGGGKKPKYPPNKVMIWDDLKKKTVIEIEFSTEVKAVKLRRDRIVVVLDSMIKVFTFTHNPHQLHVFETCYNPKGLCVLCPNSNNSLLAFPGTHTGHVQLVDLASTEKPPVDIPAHEGVLSCVALNLQGTRIATASEKGT	583025	600962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_583152_588635_588711_591549_591652_592467_592556_593930_594026_596828_597020_597743_597796_598672_598775_599207_599330_599637
711375	contig_8330_pilon	-	1874	7	Intergenic	novelGene_71771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTCTAGCCGGGCGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658567	653981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_654977_656163_656262_656346_656478_656694_656777_657148_657227_657416_657506_658166
711376	contig_7095_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_166472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGATATAAAAGTTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526356	519794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_519844_525853
711377	contig_7095_pilon	-	656	3	Intergenic	novelGene_166469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_2	40.5	618	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATGCATGATTTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519742	490190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_490578_507268_507415_519619
711383	contig_14441_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_100651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	403.5693524318	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	194	622	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111995	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117220_117344_117539
711384	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
711385	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711387	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711389	contig_12080_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_128401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCACCTGTTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216152	215741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_215700_216200
711395	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91672	2	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
711400	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
711402	contig_18869_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_56062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73576	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
711405	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711406	contig_11338_pilon	+	2699	1	Intergenic	novelGene_6300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGATGCACTTCCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208239	210938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_208200_210900
711418	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711421	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711432	contig_12257_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_152100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTGATAACAAGGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119656	121810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_119700_121800
711433	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	124	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
711434	contig_12008_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_25003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTTTAATCTAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30062	29592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_29600_30100
711435	contig_6710_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_94012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
711438	contig_11338_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_6252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55	10	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	165	719	109829	108886	FALSE	25	GCGCACTAGACTTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAEAYDVLSDPRKREIFDRYGEEGLKGGGPSGGSSGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDNFFGQRNGEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTNMNFGRSRPAQEPTRKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSVRSEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNIFKRDGMSSGLACGENFLEKASPSLKRPRNAETSLSSLK	111522	108664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_108988_109376_109919_111447
711443	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711444	contig_9354_pilon	+	2302	13	Intergenic	novelGene_108060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.8764179334617	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2142	160	2301	233330	263262	FALSE	25	AAGTTGGTGTTTCCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAKTRLFLLSPHHLKQLKESPGPRLKWQRLLHQQQPLHPEWAALAKKQLKGKNPEDLTWHTPEGIAIKPLYSSRDTKDFPEELPGMKPFTRGPYPTMYTFRPWTIRQYAGFSTVEESNKFYKDNIKAGQQGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVRGDVGMAGVAIDTVEDTKILFDGIPLERMSVSMTMNGAVIPILATFIVTGEEQGVPKEKLTGTIQNDILKEFMVRNTYIFPPEPSMKIIADIFQYTAKYMPKFNSISISGYHMQEAGADAILELAYTIADGLEYCRTGLQAGLTIDEFAPRLSFFWGIGMNFYMEIAKMRAGRRLWAHLIEKMFQPKNSKSLLLRAHCQTSGWSLTEQDPYNNIIRTTIEAMAAVFGGTQSLHTNSFDEALGLPTVKSARIARNTQIIIQEESGIPKVADPWGGSYMMESLTNDVYNAALKLINEIEEIGGMAKAVAEGIPKLRIEECAARRQARIDSGSEVIVGVNKYQLEKEEPVEVLAIDNTSVRNKQIEKIKKIKSSRDQALADQCLAALTDCAASGDGNILALAVDAARARCTVGEITDAMKKVFGEHRANDRMVSGAYRQEFGESKEITFAIKRVDNFMEREGRRPRLLVAKMGQDGHDRGAKVIATGFADLGFDVDIGPLFQTPREVAQQAVDADVHAVGVSTLAAGHKTLVPELIKELSSLGRPDILVMCGGVIPPQDYEFLY	229658	263263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_229778_233289_233715_234873_235242_238363_238522_239133_239306_242315_242565_245143_245256_246928_247045_255182_255299_256771_256904_258046_258195_259837_260006_263244
711446	SIRV5	+	303	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7665	2	-272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTAAGTGCTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
711449	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
711457	contig_11130_pilon	-	1971	8	Intergenic	novelGene_53094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	859.235113104578	852	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	260	577	61302	56070	TRUE	40	ATTGAGAGATTAGAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLLKFCSNKKSRPPLHSCSVIWPLFIATPRWGCSLLITRPKYMRRTLTILASREYSGCIFSETDLIFLLAVHVTSDNLLTSPNFGRTLRRQEDFSQVKHEHVN	66980	54233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55195_55636_56165_58684_58810_60430_60488_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
711460	contig_14871_pilon	+	1612	5	Intergenic	novelGene_63716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	772	junction_4	615.000813007593	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	410	1099	224340	233218	FALSE	35	GAATTGAGAGCTAGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	223930	233731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
711461	contig_14300_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_133135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGATAACATGTCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406684	405353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_405400_406700
711463	contig_6286_pilon	-	1760	6	Intergenic	novelGene_165654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	155	535	179762	176826	TRUE	55	AAAAAAAAGTGGAAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGQAAVSHFLLHWPAPGLEERCQVVLHFFRELLHTQVHLAGVVSGQARKGMVLSKDLDESLPPKAFLDLELCFQGHSHTPVIQGGSPAQVHPDPTLPVLRIQCKVGLVPGDAQDCLIHVHQPQVAGNLSGVQGRLLPGLWPSSWLGPHSPCCRILTSLMSSDTISKRPVIGYPACI	244599	148367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_149243_175463_175552_175837_176094_176819_177147_179702_179901_244583
711464	contig_15304_pilon	-	1421	4	Intergenic	novelGene_30595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	177	1283	66228	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66404	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
711465	contig_9833_pilon	+	1207	4	Intergenic	novelGene_68562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	485	junction_1	525.768643670072	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	485	811	254790	259941	FALSE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	254305	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_254811_256795_256954_258491_258607_259908
711468	contig_9011_pilon	-	731	7	Intergenic	novelGene_159267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACATTATCAACACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114713	82776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_82891_83476_83596_89342_89467_90305_90431_95139_95254_111441_111555_114691
711470	contig_5999_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_45614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107932	107327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_107300_107900
711471	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711475	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711480	contig_14405_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_85632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACTATACAGCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404984	403734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_403700_405000
711488	contig_12644_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_44499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATAAATACAATTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047594	1048553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1047600_1048600
711489	contig_15047_pilon	+	1197	5	Intergenic	novelGene_52238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3251.26752205967	3	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	456	569	4573	4686	FALSE	35	GAAGACCGGAGAACCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPAVFLHRRSDHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2557	21641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2588_3367_3498_4158_4434_4552_4687_21013
711490	contig_4426_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_15368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121798	119125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_119100_121800
711491	contig_7004_pilon	+	1140	2	Intergenic	novelGene_126471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	207	1094	394844	395731	FALSE	35	GAAATAAACAGTCTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	394391	395777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_394514_394759
711492	contig_5871_pilon	-	1153	9	Intergenic	novelGene_160168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	571.929573898745	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	218	964	342910	259468	FALSE	30	AACATACTTTTTAGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCLCRVLIHHQRHSLSKTAYQASLSPCSVNVQVLNRHFAAATKPAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIATLDMSSDQIAANLQAIINDVCRHRPLSLGPFVVRAFLRSSTSEGLLLKIEPLLPKEVETKESNKETA	384143	259278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_259587_260970_261053_311832_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113_364226_384123
711495	contig_5423_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_85215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAGAAAGAAAAATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345735	343192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_343200_345700
711497	contig_3004_pilon	+	2061	3	Intergenic	novelGene_127507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306324	309078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_307967_308253_308352_308757
711500	contig_11816_pilon	+	2177	5	Intergenic	novelGene_98594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTATAATGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405566	1419498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1406059_1406277_1406364_1415484_1415583_1415674_1415754_1418076
711501	scaffold_7386_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_136609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1278	1640	411585	411947	NA	30	ATCTAGTCCTTTAACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPHLELQAWKGDMEAPGVPTSRMQRARGAPSPKAEAYSRGSLCTLWGSPRWEELSPEVPGAGRAGTGAGPHTAGAETRSLGWAQPQGGRASLPANERRVSGSASAPDAVPPSTPAGSGR	410307	412303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_410300_412300
711506	contig_20819_pilon	+	2433	8	Intergenic	novelGene_55628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	511.03416555779	2	131	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	25	1245	29817	41330	TRUE	20	TGTACCAGTGCTTCCAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGPP	29792	43600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41319_41400_41530_41569_42519
711510	contig_16766_pilon	-	2883	5	Intergenic	novelGene_153347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	368.168015313661	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	51	578	116854	98835	FALSE	30	ACTTTCAATACACATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INLVEYSARNRHCLVNMETSCSFDSSFYSEDRDDSLRIAGQVHAVQALVQLFLERERAAQLAESKTDELIKDAPTTQHDKSGEWQETSGEIQWVSTEKTDGTEEKEKKEEEDEELDLNKGHAGKHMEDCIVASYTALLLGCLCQESPINVTTVREYLPEGDFSIMTEMLKKFLSFMNLVLLEPQARNLSLE	116904	96529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_98878_99174_99267_108520_108602_111645_111856_116752
711512	contig_2940_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_81990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTTGCTGTATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134354	1133648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1133600_1134400
711513	contig_2940_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_81989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGATTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133029	1130988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1131000_1133000
711514	contig_6233_pilon	+	1925	2	Intergenic	novelGene_74828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCCCACAGTCCAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465220	467269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_467121_467244
711517	contig_6710_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_89185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGAAGCTGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
711524	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
711528	contig_6442_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_166482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244218	245049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_244200_245000
711530	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_98196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
711531	SIRV5	-	287	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACCTACCTTAGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10862
711535	SIRV4	+	193	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	6	1117	6	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
711539	contig_5643_pilon	+	1383	10	Intergenic	novelGene_39053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	876.108412593604	1	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	491	1171	637802	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631344_631435_631559_631850_632055_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
711540	contig_15326_pilon	-	1519	10	Intergenic	novelGene_157694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	276.447302593299	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	98	856	114055	15820	TRUE	85	AGTAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAATAVGGGFFLLQLANHTGYIKVDWQRVEKDMKKAKEQLKIRKSNQIPTEVKSKAEEVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEMLAELTGRPMRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSEYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	122974	13955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_14601_15801_15972_19883_19928_20501_20634_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83619_83742_113977_114110_122931
711541	contig_12080_pilon	-	2480	14	Intergenic	novelGene_128391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.7540490192609	4	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	27	1448	204783	194903	FALSE	25	GGCTATCATTCATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGLQEQQMSRCDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFVEDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKEVIGCLPWVNRRTLATLIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQCPLCPSVPTPHPLASMMTSSQWSYDAVPPLTLPVRSLALCPCCLSVGMTAGPPSSQPIRPCR	204809	193870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195651_195834_195898_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200886_200956_201268_201417_202856_202963_203237_203451_204722
711545	contig_12923_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_30185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	41	379	371629	371291	NA	45	AACAACTGCAGGGGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFKFYFCSKESDLASREGYGGWVAQTVQRSTTRQKVGGSNPTRGTSEDSPASDLLLKGHSRESPMERFYSAHIGSPGVRMDSMATNNNKESSGLCPGSWEGTTKPLESPE	371669	370940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_370900_371700
711547	contig_18822_pilon	-	2532	2	Intergenic	novelGene_111744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	96	1178	281473	280391	FALSE	15	CTGATCATGTTTTCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTDVTDTTLDENVYNNYYLYESIPKPCSKEGMKAFGELFLPPLYFLVFLFGLLGNAVVVLVLLRYKRLKSMTDIYLLNLAISDLLFVFSLPFWAYYAADQWVFGLGLCKIISWMYLVGFYSGIFFIMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTSGVITSLATWSVAILASLPGLIFSTCYTERNHTYCKTKYSVNSTTWKVLSSLEINILGLAIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLDTLVELEVLQDCAFERHLNYAIQATETLAFVHCCLNPVIYFFLGQKFRKYIIQLFKTCRGPFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLHDAL	284979	279036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_281525_284935
711548	contig_10581_pilon	+	2055	2	Intergenic	novelGene_41452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	378	1274	797526	798581	FALSE	15	TTCTAATTGTCTTCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLRAAMPQVPYRVLGRMFWREENAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVVFKPPTSDAEFLERLHLFLAREGWTVQDVARVLGFHNPAPAPGPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKKLTLFSGRDIPGPGEEAFDHWLEHTNEVMEEWQVSDLEKRRRLVESLRGPAADVIRILKTNNPAITSAECLKALEQVFGSVESSRDAQVRFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNEAALLQLGLEGHF	797148	799362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_798381_798539
711557	contig_9727_pilon	-	1599	14	Intergenic	novelGene_86380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	239.458634986969	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	480	1379	585038	578319	FALSE	35	GTTCTGTTAAATTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622864	578098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_588538_588672_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622824
711561	contig_5954_pilon	-	1709	7	Intergenic	novelGene_28726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	75.2994023880668	598	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	38	853	1178000	1170586	FALSE	0	GCTGCCTGCCTCTGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKRLSVRRCLKMAAEEPQQQKQEPLGSDSEGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSERLELSVLYKEYAEDDNIYQQKIKDLHKKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSHLEALLDDSKELQRFKAVSAKSKEDLVSQGFTEFTIEDFHNTFMDLIEQVEKQTSVADLLASFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRESKFFEHFIEGGRTVKEFCQQEVEPMCKESDHIHIIALAQALSVSIQVEYMDRGEGGTTNPHVFPEGSEPKVYLLYRPGHYDILYK	1178037	1169729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170784_1170931_1171127_1171244_1171330_1171616_1171736_1176032_1176132_1176381_1176444_1177942
711567	contig_10765_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_122932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209757	208514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_208500_209800
711568	contig_9527_pilon	+	1631	8	Intergenic	novelGene_134047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	64.8133898990331	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	857	928	419690	419761	TRUE	20	CCCCACAGGGGTCCAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCSTFQSTDTHPVPGAPLLQLPPWSSPWLRYVPKVSLQAQGTASNPEGAGKAEEVPGEGGLNLQAETRAWFQKTQAHWLPQHGAAPAWFHGFITRKEAERLLETKPQGCYLVRFSESAVAFVLTYRSRTCCRHFLLAQLRDGRYVVLGEDSAHARLQDLLRHYTGSPLSPYGEKLTEPCARQTPEPIGLPLRTEETDSGSKTQDPDPHYSTVLKQGHAPALLKKEGAGESKEPSQQPRPKPPIPAKPQLCPEVYTGLAPRPRPAPPRKPSNPIYHELDEPIAFYAMGRGSPGGSPQQHLCRGGGALKK	412563	422804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_412667_414398_414584_415418_415509_415644_415814_419182_419333_419530_419832_421698_421870_422342
711571	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
711572	contig_9345_pilon	-	1675	14	Intergenic	novelGene_24508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	206.542028331901	3	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	49	1638	671829	667061	FALSE	40	AAAAAAGTAATGCCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMAVSPMGSWGKILFVLQLTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671877	667023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669655_670161_670369_670722_670815_670882_671013_671225_671275_671731
711580	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
711592	contig_11370_pilon	+	744	4	Intergenic	novelGene_98712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2185.92650074669	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	169	507	145831	148303	FALSE	25	CTAACAAAGTGCTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145662	148540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147474_147557_147616_148205
711595	contig_12270_pilon	-	302	2	Intergenic	novelGene_114106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	27	302	14409	13911	FALSE	25	ACTTTCACCATCAGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDF	14435	13910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
711596	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711597	contig_1443_pilon	+	1651	13	Intergenic	novelGene_28236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	52.870058214036	450	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	524	1342	538016	541541	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535995	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
711611	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711612	contig_16103_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_118724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	289	612	208048	207725	NA	10	CATGAGGCTGCTGGTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTTKQSQFNNFHMYNSMTLMLITFFKLCNRSRYPFPNYSTTININPSAKLIGFLKQPWEKMLWPHFSIDNIQVVSKLFLIQGTSSCCSLVLRSGVPKAGSPKGVAM	208336	207171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207200_208300
711617	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	507	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711622	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711625	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711628	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
711631	contig_16643_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_158110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACATGGAGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154317	156998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_154300_157000
711632	contig_3975_pilon	-	1372	10	Intergenic	novelGene_54884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_9	123.570742471921	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	656	1309	2096423	2091957	FALSE	25	GGAAATACATGGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099575	2091893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473_2097939_2099364_2099458_2099552
711635	SIRV6	-	278	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCGTAAACGTCACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
711640	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711646	contig_614_pilon	-	2513	7	Intergenic	novelGene_132612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	15.7559512565887	106	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	86	1342	402329	385613	FALSE	35	AAAGTGACATTTTCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAEGWAGRRRISVVLQFLKAIGGVVGVMEGHKAEEEVLDVLRLNVGGCIYTARRESLCRFKDSMLASMFSGRFSLKTDESGACVIDRDGHLFKYLLDYLHGEVQIPTDEHTRVALQEEADYFGIPYPYSLSDHLANEMETYSLRSNIELKKALTDFCDSYGLVCNKPTVWVLHYLNTSGASCESRIIGVYATKTDGTDAIDKQLGGRIHSKSIFKREAGNNVQYIWSYYSVAELKKMMDAFDAWEGKGVSYWRVPHELIECWTLEEQPLLGSLRHMAPVRKRRLVTFNEEEQNVNCKTGPKPVRFLGPSTSTQIKVKNSASVRVSPARAPQTSTQATANPPHSSSTLSKATSTMGTRVCGQPQASWGTRSAENGAPHPPPAKVLLSDKKSTPNRVIKLKRTPLCATVPAQPTSTAANQTRSPELPAPEASSTVGVRTENGNDESN	406389	384441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_386106_389314_389418_395884_395980_397035_397230_399653_399866_402169_402385_406359
711648	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711652	contig_7457_pilon	-	1748	3	Intergenic	novelGene_31603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.5	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	125	673	962606	956489	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962730	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956642_960502_960896_962603
711654	contig_7895_pilon	-	2790	8	Intergenic	novelGene_154433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_7	32.3375058672478	11	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	102	1064	455395	432532	TRUE	20	CCCATGGAATTGATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPSVFAEVSQAQPVLVFKLVADFREDPDPRKVNLGVGAYRTDDCQPWVLPVVRKVQQKIANDNSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALKDKRVGAVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFSAAGFKDIRSYHYWDAEKRGLDLQGFLNDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASIMKRRFLFPFFDSAYQGFASGDLERDAWAVRYFVSEGLELFCAQSFSKNFGLYNERVGNLTVVGKETDSVLRVLSQMEKIVRITWSNPPAQGARIVACTLSNPELFKEW	455496	425833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_426654_431625_432702_432786_432938_435236_435342_435590_435704_436648_436773_443593_443776_455277
711657	contig_17274_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_26556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATAAAAAAGAAATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185412	187910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_185400_187900
711663	contig_15105_pilon	+	2930	1	Intergenic	novelGene_150953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433940	436870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_433900_436900
711666	contig_2078_pilon	-	2202	10	Intergenic	novelGene_100176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	74.7630000256778	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	168	1118	532342	522362	TRUE	15	CTGTATCTGAGGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRTFKSSKNSSSRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTGTIKSVPTHSDPTYNRMKHCPPVLHHPHNSCYALVHCCSHCFQCLTQSSPSGLPVPRLWWGTW	532509	505005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_514636_514717_521680_521793_522157_522431_527537_527660_529455_529735_530102_530388_531775_531931_532301
711667	contig_9363_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_6606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762952	764758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_763000_764800
711672	SIRV6	-	291	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCGAACTTTGACGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
711674	contig_4857_pilon	+	3226	4	Intergenic	novelGene_48910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	4.92160768674447	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	24	644	1654299	1662801	FALSE	15	ACTTGTGTGATATTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSTFGALMVGCWFASVYILCRLMEALKWLWYENRKYLLGYILIVGFFSFAICYKHGPLVDKRSRNLLMWVLQLLSLLLIYFGISIPQYGYAVMILILCSRSLRCPVKAFHYMSRKMKRWFTSEKLVVKYLTDEEYREQADAETASALEELRRACRRPDFPSWLAVSRLQAPKKFADFVLGASHLSPEEIHLHEEQYGLGGVFLEEQLFNLRTA	1654275	1665383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1654393_1657206_1657433_1661712_1661890_1662677
711682	contig_10042_pilon	+	1986	12	Intergenic	novelGene_79209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	99.983882998732	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	441	980	1069309	1090129	FALSE	15	GTATATTCTTTTTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFALTHRSCSSECLYLCQLDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1054146	1091135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067530_1067608_1069294_1069368_1072067_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
711683	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711697	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711698	contig_15063_pilon	+	851	2	Intergenic	novelGene_14434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
711699	contig_9835_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_166486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTTCAACCTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7916	5146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9835_pilon_-_5100_7900
711701	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_96348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711702	contig_8866_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_77797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAGCAGCGAAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403606	403252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_403300_403600
711704	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711706	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
711712	contig_10324_pilon	-	1967	6	Intergenic	novelGene_7902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	26.5028300375639	467	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	281	1180	796137	793056	FALSE	20	TTTACGCTAGCTGCCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQAIQTPQLAPFPPASSAHRGEPWKLCRLRQALTAHGAVRFWCSLPTADTSSFVPLELRVTTTSSGAQRYRRIIQVNEVVFLDPPAGLLARQADEGGHVVLRWLPPPGAPMASHIRYEVDVSAGNGAGGAQRVEILEGRTECVLSNLRGRTRYTFAVRARMAEPSFGGFWSAWSEPASLLTASDLDPLILTLSLILVLILLLLAVLALLSHRRTLKQKIWPGIPSPESEFEGLFTTHKGNFQLWLYQNDDCLWWSPCTPFVEDPPAPLEVLSERCWGGDTGNRARRRRRGAPAGASGQ	796417	792268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_793227_793310_793399_794810_794899_794982_795137_795661_795820_795896
711720	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
711726	contig_10235_pilon	-	1496	9	Intergenic	novelGene_46470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_7	894.452197926194	169	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	531	992	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224482	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223231_223370_223554_223780_224427
711734	contig_10304_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_166496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTGTCAGACTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104749	105060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_104700_105100
711735	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711738	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711740	contig_13958_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_129534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATTTGTCTATACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130118	128960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_129000_130100
711741	contig_13958_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_129533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGGATTCGAACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128658	126873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_126900_128700
711751	contig_2770_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_107405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAAAAAAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113583	116023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_113600_116000
711755	contig_7202_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_18374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
711758	contig_8616_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_72424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGCCCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250614	251939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_250600_251900
711771	contig_5981_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_35519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACACGATCCAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153477	155705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_153500_155700
711775	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_93659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711776	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	324	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711779	contig_2214_pilon	+	1945	2	Intergenic	novelGene_144251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTTTCACAGCCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274188	277130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_276022_277018
711788	contig_19145_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_164148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	408	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218788	217699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_217700_218800
711802	contig_7182_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_117158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATGAAGATGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889159	887093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887100_889200
711807	contig_1143_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_86592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACCCAGAAGCATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153533	152635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_152600_153500
711810	contig_20314_pilon	+	862	7	Intergenic	novelGene_125622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	25	GAAATTCCAGCCCCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
711823	contig_11815_pilon	+	2071	5	Intergenic	novelGene_50926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.8461173781861	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1755	315	2069	299082	323092	FALSE	85	GGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSYLPSYYSPSIGFSYSLGEAAWSTGGDTAMPYLTSYGQLSNGEPHFLPDAMFGQPGALGSTPFLGQHGFNFFPSGIDFSAWGNNSSQGQSTQSSGYSSNYAYAPSSLGGAMIDGQSAFASETLNKAPGMNTIDQGMAALKLGSTEVASNVPKVVGSAVGSGSITSNIVASSSLPPATIAPPKPASWADIASKPAKQQPKLKTKNGIAGSSLPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVAKAPSQALVQNIGQQAIQGSPQPLGQQANNSPPVAQASVGQQTQPLPPPPPQPAQLSVQQQAAQPARWVAPRNRGSGFGHNGVDGNGVGQSQAGSGSAPSEPHPVLEKLRSINNYNPKDFDWNLKHGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDAAYRSMNGKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSAVDYNTCAGVWSQDKWKGRFDVRWIFVKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEESVKKVVGNKGSSAQTAATVASAYPKEEKMTFKRIRTFLLISLTSETIADLQFKYWNFTKDIGLNWK	294716	323094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_294913_295412_295438_296009_296090_299068_300651_322906
711830	contig_6048_pilon	+	2111	5	Intergenic	novelGene_73098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	51.265851207212	644	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	19	483	200699	207279	FALSE	15	TTATGCCATTGAGTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWVVEMVEKKTSVRSQDPGQRRVLDRAARQRRINRQLEALENDNFQDDPHAGLPQLGKRLPQFDDDTDTGKKKKKTRGDHFKLRFRKNFQALLEEQNLSVAEGPNYLTACAGPPSRPQRPFCAVCGFPSPYTCVSCGARYCTVRCLGTHQETRCLKWTV	200680	208907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_200721_205645_205817_206784_206865_206990_207161_207257
711839	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711840	contig_14882_pilon	-	2105	15	Intergenic	novelGene_115020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	322.134724319259	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	551	2026	317300	295835	FALSE	50	GTATCTTTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363666	295755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321737_363416
711851	contig_16461_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_139210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	27	332	919	395	FALSE	20	GTTGCAGTTTATTATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAED	945	394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
711852	contig_7179_pilon	+	1489	9	Intergenic	novelGene_78090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	68.5846876131983	576	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	469	966	580021	586398	FALSE	30	TGAAATAGCCTAATTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGVSHLKQEPEKVKVSSSVRHPETPLLISGFHLPSKLKPPREKVDHEHPASEPENLEFSSFMFWRNPLPNIDHELQELLLDKGESVPSEEEDEEENGFEERKDEDSDADGGGWITPSNIKQIQQELEQCCVPNNVRVGCMTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDVFTSYSQGGQICCQPPSN	576852	586921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657_579730_579945_580075_580168_580373_580923_581022_583194_583281_586342
711857	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
711860	contig_10958_pilon	-	1112	3	Intergenic	novelGene_5479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTGTTTCTGAGGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901550	895585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900455_901112_901360
711862	contig_10864_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_107043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1082	1432	698898	698548	NA	75	CTTAAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICMLLESRPQSWGKREGPRHKCLSGLKKKRQTLEYSFRWGLWFCECFERKIIGVPSLSVVELRFCLISLSFKGTWSPGGAVVKSSAANQKVSSSNPPAALWKPYGAVLLCPVGSL	699979	698072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_698100_7e+05
711869	contig_6710_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_89142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653674	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
711878	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	656	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
711880	contig_14414_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_166503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87706	87292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_-_87300_87700
711891	contig_16594_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_53895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGCAGTGGTTAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235174	235472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_235200_235500
711892	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711903	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
711906	contig_10904_pilon	-	1786	8	Intergenic	novelGene_22784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	189	junction_6	169.334351060202	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	34	720	773328	759449	TRUE	25	TGGAGTGCACAGATTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRNLETGPSQYMLFPLSAAGLSILRRLQDRTGFGGCGMSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTGFPGSFSSSPTTPHSSLVEYQRPQPGDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGIPRSKGEEQNPQER	773361	757081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759496_759593_759723_768446_768525_769599_769885_772375_772412_773216
711908	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_17611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27827	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
711915	contig_11815_pilon	-	1870	5	Intergenic	novelGene_50931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACTCTCCTCAGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323105	294853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_294918_296006_296081_299061_300648_322894_322984_323048
711918	contig_12050_pilon	-	1985	7	Intergenic	novelGene_62737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	138.803718329958	25	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	284	835	697920	686686	FALSE	15	AATTGTGGTCATTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	698240	685535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799_697948_697984
711919	contig_11258_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_67795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTCAATGTAGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280864	280266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_280300_280900
711922	contig_15087_pilon	-	1740	7	Intergenic	novelGene_37146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	364.175972421148	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCATTCCATGACTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52922	33328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41143_42914_43047_49137_49267_52532
711923	contig_16204_pilon	+	1945	8	Intergenic	novelGene_154503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	106.788748165216	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	224	943	277830	288360	FALSE	30	CTGAAGGAAACTGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKEDAGVVCSEHQSWRLTGGTDPCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYSPEAEVLCRTLGCGTLNRVPKGLPHSLLGMMYYSCTGGEPTLSDCSWRFNNSNLCSQSLAARVICSGVRNLSSLEVPASFQPVTFYLPESSVTVRMEDKESLQLILLIPCIILGILLLGSFISIVFLLLKVKGKYALPIMANHQHLPTTTPVGINSYQEASITIPKEEVPKLPIQVRAPPPEDSDSGSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYRLPAGPSADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPLLVQQSECPGSPSPQPDSTDNDDYDDIGAA	276372	289362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_276405_277638_277942_280214_280268_283070_283225_283554_283654_284821_284945_287625_287740_288295
711925	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
711927	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
711928	contig_9389_pilon	+	1160	5	Intergenic	novelGene_83899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	981.569502124022	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	61	468	159587	167696	FALSE	45	GGAAAAAAAGTGGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APARGPSGPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVGPTLPWILARTEPPG	159526	168388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164507_167645
711929	contig_253_pilon	-	2295	19	Intergenic	novelGene_129744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	178.836198244285	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	139	1278	680705	674664	TRUE	35	CAAAGCGGAAAGGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKYLEDRGEVAFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMVSVGSLSRGLRR	689528	673063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_673304_673391_673506_673757_673895_674060_674534_674610_674678_675585_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641_680719_689403
711935	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_90845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
711938	contig_10599_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_49907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGCTTAATTATATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346347	347351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_346300_347400
711941	contig_9505_pilon	+	1363	12	Intergenic	novelGene_121858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	237.379007893347	12	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	68	754	536915	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPLRRTWKATWEDGDICQTREMSGVSGTKRYKVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	536847	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_537018_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620993_631447_631521_632605
711942	scaffold_16539_pilon	-	1937	11	Intergenic	novelGene_68393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.6055863742488	108	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	36	1475	800534	794701	FALSE	25	AGTCACATGTGACTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMMWPGQIRFLELISTPSVRRVECWPSGRTATLFWPRTSRKHIRPSSRRMSRNMSFTSDPPPTFPPPATGVQTSLTSLGTSVPKPGPLLSSSRVGLFNKYRRSNPASFLLRSLTPLESLGLEQYPLCPS	800569	794238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795500_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
711944	contig_12654_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_129315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1085	1435	790674	790324	NA	20	CATTTGCTATAAGTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNPLNLTDSFKLQDNSIYSPITHGPKIKSQILTMAYKALQSLPPSAPVSQICLTSFASFLLVPSAPATLPGTCSLCTGCSLCLEYSSLAVYKTTSLTSFKPLLKHHLPNNTVRPA	791758	790094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_790100_791800
711948	SIRV6	+	1058	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	30	0	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	215	706	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1130	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
711950	contig_1725_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_24316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAAAAAAATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240078	240710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_240100_240700
711951	contig_9345_pilon	+	1872	6	Intergenic	novelGene_24476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_5	58.8013605284776	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	979	1554	622829	629879	FALSE	15	CTTATATATGGGCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLVRRSNPSTLLS	621850	630197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774
711954	contig_5018_pilon	+	983	6	Intergenic	novelGene_47139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	461.865781369436	4576	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	136	732	1498209	1500271	FALSE	10	GAATCTGTGTCGGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497675	1500522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498136_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
711955	contig_7035_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_83535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	490	870	738069	738449	NA	60	AAATAAATTAATGGAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERFMPTPSLLGHSRIEKERSLPGCLPRVVREGSGVGRETAQVTHTCVPRAVGEAVAGLQAAAERTQRAQWKALCRAASCTCAGPRSTSLPVCPRASAFPAWLWSCHLPLGSLCQFRATSRVWHSG	737579	739637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_737600_739600
711957	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
711958	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
711959	contig_12724_pilon	-	1565	7	Intergenic	novelGene_146865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	3	35	junction_5	46.9908383505646	136	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	299	1126	497741	440995	FALSE	25	CTTTGATTACAGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDGVSKDSDSAVFMETTEELFEQLESHSLSPSDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDHVRVISTFFNYWITHILPQRNSE	541561	440555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445957_448443_448537_448584_449011_497701_497837_523020_523122_541459
711967	SIRV7	-	331	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	12	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114726	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70988_78841_78964_114680
711977	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
711978	contig_11816_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_98468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTGATGAAGATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433019	430952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_431000_433000
711980	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
711986	contig_5959_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_150212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGAGATGATAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423360	423893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_423400_423900
711987	contig_5959_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_150213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCATAGGGTTTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423946	424650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_423900_424600
711988	contig_2069_pilon	-	1696	6	Intergenic	novelGene_23332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	19.5857090757521	353	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	40	666	595572	588076	FALSE	5	GATGGTGCCCTGTCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEGSFPLLLPPPPLLPGMAEVEVKTAAETDMKHFRGPGSGVMDVERSRFPYCVVWTPIPVLTWFFPIIGHMGICTSTGVIRDFAGPYFVSEDNMAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVSVGAFVKTWLPFILLLGIILTISLVLNLR	595611	587045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_588164_588940_589072_589149_589247_590792_590825_592127_592213_595378
711993	contig_5457_pilon	-	1650	3	Intergenic	novelGene_138994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	19	119	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGTGTGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	13656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_15140_20100_20189_27753
711994	contig_9653_pilon	+	2164	7	Intergenic	novelGene_48235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	155.492497139465	996	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	603	1082	825097	830443	FALSE	35	CCAAGGTGTGTTAACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEGRKAKEDSGNKPMSKKEMLAQQREYKKKKALKKAQRIKELEQEREDQKVKWQQFNNRAYSKNKKGQVKRSIFASPESVTGKVGVGTCGIADKPMTQYQDTSKYNVRHLMPQ	818134	831525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_818310_819545_819666_822672_822863_824979_825123_825716_825879_829205_829360_830305
711995	contig_17796_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_33755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGCTAAATTCTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	6932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_6900_8200
712001	contig_7744_pilon	-	2126	9	Intergenic	novelGene_62473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	42.4911755544607	390	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	233	1489	490626	487677	FALSE	30	AACCCTAAATGGTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRRAPELYRAPFPLYALQVDASAGLLIAAGGGGAAKTGIKNGVHFLQLEQINGRLSASLLHSHDTETRATMNLALAGDILAAGQDAQCQLLRFQTHWQKGSNKAEKAGSKDQGPRQRKGAAPAGQKSGAETHCEGVELSVEDLQVVQTDFSADPLQKVVCFNHDNTQLATGGTDGYIRVWQVPSLKKVLEFKAHEGEIEDLALGPDGKLVTVGQDFKASVWQKDQLVTQLHWQENGPTFSNMPYRYQACRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	490858	487039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_488678_488866_488992_489090_489172_489350_489572_489750_489944_490491
712002	contig_9706_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_20865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGGTGTATTCAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2500_2700
712005	SIRV5	-	235	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATAAACTGCTCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
712010	contig_2940_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_81968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGACAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066823	1064586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1064600_1066800
712012	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_18395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
712014	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_91280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	657158	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657159	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712016	SIRV2	-	419	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	53	3260	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
712020	contig_13051_pilon	-	2875	14	Intergenic	novelGene_140139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.8371775803389	12	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	69	2132	531109	494061	TRUE	15	CAAGGTCTGGTCAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCRERLVVRRGQPFWLTLHFEGRAYEASVDSLTFSVVTGPAPSTESGTKARFPLSDTMEEGAWAAAVVDQQDSVLTLQFSAPADAPIGLYCLSLETSTGYQGSSFVLGHFILLFNAWCPADDVYLDSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFINSLPWNFGQFEDGILDICLKLLDINPKFLKNANRDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYKDGISPMFWIGSVDILRRWKNYGCQQVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNKFGEIQGDKSEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNADVVNWIQQEDGSMQKSVNNSLVVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPDGSPEERDAFTRANHLNKLVAKEETGMAMRIRVGQGMNMGSDFDVFAHITNNTSEDHTCHLLLCARTVSYNGILGPECGTTEVFDLALEPFSEKSIPLHILYEKYCDCLTQSNLIKVRGLLTEPAANSYLLAERDIYLENPEIKIRILGEPKKNRKLVAEVSLRNPLTVPLSGCAFTVEGAGLTEEQKTVEIPDPVEAGEEVKVRVDLLPLHVGRHKLVVNFESDKLKAVKGYRNVIIGPS	531177	492285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_492961_493992_494212_494952_495090_496056_496218_502577_502851_504509_504753_506847_506952_507711_507848_511487_511666_512759_512889_514419_514539_519665_519909_527332_527513_531099
712027	contig_14577_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_164648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTACTTCCACAGCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78925	78085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_78100_78900
712029	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712030	contig_12756_pilon	+	1574	9	Intergenic	novelGene_153200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	95	junction_1	74.1938971546852	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	375	1139	47123	66492	FALSE	30	CAAAGTTGTTTGGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFYRFWK	46748	66927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_66436
712036	contig_6488_pilon	+	1074	5	Intergenic	novelGene_44765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	606	junction_1	320.711221350298	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	44	439	197428	203836	FALSE	45	TACAATTTTAATAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEQQRDNLSQQSFNMEQANYTIQSLKDTKTTVDAMKLGVKEMKKAYKQVKIDQIEDLQDQLEDMMEDANEIQEALSRSYGTPELDEDDLEAELDALGDELLADEDSSYLDEAASAPAIPEGVPTDTKNKDGVLVDEFGLPQIPAS	197384	204471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_197479_197611_197684_199944_200054_201539_201653_203785
712038	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712047	contig_1335_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_166506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGCTCATGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29592	31048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_29600_31000
712048	contig_9197_pilon	+	1085	3	Intergenic	novelGene_154371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	174	331	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	141	362	80748	92451	FALSE	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFLEPGGRAASSSSPLSEAQPKDPGKVAIQITRAQLQDHLSRAGTMSAETANGPTEDQVEILEYNFNKVNKHPDPTTLCLIAAEAGLSEEETLKWFKQRLAQWRQSEGLPSECRSVTD	80378	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80506_80734_80892_92373
712049	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712050	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712053	contig_19721_pilon	-	2370	2	Intergenic	novelGene_99153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	113	2125	148734	146722	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRKLISATDTQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHRNILSASSTYFHQLFAVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDELIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGSTQDGNAETLPPGSNDKSLEIQKSKDEAQDNGTTIMPIITESFSLSAEDYETKKIIVTDSDDDDDDDVIFCSEILPAKETLPNNNAQVHANPGSVAISDVAPCASNNSSPLTNTTPTQKLPTSMSQVTLSQTQGSEKVLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLTTPPNVSSSLPNHMAPSINILVQNQQPPNSAVLTGNEANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAVSNTSLVPQADVPQNTTFDGSLIQKMPIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTNDPGVGSKHLTEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKDDPDEGEARLENDVPKTSGSEMTNKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCKRSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRYQCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYSYLSDRSSTMPVMKDDGIGYKVDAGKEPPVGTTSTQNKPMTWDDIFNQQENDSIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY	152052	146476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_148737_151942
712054	contig_11338_pilon	+	1572	10	Intergenic	novelGene_6189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	524.66626664769	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	185	1360	6086	13398	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVRQSGHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	2745	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10013_13242
712056	contig_9011_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_159271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTGGCTCCCTCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104955	105897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_105000_105900
712059	scaffold_12124_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_22078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTTGGTTGTGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854145	854436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_854100_854400
712060	contig_3942_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_128716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520261	517708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_517700_520300
712063	contig_13457_pilon	+	2382	13	Intergenic	novelGene_118323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	227.554328067436	3	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	985	1566	55314	56318	TRUE	50	AAAAAACGAGGACAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEEVSKHGRSTAGPSTCSCLASSFLQPHTEQ	52331	57996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53413_53513_53615_53937_54172_54259_54440_54888_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
712066	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712068	contig_5643_pilon	+	1419	10	Intergenic	novelGene_39057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	825.491742710944	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	631	1284	634983	641450	FALSE	5	GTCTCTCCGGTCATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQEITLPSPAASTPVPFSLSPGSRHLPHSLPHLSAASALTPAEASSG	631218	641585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636534_641316
712069	contig_9807_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_32886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	646.794252877649	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	90	710	109130	158783	FALSE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109040	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128613_156708_156770_158676
712073	contig_13863_pilon	+	645	7	Intergenic	novelGene_41987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	689.348827195314	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTCAGAATCCGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55012	62820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60913_60983_61931_61990_62762
712077	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
712081	contig_4964_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_157263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTTGTGTTTCAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162386	163493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_162400_163500
712085	contig_14801_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_166525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCTACTTTGAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21854	23619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_+_21900_23600
712089	contig_4364_pilon	-	1630	14	Intergenic	novelGene_123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	164.524417712596	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	529	1404	1094511	1092058	FALSE	5	TCCCTGGCTCCATGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMRKMATAFNTTVAALEDELTQLILEGLINARIDSHSKILHARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMNTNM	1097634	1091831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093425_1093639_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094797_1095572_1095733_1095987_1096081_1097563
712095	contig_6048_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_73212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATATGGGTTCCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606458	1606707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1606500_1606700
712098	contig_500_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_30929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1309	1611	1121149	1120847	NA	75	ATAGGGAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEAHCTVFCWSLLPPFLCHCVLLSSVLQLSLCLLDPEASQCRFPGSEGPHSPLLAVLPRWWWDPLFPAYGMAHFKPNRMAKLTSPLGGPQLPYLRSPI	1122457	1120576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1120600_1122500
712102	contig_9415_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_109723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCATCACAGCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459878	458595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_458600_459900
712103	scaffold_19766_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_34453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTTGGCCCCTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881287	879943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_879900_881300
712104	scaffold_19766_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_34454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACGTGAGAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883045	882828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_882800_883000
712105	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	151	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712106	contig_5302_pilon	-	1984	4	Intergenic	novelGene_81525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1444	1752	1532302	1531307	TRUE	5	ACTGCCGCGCTGGGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQFYFFFFFFGGSSSELLSVLVLLLLEELESESESEEEEELVEEAEDDELEELSSVSLSSEEDEVDVSSLSDEESLAELSLLSLLELVTLLDLFSWSFFLH	1533745	1493766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1493824_1516817_1516980_1531293_1531335_1532021
712107	contig_8541_pilon	-	1221	5	Intergenic	novelGene_105586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	447.074588295958	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	231	851	577314	565459	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKARELSLPCMLFLYKWLSC	577544	548490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_564935_565360_565507_567245_567472_576967
712108	contig_10042_pilon	+	3602	3	Intergenic	novelGene_79234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	199.5	543	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	182	388	1187799	1194106	FALSE	60	AGAAAGTCATGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSVGGAQLTSLFPLPASVVAREAPSALLHGVHRGARVSGGGGEPVGSGSWSGGSGPRCRMATAGRMNIQLLLEAADFLERREREAEHGYASMLPYNNKDRDALKRRNKSKKNNSSSRSTHNEMEKNR	1187617	1197320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187872_1188564_1188665_1194072
712115	contig_10437_pilon	-	1234	3	Intergenic	novelGene_38114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	3.5	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	151	705	80783	80229	FALSE	25	CAGGGCTCAATGTTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82798	79699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80788_81383_81482_82750
712120	contig_10766_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_151224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAACAAACCCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197386	196872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_196900_197400
712121	contig_5018_pilon	-	2466	6	Intergenic	novelGene_47201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.8	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTCCGGCTGCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599717	1595280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1595356_1595526_1595700_1596049_1596242_1596892_1597026_1597279_1597424_1597968
712123	contig_6710_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_96588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
712130	contig_11742_pilon	+	1452	2	Intergenic	novelGene_166530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGAAGGACATATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61426	62945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_62076_62142
712131	contig_8616_pilon	+	1595	10	Intergenic	novelGene_72492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	630.266629841179	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	363	1400	322373	330877	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPVLSPPLQPLLGLTSAVPFWLQRVSCLRRRSQNSSPHVERKSRSPRPVMAPGKMQLC	321627	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_321885_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330576_330720_330850
712139	contig_6710_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_89155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653688	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
712147	contig_2480_pilon	+	2259	3	Intergenic	novelGene_63557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_1	16	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	471	1298	363853	364680	FALSE	40	AAATACAAGTATTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNPQLRRTQSMRDGRGALCICLAKAEGEGGAGSDRPLHGLSKRTQESADLSDIPSWVNQSVLHVNGSSPNEELSLEMKNLLREVPDLQESVRRNCASAAALSKAVALSSAPTEEQGVKVPRGVGEALVRDWLGRGPRDTDCHGDWCHKGELWLCSACLQPSGLPCYHTLNLLPLGMGIFEDEPPSAFLGISSELELPSLHSILSATLYACPEILLNDETKDLSLDCLKPMLSEQIVEYKEMLSGVKSIPDDLQVTLGLLALRALEFANLLYHS	344441	365641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_344670_362365_362560_363804
712151	contig_34_pilon	-	765	5	Intergenic	novelGene_40025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1680	junction_1	1228.83227089786	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	69	764	247052	215299	FALSE	35	ATGGCACAGGTGAGGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPET	247120	215297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
712152	contig_18869_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_56360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73728	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
712153	contig_9127_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_103022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATAATACAGTGATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224120	225012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_224100_225000
712159	contig_7057_pilon	-	1418	5	Intergenic	novelGene_123220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	45.7192519623845	457	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	15	428	539698	537963	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKVPAGPPLEPRRRGIAMPSGRH	539712	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539509_539654
712160	contig_15888_pilon	-	1270	9	Intergenic	novelGene_84411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1561.78815284756	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	69	713	254586	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGVGGRTRRYGSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259759	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251848_252000_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254618_259722
712164	contig_17769_pilon	+	2474	17	Intergenic	novelGene_124261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	52	junction_3	99.514583573213	482	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	1183	2394	110839	116765	FALSE	25	TATAGCATGTCTGATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKNAPCILFIDEIDAIGRKRGRGHLGGQSEQENTLNQMLVEMDGFNSTTNVVVLAGTNRPDILDPALMRPGRFDRQIYIGPPDIKGRSSIFKVHLRPLKLDESLSKDALARKLAALTPGFTGADISNVCNEAALIAARHLSPSVREKHFEQAIERVLGGLEKKTQVLQPSEKTTVAYHEAGHAVVGWFLEHTDPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPREQYLYTREQLFDRMCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	97621	116845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_97780_102105_102194_102689_102759_104163_104259_104700_104851_106410_106480_106928_107054_108444_108716_110387_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_113608_114697_114814_115333_115535_116111_116307_116546
712165	contig_15952_pilon	+	1821	2	Intergenic	novelGene_154031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	341	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	747	1145	63603	64001	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVEKFRLQELCEAHCAHPEAGPQSSSLPQPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQVMPHAPRWCAGLGPVKERVVTPGLTGTSQLPNPTGRSHAAVPAH	62181	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62670_63344
712166	contig_9434_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_150520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCATTGCCGTCGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471827	473689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_471800_473700
712168	contig_7004_pilon	+	2815	13	Intergenic	novelGene_126488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGTCCCGTCGCTACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408275	414527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_408611_408831_408918_409054_409220_409351_409468_409614_410096_410781_410938_411125_411355_411635_411787_411878_411995_412402_412592_412709_412813_413191_413301_413948
712172	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
712180	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_113456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
712183	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712184	contig_8663_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_58001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCACCATCTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65290	64787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_64800_65300
712187	contig_12964_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_131661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACTACTCAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135578	136717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_135600_136700
712197	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712202	contig_12000_pilon	+	1546	10	Intergenic	novelGene_43147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	557.463900176505	959	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	152	883	417192	586887	TRUE	20	TTATATCACATGTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416802	669834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_586886_586941_669224
712205	contig_7426_pilon	-	2078	14	Intergenic	novelGene_27474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	100.488452043421	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	29	1834	668286	637491	FALSE	40	TTTTAAAAAAGTTTCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPRDSVCSWPARGPATNCSRRKRKKAMGRLCCSKGSTRCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	668314	637246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_642075_642179_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
712206	SIRV7	+	332	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCATTTTCTATAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78840_78963_114679
712208	contig_7587_pilon	-	828	4	Intergenic	novelGene_163715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	21.6384431561566	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	49	702	200989	142457	FALSE	35	AATAAATGTTGTGCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPEWTEEDLSQLTRSMVKFPGGTPGRWEKIAHELGRSVTDVTTKAKQLKDSVTCSPGMVRLAELKSTAQNSRPIKTPVALPDDIITQREDAEGRVEEEEQEELEEGAGEQNEAGITETRPRKRKPARLLETVMRVEPEEKFRAKRQKDFEILEQNESSDEESQKKERTRATEEPWTQNQQKLLELALQQYPKGSSDRWDKIAKCVPSKSKEDCIARYKLLVELVQKKKQAKS	201037	142330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_142526_145105_145567_158260_158310_200914
712209	contig_11538_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_152295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAAACAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197554	198859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_197600_198900
712217	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712218	contig_1813_pilon	-	2088	15	Intergenic	novelGene_105497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_14	15.357641187928	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	931	1824	303280	295428	FALSE	40	ACCAAGAAACAGTTCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVESLALCLRALLSEDMFRLDATVPPIPFREEVYTSSRPLRVGYYETDNYTMPTPAMKRAVLETKERLEAAGHTLIHFLPSDIPHALETLSTGALFSDGGHHLLQNFKGDFVDPCLGDLISFLKLPRWLKGLLAFLLKPLLPRLTAFLDSMKSRSAGKLWELQHEIEVYRNTVVAQWRALDLDVLLTPMLSPALDLNAAGKAIGAISYTVLYNCLDFPAGVVPVTTVTAEDEAQMEHYKGYFGDSWDWMLRKAVKKSVGLPVAVQCVALPWQEELCLRFMQEVEQLMPCEKRPS	313690	295163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_295557_295807_295954_296511_296621_297113_297154_297948_297990_298308_298409_300862_300961_301433_301560_303175_303301_303530_303572_303816_304025_304105_304240_304494_304633_305809_305924_313415
712219	contig_10937_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_67344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTGTGTGATGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185561	185980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_185600_186000
712222	SIRV4	+	345	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1426	632	971	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
712223	contig_10297_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_112551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATTATGTTGACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597343	598322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_597300_598300
712224	contig_6823_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_131199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCAATCTAGGTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21437	19906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_19900_21400
712228	SIRV6	+	764	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	557	-14	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
712231	contig_1443_pilon	+	776	2	Intergenic	novelGene_28198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	39	503	344128	344592	FALSE	40	CAAGGCAATAAAACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSVGAPTPRSEKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343710	344865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
712235	contig_16022_pilon	+	1557	12	Intergenic	novelGene_160261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	3	16	junction_1	14.7670618507027	298	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	172	1290	6174	34589	FALSE	10	ATTGTGGCTGATGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQTPAFNKPKVELHVHLDGAIKPETILYYGKKRGIPLPADTVEELQNIIGMDKPLALTEFLAKFDYYMPAIAGCREAIKRIAYEFVQMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVKPIAWNQPEGDVTPDDVVALVIQGVQEGERDFGVKVRTILCCMRHQPNWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVCPWSSYLTGAWKPETEHAVIRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKRSMGFTEEEFKRLNINAAQSSFLPEDEKEELLDLLYEAYGMAAPASAGCKVIPLKTSQQPF	6002	34856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_18661_18724_25158_25282_27588_27733_28513_28630_30098_30224_31023_31096_31177_31280_31547_31613_33208_33339_33982_34086_34545
712239	contig_8907_pilon	-	483	5	Intergenic	novelGene_85811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6559	junction_1	1762.90901282511	54246	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	30	437	179842	173397	FALSE	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179871	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391_179544_179839
712243	contig_7513_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_88963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAACCCCCGACACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157004	158732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_157000_158700
712251	contig_9527_pilon	+	2123	7	Intergenic	novelGene_134048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	64.762815119652	312	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	857	928	419690	419761	TRUE	5	CTCCAGGCTTCTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCSTFQSTDTHPVPGAPLLQLPPWSSPWLRYVPKVSLQAQGTASNPEGAGKAEEVPGEGGLNLQAETRAWFQKTQAHWLPQHGAAPAWFHGFITRKEAERLLETKPQGCYLVRFSESAVAFVLTYRSRTCCRHFLLAQLRDGRYVVLGEDSAHARLQDLLRHYTGSPLSPYGEKLTEPCARQTPEPIGLPLRTEETDSGSKTQDPDPHYSTVLKQGHAPALLKKEGAGESKEPSQQPRPKPPIPAKPQLCPEVYTGLAPRPRPAPPRKPSNPIYHELDEPIAFYAMGRGSPGGSPQQHLCRGGGALKK	412563	422823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_412667_414398_414584_415418_415509_415644_415814_419182_419333_419530_419832_421698
712252	contig_5317_pilon	+	2066	12	Intergenic	novelGene_76624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	133.300939591091	256	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	82	1293	896836	922667	TRUE	10	TTGGGATGTTGTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASRRSASRVNTARVPRRSRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMEEDSYDSFGEPSYPEVFEPPPAWLPGGGAGGRGGKGREARPRGLHLLQRAGGQGGGHGQWGLEHHAGMLRGHPYSVNRSP	885457	924984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885517_896813_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_918631_918735_921985_922105_922647_922707_924250
712253	contig_6233_pilon	-	1759	12	Intergenic	novelGene_74795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_9	305.5865786071	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	641	1480	149777	143464	TRUE	30	TTGTTCTTTTAAGCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	136695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_177116_177257_199837_199941_200462_200546_250135
712255	contig_11825_pilon	-	2402	12	Intergenic	novelGene_155414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATAGTCATACATAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133152	89124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_89271_113235_113344_116746_116856_117966_118149_123655_123757_126198_126365_126833_127051_127725_127847_128749_128833_130974_131060_131498_131673_132242
712260	contig_16506_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_166557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGAACATATTAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50406	48417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16506_pilon_-_48400_50400
712261	contig_18869_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_56260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATTTTCTCCTTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73352	73557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
712262	contig_8259_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_148873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTGAGATATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164728	165474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_164700_165500
712272	contig_14970_pilon	-	1446	6	Intergenic	novelGene_45107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	151.868364052557	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	232	765	285706	264487	TRUE	25	ATGTTGATTCAAATTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GESSSQKQALQTSSASTPEQLFSPIAQTSVDSLKTFPTHPGPFCAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315746	254903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_255535_264436_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_315615
712274	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_2957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
712276	contig_10923_pilon	+	841	4	Intergenic	novelGene_66223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_3	355.621521658443	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	94	723	36664	42718	FALSE	10	CTTGTAGGTAGCTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	36570	42836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_36698_37270_37540_38578_38742_42554
712284	contig_12074_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_53778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1432	1791	52382	52741	NA	60	AAACAAAAAAATTGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDDDPPTPEEDSETQPDEEEEEEKVSQPEVGAAIKIIRQLMEKFNLDLSTVTQAFLKNSGELEATSSFLESGQRADGYPIWSRQDDLDLQKDDEGARNALVKKFGAQNVARRIEFRKK	50950	52786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_51000_52800
712287	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_91991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657182	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657182	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712300	SIRV6	+	549	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1530_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
712301	contig_7285_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_143391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAAAAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228407	226137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_226100_228400
712302	contig_9468_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_59536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGACATCTCTATCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633459	632892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_632900_633500
712305	contig_7457_pilon	+	1955	15	Intergenic	novelGene_31584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	208.660267283585	248	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	338	1654	940402	953888	FALSE	5	TCTGGCTCTTTGCTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRNAKALKAKKEDGNKAFKEGNYKLAYELYTEALGIDPNNIKTNAKLYCNRGTVNSKLRKLDDAIEDCTNAVKLDDTYIKAYLRRAQCYMDTEQYEEAVRDYEKVYQTEKTKEHKQLLKNAQLELKKSKRKDYYKILGVDKNASEDEIKKAYRKRALMHHPDRHSGASAEVQKEEEKKFKEVGEAFTILSDPKKKTRYDSGQDLDEEGMNMGDFDANNIFKAFFGGPGGFSFEASGPGNFFFQFG	927927	954189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_928643_928808_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687_946842_947373_947539_948394_948487_951589_951664_952018_952166_952384_952538_953360_953424_953850
712310	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
712312	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_96813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	657158	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657160	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712316	contig_3009_pilon	-	1260	2	Intergenic	novelGene_132518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76600	75189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_76390_76540
712317	contig_17144_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_29137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	535	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACTGTGCCTGTATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48919	47515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_47500_48900
712330	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
712331	contig_4125_pilon	-	1366	5	Intergenic	novelGene_25094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_4	150.212141653063	1203	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	322	906	661037	631015	FALSE	20	GACCCTGGAATCCTCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSPLRVAVVCSSNQNRSMEAHNILSKRGFSVRSFGTGTHVKLPGPAPDKPNVYDFKTTYDQMYNDLLRKDKELYTQNGILHMLDRNKRIKPRPERFQNCKDLFDLILTCEERVYDQVVEDLNSREQETCQPVHVINVDIQDNHEEATLGAFLICELCQCIQHTEDMENEIDELLQEFEEKSGRAFLHTVCFY	661358	630554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_631117_631681_631801_632363_632504_648777_648922_660957
712342	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_93545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712343	contig_1009_pilon	+	1238	3	Intergenic	novelGene_121768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	59	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	51	434	298738	299568	FALSE	20	CCAGGTGTCTACCATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLPPPGKSAKPSAAPMEHKGLVSHNGSLINVGNLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLEESHNRFSATEVTNKTLAAEMQELRNRLAEAEETARTAERQKNQLQRLLQDFRRRLTPLQLEMQRMVEKADSWVEKEEPAPTN	298687	300372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_298871_299020_299227_299523
712346	contig_14353_pilon	-	2337	8	Intergenic	novelGene_82104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	404.984655793984	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	38	541	104372	83893	TRUE	30	CTTTTATTTCAATAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQTQTIIHTMHNTPGQMFPVS	104409	79107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83863_83953_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
712350	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	16	354	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14424	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
712357	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712365	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	75	AAAAGAATAAAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712366	contig_11932_pilon	-	2063	7	Intergenic	novelGene_85403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	45.9444108558254	232	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	1062	1892	248975	245563	FALSE	10	TTCCTTTTTGTTTTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGWQPESADDFDRLVLSSPNSSILWLQYMAFHLQATEIEKARAVAERALKTISFREEQEKLNVWVALLNLENMYGSQESLTKVFERAVQYNEPLKVFLHLADIYTKSEKFQEAGELYNRMLKRFRQEKAVWIKYGSFLLRRGHAGASHRMLQRALECLPKKEHVDVIAKFAQLEFQLGDVERAKAIFENTLSTYPKRTDVWSVYIDMSIKHGSQKEVRDIFERVIHLSLAPKRMKFFFKRYLDYEKQHGTEKDVQAVKAKALEYVEAKSSVLED	251125	245391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_245735_246484_246651_247156_247311_247906_248076_248805_249402_250265_250383_250607
712368	contig_6946_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_59775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAATCTCTCCTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417653	416163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_416200_417700
712369	contig_6946_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_59774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCTTTCGGAAGCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416008	415475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_415500_416000
712373	contig_2027_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_39937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAAATTAAATACTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364849	367130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_364800_367100
712376	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_16586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27842	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
712381	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712387	SIRV4	+	537	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	411	2	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
712390	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
712394	contig_8611_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_166565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTCATCCTAGAGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113651	113094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_-_113100_113700
712396	contig_7171_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_101405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	1410085	1410384	NA	35	GTGTGAGAATAAAGGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEEISKGQAALVTITQPGHIPVGAGGESEPQPSVLRGRQLSQGAALGPPSHLDPAASGSSPPQIRASPVGLLGVEVHASSKAHHHAQERVSLCGKEWR	1410083	1412308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1410100_1412300
712399	contig_11932_pilon	+	3444	1	Intergenic	novelGene_85407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251835	255279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_251800_255300
712400	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
712402	contig_5959_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_150220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTTGGTGTGTCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456644	457710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_456600_457700
712407	contig_13519_pilon	+	1259	11	Intergenic	novelGene_124634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	418.083532323386	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	123	1211	72535	120612	FALSE	25	TCATCCAAGACTTGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSPGRHDAEESVTPERGWSAGGRNPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57074	120660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100120_102309_102373_115513_115645_116672_116756_120484
712409	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_95040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712410	contig_9332_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_60729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAGGTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544550	545433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_544600_545400
712412	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	40	369	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14448	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
712415	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91666	1	-91660	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGACAAAACCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
712419	contig_14514_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_137454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAAAAGTGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24537	22124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_22100_24500
712422	contig_5059_pilon	-	1178	12	Intergenic	novelGene_140703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_8	125.089389525654	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	48	962	231713	166409	FALSE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231760	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_214153_214187_214730_214789_226820_226893_231639
712423	contig_14882_pilon	+	1836	5	Intergenic	novelGene_115001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	327.985041579643	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	357	890	254706	264587	TRUE	20	TTGATTCAGCATGTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKASLEIEYQVLDGAGLDIDFHLASPDGKTLVLEQRKSDGVHTVETEVGDYMFCFDNTFSTISEKVIFFELILDNMGEQEQEQDWKKYITGTDMLDMKLEDILESINSIKSRLSKSGHIQTLLRAFEARDRNIQESNFDRVNFWSIVNLVVMVVVSAIQVYMLKSLFEDKRKSRT	254349	267309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_254742_257635_257734_261708_261890_264368_265191_266966
712430	SIRV1	-	245	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-108	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGTTTGTGAGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
712434	contig_7411_pilon	-	2798	4	Intergenic	novelGene_137027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_2	55.9603033904888	139	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1352	1771	358572	356649	FALSE	25	TTTTTTTATTGGCATAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAIETTDIISKHLPGVCRVSTDLLREGAPIEPDPPVSHWKPEAVYYEDGARIEAAFRNYIHRADARQEEDSYEIFICHANVIRYIVCRALQFPPEGWLRLSLNNGSITHLVIRPNGRVALRTLGDTGFMPPDKITRS	359923	355621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_356800_357904_358036_358263_358353_358523
712435	contig_10235_pilon	-	2137	17	Intergenic	novelGene_46572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.0988842568466	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	587	1936	541922	537366	FALSE	25	GGGAGTTGAAGGAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNETLSGRGATGDYEEMMQIECEVMDTRWEYCSFPCSRGVGQSVEERQDMRVKHLFGGRGFTSPLTPSHFGGHSVPASSFEGIK	546924	537164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537537_537744_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539250_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811_545904_546384_546465_546840
712437	contig_9706_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_20868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2483	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2500_2700
712438	contig_7171_pilon	+	1319	7	Intergenic	novelGene_101235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	404.227108882563	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGATTTCAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733962	764968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734147_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
712439	contig_5302_pilon	+	2134	4	Intergenic	novelGene_81497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	473.765999436665	2	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	33	824	342315	355700	TRUE	40	TAAATCCATGATTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342282	357049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568_356520_356558
712442	contig_8617_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_73473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCGCTACCAACCCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
712444	contig_9995_pilon	+	1800	2	Intergenic	novelGene_47730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501182	503397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_502268_502682
712445	contig_12250_pilon	+	1931	16	Intergenic	novelGene_80558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	58.6971890297994	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	168	1871	272853	278399	FALSE	15	CCTCGGTTCACCAACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272685	278459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
712446	contig_5316_pilon	-	1510	6	Intergenic	novelGene_61208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCGAGCAGAGCGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524124	396001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_396221_453778_453969_474049_474255_511461_511608_521314_521502_523561
712454	contig_17440_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_7660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3567	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
712456	contig_9706_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_20991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435773	438228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_435800_438200
712457	contig_20293_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_153533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATTTGAGAGATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109746	109343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_109300_109700
712459	contig_11163_pilon	+	2413	2	Intergenic	novelGene_153058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATGTTTTTCCCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99191	101677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_101243_101315
712460	contig_16917_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_161929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCCTACAACTGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116482	116031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_116000_116500
712475	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712476	contig_13051_pilon	+	2706	11	Intergenic	novelGene_140097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	114.228236439157	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	39	1412	60194	173717	FALSE	30	CCATTCACTGAAAGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGELLSYQPNRGTKRPRDDEEEELKMRRRQGGTRERGRYREEETTVVEEADDDKKRLLQIIDREGEEEEEEEEPLDESSVKKMILTFEKRSYKNQELRIKFPDNPEKFMESELDLNDIIQEMHVVATMPDLYHLLVELNAVQSLLGLLGHDNTDVSIAVVDLLQELTDIDTLHESEEGAEVLIDALVDGQVVALLVQNLERLDESVKEEANGVHNTLAIVENMAEFRPEMCTEAAQQGLLQWLLKRLKAKMPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEGKITRGVAEFRYIRRMGEMRAIWKKSDVHLRSGLLRRRVLFYLLIFHAWKSSP	60155	175011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374
712478	contig_11855_pilon	+	1889	7	Intergenic	novelGene_67113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	159.190050638293	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	912	1376	2445507	2446649	FALSE	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCP	2440202	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440407_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2444464_2444587_2445373_2445964_2446641
712479	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712480	SIRV7	-	375	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33168	26	-51	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114789	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
712487	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_89630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712489	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712492	contig_16775_pilon	+	2047	14	Intergenic	novelGene_107777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	319.719255545962	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	465	1385	156947	174074	FALSE	40	TAATAGTACATTTGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWMNGLNLMMIKSASLHQKISCGFLVVETGI	130452	174736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134231_143932_144038_144961_145024_156859_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173309_173984
712494	SIRV2	-	250	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-377	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACTAAAAGTCAGGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1400_1700
712500	contig_16722_pilon	-	1689	10	Intergenic	novelGene_118270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	54.3379911659478	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	24	1448	57643	50829	FALSE	10	CCCTTTCCTTTTACTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNENANSPAARLNRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDATSPLQENRSNQGTVNWSVDDIVKGINSNNLESQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSPFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNKNPAPPLDAVEQILPTLVRLLPIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVDILSKADFKSQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYAFQVPDDTPGTFNF	57666	50587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_50922_51582_51733_52784_52968_53193_53412_54153_54269_54360_54456_54715_54985_55663_55753_57284_57423_57568
712503	contig_12128_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_131990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCTAAATTCTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402428	403776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_402400_403800
712511	contig_10765_pilon	+	1653	6	Intergenic	novelGene_122859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.179912042546	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	118	1158	18249	32071	TRUE	25	TGTATTTTAAATGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNLVMALCSALMTIFSIKMGTSIMLINSVMPMTGTRTERNKLLLRGDLQL	15649	35095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19144_28932_29040_32032_32122_32463_32541_34727
712516	contig_16775_pilon	+	2419	2	Intergenic	novelGene_107742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	130	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	295	363	77953	78021	FALSE	25	TTAACACTCTTCCATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSGGTSWTAKEPQGTDACAKGAPRTGVAEGVRAKEPRGRQRDQELSRNRLSSKDYGSFPGPSGASASPRKWKVFDLSEAIVDPSKKKSLTTSIFSPFIMMLVIGPIMRIFVVFMLRCNPY	76441	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_76676_77892
712526	contig_19628_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_166574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTTTCTGGTTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21595	23280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_21600_23300
712527	contig_15410_pilon	-	1964	7	Intergenic	novelGene_130567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_4	41.8200510122437	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1048	1803	56347	54277	FALSE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	57394	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333
712532	contig_7357_pilon	-	1274	2	Intergenic	novelGene_36819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2105	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTTGTTTTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137828	135552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565
712533	contig_14686_pilon	+	2450	2	Intergenic	novelGene_88068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	109	480	66935	67306	TRUE	75	CTAGAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSKEKGKCERRPSVPGAFFPAVTLISPVLLIPFPHCGRLHYLGVAMSTFFGVGDECGLMVYSRESLGLRGLGFLQPFPGVCHSRRVPLPKTHYLAKVPNRLYFQPWLGREERGKAWRQRRLR	66826	69392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_68687_68802
712538	contig_12000_pilon	+	2216	6	Intergenic	novelGene_43165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	554.822277851205	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	57	548	417192	587791	FALSE	40	AGCTCCAAGTACCGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLNLTTTTITNFFCYLLCIRNCWKHFTYIVLFSPINSVPYHSYSIVGETKV	416897	589459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488538_587641
712544	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712547	contig_10779_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_165520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	1091.3833824555	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	48	371	78334	61914	FALSE	60	CTTAAAAAATATGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYSSEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHISSATQNQKQHDTSSKTHSSSQQGTSMLEDDLQLSDSEDSDSEQVSFVHPIISGILLNESNISKLLILTYFLFFF	84319	60749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_62065_74901_74954_76889_76927_78250_78338_84275
712556	contig_6048_pilon	-	1365	9	Intergenic	novelGene_73237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	311.079069530562	263	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	69	650	1916833	1905836	TRUE	20	GTCCTCTCTGTAAACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKVRAISGLS	1916901	1896672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901050_1905790_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
712557	contig_3181_pilon	-	1885	2	Intergenic	novelGene_136922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	51	344	266363	264609	FALSE	10	TTTTATATTTGTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRFGGPSQVSPPLRFAMAEPQEVRASSPPPPPPSSPSSSDASSASSPGVPVSLGWPVPRRSSGRPVDRQLLEATSAVSAQVEELASKCTENARFLKTWRDLLKEGYDSLKPDN	266413	263067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_264746_266206
712559	contig_7035_pilon	+	3146	2	Intergenic	novelGene_83523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGCCTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288231	302246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_290369_301237
712560	contig_12270_pilon	+	365	2	Intergenic	novelGene_113806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13853	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14361
712562	contig_3601_pilon	-	2840	15	Intergenic	novelGene_132963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	139.826860868748	2	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	572	1528	1171264	1127225	FALSE	20	ACATTCGTGATGATCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTEEAIIYSYGFATIASAIPAYSKRGDIVFVDKAACFAIQKGLQASRSDIKLFKHNDMADLERLLKEQEIEDQKNPRKARVTRRFIVAEGLYMNTGAICPLPELVKLKYKYKARIFLEESLSFGVLGEHGRGVTEHYGINIDDIDLISANMENSLASVGGFCCGRSFVIDHQRLSGQGYCFSASLPPLLAAAAIEALNIMEENPGIFAVLKEKCEQIHKALQGISGLKVVGKSFSPAFHLQLEKSTGSRERDVKLLQEIVSQCMNRSIALTQARYLEKEEKCLPPPSIRVVVTVEQTEEELEKAASTIKEVAQAILL	1194431	1125912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1127319_1129305_1129380_1132667_1132786_1139478_1139534_1141955_1142053_1142353_1142450_1147057_1147166_1152465_1152556_1157632_1157763_1171169_1171303_1183726_1183800_1184356_1184451_1188426_1188522_1191165_1191274_1194268
712567	contig_8064_pilon	+	973	5	Intergenic	novelGene_164552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	32.310988842807	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	107	574	24192	118276	TRUE	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHYDKCSGSCTSSSAPHSLGSEPGNSNPRRNQLINLNHYATKKSVAESMLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	22889	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_22939_24134_24261_117149_117382_118109_118295_118823
712568	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_92010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712573	contig_11602_pilon	+	1990	3	Intergenic	novelGene_166583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCCATGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50945	93952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_52011_92413_92613_93226
712574	contig_5059_pilon	-	1418	12	Intergenic	novelGene_140705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	109.810053883441	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	264	1202	231713	166409	FALSE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231976	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_231639
712593	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
712596	SIRV1	-	263	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	3	3564	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGCCTGGAAGTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
712597	contig_6710_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_97859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712599	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712607	contig_19459_pilon	+	732	4	Intergenic	novelGene_59829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTATTTTTCAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6666	11389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7789_7945_10267_10330_11327
712612	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712613	contig_2036_pilon	-	2192	1	Intergenic	novelGene_131839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCAGACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620180	617988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_618000_620200
712620	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_96732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712632	contig_10042_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_79247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATTAAGCAGCCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201319	1200661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1200700_1201300
712633	contig_15666_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_70111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAATTACAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87846	88991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_87800_89000
712636	contig_361_pilon	-	2450	1	Intergenic	novelGene_166619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012954	1010504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1010500_1013000
712638	contig_15105_pilon	-	1418	6	Intergenic	novelGene_151029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	916	junction_4	702.528746742793	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	39	761	839916	829338	FALSE	30	AGCAGACCTTGACTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839954	828680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
712639	contig_15063_pilon	+	1523	5	Intergenic	novelGene_11500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	55	AATAAAAATATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
712640	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
712643	contig_9216_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_163509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAGAAAAGAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577603	579474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_577600_579500
712661	contig_17144_pilon	-	1090	7	Intergenic	novelGene_29483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1841.41799226092	2	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	36	1016	174965	166152	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWELSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	175000	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166311_172598_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
712664	contig_5832_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_134149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGACTGTGAGCGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347174	349108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_347200_349100
712665	contig_5445_pilon	+	1200	4	Intergenic	novelGene_135412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1341.9220046883	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	766	1104	52520	53758	FALSE	35	AAAAAATTTATTGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCFLPVIPLPVLFLSNTELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51640	53854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_52309_52422_52635_53127_53240_53646
712666	contig_2114_pilon	-	3874	11	Intergenic	novelGene_104307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	7.7	89	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	147	2792	1044698	1030377	FALSE	40	TATCGGATTATATAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIQFRSLFPLVLPGMLALLGWWWFVSRKKERISSHDKQVEASAVELGTDPPIEGLLLTDDTCPRVVPTPLSVTQPPEKELSTMSKPSMEPPALLRAQPAPRRSESSGSLLNTTDTRSRLGTRKDDSTKLELALTCDEAKSIPLECPLPSPKGVPFPHEAVEVGKQEPMFSRTPGRAWPGQSAALTEKRGPGEKARETGWAEGTGDAVAGEKVLEEGVLSQEHVSEVENSKVPSLAPLGGGEEKGKTSLHQGQGAGPVQKEEYVAGKVISSFIESAHAELAKDEEVPAPEIRGGKPQDGDLAGEAGKEEMVDKNEKLEQAAFQIISKVIMEATEEVQATTVGRITDRVCQASDSELQGPEEKSCAPISQEAVLGQDAVESTPATAEAAADTVDAALPSSGQPAEDPSPPKTYVSCLNSPLSSPTKDGKPPRNSAHHISLAPCPSRATSLRESLDEASVLAEDASRVTCALDSSQCVPSVGSLGQCSDSASTSGLEDSCTDTNSSPRDKDITPPLPESTVPFSNGVLKEELSDLGAEDGWSMDAETDHSGGSDGNSMDSVDSCCSLKKTDGFQSTQAGSDPKKVDLIIWEIEVPKHLVGRLIGKQGRYVSFLKQTSGAKIYISTLPYTQNIQICHIEGSQHHVDKALNLIGKKFKELNLTNIYAPPLPSLALPSLPMTSWLMLPNGVTVEVIVVNQVNAGHLFVQQHTHPTFHALRSLDQQMYLCYSQPGIPTLPTPVEIAVICAAPGADGAWWRAQVVASYEETNEVDIRYVDYGGYKRVKVDVLRQIRSDFVTLPFQGAEVLLDSVMPLSDDEHFSPEANAAMSEMTGNTALLAQVTSYSPAGLPLIQLWSVVGDEVVLINQWLVERGLAQWVDSCYTNL	1065990	1029294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1030452_1031049_1031113_1031357_1031432_1033056_1033125_1033552_1033704_1035240_1035419_1037429_1037558_1038185_1038313_1040372_1040507_1043050_1044723_1065868
712667	SIRV6	+	747	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	25	11	25	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10262	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
712674	contig_9883_pilon	+	1823	3	Intergenic	novelGene_87591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.5	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	17	631	83842	96211	FALSE	25	AGTCCTTTGTCCAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSWARTAVVLLCACDLVLLLLLPPRACATGDPAGTPGEATPPPRKKKKDIRDYNDADIDFSQIDPGKPESILKMTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPGKGGGSKEKNKTKQEKSKKKKEGDPKSRTSKEDNRAGNKREDL	83825	97403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84022_94124_94301_95952
712676	contig_10341_pilon	+	1183	4	Intergenic	novelGene_47216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	859	junction_2	148.063049633143	361	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	101	433	63271	64622	FALSE	20	CTTAGCTGTGTTATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGKAGKDSGKAKTKAVSRSQRAGLQFPVGRIHRHLKSRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGM	63170	65372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_63760_64039_64154_64484
712679	contig_17158_pilon	-	2604	1	Intergenic	novelGene_141145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGAAGAGGTTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119383	116779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_116800_119400
712682	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_96486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653781	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712684	contig_4900_pilon	-	2018	7	Intergenic	novelGene_159076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	65	AATCTGCAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1180003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1180917_1181199_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
712694	contig_18251_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_50166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTTGAAAAAACCAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48868	49522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48900_49500
712706	contig_6710_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_89573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTCTCTGGGGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
712709	contig_7898_pilon	+	1983	10	Intergenic	novelGene_47637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_6	51.1815939137846	134	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	67	1305	725339	736040	FALSE	0	GCCTTCTCTGGTGCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALLARAYGRVRGALRARDWRQLHTIYQSVALPETHQMLRQTCRDFAEKELVPIAAQLDKEHCFPAAQVKKMGELGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYSIAMEEISRGCASTGAIMSVNNSLYLAPILKFGSQKQKLQWVTPFTTGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTAVADGDSWVLNGTKAWITNSWEASAAVVFASTDRSLHNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRASSTANLIFEDCRIPKENLLGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIGQAALDCAVTYAENRKAFGAPLTKIQGIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVVAGHVLKSYRG	725272	736718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_725385_727026_727191_733435_733586_733832_733945_734362_734515_734825_734997_735089_735228_735380_735477_735699_735757_735887
712711	contig_6902_pilon	+	1137	3	Intergenic	novelGene_135596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	910	junction_1	528	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCCAAAATCCTCTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469824	471548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_469891_470397_470532_470611
712712	contig_9272_pilon	+	2395	5	Intergenic	novelGene_125941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	48.295962564173	227	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTATTGGTTTGGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422028	433821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_422228_426318_426388_426691_426794_427642_427759_431912
712715	contig_7707_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_72131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1159	1548	79769	79380	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLLFRILLQNLCSKCSVMVAGHHPVLLVSWQRSSHSWRQLATHSISSYPYSPTFSVAPGEYRPIVVPWMATCRLLRPQALCNKLGGRTEALNMLLGQLTGMSHEIITLNLQIKEQNPTKSYEVFGCT	80927	78882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_78900_80900
712718	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	109	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712719	contig_6710_pilon	+	531	2	Intergenic	novelGene_97421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653887_657149
712720	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	677	966	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTAATTTGCACATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
712726	contig_12810_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_145693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACTCCACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256367	258495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_256400_258500
712731	contig_7840_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_69011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTGATCATGGACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292860	292250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_292200_292900
712732	contig_6418_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_81240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	87	398	1443634	1443945	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLNVCCVIKKKKKKDSGCGESGTYEAPMNVLYLFAFNGICKHSCQNTQRKLPLLLCLGEGKPSSHLPNFTGKFPFFWRQEPTILSSEKVLLKDIFQKYNFSL	1443547	1445816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1443500_1445800
712733	contig_9696_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_68800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAGAGCAAGATGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358139	356824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_356800_358100
712738	contig_12638_pilon	+	2186	14	Intergenic	novelGene_33168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	169.229230762238	1	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	25	1023	269238	271285	TRUE	30	GAAAGACCACTGCTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDS	235651	274456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271746_273449_273584_273761_273999_274124
712739	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
712740	contig_3956_pilon	+	1630	7	Intergenic	novelGene_14700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_4	103.411260938492	106	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	86	1246	12062	53831	FALSE	45	TAACAAACCAATTTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETEENRLRCSRTPEPDIRLRKGHQLDDKRRIDNDNHQGDLEPILEAAVLSSHHKKSSEEHECNDEASQEDERFMGMSPLLQAHHAMERMEEFVCKVWEGRWRVIPHDVLPDWLKDNDFLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGCVFFLCLGIFYMFRPNISFVAPLQEKVVFGLFFLGAILCLSFSWLFHTVYCHSEGVSRLFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCNPQPCFIYLIVICVLGIAAIIVSQWDMFATPQYRGVRAGVFLGLGLSGIIPTLHYVISEGFLKAATIGQIGWLMLMASLYITGAALYAARIPERFFPGKCDIWFHSHQLFHIFVVAGAFVHFHGVSNLQEFRFMIGGGCSEEDAL	11976	54215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_12233_35907_36028_40474_40647_43054_43242_43500_43689_49374_49569_53702
712754	contig_8322_pilon	+	2343	9	Intergenic	novelGene_143273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	34.4954707171826	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	79	1806	504817	511748	FALSE	5	CCTGTCTGGTGTCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSALIGHPVALINPQTERPGYSHTSMDPRGILKAFPKRKQIHANPSSKALAKMPKREDGEEAGEWLSSLRAHVVPTGIGRARAELFEKQIAQHGGQICPAQAPGVTHIVVDESMDCERALRLLKLPRLPMGAQLVKSAWLSSCLQERRLVDTAGFSIFIPNRYLYQPQPSKANQDSSSPPGPHEGLLGTPLSLPPPPTRPVSPFQKAEETPSTQAQPGSDDESSDGEETQVSAADLEILISGHYPTLLEGDGEPSPTPEALDKWVCAQPSSQKATNHNPHITEKLEVLAKAYSVQGDKWRALGYAKAINALKSFHKPVTSYQEACSIPGIGKRMAEKIVEILDSGHLRKLDHISESVPVLELFSNIWGAGTKTAQMWYQQGFRSLEDIHSQVSLTAQQAIGLKYYDDFLERMPREEAAEIQQTVQESAQALNPGLLCVACGSYRRGKATCGDVDVLVTHPDGWSHQGIFSRLLDSLRQRGFLTDDLVSREENGQQQKYLGVCQLPGPRQRHRRLDIIVVPYSEFACALLYFTGSAHFNRSMRALAKTKGMSLSEHSLSTAVVRDNHGLKVGPGWVLPTPTEKDIFRLLGLPYREPAERDW	503915	512285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_503944_504766_504932_505731_506027_506219_506383_506746_507065_507868_508043_508657_508787_510780_510950_511383
712759	contig_15498_pilon	-	1546	11	Intergenic	novelGene_42674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	133.079675382832	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	11	823	697708	689615	TRUE	55	CTAAAATAAAGAGAAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRQATMS	697718	688014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689634_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
712760	SIRV2	-	552	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4314	41	3139	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1593	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
712761	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712765	SIRV4	+	289	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1471	643	1016	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
712769	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712772	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
712784	contig_9345_pilon	-	1569	7	Intergenic	novelGene_24370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	104	1042	176056	142100	TRUE	5	CTGCTTCCCTCGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176159	141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141258_141725_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
712785	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	566	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712796	contig_13558_pilon	+	2112	2	Intergenic	novelGene_123027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	0	310	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	70	666	495738	512853	FALSE	10	TATTGTCCTTCATTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRQKLSCCPTCRGALTPSIRNLAMEKVASAVLFPCKYATTGCSLTLHHTEKPEHEDICEYRPYSCPCPGASCKWQGSLEAVMSHLMHAHKSITTLQGEDIVFLATDINLPGAVDWVMMQSCFGHHFMLVLEKQEKYEGHQQFFAIVLLIGTRKQAENFAYRLELNGNRRRLTWEATPRSIHDGVAAAIMNSDCLVFDTAIAHLFADNGNLGINVTISTCCP	495668	514299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_495777_512295
712798	contig_9363_pilon	-	1651	5	Intergenic	novelGene_6611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	1531.35520046787	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	392	724	780625	777382	FALSE	60	TAAAAAAAATCAAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	787943	776454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_777660_780570_780689_781246_781352_786541_786648_787826
712808	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712813	contig_5826_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_71522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGCTAACCTTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178780	180767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_178800_180800
712818	contig_15063_pilon	+	948	3	Intergenic	novelGene_14418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1339	junction_1	2322.5	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	60	806	35349	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35289	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35836_36158_36266
712819	contig_3942_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_128639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	236	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176952	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176964_178331_178490_179045_179177_179714_179825_179974
712820	contig_4891_pilon	+	1161	7	Intergenic	novelGene_124560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	491.572985425359	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	255	806	707907	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWARASGARERRVIRSRRAAPAHYTLALLSPARRSCRRPPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700898	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701018_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
712822	contig_15410_pilon	+	985	4	Intergenic	novelGene_130610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_3	812.150369218793	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	153	641	145617	148205	FALSE	35	TGTGGATAAATTTCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGTLQMARCRRTLLISLCNLQIMPPSNNSSTPPQQHSQPTHSPLLR	145464	148549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_148070
712830	contig_6871_pilon	-	2078	7	Intergenic	novelGene_21633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	44.68283289537	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	163	1065	664971	657382	FALSE	25	TCGTATATTAATTTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAWVLLSAVLWYLTGVGWQRSALQNKKGFIYGTPGHPVKIYVKLHQNSPILVCMDSKRAKKETVDPTYVWIGPNENKLTGNNRINITNTGKLMVKDFLESLSGPYTCTFSYKSVKAETQEEKTVKKTYEFIMFAYREPDYSYQMAVRFTTKSCVGRYNDLLFRVLKKILDNLISDLTCHVIEPSYKCHLVKIPKHGLIHELFIAFQVNPFAPGWKAACNQSVDCEDNTNRNILQARDRIEEFFRSQAYIFYHDLNKTLPAMHFIDHSFQVVRMDSCRPGFGKNEAMHSNCASCCGNYEI	665133	656368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_657580_660195_660279_660817_661037_662595_662758_663413_663540_664711_664778_664922
712831	contig_14441_pilon	+	939	4	Intergenic	novelGene_100680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	433.811787145839	432	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	125	760	113653	117610	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGPGAEEGAEEGPGCGAVGVWLAPELRKEAAAELGLPQGAMLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113528	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113711_116578_116963_117220_117344_117539
712832	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
712838	contig_11285_pilon	-	1596	8	Intergenic	novelGene_5624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	883	1353	769124	766403	TRUE	50	AAAATACCAAGCAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVLVVRAADNLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEVGWGLLHPGLLAVPLLTGPLLCVTPKACRAAVHMVLTAHSLGWGIRTGYWGTGQHPRGWHLVCESKTTHQHCSGSPGGSSGVHPCKTRPLVMGSSGRFPRQ	770201	766048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_766197_766307_766442_766551_766637_767063_767121_768605_768859_769087_769301_769404_769646_769736
712840	contig_5057_pilon	-	1920	6	Intergenic	novelGene_151513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_5	400.022199383984	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	523560	514190	TRUE	10	TACTCTTGTCATTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRWVGLRTRRLGFGTVIELSGFNSWAERLSQAREARKIPDGVHDFQAEPQRPVLQHPVLRLLPCPHRNDHPGDLVYGGKPIDGNFADCGGDSSKLNASCQHSV	523562	506489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523328
712844	contig_7056_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_43687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	515	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTGTGCGTTTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860826	862966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_860800_863000
712845	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
712854	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_95806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
712855	contig_2834_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_27987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAGAAACCAGTAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242826	242027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_242000_242800
712862	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_96064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712871	contig_6710_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_93455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTTCTTTGTCTGGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
712873	contig_14322_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_115840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
712877	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712879	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712880	contig_3382_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_124209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTATCTGTAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441262	1440122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1440100_1441300
712881	contig_10734_pilon	-	1800	9	Intergenic	novelGene_51438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	76.5698210785424	459	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	646	1077	2222890	2216993	FALSE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2226437	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
712884	contig_7457_pilon	-	1573	7	Intergenic	novelGene_31402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	174.306881358393	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	351	617	470910	469327	TRUE	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWVQDDGASSLARRPLDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473208	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_473157
712886	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
712890	contig_8920_pilon	+	2323	6	Intergenic	novelGene_146058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAAAAAGCACCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62790	94927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_64428_74320_74440_92000_92125_92527_92619_93782_93948_94740
712893	contig_14142_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_120486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTTTTATCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272992	273297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_273000_273300
712894	contig_4852_pilon	-	2769	11	Intergenic	novelGene_153974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_7	62.0174169084782	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	81	1364	99919	84651	FALSE	30	CTAATTTGTAATTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRLLLLICAPLCEPTELFLTASPAHPIEGSSVTLTCAIQLPLQTTDSQLQYRFVRNGWPLRLAWSSSPKLQIPSMWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFWYKGAMGLKLGTKTQSSLTAEFEILTARESDAEQYYCAADNGYGPSLSELVSITVRIPVSHPVLTIRATGAQAVAGDTVELHCEVQRGSPPILYRFYHEDIILGNSSAPSSGGASFNLTAEHSGNYSCEADNGLGTQHSEAVPLNITVPTKNRREFITTGVIEGLLGALGPFTIVLLFCYWLKRKIGKQSASDPLRSPPSPVPQEITYLNSPTPVPLQPVYENVNLVSGDDIYSLVYCSQQEWKAAAERPRTPTEDEVSLDIYSKLKQASDSDGDYEDAM	99999	83245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86248_86278_86872_86945_87165_87249_88776_88805_90256_90374_90697_90971_91135_91424_93959_94230_95971_95993_99888
712897	contig_15063_pilon	+	939	3	Intergenic	novelGene_14420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	56	799	35349	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35293	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
712900	contig_14441_pilon	-	718	3	Intergenic	novelGene_100785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGGGGAGGGGCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126722	125515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_125900_126157_126286_126516
712902	contig_11816_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_98601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAATCAACCTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433715	1433966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1433700_1434000
712903	contig_11816_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_98602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAATGAAGTGATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434534	1436799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1434500_1436800
712906	contig_6360_pilon	+	2613	1	Intergenic	novelGene_165877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11122	13735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_+_11100_13700
712910	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
712911	contig_14855_pilon	+	2189	7	Intergenic	novelGene_146044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	42.9405273475872	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	344	982	650839	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648656	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_649765_649926_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340
712912	contig_15063_pilon	+	839	4	Intergenic	novelGene_9200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	409.179124046616	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	242	544	34808	36504	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPPAVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICLQQLCHQHPDARASGPGLLLHLQHPERV	27127	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34916_35024_35131_36415
712928	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
712937	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
712939	contig_15327_pilon	-	2149	9	Intergenic	novelGene_70783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	109	junction_1	59.1016074231488	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	120	962	1157860	1137310	FALSE	35	TTTGTGGCTCTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHR	1167442	1136122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375
712943	contig_9186_pilon	-	2100	4	Intergenic	novelGene_85361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	22.7303028283098	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	128	745	643909	638458	FALSE	55	AGAAATAATAATTAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGVDEPLSETGFKQAAAAGLFLNNVKFTHVFSSDLTRTKQTMHGILEKSMFCKDMTVKYDSRLRERKYGVAEGRALAELRALAKAAGEEVPTFTPPGGETLDQVKMRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	645413	637102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_638890_640124_640236_643834_643913_645289
712944	contig_14034_pilon	-	1818	7	Intergenic	novelGene_72680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_6	60.3123812606776	547	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	94	663	430673	421075	FALSE	5	GCTCTGGCTCTAGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVRGGWLWRQSSILHRWKRNWFALWLDGTLGYYRDETAQDEEDRVLIHFNVRDVKVGQECHDVQPPEGQSRDGLLTVHLREGSRLHLCAETQDDAIAWKTALMEANSTPVRVYSPYQDYYEVVPPNAHEATYVRSYYGPPYAGPGVTHVVVREDPCYSAGAPLAMGMLAGAATGAALGSLMWSPCWF	433825	419919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_421212_421835_421936_427441_427482_428601_428705_429295_429449_430636_430713_433771
712945	contig_7870_pilon	+	2093	2	Intergenic	novelGene_109093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	319	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAAGAGTAGGCCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822167	854118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_824167_854024
712946	contig_2069_pilon	-	1720	7	Intergenic	novelGene_23335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	35.5187743782543	341	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	11	622	595572	588147	FALSE	10	CCAGATGGTGCCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEGSFPLLLPPPPLLPGMAEVEVKTAAETDMKHFRGPGSGVMDVERSRFPYCVVWTPIPVLTWFFPIIGHMGICTSTGVIRDFAGPYFVSEDNMAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVRDLSTEAGVIMDGPTEDQRALGPS	595582	587048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_588164_588421_588478_588940_589072_589149_589247_590792_590825_592127_592213_595378
712949	contig_9014_pilon	-	1250	9	Intergenic	novelGene_106755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_4	52.3424719993238	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	215	994	81764	78380	FALSE	5	TTTGTTTGTTTTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	81978	78123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726
712950	contig_7095_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_166470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAATACATAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494877	492900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_492900_494900
712951	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
712952	contig_5445_pilon	+	1434	2	Intergenic	novelGene_135413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2873	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51645	53840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580
712959	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
712960	contig_13123_pilon	+	2092	5	Intergenic	novelGene_136896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	2	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	137	625	434529	444679	FALSE	45	AACCAAAAGGGCTACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434392	446146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
712962	contig_11338_pilon	+	2484	20	Intergenic	novelGene_6244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	126	junction_17	144.437527831182	678	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	25	2418	59541	84021	FALSE	10	TCTATGCATCCTCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVKQGAENMIQTYSHGSTKDRKLLLTAQQMLQDSKTKIDIIRMQLRRALQAGQLESQVAPDESQGSPDLGAVELRIEELRHHFRVEHAVAEGAKNVLRLLTAAKAQDRKAVCEAQEKLTESNQKLGLLREALERRLGELPADHPKGRLLREELAAACSSAFSVLLAGPFPAMHYSTLCKPAPLTGTLQVRVVGCRDLPETIPWSPSPSAGGPGASDSRTPFLSRPARGLYSRSGSLSGRSSLKAEAENTSEVSAVLKLDNTVVGQTSWKPCGPNAWDQSFTLELERARELELAVFWRDQRGLCALKFLKLEDFLDNERHEVQLDMEPQGCLVAEVTFRNPVIERIPRLRRQKKIFSKQQGKTFQRARQMNIDVATWVRLLRRFIPNGTATSTFSPGASPGPEARPTSSDISVEKLNLRADSDTSPQRSPLEPPSSLSSLSSRIQEQPLTPAPPSETQETPGPALCSPLRKSPLTLKDFKFLAVLGRGHFGKVLLSEFRPSGELFAIKALKKGDIVARDEVESLMCEKRILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLMLHIHSDVFSEPRAVFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTKGYVKIADFGLCKEGMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSDRDAEDVKKQPFFRTLGWDALLTRRLPPPFVPTLSDRTDVSNFDEEFTGEAPTLSPPRDARPLTATEQAAFQDFDFVAGDC	59516	84087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_59574_64167_64304_71600_71747_72227_72442_73648_73844_74730_74841_74930_75075_77126_77203_77282_77425_77510_77608_79806_79887_79962_80039_80132_80225_81636_81814_82107_82171_82275_82353_82552_82696_82974_83083_83183_83265_83817
712964	contig_5247_pilon	+	2423	16	Intergenic	novelGene_81806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	250.830141729418	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	187	1614	147123	156390	TRUE	15	AAGGTTTTCATGTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVSSCHLSGL	146416	161438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155971_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158553_160638_160731_161186
712965	contig_8362_pilon	-	2541	4	Intergenic	novelGene_150677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	403.346280783922	36	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	137	424	119616	81775	TRUE	5	CTTCCTTCTTGTCCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLRGRRVTHVPFPLPSLRVRSRPADPPRCTQSFPRPLSGPGPLAMAETTVTPPQPSVYTDPGVAYTVTDIAIIAGVVAAIAFVLIGLLFIMLHYLCQHKGTYYTNEDKGTEFAESADVALQDDPDLQDVGDSSTKEYFI	119752	79564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_81571_81663_81972_83911_83963_119576
712966	contig_10003_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_88226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	833	1162	605708	606037	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFVLLVTTGMKFLISSILTGHGRIPIIPQKIVSKHIRVVHAKANQRTKPLFCLSLVSSSIKCEAGLDHLRNFKNSMTLQSKKKEKNEHTHTHTPYILGMRSQTQTEN	604875	607087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_604900_607100
712969	contig_12638_pilon	+	1734	12	Intergenic	novelGene_33295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_11	78.3771344628749	250	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	161	1468	1176584	1283566	FALSE	30	AGTCTACCCTGGAACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPLAVVLVLAVTVRAALFRSSLAEFISERVEVVSPLSSWKRVVEGLSLLDLGVSPYSGAVFHETPLIVYLFHFLIDYAELVFMMADALTAIALYFAIQDFNKVVFKKQKLLLELDQYAPDVAELIRTPMEMRYIPLKVALFYLLNPYTVLSCVAKSTCAINNTLIAFFILTTIKGSAFLSAVFLALATYQSLYPLTLFVPGLLYLLQRQYIPVKIKSKAFWIFSWEYAMMYVGSLVVIVCLSFFLLSSWDFIPAVYGFILSVPDLTPNIGLFWYFFAEMFEHFSLFFVCVFQINVFFYTIPLAIKLKEHPFFFMFIQIAVISIFKSYPTVGDVALYMAFFPVWNHLYRFLRNIFVLTCIIIVCSLLFPVLWHLWIYAGSANSNFFYAITLTFNVGQILLISDYFYAFLRREYYLTHGLYLTAKDGTEAMLVLK	1176423	1283832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1176714_1190109_1190175_1205821_1205882_1207256_1207320_1223709_1223820_1226010_1226112_1242583_1242682_1256152_1256308_1257964_1258109_1260881_1261007_1267724_1267868_1283452
712972	contig_5947_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_101586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTGAGAGAGAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869908	870397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_869900_870400
712981	contig_6710_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_89095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653599	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
712989	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
712990	contig_6589_pilon	+	1396	9	Intergenic	novelGene_26003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	898.495400308204	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	418	1059	1726977	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725345	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725727_1725983_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
712993	contig_12125_pilon	+	2867	1	Intergenic	novelGene_76213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAGAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206319	209186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_206300_209200
712994	contig_6050_pilon	+	1272	2	Intergenic	novelGene_123118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	674	1030	360223	360579	FALSE	10	TTGCCCCCTCCTCTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPHPALQLSGQDGQELLQHQQLQDLLLAVHLGLQPLSAELPELAQGLSGPRCLLITKVPEPLAKNLPGMGFFPLKAGFLSPNMFIFLHLHDLKPHRLLCNLEGQLCSFSWLHGLLG	359290	360821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_359890_360148
712995	contig_5467_pilon	-	2181	7	Intergenic	novelGene_111958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	21.3105346927028	186	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	144	659	113214	109553	TRUE	25	TGAAGCGCATTCAGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSASCEFSNRRDPAGLSLTEPTSPLGESARSPNGETAGGPSSAGEVDMRLAGPLRIVALIITAGLTWIVISILLGRPGSGFPRIQQLFTSPENSVTAEPRARKYKCGLPQPCPEEHLAFRMVSGAANVIGPKICLEDKMLMSSVKDNVGRGLNIALVNGESPSYCGARAPGRGEASRAVTCGALLPTLPPSGFWPRVGLCQLKTPQRKRYSSGWAAAV	113626	107270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_107992_108751_109794_109913_110038_110546_110571_110948_111063_113201_113275_113543
712998	contig_4716_pilon	+	2563	6	Intergenic	novelGene_166626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	1.35646599662505	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	65	706	835952	863109	FALSE	10	CAAGTTGTTTTGCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWRKTGGFKMAKDLDELLDEVESKFCRPDPLRLGMVEQPKGTHSSDRNRAEAKENLRLADTFKRADDLDSLINEIFEEPDFDKKTFKLKSKSSGNTSVRASIQGVGKSCSPVYLGGSTAPCGIGTNISQRACDHLRCIACDFRIVSYDDYMWDKSCDYLFFRNNMPEFHKLKTKLVKKKGARAYACQCSWRTVEELTDLRMDHQLRWVCGKH	835887	864966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4716_pilon_+_836125_843362_843451_845039_845105_845654_845721_857614_857711_862955
713005	contig_11338_pilon	+	2108	12	Intergenic	novelGene_6164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	553.353219132199	1	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	440	1900	6086	13398	FALSE	40	AAAAGCTGAATTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVCARSLGRLPSRAVPACVLTAPPGPCPGGWQWLGSSVPRGAGPRPCSAAPTSQRSPPVRQQQSGHRPTVRRQCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	745	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4661_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10621_13063
713008	contig_18869_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_56110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73589	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
713017	contig_1150_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_61373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTGAGCGGAAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308882	307738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_307950_308789
713023	contig_6489_pilon	-	1170	4	Intergenic	novelGene_128962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	91.9069577827973	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAACTTTATTCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395622	389270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_393919_393986_395427
713029	contig_12566_pilon	-	1834	15	Intergenic	novelGene_86010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	73	402	86391	69095	TRUE	30	CAACAGCTGGAAGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFASISWPPLQSDELSVQPPEHIRPLLRLRSEHAKPCHQYCRSLLVKRCFDVPELTLCICPISGDGGNPDASLGAGVLILRNKLDGSSASLGDRGIVLVDYFEVDAER	86463	44400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_44457_47505_47730_50022_50079_52260_52350_54028_54266_54371_54456_56419_56567_56966_57126_59038_59153_63021_63148_65087_65170_69036_69128_69730_69841_72484_72636_86355
713030	contig_3153_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_104712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCCAAAAGGTAGAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543043	542356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_542400_543000
713037	scaffold_7386_pilon	-	1381	7	Intergenic	novelGene_136582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16813	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTGGGCAAACCAAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294706	287371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_287495_287633_287771_288860_288957_289386_289557_289752_290053_293534_293849_294465
713048	contig_13211_pilon	+	2739	2	Intergenic	novelGene_123134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACAATGACAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37863	43560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_40328_43285
713049	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713050	contig_11896_pilon	-	2228	2	Intergenic	novelGene_88006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATGAACACATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134577	131987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_132253_132614
713051	contig_990_pilon	-	2157	7	Intergenic	novelGene_76167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATGAAAGTCATCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1916460	1905151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1905180_1906166_1906301_1908043_1908134_1911074_1911145_1911719_1911816_1914619_1914838_1914939
713057	SIRV2	-	625	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	34	2958	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATTTGCCAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
713058	contig_14637_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_114555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCACAGCCCATTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365881	367817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_365900_367800
713059	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
713062	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713065	contig_7234_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_145962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACCATTCAAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544476	542532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_542500_544500
713070	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713079	contig_5286_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_157366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_4	623.895223575241	47	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	548	1213	564457	558602	FALSE	15	GCCTCCACGAAGCTTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLNEATQGKEHSEMSNNVSDPKGPPAKIARLEQNGSPLGRGRLGSTGAKMQGVPLKHSGHLMKTNLRKGTMLPVFCVVEHYENAIEYDCKEEHAEFVLVRKDMLFNQLIEMALLSLGYSHSSAAQAKGLIQVGKWNPVPLSYVTDAPDATVADMLQDVYHVVTLKIQLHSCPKLEDLPPEQWSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQVFSIARNK	567648	558282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_558753_559504_559632_560396_560574_564246_564482_567125
713083	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713085	contig_14925_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_55193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	1552.7624576863	72	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	208	465	29675	27020	TRUE	25	AGCAAAGGCTGTGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSYKYVFGAGTRLKVLTNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	77406	25795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_77351
713086	contig_19816_pilon	+	1391	4	Intergenic	novelGene_156460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	37.1752605908822	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGATCCTGTGTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35628	39185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_36266_36558_36834_38399_38433_38739
713087	contig_7396_pilon	-	1402	14	Intergenic	novelGene_79633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3303.55270300603	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1278	124	1401	255163	245943	FALSE	15	TGAACCTATTTTTGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDVSIFNWHSIQSSVQNVMLFCKKRFMIFKINL	257477	245941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246021_247703_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
713090	contig_7945_pilon	+	2570	8	Intergenic	novelGene_161608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	32.7887486924452	131	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	15	1163	465902	524517	FALSE	25	ATTTACCCAGAAGTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGSYMEEKHIPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYSLPDVDILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPDQNQLCWHQFQKSTAYAAYSQQQIQMPRCPRHIARSGQIQLWQFLLELLSDSSNSNCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHTHSQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPASHMPSHLGTYY	465887	525924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_465969_499460_499665_500474_500556_513319_513389_514010_514068_515597_515646_516055_516158_523996
713091	contig_15720_pilon	-	1019	8	Intergenic	novelGene_41899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2211.66717981836	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	104	748	283894	279800	TRUE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGMARPCCGTSTKASTSIL	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279038_279116_279713_279855_280277_280376_281459_281556_281786_281912_282587_282750_283785
713092	contig_2940_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_81983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119285	1119975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1119300_1120000
713103	contig_11932_pilon	+	1854	3	Intergenic	novelGene_85397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	20.5	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	371	1342	241177	243522	FALSE	15	CTAGCTTGGTGTCAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	235983	244034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_236346_241168_241732_243105
713115	contig_5286_pilon	+	1098	3	Intergenic	novelGene_157368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAACAAAGGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559737	567152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_560573_564245_564478_567121
713123	SIRV2	-	457	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4415	35	3240	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
713129	contig_15114_pilon	+	1064	2	Intergenic	novelGene_121084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTTTATTGTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24552	31499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_24722_30604
713133	contig_14441_pilon	+	1287	6	Intergenic	novelGene_100524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	392.50936294565	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	673	1101	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111150	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_112085_112154_112454_112669_116558_116963_117220_117344_117539
713134	contig_14322_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_116088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
713139	contig_3077_pilon	+	1160	7	Intergenic	novelGene_26600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3520.75429497083	28	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	147	878	9676	17801	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSFCCPFPLHTVGPAMPHPLMAAGQEPDHCPVESQAEPQLRDLGSALGNKEVGWGYGTARASGPAR	9529	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13932_17602
713144	contig_7457_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_31500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	833	1282	656715	656266	NA	35	CATGAATTACATGGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSFLVWLHLLSIIILIFINSLFLLLLSSIPLGVLVAQWLSAQLLTERSAVQTHQPLRRKKMWQSASVKITAMETLWGSSILSYRVAMSWNRLDGNRFDLVSIPLYDYTTNCLSIHLLMDVHVHRPCTVLTRFISAYFIDFAATVNKVF	657547	655894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_655900_657500
713147	contig_11677_pilon	-	721	5	Intergenic	novelGene_85926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_4	14078.5049721197	452	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	81	449	597508	595857	TRUE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEPLMHVWPGAPTAGIEAKSDRFLSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKRRPGDPVLPCLPGLTTMPSSSSL	598063	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595930_597212_597553_598027
713149	contig_7202_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_17596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCAAAGAGATACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
713154	contig_6710_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_97946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCAGGGTGATGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653413	653761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
713155	contig_19934_pilon	-	1247	2	Intergenic	novelGene_166631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	352	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTGTGGAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259282	202715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_203778_259097
713165	contig_10864_pilon	+	2527	19	Intergenic	novelGene_107066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_18	25.1246890528022	105	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	17	2293	832846	891756	FALSE	30	ACATGTTTCTTAGAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVAGVIRRLDETVVNRIAAGEVIQRPANAIKEMIENCLDAKSTSIQVVVKEGGLKLIQIQDNGTGIRKEDLDIVCERFTTSKLKSFEDLASISTYGFRGEALASISHVAHVTITTKTADGKCAFRASYADGKLKAPPKPCAGNQGTQITVEDLFYNIATRRKALKNPSEEYGKIVEVVGRYSIHNSGISFSVKKQGETVADVRTLPNATTMDNIRSIFGNAVSRELIEVGCEDKTLAFKMNGYISNANYSVKKCIFLLFINHRLVESASLRKAIETVYAAYLPKNTHPFLYLSLEISPQNVDVNVHPTKHEVHFLHEDSILERVQQHIESKLLGSNSSRTYFTQTLLPGLAGPSGEVVKSTIGMTSSSTSKSGDKVYAHQMVRTDSREQKLDAFLQPVSKAVSSQPQALVPEDSRDGSSGRTRQQDEEMLELPAPAEVVAKNQGFEEEATKGPSETTEKRGPTLSPDVPRKRPREDSDVEMVEDESPKEITAACAPRRRIINLTSVLNLQEEINEQGHEALREMLHNHSFVGCVNPQWALAQYQTKLYLLNTTKLSEELFYQILIYDFANFGVLRLSEPAPLFDLAMLALDSPESGWTEDDGPKEGLAEYIVEFLKKKAEMLADYFSLEIDEEGNLIGLPLLIDNYVPPLEGLPIFILRLATEVNWDEEKDCFESLSKECALFYSIRQQYVCEGSTLSSQQSEEPGSAPNPWKWTVEHIVYKAFRSHLLPPKRFTEDGNILQLANLPDLYKVFERC	832829	891990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_832962_835127_835219_837193_837293_841711_841786_844267_844341_845665_845758_846287_846331_846466_846556_849001_849115_860876_860971_863338_863493_868320_868698_870832_870982_880039_880149_881983_882048_887972_888138_888680_888774_889055_889170_891588
713166	contig_19469_pilon	-	2045	8	Intergenic	novelGene_134998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	42.2770261344801	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	175	918	155587	134615	FALSE	35	CATGTTAAAAATCTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQTLLGLKTAVVQTTPPHDLAATQIPSSPPSPSIQGQSVLSYSPSRSPSTSPKFTTSCMAGYSPQLQGLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPDVTNENVFCIYQSAINAPHYELIYQSHVYSLPKGRNNMFHTLLMFLYIIKTKESGMLGRVNLGLSGVNILWIFGE	156218	133487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_139384_139459_141415_141514_141610_141726_142377_142476_153483_153689_155488_155731_156187
713168	contig_8357_pilon	+	2491	2	Intergenic	novelGene_39692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTACTGAGATGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242155	245246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_244292_244891
713170	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298
713177	contig_6418_pilon	-	2913	1	Intergenic	novelGene_81130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115297	112384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_112400_115300
713180	contig_1154_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_87106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTGGAGGCAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385663	386808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_385700_386800
713182	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
713184	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713185	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713187	contig_12324_pilon	-	1433	1	Intergenic	novelGene_166642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCTGAAATGAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32296	30863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_30900_32300
713188	contig_2455_pilon	-	2189	4	Intergenic	novelGene_119187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	78.3212756677407	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1541	2104	157152	142765	FALSE	50	CAAGTAAAGAAAATTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLKEKERDKVLTPEELKAAQTSVAYGCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAYLLYAFTRIRSIARLANIDEEMLQKAAQETKIILDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDYIYELATTFTEFYDSCYCVEKDRQTGKVLKVNMWRMLLCEAVAAVMAKGFDILGIKPVQRM	158692	142679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142875_143681_143930_144362_144536_157119
713189	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91673	2	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
713193	contig_11318_pilon	-	1320	12	Intergenic	novelGene_48140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	512.376959630632	20	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	297	1319	49795	14968	FALSE	75	AAGAAAAAGAAGAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEK	58277	14966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17556_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_58143
713196	contig_1225_pilon	-	1615	4	Intergenic	novelGene_44161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCGAGCTCCCGGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276792	250604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_250729_253389_253508_274210_275119_276327
713197	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	397	2972	-397	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGAAGCGTTGTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
713201	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713207	contig_8263_pilon	-	1911	5	Intergenic	novelGene_83114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1442	1813	190595	188959	TRUE	25	GTATAGTTTTTGTCCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAKAKVSVQELSLLISVIDVVCTSVCISKECSAFLTLKKNMRNFAASFGLGELALPSSASLLPLKKNVSVCGVYPSERLKVPLSVQDTSDTSVSDTDNSLAATVRLILGQRAEKSNSLSSL	192959	188018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_188095_188936_189003_189256_189380_190390_191478_192400
713208	contig_20170_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_166656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAATTAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67372	67662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20170_pilon_+_67400_67700
713215	contig_14519_pilon	+	2286	6	Intergenic	novelGene_66842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	384.5384766184	546	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	66	1160	391439	406074	TRUE	20	ACACTGATTTGCTCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFVALGVLTLCKFYLQGYRAFMNDPAMNRGMTEGVTLLILAVQTGLIELQVVHRAFLLSIILFIVVASILQSMLEIADPIVLALGASRDKSLWKHFRAVSLCLFLLVFPAYMAYMICQFFHMDFWLLIIISSSILTSLQVLGTLFIYVLFMVEEFRKEPVENMDDVIYYVNGTYRLLEFLVALCVVAYGVSETVFGEWTVMGSMIIFIHSYYNVWLRAQLGWKSFLLRRDAVNKIKSLPVATKEQLEKHNDICAICYQDMKSAVITPCSHFFHAGCLKKWLYVQETCPLCHCQLKNSSQLPGLGTEPVPQPNAGAEQNIVHQEGTEPPDQERPEGTRIQEGPSDNNECFARADSQEGTFDPKEYPLSTKDEACLLPVSLEEKKQE	391373	407297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_391462_394196_394380_401744_401893_403076_403434_405690_406569_406665
713217	contig_9345_pilon	+	1198	9	Intergenic	novelGene_24478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.077407115657	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	107	877	622097	631320	FALSE	80	TTATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVHMYLPFKMLRESVAHQSFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	621990	631641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_622156_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
713218	contig_15888_pilon	-	816	5	Intergenic	novelGene_84445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1731.8379507044	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	10	369	253673	252475	TRUE	20	ACTGACTCCACATTTCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	253682	251608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251806_252056_252301_252468_252539_252807_252833_253402
713219	contig_11492_pilon	+	1756	14	Intergenic	novelGene_152256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_6	91.1787372701416	501	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	78	1307	394652	486678	FALSE	5	GCACCTCGCCTCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGEQSICQARASVMVYDDTSKKWIPIKPGQQGFSRINIYHNTASNTFRVVGVKLQDQQVVINYSIVKGLKYNQATPTFHQWRDARQVYGLNFASKEEATTFSNAMLFALNIMNSQEGGPSAQRQAQNGPSPDEMDMQRRQVMEQQQQQRQESLERRTSATGPILPPGHPSSAASVPLSCSGPPPPPPPPVPPPPPLPAGGAQGASHEESSVSGLAAALAGAKLRRVQRPEDASGGSSPSGTSKTDPNRASSGGGGGGLMEEMNKLLAKRRKAASQTDKPADKREDESQTEDPSTSPSPGTRAASQPPNSSEAGRKPWERSNSVEKPVSSLLSRTPSVAKSPEAKSPLQSQPHSRMKPAGSVNDVALDALDFDRMKQEILEEVVRELHRVKEEIIEAIRQELSGISTT	394574	487127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_394663_420235_420405_431936_432115_467628_467693_470712_470778_473726_473930_474740_474863_477958_478020_479357_479422_480854_480922_481010_481074_483808_483876_484297_484356_486640
713220	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	83	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713224	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
713225	contig_2087_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_65572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	690	1031	71331	71672	NA	30	ATTTCAAAGTGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYAFPHLGLHLWSGLPGTRFHDLLVWLTSAYPSQLSSYFTLFGSCSQACVKSTWHLGHACLTILITLCDNFSLTGHWTLSSTVLAMSFVSTGTVFCLLFYPQHQASAWHTVP	70641	71914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_70600_71900
713226	contig_15323_pilon	+	3804	1	Intergenic	novelGene_148515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGAAGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68966	72770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_69000_72800
713232	contig_10331_pilon	-	1528	3	Intergenic	novelGene_54221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	49	junction_2	4	416	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCTAACAGCCAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456626	1444625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1445814_1455204_1455365_1456446
713235	contig_10722_pilon	+	1337	3	Intergenic	novelGene_70993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.5	248	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	578	1258	31560	32414	FALSE	5	TGGTTTTGTTTCTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30576	32493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31137_31542_31755_31928
713239	contig_1399_pilon	-	2542	7	Intergenic	novelGene_166661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	32.0749989174677	4	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	5	1090	96144	83941	TRUE	35	TACTGATGGCTAAATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMKETLQNVRTRLEILEKGLATSLQNDLQEVPKLYPEFPPKEMPEKPPSFGSLLWHAEVNGDTPATSGASASAPGPLPSAPQGRPTEAPPAYTPQAAEGHYTVSYGTDSGEYSSVGENFYRNHSQPPPLETLGLDADELILIPNGVQIFFVNPAGEVSAPSYPGYLRIVRFLDNSLDTVLNRPPGFLQVCDWLYPLVPDRSPVLKCTVGAYMFPDTMLQASGCFVGVVLSSELPEDDRELFEDLLRQMSDLRLQVKDTSSEEMNLSHIVPYEPVSEEKAKELPEWSEKVAQNILSGASWVSWGLVKGAEFTGKAIQKGASKLRERIQPEEKPVEVSPAVTKGLHIAKQATGGAAKVSQFLGE	96148	73449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055_82215_83885_84144_87124_87249_92501_92700_95583
713240	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	355	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713243	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
713244	scaffold_13505_pilon	-	1775	9	Intergenic	novelGene_111632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	271.334635413542	235	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	772679	748569	TRUE	5	CGGCTCTGTGCCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVAAVRVWGPSRGLGRAGLLLLRRLGARGLASSHPRRQQQQQFSSLDEKPQFPGASAEFIDKLEFIQPNVISGIPVYRVMDRQGQIINPSEDPELPQKEVLKLYKSMTLLNTMDRILYESQRQGRISFYMTNYGEEGTHVGSAAALDSADLVFGQYREAGVLMYRDYPLELFMAQCYGNVSDPGKGRQMPVHYGCKERHFRHHLLSTGHADPSGCGGGLCSQAGQ	772690	746361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_746955_747638_747811_748008_748151_748398_748606_751724_751888_755081_755191_760469_760557_760653_760837_772571
713256	contig_8357_pilon	-	1717	8	Intergenic	novelGene_39774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	510.492959035176	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	260	550	891622	891010	TRUE	65	TCCAAGAAAGAGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKFTAL	891881	883870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_887117_887179_887257_887410_887717_887787_890560_890614_890873_891025_891346
713260	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	16	363	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14424	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
713262	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
713264	contig_1856_pilon	-	2455	2	Intergenic	novelGene_84868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGCCTTTATTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173809	171309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_173339_173383
713268	contig_6589_pilon	+	996	6	Intergenic	novelGene_25764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_5	2051.79400525491	5571	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	288	689	669670	671366	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTTQGPLEMSPGATCLPEELMGVVVFSD	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669650_669748_670000_670104_671046_671188_671286_671412_672584
713271	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_115755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671644	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
713272	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713273	contig_11056_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_130394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	622	933	646090	645779	NA	20	ATGCCAGTGTCCTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGRNDWRKRVRRTDRLQCHHRVIGLHVVGTSVGGPYLEPGVVRPTRPLMAPPPPSSACPQEIDGKALLLLRSDMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF	646711	644735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_644700_646700
713276	contig_14513_pilon	-	1074	4	Intergenic	novelGene_70348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1383.57226852168	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	173	331	18880	18722	TRUE	15	TTAGAACTCTGCTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19052	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11559_11760_12158_13087_13136_18691
713277	contig_2209_pilon	-	1817	8	Intergenic	novelGene_141023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_5	214.601196337271	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	105	779	270074	262821	TRUE	15	GCAGTGATTTATTTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVWGATLNKDATKAATAAADFTAKVWDAVSGDELMTLAHKHIVKTVDFTQDSNYLLTGGQDKLLRIYDLNKPEAEPKEISGHTSGIKKALWCSEDKQILSADDKTVRLWDQATMTEVKSLNFNMSVSSMEYIPEGEILVITYGRSIAFHSAVSLDPIKSFEAPATINSASLHPEKEFLVAGGEDFKLYKYDYNSGEELESYKGHFGPIHCVRFSPDGELYASGSEDGTLRLWQTVVGKTYGLWKCVLPGKNFYSDLSN	275173	257619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_258179_262341_263003_265205_265343_265496_265635_266280_266378_268909_268983_270026_270109_275103
713281	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713293	contig_9345_pilon	-	1749	7	Intergenic	novelGene_24346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.497240610898	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	89	1027	176056	142100	TRUE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176144	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141414_141690_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
713295	contig_3942_pilon	-	2180	9	Intergenic	novelGene_128808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_1	68.9772380934464	31	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	899	2017	1056399	1050289	FALSE	20	CCCCAGGGCACCCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGCGLQPDFDDAWLLRALSFLSPHSSVKRGRQLPSGGCCGGRDRPVPGTQGPSVRSFLCCARSWPRRASTYTGAWTLPHISWALVAVWVHWGKDRLSDPYLSLQPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKDSGHPETLINLIVLSQHLGKPPEVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1057297	1050125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1051201_1051271_1052698_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018
713298	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
713301	contig_1639_pilon	-	1983	10	Intergenic	novelGene_74914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	50.6822588094166	410	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1101	1412	339160	335862	TRUE	30	TTTGAAAGATGTTTCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTTVNIGSISTADGSALVKLGNTTVICGIKAEFAAPPTDAPDKGYIDFGPDLLGKRPKWLASSLQMSLKIHR	340260	331865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_332077_332460_332568_333095_333217_335007_335105_335826_335873_335959_336029_336879_336926_338135_338210_338868_338933_339112
713305	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713308	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713309	contig_8045_pilon	-	1940	7	Intergenic	novelGene_35332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	184.163574634677	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTGAAAGAAAGGTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235837	82722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_83606_98059_98115_100942_101059_102484_102764_232388_232502_235227_235597_235712
713317	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713328	contig_14441_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_100744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	326	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	193	636	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121195	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126496
713331	contig_9705_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_41764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATCAGAAAAGGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533031	534481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_533000_534500
713336	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
713337	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657829	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSAVAPSWSSKVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657789
713339	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_90409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713346	contig_10235_pilon	-	1292	9	Intergenic	novelGene_46274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	371.452196621584	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	195	1103	24268	14151	FALSE	20	GAAACAGTGTGCGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	25283	13961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_19632_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124
713348	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_93619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713353	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
713361	contig_19408_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_166676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTTCATCTTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108724	111178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19408_pilon_+_108700_111200
713367	contig_11098_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_166682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTACCCCTTATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57796	58851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_57800_58900
713369	contig_6102_pilon	+	1941	11	Intergenic	novelGene_32265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.7550794756887	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	477	1202	1446602	1448424	TRUE	20	CCACCCTGAGTATCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGEPGGLVRASLASGRLRTHHSLIIARPP	1444288	1449376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445671_1446211_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448581_1448676_1448785_1448901
713372	contig_10734_pilon	-	2076	10	Intergenic	novelGene_51210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGAGAGACTACAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161541	1146920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1147292_1148784_1148826_1151368_1151446_1153410_1153515_1154921_1155002_1158640_1158750_1158865_1158921_1159494_1159562_1160094_1160235_1160509
713376	contig_5039_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_64937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTGTGTAGATAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443847	1442668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1442700_1443800
713388	contig_11293_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_134675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTCAAAATGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88537	87636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_87600_88500
713391	contig_12353_pilon	-	966	9	Intergenic	novelGene_165770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	61.0117816491209	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	70	966	121330	97602	FALSE	30	TGGTTTAAAAATCCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKAETSTNGSLAIDEKTQWILEEMESRRARRRQARVLSANCSHEEGTSSDDELPSAEMTDFQKSQDDILQDCKKIFEDVHDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAFISLCIPKLLNPLIRIQLIDWNPLKLDSIGLKQMPWFTSIEEFVDSSVEDSKKEDCSDKKILAAVINKTIIPRLTDFVEFVWDPLSTSQTTSLITHCRMVLEEHSTCENEGLLKSILSRIKKAIEDDVFIPLYPKSAVENKTSPHSKFQERQFWSGLKLFRNTLLWNGLLPDEALKELGLGKLLNRYLIIALLNATPGPDVVKKCSEITACLPEK	121399	97601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_97626_101528_101676_103408_103476_105343_105421_113874_113979_117959_118111_119729_119930_120712_120826_121316
713398	contig_10907_pilon	-	1253	9	Intergenic	novelGene_144904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	300.286529834423	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	182	1051	36093	14797	FALSE	45	AATGAAAATGACTCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVIVVGNPANTNCLTAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITTVQQRGAAVIKARKLSSAMSAAKAIGDHVRDIWFGTPEGEFVSMGVISDGNPYGVPDDLLYSFPVVIKNKTWKIAEGLTINDFSREKMDLTAKELTEEKENAFEFLSTA	41094	14594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_16700_16878_28331_28455_30318_30495_36029_36127_36951_37026_41020
713399	contig_20614_pilon	+	957	7	Intergenic	novelGene_107547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	995.785563707814	22	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	524	871	154222	155100	FALSE	30	CTGAAAAGATAGTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152056	155186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152659_152737_153645_153835_154009_154282_154394_154533_154771_154856_155034
713405	contig_5023_pilon	+	1765	10	Intergenic	novelGene_7150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	264.495653305085	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	645	1391	359358	385288	TRUE	45	CAAAAGCCAAGGAACTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPTIVRKLYLESEFPAGANS	353315	387370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_385232_385453_387160
713406	contig_9871_pilon	+	3164	1	Intergenic	novelGene_75634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2547	3008	346992	347453	NA	25	TGTCTCTCTAACACCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVMKESRSKAGFRQVEIVGNGKYRGKGQLEAVGKIQGSQWVIVQREASVEEEPNHFYKWRLKQSGPCFCISYNNCYYYYKLEIGGSDCAQVPLQFSVRRNSVKLPESSSEGRFGTVGIKWPLKNAQQIRTMVRVIPRHRSQKLLGEKTVVIL	344445	347609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_344400_347600
713410	contig_11378_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_112319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTACCCCGCCGCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153118	1154152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1153100_1154200
713411	contig_4868_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_136766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTAAAAAGACAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273266	274501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_273300_274500
713416	contig_14142_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_120480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.607340726402	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	159	791	268562	274180	FALSE	10	CCTGTGTGTCTGAGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLTQTDVLHFLFPIYTPHPCPPFLPF	261236	274996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_261367_268533_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_274100
713419	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713425	contig_14289_pilon	-	949	6	Intergenic	novelGene_110561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	385.276731713712	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	421	843	58752	51527	FALSE	15	CATGACCATGTTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66625	51420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66395
713427	contig_854_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_36346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGTGTTGGAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976350	974685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976400
713428	contig_11566_pilon	-	2536	2	Intergenic	novelGene_166704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_1	0	52	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	488	829	195721	194651	FALSE	75	TGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEVTQLRRVLETASDASLGWLHVNRVRETLKEHQGHLLNFVVVPVSKLFSPKLLKCLE	196208	192943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_194969_195697
713430	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
713431	SIRV3	+	646	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5660	2	3601	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTTAACGTCTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7604	8937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
713433	contig_9919_pilon	-	2443	3	Intergenic	novelGene_137995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	221	junction_2	35	221	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1679	2098	843092	835210	FALSE	30	TACCAATATGTCTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHGQPDQPRSARYILKDYVSGKLLYCHPPPGTDPVLFQQQQRPLTENKRSSDEGRMPPGREKKVKQIENVVDKTFFHQENVRALTKGVRAMTGYEPGSGLVTAATQSREFVAGKPWKKHGNRNKKEKSRRLYKHLDM	844770	834864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026
713436	contig_12019_pilon	+	1602	5	Intergenic	novelGene_87738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	176.726306757087	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1062	1373	634020	642415	FALSE	30	TGGAATGAATTATTGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAGAQAL	623201	642644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_634035_635731_635969_636053_636097_642398
713437	contig_7992_pilon	+	2198	10	Intergenic	novelGene_115543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.734463312043	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	142	963	606531	645332	FALSE	0	TGCTTTGTGTCTGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKQYMITGNPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRSTPAVLFWQWINQSFNAIVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVISRVLMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPVQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEADLQAKIRETHPELRRVYFNKGL	606389	646567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_606564_609979_610135_611209_611309_614478_614555_615800_615887_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235
713445	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_96665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713448	contig_16643_pilon	-	992	2	Intergenic	novelGene_158118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	88	471	215930	211409	FALSE	40	AATAATGTAACATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSWAANQTDLRRRPPDRSGTCGTRAQAAAMPLELELCPGRWVGEQHPCFIIAEIGQNHQGDLDVAKRMIRTAKECGADCAKFQKSELEYKFNRKALERPYTSKHSWGKTYGEHKRHLEFSHAQYRELQKYAEEIGIFFTASGMDEVSPLLLCCLPL	216017	210887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_211661_215798
713449	contig_16643_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_158117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATAAAAAGTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210737	209426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_209400_210700
713455	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713458	contig_5419_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_15465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCCACCCAGAGGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38701	38927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_38700_38900
713459	contig_2257_pilon	+	2497	2	Intergenic	novelGene_122496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	949	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAGCTTTGATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290323	293589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_291572_292340
713460	contig_6098_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_145472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCGACAGAGAGAGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65696	66148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_65700_66100
713461	contig_12661_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_166714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40225	41982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_40200_42000
713466	contig_8615_pilon	+	2444	17	Intergenic	novelGene_165208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	132.929007721227	5	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	224	1042	14070	52552	TRUE	65	TCAACAGAAAAATCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNVQLPPKESNLFKRILKCYEQKQYKNGLKFCKMILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLGRKEEAYEFVRKGLRNDVKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKLDKDNLQILRDLSLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQVPPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLFQESLEHIETYEKQICDKLLVEEIKGEMLLKLGRLKEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQLSM	13846	107467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_14124_23318_23404_25714_25820_27074_27233_29227_29363_43082_43237_52424_52580_55010_55098_60417_60525_89003_89077_89970_90165_94892_95063_95392_95546_100245_100375_100982_101128_106274_106489_107364
713469	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
713472	contig_9014_pilon	-	2569	8	Intergenic	novelGene_106780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1663	1998	142733	141773	TRUE	25	CCATGAGCCCAGGGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWWQKWQVRKSIPPCSLGIPHANLNRLFGNRHLPQDLPTWRPAQPLCQAIEEPERSEDGHRGAPRKDDVDQANQEQPRGEEPASAHLVRQHPTHKLADGVRCRLAAGDEP	146397	141031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_141557_141726_141774_142398_143200_143666_143824_144066_144156_144681_144796_145426_145566_145700
713476	contig_12733_pilon	+	1300	4	Intergenic	novelGene_129586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_3	11.5854314646552	2754	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATTTGTCAATTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278980	281029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_279718_279823_279902_280327_280397_280613
713478	contig_5467_pilon	+	1626	5	Intergenic	novelGene_111944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1077	junction_2	318.105623181987	1735	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	130	816	20068	21610	FALSE	10	GCCTGGCTCTTTAGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPVDDIIMENGKVVGVKSEGEVARCKQLICDPSYIPERVRKAGQVIRIICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISYAHNVAAQGKYIAIASTTVETSEPEKEIEPALELLEPIDQKFVAISDLYEPIDDGSESQVSRPALAPWLLAAHQGHCPPHPRPLAGCFQVFCSCSYDATTHFETTCNDIKDIYKRMVGSAFDFENMKRKQNDVFGEADQ	19335	22420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_19437_20039_20140_20623_20796_21032_21178_21312
713481	contig_12019_pilon	-	337	3	Intergenic	novelGene_87796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGCCTGGAAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879796	877936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_878130_878936_879048_879763
713482	contig_3797_pilon	+	1947	6	Intergenic	novelGene_120087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	63.5893072772459	320	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	238	1209	346123	393714	FALSE	0	GGTGCTTGTTTTCCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQGNGRASAARLLLLLLVPLLWAPAGVRAVVDEDLSHRNKEPAAPAQQLQQQPAAVQGPEPARAEKGVTPAAPVHTNNEDPATQGNLGFIHAFVAAISVIIVSELGDKTFFIAAIMAMRYNRLTVLAGAMLALGLMTCLSVLFGYATTVIPRVYTYYVSTALFAIFGIRMLREGLKMSPDEGQEELEEVQAEIKKKDEELQRTKLLNGPGDVETGTSTTIPQKKWLHFISPIFVQALTLTFLAEWGDRSQLTTIVLAAREDPCGVAVGGTVGHCLCTGLAVIGGRMIAQKISVRTVTIIGGIVFLAFAFSALFISPDSGF	345885	394452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_346327_379351_379578_386444_386621_387159_387343_392785_392892_393637
713488	contig_938_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_143911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63856	63006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_63000_63900
713491	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
713494	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713499	contig_12790_pilon	+	1009	2	Intergenic	novelGene_35264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308739	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_308757_312348
713500	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713502	contig_15405_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_112093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCTCCCAAACTGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32838	32303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_32300_32800
713514	contig_9482_pilon	-	2590	9	Intergenic	novelGene_44258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	37.1884978857711	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1240	1860	748184	738770	FALSE	0	GTTGTGGCCGCTCTTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHNSVFGDLKADETELLYSAYGDETGVQCALSLQEFVKDAGRYSQKLVDDLLDQITGGDHSRMLVRLKQRRSIPMKPPDEVKVGDSLGDGGGSVLDFMSMKPYSDVSLDISMLSSLGKVKKELDHDEGHLGLDETTKLLQDLHEAQTERGGSRPSSNLSSLSNTSERDAHHLGSPSHLSVGEQPDVAHDPYEFLQSPEPAASTSS	757552	738039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738871_740661_740830_742838_742942_744776_744816_747459_747572_748086_749099_751176_751253_754752_754886_757436
713519	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713522	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713524	contig_12079_pilon	-	940	7	Intergenic	novelGene_67457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	935.17106278299	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	473	772	600738	580327	FALSE	20	GCCACGGAATTCGTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINFCVLLNS	638841	580158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580358_598097_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
713528	contig_10042_pilon	-	2457	6	Intergenic	novelGene_79167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_5	64.4279442478184	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	4	603	743386	721648	FALSE	75	CTGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAAAARLAWGGAAAAARLRRRFRHIMRSPHIIKKQPLHHFVQRPLFLLPTTLCTTVRNMFIQTQDTPNPNSLKFVPGKPVLETRTMDFPTPASAFRSPLARQLFRIEGVKSVFFGPDFITVTKESEELDWNLLKPDIYATIMDFFASGLPLVTEETSSGEAGSEEDDEVVAMIKELLDTRIRYVLICTLNQMLQRQIS	743389	719793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_721761_725762_725878_729321_729389_737192_737329_741097_741202_743321
713530	contig_6374_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_158423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	228	687	2	688	4691	5377	NA	85	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTLRNPDASERVPPPPPPPLLFFGAAAAATTAARFRASRSLCAVPSVPGREEPGCTAPAVGPHHGDQTGGNSRQRLGRSLQVPRRPALPRPRSVSSPSRSPCSLRSADLQTPPGLFPATDTHVLVFLSRRCPLFTVDLSLRRHHPSFSSAASLFLTAPPHPSPRSTQNFLIFLFPQLFCFPACGGASPKLWRFPAASSPSPYHCFFFCLSEFHRPFFHLFPLSHSRIL	4689	6589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4700_6600
713531	contig_5718_pilon	-	705	3	Intergenic	novelGene_110459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	134.5	59	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	10	354	1766376	1755405	TRUE	45	GACAAATCTTAAGTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGMGMTVPVSFAVFPNEDGSLQKKLKVWFRIPNQFQSNPPVPSDEDIKIEEREGITVYSMQFGGYAKEADYVARAAQLRTALEGTATYRNDVYFCTGYDPPMKPYGRRNEIWLMKT	1766385	1755008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1755360_1755404_1755577_1766203
713532	contig_6102_pilon	+	679	6	Intergenic	novelGene_31961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	1196.56214213889	37268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	172	522	414294	416047	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414194_414364_414613_414788_414877_414956_416018
713533	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91673	0	-91667	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATTGAGACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
713537	contig_14959_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_166732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTCCTTACACGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121229	120885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_120900_121200
713538	contig_12270_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_113981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
713540	contig_8848_pilon	+	1765	5	Intergenic	novelGene_140468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	76	junction_4	52.6070337502505	215	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	372	1088	346167	351866	FALSE	25	TATAACATCTGTTTATTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRPDVVTKSALGDDINFEKICKKPDSTATERAIARLAVHPLLKKKIDTLKAAVKAFKDARQNTAEVKSSNASEENRSKETLCSNDDEKKLQHEGTIFSEQKEKEVKILANKPINNAKEKRGKMDYGPNAMNIPISPTKPSEEDSVVLSPSQKTPADLKINTLSQTKKKEASNSSVGDNSDGEELHEEEKEYFDDSTEERFYKQSSMSEDSDSDDDFFIGKVRRTRKKESSCHSSVEEQKNPKKLLPEEETLKTHWVMKEDKNKPNTESRKFESVFFHSLSGSKSFRRSSREQAPKSKIPGFQQNEPEIKNQFNNSKQRRPNNTKQQLQLPLHPSWEASRRQKEQQSKIAVFQGKKITFDD	327514	352543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_327589_344945_345028_345951_346661_347910_347949_351681
713547	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
713548	contig_6975_pilon	-	1347	8	Intergenic	novelGene_74271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	419.936632731897	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	516	887	162477	159839	TRUE	30	AACCACTGATGTTGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMGM	169976	159234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163054_163195_164402_164538_169807
713549	contig_6031_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_56747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	138	422	207906	207622	NA	50	TGATAATGAAAGGAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDDKPPAAWFPASSQNTRAAAQRLLLSLLSPVQGEAEPLQGGARSMSPMDAEQVRSQEQFWGAPEVIHDRGGPSAGSRAGQPRASRLRNPGVTNKLFFLLGRSSHSTPLVRTDSPSYQAQDPTGEFATLRERCSARQFF	208043	205715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_205700_208000
713550	contig_5041_pilon	-	1414	11	Intergenic	novelGene_27094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.494770686279	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1308	105	1412	616721	565919	FALSE	35	GTGAAAATTGCTGAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVFFVLQFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLQN	636084	565916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_565924_572158_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581194_594960_595135_598425_598587_605335_605439_616559_616729_635987
713557	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_97985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713559	contig_593_pilon	-	3408	1	Intergenic	novelGene_101975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAACACGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118708	115300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_115300_118700
713561	contig_1694_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_144993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	160	609	1686878	1687327	NA	60	AAAAAAAAAACCATCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFIDKRITNFKQLYNLHYYLRENVYQIYVANSNLSPNVQSHTSSILLNISSLAGSTVIPNSSPLLPVGFLVSTDALIIFLVTHVQNAHSFHSLLALNWVLTAIAFTPTLFWSLFLAVNCLKVHFAHLSRTLLKTFLALKEINPQPNK	1686718	1689045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1686700_1689000
713567	contig_7396_pilon	-	1152	8	Intergenic	novelGene_79629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2016.34378142666	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	224	460	248986	248600	TRUE	15	AACCTATTTTTGGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPREI	250259	245939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246001_246216_246476_247186_247357_247718_247874_248552_248608_248757_249062_249736_249866_250240
713571	contig_17144_pilon	-	2859	1	Intergenic	novelGene_29108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4204	1345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_1300_4200
713574	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713577	contig_11338_pilon	+	367	2	Intergenic	novelGene_6271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCAAGGGCAGGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172036	176207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172384_176187
713581	contig_7171_pilon	+	1353	8	Intergenic	novelGene_101240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.772147840974	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATTTCAGCTGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733991	764973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734167_734402_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
713582	contig_12178_pilon	+	3150	10	Intergenic	novelGene_156549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	7.18021974284601	64	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	69	1229	323529	329951	FALSE	30	GTTCCTTGAGTGCGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLVCEVPCSVSLHLADSHAIAMFSARVPLATIDQQQLQLSPMKGLSLADKENTPPSLSSARVLASKAARKIFQEPENTKVPASSVEDEPLLRENPRRFVVFPIEYHDIWQMYKKAEASFWTAEEVDLSKDIQHWEALKPEERYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQITEARCFYGFQIAMENIHSEMYSLLIDTYIKDSKEREFLFNAIETMPCVKKKADWALRWIGDKEATYGERVVAFAAVEGIFFSGSFASIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLMFKHLLHKPSEQRVKEIVINAVRIEQEFLTEALPVKLIGMNCALMKQYIEFVADRLMLELGFNKVFRVENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVGEYQRMGVMSSPTENSFTLDADF	323460	331872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_323625_323978_324045_324567_324715_324996_325114_325570_325705_327820_327916_328030_328165_329409_329515_329604_329719_329798
713583	contig_12277_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_139697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	63	500	279955	279518	NA	25	GGAATTCCATCCTTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKALTKNKAPGIKRKPVEMFQQTDAALEVLTRLCQEIWKTATKRSIFVPIPKKGDPTECGNYRTISLISRASKILLKIIQKQLQLKINKELREIQARFRRGRGTRDITVDVRWILDERREYQKDVYLCFTDYAKAFNCVDHNKLWITLQRMGIPELCSCGTCI	280017	277673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_277700_280000
713587	contig_11590_pilon	+	1921	2	Intergenic	novelGene_125568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAAAGTCATCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61683	68918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_63464_68777
713588	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713594	contig_19237_pilon	+	1355	4	Intergenic	novelGene_162956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	127.444105395267	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	18	350	23905	44675	FALSE	15	GAGCGCTTTACTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRRKMAAAAELLLLEKSLGLSKGNKYSAQGERQIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVKQANKEYLLGSTPEEKAVVQQWLEYRVTQVDGHASKDDVRTLLKVLYPVILWPASLYS	23887	45680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458_28665_35826_35862_44670
713595	contig_5889_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_133681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAAAAGGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87968	85415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_85400_88000
713597	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713598	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713601	contig_14030_pilon	-	2200	3	Intergenic	novelGene_62218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.5	149	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	233	1192	285317	282853	FALSE	10	GCACATTGGCTTCTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLGIGPQDAGGNSTTTANGSSGSGSKVGVADKSVAVAAATPASVADDTPPPERRNKSGIISEPLNKSLRRSRPLSHYSSFGGSGGSGGASMMGGESADKAAAAAAAASLLANGHDLAAAMAVDKSNPTSKHKSGAVASLLSKAERATELAAEGQLTLQQFAQSTEMLKRVVQEHLPLMSEAGAGLPDMEAVAGAEALNGQSDFPYLGAFPINPGLFIMTPAGVFLAESALHMAGLAEYPMQGELASAISSGKKKRKRCGMCAPCRRRINCEQCSSCRNRKTGHQICKFRKCEELKKKPSAALEKVMLPTGAAFRWFQ	316706	281844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_282898_284402_285478_316634
713603	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713604	contig_9609_pilon	+	1460	8	Intergenic	novelGene_23069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	830.122489117585	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	31	1014	449884	455808	FALSE	75	AAAATGTAGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSLPRPVAGGAPTSPAWDPWLHPTPAPNLAQVQMFTGSLLPSPPHPQLLGGPKGKSTRIVRCRHSWRPQSTCSFS	449853	456254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454459_455585
713605	contig_9074_pilon	-	1850	18	Intergenic	novelGene_156619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	232.397464088744	223	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	2	1705	111461	61565	TRUE	5	TTTCTTGCACTTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPERQIPFHDVRFPPPVGYNKDINESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKPATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKESAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKRAHMLIDMHFRSLRTKLSLILRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKNGKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIIPPNSLPSSNSRVGPNPSEEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRVLVVSSIVAGESQKPELKAWQGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	111462	60520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_60648_61546_61607_62803_62887_63085_63194_64807_65004_67449_67537_70247_70311_70814_70950_71841_71952_76158_76238_76326_76498_78722_78840_78924_79019_79641_79791_80067_80140_82886_82981_88322_88376_111410
713606	contig_10134_pilon	-	2035	4	Intergenic	novelGene_16248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	505.345646287986	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCAAGTTATTAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39697	32215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33625_34922_35178_38558_38817_39584
713610	contig_15449_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_33650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	787	1095	161103	160795	NA	70	TAAACAAAGAAACCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFTFQVSRPYKILYINCYMTLIAHPILRQHTPPFRPDSPCQFNQLLTLSAFPSHLWTEAAPLVSCIYLTKRHTLHEYHFMFHSPVQSLSEDLASEIVLVLG	161889	159789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_159800_161900
713614	contig_19851_pilon	+	947	6	Intergenic	novelGene_29867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	85	600	53637	56177	FALSE	25	GATTTAATTGTTCCGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RETNEEPPPPAVQVQGLGPQREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53552	56524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
713631	contig_16098_pilon	-	1511	10	Intergenic	novelGene_46042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1479.48698148887	4	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	79	888	352350	349639	TRUE	20	AAATGGCTTTATTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVRNPAGACSICIRGKDPDHRLQPHERAAGGAVGHEAPGGAAVPAGAGHEQWRPAALL	354067	348308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349080_349346_349493_349604_349710_349955_350055_350232_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
713633	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713635	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713636	contig_6710_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_96039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACTATGCACACTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
713642	SIRV4	+	341	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTGCACTGGGGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
713650	contig_3252_pilon	-	815	3	Intergenic	novelGene_61521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	304	660	749226	748870	FALSE	15	CATGAGGGCCATTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNPKVQVEAIEGGALQKLLVILATKQPLATKKKVLFALCSLLRHFPYAQQQFLKLGGLQVLRSLVQEKGTEVLAVRVVTLLYDLITEKAPFPGTWPCGRQMFAEEEAELTRETSPEKLQQYRQVHLLPGLREQGWCAITASLLALPEHDAREKVLQTLGTLLATCQDHYRQDAQLSRTLASLQAEYQALAALELQDGEEEGYFQELLGSINSLLQGLR	753570	748714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_749263_752804_752970_753468
713668	contig_10082_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_63842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	652	957	65409	65104	NA	15	AAGTTGCTGTTCTTAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWWEGDRRGSSGMPGEGQQVIRLRSQQMQAVVGTQPWVQSDSSILSWQGQEAGRRGWEGTLLIHCVLREGDGEASVQKQAFLTSGPQRLCATESFLCVLG	66060	64436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_64400_66100
713673	contig_8020_pilon	+	2805	7	Intergenic	novelGene_114440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.69018133003955	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	536	1354	328663	331625	FALSE	20	TAAGGTACCTGGCCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317300	333076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_321514_321672_322110_322157_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
713676	contig_205_pilon	+	1255	3	Intergenic	novelGene_144312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	166	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	88	432	292858	294050	FALSE	35	GCACTATACCTTAAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDSNDKGSGDQSAAQRRSQMDRLDREEAFYQFVNNLSEEDYRLMRDNNLLGTPGESTEEELLRRLQQIKEGPPPQNSDENRGIVWFWRIEDGMDKELYNSKHQIWHKLSNF	273873	294873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_273937_292833_293027_293874
713680	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713686	contig_7083_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_125165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	148	462	185148	184834	NA	55	AAAAAAACTCAACAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDNITDVRWILAESREHQKNVYLCFTDYAKAFNCGDHNKLWLALQRMGIPEYLIVLIKNLYIDQEALVRTKQGHTACFKIRKSVHEGCILSQYLLDLYTEQII	185295	183648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_183600_185300
713687	contig_3774_pilon	-	1303	12	Intergenic	novelGene_142042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	134.662725305768	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	407	1111	198922	144743	FALSE	5	TGCCTGTGTGTTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210560	144550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294_210344_210390
713691	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_95998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
713693	contig_3825_pilon	+	710	7	Intergenic	novelGene_77920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1368.96964498446	152	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	21	653	12232	15603	FALSE	15	CATTTGGCATTGTGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGEKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12211	15660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14202_14872_14912_15231_15302_15498
713696	contig_7694_pilon	+	1767	13	Intergenic	novelGene_159929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	24.9460529053306	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	82	1488	185836	217511	FALSE	15	GGCTTTTCTGTGGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKPLRLLACGDVEGKFDVLFNRVRAIQKKSGNFDLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYRNHIVLQENAQHATRFIALANVGNPDKKKYLYAFSIIPMKLMDAAELVKQPPDVTENPYRKSGKDTTIGKQTPAPEEESACQFFFDLNEKQGRKRSSTGRHGKSSPHPKQPCKPPQPPGSCWFCLASPEVEKHLVVSVGTHVIPVPLSCCATDDIKDAFISQAQEQQIELLEIPEHSDIKQIAQPGAAYFYVELDTGEKLFHRIKKNFPLQFGREVLASEAILNIPDKSDWRQCQISKEEEETLARRFRKDFEPFDFTLDN	185754	217790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_191858_191944_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227_199347_200220_200306_201896_202038_202967_203083_203644_203725_213862_213983_214447_214546_217366
713699	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_89059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	GTTTTGCTCTCCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713700	contig_8330_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_71990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTTAAAAGTTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2057859	2055291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2055300_2057900
713701	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_97988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713702	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	35	TTTAATCATACTAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713710	contig_14928_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_98793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGCATGGTGGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290411	289235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_289200_290400
713711	contig_14142_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_120558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	269	810	2	811	433691	432882	NA	35	AAAGTATTGTGCATCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433692	432443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433700
713713	contig_5033_pilon	+	2853	1	Intergenic	novelGene_29071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	1229	1747	542039	542557	NA	70	CCCCTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLAQNTLQCMKRSEVYHVSQTRPQAVTLLLDMIHQGLDKGGVGPYSNLDVSHQLNAVLTNVPISLERGGRLGCKYCMLLQQLRGFKFLGKFPYISTFTLPGGEFKPAPNVFLQALKLLTGLKSIGRSFLVRLSKKGEKIVVCFGDPILQNLQSTILKPGLCARLQSQTQA	540810	543663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_540800_543700
713716	contig_3426_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_57961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTCCTCTGTATGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434881	435678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_434900_435700
713721	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_95865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713724	contig_294_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_166750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150313	152950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_150300_153000
713726	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713731	contig_6726_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_86211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAGAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43917	40887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_40900_43900
713738	contig_9482_pilon	-	2593	15	Intergenic	novelGene_44262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	68.7558902857027	3	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	3	1343	773701	748914	TRUE	15	TAAGCTCCAGGCCCTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSRLSLVCPSPTGSLRGPQHHRAECPSHGPSHHGGLLGGSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKGTRERRAAPQHGVSLRVLLRVFPTACVCC	773703	740660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_740830_742838_742942_744776_744816_747459_747572_748086_749099_751176_751253_754752_754886_756965_757080_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
713739	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713741	SIRV7	-	252	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35790	-7	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78948	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70883_70988_78841
713742	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713743	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713744	contig_12638_pilon	+	1774	10	Intergenic	novelGene_33238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.3956015999518	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	129	1262	737303	764074	FALSE	20	CAAATCTGCTTTTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRALMEPRRTLPTTAGFFFWPPVLFLVPRTRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPDQRSSRPQA	737174	764586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737527_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_764045
713747	contig_6062_pilon	+	2634	10	Intergenic	novelGene_5302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	260	junction_7	430.766958853051	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	869	2607	26	2632	791734	814839	FALSE	45	GGTGACCTTAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKKPLEFHAKRPWGPEKAVEDPDEDDEDDNDEAESGFSLEEVLRLGGTKQDYLMLATLDENEELVDGGKKGAIDDLQQGELEAFIQNLSLAKYAKTFLTEEDGEPSKKENAGKKEAKVSKIDNKKQNTAESDRTSVSKIKNKKRPEQLPDENSTISKVKKDKQEDIFEYSERQTLLLKPGGKWYDLEYTSEYSLELQPRDVVSKYKTLAQKLYEHEINLFKSKTNNQKGGSSTWMKAIVSSGTLGDRMAAMILLIQDDAVHTLQFVDTLLNLVKKKGSKQQCLMALDTFKELLITDLLPDSRKLRIFSQHPFNKLKELSSGNKDSRDRRLILWYFEHQLKHLVAEFVHVLETLSHDSLVATKTRALTVAHELLCNKPEEEKALLVQVVNKLGDPQNRIATKASHLLETLLSKHPNMKGVVCSEVERLLFRSNISPKAQYYAICFLNQMTLSHEESELANKLITLYFCFFRTCIKKKDIESKMLSALLTGVNRAYPYSQTGDDKVREQLDTLFKVLHIVNFNTSVQALMLLFQVMNSQQTISDRYYAALYRKMLDPGLLSCSKQAMFLNLIYKSLKADIVLRRVKAFLKRLLQVTCEQMPPFICGALYLVSEILKAKPALRSQLDDHPESDDEENFVDIGDNEDREKFTDADKETDTVKKVETEETKTPEPASWVHFDNLKGGKQLNTYDPFSRNPLFCGAEHTSLWELKKLSEHFHPSVALFAKTILQGNYIQYSGDPLQDFTLMRFLDRFVYRNPKPHKGKENTDSVVMQPKRRHFIKDIRSLAVNSKEFLAKEESQIPVDEVFFYRYYKKVAIAKEKQKRHADEESIEDVDDDEFEKMIGNLFLLTLYKIICPYLFLDYRTLVV	791708	814841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_791890_793882_795385_800518_800751_801584_801745_803000_803090_804994_805049_806061_806165_806270_806340_813447_813515_814664
713752	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713763	contig_3270_pilon	+	463	5	Intergenic	novelGene_104432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4746.21275334345	77	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	354	431	46649	46726	FALSE	20	CAGTTGTTGAGTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44121	46758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44130_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
713773	contig_9098_pilon	-	1231	9	Intergenic	novelGene_75791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	492.000619283147	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	348	977	288027	264388	FALSE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFCLISGVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295266	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_287999_288160_289194_289280_292840_292905_295200
713774	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713775	contig_6842_pilon	-	2655	1	Intergenic	novelGene_130831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	435	2220	2654	1795805	1795371	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLAAIKLAQTHGDLMYNKCNAAQSCHSHDCLGMGPLSSTGFSLVDFQKQITRPFFLVHCSLKTLLKPVQHDSNMQASTDRCVMAVNYTQVSHVEGENSATEPPMPCLAHSKCLISICTLSQLFGVLLIEKEQLGESLRQMPGV	1798024	1795369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1795400_1798000
713777	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_95846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713786	contig_11678_pilon	+	1891	6	Intergenic	novelGene_160851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	28.9482296522603	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	13	639	277059	280492	FALSE	20	TCCACTGTATTCTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLVAGERLVRALGAGGELEPEQLPRKLRVELEAALRKKHKSDDSPGDPRPLVSFGLIRDLHQHLRQRDSTLYLHELLEGSEIYLPEVVKPPRNPELVARLEKIKIQLANEEYKRITRNITCQDSRHGGTLSDLGKEVRSVKALVITIFNFIVTVVAAFVCTYLGSQYIFTEMASRVLAALIVASVVGLAELYVMVRAMEGELGEL	277046	281744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_277270_278363_278438_278721_278812_279251_279295_279986_280100_280396
713790	contig_8020_pilon	-	1102	7	Intergenic	novelGene_114363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	95.2565250025192	2349	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	522	1040	106445	104794	FALSE	5	CAGGGCTGTGTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107294	104731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106715_106803_106892_107130
713795	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713796	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713798	contig_12931_pilon	-	3536	1	Intergenic	novelGene_166764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTACTTTATATTTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80676	77140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_77100_80700
713803	contig_7816_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_66475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	716	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAATTTTCGTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151232	152814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_151200_152800
713804	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713805	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
713814	contig_9424_pilon	-	2213	2	Intergenic	novelGene_143794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4531	junction_1	0	22	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTATGGTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280480	277476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_278762_279552
713817	SIRV6	+	325	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10500	1	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11500	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
713818	contig_12654_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_129260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71197	69661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_69700_71200
713822	contig_12128_pilon	-	1855	4	Intergenic	novelGene_131972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	46.6214066235196	377	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	168	710	304352	194868	FALSE	15	GATTTTGCATTTTTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKKSPTRPKRQPKPSSDEGYWDCSVCTFRNSAEAFKCMMCDVRKGTSTRKPRPVSQLVAQQVTQQFVPPTQSKKEKKDKVEKEKSEKETTSKKNSHKKTRPRLKNVDRSSAQHLEVTVGDLTVIITDFKEKTKSPPASSAASADQHSQSGSSSDNTERGMSRSSSPRGEASSLNGESH	304519	193722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_195106_195873_196027_303782_303909_304326
713828	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
713831	contig_9651_pilon	+	1769	6	Intergenic	novelGene_162845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	20.242529486208	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	61	507	16280	29407	FALSE	20	GATGCAACTGTGTGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLDGKVIILTAAAQGIGRAAALAFAREGARVIATDINESKLQELEKYPGIQTRVLDVTKKKQIDEFANEVERLDVLFNVAGFVHHGTILDCDEKDWDFTMNLNVRSMYLMIKAFLPKMLAQKSGNIINMSSVASSIKGRSVFLGGT	11367	30669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_11420_16271_16352_17400_17480_22401_22499_24138_24248_29317
713833	contig_11986_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_69118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111319	108405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_108400_111300
713834	contig_9177_pilon	+	2579	1	Intergenic	novelGene_32657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86347	88926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_86300_88900
713840	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
713841	contig_12638_pilon	-	487	2	Intergenic	novelGene_33318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1730	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303658	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534
713848	contig_8631_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_121955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGAACATCCTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698453	697807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_697800_698500
713849	contig_8631_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_121954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697101	695737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_695700_697100
713854	contig_19311_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_144092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATCTCTGCTTGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246146	248632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_246100_248600
713866	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
713867	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
713869	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713870	contig_12249_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_121013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	353	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGGGTTTTTAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184711	186030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_+_184700_186000
713879	contig_5302_pilon	+	1862	9	Intergenic	novelGene_81479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	241.632986158761	2	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	620	1009	328325	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306695	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_308086_308198_318283_318354_318938_318989_319808_320008_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
713885	contig_4857_pilon	+	2098	20	Intergenic	novelGene_48664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	107.48752423903	2	38	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	758	1774	1084250	1107950	TRUE	15	AGACCCCTTCGTATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEESSNGSLSVEFRHLQPKEMKSSAGSKGNEGSHMVTEELHSITFETQICLYGLTIDLETSSLPVVMISNVSQLPNAWASIIWYNVSTNDSQNLVFFNNPPSATLSQLLEVISWQFSSYVGRGLNSDQLNMLAEKLTGLSSYSDGHLTWAKFCKEHLPGKSFTFWIWLEAILDLIKKHILPLWIDGYIMGFVSKEKERLLLKDKMPGTFLLRFSESHLGGITFTWVDHSENGEVRFHSVEPYNKGRLSALPFADILRDYKVIMAENIPENPLKYLYPDIPKDKAFGKHYSSQPCEVSRPTERGDKGYVPSVFIPISTMSHILHQTFFPCLQVFMQC	1012076	1109807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074236_1080626_1080720_1083743_1083804_1084191_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107892_1107986_1109518
713886	contig_5643_pilon	-	1632	14	Intergenic	novelGene_39097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	592	918	638099	636440	TRUE	20	TCAGTGTCGCAAACTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPAQVLVVPDLPNQVLIVQWADLQSAEFVLSCIVLRTVGHGVGPINALHAQLWPVWDTFVPAFFHLSSGHDNDAGVLLPYHLPEVINCGLQAALAGDVGLSILIGA	641508	631936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_632054_634807_634990_635154_635281_635382_635480_635627_635731_636174_636258_636433_636580_637767_637901_638045_638175_640221_640281_640391_640536_640634_640715_641106_641243_641411
713889	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	78	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
713893	contig_7398_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_166173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	471	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACATGTTGAAATGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236575	234895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_234900_236600
713894	contig_15410_pilon	+	843	5	Intergenic	novelGene_130629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	831.234435944517	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	60	413	146836	148093	FALSE	45	TGAAAATAAATTAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	146169	148523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_146211_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
713897	contig_513_pilon	-	1921	8	Intergenic	novelGene_80140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_6	656.116589937975	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	23	949	416603	338175	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSVQSSVMNPEERIVTWLISLGVLDSPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLVPGSVEKYCLEPQTKADCTNNINDFLKGCAALQVEVFDPDDLYLGVSFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCGRSSSLSAANSSQTNPQGAVSSTAPGLQRQSKAVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGLETAPLTKNYYAVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEFTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSK	416625	337202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_338275_345090_345186_356920_356992_368639_368842_370350_370476_373327_373413_415123_415208_416438
713901	contig_11702_pilon	+	527	6	Intergenic	novelGene_141991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_1	224.948349627198	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	27	527	381109	384165	FALSE	30	AAGAGCCATATTCAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAPLGALALLLLSGLSCCSAEACAEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSA	381082	384165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382657_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
713904	contig_11016_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_163289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCCCCAGGCCCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65055	65640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_65100_65600
713909	contig_7004_pilon	+	2256	15	Intergenic	novelGene_126478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.2460444610866	119	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	857	1267	405275	406398	TRUE	20	CCAGCTCCACACACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIFTQLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKVPYHFIKLQSSRKFPWDHYLPPAPR	402245	408324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_402356_402537_402705_402952_403104_403286_403349_404817_404913_405003_405326_405432_405555_405663_405705_405918_406067_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
713910	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
713913	contig_9345_pilon	-	2727	4	Intergenic	novelGene_24410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	62.0698531226445	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	343	789	201743	196143	FALSE	35	CACAAGAGTTTAAGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYECRHLKATRGSPCHSPCSPVIVSHPLQPWAGVALCRRVIPGPLVHVTVIMQERP	202085	194204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_199399_199463_199555_199686_201653
713917	contig_1239_pilon	-	1698	4	Intergenic	novelGene_150416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_3	105.758635055909	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	576	1070	665651	654367	FALSE	40	AACATATTATTTGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEVCENNSVFACLCNRISWLYSDRGHGVSPFCDIQLLECINGWIFLLRTSIITGLGITRPGFYS	666855	653738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_654670_664901_665016_665573_665655_666283
713919	contig_7412_pilon	-	1187	5	Intergenic	novelGene_76316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1025.18519668399	32	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	366	941	370310	364445	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	373516	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393
713921	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
713925	contig_6735_pilon	-	1005	10	Intergenic	novelGene_15683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.835290761347	639	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	77	799	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTSLLMDTYLVVLPHPP	568274	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542239_545891_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
713926	contig_6710_pilon	-	480	2	Intergenic	novelGene_98095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
713929	contig_6557_pilon	+	446	4	Intergenic	novelGene_32976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5979.15094306876	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	56	406	435225	440040	FALSE	15	GAAGCGCCTTTTTGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434242	440080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434253_435179_435306_436630_436772_439911
713945	contig_13702_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_102620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCACCTAAGGTTGGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200710	199882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_199900_200700
713947	contig_17106_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_127657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAAGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12980	12568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_12600_13000
713948	contig_10135_pilon	+	705	5	Intergenic	novelGene_106651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	3550.2913612829	14113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	61	396	116715	119864	FALSE	25	TTCATTCATTCATTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEPFPFSPPSTRSSLMPLTPWASSIPSEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116654	120173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118671_118842_119162_119196_119619_119641_119801
713952	contig_7594_pilon	+	1284	6	Intergenic	novelGene_55424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	606.040460695488	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTTTGTGATTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538991	555179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
713959	contig_5039_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_64807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTGATGGTTAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212028	210536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_210500_212000
713962	contig_14441_pilon	-	775	4	Intergenic	novelGene_100753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	169	693	126577	125565	TRUE	30	CATTGTAGCACAGTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLCTAPDHGTDVLGDGLGPGLAPLVVGREPVELDLAAEVVAGIVPEGGRHSQAAAQAVAGVIGAGLQPRLGVRADPAEGHLAIHPPAQLHVVGVEAGGQAHERGLLGSGDLDL	126745	121199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_121234_125516_125902_126157_126282_126513
713964	contig_10890_pilon	-	2555	7	Intergenic	novelGene_166781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.179441218068	1	141	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	393	815	149139	126635	FALSE	30	TCCCATGCTGGAAACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGARPPPEQRPRHARERQGCAGDRRGARHRQSLCGGAAAQGRQALVDWNLEAGVKCKAALEELFEPQKTLFIQCDVADQKQLRDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNWEKTLQINLVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSIAGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	161088	124894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_149081_149173_156819_156927_160559_160680_160956
713967	contig_11564_pilon	-	2844	10	Intergenic	novelGene_158584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_5	239.37139901556	102	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	177	1577	195486	161351	FALSE	65	ACATGGAAATATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQMPAEERIFGVVLLFSWTVYLWETFLAQRQRRIYKTTTHVPLELGQIMDSETFEKSRLYQLDKSTFSFWSGLYSEIEGTLILLFGGIPYLWRLSGRFCGYAGFGPEYEIIQSLVFLLLATLFSALTGLPWSLYNTFVIEEKHGFNQQTLGFFMKDAIKKFIVTQCILLPVSSLLLYIIKIGGDYFFIYAWLFTLVVSLVLVTIYADYIAPLFDKFTPLPEGKLKQEIEVMAKSIDFPLTKVYVVEGSKRSSHSNAYFYGFFKNKRIVLFDTLLEEYSVLNKDIQEESGMEPHRDGEGDSEEIKAKVKNKKQGCKNEEVLAVLGHELGHWKLGHTVKNIIISQMNSFLCFFLFAVLIGRKELFAAFGFYESQPTLIGLLIIFQFVFSPYNEVLSFCLTVLSRRFEFQADAFAEKLGKAKDLYSALIKLNKDNLGFPVSDWLFSMWHYSHPPLLERLQALKNSKQD	195662	160083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_161576_164735_164880_167495_167601_172246_172432_178147_178290_179798_179952_180361_180479_188507_188595_193267_193415_195390
713976	contig_8663_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_58010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAATTATCAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285637	288240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_285600_288200
713979	contig_8453_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_125108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65183	62906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_62900_65200
713988	contig_18869_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_56323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73735	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
713989	contig_19721_pilon	-	2387	2	Intergenic	novelGene_99156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	1	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	135	2147	148734	146722	FALSE	80	AGAGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRKLISATDTQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHRNILSASSTYFHQLFAVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDELIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGSTQDGNAETLPPGSNDKSLEIQKSKDEAQDNGTTIMPIITESFSLSAEDYETKKIIVTDSDDDDDDDVIFCSEILPAKETLPNNNAQVHANPGSVAISDVAPCASNNSSPLTNTTPTQKLPTSMSQVTLSQTQGSEKVLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLTTPPNVSSSLPNHMAPSINILVQNQQPPNSAVLTGNEANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAVSNTSLVPQADVPQNTTFDGSLIQKMPIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTNDPGVGSKHLTEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKDDPDEGEARLENDVPKTSGSEMTNKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCKRSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRYQCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYSYLSDRSSTMPVMKDDGIGYKVDAGKEPPVGTTSTQNKPMTWDDIFNQQENDSIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY	152074	146481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_148737_151942
713994	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
713999	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714001	contig_6503_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_145758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATGTTTATTGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123894	123696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_123700_123900
714002	contig_7887_pilon	+	1532	9	Intergenic	novelGene_124890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_8	53.0889583623563	326	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	187	1230	294122	298611	FALSE	15	CTTAAGTCCCTGTTTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNRDGGNPFAEPGELDNPFQDPAVIQHRPSPQYATLDVYNPFETREPSPAYEPPAPAPLPPPSAPSSQPSRKLSPTEPKNYGSYSTQATAAAATAELLKKQEELNRKAEELDRRERELQHATLGGTATRQNNWPPLPAFCPVQPCFFQDISMEIPQEFQKTVSTMYYLWMCSTLALLVNFLACLASFCVDTGNGSGFGLSILWILLFTPCSFVCWYRPMYKAFRSDSSFNFFIFFFIFFAQDVLFVLQAIGIPGWGFSGWIAALVVVKTNPGVAVLMLMVALLFTGIAVLGIVMLKRIHSLYRHTGASFQKAQQEFAAGVFSNPAVRTAAANAAAGAAENAFRAP	293935	298913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_294188_294521_294600_295210_295334_295417_295539_296215_296345_296825_296986_297103_297206_297746_297865_298464
714003	contig_3866_pilon	-	1660	8	Intergenic	novelGene_112373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	50.8438987570419	49	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	519	1268	91352	85095	FALSE	30	AGAGTTGGAGGTATACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFKEVKVQLLEDAGAEKDTVTQETRTSPSGIDSATTVAAATAAAIATAAPLIKVQSDLEAKVNSVTELLNKLQETDKQLQRVTEQQTNIQNKHEKLHCHDHEKQMNVFMEQHIKHLEKLQQQQMDIQTHFISAALKSSSFQPVSIPPSRAVDKYFVKPEHPNLGSRDVSSHNTFTFKQAPSREVEDMDFDKQKSSLETPAPRRFAPVPVSRDDKISKRENPVEEKENMEMSVHRGKRAIAVSTHCFY	101039	84702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_85304_87488_87643_90187_90410_91187_91363_95473_95550_99029_99101_100196_100490_100971
714006	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
714007	contig_7410_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_106098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406438	407962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_406400_408000
714010	contig_14790_pilon	+	3453	1	Intergenic	novelGene_127906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGGGAAGGAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145994	149447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_146000_149400
714017	contig_13421_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_166816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246563	248087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_246600_248100
714025	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714026	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714033	SIRV6	+	567	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
714034	contig_2703_pilon	+	2159	12	Intergenic	novelGene_101814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	14.0442041220387	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	537	1922	1113698	1144948	FALSE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPSWEEHATCLANAEEQDMQRVLIGIIEKEAVNLQQDAFVVIGRDTRPSSEKLSHSVIDGVTILRGQFHDYGLLTTPQLHYMVYCRNTSGQYGKATIEGYYQKLSKAFVELTKQASCSGDEYRTLKVDCANGIGALKLREMEHYFSQGLSVHVFNDGTKGKLNHLCGADFVKSHQKPPEGMEMKSNERCCSFDGDADRIVYYYRDADGHFHLIDGDKIATLISSFLKELLLEIGENLNIGVVQTAYANGSSTRYLEEVMKVPVYCTKTGVKHLHHKAQEFDIGIYFEANGHGTVLFSKVAEMKIKQLAKELEDNKRKVAKMLENIIDLFNQAAGDAISDMLVTEAILALKGLTIQQWDALYTDLPNRQLKVKVADRQVINTTDAERQAVTPPGLQEAINGLVKKYRLSRAFVRPSGTEDVVRVYAEADSQESADSLAHEVSLAVFQLAGGVGERPQPGF	1110769	1145185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1111267_1113658_1113844_1115799_1115868_1131020_1131155_1132005_1132202_1134417_1134576_1135866_1135951_1139440_1139540_1141092_1141207_1142192_1142316_1143687_1143862_1144858
714046	contig_11126_pilon	+	2600	2	Intergenic	novelGene_138110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTTTCCTCTAGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122935	127489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_123509_125462
714053	contig_5649_pilon	-	1461	9	Intergenic	novelGene_82374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.8638161027471	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	51	743	1064307	1056330	FALSE	30	CCCATCAGTTATGGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGQRVSTQSWMRMSPRHPTTPTASQRGFSTTWSPVAPCALKPSFSQPCLD	1064357	1055611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057331_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
714054	contig_8486_pilon	-	2540	13	Intergenic	novelGene_139287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	25.3804386618251	386	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	86	2140	60945	55211	FALSE	10	GGTTAGATGTGCTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKMDCGAGLLGFQTEASVEDSALLMQTLMEAIQISEAPPTNQATAAVSGLNASPQSSQPPTAKEMADIQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHDWIPTDWPVPPDWQNLRPSPNLRPSPISRASQNPGASQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPDSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAETRAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGAASANFAANFGAIGFFWVE	61590	54810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58865_59479_59738_60034_60203_60900_60975_61534
714060	contig_10372_pilon	+	1302	8	Intergenic	novelGene_112510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	360.885758394876	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	350	1300	78470	85596	FALSE	50	AAGACTCCAATTGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDSLFMMKELAGAK	28715	85598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_29028_78432_78580_81391_81549_82564_82687_83020_83159_84585_84674_85059_85192_85392
714064	contig_12257_pilon	+	2458	6	Intergenic	novelGene_152110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	70.9326441069272	63	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	173	2020	151413	162361	FALSE	25	TTTTATTGTGTTATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPVPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLTASSILSLKTLRHLFRGTGRSFPWSAASLPAV	148886	162799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149414_149522_151405_152947_156678_156787_157405_157514_162263
714065	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	291	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714068	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	75	GAAAAAGAATAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
714071	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714086	contig_5770_pilon	-	819	7	Intergenic	novelGene_74179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_6	5228.6581585421	60363	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	230	784	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265687	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265471
714093	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
714094	contig_8775_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_166826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCCCTGATTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110991	113784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_111000_113800
714095	contig_10235_pilon	-	2252	16	Intergenic	novelGene_46530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_15	50.0531273304232	196	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	43	1512	354716	348134	TRUE	25	TGAACTATCTGGGTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPGRADTSQPSARMRGHGEPRRPPCDPLADTIDSSGPSLTLPNGGCLSAVGLPPGPGREALEKALVIQESERRKKLRFHPRQLYLSVKQGELQKVILMLLDNLDPNFQSDQQSKRTPLHAAAQKGSVEICHVLLQAGANINAVDKQQRTPLMEAVVNNHLEVARYMVQRGGCVYSKEEDGSTCLHHAAKIGNLEMVSLLLSTGQVDVNAQDSGGWTPIIWAAEHKHIEVIRMLLTRGADVTLTDNEENICLHWASFTGSAAIAEVLLNARCDLHAVNYHGDTPLHIAARESYHDCVLLFLSRGANPELRNKEGDTAWDLTPERSDVWFALQLNRKLRLGVGNRAIRTEKIICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDYKYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCWYDKDGRLLQEFNKIEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGWGGPRPADHPPGYLHLRVCRGADL	354835	346813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_347323_347726_347903_348078_348158_349804_349893_350027_350144_350483_350562_350876_351022_351656_351825_351911_352067_352175_352281_353357_353460_353540_353664_353761_353869_354355_354439_354540_354724_354800
714103	SIRV7	-	300	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91624	2	-91618	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTAGTAGAGTGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
714105	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91670	0	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
714106	SIRV7	-	356	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-2	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78970_114680
714115	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714116	contig_14441_pilon	+	767	3	Intergenic	novelGene_100710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	491.5	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	152	505	116728	117335	TRUE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	116576	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117216_117344_117539
714121	contig_6589_pilon	-	1078	6	Intergenic	novelGene_25865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_5	1215.89841680956	781	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	678	1076	956805	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_957360_957758_957846_959101
714123	contig_17796_pilon	+	2313	12	Intergenic	novelGene_33814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_11	389.769183657361	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	82	1182	53527	120497	TRUE	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53445	122379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424_120724_121474
714125	contig_19851_pilon	+	966	5	Intergenic	novelGene_29861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3442.53485821132	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTTCCGTGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53489	56529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53706_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
714130	contig_2504_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_166859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAATAAAATAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409750	408861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_408900_409800
714135	contig_3095_pilon	-	895	5	Intergenic	novelGene_75222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1305.4030986634	279	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	63	440	255481	247934	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEARSLNLPRASC	255543	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_253560_253806_255384
714136	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_95080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714139	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714140	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714144	contig_5003_pilon	-	1729	4	Intergenic	novelGene_120208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	226.047684251698	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	441	1481	134487	133447	FALSE	10	CATCCTTTGTCATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139662	133198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134647_138171_138241_138818_138891_139522
714145	contig_10500_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_41183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCAGAATTATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332252	1329712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1329700_1332300
714147	contig_7285_pilon	-	1467	7	Intergenic	novelGene_143417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_6	48.6326936215638	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	302	715	370123	356156	FALSE	50	AAAAGTAAAGATTGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKKKFAENPKAADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDSAMKLGAGYPMGPFELTDYVGLDTTKFIVDGWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	379910	355403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357278_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390_377549_379879
714149	contig_3602_pilon	+	1516	9	Intergenic	novelGene_60638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCCAAACCGAGCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106029	1139417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1106805_1108683_1108763_1110847_1110955_1111711_1111821_1112141_1112226_1113548_1113592_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
714150	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714154	contig_16122_pilon	+	1332	4	Intergenic	novelGene_134541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	4.02768199119819	508	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	49	588	234895	236139	FALSE	35	ATAACTCACTGTATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSRAAEATGTCAIRAMGSEVAQVLEAADFAARKHRWQRRKDPEETPYINHPIGVARILTREAGITDIVVLQAALLHDTVEDTNTTLDEVELHFGAQVRHLVEEVTDDKTLPKLERKRLQVEQAPNSSLGAKLVKLADKLYNLRDLNRSTPKGWSEHRVQEYFQWAAQVVRGLQGTNQQLEEALKKLFEDRGLTL	234846	236883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_235007_235301_235358_235465_235707_236008
714161	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714166	contig_593_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_101974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGAAACGCTAGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114175	113779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_113800_114200
714171	contig_8049_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_166866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGGAGGCTAGAAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242673	241689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_-_241700_242700
714177	contig_9727_pilon	+	2471	6	Intergenic	novelGene_86301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	42.8140163965027	491	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	89	748	274857	277981	FALSE	5	GAGGGTGTCTTGGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSQVHPTVSNPFGINAASLGSGVFNSPEMQALLQQISENPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGMARTPAPSAGSSAGSVPEAPNSSPSTPATSSPAGAPSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNNMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS	273702	279704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_273771_274836_274977_275487_275572_275748_275865_276091_276279_277828
714179	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_18484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27834	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
714184	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714187	contig_2332_pilon	+	1730	5	Intergenic	novelGene_58719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.0354027405107	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1373	1699	860887	861213	FALSE	35	AATAGCAAAATGTTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKLWKPTERAREFLISLLNSLTWAQGVNFEEPNAGSRVTILPLIGTHHRFRFDGFSSADGLFPCDRLLKRVWVVCFYIYSNLYILPLVGIASFFFFFKKIKDTKIK	832369	861244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_833307_839938_839970_842350_842435_857439_857546_860672
714193	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714197	contig_11816_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_98605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTGCAAGGTTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471994	1470189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1470200_1472000
714198	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714210	SIRV1	+	303	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGAGAGTTTCACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031	1334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_1000_1300
714214	contig_13496_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_107633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCTCTACATTTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271034	270083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_270100_271000
714215	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	62	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714221	contig_5059_pilon	-	2164	11	Intergenic	novelGene_140735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	317.92099647554	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	700	1404	270470	263572	FALSE	25	AAGCAGTGTCTGTAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLIATVFVFAVVIYFQGFRVDLPIKSARYRGQYSSYPIKLFYTSNIPIILQSALVSNLYVISQMLSVRFSGNFLVNLLGQWADVSGGGPARSYPVGGLCYYLSPPESMGAIFEDPVHVVVYIIFMLGSCAFFSKTWIEVSGSSAKDVAKQLKEQQMVMRGHRDTSMVHELNRYIPTAAAFGGLCIGALSVLADFLGAIGSGTGILLAVTIIYQYFEIFVKEQAEVGGMGALFF	292680	262811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_263759_266445_266523_267451_267644_269915_270114_270419_270581_275956_276067_276480_276613_283551_283631_288493_288598_290235_290304_292584
714231	contig_6513_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_117783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGAATCATCTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226726	225067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_225100_226700
714233	contig_7569_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_114594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100303	98224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_98200_100300
714234	contig_6031_pilon	+	2301	1	Intergenic	novelGene_56771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTTGAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405183	407484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_405200_407500
714235	contig_3560_pilon	-	1533	4	Intergenic	novelGene_149503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.7671766990109	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATAGTTGTCATTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211210	197090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_198193_207919_207965_209277_209349_210895
714236	contig_665_pilon	-	3077	2	Intergenic	novelGene_158200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAATGAAGTCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152913	140298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_141560_151097
714237	contig_8772_pilon	+	1253	9	Intergenic	novelGene_21123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5468.18094610767	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	574	945	20497	23105	FALSE	30	TGAAAAAACTCTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	16071	23413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_16186_16549_16611_19022_19112_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
714242	contig_7356_pilon	-	1590	4	Intergenic	novelGene_60393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	6	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	50	439	457848	433924	FALSE	25	ATTTTCCCAGGTTTGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457897	432772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
714244	contig_10163_pilon	+	2972	1	Intergenic	novelGene_82671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGAAAGTGAAAATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417395	420367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_417400_420400
714246	contig_9706_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_20804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCGCTACCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
714249	contig_4392_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_117321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGGTCAGCAGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419861	418467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_418500_419900
714251	contig_11417_pilon	+	2158	5	Intergenic	novelGene_103287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2346	junction_1	296.24008422224	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	106	576	479699	521652	FALSE	15	CAGCTGATGGGCGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLETEQPAHSAGFSSAAAALPRSHRFLSRDPGLVAMSATDEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGEDLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWLNAMGEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALR	479593	523234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437_517516_521571
714252	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714253	contig_16098_pilon	-	670	6	Intergenic	novelGene_45835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	498	junction_1	137.271118593825	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	40	585	202417	201500	FALSE	25	GCTACAGTTCCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	204693	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668
714256	contig_15087_pilon	-	2498	17	Intergenic	novelGene_37159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.335368023702	1	109	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	945	1910	54502	33934	FALSE	45	AATACAAGTTGAAGATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGEVTRASAGRAAGVGVSSCPALT	74138	33345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34000_39022_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54564_58871_59000_60952_61048_66533_66725_69120_69205_71087_71174_72506_72637_73969
714263	contig_9656_pilon	-	1157	10	Intergenic	novelGene_121924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	370.33471680243	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	59	499	446594	438108	TRUE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQ	446652	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
714267	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714268	contig_7057_pilon	+	1580	5	Intergenic	novelGene_123260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	62.6034144436228	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	261	569	567112	569191	FALSE	5	GTGGGTGTGCAGGGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLGRRPRTRTIRTAPLQPPANDAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEVGWGVGSGWTSLRDYLLNPRLVE	542630	570202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568676_568707_568952
714270	contig_15034_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_143626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAATAAAATTATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6122	3749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_3700_6100
714271	contig_9185_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_166895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGATGGCCTAGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269988	270835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_270000_270800
714275	contig_7359_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_139865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGGACTCGAAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338375	340035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_338400_340000
714278	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714279	contig_2646_pilon	+	2483	18	Intergenic	novelGene_69635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	89	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCCTCTGCCGCCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2069350	2078678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2069684_2069789_2069907_2070139_2070268_2070462_2070563_2070654_2070819_2071050_2071120_2071326_2071486_2071670_2071764_2071889_2072044_2073159_2073259_2073435_2073501_2074871_2074998_2075142_2075303_2075590_2075810_2075979_2076109_2077145_2077310_2078032_2078093_2078534
714287	contig_546_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_117229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTGCTTTCCCACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149214	147576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_147600_149200
714290	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714291	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714301	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
714304	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714305	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
714306	contig_14681_pilon	+	1545	10	Intergenic	novelGene_134193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	200.302055856267	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	604	1041	57735	71147	TRUE	35	ATCAAAATGATTATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSHLTSPYQLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	23060	72946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_50350_50634_56129_56208_57657_57768_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
714311	contig_5039_pilon	-	2853	1	Intergenic	novelGene_64830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGTTGGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276957	274104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_274100_277000
714312	contig_9839_pilon	+	1022	8	Intergenic	novelGene_88521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1364.27780102417	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	507	917	52079	57979	FALSE	25	ACTACAGTTTATTGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTVWTSGGRQGL	47872	58084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_47986_48720_48860_49450_49614_49726_49806_52066_52202_54064_54122_57651_57850_57946
714315	contig_12644_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_44520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTAATTAATAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150452	1149793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1149800_1150500
714316	contig_13894_pilon	-	1093	3	Intergenic	novelGene_62035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.5	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	177	1013	288137	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTAFSSSVAVTDKDTFESSTFLDSSKTSQHGRDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287021_287436_287538_288132
714317	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714322	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714328	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714329	contig_10766_pilon	-	1690	2	Intergenic	novelGene_151197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACAGGCTTTTAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135488	133693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_133816_133920
714331	contig_10777_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_101172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATACTTGTACACTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50083	48101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_48100_50100
714332	SIRV1	-	241	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	1	3588	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714333	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_90589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714336	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
714337	contig_6710_pilon	+	560	2	Intergenic	novelGene_91619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
714340	contig_1719_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_87317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATCAAGAAGGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453520	455157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_453500_455200
714342	contig_2733_pilon	+	3114	1	Intergenic	novelGene_128545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATATAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515095	518209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_515100_518200
714343	contig_8330_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_71899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105765	1107550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1105800_1107600
714349	contig_15029_pilon	+	2180	9	Intergenic	novelGene_128204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	35.1025283989629	455	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1553	2164	232392	233287	FALSE	0	GTGGCTCTGCCTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQNCYVNQQELEPYPFGIRIDYVLYKAVSGVCVSCKTLKTTTGHDPHSGTPLSDHEALMATLYVRHSPLQHSPSPTHGAAEMSPLITVLKEAWTELGLGMAQAHRWAAFASCVIGLGLLLLVLLCALVARGKTSEVTLLLLSPSVGLMLGAGAVYLFHVKEVKGLCRARAELLHMLRRARDAEDLGSVSQPAQQEDRAEEQ	229877	233303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_230463_230685_230783_230907_231447_231609_231700_231937_232025_232146_232280_232370_232476_232660_232815_232913
714356	SIRV1	-	242	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5560	3564	-111	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTAGGTTTGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
714360	contig_6589_pilon	+	911	6	Intergenic	novelGene_25765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1974.4345013193	13677	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	328	819	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668433_668494_668556_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
714362	contig_8330_pilon	+	2057	10	Intergenic	novelGene_71766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	249.86371593973	41	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	369	1187	654823	657697	FALSE	15	CTTACTGTTTGTAACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVFMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKVSFWLPLAELMPQRPQAPGRHTAETGQAVKGCLLVPVLWEAAPETAVCWQWRFWQTAPEGP	649230	658567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_649305_651159_651257_651531_651599_653909_654027_654809_654977_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420
714363	contig_4364_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_22	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAGAAAAAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261388	263382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_261400_263400
714369	contig_753_pilon	-	2186	6	Intergenic	novelGene_112966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	344.594834552116	3	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	630	1555	2184	1186997	1183234	FALSE	35	ACATGTAAGTGTCATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFYLGVDAEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCD	1192897	1183231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185842_1186970_1188410_1192755
714375	contig_3529_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_105390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_3	225.110528407714	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	87	620	790139	784487	FALSE	50	TAAAGGAAAAGATTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAILLLSVTDSPVGVRGTLRPPPGSFLIMLSRVVLSAAATAAASLKNAAVLGPGVLQATRIFHTGQPSLAPVPPLPEYGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYMLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRVGFRSC	790225	783566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_784634_785190_785355_786999_787146_789784_789822_790099
714377	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_93471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714381	contig_9955_pilon	-	1467	10	Intergenic	novelGene_21346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	43.1743522401671	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	431	1312	113790	86976	FALSE	35	TAAAAACTTGTTTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	128109	86820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113655_113807_118303_118421_127812
714385	contig_3472_pilon	+	1815	7	Intergenic	novelGene_166925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	321.266590578949	46	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	155	1459	226205	236525	TRUE	20	TCCTCACCTACATGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYAEKEPAAMDQESNKAAWPKPAGGYQTITGRRYGRRHAYVSFKPCMTRHERSLGRAGDDYEVLELDDVPKENSSGSSSLDQVHSSLPNESLFKESETEIPICGTALNQTTESSPSCAAVHHSEEGGETIGSSTDLHNHSEGEYIPGACNASGVQNGNEVVLTNSYDPDAKHGEDNDRLQLSTEVVEGGRYQEALGNTVFELENGVEAYTGISPPVPSLNSEIREEFEELDSAPLVKSSSGDTEFAHQNNQKFQSSSSEDEVVRKKQQNNISQEKERENSPEDSAWALGHICSEQNTSDRENNQERSPEQVVRPKVRKVVSSSQVDQETGFNRHEAKQRSVQRWKEALEVEENGPDDLLIKCEDYDGEHDCMFLDPPFGGVIQIEPEDHQTTPGNGATAVRQDVVDNTFWNGCGDYYQLYDKDEDRERSVFK	198355	248358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_198426_226120_226236_227854_228056_229212_230264_236503_236631_242066_242253_248293
714387	contig_8616_pilon	-	1832	9	Intergenic	novelGene_72376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	59.8204344267074	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	143	901	185319	180961	TRUE	15	GTCACCCCTGACTGGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLVKIKVPDNEAEEAKFTGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGLTEYLDYVSTLKVKGIVLGPVHNNQKDDLAETNLQQIDPAFGSNKDFESLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVQCVHVLG	185461	178706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181108_181158_183570_183666_184266_184441_184901
714390	contig_10163_pilon	+	2778	1	Intergenic	novelGene_82643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATTTCTTTAAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159442	162220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_159400_162200
714392	contig_6837_pilon	+	2214	4	Intergenic	novelGene_149808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.9865869364129	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	180	302	11753	11875	TRUE	45	GAACATAAGATGGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAWLNFSGGRKVLILRSGAVYVCARGITHPAPLTEDPNAVQEGKTSVEKAELDHGGSAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGK	11303	15476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11475_11744_13257_13422_13599_15121
714393	contig_10734_pilon	+	1521	12	Intergenic	novelGene_51287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	285.149489575133	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	8	373	1347353	1353345	TRUE	40	AGCTCCGGCAGAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFERKPAVL	1347345	1388859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1347504_1352397_1352592_1353324_1353436_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
714396	contig_1225_pilon	+	1600	4	Intergenic	novelGene_44138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274890_276214
714397	contig_10554_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_166962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTAACTTGTGCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20803	18866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_-_18900_20800
714398	contig_2093_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_153017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGCAGTGATACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479430	1478675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1478700_1479400
714405	contig_8063_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_152415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45229	44535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_44500_45200
714406	contig_16322_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_87493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAGAAATAGCAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21358	20579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_20600_21400
714409	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714411	contig_11572_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_100082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTTGTGTGATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404104	406838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_404100_406800
714414	contig_18869_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_56010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73523	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
714415	contig_18869_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_56301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73574	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
714417	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_94273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714418	SIRV4	+	407	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	0	-909	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAAGTTGACGGACGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
714419	contig_3095_pilon	-	1031	6	Intergenic	novelGene_75261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	22	777	255439	246716	FALSE	15	TGTTCCCCCCACAGACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255460	246461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
714420	contig_6028_pilon	-	2697	2	Intergenic	novelGene_156588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAACGCTATTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313779	310012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_311424_312493
714427	contig_10711_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_118432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760900	757967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_758000_760900
714428	contig_4857_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_48674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCCCCAAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075880	1076749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1075900_1076700
714438	SIRV1	-	132	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3675	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6691	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
714439	contig_18869_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_56229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73524	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
714440	scaffold_16539_pilon	+	1340	11	Intergenic	novelGene_68370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	12	461	490446	494660	TRUE	10	GGCGGGACCCGAGCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGNMGSGPGPRLQGPRRVSDLDVQVGVVVTQISQGQQEGPHGRLRVAPAADQQAHLDTPLVGGPSQPIVNGGPEPEWVGELHGGQIAHDCNVDEAPGAVHHAEQSLQVWGAATRTQWWRSTHCQVGQSRGSIEADLHWCLLIVAGIIGPGPG	490434	502768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_490496_490970_491140_491825_491958_494561_494767_498733_498866_498949_499067_500545_500733_501684_501834_501917_501993_502111_502204_502747
714441	contig_6589_pilon	+	2197	2	Intergenic	novelGene_26293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	829	1359	2272905	2273435	TRUE	10	GCTGGTCCCTCCCTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWVVVGGKRGSNGRNTNDTPRIHTYWVAAWTIGIKCCLPAKAKVKPQNSLLNSTITGKKERKTNKQVIKHQVITAHSLPPWPTDAHQSKVIRKLRSCSLRRPSHTLLASSTRRCSRAEFWSTHCSESMCALRILQICCSGSLESAGPPAVFRCSMMSLRSCAMRLSCASMFSASL	2272076	2290255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2274175_2290156
714443	contig_3132_pilon	+	1176	13	Intergenic	novelGene_127410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	61.7971592299265	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	349	1176	13928	23082	FALSE	20	CTGCTGTACTACCCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFIN	12627	23082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_12680_12806_12865_12964_13169_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953
714448	contig_14300_pilon	+	2515	1	Intergenic	novelGene_133112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268620	271135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_268600_271100
714460	contig_18869_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_56023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73536	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
714462	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714463	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_18166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
714469	contig_2323_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_151846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATTAGGGTAATGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82318	80231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_80200_82300
714471	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714474	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_93712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714480	contig_2414_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_158504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAAGCAGTTGGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406787	405742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_405700_406800
714484	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
714487	contig_3627_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_78527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGATATCTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634066	634937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_634100_634900
714490	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_93992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714491	contig_11832_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_106982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGGCACCGGGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493517	494251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_493500_494300
714492	contig_9682_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_125280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1651	2073	1950	1528	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSSKAMLVRKPTSDLWAGGWGGFFLRTSEEPAHSALCTSLALHGVMESGNPQSWGRSGEPPLPSRQDAHLISNQFHPLYGRGQCSFQNLKTRNEAEAEDQVSGANFIYLRKGENILASLISKYQPTPDKIWESASYLQ	3600	1147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_1100_3600
714498	contig_17311_pilon	-	4533	32	Intergenic	novelGene_57864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	15	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	668	1045	194812	191743	TRUE	0	CGTGTCCGCTTCTTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGHDSPQIIAFHQKLILLLPALLVDVDDSSGHLWDALHHHLGEVLLQELQHVVHGALAVLSGGDTHHSLAVHSHIAWLHTELGRADGVPHRLSVHFQSQKSNPFQGELDENKAIIGKKHFFDIL	202738	130139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_130328_139279_139415_139652_139790_140299_140473_140750_140904_146709_146950_148256_148420_148774_148918_151897_151995_152644_152789_166722_166866_170941_171011_171942_172071_172284_172424_174313_174481_177641_177814_179169_179283_180602_180722_182327_182466_184252_184419_185340_185458_189331_189420_189499_189583_190119_190291_191456_191551_191734_191833_194036_194200_194687_194853_195091_195224_196409_196544_199608_199764_202532
714503	contig_3602_pilon	+	2631	3	Intergenic	novelGene_60539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	12.5	120	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAGGAAGAGAGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260149	269580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_260607_266707_266922_267620
714505	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_98132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CCACCCATCTCGTCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714508	contig_5669_pilon	-	2916	1	Intergenic	novelGene_86093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATAAAAAAAAGAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218996	216080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_216100_219000
714509	contig_15327_pilon	+	2744	4	Intergenic	novelGene_70834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	28.1937739383873	25	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAACCTGACTCGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639655	1645251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1640265_1640871_1640969_1641609_1641709_1643312
714510	contig_10549_pilon	+	1408	5	Intergenic	novelGene_110632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	442	junction_2	119.64217483814	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	841	1407	414568	441247	FALSE	35	TTCAGACTTCAAAAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDLSFLTEEEQEAIMKVLQRDAALKRAEEERVRHLPEKVKDDQQLKNMSGQWFYEAKAKRHRDKIHGADIVRASMRKKRLQVAAEQSKDKAKGAKESWVNNVNKDAFLPPELAGVKEEPEEDAAPTSPSSGVVDPASTVINMSQEHTRKSAVSPAKQRKNPFNSSKLPEDHLSQQTKNEQSKNGRTGL	413727	441248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_414669_426015_426168_428716_428853_440133_440216_441151
714511	contig_10549_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_110635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAATGTCAGAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461283	461819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_461300_461800
714512	contig_7410_pilon	-	2443	7	Intergenic	novelGene_106104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	34.7630870640428	165	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	251	1279	497091	427503	FALSE	30	CTCAGAAGACTCCAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVTRAVFGELPSGAGTVEKFRLQSDLLRVDIISWGCTITALEVKDRQGRASDVVLGFAELEGYLQKQPYFGAVIGRVANRIATGTFTLDGKEYKLAINKEPNSLHGGIRGFDKVLWTPRVLSNGVEFSRVSPDGEEGYPGELKVWVTYTLDGGELVVNYRAQASQTTPVNLTNHSYFNLAGQGSPNIYDHEVTIEADAFLPVDETLIPTGEIAPVQGTAFDLRKPVELGKHLQESHINGFDHNFCLKRTKEKQFCARVRHAGSGRVLEVYTTQPGVQFYTGNFLDGTIKGKSGAVYPKHSGLCLETQNWPNAVNQPNFPPVLLRPGEEYDHTTWFKFSVA	497341	426338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_427581_428206_428382_430015_430158_471678_471761_479082_479290_483870_484026_496901
714514	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	51	3249	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
714527	contig_5059_pilon	-	1320	14	Intergenic	novelGene_140700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	142.093976736708	586	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	28	1104	231713	166409	FALSE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRELLGTGTPVQRTHSAPGTAFLMDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231740	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_205347_205414_206935_207032_214153_214187_214730_214789_226820_226893_231639
714529	contig_10159_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_30890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCTATGGCTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994485	994882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_994500_994900
714530	contig_10159_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_30891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995036	996466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_995000_996500
714533	contig_9527_pilon	-	2390	7	Intergenic	novelGene_134077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	22.3513608832512	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	293	1090	494027	490438	TRUE	10	TTATTTCCCTTGCATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVSARGLSLEERRQLAVKLTRVLALYRSILDAYIIEFFTDNLWSTLPCSWQEALDRLNPPQLATLLLGMPGEGEVVRYRSVWPLTLLALKSTASALAFTRTPGFQTPSEFLENPSQSSRLTPLFRKHVRPKKQHEIRRLGELVKKLSDLTGCTQVVDVGSGQGHLSRFMSLGLGLLVKSIEGDQRLVERAQRLDQELLLALEKEKKRTPQVRHPFPQPGLQEQGLLGWNRAPRLNSHFQVSQLEVVWSLFLLPKASPHLQGTF	494319	488332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_488672_489070_489256_489661_490744_490976_491040_491533_491727_491886_492012_493916
714539	contig_10341_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_47229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCATTGTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79187	81485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_79200_81500
714543	contig_12081_pilon	-	509	4	Intergenic	novelGene_166984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTACGAGGACATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18201	16449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_-_16548_16843_16992_17069_17242_18110
714544	contig_18420_pilon	-	1420	8	Intergenic	novelGene_109370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_7	346.092768028505	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	23	1006	142774	109372	FALSE	25	AAAATGCCAGTGGCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142796	108957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_142711
714545	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
714550	contig_6710_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_97943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653723	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714551	contig_7695_pilon	-	1904	6	Intergenic	novelGene_41623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	242	junction_1	253.976849338675	556	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	60	665	687243	681554	FALSE	0	GTTGCTGGTGGCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREAEQSRLGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAGGGCC	687302	680314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
714557	contig_11978_pilon	+	2003	8	Intergenic	novelGene_63029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1285.57843726758	1762	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	127	918	1608423	1646860	TRUE	5	TGACTTGGTTTCCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNCARCDKIVYPTEKVNCLDKFWHKACFHCETCKMTLNMKNYKGYEKKPYCNAHYPKQSFTMVADTPENLRLKQQSELQSQVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1608296	1649719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1608492_1616197_1616293_1625946_1626032_1633574_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1647014_1648787
714574	contig_16322_pilon	-	1280	6	Intergenic	novelGene_87513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_5	373.95957000724	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	193	606	37060	32956	TRUE	35	ACCAATCTAATGAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57620	31770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
714575	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714576	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_98156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
714578	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
714593	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714597	contig_10064_pilon	-	1826	7	Intergenic	novelGene_122733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_6	43.8915962596739	265	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	128	1309	418579	411046	FALSE	15	GTGAGAGTCCAGTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPPLVSVGWLPGPPQLSRCLGTCRSVCPGAGTRDPVGARKAMVSLPGRPAASLLRFLFLGLSALASPARAQPELHVPAGLSRLQAVEGAAVVLPAWYTLKGELSSAQQWEVPLVIWFLEQKGKQLKQVLSYNNGVVSSKRGVSLVHSMPSRNVSLQLQGLREEDSGSYHCSVNVYDSQNVDKGHSSAILELSVLVPPAPPSCRLLGVPRVGTNVTLSCQSPRSKPAAQYQWERLPPSSQVFFAPVLDAVRGSLSLTNLSTSVSGVYICKAHNQAGSAKCNVTLEVSTGPGPAVVAGAVVGTLVGLGLLAGLVLLYQRWNKALEEPANDIKEDAIAPRALPWPKGSDTISKNGTLSSVTSARALRPPQGPPRPGALTPTPSLSIQALPSPRLPRTDEAHPQPVLPSPGGVSSSALSRMGAVPVMVPAQSQAGSLV	418706	410528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_411362_411575_411703_411974_412098_413268_413425_413612_413815_414777_414966_418509
714605	contig_12270_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_113575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCAGCCAGAGAGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13850	14086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_13800_14100
714606	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	265	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714608	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714609	contig_7051_pilon	-	1543	4	Intergenic	novelGene_64299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	162.729496062911	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATATCTAACACTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217873	188147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_189291_216860_217052_217573_217734_217824
714613	contig_14513_pilon	-	1053	4	Intergenic	novelGene_70371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	1262.5702180693	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	23	514	18856	11833	FALSE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	18878	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12108_13087_13136_14952_15001_18735
714616	contig_12292_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_167028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	877	1434	463603	463046	NA	30	CCCAGTAGAGAACTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSLSPEQHQHKTQLLGLLKASKLKVSEEALTQLLLLIDSACPWYPLQGNLDVEAWEHIGNIICDMNIPASVLIAWHHCRLTLQPLQAAPSAPSPSKENVYDPPLSTPPKADFSQHESLMERCLQEGREKEGFSAYPVIRGSGPPRHDGLEFQVFKELRKSMIENGLQCSFTKGIVEAIGQNYK	464479	462268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_462300_464500
714621	contig_6589_pilon	+	1297	8	Intergenic	novelGene_26086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	85.4784851794382	803	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	23	538	1865997	1872188	TRUE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPEVAPTVKTLSR	1865974	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872153_1872463_1872601_1872787_1874884
714625	contig_14300_pilon	-	1215	9	Intergenic	novelGene_133095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	107.381839130274	13	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	555	1067	155860	148003	FALSE	30	ATGAAGCAGTTGCTGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPEIFNPEKEREAGISTSNKKSLRSRQH	186544	147854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_170673_170839_180175_180362_186493
714626	contig_15304_pilon	-	1042	5	Intergenic	novelGene_30420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1549.42578073298	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	198	857	54100	49917	TRUE	30	CCAAACTTTCTCAGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVIGKSLAHGWCWTCHRTAWRRRHKGLACGQPLSLCSHSSCSASSTAQH	54297	49407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_53233_53320_53491_53813_53991
714627	contig_20058_pilon	-	2128	11	Intergenic	novelGene_109282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_5	396.118871047568	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	6	1775	59150	30516	TRUE	25	TGTTCATATGATAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPGNLIKHLVKGTRPLFLETRIPWHMGHSIEEIPIFGLKAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59155	23525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_23874_30510_30706_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40135_40247_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
714628	contig_15629_pilon	+	2428	6	Intergenic	novelGene_122480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	23.6220236220354	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1389	2042	202323	208025	FALSE	55	AATAAAATAAATATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAGMLLVSALLYTYWIEIVLLYRTYQSKDETLGDKKEYDAFVSYAKLSSLESEVTSSLSEENLALNLLPEVLENKYGYTLCLLERDVTPGGVYAEDIVSIIKKSRRGIFILSPNYVNGPSVFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCSFKEPASLPHLVKKALGVLPTITWRGLKSVPPNSRFWTQVRYHMPVKNSKRLTWNHLRIISRIFSLERTQ	194224	208411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_195304_197179_197304_200802_200956_202290_202429_206533_206708_207651
714631	contig_9345_pilon	-	1483	7	Intergenic	novelGene_24680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1956.1874200143	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	239	820	955353	947957	TRUE	5	TTCCCGTTTTGTCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001313	947226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947724_947790_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
714634	contig_5936_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_53559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147146	145090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_145100_147100
714635	contig_6707_pilon	-	2592	21	Intergenic	novelGene_167036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.7687138960127	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	822	2469	95	2563	212721	124664	FALSE	5	CGTCGTGTGTCTGCGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDSERRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQSACDEAIYQLGLDLEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGKVKHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNTVNTMRLWSAKAPNDFKLHDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALAIPELMRILVDVEKVDWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLDIIYAINQRHLDHVAALFPGDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAINGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKFQNKTNGVTPRRWLLLCNPGLADIIVEKIGEGFLTDLSQLKQLLHLVSDEAFIRDVAKVKQENKLKFSAFLEKEYKVKINSSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHIITLYNRIRKDPTNSFVPRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIKLVTSISNVINHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPSADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVEEVEALDRSGYNAREYYDRLPELRQAVDQIGSGFFSPREPDCFRDVVNMLMNHDRFKVFADYEAYMECQAKVDQLYRDPKEWTKKVIWNIACSGKFSSDRTSPHPK	212815	124634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_124682_126473_126546_127253_127321_128853_128989_130454_130663_132577_132720_134528_134588_144271_144420_145219_145322_147007_147123_147772_147937_148624_148772_151131_151225_151866_152011_154091_154175_154634_154747_156653_156786_158139_158244_159515_159595_162524_162627_212478
714641	contig_3818_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_99220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	339	872	235268	234735	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRTLQLQLQSHFARTTLSVGRGRKLRYEVPGREVPGEVATKRLWSVCKALGAGLLETAEEAGLPESPPSEEALDLEAKQGTPLSKGLRAAEPGNTGRDPESGPGRLPEMDTRLEHFVSSFHLPNSVSRPSTMTELVGQWYNSCLPCRKHEFDSWSIHLMHSHHPSVSGSLVLLIR	235606	234005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_234000_235600
714642	contig_3584_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_108117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTGACTATACCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200020	198618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_198600_2e+05
714649	SIRV7	-	909	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	25	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCCTAAGAGATCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
714653	contig_6503_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_145781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTACACCAGTTTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480335	478431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_478400_480300
714658	contig_8907_pilon	-	1921	3	Intergenic	novelGene_85844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_2	11.5	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTCAAGACGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656696	652800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_653713_655098_655227_655815
714659	contig_7426_pilon	+	953	3	Intergenic	novelGene_27514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_2	98.5	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	457	789	983629	987945	FALSE	35	CAAAAAAGGAGGGCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLMPHLSTQDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDFTEERLAKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	983172	988109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_983761_985081_985205_987867
714675	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_97348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714677	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714679	contig_15325_pilon	+	669	5	Intergenic	novelGene_157184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_2	540.834771441334	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	45	602	94466	96243	TRUE	15	TATTGTTGTATTGGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	94421	96614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
714681	contig_11896_pilon	-	3181	17	Intergenic	novelGene_87998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_15	25.4776249874277	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	38	1159	89370	83519	TRUE	15	GTGCTGTTTCTGATACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIKSEFIRAKYQMLAFVHKLPCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQTLQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPDHKNGHYIIPQMADSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEAKRRQQGKSLSSPTDNLEFSTRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSAGATRNNRARSIDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQIRQQSGPVPTPPHPQ	89407	80654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_82061_82223_82288_82412_82596_82759_82834_82976_83064_83224_83279_83364_83597_83684_83838_84039_84174_84277_84390_84807_84906_85481_85555_86003_86053_88098_88142_88478_88574_88657_88876_89301
714684	SIRV4	-	317	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1206	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
714687	SIRV6	-	558	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	177	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
714689	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_89170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653698	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714697	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
714705	contig_10159_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_30835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCTTTGCTCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573266	571151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_571200_573300
714708	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714712	contig_12528_pilon	+	1500	9	Intergenic	novelGene_81337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTTGGGAGAGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937259	968112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956051_956217_959917_960131_964909_964969_966189_966274_967656
714713	contig_16666_pilon	+	2632	20	Intergenic	novelGene_61815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	2267	2632	313996	328006	FALSE	10	GGCCGCCATCTTGCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLHNPYVSLRWTCKIPYVHSILLLSCQKRQILTCFPITTEYNVVYPIGMVFHGRYIWILLVLIDTPYSYDGVSTGSEESIQRWIQLQGIDSIAIVLLHFISNDIGDLHFPPPCRVLSVM	280499	328006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_281161_281719_281917_283329_283406_284996_285032_285693_285782_286684_286793_289939_290036_290525_290623_290948_291056_295862_295961_296832_296937_298351_298427_300178_300404_311349_311450_311841_311933_313887_314020_314138_314212_314808_314898_317273_317413_327965
714728	contig_6710_pilon	-	487	2	Intergenic	novelGene_98111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714741	contig_5791_pilon	+	1386	8	Intergenic	novelGene_35867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	979	1296	1085717	1088260	FALSE	15	AGCCACTCTGTCTCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTGLNLTYELLSFNSYQVLSPWKPLGMFHPWIISRFPTSQSTVTAKAFDIIAMTQIIKTSTCKLLRMNWHTRWPVTECFKPSCLCLHAQIRNSVSRRFLKLIF	1079332	1088350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1080015_1080126_1080169_1083751_1083887_1083936_1083995_1084899_1084949_1085704_1085780_1087896_1087999_1088107
714744	contig_12528_pilon	+	2369	2	Intergenic	novelGene_81338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937444	945892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_937622_943700
714747	contig_11121_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_167050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAACTTTAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19685	17430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_17400_19700
714754	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	107	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714761	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	283	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714762	contig_4832_pilon	+	600	3	Intergenic	novelGene_163393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	17.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGAACTACCTACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247935	264293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_248091_263349_263410_263908
714764	SIRV1	-	214	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3890	0	3616	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6750	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714765	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
714766	contig_9233_pilon	+	2711	4	Intergenic	novelGene_78241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98.9949493661167	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	579	968	676621	677010	TRUE	0	CGCGTGTCTGTGGGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEREQTPDLVYVVLIGCCSGTIIPGSSQFGLKTPVAVELILTHGDPVCVRVELHSIGFSVTDFLEVDHQAFLPGSLSSKEPLGGFELPAFQLAAQCLTICATWGLPVWSRDAVIRICQHLHKVVVLKV	582288	678947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_676300_677612_677805
714767	contig_5063_pilon	-	2279	5	Intergenic	novelGene_109980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGAGATTCTTGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57619	7955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_9527_12182_12314_19754_19855_35529_35643_57255
714769	contig_5095_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_74940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACAACAGTGTCAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139470	138922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_138900_139500
714775	contig_15084_pilon	+	1988	2	Intergenic	novelGene_116688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGCCACTGTTCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172146	174614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_173440_173919
714776	contig_20561_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_166370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGGACCCCTCAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77081	79216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_77100_79200
714777	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
714782	contig_57_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_44923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTTGTGTCTAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323717	325670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_323700_325700
714784	SIRV2	-	397	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1	673	1	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
714786	contig_2219_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_67204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACTTATTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237917	237597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_237600_237900
714787	contig_9972_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_162790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208434	207722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_207700_208400
714791	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	461	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
714802	contig_11081_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_167080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCCAGCTGGAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38385	37959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_38000_38400
714803	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_94246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714810	contig_12019_pilon	+	1302	5	Intergenic	novelGene_87793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	1199.40326308544	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	870	1271	765864	767304	FALSE	15	CACCTCTGTGTCTGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764824	767335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_765687_765772_765922_766639_766813_767133
714812	contig_9014_pilon	-	2009	9	Intergenic	novelGene_106710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.7731311340337	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	9	1082	46598	42232	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRWFAMRA	46606	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42254_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504
714815	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714817	contig_17171_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_147354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	12	317	60936	60631	NA	40	GACAGATATTGGTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLIMSVPQTSTSKGKVMLKEYSGRKIEVEHIFKWITAHAASRIKTIYNAEHLKEEWNKSDQYWVKIYLFANLDQPPAFFSALSIKFTGRVEFIFVNMENWDNMSY	60947	60628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_60600_60900
714823	contig_14441_pilon	+	1074	3	Intergenic	novelGene_100739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	326	56	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	2	655	121136	126326	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGKGDGGWGDYWREG	121134	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159
714824	contig_16548_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_167088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6356	8114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_+_6400_8100
714825	contig_10976_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_155590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAAGATAATTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124986	125220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_125000_125200
714826	contig_15434_pilon	-	1152	7	Intergenic	novelGene_56695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCCGAACGTCCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33482	26608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_26661_26899_27059_28952_29078_30407_30588_31080_31265_32952_33061_33138
714827	contig_18364_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_102580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATGTATTTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160318	159764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_159800_160300
714832	contig_7630_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_133638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAAAAAAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411335	409264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_409300_411300
714838	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714839	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_93459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714840	SIRV6	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGACCATTTCTGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
714845	contig_11850_pilon	-	2182	6	Intergenic	novelGene_125229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	999.788457624912	1	113	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	89	337	286397	285248	TRUE	20	CCGATTTTATTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKEFWN	286485	281495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283292_283503_284279_284323_285109_285261_285380_285531_286311
714846	contig_10176_pilon	-	1969	11	Intergenic	novelGene_72712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	263.21103700263	2	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	560	1312	268640	261068	TRUE	55	AAAAATTCTCACAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_252873_261011_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267930_268559_268677_270324_270450_271918_272048_273752_273864_274897
714848	contig_5021_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_167101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342329	344197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_342300_344200
714849	contig_6494_pilon	-	808	6	Intergenic	novelGene_108557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1112.58642810345	29	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2938_3245_3486_5564_5599_6792_6883_8256
714859	contig_6871_pilon	+	1512	5	Intergenic	novelGene_21626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	371.686023412234	497	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	45	506	623952	625553	TRUE	0	TGTTTCCCCCGTCTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSFRSGTASERGGRMNVGTAHSEVNPNTRVMNSRGIWLSYVLAIGLLHVVLLSIPFVSVPVVWTLTNLIHNMGMYIFLHTVKGTPFETPDQGKARLLTHWEQMDYGVQFTASRKFLTITPIVLYFLTSFYTKYDQIHFVLNTVSLMSVLIPKLPQLHGVRIFGINKY	620644	627031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_620664_623926_624126_624865_625018_625417_625929_626400
714860	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_18437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
714861	contig_13015_pilon	+	1519	2	Intergenic	novelGene_165560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	0	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAGAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396039	405427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045
714862	contig_5018_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_47149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	264.140114333283	1966	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	63	491	1498209	1499336	TRUE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRYCGALSRALGDSSPG	1497685	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499588_1500185
714863	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
714865	contig_6164_pilon	-	3096	1	Intergenic	novelGene_121295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATAATCCATAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608252	605156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_605200_608300
714868	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_95866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
714872	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
714874	contig_11417_pilon	+	1275	8	Intergenic	novelGene_103264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_5	165.13952048038	1027	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	101	583	284496	328238	TRUE	20	GAACCCCTTATCCCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARGCHMALLGLPAHLFLLA	284395	334218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751_319902_327166_327287_328186_328319_329070_329103_333430_333489_333696
714881	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714884	contig_8452_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_48085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3190	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968745	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669
714893	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
714895	contig_11751_pilon	+	2703	11	Intergenic	novelGene_150282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.1926067922107	88	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	523	2247	30829	56892	FALSE	20	TCACTACTTTTTCCAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNSLRTKVPAFLSDLGKATLRGIRKCPRCGTYNGTRGLSCKNKTCGTIFRYGARKQPSVEAVKIITGSDLQVYSVRQRDRGPDYRCFVELGVSETTIQTVEGTIITQLSSGRCYVPSCLKAATQGVVENQCQHIKLAVNCQAEATPLTLKSSVLNAMQASPETKQTIWQLATEPTGPLVQRITKNILVVKCKASQKHSLGYLHASFVQKISAKSLPERRFFCSCQTLKSHKSNASKDEAAQRCIHFFACICAFASDETLAQEFSDFLNFDSSGLKEIIVPQLGCHSESVVSAGESTASKPKKRKKDEVSGAQTNSSLLPQDAVSSNLRKSALKKPVVASALKRQACGQLLDEAQVTLSFQDWLASVTERIHQTMHYQFDGKPEPLVFHIPQSFFDALQQRISIGSTKKRLPNSTTAFVRKDALPLGTFSKYTWHITNILQVKQILDTPEMPLEITRSFIQNRDGTYELFKCPKVEVESIAETYGRIEKQPVLRPLELKTFLKVGNTSPDQKEPTPFIIEWIPDILPQSKIGELRIKFEYGHHRNGHVAEYQDPRTPLDQPLELAPLTTITFP	16673	57348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_16715_27536_27744_30023_30286_30816_31652_32857_32969_35078_35184_37347_37453_41648_41757_42973_43075_45722_45886_56683
714897	contig_6710_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_97571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
714909	contig_20615_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_146919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212001	210137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_210100_212000
714915	SIRV4	+	202	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1569	632	1114	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
714917	contig_14513_pilon	-	827	5	Intergenic	novelGene_70344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	87	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	198	617	18880	11499	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIGFHGCFSEVDHKAFLPRHF	19077	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11559_12038_12158_13087_13136_14952_15001_18735
714921	contig_15063_pilon	+	822	2	Intergenic	novelGene_14450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	192	680	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35872	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
714922	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714923	contig_7342_pilon	-	1720	10	Intergenic	novelGene_71098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	102.063282233362	1	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	333	1397	78723	76155	FALSE	50	TACCAGTTTTATAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	82400	75831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80392_82306
714925	contig_5999_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_45662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACTGATAATAAGAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282516	282166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_282200_282500
714927	contig_13592_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_33691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAATAAAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248331	247419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_247400_248300
714930	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714952	contig_7695_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_41652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCAGGGGAGATCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829613	829405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_829400_829600
714956	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	23	379	14409	13830	FALSE	20	ACCACAGTGCTTCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14431	13828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
714958	contig_7202_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_18227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCATCTTCCGCAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
714959	contig_6533_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_114646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAAGAATAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145556	147740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_145600_147700
714960	contig_401_pilon	-	2227	15	Intergenic	novelGene_42938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	133.718101288662	80	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	188	1831	2248554	2200327	TRUE	30	ATCCTATATTACACCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRKFLYHHNSTYSDSSGFTEEPNSRVFSKEDICELVLEPIAYLLAR	2262034	2196679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2196916_2198421_2198461_2199247_2199289_2200246_2200375_2225535_2225622_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
714965	contig_11512_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_43220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	26	349	4011	4557	FALSE	15	GTGCTTATGCTGCTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	3985	4558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
714966	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714969	contig_10135_pilon	+	1290	12	Intergenic	novelGene_106641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.956824377165	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	62	1084	107797	115842	FALSE	20	TGCGGCCCCTATGCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIILQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGTTYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAILGTQDIVFGEVDR	107735	116048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_107846_112369_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114015_114473_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
714970	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
714972	contig_6710_pilon	+	520	2	Intergenic	novelGene_97880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTCCAAGAGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653405	657515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
714979	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
714985	contig_10431_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_117388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17380	16783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_16800_17400
714988	contig_11370_pilon	+	1022	7	Intergenic	novelGene_98707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_3	29.2541545007808	888	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	9	692	131678	135954	FALSE	10	ATGTCCTGGTTTATTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLLGSILSSMEKPPSLGDQETRRKAREQAARLKKLQEQEKQQKVEFRKRMEKEVSDFIQDSGQIKKKFQPMNKIERSILHDVVEVAGLTSFSFGEDDECRYVMIFKKEFAPSDEELESYRRGEEWDPQKAEEKRKLKELAQQQEEEAARQGPVVVSPASDYKDKYSHLIGKGAAKDAAHMLQANKTYGCVPVANKRDTRSIEEAMNEIRAKKRLRQSGEELPPTS	131669	136284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_131763_134636_134705_134944_135034_135172_135258_135377_135468_135567_135725_135844
714989	contig_13349_pilon	-	2122	2	Intergenic	novelGene_161128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	478	777	230357	230058	TRUE	45	AAAGCAAACCCCCAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLSFRSIILAVLWRPWVAVATAGLILRVLPPALSSPPACGSTPALPCCLCKCWTRRQDHTNPQLCTELESGFLEFSIWESPIWEFICSVFCLPVWHL	230834	228243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_228755_229223
714990	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
714992	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	695	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
714994	SIRV6	-	564	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9450	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
714998	contig_16503_pilon	+	1767	9	Intergenic	novelGene_162062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_8	118.77683907227	517	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	188	901	123420	146861	FALSE	15	CTCAGCCTGCCACAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPVYEELLGILLSICLCRHIHSEDYSKVPKY	92053	147727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_115699_115775_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145653_146783
715000	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715004	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715005	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715009	contig_18420_pilon	-	2510	3	Intergenic	novelGene_109353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCGCTGTCACTCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105853	102659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_102858_103140_103295_103695
715011	contig_4315_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_46802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAAGAAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328249	327091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327100_328200
715016	contig_10037_pilon	-	1407	7	Intergenic	novelGene_148944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGTCCGGAGTCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445818	115307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_115533_128018_128106_186796_186881_236069_236179_378520_378595_425456_425591_445124
715021	SIRV6	+	540	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
715023	contig_19851_pilon	+	955	7	Intergenic	novelGene_29835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	47	junction_6	3164.35077157314	10	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	175	693	53637	56267	FALSE	25	AATTGTTCCGTGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLSILFVVE	53462	56529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006_56150_56236
715025	contig_7760_pilon	-	2327	7	Intergenic	novelGene_138440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	14.8061548763419	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	66	884	265537	257665	FALSE	25	CGTCGTAGTGTTATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSASTPAVAVQTSNASDHQTASPPSGCPVHEGKMRGCPLSTKPSDSTCESKTYSLPAHQERAYEYVECPMKAAASENKENLDPSNLMPPPNQMPAPDQPFPLSTAREESSIPRADSQKKWVYPSEQMFWNAMLRKGWKWRDEDISQKDMYNIIRIHNQNNEQAWKEILKWEALHATECPCGPSLIRFGGKAKEYSPRARLRSWMGYELPFDRHDWIINRCGTEVRYVIDYYDGGEVNKEYQFTILDVRPALDSLSAVWDRMKVAWWRWTS	266264	256221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_257864_258608_258696_260544_260665_261241_261391_262297_262450_265425_265570_266231
715028	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_94666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3	380	657529	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657531	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715030	contig_6217_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_109578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCATTATTTTTAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147682	147196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_147200_147700
715037	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_89605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653774	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715039	contig_3223_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_151834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATACAGCCCTGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981334	982128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_981300_982100
715041	contig_14441_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_100607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.563872498141	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	508	861	116876	117560	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111205	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_113164_113209_116578_116963_117097_117344_117539
715044	contig_7457_pilon	+	1280	11	Intergenic	novelGene_31313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	61.8737424114624	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	12	782	183157	189512	TRUE	20	GTGGTTGTCGTATACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183145	195103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189537_190243_190336_190768_190824_192098_192194_194871
715052	contig_9909_pilon	+	986	2	Intergenic	novelGene_42461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	157	576	540175	541286	FALSE	20	TTCATTTTTTGATACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSGNRSGGQDLWEGGGDSGTAGPAGTLSPAPLFSSDTYERLALLVGSIGLLGVGNNLLVLVLYYKFQRLRTPTHLFLVNISLSDLLVSLFGVTFTFVSCLRNGWVWDTVGCVWDGFSSSLFGSMTPKSKVRIPTQMNK	540018	541696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_540542_541233
715054	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_89423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715055	contig_4531_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_47860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	19	318	165618	165917	NA	75	AATAAAATTTAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPLSQKVCGGYTLGASPIPFRPANLVPLLRARIPFHIPPQLCPEPSAAISVRAVGGGSRAPSSCTGPSLVEALTAMVHQSLGPIPSLYPALLTLPCS	165599	167146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_165600_167100
715061	contig_4797_pilon	+	1360	4	Intergenic	novelGene_6914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_3	1485.65832770078	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	26	622	368372	371016	FALSE	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCRTAAIMGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTVSSVQGLGARQGSIGFSREAAPGWGSMCVRTADLRVEGAAPLRLHSWFIVLRPIFILQWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWK	368346	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368844_369855_370026_370914
715062	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715063	contig_11855_pilon	-	1252	9	Intergenic	novelGene_66977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	992	junction_8	1830.61334922889	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1116	135	1250	1102035	1082908	FALSE	55	TAGGAAATCCAAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQ	1102169	1082905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
715069	contig_16210_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_147671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAGAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37348	35182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_35200_37300
715072	contig_14029_pilon	+	1356	6	Intergenic	novelGene_151942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_2	242.210321827952	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	7	330	131703	133480	TRUE	40	CCCCCACACAAGAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQVT	131696	135614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_134021_134104_134162_134258_134319_135245
715077	contig_14441_pilon	+	793	4	Intergenic	novelGene_100681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	433.811787145839	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	192	620	116728	117610	FALSE	10	TGCTTGGCGCTGCCTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113668	117783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113711_116578_116963_117220_117344_117539
715080	contig_10235_pilon	+	1076	7	Intergenic	novelGene_46378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	235.831625435512	2705	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	520	936	156263	158044	FALSE	10	CATGAGCTGGTCTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGLIHARYILTNRGIAQMLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153836	158184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_154761_154845_155532_155646_156048_156323_156763_156840_156980_157171_157953
715082	contig_7839_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_45704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTTTTTGCCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238032	239372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_238000_239400
715083	contig_7839_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_45705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGGGCTTTCTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239372	239636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_239400_239600
715084	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715087	contig_12250_pilon	+	1999	17	Intergenic	novelGene_80554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	67.0398377366025	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	187	1941	272853	278399	FALSE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNCTCLQILCPQPSPALHPVHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272517	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_274040_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
715089	contig_12079_pilon	-	1810	4	Intergenic	novelGene_67419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1512.7619332422	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584252	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582109_583683_583756_584142
715096	SIRV5	-	453	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGTTCTCCACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
715097	scaffold_19766_pilon	-	1208	6	Intergenic	novelGene_34367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	165.429138908476	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	12	446	678396	677637	TRUE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVMRTETQVLSPVAPEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGKPEPTSPSPLEGQRGKAPVPTAPFAASLCPSLRAPRRPVGTSFSAQTKIFLPLLQPPF	678407	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677548_677670_677786_677930_677999_678138_678275
715103	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_89427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715105	contig_6710_pilon	-	673	3	Intergenic	novelGene_94699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3872	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662771	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471_657606_662756
715113	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_93708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715121	SIRV4	+	151	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1165	0	-1165	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTGGTTCGTTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1600
715124	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
715126	contig_4469_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_21873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACTCTTCTGTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94807	96481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_94800_96500
715127	contig_16622_pilon	-	1475	12	Intergenic	novelGene_48445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1121.68735055571	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	227	1471	128619	108220	FALSE	20	ACTTCACCTGACCAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQATQWKTQKVWIFYSLGFSPKMKLKFLILLLFSELTVK	132340	108215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108333_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128337_128679_132173
715139	contig_9571_pilon	-	2985	1	Intergenic	novelGene_136336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790864	787879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_787900_790900
715140	contig_6589_pilon	+	1296	6	Intergenic	novelGene_26091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	60.1464878442624	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	185	382	1867977	1872172	TRUE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPGGANS	1866786	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868960_1869046_1872155_1872787_1874884
715154	contig_4232_pilon	-	845	3	Intergenic	novelGene_63227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTTCTTGTCCTCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149682	148365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_148536_148803_148883_149086
715156	contig_11285_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_5517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1205	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAACAAAAGGTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651845	650780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_650800_651800
715157	contig_12586_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_121800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAGAATCCAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44787	44589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_44600_44800
715158	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715159	contig_16310_pilon	+	1186	5	Intergenic	novelGene_70074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	3396.77972497482	20	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	285976	289135	TRUE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNALSLKSEGIGS	285794	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_289102_289162_289558_289633_289879
715160	contig_7720_pilon	-	2054	17	Intergenic	novelGene_155774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.541101317886	186	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	161	1264	860670	798987	TRUE	5	TCTCCGAGGCTCCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYSTRYGSPKRQLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872295	795752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796128_798571_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_859303_859346_860593_860723_872187
715163	scaffold_13609_pilon	-	530	4	Intergenic	novelGene_124410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGACAATGCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575048	564620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_564692_572408_572506_573271_573479_574893
715164	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715170	contig_2854_pilon	-	1734	7	Intergenic	novelGene_120839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	136.774043183964	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	674	1333	305715	262691	TRUE	5	TGGGGGTTACTGTCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGCREHILEDAKPESVDDTTDLALPPEMPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNVGGWCVLM	306388	257702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262717_264212_264421_274368_274512_300455_300590_303933_304061_305693
715171	contig_13300_pilon	-	2265	3	Intergenic	novelGene_125809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	25	118	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	155	352	248830	248633	TRUE	35	TCCCGGAATCTGAAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNHWGAPSLKTKTQEACSQNVRRGARARAWRSPLSRSWFCSPLLIPHLGEPMERQQWNFLLFSLTPLADTLPLLLSCPEGEIPLVSHVRSRDSTSSLRQPGAAQQAKGLLLVSAAA	248984	244139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_247547
715172	contig_7707_pilon	+	2096	23	Intergenic	novelGene_72113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	148.831488548194	39	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2085	12	2096	7375	81376	FALSE	20	TGGTCCCAGTGTGTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAMEESQPVTVPEGETASCSSWAAGSTNTNLPIVSTESVEIDDALYSRQRYVLGDTAMQKMAKSHVFLSGMGGLGLEIAKNIVLAGIKALTIHDTENCQPWDLGTNFFICEDDVANMRNRAEAVLQHIAELNPYVHVTSSSLPLNETTDLSFLDEYQCVVLTEIRLPLQKKINDFCRSQCPPIKFISADVHGIWSRLFCDFGDEFEVLDTTGEEPKEIFISSITQANPGIVTCLENHPHKLETGQFVTFREINGMTGLNGSTQQITVVSPFSFSIRDTTELEPYLHGGIAVQVKTPKIFYFESLEKQIKHAKCLIADFSKPEAPLQIHTAMLALDQFRENYSRKPNVGCQQDSEELLKLATSISETLEEKPEVNADIVNWLSWTAQGFLAPLAAAVGGVASQEVLKAVTGKFSPLCQWLYIEATDIVESLGKPECEEFLPRGDRYDALRACIGDSLCKTLQNLNIFLVGCGAIGCEMLKNLALLGVGTGKEKGMVTITDPDLIEKSNLNRQFLFRPHHIQKPKSYTAADATLKINPQLKIDAHLNKVCPATETIYNDAFYTKQDIIITALDNVEARRYVDSRCLANLRPLLDSGTMGTKGHTEVIVPHLTESYNSHRDPPEEEIPFCTLKSFPAIIEHTIQWARDKFESSFSHKPSLFNKFWQTYHSAEEVLQKIQTGHSLEGCFQVTKLLSRRPRN	7363	81376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_7446_14660_14724_35290_35386_35922_35952_38977_39073_39609_39722_42243_42325_53086_53210_54824_54949_59055_59160_60840_60904_61684_61762_62215_62283_64333_64478_66896_66965_67653_67733_69943_70025_73499_73578_75143_75326_76905_77012_78755_78846_78970_79052_81304
715175	contig_18889_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_167118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197612	199640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_+_197600_199600
715177	contig_7744_pilon	-	2029	8	Intergenic	novelGene_62478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	44.2875575653257	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	169	1398	489862	487677	FALSE	40	AACTGAAACCCTAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YALQVDASAGLLIAAGGGGAAKTGIKNGVHFLQLEQINGRLSASLLHSHDTETRATMNLALAGDILAAGQDAQCQLLRFQTHWQKGSNKAEKAGSKDQGPRQRKGAAPAGQKSGAETHCEGVELSVEDLQVVQTDFSADPLQKVVCFNHDNTQLATGGTDGYIRVWQVPSLKKVLEFKAHEGEIEDLALGPDGKLVTVGQDFKASVWQKDQLVTQLHWQENGPTFSNMPYRYQACRCEDPGRWLKEAQPRCGGGNREAGEDCGLGVGVSPGLTRMQEGTNLHRQVGRPWELSSLSPGPRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	490578	487045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_488992_489090_489172_489350_489572_489750_489944_490491
715199	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
715200	contig_614_pilon	+	2001	6	Intergenic	novelGene_132629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	32.4444140030299	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	308	718	619179	619956	TRUE	20	GTATCTGTTAATTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHHKATVSPMCQVSMLHSAAGSPTNMTALVWALAVLQLPSGPACSSHPWGSPPGQGPCVQPRWPCSWCSSEFFLWPSSPVNWGPFQDGYRGCLIVYLQHSPQSRCQIRHHRDCSGSSHICGLPGPEDLHVPQARV	588679	641288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_619493_619859_619971_621721_621753_634039_634064_640074
715203	contig_2703_pilon	-	1433	7	Intergenic	novelGene_101735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGCGGGGGAAGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585278	526214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526411_559432_559521_564146_564207_577993_578076_578760_578913_582629_582668_584461
715204	contig_500_pilon	-	739	7	Intergenic	novelGene_30975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468893	1447848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1447907_1452268_1452366_1454482_1454585_1460703_1460789_1461319_1461548_1464028_1464136_1468831
715205	contig_14225_pilon	-	3081	1	Intergenic	novelGene_52745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2181	2570	252886	252497	NA	85	ATAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILFQSSLFIVQLLHAYEVVENTMAWVRCTLVFKETSLLFNTLKGSFAATICTIKVEKKQGKKDWDSCCYVHQVVLQISLEAYADPSAATVLVCIPTFCPDKLLLNNHNKLHYCFKESFINFLSGWAR	255066	251985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_252000_255100
715224	contig_19098_pilon	+	2032	4	Intergenic	novelGene_65859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	12.675435561221	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	472	936	483958	486390	FALSE	30	ATAAAAACCTTGTTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVQSGNKNRILPAWMTAQEVEKRGVSAEAPKRRRTAVVKASAARLPTTGTVYCMNEAEVVDVALGILIEDHKQEKPLEQKALAGADKLELSPTRSRSPCSPGGRSEDKDNGEDTLPPTLGASQELGGSDSTHSQSQKEEEDALKYVREIFFS	482305	487486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_482638_483818_484095_485036_485113_486138
715228	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715229	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715232	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_97949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715235	contig_14868_pilon	+	1784	12	Intergenic	novelGene_150459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	85.6422503284583	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	100	1605	186170	252493	FALSE	45	AACGGCATGCATGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSPGNSTLEEILGQYQRSLRERANRSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVRDDKR	186070	252672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
715244	contig_14341_pilon	+	640	6	Intergenic	novelGene_111828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	79	639	548758	551683	FALSE	45	ATGCCATCAAGAAGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNS	547737	551684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
715249	contig_14208_pilon	+	1065	9	Intergenic	novelGene_129103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_8	54.5227876671764	380	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	948	117	1064	291920	343206	FALSE	40	TAAGCAGTTTAGAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSYQLLSYGSGFTAVGWEWFACFQRAGEGNSSLNRGSEMDILKSEILRKRQLVEDKNLLAENKKYFKRSELAKKEEEAYFERCGYKIQPKEEDQKPLTSSNPVLELELAEEKLPMTLSRQEVIRRLRERGEPIRLFGETDYDAFQRLRKIEILTPEVNKGLRNDLKAALDKIDQQYLNEIVGGQEPGEEDTQNDLKVHEENTTIEELEALGESLGKGDDHKDMDIITKFLKFLLGVWAKELNAREDYVKRSVQGKLNSATQKQTESYLRPLFRKLRKRNLPADIKESITDIIKFMLQREYVKANDAYLQMAIGNAPWPIGVTMVGIHARTGREKIFSKHVAHVLNDETQRKYIQ	291803	343207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_291986_325813_325892_328608_328714_332389_332504_337414_337562_338904_338974_340395_340537_340675_340748_343050
715250	contig_15063_pilon	+	1012	3	Intergenic	novelGene_14400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1339	junction_1	2322.5	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	60	884	35271	36661	FALSE	35	ATATCAGTTCACAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35211	36789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35836_36158_36266
715256	contig_8676_pilon	-	2499	3	Intergenic	novelGene_142226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	741	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCCCGAAATGGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673270	669334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_669571_669677_669797_671126
715259	SIRV7	-	356	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	26	-32	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
715264	contig_7057_pilon	-	481	6	Intergenic	novelGene_123280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1247.08662088886	110	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	24	380	707634	705809	TRUE	35	CAAAAACACTGTTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPVALRLMSSSVTCNMGGIRPSRRLLLLAFLLTAGGLSPAQAQSECKCATMSPGVLAGIVLGDLLLTLLIALAVYSLGRLVPQKRGAAEMSGKQRMNQTESTYQELQGPRSDVYSDLNTQRQYYR	707657	705649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_705657_705714_705875_706664_706709_706884_707020_707173_707201_707549
715267	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_96904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715268	contig_14575_pilon	+	1714	19	Intergenic	novelGene_101883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	124.14424356319	2	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	12	506	19976	26356	TRUE	60	GAGAAAGATCCAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	19964	63906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_33862_33918_40652_40702_41533_41652_42757_42849_47212_47376_51064_51146_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
715270	contig_19769_pilon	+	650	5	Intergenic	novelGene_102254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.444799541576	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	36	650	87249	88957	FALSE	30	GTGAGTAGCTCGGAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMN	86994	88957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841
715279	contig_16382_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_160237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCAGTGATTAACAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284893	285666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_284900_285700
715286	contig_12125_pilon	-	2467	1	Intergenic	novelGene_76217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	860	1237	242244	241867	NA	60	TCGAGAGAGAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKDVTELLQSHDKTLTDEELLTDEQIKRFPEMESTPGEDAVNIVDMKTKDLEYYLNLVDKAAWQGLRGLTPILKEFLLWVKCYQTALRATEISFTKGRVNRCSKLHCSLILRKYHPSLQQPPP	243103	240636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_240600_243100
715295	contig_6027_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_74417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTCAGCCCCTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108071	106823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_106800_108100
715299	contig_12624_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_61143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGATAAAAAGTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948399	947525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947500_948400
715300	contig_9443_pilon	+	2459	5	Intergenic	novelGene_167126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	33.7370345466225	114	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	389	1384	110845	111840	FALSE	10	CTGCTGCTATTTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALALWTTLPSRMSLRSLKWSLLLLSVLSFLVMWYLSIPHYNVIERVNSMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQQAEREDKMLALSLDDEHVLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYIMKTDTDVFINTGNLVKYLLNLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKAHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIISRDLVPRIYEMMSHIKPIKFEDVYVGICLNLLKVDIHIPEDTNLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY	67241	112915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_67350_68648_68746_105724_105809_106532_106598_110810
715304	contig_15410_pilon	-	1517	10	Intergenic	novelGene_130572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	81.455888236487	1988	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	414	935	57546	55102	TRUE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVVSHLAGKARHCSGLSLPEGHPYSPF	59306	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55158_55333_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57870_59216
715312	contig_9290_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_77525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	54	383	245344	245015	NA	45	TGAGAAATGCAGAGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVALEETLKQYETAKSVMRSEPEGCSGTVGNKMVIPVMTIIKSDSSSDTSDGHGSCSWDGNLPESLESVSDVLLNFPDVSPNASIADSREEEGVSESDDGSSSVDSLAAHVKNLLQCESSLNHAKQI	245397	245013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_245000_245400
715315	contig_20493_pilon	-	2103	8	Intergenic	novelGene_86414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	38.1800246950455	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1460	2059	43387	37388	FALSE	30	ATAAAACTCTGCTGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	49193	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_47119_48978
715316	contig_5280_pilon	+	2344	10	Intergenic	novelGene_52577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	717.907109091386	1	129	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	871	1236	47466	78235	TRUE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKEHGVVYHLTAKPSCYQGSTSCSETHLSNCSRYRGPKSSSETHLSNCSRCYDSCIWTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38290	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38453_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56222_56333_62043_62065_78042_78530_78690
715321	contig_11427_pilon	+	1672	2	Intergenic	novelGene_78969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	613	1650	93223	94260	FALSE	45	ATAAATAATCATCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92297	94282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92898_93210
715325	contig_10446_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_162466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACAGAAGAGAGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629292	631055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_629300_631100
715331	contig_21388_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_136636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	788.053416653973	204	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	445	795	26799	21603	FALSE	20	TTAATAACCTGCGTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28496	21400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26949_27497_27649_28352
715333	contig_10947_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_167141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTTGTGTTTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95348	97306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10947_pilon_+_95300_97300
715335	scaffold_12510_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_151407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610773	613034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_610800_613000
715336	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715337	SIRV4	+	325	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1443	635	988	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
715338	scaffold_19766_pilon	+	2380	12	Intergenic	novelGene_34438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	162.101590429689	1	106	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1165	2220	847654	851417	FALSE	20	CACCTTCTAATCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	845083	851577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845163_845497_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
715339	contig_4232_pilon	+	1942	8	Intergenic	novelGene_63173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_6	40.1974717450473	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	74	589	117183	119151	TRUE	20	GACTGATTCTTACTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLARSGRCSLLLGVLQRRSVLGVTMTSELDIFVGNTTLIDEDVYRLWLDGYSVSDAVALRVRSGILEQTGATAAVLQSDTMDHYRTFHMLERLLHAPPKLLHQLIFQIPPSRQALLIERYYTFDEAFVREVLGKKLSKGTKKDLDDISTKTGITLKSCRRQFDNFKRVFKVVEEMRGSLVDNIQQHFLLSDRLAR	117109	121339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117670_117881_118009_119046_119765_120102_120212_120280_120691_120778_120877_121216
715342	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
715343	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715346	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	385	3	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
715356	SIRV6	+	568	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
715368	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715369	contig_3612_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_87808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACTTGATAGCAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855208	854700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_854700_855200
715371	contig_18859_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_150554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAACTACAAAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173987	173598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_173600_174000
715372	contig_7202_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_18749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGCCGCCGTCAACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
715373	contig_15039_pilon	+	956	3	Intergenic	novelGene_110170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	139	4535	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	237	764	329947	343905	FALSE	20	TATAATCTGTGTCCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGILIKKLLREQIVADMYTYKEISFFVAEFIVKNTAEWIRQNGGWENGFVKKFEPRSGWLTFLEVTGKICETLFLLKQYY	329586	344097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_329648_329771_330367_343797
715374	contig_7318_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_152231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGTCAGCAGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327438	325992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_326000_327400
715381	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
715383	contig_5725_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_167142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATTTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215678	217723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_+_215700_217700
715387	contig_16220_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_163635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAGAAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186941	189064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_186900_189100
715390	contig_854_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_36301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	108	377	548410	548141	NA	15	TTCAAGGTCCTCTCGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQALPVAGAPLGVYPELSNAELEGKAGWGAGPAVYMRGPVQNEDAGAPVLKSLRKSRWRQQSLQPRVGPFGARALCSARRTVKVARAESPREADLVWCILSASERLSRTIESSWGHRGLGPPRN	548517	546385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_546400_548500
715403	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715407	contig_8772_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_21102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6080.75939382209	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	129	695	15355	15921	TRUE	10	ACTCTTGCTGTGTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREK	15226	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15938_19151_19364_19996_20123_20475_20697_21493_21523_21966_22057_23073
715408	contig_11427_pilon	-	2236	16	Intergenic	novelGene_78978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	47.9933328703061	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	26	2077	138608	106977	FALSE	20	TTTTCTTTTCTTATAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPPQDPDMRLVFATLLSLGALGLCLATPENTVRWCTISGDEATKCSEFQKNMARVGAAPLTCVNRTSYRECVKAIVKNQADAVSLDSGLVFKAGQAPYKLKPVVAEVYGSKEQPQTHYYAVAVVKKDTNFQLNELRGKKSCHTGFRRSAGWYIPIGTLRPFLEWTGPPASLESAVSSFFSGSCVPCVDARQFPKLCSLCAGQGANKCACSSQEPYFGYSGAFRCLQDGAGDVAFVKDSTVFENLPNKNDRDQYQLLCPNNTRKPVDAFKSCHLGRVPSHAVVARSVNGKEDLIWELLRQAQARFGKTKAPEFQLFASPPGKKDLLFKDSALGFLRIPSKIDSALYLGFKYLSALQNLKKKKSSLDARRKQIVWCAVGREEQSKCNQWRRWSRRQVSCALASTSEDCIALIMKGEADAMSLDGGLVYTAGKCGLVPVLAENARSQESNGSDCVTRPSKGYLAVAVVRKSDADLTWNSLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLFNQTGSCRFGEFFRQSCAPGADPGSNLCALCIGDDSGQNKCVPNSKERYYGYTGGKNTQEWAKNLKPEDFELLCLDGSRKSVSEAWKCHLAVAPSHAVVSREEKAEYLENVLLQQQEQFGQNGSKCPKQFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYEKYLGAAYVTAVANLKKCSSSGLLEACAFLNS	138633	106817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_107012_108713_108904_110424_110610_115235_115371_116173_116330_117356_117405_118609_118701_120840_120996_121855_122031_123102_123282_127146_127203_128162_128311_128662_128846_129192_129302_131655_131820_138565
715410	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_95117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715416	contig_11832_pilon	-	1293	11	Intergenic	novelGene_106918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	988.003446350264	8	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	146	1036	88105	84055	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNNFLNQPLPAFSHPLKYALDPSPVESGH	88250	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84140_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081
715417	contig_11163_pilon	+	2501	1	Intergenic	novelGene_153059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAACAAATGTAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99191	101692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_99200_101700
715420	contig_13481_pilon	+	2198	2	Intergenic	novelGene_119435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAATGGAAAGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937340	947667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_939317_947445
715425	contig_18869_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_56025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73538	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
715427	contig_10734_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_51246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAGCGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237920	1240160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1237900_1240200
715428	contig_8375_pilon	+	3131	1	Intergenic	novelGene_141298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	354	1065	38	1102	156936	158000	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KESPHPPRHRHLMKTLVKSLSTDTSRQESDTVSYKPPDSKLNLHLFKQFTQPRSTGGDSKTAPSSPLTSPSDTRSFFKVPEMEAKIEDTKRRLSEVIYEPFQILSKIIGEESGSHRPKALSSSASELCNLSSLNGHLESNNNYSIKEEECDSEGDCYGSDSNIPRSDHPKSADDPPREVELKSSQVSSLKDLGLKTSSLVLEKCSLSALVSKEDEEFFELYTEDFDLDTEGESKVDKPPDIPLKPEVLVDNGMALDSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPSAHKYHRLHKNLQHWNTRSLDIKEPEILKVSLLHSSPLFHIQRILDLT	156898	160029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_156900_160000
715432	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
715435	contig_5451_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_167189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTTTGGGGATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739009	738268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_738300_739000
715436	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
715442	contig_5434_pilon	-	1654	11	Intergenic	novelGene_74644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_9	50.8115144430866	317	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	826	1413	128274	116749	FALSE	10	GGAAGTTTGCTTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVKQLNPISLTDRGSVTKIYGRSFVAGVLPFKVAKDMAAAAVRCIRKEIRDLYVNIQPVQESKDQAFGNGNGIIIIAETSTGCLFAGSSLGKRGVNADKVGIEAAEMLLANLRHGGAVDEYLQDQLIIFMALANGVSRIKTGPVTLHTQTAIHFAEQLAKAKFTVKKSEDEEDATKDTYIIECQGIGMTNPNV	136094	116507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_116851_119223_119329_120540_120636_126854_126914_127803_127929_128172_128316_129676_129736_131514_131639_134396_134618_135615_135717_135815
715443	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_18695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTACGTCTACCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
715448	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_90544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653840	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715451	contig_1443_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_28208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1	420	344893	344474	NA	50	CAAAGCAAAAAGTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRKRFYCLEYSAAKLGKVSNLKIWRPGPFFASFLLPSFKTHRDPKERKIISLCPNSYLANSSNTFLLPSVGTRESNRRKEKAEEIITEPVPSEGKSDRKFKRSYLSAQEPNDREGLSAEGGHRQQRRTCTGQHCCSCS	344893	344211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_344200_344900
715452	contig_11422_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_99077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1300
715456	contig_3612_pilon	-	1609	6	Intergenic	novelGene_87819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCGAATTTGGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978345	931972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_932059_953606_953719_955598_955907_965348_965996_969732_969848_978004
715459	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTTCAAAATAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
715466	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
715472	contig_13041_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_127713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTGCCAGAAGTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9782	9012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_9000_9800
715476	contig_4754_pilon	+	836	4	Intergenic	novelGene_35911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.2138486760204	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	418	834	166682	174338	FALSE	50	TCAAAAATCCAATAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRFLNRHLELIQKAQRQRIPVAGIVPSTKENDRGPEIWKVDDHLPEHLQNESRVNRSEQRHKHNTWENIFHQHRSHFPLRQNHNMFDLHEKSVKSNLTLINQSRSYKVKNSTEFNRDEKTFLHANHEQFHTEIKFPE	163594	174340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_163792_164269_164394_166585_166794_174033
715479	contig_5649_pilon	-	2250	16	Intergenic	novelGene_82401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.5976701961785	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	279	2006	1286943	1250250	TRUE	35	TTGATTAAGATTTCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFGWAVFLASRSLGQGLLLTLEEHIARFLGTRGTTTMGNSCICRDDSGAEDSVDTQQQQSENSAVPTADTRSQPRDPVRPPRRGRGPHEPRRKKQNVDGLVLDTLAVIRTLVDNDQEPPYSMITLHEMAETDEGWLDVVQSLIRVIPLEDPLGPAVITLLLDECPLPTKDALQKLTEILNLNGEVACQDSGHPAKHRNTSAVLGCLAEKLAGPASIGLLSPGILEYLLQCLKLQSHPTVMLFALIALEKFAQTSENKLTISESSISDRLVTLESWADDPDYLKRQVGFCAQWSLDNLFLKEARQLTYEKVDLNNIRAMLNSNDVSEYLKISPHGLEARCDASSFESVRCTFCVDAGVWYYEVTVITSGVMQIGWATRDSKFLNHEGYGIGDDEYSCAYDGCRQLIWYNARSKPHLHPCWKEGDTVGFLLDLNEKQMIFFLNGNQLPPEKQVFSSTVSGFFAAASFMSYQQCEFNFGAKPFKYPPSMKFSTFNDYAFLTAEEKIILPRHRRLALLKQVSIRENCCSLCCDEVADTQLKPCGHSDLCMDCALQLETCPLCRKEIVSRVRQISHIS	1301141	1248824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1249026_1250206_1250347_1253589_1253695_1258577_1258731_1259043_1259147_1261256_1261369_1270967_1271112_1272067_1272184_1273155_1273288_1274126_1274194_1276017_1276077_1276851_1276979_1279129_1279243_1280476_1280530_1286596_1287099_1301018
715481	contig_10196_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_132093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	501	887	907588	907974	NA	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRETKDLLGTSDRPPCGLSFLEGRNKLWALGTDAGHLGVWPQPVSLCLQAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVGGCKLGEGTCKGLCDFLGP	907087	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_907100_908600
715488	contig_10042_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_79179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	910	1221	796261	796572	NA	80	TATAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLNNPDTGRTAWYPATTTDCSDGDHNRESWTEWEKNIEQKTKFTKQTRLTGLTETGGTPETMALRHSFDLEMKPFPETTFQPNNRQAHKINNNIRKERVP	795351	797624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_795400_797600
715489	contig_15327_pilon	-	2152	6	Intergenic	novelGene_70510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	83.1937497652318	336	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	189	515	456350	448131	FALSE	20	CTTGGAATCCTTCTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGAGPDVLVVVVSMLNTAPLPIRGIMLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPTQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYRLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVERWGSL	465129	446493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_448242_448493_448605_448692_448773_456325_456402_456527_456613_465077
715490	contig_5361_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_167202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234290	233352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_233400_234300
715491	contig_9759_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_167227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTAAAAAGCAAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84626	83512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_83500_84600
715498	contig_12086_pilon	+	915	5	Intergenic	novelGene_74707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	250	630	11359	14773	TRUE	10	AGGCCGCGAGCGCTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHSFWSLLSHDILEVLQQSTWLLAIGLHTNYTGVHRGLDNLFSSRHAFPAHPPEARDWLCGRHCCPSGSSGLLGKGICLQCPGSWQGRGVQTEAAPHLESSGIHQKPAGPRLWQFCPFHWLEGFL	10691	16073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_+_10916_11333_11486_12645_12873_14746_14969_15983
715501	contig_8020_pilon	+	3336	3	Intergenic	novelGene_114355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	11.5	189	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	178	1452	83692	98927	FALSE	5	TTTGTTCCGTGAGTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRWRWLWQRWRRPWPRPGDGRQSRRDAKDSAARARCRRGAACRAGPASRAGEDAPVSVMGCGTSKVLPEPPKDVQLDLVKKVEPFSGTKSDVYKHFITEVDSVGPLKTGSLAANQHAHPCPGAPTTGHTEPPSEPPRRARVAKYRAKFDPRVTAKYDIKALIGRGSFSRVVRVEHRATRQPYAIKMIETKYREGREVCESELRVLRRVRHANIIQLVEVFETQERVYMVMELATGGELFDRIIAKGSFTERDATRVLQMVLDGVRYLHALGITHRDLKPENLLYYHPGTDSKIIITDFGLASARKKGDDCLMKTTCGTPEYIAPEVLVRKPYTNSVDMWALGVIAYILLSGTMPFEDDNRTRLYRQILRGKYSYSGEPWPSVSNLAKDFIDRLLTVDPGARMTALQALRHPWVVSMAASSSMKNLHRSISQNLLKRASSRCQSTKSAQSTRSSRSTRSNKSRRVRERELRELNLRYQQQYNG	72697	100811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_72805_83621_84649_98609
715502	contig_5881_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_129053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499779	497295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_497300_499800
715503	contig_7165_pilon	+	1401	4	Intergenic	novelGene_116888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	536.03876310912	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	118	378	1016847	1063285	FALSE	20	ATAACTCTGCCTGATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELCWQLRGEAGKRQVPGAKVALQHNIGLGGAVVVTVYKMGFPEAARTHQIEAVPTSSAFDGFKANLVFKEIEKKLEEEGEEFVKKIGGIFAFKVKDGPGGKEATWVVDVKNGKGSVHPNSFKAN	1016729	1064308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582_1043677_1053994_1054121_1063267
715505	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715508	contig_12270_pilon	-	325	2	Intergenic	novelGene_114077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	16	324	14409	13878	FALSE	20	CCGCAGTTTATTACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14424	13876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715509	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_96867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653769	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715518	SIRV6	+	200	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	505	3	-335	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAGTCGAAGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
715523	contig_9848_pilon	-	1350	6	Intergenic	novelGene_79990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_2	564.946227529665	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	32	718	149215	130372	FALSE	10	CCTGCCTGTCCGCATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGFRDDFLGGRGGSRPGDRRTGPPMGSRFRDGPPLRGSNMDFREPTEEERAQRPRLQLKPRTVATPLNQVANPNSAIFGGARPREEVVHKEQE	149246	129739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_130512_130796_130935_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
715524	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715527	contig_9147_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_167234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCCAAATTCCTAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123170	124460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9147_pilon_+_123200_124500
715538	contig_7362_pilon	+	1858	1	Intergenic	novelGene_147548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCGATGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358980	360838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_359000_360800
715542	contig_6424_pilon	-	2312	10	Intergenic	novelGene_109270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	22.1097151988179	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1085	1573	87743	83707	TRUE	35	TTGCAATAAATGTTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVSINQLPENILLELFTHVPARELLRNCRPVCSLWRDLIDVVTLWKRKSLRDGFITEDWDQPVTDWKIFYFLSSLRRNLLRNPCAEEDMGFWRIDSNGGDHWKVESLPGGHGTNFPDPKVKKYFVTSYGMCLKSQLVDLKAEGYWEELLDTFRPDIVVKD	98984	82861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_83289_83394_83708_84310_84407_85061_85189_87478_87774_94480_94659_95619_95756_95862_96232_97632_97931_98911
715548	contig_6876_pilon	+	1979	4	Intergenic	novelGene_147022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	67.3498329619309	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	494	1603	133885	141512	FALSE	45	CCCCTAGAAGGAAACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTITVLTAFLLSQFPYNCILLVQTINAYTMIISNCTISTNIDICFQVTQTVAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSFTRREGSLKLSSGLLETTSGALSL	126393	141888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_129122_129496_133860_133906_140423
715549	SIRV1	-	183	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3921	0	3647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6719	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
715550	contig_2455_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_119200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814107	816105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_814100_816100
715551	contig_13456_pilon	+	1873	1	Intergenic	novelGene_153316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	2	625	599677	600300	NA	35	GAGCATAATTCTAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELPVHVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELCSRVRAVCSRVRTVC	599675	601548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_599700_601500
715552	contig_12201_pilon	-	1348	9	Intergenic	novelGene_159980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	312.194250427518	32	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	428	820	132930	122405	TRUE	10	GGTGGTTTCACTAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQALCIFKVFKRTF	139126	110374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122444_124329_124453_130805_130980_132873_132971_133558_133697_138877
715554	SIRV4	+	232	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1539	632	1084	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2539	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
715566	contig_5331_pilon	-	1684	5	Intergenic	novelGene_112781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	293.410122524769	23	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	42	686	253336	248938	FALSE	10	ATGCAGTGTCTTTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTFLTSLPFSITGDVTSQAGSH	253377	247939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249001_249458_249582_250439_250569_251700_251798_253103
715568	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
715574	contig_3382_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_124073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACATCAGGAGTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334197	336156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_334200_336200
715577	contig_19744_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_120352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTAGCAATTTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14363	13082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_13100_14400
715581	contig_5605_pilon	+	2812	2	Intergenic	novelGene_143933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATGATTCACAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242554	248703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_244905_248241
715584	contig_6227_pilon	-	2557	4	Intergenic	novelGene_49686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1020	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2246	2551	880771	880466	FALSE	35	ACATATAATCACCTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCFLRWTTSRHTQSCHLRCLALPAWTQSLGRSSVKNLQKVRCFSSLCFSSTPVTLPASLVPGLSTALAATELPVSKNTVLYLRRRSVNVLLQLILQLQFL	884243	880459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_882537_883248_883394_883590_883734_884051
715591	contig_8934_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_167250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753952	751750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_751800_754000
715597	contig_14925_pilon	-	981	5	Intergenic	novelGene_55216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	1539.44460358273	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	207	464	29675	27020	TRUE	50	AAAGTAATTTGGAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFQKLVFGTGTQLLVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	42391	25810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_42337
715600	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_93448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715604	contig_9235_pilon	+	1208	2	Intergenic	novelGene_156234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	53	538	46342	46953	FALSE	10	CACTTTGATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	46289	47623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_46534_46659
715606	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715607	contig_504_pilon	-	1899	13	Intergenic	novelGene_54423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.459277054681	326	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	74	1501	187841	154422	FALSE	20	TTGTTGATTTTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAADAPPGGIDPPLTCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHVKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEGSIYIHNIKDMKLLKTILDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTTGEIVLYDGNSLRTVCTIAAHEGMLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYIYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSETTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSTSSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPYNLVPWKSEGQNEAIMMSSTLQKSGHPLSGGSGENEVEEWRALV	187914	154023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_154556_157946_158049_158690_158810_159462_159571_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167643_167742_175457_175555_181414_181585_183341_183425_187761
715623	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715627	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_90344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715633	contig_5959_pilon	+	2227	1	Intergenic	novelGene_150180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTCAGAGGAGGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174164	176391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_174200_176400
715637	contig_7171_pilon	-	1840	12	Intergenic	novelGene_101400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	93.5822438480525	397	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	904	1335	1412687	1409817	FALSE	10	ACTCAGCTGTCTGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1422077	1409311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413450_1414806_1414937_1421053_1421123_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050
715644	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715656	contig_3942_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_128894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652331	1651636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1651600_1652300
715660	contig_9389_pilon	-	1846	9	Intergenic	novelGene_83881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_8	489.871268166444	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	484	924	38959	36611	FALSE	0	TGCTCTGGCCTCGGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45854	35688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38975_39409_39535_40050_40206_45142_45230_45753
715667	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
715670	SIRV6	+	1171	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	791	7	-447	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAATCATGGAAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9790	10961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_9800_11000
715673	contig_1154_pilon	+	1035	5	Intergenic	novelGene_87159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	370.312958860475	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	26	790	896007	901946	TRUE	25	AATCTTTTTTCCAGATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLVLIRHGESTWNLENRFSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895981	902782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900253_900808_900990_901776_902119_902709
715676	contig_6503_pilon	+	2468	10	Intergenic	novelGene_145803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	9.24695478736142	98	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	202	1194	1437289	1464228	FALSE	15	GGTATCATTAGCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGQKLMRAVRVFEFGGPEVLKLQSDVARPIPKNHQVLIKVHACGVNPVETYIRSGTYSRLPPLPYTPGSDVAGVIEAVGDNVSAFKKGDRVFTTGTVSGGYAEYAVAADHMVYSLPEKLDFKQGAAIGIPYFTAYRALFHSARAKAGETVLVHGASGGVGIATCQIARAYGLRVLGTAGTEKGQNIVLQNGAHEVFNHKDVNYIDEIKKSVGDKGINVIIEMLSNVNLSNDLKLLSHGGRVIIVGSRGPIEINPRDTMTKESSIIGVSLFSSSTEEFQQSAAALQAGMETGWLKPVIGSQYPLEKVAQAHENIIHGSGTAGKMILLTC	1429601	1465502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_1429672_1431732_1431858_1437282_1437400_1438750_1438904_1447298_1447463_1451943_1451996_1457257_1457408_1463302_1463405_1463527_1463624_1464063
715680	contig_6488_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_44755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCAGCAAGGAGAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182463	181523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_182343_182407
715683	contig_953_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_130016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCCTTTGTTAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547071	547856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_547100_547900
715686	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_93429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715692	contig_6710_pilon	-	454	2	Intergenic	novelGene_98167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	TATTTCAGCCTTGCAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715701	contig_3975_pilon	-	955	2	Intergenic	novelGene_54916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTTTAGGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2236326	2234294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2235189_2236265
715702	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715709	contig_6710_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_97130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653720	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715712	contig_12464_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_68726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTGATAACTAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375166	377509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375200_377500
715713	contig_8161_pilon	+	1665	5	Intergenic	novelGene_156775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	521	820	405579	410887	TRUE	40	GAATCAACTCTACAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSEARPAQGYALAVLPRPVLLAVSYPVILVHHLLQECLIICIEGGHRDVPHSTEFTTVIQMFILQAEEVPYKSPEDLKGSKDSSNDVPRMRQQSRGGN	405058	438865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_405580_408237_408459_410809_410951_411679_411848_438251
715715	contig_5092_pilon	+	2183	5	Intergenic	novelGene_62299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCACCAGACGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443175	451615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_444965_446111_446166_447837_447993_449413_449497_451513
715716	contig_9471_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_21862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435155	435695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_435200_435700
715719	contig_12410_pilon	+	2571	1	Intergenic	novelGene_167281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGATAAAAAAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156701	159272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_156700_159300
715720	contig_13041_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_127716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTATTACTTTCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23837	22560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_22600_23800
715723	contig_11364_pilon	-	2160	7	Intergenic	novelGene_65154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	200	junction_2	36.5729863879521	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	665	1285	67737	61299	FALSE	5	ATTTGCTTTGTGGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKLDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNNKSPLTPEKEAGYTEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	68401	60423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64315_64454_65141_65189_66590_66616_67011_67048_67659
715725	contig_5794_pilon	+	2747	1	Intergenic	novelGene_69772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTATTCGGTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726435	729182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_726400_729200
715726	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715735	contig_16804_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_167288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTAATAAATCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32721	32272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_32300_32700
715736	contig_19564_pilon	-	1219	4	Intergenic	novelGene_29643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1059	160	1218	15529	12477	FALSE	20	GTGACATCCCACCCCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAV	15688	12475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
715738	contig_20819_pilon	+	1947	14	Intergenic	novelGene_55665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	29.8808283908837	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	747	1778	56353	62431	FALSE	15	TAGTGTGTCTGGATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEINVIEAVRDIRFLHSEALLSVAQNRWLHIYDNQGIELHCIRRCDRITRLEFLPFHFLLATASETGFLTYLDVSVGKIVTALNARAGRLDVMTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGAAEPNFDGLENNPYRSRKQRQEWEGYDPEAKAPFQPKPKQKGRSSTASLVKRKRKVMDKEHRDKVRQSLEQQQHDQEKKTKPTGTRPSALDRFVR	54806	62600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56094_56294_56394_56486_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61409_61556_61631_62105_62220_62329
715740	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715742	contig_5988_pilon	-	1818	5	Intergenic	novelGene_15887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	34.4818792991333	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGTATTGCAATGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531971	529331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530963_531067_531195_531641_531697_531805
715751	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_89216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653717	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715754	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_94788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
715759	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715763	contig_1339_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_163088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	161	616	8599	8144	NA	65	TTAAAAAATTGAAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIRELTGYSSCSGTLRIQFFHQEDSLFSAVPVGTPLSGPRPLPCSGKRCKALLALANKCLEALYSASKPPAKRHSAFLLRGSGSPPRHFLPLFLCHHFLSSLSVSWFQELFSAGIPGPKDALSAPDGGSGILSLAPLGWLTLSPAGGQN	8759	8030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_8000_8800
715768	scaffold_17542_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_139241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCACCACATAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452006	452829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_452000_452800
715770	contig_13457_pilon	+	1259	12	Intergenic	novelGene_118356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	66.0868449419411	2	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	237	1259	68182	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRHLAHRLRRRHQRCQRRPPLAVAPPAGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	67616	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_70946_71026_71059_71202
715774	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_91289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	657164	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657165	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
715775	scaffold_13505_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_111422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCCTGCCCAGACGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456021	456655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_456000_456700
715787	contig_7457_pilon	+	1553	8	Intergenic	novelGene_31585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	272.806502406196	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	338	979	940402	946898	FALSE	55	ATAGACCCCAACAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRVSSRHQICVGKEAYPLGL	927931	947472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_928643_928812_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687
715788	contig_6360_pilon	-	483	4	Intergenic	novelGene_165879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	39.4658783705058	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	160	483	48545	17834	FALSE	15	TCAGTGGGGACCATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAREKDPADDIENDLEKKKLDWSCSLLLASFVGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTQYIKAFYNESWERSRGHPVDSDTVTLLWSVTVSIFALGGVVGTLMVKLIGKFLGR	89002	17833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_17996_38188_38288_48482_48586_88883
715789	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715790	contig_6589_pilon	-	993	10	Intergenic	novelGene_25894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.201598618378	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	120	974	1178015	1158505	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTQLGHPCLGPSHPALRPPDPHLLSSPVSQVQPQTIPRSP	1178134	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158623_1158709_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
715791	contig_8050_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_114846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1008	1349	353682	354023	NA	55	TTCCATCACCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIYIHIYTHIYICIYLSMLKFVQLLNSNIFLDIGSTLARMVLRYQMKSAGEEGAASGSDGNFSEDVLVKFDEWTFIPDSSMDCVFGQSDDLDSEGIYDKKQFLLCVTLIHWH	352674	354982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_352700_355000
715792	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1133	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
715793	contig_11418_pilon	+	2700	3	Intergenic	novelGene_167296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	1.5	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTATAGTTTCTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112289	130973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11418_pilon_+_112622_128353_128436_128687
715794	contig_20452_pilon	+	1868	3	Intergenic	novelGene_167297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	3	251	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	227	1330	23129	24232	FALSE	55	TAATAAAAACAACATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSVSNWPFSSHGTHFITNHSDQSPQNFSKTSNVTTVCSMDENLLSNVLTTFYSVIFIVGLVGNVIALYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMHHINQNNWTLGVIFCKVVGTLFYMNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKVITTKQSIYVCCTVWTIALAVFLTMITLTLKKEGHNSTMCFHYRDKRNAKGEAIFNFILVVMFWLIFLLIILSYIKIGKNLLRISKRRSKFPNSGKYATTARNSFIVLIIFTICFVPYHTFRFIYIFSQLNKSSCYWKEIVHKTNEIMLVLSSFNSCLDPVMYFLMSSNIRKIMCQLLSRRFQGEASRSESTSEYKPGYSLHDVSVAVKV	17644	24770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_+_17748_18704_18798_23098
715798	contig_6544_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_142116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378465	379182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_378500_379200
715803	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
715804	contig_6117_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_167308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAAAAGGTATATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134630	132357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_132400_134600
715805	contig_18869_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_56253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGACACCCCGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73351	73605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
715806	contig_16187_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_101078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTCACTTAAAATAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65984	64838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_64800_66000
715807	contig_16187_pilon	-	913	7	Intergenic	novelGene_101073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTCCGGGAAGCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64838	53284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_53550_59845_59948_62052_62188_62312_62404_63110_63226_64555_64616_64693
715811	contig_8617_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_73432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATATGTCTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62506	62033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
715816	contig_7410_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_106106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	718	1020	427284	427586	NA	25	TGTTTATCATGTTTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVIRHGQEPAIGKAPRKSILRLIITTATIYMILIHRITFKASKSSPHLWTGNRLLRKFLSQSWHKSCLHTSLSHRKLEPGGVVILLTRPQQHRREVGL	426566	428072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_426600_428100
715818	contig_2069_pilon	+	1334	11	Intergenic	novelGene_23267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	329.079944694295	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	600	1067	341330	343619	TRUE	20	GTGTCTGCTGAATGCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQVPHQVDRPRGCPLWQIHHQVRRVVLRDPAH	324079	345517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_333946_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343527_343652_345282
715840	contig_14811_pilon	-	1250	3	Intergenic	novelGene_74469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	20	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	184	330	375397	357493	FALSE	30	CAAAGTGTCTCGATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGEAGPVAARRRCCCCWLLCRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVSRMKTLSTSLSLLVSPFSWNWMKTCMPLDLTSSWATRR	386590	356572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375370_375519_386528
715842	SIRV4	-	266	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1257	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
715844	contig_4232_pilon	+	915	5	Intergenic	novelGene_63214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1981.19854822781	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	61	699	146362	149463	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLQGEGNPFTPIAKQPPTPLDLPQIAFDLLIPLGLKQTNSPQAPPFGRGLYFF	146301	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087_149183_149307
715847	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715854	scaffold_19766_pilon	-	2487	12	Intergenic	novelGene_34289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	44.5627053795413	52	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	158	1036	433431	423818	TRUE	40	AAAAGGAAAATGCCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAESRADAAGCSASVRVAERAEVAEEAGRRQWLKGLRFERGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVIFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTSLVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGSASAPVQGSVPEGKPLRTLLGDPVPSLSAAASASNQSVSQSQARIAQPRSSQAPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQAAPAFAAFPAFAGQTPSHGGFANFDAFGSSPSSSTFGNIPPAGQAPFQAQPTPTGSSQVTPFGVSPLAPASQPNSLTDMSSILGPGVSAGGIPPHSVFGMAGPVPALQSATTGGSGGTGFAFGAFTNPFTAPAARPPAAFH	444468	420196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_421404_421755_421842_422623_422753_423788_423874_424063_424147_424376_424501_429374_429501_430421_430588_431159_431314_432416_432533_433377_433472_444351
715857	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715873	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715874	contig_2463_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_43013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAATTCCTACATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419432	418897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_418900_419400
715876	contig_3942_pilon	+	1669	2	Intergenic	novelGene_128707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	876	junction_1	0	13	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCATTTGACAAGTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427640	430176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_428587_429453
715877	contig_14666_pilon	+	2021	14	Intergenic	novelGene_39522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	90.1506956656136	2	45	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	305	1588	443672	448893	FALSE	15	AGGTATCGAGTCCGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTELFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	440761	449326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446215_446600_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448683_448769_448858
715880	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	30	-1	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
715881	contig_18081_pilon	+	641	4	Intergenic	novelGene_23776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.257460879121	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	59	421	104555	112338	FALSE	20	GCCTCAAATGTAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90647	112558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90655_104503_104681_108417_108517_112200
715882	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
715884	contig_4857_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_48885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACTTTTTATTACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409884	1411070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1409900_1411100
715889	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715892	contig_5954_pilon	+	1941	6	Intergenic	novelGene_28486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	539.101103690208	62	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	97	1701	344839	365383	TRUE	5	GGCTCCTGGTGCTTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAGRPGPASAPALVQLSAARLPAAGSPVSRNMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYSQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGMVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIADNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPNLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESQMPTQAVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLIPPSKRRHE	344742	367090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_345243_348617_348716_360707_361121_364255_364421_364858_365396_366862
715894	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715895	contig_9609_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_22972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATGGCTATTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285987	284206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_284886_284973
715910	contig_9186_pilon	-	1211	11	Intergenic	novelGene_85341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	70.6841566406504	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	5	1066	310847	274227	FALSE	15	TTTCTGCAGCAGCATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAAVHRLLVRALPMSRSGITAIATSVFHGPPRCQLHHAVMPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRPFLPYPLPHFAYKLIARLFEISPFEPWTTRDKMERTLAFRQHPWKPRPSRCCVIIARTAGCLLKWRM	310851	274081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274326_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_310798
715924	contig_17144_pilon	+	673	3	Intergenic	novelGene_29114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	479	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATCTGAGTTTGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5049	11939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_9615_11845
715927	contig_2933_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_111308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTCTAACCCAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267341	266815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_266800_267300
715928	contig_3956_pilon	+	2733	8	Intergenic	novelGene_14736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	15.8629333057044	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	1259	2575	475233	476549	FALSE	80	TAAAAATAAAGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARNLNTNQVEETSDCNSSLQVPSMYDKEPKITTNSNEKIQMRSACVNSSVKVQQDQLQLESDVKAGLHNVKSCLSVFTSKSYTSLGQLQSPSLNSPVDMQKQIKNGHLAFNTKSDSSTVGSGLVLVSTTISSVNHVSDMETNSALDCLPMLADWEDVALLPASQPKQNIDCILPISDSNLDTSFNSEEGLMVLKEPEMLGRENFGGTEEMPQKSETSKSVVYKSPHTTIYNVKKVKDPVSNVSAFKLPEPKSSTFNSVNANMSHSSILGKHPLLGSTKRKPSSPPAFPLVKKQTFTIHEEKPTSSDCSPVKSTSQKILPSVLTSTVNLQERWKSGKMTPPLCKCGRRSKRLVVSNNGPNHGRVFYCCPIGKYQENRKQCGYFKWEQTLQKERANNTVQSHSPGGLPFSSLKTSHISDRNVNFSTKNSLKLRPSMRS	467790	476707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_467924_469643_469712_469801_469886_470607_470736_472097_472255_473476_473578_473845_473928_474727
715929	contig_14322_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_116194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671576	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
715930	contig_17880_pilon	-	2085	8	Intergenic	novelGene_167320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	120.707269449521	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	7	1167	26807	15176	FALSE	30	TCTTGGTATAATCTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASSIRELHRCLLLALVAESSSQTLTQIIKCLANLVSNAPYNRLKLSLLTKVWNQIKPYIRHKDVNVRVSSLTLLGAIVSTHAPFPEVQLLLQQPCSSGLSNSSSATPRLSLPDWWKKAPSGSSLEETTINSPRNSSEPCWLVRLCISLVVLPKEDSCSGSEAGSATGSTYEASPMRLEALQVLAHLARGYFSMAQVYLMELGEVICKCMGEADPSVQLHGAKLLEELGTGLIQQYKPDSAIAPDQRVPVLLVVTFWTMMLNGPLPRALQNSEHPTLQASACDALSSILPEAFSVLPPSSLENDRQILCITLLLGLNDNKNRLVKAATSRALGVYVLFPCLRQDVIFVADTANAILMSLQDKSLNVRAKAAWSLGNLTDTLIINM	26813	14257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_15305_16659_16798_17566_17702_21255_21343_21743_21867_22702_23059_26218_26319_26714
715932	contig_10451_pilon	+	2241	2	Intergenic	novelGene_138308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	925	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCTTTGGCGTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144031	153687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_144683_152097
715933	contig_14970_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_45023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACGAAATCCAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168981	168782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_168800_169000
715937	contig_6098_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_145473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAGAAAGAATAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66360	68195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_66400_68200
715940	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
715941	contig_6677_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_114196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGGTATCTGTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572715	573808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_572700_573800
715942	contig_6677_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_114197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAAAGTATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573758	574962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_573800_575000
715945	contig_10940_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_49254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	155	367	874886	874674	NA	30	TCCAAGAACAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	875040	874040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874000_875000
715946	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_95709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
715948	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_96361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
715951	contig_4364_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_3733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
715956	contig_9752_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_122041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201323	198762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_198800_201300
715957	contig_12270_pilon	-	296	2	Intergenic	novelGene_114107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTTTCACCATCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
715964	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
715967	contig_233_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_14492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGCAAAGCCTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42719	41307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_41300_42700
715972	contig_16907_pilon	-	2134	2	Intergenic	novelGene_87459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	30	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	141	392	467716	467465	FALSE	30	AGGGGCTCCCAAGCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGCLRSGEVRKLSALSSRAAVWRLHHPDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGKQNQTAVSPNLDVNAQRIILMELWFPACGPQVLIVSCQQIGSDSWQP	474495	465722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_467773_474411
715974	contig_6710_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_89805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
715978	contig_8660_pilon	-	915	3	Intergenic	novelGene_136502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	15	GGCTTAGTTTCCTGTCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
715983	contig_16098_pilon	-	1246	8	Intergenic	novelGene_46106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1595.92812226258	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	134	1198	458816	456113	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGEAWPTASPAKESTPQAVRLGPQPANPSSSLTMPTKWRCSKAGPSTLQAPALSHTHSGGEGIIRGSRPLFPVTLATLVTLVRGVVCKC	460260	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456814_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
715984	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
715989	contig_7919_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_28138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	789	1115	1577506	1577832	NA	20	TTAAGCGCTTGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMQKAGNKEELVVGKYGFGDRNDTRGCVIEFCNTNDFFIANKYFFNNVNSDYTHGPHQTDHTSIKLTISVERYDEKAQYHQSEQGRGRLWNRPSTAHMQTQGEVEEN	1576717	1579079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1576700_1579100
715990	contig_8729_pilon	+	1935	6	Intergenic	novelGene_40114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	12.0233106921513	174	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	291	1403	423980	490356	TRUE	25	GCATTTTAGTCATTTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKLKQNLLLACLVISSVTVFYLGQHAMECHHRIEERSQPAKLESTRATVQTALDVKANKTFAYHKDMPLIFIGGVPRSGTTLMRAMLDAHPDIRCGEETRVIPRILALKQMWSRSSKEKIRLDEAGVTDEVLDSAMQAFLLEIIVKHGEPAPYLCNKDPFALKSLTYLARLFPNAKFLLMVRDGRASVHSMISRKVTIAGFDLNSYRDCLTKWNRAIETMYSQCMEVGYKKCMLVHYEQLVLHPERWMRTLLKFLHIPWNQSVLHHEEMIGKAGGVSLSKVERSTDQVIKPVNVGALSKWVGKIPPDVLQDMAVIAPMLAKLGYDPYANPPNYGKPDPKILENTRRVFKGEFQLPDFLKEQPQTEQVE	381161	493968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_381351_423878_424825_448566_448766_486781_486833_490338_490384_493463
715991	contig_10042_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_79240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAATAATCTTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193638	1194036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1193600_1194000
715992	contig_10042_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_79238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAACCCCCCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190356	1191476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1190400_1191500
715993	contig_6710_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_89135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCAATGTGCTACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
715994	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_18304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGGTACCCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
715998	contig_7718_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_129413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAGCTCCTCTAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294539	295299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_294500_295300
716004	contig_12270_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_113181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	30	380	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14438	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
716005	contig_8476_pilon	-	2204	3	Intergenic	novelGene_121353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	456	junction_2	80	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	696	1025	209623	206135	FALSE	45	GCCTAGTTATTAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGTSRARSPRSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRGAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYSFVQQLTERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRSVHYHFTAGF	210318	204955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_206241_208667_208740_209471
716018	contig_7398_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_166187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTGGTTTTAGGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388657	386398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_386400_388700
716020	contig_7457_pilon	-	2238	12	Intergenic	novelGene_31321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	78.6139221787756	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	194	958	268463	263970	TRUE	30	CTTCTTTTTAAAGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGSRQQADGREDCTEGGSEPAVSEPARAAVSRGQPRFPPPFWPPPRSPQRLRSPAERTRPGPAMASLLKVDQEVKLKVDSFRERITSEAEDLVANFFPKKLLELDSFLKEPILNIHDLTQIHSDMNLPVPDPILLTNSHDGLDGPTYKKRRLDECEEAFQGTKVFVMPNGMLKSNQQLVDIIEKVKPEIRLLIEKCNTVKMWVQLLIPRIEDGNNFGVSIQEETVAELRTVESEAASYLDQISRYYITRAKLVSKIAKYPHVEDYRRTVTEIDEKEYISLRLIISELRNQYVTLHDMILKNIEKIKRPRSSNAETLY	268656	262261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_262923_263350_264051_264699_264787_264908_264964_265061_265130_265265_265335_265570_265684_266212_266262_267146_267252_267508_267572_267690_267724_268421
716025	contig_9505_pilon	+	1402	13	Intergenic	novelGene_121833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	237.693240099269	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	68	721	482124	597995	TRUE	40	GCAGGATTTTCAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDESFLGKLGGTLARKKRAKEVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	482056	632870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_482194_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632257_632353_632605
716029	contig_6195_pilon	+	2057	12	Intergenic	novelGene_71024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	156.314632913269	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1956	102	2057	94415	135401	FALSE	65	GAAAGACACAATGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDRALGPSSGRRLRPGSPSPVPWRRWWRGKSKMRTATAAAGICASWIRACGGLIPLHGIKHKLRHIDLHSNCIDNIHHLLQCMIGLHFLTNLILEKNGDDNPVCHIPGYRAIILQTLPQLRTLDCKNIFGEPVNLSEINLSHLQCLEGLLDNLISSDCPLNISEEETVDSMPVVTTNVDQLVPLDQFACTPTDTALTSVDSVCPSSEPEKINHENDFQNEMKLQKIDDQISQLLTESLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSCLQERDEDIKTLQEKISEIQKCTQEQLEEKSSQLDVVIEKL	94313	135401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_102785_102954_104900_105077_105171_105382_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_131449_135278
716030	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
716032	scaffold_13505_pilon	+	2017	4	Intergenic	novelGene_111562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_2	82.9671956592216	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGTGGTCTCATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608571	635984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610099_623354_623423_635129
716043	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
716044	contig_7887_pilon	+	2203	4	Intergenic	novelGene_124927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	119.973145143218	64	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	62	1180	578008	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCPDSDKSWVLAGSEEPGSGFLEQKEQLEAEAQGLRQELERQRRLLGSVQQDLEQSLREAGQGDPAHSGLAKLSHRLAQKLQDLESWGQDPGTPANASGAWGQELHFQSSRERSGKEKWWGGQGNRKAEHWKHKKEGSGGERKSWESEKDREQTRKRKEGKLRVQEWEDKDGKPQGPREPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	575204	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_575232_577973_578059_584147_585122_585612
716046	contig_4759_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_106352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985482	986749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_985500_986700
716052	contig_10732_pilon	-	2434	10	Intergenic	novelGene_114671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1617	1955	131217	126744	TRUE	5	AGCTCCGTCCCGCGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVIPIIFWDLKGFVFYALIQIPQELLGQVPPVVDAAVHGDEPLYRGLVFDIGVMQAGVQHDDGKGQDVTSLPVDWNTPLLHWQYRWANASIIRSIFCASPGNRKLHRNCL	134900	47558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_47621_118289_118375_120068_120134_125783_125851_126162_126285_126665_126747_128086_128207_130564_130711_131147_131260_133326
716058	contig_1932_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_167342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137424	136087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1932_pilon_-_136100_137400
716059	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_94869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716061	contig_9843_pilon	-	2218	10	Intergenic	novelGene_114341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	27.7448693955797	65	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	201	1340	302693	259346	FALSE	40	TAAAGATAATCGTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQDQK	305711	258467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_259358_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_304403_304509_305624
716068	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_93661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716076	SIRV6	+	802	6	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	5	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3110	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10721_10819_11031_11109_11205
716080	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716089	contig_8138_pilon	+	1643	5	Intergenic	novelGene_52426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	215	670	280295	306552	TRUE	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280080	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306940_307351
716094	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716099	contig_9373_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_162734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGACTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319614	320554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_319600_320600
716100	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716105	contig_4083_pilon	+	1045	7	Intergenic	novelGene_152337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	109.053503688174	1992	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	237	788	323237	329750	FALSE	20	AATCTGTGTCCCTAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKKFATVTSEESWKRERELLQEKKNRDRPTREHTTSSSVSKKPRLDQIPAANLDADDPLTDEEDEDEDFEEESDDDDTAALLAELEKIKKERAEEQARKEQEQKAEEERIRMENILSGNPLLNLTGPSQPQANFKVKRRWDDDVVFKNCAKGVDDQKKDKRFVNDTLRSEFHKKFMEKYIK	320410	330007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_320494_322191_322331_323222_323337_324449_324539_325623_325738_328878_328998_329620
716125	contig_11370_pilon	+	1419	8	Intergenic	novelGene_98751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.3809887313598	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	196	1044	154251	155741	FALSE	30	CAAATCTGGAGCATTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	152572	156116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_152767_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
716139	contig_12623_pilon	-	2788	7	Intergenic	novelGene_138160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	141.136655605677	427	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	12	1037	177710	51811	FALSE	20	GACATATGATTTGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177721	50059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_147430_147540_177617
716145	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716149	contig_14441_pilon	+	741	3	Intergenic	novelGene_100784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	138	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	153	701	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125514	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
716151	contig_8317_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_20096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16432	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
716156	contig_6870_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_103932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	336	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	371	1116	4	1119	1158104	1159219	NA	25	TAATCACTTCTCTGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASSASPRTSSGKRVVNQDELRRLMKEKQRLSTNRKRIESPFAKYNRLGQLSCALCNTSVKSELLWQTHVLGKQHREKVAELKGAKEATQGLSASAEPHSVKRKAPDADSQDAKRATASTVPQVQPSTSALPTNFAKTGKESTEAIASKPSRLGLLLDYEDEEEDEGEEEGEEGKKEDASKVPPDAQGKEHSLASSRETTASVLPNDFFDTNPPKAPLIPHSGSIEKAEIHEKVVERRENTAEALPEGFFDDPEVDARVRKVDAPKDQMDKEWDEFQKAMRQVNTISEAIVAEEDEEGRLDRQIGEIDEQIECYRRVEKLRNRQDEIKNKLKEVLTIKELQKKEEENVDSDDEGELQDLLSQDWRVKGALL	1158100	1159681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1158100_1159700
716157	contig_14516_pilon	-	2087	10	Intergenic	novelGene_153934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCCGGGCCAAGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419165	316987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_317156_361652_361758_365815_365950_378663_378798_387105_387174_388338_388414_391021_391102_394145_394351_416429_416565_418182
716158	contig_5935_pilon	-	1620	6	Intergenic	novelGene_102715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	30.4197304393053	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1521	100	1620	1049311	1028678	FALSE	20	ACATCTGTGGCCGAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVAAHSCHLLQQLHEQRIQGLLCDCMLVVKGVCFKAHKNVLAAFSQYFRSLFQNSSGQKNDVFHLDIKNVSGIGQILDFMYTSHLDLNQDNIQVMLDIAHCLQVQNVLNLCHTFLKSTTLDQPPGIPCNSTFSPQSALTPDANCVINENYPPQLLQECSPDAQHNKVADEPHSSAAPSVNLHNSSGEIPKQAPDTLDSSCTELPFKQPNYYYKLRNFYSKQYYKQATCPNHERIIEQPFAFSTSTDLNAVENPPCAVSHPECILESSEHLPSNFLAQPLSESAPDPESDCTCPQPAKQMRLKKAIHLKKLNFLKSQKSAEQTSEPKSNDDVTKRIGSTSENLIEKASSQSTEEKESEELASSENFSCMNETERLEDPAVLEDQSQALQSQRQYACELCGKPFKHPSNLELHKRSHTGTPIQYSQAEGKEVMQSQTPLPALFFVRNLLNVTFVGNISLRQVTCRLTYVGILVKNRTSARSVERGLPPLGTSSVTSSSTQEKNHTCA	1057449	1028677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1028746_1030987_1031062_1041487_1041535_1045113_1046294_1049159_1049331_1057369
716163	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_94812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716168	contig_13744_pilon	-	2615	1	Intergenic	novelGene_77186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACACTATGAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726280	723665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_723700_726300
716170	contig_8628_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_164413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384298	386650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_384300_386600
716173	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716178	contig_9017_pilon	-	2312	4	Intergenic	novelGene_130331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	45.2621990922521	302	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	248	589	218109	217768	FALSE	25	TAGTGGAGCATCAGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSTLVLTYPRRGNHYYTFTNLITISRRFKQHYKPMIVWILQVYDRGGQALSLNSEELVILGRLTGDTLFNCYCQTLQGGCQLLLTWLVRAWCLRDAPMALGHPGGRHIAGA	224349	216044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_218126_219573_219605_220072_220192_224268
716181	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716182	contig_12142_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_147836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	6	308	203622	203924	NA	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAKRFASRLRGSRRFLSGFAAGAVVGAAGAGLAVLQFLRSHGPEAASAVREPDGKAAVCFPFAPAFPPRAWSGTMDALPSPTFFWGHRAFLHRALCSPK	203616	204858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_203600_204900
716183	contig_14158_pilon	+	1537	5	Intergenic	novelGene_136121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	117.559293550106	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	41	511	18010	25162	TRUE	10	CCACTGTTCCTGTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	17969	26471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21301_24096_24236_25090_25893_26175
716185	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
716187	contig_9186_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_85360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634703	636007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_634700_636000
716190	contig_854_pilon	-	1819	6	Intergenic	novelGene_36135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	238.481361955185	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	53	733	509201	471108	FALSE	0	GCCTGGGGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGFLSRLHRQLTVCPLLRHASSLVLGKQRAWNTDVLAPLGATAISQSPPWMLGTGTTPTPPGWQKQSQCGTPTVVNWPASSSPGVSSPRKARIALGLPQGALGWRASTCLLSRGRV	509253	470021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471455_491455_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
716191	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
716192	contig_3721_pilon	+	2596	1	Intergenic	novelGene_123790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49436	52032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_49400_52000
716198	contig_7744_pilon	+	2115	18	Intergenic	novelGene_62553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	230.30719668367	2	87	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1111	1680	889342	890785	FALSE	20	TGCTAAAAGCGTCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879808	891220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885362_886865_886943_887134_887194_887353_887446_889021_889133_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
716199	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716200	contig_15063_pilon	+	1124	4	Intergenic	novelGene_13792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3105.72288954869	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	200	703	34808	35888	TRUE	35	TCCAACAATTATGTCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	34608	36418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35844_36158_36266
716202	SIRV1	-	121	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3688	-108	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGTTTGTGAGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6678	6557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
716206	contig_1262_pilon	+	2881	1	Intergenic	novelGene_133540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12951	15832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_13000_15800
716210	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_90553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716213	contig_709_pilon	-	1332	8	Intergenic	novelGene_57654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.963723531711	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	59	1033	3772541	3764733	TRUE	20	TGTTGGATGTTTTTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSNEFKLNQPPEDGISSVKFSPNTSQFLLVSSWDTSVRLYDVPANSMRLKYQHTGAVLDCAFYDPTHAWSGGLDHQLKMHDLNTDQDNLVGTHDAPIRCVEYCPEVNVMVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPK	3773011	3762199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3762499_3764732_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806_3769959_3771705_3771776_3772346_3772542_3772953
716218	contig_18735_pilon	-	1927	12	Intergenic	novelGene_132681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	189.671878483879	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	676	1836	86559	65731	FALSE	70	AAAAAAAAAACCTTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTKEKDQLSKSIIMYRSLFEASKQLLDEMKCQVEEAKLKEAQLRNELKAHNIDIPATQQMTHIEALLKRKVTEQEELKKKPRRSCTLPNYTKGSADVLGKIAHLAQIEDDRAAMVISWHLASDMDCVVTLTTDAARRIYDETQGRQQVLPLDSIYKKTLPDWKRPLPHLRNGKLCFKPIGDPIFARDLLTFPDNKEHCETVFGMLLGDTIILDNLDAANHYRREVVKITHCPTLLTRDGDRIRSNGKFGGLQNKAPPMDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRSVHCDLVAIIG	93494	65639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_65880_67037_67197_71407_71580_77769_77841_78099_78210_81403_81595_84587_84711_85317_85404_86459_86580_86748_86876_91897_92051_93119
716229	SIRV6	+	290	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	212	-4	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTAACGTTTCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
716231	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	22	357	14385	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14406	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
716237	contig_13937_pilon	-	2247	16	Intergenic	novelGene_167352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	69.1385083244738	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	75	1880	62067	35956	FALSE	70	GAAAACTTAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICKLGFEVVENRDINSIVTENGEVCWKTITECVSFTESDQSLDYQGSVRRLGPLCEAVHLHFSSLTKAQFEIRYAPWFQWTNFPELFPEIFDALESLQSAAISLSLTKLTSCLERALGNVFLLVGKECPFLLRDLLASDELAQVFGQPVMDVLKVFVGSPSGLNLRNVLWHGFAAPQEIPPKYCSVMVLLTAGLGQLLKRFLRQTNRTLWHRSFLALTNLEDWIVFPDVTSEALSVLEDVMKKSTFVFKTMLPYWEAAVIKFRSHRFADCVILLLTQLEAGLRRAFATVNRCPQRLLTAESTVLYTTFDEMLAKELNDGTINQLPLLLGEPVMEFLWDFLNHQEGPRIRDRLSHGEVNLNEFPGEAANQLLAFSTVLLLRFTSGDVVSVLKEKAAIKSLISIAEGYSSHFHPASQLKKQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGRCGSRALGKPSGTGSYLGRQFLKIFTLRSSYLQGKLWYILQ	64447	35588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274_45449_47031_47101_48570_48601_50572_50676_54171_54287_54957_55095_55517_55616_57597_57688_57975_58078_59681_59822_61949_62119_64424
716239	contig_3077_pilon	-	1336	2	Intergenic	novelGene_26892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTAAAGCAGAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503294	1500348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1501627_1503236
716250	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716255	contig_7887_pilon	+	627	6	Intergenic	novelGene_124899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	91.5742321835133	329	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	193	603	375247	378486	FALSE	10	TCGTTGTAGTTGTGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGTGTSLALSSLLSLLLFAGMQMYSRQLASTEWLTIQGGLLGSGLFVFSLTAFNNLENLVFGKGFQAKIFPEILLCLLLALFASGLIHRVCVTTCFIFSMVGLYYINKISSTLYQATAPVLTPAKVTGKGKKRN	374647	378510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_374686_375092_375251_375570_375726_375862_375927_378067_378135_378365
716256	contig_10341_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_47219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1215	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAGCTGTGTTATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63702	65372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_64154_64484
716265	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_89217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653717	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716266	SIRV5	-	443	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGATGTCCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
716269	contig_18794_pilon	-	1442	6	Intergenic	novelGene_54660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	105.331856529732	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	150	731	333066	325647	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404627	324935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_404550
716271	contig_16907_pilon	+	2191	5	Intergenic	novelGene_87486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	22.3215142855497	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1517	1987	536965	540528	FALSE	20	TGAAGTTATTTATTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLTLGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	530265	540732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_530297_535479_537121_539149_539243_539756_539907_540456
716278	contig_9720_pilon	+	1194	3	Intergenic	novelGene_116789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	713	junction_2	258	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	44	448	391741	392457	TRUE	15	TGCCTGCATTCTGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391697	393998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392089_392400_392465_393259
716280	contig_2987_pilon	-	2018	5	Intergenic	novelGene_125850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	101.450418924714	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	515	1207	511486	507993	FALSE	45	AATTGAGATGCACTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKNIVPKLGMCLGELVINPHQQHMDAFYWVIDWEGMISVSSLVGLLEKHFFPKWLQVLCSWLSNSPNYEEITKWYLGWKSMFSDQVLAHPSVKDKFNEALDIMNRAVSSNVGAYMQPGARENIAYLTHTERRKDFQYEAMQERREAENMAQRGIGVAASSVPMNFKDLIQTKAEEHNIVFMPVIGKRHEGKQLYTFGRIVIYIDRGVVFVQGEKTWVPTSLQSLIDMAK	524063	507181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_508349_510118_510285_510773_510917_511458_511498_523560
716281	contig_8045_pilon	-	1731	11	Intergenic	novelGene_35424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_10	163.138468792618	402	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	111	1100	434645	380007	FALSE	20	CTTAAAGTGTTTGGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGNAGEWCLMESDPGVFTELIKGFGCRGAQVEEIWSLEPENFEKLKPVHGLIFLFKWQPGEEPAGSVVQDSRLDTIFFAKQVINNACATQAIVSVLLNCTHQDVHLGETLSEFKEFSQSFDAAMKGLALSNSDVIRQVHNSFARQQMFEFDAKTSAKEEDAFHFVSYVPVNGRLYELDGLREGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEKRIQKYSEGEIRFNLMAIVSDRKMIYEQKIAELQRQLAEEEPMDTDQGNNMLSAIQSEVAKNQMLIEEEVQKLKRYKIENIRRKHNYLPFIMELLKTLAEHQQLIPLVEKAKEKQNAKKAQETK	434755	379375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_380052_388099_388199_390871_390986_392296_392400_399315_399380_401391_401523_401905_401968_402049_402176_413301_413408_414824_414889_434569
716282	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
716286	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716291	contig_3774_pilon	-	1359	12	Intergenic	novelGene_142035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	104.696175938753	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	771	1166	167949	144743	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210495	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175059_175133_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
716292	contig_10494_pilon	-	2203	15	Intergenic	novelGene_102197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	30.1276197099564	2	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	541	1365	1076549	1064899	TRUE	0	GCTCTGTTGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRFYEEFPINLKTGEANLTQIYLQEALDFIKRQQSQHRPFFLYWAIDATHSPVYASKPFLGTSQRGRYGDAVREVDDSVGQILQLLRGLRIAEHTLVFFTSDNGAALVSAPKQAGSNGPFLCGKQTTFEGGVREPAIAWWPGHIPAGQVSHQLGSLMDLFTTSLSLAGLEPPSDREIDGLDLLPVLLQGKLIDRPIFYYRGNELMAATVGQYKAHFWTWTNSWEEFRQGINYCPGQNISGVTTHTQEEHTSLPLLFHLGRDPGERYPLSLSF	1082954	1060359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1060742_1060952_1061291_1064780_1064912_1065985_1066108_1070255_1070359_1071258_1071396_1074273_1074378_1074978_1075119_1075310_1075439_1075514_1075582_1076538_1076683_1078185_1078290_1079044_1079120_1080318_1080443_1082850
716294	contig_12019_pilon	+	777	3	Intergenic	novelGene_87676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	106	414	5225	6248	TRUE	55	TCAAATAAACATGAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKGKESVGS	5119	8650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6250_8288
716306	contig_12977_pilon	+	1495	13	Intergenic	novelGene_122781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	689.102974686819	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	240	1121	37085	57283	TRUE	35	GGAATAAAGAAGTGCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATRCCCSGCWMVGRCAKTWRTCCGRGPKRRSDTARSWCRSPGRQAARRRSSPSGLTSPYSAPEIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10699	58775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_47222_47366_49465_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
716307	contig_4364_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_1045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
716309	contig_16970_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_157617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTCATTCTTTAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203296	204698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_203300_204700
716322	contig_6230_pilon	-	2260	2	Intergenic	novelGene_102095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAGTAAAGTTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129516	117846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113
716323	contig_1154_pilon	+	1901	4	Intergenic	novelGene_87209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	8.83176086632785	374	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	7	435	1169144	1175708	FALSE	5	TGATGCTTTTGTCCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMGVCHAGCLCMQDPGPCQEVGRTGRSCSPQEDDEGAACPAEDELALQDNGFLSKNEVLRSKVSRLTERLRKRYPTNNFGNCTGCSATFSVLKKRRSCSNCGNSFCSRCCSFRVPKSSMGATAPEAQRETVFVCASCNQTLSK	1169137	1177174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1169379_1173544_1173592_1173964_1174047_1175643
716327	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_17666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27843	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
716334	contig_8476_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_121327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68935	66810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_66800_68900
716336	contig_3584_pilon	+	1423	8	Intergenic	novelGene_108162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	14.379690893899	265	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	20	1093	482440	498574	FALSE	15	TTTGAACTGTAGTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRHLKKRAQDAVVILGGGGLLFASYLTAVGDEHFYAEHLMPALQGLLDPESAHKLAIRFTSLGLLPRATFQDSDMLEVRIMGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLFKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAIINRYGFNSHGFSVVEHRLRARQQKQTKLSEDGLLLGINLGKNKMSVDAAADYTEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAKLHHLLTKLGIDGLIVTNTTLSRPASLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGACLVQLYTALTYWGPPVVGKVKHELEALLKEQGFSSITEAIGADHRR	482420	498904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_482461_484970_485184_487766_487967_490200_490284_495888_496077_497541_497696_497806_497967_498519
716339	SIRV6	+	373	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	406	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
716345	contig_11933_pilon	+	1465	5	Intergenic	novelGene_107244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	90.9982829508338	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1029	1355	91153	91479	FALSE	15	CTTACGTGGAGTTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQSAQRKDKNSFKIQSSQFGRVYDYARVCLCFCIVREVHSIFWLSDGLISSLPPPQLSFCNVFPTWRSLELSIWHSCLLCSLILQQTPSDLLTQNQTRPPTLWHIQ	82806	91589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_83058_85042_85091_85207_85325_86106_86319_90752
716350	contig_9995_pilon	-	1521	9	Intergenic	novelGene_47658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.9175664887388	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	43	981	141594	120161	FALSE	30	TAATAGTGACATGTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTSPSLTAARVSKMEGALLALFALRLLLLLALPTAGWLTTGVSEPLSQAPKDSIRVNVTTLTDDGQVSKEQVVLNITYGSGQVYVNDFPVNNGVTRISCQTLIVKNENLENVEEKGYFGIVSVRILVHEWPMTSGSSLQLIVIQEEVVEIDGKQAQQKDVTEIDILVKNQGILRHSNYTLPLEESMLYSLSRDSDILFTLPNLSRKESAGSLQTTSQYLIRNVETTIDEVALPGKLPETPLRAEPPSSYKVMCQWMEKFRKDLCRFWSIIGAAVVITVLKVLFPACEYKGILQLDKMNVIPVTAINLYPDGPEKKAENLEDKTCI	141636	119620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_120273_123666_123728_123775_123831_125378_125510_126524_126682_127651_127804_136103_136201_136370_136431_141480
716351	contig_854_pilon	+	1873	15	Intergenic	novelGene_36442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	450.152649845878	1	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	109	1749	1453661	1465350	FALSE	15	AGTCTCTTTCCTTTATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451222	1465474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457306_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460075_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
716354	contig_5649_pilon	+	1835	7	Intergenic	novelGene_82274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	196.402364774177	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	56	829	25982	34768	TRUE	35	ACCCAACCACTGTCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	25926	35841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645_35065_35131
716355	contig_5620_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_161362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATGCTCTGTTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428460	427302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_427300_428500
716356	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	383	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
716359	contig_9363_pilon	-	2000	2	Intergenic	novelGene_6671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	305	junction_1	0	401	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	227	1123	1077971	1074222	FALSE	15	TTTCCGTGTAGCTGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGGEGDAGEQAPLNPAGDSPAASATYREFVHRGYLDLMGASEHSLRALSWRRLYLSRAKLKASSRTSALLSGFAMVAMVEVQLESNHEYPPGLLVAFSACTTVLVAVHLFALMVSTCLLPHIEAVSNIHNLNSVHQSPHQRLHRYVELAWGFSTALGTFLFLAEVVLVGWVKFVPIGAPLGTPAPVVPASQVPGTLPPVATSLSPASKLPPSPDSVAPSQAGSSEACPPRQVCGGGGGAHGPGWQAAMASTAIMVPVGLVFMAFALHFYRSLVAHKTDRHKQELEELSRLQGELQAV	1078197	1073344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1074891_1077743
716360	contig_1813_pilon	+	1346	3	Intergenic	novelGene_105487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224.5	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113679	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_113838_128312_128369_155169
716373	contig_14647_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_167377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAAAGCCAAAGAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124837	127103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_124800_127100
716374	contig_9653_pilon	-	1624	2	Intergenic	novelGene_48287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATGTTAAATCACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006796	1005045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006128_1006254
716375	contig_17427_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_30390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGGGGAAAAAACCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197038	198442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_197000_198400
716376	contig_4125_pilon	+	2359	2	Intergenic	novelGene_25085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533214	535988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_534800_535214
716377	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_97121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1	387	657538	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESLCSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657538	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716378	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	110	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716379	contig_11335_pilon	-	1185	2	Intergenic	novelGene_104941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	100	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAGATGGAATCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451504	447107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_448203_451414
716387	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716389	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716390	contig_4857_pilon	+	1636	6	Intergenic	novelGene_48839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.08491479939	11	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATATGTCCTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1411060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1336702_1336828_1405453_1405556_1407013_1407076_1409428_1409547_1409988
716397	contig_13542_pilon	+	2368	12	Intergenic	novelGene_131465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25.2962611159492	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	788	1486	98824	157653	FALSE	35	ACTACCACTCATTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAATIIGSAGAAALGSVAGIAVMTSLFGAAGAGLTGYKMKKRVGAIEEFTFLPLTEGRQLHITITITGWLASGKYRTFIAPWAALARSREQYCLAWEAKYLMELGNALETILSGLATMVAQEALKYTVLSGIVAALTLPASLLAVANVIDNPWGVCLHRSAEVGKHLAHILLSRQQGRRPVTLIGFSLGARVIYFCLQEMAQEKGQRPFGLCQEDGRHPEGCGHPHQARLG	39579	158535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_39602_55460_55572_56310_56501_69679_69855_87806_87963_97444_97543_98788_98933_99790_99911_106490_106656_107573_107711_111055_111141_157570
716403	contig_7426_pilon	-	3396	1	Intergenic	novelGene_27561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	448	801	1171806	1171453	NA	65	AAAAGAAAAAAAAGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKEYYRRGKNGETDNHAATAMSAQVQRILQNTQEWENGQACCYSHVCPESKEQLQSHQYLLTLQMGKTFESLAFSRWLETVIMHFELSFLTIIGTGFRNESQESLYWSNKFLFTKC	1172253	1168857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1168900_1172300
716404	contig_348_pilon	+	1584	7	Intergenic	novelGene_67598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	10.7458002132099	181	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	17	1159	314485	345268	FALSE	35	AAAAACTGTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLARRAVPALRKGLFPARRPLGAGGERRPVSLSTCTSRDSGGGGGSTREQLSLQDVAELIRTRACQRLVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEKPEVNLCCPLRPPRQAMGCWSLSGVPCPPRDARFLSGAFQVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314468	345693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342659_342990_345214
716409	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
716412	SIRV7	-	257	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91669	0	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
716418	SIRV6	+	386	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	494	-2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
716422	contig_12080_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_128351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATATTTTCCTTTACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61254	62007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_61300_62000
716431	contig_3202_pilon	-	2909	1	Intergenic	novelGene_167390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTGGGGCATAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21028	18119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_-_18100_21000
716434	contig_6710_pilon	-	482	2	Intergenic	novelGene_98074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	TCCCCCCTTCTCCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716435	contig_10312_pilon	+	1595	7	Intergenic	novelGene_159035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_2	29.6348143611905	195	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	102	1490	625757	642192	FALSE	10	TTTCTATTGTTTTTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVNLELDPIFLKALGFLHSKSKDSAEKLKALLDESLARGIDSGYRPSPKDVEPPKISSTKTVSIKQEPKTSSSLPSGNNNGKVLTTEKVKKEAEKRPADKIKADISEGVDVPKKPRLEKPETRSSPITVQTSKDLAMADLSSFEETSADDFAMEMGLACVVCRQMTVASGNQLVECQECHNLYHQDCHKPQVTDKEVNDPRLVWYCARCTRQMKRMAQKTQKPAQKPAPTVVSVAPAVKDPLVKKPETKLKQETTFLAFKRAEVKASPVISGNSSSTSISSSAASGLTGWAAFAAKTSSAGPSTAKLSSTAQNNSGKPTTSSANQKPVGLTGLATSSKGGIGSKLGSSNSTTPTVPLKPLPPLTLGKTGLSRSVSCDNVSKVGLPSPSSLVPGSSSQLSGNGNSGTSGPSGNTTSKTTSELSSSSSASLKGPTSQESQLNAMKRLQMVKKKAAQKKLKK	620110	642297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_620203_625747_625913_630661_630815_632724_632913_634403_634564_637638_637786_641607
716444	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	175	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
716450	contig_11017_pilon	+	1195	10	Intergenic	novelGene_128082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	653.392703273734	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	168	662	233889	285534	TRUE	0	TTCTCTTTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPKPVKPGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKAS	233721	295075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285526_285552_294559
716454	contig_8801_pilon	+	2161	10	Intergenic	novelGene_66329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	139.902964608234	345	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	379	696	938911	940089	TRUE	30	GATGGAGATTCCTATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILTFIKSCQHESGGISASIGHDPHLLYTLSAVQILTLYDSINAIDVNKVVEYVQSLQKEDGSFAGDIWGPTKQLV	936729	944881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_936839_938220_938481_938901_939100_939696_939803_940066_940189_940884_940938_941018_941130_941760_941871_942886_943037_943939
716458	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
716459	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
716461	contig_5947_pilon	-	2179	4	Intergenic	novelGene_101546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_3	70.5706895405041	79	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	119	472	589186	584658	FALSE	85	AGTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQNYPLLLLTLLEKSQDNVIKVCASVTFKNYIKRNWRIVEDEPNKICEADRVAIKANIVHLMLSSPEQMQKQVTHSSAF	601463	582950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_584784_586374_586518_589101_589198_601356
716468	contig_8761_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_167398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGGCTGCTTGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8632	9957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8761_pilon_+_8600_10000
716472	SIRV4	-	268	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
716476	contig_1516_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_49931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131865	134496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_131900_134500
716479	contig_2069_pilon	+	1609	12	Intergenic	novelGene_23256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	271.240066276572	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	867	1424	341330	345332	FALSE	20	GTGTCTGCTGAATGCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGSQEMCVHCLAHSENG	324003	345517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332991_333888_334103_334697_334801_335607_335711_339011_339107_339558_339709_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_345282
716484	contig_5643_pilon	+	1504	5	Intergenic	novelGene_38739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_2	312.551595740607	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	173	652	152580	155957	TRUE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAESKLQATLCPVI	152407	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_156206_156463_156584_156823
716485	contig_2710_pilon	-	2215	4	Intergenic	novelGene_161804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	5.24933858267454	104	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	217	1380	1150701	1149538	FALSE	35	ATCTCTATAAAGATTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIEEQFANLHIVKRSSENKEPTYLLGIDTSKTVQAEKGSLVAVLCSNGSIRIYDKERLNVLREFSGLPGLLNGVRFANSCDSVYSACTDGTVKCWDARLASEKPVQLFKGYPSNIFISFDINCNDHVICAGTEKVDDDALLVFWDARINSQDMSTVRDPLGTYSETHSDDITQVRFHPSNPNMVVSGSTDGLVNVYDIGVDDEEDALVTTCNSVSSVSCIGWSGKDYKQIYCMTHDEGFCWWDLNHLDTDEAITRLNIQDVREVVNVKEGILDYLIGGLYHEKMDKLFVVGGTNTGRIQLLSCTPSGLNHVMSLQGGHAATVRSFCWNTQDESLLTGGEDAQLLLWKPGAIEKTFTKKDSMKIASSVLQRMRVHSNDSYKRRKKQ	1193054	1148702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1150733_1161853_1161926_1162284_1162341_1192997
716489	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27844	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
716491	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
716492	contig_7080_pilon	+	1621	10	Intergenic	novelGene_100098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	899	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	64	876	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460818	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540921_541788
716493	contig_6199_pilon	+	1438	2	Intergenic	novelGene_126419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCACCTAGTGGTAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717066	726140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_717868_725503
716496	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716500	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716510	contig_13258_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_146932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	729	1043	136242	136556	NA	30	TTTTGTAATTTTTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQFLLLLPDSQGRLLSRRNLLRVEKFNVLCILLLRSCLNYEQGALGGAAVKALGCEPKGWRFEPTSRSVGEKTWRSASVKITALETLWGSSTPSCRVTMSWN	135513	137879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_+_135500_137900
716511	SIRV1	+	261	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6454	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
716515	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_96011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716518	contig_8330_pilon	-	1653	7	Intergenic	novelGene_71978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	354.796655376945	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	235	687	2056301	2039848	TRUE	30	TCATTTCTTAAATGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKVLYVFFGVYVLSPGSRAPSASEVQHGV	2056535	2038190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039931_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056297
716521	contig_6871_pilon	-	2404	6	Intergenic	novelGene_21634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	49.3177452850391	22	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	658	1398	663492	657382	FALSE	25	CATGCTTTCGTATATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKRAKKETVDPTYVWIGPNENKLTGNNRINITNTGKLMVKDFLESLSGPYTCTFSYKSVKAETQEEKTVKKTYEFIMFAYREPDYSYQMAVRFTTKSCVGRYNDLLFRVLKKILDNLISDLTCHVIEPSYKCHLVKIPKHGLIHELFIAFQVNPFAPGWKAACNQSVDCEDNTNRNILQARDRIEEFFRSQAYIFYHDLNKTLPAMHFIDHSFQVVRMDSCRPGFGKNEAMHSNCASCCGNYEI	665117	656375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_657580_660195_660279_660817_661037_662595_662758_663413_663540_664507
716524	contig_3942_pilon	+	525	5	Intergenic	novelGene_128648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGGACTGATGATGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176958	180107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_178345_178490_179045_179177_179714_179825_179974
716525	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
716527	contig_5816_pilon	+	1735	2	Intergenic	novelGene_158244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTAAAAGAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206195	207994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_207658_207721
716528	SIRV5	+	444	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-114	875	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8201	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
716530	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_89524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716531	contig_14868_pilon	+	1407	11	Intergenic	novelGene_150460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_4	84.8754970530365	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	358	1407	209016	252472	FALSE	50	GTAAGAGATGACAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQ	202453	252472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
716540	contig_19145_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_164139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85757	87956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_+_85800_88000
716543	contig_12427_pilon	-	2312	17	Intergenic	novelGene_40402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACGATAAACATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60523	6187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_6283_33629_33735_36188_36291_37392_37498_39301_39378_43866_44044_46431_46504_48979_49059_50696_50766_51043_51165_52615_52745_55687_55770_56458_56701_56997_57076_57994_58126_58843_58917_59947
716545	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716546	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716549	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716551	contig_15039_pilon	-	1940	10	Intergenic	novelGene_110120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	484.763656299785	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	483	1166	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260873	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198673_200448_200620_201172_201244_202795_202857_208401_208526_222093_222255_260825
716553	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_89292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716558	contig_13700_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_68289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACTAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139603	136928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_136900_139600
716566	SIRV1	-	175	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3929	0	3655	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6711	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
716568	contig_15123_pilon	+	711	3	Intergenic	novelGene_110893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	465	junction_2	52	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	157	705	24696	28950	FALSE	35	ACATTTAAATACTTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQKALTTPTHYKLTPRPATRVRPKALQSTGTAKSHLFDGLDDDEPSLANGAFMPKKSIKKLVLKNLNNSSLFSPVNRDAEDLASPSDYPENGERFSFLSKRVDENHQQDGDDDSLVSRFYTNPIAKPIPQTPESAGNKHNSSSSVDDTIVALNMRVALRNGLEGSSEETSFHDESLQDDREEVENNTYHMHPAGEILIGTWLISYQLLAISFVTDFQHSESQLSELLNIVYCIL	24539	28956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_24704_26366_26484_28526
716569	contig_20819_pilon	-	2114	8	Intergenic	novelGene_55702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_7	34.3499398448809	112	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	85	1482	123685	121091	FALSE	10	CGCCCCACTTGCAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSLGAPHWVAVGLLTWAALRLLVAGHGGHGDLHDDLHEDFHGHSHGDSHEDFHHGHSHAHGHGHTHESIWHGHTHGHDHGRSHEDLHHGHSHGHSHESLYHRGHGHDREHSHGGYGESGAPGIKQDLDTVTLWAYALGATVLISAAPFFVLFLIPVESNSPRHRSLLQILLSFASGGLLGDAFLHLIPHALEPHSHHAMEQPGHGHSHSGQGPILSVGLWVLSGIVAFLVVEKFVRHVKGGHGHGHTHGHTHGSHVRGRQEYSSKEKQNSQEEEKDTGGARKKKGGSTGPKDGPVRLQNPEEETAGSDLRVSGYLNLAADLAHNFTDGLAIGASFRGGRGLGILTTMTVLLHEVPHEVGDFAILVQSGCSKKQAMRLQLVTAIGALAGTACALLTEGGAMGSEVSGSTGPGWVLPFTAGGFIYVATVSVLPELLREASPLQSLLEVLGLLGGVVMMVLIAHLE	124078	120458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_121364_121808_122006_122217_122359_122508_122662_122801_122856_123016_123186_123274_123690_123998
716572	contig_6215_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_21201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGTGTAGTGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227044	226728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_226700_227000
716574	contig_15185_pilon	+	3002	6	Intergenic	novelGene_99383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_5	213.746204644667	724	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	226	774	64414	120520	FALSE	20	CAAAGGTCTTGCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVVPDQRSKFENEEFFRKLSRECEIKYTGFRDRPHEERQARFQNACRDGRSEIAFVATGTNLSLQFFPASWQGEQRQTPSREYVDLEREAGKVYLKAPMILNGVCVIWKGWIDLQRLDGMGCLEFDEERAQQEDALAQQAFEEARRRTREFEDRDRSHREEMEVRVSQLLAVTGKKTTRP	64188	122748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_64492_64731_64819_70100_70218_89657_89775_107652_107780_120497
716584	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716585	contig_9871_pilon	+	1787	9	Intergenic	novelGene_75728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	106.825500232856	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	31	774	602207	611598	TRUE	30	TACAGAAGTGATTTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISEQHLETWAESRKQ	602176	615348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610882_611555_611653_613744_613970_614614
716590	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
716591	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716601	contig_10531_pilon	+	2029	2	Intergenic	novelGene_114534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472722	488850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_473188_487286
716602	contig_10953_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_42568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAATGAAGATTGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424463	425266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_424500_425300
716611	contig_7202_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_16564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27838	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
716614	contig_10734_pilon	-	1883	12	Intergenic	novelGene_51443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	81.588060218686	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	90	1160	2234466	2216993	FALSE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRGSGKERGGENTAQNSESALQRPQRSQAMAGCRAVVAGFLFEYDTPRIVLIRSRKVGLMNRAVQLLILAYVIGWVFVWEKGYQEVDSVVSSVTTKAKGVAVTNTSELGFRIWDVADYVIPAQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234555	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2222925_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2229766_2229915_2234332
716630	contig_6165_pilon	+	1515	3	Intergenic	novelGene_167424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8	173	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAAAAAAAAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508065	526237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_508212_522553_522734_525048
716633	contig_2367_pilon	-	1532	3	Intergenic	novelGene_65319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAATTTAAGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230097	192224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193598_208552_208608_229993
716636	contig_4857_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_48766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAAGTTAGCCCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209588	1210603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1209600_1210600
716643	contig_15658_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_157873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATGATTGAGTGAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72327	74000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15658_pilon_+_72300_74000
716644	contig_6691_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_60170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408510	410919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_408500_410900
716645	contig_12090_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_80512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312723	310493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_310500_312700
716646	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
716648	contig_15327_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_70560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTACCTCAGACTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579602	577148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_577100_579600
716654	contig_2703_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_101748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAAGAAGCTCAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552735	553196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_552700_553200
716655	contig_2703_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_101749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCAATAGTGCTATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553296	555332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_553300_555300
716666	contig_5896_pilon	+	2106	2	Intergenic	novelGene_159237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGATGCCTGTCCTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107621	109920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_107639_107831
716667	SIRV4	+	366	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGTTTCCGAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3638	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
716669	contig_15498_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_42692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTTGATCAAAAACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816253	815484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_815500_816300
716680	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3792	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716685	contig_10235_pilon	+	1923	10	Intergenic	novelGene_46585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	51.073899497459	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	258	998	567174	571582	TRUE	10	TTCCTCAGTGTAGCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSRRGETSGVS	566729	582331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566979_567165_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_571554_571628_581262_581318_581506
716686	SIRV6	+	552	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
716691	contig_5229_pilon	-	2169	12	Intergenic	novelGene_117711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	39.1705320172243	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1087	1683	655325	652839	FALSE	10	GGATTGTTTCTGTGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657613	652352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655467_655590_655758_655942_656197_656307_656546_657083_657531
716693	contig_14033_pilon	-	1654	4	Intergenic	novelGene_167430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	33.436506994601	233	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	14	841	285113	277752	FALSE	20	TTTATTTGTCATTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHWLARWRHIVLCGWRWSQAGFLTRAGERVEPFLRPWWSGTGGAERGLRRLGTSGRPSLSRDLTLQPPRRPKSTNPFTRAQEENWRRRNKTVLTYVAAAAVGMLGASYAAVPLYRLYCQTTGLGGSAVAGHTSDQIESMVPIKDRIIKVTFNADVHASLQWNFRPQQTEVYVVPGETALAFYKAKNPTDKPVIGISTYNVVPFEAGQYFNKIQCFCFEEQRLNPQEEVDMPVFFYIDPEFAEDPRMVNVDLITLSYTFFEAKEGHKLPVPGYN	285126	276938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_277935_278326_278453_279983_280140_284750
716697	contig_5317_pilon	+	1952	11	Intergenic	novelGene_76627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	132.566398457528	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	135	1379	896836	924406	FALSE	15	CCCCATTGGGATGTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPECRGGAGEAAWNAALGAAACGVLDVKTLPLQSPQRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMGGVKLGLGDFIFYSVLVGKAAATGSGDWNTTLACFVAILIGLCLTLLLLAVFKKALPALPISITFGLIFYFSTDNLVRPFMDTLASHQLYI	885489	924979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885517_893291_893377_896813_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_921985_922105_924250
716698	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_89085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716700	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716705	contig_9833_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_68473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGACCAGATTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69233	69487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_69200_69500
716713	contig_16594_pilon	-	1989	3	Intergenic	novelGene_53913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACTTGCAGTCTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306539	269623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_271286_273531_273670_306350
716714	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716720	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716726	SIRV6	+	671	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-360	-60	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	96	410	2021	10736	TRUE	20	TTTACCATTTCGTCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1925	11210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
716731	contig_8594_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_140009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTAGTTGCCATCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88305	89068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_88300_89100
716732	contig_8594_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_140010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90197	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_90200_90900
716735	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716736	contig_5419_pilon	-	2432	8	Intergenic	novelGene_15474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	71.3711197522771	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	402	803	72789	70320	FALSE	15	GCGTATGCTGTATTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRVGVRVSPLCEAGRQCLPDSTSGLQSRLQPDWTGRLRITSKGKIAYIKLEDKVSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSRYFVIRIQDGTGRSAFIGIGFTDRGDAFDFNVSLQDHFKWVKQESEISKESQEMDTRPKLDLGFKEGQTIKLSIGSITTKKGGASKPRTAGPGGLSLLPPPPGGKITIPPPSSSVAISNHVTPPPIPKSNHGGSDADILLDLDSPAPVITPAPAPVSASNDLWGDFSTASSSVSNQAPQPSNWVQF	79704	68690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_70369_70693_70797_72459_72644_72723_72833_73654_73737_74407_74513_74670_74747_79609
716737	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
716741	contig_10627_pilon	-	2119	2	Intergenic	novelGene_60017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	0	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	202	519	402038	381766	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVSRKLG	402239	380165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_381946_401900
716742	contig_14184_pilon	-	1657	8	Intergenic	novelGene_66593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.031508216066	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	112	606	105839	90622	TRUE	25	TCTGAACCAAGTGTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEAEPIELVESAGDEIVDLTCESLEPVVVDLTHNDSVVSPQTLERRRPRRNARRLRQDHADSCVVSSDDDESPRDGDVYVTPHTPRGTREEGTAGLRPSGTVSCPICMDGYSEIVQNGRLIVSTECGHVFCSQCLRDSLKNASTCPTCRKKINHKRYHPIYI	109204	88550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89175_89762_89960_90391_90772_91298_91348_91951_92128_103421_103502_105799_105915_109168
716747	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716759	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_97948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
716772	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716776	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_94387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657164	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657164	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
716779	contig_17108_pilon	+	943	2	Intergenic	novelGene_109509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATATGTTGCTTAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28790	29795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_29461_29522
716783	contig_14666_pilon	+	1683	7	Intergenic	novelGene_39526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	78.7204971190265	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	757	1254	446586	448893	FALSE	25	TGAAAGGTATCGAGTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFQNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	444630	449322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_444715_445537_445704_446079_446692_447980_448067_448153_448295_448638_448769_448858
716786	contig_18272_pilon	+	2421	8	Intergenic	novelGene_7062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2817.6874727119	3	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	107	1189	509583	538332	TRUE	15	TAATGATGTGGGTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	507876	541837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_507953_509552_509743_512634_512713_514111_514361_518778_519040_537077_537197_538116_539043_541315
716788	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716789	contig_7707_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_72223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGCTAATAAAAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813780	813232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_813200_813800
716790	contig_7707_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_72222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCTGACATATACTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812520	810498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_810500_812500
716794	contig_16999_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_85016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAGCAGTGGGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379558	380302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_379600_380300
716795	contig_4156_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_88098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAATCAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297857	296581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_296600_297900
716796	contig_6230_pilon	-	2256	11	Intergenic	novelGene_102110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	29.4136022955367	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	546	1490	178669	166056	FALSE	25	TAAATACTGTCTTGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182130	165289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_180772_180857_181156_181253_181942
716797	contig_2834_pilon	+	1045	2	Intergenic	novelGene_27966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	3533	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	122	577	213515	213970	FALSE	15	CATGTCCTGTGGTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCAWDLVSFSPESGVWVRVFRCSSPLLFSRPPRRHLRSSRMETEGYPETQGNRNEVHNGQIRSPPDGMMAEELEVILKPAPRVQVSLEPVGLPPESLDEVSVEDLEAIPQRNPPNPADSLQRFRQFRYEDAAGPRDVLRHLQELAGQWLRPDIHTKEQIVEMLVQEQFQAVLPEELRARVQRYRPGVRITG	209543	214438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_209658_213507
716801	contig_8259_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_148894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTATAATACCATAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332203	330429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_330400_332200
716805	contig_9609_pilon	+	747	7	Intergenic	novelGene_23046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	877.498480530498	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	36	737	435608	455816	FALSE	65	AGTAAAGGAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRRPGRADGGMGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKHKNREMPPFLETTVHLLILVAF	435572	455826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453685_455746
716807	contig_7202_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_17242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATTTCACCTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
716808	contig_14441_pilon	+	1096	4	Intergenic	novelGene_100551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	189.033212837204	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	590	1096	116728	117795	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111196	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111382_111784_112040_116578_116963_117523
716811	contig_4780_pilon	-	1459	13	Intergenic	novelGene_65394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.477435563545	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	304	1236	419847	312144	TRUE	20	AATCTATGTCTCCCGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLLRLGGGMPGLGQGPPTDAPAVDTAEQVYISSLALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428914	311832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_311944_312031_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_419799_419852_422134_422260_428740
716815	contig_6870_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_103947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTACTAGTTGCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229936	1231301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1229900_1231300
716821	contig_12250_pilon	+	1142	9	Intergenic	novelGene_80675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	257.744059097392	3683	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	75	512	391631	393963	TRUE	5	TACTTCTGGTGTGCGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLGSESESPGGEPGDRKSCNWRNMAKPCGVRLSGEAREQVDVFRQNLFREAEEFLCTFLPQKIIYLNQLLKEDSFNVADLTSLRAPLDIPIPDPPPKDDEMETDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQVR	391556	394992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392016_392628_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_394382_394687_394775_394867
716828	contig_3111_pilon	-	1778	2	Intergenic	novelGene_129964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	401	junction_1	0	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	521	850	40087	39237	FALSE	55	GAGAAAAGAGGTAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAFICPVCHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVRATGQGL	40607	38308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_39444_39964
716831	contig_5864_pilon	+	349	3	Intergenic	novelGene_162772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	113	349	79500	96749	FALSE	40	AAACTGGAGTGTGAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGGAGVFTVWKLLLSAWLVSRGSRLSAREREAPDGVMDFENLFSKPPNPALGKKPATDSDESQENGSWCSTGPTSDPRCAAIPVSRLGPGAEQRRGRIDDEIDDTEVEETHEEKI	79387	96749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_79577_89971_90077_96694
716836	contig_7201_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_152517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306551	304442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_304400_306600
716837	contig_1443_pilon	+	783	3	Intergenic	novelGene_28189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGTGAGAGTGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343656	344897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344343_344421
716839	SIRV4	+	346	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGGGGCCGCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
716847	contig_1146_pilon	+	1361	4	Intergenic	novelGene_84851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4074	junction_1	2152.72731410388	254	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	31	333	950980	956107	FALSE	40	TGTAATACATACCTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFG	949778	957135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951113_951651_951732_956017
716848	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_95956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
716856	contig_7730_pilon	-	2919	1	Intergenic	novelGene_156303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2040	2384	455723	455379	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKVAGLFSWMVCMGDWRREFRDGGPNTVLLKELVGEPRPEPLVVYGKLELRCMSPPVGDDWDDGSVMLSSRSSMRLSASPSFRFMVPAMSVSRGSSTVHGLLTGGERLAELL	457762	454843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_454800_457800
716857	contig_990_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_76082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121884	1119684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1119700_1121900
716862	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
716863	contig_4759_pilon	+	2206	13	Intergenic	novelGene_106354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	8.98571397027279	111	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	52	1248	992239	1050731	FALSE	30	ATACTCCATTTTGGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVVKWPVELAQDDSWRMESVLSKYENQITIFTDYLEEFPDTDELVWILGKQHLLKTERSKLLSDVSARLWFTYRRKFSPIGGTGPSSDAGWGCMLRCGQMMLAQALICRHLGRDWNWEKQKEQPKEYQRILQCFLDRKDCCYSIHQMAQMGVGEGKSIGEWFGPNTVAQVLKKLALFDEWNSLAVYVSMDNTVVIEDIKKMCCVFPLSADTVGENPPDFPSASSQSKGTSACCPAWKPLLLIVPLRLGINQINPVYVDAFKECFKMPQSLGALGGKPNNAYYFIGFLGDELIFLDPHTTQTFVDTEENGMVDDQTFHCLQSPHRMNILNLDPSVALGFFCKEEKDFDNWCRLVQKEILKENLRMFELVQKHPSHWPPFVPPAKPEVTTTGAEFIDSTEQLEECDLEEEFEILSV	992187	1051689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_992249_1029771_1029883_1032566_1032639_1034748_1034848_1037289_1037392_1037571_1037645_1041389_1041470_1042389_1042578_1042698_1042778_1046873_1047020_1048334_1048392_1050053_1050163_1050660
716865	contig_16578_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_148628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113205	115510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_113200_115500
716871	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
716880	contig_8615_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_165219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTATTGTATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112620	114639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_112600_114600
716881	contig_3018_pilon	-	1649	5	Intergenic	novelGene_78896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	321.024142394307	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	377	796	600079	583414	FALSE	45	AAGTATAAAAAGTGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCR	625097	582560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_583648_585063_585179_600008_600194_624772_624903_624965
716890	contig_1982_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_151315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCAATTCAACAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126979	124796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_124800_127000
716895	contig_7457_pilon	+	3686	14	Intergenic	novelGene_31271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	9.91203918021207	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	234	2573	77685	121830	FALSE	20	TCCACCGAGCATCACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTISLERAVGNESIVQSTVSTVSQNNIKESASKEASSSSINEVGSSVNEVGSSGENIQAELGRNRGPKLNAVLRLGLMQPEVYKQSLPVSNCKHPEIKRQGENEGVVEDVNMDFSPCLISDNLEQPMGSSRASQICSETPDDLLDDDEIKENISFAESGIKERSAVFSKDQRREFRRNPSPLSRSGLAQGHLRGARELESSEENISSEDEELPCFQHILFGKVTSIPSQSTRHSADATECLSKNTEENLGSVQNSINECCNQVTSAKASQEYHLSEEVRCSSSLFSSQCSAVEDLTTNTNTQDPFLMFGTPSKQVRHQSENQEVVLSDKELVSDDYEREPGLEEDNHQDDQSMDSNLGEVASRYESESGLSEVGSGPSSQSDILTTQQRDTMQDNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPANSSPSLLAGSRAPEDLLNLEQNTSGKGSILTLEKSNEHPISKNPESLSADKFQVSPDSATSKNKELGMERSSLSKFQLLDNRWDMHSHSRSLQNGNCLSQEELVKVVDVEEQQLEKSETRGLMEQSYLSRQDLEATPCLESGVSLFSDDPESDPSEDRAPDPAHVCSMPTSSSGLKLPQFQAAESANSSTDAHTSTIAGYIVREESGSREKPGVISSTERVNKRVSMVASGLTQKEFMLVHKFARKHHCTLTNQITEETTHVIMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGGKWVVSYFWVTQSIKERKMLDEYDFEVRGDVVNGRNHQGPKRAREFQDRKIFRGLEICCYGPFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKEPLSFTLGVDTHPIVVVQPDAWKEDSGFHGIGQLCEAPVVTREWVLDSVALYQRQELDTYLIPQIPHSHY	77451	122943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_78526_78947_79037_91606_91779_100244_100375_102303_102495_103880_104192_106482_106571_109845_109924_110430_110472_113479_113564_116311_116367_120454_120529_120892_120954_121705
716896	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
716897	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_89257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716901	contig_2817_pilon	-	2150	2	Intergenic	novelGene_104354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACAGAGAAGTGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424217	420889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_421053_422230
716903	SIRV5	+	231	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	156	167	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
716908	contig_9354_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_108065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTTTTTTGTGCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264760	265605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_264800_265600
716909	contig_7078_pilon	+	2143	5	Intergenic	novelGene_130117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	497.958080565021	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAATCGCGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29776	220818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_90824_90980_106254_106398_182312_182515_219233
716911	contig_4364_pilon	-	195	2	Intergenic	novelGene_755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGCGATGCCTGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532568	1532291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532341_1532422
716915	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_93421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653697	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
716924	SIRV6	+	297	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	41	39	-41	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3064	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
716925	contig_4644_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_160188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACACAGTGTTACATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30173	30775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4644_pilon_+_30200_30800
716930	contig_15888_pilon	-	1065	7	Intergenic	novelGene_84443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1782.07909944162	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	327	686	253673	252475	TRUE	15	ACTCCACATTTCGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	254685	251604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251829_252151_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254076_254512
716932	contig_2903_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_148974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAAAGGGAATGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141596	139821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_139800_141600
716949	contig_12250_pilon	+	1957	6	Intergenic	novelGene_80617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	25.7557760512084	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	158	1072	350196	351971	TRUE	50	AAGAAAAAGAATCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPQELGRASGCRKLHRRALGRAECGVSCEVAAAAAIRHSSRQPSGGPAALRMTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLENYPYRCLPLSSIPWPALCCAWRGCPVPGPWHW	349606	354958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_351808_351866_352017_352256_352443_354304
716950	contig_935_pilon	+	2159	2	Intergenic	novelGene_45511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTTACTATATTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18948	22127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_20239_21258
716952	contig_3277_pilon	+	1361	9	Intergenic	novelGene_74729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	503	junction_8	450.386153761414	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	79	1209	240775	265230	FALSE	65	AAGAAAAAAAAAAGGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPR	191005	265382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618_263687_265054
716954	contig_14322_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_116516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTACTCTGTAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674844	672798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672928_674670
716957	contig_6533_pilon	+	1653	11	Intergenic	novelGene_114651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	118.614037955041	246	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	213	1130	215442	236125	TRUE	45	CCTAATGGTTGCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDDLQFEEFGDAASSLVANSDDTTISIEDPGETPKHQPGPPRGSGREEDDELLGNDDSDKTELLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQIFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDLYGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKVSIAATVIYAYAWLVPLALWGFLMWRNSKVMNIVSYSFLEIVCVYGYSLFIYIPTAILWIIPQKAVRWILVMIALGISGSVLAMTFWPAVREDNRRIALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTATANQTVTAAKSS	214509	246755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_214602_214928_215001_215393_215473_220467_220632_224459_224541_224786_224875_227139_227257_230502_230670_231042_231226_236038_236134_246240
716958	contig_12098_pilon	+	2737	1	Intergenic	novelGene_160671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATTACCCAGGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128462	131199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_128500_131200
716959	contig_14553_pilon	+	2162	4	Intergenic	novelGene_125000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_3	152.342450493033	381	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	43	1032	5787	22522	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQESVSHENMTSHMKLLSTRLLTT	5744	23652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_6138_6387_13796_14424_22455
716972	contig_348_pilon	+	1784	9	Intergenic	novelGene_67605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	9.5524865872714	199	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	548	1354	320222	345268	FALSE	10	CTGTATCTCTTCATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314477	345698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319673_319792_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
716978	contig_1154_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_87067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCACTGCACAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181934	182707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_181900_182700
716979	contig_8377_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_35048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAACCTCCATTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89203	88276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_88300_89200
716982	contig_401_pilon	-	1512	2	Intergenic	novelGene_42882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	189	815	1779305	1778615	FALSE	10	TGCTCAGATGTGGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTSDANFSCYHESVLGYRYVAVSWGIVVAVTGTLGNVLTLLALAIQPKLRTRFNLLIANLTLADLLYCTLLQPFSVDTYLHLHWRTGANFCRVFGLLLFASNSVSILTLCLIALGRFLLIAHPKLFPQVFSAKGVVLALVGTWVVGVASFAPLWHIYILVPVVCTCSFDRIRGRPYTTILMGIYFHRHWTSTSCARQVSVLTMWLG	1779493	1777917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1778681_1778744
716985	contig_3233_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_56592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGGAAAGCCTGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767269	767583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_767300_767600
716990	contig_5050_pilon	-	1517	11	Intergenic	novelGene_110274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	213.114617049136	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	465	1196	671156	507209	FALSE	15	GAGACTTGGATGTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLGYYRPFSEKPGIGKSHVCQTDQSRKGDISRPYDSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716409	506887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636050_636104_636131_646842_646924_671150_671310_690401_690572_716268
716991	contig_15666_pilon	-	1241	5	Intergenic	novelGene_70193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	713.692992469451	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	293	724	108757	107816	FALSE	15	CTTGCTGCTGTCTTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110711	107298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108810_110158_110246_110558
716993	contig_10861_pilon	+	1066	2	Intergenic	novelGene_39379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	329	junction_1	0	1037	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	68	523	1685906	1686361	TRUE	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRLRELVPGVPRGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIQVSVGVLGSQGRDDCFFCNVAQFPEIPSAMHNSSFFTSLSDSRTHSRTRDLQ	1685838	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686409_1686956
716995	contig_15629_pilon	-	1844	5	Intergenic	novelGene_122474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAATGCATGAAACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192930	176398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_176668_180097_180264_180733_181050_181146_181335_192025
717001	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
717002	contig_7179_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_78149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	189	230	418	1005345	1005157	NA	15	ACTGATCTTTCCCTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSKQFLLFYPSIFFFNPIRVVPLAFVYSEGRSTRRQGIKQIHPGPSHILPLAHTPSYLAVTTFEVHPHTTQLPNPMSFFPRTSLRLQDHPANSAPNISLTPENLLLLLFFYRSQHPSTLETVELLSPFPSQTCPISIS	1005574	1005154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1005200_1005600
717005	contig_6159_pilon	+	1756	12	Intergenic	novelGene_128239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	86.0158547753103	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	205	1611	36174	45745	FALSE	10	GCCTCAGCATCCTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVAVVLVALITGLCIWLPSSSQHPNHVYPRAAVATDAKRCSEIGRDALQDGGSAVDAAIAALLCVGLMNAHSMGIGGGLFLTIYNNTMRKAEIINAREVAPALAFASMFNSSEQSQEGGLSIAVPGEIRGYELAHRRHGRLPWARLFQPSIQLAREGFPVGKGLAAALERSRGTIERHPFLCEVFCRNGKVLQEGERVVMLRLASTYETLALEGAQAFYNGSLTAQIVQDIQAAGGIVTAEDLNNYRAELIEHPLNISLGDSVLYMPSAPLSGPVLALILNILQGYNFSQASVETPEKKGQTYHRIVEAFRFAYAKRTLLGDPKFVNVTEVVHNMSSEFFAAQLRARISDDTTHPISYYEPEFYTPDDGGTAHLSVVSEDGSAVSATSTINLYFGSKVRSMASGILFNDEMDDFSSPSITNQYGVPPSPANFIQPGKQPLSSMCPSIIVGRDGQVRMVVGASGGTQITTATALAIIHSLWFGYDVKQAVEEPRLHNQLLPNTTTLERHMDQAVVRTASGWAAASDSRKGGEPAGY	34632	45890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_34770_36106_36238_36396_36484_39342_39536_39901_40060_41556_41707_42111_42249_44448_44637_44892_45021_45104_45218_45286_45401_45670
717010	contig_3018_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_78935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGTCGGAAACAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671123	672601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_671100_672600
717014	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_89547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653764	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717017	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717019	contig_20748_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_138183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTTTTTCCAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194592	194895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_194600_194900
717020	contig_12250_pilon	-	1166	12	Intergenic	novelGene_80691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	341.652353392322	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401265	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400702_401003_401120_401200
717021	contig_2168_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_147263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTCATATGGAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246302	247711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_+_246300_247700
717022	contig_11386_pilon	+	1402	4	Intergenic	novelGene_82814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_1	150.202086092926	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	439	879	138167	142106	FALSE	20	TGATGTGTAAGCTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKGPLLGGSPHQ	137728	142629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_138315_140637_140759_141029_141170_142074
717027	contig_12270_pilon	-	273	2	Intergenic	novelGene_114127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGGCAGTGGGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
717029	contig_6710_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_97213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCTGGAAGTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	653718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
717032	contig_4857_pilon	+	2082	7	Intergenic	novelGene_48656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_4	55.7177908950294	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	84	731	1015035	1077143	FALSE	75	AAAGAAAAAATAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWNQVQQLEIKFLEQVDQFYDDNFPMEIRHLLAQWIENQDWEAASNNETMATILLQNLLIQLDEQLGRVSKEKNLLLIHNLKRIRKVLQGKFHGNPMHVAVVISNCLREERRILAAANMPVQGPLEKSLQSSSVSERQRNVEHKVAAIKNSVQMTEQDTKYLEDLQDEFDYRYKTIQTMDQVDKNSVLMNQEILTLQEMLNSLDFKRKVSEEF	1012010	1078494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039
717033	contig_6102_pilon	-	2652	8	Intergenic	novelGene_32002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	95.0726896986228	25	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	365	970	455625	450744	TRUE	65	AACAATCAACAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYDVTRFQGDVDEDLICPICSGVLEEPVQAPHCEHAFCNACITQWFSQQQTCPVDRSVVTVAHLRPVPRIMRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKTSAEHKHQLAEQKRDIQLLKAYMRAIRSVNPNLQNLEETIEYNEILE	473578	448597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450263_450405_450496_450852_451251_451388_452090_452363_455535_455649_470683_470869_473422
717039	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717044	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4280	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717045	contig_8696_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_153340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAATGTAGGACAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008901	1009914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_1008900_1009900
717050	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717052	contig_17274_pilon	+	1387	13	Intergenic	novelGene_26531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_12	381.555769915167	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	65	1387	131715	195908	FALSE	15	ATTGCTTTCTGTAGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGKEEKMNTLSITKHLNAHTFFCAFSNKPVSL	131650	195908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_195741
717064	contig_5039_pilon	-	696	2	Intergenic	novelGene_65060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGACCCATCTTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831429	1829965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1830573_1831340
717074	contig_10235_pilon	-	1464	8	Intergenic	novelGene_46266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.212383828689	28	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	545	1132	24268	19534	TRUE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27173	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14110_19353_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_24573_24697_25124_25469_27131
717075	SIRV7	-	299	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91625	2	-91619	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACTAGTAGAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
717077	contig_10904_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_22592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	19.5	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGGTGTGGCCCAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451571	454130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_451624_451716_451816_453838
717078	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_18821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCCAGAACTACAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
717086	contig_15219_pilon	-	1508	7	Intergenic	novelGene_40835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCCAATGTGTTTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25910	22888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_22903_23149_23281_23357_23498_23695_23905_24125_24312_24451_24585_25215
717090	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717097	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717103	contig_3424_pilon	+	1963	4	Intergenic	novelGene_55472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	134	1723	163695	170678	FALSE	35	TATTTTTTTACTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDVNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149870	170918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168790_169284
717109	contig_7171_pilon	-	1313	9	Intergenic	novelGene_101191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	362.700267955512	111	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	599	1063	49603	37659	FALSE	5	CCCTGTGTCTCTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50443	37408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_50264_50365
717110	contig_5643_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_39159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTGTCCTGTAGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700592	701814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_700600_701800
717121	contig_12644_pilon	+	929	5	Intergenic	novelGene_44631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4525.62500517884	156	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	53	637	2675526	2680545	FALSE	35	GAGACTACAGAAGCTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVGAAGLRGAWPSLPAMACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNSLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677367_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
717125	contig_6513_pilon	+	1017	2	Intergenic	novelGene_117745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCGGATGGAAAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48549	137002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290
717126	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
717127	contig_10734_pilon	+	2346	2	Intergenic	novelGene_51277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_1	0	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAAACACTGGCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336663	1341620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438
717133	contig_14322_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_116102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
717139	contig_10003_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_88243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAGATAGCTCAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683320	685218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_683300_685200
717168	contig_8588_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_146513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCTAAAAATGCAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407373	404671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_404700_407400
717169	SIRV6	+	591	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	369	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1745_1856_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
717170	contig_7004_pilon	-	793	5	Intergenic	novelGene_126499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	39.436658073422	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	433562	432641	FALSE	10	GCATTCAGGTCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGLSEDEALQRALELSLAETKSQVPSSQEEEDLALAQALSASEAEYQQQQYDSRP	433562	432156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432659_432779_432853_433184_433253_433335_433397_433473
717173	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
717175	contig_5515_pilon	+	991	10	Intergenic	novelGene_52350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	115777	118283	TRUE	20	GCGGGCACGCACCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFISRRFSSPGFTRSLRTLPSPLRSVWPAATDTLTNPAVHDIGLNDGTLPAEVLCHGGTAYLQVTHLFLQHPFLLLCLCQPLKELSHFLIRQLCWSRGLGLRAARQRPSWNG	115774	122628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_115878_116733_116827_116955_117086_118265_118404_120048_120144_120246_120303_120409_120508_120610_120685_121643_121758_122538
717187	contig_12292_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_167011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAATGGGGCTGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322898	322202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_322200_322900
717188	contig_12292_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_167016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCTGTATGTGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342612	341918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_341900_342600
717197	contig_2161_pilon	-	2119	10	Intergenic	novelGene_114906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_6	34.9602949390051	241	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1059	1874	766929	760359	FALSE	30	TGTATGGCTCTAGAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHIWSENTIWPQGVLVRHSRCLYRAMGPYNVAVPSDVSHARFYFLFHRPLRLLNLLILIEGSVVFYQLYSLLRSEKWNHTLSMALILFCNYYVLFKLLRDRIVLGRAYSYPLNSYELKAN	792854	760113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763652_763774_765726_765915_766656_767006_773463_773619_775907_775958_778784_778869_782626_782850_791191_791379_792571
717208	contig_8050_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_114811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTACATCTTCAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244443	243689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_243700_244400
717211	contig_6710_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_89186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
717212	contig_15105_pilon	+	2842	3	Intergenic	novelGene_150989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.5	149	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTGCTGCAGTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678807	684288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_679360_680706_682189_683480
717218	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_116304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671654	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
717227	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717228	contig_4180_pilon	+	1786	9	Intergenic	novelGene_8308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	198.628421934022	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	295	1251	811036	821915	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPEQNLNRNNNILLPSQQFCNQVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	735159	822450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_735216_802493_802660_810963_811043_811147_811213_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
717229	contig_7720_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_155728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACTAAAAACTGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16990	16702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_16700_17000
717230	contig_14322_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_116496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATAAACGCTCACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671835	671381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
717235	contig_12689_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_145064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	321	966	2	967	330594	331559	NA	15	CTCAAGCATGTCTGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPWPSQRALCPVPLQWAGGAVAQSACTLPRSPSVGRWSRGPVSVHSAPFPFSVGRWSRGSVSVHSAPFPFSVGRWSRGSVSVHSAPFPFSGQVEPWPSQRALCPVPLQWAGGAVAQSACTLPRSPSVGRWSRGPVSVHSAPFPFSGQVEPWPSQRALCPVPLQCGQVEPWLSQRALCPVPLQCGQVEPWPSQCALCPVPLQWAGGAVAQSACTLPRSPSVGRWSRGPVSVHSAPFPFSGQVEPWPSQRALCPVPLQWAGGAVAQSACTLPRSPSVGRWSRGPVSVNSAPFPFSGQVEPWPSQRELCPVPLQWAGGAVAQSA	330592	332528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_330600_332500
717237	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717238	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
717242	contig_7202_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_17863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27886	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
717244	contig_12485_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_147303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	4	15	313	327	796522	796508	NA	55	AAAAGAAGAGAATGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVREPGEGRAPALQGRSGGGGRGGLPAGGGDPSLTSSRTLAGIGPACAGPGPQGHWPPFPPKSPVSKNEIKAGARALRSRDPDPQSAVAESSLRRRARLGATGTMVLG	796834	795826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_795800_796800
717248	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_95118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717249	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
717250	contig_13894_pilon	+	1168	8	Intergenic	novelGene_62130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2614.26240426766	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	155	895	521729	526523	TRUE	20	TGAGCTGATATAGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKRSTRLARATLSRMAN	521574	527580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526475_526580_526851_526948_527459
717251	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717252	contig_15104_pilon	+	2192	10	Intergenic	novelGene_163350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	54.2320118667113	103	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	192	1958	587189	631236	FALSE	25	TTTATAGTCTTTAATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKGRPPPRSLPPLRSDALCHGHGRRHRHPEPHPRPARASSLSLTRTCPQAPRGRRSVPFWSRNMEVIHGRSCCCRELEGDDLLSDNFCSNEIHTPLQTPARPTASEDRYQELRESLQQCRLPWGADREYGGIIPISLPEEHRPKCEPPRVMGKGHQHYGFGGETWHRKLPIEQFYYLTQNKKSDIYGNDSLIPKPPNAMVQEICCPYPVEHPYNTHISRCAMFPTFTSPKELYTGIKARSQQPFPPTVPTKAYDKTVLKTRGNPYRYELVDFPSDSKKKALTWPGQGVYYDFPKCVEKNKPVFYPKPPKTFAPNTSLNSWDPINSLKEANIQRNLERSHWITSYTHDFTGLGSMNPLELDDYHEKEVADLTGQIEFDPEPQEKFHPVLKPVRPLEGRIARLIHDQRPLEATVQEKPPSCPDCTPTVLCTFHSFIPSSEEMRALSGNTRASMTHKNQDAEEKIKEEQSLLSTYALPSCYPTKELTDIYDIKPFPKVTDTKKTEDLYWRQLALKPQPIPYAKANNYIHYEHFKSDQYTMCQDPTSLSKPGILQNKQGTAAFTLEQVFGKPEEHQLALNMENSEETRPILGWIPRVGVAKPQTNLLDLKNSFSKSGVRKHFHKSILDDHKDLRDKEHSGMKHQFYGHNSYYFYN	586195	631470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_586362_587163_587323_595072_595250_607434_607507_609950_609981_616639_616822_619364_619454_626900_627076_627366_627459_630420
717254	contig_13004_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_112745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCTTTAAAATAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948776	949321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_948800_949300
717256	SIRV4	+	301	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1470	632	1015	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
717258	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
717262	SIRV4	-	317	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1206	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
717264	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-48	875	-48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8267	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
717265	contig_3948_pilon	+	2354	3	Intergenic	novelGene_53394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.5	1	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	445	900	1814202	1860572	FALSE	35	GTTGACTCATTGAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813678	1862026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1814033_1814111_1814520_1860434
717268	contig_1443_pilon	-	1528	8	Intergenic	novelGene_28298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.681662810795	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	86	568	776427	749310	TRUE	60	GAGAAAAAAAAAGAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSFRPLRRS	808741	747988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748713_748831_748993_749234_749334_750436_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_808690
717270	contig_18342_pilon	+	754	6	Intergenic	novelGene_154560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_2	143.555703474296	125	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	164	754	36952	60757	FALSE	15	GTGAGTACTGAGTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASG	26162	60757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655
717273	contig_10404_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_138636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTGTCTTTGTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426009	427101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_426000_427100
717274	contig_10404_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_138637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAGACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428106	428391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_428100_428400
717281	SIRV2	-	428	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	44	3260	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
717282	contig_6975_pilon	+	1859	7	Intergenic	novelGene_74264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGATTTAAATGCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159232	164524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_159535_159678_159943_160732_160869_162001_162112_162457_162551_163055_163193_163707
717292	contig_6589_pilon	+	1470	12	Intergenic	novelGene_26221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	189.580049164785	933	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	231	1274	2051428	2059863	FALSE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVAEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048753	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051047_2051106_2051328_2051446_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
717298	contig_5018_pilon	+	2168	7	Intergenic	novelGene_46936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	142.023472238453	911	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	402	764	260626	263264	FALSE	45	TTTGAAAACTATTACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVSINEKCGKEFAEF	258624	264668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_258666_259714_259800_260172_260300_260386_260484_260574_260698_262586_262752_263138
717308	contig_15087_pilon	+	554	6	Intergenic	novelGene_37215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGGGTGGCAGAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111011	119025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116908_118079_118285_119010
717309	contig_12270_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_113376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14055	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
717311	contig_4442_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_127943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217299	215078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_215100_217300
717313	contig_8357_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_39751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGGAAAAACCAATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763688	763041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_763000_763700
717330	contig_9011_pilon	-	2739	1	Intergenic	novelGene_159360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785021	782282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_782300_785000
717333	contig_5718_pilon	+	2170	2	Intergenic	novelGene_110305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCGTCACAAACAGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188146	190640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_189720_190043
717335	contig_6102_pilon	+	2187	9	Intergenic	novelGene_32049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTAGCTCCTTCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557362	562012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_558048_558363_558566_558805_558894_559564_559745_559872_560023_560119_560276_560923_561015_561244_561307_561439
717336	SIRV7	-	358	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	-15	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56095_70883_70988_78841_78964_114680
717341	contig_8978_pilon	+	2484	8	Intergenic	novelGene_49419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	186.140828845434	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	47	1423	426211	435210	FALSE	15	TATTTTGTCTGCTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLRPAVAVGSAVAIMSDSDSDEDSAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGTLITELTANEELTGTDGALVNDEGWIKSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPVLIKKDKDQDTIASVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESDMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVDSEVNQKSLWNYDYAPPPPPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKCRMIEDFRKLEESSGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGVLPC	426164	436271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_426331_427385_427501_427646_427764_431918_432039_433127_433370_433781_434001_434422_434642_434985
717345	SIRV4	+	333	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	199	418	199	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTTTCCACTCTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
717349	contig_1856_pilon	-	2279	5	Intergenic	novelGene_84870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_4	227.883056632124	191	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	515	1354	260083	181396	FALSE	15	ATCCACTCTTCTCCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLTFLFVILHVYKALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSDSFETDVPSNKHLDSEPGKNVTLTYQLQRKQPMQLVMWEKIQPHQIDLLTFCNLSQGRSYISKYQRQILTNCSQGMRRSFIVIHHVTASDSGLYRCSFEASTGEKETFVVRLTVTNGKTSNQSILFLAGGTVLLLLLVIIITTVIVIYCNR	271583	180470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_181503_205261_205610_259395_259735_260037_260191_271176
717356	contig_3095_pilon	+	948	4	Intergenic	novelGene_75127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2952.89654407329	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147250	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147301_150361_150696_150996_151163_151848
717363	contig_15732_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_88904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAGTTAACTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279861	280343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_279900_280300
717367	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	37	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717370	contig_10134_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_16187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGGCATGTACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30641	31936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_30600_31900
717377	contig_10581_pilon	+	2619	1	Intergenic	novelGene_41346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2160	2528	73656	74024	NA	15	CTTCCCCCACAAGCTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKGELRTPRDREEKCERRGGTGARPDTDAARAASYLDAIVGEVDLPFVGLGARGRRFPKHLRPGEGRREPATQGRRMNQGDEGAPDPGQDKLTPASLPSTAPPTGLSFPLVLEAQNLTLPS	71496	74115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_71500_74100
717380	contig_3975_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_54920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAATGTGATGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239322	2237767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2237800_2239300
717382	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
717384	contig_5671_pilon	+	1154	7	Intergenic	novelGene_79447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	2112.58012997272	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	181	603	370430	531238	FALSE	30	CTCATTGCATATATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368864	531789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
717385	contig_7171_pilon	+	1008	7	Intergenic	novelGene_101257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	63.046059000984	1332	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	62	916	869817	876795	FALSE	0	TCTCTTGGGCCCTTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVNGAPGASSSAASGAVLQAAAGMYEQLKGEWNRKSPNLSKCGEELGRLKLVLLELNFLPTTGTKLTKQQLILARDILEIGAQWSILRKDIPSFERYMAQLKCYYFDYKEQLPESAYMHQLLGLNLLFLLSQNRVAEFHTELERLPAKDIQTNVYIKHPVSLEQYLMEGSYNKVFLAKGNIPAESYTFFIDILLDTIRDEIAGCIEKAYEKILFTEAARILFFSTPKKMTDYAKKRGWVLGPNNHYSFASQQQKPEDTTIPSTELAKQVIEYARQLEMIV	869755	876887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_869979_871007_871081_871200_871304_872377_872544_873459_873561_875805_875918_876657
717388	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
717389	contig_11321_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_86645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAAATACCCCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10539	11036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_10500_11000
717390	SIRV4	+	292	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	210	448	210	-448	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAAATTGCCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1665	2323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
717394	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_97520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717395	contig_4654_pilon	+	2040	6	Intergenic	novelGene_103062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_1	144.243405395186	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	54	908	444670	457859	FALSE	20	ACTCTGATTTTGTTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKSPDSVEGLRAAGNQSFRNGQYTEASALYGRALRVLQARVSTRAGSSDPEEESVLYSNRAACHLKNGNCSDCIKDCTSALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPKETTTTKNKVPSAGDVERAKVLKEEGNEFVKKGNHKKAIEKYSESLSFSHLESATYTNRALCYLALKQYKEAVKDCTDALKLDGKNVKAFYRRAQAYKALKVKRS	444616	458991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_444797_449177_449293_450644_450798_453119_453290_456226_456375_457717
717398	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717405	contig_7494_pilon	+	2471	9	Intergenic	novelGene_167437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	66.3144733448136	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	484	1602	42488	50990	TRUE	35	AATGAATTCCTAAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANVPTITAKIPEFDSIIGQRLDFSTIDLERLNQMYNCTTTHTLLDHCAFEKANICGMIQGTRDDADWVHENSAWPGQVDHTLVGCCTGAGYFMHFNTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSLSDRLIVWVRRDDSTGNVRKLIKVKTFQGDLDQNWKIAHVTLREEKKFRYLFQGTKGDHQNSNGGIYLDDITLTETPCPTGVWTIRNFSQALENTVKGEGLLSPRFYNTEGYGFGLTLYPHGRTTSTISDYIKLAFHVCSGENDALLEWPVVDRQVIITILDQEPDASNRMSSSLVFTTSKSQTSSGAASPRGRHREGLGRESSTQQPGPRADQPTEAVSGEYGPHGGPQLATVLQRPV	27857	55727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_+_27980_32070_32152_35976_36153_42383_42606_43374_43525_46667_46884_48876_49351_50829_51051_54918
717406	contig_11281_pilon	+	3247	1	Intergenic	novelGene_125508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	2686	3117	957522	957953	NA	15	CCAGCATCTGCCTCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYFNPPHSTKLSGPPTIPNAVYSGDLSPFLLSTGKFALVSSLGSREASTQFKVYFQKKGAAREKPCELSHPFPPHPLILLNFPVQDNIFFLIESKGPHNRHELPLNITNLTLGNPFAQDWLCLKSRSEHPEVKQQSNGMINA	954836	958083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_954800_958100
717410	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
717414	contig_18869_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_56490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAAGATAAACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370703	369090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_369100_370700
717416	contig_9091_pilon	-	1998	14	Intergenic	novelGene_32423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	128.312119458764	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	366	1565	44206	18674	FALSE	25	CTTTAGTATTTCATGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTTLLIELCKLQPGSLPQVLAQATEMLYMRLDTMNTTCVDRSDCLTQDPESPKPKFVREVLEKCMRLSYHQRIIDIVPPTFSALCPANPTCIYKYGDESSNSLPGHSVALCLSVAFKSKATNDEIFSILKDVPNPNQDDDDDEGFSFNPLKIEVFVQTLLHLAAKSFSHSFSALAKFHEVFKTLAESDEGKLHVLRVMFEVWRNHPQMIAVLVDKMIRTQIVDCAAVANWIFSSELSRDFTRLFVWEILHSTIRKMSKHVLKIQKELEEAKEKLARQHKRRSDDDDRSSDRKDGALEEQIERLQEKVESAQSEQKNLFLVIFQRFIMILTEHLVRCETDGTNVLTPWYKNCIERLQQIFLQHHQIIQQYMVTLENLLFTAELDPHILAVFQQFCALQA	49067	18240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_18788_24577_24692_25320_25450_28659_28775_31150_31255_32012_32107_33094_33198_34423_34547_37956_38061_40453_40529_43441_43507_44146_44258_46704_46803_48851
717420	contig_7004_pilon	+	1176	5	Intergenic	novelGene_126464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	155.100773692461	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	59	676	392109	395294	FALSE	10	TGCACGGTTTCTTGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRNGPYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYMSSCQWQRSPMPALSLPTRW	392050	395794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394061_394364_394514_394759_394939_395230
717422	contig_11120_pilon	+	1059	2	Intergenic	novelGene_161289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGTGTGTGACTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22769	53965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11120_pilon_+_22846_52982
717423	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
717425	contig_11056_pilon	+	2042	4	Intergenic	novelGene_130360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	23.6690139681023	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	149	1270	147617	151925	FALSE	15	ATTCCCATCCTTTTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQDVAVDFTPEEWQLLDCAQRNLYWDVMLENFRNLISVGCPVANPKVIFKLEQGQEPWMVEGEDPCWSYPEADCLLVEEPEKHQESKDSFLKSVSFTFSEILTMGRLHHYNMNTSLNPTIQKSYTCKSCGRSLQPNLNLLNYNSGYTRENSNECNECGKAFKKKFHFIRHEKNHVGIKAFECNDCGKAYRRKTHLETHQKIHNGERPFVCNDCGKAFVHKFQLVIHQRLHTGEKPYECSECGKTFTWNSSFNQHVKSHTLENSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIVCGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYGCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNKCGKAFSQRSNLIVHQKTHI	139539	152697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_139682_147610_147738_149786_149883_151020
717433	contig_19769_pilon	-	1892	1	Intergenic	novelGene_102338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	495	1398	1892	175902	175408	NA	15	AACTTCCGCCCCGCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAGLALALGCVISGLYPQPPRPLHRVFAQIYPLFLLNGKYFFSLLRKPQFGSSHNSTTPQRRLFSKAFFIQPAAPFSSCPSLTPNWALNASQARLPRVSEASGRVLMPLSPDPSRPPQNHCDTSAPTAPGPELTQVGQGREKRSCRSLERWRQLSPPRTGTAAP	177299	175407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_175400_177300
717434	contig_15304_pilon	-	997	3	Intergenic	novelGene_30507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	163	957	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSIPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54262	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_54021
717435	contig_253_pilon	-	1187	6	Intergenic	novelGene_129689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_5	447.184346774348	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	64	462	421711	420586	TRUE	30	TAAGAGAAGCTGTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGESWSRGGPASGRGGARQPVFLSLSHCWPPEPRPFKSSCPAILWTGEHPILQLRK	421774	418701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420841_420948_421056_421318_421355_421710
717440	contig_1639_pilon	+	2215	9	Intergenic	novelGene_74922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	107.142355653588	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	271	978	343623	397115	FALSE	55	GGGTTAATAACAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDEALDYLEKRQKQDPMFTYEVIVVDDGSKDQTSKVAFKYCQKYGSDKVRVITLVKNRGKGGAIRMGVFSSRGKNILMADADGATKFPDIEKLEKGLNDLQPWPDHMAIACGSRAHLEKESIAQRSYFRTLLMYGFHFLVWFLCVKGIRDTQCGFKLFTREAASQTFSSLHIERWAFDVELLYIARFFKIPVAEVAVNWTEIEGMLFIVQLILKPTGRETSDNAVLRQFSRKVS	341624	398352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_341693_343053_343248_343614_343662_344780_344850_354138_354232_357538_357653_374183_374244_390252_390405_396934
717442	contig_8676_pilon	+	1971	9	Intergenic	novelGene_142222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	300.746752891864	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	124	1008	666237	672298	FALSE	25	TCAAAAGTGGCTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPKLAGELQGIRLGSLLPPKQIRLLEATFLSNEVANVKELMARALELESQRWAQDVPPQRLDGHCHSELAIDVIQIVSQSQAKAESITSDLGVQIRQVLLLELAGFLRSYQRAFDDFLERYKQLKNYRANVIANINNCLSFRASVEQRWQTLQDTHSHLLVPLNEIKTHGFDSLLQNLFLDLKPLFKRFTQTRWSAPVEILEEILATVSERLPEFSELQDSVRKELMEAVHLHLVKEYIIRLSKRRLILKTAEQQQQLARHILSNADLIHCFCTQNGSSANWQACLLIPWTLHEFSIAAVTNDHKLSGLKQELIISQPGGQKSEMGLTGLKSRC	665697	673261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_665803_666218_666342_666550_666652_667206_667306_667814_667939_668983_669107_669414_669571_669677_669694_672137
717443	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
717447	contig_15720_pilon	-	1098	8	Intergenic	novelGene_41900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	751	1056	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281930_282573_282750_283785
717452	contig_14807_pilon	-	698	5	Intergenic	novelGene_124663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	5054.1799223514	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	110	601	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38865	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827
717457	contig_16578_pilon	+	3031	1	Intergenic	novelGene_148691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAGAAAAAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342774	345805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_342800_345800
717460	contig_8330_pilon	+	2012	13	Intergenic	novelGene_71788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.992246987467	1	100	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	269	1372	852673	856687	TRUE	40	TTACAAGAAGTACGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837478	857541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837679_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
717464	contig_15410_pilon	-	1727	11	Intergenic	novelGene_130587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_8	211.927346041043	396	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	33	1496	92500	85562	FALSE	10	TGGTGTGCTAGCTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAEKGVSRQAAVSAAPISFSFSRTSARRRVVDLGDSARAAPEEKDFLKTVEGRELQSISVKPSEAPKELVIPLIQNGHRRRLLTQAPGPSTDAETLVDGVLLSQAVKELIEESKKSLEERKNESVDPTLAIPVIQKGCIPSGEGADSELQAETVPEEADYEAVPVEAYGLAMLRGMGWKPGEGIGRTFNQVVKPRVNSLRPKGLGLGANLTEAQALASTGPHRLPKPDEEQEKEKEDQPQGLVPGGAVVVLSGPHRGVYGKVEGLDPDNVRAMVRLAAGSRVVTVSEYCLRPVSQQEFDKNSSDLSQVSKTSSEQQNGTASSWKALWDQDLHVQQEDSERKRKNPPDREDRPAAKSEKAAPRSQHWLRRDLRVRFVDKTHEGGQYYNTKMTVEDVLSPDTCVCRTDEGQILEGLREDMLETLIPKVEGNRIMVVLGPQAGRVGRLLSRDTQQSRALVQLQRENQLVELHYDAVCQYMGPSDSDED	92532	85330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_85697_85793_85880_86394_86465_86562_86687_86891_87019_87711_87845_88121_88336_89116_89227_91215_91341_91434_91599_92324
717467	contig_2867_pilon	-	1387	5	Intergenic	novelGene_135262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	598.48240366781	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	20	430	1289367	1286189	TRUE	10	GGCATTTTGCTTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQLLAQGHLLPARVPPLPTILPPFPISLPCHLLPVLGSGPVEATCP	1289386	1285132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285763_1285861_1286324_1286690_1286781_1288013_1288149_1289316
717468	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717472	contig_3679_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_112123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTAGGTTCAAACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028224	1029420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1028200_1029400
717486	contig_8616_pilon	+	866	7	Intergenic	novelGene_72571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1052.73875623959	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	18	791	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427797_431131_431238_435726_435900_435993_436119_436357
717487	contig_9609_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_22961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAACTTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239158	237160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_237200_239200
717492	SIRV6	+	339	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	144	2	26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAATCTGTATCGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
717494	SIRV6	+	552	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1594_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
717504	contig_6673_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_164002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1024	1443	5905	5486	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIQCSLQPERFSSAFLQLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	6928	5432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5400_6900
717512	contig_859_pilon	-	3537	1	Intergenic	novelGene_132825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104669	101132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_-_101100_104700
717520	contig_253_pilon	+	1463	6	Intergenic	novelGene_129728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.103765954092	94	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	77	961	580321	584892	FALSE	5	CTTGCCACGGCCTCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQVGRGSDGLSCAPSRWVWG	580244	585394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_580322_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700
717521	contig_12790_pilon	+	1574	7	Intergenic	novelGene_35240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	514	junction_5	113.590883828276	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	201	776	307252	310194	TRUE	70	AATATAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	305943	311528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310494_311029
717522	contig_8138_pilon	+	1636	5	Intergenic	novelGene_52427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	554.521415276272	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280080	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280357_288507_288616_304973_305098_306364_306886_307331
717525	contig_10196_pilon	-	2525	21	Intergenic	novelGene_132066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	72.4696488193506	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	336	2261	732513	721848	FALSE	25	TAAACGCTGCGCAGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTFGPAFSAVTTITKADGTSTYKQHRRTPSSSSTLAYSPRDEEDSMPPISTPRRSDSAISIRSLHSESSMSLRSTFSLPEEEEEPEPLVFAEQPSVKLCCQLCCCVFKDPVITTCGHTFCRRCALKSEKCPVDSAKLTVVVNNIAVAEQVGELFIHCRHGCRVAGSGKPSAFEVDPRGCPFTIKLSARKDHEGNCEYRPVRCPNNPNCPPLLRMDLGAHLKECEHIKCPHSKYGCTFIGNQDTYETHLETCRFEGLKEFLQQTDDRFHEMQVALAQKDQEIAFLRSMLGKLSEKIDQLEKSLELKFDVLDENQSKLSEDLMEFRRDASMLNDELSHINARLNMGILGSYDPQQIFKCKGTFVGHQGPVWCLCVYSTGDLLFSGSSDKTIKVWDTCTTYKCQKTLEGHDGIVLALCIQGCRLYSGSADCTIIVWDIQNLQKVNTIRAHDNPVCTLVSSHNMLFSGSLKAIKVWDIVGTELKLKKELTGLNHWVRALVAAQSYLYSGSYQTIKIWDIRTLDCIHVLQTSGGSVYSIAVTSHHIVCGTYENLIHVWDIESKEQVRTLTGHVGTVYALAVISTPDQTKVFSASYDRSLRVWSMDNMICTQTLLRHQGSVTALAVSRGRLFSGAVDSTVKVWTC	741320	721583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_721863_721965_722086_722171_722304_722387_722508_722691_722815_722894_723012_723113_723154_724788_724872_725003_725132_725235_725285_725381_725456_725537_725756_726387_726523_726603_726788_727376_727411_727910_728004_728384_728502_730700_730793_732461_732550_733360_733479_741139
717528	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_114044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	TATTACTGTCAGTATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
717530	contig_709_pilon	-	2679	11	Intergenic	novelGene_57662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	24.1163844719726	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	119	1417	3910980	3862967	FALSE	35	CAGTGTTTATTAAGAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAAVRLLRGSRLLTGNIPTCLSSWNIPPHVLKYSQSEASLNLSNNGLSSVPLQTFTKEELMIKNSVKKFAQQQIAPLVSTMDKNSEMDKSIIQGLFQQGLMGIEVDTKYGGTGASFFTSVLVIEELAKVDASVAVLCDIQNTLINKLIGKHGTEEQQATYLTQLTSEKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKNGDYYVINGSKLWISSAEYAGLFLVMANADPAMGYKGITCFLVDRDTEGLHIGKPENKMGLRASSTCPLTFENVKVPETNILGQVGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERVQFGKRIFDFQSLQHQVAHVATQLEAARLLTYNSARLVEAGRPFIKEASMAKYYASEIAGLVTSKCIDWMGGVGYTKNYPVEKFFRDAKIGTIYEGTSNIQLSTIAKSIDAEY	3911098	3861704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3863038_3864679_3864780_3868088_3868227_3873367_3873458_3875846_3875940_3877721_3877848_3878770_3878942_3879652_3879860_3883848_3883950_3887316_3887477_3910938
717531	contig_11106_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_167454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCAAACTTTTTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151048	150409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_150400_151000
717536	contig_16303_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_34023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGACAAGAGAAGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22865	23119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_22900_23100
717537	contig_18168_pilon	-	1210	7	Intergenic	novelGene_122067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	207.524094986582	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	241	969	26220	23694	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHSLCHCGCGGWSCDLEEEELRWKQRELCSGCNMRLLPCVALSDTKFVHHHHPPPLDFVTSRKPDFVFCSWCLNVSVFLSA	27119	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24883_25081_25315_25964_26224_26483_26642_27040
717545	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717548	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_97499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
717549	contig_12619_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_73553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	138	440	664894	664592	NA	25	TAAACAGGTGTGGTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTHIIKGEDDALSDKHGCPAYVSPEILNTTGTYSGKAADVWSLGVMLYTLLVGRYPFHDSDPSALFSKIRRGQFCIPDHISPKARCLIHSLLRREPSERLAAPEILLHPWFESVLEPGYVDSEIGTSDQIVPEHQEDSDISSFFC	665031	662645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_662600_665000
717550	contig_5832_pilon	+	1318	4	Intergenic	novelGene_134171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	51.0511725842044	1556	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	60	434	565712	569933	FALSE	15	CAGGGGTCTCTGCTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYIPGQPVTAVVQRVEIHKLRQGENLILGFSIGGGIDQDPSQNPFSEDKTDKGIYVTRVSEGGPAEIAGLQIGDKIMQVNGWDMTMVTHDQARKRLTKRSEEVVRLLVTRQSLQKAVQQSMLS	565652	570817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_565751_568817_568938_569380_569459_569795
717551	contig_16103_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_118802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGGATACATCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603899	605568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603900_605600
717554	contig_5039_pilon	+	2473	4	Intergenic	novelGene_64758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTTTGTCGAAAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115186	140087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_116908_118630_118714_118876_118959_139500
717564	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
717571	contig_7356_pilon	-	1864	4	Intergenic	novelGene_60389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	116	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	52	441	457848	433924	FALSE	25	ATAAAATTGCTTTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457899	432500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
717572	contig_13138_pilon	-	1336	4	Intergenic	novelGene_143157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.446825855364	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	498	896	201199	200192	FALSE	25	ATATTTATTGAGTACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSCGDTSVGFSVGIFLFLLLLFFGIGCVWHWKHPNTTRFTLPKFLRRKESKRNDYAKTPSFSPQVIGLKHKISVQTQGHRSAMGKTNIHGNYENVEARPPKAREETDKEITPEFMTFHSWVQFTLPMTLS	204471	199751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_-_200255_200863_201601_202073_202139_204440
717573	contig_10246_pilon	+	1439	10	Intergenic	novelGene_46904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_9	219.391639216322	380	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	64	1068	144696	186021	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQYLSDEVYVKQTS	140736	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_185982
717580	contig_4469_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_21902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTGTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429931	428770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_428800_429900
717583	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717584	contig_3095_pilon	+	1097	5	Intergenic	novelGene_75014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	103	801	147280	151151	TRUE	10	CTCCGCTTTGTAATCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151023_151163_151848
717593	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_95601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
717594	contig_5429_pilon	-	2204	5	Intergenic	novelGene_127778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	516.535272270926	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	54	920	119158	111060	TRUE	20	ATACCACTCAGCTGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWPFLPGASAPAPQVQKMNNLSFSELCCLFCCPPCPGKIASKLAFLPPDPTYTLMCDESGSRWTLHLSERADWQYSSREKDAIECFMTRTSKGNRIACMFVRCSPSAKYTLLFSHGNAVDLGQMSSFYIGLGSRINCNIFSYDYSGYGASSGKPTEKNLYADIEAAWLALRTRYGIRPENVIIYGQSIGTVPSVDLAARYESAAVILHSPLTSGMRVAFPDTKKTYCFDAFPNIDKISKITSPVLIIHGTEDEVIDFSHGLALFERCQRPVEPLWVEGAGHNDVELYGQYLERLKQFVSQELVNL	158342	109716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_110007_110065_111280_113955_114136_118691_119162_158292
717595	contig_3077_pilon	-	2242	8	Intergenic	novelGene_26893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_5	113.307059779691	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	151	1293	1517496	1501298	FALSE	55	AAAATTAAAGCAGAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEQTAGKKKPFVYTQGQAVLNRAFFPCFDTPAVKYKYSALIEVPDGFTAVMSANTWEKRGPNKFFFQMCQPIPSYLIALAVGDLVSAEVGPRSRVWAEPCLIEAAKEEYNGVIEEFLATGEKLFGPYVWGRYDVLFMPPSFPFGGMENPCLTFVTPCLLAGDRSLADVIIHEISHSWFGNLVTNANWGEFWLNEGFTMYAQRRISTTLFGAAYTCLEAAAGRALLRQHMDITGEDHPLNKLRVKIEPGVDPDDTYNETPYEKGFCFVSYLAHLVGDQDQFDNFLKAYVDEFKFQSILADDFLEFYLDYFPELKKRKVDSIPGFEFDRWLNTPGWPPYLPDLSAGDSLMKPAEELAQLWVTKELDMKAINAVAISPWKTYQLVYFLDKILQKSPLPPGKKMWVISFSVVNRGSLCEELIIWGPERDSEKKV	1517977	1500348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1501627_1502946_1503056_1503236_1503350_1504902_1505017_1508719_1508956_1509681_1509799_1517371_1517521_1517851
717598	contig_16907_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_87460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAGAAGGGGCTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467874	465729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_465700_467900
717601	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717602	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	745	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717614	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717615	contig_13740_pilon	-	1591	10	Intergenic	novelGene_34673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	4455.98200785427	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	285	1070	161718	157474	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162027_165237
717616	contig_18869_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_56412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATGTGAAGGAGAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73778	73578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73600_73800
717618	contig_16775_pilon	+	2085	15	Intergenic	novelGene_107778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	236.324448371215	2	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	481	1479	156947	174136	FALSE	30	TACATTTGATTATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130464	174742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145091_156919_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
717626	contig_8729_pilon	+	1491	6	Intergenic	novelGene_40060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	123.905770648505	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	65	793	33998	39354	FALSE	55	TGTAAAAGCTGAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAELADVLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKT	33933	40052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_36925_37784_37959_38491_38596_39239
717630	contig_10627_pilon	+	1311	6	Intergenic	novelGene_59922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	167.309294422037	42	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	67	591	105394	108477	TRUE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGGSWAGLSFNLGGEQRQTGLGRHHGLFIYPPWAS	105327	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108226_108460_108573_108962_109005_109122
717631	contig_14322_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_116487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	129	230	358	671606	671905	FALSE	20	AAGCCGGGCCCGCGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGCGEMRPDVVHVELLLGKLKDNCEA	671376	671906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671680_671850
717632	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
717635	SIRV5	+	350	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-20	875	-20	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8295	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
717641	contig_8020_pilon	+	2254	18	Intergenic	novelGene_114461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	40.099789021699	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	254	2206	388413	431573	FALSE	25	AGGGCACATGGGCTATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHDKDRNVKYYQGIRAAVSRVKERGQKALVLDIGTGTGLLSMMAVTAGADFCYAIEVFKPMADAAVKIVEKNGFSDKIKIINKHSTEVTVGPDGDMPCRANILVTELFDTELIGEGALPSYEHAHRHLVQENCEAVPHRATVYAQLVESRRMWSWNKLFPIHVQTSLGEQVIVPPLELERCPGAPSVYDIQLNQVSPADFTVLSDVLPMFSVDFSKQVSSSAACHSRQFEPLVSGRAQVVLSWWDIEMDPEGKIKCTMAPFWAHSDPEGLQWRDHWMQCVYFLSQEEPVIQGSALCLVAHHDDYCVWYSLWRTSPEKNGGDLHQVRPVCDCQAHLLWNRPRFGELNDQDRTDQYVQALGTVLKPDSICLCVSDGSLLPMLAWHLGAKQVFTVECSAASHRLMKKIFKANHLEEKINIIEKRSELLTPADLGGKKVSLLLGEPFFTTSLLPWHNLYFWYVRTAVDQHLVPSAIVMPQAASLHAMVVEFRDLWRIRSPCGDCEGFDVHIMDDMVKRALDFRESREAEPHPLWEYPCRSLSEPQRILTFDFRQLVPQQPVRAEGAIEAWEKPRGCTVDGLPPDPGQHGQHRPPEACRGQGRLLLEPPLQAGRVLLQHQSGPQSATEQPTVSHLHCGVSSSHRRHHHGFQTLR	382282	431621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387561_388396_388434_401951_402102_403939_404049_406635_406749_413007_413250_413715_413897_416561_416690_417077_417217_423111_423196_423586_423635_424287_424378_427026_427189_428340_428416_430050_430204_431062_431160_431412
717642	contig_990_pilon	+	1128	2	Intergenic	novelGene_76153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	437	514	1799953	1800030	TRUE	80	CAAAAAAAAAAAGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKVSVPDPAGNPWSPAPALSVPVSVTHHGDAAASQPPTNPSSVQQYPRSLAHCCGQPSGPVGPAQATYVSRGQLADLVGLSWDSWGLLHVSLILQQSTQACCHGDGRGARVSKAQGAIPSQVCASLISCQHLTGKARHVAESRVMGTGSIFATCHTTCAELVKYSEYHL	1799516	1803299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1800436_1803090
717649	scaffold_880_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_121504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCAGGGTTCTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558220	555719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_555700_558200
717661	contig_9484_pilon	+	821	6	Intergenic	novelGene_105645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	681.827720175705	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	66	608	98584	101646	TRUE	40	AGCCAAAATGAACGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLLRCNEVHHCGFSYCF	98518	101958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101347_101598_101756_101854
717662	contig_9484_pilon	+	615	4	Intergenic	novelGene_105647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	325.117756444577	7	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	106	471	103508	104965	FALSE	15	TTTCTGTAGTTAGTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	102014	105109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_102080_103467_103641_104260_104412_104883
717663	contig_6028_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_156608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	969	1379	390434	390024	NA	35	CCTAGAATATAATATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGDSAMIAPYFSGKTTSGVLCSLYVLSLAELILSHGFKYHLYADNSHIDTSCPSLSSELHSYIHLPSLPGHLTGICNITCPDRTLNLVIPLALSEYFHPISTTIQWLAKGRILGINFNFSLSFTFHIQTRKHFS	391402	389156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_389200_391400
717666	contig_7202_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_18586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTCATGACATCAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
717672	contig_6710_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_98058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653428	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
717681	contig_18393_pilon	+	2531	13	Intergenic	novelGene_167464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_7	128.75264290707	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1347	1185	2531	93737	100385	FALSE	25	GGTAAAGAGTGTGTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMNLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQEEDVTSKAFTGREFDELSPPAQRDACLTARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKSEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKDDNPDFDGVDCAVFESPYPMTMALSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNLTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEP	81494	100385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_+_81582_82773_83239_86344_86434_86884_86988_88016_88149_93428_93866_95083_95420_96803_97025_97479_97683_98986_99073_99372_99507_100051_100170_100265
717682	contig_10436_pilon	-	837	4	Intergenic	novelGene_108485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1598.30166809092	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTTTGCCTTGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103437	101592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_101973_102019_102098_102535_102868_103390
717685	contig_3789_pilon	+	2359	3	Intergenic	novelGene_79854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	365.5	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2	424	445477	472488	FALSE	10	GGTTGTCTGTCTTAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFAFCTAASAASASTPSTRGAGSVVRGPRRGVGDCEHPGDLRSEDVGHRGLVQEHPSHHALLVRRHRRGALGRQTRPHQPGLLLSLARSLPLSLPDLEANHCHLLLPCGSRNWISLFGQFIFLISVFYTECSLSVQDTIF	445475	474423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457358_472447
717687	SIRV4	+	394	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	145	411	145	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
717688	SIRV4	+	211	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1560	632	1105	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2560	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
717694	contig_15500_pilon	-	2791	1	Intergenic	novelGene_128966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGAAATGTCTAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23704	20913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_20900_23700
717695	contig_1301_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_47320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAAAGAGAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271533	269183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269200_271500
717696	contig_3382_pilon	+	2837	1	Intergenic	novelGene_124114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAACAAAGCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713667	716504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_713700_716500
717701	SIRV4	-	369	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	0	1152	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
717702	contig_13625_pilon	+	794	3	Intergenic	novelGene_150168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	454	792	39993	43692	FALSE	10	CTAGCTGCTTCCTCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLMGLVSLGLRHWPCISSMALQACELRANLTKAMPLDSLVCLSRTTQMSWISPKGENRSLSTDSGVYLLITRKMRLLGGSSRLFTPGRKPPPLAQPPASSMALHPGAESPQ	37707	43694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_+_38042_39873_39999_43359
717704	contig_10734_pilon	-	2089	4	Intergenic	novelGene_50999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	2	119	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	87	692	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320718	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
717721	contig_8377_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_35157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATGTCATACAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198974	197692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_197700_199000
717725	contig_7057_pilon	-	1372	3	Intergenic	novelGene_123263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_1	21	510	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	28	516	572964	571437	FALSE	25	GAGGCCAGGGCACAGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRERRRNRMEIPVPVQPSWLRRASAPLPGLSTPGRLFDQRFGEGLLEAELAALCPATLAPYYLRAPSVALPTAQVPAEPGHFSVLLDVKHFSPEEITVKVVGEHVEVHARHEERQDEHGYIAREFHRRYRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPAPAQSTPPPPAAAK	572991	570580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_571605_571706_571830_572766
717726	contig_5779_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_106504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCAAGGCCCAGCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209816	208652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_208700_209800
717733	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
717738	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
717744	contig_6568_pilon	+	1955	11	Intergenic	novelGene_152860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.1047166813062	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	238	1725	157628	181774	FALSE	40	AAGAGAAACTGGACTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGKGCDLNTSGHSKTDGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	144093	182004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148907_157598_157683_160247_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
717747	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717756	contig_9354_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_108054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCAAAAAAACCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207452	206770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_206800_207500
717759	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717760	contig_10196_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_132229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	747	1208	1432233	1431772	NA	0	TCGGCCTGTGGGCTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGCPGRAGQVGLATGLSWLPQPGIWFRRGVPGVPEKTWQAHEAWCRRSTGHGPQGGQCGAIGPLGPPWNLVALEVTPEGLYQLEMARLEGLVGSWGLSPCRSCSQSRVRDLWVARGTSVWDHHLCIASPRMSYFVMIKLHLVITPMYMANI	1432979	1431524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1431500_1433000
717761	contig_10063_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_127765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774201	771577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_771600_774200
717762	contig_15744_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_83615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTGGTCCCATTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154343	156517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_154300_156500
717763	contig_20374_pilon	-	2080	10	Intergenic	novelGene_166011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_9	71.6872494129539	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	39	716	23097	8939	TRUE	30	CTAATATAGCTCTTATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVARLTRSWRPRYARSPMQISNFPVLQMHKSQTAMRASQKDFESAVNQMKLLTKDPGNEMKLKLYALYKQATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLR	23135	3681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128_5273_6728_6819_8068_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_20713_20877_22691_22739_23091
717768	contig_3846_pilon	-	1959	4	Intergenic	novelGene_137142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_3	385.882826199295	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTGAAGTTGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160229	148813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_149077_152512_153985_158531_158609_160082
717771	contig_3942_pilon	+	1797	13	Intergenic	novelGene_128817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	158.815581379438	406	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	21	1493	1060476	1072979	FALSE	10	TCCCTGGTCCAACTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFRELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSSTFSIKKIRFLVLDEADRLLEQGCTDFTADLEAILGAVPACRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVRTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQGFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFNFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGMAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLDEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEATSFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKTELAKIRQKNRRFKEKVEQTLQRQKAGGRPRGVPTQGPARVPQSPAHPGPGLSPPQPPST	1060455	1073283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1060591_1067851_1067976_1068944_1069031_1069113_1069236_1069385_1069574_1069654_1069796_1070818_1070895_1071136_1071214_1071329_1071428_1072218_1072294_1072448_1072538_1072617_1072690_1072769
717777	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717779	contig_1948_pilon	-	2196	3	Intergenic	novelGene_31184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	359	junction_1	174.5	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	34	393	552044	546700	FALSE	65	AAAAAAAAAAGATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWQVQQSLQYFVLCSVCLL	552077	544896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_546900_548485_548594_551992
717784	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	62	488	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
717788	contig_8812_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_57263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACGGATGAATCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22562	23516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_22600_23500
717789	contig_10341_pilon	+	1377	8	Intergenic	novelGene_47242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90.0331004890616	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	230	598	137256	156517	FALSE	30	TAGTTTGAGCACTACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKRFLYKKLPSVEGLHAIVVSDRDGVPVIKVANDNAPEHALRPGFLSTFALATDQGSKLGLSKNKSIICYYNTYQVVQFNRLPLVVSFIASSNANTGLIVSLEKELAPLFEELRQVVEVS	136063	157296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_136124_136460_136511_137136_137259_139287_139323_147431_147491_149233_149368_151628_151693_156443
717790	contig_3472_pilon	+	3369	20	Intergenic	novelGene_166938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAGGGATTTTAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697057	801837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_697701_708129_708307_715185_715345_738896_738982_744459_744593_745689_745895_747897_748098_756336_756423_758043_758179_759468_759547_759631_759779_766107_766204_773649_773808_779791_779958_782991_783208_790094_790257_795520_795588_796723_796846_801299_801432_801635
717798	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717803	contig_20199_pilon	-	783	3	Intergenic	novelGene_82525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	40	375	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44026	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
717806	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
717807	contig_7078_pilon	-	2460	1	Intergenic	novelGene_130174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTTTAAACTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754123	751663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_751700_754100
717817	contig_12671_pilon	+	1834	6	Intergenic	novelGene_19218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	392.97562265362	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	78	626	197316	211199	FALSE	20	CATGTTTCTTCGTGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDVSMLFNTFDIYIKTNKPVLEEVQPECSP	197238	212407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053
717818	contig_9345_pilon	+	2017	8	Intergenic	novelGene_24475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_7	69.0876402898256	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1001	1696	622829	631320	FALSE	80	TTATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	621828	631641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
717820	scaffold_19766_pilon	+	2475	5	Intergenic	novelGene_34378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.06155281280883	81	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1235	2032	726532	727329	FALSE	20	CTACTTGATTTATGTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722581	727772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722731_723435_723738_723925_724236_725832_726071_726296
717827	contig_6710_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_89112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653637	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
717828	contig_4079_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_167483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135983	133422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_133400_136000
717829	contig_6199_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_126411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAAGTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692606	691249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_691200_692600
717834	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717841	contig_8628_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_164427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAAAAGAGCTGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447584	449567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_447600_449600
717842	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717844	scaffold_15568_pilon	+	2248	4	Intergenic	novelGene_122573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	18.7082869338697	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	128	1279	57920	94676	FALSE	40	ATAAACCATAACTCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVREPITFEDVTVVFTEAEWKRLSCEQKNLYKEVMVEIYRNLLSLEPKLELYPCSSCLLAVSCQQFLSQHVLQIFPGLCAENHFHPEDSSPGRQKQSEQQGSLPRCWNENTKGQEREVVSKPLCGRTGERETSRTFSSLAQGWSASPREGNTVVGTEPNSAQRVNSVETDNGLKELETSRFGAVSYREDQPHCGLKSKFITNQRALLREKPYVYSECGRGFSHKSDLVIYHRIHSDEKPYVCSECGRGFNRKSNLIAHQRTHSGEKPYKCLECGRGFSQKSGLLLHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLIRHQRTHSGKKPYMCLECGQGFSHKSRLFRHQRTCSGEKTYVCLVCGFNWKSVLMHQRAHWGEALSLQRV	57792	95645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_57935_81493_81621_92072_92920_94513
717846	contig_9706_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_20976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTTGTTTATCAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350558	351639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_350600_351600
717847	contig_9345_pilon	-	1530	4	Intergenic	novelGene_24331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	12.9185482500507	237	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	377	1282	112405	110961	FALSE	25	TTATATCAGACTGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARGLVREAQGDLEVQQAKLKEVRDRLDRVSREDNQYLELATLEHRMLQEEKRLRTAYLRAEDSEREKFSLFSAAVRESHEKERARAERTKNWSLIGSVLGALIGVAGSTYVNRIRLQELKALLLEAQKGPVSLQEAIREQASSYSLQQRDLHDLMVDLRGLVHAGQGQGSASQTGTSPTQVKDTEVLSAALQEQISHSRQVHSCLKGLQEQLDGLEKTFSQMAGVVQLAKAAVHPGLAEQADRAPPSSLLEQGSMLLALSDMEQRLEAQVNRNAVYSTLVTCVMVAATLPVLYMLFRAS	117427	110712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_111717_112255_112421_113428_113628_117265
717848	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
717849	contig_4640_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_147966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAAACCAGCCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394190	394648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_394200_394600
717850	contig_17432_pilon	+	1829	9	Intergenic	novelGene_159003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	199.966208082766	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	67	1434	19967	82590	FALSE	25	GACCCACACAGGGTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMTTRMITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYVIAFQSIGVTTNSEMQQCIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPSSRNVWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAILTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLGRMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEGDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVRRIFARAFCFSSLYQFINSEF	19900	82985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_19990_24841_25000_25124_25358_33827_33933_36071_36160_40289_40388_41643_41777_47851_48100_82308
717853	contig_9381_pilon	-	1257	7	Intergenic	novelGene_129366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	93.2572606646081	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	808	1185	47583	19597	FALSE	20	GTAATCCCTTTTGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVRSVPVSSRRYKRLNGQLLSGDLLLLPGEVEQYISTSAPSYIPSVDQILTPEVKPSTTTNRAGKPMEELLGDEVHPFSLDEEFDYDKVMLTPKFTSAEMDTIKQLSKQKKENPNGDLEEPHD	74684	19524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9381_pilon_-_19762_34777_34918_47510_47936_48899_48967_50275_50348_52639_52798_74526
717856	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	31	354	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
717865	contig_5812_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_167492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCAACAACTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90502	92051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_90500_92100
717867	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717873	contig_6710_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_97904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653705	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
717876	SIRV2	-	650	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	0	2967	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
717878	contig_12864_pilon	-	1405	4	Intergenic	novelGene_76452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	783.666737558483	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATCTGCATCACTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249715	244710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_244767_245704_245780_245825_246348_248963
717880	contig_8636_pilon	-	1300	4	Intergenic	novelGene_141922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_1	60.0795768589922	1368	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	382	714	391928	384902	FALSE	15	GTCAGTCACCTTCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKHHPDLIFCRKQAGVAIGRLCEKCDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSYQGRCVICGGPGVSDAYYCKECTIQEKDRDGCPKIVNLGSSKTDLFYERKKYGFKKR	392309	384315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_384992_390530_390698_391414_391439_391876
717887	contig_10734_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_51522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAACCTAATTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2274608	2276659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2274600_2276700
717888	SIRV1	-	172	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3932	0	3658	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6708	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
717892	contig_9121_pilon	+	2360	1	Intergenic	novelGene_134471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGGTGAGGGAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264285	266645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_264300_266600
717897	contig_6710_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_97855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717902	contig_1406_pilon	-	2776	6	Intergenic	novelGene_25626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	236.03440427192	100	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1740	2363	2660134	2614118	FALSE	15	GATGTTAGTGAGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNLKDKKALLRLLDKHDQRGLGGILLEDIEEGLPNSHKAVKALGDQIIFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDDEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKVAPVQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITPGK	2661873	2613704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2635836_2635931_2644012_2644196_2645903_2646012_2660128
717903	contig_3155_pilon	+	1450	5	Intergenic	novelGene_26401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	42	548	258156	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258114	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261836_262254
717915	contig_12864_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_76370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTTGACAGTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183292	184895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_183300_184900
717916	contig_12864_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_76371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	184948	185256	NA	80	AAACAAACCAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHLDSLCQIAESHNHISRLVYLLQDSDCLCEQSWGIGTSILGHSGTEILLIPGRSASEDTSNGEDSKRVAEGSPLLISHGCSWIYKNFLFSRRKPIKYPVP	184945	185872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_184900_185900
717917	contig_14322_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_116177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671859	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
717928	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717932	contig_15047_pilon	+	1420	7	Intergenic	novelGene_52112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	7	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	46	822	2194	4409	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPARTQSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDPLWRPLERSKDTHVVCSTRG	2148	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4181_4292_4346_4434_4552_4664_21198
717936	contig_6102_pilon	-	1764	14	Intergenic	novelGene_32383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_10	150.774999889624	692	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	168	1379	1743430	1728861	FALSE	0	TGTGGCCTCTGCTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGK	1743597	1728475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743394
717941	contig_6217_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_109567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACTGTATTATACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54957	55532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_55000_55500
717942	contig_12250_pilon	-	2122	5	Intergenic	novelGene_80625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	688	1056	353738	352316	TRUE	30	TGCGGTTATGGAAACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMTVDLYQGWGGISRAMFLVRQGASKGLALFFPKMPPMTVRGKPTSSQTVRSSRMVVAGSACVEPLAQCTEFTTLHVRKKGEETGGENDVPHPTLASNLPVEVAGHIARDAAGQGIQQDGC	354969	350162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_350550_351347_351965_352253_352440_353493_353759_354302
717947	contig_12270_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_113295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	31	378	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14439	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
717951	contig_4754_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_35988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAATTCACCTAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549468	548823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_549016_549379
717953	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	282	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717954	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
717958	contig_6980_pilon	+	1887	7	Intergenic	novelGene_36061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	848.156170106006	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	7	573	356720	370545	TRUE	30	ACTGTGTCATTGGAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQVCLNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRPLNGLLPCIRIVLDMLVLSLKMEK	356713	373890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_356781_362331_362433_364872_365032_368206_368376_370468_370641_371430_371485_372725
717959	contig_4125_pilon	-	1591	8	Intergenic	novelGene_25204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCGCGCTTCGCTCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518929	1505641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1505710_1510863_1510951_1512030_1512099_1512260_1512364_1513875_1513974_1515275_1515359_1517031_1517174_1517987
717963	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657826	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVAPSWSWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657798
717964	contig_20356_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_159522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGTTTAACAGAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4801	3363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_3400_4800
717970	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
717971	contig_10642_pilon	-	2825	1	Intergenic	novelGene_78730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	15	557	1266079	1265537	NA	20	GCCACACTGGTATTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIPSTPPNSPMQTPTSSPPSFEFKCTSPPYDTFLASKPASSILREVREKKSVRSSESQTDVSVSNLNLVDKVRRFGVAKVVNSGRAHIPTLTENQGPLLCGPPGPAQALVPRGLVPEGLPLGCPTVTSAIGGLQLNSGIRRNRSFPTMVGSSMQMKAPVTLTSGILMGAKLPKQTSLR	1266093	1263268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1263300_1266100
717972	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
717974	contig_7202_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_17320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
717980	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	176	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
717983	contig_16999_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_84978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTTGTTAGGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75336	77452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_75300_77500
717986	contig_14666_pilon	-	1875	6	Intergenic	novelGene_39485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	1084.06973945406	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	223	783	458202	296402	FALSE	20	TGTATCTATCTATCTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWIPDGPTALEEPKGRPIYRT	475119	295309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_296462_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_475054
717988	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
717990	contig_709_pilon	-	1790	12	Intergenic	novelGene_57558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_11	111.315499800647	261	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	45	1568	1580832	1566311	FALSE	20	TTTCACCAGATACCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPGSWSRLPWAEVMGDLKEAEAEAPPAGAAARGRLSLLPQGEPEESSAQGSAVFLGGNEVKSRAVVKYSSAPARTAFARLQEKTDLKLPPANWLRESAKLGPAGTTILGNSKRSKPFSSFGMAYDFIDSVGNDVDVVSDSENIKKLLKIPYSKSHVSMAVHRIGRTLLLDELDIQELFMRSSQTGDWTWLKEFYQRLIDQKWQRKKKSKEHWYQKAILSKFLYYSISGDGAAQPVPSAADQQGSSSPAQTTDSERASWPAPFEVPSSVSEDPSASNQESEPFEPSYIVGHVASAPKEQNLTTLFNDGENSQGLKNDFVRNILWTFEDIHMLVGSNMPIFGGGRYPAVSLRLRDNNKPINVLTGIDYWLDNLICNVPELVMCFHVNGIVQKYEMIKTEEIPNLENSNFSTKVIKDIAQNILSFLKSNCTKEGHTYWLFKASGSDIVKLYDLTTLCEETEDKYRNPFTMPVAVLLYKVACNMMMKKNQNKKHYGTIRTLLLNCVKLLDKGRHPQVRLTLSVH	1580876	1566088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1566450_1566821_1566931_1567005_1567154_1569749_1569862_1570545_1570668_1570944_1571047_1575108_1575266_1575514_1575640_1576673_1576800_1577471_1577539_1578620_1578830_1580724
717992	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
717994	SIRV7	-	220	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69050	10	35831	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAACATGAAAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78907	56047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
717995	contig_10050_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_119621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCTGGCATTTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216853	215343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_215300_216900
717996	contig_15888_pilon	-	1079	9	Intergenic	novelGene_84427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	64	873	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259789	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251718_252221_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
717998	contig_13547_pilon	+	2701	2	Intergenic	novelGene_104898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCTTAAACATTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216609	220886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_217119_218694
718001	contig_6885_pilon	-	1977	8	Intergenic	novelGene_83642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_7	245.187225422133	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	215	1267	278167	128411	FALSE	75	GCCCATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPPGKALCCQSKSRVIKLRLLRAASSVPGSRAFEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGLHAGSMKTEVLGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGEDEEETNVIVLSYPQYCRYRSMLKRIQDKPSSILTDQFALALGGIAVVSKNPQILYCRDTFDHPTLIENESVCDEFAPNLKGRPRKKKSCPQRRDSFSGVKDSNNNSDGKAVAKVKCEARSALTKPKNNHNNCKKVSNEEKPKVTIGEECRADEQAFLVALYKYMKERKTPIERIPYLGFKQINLWTMFQAAQKLGGYETITARRQWKHIYDELGGNPGSTSAATCTRRHYERLILPYERFIKGEEDKPLPPVKPRKQENSSQENDNKTKVSGTKRIKHENPKSKKEKENAPKPQQEASEVSCSPPWKSL	312244	127700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_128646_144722_144821_154941_154995_156958_157164_163851_163965_219234_219466_278049_278276_312138
718002	contig_19851_pilon	-	972	6	Intergenic	novelGene_29864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1098	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCACCATGACCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	53530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53700_53931_53978_54059_54144_55648_55751_55838_55880_56001
718004	SIRV2	-	433	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	45	3254	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
718005	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	80	AAAAAGAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
718011	SIRV7	-	275	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	21	91630	-11	-91624	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTATAAAACTAGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147936	147661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
718019	contig_10324_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_7850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGGACCCTGGCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307900	306343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_306300_307900
718021	contig_15304_pilon	-	849	3	Intergenic	novelGene_30491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1400	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	777	806	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_54207
718022	contig_14273_pilon	-	2197	5	Intergenic	novelGene_21131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	23.6008474424119	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	385	1863	24983	20455	FALSE	25	TTATTATGTAACTTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGICCSVNFSVEHFSKDLKEDLLYNLKQRGPNSSKQLLKSDVNYQCLFSGHVLHLRGVLTPQPVEDERGNVFLWNGEVFNGIMVEAEENDTQIVFNYLSSCKNESDILSLFSKIQGPWSFIYYQASTHYLWFGRDFFGRRSLLWHFNNLGKSFCLSSVGTQTSGVANQWQEVPACGIFRIDLKSAAISKCVILKSYPWKYISRENVIKECVDSLTQISADLPKIVSVEANEAKLYLEQSVVPLNMVLPPAAFETHCTDISRVPPIRETLQVCLTDRHMKEVVQQFIDVLSISVKRRVLYLPRDESLTSNVLKTCDKRASIAILFSGGIDSMVIATLADRHIPIDEPIDLLNVAFMTKEKTIPTSSNKKRSKQKNHCEIPSEEFSKNLAATADDNPDKQLSVPDRITGRAGLKELQAVNPSRIWNFVEINVSLEELQKFRRTRICQLIQPLDTVLDDSIGCAVWFASRGIGCVVTQDEVKSYQSNAKISFPG	29342	20120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_20473_23522_25076_25991_26068_27254_27309_29180
718027	contig_9706_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_21019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563860	562500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_562500_563900
718029	contig_16685_pilon	+	2673	2	Intergenic	novelGene_115065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATATTTGCAGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613959	621871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_614038_619276
718030	contig_13481_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_119270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTAAGACAGTTTAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52523	50538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_50500_52500
718031	contig_6412_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_149989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAAGCTCTCCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667189	669428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_667200_669400
718032	contig_6589_pilon	-	749	7	Intergenic	novelGene_25872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1250.19937298905	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	25	747	959104	955188	FALSE	10	GCAGATGGCTCTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEQPLGCRAVGPDPTCTFPQVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQVSIRPQPLLPLHPRSVALSSPPAPNPQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFW	959128	955185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955679_955831_956001_956181_956730_956815_957251_957360_957758_957846_959101
718034	SIRV7	-	361	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-21	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114759	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114689
718036	contig_11281_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_125502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCCAGTCACATAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942518	941782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_941800_942500
718044	contig_6208_pilon	-	1758	2	Intergenic	novelGene_53008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	1120	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTTGTGTCTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460964	457258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_458223_460170
718048	contig_16594_pilon	-	2788	1	Intergenic	novelGene_53933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTTTGCAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334743	331955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_332000_334700
718057	contig_3153_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_104680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGACCAGGATCACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246802	248836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_246800_248800
718069	contig_19076_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_74226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143445	145360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_143400_145400
718072	contig_19145_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_164143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTTGTTAAAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144843	144086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_144100_144800
718083	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2794_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
718092	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718103	contig_10711_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_118452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	107	313	847271	847477	NA	25	CATCAAGTTGATTCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THQKPALTWLAQPPISCTTSGSFLNSLDLIFLIYEMRQLNTVTLRFLPALTVHSYDQRLWLHLLTLTLQSLAPDSSLLCLHSVFLTQQTMVANEDVRSFSDLS	847164	848503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_847200_848500
718107	contig_12116_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_167500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTATATTTCCAACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26402	25916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12116_pilon_-_25900_26400
718108	contig_15114_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_121110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAGGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83264	85269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_83300_85300
718109	contig_5947_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_101463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGCATCAGGATTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33792	34990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_33800_35000
718115	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718116	SIRV2	-	645	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	0	2972	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
718117	contig_6710_pilon	-	477	2	Intergenic	novelGene_98125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CCCATCTCGTCCCCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718119	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	187	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
718121	contig_8045_pilon	+	1378	5	Intergenic	novelGene_35372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	1187.08516438375	3	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATAAATTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116045	119381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
718124	contig_11115_pilon	+	843	4	Intergenic	novelGene_102853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	385.016305571018	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	216	719	171704	173204	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDRDPIPRQVIPQWHLPLSGRQLAGHDHRGGGDGSSGLERPLRHHHHGGVSGLGPGDYYSSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	171128	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171336_171695_171948_172860_172964_173047
718130	contig_1331_pilon	-	1254	4	Intergenic	novelGene_37829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	FALSE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
718151	contig_1275_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_108740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGACTCCTGGTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371497	373081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_371500_373100
718153	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
718157	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718159	SIRV6	+	382	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	411	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1750_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
718160	contig_15063_pilon	-	1175	4	Intergenic	novelGene_14323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	728	1051	35891	35108	TRUE	15	CCAGGTACTCATCGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36728	34871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36146_36255
718163	contig_16525_pilon	-	394	3	Intergenic	novelGene_133862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2163.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	75	338	181180	178157	FALSE	15	AGGTTCGAGGACTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKGAHTPSFVCVFPTAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181254	178100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178516_181150
718165	contig_13494_pilon	-	2376	10	Intergenic	novelGene_167514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	260.609731396902	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	261	902	84021	32953	FALSE	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKLEFPSLPQCKDDAEEWSYPMRREMQEILPGLFLGPYSSAMKSKLPILQKHGITHIICIRQNIEANFIKPNFQQLFRYLVLDIADNPVENIIRFFPMTKEFIDGSLQTGGKVLVHGNAGISRSAAFVIAYIMETFGMKYRDAFAYVQERRFCINPNAGFVHQLQEYEAIYLAKLTIQMMSPLQIERSLSVHSGTTGKDFFFLEKVGGER	84281	31478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_33091_41549_41623_45170_45222_45317_45358_48686_48724_49145_49207_51817_51916_55521_55576_58442_58476_83964
718167	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
718169	contig_15866_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_63640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAGAAAAAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478141	480511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_478100_480500
718174	contig_1639_pilon	-	2030	9	Intergenic	novelGene_74916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	40.5953738127881	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAGTTGTAGAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340164	331939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_332077_332460_332568_333095_333217_335007_335105_335826_335873_335959_336066_336879_336926_338135_338210_338868
718179	contig_11702_pilon	-	1177	8	Intergenic	novelGene_141955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	101.926343954037	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	131	844	319845	289501	FALSE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321154	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
718184	contig_5643_pilon	+	1401	11	Intergenic	novelGene_39061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	653.576537216568	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	629	1399	634983	638117	FALSE	10	GGGTGTCCTGAGCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEP	631220	638119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045
718189	contig_5317_pilon	+	730	4	Intergenic	novelGene_76510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	110	520	35282	43326	FALSE	45	GGACACAAAGCATTAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33679	43536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
718191	contig_11678_pilon	+	2901	1	Intergenic	novelGene_160856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	715	1155	315703	316143	NA	40	CACACTAAAAGTACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWQGSAPSFSANLLQAWHPSPSSSGEENGVYLRPGLATPSTKPVGSSRAPAHPSTYCSLTCGRETRGRKTEGPKAPCSGGQKVHFGVFVWIYYHNWHGEVLGQAGHSQGLAPYQRQQPSPSRGTKPFPQSSLPTRLALMEHHIYH	314988	317889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_315000_317900
718192	contig_12032_pilon	-	1490	7	Intergenic	novelGene_139264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	78.3127632566294	1	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	79	954	122315	96979	FALSE	15	CTTGGCAGTCTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSARVTRRVVSGELGLLLPKSRLRGHMAQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQAVQEEAQAEKRCSERAPHGVPATVTPPHPILSYSLSFQPSLSSRNYWW	122393	96442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
718200	contig_5092_pilon	+	1856	3	Intergenic	novelGene_62310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTTTCAAACTGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443205	447877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_444965_446111_446166_447834
718201	contig_5620_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_161357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAGAAGAAGATAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414515	413200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_413200_414500
718203	contig_4418_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_98388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAACCATACCTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882202	883420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_882200_883400
718204	contig_20029_pilon	-	1337	7	Intergenic	novelGene_138898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.986854216697	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	39	1178	11696	5156	FALSE	10	AGCATTGTCTTTTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRPVELLPPLTMEQLSAANTRFAVDLFRALNEDSPAGNIFFSPVSISSALAMVFLGAQGSTALQLSKTFHFDAVEEVHSRFQSLNADINKRGASYILKLANRLYGEKTYSFLPEFLESTQKMYGAELASVDFQLASEEARKQINQWVKGQTEGKIPELLASGTVNSMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTDAPFRLNKKDTKTVKMMYQKKKFPYGYIQALKCRVLELPYQDKDLSMVILLPDDIEDDSTGLQKIEEQLTLENLSEWTKPENLHTMEVNVSLPRFKLEETYDLNSYLARLGVQDLFNSSKADLSSMSGARDLFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIANFCMLVPEETFNADHPFFFFIRHNPSKSILFCGRFSSP	12758	4996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_-_5561_7095_7264_7349_7493_9501_9620_10088_10227_11528_11706_12729
718205	contig_11417_pilon	+	1232	7	Intergenic	novelGene_103268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	158.113619485061	999	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	94	576	284496	328238	TRUE	20	CATCGAACCCCTTATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARGCHMALLGLPAHLFLLA	284402	334214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751_319902_327166_327287_328186_328319_333430_333489_333696
718206	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
718207	contig_17660_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_167520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTAAACCCACTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2990	717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17660_pilon_-_700_3000
718211	SIRV1	-	192	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3912	0	3638	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6728	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
718218	contig_7334_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_50578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	125	880	120421	121176	NA	25	AGATGGGCTCCAACTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	120296	122487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_120300_122500
718221	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718226	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
718231	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_96485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653770	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718232	contig_8587_pilon	+	3192	21	Intergenic	novelGene_159118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	13.2795896020924	162	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	535	2796	173685	188108	FALSE	10	CTGTCCTGGGTGTGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWVFGAERWDNLIYYALGGHKDAIVACFFESCSLDLYTLSQDGALCVWQCDTPPEGLRLMAPRGWKADLLKRDEDVEDDADRERETTVRGTATPAEEEKKGKVKYTRLAKYFFNKEGDFNNLTAAAYHKKTHLLVTGFASGTFHLHELPEFNLIHSLSISDQSISSVAINSTGDWVAFGCSGLGQLLVWEWQSESYVLKQQGHFNSMVTLAYSPDGQYIATGGDDGKVKVWNTLSGFCFITFTEHSSGVTGVTFTSTGYVIVTSSMDGTVRAFDLHRYRNFRTFTSPRPTQFSCVAVDGSGEIVSAGAQDSFEVFIWSMQTGRLLDVLSGHEGPISGLSFNPAKSVLASASWDKTVRLWDMFDSWRTKETLALTSDALAVTFRPDGAELAVATLNSQITFWDPENAVQTGSIEGRHDLRAGRKELDKITAKHSAKGKSFTTLCYSADGQNILVGGLSKFVCIYHVKEQILVRKFEISCNLSLDAMEEFLNRRKMTEFGNLALIDQDAGEEDGVVIPLPGVRKGDMSSRHFKPEIRVTSLRFSPTGRCWAATTTEGLLIYSLDARMTFDPFELDTSITPSRIRAALRQRDFTRAILMAFRLNEQALVQEALESVPQDEVEVVSSSLPELYVEKVLEFLATSFEVSRHLEFYLLWTRQLLMQHGQKLKSRAGTLLPAVQFLQKSIQRHLNDLSKLCDWNCYNMRYALAVSKQRGVKRPAEPPGSEEEAAASTDDEDSLRLLAGTEEEEGEMLS	166370	188504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_166426_168271_168385_169728_169824_171635_171736_172453_172600_173659_173796_174130_174355_175056_175201_175969_176041_176721_176859_177477_177627_177825_177974_178217_178369_179517_179699_179988_180137_180453_180563_181284_181351_182663_182883_183008_183160_183283_183359_187930
718235	contig_14322_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_116406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671578	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
718237	contig_6445_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_77043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAGTACATATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613648	615635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_613600_615600
718245	contig_3721_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_123842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCTACCTTAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519975	518516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_518500_520000
718258	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718260	contig_253_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_129665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	111.34841326127	615	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	552	1559	393089	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREACRGLLLAPPPHAPLASAAGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395642	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390263_390353_390436_390689_390857_391020_391234_391669_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
718261	contig_20004_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_167524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAACGTGGCCAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15292	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_13800_15300
718262	contig_4071_pilon	+	2086	2	Intergenic	novelGene_151888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	256	804	338050	338598	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRRCFAVHSLNSLGRLISSLNSGIGQGSL	332235	339880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_332490_338048
718264	contig_9935_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_164849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTGCTTTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3576	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_2800_3600
718267	contig_5039_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_65054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTGTGGACTCGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1824137	1825596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1824100_1825600
718274	contig_14322_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_115682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGCTGGTGTAAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
718275	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
718276	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718277	SIRV5	+	547	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCTTTGGTACGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	2393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
718278	contig_8020_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_114358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	96.729002889516	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	104	853	107186	101913	TRUE	10	GCTCCATTCTGTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKSPGRHFVILDEYN	107289	101027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_101444_101870_101953_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
718279	contig_10475_pilon	-	1869	7	Intergenic	novelGene_148738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_4	226.691910359021	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	144	437	266553	240259	TRUE	35	CTATATTGAAGTCAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPPVHRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTTR	268719	228100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_229298_239076_239131_239831_239882_240127_240269_263189_263254_266333_266556_268578
718286	contig_16310_pilon	-	1819	4	Intergenic	novelGene_70099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	71	junction_3	116.816094781498	265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	8	403	321230	316889	FALSE	65	AAAAAAACATACGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWMNLRDAETGKVLWQGTEDLSIPGVEHEARVPKKILKCKAVSRELNFSSAEQMEKFRLEQKVYFKGQCLEEWFFEFGFVIPNSTNTWQSLIEAAPESQMMPASVLTGNVIIETKFFDDDLLVSTSRVRLFYV	321237	315472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_316971_319416_319523_320234_320361_321148
718291	contig_11702_pilon	+	985	7	Intergenic	novelGene_141992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	583.484861271767	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	337	669	383406	384186	FALSE	5	GGGGTCTCTGCTGTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	381089	384502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382433_382562_382657_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
718294	contig_7963_pilon	-	2400	12	Intergenic	novelGene_58588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	131	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	561	905	268683	267962	TRUE	20	CCCTTATCAGGGAGCGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFRYEFICTGILGSSHNLLIRAVLQSISNVVPHRAREKHRLLPHQNHLSVQVAVLILGDGLPIQQQLAPCGLVQILQQGSHCALPRPIGSHQRGHLTRTKGERQPLDTGWSG	270146	259796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_259885_260448_260953_261042_261141_263614_263852_264153_264228_265073_265273_265462_265594_267797_267981_268165_268343_268534_268697_269103_269239_269734
718300	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718301	contig_5799_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_50276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTGAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286921	287868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_286900_287900
718302	contig_11816_pilon	-	1343	13	Intergenic	novelGene_98516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	389.78329983894	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	77	1054	1086647	989467	TRUE	60	AAAAAAAAGATTTTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNPGASSSCRTPSRKQQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLSKTNLYIRGLPPNTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPNGRPWHREGEAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQVQSPSWMQPQPYILQHPSAVLTPSMEHTMSLQPASVISPLAQQMSHLSLGKWSAAGGCRDV	1125282	986064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986310_989422_989505_992068_992166_995414_995466_999066_999161_999284_999335_1000393_1000501_1015122_1015203_1017129_1017288_1027665_1027758_1033126_1033186_1086495_1086672_1125230
718304	contig_19647_pilon	-	1909	9	Intergenic	novelGene_144004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	225	junction_4	245.858063727835	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	181	1296	137920	73991	FALSE	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTIASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAGGKKGARKSKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQKLNLIHSEITNLAGFEVEAIINPTNADIDLKDDLGNTLEKKGGKEFVEAVLELRKKNGPLEVAGAAVSAGHGLPAKFVIHCNSPIWGADKCEELLEKTVKNCLALADDKKLKSIAFPSIGSGRNGFPKQTAAQLILKAISSYFVSTMASSIKTVYFVLFDSESIGIYVQEMAKLDAN	146552	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_94938_95039_102559_102668_112495_112694_113103_113211_137748_137954_146405
718305	contig_11227_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_163182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAAAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137317	135071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_135100_137300
718307	contig_15063_pilon	-	837	2	Intergenic	novelGene_14427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTCAAAAGAGAGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	35836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36156_36264
718309	contig_5403_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_87984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457458	455380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_455400_457500
718311	contig_1275_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_108800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCTTAAAGTTAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527359	529989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_527400_530000
718315	contig_17274_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_26509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTACAAAAATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87699	88594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87700_88600
718316	contig_11338_pilon	+	1073	8	Intergenic	novelGene_6153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	517.715271206883	14	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	428	856	7368	13398	FALSE	30	ATTTAACCTCTAGTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	744	13615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6083_6131_6252_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8006_13296
718320	contig_13305_pilon	+	1863	13	Intergenic	novelGene_146780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	51.1742665365665	96	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	575	1024	175995	180726	TRUE	5	GCTGTCACCCTCTCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTKLGQFRVKEEDEGGSSLRPGALFFSRVNKTSPATASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSPLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKLSAQSSPPVLKRPKSTASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSSLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKPSAQLSPPVLKRPKLPTPAHTPAMAPVPAPACGTEPGKPQREGTKPKGPRTSPQELGKILQGVVVVLSGFQNPFRSELRDKALELGAKYRPDWTPDSTHLICAFANTPKYSQVLGLGGRIVRKEWVLDCHRMRRRLPSRRYLMAGPGSSSEDEGDSHSGSSGDEAPRLPHKV	174165	184711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_174270_174485_174596_174671_174784_175278_175389_175464_175577_175968_176228_176565_176683_180626_181019_181600_181656_181737_181875_183844_183936_184340_184417_184523
718325	contig_9668_pilon	-	1470	7	Intergenic	novelGene_58233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	574.6545097322	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	300	890	605373	578038	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKYLSPWNPWMVQTVNMLGC	669996	577457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_578095_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866
718333	SIRV1	-	203	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3605	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6761	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
718334	contig_14513_pilon	-	1105	4	Intergenic	novelGene_70349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1363.30187412766	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGAACTCTGCTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19063	11290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12159_13087_13136_14952_15013_18934
718341	contig_13894_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_62063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	274	1239	287445	286290	FALSE	30	AATTCTTTTGTAGTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKKRVP	288313	286230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286305_286397_287123_287219_287538_288132
718342	contig_7031_pilon	+	1939	2	Intergenic	novelGene_132783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCACATTTCATTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197337	199336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_198533_198592
718345	contig_20493_pilon	-	1733	9	Intergenic	novelGene_86389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	81.050524365978	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	32	1153	54655	18366	FALSE	50	ATAGTATTAAAGAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWY	54686	17785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_18373_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457
718348	contig_10235_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_46481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	998.071985129329	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAATTTAGTGGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222859	217924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_222804
718350	contig_8606_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_159385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	679	1032	10769	10416	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKNQCNTVKVKNHMIISVDVGKTFLKIQCLFIIKTPNKLETEENFLNLIKGIYEKPTADIALNDERLKVFHLRSGTRQGFLPLPTSIQYCTGNSRQSNLGKKKKLKGIQLGKEEV	11447	9030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_9000_11400
718352	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718356	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_97601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
718363	contig_16098_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_46161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1574.55496790007	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	136	885	458816	456972	TRUE	15	AGGCTGGGGCCGCAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVGCLPAWAVWWAGDPGSHPCTPPHPTLVLPCSRCWLPSTRL	460262	456325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
718367	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_90298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718372	contig_5300_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_144237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20678	22582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_+_20700_22600
718374	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_89221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
718378	contig_567_pilon	-	1950	13	Intergenic	novelGene_33964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	975.786776572286	73	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	285	1283	331097	308820	TRUE	35	ATATTTCAAATTATTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338301	308105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308638_308684_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331171_338090
718382	contig_1008_pilon	+	2012	15	Intergenic	novelGene_121532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_12	103.544750258632	226	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	52	1314	217664	329175	FALSE	25	TACTGGTTATGGACGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGPGARQGPRLAPLPGMVSKALLRLVSAINRRRMKLLLGIALVAYVASVWGNFVNMRSIQENGELKIESKIEEIVEPLREKIRDLEKSFTQKYPPVKFLSEKDRKRILITGGAGFVGSHLTDKLMMDGHEVTVVDNFFTGRKRNVEHWIGHENFELINHDVVEPLYIEVDQIYHLASPASPPNYMYNPIKTLKTNTIGTLNMLGLAKRVGARLLLASTSEVYGDPEVHPQSEDYWGHVNPIGPRACYDEGKRVAETMCYAYMKQEGVEVRVARIFNTFGPRMHMNDGRVVSNFILQALQGEPLTVYGSGSQTRAFQYVSDLVNGLVALMNSNVSSPVNLGNPEEHTILEFAQLIKNLVGSGSEIQFLSEAQDDPQKRKPDIRKAKLMLGWEPVVPLEEGLNKAIHYFRKELEYQANNQYIPKPKPARIKKGRTRHT	217612	329873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_217758_248477_248506_249842_249892_253727_253772_259214_259276_266009_266191_280306_280412_289286_289347_292120_292243_308208_308329_318553_318598_322911_322973_326154_326213_327713_327818_329043
718383	contig_3277_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_74744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAATGCTTGGAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291807	290990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_291000_291800
718387	contig_12270_pilon	-	192	2	Intergenic	novelGene_114149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTATCAGCAGAAACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	14020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
718391	contig_1594_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_138835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATACACAAACACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627765	630028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_627800_630000
718395	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718397	contig_7494_pilon	+	2467	9	Intergenic	novelGene_167438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.5763840347228	100	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	400	1815	42488	55075	FALSE	35	AATGAATTCCTAAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANVPTITAKIPEFDSIIGQRLDFSTIDLERLNQMYNCTTTHTLLDHCAFEKANICGMIQGTRDDADWVHENSAWPGQVDHTLVGCCTGAGYFMHFNTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSLSDRLIVWVRRDDSTGNVRKLIKVKTFQGDLDQNWKIAHVTLREEKKFRYLFQGTKGDHQNSNGGIYLDDITLTETPCPTGVWTIRNFSQALENTVKGEGLLSPRFYNTEGYGFGLTLYPHGRTTSTISDYIKLAFHVCSGENDALLEWPVVDRQVIITILDQEPDASNRMSSSLVFTTSKSQTSSDITHLYQTEVPTKNTRLIPQGLVLHGQEQPAPEEGTGKALVEKAPPSSLGQGQTSRQKRSVENTGPMEDHNWPQYFRDPCDLNPCQNDSICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAMQVHGSVLELMIGGTAGAIFLTFTILSIIFQRSRQ	31769	55727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_+_31808_32070_32152_35976_36153_42383_42606_43374_43525_46667_46884_48876_49351_50749_51051_54918
718399	contig_7027_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_164328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACAGCAATGCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13161	12569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_-_12600_13200
718406	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	242	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718412	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
718418	contig_6445_pilon	+	1974	11	Intergenic	novelGene_77126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	159.733559404403	933	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	89	1276	1470295	1488667	FALSE	10	GCTGCCTGGCCTACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGGGGGGSRGRGAARLRSSERSRPCVRTMDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS	1470206	1489365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1485815_1485840_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559
718419	contig_8210_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_30209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACATTTGTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13807	12598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_12600_13800
718431	contig_6445_pilon	-	3061	2	Intergenic	novelGene_77082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	0	77	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGACTGTTGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763782	760406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_761695_762009
718436	contig_14621_pilon	+	1836	2	Intergenic	novelGene_105842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124861	126771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_126260_126333
718442	contig_4486_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_38591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312289	314750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_312300_314800
718443	contig_11248_pilon	-	2001	1	Intergenic	novelGene_142530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	253	681	99736	99308	NA	25	ATTGATGAAGTTCACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARLPLEAGMEKHKDLAASLQDFAYPLHKASVDAASSTRLSVIYQESAQFHRFLSCICCMPAYRCAGYHGELRRVKCSACSAFLAPVILRGGGEGRMEAGLMGHVILNNFRFCLLAFPCCLHVLGQRGVSRPRRNNLQTQR	99988	97987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_98000_1e+05
718451	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718453	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718458	contig_10766_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_151200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGCCACATTCTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136501	137320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_136500_137300
718461	contig_15687_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_129155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259962	258090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_258100_260000
718470	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
718472	contig_3472_pilon	-	1849	2	Intergenic	novelGene_166948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1217	1558	980419	980078	TRUE	55	ACTTAAAGTAACTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSRDWSFLITCPKYVRQNLAILVSKAHSGCTSSERSVLLAVHGIFNILRQHHHSKALILFWSSLFIAQLSHAYEVTENIVAWVRRTLVLKAMCALRSFAADLPNEMRRLIS	981635	971551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_971756_979990
718473	contig_5480_pilon	+	2278	6	Intergenic	novelGene_107218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	85.7671265695663	26	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	48	968	79527	92525	FALSE	45	TTTTAATCAATCCATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKTGKRPKANIIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISVSGEAKLLARGVMCWTVP	53856	93835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_53887_79509_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89918_92258
718479	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718484	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718487	contig_10801_pilon	+	1948	8	Intergenic	novelGene_74071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	36.5976468519773	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	222	1070	456112	499596	TRUE	50	AATTAAAACTGAATGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSSSTVNEEPDALSVVNQLRDLAADPLNRRAIVQDQGCLPGLILFLDHPNPSVVHSALLALRYLAECRANREKMKGELGMMLSLQNVIQKTTTPGETKLLASEIYDILQSSNMADGDSFNEMNSRRRKAQFFLGTTNKRAKTVVLHIDGLDDTSRRNLCEEALLKIKGVISFTFQMAVQRCVVRIRSDLKAEALASAIASTKVMKAQQVVKSESGEEMLVPFQDTPVEVEQNTDLPDYLPEDESPTKEQDKAVSRVGSNPEGGASWLSTAANFLSRSFYW	451882	501527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_452066_456073_456295_460545_460638_488575_488766_497846_497964_498050_498126_499404_500050_501102
718490	contig_1443_pilon	-	1137	9	Intergenic	novelGene_28319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	518.721008226002	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	336	854	750529	748649	FALSE	45	ATCAACTGTCTCCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809525	748365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767475_805972_806053_808694_808741_809399
718495	SIRV3	+	574	1	NIC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	3715	0	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	914	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACCTAACAGTAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7718	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_+_7700_8300
718496	contig_15042_pilon	-	987	7	Intergenic	novelGene_115431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	139	987	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43087	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
718502	contig_15092_pilon	-	1426	2	Intergenic	novelGene_57828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCCTGCTGCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352601	351121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_351287_351340
718514	contig_20944_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_167534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTATTAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19328	18428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_18400_19300
718517	contig_12425_pilon	+	1330	5	Intergenic	novelGene_46650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	198.276322338296	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	52	1140	173715	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRASPDLGGRLRAPLGSMEEKPYAEPAILMAAAACSTKAMSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173663	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_179208_179338_190682_190836_198178
718520	contig_5954_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_28501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAATGACAAAGTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424565	425300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_424600_425300
718529	contig_9995_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_47693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCTTTTGTGACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297208	295635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_295600_297200
718535	contig_5684_pilon	-	1120	3	Intergenic	novelGene_81028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1156	268	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCATCTGTGAACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361647	351257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_358810_361113
718538	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	65	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718542	contig_10205_pilon	+	2133	10	Intergenic	novelGene_143106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	72.7232195840274	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	423	1436	197107	207510	FALSE	25	CTTCAAGGTCATGGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVIIDASTAIDAPSNLHFLATTPNSLLVSWQPPRARITGYIIKYEKPGSPSREVVPRPRPGVTEATITGLEPGTEYTIYVIALKNNQKSEPLIGRKKTEILDVPSTVQKTPFITNPGYDNGNGIQLPGTSGQQPSVGQQMIFEEHGFRRTTPPTTATPVRHRPRPYPPNVDEEIQSGHVPRGDVDHPLFPHILGLNPNASTGQEALSQTTISWTPFQESSEYIISCHPVGIDEEPLQFRVPGTSASATLTGLTRGATYNIIVEAIKDQKRHKVREEVVTVGNSVNEGLNQPKDNSCFDPYTVSHYAIGEEWERLSDSGFKLSCQCLGFGSGHFRCDSSKWCHDNGVNYKIGEKWDRQGENGQMMSCTCLGNGKGEFKCDPHEATCYDDGKTYHVGEQWQKEYLGAICSCTCFGGQRGWRCDNCRRPGAEAGPDGSTGHSYNQYSQRYHQRINSNVNCPIECFMPLDVQADRDDSRE	194245	208207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_194276_194534_194715_195878_195969_196984_197401_198353_198493_200746_200912_203224_203351_203881_203989_206780_206892_207438
718545	contig_5031_pilon	-	2148	8	Intergenic	novelGene_133214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_7	400.876692324435	123	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	499	1326	116574	98495	FALSE	30	CTACAAAGTTCCTGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVREPQPVTMIADELVFFVNGKKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRFQNKVIHFSATACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKMRLHPVQETIAKNHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNQPEPTMKEIEDAFQGNLCRCTGYRPILQGFWTFARDGGCCGGNGANPNCCMNQKKNPTEVTLSPSLVNPEDFMPLDPTQEPIFPPELLVGDASGRGPTTCLYQEPLRPALFSYPPGTLCPLCHLGFSLDFPSSF	117072	97672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_98726_99042_99112_102699_102762_103672_103800_105906_106016_107368_107466_110278_110337_116499
718549	contig_7870_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_109019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	972	1286	543873	544187	NA	30	AAGACTTTAGAATCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEDELKMIHIYGTFSTLTKVFKGRLVMKTPFKTERRKFQGRKELMIVYTQLSAFIQLLRRIIYLFPFILFFWRIFITNSSKIWIYLYTFQMIAGRHSKYLKQR	542901	545577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_542900_545600
718556	contig_11719_pilon	+	646	5	Intergenic	novelGene_154750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2553.12733476025	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	243	596	14219	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13976	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14222_14328_14504_16247_16326_19126_19183_19997
718557	contig_16382_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_160241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTTAAGATATTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292330	291219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_291200_292300
718558	contig_16382_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_160240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAGAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290691	290301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_290300_290700
718570	contig_5732_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_119576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106923	107460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_106900_107500
718577	contig_10103_pilon	-	2006	5	Intergenic	novelGene_86170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	100.068414097556	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	1456	2004	654769	651418	FALSE	65	AGAAAAGGAAAAAATGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEH	656224	651415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_651475_651637_651739_653443_653647_654456_654570_654694
718578	contig_6842_pilon	-	1960	3	Intergenic	novelGene_130746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	6.5	201	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTGTTCATTCATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306669	1302633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1303978_1304196_1304364_1306220
718582	scaffold_880_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_121486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACTAAAATAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500754	501920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_500800_501900
718583	contig_10951_pilon	-	1347	11	Intergenic	novelGene_61612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	75.6555351577133	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1269	78	1346	63149	7920	FALSE	35	TACTCAGACGACGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVRVNRYAPRGVGRKALKVKKKKPSVKQEWDNTVNDLTVHRATPEDLLRRHEIHKSKNRALAHWELQEKALKRKWRKQKPEAASLEKRRLAIMKEILSDQYQMQDVLERSDHLMAAAKDLFVDFPRRRTGFPNVTMAPDSSQSPIVVNEDPVTQSILSESVIDPQALNEVDDEQRGGTVNSQSEESENELDSTLNSESNKNTDRFLHQLKEENSELINKLWTDIQQKTATQSSGPPLSATPPAALNATSAVKRIHTRLQPEESSETLDSSYVVGQVLNPRKPKQLLNKVKRKPDLRAPSKQKKNTLSTSPASADFRNNNNSSLDVLRHMIDEVEQEMEEYERWTGREVQGLQGGQGLTGFTLSLVSSLCRLLRYLRESELQLRKEVETRQQLERVLVDHRELIDALTAEILLLREENTTVQ	68470	7918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_8052_8895_9162_9755_9894_10112_10229_35804_35921_40081_40189_40986_41090_50490_50635_60377_60426_63050_63150_68393
718590	contig_2550_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_135627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_5	113.51468333803	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	642	1187	401163	478483	FALSE	20	AATTGGGTGGTTAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKTLVSEAIAAGVFNDLGSGSNIDLCVISKSKLDFLRPFSVPNKKGTRFGRYRCEKGTTAILTEKVTTLEIEVLEETVQTMDTS	397198	478609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397708_398493_398592_401128_401270_409544_409661_436086_436146_473100_473253_478371
718596	contig_9363_pilon	+	2127	9	Intergenic	novelGene_6828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	325.434997349701	1	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1219	1782	1624307	1625624	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTLSASVSSEIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLTRPGPRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLAETEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622267	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622552_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1624445_1624573_1624662_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
718598	contig_4211_pilon	-	2075	3	Intergenic	novelGene_80249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	42	junction_2	25	633	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	66	815	1247001	1239395	FALSE	25	GTGTGACTAATCCATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKITRQKHAKKHLGFFRNNFGVREPYQILLDGTFCQAALRGRIQLREQLPRYLMGETQLCTTRCVLKELETLGKDLYGAKLIAQKCQVRNCPHLKDAVSGSECLLSMVEEGNSHHYFVATQDQNLSVKVKKKPGVPLMFIIQNTIVLDKPSPRTIAFVKAVEAGQLVSGHEKQNIKQLKEEQGLVQNPEQGRRKKRKKVSGPNPLSCLKKKKKTRDTKPPSASEKKRKRKRIRNRSTSEVLSEKQNAEG	1247066	1238134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1239782_1240689_1240865_1246813
718599	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718600	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
718603	SIRV2	-	322	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4551	34	3376	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
718605	contig_8317_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_20146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGACCAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
718606	contig_8914_pilon	+	769	6	Intergenic	novelGene_112865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	676	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	144	491	264665	267418	TRUE	25	GACGGAAGTGCAACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264521	268967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264950_265588_265706_267319_267508_268075_268179_268881
718609	contig_7513_pilon	-	2250	14	Intergenic	novelGene_88958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	84.9257245964075	4	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	945	1826	159582	146657	FALSE	30	CTAGGAGGTGAAGGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWAATSLLQPASLHRPPVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	176220	146232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147151_147983_148086_152144_152280_154232_154428_155879_156004_159565_159650_164928_165049_166132_166281_167532_167621_168455_168591_169675_169813_170655_170838_176153
718611	contig_4857_pilon	+	1497	5	Intergenic	novelGene_48838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	95.6935212018034	20	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	59	403	1331453	1407681	TRUE	25	CCAGCTGCTTTCCATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDCSNNNNRITSISKGKISQANQSDEHKN	1331394	1410987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1407599_1407777_1409988
718618	contig_12078_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_74100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGACAAATTTGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215828	217279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_215800_217300
718622	contig_5769_pilon	-	2692	9	Intergenic	novelGene_138750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.120323097926	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	419	1060	28163	17416	TRUE	20	TTTGCTTATGTTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTSVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKRYEEELEINDFPQTARWKVTSKEALQRISEYSEAAITIRGTYFPPGKEPKEGERKIYLAIESANELAVQKAKAEITRLIKEELIRLQNSYQPTNKGRYKVL	38092	15703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_17159_17238_17464_18739_18814_26431_26577_26929_27149_28007_28185_35367_35518_35838_35977_37983
718624	contig_14441_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_100331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	275.750226654485	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	238	1200	6011	126705	FALSE	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGAKQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5773	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6905_121199_121239_125517_125902_126496
718637	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_97329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
718644	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718655	contig_4364_pilon	+	1403	7	Intergenic	novelGene_192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	864.625111440405	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	57	689	1268714	1270358	FALSE	20	AGGAGCCAGTGTCCCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1267049	1271072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1269992_1270294
718665	contig_4125_pilon	-	1642	2	Intergenic	novelGene_25097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	0	270	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	322	858	661037	648465	FALSE	30	ACATCTGTAGATTATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSPLRVAVVCSSNQNRSMEAHNILSKRGFSVRSFGTGTHVKLPGPAPDKPNVYDFKTTYDQMYNDLLRKDKELYPRGWPFKPHGHLWRCPVLRMPCPGVSCRQMSFAKREEAEALLLCHLLSRGACGDATLHSLFFSSFPFLFLRERDLHNPHDHFCLPGAHWMVPGLEPSGQWAS	661358	647680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_648922_660957
718666	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
718671	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
718674	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718676	contig_7057_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_123297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	69	566	898785	899668	FALSE	5	TCCGTTTCTTTGCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTGISAPTVTVFISSTLNTFRSEKRYSRSLTIAELKCKLELVVGSPASCMELELYGADDKFYSKLDQEDALLGSYPVDDGCRIHVRPSCLGHHPTSIHLFNKYSLCPALCDNQDRPHPPGAPVQHGERQIHHQAGQGWDGESPEEVPDPTGEYQEGLPGGVGV	898716	900035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_898899_899284
718681	contig_2917_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_147568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	327	704	74024	73647	NA	45	GCAAATAAAAGCAGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPDCSQPVTEHGGRTRTIPARYRTPLMGNFGLGTPHQPGRNFPGTALLSETLLVQTAFLLSLLLHVLAHLPTWALSLLLFTGIFPNKSLAHFLCVINYHKFNCLKPHTSIFSQFLWIRDPGMA	74350	73010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_73000_74400
718687	contig_7333_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_142765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCAATGTCAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164082	164759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_164100_164800
718689	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718691	contig_12414_pilon	+	1673	2	Intergenic	novelGene_59567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	87	1145	370898	374054	FALSE	25	TAAACTTAGTGTTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370811	374582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
718693	contig_14925_pilon	-	1458	3	Intergenic	novelGene_55380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	291	617	322071	129433	FALSE	60	TCTCACTTAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSRNLLSAVIQAHLWERNSCDCGTK	322461	128591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_129503_321814_322113_322212
718694	contig_6842_pilon	-	1822	3	Intergenic	novelGene_130749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.5	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCATATGTTTGTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306682	1302638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1303978_1304196_1304320_1306322
718695	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_94707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718699	contig_16461_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_139198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	26	370	919	356	FALSE	20	ACTCCCACAGTGCTTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQNSYGSY	944	355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
718704	contig_6286_pilon	-	1775	8	Intergenic	novelGene_165660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	389	junction_5	3081.69253124689	1429	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	186	1433	364784	357787	FALSE	20	CAGAATTCCCGGTGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPIDEPFPPAPLEDEIFPSPPPPLEEEGGTEGPTPLRSQPREKVSSIDLEIDSLSSLLDDMTRNDPFKARVSSGYVPPPVATPFSLHSSPRPAAGATAPLPPWKAPSSSQPLSQAQALPQSQTQVPVPPQVRPQARPQVPPQVKLQAQAEPMSSADTQPRGPTAPKFSPVASRFTPVASKFSPGAPGAPGGPVSQPNQKVGSPEAPSSMGTVSPQPPSVTCAQQKEKPHVQEKQSPGSLPRPAPNQVRPPGAPGPLTLREVEELEQLTKQLMQDMEQPQKSSAGTSELCGRCCQPLARAQPVVRALGQLFHITCFICHQCSRQLQGQQFYSLEGSPYCEGCYTETLEKCSTCGQPITERMLRATGRAYHPNCFTCVLCACPLEGTSFIVDQANRPHCVPDYHRQYAPRCSVCGEPIMPEPGRDETVRVVALDKNFHMKCYKCEDCGKPLSIEADDNGCFPLDGHVLCRNCHTARA	365072	357444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_357886_358289_358411_359979_360159_360238_360409_360556_360678_364133_364662_364754_364848_364950
718707	contig_5452_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_101031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562269	564581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_562300_564600
718708	contig_14691_pilon	-	2240	1	Intergenic	novelGene_146796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAGAATTGAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33013	30773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_30800_33000
718709	contig_7513_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_89029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	694	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCACGTCTGTCCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690509	692379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_690500_692400
718713	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718714	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_17330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
718716	contig_5236_pilon	-	1821	3	Intergenic	novelGene_100968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	512	junction_2	64	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGGGAGCTTCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011752	1009165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1010289_1010453_1010997_1011597
718718	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
718720	contig_2114_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_104285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713363	710931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_710900_713400
718744	contig_10953_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_42557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2315.24667962185	92	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	314	640	423183	426254	FALSE	15	TTTCGACTCATCTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAFVPRETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419997	426305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422744_423141_423365_425213_425291_426186
718745	contig_7806_pilon	-	1902	3	Intergenic	novelGene_157545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAACAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286099	277865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_278106_281420_281640_284656
718748	SIRV4	+	214	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1557	632	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
718749	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
718750	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718751	contig_15897_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_49577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGATATTTTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834569	836693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_834600_836700
718754	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718757	contig_8616_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_72597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACTGGAAATCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429724	429248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_429200_429700
718758	contig_3394_pilon	-	2415	4	Intergenic	novelGene_152715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1664	2017	543685	543332	TRUE	15	GGCTCAGGGGACTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPCVLSAELPPVLGFCPPTLPLNPEEEVVLIWLMPGAEEDDETGGTEEPGAELLAAGFAELPLEVGLNALPAGGTADPEFEAKGPAFPGVACPCAAGGVWYLGGINRLLSSCRVAK	546133	540056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_540257_542471_542663_543324_543750_544534
718759	contig_11259_pilon	-	1915	8	Intergenic	novelGene_144522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	151.776150959233	36	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	18	635	159043	131887	TRUE	10	GTTCTGTCAGGGTGTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRSAAMLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLAVVIMGVVLQGANLYGYIRCKVGSRKNLTSMATSYLGKQFLRQNAGDDQTS	159060	127830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_128399_131174_131914_133312_133442_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_159031
718760	contig_9797_pilon	-	1572	5	Intergenic	novelGene_65584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	628	1017	191434	189331	TRUE	20	TGATGTCACACGTCGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSWMLQLRVADGARVVPVILLEEVFPLLDEFP	192061	172537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_172568_183680_184009_188589_188734_189277_189420_191133
718761	contig_11832_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_106965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGCCTTGTGTCCGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461887	463585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_461900_463600
718762	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
718764	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
718765	SIRV7	-	226	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69060	0	35841	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78897	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
718771	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
718772	contig_13760_pilon	-	1647	7	Intergenic	novelGene_61299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	219.601153609599	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	663	1211	165393	161870	FALSE	5	TTCTTCTGTCTCTCACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNMFSFAAVMGALDMAQITRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEGPPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPAEGPEPWDNTEHGVEVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	172516	161433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166104_170847_171307_172482
718778	contig_3900_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_84189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAGTACAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238143	237658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_237700_238100
718790	contig_8663_pilon	-	1955	7	Intergenic	novelGene_57994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	158.520678637065	10	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGTGTAAGACTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74415	52001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54118_54981_55085_55136_55188_67192_67307_71141_71209_74343
718796	contig_11427_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_78977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTTGTTAAAGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106563	107914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_106600_107900
718797	contig_14513_pilon	-	1148	4	Intergenic	novelGene_70394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1373.54925487059	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	133	312	18880	14961	TRUE	25	CATTTTATACTCCCTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGIYSSYTNLFE	19012	11377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_14992_18731
718802	contig_15937_pilon	-	1326	3	Intergenic	novelGene_143135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4603	junction_2	222	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTCTTAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30554	28044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28680_29194_29246_29914
718806	contig_7106_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_148319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCCCCCAAAGTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538976	539821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_539000_539800
718816	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718818	contig_15060_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_167544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATACCTGTATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521630	520878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15060_pilon_-_520900_521600
718819	contig_13608_pilon	-	2685	6	Intergenic	novelGene_52395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_5	336.001547615483	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	383	2035	453349	450109	FALSE	30	TAGATTATTTTTTATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGVLFSSSEVSADNVQSHCPSSANHLGSSSTLFDFSGPVVKCGLYHNSPVVPSHGLLHKKKKLDRPKSEKKLESCKLTEELSLADLINDMPRDSFYESYKSQPSVRLSSTDSLESLLSKSLDAELLRPHASECISKGDTQFKGVSDLKSLMIKSTPDKSLFIQNKSLPDFQNIPVQNSLRNLNNPSHLTSSLENMTLDNLNASKKTEFESVPLAEQSTKNSIFKKDNLQFSQCESPSLAELCQEHKENNPNQCFTSSSDLCNPSSASFTDLSLGSFPLSQLANRHQSSTGVSELTGSLSSLAFCKASPTRDLNNLSLSDLIAETIDVDKSQIKNDSYKFSSSEMRTSGIDSNIDLSVLIKTPDFVPKPVVDQSAAPAPGTKVLNSKLGKNSNSAKDNKKNSKGSLTRKPPFSLSWTKALAARPSAFASTLCLRYPPKSCKRHTLDLYKTFLYSRQVQDVKDKEKSPLIAITPFDFKSASPDDIVKANQKKAFTRE	470283	449458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_451593_453180_453376_456289_456419_466411_466478_468884_468954_470191
718824	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
718832	contig_17753_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_105032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTACAGCCTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17540	16624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_16600_17500
718842	contig_253_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_129699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	362	805	488776	489301	FALSE	10	CTCAGCTCTGAGCCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHPFGGNRTDLAGGSELWEEASLPRADLFLAPVAAGSVPSPSGSGPGAAAPFRPLFNDFGPPSMGYVQAMKPPGAQGSQSTYTDLLSVIEEMGKEIRPTYAGSKSAMERLKRGKQAQAHLALPRRWTLGSLFLREGRPSGGYQSGA	488414	490477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_488983_489064
718846	contig_12479_pilon	+	2443	15	Intergenic	novelGene_56824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_8	147.91367104373	134	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	422	1771	95993	219853	FALSE	30	CATAAGTGTCCTCAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQRLQELISQKKAEDPEKKGEESSKDNQQQALIDHRYFQVLCSINSIIHNPRAPVVIYKQSKGGPQHFNKDFVQDCAFEHLVPIIAMWADQLTSLKDLYKSLKILSAELVPWHNLKKQDENESIKVEDLLFIVDTMLEEVENKNKDNNVPNFQTLQAVVSHFQKLFDVPSLNGVYPRMNEVYTRLGEMTNAVRNLQELLELDSSTSLYVLVSTVGKLCRLIIDGVNEQVKQLLGPEELQSIINKLEEHEEFFPAFQAFTNDLLEILEIDDVDAIVPAVKKLKVLSY	76389	220525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_76423_78775_78935_92941_93068_95744_95836_95980_96082_96398_96580_110726_110897_119057_119115_195306_195416_209149_209321_212821_212969_213175_213345_213530_213646_216920_217001_219791
718855	SIRV5	-	263	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCGACCCAATTCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
718859	contig_5229_pilon	-	2684	3	Intergenic	novelGene_117680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	411	902	343231	342740	FALSE	25	CAACAGCTGAGTCTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGWHHEQGPRHPIRAAASYATAHPWQLVDCASNGVTYTPLVDPWIEQLCCGDSECIRTAVEQKIVASSAPGGEPAERGLPVARLPILQPHGVDFGYRALTQAPLTAPHGCWTAFWPSWEMTHRSASSTTRIASAESATFLGMDGLGLGLGCLLPQCRPAYA	346233	340957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_343478_345788_345884_346164
718866	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_97678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718867	contig_7078_pilon	-	1463	11	Intergenic	novelGene_130183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.962660659428	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	437	1411	795828	774100	TRUE	65	AGTATGAAAGAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRFVV	796264	773197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773232_774081_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702
718874	contig_13905_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_130421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	78	398	218514	226369	TRUE	25	TGATTCAATGACTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218436	229556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_228605_228652
718879	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
718886	contig_5686_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_45438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAATAAAAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209847	212359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_209800_212400
718888	contig_715_pilon	-	1820	3	Intergenic	novelGene_167546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	12.5	253	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	274	678	28915	26980	FALSE	40	GATAAACAAGTGTTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGVYQLRHFSISFLSSLLGTENASVRLDNSSSGASVVAIDNKIEQAMDLVKSHLMYAVREEVEVLKEQIKELIEKNSQLEQENNLLKTLASPEQLAQFQAQLQTGSPPATSQPQGTTQPPAQPASQGSGPTA	29188	25837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_27238_28363_28416_28820
718892	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_90352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
718893	contig_20493_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_86420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	550	924	43015	43389	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLREQVVRACTHHSISSGLRSFRSSCTSCRQRSWYSGCLARLYRTQEMPLAVESWPEGSQAGLRHWAASAPEGRELPCIEVLKKGGGGCSRMRRGHSRVHLPSPWAGDTPAPNAIPGWDPHPQT	42465	44580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_+_42500_44600
718894	contig_14727_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_56655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCACCTTTAATTCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317071	317371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_317100_317400
718898	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_91291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718900	contig_10923_pilon	+	1871	11	Intergenic	novelGene_66195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_3	774.652025105466	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	49	1767	21667	42718	FALSE	40	AGCAAACTGCAACACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13830	42822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
718901	contig_13301_pilon	+	2682	6	Intergenic	novelGene_153112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	82.1062725983831	206	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	108	1406	153697	158286	FALSE	10	GGTGATGCTGGAGGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSVTLWQFLLQLLREQSNGHIISWTSRDGGEFKLVDAEEVARLWGLRKNKTNMNYDKLSRALRYYYDKNIIRKVSGQKFVYKFVSYPEVAGCSTEDCLPQPEVSVTSSVANVAPAAVHVAPGDSASGKPGTPKGTGMAGPGGLARSSRNEYMRSGLYSTFTIQSLQPQPPPQPQPQPPPHPRPASVLPNTASAGAAAPPSGSSSTSPSPLEACLEAEEAGLPLQVILTPPEAPNPKSEEMNVEPGLGRPLPPEVKVDRPKEELKTATSGEAGFVPEATKVGPEIPPAVVMETATQGAGLASSTASSTEIVQPQKGRKPRDLELPLSPSLLGGPGPERTPGSGTGSGLQAPGPALTPSLLPTHTLTPVLLTPSSLPPSIHFWSTLSPIAPRSPAKLSFQFPSSGSAQVHIPSISVDGLSTPVVLSPGPQKP	145964	159562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_146010_153634_153907_155824_156293_156942_157363_157999_158102_158187
718909	contig_15741_pilon	-	1011	5	Intergenic	novelGene_159658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	265.482932596429	1819	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	13	459	60544	50105	FALSE	5	TGTGCGTCTGTCCATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60556	49552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470
718920	contig_4364_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
718924	contig_18967_pilon	-	2473	14	Intergenic	novelGene_165331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	15	junction_13	417.90219970791	124	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	23	2041	168887	131496	FALSE	35	TAACTTACACTCAGCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTRSRKMAAAQEADGAGSAVVAAGGGGSGQVTSNGSIGRDPPAETQPQNPPPQPAPNAWQVIKGVLFRIFIIWAISSWFRRGPAPQDQVGPGGAPRVASRNLFPKDTLMNLHVYISEHEHFTDFNATSALFWEQHDLVYGDWTSGENSDGCYEHFAELDIPQSVQQNGSIYIHVYFTKSGFHPDPRQKALYRRLATVHMSRMINKYKRRRFQKTKNLLTGETEADPEMIKRAEDYGPVEVISHWHPNITINIVDDHTPWVKGSVPPPLDQYVKFDAVSGDYYPIIYFNDYWNLQKDYYPINESLASLPLRVSFCPLSLWRWQLYAAQSTKSPWNFLGDELYEQSDEEQDSVKVALLETNPYLLALTIIVSIVHSVFEFLAFKNDIQFWNSRQSLEGLSVRSVFFGVFQSLVVLLYILDNETNFVVQVSVFIGVLIDLWKITKVMDVRLDREHKLAGIFPRLTFKDKSTYVESSTKVYDDMAFRYLSWILFPLLGCYAIYSLLYLEHKGWYSWVLGMLYGFLLTFGFITMTPQLFINYKLKSVAHLPWRMLTYKALNTFIDDLFAFVIKMPVMYRIGCLRDDVVFFIYLYQRWIYRVDPTRVNEFGMSGEDPTAAAPVAEAPAAAGALTPATTPITTTASTATEEEAATPRPDKPTQGASSADEPREAPPKPAEDKKKD	168909	131063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_131792_131968_132137_132704_132841_133101_133198_133472_133664_135794_135889_136631_136877_137493_137615_138447_138534_147780_147899_151331_151491_152549_152674_162006_162120_168815
718930	SIRV6	+	399	3	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	714	8524	-441	267	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740
718931	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
718940	contig_9683_pilon	+	1017	3	Intergenic	novelGene_151284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	13	1257	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTCTTACTTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487017	488190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487172_487259_487367_487434
718941	contig_5715_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_127974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTTTTTAAGTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603269	601159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_601200_603300
718942	contig_9668_pilon	+	1432	7	Intergenic	novelGene_58114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	390.592605323415	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	524	1066	339365	359314	FALSE	45	CAGAAAATTTAAATGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214075	359680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_331983_332173_337928_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
718944	contig_20902_pilon	+	1233	4	Intergenic	novelGene_167558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	6.64997911442	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5007	10178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20902_pilon_+_5602_6116_6274_7716_7818_9797
718946	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
718956	contig_12528_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_81296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAACAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334227	336352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_334200_336400
718957	contig_4151_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_65225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTATATGTATACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496472	494550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_494600_496500
718963	contig_9239_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_137197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAAAACAATGTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235758	236271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_235800_236300
718966	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718971	contig_9571_pilon	-	2264	5	Intergenic	novelGene_136240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.188400179084	9	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	299	919	321781	130939	FALSE	35	TACGTACCTCAAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKHFSAGSGTYYSDSIFFLSVAMHQIMPKEILRIIQLDLDLKYKTNIRELFEEFDSFLPGAVIGIAREMQPVYRHTFWQYRHENPKTRVGGPPPKGLPGFNSGVMLLNLDAMRQSPLYSRLLEPARVQQLADKYHFRGHLGDQDFFTMIGMEHPELFHVLDCTWNRQLCTWWRDHGYRDVFEAYFRCEGHVKIYHGNCNTPIPED	352890	129593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_131336_223025_223159_321690_321839_347509_347632_352771
718972	contig_11512_pilon	+	366	2	Intergenic	novelGene_43212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	30	365	4011	4569	FALSE	25	CTTATAGTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYA	3981	4570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
718974	contig_4131_pilon	-	1643	3	Intergenic	novelGene_127845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTCCCCTGCTAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97872	93465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_94332_94425_94538_97207
718981	contig_16098_pilon	-	1909	18	Intergenic	novelGene_45894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	52.3461330669117	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	560	1660	251589	244355	FALSE	15	TATTTTGTCAGTTTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSDSPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	255225	244105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250755_251573_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
718982	contig_9345_pilon	-	3401	13	Intergenic	novelGene_24414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	77.6617934808788	3	198	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	632	1465	207650	196143	FALSE	35	CACACAAGAGTTTAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSWTGDLSYIKIMDVGLSYVVNRVADHIQSRIVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDTGLSPRGREFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYECRHLKATRGSPCHSPCSPVIVSHPLQPWAGVALCRRVIPGPLVHVTVIMQERP	221103	194206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_196307_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205205_205415_207634_207757_208548_208606_209024_209100_211740_211804_214942_215044_215211_215329_220991
718985	scaffold_9100_pilon	-	1842	8	Intergenic	novelGene_83235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_7	49.2672843388231	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	774	1130	536546	533389	FALSE	30	GCAAATGCTTTTATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMEGDNGWIPETMEEWKLLLHLVQNKSTRPALQESPNGNLSDGPSPINVENVALLLAKAMGPDQAWSLLQECGLALELSERFTRTCNILRIAEKRQRALIQSMLEKCDRFFWAQQA	540826	532676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_533450_533795_534067_536521_536629_537271_537430_538582_538697_539475_539596_540337_540514_540703
718986	contig_14029_pilon	+	1445	5	Intergenic	novelGene_151950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	168.935453650203	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	14	313	131739	133382	TRUE	35	CAAGAAAGTTATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLRYRIYLNIHLFSNSTFMIPISVFKMHTN	131725	135622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_134021_134104_134162_134258_134319_135245
718989	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
718994	contig_953_pilon	+	3335	22	Intergenic	novelGene_130015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	102.76711227372	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1064	3195	97	3291	538791	580958	FALSE	20	TCCGGGCTTCCACAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESETLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASYDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELERKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDSTVIDHTLPTPEAAEFLKESELPPRAGSEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKRSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKEELSSGQYEITECQAALAPMRPTHSSVRQVEDGLTFPDYSDSTDVKFEELKNVKLEEEEEEEEQEAAALDLSMNPASIEGCLVFSGSKKKSSSSLGSSSSQDSVSSDSETNEPLSCRAQGQAGVLTVHSYAKGDTRVTVGEPCARKKGSATGNISEQELAEVANEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVLQECVSDDELSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIFLTYHQVEFGGLSQNSGNAPDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCVFCKKRRKRAAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFVVFITCFRHRIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQLGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDYIEPALYRAIME	536519	581002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_536578_538752_538929_540534_540711_542696_542812_544040_544235_547044_547095_548541_548646_549083_549222_550728_550977_551738_551939_553042_553414_562956_563078_567413_567596_569174_569380_569864_569942_570612_570669_572349_572459_572800_572987_577381_577553_580193_580314_580596_580690_580817
718996	contig_4364_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_4405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTCCTGTCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533088	1533320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
718998	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719000	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_16515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27832	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
719003	SIRV6	+	537	5	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	13	41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCTAGGACGCGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	2581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2480
719004	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
719009	contig_9988_pilon	-	1524	7	Intergenic	novelGene_113065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	17.6894507169292	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	8	820	532674	244432	FALSE	15	TATAGGAGTTTTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWMIQKPHKAATFFGCIGVDKFGEILKTKAAEAHVDAHYYEQNEQPTGTCAACITGDNRSLVANLAAANCYKKEKHLDLEKNWLLVEKARVCYIAGFFLTVSPESVLKVARHASENNRIFTLNLSAPFISQFYKEPLMKVMPYVDILFGNETEAATFAREQGFETEDIKEIAKKAQALPKVNSNRSRTVIFTQGKDDTIVATESDITSFAVLVQDQREIVDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIHAGHYAASVIIRRTGCTFPEKPDFH	532681	243727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_244557_285008_285096_348842_348958_367853_367890_428008_428180_528981_529091_532504
719028	contig_2892_pilon	-	1146	2	Intergenic	novelGene_119040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	779	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCAAAAAAAGAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339507	331704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_331811_338467
719034	contig_6871_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_21663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	2.5	303	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGCCAACTAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795170	796547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396_796023_796104
719039	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
719041	contig_9515_pilon	+	2124	12	Intergenic	novelGene_73843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	7.11534251976345	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	20	1843	108418	122357	TRUE	15	CCCCTGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPVLLAVLLLAILYKVYLVLFAGSSPNPFSEDVKRPPAPLVTDKEARKKVLRQAFSVSRVPEKLDVVVIGSGFGGLAAAAILAKAGKRVLVLEQHTKAGGCCHTFRQDGLEFDTGIHYIGDMEEGSTGRFMLDQITEGQLDWAAMSSPFDIMVLEGSNGRKDFPRYSGEKAYVQGLKEKFPQEEAAIDKYIKLVKAVSSGVTLAVLLKLLPLPVVQLLNKCGLLTRFSPFLRASTQSLSEVLKQLPASPELQAVLSYIFSTYGVTPSHSAFSMHALLVDHYLKGGFYPRGGSSEIAFHTIPVIQRAGGAVLTRATVQSVLLDSAGKACGVSVKKGQELVNIYCPIVISSAGLFNTYEHLLPEHARCLPDVKKQLAMVRHSLGMFCVFICLRGSKKDLGLKSTNYYVYFDIDMDKAMERYLSVPREKAAAHIPIFFISFPSAKDPTWEDRYPDRSTVNVLIPTAYEWFEEWQEEPQGKRSSDYETLKNAFVEAAMSVVLKLFPQLEGQVDSVTGGSPLTSQFYLAAPRGACYGADHDLGRLHPHVIASMRAQSPIPNLYLTGQDIFTCGLIGALQGAMLCSGAILKRNLFSDLKKLHSRIQAQKKKN	108398	124186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_108581_110654_110838_111168_111411_113048_113251_113692_113891_116662_116783_120844_120984_121213_121324_121403_121571_121776_121937_122217_122367_123914
719046	contig_16882_pilon	+	1755	9	Intergenic	novelGene_148241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	51.5242661277189	201	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	173	1336	445854	615444	FALSE	20	CTCCTGGCTCATTCATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDAPVIYGLEFQARALTPQTAETDAIRFLVGTQSLKYDNQIHIIDFDDENNIINKNVLLHQVGEIWHISASPADKGVLATCYNKTSDSKVLTCAAVWRMPKELESGSPESPDDSSSTTQTLELLCHLDNTAHGNMACVVWEPMGDGKKIISLADNHILLWDLQESSSKAVLASSASLEGKGQLKFTSGRWSPHHNCTQVATANDTTLRGWDTRTMSQIYCIENAHGQLVRDLDFNPNKQYYLASCGDDCRVKFWDTRNVTEPVKTLEEHSHWVWNVRYNHSHDQLILTGSSDSRVILSNMVSISSEPFGHLVDDDDLSDQEEHHQEEKNKEPLQDSVIATYEEHEDSVYAVDWSSADPWLFASLSYDGRLVVNRVPRALKYHILL	445681	615863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_445896_459574_459659_478552_478686_555368_555526_585050_585151_606970_607108_609865_610034_611534_611703_615269
719047	contig_7815_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_134382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTTGAGAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486809	486151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_486200_486800
719048	contig_12938_pilon	+	1542	8	Intergenic	novelGene_99709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	840.875806792525	3	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	117	764	78117	85540	FALSE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAPDIRVSSLVAATSRAITKFCLKDLRKVPAKGKKYPSMGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51946	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52052_78105_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
719050	contig_11751_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_150280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60134	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	32	349	7470	7787	NA	40	GTGGACAAAAGATCTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQWKQMVINVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYNTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRK	7438	7970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_7400_8000
719060	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719066	contig_10732_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_114701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGGGCACCATCTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107635	109177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_107600_109200
719072	contig_9801_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_167559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTCCTGAATACGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86197	87121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_86200_87100
719073	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
719074	contig_17560_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_167581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGGCAAGAGAAACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91874	94079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_91900_94100
719077	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	67	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719079	contig_9258_pilon	+	531	4	Intergenic	novelGene_104609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5135.81758069952	47	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	81	530	97238	99731	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNRDRPQPRSRPRREEWPWPGPWPQPQPRPRPWPQALIRRPEYPSLGPAWALHYGEREMASLPELSCHTALVVVWGLGLNNKAFLPT	96740	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327_99385_99476
719080	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719081	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
719084	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719087	contig_253_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_129623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGTATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136541	138488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_136500_138500
719096	SIRV6	-	347	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11832	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
719098	contig_8354_pilon	-	1866	18	Intergenic	novelGene_24072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_17	123.150061779371	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	255	1793	189598	65549	FALSE	60	TTAGAAATTTAAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHPSFKELFQDSWTPELRLKLEKFLALIFKASNTPRLLTLCKENGQSNKEMLQQLHQQLLEAERRSMTYLKRYNKIQADYHNLIGVTAELVDSLEATVSGKMITPEYLQSVCIRLFSNQMRQSLAHSVDFTRPGTASTMLRASLVPVRKLKDVPLLPSLDYEKLKKDLVFGSDRLKAFLLQALRWRLTTSHPGEQRETVLQAYISNDLLDCHSNNQRSVLQLLHSQSEVVRQYTARLINAFASLAEGRLYLAQNTKVLRMLEERLKEENKDVITRENVLGALQKFSLRRPLQTAMIRDGLIFWLIDILKDPDCLSDYTLEYSVALLMNLCLRSAGKNTCAKVAGLVLKVLSDLLGHENHEIQPYVNGALYSILSVPSIREEARAMGMEDILRCFIKEGSAEMIRQIEFIIKQLNSEELLDGVLESDDDEDEDDEEDHDTMEADLDKDELIQPQLGELSGEKLLTTEYLGIMTNTRKPIAKQRKGPAAVQWSADKPLRRPITPGGHRTGHPV	190346	65475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_65678_76088_76194_118879_118936_123405_123497_128310_128386_132891_132969_134289_134430_140151_140276_141483_141575_148518_148612_150588_150704_151641_151677_165443_165543_169664_169823_180117_180143_187891_187985_189565_189768_190261
719104	contig_6795_pilon	-	1673	5	Intergenic	novelGene_27774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.385029208477	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	657	983	489064	483517	FALSE	20	TAAGCCCCCGATTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVSCTSCLTLPSTSAIGSTGRWPASSNTPWCGVPAPSTAHSGWD	489720	482826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484441_486600_486660_487526_487616_489014
719106	contig_17074_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_145209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	52	303	863099	863350	NA	55	CCAAAGGAGAAAATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHTSDFKTYYRAAVIKTMWYWHKDRYIDQWNRVKIPEINLYIYSQLIFNKVAKTIQRAKNNLFNICFWDNWISTCRRLKVDSYLTPYIKIKMDQRPKCKS	863047	864925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_863000_864900
719107	contig_5643_pilon	-	2573	8	Intergenic	novelGene_38886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	99.3449977171904	266	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1000	1602	244850	240272	FALSE	15	CGTTTGTGTCACTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRKRERKAASEEDPSLSESDGPRQPDGDEEESTALSINEEMQRMLNQLREYDFEDDCDSLTWEETEETLLLWEDFSGYAMAAAEAQGEQQEDSLEKVIKDTESLFKTREKEYQETIDQIELELATAKNDMNRHLHEYMEMCSMKRGLDVQMETCRRLITQSGDRKSPAFTAVPLSDPPPPPSEAEDSDRDVSSDSSMR	247570	239300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_240378_241031_241163_244098_244195_244461_244583_244701_245559_245900_246042_247277_247374_247516
719108	contig_1037_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_84603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGCGCAGCGGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291719	293814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_291700_293800
719115	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
719119	contig_14133_pilon	+	2506	22	Intergenic	novelGene_119897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	16.6465184337062	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	745	2238	156	2393	72772	94424	FALSE	20	GATTGCTTTAGTGGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIPLFLYLDYRQACSTAEEKKQETPVEEAEPSCASGALGALEAALGGLRAAMVDPVRHDVVSAHIATISEKLRTALDPSEDSVKVPEIQLHVPTSELGKPEQAVGLLLTCFCQSLVAASSFAPLQRQGPWAALFVKLLCGRALLPAVLTRLCQLLLHQGPCLNTPHLVGLAALAVHLSELGPMLPHVDVGLPSSAQGFSVASFLDGLLPCRTGKSLLFCMRFCTAAISYALCKSPSGFCAAPHDRFSLGLVKKFVVLRLFSEAREPPCLDVTRDLLWRPLCLPSTDWTRAALRLWRHRTFRELLKEKEFQLTYRDWLQLELGIQPEVDILSDIERRDFHQWAIHQCYLPEPASAGGCDGDLEVACSILTEAVIDFFQSSRSYDHLENSDLVPGGRAVNQDILSRLQEMVAELELGRSGAARGHFLFQIFCRRLQALGNMSTVAAHLQRQRELLLHKRILLGLPPSMLFTSLQGQPAAVDCDEFLHFVNSELRNFSHGGALTHDITAHFFRLWWPCLEPVLTCQWKQHSQSPLPRALQQLAEARDLAKSFLSLDTTLPIPRPTWVFAASLHFAIQQALREQGRRELKRLDFEREEVVLFLFFFSMMGLLSTYLAPSEAIDPLKTLDVCAEILECLERRKVPWLALFQLTETGAGLGRVLLRVASDQHIRLLPLAFFSLLPRLDPNALIREAAFLHVAVDMYLKLIRLFVAGETSTLPTLATQSQQYQNQDDPLGLITKARLFLLQSIPQCPERCFLNMTELLATGKDLDPEVSAALQKRQQAPPNLDPDLYGEPQLF	69951	94537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_70024_72688_72797_73184_73313_73649_73721_74028_74126_74450_74639_75527_75625_80920_81092_82049_82124_83818_83948_84902_84988_87152_87305_87856_87960_88629_88687_89941_90055_90980_91120_92258_92322_92745_92852_93374_93451_93554_93712_94009_94103_94310
719128	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719132	contig_10937_pilon	+	2045	11	Intergenic	novelGene_67304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	64.6962904655282	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	56	1864	35798	45357	FALSE	35	AATAAATCTTTAATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTFAVTTQYGWVLEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	35742	45538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_36212_38929_39254_40254_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43404_43487_43523_43901_44008_44133_44249_45255
719136	contig_6726_pilon	-	1252	13	Intergenic	novelGene_86207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	435.197105727202	250	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	14	907	76688	9238	TRUE	15	CCACTGTGTTGGATTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVKMAKVSELYDVTWEEMRDKMRKWREENCRNSEQIVEVGEELINEYASKLGDDIWIIYEQVMIAALDYGRDDLALFCLQELRRQFPGSHRVKRLTGMRFEAMERYDDAIQLYDRILQEDPTNTAARKRKIAIRKAQGKNVEAIRELNEYLEQFVRDQEAWHELAELYINEHDYAKAAFCLEELMMTNPHNHLYCQQYAEVKYTQGGLENLELSRKYFAQSLKLNNRNMRALFGLYMSASHIASNPKASAKTKKDNMKYASWAASQINRAYQFAGRSKKETKYSLKAVEDMLETLQITQS	76701	6734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_7045_8129_8164_9236_9325_20192_20298_22595_22707_23629_23712_30526_30587_30747_30834_41431_41490_49977_50064_52417_52483_53014_53129_76648
719139	contig_5020_pilon	+	1363	6	Intergenic	novelGene_27879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1008.16002697984	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	299	1048	121762	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118481	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123356_125657
719143	contig_537_pilon	+	1586	3	Intergenic	novelGene_167593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	581	1402	547218	549477	FALSE	30	TATCACTTATGATTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFNVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	544558	549661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_544580_546658_547288_548725
719144	contig_6710_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_95052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
719150	contig_5954_pilon	+	2031	21	Intergenic	novelGene_28499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	131.164734208552	329	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	390	1658	412904	420257	FALSE	5	TGATTTTGCTCTGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRAPFLGPSLPEPPAEDSLSSPPGTPPLPPPGPDSPPLLPTTWATMKHQADLERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGSTFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSLAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHILPLEAGLRPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTVLVSFQRCVRIVNLQGEPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLGTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIVLESIPTDNPGAHSNLYILTGHQSSY	411017	420630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_411092_411179_411289_411898_411964_412495_412540_412619_412659_412745_412780_412879_412986_413066_413156_413233_413276_413351_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_418055_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
719158	contig_14441_pilon	+	690	3	Intergenic	novelGene_100683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	190	690	116728	117789	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACL	113670	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113711_116578_116963_117523
719161	contig_13780_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_149022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCCACTTGTGCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440684	440231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_440200_440700
719162	contig_11338_pilon	-	1437	2	Intergenic	novelGene_6184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGCCCTGTCCCAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6832	1343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_1953_6004
719163	contig_7135_pilon	+	2405	6	Intergenic	novelGene_136947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.1812714067709	92	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	153	1916	234848	268922	FALSE	30	AATATAGCCTGTTTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTRSIFQTERVALGVTSFRKELGLSHPRYSGRDVIMDHHVSTIKPRRIQNQNVIYRLERRRISSGKAGTHWHQVRVFHQNVFPNFTVVNVEKPPCFLRKFSPDGRFFIAFSSDQTSLEIYEYQGCQAAEDLLQGYEGEILSNGNDQRSVNIRGRLFERFFVLLHITNVAANGEHLNRECSLFTDDCRCVIVGSAAYLPDEPHPPFYEVYRNSESVTPNPRSPLEDYSLHIIDLHTGRLCDTRTFKCDKVVLSHNQGLYLYKNILAILSVQQQTIHVFQVTPEGTFIDVRTIGRFCYEDDLLTVSAVFPEVQRDSQTGMANPFRDPFINSLKHRLLVYLWRRAEQDGSAMAKRRFFQYFDQLRQLRMWKMQLLDENHLFIKYTSEDVVTLRVTDPSQASFFVVYNMVTTEVIAVFENTSDELLELFENFCDLFRNATLHSEVQFPCSASSNNFARQIQRRFKDTIINAKYGGHTEAVRRLLGQLPISAQSYSGSPYLDLSLFSYDDKWVSVMERPKTCGDHPIRFYARDSGLLKFEIQAGLLGRPINHTVRRLVAFTFHPFEPFAISVQRTNAEYVVNFHMRHCCT	233959	269411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_234051_234786_234949_245965_247059_251198_251387_264805_264998_268732
719174	contig_7840_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_68954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCAGTAGAGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88941	86494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_86500_88900
719175	contig_14513_pilon	-	788	5	Intergenic	novelGene_70244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	198	599	18880	11473	FALSE	10	TCTGCTTTTGTCCATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLFRSRSQGLSTEALLSGLESPTL	19077	11283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11546_12069_12158_13087_13136_14952_15001_18735
719176	contig_16098_pilon	-	1895	14	Intergenic	novelGene_45885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	70.6230094760597	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1172	1633	247373	244355	FALSE	10	TACTTTCTTGTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYTALFLFLIWSLLQFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253591	244092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247612_248284_248398_249225_249273_250006_250074_250211_250292_250688_250765_251545_251643_251721_251945_253023_253103_253255_253379_253563
719177	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_92007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657496	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657497	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719178	contig_6589_pilon	-	1774	15	Intergenic	novelGene_26261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	57.2498997414682	8	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	4	585	2233261	2230875	TRUE	15	AAGCTTGGCCAGCGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWK	2233264	2227806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229502_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110
719187	contig_13958_pilon	+	3268	18	Intergenic	novelGene_129539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_17	190.736978993874	136	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	118	1833	187484	291662	FALSE	25	ATTTTTGTTCTAGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWGGAGVGTRWCPVYGASWCRWRRGGRRGFPSSGLRSARMLPGLAAATAAHRCSWSSWCRLRLRCRAAARGSGYQQEWQNLVTFGSFSSMVPCGHPYICALNQVKLYSTNIQKEGQGSQTMKGGKVPTFDETAENIGAELKAPLLKQEPLQVRVKAVLKKREYGPKYTQNNFITGVRAINEFCLKSSDLEQLRKIRRRSPHEDTESFTVYLRSDVEAKSLEVWGSPEALAREKKLRKEAEIEYRERLFRNQKILREYKDFLGNTKPRSRMTSVFFKGPGKVVMFAICINGLNCFFKFLAWIYTGSASMFSEAIHSLSDTCNQGLLALGISKSVQTPDPTHPYGFSNMRYIASLISGVGIFMMGAGLSWYHGVIGLLNPQPMESLLWAYCILAGSLVSEGATLLVAINELRRSARAKGMSFYKYVMESRDPSTNVILLEDTAAVLGVTIAATCMGLTSITGNPLYDSLGSLGVGTLLGVVSAFLIYTNTEALLGRSIQPEQVQRLTELLENDPSVRAIHDVKATDLGLGKVRFKAEVDFDGRVVTRSYLEKQDFDQMLQEIQEVKTPEELEIFMLKHGENIIDTLGAEVDRLEKELKKRNPEVRHVDLEIL	187366	293097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_187596_216716_216885_230747_230811_233315_233416_235681_235775_236201_236285_249608_249668_257283_257352_260342_260446_264511_264568_266567_266704_272991_273032_274905_274978_275439_275548_278315_278482_283884_284015_286080_286195_291617
719188	contig_9335_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_147468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	32	99	199	297	687075	687173	NA	40	TTGGAAAAACACAGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATNVTKQFVYKFLNEKLTCAVNFYLKHNKIKKYIYSVYTHKKKITRTRKLDGFVQSQTSPDKKAQMSWHNSSPSEMCSGFGEYMALFFSPGDGTAER	686876	687760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_686900_687800
719189	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
719192	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	15	-1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	245	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGAGTTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
719195	contig_5690_pilon	-	3309	10	Intergenic	novelGene_119680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	12.3538368109109	50	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	73	1179	315190	304957	FALSE	50	AGATTAATAAAAAACCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFKQRRRKQKAKAKKLFKKKEASRFLSKLIAPPPPPQSPERVVIPPTDTPNSRSWLRSTCNFNFPNIKDAVKLWTNRVWSIYSWCQNCIAQSLEVLKDTIFPSHICRKELHSLKQRFCILESEFCKLQEALKTVSENSSCPSCGHMCHLSGKLTCVPACELTIPGESQAALPAALPQLASHLPPPPPPPPPPPPPPPPLPPPPPPIAPLLPRKADRPKSLQAGPLKRDGPMQITVKDLLTVKLKKTQSFDERKKLVLSPKTRNPLVTVSDLQRVTLKPNSKVLSTRVTNVLITPGKSQIDLRKLLRKVNVERSPGGTPLTNKENMDTGTGLTPVVTRALRRKFQLAHPRSPTQTLPPSASSFGEQN	327325	302826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_305026_307649_307747_307831_307892_308725_308839_309634_309734_310687_310955_312523_312647_314359_314511_315062_315196_327258
719196	contig_19730_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_142498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCACATGCATATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165273	165695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_165300_165700
719199	contig_6710_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_98102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719202	contig_4426_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_15380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTCAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332708	334802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_332700_334800
719203	contig_9481_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_149630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	884	1183	99156	98857	NA	65	ATAAAGAAAACAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWITPIRNQSWDGAVPGSVSFQAVFHCAWGRHQSGADSTAAHNNNSIPQAHKGTRRKYIKVSLPSARMVMAPNYQSWCFLKMGQFTNTSIFQYCSH	100039	98252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_98300_1e+05
719207	contig_17518_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_117358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107146	104995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_105000_107100
719211	contig_6710_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_95677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653691	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
719216	contig_12886_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_135480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGGTCGAGAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320373	320657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_320400_320700
719220	contig_17769_pilon	-	2263	3	Intergenic	novelGene_124263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAACTAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107476	103205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_104848_106406_106478_106926
719223	contig_7843_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_152051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488532	487486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_487500_488500
719245	SIRV4	+	476	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	27	447	27	-447	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAATTGCCATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	2324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
719256	contig_2646_pilon	-	1502	8	Intergenic	novelGene_69659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	258.481673451338	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	609	1025	2176772	2172056	FALSE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC	2181033	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174051_2176766_2177024_2178876_2178992_2180692_2180858_2180956
719257	contig_15114_pilon	+	1449	7	Intergenic	novelGene_121203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	65.3477875167425	507	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	338	1090	785166	800215	TRUE	35	AGAATCTGCCTAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVKRGDESQFLLQAPGSSELEELTVQVTRIYNGRLKVQRLCSEMEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQAELSVIKESEAQLWWAAKELRRTKKLSDYVGKNEKTKIIVKIQQECLSPRFPLTLLFAEGTRSSSPRTRHQQ	784828	800844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_789237_789406_791308_791377_793688_793848_795328_795461_800128_800268_800537
719259	contig_12270_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_113527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	6	341	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14414	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
719268	contig_15410_pilon	-	1351	11	Intergenic	novelGene_130573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	69.6885212929648	1933	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	108	1190	57724	54277	FALSE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59306	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57564_57669_57742_59216
719276	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	78	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719279	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719281	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719283	contig_4392_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_117330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTATAATTAATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537336	539337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_537300_539300
719285	contig_13528_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_66859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1202	1540	27689	27351	NA	55	AAAAATCTTTAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFISFFYELCCLLKFGIHELLLQFLMFEHFINMLREKENVFRHLANKGTLCGRDITQVTIPCLPCFSCLYHQSHKHWALLSVCLHKSLLHISLQPCCPAGPILWEADYPHQ	28890	26139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_26100_28900
719287	contig_4442_pilon	+	1764	4	Intergenic	novelGene_127958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	236.365536122902	1218	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	282	509	1349865	1355688	FALSE	25	CATGAGTATCAGGCCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVVAAQLVSVSDPQYLGRRQLSRYLLSSVGASRGQLVAGVFGFLCCWRCRVPWSSCAKHHDVRFGELHQPYPREDRRGELSGTVAVITSDGRMIVGTLKGFDQTINLILDESHERVFSSSQGVEQVVLGLYIVRGDNVAVIGEIDEETDSALDLGNIRAEPLNSVAH	1348490	1356943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_1348733_1349825_1349874_1353102_1353231_1355597
719290	contig_13245_pilon	-	437	5	Intergenic	novelGene_148815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4577.58465241223	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	117	437	26752	25417	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSIIGK	26868	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25425_25500_25637_25998_26073_26356_26457_26749
719293	contig_299_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_129460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	53	355	990482	990784	NA	80	CGCAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCITGIAGAHLSLGVQNMWPTRRTIRTWAWCRAPSCSTVAAPSFHSVCLDGISVVQCMVYTASGGGPGLVLDSGGQLKKIIHLKHFSQSLEHCKFSVNVVVVVSCHRVDSDLRWLCV	990429	992917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_990400_992900
719299	contig_6576_pilon	-	1104	6	Intergenic	novelGene_42284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	726	junction_3	499.865581931783	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	111	716	339439	330284	FALSE	50	AAACAGTCTTCAATCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENM	339549	329895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
719305	contig_6677_pilon	-	2715	4	Intergenic	novelGene_114177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	65.1204013091648	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	295	1932	473323	463496	FALSE	20	AGATCACGTGTGCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVLIPHTPIAVDFWSLRRAGSARLFFLSHIHSDHTVGLSSTWARPLYCSPVTAHLLHRRLQVSKQWIRALEVGESHVLPLDEIGKETMTVTLIDANHCPGSVMFLFEGYFGTILYTGDFRYTPSMLKEPALRLGKQIHTLYLDNTNCNPALILPSQQEATHQIIKLIRKYPQHNIKIGLYSLGKESLLEQLALEFRTWVVLSPRRLELVQLLGLADVFTVEENAGRIHAVDRTEICLSTMLHWNRTHPTIAILPTSRKIHISHPDIHIIPYSDHSSYSELRAFVAALKPCQVVPIVSGQPCRHYFQDSLNPRLSMPLIPASVRQYMSSNSRKQSFLWLLERRLKKPRTQGVVFESLEENADQCQPDRDSKKVKKEKLSPQPGDLEQQPSPCTLQVKKQLLPDLYSKEWDLLVPFCESQGMATVVTAPLGLSVQLRCTDEEFISLKTGEEISLEPHLLPRGDNDGPATTGNQSAWIGKDSSLSPSSRAGPLLTSGFRGLALKYLLTPVNFFQAEFSSRSFDQQVEKYRRTLAEVQRRAQNDTLV	473617	462712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_464596_471606_471790_472260_472427_473134
719309	contig_14744_pilon	-	802	6	Intergenic	novelGene_66091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCCTTGAGGTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386693	1383076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1383209_1383301_1383401_1384428_1384572_1385181_1385234_1385823_1386004_1386497
719310	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719311	contig_4891_pilon	+	1124	6	Intergenic	novelGene_124572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	567.71274426421	9	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	286	783	707907	756631	FALSE	10	TCATGTTGCCGGTCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	702912	756972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_703063_707771_707925_708893_708977_733743_733930_755867_756027_756579
719312	contig_15744_pilon	+	1318	4	Intergenic	novelGene_83609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_2	603.484879678025	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	674	1129	152116	153378	FALSE	65	GTAATGAAATAAAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINCNFLLQLFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	151442	153567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152177_152263_152353_152532_152706_153245
719313	contig_7202_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_19086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCGCCATGACGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
719320	contig_19647_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_144011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCTGTGGCTATTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78653	77797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_77800_78700
719323	contig_14176_pilon	-	2762	17	Intergenic	novelGene_74835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_16	142.550868113807	526	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	227	2356	231844	223438	FALSE	35	GAACTGACTTTGGAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLTKNGHVYKYDGFRESEFEKLSDFFKTHYRLELMEKELCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSLMEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRDKSKKKKKVKVKTEKKSTPSRGSSSKSSSRQLSESFKSKEFVSSDESSSGENKGKKKRRRSEDSEEEELASTPPSSEDSASGSDE	232548	223031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_223762_223950_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_229930_230207_230314_231182_231369_231790_231966_232443
719324	contig_8600_pilon	+	3536	2	Intergenic	novelGene_125747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	80	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	38	817	301849	304967	FALSE	40	GAGCAATAAATTCCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLERCARVLRGTLVRAAVRRYLPWALMTFMLAGSLLKELSPLPESYLSNKRNVLNVYFVKLAWAWTFCLLLPFIALTNYHLTGRAGLVLRRLSTLLVGTAIWYVCTTIFSNVEHYTGNCYHSPALEGVRKEHQDKQQCHGEGGFWHGFDISGHSFLLTYCALMIVEEMAVLHEVKTDRSHCLHVAITTLVVALGTLTFIWVLMFLCTAVYFHDLSQKVFGTLFGLLGWYGTYGFWYLKSFSPGLPPQTSSFSLKRDS	301811	307686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_302022_304360
719328	SIRV7	+	437	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCAGTTACTATGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	114798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70966_78788_78962_114676
719329	contig_12005_pilon	-	1803	9	Intergenic	novelGene_160471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.8887304843844	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	933	1667	193197	186547	FALSE	20	TTTGACTCATTGGATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRDEENMGHVTQYRTRTLSVTSAGSVVSCSTIPLELVKQKVKRQLTKQQKAAVRRRLQKGEANIFTKQRRENMQNIKSSLEAASFWED	216518	186410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_186712_190632_190730_192724_193250_197998_198195_202798_202888_205826_206003_208295_208413_209587_209727_216355
719330	contig_6710_pilon	-	444	2	Intergenic	novelGene_98187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719332	contig_2693_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_167603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACAAAACTTATTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305236	306995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_+_305200_307000
719334	contig_15304_pilon	-	1055	3	Intergenic	novelGene_30557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	25	TCCACCAGAAGCAGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
719336	contig_16185_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_144751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTACCTCCCACAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84551	83990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_84000_84600
719345	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_89616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653780	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719354	contig_14536_pilon	-	1069	5	Intergenic	novelGene_69306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_1	90.3890894964652	150	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	5	496	235581	171562	FALSE	15	TTACTGATGTGCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMLDSDGNEKVEKKEFFKLQKIISKQDDLKTTVTNETECQERKLKEPEVNTTLQIRFFGKRGEKKLHYKEFRRFMENLQTEVQEMEFLQFSRGLSFMRKEDFAEWLLFFTNTGNKDIYWKNVREKLSAGEVPQQLSVQEYWKCVKKESIKGVKEVWKQAGKSHF	235585	170988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_171667_178024_178197_185030_185129_203390_203457_235530
719358	contig_15112_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_124768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71508	70894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_70900_71500
719362	contig_7457_pilon	+	1895	14	Intergenic	novelGene_31640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	200.032837540926	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	138	1544	1005828	1040226	FALSE	65	AAAAAAATAAAAAAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1001538	1040577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005804_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014445_1036976_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
719363	contig_6165_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_167422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTGGGTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507036	506549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_506500_507000
719364	contig_8740_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_167608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	59.7918156982191	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	211	771	48349	52715	FALSE	55	CAAGAAAAAAAACATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIRPDVVDIVAKLHQLEGLRTIGITTNGISLARLLPQLQKAGLNAINISLDTLVPAKFEFIVRRRGFHKVMEGIHKAIELGYNPVKVNCVVMRGLNEDELLDFVALTEGLPLDVRFIEYMPFDGNKWNFKKMVSYKEMLDTVRQRWPELEKLPEEESSTAKTFKIPGFRGQISFITSMSEHFCGTCNRLRITADGNLKVCLFGNSEVSLRDHLRMGASEEELLRIIGAAVGRKKRQHAGMFSISQMKNRPMILIGG	33235	53464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_33267_47562_47728_48334_48397_48746_48859_49271_49385_49899_50011_52042_52164_52659
719365	contig_8740_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_167610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGACCTATAACTAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53567	54892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_53600_54900
719366	contig_14142_pilon	+	2557	3	Intergenic	novelGene_120493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	5.5	126	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACCTCAATAAAGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307869	311733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_310041_311187
719371	contig_19908_pilon	+	2840	14	Intergenic	novelGene_167615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_8	52.7760704246485	135	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	74	1414	40364	56296	FALSE	5	TTTATTGCCTGTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFSVEGQENLQEILSKQLLLCQFLMALSVVRTGGHFICKTFDLFTPFSVGLIYLLYCCFERVCLFKPITSRPANSERYVVCKGLKVGIDDVRDYLFSVNIKLNQLRNTDSDVNLVVPLEVIKGDHEFTDYMIRSNESHCGVQIKALAKIHAFVQDTTLSEPRQAEIRKECLRLWGIPDQARVAPSSSDPKSKFFELIQGTEIDIFSYKPTLLTSKTLEKIRPVFDYRCMVSGSEQKFLIGLGKSQIYTWDGRQSDRWVKLDLKTELPRDTLLSVEIVHELKGEGKAQRKISAIHILDVLVLNGSDVREQHFNQRIQLAEKFVKAVSKPSRPDMNPIRVKEVYRLEEMEKIFVRLEMKIIKGSGGTPKLSYTGRDDRHFVPTGLYIVRTVNEPWTMAFSKSFKRKFFYNKRTKTSTYVLPTDSIAPFHVCYFSRLFWEWGDGIRVHDSQKPQDPDKLSKEDVLSFIQTHSA	40290	57722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_+_40389_40664_40798_41533_41714_47460_47518_48258_48317_48762_48832_49792_49925_50929_51053_51740_51833_52543_52613_53508_53557_54527_54641_55249_55359_56163
719373	contig_17440_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_7631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAAGAAATATGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3451	4003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
719374	contig_5236_pilon	+	1535	3	Intergenic	novelGene_100908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	34.5	240	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	227	1138	451179	452090	FALSE	20	GCTTGACCTTATTTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVGPDGQKWASMDPEERMLAAATAFTQICAGQGEGDVRREAPSTRYDPYSKASVTAGKRPVALPLQVQYPHLDCNVTSETVSEASQRLQKPVMKRKVLRRKPGGEVLVTDESIISESESGTEREMDLWDLRQRLMNMQFQEDRESPVEISQKFNLPHEYQTLTQEDQLVYYLQREGMGPPADEQDLIVASRPKSFILPRLDQLSRNRGKIDRVARYFEYKRDWDSMRLPGEDHRKELRWGVREQMLCRAEPQPKPQHVYVPNNYLVPTEKKRSALRWGVRCDLANGVMPRKQLPFPLSPS	436107	452487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_436191_448510_448629_451153
719376	contig_20371_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_129175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAAGAAGAGTTTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25335	24506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_24500_25300
719377	contig_14807_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_124713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1123	1620	38792	38295	NA	65	AAAAAACAAAAAACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEGEAGFFGNPNPSALELIQQAHCPLIRPGAHWRAGPSPRQHGHHLAYTWGCGGECLCAILSLSLCIALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADR	39914	37980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_38000_39900
719378	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
719383	contig_5084_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_64607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	168	482	1015008	1015322	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPYWRPLADPLLCVPSSRQAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLGRWPLALGRGFAPPAVSIHLVNLLPGASVQSLHASPPRLWQNPVPRGRIFQGYS	1014840	1016450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1014800_1016400
719384	contig_1719_pilon	+	1306	10	Intergenic	novelGene_87384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGGTTGCTGAGAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847000	854032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_847385_848129_848271_848615_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849971_851395_851471_853348_853437_853592_853647_853888
719385	contig_16724_pilon	-	1428	9	Intergenic	novelGene_105291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	790.118464219132	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	267	794	569099	543969	TRUE	20	TGTTTGTGTACCGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRHFKYRYNS	575921	541136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541365_541649_542004_543916_544002_547924_547980_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
719386	contig_12128_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_131998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGTCTTTTCTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551654	553753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_551700_553800
719387	scaffold_19766_pilon	-	1040	6	Intergenic	novelGene_34318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	387.410583231796	732	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	148	816	622205	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622352	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_621454_621815_622153
719388	scaffold_19766_pilon	-	1120	4	Intergenic	novelGene_34366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	188.280523569369	117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	35	952	678336	676839	FALSE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGLSLGFCHPTPAPGHKGELSLLARPPGPPSTSPTPPSTLTTSAQQPWRWPTTTSNSPGGHRSPFPPHPRPRHWPPGHPCLRPPTAVSSLLRMYSMLRQEGALLTLAQVAPTSSHSLTLWSPSHGGTLSSIREAPSPPGFPCLPGLWNLPSGGSLVPGLLTFLHIMFYS	678370	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677786_678138_678275
719391	contig_2463_pilon	+	1224	3	Intergenic	novelGene_43021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	653	junction_1	6.5	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	289	372	515468	515551	FALSE	40	CTATTAATATTGTCAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSGGGGGSSGAGGGPSSGTSSNRSGLLDKWKIDDKPVKIDKWDGSAVKNSLDDSAKKVLLEKYKYVENFNLIDGRLTICTVSCFFAIVALIWDYMHPFPESKPVLALCVISYPFFMVRFVF	504408	516403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_504502_514673_514758_515356
719392	contig_15118_pilon	+	1918	6	Intergenic	novelGene_74586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	287.962914278905	67	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	962	1270	377560	379761	TRUE	30	TATTAACCATTTCAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKALNPEVLELPQLLSGDGGKFTCQAHHLLGP	376598	380642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_377591_377789_377838_378493_378631_379668_379782_379884_380022_380151
719393	contig_18869_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_56237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTACCTTCCCAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73350	73597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
719396	contig_7088_pilon	-	2523	1	Intergenic	novelGene_159807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746210	743687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_743700_746200
719397	contig_5549_pilon	+	969	10	Intergenic	novelGene_81631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGACAGAAATGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438890	445628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_439391_442017_442091_442271_442319_442859_442938_443305_443363_443637_443682_443957_443989_444483_444524_444927_445002_445603
719398	contig_6208_pilon	-	1403	2	Intergenic	novelGene_53046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	597	junction_1	0	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACATTAATTCATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532579	530643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_531973_532505
719399	SIRV7	+	539	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	26	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGTCACTTAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78962_114683
719401	SIRV4	-	182	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACTTGGTAAATAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
719408	contig_10058_pilon	+	1098	5	Intergenic	novelGene_67702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	68.7654528088051	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	177	419	52594	53244	FALSE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	52141	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
719409	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719413	contig_7914_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_165014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGATGTTAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7819	9958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_7800_10000
719416	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
719418	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
719424	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719428	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
719431	contig_8972_pilon	+	2227	2	Intergenic	novelGene_167633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTGTATTTTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381636	384172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_381719_382027
719432	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
719433	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
719434	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	6	353	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14414	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
719435	contig_6710_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_97941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
719436	SIRV6	+	194	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	511	3	-341	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAGAAGGTAGTCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
719440	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719446	contig_5020_pilon	-	1534	8	Intergenic	novelGene_27795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	456	899	124967	123330	TRUE	25	AATGAGCGAGGGTGAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVQKPAPKAEVKWQGTSSAREEGGAGKAVRILHPYPCHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126071	118396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118564_119436_119583_122804_122973_123175_123362_124165_124361_124442_124545_124852_125047_125695
719448	contig_6031_pilon	+	1126	8	Intergenic	novelGene_56725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	624.397930417938	2146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	461	964	158033	165819	FALSE	20	TAATAGCATCCTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLVALAERD	149006	165981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_151194_151311_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_165761
719449	contig_10940_pilon	-	1706	3	Intergenic	novelGene_49262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	713	1	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	704	1084	875054	874674	FALSE	20	TTTTTTCTTTTTCCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917144	874051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875498_916708_916748_916923
719455	contig_5020_pilon	+	864	5	Intergenic	novelGene_27887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	326	862	122915	126085	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSSCHHIPSLPHILTPPLYLISPFSLSPGGIDPTLAPARIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPPIKQAQP	118499	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123356_125877
719459	contig_5794_pilon	-	1452	11	Intergenic	novelGene_69805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_1	4435.16349191323	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	38	1105	749501	743712	TRUE	50	GGTACCAGGAATAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749538	743272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749495
719464	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719467	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_93480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
719469	contig_7234_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_145944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGAAAAACAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443562	445469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_443600_445500
719472	contig_13905_pilon	+	1547	3	Intergenic	novelGene_130419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	11	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	100	420	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218414	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438
719476	contig_19012_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_159480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAGAAAAGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46031	47493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_46000_47500
719477	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719490	contig_5928_pilon	-	1900	8	Intergenic	novelGene_40368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	44.9344193332497	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	30	614	251809	215803	FALSE	25	AGTCCAGTCCTTTACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRATPWQDMACGFRRSIAYQLSRVLDLPPENLIKSISAVPISKKEEVADFQLSVDSLLENNSDHLRPDIQDQAKRLAEKLKCDTVVSEISTGQGTVNFKINRELLTKTVLQQVIEDGSKYGLKSELFSDLPQKKIVVEFSSPNVAKKFHVGHLRSTIIGNFIANLKEALGHQVTRINYLGDWGMQFEHAGHFSTPCSQGPES	251838	214516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_215853_217593_217678_220326_220383_221490_221589_229383_229468_230831_230935_249346_249421_251773
719491	contig_12756_pilon	+	1388	10	Intergenic	novelGene_153197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	95	junction_2	76.9949493293049	346	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	188	952	47123	66492	FALSE	35	AAAGTTGTTTGGATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFYRFWK	46743	66928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_46874_47065_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_66436
719496	contig_10377_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_115358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTGAAGCAATAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187749	187314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_187300_187700
719498	contig_9017_pilon	+	2482	4	Intergenic	novelGene_130346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.5619692784682	9	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	32	925	609506	614480	TRUE	40	TATATATTTTACCACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNLTCRATFPGADVTTESTVLLNVSYPPPAVWPLLLLGDQGSALHLLCPSLASPLPVLAGWGQAGGGEQQHLLHGQLFLHWALDQQLIEPQHRAHLWPQAQL	609474	617952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609855_610072_610385_614247_614936_616850
719502	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_89236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
719505	SIRV7	-	276	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91639	11	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
719506	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
719507	contig_4068_pilon	-	2429	21	Intergenic	novelGene_161700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	41.0421734317275	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	1373	2428	83525	29004	FALSE	55	AAAAGGAGCTATCAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALGLGEEEDVESPWDSESVSESLAQKYVGHFSGATDEKGENIVNGQIEDSPEKYPHLKPIQPIIEMKDSTPDKAAERKDVQTSKSDFSDWDSTSLTHKLSRDLKVDDKCPFVSQSMTKSQSASTEFGEMTLIDKEKINIGAVFLLGNYPLHDLCESHLPENKESKEDLSAELDLEMTSEEERERLDERENNRPQVEEERKKFKSSELEVTENTYDPAIDNGANGFIKQGKSGKSDNQQFCIKENDDSDRPAKKTSDEESKVQKQINSMNDLDDLSQSSETASEDCALPNSNYKNSMLLIEQLGMDCKDSVSLLKIQDAILSYERLVELKKNHCELLTGKIKKMENKVSGL	113742	29002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_29132_34322_34465_34756_34791_42831_42996_61062_61146_63826_64070_78188_78271_78366_78396_80957_81052_83468_83531_83823_83962_85997_86201_86292_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102902_108099_108274_109188_109304_113408
719508	contig_4151_pilon	-	2825	1	Intergenic	novelGene_65246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAACCTGCTGATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551088	548263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_548300_551100
719512	contig_500_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_30944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAATATTAAAAATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443574	1444273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1443600_1444300
719513	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	90	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719518	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_18171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
719521	contig_1143_pilon	+	3483	5	Intergenic	novelGene_86582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118771	149746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_121454_135918_136018_147614_147701_148392_148459_149196
719524	contig_10009_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_82723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43810	41548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41500_43800
719525	contig_348_pilon	+	1735	9	Intergenic	novelGene_67602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	9.27951372648373	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	504	1310	320222	345268	FALSE	35	AAAAACTGTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314470	345693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
719527	contig_6344_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_157116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1248	1562	1176657	1176971	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFFGSALGGKIAGLGIPMPDSGSKLCHLPDLGYDSSSAELGALVVQWLRTTAANQKVSSSNPPPIPWKPYGAVLLCLIGSLGLEVGIDLTATGFCFCRASSL	1175409	1178480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1175400_1178500
719545	SIRV2	-	393	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	0	678	0	-678	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTCACATCTATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5895	4343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
719563	contig_11538_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_152294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAGAAAAAAGAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193073	190874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_190900_193100
719565	contig_10487_pilon	+	2288	4	Intergenic	novelGene_159411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	11.9536140513607	85	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	596	1075	220938	245004	FALSE	20	TATTTGGTTTATGATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFSKNHGVVVQPTYKDRVNITHPGLRNTTLTFWNTTLEDEGCYMCLFNIFGSGKISGEACLTLYVQPTVSLHYKFFEDHLNLTCSATARPAPVISWKVAGSGIENSTESVSHPNGTTSVTSILQVKDPESYVGREVICEVLHLGTVTDVRETVSKEP	210086	246217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10487_pilon_+_210554_220809_221137_223552_223826_244996
719568	contig_15063_pilon	+	1060	3	Intergenic	novelGene_14386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	125	946	35271	36661	FALSE	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35146	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
719575	contig_15456_pilon	+	1087	4	Intergenic	novelGene_139503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	642.086356255051	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	86	406	131507	142452	FALSE	25	CATTTATTTCCACTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCEKCEKKLGTVITPDTWKDGARNTTGLIHMERISSPLAEFAKVLCTNLVLITVRAVPTKRASVQCVEKRSWIPKTTSKRPSRHIDDFLAFCRILLSDLNFQHIT	131421	143133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_141935_142040_142317
719579	contig_6795_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_27710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1865	2272	129930	129523	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGHLLGGGEVPVFGGGDFSLNCNFLIFARRMCLCVTYIIRNNNRKVWLGFSPFVISTNCPRAMPRKHRSEETKWACRGGAVSPPPTRRLLLHLVQHPHCVIKALNPESGLFNQPYVPVEEHEDDKVSFGHDLGI	131794	129127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_129100_131800
719580	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719581	contig_9571_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_136284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457185	459476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_457200_459500
719585	contig_10734_pilon	-	1209	7	Intergenic	novelGene_51512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	520.421223625632	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	42	1151	2274500	2265543	FALSE	45	AGTGATATTGAAAATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2275786	2265484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754
719599	scaffold_16539_pilon	+	2019	7	Intergenic	novelGene_68303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	643	1146	97552	103848	TRUE	5	TTTGTGCCAGCCGCCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVFVFGCCPLLGIKIPDGDGIPGGIGWLHLVGVPPVRPENEQPIKEWLDVGYHRPALREDLQQAAMHLDVPVLIQVIDTGDATPVAVGIVNVPHIPQPVAWVTRHHGLGAPVDDVATQPPGAVPDDRIHMGHESADAPAAWLVAFHPGNLVPTDASRRDSPLAH	96909	105784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_97561_97825_97886_98110_98250_98677_98799_103673_104095_104144_104741_105753
719603	contig_10864_pilon	+	896	4	Intergenic	novelGene_107131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	10.8423039781937	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	362	541	1542358	1542537	FALSE	45	TCTAATCAAAGATGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSVIFDTSHLSGEEDVLTFIVTAQSGNVERSETQHDNILSLIVPLVHEVDTSVTGVTSPTSFVYGESVDASNFVQLDDLECHFQPLNVTLQVYNTGPSTLPGSSVSISFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVSSQSVFTVAFRLEPARSHFVSTLTLSSTLGAQKVYLIHPSETYLEKPGDQ	1527381	1542892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1527460_1533918_1534009_1536545_1536655_1542273
719604	contig_3269_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_117010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTTAAAGCCACCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60225	60706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_60200_60700
719606	contig_17829_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_157028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGATATGCTAAGAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22040	22782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_22000_22800
719610	contig_1337_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_84263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCTTTTAGCTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580234	578595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_578600_580200
719617	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719618	contig_10011_pilon	+	2103	2	Intergenic	novelGene_68027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	478	882	89374	89778	FALSE	40	GTAACTTATTCCATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESDDDFKELCASFFQRVKKNGTKELSGERKKQKASDGTQIRSKPKRPKRTTTKSKTLHGPAEEKTQSGSQATRTKTQGAAKSQGREPAPTVNGKGRVLAPTPAPEQPPPQDSAQSTQSGNEHEPLPDVSTGN	85904	90999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_85975_88966
719624	contig_5727_pilon	-	1060	4	Intergenic	novelGene_7990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_1	57.521010654079	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	117	530	504690	500853	FALSE	35	TTTATTTAGGAAGCCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITHLVSAFLTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLREFLHKGLHVSLSTDDPMQFHYTKEALMEEYAIAAQVWKLSTCDLCEIARNSVLQSGLSHQEKQKFLGQNYYKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNELSFLSDAMKSEEITALIQ	506159	500322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_501030_502675_502787_504564_504739_506091
719625	contig_4782_pilon	-	1641	7	Intergenic	novelGene_73638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	13.7315532826973	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	93	1358	418385	391964	FALSE	25	CCACACAACTTTACTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICQFFLQGRCRFGDRCWNEHPGAKGASGGRQQPQQQPSGSNRRGWNAANHRYSSVIQPSSFSKSTPWGGSRDQGKSSLGSFESGTSASRDREFGLSQNPFASLSPDEQKEEKKLLEGIVKDMEVWESSGQWMFSVYSPMKKEPNISGFTDISPEELRLQYHNYLTSNSLQSYLNSIQQLIDQWRKRVNELKTLNTSTKVTLLSDVKAGVSQVAPAFGFGSGQTSTFESAGFPVNNISSDNARNFSFKPSSAFVTAPSGNPSVFGSLPAFGAAPSASITTSASAFGFGKPKITSASSFSFKSPAASGFGSPGFSVFPASLAAGPVGAPAAAGFGSGSSVAGCGGPGSHSNTAFSKPSNNISGNSNIATSLPVSNGCIITDNVLFTPKEQLTAEELEQFQSRKFTLGKIPLKPPPVELLNV	418477	391680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_392536_393199_393285_397143_397231_397970_398048_412788_412884_414170_414400_418264
719629	contig_12270_pilon	-	265	2	Intergenic	novelGene_114124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGACAGACTTCACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14412	13924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
719632	contig_8122_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_40256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2011	junction_1	464.652827388363	32	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	390	911	742073	748168	FALSE	50	AAAATTTCAAAGAGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	736725	748832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
719637	contig_11227_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_163179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACAAGGGCTAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125995	127560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_126000_127600
719640	contig_12299_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_29740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAATCCACCAGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131114	132463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_131100_132500
719642	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719648	contig_18108_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_33489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTAGATGTCCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250952	249636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_249600_251000
719650	SIRV6	+	565	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3143_10707_10819_11031_11109_11205
719651	contig_11507_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_103357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTTTGCTCTGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87048	86605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_86600_87000
719654	contig_10848_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_133538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACCATATAAAGACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872354	873235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_+_872400_873200
719662	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719675	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_97225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719677	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719678	contig_11428_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_138485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGCCTAAGACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17010	15680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_15700_17000
719679	contig_11428_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_138484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15425	14777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_14800_15400
719680	contig_165_pilon	-	2731	1	Intergenic	novelGene_117065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1790	2107	59023	58706	NA	80	AAAAAAAAAAACACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPIKKIHLRFQFLLHFGKFFFGHRPFTLSQFLHLLSRAVKVRFCRSGRNLQQRQVNREHSWPGSNILVGVSRRQPTQHGCLKVNFCFSINPINSHLIKTKWPPP	60812	58081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_58100_60800
719681	contig_4852_pilon	-	1842	6	Intergenic	novelGene_153962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	85.51865293607	98	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	69	413	62078	26582	FALSE	60	GAACAATAAAGTATCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSQAPAGGCENISSQIAGPGVLMLLCSLLVIFGGSSAYNASRGPFSPGSQESTYSSPLPAVEELQLMYANDETTHPSPLTVTEELQPAYMNVGAADTDVVYSQVWCTQQTEGSANIRKTFLEIKDSSAIYSEVKKA	62146	25152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_26621_26715_26748_28559_28626_28870_29020_29871_29900_62047
719695	contig_1406_pilon	-	1714	8	Intergenic	novelGene_25548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	695.688911241576	3	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	89	493	2159494	2143381	TRUE	25	CCAAGAATTCTGGGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTTVALTLSLIIIISCTPQIPVVLVD	2159582	2136630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141119_2143209_2143284_2143351_2143456_2143579_2143628_2147740_2147920_2159391
719702	SIRV4	+	330	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	209	411	209	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
719704	contig_13894_pilon	-	1411	3	Intergenic	novelGene_62048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	276	1334	287445	286290	FALSE	10	GTACTTCTGCAGGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288315	286212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
719705	contig_4232_pilon	-	908	4	Intergenic	novelGene_63206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAACGCGGCCTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149531	146285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146364_148229_148536_148803_148883_149086
719717	scaffold_15027_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_163569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61975	63902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_62000_63900
719724	contig_19362_pilon	+	1503	11	Intergenic	novelGene_157801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_1	250.805283038456	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	623	1501	132435	146380	FALSE	45	ATGTACATAATCTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKFELHPRIKQLIGKGLIKAAVTTGAWILTGGVNTGVAKHVGDALQEHASRSSRKICTIGIAPWGVIENRNDLVGRDVVAPYQTLLNPLSKLNVLNNLHSHFILVDDGTVGKYGAEVRLRRELEKTINQQRIHARIGQGVPVMALIFEGGPNVILTVLEYLQESPPVPVVVCEGTGRAADLLAYIYKQTEEGGSLPDAAEPDIISTIKKTFNFGQSEAVHLFQTLMECMKKKELITVFHIGSDEHQDIDVAILTALLKGTNASAFDQLILTLAWDRVDIAKNHVFVYGQQWL	78463	146382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_78663_120660_120741_124368_124408_128521_128721_132329_132544_134314_134440_140214_140387_141539_141715_143195_143320_144350_144424_146279
719728	contig_7179_pilon	-	1462	7	Intergenic	novelGene_78062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACCAGGGGGTGCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402591	392390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_392417_395398_395490_396248_396343_397028_397128_397713_397795_400662_400753_401610
719730	contig_13055_pilon	-	2447	13	Intergenic	novelGene_104959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	41.0362306044576	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	107	1675	143110	102958	FALSE	45	ATTAGAATATACAATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDAAIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVTGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHSGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVSIHPEPNKLKNTSLNLNVKGRLGPN	159238	102185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115979_116548_116625_119247_119368_138770_138846_139427_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_159175
719731	contig_6048_pilon	-	1424	10	Intergenic	novelGene_73331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	44.9394654569406	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	38	964	2727399	2589914	FALSE	10	CTGGATGAGTTTGCCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGLCLPYWPAGMFQFSAPSGQAPEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGAPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYMEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGAPQVREAGPATL	2727436	2589453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2590009_2590685_2590768_2612162_2612285_2620452_2620514_2631321_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2727363
719743	contig_13542_pilon	-	1379	4	Intergenic	novelGene_131472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_3	440.038129661005	4097	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253188	213428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_214565_216919_217030_218257_218306_253103
719752	contig_6710_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_98109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
719753	contig_7521_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_160543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTAGTAAGACCGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269249	270394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_269200_270400
719754	contig_8843_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_156657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89756	88951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_89000_89800
719755	contig_4402_pilon	+	2365	6	Intergenic	novelGene_140856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599800	604793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_600570_600682_600763_600895_600994_602002_602341_602446_602549_603815
719756	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719765	contig_10811_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_165778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGTGGTGCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9241	8074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_8100_9200
719769	contig_9609_pilon	-	1300	9	Intergenic	novelGene_23118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	118.033628682677	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	150	836	523819	521979	TRUE	20	CCTCTATTGAGTACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDGFAVVDFAGARAPVAQASELPLTGVPKGGGVFAREGLEATDLGPAGAMGSSCRIECIFFSEFHPTLGPKITYQVPEDFISRELFDTVQVYIITKPELQNKLITVTAMEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQILPYIDGFRHVQKISAEADVELNLVRIAIQNLL	523968	520723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521549_521978_522081_522171_522309_522696_522806_522950_523120_523204_523297_523741
719771	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
719774	contig_10856_pilon	+	1726	7	Intergenic	novelGene_167635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_1	13.856406460551	180	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	189	971	136668	154296	FALSE	20	ATTTTGAAGTATTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHHWGYGKHNGPEFWHESFPIAKGERQSPIDIDTKAAKYDPALKPLCISYEHATSRRILNNGHSFNVEFDDSQDKSVLKGGPLDGSYRLLQFHFHWGSSDGQGSEHTVDKKQYAAELHLVHWNTKYGKFEKAMQHPDGLAVLGIFLKIGSAKPGLQKVIDMLDSIKTKGKSAEFINFDPCGLLPGSLDYWTYPGSLTTPPLLECVIWIVLKEPISVSSEQMLKFRNLYFNEEGEPEELMVDNWRPVQPLKNRQIKASFT	136479	155051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10856_pilon_+_136702_137830_138029_144934_145054_145907_146001_147427_147491_148913_149070_154176
719779	contig_5145_pilon	-	2087	12	Intergenic	novelGene_131425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	154.992828413137	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	571	1245	925621	916397	FALSE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947054	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936231_937354_937469_939101_939164_941152_941310_946949
719780	contig_11285_pilon	+	2082	12	Intergenic	novelGene_5613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	539.069645449109	1	101	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1010	1759	768710	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763528	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766408_766534_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768187_768591_768857_769085_769320_769421_769653_769740
719783	contig_9706_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_20842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2244	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2700
719790	contig_16098_pilon	-	1679	15	Intergenic	novelGene_45886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	51.6604396071904	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	176	1417	253301	244355	FALSE	10	TACTTTCTTGTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGELLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253661	244092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253251_253379_253563
719795	contig_11026_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_167646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56116	55532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_55500_56100
719796	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
719797	contig_6726_pilon	+	1352	13	Intergenic	novelGene_86234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	666.373034293355	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	528	1226	308170	333034	FALSE	10	GGCCGTGCTTTATTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNWDAAMEDLTRLKETIDNNQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSATQDSGFY	287840	333160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300303_300345_301435_301541_308106_308233_309168_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331614_333007
719798	contig_15304_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_30411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1297.67390185499	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	2	862	53813	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRPSCLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	53814	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50078_52994_53320_53491
719804	contig_11416_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_145374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	472	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	651	1115	653484	653020	NA	10	GCTGATGGTGTGTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRSRHCLRPHFCHTELNGWVCSLVLGPTPHTCQELKDHLKAHSPCQEGSGLGLSLTPSQGWTASPAALSQCKTPCRHTLGLTPTLWQPRRLLQGRPPHKTQHDEVWEAPGLGDVAPPGVRQTAFKMPPMSPPPVFVACATPCLTVGGLSTCL	654134	652634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_652600_654100
719806	contig_4429_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_50776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATTTTAAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61603	63716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_61600_63700
719808	contig_4857_pilon	+	2175	20	Intergenic	novelGene_48658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	115.230757282171	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	819	1910	1084250	1109542	FALSE	15	AGACCCCTTCGTATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEESSNGSLSVEFRHLQPKEMKSSAGSKGNEGSHMVTEELHSITFETQICLYGLTIDLETSSLPVVMISNVSQLPNAWASIIWYNVSTNDSQNLVFFNNPPSATLSQLLEVISWQFSSYVGRGLNSDQLNMLAEKLTGLSSYSDGHLTWAKFCKEHLPGKSFTFWIWLEAILDLIKKHILPLWIDGYIMGFVSKEKERLLLKDKMPGTFLLRFSESHLGGITFTWVDHSENGEVRFHSVEPYNKGRLSALPFADILRDYKVIMAENIPENPLKYLYPDIPKDKAFGKHYSSQPCEVSRPTERGDKGYVPSVFIPISTIRSDSTEPHSPSDLLPMSPSVYAVLRENLSPATIETAMKSPYSE	1012030	1109807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1080626_1080720_1083743_1083804_1084191_1084304_1086305_1086351_1095241_1095326_1100289_1100389_1102746_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1106005_1107422_1107490_1107876_1107986_1109518
719817	contig_3243_pilon	+	1617	4	Intergenic	novelGene_147530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	550	junction_3	78.2318491550738	608	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	327	824	20577	33350	FALSE	20	TTCAATGGAGTTTGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPGSSSQPPPVTAGSLSWKRCAGCGGKIADRFLLYAMDSYWHSRCLKCSCCQAQLGDIGTSCYTKSGMILCRNDYIRLFGNSGACSACGQSIPASELVMRAQGNVYHLKCFTCSTCRNRLVPGDRFHYINGSLFCEHDRPTALINGHLNSLQSNPLLPDQKVC	20250	34143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_20813_28044_28142_28539_28696_33341
719818	contig_15970_pilon	-	1335	13	Intergenic	novelGene_144047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	123.641282210541	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	172	1272	220872	162388	FALSE	65	TTTAGAAAAGAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKEIDWQPYFTTRIVDDFGTHLRVFRKAQQKVTEKDDQVKGTAEDLIDTFFEVEVEMEKKICRDLVCTSPKDEEGFLRDLCEVLLYLLLPPGDFQNKIMRYFVREILARGILLPLINQLSDPDYINQYVIWMIRDSNCNYEAFMNIIKLSDNIGELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDISTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKEINTVKLAANFGKLCTVPLDSILVDNVALQFFMDYMQQTGGQAHLFFWMTVEGYRVTAQQQLEVLLSRQKDGKHQTNQTKGLLRAAAVGIYEQYLSEKASPRVTVDDYLVAKLADTLNHEDPTPEIFDDIQRKVYELMLRDERFYPSFRQNALYVRMLAELDMLKDPSFRGSDDGDGESFNGSPTGSINLSLDDLSNVSSDDSIQLHAYISDTV	221134	162324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_162393_172368_172439_178244_178283_183964_184098_185045_185151_190522_190717_201786_201887_206505_206595_206961_207101_211533_211618_219477_219567_220817_220920_221010
719819	contig_953_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_130013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACAGGAATCAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347455	348117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_347500_348100
719822	contig_12479_pilon	+	2129	14	Intergenic	novelGene_56829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	169.894328452237	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	214	1638	95993	219853	FALSE	75	GAGAAAGAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQRPTQHELRLYKQQVKNLEKALKKNIKLQELISQKKAEDPEKKGEESSKDNQQQALIDHRYFQVLCSINSIIHNPRAPVVIYKQSKGGPQHFNKDFVQDCAFEHLVPIIAMWADQLTSLKDLYKSLKILSAELVPWHNLKKQDENESIKVEDLLFIVDTMLEEVENKNKDNNVPNFQTLQAVVSHFQKLFDVPSLNGVYPRMNEVYTRLGEMTNAVRNLQELLELDSSTSLYVLVSTVGKLCRLIIDGVNEQVKQLLGPEELQSIINKLEEHEEFFPAFQAFTNDLLEILEIDDVDAIVPAVKKLKVLSY	78842	220344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_78935_95744_95836_95962_96082_96398_96580_110726_110897_119057_119115_165734_165810_195306_195416_209149_209321_212821_212969_213175_213345_213530_213646_216920_217001_219791
719824	contig_14953_pilon	-	1146	2	Intergenic	novelGene_137292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314772	313483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_314316_314458
719825	contig_7629_pilon	-	1640	3	Intergenic	novelGene_153545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	18	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATTTATATTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222939	217359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_218775_222371_222497_222839
719838	contig_2537_pilon	+	1770	3	Intergenic	novelGene_33411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	109	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	85	591	205895	228969	FALSE	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPGRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVVSAKIINLETCVFVSAVFPVSRMKAKKWKNVDFGELRKKNLILQSFVQTSFKCLIWPSTVRCW	205810	230148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665
719841	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
719842	contig_12977_pilon	+	2235	14	Intergenic	novelGene_122787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_12	508.371678315786	4	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	144	854	10884	49056	TRUE	5	TTCTATTTCTCCTTGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADGAGQGGEPGLALPALGTGQCSWLLALGRPCLGQESVLCCSRRPRMMPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMEVSARVWGLSSVEGGSVQGVVPRGPGLESGTGLASALCQPHIRRPSRWLGLHWAPTSQVDQPGPALGGLMGRLIVPDSGPRVIHFVSWGLRDGGRRDF	10740	58791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
719843	contig_11752_pilon	+	1267	8	Intergenic	novelGene_37647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1268.84125187077	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	2	970	85049	105606	FALSE	30	TATAAAGATGTCCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESSEGLVEHLQAMGLDGALLRFHGASWNRLLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTQHE	85047	105903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_87159_87188_87299_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105593
719853	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719861	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719862	contig_18869_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_56389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73737	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
719863	contig_9516_pilon	+	1635	6	Intergenic	novelGene_106195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	20.0559218187547	1335	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	59	1039	1108765	1117222	FALSE	35	AAAGCAAATGCTTCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLRPEADDLVQSAESGPAKMNPLTKVKLINELNEREVQLGVADKVSWHSEYKDSAWVFLGGLPYELTEGDIICVFSQYGEVVNINLVRDKKTGKSKGFCFLCYEDQRSTILAVDNFNGIKIKGRTIRVDHVSNYRAPKDSEELDDVTKELQEKGCGARTPSPSSSEGSDDDKSTKPKKDKKEKKKRKKDREKTDQEVQAEPLSSSSSPRSKMIREKEEPGSNKHSSKSSERAQKAESREGRKHYPSSPEVRTTWRDGAADLEREQRKEKPKQELKSSSRREEREEKNRDRDRGRSSDTHSSRPNGRPEGRSHRSRSRSRDRSHRHKRARHSRDREASNPSDRKHH	1108706	1117818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1108770_1108964_1109081_1110123_1110176_1112327_1112458_1114789_1114965_1116719
719867	contig_15146_pilon	+	2320	10	Intergenic	novelGene_116971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	138.966822579268	3	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	193	1194	615265	625806	TRUE	10	CATGTTGATTTTGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGTVRLLLLLLALAQLLAVACAQEPDADSPSRDDAIEDEDAEDEDEDEDDDEDLEVKEENGVLVLNDANFDTFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFAPEYEKIAETLKGDTPPIPVAKIDATTASAVASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGARTQEEIVAKVREVSQPTWTPPPEATLVLTAQNFDSVVGEADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEKAAKELSRRSPPIPLAKVDATAETDLAQRFGVSGYPTLKIFRRGKPFDYNGPREKYGIVDYMVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAAPRSPSS	615072	629092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_615353_618678_618860_620585_620792_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625783_625893_626792_626950_627221_627456_628443
719874	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	641	1083	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
719875	contig_6795_pilon	-	2233	2	Intergenic	novelGene_27688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	0	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109830	72588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_74765_109773
719876	contig_14326_pilon	+	1837	8	Intergenic	novelGene_120646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.2091108974469	43	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	453	869	35571	48402	TRUE	15	TTTTGAGCTGTAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLLVTCLQWLETRPNRQVCPVCKAGISRDKVIPLYGRGSTGQQDPREKTPPRPQGQRPEPENRGGFQGFGFGDGGFQMSFGIGAFPFGIFATAFNINDGRPPPAVPGTPQYVDEQFLSRLFLFVALVIMFWLLIA	17905	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_17998_20231_20376_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_48304_48791_50151
719878	contig_5451_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_167197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAACCCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868676	869004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_868700_869000
719879	SIRV6	+	379	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	502	3	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
719881	contig_15114_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_121080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTGCATTATCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22340	25073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_22300_25100
719883	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
719884	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
719887	contig_16535_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_167720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	71.3735770436091	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	17	658	417339	420863	FALSE	20	GGCACCCCCCAGCCCAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPSDRMTMSSLVERACCRDYQRLGLGTLSSSLSRAKSEPFRISPVNRMYAICRSYPGLLIVPQSIQDNALQRVSRCYRQNRFPVVCWRSGRSRAVLLRSGGLHGKGVVGLFKAQNAPSPGQSQADSSSLEQEKYLQAVVSSMPRYADASGRNTLSGFSSAHLGSHVPSPRARVTTLSNPMAALVSRRTAPRGKWGSIRASGRSGGSVDVGSRLAGRDVL	417322	420863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_417485_417623_417821_417977_418116_420401_420480_420780
719893	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
719897	contig_15720_pilon	+	1090	8	Intergenic	novelGene_41920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGAGCAGCCCACCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278585	283998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278616_279018_279115_279712_279854_280269_280386_281478_281555_281785_281952_282497_282750_283785
719901	contig_6375_pilon	+	1163	2	Intergenic	novelGene_73047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	109	534	500167	500592	FALSE	25	ACCATAAGTCTCTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESECQLLYGPNSSAPESTKRVYTEVCRWAVAEETRMPRESSSSIPLSFPSPLSSVPDNIINSSLPSMSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498563	501221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498671_500165
719902	contig_546_pilon	-	1758	2	Intergenic	novelGene_117222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1339	1758	136902	136315	FALSE	55	AAGAATCTTCAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLQTTKLCPSSVTEKETLVTIISVGRGSQLGHSSLEQSSQTRWSAPSKTSTASTTAATSSTKSAEPGPRVDNWDFFTKMQGFKGSPYPSQIWKNFLHFRAATDAVVEKTIIDGDLSPHPLAAIWVNICLFYILRYDK	138240	136314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_136537_136704
719907	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
719917	contig_11855_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_66911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791776	793404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_791800_793400
719918	contig_4071_pilon	-	694	2	Intergenic	novelGene_151898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	0	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTAAGTGTTTTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356052	354573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_354660_355444
719919	contig_401_pilon	+	1114	9	Intergenic	novelGene_42811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1598.74747849684	42	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	73	933	1711949	1717936	TRUE	10	TCCATCTCTTATGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGEYGFVAYLWGFYICLILKIVYFSREESATTDFSAL	1711876	1718325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714141_1717870_1717970_1718177
719921	contig_6710_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_89098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653604	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
719922	contig_12125_pilon	-	2739	9	Intergenic	novelGene_76184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	33.6971808909885	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	94	2277	55963	16886	FALSE	35	GAGAGATTGAAACGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDYDSTKNFWLRRFFTWEPAPLNTPRSEGKYMRIPDMRTALRGDLNLLEARHYYLRMEEDTDYGNRFSSLCYINDHVGFLGTIKSSPSDFVVIEIDEQGQLVNKTTDEHLYKINNILPEPNNFAKKTKLDLQNLSFEGGHNQELGTLSRCSNGDHNHQSTSESEATIDDGTSKCEEETADVLGSVLDKKTNELLNQFAYNIKEKWNSETELVGPSPELSLGRILDKNQRASLHSAIRQKFPYLITVGKKSEIVVKPNFEYKELCHLVSEEEAFDFFKYLDAKKENSKFTFKPDANKDHRKAVHHFVNKKFGNLVETKSFSELNYSADNPNVVITVKFREKAYKHRKRSHLECQERKVIYTAFTLRKENLEMFEAVGFLAIQLGVIPSDFSYAGLKDKKAITYQAMVVRKVTPERLKNIEKEIEKKRMNVFNIRSVDESLRLGQLKGNHFDIIIRNLKKQINDSSDLKERILEAIENVKTKGFVNYYGPQRFGKGRKVHTDQIGLALLKTEMVKAIKLFLTPEDLDDPVNRAKKHFLQTEDAKGARSLLPEFKVRERAVLGSLHRFGMTEEGCIQAWFSFPHSMRIFYVHAYSSKIWNEAVSYRLATYGSRVVEGDLVCLDGDVDDEHFPNGNVHLVTKEEESANTYAMHQVVLPILGYNIQYPKNKVGQWYQEMLSRDGLHTCRFKVPALKLNVPGCYRQILKCPHNLSYQLIEDHEIDVKTEDSCISEATLSLFISFDLDSSCYATVCLREIMKHDV	56056	16423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_17213_18277_18332_23322_23604_25604_25687_29637_29737_34259_34453_47647_47808_51673_52603_55904
719925	contig_1154_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_87162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAGATAAGCAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902518	900467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_900500_902500
719932	contig_10197_pilon	-	2994	2	Intergenic	novelGene_115243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	0	473	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	298	372	995777	984171	FALSE	20	GCTTGGTGATCTTTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGR	996074	981548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_984179_995710
719933	contig_9807_pilon	+	1128	7	Intergenic	novelGene_32918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.182215840064	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	206	913	147193	158783	FALSE	25	GCGCTTAAACCACGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	145053	158998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_145185_147118_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
719937	contig_9580_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_167744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATCTGAATAAGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110409	1110871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_1110400_1110900
719940	contig_12886_pilon	+	1662	11	Intergenic	novelGene_135502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGGAAGGAGGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592746	659285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_592973_594073_594229_596154_596265_597394_597619_598329_598432_600458_600627_605604_605810_607026_607106_607260_607346_626332_626552_659196
719942	contig_8269_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_106255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACCCTGCCAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373479	375756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_373500_375800
719949	contig_12884_pilon	-	1183	10	Intergenic	novelGene_104994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	569.672247117413	3111	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	526	1125	901084	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915304	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_904570_904726_905761_905834_906224_906349_915235
719951	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
719957	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_96074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719958	contig_7707_pilon	-	2114	23	Intergenic	novelGene_72114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCACGGGCTGGGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81400	7398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_7443_14657_14718_35284_35385_35921_35949_38974_39102_39609_39720_42241_42323_53084_53210_54824_54948_59054_59160_60840_60902_61682_61761_62214_62281_64331_64477_66895_66963_67651_67733_69943_70024_73498_73576_75141_75324_76903_77012_78755_78844_78968_79050_81302
719959	contig_14441_pilon	+	995	6	Intergenic	novelGene_100485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	27.7676070268938	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	490	993	116728	117792	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLA	92175	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92487_92567_92708_114102_114161_116578_116963_117523
719961	contig_1379_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_134587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTACTTTGTAGAGCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433828	431721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_431700_433800
719963	SIRV6	+	584	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1750_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
719967	contig_614_pilon	-	2462	6	Intergenic	novelGene_132611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	37	junction_3	47.2296517031409	101	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	662	1291	395918	385613	FALSE	35	AAAGTGACATTTTCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDAFDAWEGKGVSYWRVPHELIECWTLEEQPLLGSLRHMAPVRKRRLVTFNEEEQNVNCKTGPKPVRFLGPSTSTQIKVKNSASVRVSPARAPQTSTQATANPPHSSSTLSKATSTMGTRVCGQPQASWGTRSAENGAPHPPPAKVLLSDKKSTPNRVIKLKRTPLCATVPAQPTSTAANQTRSPELPAPEASSTVGVRTENGNDESN	402385	384441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_386106_389314_389418_395884_395980_397035_397230_399675_399866_402169
719968	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
719972	contig_1331_pilon	-	1686	2	Intergenic	novelGene_37879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATTGCAATGTGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428487	423813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_425005_427992
719973	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
719975	contig_5569_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_86734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTACCAAAGAAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231948	234419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_231900_234400
719978	contig_7119_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_40871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAACCAATGTCACTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99613	100634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_99600_100600
719979	contig_10437_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_38178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCCCCACCGAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196228	196729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_196200_196700
719980	contig_2444_pilon	-	1663	5	Intergenic	novelGene_83782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	69.5467468685632	172	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	103	831	279787	245651	FALSE	40	AATAGTTACTTGGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGWKASEPDGQDRLKEGGSAGLVREVSTGFSETIMAARTGQGALRKVVSGCRLKSAAAAGAPAPAQSSARNVRYLASCGILMSRTLPLHTSVVPKEIHARTFFKITAPLINKRREYSERRILGYSMQEMYDVVSGVEHYKHFVPWCKKSDIISKRSGYCKARLEIGFPPVLERYTSVVTLVKPHLVKASCTDGRLFNHLETIWRFSPGLPGYPRTCTLDFSVSFEFRSLLHSQLATLFFDEVVKQMVAAFERRAYKLYGPETNIPRELMLHEVHHT	279889	244818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_245819_247146_247249_254209_254403_261967_262118_279671
719981	contig_13894_pilon	+	885	8	Intergenic	novelGene_62114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2827.56218647218	52	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	263	829	524982	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520686	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521761_524933_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
719984	contig_8617_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_73486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62747	62987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62700_63000
719990	SIRV2	-	432	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4414	61	3239	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
719995	contig_366_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_51626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367649	1370325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1367600_1370300
719998	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
720002	contig_10446_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_162435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	458	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTTAATTTATTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160541	159437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_159400_160500
720004	contig_10765_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_122889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGGCACATGCCGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63674	62305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_62300_63700
720011	contig_6283_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_100214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	213	314	612463	612362	NA	20	TGCTTGTCATGAATCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRWSLQPVTGASSCVVDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYGGYTARVGVQLQVPESPVYRAMPVYPPHPLHRAVAALQLCEEGASAPECPFALY	612675	610861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_610900_612700
720012	contig_3137_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_167747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACAGGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241272	243046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3137_pilon_+_241300_243000
720017	contig_8658_pilon	+	1267	6	Intergenic	novelGene_55825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCGAGGGCGGGGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5713	55716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_6236_6700_6818_13111_13267_30045_30245_34539_34626_55528
720020	contig_16846_pilon	-	2402	4	Intergenic	novelGene_82993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	86.9495383669299	374	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	329	835	598783	575489	FALSE	20	ACCAAGGGCTCCTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETTSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDAGDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL	599111	573921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_575708_576521_576678_577456_577549_598743
720024	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720026	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_93560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720029	contig_10940_pilon	-	1937	3	Intergenic	novelGene_49257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	588	2	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	924	1304	875054	874674	FALSE	30	TCCAAGAACAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917143	874040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_916664_916748_916923
720030	contig_12746_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_152191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGAAACGCTGCCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566539	565576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_565600_566500
720033	contig_12250_pilon	+	1241	3	Intergenic	novelGene_80598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_1	779.5	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322844	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_323438_328400_328687_332096
720037	contig_6710_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_93465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTGGTCGGCATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
720039	contig_1143_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_86639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362875	1360347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1360300_1362900
720040	contig_7864_pilon	+	2364	16	Intergenic	novelGene_164856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	28.0974494690651	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	907	1941	61001	65615	FALSE	25	AGGGGAGAAGGTTGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSERRSDMAHHPTFRKIYCDAVPYLFKKVRAVYTEGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATICKVLLDGYLMICVDGGLSTDGLDWFCYHASSHAIFPANFCQKNDIELIPPKASDHSALLGYEAQTFNWEAYLEKTKSRAAPSRLFNMDCPNHGFKVGMKLEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQWVDCESPDIYPVGWCELTGYQLQPPVATEPTTPLKAKEATKKKKKQFGKKRKRIPPTKTRPLRQASKKPLLEDDLQAAGKISSEPVPDEIVAAQVKEEHLDTATPDKAASPKLPVPIEDIKQETDD	47186	66038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_+_47325_48635_48770_51220_51296_52197_52249_53759_53878_54318_54454_54753_54851_60842_61068_61473_61551_61738_61844_62557_62706_63069_63177_63532_63768_64258_64325_64987_65105_65502
720041	contig_11259_pilon	+	1580	6	Intergenic	novelGene_144533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAAAATTAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132432	155801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_133441_139869_139990_144321_144455_147762_147854_153633_153777_155716
720045	contig_6446_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_149237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGTTTTAAGCCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498294	498493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_498300_498500
720046	contig_6446_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_149238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498688	499500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_498700_499500
720049	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720054	SIRV7	+	380	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTATTTTCACTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
720055	contig_10793_pilon	-	2773	1	Intergenic	novelGene_83356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	2	454	130738	130286	NA	10	CCAAGGTTTTGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQNLPSSPATSTTSPGVHAAGRRGQRFGSFRSRFRHLIRARPSLCSPVRGKGSLNPIICGRSCDPRQALAYLERPRRNTGLERADVPQPLRSLLAPSCRRARLSSCPGLILATPQPPPRRVRSSFCFNSAVSGHPGVLLIATPLFLIPDL	130739	127966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_128000_130700
720058	contig_9548_pilon	-	1333	6	Intergenic	novelGene_141066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	70.9439215155182	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	603	729	1331	156195	148456	FALSE	25	TCGTCCTTCCTTACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYINWENEQGNLREVTAIYDRILGIPTQLYSHHFQRFKEHVQNNLPRDLLTGEQFIQLRRELASVNGHSGDDGPPGDDLPSGVEDITDPAKLITEIENMRHRIIEIHQEMFNYNEHEVSKRWTFEEGIKRPYFHVKPLEKAQLKNWKEYLEFEIENGTHERVVVLFERCVISCALYEEFWIKEMVCLQPDLTAAYANLVAS	162089	148453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_148513_148621_148787_149467_149576_150055_150222_156088_156257_161422
720059	contig_2069_pilon	-	703	3	Intergenic	novelGene_23478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	24	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	38	319	1509802	1508747	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509839	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
720060	contig_4402_pilon	-	3274	1	Intergenic	novelGene_140821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAGGAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439092	435818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_435800_439100
720064	SIRV7	-	210	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69049	21	35830	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78908	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
720067	contig_7202_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_18762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
720069	contig_935_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_45504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAGAAAGATGTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10128	7921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_7900_10100
720076	contig_14219_pilon	-	1295	10	Intergenic	novelGene_54374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	888.421960695994	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	149	703	1084399	1057776	TRUE	5	TTCTTGCTGTTTTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTRIFLVSLSTLVFTFFTLPELIF	1084547	1047154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
720080	SIRV6	+	543	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1496_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720082	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720083	contig_91_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_127100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCAGACGTGCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325078	324538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_324500_325100
720084	contig_91_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_127099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGTATCTGCTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324326	323174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_323200_324300
720085	contig_12622_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_5832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACAGCATCTACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436771	434472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_434500_436800
720086	contig_5337_pilon	-	2512	1	Intergenic	novelGene_136566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTGTTGCCTGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357622	355110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_355100_357600
720089	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	51	490	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
720092	contig_14661_pilon	-	1943	16	Intergenic	novelGene_47438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	153.943481692326	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	302	1777	69405	46200	FALSE	10	CTCCCCCAGTGTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVADNGKPVPLDEESHKRKMAVKLRNEYGPVLHMPTLKENFKEKGLQNSSDSYGHKQYPDNQGQEVEYLVTGTHPYPPGPGVALTADTKIQRMPSESAAQSLAVALPSQARVDANRTAPGGSEYRLPGASDRSQPPVMTSVIMEAGNAKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF	70868	46033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_46260_46801_46996_47430_47571_48278_48388_49117_49221_49761_49864_49950_50101_63314_63408_64387_64490_66234_66323_66529_66621_67393_67448_68173_68317_69358_69466_69584_69743_70785
720094	contig_10627_pilon	-	1379	8	Intergenic	novelGene_60011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	138.830685310105	430	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	217	1245	402038	373138	TRUE	10	TTGGCTCAATTTCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVYDIAFSRAGGGRDMFASVGADGSVRMFDLRHLEHSTIIYEDPQHHPLLRLCWNKQDPNYLATMAMDGMEVVILDVRVPCTPVARLNNHRACVNGIAWAPHSSCHICTAADDHQALIWDIQQMPRAIEDPILAYTAEGEINNVQWASTQPDWIAICYNNCLEILRV	402254	368370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_368439_373071_373311_375715_375834_376928_377139_380441_380561_380960_381073_381786_381946_401900
720095	contig_8394_pilon	-	1840	4	Intergenic	novelGene_27317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	239.002092041053	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	619	1587	33434	32466	FALSE	50	TCTGGGATAAGAATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39826	32212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35324_35523_38754_38906_39806
720096	contig_14522_pilon	-	1699	4	Intergenic	novelGene_147327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_3	185.993428796707	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	128	775	175672	110885	FALSE	45	AAAAAATTTTTTTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSERAGCRQRPCGEQASGKTQPTFLTQPAESSFVFFLGSAPMPGPTQTLSPNGENNNDIIQDNGTIIPFRKHTVRGERSYSWGMAVNVYSTSITQETMSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGIVIWKSLHSLSF	175799	109960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_111140_118926_119073_146750_146879_175553
720102	contig_6735_pilon	-	524	5	Intergenic	novelGene_15784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.314165591956	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	172	477	554315	542042	FALSE	15	GTTCACCCTTATGCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKVSQICCPFWDSWFAYLGRYLESLVCQVVLFAHFPFLQRYL	564823	541994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542161_552836_552952_554243_554374_564157_564232_564784
720104	contig_8814_pilon	-	1635	7	Intergenic	novelGene_167750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_1	356.376985165366	353	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	22	630	351637	135066	FALSE	40	GGGTAATAGCATGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAALILRETPSMKKAVSLINAMDIGRFPRLLTRILQKLHLKAESSFSEEEEEKLQAAFSLEKQDLHLVLQTISFILEQAVYHNVKPAVLQQQLENIHLRQDKAEAFVSAWSTVGQDAVEKFRQRILAPHKLETVEWQLNLQMAHSAQAKLKSPQAVLQLGVSNEDSKSLRKVLMEFSHKELFDFYNKLETIQAQLDSLT	351658	134060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_135105_135836_135897_293657_293769_330491_330648_332548_332660_349780_349872_351596
720111	contig_6710_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_95012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACTTGCTGTGCCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
720113	contig_15732_pilon	+	1336	11	Intergenic	novelGene_88913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	138.732872816791	3	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	348	974	348899	393447	TRUE	25	CAGCACTGGCACTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQILEISRNNEQEHAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYSSSKVVSLCT	339844	398727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_339890_343598_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393415_393452_393814_393845_395326_395383_398197_398263_398520
720114	contig_12032_pilon	+	1870	4	Intergenic	novelGene_139271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGATGTTAGTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96447	106025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_+_97127_98347_98385_101195_101373_105048
720117	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720118	contig_14142_pilon	+	1358	9	Intergenic	novelGene_120623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_7	230.862919283284	746	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	101	742	617485	618996	TRUE	0	CCCCTGGCTGCTGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAEKAKSRRAPSEVWQSVIEPGAHGPSVPSGTMPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRGE	617189	619882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_619348_619435_619532_619713
720123	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	640	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720132	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
720135	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_89237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
720138	contig_6102_pilon	+	786	7	Intergenic	novelGene_31951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	1421.22854718491	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	234	584	414294	415290	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGGREGRAFSLLPKSDSLCFFAARKCRSVATQPSPAVPESQCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEAFVRHILSG	412753	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_412885_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_415261_415307_416018
720149	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720156	contig_8888_pilon	+	1533	6	Intergenic	novelGene_167761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGGGAAAAGGAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154178	162353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_+_155029_155967_156072_157256_157402_157653_157785_159710_159854_162193
720158	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_96017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720161	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657833	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657835	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
720165	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_94886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720166	contig_20356_pilon	+	2167	7	Intergenic	novelGene_159534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	153.637831712548	35	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	49	855	68419	123325	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSVNSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFP	68370	124637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_68510_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149
720170	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
720174	contig_8377_pilon	-	3310	1	Intergenic	novelGene_35170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAGTGAAGAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380020	376710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_376700_380000
720175	SIRV7	+	289	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147668	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_148000
720177	contig_8820_pilon	+	1984	4	Intergenic	novelGene_79307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	69.3797921267825	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	7	1611	241873	307423	FALSE	15	TTATGCTGGTTTGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEGGGKEMNEIKTQFTTREGLYKLLPHSEYSRPNRVPFNSQGSNPVRVSFVNLNDQSGNGDRLCFNVGRELYFYIYKGVRKAADLSKPIDKRIYKGTQPTCHDFNHLTATAESVSLLVGFSAGQVQLIDPIKKETSKLFNEERLIDKSRVTCVKWVPGSESLFLVAHSSGSMYLYNVEHTCGTTAPHYQLLKQGESFAVHTCKSKSTRNPLLKWTVGEGALNEFAFSPDGKFLACVSQDGFLRVFNFDSVELHGTMKSYFGGLLCVCWSPDGKYIVTGGEDDLVTVWSFVDCRVIARGHGHKSWVSVVAFDPYTTSVEESDPMEFSGSDEDFQDLLHFGRDRANSTQSRLSKRNSTDSRPVSVTYRFGSVGQDTQLCLWDLTEDILFPHQPLSRARTHTNVMNATSPPAGSNGNSVTTPGNSVPPPLPRSNSLPHSAVSNAGSKSSVMDGAIASGVSKFATLSLHDRKERHHEKDHKRNHSVGHISSKSSDRLLYPHWPQHAPRCEPAGPCVPPRGGTPRTGSPLLMIGWQL	241866	307796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_242122_292797_292981_305117_306167_307299
720180	contig_18869_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_56411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGAAAATTCTCAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73772	73570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73600_73800
720183	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
720185	contig_9345_pilon	+	985	2	Intergenic	novelGene_24677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGACAGAAATGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947226	949557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949475
720186	contig_15063_pilon	+	1494	4	Intergenic	novelGene_14132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	178	1350	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34630	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
720189	contig_9609_pilon	+	1270	10	Intergenic	novelGene_23048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	799.528194207892	28	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	13	1080	435608	454609	TRUE	65	AAAAAAAATACCAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435595	456267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455335_456153
720195	contig_8873_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_162905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	167	715	390781	390233	NA	20	GCTGTGATCTTTGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPSLCSMLLPKPPPVDLRNALSTLMVLYKALPLIKELTSQQMKCGSGPTLMEFTGLTLFPLILKQRHFQHNSSKGSSVQPRSQAGTLAGALPPLSLGPLLMLLTAGGGSLARLCWPGLHAGAGKWQHAQGHSHGAHVVLLFMMWPLRQLHACLAGPAWCYVPPFTESLRSVSKERTTSSA	390947	389203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_389200_390900
720199	contig_11285_pilon	-	1930	5	Intergenic	novelGene_5733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	23.123310749112	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	10	684	1058973	1047096	FALSE	30	TATCTGTCTCTTTACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSEVAAAGSAEGDGGGSGFGMWLDGRLEALGVDRAVYGAYILGVLQEEEEEEKLDALQGILSAFLEEDSLLNICREIVERWSETQNVVTKVKKEDEVQAIATLIEKQAQIVVKPKMVSEEEKQRKAALLAQYADVTDEEDEADEKDDSGATAMNIGSDKSLFRNTNVEDVLNARKLERDSLRDESQRKKEQDKLQRERDKLAKQERKEKEKKRTQKGERKR	1058982	1045849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1047284_1049271_1049331_1050568_1050705_1051878_1051967_1058769
720205	contig_678_pilon	-	1869	14	Intergenic	novelGene_167822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	48	junction_1	152.457036338091	389	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	70	1788	153915	145019	FALSE	20	GTCATACTGATGGTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAVQSAGRGPGALPAACSAAMSQGSPGEWAPLDLTAGTPNPFVHELHLSRLQRVKFCLLGALLAPIRVLLAFIVLFLLWPFAWLQVVGLTDEQLQEPVTGWRKSVCHSGVLGLGRLLFFLLGFLRIRVRGQRASRLQAPVLVAAPHSTFFDPIVLLPCDLPKVVSRAENLSVPVIGALLRFNQAIFVSRHDPASRREVVEEVRRRATSGGKWPQVLFFPEGTCSNKKALLKFKPGAFIAGVPVQPVLIRYPNSVDTTSWAWRGPGVLKVLWLTASQPCSIVDVEFLPVYHPSPEESRDPSLYANNVQRVMAQALGIPATECEVVGNLPVIVMGRLKVALEPRLWELGKVLLKAGLSPSCVDAGAEPGRSRMISQDEFARQLQLSDPQTVAGAFSYFHQDTKGSVDFRDVALALAALDGGRSLEELMCLAFELFAEEQAEGRGRLLHQDGFSSILHLLLGSPRPAAATLHAELCRELCQAGPGQGLSLQGLSLRQFQDFSLRDPLYGKVFSTYLCLPHAPRGTPQRSKASSPRRPHCSGQRDRAGAQAEGRLSAWALLAASPPAGTRPADSGQRQGHPVPHPPLLLSEFLSLF	153984	144937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_145321_145530_145715_146490_146590_148618_148752_149076_149203_149464_149548_149666_149722_150264_150300_150481_150541_150984_151046_151167_151281_151690_151912_152220_152364_153810
720211	contig_5643_pilon	+	1508	12	Intergenic	novelGene_39095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	754.227293272628	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	137	1144	631988	640691	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEEINDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTERAGSRSTGTSHTPQP	631851	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635456_636500_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640462_640642_640729_641102_641244_641412
720218	SIRV6	+	352	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	19	412	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720219	contig_6929_pilon	+	1671	9	Intergenic	novelGene_139360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	382	junction_4	456.700599408409	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	24	557	77555	90425	FALSE	70	AAAAAAAAAACATGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRVEAMAVANSSPVNPVVFFDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRQFCTGEFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77531	91539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_78374_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356
720225	contig_1146_pilon	+	2166	5	Intergenic	novelGene_84783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.6705423736629	508	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	50	1414	91307	99804	FALSE	30	ATGTTTTTGTTTAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSWLSRAGGEVWPTGMIAKTQQVDMGLGLPEKKKKKKKGVKEPEIQYSLLKDDYFTEASPRRATSLSKNVVQAPEMPLVKKKKKKKKVLSEDHLEPETVLRARRTEKSPSSRKQALGLVECHGGEKKKKRRSLSALAVSHGLGVETSLNPRQGEEGTRVGKKLKKHKKEKRAQDTVAFSAQSPWLCEAGDARCACALGKDAEEPATSGQKRKQGSPREHHIKMKKKKKIYQEGDLPLGHLEVFRSTENSPRKGSKKKPAKAEILEYIPIGDDPKTSVKKKTKSKKQAEQPGIEEPALKSKKKKKRKESRIAEESCEEEPDPDLEVVLEKKGNMDEAHIDQVRRKALQEEIDRESGKTEASETKKWMGTKFGQWDTAGFENEDQKLKFLKLMGGFKNLSPSFRRPPSMIGRPNMALNKKAADALQQNLQQDYDRAMSWKYNRGAGLGFSTAPGKGFYIDRNASKSIKFEN	88546	100556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_88594_91304_92213_94484_94554_96821_96900_99492
720232	contig_17964_pilon	+	2340	5	Intergenic	novelGene_33919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1841	2260	431407	473048	FALSE	10	ACTGGGGACTGGGCTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQFIHRTYLMFCMNVIPSRPSMFAIIIAASTTSSSPKLLTMLPLKEVVHHSVVLGTACNSYRSWDRAGVCPSCKSLICSWLWLRLRPCSRCQNNRHVGISWFLRVMFQVGAERVLPKHCFSLQDTCNAHSTNTGGALG	409729	473128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_411414_412386_412501_431364_431430_468565_468941_473026
720233	contig_8661_pilon	-	1108	10	Intergenic	novelGene_137931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_8	358.620505083949	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	103	795	312848	301399	FALSE	20	AAGTAGCACTGTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	313853	301085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805
720239	contig_3825_pilon	+	799	3	Intergenic	novelGene_78005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGACCAGAGGGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461792	1464807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1462325_1463666_1463796_1464669
720245	scaffold_15027_pilon	+	1976	9	Intergenic	novelGene_163558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	85.4806264600348	54	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	56	1000	48927	83597	FALSE	35	AAACAGCATATTTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRQDPRLWELRPGRLWEDMAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKTDAHYSILSLLLCLSDSPSNSNYVGTPRDKEVEKKDDFDWGKYLMEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHVSYLYLL	48871	84573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479
720247	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_97752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720248	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720249	contig_20614_pilon	+	1087	11	Intergenic	novelGene_107532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	379.456993610607	2026	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	207	839	69268	123234	FALSE	25	AGACAGTTATGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAETVELHKLKLAELKQECLARGLETKGIKQDLINRLQAYLEEHAEEEANEEDVLGDETEEEEPKPIELPVKEEEPPEKTVDMAAEKKVVKITSEIPQTERMQKRAERFNVPVSLESKKAARAARFGISSVPAKGLSSDTKPMINLDKLKERAQRFGLNVSSISRKSEDDEKLKKRKERFGIVTSSAGSGATEDTEAKKRKRAERFGIA	69061	123482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_69304_81157_81258_82948_82996_83222_83291_86601_86654_87522_87597_88010_88040_98515_98542_99107_99177_120762_120853_123192
720250	contig_12046_pilon	-	1729	13	Intergenic	novelGene_83473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	123.364297914753	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	215	1414	338501	319447	FALSE	30	AAATCACAGATTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSYVVKPTLNEVVIVSAIRTPIGSFLSSLSSLPATKLGTIAIQGALEKAGIPKEEVKEVYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCTTINKVCASGMKAIMMASQNLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGATPYGGVQLEDLIVKDGLTDVYNKIHMGNCAENTAKKLNISRDEQDTYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTISVKGKPDVVVKEDEEYKRVDFSKVPKLKTVFQKENGTVTAANASTLNDGAAAVVLMTTDAAKRLNVKPLARVAGFADAAVEPIDFPIAPAHAVPKVLKNAGLKKEDVTMWEVNEAFSVVVLANIKMLGIDHQKVNINGGAVSLGHPIGMSGARIVIHMVHTLKQGEYGLASICNGGGGASAMLIQKL	345776	319131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_319568_319937_320096_321962_322028_323275_323390_328104_328201_329128_329280_329920_330065_331755_331857_332089_332186_332477_332596_338465_338514_344287_344359_345645
720255	contig_8866_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_77907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146910	1145036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1145000_1146900
720257	contig_15135_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_119857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGAGTGCTTAACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	29255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_27900_29300
720258	contig_6710_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_98159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
720270	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
720276	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	28	-2	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720278	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
720279	contig_10324_pilon	+	1912	8	Intergenic	novelGene_7843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	75.4485904170407	9	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	66	422	283476	286399	TRUE	15	CCAAGGCCTCTCTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPAPDLC	283410	296548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_286382_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
720283	contig_20742_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_150664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGAACTCTTTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153848	154197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_153800_154200
720288	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_94790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
720291	contig_5671_pilon	+	1102	6	Intergenic	novelGene_79462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	1748.54595593024	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	123	545	370430	531238	FALSE	30	GCATATATATTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370100	531795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
720295	contig_7321_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_53121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115438	113475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_113500_115400
720296	contig_10196_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_132031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	468	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	141	455	409282	404169	FALSE	10	TCCCCTGTCCACGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTTGVPEYASFFAVMGASAAMVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLNDKISLYKMLACEALPSSPGYLWA	409422	403566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404221_404421_404606_409203
720298	contig_14362_pilon	-	1687	6	Intergenic	novelGene_142517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	57.807957929683	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	184	1056	42077	37574	FALSE	10	CATCGGCCTCCATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	42260	36942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37729_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056_40233_42067
720306	contig_3270_pilon	-	2077	13	Intergenic	novelGene_104447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	87.2766991941275	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	202	2049	68067	48840	FALSE	15	CTTAACGCCTTGCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEKKKKFKLIRNGHVIWKGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMVCYEEKEVLVKTSWDPGF	78117	48811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_50386_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63791_67867_68088_70709_70822_78048
720312	contig_6710_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_98309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTCGCCTATCGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
720313	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720317	contig_16541_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_126737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCAACAGTTCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319081	319890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_319100_319900
720321	contig_6710_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_89118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653643	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
720335	contig_3410_pilon	+	770	3	Intergenic	novelGene_58948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGACTTTTAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235068	244064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_235530_238597_238777_243934
720341	contig_935_pilon	-	2809	5	Intergenic	novelGene_45584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	178.110218684948	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	81	2120	630665	623902	TRUE	50	AAAAAATTAGGTATTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQLLYDLKQVVHSHPK	633035	623013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623566_623677_623744_623830_623947_628670_630678_632967
720347	contig_7428_pilon	+	2289	7	Intergenic	novelGene_77685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	312.471687606342	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	122	1270	221272	223939	TRUE	10	AGCCCTCTGTGACTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALALPDCLVLWVPAEAHPLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTRSVLSPSEACGLLLGSTCGHWDVFSSWNISLPAVPKPPPRPPSPPAPGAPVSRILFLTDLHWDHDYLEGADPDCVDPLCCRQGSGLPPTSRPGAGYWGEYSKCDLPLRTLESLLSGLGPAGPFDMVYWTGDIPAHNVWQQSRQDQLRALTTITALVRKFLGPVPVYPAVGNHESTPVNGFPPPFIEGNHSSSWLYEAMAKAWEPWLPAEALQTLRIGGVLCPVPTPPASASSLSI	221150	225741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221584_222563_223337_223875_224050_224356_224434_224643_224790_224957_225355_225452
720349	SIRV1	-	217	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3591	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6775	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
720351	contig_10196_pilon	+	1167	5	Intergenic	novelGene_132103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	205.222440293453	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	41	325	922274	924513	TRUE	20	CCCAGTGTCTTTATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRRARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922233	926565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701_926157_926212
720352	contig_13305_pilon	+	1805	5	Intergenic	novelGene_146788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	37.2382531813725	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	714	1397	265490	267051	FALSE	20	GGAGCCATTTTCACCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSPEACQGSAPPVVNCYNASDHFYKGCFDGKVTLTAASVTVSLPIRGCVTDELCTRDTVTGPGFTLSGSCCQGSRCNSDLRNKTYFAPRIPPLVLMTASQPTTPALTTSVTTSTPAPASQTPPEEKKAEPEASQENGPTLAGGAAGHQDRSNVGKRPVKGELQDHSKGSSAPMVGLATLLLAVVAGALALGTPLPITFPFPLSGLGWPSSHSSSLPSPLSFRCAG	264482	267459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_265149_265442_265605_266396_266629_266667_266886_266932
720353	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720356	contig_10658_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_130070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGAACATTGTTGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168607	166512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_166500_168600
720358	contig_401_pilon	-	1152	5	Intergenic	novelGene_42774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.097876395502	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	110	343	1083727	1079710	FALSE	25	ATAAATTATGGGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGACAEPSLPQSSTPCPLCLLCTWSSSSATAPHPLKMYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSSSPTPFWALPSQKPWDSFA	1086653	1078900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079771_1081709_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
720360	contig_15361_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_167870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAATAAAAAGAAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481132	481461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_481100_481500
720367	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_93780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGAAGGAAGCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
720378	contig_11258_pilon	+	1991	3	Intergenic	novelGene_67804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_1	13.5	15	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAGAGAAGAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290465	293400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_291387_291794_291915_292450
720382	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
720384	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720389	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
720392	contig_9363_pilon	-	1643	9	Intergenic	novelGene_6537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	108.858781800092	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	9	1238	639049	634178	FALSE	5	CGCTGGTGCCGTGTCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMLCFLTWRPLPHTCQGQGLQKSDPQSRSRLPCPMTTRHRQGLGSLWEHLGTKTICTDEIMSQFPSTKAAAGEQKEDQSEDKKRPNIPPSPSPVPAKPSATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPTQPPVPSSVNEGSPSPPEPTSKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGLCNQPIQHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCREPFGDEGFHERDGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG	639057	633772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_634445_634661_634811_635148_635231_635484_635659_637745_637941_638052_638159_638273_638362_638765_638819_638933
720397	contig_6494_pilon	+	1844	2	Intergenic	novelGene_108558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	983	1378	3158	3553	FALSE	35	GAAGAACCCAGAAGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTNKPKEYKHGTATPKMNFPNTEVYMENHPYPQNALYPKHSQLLTLSEQHMSHSCVNVVVNRVPTVNHQAIHKFHGFSPLSSEFPRHHDLAALGSTLHDESQHTIAGPLKQRPIRVINKDRPYQPQRPH	2103	4019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_2891_2962
720400	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	309	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720402	contig_6710_pilon	-	482	2	Intergenic	novelGene_98096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
720408	contig_9345_pilon	+	1924	3	Intergenic	novelGene_24715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	23	junction_2	1.5	232	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1396	1710	1004893	1005207	FALSE	35	AAATGGAAGCGGATCAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSLITSHLDLEQQEPHPKSPKVQLLLTSTISVQKSHRPGRPAISLVGQGSFQKCVLQNIPKEALVPESSVALYLPHSLIATPLPASAGPLATSVSCCLLPLC	1001577	1005421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1001995_1002351_1002407_1003969
720411	contig_8161_pilon	-	608	4	Intergenic	novelGene_156755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	32.2214559295855	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	108	590	254273	230026	FALSE	15	ATGGATTCAGTTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDAQPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254380	230007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_230067_231373_231479_232136_232413_254212
720414	contig_14333_pilon	+	2373	14	Intergenic	novelGene_49157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_1	162.604977470632	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	98	1717	447369	523075	FALSE	85	AGAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGASSSFGTLCFQWLLLFGLLGPVLDGARPGFQQTSRLSSYEIITPWRLTRERREAPRPYSKQVSYVIQAEGKKRIIHLEMNKDLLPKDFVVYTYNKEGALISDHPNIQNHCHYWGYVEGVSNSSVALSDCFGLRGLLHLDNTSYGIEPLQNSSRFEHIVYRMDAVHKEPLKCGVSNKDVEKETTKDEEEESPSMTQLLRRRRAVLPQTRYVELFIVVDKEKYDTMGRNQTAVREEMIRLANYLDSMYIMLNIRIVLVGLEIWTNGNLISITGGAGDVLGNFVQWREKFLITRRRHDSAQLVLKKGFGGTAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFGQITVETFASIVAHELGHNLGMNHDDGRDCFCGAKSCIMNSGASGSRNFSSCSAEDFEKLILNKGGNCLLNIPKPDEAYSAPFCGNKLVDPGEECDCGTPKECELDPCCEASTCKLQSGAECAYGDCCKNCLFLPGGTLCRGKSNECDVPEYCNGSSQFCQPDVFIQNGYPCQKNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIFGSSKIICNLLL	447271	523731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_447466_470473_470572_483946_484006_487545_487625_493959_494037_495606_495803_497018_497085_499000_499073_500333_500504_503128_503211_503708_503843_518615_518788_521811_521905_522850
720420	contig_12250_pilon	+	1836	2	Intergenic	novelGene_80735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCTTGTGAAGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414639	416728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_414740_414992
720421	contig_6710_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_90810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
720422	contig_5222_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_58972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCTGCAGTTCATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27171	29641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_27200_29600
720425	contig_5711_pilon	+	1818	10	Intergenic	novelGene_80265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	72.5255170080431	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	219	1028	61982	113410	TRUE	40	TAAGTATAGTTTTAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQKRNCVHPL	52541	122451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_113383_113568_121458_121637_121996
720426	contig_18251_pilon	-	1381	3	Intergenic	novelGene_50177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	148.5	12	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	125	310	152963	144782	FALSE	30	GTGTAATGTGAAATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHRCSPCPEKWKWHGNKCYQFYKESKSWQGCQYFCIAENSTMLKINTQEVLVFLCAFHRTLPCLRATLSFSTLIGQGFPATAVSRPGCGWTEPITRLNCLTL	153087	143710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_144796_150023_150166_152933
720427	contig_13780_pilon	-	2510	15	Intergenic	novelGene_149075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1369.39162717297	1	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	357	1976	686613	657588	FALSE	35	TCACTTTTTCTCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727522	657053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_660148_660194_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686677_694805_694852_699207_699268_702167_702217_713180_713235_727438
720433	contig_151_pilon	-	2850	9	Intergenic	novelGene_132570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_8	142.575363843127	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	16	1668	253657	216804	FALSE	75	ATAAAAAAAAAGAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNGRLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEDEVLSCLYSRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDSFLDDHHFTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRNDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ	253672	215621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_217049_219634_219762_219870_220358_223422_223648_226819_226908_228049_228195_231678_231773_233386_233529_253557
720434	contig_6017_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_152540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGGAAAGAGGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440272	442543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_440300_442500
720439	SIRV4	-	462	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1057	2	1057	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4101	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
720442	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720450	contig_16882_pilon	+	2226	4	Intergenic	novelGene_148244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	20.4124145231932	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	128	547	445854	555529	FALSE	40	ACAATAACCACATTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDAPVIYGLEFQARALTPQTAETDAIRFLVGTQSLKYDNQIHIIDFDDENNIINKNVLLHQVGEIWHISASPADKGVLATCYNKTSDSKVLTCAAVWRMPKELESGSPESPDDSSSTTQTLELLCHLDNTAHGNMAW	445726	557208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_445896_459574_459659_478552_478686_555368
720451	contig_16882_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_148251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTAGTTCAGCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557352	558096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_557400_558100
720454	contig_7945_pilon	+	3458	2	Intergenic	novelGene_161618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCATTCCAGAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711327	715061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_711905_712180
720455	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720458	contig_6710_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_89187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
720459	contig_1090_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_131101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAACCAAATGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224465	225349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_224500_225300
720462	contig_6735_pilon	-	1001	4	Intergenic	novelGene_15693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	487.388505768812	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	180	521	543144	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWQQPEREPGVVVRSWDSESQTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543260_568213
720465	contig_16761_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_146904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAATAAATGTTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351542	351751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_351500_351800
720466	contig_4232_pilon	-	1780	10	Intergenic	novelGene_63493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_7	307.253825981463	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	45	425	620488	615204	TRUE	5	ACTCGGCTTGCCTTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPGKAHTSMLHGKRPAIHLVCTRPSARS	620532	608707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_615392_615783_615945_620456
720467	contig_4678_pilon	-	2222	16	Intergenic	novelGene_126057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	53.7508656261046	15	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	13	1746	578108	572336	TRUE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQQRMEESEPERKRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYGGKLKGLGVRGLRERARPGPSSWAVGQSSPSLQYTVLAALGAQETRALPPPSSTRPVMSPC	578120	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
720468	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
720470	contig_6270_pilon	+	1345	7	Intergenic	novelGene_99817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	134.364450490282	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	530	838	39429	45668	TRUE	30	ATTTATTAGTCAATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPDARTSPRSALEKSLFTGEETDLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	36569	47767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39449_40396_40558_45418_45457_45578_45711_47302
720472	SIRV7	-	336	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33220	13	1	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114737	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
720473	contig_14415_pilon	+	690	4	Intergenic	novelGene_77619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	225.343195050473	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	79	417	33410	46612	FALSE	5	CCTTCGTAGTTTTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTGSQSSQPSRLFISLSTKEKSKCSPKQRLCVLYLNPTRDGPCEICVQGAES	33331	46885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_46460
720485	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8138	-2	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
720489	contig_5003_pilon	+	1745	7	Intergenic	novelGene_120210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1309	1665	134768	136826	TRUE	10	CTCTACGTGTACGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPSNLTIHFSLRLFYKFLGSWTHSSRNIEQMGLCLSSYIFNYLSIMLIPFFLQLCKLNFLFQKPQFCLFSTSLFKQFSPLIFNLLSLFFCLHFKFLFNFLAPLLLSVATVDSCLNF	133199	137058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_134054_134210_134618_134720_134786_135526_135671_135748_135905_136787_136865_137016
720497	contig_15687_pilon	-	1480	7	Intergenic	novelGene_129145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_5	44.3007398985114	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	7	375	191992	190393	TRUE	15	CACTGGGGCTTCTTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRVSI	191998	187387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190486_191289_191374_191539_191622_191882
720501	contig_12464_pilon	-	2210	5	Intergenic	novelGene_68712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_4	75.6021659742629	19	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	409	969	357758	356959	FALSE	25	ACACCTGTTACGTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPGKCLVILNILILHQVKNT	382246	355717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_357109_357347_357838_378909_379024_381087_381156_382099
720505	contig_11702_pilon	-	1318	12	Intergenic	novelGene_141975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	71.1027658096724	432	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	217	1224	376758	372981	FALSE	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380803	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374078_374165_374269_374525_374660_374903_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
720506	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720515	contig_14322_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_116558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
720517	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
720518	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_97874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720519	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720523	contig_1618_pilon	+	1306	8	Intergenic	novelGene_141804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	39.1798573822034	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	105	1109	727106	745924	FALSE	10	CTTCTGTTTCTGAGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESILKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEAFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL	724118	746121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724217_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742218_742337_744092_744217_745756
720527	contig_9481_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_149626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAGAAAATAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92116	90764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_90800_92100
720528	contig_5954_pilon	-	1930	3	Intergenic	novelGene_28479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	15	243	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	799	1287	290212	289124	FALSE	10	CTGCTGGCTTTATTTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGIGSPGFWGEGWTATLCTQRSYCQALPLLSCLAQVAERALYFWNNEYILSLIEDNCHTVLPAVFGTLYQVSKEHWNQTIVSLIYNVLKTFMEMNGKLFDELTASYKLEKQQEQEKARERQELWQGLEELRLRRLQGAQGAKEAPLQRLTPQVAASGGQS	291010	288480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_289272_289622_289725_289973
720535	contig_1865_pilon	-	1572	4	Intergenic	novelGene_103236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	25.5081686262787	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	464	862	56413	41886	FALSE	20	GATTTGGATTAATGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIIKLHGGTPANFLDVGGGATVLQVTEAFKLITSDKKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGTRVDDAKALITDSGLKILACDDLDEAAKMVVKLSEIVTLAKQAQVDVKFQLPL	56876	41175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52489_52962_53084_56299
720537	contig_343_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_163906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	77	415	143382	143720	NA	70	TAAAAAAAAAAAAATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVVQWAPFSHHAFLTTREPAGSGWWMVVWGCPLPLEHQGPRIIWPHSRPPRGPLRLVPLLSHSFGSRDGLGSGRWLLGLQADERWPPGPSSGCRGSRDASLEEETSEAPVRLLRLLLDLFALLAMNLAQLFCPTWVK	143305	143925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_+_143300_143900
720542	contig_14618_pilon	+	1516	11	Intergenic	novelGene_136791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	55.8878340965187	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	154	1167	298711	312071	FALSE	15	TGCCAAGCCCTCTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFGTTSGFGTGGTSMFGSTTTDNHNPMKDIEVTSSPDDSIGCLSFSPPTLPGNFLIAGSWANDDGSKVFTASCDKTAKMWDLNSNQAIQIAQHDAPVKTIHWIKAPNYSCVMTGSWDKTLKFWDTRSSNPMMVLQLPERCYCADVIYPMAVVATAERGLIVYQLENQPSEFRRIESPLKHQHRCVAIFKDKQNKPTGFALGSIEGRVAIHYINPPNPAKDNFTFKCHRSNGTNTSAPQDIYAVNGIAFHPVHGTLATVGSDGRFSFWDKDARTKLKTSEQLDQPISACCFNHNGNIFAYASSYDWSKGHEFYNPQKKNYIFLRNAAEELKPRNKK	295971	312420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_305016_305104_306087_306175_306283_306356_307516_307625_308389_308497_308603_308680_310016_310212_311984
720547	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720548	contig_10990_pilon	+	1445	3	Intergenic	novelGene_7403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	128	616	119582	121424	TRUE	35	GAAGCTATGTGGTATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119454	123564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121610_122920
720554	contig_11548_pilon	-	1045	2	Intergenic	novelGene_66788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1556	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCTGGAGGGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120481	119349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_119404_119490
720558	contig_19564_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_29655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCTTATGGTGTGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29442	30570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_29400_30600
720559	contig_14953_pilon	+	2076	3	Intergenic	novelGene_137272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	44.5	491	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	101	1150	75738	87422	FALSE	5	TTGCTGGATTTTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYCWFENNTSSFFCFLPPGDLWSYDFFSGEFVVSPEPDTSVHTLDPQKHKYIILGSDGLWNMIPPQDAISMCQDQEEKKCLMGEHGQSCAKMLVNRALGRWRQRMLRADNTSAIVICISPGVDLQGNFSNEDELYLNLTDSPSYNSQETCVMTPSPCSTPPVKSLEEDPWPRLNSKDHIPALVRSNAFSENYLEIPAEITRGNVQAIVIPSKDPEPLEENCTKALTLRIHDSLNNSLSVGLVPTNSTNTIMDQKNLKMSTSGQMKAQEVERTPPANFKRTLEESNSGPLLKKHRRNGLSRSSGAQPASLPTTSQRKNSVKLTMRRRLRGQKKIGNPLLHQHRKTVCVC	75637	88348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_75987_81223_81467_86864
720561	contig_5649_pilon	-	1836	7	Intergenic	novelGene_82460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	143.064864853519	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	328	1236	1570696	1564135	FALSE	15	GTGGAGACTCCTGTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573899	1563534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570779_1573654
720562	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
720565	contig_19735_pilon	-	2193	13	Intergenic	novelGene_167887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_4	34.0036762718386	196	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	190	1461	141275	117471	FALSE	40	AAACATTCTACAGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLQTRFYTDNKKYAVDDVPFSIPAASEIADLSNIINKLLEAKNEFHKHVEFDFLVKGQFLRMPLVKHMELENISSEEVVELEYVEKYTAPQPEQCMFHDDWISSVKGAEEWILTGSYDKTSRIWSLEGKSIMTIVGHTDVVKDVAWVKEDNLSCLLLSASMDQTILLWEWNIERNKMKALHCCRGHAGSVDSIAVDSTGTKFCSGSWDKMLKIWSTVPTDEEDETEESINRPRKKQKTEQLGLTRTPMVTLSGHKEAISSVLWSDAEEVCSASWDHTIRVWDVEAGSLKSTLTGNKVFNCVSYSPLCKRLASGSTDRHIRLWDPRTKDGSLVSLSLTSHTGWVTSVKWSPTHEQQLISGSLDNYVKLWDTRSCKAPLYDLAAHEDKVLGVDWTDTGLLLSGGADNKLYSYRYSPTTSHVGA	141464	116738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_117549_118538_118612_120821_120955_121115_121222_121337_121479_123934_124021_129655_129702_130837_130993_131447_131564_133394_133502_136235_136331_139902_139998_141234
720571	SIRV7	-	366	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	16	-32	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAACATGAAAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
720583	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
720584	contig_846_pilon	-	1721	4	Intergenic	novelGene_136101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	49.4974746830583	735	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	211	330	214365	213516	TRUE	25	CGTGTTAAATATGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKRRAGSGVGEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPDDLGGRQRYSKDYIFL	214575	211430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212690_213134_213244_213492_213567_214296
720594	SIRV4	+	349	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1422	632	967	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2422	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
720598	contig_405_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_135307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334063	332132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_332100_334100
720602	contig_7963_pilon	-	888	5	Intergenic	novelGene_58332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1215.48570538695	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATGTTGTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43785	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546
720603	contig_5787_pilon	+	2170	2	Intergenic	novelGene_167896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCTGATCAGTGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94766	97397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5787_pilon_+_95029_95489
720608	contig_13044_pilon	-	2116	5	Intergenic	novelGene_99977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	29.5920175047258	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	50	442	51209	48899	TRUE	50	AAAATAAGAGGATCCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRLDGRWLRRLPVLQLGARGLPPAPAPTGGTERPALPAWAVASVSPVAPGGTSGWYEALAASAPVRGAEEVLLSAHAATGLPWWGSILLTTVAMRGAVTLPLAVYQHHILAKLGGKFAARNKKYCQTS	51258	31347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_31864_35195_35304_36991_37988_48844_48950_50867
720610	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720611	contig_6710_pilon	+	566	2	Intergenic	novelGene_94534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACTCCAAGAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
720612	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_91283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	657161	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657162	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
720614	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_95979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	657854	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVKRNHCVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657855	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
720615	contig_15720_pilon	+	1516	2	Intergenic	novelGene_41915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTAGGATTCAGGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278508	280440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_279854_280269
720617	contig_3161_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_84534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGGTGATCTCCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507144	506083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_506100_507100
720630	contig_15039_pilon	-	1924	10	Intergenic	novelGene_110122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	518.405985143014	8	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	528	1214	202841	185257	TRUE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260896	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_184909_184972_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202966_208401_208526_222093_222255_260778
720634	contig_16461_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_139207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	22	345	919	377	FALSE	35	GAACAGTTATGGTAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYC	940	374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
720639	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720640	contig_10140_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_148423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTTTTTAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304483	303417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_303400_304500
720643	contig_2750_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_164477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGCCTTATAGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147738	146194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_146200_147700
720651	contig_11145_pilon	+	905	8	Intergenic	novelGene_160514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCACAATTCCACGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73373	284020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_73495_83177_83372_100830_100934_114514_114631_209145_209284_215605_215719_217813_217898_283984
720654	contig_15123_pilon	+	2416	14	Intergenic	novelGene_110918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	326	430	229649	229753	TRUE	55	CCCCACACACAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLRPAFSSSSSFCSCLRCSARLRVSASSSEIQRCCSSRASAAWRFSSSRLPLAAFKDSSRARSCSWSWSFSWATPSLSVAFCCSDLNWASSSVTWTWASRCSWRAASMQAWSSSTFWLSSAFSRWACVTEVWALSWASLAA	229323	255003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_230386_230534_230655_231604_231746_232065_232184_232275_232394_232678_232837_233351_233476_234790_234878_236235_236313_236891_236979_238060_238141_244656_244745_250006_250080_254920
720655	contig_14599_pilon	+	455	3	Intergenic	novelGene_167899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	61	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	141218	141520	TRUE	35	TGTGATTTTAAATGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVAGARVAAGRWPVLGPRLAARFFPQRPPQQTPEPGLALQRSLHATAVRAVPLIPIVVEQTVRRPGGSKVPGLRAGRGDSQPPFYLHLHLPAPGSRRARL	141216	146150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_141570_142212_142249_146084
720656	contig_14441_pilon	-	955	5	Intergenic	novelGene_100440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAGACAAAGGTGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126614	82061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_82354_121182_121237_125515_125900_126157_126282_126513
720657	contig_405_pilon	-	2592	1	Intergenic	novelGene_135340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTATGTACCTTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944694	942102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_942100_944700
720659	contig_5145_pilon	+	1666	3	Intergenic	novelGene_131378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	77.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTAAAAAGGACCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544346	554991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_544740_550233_550325_553809
720664	contig_7376_pilon	-	1698	4	Intergenic	novelGene_108071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	841.24365607646	4947	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCTTCTGTCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79885	70938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_76910_76953_79674
720669	contig_6199_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_126366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200415	199859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_199900_200400
720676	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
720681	contig_2125_pilon	-	2162	3	Intergenic	novelGene_147723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGTAGGACGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454937	449693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_451639_453154_453301_454866
720685	contig_18869_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_56400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73393	73779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73800
720695	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720696	contig_20314_pilon	+	858	7	Intergenic	novelGene_125632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	369.499398586189	282	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	23	658	1482	21590	TRUE	30	CAGAAATTCCAGCCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRRPCTSLPPMGPQSFRTQRSSQLSSGTF	1459	24334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21506_21647_24190
720697	contig_987_pilon	+	1404	5	Intergenic	novelGene_72348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	413.957349856238	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	377	1129	1289789	1304627	FALSE	35	ATTGCATATAACTTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNINRPLTMKKEGIQTRNRKMSSKSKKCKKVHDTLEDFPKSSSFNPAALSRHMSSLSHISPFSHSSHMLTTPTPMHPPSSLSFGPHHPSSMVTAMG	1286971	1304902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1287010_1289450_1289988_1295468_1295612_1300073_1300200_1304342
720700	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720701	contig_5050_pilon	-	2240	5	Intergenic	novelGene_110272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	221.01852297941	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTTGGATGTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590392	506887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_588461_590052_590318
720705	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
720706	contig_9345_pilon	-	1849	6	Intergenic	novelGene_24665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1528.68340738035	1	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTTTTCTAAACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001321	946896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949479_949580_952439_952528_955172_955356_997013_997093_1001156
720711	contig_16882_pilon	-	609	7	Intergenic	novelGene_148211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1876.08935021763	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	69	437	189133	182728	TRUE	25	TCACAATATTCTGTCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKSQVKLLARESV	189523	181940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182764_186983_187026_187480_187625_188683_188756_189058_189143_189464
720713	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_17221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
720714	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
720715	contig_11978_pilon	+	2126	5	Intergenic	novelGene_62869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_4	33.8415425180354	585	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	228	785	636922	640825	FALSE	15	TAATCCCTGATTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRLFCSQRGKAVGWGLLYAASVRSSTAATRLVAFVGVTPPAGPTRRASSAAPIPLGLLGAALSSVTLYTRKLAGTMGKKQNKKKVEEVLEEEEEEYVVEKVLDRRVVKGKVEYLLKWKGFSDEDNTWEPEENLDCPDLIAEFLQSQKTAHETDKSEGGKRKADSDSEDKGEESKPKKKKEESEKPRGFARGLEPERIIGATDSSGELMFLMKWKNSDEADLVPAKEANVKCPQVVISFYEERLTWHSYPSEDDDKKDDKN	612966	642166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_613157_636884_637062_637527_637706_638324_638420_640680
720720	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_97672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720721	contig_12920_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_166330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTCATGGTGACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105107	103459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_103500_105100
720723	contig_9609_pilon	+	2134	16	Intergenic	novelGene_22950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	79.5036267516562	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	351	2015	214967	300464	FALSE	20	TTATTTTTTGTTAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELETDCMPQKTSVPALSEKQPNQPPRSADKEPESKKWEEGQEPRLGHQKREAERYLPPSRREGLAFRRDREKEPWSGETRQDGESKTIMLKRIYRSTPPEVIVEVLEPYVHLTTANVRIIKNRTGPMGHTYGFIDLDSHAEALRVVKILQNLDPPFSIDGKMVAVNLATGKRRNDSGDHSDHMHYYQGKKYFRDRRGSGRNSDWSSDSNRQGQQSSSDCYIYDSATGYYYDPLAGTYYDPNTQQEVYVPQDPGSPEEEEIKEKKPTSQGKSSGKKETSKRDGKEKKDRGVTKFQENASEGKAPPEDVFKKPLPPTVKKEESPPPPKVVNPLIGLLGEYGGDSDYEEEEEEEQTPAPQPRTAQPQQREELTKKENEEDKLTDWNKLACLLCRRQFPNKEVLIKHQQLSDLHKQNLEIHRKIKQSEQELAYLERREREGRFKERGNDRREKLQSFDSPERKRIKYTRETDSDRKPVGKEGIDNSSKGGCVQQATGWRKGTGLGYGQPGLASAEETEGRVRGPSVGTAGRTSKRQSNETYRDAVRRVMFARYKELD	196221	300583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_196281_211345_211458_214787_214991_288276_288515_288892_289054_289840_289939_290639_290683_290875_290958_291206_291293_291832_291980_293113_293210_293842_294104_295731_295807_296549_296648_299503_299634_300338
720726	contig_11855_pilon	+	2167	11	Intergenic	novelGene_67023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	247	597	1632113	1632463	TRUE	10	CAGAGCTCCCGCCCCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKDWREGRTLLRLPARPRAARWTGNFPGSPGSFTLGCWGRAPSLPCNLDLKAQSGGRGCRTRSLNGGLGPNPFPHQLPQIWDTQSLPNTTGQDQGWGNKASRGIHVKRSGLVGQ	1631866	1650239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1632950_1633554_1633663_1634464_1634534_1634745_1634845_1634931_1635009_1636705_1636784_1636973_1637066_1637741_1637924_1638423_1638500_1647839_1647978_1650074
720731	contig_15720_pilon	+	783	7	Intergenic	novelGene_41880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	545	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	40	AGAGGAGATAACCACGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	282639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281929_282569
720735	contig_4769_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_117971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCACTAAGCTTTCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412189	414650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_412200_414600
720738	contig_5317_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_76638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909969	910760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_910000_910800
720749	SIRV7	-	917	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114967_147611
720751	contig_11304_pilon	-	1836	9	Intergenic	novelGene_156694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1400	1798	433645	319919	FALSE	55	GGAAAAAACAGTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKFFLLKSSVCPCRLLLRIFHSNLGCVCLCACSRWGTENTKVYRQRSLVSVPCSVVNSTLHKASTLNWMLVLILHLNHGFACGRASNLHITAFCVFKVIYLNSTLCNLFLILSFETQREFIITSWVSPSV	558765	319880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_319989_351742_351860_357445_357628_433615_433674_441233_441326_447547_447605_447719_447873_457802_458137_558030
720754	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_97699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
720756	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_94289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720767	contig_4364_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_15	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261552	260065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_260100_261600
720769	SIRV1	-	167	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3937	0	3663	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6703	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
720774	contig_19737_pilon	+	2102	11	Intergenic	novelGene_158963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	590	junction_7	244.196007338367	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	439	1083	40116	50890	FALSE	15	TATTTTGCCTTATGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFGSLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE	21809	51909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_21912_35434_35528_37367_37499_38872_38933_40063_40173_41152_41207_47230_47282_47575_47696_47781_47910_48698_48801_50757
720778	contig_3018_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_78954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACCTCACTGTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397820	1397320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_1397300_1397800
720782	contig_8354_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_24073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCATTCTTTCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72814	70777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_70800_72800
720789	contig_14680_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_132738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4975	4265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_5000
720803	contig_6710_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_98192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAAGTTCTTTGTCTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653473	653725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653700
720805	SIRV6	+	570	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
720807	contig_3789_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_79831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACCTACAGTGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287315	285103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_285100_287300
720811	contig_7870_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_108908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGTTAAGAGCTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210379	210638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_210400_210600
720812	contig_7870_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_108909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCACTAAGCTAACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211349	212360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_211300_212400
720814	scaffold_12510_pilon	-	2532	1	Intergenic	novelGene_151377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTACTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253601	251069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_251100_253600
720816	contig_13292_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_142934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168153	165724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_165700_168200
720831	contig_5988_pilon	-	1087	2	Intergenic	novelGene_15957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	465	917	652414	651962	FALSE	20	GAAAGGTTTTTGACTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786726	651791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652491_786338
720838	contig_1443_pilon	+	917	2	Intergenic	novelGene_28194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	42	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	132	617	343817	344592	FALSE	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSEEKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343685	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343833_344122
720839	contig_8161_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_156758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270991	269395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_269400_271000
720842	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
720844	contig_6031_pilon	+	1256	8	Intergenic	novelGene_56726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	623.45040553621	62	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	591	1094	158033	165819	FALSE	20	TAATAGCATCCTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLVALAERD	149030	165981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149347_152727_152841_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_165761
720846	contig_10437_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_38453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTCAGCGGAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986838	988907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_986800_988900
720850	contig_9002_pilon	-	2050	14	Intergenic	novelGene_116720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	86.3538201153875	352	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	222	1907	331854	316878	FALSE	25	CATTGCTGTAGTCACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGIWALFGSDECLSVQCLSAMKIAHRGPDAFRFENVNGYTNCCFGFHRLAVVDPLFGMQPIRLKRYPYLWLCYNGEIYNHKEMQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKAPSPEKAEQESERLLKELYLFDVLRADRTTAAHGLELRVPFLDHRFSSYYLSLPPEMRIPKHGIEKHLLRETFEDSNLIPKEILWRPKEAFSDGITSVKNSWFRILQDYVEHQVDDTMMAAASEKFPFNTPKTKEGYYYRQIFERHYPGRADWLTHYWMPKWINATDPSARTLTHYKSAAKA	337851	316734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319052_319154_319664_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331605_331878_332150_332237_333832_333869_337775
720852	contig_7412_pilon	-	1159	6	Intergenic	novelGene_76317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1398.4	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	370	630	370310	365925	TRUE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVSSWPFPLLIQSLLTRMEKLTRYVSCSPGGAAAALPQPELGDPSSPACETPP	373520	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364557_364673_364699_365778_366041_370165_370349_370542_370747_373393
720854	contig_16870_pilon	+	2054	3	Intergenic	novelGene_155506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1560	1955	112256	112651	FALSE	60	TAAGAGGTCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYRQVFLLWSHWVFELPTFGLAANHLTIAYPGILGKGLVSRLYKELSQFNNKKTNNPVKKWAKDLNRYFFKEDIQMADKHRKRCSISLVIREMQIKTTIRYHFTPIKMAIKKTPENNKCWWELKMIQLL	109987	112750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_110576_110775_110891_111399
720855	contig_13894_pilon	-	1514	2	Intergenic	novelGene_62179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCGTGGAAGGGGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697373	694904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_695530_696484
720856	contig_5758_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_119108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATAAATACCCAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248763	248331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_248300_248800
720857	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
720865	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
720869	contig_7202_pilon	-	427	2	Intergenic	novelGene_18591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCGAGGTGGCCGAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	28522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
720873	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
720897	contig_2438_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_112055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGGGGAGCTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313079	310571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_310766_311903_312405_312725
720898	contig_6069_pilon	-	1428	5	Intergenic	novelGene_8045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.92078264374	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	99	1283	362227	360022	FALSE	5	CCTCCGCCTCTCCATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAENTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362325	359876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360831_360983_361083_361559_361671_361753_361863_362170
720903	contig_2703_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_101838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATGCCAGTTGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260202	1260586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1260200_1260600
720904	contig_2703_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_101839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266460	1267393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1266500_1267400
720912	contig_10494_pilon	-	2459	14	Intergenic	novelGene_102198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	27.3337903459172	182	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	599	1615	1076549	1061204	FALSE	0	GCTCTGTTGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRFYEEFPINLKTGEANLTQIYLQEALDFIKRQQSQHRPFFLYWAIDATHSPVYASKPFLGTSQRGRYGDAVREVDDSVGQILQLLRGLRIAEHTLVFFTSDNGAALVSAPKQAGSNGPFLCGKQTTFEGGVREPAIAWWPGHIPAGQVSHQLGSLMDLFTTSLSLAGLEPPSDREIDGLDLLPVLLQGKLIDRPIFYYRGNELMAATVGQYKAHFWTWTNSWEEFRQGINYCPGQNISGVTTHTQEEHTSLPLLFHLGRDPGERYPLSFVSAEYQDALLRITPAVWQHRKALVPGQPQLNVCNPAVMNWAPPGCEKLGKCLTPPESVPEKCSWPH	1083012	1060359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1061291_1064780_1064899_1065985_1066108_1070255_1070359_1071258_1071396_1074273_1074378_1074978_1075119_1075310_1075439_1075514_1075582_1076538_1076683_1078185_1078290_1079044_1079120_1080318_1080443_1082850
720913	contig_12638_pilon	+	1538	2	Intergenic	novelGene_33280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	869	junction_1	0	583	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	462	767	860820	861300	FALSE	30	TAAATGACTGATGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	860358	862071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_860988_861162
720914	contig_10583_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_167906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATCTTCAGTCTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116378	113974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_114000_116400
720916	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
720923	contig_1544_pilon	-	1743	2	Intergenic	novelGene_167937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	261	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTGAAACCCTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130521	108498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_110054_130333
720927	contig_10003_pilon	-	3042	1	Intergenic	novelGene_88170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAATAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418529	415487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_415500_418500
720931	contig_8045_pilon	+	1218	6	Intergenic	novelGene_35371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1360.64975655016	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAATAATGTCATTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116043	119400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527_118772_118952
720932	contig_6710_pilon	+	538	2	Intergenic	novelGene_97437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGATGGCTCTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
720934	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_96018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720937	contig_253_pilon	-	2306	14	Intergenic	novelGene_129636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	110.473215581637	569	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	619	2226	256787	249651	FALSE	10	GAACTGCGTTCTGGTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVYLALNQCSVSATHKCLIAEAWCPTRDLPTIQQALQESSSEVGVSAVVHCIPCRDMPPTLIHTNRFTASFQGIVDAYGVGRYMEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAEDQPAVKAAQNEIWRTFFGGRYLLLLMGLFSVYTGFIYNECFSRAATIFRSGWSVAAMANHSGWSDAFLAQHPILTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSIILGVIHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLEFLPQLTFLLGLFGYLVFMVVYKWLRVSAAGAAEAPSILIHFINMFLFSRSPTNRPLYSGQEVVQSTLVVLALAMVPILLLGTPLYLRWQHRRHSLRRPSGPQLDEDKAGFMDSRDSGASVNSWGSDEEKGGPPGDEEQAKFAFSEVFMHQAIHTIEFCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMRTGLGMGSRVGVTAAVLVPLFAAFAMLTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLTPFTFAVEDE	257684	249570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_249730_249813_249992_250164_250283_250358_250470_250724_250854_251200_251415_251497_251617_252198_252290_252525_252684_252757_252898_255913_256059_256661_256875_256959_257424_257617
720941	contig_14441_pilon	+	1457	5	Intergenic	novelGene_100693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	425.220237053694	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	853	1281	116728	117610	FALSE	10	TTGGCGCTGCCTACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	114178	117786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114732_114871_115022_116578_116963_117220_117344_117539
720947	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_93640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
720948	contig_10629_pilon	-	2550	21	Intergenic	novelGene_52935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	77	junction_20	251.249159202573	377	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	38	2416	383003	353156	FALSE	10	TCTTTATGTGTGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLTDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLVGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVHNR	383040	353021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_353268_354225_354315_356287_356395_357347_357457_357911_357973_359037_359122_360253_360328_360849_360986_363537_363644_364297_364492_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372183_372258_372880_373047_374990_375096_377647_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
720949	contig_8122_pilon	+	1074	7	Intergenic	novelGene_40198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	15.8815056660955	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	138	770	239303	249052	FALSE	20	CCCCCACCTCTCATCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQYSILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAASSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDGKYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGISHHFVLCKLDYQITKEELFFH	236837	249356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_236936_239263_239315_240450_240479_242477_242584_243181_243355_248545_248695_248887
720950	contig_10235_pilon	-	1127	6	Intergenic	novelGene_46466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	794	junction_5	706.278868436541	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	162	623	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	223004	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804
720952	contig_17796_pilon	+	2349	1	Intergenic	novelGene_33843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1886	2335	144432	144881	NA	35	ACAGGACAATTCCGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHESKNFVLLRSVSPALVQLLAYSRGSICICRRKVFALLSPACPQIPKGICLCPASPKECGTAFPGDRDVPLGIWPFTLVHISSPDCLSSEGLSSQKCLTSTQEDVGTAEKVQAWNQISTSPLIKCVTLVNSLDNHSCCCCCVPSSHF	142546	144895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_142500_144900
720954	contig_8322_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_143267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACATATTGTTTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430916	428631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_428600_430900
720957	contig_10446_pilon	-	3063	7	Intergenic	novelGene_162445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.46275606327	40	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	169	537	233785	228913	TRUE	15	TTTCTCTGTTTTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELFMECEEEELEPWQKKVKEVEDDDDDEPIFVGEISSSKPAISNILNRVNPSSYSRGIKNGALSRGITAAFKPTSQHYTNPTSNPVAASPVNFHPESRSSNSSVIVQPLSKPVSVSKITQ	260057	224865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_226767_228287_229080_229179_229246_233649_233797_235004_235074_235188_235234_260014
720964	contig_6589_pilon	+	1571	12	Intergenic	novelGene_25820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	38.8816810846309	274	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	194	1396	815268	825205	FALSE	20	ACCACTTGAGGTTTGCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRSLLAGRLGGEGRVFSALRTGAEEAAVAPGAFERAHPSPRANADPSPTGGTAPDSPRAFLAAMEDGVYEPPDLTPEERMELENIRRRKQELLVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMAMGRKKFNMDPKKGIQFLVENELLQNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFAVIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLAGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVDDPRKPNCFELYIPNNKGQLIKACKTEADGRVVEGNHMVYRISAPTQEEKDEWIKSIQAAVSVDPFYEMLAARKKRISVKKKQEQP	815074	825380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_815287_816117_816266_816354_816422_817384_817504_818510_818592_819325_819439_819686_819836_820308_820421_824102_824183_824426_824499_824588_824744_825117
720967	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_93481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
720973	contig_15498_pilon	-	1785	2	Intergenic	novelGene_42687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAAGCAAGTGGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786276	784443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_784562_784609
720976	contig_8978_pilon	+	1734	11	Intergenic	novelGene_49408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	371.910419321643	3	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	35	907	339807	343826	TRUE	20	AGCCCCATTGCTGCATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFRSESSHPGLHSLALLSMSMPCAGRHSLRWRSNSRTKWTATLRKLGRSWRWRWRLLAMSTRSC	331628	347670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342427_342670_343350_343443_343638_343836_344175_344261_344692_344796_345356_345397_345627_345723_347175
720977	contig_17281_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_105179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAATTTATGGTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2600
720981	SIRV4	+	310	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1461	632	1006	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2461	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
720985	contig_9888_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_162275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	493	540	219273	219226	NA	55	TACACCTCAACATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNYRVYLGSNRLQFRIRINLEVTETTQETGYTAHQSGQLPTKTAISSFSAIPTGRLSSGLCHPAPLGEVLQLFWLCHQVPRGTPLCQQASCLKVFSSVSLWVDKPNALDLLRGPGSPLRPSLTGLLVLAACAILYHLVLSPVSRVFSVQGPWIQRPRSAPRLFLMVLRLPLFSLREQQH	219765	218648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_218600_219800
720987	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
720991	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
720992	contig_3818_pilon	+	2267	4	Intergenic	novelGene_99263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	189.589615280538	722	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	55	357	520461	528488	TRUE	35	ATACAAAAGAGTGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVPESPEFVRVRSYESQMVIRPHKSFDENGFDYLLTYSDNPQTVFPRYCVSWMMSSGMPDFLEKLHMATLKAKNMEIKVKDYISAKPLDMGSEAKATTQSSERKNEGSRGPAQIEYA	520406	530474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_520494_527216_527302_528303_528852_528927
720997	contig_6710_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_89172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGCTCTGTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
721000	contig_6489_pilon	+	1146	2	Intergenic	novelGene_128932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	0	1162	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	77	355	203780	208496	FALSE	30	ATAGAACTGAGCACTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILLSVISLLNEPNTFSPANVDASVMFRKWRDSKGKDKEYAEIIRKQVSATKAEAEKDGVKVPTTLAEYCIKTKVPSNDNSSDLLYDDLYDDDIDDEDEEEEDADCYDDDDSGNEES	203703	209287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_203839_208276
721005	contig_854_pilon	+	2016	5	Intergenic	novelGene_36750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	30.3840007240653	4	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	651	1454	1745134	1745937	FALSE	75	ACAACAACAAAAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722228	1746499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722355_1737993_1738042_1739406_1739713_1743412_1743540_1745090
721007	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_89807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721018	contig_11816_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_98463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCCTAATTTGGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415588	413886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_413900_415600
721019	contig_7963_pilon	-	999	6	Intergenic	novelGene_58295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1352.39926057359	63	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	57	671	48841	38897	TRUE	25	ATGAAGAAGTTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPARRTILEELDGPRVEHAVQTQLRAGRGLHPEAPRLQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	48897	38238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43649_48741
721023	contig_11386_pilon	+	1439	7	Intergenic	novelGene_82766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	292.09283151461	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	360	1049	17940	27749	TRUE	35	GAGCCGCTTAGGAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	7893	32237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_13558_13752_17844_18037_19625_19974_20825_21022_27700_27893_31990
721025	contig_10141_pilon	-	1474	5	Intergenic	novelGene_84624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	139.27042040577	1366	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	98	1216	418688	395520	FALSE	15	CTGGCGTGTCATCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKETKSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRAAAALEIELEEGMYKGGKADEQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPLFKDDLKTKYPTQSGKPIVVSAPGNGKSALSCISKQKKKKKKKLKEQQQPQPSTSAD	421186	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397280_409274_409370_417973_418694_421094
721026	contig_9653_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_48241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAACACCTTTGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822898	824117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_822900_824100
721027	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721028	contig_5062_pilon	+	1123	3	Intergenic	novelGene_157824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	12.5	566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	128	331	117111	129772	FALSE	55	AATAATTTAAAGGTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSTPKARKRKSLLSGVTTGRARAGIARVRVAAGQGSSRPGTMSRNLRTALIFGGFVSLLGAAFYPIYFRPLMRLEEYQKEQAINRAGIVQEDVQPPGLKVWSDPFGRK	116983	130564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_117220_128897_128955_129734
721029	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721031	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721035	contig_7963_pilon	+	1246	7	Intergenic	novelGene_58522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.26066849983	51	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	159	950	194098	200117	FALSE	10	TATCCATGTCTTTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	193895	200413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_193949_193992_194153_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
721036	contig_9848_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_79996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGGAGCGGAGGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146159	148698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_146200_148700
721042	contig_19851_pilon	+	751	6	Intergenic	novelGene_29873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	70	498	53949	56177	FALSE	25	AAACTTCATTCTTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53654	56430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
721048	SIRV6	+	575	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
721056	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721069	contig_6208_pilon	-	813	6	Intergenic	novelGene_52971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	380	junction_1	191.845145885946	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	24	461	351750	334758	FALSE	25	TTACTTCCTTTATTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVRWTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRSEPVKYQRELWNKTIEAMKRVEEIKQKRQATFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEDKMVQKLQEDVDMEDVS	351773	334405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_334832_336085_336172_338944_339009_344015_344089_345798_345913_351723
721075	contig_7045_pilon	+	2174	6	Intergenic	novelGene_77453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	184.396312327552	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	598	768	364141	364311	FALSE	35	AAACTCCAAAGCTTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEVRNLFLL	323368	365717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111
721076	contig_8156_pilon	-	1681	6	Intergenic	novelGene_98934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	88.6453608487212	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	357	1082	441382	398513	TRUE	25	TGTGAGTCCCTTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWTTKAFLPRMLELQNGHIVCLNSVLALSAIPGAIDYCTSKASAFAFMESLTLGLLDCPGVSATTVLPFHTSTEMFQGMRVPQPLPPAEA	441738	395200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403296_403531_403883_404004_404665_404810_441187
721077	contig_15449_pilon	+	1460	4	Intergenic	novelGene_33627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	807	junction_3	584.983380580641	10	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	132	506	84815	88945	FALSE	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	62222	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000_86181_88888
721078	contig_18096_pilon	+	2597	13	Intergenic	novelGene_58045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	672.135940284569	1	136	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	341	1633	53772	78155	FALSE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPKKRE	40343	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44252_53716_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_78142
721079	contig_13992_pilon	+	1853	8	Intergenic	novelGene_147659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_1	153.872727689252	2041	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	122	898	690047	704197	FALSE	40	CTGAATTATTAAATTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACRPRSPPRYGDASPHFPARWSLGRKRRADGKRRKSEDCDPSASPDDHERRRADHRLESFTTPEGPKPRSRCSDWASAVEEDEMRTRVNKEIARYKRKLLINDFGRERKSSSGSSDSKESVSAVPADLETDESVLMRRQKQINYGKNTIAYDRYIKEVPRHLRQPGVHPKTPNKFKKYSRRSWDQQIRLWKVALHFWDPPAEEGCDLQDIHPVDLGEMETESTESSSESQTSSQDNFGLPTELRPTQLSSSSECSAV	689925	705152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_690091_690257_690393_693546_693652_697446_697507_697804_697943_698839_698990_700379_700462_704134
721083	contig_11427_pilon	+	1681	2	Intergenic	novelGene_78974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	593	1630	93223	94260	FALSE	15	CATTGTTTCGTGTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92364	94311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92898_93163
721086	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_96629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721087	contig_12427_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_40486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325988	324171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_324200_326000
721088	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	289	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721091	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	316	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721096	contig_5059_pilon	-	2211	11	Intergenic	novelGene_140734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	32.9516312191066	7	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	367	1305	276604	263572	FALSE	60	AAAATAAAGAAATCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKRTEFEGAVIALFHLLATRTDKVRALREAFYRQNLPNLMNLIATVFVFAVVIYFQGFRVDLPIKSARYRGQYSSYPIKLFYTSNIPIILQSALVSNLYVISQMLSVRFSGNFLVNLLGQWADVSGGGPARSYPVGGLCYYLSPPESMGAIFEDPVHVVVYIIFMLGSCAFFSKTWIEVSGSSAKDVAKQLKEQQMVMRGHRDTSMVHELNRYIPTAAAFGGLCIGALSVLADFLGAIGSGTGILLAVTIIYQYFEIFVKEQAEVGGMGALFF	292657	262665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_263759_266445_266523_267451_267644_269915_270114_270419_270581_276480_276613_278003_278076_283551_283631_288493_288560_290235_290304_292584
721097	contig_5945_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_104525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTTTGGGGACCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4339	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_2600_4300
721099	contig_6109_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_160368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTTTTATCACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219233	217525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_217500_219200
721103	contig_19769_pilon	+	816	6	Intergenic	novelGene_102284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	241.073432795901	5	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	29	802	87249	89322	FALSE	20	TAAAGCTTGTTCTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87001	89336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
721110	contig_14357_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_121703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730881	731828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_730900_731800
721113	contig_4891_pilon	-	1097	5	Intergenic	novelGene_124596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.833326066736	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGCTCTGTGTGATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964318	937407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937762_938261_938536_939963_940129_943507_943621_964127
721115	contig_6589_pilon	-	1910	7	Intergenic	novelGene_26214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.127834957785	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	87	581	2032681	2030536	TRUE	35	ACCAGCCGTGGACCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFEFQRYPDPRRQGWPQHTARPNPQSQSMGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033530	2028692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2029172_2029582_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
721120	SIRV6	+	570	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721123	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721124	contig_5967_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_44419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	505	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475250	477292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_475200_477300
721126	contig_6489_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_128933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAGAAGATCATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205655	207566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_205700_207600
721129	contig_10904_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_22536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAAACGAGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370866	368928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_368900_370900
721130	contig_610_pilon	-	1170	3	Intergenic	novelGene_76743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_2	1527	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	58	486	252557	214183	FALSE	25	TATTGTCAAAGTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252614	213498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_252475
721131	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721144	contig_15888_pilon	-	1208	9	Intergenic	novelGene_84426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	106	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	62	871	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259787	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251809_252181_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
721146	contig_7031_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_132809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCAGCACCCTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376394	377234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_376400_377200
721147	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	118	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721148	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	68	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721160	contig_16119_pilon	-	1267	6	Intergenic	novelGene_164269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	95.3108598219531	102	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	203	757	85327	68292	FALSE	10	TCTTTGTCTGTTTTGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKQRGLRRRWGRDVTRAQAAPVAARAAAAAAAVTSEPPESLQIGDSDPFLPEVLRSSSWCNKELKTMEERKVKRRSPKSFSAHSTQVVNTKKSAIPVSKSTGFSNPATQSTSQRPKLKRVTKEKTRPQGGEGKGAQSTPIQHSFLTDVSDVQEMERGLLSLLNDFHSGKLQAFGNECSIEQMEHVREMQEKLARLNLELYGELEELPEDKRKTASDANLDRLLSDLEELNSSIQKLHLADAQDVPNASTS	87359	67781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_68347_72574_72598_73733_73889_78145_78310_85169_85370_87199
721161	contig_3132_pilon	+	1812	14	Intergenic	novelGene_127411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	69.3446925909441	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	305	1426	13928	23874	FALSE	15	TCATATGTAGTCTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMPHESTVEHTHVDINEMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	12644	24260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_12680_12806_12865_12964_13142_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953_23131_23628
721169	contig_8914_pilon	+	855	6	Intergenic	novelGene_112874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23642	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	137	577	264665	267418	TRUE	25	GACGGAAGTGCAACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264528	268967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264950_265588_265799_267319_267508_268075_268179_268881
721170	contig_3948_pilon	+	2216	16	Intergenic	novelGene_53174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	31.1740632934211	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	252	2045	346422	384260	FALSE	15	TAAAGTGGTCCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLQHVLRAQGSLRQGTLASVSWLLLRNCRAHSGLPSTACPSPERQEDGVPKDFSSRLATGPTFQHFLRSASTPQEKPSSPEVEDPPPYLTVDELLGRQRKVYLETYGCQMNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQGLKEVTLLGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRQKTRAYHRLQDDVPGEVKIRRLEELITVFREEATTANKTSVGCAQLVLVEGLSKRSATDLCGRNDGNLKVIFPDTEMEDVSNPGLRVRAQPGDYVLVKITSASSQSLKGHVLCRTTLKDSSAYCSPGWMATQS	343561	384431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343585_344212_344314_345537_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361249_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368963_371245_371396_379631_379773_384152
721179	contig_4059_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_140583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	516	1274	171277	169738	FALSE	30	TTATTGTAGTGCAGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIPLDLSSSAGSGKRRRRGNLPKESVQILRDWLYEHRYNAYPSEQEKALLSQQTHLSTLQVCNWFINARRRLLPDMLRKDGKDPNQFTISRRGAKISEASSVESAMGIKNFMPALEESPFHSCTAGPNPTLGRPLSPKPSSPGSVLARPSVICHTTVTALKDVPFPLCQSVGVGQNTDIQQIAASNFTDTSLMYPEDTCKSGPSTNTQSGLFNTPPPTPPDLNQDFSGFQLLVDVALKRAAEMELQAKLTA	171792	169260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_170314_171094
721180	contig_9363_pilon	+	2797	13	Intergenic	novelGene_6529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	10.8691714904536	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	21	1427	609636	623409	FALSE	10	CACGTTGTGCCTGCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQNAGIEVALCSEQFGSGAARGCRAAADGSLQWEAGGWHWWGFSGVFSVKPEGRDGGRGGTPGAASSPLSGLLAVFLPQGFPDSVSPDYLPYQLWDSVQAFASSLSGALATQAVLLGIGVGNAKASVSAATATWLVKDSTGMLGRIVFAWWKGSKLDCNAKQWRLFADILNDVAMFLEIMAPIFPICFAITVCTSNLAKCVVSVAGGATRAALTMHQARRNNMADVSAKDSSQETLVNLAGLLVSLLMLPMVSDCPSLSLGCFFLLTALHIYANYRAVRALVMETLNEGRLWLVLKHFLQKGEVLNPTSANQMEPLWTGFWPSLSLSLGVPLHCLVSSVSELQQLIDGHQEPYLLRWDPSRNQIQVVLSQTAGPETVLRAATHGLVLGALKQDGPLPGELEELRNQLQAGPEKDCWVIVKETHQVLDKLFPKFLKGLQDAGWKTEKHQLEVDEWRATWLLSPEKKVL	609615	624779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_609936_610150_610266_613807_613854_615160_615194_615282_615389_618230_618333_620673_620745_620823_621009_621087_621146_621569_621641_622468_622613_622737_622816_623311
721184	contig_12733_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_129605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387482	386395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_386400_387500
721185	contig_7457_pilon	-	1485	5	Intergenic	novelGene_31623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.579474460415	99	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	129	1373	962606	955529	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSPPLPSAQ	962734	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955553_956530_956939_958234_958375_960225_960896_962603
721186	contig_262_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_140615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGGGAGGGGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33628	35900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_+_33600_35900
721187	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
721188	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721192	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
721195	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_96592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721199	SIRV2	-	541	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1096	0	-67	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4799	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
721205	contig_7695_pilon	-	1202	4	Intergenic	novelGene_41664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.7574286553751	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	714	1055	904770	896494	FALSE	25	ATATGTAACACTCCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKMREKVRPKMGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPVADCHAAIRTTPVVPQDSRGGSKKYKEFKF	905483	896346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896545_903742_903809_903914_904005_904635
721208	contig_4974_pilon	-	2400	1	Intergenic	novelGene_161397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39601	37201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_37200_39600
721210	contig_10134_pilon	-	2009	4	Intergenic	novelGene_16223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	790.073976845769	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35108_38639_38831_39594
721214	contig_14322_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_116173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671835	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
721215	contig_6361_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_24032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644315	642215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_642200_644300
721225	contig_6489_pilon	-	1336	5	Intergenic	novelGene_128961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	306.889536315594	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	19	762	395604	389842	FALSE	30	CAACTTTATTCAGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRDGSMGLWEVTDDVLTKSDARHNVSRVPVYAHITHKALKDIPKEDTNPDNCKVRALAFNNKNKELGAVSLDGYFHLWKAENTLSKLLSTKLPYCRENVCLAYGSEWSVYAVGSQAHVSFLDPRQPSYNVKSVCSRERGSGIRSVSFYEHIITVGTGQGSLLFYDIRAQRFLEERLSACYGSKPRLAGENLKLTTGKGWLNHDETWRNYFSDIDYFPNAVYTHCYDSSGTKLFVAGGPLPSGLHGNYAGLWS	395622	389267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_392609_392773_393919_393986_395427
721230	contig_6735_pilon	-	1082	5	Intergenic	novelGene_15768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	745.33616576683	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	265	606	543144	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543824_568198
721231	contig_6710_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_98023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721235	contig_11590_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_125595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCGCGTTGTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716846	719016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_716800_719000
721236	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721237	contig_11370_pilon	-	3404	25	Intergenic	novelGene_98774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_18	18.3944058525049	72	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	933	2802	61	2862	292291	281536	FALSE	0	TCCCTGCCTCTTCCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRSAPSARDPRLLPLLLPGMMAIPQSLFSTGGALDSSELQMEPDEVDTLREGEDPADRMHPFLAIYDLQPLKMHPLVFAPGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFTWTTKKKFRHFQELHRDLLRHKVLMSLLPLARFAVAYAPAGEAANREIPSLPRAVPEGSTRQAASRQRYLENYLNHLLAMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFITDLGPKGLEGVIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGVISFVQLFDPGFEVQVGKRSTETQYGVRIDTSHRSLILKCSSYRQARWWGQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGSLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDSMLKRKAEEGVRVSVLLFKEVELALSINSGYSKRALMLLHPNIKVMRHPDQMTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDFHYRLTDLGDSSESAAPQPPTLCPDSPTTPDLSHNQYFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPWRDIGMVVHGPPARDVARHFIQRWNFTKTTKVKYKTPMYSYLLPKSSSTASKLPFTLPGAQCATVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESKHFLYIENQFFISCSDGRMVLNKVGDEIVDRILKAHKQGECFRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHRLKAAMGTAWRDYMSICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKMLIADDRTVIIGSANINDRSLLGKRDSELAVLIEDTEMEPSLMNGVEYQAGRFALSLRKHCFSVILGADAQPDLDLRDPVCDDFFQLWQETAENNANIYEQIFRCLPSNAIHSIRALREYVAVEPLALVSPPLARSELTKVKGHLVHFPLRFLEDESLLPPLSSKEGMIPLEVWT	292871	280993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_281761_282029_282145_282505_282660_282899_283035_283314_283365_283528_283643_283748_283838_284076_284182_284289_284404_284493_284613_284804_284932_285325_285497_285678_285790_286844_286924_287068_287153_289773_289924_290370_290524_290614_290708_290848_290908_291049_291116_291209_291316_291719_291863_291966_292098_292182_292293_292812
721243	contig_19938_pilon	+	1177	6	Intergenic	novelGene_146561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.898098720431	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	139	813	8931	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLVWFQLQRRLLQALPVPLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5732	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5788_8847_9006_16532_16644_17241_17473_18414_18535_18953
721248	SIRV4	+	308	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1463	632	1008	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
721251	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
721259	contig_10045_pilon	+	1707	2	Intergenic	novelGene_163758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACACTTTAAAAAACGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52766	66521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_52841_64888
721260	contig_9177_pilon	+	1051	6	Intergenic	novelGene_32669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	735.495044170931	218	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	65	529	395377	415476	TRUE	20	TTTTTCTTTTATGTAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRGAGIELSLSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395312	416867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315_415698_416566
721262	contig_11370_pilon	-	1141	5	Intergenic	novelGene_98781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_2	207.547584905245	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	703	1065	301670	300981	FALSE	10	TCTGTGTGACTTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTANALALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFTIATLPPP	302913	300904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301124_301252_301398_301595_301726_301843_302379_302801
721264	contig_7202_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_18390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27638	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
721268	contig_14441_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_100425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.651485960052	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	192	614	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81883	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81901_112106_112132_116578_116957_117220_117344_117539
721277	contig_7171_pilon	+	1638	9	Intergenic	novelGene_101187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	37	330	37445	37738	TRUE	15	GTTAAGGCGGAGGGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPQCFTFDLNRMGNLECSAGWAGGLGMSVPALVPSVFPLRLRFIHAPLCRLYDGRQEAGHGELMGELGVGVPIRTSAPTSDGLTCNNSDRIWTRVYICHLWVKEIVWS	37408	50430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_38395_39058_39179_40625_40702_40779_40818_44870_44956_46837_46895_47596_47692_49544_49604_50308
721281	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721284	SIRV6	+	556	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
721291	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
721293	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
721294	contig_20165_pilon	+	2629	14	Intergenic	novelGene_54469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1364	1717	70012	75396	TRUE	5	CACTGCTTCCTTTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEGGGGILVPAEGATEGLEGLTVLLVLLNGGPDDLNPFVLLFLCPSLQLQGPFPSCYNKRVSCIWLDNILYLKARNVHLLPDTELLAHEPQLGHTVKDHAVELEEVAVLGGAVLG	40764	128163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_42044_58003_58088_70011_70118_70985_71018_72216_72296_75015_75114_75357_75501_77718_77777_78293_78440_89210_89365_92257_92396_92999_93090_118295_118458_128103
721295	contig_11396_pilon	+	1044	7	Intergenic	novelGene_71437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	504.544018561975	2769	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	85	918	1782334	1789745	FALSE	40	TAACCTTTTTTAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRNAGGVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQMVVVWGCRWYFLWLVWGLAPMLTRLVCRQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782249	1789871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787747_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
721296	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721300	contig_14970_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_45118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTGTCCCAGCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267484	265969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_266000_267500
721303	contig_14017_pilon	+	1834	6	Intergenic	novelGene_165682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	77.1154977938935	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	33	689	29686	52331	TRUE	10	TTATTGTGTGCCCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKGCIKVKNFNFIVPDGMNLDFTYATVSANDNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVRVVGSPIDALPPPDPFTQ	29653	59745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524_34712_49339_49506_52284_52358_55732_55860_58753
721304	contig_6241_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_156432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303398	305445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_303400_305400
721313	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721314	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_90322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721317	contig_7744_pilon	+	1554	11	Intergenic	novelGene_62533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.955551515571	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	689	1144	828968	829895	TRUE	15	CCTGTGCACCCCCAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVSWSRKGKPAGRCHCPAEARAARAGAGVRYAWNWLLNTS	827103	830800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_827202_828119_828260_828369_828461_828608_829007_829274_829368_829471_829711_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
721321	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
721323	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_89424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721324	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
721328	contig_15172_pilon	+	1622	7	Intergenic	novelGene_158740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_3	273.771194004531	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	680	1156	224971	237132	FALSE	75	AGCAGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	219849	237598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
721331	scaffold_15568_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_122583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGGCAACTGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83131	85680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_83100_85700
721343	contig_7357_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_36939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTCCCCCCACCCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916848	918445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_916800_918400
721348	contig_5649_pilon	-	2912	14	Intergenic	novelGene_82437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	196.522278424508	47	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2670	242	2911	1519324	1469833	FALSE	30	AAGGCTGTCGACTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLLMDHASLQLSTGNLWNCLVRLLSKQPEWLNAKEKFFLPNMDLGSRNEAPDPAERVILQLKRLHAQGLATWQAFIHCVCMELDVPLELEVPLLSTWGQEDVFPKQLGAGEEGCPESQQYHGLKRPHQSCGSSPRRKQCKQQQLELTRQYLQLLRTSTQQRYGGENPRPGQPVSFHIAPILKKSWVTAPLDTQEEDVMGDSKAKDGIQDLFNTKTKKGPRVTVVLGKAGMGKTTLAHQLCQKWADGQLDRFQALFLFEFCQLNLITGLLTLPQLLFNFYPSPESGADTVFQYLEENAHRVLLIFDGLDEALYPCSSRNTEGLDTPGPAFTLFSGLCDGTLLPGCWVMATSRPGKLPACLPVEATMVHMWGFDRLRVEEYVGRFFRDHPLQAAALEEVRADRRLQSMCAVPALCRVACLCLRRLLPGTSLGQSSALLRTVTQLYVQMVLTLSHHRCLPTTSLLGLGEVALKGLEAGKVVFYAGDIPPPVMAFGAAHNLLTSFCVCTGPEHQETGYAFAHLSLQEFFAALQLMVSPEVDKDMLSRYVTLNSHWVLRTSARLGCLDHLPTFLAGLASCTCRPFLSHLAQQDEVWVRAKQDAVVQALSKLATRRFRGPKVMELCHCVDETQEPRLARLAAQSLHYPLSFHNFPLTYTDLAALANILGYRDTPIHLDFEGCPLEPHCPDALVGCGQVENLSFKSRRCGDAFAEALSRSLPTMRSLQKLGLTGSKITTKGMSHLVKALSLCPQLEEVSLQNNQVKDQEVLDIVKVLSCLPRLRKLDLSHNDISVSTLLSLAKVVVACPTIRALQARQRELVFLLSPSTETAAELQGTPDLQGNASQREEALTRSLTLRLCECQLRVHDTEVLIALLRDGPCLEEVDLSGNQLED	1520934	1469831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1469858_1471388_1471473_1471986_1472053_1473726_1473787_1474560_1474651_1474786_1474871_1476947_1477032_1477173_1477258_1478519_1480174_1481320_1481390_1482882_1482943_1483582_1483890_1519321_1519533_1520901
721350	contig_12644_pilon	+	1349	10	Intergenic	novelGene_44608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4402.24697676589	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	53	877	2675526	2679914	TRUE	45	TCAAAGAGGCAGTGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWLLQPSHAQDDEYRP	2675473	2680614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675533_2677248_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679634_2679870_2679963_2680107_2680229_2680311
721355	contig_5515_pilon	-	1796	9	Intergenic	novelGene_52341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	444.103573927299	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	151	1155	99142	68274	FALSE	45	TCAACCGATCAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCSGPGHSKRRRQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGHSRPGLTGPPPPLCPSTLLWSAGPSFSRCPPPPLV	99292	67632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68772_68869_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
721360	contig_8452_pilon	-	3184	9	Intergenic	novelGene_47984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	444	junction_8	242.691161767379	718	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	163	1248	145829	100024	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTVSGNILTTLWPTTAFVFTLEKV	145991	98087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
721361	contig_6589_pilon	+	1375	7	Intergenic	novelGene_26002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	855.214527992181	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	419	847	1727185	1731484	FALSE	35	AAAAAGTATTTTCAGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQVQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLLGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725344	1732012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727044_1727175_1727251_1728198_1728308_1728994_1729171_1731406
721366	contig_15327_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_70548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTGGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545633	547461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_545600_547500
721368	contig_3747_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_24857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200994	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201538_204140_204713_204996
721371	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721374	contig_8320_pilon	-	1593	8	Intergenic	novelGene_152269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_2	35.4193536395697	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	337	1074	558034	542143	TRUE	20	TATAGCTCTATTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSNGAKQDSHNKARTSPYPGSKVERSQVPNEKVGWLVEWQEYNPVEYTAVSVLAGPKWADPQISESNFSPKFNEKDGHVERKSQNGLYEIENGRPRNPAGRTGLVGRGLLGRWGPNHAVDPIITRWKRDSSGNKITHPVSGKNILQFVAIQRKDCGEWAIPGGMVDPGEKISATLKREFGEEALNLLQKSSAEKREIEEQLQKLFSQEHLVTFFYLPPYKNRYIRDMLMILETLITHGWRQKL	563448	538740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_539242_542124_542242_543282_543430_545318_545431_551376_551464_555377_555474_557837_558078_563155
721381	contig_13894_pilon	-	1548	4	Intergenic	novelGene_62190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	480	junction_3	56.0416511771974	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	330	878	753211	750013	FALSE	25	GTAGCGGTGCCACGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	753540	749342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097
721382	contig_2798_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_120001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATTATATGCTGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92743	92186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_92200_92700
721384	contig_4114_pilon	+	1146	3	Intergenic	novelGene_15593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	818	junction_1	224.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	295	705	234061	249670	FALSE	60	AAAAAAAAGAATTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKILNIFLSRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDSVMQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLGSKDR	233766	250111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_234230_247835_248000_249592
721390	contig_15304_pilon	-	1068	3	Intergenic	novelGene_30436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
721398	SIRV7	-	209	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	0	146711	0	-91677	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTGAATGCAAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147923	147714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
721402	contig_12000_pilon	+	1424	9	Intergenic	novelGene_43157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	419.047357108955	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	100	432	417192	488544	TRUE	20	TTATATCACATGTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGLCLEDLALYQLLRSLT	416854	669834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488492_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_669224
721407	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721408	contig_5643_pilon	+	1137	7	Intergenic	novelGene_38976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	650.308324309836	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	194	697	551251	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	550027	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_550089_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
721409	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721417	contig_5346_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_161863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCACTTAGAAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411225	409507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_409500_411200
721419	contig_11512_pilon	+	334	2	Intergenic	novelGene_43257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	27	332	43509	44038	FALSE	20	TGCAGTTTATTATTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGETATINCKSSQSVRKYLAWYQQKPGQAPKLLIYSASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISNLQAED	43482	44040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_43558_43781
721424	contig_9552_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_167943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAAATTATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407470	407714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_407500_407700
721426	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721428	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721429	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721431	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721435	contig_5566_pilon	-	3381	18	Intergenic	novelGene_153649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_10	59.0339178795344	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1062	3189	115	3303	176330	131373	FALSE	60	AGAAAAAAATACATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGGSRIIRRVSLRKRNRPSLGSVCAAPAAAELKPGNVEDEEMVAGSRRRKTVGVQPVEYDSEEDMFGDYDSFTENSFLAQVDDLEQKYMQLPEHRKHDTDLAIEDLCSESIKDSKLNITTVDNFTALKTDEPTKNQCGQEDVAIEPGTDLLYDVPSSQVLYFENLQNSSNDWGNQFTKEKDWNSSSHQTVNEELSHSCIEQPQQNDQSSSEVRTSSDTTRRKSLKDHLKSTMTGNAKAQTPVFSKTKQLKESLLSEEINVAKKTLESSSDDRGPFYSLPSKVRDLYVQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCRRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSTFGMELGFFVEEYAGSKGRFPPVKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETERISNLGLVVVDELHMIGAGSRGAVLEMTLAKILYTNKTTQIIGMSATLNNVEDLQEFLQAEYYTNQFRPVELKEYLKINDEIHEVDSKAENGITFSRLLNYKYSDTLKKMDPDRLVALVTEVIPNYSCLVFCPTKKNCENVAEMICKFLSKEYLKHREKEKCEVIKNLKNIGGGNLCPVLKRTIPFGVAYHHSGLTSDERKLLEEAYSTGVLCLFTCTSTLAAGVNLPARRVILRAPYVAKEFLKRNQYKQMIGRAGRAGIDTVGESILILQEKDKQQVLELINSPLENCYSHLVQEFTKGIQTLFLSLIGLKIATNLSDIYHFMSGTFLGVQQKILLKEKSLWEITVESLSYLTEKGLLQKDTIRKAEKEVEYNFHITKLGRASFKGMIDLAYCGILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLITPYDMVFLYDPDWMIYFRQFSQLSPAEQKVAALVGVSESFIGKKASGQAIKKKVDKDIVNRLYLSFILNTLLKETNIWSVSEKYNMPRGYIQNLLTGAASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVLEGRAKQLYNAGYKSLMHLANANPEVLIKTVDHLSRRQAKQIVSSAKMLLLEKAEALQEEVEELLRLPSDFPDTVASPIEKA	176444	131294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_131481_140998_141134_142158_142273_144562_144737_147385_147485_148382_148541_149896_150120_156087_156193_157205_157348_161414_161655_162032_162179_163516_163616_164783_164882_167749_167823_168362_168564_169131_169311_173166_173882_176150
721438	contig_5551_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_134263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTACGTGAATGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623294	624062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_623300_624100
721439	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721440	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721444	contig_5539_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_104754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAATGTCCAAGACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68830	69131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_68800_69100
721446	contig_14176_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_74864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTACGATGGTCTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477797	476822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_476800_477800
721448	contig_11171_pilon	+	1288	6	Intergenic	novelGene_48590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	482.52170935617	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	116	1066	212165	251735	FALSE	10	GGCTCCACCTCCCTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFQEQKRKEGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSARSTHASRAKPTTCPSRGAPSPRRDCTDLKMKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212049	251957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239299_250004_250068_251407
721451	contig_6710_pilon	-	998	3	Intergenic	novelGene_96333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	72	441	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659352	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152_658365_659084
721454	contig_11931_pilon	+	3033	18	Intergenic	novelGene_159899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	11.9610093196451	52	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	653	1936	144892	156727	TRUE	70	AAAACATCTGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHEKERKARTLYEKQMEEKQRKLKEQKEKDEQRRASVRIKRRQKLEEERERYKAAVLLTLQRSNRAQYRQKAWLWEGCSTLKSESRFATKHSISDEELEQGNVDSNRCMFTTSTGVQNPLTKKKTEKKRTLSFTTKDVKLHSCPEPEPPPKEEKLCVRYLYGSSQENALVSHLLVPTEASLARSETATSLSIPGKDFSGVDLLQHIRMALRSQSNNELKTTVMAPELKVAMPLQAKIEISPKEKVEMPPKADVEAPPKDAVEGSPEIIEASPMANMETLPEVSVEASPEAGVEASRKTIVETLPKAGLKAPPKACVEAPPRAGVETASGDGMKMPTKVCVVTSSEASGEGSPKAKVRENQTLTNRPQILLPRSAHHRTYHVTDGHRLQAGCVCPLLSAGKSKRITLRCLHLSYQNSPPHLLFLIK	120102	167432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_+_120486_142615_142712_143543_143622_143715_143800_144880_145045_148541_148657_149226_149332_151017_151120_152231_152358_155157_155636_156242_156362_156641_156854_158127_158267_159542_159703_163857_163934_165123_165317_166412_166697_167313
721455	contig_6208_pilon	-	1474	10	Intergenic	novelGene_53036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	384.932156921319	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1236	237	1472	513736	493758	FALSE	55	CCAAACTGGAAAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPK	532592	493755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_493763_493891_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
721459	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91667	4	-91661	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGACAAAACCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
721461	contig_15628_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_147692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATATGTCTGTTTCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99141	100400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_99100_100400
721462	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721466	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721468	contig_5372_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_149709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTTCTCTTTTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155556	154908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_154900_155600
721472	contig_10864_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_107039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	497	1135	695723	695085	NA	10	CCAGGTGTTGGGGTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCTVAWGKLASDFWGQAEHLLRVVHSTALIAKLRWPLLGPGALVVQCLRAWLLTGRLAVQIYQPLLEKEKDNAGRTTDSSLNKELKDTEGRCKGGYYQFLPIPVCVCQAMEGRCQRWLLSIPSHPCVCVCVCVCVCVCVCVRLWKGGAKDGYYQVLPIHVCVCVCVCVCVCVSAYRKGDAKGGYYQFLPIPVCVCVCHSAHREVESVFLPL	696219	694729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_694700_696200
721475	contig_4180_pilon	+	724	5	Intergenic	novelGene_8393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	83	529	875290	888134	FALSE	25	TGGCCTGTAAGACACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875207	888329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
721478	contig_6316_pilon	-	2374	12	Intergenic	novelGene_134718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGGAACGAACTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157267	143184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_144168_145288_145513_146616_146709_147102_147170_148632_148747_148836_149008_149209_149303_149539_149671_153044_153127_155949_156030_156847_156939_157021
721482	contig_7202_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_18628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTTGCCAAATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
721483	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_16817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27876	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
721484	contig_8848_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_140456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTCTTTTGTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56565	58644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_56600_58600
721485	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14419	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
721487	contig_19730_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_142499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAGAAAATAGATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168098	166332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_166300_168100
721493	SIRV1	-	176	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3928	0	3654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721498	contig_3942_pilon	+	915	7	Intergenic	novelGene_128687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	494.784015730321	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	58	741	426591	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426533	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428570_429487_429607_429798_429853_429936
721499	contig_15628_pilon	-	1654	14	Intergenic	novelGene_147700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	119.785310911059	183	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	18	1136	189985	116737	FALSE	20	TGATCAAGGTTTTCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALAVMETSLLRQCPLLLPQNREKTVYEGFISAQGRDFHLKILLPEDLQMKNARLLCSWQLRTILNGYHQIIQQRMQHCPDLVSFMMELKMILEVALKNKQELHAPPPPPQFYSRLIHELGTLGWDKVVYMDTGFSTFKLKAQDASGREHLITLKLKAKYPAESPDCVVDFPVPFPISWTPQSSLKSIHSQFLAALDSLKAFWDVMDEIDEKTWVLEPEKPTRSATARRIALGTNTSINIEVDPRHPTMLPECCFLGADHVVKPLGIKLSKNIHLWDPENTLLQNLKDVLETDFPARAVLDRPDFTMDCGICYAYQLDGVIPDQVCDNPQCGQPFHQTCLYEWLRGLLTSRQSFNIIFGECPYCSKPMTLKMSGRKP	190002	116218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_116773_118317_118390_120619_120737_122051_122134_122219_122266_122539_122624_125203_125355_141277_141347_147271_147369_159259_159361_167407_167465_173238_173300_176265_176325_189898
721505	contig_10627_pilon	+	2876	10	Intergenic	novelGene_59970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	150.375168688267	35	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	227	1270	224634	234294	FALSE	85	AAAAGAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSLAILSEMGEVTEGMMDTKMVHFLTHYADKIESVHFSDQFSGPKIMQEYV	218936	235900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_220604_220693_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232908_234198
721506	contig_5921_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_142257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTGAAAAGCTACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442669	444400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_442700_444400
721509	contig_5711_pilon	+	2251	9	Intergenic	novelGene_80263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_8	38.4675187658367	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	11	1603	52529	109104	FALSE	70	CCAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLEVFNSLYLDILFTFLLPKLHCLITGKCIGHDLSINFAAELLKYVNIWGKKKTLLSS	52518	109752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_108771
721516	contig_5696_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_117512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCCACACAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341165	339769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_339800_341200
721519	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
721520	contig_20842_pilon	-	2172	1	Intergenic	novelGene_160983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCGCTTTATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235649	233477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_233500_235600
721532	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	221	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721533	scaffold_19766_pilon	+	2345	5	Intergenic	novelGene_34296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	73.7461863420747	450	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	664	1851	520471	529612	FALSE	5	TTTGGGGGCTGGCATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGKKKSSFQITSVTTDYEGPGSPEGADSPAPPAPTRPPPRLPNGEPSPEPGGKGTPRNGSPPLGAPASRFRVVKLPHGLGEPYRRGRWTCVDVYERDLEPPNVGRLLEAIRGASGGTGGRSLDSRLELASLGLGAPTPQPGLSQGPTSWLRPPPTSPGPQARSLTGGLGQMAVPGKATVETPPLLASLPQQRPPEPGTRDSEGTSQASTPLSSLRVEVEPRNSAGGTPPLSQGKDGPFQLRMELVAPEETGQVPPLDSHPSSPALYFFPDASLVHKSPDPFGAAAAQSLSLARSMLAISGHLDSDDDSGSGSLVGIDNKIEQAMDLVKSHLMFAVREEVEVLKEQIRELAERNAALEQENGLLRALASPEQLAQLPSSGVPRLGPPAPNGPST	519366	530106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_519769_520209_521233_523465_523633_528931_528981_529402
721535	contig_3414_pilon	+	2383	17	Intergenic	novelGene_80973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	189	500	67134	70789	TRUE	70	ACGGTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKTRRKEVTVLIFKATECILHIFKKLCVVSLDLCLAIFHWIQFHGGKFIEDLPHVLTDNGPCDFIVTLGSGFNSSTGHIIKRNHVGQHSYCLVEWAEPRS	64993	101989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_65127_65307_65361_67131_67267_69040_69214_70783_70872_71145_71440_76898_77096_78450_78521_79117_79233_79321_79444_89138_89255_89795_89949_93529_93681_95072_95209_95420_95642_98057_98190_101895
721538	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721541	contig_8907_pilon	-	1224	4	Intergenic	novelGene_85816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6559	junction_1	935.700925628602	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCATCCTTGCCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179920	173355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_179544_179839
721552	contig_17194_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_155377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATGGAAACTGTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274455	274798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_274500_274800
721553	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
721560	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_89525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721561	contig_11846_pilon	-	1338	11	Intergenic	novelGene_105938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	100.47308097197	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	25	855	263830	251464	TRUE	25	CATGGTACTTTCATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRS	263854	248489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_263659
721566	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721570	contig_12790_pilon	+	1847	11	Intergenic	novelGene_35217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.210302015571	2	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	129	980	307252	312473	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGGDAGLNIHRVFTDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305931	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306017_306100_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309627_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312348
721572	contig_6710_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_90075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACAGAAGCACTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
721573	contig_7151_pilon	-	1732	9	Intergenic	novelGene_40665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	189.645557554086	1	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	59	850	18221	6283	TRUE	25	AACCCAATGTTTTTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGQ	18279	1820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3174_4692_4730_5148_5308_5939_6291_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
721577	contig_16400_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_150894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTACAGCAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3464	4652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3500_4700
721581	contig_15092_pilon	+	1987	3	Intergenic	novelGene_57811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325136	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325327_348139_348330_350992
721584	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
721593	contig_9363_pilon	+	1427	10	Intergenic	novelGene_6832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	268.546062444269	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	83	781	1622549	1624935	TRUE	10	GGGGCCACGCGAGTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTWRTHITAIS	1622466	1625966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624667_1624905_1625066_1625347_1625435_1625537
721599	SIRV6	+	779	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-18	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10726
721603	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721604	contig_4105_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_21493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAAAGTTCATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99424	98179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_98200_99400
721605	contig_151_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_132576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTATTTCGTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239503	241271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_239500_241300
721608	contig_19352_pilon	-	1828	7	Intergenic	novelGene_122356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	725.875735462574	3	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAGGATGTATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122356	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103679_103745_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122061
721609	contig_8848_pilon	+	1958	3	Intergenic	novelGene_140452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATGTCTTCTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49795	58640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_49895_52692_52738_56826
721612	contig_5549_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_81663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACACATAAGCTCACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469287	468872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_468900_469300
721621	contig_12019_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_87702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTCAGAATCGACTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193084	192158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_192200_193100
721622	contig_9239_pilon	+	1188	4	Intergenic	novelGene_137166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	148.276768241016	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTCTTGTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100870	110680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_107581_107682_109271_109455_109924
721626	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	555	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721633	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721635	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
721636	contig_9886_pilon	-	3530	1	Intergenic	novelGene_147086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	592	1779	344	2122	237771	235993	NA	35	CACTACAAATAGAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRTVPPAVLSAGHVAPAGVVPPGQTASSGVLPSGQIVQSGVLPIGQTAPSGVLPTGLTVPSRLLPTGQTVPLKVLPAGHKAPSGALPAGQVVPSGLLPPTQGVSSGVLPVGQSMSPSVLQLSQPVVSGVLPVGQPVRPGVLQFGGQSVSTSLLPVSQPVRPGAAPNTTFLTSGSILRQLIPTGKEVNGIPTYTLAPVSVTLPVPPGGVAATAPPQMPLQLLQPGAASLPPPPMVVSTSQSMFVQASPSVSEASQALKQAKQWKTCPVCNELFPSNVYQVHVEVAHKHSEAKPVTIKRLKPEKLAACAPFLKWMKEKTVRCLSCKCLIPEDELIRHLLTHGLGCLFCPSTFHDLRGLSDHCKATHLEKKRLSVDYSNRGFQLDVDASGSLLFPHIDFITLLPKDELGEREVYLAVLAGIHSKALVPVYIKVRPQTEGATSSPGREVLTCPFCFGTFMTMDAYEMHLKERHHIMPTVHTVLKSPAFKCIHCCGVYTGNMTLAAIAIHLLRCRSAPKDSSSDLQLQPSFIDNSGLLLVNGEVIHESSFSVKRKLPDGHAGADDPRAGEEQPLVIDADPMPAPEKAASGMPFKRQKNESRTDGLLINDDALQILALNPRKYEDRSYEAQKQFLRDYFHKRPYPSKKEIELLSSLLWVWKIDVASFFGKRRYICMKAIKNHKPSVLLGFDMSELKNVKHKLNFEYEPQNL	238114	234584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_-_234600_238100
721639	contig_16098_pilon	+	1406	3	Intergenic	novelGene_45899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_2	15	504	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	187	594	258934	259512	FALSE	20	TGTCAAGGATTGGAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAEEAGEAEEAQEAEEAGEAEEAGEAEKVNDIKKSDPEGLEDVKGQKEQPTTQDPSKAEPEMQGEAEAAETTESTRGHAHSSWSKALLPGSRLDVSIPRSRALLSRSSSQRRSRPSFRRTPPSGPQEEPSSPAPEAELSAPQQRLLQSVEPPESSPPRPEGTPVPARRRPLGHGFGLAHSGMMQELQARLGQPKPQ	258747	260324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_259006_259088_259355_259442
721641	contig_15120_pilon	-	1786	5	Intergenic	novelGene_107988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	262.456186819819	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCGTGTGAAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116185	90908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_92296_99853_99957_107823_107943_115269_115334_116072
721647	contig_7870_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_109055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACACAAGCTTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660127	660643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_660100_660600
721652	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_95498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721656	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721657	contig_5467_pilon	+	1998	11	Intergenic	novelGene_111936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	387.103203293385	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	13	768	8246	13540	TRUE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEDMAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASAGVMAPREVLTGNDEVIGQVLSTLKSEDVPYTAALTGGPGCSHGVWGSRSAAARKSDRGRCDSPPCELQ	8233	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_12039_12081_12961_13031_13439_13680_14371_14420_14507_14575_14652_14740_14956
721662	contig_7992_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_115544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGCAGATGGTTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607516	606962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_607000_607500
721663	contig_253_pilon	-	1807	6	Intergenic	novelGene_129710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	58.5334092634284	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1089	1703	508925	507405	FALSE	5	CTCTCTGGTCTGTTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPGIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPDWIQLDQQITPLLLNYSQCKLVAEEYYEVLDHCSAILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALEPVVSRELRTLEARIRQKDEEDKARFRGIFTP	513624	507300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507611_507918_508061_508150_508328_508835_509025_509568_510450_513516
721666	contig_15092_pilon	+	1857	3	Intergenic	novelGene_57807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151	4	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	229	600	348159	351165	FALSE	30	TCTGTATGTTCTTAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325120	352422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325330_348139_348358_350992
721669	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721670	contig_6710_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_98042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721674	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
721675	contig_17500_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_157927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAACTCTCCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275082	275652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_275100_275700
721680	contig_10011_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_68060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAATATCAGGGTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229872	231552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_229900_231600
721691	contig_16504_pilon	+	2363	3	Intergenic	novelGene_167947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	2	48	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	151	483	694646	694978	TRUE	20	GATCTTGTTTTTCATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEERQQLRPLHPFPKELVERSPLPLPQLPNSPPGAGETALHLAAEITGWQTRPGIRLPSSLLKPRRFFRSRWANNLQSRNNFVYVSTTGRTASASPVGCAATRNAGNQG	694495	699945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_+_695362_697837_697942_698552
721692	contig_8606_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_159387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14370	16473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_14400_16500
721694	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_97143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721697	contig_18898_pilon	+	1632	5	Intergenic	novelGene_77643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	405	junction_4	276.938959881054	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	264	530	67463	70143	FALSE	25	TATCTTGAAACACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSQDQPHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGSRGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFNAPRDYSGYQRDGYQQNFKRGSGQSGPRGAPRGRGGPPRPNRGMPQMNTQQVN	66138	71245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_66244_67304_67500_67957_68059_68476_68541_70078
721698	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721705	contig_15893_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_128511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGCTGCCAACATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75962	74462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_74500_76000
721727	contig_7202_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_18826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCAGGTGCGCCAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
721730	contig_12635_pilon	-	537	4	Intergenic	novelGene_60822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1082	junction_3	26.1576417557513	170	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	60	536	201104	189587	FALSE	25	GTAATGGCCGCTTTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYIT	201163	189585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_189753_192587_192740_197104_197174_201014
721737	contig_753_pilon	-	2009	12	Intergenic	novelGene_112941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	109.748849275769	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	127	1767	841832	731406	FALSE	25	GTATTGTTACTGCCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQPLALQLEQLLNPRPREADPEADPEEATAARVIDRFDEGDDEEGDFLAVGSIRKLASASLLDTDKRYSGKTTSRKAWKEDHWEQALPGSSDEEIPDKEGSGDGDSEGLGLEESDEDHMSAAEEQESGDDGENGLARRKRSRHRSAKTPGFSVQSISDFEKFTEGMDDIGSSEEEEGEEEESGMEEGDGEIDFEGESEEDRAENRNSEDDGVVMTFSGVKLLEGRIKLQKALLTTNQLPQPDVFPIFKDKGGPEFASALKNSHKALKALLRSLVDLQEELLFQYPDTRYLVDGTKPKAESEEEISSEDDELVEEKQRRRAPPKRKLETDDYPSFMAKRFADFTVYRNRTLQKWHDKTKLASGKLGKGFGAFERSILTQIDHILMDKERLLRRTQTKRSVYRVLGRPEPTAEPVPESLPGQPEILPQAPANAHLKDLDEEIFDDDDFYHQLLRELIERKTSSLDPNDQVAMGRQWLAIQKLRSKIHKKVDRKASKGRKLRFHVLSKLLSFMAPIDHTTMNDDARTELYQSLFGKLNPPGDSHRN	841958	731163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_731470_754678_754751_764070_764152_766291_766360_800800_800885_802202_802368_802884_803084_804441_804557_837241_837366_837901_838288_840540_840733_841741
721738	contig_10058_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_67680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1241	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	474	1094	45626	46246	NA	20	TAGTGTGGAGTCTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGNLGKSEEL	45152	47252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_45200_47300
721743	contig_16525_pilon	-	826	3	Intergenic	novelGene_133852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3625	junction_2	351	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	416	766	178745	178157	FALSE	15	TCGAGGACTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLSCPGCDSKPRSCSLFLQLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	179160	178096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588
721745	SIRV1	-	206	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	5	3619	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721746	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721747	contig_3095_pilon	-	1284	5	Intergenic	novelGene_75234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1498.20198488054	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	36	650	255439	247957	TRUE	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVERAV	255474	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247677_247970_248481_248759_253535_253806_255384
721749	contig_19721_pilon	-	2324	2	Intergenic	novelGene_99157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	85	2097	148734	146722	FALSE	40	CAGCTCATTTAAAAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARESRFFLLADSHRSARPEKKRRRQEAGMEGRKLISATDTQYSGSLLNSLNEQRGHGLFCDVTVIVEDRKFRAHRNILSASSTYFHQLFAVAGQVVELSFIRAEIFAEILNYIYSSKIVRVRSDLLDELIKSGQLLGVKFIAELGVPLSQVKSISGSTQDGNAETLPPGSNDKSLEIQKSKDEAQDNGTTIMPIITESFSLSAEDYETKKIIVTDSDDDDDDDVIFCSEILPAKETLPNNNAQVHANPGSVAISDVAPCASNNSSPLTNTTPTQKLPTSMSQVTLSQTQGSEKVLVSSAPTHLTPNIILLNQTPLTTPPNVSSSLPNHMAPSINILVQNQQPPNSAVLTGNEANEEEEEEIIDDDDDTISSSPDSAVSNTSLVPQADVPQNTTFDGSLIQKMPIPTLLQEPLSNSLKISDIITRNTNDPGVGSKHLTEGQKIITLDTATEIEGLSTGCKVYANIGEDTYDIVIPVKDDPDEGEARLENDVPKTSGSEMTNKRMKVKHDDHYELIVDGRVYYICIVCKRSYVCLTSLRRHFNIHSWEKKYPCRYCEKVFPLAEYRTKHEIHHTGERRYQCLACGKSFINYQFMSSHIKSVHSQDPSGDSKLYRLHPCRSLQIRQYSYLSDRSSTMPVMKDDGIGYKVDAGKEPPVGTTSTQNKPMTWDDIFNQQENDSIFKQNVTDGSTEFEFIIPESY	152024	146494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_148737_151942
721752	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721760	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
721761	contig_7629_pilon	-	1426	2	Intergenic	novelGene_153604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1200	227	1426	449167	447968	FALSE	25	GAGCCGTTCACAGGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVSLVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQGTPTHQKMTDFEQLNQFDSLKFHQVNQSFGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQNQSNGLFPDVADGSPMWGHHTATSISNLNGSPFHQQGHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRLQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFMDVSVSGPHRVSVNHPPQITNASTSQQSLSMQQFSQTSNPSIHFLKCSNHQEGNFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSHYSFSSNHLSSNSLLQSSAVLASNHTNQTLSDFTGNNSFSPQRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQMLHSSHPQGNYSSSKLSPVHMNFPDPVDSGTQMGHFNDRVETNGFSSLEENLLHQVESQT	540133	447967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_449330_540069
721767	contig_2917_pilon	-	1316	6	Intergenic	novelGene_147586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	228.906443771249	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	397	1008	109433	93080	FALSE	30	AACTGGAATATTTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASRNHPALPQRWRPWRRRRRRWTRRTRARGVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124076	92771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_123985
721768	contig_5217_pilon	-	2270	14	Intergenic	novelGene_135739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_13	98.6520392697029	325	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	993	1991	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533746	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531863_532688_532777_532869_533000_533128_533246_533343_533452_533618
721770	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
721774	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721779	contig_6724_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_167956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155105	153036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_153000_155100
721782	SIRV6	+	602	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	367	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2024_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
721785	contig_5084_pilon	+	1451	6	Intergenic	novelGene_64507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACTGAAATTAGACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349232	353673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_350027_350978_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383
721795	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_93585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721797	contig_4659_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_118255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	173	532	876466	876107	NA	40	GCCCAGCAATTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQSAFIKIYSLGNTTGQFCSVLQDRYKLELTCWQWVWFWFGLIFTEAHCHIFLPWSCHGFEPLTDLSVSSRVLNHWATKAPIASHPRTCEVVSHCGFDLHKDVKHLFMRLMDICVSLE	876638	874444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_874400_876600
721799	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721801	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_96514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721802	contig_8631_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_121995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTCAGTTTATCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162350	1164389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_1162400_1164400
721803	SIRV6	+	564	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
721806	SIRV6	+	480	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	374	2	195	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
721811	contig_5415_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_146132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143301	140533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_140500_143300
721819	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
721820	contig_7457_pilon	+	2666	7	Intergenic	novelGene_31586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.804056380534	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	608	1066	940402	945817	TRUE	10	ATGTTTTGACCCTTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVARYEIKPIQY	928291	954175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928808_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_947399_954156
721821	contig_10477_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_112503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATCTTGGTGAGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463100	463745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_463100_463700
721826	contig_14273_pilon	-	2128	6	Intergenic	novelGene_21163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	57.5590131951548	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTTTTAAATAATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282614	275507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_275826_276208_276301_276672_276820_279440_279501_280222_281640_282520
721827	contig_5954_pilon	+	2726	32	Intergenic	novelGene_28496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	136.471873734112	3	79	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	931	2415	411743	420257	FALSE	30	ACACGCTGTCCTAGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRPALEVQGPSLPEPPAEDSLSSPPGTPPLPPPGPDSPPLLPTTWATMKHQADLERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGSTFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSLAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHILPLEAGLRPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTVLVSFQRCVRIVNLQGEPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLGTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIVLESIPTDNPGAHSNLYILTGHQSSY	408282	420568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_408384_408506_408565_408783_408875_408957_409023_409302_409359_409667_409716_409807_409851_410239_410313_410389_410522_410598_410662_411009_411092_411179_411289_411733_411813_411904_411964_412495_412540_412619_412659_412745_412780_412933_412986_413066_413156_413233_413276_413351_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_418055_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
721829	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_94862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721830	contig_3380_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_60113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAACAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434488	436761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_434500_436800
721832	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_98009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	25	CTCTTCTTTAACTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721836	SIRV7	+	766	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAAATTGGGCGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	147808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683_114961_147608
721837	contig_13863_pilon	+	1103	5	Intergenic	novelGene_42044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	929.840174438597	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114057	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_114121_114261_114325_115313_115396_118886_118965_119571
721839	contig_6102_pilon	+	2097	13	Intergenic	novelGene_31923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	471.370246963279	1	129	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	539	1351	380930	394507	FALSE	25	TACTCAAACCAGCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERSWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVRGLEYDLVDDKDKGSS	379421	395253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379487_379617_379771_379955_380047_380307_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393860_393936_394050_394467
721841	scaffold_12124_pilon	+	2128	4	Intergenic	novelGene_21999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	162.874866760413	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	145	510	800040	803975	FALSE	50	AAATCAAAAGATGCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSE	791843	805593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841
721842	contig_7275_pilon	-	2717	14	Intergenic	novelGene_111235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	57.8240546985002	52	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	843	1514	206128	190375	FALSE	55	AATGAAAAGTAGCAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQLRRENSLLLWNVFDLNTPVHTFVGHDDVVLEFQWRKQKEGSKDYQLVTWSRDQTLRMWRVDFQMQRLCANDILDGVDEFIESISLLPEPEKTLHTQDTDHQHNSSHGEEEASKEDPPSNLLEERKSDQLGLPQTLQQEFSLINVQIRNVNVEMDAADRSCTVSVHCSNHRVKMLVKFPAQYPNNAAPSFQFINPTTITSTMKAKLLKVRLCVHKFSVML	269437	189171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_190579_193242_193368_202185_202319_203309_203390_205998_206156_207654_207733_213939_214057_216127_216217_219431_219470_221123_221205_233034_233123_236677_236814_251104_251155_269299
721843	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_93902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	657493	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657493	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721847	SIRV7	-	275	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91651	0	-91645	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTGAATTAGCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
721851	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
721857	SIRV7	-	328	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	7	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114731	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78844_78964_114686
721867	scaffold_13505_pilon	-	1036	5	Intergenic	novelGene_111449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	273.662543107383	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	354	629	532469	531050	FALSE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSACDSLPPADHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535574	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_533003_535542
721868	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
721873	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
721876	SIRV6	-	390	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-154	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTTTTGCAATGGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
721880	contig_16098_pilon	-	1402	3	Intergenic	novelGene_46068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	1.5	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	718	1068	446699	445488	FALSE	10	TTTCGGGTCTGTGTCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	447416	445153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668
721886	contig_12427_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_40426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	95	418	224291	223968	NA	65	AGAGATGAACAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGTPLPGPRPLPEGVQLSHSLDWGVHCTVSPASLSCHCFSASTSCHLQGYSLLSVSWVQELLSQGIPSPKDALSAPGCSSLVVVGSSLSRLWSGLFQAQQDGKTD	224385	222261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_222300_224400
721888	contig_818_pilon	+	2196	2	Intergenic	novelGene_167992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTTCTGCTCTTGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670083	672696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_+_671391_671807
721894	contig_6710_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_96226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTGCTGTACTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
721900	contig_12179_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_127990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCGGAGGACCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485555	485115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_485100_485600
721902	contig_11978_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_63025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGCTTGCCTTCCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1594278	1591849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1591800_1594300
721903	contig_2504_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_166844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGTCATGTATGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384295	382931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_382900_384300
721920	contig_6710_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_89168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653697	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721925	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721931	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
721932	contig_3774_pilon	-	1106	8	Intergenic	novelGene_142037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	158.872686803758	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	170	913	210407	144743	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210576	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_200894_200987_210294
721933	contig_12970_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_50552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574817	576865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_574800_576900
721934	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
721936	contig_18096_pilon	+	2172	13	Intergenic	novelGene_58043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	672.135940284569	1	78	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	342	1754	53772	78714	FALSE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIAIQQIFIQQIFVVLLLQVRLCDHSFSSLHQSVSKRGNLNYEASENLGAF	40332	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53731_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75494_78568
721938	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721942	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_93461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721946	contig_5018_pilon	-	1413	8	Intergenic	novelGene_47032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_3	159.966705719583	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	706	1302	1394992	1392342	FALSE	80	ATCAAAAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAVGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397340	1392230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394422_1394550_1394630_1394887_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
721947	contig_9696_pilon	-	1071	4	Intergenic	novelGene_68764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	362.340846288255	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	53	376	150836	138024	TRUE	10	TGACTTCTGTCTGTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDTQLPAGVLCGLVQDTMNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETATMVLEYKAHVNNSLFLIVMPS	150888	135730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_137980_138092_146412_146595_150762
721950	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_94871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653775	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
721951	contig_5341_pilon	-	1468	3	Intergenic	novelGene_168022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	705	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	241	798	340653	338480	FALSE	25	CAAAATCTCAGTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEVGSLDVGSLRALLRERAAHCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339325_340500
721953	contig_6710_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_89151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653686	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
721967	contig_15105_pilon	+	1613	14	Intergenic	novelGene_150937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_9	170.622008611097	619	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	61	1422	312508	338459	FALSE	5	GTGCTTTTCTCATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLTRAGILSRFYSLKVAPKVTATAAPTGAPPQPQDLEFTKLPNGLVIASLENYAPTSRIGLFIRAGSRYEDSNNLGTSHLLRLASSLTTKGASSFRITRGIEAVGGKLSVTTTRENMVYTVECLRDDVDILMEFLLNVATSPEFRHWEVAALQSQLRIDKAVAFQNPQARVIENLHAAAYRNALANSLYCPDYRVGKVTPEELHYYVQNHFTSARMALVGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKALYRGGEIREQTGDSLVHAALVTESAAVGSAEANAFSVLQHLLGAGPHVKRGSNATNSLYQAVAKGVHQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQAEAAGDVLKAAYNQVKTIAEGNLSDTVIQAAKNKLKAGYLMSVESSDGFLDEVGFQALVAGLYVPPSTVLQQIDSVAAADVKNAAVKFVSGKKSMVASGNLGHTPFVDEL	312447	338650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_312541_315576_315661_315757_315908_316439_316505_317948_318006_318254_318380_321025_321124_323169_323228_324221_324318_325249_325450_327725_327807_333914_333992_336811_336966_338375
721969	SIRV7	-	349	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-11	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114749	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
721970	scaffold_19766_pilon	-	1331	4	Intergenic	novelGene_34365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	144.569091517593	26	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	8	1039	678336	676963	FALSE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGRSDEERGPGREGKDSGTRDGREGLMDPSCPSGASLSVADLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHWSVPRLLPPHTSPWTQRRAQPAGQTSRASLHIPYTTVNTNYFCPAALEMAHHHQQLSRWPPLPIPTTSQTQALAPWAPLPASAHSSFISVENVLYAQAGGSPPHSGPGSPNLIPFPDPLEPKPRRNA	678343	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677548_678138_678275
721971	contig_10976_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_155582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAACTAGAGCTAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95695	96398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_95700_96400
721972	contig_10976_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_155583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTGATAAAAGTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96448	98159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_96400_98200
721973	contig_12965_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_65203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGATTTACTGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324982	324739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_324700_325000
721974	contig_5954_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_28399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCCATTGCAACGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7007	8790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_7000_8800
721977	contig_10569_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_44089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1599	1901	377753	377451	NA	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWSPSIHYLYGHYGYLFIPHPCLKRVCSLKCLDEFCIKSQKVAVFNDSNIVNDSIYYTHYNSFFMRLSPPDCELLDSRDRILVTGMSQGQALCLQSFTE	379351	377362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_377400_379400
721980	contig_6048_pilon	+	1937	9	Intergenic	novelGene_73339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	23.1826982898885	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	49	1014	2884821	2900166	FALSE	5	GTTGTGCTTCTTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEGARNGARNRGGVQRVEGKLRASVEKGDYYEAHQMYRTLFFRYMSQGKHTEARELMYSGALLFFSHGQQNSAADLSMLVLESLEKAEVDVTDELLGNLAKLFSLMDPNSPERVAFVSRALKWSGGGSGKLGHPRLHQLLALTLWKEQNYCESRYHFLHSADGEGCANMLVEYSTSRGFRSEVDMFVAQAVLQFLCLKNKSSASVVFTTYTQKHPSIENGPPFVQPLLNFIWFLLLAVDGGKLTVFTVLCEQYQPSLRRDPMYNEYLDRIGQLFFGVPPKQTSSYGGLLGNLLSSLMGSSEQEEGEESQEDSSPIELD	2884772	2901089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2884958_2889643_2889723_2890059_2890142_2891037_2891188_2894610_2894750_2896952_2897094_2897169_2897246_2897452_2897526_2900077
721981	contig_5018_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_47152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	546.847839896986	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	120	638	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDDFSKHN	1497691	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498136_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499576_1500251
721982	contig_5549_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_81601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGTAGTAATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102994	100865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_100900_103000
721983	contig_14300_pilon	-	1832	6	Intergenic	novelGene_133096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	75.3779808697474	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	27	689	180320	149488	TRUE	55	AATAAAACTATATGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQVPRAGGRGLALLLSRVLPAQTSGAAYTSSE	180346	147865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214
721984	contig_9177_pilon	-	2400	2	Intergenic	novelGene_32641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1092	1403	53444	52625	FALSE	25	AAGACCATTTCTGCATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVLGPGAAYEARVGLVGSTLMGRSQLKVSTGTCSGPVQVAGSGCSMGGRSTKPGSRDVTNSKCNRHFRDTIAVQKPGVELRGMGREKLVLVVCKQDSWCRA	54535	51627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_52722_53229
721986	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
721990	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	108	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
721992	contig_13547_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_104874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACAATCATTAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85402	82892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_82900_85400
721995	contig_6217_pilon	-	1892	2	Intergenic	novelGene_109660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	219	1082	739958	739095	FALSE	30	CTCTTTAACTATTAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	781163	738284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739964_780950
722000	contig_7045_pilon	-	2099	3	Intergenic	novelGene_77422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	82	junction_2	38	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	113	343	174203	170848	FALSE	15	ACCTGGGCCTGTCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANIIISGTRAFEEDKWDEISVGSLRFQVSGPCHRCQMICIDQQTGQRNQEVFQKLSESRKRKVTFGVYLMHTSLDLSSPCFLSVGSLVLPVLKENVECHHLSAADKHQDIIS	179317	169091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_171001_174125_174231_179232
722001	contig_6710_pilon	-	454	2	Intergenic	novelGene_98172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722003	contig_11293_pilon	+	2500	2	Intergenic	novelGene_134672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	62	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACTGGATTAAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65188	69510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_65296_67117
722006	contig_5649_pilon	-	2558	3	Intergenic	novelGene_82308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCAAGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185188	181644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_183210_183312_183485_184367
722008	contig_14924_pilon	+	1801	8	Intergenic	novelGene_104149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	43.4802324308978	274	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	106	1329	44129	54484	FALSE	10	GTACTGTCCTCTCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLGGSRVRGMVSISLVLCLWIEPFVLLPSHPLSCVLDYCSSSPSPKAAAHFLVTMGVRERVPSGWLILGPALSQVGKVKSVRIFAGSRILLGSLEAWGLGPLSSGTSGGGLKSSAVDQPLEERCWTCCCRHWPLGTRRRQGRGRTLLWVLLRARNFTWYLMVSSGIRLEAQRLFCLTTPFYRHHFNVRGRITSGCLGVLPCHLLWTTGPSVPS	44023	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47128_53847
722013	SIRV7	-	246	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91680	0	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
722014	SIRV7	-	352	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-26	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114764	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78841_78964_114687
722026	contig_14640_pilon	-	889	3	Intergenic	novelGene_168040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	9.5	130	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	384	503	147738	147619	FALSE	20	TTTTTAGACCTTCAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISECQRQQLESVSYSSRYALGLFYEAGSKIDVPWAGQYITSNPCIRFISIDNKKRNIESPDVGPCLVIHTTVPFGVTYLEHSTEDVKELIFRQLENILPDLPQPVGTKCQRWRYSQVTNAAANCPGQMTLHVKPFLVCGGDGFTRSNFDGCVTSARCVLEAFKNHI	212547	147232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_147772_171074_171251_212373
722030	contig_7718_pilon	+	1409	9	Intergenic	novelGene_129404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	74.1492371842084	1911	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	115	816	257538	284723	FALSE	25	GTAGTATTTGGAGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252814	285316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_252859_254873_254936_257529_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
722043	contig_15384_pilon	-	2434	22	Intergenic	novelGene_85151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	64.8450796417238	1	90	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1035	1712	124750	119936	TRUE	50	AATAAATGAGGACACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLDTWVSRGLEMASDYPVWSLLGLQ	127975	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119340_119431_119548_119740_119849_120007_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125757_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127721_127857_127931
722050	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
722051	contig_7318_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_152229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGGAGCATTAGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309694	310365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_309700_310400
722056	contig_10766_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_151241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTCCTGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590890	589531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_589500_590900
722059	SIRV6	+	246	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8472	-2	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
722060	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
722062	scaffold_6394_pilon	-	1105	7	Intergenic	novelGene_111005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGAGCGGCTGCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406279	398209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_398312_402117_402258_403219_403372_405024_405198_405299_405498_405714_405868_406092
722064	contig_4857_pilon	+	1870	6	Intergenic	novelGene_48822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_5	86.7303868318365	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAGTTAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331355	1409420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1336704_1336828_1405453_1405556_1407013_1407076_1407599_1407777_1408210
722065	contig_4857_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_48884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCCCCCAGGCATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409372	1409858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1409400_1409900
722067	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
722068	contig_6544_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_142094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAAAAATTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98472	96775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_96800_98500
722069	contig_5871_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_160186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCTCCCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427396	429856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_+_427400_429900
722070	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
722071	contig_11572_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_100035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGGAAAAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138849	138545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_138500_138800
722078	contig_4336_pilon	-	2389	1	Intergenic	novelGene_152377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTTATCTAATAACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618203	615814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_615800_618200
722083	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	392	-2	-222	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGGTATAGTGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
722088	contig_6710_pilon	-	487	2	Intergenic	novelGene_98137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	15	GCTACCCACCCATCTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722090	contig_6552_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_163586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTATTTTTGGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68384	67764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_67800_68400
722091	contig_6552_pilon	-	1218	4	Intergenic	novelGene_163584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	425	junction_3	89.1303664427687	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	194	439	56455	52827	FALSE	70	GGAGGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRDSRHLGSYTISVFVRARRSTEATIKHYQIKKNDSGQCYVAERHLFQSIPELIWYHQHNAAGLMTRLRYPVGLMGSCLPTTAGFSYEKWEIDPSELAFIKEIGSGQFGVVHLGQWRAHIQVAIKAINEGSMSEEDFIEEAKVMM	66656	52047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_53003_56385_56461_64968_65097_66596
722092	contig_16846_pilon	-	1134	3	Intergenic	novelGene_82987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4534.5	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	10	522	555239	551492	FALSE	35	ATAGAAGGCTGAGCACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGEQAGYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555248	550879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552804_555041
722105	contig_11171_pilon	+	1322	6	Intergenic	novelGene_48595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1142	junction_1	80.9775277469003	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	94	837	212165	251467	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212071	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
722106	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	382	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
722111	contig_14643_pilon	-	1731	1	Intergenic	novelGene_99129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65322	63591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_63600_65300
722113	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_94141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722115	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91671	11	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
722119	contig_7513_pilon	+	2376	3	Intergenic	novelGene_89026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	119.5	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	623	922	690156	690539	TRUE	30	CAGTGCAGATGTAATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSFLGFQLIPEQEQLWAACAAYSKVYIWSLQDLAQAPQRIPLQDCTEVSCMIRVKRQVRCKVTSLLSGRPAFGPQFPSLLSGRGQSTALGGLASACD	689533	692323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_690195_690278_690819_691148
722124	contig_10312_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_159016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAGACTCTGTACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24100	22115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_22100_24100
722134	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
722135	contig_12019_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_87761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACGTGCATGCCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654323	652629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_652600_654300
722137	contig_18610_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_168056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	860	1180	13043	13363	NA	30	TGATCATAAAGCTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCQHRAHPDTTAVELAFCIGTEPILIDRVLVLVILTIQKCTAGPGCEAAVGGLSWKRDCCSTWCTHPCRVGPSRFPVLVGTYKRLLVLEVYPAPLCPTLNWEVPH	12183	14323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_12200_14300
722138	contig_5549_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_81681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGACTGTATCTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580430	579415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_579400_580400
722139	contig_10016_pilon	-	2859	4	Intergenic	novelGene_117861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_1	86.5075462347393	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	209	517	351195	349871	FALSE	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAGYEGISEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVSIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNPDGTTLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKFYLTLPGTKVEMEEKELQASKNLASFTPAKDSTKDSFQIATLICSTKLTQNGRCGDHIGTRMCFLLGLPGHLC	355852	347528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_350123_351138_351243_353982_354056_355764
722140	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
722143	contig_2215_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_163849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATGATGAACAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155525	153376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_153400_155500
722153	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
722155	contig_1596_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_131611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCTAGATATGTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155840	154766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_154800_155800
722156	contig_8045_pilon	+	2314	3	Intergenic	novelGene_35432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387097	393395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_388199_390871_390985_392295
722161	contig_10642_pilon	-	1281	2	Intergenic	novelGene_78728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCTTGGAAACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274582	1104527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1104596_1273369
722163	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146660	1	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
722166	contig_11978_pilon	+	1294	11	Intergenic	novelGene_62803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	72.3580679675736	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	70	417	299759	545635	TRUE	10	TTGCCATGTCTGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIF	299689	589572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539076_545628_545686_547581_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587387_589201
722167	contig_15031_pilon	-	2037	7	Intergenic	novelGene_138398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_3	196.631352761682	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	105	1208	129549	72478	FALSE	55	CTGAAAAAAAAAACTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQVTVLH	161631	71648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_161576
722168	contig_6364_pilon	+	1752	11	Intergenic	novelGene_51747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	45.1429950269142	126	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	54	1082	573392	625644	TRUE	40	ACAAAAACACTGAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNTGRLAGCTLFITGASRGIGKAIALKAAKDGANIVIAAKTAQVHPKLPGTIYTAAEEIEAAGGKALPCVVDVRDEQQIRDAVEKAVEKFGGIDILVNNASAITLSSTLDTPTKKVDLMMNVNTRGTYLTSKACIPHLKKSKIAHILNLSPPLNLNPLWFKQHCAYTIAKYGMSMCVLGMAEEFKGEIAVNALWPKTAIHTAAMDMLGGTGIESQCRKVDIIADAAYSIFKRQKNFTGNFIIDENILREEGIKNFDVYAVKPGHPLIPDFFIDELPDAVNKKMETPDAAPAFKEGKQVPQPKAGSRPVEETFRIVKETLSEDVVKATQAVYQFDLSGQMW	573338	634312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_573409_581820_581985_583015_583115_585191_585307_591170_591275_592689_592789_603139_603335_605141_605214_621697_621848_625630_625684_633681
722169	contig_233_pilon	-	1804	5	Intergenic	novelGene_14477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.590864938839	524	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	158	502	20479	13017	FALSE	15	TCTCTTGGCTTCTGTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSSAASLGLGRRKDKEGVKTENDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGTRAARRLSGCGV	22439	11714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_13110_14678_14751_18722_18852_20428_20538_22340
722176	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
722185	contig_3163_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_168073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	177	578	784969	785370	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIHENTSGSLKDHLSFSNEHLYEKPEIFNSDSNLDLLPTKCSNYTFLISSKRKKKRNKCNKFKQLCETMQREETIFCLSVSLSICHEDCSSTFRFQLLAISSIIYKTMNLHIEKRWKFVSEDLFLHKFLIKS	784792	787689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_+_784800_787700
722186	contig_4782_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_73663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTAAGTCACTGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545579	545144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_545100_545600
722189	contig_12270_pilon	-	262	2	Intergenic	novelGene_114128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGGTTCAGTGGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
722191	contig_6710_pilon	+	569	2	Intergenic	novelGene_96442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
722200	contig_14986_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_59738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155205	153278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_153300_155200
722201	contig_10734_pilon	-	1693	4	Intergenic	novelGene_51025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	2	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	86	691	320632	311551	FALSE	15	CTCTCGATCTCTGATGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320717	310548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
722202	contig_13365_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_168078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAATTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16100	15530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_-_15500_16100
722203	contig_1225_pilon	+	1838	4	Intergenic	novelGene_44185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300.756084264678	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	149	415	253442	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDPFRLHSLKKKNRGVFAGGQEDSPSQFRAGRIPGQAGDCEGFYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251378	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251508_253422_253520_274222_274620_275582
722204	contig_13015_pilon	+	1312	11	Intergenic	novelGene_165559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_10	31.5620024713262	708	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	110	1117	396085	427161	FALSE	50	AATAATTGTGTAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGLRGTVLCRSAASRCRGPAHRAARARLLLSGGGSMAAGALEAAAVAVVEVGSARQFEELLPLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMTELAKEHPQVSFVKLEAEAVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQSIDRLDGAHAPELTKKVQRHASGSAFPPSTKEHPKEDLNLRLKKLTNAAPCMLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAPKLEERLKALTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTDVEYETFDILEDEEVRQGLKAYSSWPTYPQLYVKGELVGGLDIVKELKENGELLPILRGEN	395975	427356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411107_411310_416546_416720_416945_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
722206	contig_6691_pilon	-	1393	4	Intergenic	novelGene_60154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	15.5777619273972	243	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	7	1005	350807	342821	FALSE	25	TATTGCATTGTAGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAMASGLVRLLLSGPRCLLASPAPKLAPPVRGMKKGFRAAFRFQKELERWRLLRCPPPPVRRSEKPNWDYHAEIQAFGHRLQETFSLDLLKTAFVNSCYIKSEEAKRQKLGIEKEAVLLNLKDNQELSEQGTSFSQTCLTQFLEDAYPDLPTEGIRSLVDFLTGEEVTCHVARNLAVEQLTLSAEFPVPPAVLKQTFFAVIGALLQSSGPQRTALFIRDFLITQMTGKELFEIWKIINPMGLLVEELNKRNISAPESRLTRQSGSTTALPLYFVGLYCDKKLIAEGPGETVLVAEEEAARVALRKLYGFTENRRPWDYSRPKKNSRAEKNITAS	350813	342432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_342993_344361_344541_348377_348847_350628
722209	contig_9727_pilon	+	727	7	Intergenic	novelGene_86316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	277.148826846195	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	29	682	309192	314613	FALSE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSRCELSGVQEGALQRLPDTTPPLIFRSQKRVEDESCGTLGGYPVSVLG	308437	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078_314150_314471
722214	contig_2219_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_67163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTCAGTGGGATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66037	67194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_66000_67200
722222	contig_5337_pilon	-	1968	4	Intergenic	novelGene_136562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.24264068711928	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	220	1563	322179	320836	TRUE	20	GGTTGGAGAGGAATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	330293	319786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_320044_320599_320647_320734_322308_330202
722223	contig_17993_pilon	-	2613	2	Intergenic	novelGene_61942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105417	102321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_104198_104680
722224	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
722225	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
722228	contig_16907_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_87439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAGAAAGCCCACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395889	394116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_394100_395900
722231	contig_8617_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_73422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63020	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
722235	contig_5413_pilon	+	2631	5	Intergenic	novelGene_168089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	39.0344399216897	100	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	49	561	333864	451713	FALSE	80	AGAGAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAPAAPAARTRTAPSMRVAALISGGKDSCYNMMQCLAAGHQIVALANLRPAENQVGSDELDSYMYQTVGHHAIDLYAEAMGLPLYRRTIQGRSMNTERVYTRCEGDEVEDLYELLKLVKEKEEVEGISVGAILSDYQRVRVENVCKRLNLQPLAYLWQRNQEDLLREMISSNIQAVIIKVAAFGM	333815	453783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_+_333887_347734_347830_350898_351093_444056_444131_451586
722249	contig_11447_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_168107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCCATAGAAAAATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550240	550439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_550200_550400
722257	contig_13305_pilon	+	2348	18	Intergenic	novelGene_146778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	49.0859002722404	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	440	2275	172872	184637	FALSE	10	AGCTGTCACCCTCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSESRSGSNPNRVRIFGPDKLVRAAAEKRWDRVKIVCSQPYSKDSPYGLSFVRFHSPPDKDEAEASSQKVTKLGQFRVKEEDEGGSSLRPGALFFSRVNKTSPATASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSPLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKLSAQSSPPVLKRPKSTASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSSLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKPSAQLSPPVLKRPKLPTPAHTPAMAPVPAPACGTEPGKPQREGTKPKGPRTSPQELGKILQGVVVVLSGFQNPFRSELRDKALELGAKYRPDWTPDSTHLICAFANTPKYSQVLGLGGRIVRKEWVLDCHRMRRRLPSRRYLMAGPGSSSEDEGDSHSGSSGDEAPRLPHKPPQTTTKPPQAAGPSSPKRSPAPEETKPATPGAQEDSDAEGEPSEGQDNGAEDSGDTEDELRRVAKQRQQRQPPGQENEEDPYAGSTDENTDTEERPGSPTLPVPELPDFFQGKHFFLYGEFHGDERRKLIRYVTAFNGELEDYMSDRVQFVITAQEWDPSFEEALMDNPSLAFVRPRWIYSCNEKQKLLPHQLYGVVPQA	139044	184710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_139349_154914_155026_172847_173007_173987_174063_174163_174270_174485_174596_174671_174784_175278_175389_175464_175577_175968_176228_176565_176683_180626_180721_180885_181019_181600_181656_181737_181875_183844_183936_184340_184417_184523
722258	contig_8616_pilon	+	1685	7	Intergenic	novelGene_72380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_6	44.3533789267765	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGTTTGTACCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195790	199026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_197657_197845_198124_198540_198588_198825_198858_198952
722259	contig_2834_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_28014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGTAATCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290881	291984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_290900_292000
722262	contig_7171_pilon	+	1478	8	Intergenic	novelGene_101238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	380.772147840974	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	363	1121	734335	764486	TRUE	5	TTTCAGCTGTGTGCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLCGPRWCRALLALLGSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	733972	764976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319_764636_764768
722263	contig_16411_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_77386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATTTCTACTCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371414	369893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_369900_371400
722264	contig_14481_pilon	+	1893	6	Intergenic	novelGene_153852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_3	29.0199931082004	131	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1290	603	1892	204419	205708	FALSE	70	TGAAAAATAATAAAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQKQLFCDEKRTTLQKDNDVKNEIVDTIRLIPKPSISESSCHYELRNVKIDLPKINIPNGVLLKHEVDKYRKLFQSKPQTARKSISIKTVSCVEECMLLHKSEITEEEGIKMSAKILNFNCSKCRDNTRYSPNDLQKHFQMWHRGELPSYPCEMCSFSANDFQVFKQHRRTHKSTLVKCVICNNENVYTLLDLTKHFTSTHCINGNFQCERCKFSTQDVGTFVQHIHRHNEIHYKCGKCHHVCFSKGELQKHLNVHSGTFPFTCQYCSYGATRREYLIRHVITLHKEHLYAKEKLEKDKYEKRMGKTSAGLKLILKRYKIGASRKTFWKRKKISNGSDRSIEKNTQVIKKTNKTQTKSKDQSCLVQEHLNEKKDERVHCEKSDKPTELQSEKSTLLSTGQCNRAEEGLNSTSGSLKTSSVQGPTVLM	184474	205709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_184537_187153_187240_192612_192742_197918_198064_203458_203508_204287
722273	contig_1275_pilon	+	2089	6	Intergenic	novelGene_108805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	35.5325203159022	20	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	76	684	548427	632186	FALSE	50	ACGGAAAAATACTCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVFLCSAAAVLVWGFLWAWDALERMKSWEQTGQLRAGSRTLLVIAHPDDEAMFFAPTVLSLARLRHRVSLLCFSTGNYYNQGEIRKKELLQSCDVLGIPYSSVMIIDNRAFPDDPGVQWDTEHVASDLLQHIEANGINLVVTFDARGVSGHINHITLHAAVRTLHSEGRLPKGCSVLMLETVNVVRKYISFLDLPFSWLQTQNVLFVLSSKEVAQAKVRIVNSWTP	548351	633591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_548581_566667_566768_622417_622509_625821_625890_630866_630899_632022
722276	SIRV2	-	199	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1	1079	1	-1079	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATACCAAATGGTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
722281	contig_20493_pilon	-	2101	3	Intergenic	novelGene_86421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	51.5	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCCTTCTGTCTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47513	42728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_43181_43377_43445_45931
722282	contig_5018_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_47030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1638	1964	1392668	1392342	NA	75	AACCAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERVRGLAEVDPTGWWGLSHHPRHVPVFLQLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1394305	1392224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392200_1394300
722287	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722290	contig_14959_pilon	-	955	2	Intergenic	novelGene_166731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	175	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTGTGCTAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121229	117975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_118671_120969
722292	contig_11720_pilon	+	1243	9	Intergenic	novelGene_43986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	399.193072804376	9	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	75	953	262851	272176	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTWKLQKEAGHSPCLMGPLAGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLRPAQRAAEPAASLCCAAHPHVHQHACLHARVCQWLAEQGHHFLHHGANLCHQSLLRGQLPAQSPPPCLLWSCSPAGRSLPGTYHLPGLDLLHCPRSHLPGSQLPPTLPVWAP	262306	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262828_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265303_270668_270700_271268_271343_271806_271961_272096
722295	contig_10722_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_70985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACCACCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21722	20432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_20400_21700
722296	contig_18420_pilon	-	2136	13	Intergenic	novelGene_109366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	353.350029086677	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	978	1715	118470	109372	FALSE	10	CAGTGGCCTTGTGACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFHRRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142741	108950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_118456_118531_119704_119902_124360_124430_127611_128016_128822_128902_129147_129286_142711
722301	contig_10575_pilon	-	1605	3	Intergenic	novelGene_141813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAGAAAAATAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337168	304857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_306116_331466_331787_337141
722307	contig_3529_pilon	-	2981	1	Intergenic	novelGene_105371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTGTGTCTGGCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620374	617393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_617400_620400
722315	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCATGGTGAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30062	29806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
722321	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
722322	contig_14287_pilon	+	2245	3	Intergenic	novelGene_24040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCCTGAATTTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20430	27861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_20528_21046_21515_26181
722327	contig_1443_pilon	+	805	2	Intergenic	novelGene_28193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1860	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	194	499	344287	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343668	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343767_344191
722346	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722349	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
722353	contig_8354_pilon	-	1438	7	Intergenic	novelGene_24128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	565.750141159702	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	77	880	513617	500999	TRUE	10	CTGTGACTTGGGGGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	513693	499976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500406_500869_501091_501670_501822_502359_502471_503634_503824_505824_505966_513497
722354	contig_13138_pilon	-	1899	2	Intergenic	novelGene_143159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	540	junction_1	0	720	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	462	938	201199	200723	FALSE	35	CATCCAAGCAATATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSCGDTSVGFSVGIFLFLLLLFFGIGCVWHWKHPNTTRFTLPKFLRRKESKRNDYAKTPSFSPQVIGLKHKISVQTQGHRSAMGKTNIHGNYENVEARPPKAREETDKEIYENTRQSNFEEHIYGNETLSDDCYFLKPSTSAAPQEEDIYILPDSY	204500	199761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_-_201601_204440
722366	contig_11337_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_107197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATTTTCAAAATAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229330	228773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_228800_229300
722371	contig_10861_pilon	-	1641	5	Intergenic	novelGene_39347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_3	496.628130496048	614	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	283	789	1506947	1497139	FALSE	5	TGCTTGTGTTTTCTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIVGTQQIFVAFSSPLPTPYQFVESDADEELLFNIPFTGNVKLKGIIIMGDDDESHPSEMRLYKNIPQMSFDDTDREPDQTFSLNRDLTGELEYATKISRFSNVYHLSIHISKNFGADTTKVFYIGLRGEWTELRRHEVTICNYEASANPADHKVHQVTPQTHFIS	1507229	1496286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1497241_1497820_1497930_1498794_1498900_1506405_1506484_1506834
722380	contig_8978_pilon	-	1261	8	Intergenic	novelGene_49351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	792.846486414872	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	33	1154	194082	190773	FALSE	15	TGTGCCCTGTATAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194114	190665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
722384	contig_6100_pilon	+	881	9	Intergenic	novelGene_168124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	61.9631947207372	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	397	879	546017	656737	FALSE	20	AAGTACTGCATCTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVRILQCLELAGYADIFLRNVTASGVIPQISLIMGPCAGGAVYSPALTDFTFMVKDTSYLFITGPDVVKSVTNENVTQEELGGAKTHTTMSGVAHKAFENDVDALCNLREFFNYLPLSNQDPAPICECHDPSDRVVPELDTIVPLESTKAYDMEDIIHS	529817	656739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_530039_544839_544960_545961_546031_549632_549652_551767_551795_634297_634409_649660_649770_654387_654509_656655
722386	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
722393	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
722396	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
722403	contig_17470_pilon	+	873	6	Intergenic	novelGene_110499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	18.4542677990756	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	27	443	229562	233735	FALSE	10	GCTGTCTCCTCTGAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRDPEVNIMSSLHKSRIADFQDVLKEPTIALEKLRELSFSGIPCEGGLRCLCWKILLNYLPLERASWTSILAKQRELYSQFLREMIIQPGIAKANMGVSREDVTFEDHFFEEGTVILQLKKDHSRAGVKKNCIPGAWRKPCSTCKY	229535	234165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_229585_230718_230793_232362_232404_232992_233055_233201_233302_233618
722407	contig_15866_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_63585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACTACATTACATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200506	202713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_200500_202700
722408	contig_15866_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_63586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAACAGCTGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202713	203934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_202700_203900
722411	contig_11832_pilon	-	1719	14	Intergenic	novelGene_106938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	909.337895550396	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	615	1271	86997	84249	FALSE	10	GCATGAGTGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92459	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88726_92387
722412	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722416	contig_2453_pilon	+	2030	13	Intergenic	novelGene_147763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	54.2775787554636	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	101	1891	56543	62827	TRUE	5	CTGGGTTTATTGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	56285	63157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56357_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
722423	SIRV6	+	607	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	538	544	365	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
722426	contig_13894_pilon	-	1218	4	Intergenic	novelGene_62064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	254	973	287445	286538	FALSE	25	TAGTTAGGGTAGTCAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPSTVPPPPGALQIGACSLQLPLLALLAPNLMTLLERKC	288293	286292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286652_286742_287123_287219_287538_288132
722433	contig_8020_pilon	-	2247	10	Intergenic	novelGene_114394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	56.0555280255411	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	49	1398	152275	148058	FALSE	30	TGCTTTATATATATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPVTGPPPACQALCIMQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTPWAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQLARGPGLRPDSWPERFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	152323	147208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148483_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151231_151580_151708_152036
722434	contig_15104_pilon	+	2324	10	Intergenic	novelGene_163348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	38	junction_1	47.9940839975661	138	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	591	2096	595200	631236	FALSE	45	AGAAAATTTATAGTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGHQHYGFGGETWHRKLPIEQFYYLTQNKKSDIYGNDSLIPKPPNAMVQEICCPYPVEHPYNTHISRCAMFPTFTSPKELYTGIKARSQQPFPPTVPTKAYDKTVLKTRGNPYRYELVDFPSDSKKKALTWPGQGVYYDFPKCVEKNKPVFYPKPPKTFAPNTSLNSWDPINSLKEANIQRNLERSHWITSYTHDFTGLGSMNPLELDDYHEKEVADLTGQIEFDPEPQEKFHPVLKPVRPLEGRIARLIHDQRPLEATVQEKPPSCPDCTPTVLCTFHSFIPSSEEMRALSGNTRASMTHKNQDAEEKIKEEQSLLSTYALPSCYPTKELTDIYDIKPFPKVTDTKKTEDLYWRQLALKPQPIPYAKANNYIHYEHFKSDQYTMCQDPTSLSKPGILQNKQGTAAFTLEQVFGKPEEHQLALNMENSEETRPILGWIPRVGVAKPQTNLLDLKNSFSKSGVRKHFHKSILDDHKDLRDKEHSGMKHQFYGHNSYYFYN	586158	631464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_586463_587163_587323_595072_595250_607434_607507_609950_609981_616639_616822_619364_619454_626900_627076_627366_627459_630420
722435	contig_4531_pilon	+	1757	6	Intergenic	novelGene_47886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	196.300382067891	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	88	612	297563	330172	FALSE	45	GGAAAATTGATACCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKREDFASRAKLAVQNLVQKVGFFGILACASIPNPLFDLAGITCGHFLVPFWTFFGATLIGKAIIKMHIQKIFVIVTFSKHIVEQMVAFIGAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	297475	331317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_297581_301983_302065_303610_303728_310531_310594_328808_328912_330028
722436	contig_9839_pilon	+	930	6	Intergenic	novelGene_88477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1482.05136213291	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	166	798	49467	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	44235	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_44385_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_61264
722437	contig_1331_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_37858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAACAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246400	244072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_244100_246400
722438	contig_9609_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_22971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGAGTTGGCTGACTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277424	278612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_277400_278600
722442	contig_14101_pilon	+	2929	1	Intergenic	novelGene_122767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGAAAAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276729	279658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_276700_279700
722443	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	585	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
722444	contig_3584_pilon	+	1061	5	Intergenic	novelGene_108179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1500.63994682269	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	374	1009	530695	531428	FALSE	15	GGGAGCCAGCCCTGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSGRWTKDEVSLQLCPLPLLWFFAYNCHLYDGPDDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFELKLLAESKIAL	527069	531480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527174_528774_528877_529607_529683_530602_531294_531391
722457	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722458	contig_19469_pilon	-	2835	1	Intergenic	novelGene_134982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCTCCTTTAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24226	21391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_21400_24200
722459	contig_12090_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_80489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115782	114298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_114300_115800
722460	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722465	contig_6710_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_97328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
722466	contig_2550_pilon	+	1002	8	Intergenic	novelGene_135624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_6	106.937708360464	1948	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	26	859	397136	478483	FALSE	0	CTGGGGGCTGTGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKCLFGKMAAVSVYERPVGGFSFDNCRRNASLEAEFAKKGYKLPAARKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKTLVSEAIAAGVFNDLGSGSNIDLCVISKSKLDFLRPFSVPNKKGTRFGRYRCEKGTTAILTEKVTTLEIEVLEETVQTMDTS	397110	478626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397198_397613_397708_398493_398592_401128_401270_409544_409661_436086_436146_473100_473253_478371
722468	contig_12964_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_131743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGAGTAACTCCAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685033	686111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_685000_686100
722471	contig_1452_pilon	+	2752	1	Intergenic	novelGene_115115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATCCGATTCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13829	16581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_13800_16600
722475	contig_12790_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_35272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344014	346210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_344000_346200
722477	contig_1275_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_108863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	9	698	747279	747968	NA	25	GTTGCATGGTAGCATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747270	748099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
722485	scaffold_19766_pilon	-	2088	7	Intergenic	novelGene_34457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.0434153756142	94	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	344	1690	909694	894305	FALSE	45	CCTCAAGACTATTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVLGMATVLGPRPPQKQVGPVIVKVEEEEEEKKKCLPGLEIFRQRFRQFGYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPNELQTWVQEHCPESAEEAVTLLEDLERELDEPGQEVPAPPDEQKQLWEKMSSSGTAKESLSGMQPRPARNKYESWEPLHIEEIDEEQDFTQELRKIQDYESNTQNEESTDKQQSSEEDSHTEGFQRDIITMSIDNKYETRLEGQRVNLERKRGTKSPLRDIGSKKVTELIPINLTTREKRYICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHTGEKPYVCTKCGRAFSHSSNLTLHYRTHMVDRPYDCGKCGKAFSQSSDLLKHQRSHTGEAPYQCKDCGKSFSGKASLTRHYRTHTGEKPYQCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKECGRAFCSKSNLSKHLRVHTGEGEVL	915348	893906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_894373_894456_895150_908826_909014_909295_909794_912710_912821_914968_915068_915313
722495	contig_15087_pilon	-	1910	15	Intergenic	novelGene_37141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.42318423933	6	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1368	542	1909	58989	33326	FALSE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNQNFPPSASGPSRCHCQFVCLSFASSSVAGMFWCWGPLHLHPQSPLPMPPTAWDEGHPSHIRQGSDRNHQALTFSPKPRSWRLVAPGGPDWGGCPSQGSCLHGVLGHKYKLKIS	89806	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33579_33662_33749_40473_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_66533_66725_71087_71174_72506_72642_89687
722497	contig_10940_pilon	-	3321	6	Intergenic	novelGene_49202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	20.0359676581891	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	147	1139	468790	462988	FALSE	25	TGGAAGAGGTTTTTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGGDGGGGRVGLAGLGRRLRRLCRLAVRERAADSCRRGAGRDKVAITMAAVDSFYLLYREIARSCNCYMEALALVGAWYTARKSITVICDFYSLVRLHFIPRLVSRVDLIKQYGRWAVVSGATNGIGKAYAEELASRGLNIVLISRNKEKLQVVAKDIADTYKVETDIIVADFSNGREIYVPIREALQDKDIGILVNNVGVFYPYPQYFTQVSEDKLWDIINVNIAAASLMVHIVLPGMVERKKGAIVTISSGSCCKPTPQLAAFSASKAYLDHFSRALQYEYASKGIFVQSLIPFYVATNMSAHSSFLHKCPWLVPSPKVYAHHAVSTLGISKRTTGYWSHSIQFLFAQYMPEWLWVWGANILNRSLRKEALSCKA	495265	460805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_463087_466164_466393_466611_467058_468570_468803_471604_471663_495189
722498	contig_12352_pilon	+	2602	8	Intergenic	novelGene_57455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	175.284608216326	1	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	106	768	238274	284811	FALSE	25	CAATGAGTTGCTTGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQPPVGEGCWRPRADQCASVPSPRAFPRVPAQIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	230011	286645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
722502	contig_675_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_136357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	880	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	226	558	244023	244355	NA	50	GAGAAAAGGGCAATGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHEPCIEETGEYFRLTYDTRGGFALHRITAEEAKYQQCKMRKIFVGTKGIPHLVVTHDAGTSRHPDPLIKVNDTVVIDLGTDMITDFWWGQSWPCWCDHQQKRISWFF	243797	244576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_243800_244600
722509	contig_7202_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_18378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
722513	contig_19735_pilon	-	393	3	Intergenic	novelGene_167891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACAAAAAGAACAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169474	163723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_163851_165536_165620_169291
722514	contig_19735_pilon	-	540	4	Intergenic	novelGene_167888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGACCAGCACAATGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155730	142298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_142324_146253_146421_154864_154986_155503
722515	contig_9656_pilon	+	1172	11	Intergenic	novelGene_121920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	58	360	430484	432171	TRUE	25	CACGAGCCACGCCGATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKNSGIRKTQKAVFHFVQVLFPGIKCVIQLLPLLFSKCPMCAMTDNYFSLGLINFAVDHFSSYRINNKCFNIISSNLEFLLHCVKRNFFIFHCHSHKSK	430426	446626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_430617_431077_431139_432062_432206_436343_436427_436929_437028_438024_438111_440922_441016_441181_441307_442127_442214_443248_443384_446554
722526	contig_9272_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_125995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCCAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816925	819067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_816900_819100
722532	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
722534	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
722541	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722543	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
722547	contig_14322_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_116441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671883	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
722548	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_97344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
722558	contig_8156_pilon	+	1454	2	Intergenic	novelGene_98948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403919	441751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_404810_441187
722562	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722565	contig_16999_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_84991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCTAGCATAAGTCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126877	127334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_126900_127300
722566	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722573	SIRV5	-	370	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGATGCGTAAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
722579	contig_8616_pilon	-	1744	7	Intergenic	novelGene_72451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	55	junction_5	35.7910603363466	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAAGTGTTATCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274344	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271276_271486_271521_271722_271795_271904_271971_272093_272145_272904_274150_274282
722580	contig_4754_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_35977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCCAGAGAGAGGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473036	474739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_473000_474700
722582	contig_7440_pilon	-	1143	9	Intergenic	novelGene_61166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	407.466850645546	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	182	511	66382	56410	TRUE	15	CCCTGAATTATGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMK	74559	53817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56413_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66432_72959_73011_74478
722587	contig_7513_pilon	-	1818	7	Intergenic	novelGene_88976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_6	68.762069647606	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	402	749	274570	269761	FALSE	30	GAGAAGTCCTTGCGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPVLPASTHREIEMAQKLLNSDLGGLINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLAQTRPH	284706	268691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279737_280088_280129_282426_282490_284617
722588	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722590	contig_11994_pilon	+	2151	11	Intergenic	novelGene_129344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	79.8583746391072	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	399	1040	95169	102983	TRUE	30	TGATGAAAAAGGCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLV	93700	108879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93885_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100442_102978_103045_104968_105137_106206_106253_106963_107110_107200_107248_108236
722593	contig_11285_pilon	-	1268	13	Intergenic	novelGene_5554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.670882640838	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	129	1184	744458	741540	TRUE	50	TAAGTCTAAAGATGATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745450	741235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741289_741508_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
722597	contig_16385_pilon	+	1763	15	Intergenic	novelGene_86182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	201.317243804552	2	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	49	789	3004	22424	TRUE	40	TAATGATTAAAAGTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHETSAASRTE	2955	36818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27717_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
722598	contig_10904_pilon	-	1345	5	Intergenic	novelGene_22532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	416.660158282502	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	198	917	354975	352021	FALSE	15	AAGATCTGTTGTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTDLTASQGNNECLLELDLLILTVSCRIFTLSSMENSSRTR	362577	351592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_352140_353957_354255_354560_354852_354962_354999_362403
722601	contig_10235_pilon	-	1399	11	Intergenic	novelGene_46542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	24.153674668671	497	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	53	1183	417693	412423	FALSE	25	ACAGCTGTTTTAATTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPEIVGLRLPPPSGVTMLVIPPGLSEEEEALQKKFNKLKKKKKALLALKKQSSSSTANQGGVKRSLSEQPVVDTATATEQAKQLVKSGAISAIKAETKNSGFKRSRTLEGKLKDPEKGPVPTFQPFQRSISADDDIQESSRRPQRKSLYESFVSSSDRLRELGPDGEESEGPGAGDGPPRSFDWGYEERGSARSSASPPRSHSRDRSRERNRDRDRERERDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDREGPFRRSDSFPERRAPRKGNTLYVYGEDMTPTLLRGAFSPFGNIIDLSMDPPRNCAFVTYEKMESADQAVAELNGTQVESVQLKVNIARKQPMLDAATGKSVWGSLAVQNSPKGCHRDKRTQIVYSDDVYKENLVDGF	418168	412206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_412521_413882_413986_414227_414283_414418_414564_414689_415016_415194_415233_415339_415415_415912_416059_416159_416230_417618_417702_418124
722602	contig_5018_pilon	+	779	7	Intergenic	novelGene_47144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	421.64756214956	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	70	660	1498209	1500406	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDWDPGGPG	1497678	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185_1500241_1500381
722605	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722606	SIRV6	-	385	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-156	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTTTTGCAATGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
722608	contig_2069_pilon	-	1143	6	Intergenic	novelGene_23423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	31	303	1331269	1327936	FALSE	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLRPAAVATMPKRKAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1331299	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
722618	contig_9848_pilon	+	1277	3	Intergenic	novelGene_79966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGAATCAGGAAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98503	105110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_99392_104027_104150_104843
722621	contig_6710_pilon	-	452	2	Intergenic	novelGene_98207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	40	CCACAAAACACCTATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722623	contig_10627_pilon	-	1458	9	Intergenic	novelGene_60012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	164.891441560804	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	186	1214	402038	373138	TRUE	30	ATAAATTGGCTCAATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVYDIAFSRAGGGRDMFASVGADGSVRMFDLRHLEHSTIIYEDPQHHPLLRLCWNKQDPNYLATMAMDGMEVVILDVRVPCTPVARLNNHRACVNGIAWAPHSSCHICTAADDHQALIWDIQQMPRAIEDPILAYTAEGEINNVQWASTQPDWIAICYNNCLEILRV	402223	368375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_368439_369068_369184_373071_373311_375715_375834_376928_377139_380441_380561_380960_381073_381786_381946_401900
722627	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_97113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722637	contig_10299_pilon	-	2246	5	Intergenic	novelGene_79755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	32.78719262151	18	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	119	1618	593453	580269	FALSE	0	TGTGGGCTTCTTCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLTRGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLERSPCTNFPVATFCAGPAWVRSSGPCP	622503	579640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580352_584724_584887_591057_592259_593399_593495_622426
722646	contig_9981_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_121014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7054	4942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_4900_7100
722647	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722648	contig_3975_pilon	-	2192	8	Intergenic	novelGene_54723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	352.853556951126	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	326	1591	1603436	1560510	FALSE	40	GCACAATAGTGTTTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLVPSEQSSGTSLLPKDNARFSWSSLDEDGLDDSLLELSDGEEDDGHFSFTEEEIQELLKDDDLSNEHFSWRGGLLKDDSRHVEKGERESQIPLDALQEKNSLYSLGPVAETPGLFRLPQLSTSIGHGPTATKPLNRHFALEKNVIKITVVAPFDPTVYDAVLDKDKTDSSKDIKKPSSVGEELRENGLNPNESKLCTESEGISPTNSAWDGNTFPSPSNNNFQETVSDKNMPDCKKPTPVFSQVLDHSKSSSNIGSSWRNGGSHKSSCEVRFPVSSKQDVLDKDSGKMKVHERRLGKVIPVLQTKTRTSFLTFSQSDLEQQKQIYLRSVIAHIEDPVDSNQGALGELYALMDQVHHMQNQKWQHPSDLTMRNYARFRQKPLQRYSLTQWVDRNMGSHHRFQHLPDFPNSPFVSSHQQ	1609668	1559908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1560652_1562840_1562929_1599911_1600016_1601762_1601852_1602593_1603439_1604172_1604290_1606203_1606296_1609554
722656	contig_17171_pilon	-	2018	7	Intergenic	novelGene_147374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.5799096787005	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	54	749	270859	266475	TRUE	20	TCCCATATTGGGTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPATALLLQLAQRPSTFRMSPLKVQGTLGKSVELECEVLLSNFASGCSWLFQRPDAATSPTFLLYISSSRPKPSSDRYSGSKTESRFKFTLHDFQVEDQGYYFCSVVSNHALYFSAVVPVFLPEKPVTTLAPRPPTPAPTKALQPKSLSPEVCRPSAGRPSAGGAVDSRGLGFSCDLYIWAPLAATCAVLLLSLIVAVICSHRNRRRVCKCPRPLVRPGGKPDLSEKYV	270912	264896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_265360_265668_266527_268720_268752_269338_269450_269671_269798_270365_270702_270819
722659	contig_10058_pilon	-	2543	6	Intergenic	novelGene_67732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	143	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCAGCCCTAAGAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101679	72569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_72662_97060_97105_98446_98538_98695_98813_99355_99406_99530
722660	SIRV2	+	231	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	366	-74	-366	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTACATTTGAGTGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
722666	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
722668	contig_20507_pilon	+	2120	5	Intergenic	novelGene_164203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	667	junction_2	149.098960425618	43	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	90	716	46163	74496	FALSE	5	TGAGCTCTCTGGCTTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFHREAERPLSPAFCRSCRSCSLRPPATMEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASSIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAAANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELLRKCLEEVSSSHGILKGMCCLCLPILFQFFGCIFLILARRCKKYFTIQM	46073	75900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_46254_50610_50734_52471_52543_72663_72827_74317
722669	contig_13894_pilon	+	1195	9	Intergenic	novelGene_62138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2481.20555375809	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	135	545	521729	524911	TRUE	15	TGACACCTGCGTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQVSTSPEESPLDGDPGERRHCG	521594	528170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523635_524855_525000_525630_525799_526477_526580_526851_526930_527463_527580_528072
722674	contig_6102_pilon	-	2223	4	Intergenic	novelGene_32329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_1	95.1361597337673	39	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGCATCGTTGGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689398	1685154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1688077_1688226
722678	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
722682	contig_6102_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_32392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCTGAGGATGATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743548	1742408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1742400_1743500
722683	contig_13740_pilon	-	966	6	Intergenic	novelGene_34682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3334.11831823647	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	73	483	165243	157286	FALSE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRPRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEPILSFFLFDMGFTV	165315	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157487_161170_161270_161574_161722_161919_162031_165237
722688	contig_13780_pilon	-	1995	13	Intergenic	novelGene_149079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	264.155717438702	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	243	1862	686613	657588	FALSE	15	CGCCCGGGAGCGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727481	657454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_660148_660194_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686693_699201_699268_713180_713235_727438
722692	contig_10437_pilon	+	2398	3	Intergenic	novelGene_38163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_2	123	1	145	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTAAGCAAAAGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160752	164077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160844_161549_161639_161859
722693	contig_6710_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_90480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
722695	contig_8269_pilon	+	3554	1	Intergenic	novelGene_106216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAGAGAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235603	239157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_235600_239200
722697	contig_8693_pilon	-	2000	2	Intergenic	novelGene_150879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169472	1167395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1168372_1168448
722699	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	1	1156	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
722709	contig_9609_pilon	+	2028	9	Intergenic	novelGene_23057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	945.837517428337	1	103	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	11	451	435659	453048	TRUE	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSLPERSGAHRTE	435648	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450633_453012_453142_453645_453776_453861_454008_454418_454634_455282
722710	contig_6137_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_59144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTTTGTTTATCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989637	990513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_989600_990500
722711	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722712	contig_10689_pilon	+	993	4	Intergenic	novelGene_118619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1733.91759383836	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCTTTCTTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51251	61580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57733_58267_58374_60928
722715	contig_16622_pilon	-	1370	8	Intergenic	novelGene_48424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1033.41455024257	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	623	1201	113714	108374	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKDEAFPVWSPKPFYNEAEPEGTREDKDWDLRDQLQKKTLQLQAKEKECRELHSELDNLSDEYLSCLRKLQHCREEMNRSQQPPPRRQCGQWLPMLIVVTAIALAVFLANKDSLMM	121995	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115294_121537
722718	contig_14698_pilon	+	1873	9	Intergenic	novelGene_168130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_5	31.1285138578763	131	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	54	1478	64977	183440	FALSE	80	CAACCAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAEHPGASKPPISSSSMTSRILLRQQLMREQMQEQERREQQQKLQAAQFMQQRVPVSQTPAINVSVPSTLPSATQVPMEVLKVQTHLENPTKYHIQQAQRQQVKQYLSTTLANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMPPVPGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFEEQNRVESECPSMNTHSRAPCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMDPALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKELENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRVIKQEPVLENCNQDLLQHHTDLTCTTTLDLTDGTITFNNSLGTGTESNQVYCVPAKMGAKLEDILMDDTLSPVGVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEEAEHAC	64923	183835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_65175_153405_153634_154692_154777_157092_157189_166046_166165_168165_168241_175145_175222_178570_178719_183038
722719	contig_9345_pilon	-	1821	10	Intergenic	novelGene_24463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	35.2735343029618	316	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	359	1114	535680	516935	FALSE	10	TTGCAGTGTGTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSGTFDCFRKTLIREGITGLYRGMAAPIIGVTPMFAVCFFGYGLGKRLQQKSPEDVLSYPQLFAAGMLSGVFTTVIMTPGERIKCLLQIQASSGETKYTGTFDCAKKLYKESGIRGIYKGTVLTLMRDVPASGMYFMTYEWLKNIFTPEGKSVNELSVPRILVAGGFAGIFNWAVAIPPDVLKSRFQTAPPGKYPNGFKDVLRELIRNEGVASLYTGFTAVMIRAFPANAACFLGFEVAMKFLNWITPNL	547233	516227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_516998_517339_517465_517924_518035_518400_518474_519266_519385_529031_529123_531970_532099_535632_535726_545770_545926_547075
722725	contig_13744_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_77195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	346	753	759243	759650	NA	10	TTTTCTTCTTGATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVTQDPSLLPRQHMALRGGKWAGGWRWRLSWSCLEVTVVTSTHNPWARARRMALPAYPRAGKGKYQVRAQDEGETAGGAWLPQLAQCLSHEGTCSLMVFYIPVPVCVCTRTLYSGFLAFFNFFVYPVLTNVAL	758897	761166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_758900_761200
722726	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	239	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722727	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
722728	contig_5302_pilon	+	1705	10	Intergenic	novelGene_81473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	209.086962828129	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	112	897	318333	337399	TRUE	5	CATCCTTCTTCTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306683	338250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318342_318946_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307_337491_337533
722730	contig_1261_pilon	+	1593	4	Intergenic	novelGene_168142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCTTTAAGTCAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15924	26099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_+_17000_17757_17902_24305_24484_25903
722731	contig_6576_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_42220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	883	1182	220521	220222	NA	25	CATTACATAGACCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSPTLIIHSCSPTCGASWNMAGGQRVVLHRIRVSVAAGFSTSTTETHIKEEKAVKLKSRLERSGAEGDPASPWCPQRWGQGPAGPASICPSSAARPT	221403	219068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_219100_221400
722737	contig_8616_pilon	+	1681	10	Intergenic	novelGene_72406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	105.261344363845	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	581	1093	220023	237101	FALSE	15	CTAGCCATGTCGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNDFKSVLEVRTENLKQQKSRREQFSRAPVSALPLAPNHLGGGAVVLGAESCASGDVAINMIDSRTSQQLQLIDEQDSYIQSRADTMQNIESTIVELGSIFQQLAHMVKEQEETIQRIDENVLGAQLDVEAAHSEILKYFQSVTSNRWLMVKIFLILIVFFIIFVVFLA	214309	237689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_214387_215051_215296_216556_216613_216728_216800_219806_219924_220007_220065_220243_220326_221061_221169_221372_221495_236941
722741	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
722744	contig_19769_pilon	+	756	5	Intergenic	novelGene_102314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	267	722	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87300	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
722745	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_95577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722751	contig_10235_pilon	-	1227	2	Intergenic	novelGene_46295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGCCAATGTAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85337	83481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84640_85268
722753	contig_10023_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_123502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGGTTCATCCATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400429	402147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_400400_402100
722754	SIRV2	-	648	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	2	2967	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGCTCTATAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
722755	contig_5586_pilon	+	2031	8	Intergenic	novelGene_143565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	496	junction_2	305.141385764243	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	58	1080	384614	430164	FALSE	45	TTAATAAACATTGTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	383552	431115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
722761	contig_7919_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_28098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGTTTGTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297826	1298425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1297800_1298400
722762	contig_1863_pilon	-	2072	3	Intergenic	novelGene_156524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62696	54761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_56446_56899_57201_62609
722764	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
722770	contig_7549_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_164537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCCAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725859	723565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_723600_725900
722771	contig_6102_pilon	+	1848	15	Intergenic	novelGene_31855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	613.779326162498	1	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	58	1641	370803	376333	FALSE	60	AAATTGTTGAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIQTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVRESSIQSPSPH	370745	376540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373690_373900_373960_374383_374508_374590_374736_374914_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207
722775	SIRV1	-	250	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3852	2	3578	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
722776	contig_5551_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_134231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAACTCACGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329243	328900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_328900_329200
722781	contig_14289_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_110570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCGTCTTTACCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65896	63491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_63500_65900
722782	contig_9614_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_104413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAGGAAGAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98583	97030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_97000_98600
722783	contig_11285_pilon	-	1635	15	Intergenic	novelGene_5661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	418.116525111635	2	46	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	25	1050	798530	787042	TRUE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLLLCLPSWTGGCPPPAGPLFTPSITSGSADRLCSQAHSSPPSSKNPF	798554	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787183_793809_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796604_796731_798349
722786	contig_6164_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_121290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAAAATCCAAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587686	585630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_585600_587700
722787	contig_5569_pilon	-	2811	20	Intergenic	novelGene_86750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	160.055270924429	5	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1118	1630	487345	467456	FALSE	60	TAAAAAATTTTAACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	517666	466274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487366_489335_489403_490827_490926_493479_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517558
722788	contig_8330_pilon	-	2743	7	Intergenic	novelGene_71917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	201.026532245539	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	303	1226	1323488	1283191	FALSE	25	GCTAATGTTGTGTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRLDDQESPVYAAQQRRIPGSTEAFPHQHRVLAPAPPVYEAVSDTMQSATGIQYSVTPSYQVSAVPQSSSSHGPTIAAVHSSHHHPTAVQPHGGQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFKSQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHGIQPQPQPAPQHSSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASPRSPPVQPHTPHTILTFFFVNNVQTVNFLLKEV	1345203	1281673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1283260_1309798_1309898_1311109_1311393_1312058_1312166_1318951_1319129_1323299_1323522_1344934
722789	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	9	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
722792	contig_8587_pilon	-	2404	2	Intergenic	novelGene_159145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTTCGGGCTGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507463	504404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_504902_505556
722796	contig_12427_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_40568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAATATGAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514415	511936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_511900_514400
722798	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722802	contig_10734_pilon	-	1917	4	Intergenic	novelGene_51021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	458.659641419066	1	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	64	555	320632	311551	FALSE	50	CAGGTTCAGTAAATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGCGGSRDRSPGRGLGTSPTMVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320695	310188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315939_318938_319032_320452
722803	contig_7457_pilon	-	2493	3	Intergenic	novelGene_31461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	1.5	24	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	742	2262	489928	484749	FALSE	20	CCTGGCCTGTCAGTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVLPAFAGHVPKAITRVFPQVNVTQMGSWGQFNCSYSCSFLLAPGDPMFPIIGSLFLRELTKEFGTDHIYGADTFNEMQPPSSEPSYLAAATAAVYEAMITVDPDAVWLLQGWLFHHQPQFWGPAQVGAVMRAVPRGRLLILDLFAETQPVYIRTASFQGQPFIWCMLHNFGGNHGLFGTLETVNQGPAAARLFPNSTMVGTGMAPEGIGQNEVVYALMAELGWRKDPVPDLGAWVASFADRRYGGFHQDAEAAWRLLLRSVYNCSGEACVGHNHSPLVRRPSLQMHTTVWYNRSDVFEAWRLLLAATPTLAASPAFRYDLLDITRQAAQELVSLYYGEVRTAYLNKELVHLLRAGGILAYELLPALDEVLASDSRFLLGSWLEQARAVAVSEAEAHFFEQNSRYQLTLWGPVGNILDYANKQLAGLVSDYYTPRWQLFVGALIESLVQDIPFQQRLFDENVFQLEQAFVLNTRRYPTQPKGDTVDLAKRLFLKYYPRWVAGSL	490669	484517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_485960_488371_488629_489875
722806	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722807	contig_6206_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_168148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTAACTGCCGACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16709	17096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_+_16700_17100
722812	contig_7707_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_72215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGAGAGCATTATATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763158	763730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_763200_763700
722814	contig_12622_pilon	-	1308	12	Intergenic	novelGene_6038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	342.815566152843	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	35	1144	1691275	1685282	FALSE	25	TTAAAACCCTGTCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIIPEGHSTSCRQPRVVSTLFLQ	1691516	1685117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685349_1687798_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
722816	contig_9083_pilon	-	2233	2	Intergenic	novelGene_150131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACGTTATAATGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042390	1039118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_-_1041328_1042366
722817	contig_15974_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_164814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157129	159184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_157100_159200
722822	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722827	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
722832	contig_9609_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_23025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322716	320953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321000_322700
722834	contig_8866_pilon	-	1890	2	Intergenic	novelGene_77767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	184	360	348954	342296	FALSE	15	TTTCAGATGTGTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEEFIVPS	349137	340765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342317_348798
722840	contig_7272_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_25423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTAACATGTTTTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933114	933563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_933100_933600
722842	contig_4136_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_161260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTTTGAGAGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402642	403687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_402600_403700
722846	contig_6494_pilon	-	782	7	Intergenic	novelGene_108556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	939.276213664306	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	33	704	8286	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8318	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3357_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
722847	contig_8651_pilon	+	1637	3	Intergenic	novelGene_168186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3336.5	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	252	320	185814	185882	TRUE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSLGLGSGGGWLLGLSHGQDQGSGPSRQEEGGAAETAGGSEGGAVPAARRQSDWRCGVQALQNVSPSVRLQPSGDEGHVCIRMERFWLFGIDLRYSCPFNGSVS	185067	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_187011_189168
722848	contig_12528_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_81367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGTAAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056236	1057839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1056200_1057800
722851	contig_8616_pilon	+	1882	6	Intergenic	novelGene_72384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	44.5313372806162	602	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTGTAGTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_198124_198540_198588_198825_198858_198952
722852	contig_15304_pilon	-	872	4	Intergenic	novelGene_30423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	1290.77728520454	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	3	689	53684	49917	TRUE	35	AGCCAAACTTTCTCAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGLPVLQIGKSLAHGWCWTCHRTAWRRRHKGLACGQPLSLCSHSSCSASSTAQH	53686	49409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50078_52986_53320_53491
722853	contig_11720_pilon	+	1042	11	Intergenic	novelGene_43774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	725	junction_1	2169.21812872749	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	62	1042	68064	98401	FALSE	15	GTTGCACCTCTTCAGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFN	67786	98401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
722856	contig_7293_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_54270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTGCATGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338088	336679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_336700_338100
722860	contig_8729_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_40126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGCAGTTATGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526762	524807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_524800_526800
722861	contig_5217_pilon	-	1970	5	Intergenic	novelGene_135717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	23.9060661757638	25	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	693	1157	296664	295847	FALSE	20	TGGAATCTAGTATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMVRMGMGDLRWACGAFWASLACTIMTTGGQQRYSSERLVGMARPSGLSYLPFPLDHLC	298373	295033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_296159_296511_296674_296801_296992_297229_297685_298335
722862	contig_4068_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_161693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	477	28	504	24737	24261	NA	30	CCTAGAAATTGAGCTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKDLLHKHHMLQDEIAMLTLEIDALKNQNQEKEKKYSEDIEILKEKNDDLQKTLKQNEETLTKTIFQYSGQLNVLTAENAVLNSKLENEKQNKERLETEVESYRSRLAAAIHDHDQSQTSKRDLELAFQRARDEWFRLQDKMNFDLSNLKDSNETLSQQLSKTESKFN	24764	24258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_24300_24800
722866	contig_12622_pilon	-	2166	8	Intergenic	novelGene_5884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_7	8.90310654336165	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	28	798	1473059	1463222	FALSE	45	GAAATCCATAACTCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPLRSHPVMVRLRLQCLVWGCLLTTVHLEPPTPCKQEQYQIEGQCCDLCLPGTKLMKDCTDGVDTVCEPCQAGEFLDTLNREMRCHQHKYCDPNLGLRIQTEGTSETDTTCTCKEGQHCTSDTCESCAPHSSCHPGFGVEQIATGTSDTICTPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCKTKDLAELKAGTNTTDVLCGPWPRTRALVAIPITLGILFVIFVSAYINKVVKKPDNKVGSPWELGQSFGKPERLTCYLYGSKELWWCSS	1473086	1461853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1463350_1463458_1463543_1464886_1464949_1468407_1468502_1468831_1468979_1469211_1469338_1469677_1469757_1473008
722868	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_96515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	653864	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653864	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722870	contig_5125_pilon	+	2022	11	Intergenic	novelGene_43505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	506.722024388125	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	341	1324	1100721	1127980	FALSE	25	TATAAAATTCTGTCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVPGVATWSPAPATWLSTLGLRRAPRAPLQPLRPPQVGLEDLGQHLQQQVLHSSALSAPTLLGDERDAILAKWNQLQAFWGTGKGYFNNNNAPVEFTQENPFCRFKAVGYSCMPNNKDEDGLVVLVFNKKETDIRGQQQQLVESLHKVLGGNQTLAVNVEGIKTLPDDQTEVVIYVVERSPNGTSRRVPATTLYAHFEQANIKTQLQQLGVTLSMTRTELSPAQIKQLLQNPPAGVDPIIWEQAKVDNPDSEKLIPVPMVGFKELLRRLKVQDQMTKQHQTRLDIISEDISELQKNQTTTMAKIAQYKRKLMDLSHRTLQVLIKQEIQRKSGYAIQADEEQLRVQLDTIQCELNAPTQFKGRLNELMSQIRMQNHFGAVKSEERYYIDADLLREIKQHLKQQQEGLSHLISIIKDDLEDIKLVEHGLNETIHTRGGVFS	1087565	1128678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1087678_1091825_1091875_1098968_1099130_1100702_1100891_1101756_1101954_1103604_1103660_1104087_1104182_1119633_1119742_1125790_1125911_1126191_1126303_1127851
722871	contig_6418_pilon	-	1113	11	Intergenic	novelGene_81098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	277.473259972921	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	50	859	106563	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWGRSQLSAPGPASFEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	117997	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69684_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
722873	contig_14441_pilon	+	698	3	Intergenic	novelGene_100672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.5	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	198	698	116728	117789	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACL	112616	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_116578_116963_117523
722874	contig_401_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_42732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGACTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112088	113967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_112100_114000
722880	contig_7272_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_25380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTCCAGAATGAACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687106	686490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_686500_687100
722885	contig_14273_pilon	+	1460	7	Intergenic	novelGene_21146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	595.680563165639	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	871	1458	147836	149286	FALSE	10	GTGTGTGATCTCCGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLI	127918	149288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777_128846_135359_135521_137943_138052_139057_139185_147782_148029_148891
722886	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
722890	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_94300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722892	contig_11933_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_107249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGCAATGTTCACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90518	88917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_88900_90500
722900	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722903	contig_9727_pilon	+	1608	6	Intergenic	novelGene_86323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	207.044536271789	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	147	551	343348	366050	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIESLTRARIDRSKELASKTREKERMKEAKDARYTNGHLFTTISVSGMTLCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALTTRRKVAAACRHPTVHETSPECRTSQRRRRAAMGSL	343201	367107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_343411_351017_351163_353409_353478_353819_353842_365172_365220_365990
722907	contig_5372_pilon	-	2794	2	Intergenic	novelGene_149705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	0	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2488	2793	142060	141755	FALSE	45	CCATGCAAAATGAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAALVMFLCRNQSLGFGDEVICLVIPRPQRVVLMERGVPERKELYRREREDGGGKVTTISLKTFDLDFSIFKIRELVKMMYLVPSGSKFYMYLCNKSLCK	146630	141753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_144487_146569
722910	scaffold_2602_pilon	-	2454	6	Intergenic	novelGene_127710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	33.1215941645326	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	82	1056	508880	446071	FALSE	30	TTTCAAATACTTTTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVEKRCGKVPYPPSYVPAVLSELTDQMSFTDRIRNFISYHLQDYMFDTLWKSWDSYYSKALGKPTTLCETMGKAEIWLIRTYWDFEFPRPYLPNFEFVGGLHCKPAKPLHKEIEEFVQSSGEHGVVVFSLGSMVKNLTEEKANLIASALAQIPQKVLWRYNGMKPATLGANTRLYDWLPQNDLLGHPKTKAFVTHGGTNGIYEAIYHGVPMVGVPMFADQPDNIAHMKAKGAAVDVNINTMTSADFLNALRTVINDPSYKENAMRLSRIHHDQPVKPLDRAVFWIEFVMRHKGAKHLRPAAHDLTWYQYHCLDVIGFLLACVATIILLITKCCLFSCQKFGRTGKKKKRE	508961	444672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_446351_454389_454610_455073_455162_456652_456785_459445_459595_508774
722916	contig_11338_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_6412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATGTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321958	323854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_322000_323900
722917	contig_10923_pilon	+	1152	8	Intergenic	novelGene_66188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	899.927457393888	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	51	767	21667	37418	TRUE	45	CTCTGCAATTTAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLWCSGVCAAP	13828	53256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30289_37383_37540_38578_38742_53155
722918	contig_15087_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_37289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGACTTGGGCAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303730	301815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_301800_303700
722920	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	35	TTTAATCATACTAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
722924	SIRV7	-	329	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-13	-21	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114751	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
722925	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_94710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	653873	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653873	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
722927	SIRV7	-	209	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69050	21	35831	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78907	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
722933	contig_5467_pilon	-	1980	6	Intergenic	novelGene_111956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	722.64331450585	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	221	1900	91730	88200	FALSE	15	GTAACTGTCTCTTGCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPRARQAPSSVFLHPSFLAGRKAGPRPPGESSAIQEGSPGPGLAHGFLSGAANGTGWGALLSCRGPGRTEEAMVLGRPGLGRGGGCPGPLSMLGAAVLLASLPWGVRGTASANHSIALGHTGPLTGPRYLSIGDGSVMAFEFPEESEGIIVVSSQYPGQSNGTRLGPTLRVTSLDTAVLTIKNVSAISWGGGGGFVVSIRSGLEGLAPLHLQLVDLHQAQPLLIEERSDFCIKVLPAEDAPAPLGADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLLQSPQPMLLGLLGQFLVMPFYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLAISMTFISTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPVSKILGTLLFIAIPIAAGVVIKSKLPRFSQLLLQVIKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGVRFPIVLVGVTVPLVGLLVGYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVSEDEMVSSLKLLVSEQLNVPVRQQRLLFKGKALADGKRLSDYSIGPNSKLNLVVKPLEKVLLEQGTARRQAETQSRPLAPPSETWQVIAKVLGRHFSAADANRVQEQLQREYERSLSRLTMDDIERLASRFLNPEVIEATEKGLSK	93767	88119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_88311_88417_88645_88878_88985_90494_91861_93140_93209_93745
722941	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
722946	contig_665_pilon	+	2334	4	Intergenic	novelGene_158227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	75.2122921395758	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	165	782	367931	373206	TRUE	20	ATAAAGCCTTGTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADSGRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPPGLWASSSHMDQIVFADHSTKYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEGSEGDTGTIKRRGGKDVPTDAESSSTAPVPPEDARPAPVPAHGATTSSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSEGPGPSPVQQPHGHPASSRPTSKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSAEEDEDEQVSAV	367766	375193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_368217_370986_371293_373180_374078_374512
722948	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
722949	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
722953	contig_8354_pilon	-	1908	17	Intergenic	novelGene_24108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.086340748949	4	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	361	1758	317393	240665	TRUE	75	GGAAAAAGAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQCLIFLDDPQAVSDILEKLVKEDNLLMAYQICFDLYESASQQFLSSVIQNLRTVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEKESESMETEEKTVSALVGKTPEASPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGISSFTLPVIGLYSYLCHWP	327692	231418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_231463_232863_232957_240651_240723_297523_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296_307426_308574_308636_312425_312653_315101_315246_317291_317498_321129_321204_322339_322384_327554
722955	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
722956	contig_7202_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_17548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTGTCTTGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
722960	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
722961	contig_19634_pilon	-	971	2	Intergenic	novelGene_168198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTGTCTCTGGTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13322	6487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19634_pilon_-_7071_12934
722967	contig_13778_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_70845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213732	212557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_212600_213700
722969	contig_10196_pilon	+	2418	6	Intergenic	novelGene_132299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	263.720761412521	62	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	682	1251	2352501	2369190	FALSE	20	TTCACATACTTGGAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKVAELVPGTGPYL	2348153	2370357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348832_2352497_2352597_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2369148
722973	contig_11548_pilon	+	1234	5	Intergenic	novelGene_66769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	227	817	112832	119638	FALSE	35	GATTCTAAATTGAATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112605	120055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
722976	SIRV6	-	493	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9409	387	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGTCCACAATTGTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11229	1157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
722978	contig_6589_pilon	+	1265	9	Intergenic	novelGene_26005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	800.578452979469	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	83	928	1725483	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1725347	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725400_1725452_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
722987	contig_2940_pilon	+	2545	2	Intergenic	novelGene_81956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTCTCGTCCCCCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999093	1003990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_999505_1001856
722988	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	10	2958	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
722989	contig_13608_pilon	-	1577	9	Intergenic	novelGene_52378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	264.347191208834	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	116	1006	470234	369353	FALSE	45	TTTGAGCATAACAGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPRDPIKACTRFRARILIFNIEIPVTKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	470349	368781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382428_382538_382986_383078_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
722994	SIRV1	-	793	4	NNC	SIRV1A	novel	973	3	NA	NA	7	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCATTACTTTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10633	1013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1199_6545_6818_7552_7809_10553
722998	contig_7020_pilon	-	1371	7	Intergenic	novelGene_57062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	80.8036027799641	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	10	510	98420	92029	TRUE	25	CTACTTCTAAAGGTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVIMVTGKFINRGQRLGCVLALSVLALVLWGVPGAKALDNGLAMTPTMGWLHWERFMCNVDCKQEPNSCVSEQLFMQMADLMVSDGWKDAGYQYLCIDDCWMAPTRDSKGKLQADPERFPGGIHRLANYVHSKGLKLGIYADVGQKTCAGYPGSFGYYDIDAKTFADWL	98429	83728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_84145_84997_85196_85309_85472_91943_92036_92969_93086_94387_94563_98217
723001	contig_7895_pilon	-	2384	3	Intergenic	novelGene_154441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_2	89	374	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1524	2057	626028	624136	FALSE	20	TTAAATGGTTTCATTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAEVVKQRMQMYNSPYHRVTDCVRAVWQNEGAGAFYRSYTTQLTMNVPFQAIHFMTYEFLQEHFNPQRRYNPSSHVLSGACAGAVAAAATTPLDVCKTLLNTQESLALNSNITGHITGMASAFRTVYQVGGVTAYFRGVQARVIYQIPSTAIAWSVYEFFKYLITKRQEEWRAGK	633568	623808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_624654_626012_627420_633436
723004	contig_1107_pilon	+	2100	6	Intergenic	novelGene_126556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_2	31.840854259897	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	47	625	209781	230663	TRUE	35	TATATGACTGTGACTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEEGLTSSAPASSQTLLDALLQNLYDFGERKDETKQRIKKKRESKKRDLSTAAVLAEGPALPPDSLVRGQRKSASSFFKELREELHCAPAVTSTSFSSEPEVDSAVSHSLRNNRELVEVVEFHSRRQKRKLKPGQDEIPKTKTSVLEKDVVIQEFNLEKVCALKLLICSFFYNTKKVSMFLYLTDGKMVK	209734	233881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209869_210850_211189_230510_231407_231544_231632_232190_232244_233289
723012	contig_8594_pilon	-	1427	7	Intergenic	novelGene_140057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.317790010915	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	37	858	496028	461703	TRUE	15	AATTCTGTGTTTCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFQFSVSDPVQNMFLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	496064	460969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461445_461608_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_495973
723014	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
723016	contig_11370_pilon	+	816	3	Intergenic	novelGene_98717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2677	6	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	163	342	145831	147474	TRUE	30	CACTAACAAAGTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITQRLQFSLAKTGQVFS	145668	148538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147426_147616_148205
723022	contig_500_pilon	+	2567	2	Intergenic	novelGene_31124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAACATGTAGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734416	1737572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1734469_1735057
723023	contig_7594_pilon	-	2671	5	Intergenic	novelGene_55413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	64.7649596618418	25	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	27	758	519064	481163	FALSE	25	TCCTATGTGTAGTCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVFGSLAMAWAAARIGGARGALSARTLLFDLPPTLLGELCAILDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEKYVEQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQILQEMGHHRAIHLITNHGAALNPSEQSHQGDEFPNISSKETATVTVDNVLIPQRNEKGMLHRSSVSFQNIIEGTKNFHKDFLIGAGEMFEVYRVEIQNRAYAIKLFKQVWKELLLQEINSIYLLIFHIKMCHFFHQYWEEVYFKIKCHKWK	519090	479249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_481447_483904_483960_484575_484641_500701_500885_518919
723024	contig_20819_pilon	-	2871	20	Intergenic	novelGene_55687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	299	778	88313	87624	TRUE	35	TAAGCACAAACGGGAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMDKIEKMIKVILGAQGEVVLGNLKTWGDSESQGNLAYPDGNEGRMRHVKGLGGKRRTGRETQVKKDMGWGAEVHGEGWQIPGFGTSEVRLVLLELHHKVVNIDELSPGREGSELRLGQYPVESMIELDQLGQRSLNDTGSISEIGKTPHYVLTQRLH	88611	70519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_70747_71581_71669_71829_71883_72063_72141_72326_72393_72685_72864_73243_73393_73682_73783_73892_74027_74165_74226_74600_74734_75196_75351_75833_75953_76234_76361_76632_76726_76844_76955_77167_77233_87242_87356_87574_87693_87902
723030	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723031	contig_6076_pilon	-	2780	1	Intergenic	novelGene_81727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1162	1494	30136	29804	NA	75	AGTTTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRQKCNIQITPVTVLFLFPRLHFLVVDIHTHIHPGQFNHYVPPLWPFIPKLSDQSSPGAQWLKHSAANRKVCCWNPPATPREKDVAVFFHKDLQPWKPYRTVLLCPRSL	31297	28517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_28500_31300
723033	contig_7165_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_116813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGTCCCCAGATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140238	141113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_140200_141100
723034	contig_7165_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_116814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141838	143139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_141800_143100
723035	contig_11720_pilon	+	1351	10	Intergenic	novelGene_43962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	390.380156599521	5	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	392	1129	264034	272244	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQCVETLSLLISPGWPAWMEFQGEGVKFKMGQKRIPRQTLQRLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSWPQSTWDLPSTWSGPVALPTEPPSWLTAPTNTSCMGSLMRSRRREGQLDEPPHGGRHLAC	262262	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264166_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266512_271926_271961_272096
723041	contig_5696_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_117611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGGCTCCTTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937141	934563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_934600_937100
723048	SIRV4	+	432	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	867	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAACTTTAACCGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2322	2754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2800
723051	contig_3818_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_99305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATCTGCAATTTCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978116	977839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_977800_978100
723053	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723055	contig_5945_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_104523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_0_2400
723058	contig_10103_pilon	-	1785	15	Intergenic	novelGene_86158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	332.098030769254	3	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	858	1538	649919	638598	FALSE	15	TGTGCTTATCTCTCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAVESYAKALRMLPTIIADNAGYDSAALVAQLRAAHSEGNVTAGLDMKEGTIGDMAVLGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC	657001	638350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_638629_642595_642738_644399_644500_644796_644901_645103_645233_645632_645753_649864_649978_651359_651453_653439_653647_654456_654570_654694_654772_655131_655244_655980_656047_656148_656224_656945
723069	contig_2455_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_119211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGCACACCCATGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351669	1350766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1350800_1351700
723070	contig_9668_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_58165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGCAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475046	475601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_475000_475600
723071	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
723072	contig_3787_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_102420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCCCGCAGAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565245	566167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_565200_566200
723075	contig_7933_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_164673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	123	440	171531	171848	NA	90	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGISVCRKMCRNEGGRAAARTTAESKSQSRSGGNSDIPKLDTSAASTGRWMLVGSLAPVLMEARGCCPPALPAGALEPLLLASLTSTPTEGSWESKYLVFQFL	171408	171914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_171400_171900
723084	contig_2310_pilon	-	1592	6	Intergenic	novelGene_71609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAGGCGAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119230	106072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096
723089	contig_5780_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_29763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGACAGAAGGAAACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12065	10567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_10600_12100
723094	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723098	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723102	contig_10506_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_125175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACAATGATTGTGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29235	28733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_28700_29200
723113	contig_19792_pilon	+	190	1	Intergenic	novelGene_168200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTGCTCATAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21602	21792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19792_pilon_+_21600_21800
723118	contig_9345_pilon	-	1453	13	Intergenic	novelGene_24495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	345.390318657345	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1021	1410	667708	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	671872	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667808_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669367_669597_669655_670161_670369_670722_670798_670910_671048_671731
723127	contig_10689_pilon	+	1517	2	Intergenic	novelGene_118614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3826	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCAGAGTTAACTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51225	58988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592
723128	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723131	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
723132	contig_7870_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_109008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508228	505917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_505900_508200
723138	SIRV6	+	555	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	14	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723143	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
723148	contig_14441_pilon	+	924	5	Intergenic	novelGene_100407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	39	743	67671	117610	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSGMYFCASSPSTVLHVGYYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	67632	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67753_112108_112154_116578_116963_117220_117344_117539
723155	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_97505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723158	contig_7171_pilon	-	2501	30	Intergenic	novelGene_101297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.5809205658165	2	118	17	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1716	2339	1063000	1057783	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQVSPPTPTSQPCPLGLWWWRRVQ	1075806	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060904_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065059_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069158_1069212_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1071013_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075258_1075439_1075482_1075657
723161	contig_11709_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_168229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGGGGTGAGGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255410	254765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_254800_255400
723163	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
723169	contig_8330_pilon	-	1070	5	Intergenic	novelGene_71870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_4	390.159903116658	5250	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	137	589	962626	950747	TRUE	30	CAACGTGGTTATTGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGGPARSAHRASERESGPRELRSSPRAHTRLSFSLSLCAAIAVMLGAGLRRCAVAAAFRAGPRGLLHSAPAPSPAAAVQSVRCYSHGSHETDEEFDARWVTYFNKPNIDAWELRKGMNTLVGYDLVPEPKIIDAALRACRRLNDFASAVRILEVVKDKAGPHKEIYPYVIQELRPTLHELGISTPEELGLDKA	962762	946816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_947288_950736_950861_953221_953344_955449_955567_962526
723171	contig_5758_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_119065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAACATTAATGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80726	78131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_78100_80700
723172	contig_13481_pilon	+	2115	4	Intergenic	novelGene_119555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1041	junction_1	93.5129224581644	81	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	122	649	1568681	1578148	FALSE	50	TAGCAAAAATACCAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGALYPVRHLKLGARVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTGKTFI	1568559	1579614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050
723176	contig_8168_pilon	+	3172	1	Intergenic	novelGene_168242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATGGAACAGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165755	168927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8168_pilon_+_165800_168900
723179	contig_18888_pilon	-	1759	2	Intergenic	novelGene_168245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	167	1759	9799	6343	FALSE	35	GTAATTTCTAAAATCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKCHNTPQDRRPPSSCGRAAEEQNHQLIEATERGDVEKVQQLLERGADVNFQWKGGWTPLHNAVQHCREDIVHILLHHGADPCMRKHNGATPFILAGIVGDVNLLQLFLSKGSEVNEYDSNGFTAFMEAAAYGRVDALRFLHEKGADVNLRRKTKEDQKKLGKGGATALIDAAEKGHQNVLTILLDEMGADVNARDNMGRNALIHVLQSCRDGKVKAVTAETITRLLLDRGADVKVRGEGKKTPLILAVEAKELGLVQMLLEQKHIEINDTDSEGNTALLFAVKLGLMEIVCLLHHHGASLDCGDLVMIAKRDYNYPLVQFLLREGAREDFHPPAEDWEPQSSRWRVALKHLHGMYRPMIGKLKIFIVEEYKIADTSEGGVYLGLYNGQEAAVKRFCKDSKQAQNELSCLALSRGSNCLVTFYETESLKDCLYVCLALCERTLQEHFDMHRGEKAAEKEEGEKEEDEFAQNALLSIFKALQELHQNGYTHQDLHPQNILIDSKNAVRLADFDKSIKWTGDPQKIKTDLQ	9965	6342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18888_pilon_-_6429_8292
723186	contig_15304_pilon	-	992	4	Intergenic	novelGene_30429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1490.4765084436	6	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	198	596	54100	53260	FALSE	10	CCAGCTGCTTGTCTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEASFLAAGSPGRVGRTSPALPPTPRLGPNLPPFPKTQGTASHPRSTCCHHRRRSWR	54297	52863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53599_53689_53813_53991
723195	contig_8357_pilon	-	2456	19	Intergenic	novelGene_39747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	277.512590082542	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	182	1810	808111	762891	FALSE	40	ACAAAAACTTTATCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLLAEGITVVENIYKSREPVRQMKALYFVSPTSKSVDCFLRDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDSLFNKIKASCSKSIRRCKEINISFIPLESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPSNANGKDAVMETMAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818297	762244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808849_818245
723196	contig_5484_pilon	+	1742	11	Intergenic	novelGene_151080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	185.010161883071	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	462	1640	48767	342119	FALSE	15	CCTGTTCATTTTAGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSNTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANAGDRGQTNNAASASASNST	48305	342221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_48855_137609_137720_201596_201681_238751_238863_246565_246697_250578_250686_263868_263967_302319_302416_318738_318926_333538_333638_342051
723199	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_94136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723210	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_89438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723211	contig_1639_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_74912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	826	1236	324074	323664	NA	70	TCAAATTGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLAANWKVGSLNPSRGVLEERSGDLLWKNQPLKTLWSTVNSDTHGVLHGCNLLNGNWFSGVLILCARQHSRHLGNRGKQQQTKIPVLKKKKKKKKSPGGTMVKGLAANRKVSGLNPLAALQENYVLLYRLQPWKP	324899	323204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_323200_324900
723213	contig_3747_pilon	-	1186	5	Intergenic	novelGene_24983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	446.575021692884	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	406	783	271128	270395	FALSE	5	TGTCTCTAGTTTCTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEYGEIKNIHLNLDRRTGYLKGYTLVEYETYKEAQAAMEGLNGQDLMGQPISVDWCFVRGPPKSKRRGGRRRSRSPDRRRR	271669	269991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546_270684_270796_270934_271070_271149_271284
723217	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_91997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723229	contig_16948_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_166421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACAGGTCAAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392757	391578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_391600_392800
723234	contig_5317_pilon	+	887	4	Intergenic	novelGene_76545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5602.73808061737	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	22	432	35282	43326	TRUE	50	GCTATTAAAATACATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35260	43820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197_43510_43548
723236	contig_14326_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_120653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATGATGCTTACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26498	26267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_26300_26500
723239	contig_20075_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_168247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTTCTGGACAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25480	24429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20075_pilon_-_24400_25500
723240	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_94820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
723242	contig_8122_pilon	-	769	2	Intergenic	novelGene_40217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTGTGTGTTCAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412621	410152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_410895_412594
723251	SIRV7	-	293	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91622	11	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
723260	contig_15003_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_137331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTTAAGAAACCTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210610	208205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_208200_210600
723262	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723266	contig_16148_pilon	-	2329	3	Intergenic	novelGene_50382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_2	43	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCAAACAGAACAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153100	110244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_111491_150789_151734_152961
723271	contig_6217_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_109632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAAGAATGATGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464146	465346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_464100_465300
723272	contig_14522_pilon	-	3078	1	Intergenic	novelGene_147326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTTTTTTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113038	109960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_110000_113000
723276	contig_7188_pilon	-	2131	2	Intergenic	novelGene_108521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41450	39071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_40153_40400
723279	contig_16098_pilon	+	1247	9	Intergenic	novelGene_46160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.30718913883074	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	661	1071	457627	458757	TRUE	20	TCGGCGGCGCGTTCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPNFQHTAPFGKVSSVLLILGTALRQPIQPLGGGLAICSCQGYHTLVNLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASVDSSAARMPLPGATMR	456238	460244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456663_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458617_458704_458842_460152
723280	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_95355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657143
723281	contig_14322_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_116586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGGCCACAGCAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
723282	contig_2054_pilon	+	1873	2	Intergenic	novelGene_51651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1206	junction_1	0	60	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	18592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890
723283	contig_2444_pilon	-	1409	4	Intergenic	novelGene_83777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCCCCCAAGGTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243498	241257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_241693_242125_242300_242566_242742_242873
723286	contig_2924_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_140239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAGAAAATACAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6152	7144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_6200_7100
723294	contig_3975_pilon	+	2546	13	Intergenic	novelGene_54727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	31.1537406350434	228	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	195	1781	1610001	1634766	FALSE	0	GGTGCCTGGTTGGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAPSPEEKLHLITRNLQEVLGEEKLKEILKERELKVYWGTATTGKPHVAYFVPMSKIADFLKAGCEVTILFADLHAYLDNMKAPWELLELRTSYYENVIKAMLESIGVPLEKLKFIKGTDYQLSKEYTLDVYRLSSVVTQHDAKKAGAEVVKQVEHPLLSGLLYPGLQALDEEYLKVDAQFGGIDQRKIFTFAEKYLPALGYSKRVHLMNPMVPGLTGSKMSSSEEESKIDLLDRKEDVKKKLKKAFCEPGNVENNGVLSFIKHVLFPLKSEFVILRDEKWGGNKTYTAYFDLEKDFADEIVHPGDLKNSVEVALNKLLDPIREKFNTAALKKLASAAYPDPSKQKPVAKGPAKNSEPEDIIPSRLDIRVGKIISVEKHPDADSLYVEKIDVGEAEPRTVVSGLVQFVPKEELQDRLVVVLCNLKPQKMRGVESQGMLLCASIEGVSRKVEPLDPPAGSAPGERVFVKGYEKGQPDEELKPKKKVFEKLQADFKISEECIAQWKKTNFMTKLGHVSCKSLKGGNIS	1609806	1635531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1610058_1613560_1613708_1613828_1614005_1615732_1615863_1618540_1618622_1623225_1623319_1625157_1625294_1626016_1626103_1629259_1629396_1630195_1630294_1631348_1631543_1632778_1632921_1634655
723299	SIRV2	+	661	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-74	141	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGCCTACGTGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1651_1727
723301	contig_408_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_84934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	27	386	219714	220073	NA	85	AAACCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESITSFSLMLQMRTLRSTGVVTGLISQHQSLKIQDSNPVLMISRKTFFLLTLATLLETWKAITALLTIQGCDYMPRITQPRRQERLPREGWLLGSLVTYLSEHRWFSDPVRELKTNMLTLTSSSRIY	219687	221677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_219700_221700
723309	contig_9127_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_102999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	403	759	59732	59376	NA	45	TGATGAAATAACATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFATLLTKLSKLDVSLEDRLGTLALELMGAPAANKELTDSLLLAEELRGRCEAASLLVKSDTELTSGELTLTIPMDIALDSPGVRTELSGPNFLSAFSLPVSAVKVLVLALEDDPTSA	60134	57751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_57800_60100
723313	contig_6710_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_97940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653678	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
723316	contig_13348_pilon	-	1753	4	Intergenic	novelGene_162688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	19.3275853524323	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	23	1117	296331	257529	FALSE	20	GGGGTCAGTGATTTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVLDLGEERRRGSATSGPKMGRRAQLESAQTENQLSGKNSSLTLTGEAPPPKPPRRQGGWADDSMKATNAVLEDEPPRLEDTQNMTGEELPTQSRPNFSDTDEVKPPGYPLIIGTWNVRSMNDGKLEVVKNEMERVGIDILGISELAWTGTGRLVSKNHMVYYAGNDKLKKNGVAFIMKRSISKCLLRYNTVSDRLISIRLRGKPVNTTIIQIYAPTTNAKDEEIEEFYTMLQSEIDHTCKKDALIITGDWNAQVGSIEEGPVVGKFGLGDRNDAGERMIEFCKTNDLYIANTFFQQHKRRLYTWTSLDGLHREQIDYFCGKTRWRCLLTSVKTKPGASCGTDHRLLVCKFKVNLKKIRASP	296353	256892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_258412_263502_263568_292757_292851_296277
723317	contig_11429_pilon	+	1120	7	Intergenic	novelGene_60442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1028.31778756483	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	127	525	46162	48529	FALSE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDKTITTTKMRHAHVM	45365	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47497_48485_48530_48899
723319	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_93438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
723322	contig_7019_pilon	-	180	2	Intergenic	novelGene_149461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGCCCAGGTAGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524583	523632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_523718_524488
723327	contig_5643_pilon	+	1769	14	Intergenic	novelGene_39078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	786.428162286849	2	85	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	592	1557	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQEMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631257	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635446_636517_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640394_640538_640636_640729_641102_641244_641412
723332	contig_9901_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_126923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATGGTATGACTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120823	118606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_118600_120800
723335	contig_366_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_51570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGACTCAGGGCAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750177	750482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_750200_750500
723337	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723341	contig_6102_pilon	+	789	3	Intergenic	novelGene_31808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6373.5	37	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360135	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360615_360864_361056_361102
723343	contig_8651_pilon	+	443	4	Intergenic	novelGene_168190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3160.6362580271	90440	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	33	404	185122	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185089	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_187011_189168
723347	contig_10013_pilon	+	1881	12	Intergenic	novelGene_125083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_8	235.474025168225	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	734	1819	474427	479307	FALSE	10	GTCCGCAGCCATCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEHDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWMELRHMHIADVSKKVTELLRTFCDSKRLTTDKANIKDLSHILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDAMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHCSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGPSSRLERKERLEPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRKLWPFVSDPAPTPSSQAAVSARFGHWHKNKAGVEVRAGPRLIVYVVGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKTLDQKLEDIPLP	473614	479369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_474315_474393_474525_474618_474727_475078_475137_475264_475331_475428_475510_475838_475978_476437_476548_477338_477435_478243_478330_478470_478629_479221
723350	contig_5018_pilon	-	2426	13	Intergenic	novelGene_46942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	74.7289546739861	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	74	1774	316115	301750	FALSE	10	CTGTAGCTTGAGGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGDQRGRRVGLRPAGPDSGRRGAMRGAQAAPFRLRPLSNPWLLSLLFLLLNRIRPQGSPGPMQCYRIGLLGDLNCSWEPLGDSRTPSTLHFQSQKYISPYSHLNRTQVVAVPTGQSWVTIPREQFTEFDTLLVWGAEADGPLWPPISVDLETRVKLDAPRLCPDINFSEDDPLETTVHWAPPTLRPHQKDMVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	316188	301097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312666_312747_312921_315476_315595_316015
723356	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723357	contig_753_pilon	+	3261	1	Intergenic	novelGene_112944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751181	754442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_751200_754400
723360	contig_3601_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_132836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGTAATATTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93204	93495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_93200_93500
723364	contig_14744_pilon	+	1706	3	Intergenic	novelGene_66051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2700	junction_1	2862.5	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	20	427	1382976	1383476	FALSE	35	CACCCAGCATAAACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMVRFGGCSRLDVFSLSANTLKICMY	1382037	1384755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302
723365	contig_6735_pilon	-	983	10	Intergenic	novelGene_15778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	817.531711168094	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3	524	564868	543101	TRUE	30	ACCCTTATGCTGAGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRRTGRL	564870	541990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542192_542503_542601_542790_542857_543005_543120_547305_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
723368	contig_14208_pilon	+	2197	2	Intergenic	novelGene_129088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGGCCTGCAGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174061	212824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_175913_212478
723369	contig_9875_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_154423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTCTTAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426406	424515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_424500_426400
723371	contig_6616_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_141765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTAGGAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355669	358254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_355700_358300
723372	scaffold_15027_pilon	-	2452	2	Intergenic	novelGene_163572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCCACAGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84589	81359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_82707_83484
723375	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	1	503	1	-333	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTCGAAGTACTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	1617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
723377	contig_3986_pilon	-	2102	13	Intergenic	novelGene_52704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	112.494783829691	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	148	1449	60653	35584	FALSE	40	AAATTTTAATAAGCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPV	108542	34930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35589_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396
723384	contig_6673_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_163999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	3	440	2698	3135	NA	45	AAACCATACAGCACCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTNIWTARGRHRWWSREGTDRFSGLRYKVCTFRLLYSSYFKYCQVPVVPPLSKVLIHLTLLKEVEEEEDCANLTVLWFRRDYHHLGSLSDFNCNILLSVKLCICSFSVAVIVTSIFAKHNIKILQIQPKAVCYSCNTILTYINTR	2695	3393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_2700_3400
723388	SIRV5	+	389	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	875	55	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
723390	contig_12624_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_60983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACAGAGTTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75538	73293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_73300_75500
723392	contig_8362_pilon	+	2293	1	Intergenic	novelGene_150689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCACGTTAGCAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115767	118060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_115800_118100
723393	contig_13894_pilon	+	1170	9	Intergenic	novelGene_62140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2544.30191801209	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	105	833	521729	526523	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKAAGTPRSYPARPTEGCARLPVLGPGILPVWPSLWHVLGRRATITALRSTRRSTRLARATLSRMAN	521624	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525647_525799_526477_526580_526860_526948_527459_527565_528084
723398	contig_15449_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_33632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAACAGGAAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65568	66953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_65600_67000
723401	contig_16666_pilon	-	1352	4	Intergenic	novelGene_61741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
723403	contig_9848_pilon	+	2847	1	Intergenic	novelGene_79935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92733	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_92700_95600
723406	contig_14289_pilon	-	1064	6	Intergenic	novelGene_110559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	385.276731713712	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	531	953	58752	51527	FALSE	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66613	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66273
723408	contig_17522_pilon	+	2137	3	Intergenic	novelGene_160793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	153.5	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	32	439	57911	64416	FALSE	10	CACACTTGTCTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVGPAVAAGAMVGGEAAAAVEELVSGVRQAADFAEQFRSYSESEKQWKARMEFILRHLPDYRDPPDGGGRLDQLLSLSMVWANHLFLGCSYNKDLLDKVMEMADGIEVEDLPQFTTRSELMKKKLKQPGQLCPTPQASLAVWWTQ	57879	66114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_58150_59690_59791_64347
723411	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723412	contig_11512_pilon	-	2175	2	Intergenic	novelGene_43295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTACGGAACCCTTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409397	366018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368132_409335
723413	contig_2219_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_67186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141337	140463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_140500_141300
723419	contig_10341_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_47246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTGAAATCCCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156490	158186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_156500_158200
723424	contig_16643_pilon	-	1263	7	Intergenic	novelGene_158123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_6	1492.11088357698	1330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	343	876	243304	231365	FALSE	5	TTTCATGCTTTTCTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSYAAVEPGGPCPGRLAPRCGRAAVSRARRGAPQADTAPCWRAPVSFSRVRELVLDNCKSNDGKIEGLTAEFVNLEFLSLINVGLISVSNLPKLPKLKKLELSDNRIFGGLDMLAEKLPNLTHLNLSGNKLKDISTLEPLKKLECLKSLDLFNCEVTNLNDYRESVFKLLPQLTYLDGYDREDREAPDSDAEVDGVDEEEEDEEGEDEEDEEDEDGEEDFDEEDEEDEDEDVEGEEDEDEVSGEEEEFGPDGEVDDDEEDEDEDEDEEEEESGKGEKRKRETDDEGEDD	254669	230977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_231433_232651_232722_234526_234649_237584_237775_243220_243344_247251_247402_254516
723427	contig_8330_pilon	-	1877	9	Intergenic	novelGene_71769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTATAAAGAAAGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658581	650893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_651595_653905_654027_654809_654977_656163_656257_656346_656478_656694_656777_657148_657227_657416_657506_658166
723428	contig_6375_pilon	-	1779	7	Intergenic	novelGene_73012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	22.0504472113883	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	151	900	364700	359165	FALSE	35	GACACTTACACTGCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGDFCLPGEGMEILQQVCSKQLPPCNLNEEDLLHNPYFGKLLLSLSQHVDESGLSLTLAKEQAQAQKEVRLHRTAWLRSEILQRVIQELLVDYYVKTQDTNLIPEDKKFHETLEQRLLVTELTRLLGPSQEGEMPSLLGLEKADLLELMPPSEDFVWMRARLQLEVEEQLKKKCFTLLCYHDPSSDTDSETLKAAKMWKLAEVLVSEKQQCQDTKSQQKERMVLLEKQIATFSQVCQGRGTASPPLP	366609	358285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_359353_360206_360304_361156_361292_361625_361758_361846_361990_364645_364731_366489
723434	contig_5084_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_64651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAAGCCTATGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448433	1446446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1446400_1448400
723440	contig_14034_pilon	-	1621	3	Intergenic	novelGene_72651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	155.5	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACATTATCTGCAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337287	318230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_319462_336699_336797_336994
723443	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723444	SIRV5	-	412	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTCGCACACTTCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
723446	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723453	contig_5253_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_61596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355703	353632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_353600_355700
723454	contig_9708_pilon	+	2073	8	Intergenic	novelGene_67270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	118.269667648617	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	20	754	768056	803598	FALSE	25	GTTACCTAAAGTGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768036	804917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781455_795600_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
723455	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723459	contig_14326_pilon	+	1635	11	Intergenic	novelGene_120696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	78.2509424863369	21	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	107	469	221889	226301	TRUE	15	GCTGGCTACGTGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVASGDGGKSAGVCVSGDSKCGRSYRFFPPGLATMSSTLAKIAEIEAEMARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQACLIRG	221782	249144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_226280_226392_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_245640_245751_248840
723460	contig_6710_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_93440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCTGTTCTGGAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
723463	contig_7357_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_36851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTGTGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172386	170617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_170600_172400
723464	contig_2069_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_23577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAGGATGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2326325	2324514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2324500_2326300
723469	contig_20753_pilon	+	1489	3	Intergenic	novelGene_168252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGAGCATGTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39910	66782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_+_40181_65434_66259_66387
723470	contig_12425_pilon	+	1448	8	Intergenic	novelGene_46633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	198.16927416855	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	496	1302	179275	198400	FALSE	65	TTGAAAAGAATATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167059	198546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175637_179141_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
723473	contig_10324_pilon	+	1928	11	Intergenic	novelGene_7911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	92.7869064038671	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	311	1399	824693	835746	FALSE	0	GTCCTTTGTGTCTGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSLLLLLPFCSAVEVKRPRGVSLSNHHFYDESKPFTCLDGSATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGNFHCTNTGYKPLYIPSSRVNDGICDCCDGTDEYNSGIVCENTCKEKGRKERETLQQMAEVTREGFRLKKILIEDWKTAREEKQKKLIELQEGKKSLEDQVEMLRTAKEEAEKPEKEAKEQHRKLWEEQQAASKAQQEKELVASTFQELDDDMDGMVSVAELQTHPELDTDGDGALSEGEAQALLGGDSQTDANAFYDRVWAAIRDKYRSEVLPTDQPAPTTDLTEPKEEQPPPVPSPPSEEDEEEEEAEEEEEEEEEEEEPEAQGEQPKVCAAPVWEGDGGDQHDGA	824382	836275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_824778_824994_825112_825629_825726_825821_825880_826747_826866_828320_828451_831514_831600_832602_832682_833524_833612_833912_834094_835693
723474	contig_18342_pilon	+	1050	8	Intergenic	novelGene_154557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	183.724505381158	48	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	171	1016	36952	63440	FALSE	45	ATTTCCAAAAGAAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASGVKRTARCARNYSIVLLWQHFLGYWGNVLCSSCPQMLMWQKQHLRQHCQEIHCLQQNSRNIFQKIYPDSNAITPLEKVPKSNSEF	26155	63474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655_60762_61547_61624_63265
723475	contig_1986_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_64155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCATAGCAACCGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394357	395013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_394400_395000
723477	contig_9883_pilon	+	1523	3	Intergenic	novelGene_87589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.5	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	299	685	94173	96211	FALSE	40	GTGTAAATAGGGAATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPGKGGGSKEKNKTKQEKSKKKKEGDPKSRTSKEDNRAGNKREDL	83821	97049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84037_94089_94301_95952
723478	contig_10943_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_168270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAACTCACAATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66667	66314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_66300_66700
723480	contig_9720_pilon	+	1951	2	Intergenic	novelGene_116781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	713	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	630	1073	391741	392184	TRUE	20	ATTGAATGGTGATTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQVSLALGALSSTARTSQRRSGLSLIGPLSRRL	391111	393857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392465_393259
723484	contig_2733_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_128577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGGCAATAATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739748	740760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_739700_740800
723490	contig_16205_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_156889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTCAATGAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112045	111310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_111300_112000
723493	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_96794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723499	contig_12635_pilon	-	1902	2	Intergenic	novelGene_60796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1166	1480	151125	150811	FALSE	30	TGATGCTGGAAACTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKAVSIMDTMKKLQCCCNYINHKCIFEKRFAHLDWKYHVIKPLTQTSSSVSCHTLCPFPSVSLPTHNHTHCLYNPIYPHKLPNARSVATESRQAPALGLKFS	155059	150388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_151278_154046
723500	contig_5210_pilon	-	2298	9	Intergenic	novelGene_65470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1267	1980	812652	807587	TRUE	20	CAGGAACCGGGTCCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTQAKENRWAEWVGSGVAARELRRGHTADGTSEMVGVSQWFSKFCLFEQFVAIITFDPVGLHCRDVTHEVLGQADAKDLEEGDSHKDPSHDDQVVLQPLLKLAHAAFGVDEALLLQLLGFEPDVVATLGVENILRRVSDAAGEGHSAALPARVQVSAVEIDIEVPVVGPSGSTARPVFLSKVNEVLEVNVIPVGLNVAVDEEVELVSNPVLEDKGQDPCCQFQEEDEAKEHGEKL	813918	803772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_803901_807296_807347_807446_807596_808816_808988_810095_810221_811046_811093_811632_811754_811829_811891_812471
723506	contig_11285_pilon	+	1150	8	Intergenic	novelGene_5637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	526.327127267785	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	366	803	767140	769849	FALSE	10	CTGTCTCTTGACTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPLSRASVVQISVTAVLLASAVRPGVPSVCPRRSCAGTPL	766126	770196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768061_769732
723514	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-51	875	-51	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8264	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
723519	contig_5423_pilon	+	2258	2	Intergenic	novelGene_85291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGTCACTTGACCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581367	584601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_582157_583132
723520	contig_8631_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_121962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGCATGCTTCCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750195	750792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_750200_750800
723522	contig_8631_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_121963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAATAAAAAATATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751206	752911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_751200_752900
723523	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
723529	contig_17989_pilon	+	3132	1	Intergenic	novelGene_150839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1980	2435	269614	270069	NA	70	ACCAAAAAAAAAAGAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKATTALSPGSQGRAAKAGDDSLGRAAAGQPQGPPYSKAGPRSCSCRASRIRFNSRKGCLKSKSTFSVDSCRGRETPPLEGSVSRILCSAHDESSSTTTGWKKQDLHQESYGPSHSHLSSGEAECRKLGFPKCGLQSPPTTVVLETGPGLH	267634	270766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_267600_270800
723535	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723542	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723547	contig_15327_pilon	-	1786	12	Intergenic	novelGene_70767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	78.1646915701998	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	14	1321	1169101	1130175	FALSE	30	AAAGATGGTGGAGACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSLTLNLCCEKIPASSMILNPGPHWPRVGA	1169114	1129709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130263_1135749_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
723557	contig_12414_pilon	+	867	3	Intergenic	novelGene_59556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	333	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370805	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373063_373882
723558	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	191	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723559	contig_5260_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_144369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268176	267259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_267300_268200
723560	contig_6136_pilon	+	1299	6	Intergenic	novelGene_154111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_3	158.688373865258	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	120	977	460275	494274	FALSE	35	ACTGAGCCTCTGCAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FETSKQLLDEVEVATEPTGSRIVQDKVFKGLDLLEKAAEMLSQLDLFSRNEDLEEISSTDLKYLLVPAFQGALAMKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	460155	494596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460680_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
723561	contig_8476_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_121345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1715	2050	161884	161549	NA	80	AAAAAAACAAAACAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNTDYTMSFQRNKQMCLRGSTDRMLLRLEDGKTCLAYFGHVIRRDKLLEKDIMLGKVEGQQKSERPSRRWIDTVAATMRSNIATIVRMARDQTTFCSLICGVSTKQS	163598	161218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_161200_163600
723562	contig_11071_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_131021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGCTCTCCCCATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75370	73917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_73900_75400
723565	contig_18108_pilon	-	2647	4	Intergenic	novelGene_33526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	825	junction_1	15.7480157480236	68	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	188	613	287542	282621	FALSE	80	TAGAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGTGDRGSNQPSGPWVVYLFPRAAVTVPHTGGL	289433	280586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_282852_284892_284983_287437_287588_289291
723576	contig_2854_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_120856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGGAGGTCAGATACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321329	323069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_321300_323100
723577	contig_9668_pilon	+	1244	6	Intergenic	novelGene_58144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_4	231.059645979128	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	90	869	332086	359314	FALSE	25	TAAATGATGGTGCTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	331996	359689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
723581	contig_14522_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_147334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	264	581	149994	149677	NA	15	TTCTCTGTTTATGGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRGVYKYLFESLLSILLGTYLGVELLNHMAVLCLTFGETRKTIFHRGCTILQCHQQCMRVSVFSHPRQHLLFSIFLIIAIIVKVKWYPIMILICIPLMETLVA	150257	149007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_149000_150300
723587	contig_11751_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_150286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5673	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	48	623	113589	113014	NA	35	TTGCTTCATATTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMTIPYQPMPATSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQVARQQSHFAMLHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTTHELTIPNNLIGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKGMGCS	113636	112663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_112700_113600
723588	contig_7962_pilon	-	2129	15	Intergenic	novelGene_149317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	87.2628272542677	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	196	1905	450659	446742	FALSE	35	TGTTACAGCTTTTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPPRLSRSGAPSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREVCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHVPRAPAPGEGEGPSPWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGHLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLHARTPPPVEPTGDGAPTSFPSGQGPGGGVSRPLGKRRRLEPEPLRQRQKGKVEELGRPSAVRNHPEPQEQRERARLQRALQASVSPPPPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMFASFHPSASTAGTSGDGEPPDRSPLELHIGFPTDTPKSAPNSMTASSSSVPAPSPGLPRRSAPPSPLCRSLSPGTGGGARGGAGSGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGSIF	451588	446517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_447037_447202_447284_447562_447658_447742_447933_448056_448159_448332_448401_448509_448634_448774_448844_449035_449132_449318_449468_449592_449697_450116_450213_450327_450410_450500_450676_451409
723590	contig_5286_pilon	-	2135	3	Intergenic	novelGene_157365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1198	junction_2	294.5	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	917	1366	560568	558602	FALSE	50	AAAAGAAAAAGAGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVFCVVEHYENAIEYDCKEEHAEFVLVRKDMLFNQLIEMALLSLGYSHSSAAQAKGLIQVGKWNPVPLSYVTDAPDATVADMLQDVYHVVTLKIQLHSCPKLEDLPPEQWSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQVFSIARNK	561484	557832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_558753_559504_559632_560396
723598	contig_2069_pilon	-	1151	6	Intergenic	novelGene_23442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	439	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	107	379	1331269	1327936	FALSE	30	CTGCCTGAAATACCATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEQCEEEARTTPGSTKARAPLHPRVQRLRPAAVATMPKRKAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1331375	1327163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
723600	contig_7179_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_78066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGTCTTTGATGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402740	401628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_401600_402700
723602	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723610	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
723614	contig_3004_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_127495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTATGGTATTCTGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280794	280087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_280100_280800
723617	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723628	contig_7396_pilon	+	2473	5	Intergenic	novelGene_79655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	9.90896059130321	54	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	414	2294	273886	275766	FALSE	25	CTGTTAGTTGAAGGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTGIALRVETWLSATWHVKVPLMWLEACINWIQEENNNVKLSQAQINKQVFEQWLLTDLRDLEHPLLPDGILEVPKGELNGFYALQINSLVDVSQPAYSQIQKLRGKNTTNDLVTAETQVPEKPWEAKASRMLMLQITDGIIQMQGMEYRSIPALHSDLPPGTKILIYGNISFRLGVLLLKPENVKILGGEVDALLEEYAQEKVLARLIGEPDPLVSVIPNNSNRSIPRNTDILDPALEPSDEELLASLDENGELAANNDTLERGHFSTGSSSNTKTARQPSFEPGFVISQRPNEEPPNQSVHFIDGELDDFSLEEVLLLEETVQKEQLEAKELQPLTWNRNTDKSIERIPHKSNTLNSFSSICKNGNNNWNEKNVSEQITNKDRSFGCPSAREQNSSVFSVDHNIPLPHDFTNKDKNSKIDNKEKQTVSSSDGCSLNNKILSRELVSYVPERSLQISNENDHYLQTCSLRSSENNSNPSITTDLYSPPFIYLSVLMASKPKEVTTVKVKAFIVTLTGNLSSSGGIWNITAKISDGTAYLDVDFADEILTSLIGFSVPEMKQLKRNPLQYQKFLEGLQKCQRDLIDLCCLMTISFNPSLSKAVVLSLQDVTMEHLENLKKRLNK	257691	275945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_257872_262643_262684_263174_263238_272967_273062_273849
723630	contig_401_pilon	-	2028	5	Intergenic	novelGene_42924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTACAAGATGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1952517	1944934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1945593_1946389_1947080_1948358_1948493_1948787_1948908_1952091
723631	contig_7594_pilon	+	1047	6	Intergenic	novelGene_55439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1158	junction_5	668.383303202586	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	56	622	544633	554556	FALSE	45	GTCAGATATTATGACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	544577	554981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
723639	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723646	contig_2799_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_85483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501471	499660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_499700_501500
723649	contig_11932_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_85421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	11.5	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	197	583	362661	360996	FALSE	40	GAATCCCACCAACGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTSGLSISGLNPLPNPSYLLPSRIFSSTTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIGESFEEILEETVISTKKTEKSNIEESTISSQKI	423195	359266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_361306_362584_362710_423047
723650	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
723654	contig_1910_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_168278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45622	46684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_45600_46700
723655	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
723663	contig_13481_pilon	-	1359	3	Intergenic	novelGene_119385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	571	junction_1	349.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCCAGAGTGGCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536282	526079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157
723666	contig_7945_pilon	+	2952	2	Intergenic	novelGene_161600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1528	1929	388861	389262	FALSE	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFYPFKIWCMGVNSLVYSLCIGHLPWHGCWGQQDEQAHRGFMVQGAWRGGGDELKENTSKDRICREIVSVRRSIQDCGGGSVWVLFCIWWPGQGSQAETRRDYENKSLDVWWKRVVGQGNGKDPEARTGLGV	387250	390285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_388516_388598
723667	contig_20693_pilon	+	1806	12	Intergenic	novelGene_60247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	721.795248089989	3	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	291	1211	21258	34175	FALSE	25	TATTATGTATAGTCCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEEDFLHAKKYLSLFLVLDNAFYNKYKGNLPVIRSFVFDVINLLNVIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPNFLTGKMELMILSLSRVISII	14713	34770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19530_21228_21261_23923_24001_25834_26022_26227_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29865_34111
723669	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
723679	contig_8570_pilon	-	1511	1	Intergenic	novelGene_120150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323365	321854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_321900_323400
723682	contig_14142_pilon	-	1062	5	Intergenic	novelGene_120514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	346.191421037553	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	44	784	347473	346151	TRUE	20	AGGAGGAGTCCGGGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLAVFFSGALLGLLAAKGAGNDCPHKKSATLLPSFTVTPTATESTTSSGTTSHRTTKSHETTSHRTTTTNTTSHRPTTVTHNPATTTSHGNATVHPTSNSTATSPGITTSPEPGPPPPSPGPTPGSKEAIGDYMWHNGSQPCVRLQAQIQIHVLYPTQDGGEMWGVSVLNPNKTKVQGSCEGAHPHLLLSFPYGQLRFGFKQVQSGHSRLRIHPFEISKPPWARASAAEMQASLFHQLSTLTCSS	347516	345539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_345773_346105_346277_346596_346723_346896_347337_347424
723684	contig_15114_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_121226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTACTTTGGTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675352	1677161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1675400_1677200
723688	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_98035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTCTTCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723690	SIRV4	-	318	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1205	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723692	contig_9807_pilon	+	1210	8	Intergenic	novelGene_32915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	444.25470723219	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	279	986	147193	158783	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	140838	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
723694	contig_1339_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_163089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTGAAAAAATAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15990	13427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_13400_16000
723700	SIRV2	-	581	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	34	3117	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
723701	contig_9505_pilon	+	1384	12	Intergenic	novelGene_121838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	220.909465020259	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	144	794	507673	597995	TRUE	35	GATTTTCAAAAGCAACGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGRLHRGGLCANRRGPCRTTVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	507529	632874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_507740_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
723703	contig_7331_pilon	+	1678	2	Intergenic	novelGene_67233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGCGTGCGATAGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472261	474002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_+_473645_473707
723705	contig_8581_pilon	+	1060	3	Intergenic	novelGene_22806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCAAACCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283628	316635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_283873_312024_312088_315882
723714	contig_17075_pilon	-	1942	4	Intergenic	novelGene_131757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_3	2056.37550613263	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTAGAAGTTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91219	88013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_90723_90984_91038_91136
723715	contig_10399_pilon	-	752	2	Intergenic	novelGene_114480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACCGTTATATAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209333	205785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_205915_208710
723720	contig_6227_pilon	-	2337	8	Intergenic	novelGene_49798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	88.6840298072722	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	850	1554	1291269	1260481	TRUE	45	ACACAAAAACAATGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1308753	1252259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1252484_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1292061_1308695
723721	contig_15063_pilon	+	1238	4	Intergenic	novelGene_14331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	275	1096	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34884	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
723722	SIRV4	+	341	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	436	173	-436	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCAATTGCTCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
723725	contig_6445_pilon	-	781	9	Intergenic	novelGene_77072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_7	72.6118748897176	8	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	207	779	703326	695335	FALSE	20	CCAGAAGTTGGTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSRDLCPHLDSIGEVTKEDLLLKSKGTCQSCGVAGPNLWACLQVACPYVGCGESFDDHSTIHAQVKKHNLTVNLTTFRVWCYACAKEVFLEQRLAAPAPGPSPKFSEQDSSSPSHPLKAVPIAVADEGESESEDDDLKPRGLTGMKNLGNSCYMNAALQALSNCPPLTQFFLECGGLVRTDKKPALCKS	727068	695332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_695411_696685_696756_697294_697392_698952_699085_699597_699661_701312_701367_703245_703343_705709_705813_726981
723726	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723727	contig_12977_pilon	+	1555	16	Intergenic	novelGene_122782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	664.236952366314	1	25	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	138	1160	10884	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSAALACSCLPELLQTAPACSWLLALGRPCLGQESVLCCSRRPRMMPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10699	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10762_10808_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
723728	contig_20710_pilon	+	1992	6	Intergenic	novelGene_159777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	909	1352	10390	11279	TRUE	20	TTCTGGGAGGGCAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNLHTFLPNTLSDASFFPPFPLHSNFELQGFRPHRCWEPRTDRCLLARYWLCVYPEAMATEEAGPAQQLDVAFLPAGGSRGHRAAQSSFEAQFSSEGKLHSCCHHARHIVNVQELDSRFFTIVINSNSLSNSSSSSKRSYTCSRS	2473	17741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20710_pilon_+_3068_10075_10778_11223_11356_11827_12035_14698_14792_17477
723729	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
723730	SIRV6	+	566	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1636_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723731	contig_5331_pilon	-	2301	11	Intergenic	novelGene_112833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	127.445243143869	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	594	1415	790559	779458	FALSE	50	TATATATAAAGAGACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKCLPPRTASNESAESPEAAPTGAPPAEQPDVIPPQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSAQMGAVDLLGGGLDSLIGSTNFTPPAAAVPASLGAPIGSGLSDLFDLTSGVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAEAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSLTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN	797761	778571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_789024_789127_790517_790720_791290_791551_792042_792142_797687
723732	contig_18869_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_56242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAATAAAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73350	73731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73700
723735	contig_10861_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_39405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1917296	1917568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1917300_1917600
723752	contig_14556_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_138537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCTGGGTTCAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186275	188032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_186300_188000
723753	contig_990_pilon	+	3479	1	Intergenic	novelGene_76099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	783	1115	1364785	1365117	NA	50	AATAAATTACCAAGACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCDFLDGILQPNVTFSSDSSSTRRTNIMPERAHGNTTWPVAPSVFPVLRELLGISLENLDNKCYIDNYSGLQGPRLLKQLPIITLLVRISSVCLSLGFFLNTGKRRSQR	1364002	1367481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1364000_1367500
723758	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
723759	contig_7467_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_69480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGGACTCCTTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82345	82794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_82300_82800
723761	contig_12605_pilon	+	639	3	Intergenic	novelGene_64171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	29	397	3897	4829	FALSE	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3868	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
723762	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
723763	contig_6576_pilon	+	2018	1	Intergenic	novelGene_42369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	532	879	1125662	1126009	NA	30	AGACTCTGGAGCCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLNVYASSNIISRYIKQNLEVNTGDHNLPLSVVMEQAKKKERRDIEYLANTVNQLDLTHTENYPPKLQNKTIRLKVDGELDTCPVPKNHPTEDWNMHMNTHTSTMEKTVVTLMQ	1125130	1127148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1125100_1127100
723764	contig_6576_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_42370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCCCCTCCACCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127148	1127757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1127100_1127800
723765	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723766	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723768	contig_10904_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_22597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGCAGCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467341	465558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_465600_467300
723772	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723773	contig_9161_pilon	+	1572	3	Intergenic	novelGene_160650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	9.5	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	177	719	108217	111738	FALSE	25	CAGCCTATTTTAGTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKSRVKLKSQEIIPFPGTKMMRNLLCVHVSVSGNELYLMTSHLESTRGHAKERINQLKAVLKKMQEAPESDTVIFAGDTNLRDQEVTKCGGLPNNILDVWEFLGKPEHCRYTWDTQMNSNLGIPNTCKLRFDRIFFRAAAEEGHIIPRSLDLLGLEKLDCGRFPSDHWGLLCNLDIIL	108040	112591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_108307_109922_110094_111456
723775	contig_15952_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_154101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753252	752464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_752500_753300
723783	contig_8044_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_132387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510203	512488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_510200_512500
723787	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723790	contig_3270_pilon	+	811	6	Intergenic	novelGene_104430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1374	junction_1	4370.44833398131	32956	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	309	779	44259	46726	FALSE	20	CAGTTGTTGAGTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	43851	46758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44241_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
723791	contig_8576_pilon	-	1624	3	Intergenic	novelGene_88770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	99.5	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGAGAGATTGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763038	759814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_761077_762178_762324_762821
723792	contig_1146_pilon	+	2654	4	Intergenic	novelGene_84838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_3	84.3853594463452	47	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	908	1477	918724	921040	FALSE	75	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPIKAFTADFVRQLLIGLPNQALGLTLCSFISALGVDIIAQVEAKDFGAESKVSVDDLCKKAVEHNIQVGKFSQLVMNRATVLASSYDTAWKKHDLVRRLETSISSCKTSLQRVQLHIAMFQWQHEDLLINRPQAMSVTPPPRSAILTSMKKKLHTLSQIETSIATVQVCFVRSSSLRILVLEIKYT	916065	922217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_916161_917817_917969_918062_919096_920842
723793	contig_7308_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_159609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCAGGTACTTGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519729	519433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_519400_519700
723794	contig_7308_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_159608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	276	831	83	913	519351	518521	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGKLSSVLSSHICIIEQNVPCVRLYFHNYHVCDRSRRTPVQSGVIKDSVIRCVVMCHRVRF	519433	517592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_517600_519400
723801	contig_10020_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_168283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTTCTGAAACTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61974	62425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_+_62000_62400
723802	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
723804	contig_6870_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_103949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATTCCTGAGAAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248651	1249318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1248700_1249300
723807	SIRV4	-	175	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAACGTCAACTTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2600_2800
723814	contig_11978_pilon	+	1949	11	Intergenic	novelGene_62912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	112.0125439404	10	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	38	1237	848223	862940	TRUE	10	ATTGGCTATGTTGTCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALEVAAGTELGIMEGERMASLTPDTPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAAMHAPGSRLQCTYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRLALERGSSAQEALHVITGLLERYGQGGSCREDPMPFCYHNTFLLADRTEAWVLETAGQLWAAQRIREGARNISNQLSIGTDISAEHPKLRAHAQTQGWWGGQGTFDFAQVFSLTQQPVRMEAAKARFQVGRELLRQQQGGITAEVMMGILRNKESGICMDSGGFRTTASMVSILPRDPTQPCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPKVLSPTFGAQDPARTLPRFQTQVDRRHILYQGHQVALGLMESEQAGCLPSRLSAMAPRLLPATVV	848185	867003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_848238_848605_848780_849083_849266_849842_850043_850524_850741_850841_851008_851099_851281_862874_863045_865281_865447_865690_865836_866705
723820	contig_15273_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_140437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGTTGAGTCGATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125347	125821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_125300_125800
723821	contig_7066_pilon	+	1891	9	Intergenic	novelGene_42189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	54.0287828384094	591	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	196	1494	994581	1003261	FALSE	20	CCCAGAGTCTTTGAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKDCPLQFHDFKSVDHLKVCPRYTAVLARSEDDGIGIEELDTLQLELETLLSSASRRLRVLEAETQILTDWQDKKGDRRFLKLGRDHELGAPPKHGKPKKQKLEGKVGHGPGPGPGRPKSKNLQPKIQEYEFTDDPIDVPRIPKNDAPNRFWASVEPYCADITSEEVRTLEELLKPPEDEAEHYKIPPLGKHYSQRWAQEDLLEEQKDGARAAAVADKKKGLMGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993692	1003658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997150_998459_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
723823	contig_3181_pilon	-	1603	10	Intergenic	novelGene_136934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_9	67.7283973121256	745	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	79	1191	322396	310415	FALSE	50	AAAGAAAGTTTACAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPSPQTKPSNPSNPRVFFDVDLGGERVGRIVLELFADIVPKTAENFRALCTGEKGIGPTTGKPLHFKGCPFHRIIKKFMIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFYYKHDQEGLLSMANAGPNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGMGVARILENVEVKGENPAKLCVIAECGELKEGEDWGIFPKDGSGDSHPDFPEDADIDLKDVDKILLITEDLKNIGNTFFKSQNWEMAIKKYAKVLRYMEGSKAVTEKADSSKLQPVALSCVLNIAACKLKMSDWQGAIDSCVEALEIDPSNTKALYRRAQGWQGLKEYDQALADLKKAQEIAPEDKAIQAELLKVKQKIKAQKDKEKAAYAKMFA	322474	310002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_310504_311292_311336_311428_311516_313189_313332_315990_316098_316236_316360_317405_317595_319464_319572_320966_321108_322311
723824	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91657	-7	-91651	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCGATTTCTTGAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
723830	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
723832	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
723834	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723842	SIRV6	+	359	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3140_10713_10819_11031_11109_11205
723843	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723845	SIRV1	+	1325	6	NNC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-9559	-820	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	86	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACGTGTCATGTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_+_1495_6354_6467_6554_6796_7540_7817_10280_10365_10645
723847	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_94791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
723850	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
723852	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
723853	contig_9272_pilon	+	1712	6	Intergenic	novelGene_125919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	113.943845818895	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	28	624	322407	327292	FALSE	30	TTTTTCTCGTATGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASEGRGDRMGKAAAVALGAEVGVRLALFATFLVTELLAPFHRLIQPEEMWLYRNPYVEADYFPTKPMFVIAFLSPLSLILLAKCLKKADTADSRQACLAASLALALNGVFTNTIKLIVGSCICWPGLCFLLPGREATLLHTTRPWEILEVLCLPVTSTFRSCDCTVPYLRLQASLARCPSWIHDWPDFCLRLLQAVLSSTDGCRMP	322379	328380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322478_322741_322851_323324_323416_323879_323944_325357_325529_327201
723855	contig_16148_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_50385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGAAAAAAAAAACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136546	134173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_134200_136500
723860	contig_7078_pilon	-	2049	7	Intergenic	novelGene_130175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	327.232206035205	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	515	1366	771415	759709	FALSE	10	CCCTTCGCACCCTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEESVDSLSEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQISNLRDEVEAKEKLITDLQE	771929	759025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_759823_759916_759979_760495_760614_761213_761403_766006_766151_767864_768072_771397
723866	contig_14744_pilon	+	771	7	Intergenic	novelGene_66088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4508.17116159338	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	180	758	1383156	1386680	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGKNGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVLCSLSQMEFILTNWCSRFLAKNLIK	1382976	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385240_1385902_1386006_1386499_1386542_1386599
723870	SIRV2	-	290	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	1831	2274	652	334	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTAGCTTTGAACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4080	3309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3326_3665_3826_3966
723871	SIRV6	+	425	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10397	4	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11397	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
723879	contig_9988_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_113057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108284	106389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_106400_108300
723880	contig_14243_pilon	-	2484	7	Intergenic	novelGene_57441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	97.6742033497074	3	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1740	2315	705976	702878	FALSE	40	AAAACAGCATTGGGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	707799	702708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_706122
723881	contig_14273_pilon	-	2155	5	Intergenic	novelGene_21132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	23.6008474424119	2	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	349	1827	24983	20455	FALSE	25	GCTTTATTATTATGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGICCSVNFSVEHFSKDLKEDLLYNLKQRGPNSSKQLLKSDVNYQCLFSGHVLHLRGVLTPQPVEDERGNVFLWNGEVFNGIMVEAEENDTQIVFNYLSSCKNESDILSLFSKIQGPWSFIYYQASTHYLWFGRDFFGRRSLLWHFNNLGKSFCLSSVGTQTSGVANQWQEVPACGIFRIDLKSAAISKCVILKSYPWKYISRENVIKECVDSLTQISADLPKIVSVEANEAKLYLEQSVVPLNMVLPPAAFETHCTDISRVPPIRETLQVCLTDRHMKEVVQQFIDVLSISVKRRVLYLPRDESLTSNVLKTCDKRASIAILFSGGIDSMVIATLADRHIPIDEPIDLLNVAFMTKEKTIPTSSNKKRSKQKNHCEIPSEEFSKNLAATADDNPDKQLSVPDRITGRAGLKELQAVNPSRIWNFVEINVSLEELQKFRRTRICQLIQPLDTVLDDSIGCAVWFASRGIGCVVTQDEVKSYQSNAKISFPG	29306	20126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_20473_23522_25076_25991_26068_27254_27309_29180
723882	contig_18168_pilon	-	1227	5	Intergenic	novelGene_122080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.123562766773	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	132	995	26622	23694	FALSE	35	TGGAAGAAATATGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGIGDFVFCSWCLNVSVFLSA	26753	23461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23748_24815_24935_25038_25315_25964_26241_26483
723885	contig_3018_pilon	+	2089	14	Intergenic	novelGene_78946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	42.9397541353825	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	442	1353	1362096	1438845	FALSE	30	CCTGTTACATCACCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANVLPGFLRLQELTDRNVTVIFLSEIIWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILCHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQQDDTDPGQLKGLSAYTHVELPYYSKFILIAAYLASYNPARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKTSNHLLGPKSFPLDRLLAILYSIVDSRVAPTANIFSQITSLVTLQLLTLVGHDDQLDGPKYKCTVSLDFIRAIARTVNFDIIKYLYDFL	1350534	1439581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1350696_1354411_1354505_1356706_1356864_1362065_1362141_1365533_1365646_1368023_1368155_1384570_1384620_1384708_1384800_1388934_1388988_1389909_1390023_1395834_1395883_1399266_1399378_1429642_1429756_1438799
723890	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2840_3125_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723895	contig_15545_pilon	+	894	2	Intergenic	novelGene_120121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAACATACAACTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9188	27815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
723896	contig_7870_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_108951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACTACATCATTACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310456	311024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_310500_311000
723899	contig_11130_pilon	-	1605	5	Intergenic	novelGene_53091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	968.01988615937	82	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTCCAGTCATGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55213_61257_61340_62521_62608_64167_64208_66884
723901	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723907	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
723911	SIRV6	+	551	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723920	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723925	contig_17127_pilon	+	2241	2	Intergenic	novelGene_168298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAACCCTAATAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41523	46496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_43071_45802
723927	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	1	1157	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
723932	contig_4114_pilon	-	2343	8	Intergenic	novelGene_15580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_7	33.0095842606541	229	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	473	1033	187266	181497	FALSE	30	AATGTTTTCTAAACCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFAARLLRPAQSCRPRHRSLHLSAVRDEAVVISGRKLAQQIKQEVRQEVEQWVASGNKRPHLSVVLVGENPASHSYVLNKTRAAADVGISSETILKPASISEEELLNLISKLNNDDNVDGLLVQLPLPEHIDERKVCNAVSPDKDVDGFHVINVGRMCLDQYSMLPATPWGVWEIIKRTGIPTLGKNVVVAGRSKNVGMPIAMLLHTDGAHERPGGDATVTISHRYTPKEQLKKHTILADIVVSAAGIPNLITADMIKEGAAVIDVGINRVQDPITAKPKLVGDVDFEGVRKKAGYITPVPGGVGPMTVAMLMKNTIIAAKKLLRHEEREVLKSKELGVASN	205364	180186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_181661_184673_184800_185336_185430_186427_186536_187196_187350_187763_187887_190049_190235_205283
723944	contig_16768_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_168321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTTTGCAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59834	57656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_57700_59800
723955	SIRV1	-	212	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3887	5	3613	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6753	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
723956	contig_3787_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_102432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620461	622994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_620500_623000
723957	SIRV6	+	532	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	38	-2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	180	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
723958	contig_10734_pilon	-	1884	12	Intergenic	novelGene_50988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	42.2941294795123	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	279	1151	306589	294524	TRUE	70	AAAAAGAAAAGAGAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGWRHNHHAHTGAGCSDRREDVEKFKAQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVKSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRISVKEKGVAASSTQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEALVKRVTILCIHGKMKYKRNKIFMEFRKLQNGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYVKFLAINQKVCCLLF	308542	293360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_293530_293959_294660_295378_295472_296402_296535_299615_299699_302298_302489_304461_304612_305497_305526_305677_305732_306582_306670_306762_306814_308395
723959	contig_8075_pilon	+	2021	8	Intergenic	novelGene_42491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_7	149.459707217807	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	9	785	664009	685509	FALSE	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCMCGNNMSAPLPAIVPAARKATAAVIFLHGLGDTGHGWAEALAGIRSSHIKYICPHAPIMPVTLNMNMAMPSWFDIIGLSPDSQEDEHGIKQAAENVKALIDQEVKNGIPSARIILGGFSQGGALSLYTALTTQQKLAGVVGLSCWLPLRTSFPQGPISGANKDISILQCHGDFDPLVPLMFGSLTVEKLKTLVNPANVTFKTYEGMMHSSCQQVNVWKRWLQSHICNFFHVIFFLSFGGKFIGNKTFAILTFFTCTVQ	664000	686745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_676735_676802_677759_677808_681283_681355_681594_681669_684219_684322_685194
723960	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	424	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
723961	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	488.532723798746	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	193	741	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	122144	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_122188_125517_125902_126159_126283_126514
723962	contig_12624_pilon	-	1683	5	Intergenic	novelGene_61101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	5	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	65	436	955704	948779	TRUE	20	TACTTTTCTAATGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATAKPGPTRARWTLACDNILATAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955768	947478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948479_948531_948842_950590_950768_952913_952978_955636
723966	contig_12938_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_99755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAATAATAAATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93061	95255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_93100_95300
723974	contig_14322_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_115938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	251	307	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671355	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
723978	contig_21203_pilon	+	1131	2	Intergenic	novelGene_84464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	261	437	4320	4496	FALSE	65	TGAAAAAAAAAAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQIWDTAGQERFRSITQSYYRSANALILTYDITCEESFRCLPEWLREIEQYASNKVITVLVGNKIDLAERREVSQQRAEEFSEAQDMYYLETSAKESDNVEKLFLDLACRLISEARQNTLVNNVSSPLPGEGKSISYLTCCNFN	979	5190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_1166_4245
723979	contig_20371_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_129188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAAAAAAAATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75410	76178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_75400_76200
723982	contig_13800_pilon	+	1937	12	Intergenic	novelGene_153703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.008567991938	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	21	953	94219	142298	TRUE	65	AAAAAAAAGAAAACACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDCRRMDGASSGGGGSSEGGGDSGGSGSILLKYSLPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKNIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAARGIICLDRGRV	94198	162901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_114262_114436_125048_125211_125894_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142266_142360_154784_154913_159543_159684_162246
723986	contig_401_pilon	-	1487	3	Intergenic	novelGene_42884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.5	439	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	646	1290	1778759	1778115	FALSE	10	TGCTCAGATGTGGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIYFVLGLSSVGIFYCLIHRQVKRAAQALDQYKLRQASVRSNHVAGIDEAMPGRFQELDSGLSSGGPSEGISSEPVSAATTQTLEGNSSEVGNEGKSKMAKQMAEGSPPEAPAKARPTKGAQKAQDSSSEFGKVTRMCFAVFLCFALSYIPFLLLNILDARVQAPRVLHMLAANLTWLNGCINPVLYAAMNRQFRQAYGSILQRGPQSFCRLR	1779941	1777917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1779035_1779074_1779314_1779810
723991	contig_5253_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_61583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGTTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308136	305880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_305900_308100
723998	contig_5797_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_56948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331821	332999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_331800_333000
724004	contig_10904_pilon	-	1346	8	Intergenic	novelGene_22754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	360.022164850546	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	30	1100	662714	652201	FALSE	20	ATCTCTACTGTTGTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662743	651954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662059_662106_662222_662408_662445_662665
724005	contig_4083_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_152315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	390	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTCCACTCATCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19782	21534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_19800_21500
724007	contig_15114_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_121246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCAGCAGAATGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1738650	1739096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1738600_1739100
724008	contig_6710_pilon	-	421	2	Intergenic	novelGene_98246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	CCTTAGGCCTCTGGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724015	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_93602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
724016	contig_13765_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_165868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGAGTTTCAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3361	4499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_3400_4500
724017	contig_8920_pilon	-	2268	3	Intergenic	novelGene_146059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	18.5	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	716	1582	64349	63483	FALSE	35	TCTAAACCAAGTAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNNVNKTNMRESFNREEPYDYEKNFSNISNFIQQPQIVIEEKSQMCNICGKLFRRNSYLIQHERIHKQEKPHKCHECGKAFDHSSNLIHHQRIHTEEKPYECSECGKTFRRSSHLIQYQIIHTGEMPYMCNECGKAFGRSSSLTQHQRIHTREKPYECNECGKAFSQSSNLIEHQRVHTKERPYECNDCGKTYSHNSHLIEHQRVHTGETPYNCNECGKSFSRTSLLIKHHRIHTGERPYECIQCGKTLSWNSHLIQHKKTHGGIKPYEVKNVRKQSSIVHTLLII	76222	62796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_64428_74320_74440_75704
724018	contig_16103_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_118739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGCACGTCCCTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305729	305304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_305300_305700
724021	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
724024	contig_2867_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_135258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATATTCCTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286330	1285025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285000_1286300
724026	contig_6795_pilon	-	1358	7	Intergenic	novelGene_27659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	118.870260742075	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	220	639	129029	46282	FALSE	30	CATGCTGTGGATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAENKSTDSRVCEGKRCFHHPNRFKIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPRGGYQHNST	134319	45562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_74615_74765_110795_110852_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
724034	contig_16951_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_98663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	281	577	111216	111512	FALSE	25	CTAACAATTTGCTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCPEMLFPVPAWRCQPQQQLPLHVHTTCASSLTPGCIAKGSGLGTSASRVPSPAKVVLVKDNSFTDNWKLDFWKSSMYLRENRSYLLPPVKYYGNMS	110495	111513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_110582_111021
724035	contig_4364_pilon	+	2314	11	Intergenic	novelGene_202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	124	junction_8	168.000624998837	411	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	549	1532	1280138	1286814	FALSE	0	TGTCGTTGTCCCTGCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRALLCLALAAAAGVRADAAEEEDHVLVLNKSNFEEALAAHKYLLVEFYAPWCGHCKALAPEYAKAAGKLKAEGSEIRLAKVDATEESDLAQQYGVRGYPTIKFFKNGDTASPKEYTAGREADDIVNWLKKRTGPAATTLADGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDFAKQFLLAAESIDDMPFGITSNSDVFSKYQLHEDGVVLFKKFDEGRNDFEGEVTKENLLSFIRHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYEGKLSNFKKAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEEEMTKYKPESDELTADKIKEFCDQFLEGKIKPHLMSQELPEDWDKQPVKVLVGKNFEEVAFDEKKNVFVEFYAPWCGHCKQLAPIWDKLGETYKDHENIVIAKMDSTANEVEAVKVHSFPTLKFFPASPDKTVIDYNGERTLEGFKKFLESGGQDGAGDEDDLEDLEEAEEPDMEEDDDQKAVKDEL	1276169	1287596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1276320_1277650_1277858_1279811_1279946_1280080_1280219_1283804_1283910_1284006_1284133_1284418_1284620_1284965_1285087_1285190_1285373_1285758_1285846_1286733
724036	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724042	contig_7695_pilon	+	2153	4	Intergenic	novelGene_41571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTCCGGCCGACCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388146	397090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_388902_390190_390779_390835_391252_396696
724049	contig_6691_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_60162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTACCTTTTTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373320	372475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_372500_373300
724050	contig_3866_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_112440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCAGATAGATGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287443	286993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_287000_287400
724051	contig_7457_pilon	-	1322	6	Intergenic	novelGene_31354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.46197490365	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	139	750	321396	317540	TRUE	10	CTGCCTGCCTTGGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGRKDPAATTLSSPPPPPNVLRTIAASHVLKPSNSAPHPSPGRLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321534	316920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317221_317267_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116
724053	contig_16724_pilon	-	1081	7	Intergenic	novelGene_105309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	738.322140622461	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	143	799	569099	541872	TRUE	35	ACCAAAGCAATGTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	571174	541146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541869_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072
724054	contig_13051_pilon	+	1823	15	Intergenic	novelGene_140141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	333.926394186943	127	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	290	1495	680923	709585	FALSE	20	AATTCTGAGTGCTGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRRFQLPTSRITLVPNVGLKLSISHASVAISGKWKARKSFIKTRGHFDLSVEGISISVDLNLGSNSNSGQPTIACSSCSSSINRVRLHISRSKLGWLIRLFRKKIESVLRKTINSEICKAVRKAVSSELQPYFQTLPVTAKIDAVAGIDYSMVAPPLATANSLDLQLKGEFFSLAHRTPSRISPSALVFPTERDRMVYLGISDYFFNTAGFVYQRAGVLKLTLTDDMIPKESKFRLTTKLFGTLIPEVTRRFPNMKVRILLSVTSPPHLTVDSTGLALTPELEAQTFVVLPNSSLAPLFQLGLSTNVSVMVGVNSDRLIGQLTMDKLQLKLKHSDVGPFSVQSLQTVMNYLLPLLVLPSVNERLQKGFPLPLPARIRLFNLVLQPRQDFLLFGADVYYG	659679	709913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_659852_661933_662050_680921_681051_682927_683090_684565_684630_690355_690420_692091_692184_695464_695642_696735_696796_697731_697900_699209_699278_701884_701928_706424_706489_707612_707690_709546
724059	contig_1918_pilon	+	2188	2	Intergenic	novelGene_168331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	167	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACAAGATAATCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49531	53694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_51870
724060	contig_10235_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_46473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	932.071617420035	6	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	393	788	222843	219464	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRSWQLRTLSPTQLGWMYLPSFLPTSRIQTQHSMTIWRRGS	224484	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220190_220354_220481_220677_220788_222804_222956_223231_223370_223694_223780_224427
724064	contig_13464_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_125253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATAAATGGTATCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590331	589634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_589600_590300
724065	contig_5981_pilon	+	1832	9	Intergenic	novelGene_35497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_6	259.197198094424	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	17	1255	23508	37804	FALSE	45	TCTGGAACTCGATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23491	38381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
724068	contig_11285_pilon	+	1174	5	Intergenic	novelGene_5627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	153.740650122211	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	102	851	768710	769878	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYHVDPGELGGLGGRAGGWNTGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	766050	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766116_768673_768857_769085_769320_769421_769653_769740
724069	contig_1008_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_121590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	967	1305	704095	703757	NA	45	TCAACTCTCTTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSEFSSLYLGRAKIEGRKSRCHEVSTLGAEVRGGLLAKPDRWWEKELASKSDEFHSEHADIDETMNCPQERASGPLIIREYSAGKRSGLRSHPRLQSCELITEVRPGSTKN	705061	703754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_703800_705100
724071	contig_10434_pilon	+	4107	1	Intergenic	novelGene_82029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTTCTCAGTTACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130357	134464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_130400_134500
724078	contig_1996_pilon	-	1447	8	Intergenic	novelGene_131933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	372.967963826407	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	176	949	509912	508483	FALSE	5	CGGACCCGGGGGCGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511097	507984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509964_510973
724081	contig_7744_pilon	-	2103	10	Intergenic	novelGene_62537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_7	259.220388620462	289	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	60	1694	857410	835679	FALSE	10	CCCATGGTGTCATTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYLSQPNTVKCSGDGIGAPRLPLPYGFSAMQGWRVSMEDAHNCIPELDNETAMFSVYDGHGGEEVALYCAKYLPDIIKDQKAYKEGKLQKALEDAFLAIDAKLTTEEVIKELAQIAGRPTEDEDEKEKVADEDDVDNEEAALLHEEATMTIEELLTRYGQNCHKGPPHSKSGAGTGDESGSQGLNGETGPEDPSRETPSEENGPTAKAHTGLSSNSEHGTEAGQVGEPGTPTGEAGPSCSSASDKLPRVAKSKFFEDSEDESDEAEEEEEDSEECSEEEDGYSSEEAENEEDEDDTEEAEEDDEEEDEMMVPGMEGKEEPGSDSGTTAVVALIRGKQLIVANAGDSRCVVSEAGKALDMSYDHKPEDEVELARIKNAGGKVTMDGRVNGGLNLSRAIGDHFYKRNKNLPPEEQMISALPDIKVLTLTDDHEFMVIACDGIWNVMSSQEVVDFIQSKISQRDENGELRLLSSIVEELLDQCLAPDTSGDGTGCDNMTCIIICFKPRNTAELQPESGKRKLEEVLTSEGAEENSNSDNKKAKRD	857469	835269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_835883_836203_836307_836777_836908_837298_837534_837881_838020_838561_838978_839650_839784_840281_840368_840855_840926_857290
724090	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
724095	contig_9011_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_159301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGACAGGAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436790	438079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_436800_438100
724106	contig_14546_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_157437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGTACGGATGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502648	500314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_500300_502600
724107	contig_8377_pilon	-	1835	4	Intergenic	novelGene_35161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	7	junction_1	39.0213616710984	119	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTATGGTGTTTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425364	339265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_340320_352215_352636_381079_381241_425164
724111	contig_10324_pilon	-	1221	2	Intergenic	novelGene_7696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_1	0	3491	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	147	647	24495	22912	FALSE	15	CAGCGCGAGTGGCTTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEEVRAGDRLSGAAARGDVQEVRRLLHRELIHPDALNRFGKTALQVMMFGSPTIALELLKQGASPNVQDISGTTPAHDAARTGFLDTLKVLVEHGADVNIPDGTGALPIHLAVREGHTAVVSFLAAESDLQHRDARGLTPLELAQQRGNRDLMDILQGHTVASL	24641	22337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_23272_24354
724112	contig_7171_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_101437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGGGCGGGAGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667436	1665610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1665600_1667400
724114	contig_4857_pilon	+	1708	5	Intergenic	novelGene_48819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_3	56.7274184147313	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAACTGTTAATTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331354	1339924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335236_1335517_1336704_1336828_1338029_1338119_1338905
724116	contig_14158_pilon	+	2705	2	Intergenic	novelGene_136120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	284	junction_1	0	72	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	49	351	18010	21343	FALSE	25	TTGGCAGCTGAGCACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPHCSRSRGVPVHLRTMSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYPSCMSDAAAELG	17961	23697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118
724120	contig_6494_pilon	-	733	6	Intergenic	novelGene_108580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1673	junction_5	473.442287929585	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	33	731	8286	2668	FALSE	15	TGCCATGCCCCAGCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEP	8318	2665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
724121	contig_9345_pilon	-	2351	22	Intergenic	novelGene_24541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	194.757457161931	1	117	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	799	2046	727435	724440	TRUE	10	CCTGGAGTCTGTGTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLKQHLEITGGQVRTRFPPEPNGILHIGHAKAINFNFGYAKANSGICFLRYDDTNPEKEEANFFTAIYDMVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKVRWLCGEPGGDL	730082	723451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_724193_724261_724352_724473_724611_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727393_727480_727596_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770
724123	contig_10496_pilon	-	1704	9	Intergenic	novelGene_59431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	66.1735407848182	236	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	452	1240	187240	110723	FALSE	15	GGATGGAGTTGGTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGLRCFRLAHPAFCNSLAALTRPVSEVTLKTMSGKQNDHRQYMAYPALPVRHFATKKAKAKGKGQSQTRVNINTTLVEDIINLEELDEEMKSVMEALKDNFNKTLNIRTSPGSLDHITVVTADGKLALNQIGQISMKSPQLILVNMSSFPECTAAAIKAIRESGMNLNPEVEGTLIRVPIPKVTREHREMLVKLAKQNTNKAKDSLRKIRTNAMNKLKKSKDKTSEDTLRLIEKQISQMADDTVAELDRHLAVKTKELLG	195346	110258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_110801_124523_124684_154723_154816_163846_163966_168841_168998_187056_187269_187903_188122_189193_189354_195301
724130	SIRV6	+	555	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1761_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724131	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_97010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724133	contig_848_pilon	-	1884	5	Intergenic	novelGene_83343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	223.343345546716	249	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	185	688	571558	559092	FALSE	35	TCACAAAGTAAGTACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTSSNLQKAIDLASKAAQEDKAGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVKYEAQGDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKKKEKKPQKPVKEGQPSPAEDKGNDSDGEGESDDPEKKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFPHLFTGEVTVT	571742	557895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_559232_563380_563449_566202_566360_567558_567671_571531
724135	contig_5947_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_101512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATCTAAATCCAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423788	423173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_423200_423800
724151	contig_6589_pilon	+	875	7	Intergenic	novelGene_26120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_4	2566.73851089926	42	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	14	562	1876599	1880297	FALSE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMVRGPGLG	1876585	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150
724152	contig_14441_pilon	+	1104	6	Intergenic	novelGene_100471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	438.306103083222	3	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	130	369	85675	121862	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASRPAGREQKLRPSAEAPG	85443	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85862_121809_121872_125517_125886_126155_126283_126514
724153	contig_8651_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_168193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8620	junction_2	31.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	267	368	189217	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185620	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185757_186928_187011_189168
724162	contig_5643_pilon	-	929	6	Intergenic	novelGene_39126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.237851895587	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	11	604	649521	646519	FALSE	20	AGTCAAGCCCTCACGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLQMVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTRDSLIKAKK	649531	646193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647316_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344
724169	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACAACTAAAATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
724176	contig_5461_pilon	+	1956	7	Intergenic	novelGene_156810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	69.1023797628482	64	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	145	993	206753	264281	FALSE	65	TCTGTTAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFQYPDVYRDETAVQDYHGHQVCDPYAWLEDPDSEQTKAFVEAQNKITVPFLEQCPIRGLYKERMTELYDYPKYSCHFKKGKRYFYFYNTGLQNQRVLYVQDSLESEARVFLDPNILSDDGTVALRGYAFSEDGEYFAYGLSASGSDWVTIKFMKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGKFCFKHR	206608	265244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_206798_213485_213561_233706_233841_235158_235290_239959_240170_242392_242515_264149
724178	contig_7229_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_39872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGCTTTGGTTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527967	1530587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1528000_1530600
724185	contig_10106_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_73888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAGAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154209	155151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_154200_155200
724192	contig_16098_pilon	-	1148	10	Intergenic	novelGene_45793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	340.116973342342	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	409	903	35742	31519	TRUE	30	AGAATAAAGGCTGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPQIDTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSNGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36309	31114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35720_35749_35907
724195	contig_12842_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_168345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1812	2240	163926	163498	NA	65	AGAAAAGACAAAAGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVADGRRVIPPAQVPVIPASGIMDNQPLKGPLKKSLSRGPGASFILALPSLSALSLKHQAPQGRFGLSRLPHNNHNDHNHQSQQSCGFYSLGPILNFSGAQLLAVPSIPGSISGTSLSLPVAPSVLSVMYLKIHIREASA	165737	163010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_163000_165700
724198	contig_11720_pilon	-	1120	13	Intergenic	novelGene_43909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.296040039848	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	89	1018	124674	118106	TRUE	55	ACACAAAGGGATACAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	134610	116918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117021_118105_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124711_134558
724199	contig_5643_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_39146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	455	754	657330	657031	NA	75	AAAAAAAGAAAGAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLAVPLLPAKSSFGAKGETLVGGVEGPMSPLCAPPCTLPYLSPASQESVVFLLPIYYDCICAATTTPPMGGREGLQGPRLLHFFYLGTVPDKITSVY	657784	655989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_656000_657800
724202	contig_9460_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_155305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAACTATAAAATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34249	33899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_33900_34200
724204	contig_18096_pilon	-	2171	5	Intergenic	novelGene_58062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_4	45.9374574829735	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	292	336	121594	121550	FALSE	25	ACATCATTTTTGATTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHCDEVGFNADEAHNIVKECIDGVLGGEDYNQNNINQWTASIVEQSLAHLVKLGKAYKYIVTCAVVQKSAYGFHTASSCFWDTTSDGTCTVRWENRTMNCIASVFAIAIVL	130853	119714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_121627_121914_121993_122639_122764_128438_128481_130838
724205	contig_15219_pilon	+	1960	2	Intergenic	novelGene_40846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCAGTATCCCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61026	64282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_61077_62372
724209	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_96027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
724213	contig_935_pilon	-	1849	7	Intergenic	novelGene_45515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	37.2275286433157	74	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	542	1495	27171	19993	FALSE	45	AACCTTTTAACATTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDCIKTIVCQERKKDPIEMFCSGRLVKVCAPMVRYSKLAFRTLVRKYNCDLCYTPMIVAADFVRSLKARDSEFTTNQGDCPLIVQFAANDARLLSDAARIVYPYANGIDINCGCPQRWAMAEGYGACLINKPELIQDMVKQVRNEVENPRFSISIKIRIHDDLTRTVDLCRKAEATGVSWITVHGRTVEERHQPVHYDAIKIIKENMSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	32136	19638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_22450_22574_23645_23764_26040_26163_27055_27193_31616
724216	contig_13894_pilon	-	1281	4	Intergenic	novelGene_62044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	679.409711113666	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	170	1204	288137	286290	FALSE	10	GTACTTCTGCAGGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTAFSSSVAVTDKDTFESSLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288306	286212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287357_287477_287538_288132
724220	contig_8138_pilon	+	1330	5	Intergenic	novelGene_52434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	204	659	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280091	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306916_307630
724222	scaffold_12124_pilon	+	2010	9	Intergenic	novelGene_21991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	156.168928967961	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	143	910	799011	807554	TRUE	30	GAGATGCTTGGAATCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791833	815334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798987_799072_800004_800148_803837_803972_804060_804234_807297_808331_808432_808463_813915_813998_815122
724223	contig_4213_pilon	+	2339	3	Intergenic	novelGene_124825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATGAAAGATTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157443	166051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_159534_162609_162699_165891
724225	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724228	contig_10732_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_114694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTAAAAAGTAAAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93660	95848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_93700_95800
724230	contig_6710_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_98106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724231	contig_5013_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_110099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATAGGACAGAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245002	243759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_243800_245000
724235	contig_10904_pilon	-	2099	7	Intergenic	novelGene_22617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	299.149581684852	178	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	949	1419	505089	499813	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	515114	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505173_507164_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034
724237	contig_12543_pilon	+	2117	5	Intergenic	novelGene_168377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.76662979332984	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	164	1795	310720	319603	FALSE	25	TGTGCAACCTGAATTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSKEAVTFNDVALVFTEEELGLLDSAQRKLYRDVMVENFMNLVSMGIHPFKHNIFYLIREKSLWIMKPRTQREGNSGSKIQSEMETTPEAQPHEELSCWQIWQQIARVLTRYQDSMINRSQFCKQGDSSCQVEAGPSIIHTGEKSYQCNECTETFSDVSSFDLHQQSHSGEKSHTCIECGKSFRYSSILRIHQRVHMKKKLCKCVDCGKEFSQSSHLQMHQKVHTIEKSPKCEESGKGFSHRSALNVHCKVHTQEKTCNCEECQRSFICALHLPERQKINTGKKRFKCDACGENFRRRSALNTHYLLHPGEKPYKCEECGKGFNQASHLLIHRRGHSGEKPFKCEECGKRFVQKSHLRSHQGIHAREKPYKCEECGKSFMTKYYYEFHLVAHTGDKPYKCEVCGKGFSRRGDHKIHCRIHIGEKPYNCEECGRAFIRASRLREHQRIHTGEKPFKCDACGKNFHFRSSFINHYRMHTGEQPYKCEHCGKGFSFRSKLYIHKRVHTGEKPYNCKECGKGFTQASYLLTHQKVHTGEKPFKSK	304451	319925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_304551_310655_310735_311118_311246_312280_312374_318206
724240	contig_414_pilon	-	2359	6	Intergenic	novelGene_115097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	29.2191717883995	270	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	200	1066	338494	305102	FALSE	20	GATTTCTATTAATCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSTEQLLLSSCLAKREEMKVKECVPILPHKESPSAWFSKDGKLLSMTLLLTLLSSCLTVVSFYQVATLQAELLSLQAKLQSYQAEQLPAPSKAEAGAPAAAWRETPADTPGLQGILAPPAPGESNSSQGGRSKRAAQSLEETVTQDCLQLIADNETPTIRKGSFTFVPWLLSFKRGRALEEKENKILVKETGYFFIYGQVLYTDNTFAMGHLIQRKKVHVFGDELSLVTLFRCIQNMPETLPNNSCYSAGIAKLEEGDELQLAIPRENAQISQDGDGTFFGALKLL	338693	303808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_305215_308524_308676_308763_308877_318141_318199_337963_338052_338149
724242	contig_17059_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_166095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACGTATTGTTCGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488785	490709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_488800_490700
724243	contig_13901_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_146644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCTTGAGTGTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173955	174716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_174000_174700
724250	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724254	contig_10734_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_51165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	364	1095	68	1162	998765	999859	NA	25	ACACAGTCTGGGGTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHAINKISNQTATIISSVLWGITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGEPDNNRSTSMELTEDQNTSRNAPEALMVNSSEPWSPQHLTPTSP	998697	1000775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998700_1000800
724255	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
724259	contig_14925_pilon	-	926	4	Intergenic	novelGene_55211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	146	403	29675	27020	TRUE	35	ATTTGGAAGAGCAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29820	25804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
724261	contig_5302_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_81534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCTTTATTGAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575107	1576989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1575100_1577000
724275	contig_3095_pilon	-	906	5	Intergenic	novelGene_75203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	409.110315196281	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	328	564	248564	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	253668	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535
724276	contig_9424_pilon	-	974	5	Intergenic	novelGene_143780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1989.26299166299	44	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAACACCTGTTCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280479	277215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279339_279629_280079_280144_280458
724277	contig_4531_pilon	-	2102	10	Intergenic	novelGene_47903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	33.8755893757667	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	91	1353	369728	345822	TRUE	30	TGCATATCATGCTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLAGFKDPALYTSWLEPDNAFNVWKTQRAFNKYEKSAALVSNSQFLVKPLDVIVGKAWNMFASK	370808	343926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_344614_345039_345097_345816_346010_348653_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370754
724278	contig_14322_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_115815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671841	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
724281	contig_5671_pilon	+	998	5	Intergenic	novelGene_79432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2248.47574758991	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGTGCTTGTATATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368841	531744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370579_392775_392919_521218_521303_531205
724282	contig_10437_pilon	+	1456	7	Intergenic	novelGene_38312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1243.99513218054	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	145	846	439767	451096	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSW	431123	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451089
724285	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724287	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724289	contig_20614_pilon	+	914	8	Intergenic	novelGene_107549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1131.33724378882	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	108	821	152671	155100	FALSE	25	GATAGTTTGTCTTCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYSLGEPRAGQESGNQRPPWLLLTPRSPFAPGPAAMAVEGGMKCIKFLLYVFLLAFCACAVGLIAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLVALVGCCGACKENYCLMITFAVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152076	155193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152588_152737_153645_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
724290	contig_9389_pilon	+	2398	8	Intergenic	novelGene_83954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1756	2292	207892	213787	TRUE	15	GCCTGCGCTAGTCAGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLPAVSLGRMIFTTWPRFIPKYRATGSPAWILGSWFSRSLYRASSSVTSSLVMTTCSGTSSCSVMLMSSSCCRNCSRMYLGAMSTRDCLAEGVMPCCTTMRARVMFSSCMRWQYTLMVLMPTLGSSGKKTNIWSVGSSLWATSTVRSVRRGRPSLGLSPNWALNSSSVWSSSSCVTR	205497	215530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_207219_207857_207933_208218_208301_208414_208474_208771_208853_209776_209895_213631_213805_215441
724292	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724294	contig_3095_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_75197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAATGCTTGCAGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231737	232972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_231700_233000
724298	contig_7816_pilon	+	1168	8	Intergenic	novelGene_66526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_1	1044.23873257615	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	98	1063	195914	211658	FALSE	40	AATGAATTGTCCCCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	195816	211763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
724303	contig_18869_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_56045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATTTTCTCCTTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
724304	contig_10323_pilon	+	2216	2	Intergenic	novelGene_123639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	928	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	315	674	523023	523382	TRUE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWTVKLSWLLKIKQHPSKETSTSPGCSRWGHAPGAGHLPQPLGDTVEKSKRCGGLRVSAAFSFKLFCRWRLSRKSLQSQKPVLLLSRASYMSLGKFLNLLNIGLHYKGQGRVMRNQAT	522708	525976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_523860_524911
724308	contig_7870_pilon	+	2939	1	Intergenic	novelGene_108947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300450	303389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_300400_303400
724310	contig_5889_pilon	+	1460	13	Intergenic	novelGene_133673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	110.887424144189	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	709	1299	196991	323066	FALSE	35	ACTTAAAATTTCCCATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVKLFPQETLFLEAKE	20412	323227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168810_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_322982
724315	contig_8167_pilon	-	2006	10	Intergenic	novelGene_155660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.0692943909253	3	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	334	1326	148855	137246	TRUE	35	CTGAGTAGGTCAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKWPLPGPVTQKMSLVSAVFDQVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKALLPSMIERRQGHVAVISSIQGKISIPFRSAYAASKHATQAFFDCLRAEVRQHEIEVTVISPGYIRTNLSLNAITADGSRYGAMDKTTAQGRSPADVARDVLTAVGKKKKDVILADLLPFLAIYLRTLAPRLFFSLMASRARKERKSKDL	180490	136490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_136621_136695_137452_139852_140006_143293_143387_143934_144212_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_180432
724321	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
724334	contig_5899_pilon	-	696	4	Intergenic	novelGene_146953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	292.091690322672	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	205	696	53130	12694	FALSE	20	TGAGTCTGATGTCTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEIDHWNNEKEKIVLITDKTLFICKYDFIMLSCVQLQRIPLHAICRICLGKFSFPGMSLEK	84477	12693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_43099_43192_52908_53140_84282
724335	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
724338	contig_16930_pilon	-	1175	2	Intergenic	novelGene_139151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATAAGTGCAAATATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84701	82673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_82769_83621
724339	contig_6102_pilon	+	2407	15	Intergenic	novelGene_32050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1681	2070	561512	562419	TRUE	5	GCCTGGCCAGGCTGCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTVAIRSYTQTPCSSSALAAPHCTSSPSVQLQTSSPLFLVIFTRMEKGSQTFFNSSMEEHISMPSGLPSSFQSAKANSLFLEISPPCFFIAILKANSACILQKSASFELFTSQLMTRISGRWRILRV	557368	563206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_558048_558363_558566_558805_558894_559564_559745_559872_560023_560119_560276_560923_561015_561244_561307_561439_561585_561881_562027_562131_562207_562322_562422_562635_562743_562867_563002_563112
724342	contig_11338_pilon	+	1707	11	Intergenic	novelGene_6182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	539.467413288328	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	441	1529	6086	13398	FALSE	45	TATCCCGACCTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFCSLPKLQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFFSLSLSLT	750	13576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9959_13275
724345	contig_9290_pilon	+	2104	2	Intergenic	novelGene_77562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATCAGGGTTGCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498235	502422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_498437_500519
724350	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724353	contig_4232_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_63156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTGGATTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25312	24260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_24300_25300
724356	contig_5718_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_110383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTTGGTCTGGAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194363	1193795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1193800_1194400
724358	contig_12079_pilon	+	2139	14	Intergenic	novelGene_67410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	149.005500077193	1	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	587	1819	535255	578891	FALSE	15	GTAACCTGTGTCTCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSHGRCRQGFVASLECFWSRSFHPTPSNHSNLCRRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	494511	579211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560276_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
724361	contig_6710_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_94355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
724367	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724368	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_96232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724370	SIRV6	-	575	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9453	418	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAGGCGGCGCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	1126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1746_2783_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
724371	contig_12638_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_33055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATCAGTTACATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13119	10775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_10800_13100
724372	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724381	contig_6397_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_146223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAATAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134782	134308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_134300_134800
724384	contig_6445_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_77041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGTAAAATTATGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586410	584554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_584600_586400
724385	contig_13464_pilon	+	2093	3	Intergenic	novelGene_125236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	15	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTAGTAGACCCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233074	287706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_233153_233717_233859_285832
724387	contig_10627_pilon	-	1407	12	Intergenic	novelGene_59945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_5	41.0699866283505	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	53	1273	172150	167896	FALSE	40	AAATTTCTAAACCTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK	172202	167761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_167950_168059_168147_168251_168363_168444_168544_168647_168839_168959_169087_169387_169619_169698_169756_169934_170033_170341_170412_171485_171558_172126
724393	contig_12786_pilon	-	2042	8	Intergenic	novelGene_103449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4571362157133	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	101	970	674025	650058	FALSE	25	GTAAGGCATTCATTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLRPQPGKLHRLGAAGGTHGDPLGKRCLQTPVMRNTSKELHGATNRYAPCVKRSEKAVDAPPASQIPGLSEVGDTQNGNTFGTRRYWIKETDSEYIKLAKQGGRPDLLKHFGPATQKGSPVTYSMPDWYLHHSKPPTANQREVPFTSMPDYMVHEEFNPNQANGNYESRRGPFDFDMKTVWQREAEELEKDKKKVRLPAITSKHPSKVGTPVTSKETSGNRISFPPMPGQKTSSPTNFSKLISNGYKDEWLQQRADSEKRTPQTSKTSTSSRSPENPEGQQDPEALPDPDVPEGSQRDEDFALQVRRHLCLLQHPRSSNEP	674523	648985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_650126_653179_653398_655354_655453_660804_660962_664259_664369_669384_669550_673970_674044_674441
724396	contig_11285_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_5726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCTTAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854747	854256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_854300_854700
724408	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724412	contig_2161_pilon	+	1706	8	Intergenic	novelGene_114926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	30.7186043475485	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAATTCTGCATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832715	859452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_833137_834735_834902_839290_839380_839886_839955_842080_842366_847906_847986_850901_851013_858965
724413	contig_7202_pilon	-	644	4	Intergenic	novelGene_18566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_2	11452.731416081	1600	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	198	644	29911	27891	FALSE	25	GGTGACTACGTGACCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHLCDFIETHYLHEQVKSIKEL	30108	27890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28169_28486_28634_29797
724414	contig_8588_pilon	+	1629	3	Intergenic	novelGene_146512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	324	junction_1	92	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	893	1375	400361	402935	FALSE	45	AAAGTGTATACTTCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGVYINSYKWLFFFLKKKNLSLAKKIEASAQLKELVSDLSSPFVFSPPTLRTRRKNASSTSKLIDKLEDDSKSTETVEKQKVKRIRTAKTKQASKKTEKESSWSPPPVEIKLISPLASPIDGVKSKPRKPTEATGKVLGRSRKKPSSFPKQVLRRKML	399468	403189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_400568_401636_401720_402742
724416	contig_5485_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_37696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	478	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTACAGGTGACTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84683	85638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_84700_85600
724421	contig_6658_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_168398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCAGTGTTGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114842	115344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_114800_115300
724425	contig_1719_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_87371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767386	765503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_765500_767400
724432	contig_13366_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_99769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43129	44164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_43100_44200
724433	contig_13366_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_99770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATTATTAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44469	45148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_44500_45100
724441	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	287	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724444	contig_7695_pilon	-	1368	5	Intergenic	novelGene_41549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.785041295675	22	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	72	926	380076	375835	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381076	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_375915_376157_376521_379664_380089_381017
724445	contig_16724_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_105280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTTGACCTATCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426967	424633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_424600_427000
724450	contig_7207_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_72059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTATGGATAAGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636054	634290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_634300_636100
724451	SIRV2	+	641	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-64	134	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCGTTCTAGGCCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
724452	contig_9839_pilon	-	1712	7	Intergenic	novelGene_88570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAACAATACAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270009	259538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_260286_261581_261770_264518_264599_266320_266510_267520_267703_269526_269646_269802
724454	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724457	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
724461	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_97998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	30	CTTCTTTAACTTTAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724463	contig_15003_pilon	-	2397	24	Intergenic	novelGene_137336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_21	51.4297656416092	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	268	2130	273275	216108	FALSE	30	AAATCAGTGTAACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENHHYRTMRKRGKKERAMVDKVFFSRLTKILKIMVPRTFCKETGYLILIAVMLVSRTYCDVWMIQNGTLIESGIIGRSRKDFKRYLFNFIAAMPLISLVNNFLKFGLNELKLCFRVRLTKYLYEEYLQAFTYYKMGNLDNRIANPDQLLTQDVEKFCNSVVDLYSNLSKPFLDIVLYIFKLTSAIGAQGPASMMAYLVVSGLFLTRLRRPIGKMTITEQKYEGEYRYVNSRLITNSEEIAFYSGNKREKQTIHSVFRKLVEHLHNFILFRFSMGFIDSIIAKYLATVVGYLVVSRPFLDLSHPRHLKSTHSELLEDYYQSGRMLLRMSQALGRIVLAGREMTRLAGFTARITELMQVLKDLNHGRYERTMVSQQERGAEGPQVIPLVLGAGEIINADNIIKFDHVPLATPNGDILIRDLNFEVPSGANVLICGPNGCGKSSLFRVLGELWPLFGGRLTKPERGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQVIYPDGREDQKKKGISDLVLKDYLDNVQLGHILEREGGWDSVQDWMDVLSGGEKQRMAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEDYIYSHCRKVGITLFTVSHRKSLWKHHEYYLHMDGRGNYEFKQITEDTVEFGS	313675	215840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_216186_219570_219628_224440_224546_225456_225577_226789_226880_226979_227046_227150_227229_237550_237615_237741_237815_237894_237987_239529_239622_239917_240016_240106_240177_242386_242457_245915_246059_248538_248596_252630_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265957_273246_273284_285992_286082_313505
724478	contig_2867_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_135215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATACGACTTTTGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019801	1016983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1017000_1019800
724479	contig_2438_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_112030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2465.96110826996	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	225	557	311995	312871	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305089	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310698_311956_312083_312305_312409_312729
724483	contig_11171_pilon	+	1376	7	Intergenic	novelGene_48600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	596.334917083792	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	142	891	232542	251467	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESRDIKSSVNSRPSPPTRGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212087	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_232532_232603_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
724488	contig_9706_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_21020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563733	562515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_562500_563700
724494	contig_15047_pilon	-	2026	4	Intergenic	novelGene_52296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	9.39266853573691	157	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	455	1492	131962	129252	FALSE	5	CGTGTCTGGCTCTTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQGTLVNNVRLPRGHRLELSDGDLLTFGPEGPPGTSPSEFYFMFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGNRRGRPRKHPVSAHMAPPAAGGGEPCAAPHCCLPQEETVAWVQCDGCDTWFHVACVGCSIQVAREADFRCPGCRVGIQA	132809	128717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129493_130052_130621_131733_132294_132686
724495	contig_12179_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_128011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGAACCAAAAAGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534843	535175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_534800_535200
724500	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724505	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
724509	contig_4180_pilon	-	2935	1	Intergenic	novelGene_8404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTAAATGATTAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879217	876282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_876300_879200
724510	contig_5910_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_168413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCAAACCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92777	92523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_92500_92800
724511	contig_5910_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_168412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAATAAAAATTATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92226	90417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_90400_92200
724512	contig_11307_pilon	+	2307	2	Intergenic	novelGene_105250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGTAGGGAAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92741	95775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_94955_95681
724514	contig_6710_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_97212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724515	contig_6710_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_94839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACCTTCCACTTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
724521	contig_17436_pilon	+	2147	16	Intergenic	novelGene_164176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	24.6327695018919	177	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	856	1887	97405	152520	FALSE	60	TTAAAAAATCAGATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLLLYEEGLRVVIHTSNLIHADWRQKTQGIWLSPLYPRIVHGTHGSGESTTNFKADLISYLMAYNAPPLKEWIDTIQEHDLSETNVYLIGSTPGRFQGNQKDNWGHFRLRKLLREHTSPIPKAETWPIVGQFSSIGSMGADESKWLCSEFKESLLMLGKEGKALGKSAAPLHLIYPSVENVRTSLEGYPAGGSLPYSIQTAEKQNWLHSYFHKWSAETSGRSHAMPHIKTYMRPSPDFSRIAWFLVTSANLSKAAWGALEKNGTQLMIRSYELGVLFLPSTFGLDSFNVRPKFFSGSQELTASFPVPYDLPPELYGSKDRPWIWNIPYVKAPDTHGNMWVPS	68773	152780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_68813_77834_78415_81547_81592_82800_82857_86293_86391_89607_89643_97400_97494_100419_100588_101058_101138_106653_106840_107459_107509_110438_110506_112318_112427_128543_128647_140932_141042_152446
724522	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724523	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
724524	contig_19007_pilon	-	2723	1	Intergenic	novelGene_168442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATGATACAAACAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34086	31363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_31400_34100
724525	SIRV3	+	1080	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5214	14	3155	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	56	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATTTGCGTTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7158	8925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
724526	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724529	contig_4364_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGCAGTGAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532865	1533299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
724532	contig_953_pilon	-	3142	2	Intergenic	novelGene_130018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2033	2398	568831	568466	FALSE	75	CTAGAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPSKESTQSRRSSWDSTHFLPWYTSAGHLSCSTVTQSEPHLLIPGSGPLQEEHYVHTLPLANMLTANTYWLCCWTATVSPTIPRKEPSNISTPKPMPFMKMIVSARPFISLTDMAHGVP	571341	567721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_569390_569867
724534	contig_405_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_135312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGAAACTAGAGAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437029	435685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_435700_437000
724535	contig_8045_pilon	+	1106	3	Intergenic	novelGene_35390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1784.5	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	317	412	118627	118722	FALSE	25	AACACTTGAGTTCAGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPQERREAGEDEADPVNGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116136	119416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116187_118075_118243_118527
724536	contig_13201_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_130879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGACATTGCCAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140059	142126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_140100_142100
724537	contig_6062_pilon	+	1792	15	Intergenic	novelGene_5306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258.821948490479	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	39	1592	791834	822602	FALSE	25	ACTTTTTCAGATTCCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPRVGSPWRKCYGSEAPRKMLDPGLLSCSKQAMFLNLIYKSLKADIVLRRVKAFLKRLLQVTCEQMPPFICGALYLVSEILKAKPALRSQLDDHPESDDEENFVDIGDNEDREKFTDADKETDTVKKVETEETKTPEPASWVHFDNLKGGKQLNTYDPFSRNPLFCGAEHTSLWELKKLSEHFHPSVALFAKTILQGNYIQYSGDPLQDFTLMRFLDRFVYRNPKPHKGKENTDSVVMQPKRRHFIKDIRSLAVNSKEFLAKEESQIPVDEVFFYRYYKKVAIAKEKQKRHADEESIEDVDDDEFEKMIDTFEDDNCFTSGRDDLDFAGNVKKKTKGAKDNPDEDSEGSDDDFNNLDDDEVSLGSMNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	791795	822802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_791890_800518_800751_801584_801745_803000_803090_804994_805049_806061_806165_806270_806340_813447_813515_814664_814766_815502_815561_815871_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
724538	contig_7202_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_18958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
724540	contig_5041_pilon	+	1793	4	Intergenic	novelGene_27057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTTCTCTGATACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520498	532526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_521618_525500_525658_526413_526496_532091
724541	contig_5649_pilon	+	1277	10	Intergenic	novelGene_82265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	158.909322695386	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	63	1271	12779	35841	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSRAQASPFGKIKTICSDHVDLLQPGFSVTIKSL	12716	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33726_35741
724542	contig_8375_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_141303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCTCCTCTCTCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164913	164437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_164400_164900
724557	contig_15118_pilon	-	1994	8	Intergenic	novelGene_74563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	30.279648988341	115	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	818	1528	216747	214422	FALSE	10	TCTCTGTGGCCCTTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIPLPILEGQSLRLVCVADSNPPAELSWFQGSQALNASPVFNMSDLELPPVRTGNEGEFTCQAQNSLGSQQVSLCLSLLSPTDSPQLPHPSCSWEVEGLHCSCSARAWPAPSLRWRVGDQLVEGNSSNASVTVTSSSTGSWANSSLSLHKGLSPGLGLYCEAGNDHGNQSVTVLLLAENSFCCTCFTKVKEGSWPLVLTLIRGAVMGAGFLLTYGLTWIYYTWCAGTQRSRAD	219011	213955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_214456_214591_214728_216123_216418_216500_216759_217488_217537_217967_218247_218458_218837_218910
724561	SIRV4	+	197	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	2	1117	2	-1117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACGACGAGCCACCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	1654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
724563	contig_8544_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_55903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTGAGATAACTACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6294	5253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_5300_6300
724565	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	28	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
724572	contig_17976_pilon	+	1468	3	Intergenic	novelGene_32505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	182	1198	41843	47385	FALSE	10	TGTGCTGCCCTTACTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41661	47655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
724575	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724577	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724580	contig_7070_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_104061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACCACAATAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240200	240451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_240200_240500
724581	contig_7806_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_157538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237617	235235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_235200_237600
724585	contig_5936_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_53543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAGGGCATTATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58266	57566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_57600_58300
724589	contig_10078_pilon	-	1328	3	Intergenic	novelGene_159992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31.5	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	265	1041	57163	56270	FALSE	30	TCAATCAATTTGTCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDQPVTNTKEAKWQKVLYERQPFPDNYVDRRFLEELRKNIYARKYQYWAVVFESSVVIQQLCIDGGEGRKKSGRTRWADLKSALVFITFTYGFSPVLKTLTESVSTDTIYAMSVFMLLGHLIFFDYGANAAIVSSTLSLNMAIFASVCLASRLPRSLHAFIMVTFAIQIFALWPMLQKKLKACTPRSYVGVTLLFAFSAFGGLLSISGVGAILFALLLVSISCLCPFYLIRLQLFKENIHGPWDEAEIKEDLSRFLS	58463	55982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_56857_56973_57381_58416
724590	contig_15457_pilon	-	2147	6	Intergenic	novelGene_168452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	9.32523458149981	100	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	405	1040	18771	16330	FALSE	35	AAAGCCAATGGTCTCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTAMNVHSSRPDVKSSQNWRFSTRANAKVKTCRDVYCPGSSTCVVDQTNNAYCVTCNRICPEPTSSEQYLCGNDGVTYSSACHLRKATCLLGRSIGLAYEGKCIKAKSCEDIQCTGGKKCLWDFKVGRGRCSLCDELCPESKSDEPVCASDNATYASECAMQEAACSSGVLLEVKHSGSCNSISEDTEEEEEDEDQDYSFPISSILEW	19815	15222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15457_pilon_-_16413_17146_17378_18095_18321_18674_18898_19337_19530_19729
724596	contig_14575_pilon	+	1758	20	Intergenic	novelGene_101882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_8	106.517526161197	1	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1239	518	1756	26368	63898	FALSE	55	ATTGAAGAGAAAGATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYNLLEEFKTADCTDCTEQGEIMKIKGNEEFSKERFALAIIYYTRAIEYRPENHLLYGNRALCFLRTGQFRSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEK	19964	63900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
724597	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
724598	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724600	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_95689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
724601	contig_1925_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_162210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAATTGTTCATAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206789	207688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_206800_207700
724602	contig_7909_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_155931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891491	889639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_889600_891500
724606	contig_10753_pilon	-	1622	4	Intergenic	novelGene_105143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	286.929724264787	431	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	226	807	330074	323783	FALSE	20	TTGTGTGTTTGCCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQNSKLRPEVLQDLRENTEFTDHELQEWYKGFLKDCPTGHLTVDEFKKIYANFFPYGDASKFAEHVFRTFDTNSDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISRSEMLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTDKIFRQMDTNNDGKLSLEEFIKGAKSDPSIVRLLQCDPSSASQF	443275	322967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_323881_327580_327687_329696_330099_443074
724607	contig_5696_pilon	+	1879	12	Intergenic	novelGene_117534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	43.6157148114346	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	60	884	635115	645412	FALSE	55	ACATAAGAGACATTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMA	632377	646407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638565_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344
724609	contig_2278_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_118143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	340	648	1390664	1390972	NA	70	TTGTAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEHFSYSLFKHTSKVFIISLSLCSRHTGLQLLDSNDLLYARALCTYCSLRLECSNASTLVCTHTLVLQILTGSITSPGKPSLTPTASLDQILLLYTVFFPS	1390324	1392125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1390300_1392100
724611	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	39	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724619	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724625	contig_11702_pilon	+	710	5	Intergenic	novelGene_141997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1081	junction_3	140.78707327024	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	68	400	383406	384186	FALSE	15	GACCAAGGGGTCTCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	382712	384496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
724626	contig_16667_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_153248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATAAAAAAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2676	4388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_+_2700_4400
724627	contig_7898_pilon	-	1279	2	Intergenic	novelGene_47584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	382	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCGTCGAGTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491471	489205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_490313_491299
724629	contig_6658_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_168410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAATAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215019	217054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_215000_217100
724635	contig_6710_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_94773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653658	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724637	contig_2027_pilon	+	966	6	Intergenic	novelGene_39958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	795.008025116728	157	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	512	871	663008	664407	FALSE	10	CAGCAGGCGGTGTCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	660227	664502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_660373_661330_661463_662681_662821_662912_663072_663312_663438_664236
724640	contig_11681_pilon	-	3331	1	Intergenic	novelGene_102981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCCAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193528	190197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_190200_193500
724641	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724642	contig_7234_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_145952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTAAATCACAGGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493505	494384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_493500_494400
724651	contig_14556_pilon	-	2449	1	Intergenic	novelGene_138533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2483	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCTATAAAGTAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169723	167274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_167300_169700
724652	contig_3103_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_146202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATGACTAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94482	95500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_94500_95500
724653	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	6	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724658	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
724660	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724663	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_16704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
724665	contig_11855_pilon	+	2489	11	Intergenic	novelGene_67068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	92.0942994978517	413	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	224	1348	2086282	2105965	FALSE	5	CTGTGTGGTATCTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSGANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVKVPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNRVEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVENAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINYHASDVLETSGWKSMVVSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS	2034433	2107106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2034540_2071770_2071822_2086215_2086360_2086951_2087074_2089215_2089368_2089903_2090032_2097169_2097348_2100083_2100140_2100603_2100727_2104362_2104506_2105820
724673	contig_16776_pilon	-	1228	6	Intergenic	novelGene_130534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	124.546537486997	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	39	659	129630	96429	TRUE	10	TAGCCGGCTGGGTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLVQETGSHEEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEKDCFQLKEPACPENLNTWGKNPRDGLIGEMKWLSCKLQDCRASNASLDSPTGLGLLCSGSREEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEEDCFQLKEPSCPENLSTWGKNPQDGLIGEMKWLSCKLQDCRTSNASLDSPTGLGLLCSENTTILKSERKYNGLSRAV	129668	95616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96143_96385_96439_97348_97398_99707_99975_100905_101173_129602
724674	contig_12270_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_114074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	27	335	14409	13878	FALSE	20	CGCAGTTTATTACTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14435	13875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
724677	contig_5711_pilon	+	1876	4	Intergenic	novelGene_80295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1185	junction_3	284.429643712153	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1266	1760	232712	236004	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRVVPEITAMKADASKKLLKKKKGDLDTTIVKVEFDEEFSGTVEGTGEEALTPSAPINKGPKPKREKKEPGTRVRRTPASSGKSNTKKVKKRNPWSDDESKSESDLEETEAVVIPRDSLLRRAAGIMICFIFILL	230037	236120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_231264_232672_232868_235431_235574_235807
724678	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_97064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724685	contig_7629_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_153561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAACACCTATTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243251	242688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_242700_243300
724687	contig_5302_pilon	+	2133	3	Intergenic	novelGene_81501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	3	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	73	780	342399	355700	FALSE	25	TCCATGATTTTATTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342326	357053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
724689	SIRV6	-	379	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8961	411	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGCCCCTGAAGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	1133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1728_2770_2828_3105_3164_10723
724690	contig_11413_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_103142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAGAAGCTTACTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87698	88202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87700_88200
724691	contig_5916_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_158034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303226	302420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_302400_303200
724694	contig_2036_pilon	-	1822	2	Intergenic	novelGene_131847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	117	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	112	468	661441	636681	FALSE	50	AAAAAAGAGTATTTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILDLSSVNLHLWLAIASR	661552	635326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_636731_661134
724699	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
724702	contig_5280_pilon	+	1779	4	Intergenic	novelGene_52583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	731.765141436938	70	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	34	543	38343	41284	FALSE	25	AAGCTTTGCACCCTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEI	38309	42520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41279
724707	contig_10324_pilon	-	1904	8	Intergenic	novelGene_7903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.7607281073307	452	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	965	1561	793210	792614	FALSE	25	AATTTACGCTAGCTGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTVCGGAPALPSWRTHPPPWKSSLSAAGGVTQAIEPGAEDEGPLLEPVGSEQARDTYLVLDKWLLPQSPPSGALPGPGGSVDTAAMDEGSEASSCSSALALKPRPEGASAASFEYTILDPSSQLLRPRALPLALPPTPPHLKYLYLVVSDSGISTDYSSGDSQGTPGGSSDGPYSNPYENSLVPAPEPLPPSYVACS	797798	792270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_793227_793310_793399_794810_794899_795013_795137_795661_795820_795896_796076_796553_796687_797619
724711	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724716	contig_3818_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_99303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACAGAAAGTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968129	969113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_968100_969100
724720	contig_10196_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_132357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTGGTCTTTTATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2494764	2496775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2494800_2496800
724734	contig_15031_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_138394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGAAGTGAATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69165	68122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_68100_69200
724736	contig_4769_pilon	+	2459	1	Intergenic	novelGene_117957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAACCCTTAAAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391855	394314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_391900_394300
724738	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724741	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724742	contig_1275_pilon	+	920	2	Intergenic	novelGene_108826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	8	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	89	778	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746548	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
724743	contig_11896_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_88039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCCCCCCCCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163284	161122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_161100_163300
724744	contig_20819_pilon	+	1117	2	Intergenic	novelGene_55656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1053	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41549	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_41569_42519
724749	contig_14322_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_115716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTTATATTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671555	671291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
724754	contig_15371_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_151479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTGTTGTTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224910	224112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_224100_224900
724757	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724765	contig_3077_pilon	+	1787	2	Intergenic	novelGene_26849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1285	1632	725493	726369	FALSE	75	TTTGAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELARSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK	724208	726524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_725703_726231
724774	contig_10609_pilon	-	2034	10	Intergenic	novelGene_123928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1392	1823	391053	386574	TRUE	55	GAATCCTGAAACAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGEPVVVWLVHVSTVVNQLINYSILAIVAGDMKGSISIDVDFINLHPQIQEVFDNIDLSIGDCSVQGRVTLLILTRHFCAMVNEQCYYVQVAIYAAQCRARRSFLSNALMFAPLANSKLTISHGHSELHGARLSAPLGRRH	421338	361241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_361314_386434_386636_386994_387083_389595_389738_390913_391127_400430_400514_415523_415599_416760_416827_418779_418848_420312
724776	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_93424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
724782	contig_17144_pilon	-	421	3	Intergenic	novelGene_29567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	941.5	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	108	419	166806	166495	FALSE	15	CAGCCCTCTGGGAGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQ	183221	166492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_181806_181850_183158
724783	contig_13097_pilon	-	1853	15	Intergenic	novelGene_107698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	735	1040	243916	215377	TRUE	5	GTGGCTTAGCTTCCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVERLVEEENLKHLFTWWWNQRWSSTDSWRRWKKWRRWKVGGRSSWRKKWRWFAKIVVYFSSRSFRKNLYVAVFICPSSSFYSADSYSLTNNVDCPRQSP	264553	184507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_184830_186116_186161_190438_190497_191574_191686_195149_195165_196345_196400_205978_206082_215270_215380_225263_225358_226994_227161_243873_243937_245486_245548_253990_254196_263404_263544_264244
724784	contig_11551_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_168455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGGGGACAGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329454	326676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_326700_329500
724785	contig_14415_pilon	+	1161	4	Intergenic	novelGene_77626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	183.725036097122	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	13	297	35981	38644	FALSE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSHMSLKNPQDHQMLRQGSLRKPALILERRKPTRLQRAQQQTGALLEKSGSLRVEPRRDPLPTVKNPRPTSPSSLVTALPSAPRMGGFKEQKFTFSD	35968	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_35993_36102_36199_37805_37942_38603
724788	contig_14811_pilon	-	1385	4	Intergenic	novelGene_74473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	421.842255930921	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	153	527	375703	357434	FALSE	30	CCCCAAAGTGTCTCGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386619	356575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375291_375695_375765_386528
724791	contig_8616_pilon	-	1994	10	Intergenic	novelGene_72373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	57.0096374785185	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	269	1942	185319	178743	FALSE	10	GAGGTATTGTCTTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDTEVDMKEVELNELEPEKQPMNAASGATVAAASDAEKNGLVKIKVPDNEAEEAKFTGLSKEELLKVAGSPSWVRTRWVLLVLFWLGWLGMLAGAVVIIVQAPRCRQLPTQRWWQKGALYRISDIQAFQAQEAGKLTGLTEYLDYVSTLKVKGIVLGPVHNNQKDDLAETNLQQIDPAFGSNKDFESLLQSAKKKSIRVILDLTPNYRGQNSWFLPTQVDTVDTQMQAALKFWLEAGVDGFQVRYVENLTNASTYLAKWQNITQNFSEDRLLIAGTDSSDLQQILKLLNSTEDLLLTSPYLSSAGFTKEHAKPLVTEYLNAAGNHWCSWSLSQAGLLTSFVPASLLRLYQLLLFTLPGTPIFSYGDEIGLEAAALPGQPAEAPVMLWNESSFLSTSRPSSGSVSANMTVKGQDGIPGSLLSLFRQLSGLRSKERALLHGDFHALSSGTGLFSYVRQWDQNNRFLVVLNFGNVRVPATLEADSLPSSASLPAKAELLLSTEPGRKEGVSLELQQLNLEPNEGLLFSFPLRGLTPSLIGTPFSFLPKPFFFIVTDVR	195548	178690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_179181_179286_179383_180337_180482_180574_180756_180924_180984_181088_181158_183570_183666_184266_184441_184901_185334_195294
724792	contig_3386_pilon	-	2725	3	Intergenic	novelGene_34558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCGACGGAGAAGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484970	470076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476262_477762_483970
724793	contig_2596_pilon	+	1967	12	Intergenic	novelGene_53448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	171.985921007487	430	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	614	1504	42575	61358	FALSE	10	CTAGCCTCTTGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLVQRFGELMRKLWNPRNFKAHVSPHEMLQAVVLCSKKTFQITKQGDGVDFLSWFLNALHSALGGTKKKKKTIVTDVFQGSMRIFTKKLPHPDLPAEEKEQLLHNAEYQETMVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA	30159	61821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_30303_32585_32681_33834_33972_36842_36996_42489_42717_44873_44952_45290_45359_45872_46062_48753_48897_58522_58659_60346_60434_61310
724801	contig_14516_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_153908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209139	208869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_208900_209100
724803	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724811	contig_1225_pilon	-	1654	4	Intergenic	novelGene_44153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	1246	1653	274284	250598	FALSE	25	TCCCGGCCCCACAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRRSFSLQQRSKSDGSGKNLIGKAILSGAESNLLHGWGIHHHLSHLGRSQIVRAVNGEIYRHEVLGEADPRPCDLKTVTASQARMTRAQTDARQAGRQAGSRMRELGFAGSAFPKQPHSQRRLQSRQRSTLSTE	276790	250596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_250837_253413_253522_274223_274979_276239
724812	contig_18145_pilon	+	2604	14	Intergenic	novelGene_37318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	21.9224021488598	138	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	443	2323	79314	84552	FALSE	10	TTATCTCGTCTGCCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAPLDSSSPRASCMDLWREKNDRLVRQTKQVTQDSDLLLRQQQLAQDALQGFRELLHSLQGLPAAISALPLELTVICNFITLKASHTQGFTEDQDQDIQHGLERVLEAQKQLGPRLECGLRELWDSVLHASSLLPELLPALHHLAGLQAALWLSTDHLGDLALLLQSLNGSQSGASEDLLLLLKTWSPPAEESDAPLTLQDARGLRDVLLTASALRQGLQELITGSLPRALSSLQEAASGLCSWPVLVQVYTALATCLRKMGSPQRALLYLVAALKGGSVWGPPLLEASRLYQQLGDTAAELKSLELLVDALSVTQNSEAPQLLIEVELLLPRPDPASPLYCGTQSQAKHLLASRCLQTGRAEDAAEHYLDLLALLLDGLEPRFSPLPCPPGPCMPEVFLEAAVALIQANRAQDALTVCGELLSRTSSLLPKMPWLWEDARNVAKEPINCPLWVSATYLLQGQAWVKLGDQKQAVSEYSRCLELLFRATPEDKEQGAASNSDQRCRPDAALQQLRLAALISRGLVWVASGQDTKALQDFLLSVQMCPGNRDASFHLLQTLRRLDRRNEATAFWWRLEAQTKLPPEDATWSLPLYLETCLNWIHPPDRETLLEEFRTSLLEPSDL	78871	84833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_79407_79604_79699_80033_80166_80423_80627_81119_81256_81432_81564_81663_81811_81951_82104_82502_82570_82844_83135_83277_83325_83516_83673_84166_84291_84443
724817	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724823	contig_16091_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_112349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTTAATATGACCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26950	28610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_27000_28600
724824	contig_16303_pilon	-	1113	7	Intergenic	novelGene_34118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	717.881760613976	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	172	1086	40611	35759	FALSE	30	ACACTTCTTCCAAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45435	35731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40714_45366
724825	contig_13894_pilon	-	1910	3	Intergenic	novelGene_62177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	9.5	218	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	336	923	696390	695803	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSKPLSWQRGNRPREEDDFLQVSWLITRAAGARSWVGRGQKVGRGTDGQTDKHTQKSLTLGAILSTSPDTRLYPGKREREADTVRYAVSPTTTHRTVRPKGPQSQIPTADGCPPTHTHSLRTLQQILANLETLTFGCHMTTPDHHPYESTGGHPPKQLLEQKLGAAGPVSPCHAWGNRPGRGYARPEITVSQSW	701362	694815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_696555_696672_696753_701271
724827	contig_15629_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_122442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTCCTATAGGGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83473	82461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_82500_83500
724828	contig_15629_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_122441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGTATGAGAGAAAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82361	81835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_81800_82400
724830	contig_7357_pilon	+	1240	13	Intergenic	novelGene_36877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.156444006494	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	44	1240	250864	272727	FALSE	15	CCTTTGCTTTTGTGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPWSQRWNRQSASMAHITINQYLQQVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMVYDLSVLILKQLFRIEFESLVALKLLKS	250820	272727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519
724831	contig_1594_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_138799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGAATGTGGGTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228059	229046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_228100_229000
724839	scaffold_16539_pilon	-	1132	8	Intergenic	novelGene_68312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	69.7218965400602	541	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	128	769	126401	120781	TRUE	5	CCTGTGTCTTAGCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAAPARGVGRSRVAAGVEWLPAEDQAQPRRHTEALSGRYRVMAETYDFLFKFLVIGSAGTGKSCLLHQFIENKFKQDSNHTIGVEFGSRVVNVGGKTVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNSLAAWLTDARTLASPNIVVILCGNKKDLEPEREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFLKCARTILNKIDSGELDPERMGSGIQYGDASLRQLRQPRSAQAVTPQPCGC	126528	107467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_107815_120764_120897_120985_121082_122380_122536_122615_122679_124586_124702_124967_125049_126385
724840	contig_12654_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_129287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATACTAGTCCTTCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743755	744901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_743800_744900
724843	contig_12019_pilon	+	561	3	Intergenic	novelGene_87687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5310	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
724847	contig_8907_pilon	+	2379	5	Intergenic	novelGene_85853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	16.1303285769385	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	764024	781631	TRUE	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASAATGVFVLSLSAIPVTYVFNHLAAQHDSWTIVGSAALILLLVALLARVLVKRKPPRDPLFYVYAVFGFTSVVNLIIGLEQDGIIDGFMMHYLREAEPYLNTAYGHMICYWDGSAHYLMYLVMVAAIAWE	763990	785506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_764116_772866_772971_777382_777481_781523_781682_783612
724852	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724853	contig_7471_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_161284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTAAAATAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22665	22016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_22000_22700
724855	contig_4845_pilon	+	1501	12	Intergenic	novelGene_53672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	887.074595985577	40	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	479	1501	803035	956928	FALSE	35	GAACAACTTTTTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQTLQEALKVEIQVHQKLVAQMKQDPQNADLKKQLHELQAKITALSEKQKRVVEQLRKNLIVKQEQPDKFQIQPLPQSENKLQTAQQQPLQQLQQQQQYHHHHAQQSAAPSPNLTASQTVTTASMITTKTLPLVLKAATATMPASVVGQRPTIAMVTAINSQKAVLSTDVQNTPVNLQTSSKVTGPGAEAVQIVAKNTVTLQVQATPPQPIKVPQFIPPPRLTPRPNFLPQVRPKPVAQNNIPIAPAPPPMLAAPQLIQRPVMLTKFTPTTLPTSQNSIHPVRVVNGQTATIAKTFPMAQLTSIVIATPVSLCESLCHRLGHCFFMQGQKSLYLGKKKK	764448	956928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_764605_764852_764930_794494_794536_795890_796003_802942_803089_807471_807505_810596_810663_916632_916840_923065_923315_924518_924609_930192_930428_956839
724856	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGCAGTGAACGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
724862	contig_4315_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_46864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	533	880	803223	802876	NA	20	GACTCTGGACTTTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCGHCLWEPKEQGFQREGYGYNQEQSKGQGDWRTERLPLPACDSSLRKQPSLPGLLKLEHSFGACKGRSIHVPAGERRRKAEEAEESGSGYTCSYSPSLPDGDSPCSHLTCSS	803755	802402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_802400_803800
724868	contig_2710_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_161787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	51	470	1028122	1028541	NA	30	TTTCTAAAACATTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKKSVPKIIQCSTISMSVHPSYGILAESTEYQKDVYLCFAGYAKAFSCVDYNKVWITLQRVGIPEDLIVLMRNLYTDQEAVIRSEQGDTVWFKIRKDVHQGCILSLYVFYLFAEQIIRAADYMKKNGASGLEEDSLTSCVTQMTQSCLQKVKRT	1028071	1030145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1028100_1030100
724873	contig_6556_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_168492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	703	1128	310767	310342	NA	15	CTCCCTGGCTGCTGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSLKMFRHLIQVPASSLKPSAHIDNLKSLHGTVGDLFSYNLHLRVQVADTIYPGLVNKIPTILHPQQPGLKRDGEGWGPCHSLEGHQEMEEVLQALSLMACGTFLVCKAIWPWQTSHEERQETSRPCILCALISHKERP	311469	309273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_309300_311500
724880	contig_10838_pilon	-	2041	9	Intergenic	novelGene_129167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCATAGCATTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103868	76049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_76920_77354_77562_81321_81406_81581_81678_87341_87462_87900_88024_90327_90455_90944_91003_103512
724881	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_96656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
724884	contig_10907_pilon	-	1257	9	Intergenic	novelGene_144905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	306.320094019312	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	111	1055	41010	14797	FALSE	45	AATGAAAATGACTCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITTVQQRGAAVIKARKLSSAMSAAKAIGDHVRDIWFGTPEGEFVSMGVISDGNPYGVPDDLLYSFPVVIKNKTWKIAEGLTINDFSREKMDLTAKELTEEKENAFEFLSTA	41120	14594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_16700_16878_28331_28409_30332_30495_36029_36127_36951_37051_41007
724891	contig_3774_pilon	+	1814	12	Intergenic	novelGene_142030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATTTACTTGGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106293	193513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_+_106750_107996_108134_109810_110024_112485_112614_115855_116109_146369_146468_152052_152146_153073_153174_167866_167988_175497_175603_191636_191699_193465
724892	contig_5999_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_45608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCCCCTTTACCTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94782	94133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_94100_94800
724894	SIRV7	-	373	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33194	2	-25	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114763	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
724896	contig_4974_pilon	-	151	1	Intergenic	novelGene_161395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCACTGTCTTCAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21319	21168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_21200_21300
724900	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	859	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724908	SIRV1	-	257	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	4	3569	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
724909	contig_12923_pilon	-	1379	14	Intergenic	novelGene_30140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	184.347722633714	1	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	392	1378	169637	162870	FALSE	10	TCATCTGGGGCATCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLRGQGLLLGRQCHRHRLLGPLRSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYY	174744	162868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172032_172176_174669
724913	contig_9433_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_168507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	184	414	20958	20728	NA	30	CATAAATTTCCCATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLCSIAWSRGEGGRHACRLPFPVSCDSWLPAILASGRLWKESKGQEERDKARRLPSSSGLMVFLRAAESPQWLQLPPNRSSMIPVSTADHSPWALITPPLPFFSQPQAAGALLQLPISGLSPHAVLEYQLFHFLFE	21141	20721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9433_pilon_-_20700_21100
724916	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
724919	contig_4845_pilon	+	1475	6	Intergenic	novelGene_53680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	1009.37616377642	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	246	668	803035	916902	FALSE	40	AAATACGCATTTACACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQTLQEALKVEIQVHQKLVAQMKQDPQNADLKKQLHELQAKITALSEKQKRVVEQLRKNLIVKQEQPDKFQIQPLPQSENKLQTAQQQPLQQLQQQQQYHHHHAQQSAAPSPNLTASQVKCGQSTAGFTLNIGLSSVM	794494	917709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_794536_795890_796003_802942_803089_807471_807505_810596_810663_916632
724921	contig_5686_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_45427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTCTAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189100	187488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_187500_189100
724928	contig_5084_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_64475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTCACTGAATGCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64705	65635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_64700_65600
724929	contig_5084_pilon	+	603	2	Intergenic	novelGene_64478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTCAGGATACAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65585	66976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_65650_66437
724931	scaffold_6394_pilon	+	1244	8	Intergenic	novelGene_111011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	932.594034214814	2	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	425	1087	403262	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398220	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402790_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
724941	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
724943	contig_2496_pilon	+	2641	1	Intergenic	novelGene_168513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAAAATGCCTGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50898	53539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_+_50900_53500
724944	contig_5549_pilon	+	1855	6	Intergenic	novelGene_81602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	20.5484792624661	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	176	1165	304420	346562	FALSE	80	AAAAAATTTAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGGGGEEIAPKSGILLALPLAEEEAADGRRGREGCGREGSVRAGSALECGEGYFSWCMEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAGLDLNIL	303512	347252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344101_346423
724945	contig_12622_pilon	+	2213	7	Intergenic	novelGene_5872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_5	39.9308429941345	6	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	30	884	1206137	1212133	FALSE	25	CTACGGTTCCCACTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1206107	1213462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1206245_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932
724949	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	28	375	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14436	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
724955	contig_3601_pilon	-	1236	2	Intergenic	novelGene_132956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1	393	464203	463600	FALSE	10	CTTTTTGTCTTTTAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKKQEADQAGRRRIAAKGSNFRHVDTRVDAAWLPGRRWSYKQSTLAWKVNRSKPGATSSPKGRRNATLKSNTFLDSAFRGTVESVQQNETPPGPVPPSQLLCLTPLLQPLCQSISLKVFLFLDDPLLYQA	464203	462756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_463755_463965
724956	contig_2069_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_23323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	245	400	537965	538120	NA	25	CAAGGACTTCATTTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEQEEVSDLGIQASSAGGTLPLKARAVDEGVPAPGPLHWLFLLPRTPSLNSDLRPSLPPRSLLPTDPLSRGKGSPSSPVLLMPSAPTALLSPPPLTLPPILATYQVPQHKEKENQNVHNWTNKRHHDKKRKY	537720	538126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_537700_538100
724959	contig_12427_pilon	-	2061	5	Intergenic	novelGene_40552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1196.91465339012	2	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	204	641	522337	506105	FALSE	50	ACAAGAACAAAGATCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQLPCPGNRGGAVQ	578155	504684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506144_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
724966	contig_11815_pilon	+	2022	5	Intergenic	novelGene_50925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	123.64465212859	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	595	1848	299421	322920	FALSE	85	GGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDGQSAFASETLNKAPGMNTIDQGMAALKLGSTEVASNVPKVVGSAVGSGSITSNIVASSSLPPATIAPPKPASWADIASKPAKQQPKLKTKNGIAGSSLPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVAKAPSQALVQNIGQQAIQGSPQPLGQQANNSPPVAQASVGQQTQPLPPPPPQPAQLSVQQQAAQPARWVAPRNRGSGFGHNGVDGNGVGQSQAGSGSAPSEPHPVLEKLRSINNYNPKDFDWNLKHGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDAAYRSMNGKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSAVDYNTCAGVWSQDKWKGRFDVRWIFVKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEESVKKERQGRGK	294701	323094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_294913_295412_295438_296009_296090_299142_300651_322896
724970	contig_3942_pilon	-	2132	8	Intergenic	novelGene_128809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	129.306628142693	14	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	920	1969	1056399	1050289	FALSE	20	CCCCAGGGCACCCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGCGLQPDFDDAWLLRALSFLSPHSSVKRGRQLPSGGCCGGRDRPVPGTQGPSVRSFLCCARSWPRRASTYTGAWTLPHISWALVAVWVHWGKDRLSDPYLSLQPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1057318	1050125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1052698_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018
724974	contig_12250_pilon	+	2431	17	Intergenic	novelGene_80552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	62.6796169021477	253	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	216	1919	272853	278399	FALSE	25	CTTTGGTTGAAGAACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272488	278911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
724975	contig_854_pilon	+	2285	4	Intergenic	novelGene_36121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	61.1464544261471	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1078	1413	299587	306557	FALSE	5	CTCTTCTTGGTCAGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWASGPRFVDTSTLIRLPDDCTVGYIIECKLGGRLQPSPLFHSHLETLQLLGAAQLPEQVTLSYGVFEGKLNVIKLQGPFSPEEDPSRFRSLHCLLFPDTPWCPQLVAR	298509	307429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_299604_302162_302329_304379_304466_306490
724976	contig_10689_pilon	-	1064	4	Intergenic	novelGene_118616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTCCTTTAGAGAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61584	51239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_51345_57590_57735_58214_58372_60926
724979	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724982	SIRV5	+	409	4	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	2	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2206_2316_3298_3374_3453
724985	contig_1107_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_126571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGGCCTACAGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505213	504402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_504400_505200
724986	contig_10523_pilon	-	2157	8	Intergenic	novelGene_120937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	213	1196	39240	15001	TRUE	45	GAAACACTTCTCAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39452	12776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13089_14351_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
724987	contig_6710_pilon	-	160	2	Intergenic	novelGene_98337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGGATAATGCCGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657509	653759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
724995	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	152	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
724996	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	42	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
725001	contig_2069_pilon	+	753	4	Intergenic	novelGene_23541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGGAGACGACGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508465	1509859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508596_1508648_1508812_1508941_1509276_1509733
725007	contig_513_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_80131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGGATCATTCAGGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303174	304131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_303200_304100
725008	contig_15328_pilon	-	2376	13	Intergenic	novelGene_161216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	44.1358382974904	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	116	2197	162154	137528	FALSE	10	TAGTTTTGGTGTTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVWSAWCGKCAKGKGSSPLWAQRIVVAWLNRAEWDQVMVYLFCEDHTLQRYALNRITVWRSRLGNDLPLAVASTADLVRCKLMDVTGGLGTDELSLLYGMALVRFVNLISERKTKFVKLPLKFLAQEVNIPDWIVELRHELTHKKMPHINDCRRGCYFVLDWLQKTYWCRQLENSLRESWELEEDREETDEEDQEEDKNIVVDDITEQRPEPKEDVKGAELDVRADGESKEVDSHQEKALRRKELYERVRELLVSYEEEQFKVLEEFRHLPQAIKVWNNLSPRVECILAELKSITRENSDAVLDAFLDDGFLIPTFEQLAALQIDYEENVDLNDILVPKPFSQFWQPLLRGLHSQTFTQALLERMLSELPALGDSGIRPTYILNWIIELIVANTKTGRNARRFSASHWEVRKSWRLFSCPASLDWPRVVESCLGSPCWASPQLLQLIFIAMGSVLPDEDQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASTIGNSPYTLDSLYWSLKPASSSFESEGKAQEQGSLNHDKEDEKNEKEVLEEQVEEEEDDDQEEDEEDDDEDDDEEDRMEVEAFSPREESPTAENARLLAQKRGALQGSVWQVSSEDVRWGTFPLGRMPSQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLDQRLEPPMCKTGTLGLSCGIGSANYSNSSSNFEGFLWSQGQLHGLKTGLQLF	162269	137348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15328_pilon_-_137652_139547_139699_145098_145563_150972_151121_151469_151677_152344_152431_154237_154348_155118_155166_155433_155710_159181_159264_160049_160120_161144_161271_161963
725010	contig_15236_pilon	+	1935	6	Intergenic	novelGene_141603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	73	junction_1	248.754015042974	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	66	872	547536	580001	FALSE	35	TAACGAGATGCTAAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRPFAAEPEEEGSGLEDTNMNKLKSSQKDKVRQFMIFTQSSEKTAVSCLSQNDWKLDVATDNFFQNPELYIRESVKGSLDRKKLEQLYNRYKDPQDENKIGIDGIQQFCDDLALDPASISVLIIAWKFRAATQCEFSKQEFMDGMTELGCDSIEKLKAQIPKMEQELKEPGRFKDFYQFTFNFAKNPGQKGLDLEMAIAYWNLVLNGRFKFLDLWNKFLLEHHKRSIPKDTWNLLLDFSTMIADDMSNYDEEGNESCCPTSCFRLISFYCTFLNFLCTSAWRWISIF	547470	581064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_547539_563914_564132_565387_565557_568402_568534_579482_579566_579797
725012	contig_6270_pilon	-	175	3	Intergenic	novelGene_99858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAGGCAGAACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973045	885086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_885181_922701_922761_973023
725017	contig_14681_pilon	+	1583	3	Intergenic	novelGene_134208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_1	102	665	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65712	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_66468_71088_71167_72461
725027	contig_11258_pilon	-	507	3	Intergenic	novelGene_67841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	59	316	354760	352035	FALSE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPATTEGLLVPSTALATVSTTHSPSSQENSNQSQSPWSLLSSIHFLLLVFLKVPLFLSMLSAVLWVNRPQRDPREGPYENQ	354818	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353000_353104_354741
725028	contig_6871_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_21642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	795	1139	678575	678231	NA	25	GAAAGGCTCACCCACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGGTNPWRRTSCLVEGQLKRGRPTMRWADTVAATMGSNMATIVRMARDLAVFRSVIHRVAMCWNRLDGTVTTEYSYYILTRKCELLVNVSTWIDLKILLNKRSQTHKKAHTV	679369	677083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_677100_679400
725031	contig_14441_pilon	+	1052	5	Intergenic	novelGene_100470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60.3008084522919	11	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	148	1050	85675	117789	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALPLACALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASSFATAPRDQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACL	85425	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85883_113665_113711_116578_116963_117523
725032	contig_1154_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_87100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATGCAACCGTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356315	353704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_353700_356300
725036	contig_2278_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_118091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACAACAGAACGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654602	656006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_654600_656000
725039	contig_14441_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_100538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	373	801	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_113161_113209_116578_116963_117220_117344_117539
725040	contig_20527_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_138547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATATAAAATATAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13975	12179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_12200_14000
725041	contig_11338_pilon	+	621	5	Intergenic	novelGene_6195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	494.589413048844	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	5	409	6086	13393	FALSE	40	CAAAAGCTGAATTTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAA	6081	13605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7716_13388
725043	contig_8412_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_118373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATATGCAATATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630335	630842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_630300_630800
725046	contig_15039_pilon	-	1680	15	Intergenic	novelGene_110102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44.106145159335	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	97	1023	169493	137927	TRUE	10	CTTAACTCTTTGGGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIPVAEDSDFPIHNLPYGVFSTKTNPRPRIGVAIGDQILDLSVIKHLFTGPVLSKHQDVFDQTTLNSFMGLGQAAWKEARALLQSLLSASEARLRDDMELRKSAFISQASATMHLPATIGDYTDFYSSRQHATNIGIMFRGKENALMPNWLHLPVGYHGRASSVVVSGTPIRRPMGQISPDDSKPPIYSTCKLLDMELEMAFFVGPGNKLGEPIPVSKAHEHIFGMVLMNDWSARDIQKWEYVPLGPFLGKSFGTTISPWVVPMDALMPFAVPNPVQDPRPLPYLCHDQPYTFDINLSVALKEEKE	169589	104151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_104489_105006_105072_134004_134123_134849_134952_137891_137941_140603_140680_142436_142568_143556_143657_145457_145511_145619_145718_153248_153340_160156_160207_160720_160843_163620_163732_169412
725047	contig_11832_pilon	-	1542	12	Intergenic	novelGene_106919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_8	934.483018784555	2	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	435	1091	86997	84249	FALSE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPNAQPTPAPDPPAGPAAEEAGPACPPLFFSQYPRICLALSPCSQAQRTRGRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	88685	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646
725049	contig_5649_pilon	-	1954	16	Intergenic	novelGene_82476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	63.7661003634028	5	19	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	106	1329	1667499	1654493	TRUE	25	TGTATTTCTTTTAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIYIYNEKIVNGHLQPNLVDLCATAVELDDKNISDMWTMVKQMTDVLLAPATNALKSRSSVEVRMEFVRQALGYLEQSYKNYTLVTVFGNLHQAHLGGVPGTYQLVRSFLNIKLPAPLPGLQDGEVEGHPVWALIYYCMRCGDLLAASQVVNRAQHQLGEFKTWFQEYMNSKDRRLSPATENKLRLHYRRALRNNTDPYKRAVYCIIGRCDVTDNQSEVADKTEDYLWLKLNQVCFDDDGTSSPQDRLSLSQFQKQLLEDYGESHFTVNQQPFLYFQVLFLTAQFEAAIAFLFRMERLRCHAVHVALVLFELKLLLKSSGQSAQLLSHEPGDPPCMQRLNFVRLLMLYTRKFESTDPREALQYFYFLRDEKDSQGENMFLRCVSELVIESREFDMILGKLENDGSRKPGVIDKFTSDTKPIINKCSALSSPRSAHHSPTKRG	1669104	1648726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1648993_1650155_1650285_1651700_1651785_1652259_1652378_1654464_1654550_1655409_1655461_1657297_1657343_1657610_1657684_1657798_1657926_1658641_1658834_1659677_1659772_1660050_1660217_1661353_1661512_1662924_1663058_1667371_1667512_1669011
725055	contig_20951_pilon	-	267	2	Intergenic	novelGene_43089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAGGACTGTCCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27630	27151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
725058	contig_19731_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_168519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCTGGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46032	44877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19731_pilon_-_44900_46000
725059	contig_8775_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_166821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACACTGAACGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31841	33642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_31800_33600
725066	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_96035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725067	contig_5317_pilon	+	1034	4	Intergenic	novelGene_76509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5602.73808061737	9	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	106	516	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33678	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35263_35410_36684_36839_43197
725072	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_96862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
725073	contig_6062_pilon	-	1437	8	Intergenic	novelGene_5250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	207.64235343199	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	466	996	561077	546502	TRUE	25	CTGTGTCATAAATTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGRFTGTIGFNWSSKPNISQFFSKLCQMV	598250	541227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548607_548783_560804_561084_569595_569743_597863_597914_597988
725075	contig_8538_pilon	+	2321	12	Intergenic	novelGene_5106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.3692934186232	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	98	1459	939722	974920	FALSE	25	CAGTCGAGTCTGTGACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKEIPIPFYLSVYFFHVVNPEEILKGEKPQVQERGPYVYREFRHKSNITFYDNDTVSFLEYRRFQFQPAKSHGLESDYIVMPNILVLTAAMMMEDKPLSQKLLLTLMFSTLGERAFMNRTVEEIMWGYDDPLLSIINNYLPNMFPFNGKFGLFSELNNSHSGLFTVFTGVKDFSRIHLVNRWNGLSKVNFWHSDQCNMINGTSGEMWAPFMTPKSSLEFYSPDACRSMKLVYKEAGVFEGIPTYRFVAPPTLFANGSVYPPNEGFCPCLESGIQNVSTCRFGAPLFLSHPHFYNADPVLAEAVIGLHPSDQEHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYIKAIKGIGQTGSIKPVVLPLLWFGQSGTMEGQTLRTFYTQLVLLPAVLHYAQYVLLALGCALLLLIPVVCQIRSQGPEDSTSQSSLVAQPDQLPSPCTPLLMDSGSRQPASHKA	888173	975782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_888235_939685_939844_944023_944166_944573_944778_946502_946599_949137_949254_951881_952049_960037_960157_962507_962582_965576_965629_966444_966595_974800
725076	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1192	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725084	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725092	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_17615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
725101	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	36	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725104	contig_7035_pilon	-	797	3	Intergenic	novelGene_83512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_2	36	822	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	500	529	225928	225899	FALSE	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPRINSQLVAQQVAQQYATPPPPKKEKKEKVEKQDKEKPEKDKEISPSVTKKNTNKKTKPKSDILKDPPSEANSIQSANATTKTSEANNTSRPRLKNVDRSTAQQLAVTVGNVTVIITDFKEKTRSSSTSSSTVTSSAGSEQQNQSSSGSESTDKGSSRSSTPKGDMSAVNDESF	226937	225630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_226152_226573_226673_226760
725109	contig_3975_pilon	-	2191	15	Intergenic	novelGene_54805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	408.322557819783	2	118	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	307	1632	2044892	2016131	FALSE	20	TGTTTGTGAGAATCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052451	2015571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021128_2021619_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044921_2048324_2048515_2052363
725110	contig_15687_pilon	-	2408	11	Intergenic	novelGene_129151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	54.5816819088602	259	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	73	1038	247912	205671	FALSE	20	TTTCAGTGTAAGTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEDNEVYLPNDEIWTYDIDSGLWTMHLMEGELPTSMSGSCGACINGKLYIFGGYDDKGYSNRLYFVNLRTRDGTYIWEKISNFEGQPPTPRDKLSCWVYKDRLIYFGGYGCRRHNELQDCFDVHDASWEEQIFWGWHNDVHMFDTKTRTWFQPEIKQTRMNDLHYLNLDTWTWSGRIPTTGENPKHRSWHTLTPIADDKLFLFGGLSAENIPLSDGWIHNVMTNCWKQLTHLPKTRPRLWHTACLGKENEIMVFGGSKDDLLSLDTGHCNDLLIFQTQPYSLLRSCLDCIGKNVIILESQISLLPPKLLQQVFKKITFWTAANHREEQRAQTEETENKYQWISSN	248444	204300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_205858_214304_214358_216565_216651_220875_220949_223354_223468_228405_228465_236024_236109_240857_240937_247263_247383_247798_247917_248376
725121	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
725122	contig_15039_pilon	+	2449	4	Intergenic	novelGene_110187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	153.888126753027	653	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	295	735	368040	414815	TRUE	70	AAAGAAAAACAAGATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEIETEEIIKDIFQQGKTCFIPQYQFQSNHMEMVKLASPEEISLLPKTSWNIHQPAEGEVREEALSTGGLDLIFMPGLGFDKHGNRLGRGKGYYDTYLKRCLQQQEVKPYTMALAFKEQICLQVPVDESDMKVDEVLYEDSSTS	360902	418600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_361143_367985_368248_414582_415894_417964
725131	contig_6958_pilon	+	1634	11	Intergenic	novelGene_69912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	82.6791388440881	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	754	1098	132152	138329	FALSE	20	GTATTAATTTCTGGCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNDLQESRVLLEKISGHLEARHVMEKSMQKIVSLLVMSNAEAEQFLSQRVELTKYACYQEAAMHFRTHCFNWHSSMYEYALRHLYVLVNLCEKLYPVDRIKLAMDKVCLGYY	89767	138865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_89859_99712_99880_121575_121674_122965_123053_124493_124580_126347_126424_127155_127219_132066_132215_135018_135190_138007_138076_138286
725133	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_89782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653794	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725138	contig_2854_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_120855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTGCTGGGTCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320509	321302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_320500_321300
725139	contig_10011_pilon	-	2990	2	Intergenic	novelGene_68074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	150	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	332	784	282612	282160	FALSE	75	AAAAAAGAAAAAAAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTVDLKVATDLNPQIRALWETKGSVTESSSHSKKSSPQMDSLHPESSRRDFRNFHYHEAAGPLEAVSQLQELCRQWLRPEIHSKEQILELLVLEQFLTILPRETQTQMQKHHPQSIKEAVALVEYLQRESGQTRNGVRRKIPDMYNTIG	284747	279953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_282712_284515
725141	contig_9848_pilon	-	1115	5	Intergenic	novelGene_79959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	500.034186331295	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGCAGTCGTTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113900	98500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99361_107354_107399_110003_110044_110455_110567_113840
725146	contig_17814_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_168526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	657	971	120134	120448	NA	70	AAAAAAAAAAAACATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAPWTPTYQGLVEEGRAGARKLTQNSQSWEENQQSQGGAISKRKEKAVSYTQEGSSTVGTEESIGFDSEVSDGLCVTSMVSVELTKYLKSDFSGSKRKCEVRR	119477	120452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_+_119500_120500
725150	SIRV5	+	548	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	561	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGTACGGCCAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	2397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
725151	contig_18184_pilon	+	2328	6	Intergenic	novelGene_123850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	60.0752861000262	7	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	512	1816	48717	62430	FALSE	20	TAAAGATTGTTTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFMESLTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQKKLYRDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMETVPQAGAQEELSGSHIWQQVASDLTRCQDSVINYSQFYKQGEKPYKCEECGKGFRFASQLLIHHKVHSGEKPFKCEECGKYFSSRSNLQTHHKIHTGEKSYNCEECGKCFRQAIHLLTHQRKVHSGEKPFKCEECGKYFRSISNLQAHRRIHTGEKSFNCEKCGKSFRVASQLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSIRSNLQTHRRIHTGEKSYNCEECGKVFRQAVHLLIHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSNLQTHQRVHSKEKPYKCEECGKYFGTRQNLQVHFRIHKGEKSYNCVECGKCFRQSAHLLTHQRVHSGEKTFKCEECGKYFRNRSNLQTHHRIHTGEKYFNCVSGPYSWGFSSLCRNSKSGLLL	37548	62942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_37997_48653_48732_55969_56097_60466_60614_61165_61408_61656
725157	contig_5954_pilon	-	1522	9	Intergenic	novelGene_28668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.969385706264	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	104	1165	959926	945083	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTASGDYIDSSWELRVFVGEEDPEAESVTLRVTGESHIGGDSLTTIPELKDHLRIFRPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960563	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945246_945373_945527_946209_946335_946673_946891_947107_947205_947435_947561_947661_947712_959794_959941_960474
725158	contig_15449_pilon	+	956	2	Intergenic	novelGene_33654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	80	junction_1	0	181	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	90	488	186393	188257	FALSE	40	AAAGAAACCAGGAGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQVCHYLWPSPAVNSSLGQEPQKQLPEVLGGAWGTPQGDGLPQLTIIVTIFVLLAVCIVVAVHFGPRLHQGHATLLKEPSAPKPEGGIYLIHWRMLSPQNSHKEAQQGTPAPDHYPAPDGPRPSIDEITYL	186303	188725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_186402_187867
725159	contig_3948_pilon	+	1977	14	Intergenic	novelGene_53180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.9874950919077	16	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	342	1802	349317	384260	FALSE	0	GTGGTCCCTTTTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQGLKEVTLLGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRQKTRAYHRLQDDVPGEVKIRRLEELITVFREEATTANKTSVGCAQLVLVEGLSKRSATDLCGRNDGNLKVIFPDTEMEDVSNPGLRVRAQPGDYVLVKITSASSQSLKGHVLCRTTLKDSSAYCSPGWMATQS	345535	384435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_345645_346522_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361249_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368963_371245_371396_379631_379773_384152
725163	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
725165	contig_15442_pilon	+	2811	8	Intergenic	novelGene_119145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_1	72.7988562368102	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	32	1012	243902	263831	FALSE	60	TTAAAGAAGTAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQALLLAPGEMEGPGVGSQCRNHSHGPHLPGFGRHGICADENKELAKAKDALPLIEDSSNCDIVKATQYGIFERCKELVEAGYDVRQPDKENVSLLHWAAINNRLDLVKFYISKGAVVDQLGGDLNSTPLHWAIRQGHLPMVILLLQHGADPTLIDGEGFSSIHLAVLFQHMPIIAYLISKGQSVNMADLNGQTPLMLSAHKVLGPEPTGFLLKFNPSLSVVDKIHQNTPLHWAVAAGNVNAVDKLLEAGSSLDIQNVKGETPLDMALQNKNQLIIHMLKTEAKMRANKKFRLWRWLQKCEVFSHGAYCTGYKNLFVCFCFLGHQGKPGSWFSASL	243870	265630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_243929_253373_253520_257494_257618_258867_258946_260670_260816_262452_262518_263193_263357_263597
725166	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725167	contig_18869_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_56409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAATTCTCAAGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73776	73567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73600_73800
725169	contig_9455_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_161839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAATAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304836	306921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_304800_306900
725170	contig_2069_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_23231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCATGGATTGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254227	256902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_254200_256900
725172	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
725182	contig_7272_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_25384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	816	1226	730291	729881	NA	50	TCTTTAAAAGCCTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKDTRQSLAILTSKERSGCTSSKTDLFLLLAVHGIFNVIHQHHNSKASILLWSSLLIVQLLHAYEAIKNIMAWARHTLVLKVTSFNTLKRSFAADLPNAIPLFDFLTAASMGVGCGIWRTDTD	731106	728754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_728800_731100
725185	contig_8263_pilon	+	1444	8	Intergenic	novelGene_83083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_6	214.585884999029	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	863	1390	190666	192899	FALSE	85	CGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLFFTYFTNLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	129472	192953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_129530_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_190402_190697_192402
725192	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_93475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
725193	SIRV1	-	237	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	5	3588	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
725194	contig_10324_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_7920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_4	16.3859696081739	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	305	1081	929627	928503	FALSE	15	TAGCGTGTGCCCCGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWTALLTLVLQASLVLPLAESAAPALRFVAVGDWGGVPNAPFYTAREVASAKEIARTVQTLGADFILSLGDNFYFSGVQDVNDKRFQETFEDVFSARSLHNVPWYVLAGNHDHLGNVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKVPRTNVSLAIFMLDTVTLCGNSDDFLSQQPERPRDLMLARTQLSWLKKQLAAAKEDYVLIAGHYPVWSIAEHGPTRCLVKQLQPLLATYGVIAYLCGHDHNLQVRGLWEGWGAR	931637	927362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_928885_929014_929143_929360_929628_929916_930004_931420
725195	contig_10627_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_59912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	51.6204094004171	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	100	483	29280	30355	TRUE	10	AACCTGTGCCCTTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNTGLQLLAATPDLHPPSLRRRPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYREWLRHGVLLSHRQNLVY	29180	33059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30711_31515_31837_32744
725196	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	146	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725198	contig_2455_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_119233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTGGTGAATGCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453956	1455174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1454000_1455200
725199	contig_9527_pilon	+	2464	2	Intergenic	novelGene_134084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	238	885	495981	498812	FALSE	25	CAATTGTGTGGGATTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDKKATVPWLTPAPSQEGHSVAAKVDLLGEFQSALPKIKTHLVCSQKKHPQKNPPQKNASQNSTPAHSENNCPGVSQEMPRKMVAVDCEMVGTGPKGHVSSLARCSIVSYDGDVLYDEYILPPCHIVDYRTRWSGIRKQHMVNATPFKIARSQILKILTGKIVVGHAIHNDFKALQYFHPKSLTRDTSHIPLLNRKADCPENTTMSLKRLTQKLLNRDIQVASPQVLPGPWRGCCGGSHCFLALGSDPRVPLVVEIRVGCSDGRSFGLRGPVFSLHLYIIRNSNSCSLLHRVS	495743	500391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_496206_498389
725205	contig_1895_pilon	-	319	2	Intergenic	novelGene_168527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTGAACAGTGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78934	4309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1895_pilon_-_4403_78708
725212	contig_5715_pilon	-	1975	2	Intergenic	novelGene_127971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604808	599649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_601415_604598
725216	SIRV4	-	269	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1254	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3904	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
725222	contig_8693_pilon	+	1773	5	Intergenic	novelGene_150853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	15.337861650178	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	135	779	1055936	1076287	FALSE	15	TGACTTTCTGGCCCAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGVVRFRFFDGVSLEEDGQHTIENRGLGCQGRWKSGEVHWLKPWMWVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAGEVEAKVEELEFDRYSIFRPGVLLCDRQESRPSEWLIRKFFGSLPESWARPYSVPVVTVVRAMLNNAVRPSDKKMELLDNKAIYALGKAHDTLKP	1055801	1077281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1055942_1056608_1056852_1061608_1061717_1075676_1075739_1076061
725223	contig_3077_pilon	-	1921	7	Intergenic	novelGene_26903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_6	54.4714502183381	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	33	779	1651385	1646859	FALSE	25	TTTAGTCTGTATGGTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQILRAILSKMQQAETLSVMQSLIMVFAHLVHTQLEPLLEFLCSLPGPTGKPALEFVMAEWTSRQHLFYGQYEGKVSSVALCKLLQHGINADDKRLQDIRVKGEEIYSMDEGIRTRSKSAKNPERWTNIPLLVKILKLIINELSNVMEANAARQAAPAEWNQDDSNDMWEDQEEEEEEEDGLAGQLLSDILASSKYEEDYYEDDEEDDPDALKDPLYQIDLQAYLTDFLCQFAQQPCYVMFSGHLNDNERRVLQTIGI	1651417	1645716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1646970_1647422_1647500_1647712_1647815_1648285_1648409_1649059_1649194_1650901_1651069_1651352
725235	contig_7202_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_18646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCCTGGCGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
725237	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
725244	contig_11978_pilon	-	1353	6	Intergenic	novelGene_63046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	6.87022561492707	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	76	615	1802644	1797292	FALSE	15	CTCATCTCTTATCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSELWGLTRVPRGHRALALPGSGRAMGQLIAKLMGIFGNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLTNEVVHTCPTIGSNVEEIILRKTHFLMWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGLPAGLQWMLSQTTAN	1802719	1796553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1801968_1802030_1802598
725246	contig_5217_pilon	-	2109	15	Intergenic	novelGene_135741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	99.0205091104353	323	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	832	1830	531324	529231	FALSE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	534331	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477_531679_531766_531863_532688_532777_532869_533000_533128_533246_533343_533452_534276
725248	contig_20951_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_43139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGACCACGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337836	338941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_337800_338900
725250	contig_20739_pilon	+	3221	1	Intergenic	novelGene_83191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGATGGGTTCTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189661	192882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_189700_192900
725252	contig_13224_pilon	+	2156	10	Intergenic	novelGene_104128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	67.8867975673519	50	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	612	1514	409113	413151	FALSE	0	TTCCGTCTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFSESLECPLPGAFSRPGGGEKRGVFL	393382	413793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405040_405134_409035_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882
725265	contig_6326_pilon	+	2472	5	Intergenic	novelGene_168532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	45.8393935387457	189	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1800	2276	284987	291496	FALSE	5	TGTTTTGCCTTTTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEVEESQLKDEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLPNGADILFEPKLKFA	282434	291692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_283914_284666_285143_286930_287015_289403_289467_291322
725266	contig_8322_pilon	-	1836	11	Intergenic	novelGene_143280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	25.1944438319245	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	28	1494	569032	541539	TRUE	20	TATATTTAGTGTTTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGTAPPNSFYRALYPKIIRDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR	569059	538801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_539113_541507_541701_551795_551875_554777_554889_556241_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560072_565004_565192_568827
725276	contig_960_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_108308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCGCACAGCCTATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045781	1044149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1044100_1045800
725283	contig_10058_pilon	+	1646	10	Intergenic	novelGene_67693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	107.591821250502	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	305	973	51319	53244	FALSE	10	GCCACAGTTGTTTCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVSQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	48260	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52829_52967_53154
725286	contig_854_pilon	-	1782	15	Intergenic	novelGene_36153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.379205144089	5	67	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	41	1300	509201	471803	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509241	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470469_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
725290	contig_14357_pilon	+	2629	6	Intergenic	novelGene_121645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	41.7545207133311	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	442	987	58167	66150	FALSE	30	GGAGAGGACAGCCATATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNVFEKLFKSLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELTRMLAEDELRDAVLLVFVNKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRQRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLKNQK	55927	67792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_55986_56105_56470_58147_58315_61803_61915_63904_64030_65988
725294	SIRV4	-	317	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1206	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
725295	contig_3942_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_128743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	635	1033	790349	789951	NA	25	GACTTTTCTTCCAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEPGRAWDRSSKPGLRGSEMRSGLVSQEPVLCSEVAMVVVVLGGMGSSSSSSNRDASGMSGEGERLKPVQDSQPEVLACKAAQRGSCWVREPTGSPSNPQGMTWPKLKNKKQKQLPLSQPQLMVTLYVSE	790983	789899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_789900_791000
725298	contig_16978_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_168548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGACAAGAGAGTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22755	20275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16978_pilon_-_20300_22800
725302	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_93976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725303	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
725304	contig_3469_pilon	+	648	2	Intergenic	novelGene_34194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCAGCCTCTGCCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479536	480272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_479681_479768
725315	contig_19744_pilon	+	2060	2	Intergenic	novelGene_120415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	43	345	271532	271834	TRUE	15	ATGCTGTTGTTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	271489	273587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_273035_273072
725318	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725324	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725335	SIRV6	+	568	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725342	contig_8140_pilon	+	2736	1	Intergenic	novelGene_86436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTTATTGGAGACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196251	198987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_196300_199000
725345	contig_253_pilon	-	2172	19	Intergenic	novelGene_129745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_10	142.864057372346	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	182	1489	679264	674282	TRUE	20	TTGTTGAATTTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMAVELPDSFSPELRSLLGGLLQRDVNRRLGCLGRGAQEVKESPFFRSLDWQMVFLQKYPPPLIPPRGEVNAADAFDIGSFDEEDTKGIKVLGLSPGGPDPLQPHLIAGPHVPPPQTSLGWLWPRPSLPQGPGPGSSQACS	680673	673092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_673304_673391_673506_673757_673895_674060_674534_674610_674678_675192_675294_675610_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641
725347	contig_8594_pilon	+	1825	4	Intergenic	novelGene_140060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	13.7194104181711	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGATTGAAATGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488113	537936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_489455_496157_496237_534656_534924_537798
725350	contig_15185_pilon	-	1597	8	Intergenic	novelGene_99452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	348.138489919264	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	98	1144	472420	429911	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472517	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430249_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
725351	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725352	contig_8878_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_147870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAATTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227860	229583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_+_227900_229600
725354	contig_500_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_30974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449541	1447848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1447800_1449500
725370	SIRV4	-	384	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTTAACTTCAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
725372	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
725373	SIRV6	+	203	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	502	3	-332	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTCGAAGTACTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
725376	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
725377	contig_7293_pilon	+	472	3	Intergenic	novelGene_54259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	21	347	335695	336451	FALSE	40	CTGCAGTATGTTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335674	336576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
725381	contig_13794_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_168551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1139	1468	51002	51331	NA	85	AAATAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNAASELEEDSLNNLQYADDTTLLAENEDDLKHFLYELHLNVKKMKILTTGPVNNIMINGEEIDVVKDFILLRSVTKEAAVRISNDVLHWANLLQKTLYYKGPNTRG	49863	52130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_49900_52100
725390	contig_12340_pilon	-	1790	4	Intergenic	novelGene_122090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	93.3523790091429	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	317	655	5507	3862	FALSE	10	TCTTGATGCTGTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	14325	2726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_12767_12960_14209
725400	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
725401	contig_13479_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_168558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	225	524	18042	18341	NA	65	CAGTTTAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKYHSLHQPKPRRTSWCLATTTNHSDRDHNRVEEKCRTKFKLIERPDLLVCQKLKEPPRLWPPDTLLTQNQSHSQSSPFRQRLGRSIKQTELWWCSG	17817	18737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13479_pilon_+_17800_18700
725402	contig_14509_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_168562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGAGTTTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270321	269338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_-_269300_270300
725408	contig_8907_pilon	-	184	3	Intergenic	novelGene_85800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3431	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179864	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173356_179391_179544_179839
725412	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8114	-2	625	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTATGAGTAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
725422	contig_2027_pilon	+	1683	13	Intergenic	novelGene_39914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	213.217546703413	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	26	1555	128911	136541	FALSE	35	AATTATTAACCCAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCLPFSDPF	128885	136669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351_136430_136516
725423	contig_17059_pilon	+	2212	6	Intergenic	novelGene_166084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	137.903734539714	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	388	1344	421631	429087	FALSE	35	CCACAAACCAGAGAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLGLRDDIPFNFQKLEKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDLAQRRLYRDVMMETFRNLASVVSLHLNDGENLSSEHIMVRLMKNNTWSSMLGEISDSLGNKDHHKNQWRHVRSHTVQNHCESNEGNQCEKPFSQIPPKVNPFEFCECGKAFMDHSSHKHDARSHTGCNTRPCKECGEASSCSSHLTTPIRTLNGKKPHKCKVCGKYFICISTLRNPVTTLTGEKWYECNQCRKDFCSFSSFWIHMRGHKHECKECCKTYSPSSLILQKKIHNKDNPYKCKVCGKAFSRSSSLTRHIKTHSGGVMNVRNVGKSLVRP	419460	429955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_419664_421446_421694_425605_425733_426717_426869_427547_428073_428996
725426	contig_13403_pilon	-	2615	1	Intergenic	novelGene_158096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGCTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80879	78264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_-_78300_80900
725429	contig_3817_pilon	-	2634	1	Intergenic	novelGene_78367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAAGGAAATGACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636582	633948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_633900_636600
725430	contig_19769_pilon	-	418	3	Intergenic	novelGene_102331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	89175	88018	FALSE	10	GGAGGCTCGCGCCAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTNHGSVG	89356	87930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_88039_88840_88958_89163
725433	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
725434	contig_8616_pilon	+	1517	6	Intergenic	novelGene_72389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	76.6331520948995	12	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATAAAGCCTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196155	199014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479_196640_196862_196914_197236_197657_197845_198596_198934
725437	contig_6742_pilon	+	2339	7	Intergenic	novelGene_144549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	11.4842887846348	91	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	131	805	25724	27436	TRUE	10	CTCCATCTCATTTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAVPRVECPCESSAKTCFSPENLERHSIPEALRLKWKNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVPSWEWLRRTSRFLKLPVSYFSDGCLPASCPT	18173	48028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_18199_25618_26114_26786_26974_27338_27495_41061_41147_41800_41909_46745
725438	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725441	contig_2114_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_104280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGACCAATAGAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624908	627087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_624900_627100
725444	contig_7730_pilon	-	1288	5	Intergenic	novelGene_156248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	611.200202470516	1013	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	212	688	43591	2295	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIKKKTFRDY	43802	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2322_2377_2445_4051_4177_7798_7895_43429
725445	contig_20600_pilon	+	2064	6	Intergenic	novelGene_137105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.1265395851856	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	212	712	112379	117548	FALSE	25	ATAAAGGTTTCAGCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMSTALCSRGRVIGLKEEPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	58512	118900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_58614_112268_112446_114085_114161_114959_115049_116223_116332_117386
725446	contig_14362_pilon	-	1422	7	Intergenic	novelGene_142521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	67.2848422752108	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	95	937	40212	37574	TRUE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAERLGPGFSTRTSAAPRCCLLLRGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	45384	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37398_37542_37729_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056_40233_45310
725449	contig_4496_pilon	+	2248	6	Intergenic	novelGene_66659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	80	junction_1	127.026926279431	6	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	243	2246	941408	998163	FALSE	80	AAAAAAACAAAACAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859244	998165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
725452	contig_9727_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_86253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12594	10885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_10900_12600
725454	contig_14322_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_116116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	54	249	302	671606	671659	NA	10	GCTGTGGGGAGATGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQC	671357	671660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
725457	SIRV5	+	371	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-41	875	-41	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
725460	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
725463	contig_3627_pilon	+	2117	16	Intergenic	novelGene_78472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_7	173.462720938983	4	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	88	1341	432362	448483	TRUE	45	CCTGAAATTGAAGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEPRNFIPRGVWLCLRGFPDYTPCVLYVSLHLQSSLGHPVPLVSEASSYWRCPASL	432274	483225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054_444201_447750_447848_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461510_461621_476760_476896_478112_478158_483177
725466	SIRV2	-	244	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4629	34	3454	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
725470	contig_13966_pilon	-	2367	8	Intergenic	novelGene_158146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_6	61.585845179965	187	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	479	937	415811	412840	FALSE	55	AAAGCAAATTACATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNFLIQVTGKKRVVLFSPRDAQYLYLSGTKSAVLNIDNPDLAKYPLFSNARRYECSLEAGDVLFIPALWFHNVISEEFGVGVNVFWKHLPSECYDKTDTYGNKDPTAASRAAQILDRALKTLAELPEEYRDFYARRMVLHIQDKAYSKNFE	430004	411409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_413097_415225_415343_415726_415815_417992_418131_419096_419142_419916_419987_427336_427473_429918
725471	contig_1781_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_168570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCCATAGGGTTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158495	157892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1781_pilon_-_157900_158500
725472	contig_16722_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_118283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATAATTTTTTTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96191	93485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_93500_96200
725473	SIRV2	-	612	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	47	2958	-47	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCGTAATTGTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
725474	contig_6489_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_128936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	392	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATGGGATGACCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209486	211730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_209500_211700
725475	contig_14142_pilon	+	1555	6	Intergenic	novelGene_120484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	142.147247599101	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	125	685	268562	274106	FALSE	45	ACAATAAAACTTTGCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGA	265565	274976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_265662_268533_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_274098
725476	contig_13828_pilon	-	2502	10	Intergenic	novelGene_158280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	31.8468557666565	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	215	1354	323602	50314	TRUE	35	TTTAATAAGCATATCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRYMPKHKITHLKKMLSLERNNGAAPSMALPSQQEQRGSESVLKNFTGESGLCGAVSGLGTIQQESLGSSLMQLSDLNQSNSSDDSNSYQEEKKQNPTLNPSDTLGGVDDQQRPLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMRLKELGLKFHVSVLGETFTDVPGWKLRIVVVTHFVPRIWFIPKYSQLNICILHLNSFQKGSRISARDQIL	327018	44203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_45335_50296_50389_51088_51160_72609_72720_115165_115529_246998_247173_250617_250786_323423_323636_325397_325510_326949
725486	contig_10196_pilon	+	1837	8	Intergenic	novelGene_132043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	104.921545033634	521	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	169	1086	643457	647887	FALSE	40	TAGAAGGCAGAGCAGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSKSKPPKRDEKERKRRSPSPKPTKVHIGRLTRNVTKDHIMEIFSTYGKIKMIDMPVERMHPHLSKGYAYVEFENPDEAEKALKHMDGGQIDGQEITATAVLAPWPRPPPRRFSPPRRMLPPPPLWRRSPPRMRRRSRSPRRRSPVRRRSRSPGRRRHRSRSSSNSSR	639738	648638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644721_644998_645102_645445_645600_646997_647140_647787
725487	contig_12464_pilon	-	2247	6	Intergenic	novelGene_68644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	66.8329260170464	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	177	629	98468	96686	TRUE	20	ACCTTGATCTCTCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAMQNLGFPPDNISGKPARSHLLGSGGGLDNRLALTSGTTRRFLPETLEQPWKLICLRLNHDSAGDTKCARVIWQSDPDIQKKTSRNMREVWSWGSHGLISLPTRYIPTGIRNRKRKKSLIRRVRSHSWLPPCREMTHLPADQEEEGP	101886	93014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_94384_95478_95560_95791_95948_96673_96912_98241_98524_101765
725503	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725509	contig_7202_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_16374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTCTTGGCGATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
725512	contig_11413_pilon	+	775	4	Intergenic	novelGene_103123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	17889	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	153	653	87465	90735	FALSE	10	CCTACTCAGTGTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87312	90857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
725513	contig_6608_pilon	-	2234	4	Intergenic	novelGene_162542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	35.1409858838492	53	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	70	936	254585	249448	FALSE	15	TTTGGCAATTTCTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSMWYIMQSIQSKYSLSERLIRTIAAIRSFPHDNVEDLIRGGADVNCTHGTLKPLHCACMVSDADCVELLLEKGAEVNALDGYNRTALHYAAEKDEACVEVLLEYGANPNALDGNRDTPLHWAAFKNNAECVRALLESGASVNALDYNNDTPLSWAAMKGNLESVSILLDYGAEVRVTNLKGQTPISRLVALLVRGLGTEKEDSCFELLHRAVGHFELRKNGTMPREVARDQQLCEKLTVLCSAPGTLKTLSRYAVRRSLGLQYLPDAVKGLPLPASLKEYLLLVE	257828	248149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_250081_252879_252985_254456_254621_257794
725514	contig_12756_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_153227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGAAAAAGACTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245199	247050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_245200_247000
725515	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725520	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_96078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725525	scaffold_12124_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_22152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	195	311	975442	975326	NA	20	CCTTCCATGCAGGAGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANPSLHHTGPHTRKDSPGSSESAAHKSPSSQTAELRLWLVCLRHGLGTPRGSWAHFPPRFPTVSMSSHRGRGDQPVSPTWDVSNMSPGNTSVLQTWTASNPS	975636	973712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_973700_975600
725527	SIRV4	-	321	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
725529	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_90217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725532	contig_6898_pilon	+	1297	8	Intergenic	novelGene_35705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2934.58431503353	15	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	466	939	124380	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59536	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113077_123021_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125707_127406
725536	contig_6881_pilon	-	2623	1	Intergenic	novelGene_164845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1367	1765	97859	97461	NA	40	TTTTCAAAATCAATTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASMFDLSMKDKTRSPFAKLKDKMKGRKNDGTFSDTSSAIIPSTHMPDANTEFPSGEIQMKSKPKKPFLLGPQRLSSAHSMSDLTGSHISSEKLKSGTIGQTHLLGRQIDSFGAVPESGEQHVFLIVSSVV	99225	96602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_96600_99200
725541	contig_8866_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_77819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACTAGCATACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558686	560860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558700_560900
725542	SIRV7	-	903	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAATCCTAAGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147611
725545	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_18218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27821	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
725548	contig_9363_pilon	-	1923	11	Intergenic	novelGene_6695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_10	519.630099205194	215	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	136	1026	1283701	1280912	TRUE	30	TATTGAGGAGCAGTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRRHESQGELSSGTEAPGTQEGPTHDGTPLTEPGTSELREPLPTQLRPPLSESALAFVVALGASSSEEVELQLQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRQVEELCQRVYSRGDSEPPSEVAQARTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKRRAEA	1283919	1278928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1279423_1279616_1279797_1279887_1280008_1280716_1280792_1280883_1281032_1281154_1281277_1281845_1282053_1282733_1282876_1283009_1283178_1283569_1283763_1283845
725549	contig_9363_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_6693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCAGCGCTATAAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278714	1278165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1278200_1278700
725552	contig_8443_pilon	+	2503	3	Intergenic	novelGene_150607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5	64	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741144	779229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_741214_776112_778068_778750
725554	contig_5727_pilon	+	1614	13	Intergenic	novelGene_7937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	837.912299010662	121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1123	1563	173359	179994	FALSE	35	TATATACTTGTATCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDLLL	167960	180045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174772_179981
725568	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	616	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725570	contig_13123_pilon	+	1599	5	Intergenic	novelGene_136895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	137	625	434529	444679	FALSE	40	GAAATGGAAACCTAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434392	445653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
725576	contig_6589_pilon	+	727	5	Intergenic	novelGene_26060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	566.777293123145	475	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	16	390	1728220	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1728204	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1728304_1728996_1729042_1729149_1729234_1730067_1730152_1731406
725577	contig_7057_pilon	+	778	9	Intergenic	novelGene_123342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	732.704578940244	67	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	64	534	938907	943233	TRUE	5	CTCTTCGTGGCATCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	938691	943712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943305_943539
725582	contig_15063_pilon	+	886	3	Intergenic	novelGene_14425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	4	747	35349	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35345	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
725583	contig_6710_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_98043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725590	contig_10765_pilon	-	2270	2	Intergenic	novelGene_122937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_1	0	26	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	344	925	243671	242326	FALSE	70	AGAGAAAATAAAGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQEGVGREVMGQCVWLQGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLIMTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKVKRFLAILTVVSLKKKSTHNFQSILRGKGRGTVLPSFSLSLPSVDGSSPGLVV	244014	240980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_242650_243413
725591	contig_18620_pilon	-	2275	3	Intergenic	novelGene_168580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	184	junction_2	32	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	33	437	54372	50116	FALSE	65	AAAAAAAAAAATCATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGCEGSCRVMLGGSLGSRLLRSVGGSCGQFWGRGVREGGAAMATGESMAQRMVWVDLEMTGLDIEKDQIIEMACLITDSDLNILAEGPNLIIKQPDELLDSMSDWCKEHHGKVTLPNNRIAALGIITSLLLPHLNPIPLLDGI	54404	48277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_50290_53171_53256_54225
725594	contig_4315_pilon	-	3204	15	Intergenic	novelGene_46742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCAGGGGACAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216525	180134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_180212_181971_182073_182685_182822_183556_183638_185144_185297_186245_186306_188081_188165_190413_190497_191179_191320_191896_191982_192098_192236_207185_207351_207425_207573_214649_214840_214958
725601	contig_15866_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_63577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAATTAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160605	162826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_160600_162800
725603	contig_8377_pilon	-	2715	1	Intergenic	novelGene_35173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATGGTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422840	420125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_420100_422800
725606	contig_1146_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_84795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	943	1260	182071	182388	NA	20	ACTGTGCCACCAGGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPEEVKAATQTETCKLIFVAALFTTAKRQKQPKCPSTDGQAKCGVYTHTHTHTMKCSCKEKRSSDACHKLENIMLSKISQLEKDKYCMIYCSHEISKYMGIKDY	181128	182997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_181100_183000
725608	contig_15245_pilon	-	532	4	Intergenic	novelGene_145216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1008.55584321786	146	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	88	354	131120	43003	FALSE	30	TCTAATAAATTGTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWDTTASSALSSSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQAEILQESRMMIPDCQRRLEAAYTDLIKKHVQYWIQ	131207	42824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_43036_47651_47727_56801_56908_131067
725611	contig_7293_pilon	+	960	3	Intergenic	novelGene_54238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	367	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTAAGCAGTGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329151	330682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329330_329744_329881_330036
725614	contig_18364_pilon	+	2557	1	Intergenic	novelGene_102540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13440	15997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_13400_16000
725622	SIRV1	-	255	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3847	2	3573	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6793	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
725623	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_97178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAGCACAGTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653375	657519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
725631	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725632	contig_11337_pilon	-	2017	2	Intergenic	novelGene_107205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGAATTTGCCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359448	357320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_358149_358259
725637	contig_6189_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_164949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	194	868	119532	120206	NA	40	AGGACAGACTAACCGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVAKEFGRSRQQTCLSHRTNIDTSGMLLLAKASIQESKSRNLSDVSSLVPPAEAQHTHSIPWGQGLGNSQLSTLLSAESSQPGWEGGEGDITAQQGKCQSRHGTVGTAKLCPEECWEGFLEEAASELGCGECLGVPQVEESAGKHITASCAKQVKRSVLSKSNTRGTALSTPCISPGAFLHTAPPSRTTFRTLLILQSTAKMPPPPCSHPSCPSSCRIFLFP	119338	121621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_119300_121600
725638	contig_16948_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_166400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCTAGGGAGGAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182005	183461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_182000_183500
725639	contig_15559_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_141899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCCTCTTCCAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189251	191097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_189300_191100
725644	contig_14142_pilon	-	2149	16	Intergenic	novelGene_120604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.074527420985	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	85	1095	598441	589168	TRUE	30	TTTCCTTCATAAGTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVHHQLPCWTTSPPAHLASRACSPQQPEMTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSK	598525	584547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585423_585573_585651_585685_588385_588616_588714_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
725660	contig_9872_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_168582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGAGTCATAGTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45551	44907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9872_pilon_-_44900_45600
725664	contig_5018_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_47194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	443	junction_1	0	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	497	949	1592247	1592699	TRUE	10	GCCTTCCTCTGCAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTWKVGQRVGQALKQLGGCLWQKGGVFIFGSTSRARCLGSERTSSGQGVGSGTGIGYEGAGPEGFLLTRPELCQMESVGANLCWEMWLALSEACRGSLAASHRPNPYIHLLLLSTYSSPAEVVCLGRCILLLHQLRQFPELGGYQADDE	1591750	1593188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1592706_1592804
725668	contig_13982_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_163479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	34	381	346397	346050	NA	25	TCTATAGGTCACCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIKSIFLIKVLGVYFAHSLTVLKFFCTSPAPPRHIYFPKGEERSGFYLNLALRMTSAAKKTGDNWESGLTERRRSCRVMWENRSTSEKKLWQVRSGPGSEIEPKTQTSSSRTLS	346430	345072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_345100_346400
725671	contig_13800_pilon	+	1803	2	Intergenic	novelGene_153751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAAAACCTAACCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191927	197655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_193574_197498
725672	contig_12638_pilon	+	2661	1	Intergenic	novelGene_33294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGCAAGGAATTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138097	1140758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1138100_1140800
725673	contig_7898_pilon	+	1986	10	Intergenic	novelGene_47639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	55.9483889153407	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	187	1122	727098	735721	TRUE	5	CAGCCTTCTCTGGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQTCRDFAEKELVPIAAQLDKEHCFPAAQVKKMGELGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYSIAMEEISRGCASTGAIMSVNNSLYLAPILKFGSQKQKLQWVTPFTTGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTAVADGDSWVLNGTKAWITNSWEASAAVVFASTDRSLHNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRASSTANLIFEDCRIPKENLLGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIGQAALDCAVTYAENRKAFGAPLTKIQGIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKRRLQWPS	725316	736716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_725385_726979_727191_733435_733586_733832_733945_734362_734515_734825_734997_735089_735228_735380_735477_735697_735757_735887
725674	contig_5945_pilon	+	1907	3	Intergenic	novelGene_104546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.5	73	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	36	740	196496	197866	TRUE	75	ATAAAGTAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAALSGGERAMLALLGLKPEVQDTCTSLGLMLSVVLFMGLARVIARQRLHSPKAHAFVLEFLATFQLCCCTHELLVLSEQDPANPTWPLTLIYFFSLVHGLTSVGTASNPCGVMMQMMLGGMSPELGAIGLLAQLISALCSRYCIGALWSLRLTKYHVSERSFACRNPIHVDLPKAVVIETIFSFIFHSALLHFQEIRTKLRIHLLAALITFLVYADLRSSLYILNGTRKSKKQALYDKMCHFK	196460	200716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_197115_197780_198649_200331
725676	contig_17427_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_30304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATTCCTGTTACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172221	176554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_172352_175446
725682	SIRV6	+	392	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	570	0	391	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1694	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725689	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
725694	contig_6589_pilon	+	1245	7	Intergenic	novelGene_25744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_5	52.930772398168	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	210	881	479590	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	479380	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
725700	contig_13004_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_112586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACTTTGCTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24593	25021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_24600_25000
725702	contig_6684_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_168586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	36803	37105	NA	25	TGGGCTCAATTCTTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSISVSSTPFHLKRASRSYKDKGHPKSHISLHFSLFAEYSESSSEFSICSQNSCSIKWNLFIKVFLYHLSTLFPSGVITIQGWQSFPPNQTHCLQVNYDS	36800	37363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_+_36800_37400
725703	contig_6215_pilon	-	1975	2	Intergenic	novelGene_21215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1103	1408	227679	227374	TRUE	50	ACCTATAAATAAATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSAGFACRLRHIAFKERLAMVHTELSTQLDCNLPWVGMASFHTYTVNFVLVYKHMQNNGFSGDVRNAEGLDKGFEKENHGLRKKFFKKTLEISFEKERW	228781	226752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_226874_226927
725714	contig_7035_pilon	-	1683	2	Intergenic	novelGene_83547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	0	432	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	486	1223	779961	778935	FALSE	0	CTTTCGCTGTGCCTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEGVGDEVTILFAVLACLLVLALAWVSTHTAERADPLPQPSGTPTSAQPSKAMAATDSIRGAAPGTEAPSLRHRGQAAQPEPSMGLPATPPPDSPQEPLVLRLKFLNDSEQVARAWPQDTIGSLKRTQFPGREQQVRLIYQGQLLGDDSQTLGSLHLPPSCVLHCHVSTRVGPPHPPCPPGSEPGPSGLEIGSLLLPLLLLMLLLLWYCQIQYRPFFPLTATLGLAGFTLLLSLLAFAMYRP	780446	778474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_779287_779575
725721	contig_1516_pilon	+	1444	6	Intergenic	novelGene_49995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1691.82015592675	15	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	432	803	347241	363092	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTVP	335215	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_336185_336551_347227_347395_347975_348068_352897_353013_363081
725722	contig_8017_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_65388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1630911	1629032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1629000_1630900
725724	contig_11281_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_125519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCGACTCATACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991326	992432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_991300_992400
725725	contig_11281_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_125521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996394	997954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_996400_998000
725733	contig_4797_pilon	-	1639	14	Intergenic	novelGene_6890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	67.6695766030285	494	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	241	1500	126871	105799	FALSE	15	CACGTTTTTTTTTGGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWKTVLLQYFLLVTCLLTAFEAVPIDIDKTKVKNTEPVESAKIEPPDTGLYYDEYLKQVIDVLETDNHFREKLQKADIEEIKSGKLSKELDLVSHHVRTKLDELKRQEVARLRMLIKAKMDSLQDTGIDHQALLKQFDHLNHMNPDTFESTDLDMLIKAATSDLEHYDKARHEEFKKYEMLKEHERREYLKTLNEEKRKEAESKFEEMKKKHEDHPKINHPGSKDQLKEVWEEADGLDPNDFDLKTFFKLHDVNNDGFLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMIEMEEERLRMREHVMNEIDANKDRLVTLEEFLKATEKKEFLEPDSWETLDQQQLFTEEELKEYENHISLQENELQKKADELQKQKEELQRQHDQLQAQKMEYHQAVQQMEQKKLQQGIPPSGPAGELKFQPHV	146961	105659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_105807_106217_106300_106556_106728_111706_111797_115162_115256_115367_115427_115991_116083_116273_116460_117508_117613_122662_122790_126062_126171_126730_126872_140864_141023_146879
725735	contig_6316_pilon	+	1727	15	Intergenic	novelGene_134706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	187.357456020652	10	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1311	417	1727	144118	157137	FALSE	40	TTCTTTGACTTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPLEASHSVEEDTHPSHYLEARSLNERDYRDRRYIDEYRNDFCEGYVPRHYHRDIESGYRVHCSKSSGLSRKSSLKRKHNRHCSSHHSRSKSHRRKRPRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHP	136302	157137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_142566_142734_144111_144171_145291_145515_146617_146709_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
725738	contig_5916_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_158045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362579	362284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_362300_362600
725741	contig_4125_pilon	-	2335	3	Intergenic	novelGene_25056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	162	324	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1464	1856	357195	355996	FALSE	35	TTCATTCTTTGGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFMVKEIVRDLDQDGDKRLSLPEFISLPVGTVENQQAQDIDDNWVKDRKREFEELIDANHDGIVTPEELEEYMDPMNEYNALNEAKQMIAIADENQNQHLEPEEILKYSEFFTGSKLVDYARSVHEEF	358658	355516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_356173_356655_356832_357155
725742	contig_14796_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_159368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGCATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122494	121977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_122000_122500
725745	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	282	1	51	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
725747	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_89284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
725748	contig_15882_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_144816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGAAGCGCGGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372512	371964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_372000_372500
725750	contig_4654_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_103031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTATTACACTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9884	10696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_9900_10700
725752	contig_7748_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_101061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCATCAGGTAACAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187246	188660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_187200_188700
725757	contig_7151_pilon	-	1348	4	Intergenic	novelGene_40721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_1	264.905433860631	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	86	871	268488	262705	FALSE	20	GACTCTCATACTCCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKPKMVLLEDSGSADFRRCFVRLSPFAIALVSLLSACFITISLGETEKQLRLVAGENRCTGRVEVKVNEEWGTVCNNGWDMDDVSVICGQLGCPTVIKATGWTNSSAGSGRIWMEHVSCQGNESALWDCKHDGWGKNNCTHQQDAGVTCSDGSDLEMRLVNGGNRCSGRIEVKFQGQWGTVCDDNLNIDFASVVCKQLECGSAVSFSGSANFGEGSGPIWFDDLVCHGNESALWNCKHQGWGKHNCDHAEDAGVICLGKD	268573	262227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_263037_266028_266350_267402_267490_268442
725758	contig_5684_pilon	+	2771	10	Intergenic	novelGene_80988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	47.377913278939	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	152	1030	82611	95648	TRUE	45	ATTAAAAAACCCCAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFSAFKRSREVNSTDWDSKMGFWAPLVLSYSRRQGVVRLRLRDLQEAFQRKGSVPLGLATVLQDLLRRGELQRESDFMASVDSSWISWGVGVFLLKPLKWTLSNMLGDNKVPVEEVLVAVELLKEKAEEVYRLYQNSPLSSHPVVALSELSTLCASSCPDERTFYLVLLQLQKEKRVTVLEQNGEKIVKFARGPHAKVSPVNDVDVGVYQLMQSEQLLSCKVESLSQEAERCKEEARRACGAGKKQLALRSLKAKQRTEKRIEALHAKLDTVQGILDRIYASQTDQMEL	82459	98341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_82820_85404_85577_93558_93745_93881_94016_94905_94955_95200_95321_95639_95711_95930_95992_96479_96660_96903
725759	contig_10861_pilon	-	1056	4	Intergenic	novelGene_39430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1058	junction_1	454.773203549491	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	11	583	2432774	2423627	FALSE	50	TTAGAGAAAAGCAGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALSGILWVRAQLGLPPLLLLTMALAGGSGTASAEAFDSVLGDTASCHRACQLTYPLHTYPKEEELYACQRGCRLFSICQFVDDGIDLNQTKLECESACTEAYSQSDEQYACHLGCQNQLPFAELRQEQLMSLMPKMHLLFPLTLVRSFWSDMMDSAQSFITSSWTFYLQADDGKIVIFQVTTVLLRFI	2432784	2423153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2423810_2425542_2425638_2427135_2427242_2432585
725760	contig_13707_pilon	-	1582	11	Intergenic	novelGene_43575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	822.394674107268	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	14	721	276433	273324	TRUE	20	CCCCAGCTCCATCGGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVPMGEMQGALARARLESLLRPRHKKRAEAQKRSESFLLSGLAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYR	276446	270842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271622_271738_271895_272363_272460_272853_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_276315
725763	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
725770	contig_8312_pilon	+	2684	3	Intergenic	novelGene_152869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAAAAAAAAATCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212170	215337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_214103_214290_214924_215218
725771	contig_1996_pilon	+	993	9	Intergenic	novelGene_131900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	128.962627822947	50	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	300	851	252597	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249917	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
725775	contig_20844_pilon	-	1018	10	Intergenic	novelGene_78604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_5	330.437457895207	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	51	908	209140	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209190	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
725776	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
725780	contig_5280_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_52639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTTTCTGTTGCTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84510	83824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_83800_84500
725785	SIRV4	+	326	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1445	632	990	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2445	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
725786	contig_4964_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_157245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACAAGACTGTACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9249	10396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_9200_10400
725790	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_96016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
725792	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1444	632	989	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
725793	contig_6589_pilon	-	1130	9	Intergenic	novelGene_25905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_7	197.318231228136	6316	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	209	982	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178548	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177927_1178100_1178424
725796	contig_3068_pilon	-	1157	4	Intergenic	novelGene_137615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	40	381	188903	188562	TRUE	25	CCCGTTTCGGAATTCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHYSIICKIKHGQESKKSPRKCNPVSVGARGEWDSSEAAFLEPELRAASVADGLGSLGEPGWFVVKTLGEGWGGGGGGGGERPGFLQEKPQRLGSSTNLPRACARTLKGDR	188942	175290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_175363_175530_175605_178803_178849_187976
725801	SIRV6	+	251	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	279	1	48	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2564	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
725806	contig_6677_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_114204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584421	586347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_584400_586300
725807	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725808	contig_6477_pilon	-	3076	25	Intergenic	novelGene_154187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	42	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGTCGCTGGGAGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820894	773291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_773355_773674_773891_776696_776803_777232_777293_777829_777875_778916_779000_780212_780278_782027_782113_783187_783310_784957_785057_785689_786445_790317_790449_790803_790945_791891_791937_794157_794229_795887_795987_805711_805803_806785_806861_808595_808676_810343_810440_814076_814177_815088_815221_816006_816089_819380_819531_820810
725811	contig_6589_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_25807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTTGGATGAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675460	674002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_674000_675500
725816	contig_9706_pilon	+	2887	2	Intergenic	novelGene_21058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731461	734458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_733512_733621
725823	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725824	contig_13481_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_119331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329799	327760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_327800_329800
725829	contig_7333_pilon	+	2426	4	Intergenic	novelGene_142778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	31.4572019664107	9	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1607	1909	217233	217535	FALSE	40	TGAATGAGCAACCAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYLSWSLLQRCFGHNFRSHLHQGKYLKIIPVHLLMLLLYVWQVYSCYFLQVTYGTLAFFFSPLRTWLTLLTPVLIRCVWTLNPSELGTFTVQLKSHLSS	202227	218052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_203620_206388_206474_212390_212496_217208
725830	contig_5816_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_158264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACCATTCAGCCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344230	343126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_343100_344200
725831	contig_5816_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_158262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339807	339020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_339000_339800
725832	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91681	4	-91675	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAATGCAAATAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
725836	contig_13528_pilon	-	1843	11	Intergenic	novelGene_66873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	241.672588433194	3	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	285	1265	67895	45849	TRUE	35	GTTTTAAAATAAATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAETVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLR	68179	39852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_45814_45930_46533_46612_46802_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
725839	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
725842	contig_11678_pilon	+	1669	3	Intergenic	novelGene_160842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	97	junction_1	69.5	694	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	67	600	235648	249959	FALSE	5	GCCTGGCTTGTTTTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFPRRLVQASAPLAPVWLNQRMMGVLGVRRGLEWLLGVYFLSHIPVTLLIDLQALLPRELYPIELRNLQQWYAKEFKDPLLQDPPTWFKSFLLCELVFQLPFFPFATYAFFKGGCKWIRTPAIIYSVHTMTTLFPVLSTLLFENFSKASGFKGEGPKTFHERLTLVSVYVPYFLIPLTLLLFMLRSPHYKYEEKRKKK	235581	251028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_235777_248121_248267_249699
725843	contig_8063_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_152413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGATGGGCACACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38057	37764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_37800_38100
725845	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725846	contig_4496_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_66697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	436	813	966883	967260	NA	80	GGGAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVWIYFWTPYLIPLVCMSVIIPVPGCFNYCGFIVRFEVVKDFILLGSTINTLGNSSQEIRRRITLGRYTAKDLFKMLKIKDVTLRSKVHLTQALVFSIASYSYKSWTANKEDRRRIDAFELWYW	966447	968561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_966400_968600
725847	contig_11248_pilon	-	1802	12	Intergenic	novelGene_142545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	300.46704691362	2692	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	239	1285	294216	273839	TRUE	0	TCTGTGTGCCTCTCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAGEVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQKEIEEREKRRKDRHEASGFSRRPDPDSDEDEDYERERRKRSMGGAAIAPPTSLVEKDKELPRDFPYEEDSRPRSQSSKAAIPPPVYDEQDRPRSPTGPSNSFLANMGGTVAHKIMQKYGFREGQGLGKHEQGLSTALSVEKTSKRGGKIIVGDATEKDASKKSDSNPLTEILKCPTKVVLLRVRSKKKETCLPTLLFVHHLPYPTPYAFTPTDITKVKEN	302283	257060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_257365_257495_257569_273164_273264_273797_274030_275172_275325_279315_279458_281127_281185_283154_283253_285271_285439_290108_290226_294093_294235_302063
725848	contig_3866_pilon	+	2280	1	Intergenic	novelGene_112441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTGATATCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293583	295863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_293600_295900
725854	SIRV6	+	570	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
725857	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_96922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
725859	contig_18592_pilon	-	723	2	Intergenic	novelGene_114764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_1	0	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	233	391	1462	1304	FALSE	15	ATTCCACTTTTGGTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYDSKLFGDGTKLIVTDRGLRAALSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGDTFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEGIKDPPKVILFPSTKRGMCM	6310	971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1645_6260
725863	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_96767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653854	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
725864	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725877	contig_18898_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_77644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCCTCGCTTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69828	68510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_-_68500_69800
725880	contig_10479_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_147100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55403	54656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_54700_55400
725881	contig_10479_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_147099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTGCCCTAGACAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54596	53793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_53800_54600
725882	contig_11285_pilon	+	1295	11	Intergenic	novelGene_5600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	571.980497919291	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	34	684	766060	767777	TRUE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAAHCCHVPRCTVPVP	763524	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767733_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768669_769928
725883	contig_9436_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_60932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	308	703	442886	442491	NA	10	GTTTGGGGCTCTCAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRENPQLKQIEGLVKELLEREGLTAEGGPWRAGLDSELSEGLAAQHGGAGGLGGRGAALNLPAFLSSHCPSCPCPGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTDEDTKNLKEIFFNILVRGALPAAPGPSTLPGL	443193	442187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442200_443200
725884	contig_19815_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_154699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTTCACTCCTTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72079	71596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_71600_72100
725886	contig_20879_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_168597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTAAGATTGCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159966	157532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_-_157500_160000
725887	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
725892	SIRV2	-	320	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4553	34	3378	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
725896	SIRV6	-	570	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
725901	contig_1009_pilon	-	2600	10	Intergenic	novelGene_121771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	89.5773339937738	3	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1087	1482	305255	301449	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356433	300330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_313130_313179_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_333727_333844_356347
725909	contig_8286_pilon	+	2586	1	Intergenic	novelGene_139811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	124	471	200191	200538	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLMCTLKVHRWIRVLSKSWPQEHHLNSSQHMSLHSERLLHSLGSGEVKGLPCPQSEDLICVSGDAGWWRSWQSSESSNRGPEGENGSQARETGRLLKKHRLLAASVPSAKIRG	200067	202653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_200100_202700
725913	contig_7202_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_18472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27899	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
725916	scaffold_21177_pilon	-	1744	7	Intergenic	novelGene_145476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	130.775464909218	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	102	1280	221483	168344	FALSE	25	CATATAAGTCCTATGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGGTVDIVESEPENDHGVELLDQNSSIRVPREKMVYMTVNDSQQEDEDLNVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGAVELVPTHSDPMYNRMKHCLVLRHPHNRCHA	254679	167879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_168442_182184_182341_182719_182864_183067_183218_217716_218287_221422_221512_254606
725917	contig_1076_pilon	-	2080	5	Intergenic	novelGene_101095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	224.161214307917	30	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	1610	2080	54398	51354	FALSE	15	GTATGTTTTTGTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAIS	56092	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_54492
725918	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
725926	contig_11258_pilon	+	1843	7	Intergenic	novelGene_67778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	161.988425512442	2	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	560	1018	285721	292582	FALSE	55	GAAGAAAAGAGTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279211	293407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279337_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
725927	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
725928	contig_10904_pilon	+	1483	7	Intergenic	novelGene_22650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1183.36024617283	20083	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	656	1084	530908	534035	TRUE	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHISLRRWHV	529840	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530278_530444_530638_530882_531005_531238_531362_533736_533924_534013_534186_534946
725931	contig_6684_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_168589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTTCATTCCATGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54495	54800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_+_54500_54800
725932	contig_9955_pilon	+	278	3	Intergenic	novelGene_21330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	347	junction_1	108.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGATGTAAGTGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67791	72011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_67858_69952_70058_71904
725934	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
725935	contig_8059_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_111072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTACCCCCAAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3031	3437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_3000_3400
725939	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725942	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
725948	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	198	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725949	contig_6710_pilon	-	480	2	Intergenic	novelGene_98127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	10	ACCCATCTCGTCCCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
725951	contig_12638_pilon	+	1571	5	Intergenic	novelGene_33120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	987	junction_2	419.904974369202	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTATTGATTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170904	179303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085
725958	contig_12888_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_155026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGCAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162165	160214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12888_pilon_-_160200_162200
725959	contig_2757_pilon	-	1943	7	Intergenic	novelGene_164577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_5	73.280283842245	133	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	148	1140	176412	171697	FALSE	40	AAAACCAAACCCTTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLTEWRLFPRESFPRERRQGSHRRTLWELGGEHRQAEPLPTGVGCTLRMPRSFLVKSKKAHTYHQPHIQEDELAWPPALTPVAGDQVLSNGPVLSTLFTNQCLDWTSLKREPKPELDRSLTRMASAPEGPVVMSRAQDGDSPPSDSPPFYKPSFSWDALASSYGHSYRQAASTMQSAFLERSVSLYGSPLMPNAEPPLDFSLRYSPGMDTYHCLKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHIHSQERSFECQMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFTCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK	182371	170893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_171876_172751_172918_173937_174076_174679_174952_175960_176099_176312_176433_182244
725964	contig_10000_pilon	-	1415	5	Intergenic	novelGene_139301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	569	junction_4	133.478462682187	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	155	514	168014	159846	FALSE	45	TCCTAATAAAGAGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	168630	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530
725967	contig_12352_pilon	+	2752	9	Intergenic	novelGene_57453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	228.353207772521	1	141	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	256	918	238274	284811	FALSE	25	CAATGAGTTGCTTGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	229990	286645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_237953_238083_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
725968	contig_9955_pilon	-	1325	10	Intergenic	novelGene_21342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	43.3899914499265	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	100	1164	118470	86976	FALSE	20	CTTGTTTAAGTGGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGLGFLTSSFPKNSWSSVAFNLFILAIGVQWAVLLDGFLNKFSSGKIVIELSSIQLATMSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	123101	86814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113655_113807_118303_118491_123022
725974	contig_9389_pilon	-	1679	8	Intergenic	novelGene_83871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	485.372737056328	57	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	7	807	45836	36552	FALSE	0	CTCGGGCTGGGCGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALENPEGGSEEAATVAEVSPGGRRMLPLPGCLPALAGSQVKRFSASKRKQHFINQAVRNSDLVPKAKGRKSLQRLENTQYLLTLLESNGGTPGLEDGDLAPPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERRRPGLHPTRVLPAHQPAPPSHPQAEPNPHGDAGDLGRAAAEVLLGVPPGRLHSHAGQQLREAPASRRLPVHGPHLSQCRPGGQTADESQQSTPGLPAAGAAPVCLPGAAQLMAASWSPAWRRDLQYHLLK	45842	35679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38671_38929_38975_39409_39535_40050_40206_45753
725977	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
725978	contig_19957_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_57716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212037	210549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_210500_212000
725979	contig_19957_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_57715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACCAAGGCTCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210599	210180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_210200_210600
725980	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
725981	contig_14838_pilon	-	1564	5	Intergenic	novelGene_151909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	135.19499805836	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	798	1373	109637	109062	FALSE	10	GCATTGTGGTCTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112892	108870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_109676_109721_110129_110895_111007_111351_111461_112760
725983	contig_20719_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_140558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4897	6699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_4900_6700
725986	contig_10324_pilon	+	1097	3	Intergenic	novelGene_7868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	13.5	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	514	894	498900	501410	FALSE	85	GAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGWVSGQPSNQAPATQAHVSPTQIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKEKAQDRLKGSRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED	498386	501613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_499105_499247_499391_501377
725989	contig_6929_pilon	+	963	5	Intergenic	novelGene_139383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3792.5750074982	20	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	185	565	127176	130939	TRUE	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQRALSSPTAAAGLVTITRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101643	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101700_127047_127242_127703_127787_130707_130971_131948
725992	SIRV1	-	210	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3598	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6768	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
725994	contig_12635_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_60857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATCTGAAACTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595478	596807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_595500_596800
725997	contig_11560_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_117912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTGATCAGAGATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124107	123106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_123100_124100
726000	contig_2027_pilon	+	1717	13	Intergenic	novelGene_39909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	261.930917525128	2	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	102	1520	126391	136487	FALSE	5	TGTGGCATGCCCTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTLKSDTAAAAVRQMNPHIRLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	126289	136684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128874_128929_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
726004	contig_11285_pilon	-	1602	15	Intergenic	novelGene_5696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	357.377387279575	40	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	31	1239	798530	785500	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPRHWISLSCSLTLRSTYLPFPTRCPPSACPEGKH	798560	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785805_793853_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
726013	contig_3095_pilon	+	622	3	Intergenic	novelGene_75149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_1	574.5	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150638	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_150696_150996_151163_151848
726014	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1729_2772_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726017	contig_4213_pilon	-	856	3	Intergenic	novelGene_124837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCAACTGGGTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269657	254444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_254866_268296_268399_269324
726024	contig_19459_pilon	-	1269	7	Intergenic	novelGene_59819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9107.1201769092	6	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	167	526	16240	11416	TRUE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAET	19130	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7992_11329_11422_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
726026	SIRV4	+	299	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1469	635	1014	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2469	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
726027	contig_7775_pilon	-	2266	1	Intergenic	novelGene_37461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATATTTCCCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69381	67115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_67100_69400
726030	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_96599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726032	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726035	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726039	contig_4083_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_152339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	137.450597185559	967	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	392	943	323237	329750	FALSE	35	TAAATATCAAATCTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKKFATVTSEESWKRERELLQEKKNRDRPTREHTTSSSVSKKPRLDQIPAANLDADDPLTDEEDEDEDFEEESDDDDTAALLAELEKIKKERAEEQARKEQEQKAEEERIRMENILSGNPLLNLTGPSQPQANFKVKRRWDDDVVFKNCAKGVDDQKKDKRFVNDTLRSEFHKKFMEKYIK	320427	329998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_320666_322191_322331_323222_323337_324449_324539_325623_325738_328878_328998_329620
726042	contig_4732_pilon	-	1858	13	Intergenic	novelGene_75366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	50.2258786771211	336	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	18	1385	168341	149382	FALSE	10	CTTGGATGGCCCAGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALRQSWCRCPRRCLGNGVQFLASHNLLPLPHGLTCQIRRPGGELSLSKSYSSGNRKGFLSGLLDNIKQELAKNKEMKESIKKFRDEAKKLEESDALQEARRKYKTIESETVRTSEVIRKKLGELTGTVKESLDEVSRSDFGRKIKEGVEEAAKTAKQSAESVSKGGEKLGRTAAFKALSQGVESVRKEIDESVLGQMGPYRRPERLRKRTEFAGEKIKEEKVFEPNEEALGVVLHKDSKWYQQWKDFKDNNVVFNRFFEMKMKYDESDNAFIRASRALTDKVTDLLGGLFSKTEMSEVLTEILRVDPAFDKDRFLRQCENDIIPNVLEALIAGELDILKDWCYEATYSQLAHPIQQAKALGLQFHSRILDIDNIDLAMGKMMEQGPVLIITFQAQLVMVIKNPKGEVVEGDPDKVLRMLYVWALCRDQDELNPYAAWRLLDISASSTEQIL	168358	148908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_149502_149785_149897_150766_150857_153390_153442_155535_155661_155743_155837_156574_156661_157003_157144_158619_158770_160698_160780_163059_163231_165422_165528_168296
726051	contig_7179_pilon	-	1858	4	Intergenic	novelGene_78150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	8.73053390247253	268	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	34	549	1041245	1039825	FALSE	20	GGGCACTCTACGAACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDSVFRPSGKMRPLTEEETRVMFEKISKYIGENLQLLVDRPDGTYCFRLHNDRVYYVSEKILKLAANISGDKLVSLGTCFGKFTKTHKFRLHITALDYLAPYAKYKVWIKPGAEQSFLYGNHVLKSGLGRITENTSQYQGVVVYSMSDIPLVSRDGICLSQKKLSTFLCKKDVFSNRMLRD	1041278	1038515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1040059_1040747_1040887_1040984_1041072_1041189
726057	contig_19812_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_100978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTTTTCAAGATATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15042	14700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_14700_15000
726061	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726068	contig_12728_pilon	-	1896	12	Intergenic	novelGene_155809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	46.6068487146196	191	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	109	798	214046	192339	TRUE	25	TGATCACTTGCCCAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLCYNRGCGQRFDPETNSDGACTYHPGVPVFHDALKGWSCCKRRTTDFSDFLSIVGCTKGRHNSEKPPEPVKPEVKTTEKKELSELKPRFQEHIIQAPKPIEAIKRPSPDEPMTNLELKISASLKQALDKLKLSSGNEEDKKEEESDEIKIGTSCKNGGCSKTYQGLQSLEEICIYHSGVPIFHEGMKYWSCCRRKTSDFNTFLAQEGCTTGKHMWTKKDAMHKHSI	214154	189237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_189980_190221_190285_190726_190847_192165_192360_192791_192898_194279_194351_198684_198744_199399_199504_201483_201642_202943_203001_209323_209374_213982
726070	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
726071	contig_854_pilon	-	1914	3	Intergenic	novelGene_36461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGCAGAGATAAACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465475	1462854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1464346_1464538_1464821_1465334
726074	contig_8138_pilon	+	1471	6	Intergenic	novelGene_52467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	129	611	280295	306552	TRUE	10	TTCTTAGTAGTGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280166	307936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_307031_307554
726077	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726087	contig_18145_pilon	+	1882	11	Intergenic	novelGene_37314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	24.6902814888774	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	126	1622	67838	73109	FALSE	35	ACATAAATATGTGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALTTGSLPTFIDAGSNFASHAIVEDNLIKQLTGAGRRVVFMGDDTWKDLFPGAFSQAFFFPSFNVRDLHTVDNGILEHLYPTMDSGEWDVLIAHFLGVDHCGHKHGPHHPEMAKKLSQMDQVIQGLVERLENDTLLVVAGDHGMTMNGDHGGDSELEVSAALFLYSPTALFPSVPPEEPEVVPQVSLVPTLALLLGLPIPFGNIGEVMTELFSGNKDSQPHTSAMAQASALHLNAQQVSRFLHTYSAATQDLQVKELQRLQSLFSKASADYQRLLQSPQGAEAALQAVIAELQQFLRGARAMCIESWAQFSLSFLLLHLLAAGIPITTPGPFTVPWQAVSAWALMATQTFYSTGHQPVFPAIHWHAAFIGFPEGHGSSIWLPAFLVGANTFASHLLFAVGCPLLLLWPFLCESHGPQKRRQTPRNEAETRVRPEEEEEEEPLMEMRLRNAPHHFSAALLQLGLKYLFVLGVQILACALAAFILRRHLMVWKVFAPKFIFEAVGFIVSSVGLLLGIALVMRVDGAVSSWFKQLVLAQQR	67096	73369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_67205_67820_67965_68158_68283_68601_68762_68949_69130_69376_69602_70849_70902_71494_71702_71918_72140_72755_72827_72979
726088	contig_12884_pilon	-	978	9	Intergenic	novelGene_104992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	546.458927436454	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	75	920	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVQSVDIAAFNKI	915302	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899845_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905761_905834_906224_906349_915235
726089	contig_11512_pilon	+	2725	1	Intergenic	novelGene_43308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAAAAAAAAAAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376198	378923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_376200_378900
726090	contig_11752_pilon	+	730	5	Intergenic	novelGene_37645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	1446.62659314697	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	125	436	92915	105616	FALSE	10	ATGTCCAGTTGTGCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQESDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	85033	105910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_85117_92873_93060_96442_96572_100956_100976_105597
726092	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_93495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726093	contig_9099_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_149898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGATAATAAAAGGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282451	285204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_282500_285200
726101	contig_5018_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_47110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	480	851	1401408	1402207	FALSE	10	GACCGACGCCGTCGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSARATDVRAKHDVVFGVPMHVCLVQTLRKQLHITAPTVNVLLVLHSKLHHQRLVLVAEGLESRRQGVEAGVLARLQPWHRTVMRSQLGHDPRYPRLPEYKQLLSSAYPAPGDAQVPYGY	1400754	1402861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1400972_1401057_1401262_1401349_1401445_1401872
726111	contig_11258_pilon	-	278	4	Intergenic	novelGene_67746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCAAGCAGCCAGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52866	49174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_49231_49378_49421_50091_50154_52748
726117	contig_3575_pilon	-	1539	3	Intergenic	novelGene_141118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	414	716	696860	696558	FALSE	25	GATACAACAGCCTGTTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSALSSPPRRDFAERQVHPAKNSSTFPHGAGQLPQTRASPAYVVLHVPPGKGLGQHPLGLGAETGLFLPQGILGSFQNTLKLDHIFPKPTLNFPFVKKS	711391	695734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_697127_711115_711239_711367
726120	SIRV6	+	1068	5	NNC	SIRV6A	novel	1163	5	NA	NA	-2	-53	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	46	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAACGACAAAGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	11637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3162_10721_11109_11205
726121	SIRV6	+	526	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726124	contig_13349_pilon	+	2163	4	Intergenic	novelGene_161123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	2.94392028877595	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	21	605	221157	225833	FALSE	20	GCAGTCATAGTTCCACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATIPEAGASAPEAAGSPESPLQYSLLLQYLVGDKRQPRILEPGSLGGIPSPAKSEEQKMIERAMESCAFKAALACVGGFVLGGAFGVFTAGIDTNVGFDPKDPYRTPTAKEVLKDMGQRGISYAKNFAIVGAMFSCTECLVESYRGRSDWKNSVISGCITGGAIGFRAGLKAGVIGCGGFAAFSAAIDYYLR	221136	227391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_221395_223570_223768_224209_224283_225756
726125	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_95031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726129	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
726135	SIRV4	-	306	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1217	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
726136	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
726140	contig_10479_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_147112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131084	128936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_128900_131100
726142	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_94894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726143	contig_20611_pilon	+	1870	9	Intergenic	novelGene_168604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	53.7697638082966	271	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	209	1168	35165	49419	FALSE	30	CATACTTTTGATATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKKTGARKKAENRREREKQLRASRSTIDLAKHPCNASMLFYMTRRQKNRAFCYFCNSLQKLPICAQCGKTKCMMKSSDCVIKHAGVYSTGLAMVGAICDFCEAWVCHGRKCLSTHACACPLTDAECVECERGVWDHGGRIFSCSFCHNFLCEDDQFEHQASCQVLEAETFKCVSCNRLGQHSCLRCKACFCDEHTRSKVFKQEKGKQPPCPKCGHETQETKDLSMSTRSLKFGRQTGGDEGDEASGYDAYWKNLSSNKYGDTSYQDEEEDEYEAEDEEEEEDEGGKDSDTESSDLFTNLNLGRTYASGYAHYEEQEN	32679	50121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20611_pilon_+_32876_35152_35285_37077_37166_39445_39526_41984_42112_42592_42698_46246_46294_47798_47917_49144
726144	contig_12414_pilon	+	986	3	Intergenic	novelGene_59540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1133	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	93	656	370898	374054	FALSE	20	CATTCCAGTGGAATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370805	374384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373365_373859
726150	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726151	contig_10437_pilon	-	2945	8	Intergenic	novelGene_38177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	49.7097699098457	76	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	88	1449	194828	175853	FALSE	10	TGTTTGAGGTCTTATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYLQGCRAALQDSRPLHVVLGNEACDLDSMVSALTLAFYLAKTTEAEEVFVPVLNIKRSELPLRGDNVFFLQKVHIPESILIFRDEIDLHALHQAGQLTLILVDHHVLPKSDAALQETVAEVLDHRPIEQEHCPPCHVSVELVGSCATLVTERILQGAPEILDRQTAALLHGTIILDCVNMDLKIGKATLKDRRYVEKLEALFPDLPNRNDIFDSLQKAKFDVSGLTTEQMLRKDQKTIHRQGTKVAISAIYMDLEAFLQRSGLIADLRAFCQAHSCDVLVAMTILFNTNNEPVRQLAVFCPHVALRMTICGVLERSHAPSLKLTPLPSTHPDLQAYLQGNTQVSRKKLLPLLQEALSAYLDSTQIPAGLPEMVGVSTEPVDKEGNSAGNSLLPGVSQDEEEPPLPPTPMNSLVDECPLDRGLPNLSAEAIFEKCSQISLSRSTAASLAKE	194915	174356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_176282_178263_178423_181338_181434_182497_182657_183171_183357_184981_185185_185889_185983_194789
726153	contig_15629_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_122435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_8	98.5054990004788	23	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	159	1679	89415	107009	FALSE	10	TGTCCGAATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWVLAILTLLQDSITAHLSKTHWGLENEALIVPCPKNPNSEHPVDWYSKTNRSITTQKKYRVFASKNFLKFLPTKVDDSGIYTCIIRSPTSNWTRSVNLTIYKKQPDCIIPDYLMYSTVTGTPKRSQIFCPTTQYYNWTAPLEWFKNCKPLQGLRYYRSESYLLIDNANSNDAGDYTCKWVHNEKGVSYTVTATRTLRFGEGKAFPVVPVITAPPPNDTKEVEIGKTVNITCLACMGKGLQILASIKWQVNGSSISDLGEARIHQEQVQSQSSRDELTCLKRILRITDVKEEDFSLKYECLALNLRGVTTRAVRLRRKNPNGKIYDAYVIYSRDYRNQPEGASSVENFVHQILPDVLENKCGYNLCIYGRDLLPGEDVATAVETNIQKSRRHIFILTPHTAHSKEFAYEQEIALHNALLQNKSKVILIEMEAPNEQAGLQLGKFQESLKHLMKVQGTIKWREDRVADKLSLNSKFWKHVRYQMPVPNKLPKKTLNLVSLSAQRR	69498	107466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_69559_89316_89476_89952_90161_91520_91696_91787_91951_93239_93312_95352_95495_95589_95736_103346_103515_106623
726154	contig_18364_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_102569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127219	125264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_125300_127200
726157	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
726158	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
726160	contig_6873_pilon	-	3083	1	Intergenic	novelGene_129831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCTATTTGTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512262	509179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_509200_512300
726163	contig_2069_pilon	-	968	7	Intergenic	novelGene_23221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	63.4789991519505	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	111	773	218720	186850	FALSE	25	TCTGATAAATCTTTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYGPLHMYRNPGPSGPQLRDFNSIIQTCSGNIQRISQATAQIKNLMSQLGTKQDSSKLQENLQQLQHSTNQLAKETNELLKELGSLPLPLSTSEQRQQKLQKERLMNDFSAALNNFQAVQRRVSEKEKESIARARAGSRLSAEERQREEQLVSFDSHEDWNQMQSQEDEVAITEQDLELIKERETAIRQLEADILDVNQIFKDLAMMIHDQGDLIGMYY	218830	186654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_186937_190692_190799_192108_192153_196226_196365_201208_201309_202852_202923_218602
726167	contig_9848_pilon	-	1440	11	Intergenic	novelGene_79962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	877	junction_1	232.947655064394	2	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1	534	110035	104044	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	110035	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003
726169	contig_3386_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_34581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCCATCACTTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486032	485276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_485300_486000
726170	contig_15741_pilon	-	1172	6	Intergenic	novelGene_159675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	611.324005744908	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	266	685	60541	50105	FALSE	80	ACAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGAACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60929	49617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50394_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681
726172	SIRV4	-	262	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTCTGCGAAAACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
726177	contig_15304_pilon	-	1062	3	Intergenic	novelGene_30522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
726183	contig_3161_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_84528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCACATCTTTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441757	443746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_441800_443700
726184	contig_3161_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_84526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439116	439559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_439100_439600
726189	contig_11978_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_62909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	463	510	797631	797678	NA	85	AAAAAAAAAAACCATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELHKFSQLSCPKGCPRHTIQKTHKKVSELLKKDFTPDLQLTGFKSIPWKLRHVHTTVLELYSTQPSKGLQTGSFWFKPLGRICISTTDILVQSPALKHCFSVFFILWPLLTPSKIIPKFFKIHIVWSFQFVCIERTDEVKINLRKRTCPISITEMGVGKLTRLLSPNQN	797168	799264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_797200_799300
726192	contig_1948_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_31161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	148.942569095907	27	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGAACTTTTAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468395	485924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_474126_474214_475005_475056_478752_478891_480516_480654_484571_484686_485454
726196	contig_21027_pilon	+	1226	5	Intergenic	novelGene_127564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_1	417.286697008184	2239	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1	525	1634	8128	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISVSQSRTGRQHPGLEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1633	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1686_1826_1879_5171_5261_6365_6482_7912
726199	contig_13481_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_119564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGTTTGTATAGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1576065	1577875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1576100_1577900
726200	contig_10016_pilon	+	2971	12	Intergenic	novelGene_117840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_9	195.626309305681	62	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	338	1165	226856	237705	FALSE	20	GAGAAGGAGTTTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVTLFLNGSPKNGKVVAVYGTLSDLLSVASSKLGIKATSVYNGKGGLIDDIALIRDDDVLFVCEGEPFIDPQTDSKPEGLTGSHTDWLTLNVGGRYFTTTRSTLVNKEPDSMLAHMFKDKDVWGNKQDHRGAFLIDRSPEYFEPILNYLRHGQLIVNDGINLLGVLEEARFFGIDSLIEHLEVAIKNSQPPEDHSPISRKEFVRFLLATPTKSELRCQGLNFSGADLSRLDLRYINFKMANLSRCNLAHANLCFANLERADLSGSVLDCANLQGVKMLCSNAEGASLKQCNFEDPSGLKANLEGANLKGVDMEGSQMTGINLRVATLKNAKLKNCNLRGATLAGTDLENCDLSGCDLQEANLRGSNVKGAIFEEMLTPLHMSQSVR	206206	239511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_206253_216753_216876_218680_218725_226100_226195_226824_226884_227081_227211_229310_229379_229465_229562_230482_230633_234770_234877_235638_235773_237588
726206	contig_10011_pilon	+	2047	5	Intergenic	novelGene_68094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	122.989836978508	31	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	60	1691	322928	333868	FALSE	25	TAATTGCATTTATTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLYPALKLAFMHSMVIIIIGHLLGAKCCEYYNE	322868	334224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_333772
726207	contig_14483_pilon	-	1481	4	Intergenic	novelGene_133737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	22.8958996814325	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	283	1479	14197	11524	FALSE	25	TTTGTAATACTTGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPFGDAFRSHTFSEQTLMSTDLLANSSDPDFMYELDREMNYQQNPRDSFLSLEDCKDIENLESFTDVLDNEGALTSNWEQWDTYCEDLTKYTKLASCDIWGTKEVDYLGLDDFSSPYQDEEVISKTPTLAQLNSEDSQSVSDSLYYPESLFSVKQNPFPSSFPGKKITSRAAAPVCSSKTLQAEVPLSDCVQKASKPTSSTQIMVKTNVYHNEKVNFHVECKDYVKKAKVKINPVQQTRPLLSQVHTDAAKENTCYCGAVAKRQEKKGMEPLQGHATPALPFKETQELLLSPVPQDGPGSIAAGESSSLSASTLVSDSSQKKEEHNYSLFVSDNMGEQPTKCSPEEDEEDEEDVDDEDHDEGFGSEHELSENEEEEEEEEDYEDDKDDDISDTFSEP	39240	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_12610_14086_14213_16422_16616_39166
726208	contig_2278_pilon	+	2413	1	Intergenic	novelGene_118107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764631	767044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_764600_767000
726211	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
726213	contig_15434_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_56707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAGAGAATATATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33482	31643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_31600_33500
726214	contig_11978_pilon	-	1497	8	Intergenic	novelGene_63044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	12.1386547349989	332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	330	671	1800665	1797886	TRUE	15	CTCATCTCTTATCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGFHTLCQASVAYS	1802670	1796553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1797846_1797926_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1801002_1801117_1801968_1802030_1802598
726215	contig_5278_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_139776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209899	207523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_-_207500_209900
726224	contig_19812_pilon	-	1654	11	Intergenic	novelGene_101005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.072077910412	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	16	870	67090	50202	TRUE	10	AACTTCGTGTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKEYLEFRKERSQMLQSRRNQLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKPGTMIEWGNNWARAIKYRQENQEAVGGFFSQIGELYVVHHLWAYKDLQSREETRNAAWRKRGWDENVYYTVPLVRHMESRIMIPLKISPLQ	67105	49128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_49622_49910_50267_51992_52077_53251_53347_53730_53763_54056_54198_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
726232	contig_19775_pilon	-	3111	1	Intergenic	novelGene_147748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTATTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194788	191677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_-_191700_194800
726233	contig_12841_pilon	-	706	2	Intergenic	novelGene_55873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACCCTGATCCTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456839	455747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_456339_456724
726238	contig_13894_pilon	+	1265	9	Intergenic	novelGene_62132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2034.99621851614	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	155	1264	521729	528172	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRCLLSNSPCWYRLNAGPWRRLTSSSLIPPPSLATAASRLWRRRKHSWDRLRKTELQRKKELNVRNRLYSWWDLNKKYFLV	521574	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526930_527442_527580_528072
726245	contig_6412_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_149967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATAAAGAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473533	475836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_473500_475800
726248	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
726249	contig_5958_pilon	-	2499	5	Intergenic	novelGene_140081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	15.5463018110418	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	273	1805	116728	108264	FALSE	50	AAAAAAAATCCTTGTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLPKSSKEFGSVDYWEKFFQLRGKKAFEWYGTYLELCGVLHKYIKPREKVLVIGCGNSELSERLYDVGYQNIVNIDISEVVIKQMKEHNASRRPQMSFLKMDIMQMQFPDASFQVVLDKGTLDAVLTDEEEKTLQQVDRMLAEVGRVLQVGGRYLCISLAQAHILKKAVGHFSREGWMVRVHQVTNSQDQVLEAEHQFSLPVFAFIMTKFRPVPGSALQIFELCVQEQGKPTRLESAERLAEAVLERQQYAWLCSQLRRKSWLGSVSLDLCNGDTGEPRYTLHVVDSSAVKPSRDNHFAIFIIPQGRETEWLFGMEEGRKQLAASAGFRRLVTVALHRGQQYEGMDSIQAELSARVMELAPVGMPAQQQVPFLSVGGDIGIRTVQHRDCSPLSGDYVIEDVQGDDKHFFRRLIFLNNRNVVQSEARLLKDVSYRAQKKHKKDRKKQWPAETPDAVPAAPSQSIDKSYLCCEHHKAMIAGLALLRNSKLLLGEGNTTAFHSGEPVRLQM	117000	107569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_108488_110724_110921_112593_112794_114152_114913_116575
726250	contig_12886_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_135497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	479	877	466838	467236	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEMGNKCWQGCGETGTLMSCWGECKNGKAPMNNSLEVPRQVKYRTTIRSSNSTPSRIPKRLESRNSETCTPMFTAALFTRAKRWKQPKYSSRDEWISKTWYIHTLDDYSAIKREEVLIHGAARMNLETLC	466359	467927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_466400_467900
726251	contig_12279_pilon	+	1206	6	Intergenic	novelGene_50081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2442.36054668429	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	52	360	68297	71619	TRUE	25	AGCTGTATATTCTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGNLPVCLLLRRINSF	57431	77619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57477_68290_68475_69362_69451_71576_71711_75031_75096_76928
726260	contig_18859_pilon	+	2161	4	Intergenic	novelGene_150527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	129.926474934437	29	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	10	405	28869	39784	FALSE	35	TACCCCAGCAATACCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRMAAPVSFPLLVNGSWGPDPPKNLRTKLQVYFQSPKRSGGGECVVREEPGSPLAFLVLFSREDVRQKVLERENHELVWPEKGTFKLTVQLPTPPDEICDVSGRKIPRIQDQRRCQKNRLRCVRRTGWKALSQ	28859	41540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_29056_33257_33387_34322_34357_39738
726265	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
726266	contig_9706_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_21000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1018	1341	476404	476081	NA	10	GATTGCTCACCCTGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSPAPLPCSLPPATLTSLLFLSHTGYSCLRAFTLLFPLSGKVLFRYFLSPLPQFTHISGQCHLLSGEFLSAPSPFSVWFSPPYCLPSAILYLTMVCFSPTKKEIP	477421	476007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_476000_477400
726268	contig_6760_pilon	-	1951	12	Intergenic	novelGene_150801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	84.3653996680927	468	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	154	1767	435262	402618	FALSE	10	TTCTCCCAGCATCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFANLRKVLISDSLDPCCRKILQDGGLQVVEKQNLSKEELIAELQDCEGLIIRSATKVTADVINAAEKLQVVGRAGTGVDNVDLEAATRKGVLVMNTPNGNSLSAAELTCGMIMCLARQIPQATASMKNGKWDRKKFMGTELNGKTLGILGLGRIGREVATRMQSFGMKTIGYDPIIPPEVSSSFGVQQLPLEEIWPVCDFITVHTPLLPSTTGLLNDSTFAQCKKGVRVVNCARGGIVDEGALLRALQSGQCAGAALDVFTEEPPRDRALVDHENVISCPHLGASTMEAQSRCGEEIAIQFVDMVKGRSLVGVVNAQALTSAFSPHTKPWIGLAEALGSLMRAWAGSPKGTIQVVTQGTSLKNAGNCLRPAVIVGLLKEASNQADVNLVNAKLLVKEAGLNVTTSHSPAAPLLPGEQQGCGECLLTVTLAGAPYQAVGSVQGTTPVLQALNGAVFRPEVPLRRGLPLLMFRAQPSNPAMLPTMIGLLAEAGVQLLSYQTSVVLNGETWHVMGISSLLPSLEAWKQHVTEAFQFHF	435415	402433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_402773_403802_404053_405679_405811_407060_407194_409110_409264_411082_411232_411721_411855_418731_418831_418930_418986_423119_423186_425004_425157_435124
726279	contig_4783_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_108386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACCAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224173	223851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_223900_224200
726282	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_95075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	653861	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653862	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726284	contig_13904_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_165497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATTTTTGTATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112982	112228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_112200_113000
726287	contig_3068_pilon	+	1410	8	Intergenic	novelGene_137610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.510632168776	6	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	84	551	167655	187568	TRUE	20	AGCCCCACCGACTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCSQEERIEFYELDKKENWGNFLPSSLEGRSGPDPVPPSHATSVSPHC	162573	188947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162635_167632_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175363_175530_175540_187475_188152_188671
726288	SIRV7	-	260	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91664	2	-91658	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAAAACCGATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
726289	contig_10627_pilon	+	1352	5	Intergenic	novelGene_59919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_4	107.101295510372	943	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	70	738	105394	109091	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEVRSRFRGWTQPLCGPVVSGHLLLVWSGM	105324	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108139_108453_108573_108962
726292	contig_5997_pilon	+	2274	3	Intergenic	novelGene_168616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAAGTTAATTCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328857	339610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_329039_336535_336661_337642
726293	contig_18145_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_37299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	32.9212022191711	215	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	357	1058	53636	55054	FALSE	40	AAAGAATAAATTCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLHSLAQIGDKSPVTGVGNGSSPWPRDSPGTANGHSPEHTPPGPGPPGLCPTKRRLLPAGEAPDVNSEDEGPAPRRRRGTLGHPPAANSSDAKATPFWSHLLSRSKEPVLEPTDCSPMGRRLKGARRVKLSSLRSLRKGPGLLSAPSASPVPTTTVSRTLLGNFEESLLRGRFPPSGHIEGFTAEIGASGSYCPQHVTLPVTVTFFDVSEQNAPAPFLGVVDLNPLGRKGYSVPKVGTIQVTLFNPNQTVVKMFLVTFDFSDMPAAHMTFLRHRLFLVPVGEEGNASPTRRLLCYLLHLRFRSSRSGRLSLHGDIRLLFSRRSLELDTGLPYELQAMTEAPHNPRYSPLP	53124	56110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_53460_53614_53674_53859_53966_54094_54254_54472_54542_54622_54799_54900
726294	contig_13504_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_157955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45707	47446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_+_45700_47400
726295	contig_19851_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_29819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3878.14001810146	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	207	533	53637	55775	TRUE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGMVKYRG	53430	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55795_56001
726297	contig_10848_pilon	-	1997	2	Intergenic	novelGene_133524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	738	1172	40685	40251	TRUE	35	TAAGAGCCTCAGGATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	41422	39375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40120_40169
726302	contig_3424_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_55458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAATGTGAAACGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71070	72231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_71100_72200
726303	scaffold_19766_pilon	-	1377	9	Intergenic	novelGene_34316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	138	junction_2	452.665922618436	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	302	1150	622205	596625	FALSE	35	AGAGAATTTGTCTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623658	596397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
726305	contig_2636_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_52091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAAAAGCCTTCTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61196	62366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_61200_62400
726308	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726309	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726319	contig_11702_pilon	-	1005	2	Intergenic	novelGene_142020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAAGCCCAGGGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548164	547013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_547790_547935
726320	contig_11702_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_142019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACCGGCTGCTGTCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546909	545943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_545900_546900
726324	contig_12427_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_40411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAACTCACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42383	42714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_42400_42700
726331	contig_3469_pilon	-	2035	15	Intergenic	novelGene_34161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	110.48520078199	1	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	336	1580	408599	380499	FALSE	55	ATAAAATGAAGAAGTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLTDGASAMLIMAEEKALAMGYKPKAYLRDFVYVSQDPKDQLLLGPAYATPKVLEKAGLTMNDLDAFEFHEAFSANLKAMDSDWFAQNYMAGKTKVGPPPLEKFNTWGGSLSLGHPFGATGCRLVMAAANRLQRDGGQYGLVAACAAGGQGHAMIVEAYPK	427633	380043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_380535_383200_383366_383778_383842_384228_384317_385139_385188_385267_385348_392528_392651_393186_393350_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408671_413440_413516_427444
726332	contig_2867_pilon	+	2082	9	Intergenic	novelGene_135224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.3101701968538	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	849	1499	1204485	1219398	FALSE	15	ATTTGCTAATTTTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVKCDLTAKDMLLALGELAQRDHGALDCCVVVILSHGHQASHRQFPGAVYGTDGYSVSIERIVNIFNGTGCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASASSEDWASGSNPESDAAPFQEGPGSSDQPDAVASLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDTRSGSWYIEILDGVLEQWADSEDLQTLLLRVADAVSEKGIYKQMPGYFNFLRKKLFFKT	1192474	1219981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1192666_1193321_1193710_1202201_1202234_1204247_1204518_1204997_1205088_1208274_1208423_1216965_1217146_1217752_1217863_1219308
726336	contig_3866_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_112407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAGAACGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188347	186057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_186100_188300
726337	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726338	contig_15304_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_30462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	54286	53061	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53191_54116
726339	contig_4736_pilon	+	2658	1	Intergenic	novelGene_168628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGCGTTGAAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248880	251538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_248900_251500
726340	SIRV2	-	481	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4375	51	3200	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
726342	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726349	contig_12920_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_166325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCCAGATGATTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69009	69503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_69000_69500
726352	contig_11126_pilon	+	2584	19	Intergenic	novelGene_138123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	38.2614866154556	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	972	1631	319836	348401	FALSE	30	CGCCCTTTGAAATAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISFTGALRIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDHLDAQKAGVLSTLFDVGGIFGGILAGLISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYVFSAISKMGLEATVVMLLLSGALVSGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAHALATVTAIIDGTGSVGAALGPLLAGLISPSGWNNVFYMLMFADACALLCLIRLIHKELGCTGTPAGDQVPFKEH	276553	349354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_276580_282536_282765_291867_291950_301079_301213_301930_302010_306602_306740_308270_308348_310610_310649_314832_314911_319742_319875_322781_322873_324636_324700_325160_325247_326767_326817_328208_328283_336634_336714_344168_344267_347901_347967_348385
726353	contig_15361_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_167862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGCTCCATTCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426108	427464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_426100_427500
726354	contig_15361_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_167864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAGTAGGAGGGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435215	434615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_434600_435200
726356	contig_14300_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_133140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422824	420649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_420600_422800
726361	contig_8357_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_39736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTCTAGCATACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752376	751113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_751100_752400
726367	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726368	contig_13780_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_149138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGAACGGATAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927861	928169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_927900_928200
726371	SIRV6	+	749	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	782	55	-373	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	90	422	2002	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1912	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
726374	contig_12842_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_168352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAGAGTACGGCCCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217528	218704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_217500_218700
726379	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726386	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
726389	contig_7207_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_72046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	282	849	214	1062	519827	518979	NA	70	TATTTAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKVGAVPEAQDREISGDPRKVSVAGGEPRACLKKRELLRSTLLPEPGTQAAGPTALPLHGGFRGRVCAPAMRIRMAVRWTWAVKSCLLLALLTVAYIVVELSVSTFHSSRGASLVREQWQRQLSDSEKKAEDLSRPLYEKPHADSYALGEWGKASKLQLSEGELKKVEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMHECKSKKFNYRRLPTTSVVIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKAQLESYISNLERVRLIRTKKREGLVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECTSGWLEPLLERISKDETAIVCPVIDTIDWNTFEFYMQTGGAHDWWV	520040	517694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_517700_520000
726394	contig_1406_pilon	-	1870	4	Intergenic	novelGene_25437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	91.4524770334601	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	357	1709	585881	481289	TRUE	20	TGAGTATGCACCCTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPTRTFGDARPIFSTCSTTGCRSSPPVLPVSCRDPRQLQRLRDKLLSVAEHREIFPNLHRVLPRSWQVLEELHFQPPQAQRLWLSWWDSARLGLQAGLTEDRLQSALSYLHESGKLLYFEDSPALKEHVFHNLTRLIDILNVFFQRDASLLLHKLLLGTSGDGEADGESASLVGLPAPSQDLLRATQLHHYVEGFLLHGLLPAHAIRLLLKPHVQAQQDLQLLLELLEKMGLCYCLNKPKGKPLNGSTAWYKFPCYVQNEVPHAEAWINGTNLAGQSFVAEQLQIEYSFPFTFPPGLFARYSVQINSHVVHRSDGKFQIFAYRGKVPVVVSYRPAKGVLQPDTLSIASHASLPNIWTAWQAITPLLEELNVLLQEWPGLLYTVHILCSKCLKRGSPNPHAFPGELLSQPRPEGVAEIICPKNGSERVNVALVYPPTPTVISPCSKVSR	586237	452363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_452413_481176_481302_498646_498774_584668
726396	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726403	scaffold_16539_pilon	-	1967	7	Intergenic	novelGene_68308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	74.4304298582837	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTAGCCTCTGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126021	107462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_107815_120764_120897_120985_121082_122380_122536_122615_122679_124586_124702_124967
726405	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726407	SIRV5	+	231	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	156	167	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
726410	contig_11300_pilon	-	1465	7	Intergenic	novelGene_168646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_6	69.5717056153018	259	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	20	1162	93928	80702	FALSE	25	CTTTCTATCATGGATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARILWEAARCLRSRGALVPARRSLSSGSPPLEELFARGGPLRAFLERHAKSEVQLQARGPELAVVAKLLSEKELELRETEHLLHDENEDLRKLAENEITLCQKEITQLKHQIILLLVPSEETDENDLILEVTAGVGGQEAMLFTSEIFEMYQQYAAFKRWHFEPLEYFPSEIGGLRHASASIGGAEAYKHMKFEGGVHRVQRVPKTERQGRIHTSTTTVAILPQPAEIHLVINPKDLRIDTKRASGAGGQHVNTTDSAVRIVHLPTGVVSECQQERSQLKNREMAMKKLRAKLYSMHLEAAASKRYNARKIQIGTKGRSEKIRTYNFPQNRVTDHRINKSLHDLVTFMQGEYLLDELVQSLKEYADYESLVEVISKKV	93947	80398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_80903_81667_81805_83208_83327_87047_87212_87717_87902_90151_90232_93669
726411	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
726413	contig_11086_pilon	+	2277	11	Intergenic	novelGene_61190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	51.8695479062619	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	44	2167	24460	48353	TRUE	30	GGAACTCAGCTGCACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEGQHLP	24416	48862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48107_48334_48363_48761
726424	contig_7839_pilon	+	1218	5	Intergenic	novelGene_45741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_3	524.491658656265	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	160	936	955668	956984	FALSE	10	ACACTTCTGCTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	955390	957266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
726426	contig_8064_pilon	+	1101	6	Intergenic	novelGene_164560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.5381991893416	74	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	384	704	117228	118276	TRUE	15	CACTGTGAGTCAGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101608	119202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_112782_112880_116026_116130_117149_117382_118109_118295_118823
726427	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_93457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726431	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726437	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_95694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726450	contig_10074_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_57140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCATACCAAATTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439835	440254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_439800_440300
726451	contig_10074_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_57141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACTCATGTAGTAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440454	441309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_440500_441300
726455	contig_15384_pilon	-	2282	21	Intergenic	novelGene_85137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.6427242132146	1	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	118	1806	127101	119545	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQVMFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDW	127814	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119544_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125635_125757_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723
726458	contig_16122_pilon	-	1945	2	Intergenic	novelGene_134559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	231	533	282583	282038	FALSE	25	GCTTCCTCGCTAGGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTLCVSLASAPRNSPSTLSWSSCRVSRGADLQGRGLSPARWVPAGGSTGLLPPTGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGIWSLSSHGCRAGGWAWVLLPNGDVSVP	282813	280625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_282282_282524
726466	contig_3103_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_146207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAGGGTAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137726	135603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_135600_137700
726467	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
726468	contig_5620_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_161331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAACCCTAAAAATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130233	129302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_129300_130200
726473	contig_3602_pilon	-	1449	12	Intergenic	novelGene_60666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.510225395575	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	82	969	1139393	1106687	TRUE	10	TTGCATGAGTCTCTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139474	1106034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106181_1106352_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
726475	contig_11413_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_103151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATTTATGAGATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220611	218135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_218100_220600
726476	contig_5686_pilon	-	2156	2	Intergenic	novelGene_45445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGTACCAGTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225915	218246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_220161_225673
726480	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
726483	contig_9875_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_154417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289274	290729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_289300_290700
726486	contig_14829_pilon	-	923	7	Intergenic	novelGene_163813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	184.862786952918	605	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	186	923	213515	49172	FALSE	25	GTAAGTGAGATCTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIPRGKVITTARGSSTGELEGHASSRLPPQPCSWGQTSDCLLKIDVYFLELFNLLPIWISMAQIQQGGPDEKEKSTALKDLLSRIDLDELMKKDEPPLDFPDTLEGFEYAFNEKGQLRHTKTGEPFVFNYREDLHRWNQKRYEALGEIITKYVYELLEKDCNLKKISIPVDATESEPKSFIFMSEDALTNPQKLMVLIHGSGVVRAGQWARRLIINEDLDSGTQIPFIKRAMEEGYGVIVLNPNENYIEVEKPTIHVQSSSDSSDEPAEKRERKDKVPKETKKRRDFYEKYRNPQREKETMQLYIR	261538	49171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_49391_124873_125066_134655_134722_191595_191697_194926_195029_213457_213581_261418
726487	contig_5423_pilon	-	2602	2	Intergenic	novelGene_85296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAAGTCTGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590617	587946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_588767_588835
726488	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	157	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
726504	contig_5018_pilon	+	664	4	Intergenic	novelGene_47165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_1	124.946210649045	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2	412	1498484	1500271	FALSE	10	AATCTGTGTCGGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498482	1500523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
726505	contig_3449_pilon	+	2396	2	Intergenic	novelGene_73699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTAATAAACACTTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289990	293413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_291198_292224
726507	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91671	0	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
726511	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
726531	contig_5671_pilon	+	1058	6	Intergenic	novelGene_79413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2579.74862341275	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	126	497	370430	392984	TRUE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKVCLHTLCVYICKIVRSCCIFT	368799	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_393062_507913_507927_531326
726536	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726537	contig_11590_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_125579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCAAAGATAAAACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443154	443454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_443200_443500
726539	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_89899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726542	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
726544	SIRV7	-	263	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	27	91636	-5	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147930	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
726546	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726551	contig_13958_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_129551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCCCTGTAAATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294051	294903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_294100_294900
726552	contig_9839_pilon	-	1296	2	Intergenic	novelGene_88576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCCTGGTGGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269952	268499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_269646_269802
726553	contig_12427_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_40433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGCAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232460	233209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_232500_233200
726554	contig_14467_pilon	-	2101	12	Intergenic	novelGene_138218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	60.5232009335236	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	207	1763	71109	57859	FALSE	20	TTTCTAAGTGACTGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVYNNTARYVDQGGNKRPGAFAIYLEPWHLDIFEFLDLKKNTGKEEQRARDLFFALWIPDLFMKRVETNQDWSLMCPNECPGLDEVWGEEFEKLYESYEKQGRVRKVVKAQQLWYAIIESQTETGTPYMLYKDSCNRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIVEYTSKDEVAVCNLASLALNMYVTSEHTYDFKKLAEVTKVIVRNLNKIIDINYYPVPEAFLSNKCHRPIGIGVQGLADAFILMRYPFESPDAQLLNKQIFETIYYGALEASCELAKEHGPYETYEGSPVSKGILQYDMWNVTPTDLWDWKLLKEKIAKYGVRNSLLIAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYTRRVLSGEFQIVNPHLLKDLTERGLWNEEMKNQIIACNGSIQSIPEIPDDLKQLYKTVWEISQKTILKMAAERGAFIDQSQSLNIHIAEPNYGKLTSMHFYGWKQGLKTGMYYLRTRPAANPIQFTLNKEKLKDKERVSKEEEEKERNTAAMVCSLENRDECLMCGS	90334	57520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_58048_58732_58922_60040_60137_61333_61470_63038_63116_64970_65193_65403_65554_68553_68756_69423_69504_69857_70020_71055_71140_90158
726556	contig_15859_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_50224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAATGTAAGCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379631	377457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377500_379600
726557	contig_15327_pilon	-	1873	12	Intergenic	novelGene_70711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_11	97.4598879132647	186	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	73	1095	957571	954693	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSRERPGDEEASSEDGPSKGLLQEQVEPQSHHFSPEERTLLYEEALYTVLHRLGQLEPNHVAESSELLRYLQEAFHLEPEEHQQMLQQALELEKPMFFLKATVKQAKDILGKDVSGFSDPYCLLGIEEGVGMPGGSAGARRRQKAVVRDTIPEEQIHRTQVITQTLNPVWDETFILEFKDIANASFHLDMWDMDTVESVRQKLGELTDLHGLRRILKEVRKDKGQDDFLGSLVLRLQDLHCREDQWYPLEPCTETHPDRGQCHLQFQFIHKRRATRASRSQPSYTVHLHLLQQLVSHEVTRHQAGSTSWDGLLSPQAATILFLHATQKDLSDFHQSMA	957643	953914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_954801_954875_954969_955069_955175_955357_955428_955546_955616_955753_955799_956215_956397_956647_956715_956810_956871_956963_957072_957317_957354_957490
726558	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726560	contig_1275_pilon	+	754	2	Intergenic	novelGene_108848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	145	606	747507	747968	FALSE	15	TTGTGTCTGTCGTCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLGAAEWLLLCLVNSSRSKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746553	748116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746609_747417
726566	contig_7455_pilon	-	1662	5	Intergenic	novelGene_168652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	37.6123317543595	250	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	78	698	394313	373984	FALSE	35	GAAACTCCATTTGATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGYKRAARRQRARAGGPRQRRSTPAMTRGLQFLLLSCACSLAPAARDLKVVCSEDVDLPCTARWDPRVSYKVSWAKLTERGEEVMEVPQEDLSASEQYYYQKEQNSSLEAPTERRYSLKIRNATSCNTGTYRCTLWGPEGQRNQSGTVTLRVIGCPKQHREVNFKKYRAEIVLLLVLVIFYLTLIIFTCKFARLQSIFPDASKPGMERAFFTVTSQSKHLGPVIVQKTELV	394390	373019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_374113_374914_375022_377162_377395_394071_394188_394276
726573	contig_6589_pilon	+	658	4	Intergenic	novelGene_25968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	14235	junction_2	3315.92383641254	101	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	181	657	1296229	1297367	FALSE	10	CTGGGTTGGGCGAGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQIRQNYSSEAEGNVNLLVNLHLKASYTYLSLGYYFDRDDVALEGVEHFFRELAKEKREGAERLLKLQNQRGGRAVFQDVPKPPAKEWNGILDAMEAALALEKSLNQALLDLHAVATAHTDPHLCDFLENHFLDEEVKLLKKMGDHLTNVRRVASPQ	1296048	1297368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1296641_1296969_1297096_1297265
726574	contig_6710_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_90583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGGTTTAGCATCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
726584	contig_17471_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_168660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTCTTCACACTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14947	13048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17471_pilon_-_13000_14900
726585	SIRV7	-	242	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91669	15	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
726588	contig_5935_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_102695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAACACAATAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834497	833259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_833300_834500
726590	contig_6735_pilon	-	951	3	Intergenic	novelGene_15661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	918	junction_1	101	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	130	471	543144	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	543273	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005
726596	contig_14711_pilon	+	2469	8	Intergenic	novelGene_68879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.642834293024	174	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	207	1367	63306	67289	FALSE	15	TAGGATGTGGCTCCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSCEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKKKKEVKEEGSPDSYELSPQLEELINKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLWDKFSELATKCIIKIVEFAKRVPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKVDKLQEPLLEALRLYTRRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGPMPPLIQEMLENPEMFEDDSSQPGPHPKASSEDEVPGGQGKGGQSPQPDQGP	59452	68391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_59627_63273_63423_63802_63945_64602_64764_64976_65154_65703_65909_66294_66454_67089
726599	SIRV1	-	237	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	5	3588	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
726609	contig_1107_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_126541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134761	131935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_131900_134800
726622	contig_10057_pilon	-	773	5	Intergenic	novelGene_162343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.732632304889	9	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	23	490	64936	35735	FALSE	65	CAGCAAAGAAGAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKVNTKHTKIYNTYCTVA	64958	35451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35782_50224_50372_52130_52232_63462_63555_64855
726624	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_95686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726625	contig_20293_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_153527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTACTTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95154	96781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_95200_96800
726626	contig_9995_pilon	+	2057	13	Intergenic	novelGene_47665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	101.312326495842	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	15	1271	158431	189813	FALSE	10	TCCGTTTTTCTGTTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLETTLGDVVIDLYTEERPRACLNFLKLCKIKYYNYCLIHNVQRDFIIQTGDPTGTGRGGESVFGQLYGDQASFFEAEKVPRIKHKKKGTVSMVNNGSDQHGSQFLITTGENLDYLDGVHTVFGEVTEGMDIIKKINETFVDKDFVPYQDIRINHTVILDDPFDDPPDLLIPDRSPEPTREQLDSGRIGADEEIDDFKGRSAEEVEEIKAEKEAKTQAILLEMVGDLPDADIKPPENVLFVCKLNPVTTDEDLEIIFSRFGPIRSCEVIRDWKTGESLCYAFIEFEKEEDCEKAFFKMDNVLIDDRRIHVDFSQSVAKVKWKGKGGKYTKSDFKEYEKEQNKPSNLVLKDKVKPKQDAKYDLILDEEAEDSKSSHSHTSKKHKKKTRHCSEEKEDEDYVPIKNPNQPISRKRWPL	158416	190599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_158501_162342_162411_162497_162563_163986_164105_165053_165197_165736_165834_166586_166704_171011_171137_172569_172637_176756_176869_178602_178700_182787_182936_189783
726628	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726630	contig_6710_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_89152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653686	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726634	contig_15991_pilon	-	798	6	Intergenic	novelGene_70891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	3186.46251507844	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	361	729	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102193_105011_105142_106315
726639	contig_12884_pilon	-	1224	8	Intergenic	novelGene_105004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	506.961496746719	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	333	1169	906341	899626	FALSE	10	GCACTCTGACTCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915560	899570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_905761_905834_906224_906349_915235
726640	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_97000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
726641	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_96345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726642	scaffold_6394_pilon	-	1995	10	Intergenic	novelGene_110965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	116.236349258263	312	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	667	1947	250850	248602	FALSE	0	GGTGGTGGTGGTGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDNSGDPADPHKVYAVSPAPGWGGQGSDRTEEEAPTDGRLMRGEPPGPFLGEAGERPEPVLGWAGATGQRSEPCTSSPQPTPAADARDLLHQALQHTHLGDHLLEEAWRMDSAPQQPPGPALVSEELYLPWAEAAPSCPPQPPAQHQALMTDAAWTPALEPSQEAGPAPSPLTGAPLAEGGLAVLEVTILYKGRPVLQEVVGRASCVLLYRTPGPAAEAVDAQLVAFPSPAELPDQKQLRYTEELLRHVDPGLQLELRGGSLWARRLGKCKVYWEVGGPLGSASPSSHACLLHRNFDTPIFDFGVFFRGQWCTLPEGCSRACRLARSLEPFSAELVEFRERRRQGSPHYTIYLGFGQDLSAGRPKEKSLVLVKLEPWLCRMYHEGAQREGTSSLNSSSLGLCVSSSNSLYDDINHFLMELGQPP	252555	248553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_248758_248834_249419_249495_249577_249650_249750_250025_250255_250350_250407_250774_250983_251068_251233_251312_251643_252515
726650	contig_6710_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_89238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAAGTTCTTTGTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
726653	contig_7342_pilon	+	3294	1	Intergenic	novelGene_71222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGCATTTCTCCCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701475	704769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_701500_704800
726658	contig_854_pilon	-	1390	11	Intergenic	novelGene_36413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	143.076343257717	226	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	507	1217	1074160	1064774	FALSE	35	CAAGGTTGAGGAAAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081791	1064600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1074587_1074682_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
726659	contig_8538_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_4730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	75	308	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842753	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
726660	contig_15245_pilon	+	544	4	Intergenic	novelGene_145214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	463	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	64	363	42868	56812	TRUE	20	GAGCTGGGTAACCGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHKKNHILILLEHTAVVKNNELWNGSQDLMQKNPKQKNFRLLTSLNPVLNVLLYILQLLPTLFHFLITAEDPYMQLPTCAGNLGSSSGTLARSLPAF	42804	131153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_43069_47638_47726_56800_56908_131067
726669	SIRV2	-	240	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	686	22	686	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
726670	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726671	contig_10904_pilon	+	1682	13	Intergenic	novelGene_22583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	199.021704567338	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	63	1325	439135	453918	FALSE	25	AAGATCCGTCCTCGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQRKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEVLLQHG	438413	454275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448434_449228_449357_449456_449530_451494_451592_453898
726674	contig_2487_pilon	-	1506	2	Intergenic	novelGene_148436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAATTTTGGAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16115	2137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_3614_16085
726682	contig_16071_pilon	+	2319	5	Intergenic	novelGene_166000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1679	2053	70762	72926	FALSE	30	CATAGGTGATTTTATCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELGLGTRSRGDIQCIRHGLRSHRAQQPVYNGIAGVVGITQRISQCFIGSCVYGEAFGFSTFPEFQKKLLVWRRVLAQQGLVREALPDLLGYPVVGQDHAFSHHLMDFQRLLGDEVMNILFFI	67259	73192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_67850_68109_68993_70474_70676_70757_70913_72702
726687	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726690	contig_10253_pilon	+	1565	10	Intergenic	novelGene_76863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_8	96.5988267699631	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1497	68	1564	16207	100304	FALSE	35	AGGTAGACCGCACTAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPGSKKVKLSNNTQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLNSETTVVAIFPSPMMYAGPT	16139	100305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
726691	contig_7179_pilon	-	1706	5	Intergenic	novelGene_78154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	31.4036224025191	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	185	370	1041245	1040806	TRUE	30	TGATGAATATACTGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLLTRLASLPWLSSTLRGAGVENEWKAAREASFEVAREPLTADFRFRQLWHEDSVFRPSGKMRPLTEEETRVMFEKISKYIGENLQLLVDRPDGTYCFRLHNDRQHFWGQAGVTGDLLRKIH	1041429	1038587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1039725_1039917_1040059_1040747_1040863_1040998_1041072_1041189
726694	contig_10021_pilon	-	3296	15	Intergenic	novelGene_168663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.23782770691181	202	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	23	1612	1029854	988583	FALSE	35	AATAAATGCCTGTTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPPPALRRALLARPWREARLRWKHVSSLKVANEPVLAFTQGSPERDALQKALKDLKGWTEAIPCVVGDEEVWTSNIQYQVSPFNHGHKVAKFCYADKALLNKAIEAALAARKEWDLKPVADRAQIFLKAADLLSGPHRAEILAKTMVGQAKTVIQAEIDAAAELIDFFRFNAKYAVELEGEQPISVPPSTNSMVYRGLEGFVAAISPFNFTAIGGNLAGAPALMGNVVLWKPSDTAMLASYAVYRVLREAGLPPNIIQFVPADGPVFGDTVTSSEHLCGINFTGSVPTFKHLWKQVAQNLDRFRTFPRLAGECGGKNFHFVHCSADVDSVVSGTLRSAFEYGGQKCSACSRLYVPSSLWPRIKGRLLEEHSRIKVGDPAADFGTFFSAVIDAKSFGRIKKWLEHARSSPSLTILAGGKCDDSVGYFVEPCIVESKDPQEPIMKEEIFGPVLTVYVYPDDKYKETLQLVDSTTTYGLTGAVFAQDKDIVHEATKMLRNAAGNFYINDKSTGSVVGQQPFGGGPSLWHQ	1029876	986898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_-_988593_989453_989574_989954_990077_990904_991058_992524_992573_992741_992939_995960_996035_998874_999063_1000398_1000474_1000551_1000702_1004538_1004695_1005555_1005604_1013315_1013409_1014054_1014149_1029792
726696	contig_8161_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_156738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191904	194588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_191900_194600
726699	contig_2757_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_164597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	309	761	470239	470691	NA	20	CTGTTTCACTGAATTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIRLPHRGVCRPKKKDYKQKALYNFHFIFSTIFPTSNFSQKPVLTLDKSSGPWYAIFRKRQNSINILSLVHPVQTQERIRPSSSHQWLCSTEHTGKSEPRFILKVAGGHSLTHSINHEHLFCARHFILGAAGTTKMKQTVPALEELTI	469930	472238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_469900_472200
726705	contig_6823_pilon	-	2626	7	Intergenic	novelGene_131226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_3	12.7202812687281	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1662	2225	282988	248884	FALSE	25	AATGTTAGCCAGTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	290232	248482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585
726712	contig_2114_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_104267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	241	684	519121	519564	NA	80	AAAAAAAAAAGAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPWGLDGKPGLPQSGKPEPCAPALISHPAQGNSVWPEEASVGSFISHPKQVMLEMADSSRAEGPISKDKTPTVHRVTLTVWLVGRARGRGAGRLSAASAQGEGSLWLPQRNFLKGTEAVFAMRPEEMDDAWPPLLNILTKHSIEES	518880	520703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_518900_520700
726715	contig_12626_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_80454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTACTTAGATGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166923	165342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_165300_166900
726720	contig_13744_pilon	+	886	3	Intergenic	novelGene_77190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	13.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	275	721	741333	742773	FALSE	50	AAGATGACTTGAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFKIYPPPELPREYRPVHYFRPVVAATSENSQLLQVLSESSGKALCDPGTHSRHQLNASKRGDLLGETPIQGSATSVLEFLSQKDKERIKEMKQAAELKAAQLKAKSLAQHALSGRPQPSSPDLGHCSRHMASSGRTATVRASNFKPFAKDPEKQKRYEAFLVNMKQGHKDALERCLDPNMTEWERGRERDEFARASQLYVSSHSTLSSRFTHAKEEDDPDQVEVPRDQEVCRHPVPVW	739284	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_739500_741273_741571_742564
726721	contig_6063_pilon	-	1857	14	Intergenic	novelGene_27577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	539.670127164591	1	83	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	723	1427	27938	17150	FALSE	45	AAGCTTTAGTAACAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	53057	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25920_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36256_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947
726723	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726724	contig_5978_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_152401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAATTTCATTTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371820	372965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_371800_373000
726730	contig_7898_pilon	+	1407	2	Intergenic	novelGene_47587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTCAGATACCCAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497067	499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_497778_498892
726731	contig_14441_pilon	+	1169	4	Intergenic	novelGene_100343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.82842712474619	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	686	1129	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	6237	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6425_6604_6934_125497_125902_126496
726734	contig_8693_pilon	+	1805	4	Intergenic	novelGene_150858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	15.1730755689881	43	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	64	552	1056255	1069118	FALSE	70	AAAAAGTTAAAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGRLPTGARGEKPQRRRAAQMPGGAGLIAAAVTALVAALLLLRQEDSGSGAGSREPPPRLLWAEEVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGA	1056191	1070371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1056390_1056608_1056852_1061608_1061717_1069115
726735	contig_8729_pilon	+	2168	7	Intergenic	novelGene_40115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	20.9238035632998	140	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	530	1642	423980	490356	TRUE	25	TGTGAAGCATTTTAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKLKQNLLLACLVISSVTVFYLGQHAMECHHRIEERSQPAKLESTRATVQTALDVKANKTFAYHKDMPLIFIGGVPRSGTTLMRAMLDAHPDIRCGEETRVIPRILALKQMWSRSSKEKIRLDEAGVTDEVLDSAMQAFLLEIIVKHGEPAPYLCNKDPFALKSLTYLARLFPNAKFLLMVRDGRASVHSMISRKVTIAGFDLNSYRDCLTKWNRAIETMYSQCMEVGYKKCMLVHYEQLVLHPERWMRTLLKFLHIPWNQSVLHHEEMIGKAGGVSLSKVERSTDQVIKPVNVGALSKWVGKIPPDVLQDMAVIAPMLAKLGYDPYANPPNYGKPDPKILENTRRVFKGEFQLPDFLKEQPQTEQVE	381171	493962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_381351_385050_385300_423878_424825_448566_448766_486781_486833_490338_490384_493463
726740	contig_8464_pilon	-	2062	2	Intergenic	novelGene_125386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGGGATTCCTAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848233	846024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_847697_847843
726741	SIRV4	+	876	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	54	20	54	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	432	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATAACTTTAACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
726742	contig_2704_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_75317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACCGTGGATGAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320817	319472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_319500_320800
726743	contig_20779_pilon	+	1868	2	Intergenic	novelGene_112363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	374	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	40	1698	8301	10896	FALSE	30	AGTAGTAGATATGTTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIVCMDLYTVCNILFTL	8261	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654
726744	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726745	contig_15325_pilon	+	633	5	Intergenic	novelGene_157185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_2	540.834771441334	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	15	572	94466	96243	TRUE	25	TTGAAATATTGTTGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	94451	96608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
726746	contig_6710_pilon	+	574	2	Intergenic	novelGene_95537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
726747	contig_12000_pilon	+	1992	8	Intergenic	novelGene_43177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	569.682295992553	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	488517	492333	TRUE	55	AATCATGAGAGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELVTCSKIP	488515	588407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_488596_490220_490304_490573_490689_492310_492414_494931_494989_558472_558606_584748_585374_587611
726750	contig_10196_pilon	-	1124	7	Intergenic	novelGene_132232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_6	197.593578393181	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	109	585	1442405	1433608	FALSE	10	TTTGGTTGCGTTATCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448622	1433068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
726754	contig_11978_pilon	+	668	6	Intergenic	novelGene_63055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4015.20198246614	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	58	585	1827946	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827888	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830065_1830668_1830785_1831161_1831273_1831759
726756	contig_6375_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_73051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGTATTTGGTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532135	531908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_531900_532100
726759	contig_15047_pilon	+	1113	6	Intergenic	novelGene_52244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	547	660	4573	4686	TRUE	40	AATGGAAGACCGGAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2590	21637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2766_3421_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
726760	contig_14441_pilon	+	1166	6	Intergenic	novelGene_100539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.223608922637	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	552	980	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112614_112665_113052_113209_116578_116963_117220_117344_117539
726761	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726762	contig_13496_pilon	+	2664	6	Intergenic	novelGene_107636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	383	junction_1	351.380363708617	35	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	46	1047	285144	392728	FALSE	80	GATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTDGNAGLLAEPQIAMFCGKLNMHMNVQNGKWESDPSGTKTCIGTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHAHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLADESDSVDSADAEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSVSKWTFLEPGHLSSLSPLTLLSVTD	285098	394345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_285264_309234_309365_343908_344022_347585_347780_378499_378703_392486
726763	contig_4782_pilon	-	2674	10	Intergenic	novelGene_73646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_9	80.277450979727	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	568	1530	456386	431418	FALSE	35	AAAATAGACTGTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLLSPEDREELVEGTRPRRKKHDYRIALFGGSQPQSCRYFNPKDYSWTDIRCPFEKRRDAACVFWDNVVYILGGSQLFPIKRMDCYNVVKDSWYSKLGPPTPRDSLAACAAEGKIYTSGGSEVGNSALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCGGSLGNNVSGRVLNSCEVYDPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLDNVEYYDIKLNEWKMVSPMPWKGVTVKCAAVGSIVYVLAGFQGVGRLGHILEYNTETDKWVANSKVRAFPVTSCLICVVDTCGANEETLET	529469	430273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_431702_434696_434795_438418_438621_440983_441225_456248_456392_471146_471323_476983_477109_477443_477538_478827_478931_529405
726764	contig_6710_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_89674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
726767	contig_1867_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_54563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	664	1623	449145	448186	NA	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449808	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448000_449800
726768	contig_9290_pilon	-	2667	13	Intergenic	novelGene_77574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_12	16.2420920929404	4	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	28	1284	516542	504291	FALSE	20	AGTGGTGACAGGCCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASMCDVFSFCVGVPGRAQVAVEVRFVSSSKGKGLFAKQLIRKGETIFVERPLVAAQFLWNALYRYRACDHCLRALETAEENAQRLTGKPGQVLPHPELCIVRKDLHQNCPHCQVMYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWRSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516569	502907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509230_509606_509729_510196_510337_511094_511204_516446
726774	contig_6102_pilon	-	1615	7	Intergenic	novelGene_32143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	646.13724032386	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	363	470	841255	839973	FALSE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKREEATTGEKTPELPPERSQIPLCRQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867361	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_846088_846188_846753_846824_846979_847102_867290
726784	contig_7293_pilon	+	1020	2	Intergenic	novelGene_54242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	734	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCTTGTAAGCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329502	330678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329881_330036
726787	contig_1276_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_159766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATTGGATGAAGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154380	155928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_154400_155900
726791	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726804	contig_9799_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_145563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAATATGATTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985575	984331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_984300_985600
726805	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	99	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726806	contig_854_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_36119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGCCTCTTCTTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286696	307423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_286725_296473_296942_298516_299067_307071
726810	contig_8710_pilon	-	2373	16	Intergenic	novelGene_73538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_14	72.8018925272932	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	56	1894	518747	459003	FALSE	45	GGTAGCTATCTATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRRGPIKLGMAKITQVDFPPREIVTYTKETQTPVMAQPKEDEEEEDDVVIPKPPIEPEEEKTLKKDEENDSKAPPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTRIVERALSEQINIFFDYSGRDLEDKEGEIQAGAKLSLNRQFFDERWSKHRVVSCLDWSSQYPELLVASYNNNEDAPHEPDGVALVWNMKYKKTTPEYVFHCQSAVMSATFAKFHPNLVVGGTYSGQIVLWDNRSNKRTPVQRTPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGKICSWSLDMLSHPQDSMELVHKQSKAVAVTSMSFPVGDVNNFVVGSEEGSVYTACRHGSKAGISEMFEGHQGPITGIHCHAAVGAVDFSHLFVTSSFDWTVKLWTTKNNKPLYSFEDNSDYVYDVMWSPTHPALFACVDGMGRLDLWNLNNDTEVPTASISVEGNPALNRVRWTHSGREIAVGDSEGQIVIYDVGEQIAVPRNDEWARFGRTLAEINANRADAEEEAATRIPA	520786	458523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_459117_460704_460831_462654_462796_480217_480363_481184_481319_481630_481745_482104_482252_483151_483278_483789_483890_483993_484157_484364_484461_495500_495617_502005_502097_516296_516415_518639_518757_520740
726812	SIRV4	+	266	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1505	632	1050	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2505	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
726816	contig_5889_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_133696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTCTTTGCTGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288863	288551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_288600_288900
726821	contig_3975_pilon	-	1287	2	Intergenic	novelGene_54918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAATGTGATGAATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239105	2237765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2238467_2238519
726826	contig_7898_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_47655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATTATCAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868726	867410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_867400_868700
726829	contig_10801_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_74052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGCACTGAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336510	338665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_336500_338700
726830	contig_16999_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_84968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_3	58.7329171381395	183	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATGGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50652	84049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_73925_74018_81568_81688_82921
726834	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	198	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726836	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_89251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726837	contig_10159_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_30776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCTCATGTTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313325	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_313300_314700
726838	contig_7091_pilon	+	1485	8	Intergenic	novelGene_131774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.8909609606027	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	557	910	420898	435147	FALSE	25	TTAATCCTTGTGGTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIRLLHDLNFSKDEIHSFTA	349723	435722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349873_354241_354361_415625_415657_417076_417230_420793_420945_421228_421316_431521_431687_435092
726841	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
726843	contig_11096_pilon	+	2438	3	Intergenic	novelGene_143463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_2	87.5	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	98	505	198818	211194	FALSE	65	ACAATAAAATGTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRTVRAGAGGRGVGAAGRWERKRLRGGEGARMATPSRRTSTPSSQASKRVLPRDPSSEVPSKRKSSAPSTLPPTPLLPPPLQSSGPFVEGSIVRIAMENFLTYDICEVSPGPNLNMIIGANGTGKSSIVCAICLGLAGKPAFMGRADKVGFFVKRGCSKGMVEIEL	198720	213127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_199027_204496_204639_211137
726844	contig_11364_pilon	+	2577	5	Intergenic	novelGene_65162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	95	577	84806	85288	TRUE	10	TACTGGTTTGCTCACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIYLGWACLGTGAPPWGERHDHGVTAFCKEHQTVFVSIVWDAPFLSCNSELRNAREGKRGGWGPYDLDARETRTQMFCDRDIQRWYDGGRKKAQMEPLFTGHPDSGPEPLHGTPGRNSMLWGTLTVPKPLGFLLRGLCSGQGPTGRPWTWRLKLQAGT	84711	93519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_85591_86484_86592_90472_90678_92018_92115_92229
726845	contig_7415_pilon	-	1840	10	Intergenic	novelGene_168675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_9	26.3049542345914	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	178	885	302651	234983	FALSE	15	CATCTGTATTGCATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYSCSLPCVKKHKAELTCNGVRDKTAFVSIQQFTEMNLLSDYRFLEDVARTADYISRDTFLKRPTGNKHMYYLKNRARRQGIYLKLLPNGFTKRKENSTFFDKKNQQFYWHVKLLFPQSQAVYIEKRVPDNKTINDILRTYIDPEKSDPVIRQRLKAYIRSQTGVQILMKVECVQQNLVSYYELDPCRSLLDNLKNKVIIEYPTLHVVLRGSSTDMKVLQQVKSESTKNFGSES	304693	234027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_235024_239414_239540_259273_259352_261404_261486_265596_265666_294721_294826_302270_302357_302441_302549_302634_302701_304565
726852	contig_15449_pilon	+	1563	7	Intergenic	novelGene_33661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	215	640	191181	192186	TRUE	55	AACATTAAAATAAACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLDLQLLKKVPVQNLGDHLRLRQGDSGSQKTSVRRGRGCSMPLMRSLGSWDSEEVLGEEGLGTTEVPTLPTVTSSLSSCRRCRRISWDSEKLLPSADSGRGAAVVLIFWGICQDVLKCPAEEFGLLKPILPAKASSAIL	190966	196179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_191490_192069_192240_192895_193135_194659_194772_195026_195205_195335_195569_196071
726853	contig_11115_pilon	+	1784	8	Intergenic	novelGene_102797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_7	155.199147904246	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	298	726	155012	156185	TRUE	15	GTTATTCTGGTGTTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFW	153741	158457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_153881_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156507_157401_157513_157601_157738_157967
726868	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_98059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726874	contig_4884_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_63777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAACCGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74086	71856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_71900_74100
726875	contig_15628_pilon	+	2278	3	Intergenic	novelGene_147706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTGGCAATGGAAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189743	195642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_190019_191946_192814_194506
726876	contig_3077_pilon	+	1497	8	Intergenic	novelGene_26706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3210.78347613355	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	316	999	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
726878	SIRV2	-	223	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	703	22	703	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4029	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
726879	contig_2114_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_104284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713526	710929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_710900_713500
726880	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_95499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
726886	SIRV2	-	336	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4537	34	3362	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
726891	contig_4732_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_75443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641258	643071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_641300_643100
726892	contig_6805_pilon	-	2114	6	Intergenic	novelGene_163891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_4	28.5166617962201	107	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1032	1415	426023	421495	FALSE	25	ATCATTTGCAGTTGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKKIAILKDHGFIENLTFGWDGPSWRLLTALKLLCLEAGEFTCWKKVLLGEIISDTNEKTSLDITRKICCYFIEESNAMLQKVSHMKDKEVALVNQLTLVETLWTEELKILQASAAILSNLQTTFT	435404	420795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_421630_421958_422083_425011_425093_425979_426062_432822_432998_434586
726896	contig_5961_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_144132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157572	155070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_155100_157600
726899	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	301	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
726901	contig_2537_pilon	+	1728	9	Intergenic	novelGene_33402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	26.0756112104779	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	51	1688	47272	158746	FALSE	35	ACTACAACCTTGTATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASQAGINLGTAVSGGMYQPATIFMGRQMSAISSIGDFSTEQKSPQPTKNFSIPNPHSCRQTTQSSNVTDSCVVQTDSDTQCLNKPDKTDGKTSLQIGEETPVTADVLSEGEETHCLEIGSNTRHSNLSESKKSAELHSPLQEGLSPENRTTDLKCDSSSRSEGSEEEILTREHIEVKEERARLPVSPITVSEYCAFENKCSQENRSAWEDFLDHLPQGDPESQRTFGKTQEEQEEESLSSSSDLTVSVSEDDLILKSPEPQPNPYDKMEGKDGIKALKLIHSEEERDTLFTKKKNSILQSLSSPNSKKESSTNSPTRESEQPPHSDLLRAQLSQHVTILNEQDSSLTEEIAKPFEVSTVRNEHQRMKATALLKKALTEECADRSSIHSDESSCSLPSILNDNGGIKEANLGLWLNSVPTGEQEVSSSCRDESKEESVATKIPVTETKAYQLLKRSTLQDNTHQTEDRFHKAGVSTSQLSGLNVGSGTFKTKTTNKIASEANFSSSEGSPLSRHENKRKLTTTLKSKDFWGESDDSNSEIEAALRPRNHNTSTDDFDDFYD	47221	158786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_47864_48770_49087_100139_100288_121460_121627_122499_122566_139079_139185_141607_141705_156611_156656_158642
726902	contig_12977_pilon	+	1799	15	Intergenic	novelGene_122771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	672.467038870566	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	413	1432	10887	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10474	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58523
726903	contig_8651_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_168176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	152.975669815679	858	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	74	535	180836	173502	FALSE	25	TCCAGGCTTTAAAAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSWSRAERCCGVERNRLSGRGAPAMARNTLSSRFRRVDIDEFDENKFVDEQEEAAAAATEPGPDPSEVDGLLRQWDMLRAFHAALRNSPVNTKNQAVKERAQGVVLKVLTNFKSSEIEQAVQSLDRNGIDLLMKYIYKGFEKPTENSSAVLLQWHEKALAVGGLGSIIRVLTARKTV	180909	172739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_173565_174900_175078_176042_176114_180685
726904	contig_7815_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_134354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	49	342	127427	127720	NA	20	TTTTCCCCAGGAGTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGSGRPGILLRPRGEMLTAGNQLTVSSPTAARVRCEKGSRLSAGAPASRSGVVSAEVEQAEEGREGPVRCRNPRQACAPSLGFPFPSDLGARIRVPIVTWKLLSGLFPAGSR	127378	129645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_127400_129600
726905	contig_15236_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_141630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGCAACAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634196	631357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_631400_634200
726910	contig_7457_pilon	-	1173	6	Intergenic	novelGene_31355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	146	junction_2	53.2826425771095	892	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	30	554	321514	317540	FALSE	10	CTGCCTGCCTTGGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321543	316920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
726911	contig_5586_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_143542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATTAAAAAAAAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338325	335643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_335600_338300
726921	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	285	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
726922	contig_2730_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_135377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCCAGACATTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312794	313457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_312800_313500
726923	contig_7996_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_165154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGATTCACATGTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222190	223647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_222200_223600
726933	contig_6710_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_90812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGAGGAAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
726934	contig_8576_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_88729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACAGGCCAGTGAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619967	620599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_620000_620600
726935	contig_8576_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_88730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	351	677	621203	621529	NA	50	GGAAAATAATAACCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAAAEEALEGAGPWRQSAEHTPCSWAARPSLKEEQGGASLSVTAKRSECEHFFPREQMRNTQRCFGCRKDGGWGQLAFSEQEPEKSAIHNVQDSPAQLRIVPSHHMA	620852	622824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_620900_622800
726938	contig_12250_pilon	+	658	8	Intergenic	novelGene_80682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	349.501569293724	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	124	612	393102	394948	FALSE	0	CTTCTGGTGTGCGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQEKVLERVNAVKTKVEAFQTTISKYFSERGDAVAKASKETHVMDYRALVHERDEAAYRELRAMVLDLRTFYAELYHIISSNLEKIVNPKGEEKPSMY	392898	394994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_392998_393077_393133_393218_393317_393885_393955_394108_394177_394326_394382_394687_394775_394867
726942	contig_7457_pilon	-	1524	10	Intergenic	novelGene_31379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	53.5599352750418	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	853	1329	437993	437249	FALSE	10	GTCACGGGTCTCTTTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	441783	437053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438030_438414_438599_438678_438766_438987_439115_439569_439651_439898_439968_441329_441498_441683
726945	contig_12540_pilon	-	2146	4	Intergenic	novelGene_148112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	299.381955961871	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	28	1326	1108562	1092439	FALSE	35	TAAAGACTTCAGAGCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPASRGLHMGLVMERGGPYSRGLHKAGGGERGCWYYFRYFFLFVSLIQFLIILGLVLFMVYGNVHGGTESNLQATERRAEGLYGQVVGLTASQANLTKELNLTTRAKETIMQLLLNARRDLDRINASFRQCQGDRAIYLNNERYMAAIILSEKQCKEHLNENNKSCNSLLFMLGQKAKTLELELEKEKAVCTKDKEALVLGKRQVEEQLVDCGKIQGQLQQEKRIAEEQLRKVETLCLQWDKDKFETDVRNLWRDSIIPRTLDSLSYGPYHSFGGELASIHRSCDRMPELMNAKVAELARSLRVDIDRVARENADLQRQKLEAERGLQASQEAKEKVEKEAQAREAKLQAECARQTQLALEEKATLRKERDSLAKELEEKKKEAEQLKMQLAIGNSALDTCIKAAGGQASHSLHQSPPHPHGHLQCWLTSPPPHHVTTAM	1108589	1091618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1092553_1102444_1103152_1103234_1103332_1108181
726946	contig_6109_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_160381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAACTTGAGGAAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579434	580244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_579400_580200
726950	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	323	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726952	contig_5836_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_106281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTTTATTTGGTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105197	104509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_104500_105200
726954	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
726956	contig_5217_pilon	-	2074	11	Intergenic	novelGene_135745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_4	67.4839981032541	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	786	1838	531378	529231	FALSE	10	ATTTATTGGCCTCCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPPQGYTPDQLPVTSCMTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVQYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGVLRYFATYMEQHLMKGGDLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWEPLLVTFVARNRRACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLCYALRLLRDRSPAYGPTCRAGLDPSP	533211	528994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_529984_530119_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531863_532688_532777_532869_533000_533128
726964	SIRV6	+	701	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	82	0	82	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10319	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
726966	SIRV4	+	1554	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	76	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1344_1678_1884_2389
726975	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
726976	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_89184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653706	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
726977	contig_9363_pilon	-	1677	7	Intergenic	novelGene_6534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	59.9935181684007	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	386	1270	637958	634178	FALSE	5	CTGGTGCCGTGTCTCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIMQLPASGPTQPPVPSSVNEGSPSPPEPTSKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGLCNQPIQHKMVTALGTHWHPEHFCCVSCREPFGDEGFHERDGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG	638617	633770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_634445_634661_634811_635148_635231_635484_635659_637745_638159_638273_638362_638520
726979	contig_6710_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_97786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653650	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
726981	SIRV6	+	564	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1763_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
726982	contig_8964_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_168716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	3	527	570322	570846	NA	20	TCCAAATGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGKAFTERSNLTQHKKIHTGEKPYKCNECGKAFTQFANLTRHQKIHPGEKPHKCNICNKAFIQSSSLVEHQRIHAGEKPYKCAKCGKAFIKRCHLWSHERIHTGEKPYKCSECGKAFTERSNLTRHKKIHTGEKPYKCNECGKVFTQFGNLTRHQKIHTEKPNTCGSALSFGDH	570319	572698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_570300_572700
726984	contig_6975_pilon	-	417	2	Intergenic	novelGene_74305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCTGTGTAACTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522080	521589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_521920_521993
726996	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3895	0	3621	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6745	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
726999	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	99	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
727009	contig_18869_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_56351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACAACTAAAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73708	73362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
727014	contig_5145_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_131346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATCTGGGGAGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7411	8693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_7400_8700
727016	contig_18108_pilon	+	1283	9	Intergenic	novelGene_33523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAAGGGCCCAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266710	316762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_267082_267669_267734_269578_269652_269893_269937_287472_287590_289293_289454_296016_296176_296964_297166_316667
727017	contig_6364_pilon	-	2408	4	Intergenic	novelGene_51783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	5.90668171555645	474	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	162	1589	1102801	1091442	FALSE	20	TAACATGGTATGTGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPETSCPWMGHLPRLQVRTWIEPVVASTQVAASLYDAGLLLVVKEYYDAGGSSNHSASPSTRGAVEDQQQRAISNFYIIYNLVMGLTPLLSAYWLGWLSDRYHRKISICVPLLGFLLCRLGLLLKVLLDWPLEVMYAAATLKGLCGGFSAFWSGVMALGSLGSSEGRRSVRLVLIDLILGLAGFCGSMASGHLFKQIAGRARQGLVLTACSVSCATFGLFYSLLVLKVPESVAKSNKALTTVDTVSGMVGTYRTLDPDQSEKQSVVGHPPPLGKGKPPKAIIALLFVGAIIYDLAVVGTVDVMPLFVLRAPLSWNQVQVGYGMAAGYIIFITSFLGVLIFSRCFRDTTMIMIGMVSFGSGALLLAFVKKTYMFYIARAIMLFALIPITTIRSAMSKLIKGSSYGKVFVILQLSLALTGVVTSTVYNEIYQLTMEKFVGTCFTLSSFLSFLAIIPIGIVAYKQVPRSQFEDITEK	1102962	1090622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1091500_1099429_1099587_1100102_1100187_1101672
727018	SIRV4	-	263	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAAAACAAGCCATTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2764	2501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
727024	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727026	contig_7031_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_132800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336163	337323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_336200_337300
727027	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727028	contig_4857_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_48888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATGTGCACCCAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417245	1419553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1417200_1419600
727029	contig_7744_pilon	-	1898	19	Intergenic	novelGene_62573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	37	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	642	1049	891733	889750	TRUE	30	GAACACAGCACGGACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAVVYSGVTAPRGLATCRSTVPCSTAPSSRLPWPTRISASPTLISRWGPRAAFGMRSQLRCRFNLSSSFNRSVRWCLTPSSTDSMLHCISTTLRVSTSAGSGVGVLTEGGTTGDVTSSCCGCWGRGSPKAVRG	893015	883433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_883514_884617_884707_884859_884901_885272_885368_886855_886941_887132_887189_887341_887446_889020_889158_889341_889448_889594_889639_889737_889875_890087_890144_890223_890288_891570_891753_891834_891894_892065_892276_892400_892534_892671_892784_892907
727030	contig_18800_pilon	+	651	2	Intergenic	novelGene_110669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	166	651	44318	44803	FALSE	15	CCCCCGGACTCAGGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAPGAPRLAHPFLGPSEGRYGSPATPLASTHPNLHNGIVKADTSGGSCAAFALWMMGDDRLSDHPKSTEFLDIYLEDNLQPSPGVPSREPSSHPESPGPCREQTWAFDPPDSKGQDAPRGPDTEPVHLESCSSQGEHRQRTTPPGSPGASHPLGSPQQSQSTSAQVMFWAGILQAQMCVLDLEEELEKTEGLRAELRCCLPTAPADLPRFPSSPVS	36269	44803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_36324_44206
727031	contig_8674_pilon	-	1644	13	Intergenic	novelGene_102948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	53.1653604855225	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	358	1272	723870	707008	FALSE	20	TATCCTGCTCTTCTGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727564	706635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_726863_726959_727434
727034	contig_11656_pilon	+	2142	13	Intergenic	novelGene_54025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	169.987662951038	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	120	1388	468970	536596	FALSE	30	TTAAAAATTGTCTCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRVSIRPETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQ	468850	537350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_468997_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525031_536593
727041	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_95047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
727042	contig_17311_pilon	-	900	5	Intergenic	novelGene_57836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2350	junction_1	6724.89075654765	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	34	426	126865	119271	FALSE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	126898	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_119274_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
727045	contig_6364_pilon	+	2535	13	Intergenic	novelGene_51724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	137	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	2112	2534	466353	521085	FALSE	15	GACGGGCTCACCGCGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVSLKFSMIGILNINRLASEVRSNRRVIIHHSNSSFLRSLHTWLFPFKIKRLVTLPNGRPNDMTSASVTSFGILRRWRTREGEQGGLSPLNFLLSFPLAYTPGAEVELFMVKGPLMMPEERSSSDPRHPWPRWRSAQCGD	435221	521086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_436298_436434_436506_439790_439985_440671_440788_445010_445150_447070_447150_457079_457255_458660_458773_466203_466356_472508_472627_477558_477736_490716_490802_521045
727048	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727049	SIRV6	+	552	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	22	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727061	SIRV6	+	582	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3140_10687_10819_11031_11109_11205
727062	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727065	contig_5936_pilon	+	1521	7	Intergenic	novelGene_53537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	178.757206536936	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1200	1520	441372	446846	FALSE	25	GCCCAGCATCATCAGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPHPSLVLTSPGGGTNATPVVPSRAATPRSVRNKSHEGITNSVMPECKHPFKLMIGSSNAMGRLYVQELPGSQQQELHPVYPRQRLGSSEHGQKSPFRGSHGGLP	32345	446847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_32377_223961_224056_251615_251764_351321_351444_428230_428906_441242_441424_446577
727068	SIRV2	-	234	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	691	23	691	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4041	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
727069	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727070	SIRV6	+	561	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	9	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727081	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727083	contig_9797_pilon	+	1414	5	Intergenic	novelGene_65587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440.017613283832	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	7	705	172546	191368	FALSE	10	TTTATTTGCCGTTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYPYGQGCPGAAGQAPGAPPGSYYPRPPPRWRAVWKRGTPWWRLWGSCTWGALWTTSWWRTLWTWGTDLWNSRRTLCGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172539	192077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183895_188644_188734_189277_189422_191138
727084	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
727085	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
727087	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
727101	contig_7775_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_37456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATTTCATAGAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51623	52867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_51600_52900
727104	contig_6445_pilon	+	1612	11	Intergenic	novelGene_77130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	229.532764545718	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	43	1302	1470295	1489055	FALSE	10	GCTGCCTGGCCTACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASAAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELQQLHSDPRPMVGVSHRWPKEALGCTPGKQRAPVF	1470252	1489365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559_1488655_1488946
727107	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
727112	contig_7428_pilon	+	1637	6	Intergenic	novelGene_77683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	289.953513515529	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	137	613	221272	224033	TRUE	10	GCCCTCTGTGACTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGVSPGQGYPSSDREQDSDRSSEASSLGRLWMALGLALALALALPDCLVLWVPAEAHPLPAQSHPARLNRMLPQLRDTFGWWNFTCPVCKVLFTVIDIGLKQESSVAQVGSMAIKLCNLLKIAPPAVCQSAVQLFQGDMVEVWTAPVAGPGASGR	221135	225742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_221584_222563_222686_223990_224050_224356_224434_224643_224790_224957
727113	contig_8330_pilon	+	1385	6	Intergenic	novelGene_71834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	373	junction_3	74.0659165878611	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	82	468	855530	856687	TRUE	5	CAGCCTTGGCGCTTCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	855448	857818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
727121	contig_15063_pilon	+	1437	6	Intergenic	novelGene_12560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3144.27263448957	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	6	746	28164	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPNNHQYLRHPPILC	28158	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35844_36158_36266_36511_36625
727126	contig_8617_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_73437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62982	62036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
727127	contig_15412_pilon	-	1948	5	Intergenic	novelGene_165470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	147.261671863387	692	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	17	925	137380	115155	FALSE	25	TATGGTGACTGGAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLAGQMWAVGRPGVTSVSPHTWFPADCRPRSRRSSGSFSVFMAGARGQGLEVVTVSLCSPSPPPSCSNSTMSLLSPLGHQSFPFDEDDGDEEDEEDVDEDDHDSEAKVASLKGMELQGCSSEVESEDTQEEQKQVRLPEGSLTPWEVWFVGKEKEERDRLQQKALEELNQQLEKRKKKEEHEKRKIIAEEKHKEWVQKKNEQKRKEREQKINKEMEEKAAKELEKELLQEKAKEKYQEWLKKKNAEECEKKKKEKEKEKQRQAELQEKKEIAEKKFKEWLENAKNKPRPAAKSYGYANGKLTGWFLC	137396	114131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_115314_116018_116178_126104_126213_132580_132717_137033
727128	contig_9871_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_75630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGACTCATGGTGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338137	337423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_337400_338100
727133	contig_5479_pilon	+	2583	1	Intergenic	novelGene_133601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAACAAAAAAATGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308094	310677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_308100_310700
727136	contig_14133_pilon	+	2453	6	Intergenic	novelGene_119916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.780123649964	1	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	116	688	136738	146688	FALSE	10	AGAGCTTTTGTGTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPQFTAKQLEKLAKKAEKDSKAEQAKVKKALQQKNVECARVYAENAIRKKNEGVNCLRMASRVDAVASKVQTAMTMVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136622	148453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142274_142361_142941_143083_145605_145735_146042_146231_146666
727138	contig_9440_pilon	+	1507	7	Intergenic	novelGene_59096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	806	1264	1700756	1709386	TRUE	25	AGACCTCGGCACTCCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPDLVGFCSRECFQHPLLPVIFQDRLRLRLVRLQPLDDRLRLVVLTLDERLPSQVVNAHGLRRVEFDVVDATTGWMNPASSEALLNDLEGHVQVNHRVYLINSIQGFSLWNCPWKTIQQPATLGEMLQLMKDQPSHDIIWDELPLVNESLG	1698662	1716707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1699019_1699766_1699811_1700350_1700813_1705390_1705510_1706374_1706547_1709275_1709398_1716475
727139	contig_4103_pilon	-	2607	13	Intergenic	novelGene_51886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	26.3797060045954	247	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	150	1670	53593	47855	FALSE	30	TGTAGTAGTTTGAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLGLLPRKAWVALLSQILRPPHAACPRAVRFHSQVAEAVLTSQLKPNQEKSNFIIKTPKGTRDLSPQQMVVREKILDTVVSCFKRHGAKGLDTPAFELKETLTEKYGEESVLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKCYHVGKVWRRESPTIAQGRYREFCQCDFDIAGEFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGGVSLVEQLFQDPRLSQNKQVLEGLGDLKLLFEYLTLFGIAEKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPNQAGKDSLSMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRMKVFGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIAELWDAGIKAELLYKNNPKLLTQLHYCENMGIPLVVIIGEQEMKEGVIKLRSVASREEVAIKREHLVGEIQKRLSDS	53742	46917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_48833_48991_49235_49326_49455_49761_49856_50128_50228_50474_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53485
727141	contig_3832_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_161478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGACTTTTAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439190	437500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_437500_439200
727143	contig_18231_pilon	-	983	7	Intergenic	novelGene_105884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_4	456.748532807958	157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	229	981	276952	246850	FALSE	35	AACTGGCCAACAGCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFHSEEQQLLLQVQQQHQPQQQQHHHHHHHQQAQPQQTVPQQTQTQQVLIPASQQATAPQVIVPDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSGQLLQVVRAANGAQYIFQPQQSVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTVAAPTPAQAQIT	277180	246847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_246991_249443_249578_250802_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_276922
727144	SIRV5	+	405	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	18	7460	-1	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
727149	contig_6710_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_96644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCACTTGCTGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
727150	contig_12005_pilon	-	1883	10	Intergenic	novelGene_160473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_9	43.2557710415045	195	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	99	1757	216421	186547	FALSE	30	CCGTTATAAATTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPCSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKHKLIAWEHTKTVQGYRLTNAGYDYLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGHQFALKLHRLGRTSFRNLKNKRDYHKHRHNMSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYERKFPVPKPIDYNRHAVVMELVNGYPLCQIHHVEDPASVYNEAMELIVKLGSHGLIHGDFNEFNLILDKDDHITMIDFPQMVSTSHPNAEWYFDRDVKCIRDFFIKRFSYESELYPTFRDIRREDSLDVEVSASGYTKEMQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRDEENMGHVTQYRTRTLSVTSAGSVVSCSTIPLELVKQKVKRQLTKQQKAAVRRRLQKGEANIFTKQRRENMQNIKSSLEAASFWED	216519	186420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_186712_190632_190730_192724_193250_194007_194101_198002_198195_202798_202888_205826_206003_208295_208413_209587_209727_216355
727152	contig_4103_pilon	+	1379	2	Intergenic	novelGene_51954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1872	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	832	1209	130381	130758	FALSE	25	GAATTGGTGTCATTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPNGVCAVLAAAAVQPNRLDLSQNALRATANPGGPRCVWPSELSSLLLSFAGLEQVPKGLPAKLSVLDLSCNRLNRAPRPDELPQVENLTLDGNPFLDAGVAKPHEGPKNSGATGVCGHSTLT	129465	130928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_129599_129682
727153	contig_5954_pilon	+	335	4	Intergenic	novelGene_28423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	1626.09969627395	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	58	333	97851	98693	FALSE	25	AAGTGAGAGTGTGAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPK	97522	98695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98637
727154	contig_10793_pilon	+	1346	12	Intergenic	novelGene_83405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3487.55919526764	5	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	229	879	152887	163152	TRUE	25	GCAACATTTTTTTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTG	130888	165013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152874_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163148_163273_163944_164068_164789
727157	contig_9582_pilon	-	2244	7	Intergenic	novelGene_106836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	23.4431937528429	71	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	159	1502	431196	417968	FALSE	60	AGGAAGAAAGAAGAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGRPVPTCVHLASDVQLDGRCDPRKLQTQNQLQFNRNVPTHSSNLAIRYSCPHAIRIEKLKHSFNESYHCKDSNFRDGPDPSSSVSFSVISEEKLSYAVHLAKRDVKRRQFEEHMKEHHLRSQPQISQKCGHTTKSKIPEHRLEKKETKGHEVFPCSHQPSKVEISSSGAKVYLYTSHPGQPDLTVQNSPPTRDPGLQPHSRIGEHKSLLEVQRLQKELSSCIHKIEEVTKKDKIEEALDPDEERRVQIRRQEQAVRSARMLYVLQQQVKEIQEELDKLSPHKIKHTKKSWAVSRLAAAHRGAIRALQMFVTQFTDRGEHPVPTRGRELGSLIRQLSLCSAKLDSDPSVPDVVIDILQQIEDLESLLEKKLSPKKVKKYASEIRNKFPVGSQRVLERWPSTSSKSERRLFGAKEMFPQETRRPSVAKKLLVGMCLQVFIAGYFIL	436741	417225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_418223_420110_420327_420724_420788_422905_423013_425333_425944_431103_431267_436653
727158	contig_6740_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_142692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGAATTGATTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632108	630139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_630100_632100
727159	contig_12884_pilon	-	1750	10	Intergenic	novelGene_105015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_7	86.4991258073288	598	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	64	1002	1137687	1126202	TRUE	15	GTCCTGTGTCTGACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIALGTDAIKIENGQSTATKLGLPPLTPEQQEALQKAKKYAMEQSIKSVLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAQRQRALAIMCRVYVGSIYYELGEDTIRQAFAPFGPIKSIDMSWDSVTMKHKGFAFVEYEVPEAAQLALEQMNSVMLGGRNIKVGRPSNIGQAQPIIDQLAEEARAFNRIYVASVHQDLSDDDIKSVFEAFGKIKSCTLARDPTTGKHKGYGFIEYEKAQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLRVGKAVTPPPCPCSHLPHLEASHPLLLWLPLPPQPRSLHRKQWREQQCWARWPRQDWCRLP	1137750	1125186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1125630_1125739_1125976_1126132_1126269_1126358_1126552_1126627_1126842_1126918_1127012_1127087_1127250_1130257_1130348_1130454_1130551_1137663
727162	contig_15459_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_106366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	321.702761360027	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGGAATTGTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	12162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892_11107_11206
727163	contig_14362_pilon	-	1456	5	Intergenic	novelGene_142523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.5058227707785	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	154	516	40212	38011	TRUE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPAASLAACSAAARPDPQVGTAERLGPGFSTRTSAAPRCCLLLRGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPDTDTGRRDIP	45443	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37729_37855_38043_39772_39948_40056_40233_45310
727166	contig_10235_pilon	+	1911	10	Intergenic	novelGene_46582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	53.9583744458588	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	533	979	567711	571582	TRUE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSRRGETSGVS	565822	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566051_567165_567362_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_571554_571628_581262_581318_581506
727172	contig_10689_pilon	+	899	4	Intergenic	novelGene_118628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1733.91759383836	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	78	416	57608	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRQQRQLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51284	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57673_58272_58374_60928
727173	contig_9708_pilon	+	2554	10	Intergenic	novelGene_67268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	129.843020130245	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	232	1263	783184	803598	FALSE	55	ATGAAAATAAATGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH	768036	804889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_783107_783283_783618_783721_784067_784166_785039_785164_795496_795648_797313_797397_797867_797973_798891_799022_803458
727177	contig_16685_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_115067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAGGAGGTAGTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621888	619537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_619993_620081
727180	contig_7408_pilon	+	1804	9	Intergenic	novelGene_168745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGGACTACCTCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12569	48266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_13227_24281_24445_26364_26456_26932_27156_36881_36936_38373_38596_47312_47360_47829_48042_48131
727186	contig_2201_pilon	+	1974	3	Intergenic	novelGene_168762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	52.5	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGGTGATCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46958	55173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_47053_48088_48207_53411
727188	contig_15327_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_70836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGAGGATGTCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643339	1642058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1642100_1643300
727191	SIRV7	-	222	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146697	1	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
727192	SIRV7	-	369	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-31	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114769	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
727194	contig_7410_pilon	+	2156	7	Intergenic	novelGene_106125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_3	66.904575495419	124	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	441	1154	638686	648710	FALSE	15	TTCTTTCTTCAACTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRDTPELVAYPLPQASSSYMHGGNPSGSVVMVSGLHQLKMNCSRVFNLFCLYGNIEKVKFMKTIPGTALVEMGDEYAVERAVTHLNNVKLFGKRLNVCVSKQHSVVPSQIFELEDGTSSYKDFAMSKNNRFTSAGQASKNIIQPPSCVLHYYNVPLCVTEETFTKLCNDHEVLTFIKYKVFDAKPSAKTLSGLLEWECKTDAVEALTALNHYQIRVPNGSNPYTLKLCFSTSSHL	633416	649712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_633816_638644_638863_641517_641640_642130_642333_642997_643056_643148_643248_648654
727195	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
727196	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727199	contig_12270_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_114136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGGGGTCCCTGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
727201	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727202	contig_8616_pilon	+	2083	11	Intergenic	novelGene_72472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_3	555.519180586953	17	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	362	1372	320431	330137	TRUE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVRGRDPFSSLLVTLL	318047	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330546_330638_330720_330850
727206	contig_15744_pilon	+	568	3	Intergenic	novelGene_83611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_1	733.5	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	41	355	152344	153378	FALSE	5	AGTTGTGTCTGTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	152303	153591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_152353_152532_152706_153245
727209	contig_11427_pilon	+	1535	3	Intergenic	novelGene_78968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	7.5	341	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	447	1484	93223	94260	FALSE	15	CATTGTTTCGTGTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92245	94311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_92733_92898_93210
727212	contig_5050_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_110280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGGAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540146	541792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_540100_541800
727213	SIRV1	+	724	3	NNC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-9478	-965	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACACCTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104	10641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_+_1485_7552_7808_10552
727215	contig_14300_pilon	-	1561	4	Intergenic	novelGene_133142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	79.7036176510619	257	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	16	795	442548	429690	FALSE	25	AGACAGGTGGGCAGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALESLLDEVALEGLDGLCLPALWSRLETRVPPFPLPLEPYTREFLWRALTTHPGISFYEEPRERPDLQLQDRYEEIDFETGILESKRDPVPLEDVYPIHMILENKDGIQGSCRYFKERKNITNEVRTKSLQPRCTMVEAFGRWGKKLIIVASQDMRYRALIGSEGDPDLKLPDFSYCILERLGRSRWEGELQRDLHSTAFKVDAGKLHYHRKILNKNRLITMQSHVIRLPSGAQQHSILLLLNRFHVDRYSVYRRKH	442563	428923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_429862_430487_430665_435728_435939_442327
727219	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727225	contig_9333_pilon	-	1995	23	Intergenic	novelGene_120317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_5	142.863347120293	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	5	1942	142532	106415	FALSE	20	TGAGCTTTTGAATGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAFSEMGVMPEIAQAVEEMDWLLPTDIQAESIPLILGGGDVLMAAETGSGKTGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGKKGKTTIKTGASVLNKWQMNPYDRGSAFAIGSDGLCCQSREVKEWHGCRATRGLMKGKHYYEVSCHDQGLCRVGWSTMQASLDLGTDKFGFGFGGTGKKSHNKQFDNYGEEFTMHDTIGCYLDIDKGHIKFSKNGKDLGLAFEIPSHIKNQALFPACVLKNAELKFNFGEEEFKFPPKDGFVALAKAPESYVTKSQHTGSAQVAQTKFLPNAPKALIVEPSRELAEQTLNNVKQFKKYIDNPKLRELLIIGGVAARDQLSVLDNGVDIVVGTPGRLDDLVSTGKLNLSQVRFLVLDEADGLLSQGYSDFINRIHNQIPQITSDGKRLQVIVCSATLHSFDVKKLSEKIMHFPTWVDLKGEDSVPDTVHHVVVPVNPKTDRLWERLGKNHIRTDEVHAKDNTRPGANSLEMWSEAIKILKGEYAVRAIKEHKMDQAIIFCRTKIDCDNLEQYFMQQGGGPDKKGHQFSCVCLHGDRKPHERKQNLERFKKGDVRFLICTDVAARGIDIHGVPYVINVTLPDEKQNYVHRIGRVGRAERMGLAISLVATEKEKVIFSVLCYIQCVCCDFRCWK	142536	106361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_106521_106609_106683_106810_106884_108397_108490_112879_113027_114559_114612_115519_115709_116456_116547_117376_117476_120058_120120_125727_125867_126620_126736_126871_126949_128788_128862_131045_131123_131655_131740_131961_132046_133811_133860_136925_137023_137591_137622_138606_138671_139421_139474_142516
727234	contig_9582_pilon	+	1093	8	Intergenic	novelGene_106846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_4	59.6989043758214	456	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	31	936	560104	574096	TRUE	5	TGCTTCTTGTTCACCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDVKVCEYCKRSVACAHFALHEAHCLRFLVICPECGEPIPESKMEEHFENSHKEVERAKCRQNMQKHLLEVHETKECQMRQVKCKFCELAMDFSKQEIHEYHCGSRTELCPDCNQYILLRELASHKDACQGEQAQPSKGERMSAPVGKINCNSCNQMIPINKYAHHMDECCPVSEFAKLSPFEKPRNAPLSLPSLFAVDQTSTAQKDVRPKTKSINRFPLLSENSTKKAPTGKKKPLDLPLTSELKPRTTSPTGDEATYDILRKCSRCDILLPLPILNRHQEKCRWLASRKGKYMRNFS	560073	574409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_560136_560762_560899_565448_565506_565875_566072_567248_567335_571076_571419_574039_574116_574271
727236	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
727237	contig_13453_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_146728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGTTATTTCATGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178302	176248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_176200_178300
727238	contig_6589_pilon	+	916	6	Intergenic	novelGene_25795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2179.03516263506	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	208	609	669670	671366	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTTQGPLEMSPGATCLPEELMGVVVFSD	668577	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668670_669554_669748_670000_670104_671046_671188_671286_671412_672584
727245	contig_5018_pilon	-	2365	13	Intergenic	novelGene_46953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	80.8769212376985	1	85	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	98	1804	315580	301750	FALSE	35	GTGGGGCAAGAAGTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTPPQLPEVLECAVTLPWDLPPRPTFPGSPGPMQCYRIGLLGDLNCSWEPLGDSRTPSTLHFQSQKYHLNRTQVVAVPTGQSWVTIPREQFTEFDTLLVWGAEADGPLWPPISVDLETRASPVKLDAPRLCPDINFSEDDPLETTVHWAPPTLRPHQKDMVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	315677	301188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312675_312747_312906_315476
727254	contig_5125_pilon	+	1612	2	Intergenic	novelGene_43477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTATTCTCAGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98733	115223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_98938_113815
727255	contig_5125_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_43478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATGAATGAATTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115282	115829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_115300_115800
727256	contig_9366_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_166248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880981	879458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_879500_881000
727258	contig_20951_pilon	+	2302	4	Intergenic	novelGene_43129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.24933858267454	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTAATTTCACTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286845	302745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286955_289624_289758_297989_298155_300850
727262	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727263	contig_6710_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_97760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAGCATCAGCCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653399	653866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
727269	contig_6674_pilon	+	3431	1	Intergenic	novelGene_148016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTCAGCAGAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226497	229928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_226500_229900
727274	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727277	SIRV6	+	439	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	122	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCACAAAGAAATTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3187_10784_10819_11031
727282	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	1	1159	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
727285	contig_3747_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_24967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204191	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204200_205200
727286	contig_3721_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_123839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1357	1746	363061	363450	NA	35	AAGGGCCAAAGGAGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSQPPEQDHVWGGHWQSLVSGFTVMKSAPPPPPQSNVRFSVEDLPRSQGPSSMMWLSPHLCILSFLEKVWLWNGRGLLSYDPGLVGVWHICSASGREHLGVGVARESRSRHGEREDFCNPDQLALSI	361704	363751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_361700_363800
727287	contig_5988_pilon	-	1604	4	Intergenic	novelGene_15914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.91395240807	6	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	533	1429	652858	651962	FALSE	5	GTTTTTGACTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655554	651786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653400_653549_653773_655456
727292	contig_500_pilon	+	2002	10	Intergenic	novelGene_31126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	47.2866227527197	242	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	23	883	1740213	1774828	FALSE	25	ATACTCCACGTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLRARGAVSVGGLLQRVSPCSLLPGLRGLTSSSVRPGEDSWLKSLFVRKVDPRKDAHSNLLAKKETSSLYKLQFHNVKPEYLEAYNKICQEVLPKIHEDKHYPCTLVGTWNTWYGEQDQAVHLWRYEGGYPALTEVMNKLRESQEFAEFRKARSDMLLSRKNQLLLEFSFWNEPVPRSGPNIYELRSYQLRPGTMIEWGNYWARAIRFRQDGNEAVGGFFSQIGQLYMVHHLWAYKDLQTREDIRNGVWHKHGWEELVYYTVPLIQEMESRIMIPLKTSPLQ	1740190	1775947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1740305_1755485_1755626_1755708_1755755_1758980_1759076_1759406_1759478_1760559_1760701_1761554_1761587_1771929_1772025_1772907_1772992_1774763
727297	contig_1443_pilon	+	1574	14	Intergenic	novelGene_28243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	60.3921112446958	368	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	521	1432	538016	541708	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535998	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
727301	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727302	contig_6361_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_23941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAGAAAATGGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345395	346461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_345400_346500
727316	scaffold_2602_pilon	+	2506	2	Intergenic	novelGene_127705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1264	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	519	863	65360	68818	FALSE	25	AACCTGGATTCTAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	64841	70461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_65480_68593
727318	contig_6589_pilon	-	967	10	Intergenic	novelGene_25908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.40420110824	4	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	594	965	1160565	1158488	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTSLPRTLPPRTQTTRSPPPIITCLSSAAPDHPQVPIKTTCSQ	1178553	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158612_1158709_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177976_1178079_1178424
727320	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727321	contig_7157_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_131281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830336	832736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_830300_832700
727323	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCGTCAACCGCCAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
727331	contig_6364_pilon	-	1927	12	Intergenic	novelGene_51823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	6.27338599966768	235	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	150	1142	1591470	1586979	FALSE	45	TAAGTGCTTCAAAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRSVLHSGYFHPLLRTWQVATTTLNASNLIYPIFVTDVPDDVQPIASLPGVARYGVNRLEEMLKPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEDSPAIEAIRLLRKTFPSLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSENGVFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVIAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1596998	1586193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1588844_1588934_1589040_1589125_1589244_1589381_1589757_1589855_1590376_1590428_1591357_1591545_1596923
727332	contig_16411_pilon	+	1678	5	Intergenic	novelGene_77394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.67340285895511	5	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTATCGTTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406233	418219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_406252_408215_408350_409801_409866_414404_414519_416871
727333	contig_1331_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_37826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAACAAATACCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159248	160214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_159200_160200
727334	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
727335	contig_4339_pilon	-	1296	11	Intergenic	novelGene_146071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_10	72.8731088948454	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	325	1182	1001161	976186	FALSE	25	TATATTGAGTGTGTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPDSFQGKVAFITGGGTGLGKGMTTVLSSLGAQCVIASRNIDVLKATAEEISSQTGNKVHAIQCDVRDPDMVQNTVSELIKVTGHPDVVINNAAGNFISPTERLSPNAWKTITGIVLNGTAFVTLEIGKQLIKAQKGAAFLAITTIYAETGTGFLVPSSSAKAGVEAMYKSLAAEWATYGMRFNIIQPGTIKTKGAFSRLDPTGAFEKEMIHKIPCGRLGTVEEIANLAAFMCSDYASWINGAVIRFDGGEEAFISGQMNSLTKVTKEQWDTIEGLIRKTKGS	1027171	976071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_976246_976346_976410_976832_976980_979232_979306_984376_984477_995831_995980_997153_997241_997359_997418_1001039_1001243_1001382_1001527_1027072
727336	contig_5649_pilon	-	2349	4	Intergenic	novelGene_82393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	40.4337592722825	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1022	1480	1146909	1146451	FALSE	10	CCTGCTTTTGTTCCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIGLPVLQTHAIHFHFGAFAWSIPDTQNALPIISICPTPPALQGIAQPKQPVIKFHFFNFPWPFAHLNSPDHHLPRILRIWGLVLQPHWLNQASQLGNSCLCASSTEHRAWLKGRAQQVAVEWNSKSNVLPPSLSKIQTRGHLERGQLGQL	1190260	1145581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1147354_1149612_1149737_1151999_1152237_1190044
727337	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4920	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727338	contig_4732_pilon	-	2037	14	Intergenic	novelGene_75476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	336.26898221865	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	34	738	720167	704529	TRUE	45	CAGAAGGCAATAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEEGRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFPKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLQAVNMDPDQYQMGGTKVFIKNPESLFLLEEMRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEASNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFA	720200	700630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_701063_701993_702164_702247_702444_703044_703129_703544_703694_703910_704058_704407_704532_706237_706375_706555_706671_712566_712712_712811_712911_713353_713461_715492_715575_720150
727343	contig_5499_pilon	+	2096	11	Intergenic	novelGene_57010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	268.542007887034	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	146	1183	816585	840037	TRUE	35	ATTATATAGCCATGTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803407	841053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
727351	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	6	338	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14414	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
727352	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_89548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653764	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
727353	contig_10159_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_30824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515897	513936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_513900_515900
727354	contig_12425_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_46705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTACTTACAAATTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224116	222973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_223000_224100
727356	contig_12540_pilon	-	2211	6	Intergenic	novelGene_148088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	169	678	966536	965286	TRUE	90	AAAAAAGAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYGFSLQLCIQGGTLFPAVLLVFQKVFLLLWACPSGSFSESTLFLIGLDVLVLEFHMLQAPLPSRLALLAAAGGFLVIFSWQFLGRGGLLWNWGLCLWVGDHCGGPITGLWLRLRHGQGLRDLRRHVPKLLLPTGLLSGFPCGKLCLSFLFFCLPLLQDHLAEAFALQVAPAEALQADDALSPVPVGPPLQVAPPCGLKEHGCLCPLQRPPDSVGTPAGLGGQRV	966704	957763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_958769_960891_960973_961435_961552_963672_963792_965073_965472_966212
727357	contig_2113_pilon	-	3475	3	Intergenic	novelGene_161155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTCTAGCCGGTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513508	505634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_505839_508530_508621_510327
727359	contig_15066_pilon	-	1298	11	Intergenic	novelGene_149547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_10	150.8852544154	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	61	1155	114591	111830	FALSE	10	TTCAAGGTCTCTTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114651	111686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114541
727360	contig_9363_pilon	-	1571	11	Intergenic	novelGene_6655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	92.2143698129527	454	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	419	1315	1014186	1009478	TRUE	15	CTTGGAGAGTCCCCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDRTHELRQGDDSSDDEDKERIALVVQPGPARRESPDDEFFQKVRTIRQTIVKLESKVRELEKQQVTILATPLPEESMKQDLQNLREEIKQLGREIHTQLKAIEPQKEEADENCNSVNTRMRKTQHGILSQQFVELINKCNSMQSEYREKNVERIRRQLKITNAGMVSDEELEQMLDSGQSEVFVSNILKDTQVTRQALNEISARHSEIQQLERSIRELHEIFTFLATEVEMQGEMINRIEKNILSSVDYVERGQEHVKTALEYQKKARKKKILIAICVSVTVLILCVIIGITIAVG	1014604	1009115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009359_1009464_1009562_1009641_1009753_1010764_1010903_1011144_1011222_1011305_1011415_1012877_1012949_1013457_1013533_1013669_1013770_1013887_1013990_1014156
727361	contig_2069_pilon	-	1151	3	Intergenic	novelGene_23501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	469	16	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509846	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509554_1509754
727362	contig_3975_pilon	+	2282	2	Intergenic	novelGene_54946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTTGGATTTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2347142	2356552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2347150_2354277
727368	contig_10042_pilon	+	2287	12	Intergenic	novelGene_79195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.9820320218902	1	101	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	574	1284	1066614	1090129	FALSE	20	GAGGTATATTCTTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028284	1091132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1028652_1054143_1054199_1059991_1060080_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
727371	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727372	contig_14638_pilon	-	1750	5	Intergenic	novelGene_71572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	140.166641894568	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	42	335	277550	254173	FALSE	10	CTGTTCTGAAGTGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVS	277696	252757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254177_258234_258365_262339_262459_277509_277556_277660
727373	contig_14566_pilon	+	698	5	Intergenic	novelGene_148843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	361.353704837795	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	284	697	99217	125249	FALSE	30	GTAAGCATCTCAGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESVPYTLIMNCQHPKEINRNIT	90670	125250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_90937_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
727375	contig_8291_pilon	+	2354	9	Intergenic	novelGene_99969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_4	14.7287983216554	120	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	85	1200	821452	835129	FALSE	0	GCTTGTCTGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKNLRVKNFKKFSYVKLISMETSSSSDDSCDSFASDNFANTRLQADQEGCRTRSQCRRSGPLRVAMTFPTRNARTAAKKKAIPPQSSENSVTDASSDSEDEKGMNFLEKRALNIKQNKAMLAKLMSELESFPGSFPGRRSLPVPSSQSKTPRRRTFPGVASRRNPERKARPLTRSRSRILGFPGALPTEEEEEEEEEEEEEDKYLLVRKRKVMDDYMNEDDMPRNRRPGPMTLPHVIRPVEEITEEELENICSNSREKIYNRSLGSTCHQCRQKTIDTKTNCRNPECWGVRGQFCGPCLRNRYGEEVKDALLDPNWHCPPCRGICNCSFCRQRDGRCATGVLVYLAKYHGFGNVHAYLKSLKQEFEMQA	821367	836283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_821458_824596_824720_827973_828211_828550_828629_829510_829727_830112_830251_830831_830982_834627_834765_835098
727376	contig_7775_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_37473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAAGTGAGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106546	108601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_106500_108600
727378	contig_13702_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_102602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTTATTTATGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94504	91919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_91900_94500
727379	contig_12837_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_57341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGTGTACTTTAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178702	177869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_177900_178700
727381	contig_10982_pilon	+	1591	9	Intergenic	novelGene_87877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	239.911963019771	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	240	1172	145192	201769	TRUE	25	ATTATGTATACTTGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	141988	202260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_145185_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624_201906_201977
727382	SIRV6	+	559	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
727391	contig_12786_pilon	-	1583	8	Intergenic	novelGene_103397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_7	527.441804508191	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	305	1297	614067	592872	TRUE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGEMDGGVFTEVLLIQGASTNPRNHGSVFLLWCFHDMVLLPSVTMVGHNGLFMSGQELGGPHLPLSRVWCEVGAHVMCVLRVPRSQVSVSSCVLQVKAAWMVLSAHTRKRTSRST	629490	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_629303
727392	contig_11829_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_128149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATACTTAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249715	251337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_249700_251300
727397	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
727402	contig_5023_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_7387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1482	1832	644560	644910	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPKCSHPICEYPWICRGSGGVQSQSLYHVGNSCHLLFNWATCRMMTTEPRFGKLQSMSPAWPVVCCCRYSFTETQPSLFLCFLWLLTYYRQSWVVSTKPKKLKILTVWSYKSTS	643078	645302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_643100_645300
727408	contig_17976_pilon	-	1536	3	Intergenic	novelGene_32506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGACAGTCACCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47726	41661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41853_45522_45583_46441
727416	contig_6589_pilon	-	911	10	Intergenic	novelGene_25891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.201598618378	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	60	797	1178015	1158600	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFA	1178074	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158606_1158714_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
727420	contig_12142_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_147830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTCCATTTGGGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165751	164749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_164700_165800
727424	contig_14333_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_49114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAAGAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378527	377899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_377900_378500
727426	contig_1861_pilon	-	1882	14	Intergenic	novelGene_77649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	131.66381791041	2	89	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	840	1721	97085	87440	FALSE	25	GGCTGGAGTTGGCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115208	87278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_101645_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112570_115112
727427	contig_14209_pilon	+	1164	6	Intergenic	novelGene_88351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	270.786705729805	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	494	871	35270	37768	TRUE	25	CTCCTTGTGGCAATAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGGHCETISRSQPPAGGGTTTTTSYSGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	34776	40981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_35355_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38020_40841
727429	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727431	contig_11512_pilon	+	1327	9	Intergenic	novelGene_43320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	16.161296358894	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	51	1199	406267	471553	FALSE	30	CAGTAAAGCATTGGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALMRKLTLGEAKRLAKQPSRMLTQAQGGSALSPAAIISQERAQQQATALAKEVDCPTSPSQDLVSCLRQKPASVLNDAQTKLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	406216	471681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_406278_407490_407561_434415_434581_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
727432	contig_11538_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_152304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTTGTCCTTAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232742	230754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_230800_232700
727433	contig_11538_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_152303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230701	230404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_230400_230700
727435	contig_6710_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_95801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653689	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
727440	contig_20844_pilon	-	588	5	Intergenic	novelGene_78595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_1	103.137044751147	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	47	478	206656	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	206702	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592
727441	scaffold_7386_pilon	-	1410	11	Intergenic	novelGene_136587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	54.5205465856681	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	73	1146	309042	296776	FALSE	5	GGGAGCCTCTCTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLAGNRKHAAAAAAGWLVSKEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKPPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEIQPGPSESSTAYLLMYRRESLGPTRV	309114	296511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_296783_297337_297386_297863_297890_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308864
727442	contig_5145_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_131457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAATGTGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949907	948699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_948700_949900
727443	contig_9389_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_83856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	413	junction_2	651.997843171279	2486	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	376	1146	9677	12342	FALSE	15	TCCAGTCTGCCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDTAVRLVALALLGAAVCAAQPRGRILGGREAEPHARPYMASVQVNGAHVCGGFLVAEQWVLSAAHCLEDAAGGKVQVLLGAHSLSQPEPSKRLYDVRRAVPHPDSRPETIDHDLLLLQLSEKAVLGPAVRPLTWQREDRDVAPGTLCEVAGWGVVRHTGRRPDRLQYVSVPVLDRATCNLRTYHDGAITERMMCAESKSRDSCKGDSGGPLVCGGVAEGVVTSGLRVCGNRKKPGIYTRTASYVAWIDGVMAEG	9301	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9735_10655_10813_10913_11059_11303_11562_12189
727444	contig_11986_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_69182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	533	1015	575000	575482	NA	60	AAAAAAAACCAAACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGEAPRPPFQRLDNPPAECPLPGRLRAGNHRSDYLIAGTCLISTCLDFLDFSSPLPDLPLLRTASLSYSFSPFIPVQETNNRGQMCQLAPWTRFPAAGTCDAVLGKRPVGRITHHSFTILGPGVRGGETLGLAGCTSTPIRTWPPTLTATPVFRGQHL	574467	576108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_574500_576100
727448	contig_1154_pilon	-	445	2	Intergenic	novelGene_87181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAATACGTGAGAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958061	957039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_957359_957935
727453	contig_5590_pilon	+	2333	2	Intergenic	novelGene_163054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTTCACGTAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452870	456451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_454518_455765
727456	contig_10734_pilon	+	2540	3	Intergenic	novelGene_51218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	14	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	523	1512	1166253	1172828	FALSE	15	TTACTAGTCTCCCGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGSIPMQASQQKDVFASFLSSNFQTPSMRSGSKRSSSQSSPCSPKKQRKESSSEASPADMELDSDVELAHVSQSSDAFQFQPPLPPGTPPIFTPPLPKGTPPVTPSDSPQTRAASAAMDEDALTLEELEEQQRRIWAALEQAESVNSDSDIPVDTPLTGNSVASSPCPNEPDLPVPEGRPSEKQLPDEAKVPLEAEVPQEAEVPSTCTEKSQVEHSPASPDAEAPLLCQKEKEESAQVDSQGVLLNNGSVMSNCDISNGGSQNLLPPGASPSPATKTHSPIPDMSKFATGITPFEFENMAESTGMYLRIRNLLKNSPRNQQKNKKASE	1165730	1173856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1166331_1166598_1166717_1172034
727457	contig_5945_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_104578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAACTGTTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230250	232307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_230200_232300
727458	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727464	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_93607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
727468	contig_10494_pilon	-	1758	6	Intergenic	novelGene_102175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	34.8849537766642	357	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	36	749	958457	952197	FALSE	25	GCCAAACTTGATCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAAAAGLAPGMAMFRSLVASAQQRQPPAGPTGGDSGLEAQYSCPICLEVYHRPVAIGSCGHTFCGECLQPCLQVPSPLCPLCRLPFDPKKVDKATHVEKQLSSYKAPCRGCNKKVALAKMRVHVSSCVKVQEQMANCPKFVPVVPTSQPIPSNIPNRSTFTCPYCGARNLDQQELVKHCVENHRSDPNRVVCPICSAMPWGDPSYKSANFLQHLLHRHKFSYDTFVDYSIDEEAAFQAALALSLSEN	958492	951187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_952263_953261_953370_953625_953741_954312_954426_955940_956098_958302
727471	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727474	contig_8196_pilon	+	2105	6	Intergenic	novelGene_168770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_5	13.3026313186527	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	26	1123	529504	537438	FALSE	10	GTAATGGCTTCTTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEDCKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQQQLQADSFKAKQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEELDREKKLKEDSPRKTPNKESGVSGLPVSLTSIKEEPKEAKRPDSQSMEENKLKNDDRKTPVNWKDSRGTRVAVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSPGFHYPVYGKMSGREEAEKVNTSPSINTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKGTTEREREAESERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGMGYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQASASGMFPAQRRE	529478	538420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_+_529768_531532_531951_532534_532708_534880_535035_536768_536851_537431
727475	contig_11512_pilon	+	316	2	Intergenic	novelGene_43248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	1	315	4020	4557	FALSE	15	GTGCTTATGCTGCTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	4019	4558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
727480	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727483	contig_14744_pilon	-	922	3	Intergenic	novelGene_66021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	607.5	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	153	662	969897	968300	TRUE	30	CTTATAGGATATCTGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	970049	967899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_967997_968136_968630_969717
727487	SIRV6	+	432	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	530	0	351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727491	contig_7286_pilon	-	817	6	Intergenic	novelGene_108675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3662.83472736622	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	12	749	292049	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292060	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022
727495	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_96596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
727496	contig_7165_pilon	-	2358	1	Intergenic	novelGene_116853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327569	325211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_325200_327600
727501	contig_5791_pilon	+	2468	11	Intergenic	novelGene_35818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	47.5542847701445	108	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	101	1507	748885	761894	TRUE	35	AATTGTGGCTTGTAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDAVSFQVPNRGGLYPEKQRGKPAEVVLEEKAMLSLKMLTLLLLLHMQLSMAFPVPAEPPEEKNTKIVQNYLEKFYQLPRTQFKSERKNSASVVVEKLKVMQLFFGLNATGKPDAETLEIMQKPRCGVPDGGGFMVTPGNPKWKHMNVTYRIRNYPSDLAKAEVEKAIKKAFKVWSRVSPLSFTKISERKADIEISFLVRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQPGPGIGGDAHFDAEEKWTNTYENYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPTYAYRDPNTYLLSQDDINGIQAIYGSSSDPIQPTGPSTPIACDPRLAFDAITTLRGEIFFFKDKYFWRRHPQLRIVRLNFISLFWPSLSNGIQAAYEDYDRDMIFLFKGRRYWAVSGYTIQQGYPRDISNYGFPRSVQAIDAAVSYSGKTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSIASTFQGIQSRVDAVFHQDHFFLFFSGPIYYAFNLNARRVTRIDRSNKWLNCR	748784	763233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_748996_751281_751527_752586_752736_752822_752949_755401_755564_758438_758557_759546_759681_760646_760801_761524_761629_761790_762356_762733
727502	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727509	contig_6589_pilon	+	1179	10	Intergenic	novelGene_26218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	162.081445766406	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	43	1047	2048791	2059909	FALSE	30	ATAAATCCTCAGCTGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTATWTSPSTWTSRASFASCPAPPTTGCAEGWPAAPRGPGLRCS	2048748	2060041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058210_2059779
727513	contig_5467_pilon	+	1300	4	Intergenic	novelGene_111946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1441	junction_3	193.165444344709	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	167	505	21047	21610	FALSE	20	TGTGTTGAAACCTGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICDPSYIPERVRKAGQVIRIICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISYAHNVAAQGKYIAIASTTVETSEPEKEIEPALELLEPIDQKFVAISDLYEPIDDGSESQVFCSCSYDATTHFETTCNDIKDIYKRMVGSAFDFENMKRKQNDVFGEADQ	20643	22405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_20796_21032_21178_21312_21368_21457
727525	contig_10500_pilon	-	2220	4	Intergenic	novelGene_41168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	97.7218274264023	54	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	87	524	1290675	1282847	FALSE	20	TTTTTTCGCTCAGCATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSKADVERYIASVQGSAPSPREKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLYELEENIDKAVECYKRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPTIYKLKVKKFIKQYLL	1290761	1281150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1283033_1283520_1283633_1284886_1284955_1290603
727526	contig_6871_pilon	+	756	2	Intergenic	novelGene_21627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1200	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	349	690	626628	626969	FALSE	0	TCCCCCGTCTGGCCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGMRPLPPGLVGCLNRTVEGAKSGLQTLPCQRVRQREVGLEPEHRPGEGPSTSLPTPMGSLLLRKAVGACALSQGPEGGGEVTDPVFCLLAPQPPARVIIGNFHLKIFVSKV	626184	627035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_626264_626358
727532	contig_8616_pilon	-	1058	4	Intergenic	novelGene_72432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	455.444349570346	2388	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	35	634	255468	253726	FALSE	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQGSFSGRCPLYGVAALNGSSLALSRPSAPSLCYFVAGVSGLLALYCLLLLLFWVYSSCIEDSHRGPIGLRIALAISAIAIFLVLVTACILRFGTRSLCNSIISLNITSSCPEAQKISWTPPGTAVQFYSNLHNAEVRPWDMKGLGRSRDTLDISVCSQGCCEQLRRSC	255502	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254491_255372
727554	contig_1091_pilon	-	2920	16	Intergenic	novelGene_168771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	38.9109524712801	94	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	110	2437	549296	474139	FALSE	35	ATATCATTTAAATAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSAAEPGVMYLTMLDLYKSMNEIKEEKVCSTTVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVREDAQKGVVVQGLTLHQPKSSEEILQLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQEKTASINQSVRIAKMSLIDLAGSERASATSAQGIHFREGTNINQSLLALGNVINALADAKRKNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSMFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLKSNVLSLNNHITQYVKICNEQKKEILMLKEKLKAYEEQKTFADENSKAKLMMSNPQEKEIKRFQENLNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKTYHEQQCHKQIEMISSEDKVEKATCKRDHRLAMLKNRRCYLEKKKEEELKQFDENTNWLHRVENEISLLDENGHIPKELDKDLQYHHLYLQTKDLKAQIEHMMDLANLQEQQYRQTEIVLNALLPAFKKQYCALKEAGLSNAAFESDFKVIQHLVERKKMVAWADQTTEYPKQKDLPGVSVLMTFPQLGPVQSTCCTSSSESNPLMIPPQKRTRRKLMPSPLEAKLNQKSILSESIQLNDSFSKELQPIIYTPEDCRKTFQTLPTETLIKPSSHTMSFQAISSNINSNNSLKMLCEVDTPFSRRTECGQADLDSTFTICEGTRGLKSELPEKESLPNHNNNILQRLDPSSLSTKHSMPIPSIVPSYMAMTAAAKRKRKLTSSEPNTSLTASVNSGLAKRVRQDNSSNKHLQENRSTVEYKRKNHKINSSLVRKFGRSISKGNLR	580024	473655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_474222_476521_476632_484526_484635_485387_485836_517491_517725_521170_521293_523991_524157_532585_532749_537437_537551_537771_537847_539404_539582_543378_543577_545570_545682_546161_546267_549179_549338_579956
727560	contig_990_pilon	+	1953	7	Intergenic	novelGene_76049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	63.5260226643818	8	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	127	963	880846	893441	FALSE	25	TGCTTTTGTTCCAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQKSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELEVHYWTSRFLIVNAMLLSVLELFSVWRIWSRSELK	870487	895956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887107_893330_893442_894966
727561	contig_3627_pilon	+	2219	10	Intergenic	novelGene_78573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42.2637222949212	7	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	233	1912	1315509	1343837	FALSE	20	GTCATTCTCTTAACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEICLWYVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKREYASDLSPPRKKPAKSHFRNKQHDSKGSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313494	1344144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315533_1319935_1320021_1322849_1323504_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
727572	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727573	contig_20753_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_168249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAATTGTGTAGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37490	38355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_+_37500_38400
727574	contig_6048_pilon	-	3283	3	Intergenic	novelGene_73321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	2	8	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	15	323	2122086	2120028	TRUE	45	AAACAAGCAGACATTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAASGPGCRSWRLCPEVPSATFFTALLSLLVSGPRLFLLQPPLPPSGLSLRSEALRNWQATMEGEVRITARRLAHRVLSDSPTQSTLKLLQLINPQTSL	2122100	2116724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2119684_2120026_2120150_2121899
727575	SIRV6	+	556	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727579	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_96340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
727583	contig_18869_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_56335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73570	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
727585	contig_6710_pilon	+	571	2	Intergenic	novelGene_92391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTCCAAGAGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
727587	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
727590	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727595	contig_16870_pilon	+	256	2	Intergenic	novelGene_155510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGCTCCCGTCCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131745	132662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_131891_132551
727599	contig_4732_pilon	-	2243	6	Intergenic	novelGene_75370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	71.1910106684826	203	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	89	1069	220673	189646	FALSE	5	TGCTCGAGTTTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGYEDHMAEDCRDDIGRTNLIVNYLPQNMTQDELRSLFSSIGEVESAKLIRDKVAGHSLGYGFVNYVTAKDAERAINTLNGLRLQSKTIKVSYARPSSEVIKDANLYISGLPRTMTQKDVEDMFSRFGRIINSRVLVDQTTGLSRGVAFIRFDKRSEAEEAITSFNGHKPPGSSEPITVKFAANPNQNKNVALLSQLYHSPARRFGGPVHHQAQRFRFSPMGVDHMSGLSGVNVPGNASSGWCIFIYNLGQDADEGILWQMFGPFGAVTNVKVIRDFNTNKCKGFGFVTMTNYEEAAMAIASLNGYRLGDKILQVSFKTNKSHK	235857	188471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_189971_192932_193159_197865_198020_206268_206373_220501_220692_235787
727600	contig_8652_pilon	+	1432	8	Intergenic	novelGene_168786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	17.4823526180324	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	89	916	663643	676543	FALSE	20	TCACCCATGAGTACTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRHPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQFMDSSLVKSYLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSVKAYRTNSFS	660291	677059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_+_660355_663617_663680_668244_668402_669271_669396_670555_670727_671699_671864_671986_672129_676510
727601	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727608	contig_7356_pilon	+	1634	9	Intergenic	novelGene_60418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAATTAAGAGCTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478694	487754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_479145_479854_479948_480030_480083_482348_482528_483360_483436_483606_483721_484518_484608_485069_485173_487275
727610	contig_6296_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_168790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAATGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239529	240885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_+_239500_240900
727614	contig_9363_pilon	+	1827	10	Intergenic	novelGene_6643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTGACGCCAGAATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939820	949601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_940478_940670_940821_940912_941005_941102_941247_942987_943077_943832_944001_944093_944147_947708_947887_947965_948041_949380
727621	contig_5236_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_100907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCACCACTCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181469	182869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_181500_182900
727622	contig_9578_pilon	+	1659	7	Intergenic	novelGene_68003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	122.622387841699	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	491	904	1319409	1321498	TRUE	25	CAGACATGTGTGAAGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKMII	1309318	1327260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1309462_1317336_1317594_1318288_1318359_1319388_1319811_1321486_1321545_1324878_1325043_1326715
727625	contig_12123_pilon	+	2666	2	Intergenic	novelGene_144603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTGTCCCAGCAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123648	126513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_124542_124740
727627	contig_2453_pilon	+	2091	10	Intergenic	novelGene_147767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	63.7624836482053	2	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1289	1951	60643	62827	TRUE	5	TGGGTTTATTGCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELPLPTSGKYHGPDNVCFFSFCDVRVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	56513	63158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56588_57069_57423_58044_58354_58464_58512_59355_59496_60185_60266_60357_60786_61900_62016_62422_62836_63026
727629	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
727630	contig_9940_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_125346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGCAACAAGGAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148188	145877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_145900_148200
727634	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
727636	SIRV5	+	454	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	875	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
727637	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
727638	contig_12257_pilon	+	1997	5	Intergenic	novelGene_152103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	64.9326574229024	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	101	1873	151413	158899	FALSE	35	GAAACCGTTCTATAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPVPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLKLPRWRK	148851	159023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_151405_152947_156678_156787_157405_157514_158876
727641	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3143_10721_10819_11031_11109_11205
727647	contig_16831_pilon	+	1697	7	Intergenic	novelGene_134783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	81.6164811787423	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	100	546	20751	128859	TRUE	35	GTTATATGCATTTTAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLYNSSGRDLRRALFSLKQIFQDDKDLVHEFVMAEGLTCLIKVGAEADQNYQNYILRALGQIMLYVDGMNGVINHNETIQWLYTLIGSKFRLVVKTALKLLLVFVEYSESNAPLLIQAVSAVDTKRGIKPWSNIMEILEEKDGVDTELLVYTMTLVNKPRRSPGRFMRMLLQMEILCSKR	10850	130116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_10920_20720_20827_96149_96245_116899_117012_126176_126272_128790_129427_129532
727648	contig_10734_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_51150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATTTAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917264	916706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_916700_917300
727649	contig_500_pilon	-	2641	1	Intergenic	novelGene_30936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1203582	1200941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1200900_1203600
727654	contig_5643_pilon	+	884	4	Intergenic	novelGene_38969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	729.073536909839	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	37	444	549664	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTDLQCLDSCAMAPSRKFFVGANWKMNGRKKGLGELITTLNAAKVPADTDNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549627	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551805_551892_552142_552231_552357
727655	contig_19352_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_122404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGTGAAGAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290044	291506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_290000_291500
727659	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727661	contig_9363_pilon	-	1723	5	Intergenic	novelGene_6485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	65.3237131522696	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	336	1619	397317	372391	FALSE	5	TGTTTCTGTGGGGACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVLLTAKWKGLLSFEDVAMFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDLPSAGNRKASSSACPGSEARYKMKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	405787	372286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_374687_376997_377125_397284_397367_405501
727669	contig_13894_pilon	+	1192	10	Intergenic	novelGene_62117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2925.02834849616	3	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	23	550	520713	524911	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDEHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIHAPASPAPEESPLDGDPGERRHCG	520690	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522820_523488_523605_524837_524991_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527593_528102
727670	contig_8050_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_114866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAAGGGGATACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408360	406813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_406800_408400
727675	contig_13865_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_122747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTAGCATTGGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67795	70076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_67800_70100
727686	SIRV6	+	434	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	528	0	349	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727687	contig_7045_pilon	-	2233	12	Intergenic	novelGene_77423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	62.047302669778	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2217	16	2232	224324	179791	FALSE	30	GATCAAGTGTTTCAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEAAQRGAELLDFEQFRDSSSPRLPYGYGQRSLRELREREFSRLAGTVYLDHAGATLFPQSQLTSFTNDVLKNVYGNPHSQNINSKLTHDTMEQVRYRVLVHFHTSPDDYTVIFTSGSTAALKLVAEAFPWVPQGPESSGSRFCYLTDSHTSVVGMREITTARNVTSIPVRPEDMWSAETQGAATCDPDGHPPHLFCYPAQSNFSGTRYPLSWIEGIKSGWMCPVNAPGKWFVLLDAASYVSTSPLDLSLHQADFVPISFYKIFGFPTGLGALLVNNRVAPLLRKTYFGGGTAAAYLAGEDFYVPRQSVAERFEDGTISFLGVIALKHGFDTLERLTGGMENIKQHTFTLAQYTYSALSSLRYPNGAPVVRIYSDSEFSSPEVQGPIINFNVLDDQGNIIGYSQVDKMASLYNIQVRTGCFCNTGACQRFLGISNEMVKKNLQAGHVCGDNIDLIDGQPTGSVRISFGYMSMLEDAQAFLRFIIATRLCSSDGQPLPQTLAGEAPAPLAECKALSTLAVVDGHSLSPQEDTSAVWDNFSTTMNAVGLCSPVCEVNGSQQTPSEKAERVLAGGLGPHIVTNLCLYPVKSCAAFEVTRWPIGNQGLLYDRSWMVVNHNGICLSQKQEPRLCLIQPFIDLQQRIMVLKAKGMEPIEVPLEENSERAQICQSKVCADRVNTYDCGEKISRWLSKFFGRQCRLIKQSSNFQRNAKKKHGKDQSPGTTATLSLVNEAQYLLLN	224339	179789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_179856_183823_183949_187607_187687_194935_195099_198622_199073_201082_201200_203944_204145_211406_211484_214792_215435_216586_216654_220741_220832_224182
727693	contig_15034_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_143633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTAATTCTAACTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32126	31788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_31800_32100
727698	contig_7870_pilon	+	1517	6	Intergenic	novelGene_108940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACGACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294408	497931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_295385_370811_370889_402900_403000_441669_441796_496465_496595_497821
727700	contig_854_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_36381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATCAATACAATATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976381	974737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976400
727704	contig_12742_pilon	-	2536	1	Intergenic	novelGene_168795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACATAATATTAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12220	9684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12742_pilon_-_9700_12200
727709	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727713	contig_5816_pilon	-	937	3	Intergenic	novelGene_158252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_1	41	1675	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	237	605	333346	308998	FALSE	10	CTTGGCAGGACTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSSDSSDSSFSRSPPPGKQDSSDDVRKVQRREKNRIAAQKSRQRQTQKADTLHLESEDLEKQNAALRKEIKKLTEEMKYFTSVLNSHEPLCSVLATSVPSPPEVVYTFHQPHVSSPRFQP	333582	308665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_309199_330700_330806_333283
727714	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_96790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
727720	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727727	contig_9848_pilon	+	1440	11	Intergenic	novelGene_79916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	159.498620683691	13	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	479	1180	80009	95315	FALSE	15	GTGGACAGTTTGGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58806	95575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_75091_75162_77678_77721_78015_78135_79874_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
727728	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727733	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
727734	contig_4364_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1288	1590	1013001	1012699	NA	15	CCATAGGGTTTTCTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSAVLRKAQGSSGCTDTEQTWYGCGMDAVGTQYKYQVDSSLLSSPHLMLLSPAIFRQPGLLLPPSSCTHWFHAVPPKVGPSDGFSQKCHDDGENQLKV	1014288	1012294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1012300_1014300
727735	SIRV6	+	211	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	393	-2	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
727736	contig_5988_pilon	-	264	4	Intergenic	novelGene_16060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	27.6445694888204	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGATCTCACTTCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183323	1146260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1146307_1146586_1146668_1149071_1149156_1183270
727737	contig_5988_pilon	-	2645	15	Intergenic	novelGene_16059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	28.0717920732553	122	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	60	1886	1134668	1127245	FALSE	5	GCGTCACGCTGTCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEEHVSHLTEKLLDLENENMMRVAELEKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRLIKEKEEAFQRRCHLEPSARGLESSGNEALARVGPAELSEGMLPSDLDLLAPAPPPEETLPLPPPPAPPLPPPPPPLPDKCPPAPPLPGAAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDLDLDKFEELFKTKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLENVLLDVKELGRGMDLIRRECSLHDNSVLRNFLSANEGKLDKLQRDAKTAEEAYNAVVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREKQLAQEAKKLDAKTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPTIVRHQARSATPPSSSPRAPGPH	1135176	1126485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1127334_1128481_1128606_1128927_1129021_1129351_1129454_1129793_1129955_1130621_1130752_1130847_1130929_1131058_1131128_1131261_1131497_1132027_1132231_1132440_1132566_1132653_1132723_1133360_1133641_1134602_1134705_1135153
727751	contig_6230_pilon	-	2337	10	Intergenic	novelGene_102094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	78.3751661348585	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1001	1564	136521	118618	FALSE	20	TTAGTAAAGTTTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVSNLTRSMSLVLDEFYSSLRVVGVSAVLGTGLDELFVQVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATDSLSPVLDPSDLILTRGTLDEEDEEVDSDTDDIDHRVTEESHEEPAFQNFMQESMAQYWKRSNK	157540	117844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128222_132861_132953_133621_133662_134932_135016_135714_135862_136512_137240_137622_137702_156635_156730_157431
727756	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
727758	contig_2987_pilon	-	1779	6	Intergenic	novelGene_125856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	230.973072023559	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	184	1434	545821	533633	FALSE	10	TTTGTCTGTGCCTTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYAVVLQCLARGLPADSLGDQGRGLEPRDENVQGRCEPGQQPADQSLKQAPRLGLPHPRPSMRLSVRRLLLVAGCALALVLAVQLGQQVLECRAVLAGPRSPRRVMRPEQEELVIVGTNHVEYRYGKAMPLIFVGGVPRSGTTLMRAMLDAHPEVRCGEETRIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQISANGFLLPRREETLHLSGNRTSNPSILLAVNRQNGTANEECICICLQKLNH	593470	533287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_538273_538325_539478_539678_544979_545901_553777_553850_593438
727767	contig_1372_pilon	-	1696	11	Intergenic	novelGene_140519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAAAGCTGCCGGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484976	451718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_452039_457493_457622_465651_465800_467186_467342_467692_467813_469560_469729_470833_471041_471791_471867_483573_483699_483956_483997_484766
727770	contig_854_pilon	-	1617	8	Intergenic	novelGene_36426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	136.594140370931	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	654	1448	1081689	1064774	FALSE	40	AAGGCAAGGTTGAGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPQQLRAESDFEQLPDDIPISANIADIEEKRGFTSHFVFVIEVKTKGGSQVPHLPPLPPVLCLADQAGGAVRAREQDQPLHLQPPHPPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1082342	1064604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070820_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
727773	SIRV4	-	413	4	NNC	SIRV4A	novel	592	4	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22694	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14622	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8332_8766_8991_13672_13823_14592
727780	contig_5643_pilon	+	1206	12	Intergenic	novelGene_38804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2592.16236036236	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	619	996	237196	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGLLRTSSLHLLVLKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236318_236471_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237243_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
727781	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_98091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727789	contig_709_pilon	+	2327	9	Intergenic	novelGene_57633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	26.2773666869418	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	440	862	2691473	2696679	TRUE	70	ATTTGTAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELWFCLLLMKYRRDWPELADGWLSIMKM	2688685	2702312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695626_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
727790	contig_7056_pilon	-	1285	8	Intergenic	novelGene_43733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	769.081349695193	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	377	1102	1176512	1079648	FALSE	20	TACTGTGCTTTTGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPIHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGARMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRHLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLASDSSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTR	1211490	1079464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1079653_1089950_1090156_1094903_1095001_1099856_1099940_1109072_1109145_1146709_1146961_1176499_1176695_1211296
727792	contig_18108_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_33445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63324	65580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_63300_65600
727795	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5307	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727806	contig_13760_pilon	-	2840	7	Intergenic	novelGene_61316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCCGCCTCCACGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206511	201002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_201183_201648_201733_202500_202591_202948_203116_203238_203412_203568_203695_204491
727811	contig_2733_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_128588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTATTTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853625	853994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_853600_854000
727815	contig_12148_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_140345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCCTGAATCCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128185	128588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_128200_128600
727817	contig_1150_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_61433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311052	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_311100
727824	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
727825	contig_20951_pilon	+	2239	5	Intergenic	novelGene_43132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	4.08503365959205	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATTTCACTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286881	302748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286955_287189_287282_289624_289758_298111_298155_300850
727830	contig_4486_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_38531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGCCACCCTCCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124050	123261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_123300_124000
727831	contig_120_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_165250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTCATTAACCCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90672	88508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_88500_90700
727832	contig_120_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_165249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAACCGGATAATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88658	88466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_88500_88700
727834	SIRV2	-	437	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4436	34	3261	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
727835	contig_9471_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_21844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCAGTAATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417520	415427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_415714_416192
727840	contig_1786_pilon	+	1440	10	Intergenic	novelGene_142595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	46	387	54268	55695	TRUE	20	GGAACTTCCGGTAGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHKPLFNTLAYTTPICNRGSWISHGQNLLRRIVSPSKLLGRPKALVSQRHCCVDDILTITTHHNNLPSIRIVLNSLRVYFTTAHILYCQWQSFSIFNFSISHCFQVGLLDL	54222	80031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_54468_55553_55759_56012_56155_56781_56885_57797_57941_60872_61024_61894_62021_62221_62310_68182_68321_79932
727854	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727858	contig_11160_pilon	-	2737	4	Intergenic	novelGene_168809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8.37987005998436	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCACTTTTCTTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314071	310186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_312651_312743_312914_313920_313961_314008
727862	contig_12970_pilon	-	437	4	Intergenic	novelGene_50511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAATAAACAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61805	45021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_45115_48321_48525_49409_49464_61718
727865	contig_6885_pilon	-	2624	2	Intergenic	novelGene_83646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	911	1372	135150	134259	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKPPTCWVLLACAFFFALLRVIVTPGFDVQSFQFPSLICWKVTSEASFSLLSWLLLSCCPRFAHYLAAPLKLIPSNSSSLSGAHIFFRWSLTLKNRSKAAQLLLYSVSLVPTKETLLCRSLRTSIAHLCIWLLFRPPTPPTAETHPPFLYS	136060	133006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_134638_135067
727866	contig_7695_pilon	-	1441	4	Intergenic	novelGene_41556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	192.147512777727	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	78	476	380076	376361	TRUE	15	TTAGGGTATGTGTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKDGRPERLLSVRERGALVQRVSDRSFRPRGRLYRAV	381082	373559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376470_379786_380089_381017
727867	scaffold_16539_pilon	+	2329	8	Intergenic	novelGene_68380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_4	28.5978449309363	57	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	1243	2220	612051	617625	FALSE	15	CCCCATACCCAGCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLFTKTRFLASLRVGRAGPVFPASLASGTLCLQDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEIDTRYFDDEFTAQSITVTPPDRYDSLGSLELDQRTHFPQFSYSASILE	610808	617734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_612222_613174_613244_614032_614156_615281_615411_615536_615752_616279_616368_616464_616568_617545
727869	SIRV2	-	431	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	39	3262	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
727870	contig_16098_pilon	-	1808	7	Intergenic	novelGene_45884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_5	39.4489825245496	27	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	989	1546	248315	244355	FALSE	10	TACTTTCTTGTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	249303	244092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284
727871	contig_8598_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_22889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGTTGTTTTTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120504	118335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_118300_120500
727876	SIRV6	-	1292	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	56	4	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATAAGTAGCTCACTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	3120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3163_7102_7451_7806_7924_10722_10825_11040_11099_11199
727877	contig_5916_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_158047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTTCCTAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372501	374552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_372500_374600
727880	contig_610_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_76686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAGGGCAAACTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47975	49120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_48000_49100
727881	SIRV1	-	284	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3059	109	2785	-109	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7581	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6814_7552
727882	contig_13932_pilon	-	3306	2	Intergenic	novelGene_168864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	124	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	156	1748	19507	17069	FALSE	35	CCATGGAATCATTAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDLEDAIKKAEEERGRLEGELKGLQEQIAETKARLITQQHDRAQEQSDHALMLRELQKLLQEERTQRQDLELRLEETREALAGQAYAAGQMEGFELQAKQLTREVEELKGELQALRNEKNQPDPRLQDLQEEAARLKSHFQAQLQQEIRKTALAEEQLRQQSQVEEQRVAALENQISEVSELLGTYEKAKQKDQQAIQKLKERILQLDLENKTLALAASSRSPLDSHGEESSLDVNVLKDKMEKLKRLLQVAARKSQVALDVEKLCNPEIMLTSEAADGEKATALYYQQELKQLKEEFERYKMRAQVVLKSKSTKDGNVTKELEEAQEQLAELKEKYISLRLSCEELERQHQQEAEDWKQELAQLQQLHRQELERNQLDFRDRTLKLEEELHKQRDRALAVLAEKDLELEQLRSVALSSSLPGRRSPVGAGGPGDPADTSSPDSLTQALHLAVASEPTFILYAEQLARKEVEITSLRKQKHRLEAEVRQLQDRLLEEGERHREEVGALQSHIEKNIRDQSREGANLEYLKNIIYRFLTLPDALGRQQTLTAILTILHFSPEEKQVIMRLPASGSWWPSGKR	19662	15510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13932_pilon_-_18365_19210
727889	contig_19938_pilon	+	1239	6	Intergenic	novelGene_146568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	148.699697376962	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	72	875	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAQAPPGSPCALCLWGPEKAGRMTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5750	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_8796_9006_16532_16644_17241_17473_18414_18535_18953
727892	contig_17964_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_33923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTGAAATGGTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437388	439199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_437400_439200
727895	contig_1532_pilon	-	1916	8	Intergenic	novelGene_37416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1666.05829576818	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	636	1172	15864	13113	FALSE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34926	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15881_17971_18115_27260_27379_28825_28968_29458_29500_32075_32210_34885
727898	contig_3602_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_60526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170385	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170400_171100
727899	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	294	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727905	contig_11281_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_125468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGTTACTGGCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848486	849299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_848500_849300
727910	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
727913	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
727914	contig_15720_pilon	+	644	6	Intergenic	novelGene_41917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCAGCACATCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278524	281884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785
727916	contig_15629_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_122446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90650	93390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_90600_93400
727917	contig_15021_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_26938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTCAAGGCATACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233191	232600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_232600_233200
727918	contig_15021_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_26937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232600	230209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_230200_232600
727922	SIRV2	-	621	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	38	2958	-38	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGAAGATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
727925	contig_16541_pilon	+	856	3	Intergenic	novelGene_126758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	476	junction_2	84.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	70	414	441353	464200	FALSE	45	TAATTTAAAAAATCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREASDDYLAILLSFLKFWRFSVMFQFVLFSTLFPSVFTELGEPRWVCNSSDISIWYTYCDNMKYPISLNLTPCITLKGSRGLLHIYYIPRRDVEKLYFNLYLSVNSINLPKRKEVICRGSDDSYSFCRALKGGKHS	441283	464642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441465_459495_459586_464057
727928	contig_7963_pilon	-	2648	12	Intergenic	novelGene_58549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	144	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	792	1169	251645	250519	TRUE	30	ATGCGAACTCTGGCGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRLLCSSCDFFHIWLLGHTIGNIFSKTSSKYLWLLSHCSHLFVQIAVLILGKWLPIQQQLAPCGLVQILQQGSHCALPRPVGPHQCSHLTRTKGERQPLQHWNIWLGWVGKGDILELDIAFQV	253518	246106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_246335_246513_246874_247354_247477_247607_247735_248511_248731_249159_249341_250118_250248_250405_250595_251104_251281_251519_251686_251957_252093_252902
727930	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	5	3587	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
727933	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727937	contig_7963_pilon	-	923	6	Intergenic	novelGene_58572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGAAGTGAAAGCGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257566	254672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_254851_255601_255752_255910_256020_256443_256576_256970_257177_257418
727944	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	692	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727945	contig_17074_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_145100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGTCCAGATTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207859	209340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_207900_209300
727946	contig_12810_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_145699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACACCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294373	296233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_294400_296200
727950	contig_753_pilon	-	2546	2	Intergenic	novelGene_112936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAACACCATCTTCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706609	702097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_702158_704123
727957	contig_10296_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_168878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATTTTCATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548962	549255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_549000_549300
727961	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
727966	contig_13004_pilon	+	2049	9	Intergenic	novelGene_112704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_6	307.19374993642	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	900	1514	943766	952167	FALSE	15	TCTAGAGTGTTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837826	952702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039_898169_923623_923840_926828_926989_927531_927669_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951
727970	contig_9609_pilon	-	2140	11	Intergenic	novelGene_23092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	34.1027858099599	235	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	229	1785	481425	476965	FALSE	5	CAGTCTTCTGTGGTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARKGNAPRKGSQRRGGGARSSAQADSGSSEDEAASEARSTTSECPSLLSVTAEDCLGGDAVDEQAQQEDLEDKLKEYVDCLTDKSAKTRQGALENLRLALASHLLPDFLLERRLTLADALEKCLRKGKGEEQALAAAVLGLFCVQLGPGPKGEELFHSLQPLLVSVLNDGTASPAARLHCASALSLGCYVAAADVQDLVSCLTCLEGVFSRACSVGGSTAPVAPASFHGLLCAALQAWALLLTICPSTHISHILDRQLPRLPQLLTSESVNLRIAAGETIALLFELARDLEEDFIYEEMEALCSALRTLATDSNKYRAKADRRRQRSTFRAVLHFVEGGECEEETVRFGLEVLYVDSWARRRVYTAFKDVLGSGMHHHLQNNELLRDIFGLGPVLVLDAAALKAYKISRFEKVCTLATFIFPPFPCFLGDWGSAGARGGALEPWASLLPAHQVITRCPSSTCTTLPPSKPGPRHAAACGTSGQTFCEAGPAGEETVHTLARVFLTEDSAMTGFRQ	481653	476609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477373_477447_477577_477649_477788_478081_478188_478265_478445_478528_478580_478748_478907_478988_479114_479222_479308_479392_479513_481367
727972	contig_9218_pilon	+	1698	9	Intergenic	novelGene_157686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	159.628817495464	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	580	1095	351500	359239	FALSE	45	AATCCCAAAAAACTTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSHHLSVSGGFCVAVRLNKFPWCFQTETRKKGLVIYFQKSASENCVDHNSDRGNGTGPGSFLSIVHGITISGLTQRPITITNGYEVDIIDTGKTMQTLLSLVRQYNPKMVKVASLLVKRTPRSVGYRPDFVGFEIPDKFVVGYALDYNEYFRDLNHVCVISETGKAKYKA	330466	359842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_330580_337636_337744_339023_339208_347592_347663_351394_351761_353145_353229_358167_358215_358384_358462_359191
727986	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
727992	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
727993	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
727994	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
727999	contig_15859_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_50215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379709	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377400_379700
728006	contig_2537_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_33423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTCCAGGTTCATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209272	209672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_209300_209700
728012	contig_14811_pilon	+	1291	3	Intergenic	novelGene_74474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1147	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAGAAGCGGGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356575	386632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_357483_375484_375765_386528
728014	contig_19579_pilon	-	1071	8	Intergenic	novelGene_59396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	742.535589746927	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	88	561	13090	8786	TRUE	25	TTCCAGATTCTTCATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDMVLNKDTLTF	13177	7751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_7980_8022_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8821_12012_12262_12900
728015	contig_12118_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_168903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAGTCTAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34367	34659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_+_34400_34700
728017	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728018	contig_501_pilon	+	990	7	Intergenic	novelGene_134902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	23.7445900271105	352	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	241	990	793438	808589	FALSE	30	GTACGTTGTTTCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIRHSEQTLRTALISKTPALVLQYENLDAGERRLMNEAFQPNSALFEPITLHSQSDWITSHPEAPQDFEQFFNDAKRKTPSPEKCNIYIQSIGSLGNTRIISEEYIKWLKGYCEAFFYGLTVKLLEPIPVSATRCSFRVNDNTKNLQIHAGDILNFLKRKKPENAFCVVGITMIDLYPRDSWNFVFGQASLTDGVGIFSFARYGSDFYSSHYEGKVKKLEKSSSSEYSVFDNYYIPEITSIFLLRSCK	791711	808589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_791770_792225_792318_792607_792698_793437_793721_794083_794258_794349_794479_808425
728028	contig_7895_pilon	-	1796	9	Intergenic	novelGene_154450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13.2547161418116	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1015	1362	716427	713398	FALSE	50	AGATAACCTTCAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESWIPEDVFTFSPILRNVFENPTMVQFDHRVLGISSVTAITVLYFLSRRIPLPRRTRMAAVTLLALAYTQVGLGISTLLMYVPTALAASHQSGSLALLSVSLWLMNELRRVPK	725070	712963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_713530_714487_714602_716325_716507_717683_717766_718418_718587_720125_720313_721130_721254_723434_723626_724886
728029	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
728031	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728032	contig_6735_pilon	-	831	7	Intergenic	novelGene_15694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	802.514520463995	547	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	80	625	564868	542190	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKGILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542281_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
728034	contig_7202_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_17758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
728041	contig_5643_pilon	+	2272	6	Intergenic	novelGene_38990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_4	71.8704389857193	476	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	872	1762	619388	621718	FALSE	10	GATGGCTGCGACTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVTTSSATLSTVIATVASSPASYKTASPPGPPPYGKRAPSPGAYKTATPPGYKPGSPPSFRTGTPPGYRGASPPVGPGTFKPGSPTVGPGPIPPAGPSGLSSLPPPPSAPASGPPLSATQIKQEPAEEYEPPESPVPPARSPSPPPKVVDVPSHASQSARFNKHLDRGFNSCARSDLYFVPLEGSKLAKKRADLVEKVRREAEQRAREEKEREREREREKEREREKERELERSVKLVQEGRAPVECPSLGPVPHRPPFEPGSAVATVPPYLGPDTPALRTLSEYARPHVMSPGNRNHPFYVPLGAVDPGLLGYNVPALYSSDPAAREREREARERDLRDRLKPGFEVKPSELEPLHGVPGPGLDPFPRHGGLALQPGPPGLHPFPFHPSLGPLERERLALAAGPALRPDMSYAERLAAERQHAERVAALGNDPLARLQMLNVTPHHHQHSHIHSHLHLHQQDAIHAASASVHPLIDPLASGSHLTRIPYPAGTLPNPLLPHPLHENEVLRHQLFAAPYRDLPASLSGPMSAAHQLQAMHAQSAELQRLALEQQQWLHAHHPLHSVPLPAQEDYYSHLKKESDKPL	617908	622228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_618392_618625_618849_619222_619920_620829_620974_621321_621503_621684
728046	contig_5728_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_126697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTTGCTTTATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344602	343676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_343700_344600
728051	contig_6048_pilon	+	1057	4	Intergenic	novelGene_73209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1022	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAACCCGCGCGAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518898	1522770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1519546_1520400_1520579_1521440_1521530_1522627
728057	contig_3111_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_129985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAGATGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161631	162170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_161600_162200
728058	contig_8020_pilon	-	1394	10	Intergenic	novelGene_114359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	131.111864404616	33	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	77	898	107186	104794	TRUE	15	CAGGCTCCATTCTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107262	101030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_101444_101870_101953_104792_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
728060	contig_4754_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_35888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTTTTGATATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78372	78725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_78400_78700
728061	contig_4759_pilon	-	1626	5	Intergenic	novelGene_106351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	16.8002976164114	512	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	26	706	991935	985401	FALSE	30	GAATTGGTAATTAAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERCVSNLMVCNLAYSGKLEELKETILADKSLATRTDQDSRTALHWACSAGHTEIVEFLLQLGVSVNDKDDAGWSPLHIAASAGRDEIVKALLGKGAQVNAVNQNGCTPLHYAASKNRHEIAVMLLEGGANPDAKDHFEATAMHRAAAKGNLKMIHILLYYKASTNIQDTEGNTPLHLACDEERMEEAKLLVSQGASIYIENKEEKTPLQVAKGGLGLILKRMVEG	991960	984480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_985555_987840_988008_988100_988248_989174_989274_991821
728062	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
728066	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728069	contig_5423_pilon	+	2406	2	Intergenic	novelGene_85254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGTATTGAATTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534748	543230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109
728076	contig_7895_pilon	-	2191	5	Intergenic	novelGene_154437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	17.0202085768653	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	87	860	455395	435105	FALSE	15	TGGACCCTGTGCTGAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPSVFAEVSQAQPVLVFKLVADFREDPDPRKVNLGVGAYRTDDCQPWVLPVVRKVQQKIANDNSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALKDKRVGAVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFSAAGFKDIRSYHYWDAEKRGLDLQGFLNDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASIMKVTNCPFRASLKKWYVFVLYIFKSNTCLLKNLENGKKPKETNKY	455481	433773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_435342_435590_435704_436648_436773_443593_443776_455277
728094	contig_8921_pilon	+	1981	4	Intergenic	novelGene_161629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	14.6969384566991	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	241	1227	211227	217517	FALSE	40	AAATTACCTTTAATCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATLRDLAQGSVTFEDVAMYFSQEEWGLLDEAQRHLYHDVMLDNFGLISSLGWCGAENAEAPSEQSVSVGIVSQAGTPKSGPSTQNVHLCETCVPVMKEILYLADPPGIYRGQKLYTCGACGKHFWLSTDLHHHQKEHIGETFWLKYKLVQHQRIHTGEKPYECSECRKAFGCKSKLVQHQRIHTGARPYECGDCGKCFRQSSSLVQHRRIHTGARPYECGECGKCFSQSSILIQHRRIHTGARPYECNECGKCFRQSSSLIQHQRVHTGARPYGCSECGKSFRQRFSLILHQRIHTGERPYECSECGKCFSQNFVLIKHQKLHTK	210986	218271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_211260_214869_214997_216294_216565_216960
728100	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
728101	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728103	contig_7173_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_37528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTACTATGACCAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148044	150268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_148000_150300
728104	contig_14361_pilon	-	516	4	Intergenic	novelGene_139257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	253.003732954454	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	61	516	73579	71377	FALSE	60	ATTAAGAAAGAAAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRPLPDEPQEAVTFKDVEVIFFQDEWGWLDSAKKNLYRDVMLENYGNVASLVGPFPKPALISWLEGRGPWGLNVQGAQQRENPGAASAGGELQIKTNKFILKHQPLEEAETLAVQSGCPVMSVFEGTGFQESFELKSGLKEQWGPPMLMT	73639	71376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_-_71562_72527_72639_73150_73278_73546
728105	contig_15327_pilon	-	894	4	Intergenic	novelGene_70688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	106	516	901528	900904	FALSE	30	TGACCATACATCACTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902133	900525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
728109	contig_6595_pilon	-	2496	1	Intergenic	novelGene_122537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTACTAGAATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528631	526135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_526100_528600
728110	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
728113	contig_12837_pilon	+	1653	8	Intergenic	novelGene_57306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	2218.19382307649	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	241	684	129778	166049	FALSE	35	AAAGTGCACAGTCTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128770	167018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
728114	contig_14220_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_159877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCCATTTTCATCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382952	381662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_381700_383000
728115	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1651_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728123	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
728125	contig_18859_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_150539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGTGTATAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75300	73908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_73900_75300
728127	contig_15152_pilon	-	1671	14	Intergenic	novelGene_126957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	16.6434947399806	131	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	89	1429	119450	84116	FALSE	30	AATTTATGAGAGTCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTGSQVTMEKELRSTILFSASKKEIFTTNNGYKSIQKRLRSNWKIQSLKDEITSEKLIGVKLWITAGPREKFTAAEFEVLKKYLDGGGDILVMLGEGGESRFDTNINFLLEEYGIMVNNDAVVRNVYYKYFHPKEALVSNGVLNREISRAAGKAVPGIIDEESSGNNAQALTFVYPFGATLSVMKPAVAVLSTGSVCFPLNRPILAFYHSKNQGGKLAVLGSCHMFSDQYLDKEENSKIMDVVFQWLTTEDIHLNQIDAEDPEISDYMMLPDTATLSERLRVCLQEGDENPRDFTTLFDLSIYQLDTTSLPKVIKAYEQLNVKHEPLQLIQPQFETPLPALQPAVFPPSFRELPPPPLELFDLDETFSSEKARLAQITNKCTEEDLEFYVRKCGDILGVTSKLPKDQQDAKHILEHIFFQVVEFKKLNQEHDIDTSETAFQSNF	119538	83873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_84164_86368_86515_88404_88514_90100_90189_95672_95828_99227_99297_100532_100620_106314_106442_108208_108281_111343_111420_111713_111844_115670_115759_116420_116546_119429
728132	contig_16098_pilon	+	1364	9	Intergenic	novelGene_45808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	88.6816638319332	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	257	1207	151768	153863	FALSE	30	GTTCTGTGAATAGCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150443	154020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150502_150713_150909_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
728134	SIRV6	+	380	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	0	403	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728138	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
728141	contig_14363_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_112526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_6	29.071272570854	368	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	193	972	142132	119439	FALSE	35	TACAGATGTTTTAATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRRALKAVLVDLSGTLHVEDAAVPGAQEALKRLRGAPVMIKFVTNTTKESKQDLLKRLKKLEFDISEDEIFTSLTAARNLVEAKQVRPMLLIDDRALPDFKGIQTEDPNAVVIGLAPEHFHYPALNQAFRLLLDGAPLIAIHKARYYKRKDGLALGPGPFVTGLEYATDTKATVVGKPEKTFFLEALRGTGCEPEEAIMIGDDCRDDVGGAQNAGMLGILVKTGKYRAADEEKINPPPYLTCESFPHAVDHILQHLL	145413	118686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_119543_120125_120190_122254_122472_135352_135438_138810_139020_142031_142143_145231
728146	contig_8418_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_166070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCGCTATGAGTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208300	1209765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1208300_1209800
728147	contig_5105_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_168910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCAGACGAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244994	245908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_245000_245900
728149	contig_2062_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_139034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGTTTGCTTTACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179579	1179977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1179600_1180000
728150	contig_2062_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_139035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180272	1181543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1180300_1181500
728153	contig_9848_pilon	+	1507	12	Intergenic	novelGene_79917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	166.177242825418	1169	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	523	1242	81216	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRPRITQLSQAKAVGLRGLCSCLQNVPVMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58806	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_75091_75162_77678_77721_78015_78123_79977_80117_81164_81305_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
728154	SIRV6	+	559	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
728155	contig_15384_pilon	-	2287	21	Intergenic	novelGene_85152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	66.3923753152423	1	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	47	1561	127943	120302	TRUE	40	GGCTATGTCATCATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLRSRPSPGGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLLGSCLLRGRRSRCFGCPWRRPIPYLTSSGTSGCCSHPRSKRTCSMGGPIHPLSLPGCCSQPCSARWALQCC	127989	118810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119325_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_121025_121161_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
728164	contig_6550_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_110661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTACCTTCATGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65738	67188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_+_65700_67200
728170	contig_753_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_113016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGTGCCCATGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366785	1365450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1365400_1366800
728175	contig_10446_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_162448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTCTGGACAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251355	251656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_251400_251700
728176	contig_7078_pilon	-	1154	12	Intergenic	novelGene_130182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	328.098125818008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	128	1153	795828	773199	FALSE	65	AGTATGAAAGAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGATFSGSRIFSASQPALAGEEKVQESWVALPVPPAPAARKMADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKK	796184	773197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795851_796079
728185	contig_19459_pilon	-	661	3	Intergenic	novelGene_59822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11044	junction_2	7997	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	10319	7003	FALSE	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	10319	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268
728186	contig_9258_pilon	+	652	3	Intergenic	novelGene_104606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	110	502	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEYPGQGLPIIAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96711	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
728188	contig_14513_pilon	-	743	5	Intergenic	novelGene_70322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	99	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	198	617	18880	11414	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLTSEWTRVSNPLISRGALNHLHHPGTSAMPA	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11507_12071_12158_13087_13136_14952_15001_18735
728193	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	78	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728194	contig_8491_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_154214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTAATTGCTGTTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12433	14527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_12400_14500
728195	contig_6048_pilon	+	1373	13	Intergenic	novelGene_73263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	66.4678284753024	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	24	344	1972099	1975332	TRUE	10	GTGACTTGAGGTGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACSPAAMHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNG	1972075	1978305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1975328_1975406_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
728196	contig_7344_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_168920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	798	1292	192890	193384	NA	60	GGTTATCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMQFIREVTVTVQAQEHSEYSSFIRTAFSQRCSQVSLSLALGLCPKALSFLSLLAGKPTNTDSYCHVSAATSHRLQGYSSLSVSWVQELLSAAIPSPEDALSTPGCSSLPVVGSSSQLWNWLSFKAKLTNLLGGPQLPYHIVLPKYLGRSYKIMARKATHKSN	192092	194041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7344_pilon_+_192100_194000
728198	contig_3077_pilon	+	1544	8	Intergenic	novelGene_26699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3800.06484370024	2	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	338	1051	12050	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10100	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10200_11276_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
728200	contig_5429_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_127785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCTAACGTTAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146752	147309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_146800_147300
728201	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_96786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728204	contig_9363_pilon	+	2369	13	Intergenic	novelGene_6777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGCAAAAGGTCTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505652	1520906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1506734_1508245_1508348_1509057_1509147_1509561_1509659_1509767_1509824_1510100_1510209_1516330_1516400_1517872_1517973_1518084_1518160_1518573_1518687_1519972_1520119_1520476_1520542_1520638
728208	SIRV6	+	459	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	395	2	216	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728210	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_90550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653845	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728214	contig_10973_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_150323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
728215	contig_3825_pilon	+	698	6	Intergenic	novelGene_77959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1308.70510047145	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTGGCATTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13045	15658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13077_13971_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
728220	contig_8907_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_85828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	429161	429475	NA	50	AAAAAAATTCTATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLFLTERNRFSLNYNICTYDICSCYVKSYTFPQLKFIQEYYSASIVHAGSPGGAVVKCLAANQKVSGSNPPAAAWEKDVAVCFRKDLQPWKPYGAVLLCPVGSL	429160	429970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_429200_430000
728221	contig_9727_pilon	+	2857	12	Intergenic	novelGene_86356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_9	27.4801205381888	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	219	2501	546859	557417	FALSE	15	TTGTTGGTGTAGCCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDVSKGSPKTSLSSTDPEVVLSSPLGKPEDSSSVDGQSVGTPAGPETGGEKDGPEEEEEEDFDDLTQDEEDEMSSASEDSVLSVPELQETMEKLTWLASERRLSQEGESEEDNSQEENSEQEEEEEEEAEGMEGLQKEDEMIDGAVGDPAEKPPSTFTSPKTVPEVETSRTPPGESIKAVGKGRSNHRARNKRGSRARASKDTSKLLLLYDEDILERDPLREQKDLAFAQAYLTRVREALQHIPGKYEDFLQVIYEFESSTQRQTAVDLYKSLQSLLQDWPQLLKDFAAFLLPEQALACGLFEEQQAFEKSRKFLRQLEICFAENPSHHQKIIKVLQGCADCLPQEITELKTQMWQLLKGHDHLQDEFSIFFDHLRPAASRMGDFEEINWTEEKEYEFDGFEEVALPDVEEDDEPPKIPTASKNKRRKEIGVQNHDKETEWPDGTKDCACSCHDGGPDSKLKKSKRRSCSHCSSKVCDSKSKSKEPHELVSNSPHREASPMLGAKDAVQGKDTVEEEAPEERESIEATQSRTGKATRTGETPVPGLAVESTLLSPREVTPTDRLLLDGPPPCSPDTPQLFHQTVKRNQAGPEAASYAKASPELHRDREGHEAVGESETSRLVWDASETEPLPGTVELPASFLSPVSPRTRDIVRSQVSGKADTQESWLSLGRAGVKTADRMSPVRESSSSGTDTSETSPTTLRGSLDKDSGTQGRGPEGEQLPKATEATVCANNSKVSSTGEKVVLWTREADRVILTMCQEQGAQPQTFSVISQQLGNKTPAEVSHRFRELMQLFHTACEASSEDEDDATSTSNTDQLSDHGDLLSEEELDE	546640	557773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_546907_547598_547855_548460_548646_549550_549749_551164_551309_551871_552016_552117_552238_553393_553508_555451_555660_556065_556679_556773_556877_557267
728222	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728223	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_93591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728226	contig_13216_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_47453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1085	1393	149243	148935	NA	75	TTAAAAAATAAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNSVGVQIFYRGRLALLLEPDLWLQSPHSSLHLHFDPAVWNYCSFLRQPGPGIMAQADICQQSHLSMYPHHTPHPTPPSSPGRHLLILEKNSKKKLLSSQF	150327	148255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_148300_150300
728228	contig_8291_pilon	+	2227	1	Intergenic	novelGene_99938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTGACAAAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23825	26052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_23800_26100
728233	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728234	contig_1982_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_151310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGATGAGTAATATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115524	115070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_115100_115500
728235	contig_1982_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_151309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTTTGTTGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114976	113226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_113200_115000
728243	contig_6048_pilon	-	2167	2	Intergenic	novelGene_73322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	22	642	2122086	2119250	FALSE	35	TTATTAAAAATTGACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAASGPGCRSWRLCPEVPSATFFTALLSLLVSGPRLFLLQPPLPPSGLSLRSEALRNWQVYRLVTYIFVYENPVSLLCGAIIIWRFAGNFERSVGTVRHCFFTLVFTVISAVIYLSFEAVSSLTKLGEVEDARGFTPVAFAMLGVSSVRSRMRRALVFGMVLPSALVPWLLLGISWLIPQTSFLSNVCGLVIGLTCILPRREL	2122107	2117724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2119684_2121899
728248	contig_11003_pilon	-	1306	4	Intergenic	novelGene_105415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_3	32.7142510570275	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	46	417	27839	22091	FALSE	50	GTGTGAAACAAATGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKER	27884	21201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_22205_23380_23535_24812_24893_27815
728249	contig_13300_pilon	-	2908	9	Intergenic	novelGene_125800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24.4307055772035	2	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2400	2906	240127	239141	FALSE	15	TGTGCCCCATCCCACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFGKVEDQPKERDLAWDKTVKRREAKNLPHPTTSPACPGYRTVAENGSPGAESGPSLGFFPGPANKEAVWVAKHGACRGTCQPSLRATALSVEMKISLSRGVSLAHLSAGSAQASGCPAPRTGEREEDLAACATGPLCRWPGSLPFSQHPRGLTCPKTEGGKEPGNPR	250780	239138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_239615_240094_240268_241165_241338_242243_242458_244230_244442_246913_247029_247267_247900_248071_248782_250575
728251	contig_11978_pilon	+	1246	6	Intergenic	novelGene_62918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	99.7909815564513	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	417	1214	864093	866962	FALSE	15	TCTGACTCTATTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFSRDWSFLITCPKHVRRSLAILTFKEHSGRSSSKTDLLVLLAVHGVFSICQHHNSKTSVLQSPLFIVPLSDACEETGLIRLLRREIAAIFRDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGGCIDDTILSRQGFINYSKLPSLDLVQGELVRGLSFLTAQTHSLLQHQPLQLTALLDQYIRQQHEGDSVQPASRKLDPPDSVLDS	860822	866994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860897_862874_863045_863920_864324_865281_865447_865690_865836_866705
728254	contig_12624_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_60973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38342	36511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_36500_38300
728255	contig_8330_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_71890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACACGAGCCAGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066104	1065624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1065600_1066100
728256	contig_8683_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_150266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATCTTTCTCCCGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702035	703793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_702000_703800
728262	contig_8452_pilon	-	684	4	Intergenic	novelGene_48106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	950.50127125989	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	154	321	968728	962980	FALSE	15	ATGTTTCAGGCTAGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSFQHTWVHIRETHHPIPVPHVPRWYTQLLPHPLFRK	981696	962616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963089_968669_968752_972861_972933_981637
728269	contig_12938_pilon	+	1504	8	Intergenic	novelGene_99711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	620.043415201463	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	113	760	78117	85540	FALSE	40	CTATTTTAACACTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51950	86284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
728271	contig_6488_pilon	+	1283	8	Intergenic	novelGene_44761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	420.069867852422	2293	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	25	648	193685	203836	FALSE	45	TACAATTTTAATAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSSRLPKMNRFFGKAKPKAPPPSLTDCIGTVDSRAESIDKKISRLDAELVKYKDQIKKMREGPAKNMVKYEQQRDNLSQQSFNMEQANYTIQSLKDTKTTVDAMKLGVKEMKKAYKQVKIDQIEDLQDQLEDMMEDANEIQEALSRSYGTPELDEDDLEAELDALGDELLADEDSSYLDEAASAPAIPEGVPTDTKNKDGVLVDEFGLPQIPAS	193660	204471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_193754_194625_194731_196117_196129_197384_197479_197611_197684_199944_200054_201539_201653_203785
728274	contig_12638_pilon	+	1365	12	Intergenic	novelGene_33162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	181.136951065547	83	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	145	1137	269238	274237	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVLLQGPRLGPIQATSTPG	235649	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271221_274178
728291	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	30	TTCAATAAAGTTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
728292	contig_7915_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_42962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1893	2216	75372	75049	NA	50	TATAAAAAAAAACCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVILKNKYEGRKEIAKEHVHYDTFYINCKIIQNTITLGLRMDTYTIKRTEMQENGNYIQGFVTTGKGHTQSFIYIHSVLFLKLGYRYKLLNIIFYMSEKLYNIKIY	77264	74923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_74900_77300
728294	contig_2770_pilon	-	1534	6	Intergenic	novelGene_107444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1807.35818254158	2	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	295	636	746670	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCLECSGGCTVTGTRQRHRRRRRHSAHRTRRLSSSSPSGCRRSSRDTPAVTALALVKPLSLPLADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750773	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750584
728298	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728299	contig_14322_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_116206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671638	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
728300	contig_4732_pilon	+	2673	1	Intergenic	novelGene_75482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738915	741588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_738900_741600
728306	contig_5145_pilon	+	2473	24	Intergenic	novelGene_131402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	66.5431054063954	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	282	2360	718851	783079	TRUE	25	ACGGCAGTGACCCGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPLSQQIPTGNPLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDITLGKIWDLADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHDVSLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMAAVPPAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPAVLPPSLVPPAKRKKTVFPGAVPVLPASPPPRDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHGVKQAQPVVSWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVKDIFMHSGLTQSLLAHIWALADTRQMGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGLDPPQVLSPDMVPPSERGTPVQDGSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTNEVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSLKMQIQSQESDLRSQEDDLNRAKAELGRLQQEEAQLEQSIQAGRAQLETILKSLASTQDEINQARSKLSQLHESQQDARRGLPPTEEVLNGAPGLTDLTERGGFGATVQDDPFKNKALLFSNNAQDLHPDPFQAEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQAASTDPFGGDPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKGSDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSDPFASSFGGAGFSEDPFKSKQDTPALPPKKPAPPRPHPPSGQRNC	693530	796158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_693554_715248_715291_715812_715903_716421_716470_718772_718869_719044_719108_724140_724267_725568_725629_726482_726717_729680_729839_733079_733237_733632_733719_735692_735766_745681_745844_748661_748860_750477_750616_755172_755297_757458_757510_758761_758899_773745_773807_774669_774753_780482_780620_783066_783115_796080
728307	contig_5145_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_131413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTCGGTTCGGATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796108	796474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_796100_796500
728310	SIRV2	-	468	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4398	41	3223	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATTCGCTCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	1041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
728317	contig_10500_pilon	-	1888	5	Intergenic	novelGene_41150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	229.063719300984	7	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1	660	1208507	1191592	FALSE	25	AAATGTACCATCTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQAKRVQARLDNLQRKYEFMTIQRLKGNSHSAHEMKSLKQEKIPISKTCKVPLNAQVYELLAMFMDWISDHHLSKLKNEEFGMEAEKPLIKHASQRNDIQEKCVKLLPVIAEQLQWMPFVNAKHHEPFVKFIYWSLRQLDAGTQHSTLTSTLRRLGEDIFKGIVTKGIQDNSLEHSGENKPKTAAFFKSPNLPLRFLSTLIVLKTVTQGKLSNMFIV	1208507	1190363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1191814_1197867_1197985_1206044_1206210_1208238_1208347_1208459
728318	contig_9848_pilon	-	1486	12	Intergenic	novelGene_79970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	639.249172179543	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTCAGTTTAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113870	98512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107392_109994_110048_110526_110570_113840
728319	contig_9345_pilon	-	1543	4	Intergenic	novelGene_24333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	7.76029781788188	260	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	70	1302	113740	110961	FALSE	40	AATCAATTTATATCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQGSEDNRVADALLELWLWRDLPMRGRSSVFAMQHIVCVPHVLVRRGLLGRDLFMTRTLCSPGPSQPGEKRPEEAALGLYHRLTTLGRALGHSIQRHVSSTAKNWWDRYEEFVGLNEVREAQGNVTEAEKVFMVARGLVREAQGDLEVQQAKLKEVRDRLDRVSREDNQYLELATLEHRMLQEEKRLRTAYLRAEDSEREKFSLFSAAVRESHEKERARAERTKNWSLIGSVLGALIGVAGSTYVNRIRLQELKALLLEAQKGPVSLQEAIREQASSYSLQQRDLHDLMVDLRGLVHAGQGQGSASQTGTSPTQVKDTEVLSAALQEQISHSRQVHSCLKGLQEQLDGLEKTFSQMAGVVQLAKAAVHPGLAEQADRAPPSSLLEQGSMLLALSDMEQRLEAQVNRNAVYSTLVTCVMVAATLPVLYMLFRAS	117820	110719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_111717_112255_112421_113428_113749_117759
728320	contig_4364_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_3562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533046	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
728322	contig_4429_pilon	+	2960	1	Intergenic	novelGene_50797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGCCACTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161515	164475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_161500_164500
728323	contig_7815_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_134374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTATCCTTTCATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376169	375461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_375500_376200
728329	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728334	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
728336	contig_6742_pilon	+	2345	5	Intergenic	novelGene_144554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	10.4731800328267	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	107	781	25724	27436	TRUE	35	GGGTCCACACGGGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPCESSAKTCFSPENLERHSIPEALRLKWKNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVPSWEWLRRTSRFLKLPVSYFSDGCLPASCPT	25617	47404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_26114_26786_26974_27338_27495_41061_41909_46745
728343	contig_13300_pilon	-	1990	5	Intergenic	novelGene_125817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	26.4799452416352	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1166	1567	247599	247079	TRUE	40	GAAAGGAAAAGAGGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAAGLCRKNKWTPWRQGDSSMPPPCGISLNCILLSGQAPELPKAMCPCLLPPGCSLDPCRHFQETKQEWKYKLKDWDWALTCSEEVAERPYEAPVRLRSEQGWDPVLGSSPHLLAWSRGGGGSLVPSALASP	250687	244183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_247928_248056_248782_250575
728344	contig_9091_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_32453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238972	241341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_239000_241300
728345	contig_16666_pilon	-	1285	4	Intergenic	novelGene_61748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	10	297	59688	56631	TRUE	10	CATACCTTGTCTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGASLKL	59697	55098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56646_58126_58264_59552
728348	contig_4072_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_168921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCCGCTGCTAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41968	40348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4072_pilon_-_40300_42000
728350	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_95016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728357	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728358	contig_11413_pilon	+	2738	4	Intergenic	novelGene_103209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	5.79271573232759	25	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	729381	736833	FALSE	35	AAGTAAAATTTGGGGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPELNNLLNTTPDRAEQGKLTLLCDAKTDGSFLVHHFLSFYLRANCKVCFVALIQSFSHYNIVGQKLGVSLTTARERGQLVLLEGLKSSVDVFFRAQEEPHPLQFLRSVSL	729326	739178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_729435_732105_732185_734375_734447_736698
728360	contig_14322_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCACAGCAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
728365	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	597	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728368	SIRV6	+	231	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	51	501	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
728369	contig_1719_pilon	-	1600	7	Intergenic	novelGene_87319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	60.4032743777649	1710	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	43	822	467734	458348	FALSE	25	TTTGGCATTTTTAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSSSGPDTRLQRAMKMAAAAGKLLRASVACHMSAIPWGVSASAALRPAASGRKCLTNALWSGSHPAKRAFSTSSSYLAPAVTQHAPYFKGTAVVHGEFKELSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIPLLSDLTKQISRDYGVLLENPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVDETLRLVKAFQFVEAHGEVCPANWTPHSPTIKPSPTASKEYFEKINQ	467776	457569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_458761_458928_461153_461258_462091_462228_463065_463208_466480_466617_467692
728370	contig_4884_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_63779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96046	95129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_95100_96000
728371	contig_709_pilon	+	1614	5	Intergenic	novelGene_57595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	843	1226	2326776	2327159	TRUE	35	GCAGTGGAGATGGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAFTVRGLCGVDQILIITVVGLIPTVSSCSLGRRKVCSTCRVLQSGAGGSVIGRAHSLRSRHKDTTLHARMAQSTFLIVGVKIRVGGRRIRGLGISKCTSTFGCKCRIGHPRAEPRFQIFRRHWSA	2325933	2334251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2327176_2329517_2329633_2332075_2332162_2333228_2333351_2334202
728374	contig_15486_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_157319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAAAGAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118470	120353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_118500_120400
728382	contig_6710_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_95985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653647	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
728383	contig_500_pilon	+	1244	8	Intergenic	novelGene_31035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_6	1169.93036597248	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	441	854	1496587	1498065	TRUE	35	ATAAACATGCAATTGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVDCPESAAGVPAGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485758	1499568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498886_1498974_1499277
728384	contig_8772_pilon	+	1838	9	Intergenic	novelGene_21072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5378.37500435773	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	147	1523	15355	23105	FALSE	10	ACTCTTGCTGTGTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDMLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTSLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15208	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15900_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20481_20697_21478_21523_21966_22053_23063
728385	contig_11752_pilon	+	1427	7	Intergenic	novelGene_37631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1018.51440016002	3	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	90	1088	87165	96579	TRUE	5	TCTCTTTCTTGACTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGT	84112	105924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96592_105597
728388	contig_15538_pilon	-	2083	2	Intergenic	novelGene_152636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	75	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTGGGTCTTTTCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59297	55625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_-_57567_59155
728389	contig_10235_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_46509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	441	1323	339	1661	297036	298358	NA	30	GTACGAAGGTGAGAGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQ	296697	298360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_296700_298400
728390	contig_2917_pilon	-	2166	7	Intergenic	novelGene_147571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	225.056597819798	2	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	54	1070	124032	77876	FALSE	65	GGAAAAAGAAAAAATGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTNQSKRPHKGTHFTRWSQLL	124085	76779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93785_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
728391	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
728404	contig_7171_pilon	-	1516	14	Intergenic	novelGene_101396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	85.2305609550357	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	579	1010	1412687	1409817	FALSE	5	CTCAGCTGTCTGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1436607	1409310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413044_1421053_1421123_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580
728410	SIRV6	-	271	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACAAGTTTAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
728413	contig_12464_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_68738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	648	1947	40	1986	422066	424012	NA	30	TAGATTAAGCTTTACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKTLKDFYTALALHKTIIQYRPIHIDPVSRKRVLRLMEYYETKRPGSVEKERPGHDSQKYSQEGYSGQKLCIYIRNFPFDVTKVEVQKFFADFSLEEDDIYLLYDSKGVGLGEALVKFRSEEQAVKAERLNRRRFLGTEVLLRLISEAQMQEFGINFSLMSSEKMQDHSEPHDRDDHSHSFDSKEPPVYSAGTSENFRHQLEDVKKPENFKHPQGDFRQSDRRPPEDFRHSPEDFRRPPEDFRHSPEDFRHPQEEHFRRPPEEDFRHLREEEWRRPPEEDWRRPPKEDFRRPPKEDWRQPAEGDFRRPPDEDWRRPPEEDFRRPPQGDWRRPPEGDFRRPPEEDFRRPPEEDFRRPPEEDFRHSPEEDFRRSPQEHFRRPPQEHFRRPPQDHFRRPPQEHFRRPSQDHFRRPPQEHFRRPHQEHFRRPPQEHFRRPPQEHFKRPREEDFRHPPDEDFRGPPDEDFRHPPDEDFRSPREEDFRCPSDEDFRQLPEEDLRGALEEDPRLPDNFRPAGEQFRSPPDDFRSHRPFVSFGRPEGGKFDFGKRNMGDFPEGRFMPDPKLNCGSDRVTPIKIMNLPFKANVNEILDFFHGYKVIPDSVSIQYNEKGLPIGEAIVTMINYNEAVAAIKDLNDRPVGPRKVKLILL	422026	424608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_422000_424600
728414	contig_829_pilon	+	2945	1	Intergenic	novelGene_168924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAACAGAAAAACAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68461	71406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_+_68500_71400
728417	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728421	contig_19210_pilon	-	1399	10	Intergenic	novelGene_168933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_4	13.5482676219344	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	53	1177	216943	191677	FALSE	30	TCTATGGTCAATCATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSSYHCCRRQVWLRAVMVRCSCVLFRKYGNFIDNLRLFTKGGSGGMGYPRLGGEGGKGGDVWVVAEKKMTLKQLKDRYPQKRFVAEGGANSRVSALKGSRGKDCDIPVPVGISVIDENGKIIGELNKEKDRILVAEGGLGGKLLTNFLPLKGQKRVIHLDLKLIADVGLVGFPNAGKSSLLSQVSHAKPVIADYAFTTLKPELGKIMYTDFKQISVADLPGLIEGAHMNKGMGHKFLKHIERTKQLLFVVDISGFQLSSQTQYRTAFETIILLTKELELYKEELQTKPALLAVNKMDLPNARDKFRELMNQLQNPKDFLHLFEKNMIPERTMEFQHIIPISAITGEGIEELKNCIRKSLDEQTNKENNAYHEKQLLNLRIFNTVSYHEPS	216995	191454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19210_pilon_-_191901_194566_194691_197484_197563_198123_198232_201291_201345_203481_203556_208713_208859_209260_209353_214164_214359_216910
728427	contig_19957_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_57726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGTTCCAGGTCAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252861	256005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_252900_256000
728430	contig_9955_pilon	+	1835	8	Intergenic	novelGene_21377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	51.9717348612666	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	149	1018	570882	580436	TRUE	25	TGGAGAGAGATTGCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASVTIPIWQNKPHGAARSVVRRIGTNLPLKPCPRASFEALLNISDLCLRDAPPVPTLADIAWIAADEEETYARVRSDTRPLRHTWKPSPLIVMQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAASASLTPDFLSPGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDLNRSLLKEEDPAVLISEVLRRKFALKEEDITRKGN	567649	581330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_567673_570756_570897_571397_571503_574376_574487_574747_574960_576188_576511_580330_580876_580952
728433	contig_3018_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_78804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTAAAGCTTACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503804	504923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_503800_504900
728435	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728438	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728449	contig_10135_pilon	-	2019	9	Intergenic	novelGene_106610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	42.5453801839871	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	397	1515	88066	84292	FALSE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89570	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86355_87051_87251_87804_88079_88500_88681_88920_89057_89502
728453	contig_366_pilon	+	1827	6	Intergenic	novelGene_51559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	193.763360829647	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	473	1522	643390	649345	FALSE	5	ACTTCTGCCTTGGCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVEEVMEKFMRIYKYQAHGYAFSGVEELLYSLGESAFVNMTQRSVAESLLQVGVTQRFIDDVISAVLRASYGQSAAMPAFAGAMSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	636402	649650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_636524_641061_641273_643249_643425_645173_645386_647843_647985_648683
728470	contig_10058_pilon	+	2013	10	Intergenic	novelGene_67698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_5	81.789854180782	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	587	1342	51319	53244	FALSE	15	GAGCCACAGTTGTTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	49842	53915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53154
728473	contig_2078_pilon	+	1746	5	Intergenic	novelGene_100144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	112.748614182171	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	271	978	286189	311030	FALSE	35	TGCAAAATACTTATTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	285918	311798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_286268_306345_306646_308290_308402_308836_308962_310937
728475	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_93534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728477	contig_6710_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_97944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653730	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
728481	contig_14643_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_99133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88519	86190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_86200_88500
728482	contig_4847_pilon	+	1743	9	Intergenic	novelGene_156147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	38.3778500570316	1239	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	689	1294	86730	92768	FALSE	25	TTTCATACCAGGAAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIDIYQLATASVSGTITNEKRISSVTFLSESVLAVAGDEEVVRFFNCDSLMCLCEFKAHENRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	79636	93217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85410_85681_86203_86257_86676_86823_86915_87014_90208_90309_92290_92415_92577
728484	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
728485	contig_1275_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_108723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAGAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264162	262311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_262300_264200
728486	SIRV6	+	573	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
728487	contig_5551_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_134248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGGTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486583	485678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_485700_486600
728488	contig_9345_pilon	+	1555	7	Intergenic	novelGene_24674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTCGAGCGAGCGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947170	1001309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948126_949468_949607_952439_952487_952535_952563_955199_955356_997013_997093_1001156
728489	contig_253_pilon	-	742	7	Intergenic	novelGene_129679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_6	436.090204735977	10728	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	35	667	421711	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421745	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
728498	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
728504	contig_6434_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_61896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAGAAAATGTAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908982	909900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_909000_909900
728506	contig_12638_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_33141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACTGAGCTGTAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193225	195487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_193200_195500
728507	contig_12250_pilon	-	985	6	Intergenic	novelGene_80689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_4	294.802985059514	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400154	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399883_399972_400019_400106
728508	contig_21079_pilon	+	1902	6	Intergenic	novelGene_161210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_5	4.99599839871872	262	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	11	481	42	3204	TRUE	50	TAATGCAGAATGAGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIDMPEHSPEQMGGTMRLGKRRTVFQTKNSVMRKLYGDPEFVEERHRHRFEVNPVLKKCLEEQGLKFVGQDVEGERMEIVELEDHPFFVGVQYHPEFLSRPIKPSPPYLGLLLASVGRLSHYLQKGCRLSPRDTYSDRSGSSSPDSEITELKFPPINHD	31	6681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21079_pilon_+_130_1379_1436_1534_1632_2159_2305_3119_3215_5270
728509	contig_5502_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_154994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418944	421074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_418900_421100
728511	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728518	contig_9202_pilon	-	1633	10	Intergenic	novelGene_168946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	46.9004725028187	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	93	1250	286117	265138	FALSE	35	CCAGCTAATAAGAGCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHIERDKTPATASDTNKPLDALVSLVLRAAMLYLEDYLENAMDQLEQRVSEFFMNAKKNKSEWREEQMTSIKKDYYKALEDADEKVQLANQIYDLVDRHLRKLDQELAKFKMELEADNAGITEILERRSLELDTPSQPVNNHHAHSHTPVEKRKYNPTSHHTTTDHIPEKKFKSEALLSTLTSDAAKENTLGCRNNNSTASSNNAYNVNPSQPLASYNIGSLSSGTGAGAITMAAAQAVQATAQMKEGRRTSSLKASYEAFKNNDFQLGKEFSMPRETTGYSSSSALMTTLTQNASSSAADSRSGRKSKNNNKSSSQQSSSSSSSSSLSSCSSTSTAVQEISQQTTVVPESDSNSQVDWTYDPNEPRYCICNQVSYGEMVGCDNQDVSIESFLFEIENSHRLLLEYFSFVLCLLV	286209	264754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_265267_267566_267760_267991_268186_268797_268956_269241_269362_270145_270218_272100_272198_281603_281670_282798_282900_286089
728521	contig_7720_pilon	-	1946	17	Intergenic	novelGene_155781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	115.541101317886	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	180	1283	860670	798987	TRUE	10	ATCTCCGAGGCTCCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYSTRYGSPKRQLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872314	795753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796075_798644_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_859303_859346_860593_860723_872187
728522	contig_11987_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_168957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATTTCTTTAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199442	197134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_197100_199400
728524	SIRV4	+	194	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1577	632	1122	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
728528	contig_5019_pilon	+	1868	2	Intergenic	novelGene_109202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGATTAAAATTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171550	173463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_172478_172522
728529	contig_5954_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_28799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	444	1332	877	2208	1434230	1432899	NA	60	TAAAAACAGGTGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSFNSSSEIHNTDLTALHGEKNKMLGSQPILAKEGKDCLTLLDVKNMEKPQGTSKDTGDSPVSVEAGVPCSHPPIPASLPEHPAFLSKEVGQMEINKEEESKNPNEVPSRDDKTALDADDGFTLLTAQKPPTEQSEAEGIHTCSLSPSKVLGADVIEKDSPESPFEVIIDKAAFDKEFKDSYKESTNAFGSWTVHTDGESSADITETNDKLFPLRSKEIGRYPASALLTRQFSHTTAALEEVSRCVSDMHNFTNEILTWDLVPQVKQQCDKSDYITKTTGLDMDEYNSEIPIVDLKTNTHQKIPVRSLNGSSLITKSTGGWAETSLPQEEALPDHLDSTKEVSIKGMQDSVKKQDNTLSELPGSLFEKCVSLGSGVTTGKMALPDDRLKDEMNWQSSVLGEATEADSSGESDDTVIEDITADMSFQSNKIQAEKPVSIPSAV	1435106	1432897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1432900_1435100
728530	contig_4742_pilon	-	929	2	Intergenic	novelGene_130988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAGTCCCCAATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201300	200328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_201203_201245
728534	contig_6710_pilon	-	435	2	Intergenic	novelGene_98209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	35	CCCACAAAACACCTATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728537	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	126	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728543	contig_12079_pilon	+	2444	15	Intergenic	novelGene_67404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	139.682511724384	2	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	322	1761	491184	576441	TRUE	25	AACGTTCACTGGTAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLSSKISVVPPTPPPQSENQCCGQTGLQELGQFKGFNKSVENLFLSVTTHMKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKVTLLTIMENLQFVPNLSSLQGPGSPRRLKKEQEISHHSMVNSVW	490862	579200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494839_510897_510963_531245_531298_532323_532394_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571947_575164_575251_576396_576503_577602_577809_578784
728546	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728547	contig_7428_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_77697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAAAGCACTATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250564	274549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_250839_274271
728548	contig_9098_pilon	-	1785	12	Intergenic	novelGene_75845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	168.738146201359	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	508	1377	345261	335775	TRUE	25	ATTTATATCTATGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	348991	335328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335588_335625_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_348781
728551	contig_6374_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_158440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTGATCATTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116475	116918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_116500_116900
728555	contig_10437_pilon	-	2280	16	Intergenic	novelGene_38410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	335.063907668705	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	859	2079	783630	774056	FALSE	30	TATTTTTAAATTTGGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESAD	792972	773854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779203_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783687_784334_784556_784800_784885_786428_786576_788620_788752_789435_789628_792945
728563	SIRV6	+	381	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2780_2829_3106_3165_10724
728568	contig_3588_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_72872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCAGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93624	93154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_93200_93600
728569	contig_12998_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_168965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGCAAAAAACCTCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28744	31153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_+_28700_31200
728570	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3140_10706_10819_11031_11109_11205
728573	contig_16204_pilon	-	2707	1	Intergenic	novelGene_154468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAAACCGTTGAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40992	38285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_38300_41000
728575	contig_8712_pilon	-	1606	8	Intergenic	novelGene_58741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATTCCACAAGACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104147	88702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_88733_89380_89462_90064_90195_90593_90644_93510_93622_99333_99466_101387_101554_103241
728578	contig_6513_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_117735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39562	37814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_37800_39600
728579	contig_15304_pilon	+	1038	4	Intergenic	novelGene_30501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGTTGGCTGGAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52883	57616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493_53828_54140_54295_57504
728585	contig_11285_pilon	-	2708	23	Intergenic	novelGene_5743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	150.815804956886	2	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	7	1407	1229333	1200229	TRUE	35	CCTTAGACAAACTTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIMDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGREAKDLDEMDDDDDDDDIGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGGGHE	1229339	1192612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195886_1198326_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228
728590	contig_2487_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_148487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAGAGAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218468	218021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_218000_218500
728592	contig_4654_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_103074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATGTAGAACATGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486406	485804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_485800_486400
728598	contig_3004_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_127557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGGGCATAGAAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822969	825067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_823000_825100
728601	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_96887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728607	contig_17603_pilon	+	613	2	Intergenic	novelGene_152788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2152	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGTTGCGAAGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60403	61797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_60788_61568
728610	contig_7426_pilon	-	1273	9	Intergenic	novelGene_27547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	177.389225997522	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	73	939	1102748	1087105	FALSE	20	GAAGGGGTTGAGTTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTASRRGPPTVATGGREKSNRSALVKFRLRRVNTRAPTCIDCLWRGTQETARGERAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102820	1086770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102051_1102176_1102705
728613	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
728616	contig_7909_pilon	+	2309	12	Intergenic	novelGene_155903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_4	174.671356108058	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	140	1882	444983	517918	FALSE	30	GTTTAGCTAAATACGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVWPTLLDLSRDECKRILRKLELEAYAGVISALRAQGDLTKEKKDLLGELSKVLSISTERHRAEVRRAVNDERLTTIAHKMNLSLYLGERPSYSMSGPNSSSEWSIEGRRLVPLMPRLVPQTAFTVTANAVANAAIQHNASLPVPAETGSKEVVVCYSYTSTTSTPTSTPVPSGSIATVKSPRPASPASNVVVLPSGSTVYVKSVSCSDEDEKPRKRRRTNSSSSSPVVLKEVPKAVVPVSKTITVPVSGSPKMSNIMQSIANSLPPHMSPVKITFTKPSTQTTNTTTQKVIIVTTSPSSTFVPNILSKSHNYAAVTKLVPTSVIASTTQKPPVVITASQSSLVSSSSSGSSSSTPSPIPNTVAVTAVVSSTPSVVMSTVAQGVSTSAIKMASTRLPSPKSLVSAPTQILAQFPKQHQQSPKQQLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGRYI	442973	518345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_443074_444943_445053_451521_451622_453110_453186_454741_454784_458393_458570_460213_460367_462225_462486_496264_496542_511061_511317_516141_516292_517733
728618	contig_5423_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_85167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTCGCTCTCTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92766	94924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_92800_94900
728623	contig_4783_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_108369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAGAAGAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155384	153963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_154000_155400
728628	contig_12142_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_147808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97846	99927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_97800_99900
728630	contig_10163_pilon	+	2490	9	Intergenic	novelGene_82627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	170.685383088301	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	196	1416	120881	152467	FALSE	45	CCAGTAAACCAAAATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRVNKFFLFLLTLFNLYNGFFFFFPFKITEMIIDMSVTPQIVLEMITSA	87402	153541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_87463_116321_116426_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149848_152146
728631	contig_5279_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_105560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGATAGGAAGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314916	314061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_314100_314900
728634	SIRV4	+	336	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	203	411	203	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
728635	contig_6589_pilon	+	729	3	Intergenic	novelGene_26117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3437	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACAAGATTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1876584	1881096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876593_1880150_1880274_1880498
728638	contig_10023_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_123485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACCACCACAGGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178802	179143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_178800_179100
728641	contig_6163_pilon	+	1721	2	Intergenic	novelGene_103786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	106	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATAAATTCTTGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12396	16576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_13842_16300
728650	contig_20487_pilon	-	867	7	Intergenic	novelGene_154382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	80.0617816994406	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	3	806	22169	8358	FALSE	25	CAGTGTGTTGCAGTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPKLLAATTPARSRRVLLPLLLLLLPTGALRGWEAEERPRTREEECHFYAGGQVYPGEPSRVSVADHSLHLSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFRSINTEVVACSIDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN	22171	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8409_12726_12762_13744_13876_15072_15196_17370_17488_18175_18294_21940
728651	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728654	contig_2854_pilon	-	2284	7	Intergenic	novelGene_120837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	70.6267575985822	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	640	1443	276565	275558	TRUE	20	CAGAGAGCTCTTCCGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTKHHRLERLVASSGHWLKLQSTTACISEHHCLRLTAPLPASHSTTASHLRAPLPASQSTTASHLRAPLPRISEHRCLRLTAPLAVSHSTTASHLRAPLPRISEHRCLASQSTAASHLRAPLPRISEHRCLRLTAPLAVSHSTTASHLRAPLPRISEHRCLASQSTAASHLRAPLPRISEHRCLASQSTAASHLRAPLPRISEHRCLASQSTTACVSEHHCLRLTASLPASHSTAASHQGTPLPGSQSTTASLTLCSIRTGRKRN	277204	257650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262717_264212_264421_274368_274512_275546_275680_275837_276294_276339
728655	SIRV2	-	624	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
728656	contig_8866_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_77789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTTGGAGAAGAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354613	356516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_354600_356500
728661	contig_709_pilon	-	1277	6	Intergenic	novelGene_57597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	85.2065725164438	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	343	1275	2337558	2326797	FALSE	35	TAACAGTGAATGCCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVWTGFLKIGERKLLGGTDFGRNTQQQMSYREQVIHKQLTRLLGAPDLVFLLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQITQRKNEKEQERRMQQAMLSRPVPSENLESGFSPRMPYSAFAAEGRSTLGDAEASDPPPPYSDFHPNNQESTLSHSRMESSVFMPRPQAVGSSNYASTSTGLKYPAGGADLPPSQRAAGDSGDESDDSDYENLIDPTEP	2337900	2326794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2327177_2329518_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200_2334393_2337517
728665	SIRV6	-	549	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1538_1655_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
728671	contig_6361_pilon	-	608	4	Intergenic	novelGene_23994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	147	323	419537	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	420963	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
728673	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	15	1152	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
728676	contig_15410_pilon	-	967	5	Intergenic	novelGene_130626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	467	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGACGCTGCACACCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148533	145559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_145713_146817_146980_147079_147182_147754_147839_148067
728682	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	82	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728684	SIRV6	+	347	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	533	-2	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
728685	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
728687	contig_6710_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_95841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATGCACACTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
728693	contig_5643_pilon	+	1754	7	Intergenic	novelGene_38920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	49.9380171368023	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	189	509	386563	389878	TRUE	35	TCTACAAACATGCCCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELKPGIFPHSQRPRRISFDTYQLSPWLPKSSVSHMQCCWRPLPCITCGSWKTW	385992	392113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_386138_386519_386725_388568_388658_389808_390012_390678_390785_390942_391095_391259
728694	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728702	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
728710	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728715	contig_10734_pilon	+	2205	5	Intergenic	novelGene_51367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	87	junction_4	81.3971743981325	311	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	25	654	1789662	1799702	FALSE	20	GCCACATCCATTCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQCCQCRAMDAPGAQDATAAPGRKELKIVIVGDGGCGKTSLLMVYSQGSFPEHYAPSVFEKYTASVTVGSKEVTLNLYDTAGQEDYDRLRPLSYQNTHLVLICYDVMNPTSYDNVLIKWFPEVTHFCRGIPMVLIGCKTDLRKDKEQLRKLRAAQLEPITYMQGQSACEQIRAALYLECSAKFRENVEDVFREAAKVALSALKKAQRQKQRRFCLLL	1789637	1801253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1789794_1790054_1790143_1798218_1798329_1798409_1798545_1799537
728727	contig_7919_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_28087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAGAAAATTTAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121113	1122649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1121100_1122600
728728	contig_17195_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_168974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGATGCCCACACATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98736	99882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_+_98700_99900
728729	contig_4364_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533269	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
728732	contig_14142_pilon	-	1746	18	Intergenic	novelGene_120600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	132.980655252109	51	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	180	1265	598441	586231	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVMGVKRMPRH	598620	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586260_588788_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
728733	contig_18869_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_56448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGTGTTTTCCTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132541	132782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_132500_132800
728734	contig_14838_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_151905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTGTAAGGCGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108788	107672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_107700_108800
728736	contig_5018_pilon	+	766	5	Intergenic	novelGene_47161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_2	246.180827848149	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	3	518	1498290	1500271	FALSE	10	TGCGAATCTGTGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498287	1500519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
728740	contig_6028_pilon	+	637	3	Intergenic	novelGene_156569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	48	497	291121	296341	FALSE	30	ATCAGTAATATGCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF	291073	296481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_291245_293433_293616_296197
728745	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1073	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728747	contig_11294_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_50047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGACTTCAGTACTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224929	226133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_224900_226100
728749	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728757	contig_10861_pilon	-	1681	10	Intergenic	novelGene_39329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	235.542400051927	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	11	856	1493849	1490156	FALSE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFPGLKRKFRRGRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493859	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
728761	contig_6862_pilon	-	467	2	Intergenic	novelGene_63758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137848	136936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_137324_137768
728762	contig_14694_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_152480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGCAAGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181890	179413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_179400_181900
728763	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728765	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	28	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728768	contig_15236_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_141673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGCTAGTCTGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755808	757011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_755800_757000
728769	contig_15236_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_141674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGTTTAACCCAGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757421	757724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_757400_757700
728778	contig_4103_pilon	-	2785	14	Intergenic	novelGene_51883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_12	28.3440402092683	246	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	535	1845	51852	47855	FALSE	35	AGTAGTTTGAGTAATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVREKILDTVVSCFKRHGAKGLDTPAFELKETLTEKYGEESVLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKCYHVGKVWRRESPTIAQGRYREFCQCDFDIAGEFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGGVSLVEQLFQDPRLSQNKQVLEGLGDLKLLFEYLTLFGIAEKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPNQAGKDSLSMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRMKVFGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIAELWDAGIKAELLYKNNPKLLTQLHYCENMGIPLVVIIGEQEMKEGVIKLRSVASREEVAIKREHLVGEIQKRLSDS	53760	46914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_48833_48991_49235_49326_49455_49761_49856_50128_50228_50474_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53126_53284_53485
728781	contig_5480_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_107220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57368	55352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_-_55400_57400
728782	contig_4501_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_168978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTAGAATTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59494	57354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_-_57400_59500
728783	contig_7338_pilon	+	1511	8	Intergenic	novelGene_156799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	346	402	274093	274149	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQGISWKGSNELFVDLGTFEDLTGLHFSSSLLLANSSAERCSNVCPSKSFASHQLPHGSRTLRLLVRYRLQTLGKLVGFYRVFSVFDSHFINWLWSVIYSLFTSKIDCSYQFEVCMNPSNTINIPTVLQARTY	266506	284997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_266540_269922_270012_271333_271414_272612_272716_274052_274183_278433_279217_281307_281403_284799
728785	SIRV4	+	206	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1565	632	1110	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2565	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
728788	contig_3380_pilon	-	821	4	Intergenic	novelGene_60093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	25.694789787469	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGTGTCCTTTGGATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373175	370256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_370657_370961_371111_371942_372104_373064
728792	contig_5961_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_144183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCCAAACCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299294	297906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_297900_299300
728798	contig_4891_pilon	+	1063	5	Intergenic	novelGene_124561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	564.395916002233	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	102	656	701017	733933	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPW	700915	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733934_756579
728802	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728810	contig_1339_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_163127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCAGGTGAGTAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354423	353636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_353600_354400
728812	contig_10749_pilon	-	844	5	Intergenic	novelGene_133444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	881.972044624998	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	151	462	149508	136250	FALSE	25	TGGATGCCACAGTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	149658	135867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_149498
728816	contig_19727_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_168986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAACAAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176	498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_200_500
728818	SIRV7	-	284	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69001	1	35782	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78956	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
728820	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728826	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
728828	contig_13780_pilon	+	1568	3	Intergenic	novelGene_149010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	187	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	71	322	292779	294587	FALSE	0	GTGGTTCTGCTGCTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYVTFRVVGCGSSVRRSRSSCAEMLQGLIKNVWIPMKPYYTQAYQEIWLGTGLMSFIVYKIRSAEEEENFICEENFEDMAAVSPARAVACSHSIFGSSLAVLGCET	288612	295833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294459
728829	contig_5690_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_119752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCTGCAGATGGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093581	1094047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1093600_1094000
728837	contig_610_pilon	-	1438	9	Intergenic	novelGene_76856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.460746825865	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	2	1066	390350	379011	TRUE	35	ACATTACTGGAAATCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSADHVIHPSGESLWLRPPNLELNKAYSVQWKVQFSSSAICEILTWRGNCSWTPTPCVLEHFNNTLKFICKELAILIEGAQQQDSGFYFLEVTDKSGKIQKTKFQVSVLEPIEKPDLQGRLKELDDGTCQLNLSCSVSRDENVSYAWYKGKKLIQPWGNLTHLVEHIDVNGLHIYTCNVSNSVSWANHTLILPGDCLRTQQNVIFPRLLVIIFAILLVILCLGTLISFCVWRRKRKQSSESTEEECRTVYERINHLPLRRNQEQEQEQEQEQNSSREDRTIYSRIQSQKSASLLPKNENTVYSTVQSFQKSGSKKNHGPSSRCTVYEEVGKRQLRAQNPARLSRRELENFDIYS	390351	378255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_378482_378864_379092_380222_380277_381346_381413_384549_384628_387146_387218_387817_387929_389658_389935_390022
728838	contig_5253_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_61594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTACACCTTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349536	351169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_349500_351200
728839	contig_5253_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_61595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATCAAGCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351222	352210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_351200_352200
728851	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_90567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653856	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
728852	contig_11338_pilon	-	1563	12	Intergenic	novelGene_6377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	284.307917117229	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	299	694	319426	307334	TRUE	25	AAGACCATGCATTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGGRPRADCDHLHGARPLSPLPSSGGPHLCPV	323314	298712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_301732_301822_306727_306964_307230_307429_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
728853	SIRV5	+	362	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	970	-10	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGCGGCTTTGGTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	2388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2000_2400
728854	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
728862	contig_6654_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_85711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCACCAGAGGCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208777	208384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_208400_208800
728864	contig_1154_pilon	+	1663	4	Intergenic	novelGene_87160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	191.809511987516	6	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	19	783	896007	901946	FALSE	15	TTGTCCTGTGTGATGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLVLIRHGESTWNLENRFSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKDRRYADLTEDQLPSCESLKDTIARALPFWNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	895988	902826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900253_900808_900990_901776
728865	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728866	contig_11136_pilon	+	464	2	Intergenic	novelGene_169012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8858	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	47	358	127946	128257	FALSE	5	GCTGCTGTCAGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVLAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKSKAKAQSKAEAPAKASTQVLAPGQAPKGTQAPTKASE	126138	128363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_126150_127910
728872	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	88	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728873	contig_17127_pilon	+	2427	2	Intergenic	novelGene_168297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	36979	39455	FALSE	15	CTGCAAGGCTTGCCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLTFSVCGALSPHGGLTFSVCGVWSPHGGLTFNICDVLSLDPKLLQKIEVLFGDPQEGGCREAEETSSEQTPRTLSRGLGKAFRPAPSVRQEAFALTSLVLQHTPRDAPGFLLSQLLLGATED	36978	41507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_37120_39221
728876	contig_7945_pilon	+	2498	5	Intergenic	novelGene_161588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	16.6508258053467	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	241	981	366072	500623	FALSE	75	TGGAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTIKEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSNDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQPPTRVTIKMECNPNQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHIPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYSLPDVDILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGNAALPSRPQYRCKGLSTGCML	365831	502140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_366090_433799_434018_465816_465969_499460_499665_500474
728878	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRNDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653878_657138
728879	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728882	contig_2710_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_161779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCCTCCTCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944578	945581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_944600_945600
728883	contig_5569_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_86711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	542	901	12089	12448	NA	85	AGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQGMKPQNLLLNFVLVISDLKENRATFLFSVVSPVWVCCQGASETVERPRGPERTRLSELGALMDVSHIQGSQHTSGPSVPFCLLLLQISHWKPGPLGSSQNSWFTMRSFICSADIC	11547	13904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_11500_13900
728885	contig_5020_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_27832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	416.140225765306	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	363	800	122915	124268	FALSE	10	CAGGCCCGGGCTGGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQA	118462	124268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167
728886	contig_6272_pilon	+	2647	4	Intergenic	novelGene_160445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_3	19.2238278070616	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAGAGAGAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133473	148738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_133679_136037_136095_139069_139111_146394
728888	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728897	contig_21027_pilon	-	1074	5	Intergenic	novelGene_127573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTTGAGCGGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8829	1855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_-_1873_5165_5249_6358_6480_7910_8335_8400
728901	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
728905	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
728907	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728909	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728911	contig_11417_pilon	+	180	1	Intergenic	novelGene_103276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATGAAAAGAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330223	330403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_330200_330400
728913	SIRV7	-	251	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91669	6	-91663	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAGACAAAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
728917	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	348	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
728919	contig_7457_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_31463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCCAGAAATAAACCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497496	496806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_496800_497500
728920	contig_18859_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_150558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAACCATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194340	194597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_194300_194600
728922	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_17616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
728923	contig_5153_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_74409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAGAATTTTTTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021329	1022889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1021300_1022900
728926	contig_7580_pilon	+	1320	5	Intergenic	novelGene_108598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	132.821308531425	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	197	931	103420	109647	FALSE	20	TTTCATCTATATTTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLNVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96447	110036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_106952_107190_109428
728928	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
728933	contig_6710_pilon	+	538	2	Intergenic	novelGene_97280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
728937	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
728941	contig_12689_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_145028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAACCTTTCCCAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34546	35550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_34500_35600
728942	contig_4232_pilon	+	1033	4	Intergenic	novelGene_63207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	77	577	146362	149200	FALSE	55	AGGAACCTTCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146285	149656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
728944	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
728946	contig_10324_pilon	-	1975	8	Intergenic	novelGene_7904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	27.3861278752583	462	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	106	1191	797734	793056	FALSE	20	TAATTTACGCTAGCTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLWAPLWPRVGFLCLLLAGAAWAPLPNPPDPKFERKVALLGAGPEELLCFTERLEDLVCFWEEAASVGVGPDNYSFTYQLEGEPWKLCRLRQALTAHGAVRFWCSLPTADTSSFVPLELRVTTTSSGAQRYRRIIQVNEVVFLDPPAGLLARQADEGGHVVLRWLPPPGAPMASHIRYEVDVSAGNGAGGAQRVEILEGRTECVLSNLRGRTRYTFAVRARMAEPSFGGFWSAWSEPASLLTASDLDPLILTLSLILVLILLLLAVLALLSHRRTLKQKIWPGIPSPESEFEGLFTTHKGNFQLWLYQNDDCLWWSPCTPFVEDPPAPLEVLSERCWGGDTGNRARRRRRGAPAGASGQ	797839	792271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_793227_793310_793399_794810_794899_794982_795137_795661_795820_795896_796076_796553_796687_797619
728950	contig_6230_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_102085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1534	1917	114508	114891	NA	35	GATTTGACTCTTAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWFLPITCPKYMRRSLAILASKEHSGCTSSKIDLFVLLAVHGVFSIFCQHHNSKASILPYSSKASIFLIHCRISYAYEAIENTMAWVRHAFVLKVMSLLFNTLKRSFAADLLQSVDYQGCFS	112974	115634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_113000_115600
728962	contig_14142_pilon	+	2357	9	Intergenic	novelGene_120490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	31.6188235075248	5	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGTGAATTCTGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307858	318471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308467_308566_308669_308814_308856_309006_310036_311305_311383_312644_312815_313548_313645_318077
728964	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
728965	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
728966	contig_7080_pilon	+	2529	9	Intergenic	novelGene_100091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	84.9189871289101	816	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	109	921	488513	540726	FALSE	5	GTGTCTTTTTAGGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSRALLPCVAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460773	542334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654
728967	SIRV6	+	561	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
728969	contig_2867_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_135164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	622	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	1589	1981	550083	550475	FALSE	40	TTTGTAAATAAACTCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGVAWDTSSRTSLEGSPCPKLLLLGTSCTQEGAGPPKGPHCPQTPQCPLFKTKSSFFFWYGDHDRYLFTAGKDLGSLPSMPLNLPDSWSFRRGLAGEGPGVNGCWDLCISWVSLATSLGQNLSGPGCCDL	548083	550475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_549515_549925
728970	contig_12837_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_57373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331496	329038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_329000_331500
728975	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
728976	contig_18869_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_56256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAACTTGAGAATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73352	73548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73500
728980	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
728981	contig_2867_pilon	-	2824	1	Intergenic	novelGene_135214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTTGTTTGATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019801	1016977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1017000_1019800
728986	contig_13428_pilon	-	1443	2	Intergenic	novelGene_143452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGGATTAACTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157419	150847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_152207_157335
728989	contig_14362_pilon	+	1024	9	Intergenic	novelGene_142502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	94.9772999195071	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	614	817	10276	18437	FALSE	30	TAAAATCAGCATTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETSSALTHAGAHLDLSAFSSWEELASLGLDRLKSALLALGLKCGGTLEERAQRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYEDSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL	4682	18644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_4753_5174_5243_5400_5509_6338_6409_8660_8826_8930_9042_10254_10346_17259_17316_18359
728993	contig_10962_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_103902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	320	460	332259	332119	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLACNPEGPGFDVSDLEDPGRDSFVLGRLTLGLKRAAQSNFEEPPVLLCSFSLLLLLGLGLDAERERLALFWSFPCFTLAPGGTVEEAEATAEDEEEVDAAEESVMVLHPALAEAADFEASLVGFADLSSAPVDSDTEPLFIQELSVLFLF	332578	330681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_330700_332600
728995	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
729006	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729007	SIRV2	-	622	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	21	2974	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCTAAGGAGACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
729012	contig_8697_pilon	-	2664	1	Intergenic	novelGene_83207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACATCTGGTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19127	16463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16500_19100
729013	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729015	contig_1331_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_37825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159757	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159200_159800
729019	contig_1575_pilon	+	965	4	Intergenic	novelGene_45182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	749	junction_3	238.245438338049	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAGGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149382	168263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_149638_150137_150247_166978_167135_167818
729020	contig_1575_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_45186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCCAGCTATTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168213	169309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_168200_169300
729021	contig_14220_pilon	-	1636	7	Intergenic	novelGene_159863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	402	junction_6	270.571257814934	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	209	1177	422880	325890	FALSE	40	TTATAATCTAGAAGTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVVVIFPILLW	423088	325430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_326126_331917_332090_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
729028	contig_5039_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_64829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCAGGCCACTGGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268146	269046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_268100_269000
729031	contig_17964_pilon	+	2240	4	Intergenic	novelGene_33920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1771	2190	431407	473048	FALSE	25	TTACCTTTCACTCCGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQFIHRTYLMFCMNVIPSRPSMFAIIIAASTTSSSPKLLTMLPLKEVVHHSVVLGTACNSYRSWDRAGVCPSCKSLICSWLWLRLRPCSRCQNNRHVGISWFLRVMFQVGAERVLPKHCFSLQDTCNAHSTNTGGALG	410772	473098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_412501_431364_431430_468565_468941_473026
729038	contig_934_pilon	-	1489	10	Intergenic	novelGene_129019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	299.201571264112	1655	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	538	879	158890	150570	TRUE	40	TCAGTGGAAAAGCAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAEKKVLATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPDGVPVEGSRYAADRCRYRRGYYGRRRGPPRNYAGEEEEEGSGSSEGFDTPATDGQFSGAQSQLRRPQYRPQYRQRRFPPYHVGQTFDRRSRVFPHPNRMQADEIGEMKDGVPEGTQLQGPVHRNPTYRPRYRRAPPRPRPAPAVGEAEDKENQQAASGPNQPSARRGYRRPYNYRRRPRPPNAPSQDGKEAKAGEAPTENPAPATEQSSAE	171978	147858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153_151326_152947_153046_158884_159092_161354_161478_163597_163688_166796_166831_167819_167884_171953
729039	contig_6557_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_33034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647824	645650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_645600_647800
729041	contig_18869_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_56468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTTCACCTAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192576	194784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_192600_194800
729044	contig_6048_pilon	+	1267	11	Intergenic	novelGene_73254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	65.8741982873416	665	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	58	1029	1972099	1978064	FALSE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLRLRPLTSVPPACSPAAMHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKCKPSLPSGAKEAVQELENQIKERQGLFFDMEAYLPKKNGFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972041	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
729045	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729046	contig_14142_pilon	+	2312	14	Intergenic	novelGene_120430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1473	1904	45731	46969	TRUE	25	AGTTTTGGGGACTCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQQLLPVVRIHILLLLDDLPLDFLNLVFFPHNVLCHLEGAEILIHVLHISILSCILIPVQEPSDGLIVIVDHTAVLLLVLSCSFSSLNSSSVPNLRMSSSSCLDMEPAFEPSPGRTTRCVNIIFLLATCVIRSSTEARVTNR	37532	48429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_38039_42692_42843_42947_43073_43196_43353_43517_43666_44235_44368_44522_44618_45102_45163_45630_45809_46300_46471_46785_47016_47207_47334_47556_47670_48306
729051	contig_14925_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_55373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129478	128117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
729052	contig_14068_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_165955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTCCAGGCTCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7163	8442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_7200_8400
729053	contig_6031_pilon	+	1170	8	Intergenic	novelGene_56731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	492.15059085775	971	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	67	1008	149114	165819	FALSE	20	TAATAGCATCCTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRCWMLVCSYSETNSHTSALTASMIQIHTGCLICISLFSPPSSPMRCFTYHGPRCCCLLVKNIQLNLQMILTEAEIDAHLVALAERD	149047	165981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_164071_164273_165761
729059	contig_10734_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_51048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGAGAAAAAGATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408400	409468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_408400_409500
729060	contig_9053_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_87918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50180	51133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_50200_51100
729072	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10707_10819_11031_11109_11205
729083	contig_5023_pilon	+	1059	10	Intergenic	novelGene_7351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1505.91456154281	1	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	280	1011	618569	639062	FALSE	40	AGAAGGTCAACGATGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRNHS	611799	639110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_611807_614422_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639049
729085	contig_6710_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_90670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCATCAGCCCCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
729093	contig_6048_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_73184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1912	2253	1335948	1336289	NA	85	AAAAAGAAAAAATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVEKFSVARSTANKTPSCLGVGWTCGPQALPRGPLRRKLTPGEGRSPARPTVGRKAASSPKGPADHPTHLAEAFPFMPWLSPSLSCCSCLFERKPSNKIIAPIPRRVFIFL	1334036	1336800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1334000_1336800
729094	contig_10428_pilon	-	2787	16	Intergenic	novelGene_162596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	35.6106101542161	42	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	7	2010	289409	124608	FALSE	30	GTAACCTAAACTTCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQMASQVASPSASLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVRKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGGTDRLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAVNELQDELMTIRLREAETQAEIREMKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVNSLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAELECKSKEEVMAVRLREADSIAAVAELQQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIRELKDQIAELNHEVSDKF	289415	123830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_124722_161231_161328_169144_169292_186894_187054_189306_189448_191834_191970_221148_221203_235341_235403_241361_241460_241564_241655_242787_242932_244580_244707_250833_250909_252244_252470_253328_253519_289260
729103	contig_5988_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_15947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTGTGGATTGGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651787	786487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652488_786331
729107	contig_20314_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_125653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCAAATATCACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80932	82501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_80900_82500
729109	contig_5018_pilon	+	812	6	Intergenic	novelGene_47145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	459.389856222359	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	70	558	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497678	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498447_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
729110	contig_17144_pilon	-	1362	8	Intergenic	novelGene_29491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2123.60157107049	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	328	1119	179764	166321	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLPAP	183409	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166334_173644_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
729113	contig_990_pilon	-	2181	1	Intergenic	novelGene_76070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGAAATGCCCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083585	1081404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1081400_1083600
729115	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	251	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729117	contig_5574_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_155851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTTTTAATTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138639	139411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_138600_139400
729120	contig_8330_pilon	+	1233	8	Intergenic	novelGene_71770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	229.416028833459	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	208	1017	654823	658351	FALSE	15	CTTACTGTTTGTAACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSELGQRVGEGRTAADTDPRLLPGPRGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVFMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	653832	658567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_654027_654809_654977_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
729121	contig_990_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_76128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2121	2531	1588008	1587598	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLLWSPFFSPHNKRNLSARGLAFPLTRHSEWCAQGLAFPLTRHSECSARGLAFPLTRHSECSARGLAFPLTRHSECSARGLAFPLTRHSEWCARGLAFPLTRHSEWCAQGLAFPLTRNSEWSQGLWAPLNAHGA	1590128	1587581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587600_1590100
729124	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729125	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
729128	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729130	contig_9515_pilon	+	1663	4	Intergenic	novelGene_73832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_3	144.873124568438	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	493	942	68062	68511	TRUE	0	TTTCCTTGGCTCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPQWTALLRGEREVKTLPPSCLPPYCMGSRAQAAALTALPTSLQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVEGTLGWVAGSLCLEVARRGGDHLGGMWVAGGGWQEGSGVLMRSVAGSQGAYV	67569	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_68824_69343_69477_71788_71878_72464
729134	SIRV4	+	226	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1545	632	1090	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
729137	SIRV6	+	553	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11040_11109_11205
729138	SIRV6	+	564	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729152	SIRV6	-	574	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	418	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAGGCGGCGCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
729153	contig_2933_pilon	+	687	5	Intergenic	novelGene_111380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	66.027929696455	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	9	686	1088869	1099831	FALSE	15	TGAGGCCTCAGTTCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMEDLGENTTVLSSLRSLNNFISQRVEGGPGLDVCASVPGSLQMQYQQSMQLEERAEQIRSQSHLIQVEREKMQMELSHKRARVELERAATTSARNYEREADRNQELLTRIRQLQEREAEAAEKMKEQLERNRSCRQSLDAANKKLREKEDGLAEANETISMLKGRISELQWSTMNQEMQVKGLESEKQELREQLDAQHRKWQEANQKIQELQASQEVRVEHEQKIK	1088860	1099832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1089019_1092650_1092792_1095538_1095719_1098493_1098619_1099749
729154	contig_16666_pilon	+	2133	2	Intergenic	novelGene_61783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	1	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	44	1111	116861	117928	FALSE	65	CAACAAAATAAATAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106120	118950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851
729156	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
729158	contig_8820_pilon	+	1753	6	Intergenic	novelGene_79281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	150.60066400916	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	603	1529	130154	133364	FALSE	0	GGCCCGGCTCCCGCCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISKMLKMQMLEDEDDLAYAETEKKARTDSTSDGRPTWMRTLHTTASNWLHLIPQTLTHLKRTVENIKDPLFRFFEREVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRSWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERVKQLQSISLAAASGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQANSWSLEELCLEVNVTTSQGATLDACSFGVTGLKLQGATCSNNKLSLSNAISTILPLTQLRWVKQTNAEKKASVVTLPVYLNFTRADLIFTVDFEIATKEDPRSFYERGVAVLCTE	129551	133588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132604_133235
729161	contig_9345_pilon	-	1410	4	Intergenic	novelGene_24479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATCTATGGAGGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631657	628310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_629160_629774_629841_630941_631026_631246
729162	contig_10982_pilon	-	499	4	Intergenic	novelGene_87849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATGGAAAGTTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54175	16014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_16142_38713_38841_51274_51489_54144
729164	contig_5542_pilon	+	3137	1	Intergenic	novelGene_169036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACAAGTATCTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278223	281360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5542_pilon_+_278200_281400
729167	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_16378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27825	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
729171	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10721_10819_11031_11109_11205
729173	SIRV6	+	634	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	24	222	24	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10261	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
729174	contig_6418_pilon	-	2026	11	Intergenic	novelGene_81219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1200	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1501	1953	1388802	1364224	FALSE	15	CTCGGCTACAACCTTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGSKVTLQIAGCEHDDFIAQGLRTIPCFDLQNAPACSLHRVIVKAIGIPILVQYVFDSHCLFRTLPVHSCIVDFCSSAAPRRPAASAAATATAAAGPASWAARGAPLGCGWTSLRRRDLRSAGLGGRSGGDSCCKSCFLTRSRAPRLRG	1444785	1364150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1364448_1375712_1375938_1388798_1388880_1390217_1390359_1409653_1409795_1410275_1410421_1428927_1429141_1429231_1429373_1441100_1441348_1441958_1442064_1444495
729177	contig_854_pilon	-	1424	2	Intergenic	novelGene_36304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCCCAGTTTTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558019	552261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_553618_557951
729184	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729186	contig_266_pilon	+	2501	2	Intergenic	novelGene_166295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCACTGTAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444730	479522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_444748_477038
729191	contig_12057_pilon	+	2279	20	Intergenic	novelGene_131633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	44.3910474865474	1	82	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	56	1516	121149	155594	TRUE	5	CTCTGCCCTGTTCAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGLPAWNRTWCWVFSECSRGSLWHQL	99508	162064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154527_155514_155642_156319_156397_157622_157722_161524
729192	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
729195	contig_7180_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_169043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTATGACATTTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294348	293381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_-_293400_294300
729196	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_96233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729197	contig_9440_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_59116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGTTTTATGGTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788688	1789721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1788700_1789700
729199	SIRV6	+	572	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729202	contig_14322_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_115648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	917	1327	411099	410689	NA	35	TCGACGGCAGCTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLIQNLHIDQEAVAGTEQGDTVWFKIRKGACQGCILSSYLFNLYAEQIIRETGLYEEEQGIRIGGRLINNLHYADDTALLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLSIKKTRNPHKWTNKQHHDKCRKD	412015	409853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_409900_412000
729203	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729204	contig_10323_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_123626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	122	448	485119	485445	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTRHLTRPCIRTRLVHLWLAKKAQPLRPGLDAGLGNTGSRGGALPASQRWRSQAAHAGLPTCFLDTFTRGKEKQKQMKPQTGNNCWKRREDSGDQFVGLEPLKIHI	484997	487323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_485000_487300
729206	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
729207	contig_7293_pilon	+	1990	3	Intergenic	novelGene_54260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5570	1	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATTTGCACACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335674	338170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335700_336082_336241_336363
729209	contig_9833_pilon	+	1082	7	Intergenic	novelGene_68538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	199.700956988749	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	19	717	230823	259972	FALSE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANFLHHQ	230804	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250168_259953
729214	contig_12270_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_113616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	307	354	14384	14431	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGKAQSNRDMRNRVCGTILLPLPA	13850	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14137_14363
729217	contig_18869_pilon	-	592	4	Intergenic	novelGene_56413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_3	1442.53719382051	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	33	392	79419	74943	TRUE	10	GCTTGGATGACCGGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79451	73599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73786_74928_74957_75486_75766_79352
729218	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
729221	scaffold_6394_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_111031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2426	junction_4	206.540552918791	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	65	583	405059	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	403341	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
729222	contig_19730_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_142497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACTGATTACTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152270	153523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_152300_153500
729223	SIRV2	-	198	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1	1080	1	-1080	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATACCAAATGGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
729228	contig_10005_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_148919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTGAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171067	168445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_168400_171100
729231	contig_7840_pilon	+	2340	11	Intergenic	novelGene_69038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGTCCCAAGCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365187	445709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_366116_367533_367652_373195_373367_378781_378875_389411_389509_393093_393317_395376_395442_403143_403288_406620_406876_427592_427738_445608
729238	contig_10197_pilon	-	2252	13	Intergenic	novelGene_115282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_12	511.986728072342	35	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	94	2004	1197388	1190847	FALSE	5	CTTGGTTCTTGATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTVRPCPHGLNFSGLFSFYT	1197671	1190598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1191039_1191152_1191273_1191416_1191607_1191693_1191814_1191979_1192171_1193341_1193448_1193543_1193670_1193759_1193973_1194097_1194317_1194408_1194574_1196589_1196759_1197288_1197400_1197589
729239	contig_13744_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_77220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	358	891	1155368	1154835	NA	10	CTTCTGCATGTGGCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDRRRINAFELLCWQRILNIPWTVRRTNKSVLEKIQPECSLEARMARLHLTYIGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSTRWIDTVTATMCSSITMIMRMAQDRAEFRSVVRRVAMGQNRVDAPNNNNLTNHCQNQGHKNLCLFSLKSFIVLAPTFWSWMRFYLIFVYGMR	1155725	1154819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1154800_1155700
729240	contig_7338_pilon	+	1950	10	Intergenic	novelGene_156789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGACCTACACGCAAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27171	137873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_27609_52200_52297_53883_54033_101597_101674_105841_105970_109944_110054_110149_110324_120527_120758_122700_123219_137840
729241	contig_15236_pilon	+	2616	2	Intergenic	novelGene_141667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	51	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	728276	728647	TRUE	15	CCTACCACTGTTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGGRRGAGGLSAFAPHPLCAVEAGAAVGLSTESAPSGPLLSSSCCRSVGALCPVWATLSPPQANAQSEVGVTEDYRQGSPVWGSVKSSKRITQPSSKSHLELWECWPLSDFERGAATPLCLV	728275	735064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_728791_732963
729244	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
729245	contig_5988_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_16027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	267	801	13	813	785923	786723	NA	15	GCCCGTGAGGACATGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSE	785910	786723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_785900_786700
729249	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729250	contig_16098_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_45800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAATGACAGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64443	64960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_64400_65000
729251	contig_12157_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_135890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGCTTACGTAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80798	83098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_80800_83100
729252	contig_6069_pilon	-	1758	8	Intergenic	novelGene_8066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	25.0354850203483	150	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	114	1133	515909	498920	FALSE	15	TTGATTTTGCTCTCAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPSLQPPPHRDFISVTLSLGESYDNSKGWRRRSCWRKWKQLSRLQRNVLLTLLAFLIICGLLSYMNTTHHWKALSGRSSEKQKARPDIPGLKPVNPPVLPAPQTAGAAQQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	516022	498294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501463_514309_514420_515227_515337_515795
729253	contig_7594_pilon	+	1141	4	Intergenic	novelGene_55428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	791.371102721234	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	50	517	539045	554556	FALSE	15	GTGTTTTGTGATTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	538995	555180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_551173_551292_552953_553000_554349
729254	contig_6589_pilon	+	1670	10	Intergenic	novelGene_25934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	272.241087781663	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	91	1173	1228758	1258163	FALSE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVAPQVLLCCVGCPNSAAPGSKSVLHLSVPSPRACPLCVQLSWFSSSLDEPNLGRPLPV	1228256	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228890_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1257986
729255	contig_5031_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_133189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTGATGGACTTTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22687	24681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_22700_24700
729256	SIRV2	-	655	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	-1	2963	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
729259	contig_12490_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_169046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGTTCAGCCTGGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2818	3241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_+_2800_3200
729263	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
729265	contig_15491_pilon	+	1324	2	Intergenic	novelGene_75978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCCATAAAAACTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80068	81656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_80971_81234
729272	contig_3588_pilon	+	2327	2	Intergenic	novelGene_72897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1359	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGAAAAAGGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135943	139324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_136117_137170
729274	contig_16504_pilon	+	2231	4	Intergenic	novelGene_167948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.25967446224258	67	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATCTTGTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694500	699943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_+_694791_694913_695362_697839_697942_698552
729277	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
729285	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729291	contig_4068_pilon	-	2196	20	Intergenic	novelGene_161698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	54.042150370063	2	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	491	1405	108207	78306	TRUE	35	GCTGATATGTTGTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVNGNTALHYAACGQNISIAAKLLSHNANIEARNKNDLTPLLLAVSENKQQMVEFLVKKEANIHAVDKAKSNRQLISEYKEEKRPKNSSQNNNPDIEIQESPRQISRRTESRKVDESSDEDSSSRLSKKPGVDDSWPTSDDEDLDLGIQNVAKPNLTKLITASQQSRKNIEEKPSIVRPEKRTLFEDSNSDSEDEDVVETLPKPSFTVQGFSHPAFPPSDPPLKPSLNFSAVPGVTKEGAAKPAVGKRENSIDIIESAPREQRNNDNLTYIDGAHKNNRSDMMSALGLGEEEDVESPWDSEIV	113775	27411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_27449_28917_29132_34322_34465_34756_34791_42831_42996_61062_61146_78188_78315_83468_83531_83831_83962_85997_86201_86292_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102902_108099_108274_109188_109304_113408_113494_113551
729293	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-9	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729295	contig_6576_pilon	+	1472	2	Intergenic	novelGene_42387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1604	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	147	890	1288392	1289135	FALSE	25	TTAATACTTGTACTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTGHYLHLAWLMTTVFFLSPGTKANYAHLWANNTIWDPVIQNKTGKNQDENINTNPITPEVNYKGNSTSKPEIATSSHIISLTPKSEQIYTLSVLRNSSPPVQNTENTSKSHSEILKKDVCDENNNKTAMLICFIIIAVLFLVCTLLFLSTVILANKVSSLRRSKQAGKRQPRSNGDFLASSGLWPAESDTWKRAKQLTGPNLMMQSTGALTATRERKDEEGTETLTNRCFNEEKCKVAMRKTME	1286457	1289717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1286583_1288370
729300	contig_12414_pilon	+	2848	17	Intergenic	novelGene_59627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_1	329.869647550362	46	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	51	2516	653015	695975	FALSE	15	TTATACTTGTCTTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAAAADPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPARHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGVRGLRALGVRDLSYRLVFLACSVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDIRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPVGGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEDSIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKRLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEESQMEVDEGPGGINGHVDSPAPENGINGHVDDINQESVPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVEEEQDESALKRSELINWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIQRLTRYDHVLIELTQAGLKGSTGESESYEEDPYLVVNPNYLLED	652964	696307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653122_655641_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_679840_679949_681136_681293_683109_683239_684738_684901_690260_690397_690966_691123_693031_693172_695858
729305	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_89612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653779	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729306	contig_4131_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_127883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAATAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242810	240654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_240700_242800
729308	contig_6364_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_51705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTAGTGCATGGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433138	431221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_431438_431924
729315	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729321	contig_6397_pilon	+	1004	5	Intergenic	novelGene_146263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAAAAGCTTACCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473439	523346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_474008_475530_475678_516800_516920_520171_520265_523269
729323	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729326	contig_5571_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_75518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	557	940	142023	141640	NA	65	AAAAAAAGAAAAATTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLREPDGFVLVFCVIYGKPAGVPAINYISSSHWYMVMPQIGGATVSLTSLGGLYYKITFLKIHIPVAIELIPTNSDRVIGQSRTAPLGFQGAAGVFELPTFWLTAEFLTTASTKNLKHLISKHAFQY	142579	141576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_141600_142600
729329	contig_2455_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_119235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAACCTAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472235	1470187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1470200_1472200
729330	contig_11987_pilon	-	1581	3	Intergenic	novelGene_168953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42	232	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTGACTTCTCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181923	174517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_175787_180782_180844_181672
729331	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729332	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1183	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729336	contig_6117_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_167314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTCTTAAAGGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170490	169796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_169800_170500
729344	contig_10583_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_167925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAACAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239508	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_238200_239500
729345	contig_10583_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_167924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAAAAAAATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238191	236377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_236400_238200
729348	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
729353	contig_2161_pilon	-	1974	10	Intergenic	novelGene_114910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.7986254052039	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	999	1634	766929	760543	FALSE	30	AACAAGGTGATGTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHIWSENTIWPQGVLVRHSRCLYRAMGPYNVAVPSDVSHARFYAIPISSSIKAVKSAYPY	792850	760202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763648_763774_765726_765915_766656_767006_773463_773619_775907_775958_778784_778869_782626_782794_791191_791379_792571
729355	contig_6710_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_89097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653600	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
729358	contig_7457_pilon	-	1595	5	Intergenic	novelGene_31597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.88964618645	79	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	293	1480	960838	955529	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVYSDGTPGLVSTPALVCARTAFPRLLLPKGLSAKTLCPLRGAQGGGASLEEKTVYTLVAFKSPDGAVVQCWSADRKNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSPPLPSAQ	962345	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955552_956526_956939_958234_958375_960225_960896_962110
729359	contig_4857_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_48897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATATTCTGTTGTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471459	1472321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1471500_1472300
729361	contig_13501_pilon	+	1645	2	Intergenic	novelGene_169058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	466	795	14989	15560	FALSE	45	AAAAAATCAGGAGTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHTITTASTSVSPEELDGARLPAPTSVVGITVRIPDRAGEKYRTKFRFTKEDQTYCLTETEGTWTLWALDTLLTQNWSHSRSSLFSQRLHRSIKRTVTPTHTHTQNYV	14523	16410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_15289_15530
729362	contig_6100_pilon	+	817	7	Intergenic	novelGene_168125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	65.3265302580472	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	21	815	529838	656737	FALSE	20	AAGTACTGCATCTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAMRMAAAGTKLCVLVTSLGSQAARGTAVRTLCSQTVSVNERIENKRRAALLGGGQRRIDAQHKRNFTVFGGSLSGAHAQKICKIMDQALTVGAPVIGLNDSGGARIQEGVESLAGYADIFLRNVTASGVIPQISLIMGPCAGGAVYSPALTDFTFMVKDTSYLFITGPDVVKSVTNENVTQEELGGAKTHTTMSGVAHKAFENDVDALCNLREFFNYLPLSNQDPAPICECHDPSDRVVPELDTIVPLESTKAYDMEDIIHS	529817	656739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_530039_549632_549690_551680_551795_634297_634409_649660_649770_654387_654509_656655
729363	contig_6227_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_49825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTGTGTGATACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383599	1385974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1383600_1386000
729367	contig_6589_pilon	+	1402	9	Intergenic	novelGene_26041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	912.949812078955	6	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	78	803	1725483	1729133	TRUE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLVGGSSPSSGSSEEKMWPSAPKRSQPWKSYGAALLCTRAVAMSQNPLEAGAEGARNGAGDDPELPRQPGGDGGRGELGLRAVPAALLRLEFSAGLAPGPQPERQRVGGVPRALLLLQLVVDQRLRNLR	1725405	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1727822_1727965_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
729368	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
729371	contig_15063_pilon	+	558	3	Intergenic	novelGene_10594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3096	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	233	556	34808	35243	FALSE	35	GCCACAAACCTTCCAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGS	27136	35245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037
729377	contig_11855_pilon	+	2102	5	Intergenic	novelGene_66898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	18.1176709319934	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	238	801	713170	718345	TRUE	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQCKLVHRKGVLL	712932	728086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_713233_716703_716852_717594_717678_718075_718876_727315
729378	contig_9833_pilon	+	1331	8	Intergenic	novelGene_68556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	155.575823104665	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	429	851	252363	256957	TRUE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMLSFWSEALPRPRHGWLATPLIARLSRGHRWTRLSLRRFLAISNLGSRRGAKLLCGGGAAADRGYFIQPTVFGDVQDSMTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVW	248787	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_248817_249384_249497_250051_250154_251795_251891_252272_252458_254644_254811_256795_256966_259865
729379	contig_10734_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_51096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTACCTCTACCAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565299	564045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_564000_565300
729386	contig_7593_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_127364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCCCAAATTTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705668	706022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_705700_706000
729394	scaffold_2602_pilon	-	2642	2	Intergenic	novelGene_127691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGTATGGGGAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38355	35602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_37627_37737
729398	contig_3832_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_161467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGTTAACAATGATGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379361	377996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_378000_379400
729399	contig_9901_pilon	+	1769	10	Intergenic	novelGene_126919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	139.369036715699	734	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	175	1191	107560	171270	FALSE	30	GCATAAACTCATGATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQACQPGPDDGLCGAEAKPAWGALPLPTGVFQVAEKLEKKTCALCPKGLDYSVLYFAQAENVAAHENCLLYSSALVECEDHDPFNPDRNFDVESVKKEIHRGKKLKCTYCGERGATVGCDRKKCTKNYHFFCAKSDHAFLHVDEAQGIYKVFCQQHTPEFPIVTQIGDDSLPPNNISGMKRKKGKKKHLSTGICGLQPEAMAFNRLIRHMNEESGRHTDAVVKVAFLKKCKEAGLLNDLFEEILDKLHLIQERLVNETTSDSDYEEIGTSLLDCRLFEDTFVNFQAAIENKIHQSEQRQQQLKKEIELLQDLKQRLYLLQENRGLRSGSTSVSSLSS	107385	171848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_107648_118392_118515_126701_126810_130669_130804_143698_143749_153374_153464_154802_154870_157908_158041_168023_168096_171115
729401	SIRV7	-	274	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69012	0	35793	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78945	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
729402	contig_10019_pilon	-	2832	1	Intergenic	novelGene_86688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCAGGTACAAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342296	339464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_339500_342300
729403	contig_9363_pilon	+	838	9	Intergenic	novelGene_6819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	184.5541925831	26	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	39	827	1622283	1625951	FALSE	10	CCCTGGGGCCACGCGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPTIKTLFSIFGRHPSSPTLYLQ	1622244	1625962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624637_1625885
729414	contig_14513_pilon	-	771	5	Intergenic	novelGene_70263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	198	587	18880	11469	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVDSSLQPFD	19077	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11499_12038_12158_13087_13136_14952_15001_18735
729417	contig_11751_pilon	+	176	1	Intergenic	novelGene_150290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCGAGCGGAGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113205	113381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_113200_113400
729420	contig_11259_pilon	-	1499	8	Intergenic	novelGene_144526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	151.976904797527	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	25	642	159043	131887	TRUE	25	TTCAGACTCATGGCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWGWRSAAMLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLAVVIMGVVLQGANLYGYIRCKVGSRKNLTSMATSYLGKQFLRQNAGDDQTS	159067	130594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_130740_131174_131914_133312_133442_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_159031
729421	contig_1274_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_137781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATCCTTCTGCCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73701	73107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_73100_73700
729424	contig_14441_pilon	+	767	3	Intergenic	novelGene_100711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	491.5	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	152	505	116728	117335	TRUE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	116576	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117216_117344_117539
729432	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
729433	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	8	1153	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
729437	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
729452	contig_9218_pilon	-	2232	8	Intergenic	novelGene_157685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	901	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCCGCCGCCGCCGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360689	330430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_330579_337635_337742_339021_339208_347592_347668_353133_353227_358165_358215_358384_358462_359191
729455	contig_6028_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_156601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCAAGTCCAAGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366178	366775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_366200_366800
729456	contig_20374_pilon	-	1187	9	Intergenic	novelGene_166015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	78.1424980404389	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	150	1097	18704	3786	FALSE	25	GCCTCTTTTCAGTACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPWTGSQATSLVPLGRLAPLLNCSGLGGRKADAELAAEVRPEATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLRDFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDIVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYMFPKIMGSAKAAEMLIFGKKLTAREACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAYSKLPPNAMRISKQLIRNVEKEKLHAINSEESSVLQGRWLSDECTNAIMNFLSRKAKL	22819	3695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128_5273_6728_6819_8068_8190_8942_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_22691
729461	contig_6710_pilon	-	507	2	Intergenic	novelGene_97927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729468	SIRV6	+	299	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	203	-4	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTAGACCGATCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
729469	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_92017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657501	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729470	contig_15063_pilon	+	1477	4	Intergenic	novelGene_14145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	164	1336	34808	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34644	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
729473	contig_3233_pilon	+	1133	8	Intergenic	novelGene_56545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	326.265198254176	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	416	1003	742817	747909	FALSE	15	CTCCCCAATGGGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738551	748039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740817_740917_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
729475	contig_6233_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_74826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGCCCATTTCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442781	443577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_442800_443600
729476	contig_12638_pilon	-	1229	12	Intergenic	novelGene_33199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	279.966585963751	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	13	1086	333499	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333511	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_326211_326358_327062_327157_332668_332789_333007_333096_333202_333274_333411
729480	contig_6278_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_119822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCTGAGAGATAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502567	501556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_501600_502600
729481	contig_12923_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_30164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTATCGCCCTGTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299702	299943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_299700_299900
729482	contig_12923_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_30165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAATTTTACGCTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300093	301630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_300100_301600
729484	SIRV4	-	319	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACGGTGGCTCGTCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2248
729487	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
729495	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729496	contig_7376_pilon	+	1650	5	Intergenic	novelGene_108085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	37.0742498238333	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGATATCACTTAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80063	113835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_102779_102959_104743_104851_112441_112496_112599
729497	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729498	scaffold_6394_pilon	-	778	5	Intergenic	novelGene_111030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAGCTCGATGAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406270	403297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_403372_405024_405198_405299_405498_405714_405870_406092
729501	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729511	contig_4797_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_6928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACCTTGTAAACCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655916	655437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_655400_655900
729512	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
729514	contig_7898_pilon	-	1711	7	Intergenic	novelGene_47599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	10.761298971572	292	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	13	996	560200	543007	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGTCLLWSYCGRGWSRAMLACRLPGFRSSSSGGPLGARLLSHEKQSTETHFGFETVSEKEKGGKVYHVFESVAKKYDVMNDMMSLGIHRIWKDLLLWKMHPFPGTQLLDVAGGTGDIAFRFLNYVQAQHQRKQKKQLRAQQNLSWEEIAKKYQSEEDSLGGSHVMVCDINKEMLKVGKQKAHAQGYKAGLTWVLGDAEELPFGDDKFDVYTIAFGIRNVTHIDQALQEAHRVLKPGGRFLCLEFSQVNNPLISRLYDLYSFQVIPVMGEVIAGDWKSYQYLAESIRKFPSQEEFKEMIEDAGFQKVTYESLTSGIVAIHSGFKL	560212	542291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_543109_543187_543300_543896_543986_545600_545708_551493_551716_554752_554903_559998
729518	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
729531	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	582	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
729534	contig_9848_pilon	-	1289	12	Intergenic	novelGene_79943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	443.341742706962	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	4	639	110549	104044	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	110552	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99129_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455
729536	contig_7457_pilon	-	1090	7	Intergenic	novelGene_31357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.962726895732	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	37	561	321514	317540	TRUE	10	CTGCCTGCCTTGGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321550	316920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317163_317252_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
729547	contig_8418_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_166061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTACCTTTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079087	1078631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1078600_1079100
729550	contig_16122_pilon	-	1554	3	Intergenic	novelGene_134551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	1.5	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	239	541	282583	282038	TRUE	5	GTGCTTGGCATGTGCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATPTLCVSLASAPRNSPSTLSWSSCRVSRGADLQGRGLSPARWVPAGGSTGLLPPTGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGIWSLSSHGCRAGGWAWVLLPNGDVSVP	282821	280582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_282282_282524
729551	contig_14681_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_134206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATATCGAACCTTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54541	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_54500_56000
729553	contig_7078_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_130125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTAATTTTTATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69379	70176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_69400_70200
729557	contig_19851_pilon	+	1018	5	Intergenic	novelGene_29848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4143.46342900477	12	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53736_54061_54146_55650_55753_55840_55899_56029
729560	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729561	contig_9646_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_117422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99475	102203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_99500_102200
729562	contig_9011_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_159357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767672	770059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_767700_770100
729563	contig_1813_pilon	+	2589	11	Intergenic	novelGene_105486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	392.871543891894	1	103	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	185	670	128315	147618	TRUE	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGVSSENLRL	113655	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
729566	contig_18342_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_154566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTCAAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54090	54353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_54100_54400
729567	contig_3153_pilon	+	2690	3	Intergenic	novelGene_104704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	37	444	473771	475428	FALSE	15	TGTGTATCGTCATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGQESVEWRAAQAPRCPTEWSAGKPVTLGAGTQPQFRKRGTDEVLRAVERLGVKNSTFSRSWLETRSQRVSSVKRRAFSGIWSFVCWGSAEVLLREALGGLPALCQCFHCYCHSRTGQLEMASALFQSSLPSL	473734	477674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_473804_474463_474542_475131
729573	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
729576	contig_10235_pilon	+	2092	5	Intergenic	novelGene_46442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	230.946287045278	1	130	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	5	508	210483	211834	TRUE	15	GCCTGAGGGAGCCCCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSSVPPT	210478	213542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211815_211924_212047
729579	contig_1535_pilon	-	1927	6	Intergenic	novelGene_127247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	399.05959454698	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	216	695	132614	129144	TRUE	0	TTGCTTTGCTGGGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFESSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	135989	127063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129825_132498_132718_135877
729583	contig_11566_pilon	+	2946	14	Intergenic	novelGene_166698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGGAAAAATTAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184924	259300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_186393_189026_189166_189367_189447_191618_191706_194820_194968_195696_195757_197639_197781_203212_203339_223965_224059_224288_224383_234701_234794_245832_246034_255112_255245_259213
729585	SIRV2	-	279	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	647	22	647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4085	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
729588	SIRV6	+	564	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	6	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729589	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
729590	contig_6589_pilon	-	711	5	Intergenic	novelGene_25850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1375	junction_2	832.888160259227	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	88	357	957293	955998	TRUE	10	ATGGCTCTTTGTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALW	957779	955181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_956127_956715_956815_957251_957360_957758
729597	contig_9535_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_124500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCTCCCCTCAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617051	617450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_617100_617400
729598	contig_3832_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_161471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGTTAAAAACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384457	383669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_383700_384500
729605	contig_4852_pilon	-	2295	4	Intergenic	novelGene_153960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	57.1547606649408	56	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	165	551	29120	26582	FALSE	65	CTCTGAGAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAWLLTPSLPNLSHFCSHSLSLGLSSNSSLSHRGPFSPGSQESTYSSPLPAVEELQLMYANDETTHPSPLTVTEELQPAYMNVGAADTDVVYSQVWCTQQTEGSANIRKTFLEIKDSSAIYSEVKKA	29284	24837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_26621_26715_26748_28559_28626_28870
729608	contig_7202_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_18929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGACCGCATCCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
729609	contig_7202_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_17059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27887	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
729615	contig_2419_pilon	+	2665	1	Intergenic	novelGene_137125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAGAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122218	124883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_122200_124900
729621	contig_13481_pilon	-	2281	12	Intergenic	novelGene_119481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_9	22.2439517269246	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	116	1672	1332898	1306097	FALSE	25	AACTAATGGGCATTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVVVMDVSLSMTRPVSVEGSEEYQRKHLAAHGLTMLFEHMATNYKLEFTALVVFSSLWELMVPFTRDYNTLQEALSNMDDYDKTCLESALVGVCSIVQQEWGGAIPCQVVLVTDGCLGIGRGSLRHSLATHNQRSESNRFPLPFPFPSKLYIMCMANLEELQSTDSLDCLERLIDLNNGEGQIFTIDGPLCLKNVQSMFGKLIDLAYTPFHAVLKCGHLTADVQVFPRPEPFVVDEEIDPIPKVINTDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISDAKENPYGEDDNKSPFPLQPKNKRSYAQNVTVWIKPSGLQTDVQKILRNARKLPEKTQTFYKELNRLRKAALAFGFLDLLKGVADMLERECTLLPDTAHPDAAFQLTHAAQQLKLASTGTSDYAAYEQNITPLQTDFSGSSTERM	1338591	1305487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1325725_1325869_1326653_1326773_1327573_1327730_1331083_1331192_1332676_1332961_1338538
729622	contig_3584_pilon	+	1528	9	Intergenic	novelGene_108164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	23.3117459663578	306	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	12	1199	482440	498574	FALSE	20	ATTTGAACTGTAGTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRHLKKRAQDAVVILGGGGLLFASYLTAVGDEHFYAEHLMPALQGLLDPESAHKLAIRFTSLGLLPRATFQDSDMLEVRIMGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLFKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAIINRYGFNSHGFSVVEHRLRARQQKQTKLSEDGLLLGINLGKNKMSVDAAADYTEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAKLHHLLTKVLQERDALKGAHKPAVLVKIAPDLTAQDKEDIAGVVRELGIDGLIVTNTTLSRPASLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGACLVQLYTALTYWGPPVVGKVKHELEALLKEQGFSSITEAIGADHRR	482428	498903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_482461_484970_485184_487766_487967_490200_490284_495888_496077_496710_496825_497541_497696_497806_497967_498519
729627	contig_12939_pilon	-	1079	3	Intergenic	novelGene_166197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1000	junction_2	125	161	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46787	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45889_46031_46379_46727
729628	contig_7342_pilon	-	2435	22	Intergenic	novelGene_71113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.9920159189367	1	107	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	689	1942	81495	76592	FALSE	10	CTAGTTTTCTCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSSRYQEDRDGTQRMRRHQNSNPFPCPPTCSLFKTPRPWMPQAAQRTPTPSFPQRPAKTSFLHPSL	86802	76098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76886_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82550_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83938_86703
729632	contig_1244_pilon	-	3166	1	Intergenic	novelGene_38047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	108	434	978645	978319	NA	60	AAACAAATAAAGGTACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQILSEEKGSSSLLIVSSPLTGQVVWLPEAPQKILFLSAASEFYRKDTGERPPGYFSYFAILYFPCLYYLRWNLSVSPSRKHLRKYPCAHFVEDQGFSALRLLTIR	978752	975586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_975600_978800
729633	contig_7179_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_78074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATATTGTTGATGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438323	437767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_437800_438300
729636	contig_13780_pilon	-	1409	7	Intergenic	novelGene_149088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	310.872785700017	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	265	561	686159	684700	TRUE	5	GTTCAGTGCCTTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCLRCSTATRSTSFTETSSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEAEQ	688761	675858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_676618_684610_684712_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686561_688702
729639	contig_5084_pilon	+	1668	4	Intergenic	novelGene_64606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.9103822808329	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	105	539	1009317	1015322	FALSE	75	GAAAAAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSLTLTFWASPLSLLISNQCTRLKALSCHPDKNPDNPRAAELFHQLSQALEVLTDAAARAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLGRWPLALGRGFAPPAVSIHLVNLLPGASVQSLHASPPRLWQNPVPRGRIFQGYS	1009212	1016451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1009392_1014410_1014460_1014754_1014814_1015070
729641	contig_9345_pilon	+	2075	3	Intergenic	novelGene_24335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_1	561.5	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCATACAGTGGTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117927	120194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_117988_118097_118154_118235
729647	contig_14446_pilon	+	1301	5	Intergenic	novelGene_160712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	2.8613807855649	318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	62	652	284856	288320	FALSE	10	TTCTGCTTATATTTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVFFSANPKELKGTGHSLLDNKTQKKRPKTFGMDVKAYLRSMIPHLESGMKSAKSKDILSADEVIQWSQSLEKLLANQTGQDVFGNFLKSEFSEENIEFWLACEDYKKTESELLHYKAEKIYKAFVHSDAAKQINIDFHTRESTAKKIKAPTRTCFDEAQKIIYTLMEKDSYPRFLKSNIYLNLLNDLQANSLK	284794	288969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_+_284954_285313_285395_285816_285879_287226_287391_288134
729648	contig_16492_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_100295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCCAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152832	151093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_151100_152800
729654	SIRV7	-	372	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33196	1	-23	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114761	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
729657	scaffold_19766_pilon	+	2005	4	Intergenic	novelGene_34379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.16024689946929	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	762	1559	726532	727329	FALSE	25	CTTGATTTATGTAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722583	727775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722731_723435_723738_723925_724236_726529
729665	contig_18869_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_56309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
729666	contig_12437_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_169071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTAGCTCACTACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37993	38453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_38000_38500
729670	SIRV7	-	280	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91646	0	-91640	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTAGCACGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
729674	contig_12638_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_33338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAATAAGAAAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357991	1355415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1355400_1358000
729678	SIRV6	+	566	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	345	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729681	contig_14985_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_169095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	126	386	28637	28377	NA	55	AGATTAGAGAAGATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPQTTTKKSANLGLSKSKLRSRPRGSAPQRGGRSPSAPPMLSASNRVLQLFHSLFPAPRMSDSTSKIVSPQEALPGRKEPIPVAGKDAGTQRGHSRRWFASARALAAVLSPPPVKEYRGLLWFGL	28762	26521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_26500_28800
729683	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_95710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
729690	contig_10581_pilon	+	2940	19	Intergenic	novelGene_41362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_3	10.1816828995342	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	832	1911	240741	247711	FALSE	25	TAGAAATTTTATCCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTDRRLQRLLQTQRELMSKELWLSIGINTFDYLGSILSYAVIAIPIFSGVYGDLSPTELSTLVSKNAFVCLYLISCFTRLIDLSTTLSDVAGYTHRIGELQETLLDMSLTSQDSENLDESEWDLDKAPEWPAEPADTAFFLERVSISAPSSDKPLIKDLGLKISEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWASTRGSVQMLTDFGPHGVLFLPQKPFFTDGTLREQVIYPLKEIYPDSGSTDDDRIMRFLELAGLSSLVTRTGGLDQQVDWNWYDILSPGEMQRLSFTRLFYLQPKYAVLDEATSALTEEVESELYRICQQLGMTCISVGHRRSLEKFHSWVLKLYGGGRWELTRIKAE	229671	248740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_229802_233890_234010_234167_234296_236131_236272_237458_237577_237930_238057_238688_238740_240721_240817_241093_241216_241313_241406_241587_241678_244308_244515_244687_244780_245281_245319_245681_245732_246186_246240_246572_246650_247348_247465_247642
729695	contig_233_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_14490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGTAGAAGACCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40596	42348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_40600_42300
729697	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_97364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729701	contig_5894_pilon	-	1944	4	Intergenic	novelGene_83059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.49691252107735	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	174	920	590740	586923	FALSE	35	GACATCTGATTTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLIQNMCTIAEYPAQGSAAAADCFLGAAGRRLVKIAVVGASGVGKTALVVRFLTKRFIGDYERNAGNLYTRQVQIEGETLAIQVQDTPGIQVHENSLSCSEQLNRCIRWADAVVIVFSITDYKSYELIGQLHQHVQQLHLGTRLPVVVVANKADLLHIKQVDPQLGLQLASVLGCAFYEVSVSENYNDVYNAFHVLCKEVSRKQQPSSTPEKRRTSLIPRPKSPNMQDLKRRFKQALSAKVRTVTSV	590913	585898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_587394_588439_588517_589897_589955_590598
729702	contig_15897_pilon	+	1581	4	Intergenic	novelGene_49548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_1	93.4713265600146	1487	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	305	529	657441	659138	FALSE	30	TCCTAGAGAGTTGCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWFLIIQCLPVSSFLSPFLFVCLCFAQVASVLLQCLAALLLLGDPLGLEGCQHSVQPQPLQALWARREAKCSERVPRLPAQEDSGLGAAATPHLLAPLRVKMLLLLDHCLNRLLVLGHRAVDSLVLDPVEEHSALEHLTRLSKGLVDGEVEWVSLSLSVPVTDWLHSQILSTEKS	654036	660190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_654291_657390_657531_658444_658470_659028
729706	contig_4125_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_25092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCCTGGAATCCTCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631772	630554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_630600_631800
729708	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
729712	contig_13645_pilon	-	1712	6	Intergenic	novelGene_146158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	78.3709129715866	97	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	89	436	23717	10453	FALSE	25	ATAATTTGTGATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLEQAEDLKAFERRLTEYIHCLQPATGRWRTTGAWNWLIDPETQKVSFFTSLWNHPFFTISCITLIGLFFAGIHKRVVAPSIIAARCRTVLAEYNMSCDDTGKLILKPRPHVQ	23805	9176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_10495_15103_15159_15278_15389_19509_19554_22530_22603_23692
729713	contig_14483_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_133741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAGTGTAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17843	15298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_15300_17800
729716	contig_10627_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_60006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTCATACTAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322261	322853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_322300_322900
729718	contig_16098_pilon	-	1917	17	Intergenic	novelGene_45882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	59.7639889481952	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	983	1654	249257	244355	FALSE	10	ACTTTCTTGTGTCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253594	244091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250280_250678_250765_251545_251643_251721_251945_253019_253103_253255_253379_253563
729727	contig_10205_pilon	+	1650	14	Intergenic	novelGene_143115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1292	1618	241710	256313	FALSE	5	CGGGGCGGGCTGGGCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALSSGILRAKIPAWTAGCKVFTRPPNISGNPVSSETSLTVRPASLRAFAVPPEATRFKPTEVRFLANSTRPVLSETLNKASWPGAMIADGASGAEGQAAAVIHVRR	219969	256345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_220178_220496_220655_222044_222224_224396_224492_229372_229502_231373_231466_232782_232866_233924_234037_234914_235038_237897_237981_241680_241749_242568_242647_255694_255822_256230
729730	contig_1694_pilon	-	1756	2	Intergenic	novelGene_144920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGGAAACAAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434848	418050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_419715_434756
729737	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729738	contig_5881_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_129042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTCAGAAGTAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337287	335370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_335400_337300
729742	SIRV2	-	534	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1103	0	-60	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4792	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
729747	contig_7202_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_18322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
729749	contig_7202_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_16449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27809	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
729760	contig_14807_pilon	+	1321	6	Intergenic	novelGene_124725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	373	junction_3	218.373624781016	1234	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	142	924	75260	77275	FALSE	0	CGTGTTGGCTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYTVLSDAELVAMLRQYNIPHGPVVGSTRKLYEKKIFEYETQRRRLSPSNSSASSFSYRFSDFDSTSSDSDKYDLPKKEDALFYQSKGSNDDYEESYLHTRTSGEPESVGASRNFREPVASLSNTETFGHQTREDDLFTSSEEESKDRERPLYARDSTYQSIAHYRPISSISRATVGLPCYPSTTSTSSTSSSSYSSPSWLARRAIRPEKQVPGAGQSQDRQVPLWGQLLLFLIFAAFLVFVYYLLQADDGNPFWVDP	75118	77672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_75342_75435_75544_75934_76013_76211_76343_76791_76842_76941
729764	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
729765	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729771	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
729772	contig_5566_pilon	-	1828	9	Intergenic	novelGene_153665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_8	21.7255609824004	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	89	1318	212904	187916	FALSE	10	ACTGGGTGTCCTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGESTSAVLSGFVLGALAFQHLNTDSDTEGFLLGEVKGEAKNSITDSQMDDVEVVYTIEIQKYIPCYQLFSFYNSLGEVNEQALKKILSSVKKNVVGWYKFRRHSDQIMTFRERLLHKNLRKHLSNQELLFLLLTPSITTESCSTHRLEHALHKPQEGLFHRVPLVVANLGMSEQLGYKTVSGSCMSTGFNRAVKTHSSEFFKEDGSLKEVHKINEMYASLQEELRSICKKVEHSERAVEKLLEDVNRLKQEIKKRKQAQIQVAGEKNVPEEPQENTFLCQALQTLFPDSEFLHSCVISLKNRHISKSCCNTNHHLDMVDRLTLMVEYTDVPESSQACTQQIIKRKALDMGDGWQFKKSRLLEIQNKQSKTDTDSSNQEKASTVSSPETDEDIEKMKGSGEYPQSPTF	212992	187405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_188350_188806_188922_191213_191299_200581_200702_201469_201664_203509_203577_207285_207323_209857_209949_212817
729774	contig_6837_pilon	-	1059	8	Intergenic	novelGene_149826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAGCCACAGAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17339	13462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_13594_15116_15271_15418_15470_15613_15695_16231_16505_16747_16822_16919_17019_17143
729775	contig_3122_pilon	-	1555	12	Intergenic	novelGene_64391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	156.446965111382	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1461	93	1553	276393	258151	FALSE	45	CGAGAACGGAGGGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKVKSFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRTYAHSPPCRRHRKRKSMKLSPNGMKKNE	277578	258148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258236_258937_259033_260012_260193_261488_261609_261802_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277512
729776	contig_10331_pilon	+	1353	11	Intergenic	novelGene_54192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	64.2066195964248	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	7	1284	604724	620153	FALSE	15	TGTGTTCAGTTTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKKPHLQEPAKKKVKKKLSDADKKLANRESALACADLEEEEIHQEHGQKRRSSQSGGGVRAADTKVPNNVDHIVVNQRKKIQVNQEEERLKNERTVFVGNLPVTCNKKKLKSFFKQYGQIESVRFRSLIPAEGTLSKKLAAIKRKIHPDQKNINAYVVFKDESAATKALKRNGTQIADGFRIRVDLASESSSRDKRSVFVGNLPYKIEESAVEEHFLDCGSIVAVRIVRDQVTGVGKGFGYVLFENTDAVHLALKLNNSELMGRKLRVMRSVNKEKLKQQNSNPGLKNVSKPKQGLNFASKHAEGQSKSLFIGEKAVLTKKKKKGQKRSGRPKKQKKQK	604717	620222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605105_605423_605501_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_617716_617757_618144_618264_619868
729777	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	10	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729780	contig_12277_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_139679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	217	570	119758	119405	NA	35	TCAAGCAATGACCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSLLGLSRPPDETLECRAGVIVSSVAGGPGRIREVTCSQALLLSLCGEISLLAFPPTQPSHGPMWRQGPEKRKHLARGWPEPPQPCPCQAPFLLPPCSGVMGFLAQACVCSPSDL	119974	118737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_118700_120000
729782	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_96657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	653867	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653869	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
729783	contig_11386_pilon	+	1283	7	Intergenic	novelGene_82834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	54.1830744380157	66	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	132	635	231646	244485	FALSE	10	TGAGGTTTTGTGCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPNEDSEGSRITYIKGDLFACPKTDSLAHCISEDCRMGAGIAVLFKKKFGGVQELLSQQKKSGEVAVLKRDGRYIYYLITKKRASHKPTYENLQKSLEAMKSHCLENGVTDLSMPRQPGEWLRAHDRFYFWPRELAIRQSLKLAHPGPGLDVVLIACNGRMYPQ	230699	245133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_230794_231608_231685_232027_232173_233457_233517_234770_234887_243194_243290_244435
729784	SIRV6	+	549	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11046_11109_11205
729785	contig_5023_pilon	-	2206	2	Intergenic	novelGene_7117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTCATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112933	110554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_112199_112371
729786	contig_13021_pilon	-	2275	7	Intergenic	novelGene_8111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_3	49.6904305564853	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1313	2107	152920	147970	FALSE	15	GTTACTGCTTTTGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVNEQSLLPLMLEQFPFLSVSDQTLSKMWKQQIAQVKQLKKDAYGENRSKKKLQDEIEEALRRHDLLTALVKKEYEHNRRLQDFKDRINRQRLTQSKIKENRQQIVRARKYYDDYRVQLRAKMMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	154232	147801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_150265_151766_151842_151957_152128_152919
729789	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729791	contig_12411_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_145683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGTTTTTATAGGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415583	416514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_415600_416500
729796	contig_11370_pilon	+	1282	8	Intergenic	novelGene_98752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	62.0986706617717	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	63	911	154251	155741	FALSE	25	CCCCCAAATCTGGAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	153257	156112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153319_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
729808	contig_6710_pilon	-	820	3	Intergenic	novelGene_97062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	72.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658792	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152_658365_658694
729816	contig_17198_pilon	+	1684	2	Intergenic	novelGene_62347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662499	672839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_662798_671453
729818	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_90694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
729828	contig_3153_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_104629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGGCTGCACGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57751	59685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57800_59700
729832	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
729833	SIRV6	+	554	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729835	contig_9548_pilon	+	2164	9	Intergenic	novelGene_141043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	11	junction_1	192.197001797635	106	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1677	487	2163	15328	38471	FALSE	25	TAAGCTTTTACTATGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIATPVKHPGIHLSSEASQRRNMSMHAIFFDSIPSGTLTPIKDLVRYQKSSLKLNDRKKNQFLEMATFNNKEIFQSTVLAEATVSNSSLDISVIKPNKDRLKNRENYESPGKIFQRMKEKVLRDKQEQASRNNCLLEPLKSESNKILTPNRAEKRLLKHTYVCEEKENNQPSQSVNSSLKVKQKIQHQQEKKGPLHNLTYELLILKQEHENISAAGVSLGRAQSAKQNFHSKENTVATTKSIKGTFVLESIDSAYEKSQNSTVETLSTNCIPTSNGSQLMVSESKVTTEGTSQQETKEGNEKPISRETDLLCSMNSTCKIVLATPRLNITIPRRSERKKKLSPPNIFQTITNGAKKNKVVQLQEWMIKIINDNTAICVEGKLIDVSDIYWHSNIIIERIEYNKLRTLSGNIYVLKGMIDRISMKEAGYPNYIIRKFMYGFPKNWKEHIENFLEQLRTCEKKGKKTRKKQKTGRSVPNIPKSLKNNAGENQTDVLQRGSITYDLDCDNLELKNNKCSMLLGATELNVCHSNRENKLPLKLPDDQINNTIQNGGKYDLSNQ	7734	38472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_8129_15235_15869_19604_19665_19947_20421_27391_27466_29146_29278_34246_34335_35351_35510_38319
729836	contig_19185_pilon	-	2216	4	Intergenic	novelGene_163640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	381	junction_1	300.476658365042	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	91	1167	111999	91474	FALSE	40	TATGCAAACACCAAGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAVIITFYCYRVHRQQKLSPSWETSKPRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLHLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSSWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK	112089	90424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_91654_94806_94935_109520_109663_111372
729838	contig_7861_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_77407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTTATTATTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87721	88594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_87700_88600
729839	contig_5988_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_15864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTTTTGTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289513	291628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_289500_291600
729840	contig_5523_pilon	-	1847	3	Intergenic	novelGene_169103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_2	128.5	136	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	154	1215	410975	409260	FALSE	35	GAAATCATTTACCTGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMMKLLIILIFSGLITGFRGNSSYSLPPKLLLVSFDGFRADYLQNYEFPHLQNFIKEGVLVEHVKNVFITKTFPNHYSIVTGLYEESHGIVANSMYDVITKKHFSDLNDKDPFWWNEAVPIWVTNQLQGNRSSAAAMWPGTDVLIHNTTPSYFMNYNSSVSFDERLNNITMWLSNSNPPVTFATLYWEEPDAGGHKYGPEDKENMRTVLKEVDDHIGDLVHKLKVLGLWENLNVIITSDHGMTQCSKERLINLDTCISHTSYTLIDVSPVAAILPKINRTEVYNKLKICNPHMNVYLKEDIPARFHYQHNDRIQPIILVADEGWTIVQNKTLRKCKYLFRIFLLYPRDKSQL	420658	408627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_409487_410140_411000_420529
729846	contig_10331_pilon	+	1734	17	Intergenic	novelGene_54105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCTGAGAAGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304602	371605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311290_312016_312168_312477_312542_312622_312662_318127_318200_318790_318870_320097_320200_321427_321525_325324_325414_332861_333046_350133_350216_355497_355627_371587
729847	contig_7202_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_18908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
729849	contig_6403_pilon	-	2832	2	Intergenic	novelGene_139901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	163	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	658	975	1135307	1134990	FALSE	0	TCTCCTCCTCCTCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPSEEVPRPLTPSSCPTSMKENLGMLLEMIQLTSGSALCWEALLTALDWTTGLLWPKRGFGLAGQGALYCQGWVRLSLAFLPAKLSHTHEIVDTPSRGHLHTQT	1136958	1133132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1135760_1136753
729852	contig_10000_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_139332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCCGTCAGAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270409	269250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_269200_270400
729853	contig_10000_pilon	-	1062	2	Intergenic	novelGene_139331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTTACTAGCAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269001	265617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_266348_268669
729856	contig_2768_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_57517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCACTGTTTCTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972579	970325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_970300_972600
729868	contig_9937_pilon	+	2360	1	Intergenic	novelGene_129205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATTTATAGTAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111364	113724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_111400_113700
729871	contig_18967_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_165328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCCCATGTGGTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109766	110111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_109800_110100
729874	contig_9186_pilon	-	2049	4	Intergenic	novelGene_85362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.195028426722	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	197	703	643909	638458	FALSE	50	CCACCATCCAGAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGILEKSMFCKDMTVKYDSRLRERVKMRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	645811	637111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_638890_643834_643913_645289_645412_645740
729879	contig_7694_pilon	+	1646	4	Intergenic	novelGene_159924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_3	37.853518844209	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	23	322	174784	178706	TRUE	10	CTTGTGCTTTGCAGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRRWFGMAAAAEAIPANRTEEPARDDAAVETAEEAKEPAEADINELCRDMFSKMATYLTGELTATGEDYKLLENMNKLTSLKYLEMKDIAINISRNLKDLNQKCK	174761	181313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_174839_175252_175370_178578_179555_180837
729884	contig_9177_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_32759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCGGACCTTTCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307814	1306915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1306900_1307800
729895	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
729896	contig_16685_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_115068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAAATATCTTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622048	624285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_622000_624300
729898	contig_6589_pilon	-	1442	3	Intergenic	novelGene_26286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2290241	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273344_2274687_2274793_2290175
729901	contig_6589_pilon	+	1504	15	Intergenic	novelGene_25980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	70.2402582394955	276	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	170	1426	1327516	1336231	FALSE	15	CTGTTCATGCATGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGQLAARRAAGVVLEMIREGKIAGRAVLIAGQPGTGKTAIAMGMAQALGPDTPFTAIAGSEIFSLEMSKTEALTQAFRRSIGVRIKEETEIIEGEVVEIQIDRPATGTGSKVGKLTLKTTEMETIYDLGTKMIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDMAPVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIISTSPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLRYAIQLITAASLVCRKRKGTEVQVDDIKRVYSLFLDESRSTQYMKEYQDAFLFNELKGETMDTS	1321840	1336309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1321886_1324123_1324179_1327141_1327199_1327503_1327646_1330373_1330504_1330641_1330709_1331802_1331910_1331996_1332091_1332495_1332620_1333015_1333111_1333194_1333314_1334933_1335054_1335429_1335560_1335988_1336104_1336205
729908	SIRV6	+	559	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729910	contig_12125_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_76234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	17	454	434936	434499	NA	15	CCAGAGGTCCTATGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQSPMLDRPQGARVRPVGPAAPKQQKMRPLDVVELAEPEEVEVLEPEEDFEQFLLPVIHEMREDIAALTRERGRAYLRTRGKLWEMDSMLLQIKTQVEASEESALNHLQNADDGAAARGEKAEEKAREMAKMAEMLVELVRRIERSESS	434952	432538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_432500_435000
729912	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729913	contig_1275_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_108874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	28	489	747507	747968	NA	20	TAGCATAATTGTGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747479	748108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747500_748100
729914	contig_14142_pilon	-	1987	8	Intergenic	novelGene_120472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	22.0111289105845	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	121	969	259646	248154	TRUE	40	TTTATATAAAAAGGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLVWTCQPSLSSSPGQAFLP	259766	246267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_247008_247199_247410_247970_248302_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
729916	contig_12123_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_144596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCACCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84394	85160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_84400_85200
729917	contig_10734_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_51049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411567	409431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_409400_411600
729921	contig_6740_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_142672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1426	1731	589184	588879	NA	65	GAATGAAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVASYACKSWTMNKEDRRRIDTFELWCWRRILKIPWTAKRTNKSILEEVQPECSLEARMARVCLTSFGHVIRRHQSLEKDIVLSKVEGQRTRERPSTR	590609	588556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_588600_590600
729922	contig_9571_pilon	+	2458	1	Intergenic	novelGene_136306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCAGCCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580975	583433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_581000_583400
729925	contig_401_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_42745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAACAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905217	907597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_905200_907600
729931	contig_1406_pilon	-	2643	3	Intergenic	novelGene_25467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	28.5	510	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	123	431	835192	832685	FALSE	10	CTGTCTTTCTATTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDIEYGYNCMAPSLRRERFAFKISPKPSKPLRPCIQLSSKNETSGMVAPTVQEKKQVFPREAGRGSTVVWMWGHSCWTLRAKGLPLLALSRSIGNTSWPL	841154	830472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_832823_835021_835221_841060
729938	contig_5018_pilon	-	2346	13	Intergenic	novelGene_46949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	81.8767705491341	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	271	1701	315477	301750	FALSE	25	ATAGCTACTGTAGCTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDAPRLCPDINFSEDDPLETTVHWAPPTLRPHQKDMVCQFYYRRCQEEAWTLPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	316168	301104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310164_312504_312666_315476_315595_316015
729939	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729943	contig_2703_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_101760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580658	582851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_580700_582900
729945	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
729947	contig_9423_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_99188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGACTAGATCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83494	86048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_83500_86000
729952	contig_6102_pilon	-	2085	2	Intergenic	novelGene_31942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	733	1035	402016	401714	FALSE	35	TCATGAGTATGGTCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECQNNEQICLGRSIARMLLRGKDGETSSHIFGHVIRRDQSLEKVIMLVKVEDQQKRGRPSTRWIDTVAATMASSITIARMVQNRAVFHSVVHRVAMSRN	404773	400663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_402075_404099
729953	contig_20157_pilon	+	1191	9	Intergenic	novelGene_145862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.716801427435	2315	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	421	1047	48801	53749	FALSE	20	CGCCATCTTATGTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRQDGHTDFASECFSRLSSPSTGCGAGSSLSPNSGSGPVPDSSYCSCPCVILRPGGSSGNDRGLSAEPGLSASPSADLGRVVRLHPVILASIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDMEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHLTVDTSLQNGRMSIKAYVSTLMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVDLIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSADNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIALNEKLVNL	40951	53893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_41188_41233_41335_48495_48567_48788_48869_49551_49690_51049_51142_52576_52714_52849_52964_53671
729954	SIRV4	-	204	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	410	3	-410	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTATCGGCGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
729955	SIRV4	-	260	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1263	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3895	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
729960	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_97017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
729963	contig_12790_pilon	-	1932	3	Intergenic	novelGene_35274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0.5	112	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	1573	1932	347877	347518	FALSE	60	AAAAAAAGTAGGTAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDEGIGGPVVEFLPSMRETQVCLPTSASRVATIHLFLEACILLRCLTGFSGASRLGQTRKKGLVIYFHKLANENLKLYGSKTIMGMAQDQAALFSIVHEIAMSPGQTLQQPTTYNVGIM	406753	347517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_349229_395577_395682_406636
729969	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_96864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
729972	contig_12250_pilon	+	3536	30	Intergenic	novelGene_80628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_16	57.1731001165078	145	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1890	3299	361815	365645	FALSE	25	GCTCTGAGGGCAGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLRSTEGIVPQYDGSSSFLLFDDESDGEEEEELMDEDVEEEEDSEISGYSVENAYFDEKEDTCAALGEISVNTSVAFLPYMESVFEEVFKLLECPHLNVRKAAHEALGQFCCALHKACQSCSSEPTSAALQVVLARVVSSYMQAISGERERQVVMSILEALTSVLRSCGTLVLQPPGRLAELCSVLKAVLQRKTACQDTDEVEEEKEDQAEYDTMLLEHAGEAIPALAAAAGGDAFAPFFAGFLPLLLCKTKQGCTVAEKSFAMGTLAESIQGLGAASAQFVSRLLPVLLSTTREADPEVRSNAIFGLGVLAEHGGRPAQEHFPKLLGLLLPLLARERHDRVRDNICGALARLLMASPTRKPEPQVLAALLHALPLKEDLEEWVTIGHLFSFLYQSSPNQVVDVAPELLRICSLVLADVKIPAEAKSALLLLLTFLAEQHADSFQTALGSLPGNKAQELQTILSFT	355270	365882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_355393_355472_355560_355683_355764_355850_355893_356327_356458_356543_356724_356991_357058_357168_357271_357351_357436_357675_357842_357941_357997_358153_358264_358567_358677_358845_358976_359187_359303_359400_359515_361461_361583_361738_361851_361958_362075_362169_362248_362320_362379_362481_362588_362674_362869_363009_363058_363488_363615_363721_363931_364191_364325_364407_364513_365330_365401_365514
729978	contig_12464_pilon	-	2941	1	Intergenic	novelGene_68666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1662	2000	146146	145808	NA	80	CTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFSIHRLNSVERTSFLNKMVNERIQVFCMHFCMFVLNISLIFHAGHHPIFIYSLNRLPSGGHSFFCSRLSCLLSRTAAAKRDPLGLCSGFFWTGCALCWIFIKRMLDNPL	147807	144866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_144900_147800
729979	contig_11386_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_82799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	90450	90130	NA	45	ATATAATTAACGTCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPRSPSKSRAGVGVGVGGGSTERTKQGRKPHWCPRVVKPHGLTGWWSVLCLYTGQFHGDWRGEERGAEDRSIGRVPGKGGRQNTWEQQKSLAVSSEGKAEGDRQV	90450	89975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_90000_90400
729984	contig_5229_pilon	-	2460	3	Intergenic	novelGene_117681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	6	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	194	685	343231	342740	FALSE	25	GTTGGATCAACAGCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHGAAWTRSLRCSELVSWTVACGWRVDSPSEGDPCALSQAVVPWTLFAAPRVAAVGVATPTAPSMPRGWHHEQGPRHPIRAAASYATAHPWQLVDCASNGVTYTPLVDPWIEQLCCGDSECIRTAVEQKIVASSAPGGEPAERGLPVARLPILQPHGVDFGYRALTQAPLTAPHGCWTAFWPSWEMTHRSASSTTRIASAESATFLGMDGLGLGLGCLLPQCRPAYA	346233	340964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_343261_345788_345884_346164
729988	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
729989	contig_4136_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_161242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGACAAAGAGGAAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47503	46952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_47000_47500
729990	contig_4136_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_161241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTGGCAGTCGTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46952	46704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_46700_47000
729991	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
729992	scaffold_16539_pilon	-	1393	7	Intergenic	novelGene_68311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	74.9342304216764	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTAGCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126523	107467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_107815_120764_120897_120985_121082_122380_122536_122615_122679_124586_125049_126385
729997	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730001	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
730002	contig_5423_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_85162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGAAGCAGGCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49837	51082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_49800_51100
730006	SIRV7	-	277	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91634	15	-91628	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAGTATAAAACTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
730010	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
730016	contig_2219_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_67181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCTCCCCAGCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126937	128459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_126900_128500
730017	contig_5423_pilon	+	1764	4	Intergenic	novelGene_85297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	26.2339898266013	2817	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	22	456	612676	621290	FALSE	25	GACTTTTGACATGAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRLTQLQDAVNSLADQFCNAIGVLQQCGPPASFSNIQTAINKDQPANPTEEYAQLFAALIARTAKDIDVLIDSLPSEESTAALQAASLYKLEEENHEAATCLEDVVYRGDMLLEKIQSALADIAQSQLKTRSGTHSQSLPDS	612654	622598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_612718_619470_619586_620119_620221_621113
730018	contig_10962_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_103909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTACATACACTGCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361878	361447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_361400_361900
730019	contig_10962_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_103908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTAAAAACATACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361092	359871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_359900_361100
730024	contig_18794_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_54661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGAACGCGCAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324936	327647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_324900_327600
730025	contig_15327_pilon	-	1939	8	Intergenic	novelGene_70521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	18.3202798303199	101	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	490	1446	488304	478231	FALSE	15	TCTTTGTTGTTGTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492584	477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172_488343_492026_492331_492437
730026	SIRV6	+	548	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	2	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730042	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730047	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730050	contig_16575_pilon	-	1330	13	Intergenic	novelGene_146490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_12	72.0952302321188	634	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1269	61	1329	26216	2061	FALSE	25	TAAGTAATTCTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGSGAGRRRVSAPRVRVAMMEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRDNLVELSKAKYSRNVVKKFLMYGSKPQIAEIIRSFRGHVRKMLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQKEAVIKHSLVHKVFLDFFTYAPPKLRSEMIEAIREAVVYLAHTHDGARVAMHCLWHGTPKDRKVIVKTMKTYVEKVANGQYSHLVLLAAFDCIDDTKLVKQIIVS	28097	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_2142_7368_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13320_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_28044
730052	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
730054	contig_11978_pilon	+	1215	2	Intergenic	novelGene_62924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	13	339	865342	865912	FALSE	20	GAGCTGGTCAGAGGACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGEQAALPGGGGGEGERALQQPGAIC	865329	866788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_865447_865690
730057	contig_10904_pilon	-	1872	10	Intergenic	novelGene_22490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	434.528636343417	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	204	833	336807	293360	TRUE	35	ATTATTATATGTGTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRRTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLGSHGMPEHLQAHQK	337010	291715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_291741_292345_293405_315357_315390_315486_315525_315742_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
730060	contig_8712_pilon	+	1709	2	Intergenic	novelGene_58748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_1	0	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	660	995	101410	103433	FALSE	15	GATGTCTCTAACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRKNCNSEKQWQGHISSEKHKEKVFHTEDDQYCWQHRFPTGYFRTCDGFLNGTCTEGNSCKFAHGNAELQEWEERRDALKMKLNKARKDHLIAPNDNDFGKYSFLFKDLN	100750	104147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_101556_103243
730061	contig_11171_pilon	+	981	6	Intergenic	novelGene_48611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2	520	235135	251467	FALSE	35	GGGGTGAATAAACCAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDVQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	235133	251928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_235202_235300_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
730062	contig_5084_pilon	+	2308	3	Intergenic	novelGene_64583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	28.5	118	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1583	2149	774439	784389	FALSE	10	CCCTTAGTTTCCTCCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTRVSVLQSLVFSSHCTAVSGYSDQVIHQRRAAASLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAARQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEVGERDLGDLVQLYI	772856	784548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_774607_779888_780115_784216
730064	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	16	351	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14424	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
730066	contig_8631_pilon	+	2628	1	Intergenic	novelGene_121976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGAAAAAAAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800122	802750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_800100_802800
730068	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	26	-2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730069	contig_13148_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_162934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAATTGGATTGGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213928	212679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_212700_213900
730073	contig_10236_pilon	-	1964	7	Intergenic	novelGene_169123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_6	81.9805193662223	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	311	925	137039	133631	FALSE	35	GTAAAGATTACAGCCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRLEGQLAGLRQELAALALKQGSVEDRVDQLPQQIQAVRDDVESQFPAWITQFLRRGGGARAGLLQQEEIEAQLQELESKILTHVAETQGKSAKEAAASLGLMLQKEGMIGVTEEQVHRIVNQALKRYSEDRIGMVDYALESGGASVISTRCSETYETKTALLSLFGIPLWYHSQSPRVILQPDVHPGNCWAFQGPQGFAVVRLSARIHPTAVTLEHVPKSLSPNSTISSAPKDFAIFGFDEDLQQEGTLLGKFTYDQDGEPIQTFYFQGPTMATYQVVELRILTNWGHPEYTCIYRFRVHGEPAH	137712	132591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_133745_135183_135277_135765_135934_136079_136196_136592_136678_137000_137223_137585
730074	contig_10236_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_169122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	494	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTAATGGAGCATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132184	131782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_131800_132200
730075	contig_7530_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_141830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGTACAAATTATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131952	129619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_129600_132000
730077	contig_15063_pilon	+	420	3	Intergenic	novelGene_11651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3096	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	192	229	420	34808	35111	FALSE	20	CGCACCTCCAAGCTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQ	27140	35111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037
730082	contig_6270_pilon	-	1431	2	Intergenic	novelGene_99892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	70	321	1145876	1145625	TRUE	50	AGTATTAGTAAAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFRLYLITFIKHTSESVSTVHLMVSQFTAKLNKAIVFTGKVFSKKLHNTVNCNAVFILFRYLGKWTIKVLCYSARKKTSLKDLNGNQKFRALGKDLLGIDTHVHL	1145945	1144440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1144824_1144897
730084	contig_4531_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_47845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108167	107854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_107900_108200
730087	contig_16907_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_87461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAACACAGTTAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469859	469314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_469300_469900
730092	SIRV6	+	559	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
730093	contig_6102_pilon	+	3238	6	Intergenic	novelGene_31752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	147.74897630779	994	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	148	795	258180	261121	FALSE	75	AGTAAAAAAGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRSTARPNGQPQASKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQSVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNQETFARAKTWVKELQRQASPSIVIALAGNKADLANKRMVEYEEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNDLFLAIAKKLPKSEPQNLGGAAGRSRGVDLHEQSQQNKSQCCSN	246883	263564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_246931_258079_258343_259485_259638_259889_260013_260573_260668_261005
730095	contig_9656_pilon	-	1713	8	Intergenic	novelGene_121891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_7	131.799321790705	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	209	1360	97308	73704	FALSE	35	AAACTTACCCTAACTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLP	101207	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_101023
730102	contig_6710_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_89242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAAGTTCTTTGTCTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
730106	contig_9074_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_156616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTCGTTAAATCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58016	58738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_58000_58700
730107	contig_2100_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_50602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATTGTCTCGTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702479	701221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_701200_702500
730108	contig_1813_pilon	-	2372	12	Intergenic	novelGene_105489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	964	1266	155314	155012	TRUE	40	AGAAGTGAATTGCTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPLEKAFSSRTLGNWGTGWEPQGLCGGEGLNGTAQQVPQLALQTLTSQLSGGYTWTDLGPRRGDCVGHLHGSECCGCRAQSRICTAACLGQGPPAGQA	156277	113815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_113844_128319_128399_130937_131049_136496_136566_138162_138230_141496_141602_144963_145020_147587_147696_150003_150120_152058_152224_153456_153500_154852
730114	contig_6873_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_129833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTCTAACTCACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534802	534457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_534500_534800
730115	contig_504_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_54404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAGTTAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31155	29208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_29200_31200
730125	contig_18859_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_150562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271351	273416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_271400_273400
730126	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
730132	contig_21404_pilon	-	1713	7	Intergenic	novelGene_169133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	392	junction_5	52.562396782829	1146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	967	1617	5716	1446	TRUE	50	AAAAATGAAAATTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLLEGLGYSVNVKQNLTASDMTAELKTFADRPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKVRLSFESPDGKAQMPTVERMTLTRYFYLFPGY	10166	296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_388_1440_1545_2004_2115_4453_4598_4996_5232_5653_6615_10098
730137	contig_14142_pilon	-	1844	10	Intergenic	novelGene_120468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	19.7989898732233	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	207	1310	259646	247231	TRUE	20	ATACTAGAGTCTGTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLDELTAAHSLCFSLDGSQLFSGFNRTVRVFYTARPGRDCEVRSTFAKKQGQSGIISCIAFSPTQPLYACGSYGRSLGLYACDNGSPLALLGGAPWGHHPPLLSP	259852	246244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248104_248210_248302_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
730140	contig_20693_pilon	+	2202	14	Intergenic	novelGene_60248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	569.778572167974	1	121	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	5	631	14718	26247	TRUE	25	CACTTAGTAGCTGAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRRFSSR	14713	35066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26011_26227_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
730141	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730142	contig_5643_pilon	-	2264	7	Intergenic	novelGene_39168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.9295883145843	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	100	1317	784100	772467	FALSE	35	AAATACAAGTGGATGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVEKVVLIAFHF	784199	771519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_772497_772763_773342_775224_775288_775435_775562_776619_776810_783328_783558_784098
730143	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	87	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730144	contig_16122_pilon	+	2458	22	Intergenic	novelGene_134520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	48.3249113000137	1	70	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	360	1643	142082	157709	TRUE	30	TATACTCTAATGTAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDVDLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGSFPNCYGIGRCAKMSHELWRKLEEEEDGETKGRRPEIGHVFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGLVDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDRSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGFLSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLHIGACESIMKKKTKQDFQELIKTEHALLEGFNIRESTGYIEEHIDRQVSLIESLRLMCLLSITENGESQGLKMGVFRAMVLSTC	141722	160276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154264_154339_154658_154746_154915_155007_155255_155331_155590_155656_155789_155872_157677_157818_158440_158515_159013_159116_159311_159356_159487_159612_159913
730157	contig_10016_pilon	+	3170	1	Intergenic	novelGene_117860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343323	346493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_343300_346500
730160	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730161	SIRV5	+	465	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-135	875	-21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8180	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
730172	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730176	contig_15325_pilon	+	794	7	Intergenic	novelGene_157174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	855.582257880562	267	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	101	727	94114	96243	TRUE	15	TATTGTTGTATTGGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93229	96614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93240_94023_94117_94399_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
730182	contig_7816_pilon	+	2315	14	Intergenic	novelGene_66564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	10.316873064184	17	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	235	1656	462329	517856	FALSE	45	TCAGGAAGCATTCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEQQLDADTGSGVEEVELSWEDYLEDTGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVKADPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRKADFWCDIRKTDLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWAAFLRQTLTGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLQSSDNFEHWLYYLDPFLHHIGWATQQGYELQPPLAIRHLKKEAEWQEIVAKVREEEEEPLPSYLFKDKQVIGTHAFSVNMKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQA	385814	518515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_385922_462201_462357_479393_479489_494932_495174_502521_502611_506455_506703_507389_507485_507957_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560_517604_517849
730183	contig_12622_pilon	-	2131	14	Intergenic	novelGene_6013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_12	32.4806724505549	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	264	1880	1653250	1647058	FALSE	35	GACTTAGAAACTAGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANENHGSPREEASLLSHSPGTSNQSQPCSPKPIRLVQDLPEELVHAGWEKCWSRRENRPYYFNRFTNQSLWEMPVLGQHDVISDPLGLNATPLPQDSSLVENPPAENKARKRQLSEEQPSGNGVKKPKIEIPATPISQSVPSSPSVPGTPTLKIWGASPEDKQQAALLRPTEVYWDLDIQTNAVIKHRGPSEVLPPHPEVELLRSQLILKLRQHYRELCQQREGIEPPRESFNRWMLERKVVDKGSDPLLPSNCEPVVSPSMFREIMNDIPIRLSRIKFREEAKRLLFKYAEAARRLIESRSASPDSRKVVKWNVEDTFSWLRKDHSASKEDYMDRLEHLRRQCGPHVSAAAKDSVEGICSKIYHISLEYVKRIREKHLAILKENNIPEEVEAPEVEPRLVYCYPVRLAVSAPPMPSVEMHMENNVVCIRYKGEMVKVSRNYFSKLWLLYRYSCIDDSAFEKFLPRVWCLLRRYQMMFGVGLYEGTGLQGSLPVHVFEALHRLFGVSFECFASPLNCYFRQYCSAFPDTDGYFGSRG	1656798	1646806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1647247_1647328_1647416_1647565_1647739_1648484_1648648_1649690_1649791_1650069_1650154_1650234_1650383_1651068_1651224_1651346_1651478_1651666_1651805_1652911_1653037_1653126_1653270_1654659_1654834_1656728
730189	contig_7260_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_169141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGCATACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346022	345794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_-_345800_346000
730196	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730198	contig_20889_pilon	+	2172	5	Intergenic	novelGene_127637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	52.9167979000997	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	339	1328	60728	63377	FALSE	35	TGCAATAAAGTGTACTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNDTCFSMVGDICKSHGVEDKDNNQKTHVSILPIFNRKHMIENLCERNEDNQCGQTFSQILSHSVLKRTPMEGHPSEFLECGKSLMDHSSLKHHIRSHSGCVASQCKECGQACSCLSYLSTPVRTLTGEKPYESKEYGKAFRHFSVLKTHMRNHSGVRPYECKECGKTFRQSSVLMTHMRTHSGERPYKCKECGKAFSYSSNFTVHIRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDVTRHMSIHSGERPYECKECGKAFRLSSHLSTHMRIHGGERPYECKECGKTFRWPPDLTAHTRTHSGERPYKCKECGKAFRRSITPHYTYKNSQWREAL	20035	64221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_39283_39526_60671_60820_61809_62656_63325
730205	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730212	contig_1443_pilon	+	1851	12	Intergenic	novelGene_28238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	54.9479092165728	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	522	1265	538016	541250	FALSE	50	TTAAAGAATGGAAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMVCTLGVLGQGENSLESRKKRIRWEELENLENSLEILRHTCV	535997	541836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028
730213	contig_14005_pilon	+	341	2	Intergenic	novelGene_154722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTAAAACCAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774	21349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_892_21125
730222	contig_5590_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_163056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTTTGTAGTGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455503	456287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_455500_456300
730223	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730226	contig_8020_pilon	-	1192	8	Intergenic	novelGene_114366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	88.89112808971	1950	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	309	1130	107186	104794	FALSE	5	CAGGGCTGTGTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107494	104731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
730227	contig_7457_pilon	-	1223	8	Intergenic	novelGene_31587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTTAACAAGAGAAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947493	928380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_928806_939265_939355_940397_940524_941144_941258_941793_941869_945668_945787_946684_946842_947373
730230	contig_20718_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_169150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84700	85041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_+_84700_85000
730234	contig_4538_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_153078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAATAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104105	102301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_102300_104100
730236	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730237	contig_9535_pilon	-	3040	21	Intergenic	novelGene_124482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_9	16.4203379989573	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	984	2952	88	3039	365777	303731	FALSE	50	AAATGAAGATGAGATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGSEETEENLALGRVSTGRASSDWVLGAMGAEKRLPSIKEAFQLAQQPHQNQAKLVVALSRTYCTMDDKAVFHEEFIHYLKYAMVVYKREPAVERVTEFAAKFVTSFHQSEMEDDDGEEDGGILNVLFTFLLKSHEANSNAVRFRVCQLINKLLGSMPENALIDDDLFDKIKEAMLIRLKDKIPNVRIQAVLALSRLQDPKDDDCPVVNAYATLIENDSNPEVRRAVLSCVAPSAKTLPKIVGRTKDVKEAVRKMAYQVLAEKIHMRAMSIAQRVMLLQQGLNDRSDAVKQATQKHLLQGWLRFTEGDILALLHRLDVENSSEVAVSVLNALFSMTPLIELVGTCRNDARKLIPLETLTPEIALYWRVLCEYLKSKGDDGEEFIEQILPEPVVYAEYLLSYIQSIPVVNDEQRGDFAYIGNLMTKEFIGQQLILIIKSLDTSEEGGRKRLLAILQEILTLPTTPISLICFLVERLLHIITDDNKRTEIVTEIISEIRAPIVTVGVNDDLADARKKELKMAGIKVKLIEAKEALEKCIAIQDFNQASKLKEEIKALEEAKINLLKETEQLEIKEVHIEKNDSETLQKCLILCYELLKQMSISTGISATMNGIIESLILPGIISVHPVVRNMAVLCLGCCGLQNKDFASKHFVLLLQVLRIDDVTIKISALKAIFDQLMTFGIEPFKTKKITAPQSEGSEINSGDGQELRGEEEETATAKNVLKLLADFLDNEVSELRTGAAEGLAKLMFSGLLVSSRILSRLILLWYNPVTEEDVRLRHCLGVFFPMFAYASRTNQECFEEAFLPTLQTLANAPASSPLAEIDIINVTELLVDLTRPSGLNPQTKNSEDYQALTVHDNLAMKICSEILASPCSPEIRVYTKALSSLELSSYLAKDLLVLLNEILEQVKDRLCLRALEKMKIQLEKGNKEHGDQTVAAQDAKTTTTIIQNEDEENKEVYMTPLRAIKATRASKSTQQKTNRGRRKVTASARVNRRHHTAEADSESDHEVPEPES	365864	303729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_303759_304736_304807_306404_306492_306875_307015_307218_307381_309459_309635_309932_310115_313088_313317_314249_314370_317313_317425_324670_324851_325177_325268_326604_326729_327243_327385_340497_340648_341120_341311_343006_343092_344130_344277_350129_350359_354680_354885_365666
730244	contig_14441_pilon	+	738	4	Intergenic	novelGene_100448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.0555074137902	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	232	552	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCTSVPAAVSNNSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAAFSSSGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_114102_114161_116578_116963_117524
730245	contig_15084_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_116717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATAAAATGAGTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265574	265188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_265200_265600
730246	contig_6710_pilon	-	440	2	Intergenic	novelGene_98231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730254	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730260	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730261	contig_3380_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_60102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTTCTCCACAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405748	404642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_404600_405700
730262	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730264	contig_5495_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_157676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGGAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596940	597714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_596900_597700
730265	contig_11136_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_169031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCGGTGAAATAAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151483	152612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_151500_152600
730267	contig_15991_pilon	+	1017	4	Intergenic	novelGene_70919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1	717	100385	102294	FALSE	45	ACAGGGTTATGAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLFPSTSLLFSKITLCKGSLRPLGGGSHPLGGLSRGGCRPVFSCRLSTPVSRELLNGHRGHLHALGPVCHLRLSSCKFRSRSSPFTLKFFLGHSLFSSRLLFLFNLFRISVEVEVRHDLPRVLPGNGATHAQDFPGQHPPHQTNRVRSLVVARDGNVHVAQRRVRVTQSNGGQVHVRRLCERLVVSPGVGHHQKTRLPEGCLDLVSEGSRSEAPGNGSGSSSSSKLQHRPLELRTSS	100384	102594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100537_100882_101049_101159_101288_102023
730269	contig_11832_pilon	-	1225	9	Intergenic	novelGene_106916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1078.03350336388	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	144	593	86997	84828	TRUE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKGCLRGAAFCSYAPQAP	87278	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84993_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87096_87233
730271	contig_4924_pilon	+	2797	1	Intergenic	novelGene_84737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137834	140631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_137800_140600
730272	SIRV6	-	570	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
730273	contig_5982_pilon	+	3124	10	Intergenic	novelGene_169154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	30.1404121478862	59	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	132	1442	17280	68320	FALSE	30	AGTACTTCGACTAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLCARWGWNVTRVRGSSYWGPALSGRSCSAPKPESEAAAPQLMHVFKTPESVDAMHRKHLQEIPDQSSNVTTSFTWGWDSSKTSELLSGMGVSALEKEEVDSENIPQELLSSLSHPQSPPRKRLKSKGNDKDFVIVRRPKLNRENFPGVSWDTLPDELLLGIFSCLCLPELLKVSGVCKRWYRLAIDESLWQTLDLTGKSLHPDVIVRLLSRGVIAFRCPRSFMDQPLVENFSTFRVQHMDLSNSVINVSTLHDILSQCSKLQNLSLEGLQLSDPIVSNLAQNSNLVRLNLCGCSGFSESALKALLSSCSRLNELNLSWCFDFTEKHVQVAVAHVSETITQLNLSGYRKNLQKSDVSTLVRRCPNLVHLDLSDSVMLKNDCFQEFYQLNYLQHLSLSRCYDIIPETLLELGEIPTLKTLQVFGIVPDGTLQVLQEALPHLQINCSHFTTIARPTICNKKSQEIWGIKCRLSLQKPGCV	17148	70002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5982_pilon_+_17324_18043_18316_38576_38689_47543_47688_49450_49586_51094_51194_53159_53291_61503_61556_61725_61834_68106
730274	contig_8616_pilon	+	908	6	Intergenic	novelGene_72590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1142.2583595667	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	159	836	430606	436516	FALSE	15	GAACCTTTTCATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426894	436588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427035_430587_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
730276	contig_19640_pilon	+	1905	1	Intergenic	novelGene_134874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110205	112110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_110200_112100
730278	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_94944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730280	contig_6589_pilon	+	947	6	Intergenic	novelGene_25766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_5	2102.88559840996	13060	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	239	640	669670	671366	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTTQGPLEMSPGATCLPEELMGVVVFSD	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_670104_671046_671188_671286_671412_672584
730283	contig_5302_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_81539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTAGCAGCAGATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612866	1612531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1612500_1612900
730284	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	0	204	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730285	contig_2646_pilon	+	1177	6	Intergenic	novelGene_69666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	723	1163	2173795	2174930	FALSE	10	CCGGCCTGACACGTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSLALYLALPFMQITCTPLVFSGVGILTSIFWASNEGLKLDLMTTLTSSLVRPTSRTSGITRKGRMMSLVVRYLMSSNSPSGGMKLMLRSESNLLSRTHWWKVQSSMAIDCFPLLLVSSAVPLPCFSMTILSFIPNLHSGMPLR	2171589	2174944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2172189_2172823_2172937_2173784_2173877_2173977_2174119_2174223_2174346_2174834
730294	SIRV3	+	259	2	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	2039	4184	-1	-1963	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCAGCTAATAACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	4755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4081_4574
730295	contig_11115_pilon	-	1536	2	Intergenic	novelGene_102783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATTTTTAAGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56383	53831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_55302_56317
730296	contig_8978_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_49409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAGAAATTTTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341448	338950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_339000_341400
730301	contig_16541_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_126727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGTCTTTTGTAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283605	285201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_283600_285200
730304	contig_3155_pilon	-	1894	13	Intergenic	novelGene_26435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_2	836.543130820057	218	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	26	1729	332640	295308	FALSE	40	ACCTAGCATTAATAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESKAGGAAGLFAKQVQKKFSRAQEKVLQKLGKTVETKDERFEQSASNFFQQQAEGHKLYKDLKNFLSAVKVMHESSKRVSETLQEIYSSEWDGQEELKAIIGNNDLLWEDYEEKLTDQVVRTMENYIAQFSEIKERIAKRGRKLVDYDSARHHLEAVQNAKKKDEAKAAKAEEEFSKAQIVFEDLNQELLEELPILYNSRIGCYVTIFQNISNLKDVFYREMSKLNHNLYEVMSKLEKQHSNKVFVVKGLSSSSRRSLVISAPLRTSTASSPLTSPISPSALSLKSERESISAAEEERAPDPAQEEDNSEMEEEPLKDKEIEGGGAKASSSEEEEPLPAYNGPTQTQPSPTTEGGESQEEVFSCSPAPSSGRALIPSEQPSSSFPEVVLQTHTTSEGSEQPKRASLSRTSAPPSRPPPPRASPSPRLSSGSIPSSPTTSEGGSPTSSRAFFGAGTPSPRTSIEVSPDPELPEKPERNPEAREKETTHHLNPEELCTSPTLMISQVFSEPSEAGKMEDKEENNEFTSADSPEGQGLELQVSTVAGESSVIAPEPQEEVSTSQNAQL	332665	295142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295338_295600_295676_298123_298205_299936_300694_306112_306196_307222_307299_308408_308495_309008_309117_310332_310429_310991_311087_311678_311734_321619_321701_332559
730305	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
730308	contig_13592_pilon	+	1176	3	Intergenic	novelGene_33731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1562	junction_1	351.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTTATTGTGTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267105	269472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_267704_267825_268000_269068
730309	contig_11933_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_107240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTACTCTGTGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76389	75589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_75600_76400
730310	contig_11386_pilon	-	1389	3	Intergenic	novelGene_82791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	581	892	34528	34217	TRUE	10	TCTGGTCTTCGTGCGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFHGTYVVLHIGERASMGSLRSCPKGLPRGRGTSWKEARGGLQDLWRLKESEATSQIKGDAISCVKKTAGERPGYSEELTTVPDEGKSALNRATIVAVPIR	35108	19792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_19979_20815_21039_34128
730311	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
730314	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730323	scaffold_6394_pilon	+	1084	8	Intergenic	novelGene_110986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1013.95449320259	5	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	410	928	405059	406119	FALSE	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398174	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402921_403314_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
730331	contig_10444_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_139460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAGAAAGAAAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756604	758682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_756600_758700
730335	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1807	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
730337	contig_8020_pilon	-	1984	10	Intergenic	novelGene_114396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	65.7916652006661	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1161	1769	150417	148058	FALSE	35	GAAGCAGGCATGAGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	153257	147842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150544_150618_150901_151044_151127_151708_152036_152321_153191
730338	contig_12864_pilon	+	1406	7	Intergenic	novelGene_76412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGCAGGCTTCTGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242232	252145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242914_244584_244767_245706_245913_246327_246350_249530_249700_251883_251990_252105
730340	contig_3942_pilon	+	983	10	Intergenic	novelGene_128610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_3	70.394128543035	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	289	981	95207	106807	FALSE	10	GAGTTGGGCCAGGGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPVSTKELAEFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASNGTPVGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKSKEEVVGTLDAVQVFAGVNQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAEAKTKKAAESLRRSVEKYNSARADFEQKMMDSALRFQAMEETHLKHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQ	89358	106809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_89408_94440_94548_94690_94779_95162_95234_100708_100801_102070_102146_103074_103217_105002_105156_105389_105495_106708
730342	SIRV6	+	363	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	411	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2846_3132_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730343	contig_6375_pilon	+	2688	1	Intergenic	novelGene_72972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCACTCCTCCCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221994	224682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_222000_224700
730345	contig_987_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_72295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	291	656	931463	931098	NA	45	GTCCAGATAATACAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHCLVGYISPNSGCQLQGKALLSLLALEEGPSCHQSSPGLGASLRRNLRSRGRAVLLLFLSWWCEVPNSACFPFISCKVKRGAGHTLGKLLLHWIRVVTWVRVVLQSHPNPL	931753	929885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_929900_931800
730351	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_98021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730353	scaffold_12124_pilon	+	948	10	Intergenic	novelGene_22299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	183	560	1490385	1508039	FALSE	30	CACATCTGAAATTTCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473585	1508427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
730356	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_96594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
730357	contig_5302_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_81399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTATCCAGATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155943	154168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_154200_155900
730359	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730360	contig_12635_pilon	-	1224	9	Intergenic	novelGene_60813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	390.842999169743	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	203	1207	227358	180251	FALSE	10	CCTTTTGTTATTTGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDPKCKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262824	180233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_227341_227446_262709
730362	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
730363	contig_6227_pilon	-	1385	11	Intergenic	novelGene_49773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	364.546348219263	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	123	1004	1224979	1203017	FALSE	50	AAAATGCCACAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNIHVRAQDLRSGRHLGHQQLRPVGSGAGEAAG	1225101	1202635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1211226_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
730366	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11024_11109_11205
730367	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
730368	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
730371	SIRV6	+	553	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730372	contig_8866_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_77761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCCCAGCATCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339162	339555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_339200_339600
730377	contig_6458_pilon	+	1836	8	Intergenic	novelGene_163737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	410.235422703618	409	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	208	1401	33542	61473	FALSE	25	TTAGTGGTCTTGTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLDLSGKLIIKAQLGEDIRRIPIHNEDITYDELVLMMQRVFRGKLLSNDEVTIKYKDEDGDLITIFDSSDLSFAIQCSRILKLTLFVNGQPRPLESSQVKYLRRELIELRNKVNRLLDSLEPPGEPGPATSIPENDTVDGREEKPAASDSSGKQSTQVMAASMSAFDPLKNQDEVNKNVMSAFGLTDDQVSGPPSASAEDRSGTPDSIASSSSAAHPPGVQPQQPPYTGAQTQAGQLYQQYQQQAGYGAQQPQAPPQPPQQYGIQYSASYSQQTGPQQPQQFQGYGQQPTSQAPAPAFSGQPQQLPAQPPQQYQASSYPPQTYTTQTPQPANYTVAPSSQPGMAPSQPGAYQARPGFTPPPGSTMTPPPSGPNPYARNRPPFGQGYTQPGPGYR	29832	61908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_+_29997_33498_33726_36964_37049_42665_42813_51160_51329_54195_54325_57297_57397_61090
730378	contig_6159_pilon	+	1968	13	Intergenic	novelGene_128238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	81.7945851916046	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	130	1836	34609	45745	FALSE	10	GCCTCGTGGCCTAGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRYAVLGLVAVVLVALITGLCIWLPSSSQHPNHVYPRAAVATDAKRCSEIGRDALQDGGSAVDAAIAALLCVGLMNAHSMGIGGGLFLTIYNNTMRKAEIINAREVAPALAFASMFNSSEQSQEGGLSIAVPGEIRGYELAHRRHGRLPWARLFQPSIQLAREGFPVGKGLAAALERSRGTIERHPFLCEVFCRNGKVLQEGERVVMLRLASTYETLALEGAQAFYNGSLTAQIVQDIQAAGGIVTAEDLNNYRAELIEHPLNISLGDSVLYMPSAPLSGPVLALILNILQGYNFSQASVETPEKKGQTYHRIVEAFRFAYAKRTLLGDPKFVNVTEVVHNMSSEFFAAQLRARISDDTTHPISYYEPEFYTPDDGGTAHLSVVSEDGSAVSATSTINLYFGSKVRSMASGILFNDEMDDFSSPSITNQYGVPPSPANFIQPGKQPLSSMCPSIIVGRDGQVRMVVGASGGTQITTATALAIIHSLWFGYDVKQAVEEPRLHNQLLPNTTTLERHMDQAVTAALESRHHYTEVTSTFIAVVQAVVRTASGWAAASDSRKGGEPAGY	29537	45877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_29663_34604_34770_36106_36238_36396_36484_39342_39536_39901_40060_41556_41707_42111_42249_44448_44637_44892_45021_45104_45218_45286_45401_45598
730381	contig_6589_pilon	+	912	5	Intergenic	novelGene_26059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	566.777293123145	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	93	575	1728220	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLGCVGALKELRCLLASLLASQLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1726983	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1727035_1728178_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
730384	contig_9481_pilon	-	1667	6	Intergenic	novelGene_149698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	68.0823031337807	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	41	835	600300	585107	FALSE	25	CATTATCATTATGTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKSQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNYTFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKSGGKWIIRLRKGLASRCWENLILAMLGEQFMVGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKYVLWGGRGGVPKLSRSRSVVGPRGVWLYRRLTGGEGTAQLSR	600340	584274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_585374_585465_585619_587035_587141_591476_591612_592669_592785_600280
730386	contig_6496_pilon	+	2017	12	Intergenic	novelGene_103490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	68.5314671043242	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	943	1455	462849	467595	FALSE	45	AAATGAAGCGTCTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	451337	468157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_451439_452592_452677_453536_453681_455572_455702_457424_457514_459854_460056_461054_461140_461416_461507_462829_463002_463278_463421_463637_463786_467525
730387	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_96654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730395	contig_16724_pilon	-	1308	11	Intergenic	novelGene_105321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	762.489055659162	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	301	1209	569099	541872	TRUE	50	GATTAAATTAAAATAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIGTPSPQQARVCPPRTLPDDGANLSSVRGILSLIQSSTRRAYQQILDVLDENHSVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575955	541329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541869_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_553367_553527_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
730400	contig_8452_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_47983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_1	0	561	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101282	98087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_100202_101016
730401	contig_7066_pilon	+	1796	10	Intergenic	novelGene_42185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	72.06033137604	10	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	158	1426	994581	1003261	FALSE	15	GTGACTGCTGTGGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKDCPLQFHDFKSVDHLKVCPRYTAVLARSEDDGIGIEELDTLQLELETLLSSASRRLRVLEAETQILTDWQDKKGDRRFLKLGRDHELGAPPKHGKPKKQKLEGKVGHGPGPGPGRPKSKNLQPKIQEYEFTDDPIDVPRIPKNDAPNRFWASVEPYCADITSEEVRTLEELLKPPEDEAEHYKRWAQEDLLEEQKDGARAAAVADKKKGLMGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993343	1003631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993417_993803_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997150_998489_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
730404	contig_11656_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_53975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGGAAACTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184029	181975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_182000_184000
730405	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730407	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730418	contig_11832_pilon	-	2614	6	Intergenic	novelGene_106958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	23.7739353073907	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	480	926	437122	399685	TRUE	65	ATGGAAAAAATAAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLCLAETDSGSSPVLISLTSVVEQMLQFQEQECTCRCRKPRMIPKQEAVTIPLNLCARIPKGLVGWIVPSPYLSKLGLTVNTAMLLSGQNSPLVFYLCNPIQYKWECTEGEELARLVLLPAIWTGTVAEPDVPSQGGKVWVKINDK	461587	392815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_393587_398767_400054_437044_437239_439984_440135_458909_458991_461455
730427	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
730435	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730436	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730447	contig_6208_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_52991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAGTGCCTTTTCCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392977	392457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_392500_393000
730450	SIRV7	-	362	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-28	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114766	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
730454	SIRV2	-	643	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4153	0	2974	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
730457	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730459	contig_5947_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_101521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489838	488125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_488100_489800
730461	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730462	contig_91_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_127116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	538	849	440725	441036	NA	5	TCCCCTCCTGCCCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVCETQSHHPSFKEHSGCTSSKTDLFILLGVHGIFNILRQHHHSKASILLRSSLVIVQLSHAYEANEKTMAWVRHTSVFKVTSSQPRKSYGAVLFCHIGSL	440187	441244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_440200_441200
730466	contig_6885_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_83690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	264970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_262700_265000
730468	contig_15407_pilon	+	1898	5	Intergenic	novelGene_123092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	92.898802468062	693	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	356	859	520361	526565	FALSE	20	TGAGTTGCTTTTGCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVDNYVFAGEYEDTLGTCVIFEEDVEEHVDAEGNNKTVLKYKCHTMKKLSMTRTLLTEKKEGEENIGGVEWLQIKDNDSSNRPNMICSFLHENEDEEVVAPAPDKPLELKEQEIQMKDNSDLSYEQGKPLHLEIEDSGPLIEIPSFDTEGFDFMETQDADLEATPR	519304	527604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_519636_520336_520401_520497_520546_523324_523439_526263
730470	contig_10626_pilon	+	1648	11	Intergenic	novelGene_138189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCCTCCGCCGAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10084	199430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_10596_13874_13999_16072_16170_16855_16999_59102_59199_59500_59544_84175_84334_168569_168701_169711_169855_197893_197992_199326
730477	contig_14814_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_137718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAACTTCCGCCTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283505	283806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_283500_283800
730478	contig_13074_pilon	+	2734	2	Intergenic	novelGene_153463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710243	713021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_711623_711666
730479	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730480	contig_7057_pilon	+	1582	2	Intergenic	novelGene_123179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	157	junction_1	0	211	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCAATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26822	28779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_27060_27434
730483	contig_4659_pilon	-	2341	5	Intergenic	novelGene_118180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_3	267.239943683574	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	108	524	123066	120651	TRUE	40	AAATGGAAGATATCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLNPGNHQRLCVLFSSSSAQSSNAPSACVSPWIVTMEFYGKNDLTLGIFLERYCFRPSYQCPSMFCDTPMVHHIRRFVHGQGCVQIILKELDSPVPGYQHTVLTYSWCRVCKQVTPVVALSNESWSMSFAKYLELRFYGHQYTRRANAEPCGHSIHHDYHQYFSYNQMVASFR	124555	118404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_118485_118913_120834_122174_122347_123004_123077_124458
730484	contig_10023_pilon	-	922	7	Intergenic	novelGene_123520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_6	359.658634448463	4430	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	24	818	458219	456118	FALSE	10	CTTGCAGAGTGGTTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAIVTKMEAFLESRSGLWAGGPALGQFYRIPPSPSSFVDVASAPYGGPSTRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREFLEKQPVVSQAEARELVERCMRVLYYRDARSYNRFQVATVTEKGVEIEGPLSAETNWDIAHMISGFE	458242	456013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_456714_457083_457166_457288_457436_457682_457890_458079
730489	contig_3181_pilon	-	1884	3	Intergenic	novelGene_136924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	266442	264609	FALSE	40	AAACAAATTTTATATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRARAVERQLVSVRGSKSGIAAPALRHGRASGAGVPVSLGWPVPRRSSGRPVDRLEEVELQIGDAAFSLTQLLEATSAVSAQVEELASKCTENARFLKTWRDLLKEGYDSLKPDN	266444	263074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_264765_266177_266273_266345
730493	contig_9863_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_153992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTAAGCTATAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24810	25556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_24800_25600
730494	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
730499	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_90761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
730501	contig_13982_pilon	-	2514	14	Intergenic	novelGene_163474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_13	86.0361146132918	140	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	27	2255	548056	353103	TRUE	20	CACATTGCTTACTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVPGAALSQAGWYLSDEGIEACTNSPDKVNINDIIMIALNTDLRTIGKKFLPSDINGGKVEKLEGPCVLQIQKIRNVAAPKDNEESQAAPRMLRLQMTDGHISCTAVEFNYMSKISLNTPPGTKVKLSGIIDIKNGFLLLNDSNTTVLGGEVEHLIEKWELQRSLSKHNRSNIGTEGGPPPFVPFGQKCVSHVQVDSRELDRRKTLQVTMPVKPSNDNDEFEKQRTAAIAEVAKSKETKTFGGGGGGARSNLNVSTGGNRNREVLQKEKSTKPEGKHEGVYRELVDEKALKHITEMGFSKEASRQALMDNGNNLEAALNVLLNSNKQKPVTGPPLRGKGRGRGRIRSEDEEDLGSARPSAPSTLFDFLESKMGTLNVEEPKSQLQQLHQGQHRFSNMEQNGVRDNNQPRHLPRNDTRQLRNEKPPRFQRDTQNSKSVFEGCGLPRNRGSEKPTSSVSEVWAEERIKCDRPYSRYDRTKDTSYPSSSQHNDGAFKKRDNSMQSRPGKGPSYAEAKENPLPQESIDYNNQKRGKRENQPANLDHFYDRKPRTMSNEAFSGVKTEKHFNVNTDYQNPVSTNSFIGVPNGETEMPLKGRRVGPIKPAGPIAATPYDDKIFYNSGPKRRSGPIKPEKIIESSIPMEYAKMWKPGDECFALYWEDNKFYRAEVEALHSSGMTAVVKFIDYGNYEEVLLSNIRPVQTEAWEEGTYDQTLEFRRGGDGQPRRSTRPTQQFYQPPRARN	548082	343278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_343529_353093_353217_383217_383344_388758_389607_413476_413603_414281_414439_428839_428981_434214_434365_436803_436876_459706_459849_463745_463907_477513_477580_483748_483834_548015
730502	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730503	contig_9848_pilon	-	1223	5	Intergenic	novelGene_79967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	519.240069717274	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTAAGAGCAGTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106524	98505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104130_104841_104905_105852_105909_106409
730507	contig_5671_pilon	+	823	3	Intergenic	novelGene_79474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_2	456	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392772	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_392919_521218_521303_531205
730508	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10732_10819_11031_11109_11205
730518	contig_8571_pilon	+	1922	2	Intergenic	novelGene_169163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAACTTGATTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375136	377896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_376420_377257
730519	contig_11378_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_112221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTGGCCACCTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270510	268551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_268600_270500
730527	contig_16098_pilon	-	929	12	Intergenic	novelGene_45778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	298.662306884747	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	248	661	35038	31519	TRUE	5	TAGCTCTCTTGGCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36342	31091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
730528	contig_11846_pilon	-	1962	12	Intergenic	novelGene_105932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_11	81.2642867286772	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	46	1314	263830	248626	FALSE	30	GCCACAGAGTGTTGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263875	247977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_263659
730533	contig_5375_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_169218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTCTTTAAAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88623	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_88600_89400
730538	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730539	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	61	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730542	contig_5935_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_102699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCAAGATGGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935785	934809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_934800_935800
730546	contig_14322_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_115772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	257	313	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLIWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671349	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671300_671700
730548	SIRV7	-	904	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	49	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAATCCTAAGAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689_114961_147608
730559	contig_12250_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_80684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	981	junction_1	0	21	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGGTGTGCGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393245	394994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_394775_394867
730562	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
730563	contig_854_pilon	+	1136	4	Intergenic	novelGene_36463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.4414445969611	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAATTCTCTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513467	1527196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513676_1514629_1514830_1517440_1517565_1526592
730570	contig_11258_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_67802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCTTGTACTCTGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287771	288662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_287800_288700
730572	contig_7963_pilon	-	885	6	Intergenic	novelGene_58324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1608.70228445166	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48904	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39341_40088_40232_43546_43819_48741
730575	contig_6710_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_98206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	40	CACAAAACACCTATCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730578	contig_11285_pilon	-	3149	27	Intergenic	novelGene_5741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	143.638749077978	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	1365	2843	1199468	1192895	FALSE	25	CAGAACATTCTGACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM	1230701	1192588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195815_1195943_1196182_1196270_1196721_1196805_1196958_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203511_1203887_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213225_1215200_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
730581	contig_5954_pilon	+	1917	4	Intergenic	novelGene_28398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	8.28653526310404	186	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATTAGATTTAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7000	11754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_7301_8285_8508_8631_8768_10495
730582	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1173	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730583	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730584	SIRV1	-	210	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3894	0	3620	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6746	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
730588	contig_990_pilon	+	1889	12	Intergenic	novelGene_76025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	294	662	714096	714464	TRUE	45	GCCAAACACAGCTCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENLPRQERAQSRFEITAPGSVSSLCTVHSQRSTSGGFLDALIHGSKGFTRATNDRLVNNVPIHDSLQLSQVFTRQFKLKRKKRKKREKKKERKKHNHKNKSWFFSQDTFFVSNPFYPTFY	713802	848368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_714605_725874_726066_746125_746316_803705_803776_808856_808951_811852_811905_833875_833956_834530_834572_835681_835725_840428_840507_844874_844932_848177
730589	contig_7201_pilon	-	3135	1	Intergenic	novelGene_152530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352948	349813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_349800_352900
730593	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730594	contig_9753_pilon	-	343	5	Intergenic	novelGene_41335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	687	junction_1	127.854164969312	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	26	343	93294	70534	FALSE	45	GTTAAAAACTGCAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRDLNRKRNQ	93319	70533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70559_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
730602	contig_6710_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_89521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730605	contig_16766_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_153364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGGATCAAACTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147152	149224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_147200_149200
730606	contig_12873_pilon	+	1959	6	Intergenic	novelGene_27156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	1	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	405	1385	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15952	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
730609	contig_405_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_135304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTCTCAGCCGTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302336	303675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_302300_303700
730615	contig_15062_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_162288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACAGTTCAGAGTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17077	15323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_15300_17100
730618	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730621	SIRV5	+	317	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	13	875	13	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
730624	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730635	contig_7196_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_147161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCGGCTCTCACGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36536	36986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7196_pilon_+_36500_37000
730641	scaffold_880_pilon	+	1814	1	Intergenic	novelGene_121450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAATCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436960	438774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_437000_438800
730643	contig_3627_pilon	+	1055	2	Intergenic	novelGene_78525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_1	0	14	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	128	376	634068	634316	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	630873	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_631000_634066
730645	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730646	contig_11986_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_69130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGTCTATATTAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145465	144923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_144900_145500
730647	contig_11986_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_69125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGATAAAAACTTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132383	130878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_130900_132400
730648	contig_4469_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_21977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGCTGAACCTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936439	937635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_936400_937600
730655	contig_6557_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_32958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGGAGCTTCAGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364160	362440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_362400_364200
730659	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
730660	contig_8538_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_4778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	25	TTGCATTCCCAAATAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
730665	contig_2367_pilon	-	1643	3	Intergenic	novelGene_65317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	764	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAATTTAAGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213290	192224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193604_208552_208634_213107
730667	contig_10734_pilon	-	3063	18	Intergenic	novelGene_51328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	22.3962428880768	78	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	340	2922	1690199	1592706	FALSE	5	GTTGGACTTTCTGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWAFGWNSSLPVFSIRDENQRVLLYVCAHTVVIYDVFRNSQHHLQGHANVISCLCISEDRRWIATADKGPDCLIIIWDSFTGIPVHTIFDSCPEGNGIRAIAITHDAKYLATISDGKDQKICIWKWTLAVETPACTLDLNKEYGFQTFNKLVGKFSQSVFHLNLTQILSATMEGKLVVWDIRRPPPSAITFLGFPYIKPCKLVHLQKEGITVLTTIDSYIVTGDIKGNIKFYDHTLSIVNWYSHFKLSPIRTLSFSKTPPPPAAEKSNYPPDCTLKGDLFIVRNFVIATSDATVYHLTADGTKLEKLFVEPKDAICTVACHPYQPLLAVGSLCGMIKVWDYESKTYLFSRVFEKGIGVQSLTYNPEGAILGVGFTEGTVYILDAMSLENEIAEPFKYSRSGVTHISFSHDSHYMATADENYTVALYQVVVKHGQRVWEYLARLRSHHRSIQSLLFGVNLDSNEPRLLSLGRDRLLIEYNLLKTCKDHLEVLDIHRTDQGCYPTCMVWYPPLTKELFLLICNSGYKVKLFNSTTKMCRKTLLGPTYGSPIEQIQLLPVKTTSELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHKTSAIICHPNGVAGMTLSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWEINLSALEAAVSLGGEDLTPFYGLVAGGREGQFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETREVSEHICLSEVPYVMRAIGFYPSEEKINDMFNEIKFGEYVDTGKIVDKINLPDFLKVYINHRPPFGNTMTGIQHSFKVLGYTNSEGKTVIQREDFLRLLLTKGEHMTQEEMLDCLATLFGMNPEGWKSEPATTSVKGSEICLEEALPDEITAEVFTTEILGLTISEDSGQDHMVSDV	1696967	1592564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1592831_1594270_1594373_1595610_1595840_1616124_1616269_1616476_1616568_1623239_1623404_1624479_1624595_1642310_1642496_1643488_1643663_1653400_1653553_1654008_1654260_1655343_1655539_1659065_1659281_1667393_1667475_1667691_1667804_1687297_1687408_1690061_1690207_1696635
730670	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_93535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730673	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
730674	contig_10197_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_115318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGCTGTGTAAGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581652	1583480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1581700_1583500
730675	contig_2069_pilon	-	679	3	Intergenic	novelGene_23475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509815	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
730676	contig_9706_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_20794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCGCTACCAACCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1749	2039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1700_2000
730678	contig_5020_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_27938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCCAATTATAAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157554	158202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_157600_158200
730683	contig_7202_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_18620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAATATTTTCTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	28590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
730684	contig_7202_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_18117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27868	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
730686	contig_7202_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_17991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27912	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
730687	contig_15323_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_148497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTCAGAACTCAGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6389	6640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_6400_6600
730688	contig_15323_pilon	+	2390	1	Intergenic	novelGene_148498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGCTTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6896	9286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_6900_9300
730689	contig_16846_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_82939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCTCCAGGTACTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550861	552790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_551671_552666
730690	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730694	contig_15859_pilon	-	2130	7	Intergenic	novelGene_50195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	152.690318400786	44	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	200	1585	349672	341031	FALSE	20	CTTCAGCGTTACATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRKWWRQRPGRPVAVLASAVLSRIDHLSGGQQLPGVRAAAYEIKPGEVNEPLERATDGEIVFLSSEMYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTEIQPKIIGQAYPHKRRFILVLPGVIQSEKQRAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352983	340485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_342430_342521_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352816
730696	contig_11396_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_71442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	1403	junction_2	30.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGAAAGAAGAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788194	1789699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1788553_1789201_1789265_1789652
730699	contig_1450_pilon	+	1851	3	Intergenic	novelGene_27355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1100	junction_1	509	34	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	237	716	244426	316018	FALSE	75	CTAACTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEGKTCPLAALWSLIFCPPGSLSPFCPDCQDHTSRGLWKRSPQYLHVS	244189	317153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758
730700	contig_5794_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_69745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGTACTCAAGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478651	478226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_478200_478700
730701	contig_4364_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_19	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACGAAGTTTCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260076	261727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_260100_261700
730702	contig_4486_pilon	+	3084	1	Intergenic	novelGene_38651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1689	2045	1031794	1032150	NA	25	CTATGATTAAAGGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSLLQLKSVLFYIFVFLPALYNLPKIVNHTPYTGQVEQWLSAQLLTKRWAIHQLLSRRKMRQSASVKIYSLGNLWGTSALSCRVTESESTHRQQLWFFGVFVAVDYTMQNILAWFL	1030105	1033189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1030100_1033200
730703	contig_16846_pilon	-	1175	5	Intergenic	novelGene_82924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	170.671284931004	626	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAATCTGTTGATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487455	477741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_478282_479461_479592_484888_484993_486863_486950_487140
730705	SIRV6	+	551	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1270	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730707	contig_6589_pilon	-	2151	3	Intergenic	novelGene_26306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	127	612	2274715	2273638	FALSE	45	CAAGTTTATTGTGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTPHRSTPGTAR	2290224	2272098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2273672_2274263_2274793_2290175
730709	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730712	contig_504_pilon	-	1702	12	Intergenic	novelGene_54422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	93.841522818839	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	221	943	181501	159571	TRUE	20	TTGTTGATTTTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGIDPPLTCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHVKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEGSIYIHNIKDMKLLKTILDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTTGEIVLYDGNSLRTVCTIAAHEGMLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLST	187815	154023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_154556_158690_158810_159462_159575_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167643_167742_175457_175555_181414_181585_183341_183425_187761
730714	contig_16666_pilon	-	1410	7	Intergenic	novelGene_61723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	286.196562212446	280	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	509	937	42510	24486	FALSE	15	GTCTATAGATCCTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLKRGWGEFEIIIKIFFIDPNERPVTLYHLLKLFQSDTNAMLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47987	24012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_47684
730724	contig_18108_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_33446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAATTAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66248	67815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_66200_67800
730725	contig_7333_pilon	+	1626	12	Intergenic	novelGene_142788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	125.819823951449	5	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	543	962	223622	225101	TRUE	15	TACCCTTCCGAAGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPRPLESKLQTVEMAWRHQTF	218411	237586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_221833_221890_222679_222777_222951_223026_223598_223676_224012_224321_225043_225167_230329_230391_236788_236836_237095
730727	contig_50_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_122210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30146	28097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_28100_30100
730728	contig_13460_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_162193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATGTGTGTCAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298126	297624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_297600_298100
730729	contig_7816_pilon	+	2591	13	Intergenic	novelGene_66562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	8.17983632001413	17	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	253	1671	462329	517607	FALSE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEQQLDADTGSGVEEVELSWEDYLEDTGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVKADPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRKADFWCDIRKTDLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWAAFLRQTLTGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLQSSDNFEHWLYYLDPFLHHIGWATQQGYELQPPLAIRHLKKEAEWQEIVAKVREEEEEPLPSYLFKDKQVIGTHAFSVNMKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQ	385796	518527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_385922_462201_462357_479393_479489_494932_495174_502521_502611_506455_506703_507389_507485_507957_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560
730730	contig_11752_pilon	+	920	6	Intergenic	novelGene_37666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1100.71202410076	52	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	63	608	88745	105616	FALSE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKQLGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	88682	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_88782_92903_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
730731	contig_16846_pilon	+	1979	11	Intergenic	novelGene_82886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	113.757461293754	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	134	1198	348050	370491	FALSE	35	TCCTCAGCATTAATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSRSENVEVLEEEPVMSKTHDHQLKSSSNLVEVCTKSSASLEMTKSIAKERIHLGSSPPKGGSCDLSHQEGLQSRSLHLSPQEQSVHQGRRQSWRRASMKGMNRRKSLPPFHQGITALSRSISVNLAESKRLGALLLSSFQFSIQKLEPFLRDTEGFSLESFRAKASSLSEELKHFADKLESDGTLQKCFGKSKEKELDLSLEASVAEMKEYIAKFSSERQTWDHLLLHYQKEAEEIPSRSAEGRIIEVEVEPTTYLGSSQSEVLNTKPDYQKILQNQEKVFDCMELVMDELQGSVKQLHAFMDESTECLQKVSVQLGKRSMQQIDPSPARKLLKLRLRNPPTTHCSGSCQ	345943	371272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_346062_348034_348084_348292_348617_350707_350782_352036_352110_353713_353802_356714_356775_357182_357258_368496_368642_369719_369808_370387
730732	contig_17171_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_147351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATTGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56480	58007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_56500_58000
730735	contig_5084_pilon	+	1664	2	Intergenic	novelGene_64489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGAAAAACACCATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93283	96106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_93623_94781
730741	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
730743	contig_8617_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_73411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62472	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
730748	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
730749	contig_4857_pilon	-	1253	5	Intergenic	novelGene_48827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGAATTCTTCGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411067	1331384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1405451_1405553_1407010_1407073_1409985_1410309_1410465
730750	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730753	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	53	512	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
730756	contig_19076_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_74209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103337	101408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_101400_103300
730757	contig_5832_pilon	+	2552	12	Intergenic	novelGene_134151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	26.9928058980154	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	246	1445	355217	372226	FALSE	20	AAACCTCTGTCTTCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRLQDEMATFFFEYDTPRMVLVRNKKVGVIFRLIQLVVLVYVVGWVFLYEKGYQTSSGLISSVSVKLKGLAETQLPGLGPQVWDVADYVFPAQGDSSFVVMTNFIATPQQSQGYCAEHPEGGICTGDSSCIPGKAERKAQGIRTGKCVAFNDTVHTCEIFGWCPVEVDDNTPRPALLREAENFTLFIKNSISFPRFKVNRRNLVEEVDAAYLKTCLYHKTTHPLCPVFKLSYIVQESGQNFNSLAEKGGVVGITIDWNCDLDWHVRHCKPIYEFHGLYEENNLSRGFNFRFARYFTENGTNRRHLFKVFGIRFDILVDGKAGKFDIIPTMTTIGSGIGIFGVATVLCDLLLLHILPKRHYYKQKKFKYAEDMGPREGEHDLAATSSTMDLQENMKTS	354971	373333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_355354_362937_363086_363385_363458_364137_364208_364543_364641_364912_364994_365257_365400_368581_368710_369197_369289_371501_371568_371950_372053_372160
730761	contig_11566_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_166703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	43	402	195010	194651	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSLLTVSSCVSQAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEVTQLRRVLETASDASLGWLHVNRVRETLKEHQGHLLNFVVVPVSKLFSPKLLKCLE	195052	192936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_192900_195100
730763	contig_3956_pilon	+	1070	6	Intergenic	novelGene_14746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	63	junction_5	7.93977329651168	633	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	14	538	668005	687887	FALSE	35	CCACAAAGATGTAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSGGRIGGGSASLWAALLLAAVALRPAEAVSEPITVAFDVRPGGVEHSFSHSAGPGDKYTCVFTYASQGGTNEQWQMSLGTSEDHQHFTCTIWRPQGKSYLYFTQFKAEVQGAEIEYGMAYSQAAFERESDVPLKNEEFEVTKTTVAHRPGTFKAELSKLVIVAKAPRSEL	667991	688419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_668182_669687_669739_678336_678399_686615_686698_687256_687330_687807
730765	contig_2219_pilon	+	1704	2	Intergenic	novelGene_67213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	337	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTATAGTGCTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384821	386815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_385142_385431
730766	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	886	-38	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
730772	contig_1443_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_28181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	344128	344592	TRUE	25	TCTAATGAGTGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344751_344814
730774	contig_9471_pilon	+	1118	8	Intergenic	novelGene_21765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_7	147.874878163388	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	275	841	385781	401578	FALSE	25	GCCTCTTCATTAAACCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTLHTDVGDIKIEVFCERTPKTCENFLALCAGNYYHGCIFHRNIKGFMVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGNSPHRHNVGMTAPIKPSVWHSERRKDKRVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	384797	401855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_385008_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_399693_399775_401451
730775	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	513	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730781	contig_5954_pilon	+	1760	18	Intergenic	novelGene_28500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	133.001157733598	323	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	137	1381	412904	420257	FALSE	0	TGCTCTGCTGGTCCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRPALEVQVLDSPDEAMGTIKRAPFLGPSLPEPPAEDSLSSPPGPDSPPLLPTTWATMKHQADLERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGSTFLLAALPTSLLLLQWYEPLQKFLLLKNFSSPLPSLAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHILPLEAGLRPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTVLVSFQRCVRIVNLQGEPTATLAPELTFDFPIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLGTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIVLESIPTDNPGAHSNLYILTGHQSSY	412500	420636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_412540_412619_412659_412745_412780_412879_412986_413090_413156_413233_413276_413351_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_418055_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
730784	contig_12050_pilon	+	1666	4	Intergenic	novelGene_62657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_1	167.659045552441	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	824	1153	362575	363452	FALSE	5	GCTTGGAGCCCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	361751	363965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_362686_362766_362817_362918_363046_363410
730787	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730788	contig_5467_pilon	+	1893	12	Intergenic	novelGene_111939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	371.590884070058	1	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	662	1288	13537	15166	TRUE	10	CATGAGTTGGGCCTCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPRILLWAQNFSVTYNGQTEDLTSLTFGAQELNLTGSFWNSSAAGLALTYEQLFGTMVTFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCQYVSSLTKNGNLLVPHTQPSAWDVTLRDFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTSLLMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDDHKGPAISLTQIV	8235	15840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8245_8346_8395_8664_8792_11139_11215_11443_11622_12039_12081_12961_13048_13439_13680_14371_14414_14507_14740_14956_15270_15338
730790	contig_14882_pilon	-	2023	4	Intergenic	novelGene_115032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.1896740267671	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	241	594	363421	320748	FALSE	25	TATTTTACCCAGAGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSTGAGNSLVHKRSPLRRNQKAPTSLTKLSLQDGHKAKKPACKFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINILKQSCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTDGKMRLYLGASKNEYRYALVWL	363661	319318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_320816_321327_321410_321539_321739_363416
730791	contig_6589_pilon	-	2090	9	Intergenic	novelGene_26072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	9.13013554116257	190	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	222	1103	1832142	1826982	FALSE	10	TCATCTGTGAGTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSKLLVPELSEAETIGPETARFEELLLQASKELQQAQTTRPESTQIQPQPGFCIKTNSAEGKVFINICHSPSIPPPADVTEDELLQMLEEDQAGFRIPMSLGEPHAELDAKGQGCTAYDVAVNSDFYRRMQNSDFLRELVVTIAREGLEDKYSLQLNPEWRILKNRPFLGSISQQNIRSQQRPRIQELGNLPTPGYRAAETGPEKPHLNLWLEAPDLLLAEIDLPKLDGAMGLSLELGENRLVMGGPQQLYHLDACISLRINADESKAAFHRKRKQLMVAMPLLSVPSESW	1832363	1825994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1827033_1827166_1827311_1828471_1828548_1828780_1828911_1829249_1829332_1829423_1829486_1830763_1830944_1831259_1831327_1832052
730793	contig_8724_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_169233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	3197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8724_pilon_+_2500_3200
730794	contig_3721_pilon	+	2516	12	Intergenic	novelGene_123798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281.622248604564	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	385	1419	81648	102235	TRUE	20	GTACTCTTTGTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLIKPSDQLVNMQNHFGSHHEVSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63851	103788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69507_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81608_81660_88204_88266_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450_102444_102899
730795	contig_12050_pilon	+	547	2	Intergenic	novelGene_62762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGCTGGCCACCTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794076	799000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_794160_798536
730796	contig_7396_pilon	+	2582	5	Intergenic	novelGene_79654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	9.90896059130321	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	528	2408	273886	275766	FALSE	35	AGTAACTGTTAGTTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTGIALRVETWLSATWHVKVPLMWLEACINWIQEENNNVKLSQAQINKQVFEQWLLTDLRDLEHPLLPDGILEVPKGELNGFYALQINSLVDVSQPAYSQIQKLRGKNTTNDLVTAETQVPEKPWEAKASRMLMLQITDGIIQMQGMEYRSIPALHSDLPPGTKILIYGNISFRLGVLLLKPENVKILGGEVDALLEEYAQEKVLARLIGEPDPLVSVIPNNSNRSIPRNTDILDPALEPSDEELLASLDENGELAANNDTLERGHFSTGSSSNTKTARQPSFEPGFVISQRPNEEPPNQSVHFIDGELDDFSLEEVLLLEETVQKEQLEAKELQPLTWNRNTDKSIERIPHKSNTLNSFSSICKNGNNNWNEKNVSEQITNKDRSFGCPSAREQNSSVFSVDHNIPLPHDFTNKDKNSKIDNKEKQTVSSSDGCSLNNKILSRELVSYVPERSLQISNENDHYLQTCSLRSSENNSNPSITTDLYSPPFIYLSVLMASKPKEVTTVKVKAFIVTLTGNLSSSGGIWNITAKISDGTAYLDVDFADEILTSLIGFSVPEMKQLKRNPLQYQKFLEGLQKCQRDLIDLCCLMTISFNPSLSKAVVLSLQDVTMEHLENLKKRLNK	257577	275940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_257872_262643_262684_263174_263238_272967_273062_273849
730800	SIRV6	+	549	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730801	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
730803	contig_17860_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_169237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGATAAAGTAACTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23512	25915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17860_pilon_+_23500_25900
730806	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	374	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730807	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	390	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730810	contig_5671_pilon	+	1000	5	Intergenic	novelGene_79466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1977.51731977245	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	26	442	370430	531238	FALSE	30	CATATATATTTTATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370404	531796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392781_392919_521218_521303_531205
730815	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730818	contig_4364_pilon	-	1787	15	Intergenic	novelGene_126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	163.925692473941	576	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	147	1562	1096065	1092058	FALSE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRRCRCRSRCLTCSSRSDLFLPGTAGDFSLSASLSACTLLYEGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMRKMATAFNTTVAALEDELTQLILEGLINARIDSHSKILHARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMNTNM	1097609	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093425_1093639_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1096802_1096888_1097563
730821	contig_5968_pilon	-	1175	8	Intergenic	novelGene_112181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	443.091550866161	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	244	1002	638341	622680	FALSE	15	CTACTTGCTCACTGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCRHLFQLHHGHCRERQRQRRLRRLGREAIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732339	622506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700727_732248
730824	SIRV6	+	194	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	511	3	-341	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAGAAGGTAGTCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
730827	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	289	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
730831	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730832	contig_9580_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_167739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCTAGCCACTTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839747	840198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_839700_840200
730833	contig_9389_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_84044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCGCGCGCTGTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586284	585689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_585888_586120
730836	contig_10953_pilon	+	1534	1	Intergenic	novelGene_42613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGGCAAACCAGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467866	469400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_467900_469400
730837	contig_17603_pilon	+	1669	2	Intergenic	novelGene_152792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGGAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61881	68965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_62079_67493
730839	contig_15897_pilon	-	2271	4	Intergenic	novelGene_49551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	72.6697247062963	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	579	1430	699309	682019	TRUE	40	TTACACAAGTAACTGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLPWDCWPSLEIRAVLCAMGCIQSIGGKARVFREGITVIDVKASIDPIPTSIDESSSVVLRYRTPHFRASAQVVMPPIPKKETWIVGWIQACSHMEFYNQYGEQGMSSWELPDLQEGKIEAISDSDGVNYPWYGNTTETCTIVGPTKRDSKFIISMNDNFYPSVTWAVPVSESNVAKLTNIYRDQSFTTWLVATNTSTNDMIILQTLHWRMQLSIEVNPNRPLGQRARLREPIAQDQPKILSKNEPIPPSALVKPNANDAQVLMWRPKYGPPLVVIPPKHR	699887	665339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_665933_671103_671337_682003_682548_698986
730840	contig_16703_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_72793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTCTATTTAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42880	44807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42900_44800
730841	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
730842	contig_11328_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_88385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643539	641062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_641100_643500
730843	contig_14287_pilon	-	1189	4	Intergenic	novelGene_24052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	119.510111148248	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	220	870	22710	20909	FALSE	10	ATGCCCTGAGCTCTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSAGLSQSGSDFLIMMMMMVVVVMTTE	33905	20589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_20986_22136_22754_25823_25875_33780
730846	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730854	contig_6509_pilon	+	2107	2	Intergenic	novelGene_145644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128156	132519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_129808_132063
730855	contig_14441_pilon	+	1008	4	Intergenic	novelGene_100506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	461.51658210248	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	399	827	116728	117610	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	108112	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_116578_116963_117220_117344_117539
730856	contig_11227_pilon	-	2653	3	Intergenic	novelGene_163213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	2.5	44	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGTGTGTATATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480732	470284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_472657_480265_480371_480556
730863	contig_14855_pilon	+	2128	7	Intergenic	novelGene_146038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	43.831749020798	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	302	940	650839	654448	FALSE	40	AAATAAACTGTGCAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648609	655636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_649854_649926_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340
730864	contig_20614_pilon	-	1667	9	Intergenic	novelGene_107553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	172.996342085606	66	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	79	1512	164772	156167	FALSE	45	AAGAAGTGAAAGACTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRETRGRFQLPEPEGSGVPSPQPDATMLSRLLKEHQAKQNERKELQEKRRREAITAATCLTEALVDHLNVGVAQAYMNQRKLDHEVKTLQVQAAQFAKQTGQWIGMVENFNQALKEIGDVENWARSIELDMRTIATALDSCDWCGNLARLGAESQSKRGNCKHCSTRQLPPEELRPPPAGHLGSSMWLPLLLGALVWGVLWLLRDQQTLPRSDAFIFITGCDSGFGRLLALRLDQQGFRVLASCLTPAGAEDLQRMASSRLHTILLDVTDPQSVQWAAKWVKTQVGEAGLFGLVNNAGVAGIIGPTPWLTWDDFHRVLSVNTLGPIGVTLALLPLLQEAHGRVVNVTSVLGRLAANGGGYCVSKFGLEAFSDSLRRDMAPFGVRVSIVEPGFFRTPVTNLESLEGALQACWARLPSAMQAQYGEAFLTKYLKVQQCIMNLLCDPDLTKVSRCLEHALTARHPRTRYSPGWDAKLLWLPASYLPASLVDAVLTWVLPKPAQAVS	164850	156011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_156391_156677_156842_158378_158638_158839_159186_159734_159838_160658_160730_160918_161052_163291_163365_164711
730866	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730870	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4623	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730873	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1726_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730878	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730879	contig_11017_pilon	+	1241	10	Intergenic	novelGene_128080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	672.64912064625	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	276	791	268852	294618	FALSE	10	GACTTTATTCTCTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIRLACVRVSYNQDWAQVLEGAGLQIRQKETLGCLECRLTGSLVGFLCVVFRICGYRKRGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233708	295068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233889_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
730882	contig_12950_pilon	+	2757	1	Intergenic	novelGene_114790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	112	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	329	679	104314	104664	NA	55	ACTAACAAAATTGTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSQSCPAGYLPLRLFESLKVCASQDYELGYRFSVPFGGFFSCAVGNPLADSAISRDSGAPAVKKCPGGFSQHLALISDGCQVSYCVKSGIFTGGSLPPVRLPPYTRPPLMSQTATNTVMVTNMETSNSWIKDYETHQWKLGEPLELRKALKVTHEDEHGLSGGTAAGVIVGVITVLVAAITLAIYGTRKYKKRQYRAIEDEKQSLTQGTAATGDAPHQEPEQNPV	103985	106742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_104000_106700
730883	contig_10904_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_22492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAGAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293242	294622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_293200_294600
730887	contig_5718_pilon	+	2972	1	Intergenic	novelGene_110435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTAAGTTGTTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596675	1599647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1596700_1599600
730893	SIRV6	+	216	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9637	584	487	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
730894	contig_3601_pilon	-	1524	2	Intergenic	novelGene_132886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1032	1508	184819	180164	FALSE	25	TGAACAGATGTGTTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIRERQSSIPVLCRRCSGVLSVSCYLRVSPGSSWLTGPPGAGLALWDHASCRSHLPAPGFPASWPPVSSVTETCALCGHLPPSLPPSTLGRPSCLNSDLPVPTSSPSTLFLSDRVYLFAHCWASPQEHKPQEGRGFIWFSAVSAYQKHSPSMVGFQ	185850	180147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_180639_184817
730897	contig_10451_pilon	+	3647	1	Intergenic	novelGene_138302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1891	2223	109424	109756	NA	85	GAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDYAFIRSDVWNIPSIQPSIYPPTPCLPTYQPIYLLIHLSSSHPFTHKIYPSTHLPTYLSIRPSTHPPTHPSIRPPTHPSIHPSTQLFIHPHTDIYGRGVVGHRRWRE	107533	111180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_107500_111200
730899	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730903	contig_3588_pilon	-	1040	2	Intergenic	novelGene_72881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116622	114925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_115888_116544
730905	contig_9375_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_136038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110963	112441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_111000_112400
730908	contig_14516_pilon	-	2066	12	Intergenic	novelGene_153886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379587	32290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_32559_34641_34735_36342_36417_148433_148497_165667_165730_168801_168901_231881_231945_285343_285475_285938_285990_361653_361758_365815_365950_378663
730909	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	230	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
730911	contig_6742_pilon	+	2126	5	Intergenic	novelGene_144555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	12.0701077045733	112	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	21	695	25724	27436	TRUE	20	TCTCATTTGTGTCTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVPSWEWLRRTSRFLKLPVSYFSDGCLPASCPT	25703	48033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_26114_26786_26974_27338_27495_41061_41147_46745
730914	contig_11629_pilon	-	2011	4	Intergenic	novelGene_161205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.5134350376268	150	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTTATATTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506539	500109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_501028_504356_505312_505896_505955_506459
730917	contig_5451_pilon	-	2769	1	Intergenic	novelGene_167158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	544	849	87883	87578	NA	55	GCTAAAAAAAAAAGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGISETLKQHRSKIRNNSRCNSERYRVSCTPPSSQMLFCLNGRGNITNSSRTAEHHHSLQRASKYSPDTYYSSKQTHYCRIKFILKIGILLLFQQAFSHP	88426	85657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_85700_88400
730920	SIRV6	+	472	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	0	205	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730921	contig_9548_pilon	+	1111	2	Intergenic	novelGene_141093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGGCACCTAACAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323597	325375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_324613_325279
730922	contig_20429_pilon	-	1259	2	Intergenic	novelGene_169242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTTGAGTTCCTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151437	97245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_98490_151422
730926	contig_15063_pilon	-	995	3	Intergenic	novelGene_14404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAGCTCAGGCTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36799	35238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35836_36156_36264
730927	contig_3960_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_138012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371509	368990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_369000_371500
730928	SIRV6	+	249	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8469	-2	270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGCAATGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
730930	contig_1452_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_115125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTAGTGCTGCTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695139	694395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_694400_695100
730931	contig_1452_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_115124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGCTCTATGATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693941	693635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_693600_693900
730938	contig_18156_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_101453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTGTTAGATATCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59140	60448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_59100_60400
730940	SIRV2	-	453	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1	373	1	-373	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACGCTATGAACGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
730942	contig_15744_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_83604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	167	481	152344	153378	FALSE	10	GACAGTTGTGTCTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149575	153588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
730947	contig_5059_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_140709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTACAAAGATCTTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171584	173249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_171600_173200
730948	contig_5059_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_140711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACTCACTAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176892	177363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_176900_177400
730949	contig_15327_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_70746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACTCAGTGTAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040996	1040379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1040400_1041000
730951	contig_15063_pilon	+	949	3	Intergenic	novelGene_14417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	62	805	35349	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35287	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
730954	contig_4301_pilon	+	1806	4	Intergenic	novelGene_65097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	207.004562483267	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	229	618	459349	494757	FALSE	80	GAGAGAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQ	450269	495945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450448_459298_459470_492399_492508_494596
730958	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
730961	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
730962	contig_9609_pilon	-	2069	2	Intergenic	novelGene_23147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_1	0	235	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	435	1490	531595	527964	FALSE	5	CGTGGTTCCTGGGCTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRALPGARQHLGAILASASVVVKALCAAVLFLYLLSFAVDTGCLAVTPGYLFPPNFWIWTLATHGLMEQHVWDVAISLATVVVAGRLLEPLWGALELLIFFSVVNVSVGLLGAFAYLLTYMASFNLVYLFTVRIHGALGFLGGVLVALKQTMGDCVVLRVPQVRVSVVPMLLLALLLLLRLATLLQSPALASYGFGLLSSWVYLRFYQRHSRGRGDMADHFAFATFFPEILQPVVGLLANLVHGLLVKVKICQKTVKRYDVGAPSSITISLPGTDPQDAERRRQLALKALNERLKRVEDQSVWPSMDDDEEEATAKMDSPLPSDKAPTSPGKGAAPESSLITFEAATPNL	532029	527384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_528169_530744
730963	contig_8156_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_98919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGCCCACAGATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175262	176789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_175300_176800
730964	contig_2710_pilon	-	2112	2	Intergenic	novelGene_161803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	104	1267	1150701	1149538	FALSE	20	AGATTGGGCATCTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRPLGAAAELTLSPAPVLGSLSRFLLPLDATLDMEKIEEQFANLHIVKRSSENKEPTYLLGIDTSKTVQAEKGSLVAVLCSNGSIRIYDKERLNVLREFSGLPGLLNGVRFANSCDSVYSACTDGTVKCWDARLASEKPVQLFKGYPSNIFISFDINCNDHVICAGTEKVDDDALLVFWDARINSQDMSTVRDPLGTYSETHSDDITQVRFHPSNPNMVVSGSTDGLVNVYDIGVDDEEDALVTTCNSVSSVSCIGWSGKDYKQIYCMTHDEGFCWWDLNHLDTDEAITRLNIQDVREVVNVKEGILDYLIGGLYHEKMDKLFVVGGTNTGRIQLLSCTPSGLNHVMSLQGGHAATVRSFCWNTQDESLLTGGEDAQLLLWKPGAIEKTFTKKDSMKIASSVLQRMRVHSNDSYKRRKKQ	1193069	1148692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1150733_1192997
730974	contig_3787_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_102385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAACCGACTCGACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429229	428423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_428400_429200
730978	contig_4659_pilon	+	2655	3	Intergenic	novelGene_118205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	79.5	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	442	2028	417715	444626	FALSE	75	AAAATAGTAAAATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALEVDDISPALEVTEDFFSSFDSKIEKAVQQAEVYGIQEVPELVGHEVFSNIPDNGAIRNVASLGKGGMIWDHCNSRLLETKAQNIFPAKEQFMVQRGATPDNLSWMEQKETSTFNFFNICQRRRDRPRSVNDLLDETSTFKPGHARSRSDITQVDWRVVLKTTPLQQQQQLSLQGPHFTRLSFLSPSTSKVEDAQGNTEHKQTFPNILKKGYLEIRKDHDSYWQSCYAELSPYNLCFYSLDSSGNQNLYATYQLSHFQSISVLGNLEARMVDTVLYDNTQLQLKAESPWEALDWGQKLWEVVHAAGPGYVVRQDELANSPGLGHNVDYTQNHCLQKKSSGLLPSSPVLDSPKQYQNILKSGTLYRLTVQNNWKAFTFVLNGAYLLAFQPGKLDEDPLLSYNVDVCLAVQMDDLDDCDSCFQVIFPQDVLRLRAETRQRAQEWMEALKTAASAARSSEQNLQVTLRSKSKDQMGGHDGRKNKRQSVTTSFLSILTTLSLERGLTAQSFKCAGMKQVFSLKFIREQS	373665	445253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_373804_417411_418319_443643
730987	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	21	359	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14429	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
730988	contig_7171_pilon	+	1219	10	Intergenic	novelGene_101339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	97.0337856396191	795	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	362	1084	1302528	1315309	FALSE	20	AGAACCTGCTGACCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQPPGDDVARKSWYLRNIITRYQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1301645	1315444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302438_1302523_1302613_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874_1315026_1315204
730989	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
730991	contig_8464_pilon	-	2232	5	Intergenic	novelGene_125388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	33.101170674162	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	24	347	856586	853567	TRUE	10	CTGCTCTGAGTGTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCSREKAMAERSESSRRSLYKVVGSPPWKEAFRQGCLERMKNSRDRLLNKYRQGGGSMPRGAQNTLLVQEVMEEEWNALQSVDRYPEALAQLEEPVDLAVLEEIQQELIDQGDP	856609	848308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_848460_850667_850809_851973_853639_855219_855391_856505
730992	contig_8616_pilon	+	2582	9	Intergenic	novelGene_72543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.3259198889987	252	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	774	2325	213	2537	419190	424565	FALSE	20	TGCACTCCAGTTTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVGAREAILSQPQHGLGGRRLRVRPREQKEFQSPAFRSPRGAAPDSHQLARALAEVPDVEAQMVKLVGLRELSEAERQLRSLVVSLMQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410543	424610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410697_412252_412295_419172_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
730998	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731002	contig_6163_pilon	+	2444	4	Intergenic	novelGene_103857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	32.4276973520408	18	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1695	2291	506819	507858	FALSE	30	TTTAGAAGGCATCTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKVLPNCCGLSGQGKASFCWSFDAHVEERDCFLTNFVFNTSATLGYYCQPPTSWTCSSHFNESVVADMKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADEKSSDMSPVEETWQALPEESQAGEQFGSQEARSFVLDKTTKEEDDAYDFSTDYV	505124	508011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_507081_507166_507337_507598_507666_507760
731003	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731007	contig_13457_pilon	+	1309	8	Intergenic	novelGene_118357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	59.4906955510091	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	216	452	68182	68762	TRUE	5	GTGATTCCCCTCCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	67637	71058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761
731012	contig_9738_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_169265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTAGATATTTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202419	203015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_202400_203000
731013	contig_9738_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_169266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAATTACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203214	203611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_203200_203600
731015	contig_709_pilon	-	1436	9	Intergenic	novelGene_57656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	116.026936527687	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	457	1107	3769893	3762534	FALSE	25	TTAAATGTTGGATGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPKST	3773015	3762204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3762544_3764736_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806_3769959_3770361_3770426_3771705_3771776_3772346_3772542_3772953
731017	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731018	contig_11413_pilon	+	634	4	Intergenic	novelGene_103138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	36	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	8	508	87465	90735	FALSE	5	CTCAGTGTCCTCCCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87457	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
731024	SIRV6	+	573	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
731027	contig_7695_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_41674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGCAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006337	1008125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1006300_1008100
731031	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731032	contig_7870_pilon	-	856	6	Intergenic	novelGene_108944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_1	354.065304710868	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	232	726	496465	295191	FALSE	70	GTTTAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAISKYLTYRSSWWNDLALWNY	497923	295060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
731035	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
731036	contig_10436_pilon	-	961	5	Intergenic	novelGene_108481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2150.76769724208	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	63	416	103480	102032	TRUE	35	TATTCGATGGAATGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103542	101406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_101798_101877_102098_102535_102655_102788_102868_103390
731038	contig_8065_pilon	+	2527	12	Intergenic	novelGene_107321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_11	111.731821787707	76	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	411	2183	125393	182557	FALSE	65	TTGCTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMGIQMPNLDLKEKVEPEVLSTDIQASPEPGTRMNILPKRTRRLKSQSEPGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGAKDKEDEVSRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKMLPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVSLFVSPFSIFNFKVILAFDLIGSPHILCFVMGEVKGQI	124982	182901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139356_143032_143168_167447_167554_168762_168855_169620_169780_170920_171041_171704_171864_178285_178468_182274
731041	contig_3754_pilon	-	2532	16	Intergenic	novelGene_146814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.316046954738	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	457	1854	197806	40551	TRUE	10	TTGCCTTTGCTGATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYCKEWAPGAEGVFLTGDFNGWNPFSYPYKKRDFGKWELYIPPKQNKSTVVPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVTREGCNVNYDWIHWDPEHPYKFKHSRPKKPRSLRIYESHVGISSHEGKVASYKHFTCNVLPRIKDLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQITSFFAASSRYGTPEELKELVDTAHSMGITVLLDVVHSHASKNSEDGLNMFDGTDSCYFHSGPRGNHDLWGSRLFAYSSWEVLRFLLSNIRWWLEEYAFDGFRFDGVTSMLYHHHGVGQVFSGDYHAYFGLQVDEDALIYLMLANHLAHTLYPDSITIAEDVSGMPALCSPVSQGGGGFDYRLAMAVPDKWIQLLKEFKDEDWNMGNIVYTLTNRRHLEKYIAYAESHDQALVGDKTLAFWLMDAEMYTNMSVLAPFTPVIDRGIQLHKMIRLITHALGGEGYLNFMGNEFGHPEWLDFPRKGNNESYHYARRQFHLADDDLLRYKFLNNFDRDMNKLEERRGWLSAPQGLVSEKHESNKIIAFERADLLFIFNFHPSKSYTDYRVGTTLPGKFKIVLDSDAAEYGGHQRLDHNTEFFSETFEHNGRPYSLLVYIPNRVALILQNVDLPN	294961	39824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_40262_40309_40608_48489_48606_81228_81362_83405_83591_126848_127021_131262_131374_135593_135693_140691_140820_146139_146256_195328_195539_197735_197827_200348_200485_201192_201319_250723_250840_294903
731045	contig_7909_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_155936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACATACACAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965111	966287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_965100_966300
731047	SIRV4	-	214	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1309	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
731051	contig_2332_pilon	+	989	2	Intergenic	novelGene_58722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	629	955	860887	861213	FALSE	25	AGCAAAATGTTTCCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKLWKPTERAREFLISLLNSLTWAQGVNFEEPNAGSRVTILPLIGTHHRFRFDGFSSADGLFPCDRLLKRVWVVCFYIYSNLYILPLVGIASFFFFFKKIKDTKIK	857131	861247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_857546_860672
731054	contig_5896_pilon	+	1985	2	Intergenic	novelGene_159242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	351	1589	115537	118599	FALSE	20	TCAAGTCTGAGTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSFPLSGYPVPEPSLISLLEGGDLPWGLETQDDPPAERTKDICKDAETSIPSESTSTQRISGERDMISCGLQKNVLQGTDFPETCELEKHQKIPTLENIGGKVERVHYARKPFRCEECGKCFSYFSYYVRHQRVHTGEKPFECNECGKAFNGNSSLMRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNSFTSSSEFIIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLIRHQKIHTGEKPYECNECGKSFRRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFECVDCRKAFSAKEQLKRHFRIHIQESSYVCDECGKDFTSKRNLLQHQKIHTGEKPYEYSKYEKTFRTSSQLGRHEHVQPGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW	115186	118995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_115676_117499
731058	contig_4924_pilon	-	1448	12	Intergenic	novelGene_84695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	804.66343254147	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	24	884	252576	82377	TRUE	55	GAAAATAAAAGTAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDVLRDRSQNPPQSCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252599	68838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132989_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252404_252438_252533
731065	contig_8138_pilon	+	1217	5	Intergenic	novelGene_52428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	215	670	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280080	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306796_307634
731066	contig_9363_pilon	-	1062	8	Intergenic	novelGene_6820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCCTCTGGTAGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625962	1622244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1622284_1622465_1622557_1622653_1622742_1622984_1623107_1623396_1623539_1623621_1623677_1625334_1625433_1625535
731067	contig_10037_pilon	+	1523	9	Intergenic	novelGene_148945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	246.462693677968	632	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	128	862	115453	445150	FALSE	25	CTAAGACTGACGTTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTASTRRVTFEADENENITVVKGIRLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERETLGGAGGSRAQRPTKGLESAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFKRYDFHPVCADLQAQILQCYRQHTHQTLSCSALAAQYMHCVNQAKQGTLEKGG	115325	445811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_351012_351070_378523_378595_425456_425593_445126
731069	contig_9195_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_155692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTTCAAGCAGAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740911	742214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_740900_742200
731071	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	367	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731072	SIRV2	-	641	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	16	2960	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
731074	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	0	204	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731076	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731081	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731084	contig_2867_pilon	+	2028	9	Intergenic	novelGene_135225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	18.2786590044237	39	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	54	1400	1192534	1219398	FALSE	15	GGTGACTATGGACTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARKRTTAGRVQSRLSAMDEADRQLLRRCRLQLVCELQVAELWDALLSRGLFTPDMIEEIQGAGSGSRRDQARQLITDLETRGRQALPLFISCLQDTGQDMLASFLNTSRQTAEQNLEAIRPRDLVPGPVGFNPDEMRVVKQDPSRSTMGRLPTVVLRPDKLRPTELRPEVLRPQVPRPVTTGSGELRDACAPRWGGKANLAYVLEADPCGYCLIINNVNFCLNSGLSSRTGSDIDCEKLQRRFRSLHFMVEVKCDLTAKDMLLALGELAQRDHGALDCCVVVILSHGHQASHRQFPGAVYGTDGYSVSIERIVNIFNGTGCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASASSEDWASGSNPESDAAPFQEGPGSSDQPDAVASLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDTRSGSWYIEILDGVLEQWADSEDLQTLLLRVADAVSEKGIYKQMPGYFNFLRKKLFFKT	1192480	1220026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1192666_1193321_1193710_1202201_1202234_1204340_1204518_1204997_1205088_1208274_1208423_1216965_1217146_1217752_1217863_1219308
731085	contig_10962_pilon	+	2050	4	Intergenic	novelGene_103920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	545	junction_1	127.146459731375	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1394	1735	410862	412410	FALSE	15	AATCCTGGGCTGTGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS	407673	412725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_409013_410807_410903_411426_411531_412213
731086	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731088	contig_6710_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_96857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653688	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731093	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731096	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731100	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731102	contig_7815_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_134414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCCTGCTGACTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899545	901683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_899500_901700
731104	contig_2867_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_135172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTTCTGTCTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739329	737890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_737900_739300
731112	contig_7004_pilon	-	1937	7	Intergenic	novelGene_126474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	93.5463343304625	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	662	1588	399642	397565	FALSE	10	TAGTTCTTCGTTTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTALFPQGILLGLGIVGDDHGPSLTPLAHSGFSYVDLVEGLHDGHFYALKRILCHEQQDREEAQREADMHRLFHHPNILRLVAYCMRERGSKHEAWLLLPFFKRGTLWNEIERLKDKGNFLTEDQILLLLLGICRGLEAIHAKGYAHRDLKPTNILLGDEGQPVLMDLGSMNQARIHVEGSRQALALQDWAAQRCTISYRAPELFSVQSHCVIDEQTDVWSLGCVLYAMMFGEGPYDMVFQKGDSVALAVQNQLSIPQSSRHSSALRQLLASMMTVDPQQRPHVPVLLSQVEALQPIPPGQDTTQI	400674	397215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_397704_397832_397955_398375_398472_398595_398717_398884_399019_399327_400283_400653
731115	contig_15063_pilon	+	1674	6	Intergenic	novelGene_14051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3751.57737491845	1	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	194	1423	34808	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFK	34614	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39512
731116	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_96920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731118	SIRV6	+	770	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10250	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
731120	contig_6710_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_94794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCTGGAAGTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
731122	contig_5999_pilon	-	2225	16	Intergenic	novelGene_45619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_12	201.615740126278	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	77	1924	200058	116909	FALSE	60	TTCCTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLRIGLSNFDCGSCQPCQGETVNPYCAVLVKEYVESENGQMYVQKKPTMYPPWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNARYFLEMSDTRDMSEFETEGFFALHHRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCQQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAVNSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEHICREGPVEIGLPRSMKEETKLPYLPTPGKREPQGISWESPMDGMDKTCHLPEPEMNIERPSLRIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQICHKFDLCRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDARTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKVRS	270567	116607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_117110_125646_125786_134991_135055_137193_137286_163379_163554_167255_167417_168956_169075_169873_169984_175793_175924_180637_180724_180817_180850_182002_182166_191342_191404_194816_195017_199940_200068_270500
731123	contig_8920_pilon	+	2061	4	Intergenic	novelGene_146057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAAACAGACTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62786	94820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_64428_74320_74440_93782_93948_94684
731124	contig_14341_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_111813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	1240	1842	489054	489656	NA	60	ATCCACTGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTTVGQQLPDVWEQKMVNFCDFITKEISELGISEMDIINMDKVLMSFDIPATSTVAATGTKTVAITTTGHERACFTIVLGCIVSGVKLKLMVIFKRVIMLHKKLPTSVVVHCNKKGWMDCDITKTWVDRCYRGRQGGFCLKKSLLIFKAMAAHKEKTFKIILTHWCPYSSHTWWPYLQGVATRYSSQTPVQDFHEKRVG	487814	490308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_487800_490300
731150	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731153	contig_9646_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_117436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACTTTATTTCTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182694	182416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_182400_182700
731154	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731163	contig_2890_pilon	-	3470	1	Intergenic	novelGene_60293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAACAAAAAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341510	338040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_338000_341500
731166	contig_854_pilon	-	1362	10	Intergenic	novelGene_36423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	142.9204216114	420	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	679	1191	1070809	1064774	FALSE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1082320	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070868_1071967_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1082188
731167	SIRV6	+	552	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2825_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731170	contig_15905_pilon	-	2204	5	Intergenic	novelGene_154706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	847	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGCAGAGCACGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135967	117159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_-_117295_128764_130455_133188_133308_134884_134942_135764
731174	contig_5317_pilon	+	2003	11	Intergenic	novelGene_76623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	127.348380437287	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	86	1438	896836	924411	FALSE	20	GAACCCCATTGGGATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASRRSASRVNTARVPRRSRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMEEDSYDSFGEPSYPEVFEPPPAWLPGGGAGGRGGKGREARPRGLHLLQRAGGQGGGHGQWGLEHHAGMLRGHPYWFVFDPPAAGRVQESAARPPHLHHVRPHLLLLHRQPGSPFHGHLGLPSALYLT	885453	924976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885517_896813_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_918631_918735_921985_922105_924250
731175	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_96608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731181	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
731186	contig_6375_pilon	-	1290	3	Intergenic	novelGene_72940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	489	830	22634	22293	FALSE	10	TTGCTCTGCTGGCTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGIPMVSRHVSIEVTNSSSAPSGSLGNAGLELRPKPSRSKVCSVRRALSESMLRIQRPTPPPNPCTITSGVRSFISGLTVTVQILFWFGRDTYRARNLFWRPGEGRIPGQIS	30352	21832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_22699_22860_22944_30011
731188	SIRV4	-	345	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2766	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
731206	contig_10990_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_7505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750489	752159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_750500_752200
731207	contig_9345_pilon	-	2450	6	Intergenic	novelGene_24575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	164.648716970403	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	16	714	922013	913550	FALSE	65	ACAGATAAATAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAADEMAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSK	922028	911813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
731208	contig_6710_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_89062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653300_653900
731210	contig_10427_pilon	-	1648	6	Intergenic	novelGene_142182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_3	31.7553145158413	131	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	303	1508	61284	51109	FALSE	25	TGAAGTTCATGTGTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDILRELLCVAEKAANIARACRQQEALFQLLIEEKKEGEKNKKFAVDFKTLADVLVQEVIKQNLENKFPGLGEKISGEESNEFTNDLGEKIILRLCSTEAETVKLLSKVLNGNKLASEALAKVVHQDVSFTDPALDSIRINIPQNILGIWVDPIDSTYQYIKGSADIKPNQGIFPCGLQCVTILIGVYDIQTGMPLMGVINQPFVSQDPNTHRWKGQCYWGLSYMGTNIHSLQLHIPKRNGSETLSQLTENTSSEAESHGFSAVISTSEKETVKAALLHVCGDSIFRAAGAGYKSLCVVQGLVDIYIFSDDTTFKWDSCAAHAILRSMGGGMVDLKECLERNPEKELNLPQLVYHVPNEGASGVDQWANKGGLIAYRSRKQLETFLSLLIQHLVPADTNT	82509	50968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_51674_53327_53503_55182_55384_58531_58593_61080_61348_82270
731216	contig_6228_pilon	-	1649	12	Intergenic	novelGene_164499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	17.807046613375	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	125	1474	244530	212479	FALSE	20	TATTTGGGTCTGTAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWLRGARVRCCVSVSSSVVWSRNLAPLAVPLLFRRRAYDVVMPARLLRALVRSHCILSKAYQCRRLVYLTLKPLKKCENTAGSTLAISQNLDLVFPDTAVHGLNKSQILEMNQKISNTSIFSPINAVRCQDEKAHLPATKSLGIHRKVTHKPNLLGSKWFIKILKKHYSSVSTETLVPKQDFPQIKRPLKASRTKQPSRTNLPVLSVNEDLMHCTAFATADEYHLGNLSQDLTAHGYVEVTSLPRDAANILVMGVENSAKEGDPGTVFFFREGAAVFWNVKDKTMKHVMQVLEKHEIQPYEVALVHWENEELNYIKTEGQSKLHRGEIKLNSELDLDDSILEKFAFSNALCLSVKLAIWEASLDKFIESIQSIPEALKAGKKVKLSHEEVMQKMGELFALRHRINLSSDFLITPDFYWDRENLEELYDKTCQFLSITRRVKVMNEKLQHCMELTDLMRNHLNEKRALRLEWMIVILITIEVMFELGRVLF	252268	212303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_212512_212946_213064_220286_220408_223376_223454_224914_224980_226260_226368_229106_229208_231141_231182_233938_234015_236213_236323_244026_244545_252158
731219	SIRV1	-	206	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3896	2	3622	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6744	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731227	contig_12923_pilon	-	2401	17	Intergenic	novelGene_30191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	59.5737135299622	2	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	1086	2000	532029	511090	FALSE	20	CTAAGCTTCCTATCTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNSHTTCQCFHLSSFAVLVGLTPKADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTREFCSSSYTVSLIARCEWSTRNGLVGCGKGLKQKALSCLTLLPTPKWRNSRSRQSLHIQETPETLSPPNDSHQLILSLFLG	585703	510688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515342_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_531948_532117_533635_533746_535163_535254_535900_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
731230	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_95976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACAGTGGTTCCTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	657831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
731236	contig_12886_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_135494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGAGAAAAATTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462962	464306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_463000_464300
731237	contig_9482_pilon	+	1475	3	Intergenic	novelGene_44245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	238.5	89	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGGTACAGACTCGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287944	290376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_287999_288040_288944_289858
731238	contig_14322_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_115818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	25	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671901	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
731243	contig_2215_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_163846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139584	142038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_139600_142000
731251	SIRV2	-	659	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	0	2958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
731254	contig_11258_pilon	+	2463	15	Intergenic	novelGene_67754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	35.0579694861211	6	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	8	1492	58476	95823	TRUE	35	ACCACTTGTACTAAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAARVEYIVPWWVVWLHSVPHLGLRLQPVNSTFNPRDESYQESLLFLGLVAAVGLALNLIFLAVYLVCLCCCRRDDGVQTKQRNSCCVTWTAMLAGLVCCAAVGVGFYGNSETNDGVYQLIYSLDNANHTFSGIDSLVSGTTQKMQLDLEQHLARLSEIFAARGDYIQTLKLMQQMAGNIMGQLSGLPAWRDVTAELTKVADQTGYVEYYRWLSYLLLFVLDVVICLTACLGLAKHSKCLLASMLCCGVLTLLLSWASLAVDTAAAVGTSDFCVAPDAFILNVTQGRISTEVTRYYLYCSQSVSSPFQQVLTVFQRSLTTMQIQAAGLLQFAVPLFPTAEKDLLGIQLLLNSSEASLHQLTALLDCRGLHKDYLDALTGVCYDGIEGLLYLGLFSLLAALAFSTMICVGPRAWKHFATRDRDYDDIDDDDPFNPQARRIAAHNPPRGAASQLLQLQQRPGQPDQPAAPGPDHLQRPSLRVHEPSGTLRWEPPL	58468	102203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_58605_69853_70027_74243_74356_80362_80584_85695_85792_86388_86462_91419_91490_91737_91794_92498_92592_92790_92884_94256_94400_95062_95250_95784_95864_100609_100765_101427
731257	contig_13740_pilon	-	2523	1	Intergenic	novelGene_34604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGGAAAAAAGAATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153862	151339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_151300_153900
731258	contig_15991_pilon	-	1028	7	Intergenic	novelGene_70910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	594	962	101267	100445	FALSE	20	AAAGGTTGTGTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106360	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102267_103583_103703_104975_105142_106315
731259	contig_3818_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_99201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77673	78323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_77700_78300
731260	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	535	-2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
731263	contig_253_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_129670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTACTACCCCTGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392274	391977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_392000_392300
731268	contig_11338_pilon	+	1245	9	Intergenic	novelGene_6156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	580.54326658312	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	571	1245	7368	13616	FALSE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLSKAE	744	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2775_4519_4667_6085_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8013_13275
731269	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731270	contig_5815_pilon	+	1300	7	Intergenic	novelGene_141211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	387.035922823135	255	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	68	835	564325	571884	FALSE	30	ACAATCTTAGTATTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRPGVQRPAWLERLGTRCRTPMQTPSGMTSYAKRASCPQRRVRENWKRKQKRRSGEPFRRQLLQEGVLPGTLTRFLRLLGRVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	561925	572349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566190_566249_566543_566635_566892_567037_567804_568014_571741
731271	contig_3181_pilon	-	2086	2	Intergenic	novelGene_136921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	242	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	201	542	266363	264609	FALSE	10	TATATTTGTTTTCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPQEVRASSPPPPPPSSPSSSDASSASSPGVPVSLGWPVPRRSSGRPVDRLEEVELQIGDAAFSLTQLLEATSAVSAQVEELASKCTENARFLKTWRDLLKEGYDSLKPDN	266563	263064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_264765_266177
731273	contig_16951_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_98616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCCTCCCAGCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27586	27826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_27600_27800
731274	contig_16951_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_98617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28075	29423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_28100_29400
731276	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731277	SIRV6	+	567	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
731278	contig_5210_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_65449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTCAGTGGCAACGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611569	612155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_611600_612200
731279	contig_5210_pilon	+	1339	4	Intergenic	novelGene_65450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	37.0435179514881	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	1041	1337	613292	616553	FALSE	65	GGAGAAAGAAAGAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRAD	612155	616555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_613150_613245_613338_614670_614849_616480
731281	contig_8538_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_4741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
731295	contig_1443_pilon	+	1741	12	Intergenic	novelGene_28249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	58.3029988029903	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	809	1627	538444	541708	FALSE	45	ATAATAAATTTTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	536248	541822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
731297	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731298	contig_10569_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_44068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGCAATACATGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246658	245713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_245700_246700
731306	contig_6710_pilon	+	573	2	Intergenic	novelGene_93977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAAGAGCACAGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
731307	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731308	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731312	contig_13753_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_136510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTAGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145154	143511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_143500_145200
731313	contig_19007_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_168447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCACCTTGATAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47658	47359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_47400_47700
731320	contig_1406_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_25490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGAGTAGAACTGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345945	1344737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1344700_1345900
731323	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	0	411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	656	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731324	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1831	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731325	contig_5136_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_126646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAGAACTGCCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319462	320197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_319500_320200
731328	contig_7004_pilon	-	1848	6	Intergenic	novelGene_126475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	107.47390380925	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	669	1499	399642	397565	FALSE	10	TAGTTCTTCGTTTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTALFPQGILLGLGIVGDDHGPSLTPLAHSGFSYVDLVEGLHDGHFYALKRILCHEQQDREEAQREADMHRLFHHPNILRLVAYCMRERGSKHEAWLLLPFFKRGTLWNEIERLKDKGNFLTEDQILLLLLGICRGLEAIHAKGYAHRDLKPTNILLGDEGQPVLMDLGSMNQARIHVEGSRQALALQSLGCVLYAMMFGEGPYDMVFQKGDSVALAVQNQLSIPQSSRHSSALRQLLASMMTVDPQQRPHVPVLLSQVEALQPIPPGQDTTQI	400681	397215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_397704_397832_397955_398595_398717_398884_399019_399327_400283_400653
731329	contig_2867_pilon	-	1416	5	Intergenic	novelGene_135260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.747234239876	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	75	488	1305476	1285960	FALSE	40	ATAAAATTCTATATTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPSRRVFNPYTEFKEFSRKQIKDMEKMFKQYDAGRDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSCLLFLPACVLWRKRDFYLGQETQAPGTLC	1305550	1285031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286050_1286759_1286781_1288013_1288149_1289316_1289465_1305456
731330	contig_6711_pilon	+	2797	11	Intergenic	novelGene_169273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	17.3496397657127	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	71	1555	21142	88112	FALSE	25	TTTTTGAATCTGACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPVRGLPLNDGDEGTDSTPLLQGSPRAEAAVVCCSARYNLALLAFFGFFVVYALRVNLSVALVDMVNSNTTLAENSTSSECPEHSVPIKVHNQTGKRYQWDAETQGWILGSFFYGYIITQIPGGYIASKVGGKLLLGFGILGTAVFTVFTPLAADLGVGFLIAVRTLEGLGEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVIALPLSGIICFYMDWVYVFYLFGIVGIFWFILWIWLVSDTPETHRAISPAEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWIPMLKSLPLWAIVVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSALPYFGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFSTICVRRVFSLVGMIGPAVFLVAAGYIGCDYSLAVVFLTISTTLGGFGSSGFSINHLDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMIGPVIAKSLTPNNTIREWQTVFCIAAAINVFGAVFFTLFGKGEVQNWAVSDYHGHRN	21071	89354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6711_pilon_+_21236_30456_30651_32606_32841_42728_42817_45142_45230_47862_47982_52991_53151_73677_73811_75943_76092_84798_84890_87974
731331	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731332	contig_9014_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_106819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCACCACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246252	248306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_246300_248300
731334	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1440	632	985	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2440	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
731337	contig_11656_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_54040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATAAAAAAGTTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537503	527469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_527579_527841_527891_527999_528099_528536_528687_531208_531335_535319_535410_536452
731341	contig_8452_pilon	-	971	5	Intergenic	novelGene_48099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1167.80079101703	13774	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991180	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981859_991051
731347	contig_2636_pilon	-	689	3	Intergenic	novelGene_52064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	47.5	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	114	413	62513	59826	FALSE	30	GAAGTCATGGATCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	62626	59549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471
731349	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_94284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653822	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731356	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
731361	contig_7272_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_25403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775517	776945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_775500_776900
731362	contig_7870_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_108922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAATAAAATAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250280	248608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_248600_250300
731363	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
731365	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_93449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731366	contig_5728_pilon	+	1142	4	Intergenic	novelGene_126708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	24.0970260959038	1117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	327	854	392492	408722	FALSE	20	CTATGGAACCCTTGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLLFLSTWEIPRWNCFIPWAKTVRLQVFCRKTRLEECITSALRDYLKNRFDALNINDQRPDKLWDDIKGIIHEESKRSLKRQERKKRPRWMSEEILKLVLERRAAKANGKNDEVKELNRRFQRVDNINTAMMDLKKKKIRTTTEEAKIGAHGKPVIFLHPKDCDGVLVELEQA	371814	409010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_371937_392287_392626_402461_402703_408569
731367	contig_4519_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_123718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGCTGCCCCTCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678528	679422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_678500_679400
731369	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731370	contig_57_pilon	+	1585	3	Intergenic	novelGene_44878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	85.5	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	162	410	66895	75877	FALSE	35	AATTTTAATAACATGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAALRRAAWQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKVLQDCNQDVGLDCGLI	66733	77052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_75826
731374	contig_6496_pilon	-	2212	12	Intergenic	novelGene_103487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	874	1185	463350	461502	TRUE	20	CGCCGCAGAGATCTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVHLELVGAVQVSKLLGQVARHLLADDLRGHVWHESDGELAHHFPRNHGFRSRPGEGTFDAMEGEGRVPPSVHQDVLLQLCRRVLAPTSLVYSSVSKSMSL	465749	450295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_450460_452591_452684_453532_453679_455570_455735_457423_457512_459852_460054_461052_461139_461415_461571_462830_462998_463274_463418_463634_463783_465091
731376	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731379	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731380	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_94385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731382	contig_6110_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_163285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752234	753738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_752200_753700
731395	contig_9272_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_125961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCAACAAGCACGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493977	494471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_494000_494500
731398	SIRV6	+	549	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10727_10819_11031_11109_11205
731400	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731406	contig_9197_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_154364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62230	63780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_62200_63800
731407	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5699	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
731411	contig_13108_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_135872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGAGGAGAAAAATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194414	194081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_194100_194400
731413	contig_5797_pilon	-	1450	2	Intergenic	novelGene_56940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAATCAAATGTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313760	308788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_310052_313573
731420	contig_18419_pilon	+	1429	5	Intergenic	novelGene_141476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_3	166.651395133674	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	323	1096	80714	82012	FALSE	20	ACTGATTTTTGTTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSEEEKKPPAKAVICKATPKPAPGKKAAESSSDSSDSDSSEDEAPAKPASTTKSPSSKPVAITKQPAAKPAAAPKQPVGGGQKPLPRKADSSSSEEESSSSEEEEKMTKKTVATPKSKVMAKAPSSLPAKQTPQGGGDSSSDSDSSSSEEEEEEKTSKPPVKRKLQKAAGTVTPSKPASKKKVKAESSSSSSSGDSSEEEEAKPKAKATPKPQTPKVNGTSALTAQNGKAGRDNSEEEDGVAVSKPGKKRKQNEAAKEAETPQVKKPKLQTPNTFPKRKKGEKRASSPFRRVKEEEIEVDARMADNSFDAKRGAAGDWGERANQVLKFTKGKSFRHEKTKKKRGSYRGGAISIQVNSVKFDSE	80282	82345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_80393_80501_81135_81324_81426_81576_81670_81853
731427	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	3	1205	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731433	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	45	TACTAATATTTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731437	contig_18342_pilon	+	953	6	Intergenic	novelGene_154556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	129.380987784141	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	175	756	36952	63358	FALSE	35	GTCAACAGCAGTTGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQELQQTTPGAGPGVPQMGKPATLHSYMWKGMPEKFLKGEPKVLGVVQILIGLMNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMIVFIMPSNAYVAETAPTATLSGDSLPPTEQ	26151	63555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_36935_37096_38317_38447_54740_54798_56452_56612_63265
731447	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_93517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731448	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731453	contig_5918_pilon	-	1374	9	Intergenic	novelGene_99630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	140.622222194787	700	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	14	1051	2288881	2233976	FALSE	15	TTGATTGAGTGCTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTMPRIDADLKLDFKDVLLRPKRSSLKSRSEVDLERTFTFRNSRQTYSGIPIIVANMDTVGTFEMAVVMSQHCLFTAIHKHYTLDDWKLFATKHPECLQHVAVSSGSGQNDLEKMSSILEAVPQVKFICLDVANGYSEHFVEFVKLVRARFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIKVGIGPGSVCTTRTKTGVGYPQLSAVIECADSAHGLKGHIISDGGCTCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMFSGHTECAGEVIERNGQKLKLFYGMSSDTAMKKHVGGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAARLKELSRRATFIRVTQQHNTLFS	2288894	2233652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2234157_2238719_2238880_2242340_2242384_2245739_2245847_2251202_2251285_2270159_2270334_2274350_2274435_2278627_2278748_2288794
731455	contig_4151_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_65218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	451	1353	1073	2425	443745	445097	NA	20	GCCCAGGATTATTGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVYIWEEWPLLIEDGLQSNSSITVPGRPVEVSCAHTNRLAVAYKQPAYNSRSSQDFMMHVSIFECESTGGSCWILEQTIHLDELSTVLDSGISIDSNLVAYNKQEVYLSSKEIITSNTKHLVHLDWMSREDGSHILTVGIGSKLFMYGPLAGKVQEQTGKESLAFPLWESTKVVPLSKFVLLRSVDLVSSVEGSPPFPVSLSWVRDGILVVGMDCEMHVYSQWQPSSKQEAVITDSYNGSTPSIISLIKQSNSSSSGLHPPKKTLTRSMTSLAQKICGKKTAFDPSVDMEDSGLFEAAHALSPTLPQYHPLQLLELMDLGKVRRAKAILSHLVKCIAGEVVALNEAESNHERRLRSLTISASGSTTRDPQAFNKSENTDYTEIDSVPPLPLYALLAADDDSCYPALEKSSNQSTLNKSNQLSNESYNELFQISALISDSHVLEADEENA	442672	445099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_442700_445100
731457	contig_7362_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_147543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTAGAGTATTACATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314257	312820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_312800_314300
731462	SIRV6	+	534	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	40	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731470	SIRV1	-	252	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3852	0	3578	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731473	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731474	contig_11413_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_103143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1138	1467	90438	90767	NA	10	CCTACTCAGTGTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRITQQTKHSRGPLHTASSLWALHTCPFQVWVLEDHPTLLACRPYPGSCQPSLLISPHSYLGGESSQRPKKILQEGEEGYQKADSKERCWNSGVQEILRWLSAWHHLY	89300	90857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_89300_90900
731478	contig_6316_pilon	+	1583	11	Intergenic	novelGene_134700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	147.58373894166	51	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	156	1232	140538	157164	FALSE	30	CTTTGTTCTTAAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFCGVFVAVVGGGRRRFDDSSRPKGLLLLQRCGIPNALTALIGIAEKAGGMKATVEVTNGRGGLTVAHKRTGIVKNHILSLKNLIDEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136284	157515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
731483	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731489	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731490	contig_10861_pilon	+	1092	3	Intergenic	novelGene_39373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	329	junction_2	17	2241	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	212	571	1685906	1686383	TRUE	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRLRELVPGVPRGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIQTAELTPELVISNDKRSFCH	1685694	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686206_1686323_1686409_1686956
731491	SIRV6	+	702	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	544	164	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
731492	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
731499	contig_16685_pilon	-	551	6	Intergenic	novelGene_115049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	323.64153009155	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	155	505	476360	461674	FALSE	15	CCCTTGCTGCCTACCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLSTSAQCAASDSACRISAEHITQVRPKLPLLKILHAAGAQGEMFTVKEVMQYLGQYIMMKQLYDQQEQHMVYCGGDLLGELLGRQSFSVKEPSPLYDMLRKNLVTLATPATAK	494512	461627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_461682_466390_466447_467509_467644_473177_473253_476282_476396_494393
731503	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
731507	contig_5093_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_135084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGATATAAAACAATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561783	559978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_560000_561800
731510	SIRV7	+	381	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56078_70863_70987_78840_78963_114680
731511	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
731512	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731513	contig_10861_pilon	-	1355	3	Intergenic	novelGene_39336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	8	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	923	1339	1489769	1489353	FALSE	5	TCCTCAGTTTGGGCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQAPRTDPHQFCPDNLVSCLFSSRLSIMNVSTALPLAAVGHLSLGRSAGEGVEPSEGPSLRCSLPLGGWAHLPFLLLPCRPGACRAGLRLKVSTSCPTHTSSPLLGQGGGGGGVVSRLLSPCGFWVFFLLCPGFQ	1490883	1489336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572
731516	contig_10494_pilon	-	591	3	Intergenic	novelGene_102179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	2.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	68	589	971830	970813	FALSE	20	CGGCCTGAGGCACATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGYECVAAHSELLCYFIIILNHMVTASAASLVVPVLVFLWAMLSIPRPSKRFWMTAIVFTEVTVVTKYLFQFGFFPWNSYSVLRRHENKPYFPPRILGLEKTDGYLKYDLVQLMVLFFHRSQLLCYGLWDHEEDPLSKEPDRGSGKEKGAGEEPAALLGSQTELGVARTPLEDNVQAEARAGPEDEPSEPEVELKP	971897	970810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_971029_971440_971630_971713
731522	contig_5643_pilon	+	1122	5	Intergenic	novelGene_39141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	45.9483405576306	975	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	145	627	651693	655922	TRUE	5	CCTAGTTGTTCTTTGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSGGFQPRERRGGEQEQGWDVVAPKRPRLGAGSKIGGRRLIVVLEGASLETVKVGKTYELLNCDKHKSMLLKNGRDPGEVRPDIAHQSLLMLMDSPLNRAGLLQVYIHTQKNVLIEVNPQTRIPRTFDRFCGLMVQLLHKLSVRAADGPQKLLKVRY	651548	656804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_651861_655130_655233_655340_655483_655851_656145_656531
731524	contig_10734_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_51265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAGTAGAAAATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305219	1306471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1305200_1306500
731525	contig_17976_pilon	+	1277	3	Intergenic	novelGene_32485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	223	1239	41843	47385	FALSE	25	CTGCCAAATTGGTTGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41620	47423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
731526	contig_8801_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_66260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCCCCCGCAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370637	372569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_370600_372600
731527	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_97700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731533	contig_12503_pilon	+	3162	1	Intergenic	novelGene_143836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170509	173671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_170500_173700
731535	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731538	contig_3601_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_132834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTACTCTGTAGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81613	82795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_81600_82800
731542	contig_6364_pilon	+	1850	4	Intergenic	novelGene_51853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_1	64.4480841884036	345	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	616	1089	1784725	1786958	FALSE	0	TTCTTGGCCCTTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPGAQPAGKADKVMKSFKPTSEEALKWGESLEKLLLHKYGLAVFQAFLRTEFSEENLEFWLACEDFKKVKSQSKMAAKAKKIFSEYIAIQACKEVNLDSDTREQTKNNLQSVTRGCFDLAQKRIFGLMEKDSYPRFLRSDLYLDLINQKKMSPSL	1784109	1787719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772
731550	SIRV4	-	333	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTTAACTTCAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731551	contig_14322_pilon	+	2184	11	Intergenic	novelGene_115626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	122.172869328669	19	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	84	530	240212	246279	TRUE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNKKRLAYAIVQFLHDQLRHGGLSSDAQESLEVAIQCLETAFGVTVEDRDLALPQTLPEIFEAAATGKEMPQDRRSPERTPPSEEDLAEAERLKTEGNEQMKVENFEAAVHFYGKAIELNPANAVYFCNRAAAYSKLGNYAGGRAGL	232531	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_232579_240175_240312_240814_240922_241270_241356_244262_244363_246224_246331_246654_246794_247065_247129_247944_248011_249115_249238_251058
731552	contig_8640_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_117729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGCAAGACAGACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12557	15162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_12600_15200
731553	contig_11512_pilon	+	809	4	Intergenic	novelGene_43253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAACTTTTTAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5971	168461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_6050_6415_6881_119760_119950_168384
731555	contig_3601_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_132839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	663	998	106825	107160	NA	35	AACCCACCCACATGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKGREITLSTLHTGCAGCSDCLWPRYSFCSALCPELSCGLHHLGSCASGFKVCPVSGRHQREVGRATIPGRDGSPNKQGMLRLTCAYLLICSAQFHLFSPMRNCALQISK	106162	107870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_106200_107900
731558	contig_6710_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_97382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731560	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	26	3	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731562	SIRV1	-	232	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	8	3590	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731566	contig_15361_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_167871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484493	482125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_482100_484500
731569	contig_14514_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_137459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	622	954	26528	26860	NA	35	TAATTGTACTTCAAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALESVLATLVTWGHRRRPKPRPLGHLSEDKGRVSVARPSQYSHRSPQMTTVSPSPPSLSGLLPLDVPQPQLPRARAEEAEGGRSMASAVRRDIPGHSPLCDSLAPGLID	25906	27130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_25900_27100
731573	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731574	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
731581	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731586	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731588	contig_16846_pilon	-	1093	4	Intergenic	novelGene_82969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4275.16759905387	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	224	526	552791	551492	TRUE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555280	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551362_551422_551665_552661_552804_555069
731589	contig_9706_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_20798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAAGAAGAGGAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1993	1781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1800_2000
731598	contig_6027_pilon	-	2216	3	Intergenic	novelGene_74445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	48.5	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1142	1615	263882	263119	FALSE	15	CAGCCCAGCATTCTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	265813	262517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_263491_263780_264274_265063
731600	SIRV1	-	218	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3886	0	3612	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731602	contig_8453_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_125103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26155	28139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_26200_28100
731603	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
731605	SIRV5	+	236	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	151	167	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
731612	contig_2854_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_120889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAAGGCCCCATAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131438	1129790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1129800_1131400
731616	contig_498_pilon	+	1656	7	Intergenic	novelGene_148557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	61.9892463792444	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	16	1518	755864	773220	FALSE	25	TCAGGACTCGGAATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGGVFKIASWADLVNAHVVPGPGVVKGLREVGLPLHRGCLLIAEMSSAGSLATGSYTKAAVRMAKEHSEFVVGFISGSRVSMEPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKQGSDVIIVGRGILTAPNRLEAAELYRKAAWEAYLSRLGIFPSSGLLSVISKRNSCLDPM	755848	773358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760387_761736_761913_762926_763042_768216_768383_773156
731617	SIRV6	+	556	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10808_11031_11109_11205
731619	contig_8269_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_106233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302663	303358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_302700_303400
731627	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731630	contig_6710_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_89058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GTTTTGCTCTCCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653300_653900
731633	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	590	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731638	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731639	contig_1301_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_47354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAACTTTTGGCAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519705	518374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_518400_519700
731647	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_96245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTCCAAGAGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
731648	contig_12250_pilon	-	1853	14	Intergenic	novelGene_80667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	68.0269699387916	85	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	134	1465	387634	382001	TRUE	10	GCCAGGCTTCTTAGTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEEGLQLVMMVREGEAAGACPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELPYVLEMVAELAGQRDPGLGAFSCQEARKAWLDRLGNLDEAVEECVRARRRKVKELQSLGFGPEEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDSGPEPTPSWDGPDKQSLVRRLLAVYALPSWGRAELALSLLQETPRNYELGDVVEAVRHSHDRAFLRRLLAQECAVCSWALPRNRMQALTSCECTICPDCFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDTQLLSYFSTLDIQLRESLEPDAYALFHKKLTEGVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQWEEQHRGRSCEDFQNWKRTNDPEYQAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYKAMPSCLIQSLPRGPGQFLEVAVA	390689	381224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_381362_381453_381623_381918_382016_382743_382802_383353_383454_383568_383684_384737_384828_384918_385018_385100_385275_386482_386690_386793_386980_387087_387337_387595_387675_390596
731651	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	300	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
731652	contig_5896_pilon	+	2521	3	Intergenic	novelGene_159243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	12.5	84	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	352	2112	133508	135268	FALSE	30	AATTAATTTATTTCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEEKDSTSFKLQRNFPQEADFPEAYILEKQQEVHSVGSVKKEDSSFIDRTVKDETSPVEEYFFSQSPNLYHCHTVSTGEQLPECTGSGKAFSADRELIQHEIIDTGERPFKCEELVETYRCDSQCNQHQDIDTGEKPYQCKECGKAFSVNAKLIWHQRLHSGDKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKVCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECIDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKAFHSNAKLIQHQRIHTGEKPYECSECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQLRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPFECNECGKCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECGKAFSCSSDYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSYSSDCIIHQTVHTWKKPYVCNVCGKAFRFSFQLIHHQSVHSEGKS	125129	135677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_125378_126769_126835_133469
731657	contig_14727_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_56646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	222	383	276943	276782	NA	15	CCTTCACAACCTGTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSCDSDILETCFLAVFVLCIVYVLAFIIYGVCIYGCWTFYSSTIFCFRICELTIADDRDWSSLYFGGEALKQMDPEPPTIGGSGLWNQETACAYSFYNFEGGVVRRKELYLHLFKCPGIFVLVSI	277164	276583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_276600_277200
731661	SIRV6	+	300	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	86	-9	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3109	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731669	contig_2924_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_140253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGTTAAATACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40653	41174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_40700_41200
731671	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	54	510	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
731672	contig_16831_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_134800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACAAAGTGGTAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461359	460686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_460700_461400
731673	contig_9345_pilon	-	1253	4	Intergenic	novelGene_24382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	725.852602116986	6	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	69	371	176056	141990	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRTPWGSWMGFATLG	176124	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142033_148899_148948_173643_173789_175989
731674	contig_602_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_134954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489268	491911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_489300_491900
731680	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731684	contig_11978_pilon	-	920	6	Intergenic	novelGene_63075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAAGGACTCGCTCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831976	1827923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1827949_1829077_1829409_1829988_1830121_1830661_1830763_1831161_1831272_1831755
731689	contig_16110_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_126785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGGATTGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51703	54209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_51700_54200
731692	contig_19098_pilon	+	1813	4	Intergenic	novelGene_65848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	157	junction_3	49.1415189924863	450	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	34	801	445644	450502	FALSE	50	ACTGAAAAAAGAGGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVERTDELVREYLLFRGFTHTLRQLDAEIKADKEKGFRVDKIVEQLQQLMQVYDLAALRDYWSYLERRLFSRLEDIYRPTINKLKTSLFRFYLVYTIQTNRSDKAQEFFAKQAAELQNQAEWKDWFALPFLPSPDTNPTFATYFSRQWADTFIVSLHNFLSVLLQCMPVPVILSFDAECQRTNQVQEENEVLRQKVCLNRLRLGKHLCFSHVKLAEGVRECRKPRCLQMRGSLESQCHVQGQESYFKVMCAA	445610	451514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_445767_447666_447847_448381_448589_450244
731694	contig_12270_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_113724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCTCACATTACAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13852	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
731700	contig_5620_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_161363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAATCTATAGCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430880	431728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_430900_431700
731701	contig_5620_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_161364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432080	433741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_432100_433700
731705	contig_4426_pilon	-	1670	4	Intergenic	novelGene_15430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	340.354064011125	2	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1161	509	1669	821767	820607	FALSE	60	TCAGGGAAGAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKS	904632	820605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868897_890048_890141_904482
731708	contig_9833_pilon	-	2665	1	Intergenic	novelGene_68552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTTTTTTTTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237772	235107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_235100_237800
731709	contig_3285_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_153378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCATAGAGACCCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58788	59347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_58800_59300
731710	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731716	contig_7004_pilon	+	1364	4	Intergenic	novelGene_126465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	178.982929043216	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	59	1297	392109	395731	FALSE	5	CGGTTTCTTGTCACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIEEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	392050	395798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394061_394472_394514_394759
731717	contig_15744_pilon	+	650	5	Intergenic	novelGene_83575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	149562	153378	FALSE	20	CTATAATCTTTGTGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
731721	contig_10734_pilon	-	2093	4	Intergenic	novelGene_51001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	1	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	91	696	320632	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320722	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
731726	contig_6837_pilon	+	1479	10	Intergenic	novelGene_149819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	23.4115092514793	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	926	1336	15658	17185	FALSE	10	TTTTGTTTTGTATGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11626	17328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
731727	contig_10341_pilon	-	951	2	Intergenic	novelGene_47258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCTGGTGGATTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221096	219505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_219613_220252
731730	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731731	contig_3077_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_26848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1885	2190	726041	726346	NA	70	CTTTGAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTWLLWLVGQLHSFGIAIVPEVPVVGQWLLVVNGLNILRLACPILNRIFSSENPVSLLFVTRWTGSSVMAAAISGFIRSVLVFLQRWQRKKTTSVCAVL	724156	726523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_724200_726500
731738	contig_10444_pilon	-	2726	1	Intergenic	novelGene_139467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1182	1502	856417	856097	NA	65	TGACCATTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKDRWSKTLPSLQAVFMKSSPPACLLQADMFNCCQLLLFSSYLTITAKPGSWSMKSNPGGVPCSPHMYSGTLSIDVHLQLPDPILKILLGCSTLFLSVISRTGL	857598	854872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_854900_857600
731739	contig_8848_pilon	-	1414	2	Intergenic	novelGene_140457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACTAAACCAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58761	57287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_57571_57630
731740	contig_6163_pilon	-	3299	2	Intergenic	novelGene_103790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	81	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1030	3093	41	3133	25312	21288	FALSE	25	GACGGCTAACCCTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASRPSGEAQQPIMGPCRRALHPLSLLVQASALVVALALGTLPAFLPCELQPQGVVNCNWLFLKSVPHFPVAAPRGNVTSLLLRSNRIHHLRASDFARLPSLRCLDLKWNCPPVTLSPMNYPCHMTIEQGTFLAVPTLEELNLSYNNITTVPALPSSLVSLSLSRTNILALDSAAFAGLHALRFLYMDGNCYYRNPCRWALRVAPGALLGLGNLTHLSLKYNNLTAVPRSLPRSLESLLLSYNHIVSLAPGDLANLTALRVLDIGGNCRRCDHARNPCRECPRGFPRLHPDTFSHLSHLKGLVLKDSSLYSLNASWFRGLGNLTVLDLSENFLYNCITKTMAFESLPQLRKLNLSFNYHKKVSFAQLHLASSFSSLTSLEELDMHGIFFRSLSETTLHSLAHLPMLKSLHLQMNFINQAQLSIFGGFLSLKYVDLSDNRISGAAKLAASTREVGGGQKIQLQPGDLEPAPLDPRSSEDFMPSCKTLNFTLDLSRNNLVMVQPEMFAQLSHLQCLHLSYNSIAQAVNGSQFVPLVSLRVLDLSHNKLDLYHGRSFTELPKLEALDLSYNSQPFSMQGIGHNLSFVAQLHALRYLSLAHNNIDSRVSQQLCSSSLQALDFSGNALGRMWAEGDLYSHFFQGLKGLVRLDLSQNHLHTLLAPTLDNLPKSLQLLRLRGNHLAFFNWSNLALLPELEVLDLAGNQLKTLTNGSLPADTRLRWLDLSSNSISMVASGFFAQAKLLRELNLSANALKTVDPSWFGPWAGTLKVLDVSANPLHCSCGAVFVDFLLEVQAAVPGLPRHVRCGSPGQLQGRSIFEQDLRLCLDEALSWDCFGLSLLAVVLGLAVPLLHHLCGWDLWYCFHLCLAWLPRRGWRRGGDALTYDAFVVFDKAQGAVADWVYNELRVQLEERRGRRALRLCLEERDWLPGKTLFENLWASVYSSRKTLFVLAHTDRVSGLLRASFLLAQQRLLEDRKDVVVLVILRPNAHRSRYVRLRQRLCRQSVLLWPQQPRGQGSFWAQLGTALTRDNHHFYNRNFCRGPTAE	25352	21121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_24378_25309
731742	SIRV7	-	351	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	-20	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78841_78966_114680
731750	contig_6710_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_89405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATCCACCTTCCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
731751	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731753	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731754	contig_11363_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_160500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCCCAAGGAGATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198839	199988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_198800_2e+05
731755	contig_11363_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_160501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199992	201539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_2e+05_201500
731756	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731757	contig_7035_pilon	-	2989	1	Intergenic	novelGene_83522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATATTGAGTATGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291216	288227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_288200_291200
731762	contig_5084_pilon	-	625	5	Intergenic	novelGene_64527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	361.621608176281	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	271	624	443121	439641	FALSE	25	TATGTTGACAAATTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQADKLLKALKAHLKQEARRENENQETADECLPLQDGSQTCASSCDESEIQVREQDHAERKTGSYITKSRRRRRTVQGIPDSQQDHSERKMSDLTEFQNQEQPENQDLKTAGEAPTPPDESQGDENADSMEESRINGNEDSKIPSERKKYLCTDAFLKAGKNNKTGSTTPNFKKLHEAHFKKMESIDQYIERKRKHFEEHSNSLNELK	448388	439639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_439754_440829_440932_442982_443143_444435_444610_448313
731763	contig_6837_pilon	+	719	3	Intergenic	novelGene_149838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	89	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	105	599	91638	92466	FALSE	5	GCCCTGCCTGTGTTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDTSRLETYPGSNSVLVMAESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKIHSGCVTALHVLPKLLVTASRDRDVKLWERPSMQLLGLFRCEGAVNCLEPCLGPNSTLQLAVGDAQGNVYFLSWE	91533	92586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_91905_92028_92134_92343
731764	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_94137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731765	contig_7391_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_112148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATGAAACTGTCTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331453	332110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_331500_332100
731766	contig_14322_pilon	-	282	2	Intergenic	novelGene_116529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACCCCTGAAGATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674882	672863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
731769	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731771	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
731772	contig_5549_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_81622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTTGATCCTGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366761	367460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_366800_367500
731775	contig_6954_pilon	+	1901	3	Intergenic	novelGene_64433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	17.5	203	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	45	311	257164	258538	FALSE	40	ACTGAAAAAATGTTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSCALRILLYVLTVMTASRLPPVTLTLKQFIRRQQVLLLYRRILQAIRQVPNDADRRYLKDWAREEFKKNKSATEEDTIRMMITQGNMQLKELEKTLALAKS	257119	260128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_257209_257889_258031_258457
731779	contig_5350_pilon	+	1994	2	Intergenic	novelGene_99349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATCAAAAAAAAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170347	172515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_170489_170662
731783	contig_3948_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_53237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCTGATGTTATTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969691	971819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_969700_971800
731789	contig_3472_pilon	-	2411	2	Intergenic	novelGene_166927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206169	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_200513_205823
731790	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
731803	contig_6742_pilon	+	2258	7	Intergenic	novelGene_144551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	12.2304265393049	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	121	1464	25724	47227	FALSE	25	AGAGTCACTCCATCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRVECPCESSAKTCFSPENLERHSIPEALRLKWKNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEQWRHLDSTQKEYYWDLMLEAYGKMVSGDISSPKSDLANSAEHGQELARLHLDAGENIPMPTCTGDRQENDKEKVNLEHYRDQEPPNVSCDISGEAPSQAPVSGFFTGDEPRHFGEVAQGNLQVEGRGEQHSPQERSSGKQPGQHVLNPHPGDLSVLWLKEKPEAPPERSAETSHDPEAPYLHRVWENLLQEFSACVSPENSHWREVFSVPHLQKKPFCGVQTL	18183	48021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_18199_25618_26114_26786_26974_27402_27495_41061_41147_41800_41909_46745
731808	contig_3469_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_34169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCCTCTCTATTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418073	418305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_418100_418300
731809	SIRV6	+	568	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731810	contig_1275_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_108726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCTTATTCCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290434	288498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_288500_290400
731811	contig_753_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_112914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATCTTGGACGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315044	314041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_314000_315000
731812	contig_5996_pilon	+	407	2	Intergenic	novelGene_169277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	75	407	10040	14599	FALSE	55	GAAATAAACAATATCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECALMLAQEGSSWKQPQDSALQRLQWTKYPEWLLSHRLYPLSLACTHRVEVVDTSLHSGMVEHSLIFFPHQLILHLPGQLWASTMSRGYSKISVGEAVGLKLCCTLESPE	9965	14599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5996_pilon_+_10238_14464
731813	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
731814	contig_6418_pilon	-	1283	12	Intergenic	novelGene_81099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	415.121191106627	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	55	1029	106563	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKVGFSVDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118002	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_76992_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
731819	contig_13244_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_86946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAGCAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277189	276283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_276300_277200
731822	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	268	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731825	contig_6191_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_107851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAACTAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176230	176988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_176200_177000
731826	contig_8907_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_85850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACACTCTGTTGTGATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695029	693926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_693900_695000
731829	contig_15304_pilon	-	1024	3	Intergenic	novelGene_30546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	225	989	54039	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSITQAHRRPRCPAKVRGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54263	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53807_53984
731837	SIRV4	+	324	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCGATTGGCAAGGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
731839	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_93703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731851	contig_15449_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_33605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47223	44949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_44900_47200
731855	SIRV6	+	369	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	409	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
731857	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTAAAAATAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731860	contig_5084_pilon	+	1472	6	Intergenic	novelGene_64659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_5	131.959084567907	468	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	83	613	1488759	1490958	FALSE	20	GGATATTTTCTGCCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKEKLELELLQQGEEQYERLLKLKEQNMAELIAKMIELAQEKQAAELKTLKETSENDSKEMKKKLEAKRLERIQAMIKITTDKMAQERLKREINNSHIQEVVQVIKQMTEMAERQQVKLREKQAACLEQIREVEKQFQQEALAEYEARMKGLEAEVKESVRACLRTCFPSEAEDRSERPCGTTTEPSEKEPLTAEADTQESRL	1488676	1491817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1488768_1489006_1489084_1489174_1489271_1489592_1489651_1490336_1490424_1490754
731861	contig_10689_pilon	-	891	3	Intergenic	novelGene_118640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTCTTTGAACTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61584	57718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_57791_58210_58372_60926
731864	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731865	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731879	contig_12566_pilon	-	2135	8	Intergenic	novelGene_85987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	898	1323	19525	11045	TRUE	15	ACAAGGGGCCTTCTTCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSMSSMDNSTLLIPNSQMYFHTSCDEANELFLCIIGFCLLSRAVSALVCRNLKHCWLSTSTNSDSKSWSLYQAPPVTDRSGCRLYSIYTFFFEAATDLTALISFLLSKFFRILLISVSGKLLLYRISLLHIPLFPASSMI	21537	5617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_5780_6775_6895_10513_11072_12272_12388_18152_18295_18514_18623_19491_19685_20799
731880	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731881	contig_16411_pilon	+	1527	2	Intergenic	novelGene_77397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	0	120	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAATAAGTGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415141	418231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_415312_416874
731883	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731886	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731887	contig_3817_pilon	-	2064	10	Intergenic	novelGene_78339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	53.3020741726915	142	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	794	1141	475341	469880	FALSE	5	CGTTGCTTGTGTTTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADPTPEQYLVLEELIDMNQHHLNALGVGHASLDQLCRVTMAHGLHSKLTGAGGGGCGITLLKPDVEQPAVEATKQALTGCGFDCWETSIGAPGVSVHLATSLDAPIRQALDGL	515663	468956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_470032_471989_472144_475299_475417_475814_475906_482218_482265_482895_483000_491023_491180_513601_513774_514582_514675_515606
731889	contig_2757_pilon	-	2923	5	Intergenic	novelGene_164599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_3	21.3116752039815	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	111	2141	501786	476084	FALSE	25	GAGATGTTTGTACATAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPLNSCFLKVGSKKEVAECKEKFATSKDPTVSQTFMLDRVFNPEGKALPPMRGFKYTSWSPMGCDANGRCLLAALTMDNRLTIQANLSRLQWVQLVDLTEIYGERLYETSYRRSKNEAPEGNLGDFAEFQRRHSMQTPVRMEWSGICTTQQVKHNNECRDVGSVLLAVLFENGNIAVWQFQLPFVGKESISSCNTIESGINSPSVLFWWEYEHNNRKMNGLIVGSAFGPVKILPVNLKAVKGYFTLRQPVVLWKEMDQLPVHSIKCVPLYHPYQKCSCSLVVAARGSYVFWCLLLISKAGLNVHNSHVTGLHSLPIVSMTADKQNGTVYTCSSDGKVRQLIPIFTDVALKFEHQLIKLSDVFGSVRTHGIAVSPCGAYLAVITTEGMVNGLHPVNKNYQVQFVTLKTFEEAAAQLLESSVQNLFKQVDLIDLVRWKILKDKHIPQFLHEALEKKIESSGATYFWRFKLFLLRILYQSMQKIPSEALWKPSNEDSKILLLDSPGMGNAEDEQQEEGTSKQVNKQSLQERSKEGDTEEPTDDSLTQSGDVGGHEPMEEKLLEIQGKIEAVEMHLTREHMKRVLGEVYLHTWITENTSIPTRGLCNFLMSDEEYDDRTARVLIGHISKKMNKQTFPEHCSLCKEILPFTDRKQAVCSNGHIWLRCFLTYQSCQSLIYRRCLLHDSIARHPAPEDPDWIKRLLQSPCPFCDSPVF	508250	475301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_476149_477767_477857_481816_481948_500040_501865_508218
731894	contig_11493_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_143679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATACTTATATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168657	167106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_167100_168700
731895	contig_3817_pilon	+	1657	5	Intergenic	novelGene_78319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	632.038121872407	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	312	638	199106	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSGPNQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178646	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199126_201727_201852_204349
731897	contig_233_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_14692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAAAAACCCATTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117203	118235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_117200_118200
731899	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4402	38	3227	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
731900	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731903	contig_6710_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_97782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
731905	contig_9705_pilon	-	1574	5	Intergenic	novelGene_41719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_4	535.347083675628	351	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	311	865	170705	156798	FALSE	90	AGATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQKQGKGKTCKKGKKGPGEKGKGGNGGGKPPSGPNRMNGHHQQNGVENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRDIALLDLINFFIQCSGCKGKIYLFWKKNTLKNSLFFFILSKEMLAQYMENNAKVLNYLHFTHTKCLRKKKQRTK	237872	156088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_157065_162930_163096_166745_166825_170661_170802_237658
731908	contig_11678_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_160837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAAGTCAAGGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177468	176671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_176700_177500
731909	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
731912	contig_16716_pilon	+	1312	7	Intergenic	novelGene_169287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.9826263120125	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	197	871	180574	204432	FALSE	20	TTAAACCTATGGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSTAELFWRDAVMPYSAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIELPLPSESVDIIISDIPFGKKFKLEKDIKSILQEMERVLRVDGAIVLLLSEDHHRCLQDCEESGIPLNSKSSHIDEPGMKKCLNPEGENGISETASSSFQASNQEGLDRTSPFGSLVPVECYKVSLGKTDAFISKYRKSHSSGL	177084	204873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_177132_177235_177324_180512_180628_183761_183834_184294_184410_194792_194902_204107
731914	contig_2453_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_147769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_3	52.9297227987787	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	688	1350	60643	62827	TRUE	20	AAATGTATTTGTCGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELPLPTSGKYHGPDNVCFFSFCDVRVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	59955	63140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_60786_61900_62016_62422_62836_63026
731915	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_89359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731918	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
731920	contig_1331_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_37869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	0	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	701	1156	326456	327913	FALSE	30	TCCCAGCAAAGGGTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVNCSNRIIKKSGKSAFLLPGSPSSCFSLEFVSSPSFFFPSHNFFPFVLQTFSVCLSLSSSLGCFIFVMNSVFLPTMAFVFYHKFIWLTSRLRQAERGRQSAELDNRLFKQDFGDKINSLQLQVEELTRQRNQLELELKQERERRLQNNRN	325755	327914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_326851_327852
731924	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731925	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
731930	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	1	1155	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
731931	contig_9646_pilon	+	3267	1	Intergenic	novelGene_117426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136242	139509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_136200_139500
731932	contig_10500_pilon	-	2767	4	Intergenic	novelGene_41157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.226952595573	38	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1403	1993	1238256	1237545	FALSE	10	TTTCAGGTGTACTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDYADGEAKVEQLAVRFKTKEMADCFKKKFEECQQNLLKLQKGQVSLAAELSKETNPVVFFDVCADDEPLGRITMELFSNIVPHTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRIIPDFICQVSINCVLQLKSRRMHRTNLGNLSISPCLHPVIFITYL	1241095	1236770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1237994_1238114_1238389_1239109_1240362_1241077
731935	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_97986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731936	contig_5337_pilon	-	2198	3	Intergenic	novelGene_136559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	234	1577	322179	320836	TRUE	30	CTGAAAAACATTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	330812	319679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_319987_320521_322308_330707
731938	contig_6710_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_96869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653777	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731939	contig_5338_pilon	-	2169	6	Intergenic	novelGene_114587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	17.2673101553195	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAAAGGGCTTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391515	387542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387928_388106_388196_388459_388690_389280_389730_390314_391175_391359
731940	contig_6304_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_122254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAGAGAAGAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138542	140899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_138500_140900
731941	contig_17440_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_7635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3463	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
731943	contig_5649_pilon	-	1783	9	Intergenic	novelGene_82368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	47.3022198210613	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	31	585	1064307	1057321	TRUE	20	AATCTCCTTCATGCGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064337	1055334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
731945	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731949	contig_6595_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_122532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGACCTCTTGACCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400362	401239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_400400_401200
731952	contig_15185_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_99468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	112	339	462848	463075	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGYLRPFWQDCLHPTPLIKPFLGGRVPSLGLYSSQSMLFLGDLGHTSALISKAVSPAQASDLSTKNSLHITTQMAQSHLSAFSQPVPSPTCHHHSTLTPIQVPKPETGHKP	462736	464905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_462700_464900
731957	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
731960	contig_12179_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_128001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGCTGCTAACCAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511118	509000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_509000_511100
731962	contig_9389_pilon	+	1119	4	Intergenic	novelGene_83936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1119.59188993133	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTGGCTGGAGAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163477	168394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_163742_164232_164300_164401_164437_167641
731963	contig_11248_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_142534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121847	123380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_121800_123400
731965	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_89624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
731966	contig_19237_pilon	+	1081	4	Intergenic	novelGene_162958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	127.444105395267	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTGTTTGTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23957	45328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458_28752_35765_35862_44670
731967	contig_8412_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_118372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTCCTGGGAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628084	628637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_628100_628600
731969	contig_8980_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_74006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622394	624057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_622400_624100
731972	contig_990_pilon	-	2135	5	Intergenic	novelGene_76122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	100.579570490234	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	35	559	1605903	1586999	FALSE	35	ATTTAAACAACTCACCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KERLAAGGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1605937	1585422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
731973	contig_7129_pilon	+	1811	6	Intergenic	novelGene_169297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	13.0598621738516	130	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	416	811	900107	912282	FALSE	0	CCTCCTTTTGCCTGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPISFQDLPLNIYMVIFGTGIFVFMLSLIFCCYFISKLRNQAQSERYGYKEVVLKGDVKKLQLYGQTCAVCLEDFKGKDELGMLPCQHAFHRKCLVKWLEVRCVCPMCNKPIAGPSEATQSIGILLDELV	894240	913282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_894609_900059_900217_910302_910349_910689_910732_911815_911899_912167
731978	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
731980	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
731988	contig_14219_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_54318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACAAAGATTGTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700720	701270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_700700_701300
731990	SIRV2	-	406	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4491	10	3316	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGATTGACATCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
731995	contig_11932_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_85423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACTGACAGCCCCGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377733	376962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_377000_377700
731996	contig_7695_pilon	-	1265	5	Intergenic	novelGene_41546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	186.798019261447	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	42	500	380076	376401	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEAAAIGAGKRGTGPKSVR	381046	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_375915_376157_376456_379672_380089_381017
731997	contig_8674_pilon	+	1520	4	Intergenic	novelGene_102920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	41	junction_2	592.626545323631	960	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACATATGAAGCCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427065	460932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_457759_457844_460249
732001	contig_6418_pilon	-	945	12	Intergenic	novelGene_81118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.11658718902	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	603	343	945	81719	68236	FALSE	35	TAAACGGAACTTTTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLIDK	106554	68235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68246_69631_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515
732008	contig_7202_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_18906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGACCGCATCCCCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
732013	contig_8934_pilon	-	1631	3	Intergenic	novelGene_167238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3139	junction_1	447	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTCTTTATTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603924	595834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_596052_601775_601837_602571
732016	contig_9363_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_6678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	103	402	1156581	1156282	NA	20	TCGATTCTGACTCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGMETLAHHCILDTICTPRELTLPDPSLGPLCFSSLFLGLAFKLPRDWILSAMSVQSLPVGMFQLGPDTSEATRPAYRSSLAFTGHLLCGLPCKLQGD	1156683	1154821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1154800_1156700
732017	contig_9363_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_6677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154212	1153735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1153700_1154200
732018	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
732019	contig_12050_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_62745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTTAAGAATGTAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687725	685608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_685600_687700
732020	contig_8258_pilon	+	1943	1	Intergenic	novelGene_130446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCAACTATATATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39893	41836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_+_39900_41800
732026	contig_10904_pilon	-	1462	5	Intergenic	novelGene_22530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	370.487854051924	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	126	941	362437	352112	FALSE	5	GATCTGTTGTTGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362562	351590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_362403
732027	contig_5502_pilon	-	1109	8	Intergenic	novelGene_154996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_6	44.4513033256275	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	195	989	442539	426538	FALSE	65	AGTAAAAAATGAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TADKYIESSDSEEFETTELPQKTKGKLKNAKSETKSRGKGSSTIKDDSEFARALISSAPTTKKKMLRKGLSAVEESKKTDLGEKPRTTLIICPLSVLSNWIDQFGQHIKSEVHLNFYVYYGPDRIRDPALLSKQDIVLTTYNILTHDYGTKGDSPLHSIRWLRVILDEGHAIRNPNAQQTKAVLDLEAERRWVLTGTPIQNSLKDLWSLLSFLKLKPFLDREWWLRTIQRPVTLGDEGGLRRLQSLIKNITLRRTKTSKVKGKPVLELPERKVFIQHITLSDEERKIYQSVKNEGRATIGRYGERMLYKKICTYIYVYIFLFVSRLTE	443930	426417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_426803_428391_428528_429245_429385_430295_430440_436176_436275_442526_442614_443718_443764_443855
732028	contig_10019_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_86697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATCATGTCATGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378098	378695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_378100_378700
732029	contig_12312_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_63992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGACTGAAATCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437130	438229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_437100_438200
732031	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
732032	contig_4486_pilon	-	2505	2	Intergenic	novelGene_38606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	137	367	349191	348127	FALSE	55	AAATATCTATTAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSPGGEAVKRLAANQTAGGSNSPVTLQEKDVAVCFRKDYSFGNPMRQSFSHRVAGWVRTANLRSAAECLTEKIIYKNKCGIVTVHKRDRKYTKTQQLWSLLSHFNATYFSVLLFQWKPIL	349327	345988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_348350_349183
732033	contig_4486_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_38605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATCTTGAAAAGTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345683	344994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_345000_345700
732035	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91667	0	-91661	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGACAAAACCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
732043	contig_14811_pilon	-	1759	3	Intergenic	novelGene_74490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	128	907	375703	357434	FALSE	30	TGACAACCCCAAAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386594	356581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
732044	contig_3525_pilon	-	2926	7	Intergenic	novelGene_135134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	67.5189273874782	219	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	96	1106	609659	591940	FALSE	20	GTATTCTCTGGTTTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATPDWSAASFFCPGLCSVRCTPRKRVLARFMARFWVCAAGAGFFLTFLVLHSCFCGSPTTENILYRLDVGWPKYSEHFTGTTFCVAVDSFNGLVYVAQRGDNMPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVWVADRGNKRIQVFDKDTGEWLGAWDNCFTEEGPSSVRFTPDGKYLIVAQLNLSRLLLLEAPPVGSIGSCSVVSTIQLADQVLPHLLDVDRKIGAIYVAEIGAKQVQKYVPLKSYFLSLGS	609754	590119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_592193_592762_592876_602693_602786_605990_606192_608457_608606_608885_609006_609575
732048	SIRV4	+	309	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1462	632	1007	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2462	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
732050	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732051	contig_11978_pilon	-	2302	8	Intergenic	novelGene_62952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	71.91746970646	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	28	999	1053786	1041965	FALSE	55	AATAAAAATGTCAATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSEEVRPQDTVSVIGGVAGGSKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKLSVEGFAVDKMAGEVKAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1053813	1040661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289_1044338_1044611_1044768_1045289_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699
732053	contig_4730_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_71711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATCCTTGCTTCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139604	138912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_138900_139600
732057	contig_7593_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_127273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCATTCCTTCTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13420	11099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_11100_13400
732061	contig_5684_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_81083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAATTATAGTTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474270	475204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_474300_475200
732063	contig_5189_pilon	-	1632	8	Intergenic	novelGene_34867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1342.62905357742	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACTTGTTTCAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230474	198432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205750_205790_218496_218671_220258_220380_228126_228229_230388
732064	contig_16098_pilon	-	2175	14	Intergenic	novelGene_45892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	52.3378872125139	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	308	1216	253301	247493	TRUE	10	TCAGTTTACTTTCTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	255220	244098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_255169
732065	contig_16666_pilon	-	1527	7	Intergenic	novelGene_61724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	326.352272177712	257	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	640	1068	42510	24486	FALSE	35	GCTTAATAAATGTAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLKRGWGEFEIIIKIFFIDPNERPVTLYHLLKLFQSDTNAMLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47960	24026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42559_42637_42705_44969_45090_47556
732073	contig_10354_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_50868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTACAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451782	453017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_451800_453000
732080	contig_9345_pilon	-	1947	6	Intergenic	novelGene_24719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	24.5161171477051	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	426	746	1013536	1012336	FALSE	5	TGACTCTGCTGGCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEGLPDPGRVSSEVQQMWALTEMIRASQTSTRIGRFDVDGCYDLNLLSYT	1015302	1011134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012975_1013434_1013641_1013799_1013977_1015158
732081	contig_19777_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_29703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	865	1263	8781	8383	NA	45	TTTTGCCAATAAAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKRPHQRSKKRTYRLGKFFGYDISNEGLISKIYRKIQHLYNKKTNNLIKKWARDMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSRSLAIKEMQIKTTTRHHLTLTLLASIKKTENKEFSDKGQKAEGDKEAGDREHKIE	9645	7955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_8000_9600
732082	contig_6710_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_97094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
732089	contig_12312_pilon	-	1770	8	Intergenic	novelGene_63974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1022	junction_7	647.256596753418	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	102	1127	326065	245857	FALSE	30	TTGTGGAATTTTATGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLTAPSLSLLSFPAPSIPVFCRPRFAAPPAAAMPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRAR	326166	245213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
732090	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732091	contig_10135_pilon	+	2191	4	Intergenic	novelGene_106577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	4.24264068711928	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1498	1938	26805	27694	FALSE	45	AAAATGTAATCATCCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPSIEPPVSTPAGKIGLAICYDMRFPELSLALAQAGAEILTYPSAFGFVTGPAHWEVLLRARAIETQCYVVAAAQCGRHHQKRESYGHSMVVDPWGTVVARCSDGPGLCLARIDLSYLRQLRQHLPVFQHRRPDLYGSLGHPLS	25040	27947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25763_26029_26853_27021_27148_27427
732092	contig_614_pilon	+	1684	7	Intergenic	novelGene_132622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	29.8589275687449	23	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTAATTGATTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588638	641291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619516_619671_619859_619971_621721_621753_634039_634064_640090
732093	contig_5479_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_133565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGCACTTGTTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88462	89153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_88500_89200
732095	contig_5779_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_106509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231444	229377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_229400_231400
732096	contig_15354_pilon	+	2850	9	Intergenic	novelGene_65752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	48.7055887450301	418	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	733	1461	642871	647109	FALSE	30	GCTGCCTCTGCTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFAWNVSDLRFNWHPVLMVTGMVVLYGAASLVYRVPQSWVGPKLPWKALHAALHLLAFILTVVGLVAVFSAHNKKHISNLYSLHSWVGITTVFLFACQWFLGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	638977	648498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_639245_639699_640818_640895_641713_641787_642858_643055_644182_644392_645018_645174_646352_646510_647085
732097	contig_11370_pilon	-	1335	4	Intergenic	novelGene_98780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	315	junction_1	209.710912130644	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	918	1259	301451	300981	FALSE	10	TCTGTGTGACTTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVGEDTTGDSCPPSTWQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTANALALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFTIATLPPP	302909	300904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301124_301252_301726_301843_302379_302801
732098	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732099	contig_10674_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_6458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACATATGAGGTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333442	334223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_333400_334200
732101	contig_5361_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_167215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1366	1689	490288	489965	NA	50	TCAGACGACATGAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPGVGLKEMALAVEQIHSLTFLCLAGSPIRLGLDANLLGGEVAGFLWDIQKCPPQEPDADMDPEWGLTKCSFPCGNQTVSLQLYSINMNKCGLQILGKMGRSNFPS	491653	489593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_489600_491700
732103	contig_2438_pilon	+	1320	5	Intergenic	novelGene_112009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	2569.36737106627	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	74	673	310588	312871	FALSE	10	TTTGGATGGACTCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305082	313518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310569_310768_311907_312083_312305_312409_312729
732104	contig_4232_pilon	+	775	4	Intergenic	novelGene_63192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	80	580	146362	149200	FALSE	20	CTCTTGGGTTGAAGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146282	149395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
732109	contig_3601_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_132977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCTAAGGTTCCTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153302	1154917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1153300_1154900
732111	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	15	1159	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
732113	contig_9345_pilon	+	879	2	Intergenic	novelGene_24517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1	522	668662	669511	FALSE	65	AAAACGGTAACAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGILGATKNKQTRREKGSCKSPGGSPAPQHPSALSLACLTIASNDLQTGVFIFDVLDHVDLEDGISLGRVLGQGGSPSETTAWELPLLRQHPTCAAAHQNHYIYTSLGQQVQPVLVIFMCANGRSTQQLLLSIFGGQWIIPVLLQVCPGNDGHQLVVFIYNGQLSWGQGRT	668661	669868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_668707_669034
732116	contig_7707_pilon	+	482	4	Intergenic	novelGene_72179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	331.926029242795	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTGTTTAGCAATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531593	575825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531644_553051_553211_553915_554043_575679
732117	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3187_10746_10819_11031_11109_11205
732124	contig_11719_pilon	+	512	5	Intergenic	novelGene_154749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3152	junction_4	1718.95322434905	42	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	35	472	13981	20039	FALSE	40	AGAAAACTAATTGAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13946	20079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
732127	contig_6208_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_53045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCAGCCTTGAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530131	528725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_528700_530100
732130	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
732140	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
732141	contig_233_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_14691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTCGGGGTGGCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114779	113155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_113200_114800
732142	contig_6710_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_95901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
732144	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732158	contig_6958_pilon	-	2088	6	Intergenic	novelGene_69943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	550.592916772455	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	139	1203	189837	149618	TRUE	30	TTTAATAAAAGCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	189975	148607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149231_149355_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
732162	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	175	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732165	contig_15039_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_110193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATACCAAAGGAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381017	378983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_379000_381000
732167	contig_10904_pilon	-	2289	9	Intergenic	novelGene_22437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	22.6381177441942	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	724	1575	78169	63511	TRUE	60	ATGCAAATTGAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLWLDSCGLTAKACEDLSSMLGVNQTLTELYLTNNTLTDTGVRLLCKRLSHPSCKLRVLW	96555	61064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_61732_63463_63686_71079_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_93272_93354_96091
732168	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732169	contig_13481_pilon	-	2331	1	Intergenic	novelGene_119363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458743	456412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_456400_458700
732170	contig_6914_pilon	-	2233	10	Intergenic	novelGene_151738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGACAGCACGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130504	126014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_126702_126880_127060_127214_127328_127508_127583_127713_127930_128008_128095_128248_128357_128470_128547_128667_128744_129886
732175	contig_7056_pilon	+	2080	18	Intergenic	novelGene_43586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	21	junction_1	199.895578276591	152	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	284	1966	661004	728973	FALSE	60	AGAATTTAAAACCAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGRGPEQGHEPGLESGEEFEIVDRSQLPSPGELKSAAQPRAPAEGWSSPILTLARRATGNLSASCGSALRAAAGRGVGDGVGDGAARAAAKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKGQFDFIF	651428	729087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_651698_660989_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858_716937_728949
732181	contig_18794_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_54649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCAGAAAGGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171437	172446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_171400_172400
732188	SIRV6	+	553	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
732190	SIRV6	+	574	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2775_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732201	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732202	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	886	-23	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
732205	contig_10549_pilon	+	2094	9	Intergenic	novelGene_110625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.216888894093	482	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	411	1178	474688	488784	FALSE	40	TGAAAAATTAGCCTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKKTVVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNISVWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLKWYPLKRKTAPVAIEAENRGEMKLALQYVPEPSPGKKLPTTGEVHIWVKECVDLPLLRGNHLNSFVKCTILPDTSRKSRQRTRAVGKTTNPVFNHTMVYDGFRPEDLTEACVELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWKKMVDSPNTWIEATLPLRTLLIAGISK	371104	489700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_371201_426015_426168_472682_472808_474650_474754_476851_477023_481782_481862_485320_485421_486938_487145_488638
732206	contig_9668_pilon	+	1466	8	Intergenic	novelGene_58133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	398.85049114388	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	131	1090	332086	359314	FALSE	25	AAATGATGGTGCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	282782	359690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348322_348503_355527_355714_359138
732207	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
732213	SIRV6	-	406	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-149	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAATGGCGTCTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2885_10711_10825_11035_11109_11205
732215	contig_20428_pilon	+	2104	2	Intergenic	novelGene_169315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	373	1641	28998	30266	FALSE	10	ACTCTGTGGAGTTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFSKPEVISLLQQGEEPWKVEKEGPAGSSLGWENSQKTTKSTQTQESSLQGLILKRSKRNGPRDFKSEKPCVYEDRLKKQPNKNDSFQIISVTHKKILTIERIHKNIEFGQNFNPKSDLIKQQMVNREISPSKCETQGNSFKQNSGLLNQPKVNTAEKRYKCNICEKTFTNNSSLRKHLKNHTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYVCKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKVHAQENPYKYNPGRKSSLGCQRIHPRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFECNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKTHIAENP	12030	30729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20428_pilon_+_12125_28719
732216	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
732218	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732222	contig_5832_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_134126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTAAAAAATCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159815	157916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_157900_159800
732223	contig_17769_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_124244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATCTCTAAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22312	23980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_22300_24000
732224	contig_11106_pilon	+	3615	12	Intergenic	novelGene_167456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	11.5386522552579	47	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	78	2063	162565	190612	FALSE	25	TGAATGAATATTTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWPGRRAWRWGSQAGEERWRGAAGDMSLPAEKASELKQLIHQQLNKMDVHGRIREILAETIREELAPDQQQLSTEDLIKALRRRGIIDDVMKELNFVTDNVDQELPTSPKQPACFTDRQSTLFKKTNIDPTRRYLYLQVLGGKAFLEHLQEPEPLPGQVCSTFTLCLHFRNQRFRSKPVPCACEPDFHDGFLLEVHRESLGDGTRMADSTTMLSISDPIHIVLIKTDIFGETTLVASYFLEWRSVLGSENGVTNVTVELMGVGTESKVSVGILSIKLEMYPPLNQMLSQEVVNTQLALERQKTAERERLFLVYAKQWWREYLQIRPSHNSRLVKIFAQDENGINRPVCSYVKPLRAGRLLDTPRQAARFVNVLGYERAPVIGGGGKQEQWCTLLAFLCRNKGDCEDHANLLCSLLLGYGLEAFVCVGTKAKGVPHAWVMTCGTDGTITFWESLTGHRYIHKPINPDGAPLAEQPKPLYPYRTIGCVFNHQMFLGNCQPSDSVEVCVFDLNDESKWKPMSEEAIKSVCAPGATTSLPPFPPLCASMIDASVTSNEMEMQLRLLVSEHRKDLGLTTIWEDQLSYLLSPALASYEFERTTSISAGNEEFQDAIRRAVPDGHTFKGFPIHFVYRNARRAFATCLRSPFCEEIICCRGDQVRLAVRVRVFTYPESACAVWIMFACKYRSVL	162487	192164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_162628_164780_164937_166454_166537_167120_167346_168441_168628_175045_175144_176609_176739_182352_182542_185252_185420_186293_186628_189552_189771_190473
732231	contig_6710_pilon	+	580	2	Intergenic	novelGene_94037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGTGACTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
732232	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732233	contig_6270_pilon	+	1323	7	Intergenic	novelGene_99818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	162.920652125165	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	534	872	39429	45668	TRUE	25	TACAATTGCTGGGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCLTFRACSVSFPHASPSLCSSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37335	47671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
732238	contig_5894_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_83037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACTACTCAATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382919	382282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_382300_382900
732239	contig_4426_pilon	-	1657	2	Intergenic	novelGene_15454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTCTTTTCTGCAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892754	891050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_891324_891370
732241	contig_7426_pilon	-	1957	8	Intergenic	novelGene_27545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	282.343183855017	1	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	55	780	1102748	1087105	FALSE	40	TCTATCAATATATGTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTASRRGPPTVATGPRSGSWTSHHGVAGCESQRKGRWPTSSWRTGPQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102802	1085927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094723_1100318_1100420_1102705
732244	contig_10437_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_38266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_1	0	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	396	722	405392	405718	TRUE	50	ATAAATAGCTATTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGKELFSWSTIHCLLWRGFGGFSKGTEHFQYLVFMFRLSLPRDTCSHRSLQYPCLKPV	404996	408262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_405923_407600
732246	SIRV4	-	261	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1257	3	1257	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
732247	contig_15459_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_106356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4976	7273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_5000_7300
732252	contig_14467_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_138264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	72	593	318578	319153	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	318506	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_318787_318840
732255	SIRV1	-	218	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3881	5	3607	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6759	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
732256	contig_9955_pilon	+	892	7	Intergenic	novelGene_21329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	402.606783626682	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	107	484	69965	84621	FALSE	40	AAAAACTATCCAGTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLEGLRCSECVDWGEKRNTIASITAGVLFFTGWWINAVSNGQVRGDSYSEGCLGQTGARIWLFIGFMLAFGSLIASMWILFGGYVVKEKPTVYPGIAVFFQNAFIFFGGLVFKFGRTEDLWQ	67763	85029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_67858_69952_70058_71904_71922_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575
732261	contig_14441_pilon	+	667	5	Intergenic	novelGene_100571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	257	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111197	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111992_112040_116578_116647_117236_117344_117539
732262	contig_11752_pilon	+	1500	8	Intergenic	novelGene_37621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1472.32973791296	3	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	96	1184	84194	96579	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGT	84098	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96584_105597
732264	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732269	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732273	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
732276	contig_10953_pilon	+	575	5	Intergenic	novelGene_42559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2729.61410963162	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	35	403	422508	425161	TRUE	0	GGGTCGCCGTGGTCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRYGTGAGRIPSDLSRSFKN	419999	426229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423383_425121_425291_426186
732277	contig_9548_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_141087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300349	297509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_297500_300300
732280	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
732295	contig_13014_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_169332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302513	299802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_299800_302500
732296	contig_6589_pilon	-	2002	4	Intergenic	novelGene_26288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.7401153701776	12	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	153	1043	2274715	2273718	TRUE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGSSHTSSHCSRSHPAGRSCTHSHHHQHWARTLCLHCHHTSLVCHSQPLTLPPSNLSCSPRDWGTGLQFKGPWNGFQRVYGDVHCCCRHHHCHRLCLESETTGSIRAPQYCAHCRNRSVWPRCSLGGPYQPRPDLCPAGEPDQ	2290250	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272467_2273152_2274145_2274251_2274793_2290175
732297	SIRV7	+	279	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
732298	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732299	SIRV2	-	652	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	7	2958	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
732301	contig_11427_pilon	+	2365	3	Intergenic	novelGene_79009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAAGCCACTTCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707596	712268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_708445_708808_708909_710851
732305	contig_12884_pilon	-	1082	8	Intergenic	novelGene_104988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	548.035377973178	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	187	1023	906341	899626	FALSE	5	TCTGACTCCTGTCCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915531	899566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_905761_905834_906224_906349_915352
732306	contig_3252_pilon	+	1974	8	Intergenic	novelGene_61486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	58.6995115231909	195	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	136	783	227304	229870	FALSE	25	ACAACTCTGGCACTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWIVFAFFTTAETLTDIVLSWFPFYFELKIAFVIWLLSPYTKGSSVLYRKFVHPTLSNKEKEIDEYIMQARDKSYETMMRVGKRGLNLAANAAVTAAAKGQGVLSEKLRSFSMQDLTLIRDEDALPLQGPDSRLRHSPGSLLDTIEDLGDDPALSLRSSMNQADPRTETSEDDTGDKAPKRVKSIKKVPKAEPLASKTLKTRPKKKASGAGDSA	224461	231061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_224512_226865_226939_227291_227369_228584_228706_228856_228971_229340_229489_229577_229709_229801
732308	contig_16109_pilon	+	1638	12	Intergenic	novelGene_80337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	113.500573413923	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	835	1467	316708	322329	FALSE	20	CCATCTGATTTTATCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVSLEPSIMYNVAELNSVNQAGECISTFGSRAYLQPMDTRQYLYCLKPKKEFAEKAGIIKGVTVIGKLDIVWKTNLGERGRLQTSQLQRMAPGYGDVRLSLEAVPDTVNLEEPFHITCKITNCSERTMDLVLEMCNTNSIHWCGISGRQLGKLHPSSSLCLALTLLSSVQGLQSVSGLRLTDTFLKRTYEYDDIAQVCVVSSAIKMEN	282492	322500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_282822_295728_295798_296330_296431_297467_297515_303617_303722_309356_309430_311576_311626_316644_316785_317798_317998_319421_319523_321947_322096_322221
732311	contig_5083_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_151635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAATCATATGTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177302	178353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_177300_178400
732312	contig_5083_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_151636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCAGTATGTGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178403	178958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_178400_179000
732313	contig_9424_pilon	-	696	2	Intergenic	novelGene_143771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGCTTGGTGATTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274641	272245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_272736_274435
732324	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	15	1154	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
732325	contig_6102_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_32180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAGAGCAGAACTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858972	861089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_859000_861100
732326	contig_19469_pilon	-	987	10	Intergenic	novelGene_135005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	3.77123616632825	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	75	986	345027	326649	FALSE	30	GAAGAGACTCCAAGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLTKRIPQNPKYQHIKSRLDTGSSMTKYTEKLEEIKKNYRYKKDELFKRLKVTTFAQLVIQVASLSDPTLEVTAEEIQRLEDNDSGTSDPDVESTARTNGKGTPSEQSPSPVQFINNAGAGDSSRSTLQSVISGVGELDLDKELVKKAEPNTKDKPYPDCPFLLLDVRDRDSYQQCHIVGAYSYPIATLSRTMNPYSNDILEYKNAHGKIIILYDDDERLASQAATTMCERGFENLFMLSGGLKVLAQKFPEGLITGSLPASCQQALPPGSARKRSSPKVPPPPAENKWRFTPEDLKKIKYYLEEEQGPAENPSWLHQANSSGRDSKG	361322	326647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_326693_327559_327776_328236_328352_329393_329462_329887_330040_332296_332442_339280_339351_340310_340373_344987_345036_361256
732327	contig_19469_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_135004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1622	2023	324943	324542	NA	45	ATGTTGAAGATTAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLSCFPINLLPENLVQPFADAKNALAFYFLYSIDRKMQMFPHSAFPQQRQDFSVIFDTYTFLRKIYFPLYQNSGYAIFKLTGQEFRLPSLSCSLKVNGSSSLVVCCVPSPNNTRTVRNYCIYVESQFSQTY	326564	324276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_324300_326600
732331	SIRV6	+	438	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	524	0	345	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732333	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732337	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732338	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
732342	contig_16525_pilon	+	2443	23	Intergenic	novelGene_133881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	148.987720665466	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	56	1627	189487	211608	TRUE	5	AGTCTCGTTCCTGTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSGWYRRRTWDRSCEEQKMSDSEDSNFSEEDKVEEERRSAAGSEKEEEPEEEEEEEEEEEYDEEEEEEDDDRPPKKPRHGGFILDEADVDDEYEDEDQWEDGAEDILEKGEFSASNIDNVVLDEDRSGARRLQNLWRDQREEELGEYYMKKYAKSSVGETVYGGSDELSDDITQQQLLPGVKDPNLWTVKCKIGEERATAISLMRKFIAYQFTDTPLQIKSVVAPEHVKGYIYVEAYKQTHVKQAIEGVGNLRLGYWNQQMVPIKEMTDVLKVVKEVANLKPKSWVRLKRGIYKDDIAQVDYVEPSQNTISLKMIPRIDYDRIKARMSLKDWFAKRKKFKRPPQRLFDAEKIRSLGGDVASDGDFLIFEGNRYSRKGFLFKSFAMSAVITEGVKPTLSELEKFEDQPEGIDLEVVTESTGKEREHNFQPGDNVEVCEGELINLQGKILSVDGNKITIMPKHEDLKDMLEFPAQELRKYFKMGDHVKVIAGRFEGDTGLIVRVEENFVILFSDLTMHELKVLPRDLQLCSETASGVDVGGPT	189179	218200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_189226_189477_189527_193297_193466_195002_195075_196106_196183_196305_196375_196476_196543_196864_196896_197223_197293_203126_203379_204739_204830_204934_205006_209617_209724_209962_210057_210339_210477_211295_211452_211533_211682_212637_212753_214709_214774_214865_214972_215450_215610_215699_215768_217969
732344	contig_12624_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_61020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCACAATAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843556	841478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_841500_843600
732347	contig_5485_pilon	+	1619	3	Intergenic	novelGene_37707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAAGCGCCAGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84695	86847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_86135_86258_86366_86774
732348	contig_20844_pilon	-	2157	5	Intergenic	novelGene_78613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_2	215.019039854614	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1224	1739	206752	205181	FALSE	35	AGCAGGACTCCAAGGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAK	208124	204762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_205292_205376_205514_205631_205740_206592_207938_208086
732349	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_98142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	GCAGCTACCCACCCATCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732352	contig_6397_pilon	-	2036	15	Intergenic	novelGene_146243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	111.591364598974	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	336	1451	520231	437797	FALSE	5	GTTGTTGGGGTTTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	546281	437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455606_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_546153
732355	contig_11086_pilon	+	2353	13	Intergenic	novelGene_61189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	160.611505053516	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	65	1909	24460	48353	TRUE	30	AGGAAGGGCATGGTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNGHLFLQGLGFLILCTLVGAPVVELKLEKGGHRCEGRVKIKYQGQWKMVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEGQHLP	24395	50917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24533_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45682_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48107_48334_48363_48761_48900_49318_49418_49653_49738_50803
732357	contig_5423_pilon	-	2308	2	Intergenic	novelGene_85267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACGAGTTTTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540246	537750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_539925_540112
732360	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
732361	contig_12050_pilon	+	1240	7	Intergenic	novelGene_62701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	185	946	615676	619138	TRUE	15	CGGCCTGACGTGCCACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWRLGILSTAMAVWKGQLLPSRAPIVLLSGIVGAFAHVSFPIMHREPVFQGLFGQHGASLVQFTEYLHVVLKGLVGLRHDPLFGLQVQVQGIHPGPVELLELLGVVHILKQVELGPLPRAGEFQSPLGHLLQHLAPREVPHVAGVGMGHQQLRLILPHIVDPIHILLGGRGALHLLLPVLTKEVLHVLGQCLLPVQLHGEVQGGEGRVVLVAVSSFLMLPFKKSLTNWVFSARSCASLVPSFRSSERSAILV	615491	659702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_615753_615839_615964_616873_617315_617778_617892_619131_619260_619533_619600_659595
732362	SIRV7	+	274	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAATTTTTATTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	78946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
732363	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732364	contig_9440_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_59076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGTTAGGGAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211390	1210399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1210400_1211400
732370	contig_11253_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_126840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196582	197738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_196600_197700
732371	contig_17198_pilon	+	1611	10	Intergenic	novelGene_62384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	79.4095494459569	301	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	339	1154	1063432	1096458	FALSE	15	GATGTCTTGTCAGAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1047656	1096915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
732377	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732378	contig_14326_pilon	-	1890	6	Intergenic	novelGene_120748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_5	90.1265776560943	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1527	362	1888	561230	537964	FALSE	25	AGATTTTACGGTCCCGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPKVESLYQPLKKDLELSTGPCLPSTPQKAQDPRSAGCDEIHSAFENTSYQKSVLPLKKQPHRTCKRASCQDQVKVGRKLRKIRSSTFLKSSSETIPTKEPRLLSSHAVSVSVQLESETVMPRSSTSHIPKQRAAPCHVLRSLNFRKPTKESALLSKLSILACKLAPATKTQKLRYWRCSSELLPMAKSYKRLRYKRFLDGFSYNTMQLNPYLAASRWDKKPNSNPVALYPLEAIKMSFIDLSNKMPSLLFGTEIFPVSFHMNSGSDCIAEAFRTFPEHCAPARLALGEAPRCPSQPPKWTFSFFFSHGGSGMATFREDTGLQSQAHSQAPPAPLQDSGGTAIVQTRAGFSVLGLHTLLALCSPGCYRIWTKKRSFSSHMPTIQRLFMTQFTQGLKGLRSPASIADKVFCSLPYSVGRVLSIWSQHGPSACPLEMSALHSNHSKWQPSLQPSLGTTSSHTMLPYVPLPGMEAVYSTRGSQMRLEPPFSALVPKSCLVTETAVSKLLLSASEFQVPGFDELDGVTAVCPRPQSSPPEQKEAEPEKRPKKVSQIRIRKTIPKPDPNLTPMGLPRPKRLKKKEFSLEEIYTNKNYKSPPANRCLETIFEEPKERNGTLISISQQKRKRILEF	561591	537961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_538055_539168_539241_556184_556292_556836_557009_557624_557697_560217
732384	contig_10962_pilon	+	2493	11	Intergenic	novelGene_103924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	18.0911580613293	151	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	171	1568	605189	808850	FALSE	20	CAAGGATGCACCTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFDVPQNTSVKIRQDATASLILLWKVTANGFQQCSLIDGRSVTLLQAPGGLVLLEEMLALGHNYFIGFVNDSVTKSIVALRLTLVVKVSNCVPGENHANDVECSGKGKCTTKPSEATFSCSCEDQYVGTFCEEFDACQKKPCENNASCMDADEKQEGSNFTCICPAGYTGELCQSKIDFCILEPCRNGATCVSNLSGFTCQCPEGYLGSTCEEKVDPCASSPCQNNGTCHADGMHFSCSCSPGFTGPACGQLVDFCALSPCAHGTCRSVGTSYKCLCDPGYHGLYCEEEYNECLSAPCLNAAPCRDLVNGYECMCLPDYKGVHCELYKDPCANVSCLNGGTCDGEALNGTCVCTPGFAGEECDIDINECDSNPCHHAGTCLDQPNGYTCHCPHGWVGANCEIHLQWKSGHVAESLTNMPRHSLYIIIGALCVAFILMLIILIVGICRISRIEYQGSSRPAYEEFYNCRSIDSEFSNAIASIRHARFGKKSRPAMYDVTPIAYEDYSPDDKPLVTLIKTKDL	602592	809775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_602627_605052_605220_642021_642168_674584_674739_705615_705730_732726_732952_759801_759925_772764_772879_784828_784961_797269_797517_808738
732386	contig_5236_pilon	+	2769	13	Intergenic	novelGene_100905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	8.57159391374919	148	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	582	2012	89920	114831	FALSE	40	TATATAAGAACTCTGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRRTEEAVAVKIVDMKRAIDCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEQDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRHNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRKEFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSVRITIPDIKKDRWYNKPLKKGTRRPQVASGGVSEPPGGFSKHIQSNLDFSPLNSASSEENVKYSSSQPEPRTGLSLWDTNPSYIDKLVQGISFSQPTCPDHMLLNSQLLGTPGSSQNPWQRLVKRMTRFFTKLDADKSYHCLKETCEKLGYQWKKSCMNQVTVSTTDRRNNKLIFKVNLVEMDEKILVDFRLSRGDGLEFKRHFLKIKGKLSDVVSSQKVWLPAT	88615	115588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_89177_89899_89985_91285_91510_92718_92784_92878_92949_97838_98028_98594_98700_101657_101754_107057_107167_107345_107524_107790_107923_113494_113597_114735
732387	contig_10011_pilon	+	2364	2	Intergenic	novelGene_68121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1444	1887	333300	333743	FALSE	25	GTCATAATTGCATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCILVVGSPTFLSGRQDWEVEVGGKTGWVLGVCKASTSRKGSVALSPENGYWVVMTTMRNEYQASAFPPTHLWSKEPPWRVGIFLDYEAGDISFYNVTAKSHIYTFTCCSSSGPLQPVFSPGTQDGRKNTDPLIICPVCVQGPH	331819	334220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_333256_333292
732389	contig_11318_pilon	-	1607	6	Intergenic	novelGene_48169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_5	10.9434912162436	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	11	763	165460	160482	FALSE	5	GTGGTGTGTTGCTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRMGIAKTPGCATLLPASLFAHSHPAVEDRPGMLCSFQIPSAWSCAWSLNTQANNCFSTGLSRQVLLTNVVTGHQQLFGTSSDVLAQQFAVLAPLLFNGCRSGEIFAIDLRSQSQGKGWKAMRLSHDSAVTSVQILQEEQCLMASDMAGKIKLWDLRTTKCLRQFEGHVNEYAYLPLHVHEEEGIVMAVGQDCYTRIWSLHDAHLLRTIPSPYPASKEDIPSVAFSSQLGGFRGGPGLLMAVRKDLYYFSYS	165470	159637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_160676_162217_162333_162700_162875_163763_163862_163992_164095_165390
732390	contig_12884_pilon	-	1030	9	Intergenic	novelGene_104998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	527.792040011973	3225	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	79	972	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915306	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905761_905834_906224_906349_915235
732395	SIRV6	+	550	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10799_11022_11109_11205
732396	contig_8801_pilon	-	2659	1	Intergenic	novelGene_66319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797185	794526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_794500_797200
732397	contig_7272_pilon	+	2164	5	Intergenic	novelGene_25396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	139.664553484411	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	670	1107	760875	769117	FALSE	20	CTGAATCTACATGTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKVTTDWFSQRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	760205	770174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_760878_763506_763600_766027_766124_767135_767264_768999
732406	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	190	618	116728	117610	FALSE	25	AAACACAGCCTGCTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112113	117773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
732407	SIRV6	+	553	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
732410	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
732411	contig_18970_pilon	-	1347	3	Intergenic	novelGene_157818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_2	76	133	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38994	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31813_33342_33462_38235
732412	contig_5041_pilon	+	1672	4	Intergenic	novelGene_27075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCAACATTCGGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525082	533620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_525658_526413_526496_532091_532242_532755
732414	contig_4654_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_103040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362581	364588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_362600_364600
732417	contig_9484_pilon	+	1447	11	Intergenic	novelGene_105629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	628.117258161245	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	36	1232	95848	103536	TRUE	30	ATGTCATCAGCCAGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVTGVGTVP	95812	104371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101748_101960_102080_103265_103378_103513_103641_104260
732420	SIRV4	+	225	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1546	632	1091	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2546	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
732424	contig_12802_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_114238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCTCCTTTCCACCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37104	36506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_36500_37100
732425	contig_4780_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_65397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGCAGAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318578	319327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_+_318600_319300
732430	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
732431	contig_15084_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_116684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGCAGTCTCCAGATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166659	167610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_166700_167600
732432	contig_7066_pilon	+	1332	8	Intergenic	novelGene_42113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	65.1259376523827	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	135	722	567063	581230	TRUE	30	TATAATTCTCACTGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVINTVDTSHEDMIHDAQMDYYGTRLATCSSDRSVKIFDVRNGGQILIADLRGHEGPVWQVAWAHPMYGNILASCSYDRKVIIWKEENGTWEKTHEHTGHDSSVNSVCWAPHDYGLILACGSSDGAISLLTYTGEGQWEVKKINNAHTIGCNAVSWAPAVVPGNLIDQPSGQKPNYIKKFASGGCDNLIKLWK	566928	585178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_567066_569662_569708_572365_572482_575163_575316_575791_575926_581092_581231_583094_583253_584726
732434	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
732435	contig_15066_pilon	-	1505	11	Intergenic	novelGene_149535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_9	141.055450089672	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	329	1357	114229	111830	FALSE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114636	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114463_114541
732438	contig_2646_pilon	+	1999	9	Intergenic	novelGene_69518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	262.587574677478	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	554020	565383	TRUE	30	TAGAAAACTCGCTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSASSLSGSESSAFSEAVTEPPKRRPEKWTAAIEAHRAVTAARSHERQRRAELRRAGIPFCFQKWKCSWIWEIRKAYPCKVSLQGRFQAFQIKVQVQI	554017	574395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569730_570838_570917_572011_572072_572767_572842_573385
732439	contig_15952_pilon	-	1156	12	Intergenic	novelGene_154043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	25.9720129090037	920	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	81	926	105377	93502	FALSE	5	CTCTCTGGCTCTCGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGRRPEHGGPPELFYDENEARKYVRNSRMIDIQTKMAGRALELLYLPEGQPCYLLDVGCGSGLSGDYLSDEGHYWVGIDISPAMLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKKFYLCLLSGPSSFLPKGLSDQKDGDEERESAFTKERVPHRAARRGMVRKSRDWVLEKKERRRRQGKEVRPDTQYTGRKRKPYF	105457	93271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93708_93799_97043_97103_97395_97442_97625_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102732_102816_102901_102998_105197_105236_105329
732443	contig_15063_pilon	+	1125	5	Intergenic	novelGene_14321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	300	977	35271	36632	FALSE	55	GAAATAAAAATATCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDW	34862	36780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36511_36625
732446	contig_14925_pilon	+	999	5	Intergenic	novelGene_55150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACCAAGTCCCACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25791	44855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_44804
732449	contig_14686_pilon	-	2102	2	Intergenic	novelGene_88070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70879	68013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_68730_69493
732452	contig_6929_pilon	+	640	3	Intergenic	novelGene_139382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4374.5	90	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	74	301	130770	131975	FALSE	5	TTGCCTTTGTGTATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERTRALLAKDSLERTATKRIRKIKMRPKVSSHLNVGTAATSITDADAQKTLNHKMAKRQKQPIHQLRIRPLPRLSRAGLSKCRLTISTIIRFSHPTRRI	101639	132314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101651_130707_130971_131948
732458	contig_9463_pilon	-	1579	9	Intergenic	novelGene_83830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAGAGTCCCGAGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223426	185938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_185966_216046_216108_216586_216626_216768_216845_217424_217460_218618_218670_219237_219290_221964_222219_222442
732464	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732466	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732467	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2818_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732469	scaffold_880_pilon	-	1740	16	Intergenic	novelGene_121394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	276.959636048288	44	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	27	1220	311045	271869	FALSE	30	TTAGATAATGTCATCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQANGAEAEEEEQAEEDCPELVPIETKRREEEEKPGPGAKIPVTIISGYLGAGKTTLLNYILTEQHSKRIAVILNEFGEGSAVEKSLAVSQGGELYEEWLELGNGCLCCSVKDSGLRAIENLMQKKGKFDYILLETTGLADPGAVASMFWVDAELGSDIYLDGIVTVVDSKYGLKHLAEEKAGGLINEATRQVALADLIIINKTDLVPEEDLSQLRTAIRSINGLGKILETQRSRVDLSNVLDLHAFDGLSGISLQKKLQYVSATQPHLDQNIITVTFEAPGNAKEESLNVFIQNLLWEKNVRNKDGHCMEVIRLKGLVSIKDRAQQVIVQGVHELYDLEETPVSWDDDAQRTNRLVFIDRFRKAIYPSASLVPRASTQKLRKESLGYHVCVNARI	311071	271348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_271976_272078_272251_272382_275217_275284_275386_275456_277107_277160_281388_281446_286467_286513_289339_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
732475	contig_20493_pilon	-	1640	12	Intergenic	novelGene_86396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	69.0994013919605	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	370	1614	49119	36446	FALSE	35	TCAGAAAACCTGATTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQWSQGLNVKDSELCLAHSQ	55241	36419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36504_37391_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49252_54457_54665_55211
732477	contig_6163_pilon	-	1509	9	Intergenic	novelGene_103793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_8	264.033112270033	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	357	1112	31751	29418	FALSE	50	GAATAAAATATTTTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYAATRATVKKEFGGGHIKDELFGTVKDDLSFAGYQKHLSSCAAPAPLTSAERELQQIRINEVKTEISVESKHQTLQGLAFPLQPEAQRALQQLKQKMINYIQLKLDLERETIELVHTEPTDVAQLPSRVPRDAARYHFFLYKHTHEGDPLESVVFIYSMPGYKCSIKERMLYSSCKSRLLDSVEQDFQLEISKKIEIGDGAELTAEFLYDEVHPKQHAFKQAFAKPKGPGGKRGHKRLIRGRSENGDDS	50640	29020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_29586_29959_30082_30198_30350_31084_31211_31354_31460_31667_31764_32214_32394_34727_34806_50553
732479	contig_16666_pilon	-	857	4	Intergenic	novelGene_61767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	FALSE	25	CAGGCCGAATCCCAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
732482	contig_15029_pilon	-	1360	6	Intergenic	novelGene_128212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_5	205.057650430312	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	693	1190	235014	233629	FALSE	35	TCTGCCACAAACAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKYPTWRRNLLRRAKEEQMKRFHKAQAIQRRQNEIEVSLKELEAEGTKLELALRSQSTSPEQQKALWLEQLLQLVQKKNSLVAEEAELMITVQELDLEEKQWQLDQELRGYMNREETLKTAADWQAEDRILKKLLDVVHQRDALIRFQEERRLSELASGMAAQG	235992	233458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_233778_234224_234299_234399_234500_234712_234807_234933_235048_235333
732484	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_97514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732489	contig_17198_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_62368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815413	814124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_814100_815400
732491	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_93515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732496	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2707	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732498	contig_7412_pilon	-	1832	7	Intergenic	novelGene_76308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1566.35923402009	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	47	1543	377290	364445	FALSE	20	GAGGACGAGGTCTACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377336	364155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373516_375294_375801_377239
732501	contig_15353_pilon	+	799	5	Intergenic	novelGene_151988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	971	junction_1	5747.62478659663	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	747	52	798	531865	533811	FALSE	25	TAAGTTGTCTAATTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRALAEIAKAELDDTPMRGRQLRVRFATHAAALSVRNLSPYVSNELLEEAFSQFGPIERAVVIVDDRGRSTGKGIVEFASKPAARKAFERCSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEKLAQKNPMYQKERETPPRFAQHGTFEYEYSQRWKSLDEMEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLMRRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRMGYMDP	531813	533812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_532116_532207_532304_532973_533171_533269_533355_533693
732502	scaffold_6394_pilon	+	944	8	Intergenic	novelGene_111019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1197.51932369054	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	231	734	403262	405843	TRUE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFCSRTPASWYPHSPPRLPRPATWRRCTWMRRPSAGCTTRTRWPWRSSQTGSAGSQRMP	402117	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402234_402880_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405346_405451_405501_405717_405864_406086
732505	contig_11417_pilon	+	2105	2	Intergenic	novelGene_103277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	53	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCCCTTATCCCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331905	334218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_333489_333696
732507	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732508	contig_13501_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_169057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	466	909	14989	15432	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHTITTASTSVSPEELDGARLPAPTSVVGITVRIPDRAGEKYRTKFRFTKEDQTYCLTETEGTWTLWALDTLLTQNWSHSRSSLFSQRLHRSIKRTVTPVRNKLCSVMQMRPNVQLLPKSKDKKARRDRKMRQMEMGNPGWKRGEC	14523	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_14500_16400
732511	contig_1694_pilon	-	3344	1	Intergenic	novelGene_144922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTTATGAAGATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432152	428808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_428800_432200
732515	contig_5484_pilon	-	1485	11	Intergenic	novelGene_151081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCGATGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342210	48597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_48855_137525_137718_201594_201679_238749_238861_246563_246682_250604_250683_263865_263965_302317_302414_318733_318924_333536_333635_342048
732516	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732517	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732523	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732524	contig_12229_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_169393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAACAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101081	103120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_101100_103100
732530	contig_16125_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_155250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATCCACATCATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138120	138938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_138100_138900
732533	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
732534	contig_3956_pilon	-	2127	2	Intergenic	novelGene_14749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	4	603	795850	795176	FALSE	40	AATAAACTTGAGTTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMSKPSFMARAGCPRDAQSPVGTLVSKLSERSSMSSSFRPCRSPPRTLNLLLSRCSLSNRSGPLRRSEGKTSSWLSPRSRICKAVRLASSPGGSIWRRFPDRSRYARAFKPFSHKALRTSRQFSFSTRVWRAAEAWKRPAGSWDRALWVRSSTFSWGTGSRNSAERFSSRLLERCNSWRLEAPWRMLAGSWVRLKNSTAR	795853	793651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_795657_795731
732546	contig_8420_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_69367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGATTTCACACTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228491	227486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_227500_228500
732548	SIRV4	-	268	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
732554	contig_7321_pilon	-	1274	10	Intergenic	novelGene_53140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	190.465511605411	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	38	1015	208319	172267	TRUE	5	TGTCCCTTTGCTGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEIPRKRSRQTMGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTV	208356	169524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_169617_172099_172272_173563_173702_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
732555	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732560	contig_9313_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_86489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	133	414	463910	464191	NA	60	AGAAAAAGATATTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKSLGKQTATSFSCGVAGRLELLTFWLAADCFNHCATRAPTKWKMLNYYHSYTISTLHLAFIFDQQRNTRDQVQPILYLLCARSIVCDIYPVPRLCGVPSYCPWDHIVFREYCVFICTILPAEFQTRKNDFLVPFFN	463777	464806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_463800_464800
732561	contig_1735_pilon	-	1028	6	Intergenic	novelGene_106896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGGGAGGCTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139771	131700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_131841_132234_132487_134144_134417_136623_136760_137702_137785_139625
732568	contig_7426_pilon	-	2225	16	Intergenic	novelGene_27466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	93.2479132921125	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	433	1971	654875	637491	FALSE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNNEVNSGKGHALLIPDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	668291	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642373_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652872_654838_654910_655926_655980_656986_657054_659250_659432_668194
732575	contig_10300_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_152928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAAAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126697	127427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_126700_127400
732576	contig_3077_pilon	+	1384	6	Intergenic	novelGene_26644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3312.91536867455	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	70	891	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGLWAGPDGSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRLDNTLRGDFGPRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9606	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9722_11276_11488_12992_13171_13863_13986_15137_15262_17449
732583	contig_9150_pilon	-	1938	3	Intergenic	novelGene_140907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_1	35	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	436	1305	47776	46907	FALSE	45	AATAAAATTTGTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRKQGSQTRGQQSAEEDNFKKPTRSNMQRSKMRGAASGKKTAGPQQKNLEPALPGRWGGVALQRTPPSGSVRKTRKNKQKTPGNGDGGSTSEAPQPPRKKRARADPTVESEEAFKNRVEVKVKIPEELKPWLVEDWDLVTRQKQLFQLPAKKNVDAILEEYANCKRSQGNVDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILMAHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLGYLHDFLKYLAKNSAALFTASDYKVASAEYHRKAL	57991	46273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47801_49153_49253_57679
732584	contig_4754_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_35973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGAGATATATTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455332	453025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_453000_455300
732585	contig_13051_pilon	-	2484	5	Intergenic	novelGene_140122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGCTGGAACCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423597	389052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_389618_402640_402773_410937_411075_419902_420018_422062
732590	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_96489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653788	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732592	contig_5302_pilon	-	1495	3	Intergenic	novelGene_81490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTAAAATACAGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338252	333567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_334056_336228_336288_337304
732594	contig_513_pilon	-	1970	9	Intergenic	novelGene_80174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	507.647500116961	1	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	145	1311	453421	449687	FALSE	50	TAAATAAAAAGTTTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454719	449027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450911_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454596
732598	contig_14513_pilon	+	1159	3	Intergenic	novelGene_70350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	85	312	11375	11602	TRUE	55	AGGGGAAAGTAAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLNLLFLYIKNKVQNSSSKEGGFREYKMEGFKVVIWLRNTLSGHGRSPWVVQMVKCSSANQRVGDSSPLRSASVERPCDLLLKSSHENPVEHSSTLTQMGSP	11290	19066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_11678_11728_12112_18677
732599	contig_14467_pilon	+	1956	10	Intergenic	novelGene_138272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	182.946527976798	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	212	1456	369732	387086	FALSE	65	TTCATTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGNKPTLTLGTNTNTSNFGTYKKQV	352135	387586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889_385028_386924
732602	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732604	SIRV2	-	353	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	714	4	-714	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCATCCAGTAGACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
732610	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	14	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732611	contig_14415_pilon	+	994	6	Intergenic	novelGene_77599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	192.213839252016	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	169	534	33410	37984	TRUE	15	AACCTTCGTAGTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWVTAFKSTRSQGQKTPDKAESFLPSENFQCGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	25119	46883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_25210_33331_33446_35937_35993_36102_36199_37805_38022_46460
732614	contig_2710_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_161797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAACGACTTGGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084826	1087438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1084800_1087400
732617	contig_7976_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_169404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712361	710318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_710300_712400
732618	contig_13760_pilon	-	3208	2	Intergenic	novelGene_61368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	114	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	184	1167	463757	460966	FALSE	45	TAAATAAAGTTTTATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPAKKRKMNFSEREVEIIVEELELKKHLLVNHFNAGVPLAAKSAAWHSILRRVNAVATCRRELPEVKKKWSDLKTEVRRKVAQVRAAVEGGEAPGPTEEDGAGGPGTGGGSGSGGPTVAPVLLTPMQQRICNLLGEATIISLPTTTEIHPVALGPTATAAAATVTLTQIPTETTYHTLEDGVVEYCTTEAPPPLPAEAPVEMMTQHADTSVKPQALKSRIALNSAKLIQEQRVTNLHVKEIAQHLEQQNDLLQMIRRSQEVQACAQERQAQAMEGTQAALSVLIQVLRPMIKDFRRYLQNNTPNPTPASDPGQVAQNGQQDSIIQ	463940	458924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_461439_463246
732625	contig_10197_pilon	+	2569	1	Intergenic	novelGene_115326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAAAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1621221	1623790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1621200_1623800
732628	contig_723_pilon	+	1852	7	Intergenic	novelGene_169429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	98	junction_3	138.679486586878	524	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	50	865	4670	18540	FALSE	25	GCAATCTGTCTGGCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWGDRDHARRKETTVLMASADSQRVRDGGGAGGAFQPYLDSLRQELQQRDPTLLSVVVALLAVLLTLVFWKFIRSRRSSQRAVLLVGLCDSGKTLLFVRLLTGLYRDTQTSITDSSAVYRVNNNRGNSLTLIDLPGHESLRLQFLERFKASARAVVFVVDSATFQREVKDVAEFLYQVLIDTMGLKNAPSFLIACNKQDIAMAKSAKLIQQQLEKELNTLRVTRSAAPSTLDSSSTIPTQLGKKGKEFEFSQLPLKVEFLECSAKGGKGDSGPADIQDLEKWLAKIA	4620	19527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_723_pilon_+_4824_5663_5759_6639_6718_9541_9625_14127_14265_15645_15701_18326
732629	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732630	contig_13780_pilon	-	1221	6	Intergenic	novelGene_149020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	24.4081953450066	671	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	121	675	439784	433545	FALSE	30	ATACTCATCAACACTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCDTKFDFITRKHHCRRCGKCFCDRCCSQKVPLPRMCFVDPVRQCAECALVSQREAEFYDKQLKVLVSGATFLVTFGKSETPETMVCRLSNNQRFLVLDGDGHYEIEITRISTMRILTEGLPPGGGSMRASGMLLQYTVPGAEGVTQLKLTAGEDANTSKRPAVAWLAAMHKAAKLLYESRDQ	439904	432998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_433581_433682_433826_436534_436627_436728_436805_437621_437791_439745
732632	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_94781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
732633	contig_9771_pilon	+	1724	8	Intergenic	novelGene_156918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCCACCGCGGCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332013	350144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_332831_334728_334806_338905_339023_339573_339758_341992_342198_346911_347064_347656_347752_350067
732642	contig_1443_pilon	-	1205	8	Intergenic	novelGene_28328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	255.965080526582	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	185	1108	776427	748649	FALSE	20	CAGCACATGCTCACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809526	748551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776485_809399
732643	contig_5514_pilon	+	1347	6	Intergenic	novelGene_75278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	327.845695411729	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	662	1204	66595	68726	FALSE	15	TTGGACCTGTGAGTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	61077	68869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65535_66147_66389_66493_66640_67535_67662_68354
732645	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_95033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732646	contig_12786_pilon	-	1457	10	Intergenic	novelGene_103414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	986	junction_8	378.327345359695	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	464	1399	614067	590909	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629443	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
732648	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_93632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732653	contig_12864_pilon	+	1108	4	Intergenic	novelGene_76395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	796.668200835343	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	63	377	225015	228082	TRUE	15	CATTCAGCAGTTTCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSRFLVGLILAALILQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRSMCLLDPLGWNGWGLCI	224952	229312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225070_227822_228623_228901_228946_229165
732656	contig_17470_pilon	+	2095	5	Intergenic	novelGene_110474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	42.9301758673314	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1143	1790	88138	89971	FALSE	20	TCCCCCTAAAGGCTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAFDYIEFTRSLFVN	86995	90276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88983_89845
732657	contig_5643_pilon	-	2240	2	Intergenic	novelGene_38885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_1	0	254	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1331	1663	240210	239878	FALSE	15	CGTTTGTGTCACTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGGGSQRGTALVPPHQAWPQGLGAPFLASPLASTGLWGLELGLALPFPGDSHHSPDSPPSMRGCLLLSHLRMLPDCNVAPDLCIRNVLALPSILWPRASSLSLIPYWC	242194	239300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_240378_241031
732658	SIRV6	+	444	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8843	15	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
732662	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	3	412	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732663	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732668	contig_11396_pilon	-	2201	7	Intergenic	novelGene_71275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_6	690.121346012585	1	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	144	764	249053	232299	FALSE	20	AAAACCCTCTTCGGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249196	230861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
732670	contig_3077_pilon	+	1342	6	Intergenic	novelGene_26611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2200.48527375213	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	419	844	15160	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9532	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11475_15137_15262_16144_16328_17449
732671	contig_935_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_45536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAGAAAAGAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288320	290192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_288300_290200
732672	SIRV6	+	552	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_3065_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732673	contig_4364_pilon	+	334	3	Intergenic	novelGene_255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	252	81	332	1530895	1531225	FALSE	25	CTGGCACCACACTTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAAGPCSFSSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEK	1530444	1531227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
732676	SIRV7	-	764	5	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	117	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147801	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114961_147608
732680	contig_8683_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_150243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452106	449782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_449800_452100
732685	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_89353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
732692	contig_7249_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_169435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30308	29437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7249_pilon_-_29400_30300
732695	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732696	contig_10176_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_72713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAAAAATCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252428	254260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_252400_254300
732697	contig_18055_pilon	+	1675	9	Intergenic	novelGene_117819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	302.410498122998	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	671	1105	78006	80793	TRUE	70	GAGAAAGAAGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40694	82128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_63067_63116_73607_73719_75199_75383_77932_78311_80663_81306_82070
732698	contig_3956_pilon	-	1982	9	Intergenic	novelGene_14713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_2	50.4870032780715	153	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	9	1841	263832	210770	FALSE	15	TTTTGCCTAGTCAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGGLVGKGRDISLAALQRHDPYINRIVDVASQVALYTFGHRANEWEKTDVEGTLFVYTRSASPKHGFTIMNRLSMENRTEPITKDLDFQLQDPFLLYRNARLSIYGIWFYDKEECQRIAELMKNLTQYEQLKAHQGAGAGVSPMILNSGEGKEVDILRMLTKAKDEYTKCKTCSEPKQITSSSAIYDNPYLIKPIPVKPSENQQQRIPQPRQTLDPEPQHLSLMALFGKQDKATCREIVEPPQTFHQQQQQEKLPVRQGVVRSLSYEEPKRHSPPLEKQLCPAIQKLMARSADLQPLSELPENRPCENGSPRSAREIFPRLVQPACSHNIGMSHCVQSASRAQSLLEKLQSAPGAEMKYDTSTPGPSSSAAPNFSRTLTAATPVAPGKALAQPQLVYFNGSLPPETLGHQAPGKEQSAFPRTTLPLSCNQTSSCGVVSPQELLRKLQIVQQEQQLHASNRPALAAKFPAVTQSSRTAKPLESWIDKTSSTERQAPLFQVISPQRIPATVTPSLLMSPMVFTQSTSAPSKERDSGLLPLGSQEPTAASTSLFLPLKNPEPPAITSSPLTKLQLQEALLYLIQNDDNFLNIIYEAYLFSVTQAAVKKTM	263840	210628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_210851_213273_213523_216315_217174_219227_219357_225834_225971_228139_228207_251156_251285_257133_257175_263688
732701	contig_17753_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_105096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGGAGAAATAATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112073	110371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_110400_112100
732704	contig_10003_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_88214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAGGGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538171	539592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_538200_539600
732705	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
732709	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732710	contig_5988_pilon	-	1518	11	Intergenic	novelGene_16048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76.8268182342598	144	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	229	1188	1050018	1042318	FALSE	20	GGTAGTTTCTTTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLKTSSPSSGPRLPRSHRSEGWWQTPGP	1052653	1041987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042397_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1051477_1051541_1052598
732711	contig_20507_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_164205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTGAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56911	59040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_56900_59000
732713	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
732714	contig_11429_pilon	+	1115	6	Intergenic	novelGene_60469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	804.609818483468	4	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	21	491	46162	48504	TRUE	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKFTAMSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	46141	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47552_48443_48530_48899
732715	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732718	contig_3818_pilon	+	2670	8	Intergenic	novelGene_99204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	21.7415242692646	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	84	1046	104065	132090	FALSE	55	AAAATATGTGGCATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLGSGQGPRQVGAGQTFEYLKREHSLSKPYQGVGTGSSSLWNLMGNAMVMTQYIRLTPDMQSKQGALWNRVPCFLRDWELQVHFRIHGQGKKNLHGDGLAIWYTKERMQPGPVFGNMDKFVGLGVFVDTYPNEEKQQERVFPYISAMVNNGSLSYDHERDGRPTELGGCTAIVRNLHYDTFLVIRYVKRHLTIMMDIDGKHEWRDCIEVPGVRLPRGYYFGTSSITGDLSDNHDVISLKLFELTVERTPEEEKLHRDVFLPSVDNMRPPETIHPSVFARASVRLRSFPWKCRWKRLPCLAFLSPFHSLSSLSAT	103981	133714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_104177_105296_105416_109008_109127_109882_109966_125832_125995_126082_126198_131001_131122_131956
732720	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_94283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732721	contig_5039_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_65063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACGTCTGCTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1840842	1841288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1840800_1841300
732723	contig_5258_pilon	-	1456	12	Intergenic	novelGene_100231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	65.2614576242338	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1260	197	1456	227517	70948	FALSE	25	GTGAAGTAATATGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLRVFAYDHCFWSMDESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGLFARTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKNIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKSPELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYLK	248762	70947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_71083_75784_75896_97662_97876_112359_112472_113950_114064_116236_116372_117308_117397_120813_120995_122677_122771_124268_124330_227499_227605_248653
732724	contig_7171_pilon	+	992	9	Intergenic	novelGene_101338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	100.678867569118	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	42	491	1301684	1313824	TRUE	15	CTTATCTTTGTCCCATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRPPDAYSRSSVRMAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQAWTSSPPVTSATVPRTRSSR	1301642	1315409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1313328_1313367_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874_1315026_1315204
732730	contig_6946_pilon	-	1786	14	Intergenic	novelGene_59753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	37.6448681054212	198	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	124	1653	113029	85447	FALSE	25	TGGTAAATGTTGGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSRNEEVVGLAAKQSRIRNISNTVMKVKQILGRSSDDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVARLIFSKMKETAQSALGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAAGAAGFNVLRLIHEPSAALLAYGIGQDSPTEKSNILVFKLGGTSLSISVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLMNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARFELLCSPLFNKCIEAIRELLEQSAFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPDVELLNSVPPDEVIPIGAAIEAGILTGKEKLLVEDSLMIECSAKDILIKGVDESGADRFTVLFPSGTPLPAQRQHTLQAPGSISSVCLELYESEGKNSAKEENKFAQVVLQDLDRKENGLRDILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAITIEVAS	113152	85313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_85526_86274_86346_88713_88888_89349_89563_94179_94283_96975_97132_98428_98591_100115_100221_101142_101234_102515_102622_102756_102806_111802_111886_111959_112041_112972
732738	contig_7171_pilon	-	1508	9	Intergenic	novelGene_101385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	291	junction_1	871.657320496421	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	37	1215	1371664	1363653	FALSE	35	AAATAACTAGAGCGCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKPTRLNVFKNDQDTWDYTNPNLSGQGDPGSNPNKRQRQPPLLGDHPAEYGEGRGFPSVDSRGSCAPARRPPRKFSPVLPLFPSHPPGGPHGGYHSHYHDEGYGPPPPHYEGRRMGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1371700	1363359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367306_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654
732740	contig_5338_pilon	+	1956	10	Intergenic	novelGene_114568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	41.7544260979053	250	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	43	1680	356954	360655	FALSE	10	GCTCCGGGCTGCCCCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEVYKVRHRQSGQIMVLKMNRLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWTIRLHLALDIARGLRYLHDKGIFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCSMEPGARAPFTEITQHLEWILEQMPEPALLTKAPLTHNQGSLPRWGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPGSPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVAPLPLVPPSPLSSTHLPLVTTPETLVQPGTPVRRCRSLPSSPELPRRMETALPGSGPPPVGPSAEERMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSAQPWSSQSGPPLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSVPRETDEGLPCPGCCLGPFSFSFLSMCPRPTPAVARYRNLNCEAGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS	356768	360931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_356784_356926_357049_357161_357211_357757_357905_358257_358341_358523_358615_358848_358933_359087_359178_359324_359440_359771
732744	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
732745	contig_17964_pilon	+	2486	7	Intergenic	novelGene_33915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	648	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1987	2406	431407	473048	FALSE	10	ACTGGGGACTGGGCTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQFIHRTYLMFCMNVIPSRPSMFAIIIAASTTSSSPKLLTMLPLKEVVHHSVVLGTACNSYRSWDRAGVCPSCKSLICSWLWLRLRPCSRCQNNRHVGISWFLRVMFQVGAERVLPKHCFSLQDTCNAHSTNTGGALG	396058	473128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_397665_397867_397914_411235_411414_412386_412501_431364_431430_468565_468941_473026
732746	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732747	contig_12620_pilon	+	3319	18	Intergenic	novelGene_98813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_14	188.923576207573	116	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	221	2644	438129	574046	FALSE	30	ACTTGGAGATGAGTAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEYEALYNFTHFNPVQTQIFHTLYHTDCNVLLGAPTGSGKTVAAELAIFRVFNKYPTSKAVYIAPLKALVRERMDDWKVRIEEKLGKKVIELTGDVTPDMKSIAKADLIVTTPEKWDGVSRSWQNRSYVQQVTILIIDEIHLLGEERGPVLEVIVSRTNFISSHTEKPVRIVGLSTALANARDLADWLNIKQMGLFNFRPSVRPVPLEVHIQGFPGQHYCPRMASMNKPTFQAIRSHSPAKPVLIFVSSRRQTRLTALELIAFLATEEDPKQWLNMDEREMDNIIGTLRDSNLKLTLAFGIGMHHAGLHERDRKTVEELFVNCKVQVLIATSTLAWGVNFPAHLVIIKGTEYYDGKTRRYVDFPITDVLQMMGRAGRPQFDDQGKAVILVHDIKKDFYKKFLYEPFPVESSLLGVLSDHLNAEIAGGTITSKQDAMDYITWTYFFRRLIMNPSYYNLGDVSHDSVNKFLSNLVEKSLVELEHSYCIEIGEDNRSIETLTYGRIASYYYLKHQTVKMFKEHLKPECSVEELLSILSDAEEYTDLPVRHNEDHMNSELAKCLPIEVNPHSFDSPHTKAHLLLQAHLSRAMLPCPDYDTDTKTVLDQALRVCQAMLDVAANQGWLVTALNITSLVQMVVQGRWLKDSSLLTVPNIEQHHLHLFRKWKPVIKGPCAGYHGPIECLPELIHACEGKDHVFGSIVQSELQPAKVKQAWNFLSRLPVIDVSLSIKGWWNDSGEGQNELSIPTLVSDKRDDNKWIKLHADQEYVLQVSLQKVHIGFQKGKQDSSAVTPRFPKLKDEGWFLILGEVDKRELIALKRVGYVRNHHVTSISFYTPELPGRYIYTLYLMSDCYLGLDQQYDIYLNVAPASISAEVNMEVSDA	436516	574721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_436695_438086_438173_439923_440091_440199_440346_440471_440593_443051_443195_457458_457597_457682_457804_458758_458892_461809_461936_482144_482257_482451_482587_543440_543666_565206_565359_567054_567203_571226_571437_573653_573830_573919
732749	SIRV4	-	271	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1252	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3906	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
732750	contig_9313_pilon	+	1248	5	Intergenic	novelGene_86473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1052.16978192685	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	127	450	387329	461613	TRUE	50	AAAGGGGAATAAATTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387202	464789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601_462038_464415
732751	contig_15063_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_14433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
732753	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_94499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657496	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657497	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732757	contig_2704_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_75305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAAAAGACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200069	199787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_199800_200100
732758	SIRV5	+	502	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	1	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	34	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGTGGTTTATAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3389_3494
732760	contig_6424_pilon	-	919	4	Intergenic	novelGene_109248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	307.840867982144	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	26	775	21039	5841	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVPWAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMVSSDPRQSAVPTRLLTHQMRPTTPLQAQRARVRWPTGTEARPAPADPTGAVSPSSCLRGHSRDAHDLPFSDLRWNMSSHSPSQRLPAATAWRGQKPPCTPTPCTYLPQIFQAFPPLHHLTSPQAGNHNLCPHCLPLSCSVQASDQTMPEPGRIRYLWASDAPCPLLTPYLSGLSAEALIALGQAQPRGIAAWE	21064	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_9173_9280_12062_12098_21012
732761	contig_9415_pilon	-	2063	11	Intergenic	novelGene_109807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.203759566042	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	169	1203	1819921	1755950	TRUE	20	TCACACTGATTTTTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEPGARREDVLAAATGSAHAVQVRAPPPRALRDPRVTKSGSRGAAGASESPSLPKMPHRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPLNGSKWTYVGPDGERSWSKKYSSCGGLMQSPIDLHSDIIQYDASLVPLEFQGYNVSANEQFILTNNGHSVKLSLTPNMYLLGLPFRYSATQLHLHWGDQSNPHGSEHTISGRHFAAELHIVHYNSDLYPNASTASNKSKGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQDVKYKGQEVPVPGFNVKELLPERPEEFYRYMGSLTTPPCNPTVVWTVFRNPVQISAEQLLALETALYYTHVDDPSRKEMVNNFRQVQKLDERLVYVSFRQGIILSVVLAGILGICIVLGVFIWLFRRKKSKKGDSNKGVIYKRAIKKETEAHS	1820089	1753703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1754078_1755463_1756023_1756786_1756875_1770109_1770237_1771929_1772088_1772616_1772681_1773499_1773596_1776039_1776183_1777877_1778058_1811720_1811742_1819836
732763	contig_13787_pilon	-	1836	7	Intergenic	novelGene_40624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	717.52855150316	2	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	323	664	205032	175089	TRUE	35	AGTCTATAAAATCAGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEV	205354	158368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175093_179760_179838_183751_183890_189120_189184_204972
732764	SIRV6	+	546	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	19	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732767	contig_3233_pilon	+	2258	2	Intergenic	novelGene_56595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925167	959914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_925257_957745
732768	SIRV6	+	315	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8114	2	625	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTATGAGTAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
732772	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732774	contig_6048_pilon	-	2528	10	Intergenic	novelGene_73222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	34.2099545111408	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	376	2109	1645874	1609163	FALSE	40	TAAATGCCCAGTAGCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661999	1608743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
732775	contig_756_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_134778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAAAAAACTTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185866	186610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_185900_186600
732785	SIRV6	+	564	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11037_11109_11205
732786	contig_12409_pilon	-	2238	6	Intergenic	novelGene_169437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.2677595261302	280	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	96	665	137558	117946	FALSE	10	TTCCCACTAGTGTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQGGGVATISRQALPGIQVSGARSEVFTVAVMVRRLNCIVAVSQNMGIGKNGDLPWPPLRNEFKYFQRMTTTTTSSEEGKQNLVIMGRKTWFSIPEKNRPLKDRINLVLSRELKEPPQGAHFLAKSLDDALKLIEQPELENKVDMVWIVGGSSVYKEAMNHPGHLRLFVTRIMQEFESDTFFPEIDFKKYKLLPEYPGVLSDVQEEKGIKYKFEVYEKND	137653	116372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_-_118025_121294_121411_124718_124846_134609_134716_137072_137129_137472
732787	contig_12078_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_74141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGTACCATATCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875715	873464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_873500_875700
732788	contig_5549_pilon	-	1411	9	Intergenic	novelGene_81637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	373	junction_1	615.642702791156	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTACTTTGTACCGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445636	441738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442315_442504_442535_442879_442936_443118_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
732795	contig_5317_pilon	+	939	3	Intergenic	novelGene_76549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	13	423	35282	43326	FALSE	10	TACCTGTTTTTGGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSTMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35269	43842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
732804	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732807	contig_7440_pilon	-	1390	11	Intergenic	novelGene_61163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	390.321008914457	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	75	941	74491	54265	FALSE	15	CTGAATTATGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56299_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
732811	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
732813	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
732816	contig_10792_pilon	-	2194	11	Intergenic	novelGene_161000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	31.2136188225588	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	112	1338	128480	92213	FALSE	35	CTGCTCGAACTAATAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSLAYRDDMFAEWTEMAHERVPRKLKCTFTSPKTPEHEGRYYECDVLPFMEIGSVAHKYYLLNIRLPVNEKKKINVGIGEIKDIRLVGIHQNGGFTKVWFAMKTFLTPSIFIIMVWYWRRITMMSRPPVLLEKVIFALGISMTFINIPVEWFSIGFDWTWMLLFGDIRQGIFYAMLLSFWIIFCGEHMMDQHERNHIAGYWKQVGPIAVGSFCLFIFDMCERGVQLTNPFYSIWTTDVGTELAMAFIIVAGICLCLYFLFLCFMVFQVFRNISGKQSSLPAMNRVRRLHYEGLIFRFKFLMLITLACAAMTVIFFIVSQVTEGHWKWGGVTVQVNSAFFTGIYGMWNLYVFALMFLYAPSHKNYGEDQSNGDLCVPSDEERQPTTTITHVDGPTEIYRLTRKKAQE	151658	91356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_92323_102219_102374_111253_111338_112633_112778_114739_114804_115152_115251_116733_116903_120172_120310_121596_121759_128375_128501_151567
732819	contig_501_pilon	+	1051	7	Intergenic	novelGene_134904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	29.044027881056	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	302	1051	793438	808589	FALSE	30	GTACGTTGTTTCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIRHSEQTLRTALISKTPALVLQYENLDAGERRLMNEAFQPNSALFEPITLHSQSDWITSHPEAPQDFEQFFNDAKRKTPSPEKCNIYIQSIGSLGNTRIISEEYIKWLKGYCEAFFYGLTVKLLEPIPVSATRCSFRVNDNTKNLQIHAGDILNFLKRKKPENAFCVVGITMIDLYPRDSWNFVFGQASLTDGVGIFSFARYGSDFYSSHYEGKVKKLEKSSSSEYSVFDNYYIPEITSIFLLRSCK	791727	808589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_791770_792225_792395_792607_792698_793437_793721_794083_794258_794349_794479_808425
732822	contig_12402_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_133378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	626650	626961	NA	35	ACAGTCAGTACACATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTVLLRCEVSFASVGVLPGPVLLSRGLRGLLPVSCAVLVSLPYLGCSRAARLPGAVLCPGPSPVAAAATFLPPPPGWRTRPPCLRPPGPQFSARPVSRCINR	626647	628274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_626600_628300
732825	contig_5423_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_85188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAAACTTAATTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194885	194175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_194200_194900
732830	contig_11594_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_80897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132842	133584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_132800_133600
732838	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
732845	contig_6837_pilon	-	2000	15	Intergenic	novelGene_149839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_14	27.0812270243218	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	407	1327	101381	96665	TRUE	10	CCAGTGACTCCTTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRRRTNSGGARASVALNEIKRVNNGNITTEDSPPAKKTRRCQKQGVRKEPVAGGKTDNYDKTEDKKESVKTLLLKGKAPVDPECTVKVGKAHVYCEGNDVYDVILNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGKTGQHSLVTCSGDLTKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQGEEETKEEESLKSPWKPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMVEMKYDTKKAPLGKLTEAQIKAGYQSLKKIEGCIRAGQHGRALTEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTEKELSEKVQLLEALGDIEIAIKLVKTELQSPEHPLDQHYRNLHCALHPLDHASDEFKVISQYLESTHAPTHSDYTMTLLDVFEVEKEGEKEAFREDLHNRSESTLSLERQSLSSLLSRPCLKCSCGNYGGG	106332	95303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_95572_95689_95815_96053_96153_96483_96890_97159_97295_97375_97440_98218_98358_98583_98747_99760_99864_100474_100551_101365_101463_103060_103112_103734_103806_104284_104450_106294
732846	contig_12178_pilon	+	1301	9	Intergenic	novelGene_156536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	20.0296654989543	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	77	1222	8264	64734	FALSE	45	TGGAAAATAGAATTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETASVCSGSLDGVEYSRRKEKGIVKMTMPRTLAFCYLSLLWQRETITLSDLLRFVEEDHIPYINSFQHFPEEMKLYGRDKGIFAIESWPDYEDIYKKIIEVATFLDLPRFPDITEDCCLHPNILCMKYLMEVNLPDEMHNLTCQVVKLTGIGEVDFLTFDPIAKMAKTVKYDIQAIAIIIVVLKLLFLLDDNLEWSLSNLAEKHNEKNKEDKPWFDFRKWYQVMKKTVDEKKQKWEEARAKYLWKSEKPLYHSSIDKSVVYKRREMVVNLQKQFSTLVDSTPTVEKKSPSSFQFNWSEEDTDRTCFHGHSLQGILKKKGQLLTTKNSLYWLSTQKFCKSYCKHVTTYEESNYSLSYQFILNLFSFLLRIKTSFLHEEVSLVEKRLFKAKYSKIKKKSSRSKKVRRY	8187	64813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_8347_14071_14172_36645_36794_40503_40682_41472_41520_46023_46115_51584_51656_57564_57788_64529
732849	contig_14209_pilon	+	1959	3	Intergenic	novelGene_88362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	222.5	29	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1182	1616	40116	40625	TRUE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLALFPLQLSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	38934	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_40344_40418_40859_40901
732851	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732854	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732855	contig_5643_pilon	+	3059	20	Intergenic	novelGene_38964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	40.2843081703601	2	90	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	36	2453	535274	547349	TRUE	15	CTAACTTGTGTCCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSEEALLSVLPTIRVPKAGDRVHKDECAFSFDTPESEGGLYICMNTFLGFGKQYVERHYNKTGQRVYLHLRRTRRPKEEDTTTGTGDPPRKKPTRLAIGVEGGFDLTEEKFEYDEDVKIIILPDYLEIARDGLGGLPDIVRDRVTSAVEALLSADSASRKQEVQAWDGEVRQVSKHAFNLKQLDNPARIPPCGWKCSKCDMRENLWLNLTDGSILCGRRYFDGSGGNNHAVEHYRETGYPLAVKLGTITPDGADVYSYDEDDMVLDPSLAEHLSHFGIDMLQMQKTDKTMTELEIDMNQRIGEWELIQESGVPLKPLFGPGYTGIQNLGNSCYLNSVVQVLFSIPDFQRKYVDKLERIFQNAPTDPTQDFSTQVAKLGHGLLSGEYSKPALESGNGEQVIEQKEVQDGIAPRMFKALIGKGHPEFSTNRQQDAQEFFLHLINMVERNCRSSENPNEVFRFLVEEKIKCLATEKVKYTQRVDYIMQLPVPMDAALNKEELLEYEEKKRQAEEEKLPLPELVRAQVPFSSCLEAYGAPEQVDDFWSTALQAKSVAVKTTRFASFPDYLVIQIKKFTFGLDWVPKKLDVSIEMPEELDISQLRGTGLQPGEEELPDIAPPLVTPDEPKAPMLDESVIIQLVEMGFPMDACRKAVYYTGNSGAEAAMNWVMSHMDDPDFANPLILPGSSGPGSTSAAADPPPEDCVTTIVSMGFSQDQALKALRATNNSLERAVDWIFSHIDDLDAEAAMDISEGRSAADSISESVPVGPKVRDGPGKYQLFAFISHMGTSTMCGHYVCHIKKEGR	535238	548571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_535385_538205_538332_538905_538973_539162_539297_539445_539592_539856_540042_540490_540586_541291_541486_542249_542322_542641_542730_542870_542997_543499_543654_543988_544164_544781_544871_545512_545636_546216_546361_546440_546587_546804_546959_547260_547370_547985
732856	contig_16122_pilon	-	2006	4	Intergenic	novelGene_134554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.609863517051	50	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	171	554	282755	282038	FALSE	10	TGAGTGCTTGGCATGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVQGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGIWSLSSHGCRAGGWAWVLLPNGDVSVP	283331	280585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_282282_282524_282649_282739_282777_283182
732861	contig_8673_pilon	-	3034	23	Intergenic	novelGene_129906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	58	junction_4	49.3256173699389	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	947	2844	100	2943	179239	117250	FALSE	30	GGGTCAGCCCTTCAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKIINFAPSLLRIIVSDHVEFPVRQAAAIYLKNMVTQYWPDREPPPGEAIFPFNIHENDRQQIRDNIVEGIIRSPDLVRVQLTMCLRAIIKHDFPGHWPSVVDKIDYYLQSQSSGSWLGSLLCLYQLVKTYEYKKVEEREPLIAAMHVFLPRIQQQIIQLLPDSSHYSVLLQKQILKIFYAFVQYALPLQLMNNQTMTEWMEIFRTIIDRTVPPETLQIDEDDRPELVWWKCKKWALHIVARLFERYGSPGTVTKEYFEFSEFFLKTYAVGIQQVLLKILDQYRQKEYVAPRVLQQAFNYLNQGVVHSVTWKQMKPHIQNISEDVIFSVMCYKDEDEELWQEDPYEYIRMKFDIFEDYASPTTAAQALLYTAAKKRKEVLPKMMAFCYQILTDPNFDPRKKDGALHVIGSLADILLKKSLFKDQMELLLQNHVFPLLLSNLGYLRARSCWVLHAFSSLKFHNELNLRNAVELAKKSLIEDKEMPVKVEAALALQSLISNQIQAKEYMKPHVRSIMQELLHIVRETENDDVTNVIQKMICEYSQEVASIAVDMTQHLAEIFGKVLQSDEYEEVEDKTVMAMGILHTIDTILTVVEDHKEVTQQLENICLQIIDLVLRKHIIEFYEEIFSLAYSLTCHSISPQMWQLLGILYEVFQQDCFEYFTDMMPLLHNYVTIDTNTLLSNPKHLEILFTMCRKVLSGDAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVQLVLERLTQGVKTSELRTMCLQVAIAALYYNPDLLLHTLEQIQLPHNPGPITVQFINQWMNDTDCFLGHHDRKMCVIGLSILLQLQNRPPAVDAVVGQIVPSILFLFLGLKQVCASRQLLDRENHSKAEKADIEENEEISSDEEETNVTAQAMQSNNGRGEDEEEDDDDWDEEVLEETALEGFSTPLDLDNSVDEYQFFTQALLTVQNRDAAWYQLLVAPLSEDQRRALQEVYTVAEHRRSVAGQPE	185278	117158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_117381_121579_121784_123957_124164_138861_139083_142802_142899_146561_146660_147322_147449_152288_152356_156432_156559_159122_159284_161278_161445_162732_162823_163262_163380_163705_163783_166737_166838_169223_169359_170840_170926_171565_171661_174036_174127_175262_175420_176455_176615_179102_179260_185199
732863	contig_2036_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_131855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658059	659647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_658100_659600
732867	contig_9995_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_47671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAAGTCCAAGCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196083	195692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_195700_196100
732868	contig_12301_pilon	-	1318	11	Intergenic	novelGene_110012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	200.891114786095	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	62	1054	136698	75866	TRUE	30	GCAGAAGATACTTTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMFRRREVRIQDTSSRRSLSLPFGSGRKSLSSIFPWSRSFSVQGRI	136759	75455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_75536_75681_75874_94266_94394_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
732869	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732871	contig_16846_pilon	-	1183	3	Intergenic	novelGene_82984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3154	junction_2	2957.5	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	42	560	555239	551492	FALSE	15	AGCACTACTTCGGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555280	550868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055
732874	contig_14744_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_65943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGCACTCTGAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210810	210018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_210000_210800
732875	contig_14744_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_65942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTACACACACACACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208917	207577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_207600_208900
732877	contig_7412_pilon	-	1843	8	Intergenic	novelGene_76335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1453.41434742682	1	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	152	1519	377290	364533	FALSE	15	GCAGACCATGGCTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQGELAEGGQCWERNGGGPAVEWGLLGSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHLDDL	377441	364208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364547_364617_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
732880	contig_8263_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_83108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAATTGTTACTCAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170028	171377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_170000_171400
732884	contig_7870_pilon	+	2726	1	Intergenic	novelGene_108977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTTGCTATATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391543	394269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_391500_394300
732887	contig_3627_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_78502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTCCAACTTCACGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622592	621283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_621300_622600
732889	contig_13865_pilon	+	1830	2	Intergenic	novelGene_122745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTATTAGCATTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67142	70074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_67518_68619
732890	SIRV6	+	537	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732894	contig_12566_pilon	+	2618	20	Intergenic	novelGene_86001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	87.964894785826	1	137	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	392	2509	49990	86354	FALSE	45	ATCAAAGGAAATTTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTYNIYLFHSQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44355	86463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47790_49983_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
732902	contig_14244_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_169449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAATTGCCCCTTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11870	12822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_+_11900_12800
732907	contig_11413_pilon	+	772	4	Intergenic	novelGene_103127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1157.74992502219	22	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	17	319	87465	87767	TRUE	30	AAAGGTGTTGGAATTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWVRRSREGPGHSPLQPEHFGGIRAKGPAVLMGWEAL	87448	90699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87951_88139_88248_88420_88508_90624
732908	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657496	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657496	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732909	contig_12019_pilon	-	1589	3	Intergenic	novelGene_87643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAGAGAGAAAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8682	4166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_4260_5113_6226_8298
732917	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
732918	contig_15021_pilon	+	2486	4	Intergenic	novelGene_26998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	17.7951304200522	144	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	789	1142	487254	487607	FALSE	35	AGGTTTGTTTACTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKHRDVVKTDFLQYSITKIKQRHIYLERLGRYQTPDKKGQTQVLNPSLKDIFRVSEAEFLVKTACSSPEEFEVFKKLLAREEEEGPGGCTSDDSASSDGDVEDRDAEEEFTDGRD	483469	488951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_483516_484302_484845_486390_486576_487238
732919	contig_7521_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_160564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363786	365812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_363800_365800
732923	contig_5549_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_81701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCTCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847046	849043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_847000_849000
732924	contig_4213_pilon	-	984	6	Intergenic	novelGene_124822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_2	142.54346705479	1588	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	65	724	165961	144406	FALSE	10	CATAGTCTCCTTTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDIVYADIKISPLEQSSTLQKPESHHHGIFLKAGCAMIIILLLIVILLSIFVIQFNYARHNEVNNESVKKNSTAKNSSKIIISTASSNSSIVHQLCPSKDWISHGGKCYWIAKNTQSWSKSQDDCAMKNSHLFVIQDVIDMSFLWRHLKSSISYWIGLTYPSGGNSWIWVDNSSFNENIFSVKQRQAWTRSMNCATVSRSEIKAEKCDDKNQWICEL	166025	144145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_144524_147425_147539_157247_157418_159434_159534_162609_162697_165888
732926	contig_16883_pilon	-	2289	8	Intergenic	novelGene_161769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	64.1035514314336	206	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	132	1811	737189	701053	FALSE	25	ACTTTAATACTGTGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISGFVSHGAHGVGRSSTERQFFFINRRPCDPAKVSRLVNEVYHMYNRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLIGMFDSDVNKLNVSQQPLLNIEGKIVKMHSAEMEKPLPEKQESPALFQTQGEGKRAVTISRLREAFSLHHTAEYQPQGLRTPEPRRVAPGPRTRVPFSSKSDTLRPQKPVSGRGVCSPQDKKVHPDEDPCDYRDTVEMEKDSGHDSTSVGSEVGDSTPETGSHFSSDQATSSPEDGVSQEKVESCEKVPEMDCPFSDVECHVDQEDTGYKCRLLPQPTNISSSNIKLFKKEEIPSSSDIPQKLINSQNSSVSLIDVAVKINKKIVPLDFSMSSLAKRIKQLNQQEQRREEKQNYRRFRAKICPGENQAAEDELRREISKTMFAEMEIIGQFNLGFIITRLNTDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQGQRLIAPQTLNLTAVNAAVLIENLEIFRKNGFDFIIDEDAPVTERVKLISLPTSKNWTFGPQDIDELIFMLSDCPGVMCRPSRVRQMFASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIASLDVVSQN	738815	700574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_701197_709798_709969_710300_710402_715990_716159_730877_731764_735084_735241_737134_737220_738714
732927	contig_13504_pilon	+	2154	7	Intergenic	novelGene_157952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	16.3401346383682	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	47	1330	13154	25389	FALSE	20	TGTTTCTGACCCAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLSRVAKGVVDHTKMSLHGASGGLERSRDRRRSSDRSRDSSHERTESQLTPCIRNVTSPTRQHHVEREKDHSSSRPSSPRPQKASPNGSSSSAGNSSRNSSQSSSDGSCKTPGEMVFVYENAKEGARNVRTSERVTLIVDNTRFVVDPSIFTAQPNTMLGRMFGSGREHNFTRPNEKGEYEVAEGIGSTVFRAILDYYKTGIIRCPDGISIPELREACDYLCISFEYSTIKCRDLSALMHELSNDGARRQFEFYLEEMILPLMVASAQSGERECHIVVLTDDDVVDWDEEYPPQMGEEYSQIIYSTKLYRFFKYIENRDVAKSVLKERGLKKIRLGIEGYPTYKEKVKKRPGGRPEVIYNYVQRPFIRMSWEKEEGKSRHVDFQCVKSKSITNLAAAAADIPQDQLVVMHPTPQVDELDILPMHPPSGNNDLDPDGQNPML	13107	26213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_+_13308_15000_15287_17597_17701_19376_19498_20929_21128_24036_24148_25078
732933	contig_5039_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_64809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGAGCCACTGGGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213510	215061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_213500_215100
732935	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732939	contig_6710_pilon	-	437	2	Intergenic	novelGene_98205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	40	CACAAAACACCTATCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
732941	contig_13123_pilon	+	1864	5	Intergenic	novelGene_136897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	132	620	434529	444679	FALSE	20	TTTTATTCTTTGCATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434397	445923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
732943	contig_9127_pilon	+	2326	2	Intergenic	novelGene_103002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_1	0	135	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAAATTGTGTCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90436	93824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_91814_92875
732944	contig_5229_pilon	-	2304	12	Intergenic	novelGene_117706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	35	junction_9	28.5289471668038	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1141	1818	655501	652839	FALSE	10	GGATTGTTTCTGTGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKASGVNCLYFVEEGQRKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657548	652352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655263_655380_655474_655590_655758_655942_656197_656307_656546_657083_657324
732946	contig_10940_pilon	-	1817	5	Intergenic	novelGene_49271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	2	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	89	517	917000	875564	TRUE	60	AAAAAAGAAAGATGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917088	874215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874670_874717_875675_893147_893306_916664_916748_916923
732951	contig_4103_pilon	-	1410	6	Intergenic	novelGene_51877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	362	junction_5	179.080540539725	1935	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	11	610	45573	40734	FALSE	90	GAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVKMASGSGTKNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	45583	39933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_41930_42374_42449_43898_44023_45129_45224_45555
732956	contig_1719_pilon	+	1772	9	Intergenic	novelGene_87284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1291	1596	371781	375269	TRUE	30	CCAGTTTCAAATATGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNILHSFECFLPQFHADSTVQLNKPGFQMHGLAFWIVKIDCRTLVMVALNLRQVHSQIVTQLTELSLTSVLEAEFESLLGDIMVETLYSRIVSKKVQTLPV	364014	375818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_364065_364686_364882_365120_365217_366309_366906_370006_370183_371603_371810_373440_373642_375193_375360_375732
732961	contig_7887_pilon	+	1858	4	Intergenic	novelGene_124929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	133.352498622594	35	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	452	835	584832	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	577214	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_577295_577973_578031_584517_585122_585612
732962	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_96896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
732970	contig_16722_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_118280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGGAGGTGTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93222	91010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_91000_93200
732973	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
732976	contig_6710_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_89252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653727	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
732977	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_98140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	CAGCTACCCACCCATCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
732981	contig_7202_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_17702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27866	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
732984	contig_11978_pilon	-	1471	7	Intergenic	novelGene_63047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	9.19691977421426	385	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	383	733	1800665	1797292	FALSE	15	CTCATCTCTTATCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGLPAGLQWMLSQTTAN	1802723	1796553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1801002_1801117_1801968_1802030_1802598
732987	SIRV2	+	300	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	272	128	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATACCTCGTTCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380	1759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1735
732989	contig_7057_pilon	-	1467	4	Intergenic	novelGene_123221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	36.8088153692684	323	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	647	991	537793	537449	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPCTPSYLLSLTSGSLAVDSMRWGTVARGWGGHLGSETPECARGRGLPNALLSGLCPGNVLEVASATSCICGPSPGTSGGNSMGGALGAGTSGPASQDSSYPEASLDTLKAA	539712	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_538252_538336_538404_539420_539484_539654
732992	contig_3233_pilon	+	1009	8	Intergenic	novelGene_56555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	330.015955087394	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	408	881	743801	747909	FALSE	20	CACTCCCCAATGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738712	748037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740817_740917_741759_741910_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
732996	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
732998	contig_6048_pilon	-	2485	10	Intergenic	novelGene_73218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	35.2010100865176	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	171	2045	1645874	1609163	FALSE	15	GAGCAGGCCCTGGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGMTSILMSAIGLPVCLSRAPQPASPPASCLASKSHSSVKRLRKMSMKGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661959	1608722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1627230_1627372_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1661879
733001	contig_6102_pilon	-	786	8	Intergenic	novelGene_32218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1290.43035061793	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	40	687	905250	895000	FALSE	20	TGTTGGATGAACCCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906122	894900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
733002	contig_9429_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_155101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAATAAGAATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69252	66557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_66600_69300
733003	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733006	contig_11321_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_86647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCAAAGAAAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95987	49804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_49959_95575
733009	contig_10367_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_169450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGACTTGGTGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67957	67510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_67500_68000
733011	contig_4364_pilon	+	1599	7	Intergenic	novelGene_190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	901.436261381432	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	53	667	1268714	1270037	TRUE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1267044	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268701_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1270044_1270150
733013	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11031_11109_11205
733016	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733018	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733019	contig_12000_pilon	+	1373	10	Intergenic	novelGene_43146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	638.780918412874	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	710	1033	492383	669327	FALSE	50	TTATCACAAGAATAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLMVLKRPEDHPEGDRWKLLLTGWQTELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	416802	669667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_492310_492414_494931_494989_558472_558606_669224
733024	contig_7707_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_72205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAGTACAATAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704879	707141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_704900_707100
733029	contig_7895_pilon	+	2127	8	Intergenic	novelGene_154454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	67.7405012544496	208	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	125	709	725295	759409	TRUE	65	AATAAACATTCCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRQRASSQRKPARIPSGKAGAESGFLMEVCVDSVESAVNAERGGAGRIELCSGLLEGGTTPSMGVLQVVKQCVQIPVFVMIRPRGGDFLYSDREIEVMKTDIRLAKLYGADGLVFGALTEDGHIDKELCMSLVAICRPLPVTFHRAFDMVHDPVAALETLLTLGFERVLTSGCDSSALEGLPLIKRLIDQGVA	725170	761636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725356_728162_728235_731583_731644_736187_736398_737188_737225_739538_739673_759397_759504_760312
733034	contig_14556_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_138517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTAAGAGCTTAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100117	101176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_100100_101200
733049	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	9	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733054	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
733055	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_97367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733058	contig_7816_pilon	+	1180	8	Intergenic	novelGene_66518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1476.35194355021	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	81	698	195803	209294	TRUE	40	GAGAAAAATGAATTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKVGRWS	182088	211757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_182122_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207943_209284_209379_210627_210751_211482
733063	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	0	3590	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
733064	contig_3627_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_78534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGAAAAAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639524	640059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_639500_640100
733065	contig_14219_pilon	-	2216	11	Intergenic	novelGene_54298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	225.743216952359	62	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	365	1492	676735	628520	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIVNGGSWTGEPPRRNSHTFNCRMLVKPLPDSEEEGHDNQEAHQKYETMQCFAVSQPKSIKEEGEDLQSCLICVARRVPLKERPVLPSSESFTTRQDLQGKITSLDTSTMRAAMKPGWEDLVRRCIQKFHTQHEGESVSYAKRHHHEVLRQGLAFSQIYRFSLSDGTLVAAQTKSKLIRSQTTNEPQLVISLHMLHR	883380	627795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_628672_632777_632922_633201_633304_635724_635914_638846_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_845300_845389_883180
733067	contig_4232_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_63432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTGTGAAAGAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501731	501525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_501500_501700
733068	contig_7695_pilon	-	1652	7	Intergenic	novelGene_41626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	107	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	70	675	687243	681554	TRUE	15	AGGAAGTTGCTGGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATILEREAEQSRLGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAGGGCC	687312	680319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680514_680770_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
733073	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733078	contig_11855_pilon	-	2233	8	Intergenic	novelGene_66993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	23.6867309793858	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	453	1193	1310207	1307773	FALSE	10	CTTAACTGTGGTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYCEKRCGYCNFNKYIPRGVEEAAVRSCLVTEAQTLLLLSGVRRVESVFFGGGTPSLASPHTVAAVLEAVAQAAYLPADAEVTLEANPTSSAGSRLAAFGTVGVNRLSIGLQSLDDAELQLLGRTHSASDALRTLAEARHLFPGRVSVDLMLGLPAQQVGPWLGQLQELLCHCDDHVSLYQLSLERGTALFAQVQQGALPAPDPELAAEMYQKGRVVLREAGFRQYEVSNFARNGALSTHNWNYWQCGQYLGVGPGAHGRFLPQGAGGHTREARIQTLEPDNWMKEVKLFGHGTRKRVPLGELELLEEVLVMGLRTDLGITHQHWQQFEPQLTLWDVFGTSKEVKELLEQGLLLLDHRGLRCSWEGLAVLDSLLLTLLPQLQEAWQQRISTLVPRG	1313220	1306732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1307891_1308060_1308165_1308831_1308887_1309123_1309272_1309713_1309778_1309955_1310322_1312759_1312965_1313087
733081	contig_7202_pilon	-	257	2	Intergenic	novelGene_18678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCTGTCCATGGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29991_30034
733086	contig_14034_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_72669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTACTATTGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383454	383760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_383500_383800
733087	contig_8161_pilon	-	1819	9	Intergenic	novelGene_156776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_3	72.6842486375143	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	334	1362	447317	405516	FALSE	30	TACCCAGCGCAAAGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIVLNVTLVLAAVFKLEKDRSVWPLIRIYRGGFLLIEFLFLLGINTYGWRQAGVNHVLIFELNPRSNLSHQHLFEIAGFLGILWCLSLLACFFDPIKVIPTYVYPLALYGFMIFFLINPTKTFYYKSRFWLLKLLFRVFTAPFHKVGFADFWLADQLNSLSVILMDLEYMICFYSFELKWDESRGLLPDDSEEPEICHQYSYGVRAIVQCIPAWLRFIQCLRRYRDTKRAFPHLVNAGKYSTTFFTVTFAALYQTHKERGHSDTMVFFYLWIVFCIISSCYTLIWDLKMDWGLFDKNAGENTFLREEIVYPQKAYYYCAIIEDVILRFAWTIQISITSTTLLPHSGDIIATVFAPLEVFRRFVWNFFRLENEHLNNCGEFRAVRDISVAPLNADDQTLLEQMMDQDDGVRNRQKNRPWKYSQSISLRRPRLASQSKARDTKVLIEDTDDEANT	458398	405058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_405577_408237_408460_410810_410951_411680_411848_438251_438447_440004_440177_447245_447426_447632_447824_458364
733094	SIRV6	+	564	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCCTAATTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733099	contig_7593_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_127365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTACTGTTTGACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708200	707482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_707500_708200
733106	contig_11071_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_131032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGATCAGGGTGGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128648	127244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_127200_128600
733107	contig_6102_pilon	-	2109	5	Intergenic	novelGene_32056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	55.8994633247941	638	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	260	730	582716	581130	FALSE	35	AGAAGCATTTCACCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPPQRSRQRRGGPKPKTGQVVLVPNSLWERGAATRATGGSGDCDPNQNPLRFLYPRIPRDEAFGRYYQEKVNLQERRKYLKHRLIMVSNRQVDELQQPLEPKLEPGQESLDLGLALEPDLGLSLELGSLMDAGLDLGPALEPVLEPTLAMGPQTVPEPNLEPELESILESISQPVPEPDLPQDLKHLNIKEMEIFRNSSMKIEEIMINGDPPLPGPSTMDEVYSFCPSHFHTDGRWSPCDF	598600	579750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_581276_581579_581891_582702_582761_583000_583071_598455
733112	contig_9727_pilon	+	960	6	Intergenic	novelGene_86317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	289.320306926424	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	29	358	309192	312968	TRUE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSGV	308437	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_310970_312957_312991_314078
733113	contig_9752_pilon	+	1245	3	Intergenic	novelGene_121996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_1	270	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	173	1243	68566	69636	FALSE	25	CGCCCACATGCAGCTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVMSLSRDLKDDFHSDTVLSILNEQRIRGILCDVTIIVEDTKFKAHSNVLAASSLYFKNIFWSHTICISSHVLELDDLKAEVFTEILNYIYSSTVVVRRQETVTDLAAAGKKLGISFLEDLTDHHFSNSPGPYVFCITEKGVVKEEKNEKRHEEPAITNGPRITNAFSITETENSNNMFSPLDLRASFKKVSDSMRTSGLCLERTNVCQEPEPVRTLAEHSYAVSSAAEAYRSQPVCEEASSSTGKAGKENGEALAAKPKPCRKPKTLSIPQDSDPPTENIPPPPITNLEVNQERSPQPAAILSQSKSPHNEGDVDIPREDENKSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKSFDSSALL	4240	69638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_4308_19617_19723_68565
733116	contig_1406_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_25440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGATAAGCAGATGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481013	480714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_480700_481000
733117	contig_8617_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_73464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATCCCCTAATCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
733118	contig_16185_pilon	-	2050	2	Intergenic	novelGene_144728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	710	1081	61707	61336	FALSE	10	GTCTTTTGTTAGTGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGYADDTTLLAESEEDLTHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKVLTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKQRIALGKSAVKDLFKVLKSKDVTLRTKVRLICMGKLDSE	63556	60366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_61733_62872
733124	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733126	contig_11720_pilon	+	983	10	Intergenic	novelGene_43849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2730.38166282506	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	252	968	78465	98482	FALSE	30	ACTTCGTATTTCCCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPFCTRLENNLQK	70348	98497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_70509_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95450_98443
733130	contig_14322_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_115943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671518	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671500
733135	contig_16310_pilon	-	1684	13	Intergenic	novelGene_70047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1166.12851874149	1	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	638	1540	61940	57667	TRUE	35	GAAACAAGGTTACCTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPSHPKPCLSKVCLRTPPRRH	66177	57121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_57199_57599_57727_58471_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62180_63215_63538_64831_64955_66117
733136	contig_7963_pilon	-	895	6	Intergenic	novelGene_58304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48822	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40185_43610_43819_48741
733140	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733144	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_97866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733151	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733153	contig_16148_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_50348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATATACTTTAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55708	56762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_55700_56800
733154	contig_1301_pilon	+	1289	11	Intergenic	novelGene_47322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	269	349	277834	279353	TRUE	55	CTGAAGAAATTATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFSSSGRATSSYCFFSLLKISQFDLLDCLACLDLAFLWDSDSSSLTGVRTFTHLRLSLTSDVEETVPAVVVVRVVVEAAAFTTVGATGMVTVVGTLSFSFSVLSSAHKRFEVLL	269185	305409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_269257_270315_270395_277715_277906_279344_279452_283357_283450_284683_284903_292186_292274_296629_296765_296918_297008_297691_297766_305263
733155	contig_5940_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_169467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTGGACTATAAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53093	55217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5940_pilon_+_53100_55200
733162	SIRV6	+	554	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733165	contig_7171_pilon	+	1245	10	Intergenic	novelGene_101353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	109.465480211913	662	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	219	1106	1322494	1328646	FALSE	15	CCTGGTGACCTTGGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1321916	1328785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322088_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325525_1325604_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
733169	contig_5253_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_61566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTAAGCACCCGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209805	209094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_209100_209800
733170	contig_5253_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_61565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTAACTGGGTCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208349	208012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_208000_208300
733173	contig_15327_pilon	-	1763	8	Intergenic	novelGene_70523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	16.1321076725635	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	314	1270	488304	478231	FALSE	15	TCTTTGTTGTTGTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492659	477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172_488343_491906_491960_492437
733174	contig_11720_pilon	+	1139	5	Intergenic	novelGene_44005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_4	274.697105918501	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	285	917	269766	272244	FALSE	30	TTTATTGAGTACCTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECALHISLLLSRRPQFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWSGPVALPTEPPSWLTAPTNTSCMGSLMRSRRREGQLDEPPHGGRHLAC	269481	272466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_272096
733175	contig_6710_pilon	-	424	2	Intergenic	novelGene_98233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
733177	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	59	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733179	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733185	contig_7963_pilon	-	1206	7	Intergenic	novelGene_58279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1490.98442498758	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	56	352	48841	43622	TRUE	15	TCCATGCTCTTCTATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48896	37058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_37392_38533_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
733188	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733190	contig_15236_pilon	+	839	4	Intergenic	novelGene_141644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCTGATCACAGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677740	684738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_677783_679756_679805_683370_683475_684093
733196	contig_12031_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_137575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTAAGCCACTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391517	392024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_391500_392000
733197	contig_20697_pilon	+	1766	2	Intergenic	novelGene_134608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGTAAACCTTCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3756	6104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_4000_4581
733198	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	123	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733203	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
733211	SIRV5	+	414	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1146_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3402_3483
733215	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	0	204	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733216	contig_14322_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_115812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
733220	contig_11656_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_53973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCATCTAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178142	176591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_176600_178100
733221	contig_5797_pilon	-	1092	6	Intergenic	novelGene_56938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	22.0399637023295	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	67	717	318960	306126	TRUE	25	ATGCCTCTCAAACTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSGKNGDLHLKQIAYYKRTGEYHPTTLPSERSGIRRAAKKFVFKEKKLFYVGKDRKQNRLVIVSEEEKKKVLRECHENDTGIHHGISRTLTLVESSYYWTSVTNDVKHWVYACQHCQVAKNTVILTPKQHLLKVENPWSVVTVDLMGPFHTSNRSHVYAIIMTDLFTKWVVILPLCDVSVSEISKAISNIFFLYGPPKKIIMDQRDEFIHQFIA	322447	302783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_302836_305802_306138_313901_314208_316305_316500_318821_318968_322388
733223	contig_13258_pilon	+	1102	2	Intergenic	novelGene_146924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGTATCACCAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15711	24071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_+_15741_22998
733228	contig_4857_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_48671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055071	1056921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1055100_1056900
733229	contig_18794_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_54647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161561	162233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_161600_162200
733234	contig_2078_pilon	+	1852	6	Intergenic	novelGene_100125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	88	junction_4	76.4109939733806	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	21	1085	266397	311030	FALSE	40	ATGCAAAATACTTATTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCVSGSMDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266376	311797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
733235	contig_6710_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_93783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733237	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733238	contig_9682_pilon	+	1199	10	Intergenic	novelGene_125290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	160.61394555322	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	186	935	10767	36100	FALSE	40	CAGTCACACAGGAAGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEGLAPSTLRPHPVLTWLVRPHRTEEEVLVLVSGRAL	2375	36364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_35993
733239	contig_11566_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_166694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCACTGACGTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164821	166803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_164800_166800
733243	contig_10793_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_83435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAGCAAAGTTACTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157207	154937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_154900_157200
733253	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
733255	contig_7202_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_18630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAATTTTGCCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	28601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
733258	contig_8065_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_107318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTTTGAAAGCAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100537	99676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_99700_100500
733265	contig_15047_pilon	-	2377	4	Intergenic	novelGene_52291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	10.6249183003395	150	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1150	1839	130501	129252	FALSE	5	TCTGGCTCTTTAGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGNRRGRPRKHPVSAHMAPPAAGGGEPCAAPHCCLPQEETVAWVQCDGCDTWFHVACVGCSIQVAREADFRCPGCRVGIQA	132809	128713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129493_130052_130621_131733_131839_131884
733272	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
733275	contig_11932_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_85431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGACCAGATTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484158	483810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_483800_484200
733276	contig_9940_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_125358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGGTTTTGAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259658	258058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_258100_259700
733278	contig_14322_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_116195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671598	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
733279	contig_6710_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_98064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733286	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	0	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
733290	contig_2093_pilon	+	2005	3	Intergenic	novelGene_152992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCCTGTCTTCCAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369652	1385065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1371022_1372530_1372616_1384514
733293	contig_7861_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_77406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGGAAATTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71793	70466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_70500_71800
733299	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_96776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657496	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657496	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733300	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
733302	contig_11752_pilon	+	1141	7	Intergenic	novelGene_37588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1735.64173210436	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	109	819	84194	105606	FALSE	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTQHE	84085	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105593
733304	contig_11117_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_148604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126653	124921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_124900_126700
733308	contig_5945_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_104548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTGTTGCTTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204632	206080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_204600_206100
733312	contig_16400_pilon	+	733	2	Intergenic	novelGene_150895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAAAGTTTATCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3464	17510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879
733313	contig_16400_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_150902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTTCTTCTGGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17814	18228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_17800_18200
733314	contig_14184_pilon	+	2375	6	Intergenic	novelGene_66589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTCCGCTCTAGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88544	126342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_90297_91963_92117_103417_103502_105799_105915_109168_109326_126228
733317	contig_9437_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_141738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATTCCTGATAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420670	420372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_420400_420700
733325	contig_20402_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_72841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	415	816	63840	63439	NA	35	AAAAGATTATTCTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKLAFTLKQLNQPLLATNSSSQSPSFAAGAVFKSLKRLPAFFCTKSKSIAIKLILTHSNPIGQRRTAPQGFQGVADGFEMPTFWLAAKCLTTAPPGLLSCTKGKLNKNRMHLFWLNLQIHLKDTLRNRSRS	64254	62546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_-_62500_64300
733330	contig_6056_pilon	-	1230	7	Intergenic	novelGene_157883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCGGGAAGACGCATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312352	281103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_-_281167_287117_287228_291371_291778_296258_296343_298037_298191_310502_310685_312120
733331	contig_1406_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_25565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	124	330	2159494	2159288	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDAGECRWCAQAPPSPFLAAVTRRGEAPMGAHFRSSP	2159617	2157284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2157300_2159600
733332	contig_401_pilon	+	1959	3	Intergenic	novelGene_42890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACACACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1807195	1810383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1808842_1809493_1809618_1810194
733338	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733343	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733346	contig_15991_pilon	-	950	8	Intergenic	novelGene_70924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3099.91792518079	8	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	75	899	105108	100445	FALSE	40	TAAACATCGATTTCTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102127_102189_102271_103583_103703_104975_105142_106315
733353	contig_11590_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_125591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	499	837	696531	696193	NA	55	TAAGAGGAAAACCAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQHCFLGGMRSPTLCLLPFPFISCKIKGGAGHTPGKLPLHWIRDVTLVRVLQFRLILFNIKLQSQNGGQPHNTGNHGLSKLTHILGTHNSIHDKPPSQSLSQGRDITQA	697029	694158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_694200_697000
733356	contig_14768_pilon	+	1622	2	Intergenic	novelGene_115077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTCTCTGTCTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175468	189290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_176398_188597
733358	contig_13145_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_116646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTTGCATTTTAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173657	172590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_172600_173700
733359	contig_6837_pilon	-	1871	16	Intergenic	novelGene_149841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_15	26.524621685437	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	45	1763	106337	95412	FALSE	10	CCAGTGACTCCTTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARRRRTNSGGARASVALNEIKRVNNGNITTEDSPPAKKTRRCQKQGVRKEPVAGGKTDNYDKTEDKKESVKTLLLKGKAPVDPECTVKVGKAHVYCEGNDVYDVILNQTNLQFNNNKYYLIQLLEDDAQRNFSVWMRWGRVGKTGQHSLVTCSGDLTKAKEIFQKKFLDKTKNNWEDREKFEKVPGKYDMLQMDYATNTQGEEETKEEESLKSPWKPESQLDLRVQELIKLICNVQAMEEMMVEMKYDTKKAPLGKLTEAQIKAGYQSLKKIEGCIRAGQHGRALTEACNEFYTRIPHDFGLRTPPLIRTEKELSEKVQLLEALGDIEIAIKLVKTELQSPEHPLDQHYRNLHCALHPLDHASDEFKVISQYLESTHAPTHSDYTMTLLDVFEVEKEGEKEAFREDLHNRMLLWHGSRLSNWVGILSHGLRIAPPEAPITGYMFGKGIYFADMSSKSANYCFASRLNDAGLLLLSEVALGQCNELLGANPEAEGLLQGKHSTKGLGKMAPSPSSFITLNGSTVPLGPAGDTGVLNPEGYTLNYNEFIVYNPNQVRMRYLLKVRFNFLQLW	106381	95303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_95572_95689_95815_96053_96153_96483_96584_96761_96890_97159_97295_97375_97440_98218_98358_98583_98747_99760_99864_100474_100551_101365_101463_103060_103112_103734_103806_104284_104450_106294
733360	SIRV1	-	211	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3596	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
733363	contig_14770_pilon	-	1379	3	Intergenic	novelGene_169469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	5	582	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAATATATGTGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60417	41068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14770_pilon_-_41989_52498_52599_60058
733364	contig_5018_pilon	+	1823	10	Intergenic	novelGene_46931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	103.283978655518	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	47	1318	200667	206696	FALSE	15	TCCCCTGCAGGGCTACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTTCACSHLTNFAVLMAHREIYQGRINELLLSVITWVGIVISLVCLAICISTFCFLRGLQTDRNTIHKNLCINLFLAELLFLVGIDKTQYEIACPIFAGLLHYFFLAAFSWLCLEGVHLYLLLVEVFESEYSRTKYYYLGGYCFPALVVGIAAAIDYRSYGTEKACWLRVDNYFIWSFIGPVSFVIVVNLVFLMVTLHKMVRSSSVLKPDSSRLDNIKSWALGAIALLFLLGLTWAFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEYSKCLRHSYCCIRSPPGGTHGSLKTSAMRSNTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDINSTPTLNRGTMGNHLLTNPVLQPRGGTSPYNTLIAESVGFNPSSPPVFNSPGKSTLGRQAPLGRPRGLRHGHPSPKRQLQQQLFLAKRRFPSRGWGP	200620	207201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_200685_201009_201220_201344_201566_201732_201800_202242_202335_202962_203132_205306_205436_205599_205697_205788_205940_206578
733369	contig_9995_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_47772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGAGAAGTTTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722141	721842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_721800_722100
733376	contig_5602_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_133020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAACCAGGCTGCGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513085	515951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_513100_516000
733377	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733380	SIRV4	-	466	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
733382	contig_5758_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_119110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252972	251753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_251800_253000
733385	contig_15221_pilon	-	1048	4	Intergenic	novelGene_133073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	84.856742022462	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	255	479	182332	140516	FALSE	30	CTATAAAGATGTCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEGVVSPSDLDLVMSDGLGMRYAFVGPLETMHLNAEGHV	190693	139946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_140527_149435_149542_182224_182420_190526
733386	contig_9272_pilon	+	2543	9	Intergenic	novelGene_125911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	72.3550274687254	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	765	2255	298536	315378	FALSE	35	AAGAGATGTCTTCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGCWNCDDCKAGKKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAETCNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVVGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDAEIIKTEQRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFYMLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFNYNLDCLGNGRTECHCGAANCSGFLGVRPKSACASTTEEKARNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLICLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSSAASFCEFCPHSFCKDHEEGALVPSALEGRLCCSEHDPICPVSPEYWSKIKCKLESQDHGEEVKE	297771	315666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_298628_302280_302484_303122_303236_303826_304097_310458_310576_312365_312508_313585_313693_314254_314460_315136
733387	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733389	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733390	contig_7816_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_66556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTGTCTCCTCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340327	339728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_339700_340300
733394	contig_10990_pilon	+	1356	3	Intergenic	novelGene_7404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGAGAAGGTAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119454	123576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121168_122579
733395	SIRV6	+	470	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	386	0	207	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733396	contig_2078_pilon	-	1923	9	Intergenic	novelGene_100185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	76.5513512290933	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	364	1197	531872	514717	TRUE	5	TCTTTTTGTGTGGTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQTCCTCCWCPPGIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGRNCHWNTRL	532235	505116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521680_521793_529455_529735_530102_530418_531775
733397	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733402	contig_2078_pilon	-	1540	9	Intergenic	novelGene_100189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	69.7656792413003	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	109	1056	531872	505745	TRUE	15	ATTGTGATTGGAGGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNGDLDHPASKRKFSKFIKAASGG	531980	505178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508761_514633_514723_515320_515346_521684_521793_529455_529735_530102_530388_531775
733404	contig_9434_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_150501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAATCCATCATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347575	346004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_346000_347600
733405	contig_9434_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_150502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAATACAAATTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348357	347685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_347700_348400
733407	contig_15410_pilon	+	957	5	Intergenic	novelGene_130616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	832.08694707945	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATGAAAATAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145476	148518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146893_146980_147081_147178_147750_147842_148070
733408	scaffold_19766_pilon	+	2299	15	Intergenic	novelGene_34410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_12	27.0751034068163	162	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	100	2136	834478	839298	FALSE	10	GTTGTGATTCACCTCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEKKLKLSNTVLPSESMKVVAESMGIAQIQEETCQLLTDEVSYRIKEIAQDALKFMHMGKRQKLTTSDIDYALKLKNVEPLYGFHAQEFIPFRFASGGGRELYFYEEKEVDLSDIINTPLPRVPLDVCLKAHWLSIEGCQPAIPENPPPAPKEQQKAEATEPLKSAKPGQEEDGPLKGKGQGAAPADGKGKEKKAPPLLEGAPLRLKPRSIHELSVEQQLYYKEITEACVGSCEAKRAEALQSIATDPGLYQMLPRFSTFISEGVRVNVVQNNLALLIYLMRMVKALMDNPTLYLEKYVHELIPAVMTCIVSRQLCLRPDVDNHWALRDFAARLVAQICKHFSTTTNNIQSRITKTFTKSWVDEKTPWTTRYGSIAGLAELGHDVIKTLILPRLQQEGERIRSVLDGPVLSNIDRIGADHVQSLLLKHCAPVLAKLRPPPDNQDAYRAEFGSLGPLLCSHVVKARAQAALQAQQVNRTTLTITQPRPTLTLSQPPQPGPRTSGLLKVPGSIALPVQTLVSARAAAPPQPSPPPTKFIVMSSSSSASSTQQVLSLSTSAPGSGSTTTSPVTTTVPSVQPIVKLVSTATTAPPSTAPSGPGSVQKYIVVSLPPTGEGKGGPTSHPSPVPPASSSPSPLGGSALCGGKQEAGDSPPPAPGTPKANGSQPSGSGSPQPAP	830961	839461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_831003_834419_834634_834739_834827_834960_835115_835334_835392_835483_835604_835839_835986_836096_836175_836284_836387_836464_836648_836920_836996_837124_837251_837753_837928_838439_838638_838917
733418	contig_9706_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_20805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCGCTACCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
733419	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3117_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733423	contig_6102_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_32048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGATTGCTGGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556062	558197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_556100_558200
733424	contig_5967_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_44373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCAACAAATGTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388845	387557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_387600_388800
733426	contig_6557_pilon	-	2678	2	Intergenic	novelGene_32973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTATTATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433833	430425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_432953_433682
733431	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733437	contig_19899_pilon	+	1430	4	Intergenic	novelGene_102503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	42.5519290592879	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	368	973	134511	135116	FALSE	40	AATCTAATGCAGTACAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFVILGNKVDISERQVSAEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAARRVLATEDRSDHLIHTDTVNLHRKPKPSSSCC	100549	135573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_100696_130681_130771_131290_131390_134477
733438	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91676	2	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
733444	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733447	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733449	contig_12970_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_50532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251582	253313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_251600_253300
733452	contig_12622_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_5848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATCAATTGGCTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923513	921455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_921500_923500
733453	contig_14441_pilon	+	701	3	Intergenic	novelGene_100674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.5	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	195	701	116728	117795	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	112619	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_116578_116963_117523
733456	contig_1154_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_87098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGCTCTCCCCACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348885	346483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_346500_348900
733457	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_97660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733459	contig_17198_pilon	+	1659	10	Intergenic	novelGene_62393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.477536128852	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	435	1202	1063432	1096458	FALSE	15	GATGTCTTGTCAGAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1047988	1096915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1048174_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083366_1083435_1096382
733461	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733466	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733468	contig_7202_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_18661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCATGGTGAGGCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	29804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
733469	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	298	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733473	contig_1076_pilon	-	2068	2	Intergenic	novelGene_101107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	470	junction_1	0	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTGAAGAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53850	51445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839
733479	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	2	1248	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
733483	contig_15087_pilon	+	1579	5	Intergenic	novelGene_37122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	84.7271355588043	217	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	990	1313	32230	32553	FALSE	10	GCTGAGTCTACTGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVCVPTAVCLLECWGITLLSRDFCSTDDHSPSPEPKGASRSSCPALTWTSTLKFISPTASKYHPQLGSPEVSGSTTLPNPPSYRQILSQPLLLPEGPSQDPAPTP	24188	32819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_24337_29170_29325_30761_30880_31299_31400_31760
733485	contig_2209_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_141008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGGTCGAAGATTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131345	133339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_131300_133300
733489	contig_19685_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_141134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTCTAGACGCTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120371	122840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19685_pilon_+_120400_122800
733490	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
733492	contig_10811_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_165791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	223	456	211869	211636	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLALGHVQPRGGHVGRPDGLDLLNVAIVRLAQELIKVPNELIEDPVALLAPLVVLLVELTEVDDAGKDDASTVMVLGIGLGDLELLGHVVGNDVSQEPVGLVSHALDLGAVKVRFHVTMVVQAVADFELSVQEPDQEKQEKEDQNHLLAD	212091	209991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_210000_212100
733495	contig_15449_pilon	-	1307	7	Intergenic	novelGene_33675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	117.222011584856	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	51	1016	196078	191270	FALSE	40	AGGTAAACTTAAGAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQDVF	196128	190978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191281_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
733498	contig_5643_pilon	-	952	8	Intergenic	novelGene_39104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	299	415	640689	640480	TRUE	10	TCCAGGCAGCCCTGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGEREVGTRPFKLQWNRGAPRFRLWVIHWRPLQGSGLRHGHLWRVPAHFFLKESLLFSLSADRCFFIFSSFLFLPCRFSYISSLCLEEVREALAWVFFMAGGYVMFPYSDSLPFWDCTCMTSSFFLVVSMNWAMAT	641530	636492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_636580_637767_637892_638036_638197_640212_640284_640384_640542_640634_640729_641102_641243_641411
733499	contig_15042_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_115440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGATGACAAAATTATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56156	54232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_54200_56200
733500	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
733502	contig_13787_pilon	-	2195	9	Intergenic	novelGene_40622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	832.706093108487	1	113	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTTATACATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205296	157984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159157_159225_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179644_179758_179838_183751_183890_189125_189184_204972
733506	contig_6397_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_146265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	286	861	259	1119	488564	489424	NA	25	TGACACACATGGGGTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFIWILGVLFLIVMSSEHCRGQSKIKKTTQRRYPRAADGKEEAKKCAYTFLVPEQKITGPICVNTKGQDAGTIKDMITKMDLENLKDVLSRQKREIDVLQLVVDVDGNIVNEVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNSLELSQLENKILNVTTEMLKMATRYRELEVKYASLTDLVNNQSVMITLLEEQCLRIFSRQDTHVSPPLVQVVPQHIPNSHQYTPGLLGGNEIQRDPGYPRDLMPPPDLATSPTKSPFKIPPVTFINEGELPLTVKNASIR	488305	490752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_488300_490800
733507	contig_4689_pilon	+	1941	10	Intergenic	novelGene_165412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	507.529090572922	217	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	13	1326	1126336	1184633	FALSE	30	AGGTTTTGAATAAAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERFNMAEDAASAVLSPRGCADGEDAKATEERVAETTGDHQEQFECQELLECQVQTGNSAEEEDAGLVAEAETVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFHRTRDSAEAIIHGLSSLTAYQLRTVYICQFLTRVAAGKTLDAQFESDERITPLESALMIWDSIEKEHHKLHEEIQNLIKIQAIAVCMESGNFKEAEEVFERIFDDPNSYTPLKRKLLTIISQKDAFHSIFQHFSYSHMMEKIKSYVNYVLNEKSSTFLMKAAAKVVETKRARTLTSQDKPNSNDSEMETPDNLDIGESVSDKQSAITESSEGPVSLLRSHKNLFLSKFNHGSQLQDPDEKEERMETLQSRRKKEDSRRSSKRKTRYTLNNQPVTSEKHRSRKKQAWLWEEDRNLRCGVRKYGEGNWTKILLHYKFNNRTSVMLKDRWRTMKKLKLICSDSEED	1126323	1185248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1126643_1134429_1134526_1140844_1140967_1142916_1143004_1159257_1159408_1160180_1160294_1163790_1163851_1165379_1165472_1170588_1170696_1184453
733508	contig_6102_pilon	-	2187	7	Intergenic	novelGene_32001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.6709666865886	50	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	505	1245	452239	449540	FALSE	65	AACAATCAACAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKTSAEHKHQLAEQKRDIQLLKAYMRAIRSVNPNLQNLEETIEYNEILEWVNSLQPARVTRWGGMISTPDAVLQAVIKRSLVESGCPASIVNELIENAHERSWPQGLATLETRQMNRRYYENYVAKRIPGKQAVVVMACENQHMGDDMVQEPGLVMIFAHGVEEI	473574	448597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450747_450852_451251_451388_452090_452372_455613_455649_470683_470869_473422
733509	contig_8616_pilon	+	1697	12	Intergenic	novelGene_72482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	600.268011766755	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	815	1624	327034	330999	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318279	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322277_322585_323789_323876_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638_330720_330844
733512	contig_7359_pilon	+	1996	7	Intergenic	novelGene_139855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	7.73340517208012	399	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGCATGTCCTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45554	56649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_45718_46227_46272_48347_48446_49060_49087_50845_51141_51537_51581_55322
733515	contig_12638_pilon	-	1310	13	Intergenic	novelGene_33206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	266.913570592929	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	286	1173	332771	319953	FALSE	15	ATAGTACTTGCTGGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333473	319815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332789_332960_333096_333202_333274_333411
733523	contig_14441_pilon	+	830	4	Intergenic	novelGene_100449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	215	643	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82374_116558_116963_117220_117344_117539
733524	SIRV6	+	573	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11031_11109_11205
733526	contig_2438_pilon	+	1852	8	Intergenic	novelGene_112080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	58.4329373150564	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	342	1208	348967	359325	FALSE	30	ATTGGTGGAAGTAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEAKDQAFKMEKEAIMDAVTTRKKIMKQKEMVCKNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQILEKRLIQKELETEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELDRKRREERIRGRRHIVEQMQKNKEERSLLAEQREQEKEQMLEYIEQLQEEDLKDMERRHQEKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMVATWFLMPWDF	320605	359969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_320737_346411_346538_348882_349026_351267_351413_351706_351878_353064_353244_355300_355431_359142
733540	contig_6871_pilon	+	1992	3	Intergenic	novelGene_21638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	88	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAGGGTAAATACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669104	703644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_669160_700067_700122_701761
733541	contig_8660_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_136485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGCTAAAGAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237152	235870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_235900_237200
733542	contig_854_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_36611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGGGGAGCGCCGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690541	1689525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1689500_1690500
733543	contig_1335_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_166510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369490	371333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_369500_371300
733548	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733552	contig_13244_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_86938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATTTTGTGTACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256189	256637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_256200_256600
733563	contig_10940_pilon	-	2094	4	Intergenic	novelGene_49260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_3	375.647293200535	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	149	577	917000	875564	FALSE	25	TCTTTTTCCAAGAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917148	874046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875675_893147_893306_916664_916748_916923
733565	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_114017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
733567	contig_3960_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_138018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406510	405485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_405500_406500
733569	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
733570	contig_7171_pilon	-	1841	16	Intergenic	novelGene_101402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	106.03814827169	567	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	43	1338	1437436	1409817	FALSE	10	GCACTCAGCTGTCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPDPSDPLETQAGKVQEAQDSDSDSDTEEGATGRETEMDFLRNFFSQTLGLGSQKERLLDELTLEGVTRYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYANLEKYHLPYPEAIFEIGYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKVVVMIPRGRTGTELRTVSGTVARERDVLYDRQHCYDCSLQPTICHYFIRLLKEKGLLLRCYTQNIDTLERVAGLEPEDLVEAHGTFYTSHCLSPLCRQEYALNWMKEKIFSEVIPKCEKCQSVVKPDIVFFGENLPAHFFSCMQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1437478	1409313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413044_1414806_1414937_1421053_1421243_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
733575	SIRV6	+	351	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_10667_10819_11031_11109_11205
733580	contig_16724_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_105330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAGGGTCCATGACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570807	571759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_570800_571800
733584	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	80	AAAAAGAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733590	contig_11512_pilon	+	1313	8	Intergenic	novelGene_43260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18.5505377005518	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	105	1178	358531	471553	FALSE	15	GCATTGGTGACTCTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVAALSWVQTHIREFGGDPQRVSLAADRGGADVASIQLLTTRAVNARLFRRAVLMLLAVSGPFHYWGPVVDGQYLREAPARALQRAPRAKVDLLIGSSQDDGLIDRAKAVKQFEESQGRTSSKTAFYQALQNSLGGEDGDTRVEAAATWYYSLEHSTDDYASFSWALENATRDYFITCPGIDMASHWARQARGNVFMYHVPGGSGRSSPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357612	471688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_357685_358498_358702_435571_435740_452271_452454_455925_456034_468856_468992_470015_470207_471434
733591	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733595	contig_5586_pilon	+	2261	9	Intergenic	novelGene_143589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	30.7530486293636	96	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	121	1818	508601	546014	FALSE	15	GATTGTGTTTCACTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSIPVEVDESEPYPSQLLKAIPEYSLEQDSEPPAPNIRNMAPTSLSALQTPYCSSGDFTWAHPPLKLANHQWPVSEQATCLRNKVLEESEDSFCRRHPDPGKDFPLGPSAASEPESESVVGPLLPEHQFSFTEKRNQWLGSQLSAASPDTGHNSDKSDQSSPNASADSSGSSQETLQRPRPHRNPGAPDLPTIDTGYDSQPQDVLGIRQLERPLPLTSVCYPQDLPRPLRSREFHQFEPQRYPACAQMLPPNPSPHAQWNYYYHCPGGPDHQVPYGHDYPRAAYQQVIQPAVPGQPLPGATMRGLHPVQKVILNYPSPRDQEERPAQRDYSSPGPPRYQDQLYNQTPKRAGALEESLERPADLRPQGPQAPSPAGIPRPSSIPPVRGTLKTSNLPEELRKVFITYSLDTATEVVKFVNFLLVNGFQTAIDIFEDRIRGIDIIKWMERYLRDKTVMIIIAISPKYKQDVEGAESQLDDDEHGLHTKYIHRMMQIEFIKQGSMNFRFIPVLFPNAKKEHVPTWLQNTHVYSWPKNKKNILLRLLREEEYVAPPRGPLPTLQVVPL	492515	546457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_492628_508592_509430_521551_521745_526283_526463_529648_529738_537556_537626_538710_538828_543261_543337_545867
733597	contig_11136_pilon	+	1590	4	Intergenic	novelGene_169029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.89897948556636	200	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	100	732	149155	151783	FALSE	5	CCCCGCAGGCTCTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPPARIVRHSAASGLREPTQLPRRFTSTAAAGMAGVEQREGSIQVQGQNLFFREALPRGGQAARFSVLLLHGIRFSSETWQNLGTLYKLAQAGYRAVAIDLPGLGHSKEAVAPAPIGELAPGSFLSAVVDALELDPPVVISPSLSGMYSLPFLTAPGSQLRGYVPVAPICTDKIKAADYASVKTPALIVYGDQDPMGQTSFEHLKQLPNHRTLVMVGAGHSCYLDKPEEWHAGLLDFLQGLA	148010	152641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_148082_149126_149366_150992_151235_151603
733601	contig_7861_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_77411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127006	127422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_127000_127400
733605	contig_16411_pilon	-	2974	1	Intergenic	novelGene_77330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGGGAGGGGCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168688	165714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_165700_168700
733606	contig_12671_pilon	-	2154	8	Intergenic	novelGene_19228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCACAAGGACACCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213659	197578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_197746_200235_200408_203718_203791_206725_206772_207054_207205_210608_210722_211051_211113_212286
733610	contig_6241_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_156404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184050	181408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_181400_184000
733611	contig_4604_pilon	-	2490	2	Intergenic	novelGene_19175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1642	1980	374841	373399	FALSE	30	TAACCCAAGAGCCTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSASSVIPFTECVLFTFSALTLLPLPLDKLYSTMSPNSRLSTSPENSLGRKENGILNKPLPQTSPVTSSLYFFNNNIHEVLTYARKLFKHFICIDSFNRQNHSFKKYHYP	376482	372888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_373701_374804
733617	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2824_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733618	contig_14925_pilon	-	939	4	Intergenic	novelGene_55069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	144	401	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29818	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
733619	contig_9997_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_169475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCCCCCTGCATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119492	118850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_-_118800_119500
733620	contig_11098_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_166677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1014	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1071	1403	24800	25132	NA	30	ACCCAGCCTAACAGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQMMCSQIGTAKSALVFGIINFQSQSLQEKRKLSAEENKNDFEVPSSSGILSTKSQNKDVNDGMLTFATCFKCCLPKQSNLMETFFIAIIFCCRLCHLSGAQCLMYNRY	23729	25502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_23700_25500
733621	contig_9053_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_87944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGTCTGCACCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268322	270262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_268300_270300
733622	contig_15613_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_147217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGTAGCTGCAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210695	209401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_209400_210700
733624	contig_5375_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_169210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACCATAGAAATATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69243	67791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_67800_69200
733626	contig_5375_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_169209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTGGAGAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67538	67077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_67100_67500
733627	contig_5375_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_169208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAAACATAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67128	66865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_66900_67100
733630	contig_3103_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_146200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTGGAAACAACCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87560	87815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_87600_87800
733634	contig_17144_pilon	-	1845	11	Intergenic	novelGene_29331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	193	1761	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183274	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166433_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
733639	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733645	contig_13721_pilon	+	2578	1	Intergenic	novelGene_169480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12268	14846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_+_12300_14800
733646	contig_3602_pilon	-	1509	12	Intergenic	novelGene_60665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	322.95635915299	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	640	951	1110937	1106687	TRUE	10	TTGCATGAGTCTCTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139469	1106034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106271_1106364_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111807_1111892_1111949_1112163_1112217_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
733656	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733658	SIRV6	+	214	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	516	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
733666	contig_12057_pilon	+	2222	19	Intergenic	novelGene_131629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	44.9392250780683	1	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	71	1342	121149	155480	TRUE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDECSRFPNWNQRPPS	99493	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151824_154509_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
733668	contig_1719_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_87340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCGCTGGTCTAGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592026	592685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_592000_592700
733670	contig_4857_pilon	-	1437	4	Intergenic	novelGene_48828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAACAGAATTCTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410988	1331388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1405451_1405553_1407010_1407144_1409946
733671	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
733674	contig_6325_pilon	+	2890	6	Intergenic	novelGene_143377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_4	16.7618614718056	218	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	121	648	561567	570467	FALSE	5	CAGTCGCTGTGCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQEEETGVTNGFGKHTESGSDSECSLGLSGGLAFEACSGLMPPKRSRGKPALSRVPFLEGVNGDSDYNSSGRSLLMPFEDRGDLEPLELVWAKCRGYPSYPALIIDPKMPREGLLHNGVPIPVPPLDVLKLGEQRQAEAGEKLFLVLFFDNKRTWQWLPRDKVLPLGVEDTVDKLKMLEGRKTSIRKSVQVAYDRAMIHLSRVRGPHSFVTSSYL	554246	572709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_554266_557802_557897_561559_561658_564889_564988_568723_568879_570283
733680	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733681	contig_6048_pilon	+	1186	5	Intergenic	novelGene_73092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	237.945765879538	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	24	470	130291	135654	FALSE	5	TCTGGACTTTGCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGGCRMMRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	130267	136370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_132370_132529_133141_133242_134181_134320_135606
733686	SIRV4	+	587	4	Antisense	novelGene_SIRV4A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20707	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCCTATTGACAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	14619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_8373_8629_8990_13671_13823_14592
733687	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	144	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733688	contig_14441_pilon	+	1335	5	Intergenic	novelGene_100326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	275.750226654485	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	304	744	6011	125560	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTVLRRDQGAVLRAGDPAHRGRQPDQGEPAQGGRV	5707	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6932_121198_121239_125517_125896_126489
733692	contig_10050_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_119629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACAAATATGTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242564	243942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_242600_243900
733695	SIRV5	+	192	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	325	151	211	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8526	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
733696	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733701	contig_10135_pilon	+	1089	6	Intergenic	novelGene_106594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_4	91.1034576731312	2775	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	231	734	67361	70941	FALSE	0	TCCTCTGGTGGCCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEATRRVVSEIPVLKTNAGPRDRELWVQRLKEEYQSLIRYVENNKNADNDWFRLESNKEGTRWFGKCWYIHDLLKYEFDIEFDIPITYPTTAPEIAVPELDGKTAKMYRGGKICLTDHFKPLWARNVPKFGLAHLMALGLGPWLAVEIPDLIQKGVIQHKEKCNQ	67130	71296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_67484_69570_69639_69879_69944_70239_70317_70562_70654_70860
733704	contig_2380_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_117900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTATGGGGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494588	494203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_494200_494600
733708	contig_1596_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_131594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115949	114291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_114300_115900
733712	contig_8452_pilon	-	636	3	Intergenic	novelGene_48109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	1575.5	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	26	346	981713	962919	FALSE	45	AAACGTAGAAATATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLPTKWSMRARLRMGGASRRRGHWPLSGSTLPIPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	981738	962628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_981637
733723	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
733725	contig_4782_pilon	-	1671	9	Intergenic	novelGene_73636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.948804067648	2	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACACAACTTTACTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417981	391680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_392536_393199_393285_397143_397231_397454_397526_397970_398048_412788_412884_414166_414400_415789_415935_417958
733727	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	319	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733728	contig_50_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_122236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCCTAAGTGCCTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138394	139641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_138400_139600
733731	contig_13823_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_145275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAATTATATGGACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307798	309280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_307800_309300
733734	contig_990_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_76079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTACACAGCCAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108728	1106112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1106100_1108700
733735	contig_21388_pilon	-	811	5	Intergenic	novelGene_136625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	788.053416653973	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	252	602	26799	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28500	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26806_27551_27649_28352
733737	SIRV6	+	455	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	212	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1726_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733738	contig_6175_pilon	+	2185	7	Intergenic	novelGene_16291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	27.5947861419911	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2	490	1389917	1399498	TRUE	15	CAGGAGACGGGGTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAIAASALTVTFGRLASACSRSILRASAPGAAPLWSAVQRLRSQSTSPPQGYVPKTSLSSPPWPEIVLPDPVEETKHHAEVVGKVNELIATGQYGRLFAVVHFAGHQWKVTSEDLILIENELDAACGERIRLEKTETARHVPYRTKRVFMVCLPLTNVLP	1389915	1403457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154_1396213_1397764_1397851_1399127_1399292_1399417_1400981_1401374_1401479_1403348
733741	contig_5234_pilon	+	1192	2	Intergenic	novelGene_169488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	67	636	217393	217962	TRUE	15	TATTTGTGTAGTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTDDSLREHFEKWGTLTDCAVMRDPQTKRSRGFGFVIYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRTVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVNKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGSGGNFGGRGGYGGGGGS	217326	218713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5234_pilon_+_218337_218531
733744	contig_16098_pilon	-	2022	3	Intergenic	novelGene_46226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGAAGCTGGAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768096	764995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765166_765591_765636_766288
733747	contig_6434_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_61871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAAACCCGTTGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848393	846729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_846700_848400
733752	contig_12312_pilon	-	2631	13	Intergenic	novelGene_64019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	45.3213066154688	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	78	1571	551353	547145	TRUE	10	TTTTTACTCTAGTTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSEAEHPLLCEGTRREKGDLALALMITYKDDQAKLKKILDKLLDRESQTHKPQTLSSFYSSSRPATASQRSPSKHGGPSAPGTLQPLTSGSMGPAQPGSVAGAGPGPTEGFTEKNVPESSPHSPCEGLPSEAALAPRPEGKVPSRLALGSRGGYNGRGWGSPGRPKKKHTGMASIDSSAPETTSDSSPTLSRRPLRGGWAPTSWGRGQDSDSISSSSSDSLGSSSSSGSRRASASGGARAKTVEVGRYKGRRPESHAPHVPNQPSEAAAHFYFELAKTVLIKAGGNSSTSIFTHPSSSGGHQGPHRNLHLCAFEIGLYALGLHNFVSPNWLSRTYSSHVSWITGQAMEIGSAALTILVECWDGHLTPPEVASLADRASRARDSNMVRAAAELALSCLPHAHALNPNEIQRALVQCKEQDNLMLEKACMAVEEAAKGGGVYPEVLFEFISRSRTGAWSLPLACTPTLLYSPTCPAALNTSPTQLTRPTPCLTCPGLPSSLCPALHTHRVCILHSWGLSTLTQ	551430	545420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_545888_546017_546197_546450_546574_546727_546905_547030_547191_547427_547610_547834_547919_548478_548703_548851_549142_549318_549548_549649_549809_549905_550147_551314
733759	contig_610_pilon	+	1548	7	Intergenic	novelGene_76796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_6	153.883794540628	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	25	1038	296008	340621	FALSE	30	TATATTATTCCCATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTELLLAPVHLPTHSGAGSADGCSGGIASTTVLMILAPPGESCEPGGVIPKWSHSRSRADIRKTFVSS	295983	341131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_309314_309419_313377_313441_321676_321769_340512
733762	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	195	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733766	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733767	contig_854_pilon	-	1352	9	Intergenic	novelGene_36444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGCGCAGCAGCCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459555	1451223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1451319_1453648_1453782_1454085_1454134_1454899_1455034_1455688_1455776_1456385_1456459_1457301_1457417_1458336_1458468_1459019
733768	contig_16622_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_48450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACCTCTATTTTTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110195	109425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_109400_110200
733770	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733772	contig_12790_pilon	+	2532	5	Intergenic	novelGene_35289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1779	2138	456578	458416	TRUE	35	CAGGGATGAACCTGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVSVCACFPVSKLSPAHIKVKECFYPSLLCAQAQDTPLPIGLTQVNKIGRQDAAKAGRCGADSHAHVSDHRGVQLGSVHIDHGEGSSDSKLAHHHQDCSQIVQVWGHQLQKEKNTAA	454418	462248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_455168_455548_456895_458373_458599_460281_460378_462132
733776	contig_10749_pilon	+	2081	16	Intergenic	novelGene_133506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.3432129784725	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	686	2059	292847	301943	FALSE	15	CGTACCAGACCTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNWNSCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVYNANSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSLSTRPSSGCAQVLSHPGHTPVTSLAWAPSGGRLLSASPVDAAILVWDVSTETCVPLPWFRGGGVTNLLWSPDGSKVLATTPSAVFRVWEAQMWTCERWPTLLGRCQTGCWSPDGNRLLFTVLGEPLIYSLSFPERYGEGKGRVGGAKSATIVADLSETTIQTPDGETRLGGEAHSMVWDPSGERLAVLMKGNPRVQDGKPVILLFCTRNNPVFELLPCGIVQGEPGAHAQHITFHPSFNKGALLSVCWSTGRIAHIPLYFVNAQFPRFSPVLGRSRDPPVGGGVSIHDLPLFTETSPTSALWDSLPGLLPAQPHSHL	288822	301965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_289250_289305_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293798_293898_294233_294378_299644_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513_301599_301727
733791	contig_11364_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_65188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAACAATGGATCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250869	252391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_250900_252400
733798	contig_3382_pilon	+	2398	10	Intergenic	novelGene_124017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_8	102.506127489236	169	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	172	1647	144970	174737	FALSE	15	GCGGGTGGACTGCAGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYNKGDGPYGSCTFQTQCIKLHICQYFLQCECKFGASCKRSHDFSSPETLVKLKKLGMSPDLVRRLPAIYRNANDIKNRGSAPDIPLPQATSERRNSSGPGSPNAASQEENDQICLYHIWKSCSFQGRCQRVHFHLPYRWQFLCEGTWKDLDEMELIEEAYSNPGKDGVSCAESADKLLVYWLCFDSMKFGVFPARRLSTASSVTKPPYFILTTEWVWYWTDQTGTWQEYGKQGTQHPVATVSSPELEKAYLAYCTPGSDAQVATLKFKAGKYKYELDFKAFVQKNLHSSTVRKVCRRPKYVSPQGVKMKKTCHVQFQGPKSVPNHWDPSALPELGFMRIALSPSSEEYQQVYKLFSRTLSSYLIQKIERVQNLALWEVYQWQKGQMQKRRGGEAVDERQLFHGTSDCFVDAICQQNFDWRICGLHGTSYGKGSYFALDAAYSHHYSEASAETHRMFLARVLVGEFVRGCSTCVRPPAKEGQRDVFYDSCVNSVSSPTVFVIFEKHQVYPEYLIQYTSGAQPAAATPLPPASDVGRPRNGLFGWLSRR	144798	175488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_145076_147915_148018_152130_152255_163712_163909_167686_167829_169120_169218_170776_170853_171890_172022_172924_173077_174387
733802	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733803	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733805	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_93021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3614	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
733808	contig_4531_pilon	+	1519	2	Intergenic	novelGene_47893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACAATTTCACTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328470	331291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_328727_330028
733810	contig_13937_pilon	-	2020	17	Intergenic	novelGene_167347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	66.452873338931	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1965	54	2018	62067	30866	FALSE	40	AGCAGTCTCATGAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICKLGFEVVENRDINSIVTENGEVCWKTITECVSFTESDQSLDYQGSVRRLGPLCEAVHLHFSSLTKAQFEIRYAPWFQWTNFPELFPEIFDALESLQSAAISLSLTKLTSCLERALGNVFLLVGKECPFLLRDLLASDELAQVFGQPVMDVLKVFVGSPSGLNLRNVLWHGFAAPQEIPPKYCSVMVLLTAGLGQLLKRFLRQTNRTLWHRSFLALTNLEDWIVFPDVTSEALSVLEDVMKKSTFVFKTMLPYWEAAVIKFRSHRFADCVILLLTQLEAGLRRAFATVNRCPQRLLTAESTVLYTTFDEMLAKELNDGTINQLPLLLGEPVMEFLWDFLNHQEGPRIRDRLSHGEVNLNEFPGEAANQLLAFSTVLLLRFTSGDVVSVLKEKAAIKSLISIAEGYSSHFHPASQLKKQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGSIKLLSPVLYLILLLIALELVNIHAVQGKHTCEYQRYLKFLKSVLQYTENLATYTSQEKNKWDETVSLTHGVLLKIWTYSEKKQMLMHLAEKPTD	62120	30863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36079_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274_45449_47031_47101_48570_48601_50572_50676_54171_54287_54957_55095_55517_55616_57597_57688_57975_58078_59681_59822_61949
733814	contig_6854_pilon	+	3327	7	Intergenic	novelGene_169493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_4	43.2691832858239	70	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	5	2356	472500	486510	FALSE	80	AATAAAAAAAGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMKVVQSSKPFAHPSNWAGFLLIGSDVKLNSPSSLIGQALTEILQHPERARDALRVLLHLVEKSLQRIQSGQRNAMYTSQQSVDNKVAGIPGWQALLTAVGFRLDPPASGLPAAVFFPTSDPGDRLQQCSTTIQSLLGLPNPALQALCKVITASETGEQLISRLHQVLVQLQAGEKEQDFASAPIQVSISVQLWRLPGCHEFLAALGFDLCEVGQEEVILKTGKQANRRTMHFALQSLLSLFDSTELPKRLSLDSSSSLESLASAQSVSNTLPLGYQHPPFSPTGADSIASDAISVYSLSSIASSMSFVSKTEVGLEGGGTRGRQDYDRSKNAYPQRSTLPQHQLSPQARTAGSKDEEEYEGFSIISTEPLAAYQENRKARFSPDHSQSRVGTAGGVKVSVSSKGSISTPNSPVKMTLIPSPNSPFQKVGKLASSDTGESDQSSTETDSTVKSQEESNPKLDPQELAQKILEETQSHLIAVERLQRSGSQASKSNNSDDGVSVPNSTTVFRASETSAFSRPVLSHQKSQQSPVTVKPKPPARSSSLPKVSSGYNSPTTSETSIKDSRSQNSGRPSPGSDSQTSLTDQPLFKLKYPSSPYSAHISKSPRNMSPSSGHQSPAGSAPSPALSYSSAGSARSSPADAPDIDKLKMAAIDEKVQAIHNLKMFWQSTPQHPTGPMKIFRGTPGTMTSKRDVLSLLNLSPRHNKKEGVVDKLELKELSLQQHDEAPPKPPPNGHWHAQTTRLSTLPLPAGTPAAPTRPLRLPSGNGYKFLSPGRFFPSSKC	472495	487481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_+_472552_475255_475381_476232_476465_477097_477175_479721_479852_483669_483778_484882
733817	contig_1276_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_159757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGACTAACGTACAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84779	85156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_84800_85200
733820	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
733821	contig_7457_pilon	+	2018	9	Intergenic	novelGene_31562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	15.5	138	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	63	1406	859493	867405	FALSE	30	TTTATGGCTATATGTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRPYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDKAKVVVLVNRVHLVTQHREEFSRMLDGRWAIATLSGDMGPRAGFGHQARSHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELSDFSLLVVDECHHTHKDTVYNIILSRYLEHKLRRVWPLPQVLGLTASPGTGGASMLSGAIDHVLQRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFSIYYTVSQKPVVIDRDFKDWSPGGTISCRNCGEAWGLQIIYKSVKLPVLQVRSMLFETPRGRLQAKKWSRVPFPVPDFNYVQHCAQNLRDLSL	859204	868017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_859661_859839_860042_860417_860609_864042_864193_864279_864442_865537_865729_866783_866881_867222
733822	scaffold_19766_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_34456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885715	887920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_885700_887900
733826	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_96733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
733827	contig_7594_pilon	-	854	3	Intergenic	novelGene_55443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAAAGCTTGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557089	551216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_551291_552952_552998_556354
733836	contig_13481_pilon	+	1845	13	Intergenic	novelGene_119295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	46.4279609239471	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	5	1258	190796	217837	TRUE	20	AGATTCTTACCTTCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAASREPLLSWCTEELRKTFSLDVSEEIMQYVLSIESAEEIREYVTDLLQGNEGKKGQFIEELIIRWQNNDQESISDPLQQYFKKDEILDGQRSGDQIKKSRRKGRNRQEVPSSFAEPDTAVEVKTPFDLAKAQENSSSLKKKTKFVNLYTREGQDRLAVLLPGRHPCDCLGQKHKLINNCLICGRIVCEQEGSGPCLFCGSLVCTREEQDILQRDSNKSQKLLKKLMSGTENSGKVDISPRDLLPHQKSRIKSGLEKAVKHKDKLLEFDKTSVRRTQVIDDESDYFASDSNQWLSKIERETLQKRQEELRELRHASRLSKKITIDFAGRKILEEENPLAEYHSKLDETIQAIANGTFNQPLTKSGRSSAEPLGILVNPNMDQPPPQVSRPRIRTRAQFTPAPDANPGPGVSGRL	190791	242606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_190891_196375_196546_197209_197347_205538_205752_207198_207278_210021_210152_211669_211886_214285_214424_217761_217901_220528_220654_221924_221987_236494_236598_242372
733838	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733843	contig_10183_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_169514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGCCCCGCCCCTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150598	160081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_152607_160014
733846	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733847	SIRV6	+	565	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3143_10707_10819_11031_11109_11205
733849	contig_5649_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_82325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	812	1117	371425	371120	NA	20	GTCCAGTTTATCAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVRRSLAVLASKEHPGCTSSKTDLFILLAVLSIFSSLHQHHNSNASILRSYLFIVYLSHAYEATENTVAWIRRTLVLKVTSLLFNT	372236	370024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_370000_372200
733850	contig_20550_pilon	+	2462	23	Intergenic	novelGene_142602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	302.766882475556	52	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	84	1343	3777	21251	TRUE	40	GTGCTTTACAATAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDGSWTSPSSTTHWEGMPSPFKDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGNEVKL	3693	38547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_11580_11644_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20618_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29367_30909_30967_37487_37553_37627_37774_38133_38247_38325
733851	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_97366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733854	contig_4900_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_159052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAAAGTTTACAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655359	654556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_654600_655400
733865	SIRV6	+	468	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	206	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
733870	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
733874	SIRV6	+	554	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1484_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733875	contig_9833_pilon	+	1591	11	Intergenic	novelGene_68525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	447.072074726212	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	53	1195	230823	259941	FALSE	10	CTCCTTGGGTAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNGWLATPLIARLSRGHRWTRLSLRRFLAISNLGSRRGAKLLCGGGAAADRGYFIQPTVFGDVQDSMTIAKEEIFGPVMQVLKFKTIEEVIRRANNSKYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWINCYDVFGAQSPFGGYKMSGNGRELGEYGLQAYTEVKTVTVRVPQKNS	230770	260337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250112_252410_252458_254644_254811_256795_256954_258491_258607_259908
733876	contig_19990_pilon	+	1815	10	Intergenic	novelGene_30753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	166.303678793486	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	107	919	48182	76077	TRUE	20	CTGTTTGTGTAGATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPKNHKIHLRSISFRSESRPDILAPRPWSRNATPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEDLLSQLRDIRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINIKTGNLNAAIIKNGSSTWRKARKTL	39564	82767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_39634_48144_48215_59204_59376_62749_62813_64728_64826_64991_65069_69960_70219_75963_76134_80027_80215_82114
733878	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733880	SIRV7	-	520	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-44	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAATCCTAAGAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114960	56039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114686_114809_114848
733881	SIRV1	-	155	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3653	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6713	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
733887	contig_16525_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_133823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	1816	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	61	1029	156877	158630	FALSE	25	GTCTGGACTGGAATCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTAIYESLPSLSPDLAGTRGGTESSLGWPSWGPWSSSDSSPAGVAPRLPGRSTSLVEGRACAWVPPPPGFAPLAPRPGPELSPSPTSPTATPATSSRYKTELCRTFSESGRCRYGAKCQFAHGLSELRQANRHPKYKTELCHKFYLQGRCPYGSRCHFIHNPSEDLATPGHPHVLRQSISFSGLPSGRRASPPPAGLPGPSLSSYSFSPSSSPPPPPGDLPLSPSAFSAAPGTPVPRRDPTPTCCPSCRRATPSLWGPLGGLARSPSAHSLGSDPDEYASSGSSLGGSDSPVFEAGVFGPPQPLAASRRLPIFNRISVSE	156816	159339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_157685
733889	SIRV6	-	374	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-167	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTAGCGTATAGACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3161_10723_10825_11035_11109_11205
733897	scaffold_880_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_121407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCACCACTTAGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308275	306551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_306600_308300
733898	scaffold_880_pilon	-	976	3	Intergenic	novelGene_121406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	598.5	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTCAGGTACCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306600	299573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_299632_303083_303176_305774
733901	contig_20879_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_168598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGCAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162154	159890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_-_159900_162200
733904	contig_57_pilon	-	1281	2	Intergenic	novelGene_44924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATGTGACCCTAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330543	329161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_330300_330400
733907	contig_15063_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_14274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3846.59686476241	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	345	1196	35271	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34817	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36569_38977_39092_39506
733908	contig_6710_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_96802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653369	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
733909	contig_20615_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_146915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	190	1590	197110	195461	FALSE	20	ATTTGGTTTAAGAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPNLTVLKRNSPELNPFECCECGKAFIDHPSHKHHTISHTGCSTCQCKECAETCGCPSHLFTPMRTLIAKKLYKCKLCGKDLSCMSVLKNSVITLSGEKRYECNECGKHFCSFSSFWTHVRGHKHECKECCKTYSRPSSLILHEKFHIRNMPYECKECGKAFSQSSTLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASSLTQHIRIHSGERPYECKQCGKAFSQASSLTRHVSTHTGEKPYECKECGKAFSRASSLTTHIRNHSGEKPYECEECGKAFSQASSLFKHRRTHTGEKPYECKECGKAFSDSSALTTHVRTHTGERPYECKECGKVFTCFSHLTTHIRTHSGVRAYECKECGKAFSQSAHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASALTRHITTHSGERAYECKECGKAFSRALSLTTHLRTHSGGEKPYECTECGKAFSDSSHLTTHVRTHSGERPYECKQCGKAFTQASHLTRHRRTHRGKTTLCEKWDVSFLLL	197299	195162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_195681_195929
733910	contig_6929_pilon	+	1761	7	Intergenic	novelGene_139366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	382	junction_2	117.296514109424	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	496	813	79910	90425	FALSE	35	CTCATTTGAAAGTTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77964	91373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356
733911	contig_19899_pilon	-	1177	4	Intergenic	novelGene_102535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_3	33.3199973322661	973	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	268	903	419823	407770	FALSE	10	GATGCTGCCTAGTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMQSHHHAYRKAMESYFNSLWSFPSAVLPYSYYANQGGYPQSFYDRHSASQDSHCTYPHFRGSGQHPHDSHWLQASTREEQALSSEEEVESESDGEVECDLSNMEITEELRQYFAETERHREERRRQQQLDAERLGDYVNADHDLYYNTHRSAEPPSESPSERRQAEMKRLYGDSAAKIQAMEAAVQLSFNKHCDLKRPKYWPVIPLKF	430038	407495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_408027_419444_419902_420536_420582_429894
733915	contig_1143_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_86625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249999	1252014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1250000_1252000
733917	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733918	contig_10324_pilon	+	2298	16	Intergenic	novelGene_7865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	31.3195714459115	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	62	1009	467757	477132	TRUE	10	CACAGCCGTGCCTCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATSHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPLVDHQG	465574	501873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_465612_467732_467820_468651_468699_469777_469945_472375_472540_475369_475598_475850_475950_476201_476280_477030_477251_482693_482838_482903_482948_497674_497784_498130_498233_498971_499105_499247_499391_501377
733920	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_93697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733921	contig_9771_pilon	-	2389	1	Intergenic	novelGene_156916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCAAATGTTTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334395	332006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332000_334400
733922	contig_7202_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_16804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACGTAGTCACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
733923	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1557_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733927	contig_8259_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_148869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	731	1075	158703	159047	NA	25	CAATGGTTGCCAACCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRCRSKQDRERSRSAGFLGLLKKLLVAVSLEAPLVEAEPGISYGQQDQPSNCHRHVGASARGQQGLSPLPLREVSGSFSFRYVESATLIPLPCRKSPKGNGRALSYPEAPCLS	157972	159851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_158000_159900
733928	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733935	contig_6710_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_97056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGAAGGAAGCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653371	653882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
733938	contig_10753_pilon	-	2817	1	Intergenic	novelGene_105159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCACTGCCATCGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416458	413641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_413600_416500
733939	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
733941	contig_14133_pilon	-	284	2	Intergenic	novelGene_119937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208670	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206748_208573
733943	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733944	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
733945	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
733946	contig_9571_pilon	-	1825	5	Intergenic	novelGene_136281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	545	junction_4	452.425684505201	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	152	499	528898	444231	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDSGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKE	529049	442904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_444294_463910_463965_465848_465969_479402_479461_528845
733948	contig_19769_pilon	+	872	5	Intergenic	novelGene_102291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1653.76606190235	52	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	220	591	87249	88869	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKDPREAALRLQEGHLLSQQSRGWCGGWWWPH	87029	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87975_88040_88841_88958_89163
733949	SIRV6	+	530	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733954	SIRV6	+	549	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	10	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733956	contig_5280_pilon	+	1974	11	Intergenic	novelGene_52649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_1	238.551566752348	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	28	1794	258913	329255	FALSE	20	TTCTGTTGCAAACTAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASSPRSPKPPGPPAPCLSCAGGALLAVLVLLALPAAWGQCKAPEFFLFAKPVNLTDESEFPIGTSLKYECRPGYYRKLLPPIICLENSIWSSLENLCKRKSCRPPPDPVNGIVHVNTGIEFGSTVNYSCNDGFRLIGHSSNTCIISGKTITWEKEAPICERIPCGPPPAIANGDFYSSDREYFHYGMVVTYRCNSEKNGRKLFDLVGEASIHCTSKDNQVGIWSGPPPQCRPPWNMCTPPNVENGIRVSVDKKLFVLYESVKFRCLPGFVMKGPGRVQCQVQNKWTPQLPSCSRVCQPPPEILHGKHTPSDKANFSSGEEVFYSCEPGYDLRGAAFLRCTPQGDWSPAAPRCEVKSCDNILDQLPNGRVLSPPSLQLGAKVSFVCDEGFRLKGRSFSHCVLVGMKSLWSNPVPVCEQIFCPNPPAILNGKHTGNALGNIPYGKEISYTCDPDPDRGMHFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVPAGHCKTPKQFPFATPTTPIDESEFPVGTYLDYECLPGYSGSSFSITCLENLVWSSAEDACKRKSCGYPPKPSNGMVLINTDVQFGSTINYSCNEG	258885	329435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_259031_272773_272957_273638_273739_292635_292722_315755_316158_317831_318009_318096_318200_319522_319609_324496_324725_327093_327274_329151
733957	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
733960	contig_10016_pilon	+	2670	1	Intergenic	novelGene_117845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1451	1789	258168	258506	NA	30	ACCAATTTGACAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATGESKGEGARGGTNTRPRQAYVGFSFISYHSRCNPTANQSELSLYTEAVSIEHMEQPHPEGLIQCLAFTNSLIYLNEIILEEKKKQTSNQDKSPTQREKISKRERKKPT	256717	259387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_256700_259400
733964	contig_7428_pilon	+	1952	10	Intergenic	novelGene_77730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	103.160548493269	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1156	1701	434083	435117	FALSE	40	ATTATGAAAACAGGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	429287	435368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433445_433547_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
733966	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
733968	contig_16122_pilon	-	2100	6	Intergenic	novelGene_134558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_5	32.6655782131589	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	713	1096	282755	282038	TRUE	15	GCCCACTGAGTGCTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVQGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGIWSLSSHGCRAGGWAWVLLPNGDVSVP	284774	280591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_282282_282524_282649_282739_283302_284184_284239_284662
733969	contig_2704_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_75310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAACCAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224857	226967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_224900_227000
733972	contig_14450_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_48959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAGGACAAACTAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038582	1036240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1036200_1038600
733974	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
733975	contig_10627_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_60037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647825	646046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_646000_647800
733976	contig_9839_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_88588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACATCCATGTAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334508	334284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_334300_334500
733978	SIRV4	-	328	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1195	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
733980	contig_14322_pilon	-	2656	5	Intergenic	novelGene_115618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	7.34846922834953	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	187	1629	113665	107396	FALSE	35	GAAAGGAGAGTCAGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSLPLWPQGSVTFEDVAVDFSQEEWELLDPAQRTLYREVMLETCRNLVSLGCSLCQPVAPPHLEQGEAVWMVDRGIPQAFCSDWETRLEIQESIYKKVILGWKPSSGMNIIKFTRGDGECVQFEKNHEDSQRLLRQMAYVQVQAFTQMRASVWNEFGENGNLSLHRVLAQGSPPRKHFHECDLHIGSLVSDSVLNSHQVGYVDQIPCNNNECGKVLSQSGHLIQHERSQTEEKMSLYAESGKSFCHSTALTIHNKIHMVEKPYECVQCGKVFNRRHSLSEHQRIHTGEKPYDCQECGRAFTHSSTLTRHLRIHTGEKPYVCTKCGKAFNRISSLTQHQRIHTGEKPYTCEDCGKSFCQSSYLILHKRTHTGEKPYECNECGKAFSDRSSFNQHERTHTGENPYECNWCGRAFSQRSSLVRHERTHTGEKPYCCNECGKAFSQSSSLITHQKTHTIQKTFKIIDCGKAFHQSTHLIGF	123414	106368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_108583_110668_110765_112650_112778_113632_113707_123269
733984	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
733987	contig_12864_pilon	-	1537	7	Intergenic	novelGene_76390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	486.298490869777	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	67	609	223293	217842	TRUE	65	GTAACATAAATACAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223359	214881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215792_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
733988	scaffold_14128_pilon	+	2611	15	Intergenic	novelGene_169526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	179.365036521978	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	249	1871	323604	496930	FALSE	15	GTTGTGGTAGTACCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAAESRDAAPGKQNEEKTYKKTASSAIKGAIQLGIGYTVGNLTSKPDRDVLMQDFYVVESVFLPSEGSNLTPAHHYPDFRFKTYAPLAFRYFRELFGIKPDDYLYSICSEPLIELSNPGASGSLFFVTSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCMQSGGINIRIVVMNNVLPCAMRMHYTYDLKGSTYKRRASRKEREKSNPTFKDLDFLQDMHEGLYFDTEMYNALMKTLQRDCRVLESFKIMDYSLLLGIHILDHSLKDKEEDTSQNVPDAKRPAMQKVLYSTAMESIQGSGKSGDGIITENPDTMGGIPAKSHKGEKLLLFMGIIDILQSYRLMKKLEHSWKALVYDGDTVSVHRPSFYADRFLKFMNSRVFKKIQALKSSPSKKRCNSIAALKASSQEIVSSISQEWKDEKRDLLTEGQSFSSLDEEALGSRHRPDLVPSTPSLFEAASLATTISSSSLYTGEHYPHDRPTLYSNSKGLPSSSTFVSEEGTIYLTSEPDAPETQDDNDSVLDVYL	283546	497670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_283710_316132_316218_323603_323673_371402_371534_385290_385409_391348_391502_393126_393427_424169_424382_425680_425765_425887_425937_430723_430809_434788_434945_437823_437969_479042_479161_496927
733991	contig_19564_pilon	-	1327	5	Intergenic	novelGene_29612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.43123896188	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	171	1325	15529	11353	FALSE	65	GAAATGAAAAAAAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPHSTLQVSICVELAAFFHIEKMTLPQEPKIN	15699	11350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11442_12460_13259_13554_13666_13945_14046_15472
734001	contig_5005_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_84338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGAAATGTTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654228	653740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_653700_654200
734004	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3112_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734009	SIRV2	-	328	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4545	34	3370	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
734011	contig_12923_pilon	-	1848	12	Intergenic	novelGene_30089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	298.138882718155	11	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	87	1694	93727	45496	FALSE	20	TATGAGGTTCTACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSLCGSNLRLVRHIHRVGSWKNIRGLRGTSFSPERDSLS	101254	45341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45611_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
734014	SIRV6	+	444	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-28	8843	15	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
734016	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734021	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	8	1200	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
734024	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91672	0	-91666	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATTGAGACAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
734028	contig_9114_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_155184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGTGGATTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153825	153321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_153300_153800
734029	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734031	scaffold_13505_pilon	+	1735	4	Intergenic	novelGene_111387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	17.5562587763516	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	271	648	128320	128885	TRUE	0	GTCTCCCGCCTCTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEENPASKPTPVQDVQGDGRWMSLHHRFVADSKDKEPEVVFIGDSLVQLMHQCEVSAVHLLPYPCLVATLTHLGQSPSQAGCGVPEIASGSAGHRESRRKVQHSTEKVMCPLALSGWVVYSET	128049	130646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_128398_128585_129524_129614_129738_130320
734035	contig_6710_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_96609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
734038	contig_5502_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_155004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451541	449364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_449400_451500
734039	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	104	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734040	contig_6710_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_95705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
734041	contig_11512_pilon	-	2410	6	Intergenic	novelGene_43327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	420	998	471257	470679	TRUE	35	CCTCCCTGAAAGAGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVQWDLGSSTENQLALETKGRVKILKCKSDKVTSLSTPISLHLKNTCHSENLSPSITSSGSLPCPSREKWPLPPWATTGLGADLHHGARKAEEHLLGCVAHSTLCWKLLKGRSPIVFIPTCPVPSGDPFFSLASLLQISQGIPGYEPLRHSAADKTVGGLSPAKGALEERPGKPLLKNQSLKTLWSTVLL	471676	434420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_434579_435569_435738_452269_452450_455921_456025_468851_468991_470014
734042	contig_13014_pilon	-	1949	3	Intergenic	novelGene_169331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	621	junction_1	145	108	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTTTTCAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303947	299793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_301265_303161_303230_303537
734047	contig_7396_pilon	-	1589	14	Intergenic	novelGene_79643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3216.76191333779	1	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	81	455	255163	250341	TRUE	30	TAGTTCCTTACAAACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPSFLGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVVPTL	257067	246245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248493_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250862_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254712_255146_255191_257014
734049	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734051	contig_13633_pilon	+	1689	12	Intergenic	novelGene_15324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	421.755069730021	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	332	442	22853	28350	TRUE	25	TCTGATTCTGTGTGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	20264	49443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31764_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
734052	contig_18420_pilon	-	1864	12	Intergenic	novelGene_109368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_11	300.046663037602	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	52	1446	142813	109372	FALSE	10	TGCCAGTGGCCTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142864	108953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
734059	contig_15459_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_106369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGGAATTGTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11298	12162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_11300_12200
734060	contig_13004_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_112688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	234	581	816719	817066	NA	35	AATGCTTAACCACTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSSSCQGLRIRKRREVDVVIKRQHEGAFADKTVVNLDCGGSYMNLHVTKVHRTTYTHKRAHVLLDPLLSCQILTHSDPTGQGRTAPQVFQGCNLYGNRLPHLSPVEQLVGLNC	816485	817084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_816500_817100
734067	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1012	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734068	SIRV1	-	212	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3596	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
734074	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734075	contig_15042_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_115434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28189	30438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_+_28200_30400
734076	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734088	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734089	contig_14300_pilon	-	1099	8	Intergenic	novelGene_133091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	104.188996246127	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	417	929	155860	148003	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPEIFNPEKEREAGISTSNKKSLRSRQH	180313	147832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_170673_170839_180214
734092	contig_7707_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_72197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAAATCTTTTGTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657716	654972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_655000_657700
734098	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
734101	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_93575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734104	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	23	-2	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734105	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734106	contig_12638_pilon	+	2090	2	Intergenic	novelGene_33182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1179	911	2089	244775	245953	FALSE	50	CTAAAAAAGGTATGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRVNLPTTVPNFNNPSPTVVTAATSVHESSKNIQTFSTASIGTAPPNMGGSFGSPTFSSTIPSTASPMNTVPPPPIPPIPAIPSLPPMPSIPPIPVPPPVPTLPPVPPVPPIPPVPSVPPMTTLPPISGMPPLNPPPVAPLPAGMNGSGAPMNLNSNLNPVFLGPLNPVNPIQMNSQNSVKPLAINPDDLYVSVHGMPFSAMENDVRDFFHGLRVDAVHLLKDHVGRNNGNGLVKFLSPQDTFEALKRNRMLMIQRYVEVSPATERQWVAAGGHITFKQSMGPPGQTHPPPQTLPRSKSPSGQKRSRSRSPQEAGFCVYLKGLPFEAENKHVIDFFKKLDIVEDSIYIAYGPNGKATGEGFVEFRNEADYKAALCRHKQYMGNRFIQVHPI	243687	245954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_244578_244754
734109	scaffold_8345_pilon	+	1605	9	Intergenic	novelGene_107029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.387069347673	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	130	1383	786695	797810	FALSE	30	AAAACTGCATTGTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTQGSKYIDEEIQNALKGMKEIKNLMGQTDEERQTLLSTLEKAKKQKEDAVKVTRDTEMKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSVTSKTTDLDNSSKLGDTEVVVKLFDSDPMTMMVPKEVSWRRPKFMEIVAKKALDEFRKNNQEEK	779409	798032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_779474_785081_785145_786692_786842_789230_789402_790271_790675_792008_792117_795998_796229_797376_797559_797797
734111	contig_6048_pilon	+	1634	13	Intergenic	novelGene_73251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	73.3687414518078	4	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	73	1230	1972099	1978064	FALSE	25	TATTCCAAGGGTCAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASGPPGLRLRPLTSVPPACSPAAMHPSPPGPLDDCLRDWENLQQDFQSIQEAHRLYRLKLEELTKLQNNCTSSIGRQKKQLQELGLVLRKLGPVPTPWARDANPPSRQGPRRLCRSSRTRSKSAKGSSSTWKPICPRRMGEAGGCRQDGRFGREDGTDLKRLLQGVSQGAGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972026	1978468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974036_1974209_1974327_1975328_1975423_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
734112	SIRV6	+	550	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11036_11109_11205
734113	contig_7593_pilon	+	2094	2	Intergenic	novelGene_127369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	47	403	720387	721156	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRSHTRCPLKYTFYVMLCKMILQTKAVTINTQRHFCTYQPCCIHGHYNRLLLIAREENVSGVYSQGAQKLLVAMGATPLVSQAMCVVDILKLGPHIQQFPAKSMTKPPTRIGYSTAFIMNSTFNTIMTYYTLP	720340	722847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_720513_720925
734117	contig_9345_pilon	-	1041	5	Intergenic	novelGene_24688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1971.40817374282	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	253	585	955353	947815	FALSE	20	CTAGATGTAGTATTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPVFHLSIIYLRLQIRSHLATSI	1001327	947358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947880_952448_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
734118	SIRV1	-	191	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3913	0	3639	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6727	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
734120	contig_7202_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_18522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTCAAAATAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	27651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
734121	contig_14664_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_169536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21613	19863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_-_19900_21600
734123	contig_6445_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_77024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTTAGTGGAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533260	531721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_531700_533300
734126	contig_7171_pilon	-	1311	15	Intergenic	novelGene_101306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	105.503965492743	1	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	47	1192	1070516	1057742	FALSE	5	TCTGCTGTTATCTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQEWLPASSAEGKGQMVGCLPQLCQSHPPEPSLWNPYHREPDQPPRLPPKNEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFTLNRSDQEATLEMLFPGRTTWVYSINNILMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKENRAGGPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASCGGPFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPSPLSVFTLLTGPGSELPAVCIGVSTRKPAKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHKGPVQVTQVEEDMVMVLMDGTLKLVTPEGAPVRGLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1070562	1057622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062029_1062644_1062749_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066625_1070367_1070405_1070513
734127	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734128	scaffold_13505_pilon	-	959	6	Intergenic	novelGene_111442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	309.064135738846	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	24	551	535595	531050	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535618	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532777_532920_532999_535516
734129	contig_3602_pilon	-	1218	8	Intergenic	novelGene_60663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	328.709908706191	123	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	98	871	1139393	1106381	FALSE	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEHEDQGASRERWGLRPWLETSPPHPTKGSRRPKLWPCGLSSEAGPAGWTVTLYPCFTLAPAHLFKPPWCPFPPLQKPALQNL	1139490	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106625_1111740_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
734130	contig_16776_pilon	-	1051	3	Intergenic	novelGene_130501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	27.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTCTGTTGTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58017	34677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_41422_41567_57706
734131	contig_7391_pilon	-	2010	8	Intergenic	novelGene_112143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_7	51.5023280630921	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	951	1676	330262	316481	FALSE	10	CACGTTGTGTGGGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKYDPQFGDAFWNSSKYGMVTYLLRMMTSWAIVCSVWYLPPMTRETDEDAVQFANRVKSAIARQGGLVDLLWDGGLKREKVKDTFKEEQQKLYSKMIVGNHEDRSRS	331212	316146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316590_322885_322966_323053_323183_326974_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206
734133	contig_10197_pilon	+	1473	8	Intergenic	novelGene_115286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	69.243728073747	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	89	1345	1255988	1263353	FALSE	5	CTTTTGTTACCTTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILLAGAPQCAGSEGPRLGVELQRTHRPRMQALILLLWTGAFLGHGSSQNTGGSLEEGSPAPDTTGIPVEEEDPFFKVPVNKLAGAISNFGYDLYRVRSSMSPAANVLMSPLSVATALSALSLGAGQRTESTIHRALYYDLINNANIHSTYKELLATVTAPQKNLDSAFRIMFERKLRIKTSFVSPLEKSYGTRPRFLTGNPHVDLREINNWVQAQTKGKIASSTREMPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1251746	1263481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1251828_1255980_1256072_1257966_1258166_1258884_1259041_1259455_1259660_1260794_1260938_1261911_1262123_1263093
734134	contig_12701_pilon	-	1510	5	Intergenic	novelGene_169555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_3	35.742132001323	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	83	796	40561	30461	FALSE	30	TTCTGCAAAATCAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTR	52287	29746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_52219
734136	contig_7202_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_17604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27823	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
734137	contig_12998_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_168961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATTCTGTGTCTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	9685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_9700_10800
734145	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	9	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734148	contig_13992_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_147647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAGTTCGATATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565724	564699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_564700_565700
734153	contig_12279_pilon	+	1016	5	Intergenic	novelGene_50092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2044.32450640792	5	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGATCTTCATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57534	77634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68481_71603_71711_75031_75096_77041
734154	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734157	SIRV4	-	341	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	23	1157	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
734164	contig_8801_pilon	-	1816	4	Intergenic	novelGene_66297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	719	1132	546210	545797	FALSE	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549239	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546220_546385_546516_547738_548273_549194
734165	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
734169	contig_12270_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_113383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGCCTGATGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13846	14419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
734171	contig_12125_pilon	-	2527	1	Intergenic	novelGene_76235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	196	567	434870	434499	NA	15	CCAGAGGTCCTATGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLDVVELAEPEEVEVLEPEEDFEQFLLPVIHEMREDIAALTRERGRAYLRTRGKLWEMDSMLLQIKTQVEASEESALNHLQNADDGAAARGEKAEEKAREMAKMAEMLVELVRRIERSESS	435065	432538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_432500_435100
734177	contig_4087_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_156081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGAGTTCTGACACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139643	138785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_-_138800_139600
734180	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734181	contig_12464_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_68633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAACTCCAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58565	58870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_58600_58900
734184	contig_5684_pilon	+	1745	8	Intergenic	novelGene_80993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.2957243592276	176	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	803	1558	137861	143688	FALSE	30	GTTATAATGTGATTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQATEDLTGSGQSCENEPLLDPVGNEAPGPESHSGEGDGLEVAKQLESSLQLNLAEGNESQLEKSMVAEEEEEEEVEEEGRGSCSEDDYSELLQEITDNLTEKEIEVEKIYVDTSSFVEELPGEKDLGHVVEIYGFEPALKTEDLLAAFSEFQEKGLKIQWVDDTHALGIFPCLAAAAEALSRDFSMLKIRPLTQGSKQSKLKALQRPKLLQLAKERPQTNTAVARRLVARALGLQHKKKERPGVENLLS	115611	143875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_115838_135930_136056_136661_136800_137547_138149_139407_139581_140965_141037_142489_142586_143560
734187	contig_9177_pilon	+	2092	16	Intergenic	novelGene_32648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	59.3564000106326	1	80	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	1501	2091	105101	106110	FALSE	20	GCAAAGCTGAGGCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEK	57881	106111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_74357_74445_87402_87524_99894_100009_100303_100440_100685_101142_101378_101441_101950_102081_102242_102318_102531_102614_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001
734193	contig_7078_pilon	+	1849	3	Intergenic	novelGene_130111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	78	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29759	220808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_182312_182515_219236
734195	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	31	375	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14439	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
734200	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
734202	contig_14683_pilon	+	1671	6	Intergenic	novelGene_166029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	43.8789243259221	230	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	112	762	20207	52585	FALSE	50	AAAATCAAAATGGACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLREEIQPGDIIIIDQFIDRTTVRPQTFYDGSCSSARGVGHIPMAEPFCPKTREVLIETAKKLGLRCHSKGTVITIEGPRFSSRAESLMFRTWGADVINMTTVPEVVLAKEAGVCYASIAMATDYDCWKEHEEAVSVDKVLKTLKENANKAKSLLLTTIPQIGSMEWSETLHNLKNMAQFSVLLPRH	16530	53494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_20184_20353_40569_40673_44821_45062_49228_49352_52546
734206	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734207	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_97799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734209	contig_6589_pilon	-	1807	11	Intergenic	novelGene_26265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	58.5700435376311	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	914	1750	2230610	2227865	FALSE	15	CAAGCTTGGCCAGCGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2231629	2227807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230523_2230632_2230737
734210	contig_5779_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_106448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGCCCGTTTGCCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93520	94069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_93500_94100
734212	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734213	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734214	contig_10235_pilon	-	834	6	Intergenic	novelGene_46492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	794	junction_5	706.278868436541	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	9	470	222843	219405	TRUE	25	CAGTGAGCAGGGAATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	222851	218058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804
734217	SIRV6	+	246	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	232	7	-62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCGGTGGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
734219	contig_5770_pilon	-	741	6	Intergenic	novelGene_74178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2103.27348673443	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	152	706	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265083	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
734222	contig_6102_pilon	+	2219	10	Intergenic	novelGene_32289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	573	1094	1467480	1469267	TRUE	30	CTAGAGGTGGAATAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLDPSTPSTLSPSLLCWSLPVLRSLGAGSLQDPQVIVLFGHSKFEATHGVVEAKGGVLGSQGAGEHSHDGVQGSKVRVAAVLSSPTVVPPAPAGQPLSILEPLDLGAGHGELGEEFVRLGTGDALREICHLQHPTQDNICCPQVSGGRFECLSLAPVSMLQSTLSLVHCVS	1466907	1479203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1467896_1468791_1468876_1469245_1469343_1470542_1470695_1471107_1471280_1476422_1476523_1477581_1477859_1478316_1478479_1478718_1478848_1479145
734224	contig_5779_pilon	-	926	2	Intergenic	novelGene_106443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94519	93306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94067_94353
734231	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
734234	contig_5965_pilon	+	2533	4	Intergenic	novelGene_154664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	47.1192341005478	31	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTGTGTCTTGTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217321	231896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_217423_221319_221485_221670_221791_229749
734235	contig_20875_pilon	+	1534	13	Intergenic	novelGene_153099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	122	junction_1	245.88427438307	428	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	321	1292	59053	64097	FALSE	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACLDELSCEFLLAGAGGAGAGAAPGPHLPPRGSVPGDPVRIHCNITESYPAVPPIWSVESDDPNLAAVLERLVDIKKGNTLLLQHLKRIISDLCKLYNLPQHPDVEMLDQPLPAEQCTQEDVSSEDEDEEMPEDTEDLDHYEMKEEEPAEGRKSEDDGIGKENLAILEKIKKNQRQDYLNGAVSGSVQATDRLMKELRDIYRSQSFKGGNYAVDLVNDSLYDWNVKLLKVDQDSALHNDLQILKEKEGADFILLNFSFKDNFPFDPPFVRVVSPVLSGGYVLGGGAICMELLTKQGWSSAYSIESVIMQISATLVKGKARVQFGANKSQYSLTRAQQSYKSLVQIHEKKRLVHTPKGRWLTPERHPILLPRRHWTNYLLNAVFGSHAASVVPSLGFPGRDSSACCRTVTAILNAKEKTHTQLSQVLQTD	56211	64339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_56352_58546_58652_58977_59083_59687_59739_61316_61458_61638_61724_61984_62046_62249_62341_62451_62511_62609_62659_62895_62992_63311_63380_63856
734236	contig_16103_pilon	-	1238	6	Intergenic	novelGene_118798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	183	junction_5	140.60213369647	1742	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	634	1074	590829	589263	FALSE	10	TGTTTTCTTCCCCGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGAGRHGLPQGRRLCWLLCAVALKFCHAEAPVREDKQSVSTSNLQCWLVEEFVVAEECAPCSYFQAKTIPECSSTGYVEKITCSSSKRSELKSCRSAVMEQQLFWKFEGAVVVVAMVFACLVIVRQRLLDRKALEKVRKQMEST	591731	589098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_589420_589795_589876_590287_590371_590564_590603_590746_590849_591117
734237	contig_4891_pilon	+	1207	7	Intergenic	novelGene_124570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	487.373829826756	4	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	301	852	707907	756631	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	702897	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_703063_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
734241	contig_13428_pilon	-	1561	3	Intergenic	novelGene_143457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATGTTAAGTTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157521	150857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_152207_152658_152685_157335
734242	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734243	contig_2646_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_69690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAACGAAGGCTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2343766	2341798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2341800_2343800
734246	contig_3942_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_128797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1312	1713	920269	919868	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLQRYQRPSVPSTASPFQAQDGAFPLGSPTPQRGVWTLPWKPSLRDASPQPITGGPSWQLHPSRRSDNKVGVTGGKEVSDTGPGEDPRRNVALWGPQGEGVSLGWGLSLLEAWRGSVPYPGDPISAGSWGP	921580	918762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_918800_921600
734252	contig_5999_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_45639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGACCAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211819	211497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_211500_211800
734253	SIRV1	-	243	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	0	3587	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
734254	contig_5954_pilon	+	1719	3	Intergenic	novelGene_28411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAAGTAGAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93369	96099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_94753_94885_95014_95891
734260	contig_13305_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_146769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGTTGTTTTACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63763	66114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_63800_66100
734262	contig_8452_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_48113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	1	4	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	72	302	966277	967147	FALSE	25	TTTGACTCATAGCGATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVCFLRQRYIKLWKVKYCGTEHMNGAIMCSLQKQDKVIYEAVSERAGDKPVVKNETVVPPEGIMELLDLGVVVGRKTNFYHAPQIVLELKQLWISGQG	966205	968375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_966435_967074
734265	contig_12644_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_44513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118161	1120267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1118200_1120300
734271	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_89224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653719	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
734273	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
734275	contig_13424_pilon	+	3619	12	Intergenic	novelGene_151607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	70.4755980276533	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	17	1678	186186	213792	FALSE	10	CTTCATTTGTGTCTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVITMSAPFFLGKIIDVIYTDPAVDYTNSLTNLCLALSGVFLCGAAANAIRVYLMQTAGQRIVNQLKASLFSSVLRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQASFGIGMMFFVSPKLAIFVLSVVPPVSILAVIYGRYLRKLTRVTQDSLAQATQLAEERIGNIRTVRAFGKEMTEIEKYTSQVNCVMQLARKEAFARAGFFGAAGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGQLSSFLMYAFWVGLSIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLERKPELPFDEGISLNEKAFQGTLEFKKVHFAYPARPEVPIFQDFSLCIPSGSVTALVGSSGSGKSTVVSLLLRLYDPISGTVTLDGCDIRELNPVWLRSKIGTVSQEPVLFSCSIAENIAYGADNPALVTAEQVERAADVANAAAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMEGRTVLIIAHRLSTIKNANMVAVLDHGKITECGKHEELLSKPDGIYRRLMNKQSFMSA	186169	215733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_186349_187229_187433_189576_189712_192916_193064_193959_194096_196665_196762_198304_198515_204013_204094_205457_205639_210596_210641_213056_213092_213560
734276	contig_4891_pilon	+	2248	3	Intergenic	novelGene_124552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1316	junction_2	22	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	137	592	701017	709067	FALSE	30	AGAACCCTGATTCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRYFPILSFPWEKEEGANGRIQKMEWRCPEK	700880	710723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893
734279	contig_11855_pilon	-	1915	16	Intergenic	novelGene_67001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	28.8690530191453	357	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	978	1808	1327158	1316223	FALSE	0	TTTGGTCTTTTGCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEAISKERGSFLYGTPTMYVDILNQPDLSSYDISAMSGGVIAGSPAPPELIRVIINKLNMKELVIAYGTTENSPVTFMNFPEDTVEKKAESVGRVMPHTEAQIVSTENSGLMELNKPGELWIRGYCVMLGYWGEPQKTEEVVGQDKWYRTGDIAVMDKEGFCKIVGRSKDMIIRGGENIYPAELEDFFHKHPQVQEVQVVGVKDERMGEEICACIRLKSGENATAEEIKAYCKGKISHFKIPRYIVFVNKYPLTISGKIQKFKLREEMEQHLKL	1361132	1316115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1316274_1316566_1316636_1316837_1316949_1317037_1317180_1318165_1318318_1319576_1319685_1326334_1326412_1326748_1326841_1327129_1327288_1327471_1327568_1328245_1328335_1328439_1328559_1329119_1329174_1329417_1329547_1329950_1330147_1360967
734280	SIRV6	+	436	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10313	1	1163	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11400	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
734282	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734283	contig_2062_pilon	+	1869	3	Intergenic	novelGene_139017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	252	499	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	238	1002	1008971	1009783	FALSE	20	ATACTTGTTTTCTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADHMMAMNHGRFPDGTNGLHHHPAHRMGMGQFSSAHHHQQQQPQHAFNALMGEHIHYGAGNLNATSGIRHAMGPGTVNGGHPSSALAPAARFNNSQFMGPPVASQGGSLPASMQLQKLNNQYFNHHPYPHNHYMPDLHPAAGHQMNGTNQHFRDCNPKHSGGSSTPSGSGGSNSGGGGNSSSNMPASVSHVPAAMLPPNVIDTDFIDEEVLMSLVIEMGLDRIKELPELWLGQNEFDFMTDFVCKQQPSRVSC	1008297	1010650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1008527_1008962_1009489_1009536
734284	contig_10494_pilon	+	1804	5	Intergenic	novelGene_102203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_4	38.2516339520288	2057	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	27	446	1083273	1087047	FALSE	15	CTACCCCTGTGGTGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAAGPPKMAVCIAVIAKENYPLYIRSVPTENELKFHYMVHTSLDVVDEKISALGKALVDQRELYLGLLYPTEDHKVYGYVTNSKVKFVMVVDASNTALRDNEIRSMFRKLHNSYTDVMCNPFYNPGDRIHSRAFDNMVTSMMIQVC	1083246	1088405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083306_1085096_1085270_1086225_1086314_1086606_1086687_1087001
734289	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_96610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734290	contig_19209_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_169568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAGGAAAGGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208970	209714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19209_pilon_+_209000_209700
734291	contig_12746_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_152199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	35.8407589205363	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	108	1394	686644	716002	FALSE	35	CAGAGGGTCCACACAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPCESSAKTCFSPENLERHSIPEALRLKWKNLTSLMMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPRRLWQWISIQVLGQEISEKMDSPSCHVREAESHHEVVPQELGLQSSASEPADQLSHAVKEESDTEQELVMATSQFLARPEEGLIRDQDFGASLLQASSQEHWRHLDSTEKEHYWDLMLETYGKMVSGGDSQENDKENLHLENYRDQEPPNVSCDISGEAPPQASMSGFFSEDEPSRFGEGEHLPEAQGNLQGEGRGEQLSPQKRSSGKQPDQHLPNPHPGDLSVLWLEEKPEAPQKGQLRPPMTQKLPTCKECGKTFYRNSQLVFHQRTHTGETYFQCPTCKKSLSAEFRLCEASENPHRRETL	686536	716054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_687034_687710_687898_688330_688423_708120_708206_715385_715908_715991
734294	contig_9955_pilon	-	3055	10	Intergenic	novelGene_21392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	39.7575988543909	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	53	1231	742411	717731	FALSE	10	TGAAGTTGTTGGCTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNQSVGFPPVTGPHLVGCGDVMEGQSLQGSFFRLFYPCQEAEETMEQPLWIPRYEYCSGLASYLQFNKHWGGLLFNLAVGSCRLPVSWNGPFKSKDSGYPLIIFSHGLGAFRTLYSAFCMELASRGFVVAVAEHRDQSAATTYFCKKAPEKNQTINESLEEEWIPYRQLGEGETEFHVRNPQAHQRVNECVRVLRILQDVTAGRTVLNILPGGLDLMTFKGSIDMSRVAVMGHSFGGTTAILTLAKETQFRCAVALDAWMFPLERGFYPKARGPVFFINAEKFQTVESINLMKKICTQHEQSKIITVLGSVHRSQTDFAFMTGSLISKFFSSQTRGSLDPYEGQQIVVQAMLAFLQKHLDLKEDYDQWNNLIEGIGPSLTPGAPHHLSSL	742463	715906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_717826_724807_724963_726796_726968_728606_728699_733274_733389_735074_735217_735593_735663_740268_740366_741190_741345_742321
734296	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_94785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
734297	contig_12032_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_139278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAGAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101949	99665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_99700_101900
734298	contig_7379_pilon	-	1772	9	Intergenic	novelGene_150023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	105.701229888777	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	931	1710	549865	536814	FALSE	35	ATACATTTACCATAACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRVSTICLGKNYFIVSFFLYIYTHKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	551727	536751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549896_550827
734300	contig_5649_pilon	-	2356	2	Intergenic	novelGene_82311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACACACAAGCTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185169	182295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_182584_183101
734304	SIRV6	+	567	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
734305	contig_3077_pilon	+	1936	5	Intergenic	novelGene_26847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_2	68.4780986885588	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	75	1172	721160	725759	FALSE	70	CTTTGAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALQSLRLANEGKLLSPVQDVEMKVCLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTTCVAVPSISQGPQVWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSETNKVSQPTGTTSFSLPADWDSRTLYLHSPFSTGRSCIPLQGISPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREDLSSERWDRIKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELARSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVSEVWAIEDVLSLNSETL	706858	726523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_706900_721126_721613_723274_723387_724027_724183_725381
734306	contig_11978_pilon	+	558	3	Intergenic	novelGene_62980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_1	83.5	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	239	556	1490019	1490336	FALSE	35	CAAAGGAGGGGTGAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGALPLNGLLGGLNGAAAPNPAGLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQTVIYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGNSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSADGSSSG	1488284	1490338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1488408_1488867_1488959_1489994
734307	contig_9053_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_87950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298723	296574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_296600_298700
734315	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734317	scaffold_6394_pilon	+	925	6	Intergenic	novelGene_110999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1394.62175517235	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	16	594	398216	405843	TRUE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQPRPATWRRCTWMRRPSAGCTTRTRWPWRSSQTGSAGSQRMP	398200	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403364_405717_405939_406040
734319	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734320	contig_7151_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_40698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACAAATTTTTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27760	29012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_27800_29000
734326	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734338	contig_4486_pilon	+	1587	8	Intergenic	novelGene_38576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	911.62013213077	3	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	393	692	407576	412464	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311766	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_385369_385488_407559_407696_411177_411318_412424_412731_412848
734339	contig_7058_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_136015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	584	1108	50352	49828	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWLSDIYGIPISRSGVCLVFPIHLRISSFIMELTSLDEKSLSLERGGITINSSQPAGVKEHEEHQRHKESISPRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDCPDREHNRESRIERKKGGVQNSNSSKHTRLNGLTETGRSPERTAPGFSISPELKQFPRPTLQTGIGLDCGT	50935	49512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_49500_50900
734340	contig_6283_pilon	+	3026	1	Intergenic	novelGene_100226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGGAAAATAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645001	648027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_645000_648000
734347	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734357	contig_3095_pilon	+	893	4	Intergenic	novelGene_75015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2952.89654407329	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	64	510	147241	151151	TRUE	45	ATACAATAAACTATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKSPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147251_150413_150696_150996_151163_151848
734358	contig_2867_pilon	-	2123	6	Intergenic	novelGene_135205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_3	23.2430634813916	264	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	231	1262	969848	966435	FALSE	0	TGGCTGTCGTTGGCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGCREPPYPSILTDATMEKLALAKFVAQESKCEASTVTVRFYGLVHWEDPTDESLGPVPCHCSPPEGTITKEGVLHYKAGTSYLGKEHWKTCFVVLSNGILYQYPDRTDVIPLLSVNMGGEQCGGCRRSNTTDRPHAFQVVLADRPSLELSADSEAEMADWMQHLCQAVSKGVIPQGVAPSPCIPCCLVITDDRLFTCHEDCQTSFFRSLGTARLADISAACSEPGKEYCVLVSREAVWRQALQRSWVCSPEAFSPQEFSQDGQQLLLPWVIYLSCPSELDRFLSALGAAWKTIYQVDLPLKAIQEASSQKKFEDALSLIHSAWQRSDSLCRGRASRDPWC	970078	965573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_966573_967360_967733_968064_968225_968818_968885_969260_969452_969743
734365	contig_4093_pilon	+	1345	2	Intergenic	novelGene_27648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63080	66951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_64317_66842
734371	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734377	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
734380	SIRV7	-	891	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	34	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147611
734381	contig_6710_pilon	-	464	2	Intergenic	novelGene_98164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	20	TCAGCCTTGCAGCTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734388	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_96446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	657809	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657810	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
734391	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	0	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
734392	contig_10311_pilon	+	1623	11	Intergenic	novelGene_50454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAAAAGACAGCGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65134	71550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65598_65767_65920_67182_67260_67490_67580_67831_67957_68263_68407_68641_68754_68869_69016_70140_70360_70448_70493_71497
734393	SIRV7	-	248	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91663	15	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
734396	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734405	contig_5018_pilon	-	1223	9	Intergenic	novelGene_47031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	154.28863981188	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	85	1107	1397263	1392342	FALSE	80	AAACCAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQLPQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397347	1392225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392711_1394362_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
734406	contig_15165_pilon	-	152	1	Intergenic	novelGene_145309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTCACTTTGACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1985	1833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_1800_2000
734409	contig_9272_pilon	+	1863	1	Intergenic	novelGene_125971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	1022	1597	637700	638275	NA	25	AACCCCCAAATCTCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASMFDLSMKDKSRNPFGKLKDKIKRKNKDSASDSASAIVPSVTPSADSDDESSTKDKRKKSKIKTLFSKSNLQKTPVSQSMSVLPTSKSDRVLLRPGDLPSRWEDDDNEDDSSSASDSEFLSSLTWFFFLNLAYFALREKKQTLRVCMCVRVRTHKHTKTHFEKKILIQLLVTKMMRIRMKTMGYLNLG	636678	638541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_636700_638500
734410	contig_348_pilon	+	1662	9	Intergenic	novelGene_67607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.4035751066641	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	426	1232	320222	345268	FALSE	10	CTGTATCTCTTCATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314478	345698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319085_319225_319673_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
734414	contig_9177_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_32806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATAAAACGAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566486	1566815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1566500_1566800
734416	contig_12622_pilon	-	1441	10	Intergenic	novelGene_5900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2430.82027510808	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	5	877	1590968	1588038	TRUE	15	CATGTGTGTGTACGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSESETLHPERQCGR	1590972	1583529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583609_1586683_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588578_1588609_1588831_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590006_1590234_1590830
734419	contig_6975_pilon	+	2256	11	Intergenic	novelGene_74285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	76.0339397900701	89	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	426	1700	403362	464595	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKKVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGCNDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLLGSEECIRVPRNIKSLADIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGLDCKKQASPKLIKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTQIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWLPYNGQCPPDIDYEDYFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPDPSKQIWTVNEALVQKWLSYPSGRVPVEIAK	401170	465151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_401486_402769_402801_403282_403588_427502_427663_437079_437157_440405_440628_441781_441874_448648_448780_457464_457626_464105_464183_464466
734423	contig_12299_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_29753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGACCCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525897	527683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_525900_527700
734426	contig_7873_pilon	-	2525	5	Intergenic	novelGene_169569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	23.3826859021798	92	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	146	988	35139	22940	FALSE	10	GTATATTCTGTTGTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDAAEGVPLVGVRAAGRPTEDSGRLADEDNKEDVRDFHLDQQLQILTMENSEKTEVVLLACGSFNPITNMHLRLFELAKDYMNGTGKYRVIKGIISPVGDAYKKKGLIPAHHRVIMAELATKNSKWVEVDTWESLQSEWVETAKVLRHHQEKLEASNCDNRQDSPTLERPGRKRKWTEQRQDFSQKKSPQPKMKGMPEVKLLCGADLLESFGIPSLWKSEDIAQIVGGYGLICITRAGNDAQKFIYESDVLWKHRSNIHLVNEWITNDISSTKIRRALRRGQSIRYLVPDLVQEYIEKHNLYSSESEDRNAGVILAPLQRNTEEAKS	63334	21402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_-_23341_23818_23962_27296_27481_35024_35196_63245
734430	contig_6654_pilon	+	2953	4	Intergenic	novelGene_85748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_1	161.897772958398	59	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573055	605383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_578530_578588_600119_600348_602764
734436	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734437	contig_8729_pilon	-	1605	2	Intergenic	novelGene_40140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	179	484	670388	667439	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYRWVTLREYPPKGFSGSRVRVIATEMLTGPESSRAWGDWVDTLACPLVTVLSGVVVSFVRCFSVSFSDTHKSKSLNRSRKVFQSSAISGDLISLILKK	670566	666317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_667483_670126
734440	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734444	contig_9678_pilon	+	969	6	Intergenic	novelGene_146374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	584.589633845829	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	109	471	259970	263643	TRUE	15	TCGGTCTTTATTTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNEYIELHRKRHGYRLDYHEKKRKKEGREAHERSKKAKKMIGLKAKLYHKQRHAEKIQMKKTIKMHEKRNTKQKNDEKTPQGAVPAYLLDREGQSRAKVLSNMIKQKRKKESMEEDGY	259861	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_259973_261565_261754_261842_261982_263610_263711_265596_265790_266699
734445	contig_20332_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_156179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGCTTAACCGGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632896	632695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_632700_632900
734446	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734447	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
734449	contig_20842_pilon	+	1996	5	Intergenic	novelGene_160976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	497	934	147564	173622	TRUE	70	AAATCGAATGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNILQIHRIAPTSDNYPARSVNSAEVERPCYREKAGQKRGRDLTLLLQSKCNKARCGPLSGAALGLWSVRMGPVRGGQPEEKAGIPPADCLPESGISRQCVLPSLVSIPMPPWEGGRDDTMVGQRPVYKTPECGTPHQHSYLR	147067	236044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_147901_173521_173625_187148_187219_207158_207259_235154
734452	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
734454	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
734455	SIRV7	-	709	3	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	71686	-5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCGTAATTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43052	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1611_3026_3112_43028
734459	contig_5817_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_169582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATTATTGGTGGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112722	110780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_110800_112700
734463	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
734467	contig_10855_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_124385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATGCTATGGAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811857	814130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_811900_814100
734468	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
734471	contig_14755_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_129394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325439	326731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_325400_326700
734473	contig_5423_pilon	+	2082	2	Intergenic	novelGene_85301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAATTTGGAAGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710151	767705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_710242_765713
734475	contig_17344_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_169597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAGAAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108149	105894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_105900_108100
734476	SIRV5	-	358	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8455_8590_10863
734477	contig_4364_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532826	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
734481	contig_12638_pilon	-	957	4	Intergenic	novelGene_33321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	45	junction_3	1053.10029067616	267	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325507	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534_1303703_1310601_1310678_1325157
734483	SIRV4	-	276	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1247	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3911	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
734485	contig_5479_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_133596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279658	277814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_277800_279700
734487	contig_9706_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_20853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2339	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
734489	contig_3560_pilon	+	1659	7	Intergenic	novelGene_149504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	150	707	197241	197798	TRUE	5	GTCCCTAGGGGCGTCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERTRGCVNPRRQYPGSDVNSRVTRERKLHPEFLRKAGPEPRGDHEQPAGCRSRTRSSPHLFSNITCRPHPSPADRSCPNLRLLTSTSDELLFLGGPSLPAMGTLRPPGEIPWTAWFIEDTVFCPSALSSIYISDSQEVGRKRSIFSKEGEFPAMWLLPFGEGPPLAPDEPAPLSARGTDRGAVC	197091	211024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_+_198211_199031_199084_203208_203317_206571_206702_207914_207964_209276_209348_210894
734490	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734501	contig_5041_pilon	-	2501	4	Intergenic	novelGene_27035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1872	2255	521539	470841	TRUE	55	TGTAATAAAAACACAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTLLLHLPDNLSRHRGMEIDCVVPQALSCLVTLSTTTFEWFADTNLCSVTILSMVLYAIHILVSLFTSRNWAGKRLLLPSVHAHGAEDGFRADGALGGPGLVAVRLLIVHFLLIILTACWSAAAE	523410	370643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_370716_470666_470863_513724_513896_521348
734507	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734508	contig_8606_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_159394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGCATCAGCCTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45407	45906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_45400_45900
734509	contig_16977_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_169599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCAGCTTCTAGGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36716	35530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_-_35500_36700
734510	contig_5434_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_74665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGGTTTTCTTACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282098	279377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_279400_282100
734511	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734512	contig_20165_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_54472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	888	1187	49104	49403	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQMIRWGRERRGCWWLGWVGSGVVKRSGIVPEGALSLISIHLSICPSIHLAWYCSMQGATGALLQAQAYLGKQPQFLLKVALGWVYVLIQYSIINDLI	48216	50348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_48200_50300
734518	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734519	contig_2114_pilon	-	1553	2	Intergenic	novelGene_104281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTGTACAGAAGAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665795	664206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_665057_665092
734526	contig_11594_pilon	-	1240	4	Intergenic	novelGene_80877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	145.974883684375	158	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTCTTGTACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56799	24857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_25135_51461_51550_55728_55812_56007
734527	contig_19442_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_169608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAAATCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33647	31520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19442_pilon_-_31500_33600
734529	contig_7744_pilon	-	2077	15	Intergenic	novelGene_62538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCCTCGCGGCGTCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891219	879794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_879906_882664_882897_883082_883200_883410_883538_884846_884901_885272_885368_886855_886941_887132_887189_887341_887445_889020_889155_889339_889454_889594_889639_889737_889884_890197_890288_890650
734535	SIRV7	-	364	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-31	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114769	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
734537	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_94856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734538	contig_2799_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_85602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGGACTGCCTTGGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785820	785139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_785100_785800
734541	contig_17790_pilon	+	1291	3	Intergenic	novelGene_128479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	121	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTATCTTTTTCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80244	131138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_80402_113272_113331_130062
734548	contig_3449_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_73712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAACTGGAGAAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324248	325508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_324200_325500
734549	contig_3449_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_73713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325457	327212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_325500_327200
734555	contig_1694_pilon	+	2218	15	Intergenic	novelGene_144940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	47.9742703148771	50	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	1392	2216	567666	646462	FALSE	30	CCAAGGAACACAGCTTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSVRCAHEEDRLERLQAQLEEAKKSREEMYEKYVTSRDHYKTEYENKLRDELEQIRLKTNQEIDQLRSASREMYERENRNLREARDNAVAEKDRAVMAEKDALEKHDQLLARYRELQLNEESKVTEFLHQSKLKSFECERVQLLQEETARNLTQCQLECEKYQKKLEVLTKEFYSLQASSEKRITELQAQNSEHQARLDIYEKLEKELDEIIMQTAEIENEDEAERILFSYGYGANVPTTAKRRLKQSVHLARRVLQLEKQNSLILKDLEHQK	502769	646464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_502922_504116_504415_511220_511322_513612_513812_522468_522589_539777_539990_557155_557290_567211_567321_567599_567782_569200_569327_586221_586321_616111_616278_621268_621420_628749_628841_646386
734556	contig_11027_pilon	-	1634	5	Intergenic	novelGene_169610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	21.752873373419	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	733	1632	25078	6024	FALSE	40	AGTGGAAATAATTTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVHQLSSGWLLDHLSFINKINYHLCQHHKPCCGKNEPTSSVHFDSLQMDSLSSFGPSATYIASDLTTKPENDDRGNSDVLLQNYVFRSELFDVTKPYITSTGREECQQSNEKEDLMDGVKKEISTSIIGKKRKRCVVFNQGELDAMEYHAKIRNLILDGSSQLVQEGLKSGFLYPLSEKQDECSEHITLPLDTCSLSELCEMAKHLPSLYETELQILRLMEDDMSVTEQDLFSRVVENSSSFTKMITLMGQKYLVPPRSSFLLSDISCMQPLLNCRKKYDVIVIDPPWQNKSVKRSNR	26981	6021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11027_pilon_-_6095_8333_8704_22550_22614_24682_25487_26657
734557	contig_9668_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_58250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAGAATAGTCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606244	604552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_604600_606200
734558	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	258	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
734559	contig_8683_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_150249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTGTTACGTTTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521850	521514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_521500_521800
734565	contig_13952_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_133263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTAGTTTTTAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181867	184633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_181900_184600
734567	contig_5413_pilon	-	2537	6	Intergenic	novelGene_168090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTGCGTGCGGCGGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453793	333849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_-_333885_347732_347828_350896_351091_444054_444131_451586_453381_453450
734568	contig_5643_pilon	+	2205	10	Intergenic	novelGene_38952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	143.184763655949	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	148	1209	495048	501081	TRUE	25	GGATGCTCCATGTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	482189	502636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050_501854_502353_502421_502479
734569	contig_8571_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_169171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGAAAAAAATAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384624	386756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_384600_386800
734571	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734574	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734576	contig_8616_pilon	-	1148	5	Intergenic	novelGene_72428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	498.885006790142	419	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255493	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254507_254584_254668_255372
734577	contig_2924_pilon	+	1640	5	Intergenic	novelGene_140268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_3	224.452110705157	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	25	693	135725	222054	FALSE	20	GGCTATGTGTATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNVSVCDFDLRAPHIVRIVAPRDGTWDAGWGSLV	135700	223001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847
734578	contig_11989_pilon	-	1863	16	Intergenic	novelGene_68433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	354.527416272548	9	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	6	911	226870	49090	TRUE	10	TTTTTTTTTTTTAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNVSYNMVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNMQISSSTRNHSMGARSTELPLRFFLQMTRSLFAQLKGNGMV	226875	45608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53612_74975_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91038_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
734580	SIRV6	+	371	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	408	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734582	SIRV1	-	202	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5600	3564	-151	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGACGATGAATATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
734585	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
734587	contig_11989_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_68467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTAAAAAAAAAACCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183464	185218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_183500_185200
734588	contig_610_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_76848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTTTGTTTAATAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364927	366947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_364900_366900
734589	contig_10437_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_38458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAGAGAAAAGAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067831	1067158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1067200_1067800
734590	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734594	contig_8330_pilon	-	1319	8	Intergenic	novelGene_71986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_7	321.93807238191	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	113	1054	2066429	2039646	FALSE	10	CTTTCTCTTATGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLTHPEVSYSTGPTQSTNNPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGNDISVARGGG	2116570	2039380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2057892_2058041_2066340_2066434_2116462
734595	contig_19744_pilon	+	2957	5	Intergenic	novelGene_120406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	103.197323124197	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	296	1582	256567	271834	FALSE	25	TCTATCCTAGAGATCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGGRDTDQNSSEEGTAEKFKKLRTTNAHSQTCDWGNLLQDIILQVFKYLPLLDRAHASQVCRNWNQVFHMPDLWRCFEFELNQPATSYLKATHPELIKQIIKRHSNHLQYVSFKVDSSKESAEAACDILSQLVNCSLKTLGLISTARPSFMDLPKSHFISALTVVFVNSKSLSSLKIDDTPVDDPSLKVLVANNSDTLKLLKMSSCPHVSPAGILCVADQCHGLRELALNYHLLSDELLLALSSEKHVRLEHLRIDVVSENPGQTHFHTIQKSSWDAFIRHSPKVNLVMYFFLYEEEFDPFFRYETPATHLYFGRSVSKDVLGRVGMTCPRLVELVVCANGLRPLDEELIRIAERCKNLSAIGLGECEVSCSAFVEFVKMCGGRLSQLSIMEEVLIPDQKYSLEQIHWEVSKYLGRVWFPDMMPTW	250862	273209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_251157_256565_256915_260289_260413_263501_263674_271190
734596	contig_12626_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_80434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1096	1419	126347	126024	NA	10	GCTCTGATCTCATTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWKEPGLWNQMDLDPSTLFLPMSGVLNLSKAQFPHLEGGKAIGTPISGCQDHRLKLTIPCLAVPAPRAPREHTATLVLLPGVPVGASSSPEAGGPGRGTQHEVLS	127442	125864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_125900_127400
734601	contig_14923_pilon	-	883	6	Intergenic	novelGene_157768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	204.021175371578	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	93	431	592865	568926	TRUE	35	CGTATTTACATATTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVREIRKYSYAHAIEKSSVRSPSAYEHTQMKLFRSQRNLYISGFSLFFWLVLRRLVTLITQLAKELSTRGALKTQMENTSVAARKLMEENEKLKRLLKTYGKGEQHMLEAENKKLVEDQEKLKTELKKTSDENSCKLKVTY	592957	541684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_541960_547844_547946_568849_568958_581685_581795_591067_591204_592803
734605	SIRV6	+	471	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	385	0	206	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734608	contig_7457_pilon	-	1663	2	Intergenic	novelGene_31614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	59	472	960838	956608	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAMGAGC	960896	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956626_960442
734612	contig_1443_pilon	+	1544	13	Intergenic	novelGene_28244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	51.913924486168	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	421	1239	538016	541541	FALSE	30	GAAATGAATTTTGTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	536002	541846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536288_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
734615	contig_17440_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_7620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCAACATGAACCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3083	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
734622	contig_2783_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_119659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGTTGATTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768538	768096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_768100_768500
734623	contig_2783_pilon	-	1721	7	Intergenic	novelGene_119654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAGAGAAAAGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768045	736843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_737085_738326_738466_756017_756174_756672_756766_762013_762085_764254_764415_767184
734627	contig_13015_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_165544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340216	339382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_339400_340200
734628	contig_10541_pilon	-	3218	2	Intergenic	novelGene_144658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	177	junction_1	0	10	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGTAAAGAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394550	371154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_374310_394487
734629	contig_11427_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_79020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAATATAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795404	794423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_794400_795400
734635	contig_11855_pilon	+	1657	9	Intergenic	novelGene_67060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.0210136156898	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	498	1496	2011404	2016987	FALSE	50	AAAAAAACCTTGGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFADLQPLAPGFPLVFTPAFRPSQHPAASAAGAEPPQNSKMRGTRGKYGEGAKQEKFTFALTLVFIQCVINGVFAKILIQFFDTARVDRTRSWLYAACSVSYLGAMVSSNSALQFVNYPTQVLGKSCKPIPVMLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2010906	2017148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011538_2012006_2012111_2012699_2012831_2013138_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
734639	contig_10437_pilon	+	1617	7	Intergenic	novelGene_38255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	171.738819788137	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	156	1268	397110	407929	FALSE	30	TTAACATATATTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRAGENTGETKAISSWPGIRTAPVALPTWPASPGCDSSQPPASHPSIPSTLARCTHVLRKGVGVPFLKQMCSVSVFVSQVTLLLLPSLTQGLYFLHCGPSRNIPDRCAFLG	396448	408278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397108_397230_398632_398756_398840_398997_401337_401557_405379_405546_407600
734642	contig_4156_pilon	+	1731	8	Intergenic	novelGene_88099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTAACACGGCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305671	434161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_306055_310022_310191_313914_314078_328805_328877_353897_353990_355258_355338_412915_413081_433551
734646	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
734657	contig_6710_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_98165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	20	TCAGCCTTGCAGCTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734658	SIRV5	+	310	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	913	-18	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCGGAGACCTCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
734659	contig_6710_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_97688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734661	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	275	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734662	contig_14322_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_116582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCCACAGCAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
734663	contig_3095_pilon	+	1022	4	Intergenic	novelGene_75066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3781.26057757933	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	62	673	147241	151893	FALSE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVMAFLRRSMKKILL	147179	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150653_151848
734671	contig_12939_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_166198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1250	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	105	344	46685	46446	TRUE	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVLCSSSEVVASVPSRRFEVRGPGGGARGRGELMGLGRRGSAGLRESRLDAREPRGWAFRRHKGAETRLPEARGPGTPDLGPGRTQVRRCGVGEVSGRPSDWGAWGPERHGG	46789	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45889_46031
734673	scaffold_16539_pilon	-	1884	12	Intergenic	novelGene_68355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_11	262.417527382768	2	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	97	1572	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	516036	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_516002
734674	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
734676	contig_3077_pilon	+	392	3	Intergenic	novelGene_26777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAGAATTAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164349	172751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_164388_169628_169826_172594
734679	contig_8443_pilon	+	2460	2	Intergenic	novelGene_150606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATAACTTGGTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741133	778492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_741214_776112
734682	contig_3132_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_127456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390354	388880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_388900_390400
734683	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
734684	contig_11413_pilon	+	2213	15	Intergenic	novelGene_103221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	124.199641788566	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1	1245	840951	851369	TRUE	35	TTAAAAATCACATCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYTITLVFQRYHAKFLGSLRARLMLLHPSPNCSLRAESLVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALAAVVTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSSESWSIMKNMATELGIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSDFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPPEACLPPAKPVGRPARHERQLAVRPSMPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVVYFLARTRLAQRLIMAGTVVWIGILVYTDPAGLRTYLTAQVTEQSPLGEGALAPMPVPSGVLPASHPDPAFSIFPPDTPKPAENQTSTGEPSGPMGPAEGVHDSPVPECRWLHLEPGAAGQPHRGGAEQWPPGGVGRH	840950	853568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_840998_841889_842063_842456_842584_844973_845087_846178_846274_847560_847660_847775_847995_848858_849138_851137_851214_851352_851439_852156_852240_852341_852509_852663_852745_852915_853123_853207
734691	contig_5047_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_158009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTTATAGTTTAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644801	1644461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1644500_1644800
734692	contig_756_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_134766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAGAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135806	136941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_135800_136900
734699	contig_6710_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_96586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653684	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
734700	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734710	contig_2867_pilon	+	2027	11	Intergenic	novelGene_135162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	19.1543728688777	2	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	541	1041	544003	547120	TRUE	20	ACGCTTTTGCTCAGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRSARGSTFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELNECLGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQELEQRLEADVLRFSVCDVVLRHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLLLENPKFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKQTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFTVFVHAKMAELQVKDLSLKLQGIPGHVFLLQLFHGQHTKHQFLLRARTE	542335	550495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_542444_543211_543373_543480_543634_543884_544015_544157_544233_544596_544687_544867_545029_546957_547184_547440_547689_549409_549515_549925
734718	contig_20951_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_43084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	39	320	27642	27149	FALSE	70	AGAAAAAAAAAGAGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	27680	27094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
734720	contig_12923_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_30181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336831	334428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_334400_336800
734721	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734724	contig_9739_pilon	+	2589	2	Intergenic	novelGene_165092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1483	1935	191717	192169	TRUE	40	AATCTAAATTATATATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWWQCASRGAGGSLQPFPDSKGQEQFLEGPEVGCDISHTRCCPDKQLLRLAPSLLRAHVPRSMGKTSQASPSPWGCAHRQQGLLGSELPLGTSDSGLGFWGAPLGNQHWQAATLCCLPEQGCSSAPSPASWTRAPEWALCTRPRCQLSR	190234	194345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_192248_193769
734725	contig_2093_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_152966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAAAGTTATGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253260	1252444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1252400_1253300
734726	contig_6497_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_35635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTCTAGGAAGATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746005	744601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_744600_746000
734727	contig_6497_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_35634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744504	743876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_743900_744500
734728	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_94290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734729	contig_8377_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_35101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTATTCGAAGAGGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154602	153658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_153700_154600
734733	contig_9668_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_58209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	552	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	190	588	529929	529531	NA	20	AGCAGTTGTTTACTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLAADLQVTLGFTEKFSNFSPCFPTTQSSPSSPDIFSTLLILLLTYKPVTEHSLPSTLKKIEMKKIDLPWFSSCSPVSLPNTGSVLSPNFLSQKTKALPPRQTLLCLSGTAPSATLLHFSIFHLFPKNSSPWATNVFMYSLGLRFLISSFSSICLTPPSNNRSLSSLYLRLLEKYALHASTFSLSDITHHNSFI	530118	527717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_527700_530100
734740	contig_5120_pilon	-	2368	16	Intergenic	novelGene_169614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_14	35.6449154859427	193	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	295	1323	278213	247216	FALSE	25	TCATAGGTAATGAGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICDYDESTENWTCTAARQHTETSSTGWVGRFRPSEPHFTADGTSYYKIISNEEGYKHICHFQIDNKDCTFITKGAWEVIGIEALTSEYLYYLSNEHKGMPGGRNLYKIRLNDVTNVTCLTCGLYPERCQYYSVSFSQDTKYYQLRCSGPGLPLYTLHSSRTDEELRILEDNSALDKMLQDVQMPSKKLDFIVLNGTKFWYQMILPAHFDESKKYPLLLDVYAGPCSQKADTVFRLNWATYLASTENIIVASFDGRGSGYQGDKIMHAINRRLGTFEVEDQIEAARQFSKMRFVDDKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSRWEYYDSVYTERYMGLPTPEDNLDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQISKALVDAGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFIKQCFSLT	284024	246170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_247318_248948_249023_249287_249361_260212_260278_264980_265081_265634_265690_268263_268459_272723_272794_275581_275681_275921_275970_277699_277822_278187_278242_279140_279209_279454_279563_281669_281715_283979
734741	contig_12964_pilon	+	2837	1	Intergenic	novelGene_131651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1170	1490	93568	93888	NA	15	GTTATTCCACGGCTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKNKRIRLGRSTARMFIRSKDGETSSHILWTFYQEDQSLEKDIMLGKVEGQRERERPSTRWADTVDATMGSSITITVRMAQDWAVFRSVVRRVAMSWNQRDGT	92398	95235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_92400_95200
734742	contig_6445_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_77091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	176	427	926015	925764	FALSE	30	GTATTGAACAGCAAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGCCCRVWSWFCGAGCRPVGSLLPSFPLRPLLPGSGSPCPGRGTVAEHLSRDVVGNTMTSEVIEDEKQFYSKAKTYWKEVPPTVDGMLGGYGHISSIDINSSRKFLQRFLRVGRSGVLSRRRGCGSGGTAWSAWGATFYM	933015	925740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_926065_932889
734749	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_90377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734751	contig_5981_pilon	+	1468	5	Intergenic	novelGene_35527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	43.9175363607751	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	357	734	271511	276427	TRUE	60	TAAAAAAAAAATATGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSMGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHDWLNNLPAKASESKVRLKSQLLLQKYMAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP	271154	281097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_271543_272668_272822_274430_274564_276367_276699_280634
734752	contig_7816_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_66560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTAAATAAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349560	350660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_349600_350700
734756	contig_12270_pilon	-	301	2	Intergenic	novelGene_114097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	23	301	14409	13908	FALSE	25	TTCACCATCAGCAGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFT	14431	13907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
734757	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734763	contig_12638_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_33279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	579	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1002	1598	861360	861956	NA	30	TATTTTAAATGACTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRALPCSRPSPASLLLSACPRSSGTGLVGRSVLEALGPEGPVVGEPQFLQDPCVEDKGTMPTLPSEPGGPGPPRGEGALETALFELLPCRSGVSPGVGREMGTLPRSVSQASPGPGLWTQVKASEPWAGVGEKRMPLSPHLSCPPTLIFLYPSGSVCLLIDGCVHPRGFPPEVRGGPSLHPLGHGVAMPYPRVVSPA	860358	862066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_860400_862100
734764	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_93687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734769	contig_7695_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_41647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTTCACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789962	787586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_787600_790000
734774	contig_8354_pilon	-	2357	21	Intergenic	novelGene_24110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	81.5198595435493	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	814	2355	307395	231430	FALSE	80	TAAAAAAAAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAVSDVNDDVRRAAVESLGFILFRTPEQCPSVVSLLSESYNPHVRYGAAMALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKMPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAK	327676	231427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_231463_232863_232957_240651_240822_247565_247669_256652_256770_259837_259953_296384_296450_297453_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296_307426_308574_308621_315124_315246_317291_317498_320772_320943_321129_321204_322339_322384_327554
734779	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
734780	contig_17198_pilon	+	1722	10	Intergenic	novelGene_62392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.5445264782958	54	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	486	1301	1063432	1096458	FALSE	30	CTTGGTAATTGATTGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1047937	1096879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1048174_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
734781	contig_6710_pilon	+	543	2	Intergenic	novelGene_96814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653369	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
734782	contig_6710_pilon	-	507	2	Intergenic	novelGene_98050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	10	CCTTCTCCTCTTCTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734785	contig_12638_pilon	-	2340	4	Intergenic	novelGene_33247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756349	750280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_750674_751877_752019_753482_754118_755178
734786	SIRV6	-	381	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9453	-157	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGACGTTTTGCAATGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	1701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
734789	SIRV4	-	332	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	32	1157	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGTTTAGAAGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
734790	contig_9468_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_59509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1122	1427	356771	356466	NA	55	ACAGCAACAAAAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKISSFPTPMKKGLSFSTHLLIPKLIFQVSLSFICRTSTTGVNPNNPRPSLYKVEKPYRCSLPQIISHEKYKLLMKLQKDTEKTYQLHHFHHIHYHYQI	357892	355816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_355800_357900
734792	contig_9730_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_150631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTTTCTCCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428652	429408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_428700_429400
734799	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	10	CCCTTCTCCTCTTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734802	contig_1107_pilon	-	2107	6	Intergenic	novelGene_126596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	141.228042541133	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	118	888	885345	857675	FALSE	75	AAAAAACAAGAAAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSRMNLPKGPDTLCFDKDEFMKEDFDVDHFVSDCRKRVQLEELRDDLELYYKLLKTAMVELINKDYADFVNLSTNLVGMDKALNQLSVPLGQLREEVLMCVLRLIQVIRSVEKIEKILNSQSSKETSALEASSPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRIAGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSNVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVCAPQSLHSANIYRAYTMSKTFYWV	885462	856455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_857933_858472_858582_863302_863407_867475_867542_868869_869032_885273
734803	contig_7440_pilon	-	1397	11	Intergenic	novelGene_61164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	396.139483010719	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	67	783	74491	56391	TRUE	15	CCTGAATTATGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGSWDR	74557	53816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56409_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
734806	contig_5696_pilon	+	1605	16	Intergenic	novelGene_117535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	44.6728353949268	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	56	1243	635115	652960	FALSE	25	TTTATGATTTATTTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGI	632381	653322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638565_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840
734807	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734808	contig_15668_pilon	+	3040	1	Intergenic	novelGene_169630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGTAAAGGACTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111054	114094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_+_111100_114100
734810	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
734815	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734821	contig_12050_pilon	-	1930	6	Intergenic	novelGene_62735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	140.622331085785	7	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	175	780	697867	686686	FALSE	15	AATTGTGGTCATTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLQRNRTGQAEEESGDPRACRKQKRAGRPGLQTDGVGHTLEAQEELFLIEGLVFLTGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	698041	685535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696882_697799
734826	contig_14528_pilon	-	2196	9	Intergenic	novelGene_111278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	86.5324180582052	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	11	1378	201850	194938	FALSE	15	ATTCACCAGTTCCTCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVSLALLVLLLLWPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSEEPSPGAGLRATSPQLALPGSLNPSFLRILSDIQLKNNVCIKS	201860	194119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
734828	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_96015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734830	SIRV6	+	892	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	387	22	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	45	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	165	498	43	540	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1690	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10721_10819_11031
734831	contig_4678_pilon	+	1990	15	Intergenic	novelGene_126063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCTCTGGTTCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571695	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_572064_572235_572345_572460_572539_572636_572787_572923_573023_573157_573225_573494_573627_574788_574925_575003_575161_575282_575352_576882_577026_577146_577206_577285_577361_577438_577604_577900
734834	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734838	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	8	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734839	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91675	1	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
734846	contig_6589_pilon	-	1512	9	Intergenic	novelGene_26205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	103.672561461555	22	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	207	1427	2032681	2028014	FALSE	20	ATCATTGCATGTATGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGWEFEVTAFYRGRQVFQQAVFCPGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVADLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2033650	2027928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030527_2030572_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
734850	contig_7695_pilon	-	933	3	Intergenic	novelGene_41545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	88	519	380076	373971	FALSE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGGMCGG	380257	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_379664_380089_380182
734851	contig_233_pilon	-	1770	5	Intergenic	novelGene_14481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	92.5783452001601	203	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	285	473	18746	13017	FALSE	0	TTCTGTCTCTTGGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEEKPKGSPPGRVSVPLRLSARYGKGRPGPGWRPSGQSHRWGARPESRARHSRERPELPEGVKTENDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGTRAARRLSGCGV	22360	11719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_13110_14678_14751_18722_18852_21349_21509_22340
734854	contig_2312_pilon	-	2469	1	Intergenic	novelGene_160740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCACACTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242801	240332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_240300_242800
734855	contig_9653_pilon	-	2022	2	Intergenic	novelGene_48227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	0	20	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATCTGGTGATAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544474	541201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_543086_544336
734858	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_97356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734863	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734866	contig_13428_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_143442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGCTTATTACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57613	59692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_57600_59700
734867	contig_12864_pilon	-	1153	5	Intergenic	novelGene_76430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	429.049166762971	11	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	172	558	251873	242831	FALSE	20	AAAGAGTTGCTGCCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVIIARLVFPLRNKSLSPPSSAGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252157	242235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243889_245704_245915_251863_251999_252111
734869	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734870	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734874	contig_13894_pilon	-	1579	3	Intergenic	novelGene_62178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	458	835	700771	696528	TRUE	75	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGNCPSWTSLRRARAAEGSGREPSALQAGRRRPRLSAPPAGWPRTRTPGTRLRLYHLTSCMGTYSVQGKAGSGSAPRYVALRTLVLHRLDFPAQPHRPPHTQHCTCCGSEPPPSDQQPSMKPRC	701228	694818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_695534_696498_696753_700618
734877	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	933	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	15	AATGCCTTGCACCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734887	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51257	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
734891	contig_7229_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_39861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCTGGGACCTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1427879	1430435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1427900_1430400
734894	contig_12841_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_55859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322905	320833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_320800_322900
734895	contig_7410_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_106070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTGGCTACTGAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337861	339265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_337900_339300
734899	contig_10235_pilon	-	1333	7	Intergenic	novelGene_46261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	427.61876193118	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	165	998	25335	19534	TRUE	5	TGTGCGTCTGTGGTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27162	13954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14110_19353_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
734900	contig_9696_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_68797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAAGTGCTTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352253	354330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_352300_354300
734903	contig_3571_pilon	-	2343	10	Intergenic	novelGene_88702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	52.5060843035251	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	32	1690	100017	30354	FALSE	65	AAGAAGGAAAATGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAANFYAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWTVVTPMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFNSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	100048	29700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_31449_31562_33384_33490_36653_36892_38625_38763_40254_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_99969
734907	SIRV6	+	536	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734909	SIRV7	+	366	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCGTTTTAAGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
734911	SIRV6	+	565	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3162_10727_10819_11031_11109_11205
734912	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_97958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
734917	contig_6870_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_103953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTAGGTAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261046	1261591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1261000_1261600
734919	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_90552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653846	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734922	contig_14176_pilon	-	2161	15	Intergenic	novelGene_74853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	12.0248467256556	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	313	1992	451505	413308	FALSE	35	CTTACCCTAATAAAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	452474	413138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351_451519_452175
734923	contig_14176_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_74850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	189	132	320	412909	412721	NA	10	GAGACTGGCTGGTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLFSGPSSWRTCLLVPPEGLRGQQTGYLPLKSQLHNARSVHVYMCVPVCAHVCAHTTNFPSQERGPEAAGCVLEGVWGASSFQGPEGRFPRWCSFLLVLEEIKKGS	413040	412718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_412700_413000
734927	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734928	SIRV7	-	910	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	-13	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	34	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGCATTAACATGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56080_70849_70988_78841_78964_114686_114961_147608
734929	contig_960_pilon	-	1443	9	Intergenic	novelGene_108215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.435001128923	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	61	1287	335554	292669	FALSE	25	CTATGTACCTTGTATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEGESRAWQPSPGKKPQGERMQSCRLLGAGPQLSTFCVLQKLSGTMFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRVNQKEEEPIPVIVSPHQTILASLGKACKDCKSTSTVWWTANDTIIDSAYPGGRVTEGLEKEYSENNENYIEVPLVFDPVIKEDLKTDFKCIVTNRMSLQTLRTTVKEASTFSWGIALAPLSLVFLVLGGIYMYRWCKHRPEKGYSLTTVKTDHEDF	335614	292512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_292818_294744_294888_296943_297033_304239_304323_306536_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_335540
734930	contig_5916_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_158043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348740	349060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_348700_349100
734932	contig_7151_pilon	+	2493	4	Intergenic	novelGene_40773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	146	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1885	2232	529141	549675	TRUE	30	TAGTGGCTGAGAGAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFMPEYHVWVKWRPVQPLPLPFTVLICKSQEIGKLGIQKLNNKVLTTCNKTGTEK	527256	551203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529337_530062_530181_549641_549721_550987
734935	SIRV6	-	295	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTTGACGCAAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11822	11527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
734936	contig_6088_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_161271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTCTTAGATTGGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145179	143926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_143900_145200
734946	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
734955	contig_6823_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_131227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252394	251291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_251300_252400
734956	contig_6048_pilon	-	2085	4	Intergenic	novelGene_73315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	35.4244109180222	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1090	1596	2104826	2102483	FALSE	40	TATCTTTGTATAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2122128	2101993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104907_2118903_2119684_2121899
734957	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734958	contig_6589_pilon	+	748	5	Intergenic	novelGene_26139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6998.26467776119	5823	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	387	626	1886667	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFSKRPGRWRTFRPSVPTKSSRPSSKTKRGSCWEKLARRSSRVITRTSVWVSRHPRRLLKAPTLTRNALSLVTSPSEGAFCLVSEEGKEPGSLGLRQLPIPSIPWVTQAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885095	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886377_1886573_1886783_1887705
734965	contig_6364_pilon	+	2415	7	Intergenic	novelGene_51848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	223.586485876644	377	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	103	1272	1772471	1785208	TRUE	0	TTCTTGGCCCTTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARLPTGGAGWRPGQAGWQENKPRVTRLPDGVYWMFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLAKDMKNKLGIFRRRNESPGGPASGQGRQSDEVIQAHLRGSPQVG	1755039	1787719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1755142_1772470_1773440_1781110_1781176_1784680_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772
734966	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	175	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
734968	contig_11052_pilon	+	700	4	Intergenic	novelGene_115462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2271.10961622043	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	108	431	103010	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102837	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_102920_102984_103136_106346_106461_107445
734969	contig_16492_pilon	-	3154	1	Intergenic	novelGene_100279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84556	81402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_81400_84600
734972	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	965	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
734973	contig_11145_pilon	-	872	7	Intergenic	novelGene_160517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	97	870	215710	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284068	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
734977	contig_12864_pilon	+	716	6	Intergenic	novelGene_76403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	743.168729159132	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	145	633	227129	229231	FALSE	10	TTCAGCAGTTTCTGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIHNFPLPTQQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	225047	229314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225070_227006_227169_227822_228030_228490_228623_228901_228946_229165
734981	SIRV7	-	342	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33227	0	8	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114730	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
734985	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
734986	contig_2219_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_67185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136280	138579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_136300_138600
734992	contig_6871_pilon	-	2041	8	Intergenic	novelGene_21631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	45.7249987447138	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	159	1139	664971	656751	FALSE	45	GTAAAAGAATTGCATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAWVLLSAVLWYLTGVGWQRSALQNKKGFIYGTPGHPVKIYVKLHQNSPILVCMDSKRAKKETVDPTYVWIGPNENKLTGNNRINITNTGKLMVKDFLESLSGPYTCTFSYKSVKAETQEEKTVKKTYEFIMFAYREPDYSYQMAVRFTTKSCVGRYNDLLFRVLKKILDNLISDLTCHVIEPSYKCHLVKIPKHGLIHELFIAFQVNPFAPGWKAACNQSVDCEDNTNRNILQARDRIEEFFRSQAYIFYHDLNKTLPAMHFIDHSFQVVRMDSCRPGFGKNEAMHSNCASCCVVCSPGTFSPDIDVTCQTCVSIHIYGAKSCP	665129	655848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_656846_657398_657580_660195_660279_660817_661037_662595_662758_663413_663540_664711_664778_664922
734993	contig_7357_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_36866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGATTTCAGAGATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227550	229741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_227600_229700
734997	contig_5481_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_144564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACAGTTTGGTAGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73428	72717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_72700_73400
734998	contig_6374_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_158439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105436	104639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_104600_105400
735003	contig_6710_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_89102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653614	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
735005	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735007	contig_11720_pilon	-	1972	2	Intergenic	novelGene_43760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	600	junction_1	0	1122	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	47	1123	16869	15793	FALSE	20	TTGGCCCTTCTGGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSCGWTHLASASDQTMADITENIWNITDLWELFDGVLNFTGMPPLEEDVVPCNTETETLNKYVVVTIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNQVSRSVTDVYLLNLAIADLLFALTLPIWAASKENGWTFGTPLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKHHLVKFICLGIWVLSLILSLPFFLFRQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18315	14943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16878_18277
735008	SIRV6	+	341	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	531	-1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
735012	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735015	contig_3627_pilon	+	1089	3	Intergenic	novelGene_78491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	777	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	58	531	621315	634316	FALSE	35	TTAAGACCCAAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621257	634874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
735017	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735018	contig_3975_pilon	-	2006	6	Intergenic	novelGene_54721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	396.036563968531	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	63	1328	1603436	1560510	FALSE	15	GATTCAGCTCATCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLVPSEQSSGTSLLPKDNARFSWSSLDEDGLDDSLLELSDGEEDDGHFSFTEEEIQELLKDDDLSNEHFSWRGGLLKDDSRHVEKGERESQIPLDALQEKNSLYSLGPVAETPGLFRLPQLSTSIGHGPTATKPLNRHFALEKNVIKITVVAPFDPTVYDAVLDKDKTDSSKDIKKPSSVGEELRENGLNPNESKLCTESEGISPTNSAWDGNTFPSPSNNNFQETVSDKNMPDCKKPTPVFSQVLDHSKSSSNIGSSWRNGGSHKSSCEVRFPVSSKQDVLDKDSGKMKVHERRLGKVIPVLQTKTRTSFLTFSQSDLEQQKQIYLRSVIAHIEDPVDSNQGALGELYALMDQVHHMQNQKWQHPSDLTMRNYARFRQKPLQRYSLTQWVDRNMGSHHRFQHLPDFPNSPFVSSHQQ	1615955	1559831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1560652_1562840_1562929_1599911_1600016_1601762_1601852_1602593_1603439_1615895
735021	contig_4742_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_130987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCAAGTGGCGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199548	199161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_199200_199500
735027	contig_16022_pilon	+	1970	14	Intergenic	novelGene_160265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	22.4607481420498	2	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	851	1705	27635	34589	FALSE	10	TTATTGTGGCTGATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVKPIAWNQPEGDVTPDDVVALVIQGVQEGERDFGVKVRTILCCMRHQPNWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVCPWSSYLTGAWKPETEHAVIRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKRSMGFTEEEFKRLNINAAQSSFLPEDEKEELLDLLYEAYGMAAPASAGCKVIPLKTSQQPF	6040	34854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_9978_10244_18661_18724_25158_25282_25961_26150_27588_27733_28513_28630_30098_30224_31023_31096_31177_31280_31547_31613_33208_33339_33982_34086_34545
735029	contig_14322_pilon	-	1360	4	Intergenic	novelGene_115658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	55.1180551180827	516	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	239	721	500039	498811	FALSE	0	GGCTTGCTTTTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLEEIVACDNAAQKMQTVSAAVEELLVAAQRQDRLTVGVYESAKLMNVDPDSVVLCLLAIDEEEEDDIALQIHFTLIQSFCCDNDIDIVRVSGMQRLAQLLGEPIETQGTAEPRDLHCLLVTNPHTDAWKSQGLVEVANYCEESRGNNQWVPYIALQER	500277	498171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_498925_499171_499395_499765_499868_499995
735031	SIRV2	+	466	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	131	-74	-131	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGACTCTAATACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
735037	contig_18473_pilon	+	1938	5	Intergenic	novelGene_169639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	257.007295616292	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	259	696	59536	77005	FALSE	50	TAAGTGCCAAGAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSDAVLKRLEQKGAEADQIIEYLKQQVALLKEKAILQTTLREEKKLRVENAKLKKEIEELKQELIQAEILNGVKQIPIPSGTQLQANSTLSGNEIQSAPPTTISSGGKEQINREGEEKKVKEKTEKRGEKKEKKTAAVSSRKC	41916	78247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_42150_59510_59645_66184_66299_68948_69114_76955
735038	contig_8687_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_169658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAGAAGGAAATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38652	39470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_38700_39500
735048	SIRV5	-	350	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGCTCTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8583_10853
735050	contig_753_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_112888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTATAAATGAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224761	226390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_224800_226400
735061	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_93635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735062	contig_11709_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_168230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAACAAGACATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304845	305695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_304800_305700
735063	contig_11709_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_168231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGCAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305945	307298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_305900_307300
735064	contig_8122_pilon	+	1168	6	Intergenic	novelGene_40243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	644.777046737863	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	64	390	720281	732394	TRUE	30	AAAGAGTAATGTGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKQDPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGKMRGAVPGKKTSGLQQKNVEV	720217	748840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732425_748092
735065	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	30	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735066	SIRV6	+	438	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	524	0	345	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735070	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_89926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735071	contig_12756_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_153224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCATTCCAGGCTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242334	243712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_242300_243700
735079	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735089	contig_14553_pilon	+	1104	4	Intergenic	novelGene_124987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	130.199846390078	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	180	1103	5787	14424	FALSE	10	GAGTACCCCCCTCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	2462	14425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_2601_5745_5835_6138_6387_13796
735090	contig_11259_pilon	-	2763	12	Intergenic	novelGene_144546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_11	38.017829657949	49	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	183	2588	233894	176080	FALSE	80	AGAAAAAAGAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLDSRFKNAPYFSCEKRNDLVPVCQKCETCILAWKIFSTKEWFRRISEVSQRRFLVSILKQLNSLYLLHYFQNILQTTQGKDFIYNRSRIHLNKKEGKIVKSSLNQMLDKTVEQKMKEILSWFGSSTHRTKANYTLLLLQMCDPKLLLTAADVVKVLFLRERSTVVGLNQNSTDVFFFPKKDFNPKSETSHVCWTARTRQTSFPLSKAPGKESLSENVGEGAPVTEGQWKSSLQCISEMNRLFSRKSGVPKAGGLPFDQLVDLGAVRDLSSGFSQYRDFIRHLPIHVSKYILSMLDKNTLNKCASVSQHWAALAHQVKMDLSMHTFIQSQVALLQGTYTRGIDPNYANKLSIPVPKMADDGKRMRVKNQKWKLRTKTDYNLWTAYQNQETLSVQMEERNVYCGTYNIRILSDTWDRNRVIHYSGGDLVAVSSNRKIQLLDIIQVKEIPIEFRGHAGSIHALFLCEEEKFLLSGSYDLSIRYWDLKSGTCVRIFNGHQGTITCIDLYKNRLVSGARDCQVKVWDLDTGKCLKTFKHKDPILATRINDTYIVSSCERGTVKVWHFATAQLVKTLSGHEGAVKCLCFDEWHLLSGSADGLVMAWSMVGKYERCLMAFKHPKEVLHVSLIFLRVISACADGKIRIYNFLNGNCLKVMKANGRGDPVLSFFIQGNRMVINTESNIIMFQFENIKWQYSQDRVKQKKNKDKEEEKEDNSLADAVSKSSIQAHSLRDSASSKQIVGQEALSSKPHRSRVLLKAAMLSTGKRVKSQAISVVTSRVDDVCQDWFLCGIFWPMRGFLMI	234076	175904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_176468_179912_180072_206384_206528_207456_207606_213355_213478_221297_221499_223916_224027_226913_227037_228410_228539_228625_228827_229787_229965_233389
735091	contig_14683_pilon	+	1589	5	Intergenic	novelGene_166032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.3074807133108	286	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	371	670	44924	52585	FALSE	25	TGGACTTGGAGAATCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTWGADVINMTTVPEVVLAKEAGVCYASIAMATDYDCWKEHEEAVSVDKVLKTLKENANKAKSLLLTTIPQIGSMEWSETLHNLKNMAQFSVLLPRH	16530	53504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_20175_20353_44819_45062_49228_49352_52546
735092	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3131_10691_10819_11031_11109_11205
735093	contig_6439_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_154243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGGAGCCCTGGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372579	373241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_372600_373200
735096	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
735102	contig_21388_pilon	-	888	5	Intergenic	novelGene_136628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	788.967996816094	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	56	679	28487	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSSGPRLPRRTPFSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28542	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22340_22499_26756_26851_27534_27649_28352
735105	contig_10299_pilon	-	2321	10	Intergenic	novelGene_79678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	51.3516080986856	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	10	1023	194338	188987	FALSE	25	ATCAAGTTTTGTGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVMASLSSVRWLTRALVATPNPGVWRGLGTSAATRAASRSQGEDVRVEGAFPVTMLPGDGVGPELMHAVKEVFKAAAVPVEFKEHHLSEVQNMASEEKLEQVLSSMKENKVAIIGKIHTPMEYKGELASYDMRLRRKLDLFANVVHVKSLPGYKTRHNNLDLVIIREQTEGEYSSLEHESAKGVIECLKIVTRTKSQRIAKFAFDYATKKGRNKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAELYPKIKFETMIIDNCCMQLVQNPYQFDVLVMPNLYGNIIDNLAAGLVGGAGVVPGESYSAEYAVFETGARHPFAQAVGRNIANPTAMLLSASNMLRHLK	194347	187688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_189086_189360_189508_189811_189915_190007_190142_190247_190381_190455_190517_193639_193761_193858_193958_194122_194204_194302
735109	scaffold_9100_pilon	-	1849	13	Intergenic	novelGene_83310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	35.4208821020721	42	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	79	837	843636	819691	TRUE	15	CTTTGGTGTTCTCAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRPRADREEGRGSGVVEPGSGTWLEMEFDCDSLRRLLGKYKFRDLTVEELKNVNMFYPHFRYSVDTYIFKDSSQKDLLNFTGTIPVMYQGNTYNIPIRLWILDSHPFAPPICFLKPTANMGISVGKHVDAQGRIYLPYLQNWSHPKSVIVGLIKEMIAKFQEELPLYSLSSSDEARQVDLLAYIAKITEGVSDINSRSWANHETKTVNKITVVGGGELGIACTLAILAKGIADRLVLLDLSEGTKGGTMDLEIFNLPNVEISKGARENEEIKIQGKD	843714	800783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_801129_802209_802334_803972_804037_810020_810195_812141_812313_819556_819735_825143_825247_829212_829332_830592_830729_835944_836109_839094_839161_841667_841753_843594
735113	contig_3948_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_53271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAACTATGTTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407256	1407522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1407300_1407500
735114	contig_7801_pilon	-	2026	3	Intergenic	novelGene_169683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.5	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	42	1052	516962	457643	FALSE	20	GTCCTATGCTTTAATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDGGGARAWGRKMLQSLASKSCVRLVEQHRSAWFFGFLVVGYLLYLVFGAVVFSSVELPNEDLLRQDLNKAKRRFLDEHECLTEEQLEQFLTRVLEASSYGVSVLSNTSSNWNWDFTSALFFASTVLSTTGYGHTVPLSDGGKAFCLLYSVIGIPFTLLFLTAVVQRITIYVTHRPVFYFHTRWGFSKHTVSLVHAILLGFVTVSLFFFIPAAVFSSLESDWNFLESFYFCFISLSTIGLGDYVPGEGNNQKFRAIYKFGITCYLILGLIAMLVVLETFCELRELKKFRKLFYVKKFKGEDQLHILEHDQLSFSSISEQAASLKDDQKQNEPFVAAQLSAHLDGSANN	517003	456668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_-_457903_461753_462150_516607
735118	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_90415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735121	contig_16525_pilon	-	1703	3	Intergenic	novelGene_133806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1059.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGATCGCCAGTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93441	91486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_92514_92640
735125	contig_4103_pilon	+	2329	8	Intergenic	novelGene_51931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAACGACAGGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83046	91902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_84735_84825_84894_85356_85477_85645_85815_86828_86888_87788_87883_91263_91330_91837
735127	scaffold_13505_pilon	+	2095	4	Intergenic	novelGene_111560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.626615242914	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGGTCTCATGGCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608567	635988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610099_613391_613530_635129
735129	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735131	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_98018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735134	contig_8418_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_166069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGGAGGAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193872	1193426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1193400_1193900
735140	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735153	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735163	contig_6361_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_23920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACTCCTTTAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233488	232126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_232100_233500
735167	contig_14322_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_115721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTCTAAATAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
735168	contig_593_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_102039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGAAGGAGAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613394	610774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_610800_613400
735172	contig_11145_pilon	-	884	7	Intergenic	novelGene_160518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	109	882	215710	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284080	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
735175	scaffold_6394_pilon	-	1669	10	Intergenic	novelGene_110954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	73.1600646645996	421	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	105	1475	136081	128083	FALSE	10	TGGCAGGAGTCCTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDIQCECLSDTQWKELLPQMQQVEVIRLDDCGLTEVRCEDISSALQANPSLTELSLHNSGLGDAGLRRLLQALQGPARKIRKLSLQNCSLTAAGCTALPGALRSLPSLLELHLSDNTLDEAGLRLLCEGLRDPQCHLERVHLEYCRLTAAGCEPLATALRARPGLRGLVLSNNDLGEDGVRALCGGLLGARCPLETLRLASCGVTAANCKDLCSLVAAKDSLQELDLGENKLGDAGVATLCPGLLSPSSRLKTLWLWECDISAEGCREISRVLHAKESLKELSLAGNELGDQGARLLCKALREPGCRLESLWVKTCGLTHACCPDFSAMLAQNKSLLELQLSNNRLGDTGVQQLCQGLGQPGATLQMLCLGDCEVTDSGCTALASLLLSSRSLRELDLSNNCMGDPGVLQLVESLRQPGCALRQLLLYDIYLSEAVDNHLKALEDSKPSLRIIS	145787	127888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128171_128360_128532_132293_132465_132715_132887_133027_133199_133887_134059_134532_134704_134926_135098_135995_136102_145703
735177	contig_15327_pilon	-	1664	8	Intergenic	novelGene_70522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_6	18.2901780266048	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	386	1171	488304	478231	FALSE	15	TCTTTGTTGTTGTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492591	477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_487817_487974_488172_488343_488444_488585_491906_491960_492437
735181	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_93620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735183	contig_10581_pilon	+	2656	1	Intergenic	novelGene_41448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	559	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	351	1056	823	1878	797526	798581	NA	30	AAATTCTAATTGTCTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLRAAMPQVPYRVLGRMFWREENAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVVFKPPTSDAEFLERLHLFLAREGWTVQDVARVLGFHNPAPAPGPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKKLTLFSGRDIPGPGEEAFDHWLEHTNEVMEEWQVSDLEKRRRLVESLRGPAADVIRILKTNNPAITSAECLKALEQVFGSVESSRDAQVRFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNQARLEQVIAGANHSGAIRRQLWLTGAAEGPAPNLFQLLVQIREEEAKEEEEEAEAALLQLGLEGHF	796703	799359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_796700_799400
735184	contig_6589_pilon	+	844	7	Intergenic	novelGene_26113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2693.82297529408	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	21	464	1876599	1880720	FALSE	25	ACAAGATTGGTGTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLTTVNVQVPQEAWGCAERA	1876578	1881100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879802_1880661
735185	contig_10861_pilon	-	1510	11	Intergenic	novelGene_39331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	293.660279915415	4	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	91	639	1492200	1490381	TRUE	10	AGTTTGGGCTTGGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQVMPRTWPSFSAMGSWTPWCLYGLGP	1493789	1489331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489945_1490038_1490207_1490290_1490455_1490568_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
735186	contig_5059_pilon	-	2343	5	Intergenic	novelGene_140726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGGGAGAAAGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255960	245035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_245114_250083_250132_251587_251695_253215_253313_253947
735188	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735193	contig_2204_pilon	-	1205	5	Intergenic	novelGene_71646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34848	13174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_13275_14738_14915_15420_15468_25594_25712_34083
735195	SIRV4	-	328	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1195	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735197	contig_10494_pilon	-	883	5	Intergenic	novelGene_102188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	33	junction_3	12.9301005409857	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	57	599	1059298	1056579	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPIPGVLFRDMSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1059354	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057302_1058719_1058827_1059218
735198	contig_6589_pilon	-	822	8	Intergenic	novelGene_25866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1158.34188319656	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	34	534	959104	955569	TRUE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQST	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955396_955578_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
735205	contig_10734_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_51208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAAGTCCTTCGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141540	1143710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1141500_1143700
735207	contig_3095_pilon	-	800	4	Intergenic	novelGene_75101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTACAGACAGGAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151137	147191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995
735214	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
735215	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735216	contig_14441_pilon	+	718	4	Intergenic	novelGene_100634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.107647738325	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	298	717	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATCVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111295	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112101_112154_116578_116966_117613
735219	contig_17036_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_169689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAGCTGAAGTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831	2894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17036_pilon_+_800_2900
735221	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
735225	contig_2100_pilon	-	1069	8	Intergenic	novelGene_50739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	849.207505710531	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	138	878	1182812	1170114	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILAQTRTAGPSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185548	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170201_1175575_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
735226	contig_5018_pilon	+	820	5	Intergenic	novelGene_47160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_2	246.180827848149	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	6	602	1498209	1500271	FALSE	45	TAAGATGGCCAATAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498203	1500489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
735227	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	291	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735228	contig_6445_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_76989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTCTAGTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427708	427080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_427100_427700
735229	contig_11815_pilon	-	1640	4	Intergenic	novelGene_50908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	122.411873062488	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAATGCATATCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156958	153851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_154850_155177_155255_155551_155640_156481
735230	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
735231	SIRV6	+	574	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735232	contig_14017_pilon	+	1401	9	Intergenic	novelGene_165683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_8	85.2906794438877	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	33	689	29686	52331	TRUE	30	GAAAACATGGCTTCTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKGCIKVKNFNFIVPDGMNLDFTYATVSANDNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVRVVGSPIDALPPPDPFTQ	29653	72919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524_34712_49339_49506_52284_52358_55732_55860_58753_58903_68352_68503_69803_69948_72803
735233	contig_15304_pilon	-	1402	5	Intergenic	novelGene_30607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	212.798613717289	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	277	1095	66228	64723	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVAVQQGARAFGPGLHH	71750	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_64988_65310_65396_65721_66104_66402_71647
735234	contig_14744_pilon	+	3007	20	Intergenic	novelGene_65973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	7	junction_19	49.3115484330422	318	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	871	2616	57	2672	783918	803072	FALSE	15	TTGAGCACCCCTGGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQWRKKKGLRKRRGAASQARGSDSEDGEFEIQAEDDARARKLGPGRPLPTFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTIPMILDGKDVVAMARTGSGKTACFLIPVFERLKAHSAQTGARALILSPTRELALQTMKFTKELGKFTGLKTALILGGDKMEDQFAALHENPDIIIATPGRLVHVAVEMNLKLQSVEYVVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIGRLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPSLIRLDVDAKLNEQLKTAFFHVREDAKPAVLLHLLRAVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQRVTCAHIYSALDQTARKINLAKFTHGKCSALIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEVPYLLDLHLFLGRALTLAHPHEEPSADAAGVDGVLGRVPQSVVDDEDCGLQSTLAASLELRGLGRVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKALDLTGLGLHPLFSSSFEEQELQRLRLVDSIKKYRSRATIFEINASSRDVSSQVMRAKRQKDHKAIASFQQGRQERQEGPASTAPSTQAPSVPAMSDPALVKNKPSGEEEEARESVEDVFTEIVGQKRRRLGPDRGVKRQRAEARQQERDFYVPYRPKDFDSERGLSVGDSGAFEQQVAGAVLDLMGDEAQNLTRGQQQLKWDRKKKRFVGQSGQEDKKKIKTESGRYISSSYKQDLYQKWKQKQKIDDRDSEEEGPSERRGPERRGGKWGRGRGASQPCTPGPAAGRVHSELKTKQQILKQRRRAQKMRFLQRGGLKRLSARNRHRVQVLQQGAFGRGTHSKKGKMRKRM	783861	803407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_784044_787156_787287_789643_789715_790304_790494_790613_790664_792404_792447_792563_792660_793950_794073_794174_794237_794315_794448_795675_795887_796835_796971_797980_798215_798305_798380_799001_799239_799597_799741_799823_799935_800428_800534_800696_800810_802839
735235	contig_7839_pilon	-	2264	2	Intergenic	novelGene_45687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTACTAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154671	151185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_153179_154400
735236	contig_14472_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_111193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATGCTTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518004	515913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_515900_518000
735244	contig_11448_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_66417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554084	551785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_551800_554100
735247	contig_1861_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_77670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGTAACAGACAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99490	98987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_99000_99500
735248	SIRV4	+	327	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1444	632	989	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
735252	contig_9482_pilon	-	1510	11	Intergenic	novelGene_44320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165.261489766975	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	632	1111	1240827	1237310	TRUE	20	TAAACAGCCTTTCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKVTGKSAK	1253217	1236144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237320_1238157_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241041_1241086_1242537_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
735255	contig_6710_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_89119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653644	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
735256	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735261	contig_15063_pilon	-	773	2	Intergenic	novelGene_14451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTTTGTGAGGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36789	35907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36156_36264
735262	contig_9345_pilon	+	1647	3	Intergenic	novelGene_24568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCAGCTCATCTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885127	891169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_885589_885854_885927_890055
735275	contig_1154_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_87072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	694	1203	205187	204678	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLKPKWGTIDHRIKYSILNMTVQISPPSIWPLLTSPILWEYFLDFLLAVETFCPLNKTGIKPQCIKLINVGLPRFMCICKALDPSLLRLLLFPSLSSDLHCLSCSLFCFGACWSFLRSASESQMHSSLLNFSLFIISLQPNAFFKLWETFCLSSFLEELSFMHIWTF	205880	203809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_203800_205900
735278	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735281	SIRV1	-	180	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	2	3648	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
735282	contig_6735_pilon	-	890	7	Intergenic	novelGene_15746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	802.514520463995	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	74	550	564868	542327	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEMSYLRFWVDFLLQFH	568271	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542375_551204_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
735284	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	8	1158	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735285	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
735286	contig_7410_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_106121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	394	723	618130	617801	NA	30	TTTACTGTTCAAAATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSYHHQLLWQGSQQRVLGRAGEKCITKFKFKHTQKKTRLAGLTETGETPKVWSLETLLTQYSSHSWGSLFSQRLDRSIVPTITHMRDVLHSSIMYTRLMGTPAQKQR	618523	617199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_617200_618500
735287	contig_7165_pilon	+	1445	11	Intergenic	novelGene_116828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	79.489370358558	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	540	1055	239915	256219	FALSE	15	TCCCATTTTTCTGTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVDEFIDELLHSERVCDIILPRLQKRYVLEEAEQLEPRVSALEEDMDDVESSEEEEEEDEKLERVPSPDHRRRSYRDLDKPRRSPTLRYRRSRSRSPRRRSRSPKRRSPSPRRERHRSKSPRRHRSRSRDRRHRSRSKSPGHHRSHRHRSHSKSPERSKKSHKKSRRGNE	231760	256609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_232051_233711_233872_238291_238321_238364_238414_239903_239990_245489_245601_254163_254277_254902_254930_255046_255145_255605_255655_256176
735290	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735291	contig_10642_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_78704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATCTGAGTCTGCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848439	845920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_845900_848400
735298	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735301	contig_13258_pilon	+	2474	6	Intergenic	novelGene_146923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	28	junction_1	52.8257512961245	91	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	167	808	30484	41255	FALSE	35	ATCCACTTTAAACTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQPKRQPELVEGNLPVFVFPTELIFYADDQSTHKQVLTLYNPYEFALKFKVLCTTPNKYVVVDAAGAVKPQCCVDIVIRHRDVRSCHYGVIDKFRLQVSEQSQRKALGRKEVVATLLPSAKEQQKEEEEKRIKEHLTESLFFEQSCQPENRTVSSGPSLLTVFLGVVCIAALMLPTLGDVESLVPLYLHLSVNQKLVAAYILGLITMAILRT	15675	42921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_+_15741_30382_30638_30749_30826_32371_32590_38730_38893_41223
735302	contig_12644_pilon	+	1311	10	Intergenic	novelGene_44610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5193.86296210593	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	341	1240	2678137	2680545	FALSE	50	AAAGAGGCAGTGAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALPWLPQPCQHWSCHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677338_2677585_2677693_2678072_2678186_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
735309	contig_8259_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_148892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	22.9927524813074	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	6	437	392235	301954	FALSE	25	ATGTAGTCCCCAACTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMEYENRIRAYSTPDKIFRYFATLKVINEPGESEVFMTPEDFVRSITPNEKQPEHLGLDQYIIKRFDGKKISQEREKFADEGSIFYTLGECGLISFSDYIFLTTVLSTPQRNFEIAFKMFDLNGDGEVDMEEFEQASCPGEFLEI	392240	301952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_302067_341829_341945_363021_363066_392075
735314	contig_1406_pilon	-	1933	6	Intergenic	novelGene_25550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	615.223991729841	3	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	128	1138	2159494	2137428	FALSE	25	ACCCAAGAATTCTGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159621	2136632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143616_2147740_2147920_2159391
735315	contig_20614_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_107601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1293	1628	439439	439774	NA	40	AAATTGTCAAATGAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGGTYGYLGQSLPFQRKPQVLRTDLLKALLPFRASLSVCLLRTRTGGQLAEMMRWDPGPEREWHGDPGSPEPGPVQPPFYCTFTVPPQATWQAQRGARGTATKRRCCAC	438146	440618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_438100_440600
735316	contig_13592_pilon	-	2232	11	Intergenic	novelGene_33737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	130.113642635966	128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	497	1399	339938	276302	FALSE	20	AAGAGTTTGCTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLLKHAQHKAVPAVHFINDSLKNQDRKLWGQSIQLASQKLYGLSDENNDDRVLKCCLQYQELFPCSLVILCTDDRNLRNKGLISGVKSLSKEELSAELLNLSLNTDECHQPCISKHQLKAEATSLKESFEEKSANSGLSILLESIISELEKSLGTALSLILETEMKIAFGNLWMEMLYLKPPWTLIHLVQCFKKHWLAVFGLVMEKNLLLTIESLYENLCKANNAVDFTTAKFLLQDSKSLLHAFSTRSDYDGILPQAFAQVNKLLQTFTEVKAKLKPNPSENTVGKKQEDTSLMTSSNQEITLFSGSQLPQPNRHQEIWSILENVWITIYQNSTDVFQRLGSNSALSTSKIASFEEAFLYLQKLMVAVKDILEGIQRILAPNSNYQDVETLYNFLIKYEVNKSIQFTAQELYNCVSQTEYREKLTIGCHQLVEMEYTMQQCNASVYMEAKNRGWCEDMFNYRT	351468	275468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_276432_294373_294439_298294_298362_308909_309042_326680_326869_332877_333027_337466_337606_339905_340070_341523_341670_348351_348446_351343
735321	contig_9354_pilon	-	1948	10	Intergenic	novelGene_108052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.51435135049	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	69	875	226067	213306	TRUE	20	AATTCGTCACTGTGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKANASKKKSQQLKRNPKRKIGDEEVELSEKEVRKIAKNKQPKHPSSEVTGKTKHTNLKQIKIPSKKRKTWQPLSKKSREYLQTMMESVIISILSNTVKEKEQIQYHLNYLKKRLLQLCETLKVPPKKLRHLTNVSSLLKMEMAQHRANEEGLALLQEEVDKIVETTESMTENIQSLKNKIQILTTEMEKEEEKVKQMLQMDRSGVLCLPELPQNSLRAPILQEEILTLIPNQNALLKDLDTLHNSSQMKNMLTFIQEAYNKLDTS	229865	206288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_206609_212552_213438_214198_214277_214414_214535_219693_219824_223361_223431_224006_224134_225187_225237_225965_226074_229803
735322	scaffold_21177_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_145478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTCCAACCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174820	175473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_174800_175500
735323	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
735324	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735330	contig_12638_pilon	+	1644	9	Intergenic	novelGene_33232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30.856269622234	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	91	1599	737245	764546	FALSE	5	CTGCTTTTGTCCATTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLVTFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLEAYWPGLQSLIGDIDNAMRTFLNYYTVWKQFGGLPEFYNIPQGYTVEKREGYPLRPELIESAMYLYRATGDPTLLELGRDAVESIEKISKVECGFATIKDLRDHKLDNRMESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	737154	764591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739565_750462_750675_751878_752021_753484_753610_759266_759412_762088_762211_764045
735331	contig_14744_pilon	+	2475	22	Intergenic	novelGene_65966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACCACCCCATAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694610	715779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_694731_695155_695238_695434_695577_696897_696979_697161_697232_697848_697897_699217_699334_701102_701417_701640_701715_702818_702926_704152_704230_705007_705063_705151_705207_707711_707767_708818_708874_709349_709402_710550_710674_710890_711010_712802_712904_713165_713224_713712_713746_715241
735335	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	9	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735336	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735337	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735339	contig_11677_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_85893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	358	681	417535	417212	NA	50	ACTTAAGCTTATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKLVAHIFKRGFIHSPHKRCWNPGALEKSQHSGLNGHFPTLLGNIPLEGRPNNYNCAFQKSLRGMENWMLLYGQTSVDYQEKRNSQATFLQTQLRESWPVYSYWT	417892	415477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_415500_417900
735340	contig_8729_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_40120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457172	455555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_455600_457200
735343	contig_6228_pilon	+	2310	2	Intergenic	novelGene_164484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	241	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2127	183	2309	123802	150419	FALSE	45	TTCCTGGACGAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTITITVGQRESEDVSEKDSDKEMAANSEVVQDVAKDGQEEMPEIMEQITYSESNVEELTQPTESQSNDVGFKKVFKFVGFKFTVKKDKSEKSDTVQLLTVKKDEVEGTGVSNGAGDHQESSLEAGEAAPKESELKQSIEKPEETAKSEQGNDEIVLKAESDRAAEEGKEEGEEKQEKESSKSPESPTSPTASETASSFKKFFTQGWSGWRKKTSFRKPKEDELDSAEKKKEQEPEEVEIEENGKTEDTSEKPSASELPPKEKSESVNDARLSAEYEKIELPCEDQVDDLQRPSEEKTAPLATEIFDEKVEIVAEVHVSTEEKTTEEQKAEVEEAVESLPPEKSVETNAELQEAEPAEELVKTKEVCAPGEDHTQPTELSPEEKVSSKHPQGIVNEVEMLSAQERTKVQGSPLKKLFTSTGLKKLSGKKQKGKRGGGEEESGEHSQVPAESPDSTDEQKGESSASSPEEPEEITCLEKGIADGQQDGEVEEGTTSDGEKKREGVTPWASFKKMVTPKKRVRRLSESDKEDELDKAKSATLSSTESAASEMQEEIKGNGEEQKPEEPKRKVDTSVSWEALICVGSSKKRARKGSSSDEEVGPKTMGGDSQKTDEAGKDKETGTDNIPATYQEHDQGPGSFSPEQAGSPSEGEGVSTWESFKRLVTARKKSKSKLEEKNEDSVTGSGIEHSASDVEPGKEESWVSIKKF	123619	150420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_123827_148317
735346	contig_3426_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_57983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCTGGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611810	614152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_611800_614200
735351	contig_10263_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_135865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003901	1001220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_1001200_1003900
735354	contig_10800_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_152634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCAATGTCATAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590518	590161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_590200_590500
735356	contig_11370_pilon	+	827	3	Intergenic	novelGene_98718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	16	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	160	582	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145671	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
735358	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735361	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
735362	contig_7534_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_162120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCCAGTAAATCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40872	40061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_-_40100_40900
735363	contig_5947_pilon	-	2184	17	Intergenic	novelGene_101544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	56.7691322375109	5	25	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	242	1837	577867	559786	FALSE	5	CTGTTGGCGTTTGTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDNAALYAQKYDEEFQRYLPRFVTAIWNLLVTTGQEVKYDLLVSNAIQFLASVCERPHYKNLFEDQNTLTSICEKVIVPNMEFRAADEEAFEDNSEEYIRRDLEGSDIDTRRRAACDLVRGLCKFFEGPVTGIFSGYVNSMLQEYAKNPSVNWKHKDAAIYLVTSLASKAQTQKHGITQANELVNLTEFFVNHILPDLKSANVNEFPVLKADGIKYIMIFRNQVPKEHLLVSIPLLINHLQAESIVVHTYAAHALERLFTMKGPNNATLFTAAEIAPFVEILLTNLFKALTLPGSSENEYIMKAIMRSFSLLQEAIIPYIPTLITQLTQKLLAVSKNPSKPHFNHYMFEAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQKLIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPESVDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVLEKIIIPEIQKVSGNVEKKICAVGITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDDTIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFSQLAFAGKKEHDPVGHMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGRVPSMVSTSLNADALQYLQGYLQAASVTLL	578223	559438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_559876_560650_560883_561840_561988_563237_563320_564664_564751_564852_564951_565374_565428_565833_565874_567168_567267_569244_569349_570702_570840_574334_574397_575558_575644_576110_576314_576729_576796_577854_577985_578099
735364	contig_18869_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_56394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCACATAAAATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
735366	contig_15087_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_37298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGAAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310873	311936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_310900_311900
735369	contig_5057_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_151497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTGGCTGAAGCAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360000	359010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_359000_360000
735370	contig_6589_pilon	-	1342	4	Intergenic	novelGene_25817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_2	118.761198302401	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	181	660	747015	732935	FALSE	25	ATAATACCTCTCTCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFRFLGDLSHLLAIILLLLKIWKSRSCAGISGKSQVLFAVVFTARYLDLFTNYISLYNTCMKILWTFSIYLESVAILPQLFMVSKTGEAETITSHYLFALGVYRTLYLFNWIWRYHFEGFFDLIAIVAGLVQTVLYCDFFYLYITKVLKGKKLSLPA	747195	732252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_732970_736851_737105_746140_746242_746924
735375	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
735377	contig_6710_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_96847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATACACAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653369	657824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657794
735380	contig_299_pilon	+	1737	2	Intergenic	novelGene_129489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	102	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGTTTGTGGTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1559180	1562270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1559549_1560901
735382	contig_14516_pilon	+	2719	5	Intergenic	novelGene_153885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	58.5934083323372	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	291	857	34664	169163	FALSE	25	GAGGGCATGGCGCAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKIDFKLTCTFEGLCFTVEGKVDASDKVKGSCFRMLVLLTLYYSVFKLQKNTARPCLVRAHKRTKFYNCVELNTLNDTESTWKFYLS	32290	171025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_34643_34736_36343_36417_165669_165732_168803
735387	SIRV6	+	384	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	578	0	399	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735388	contig_10864_pilon	-	1703	3	Intergenic	novelGene_107044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_2	51.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	16	1626	704557	698173	FALSE	55	AAGGAGAAGGAACGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFFRFMNVLVKRCKEPLIPSIANTVALLELQYIHCGAVLARLCKNTILCLPKSYISLLHYWEFLCSKKDKEPVDVFAIIQEFKPKDVTRAIQHFRFHLSYLAEVLCGHENVNFNVLLDAFDDIDCVVSGEAERTLVLCLVMLVNAKGILKPHCKRLLCSHFQEIEKQLQRMRENFPACVPERLLRVVRRVLVAVDVKSVAEALQDLLSDRDKEYLVDCRWCWDSVHAKGSVVRGLYHEEVKLNRLLCVGSLDGAAEPESEFDQDETGEPASEDRDHLLTAILSQRQRKASSRRKLRRVCLLVSLCISWRRWASAQAERGKEEAREPSAGNFKKADVDRTQCDLCGVKFIRGPENDFSPREVLEEVTFEAAALSGAEPERKEGLERNSESYEQHICLEGHQRQQAAYQKYSAFFREQVDPAVDEGKLVVQDMEQSVWIGSRLGWKEHSHVLQRKVQENIKKVLDTVEEVYRRKAWDSGQEVMTPLVNILILSVRDAQEWLRRTELSLKERGIVQEDEYENEVEDFDELCPIKPSRKRGKQRK	704572	698095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_698271_701748_701848_703143
735389	SIRV6	+	469	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	387	0	208	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735393	contig_9363_pilon	-	2452	3	Intergenic	novelGene_6685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_1	59	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1330	1737	1272844	1272437	FALSE	20	GTCGGCATAGCCAGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHARGSAPSATQPLVPTTSTVSTSAEPVTQGTLEHLQALGAVPPAPPYPRSVGPYPAFQTLWAQFLPTWLVWGPQYVLVGSVKLSSIFSSRSKGQPRWHLLCSKVRHERPEGPELSTELPRSCPNLPPVSKGPS	1276467	1271721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272942_1275152_1275255_1275337
735394	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735403	contig_7457_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_31345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACATGGTGCATATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288300	288702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_288300_288700
735404	contig_7457_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_31346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	311	667	289928	290284	NA	30	AAATACACTACTGTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKMILGICLAQSSSLRSSSGKFSPEPLEIYRNAYLVKSCRSSVIDGNLSSRNKTECFYYLKQSISFLLFAFSPHEFRDAQENSEEYCNPHLPLAPGFSSVWVCVLSLYSTMTMSLL	289617	290319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_289600_290300
735405	contig_7457_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_31347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290319	290748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_290300_290700
735410	contig_12250_pilon	+	1972	16	Intergenic	novelGene_80549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_6	64.1683895872588	61	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	109	1170	272853	275593	TRUE	20	TTGCCCTTAAGTTATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFR	272437	278416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272493_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
735414	contig_8317_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_19880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
735420	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	20	3	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735421	contig_4678_pilon	-	1587	13	Intergenic	novelGene_126043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_6	74.1814591989729	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	332	961	545735	542940	TRUE	5	TCCCGTGTGCCCTTATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGALTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPAQSKLQKVQTPDKQPIRPLVPNASKQRLMEDTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSGTWNPAQQLSLTQASSRGPAGPSQVPRTEAPAPASATTQEPWPGPTNPSPTSRPPWAMDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQNRTSIVQAAAGGGIGDGSGSSGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPLL	551804	535659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_536000_536164_536281_536373_536495_542890_543073_544078_544317_544453_544516_544594_544664_545466_545504_545644_545782_546017_546035_547042_547074_547151_547304_551719
735424	contig_1146_pilon	-	461	5	Intergenic	novelGene_84855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3006	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAGAATAGTGAGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957171	949779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_949802_950972_951112_951650_951730_956015_956103_957037
735429	contig_4232_pilon	-	813	4	Intergenic	novelGene_63195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	260	388	149175	148843	TRUE	15	GAACGCGGCCTCTCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLGGVGLLQPKRNQKIKSNLRKVQGGGGLFGNWGEGIALALLGSPPASPVWQEGGSLQPPQLGLGLPDAPGRGLEGVHNGLPSREMTALPPSFSARVQRSLTSSRQFACTSCLIPVSFFLRASLELA	149434	146283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146364_148229_148536_148803_148883_149086
735430	contig_5959_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_150225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATGGGAAACCCAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515322	513031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_513000_515300
735431	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10721_10819_11031_11109_11205
735434	contig_3627_pilon	-	2388	7	Intergenic	novelGene_78481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTTCATGTATTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483669	444140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_444201_448415_448564_459446_459609_460274_461617_476756_476895_478111_478156_483175
735435	contig_9727_pilon	-	1002	9	Intergenic	novelGene_86352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	57	551	514175	508690	TRUE	45	GAGAAGAGACACAGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSHVFQFSSSAVLGSYMSGVISGARSLASSCPRGTSFRGILERVRNAMRLSSMVWKESTQTGLEASSSSTACNFSMKVLSLVCFGFGGGGGPMGTTSALMCLMAGVVTFSASDNMPLSSSVSVISEDCLNLDFFAPRGDEAVLSTSLSNKLSSAVSSSSSSAGWYSSSEESSSSRWMSTN	514231	477403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_477478_502778_502974_503678_503754_503936_503987_508313_508364_508682_508779_509642_509763_510398_510570_514060
735436	contig_9727_pilon	-	743	3	Intergenic	novelGene_86351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCAGCCAACGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477453	462717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_462759_464901_465435_477284
735439	contig_6691_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_60152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330824	331667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_330800_331700
735440	contig_5499_pilon	-	2784	2	Intergenic	novelGene_57026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	175	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGAAGGCTGTTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323944	1309263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1312025_1323921
735442	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	137	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735448	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	33	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
735449	contig_4501_pilon	-	1708	7	Intergenic	novelGene_168980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	47.1053783199612	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	35	853	190111	58215	FALSE	25	ATTACTTTTTGTAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGGQDGGWRMIGPGSHQQQRRPRGGGFSFECRPSSSPPPPEPLPSTHSSASRGGPGSRDSMSDSEEESQDRQLKIVVLGDGTSGKTSLATCFAQETFGKQYKQTIGLDFFLRRITLPGNLNVTLQVWDIGGQTIGGKMLDKYIYGAQGILLVYDVTNYQSFENLEDWYSVVKKVSEESETQPLVALVGNKIDLEHMRTVKPEKHLRFCQENGFSSHFVSAKTGDSVFLCFQKVAAEILGIKLNKAEIEQSQRVVKADIVNYNQEPMSRTVNPPRSSMCAVQ	190145	57359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_-_58308_67088_67167_71653_71758_145989_146120_179875_179965_185338_185436_189883
735452	contig_7428_pilon	-	2377	6	Intergenic	novelGene_77720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	54.7978101752251	89	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	98	1258	428586	425489	TRUE	5	GGACTCCTGTCTTGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLWSGWCRLSDSGRRCRTWRDARLGDSDLLALMFDEPEWTEEAPVATALAPVATGPRPAAAVQTKGLKHRQLLATLRALEAASLPQQPPSLPGSDSEEEEIEKKKKRRKKASFASASAEVEEKRKKKRQKQASYGSDSEDEEVERKKKSCKQALLGSGSVEEEKRKSKCQKQAPSSRAQHLDSGDQTDSKAQKGSATNDPHKPSPGSASPQPPHALSRKQWRNRQKNKRRHKNKFRPPQPPAQAPALAPTEEAEAPPAPRPDSHEARAGALRARMAQRLDGARFRYLNEQLYSGPSSAAQRLFQEDPEAFLLYHRGFQNQVKKWPLQPVDRIIRDLRQRPASLVVADFGCGDCRLALSVRNPVHCFDLASLDSRVTVCDMAQVPLEDESVDVAVFCLSLMGTNIRDFLEEANRVLKPG	428683	424146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_425090_425312_425600_425793_425924_426013_426468_426871_427239_428487
735458	contig_6842_pilon	-	1943	3	Intergenic	novelGene_130750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	109	357	1306598	1306350	TRUE	20	TTAGTATTCATATGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVRASPEKDAELRIKCSADAASLKPPSYTHFTDAETMSRAKIGTHPSQVRWERQSRLPTSSGRLQNFPLPCSSPSLTTARCGARTPAGRLRALALPARGVFSRPAAPGSGLPGQLREP	1306706	1302643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1303978_1304196_1304320_1306220
735461	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	683	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735462	contig_7630_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_133664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAGTTGTAAGAGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547866	545795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_545800_547900
735467	SIRV6	+	547	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735468	contig_13937_pilon	-	2079	4	Intergenic	novelGene_167372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.05480466765633	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	133	690	123993	123436	TRUE	20	CTGACATTGTTACTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARWGRALLLLLAAQAVSAALGAEDDEVPEEWLLLHVVQGQIGAGNYSYLRLNHEGKIVLRMRSLRGDADLYVSDSTLHPSFDDYELQSATCGPDSVSVPAHFQRPVGIGIYGHPSHLESEFEMKVYYDQTVEPHPFVESAYSPEGADPGQRRAQAPEDASQEEESVLWTILISILKLVLEILF	125367	121227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_121883_122081_122641_123260_124042_125283
735471	contig_7165_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_116885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATAAGTGTTAAGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742837	740749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_740700_742800
735472	contig_7297_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_169699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCTACAATATGACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154043	154846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_+_154000_154800
735475	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735478	contig_16930_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_139138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	94	375	16943	16662	NA	70	GGTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCVDTPPLNYSPTAGHFGCLQFLAITSKAAMNNQVQVFVWIQVFIFFEIKARSAIAGSYGKYMFRRKLTNYFHQQCMTDPFSLHLCQHWVLSLFFILAILICISIIANVLGIQCCYNRNTTSG	17036	15101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_15100_17000
735483	contig_11335_pilon	-	1517	9	Intergenic	novelGene_104933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	92.7803184948187	516	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	142	1062	459255	418179	FALSE	20	CATATTGTTTTTGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRRRGFSLVLNPPVRLRSLREGDVYEIGEDGELAAILLAVSLPLEFEMLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVLRAAKRGIPYRVIHNASIMNAVGCCGLQLYKFGETVSIVFWTDTWRPESFFDRVKKNRQNGMHTLCLLDIKVKEQSLENLIKGRKIYEPPQYMSVNQAAQQLLEIVQNQRMRGEEPGQLFHLNSKTSEGSALQLQHQTITEETLCVGLARVGAEDQKIAAGTLQQMCTVDLGGPLHSLIITGGSMHPLEIEMLSLFSVLEDTSESQSIDGL	459631	417723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_419081_419145_420501_420606_422034_422075_427382_427504_442122_442232_451414_451540_459120_459279_459513
735484	contig_8712_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_58874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATAAAGAAAGGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898023	897662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_897700_898000
735485	contig_17470_pilon	-	1796	12	Intergenic	novelGene_110511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_11	58.6594035073211	10	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	92	1309	277306	270076	FALSE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPETSHFLQRDQAAIPERTLTALLLSPGRHGQAAAGPKAGWARQKPMGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKGLSAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302619	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_277162_277325_302546
735486	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11199
735491	contig_7342_pilon	-	2076	4	Intergenic	novelGene_71130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.88561808316413	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	91	1425	94017	88627	FALSE	15	CGTTTCTGTGGAGGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAAAAAAAATAAAASSLCAAAASAISATSMREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLSVQSKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEGEFEEEAEEEVA	94107	87975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_89685_93133_93245_93352_93462_93960
735494	contig_11964_pilon	+	1901	15	Intergenic	novelGene_164712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	443.885580035289	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	237	1760	180279	234930	FALSE	20	GTCCAATGGAAGCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKWYLMPVVVLIGLTVRWTVSLNSYSGAGKPPMFGDYEAQRHWQEITFNLPVKQWYFNTSDNNLQYWGLDYPPLTAYHSLLCAYMAKFINPDWIALHTSRGYESQAHKLFMRTTVFIADLLIYIPALILYCCCLKETSTKRKITNALCILLYPGLILIDYGHFQYNSVSLGFALWGILGVSCDWDLLGSLAFCLAINYKQMELYHSLPFFCFLLGKCFKKGLKGKGFVLLIKLACTVVASFIVCWLPFFAEREQTLQVLRRLFPVDRGLFEDKVANIWCSFNVFLKIKDILPRHIQVIISFCFTFLSLLPACIKLTLQPSPKGFRFTLVSCALSFFLFSFQVHEKSILLVSLPVCLVLNEIPFISTWFLLVSTFSMLPLLLKDELLMPSVVTTMAFFIACATSFSIFEKTSEEELQLKSFSISVRKCLPYFTFLPRIIQHLFLISVIAMVLLTLMTVTLDPPQKLPDLFSVVVCFVSCLHFLFFLVYFNIIIMWDFRNGRNQKKIN	174111	235071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_174176_180106_180361_195807_195893_212355_212446_213716_213806_215470_215554_216225_216291_217370_217557_218143_218280_220528_220615_222042_222128_225061_225133_231783_231853_231976_232176_234732
735497	SIRV6	+	497	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	171	3	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	613	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
735498	scaffold_17907_pilon	+	2031	16	Intergenic	novelGene_150758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	154.56927968462	3	52	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	628	1359	55274	77368	TRUE	35	TTAAACTAATTATTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLAEWSKHIDSEGRILNVDSVKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSVSEEQERRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDILSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQIQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLV	19267	81642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_19299_33766_33866_34290_34366_41628_41768_46177_46369_55181_55355_56657_56787_57275_57380_58385_58481_67571_67689_72988_73090_76862_76963_77363_77467_79542_79660_80188_80276_81272
735500	SIRV6	+	582	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	368	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
735501	contig_10734_pilon	-	1908	10	Intergenic	novelGene_51449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_9	84.4192945004317	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	759	1190	2222890	2216993	FALSE	10	CTTAATCCGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234535	2216274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2234332
735507	contig_2444_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_83790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTTAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262559	262811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_262600_262800
735508	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735514	contig_6576_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_42304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAACAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478056	475635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_475600_478100
735517	contig_10734_pilon	-	1851	6	Intergenic	novelGene_51435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	67.9075842597865	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	577	906	2222890	2218369	TRUE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKVAPLNPLCSHPGLGQEPSPYPLSAPTYP	2225797	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534
735524	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735527	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735528	contig_2550_pilon	+	2070	13	Intergenic	novelGene_135688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_12	30.4661697625415	9	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	252	1397	1592401	1631339	FALSE	85	ATAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKGWPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTTQQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFEDGSGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTMSVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNEGKNETVSSNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAVSAAVQAVRGRGRGALTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYG	1590521	1632012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1590599_1591101_1591198_1592322_1592435_1593099_1593198_1593515_1593628_1602259_1602353_1603740_1603941_1614495_1614655_1618513_1618649_1618838_1618980_1622320_1622445_1625354_1625400_1631334
735532	scaffold_6394_pilon	+	878	4	Intergenic	novelGene_111033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2426	junction_3	202.491152070076	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	203	721	405059	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	404856	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_405201_405302_405501_405717_405864_406086
735533	contig_12125_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_76195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGCTCTGCTGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56168	57885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56200_57900
735535	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735537	contig_16525_pilon	-	543	5	Intergenic	novelGene_133856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	46	486	181436	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181481	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
735538	contig_1918_pilon	+	2422	3	Intergenic	novelGene_168327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	17	208	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGACTGTAATAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49490	53707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_50215_50396_51870
735544	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11208
735548	contig_10235_pilon	-	1347	4	Intergenic	novelGene_46613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	313	junction_3	186.29546424967	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	22	948	606201	604892	FALSE	25	GAGGCCAGATGTACAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGGSHRHPAWLFCTLSAFVLISCLGRIIVEGAFWGERDQAETRWECRDRGHSGVVPSAFLPAGGQRWLGNSLLFPSAGVLFCG	606222	604492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_605294_605419_605556_605714_605906_606003
735550	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735554	contig_4857_pilon	-	2371	2	Intergenic	novelGene_48814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAACAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259314	1255354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1257472_1259060
735558	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
735559	contig_14732_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_169708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATAAAAATAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73302	71752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_71800_73300
735560	contig_12050_pilon	+	604	6	Intergenic	novelGene_62614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	179.002346353337	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	8	589	321302	337637	FALSE	10	TGGTCTTCACACCTGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKSQISAQELCLLLTL	321294	337652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_337592
735561	contig_3866_pilon	+	2050	6	Intergenic	novelGene_112416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	73.7981029566479	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAGCATCTAACCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224213	254531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_224394_225367_225423_228056_228148_238726_238832_239657_239823_253077
735563	contig_9696_pilon	-	1839	5	Intergenic	novelGene_68749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	24.7525251237121	221	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	301	324	48344	48321	TRUE	30	AAATATTTTGCATCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGLIAGSGWRGWRWHGPGNRCPGSTTSTCLSRRSTCWSPGSGLCSILCWFPLWGWHCTQDTSSCHSTSWRYCTTLKLYSDRDVTRIQRFLREESPSEVGMGLHQMS	68500	25557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_26032_46789_46826_47244_47907_47977_48507_68362
735564	contig_7356_pilon	-	1917	8	Intergenic	novelGene_60400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	526.514646965673	39	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	400	960	479055	463380	FALSE	20	TTTTATCCACATTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTPQKTKPVRPAVDLGRDKLLRPPLEKWKRQDDRDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGLSKSDCVFGSPSSPSSLRPTGTFFQAVLLHEDKKKQKTAIFLSPQSGSLSSKYMTQGKASPKRTQQES	482476	462422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_463448_473372_473437_473787_473865_475963_476290_479029_479170_479840_479948_480030_480079_482346
735565	contig_5718_pilon	+	2583	2	Intergenic	novelGene_110409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGAAGAGGTCATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1423691	1426550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1423721_1423996
735569	scaffold_2602_pilon	-	911	3	Intergenic	novelGene_127712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	17	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGGAAAGACACTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508972	500789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_501360_503381_503518_508767
735570	contig_14563_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_135072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAATCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247390	245494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_245500_247400
735578	contig_12543_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_168386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	583	1752	92	1843	369234	370985	NA	15	AATTGGTTTTCAGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSQTRQQEELFCWQIWQQIASDLTRCQDSMINSSQFHKQGDSAFQVGAGLSIIHKSEKLYQYNECTETFSDASSFDLPQQLHSRETSHVCSQCGKSFRYSSGLRNHHRVHMGENCYKCDECGKKFSQKPHLQTHQKVHTVEKPHKCEECGKGFSRKSALTVHCKVHTGEKPYNCEECGRGFIHASHLQEHQRIHTGEKPFKCDVCGKNFRRRSALNTHCMVHTGEKPYRCEECGKGFTCSSNLCIHQRVHTGEKPYKCEECGKSFIQPSQFQAHQRIHTGEKPYICKVCGKGFIYNSSFQAHQGIHTGEKPYKCEECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCDVCGKGFRQRSYLKIHQKGHSVEKPYKCEECGQGFNQSTRLQVHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKGFSQASHLLTHQRIHSGEKPFRCEVCGKNFSRNSHLEAHQKVHNGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCEECGKYFSQASSLQLHQSVHTGEKPYRCDTCDKVFSRSSQLQYHQRVHTGEKPYKCEVCGKSFSWRSNLVSHHKTHAGDKISESDNSGKNIREASHERSSTK	369142	371696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_369100_371700
735579	contig_12000_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_43190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCAAGGGGATAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582110	580063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_580100_582100
735591	contig_8196_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_168768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGATCATTGCACCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477332	479212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_+_477300_479200
735593	SIRV7	-	341	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	10	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114728	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
735595	contig_3747_pilon	-	1895	7	Intergenic	novelGene_24969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	97.2002514857286	395	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	143	586	220068	217418	FALSE	40	TACAGCGAGAGAACCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQQISSWLQCGFRLGEGRQLLEFHPVPLPSGEEGEYVLALKQELRGAMRQLPYFIRPAVPKRDVERYSDKYQMSGPIDNAIDWNPDWRRLPQELKIRVRKLQKERTTILLPKRPPKTPEDKEETIQKLETLEKKEEEVTSEEDEEKGEEEEKEEEEEEYDEEEHEEETDYIMSYFDNGEDFGGDSDDNMDEAIY	226342	216108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_217505_217816_217928_218058_218133_218368_218426_218771_218841_220022_220153_226284
735596	SIRV6	-	558	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11040_11109_11205
735597	contig_16804_pilon	+	3224	1	Intergenic	novelGene_167287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAAAAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13552	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_13600_16800
735601	contig_10734_pilon	+	2617	19	Intergenic	novelGene_51541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	27.4642303845799	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	65	2095	2341861	2433418	FALSE	20	CATCATGGCTGTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQIKFIVDKLNKDPFRKNYNLITFDSLEPMQLLQVLSDVLAEIDPKQVVDIREEMPEQTAKRMLSLLGILKYKPPGNATDMSTFRQGLVIGSKPVIYPVLHWLLQRTNDLKKRAYLARFLIKLEVPSEFLQDETVADTNKQYEELMEAFKTLHKECEQLKTSGFSTAEIRRDISAMEEEKDQLIKRVERLKKRVETVQNHQRMLKIARQLRVEKEREEFLAQQKQEQKNQLFHAVQRLQRVQNQLKSMHSAAADAKPESLMKRLEEEIKFNSYMVTEKFPKELENKKKELHFLQKVVSEPAMGHSDLLELESKINEINTEINQLIEKKMMRNEPIEGKLSLYRQQASIISRKKEAKAEELQEAKEKLASLEREVSVKTNQTREFDGAEVLKGDEFKRYVSKLRSKSTVFKKKHQIIAEFKAEFGLLQRTEELLKQRHEDIQHQLQTIEEKKGVSGYSYTQEELERVSALKSEVDEMKGRTLDDMSEMVKKLNSLVSEKKSALAPVIKELRQLRQKCQELTQECDEKKSQYDSCAAGLESNRSKLEQEVRGLREECLQEESKYHYTNCMIKNLEVQLRRATDEMKAYVSSDQQEKRKAIREQYTKHIAEQENLGKKLREKQKTVRESHGPNMKQAKMWRDFEQLMECKKQCFLKQQSQTSIGQVIQEGGEDRLIL	2338867	2433940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2338911_2341839_2342005_2342551_2342656_2343155_2343337_2348647_2348738_2352309_2352376_2352690_2352802_2354904_2354990_2369511_2369676_2371643_2371740_2380260_2380408_2398346_2398497_2402134_2402264_2408107_2408198_2417280_2417368_2418368_2418441_2418523_2418610_2423642_2423689_2433235
735612	contig_5400_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_162809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGACAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34989	36261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_35000_36300
735615	contig_5602_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_133043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTATTTAAAAGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667914	665608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_665600_667900
735621	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	184	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735623	SIRV1	+	220	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTACCCTAGTATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
735624	contig_6364_pilon	-	1792	11	Intergenic	novelGene_51829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	8.77724330299668	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1297	1710	1588512	1586979	FALSE	15	GCTTTTAGAACTGTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1596998	1586896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1588798_1588934_1589040_1589125_1589244_1589381_1589757_1590428_1591357_1591545_1596923
735625	contig_5033_pilon	-	1095	3	Intergenic	novelGene_28936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	250	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	49	552	477189	450093	FALSE	10	ACATGGGTTCGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEASSVIGAFPTLPTNNLS	477237	449549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450147_464608_464983_477113
735627	contig_9440_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_59120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1921249	1921687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1921200_1921700
735628	contig_17440_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_7636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACAAACATAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3465	3997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
735629	contig_12270_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_113813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	19	348	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14427	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
735630	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_94799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
735631	contig_4884_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_63783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCTTCCTCATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146441	147232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_146400_147200
735637	contig_19352_pilon	+	1676	6	Intergenic	novelGene_122370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGACTTCGGCGGCGACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103142	123078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_104089_105885_106011_108444_108516_112795_112907_113280_113362_122736
735638	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657182	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657184	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735639	contig_13608_pilon	-	2690	18	Intergenic	novelGene_52365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	240.828601343182	1	125	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	97	1098	470234	400675	TRUE	20	CAAAATGTGTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERESNNGCWYDKV	470330	368767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_382439_382527_382986_383078_385461_385555_391792_391862_392468_392574_393164_393240_395252_395400_400592_400706_410883_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289_456419_466411_466478_470191
735646	contig_9575_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_169712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATATTTTCTACGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50678	48414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_48400_50700
735650	SIRV7	-	279	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91647	0	-91641	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAATTAGCACGAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
735652	contig_18081_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_23842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATATAAAGCCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428999	427187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_427200_429000
735656	contig_12638_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_33337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAATGTAAACTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349876	1350300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1349900_1350300
735657	contig_14519_pilon	-	2470	4	Intergenic	novelGene_66825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_3	174.694018214706	16	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGATACCTGAGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287167	279965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_282140_282222_282309_283632_283788_287112
735658	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735660	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735665	contig_11136_pilon	+	707	4	Intergenic	novelGene_169010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1542.94098684586	23	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	248	601	127904	128257	FALSE	5	GCTGCTGTCAGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKSKAKAQSKAEAPAKASTQVLAPGQAPKGTQAPTKASE	126135	128363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_126177_126594_126666_126929_127041_127879
735672	contig_12050_pilon	-	1422	7	Intergenic	novelGene_62692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	114.288620994782	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	572	907	616954	615621	FALSE	10	GCAAGCTTCCGCCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659663	615105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617075_617217_617366_617771_617890_619129_619256_659604
735676	contig_17859_pilon	-	3697	1	Intergenic	novelGene_155719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	266	625	205404	205045	NA	10	TTGTCTGTGGAGGTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSLSCWGPGPQDPPVLPPSALQRKEAPPVTFCSSGLFSTLPPGASSAPLAARPPEASVPSSLPGTHASSMAWHPCWAALHQPCPWRHPRLLTLWLVPATSREGEGSTPQPRALTSVM	205669	201972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_202000_205700
735677	contig_6710_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_89406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATCCACCTTCCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
735678	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735681	contig_5891_pilon	+	1292	4	Intergenic	novelGene_151582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	83	junction_1	61.5485355002231	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	12	1292	126193	151037	FALSE	25	GTAAGAATTGTTGTTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTMFYYICLRRRARTATRGEVMNSHRTIESNSRTSPLNAEVIQYAKEVVDFSSHYGSENSMSYTMWNLAGVPNVFPSSGDFTQTAVFRTYGTWWDQCPSASLPFKRTPPNFQSQDYVELTFEQQVYPTAVHVLETYHPGAVIRILACSANPYSPSLPAEVRWEILWSERPTKVNGSQARQFKPCIKQINFPTNLIRLEVNSSLLDYYTELDAVVLHGMKDKPVLSLQTSLIDMNDLEDDDYEEKDDCGMDNLNKKFSSATLREGPNNGYFDKLPYELIQLILNHLTLPDLCRLAQTCKLLNQHCCDPLQYIQLNLQPYWAKLNDTSLEFLQARCSLVQWLNLSWTGNRGFISVSGFGRFLKVCGSELVRLELSCSHFLNETCLEVISEMCPNLQELNLSSCDRLPPQAFNHIAKLCGLKRLVLYRTKVE	126181	151037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_126669_136359_136706_143057_143303_150823
735682	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735690	SIRV1	-	239	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	4	3587	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
735694	contig_17440_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_7659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCTGCATCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3566	3982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
735695	SIRV1	-	241	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	1	3588	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
735698	contig_9074_pilon	+	1207	3	Intergenic	novelGene_156631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAATCTTGCCTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135124	150434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_135210_147771_148046_149586
735700	contig_5758_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_119053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	70	300	34259	34489	NA	55	CATAAGAAAAAGACTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKRQTTQSKNGQGLGQFTSEDIQMANNYIERYSTSLAIRKMQIKTTMRYHLTAIRMAMTKKWKTSVDKDVEKLEPSLVAGGDVKWYSHRGKNFSRSSKS	34189	35746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_34200_35700
735707	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	3	1206	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735711	contig_5744_pilon	+	557	3	Intergenic	novelGene_149326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_2	214.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	158	388	294152	297257	FALSE	35	TTACATTCTTGGATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFFNGLRAELVTYPGITVSNICPGPVQSNIVKNAVTEEVTKSVGNPGDQSYKMATSRCVRLMLISMANDLKEVWISDHPFLLAAYLGQYMPTLTFWIIGKLGKKRIENFKSGLDADSSYFKPLKKKHD	293278	297426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_293403_294118_294335_297209
735714	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735715	contig_19851_pilon	+	1020	6	Intergenic	novelGene_29832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	175	690	53637	56177	FALSE	30	TTAATAAACTGCCCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53462	56507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
735719	contig_3601_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_132934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGGAAAAAATACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394498	393129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_393100_394500
735723	contig_8059_pilon	+	1654	16	Intergenic	novelGene_111085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	59.5823985940665	2	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	430	1296	266127	341653	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEAQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPINATSAFSVFKAPGW	90280	342011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278520_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_341610
735728	contig_12886_pilon	-	1829	12	Intergenic	novelGene_135505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	205.933793420913	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	860	1726	605639	592899	FALSE	30	GTAAATTATTCTGGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHSGKLLASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSTISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHEHFVTSLDFHKTAPYVVTGSVDQTVKVWECR	659571	592795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_592973_594073_594231_596156_596259_597389_597619_598329_598433_600459_600629_605606_605814_607030_607106_607260_607346_626332_626554_659198_659345_659413
735735	contig_16775_pilon	-	2111	13	Intergenic	novelGene_107800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	73.2550718759838	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	472	1008	227954	203129	FALSE	50	TTCTTGCAGTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNDLLRRLSKSQNTVFCGRIQLFLARLFPLSEKSGLNLQSQFNLENVTVFNTNEQESTLGQKHTEDRDEGMDVEEGEMGDDEAPTTCSIPIDYNLYRKFWSLQDYFRNPVQCYEKISWKTFLKYSEEVLAVFKSYKLDDTQASRKKMEELKTGGEHVYFAKFLTSEKNPILMFDCLY	235755	202025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_203162_209277_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219486_227461_227558_227944_227994_228445_228565_228981_229024_231987_232055_233245_233307_233399_233474_235686
735745	contig_12884_pilon	-	1092	9	Intergenic	novelGene_105001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	538.468415392212	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	141	1034	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARSLADLSGSSRRARAPWPSETGLCLCCRGEPRAERPDGEAGRKMATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915532	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905761_905834_906224_906349_915399
735756	contig_16103_pilon	-	1259	11	Intergenic	novelGene_118747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.454060127827	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	66	602	321023	315160	TRUE	0	GGTGCTCGGTTTTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGDRGRGRGGRFGSRGGPGGGFRPFVPHIPFDFYLCEMAFPRVKPAADETSFSEALLKRNQDLAPNSAEQASILSLVTKINNVIDNLIVAPGTFEVQIEEVRQVGSYKKGTMTTGHNVADLVVILKILPTLEAVAALGNKVVESLRAQDPSEVLTMLTNETGFEISSSDATGFCGYH	321088	314161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314673_314804_314896_315104_315181_316942_316999_317322_317389_318032_318136_318474_318553_319100_319206_319791_319835_320330_320391_321018
735758	contig_9014_pilon	+	1346	2	Intergenic	novelGene_106796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6293	junction_1	0	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAACTTTATTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150635	152453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151763_152234
735759	contig_11115_pilon	+	1303	7	Intergenic	novelGene_102841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	708.028816896287	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	376	1176	171704	173204	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	165603	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166359_171160_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172896_173116
735763	contig_11677_pilon	+	2753	11	Intergenic	novelGene_85897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	92.2781122477048	463	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	446	1501	465595	468297	FALSE	5	CCCCTGCATTGTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKELLAVACEQFLGKNVQDIKNVVLQTLEGHLRSILGTLTVEQIYQDRDQFAKLVREVAAPDVGRMGIEILSFTIKDVYDKVDYLSSLGKTQTAVVQRDADIGVAEAERDAGIREAECKKEMLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVHRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKGEAERMKLKAEAYRKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIASPLTKVDEIVVLSGDNSKVASEVNRLLAELPACVHALTGVDLSKIPLIQKATGAQV	451902	469549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_452165_458896_458979_464465_464558_465585_465710_466156_466276_466393_466508_466607_466728_466816_467032_467449_467634_467997_468148_468258
735764	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_93466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
735765	contig_11780_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_134300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAGCTGAGTCAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22386	22872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_22400_22900
735772	contig_7426_pilon	-	2020	8	Intergenic	novelGene_27540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	303.871616285025	2	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	58	441	1102797	1094464	TRUE	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGPAAGKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFK	1102854	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091091_1093365_1093466_1094463_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
735773	contig_14925_pilon	-	941	4	Intergenic	novelGene_55169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	151	408	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29825	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
735776	contig_10734_pilon	+	1821	6	Intergenic	novelGene_51304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	351.181206786468	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	278	589	1377357	1380475	FALSE	35	TAAGCAGCTACACACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALFLRRQSRPRCPAALRSLASPLQPEVGRLPPPWSGRRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGK	1368732	1381707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368847_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1380467
735779	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	9	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	264	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735780	SIRV6	+	571	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11203
735784	contig_3942_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_128842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACGGATCCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312798	1310557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1310600_1312800
735790	contig_5041_pilon	-	975	3	Intergenic	novelGene_27027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAGGAGAGATGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329516	280237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_281036_285633_285733_329438
735791	contig_5041_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_27025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGCAGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279936	279263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_279300_279900
735794	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8467	-1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
735798	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
735799	contig_14822_pilon	-	1361	10	Intergenic	novelGene_145395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	112.834194974554	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	299	1273	58551	53461	FALSE	15	CCACACTGCTTACTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSESGQVKEAIKYALSVGYRHIDCAAVYGNEAEIGEALKENVGPGKVLREHLFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPHAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69989	53372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_55429_56070_56220_56390_56511_58467_58558_69603_69703_69796
735803	contig_5084_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_64568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTGGATTCAGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579400	578448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_578400_579400
735807	contig_15120_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_107995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAATTACTGGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114607	114024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_114000_114600
735809	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735810	contig_4519_pilon	-	1982	9	Intergenic	novelGene_123730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_5	33.946419177875	2	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTAGTAGTTTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810707	761283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_762654_763395_763639_768630_768773_788185_788293_802293_802421_804667_804820_809552_809747_810377
735825	contig_10286_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_98420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423152	421457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_421500_423200
735830	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735834	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
735845	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735847	contig_15905_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_154711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATATTTTAGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268829	266577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_-_266600_268800
735849	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
735850	contig_6270_pilon	+	1779	6	Intergenic	novelGene_99832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	54.1575479504012	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	194	844	152121	159494	FALSE	20	AATCTGCTGCATTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKTEQLTFETAYENLRTVNPEAKMNEGFEWQLKLYQVMEYEVDTSSAIYKQYRLQKVTEKYPELQNLPQELFAVDPTSISQGLKDEVLYKCRKCRRSLFRSSSILDHNEGSGPIAFAHKRMTPSFILTKGSQAQCTSYFIEPVQWMESILLGVMDGQLLCPKCSAKLGSFNWYGEQCSCGRWITPAFQIHKNRVDEMKILPVLGSQTTKIQTCDI	148912	160429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_149063_152077_152192_152276_152396_153281_153379_153688_153876_159317
735853	contig_8045_pilon	-	954	2	Intergenic	novelGene_35409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTCTTCACAGGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119398	118159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_118241_118525
735854	SIRV6	+	563	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3187_10745_10819_11031_11109_11205
735855	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
735856	contig_16156_pilon	-	2067	10	Intergenic	novelGene_137072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.7626728046147	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	46	1236	160245	99837	TRUE	10	TTGTTTTCTATTTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKAVESIQAEDESAKLCKRRIEHLKEHSSDQPAAANVWKKKRMDRMMVEHLLRCGYYNTAVKLARQSGIEDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160290	98958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99780_99826_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_123176_123381_133371_133555_160176
735857	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
735858	contig_7057_pilon	+	549	6	Intergenic	novelGene_123327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	988.550332557731	257	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	52	549	937155	943722	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSPAPGLLPHPQGLLSSGGISPVPAPCHACSSYPPGSRTPRSTSHVPSAFVPALLSARQAQEEIKAPHCCSSW	937103	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_943506
735861	contig_2703_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_101829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTGCGTAGAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229906	1231751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1229900_1231800
735867	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_95876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
735870	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
735872	contig_7331_pilon	-	1845	4	Intergenic	novelGene_67236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	52.0405824546788	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTTTTGTTATATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645010	637468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_-_639040_642172_642287_642789_642841_644901
735874	SIRV4	-	268	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
735875	scaffold_16539_pilon	+	2164	15	Intergenic	novelGene_68324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	15.350330715044	91	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	21	1598	175927	195428	FALSE	5	TCCCCTTCCCCCAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLEVGVLLRGTCGQLGRTIGLPCGALGPGLHWWGTCGGCQAQRFHQDGPGRGLGEEDIRRAREARPRKTPRLQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGALAEVAKKTLPGGHLQSEGGSQQGSSPFLSEANAERIVQTLCTVRGAALKVGQMLSIQDNSFISPQMQRIFERVRQSADFMPRWQMTKVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGVAQSIQSDVQNLLAVLRMSVALPEGLFAEQSLHALQQELAWECDYRREAACAQNFRQLLADDPFFRVPALIQELCTTRVLGMELARGVPLDQCQDLSQDIRNQMCFQLLRLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDTSSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHYIEVVKAAADGDREKVLQKSQDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGAGDTAHRVQDLIPVLLRHRLRPPPEETYSLHRKLAGAFLACSRLRAHIDCRDLFQDTYHRYWASRQG	175513	195994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_175531_175923_176029_176160_176281_176399_176467_178208_178287_182059_182183_182326_182413_183361_183503_183583_183666_185892_185987_187735_187878_188020_188129_190542_190609_194294_194382_195146
735878	contig_5095_pilon	+	3252	4	Intergenic	novelGene_74959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	56.334319517995	164	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	565	1227	339675	345679	FALSE	15	ATTAGTTTTGTTGGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQLCEKIISTLPSWRKVSGPNQLMSLQQFMYDVQDQLNPLASEEDLRHIAQQLHSTGEISIMQSETVQDVLLLDPRWLCTTVLGKLLSVETPRALHHYRGRYTVEDIQRLVPESDVEELLQILDAMDICARDLSSGTMVDIPALIKTDNLHRSWTDEEDEVMVYGGVRIVPVEHLTPLPLWHLSQGPGQHVPVDPPAEHRGRRRHPPVGEWLQDCQPRG	333505	347704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_333936_335365_335488_339662_339852_345193
735882	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735885	contig_17171_pilon	-	1827	4	Intergenic	novelGene_147373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.6761895045715	436	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1004	1315	265720	265409	FALSE	20	TCCCATATTGGGTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKTRGTVAVVSCTQVGSDSWRPHVCRELLYRVFKAVTFWKQIARPVFLCTFEIPLPVLTSQRDPGRTDYPFTNEWGSPGVTVVKSLAANQKVGSSNPPAAP	270908	264896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_266527_268720_268752_269338_269407_270810
735886	contig_20951_pilon	-	1839	2	Intergenic	novelGene_43125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATTCCACCTGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268898	242925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_244646_268779
735887	contig_20951_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_43123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAACAAAATTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241839	241262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_241300_241800
735889	contig_6191_pilon	+	2397	1	Intergenic	novelGene_107826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATTTCAAGGATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65601	67998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_65600_68000
735890	contig_6191_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_107827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68048	68269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_68000_68300
735891	contig_3602_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_60627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAACCAAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944593	944155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_944200_944600
735893	contig_7035_pilon	-	1266	3	Intergenic	novelGene_83548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	64.5	474	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	69	806	779961	778935	FALSE	0	CTTTCGCTGTGCCTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEGVGDEVTILFAVLACLLVLALAWVSTHTAERADPLPQPSGTPTSAQPSKAMAATDSIRGAAPGTEAPSLRHRGQAAQPEPSMGLPATPPPDSPQEPLVLRLKFLNDSEQVARAWPQDTIGSLKRTQFPGREQQVRLIYQGQLLGDDSQTLGSLHLPPSCVLHCHVSTRVGPPHPPCPPGSEPGPSGLEIGSLLLPLLLLMLLLLWYCQIQYRPFFPLTATLGLAGFTLLLSLLAFAMYRP	780811	778474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_779287_779575_779992_780773
735895	contig_1867_pilon	+	1332	6	Intergenic	novelGene_54513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6136.28668169928	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTGACTAAAGGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194833	221585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194902_213513_213627_215649_215811_218786_218898_219457_219609_220857
735901	contig_6710_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_98248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TCCTTAGGCCTCTGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
735905	contig_8616_pilon	-	1137	5	Intergenic	novelGene_72427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	498.885006790142	1336	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255488	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253722_253907_254087_254223_254302_254668_255372
735909	contig_9415_pilon	-	2986	7	Intergenic	novelGene_109804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_6	116.424510592343	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	12	737	1776159	1755950	FALSE	20	CACTGATTTTTGGGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPNMYLLGLPFRYSATQLHLHWGDQSNPHGSEHTISGRHFAAELHIVHYNSDLYPNASTASNKSKGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQDVKYKGQEVPVPGFNVKELLPERPEEFYRYMGSLTTPPCNPTVVWTVFRNPVQISAEQLLALETALYYTHVDDPSRKEMVNNFRQVQKLDERLVYVSFRQGIILSVVLAGILGICIVLGVFIWLFRRKKSKKGDSNKGVIYKRAIKKETEAHS	1776170	1753700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1756023_1756786_1756875_1770109_1770237_1771929_1772088_1772616_1772681_1773499_1773596_1776039
735914	contig_6710_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_89094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653596	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
735915	contig_7945_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_161597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTGGAGCTGTAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380497	379173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_379200_380500
735917	contig_1948_pilon	+	1183	6	Intergenic	novelGene_31164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	163.735640591778	68	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	423	950	478740	485694	FALSE	15	TGAACTTTTAGTTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIVGSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKEITPPEDINDTQSDIIFFMKNVEGHDEKTQFESSSYPGYFLASEKDADLYRLILKEKNQIGDNSVMFTVDLQELGVKYS	468419	485927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_471047_471200_474126_474214_478739_478891_480516_480654_485454
735918	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
735919	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
735927	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735930	contig_9119_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_169738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACCAGATACAATGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49458	49856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_+_49500_49900
735933	SIRV4	-	318	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1205	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
735935	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
735936	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
735938	contig_8435_pilon	+	2298	6	Intergenic	novelGene_72016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.7178974879784	2	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	550	2238	94334	97944	FALSE	15	TTTGACCATGCTGTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	91120	98004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_91167_93757_94173_94245_95334_96398_96685_97030_97164_97674
735941	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	455	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735944	contig_10297_pilon	-	2229	1	Intergenic	novelGene_112565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAACAGGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758626	756397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_756400_758600
735945	contig_15720_pilon	-	1011	8	Intergenic	novelGene_41919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	98	400	283894	281909	TRUE	15	GTGCGAGTGTGGCAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGRGGSGCAAGLSELSGAILVAAATPAPVAAMTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTQPHADL	283991	278577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281927_282573_282750_283785
735946	contig_6270_pilon	+	1470	9	Intergenic	novelGene_99806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	368.34528638222	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	68	1057	27433	45668	TRUE	25	TACAATTGCTGGGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27365	47671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_47302
735947	contig_19769_pilon	+	813	5	Intergenic	novelGene_102306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	19	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	7	780	87249	89322	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87242	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
735948	contig_10549_pilon	-	2135	4	Intergenic	novelGene_110645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	28.581268146968	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	111	464	528430	527145	TRUE	45	TGAATAAACAGACTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENHELDDTIKENLKTLNIVTRKINQLPEAEKYLLEHGSTYVGLNAALCGLIANSLFRRVLNVTQGRLAASLPMAVIPFLTAQISYKGFVSLPLSTGKFCYTITIKSAVVYIVCNLN	531197	524840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_525088_525720_527404_528335_528439_531095
735949	contig_10581_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_41373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAACTATACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470261	472356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_470300_472400
735952	contig_6056_pilon	+	1217	9	Intergenic	novelGene_157880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_8	47.2043430205315	20	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	9	1010	267066	312153	FALSE	25	ATGATTTTGGAGACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIMASGSSGLAASRLLTRYFLVQRNGIRHCSYASSRNHLYIDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQKALDYGTKLVGGTTPGKGGKMHLDLPVFNTVKEAKEKTGATASVIYVPPPFAAAAINEALEAEMPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267057	312360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287230_291373_291587_291720_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
735956	contig_12157_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_135915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATTTCACATTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191782	190816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_190800_191800
735960	SIRV7	-	366	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-23	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114761	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
735964	SIRV6	+	348	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-243	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2780	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
735965	contig_1639_pilon	+	1724	11	Intergenic	novelGene_74888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	267.851152694925	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	992	1723	289050	307993	FALSE	30	TAAGTAATTTATTGCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAH	280061	307994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_286379_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_307921
735969	contig_8045_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_35437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTAGAGGTTTATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430518	431679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_430500_431700
735973	contig_9668_pilon	-	1017	3	Intergenic	novelGene_58176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	889	junction_1	126	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	485	691	503815	503609	FALSE	35	TGAAAGTGGTATTTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	522357	503282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286
735977	contig_1938_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_114889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGGAATGTCTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286757	288664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_+_286800_288700
735980	contig_14441_pilon	+	812	4	Intergenic	novelGene_100677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	411.860008578967	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	198	626	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113160	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113209_116578_116963_117220_117344_117539
735988	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	514	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
735989	contig_10923_pilon	+	1636	9	Intergenic	novelGene_66215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	832.692920589577	2	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	687	1247	32909	38597	TRUE	40	CTGACTTGAACCTCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRILTGLYPEPRWVMQR	21717	42799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_29348_29572_30146_30319_32870_33051_36532_36698_37270_37477_38549_38742_42554
735990	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
735991	contig_14322_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_116114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
735992	contig_8122_pilon	-	2287	10	Intergenic	novelGene_40203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1492	1893	397050	384889	TRUE	40	AGGATGAGAAGGCAGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPDLQDLFQLLLCVNHDDVGAAVMGDELAGLRGDGCVDASDNATCKHCAHSREEPLRRVEAEDGHAVGPLQAELQEALGRFAGEQVVLEVGDALPLALALEAQGAEVAILVQSLVEHLVHGVGRLWAAGVYA	399713	351722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_351867_371323_371429_372462_372565_384845_385063_385509_385604_385967_386088_397036_397118_397206_397359_397709_397885_398616
735993	contig_6885_pilon	-	2358	1	Intergenic	novelGene_83683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCAGCCAAGCCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246587	244229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_244200_246600
735996	contig_2703_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_101676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174726	176551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_174700_176600
735997	contig_12425_pilon	+	1136	6	Intergenic	novelGene_46639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	177.388838431283	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	67	951	167145	198400	FALSE	20	CCTCAGCAACTTGGTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167078	198585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_190682_190836_198178
736000	contig_2940_pilon	-	2385	2	Intergenic	novelGene_81957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATATTTTCTTCTTTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003925	999154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_999507_1001892
736005	contig_405_pilon	-	2735	5	Intergenic	novelGene_135314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	33.741665637606	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	54	551	465423	460974	FALSE	65	AATAAAATATTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHCHRAQEYARSKLAECMPLPSLVVCPPTLTGHWVDEVGKFCSREYLNPLHYTGPPTERIRLQHQVKRHNLIVASYDVVRNDIDFFRNIKFNYCILDEGHVIKNGKTKLSKAVKQLTANYRIILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTERQFAARYGKPILASRDARSSSREQEAGMKER	465562	458789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_461133_463102_463233_463370_463449_465292_465461_465546
736012	contig_14687_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_107940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGTAGATCGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518717	518117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_518100_518700
736013	contig_12624_pilon	+	943	5	Intergenic	novelGene_61068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	530	871	863901	874055	FALSE	20	TCCTCCTGGAGGTGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFFSFPGFIWKALVTHCVLTPQSQAVVFHLVPGGFHATFRKGHQLIAIPRPVAQPSMFRQELQFLRHIVQYLAVGEPELSLHDHSVLVVHLECVGHGHTELYFLPGMLLQDH	862084	874127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_862484_863770_863948_867655_867769_867898_868053_874027
736015	contig_13740_pilon	-	1596	12	Intergenic	novelGene_34650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4584.06880330002	1	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	287	904	161718	158742	TRUE	30	AGGTTTTGTGAGTAGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGWQFWR	165411	155163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160073_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162029_165237
736016	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
736019	contig_12635_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_60856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGTCAAGATATTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593924	595307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_593900_595300
736020	contig_10377_pilon	+	2240	2	Intergenic	novelGene_115415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGTAAAACCTACAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255112	259093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_255169_256909
736022	contig_13828_pilon	+	2596	11	Intergenic	novelGene_158277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGATCACAAAAGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44198	354308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_45337_50298_50389_51088_51158_55517_55658_72602_72719_115164_115531_247000_247175_250618_250785_323422_323628_326949_327015_354241
736029	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736030	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736031	contig_16148_pilon	-	2078	11	Intergenic	novelGene_50353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	357	junction_10	413.233057728929	3	100	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	321	1742	111433	59018	FALSE	20	GCTTCTGTCTTAAAATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	151052	58681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789
736034	contig_11855_pilon	-	2119	9	Intergenic	novelGene_66994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	23.853393364467	72	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	568	1080	1310207	1307773	FALSE	10	CCTTAACTGTGGTCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACGWVAAAKAAQRRHQAEGAGGPRCPAPRSQRASLYIHWPYCEKRCGYCNFNKYIPRGVEEAAVRSCLVTEAQTLLLLSGVRRVESVFFGGGTPSLASPHTVAAVLEAVAQAAYLPADAEVTLEANPTSSAGSRLAAFGTVGVNRLSIGLQSLDDAELQLLGRTHSASDALRTLAEARHLFPGRVSVDLMLFPPSPQGALSTHNWNYWQCGQYLGVGPGAHGRFLPQGAGGHTREARIQTLEPDNWMKEVKLFGHGTRKRVPLGELELLEEVLVMGLRTDLGITHQHWQQFEPQLTLWDVFGTSKEVKELLEQGLLLLDHRGLRCSWEGLAVLDSLLLTLLPQLQEAWQQRISTLVPRG	1313701	1306733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1307891_1308060_1308165_1308831_1308887_1309123_1309272_1309713_1309796_1310201_1310322_1312759_1312965_1313087_1313222_1313587
736037	contig_12270_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_113933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14104	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
736042	contig_10135_pilon	+	543	5	Intergenic	novelGene_106660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3695.39100603711	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATTTACCATATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116713	120181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119629_119822
736052	contig_10456_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_163464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCATCTTAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40032	41128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_40000_41100
736053	contig_10456_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_163465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41278	43084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_41300_43100
736054	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
736058	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736061	SIRV6	+	568	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736062	contig_6497_pilon	+	1540	11	Intergenic	novelGene_35559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	305.384740941652	50	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	91	414	156503	166541	TRUE	40	AATATTTTTTAGCATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNCGGPALAVCEAWSPLASDRAVLKPSSTMGKRDNRVAYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRFFRF	156412	180677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_161444_163401_163481_165792_165868_166001_166035_166526_166549_166881_166975_168288_168340_174094_174188_176990_177039_179843
736065	contig_6743_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_33554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTAGCTAAACAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229999	228667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_228700_230000
736072	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736073	contig_16766_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_153358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAATAGCATAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129300	128098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_128100_129300
736077	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736079	contig_10732_pilon	-	2663	1	Intergenic	novelGene_114738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCTTTTTAGCACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527002	524339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_524300_527000
736085	contig_8241_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_157485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTGTTGAGTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162807	164124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_162800_164100
736086	contig_116_pilon	-	2665	5	Intergenic	novelGene_154888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	57.6064232529672	98	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	31	903	81357	50570	FALSE	45	CAAAAAAACATTTGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVAIENILSFMSYDEISQLRLVCKRMDLVCQRMLNQGFLKVERYHNLCQKQVKAQLPRRESERRNHSLARHADILAAVETRLSLLNMTFMKYVDSNLCCFIPGKVIDEIYRVLRYVNSTRAPQRAHEVLQELRDISSMAMEYFDEKIVPILKRKLPGSDVSGRLMGSPPVPGPSAALTTMQLFSKQNPSRQEVTKLQQQVKTNGAGVTVLRREISELRTKVQEQQKQLQDQDQKLLEQTQIIGEQNARLAELERKLREVMESAVGNSSGSGQNEESPRKRKKATEAIDSLRKSKRLRNRK	81387	48807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_50965_53936_54133_65631_65771_69428_69539_81324
736092	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	5	1152	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGAACATTTAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736094	contig_14300_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_133137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAGCTTTTAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414642	412933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_412900_414600
736097	contig_5482_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_144469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAACTGGACAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358864	359316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_358900_359300
736098	scaffold_13505_pilon	+	1744	5	Intergenic	novelGene_111629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	43.3034351986075	150	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	65	700	735345	739702	FALSE	15	CCCGGTTCAAATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCLVAPVWNRGTRGVRGLNRMVAPQGNQRKRRTLVQFLADHFYDVQALREYFLHKQALKVHQENRSVNSIKNRFQGQEWIRPNGRGHFSLDFLKFQAVPVEAVDASGCTLNYSGLDNLLPLKELQSLWLQRCPHVDDWCLSHLHPLADSLQELSLAGCPRISERGLACLHHFQKLRKLDISDLPSVSNPGLTRILVEEMLPNCEVLGADWAQGLKSAPEEQRRDAAGPVPA	735280	740746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_735479_737020_737045_737892_738030_738222_738386_739524
736099	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736103	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736111	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_94919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
736114	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736123	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736125	SIRV6	+	342	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	8	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
736127	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736130	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736131	contig_3269_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_117042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCAGACCTGGCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220315	222552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_220300_222600
736134	contig_5981_pilon	+	917	2	Intergenic	novelGene_35520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATTTAAACTACAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154096	155132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_154934_155052
736135	contig_2453_pilon	+	2174	12	Intergenic	novelGene_147764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	48.088932765715	63	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	248	2038	56543	62827	TRUE	5	TTTCTGGGTTTATTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	56295	63154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
736137	contig_12125_pilon	+	1878	8	Intergenic	novelGene_76193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	132.675144158772	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1448	1840	67320	73189	FALSE	50	GAGATATCAAAAGGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDGWYSTTFLAHEMQDCTRCS	56161	73227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_64167_65031_65169_66245_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72068_73130
736142	SIRV7	-	384	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33185	0	-34	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114772	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
736143	contig_563_pilon	+	1607	2	Intergenic	novelGene_169778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1191	1517	719136	720513	FALSE	10	GTACCTGTCTGGGCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKSGKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK	717945	720603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_719288_720338
736146	contig_4364_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_1046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
736149	contig_3780_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_169785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCCAGACATTTCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20535	20076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3780_pilon_-_20100_20500
736156	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736160	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
736162	contig_5039_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_64779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGGAGATATTAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134434	135300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_134400_135300
736163	contig_5039_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_64780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATTAAGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135249	136381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_135200_136400
736168	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736170	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736171	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
736175	SIRV6	+	569	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3177_10737_10819_11031_11109_11205
736191	contig_20378_pilon	+	1774	2	Intergenic	novelGene_159577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114161	116166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_114342_114572
736199	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736200	contig_13048_pilon	+	2899	5	Intergenic	novelGene_138912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	4.63680924774785	55	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	368	811	320931	344404	FALSE	30	GGAGAACCTGTTCTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSGTLSQASQQVLLHSPEFEDALCALMVMAAPMAPHITSELWAGLALVPQKLCAHYTWDADVLLQAWPAVDPKFLQQPDMVEMAVLINNKACGKIPVPQQVARDQDKVHKLVLQSELGVRLLQGRSIKKAFLSPRTALINFLVQE	318987	346492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_319301_320876_320955_322277_322390_337020_337149_344224
736205	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736207	contig_2204_pilon	+	790	5	Intergenic	novelGene_71645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	180.672874278349	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	30	788	13204	34430	FALSE	20	CAGGGGTCTTGATCCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIGATLQMQKMGKKQNGKIKKVEKAEPEEFVVEKVLDRRVVIGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSENESDDSNSKKKREAADKPRGF	13174	34432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_34086
736213	contig_11832_pilon	-	2029	14	Intergenic	novelGene_106937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	915.763270099814	1	90	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	901	1581	86997	84249	FALSE	10	GCATGAGTGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSAAVMPHPTVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92436	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86407_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
736214	contig_10299_pilon	-	2739	2	Intergenic	novelGene_79775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	128	2521	613069	610676	FALSE	50	TAAAGTGTAAGATGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVICRRFPGSFCGTPPRPALIKYYTNKKLPGQTSEDWVLTAKKISTDTRMAATLKLLKPLGYQVFCSPFAYSATQSVAYWNMRSSTPPQGQDPAKQVENICSTSSSWRILTTSSAPLGVEFSKASASKASTLQPDSPSTVRVEEDVEVFDSFEDPRAFLQLRPEYQLHSYNRSETGQPLSVAEGELILHKITVFQNNLQPQVITDYFCKLSFLPAEHHPILLSSTSFTLLCQLSVKNIQLFDTPDLISILKAFVRLEIPHSHPMLDVYETKFCHQVWEMSLDQLLLVADLWRNLGRRVPRFLKIFFSYLNFHWKDLSLPQLIHLIYIIGESRQVPQDLMQKLESLILKYIDLINLEEVGTVCLGFFKSSSSLSEFVMRKIGDMACADMQHLSSYALVNILKMFRFTHVDHINFMKQFGQIAPQRIPSIGVQGVMHLTLACSALRILDEGVMNAVAASLPPRVAHCRSKDVAKILWSFGTLNYKPPNTEDFYSSLINEIHRKMPEFNQYPEHLLTCLLGLAFSEYFPIELINFALSPGFVRLAQERSKFELTKELCTLDGTVGVECPNYRGNRLNSHLQQEGSEMLWNLARKDMNSKPEFLEALFLLETVLGGPQYIKHHMILPHTRSSDLEVQLDVNMKPLPFNREATSTEDVAKLRLKHVGVSLTDNLMNQLLKGKSRRHFWGKIESEKKAAIHLRGSLCNVTGRLEATEMADLCPPAHLQAPQVKLAIQLTNKNQYCYGSRHLLGLHNMKRRQLIRLGYRVVELSHWEWLPLLKRTRSEKLAFLHEKVFTSAL	622516	610457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_613107_622426
736221	contig_6710_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_97119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTGACTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
736224	SIRV6	+	568	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	269	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736225	contig_5797_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_56935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCACTCTTCCTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274781	272638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_272600_274800
736227	contig_10235_pilon	-	1707	8	Intergenic	novelGene_46610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	251.565060355839	306	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	89	811	605878	604239	TRUE	20	CCCCTGGGTTTAGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGGWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN	606064	602676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_603035_603700_604332_604460_604548_604672_604762_605139_605294_605419_605556_605714_605906_606003
736230	contig_5711_pilon	+	1878	2	Intergenic	novelGene_80280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATATGTTAAACGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120520	122758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_121637_121996
736234	contig_12078_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_74094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206005	208175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_206000_208200
736235	contig_20693_pilon	-	1469	9	Intergenic	novelGene_60262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAAAACATGGAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34755	25834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_-_26022_26227_26288_26989_27062_27354_27525_27886_27969_28864_28996_29787_29965_32925_33013_34252
736241	contig_19311_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_144094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	255	593	263525	263863	NA	70	AAAAAAAAAAAGACCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQRLLEHQNLFSFSPMLCNIPQLPCRRNGHMNSSDQQNVRSDMTSNILDFRRQICFSSCSALASCTWWPLSFSHVNDKNASGGQRQKGLGGTWISGWPQVLLLGSYPSGIT	263270	265796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_263300_265800
736242	contig_5105_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_168914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGAGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489306	487368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_-_487400_489300
736243	contig_10074_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_57160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517740	517280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_517300_517700
736244	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736250	contig_11594_pilon	-	1347	3	Intergenic	novelGene_80876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	286	junction_1	32.5	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTCTTGTACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56710	24857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_25135_51461_51550_55728
736255	contig_9177_pilon	+	183	1	Intergenic	novelGene_32816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAGCCTAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648079	1648262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1648100_1648300
736256	contig_6102_pilon	-	1705	10	Intergenic	novelGene_32116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	413.19702053352	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	786	1499	819290	816809	FALSE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGKILSLLHGGTH	822127	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816835_817257_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819291_819845_820039_820268_820391_820920_821084_821362_821521_821978
736257	contig_9955_pilon	-	1280	7	Intergenic	novelGene_21272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	731.896338288422	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	130	441	49296	48804	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRGRDAGRGRGAEPLFA	49738	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_46011_46876_46999_47590_47737_48794_48853_49033_49380_49692
736258	contig_10968_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_84282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAAACCTTATACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119567	120711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_119600_120700
736260	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736262	contig_12733_pilon	+	1728	3	Intergenic	novelGene_129583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_2	9	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATTTGTCAATTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278978	281029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_279718_279823_280397_280613
736266	contig_7019_pilon	+	1544	7	Intergenic	novelGene_149458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	73.0791047807481	405	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	8	919	519527	534696	TRUE	35	ATCAGACAAGCATGACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFLVVPVRLMWLPGGPPWRLLPRGLGLWGSAEGTLRTVLRPFCARREEAWRASGLAGCCLRSRPLSTAMPPPPPPGSKGRRDSTRPSQPGPVSWKSLAFTFAVGGALLAGMKYFKKEKTEKLEKERQRSIGKPLLGGPFSLTTHTGEPKTDKDYLGQWVLIYFGFTHCPDICPEELEKMIQVVDEIDSIPTLPDLTPLFITIDPERDTKEAIADYVKEFSPKLVGLTGTKEEIDEVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGQFLDYFGQNKKNAEIAGSIAAHMREQRKKKS	519519	535433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_519803_521018_521110_523521_523720_524490_524584_528400_528517_534558_534715_534826
736267	contig_10765_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_122980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAGAATACAAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448797	447899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_447900_448800
736269	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736270	SIRV6	+	538	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_3076_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736272	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736273	contig_8597_pilon	-	2490	1	Intergenic	novelGene_158717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105501	103011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_103000_105500
736274	contig_20819_pilon	-	1461	3	Intergenic	novelGene_55644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTCCTCTGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43817	31283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_31676_36950_37316_43113
736276	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
736278	contig_10904_pilon	-	1232	6	Intergenic	novelGene_22625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	388.525932210451	1738	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	83	436	515110	510240	TRUE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASARPKPHPLHARGPRRRSVDPGPRTMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEAGESGQ	516248	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499789_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_516169
736280	contig_5153_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_74343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_1	110.432603881281	1246	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	235	552	719819	724093	FALSE	10	GACTGTCTGGTGTCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAARACSGGSRDPSSSSSGNPLVYLDVGADGQPLGRVVLELKADVVPKTAENFRALCTGEKGFGYKGSTFHRVIPSFMCQAGDFTNHNGTGGKSIYGSRFPDENFTLKHVGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIKTDWLDGKHVVFGHVKEGMEVVKKIESFGSKSGKTSKKIVITDCGQLS	717799	724860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_717923_719134_719166_719738_719828_721755_721853_722435_722512_723957
736281	contig_10734_pilon	-	912	2	Intergenic	novelGene_51031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	0	389	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	66	845	385659	384880	FALSE	15	GGTTGGAGTAAGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRFDPGASLREKGNPNLAENMNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	391738	384812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_385663_391676
736285	contig_16103_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_118780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACTCTACACCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535348	537412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_535300_537400
736286	scaffold_6394_pilon	+	803	6	Intergenic	novelGene_111003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1138.61881242144	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	7	657	398216	406119	FALSE	10	GTCATTTTCCTGTACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398209	406265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402935_405319_405501_405717_405864_406086
736294	contig_10437_pilon	-	2712	1	Intergenic	novelGene_38128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1357	1776	129717	129298	NA	85	GAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRLLFSSDLALFTRACFCELLNPTAFSSFPLSLNIISFKEAKIAVLVFCVILFFKADVLNLLLSSLDSSEEMVEGNSVDSSLQQVVGSGGQRVITIVTDGVPLGSLQTAIPTGGIGQPFIVTMQDGQQGELSRLDNC	131073	128361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_128400_131100
736295	contig_12031_pilon	-	1378	2	Intergenic	novelGene_137562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAATCGAGTTGGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278425	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_278304_278360
736297	contig_16204_pilon	+	2130	9	Intergenic	novelGene_154505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_7	115.253999388308	433	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	157	840	277830	287228	TRUE	25	GGAAACTGGAGTGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYSPEAEVLCRTLGCGTLNRVPKGLPHSLLGMMYYSCTGGEPTLSDCSWRFNNSNLCSQSLAARVICSGVRNLSSLEVPASFQPVTVESSVTVRMEDKESLQLILLIPCIILGILLLGSFISIVFLLLKVKGKYALPIMANHQHLPTTTPVGINSYQEASITIPKEEVPKLPIQVRAPPPEDSDSGSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDDEAQQSRFQMPPLGGRSPYPGSSAPPRTQQWLQHIFRGGLL	277673	289367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_277942_280214_280272_283083_283225_283554_283654_284821_284945_286670_286744_287149_287345_287637_287740_288295
736302	contig_11115_pilon	-	2451	4	Intergenic	novelGene_102870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	5.73488351136175	8	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	482	1108	214017	213131	FALSE	25	AAGCTTTTTCATCCAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMADLDQEGTQQLTCAVNLGNQNQETRKKVTIYSFPAPSLTLSELEVSEWTMVTVACEAHAAAVVTLTGAPAPTSAQMPASKAQFSFNASAKDNGRSFSCSAALEVAGQVLYKNQTQQLQVLYGPRLNEEDCPGNWTWQEGSEKTLKCQAWGNPPPKLDCHRKGDKVSLPIGDLRPVKREFAGTYLCQAVSVRGEVTRQVVVNVLCE	214859	211787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_213388_213570_213838_213914_214204_214564
736304	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736305	SIRV5	-	389	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTAGGACGAATTTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
736307	SIRV6	+	469	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	387	0	208	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	170	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736311	contig_8065_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_107325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1535	1852	125659	125342	NA	45	CTAAGAGAGATAGAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREEGQKDRETKAKPSVWAPPVSLLPLSPHRLRYLRRSDLADASFLSQRPDAADKAERVRELLPAGLKHWALRWWHELCRVAPRPHTSHDNIQAPPWRNGWRKAG	127193	125018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_125000_127200
736314	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736321	contig_3627_pilon	+	2233	9	Intergenic	novelGene_78560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	103.9912856926	63	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	29	820	1299272	1301640	TRUE	40	TTCAACACCTAAAACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQVSGWKEPEHPEMISHPGLLGVSGNLFCC	1299243	1304547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592
736323	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_89293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
736324	contig_7275_pilon	+	2741	4	Intergenic	novelGene_111243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	8.80656320908194	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	156	1379	405470	409539	FALSE	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQGSVSFTDVTVDFTQEEWEQLDPSQRILYMDVMLENYSNLLSVEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	401678	410901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_405425_405485_406427_406555_408457
736325	contig_5549_pilon	+	797	6	Intergenic	novelGene_81700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_4	51.1843726150863	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	323	721	876002	887439	FALSE	45	TTTAAAAAGGTACACCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFQIHVFSCEIKEAVSRILYSFCTAFKRSSRQVSDVKDSVIPTPDSDVFTFSVSLEVKEDDGKGNFSPVPKDRDKFYFKLKQGIEKKVVITVQQLSNKELAIERCFGMLLSPGRNVKNSDMHLLDMESMGKSSDGRAYVITGMWNPNAPIFLALNEETPKDKRVYMTVAVDMVVTEVVEPVRFLLETVVRVYPANERFWYFSRKTFTETFFMRLKQVGSFCSIHVVIFTSLYLSFSMPR	844379	887515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_844423_852661_852820_854423_854535_875991_876059_882459_882563_887200
736326	contig_5549_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_81707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTAGGCTAGAAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888372	889119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_888400_889100
736327	contig_10940_pilon	-	1860	3	Intergenic	novelGene_49258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	713	1	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	847	1227	875054	874674	FALSE	30	TCCAAGAACAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917144	874040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875626_916693_916748_916923
736328	scaffold_13505_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_111416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGACTGCGGCTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332115	331197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_331200_332100
736329	contig_9099_pilon	-	2090	16	Intergenic	novelGene_149891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATAAAATCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315287	252205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_252231_254416_254514_258010_258149_262914_263056_266420_266491_269762_269836_271546_271613_272218_272389_277019_277074_278298_278471_291548_291656_298023_298191_304221_304333_307781_308024_310696_310761_314894
736331	contig_19769_pilon	+	529	4	Intergenic	novelGene_102323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	41	496	87859	89322	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87526	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87534_87825_88040_88841_88958_89163
736340	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_97460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736343	contig_16098_pilon	-	2125	16	Intergenic	novelGene_45874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_15	52.7149146088868	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	372	1280	253301	247493	TRUE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCAGSWRRLSDSEGEEIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKVCMVAVVCPQWAVAVSQPSPYVF	255215	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
736349	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736351	contig_5988_pilon	+	2083	14	Intergenic	novelGene_16053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	495	812	1042639	1043971	TRUE	30	GAAAGACCTCAGGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSPLFFSLMTPCFREIFQAGPSRDRSTSIWLSLVALPRVISRERIRYRTMRPRSTASVWLSKSGELMPVMLSTSTCHLCSSCSSCRISRFWRRSATVSSGPLT	1041995	1052882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1042394_1042542_1042678_1042846_1042933_1043068_1043151_1043344_1043444_1043959_1044044_1046369_1046509_1046787_1046896_1047861_1047979_1048113_1048265_1048856_1048996_1049349_1049491_1050008_1050129_1052598
736352	contig_10437_pilon	+	1357	6	Intergenic	novelGene_38099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	140.511921202437	241	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	78	1169	52773	63251	FALSE	5	TTTGTCTGGTGTCTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGGRAPRKTAGNRLSGLLEAEEEDEFYQTTYGGFTEESGDDEYQGDQSDTEDEVDSDFDIDEGDGPSSDGEAEEPRRKRRIVTKAYKEPLKSLRPRKVSNPAGSSQKTREEKALLPLELQDDGSDSRKSMRQSTAEHTRQTFLRVQERQGQSRRRKGPHYERPLTQEELLREAKITEELNLRSLETYERLEADKKKQVHKKRKCSGPIITYHSVTVPLVGEPGPKEENVDVEGLDPAPAASALTPHAGTGAVVPPARCSRTFITFSDDATFEEWFPPGRPPKVPVREVCPVTHRPALYRDPVTDIPYATARAFKIIREAYKKYITAHGLPAASALGPGPPPPEPLAGPGPRALRQKIVIK	52695	63439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_52890_56422_56576_56745_56861_57972_58150_62429_62575_62866
736358	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736360	contig_5041_pilon	-	2928	1	Intergenic	novelGene_27010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185096	182168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_182200_185100
736370	contig_3184_pilon	+	2277	11	Intergenic	novelGene_169788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_4	55.8846132669807	103	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	310	1773	23451	46370	FALSE	35	GTAGTATTTGGTGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSATDGAAASTSQIPASEQETLVRPKPLLLKLLKSVGAQKDTYTMKEVIFYLGQYIMAKRLYDEKQQHMVYCSNDLLGDLFGEPSFSVKDHRKIYTMIYRNLVVVNQQEPLNSGTSVSENSCQLEDGNDQKDSVQELQEEKPSSSNLISRPTTSSRRRAISETEENSDELASEGQRKRHRSDSVSLSFDESVALCVIREICCERSSSSDSTETPSNPDLDAGVSEHSGDWLDQDSVSDQFSVEFEVESLDSEDYNLSEEGQELSDEDDEVYRVTVYQAEESDTDSFEDDPEISLADYWKCTSCNEMNPPLPPHCNRCWALRENWLPEDKRKDKEKTHESAKLENTVQVEEGFDVPDCKKTTVNDSKESCVEENDDKITQASHSQESEDYSQPSTSSSIIYSSQDVREFEREETQGKEESVESRYRPIATEPCVICQDRPKNGCIVHGKTGHLMACFTCAKKLKKRNKPCPVCRQPIQMIVLTYFL	22425	46874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_22716_23431_23523_26955_27031_29250_29385_31378_31429_34301_34370_34503_34601_39083_39245_43269_43426_44099_44178_45797
736373	contig_6050_pilon	-	2995	10	Intergenic	novelGene_123114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	50.7958878475632	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	275	2011	360564	325030	FALSE	65	AAGATACTGAAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPREAAELSLQVTQEPVGLQIVKVEEDEHIWRQESSFQRKETHTREIFRQRFRHFCYQETPGPREALSQLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPRELQSWVREQHPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVPVSSQEMPLKETEPMETAQESPYLKLPLANQLKNESSQSNHPLQDNELSMQNSEGASESAASVALHPSMAVPAPVAQPIPASSQQVLVQAAGFATRGAQMELISFPRVQQVPQQVQSMQHVCRAQVQYVEEGDTVYTNGAVRTAYAYNPKPQKYASSSATAYFEAPGSAQETVAASSPPVVPSHSMVGITMDVAGTPITSSASAYLIHGGIDITRHSLAHTSRWSPATLQWLLDNYETAEGVSLPKSSLYNHYLRHCQEHELDPVNAASFGKLIRSVFTGLRTRRLGTRGNSKCHYYGIRLKPDSLLSQLQEDTQCMAMQQQPVHQKPRLACCYDIEQVSAELPDQDRLGRRAWRWAIYFQKSASENPLEHNGWIHSLSWRWHRTEQCFVCCAWGCHESGATPQQPTNNNTHSWDGLLSFTFEKSLSEVVLVGCSWLHP	361539	324045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_325364_328068_328189_329320_329503_339993_340256_340902_340983_344449_344540_346833_346947_359749_359892_360150_360691_361391
736376	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736377	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736378	contig_405_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_135280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50933	48556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_48600_50900
736382	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736389	contig_1443_pilon	-	1208	8	Intergenic	novelGene_28322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	309.24364609974	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	571	927	750381	748649	FALSE	35	TTATCAACTGTCTCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809421	748367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748990_749234_749349_750380_750531_766777_766826_767479_767556_776186_776462_809399
736390	contig_2069_pilon	-	650	4	Intergenic	novelGene_23489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	891.083734686153	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	90	371	1509802	1508747	TRUE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509891	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508579_1508683_1508813_1508942_1509111_1509754
736394	contig_9833_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_68567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304255	302320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_302300_304300
736397	contig_12644_pilon	+	871	8	Intergenic	novelGene_44642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5421.53382167739	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	49	432	2675526	2679528	TRUE	30	GCTGCATAAACTCTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYALCLM	2675477	2680536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678142_2679513_2679665_2679878_2679963_2680107_2680177_2680386
736399	contig_8616_pilon	-	814	8	Intergenic	novelGene_72454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	33.1360830515618	1542	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	96	614	274294	271262	FALSE	15	TGGAAGTGTTATCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS	274389	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271276_271486_271521_271722_271795_271904_271971_272093_272145_272904_273065_274039_274150_274282
736403	contig_16322_pilon	-	2413	2	Intergenic	novelGene_87550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	95	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103176	100683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_102279_102358
736414	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	3	414	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736415	contig_17144_pilon	-	1137	9	Intergenic	novelGene_29161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	230.099978270316	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	706	1122	160376	157620	FALSE	20	TTTCTTTCTGCCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLPKHQRVVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	164780	157604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_160348_160598_161422_161508_162014_162064_162875_162952_164215_164261_164551
736421	contig_4812_pilon	-	753	5	Intergenic	novelGene_103621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	5204.94891305381	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	178	702	82626	70413	FALSE	30	TTGGTTAAGTAATGTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQHSTLPEPPRCINLRACTLMELVKNVDEVSVPLLTAVISAWQ	82803	70361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_70539_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
736422	SIRV1	-	201	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3903	0	3629	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6737	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736425	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736428	contig_5965_pilon	+	2498	4	Intergenic	novelGene_154668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	44.1537717024894	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTGTGCTTGAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217342	231902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_217423_221319_221485_221670_221771_229749
736429	contig_6047_pilon	+	876	6	Intergenic	novelGene_24219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1398	junction_5	378.850155074536	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	73	621	119982	123624	FALSE	20	AATACCCAGTGTCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	119909	123879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
736438	contig_5899_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_146993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCTGGCATATCAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534491	536092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_534500_536100
736439	contig_12967_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_169805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTCCTGATTCTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221390	220058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_-_220100_221400
736446	contig_7744_pilon	+	1486	11	Intergenic	novelGene_62527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.1141684045082	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	326	1096	828968	830740	FALSE	5	CCTCTGGTTCCCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPQNGEGGCGYALNSGGERAEPLRPSQSGIRRALPPGAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825369	831130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825485_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
736447	contig_2987_pilon	-	1048	5	Intergenic	novelGene_125874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.6145205822382	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	540	962	606175	603389	FALSE	20	CAAAATGTCTCCTGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLEKGEYPRWDTWSSSYRSDRLVSFRPVKMDSQEHKICLFEGANFKGNALEIQGDDVPSLWVYGFCDRVGSVRVSSGTWVGYQYPGYRGYQYLLEPGNFKHWNEWGAFQPQMQAVRRLRDRQWHREGSFPAPATELPK	610806	603302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_603573_604792_604936_606079_606213_609862_610037_610478
736450	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1262	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736452	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736457	contig_14322_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_115773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671700
736458	SIRV5	-	461	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCACCTTCACGGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
736459	contig_6710_pilon	-	228	2	Intergenic	novelGene_98329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTCAGTAGCACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657176	653687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736464	contig_18804_pilon	+	708	4	Intergenic	novelGene_163796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	66.0420741312351	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	159	707	43147	45249	FALSE	20	ACTCTTTCTCCATTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDNHREALLKGGLDGEYQDDSLDLLHYFTVTCYSGYGDEEKGFYTVYRNVFEMIAKEELESVLEDEAEDFPTFGDSQSDYDTIVHPFYAYWQSFCTQKNFAWKEEYDTRQASNRWEKRAMEKENKKIRDKARKEKNELVRQLVAFVRKRDKRVQAHRKLVEEQNAEKARKVEEMRRQQKLKQAKLAEQYKEQSWMTVANLEKELREMEAQYGKEFGDGSDEDEVEEQDPRVRQDG	42542	45250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_42668_43113_43237_43677_43983_45095
736467	contig_14694_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_152470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGTAAAATTCATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106708	104776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_104800_106700
736468	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736470	contig_6710_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_98294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	3	359	657514	653568	FALSE	20	TGTTAGAGGGAGGCCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDE	657516	653567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736471	contig_6710_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_89100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653607	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
736478	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736494	contig_9848_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_79978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1567	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGCTTGTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130354	128383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_129475_129672
736498	contig_9014_pilon	-	1314	13	Intergenic	novelGene_106765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	76.58691504138	1	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	154	1068	83127	78380	FALSE	10	CTCTGAAGGTTTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVIRVGTRKSQLARIQTDSVVTTLKTLYPGLQFEIIAMSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83454	78133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_83319
736500	contig_12327_pilon	+	1283	6	Intergenic	novelGene_140665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_2	45.7847136061808	478	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	293	670	1131147	1137031	FALSE	35	CTACAAATGTTTTATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERKGGFFVDLFVRVSNQVAVNMYKQLGYSVYRTVIEYYSASNGEPDEDAYDMRKALSRDTEKKSIIPLPHPVRPEDIE	1124005	1137644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128472_1131089_1131157_1131801_1131938_1136332_1136479_1136945
736501	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736502	contig_5324_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_102077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	61	660	444540	443941	NA	30	AACAATGTTTGTATGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLSAALISTPAADPEEPQTMSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444600	442189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442200_444600
736503	contig_2480_pilon	-	1702	4	Intergenic	novelGene_63519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	19.9053315024448	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	278	529	136343	135179	FALSE	55	TGGCAATCTATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARHRRRWRGAASVCSKSISAGLAGTPAGPGPSVSLSEPSFSLPDPTCSTNRESCCLQLWVPPAVPGTHCCTRERLFEFSVTVGRRNTRAPRMDFLVLFLLYLALVLIGVTLICIYSRTQFLKGLVRGGAQIFSCIIPECLQRAVQRLLHYLFHTRYLYFRRSPGDTVVKRLAAN	138419	134005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_135314_136226_136352_137755_137895_138289
736504	contig_19769_pilon	+	769	6	Intergenic	novelGene_102253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1486.43016653996	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	50	406	87249	87985	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEAPSCAVWRRSLETEASWREPPGTTPRSFPTTLRLRRPA	86980	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87568_87867_88040_88841_88958_89163
736508	contig_17144_pilon	-	1480	12	Intergenic	novelGene_29452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2102.71860627857	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	156	1403	179764	166152	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFIQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCICPVSVDWASQATCTL	183237	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166205_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172661_174940_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
736511	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736519	contig_10404_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_138714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTCTCCACATAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251248	1252591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1251200_1252600
736523	contig_7359_pilon	+	1224	8	Intergenic	novelGene_139860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	37.1115252465113	344	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	127	948	325382	335207	FALSE	25	TATTTCTTCAATTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRGSGCTMLPYVVPSGNVVVLTPSDFSMSRAERSELPNQDDRGKGLKNEVKVLGTLQVLAGMMIMSLGITLGCTVTSHHFSPIVSTLMKSMYPFIGAKCFIVSGLLSLILEKRFNKHLAWSTLAINITSLLAAAVGFIILTFNLAAMPAARERCLQNASPPLEGFYYSRSEATNCLVVSSILLGVLSVMLIFTGLEFTVAVPSSILWWKQTHPHDEPQMVHFLPQSGTTVSTKPPAELPGPGPEEQEFAKSFCFLLSDCCLFMWSPRRPR	325255	335483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_325402_326900_327052_328428_328564_329401_329459_331463_331659_333430_333536_334399_334484_335132
736525	contig_9345_pilon	-	1283	5	Intergenic	novelGene_24398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.568411733678	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	68	664	144517	141746	FALSE	45	TAATAAATGCAAACATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEGW	144584	141126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141755_142159_142414_142567_142781_142955_143072_144512
736526	scaffold_12124_pilon	+	1447	11	Intergenic	novelGene_21998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	137.574561602064	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	219	1235	800112	815200	FALSE	5	GAGCTTGTTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKRFLVMHALFPPIPKIKDKLNDNQETGLQVSWNELMPGTGKAENEEVITVEEVA	791841	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_813915_813998_815122
736527	contig_2854_pilon	+	1482	5	Intergenic	novelGene_120800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	132.761769723064	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	86	1402	68347	84677	FALSE	40	AAAGCCTTAAAATCCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSVTADLSGSPDSEHVSPDAKDTTEEMEYNILVNFFKTMGYSQDVVEKAIREFGPSAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLRYFLFLIVF	68261	84757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_82393_82502_84541
736532	contig_10774_pilon	-	2074	6	Intergenic	novelGene_158679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.5162968752036	251	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	336	902	56149	25495	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPSLPSSHTALDRSLPARPPEEESSAERIDSSALCGRPAPNSSVCSELDFPRRRPRRRRQQQRQRRWRLLGQYSGPPPFRTGSERGAGTEGGGGGQRLGGSQVRERGLLKMTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDVPMVLVGNKCDLPSRTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQGVDDAFYTLVREIRKHKEKMSKDGKKKKKKSKTKCIIM	61068	24000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_24550_24871_25612_38732_38893_42281_42461_56038_56161_60744
736534	SIRV4	+	305	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1466	632	1011	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
736535	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_95703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
736536	SIRV4	-	175	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	442	0	-442	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATTCCCGGTGGCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	4079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
736538	contig_9505_pilon	+	1220	12	Intergenic	novelGene_121834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	217.084170749695	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	489	1013	593436	632682	FALSE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSEMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFANKHLNKLNLEVTELESQFADGVYLVLLMGLLENYFVPLHNFYLTPDSFDQKVHNVAFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE	482060	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_482194_555856_555947_560338_560410_589574_589716_593382_593499_597932_597992_604972_604993_614986_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
736539	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736542	contig_16022_pilon	+	2003	15	Intergenic	novelGene_160263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	21.3466290413398	7	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1190	1714	27635	33220	TRUE	20	TCATAACTGTGTCGAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVKPIAWNQPEGDVTPDDVVALVIQGVQEGERDFGVKVRTILCCMRHQPNWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVQK	6010	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_7964_8078_9978_10244_16326_16523_18661_18724_25158_25282_25961_26150_27588_27733_28513_28630_30098_30224_31023_31096_31177_31280_33208_33339_33982_34086_34545
736548	contig_11590_pilon	-	2880	1	Intergenic	novelGene_125596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAATGCAAGGGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727016	724136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_724100_727000
736551	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11010_11109_11205
736556	contig_3386_pilon	-	1324	6	Intergenic	novelGene_34535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	854.146732125107	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	92	562	409604	405099	TRUE	20	TTTGGTTATAAATTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRR	412185	404171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404931_405095_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
736557	contig_567_pilon	+	2389	1	Intergenic	novelGene_33979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGACAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361293	363682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_361300_363700
736559	contig_19564_pilon	-	1858	13	Intergenic	novelGene_29674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	68.2883998608516	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	8	808	83587	74791	TRUE	25	GAGCTATTCTAAAGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAMEFPFDVDALLPERITVLDQHLRPPARRPGTTTPARVDLQQQIMTIVDELGKASAKAQQLPAPITSASRMQSNRHVMYVLKDTSARPAGKGAIIGFLKVGYKKLFVLDDREAHNEVEPLCILDFYIHESFQRHGHGRELFQHMLQKERVEPYQLAIDRPSQKLLKFLNKHYKLETTVPQVNNFVIFEGFFAHQHRPPSSSLRATRHARAAAVDPTPTERPRVLAGPAGTIPQPQNPRGAWQHPLTVRAHLPLAALLLHLPGLQSPL	83594	70445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_70783_71152_71196_71288_71369_74005_74248_74442_74940_76159_76229_76341_76388_82060_82163_82336_82451_82561_82623_82748_82841_82952_83014_83480
736560	scaffold_12510_pilon	-	1751	3	Intergenic	novelGene_151378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	19.5	33	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256814	251072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_252314_253485_253623_256441
736561	contig_9014_pilon	-	2500	11	Intergenic	novelGene_106715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	79.7837076100127	2	118	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	10	810	51600	43800	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEMVRGERRGVTTRGRRDDMMTMKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51609	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51551
736564	scaffold_12510_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_151387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTCTCACAGATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299824	299037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_299000_299800
736565	scaffold_12510_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_151386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAGTCCACAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296479	295047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_295000_296500
736569	contig_3948_pilon	+	2213	16	Intergenic	novelGene_53178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	32.2545431769783	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	305	1714	346422	371294	TRUE	50	AAATCATTAAATTTACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLQHVLRAQGSLRQGTLASVSWLLLRNCRAHSGLPSTACPSPERQEDGVPKDFSSRLATGPTFQHFLRSASTPQEKPSSPEVEDPPPYLTVDELLGRQRKVYLETYGCQMNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGYSREAYVELIHHIRESIPGVSLSSDFIAGFCGETEEDHLQTVSLLREVQYNMGFLFAYSMRRHGRITGCRMMSRER	343581	384409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343633_344342_344467_345535_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361279_361481_364036_364135_364811_364868_368831_368959_371245_371396_379631_379773_384152
736570	contig_11855_pilon	+	981	2	Intergenic	novelGene_67125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	326	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAGAAAAAAAGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2648162	2650926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2648909_2650691
736574	contig_7744_pilon	-	2089	5	Intergenic	novelGene_62471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	50.5686414687996	19	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	734	1450	488892	487677	FALSE	20	CCCTAAATGGTGCTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRYQACRCEDPGRWLKEAQPRCGGGNREAGEDCGLGVGVSPGLTRMQEGTNLHRQVGRPWELSSLSPGPRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	489804	487037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_489172_489350
736579	SIRV6	+	367	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	411	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10671_10819_11031_11109_11205
736582	contig_15918_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_132716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATAGGGATTGTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46783	45967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_-_46000_46800
736588	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736589	contig_9146_pilon	+	2376	1	Intergenic	novelGene_79505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGATGGCCTGGAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263559	265935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_263600_265900
736590	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736593	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11034_11109_11205
736596	contig_18420_pilon	-	1816	11	Intergenic	novelGene_109360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	347.490489078478	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	473	1393	119901	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142897	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_128822_128902_129147_129286_142711
736600	contig_5050_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_110238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	844	1155	14501	14190	NA	80	CAAAAAAAAAAAAATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGPPGLIRAPCLAHRGPSDSAECIFIHHLHLTRREDGVEEPKDLPLCRPSAPLSSSEANKVSTSLSFSFLLGKFRRDNRCLSEQVLGKFSSPSFSKMAVAY	15344	13053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_13100_15300
736608	contig_3956_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_14709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCACCCCTTAATAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56516	54262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_54300_56500
736612	contig_5586_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_143578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACAGCTGCCTATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398866	398365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_398400_398900
736614	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_96799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	653858	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653859	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736618	contig_2311_pilon	-	2441	3	Intergenic	novelGene_169821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	232.5	27	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	31	501	534687	458470	FALSE	20	CACATTTGGAGCTCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEPWPTVRTMILRLFLALNFFPSIQATAENKIFVKQAPMLVAYNNAVNLSCEYTNNLFSKEFQAALYKGVDSDVEVCVVNGNYSLQPQFHSNTGFNCDGKLGNETVTFYLWNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYILNEKNNGTIIHVKGKQASKWTSTTKAIVTHL	534717	456529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_458526_512659_513017_534629
736620	contig_12414_pilon	+	1504	3	Intergenic	novelGene_59577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1133	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	41	946	370898	374023	FALSE	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSHRGVEEQAVTMDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLICFN	370857	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010_373888_374009
736622	contig_15105_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_150952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTACTAACTAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408471	406981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_407000_408500
736623	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736627	contig_8317_pilon	+	318	2	Intergenic	novelGene_20748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	2	316	102246	111043	FALSE	20	GTAACTTTTTTATTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSPAVTLLIRKPKEISVDIILALESKSSWPASTQEGLPISNWLGTKVRTDLRRQPYYLVPKHAKEGKDFQEETWRLSFSHIEKYILNDHGQTKTCCENNGVKCC	102244	111045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_102460_110942
736628	contig_4689_pilon	-	2212	13	Intergenic	novelGene_165391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_8	23.7328885726116	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	100	1560	317554	294073	FALSE	20	TTATATACTTGCTGTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLDVCMLHSTGDKSCQDYHIEYNFKYLQCPLELTKKITPVNDVTYEPLSTLNAMVQHNRVELLNHPVCKEYLYMKWLAYGFRAHIMNLGSYCLGLIPMTFLVINIKPGMGFNSAGIINETSNHSEMLDTKNSYFIKVCMILVFLSSIFGYCKEVAQIFQQKRSYLWDHSNAVEWVIYTMSIIFVLPLFVGIPAHVQWQCGAIAIFLYWMNFLLYLQRFETCGIFIVMLEVIMKTLLRSTVVFIFLLLAFGLSFYVLLNVQDAFSNPLLSIIQIFSMMLGDVNYRDSFLEPFLRNELSYPILSFIQLITFTMFVPIVLMNLLIGLAVGDIAEVQKHASLKRIAMQVKLHTSLEKKLPLYFLRKVDQQNIIVYPNRPKYQGGLICIFHYMFSIQEARQETPNDDTSLETEILKQKYRLKDLTSLLEKQHELIKLIIQKMEIISETEDEDNHSSFQDKFKKEQLEQRNSKWNSVLRAVKEKTQCSPH	317653	293420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_294284_295631_295730_297228_297343_302505_302575_304726_304910_305355_305486_308236_308407_310334_310425_311186_311350_311905_311977_316341_316441_317150_317211_317551
736631	contig_12032_pilon	-	1357	8	Intergenic	novelGene_139258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	92.6890786777086	29	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	424	1191	117404	78821	FALSE	35	CAACAATTTTTACGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARPRRQCQGDASGRERGAGVAFAEVPAARTHGPASRGLRPPPDSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDTNGLLTKRSAI	122409	78654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_78859_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117697_122278
736634	contig_16286_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_75271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGACTTTTTAAAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8749	9683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16286_pilon_+_8993_9574
736638	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
736639	contig_9239_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_137162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAACCCCAGCTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100647	103135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_100600_103100
736640	contig_2596_pilon	-	1891	4	Intergenic	novelGene_53476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	87.7812938817579	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	685	1533	665591	662746	FALSE	30	GATGAACACTGAGTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKYEFEKDMSEKLAEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	669886	662387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223
736641	contig_10930_pilon	+	1460	5	Intergenic	novelGene_37108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8506.06390685492	42	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTTTTGTGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339427	342106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340015_340587_340639_340994
736644	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
736648	contig_7202_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_18547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGTACCATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
736649	contig_6576_pilon	-	2201	4	Intergenic	novelGene_42310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	63.4209919681348	22	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	9	665	536402	522964	FALSE	15	TATTTGTCATTTTGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFMWKEAVEKQTREELLETPSTSSCPLPDQNHSVPKKTSRFAQRAISPTFDLRSLSCSLEVSEDHRTVTVSHWPQSYPWSHERFKACQVLCSQAFSSGQQYWEVDTQHCSHWAVGVASWEMSRDQILGRTRDSWCVEWTGTSRLSAWHMAKELVLSSDRPGVVGIWLDLEAKKLAFYAVANQEKFLYECEVSASYPLHPAFWLYGLHPGNSLIINSQETK	536410	521427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_522983_524829_525344_526611_526702_536368
736661	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
736663	contig_14575_pilon	+	1501	13	Intergenic	novelGene_101898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_8	70.4313594138924	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	764	1501	51080	63922	FALSE	60	GAAGAAGCAAAAAAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEKKLKRKIQK	41401	63922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
736664	contig_4125_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_25081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	47	858	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	243	749	527566	526761	FALSE	25	AAGAGCCCACCTGTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVRLTSQLVRAASRAGRSLPWPVSGVPGAHAWKPCYSTQPVGPSKAASLPGREAQLELEEMLVPRKMSISPLESWLTARCLLPSLGAGIPGTVTPSQLYECPPSHVGEGAEQGDEGVLDVPQVQCKNVLKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLKRKQVS	528264	526501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_527216_527514_527676_528131
736665	contig_10526_pilon	+	1401	10	Intergenic	novelGene_142570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	86.5496360834223	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	256	951	277075	315492	FALSE	5	CTTGCACTTGGTTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKGSRFKKIAYPLGLATLGATVCYPVQSVIIAKVTGKKAYATSQQIYEAVKSWTKSNKKETLPEPKEKTKVGSYAEIEIPTKTAQVLKRSVPLPTELGSETKTKSELTSGATQFMPDPKLMDHGQSHPEDVDMYSTRS	223344	315942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_273809_273912_276961_277087_279949_280070_283141_283197_284658_284758_291360_291453_307400_307512_307714_307833_315403
736673	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
736675	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736677	contig_4305_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_136709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTTAATTTCCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799844	800172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_799800_800200
736689	contig_11335_pilon	-	1309	2	Intergenic	novelGene_104923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAGCATGTGCCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384795	382699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_382994_383780
736694	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736699	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
736702	contig_4364_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_10	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	34	297	193602	193339	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALLPCCPITLMWQSEGHGIDGKRLAATPFRCCSVPLMAPVQTLSCMEQSSGAWRRCTDTPLYTGPRVSSTEQRCVEEVHRHPTLHGTWGERYEAAVH	193635	191474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_191500_193600
736703	contig_7410_pilon	+	858	2	Intergenic	novelGene_106058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	562	858	133761	134057	FALSE	25	AGGCATCTGCCATCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHLDSPPAIPPRQPTSKVYSPRYSISDRTSVSDPPESPPLLPPREPVRTPDVFSSSPLHLQPPPLGKKSDHSNAFFPNSPSPFTPPPPQTPSPHGTR	132436	134057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_132995_133757
736704	contig_2783_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_119657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCTAGGATCATTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742103	742990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_742100_743000
736711	contig_11427_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_79011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGCCATCTATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719567	722017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_719600_722000
736712	scaffold_6394_pilon	+	1048	7	Intergenic	novelGene_110992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1269.98378161123	3	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	232	891	403262	406119	FALSE	10	GTACTGTGTTTTGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTHMFSAENGK	398186	406276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398288_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406089
736713	contig_6710_pilon	-	493	2	Intergenic	novelGene_98044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736716	contig_14450_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_49000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCTTTCTGCCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099696	1097455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1097500_1099700
736719	contig_8624_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_112576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTTTGTGATGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062109	1059927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1059900_1062100
736723	contig_13528_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_66856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17225	19099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_17200_19100
736728	contig_15720_pilon	-	1091	8	Intergenic	novelGene_41911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	104	1051	283894	278542	FALSE	15	GACTTTTTGGAAGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTQVPAFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281916_282564_282750_283785
736729	contig_2365_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_103757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGGCTGCATACCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250304	248955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_249000_250300
736730	contig_7338_pilon	-	1035	3	Intergenic	novelGene_156803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	28.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	44	346	295082	288987	FALSE	35	ACCAGCATAGCACTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGISPEDRTGSGPTMAAEEADVDVEGDVVAAAAQPGSDENTVSVLQQDHYLDSSWKTDNDLIPWTLDSTISEENKAVIEKMLLEEEYPLMIIRPVKISGLKMYSCKNFKRGQME	295125	288297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_289146_290818_290898_295017
736734	contig_4301_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_65090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435729	434444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_434400_435700
736736	contig_9363_pilon	-	1602	10	Intergenic	novelGene_6706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	57.2844322031694	243	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	102	1322	1298867	1288377	FALSE	15	AGGGAGAGCGGGTGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDVGPEDELPDWAAAKEFYQKYDPKDVIGRGVSSVVRRCVHRATGSEFAVKIIEVTAERLSPEQLEEVREATRRETHILRQVAGHPHIITLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVAVWTVLAAGRVALSTHRIRPLTKSALLRDPYALRPVRRLIDNCAFRLYGHWVKKGEQQNRAALFQHRPPGPFPITGPEEEGDSAAVPEDEAMLVMG	1299294	1288096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1288894_1288965_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291499_1292774_1292830_1293102_1293279_1298772_1298886_1299211
736738	contig_4156_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_88116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1131	1544	395466	395879	NA	75	AAAAAAAAAGGACAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTAVFQHNFIHKKRSGLDFGPQQSSANPWSSSYTELVRGGDRSWMASRFSEEAVSLTFEETHIMLQVKLPRSLHPHGRHPRPGQNYPKPTENREAFITRHQHEDSNKQLSARLLTKRPAVRIHPEAPQKKGLVIYF	394335	396042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_394300_396000
736741	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736743	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
736750	contig_6241_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_156428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATGGGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278078	276429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_276400_278100
736751	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736752	contig_13625_pilon	-	1868	8	Intergenic	novelGene_150165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_7	111.46135049003	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	563	1174	39925	29843	TRUE	25	TCCGTGCATGGAATGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43687	28558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_28998_29587_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_42099_42261_43361
736758	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
736760	contig_11105_pilon	-	1745	1	Intergenic	novelGene_159817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265059	263314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_263300_265100
736764	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
736765	contig_10494_pilon	-	771	5	Intergenic	novelGene_102186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	27.1753564834024	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	48	374	1059298	1056692	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPIPGVLFRDMSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGPPHTHWSMGRLSWRSRGMPWSQARGWSWWMICWPPVEPCGQPASC	1059345	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057198_1058718_1058827_1059218
736766	contig_12756_pilon	+	1304	10	Intergenic	novelGene_153199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	99.81736408481	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	317	868	49249	66492	FALSE	35	AAAGTTGTTTGGATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFYRFWK	46747	66928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_46874_47065_47223_49215_49256_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_66436
736769	SIRV7	-	277	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91645	4	-91639	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTAGCACGAAGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
736771	contig_10904_pilon	-	1671	6	Intergenic	novelGene_22731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	419.576739107401	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	30	1079	662714	651376	FALSE	35	AGAGAATAAATTTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662743	650783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662665
736772	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736773	contig_5954_pilon	+	943	8	Intergenic	novelGene_28529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	207.26843484147	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	223	714	465084	479018	TRUE	35	TGAAATCAGAGCCTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLAQLPGEQLPAASHLPPLQDPDPRHLQAGPQMPSLWCELPQTMQGSPVSRVPAPGSEHEFGGVRTLTLTHTHSPPRLQLLLASPGQARLPASRDPGGGGADGGGRSV	463513	479404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463667_465014_465157_465770_465866_477189_477254_477518_477556_477933_478111_478972_479038_479194
736774	SIRV6	+	474	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	382	0	203	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736775	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_95578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736776	contig_9436_pilon	-	1893	14	Intergenic	novelGene_60933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	106.04364402391	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1428	465	1892	457264	442587	FALSE	55	AAGACACGAAAAACCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSEIKGEVLYLGYYQSAFDWDDETAKASKQHRLKRYHSQTYGNGSKCDLNGRPREAEVRFLCDEGAGISGDYIDRVDEPLSCSYVLTVRTPRLCPHPLLRPPPSAAPQAILCHPALQPEEYMAYVQQQADGGTVLEDMQDLGPQMWSETKSEVVPPKREGTSPTKDSKESDFWKMVHEQEDQALGEEEAQAEEQEPNVEAADPAPRSPDDFQNNVQVKVIRSPADLIQLIEELKGGAKKGKLNTGQEQPVDDAAEVPQREPKTKKKGVDAEQPSEVEKEEEEEDEDDDEDEQQLLGEFEKELEGILLPSDRDRLRSEVKAGMERELENIIQETEKELDPDGLKKESERERAILALTSTVNKLIKRLEEKQSPQLVKRHRKRGVVSKKPPASPQPTEEDPEHRVRVRVTRLHHGGPNQDLTVLEMKRENPQLKQIEGLVKELLEREGLTAEGKIEIKIVRPGAEGTEEDTRWLTD	458916	442585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_442658_442804_442970_443880_444071_444807_445087_445310_445400_446110_446163_446357_446456_446674_446765_446897_447109_456745_456845_457049_457127_457257_457322_458097_458392_458803
736777	contig_3774_pilon	-	1267	9	Intergenic	novelGene_142032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_7	150.906790354179	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	474	1073	198956	144743	FALSE	5	CCTGTGTGTTGGACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNSKSWGWDGYHFLEVKDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210557	144548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_198895_199018_200837_200987_210294
736778	contig_3509_pilon	+	2543	2	Intergenic	novelGene_160706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	0	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66716	70336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_66825_67901
736779	contig_10734_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_51071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	429	743	467146	466832	NA	85	AGAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDATPSPTSFMLNSEHLQSQTLPFQPFPSSQVSWLLSRKHGVTSSSVPINASAPSPKCPLQSPSIFKILAPLHLPKIKSSQAMQVHRDLITKLVILLMSSTLYF	467574	464914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_464900_467600
736782	SIRV6	+	374	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
736785	contig_3942_pilon	+	542	4	Intergenic	novelGene_128659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_1	571.038235730907	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178333	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179177_179714_179825_179974
736786	contig_16775_pilon	+	2145	14	Intergenic	novelGene_107756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	308.489160474363	1	117	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	678	1295	156947	168113	TRUE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNALCWMCMNYVHQNFKRKWSLFGQNSRI	130274	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145102_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165263_168031_168146_172805_172867_173984
736787	SIRV6	+	200	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	505	3	-335	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAGTCGAAGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
736790	contig_15093_pilon	-	2519	2	Intergenic	novelGene_143311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAACAAGAGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204379	199206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_199413_202066
736791	contig_2988_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_136546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAACTGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79967	80258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_80000_80300
736794	SIRV6	+	568	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	261	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736798	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	10	407	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736799	contig_12050_pilon	-	2533	11	Intergenic	novelGene_62733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_7	138.221705965452	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	17	1381	719196	686686	FALSE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARCSSRWVLVAVGTPRLPAAAGRGARPPREGVVGTSLGRKLSVTAFAPPLGARGPGALLTLRPGVSRTGVNSYPFVCTASFHTSSPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDAGASSSGHSYWRGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSSFGDFQSVFDPPQEYIMDLTFNQAAKGVNKEFTVNITDTCERCDGKGNEPGTKAQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	719212	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799_697948_704917_705071_705672_705877_707622_707707_714837_714972_718985
736801	contig_16503_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_162071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCCATCCCAACTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101742	99028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_99000_101700
736805	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736806	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3146_10716_10819_11031_11109_11205
736812	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736813	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736820	SIRV6	+	555	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736824	SIRV1	-	230	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3870	4	3596	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736828	contig_14925_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_55145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	646	1023	26437	26814	NA	20	GTGGCCCATATTTAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEFLLMVMEQNALVIRVTRDTEGEGCGGSRQDWGIIGVQCLLTTELRELYWGKRTKKGIGACLGHPVKEIQQKACGLRTQALSFSFFYSLAVWLLLPLGLSCFFVSKMRIIFIPRRGDVFQLR	25791	26900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_25800_26900
736829	contig_13496_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_107640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGTCCTTGAGACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313090	311018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_311000_313100
736832	contig_6954_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_64420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTCAACCACTGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92841	91897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_91900_92800
736833	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
736841	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736842	contig_6102_pilon	-	1758	10	Intergenic	novelGene_32117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	374.519675924138	1	98	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	23	1105	822105	818236	TRUE	5	GATCTGTCTGCTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRHPDSAMLGLVGRVAAASASGALRGLSPSASLPQAQLLLRAAPALLQPGRDYAAQTSPSPKAGAATGHIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRDTRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAC	822127	816602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269_817472_818042_818245_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821521_821978
736843	contig_9389_pilon	-	1332	5	Intergenic	novelGene_83875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.464830596197	22	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCGGGCTGGGCGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45842	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36586_39438_39535_40050_40206_45142_45230_45753
736848	contig_10436_pilon	-	848	4	Intergenic	novelGene_108486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2475.73306764324	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	91	387	103480	102527	TRUE	5	CTGATTTTTGCCTTGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQVW	103570	101592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102047_102519_102655_102788_102868_103390
736850	SIRV4	-	254	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	360	3	-360	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCGGCCCCAGTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
736854	contig_18299_pilon	+	1542	6	Intergenic	novelGene_135342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	131.61610843662	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	84	818	47477	65394	FALSE	5	TTTTAGCCTTCTTGGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSARPLPRRLVSRPAELRVLPGAALRMGGAVSAGEDNDELIDNLKEAQYIRTELVEQAFRAIDRADYYLEEFKENAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALDLQPGLSFLNLGSGTGYLSSMVGLILGPFGVNHGVELHSDVIEYARQKLDFFIKTSDSFDKFEFCEPSFVTGNCLEISPDCTQYDRVYCGAGVQKEHEDYMKNLLKVGGILVMPLEEKLTKITRTGPSAWETKKILAVSFAPLIQPCPSESGRSRPVQLHSCPHFAAV	43771	66118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_43832_47453_47784_54382_54486_55448_55621_60635_60760_65365
736859	SIRV5	+	416	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
736860	contig_7909_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_155933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929477	930908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_929500_930900
736861	contig_18176_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_169828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAACCAGAAGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4318	3852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18176_pilon_-_3900_4300
736876	contig_5765_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_141386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	560	934	638078	638452	NA	35	TCCATAAGATTACAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISTVSGRQEKAGSGLRKPALAPALHSPLVVLEKMLHLSQHQHLYLPSHHNYHSLHQTEPRTTGWCPATTTDCSDRDHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKKTSFNGLTETGETPRVWPPDTLLAQ	637518	638850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_637500_638800
736878	contig_18511_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_126881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	306.677334758083	1	92	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	117	1073	47371	55405	TRUE	45	TCATACTCTAAAAATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAGAKLCQCHQQWGSALHGERSPGLGPDREHGCSAKSHCPL	35446	61297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35539_47346_47561_48082_48193_49187_49298_51672_51870_52218_52449_55285_55554_56905_57119_59155_59255_61191
736879	contig_15114_pilon	+	1516	8	Intergenic	novelGene_121204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	77.7848943942098	513	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	585	1316	789240	800648	FALSE	20	TCTGCCTAAATTATTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQAELSVIKESEAQLWWAAKELRRTKKLSDYVGKNEKTKIIVKIQQRGQGAPAREPVISSEEQKQLMLYYHRRQEELKKLEENEDDSCLNSPWADNTALKRHFHGVTDIKWRPQ	784905	800848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_785927_786111_789237_789406_791308_791377_793688_793848_795328_795461_800171_800268_800537
736880	contig_4136_pilon	+	3150	26	Intergenic	novelGene_161257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	8.90159536263023	42	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	1042	2724	394967	431481	FALSE	5	TTCTTGTTTTATTTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPLREIDKIVGQLMDGLKQLKLHRCVNVIFVGDHGMEDVTCDRTEFLSNYLTNVDDVILVPGSLGRIRSRFSNNPKYDPKAILANLTCKKPDQHFKPYMKQHLPKRLHYANNRRIEDIHLLVERRWHIARKPMDVYKKPSGKCFFQGDHGFDNKLNSMQTVFVGYGPTFKYKTKVPPFENIELYNVMCDLLGVRPAPNNGTHGSLNHLLRTNTFRPTMPEEVTRPNYPGVTYLQSDFDLGCSCDDKSKLDELNRRLNIKGSTEAETRKFRGSKNENKENVNGNFEPRKERHLLYGRPAVLCRTRYDILGHTDFESGYSEIFLMPLWTSYTVSKQAEISVIPEHLTSCVRPDVRISPSFSQNCLAYKNDKQMSYGFLFPPYLSSSPEAKYDAFLVTNMVPMYPAFKRVWNYFQRVLVKKYASERNGVNVISGPIFDYDYDGLHDTQDKIKQYVEGSSIPVPTHYYSIVTSCLDFTQPADKCDGPLSVSSFILPHRPDNEESCNNSEDESKWVEELIKMHTARVRDIEHLTSLDFFRKTSRSYSEILALKTYLHTYESEI	342824	431907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_342923_343266_343370_356739_356896_358695_358822_360835_360897_364108_364207_364613_364698_365442_365563_374349_374406_387338_387405_388104_388178_394966_395076_397806_397933_404541_404574_405271_405400_407919_408008_408170_408259_409304_409478_412756_412809_419346_419422_420747_420885_421773_421910_423369_423448_426194_426328_428216_428374_431310
736882	contig_13760_pilon	-	2334	6	Intergenic	novelGene_61332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	18.6826122370508	124	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	25	825	325640	304082	TRUE	0	GCTTGCTTTCTTGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEEIVVYGMVSDSYCRCDPSSLPPGPTAGRWPPPLSRRRREMSSSKEQRSVVFVVLFALITILILYSSNSANEVFHYGSLRGHSHRPINLKKWSITNGYVPLLGNKTLPSRCHQCVIVTSSSHLLGTKLGPEIERAECTIRMNDAPTTGYSADVGNKTTFRVVAHSSVFRVLRRPQEFVNRTPETVFIFWGPPSKMEKPQGSLVRVIQRAGLVFPNMEAYAVSPSRMHQFDDLFRGETGKDREKSHSWLSTGWFTMVIAVELCDHVHVYGMVPP	325664	301676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_303177_304072_304182_306725_307133_309563_309744_310578_310670_325617
736883	contig_12622_pilon	-	1306	9	Intergenic	novelGene_5955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2559.40743874437	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	18	992	1590968	1587731	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTPSFSWARSTRPVSGRAAEMGVSGVPPPRTSTETRSGASARTKDTACSLWRRTSSVTRWA	1590985	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583608_1586685_1586840_1587628_1587785_1587864_1587992_1588882_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
736888	contig_6710_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_97982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
736890	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
736891	contig_7171_pilon	-	1059	10	Intergenic	novelGene_101340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	558	884	1313550	1302283	TRUE	30	ATCGACTGTAAGCATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLGHFSMTLKVSWYLVMMFRKYQLLRATSSPGGCRSPEAMSVRSIPEVNVFPSPEITTARQLASSDILLKHSTISLQKALFMAFLFSGRFICTCRMCSGPDVTRRD	1315370	1301672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1301736_1302170_1302377_1302521_1302610_1313325_1313452_1313531_1313580_1313758_1313825_1314386_1314458_1314545_1314618_1314872_1315025_1315203
736893	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	825	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
736899	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736901	contig_11338_pilon	-	1419	11	Intergenic	novelGene_6233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	101.23359126298	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	99	1295	17283	12549	FALSE	30	TTATTATGGAAACCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21380	12424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16714_17106_17288_21286
736902	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
736903	contig_15172_pilon	-	3183	2	Intergenic	novelGene_158765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATAAAACTGCTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254715	247698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_248980_252813
736904	SIRV7	-	261	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	1	91664	1	-91658	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAAAACCGATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	147695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
736908	contig_16122_pilon	-	1151	7	Intergenic	novelGene_134495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	198.555337934346	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGATCCTGTGTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111337	104300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_104996_105116_105255_105407_108757_108867_110332_110368_110946
736910	contig_11720_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_43867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1139	1438	94193	94492	NA	75	AGAAAAAAAGAAATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGSEMERIPKSQREGGACRSAQGPKGTTWVFTWLVPWDGLFSAPSQSSSSSLPALIKAWKVWVFRPLVLGSQSKNIGCSLEPSFSECLLCISAPAT	93054	95459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_93100_95500
736911	contig_5461_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_156845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866649	864669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_864700_866600
736917	contig_6589_pilon	+	1230	8	Intergenic	novelGene_26016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	855.401779330411	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	118	564	1725483	1729051	TRUE	25	TGCGTTTTGGTAAAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRCAAAAGILRRTGSRSSA	1725365	1731806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728249_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
736918	contig_3601_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_132968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTTAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144066	1142244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1142200_1144100
736919	contig_5018_pilon	-	1448	3	Intergenic	novelGene_46976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	9.5	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGGCCATTTAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600025	557531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_558727_579911_580147_600007
736923	scaffold_12124_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_22097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	22	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAAGCAAACAGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862885	864210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_863787_864003
736925	contig_6364_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_51727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCTAGTACATTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443798	445922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_443800_445900
736931	contig_12158_pilon	-	2306	4	Intergenic	novelGene_104842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	92.7685291464729	23	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	185	742	36693	36136	TRUE	25	GCTCAAATAGTTCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLCSENEGKPENQGKMENQEQPQVKGKPEVAGTLEDKEKLGNEGKTEKKAKTEDEEMLKDKGKPEGEAKPRGKPASETRAAGKRPAQDDVPRKAKRKTNKGLAEYLKEYKEAIHDMHLSNEEMIREFDEMARVEDEVKKSKQKLGGFMWMQRSLQNPFHPRGPRELRGGCRAQQRGFEDIPYV	37776	34037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_34455_34988_36717_37060_37134_37688
736934	contig_9515_pilon	-	1936	11	Intergenic	novelGene_73838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	34.4443028670926	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	401	703	105931	97364	TRUE	15	TGAGTATTGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEISGSFHNEKELKDGPVERVSAGNSPPYDKENHVLPTFRGIPISELKNHSILWALTAEANGWEPGVVSTEVLRAQEEWETVDSIQPETGSRASSDQPG	108108	82231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_83027_91824_91956_95358_95482_95754_95879_97303_97396_98393_98463_102119_102190_102600_102679_105877_106138_107123_107276_108066
736939	contig_9733_pilon	-	2465	2	Intergenic	novelGene_160574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1230	1640	10164	9754	FALSE	80	AAAATAATGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFFVSSSLALSSKVPLGGLEPPIFQLAARGCINCLYHPGTPHIRAVRFSPLHPQQGFRDIGGAEWGLMRCSVVDGSGAEDRGLRWRNTPAQQQMGSSPLQWVIRAVSPQFPKATCDGGKAMQRLWRLTVVVGCR	12979	8928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_-_10945_12530
736940	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736941	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736948	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	234	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
736954	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736958	contig_13295_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_31253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGGACTCAGGAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129712	130058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_129700_130100
736964	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
736965	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_18259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27885	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
736968	contig_1275_pilon	+	802	3	Intergenic	novelGene_108849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	435	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	76	660	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746561	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747549_747653
736969	contig_10904_pilon	-	1761	5	Intergenic	novelGene_22502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	323.753378360752	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	148	594	336807	320962	FALSE	10	GCGCTTTTCACTCTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIGGGEELSNSSSKGSNDIR	336954	319794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_321018_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
736970	contig_9297_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_69834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTATTTGTTATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636171	638898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_636200_638900
736972	contig_12938_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_99734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59265	57695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_57700_59300
736975	contig_14577_pilon	+	1868	12	Intergenic	novelGene_164623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	21.4063402981144	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	134	1075	34694	47072	FALSE	50	TCTGTTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLPLVADSGAGGRLRGVPCGAVTLVAGFGPSELLSSVSLRPAEMPKVKSGAIGRRRERQEQRREVKSAGGLMFNTGIGQHILKNPLVVNSIIDKAALRPTDVVLEVGPGTGNMTIKLLEKAKKVVACELDPRLVAELHKRVQGTSLASKLQVMVGDVLKTDLPFFDACVANLPYQISSPFVFKLLLHRPFFRCAILMFQREFALRLVAKPGDKLYCRLSINTQLLARVDHLMKVGKNNFRPPPKVESSVVRIEPKNPPPPINFQEWDGLVRITFVRKNKTLSAAFKSSAVQQLLEKNYRIHCSVHNTIIPDDFSIADKIQQILTNTGFSDKRARSMDIDDFIRLLHGFNAEGIHFS	34560	47865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_34773_35111_35186_36950_37038_39007_39070_40311_40406_40490_40541_41876_42001_42138_42232_43245_43311_43961_44026_45445_45553_47029
736980	contig_7275_pilon	+	2777	4	Intergenic	novelGene_111241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	8.80656320908194	178	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	186	1409	405470	409539	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQGSVSFTDVTVDFTQEEWEQLDPSQRILYMDVMLENYSNLLSVEVWKADDQMERDHRNPDEQARQFLILQSQTPVEERGNLFEKTFNVSTDFVALRQVPYKYDLYEKTLKCNANILNSNGSCARKKAEACSGFGKALLYLKQEKTHPGLEYSEYNKNGKALGDKEAIFKHQKIKNLVQPFICNYCDKTFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSDCGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGDKP	401648	410907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_405425_405485_406427_406555_408457
736981	contig_4742_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_130999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGTGCTCACTTACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220516	222567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_220500_222600
736986	contig_15434_pilon	+	1270	7	Intergenic	novelGene_56702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	361.726607936006	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	5	1090	26904	33302	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMFSSVAHLARANPFNAPHLQLVHDGLSDPRSSPAGPPGLPRRSRNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26899	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
736990	contig_7357_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_36913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGTGAAACTCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476838	476200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_476200_476800
737000	contig_11964_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_164731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1376	1690	273820	273506	NA	60	AAATAAAATTACTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEIPQVDSFNKEKYILPQSRRIEVRIQGASSRGRLSVSVGSGERSLSSIFPWSRSFLAQGLWVQRTRSPPGSSFLVVGGSSVSSLTSLFYISKEIDSRYNLIL	275195	272971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_273000_275200
737001	contig_14326_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_120749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTTTTTCATACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539279	538194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_538200_539300
737004	contig_2310_pilon	-	1274	6	Intergenic	novelGene_71599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGAAACGAGCGGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119175	106062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106100_107853_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118168_118358
737005	contig_10541_pilon	-	1786	14	Intergenic	novelGene_144632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	225.32519563285	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	213	1691	312553	130446	FALSE	30	TGAATCCTATTGCTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEIVNVHKEIQLSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQDIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSKTYEKKSDIVLLLSQKQTLEELKQSIQQLRCTESKFAAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERKEKLSKFESLRHSIAGIIRSPKSALGSSTFSDVISVSEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQDLLKQQGDFLVRESHGKPESV	394533	130350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_130457_153907_154047_165654_165748_234189_234380_243494_243618_259379_259500_260014_260153_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_394487
737008	contig_5467_pilon	-	1811	8	Intergenic	novelGene_111960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	21.6059326697695	202	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	133	543	113214	109300	TRUE	25	ATGAAGCGCATTCAGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCEFSNRRDPAGLSLTEPTSPLGESARSPNGETAGGPSSAGEVDMRLAGPLRIVALIITAGLTWIVISILLGRPGSGFPRIQQLFTSPENSVTAEPRARKYKCGLPQPCPEEHLAFRMVSGAANVIGPKICLEDKMLMSSVKDNVGRGLNIALVNGVSGELIEARAFDMWAGGEWQPQRS	113615	107271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_107992_108751_109377_109734_109794_109913_110038_110546_110571_110948_111063_113201_113275_113543
737009	contig_15449_pilon	-	1444	7	Intergenic	novelGene_33656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	132.624469838714	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	128	1135	196078	191270	FALSE	10	TGGCAGGTGTCTTCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196205	190960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193038_194718_194770_195024_195209_195339_195567_196069
737010	contig_12923_pilon	-	2515	16	Intergenic	novelGene_30099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	407.181510167422	1	121	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	248	2068	77634	49053	TRUE	25	TGAATTTTTATGAGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKVNESGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGVQRQK	101215	45349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45526_46216_46397_48961_49071_51063_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_75636_75878_77618_77710_93602_93733_101173
737011	contig_3942_pilon	+	661	4	Intergenic	novelGene_128757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	153	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	41	418	793521	795263	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKYAPTHTVWAVWVGGVSALTALCAPFIV	792274	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
737013	SIRV6	+	366	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	409	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3177_10744_10819_11031_11109_11205
737016	contig_10437_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_38357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_3	1389.97418041567	294	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	23	385	558558	559848	TRUE	30	TGAATGATTCCCAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HETAFQGMLRKLDMKNEDDVKSISRVMVHVFSDGVTNWGRIVTLISFGAFVAKHLKSVNQESCIEPLAESITDVLVRTKRDWLVKQRGWDGFVEFFHVEDLESGIRNVLLAFAGVAGVGAGLAYLIK	558257	561351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_558278_558555_558804_559731_560150_560903
737017	contig_9258_pilon	+	858	3	Intergenic	novelGene_104602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	23029	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	316	708	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96505	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
737018	contig_4803_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_150715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29431	30271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_29400_30300
737021	contig_10196_pilon	+	999	8	Intergenic	novelGene_132153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	484.857395403588	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	483	809	1046427	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034565	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1043868_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050134_1050212_1050506
737023	contig_8200_pilon	-	2564	1	Intergenic	novelGene_169831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTTAATTTCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459369	456805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8200_pilon_-_456800_459400
737024	contig_6740_pilon	+	1081	5	Intergenic	novelGene_142642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	53.6772763839597	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTCTGATTTAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10143	46963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_10227_11303_11447_19527_19605_44182_44288_46290
737029	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_96068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737030	contig_5643_pilon	+	2850	21	Intergenic	novelGene_38962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	41.4724004610295	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	48	2555	535274	548036	TRUE	15	CTAACTTGTGTCCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSEEALLSVLPTIRVPKAGDRVHKDECAFSFDTPESEGGLYICMNTFLGFGKQYVERHYNKTGQRVYLHLRRTRRPKEEDTTTGTGDPPRKKPTRLAIGVEGGFDLTEEKFEYDEDVKIIILPDYLEIARDGLGGLPDIVRDRVTSAVEALLSADSASRKQEVQAWDGEVRQVSKHAFNLKQLDNPARIPPCGWKCSKCDMRENLWLNLTDGSILCGRRYFDGSGGNNHAVEHYRETGYPLAVKLGTITPDGADVYSYDEDDMVLDPSLAEHLSHFGIDMLQMQKTDKTMTELEIDMNQRIGEWELIQESGVPLKPLFGPGYTGIQNLGNSCYLNSVVQVLFSIPDFQRKYVDKLERIFQNAPTDPTQDFSTQVAKLGHGLLSGEYSKPALESGNGEQVIEQKEVQDGIAPRMFKALIGKGHPEFSTNRQQDAQEFFLHLINMVERNCRSSENPNEVFRFLVEEKIKCLATEKVKYTQRVDYIMQLPVPMDAALNKEELLEYEEKKRQAEEEKLPLPELVRAQVPFSSCLEAYGAPEQVDDFWSTALQAKSVAVKTTRFASFPDYLVIQIKKFTFGLDWVPKKLDVSIEMPEELDISQLRGTGLQPGEEELPDIAPPLVTPDEPKAPMLDESVIIQLVEMGFPMDACRKAVYYTGNSGAEAAMNWVMSHMDDPDFANPLILPGSSGPGSTSAAADPPPEDCVTTIVSMGFSQDQALKALRATNNSLERAVDWIFSHIDDLDAEAAMDISEGRSAADSISESVPVGPKVRDGPGKYQLFAFISHMGTSTMCGHYVCHIKKEGRWVIYNDQKVCASEKPPKDLGYIYFYQRVAS	535226	548571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_535385_538205_538332_538905_538973_539162_539297_539445_539592_539856_540042_540490_540586_541291_541486_542249_542322_542641_542730_542870_542997_543499_543654_543988_544164_544781_544871_545512_545636_546216_546361_546440_546587_546804_546959_547260_547346_547942_548050_548289
737038	contig_10907_pilon	-	1084	7	Intergenic	novelGene_144902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	168.608685686381	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	136	549	41010	16214	TRUE	45	AAAATGACTCAGACTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVTNTVVYRVFHC	41145	14590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_30280_30495_36029_36127_36951_37051_41007
737042	contig_6088_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_161277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAAGTTTCCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250335	250872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_250300_250900
737045	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
737052	contig_11396_pilon	+	1561	8	Intergenic	novelGene_71299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	52.5516267054385	414	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	75	680	372895	378548	FALSE	10	AGCTCTGTGCTCGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTLLSGLYKYVFQKDEYCILILGLDNAGKTTFLEQSKTRFNKHYKGMSLSKITTTVGLNIGTVDVGKARLMFWDLGGQEELQSLWDKYYAECHGVIYVIDSTDEERLSESKQAFEKMVTSEALEGVPVLVLANKQDVETCLSIPDIKTAFSDCTSKIGRRDCLTQACSALTGKGVNEGIEWMVKCVVRNVHRPPRQRDIT	371984	379429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_372058_372893_372988_373206_373295_373480_373564_377454_377537_377647_377719_378290_378392_378460
737055	contig_6191_pilon	+	1852	6	Intergenic	novelGene_107822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	5	junction_5	374.961011306509	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	171	635	93605	123590	TRUE	20	TCACTACCCCAACTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGARCSVRGGGERGLVSTAAGPAGSSRLCAEEIQRTGERAAHLSSGTGIGCLKPEIMTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSNSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQVRNILISCLIP	55668	151610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_55834_93599_93734_112654_112760_121430_121531_123459_124208_151010
737060	contig_15673_pilon	-	1398	3	Intergenic	novelGene_169838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	38	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	16	504	161188	160230	FALSE	15	TGAATGTTTGCTGTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPELTDEQRREIREAFDLFDADGTGTIDVKELKVAMRALGFEPKKEEIKKMTNEIDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQVCKGTELASGFCSLGAFSLPLSRKARVLLSLLSLLII	161203	159335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_160482_160693_160823_161080
737064	contig_9733_pilon	+	1913	3	Intergenic	novelGene_160575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_2	199.5	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1223	1570	10807	13736	FALSE	50	CGGCACTTAACAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVFIQLSRKHEFMSDTNLSEHAAIPARTSVLSEMSFASQSMPTIPGLTFSVAGGPGLDEVSTSSRLSQTFLHLLDGDKKTLKRKKVNQFFKTMLTSKSTEEGKQIPDFLPTDL	9584	14079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_10949_12534_12678_13673
737066	SIRV7	-	374	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-31	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114769	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
737067	contig_15063_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_13870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	787	1113	35891	35108	TRUE	40	GGACCCAAGAGTGGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36782	34609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34918_35025_35380_35836_36160_36264
737068	contig_15087_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_37255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTAGGTTAGTAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237728	237398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_237400_237700
737069	contig_15087_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_37254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTAACCTCTAACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236194	235266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_235300_236200
737070	contig_18214_pilon	-	1579	2	Intergenic	novelGene_166023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGCTCCTTAGAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234745	233084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_-_234478_234559
737071	contig_5005_pilon	-	1021	4	Intergenic	novelGene_84337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	21.6024689946929	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	77	592	667337	653602	FALSE	65	ACAAAATTAGAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAAAETEFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKTENAKVRKVKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIEVKFFSYSSLTISEDVKTIELGV	667413	653172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_653800_655985_656090_658274_658432_667280
737082	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	415	3	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATAAAAACTATCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
737084	contig_13778_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_70853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTGGTTAGCAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273464	275017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_273500_275000
737087	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737090	SIRV6	+	366	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2840_10682_10819_11031_11109_11205
737093	contig_10734_pilon	-	1906	3	Intergenic	novelGene_51216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTGCAAAATTTGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161541	1158827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1159562_1160094_1160235_1160509
737100	contig_2403_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_70999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCTATATGACAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92314	90890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_90900_92300
737102	contig_5538_pilon	+	2134	6	Intergenic	novelGene_23696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_3	196.510966615098	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	101	916	47801	139234	FALSE	70	AATTTAAAAAAAAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVSNN	44760	140452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111
737106	contig_2332_pilon	+	2527	15	Intergenic	novelGene_58686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_11	153.582790277387	401	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	121	2310	426955	528088	FALSE	65	GAAAGAAAAAGAAATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRKFFGVIPSGKKLVNETVKKNEKTKSTEETLKAKKGIKEIKVNSSCRDDDFKQKQPNKKKRIIYDSDSESEETVQVKNAKKQPEKMPLSSKPGKILRKDPVTYISETDEEDDLMYKKTAFKSKDNGGSANSYLGESNMKKNEENTKTKNKPLSPVKLTPTSVLDYFGTGSIQRSDKKMVASKRKKPSKNTDDFRLNDEAIAKQLQLDEDAELERQLHEDEEFARTLAMLDEEPKTKKIRKDQEEKETSLSVQANLSKTEKHKYPHKVKTEQFSDERKNCSPKKQTKCESSKESEQHSKLSAHRRGEPSPTKASSKLALLKKKEKSSYQEAEPMGSKKKENAIELKGETKTPKKTRSSPTKKESTSPEDSEKKRTNYQAYRSYLNREGPKALGSKEIPKGAENCLEGLIFVITGVLESIERDEAKSLIERYGGKVTGNVSKKTNYLVMGRDSGQSKSDKAAALGTKIIDEDGLLNLIRTMPGKKSKYEIAVEAEMKKEKSKLERTPQKTDQGKRKISPNKKDSESKKSKLTPKRGGSLKSVKKEPSVFQKGLDFEEQVAEETSVDSGARNLTDDSSGHKVESLLWVDKYKPTSLKTIIGQQGDQSCANKLLRWLQNWHKSPSEDKKHAAKFGKFAGKDDGSSFKAALLSGPPGVGKTTTASLVCQELGYSYVELNASDTRSKNSLKEIVSESLNNTSIKGFYSGMWFGFFELFSVVMQEKQVHFNVH	426834	528305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_426958_462517_462647_469677_469754_471303_471427_504089_504323_505189_505268_511257_511336_512570_512659_513550_513838_516407_516516_520450_520631_521828_521934_524087_524488_526117_526231_527899
737108	contig_10861_pilon	-	1711	2	Intergenic	novelGene_39202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAATAAAGATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376207	374233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_375452_375714
737109	contig_21373_pilon	+	1408	10	Intergenic	novelGene_164221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	44.9273762399104	509	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	147	1061	70851	83850	FALSE	5	TGTGATCTCCTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGLGTWKSAPGKVGEAVKVAIDVGYRHIDCAYVYQNENEVGEAIQEKLKEKVVKREDLFIVSKLWCTYHDKSLVRGACKKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKAGEDNFPLDETGSVIPSDTDFLDTWTAMEELVEEGLVKAIGVSNFNHLQIERILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLVQYCESKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLDDPRIKAIANKHGKTVAQVLIRFPMQRNLIVIPKSVTPERIAENFQVFDFELSSSDMSTLLSYNRNWRVCALVSCANHKDYPFKAEF	70704	84197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21373_pilon_+_70881_76624_76793_77377_77495_78399_78478_78790_78914_79390_79498_79791_79874_80497_80582_81710_81794_83807
737112	contig_6654_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_85714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAATGATACCAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225510	224558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_224600_225500
737113	contig_6654_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_85713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224604	222954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_223000_224600
737121	contig_7695_pilon	-	1577	3	Intergenic	novelGene_41577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	44	15	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	89	1318	397040	388406	FALSE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFLGRTAGRPDVSLLSGGEVLAFREGGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAAEVGGAFFFLDVREARKGFA	397128	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_388468_390427_391259_396703
737127	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737128	contig_6533_pilon	-	1723	8	Intergenic	novelGene_114632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	29.3598365118064	170	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	229	1506	88458	75673	FALSE	15	CTTAAGTTCTGCTTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYLNSENHLDPGPIYVRENGQLHMVNLALDGVRSSLQKPRPFRLFPKGFSVELCMNREDDTAQKEKTDHFIFTYTREGNLRYSAKSLFSLVLGFISDNVDHIDSLIGFPEQIAEKLFSAAEARQKFTEPGAGLRALQKFTEAYGSLVLCSLCLRNRYLVISEKLEEIKSFRELTCLDLSCCKLGDEHELLEHLTNEALSSVTQLHLKDNCLSDAGVRKMTAPVRVMKRGLENLTLLDLSCNPEITDAGIGYLFSFRKLNCLDISGTGLKDIKAIKHKLQTHIGLVHSKVPLKEFDHSNCKTEGWADQIVLQWERVTSEAVKPRETSEPRMAAQHFYGKRSLTEAPVKCPLADTHMNTSEKLQFYKEKAPDCHGPLLKRETVLCQESKKRAFEDPEKEQNNSSQSSKQKYVCLAVEDWDLLNSY	102797	75455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_75939_76798_76884_79977_80092_80294_80384_81594_81714_82886_83019_87985_88472_102582
737130	SIRV6	+	536	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11050_11109_11205
737137	SIRV2	-	237	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	689	22	689	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4043	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
737140	contig_7356_pilon	+	2419	22	Intergenic	novelGene_60339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	55.8536717956951	318	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	56	2089	30625	99027	FALSE	35	AAAATGCACTGCTGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKLGELLHDKLFGLFEAMSAIEMMDPKMDAGMIGNQVNRKVLNFEQAIKDGTIKIKDLTLPELIGIMDTCFCCLITWLEGHSLAQTVFTCLYIHNPDFIEDPAMKAFALGILKICDIAREKVNKAAVFEENENIQCWQGCVEDFQSMTYGFKMANSVTDLRVTGMLKDVEDDMQRRVKSTRSRQGEERDPEVELEHQQCLAVFSRVKFTRVLLTVLIAFTKKETSAVAEAQKLMVQAADLLSAIHNSLHHGIQAQNDTTKGDHPIMMGFEPLVNQRLLPPTFPRYAKIIKREEMVNYFARLIDRIKTVCEVVNLTNLHCILDFFCEFSEQSPCVLSRSLLQTTFLVDNKKVFGTHLMQDMVKDALRSFVSPPVLSPKCCLYNNHQAKDCIDSFVTHCVRPFCSLIQIHGHNRARQRDKLGHILEEFATLQDEAEKVDAALHTMLLKQEPQRQHLACLGTWVLYHNLRIMIQYLLSGFELELYSMHEYYYIYWYLSEFLYAWLMSTLSRADGSQMAEERIMEEQQKGRSSKKTKKKKKVRPLSREITMSQAYQNMCAGMFKTMVAFDMDGKVRKPKFELDSEQVRYEHRFAPFNSVMTPPPVHYLQFKEMSDLNKYSPPPQSPELYVAASKHFQQAKMILENIPNPDHEVTRILKVAKPNFVVMKLLAGGHKKESKVPPEFDFSAHKYFPVVKLV	27110	99357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_27147_30605_30721_31773_31849_35275_35444_39504_39538_51694_51762_51840_51885_53368_53420_54075_54160_54991_55107_72157_72337_74719_74780_78790_78898_85410_85478_87954_88054_88639_88819_92129_92267_93104_93173_94544_94686_95116_95240_98019_98101_98967
737141	contig_3382_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_124070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	603	992	304407	304018	NA	45	ATGTATAACAAACTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLLDYLPKFAFFKKNLLCFRLKFIKQICFLFNGLYINCSMTLAAFSTTCQHSPRFRPGFPIAFQLDFLPLPSFSFLLLGKYCPFDLMLLIVLRNTFLSGITVYFMGLSIVWLAGGLQEWLQFQVRRVP	305009	303394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_303400_305000
737143	contig_6048_pilon	+	2199	15	Intergenic	novelGene_73206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_7	14.1392491790384	232	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	116	2065	1512212	1518811	FALSE	5	GCTTGTGGAGTGCTGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLSTRLLIQRGRPKSDRLGKIRSLDLSGLKLRSEHLDPKLLGRLRQLQELDLSNNQLDTLPANLGLSHLRILRCANNQLGDVTFLCQFPQLEELSLEGNPFLTVSDNLKVSFLLPKLRKVNGKEASSTSSQVENLNRELTSRVTAHWEKFMAALGPKEEAEKAQADFVRSAVRDVRYGPESLSEFTQWRVRMISEELVASGGTQVPKADNPERPVEAAAPHEPRTRLAALKRPDDAPLNLSPNKRVCTSPSAQVEGSPMGSDGSQAGLKLEPLHFLQCHSKNNSPRDLETQLWACAFEPTGEEGHSGATSQTVATCGGEAVCVIDCQTGIVLHKYKVPGEEFFSVAWTAVTVVTQAGHKKRWSVLAAAGLRGLVRLLHVRAGFCCGAIRAHKKAIATLCFSPTHETHLFTASYDKRIILWDIGIPNHDYEFQASQLLMLDTTSIPLRLCPVASCPDAYLLAGCESGCCCWDVRLDQPQKRRVCEVEFTFSEGSEASGQRVDGLAFVNEDVVASKGSGLGTICLWSWRQTWAGRGSQATVAVVVLARLQWSPTELAYFSLSTCPGEGIVLCGDEEGNVWIYNVWHLLSQKSPLPAAPQAPAQILKWPQPWALDQTVTKTMVNTVVANPTFTYLTALTDSNIVAIWKRQ	1512096	1518945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1512292_1512857_1513093_1513184_1513302_1513789_1513931_1514154_1514260_1514475_1514599_1514675_1514791_1515001_1515112_1515303_1515512_1516020_1516094_1516190_1516332_1517975_1518068_1518207_1518364_1518450_1518564_1518670
737144	contig_10902_pilon	+	1104	8	Intergenic	novelGene_65692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	351.002180352551	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	325	675	189165	209479	TRUE	35	GTATGCAAACCTGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGGSATVVFCSHSKKHRGE	168539	218578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_168587_170547_170597_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_209426_209783_218452
737145	contig_10734_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_51315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTATTTTTTTGAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457877	1455753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1455800_1457900
737146	contig_1639_pilon	+	1468	10	Intergenic	novelGene_74923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	114.098506282083	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	501	1376	343087	399668	FALSE	20	CATTGCCTGCCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLYQHEDEKFFLNARGQKETLPSIWDSPTKQLSVVVPSYNEEKRLPMMMDEALDYLEKRQKQDPMFTYEVIVVDDGSKDQTSKVAFKYCQKYGSDKVRVITLVKNRGKGGAIRMGVFSSRGKNILMADADGATKFPDIEKLEKGLNDLQPWPDHMAIACGSRAHLEKESIAQRSYFRTLLMYGFHFLVWFLCVKGIRDTQCGFKLFTREAASQTFSSLHIERWAFDVELLYIARFFKIPVAEVAVNWTEIEGSKLVPFWSWLQMGKDLLFIRLRYLTGAWRLEHARKKN	341674	399760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_342142_343053_343226_343614_343662_344780_344850_354138_354232_357538_357653_374183_374244_390252_390405_396934_397021_399552
737147	contig_3601_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_132954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459512	457619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_457600_459500
737157	contig_11978_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_63132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966389	1964290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1964300_1966400
737158	contig_3270_pilon	+	926	4	Intergenic	novelGene_104438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9116	junction_1	1139.57604202421	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTTGAGTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44125	46758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44652_45124_45211_45934_46067_46576
737161	contig_10159_pilon	-	1842	2	Intergenic	novelGene_30782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTTTTACATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319048	316523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829
737163	contig_2069_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_23462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	351.804751720799	546	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	267	1661	1433269	1439381	FALSE	10	GTTGAGGCCTCTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGRATQKAWLVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432113	1439450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432232_1432938_1433064_1433245_1433305_1433701_1433913_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
737169	contig_7173_pilon	+	1316	4	Intergenic	novelGene_37539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	2.86744175568088	544	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	10	312	243730	244333	TRUE	25	TAACTTGTCCAGTGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVMAADEKDPLSYFAAYGSSSSGSSAEEDDSEPEETSRRAPDPANPAGGCGNKAEKRLPGPDELFRSVTRPAFLYNPLNKQIDWERHVVKAPEELLPETPSL	243720	250187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_244006_244306_244434_244645_244845_249482
737170	contig_6241_pilon	-	1604	6	Intergenic	novelGene_156409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	137.625579017856	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	361	777	189992	182242	FALSE	75	GAAGACAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365474	181414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_189999_220032_220075_293626_293710_365087_365246_365403
737171	contig_1786_pilon	+	1688	3	Intergenic	novelGene_142591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCAGAGGAAAATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40006	59246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_40043_55674_55987_57906
737172	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_96364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737173	contig_1154_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_87222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592385	1590438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1590400_1592400
737174	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
737175	contig_9369_pilon	-	225	3	Intergenic	novelGene_169841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	3.5	136	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACAAATAGTTAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28426	25032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9369_pilon_-_25136_26186_26212_28329
737178	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737179	contig_11171_pilon	+	1607	5	Intergenic	novelGene_48550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1865.40317357937	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	141	710	51117	65045	FALSE	30	ATTTAGCTAATGTTAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKAGAHSAHGGGCFAGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	49139	65942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_49235_51071_51202_52017_52143_60501_60602_64785
737185	contig_14796_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_159378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAAAAAAATGCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190846	191575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_190800_191600
737186	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737190	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
737191	SIRV1	-	237	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	5	3588	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
737192	contig_11978_pilon	+	1317	10	Intergenic	novelGene_62787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	72.2015354988733	30	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	167	943	299759	587379	TRUE	15	TTCATTGCCATGTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHALRLGQAEAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299592	589568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543069_564826_564923_587277_587387_589201
737198	contig_5935_pilon	-	1462	4	Intergenic	novelGene_102667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_3	5.55777733351102	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431636	422263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_422428_422509_422675_422837_423851_431516
737199	contig_11498_pilon	-	610	5	Intergenic	novelGene_65536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	115.330774297236	12	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	13	507	312345	293057	TRUE	15	GGGGTTCGAGTGGTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WELKMADESETAVKPPAPPPPQMMEGNGNGHEHCSDCENEEDNSYNRGGLSPANDTGAKKKKKKQKKKKEKGSETDSAQDQPVKMNSLPAERIQEIQKAIELFSVGQGPAKTMEEASKRSYQFWDTQPVPKLGMLGAPESWSWSPTWQNTSKQTPYFSTAERTVHPPE	312357	292084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_292125_292993_293163_296914_297064_300506_300616_312214
737200	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
737202	contig_6710_pilon	-	427	2	Intergenic	novelGene_98254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	CTCCCCTCCTTAGGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737204	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	0	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
737205	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737206	SIRV1	-	186	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3622	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6744	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
737207	SIRV6	+	445	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	214	-1	97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	184	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATTTAGGTATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
737218	contig_12118_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_168901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTAGAGCATAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6434	6772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_+_6400_6800
737225	contig_3960_pilon	+	2530	1	Intergenic	novelGene_138010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGCCAATTTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360078	362608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_360100_362600
737226	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737229	contig_10196_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_132331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	2397511	2405410	FALSE	25	GAGCCCCAAGTCATTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAQDVGVQLAQLGQRARDVVDALERVAHGGHHLGAVRAQLRQARVQVEVREVGLGLGVAGEEPGGLERELRRGARPPLQPLGTPFRGLPYTSCHRPANSPRSIRHTGCILSPYFFTLYAEQIIHRSWII	2397509	2406358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2397808_2405317
737231	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737232	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737234	SIRV2	-	421	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4437	49	3262	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
737237	contig_10569_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_44054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAATATGTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58053	55864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_55900_58100
737243	contig_6028_pilon	-	2729	4	Intergenic	novelGene_156557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	305.778060400386	123	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	259	426	206314	205379	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVLLSLIAGSDNAQVNAVNHKGLELTKNITKKDAGCRKGLYLASPNHEQHLCCQPCPAGTRKTADCSVNEGNPNCTHCKEGQEYTEMENYLDYCRRCRFCDEGHGLEVEKHCTRTQNTKCRCKEDFFCSSSSCDHCAPCIT	247485	203075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_205492_206259_206398_227058_227216_247467
737244	contig_16411_pilon	+	142	1	Intergenic	novelGene_77377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTGACTTAGTTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332021	332163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_332000_332200
737252	contig_3900_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_84173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184264	186862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_184300_186900
737253	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	145	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737254	contig_9815_pilon	-	609	3	Intergenic	novelGene_164246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1233	junction_2	1105	615	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAAACAAATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77352	73937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_73989_75764_75981_77010
737257	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	254	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737263	contig_19402_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_80827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAGAGTATATAGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114161	114634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_114200_114600
737265	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737266	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737268	contig_6241_pilon	-	1918	2	Intergenic	novelGene_156418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGTAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203588	200517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_201882_203034
737278	contig_14219_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_54336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTAAGAAATAAGGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794794	792842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_792800_794800
737279	contig_14441_pilon	+	803	4	Intergenic	novelGene_100691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	448.223406597895	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	195	623	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	114115	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114161_116578_116963_117220_117344_117539
737281	contig_2236_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_98688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAACTACTAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65720	63976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_-_64000_65700
737282	contig_2236_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_98687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATACATAATTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63825	63301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_-_63300_63800
737290	contig_8354_pilon	-	1395	7	Intergenic	novelGene_24126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	565.750141159702	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	68	871	513617	500999	TRUE	10	CTGTGACTTGGGGGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	513684	499976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500379_500876_501091_501670_501822_502359_502471_503634_503824_505824_505966_513497
737291	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737292	contig_9839_pilon	+	1246	9	Intergenic	novelGene_88566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	317.211655484158	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	122	1102	258527	269866	FALSE	25	GCATGTTCTAATCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	255910	270010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258530_258902_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
737293	contig_14513_pilon	-	1168	2	Intergenic	novelGene_70346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	184	540	18880	11918	FALSE	20	TAGAACTCTGCTTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCICGCSSPTPLRITPTSSSFSRVPSTWPSWDSVCSEERQSMAVERVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19063	11289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12120_18725
737296	contig_6589_pilon	+	821	4	Intergenic	novelGene_25772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	2072.16665996407	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	377	727	669670	672754	FALSE	5	CCTGACTTTGCCTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668300	672848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_672584
737298	contig_12050_pilon	-	1448	8	Intergenic	novelGene_62730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.136931201687	16	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	115	747	697920	687356	TRUE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSISCAHHGPGPTASTWIFKGPIFFSFCQETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGGSTMDSSAGGEARREAGEDKEGFLSKLKKMFTS	698034	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_685970_686456_686709_687342_687460_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
737302	contig_2069_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_23212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	250.23500066049	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	440	1945	111877	102624	FALSE	20	TGAGGTTGGTATGAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEDLIAQFSLPCEVKVVAKDTSHPDDPLTSFLGLRLEEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	114369	102465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_103694_109097_109509_111852_111994_114046
737304	SIRV6	+	543	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1504_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737305	contig_7593_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_127355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATTCTTAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690310	689522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_689500_690300
737307	contig_17281_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_105184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2900
737308	SIRV5	+	420	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-90	875	24	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
737313	contig_14472_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_111178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAGAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360009	361889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_360000_361900
737315	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
737316	contig_11702_pilon	-	1199	8	Intergenic	novelGene_141961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	162.625273533472	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	160	873	319845	289501	FALSE	25	GACGCAATCGTGCTTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	320508	289174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_320390
737321	contig_9332_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_60732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACTACAATAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553379	551212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_551200_553400
737323	contig_20493_pilon	-	1490	11	Intergenic	novelGene_86404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	65.5225915238401	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	196	1425	54509	37388	FALSE	10	TGCCTGAGCCTCCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPAAPTAELVLGAPGPGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55251	37322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_54457_54665_55211
737325	SIRV7	+	342	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTCTACCACTTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78964_114683
737327	SIRV7	+	240	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTGCACCACTAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	78918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841
737329	contig_16067_pilon	+	1821	3	Intergenic	novelGene_169844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	289.5	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	975	1346	66573	80073	FALSE	10	CTTTTGGTGATTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRKELNALIGLAGDSRRKKPKKGSGHRLLRTEPPDSDSESSSEEEEEFGVVGNCSRFVKGDYLRCCKICYPLCAFVILAACVVACVGLVWMQIALKEDLDALKEKFRTRSLGDTVVKAIDC	65598	80548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_+_66755_68208_68358_80032
737330	contig_6102_pilon	+	1227	7	Intergenic	novelGene_31924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	517.952378763402	4	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379615	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379711_393042_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394724
737333	SIRV6	+	288	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8136	7	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
737335	SIRV6	+	343	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	532	3	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
737337	contig_5092_pilon	-	1677	6	Intergenic	novelGene_62279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	416	junction_5	424.585256456227	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	120	551	252711	239928	FALSE	55	GAAGTCTGAAAGAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRALVILAKGAEEMETVIPVDVMRRAGIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGSKCLLIF	254012	238801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252621_252780_253961
737339	contig_17074_pilon	+	789	2	Intergenic	novelGene_145168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	119	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	330	350	578778	578798	FALSE	35	TTAGACTTTTTATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTRGQEEAACKLLLPRCCSQCRAPAPGNSLAPPPAPSHADAESRGQAVRGSIAESGARRPEIRRAGNPRLVEGSAGERSAASVAATPVGQEQQPFLRELQNVSAILSFAMVVLFH	563471	579237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_578712
737342	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
737343	contig_11656_pilon	+	1916	11	Intergenic	novelGene_54039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	120.816555156982	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	26	1078	523797	536519	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYTSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQAEEEEQNSLEQAS	523771	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_523843_524926_525051_525829_525958_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
737344	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
737345	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737346	contig_9945_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_104810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCCAATTAAAAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56509	53939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_53900_56500
737348	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737349	SIRV1	-	296	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	9488	2	9068	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAATCGATGCATACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_1000_1300
737352	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737353	contig_7870_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_109076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753826	751955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_752000_753800
737355	contig_14575_pilon	-	1565	5	Intergenic	novelGene_101880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGTAAACAACAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23777	19964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_20119_20521_20561_20879_21036_21521_21609_22648
737361	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-6	510	1	-340	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGGTAGTCGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	1610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
737363	contig_10600_pilon	-	2113	16	Intergenic	novelGene_169859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	165.531789494747	267	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	324	1691	111818	86861	FALSE	15	TTTTCCATATTCGCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA	163051	86438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_86942_87520_87635_88303_88410_88764_88848_88926_88975_92370_92464_101648_101781_102118_102196_102860_102979_103522_103655_103965_104015_108114_108222_108297_108406_111698_111830_135743_135991_162986
737372	SIRV6	+	552	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737373	contig_3233_pilon	+	1160	10	Intergenic	novelGene_56553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	288.062150358453	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	195	1028	740857	747909	FALSE	15	CCCCAATGGGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738706	748041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742751_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746403_746936_747016_747718
737379	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
737381	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737385	contig_6215_pilon	+	1473	4	Intergenic	novelGene_21227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	31.0268700752536	198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	167	403	503225	513006	FALSE	25	TATATATACTGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGPQGGWASRSALEPGPGSAGSSACDWKESLSEFLSKPVLEIIADINQEIHAAMRKDSSEMTDVESVVTSFASSARAGRRNALPDIQSSAATGRTSDLPAKLEALSVKEDVKKKDEETTKDQVENPPNEEK	392081	514076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_392169_469713_469785_503216_503394_512938
737386	contig_6446_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_149209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTAAATTTTTTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323930	321754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_321800_323900
737388	SIRV6	+	505	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1615_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737391	contig_14925_pilon	-	943	4	Intergenic	novelGene_55091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	26.3986531642978	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	205	726	29675	26007	FALSE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFQKLVFGTGTQLLVIPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGQGVHAVVSWSCRYEPKLSKPVCDRAPHTSPESHQDCRKSHAPSLLLLVVHPLPLQAEKRTLCPPWKRRLPLTLWPHLAMPPTGSYPALVIKMLKSYQIYCKSLCSLIAAFHHPVFSARGGLLPPLLAVEKHPPPKRL	42389	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27067_27160_29565_29828_42337
737392	contig_11338_pilon	-	2231	3	Intergenic	novelGene_6251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_2	79	473	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	69	1091	111658	108824	FALSE	10	GGGGAGCGGTCCTGCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPGAEEKFKEIAEAYDVLSDPRKREIFDRYGEEGLKGGGPSGGSSGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDNFFGQRNGEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTNMNFGRSRPAQEPTRKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSVRSEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNIFKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTLPVVFKDVIRPGMRRKLPGEGLPLPKTPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI	111726	107683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_109055_109337_109919_111447
737395	contig_11259_pilon	+	1551	4	Intergenic	novelGene_144530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCAACCATTAGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130606	147822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_131914_133312_133441_144399_144453_147759
737398	contig_12080_pilon	-	1589	16	Intergenic	novelGene_128377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	202.848120523706	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	14	1300	177526	166885	TRUE	10	CCTTTTGCTTTTCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPTCIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTVRNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQNSRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPSDLLTYDRTDEADAEERGPEENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI	177539	166312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166492_166774_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_170834_171180_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
737403	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737404	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737405	contig_15304_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_30626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	185	1291	66228	64554	FALSE	10	AGTGCCTGCCTGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66412	64429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
737406	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_97503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737407	contig_2093_pilon	-	2150	4	Intergenic	novelGene_152991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	331.505991231263	27	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	193	555	1384563	1370793	FALSE	35	TGCTAGGAGACCCACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVCFGE	1386698	1369197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1371022_1372530_1372620_1384518_1384668_1386610
737411	contig_602_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_134957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCTTCTGCTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505349	506519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_505300_506500
737415	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737420	contig_10626_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_138212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGTAATTTAACTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302358	301237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_301200_302400
737424	SIRV6	+	536	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737426	contig_10968_pilon	+	1390	9	Intergenic	novelGene_84293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	246.43606549164	4	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	543	932	172393	177921	FALSE	45	CAAGTATACATAATTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	166041	178379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167535_171547_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
737427	contig_7179_pilon	+	1832	3	Intergenic	novelGene_78087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	50	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	5	373	576847	577336	TRUE	60	AGAAAGGAAAGATGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLGECLCPNVDRKAGAQGADEAGPAPLRVGVWLLHQQLIEKQHVLGGRDGRGVPGVSQA	576842	580227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_578226_579657
737436	contig_10331_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_54203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630814	628532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_628500_630800
737441	contig_854_pilon	-	1443	10	Intergenic	novelGene_36429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	132.051710784025	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	337	1275	1081689	1064774	FALSE	45	AAAGGCAAGGTTGAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPQQLRAESDFEQLPDDIPISANIADIEEKRGFTSHFTKLEERFGPENKTSPFTCSLPTLPAKVYMGVKKEIAEMRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1082025	1064605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075313_1075806_1075892_1081657
737442	SIRV6	+	544	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737443	contig_6837_pilon	-	1419	5	Intergenic	novelGene_149798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	101.716210605783	176	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	211	1167	10764	8936	FALSE	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRGKKGAVAEDGKEPKTEPEAKKSKAAAKKNEKEATGEGTVLYEDPPDRTTSPSGKSATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDWVKEEAPDILCLQETKCSDKKLPAELQDLPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSRQCPLKVSYGIGEEEHDQEGRVIVAEFDAFVLVTVYVPNAGRGLVRLEYRQRWDEAFRKFLKDLASRKPLVLCGDLNVAHEEIDLRNPKGNKKNAGFTPQERQGFGELLQAVPLADSFRHLYPDTAYAYTFWTYMMNARSKNVGWRLDYFLLSQSLLPVLCDSKIRSKALGSDHCPITLLLAL	11172	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_9454_9593_9787_10310_10499_10706_10833_11030
737450	SIRV4	+	228	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTAGTGCTAAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4023	5155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4102_5005
737454	contig_15361_pilon	-	2354	1	Intergenic	novelGene_167867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCACCCCCCCCCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456295	453941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_453900_456300
737455	SIRV6	+	542	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737463	contig_5640_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_27293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257875	1260487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1257900_1260500
737467	contig_2161_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_114923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	18.7949461292125	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	120	977	832132	859116	FALSE	30	GTTGAATTCTGCATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPPTAPQSYLRRALGLFPRVFAADTVAADSEAPAEGQKLSPYFSEPHYPESGWDRLRELFVKDEQQRTSEELQNIYRAAISAGIIGFAYGGIPAFVHAKQRYIEQSQAEIYHNRFDAVQSAHRAATRGFIRYGWRWSWRTTVFVTIFNTVNTGLNVYRNKNAMSHFVIAGAVTGSLFRINLGLRGLVAGGIIGALLGTPVGSLLMILQKYCGESVQERKQKDRQALHAMKLDEWKARLQMTELLPEEIESSLQKNRSEDDAKKIEALLNLPRNPSSTDKQDKD	832012	859452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_832326_834735_834902_839290_839380_839886_839955_847906_847986_850901_851013_858965
737468	SIRV6	+	533	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737469	contig_15182_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_136449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATATAATGAGATCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432560	431503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_431500_432600
737470	contig_15182_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_136448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCAGCCGAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425871	425214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_425200_425900
737476	contig_6208_pilon	-	1500	10	Intergenic	novelGene_53037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	421.962376182498	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	214	708	513736	505070	TRUE	30	AGTCCAGCAGTTAGGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETEVVGEAVEDS	532569	493929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505102_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
737477	contig_6980_pilon	-	1997	10	Intergenic	novelGene_36075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	116.243783850796	369	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	677	1414	382289	375176	FALSE	10	GCAGTTTTCGTTTTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSCLLLPGDATVLSSSWDNNVYFYSIAFGRHQDTLMGHDDAVSKICWHDNRLYSASWDSTVKVWSGIPAETPCTRRHHFHLLAELEHDVGVDTISLNAASTLLVSGTKEGTVSIWDLTTATMLHQIPCHSGTVYDTAFSPDSRHVLSTGEDGCLNIIDVQTGMLISSLTSEEPQRCFIWDGNSVLSGSQSGELLVWDLLGAKLSERIQGHTGAVTCIWMNEQCSSIITGGDDRQIMFWKLQY	389156	374592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544_376648_377062_377214_378717_378802_380128_380253_380644_380713_382286_382355_386816_386876_388604
737479	contig_14142_pilon	-	1943	9	Intergenic	novelGene_120471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	20.9866028694498	15	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	204	1052	259646	248154	TRUE	30	ATACGATACTAGAGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLVWTCQPSLSSSPGQAFLP	259849	246249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248302_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
737481	SIRV6	+	568	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737483	contig_14727_pilon	+	852	3	Intergenic	novelGene_56626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	415	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATTTGATTTTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46212	52095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362
737485	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTAAAAATAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737486	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
737487	contig_10019_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_86673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTTCTGGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254608	257035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_254600_257000
737488	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	298	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737493	contig_1009_pilon	-	1776	10	Intergenic	novelGene_121776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	80.0718812870005	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	208	963	333729	301449	FALSE	40	TTGTGTTATAACTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPFKIGQPKKQIIPKTVERDFEREYGRLQQLEDQTKRLQKDMKKSTDADLAMSKSAVKISLDLLSNPLCEQDQEFLKMVTALDTAMKRMDAFNQEKVNQIQKTVIEPLKKFGSVFPSLNMAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356440	300635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_312563_313138_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_333727_333844_356347
737494	contig_5765_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_141394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTCAGTGAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687314	684600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_684600_687300
737495	contig_4315_pilon	+	2370	20	Intergenic	novelGene_46737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	120.736497957569	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	101	2242	163968	226019	FALSE	5	GCTTCTTGTCTTGCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFHKQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVWNWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPSEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESDVRGITGVDLFGTTDAVVKHVLEGHDRGVNWAAFHPTMPLIVSGADDRQVKIWRMNESKAWEVDTCRGHYNNVSCAVFHPRQELILSNSEDKSIRVWDMSKRTGVQTFRRDHDRFWVLAAHPNLNLFAAGHDGGMIVFKLERERPAYAVHGNMLHYVKDRFLRQLDFNSSKDVAVMQLRSGSKFPVFNMSYNPAENAVLLCTRASNLENSTYDLYTIPKDADSQNPDAPEGKRSSGLTAVWVARNRFAVLDRMHSLLIKNLKNEITKKVQVPNCDEIFYAGTGNLLLRDADSIILFDVQQKRTLASVKISKVKYVIWSADMSHVALLAKHAIVICNRKLEALCNIHENIRVKSGAWDESGVFIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFKLALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDERKFSDEHSFSKFIHSIFIPPLPTIFVSCLPERRCNVIRYHFLLNSPKLLAILPFSWALNFPSKYPLCA	163867	226147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_164008_168532_168647_168852_168927_172542_172624_174181_174259_175154_175265_180103_180214_181973_182074_182686_182823_183557_183641_185147_185299_186247_186315_188089_188166_190414_190498_191180_191321_191897_191984_192100_192240_207189_207353_207427_207534_225813
737497	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737498	contig_7286_pilon	-	677	5	Intergenic	novelGene_108677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	2840.71122256381	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	361	609	288495	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWSQEAPEACSSSKALDAGQTDWCVYVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292101	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_292022
737499	contig_9678_pilon	+	1621	14	Intergenic	novelGene_146354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	295.422373388044	2	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	35	1300	190975	212400	TRUE	30	TAAAACCTTTATCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPADAAEQRAAMQRSPLSPRRPRGLCPLMLPGLLALLPALVAARTLGDQAALWPLPLSVEMFPRQLLLAPRNFSIGHGPNSTAGPSCAILQEAFRRYYEYIFGFYEQHHGPTRFSTGTELQQLLVTVVLDSECDAFPGISSDESYSLLVKEPVAMLKANRVWGALRGLETFSQLIYQDSYGTFTISESIITDSPRFPHRGILIDTSRHYLPIKAILKTLDAMSFNKFNVLHWHVVDDQSFPYQSITFPELSNKGSYSLSHIYTPNDVRKVIEYARLRGIRVIPEFDSPGHTLSWGKGQNDLLTPCYDAQKPSGYFGPINPTVNTTYNFLYKFFKEISKVFPDQFIHLGGDEVEFYCWASNPKIQNFMKQKGFGKDYKKLESFYVQKLVDIIAAVNKSSIVWQEVFDGNEKLQPGTVVEIWRSLPMGRICGCN	190940	213301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_191229_195484_195631_199415_199482_200865_200913_201169_201281_204661_204764_206753_206884_208321_208503_209057_209145_210397_210471_211276_211304_212358_212419_212586_212692_213103
737500	contig_1301_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_47350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325735	325509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_325500_325700
737503	contig_6137_pilon	+	2622	18	Intergenic	novelGene_59138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGGTTCTTTTTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916561	974779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_916629_917443_917518_918807_919017_919303_919523_921675_921870_928490_928634_930457_930600_931359_931391_936359_936558_936786_936937_941886_941975_955840_956038_956812_956917_958799_958949_959360_959445_961182_961267_961544_961698_974443
737506	SIRV6	+	541	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737508	SIRV4	-	222	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1301	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3857	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
737509	contig_16846_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_82936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATCTGTGAACCGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550861	551599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_550900_551600
737512	contig_6102_pilon	+	1606	7	Intergenic	novelGene_32171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	1204	1605	846793	867494	FALSE	15	AGCGAGGGGTGGTGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKIVTSSKATECKFGFLKIYINIFTVFNTKFNKDIVPSIVPLCRSRLHCERGRGMGGRASLAAAAGDLTPLRWQLRGFLPGRGLFSLPSDDGSSRLGLGPQNAPRGESGSSGRREEESVGKGARGQRMNVRAC	839083	867495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_839996_841186_841256_844910_845007_846100_846186_846751_846826_846981_847093_867236
737515	contig_12250_pilon	+	1512	8	Intergenic	novelGene_80635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	187	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	410	979	376094	378478	TRUE	10	GCAGCGTGCCCTGCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCKGLLHLHCNKTLWGVARVRTLLPEIQGNLELGQGAQALDIPDEVSAEVGCFEELHALITGQQMWAWTRWGLGCIPGDGDGAEALHEEALGVAGHQDAPLELAQQALCGLQWVRLGENHLLHADLGARGLSHKAAVEAVHLGLPNHTPAVDEGEQQRQYLSLEEAEVPGTPDPLQRGPQLCLHLPEA	375684	379693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_376120_376268_376383_377316_377654_378280_378357_378461_378542_378629_378760_379012_379211_379551
737518	contig_9668_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_58197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAACATAAAATTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506888	507438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_506900_507400
737519	contig_16970_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_157589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18887	20803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_18900_20800
737524	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_97463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737529	contig_10792_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_161006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACATGGGGTGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107935	105916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_105900_107900
737530	SIRV4	+	331	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	202	-413	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCACTCTTAGACGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	2358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1862_2231
737535	contig_5502_pilon	+	2430	11	Intergenic	novelGene_155009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	91.9274170201687	127	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	446	1726	525648	538556	FALSE	20	TATTCCAAACTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSMAEVLAQVDWAAEDGSQKYERGLIFYINHSLHENLDEDLSEELAAKVVQMFHVAEPKQLPYILCSPSMKNINPLTAMNYLRKLDTSGFSSILVTLAKAAMALKIGDLETHRKEMKSHSEMKLVCGFILEPRLLIQQQKGQIFPTELAVHLKETQPGLLVASILGLQKNNKMGIEEADSFFKVLCGKDEDMIPQLLVDFWEAQLVACLPDVVLQELFFKLTSHYIWRLSKGQPPDSTPLRTSEDLINACSHYGLIYPWVNILISYDSSADKNYTEDLSKLQSLICGPSFDIASIIPFLELLSEDTAAGLSVHVLCRTRLKEYEQCIDTLLERCPEAVIPYANHELKEENRTLWWKKLLPELCQRIKCGGEKYQLYLSSLKETLSVVAVELELRDFLNVLPEDGTAAFFLPYLLYCCRKKSLT	490298	539260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_490570_495943_496011_523812_523877_525604_525786_526910_527145_528390_528577_528931_529121_530137_530246_532858_533066_534043_534135_538428
737537	contig_9332_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_60708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76006	73597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_73600_76000
737539	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
737540	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
737541	contig_8712_pilon	-	2197	2	Intergenic	novelGene_58730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGGCAAGGACCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3259	973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_2254_2342
737542	contig_4486_pilon	+	2250	13	Intergenic	novelGene_38566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1537.07449396573	1	136	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATTCACATAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311730	413443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311822_342998_343093_360535_360625_376088_376194_377340_377451_385369_385488_389968_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407692_411183_411318_412424
737543	contig_2867_pilon	-	1472	2	Intergenic	novelGene_135251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCCTATGTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286636	1285020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286261_1286404
737546	contig_7562_pilon	+	504	2	Intergenic	novelGene_140885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAGACACTTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257718	267251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_+_257878_266906
737548	contig_11551_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_168470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	935	1243	441560	441252	NA	75	TTAAAAAAAAAAACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKVCLTQAMVLSIASYACENWTMQKEDRRKTDTFELWCWQRILNIPRTTRRTNKSVLDKVQPECSLEARMARLCLAYFGHIIRKDQLLKNIMLGKADDHQK	442494	440800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_440800_442500
737549	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737550	contig_8443_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_150605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATTCTGTGCAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741086	742562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_741100_742600
737551	contig_8443_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_150609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743015	743570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_743000_743600
737554	scaffold_880_pilon	+	999	2	Intergenic	novelGene_121522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577877	579535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_578370_579028
737557	contig_4232_pilon	-	964	3	Intergenic	novelGene_63213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGATCCGACTGAACGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149694	146295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146364_148229_148559_149127
737558	contig_2438_pilon	-	964	5	Intergenic	novelGene_112010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.66025403784439	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCGCAGCGGCGGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313151	305083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310766_311903_312081_312303_312405_312725
737566	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_89258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
737568	contig_14575_pilon	+	1589	17	Intergenic	novelGene_101897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_9	73.7965954499257	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	885	1589	51080	63889	FALSE	60	GAAGAGAAAAAATTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEK	32721	63889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_32850_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867
737569	contig_5331_pilon	+	2275	2	Intergenic	novelGene_112821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1312	junction_1	0	143	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1673	2110	727412	729639	FALSE	75	GGGAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCFIFPFRPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSELLREKAK	725739	729804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_727609_729398
737572	contig_500_pilon	+	1505	6	Intergenic	novelGene_31097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_5	221.564076510611	1429	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	885	1319	1512837	1524409	FALSE	5	CTTGGGTCCTGTGTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVKRSRKAPPDGWELIEPTLDELDQKMREAETEPHEGKRKVESLWPIFRIHHQKTRYIFDLFYKRKAISRELYEYCIKEGYADKNLIAKWKKQGYENLCCLRCIQTRDTNFGTNCICRVPKSKLEVGRIIECTHCGCRGCSG	1510229	1524595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1510945_1512133_1512275_1512808_1512931_1522521_1522645_1522858_1523026_1524358
737573	contig_2646_pilon	+	1701	4	Intergenic	novelGene_69696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	118.852850197208	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	28	549	2412283	2428086	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHGGAEVGKMAWRGWARRGWGCGQAWAPLLGGRSCEELSAALASPRLLGRRFNLFVQQKCGFRKAPRKVEPRRSDTGTSGEAYKRSSLIPPVEETVFYPSPYPIRTLIKPLFFTVGFTGCAFGSAAIWQYESLKSRVQSYFDGLKADWLDSIRPQKEGDFRKEINKWWNNLSDGQRTVTGLC	2412255	2429238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2412408_2423862_2424059_2424581_2424723_2428026
737574	contig_10962_pilon	+	1959	6	Intergenic	novelGene_103916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_4	152.316775175947	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	66	758	396356	404009	FALSE	65	GCAAGAAGAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDVDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDTSQVGAEGRETIE	394645	405210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_394680_396324_396482_397805_397905_401835_401951_402637_402793_403811
737575	SIRV6	+	538	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10812_11037_11109_11205
737576	contig_6842_pilon	-	1761	2	Intergenic	novelGene_130747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGTTTGTTCATTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306667	1302634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1303978_1306249
737579	contig_3948_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_53279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1210	1527	1410159	1409842	NA	10	TCCTGTTGCTAATGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKGWLRPPGSSPCQDCSPAHSAGGCRKCAFQSVLVTGPFLPLPDRTRKPCDLRSPPFSGWVKAFSPWGSGPQCPYSALLARPIPSTSVRSLASSFLGLPENCL	1411368	1409190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1409200_1411400
737584	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_97898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
737586	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
737590	contig_1143_pilon	-	1644	10	Intergenic	novelGene_86608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_3	76.6347759759816	113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	144	1229	249983	228758	FALSE	30	TCAGTGTCAGATCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKDASWELEENAYQELLQHYERCDVRRCRCKEGREYNAPNSKWEIKRCQCCGSSGTHLACSSLRSWEQNWECLECRSIIYNSGDFQKAKKHALPNSNSMGINDCLLEESSPKLLKQSPGAQSKDLLRYVYELEKNINISLEKITTRNYLQY	295068	228342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_228967_229069_229195_231297_231415_232073_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_294929
737597	contig_6283_pilon	+	2056	3	Intergenic	novelGene_100205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	5.5	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	826	1191	587924	588463	FALSE	45	TTTTAATAAAATGTGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRLSSAINCRFAGQMAALCSRADFLGSFCRYHLTEPALANRHLLSPVRQAHAASRAQVPRISLRFLGSYRTLFLLLLAFFVASLFCIGPLPCTLILILGYLFYATAMALLTEQGKPHQA	586930	589328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_587663_587830_587960_588133
737599	contig_5018_pilon	+	1049	5	Intergenic	novelGene_47153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	264.140114333283	10	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	45	473	1498209	1499336	TRUE	30	AGGAACAGGTGCGAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRYCGALSRALGDSSPG	1497703	1500510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499588_1500185
737603	SIRV6	+	576	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
737604	contig_15047_pilon	+	1200	6	Intergenic	novelGene_52233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	34.4	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	295	450	3242	4256	TRUE	35	GAAGACCGGAGAACCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRISP	2551	21641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3383_4241_4434_4566_4676_21006_21062_21232
737612	contig_12638_pilon	+	1342	12	Intergenic	novelGene_33184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	183.918145645069	52	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	144	1142	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	244416	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271221_274200
737617	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_96349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737618	contig_6589_pilon	+	1901	2	Intergenic	novelGene_26303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	815	1150	2272905	2273435	FALSE	35	CCATGGAGCACACACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWVVVGGKRGSNGRNTNDTPRIHTYWVAAWTIGIKCCLPAKAKVKPQNSLLNSTITGKKERKTNKQVIKHQVITAHSLPPWPTDAHQSKVIRKRSCAMRLSCASMFSASL	2272090	2274186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2273186_2273380
737619	contig_11601_pilon	+	1016	4	Intergenic	novelGene_141030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	608	junction_3	47.2534537244516	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGCTGTGACACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92922	99205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_93056_93789_93897_97845_98220_98803
737620	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
737621	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_97602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653749	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
737622	contig_2799_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_85605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTGCCTTTCTTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797160	796864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_796900_797200
737623	contig_9363_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_6511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGACTACATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517909	514821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_514800_517900
737625	contig_4103_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_52032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGTAGGAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569960	571222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_570000_571200
737627	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	23	3	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737630	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737637	contig_12786_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_103382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACACACATGCGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583426	582974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_583000_583400
737638	contig_6088_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_161270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTGTTTTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128778	126345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_126300_128800
737640	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
737644	contig_1594_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_138802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGGCTTTCCTTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357267	356796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_356800_357300
737645	contig_10642_pilon	-	3171	1	Intergenic	novelGene_78651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATTAAATTACAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123030	119859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_119900_123000
737646	contig_5057_pilon	+	1457	2	Intergenic	novelGene_151503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAGATACCAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364773	366980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_365154_365903
737649	contig_10490_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_169879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTTAACCAATGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4369	4671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_4400_4700
737650	contig_5023_pilon	-	1786	5	Intergenic	novelGene_7315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	407	742	609714	607291	FALSE	35	TTTTAGCTAATCCACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGANTGLLRGATNRTNPFLLVDCFSKGLGNICAFQPTKNLDKLIKADPPIFVQITCSHQVFCNFSHSITRQRQAGSLEQVIQLIAADVSIAISIYFGKSFSELHHFFIGH	614665	606246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611817_614399
737651	contig_8453_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_125118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATTGTACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148555	150947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_148600_150900
737657	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737660	contig_6576_pilon	-	1905	13	Intergenic	novelGene_42224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.693541529877	9	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	17	808	261331	236938	TRUE	20	TTTCAAAACGCGTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNT	261347	227429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228092_229137_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236880_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
737664	contig_3986_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_52725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCAACACTAATTCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108534	106518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_106500_108500
737667	contig_8576_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_88788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	519.968688961172	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	130	1386	902723	915551	FALSE	25	TTTTTTTTGTAATATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893604	915763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893685_893761_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
737671	contig_2043_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_169891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173199	171600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_171600_173200
737672	contig_9436_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_60885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAACATCAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331050	332732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_331000_332700
737673	contig_14142_pilon	+	1269	10	Intergenic	novelGene_120626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	228.892394795156	362	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	315	1184	617973	619797	FALSE	0	CCCCTGGCTGCTGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGFLQPGGALSLQKQMEHANQQTGFSDSSSLRPMHPQALHPAPGLLASPQLPVQMQPAGKSGFAATSQPGPRLPFIQHSQNPRFYHK	617436	619882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617579_617800_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619167_619267_619348_619435_619532_619713
737674	contig_6364_pilon	-	1870	11	Intergenic	novelGene_51822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	8.68619594529159	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	282	1085	1589829	1586979	FALSE	45	TAAGTGCTTCAAAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEDSPAIEAIRLLRKTFPSLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSENGVFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVIAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1596990	1586193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1588844_1588934_1589040_1589125_1589244_1589381_1589757_1589857_1591357_1591545_1596923
737675	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_91482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
737680	contig_20356_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_159554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCATGGCCAATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173826	175740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_173800_175700
737683	SIRV6	+	541	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737684	contig_675_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_136344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96821	95729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_-_95700_96800
737687	contig_14441_pilon	+	1256	4	Intergenic	novelGene_100645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	189.033212837204	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	990	267	1256	111703	117792	FALSE	15	CTGCCTACGAGTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLA	111386	117792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111445_111494_112040_116578_116963_117523
737688	contig_6509_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_145630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	275	825	542	1366	73622	72798	NA	35	ACTTATGAATATGAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSF	74163	72797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_72800_74200
737690	contig_5258_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_100250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATCCTACCAGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334758	334583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_334600_334800
737691	contig_8357_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_39712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATATTTGTCCATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475886	473586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_473600_475900
737695	contig_3233_pilon	-	2305	15	Intergenic	novelGene_56524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_9	49.5679290654425	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	192	2216	376824	327696	FALSE	30	GGGGTAAAATAGGACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETVPEAASSPPPQGQHYFDRFSEEDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNFSTMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDIYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEVTASSLVSAMKWGLLPVSHSALLVGDMAYYDFNGEMEQEVDRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKYRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPVVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGTPVPVLRHHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLDMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSKGDVDTKDDSEETMPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKEIATEGPGSPVKSAPTSPVKSPSESETKSPVVSPSKTLDEDAKKTEISKPPTEPEKYQSEEVVVNGREDEQTAEEILSKGLSQMTTNADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKEKVES	386169	327606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_328004_337126_337253_340063_340212_342151_342242_343121_343242_344438_344697_349376_349554_354682_354782_356914_357059_367017_367099_367532_367685_374732_374872_376641_376859_382207_382325_386129
737699	contig_501_pilon	+	2111	3	Intergenic	novelGene_134889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.5	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2	574	721257	724212	TRUE	65	AAGTAAAGAGCAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFLPSRSVLSVCFPGCVLTTGEAEQQRKSKEIDKCLSREKTYVKRLVKILLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGQDFDQRAREEFRPTIYSNVIKGMRVLVDAREKLHIPWGDNSNQLNGDKMMAFDTRAPMAAQGMVETRVFLQYLPAIRALWADSGIQNAYDRRREFQLVRDLLFLKYCNFILMTFNNT	721255	735320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_721540_723922_724628_734198
737700	contig_3426_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_57977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAATCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577905	578643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_577900_578600
737702	contig_16098_pilon	-	2403	12	Intergenic	novelGene_45868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_3	55.1128069290914	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1792	2139	247137	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253505	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247189_247266_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250765_251545_251643_253023_253103_253255
737705	SIRV6	+	552	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737706	contig_12624_pilon	-	873	2	Intergenic	novelGene_61097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCTAATGCTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948399	947476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948220_948269
737712	contig_2867_pilon	+	1880	9	Intergenic	novelGene_135228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	24.8734295986701	12	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	54	1382	1192648	1219492	FALSE	5	TTTTTCCTGTGTTGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAELWDALLSRGLFTPDMIEEIQGAGSGSRRDQARQLITDLETRGRQALPLFISCLQDTGQDMLASFLNTSRQTAEQNLEAIRPRDLVPGPVGFNPDEMRVVKQDPSRSTMGRLPTVVLRPDKLRPTELRPEVLRPQVPRPVTTGSGELRDACAPRWGGKANLAYVLEADPCGYCLIINNVNFCLNSGLSSRTGSDIDCEKLQRRFRSLHFMVEVKCDLTAKDMLLALGELAQRDHGALDCCVVVILSHGHQASHRQFPGAVYGTDGYSVSIERIVNIFNGTGCPSLGGKPKLFFIQACGGGSRKTMDLRWPLLPPKTGPLAVTPSQTPPRSRKAQGAPTSQTPWLVCPHPATSSCPIPPSQVLSPGGIPGVAPGTSRSWTVSWSSGLTLKTCRLFCSGLPMLFQRKGFTNRCRVILISSGKNFSLKLNEARAPHPALPTALNLSAPGLDVAMTVAVML	1192594	1219990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1192666_1193321_1193710_1202201_1202234_1204340_1204518_1204997_1205088_1208274_1208425_1216965_1217146_1217752_1217863_1219308
737713	contig_6069_pilon	-	1374	5	Intergenic	novelGene_8051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.92078264374	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	595	1236	360663	360022	FALSE	5	GCGTGGACCTCCGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362325	359883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360795_360994_361083_361559_361671_361753_361863_362170
737719	contig_10734_pilon	-	2053	4	Intergenic	novelGene_51020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	458.659641419066	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	70	465	320632	315922	TRUE	35	TTTTAAAAACAGCCTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSGGCGGSRDRSPGRGLGTSPTMVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEEQARRND	320701	310164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315945_318838_319032_320452
737720	contig_20610_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_67640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44192	45671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_44200_45700
737723	contig_401_pilon	-	2785	8	Intergenic	novelGene_42947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	20.1190335305671	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	189	956	2248554	2236240	FALSE	70	ATAAAAGACATAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASECYVGSTSPLASPEPVLSSHFQLMATPYVSESNCAP	2262035	2234410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
737728	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
737730	contig_9375_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_136053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197212	194647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_194600_197200
737739	contig_9752_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_122030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTACTATTCATAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157022	158707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_157000_158700
737740	contig_6533_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_114649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGAGGTCTTTAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186047	186446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_186000_186400
737742	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737743	contig_8241_pilon	+	2155	18	Intergenic	novelGene_157490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	54.7706763662763	264	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	32	1000	237955	251728	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRRRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPNNDRLSILTKLVKKGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASLNATKLKHPYYPCMAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQWLVEYFISSEGRELIKIFLLECSVREVRVAVATILEKTLDSALLYQDELKSLHQLLEVLLALLDKDVPENCKNCAQYFFLFNTFGWRSPPEAFRSAAHDQLSPRGQSAKQSDTSMEFSTSPRIWESSQHSGITGFAFGCLFPKECCSWYI	237923	263525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_238053_238568_238720_239733_239830_240460_240565_242233_242348_244610_244708_247050_247159_247720_247803_249368_249472_251712_251835_252832_252947_255162_255229_257325_257393_258969_259049_260702_260779_261182_261270_261641_261753_263076
737746	contig_8357_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_39704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAGCACAAAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321929	319688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_319700_321900
737748	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	280	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737749	contig_500_pilon	-	1434	10	Intergenic	novelGene_30971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCGCGGGCGGAGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480977	1446864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1446940_1452268_1452366_1454482_1454585_1461319_1461433_1461478_1461548_1464028_1464138_1466068_1466290_1469103_1469324_1477837_1477928_1480639
737752	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
737754	contig_13456_pilon	+	2813	2	Intergenic	novelGene_153300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGCTGGAGTGCCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344007	348286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_344328_345793
737757	scaffold_13505_pilon	+	1844	6	Intergenic	novelGene_111626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_5	36.8271638875437	189	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	27	800	733912	739702	FALSE	15	CCCGGTTCAAATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRASLCLVAPVWNRGTRGVRGLNRMVAPQGNQRKRRTLVQFLADHFYDVQALREYFLHKQALKVHQENRSVNSIKNRYGPYIAGAFSVLNQGGAVKFQGQEWIRPNGRGHFSLDFLKFQAVPVEAVDASGCTLNYSGLDNLLPLKELQSLWLQRCPHVDDWCLSHLHPLADSLQELSLAGCPRISERGLACLHHFQKLRKLDISDLPSVSNPGLTRILVEEMLPNCEVLGADWAQGLKSAPEEQRRDAAGPVPA	733885	740746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_733930_735281_735479_737020_737102_737892_738030_738222_738386_739524
737759	contig_8538_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_5081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842857	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
737762	contig_10749_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_133466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGGAAGCTACCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147895	148746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_147900_148700
737763	contig_3095_pilon	+	1186	5	Intergenic	novelGene_75107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	49	828	147241	151893	FALSE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPLKKILL	147192	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151148_151874
737769	contig_6710_pilon	+	548	2	Intergenic	novelGene_96403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
737770	contig_2341_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_84353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGACCTTGGGTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59916	58817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_58800_59900
737774	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
737779	contig_16999_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_84973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	813	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCCACTTGAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58329	56513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_56500_58300
737784	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_96297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	185	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737791	SIRV6	+	465	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	207	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11022_11109_11205
737797	SIRV6	+	553	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737798	contig_10800_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_152629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	298	897	89	985	532067	532963	NA	25	ACATGAATATGTGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSVLLPLRLDGVIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIAGASVGAGVWARNPRYRAEGDACVEFKAMLISVGIHLLLLMFEVLVCDRVERGTHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFVALRLDRIVHWPWLVVLVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSLLFLRSLDVAAEQRRTHVTMAVSWITMVVPLLTFEVLLAHRVDGHNTFSYTSICVPLWLSLITLMATTFRRKGGNHWWFGIRRDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDSEDAEETSVPEGPKIAPIFGKKARVVITQSPGKYVPPPPKLNIDMPD	531978	533669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_532000_533700
737800	contig_11056_pilon	+	2077	5	Intergenic	novelGene_130359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_3	18.1572988079174	176	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	166	1308	144210	151925	FALSE	20	AGTATTCCCATCCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINFQGSMTFQDVAVDFTPEEWQLLDCAQRNLYWDVMLENFRNLISVGCPVANPKVIFKLEQGQEPWMVEGEDPCWSYPEADCLLVEEPEKHQESKDSFLKSVSFTFSEILTMGRLHHYNMNTSLNPTIQKSYTCKSCGRSLQPNLNLLNYNSGYTRENSNECNECGKAFKKKFHFIRHEKNHVGIKAFECNDCGKAYRRKTHLETHQKIHNGERPFVCNDCGKAFVHKFQLVIHQRLHTGEKPYECSECGKTFTWNSSFNQHVKSHTLENSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIVCGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYGCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNKCGKAFSQRSNLIVHQKTHI	139539	152694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_139682_144186_144225_147610_147738_149786_149883_151020
737803	SIRV4	-	252	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1261	8	1261	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
737804	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
737808	contig_10196_pilon	-	1286	7	Intergenic	novelGene_132265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_6	44.8581096347138	342	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	109	1020	2004523	2002557	FALSE	10	CACGGTGTGTGCTGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKEEKEGGARLGAGGGSPEKSPSAQELKEQGNRLFVGRKYPEAAACYGRAITRNPLVAVYYTNRALCYLKMQQHEQVLADCRRALELDGQSVKAHFFLGQCQLEMESYDEAIANLQRAYNLAKEQRLNFGDDIPSALRIAKKKRWNSIEERRIHQENELHSYLTRLILAQRERELEECQRNHEGDKDESHVRAQQACIEAKHDKYLADMDELFSQVDEKRKKRDIPDYLCGKISFELMREPCITPSGITYDRKDIEEHLQRVGHFDPVTRSPLTQEQLIPNLAMKEVIDAFISENGWVEDY	2004631	2002290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2002683_2002758_2002876_2002948_2003006_2003108_2003197_2003373_2003540_2003618_2003818_2004364
737809	contig_7179_pilon	-	1557	3	Intergenic	novelGene_78155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0.5	226	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	183	629	1040960	1039825	FALSE	25	TATTGCGTATACTGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRVGAWVPQCLLHPTPSSPYRPFSEKILKLAANISGDKLVSLGTCFGKFTKTHKFRLHITALDYLAPYAKYKVWIKPGAEQSFLYGNHVLKSGLGRITENTSQYQGVVVYSMSDIPLVSRDGICLSQKKLSTFLCKKDVFSNRMLRD	1041260	1038896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1040059_1040747_1041072_1041189
737814	SIRV6	+	345	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10691_10819_11031_11109_11205
737815	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
737821	contig_7919_pilon	+	1987	9	Intergenic	novelGene_28070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	179.983853442469	60	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	479	1060	1068397	1113980	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLILLTSVTLLSIYSINLLLICSKETGFIFSFSLYKFRTKMPCFYIMASKVLKVNRPLILFCASSKEKMLLLRPCGSEHTMKKRQVLWAV	1066905	1117070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1067292_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847_1079964_1113436_1113511_1113786_1114112_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449
737827	contig_2476_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_157635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTATCACTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388519	389041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_388500_389000
737828	contig_2476_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_157634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384007	384349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_384000_384300
737829	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_96436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737830	SIRV6	+	539	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1545_1664_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737833	contig_3241_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_146415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912488	915040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_912500_915000
737834	SIRV6	+	535	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737835	contig_10460_pilon	-	1763	7	Intergenic	novelGene_157465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	27.225906780124	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	20	1456	97739	83727	TRUE	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERYLKLFTFLPLSEINHIMQLHVKEPEKRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLESAKRCTQALYHNSIDALEVMSDEELKELFKEASFSELVLDPGTSVLDTCRKANAIPNGPRGYRMITEGGVSINHRQVTNPESVLVVGQHILKNGLSLLKIGKRNFYIIKWLQL	97758	64343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_64445_65943_66013_83589_83887_86273_86445_86752_86909_95896_96065_96957
737840	contig_11316_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_122694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139829	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139800_140500
737844	contig_17108_pilon	-	1758	9	Intergenic	novelGene_109550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	153.322984252199	70	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	584	925	424268	416051	FALSE	65	AAGAATAGAATAAATAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFDEKSMFAGDKKGAKSLKEEFRLHFKNISRIMDCVGCDKCRLWGKLQTQGLGTALKILFSEKEIQKLPENSPSKGFQLTRQEIVALLNAFGRLSTSIRELQNFKVLLQHSR	442463	415217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_416112_419049_419184_421902_421990_424208_424279_425250_425498_425626_425720_431143_431168_437031_437166_442388
737850	contig_11752_pilon	+	1483	8	Intergenic	novelGene_37622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1472.32973791296	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	94	1188	84194	105606	FALSE	40	AATATAAAGATGTCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKVQHE	84100	105901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_105592
737855	contig_567_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_34001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTTTGGTCAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590616	588826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_588800_590600
737856	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
737863	contig_116_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_154893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTGACCAGGATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231281	231662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_231300_231700
737868	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737872	contig_6710_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_97327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
737873	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737876	contig_6710_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_95994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653691	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
737883	contig_15025_pilon	+	2375	3	Intergenic	novelGene_155981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	5	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTCTTATGGCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89143	99382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_90019_92546_92687_98022
737884	contig_13021_pilon	-	1092	3	Intergenic	novelGene_8201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTAGCAAAATTATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176950	175426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_176060_176403_176499_176586
737885	contig_13021_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_8138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCGGCCGCCTCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175074	174506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174500_175100
737890	contig_9682_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_125293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1145	1510	13066	13431	NA	75	GAAATGCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGCSLWCAYFSWIDEKHMETVSCRREIINFPSSFLLQTGVRVSVNGMKKQEKASVPQESTSQMEIWGTSLGWAYTSRDVEVKAFTKKGRGVSQTGLSAPGSPVCVTMTLSVTTSGLVTAG	11921	13785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_11900_13800
737893	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737894	contig_16525_pilon	-	683	4	Intergenic	novelGene_133857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	961.527950711783	76	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	306	626	181180	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWQRRVVRFNRLRPQPCRRRVRCNPYRSSDARWTGRPVGRARGGRGLGEAGGQGLGSTWELGPETHAAPLSASRFPQKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181485	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150
737895	contig_8317_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_19666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGACCCATTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16401	16764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
737911	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737912	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
737916	contig_5794_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_69746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1451	1804	481131	480778	NA	70	CGAATGAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFQPKITRHRKKKRTMGPILSKKKESVETEWAQMLGIAEKDFMTTITNTFKELKETVLKALKKNVVSMSQQIGNLYREIQTIEKKQIEHLELKSTIMEMKNSLVVLNNTLERAKE	482581	480343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_480300_482600
737928	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737930	SIRV6	+	444	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	215	-1	96	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATTTAGGTATAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
737932	contig_6795_pilon	-	1696	3	Intergenic	novelGene_27758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	957.5	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTGAAACAATTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374937	372313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_373141_373209_374033_374891
737935	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
737941	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
737943	contig_4364_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_3167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAAGGCTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
737948	contig_6031_pilon	-	1953	2	Intergenic	novelGene_56746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	138	422	207906	207622	TRUE	35	TCTGGTAAAATTATGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDDKPPAAWFPASSQNTRAAAQRLLLSLLSPVQGEAEPLQGGARSMSPMDAEQVRSQEQFWGAPEVIHDRGGPSAGSRAGQPRASRLRNPGVTNKLFFLLGRSSHSTPLVRTDSPSYQAQDPTGEFATLRERCSARQFF	208043	205677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_207080_207492
737953	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
737955	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_89428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
737956	contig_500_pilon	+	1129	8	Intergenic	novelGene_31020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1208.08262658357	6	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	208	711	1491971	1498065	TRUE	20	TTGACTGTGTTTGGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSARRLPRVRRRGARSPAAPGEECCQPREQLCKGLRQEHVCLTGKVTPNRKPQPSAGTAAWNETGHFMNTCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1491978_1495442_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
737958	contig_10159_pilon	-	2852	10	Intergenic	novelGene_30779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_7	149.915367070726	3	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	752	1306	338253	317967	FALSE	40	CTGATACTTAAAATAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642169	316420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_431854_431937_456756_456901_577727_577806_597817_597913_637988_638064_641956
737959	contig_15327_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_70751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAGTTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055886	1058005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1055900_1058000
737962	contig_4857_pilon	+	1623	4	Intergenic	novelGene_48833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	60.1239460522086	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAACTGTTAATTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1339924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335192_1335517_1336704_1336828_1338905
737964	contig_8322_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_143219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99191	98777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_98800_99200
737965	contig_12078_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_74112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAATTAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371429	369370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_369400_371400
737966	contig_12425_pilon	+	1338	7	Intergenic	novelGene_46632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	207.899615199259	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	87	1148	167145	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167058	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_186767_186945_190682_190836_198178
737967	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
737968	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737972	contig_6677_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_114219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTCCCGCCTCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628107	626380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_626400_628100
737975	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
737976	contig_6241_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_156450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCATATATTTGTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601410	602577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_601400_602600
737978	contig_11285_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_5507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	78.4103787773022	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	391	876	545839	546547	FALSE	10	CTAGATTCCTTTCTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRVPMERELSFYGLTALALMLGASLIYWTLFTLGLDLSWSINLASKWCERPEWLHMDSRPFASLSRDSGAALGLGIALHSPCYAQVRRAHLGNGQKIACFVLAMVLLGPLDWLGHAPQISLFYIFNFLKFTLWPCLVLALVPWVVHLFSAQEAPPIRSS	542946	546852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_543119_544727_544835_545243_545335_545818_545961_546183
737985	contig_6710_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_97765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653399	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
737986	contig_7066_pilon	+	1288	8	Intergenic	novelGene_42114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.5988704815629	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	88	948	567063	584840	FALSE	25	TAATTCTCACTGCACTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVINTVDTSHEDMIPYSHEGPVWQVAWAHPMYGNILASCSYDRKVIIWKEENGTWEKTHEHTGHDSSVNSVCWAPHDYGLILACGSSDGAISLLTYTGEGQWEVKKINNAHTIGCNAVSWAPAVVPGNLIDQPSGQKPNYIKKFASGGCDNLIKLWKEEEDGQWKEEQKLEAHSDWVRDVAWAPSIGLPTSTIASCSQDGRVFIWTCDDASGNTWSPKLLHKFNDVVWHVSWSITANILAVSGGDNKVTLWKESVDGQWVCISDVNKGQGSVSTSVTEGQQNEQ	566975	585180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_567066_569662_569708_575155_575316_575791_575926_581092_581227_582053_582178_583105_583253_584726
737987	contig_5514_pilon	+	1321	6	Intergenic	novelGene_75283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	316.996908502275	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	138	1130	66040	68726	FALSE	15	TGTATGTGTCAGCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVCGSCPGVLSTRVGGLLPLALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGKTGLYPASTVCPTREDSPPQAPEDPDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGPALPSSLPVPSSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLTPGTYSSPKLRGTLPLPPCEARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIVSKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKDGIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGSGAVEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVASSLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGSMPSTTTATVVAPLSS	65340	68917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_65403_65469_65516_66010_66389_66493_66640_67535_67662_68354
737988	contig_15720_pilon	-	739	7	Intergenic	novelGene_41879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1863.27031050248	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	392	697	279842	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	282610	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279846_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577
737991	contig_7945_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_161598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTCACAGTTGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382772	381580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_381600_382800
737993	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738000	contig_15118_pilon	+	1078	6	Intergenic	novelGene_74622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	277.880261983467	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	316	453	395307	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	392886	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392927_393224_393273_394685_394749_395049_395141_395233_395346_398644
738002	contig_9670_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_169940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112770	110374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_-_110400_112800
738006	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
738007	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	6	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738009	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1170	3	1170	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3988	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
738012	contig_6710_pilon	+	512	2	Intergenic	novelGene_97868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTGCTGTACTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653404	657506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
738014	SIRV6	+	365	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3171_10735_10819_11031_11109_11205
738029	contig_8149_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_169947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAACCACTAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501332	502761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_501300_502800
738031	contig_6710_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_93411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653650	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
738032	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738036	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_96096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653838	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738037	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
738039	contig_10437_pilon	-	1222	2	Intergenic	novelGene_38117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1082	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	139	693	80783	80229	FALSE	25	CAGGGCTCAATGTTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82833	79699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80839_82750
738040	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
738041	SIRV6	+	743	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGTAATAGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1850_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
738043	contig_5649_pilon	+	2834	5	Intergenic	novelGene_82310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	209.598872850023	3	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1064	1480	187002	188251	FALSE	35	TGGAGTCATCTTGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTIIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVLETINFQTLTAFW	181801	189605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_182586_183103_183213_183315_183486_187001_187251_188083
738044	contig_20727_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_152571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTGTAGCTTTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9623	9111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_9100_9600
738045	contig_20727_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_152570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTATGGCAACTACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8967	6725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_6700_9000
738046	SIRV6	+	443	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	519	0	340	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738048	contig_6375_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_72982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAATCTTCACCCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244542	242450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_242400_244500
738049	contig_11338_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_6194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	599	982	6234	5851	NA	35	CTCTTTTGAGATATAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSESPEVGLGGRAKGWMLWGGISCFRGPLQPITLLLTPEGRVQEGKDISVGTGHSSLGERVCVYVCVCVCVCVCVCVCVYVCVGGIWGQVRPGTFILGGHLVILEPRFEHCYGLNCVPQNMCCKS	6832	5772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_5800_6800
738050	SIRV6	+	471	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	385	0	206	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738054	contig_14196_pilon	-	952	4	Intergenic	novelGene_169970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	105.382899730248	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	371	952	114010	95285	FALSE	15	ACTGGTTTAGTTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFLPTVSTMGDVGGELSSGDDSGDVDESPQSPETEASRSLTELFEKAAAHLQGLIQVASREQLLYLYARYKQVKVGNCNTPKPSFFDFEGKQKWEAWKALGDSSPSQAMQEYIAVVKKLDPGWNPQSPSVVQTVNTRSCYLKGWRFEFTQRCLGRKVCLSTSEKSAFEDLTEHSSVLTHMRSPRVGIDLMA	114380	95284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_95480_103247_103345_106756_106822_113785
738055	contig_10904_pilon	-	1440	7	Intergenic	novelGene_22531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_5	385.925906820928	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	27	920	362437	352112	FALSE	10	AGATCTGTTGTTGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEEAEGAAMISQFLFLLCFEQNVAQPRAIFMIIGLCLSQRDMTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362463	351591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_354962_354999_360057_360100_362403
738057	SIRV2	-	477	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4396	34	3221	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
738063	contig_13780_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_149037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	503599	503940	NA	15	GTGCGGCTCACCAGGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTDHRGHFSKLSVQIRRQGLALAHLFSDLQGPFAQRLGLLVLPSFPVEHCKIVQGRRHLSRPESSSERQKLLKHRAYVYNTQSLILRARCSSLDKTIPPQVKAKEQLTTTQTD	503598	504509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_503600_504500
738064	contig_5445_pilon	+	708	4	Intergenic	novelGene_135424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1317.60717464147	126	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51704	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52639_52976_53240_53646
738067	contig_4295_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_169975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGTGTGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63614	64061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_63600_64100
738068	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	8136	1	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
738071	contig_7744_pilon	-	1983	8	Intergenic	novelGene_62475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	67.6201877838147	24	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	634	1350	488892	487677	FALSE	30	CTGAAACCCTAAATGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRYQACRCEDPGRWLKEAQPRCGGGNREAGEDCGLGVGVSPGLTRMQEGTNLHRQVGRPWELSSLSPGPRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	490812	487043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_489172_489350_489572_489750_489812_490508_490550_490781
738075	SIRV2	-	277	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	649	22	649	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
738076	contig_7272_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_25311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTGTCTGTGGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459941	457698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_457700_459900
738077	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738086	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738094	contig_15304_pilon	-	842	3	Intergenic	novelGene_30506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	389	802	53653	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRRHLSETPVAVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54260	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53300_53614_53782_54000
738096	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_96343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
738106	contig_6710_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_90542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATGGTGGGAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
738108	contig_9177_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_32732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685913	687831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_685900_687800
738112	SIRV6	+	568	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
738119	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_93653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738120	SIRV6	+	566	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738122	contig_405_pilon	-	1691	5	Intergenic	novelGene_135289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_4	49.012753442344	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	332	1066	190847	137779	FALSE	75	AGTAGAAGAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDQALQQMLDRSCWVCFATDEDDRTAEWVRPCRCRGSTKWVHQACLQRWVDEKQRGNSTARVACPQCNAEYLIVFPKLGPVVYVLDLADRLISKACPFAAAGIMVGSIYWTAVTYGAVTVMQVVGHKEGLDVMERADPLFLLIGLPTIPVMLILGKMIRWEDYVLRLWRKYSNKLQILNSIFPGIGCPVPRIPAEANPLADHVSATRILCGALVFPTIATIVGKLMFSSVNSNLQRTILVRWL	191178	137153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_137961_138095_138280_150337_150469_165723_165927_190812
738123	contig_1107_pilon	+	2048	3	Intergenic	novelGene_126554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_2	38	82	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	59	637	209781	230663	FALSE	70	CTAGAAAAAATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEEGLTSSAPASSQTLLDALLQNLYDFGERKDETKQRIKKKRESKKRDLSTAAVLAEGPALPPDSLVRGQRKSASSFFKELREELHCAPAVTSTSFSSEPEVDSAVSHSLRNNRELVEVVEFHSRRQKRKLKPGQDEIPKTKTSVLEKDVVIQEFNLEKVCALKLLICSFFYNTKKVSMFLYLTDGKMVK	209722	232074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209869_210850_211189_230510
738125	contig_7119_pilon	+	2089	8	Intergenic	novelGene_40856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	282	junction_1	291.885006711303	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	96	1100	55132	102384	FALSE	25	TTACCCCCAATCTCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSFPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIAR	27547	103373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_27638_55126_55327_77981_78105_90791_90922_95067_95250_98276_98397_99516_99622_102234
738135	contig_10494_pilon	-	1841	5	Intergenic	novelGene_102176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	34.3037898780878	326	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	187	834	956186	952197	FALSE	30	TAGCCAAACTTGATCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWRSQAANKPACAEGWPGLGHSGPSSLRFCGECLQPCLQVPSPLCPLCRLPFDPKKVDKATHVEKQLSSYKAPCRGCNKKVALAKMRVHVSSCVKVQEQMANCPKFVPVVPTSQPIPSNIPNRSTFTCPYCGARNLDQQELVKHCVENHRSDPNRVVCPICSAMPWGDPSYKSANFLQHLLHRHKFSYDTFVDYSIDEEAAFQAALALSLSEN	956372	951189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_952263_953261_953370_953625_953741_954312_954426_955940
738136	contig_16098_pilon	-	1405	9	Intergenic	novelGene_46134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2501.64208258795	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	140	775	458816	456972	TRUE	5	GGGGGAGTCTGTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVQLLHDPPVIGSGVFLYPRRQITAPPSAGQHPATHRVRKATTNTMSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASKNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKLPSTRL	459160	456068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456361_456468_456660_456824_456993_457097_457184_457568_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458831_459035
738139	contig_7171_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_101433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATCCCAATCATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1579508	1579871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1579500_1579900
738140	contig_5623_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_154866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGATTAGGCCGTGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257370	258080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_257400_258100
738141	contig_5623_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_154867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATGCACAACAGAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259078	259467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_259100_259500
738142	contig_6710_pilon	-	502	2	Intergenic	novelGene_97936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	TTTAACTTTAATCATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738144	contig_6270_pilon	-	1229	1	Intergenic	novelGene_99887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	145	309	1136000	1135836	NA	30	AAATATTTCTCTATCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLKLLPPKCSSVLCLLFHFGHWLNIKSDHVSPWFQILQGLPTSFRVNMMSMAYRITLLDLPPLLPYLFGLILSFPHSAATAPASSNLSGIVRALELAVSFP	1136144	1134915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1134900_1136100
738148	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
738149	contig_3181_pilon	-	2029	12	Intergenic	novelGene_136929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGGATTGGGAGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309242	280131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_280338_280745_280978_283489_283570_283964_284084_286901_286980_298283_298431_300059_300202_301734_301877_305386_305557_307564_307747_308052_308276_308934
738150	contig_3825_pilon	-	1290	9	Intergenic	novelGene_78017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_4	883.365360071924	792	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	33	1013	1470962	1462075	FALSE	15	TTTGATTTGCATTTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGDQGPPGIPGKAGPKGERGPHGEKGEPGHSEYCRTAPMSWCPFPCSPPAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470994	1461797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465458_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
738154	contig_6557_pilon	+	1910	5	Intergenic	novelGene_33000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4.96865172858795	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	584	1486	530347	533579	FALSE	15	GTGGAGGCGTCTTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLLSGLAACGACVFTNPLEVVKTRMQLQGELQAPGSYQRHYRNVFHAFITIGKVDGLAALQKGLAPALIYQFLMNGIRLGTYGLAESRGYLHTAEGTHSPARSAAAGALAGVLGAYLGSPIYMVKTHLQAQAASEIAVGYQYKHQGMFQALTQIGQKHGLVGLWRGSLGCLPRVIVGSSTQLCTFSSTKDLITQWEVFPSQSWKAALAAAMVSGIVVVLAMTPFDVASTRLYNQPTDAGGKGLIYRGILDALLQTARTEGIFGMYKGIGASYFRLGPHTILSLFFWDQLRSIYYKYTK	529763	534003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_530722_532117_532184_532630_532784_533134_533270_533405
738155	contig_7707_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_72129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGTCAAATAAGATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75780	74019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_74000_75800
738156	SIRV4	-	192	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	425	0	-425	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCATGTCACCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
738157	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1196	3	1196	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
738158	contig_6048_pilon	-	2283	15	Intergenic	novelGene_73270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.073237151549	1	121	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	334	1812	1985829	1978923	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGAEHGKGRAEHLL	2006230	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978963_1979070_1979157_1979266_1979364_1979455_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987382_1987496_1993750_1993800_2006110
738159	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738162	contig_19132_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_169986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306768	305192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_305200_306800
738163	contig_6710_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_97053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653371	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
738164	contig_11986_pilon	+	1423	12	Intergenic	novelGene_69080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_9	132.847703768993	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	4	1122	11811	18605	TRUE	30	TTAAACGGGTTTTGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMSHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCYAVWQVKPSSMCGPFQTLDTMYEAGKVWVRRLERAGPRVSWLSWVHHYLLENTFFIFLVSALLLW	11807	22167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17285_17442_17620_18598_18653_21266_21335_21981
738165	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738166	contig_6048_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_73232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1778229	1775745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1775700_1778200
738169	SIRV6	-	784	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAACGTCGTTACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
738174	contig_3077_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_26782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_3	67.6527079198526	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	25	588	241006	235030	FALSE	35	ATTATTAATTCATCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPGPLGQPRSNTVAMPKRGKRLKFRAHDACSGRVTVADYANSDPAVVKSGRVKKAVANAVQQEVKSLCGLEASQVPAEEALSGAGEPCDIIDSSDEVDAQEESIYERTVSRKKKSKRHKEDLDRAGGEEYPMDIWLLLASYIRPEDIVNFSLICKNAWTVTCTAAFWTRLYRRCDHRELTVLSV	241030	234904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_235227_239666_239835_240624_240715_240897
738184	contig_17440_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_7613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGCTACCAACCCCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
738192	contig_7378_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_120297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAACTTGTGACTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649113	647107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_647100_649100
738194	contig_9505_pilon	+	1378	12	Intergenic	novelGene_121857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	220.909465020259	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	300	773	560359	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	534676	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_534866_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
738196	SIRV4	-	282	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1241	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3917	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
738197	SIRV6	+	472	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	0	205	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	288	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738198	contig_12622_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_5862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112875	1113216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1112900_1113200
738200	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738203	contig_20561_pilon	+	1914	11	Intergenic	novelGene_166369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	54.3419727282696	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	51	1310	75736	97878	FALSE	40	CTATACGTATTTGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPYLPKEIRSSLVLSMLQQMLMEDKADLVREAVIKSLGIIMGYIDDPDKYQQGFELLLSALGDPSERVVSATHQVFLPAYAAWTTELGNLQSHLIPTLLSKIEKLLREGEHGLDEHKLHMYLSALQSLIPSLFALVLQNAPFTSKAKLHGEVPQIEVTRFPRPMSLLQDVSTIIGSREQLAVLLQLYDYQLEHEGTTGWESLLWVVNQLLPQLIEIVGKINVTSTACVHEFSRFFWRLCRTFGKIFTNTKVKPQFQEILRLSEENIDSSAGNGVLTKATVPIYATGVLTCYIQEEDRKLLVGFLEDVMTLLSLSHAPLDSLKASFVELGANPAYHELLLTVLWYGVVHTSALVRCTAARMFEVCQQMPLLVQIIMIFFGRGRGNVKEKKKVLYLPFYVEVYFMALNSILDGCSQAFKTPDTASCEAFCFLYVEV	70910	98482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_70931_75705_75847_76541_76707_79541_79690_83435_83593_84218_84343_86357_86407_88076_88157_93252_93360_94307_94541_97792
738205	contig_1337_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_84251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGATCATTTATGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442040	440707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_440700_442000
738207	contig_1337_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_84247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433526	432454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_432500_433500
738208	contig_13982_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_163490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAGAACCCAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401058	402969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_401100_403000
738209	contig_8278_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_165306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATAATTAAATAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265955	267410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_266000_267400
738211	SIRV4	-	317	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1206	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738212	SIRV6	+	513	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	20	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738222	contig_7361_pilon	+	2310	8	Intergenic	novelGene_163381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	11.2376916795984	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	232	1737	265238	285342	FALSE	25	ATTCAAGGTTTCTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSTGVDTNPCPNSPVFRTGSEPTLSPALVRRVSSDIRVGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKAPFLKFPPSPSTWLNSEAHYCELNPAFAISCDRAARLPSCAQDSYVELLRARQNGALGPRNSGTSYLILDDDDRVRPWEPPAAQMDKGQEDEGEFVKPLLETDSSFRPNNFESKLLPPENKPLETAMLKHVKELLTNHDPKVIAQHMLQMDCKVARILEVSEEMQRNMGVSSGLELITLPFGHQLRLDIIERHNTMVIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSRIIQVAVELKDSMGDLYSFSAIMKALEMPQITRLEKTWTTLRHQYTQTAIRYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARLMAEAADTYRMNAEKILEGFLPDEEMSEIFKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTVLSRKLEPPPVKQTEP	264145	285915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_264334_265194_265299_266371_267025_272871_272988_277290_277463_280595_280708_280936_281150_285163
738225	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
738226	contig_12724_pilon	-	1528	5	Intergenic	novelGene_146871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	53.6982308833354	320	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	103	1095	541481	440995	FALSE	30	TAAGTACTTTGATTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRKRSGPPGLSRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKDTDEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDGVSKDSDSAVFMETTEELFEQLESHSLSPSDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDHVRVISTFFNYWITHILPQRNSE	541583	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445957_448443_449011_497701_497837_541459
738227	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
738228	contig_20875_pilon	+	2456	4	Intergenic	novelGene_153088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	19.4821855949366	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	694	1995	4981	8635	TRUE	30	CCCAGCAAGGTCAGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGCSLNKCRPPPVQGYEQSKLRHPGPGSQPNSFQLRQIEFLKGRLPEVPLTGKQTPSPPVFLPGLQPRFPGPPARDRQLQIWNIPRGVSLGSQGLQRGFQHPSPWRGVDRLTSRFQELNISQDQEKRILKLLEELEEGKTTTAYDLAKKLGVPKKEINRVLYSLEKKGKLHHEAGNPPLWRIAVPVHAAKQQSKAVRADSHRQAAPRSDPSLETEDRNPASGLEDCPVLFDMAEIKEKICDHLFHVSNSSALNLAKNIGLTKARDVNAVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERMQIKRNSSSVRETTPAATPETERNVELPTYNLPVSGASNNVTMGKVANGQEPVTKLENRPEATPGPVKLKPPVHDNGPSKPGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIHSAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNLIEQSGPPHEPRFKFQVVISGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTVLLEEARAKDGGRSEDSYHCSPEKGSERTAESQPTTPSATSLFSGKNPVTTLLECVHKLGSSCEFRLLSREGPAHDPKYVSALVFSETREIEKYTFLPASSEMADYFTVFSVGRMGVLGVSSLLWGRESGTGNSEGQAGTKHREVHGLEATKTWAYLRSFLL	4287	9238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_5694_7509_7694_8230_9049_9190
738230	contig_11285_pilon	-	1720	13	Intergenic	novelGene_5532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.214668946541	4	54	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	484	1563	744458	741540	TRUE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745222	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741287_741452_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744754
738234	contig_5959_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_150173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTGAGTTTCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88606	90365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_88600_90400
738238	contig_7378_pilon	-	1580	13	Intergenic	novelGene_120245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	43.9895031671067	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	15	1076	338876	301101	TRUE	30	TTCCAAGCAATTATTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVAMAALGNLTGRRWFSALALGVTLLKCLLIPTYHSTDFEVHRNWLAITHSLPISQWYYEETSEWTLDYPPFFAWFEYVLSHVAKYFDQEMLNTHNLNYSSSRTLLFQRFSVIFTDALFVYAVHECCKWIDGKKASKELTEKPKFILSVLLLWNFGLLIVDHIHFQYNGFLFGLMLLSIARLFQKRHLEGAFLFAVLLHFKHIYLYVAPAYGVYLLRSYCFTANKPDGSIRRNSFSFVRFISLGLIVCLVSALSLGPFLALNQLPQVFSRLFPFKRGLCHAYWAPNFWALYNALDKVLSIIGLQLKLLDPKKIPKASMTSGLVQQFQHAVLPSVTPLATLICTLIAILGPEAFSDV	338890	296955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_297210_297956_298030_298341_298440_301021_301128_302258_302399_305894_306016_310799_310904_311174_311302_313391_313460_314835_314946_317308_317503_331125_331205_338784
738240	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
738241	contig_7056_pilon	-	1467	9	Intergenic	novelGene_43734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	389	junction_2	689.37122619094	1243	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	36	1295	1211543	1079637	FALSE	20	TACTGTGCTTTTGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRRSAAAGGTMTGAARAGPARFAALVLLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPIHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGARMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRHLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLASDSSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF	1211578	1079464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1079653_1086616_1086711_1089950_1090156_1094903_1095001_1099856_1099940_1109072_1109145_1146709_1146961_1176499_1176695_1211296
738243	contig_6017_pilon	-	1848	3	Intergenic	novelGene_152562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	56	189	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	354	1520	480395	472973	FALSE	45	TTTCAAAACAAATATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWLGVTPETKTRPRTGGPPRRRKGRRTRPKLKARYALPLARKRQAWLGVTPETKTRVPAVSGLQTSGSPPRVPPRRRTRQPALGRSLSLSQKSKTSVGKRARRLTFGRSRLQKQEADMGTVADALLVCHPGTLTRVLQQKEGGAGRDLSVETRVDWEGTGREPSDGAMVGPRIESGEPLCPPLQCNQDEESLTLLIQVPRILPQSLQGDLKPLRYKLCFSTQDFIYYSFFLQFAPENKLSTKEPVISISSNNVVIELAKSPESHGHWKQWYYGLNNDSLEERLFVSEENVNEFLDEVLSSPFKQTIPLTPPLIEVLQITDNNIQIHAKLQESSNSHELHVKEGVNEGSHLTEKENIEHLITTTTEQEQTLGDARPSDSCVADNALVTDSCGSVAYLKQESRDVFQVLSGKSQQPESKMEPEFIKEKCAVYSNEEKQNLKEPVLTGEKELDGDYLSSLQNKTTVHNISAFESIKETNMQDGSVQIMKDHVTHCAFSFRNSLLYDLD	480748	472644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_473507_474670_474815_479906
738254	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
738255	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
738260	SIRV4	-	329	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1194	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3964	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738261	contig_2770_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_107406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149282	148327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_148300_149300
738263	contig_7593_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_127307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATGGTGATAAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198413	199227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_198400_199200
738267	contig_5260_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_144407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTGTGATTTACATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477755	477356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_477400_477800
738268	contig_5260_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_144406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTAAGAGAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477406	475710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_475700_477400
738272	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
738274	contig_9799_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_145574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACACAGACTGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128763	1129718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1128800_1129700
738276	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738277	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_90242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738280	contig_10159_pilon	+	1619	4	Intergenic	novelGene_30863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	51.1229454898244	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	589	603	975301	975315	FALSE	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFWTDTQGLKRGHCWVSCTSSASLQGQTQTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGMRTS	957455	976331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159
738281	contig_15354_pilon	-	1635	3	Intergenic	novelGene_65715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.5	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	213	914	224459	223758	FALSE	25	GTAACTGGAATGCTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227696	223036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224556_224887_224922_227614
738284	contig_11572_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_100045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCATTAGTGTAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216165	214212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_214200_216200
738287	contig_12540_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_148075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTAGAGACTGAGACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909829	908650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_908600_909800
738293	contig_13680_pilon	-	1868	3	Intergenic	novelGene_149600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	126	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	122	691	424581	415315	FALSE	45	TAGATAATAAGAACGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVFGYGSLIWKVDFAYQDKLVGYITGYSRRFWQGSTDHRGVPGKPGRVVTLVEDPGGCVWGVAYKLPIGREEEVKAYLDFREKGGYRTETVIFYPKDSTTRPFSVLLYIGTCDNPNYLGPAPLEDIAEQIFNAAGPSGRNTEYLFELANSVRNLVPEDADEHLFSLEKLVKERLEGEENLNCIERPKH	424702	414137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_415714_417359_417396_424446
738301	contig_1154_pilon	-	2206	6	Intergenic	novelGene_87193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	55.7616355570745	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	336	776	1062369	1059759	FALSE	20	CCTATACTTAGTTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTKGSFTYSSGEEYRGEWKEGRRHGFGQLIFADGGTYLGHFENGLFNGFGVLTFSDGSRYEGEFAQGKFNGVGVFIRQDNMTFEGEFKNGRVDGFGLLTFPDGSHGIPRNEGLFENNKLLRREKCSAVVQRAQSASKSARNLTA	1069274	1058328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1059908_1060161_1060272_1060698_1060814_1062302_1062401_1066738_1066983_1069214
738302	contig_20614_pilon	+	2273	8	Intergenic	novelGene_107515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	8.39095723176481	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	315	1535	48127	51394	FALSE	30	GAGAGGAGTGAACAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPRCGLEDPFNKKTFKYRLLGRWRKKNLTFRILNLPSTLPPHIARAALLQAFQYWRNVAPLTFREVQAGWADIRLSFHGRQSPYCSNTFDGRGRVLAHADIPELGSVHFDEDELWTEGTYKGVNLRIIAAHELGHALGLGHSQYTQALMTPVYTGYQPYFKLHQDDIAGIQALYGKKSPEKEEEMEVPSVPPVPKEPSTMPDPCNGELDAILLGPHGKTYAFKGDYVWTVTDSGLGPLFPVSALWEGLPGNLDAAVYSPRTQRTHFFKGNKVWRYINFKMSPGFPKMLNRIEPNLDAALYWPLNKKVFLFKGSGYWQWDELARTDFSSYPKPIKGLFTGVPDRPSAAVSWRDDRVYFFKGKHYWRLNQQLRVEKGYPRDTAQNWMHCHPQSPDTTPQVGTPLLQ	46687	52132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_46938_48062_48194_48406_48623_49097_49344_49746_49864_50482_50648_50804_50933_51112
738305	contig_14326_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_120705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTGGACCGCTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248061	249761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_248100_249800
738306	contig_14326_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_120706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAACTTAACCAGCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250367	251163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_250400_251200
738307	contig_18414_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_170013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTACAATGGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99734	100416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_99700_100400
738308	contig_8689_pilon	-	2739	5	Intergenic	novelGene_170027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	7.84219357067906	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	120	896	133795	128951	FALSE	20	GTTTTGCAGTTCTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSSKTALRLHERTHTGDKPYGCTECEAKFSQPSALKTHMRIHTGEKPFVCDECGARFTQNHMLIYHKRCHTGERPFMCETCGKSFASKEYLKHHNRIHTGSKPFKCEVCFRTFAQRNSLYQHIKVHTGERPYCCDQCGKQFTQLNALQRHHRIHTGEKPFMCNACGRTFTDKSTLRRHTSIHDKNTPWKSFLVIVDGSPKNDEGHKTEQPDEEYTPSKLSDKLLSFAENGHFHNLAQVQSSIPAVHENRSADMACKPDDSVVPQDSLLATTISDLSELTPQTGVMPPQLHSLANME	133914	127107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_129302_129704_129863_130538_130707_132261_132357_133790
738310	contig_5620_pilon	-	1880	5	Intergenic	novelGene_161360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_3	13.0455931256497	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	1229	1879	417447	416797	FALSE	35	GCCATGATCATCAGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQNLQRSESSRVDKYETEESSVAGLSSPELKVRPAGASSIWYTEGEKQLTKSLKGTNEDSNKSKVKVTKLMKTMKPENTKKLIKQNSKDSVVLVGYKCLKSTASNDLSKCFEGNPSHSQKEGLDPTICGYNFDPKTYIRQTIQKEASYLPTDTERTEQKSPDIENVQPNQFDPLNSGSLNLCANLSISGKLGISQDDNEITQVERNLASRSSSDD	451480	416795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_417847_419281_419356_432751_432908_447368_447419_450931
738313	contig_15897_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_49578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAACCTGAAGAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836742	834912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_834900_836700
738314	contig_9363_pilon	+	2609	12	Intergenic	novelGene_6530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	10.4833595019097	104	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	264	1244	613819	623409	FALSE	15	TGTAACACGTTGTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRIVFAWWKGSKLDCNAKQWRLFADILNDVAMFLEIMAPIFPICFAITVCTSNLAKCVVSVAGGATRAALTMHQARRNNMADVSAKDSSQETLVNLAGLLVSLLMLPMVSDCPSLSLGCFFLLTALHIYANYRAVRALVMETLNEGRLWLVLKHFLQKGEVLNPTSANQMEPLWTGFWPSLSLSLGVPLHCLVSSVSELQQLIDGHQEPYLLRWDPSRNQIQVVLSQTAGPETVLRAATHGLVLGALKQDGPLPGELEELRNQLQAGPEKDCWVIVKETHQVLDKLFPKFLKGLQDAGWKTEKHQLEVDEWRATWLLSPEKKVL	610013	624774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_610266_613807_613854_615160_615194_615282_615389_618230_618333_620673_620745_620823_621009_621087_621146_621569_621641_622468_622613_622737_622816_623311
738315	contig_6589_pilon	+	1985	7	Intergenic	novelGene_25937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_1	210.674907539238	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	63	839	1228758	1253203	FALSE	60	AAACTGAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHGKVGRES	1228284	1254349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228890_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089
738316	contig_13780_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_149087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATATATAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673977	673420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_673400_674000
738317	contig_9668_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_58171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGTCACAGTCAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500499	502104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_500500_502100
738320	contig_15459_pilon	+	1375	2	Intergenic	novelGene_106367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	397	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTAACCAGTGGAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9156	12156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_9268_10892
738321	contig_12543_pilon	+	2530	6	Intergenic	novelGene_168371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	24.2322099693775	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	454	2517	263759	275402	FALSE	25	AAGACCTCGAATGTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKFKEAVTFKDVAVVFTEEELELLDSAQRKLYQDVMLENFRNLVSLGHQSFTPNIIPPLEREEKLWMMKPATQRDSSLGGKNLKEMETLQEVGLRYLSHEELFCSQIWQQVIRELSQGQESTINIEGTVSQLQKQSDVPYKDEEYGKGFHQRSHLQIHQSVHLGEKPLVGQECGKGFIWHSHLQRNQRVHAGEKPYKCEKCDDTFRRFSSLQAHQRLHSREKSYKHDVLCKGFNQRSYLHRHQRLFTRQNPDKYEECGRNIGKSSRYQAHLIAHRGEKPYKCEECGTGFSQSSYLQVHQRVHTTKKPYKCDECGKGFSWRSRLQAHQRIHTGEKPYKCDACGKGFSYSSHLNIHCRIHTGEKPYKCEECGKGFSVGSHLQAHQISHTGEKPYKCEECGKGFCRASNLLDHQRGHTGEKPYQCDACGKGFSRSSDFNIHFRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLLAHQRGHTGEKPYKCATCGKGFSRSSDLNVHCRIHTGEKPYKCEKCGKAFSQFSSLQVHQRVHTGEKPYQCAECGKGFSVGSQLQAHQRCHTGEKPYQCEECGKGFCRASNFLAHRGVHTGEKPYRCDVCGKRFRQRSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKVFSWSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSWSSSLIIHQRVHADDEGDKDFSSENSYRKGTQ	256222	275415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_256542_258841_258929_263711_263774_266762_266890_267856_267953_273576
738322	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
738324	contig_10494_pilon	-	1824	11	Intergenic	novelGene_102167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	81.4044839059864	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	537	1226	918750	915313	FALSE	5	CCCCCGGTCTCAGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERADGKDSIAQQVAPELHWPELRILILVVSTEKKLMGSTVGMQTSVKTSALLQFRVTSVVPARMAEMIRCIRERDFPGFGQLTMKDSNQFHATCLDTFPPISYLNDTSRHIMHLVHRFNTHYGQTKVAYTFDAGPNAVVFTLDNTVAEFVAAVRHCFPPESNGDKFLKGLPVRPVPLSDELKAALALDPTPDGVRYIIATKAGPGPQILDDTHLHLLGSDGLPKPAA	923178	914714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_915394_916136_916246_917054_917171_917609_917829_917971_918047_918660_918861_919992_920140_920415_920531_921205_921277_922259_922300_923125
738326	contig_7657_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_30060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAGCTGACAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413058	415149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_413100_415100
738327	contig_9656_pilon	-	1476	8	Intergenic	novelGene_121894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	170.816406992886	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	409	1239	97308	81749	FALSE	10	CTGCATTCTTGGTCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPSMFNVLWCSFIVCVFSFQLL	101185	81511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_100608_100769_101023
738328	contig_3426_pilon	-	1980	17	Intergenic	novelGene_57945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	272.321472482432	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	52	1209	443332	385096	TRUE	75	TTTAAAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEEHLRKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPIPFPKEALAHEKFTQELKYVIQRFAEDPRQEVHSCLLSVRAGKDGWFQLYSPGGGSL	443383	366963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367305_379715_379812_381350_381399_382220_382362_382859_382977_385067_385177_388422_388472_388767_388795_390086_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_443308
738343	contig_16846_pilon	-	712	3	Intergenic	novelGene_82967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4534.5	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	32	334	552791	551492	TRUE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	552822	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550993_551242_551665_552661
738349	contig_10958_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_5352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTTTGGTTATATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796379	795883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_795900_796400
738351	contig_4857_pilon	+	2801	6	Intergenic	novelGene_48680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	59.2202668011552	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	37	537	1102861	1106009	TRUE	15	GAGACCCCTTCGTATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVGRGLNSDQLNMLAEKLTGLSSYSDGHLTWAKFCKEHLPGKSFTFWIWLEAILDLIKKHILPLWIDGYIMGFVSKEKERLLLKDKMPGTFLLRFSESHLGGITFTWVDHSENGEVRFHSVEPYNKGRLSALPFADILRDYKVIMAENIPENPLKYLYPDIPKDKAFGKHYSSQPCEG	1102824	1109806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1102883_1104465_1104516_1104745_1104841_1105135_1105273_1105812_1107986_1109518
738354	contig_1618_pilon	+	1633	9	Intergenic	novelGene_141808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.4860899066957	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	432	1436	727106	745924	FALSE	10	CTTCTGTTTCTGAGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESILKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEAFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL	724210	746121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724535_725942_726044_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742218_742337_744092_744217_745756
738359	contig_4125_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_25153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGAAATTTGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877352	874905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_874900_877400
738360	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	14	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738362	contig_7057_pilon	+	779	4	Intergenic	novelGene_123242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_3	136.274233318947	1282	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	331	636	540255	541317	FALSE	25	CAATATTGACTTCCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLERVSNEEKLNLCRKYYLGGFAFLPFLWLVNIFWFFREAFLAPAYTEQSQIKGYVWRSAVGFLFWVIVLATWITIFQIYRPRWGALGDYLSFTIPLGTP	539801	541460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540890_540996_541177
738363	contig_13146_pilon	-	2224	8	Intergenic	novelGene_170037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_7	8.13658906622751	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	132	866	60217	49525	FALSE	45	AAAAATAAAACTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSEMVSLAAVLLSSFPANGQDPDFAYLSTQLTQVQMEIVNKHNELRTGVSPEASDMLKMEWDNEAAANAQNWADKCIYKHSDPQKRRTNVSCGENLFMSSAPTSWSSGIQNWYDEERDFVYGVGPKSPNAVVGHYTQVVWSTSFRVGCGIGYCPDQSTFKYYYVCHYCPAGNYINRLYTPYKKGPRCSSCPDYCDNGLCTNGCGYEDVYSNCETLKKMFTCANEWVRNSCKASCNCEGKIH	67206	48166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13146_pilon_-_49653_51568_51658_53118_53217_53686_53833_55850_55939_56648_56766_60148_60220_67077
738364	contig_1154_pilon	-	2600	1	Intergenic	novelGene_87235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662541	1659941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1659900_1662500
738365	contig_3975_pilon	-	1647	4	Intergenic	novelGene_54896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	2.49443825784929	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	64	429	2116028	2113769	TRUE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLEEPAPKPRSRLRASSQHPMDDKKKKRSPKPCLTQPAQAPGTLRRVPVPTSHSGSLALGLPHLPSPKQRAKFKRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGESWGLSLDGM	2117397	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112988_2113492_2113971_2115864_2116039_2117344
738369	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738370	contig_7202_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_17134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCTTTGATGGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
738375	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738376	SIRV4	-	356	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1167	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738378	contig_5018_pilon	-	1071	6	Intergenic	novelGene_47077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	683.931107641698	88	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	522	839	1401907	1399318	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKNPLVPLHPRGRGCEAQA	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399372_1401127_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402168_1402363_1402701
738382	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
738384	contig_5947_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_101588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	877993	877676	NA	20	GCCTTAGGTGGGCAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGCEGGEENARAAAAQDSWGRGSSPLGGLEDCQGQWLLCTVPGGDTGSPENVCSKPLISQPEGLRLGELAACADVSKGLETAAERGGKEFESQLCEVFPNPPPT	877995	876466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_876500_878000
738391	contig_5780_pilon	+	1559	4	Intergenic	novelGene_29793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	148.966066232847	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	366	803	109448	110295	FALSE	30	ACAGATGAGCCTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	107384	111051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_107549_108837_109024_109432_109581_109990
738392	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_98273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	ATGTCTGGTCCTCAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
738396	SIRV4	-	346	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	15	1160	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
738401	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	2	414	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738402	contig_3233_pilon	+	1836	7	Intergenic	novelGene_56552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	293.901013192462	12	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1307	1708	742817	747909	FALSE	20	CACTCCCCAATGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738706	748037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740582_740664_740817_740917_741759_742836_743705_743819_746936_747016_747718
738405	contig_3095_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_75266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTACGGCATCCCCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251304	253010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_251300_253000
738406	contig_8978_pilon	+	2848	13	Intergenic	novelGene_49457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_12	221.477660649255	1	134	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	843	2819	1749586	1772377	FALSE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQVKHHVEPLTPPWHHNKKRYPPSYGPDGKPRPRFNNVQLSPTDEERDKAEEEVHLLNSTTL	1680793	1772406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1770477_1770554_1772218
738407	contig_152_pilon	+	1390	5	Intergenic	novelGene_162648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	162.019096096726	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722961	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723823_724850_724951_726442_726498_729388_729514_731414
738408	contig_10618_pilon	+	3264	10	Intergenic	novelGene_170040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	70.3706237812201	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	77	1963	73780	205331	FALSE	15	GATTTTTGTCTCAATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGDSSHSREVSAPSRTRLARLLPAMGSCARLLLLWGCSAVAAGLNGVAGVSSRCEKACNPQMGNLALGRKLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQSQCNKCNAAHPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIMVFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFAINCSATFGLEDDVVKKGAICTSRYSNPFPCTGGEVIFRALSPPYDVENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNNLNAKPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCVPVDGFRPIKAPGAFHVVHGKCMCKHNTAGTHCQHCAPLYNDRPWEAGDGKTGAPKECRSCKCNGHADTCHFDITVWEASGNRSGGVCNDCQHNTEGQHCQRCKPGFYRDFRRPFSAPDACKLCSCHPVGSAVLPFSSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGPHCERCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPLTGDCISSSTDIDWYHEVPDFHSVLNNSEPTWEWEDEQGFSALRHSGKCECKEQVLGNSKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGSHAEVNVNVKKVLKSTKLKILRGKQTLYPESWTNRGCTCPVLNPGLEYLVAGHEDVRTGKLVVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK	73703	206632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_+_73835_76754_77285_127361_127641_158703_158831_160726_160916_182731_182946_183308_183425_194542_194612_199777_199949_205194
738409	contig_11933_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_107260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGGCCCAGAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119812	118069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_118100_119800
738412	contig_14661_pilon	-	1699	14	Intergenic	novelGene_47439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	142.570609517617	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	534	1547	64450	46200	FALSE	0	TCCCTGCCCTCCCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF	70884	46047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_46260_46801_46996_47430_47571_48278_48388_49117_49221_49761_49864_49950_50101_63314_63408_64387_64490_66529_66621_67393_67448_68173_68317_69358_69466_70785
738413	contig_9345_pilon	+	2514	13	Intergenic	novelGene_24338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_12	36.822773750312	103	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	53	2422	123047	138835	FALSE	0	GCTTTGGTGTTGTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPGCLRALGDLGPAGGMAGIPAPGHRRRSGSPAPRPGPPPGAGHPPSKRARGFPIAAPDPEDPFGAQGDFTADDLEELDSLASQALSQYPATVRDASSVHKVPRIDGMSKNKNPAGKSRESTPVKDNFELEVLQAQYKELKEKLKAMEEDVLVKNGEIKILRDSLHHTESILEEQKRSHFLLEQERAQALSDKEKEFSKKLQSLQSELQFKDAEMNELRTRLQSSERTNKLAAPSISHLSPRKSPSMVIKPEACSPQFGKTSFPTKESFSANMSLPHPCETEPGYKSLVGREENKSHSLGGESIKQEEAQKILVDSWMQRSHTQGSILINLLLKQPLIPGTSLGLCHLLSSCSEALPGTLLQPPGFGSTLAGISGLRTTGFREGSFSLSALREAQNLAFTGLNLVARSEGSCDQDPAEGDRRTFPLCQLPGAVHLLPLVQFFIGLHCQALQDLAAAKRSGAPGDSPTHSSCVSSGVEASLEDSLCNLESFSVASLSVLQHLVCHSGAVVHLLLSGVGADTASGEGNQSLLHRHGHGVTSAPKGIADDQAQHPLLKMLPHLLAFSSAATGHVRASILSQSLKVLVKLAENASFDLLPRFQCVFRVLPQCLSPETPIPSVLLTVELLSLLVDHEKLAPQLCSHSEGCLLLLLYMYITSRPDKMASDRQWLQLEQEAVWLLAKLGVQSPSPVTGSDCHCNVEVVRALTVMLHRQWLTVRRAEGPPRTDRHKRTVRCLRDTVLLLHSLSQKDKLFTVHCVEVLHQYDQVMPGVSTLIRGLPDVTDCEEAALDDLCAAETDVDDPEMDCA	122994	138927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_123291_125635_125773_126700_126872_129180_129300_130416_130575_132530_132627_132960_133091_133298_133986_136980_137118_137273_137366_137835_137914_138113_138367_138767
738415	scaffold_19766_pilon	+	2165	4	Intergenic	novelGene_34382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.02768199119819	81	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	917	1714	726532	727329	FALSE	30	TTTATGTAGGGCAGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	723235	727780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_723305_723435_723738_723925_724236_726296
738416	contig_8122_pilon	+	2464	2	Intergenic	novelGene_40267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAGGAAGGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745106	753971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_745279_751679
738417	contig_19769_pilon	+	2020	7	Intergenic	novelGene_102335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	6.3355259362494	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	264	1895	101326	106288	FALSE	30	TGTTTTCTTAATCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAELLSAQPQAAVTFEDVAVLLSREEWCRLAPAQRDLYRDVMLETYRNLISLGTGLTGPKPGVISQLERGHEPWVLDVQSTKGRVDGSDCGTRTEFKELTSGEMFDGEQLDQLRGIIPQQLHLGEYIEHVGELEECLDKPVGQKGPRPVMVTGEERGQESGRSFRLGSSPIPDQRPYKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKPNTVHDFGEIYNANSLVNEDRKILIGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQQLHSEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFNRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRSHHGEKPYKCTDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNVFQHQRIHLREDFST	93194	106413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_93218_96599_96730_100449_100503_101268_101359_101571_101699_102166_102275_104924
738418	SIRV6	+	529	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738421	contig_2636_pilon	-	830	4	Intergenic	novelGene_52061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	347.295263428685	197	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	123	401	85555	62451	TRUE	25	GTCATGGATCGAATTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62442_62624_81113_81216_85551
738422	SIRV6	+	470	4	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8734	164	57	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGCTATCTTATTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470
738424	contig_3948_pilon	-	1433	1	Intergenic	novelGene_53239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	729	1181	1009324	1008872	NA	70	GTTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRCSTSLAMREMQIKTTRYHFTPIRMAIIKKIDNNKCWRGCGEIGTFIHCWWKCKMVQPLWKPVWWFLKKLNIELLYDPVIPFLGRRELKTYLYKILYMNVHTTIHNSQKAGTTKCPSTEETINKMRYIYTIEYYMSIKRNKVPIHTTK	1010052	1008619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1008600_1010100
738425	contig_3068_pilon	+	2280	8	Intergenic	novelGene_137604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_7	22.7497476998793	276	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	19	786	162547	187446	FALSE	35	TAGCAAAAGCCCCACCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGADGTGQMAAADTALCLFDVDGTLTAPRQKITKEMDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCSQEERIEFYELDKKENIRQKFVADLRKEFAGKGLTFSIGGQISFDVFPDGWDKRYCLRHVENDGYNPIYFFGDKTLPGGNDHEIFTDPRTVGYTVTAPEDTHRICRELFC	162528	188940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162640_167639_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175363_175530_175607_178805_178922_187344
738428	SIRV6	+	223	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	507	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
738431	contig_7887_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_124856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93190	95359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_93200_95400
738433	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_95679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
738434	contig_7297_pilon	-	1647	10	Intergenic	novelGene_169693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_9	43.6173031697567	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	164	1210	171538	117454	FALSE	15	CGTTTCCTAAATTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSWRLLAQAGAQVLGRGAGVLGAAPGSGNRTNIWLFVRSLNGKSCTWWDEHLSEENVPFVKQLVSDENKAQLASKLCPLKDEPWPVYPWEPGSSRVGLIAVKLGMMPLWTKDGKQHVVTLLQVQDCHVLKYTPKEDHNGKMAALTVGGKTVSRFHKSPSILEFYQELGLPPKQKIKIFHVTDNAVIKPGTPLYAAHFRPGQYVDVTAKTIGKGFQGVMKRWGFKGQPATHGQTKTHRRPGAISTGDVARVWPGTKMPGQMGNRDRTAFGLKVWRINTKHNIIYVNGSVPGHKNCLVKIRDSNLPAHKDFCKNLPFPTYFPDGDEEELPEDLYDENVFQLSAPSITYA	171701	117016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_117607_121763_121842_123968_124047_134404_134514_155440_155502_157765_157866_166548_166648_168555_168648_170171_170357_171446
738435	contig_6589_pilon	-	732	7	Intergenic	novelGene_25860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1120.07961026587	30009	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	30	608	959104	955674	TRUE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQVSIRPQPLLPLHPRSVALSSPPAPNPQA	959133	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955665_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
738442	contig_7457_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_31481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544396	545505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_544400_545500
738449	contig_9706_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_20806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGCTACCAACCCCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
738450	contig_6873_pilon	-	2491	9	Intergenic	novelGene_129830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_3	84.481414376181	23	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	8	1294	596047	492894	FALSE	60	TGAAAGAAAAATTGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVSNEQRQHAEHIFLSFRKSKSPFAVCKHILETSKVDYVLFQAATAIMEAVVREWILLEKGSIESLRTFLLTYVLQRPNLQKYVREQILLAVAVIVKRGSLDKSIDCKSIFHEVSQLISSGSPTVQTLACSILTALLSEFSSSSKTSNIGLSMEFHGNCKRIFQEEDLRQIFMLTVEVLQEFSRRENLNAQMSSVFQRYLALANQVLSWNFLPPNLGRHYIAMFESSQNVMLKPTESWRETLLDSRVMELFFTVHRKIREDSDMAQDSLQCLAQLASLHGPIFPDEGSQVDYLAHFIEGLLNTINGIEIEDSEAVGISSIISNLITVFPRNVLTAIPNELFSSFVNCLTHLTCSFGRSAALEEVVSDSSNINCLFFHKEIYYAFRTFLMKIVLSECESKCFK	596054	491696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_493186_493441_493600_497111_497225_520993_521148_521907_522025_547917_548057_553144_553287_559119_559226_595981
738456	contig_8195_pilon	+	2758	15	Intergenic	novelGene_170056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	59.4810894318522	32	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	775	1806	454620	496940	FALSE	60	CCATAAAAAAGGAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIKASCERHSGELVLLVRPNAVYDVVEEKLESEPDFQYIPEKAPLDSVHQDDHSLRESMIQLAEGLITGTVLTQFDQLYRKKPGMTMSCAKLPQNISKNRYRDISPYDATRVILKGNEDYINANYINMEIPSSSIINQYIACQGPLPNTCTDFWQMTWEQGSSMVVMLTTQVERGRVKCHQYWPEPTGSSSYGCYQVTCHSEEGNTACVFRKMTLFNQEKNESRPLTQLQYVAWPDHGVPDDSSDFLNFVCHVRSKRAGKEEPIVVHCSAGIGRTGVLITMETAMCLIECNQPVYPLDIVRTMRDQRAMMIQTPSQYRFVCEAILKVYEEGFVKPLTSSSSK	428011	497892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_428063_429133_429260_431235_431395_442950_443111_446236_446321_446411_446469_454482_454684_458376_458544_459658_459750_460178_460241_469033_469181_471377_471507_478124_478274_479578_479715_496853
738459	contig_8616_pilon	+	1662	11	Intergenic	novelGene_72486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	620.746397492567	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	250	996	320431	328382	TRUE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSCSMCQRLE	318331	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328355_328459_329944_330087_330236_330340_330596_330720_330850
738462	contig_5200_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_140160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTATATGTATATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219274	220580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_219300_220600
738463	contig_7119_pilon	-	3304	3	Intergenic	novelGene_41029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	9.5	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	124	1500	235956	233068	FALSE	10	TGCCTGAGAGTTTGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLMPMASVMAVTEPKWVSVWGRFLWVTLLSMVLGSLLALLLPLGTMEEQCLAVLKGFYLLRSRLDRAQHAVTKCTSPSTGLSVKSRDTGLLVVKTKASPASKLESRAALNQALEMKRQGKRGKAHKLFLHALRMDPDFVDALNEFGIFSEEDKDIIQADYLYTRALTISPYNKKALVNRDRTLPLVEEIDQRYFSIIDSKVKKVMSIPKGNSALRRVMEETYYHHIYHTVAIEGNTLTLSEIRHILETRYAVPGKSLEEQNEVIGMHAAMKYVNATLVSRIGSVTISDVLEIHRRVLGYVDPVEAGRFRTTQVLVGHHIPPHPQDVEKQMQEFVQWLNSEEAMSLHPVEFAALVHYKLVYIHPFIDGNGRTSRLLMNLILMQAGYPPITIRKEQRSEYYHVLEVANEGDVRPFIRFIAKCTETTLDTLLFATTEYPVALPEAKPNHSGFKETLPMKP	238772	231263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_234144_235655_236015_238707
738466	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738478	contig_10068_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_148715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50671	52949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_50700_52900
738487	contig_9516_pilon	-	1974	13	Intergenic	novelGene_106204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_12	50.3675380467309	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	186	1922	1371562	1302068	FALSE	25	CTTAGAACGTGATTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLNQLPFDPASNNEPLQFGSASGPLVTEGLIENGGESSKKRKRTNTPSADNSRTLNVDSTAMTLPMSDPTAWATAMNNLGMTPMGIAGQPILPDFDPALGMMTGIPPITPMMPGLGIVPPPIPPDMPVVKEIIHCKSCTLFPPNPNLPPPATRERPPGCKTVFVGGLPENGTEQIIVEVFEQCGEIIAIRKSKKNFCHIRFAEEYMVDKALYLSGYRIRLGSSTDKKDTGRLHVDFAQARDDLYEWECKQRMLAREERHRRRLEEERLRPPSPPPVVHYSDHECSVVAEKLKDDSKFSEAVQTLLTWIERGEVNRRSANNFYSMIQSANSHIRRLVNEKATHEKDMEEAKEKFKQALSGILIQFEQIVAVYHSASKQKAWDHFTKAQRKNISVWCKQAEEIRNIHNDELMGIRREEEMEMSDDEIEETKETEESALVSQAEALKEENDSLRWQLDAYRNEVELLKQEQGKAHREDDPNKEQQLKLLQQALQGMQQHLLKVQDEYKKKEAELEKVKDDKLQAEKMLENLKEKESSASRLCTSSQDSDYPLEKTLNSSPIKSEREALLVGIISTFLHVHPFGASIEYICSYLHRLDNKICTSDVECLMGRLQHTFKQEMTGVGASLEKRWKFCGFEGLKLT	1473988	1302015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1302200_1304419_1304506_1308192_1308302_1310088_1310197_1312522_1312705_1321920_1322027_1332467_1332575_1334277_1334491_1337286_1337521_1342665_1342873_1355880_1356037_1371465_1371601_1473841
738492	SIRV4	-	263	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1255	3	1255	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
738494	contig_7293_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_54232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	404.050971413261	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	64	384	220511	222466	TRUE	40	TACAAAATCTAAATGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSKLAFALLAAFMLSAALCKAAVLPRVVSELRCQCIKTHSTPFHPKFIKELRVIESGPHCTNSEIIVKIVTKDGEEGKEVCLDPKAKWVQIIVEKFLKRAEKGGQ	220447	223656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_220575_221496_221633_221906_222006_222444_223451_223492
738497	contig_7202_pilon	-	220	1	Intergenic	novelGene_18226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27854	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
738498	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
738499	contig_10904_pilon	-	1698	7	Intergenic	novelGene_22498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	392.240147528696	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	8	655	336807	310785	FALSE	45	TAAAAATATGTATATAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTMLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNGEFRKEWIHHSGKTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLAEDPKVNTRAPCEAAYVPTKEPLGACELQP	336814	309741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_310878_315357_315390_315486_315525_316562_316696_330781_331064_334066_334103_336773
738500	contig_9415_pilon	-	2304	2	Intergenic	novelGene_109860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2000227	1997744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1999897_2000075
738507	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738514	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738515	contig_14322_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_116604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAAAATGGCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674712	674887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_674700_674900
738517	scaffold_16539_pilon	+	1956	12	Intergenic	novelGene_68363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1649	1954	501803	502812	FALSE	20	GAAAGAGGGGCGGGGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSRTQRAFFLCSLPCLNLIHWQLAGRLLSWHLQLLVHELRLHHAGQPGDPQSRGGKVGVSGFPNCGEQKLRLGGVFQPFGRQQLPRRDPSFCQDRLSWGA	489790	502814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_490286_490392_490496_490970_491140_491825_491967_494577_494767_498733_498866_498950_499069_500545_500733_501688_501834_501918_501993_502111_502255_502754
738522	SIRV6	-	547	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1546_1655_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
738525	contig_14745_pilon	+	1713	6	Intergenic	novelGene_147846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.5202459000905	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	218	529	42040	49089	TRUE	20	TATATACTTGTTTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHYKAADSKREQFRRYLEKSGVLDTLTKVLVALYEEPEKPNSALDFLKHHLGAATPENPEIELLRLELAEMKEKYEAIVEENKKLKAKLAQYEPPQEEKRAE	41822	50478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_42055_42252_42326_47055_47105_47479_47610_49044_49415_49619
738526	contig_1076_pilon	-	1592	14	Intergenic	novelGene_101105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	313.478838597633	3	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1539	53	1591	79519	51357	FALSE	15	CTGTATGTTTTTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAI	79571	51355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62653_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
738527	contig_1143_pilon	-	2141	25	Intergenic	novelGene_86568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	234.476007864107	766	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	44	1966	201052	85910	FALSE	30	TTTTTAAAATTGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRHPGLRSPAGQWMVGVKMAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVSSLPELLEKKRLIDLHTNVATAVLEHIKARKLDVYFEYEEKIMSKTTLDKSLLDIISDPDAGTPEDKMRLFLIYYISTQQAPSEADLEQYKKALTDAGCNLNPLQYIKQWKAFAKMASAPASYGNTTAKSMGLLSRVMNTGSQFVMEGVKNLVLKQQNLPVTRILDNLMEMKSNPETDDYRYFDPKMLRGNDSSVPRNKNPFQEAIVFVVGGGNYIEYQNLVDYIKGKQGKHILYGCSELFNATQFIKQLSQLGQK	201095	85734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_85934_88855_88925_91081_91148_93804_93839_96112_96166_99347_99402_112824_112901_114899_114963_119308_119389_121382_121454_135918_136016_147612_147695_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
738534	contig_5050_pilon	+	1715	4	Intergenic	novelGene_110262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_2	8.17856276425687	119	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATAACACATGGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299079	317500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_299213_314692_314911_315420_315496_316211
738535	contig_14288_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_153812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTATACGAATGTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217711	219017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_217700_219000
738536	contig_16360_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_170080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCATGAAGATGTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133509	135107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_133500_135100
738538	contig_5482_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_144474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTGCTATTACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383650	385333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_383600_385300
738539	contig_7457_pilon	-	1650	5	Intergenic	novelGene_31378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	34	junction_2	34.1027858099599	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	979	1455	437993	437249	FALSE	10	GTCACGGGTCTCTTTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	439306	437053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438566_438678_438766_438987
738540	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738545	SIRV6	-	530	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9436	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11256	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1743_3084_3164_10723_10825_11035_11109_11205
738548	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738549	contig_7057_pilon	+	761	3	Intergenic	novelGene_123279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11299	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGGTGGCAGGAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705643	707695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_705874_706663_707046_707546
738554	contig_16098_pilon	+	1889	6	Intergenic	novelGene_45865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCTGGGTGAGGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244090	249286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_244475_244573_244717_247052_247150_247269_247486_247564_247612_248284
738560	contig_19402_pilon	+	2702	1	Intergenic	novelGene_80866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	750	1049	171342	171641	NA	65	AAAAAAAAAAAAACGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYLSLLHFITNTCLKICMDIDKHPRWKLNKSIEIMKLVPKFYLKLSLHYLFKTNERQKGNRGSTVQPGLLKVLRPPTSLHYCKPCFLPCFRGLCMTQ	170592	173294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_170600_173300
738561	contig_19941_pilon	-	2708	16	Intergenic	novelGene_139761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	25.6979030705274	196	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	15	1862	86769	51496	FALSE	5	CTGTGTTTATTTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIASVVPVAVTAAVVPVQTASGDFSDLREIKKQLLLIAGLTRERGLLHSSKWSAELAFSLPPLPLAELQPPPPVTEEDARDMDAYTLAKSYFDVKEYDRAAHFLHGCNSKKAYFLYMYSRYLSGEKKKDDETVDSLGPLEKGQVKNEALRELRVELSKKHQARELDGFGLYLYGVVLRKLDLVKEAIDVFVEATHVLPLHWGAWLELCNLITDKEMLKFLSLPDTWMKEFFLAHIYTELQLIEEALQKYQNLIDVGFSKSSYIVSQIAVAYHNIRDIDKALSIFNELRKQDPYRIENMDTFSNLLYVRSMKSELSYLAHNLCEIDKYRVETCCVIGNYYSLRSQHEKAALYFQRALKLNPRYLGAWTLMGHEYMEMKNTSAAIQAYRHAIEVNKRDYRAWYGLGQTYEILKMPFYCLYYYRRAHQLRPNDSRMLVALGECYEKLNQLVEAKKVPEIGPWRIGVKSAVWMKCYWRAYAVGDVEKMALVKLAKLHEQLTESEQAAQCYIKYIQDIYSCGEIVEHLEESTAFRYLAQYYFKCKLWDEASACAQKCCAFNDTREEGKALLRQILQLRNQGETPTTEMPAPFFLPASLSTNTTPTRRVSPLNLSSVTP	86783	50649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_51667_51857_51978_52054_52134_52843_52906_53371_53502_53806_53927_54049_54204_61675_61758_61895_61994_62076_62255_63785_63919_64020_64127_65172_65216_70252_70391_86448_86522_86608
738562	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
738566	contig_11855_pilon	+	1819	6	Intergenic	novelGene_67099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	169.405548905577	9	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	385	1329	2443397	2460582	TRUE	25	CGTGAATCTATTCCCTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCCSSRSAGGSSGSGSGSRAFKGDAAAARGDGGQVEGTAQEHIVHSPSGLEGLVSRSPKIQGWIRHRVPSNSPCRERSGPAGLFSERLFLVTTRGFDHSRQSCQRSSGQQLEAKSVPTSGAQGDVLTMSGCFPVAGLRCLSRDSGMAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQDQVSLRQDGPGSQREGATEDGGRAVEEGSEEHKSSGEPPLFLPTLFSIPSCS	2440080	2461259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440301_2441567_2441665_2443329_2443442_2445497_2446239_2460423_2460802_2460988
738567	contig_15407_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_123080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGTTTGCCCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462475	461103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_461100_462500
738572	contig_854_pilon	+	1610	2	Intergenic	novelGene_36403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGCATGAACAGACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976660	996002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976732_994463
738573	contig_6710_pilon	+	559	2	Intergenic	novelGene_94509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTGCTGTACTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
738576	contig_10042_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_79228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATAATACACGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163043	1165098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1163000_1165100
738581	contig_11281_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_125504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTATATCAGAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948703	946872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_946900_948700
738583	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_96243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
738584	contig_5569_pilon	-	1983	2	Intergenic	novelGene_86721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACCTGAGTATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139057	137022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_138749_138800
738587	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738591	contig_17311_pilon	-	447	5	Intergenic	novelGene_57848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7709.72717983587	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	37	444	126865	118804	FALSE	10	CTTATATGTGTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKRINKL	126901	118800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118822_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
738593	SIRV7	-	553	2	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	2	58717	2	-58717	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATTAAGTGGTAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	114754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_114961_147608
738597	contig_7919_pilon	-	934	4	Intergenic	novelGene_28076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTCTCCTATCTAGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079912	1066968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1067288_1068301_1068516_1079231_1079568_1079847
738598	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738613	contig_16622_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_48519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCATGGTCCCCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231756	232050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_231800_232000
738618	contig_1301_pilon	+	928	6	Intergenic	novelGene_47422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1354.77531716517	8921	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGGGGAATCATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981490	992488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981540_983736_983810_984997_985109_986236_986360_990207_990317_992025
738619	contig_6048_pilon	-	1839	5	Intergenic	novelGene_73314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	9.98436277385793	226	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	581	1330	2119438	2102483	FALSE	15	GCTGCATACCTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVSSVRSRMRRALVFGMVLPSALVPWLLLGISWLIPQTSFLSNVCGLVIGLTYGLTYCYSIDLSERVALKLDQKFPFSLMRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2122111	2101973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104907_2119275_2119684_2120026_2120150_2121899
738627	contig_14441_pilon	+	949	5	Intergenic	novelGene_100572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111197	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113155_113209_116578_116901_117217_117344_117539
738631	contig_13481_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_119358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGATGTAATGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440992	440718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_440700_441000
738633	contig_7428_pilon	+	1627	12	Intergenic	novelGene_77731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	127.204787061021	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	847	1392	434083	435117	FALSE	40	TGTCACAATAAAGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	429293	435352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_429465_432553_432721_432893_432990_433156_433254_433360_433395_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
738644	contig_9363_pilon	-	1248	7	Intergenic	novelGene_6798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	342	692	1624964	1624253	TRUE	20	AAGCAGGCTGCTCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHQHPSQVQEIAVMWVLHLHGTPGVAASPHRPGLTIPHYLARTHNCEGDAFLHLCILPLKVFILIRITVRELVDVDLLLLQLVPDLRGDRCRESEKHGQSETEHERQILPGQRQ	1625686	1622009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1622284_1622465_1622560_1624064_1624443_1624571_1624673_1624904_1625060_1625337_1625433_1625535
738646	contig_15087_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_37297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTTTAACCGCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303739	302352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_302400_303700
738647	contig_10500_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_41184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACCCCGGTTTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339776	1337671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1337700_1339800
738651	contig_9014_pilon	-	1367	14	Intergenic	novelGene_106747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.7253729627575	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	323	1108	82155	78380	FALSE	5	GTTTGTTTTTGGTGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	83405	78120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78557_78650_78738_78878_78933_79339_79424_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81803_82154_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_83319
738654	SIRV6	+	469	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	3	205	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738658	contig_10238_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_170105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1032	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCCAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422998	424283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_423000_424300
738659	SIRV6	+	230	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8480	-1	259	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGGTCTTACAAATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
738660	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	577	2	398	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738667	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
738668	contig_11677_pilon	-	468	4	Intergenic	novelGene_85933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	213	425	595842	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597375	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
738669	contig_7410_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_106135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACTTGTGATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938853	941206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_938900_941200
738671	contig_8045_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_35320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51489	48997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_49000_51500
738677	contig_5428_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_160404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAATAAAAGTTTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46311	47822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_46300_47800
738678	contig_5428_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_160405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACAGCTGCCCCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47974	48372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_48000_48400
738679	SIRV6	+	325	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8115	-2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
738681	contig_4812_pilon	-	1086	6	Intergenic	novelGene_103631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7231.84172946283	13	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTCTGAGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82740	78698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81630_81739_82268_82343_82598
738684	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738695	contig_6278_pilon	+	2065	8	Intergenic	novelGene_119799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_5	90.0879388969127	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	180	1280	306445	461093	FALSE	85	TAAAAAAAAAATAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSMNGRNPGGRGGNPRKGRILGIIDAIQDAVGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPHDHIKVTQVSTVSGKLS	305045	461878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_305211_306430_306613_328189_328441_425875_426023_446645_446803_452861_452984_456819_456958_460975
738696	contig_4732_pilon	-	2609	6	Intergenic	novelGene_75497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	17.3505043154371	51	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	590	2446	1028208	1002282	FALSE	25	CTTTAAAGCATAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVTVEFTQEEWALLDFSQRKLYTDVMMDTLRNLDSVFQQDNNGQMSTKNDSWSSMLGEICEFHGIEHPHNNQGKHMRKYSVESLWESKDGEVNKDEEGHHCRESFSWIGNLTRLKRTTGVNPFECLECGKAFMDHSSFKSHIRSCTGKKPYHCKECGEDCTCPYQKPRVREKVCKCKDYGKPCSCSLPLTKHIRTHSGEKLYECKECGKAFNYLSNLTRHIRTHSEERPYKCKECGKAFRCSSSLSVHLKSHSGEKPYACKECGKAFCRPSDLSRHTRTHSGEKPHECKECGKTFTFSSSLTIHIRSHSGEKPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIITHSEERPYECKECRKAFKQFAQLSRHVRVHGGEKPYECKECGKAFSEFSQLTKHVRIHSGEKPYECKECGKAFSRSSYLSAHIITHSEERPYECKECGKAFKQFSRLTRHVRVHSGEKPYTCKECGKAFCELSQLTRHVTVHSGYRPYKCKECGKSFSRFSYLTGHIRVHSGHRPYKCKECGKAFNQSSHLTTHMRSHSGERPYKCKECGKAFFQSSHLTDHVRTHSGEKPYECKECEKDFSCFSSFRKHVRTYHGHRPSDSKEYGKAFSSHTSLII	1035588	1002118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1003888_1004241_1004366_1005572_1005697_1028205_1028453_1033858_1033924_1035308
738698	contig_14322_pilon	-	425	2	Intergenic	novelGene_115680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTGGTGTAAGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671850	671269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
738701	contig_10937_pilon	+	1481	5	Intergenic	novelGene_67331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	12.1449578014911	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACCCTTAATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180559	185971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181397_181497_181654_181931_182017_184579_184669_185657
738702	contig_10235_pilon	+	704	3	Intergenic	novelGene_46384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTGTGGAGGCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168605	172738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_169083_171275_171439_172674
738704	contig_9363_pilon	-	1987	10	Intergenic	novelGene_6535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	16	junction_2	97.6753251123459	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	760	1737	638088	634021	FALSE	5	CTGGTGCCGTGTCTCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSDFRVQNHLPASGPTQPPVPSSVNEGSPSPPEPTSKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGLCNQPIQHKMVTALGTHWHPEHFCNCSPRVARAAKAPFWITTSRRSARSGTQTALSAGNASRPSQEAAFSSTRVARCVRTIFMRGAARCAPHVASQSRVAACRPWAAASTRTTSPAPSACVRSPKAPSRSAPASPTASPAFSSSSADRPRGSWVRGPSSHRPRPSRVPRPPDPKALLFELGSPLNPSVRPHPLERPRP	640233	633770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_634445_634661_634763_635182_635231_635484_635659_637745_637941_638052_638362_638520_638664_638765_638819_638933_639050_640059
738708	contig_6589_pilon	+	620	5	Intergenic	novelGene_26153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	5249	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	22	498	1885124	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885102	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
738710	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	8	1161	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
738712	SIRV4	+	165	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1606	632	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2606	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
738718	SIRV6	+	559	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738720	contig_14909_pilon	+	2053	14	Intergenic	novelGene_155707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	118.495399755913	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	678	1415	116717	124340	TRUE	10	GTCAGACTTCTTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIYRPHKATAEEMTKYHSDEYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVAGAVKLNRQQTDMAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNFPMRDGIDDESYGQIFKPIISKVMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLTVKDWWFKPTQRCCGRQPW	108258	133240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_+_108789_112655_112702_116615_116729_117845_117964_119445_119521_120070_120210_121369_121512_123937_124031_124110_124220_124290_124442_131058_131200_131427_131537_132125_132257_133084
738724	contig_405_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_135335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGAAAGAGGCAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620408	617964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_618000_620400
738730	contig_4301_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_65106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539174	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_538000_539200
738732	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_89986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738737	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
738739	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1183_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738740	contig_10765_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_122869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	408	869	19059	19520	NA	75	AAGATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSR	18651	21052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_18700_21100
738741	contig_9696_pilon	-	2410	4	Intergenic	novelGene_68790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	456.775899344769	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	20	313	255810	242340	FALSE	70	TTCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLGAAMMEGLDDGPDFLSEEDRGLKAINVDLQSDAALQVDISDALSERDKVKFTVHTKSSLPNFKQNEFSVVRQHEEFIWLHDSFIENEDYAGYIVSIKVPF	255829	240242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_242475_243101_243207_255599_255648_255804
738742	contig_1301_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_47283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3158	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAATGTGTGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244599	242494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_242500_244600
738744	SIRV7	-	203	1	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	13	146702	13	-91665	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATTGAGACAAAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147905	147702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
738751	contig_8248_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_125024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTGATTCATAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117807	118408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_117800_118400
738752	contig_3817_pilon	-	1775	3	Intergenic	novelGene_78390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_2	17	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	23	391	1052863	1046568	FALSE	85	CAGAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRAEVAMTAADRAIQRFLRAAAAVRYKVMKNWGVVGGIAAALAAGIYVIWGPITERKKRRKGLVPGLVNLGNTCFMNSLLQGLSACPAFIKWLEEFTSQYTRDQKEPSPHQYLSLTLLHLLKGIELGI	1052885	1045183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1046771_1048161_1048272_1052807
738757	contig_14441_pilon	+	1156	6	Intergenic	novelGene_100464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	462.321273574989	4	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	568	1116	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	85411	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85489_85573_85862_121185_121239_125517_125902_126159_126283_126514
738758	contig_14711_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_68941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131104	129770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_129800_131100
738759	SIRV1	-	243	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
738762	contig_9527_pilon	+	1219	6	Intergenic	novelGene_134064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	51.5620015127419	1198	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	98	748	486523	487885	FALSE	55	AAATGAAATCTTACATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484538	488356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486481_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
738763	contig_14694_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_152469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGCAGTATAAATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91972	93260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_92000_93300
738768	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738770	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	54	509	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
738774	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
738783	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	471	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
738785	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
738800	contig_14034_pilon	-	2535	2	Intergenic	novelGene_72658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1981	2373	377318	337560	FALSE	10	TCTAGCGCGGCGCGGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVIKDVFPTLCSPRNTSLNFLSGFPKSPPADMMKPEELPPPQSRDLPDRPCSSRQTKTARGGQEPSSIGPCRARRRSKPGPQDTFTDTQAAVAAASRQSRLAPREAHGWEGKEGGVGNSHGCARGSQG	379298	337397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_337921_377286
738801	contig_6277_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_80379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAAATGTTTATCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3394	1782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_1800_3400
738802	contig_7534_pilon	+	1274	2	Intergenic	novelGene_162119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCCCACCAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39705	41022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_+_40068_40110
738808	contig_6059_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_44786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTATATGGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126895	128649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_126900_128600
738811	contig_11564_pilon	-	2929	1	Intergenic	novelGene_158585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAACAAATGTCACGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163236	160307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_160300_163200
738816	contig_6497_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_35568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACCCCATAACATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172977	171674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_171700_173000
738819	contig_1535_pilon	-	3009	19	Intergenic	novelGene_127236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	125.316488229691	95	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	660	2342	99102	77914	FALSE	25	AGAAACTGCTTGTTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILSLELMKLRNKRETKMRSMMAKQEGMEMKLQVTQRNLQESQGKIAQLEGKLCYEEHSDEAGVSVEKEKIDEKSETEKLLEYIEEISCASDEVEKYKVDIAQLEENLKEKNHEVLNLKQSLEENAVMLSKQVEDLNARCQLLEKEKDDLVIRDREQVENLNAEIQNLKEKLILERQEHEKLQQKELQIDSLLQQEKELSCSLQQKLCSFQEEMIKERNIFEEELKQALGELDELQQREEEAERLVKQLEEETKSKAEELRFLQEKLKGKEAELEKSNAAHTQATLLLQERLDSTVQNLGDVTAQLESYKTLTTSEIEDLKLENSSLQEKVAKAEKCTEDVQHQILATESANQEYARMLLDLQTKSALKEAEIKEITVSSLKKITDLQNQLKQQGEDFKKQLEEEARKAGKENTVEELTEEINKWRLLYEELYNKTKPFQLQLDAFEAEKQALLNEHGAAQEQLNKLSDSYAKLLGHQNLKQKIKHVVKLKDENSQLKSEVSKLRSQLAKKKQSETKLQEELNKVLGIKHFDPSKAFHHESKENFALKTPLKEGNTNCC	115972	77246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_77934_78495_78659_79249_79427_80118_80219_80313_80464_81102_81250_86894_87012_92458_92674_94085_94235_96066_96246_96378_96454_96884_96915_98851_98953_99042_99130_101961_102151_107128_107177_109270_109363_109824_109924_115768
738820	contig_8798_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_143186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9718	10679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_9700_10700
738821	contig_5896_pilon	+	1718	4	Intergenic	novelGene_159240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	14.7044966667419	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	285	1322	117562	118599	FALSE	20	TCAAGTCTGAGTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISCGLQKNVLQGTDFPETCELEKHQKIPTLENIGGKVERVHYARKPFRCEECGKCFSYFSYYVRHQRVHTGEKPFECNECGKAFNGNSSLMRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNSFTSSSEFIIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLIRHQKIHTGEKPYECNECGKSFRRTSHLSQHQRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHSEEKPFECVDCRKAFSAKEQLKRHFRIHIQESSYVCDECGKDFTSKRNLLQHQKIHTGEKPYEYSKYEKTFRTSSQLGRHEHVQPGEKPVLDICRFGLPEFFTPFYW	111054	118995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_111099_111309_111374_115561_115676_117499
738822	contig_10235_pilon	-	1232	12	Intergenic	novelGene_46579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	53.8990485817378	2	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	9	1232	546922	538627	FALSE	20	CCAGACCGTTCCCAGCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELMLLSEIADPTRFFTDSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRH	546930	538626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542187_546870
738823	contig_4103_pilon	+	1357	4	Intergenic	novelGene_52013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	99.6471552807984	1093	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	66	434	462042	526980	FALSE	20	CTCATCTCTTCTTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVDLELKKAFSELQAKVIDTQQKVKLADIQIEQLSRTKKHAHLTDTEIMTLVDETNMYEGVGRMFILQSKEVIHKQLLEKQKIAEEKIKELEQRKSYLERSVKEAEDNIREMLMARRAQ	461976	527903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_462075_464788_464956_490485_490571_526896
738824	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738826	contig_7457_pilon	+	3197	1	Intergenic	novelGene_31665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGCTGGTTTGTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050255	1053452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1050300_1053500
738828	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738829	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
738833	contig_12528_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_81297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAACAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334258	336352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_334300_336400
738838	contig_6412_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_149972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	510	809	508756	509055	NA	60	AGAGAGACACAGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRNLFSHSPVGYKTKFRASAPGERFLRWLWRKVCVINLPLVWELLCSGTSGPKDTLCSRHCFLGGMRFPCVSARFSLLYLQRDCIKTQILSTSSV	508246	510752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_508200_510800
738848	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
738856	contig_6710_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_98080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
738868	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
738869	contig_15327_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_70562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAATTTAGGTTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581886	582125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_581900_582100
738870	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2415	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738878	contig_19701_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_147881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTCTGAGAGAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25286	24595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_24600_25300
738879	contig_19701_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_147880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24033	23348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_23300_24000
738887	contig_14846_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_85382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGCAAAAGAGAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212338	213515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_212300_213500
738892	contig_10436_pilon	-	869	4	Intergenic	novelGene_108503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	87	440	103480	102032	FALSE	25	CCAAGCTGAACTGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103566	101602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
738895	contig_9481_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_149655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGTTGGAAAATACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159640	159151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_159200_159600
738896	contig_9481_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_149654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTTGAGGAGCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158798	158459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_158500_158800
738897	SIRV6	+	344	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	536	-2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
738899	contig_12312_pilon	-	1911	2	Intergenic	novelGene_64027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	355	junction_1	0	20	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	52	363	574825	574283	FALSE	35	AAGATGTAACCAGTAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLTKSPIANTTEPPAVRASEERLCNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQNLFSVFSFSHITSGLVRARTQGECGFGRACCDMSGSQ	574876	572734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_574544_574774
738906	contig_9656_pilon	-	1322	12	Intergenic	novelGene_121914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	418.049227992103	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	88	1248	446594	430496	FALSE	25	CTATAGTCTGTACATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRCHRAALFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSCSARIEGLGSICHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	446681	430421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_430794_430831_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
738907	contig_9888_pilon	-	2622	6	Intergenic	novelGene_162250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	11.3419575030063	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	450	2360	22089	10670	FALSE	30	ACAAATGCTTGGCATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHELVMFRDVAIDFSKEEWECLDLEQRDLYRDVMLENYSNMVLLGLCIHQPDMFSLLEKGKEPWKVLRYQTRGPCPDMQSRCQTKKLSPKNGIVERELPQREIMDIYKNHSLESLCFGDDWEGRDQFETQQENQEEYFNQLILTYEKVPTFTQHTSSNLCQRLNTGEKLNEFKECENAFSCGLDLTQNQLIDTGKKLCEEKECGKTFLPDSELTQCQTVLACKKTYECKECRKSFSLRSSLTGHQRIHTGETPFKCKECGKAFRFHSQLSVHKRIHTGEKSYECKECGKAFSCGSDLTRHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQRSHLTKHQRIHTGEKPYECKECGKAFTRGSHLTQHQRIHAGEKTHECKECGKAFIRGSNLAQHQNIHFGRKPYKCEKCGKAYIWSSHLARHQRIHTSRKPYECKDCGKTFIWASYLAQHEKIHSERKLFECKECGKTFLHGSEFNRHQKIHTGERNYECRECGKTFLRGSELNRHQKIHTGKRPYECKECGKAFLWGSQLTRHQRIHTGEEPYVCKECGKSFIWGSQLTRHRKIHTGTEPYECKESGQIFSHHLYCIEQKIHDENLYEWKDYRNTFSHDSDFAQHQNIYTFEKSYEYKDFEKAFSQSSHFFSLL	43705	10407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_12349_19541_19638_19952_20080_22080_22166_37446_37778_43663
738915	contig_3560_pilon	-	1279	4	Intergenic	novelGene_149500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	2.44948974278318	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTGTCATTGCGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203250	197086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_198211_199031_199080_199798_199862_203206
738916	contig_5428_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_160423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTACTACAATTTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228379	224496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_226550_228101
738918	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
738919	contig_15267_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_151071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45551	47598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_45600_47600
738920	contig_5988_pilon	-	1794	13	Intergenic	novelGene_15891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_10	73.6370132625042	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	288	1187	532502	529953	FALSE	25	GACAGGAACCTTTTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	555067	529345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532541_545681_545864_549379_549429_555049
738922	SIRV6	+	336	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1671	0	-228	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2795	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738923	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
738928	contig_14925_pilon	-	741	4	Intergenic	novelGene_55114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	31	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73133	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_73082
738929	SIRV2	-	245	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4628	34	3453	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
738931	contig_2161_pilon	-	2014	9	Intergenic	novelGene_114908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	34.2782730020052	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	956	1771	766929	760359	FALSE	30	TTTGTATGGCTCTAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKSTQYYDMRWSCEHLIMVWINAFVMLTTQLLPSKYCDLLHKSAAHLGKWQKLEHGSYSNAPQHIWSENTIWPQGVLVRHSRCLYRAMGPYNVAVPSDVSHARFYFLFHRPLRLLNLLILIEGSVVFYQLYSLLRSEKWNHTLSMALILFCNYYVLFKLLRDRIVLGRAYSYPLNSYELKAN	792857	760115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763652_763774_765726_765915_766656_767006_773463_773619_778784_778869_782626_782794_791191_791379_792571
738934	contig_15087_pilon	-	1513	9	Intergenic	novelGene_37250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	529.300245607349	553	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	116	1000	258337	220722	FALSE	10	TTATTTAGCCTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGRSKLSCCKPPKKRHREPEQPHRPVPPESGPLNEDTATTVHLCVLEEAEQHQKDITRILQQHEEEKKQWEQQVEKERELELQEKLAEQRLVLKGEHEEALRVLRAAHEQEKEALIQSSQEAKAALQETIDGLTSQLQAFQAKMKRAEESILSRNYKKHIQDYGSPSPFWVQELESLHFVIEMKNERIHELDKRLIHMETVKEKNLMLEEKITTLQQENEDLHIRGRNQVVMSRQLSEDLLLTREALEKESQLRRQLQQEKEELLYRVLGADASPTFPLASVTPPKVSFLAT	258452	220208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_220900_221856_221955_222875_222996_223823_223926_224919_224994_231735_231824_234067_234175_236371_236442_258289
738938	SIRV6	+	557	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	14	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
738942	contig_12917_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_162890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54595	56807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_+_54600_56800
738943	contig_9931_pilon	+	1120	3	Intergenic	novelGene_134814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_1	8	2147	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	274	972	364058	364756	FALSE	35	AAGAATGTTGTCCCATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	297125	364904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_350571_350653_364048
738946	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
738950	scaffold_17907_pilon	+	1920	3	Intergenic	novelGene_150763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	17.5	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	397	819	79546	81494	FALSE	25	CGAAGTAGTGTTTTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTELPCKNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDVLCKAEAISLQMAKCKELPQAVCEILGLQNSEVPTPDSDIGEDENVGMTSCPTPAFHSNSLPLLATSGSRDDNPPQISVSPNVSRLTPA	79149	82595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_79660_80188_80276_81272
738951	contig_405_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_135302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274060	276384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_274100_276400
738954	contig_4125_pilon	+	1480	6	Intergenic	novelGene_25198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	248.657998061595	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	255	617	1512309	1518074	FALSE	30	TACTAAGTGACTTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKCGLQRPEPSEARRAASSVLLPAALTETVARPRRRCELQNVRRGQCWRFSPWEAFCGIQVFHKTWTDLPVLAGQVHPLHRSAMGCDTGAELHLHDQSLPIADDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505592	1518937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984
738956	contig_9955_pilon	+	864	7	Intergenic	novelGene_21328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	347	junction_1	280.144456783758	336	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	113	586	69965	84621	FALSE	30	TCAATATGAGTATTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLEGLRCSECVDWGEKRNTIASITAGVLFFTGWWIIIDAAVIYPTMEEFNHSYHACGVIATIAFLMINAVSNGQVRGDSYSEGCLGQTGARIWLFIGFMLAFGSLIASMWILFGGYVVKEKPTVYPGIAVFFQNAFIFFGGLVFKFGRTEDLWQ	67757	84899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_67858_69952_70058_71904_72018_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575
738962	contig_16098_pilon	+	1505	10	Intergenic	novelGene_45814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.3017960415657	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	310	1329	150919	153863	FALSE	10	AGCTTGTGTGTCATGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGRPGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150510	154039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150937_151350_151474_151839_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
738965	contig_401_pilon	-	711	5	Intergenic	novelGene_42778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.097876395502	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	249	632	1083727	1079628	FALSE	30	TACTGTGTTAATAAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSFQTTAISRDIDTAAKFIGAGAAALLLRHSGLCPLRSHGTLLPDGGLSDPLRHVKEPSPPPIVSFSCRLP	1086792	1079548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079774_1081644_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
738969	contig_762_pilon	-	1091	7	Intergenic	novelGene_135943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	39.5744726924932	1077	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	100	795	266669	255535	FALSE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGLL	266768	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_256436_256765_256905_257514_257668_259724_259837_263903_264056_266666
738976	contig_5217_pilon	-	1391	9	Intergenic	novelGene_135719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	34.1458269778314	286	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	503	1321	296982	295104	FALSE	20	TGGAATCTAGTATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298401	295033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297293_297368_297733_298335
738977	contig_2251_pilon	-	1444	13	Intergenic	novelGene_128463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	100.048703417663	730	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	137	1108	138003	56508	FALSE	15	GGTAACTTGTATGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEYKNISQKDIEDSIKGELSGHFEDLLLAIVHCVRNTPAFLADRLHQAVKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD	145277	56171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_56568_66235_66359_70007_70067_76931_77028_78774_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988_138042_145179
738979	contig_2646_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_69563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCATAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869511	871831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_869500_871800
738980	contig_7359_pilon	-	1568	2	Intergenic	novelGene_139843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAGTCACTGAGCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28767	25433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26893_28658
738984	contig_10689_pilon	+	1076	4	Intergenic	novelGene_118626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	24	junction_2	1722.63544863354	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	216	593	57744	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTRKICMICLPPWNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51282	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58216_58374_60928
738985	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
738992	SIRV6	+	368	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	486	2	313	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
738997	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
739006	contig_15304_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_30637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102709	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_101800_102700
739020	SIRV1	-	166	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3662	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6704	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6560
739024	contig_602_pilon	-	2793	1	Intergenic	novelGene_134961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524284	521491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_521500_524300
739025	contig_15063_pilon	+	843	2	Intergenic	novelGene_14431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	30	ATCAGTTCACAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
739027	SIRV6	+	195	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	0	506	0	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAGTCGAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	1614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
739032	SIRV6	+	468	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	386	2	207	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739036	contig_15970_pilon	-	2844	1	Intergenic	novelGene_144044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTGTTGAGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142801	139957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_140000_142800
739037	contig_10011_pilon	-	2141	4	Intergenic	novelGene_68116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1069	1446	331861	331484	FALSE	5	GGGGTAGTGGTTTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENCLSEASCLRPSTASWAEHGSLPLASSEAADAPGTCILPQGHSSPAATAVTGRTAQEAPPPASLTAWLPVFHPTAPPWPGSPCPTQLPNGLRKLQESLPPRTIPPNAGHPKHTRGPLCTCAG	333774	330788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_332228_332412_332480_332993_333043_333188
739039	SIRV6	+	575	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	537	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11200
739040	contig_7697_pilon	-	1703	2	Intergenic	novelGene_128285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCCTGGTCCTGCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263132	233426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_235079_263081
739044	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-6	32	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739047	contig_17212_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_88618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGTGAAATCCCCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115247	116029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_115200_116000
739049	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
739050	contig_15304_pilon	+	955	4	Intergenic	novelGene_30682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACGACTGCAGGATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105495	107046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_105962_106043_106374_106483_106532_106935
739051	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_96295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739055	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
739056	contig_10734_pilon	-	1511	3	Intergenic	novelGene_51413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_2	40	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	101	1021	2091217	2077571	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGATSMWASCCGLLNEVMGTGAVRGQQAGFAGGTGPFRFTPNPDFSYPPAATEGPDIVCKACGLSFSVFRKKHVCCDCKKDFCSVCSVLQENLRRCSTCHLLQETAFQRPQLMRLKVKDLRQYLFLRDIPTDTCREKEDLVDLVLCHHGLGSEEDMDTSSLNSSRSQTSSFFTRSFFFKLYSPPLLPCLHFRESLWMETGPQGLERWHRYRGVTAPRAWRADCHRQCSLQGFMTPDKGAARAGTEVPHLPNTHVQALLMASLSSWGCLKGPQIAHGSFGLSYLSFRILYRIAFVPSYYLLGLLT	2091317	2077080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2078270_2079518_2079735_2091211
739057	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
739060	contig_6109_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_160384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGGAGGATGACTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602049	601698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_601700_602000
739062	contig_6109_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_160383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTAGCAACTTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588773	587775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_587800_588800
739064	contig_9290_pilon	+	1265	8	Intergenic	novelGene_77505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	165.176837828741	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	513	1007	29894	34832	FALSE	35	TATTTTTTAAAATTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPDDAIELFNRCRGHCIERMNYIEDLQNGPIRKNWGSSVSRSSGFEESAHLMEPVHTTNKFVRQRPRYNLHRTQDYPTPSRHFHSHTQSVRKFSQNQNVYQRGLIPPPGPPGQDYSQRRYSWNVKPDTTQAAQYKRLPPNIPYNRQCYRSFPIGDGPSDMNLF	14461	35090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_14683_16219_16296_19403_19536_28018_28080_29871_29919_30188_30265_30502_30677_34612
739065	contig_18364_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_102571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTATTACACAGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128420	130478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_128400_130500
739070	contig_15114_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_121243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATGATGGAGACCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1724300	1723207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1723200_1724300
739075	contig_7157_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_131287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGTTGGTCTTGTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853769	854815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_853800_854800
739076	contig_7157_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_131288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATAGTTGACATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854965	856050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_855000_856000
739077	contig_7066_pilon	-	2250	2	Intergenic	novelGene_42145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTACCTGACTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749885	747588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749513_749559
739082	contig_5479_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_133613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366341	364216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_364200_366300
739083	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	43	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739084	contig_8418_pilon	+	3164	6	Intergenic	novelGene_166060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	30.3090745487222	102	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	22	717	1069562	1226030	FALSE	65	GTTATGGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLTVVQPLTLDRDVARAIELLEKLQESGEVPVHKLQSLKKVLQSEFCTAIREVYQYMHETITVNGCPEFRARATAKATVAAFAASEGHSHPRVVELPKTDEGLGFNVMGGKEQNSPIYISRIIPGGVAERHGGLKRGDQLLSVNGVSVEGEHHEKAVELLKAARDSVKLVVRYTPKVLEEMEARFEKLRTARRRQQQQLLIQQQQQQQQQQTQQSDSHKFETLHQNPSS	1069540	1228477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1069605_1127777_1127897_1169757_1169830_1172273_1172484_1216549_1216753_1225981
739085	contig_6710_pilon	-	486	2	Intergenic	novelGene_98041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739086	contig_8898_pilon	-	3365	12	Intergenic	novelGene_137229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	57.6006485271112	367	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	1309	2595	208485	202709	FALSE	20	GAAAACTTGTTCCCGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKIEREIKSSPSESPLMEKKNSLKEDREETKLSLGDVESRNPVVPDVGCAAAPLRAVVEERTVSFKLGDLEEAPEQEKLPSMDLKEETSIDSAMNGAVQLPNGNLVQFNQAVSNQINSSGHYQYHTVHKDSGLYKELLHKLHLAKVGDCMGDSGDKPLRRNNSYTSYTMAICGMPLDSFRAKEGEQKGEEMEKLTWASADTKKRIRMDSYTSYCNAVSDIHSASEVDISVKGEMGLGDRKGSNGSLEEEWYDQDKPEVSLLFQFLQILTACFGSFAHGGNDVSNAIGPLVALYLVYDTGDVSSKVATPIWLLLYGGVGICIGLWVWGRRVIQTMGKDLTPITPSSGFSIELASALTVVIASNIGLPISTTHCKVGSVVSVGWLRSKKAVDWRLFRNIFMAWFVTVPISGVISAAIMAVFKYVVLRV	217760	201938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_202871_203878_203964_204522_204709_205342_205905_206009_206283_208466_208587_210784_210844_210933_211031_215999_216086_216263_216405_216547_217160_217548
739087	scaffold_14128_pilon	+	2558	15	Intergenic	novelGene_169521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	179.02372719268	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	203	1825	323604	496930	FALSE	15	GTTCTCAGTTGTGGTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAAESRDAAPGKQNEEKTYKKTASSAIKGAIQLGIGYTVGNLTSKPDRDVLMQDFYVVESVFLPSEGSNLTPAHHYPDFRFKTYAPLAFRYFRELFGIKPDDYLYSICSEPLIELSNPGASGSLFFVTSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCMQSGGINIRIVVMNNVLPCAMRMHYTYDLKGSTYKRRASRKEREKSNPTFKDLDFLQDMHEGLYFDTEMYNALMKTLQRDCRVLESFKIMDYSLLLGIHILDHSLKDKEEDTSQNVPDAKRPAMQKVLYSTAMESIQGSGKSGDGIITENPDTMGGIPAKSHKGEKLLLFMGIIDILQSYRLMKKLEHSWKALVYDGDTVSVHRPSFYADRFLKFMNSRVFKKIQALKSSPSKKRCNSIAALKASSQEIVSSISQEWKDEKRDLLTEGQSFSSLDEEALGSRHRPDLVPSTPSLFEAASLATTISSSSLYTGEHYPHDRPTLYSNSKGLPSSSTFVSEEGTIYLTSEPDAPETQDDNDSVLDVYL	190339	497663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_190457_316132_316218_323603_323673_371402_371534_385290_385409_391348_391502_393126_393427_424169_424382_425680_425765_425887_425937_430723_430809_434788_434945_437823_437969_479042_479161_496927
739092	contig_14362_pilon	-	1514	7	Intergenic	novelGene_142522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.7805313865436	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	143	457	40212	38296	TRUE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAACSAAARPDPQVGTAERLGPGFSTRTSAAPRCCLLLRGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELPVPYRVPEAGVWRPDMA	45432	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37503_37547_37729_37855_38043_38165_38351_39843_39948_40056_40233_45310
739093	contig_3081_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_133909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGATTTAAGGTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65112	62550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_62600_65100
739097	contig_9875_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_154404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59726	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_58800_59700
739098	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739099	contig_13894_pilon	-	1424	6	Intergenic	novelGene_62198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	228.737054278488	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	212	760	753211	750013	FALSE	20	TATTGAGTAGCGGTGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766646	749348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_766578
739103	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739104	contig_14322_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_116526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATCCCAGGTGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674873	672855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
739106	contig_7521_pilon	-	2533	3	Intergenic	novelGene_160547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.5	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	543	866	293231	292908	TRUE	35	TTTACAGACAGCTCACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIHGQPPASPWGTWSKPSNKGATKLHRERFLYSHPGPSGAVAVPPPLCDIWGGAASKRPPSSHRGSSCQVFLSTPGIARVDMPSSCRWDAVSSDLGAQVVQLSSDP	383687	291022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_291355_291572_293630_383543
739107	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
739111	contig_5799_pilon	+	2351	18	Intergenic	novelGene_50304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	263.868728504067	2	98	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	633	2102	619664	717728	FALSE	35	AGTAAAATTGGTATACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTDLHDKLVLKGDFDACEELIEKAVNDGLFNQYISQQEYKPRWSQIIPKSTKGDGEDNRPGMRGGHQMVIDVQTETVYLFGGWDGTQDLADFWAYSVKENQWTCISRDTEKENGPSARSCHKMCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALA	561008	717977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612804_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650974_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717723
739113	contig_15146_pilon	-	1683	8	Intergenic	novelGene_116969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	212	517	628867	624560	TRUE	25	CATCGACCGGACCTAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWDASIKTQPRVAAMWRPSGVHLAPDSELLPGPAQLRGVLLDELAQVFQVPVGTLEPDGVLLVPTGREVDVGDLGAESVVEPVVFPQAVGRYSPASWYCW	629078	615055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_615350_618675_618857_620581_620790_621873_622014_623165_623372_624422_624593_625739_625799_628653
739119	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	198	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739122	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739126	contig_5429_pilon	+	2466	7	Intergenic	novelGene_127792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	49.3918571786439	99	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	477	803	186586	199101	TRUE	10	CCCTGGGCCCACCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKCLSWYLKSSFALCFSVKCLQKTVKDSYHIMCRPCACELEVCAKCGKKEDIVIPFIKEPEKTDNIENNRGSNCRSSSCIRNEDESDGGLDFDIDLDGTEEDNQVN	159319	202348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_159475_186132_186240_186371_186589_190915_190969_198157_198272_198944_200530_202113
739127	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
739129	contig_11846_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_105993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATAACTTAAAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392024	391565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_391600_392000
739135	contig_5236_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_100916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1249	1677	447928	447500	NA	20	CCAATTCTCCCCCCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDIDRNQTEKLLKRVQELEEEVQRLKKEQVNKDSSRKEDSSGSKKAKRAFDFSAHGRRHVALRIAYLGWGYQGFASQENTNNTIEEKLFEALTKTRLVESRQTSNYHRCGRTDKGVSAFGQVKQVIPRHSRCVCPEDSH	449176	446865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_446900_449200
739138	contig_821_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_149380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGTTCCAGCTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41742	39315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_39300_41700
739140	SIRV2	+	436	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	160	-73	-160	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATAAATACCACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
739144	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739148	SIRV6	+	533	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739149	contig_10803_pilon	-	3178	1	Intergenic	novelGene_170125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100461	97283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_97300_100500
739150	contig_4732_pilon	-	2010	18	Intergenic	novelGene_75470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.325692464643	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	124	1905	747726	700704	FALSE	45	AAGAATTAACTTACTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELGEGAEAGPCPSHPPWPPEPAPQPGPTWLSPRGPDASLAMGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIVGNLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGGEPDGGKISNFLLEKSRVVSQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSDTYKVDGTDDRSDFNETLSAMQVIGILPSIQQMVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESIDVTLNVEQAAYTRDALAKGLYARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPKYLVSSK	747849	700598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_700726_713389_713461_715492_715575_720150_720237_721485_721654_722527_722612_723828_723916_724035_724117_727095_727293_727793_727927_728152_728288_728409_728542_729165_729256_729369_729458_730958_731054_731135_731226_732091_732230_747723
739153	contig_4782_pilon	+	903	5	Intergenic	novelGene_73623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	69.7222166888001	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	434	901	244034	251057	FALSE	10	GTAAGTGTTGCCTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQQNASQQPRGRRGFGQRGSSRQGSPGSVSKQKTCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLKKIEQDTDTKITIS	233147	251059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_233447_233543_233608_243963_244246_249350_249486_250936
739156	contig_15304_pilon	-	744	2	Intergenic	novelGene_30432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	669	698	52954	52925	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53794	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
739157	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739158	contig_1379_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_134603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCAGCAAGTAATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481948	480468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_480500_481900
739161	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739164	contig_5018_pilon	+	2381	20	Intergenic	novelGene_47205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	593.279420605609	124	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	40	759	1597297	1601674	TRUE	25	CATTTTTAAGGCGTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAADLFTGVLPNMYSPPENLCWDMMCDDKPVVDDPNSPEYNAKELVNYFLQLAAAQGQHYRTNHTIMTMGSDFQYENANVWFKNLDKLIQLVNTQQASGSRVHVLYSTPACYLRELNKANLTWSVKQDDFFPYADGPHNFWTGYFSSRPALKRWRDLQPTRDPMAQERVCPSEKQWLCSSTTTLSAALPGSMWLTTTRASSLRAGDPVRCAPEQRSGAAQRLQGELHVLPRTQRQRLSPQPDSGALPGHHL	1597003	1608514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1597029_1597282_1597429_1597973_1598091_1600267_1600351_1600430_1600518_1600649_1600711_1600895_1601008_1601161_1601270_1601654_1601772_1602713_1602891_1604030_1604129_1604212_1604335_1605512_1605632_1605720_1605823_1606004_1606093_1606293_1606376_1606789_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
739165	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
739168	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
739171	contig_15035_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_170127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAACCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44584	42454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15035_pilon_-_42500_44600
739173	contig_16086_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_170128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTATGTGGCTGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15507	15706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16086_pilon_+_15500_15700
739175	contig_10861_pilon	-	1874	2	Intergenic	novelGene_39371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCATGAGACCAGAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648985	1645696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1647387_1648801
739177	SIRV4	-	264	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1254	3	1254	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3904	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
739180	SIRV6	+	498	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739182	contig_7843_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_152032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296127	297884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_296100_297900
739191	SIRV2	-	643	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	16	2958	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
739193	contig_1450_pilon	+	2087	17	Intergenic	novelGene_27394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	645.92150439798	1	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	1090	2040	345706	355901	FALSE	75	AAAGAAAAAAAAAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEPCAPSPAPPLPAFRVGSVPALSPERGELGPTWH	308906	355948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_309004_315758_315879_322469_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341070_342486_342622_345694_345846_346444_346536_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350366_350526_355799
739194	contig_11816_pilon	+	2929	1	Intergenic	novelGene_98505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGATCCGACCCGGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596815	599744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_596800_599700
739195	contig_6674_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_148015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTACCAAATCAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219677	220615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_219700_220600
739196	contig_4891_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_124576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAATAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736773	739168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_736800_739200
739197	contig_5569_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_86753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478044	480065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_478000_480100
739198	contig_641_pilon	+	1604	10	Intergenic	novelGene_170129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	38	junction_6	26.5083262018689	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	111	1370	2066	45324	FALSE	40	AAATTTAGTAGAAATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLLHCYEVIPENSVCKLYFDLEFNKLANPRADGKKMVALLIEHVCKALRELYNVNCSAEDVFNLDSSTDEKFSRHLIFQLHDVAFKDNIHVGNFVRKILQPALKLIASEDDDKTPETTGCRFSHFSEASIQQGTSFNTMSMEKDTRESWTLNSEKLKRLGSAKQSSPDLSFLVVKNNIGEKHLFVDLGVYTRNRNFRLYKSSKIGKHVALEVAEDNKFFPMQSKNISEENHYFLSSLVSNVRFSDTLQILTCDTSQNKQKQVEYFNHSNTSVETIEGFQCSPYPEIDRFVLSLVNKNGIKGGIRRWNYFFPEELLVYDICRYRWCENIGRAHKSNNIMILVDLKNDVWYQKCHDPVCKAENFKSDCFPLPPEVCLLRLFKDEEEFTREDETVETKNNETKNPHKPSSIKLSKGVPSNDDWDNGTDDAYFLEAIEDAELAEAAENSLLSYSSISG	1955	45558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_2087_15100_15249_18584_18873_20901_21065_23028_23118_33200_33291_33367_33477_39359_39443_39526_39574_45102
739201	contig_11883_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_163772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65067	64038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_64000_65100
739203	contig_10197_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_115245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989787	987391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_987400_989800
739204	contig_10437_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_38215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCTGGCTTGATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238367	238918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_238400_238900
739205	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739207	SIRV2	-	283	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	643	22	643	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
739208	SIRV7	-	903	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	48	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
739209	SIRV6	-	556	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
739212	contig_4531_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_47867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1615	1923	181734	182042	NA	60	TTTTCCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYASESKDTELAEELLQWFLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVMTPLSIFWTNYLEDILNSCANLFFPNVFL	180119	182210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_180100_182200
739214	SIRV6	+	352	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10682_10819_11031_11109_11205
739218	contig_13542_pilon	+	2426	14	Intergenic	novelGene_131468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	22.935979848213	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	768	1865	98824	157981	FALSE	30	CTCATTTAATATTTACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAATIIGSAGAAALGSVAGIAVMTSLFGAAGAGLTGYKMKKRVGAIEEFTFLPLTEGRQLHITITITGWLASGKYRTFIAPWAALARSREQYCLAWEAKYLMELGNALETILSGLATMVAQEALKYTVLSGIVAALTLPASLLAVANVIDNPWGVCLHRSAEVGKHLAHILLSRQQGRRPVTLIGFSLGARVIYFCLQEMAQEKDCQGIIEDVVLLGAPVEGEAKHWEAFRKVVSGRIINGYCRGDWLLRFVYRTSSVQLRVAGLQPVQLDDRRVENVDLSSVVSGHLDYAKKMDVILKAKVATSTNPSQAEVPAGLDQPEGASPPATINPIESPHVCSHIVGPNPLGCPDCASQTQGPCPGLD	55458	158542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_55572_56310_56501_69679_69855_87806_87963_97444_97543_98788_98933_99790_99911_106490_106656_107573_107711_111055_111141_137725_137844_148115_148234_157570_157622_157786
739219	contig_14838_pilon	-	1721	4	Intergenic	novelGene_151922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	9.80929264637477	205	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	112	1047	179096	176723	FALSE	0	TGGTGTCTGCTCTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEATGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPPDQPGQPAVSGPDCARAHPADVRLQEHDGCLRPPAMAAT	179207	176048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_177382_177728_177840_178081_178191_179039
739222	contig_9727_pilon	+	2318	3	Intergenic	novelGene_86305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	16.5	487	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	141	596	275749	277981	FALSE	5	TGAGGGTGTCTTGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGMARTPAPSAGSSAGSVPEAPNSSPSTPATSSPAGAPSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNNMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS	275608	279703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_275865_276091_276279_277828
739223	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
739225	contig_8065_pilon	-	2586	13	Intergenic	novelGene_107314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.4769212925789	9	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	512	1627	112224	91565	TRUE	20	ATTTGCGTTTTCTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTPTHTPVSRNVPSRFSGSTRWRGVSFTDSVESTPLPSIEDRLAVLCPSQELLEYFQKKMAECETENEDLLKKLELYKEACEGQHKLEWDLQQKEEEIAELQKALSDMQICLFQEREHVLRLYSENDRLRIREVEDKKKIQSLLALVGTDTGEVTYFYKEPPHKVTIPQKTIQAVNVPEQNASSTLKADPKVNKRRSAMREKGESPKQYQRNIQTLILQVEALQAQLEEQTKLSREQVEGLMEDRRIRIEEIQVQHQRNQEKIKELTKNLHHTQELLYESTKDFLQLRFENQHKEKSWMLEKDCLMSKIKQCRLQCKKKEDKTGKVWPVVHQSHHNQNEYIKTLKDKLVQEKKLSNMYQEQCIALEERL	117748	89844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_90746_91506_91575_91813_91888_93586_93807_97690_97840_98991_99084_99661_99735_101337_101435_106932_107076_110200_110421_112186_112241_114885_114941_117308
739226	contig_12120_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_21425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83179	80823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_80800_83200
739232	contig_18420_pilon	-	1571	9	Intergenic	novelGene_109359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	411.839907457983	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	63	1148	142813	109372	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQVGRRLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142875	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109531_110711_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_142711
739234	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_95088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739237	contig_10057_pilon	-	555	5	Intergenic	novelGene_162342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	55	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	23	553	64936	35447	FALSE	70	GAAGAAGAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAA	64958	35444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
739241	contig_3529_pilon	-	1360	8	Intergenic	novelGene_105346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	504.692106584777	3	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	98	646	550554	529100	TRUE	5	CATTTGGTTTGTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKVRYCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621496	525454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541829_544815_544892_550497_550582_621426
739242	contig_5302_pilon	+	1757	2	Intergenic	novelGene_81508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1140	junction_1	0	2	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	163	435	353721	355700	FALSE	50	GATTTTAAAAAATAAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	353558	357022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_353862_355568
739248	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739249	contig_6710_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_95214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
739250	contig_19865_pilon	+	2221	6	Intergenic	novelGene_170151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_5	109.676980264776	47	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	129	968	43592	79838	FALSE	30	CTTGAACCTAGTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFENKHQEDFPMRSPGDGNHSCLVLKRHVMLGCPSPTVGGRLCFPLVLTSLPET	43463	81091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191_79369_79682
739251	contig_12841_pilon	-	2151	9	Intergenic	novelGene_55846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	250.948917859791	237	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	106	1131	289252	254465	FALSE	50	CATATAGGACAAAACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVGEGAQDSDPGQPEQPPPQPHPPPPQQQQQQEEEMAAEAGEAVASPMDDGFLSLDSPTYVLYRDRAEWADVDPVPQNDGPNPVVQIIYSEKFRDVYDYFRAVLQRDERSERAFKLTRDAIELNAANYTVWHFRRVLLKSLQKDLHEEMNYITAIIEEQPKNYQVWHHRRVLVEWLKDPSQELEFIADILNQDAKNYHAWQHRQWVIQEFKLWDNELQYVDQLLKEDVRNNSVWNQRYFVISNTTGYNDPVVLEREVQYTLEMIKLVPHNESAWNYLKGILQDRGLSRYPNLLNQLLDLQPSHSSPYLIAFLVDIYEDMLENQCDNKEDILNKALELCEILAKEKDTIRKEYWRYIGRSLQSKHSTESDRPTNAQQ	289357	253444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_254588_254861_255034_257953_258017_263353_263503_267711_267839_273718_273824_275596_275712_286368_286455_289166
739254	contig_5145_pilon	-	1723	8	Intergenic	novelGene_131442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	158.188856389173	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	308	982	925621	916397	TRUE	30	TCCATTAAATTCCATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	925928	915577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916111_916188_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545
739261	contig_6710_pilon	+	540	2	Intergenic	novelGene_97176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTCTGCTGTACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653375	657503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653883_657470
739267	contig_9218_pilon	+	2182	5	Intergenic	novelGene_157684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_3	83.5175879680442	59	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	125	571	330553	350452	FALSE	80	ATCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATSVRSFARTLGLPAQHRLSLLSRLPLVRLPSARTPASSVMATCSPSVVISDDEPGYDLDLFCIPNHYLKDLEKVFIPHGVIMDRTERLARDVMKEMGGHHIVALCVLKGGYKFFTDLLDYIKALNRNSDRSIPMTVDFIRLKSYCNDESTGDIKVIGGDDLSTLTGKNVLIVEVSSTFTSNIVLGVF	330428	352063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_330580_337636_337744_339023_339208_347592_347659_350389
739268	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_114045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	25	TATTACTGTCAGTATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
739269	contig_6710_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_93412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653675	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
739270	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739271	contig_12543_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_168389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATGGCCCATAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396900	396532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_396500_396900
739273	contig_3463_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_62015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569374	567143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_567100_569400
739275	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_93531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653768	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739276	SIRV6	+	551	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	14	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739279	contig_6710_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_94772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653638	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
739281	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_18220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
739289	contig_2550_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_135666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGATTTTCAAATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183462	1184800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1183500_1184800
739290	contig_10793_pilon	+	1381	12	Intergenic	novelGene_83388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3247.19322411075	4	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	131	553	146975	160437	TRUE	30	ACATTTTTTTTATTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKMQFMNLQKKNVNGNQMRRMKFRRS	130871	165016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159578_159644_160427_160518_161378_161473_162549_162683_163131_163288_163929_164068_164789
739291	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
739304	contig_5928_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_40387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325184	325732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_325200_325700
739306	contig_6630_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_30725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757635	758870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_757600_758900
739308	contig_4364_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_3197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCTAAGGCTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
739311	contig_10937_pilon	+	3140	22	Intergenic	novelGene_67346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_21	284.135838294247	491	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1013	3042	51	3092	192379	209271	FALSE	0	CTGGTGTGGGCCTTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGRSEPSGLGAPAGRMEDDKGPQYGKPDFVLLDQVTMEDFMENLKLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGPEVITQYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKRRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLNSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHSFYQMLRGSEEELLQKLHLQRNPAVYTFTRQGAGLNALDSDERSHQAVTQAMRVIGFSPEEVASVYRILAAILHLGNIEFVETKEEGPEKGGLVVAEEVLVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKAHSTAEACYARDACAKAVYQRLFEWIVNKINSIMEARGRDPRLHGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYQREGIAWQSIDYFNNAAIVELVERPPRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHPHYSSRQLCPTDKSMEFGRDFRIKHYAGNVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSVDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKSSMVALVENLASKEPYYVRCIKPNEEKVAGRLDEGHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDRAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPQTLVTLEQSRAHLIPIIVLLLQKAWRGTLARRHCRRLRAVYTIMRWFRRHKVRAHLVELQQHFQAARQPPLYGRDLTWPPAPAVLQPFQDTCQALFCRWRARQLVKNIPPSDMAQIKAKVAAMGLLQGLRQDWGCRRAWVRDYLSSATDNPTASGLFAQRLQTLREKDGFGAVLFSSHVRKVNRFLKSRDRALLLTDHHLYKLEPGKQYRVMRAVPLQAVTGVSVTSGKDQLVVLHTRGQDDLVVCLHRTRPELDNRVGELVGVLAAHCQGEGRVLEVRVSDCISLSQRGARRLVSVEVKPEQPVPDFRCSRAGFTLLWPSR	192328	209319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_192474_194145_194355_194582_194677_195626_195793_196159_196214_197960_198057_198304_198422_199075_199301_199399_199546_199988_200104_200426_200598_200863_200935_202226_202302_202488_202622_203444_203612_203904_204113_205662_205887_206409_206555_207238_207344_207621_207736_208862_209018_209114
739312	contig_8865_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_164450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	493	861	376903	377271	NA	25	GTACACGCAGTCCAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSALLHARRGRDTVLGTKAGWYLWLHVLFVLVVVELLCPQHKVPLLPVLHDGPLLLQPAHLDGPFQRVEGGRRVKGRHLHASHHTLGPSYREEQTGRLTEGREEVCKVGEERQERNSQRG	376410	377421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_376400_377400
739313	contig_8865_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_164452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGGGTCACTATGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378053	379137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_378100_379100
739314	contig_10667_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_137322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTTAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207752	207435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_207400_207800
739315	contig_6576_pilon	-	1057	9	Intergenic	novelGene_42231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.6414517040584	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	9	806	261331	229139	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVEFQRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTHE	261339	228768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229149_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
739317	SIRV4	+	356	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	421	173	-421	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGACTTTCCACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
739319	contig_3414_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_80977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATCACAACAGAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75169	74319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_74300_75200
739320	SIRV6	+	427	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	535	0	356	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739327	contig_5260_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_144352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTACTCAGCAATATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86473	88397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_86500_88400
739333	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_89637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739337	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739340	contig_11978_pilon	+	1531	5	Intergenic	novelGene_62920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	120.881139968152	760	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	154	825	862940	866962	FALSE	15	AGCTTTTACTTACTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWWRWLWPGLGCCEGVSCPRRVRSSPSPHGRLPTIQTVRYGSKAVTRHRRVMHFERQKLMALTEYIPPKLAINPRCLPPPPSPPQEETGLIRLLRREIAAIFRDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGGCIDDTILSRQGFINYSKLPSLDLVQGELVRGLSFLTAQTHSLLQHQPLQLTALLDQYIRQQHEGDSVQPASRKLDPPDSVLDS	860833	867668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860922_862874_863045_865281_865447_865690_865836_866705
739346	contig_11708_pilon	-	2206	3	Intergenic	novelGene_138973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1330	1629	295082	283134	FALSE	20	GGTTATTATCGCGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDLDGPAGVQLLFFSKRFLDLSFIDFIWVQKSKMVGTASILSRRVCPVRSKQEASKCFEQRKVCFPGTKFLRLTRRIHSFLLLGSKGNLWKLMLMCLL	296411	282556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_283165_292567_292766_295011
739355	contig_11160_pilon	-	2513	11	Intergenic	novelGene_168859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	12.4759769156567	54	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	297	1355	933856	860370	FALSE	40	CAGGTAAAAGCTGTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSVKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLIEGESDDREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYKPNPNQISTSNGKPGTVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCATCWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHMSRQAMQGMPVRNTGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVPINYAAIRAECKMLLNS	968956	859211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_860616_861503_861656_864554_864677_874586_874646_876580_876656_891477_891667_910362_910463_917309_917413_933843_933962_939619_939684_968829
739356	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739357	contig_7870_pilon	-	951	5	Intergenic	novelGene_108970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_2	332.38334419763	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	240	548	496465	370804	FALSE	70	TAAAGAAAAGAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQGK	497931	370400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
739358	contig_7457_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_31593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	250	375	956614	956489	NA	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	956863	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955400_956900
739360	contig_10626_pilon	-	335	4	Intergenic	novelGene_138213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.3136337176714	477	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	59	325	311837	302422	FALSE	35	GAATGGCAGAAAGGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVYVARRSRVFSFPTSRSKMGKSFANFMCKKDFHPASKSNIKKVWMAEQKISYDKKKQEELMQQYLKEQESYDNRLLMGDERVKNGLNFMYEAPPGAKKERRNRRRD	311895	302411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_302448_303250_303325_305150_305246_311765
739363	SIRV6	+	344	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10691_10819_11031_11109_11205
739367	contig_14441_pilon	+	950	6	Intergenic	novelGene_100495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.906497713021	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	409	837	116728	117610	FALSE	10	CCTACCCCGGGGGGCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVSQKPSRHICQHGTPVTIQCQGSEATYESGFTKDKFAINHPDFTFSTLTVKNSSPEDSSVYLCSAGAHVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	92417	117723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92487_92567_92708_112103_112154_116578_116963_117220_117344_117539
739373	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739377	contig_5997_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_168620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCCATGACAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335761	336312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_335800_336300
739380	contig_15047_pilon	+	2373	1	Intergenic	novelGene_52276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATAACCGTGGGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25778	28151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_25800_28200
739381	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
739385	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739386	contig_5696_pilon	+	2044	16	Intergenic	novelGene_117538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_15	57.0482836434775	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	35	1285	635115	656904	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSATLRLPLPYLFIFALGKKHTYLLSRDTHNCIGKICCKRPL	635080	657663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840_652953_655515_655562_656828
739390	contig_17470_pilon	-	1749	13	Intergenic	novelGene_110517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	63.3350876949999	2	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	56	739	277215	271548	TRUE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISSQPPWNVGTHPDHWQRRQDL	302595	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271613_272888_272956_273479_273609_273875_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
739395	contig_7412_pilon	+	1343	7	Intergenic	novelGene_76314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	450	749	365790	370299	TRUE	15	GTGGGAGAATCTGTGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSMSWLLFTLTRGIIRRVGWNLIISSFLKTALKTVGLRAFSMSSRRCFTCWGTRITKLRLWESCSRPTLAFKVGSVKWATGYFLLVIMGTFISEDLK	364190	375483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_364265_364334_364699_365778_365997_370206_370349_370542_370749_373395_373528_375276
739398	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_113752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	15	347	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14423	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
739402	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739406	SIRV6	+	389	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	486	3	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTAATAGTGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
739408	contig_16103_pilon	+	1801	5	Intergenic	novelGene_118938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	40.0281151192509	76	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	305	817	808998	809684	TRUE	15	CTAATTCCTCAGTCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDEDEDDEEEEEGGGATWGYGSPRFGDPQPPEEFGFSFSPEGGMRFHRNFGFDDLIRDFNSIFSEMEAWTLPSRPPELPGPESETAGERRRREETLRDSMLKYPDSHQPRIFGGVLESDAGTESQKPGPDWGSQRPFHRVSIPSCPEMRTCVQRLESLLESDRLELES	808299	810937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_808579_808972_809233_809406_810322_810437_810529_810681
739409	contig_1275_pilon	-	786	2	Intergenic	novelGene_108818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	265	675	747710	747300	TRUE	25	GATATGGGAAGGCGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGFHLQGDGLSR	747974	746547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_746634_747274
739411	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
739412	contig_854_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_36088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTGTCCTGGATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4212	2940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_2900_4200
739419	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739424	contig_12622_pilon	+	1831	10	Intergenic	novelGene_5874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	57.5495492361491	283	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	283	1047	1221335	1227304	TRUE	25	CACCTTGAGTTGCCTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWALDVAFVWKAVLTLGLVLLYYCFSIGITFYNKWLTKSFHFPLFMTMLHLAVIFLFSALSRALVQCSSHRARVVLSWTDYLRRVAPTALATALDVGLSNWSFLYITVSLYTMTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGHRTASAGSWEPLPWRDSRLRFGLLRVPSGLPNL	1215033	1229635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1215082_1221100_1221455_1221992_1222144_1222950_1223015_1223758_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227200_1227336_1228537_1228668_1229012
739428	contig_7733_pilon	+	2230	9	Intergenic	novelGene_147130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	53.668979634422	23	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	69	902	88179	107305	FALSE	85	ATTAAAAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPRCAESSGLCLAFGPGRKSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86732	108633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_91178_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_100923_101033_106056_106176_107194
739436	SIRV6	+	354	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2874_10721_10819_11031_11109_11205
739437	contig_2703_pilon	+	1801	12	Intergenic	novelGene_101816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	15.3757348813153	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	39	1568	1112069	1144948	FALSE	65	TGTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVEASGSPGRDMDLDVITKYSALHAKPGGLILQYGTAGFRTKAEHLDHVMFRMGLLAVLRSKQTKSTIGVMVTASHNPEEDNGVKLVDPLGEMLAPSWEEHATCLANAEEQDMQRVLIGIIEKEAVNLQQDAFVVIGRDTRPSSEKLSHSVIDGVTILRGQFHDYGLLTTPQLHYMVYCRNTSGQYGKATIEGYYQKLSKAFVELTKQASCSGDEYRTLKVDCANGIGALKLREMEHYFSQGLSVHVFNDGTKGKLNHLCGADFVKSHQKPPEGMEMKSNERCCSFDGDADRIVYYYRDADGHFHLIDGDKIATLISSFLKELLLEIGENLNIGVVQTAYANGSSTRYLEEVMKVLFSKVAEMKIKQLAKELEDNKRKVAKMLENIIDLFNQAAGDAISDMLVTEAILALKGLTIQQWDALYTDLPNRQLKVKVADRQVINTTDAERQAVTPPGLQEAINGLVKKYRLSRAFVRPSGTEDVVRVYAEADSQESADSLAHEVSLAVFQLAGGVGERPQPGF	1111230	1145181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1111267_1112066_1112273_1113658_1113844_1115799_1115868_1131020_1131155_1132005_1132202_1134417_1134576_1135866_1135951_1141092_1141207_1142192_1142316_1143687_1143862_1144858
739440	contig_8907_pilon	-	644	5	Intergenic	novelGene_85802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179870	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178855_179391_179544_179839
739446	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739449	contig_5018_pilon	+	1264	5	Intergenic	novelGene_46937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	87.0660668687865	570	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	304	702	267545	268218	FALSE	50	AAGAACAAAATGCTAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAASSRASRSKRGGEERVLEKEEEEDDEDDEDEDEDDVSEGSEVPEGDRPAGAQHHQLNGERGPQSVKERVKEWTPCGPHQGQDEGRGPTLGSSTRQAFSMAAMNKEGGSASATTGPDSPSPVPLPPGKPALPGADGTPFGCPSGRKEKPADPVEWTVMDVVEYFTEAGFPEQATAFQEQEIDGKSLLLMQRTDVLTGLSIRLGPALKIYEHHIKVLQQGHFEDDDPDGFLG	266842	268780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_266879_267277_267576_267662_267760_267862_267975_268059
739452	contig_19459_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_59821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7119	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6700_7100
739458	contig_5860_pilon	-	1535	3	Intergenic	novelGene_147960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	526	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACTTCCGCTTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156873	153700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_-_153906_154302_154651_155891
739459	contig_6871_pilon	-	2391	9	Intergenic	novelGene_21588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	632.748172656389	12	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	412	1608	307935	286074	TRUE	40	AAGCACATTTATACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNSSSCPTPGGGHLNGYPVPPYAFFFPPMLGGLSPPGALTTLQHQLPVSSYSTPSPATIETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKKKKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKGACLDILILRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGAAQEGLCFLRSAGPGAARQGGHAAGATAGGTEGLCAETEAQPPPYVPQDADEDHRPAKHQC	320479	284434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_285216_286071_286259_287596_287802_289144_289322_289596_289758_291807_291950_293236_293386_307757_308306_320438
739468	contig_18108_pilon	-	1294	9	Intergenic	novelGene_33517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	346.445071403823	39	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	160	1086	297156	266909	FALSE	20	GTTAGCCAAGTGTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335422	266700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_287482_287588_289291_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
739469	contig_14341_pilon	+	2714	4	Intergenic	novelGene_111784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	7.78888096369861	411	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	83	661	334351	344334	FALSE	30	GGTTACAAGTGATAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSWSPEQRLRPLGRRAGAGCDGDYDEGRGVPEGTARAPVSFEDMAVTFSWEEWGCLEPAQTALYRDVMLDTCGHLVFLGLLLSKTDVISRLEQEDPWWVEQGRPRDWKTTLGKKQSASEEDIAGEEPSYSMEMKCCTWEEDPWSVSLGEVQDWREQLGKCQEDSVSEMVLTSERLLKGNAGTVNLGEVMV	334268	346387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_334465_336870_336998_337529_337611_344077
739472	contig_6691_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_60151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTTTGCGTCCGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330016	330671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_330000_330700
739474	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_95760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739481	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739483	contig_6159_pilon	+	1936	13	Intergenic	novelGene_128236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	76.2178894136191	420	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	76	1794	27886	45745	FALSE	15	CTAGCCTCAGCATCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLVSLAAPQCCVTPKCHSPSLSCWMSRAMKKRYAVLGLVAVVLVALITGLCIWLPSSSQHPNHVYPRAAVATDAKRCSEIGRDALQDGGSAVDAAIAALLCVGLMNAHSMGIGGGLFLTIYNNTMRKAEIINAREVAPALAFASMFNSSEQSQEGGLSIAVPGEIRGYELAHRRHGRLPWARLFQPSIQLAREGFPVGKGLAAALERSRGTIERHPFLCEVFCRNGKVLQEGERVVMLRLASTYETLALEGAQAFYNGSLTAQIVQDIQAAGGIVTAEDLNNYRAELIEHPLNISLGDSVLYMPSAPLSGPVLALILNILQGYNFSQASVETPEKKGQTYHRIVEAFRFAYAKRTLLGDPKFVNVTEVVHNMSSEFFAAQLRARISDDTTHPISYYEPEFYTPDDGGTAHLSVVSEDGSAVSATSTINLYFGSKVRSMASGILFNDEMDDFSSPSITNQYGVPPSPANFIQPGKQPLSSMCPSIIVGRDGQVRMVVGASGGTQITTATALAIIHSLWFGYDVKQAVEEPRLHNQLLPNTTTLERHMDQAVTAALESRHHYTEVTSTFIAVVQAVVRTASGWAAASDSRKGGEPAGY	27810	45887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_27894_34604_34770_36106_36238_36396_36484_39342_39536_39901_40060_41556_41707_42111_42249_44448_44637_44892_45021_45104_45218_45286_45401_45598
739484	contig_11908_pilon	+	1548	15	Intergenic	novelGene_133229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	104.885968206098	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	433	1446	752854	837058	FALSE	50	GGCTGTTAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAGAASVELVIGWCIFGLLLLDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSHGLAALSFSISSLTLIGMLAAITYTAYGMSALPLNLIKGTRSAAYERLENTEDIEEVEQQIQTIKSKSKDGRPLPARDKRALKQLEERLRTLKKRERHLEFIENSCWTKFCGALRPLKIIWGIFFILVALLFVISLFLSNLDKALHSAGIDSGFIIFGTNLSNPLNMLLPVLQTVFPLDYILITVIIMYFIFTSMAGIRNIGIWFFWIRLYKIRRGRTRPQALLFLCMILLLIVLHTSYMIYSLAPQYVMYGSQNYLIENNTTYDDHKGNSTISVPKRCDADAPEDQCTVTRTYLFLHKFWFFSAAYYFGNWAFLGVFLIGLIVSCCKGKKSVIEGVDEDDSDLSDDEPSVYSV	692443	837160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752803_752878_783983_784110_788412_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_836668_836761_836941
739487	SIRV6	+	534	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1761_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739489	contig_8357_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_39708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTGGTTCCAATCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473583	476095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_473600_476100
739490	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1484_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739491	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV410	950	2	0	1120	0	-1120	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCAACGACGAGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455	1651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_1500_1700
739492	contig_3386_pilon	+	1078	7	Intergenic	novelGene_34511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTACCGCCGTCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404012	412211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404260_404694_404942_405103_405188_405424_405466_407702_407838_409398_409609_412097
739497	contig_11548_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_66758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	379	708	92019	92348	NA	40	CACCCAGCATATGTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARTGKQFHARTELHSPSGRSKDGAWSQVLEQKEVVRGKEEIKRSGEKQLQQPTNGTQGVGQCSRVESKQPVLPGQETVAVASRGGQVGGVKVYIASNQLFCLLLEAP	91640	93569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_91600_93600
739500	contig_9460_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_155310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACTTTACACATACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80691	80378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_80400_80700
739501	contig_9460_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_155309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTTAATAGACTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80427	78922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_78900_80400
739502	contig_9460_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_155308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGAAAATGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77488	76574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_76600_77500
739511	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739517	SIRV4	-	349	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	15	1157	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
739520	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739521	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739522	contig_8322_pilon	-	2196	2	Intergenic	novelGene_143283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	0	88	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	28	423	569032	565001	FALSE	35	CCTCCACCCCTCAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGW	569059	563227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_565192_568827
739524	contig_11855_pilon	-	877	6	Intergenic	novelGene_66901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	286.500541011706	93	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	277	735	738197	733972	FALSE	10	CCATCTCTTGTGCTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCSRLEWSLHVSAPHRKQRVGRSIPSSFLVPAPCRSPTGSALPRDPCRVPSAPLGICTGAAASGPGRAEAAEKPRVPWRLAEGPARPVAARTMANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738701	733829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071_738202_738329_738515_738614
739528	contig_3825_pilon	+	394	4	Intergenic	novelGene_77964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1676	junction_3	807.909373355425	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	74	346	14814	15603	FALSE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	14430	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_14471_14780_14912_15231_15302_15498
739529	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739530	contig_4232_pilon	-	1064	8	Intergenic	novelGene_63465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	38.513183536582	4	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	110	1063	569910	561604	FALSE	20	AGGTAGTGGGCAGGGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGSAGQPGPAERSHRSSVSSVGPRAADVVVYLADDTMVPLALENLPALSAHELHRTIREVLQLPDIAVDAFALWLVSPLLEVQLKPKHQPYKLGRQWPELLLRFTDAPDEDVAMDEPSLQFRRNVFFPKWRELQIRDEDVLRLLYEEAKGNVLSARYPCDIEDCEALGALVCRVQLGPYQPGHPAACTLREKLDSFLPAHLCKRGHGLFAALRGRGTKAGTGEQGLLNAYRGVKEVVGSDSEHEHLLSTHYRAYLFKCHELPFYGCAFFHGEIDKPAQSFLHRGGRKPVTLAISLEGVHVIDSREKHVLLGLRFQELSWDHTSLEEEEEPVLWLEFDGESEGMPVNKLLKIYSK	571587	561602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_561748_562529_562654_563946_564172_565557_565725_565837_565897_566187_566290_569777_569946_571513
739531	contig_6138_pilon	+	1158	3	Intergenic	novelGene_159686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	229	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGATGTAGTGGTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568754	577430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_569598_575309_575528_577333
739533	contig_8317_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_20750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAATTCTCTCACTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115585	117814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_115600_117800
739536	contig_6710_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_93456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTCTTTGTCTGGTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
739538	contig_5084_pilon	+	2116	6	Intergenic	novelGene_64522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13.7840487520902	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	129	851	414204	415333	TRUE	25	TAGTATCCAACCCATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCQPPSVEASLPTSVPGGVRLFTDTSFPGGPGEFYILAFFVMALVHKLLNGVYILRKCQMPSAASCLFVGPHFADYCSSSLQKPMVAPGKAGSPQRKTERDLQGHPQREVDLDIISPEEKPEVSFDKAIQDEIKDRFRRLKEDFVNHWIGPEGRPLHEVLLEQAKVVWQFRGKEDLDKWIVTSDKTIGGRSEVFLKMGKNNQSALLYGNLSSEAPQDGESGRSGYCAMISRVPRNSFPCTEKSQRWYRELPCTPQPVSPVGIFLHCSMSLTAKKAALIHHC	413498	422332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_413553_414129_414783_415189_416110_418442_418629_419727_419803_422104
739541	contig_7078_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_130146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACACATGCTAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242533	239744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_239700_242500
739546	contig_10711_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_118435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1389	1712	776495	776818	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWSLELDLSLSASSKIPGCMTLVSYFKLAGPPFPHFNNNAIFQDFVRFQENISESVQHIVPAAVESILAHGDPMCVTVELCSTGLLMVDFLEGDCQAFLPRQLWMD	775106	777603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_775100_777600
739551	contig_4754_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_35965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	1437	1991	406267	406821	NA	45	AGCCTAGCAGGATGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSKCHCYRGCKNSVEVASDFRSLHEGGRRIKINSPRLIPIRQRSDMPSLSTIFTNLDTNVPSHGTLYVSAEFDNLLQWLHNSQTVLMIMGLIRGVTSYSSGSGTLRIQLFHQDSLISAVLTGTPLSGPRPLPCSGKCYRAPLAPANKSSEAPQSLSFLTPWGRKPTVQSPAVLSCWSSYHSL	404830	406997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_404800_407000
739553	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739554	contig_3789_pilon	+	2171	7	Intergenic	novelGene_79849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	293.36477104262	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	171	476	445610	464084	TRUE	40	AAATAAAGTTTTTTGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGWEASRLFVHAPL	445439	473600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464043_464101_465797_465913_467056_467110_468585_468699_472202
739561	contig_9653_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_48221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATATTCTTACAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515438	513774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_513800_515400
739562	contig_9955_pilon	+	2123	2	Intergenic	novelGene_21339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCAGCTCCCTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82973	85540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_83754_84197
739569	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_95010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739571	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739574	contig_5419_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_15522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAATAAATTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260638	262378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_260600_262400
739577	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_96510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739580	contig_10183_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_169507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACTTGCAACCATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63653	62758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_62800_63700
739581	contig_12864_pilon	-	830	8	Intergenic	novelGene_76451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	675.839342097314	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	174	683	251873	242831	TRUE	25	TATATAAGTTGTCCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252159	242486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242566_242762_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
739585	contig_1861_pilon	+	2458	2	Intergenic	novelGene_77669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTTCCTGTGTCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96539	99084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_+_96828_96914
739587	contig_3122_pilon	+	2649	2	Intergenic	novelGene_64399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	2	481	409328	412387	FALSE	35	TATATAACTGGTATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALSVFGITRRGLMWIVSGAPRRQFWFPSRKEKEPVLAETVEEVKKEPILACPPLRSQTYIPPDDLQSRLESCVKEVFGPSVPRNWQDISLDDGYLKFSLLAHLADDLGHAVPNSRLHQMCRVRDVLDFYNVPVQDRSKFDELMANNLPPNLKISWGY	409326	414555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_409420_411999
739591	contig_6710_pilon	-	494	2	Intergenic	novelGene_98033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739592	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	10	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739604	contig_14208_pilon	-	1471	4	Intergenic	novelGene_129114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAGTAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343207	337872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_338972_340393_340536_340674_340746_343048
739608	contig_10196_pilon	+	968	9	Intergenic	novelGene_132154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	432.974865754353	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	447	677	1046427	1050210	TRUE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGLRAHRPPEPRRPRSLRSPQPGSSPAGSPVPSQTVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTRKCTVVMNTPSTTSSLPATWSPTTPPFRRNWPGPRRSTGSGSPQCRPPLQRSSPTTPSCE	1034565	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038325_1039048_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046978_1047083_1050131_1050212_1050506
739609	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739616	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	51	490	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
739617	contig_14727_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_56625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	626.555015541333	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46210	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47480_51179_51531_54130_54263_55134
739621	contig_15384_pilon	-	2469	18	Intergenic	novelGene_85136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	57.4232148659088	2	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	112	876	126551	123213	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMKTSPGSTAACCLWGAGRLTARE	127813	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127733
739622	contig_9698_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_82511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGTGTGCCTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270759	272669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_270800_272700
739623	contig_14176_pilon	-	2145	14	Intergenic	novelGene_74829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	158.214632137755	459	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	458	1723	229160	223438	FALSE	5	CCACGTCGTTGTGCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRDKSKKKKKVKVKTEKKSTPSRGSSSKSSSRQLSESFKSKEFVSSDESSSGENKGKKKRRRSEDSEEEELASTPPSSEDSASGSDE	232571	223015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_223762_223950_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229252_231305_231369_231790_231966_232443
739624	contig_18869_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_56137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGCACTACCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
739633	contig_9011_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_159356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAGCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767594	767831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_767600_767800
739636	contig_8865_pilon	+	2705	3	Intergenic	novelGene_164466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1293	1874	435287	435963	FALSE	85	CATAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAVEATKDQQQQRTCNNREAAVADNLQGQRSGSGREPTAAEPADQREMVLEPTHGARELSACAYGASRQSGVPPGTYRWSCRALEHLLQQDRCGREAQGLRGHRKQKLKRPGTQEAELPQSQKCLTLLLRLIFNEIQMKRCLVTRTLKVAGVREKTTESHFKPEPFTTSQKQGGNGIINSVRTKTQDIQVK	426763	436794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_426846_434076_435471_435565
739637	SIRV6	-	237	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031_11111_11215
739642	contig_12000_pilon	-	1266	7	Intergenic	novelGene_43162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAACTGGCAACTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669837	416858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_416969_484074_484221_488474_488596_490220_490305_490629_490685_558468_558606_669224
739645	SIRV4	-	213	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1305	3	1305	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3853	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
739646	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739649	SIRV6	+	543	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1626_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739650	contig_12074_pilon	-	3061	1	Intergenic	novelGene_53781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64167	61106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_61100_64200
739651	contig_11574_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_64039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACCAAGGTATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310901	313312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_310900_313300
739661	contig_6217_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_109602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAACAACAAGGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347163	346426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_346400_347200
739664	contig_19816_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_156465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATAGACAATACCTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55740	53609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_53600_55700
739666	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
739668	contig_7411_pilon	-	1501	8	Intergenic	novelGene_137044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	120.248382398217	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	6	1499	889390	868273	FALSE	65	AGAAAAAAGGAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAQMRKQCLDYHYKEMELLKETFKEYLIELFFLQHFQGNMMDFLAFKKKHYAPLQAYLRQNDLDIEEEEEEEEEEEKSEVINDEQQALAGTLVAAAGNVIDVDPFQRQQALPPAGEQCKRPRLEVGHQGVVFQHPGVNTGVPLQQLMPTAQGGMPPTPQAAQLTGQKQSQQQYDPSTGPPVQNAASLHTPPPQLPARLPPASAPAATPSSALQFSQQPPMVESQTQLQIPVKTQQPPVPVPVPPSSQFPTPLQQPTQPALHVPVPGKAHMQVSQLPSQPQTVALTRPPVDAAQPCQRPLPTSSSTSSLTPVGSAVLGPSPARASPVNRPSSATNKSLSPVASRSPGAAALTPLKAQSPAQNASTSQDSSQDKLAEQMTLENQVQQRVAELRKEGLWSPRRLPKVQEAPRPRAHWDSLLEEMQWMATDFAQERRWKVAAAKKLVRTVARHHEEKKLHEERGRKEEQNRLRRIAASTAREIEYFWSNIEQVVEIKLQVEL	889395	868270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_868303_870011_870153_870891_871078_871881_872179_874669_875056_875879_875988_877599_877694_889138
739672	SIRV4	+	219	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1552	632	1097	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
739682	contig_5585_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_143064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAGCAGCTTGGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375497	377696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_375500_377700
739686	contig_11656_pilon	-	2155	8	Intergenic	novelGene_53968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_7	404.196204124397	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	407	1915	224380	157896	FALSE	60	GAAATTTGAGCAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNRDKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGMWICQICRPRKKGRKLLQKKAAQIKRRYANPIGRPKNRLKKQNTVSKGPFSKVRTGPGRGRKRKITLSSQSASSSEEGYLERIDGLDFCRDSSVPLKFNKKTKGLIDGLTKFFTPSPDGRKARGEVVDYSEQYRIRKKGNRKSSTSDWPTDNQDGWDGKQESEERLFGSQEIMTEKDMELFRDIQEQALQVKSNVQVGQ	227396	157655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_158045_160484_160802_162123_162260_164495_164578_165175_165292_169387_169497_223780_224705_227314
739694	contig_9753_pilon	-	628	7	Intergenic	novelGene_41333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	341.495241548107	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	38	514	93294	70212	TRUE	40	AAAACCTTTGATTCAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRDLNRKRNQVKNCKARIELLGSYDPQKQLIIEDPYYGNDSDFETVYQQCVRCCRAFLEKAT	93331	70010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70019_70105_70290_70452_70559_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
739695	contig_9535_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_124489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGAAACGAATTGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380890	381208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_380900_381200
739701	contig_6589_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_25775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	2113.18414957145	12676	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	223	585	669670	672560	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTRAGGKCSLLEGPP	668303	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672519
739706	contig_13292_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_142928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1520	1834	77894	77580	NA	25	TCCAAGGAGCGACTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSLIILPSKEHSGCTSCKTDLFVPLAVHGIVNILHQHHNLNASTLLQSSLFTVQLLHAYEATKNVMAWVRYTLVLKVTSLLFNSFKRSLAADLPNAMRHLIS	79413	77153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_77200_79400
739716	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739718	contig_9706_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_20821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTCCGCTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1807	2033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
739720	contig_9706_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_20862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATATGTCTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2440	2737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
739724	SIRV1	-	219	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3883	2	3609	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6757	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739730	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	8	1157	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739733	contig_6031_pilon	-	1052	5	Intergenic	novelGene_56735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAAAAAAAAGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163580	156773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_157314_157966_158046_158979_159142_161846_162026_163488
739734	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739742	contig_7066_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_42184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACACACAAAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989088	987556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_987600_989100
739747	SIRV6	+	336	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	536	-1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
739749	contig_7308_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_159634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	619	1122	756113	755610	NA	45	GTATAAGTATAACCAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQPFQEVAYDQEPMVPKEEIQAELRYWRKNKAAGIDRISIEMFQQTDAVLEVFTHLCQEIWKTATWPTNCKRSIFMPVPKKGDATECGNYQTISLMSHESKILLKIIQKWLQQYINRELPEIQAGFRRGHGTGISLLVSDGSWLKAENTRNLCFMDYAKAFDYGS	756731	754426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_754400_756700
739750	contig_401_pilon	-	2510	15	Intergenic	novelGene_42726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.3795003395828	272	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	40	1716	156146	103473	FALSE	0	GCCTTTGTGTTCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGRRRGPGSASAMLPYTVNFKVSARTLTGALNAHNKAAVDWGWQGLIAYGCHSLVVVIDSNTAQTLQVLEKHKADVVKVKWARENYHHNSGSPYTLRLASADVNGKIIVWDVAAGVAQCEIQEHVKPIQDVQWLWNQDASRDLLLAIHPPNYIVLWNADTGTKLWKKSYADNILSFSFDPFDPSHLTLLTSEGIVFISDFSPSKASLALKAFLLHQPWNGQCTLDISQVDYPENEEIKNLLQEQLNSLSNDIKKLLLDPEFTLLQRCLLVSRLYGDESELHFWTVAAHYLHSFSQDKSAAPRETVNNPLDICYDILCENAYFQKFQLERVNLQEVKRSTYDHTRKCTDQLLLLGQTDRAVQLLLETSADNQHYYCDSLKACLVTTVTSSGPSQSTIKLVATNMIANGKLAEGVQLLCLIDKAADACRYLQTYGEWNRAAWLAKVRLNSEECADVLKRWVDHLCSPQVNQKSKALLVLLSLGCFSSVAETLHSMRYFDRAALFVEACLKYGTMEVNEETDKLIFAVYADYARSLKNLGFKQGAVLFASKAEAAGKDLLNELECPKEERMDE	156185	102678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_103629_104959_105042_105765_105912_106335_106434_106920_107087_107606_107703_108434_108589_109388_109455_110558_110622_111749_111825_147509_147559_148926_149101_150029_150184_154922_155035_156060
739753	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
739762	SIRV2	-	354	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4519	34	3344	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
739763	contig_7066_pilon	+	1740	3	Intergenic	novelGene_42153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCGACTGCGCAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748418	757861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_749219_753475_754283_757728
739766	contig_6445_pilon	+	2498	6	Intergenic	novelGene_77088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.8108068652589	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	409	1416	918855	921649	FALSE	40	TATATTTATAAACTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYRTGPTSTLNPVTYYTALHIAVLRNQPNMVELLVRHGADINRRDRIHESSPLDLASEEPERLPCLQRLLDLGADVNAADKHGKTALLHALASSDGVQIHNTENIRLLLEGGADVKATTKDGDTVFTYIIFLLGETVGGDKEEAQLINRFCFQVTQLLLAHGADPSECPAHESLTHICLKSFKLHFPLLRFLLESGAAYNCSLHGASCWSGFHIIFERLCSHPGCAEDDSHVDLLRKAETILDLMVTNSQKLQLPENFDIHPVGSLAGKIQALHFSLRQLESYPPPLKHLCRVYIRLYLQPWPVDVKVKALPLPDRLKWYLLSEHSGTLQDDI	916900	922731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_917166_918711_918892_919925_920033_920135_920245_920763_920851_920981
739767	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_96279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
739770	contig_9225_pilon	-	1972	2	Intergenic	novelGene_160162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	21	440	47449	39181	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARPPAMQAPKEETAAVLQGAGVGEEKEDVSQQAKERLNKTGNRQDNLGSTGCSKIRTMDLKFNNSRKYISITVPSKTQAMSPHIKSIDDIVVLGINLSRFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQVKKKWSCGCNVFIITVEVTL	47469	37648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_39535_47383
739771	contig_846_pilon	-	1592	5	Intergenic	novelGene_136108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	42.8427356736238	571	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	96	467	220442	217175	FALSE	15	GTACAGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSRQGGDSAVIRGFSLRLSSSPGISTISHVMDLAGTCSTFQSDLDFCPDCGSVLPLPGVQDTVTCTRCGFSINVRDFEGKVVKTSFVFHKLGTTVPSLVEEGPEFQGPVIDRRCSRCGHEGMAYHTRQMRSADEGQTVFYTCTNCKFQEKEDS	220739	216049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_217200_219682_219793_219984_220086_220306_220458_220659
739774	contig_4103_pilon	-	2511	3	Intergenic	novelGene_51949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1332	1655	105659	105336	TRUE	25	CCCAATTCCTGAGGACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSECTQARGTLEFIVSCWGLGSPRSRKGFPSSIRFSIWGSSSGRGALISRLQLRSSTLSLAGSPLGTCSSPANDRLRELNVLGQTHLGPPGFAVARSAFWLRSRR	107202	104394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_104501_104585_106300_106511
739779	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739782	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_89247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
739785	contig_13607_pilon	+	1968	1	Intergenic	novelGene_170198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGAAAGGAAGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299239	301207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_299200_301200
739786	contig_13607_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_170199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAAAAAAAAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301456	301893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_301500_301900
739792	contig_3789_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_79863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGTTCCCCGGGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498572	497895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_497900_498600
739793	contig_3601_pilon	-	1216	2	Intergenic	novelGene_132892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGTTAAATGAATGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188374	180160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_180639_187636
739795	contig_12270_pilon	+	365	2	Intergenic	novelGene_113499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13847	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
739796	contig_7356_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_60346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACGCTGTTTCATCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69914	71850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_69900_71800
739800	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739802	SIRV6	+	527	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1711_2763_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739809	contig_3602_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_60674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAATTCATCTCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118058	1119917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1118100_1119900
739811	contig_14357_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_121692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613780	614798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_613800_614800
739818	contig_15500_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_128991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTTCACTTTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234035	233496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_233500_234000
739826	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_89259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
739829	contig_6062_pilon	+	2079	6	Intergenic	novelGene_5265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	188.64251906715	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	948	1880	662655	726134	FALSE	30	GTGCCAAGCACTATGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKGRIGYFP	660729	726333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918
739831	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	34	3257	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
739832	contig_10904_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_22763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	254	580	660821	661147	NA	35	GAGATAACAGGACTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASILALLQDLVSLDPISTRGDPEPTPEQIIWMWDWAGDLHLLPGCTGSLGDHPSREDFVCIIALILAPVKWFTWPRVKLGLCSLSRRCWEGRVRAVHSWLEQTCQS	660567	662603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_660600_662600
739837	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739842	contig_15905_pilon	-	1559	12	Intergenic	novelGene_154714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	84.0252815162454	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	8	1309	294450	270542	TRUE	30	TTGTGCATGGTACATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSRRSGPQARDRLLFCALLLSMSRFVRGDGVGGDPAAALPHRRFEYKYSFKGPHLVQSDGTVPFWAHAGNAIPSSDQIRIAPSLKSQRGSVWTKTRAAFENWEVEVTFRVTGRGRIGADGLAIWYAENQGLEGPVFGSADMWNGVGVFFDSFDNDGKKNNPAIVIIGNNGQIHYDHQNDGANQALASCQRDFRNKPYPVRVKIIYYQKTLTVMINNGFTPDKNDYEFCAKVENMVIPAQGHFGISAATGGLADDHDVLSFLTFQLTEPGKEPPVPDIEISEKEKEKYQEEFEHFQQELDKKKEEFQKDHPDLQGQPAEEIFETVGDRELRQIFEGQNRIHLEIKQLNRQLDMILDEQRRYVSSLTEELSKRGAGVPGQPGQISQQEVDTVVNTQHEILRQVNEMNHQMKNQNAQNYHHFHHAYLQYTSLYL	294457	269985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_-_270196_270501_270624_278199_278271_278399_278594_280803_280937_281364_281424_282957_283082_287585_287686_288831_288894_289789_289898_289976_290132_294236
739844	SIRV1	-	249	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3847	8	3573	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6793	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739846	contig_15123_pilon	+	3062	9	Intergenic	novelGene_110900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1667	2056	122280	123894	TRUE	50	CTCCTGAAGAAGAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACSSTSPAENWNWQIGHWTQEMGGGELSGEETHTTDWDEDGDEEGEAGRGGEVSPQVAACRGRISMVKEPKHKWGIVHYPGHHCFGFGVGVVASVHGFGFGVGVVSVRCFRFGVDVVVLFPSRLAES	120613	137026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_122499_123723_123911_125957_126031_127855_128026_128268_128355_132320_132501_133830_133985_134771_134920_136847
739849	contig_16461_pilon	-	297	2	Intergenic	novelGene_139215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACACTCTCACCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948	432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
739851	contig_11396_pilon	-	1554	9	Intergenic	novelGene_71406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	91.1646004488584	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	66	1319	1648829	1644485	TRUE	5	CCCGCTCACTCTGGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGSVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGTLGASGSGSHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQGKGTRAVSLRLGDGAYRPARSRALSRAWAQHVPGQCSDGDQPHPCLSPPLPVSSPGLESGAICLGGCPGPGAAADGCVCVLVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAVWPASGGRGGCQ	1649982	1644120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644523_1644778_1645372_1645524_1645607_1646269_1646357_1646708_1646833_1647806_1647924_1648616_1648831_1649918
739853	contig_6710_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_98037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAAGCACAGCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653423	653886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
739854	contig_12270_pilon	+	233	2	Intergenic	novelGene_114144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13979	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
739855	contig_10235_pilon	+	1349	3	Intergenic	novelGene_46518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_2	1.5	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302643	304396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_302743_302923_302963_303185
739856	contig_2988_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_136549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAATAAAAAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121232	123878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_121200_123900
739857	contig_12250_pilon	+	1891	17	Intergenic	novelGene_80546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	70.0579001612238	2	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	97	1005	272853	275217	TRUE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWVS	265186	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_265230_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275223_275310_275447_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276165_276272_277117_277232_277503_277592_278250
739858	contig_6576_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_42345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCTGTTGAGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718749	718361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_718400_718700
739864	contig_10324_pilon	+	1541	9	Intergenic	novelGene_7839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	84.2784632928247	83	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	83	439	283476	286399	TRUE	15	TCCAAGGCCTCTCTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPAPDLC	283393	296547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_286382_286645_287031_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
739869	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
739871	contig_6227_pilon	-	1858	9	Intergenic	novelGene_49794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	93.045603738167	10	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	855	1328	1254536	1250367	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVVVDTAQIENKEAYAPQISLEGSRIVVQVPSTW	1308753	1249836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1291831_1292061_1292294_1292465_1308695
739872	contig_10011_pilon	+	1762	5	Intergenic	novelGene_68082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	122.989836978508	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	75	1658	322928	334123	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLVRPGLSFPIKRASEA	322853	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329075_334087
739874	contig_16204_pilon	+	506	4	Intergenic	novelGene_154486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCCAGCGCCATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197910	202360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_198073_198532_198686_200098_200258_202328
739877	SIRV4	-	263	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1258	0	1258	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3900	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
739878	contig_6902_pilon	+	1870	13	Intergenic	novelGene_135579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	535.167179227409	3	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1671	200	1870	460308	490145	FALSE	65	GAAATGGAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQR	434429	490145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434491_434545_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
739880	SIRV4	+	334	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAAACTGCACTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3638	3972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
739883	contig_6215_pilon	-	1526	5	Intergenic	novelGene_21228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTCCCTGCGGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513989	392108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_392166_469710_469785_493055_493223_503216_503392_512936
739886	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
739887	SIRV6	+	546	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	19	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739889	SIRV6	+	550	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	5	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
739892	contig_11978_pilon	-	2419	13	Intergenic	novelGene_62888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_8	85.6692606611159	20	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1128	2177	725816	721097	FALSE	10	GTGTGGTTAGTCTAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQFYHSCKQYGITGDNVRRELLALVKDLPSQLADIGAAAQSLGEAIDLYQACVGFVCESPTEQVLPMLRYVQKQGNSTVYRWRTGTEPSVVERPHLEAPPEQVEEDAIDWGDFGAEAASEGIDYGISAQAAGIDWGISLDSDSKEAGSDGIDWGDDAAVSQITVLEAGTQAPEGVARGPDALTLLEYPETRNQFIDELMELEIFLSQRAVEMSEEADILSVSQFQLAPATLQGQTKGKMVTMVSMLQDLIGQLTSLRMQHLFMILASPRYVDRVTELLQQKLKQSQLLALKKELMVQKQQEALQEQAALEPKLDLLLEKTRELQKLIEADISKRYNGRPVNLMGTSL	729800	720854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_721163_721268_721441_721813_722020_723327_723417_724025_724105_724509_724621_725025_725171_725394_725532_725771_726627_726994_727096_727351_727484_729505_729555_729765
739893	contig_15047_pilon	+	1764	7	Intergenic	novelGene_52282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	879	1298	82960	84024	TRUE	35	AGAGAACTGAAACCGCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRARNVLPTVFQVAAVPLLLSLGKPCGHPGLVGPIPTRQDTPRLLGVHAQRFPILKPGQCDFRGIEASSPASQDDVALHGLTEGHIHCCPLHEVSPRVQVAPQSFTNISLHMVTIILVFVPICIPGLLHFQCQCLGQ	77768	96191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_78385_82053_82174_82700_82839_82955_83232_83876_84164_84424_84688_96127
739896	contig_3975_pilon	-	1102	11	Intergenic	novelGene_54810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_10	239.88624387405	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	81	1100	2044892	2017482	FALSE	25	GAGAATGTTGCCCCATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGTKRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFEN	2052405	2017479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
739901	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739917	contig_7720_pilon	+	2691	1	Intergenic	novelGene_155746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1083	1580	279879	280376	NA	15	CGTTTGATGTCATTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDLSLLASGPSDRGACFVLQACAWGPSTAHPLTPPGPSLYSLGESGLACPCTPTASCGPSPRGPLSPENCVGFFWPQYLPSRLGPPRGCLRTVMLAVSLFTGREALAAQVPCLSPSSRGGRAGRRPLPGSSTSPITGLIRPCIYTRQRAQFRKSTACPSRSFQ	278796	281487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_278800_281500
739918	contig_15327_pilon	-	1829	11	Intergenic	novelGene_70812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	54.4925683006408	214	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	28	1230	1424222	1385609	FALSE	15	GCTAGTCTCTGTACTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRPAARLAMNAARTGYRVFSANSTAACTELAKRITERLGAELGKSAVYQETNGETRVEIKESVRGQDIFIIQTIPRAAGEFKLPAFQLAAERLTTVPPGLLALPLPPKSFLVMAAKWKVRDVNTAVMELLIMAYALKTACARNIIGVIPYFPYSKQSKMRKRGSIVCKLLASMLAKAGLTHIITMDLHQKEIQGFFSFPVDNLRASPFLLQYIQEEIPNYRNAVIVAKSPDAAKRAQSYAERLRLGLAVIHGEAQCTELDMDDGRHSPPMVRNATVHPGLELPLMMAKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVESFVAAAEILKERGAYKIYVMATHGILSAEAPRLIEESSIDEVVVTNTVPHEVQKLQCPKIKTVDISLILSEAIRRIHNGESMSYLFRNITVDD	1424249	1385009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1385768_1386657_1386805_1387609_1387681_1394969_1395116_1395941_1395998_1396454_1396571_1397903_1398077_1398519_1398652_1417083_1417151_1421389_1421443_1424139
739920	contig_18794_pilon	-	1772	9	Intergenic	novelGene_54652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.8427887186804	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	105	1004	353203	325647	TRUE	15	TGAGTTGTGTATGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTVTRSKAGWPRTLAAASPCRCVKLLLLLPFGFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404646	306128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_306860_325609_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145_353212_404550
739921	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_90378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
739924	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739926	contig_8658_pilon	-	1172	6	Intergenic	novelGene_55803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	540.407845983013	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	474	821	13178	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRNSPLHSWFCKKFWSLRKKGIPTSLQDSEVLRLRSPKWLHQLEMLRSCPCVTNVAPALCEHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55642	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6209_6696_6819_13112_13260_30045_30246_34547_34626_55528
739933	contig_4364_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCTACTGTCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533200
739934	contig_4364_pilon	+	136	1	Intergenic	novelGene_4560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533182	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533200_1533300
739937	contig_5832_pilon	-	1990	4	Intergenic	novelGene_134157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444535	439403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_440946_441236_441360_443490_443792_444511
739938	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
739941	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739948	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739950	contig_19402_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_80788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTAAAAAGTTGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28496	26785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_26800_28500
739951	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
739953	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739954	contig_9297_pilon	-	351	3	Intergenic	novelGene_69809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	425.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	32	349	234945	204324	FALSE	40	AGCTGTGCAGAACAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVA	234976	204321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_204441_228525_228662_234880
739955	contig_9297_pilon	-	1676	3	Intergenic	novelGene_69808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	23.5	139	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGATGCAGTTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202981	197752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_199281_202052_202143_202923
739959	contig_5480_pilon	-	2349	1	Intergenic	novelGene_107221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCATCACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59687	57338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_-_57300_59700
739960	contig_13968_pilon	-	1731	4	Intergenic	novelGene_106868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.6477806156434	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	489	1511	28659	27637	FALSE	25	AATAAATGGTGGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVINMTVSSASNNTCGDTIDDFRNQVYSTLYSVISIVGFFGNGFVLYVLIKTYHEKSAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVAYYVHKGIWLFGDFLCRFSTYALYVNLYCSIFFMTAMSFFRCVAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMRRSYKDEKNNTKCFEPPQDSQAKNYVLILHYVSLFFGFIIPFVIIMVCYTMIILTLLKNSMKKNLSSRKKAVGMIIVVTAAFLISFMPYHIQRTIHIHFLHNETQPCDSVLRMQKSVVITLSLAALNCCFDPLLYFFSGGNFRRRLSTFRKHSLSSMTYVPKKKSSMPEKGEEICIV	70227	27416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_28692_34419_34505_55640_55804_70019
739961	contig_5389_pilon	+	3002	18	Intergenic	novelGene_142994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_6	162.140739412285	221	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2250	30	2279	42660	91080	FALSE	10	GTTGGTGTGTATATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELEEPGKEMSAVPGSRERDSAGGSNFDSSRPNGKGVLGHEGSWAHDKPENVLTRQNKSKSEITDMVRSSTITVSHKAHILSMQKFGLRDTLVKSQVAQKEEDYTYLQNFRFFVGTYNVNGQSPKECLRPWLSHGIQAPDVYCVGFQELDLSKEAFFFHDTPKEEEWFKAVSDGLHPDAKYAKVKLIRLVGIMLLLYVKQEHAAHISEVDAETVGTGIMGRMGNKGGVAIRFRFHNTSICIVNSHLAAHTEEYERRNQDYKDICSRMQFYQVDASLPPLTISKHDVILWLGDLNYRIEELDVEKVKKLIEEKAFQTLYAYDQLKNQVAAKAVFEGFTEGELTFQPTYKYDTGSDDWDTSEKCRAPAWCDRVLWKGKNITQLSYQSHMALKTSDHKPVSSMFDIGVRVINEELYRKTLEKIVRSLDKMENANIPSVSLSKLEFCFQNVKYMQLQVESFTIHNGQVPCQFEFISKPDEVSYCKQWLNANPSRGFLLPDSDIEIELELYVNKTTAKKLNSGEDKLEDILVLHLDRGKDYFLSVSGNYLPSCFGSPLHTLCYMREPILDLPLETIRELTLMPVQTEDDGSRLENPMDIPKELWMMVDYLYRNAIQQEDLFQQPGLRSEFEHIRDCLDTGMIDTLSASNHSVAEALLLFLESLPEPVICHSAFHSCLECSGNYTASKQVISTLPTFHRNVFNYLMAFLQELLRNSAKNHLDENILASIFGSLLLRNPAGHQKLEMAEKKKAQEFIHQFLCNSL	42630	91803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_42700_67550_67648_69226_69395_71221_71324_73072_73188_74026_74144_75158_75347_77021_77134_79034_79145_80017_80154_81618_81730_83644_83808_84826_85063_86377_86492_88916_89002_89361_89490_90601_90714_90964
739964	contig_10159_pilon	+	3170	1	Intergenic	novelGene_30845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCCACAGTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619043	622213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_619000_622200
739968	contig_6946_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_59798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAAACACTGCCCGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457350	456656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_456700_457400
739969	contig_6946_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_59800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCCAATCTGGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462963	462122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_462100_463000
739970	contig_9797_pilon	+	1598	6	Intergenic	novelGene_65592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	397.415953378824	3	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	236	862	183892	191368	TRUE	10	GAGTTCTGCGTTTTCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172543	192151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191138_191606_191652
739971	contig_12299_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_29731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81462	83400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_81500_83400
739972	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
739973	contig_9482_pilon	-	1675	11	Intergenic	novelGene_44327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	122.186906008786	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	38	1660	1253164	1236365	FALSE	20	GGGTGGAACGAGATCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLPGSGFCCCIMASVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253201	1236349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240966_1241043_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
739974	SIRV6	+	544	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
739975	contig_13740_pilon	-	897	7	Intergenic	novelGene_34622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3099.25935596806	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161218	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_156090_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_161126
739979	contig_18869_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_56275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73657	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
739982	contig_7457_pilon	-	473	5	Intergenic	novelGene_31290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	33	443	160764	157884	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161040	157853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
739987	SIRV6	+	357	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGTTTATAGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	1953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1728_1845
739994	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
739997	contig_10235_pilon	-	810	6	Intergenic	novelGene_46491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	486.232701491786	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	12	473	222843	219405	TRUE	20	TATTGTACGGAAGGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	222854	217976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218211_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804
739999	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
740005	contig_10057_pilon	-	686	5	Intergenic	novelGene_162338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	43	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	64936	35399	FALSE	30	GAATAAGGCCTCCCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64958	35313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
740008	contig_10311_pilon	+	2155	8	Intergenic	novelGene_50392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	45.9982253428747	32	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	214	930	52491	62985	TRUE	45	AACTTTTAAGTGAATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFLKGASISTKPPLTKDRGVAATAGSSGENKKAKPVPWVEKYRPKCVDDVAFQEEVVAVLKKSLEGADLPNLLFYGPPGTGKTSTILAAARELFGPELFRLRVLELNASDERGIQVVREKVKNFAQLTVSGSRSDGKPCPPFKIVILDEADSMTSAAQAALRRTMEKESKTTRFCLICNYVSRIIEPLTSRCSKFRFKPLSDKSQQQRLLDIAEKENVNISNEVMFVLLPIPLTNA	50879	65121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_51081_52478_52622_56175_56255_59300_59381_61184_61305_62478_62623_62822_63712_64622
740009	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	67	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740010	contig_9738_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_169270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	353	697	221611	221955	NA	40	TGATTGAACACATTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSHWDLPSPFMPINLCHHWKNRVLDFPSGGSISLDTLTVAVPYGQLLHPRRIPTLLSQFFLGVGVGVGGQNRFQDDSFRNCPMLDFKFLENRCCVEWQRCPPEGCHLHCFLFV	221258	223010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_221300_223000
740012	contig_17274_pilon	-	1810	2	Intergenic	novelGene_26558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTCCATTTAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198942	195680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_196371_197822
740017	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740022	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	80	AAAAAGAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740026	contig_11413_pilon	+	1896	10	Intergenic	novelGene_103223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	63.9098516333943	586	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	656	1771	850968	853453	FALSE	5	CATCTGCTGTGGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAAWCSGCTRRRAWLPFTRQPCAHPRPGLYCSPPPRRRGACLQRRAPPSLIWAPSADGSIWSLELQGNLIVVGRSSGRLEVWDAIEGVLRCSSEEVSSGITALVFLDKRIVAARLNGSLDFFSLETHTALSPLQFRGTPGRGSAPTSPVYSSSDTVACHLTHTVPCAHQKPITALKAAAGRLVTGSQDHTLRVFRLEDSCCLFTLQGHSGAITTVYIDQTMVLASGGQDGAICLWDVLTGSRVSHMFAHRGDVTSLTCTTSCVISSGLDDLISIWDRSTGIKLYSIQQDLGCGASLGVISDNLLVTGGQGCVSFWDLNYGDLLQTVYLGKNSEAQPARQILVLDNAAIVCNFGSELSLVYVPSVLEKLD	849918	853578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_849971_850050_850250_850328_850445_850679_851214_851352_851439_852156_852240_852341_852509_852663_852745_852915_853123_853207
740027	contig_6272_pilon	+	2190	12	Intergenic	novelGene_160463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	252.319225853951	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	219	2078	214328	248604	FALSE	5	GACTTCGGTGTTTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRWEEYISKVKNKGNPLPDVAEIATFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRSKYLLVKEAKVIAMTCTHAALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPPVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRYKNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYMCLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGSNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLSLVRTRAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYVFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLHIIPTEPFPATRKNGERPSHEVQMIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTFLQLPPAMVEEGEGVQSQETELETEEETTPVHGDILPGSADASSSQEMSASETETTPDLAETIPGPAEATSNHTASSDPEATHPQAETTAAVAASVTAPTKAHAPQEATPTPAETTAAVAASVTAPTKAHAPQDATPAPAETTAAVAASVTAPTKADAPQDATPAPAETKEPNSNPS	210995	248716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_211075_211281_211418_214324_214535_216555_216694_219214_219287_220337_220526_220854_221027_227478_227650_239229_239316_242789_242965_245320_245435_248067
740029	SIRV6	+	231	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	861	-1	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11098	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11100_11300
740030	contig_9389_pilon	+	1417	7	Intergenic	novelGene_83905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	42	716	159587	167696	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILWAAWGGVARGVGPTLPWILARTEPPG	159545	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166159_167612
740031	contig_4071_pilon	-	2373	4	Intergenic	novelGene_151863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	14.3061758225833	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	187	2031	41442	33402	FALSE	30	CCCAGCGTGGTCAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAATWTVQAHADKDEVWEIKIEKEKYKYTTRKDQSLRKNNSYSREVFRQYFRQFCYQETSGPREALSQLRKLCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEEVQAWVQEQNPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVSVQTEEQEMFLQEMAPLQTEQEPSMSLQSMKAKLKCESPEPKAQQEKVSDVETENEYRNLILKQEVSEEMEPYGDISSRLESEMAAEYGETHEPKEKIEYPSGYSGEDKQLTCDDNGVNLTENSDLTEQQRIYPGEKPYECNNCRKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYRCEECGKTFCGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGCWSALNQHQRLHTGEKHYHCNECGKAFSQKAGLFNHLKIHTRDKPYQCTHCNKSFSRRSILTQHEGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHRKEKCYQCKECGKSFSQSGLIQHQRIYTGEKPYKCDVCRKAFSQRTSLIEHKRIHTGERPYKCDRCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDDCGKAFRQRSDLSKHQRIHSRDGPCKCKECGKSFRQNSALIQHQTIHKGGKSVPV	42521	33059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_34691_36666_36812_41031_41500_42392
740034	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740035	contig_10801_pilon	-	2615	4	Intergenic	novelGene_74069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_3	24.589970855344	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAGCAGCAGTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439918	386159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_388484_400613_400713_409916_410060_439869
740042	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	221	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740043	contig_20241_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_159732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGGCACGCAGAACAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195620	195349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_195300_195600
740050	contig_21343_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_170231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAGAGGAAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31310	33528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21343_pilon_+_31300_33500
740051	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_97616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740056	contig_15952_pilon	+	1456	4	Intergenic	novelGene_154035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	62.8720040152124	359	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	42	782	62239	64001	FALSE	15	AAGGCCTGGGCTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWARAWRLPHGGRGASRPSFPRVPVANSSSSGGGGGVELRPLPLSFTLLDGEAGRPALVFLHGVCGCKNNFNSVAKALARRTGRKVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQVMPHAPRWCAGLGPVKERVVTPGLTGTSQLPNPTGRSHAAVPAH	62197	64675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344_63519_63695
740057	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740069	contig_16091_pilon	+	1592	11	Intergenic	novelGene_112342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	323.918276730412	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	313	1194	14294	37985	TRUE	15	GCTTTGTGATGATTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVEHYSYKPDGLLRVLTVPCQKIGADNGNINFGARPQLSSSHSVTWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKTPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	1462	40710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_1548_1933_1984_3659_3729_12750_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912_38102_40428
740075	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740076	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740078	contig_4156_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_88112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGGGAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366707	368921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_366700_368900
740079	scaffold_19766_pilon	-	1207	10	Intergenic	novelGene_34291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_9	47.8286550815887	11	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	75	1205	444337	423860	FALSE	15	CACAGCACCTGCTGCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMAAKKGPGPGGGVGGGKAEAEVASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDITVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVIFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTSLVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGSASAPVQGSVPEGKPLRTLLGDPVPSLSAAASASNQSVSQSQARIAQPRSSQAPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQAAPAFAAFPAFAGQTPSHGGFANFDAFGSSPSSSTFGNIPPAGQAPFQAQPTPTASRMLTGSYSFGSSQVTPFGVSPLAPASQPNSLTDMSSILGPGVSAGGIPPHSVFGMAGPVPALQSATTGGSGGTGFAFGAFTNP	444411	423857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_423874_424063_424147_424376_424501_428662_428696_429374_429501_430421_430588_431159_431314_432416_432533_433377_433472_444116
740082	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
740083	contig_18869_pilon	-	427	4	Intergenic	novelGene_56419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_3	1442.53719382051	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	14	373	79419	74943	TRUE	35	TTTATTTTTTTAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79432	73745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73786_74928_74957_75486_75766_79352
740086	contig_6159_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_128259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCTTTCCCTCAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240141	239018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_239000_240100
740087	contig_6159_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_128258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCACAGCATCACTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239015	236915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_236900_239000
740088	SIRV6	+	552	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11052_11109_11205
740089	contig_2078_pilon	-	2433	7	Intergenic	novelGene_100155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.3036348447442	117	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	756	989	358028	352389	FALSE	20	TAACACTTTCCTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISVLSKGGASFSLSLTEEHSGSYHCTADNGLGTQHSYSVSLSVRVPVSRPVLTLWTPRTQTVVGDLVKLHCEAQKGSPPILYWFYHEDVTLGNISVLSGRGAFFNLSLTTEHSGNYSCEANNSLGAQLSHVVTLNVKVPVSSPVLTVRAPGAQAVVGDVVELHCEAWRGSPPILYQFYHEDVILGNSSVCFRGGVSFNLSLTIEHSGNYSCEADNGLGAQRSEAVTLSIRVFTGSRSGSVATQVTRGLLSMMGLAAVALLFCYWLLRKAGRKSTSDPTRSPSNSDPQEPTYHNVPAWIELQPMYSNGLLCHLLPGKGVINPGILSCS	367560	350944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_352454_356192_356276_357272_357301_357970_358088_361704_361984_365599_365879_367422
740090	contig_12080_pilon	-	2204	14	Intergenic	novelGene_128383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_13	211.647608205648	1	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	4	750	177526	171125	TRUE	5	TTGTACCTTTTGCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	177529	166317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_166955_168253_168412_168727_168808_169040_169100_169244_169335_170534_170600_170759_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
740093	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
740094	contig_10937_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_67343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	239	720	136	855	184616	183897	NA	20	AAGCCTTTTTCTTCCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLLALAFCNCAPETQGRHRCVMGYGRETDCSPPEASGCQECEGFGTLLARYQVSLPVSWTLVSGRHKTLRHSQRQRQLIIHSKGSGLSIAFLHQIPSPNSSRETQRESEGTCTCSRVWYMKGVEQLLVAIELIFNSRQLHVISRTAPQGFPGCNLYGRSPGLFPMEPLGGFKPPSFQLAANHLTFVPPGLLHRKPKSSTADKECVCFLLWRKACSQVAIQTSLKDSLEQRALIRCAET	184751	182163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_182200_184800
740101	contig_14876_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_170242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47863	49900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_47900_49900
740102	contig_8914_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_112880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATCCACTAGCCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268965	267868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_267900_269000
740107	contig_8354_pilon	-	2189	21	Intergenic	novelGene_24070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	120	junction_1	111.962895639582	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	69	2081	198044	65549	FALSE	25	GCAGTTATCTCATTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLWVTAARRRDFCCENYQWHFMMGDILAHESELLALVREYLDFAEFQDTLKTFSKECKIKGKPLSKAAGGAFRDSTSLIIQKDLIAAFDSGDQKTFFHLWKEHVPTSIRDGDALAQKLEFYLHIHFAIYLLKHSIGRPDKEELDERISYFKTYLETKGAALSQTTEFLPYYALPFVPNPMVHPSFKELFQDSWTPELRLKLEKFLALIFKASNTPRLLTLCKENGQSNKEMLQQLHQQLLEAERRSMTYLKRYNKIQADYHNLIGVTAELVDSLEATVSGKMITPEYLQSVCIRLFSNQMRQSLAHSVDFTRPGTASTMLRASLVPVRKLKDVPLLPSLDYEKLKKDLVFGSDRLKAFLLQALRWRLTTSHPGEQRETVLQAYISNDLLDCHSNNQRSVLQLLHSQSEVVRQYTARLINAFASLAEGRLYLAQNTKVLRMLEERLKEENKDVITRENVLGALQKFSLRRPLQTAMIRDGLIFWLIDILKDPDCLSDYTLEYSVALLMNLCLRSAGKNTCAKVAGLVLKVLSDLLGHENHEIQPYVNGALYSILSVPSIREEARAMGMEDILRCFIKEGSAEMIRQIEFIIKQLNSEELLDGVLESDDDEDEDDEEDHDTMEADLDKDELIQPQLGELSGEKLLTTEYLGIMTNTRKPIAKQRKGPAAVQWSADKPLRRPITPGGHRTGHPV	203446	65440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_65678_76088_76194_118879_118936_123405_123497_128310_128386_132891_132969_134289_134430_140151_140276_141483_141575_148518_148612_150588_150704_151641_151677_165443_165543_169664_169823_180117_180143_187891_187985_189565_189722_190261_190433_195734_195861_197990_198079_203412
740109	contig_12201_pilon	-	1288	8	Intergenic	novelGene_159972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	282.671367564556	977	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	152	682	138975	122405	TRUE	20	TTTTTGTCTTTCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLTVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQALCIFKVFKRTF	139126	110296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122444_124329_124453_130805_130980_132873_132971_138877
740113	contig_16098_pilon	-	1509	3	Intergenic	novelGene_45949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1286	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	966	1310	350530	348487	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVILGSPRTPCPGWRRR	351618	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348534_350232_350643_350765
740119	contig_8120_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_159721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCAGCAACAATATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72323	71726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_71700_72300
740122	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	14	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740123	contig_7720_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_155735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAGCAATATATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202414	200835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_200800_202400
740126	contig_2890_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_60299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGGGAAGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408758	407726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_407700_408800
740131	contig_13245_pilon	-	517	4	Intergenic	novelGene_148820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	121	480	26752	25454	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26872	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
740133	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
740134	contig_10642_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_78758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAACTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479634	1480211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1479600_1480200
740135	contig_8538_pilon	-	2291	17	Intergenic	novelGene_4614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	89.7892497741238	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	115	2118	742030	692579	FALSE	30	TTCATTTTAACTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKERRIRREEIMECKVMWEPASKKNTQMDRFRAAVGASCGLALDNYDDLYHWSVKSYSDFWAEFWKFSGIVFSCMYDEVVDTSKGITDVPEWFKGSRLNYAENLLRHKDNDHVALYVAREGKEEIVKVTFEELRQQVALFAAAMRKMGVKVGDRVVGYLPNSMHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGGTLIQHLKEHILHGNMGSNDIILYYTTIGWMMWNWMVSALATGASVVLYDGSPLVPTPNVLWDLVDRIGITILGTSAKWLSVLEDRNMKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPVWQLMMGSVSCHLTVRLLSPSHGPCALGDLGTGGLLMIYI	742144	692405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_692905_693724_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928_697994_702430_702556_703455_703537_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672_724787_729514_729636_730740_730845_741897
740139	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	55	ATTTGTGGAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740140	contig_16121_pilon	+	2101	5	Intergenic	novelGene_6860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	595	junction_1	263.684470532491	1	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	110	1516	57746	62826	FALSE	50	CAACAAAAATATCACGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33601	63411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
740144	contig_10367_pilon	-	1907	5	Intergenic	novelGene_169463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	105.005952212244	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	345	1181	136272	133502	FALSE	55	AAAAAAAAAACCCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYGVEWHSVRDSEGQRLLVGVGPEGISICTDDFNPINRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQVSRCTGLAQTPTWNLDFHPEGFFISHDSKGTAWETFRISILVQ	146873	132775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_134055_134895_135061_136153_136352_137635_137822_146794
740149	contig_12922_pilon	+	2386	10	Intergenic	novelGene_157777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	22.9093759446398	55	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	64	1017	73264	82854	TRUE	25	CACTTTGTATAATTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETGLLEAGASAASTVAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALNLFCYEDQEPVCLICAISHTHRVHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLDPLEQKLQDITRCKSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQMLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSISIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIAPYSGFSRQRT	70952	87609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_71009_73256_73717_75272_75369_79798_80030_81402_81426_81968_82085_82819_83008_83328_83397_86347_87367_87480
740150	contig_7202_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_17998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
740151	contig_5084_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_64574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACACTGCCCAGTCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689459	690017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_689500_690000
740153	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740159	SIRV6	+	349	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	409	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10691_10819_11031_11109_11205
740161	scaffold_9100_pilon	-	1625	1	Intergenic	novelGene_83308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACCTGGTGATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800142	798517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_798500_800100
740162	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91675	2	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
740164	contig_10861_pilon	-	1589	2	Intergenic	novelGene_39355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	704	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	258	434	1582879	1582703	TRUE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASKVLFLHPAGLKHILFFGGLKVAGNCDATAFCEFSLLFGSWESSIESIELDVIWCREEILFPAKCFCDWDAECCRLSKFSFEELMLTRNVIATFSPQVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVV	1583136	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626
740173	SIRV6	+	537	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740175	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740180	contig_13787_pilon	-	1994	9	Intergenic	novelGene_40607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.379683521758	6	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	306	974	205032	131430	TRUE	15	CCTGTTTCTGTACTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	205337	129684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_130127_130851_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
740181	contig_15327_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_70809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1778	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACTTTTCTAACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342565	1343325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1342600_1343300
740185	contig_7080_pilon	+	1427	10	Intergenic	novelGene_100093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	98	910	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLPCVAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460784	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540784_541879
740189	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	9	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740191	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	253	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740192	contig_5039_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_65043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGTCCTGCGCCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1802069	1813662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1803055_1813308
740197	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73588	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
740199	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
740203	SIRV6	+	234	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCGGTCTTACAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780
740208	contig_17274_pilon	+	1078	5	Intergenic	novelGene_26463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	257.79303714414	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	60	563	7027	31294	FALSE	65	GTAGAAAAGAAAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQLELVLHFLTGHDPRPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEVMIFK	6967	31809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_31277
740212	contig_19459_pilon	-	948	7	Intergenic	novelGene_59850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4358.85495922445	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	26	664	16240	6952	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIV	16265	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6954_7821_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203
740226	contig_15122_pilon	+	1419	1	Intergenic	novelGene_162701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAAATGGTGGAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451789	453208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_451800_453200
740228	contig_17427_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_30385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182983	185316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_183000_185300
740229	contig_19812_pilon	+	1858	10	Intergenic	novelGene_101011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGCCATGTTGGAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49158	67081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_50267_51992_52079_53252_53350_53733_53763_54056_54174_54364_54432_59829_59910_60110_60168_60346_60475_66992
740231	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_94384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740232	contig_17198_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_62361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTGCCGAGAAGATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763037	761756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_761800_763000
740233	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740236	contig_3410_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_58937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52732	52972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_52700_53000
740242	contig_8712_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_58831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTTCTCATTCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322748	323526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_322700_323500
740247	contig_3822_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_133333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATTTAACAAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315262	316654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_315300_316700
740251	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3143_10697_10819_11031_11109_11205
740252	contig_7457_pilon	-	1198	6	Intergenic	novelGene_31358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	146	junction_2	53.2826425771095	713	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	49	579	321520	317540	FALSE	10	CTGCCTGCCTTGGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPEVLTGRFRVPLALTMAMSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321568	316920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
740253	SIRV6	+	534	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740256	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740257	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	413	3	-243	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGTCAAAGACGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
740258	SIRV6	+	379	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	0	404	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740264	contig_6710_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_96001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
740277	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740280	contig_6102_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_31804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCAGTCCCTTTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360104	361097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
740281	contig_13901_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_146634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGGTACCTACAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144258	146839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_144300_146800
740284	contig_4686_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_118546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTATTGAGTGCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526670	525300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_525300_526700
740285	contig_6710_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_94968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740286	contig_5059_pilon	-	1356	14	Intergenic	novelGene_140702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	143.934526535484	595	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	481	1140	204379	166409	FALSE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231751	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_210468_210560_214153_214187_214730_214789_226820_226893_231639
740290	contig_4114_pilon	+	454	4	Intergenic	novelGene_15569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	127.2119840616	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	4	381	35412	44490	FALSE	5	TCAGTGCTTCCTGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELLFSCSLLPEGPQGMWGAG	35408	44563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_35571_35682_35788_35990_36046_44431
740293	contig_11756_pilon	-	1504	6	Intergenic	novelGene_106033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	52.7621076152195	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	80	562	139094	123559	FALSE	30	TTCAAACTGTGGCATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPGNETADVVLKKLDEQYQKYKFMELNLAQKKRRLKGQIPEIKQTLEILKYMQKKKESTNSLETRFLLADNLYCKASVPPTDKVCLWLGANVMLEYDIDEAQALLEKNLSTATKNLDSLEEDLDFLRDQFTTTEVNMARVYNWDVKRRNKDDSTKNKA	143991	122616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_-_123630_125741_125881_134431_134531_135912_135980_138987_139113_143930
740294	SIRV4	+	245	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1522	636	1067	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2522	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
740295	contig_6710_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_94852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTCAGGGTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
740298	contig_1309_pilon	-	2601	1	Intergenic	novelGene_73971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCGTTGCCACTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186866	184265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_184300_186900
740300	SIRV2	-	274	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	647	27	647	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4085	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
740301	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740303	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	7	1158	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
740305	SIRV7	-	280	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69000	0	35781	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
740307	contig_12119_pilon	+	1479	3	Intergenic	novelGene_88694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	639	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	166	348	423607	423789	TRUE	30	CATACTGATTTAATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNRKWYFRKNGQPCYNNY	417938	425006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_418054_423556_424802_424887
740309	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
740310	contig_723_pilon	+	1798	8	Intergenic	novelGene_169430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.162029569841	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	32	799	4670	18540	FALSE	55	GCTTAAAGAAATTAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HARRKETTVLMASADSQHSLRQELQQRDPTLLSVVVALLAVLLTLVFWKFIRSRRSSQRAVLLVGLCDSGKTLLFVRLLTGLYRDTQTSITDSSAVYRVNNNRGNSLTLIDLPGHESLRLQFLERFKASARAVVFVVDSATFQREVKDVAEFLYQVLIDTMGLKNAPSFLIACNKQDIAMAKSAKLIQQQLEKELNTLRVTRSAAPSTLDSSSTIPTQLGKKGKEFEFSQLPLKVEFLECSAKGGKGDSGPADIQDLEKWLAKIA	4638	19539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_723_pilon_+_4692_4739_4824_5663_5759_6639_6718_9541_9625_14127_14265_15645_15701_18326
740311	contig_11417_pilon	-	366	5	Intergenic	novelGene_103298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTCCTAAGCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528551	514671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_514757_517435_517511_521567_521647_527037_527106_528492
740316	contig_10904_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_22769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGAGAGAGATTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704125	701883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_701900_704100
740320	contig_11292_pilon	+	2532	1	Intergenic	novelGene_109400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCATCCACCATCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112850	115382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_112800_115400
740326	contig_9797_pilon	+	1546	4	Intergenic	novelGene_65596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_1	151.28853962618	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	148	774	183892	191368	FALSE	20	ATGACACTCTGGAGTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	183744	192140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_183989_188577_188734_189277_189422_191138
740327	contig_348_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_67629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGCCAAGAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421156	423186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_421200_423200
740328	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
740332	contig_5515_pilon	-	1390	6	Intergenic	novelGene_52302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_3	24.7822517136761	921	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCAGTGTTGATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37561	32492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33386_33476_33588_33672_33802_34833_34899_36599_36700_37469
740336	SIRV2	-	247	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	679	22	679	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4053	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
740337	contig_14666_pilon	+	2153	15	Intergenic	novelGene_39519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_11	87.7082652656998	308	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	424	1719	443672	448893	FALSE	10	GGTATCGAGTCCGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429364	449327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440707_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446215_446600_446741_447493_447609_448003_448067_448153_448295_448638_448769_448858
740341	contig_3130_pilon	-	775	6	Intergenic	novelGene_103576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	219.479748496302	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	167769	133080	FALSE	10	AACGGTTTTTGCTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRGSKMAAAVGVRGRCELPPCSGPGWLLSLSALLSVAARGAFATTHWVVTEDGKIQQQVDSPMNLKHPHDLVILMRQETTVNYLRELEKQLVAQKIHIEENEDRDTGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRGVQERVNLSTPLLPKEDPVFTYLSKRLGRSIDDIGHLIHEGLRKGTSTLKK	167788	133010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_133104_133509_133642_133929_134042_134805_134976_143287_143378_167610
740347	contig_14855_pilon	+	1759	4	Intergenic	novelGene_146046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	27.3536509852382	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	91	552	652395	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	652304	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_652424_652780_652925_654023_654205_654340
740350	contig_12005_pilon	-	1810	10	Intergenic	novelGene_160475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	57.4842973727995	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	83	1693	216421	186547	FALSE	20	CCCTTTTTTCCGTTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPCSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKHKLIGYDYLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGHQFALKLHRLGRTSFRNLKNKRDYHKHRHNMSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYERKFPVPKPIDYNRHAVVMELVNGYPLCQIHHVEDPASVYNEAMELIVKLGSHGLIHGDFNEFNLILDKDDHITMIDFPQMVSTSHPNAEWYFDRDVKCIRDFFIKRFSYESELYPTFRDIRREDSLDVEVSASGYTKEMQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRDEENMGHVTQYRTRTLSVTSAGSVVSCSTIPLELVKQKVKRQLTKQQKAAVRRRLQKGEANIFTKQRRENMQNIKSSLEAASFWED	216503	186429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_186712_190632_190730_192724_193250_194007_194101_198002_198195_202798_202888_205826_206003_208295_208383_209605_209727_216355
740351	contig_12050_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_62772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888530	890895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_888500_890900
740354	contig_14441_pilon	+	637	3	Intergenic	novelGene_100692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	193	636	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	114117	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114161_116578_116963_117586
740364	contig_5236_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_100923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689941	692676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_689900_692700
740365	contig_9029_pilon	+	2753	8	Intergenic	novelGene_155132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	12.06445276041	80	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	9	917	446710	464791	TRUE	5	GGATCCTGTCGGTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMAGLGVVCLLLWAAFWPPASPSGEEFWPGQSAADILSGAASRRRYLLYDVNPPEGFNLRRDVYIRVTSLLKTLLKTEEWVLVLPPWGRLYHWQSPDIHQIRIPWSEFFDLPSLNKNIPVIEYEQFIAESGGPFIDQVYVLQSYAEGWKEGTWEEKIDERPCLDQLLYSQDKHEYYRSVMLDRAENLLHDHYGGRGYWDTRRSMVFAKHLRAVGDEFRRHHLNSTDEADRIPFQEDWTKMKVKLGSSLGGSLPRRSPEKERLYLGAQRGCAQSGRSCEEDPQPHEDPPPREGVCGHRCCEEGI	446701	469573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_446841_448915_449167_451002_451148_460924_460992_463110_463237_464345_464528_464784_464909_467854
740371	contig_4797_pilon	+	1843	3	Intergenic	novelGene_6912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7676	junction_1	1013.5	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368346	370510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764
740375	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
740377	contig_709_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_57518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGGTTCTGGACAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6152	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_6200_6500
740381	contig_6494_pilon	-	815	7	Intergenic	novelGene_108544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	131	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	6	737	8286	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8291	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
740385	contig_6710_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_89105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653624	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
740386	contig_15327_pilon	-	1814	9	Intergenic	novelGene_70520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	16.9189243156886	130	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	365	1321	488304	478231	FALSE	15	TCTTTGTTGTTGTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492570	477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172_488343_488444_488585_491906_491960_492437
740388	contig_6710_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_94109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653647	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
740391	contig_11115_pilon	+	2197	5	Intergenic	novelGene_102779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	35.8006634016746	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	45	1640	37533	42450	FALSE	15	CACCCGGCTCTCAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLQVKYEDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCAELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLTHCQLATLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRCHSLTPHFLQMQLQKCEILKSDSRCKDYLVKIFQELTLHKPTQVMPCRAPKVGRLIYAAGGYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAECYYPERDEWRMITPMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTHMTSGRSGVGVAVTMEPCRKQIDLQNCTC	37488	43007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_37893_39585_40272_41477_41684_41960_42138_42283
740396	contig_12050_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_62627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCTGTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344339	343677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_343700_344300
740401	contig_6102_pilon	-	1782	14	Intergenic	novelGene_32375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_13	158.590015131496	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	463	1470	1733603	1727326	FALSE	40	TATTCATATTCAGATAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGKTARARPWRQRDSRLYKRRS	1736869	1727013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1727387_1728864_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1736563
740402	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8144	-2	595	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTCGCTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
740410	contig_19352_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_122427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAATTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411881	413032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_411900_413000
740411	contig_7342_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_71243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAGAAGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735970	738093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_736000_738100
740412	contig_7308_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_159610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACTAATAAGAGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521508	520596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_520600_521500
740414	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_95811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
740416	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740418	contig_14322_pilon	+	390	2	Intergenic	novelGene_115974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCGGGCCCGCGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671356	671906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671823
740421	SIRV6	+	453	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGGTATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3160_10721_10819_11031
740423	contig_3529_pilon	-	988	6	Intergenic	novelGene_105381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	786.410478058374	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGGTTTTTCAAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789822	777095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713_778894_784507_784634_785190_785276_786999_787146_789784
740425	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_18198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
740431	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740432	contig_18231_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_105891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258719	261493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_258700_261500
740435	SIRV6	+	572	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740441	contig_1996_pilon	-	2101	4	Intergenic	novelGene_131882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.77123616632825	147	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	83	1570	157365	155599	FALSE	15	CAACTTGTATTTGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTLVFLSTRQVLQCQPAACRALPLLPRELFPLLFKVAFMDKKTAVLRELVHTWPFPLLSFQQLLQECAHCSRALLQERPSTESVQAVILGLTARLHTPEAEADAGTQPLCRKHVLRVLDMTGLLDDGVEQDPGTMSMWDCTAAVARTCIAQQQGAAVEPGPAPTPVEVRVDLRVNRASYAFLREALRSSVGSPLRLCCRDLRAEDLPMRNTVALLQLLDAGCLRRVDLRFNNLGLRGLSVIIPHVARFQHLASLRLHYVHGDSRQPSVDGEDNFRYFLAQMGRFTCLRELSVGSSLLSGRLDQLLSTLQSPLESLELAFCALLPEDLRFLARSPHAAHLKKLDLSGNDLSGNQLVPFQGLLEAAAATLLHLELTECQLADTQLLATLPALTHCVGLRYLGLYGNPLSMAGLKELLRDSAAQAELRTVVHPFPVDCYEGLPWPPPASVLLEASINEEKFARVEAELHQLLLASGRAHVLWTTDIYGRLAADYFSL	159085	155067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_156167_156241_156827_157030_157391_159028
740446	SIRV6	+	531	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11042_11109_11205
740449	SIRV7	-	298	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33204	14853	-15	-14847	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTATTGTATCGATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114753	70884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680
740450	contig_12620_pilon	+	2431	13	Intergenic	novelGene_98798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_6	59.5594940654581	160	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	115	1248	165660	251705	TRUE	35	GTCTCCCAAAAATATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLTGALRSFSNVTKQDNYNEEVADLKTKRSKLYEKNLDLGLTWKKIVKFLNENLDKNEVQTVNEDLKDILQAAKQIVGMENGREAVESGAAFLFKTFYLKNFVGHKETKAIKQMFGPFPSSSATAACNATSRITSHFSEVNLTALVRMTEEENREGVLFGKNIAFSFDMHDLDHFDELPINGDAQKIISLDYQKFLNERFQERCTPEVKPVEKANGSFLWCEVEKYLNATLKGMTEAPRIEDLCCTLYDMLASVKSGDELQNELFELLGPEGLELIEKLLQNRIMIVDRFLNSSNDHKLQALQENCKKILGENAKHNYGCQVTIQSEQEKQLMKQYRREEKRVARREKKAGEDGEVSGEGLMCFDPKELRMQR	156581	385300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_156661_165624_165750_168525_168677_184216_184777_238339_238461_249886_250095_251701_251828_283081_283283_283739_283881_319915_320081_334713_334891_337499_337572_384995
740451	contig_160_pilon	+	1632	2	Intergenic	novelGene_156327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211839	216275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_212946_215749
740454	contig_3601_pilon	-	1373	3	Intergenic	novelGene_132888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	170	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	882	1358	184819	180164	FALSE	30	ATGAACAGATGTGTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIRERQSSIPVLCRRCSGVLSVSCYLRVSPGSSWLTGPPGAGLALWDHASCRSHLPAPGFPASWPPVSSVTETCALCGHLPPSLPPSTLGRPSCLNSDLPVPTSSPSTLFLSDRVYLFAHCWASPQEHKPQEGRGFIWFSAVSAYQKHSPSMVGFQ	188395	180148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_180639_184817_184942_187636
740457	contig_1694_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_144947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTCGGCACCTGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711101	711719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_711100_711700
740459	contig_1694_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_144948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712627	713069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_712600_713100
740460	contig_8801_pilon	-	1144	5	Intergenic	novelGene_66283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	57.6817778852213	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	197	958	456667	445841	FALSE	65	TATTGAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYILISLQIGDLQLLKCDELDCLIKGILYIDSVGFNGRSPCYYFENPADSEKCQKLPFDLKNPYPLLLVNIGSGVSILAVYSKDNYKRVTGTSLGGGTFFGLCCLLTGCTTFEEALEMASRGDSTKVDKLVRDIYGGDYERFGLPGWAVASSFGNMMSKEKREAVSKEDLARATLITITNNIGSIARMCALNENINQVVFVGNFLRINTIAMRLLAYALDYWSKGQLKALFSEHEGYFGAVGALLELLKIP	456863	445654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_445892_449288_449415_451005_451130_455180_455358_456383
740462	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740465	contig_9290_pilon	+	1305	9	Intergenic	novelGene_77507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_7	157.455350814128	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	74	988	14582	34832	FALSE	40	TGTGTACAAAATTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHWHHARSDWGRGRAFSGHSSSKKKGKNHIPERWKDYLPVGQRMPGTRFIAFKVPLKKSFEGKLAPEECFSPLDLLNKIQEQNEELGLIIDLTYTQRYYNPEDLPETIPYLKIFTVGHQVPDDDTIFKFKCAVNGFLKENKDNDKLIGVHCTHGLNRTGYLICRYLIDVEGMRPDDAIELFNRCRGHCIERMNYIEDLQNGPIRKPRYNLHRTQDYPTPSRHFHSHTQSVRKFSQNQNVYQRGLIPPPGPPGQDYSQRRYSWNVKPDTTQAAQYKRLPPNIPYNRQCYRSFPIGDGPSDMNLF	14508	35149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_14683_16219_16296_19403_19536_24495_24620_28018_28080_29871_29919_30188_30265_30598_30677_34612
740470	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_89472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740471	contig_4301_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_65131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGATACATTGGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552750	553218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_552800_553200
740472	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
740473	contig_6954_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_64441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAAGATGAAGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489560	487029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_487000_489600
740480	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
740481	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
740482	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_93451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653725	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
740485	contig_15687_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_129139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTTTCCCACCAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146951	146011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_146000_147000
740486	SIRV6	+	291	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8138	2	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	8	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
740489	contig_12250_pilon	-	1353	6	Intergenic	novelGene_80694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	389.145011531691	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	65	331	401239	399825	TRUE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSLPCAHSSLLARRKAPSPAMATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEVLPVAQ	401303	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399521_399747_399846_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
740490	contig_15888_pilon	-	1160	8	Intergenic	novelGene_84449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1753.89948051623	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	297	596	253673	252804	TRUE	40	CACCAATAAAGACTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPL	254649	251619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251848_252025_252301_252468_252530_252803_252833_253402_253680_253936_254066_254198_254282_254571
740491	contig_14925_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_55388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCCCCTCGTGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268695	269187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_268700_269200
740495	SIRV6	+	547	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740497	SIRV1	-	176	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3928	0	3654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
740498	contig_11364_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_65178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAGGCTTACGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157347	157954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_157300_158000
740500	contig_4071_pilon	-	1310	9	Intergenic	novelGene_151895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	61.0889464224094	589	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGGTGGTCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363796	343564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_343827_344069_344130_345262_345493_346373_346455_347957_348032_354570_354660_355444_355542_360908_361010_363480
740501	SIRV6	+	529	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740502	contig_14441_pilon	+	710	3	Intergenic	novelGene_100789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	151	672	125667	126705	FALSE	5	TGGCCGTGTGTCCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125516	126743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126256_126514
740503	SIRV5	+	401	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-71	875	43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8244	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
740505	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_94815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
740506	contig_10861_pilon	+	1835	6	Intergenic	novelGene_39438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	38.2695701569798	89	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	367	993	2433965	2478785	FALSE	25	GATATGGCTTGTTTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFVIRTPRVQNSPQKKDPGAKMYKQATIESLKRVVVVEDIKRWKTILELPDQTKENLVEALQELKKKIPSREVLKSTRIGHTVNKMRKHSDSEVACLAREVYTEWRTFMEKHSDRPSIEVRSDPKTEMFRKNAQKLLSEALELKMDHLLVENIERETFHLCSRLINGPYRRTVRALVFTLKHQAEIRAQVKNGLLPVSTFVKNHKK	2432416	2479627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2432592_2432824_2432973_2433921_2434067_2451185_2451328_2469337_2469532_2478596
740508	contig_8284_pilon	+	1097	10	Intergenic	novelGene_125705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	696	junction_8	269.385216858179	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	92	859	426599	461340	FALSE	30	CGTGGTGGAAATAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425063	461578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
740514	contig_14322_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_115703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATGAAGCAGGCGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671274	671567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671300_671600
740516	contig_9656_pilon	-	1774	12	Intergenic	novelGene_121888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	134.931632520123	26	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1500	274	1773	97308	70347	FALSE	25	GTAAGAGCCTTGTCAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLPSFHLKDALTTIGEKVCVEVSSCLSLCGFTPFTTDQETVLKGQIQAVASPEDPIRRIMDSRILTFLETYLASGHQKPFPTVPGGLGPIQKELEEVAVKFVRLVNYNKMVFSPYYDAIL	101053	70345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_70526_71786_71960_73707_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_100608_100766_101023
740517	contig_776_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_139955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGAAAGAAACACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115010	1116447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1115000_1116400
740522	scaffold_12124_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_22420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACCCACCAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635181	1632780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1632800_1635200
740524	contig_9713_pilon	+	1905	1	Intergenic	novelGene_170256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCACTGTGCCCGGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342179	344084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_+_342200_344100
740525	contig_1450_pilon	-	2801	7	Intergenic	novelGene_27371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	944	1522	330252	329674	TRUE	5	ACTGCTGCTGCCTGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQEAEGKGAALGPSTVPSDSTVPSQALLGSHIPKWRLSSCSPGGQPRKRDHGTAGWGQGAKAEVGTRRLRLIPALRETITPSWHPGPNIAQITPPPTPLIPSEMLCLVRSIKLGFVARRAAFPAQGHTFDEDAIVSNTVPFPTKVARYKFQDTQALARIETSTLTWAPSLPTLHGSHFLWLGSAENSGGH	331195	244359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_244531_308896_309002_315756_315877_322453_322541_324995_325084_325652_325732_329044
740528	contig_6233_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_74822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGTGGCTCCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413685	415020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_413700_415000
740532	contig_12250_pilon	-	1505	10	Intergenic	novelGene_80662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.651865517482	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	57	1328	379717	375947	TRUE	45	AAGCATTTTAAATAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAELRATECWDSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380578	375718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_375782_375832_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537_379719_380523
740536	contig_12638_pilon	-	2073	10	Intergenic	novelGene_33382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1377	1694	1530005	1524396	TRUE	15	AGAATCTGCGCCTGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSMRDSRQPYRLSNLLLVTESLTLMAGTFRIPLAIILYRLWTPVVVSSEMPRMPEQELRVLGVNKVGEVTAIVQNHVEGPILEVQSLLDAPQVLLVCFALPGIH	1539613	1515750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1515869_1521144_1521336_1522658_1522721_1524387_1524543_1529405_1529525_1529953_1530162_1530252_1530343_1530440_1530556_1534858_1535058_1538797
740539	contig_14219_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_54337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797532	795204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_795200_797500
740542	SIRV4	-	245	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	369	3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
740544	contig_5084_pilon	-	2099	10	Intergenic	novelGene_64596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	86.6719371616789	298	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	180	1325	954405	942889	FALSE	35	AGTAATAAAAGGGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFVLDTEASVSNGATFLGSPTVRRDWDCVRACCATHSCNLALVELRPNGLEDDTPSCFLMNCLYEQNFVCKFAPREGFVNYVMREVYSSYRELQTQGFGESRVPKAWAGMDLKVQPQEPLVLRSEENADWYLLQGDTAVRIEKNDQDHVKFWGLQEGTYLFQLTVTNSDQPDDTANMTITVLSAKQTEEYCLASYKVGRCRGAFPRWYYSPTEQVCKSFIYGGCLGNKNNYLREEECKLACRDVQGPSVERQHPVCSGTCQATQFRCGNGCCIDSFLECDDTPDCPDASDEATCDKYTSGFDELQSFHFPSDKGHCVDLPDTGLCQENIPRWYYNPFTEHCARFTYGGCHGNKNNFEEEQQCLESCRGISKKDVFGLRREDPVPSIGSVEVAVAVLLAVCIVVVVAILGYCFFKNQRKGFRGHRHRHPHPHPRQLHGLHH	954584	942114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_943053_943473_943522_944105_944277_945017_945069_945190_945317_945608_945636_945808_945980_946073_946213_946668_946797_954284
740545	contig_5331_pilon	+	2399	6	Intergenic	novelGene_112814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	583	junction_1	217.850774614184	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	15	629	711291	727642	FALSE	35	AGCCAACTAGCTATGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEKMASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTRSVSSFSWPTS	711276	729412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440
740551	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740554	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	0	407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740555	contig_1076_pilon	+	1510	12	Intergenic	novelGene_101108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTTTCTGGGATAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51867	79724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_51974_53850_53893_54258_54408_58874_59038_60171_60303_60974_61135_62541_62661_64378_64516_66230_66354_72921_72975_75351_75427_79472
740559	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_97515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740560	contig_5649_pilon	+	1583	8	Intergenic	novelGene_82260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188.64587275136	4	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	84	386	12779	23207	TRUE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRRPRLLQKIWTRNTCPLGA	12695	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23150_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28387_35132
740565	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
740566	contig_8140_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_86437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAATGTGTGTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196276	198907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_196300_198900
740569	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740572	contig_6958_pilon	-	2235	5	Intergenic	novelGene_69931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	496.818062775499	1	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	142	1206	189837	149618	FALSE	20	TAAACGGCATCCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	189978	148588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
740573	contig_987_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_72287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTAAGATGTCAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916199	918258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_916200_918300
740575	scaffold_19766_pilon	-	2277	5	Intergenic	novelGene_34458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_4	56.5790376376269	111	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	456	1886	909694	894305	FALSE	30	TGTAATGCCTCAAGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVLGMATVLGPRPPQKQVGPVIVKVEEEEEEKKKCLPGLEIFRQRFRQFGYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPNELQTWVQEHCPESAEEAVTLLEDLERELDEPGQEVPAPPDEQKQLWEKMSSSGTAKESLSGMQPRPARNKYESWEPLHIEEIDEEQDFTQELRKIQDYESNTQNEESTDKQQSSEEDSHTEGFQRDIITMSIDNKYETRLEGQRVNLERKRGTKSPLRDIGSKKVTELIPINLTTREKRYICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHTGEKPYVCTKCGRAFSHSSNLTLHYRTHMVDRPYDCGKCGKAFSQSSDLLKHQRSHTGEAPYQCKDCGKSFSGKASLTRHYRTHTGEKPYQCNECGKSFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKECGRAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCKNCGKAFCSKSNLSKHLRVHTGEGEVL	915559	893913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_895150_908826_909014_909295_909794_912710_912821_915313
740577	contig_2646_pilon	+	2186	17	Intergenic	novelGene_69634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	906	1217	2071111	2071934	TRUE	0	CCGCGCCGCCGGGGGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTATPDVLPCRQGPPSCPCPSSPSCLYLPPSPWSQSARYRCGAAAAPSARSPSLQQAHTSTSVLAKLRNGSDTTSSAARMASMASPFPRWLRPSPRGSHRA	2069350	2078593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2069684_2069789_2069907_2070139_2070265_2070458_2070551_2070643_2070819_2071047_2071129_2071329_2071486_2071670_2071764_2071889_2072038_2073159_2073243_2073422_2073564_2073761_2073871_2074039_2074167_2075760_2075815_2075985_2076108_2077139_2077308_2078531
740579	contig_14322_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_116578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCCACAGCAGCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
740581	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10853_11075_11109_11205
740582	contig_19957_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_57710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1459	1794	199745	200080	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYFPSTPGLQGVKNGVVIEEMIPQRTYFVFPKGPNCLGEKIQKNQSLTTAQMITRSFLDTQTAQLAFVKLITNSDSLILKIYLEAAHFCFNAELKSVQLAHYQSKKKKNS	198286	200456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_198300_200500
740587	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740588	contig_11720_pilon	-	1540	3	Intergenic	novelGene_43765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	298	699	16194	15793	FALSE	10	GTTCCATATTGGCCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18345	14951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16317_16770_16878_18277
740591	contig_5434_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_74692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCATTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404979	398255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_399048_403031
740594	contig_17470_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_110482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	607	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATAAAGATTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147788	148966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_147800_149000
740596	contig_5954_pilon	+	1330	10	Intergenic	novelGene_28533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	60	junction_1	203.711669877905	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	291	1118	470316	479031	TRUE	40	AACCTGAAATCAGAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLFSILEELAMVTSMRPPVQANPDLLSLLTVSLDQYQTEDELYQLSLQREPRSKSSPTSPTSCTPPPRPPVLEEWTSAAKPKLDQALLVEHIEKMVESVFRNFDVDGDGHISQEEFQIIRGNFPYLSAFGDLDQNQDGCISREEMVSYFLRSSSVLGGRMGFLHNFQESNSLRPVTCRHCKTLILGIYKQGLKCRACGVNCHKQCKDRLSVECRRRAQSMSLEGSAPSPSPTHTHHRAFSFSLPRPGRRGSRPPEIREEEVQMVEDGVFDIHL	468852	479400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_468957_470129_470412_471210_471289_471548_471672_472042_472159_477111_477254_477518_477556_477933_478111_478972_479038_479194
740598	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	15	1200	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
740599	contig_10235_pilon	-	1567	7	Intergenic	novelGene_46277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.61876193118	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	187	1020	25335	19534	TRUE	20	TGAAACAGTGTGCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27184	13962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14047_19070_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
740607	contig_12292_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_167007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATTAAATTGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291787	292095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_291800_292100
740608	contig_3832_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_161443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262580	265599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_262600_265600
740609	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740610	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740613	contig_233_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_14487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGGCGTTCCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42129	40592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_40600_42100
740623	contig_4232_pilon	+	937	5	Intergenic	novelGene_63189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1981.19854822781	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	82	582	146362	149200	TRUE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146280	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087_149475_149598
740624	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740625	contig_2703_pilon	-	2585	19	Intergenic	novelGene_101821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_1	53.5080471621896	124	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	20	2323	1171960	1146058	FALSE	25	ATACACCCTGCACATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIPPDMILTLLEGITAIIHYCLLDPTTQYHQLLVNVDQKHLFEARSGILSILHMIMSSVTLLWSILHQADSSEKMAVAASASVTTINLGATKNLRQQILELLGPISMNHGVHFMAAIAFVWNERRQNKTTTRTKVIPTASEEQLLLVELVRSISVMRAETVIQTVKEVLKQPPAIAKDKKHLSLEVCMLQFFYAYIQRIPVPNLVDSWASLLVLLKDSIQLSLPAPGQFLILGVLNEFIMKNPSLENKKDQRDLQDVTHKIVDAIGAIAGSSLEQTTWLRRNLEVKPSPKIMVDGTNLESDVEDMLSPAMETSNITPSVYSVHALILLSEILAHLFDMVFYSDEKERVIPLLVNIMHYVVPYLRNHSAHNAPSYRACVQLLSSLSGYQYTRRAWKKEAFDLFMDPSFFQMDASCVNHWRAIMDNLMTHDKTTFRDLMTRVAVAQSSSLNLFANRDVELEQRAMLLKRLAFAIFSSEIDQYQKYLPDIQERLVESLRLPQVPTLHSQVFLFFRVLLLRMSPQHLTSLWPTMITELVQVFLLMEQELTADEDISRTSGPSVAGLETTYTGGNGFSTSYNSQRWLNLYLSACKFLDLALALPSENLPQFQMYRWAFIPEASDDSGLEVRRQGIHQREFKPYVVRLAKLLRKRAKDKEEDFKTVILEGLEMAKHQKNPEEDNSGRMLGWEPGHLLLTICTVRSIEQLLPFFNVLSQVFNSKVTSRCAGHSGSPVLYSNAFPNKDMKLENHKPFSSKARQKIEEMVEKDFLEGVIKT	1171979	1145795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1146364_1148722_1148783_1151389_1151520_1153715_1153881_1154788_1154845_1155706_1155844_1156984_1157138_1158828_1158891_1159033_1159184_1159440_1159551_1159957_1160038_1160166_1160312_1160547_1160615_1161492_1161598_1162911_1162968_1165741_1165877_1169471_1169598_1171590_1171774_1171882
740627	contig_15084_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_116715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGGCCAAATCCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253238	254532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_253200_254500
740633	SIRV6	+	225	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	516	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11201
740637	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740640	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_95933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657499	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657500	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740641	contig_3424_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_55543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACATTTTGGTTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289801	290608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_289800_290600
740644	contig_16594_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_53799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTTTCTTAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116357	115136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115100_116400
740645	contig_3601_pilon	-	1847	6	Intergenic	novelGene_132870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_5	41.206795556073	387	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	993	1325	169167	144563	FALSE	55	AGAAAACTAACTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	188420	144040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169200_170691_170868_187636
740647	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740653	contig_18794_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_54648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCAAATTTCTTAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165099	163526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_163500_165100
740657	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	286	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740661	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740663	contig_5959_pilon	+	2412	3	Intergenic	novelGene_150177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	15.5	124	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	153	1874	110790	118746	FALSE	55	AACAATGGAAAAAATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLQLIPEVSRVHLQPMEIQFNYESQDYHLLSDGETKTKIGESASKEEISAKSGPLTEGSGNPRKAVLQDSECSEFCEFGVKLNEKYQNLLKRKQHNCDELGQSFAWSTGLIRHRMTHWKKPYECDKCGKAFSVSSALVLHQRIHTGEKPYTCNWCIKSFSRSSDLIKHERVHTGEKPYKCDECGKAFSQSSDLIIHQRIHTGEKPYQCNHCSKSFSQRSDLVKHQRIHTGEKPYTCNQCNKHFSQSSDVIKHQRIHTGEKPYKCDVCGKAFSQSSDLILHQRIHTGEKPYPCNQCSKSFSQNSDLIKHRRIHTGEKPYKCSECGKAFNQSSVLILHQRIHTGEKPYPCNQCSKTFSRLSDLINHQRIHTGEKPYPCNQCSKMFSRRSDLVKHHRIHTGEKPYECDECGKNFSQSSNLVLHQRIHTGEKPYPCSDCTKSFSRRSDLVKHQRIHTGEKPYTCNQCDKSFSQSSDLTKHQRVHSGEKPYHCDSCEKAFSQSSDLILHQRIHTGEKPYPCTQCSKSFRQNSDVIKHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQCSALILHQRIHTGEKPYT	110001	119284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_110023_110658_110890_117124
740666	contig_13823_pilon	-	2011	3	Intergenic	novelGene_145255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	60	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTTGTTCAAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235405	225494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_226345_232332_232433_234344
740667	contig_10307_pilon	-	2812	2	Intergenic	novelGene_170297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638984	632584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_633418_637005
740668	contig_8045_pilon	+	1342	5	Intergenic	novelGene_35353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1292.62571922425	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	569	664	118627	118722	FALSE	50	ATAAATAATGTCATTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRQVREGDEAGYYVPGCPARVLWTNGQERRQWPQERREAGEDEADPVNWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116040	119400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116187_117254_117349_117450_117513_118075_118243_118527
740669	SIRV6	+	554	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740673	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740679	contig_16647_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_170309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311384	311930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_311400_311900
740680	contig_2834_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_27988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGTATTAATGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244907	245361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_244900_245400
740681	contig_2834_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_27989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAAACCACACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245966	247129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_246000_247100
740686	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_97252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740688	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740689	contig_10863_pilon	+	2681	13	Intergenic	novelGene_59325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_12	99.2912033140678	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	316	2616	64153	79134	FALSE	65	AGATAATGTTAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPLSRKVLKSLNPAVYRNVEYEIWLQSKQAQQKRDYSIAAGLQYEVGDKCQVRLDHNGKFSNADIQGVDSENGPVLVEELGKKHSLKNLKPPPPENWNTVSGKKMKKPSTSGQNFHSDTDYRGPKNPSKPVKAPSALPPRLQHPSGVRQHTFAGHSSGSQSQKSSSEHKNLSRTPSQIVRKPDRERVEDFDHTSRESNYFGLSPEERREKQAIEESRLLYEIQNRDEQAFPALSSSSVSQPASQSSNPCIQKKSSHVKGSRQRMDTEERKEKDPIHGHDHLDKKSEPNTLENIGGDKCARVSSPSKSKKSEYPSPAEQKPPERVSLSNPAPLLVSPEVHLTPAVPSLPATVPAWPSEPATLGGPTGVPAQIPVLPVTPTLTTGPDSAVSQAQLTPSPVPVSMQAVNQPLMPLPQTLSLYQDPLYPGFPYNEKGDRAIVPPYSLCHTGEDLPKDKSVLRFFFNLGVKAYSCPMWAPHSYLYPLHQAYLAACRMYPKVPVPVYPPSPWFQEAPSTQNENDCTCADAHFPMQTEASVNGQMPPAEIGPPTFSSPLVIPPSQVSESHGQLSYQPDLESENPGQLLHAEYEESLSGKNMFPQPSFGPNPFLGPVPIAPPFFPHVWYGYPFQGFIENPVMRQNIVLPSDEKGELDLPLENLDLSKDCGSMSAVDEFQEVGGEDGPPLLEGGLSSQHEGQVEQSSQTPQAEPALASTPPVAEGKAHLPTQILNRERGAVVELEPKRTIPSLKEKPEKVKDPKIAPDVVSPGAISVDSRVQRPKEESSEDENEVSNILKSGRSKQFYNQTYGGRKYKSDWGYSGRGGFQHARGEESWKGQPSRSRDEGYQYHRNVRGRPYRGDRRRSGMGDGHRGQHT	60155	79199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_60247_60337_60403_62426_62522_64088_64193_64295_64483_69282_69446_71428_71544_71851_71908_72597_72679_73643_73786_74391_74653_76164_76206_77919
740691	contig_610_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_76783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATACATAGAGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265239	267115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_265200_267100
740692	contig_10299_pilon	+	2268	19	Intergenic	novelGene_79712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106.281538529035	1	108	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	928	2106	337231	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIQVLLDRLVLRRLYPLAIQICEYLRLPEVQGVSRILAHWACYKVQQKDVSDEDVARAINQKLGDTPGVSYSDIAARAYGCGRTELAIKLLEYEPRSGEQVPLLLKMKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAEERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320531	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_335188_335254_335378_335435_335741_335839_335938_336034_336187_336265_336733_337087_337215_337257_337431_337541_337704_337840_337924_338034_338123_338222_338304_338413_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
740693	contig_6192_pilon	-	2367	11	Intergenic	novelGene_170323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	235.516220248203	49	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	69	2189	123448	112307	TRUE	20	ATCAAGTTGGCTTGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVPAIKPSREEFLSSRMLMPQDIMAYRGREVVDNTLPLRNAPGCESRTFPPSLYSGLSTPPASYPMYSHLPVSSFLFSDEELRDARMPMANPFPKERALPCDSARPVPSEYSRPTMEVSLSVCHNNIYSPKEAAPEDARSDMHYSVAEGPKPAAPSARNPPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQTSGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQGELGRLSPRTYTAPPACQPPMEPDNLDLQSPTKLSIGGEDSTIPQASRLNNIVNRSLTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHTEMCLHAAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC	135706	111233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_111402_112296_112451_114911_115050_115166_115298_116340_116509_117856_118042_118177_119150_121262_121485_123287_123460_124896_124936_135688
740694	SIRV6	+	564	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
740697	SIRV6	+	244	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	268	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780
740701	contig_14322_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_115841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
740707	contig_3754_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_146832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAATCTGATTTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225870	227143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_225900_227100
740710	contig_14472_pilon	+	194	2	Intergenic	novelGene_111188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTATAAAAAGGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416928	487051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_417003_486931
740717	SIRV6	+	189	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	513	-1	-343	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGAAGAAGGTAGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
740718	contig_5526_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_111688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATTTATTCTCTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192106	194654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_192100_194700
740722	SIRV6	+	609	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	270	1	92	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCACATATTTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
740725	SIRV6	+	555	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	14	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740726	contig_13365_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_168087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGTCAACCGAAGAAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61333	63905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_61300_63900
740728	contig_9290_pilon	-	2784	1	Intergenic	novelGene_77560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490755	487971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_488000_490800
740729	contig_12624_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_60968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAACATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15351	18244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_15400_18200
740730	contig_6726_pilon	+	1453	13	Intergenic	novelGene_86236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	641.896841833293	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	255	1313	297568	333034	FALSE	20	TTATCTTATTGTGAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287853	333174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297500_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
740735	contig_7630_pilon	-	1452	6	Intergenic	novelGene_133635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_4	156.346538177217	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	28	609	444531	390933	FALSE	35	CCAGGTTTAAAATACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRERCTWKMIHAILVFNNHGKPRLVRFYQRFPEEIQQQIVRETFHLVLKRDDNICNFLEGGSLIGGSDYKLIYRHYATLYFVFCVDSSESELGILDLIQVFVETLDKCFENVCELDLIFHMDKVHYILQEVVMGGMVLETNMNEIVAQIEAQNRLEKSEGGLSAAPARAVSAVKNINLPEIPRNINIGDLNIKVPNLSQFV	444558	390089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_391062_392968_393077_425275_425348_439452_439565_439983_440076_444462
740737	SIRV4	-	398	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	216	3	-216	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGACAACTCGCCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
740739	contig_18869_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_56078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73581	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
740743	contig_13108_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_135873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197297	195653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_195700_197300
740748	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	4	414	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740752	contig_16103_pilon	-	1565	6	Intergenic	novelGene_118904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	111.601792100306	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	121	780	766451	759680	FALSE	55	ACAAACTGTTAGAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSNWLSGVNVVLVMAYGSLDLKEEIDSRLSRVQDIKYEPQLLANDDARLLQLETQGNQNCYNYLYRMKALDAIRASEIPFHAEGRHPRSLMGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	766571	758894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761648_762206_762261_762483_762602_766385
740753	contig_1244_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_37899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	257	565	124571	123541	FALSE	30	AAAAGCCCTGGCCTAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPPGTHRCMSPALVAVSTQPFQGSLHLKLHILSSKSVSCHGEAANGLGCHFHDNWVIGGEEVPKIVSKSADSGGIPTFHSYEAGYGQDATFPLIGIGAGD	124827	122031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_123591_124312
740755	contig_7593_pilon	+	1374	2	Intergenic	novelGene_127305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATATTGTACTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196276	199194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_196495_198038
740757	contig_641_pilon	+	2000	10	Intergenic	novelGene_170132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_6	26.5083262018689	221	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	111	1370	2066	45324	FALSE	50	TTAATTTTTTAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLLHCYEVIPENSVCKLYFDLEFNKLANPRADGKKMVALLIEHVCKALRELYNVNCSAEDVFNLDSSTDEKFSRHLIFQLHDVAFKDNIHVGNFVRKILQPALKLIASEDDDKTPETTGCRFSHFSEASIQQGTSFNTMSMEKDTRESWTLNSEKLKRLGSAKQSSPDLSFLVVKNNIGEKHLFVDLGVYTRNRNFRLYKSSKIGKHVALEVAEDNKFFPMQSKNISEENHYFLSSLVSNVRFSDTLQILTCDTSQNKQKQVEYFNHSNTSVETIEGFQCSPYPEIDRFVLSLVNKNGIKGGIRRWNYFFPEELLVYDICRYRWCENIGRAHKSNNIMILVDLKNDVWYQKCHDPVCKAENFKSDCFPLPPEVCLLRLFKDEEEFTREDETVETKNNETKNPHKPSSIKLSKGVPSNDDWDNGTDDAYFLEAIEDAELAEAAENSLLSYSSISG	1955	45954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_2087_15100_15249_18584_18873_20901_21065_23028_23118_33200_33291_33367_33477_39359_39443_39526_39574_45102
740758	contig_5891_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_151588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTCTGATGTATATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156203	155856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_155900_156200
740759	contig_5891_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_151587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACAGAGAAGAACTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155448	154697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_154700_155400
740763	SIRV6	+	559	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740764	contig_4103_pilon	-	1809	5	Intergenic	novelGene_51906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	14.7542366796795	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	71	721	74485	70326	FALSE	60	CAGATTAAGAAAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSCEKSAEHGSYGEDPDSAEAPTRFRDTPEDIVLQAPASGLALHPARDLLAAGDVDGDVFVFSYSCQEGETKELWSSGHHLKSCRAVVFSEDGQKLVTVSKDKAIHILDVEQGRLERRISKAHGAPINTLLLVDENVLATGDDTGGVRLWDQRKEGPLMEMRQHEEYIADMALDPAKKLLLTASVGRRWPVAPVKVPSTSSTGMALGPRVTALP	74555	69237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_70420_70699_70880_70997_71086_71171_71273_74297
740765	contig_7612_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_170371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGGCATGTAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221390	219786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_219800_221400
740766	contig_15500_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_128996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253993	251818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_251800_254000
740769	contig_8538_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_4775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	66	299	842828	843061	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842762	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
740771	SIRV6	-	246	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTTTTTCCAGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
740773	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
740774	SIRV6	+	415	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740779	contig_5063_pilon	+	736	4	Intergenic	novelGene_109982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	131.692402548093	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	55	456	9407	57319	FALSE	40	AAGGATTGTCACTCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFLEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLRILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9352	57599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_19754_19857_35531_35646_57258
740781	contig_14925_pilon	-	963	5	Intergenic	novelGene_55166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	1556.62927105332	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	172	429	29675	27020	TRUE	20	CAAAGGCTGTGCTCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	66249	25793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_66230
740786	contig_8615_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_165217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAAATGGTGTATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101010	102227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_101000_102200
740789	contig_9468_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_59463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAGATGACTCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157485	154774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_154800_157500
740790	contig_14441_pilon	+	1166	6	Intergenic	novelGene_100468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	117.15186724931	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	556	930	116728	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMKKES	85415	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85872_113156_113209_116578_116957_117212_117344_117545
740791	contig_602_pilon	-	1548	4	Intergenic	novelGene_134981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	50.6820152190761	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	173	976	648836	646075	FALSE	15	GATCTTCACAGTTGTGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTEDKISLLLHLLEEELDHQTDERKTTTKLGSDVQVHVTACVLSVCGWACSSSLEPMQLALITCSQCMRKVGLWSFQQIESSMPDLEVSFSLSSSPIPGPEGRPERFPLVPESPRRMMTRSQDATFSPGSEQAEKSPGPIISRTRSWDSSSPVDRSEPEAASPTTRSRPVTRSMGTGDTPGLEVPSSPLRRAKRARLCSSSSSDTSSRSFFDPTSQHRDWCPWVNITLGKETRENGGTNGSTPGEPGWKGVLNTLLAHTQASQPAEADCMVRGPYLCVCVCVCVCVCVWHLLCVGWGAEAGPIISTLLALHFHKSGETHSGLF	649754	645502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_646438_646877_647091_648608_648853_649598
740797	SIRV5	-	262	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCCGACCCAATTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
740798	SIRV1	-	221	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3587	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
740803	contig_12970_pilon	-	2258	1	Intergenic	novelGene_50504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAGTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20283	18025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_18000_20300
740804	contig_7467_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_69490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131008	132426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_131000_132400
740805	contig_2036_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_131846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAGAACACGCTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634970	634243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_634200_635000
740811	contig_16098_pilon	-	1073	8	Intergenic	novelGene_46048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1830.36972957345	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	123	644	350353	349187	TRUE	50	AATAATAATAAAATGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLPLREPVVTLEGHTKRCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIASCTSGGVSPLP	350620	348318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349221_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350566
740812	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_96744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740813	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
740815	SIRV6	+	355	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-1	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1700_2772_2829_3106_3165_10724
740816	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	51	496	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
740817	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740818	contig_2453_pilon	+	2774	13	Intergenic	novelGene_147759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	53.2782919103915	17	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	105	1895	56543	62827	TRUE	30	TTGAATTCAAAGTGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	55546	63897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_55622_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
740819	contig_5264_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_165062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288053	290143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_288100_290100
740820	contig_9527_pilon	-	2084	5	Intergenic	novelGene_134079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	20.7891197504849	78	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	237	1034	494027	490438	FALSE	25	TTTGTTCTTAAAAGCGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVSARGLSLEERRQLAVKLTRVLALYRSILDAYIIEFFTDNLWSTLPCSWQEALDRLNPPQLATLLLGMPGEGEVVRYRSVWPLTLLALKSTASALAFTRTPGFQTPSEFLENPSQSSRLTPLFRKHVRPKKQHEIRRLGELVKKLSDLTGCTQVVDVGSGQGHLSRFMSLGLGLLVKSIEGDQRLVERAQRLDQELLLALEKEKKRTPQVRHPFPQPGLQEQGLLGWNRAPRLNSHFQVSQLEVVWSLFLLPKASPHLQGTF	494263	489387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_490744_490976_491040_491533_491727_491886_492012_493916
740823	contig_5039_pilon	+	584	5	Intergenic	novelGene_64934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	384	junction_1	265.173881632411	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	275	523	1366503	1368757	FALSE	40	CTGAACAGACCATATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YATALYSAASKQKKLDQVEKELLRVAQLLKDPKVSLAILNPYVKRSIKVKSLKDITAKERFSPLTSNLINLLAENGRLNITPGVISAFSTIMSVHRGEVPCTVTTASPLDSASLSELKTVLNSFLRPGQVLKLEVKTDPSILGGMIVRIGEKYVDMSAKSKIQKLSKVMRETA	1363940	1368818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1364020_1365540_1365671_1366437_1366551_1368233_1368321_1368643
740827	contig_4852_pilon	-	2623	10	Intergenic	novelGene_153971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	59.9180510322738	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	40	1206	99919	84651	FALSE	20	TCTTCTAAAAGTTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGTSPITVPDLVLMLLRLLLLICAPLCEPTELFLTASPAHPIEGSSVTLTCAIQLPLQTTDSQLQYRFVRNGWPLRLAWSSSPKLQIPSMWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFWYKGAMGLKLGTKTQSSLTAEFEILTARESDAEQYYCAADNGYGPSLSELVSITVRIPVSHPVLTIRATGAQAVAGDTVELHCEVQRGSPPILYRFYHEDIILGNSSAPSSGGASFNLTAEHSGNYSCEADNGLGTQHSEAVPLNITGKQSASDPLRSPPSPVPQEITYLNSPTPVPLQPVYENVNLVSGDDIYSLVYCSQQEWKAAAERPRTPTEDEVSLDIYSKLKQASDSDGDYEDAM	99958	83233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86248_86278_86872_86945_87165_87249_88776_88805_90697_90971_91135_91424_93959_94230_95971_95993_99888
740831	contig_4857_pilon	-	2780	8	Intergenic	novelGene_48642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	99.9520293103912	1	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1255	1560	443315	441598	FALSE	25	ACCTATAATTTTTGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448625	440377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443746_444432_444537_444997_445070_447620_447760_448062_448183_448236
740832	contig_6175_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_16368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAAAAAAAAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774312	1772569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1772600_1774300
740834	contig_953_pilon	+	1831	1	Intergenic	novelGene_130000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAATACAGAGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271526	273357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_271500_273400
740837	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740839	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
740842	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	6	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740849	contig_6958_pilon	-	2170	6	Intergenic	novelGene_69939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	611.229384110417	1	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	469	1677	190008	149618	TRUE	20	TTGTAAACGGCATCCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQTVLGTGLRGPRSKTRKQRPKPVTWAAYRSLQGRPGSLQCRPPRKKRISRQLASNLPSPLESTERSTEEVAPEKPPPEPPKEGPSPAPQAGTQSLHAQARAHPQSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLICKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190476	148591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149053_149585_149939_154425_154590_160928_161061_183135_183418_189698
740850	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
740852	contig_4301_pilon	-	2471	1	Intergenic	novelGene_65140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGAAATCTTCCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626984	624513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_624500_627000
740858	contig_7457_pilon	-	1348	3	Intergenic	novelGene_31429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.5	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAACAATAAATATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470658	468268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289
740861	contig_12125_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_76260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAAACAATCACGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686305	688324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_686300_688300
740862	SIRV5	+	411	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-81	875	33	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8234	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
740863	contig_10482_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_152834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCACAACATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120894	118810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_118800_120900
740867	SIRV6	-	384	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	-150	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCAATGGCGTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
740870	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	407	-2	-237	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACGCTTCCACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
740872	SIRV6	+	220	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	509	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11096_11195
740873	contig_15304_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_30509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	185	1009	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54284	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
740878	scaffold_19766_pilon	-	2003	2	Intergenic	novelGene_34256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGCAGGCTGGCTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180065	171411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_172066_178716
740889	contig_6576_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_42312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAGTGAGGGCTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526287	527246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_526300_527200
740895	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
740897	contig_11285_pilon	-	1340	13	Intergenic	novelGene_5539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	302.385090663471	54	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	619	1185	742691	741540	TRUE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHTVSWVPVSRLRWLRVAGAPCGWAGGPLPCGMFLSQVGTQGVHCTALSSLMSVSVPQALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745411	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741287_741454_741656_741737_741819_741892_741975_742188_742349_742563_742752_742933_743031_743214_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
740899	contig_19647_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_144024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	614	1012	135690	136088	NA	70	AAAAAAAAAAAATCTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGYPTWYAPTTRIAWACHQPQGPSRESKVSKCVQMPGDYNTPITLCLDAFSRTQKLYIPHDCIHYGESFALPIEMPGRAGCYQLFCCLTWKRHCVLLGLPFPAVGEVAARIKSFPSCHLQTCPDHALSSKW	135076	136931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_135100_136900
740901	contig_13305_pilon	+	1498	4	Intergenic	novelGene_146785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.3364778474973	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	43	942	263836	266896	FALSE	30	CTTTAAAGGAGCCATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCVQKADDGCSPQKMKAVKCAPDADVCTEAVGAVETIHGQPAVAVRGCGSGLPGKNDRGLDLHGLLAFIQLQQCSQDLCNTKLNLTSGALNPAGNESAYKPNGIECYSCMGLSPEACQGSAPPVVNCYNASDHFYKGCFDGKVTLTAASVTVSLPIRGCVTDELCTRDTVTGPGFTLSGSCCQGSRCNSDLRNKTYFAPRIPPLVLMTASQPTTPALTTSVTTSTPAPPTTSSTTKPSPAPASQTPPEEKKAEPEASQENGPTLAGGAAGHQDRSNVGKRPVKGELQDHSKGSSAPMVGLATLLLAVVAGALL	263793	267452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_263903_264977_265149_265442_265605_266396
740912	contig_6477_pilon	+	2515	1	Intergenic	novelGene_154163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	1430	2059	766301	766930	NA	15	TGGCACATGTGGGAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVAKPSVTVHPFLNIRRATLGKSPMSAVNVGRPSARAHLLFSIRGFTLERNLISAVNVGELSARMQTSQNTSELILEKSPTNAVSVRKPSVTVQPLFSIREFTLERNPTNAVTVGRPSVIVRISQTTRGLTLGKSPTNAMSVGRPSVTVQHFFSTREFIQERNPISVKHVGRPSARVQISQTIRGLTLERNPTNVVSVGRPSAKVQIL	764871	767386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_764900_767400
740915	contig_14322_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_116590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCGGCCACAGCAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
740917	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	303	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740918	contig_7816_pilon	+	2232	2	Intergenic	novelGene_66470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_1	0	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1318	1626	146640	148470	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKVCMVFLIF	145322	149076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_146703_148224
740924	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	156	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
740925	contig_1263_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_170409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATATATATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76786	74547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_74500_76800
740928	contig_6230_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_102087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTGTGAAAATACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116791	116296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_116300_116800
740930	contig_9290_pilon	-	2579	13	Intergenic	novelGene_77567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	18.448690107069	3	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	278	1183	509725	504291	FALSE	15	CTCTGCAGGAATGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFVSSSKGKGLFAKQLIRKGETIFVERPLVAAQFLWNALYRYRACDHCLRALETAEENAQRLTGKPGQVLPHPELCIVRKDLHQNCPHCQVMYCSAECRLAAAEQYHRVLCAGPSQDDPLHPLNKLQEAWSVHYPPETASIMLMARMVATVKQAKDKDRWIRLFSQFCNKTANEEEEIVHKLLGDKFKGQLDLLRRLFTEALYEEALSQWFTPDGFRSLFALVGTNGQGIGTSSLSQWVHACDALELKPQDREQLDAFIDQLYKDIEAATGEFLNCEGSGLFVLQSCCNHSCVPNAETSFPENNFLLHVTALEDIQPGEEICISYLDCCQRERSRHSRHKILRENYLFVCSCPKCLAEADEPNVTSEEEEEEDEEEEGDPEDAELGDEMTAV	516471	502894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_504442_504533_504605_505281_505377_506184_506242_506642_506750_507091_507163_507444_507508_508550_508656_509159_509227_509606_509729_510196_510337_511094_511204_516446
740931	SIRV6	+	543	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_3065_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740932	contig_2988_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_136550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTGAAAAGTATCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145208	144866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_144900_145200
740935	contig_9982_pilon	+	3312	1	Intergenic	novelGene_55744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATTAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313980	317292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_314000_317300
740937	contig_5954_pilon	-	1607	7	Intergenic	novelGene_28582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	30.2089942456437	508	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	106	615	933127	932026	TRUE	20	TATTACTGCTTTTTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRLLLAALLQLVPAQAPASQPDAPSHQKKVVSWMDVYARATCQPREVVVPLTVELMGTVAKQLVPSCVTVHRCGGCCPDDGLECVPTGQHQVRMQILMIRYPSSQLGEMSLEEHSQCECRPKKRETAGKPDRDSTPHHRPQPRSVPGWDSVPGAPSPADITHPTPAPGPSAHAAPSAVSTLTPGPAAAAANAAASSVAKGGA	934101	930427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_931398_932003_932240_932472_932509_932700_932775_932941_933139_933456_933500_934050
740938	contig_14467_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_138271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341396	343390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_341400_343400
740940	contig_6837_pilon	+	1657	11	Intergenic	novelGene_149811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	23.9768638483018	419	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1041	1502	15460	17185	FALSE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11313	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
740941	contig_5910_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_168427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGCCTCAACCAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172037	171157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_171200_172000
740945	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740948	SIRV7	+	370	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTCACTATGTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	114772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114680
740949	contig_7051_pilon	+	2138	15	Intergenic	novelGene_64324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	31	junction_14	43.6682764412215	194	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2127	11	2137	248410	305019	FALSE	20	ATTTTCCACTCATGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVREPSSDLPEKGKRSKRPNVPHDEDSSDDIAGGLTCQHVSQAVSVNHVKKAVAENLWSVCSECLKETRFYDGQPVLLSDIWLCLKCGFQGCGKNSESQHSLKHFKSSRTEPHCIVISPSTWIIRCYECDQKLSTHCNKKVLSQIVDFLQKHVSKTQTSTFSRIIKLCEEKCETGEIKKGRKDSSVTSVKGITNLGNTCFFNAVMQNLAQTYILTELMNEIKENGTKLKIFPSSDSQLDPLMVELPSPGPLTSALFVFLHSMKETERGPLSPKVLFNQLCHKAPRFKGLQQQDSQELLHYLLDAVRIEETKRIQASILKAFNNPTTKTADDETRKKVKAYGKEGVKMNFIDRIFIGELTSTVMCEECANISMVKDPFIDISLPIIEERVSKPVLVGRMSKYRSSQETDHGHYSGTVTVENTHHQRKATKKHSSSKDKNQLIRDRKHVRKLSSGEEKTVVIYPKNENLEMNGDSSVSFASIMNIESTLNESPTDGSEKEASRSESSVDADSEASESESASNQTVLFRPSNVSCVCRDGPIHHPSASELPYTKETDSGDEGVADAISQLHLSSTITGGRDLDRENQPLNIPNNLCFSEEKRMISHSPQNAFQTLSQSYVTTSKECSVQSCLYQFTSMELLMGNNKLLCENCTEKKQKYQKETSSAEKKAEGVYTNARKQLLISAVPAILILHLKRFHQAGLSLRKVNRHV	248399	305020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_248510_253985_254159_256430_256535_262811_262913_275239_275383_276409_276506_278212_278344_283708_283797_290398_290481_292199_292292_294958_295016_295378_295526_299339_300019_301264_301363_304983
740952	contig_6710_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_97829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
740957	contig_12265_pilon	+	1705	11	Intergenic	novelGene_149433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_10	36.3539543928855	234	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	105	1688	19703	50211	FALSE	45	ATTAAAATGACTGAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRTLREVSAGLKKGQITPTELCQKCLSLIKKTKFLNAYITVTEEVALKQAEESEKRYAKGQSLGDLDGIPFAVKDNFSTSGIETTCASNMLKGYVPPYNATVVQKLLDQGALLMGKTNLDEFAMGSGSTDGVFGPVKNPWSYSKQYREKRKQQPHGENEDSDWLITGGSSGGSAAAVSAFTCFVALGSDTGGSTRNPAAHCGLVGLKPSYGLVSRHGLIPLVNSMDVPGILTRCVDDAAIVLGVLAGHDPKDSTTVQDPVKPFMLPSLTDMSKLCIGIPKEYLVPELSSEVQSLWTKAADLFESEGAKVIEVSLPHTSYSIVCYHVLCTSEVASNMARFDGLEYGHRCNIDVSTEAMYAATRREGFNDVVRGRILSGNFFLLKENYENYFIKAQKVRRLIANDFVNVFNSGVDVLLTPTTLSEAVPYLEFIEEDNRTRSAQDDIFTQAVNMAGLPAVSIPVALSNQGLPVGLQFIGRAFCDQQLLTVAKWFEKQVQFPVIQLQELMDDCSAVFESEKLASVSLKQ	19598	50228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_19727_29717_29878_30194_30294_32260_32358_36604_36782_40100_40277_40364_40478_42478_42672_43407_43526_46662_46869_49990
740961	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
740963	SIRV6	+	556	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1255_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740966	SIRV6	+	202	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	503	3	-333	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTCGAAGTACTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
740969	contig_3095_pilon	+	661	3	Intergenic	novelGene_75099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	7866	junction_1	151	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	91	660	147280	150694	FALSE	30	GTATGAACCATCCTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHW	147189	150695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413
740975	contig_3975_pilon	+	2198	3	Intergenic	novelGene_54889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCGCGGCGGCTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2096295	2099571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2096485_2097467_2099458_2099552
740978	contig_15293_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_146539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAATATAGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136642	134667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_134700_136600
740979	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
740980	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
740981	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
740983	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_89288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
740985	contig_12543_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_168382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGCTCTGTCCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354137	354606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_354100_354600
740988	contig_20600_pilon	-	2299	3	Intergenic	novelGene_137104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	12	47	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	569	898	23483	23154	FALSE	25	TTTATTTGCATATTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNKPLNCEAPPAIQLPTPTVQRPSPITLFQPSVSSTAQVAVQAPSLPLCPAVPPQRFAGPSQTDTHRLHSGTSHSVKRPTPVSLESTNRIPTSASTAHARFATSTIQPPKEYPSVSTCPRNAPIPQAPPIPHSHVYQPPPLGHPATLFGTPPRFSFHHPYFLPGPHYFPSSTCPYSRPPFGYGNFPSSMPECLGYYEDRYQKHEAMFSALNRDYPFRDYPDERTHSEDSRSCESMDGTSYYNSHSHSGEEYLNPMPQLDIGALENVFTAPTSTPSSIQQVNVTDSDEEEEEKVLRNL	74780	21752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_-_23536_43923_44417_74757
740989	contig_4812_pilon	+	2253	15	Intergenic	novelGene_103696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_8	61.3984976217178	28	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	828	1526	276420	299702	FALSE	65	CTTTAGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEEIAQSLKEEQKKVPSEASFSDVQLEEAESNSLTKSGSTESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKV	264399	300429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_264415_265584_265751_266428_266504_267603_267697_268733_268860_270334_270416_274401_274446_274901_275029_275869_275949_276398_276491_277571_277712_279166_279328_287773_287880_296906_297032_299606
740991	SIRV2	-	538	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1099	0	-64	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4796	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
740993	SIRV4	-	420	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1101	0	1101	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4057	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
741000	contig_6175_pilon	-	2155	2	Intergenic	novelGene_16362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	15	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	752	1054	1745513	1745211	FALSE	35	CTTTGACAAGAAATTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPSQLMISHLPLGSTLIMTAQLAFSFIPVPRSQVRPADLTRCYSSSPAAGLCLSQVHLPSAPKTPLCTCAPTPSPSHVAMPRLWGSPRACAVKCHLLL	1793719	1744109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1746156_1793610
741004	contig_10904_pilon	-	1217	8	Intergenic	novelGene_22755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	297.109613525008	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	30	833	662714	652486	TRUE	20	CATCTCTACTGTTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSSRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSS	662743	651955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660386_660634_661462_661614_661736_661763_661936_662222_662408_662445_662665
741007	contig_14068_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_165966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81457	83619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_81500_83600
741009	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_94804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
741010	contig_12270_pilon	-	318	2	Intergenic	novelGene_114081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	13	318	14409	13881	FALSE	20	GATGCCGCAGTTTATTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAE	14421	13880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
741014	contig_3277_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_74735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCATGAGAGCTCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229734	231030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_229700_231000
741015	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
741016	contig_4845_pilon	-	2626	4	Intergenic	novelGene_53611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	4.78423336480244	58	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	347	2581	201290	196750	FALSE	10	CTAGCTGCTGAGTGTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIWTCGWLPHLFLPHALLDCSSPLATPSLFSRLPAAPEPCPGPDSGWSPSGEGCAQALKDFSPEPARAVLALKNLPPGLGPWPLTRQRAALGDLVCRGAPAAWTAVGAIGRKACLRGEGEQVDTRQEEDLSLGPWRDICACEQSSGWTSLVQQGRRENEGNVAPVRIGKRLHLQVCRVVLPGFELLLWPWPPDDPSLTQPRLEKEAAVAVVTEVESAAQQEGASPGEDAAEPCTDIGHQWHTSLQAESTVSPGLKPQAQDHLSTGSQPLGPLLHDGSMDEEDPPQTQMPRKPQSSAAIQQGPESSETSSSSSSRDPQLHAYMAKKLCSPSDQPPPRAKTSEPKDQQAEEPQHSSFPAPLRSPPALAGSSSKQGRRYQCGECGKAFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDRAYGTRRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQGSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYHCPHCTDAFPQLPELRRHLISHTGEAHLCPVCGKALRDPHTLRAHERLHSGERPFVCPQCGRAYTLATKLRRHLKCHLADKPYRCATCGMGYTLPQSLKRHQLSHQPEVPSIPPSVPPAASESAMVLLQAEPELLDTSSERAASPAQDVIEVTISESQDKCFVVPEEPGPTHSLLLIHKDMGFSAWAEVVEMETGT	201636	196704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_198279_199068_199326_199547_199610_200903
741030	SIRV6	+	539	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741033	contig_14441_pilon	+	674	3	Intergenic	novelGene_100749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	326	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	191	634	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121197	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126496
741034	contig_5643_pilon	-	2990	4	Intergenic	novelGene_39175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	149	junction_3	18.6607133363712	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	1658	2863	776863	772569	FALSE	35	CCTTTAAATATCCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSPHTCLTLTPHLPFQITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVENNMQQQSVCHGDSGSVYVVWDDCAHHWVATGIVSWGIGCGKGYDFYTKVLNYVDWIKRVMEGKD	778520	772441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_773342_775224_775288_775435_775562_776619
741036	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
741037	contig_4364_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_2796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
741041	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_96839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741042	contig_9002_pilon	-	1860	11	Intergenic	novelGene_116723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	68.2894574586737	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	382	1722	328297	316878	FALSE	35	GAAAACATTGCTGTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKAPSPEKAEQESERLLKELYLFDVLRADRTTAAHGLELRVPFLDHRFSSYYLSLPPEMRIPKHGIEKHLLRETFEDSNLIPKEILWRPKEAFSDGITSVKNSWFRILQDYVEHQVDDTMMAAASEKFPFNTPKTKEGYYYRQIFERHYPGRADWLTHYWMPKWINATDPSARTLTHYKSAAKA	331868	316739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_317837_319052_319154_319664_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331583
741049	SIRV7	-	274	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91652	0	-91646	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCTTGAATTAGCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
741053	contig_6710_pilon	+	563	2	Intergenic	novelGene_93891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGATGGCTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	657179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
741058	contig_6710_pilon	-	492	2	Intergenic	novelGene_98048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	CCTTCTCCTCTTCTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741060	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_90568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653856	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
741061	contig_6065_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_132708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCCCAGCCGTATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507701	509616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_507700_509600
741066	contig_10976_pilon	+	3407	1	Intergenic	novelGene_155602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220453	223860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_220500_223900
741067	contig_1865_pilon	-	2110	11	Intergenic	novelGene_103233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	96.6324997089488	556	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	41	1282	93228	52441	TRUE	15	TTTGGATTAATGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACSAEGTGSDSEMAACMFYGRQFAAAALRSHGSRTALQAAAQGLGSSGLFNNVGLQVQQQQQRNLALHEYLSMELLQEAGVSIPKGHVAKSPDEAFAIAKKLGSKDVVIKAQVLAGGRGKGTFESGLKGGVKIVFSPEEAKAVSSQMIGKKLFTKQTGKKGRICNQVLVCERRYPRREYYFAITMERSFQGPVLIGSSQGGVNIEDVAAETPDAIVKEPIDIVEGIKKEQAVRLAQKMGFPHNIVDSAAENMVKLYRLFLKYDATMVEINPMVEDSDGAVLCMDAKINFDSNSAYRQKKIFDLQDWTQEDERDKAATEANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIKLHGGTPANFLDVGGGATVLQVTEAFKLITSDKKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGELD	93268	41173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52399_52449_52956_53084_56299_56443_56538_56701_68472_68612_72073_72203_76048_76212_76399_76500_87792_87974_93138
741069	contig_18869_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_56354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACAACTAAAATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77957	73362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73728_77942
741070	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741071	contig_2646_pilon	-	1117	3	Intergenic	novelGene_69619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	43.5	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	598	963	2070203	2069499	FALSE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVAVAGLLTVLVSFLDVRSIILGKSHYVLYGLVAAMQPRMLVTFDEELRPLPVSVRVGQAVDVVGQAGKPKTITGFQTHTTPVLLAHGERAELATEEFLPVTPILEGFVILRKNPNYDL	2070800	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070139
741078	contig_6885_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_83653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGAATGATTAACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156901	159449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_156900_159400
741079	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741080	contig_6418_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_81140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTGCCTTGTTTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203385	201418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_201400_203400
741086	contig_6710_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_94774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653658	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
741088	contig_16775_pilon	-	637	4	Intergenic	novelGene_107810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	20.0055547841649	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	188	637	324617	323433	FALSE	40	CAGCAGAGGAACCTAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDFAEEEEVQSFGYKRFGIQEGTQCTKCKNNWALKFSIILLYILCALLTITVAILGYKVVEKMDNVTGGMETSRQTYDDKLTAVESDLKKLGDQTGKKAISTNSELSTFRSDILDLRQQLREITEKTSKNKDTLDKLQASGEALVDRQSQLKETLENNSFLITTVNKTLQAYNGYVTNLQQDTSVLQGNLQNQMYSHNVVIMNLNNLNLTQV	489994	323432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_323795_324529_324629_333540_333664_489941
741090	contig_8866_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_77875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAACGATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914287	916674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_914300_916700
741091	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	379	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741093	contig_15613_pilon	+	2762	1	Intergenic	novelGene_147198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGCCCCCAAAGGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80210	82972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_80200_83000
741094	contig_4659_pilon	+	988	4	Intergenic	novelGene_118179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTTGAATCACCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118396	122777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_118485_118913_119028_120654_120827_122163
741095	contig_12464_pilon	+	2391	4	Intergenic	novelGene_68724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAAGAGGAGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	382206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_376344_377988_379024_381087_381156_382100
741097	SIRV6	+	220	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	510	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
741099	contig_11656_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_54019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465988	466835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_466000_466800
741100	contig_13494_pilon	+	1854	5	Intergenic	novelGene_167504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	17.1464281994822	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	17	571	17153	23139	FALSE	20	GAATCCTAATGTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFTAKMKPDETPMFDPSLLKEVDWSQNTATFSPAISPTHPGEGLVLRPLCTADLNRGFFKVLGQLTETGVVNPEQFMKSFEHMKKSGDYYVTVVEDVTLGRIVATATLIIEHKFIHSCAKRGRVEDVVVSDECRGKQLGKLLLSTLTLLSKKLNCYKITLECLPQNVGFYKKFGYTVSEENYMCRRFLK	17136	24422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_17307_18514_18578_20427_20556_21977_22040_22991
741101	contig_11832_pilon	+	1289	2	Intergenic	novelGene_106966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	855	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTAAGCCTTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461890	463580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_462851_463251
741104	contig_6102_pilon	-	1786	15	Intergenic	novelGene_32374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	170.067813605308	69	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	142	1410	1743430	1727326	FALSE	35	GAGAATCGGGGAAAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGKTARARPWRQRDSRLYKRRS	1743571	1726949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1727387_1728864_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743394
741105	contig_14322_pilon	-	1045	2	Intergenic	novelGene_115612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	587	892	3174	2869	FALSE	45	AAATAATTTTGTAAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTHSQEKPYECKQCRKDFKWLMSLQTQMRTHTEEKSYKCKECGKTFKSPSSVPVHMRIHTGEKPYECGKAFNFSSALQYHLRTHTREEYYKSKVGKPPEK	18756	2715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_3677_18672
741106	contig_14322_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_115611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATTTGTAATTGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2513	2146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_2100_2500
741110	contig_13026_pilon	-	1813	5	Intergenic	novelGene_146304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	54.9772680296138	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	57	608	28091	19733	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPPPPALRACAAAAAAAMWAILPLLCAGAWFLGPATSDAAALSVSSYEKFHFQSWMAQHQKKYSSEEYPQRQQTFVRNWRKINAHNTRNHTYKMALNQFSDMTFDEIKQKYLWSEPQNCSATKGNYLRGTGPYPPFVDWRKKRTLCVTSEKPGMHGHPHPFPKNSHILRQNIGKKNSKEPQNHLKQIPNSIFLMSPAFFL	28147	18527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
741113	contig_12836_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_170410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGTATCTTTGGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	1924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_+_1600_1900
741114	contig_7078_pilon	+	1357	3	Intergenic	novelGene_130198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	137.5	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951255	966282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325
741117	contig_5649_pilon	-	2663	17	Intergenic	novelGene_82345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	7.05530607061097	20	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	225	2441	843612	818352	FALSE	30	CATATTTCACAAGCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPGEPLTSDTIDIAKLPLSYRINTPKEEQLLQVADNFSRQYSHLCPDRVPLLLYPLNECEVPKFLSTTIRPTLMPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPPTYLYSSTTVLKYQKGNCFDFSTLLCSMLIGSGYDAYCVSGYASQDLCLMDLTREVCPLTMKAKEVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVKITERFRRNPAKPADEDVAERVFLIVEERIQLRYHCRDDHITASKREFLRRTEVDSKGNKIIMTPDMCISFEVEPMEHTKKLLYQYEAMMKLKNEEKLSRHQAWESELEVLEILKLREEEEEGHMLTISIYDTKRNEKSKEYREAMERVMHEEHLRQMETQLDYLAPFLAQLPPGEKLTRWQAVRLKDECLSDFKQRLIDKANLIQARFEKETQELQKKQQWYQENQVTLTPEDEDLYLSYCSQAMFRIRILEQRLNRHKEMAPLKYLALEEKLYKDPRLVELLKVFA	846076	818129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_818446_818538_818679_819577_819773_820969_821081_821163_821275_821841_822058_823016_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_842588_842784_843519_843646_845532_845702_846054
741122	contig_3584_pilon	+	1108	5	Intergenic	novelGene_108187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1255.29538356516	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	347	1051	530695	531447	FALSE	35	TCACTCAATAAAGAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIILHSEGGQTG	528399	531504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_528477_528774_528877_529607_529683_530602_531369_531416
741123	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_94858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741125	contig_14322_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_116110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671658	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
741126	contig_6397_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_146254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGAAACCCTCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454445	455367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_454400_455400
741127	contig_14744_pilon	+	803	5	Intergenic	novelGene_66081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5392.60611277145	19	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1384434_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
741128	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741130	contig_6710_pilon	+	576	2	Intergenic	novelGene_92595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGAGCACAGTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
741132	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741133	contig_4891_pilon	+	865	4	Intergenic	novelGene_124544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	630.994981490873	110	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	148	798	701017	756919	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRPQECNIPAFPPLSWSCHCWPYQQLCSGRLGARDSAHVFAGRLGLPSHPLPEPRYLLQLSTWLYIGPKEKSLTTSSSPPPRGDPGNIYPRPDAAL	700869	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_756633
741135	contig_6137_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_59293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCACAAAAATGAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362379	1361113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1361100_1362400
741136	contig_3095_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_75110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4009.92178851409	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	43	852	147241	151893	FALSE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWEKCQPPSQRPQRIWCASWACWWVWWASLLAPFSSSRACAKAMLLNVVGLCEAPEAFLRRSMKKILL	147198	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151000_151163_151855
741148	contig_10324_pilon	+	1737	12	Intergenic	novelGene_7908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	91.7281286562462	196	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	120	1208	824693	835746	FALSE	0	GTCCTTTGTGTCTGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSLLLLLPFCSAVEVKRPRGVSLSNHHFYDESKPFTCLDGSATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGNFHCTNTGYKPLYIPSSRVNDGICDCCDGTDEYNSGIVCENTCKEKGRKERETLQQMAEVTREGFRLKKILIEDWKTAREEKQKKLIELQEGKKSLEDQVEMLRTAKEEAEKPEKEAKEQHRKLWEEQQAASKAQQEKELVASTFQELDDDMDGMVSVAELQTHPELDTDGDGALSEGEAQALLGGDSQTDANAFYDRVWAAIRDKYRSEVLPTDQPAPTTDLTEPKEEQPPPVPSPPSEEDEEEEEAEEEEEEEEEEEEPEAQGEQPKVCAAPVWEGDGGDQHDGA	824188	836275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_824276_824660_824778_824994_825112_825629_825726_825821_825880_826747_826866_828320_828451_831514_831600_832602_832682_833524_833612_833912_834094_835693
741153	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741155	contig_6710_pilon	-	470	2	Intergenic	novelGene_98135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	15	CTACCCACCCATCTCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741156	contig_7870_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_109092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAATCCCATTAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822162	824406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_822200_824400
741157	contig_11702_pilon	-	1114	8	Intergenic	novelGene_141952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.547133025917	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	128	781	319845	289501	FALSE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKAAVDGPTDKKEE	321151	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295577_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
741158	contig_6544_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_142118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCAGTCAAAAGCTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388183	387681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_387700_388200
741159	contig_6544_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_142117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387579	385606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_385600_387600
741160	contig_567_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_34000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588919	587241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_587200_588900
741164	contig_15888_pilon	-	952	5	Intergenic	novelGene_84403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1731.8379507044	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	10	369	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	253682	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251874_252000_252301_252468_252539_252807_252833_253402
741165	contig_6589_pilon	+	1353	6	Intergenic	novelGene_26057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	955.991129665961	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	234	1190	1726632	1731484	FALSE	15	CTGGGAACCCAGGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1726398	1731647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1729026_1729234_1730067_1730152_1731406
741170	contig_1082_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_170422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCACAGGAGGAGTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28389	26960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_27000_28400
741171	contig_12270_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_113148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	23	379	14409	13830	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14431	13829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
741172	contig_6710_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_89096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653599	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
741174	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741180	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	2	3619	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741183	contig_5758_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_119090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCCTTATGAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169207	170712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_169200_170700
741185	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741195	contig_8452_pilon	+	1911	5	Intergenic	novelGene_48078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGCTCTGCTCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956461	991151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_958027_968671_968752_972861_972935_981638_981738_991057
741196	contig_11630_pilon	+	1889	4	Intergenic	novelGene_147173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	40.0360948256556	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATAAGGTTGAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77622	156258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_131895_132059_154709
741200	contig_12852_pilon	+	2501	13	Intergenic	novelGene_141434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_12	190.792845049866	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	380	1942	313209	474263	FALSE	35	TGAAGGATTTTCTTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTSTTGSTLLQPLSNATQLPIDQVNFVVCQLFALLAAIWFRIYLRSSKTSSFIRHVVATLLGLYLALFCFGWYALHFLVQSGISYCIMIIIGVENMHKYCFVFALGYLTVCQITRVYIFDYGQYSADFSGPMMIITQKITSLAYEIHDGMFRKDEELTPSQRGLAVRRMPSLLEYLSYNCNFMGILAGPLCSYKDYITFIEGRSYHMTQSGEDGKEEIQYEKTEPSPNIAVTQKLLVCGLSLLFHLTVSKTLPVQYNIDEHFQATASWPTKVIYLYVSLLAARPKYYFAWTLADAINNAAGFGFRGYDKNGAARWDLISNLRIQQIEMSTSFKMFLDNWNIQTALWLKRVCYERASFSPTIQTFFLSAIWHGVYPGYYLTFLTGVLMTLAARAMRSNIRHYFMEPPQLKLFYDVITWIVTQIAISYTVVPFVLLSIKPSFMFYSSWYYCLHIAGILVLLLLPVKKTQRGRNTHEKIQLSRSKKFDEQENSLGQNSFSTTNNVCNQNQEIASRHSSLKQ	312829	474822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_313284_369981_370128_379522_379601_410516_410613_425611_425668_448985_449041_455285_455470_461206_461400_465256_465361_467532_467598_469052_469186_472149_472302_474037
741201	contig_10923_pilon	+	1693	10	Intergenic	novelGene_66216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	806.313972483562	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	145	1131	23028	37418	TRUE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLLIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGLWLCGWLHSQHPRLGGHGALLCCGLHLHHFIAPHGALWCSGVCAAP	21738	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133_30295_32909_33051_36532_36698_37275_37540_38578_38742_42554
741202	contig_14142_pilon	-	1547	15	Intergenic	novelGene_120599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	136.882435032433	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	178	1455	598441	584636	FALSE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKNSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598618	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
741205	contig_9594_pilon	+	1756	11	Intergenic	novelGene_73944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	516.858626705601	2	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	755	1330	319403	322451	FALSE	20	AAACTGGGATTTTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301226	322877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310594_310718_310851_315249_315354_316198_316296_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
741206	contig_4125_pilon	-	2619	19	Intergenic	novelGene_25210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	14.5046820878341	68	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	745	2238	10	2247	1657134	1625997	FALSE	25	AGTGAAACCAGGTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAECGASGSGSSGDSLDKSITLPPDEIFRNLENAKRFAIDIGGSLTKLAYYSTVQHKVAKVRSFDHPGKNTYIEACLDFIKDHLVNTETKVIQATGGGAYKFKDLIEEKLQLKVDKEDVMTCLIKGCNFVLKNIPHEAFMYQKDADPEFRFQTNHPNIFPYLLVNIGSGVSIVKVETEDEFEWIGGSSIGGGTFWGLGALLTKTKKFDELLHLASKGQHTNVDMLVQDIYGGACQTLGLSGTLIASSFGKSATADREFSKEDMAKSLLHMISNDIGQLACLYAKLHHLDRIYFGGFFIRGHPVTMRTITYSINFFSKGEVQALFLRHEGYLGAIGAFLKGAEQDNPNQYSWGENYAGSSGLMSSSPELCPAQRARSGTFDLLEMDRLARPLVDLPLLLDPSSYVPDTVDLTEDPMARKYWLSCFEEALDGVVKRAVASQPDSIDAAERAEKFRQKYWNKLQTLRHQPFAYGTLTVRSLLDTREHCLNEFNFPDPYSKVKQKENGVALKCFQQVVRSLDALGWEERQLALVEGLLAGNVFDWGAKAVSDVLESDPQFGFEEAKRKLQERPWLVDSYNDWLQRLKGPPHKCALIFADNSGVDIILGVFPFVRELLFRGTEVILACNSGPALNDVTYSESLIVAERIAAMDPIIHSALGEERLLLVQTGSSSPCLDLSRLDKGLAALVRERGADLVVIEGMGRAVHTNYHATLRCESLKLAVIKNSWLADRLGGQLFSVIFKYEVPTE	1657143	1625624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1626211_1627086_1627156_1627414_1627516_1628021_1628127_1628557_1628608_1629837_1629894_1631137_1631290_1632326_1632415_1632927_1633041_1634251_1634408_1636643_1636745_1637576_1637659_1638916_1639099_1649290_1649445_1649825_1649919_1650275_1650460_1651217_1651349_1651884_1651968_1657010
741214	contig_4469_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_21930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAATAACAGTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614340	614649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_614300_614600
741220	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741222	contig_15135_pilon	+	1797	5	Intergenic	novelGene_119858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.59807621135332	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATGTACAGGTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27919	37311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_28628_28802_28899_31513_31711_34145_34359_36728
741226	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741228	contig_19851_pilon	-	930	5	Intergenic	novelGene_29823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGCCTCCTCCAGCGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56428	53456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53701_53922_53978_54059_54144_55648_55769_56001
741229	contig_12042_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_170433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149795	147463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_147500_149800
741231	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	337	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741233	contig_12357_pilon	-	1205	6	Intergenic	novelGene_6140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGATGTAAAAGGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53922	34258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_34286_42137_42258_46453_46571_51134_51238_52758_52842_53167
741234	contig_9673_pilon	+	1238	8	Intergenic	novelGene_119169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.384439262678	525	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143214	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_143354_145599_145856_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
741237	contig_15039_pilon	+	908	3	Intergenic	novelGene_110172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1988	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	105	722	329947	343905	FALSE	20	TCTGTATATAATCTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGILIKKLLREQIVADMYTYKEISFFVAEFIVKNTAEWIRQNGGWLILPSASKSQDHMGPYAGTRVDKLVRMHLQENGFVKKFEPRSGWLTFLEVTGKICETLFLLKQYY	329842	344091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_330367_331194_331285_343797
741238	contig_11335_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_104922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCCTATGATCATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366504	364657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_364700_366500
741241	contig_11538_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_152280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAAAATGTTCATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113438	111926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_111900_113400
741244	contig_8895_pilon	-	617	2	Intergenic	novelGene_170450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49148	32298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8895_pilon_-_32842_49074
741245	contig_5649_pilon	+	2051	8	Intergenic	novelGene_82271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_6	153.44652728131	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	214	987	25982	34768	FALSE	30	TCACTGTAGACCCAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	23206	35832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
741246	SIRV6	+	562	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
741251	contig_12841_pilon	+	2457	17	Intergenic	novelGene_55837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	47.9099089437665	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	72	2204	135400	163103	FALSE	30	ACTATTTTAATTTTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQGDCEFLVQRARELVQEDLWAAKAWLITARSLYPADFNIQYEMYTIERNAERTATAGRLLYDMFVNFPDQPVVWREISIITSALRNDSQDKQTQFLRSLFETLPGRVQCEMLLKVTEQCFNTLERSEMLLLLLRRFPETVVQHGVGLGEALLEAETIEEQESPVNCFRKLFVCDVLPLIINNHDVRLPANLLYKYLNKAAEFYINYVTRSAQIENQHQGTQDTSDLMSPSKRSSQKYVIEGLTEKSSQIVDPWERLFKILNVVGMRCEWQMDKGRRSYGDILHRMKDLCRYMNNFDNETHAKYKNQVVYSTMLVFFKNAFQYVNSIQPSLFQGPNAQSQIPLVLLEDVSNVYGDIEIDRNKHIHKKRKLAEGREKTMSSDDEDCSAKGRNRHIVVNKAELTNSIEVLESFKLARESWELLYSLEFLDKEFTRICLAWKTDTWLWLRIFLTDMIIYQGQYKKAIASLHHLAALQGSLPQPQITGQGTLEHQRALIQLATCHFALGEYRMMCEKVLDLMCYMVLPIQDGGKSQEEPSKVKPKFRKGSDLKLLPCTSKAIMPYCLHLMLACFKLRAFTDNRDDMALGHVIVLLQHEWPRGENLFLKAVNKICQQGNFQYENFFNYVTNIDMLEEFAYLRTQEGGKIHLELLPNQGMLIKHHTVTRGITKGVKEDFRLAMERQVSRCGENLMVVLHRFCINEKILLLQTLT	135328	163356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_135529_136076_136145_137529_137634_138335_138476_141744_141827_142250_142392_142828_143001_143849_144020_144779_144914_146710_146865_147477_147561_148261_148415_150711_150821_154702_154783_156032_156196_157359_157454_162946
741252	contig_9146_pilon	-	943	6	Intergenic	novelGene_79492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1999.01245618931	16	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	394	900	146356	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147509	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146426_146694_146997_147487
741256	contig_2043_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_169920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAGGCAGTAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742808	741070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_741100_742800
741261	contig_11017_pilon	+	1192	10	Intergenic	novelGene_128071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	672.562393268837	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	239	832	233889	294708	FALSE	10	GACTTTATTCTCTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPKPVKPGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLCQKSVGNC	233650	295068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285528_294676
741262	contig_5569_pilon	-	1839	11	Intergenic	novelGene_86756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	168.113652033379	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	5	1129	518076	490778	FALSE	25	AGTAAACCTGGCCCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMVVKMAAAAWLQVLPVILLLGAQPSPLSFFSVGPAPVAAADRSKWHIPLPSGKNYFSFGKILFGNTTIFLKFDGEPCDRSLNVTWYLKSADCYNEIFNFKAEEVETYLENLKEKRGLSGKYQTSSKVFQNCSELFKTQSFSGDFVHRLPLLGEKQEAKDNGTNLTSVGDKTVMHEPLKTWQDAPYIFIVHIGIPSSKESVKEKSLSTLFTMTVEVKGPYEYLTLEEYPLMIFFMVMCIVYVLFGVLWLAWSACYWRDLLRIQFWIGAVIFLGMLEKAVFYAEFQNIRYKGESVQGALILAELLSAVKRSLARTLVIIVSLGYGIVKPRLGVTLHKVVVAGALYLLFSGMEGVLRVTGVSTAQSELLWSVQMFSF	518080	490067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_490926_493479_493580_495265_495450_498327_498390_502948_503067_506858_506904_506993_507048_508772_508887_510884_510971_516537_516599_517923
741263	contig_13457_pilon	+	1885	13	Intergenic	novelGene_118350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	63.0077155769214	1	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	131	1717	60777	71127	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRHLAHRLRRRHQRCQRRPPLAVAPPAGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVIPLPSPLILPFLTSHTLLPGG	59280	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761
741268	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
741270	contig_5023_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_7107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTCTTTGTTTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62469	60545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_60500_62500
741271	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
741274	contig_10197_pilon	+	1641	8	Intergenic	novelGene_115289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.0568320864412	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	110	1204	1255988	1262220	TRUE	5	CTTTTGTTACCTTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRTHTLRCQPEISVQKESQAAFHRQSSLKLSKLRRMQALILLLWTGAFLGHGSSQNTGGSLEEGSPAPDTTGIPVEEEDPFFKVPVNKLAGAISNFGYDLYRVRSSMSPAANVLMSPLSVATALSALSLGAGQRTESTIHRALYYDLINNANIHSTYKELLATVTAPQKNLDSAFRIMFERKLRIKTSFVSPLEKSYGTRPRFLTGNPHVDLREINNWVQAQTKGKIASSTREMPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMSMSARSFVGGKEDKSLSLPLTKQSSRAPWGLS	1253860	1263481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1253969_1255986_1256072_1257966_1258166_1258884_1259041_1259455_1259660_1260794_1260938_1261911_1262270_1263093
741275	contig_1239_pilon	-	1761	5	Intergenic	novelGene_150415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_4	123.598897648806	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	180	908	684171	654367	FALSE	20	AATGCTATACTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNCLCALNLVYTLVSLLLIGIAAWGIGFGLISSLRVVGVVIAVGIFLFLIALVGLIGAVKHHQVLLFFYMIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEVCENNSVFACLCNRISWLYSDRGHGVSPFCDIQLLECINGWIFLLRTSIITGLGITRPGFYS	684350	653513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_654670_664901_665016_665573_665655_666283_666452_684108
741279	contig_9305_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_148177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7094	7385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_7100_7400
741280	contig_13292_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_142947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAATCCAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290631	289867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_289900_290600
741281	contig_1856_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_84887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317355	315952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_316000_317400
741282	contig_9345_pilon	-	859	2	Intergenic	novelGene_24585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTGTGTGTTTCCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945587	944541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945052_945238
741284	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_89736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653792	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741287	contig_14666_pilon	+	1175	6	Intergenic	novelGene_39572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1732.84568268499	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	91	1131	477340	485184	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKCTLC	477249	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483990_484139_484761_485169
741288	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741289	contig_8330_pilon	-	1599	8	Intergenic	novelGene_71963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	364.884326093313	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	172	876	2056084	2038853	TRUE	5	CTCCAGTTGTTTGTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056547	2032110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2032828_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056390
741290	contig_14133_pilon	-	2607	17	Intergenic	novelGene_119972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_8	48.3550911874851	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	326	2446	227234	213631	FALSE	30	TTTGCAGAGATAAATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRNKDNDKSRAKTPEDDEEERKRKEREDQMYRERLRTLFIIAVVMSLLNSLSSSGGNISWNDFVNEMLAKGEVQRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEVKDRIPVSYKRTGFFGNALYALGMTAVGLAILWYIFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTVVDGKMGKGISFKDVAGMHEAKLEVKEFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARHRAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSSFSNTEEEQTLNQLLVEMDAVTRQAASEGHVSPLPPGMGTTDHVIVLASTNRADILDSALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTRASSFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTSNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQRVVAFHESGHALVGWLLEHTEAVMKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	231386	213469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220461_220638_221852_222027_222355_222519_222935_223062_224401_224505_225467_225608_226191_226434_227173_227264_228605_228709_231193
741295	contig_4852_pilon	-	2429	9	Intergenic	novelGene_153975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.3369650644953	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	261	1274	94053	84651	FALSE	25	AGATCTTTAAGCATTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFWYKGAMGLKLGTKTQSSLTAEFEILTARESDAEQYYCAADNGYGPSLSELVSITVRIPVSHPVLTIRATGAQAVAGDTVELHCEVQRGSPPILYRFYHEDIILGNSSAPSSGGASFNLTAEHSGNYSCEADNGLGTQHSEAVPLNITVPTKNRREFITTGVIEGLLGALGPFTIVLLFCYWLKRKIGKQSASDPLRSPPSPVPQEITYLNSPTPVPLQPVYENVNLVSGDDIYSLVYCSQQEWVSLDIYSKLKQASDSDGDYEDAM	99964	83495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86885_86945_87165_87249_88776_88805_90256_90374_90697_90971_91135_91424_93959_94238_99888
741298	contig_12120_pilon	-	1565	7	Intergenic	novelGene_21411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	578.655745864691	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAACTTGTAGCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156959	23103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_123249_123397_156911
741299	contig_6691_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_60188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGCAGTTCTACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510745	508446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_508400_510700
741303	contig_5429_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_127786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTTGAAAGCCACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147418	149523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_147400_149500
741304	SIRV3	+	237	2	ISM	SIRV3A	SIRV303	2018	3	-11	3070	8	-1966	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGTCAGCTAATAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1952	4752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4568
741305	contig_9345_pilon	-	2023	7	Intergenic	novelGene_24723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	23.4574082114798	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	198	824	1014989	1012336	FALSE	10	CATGACTCTGCTGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPVLCSSMSLLYVQSGAGMEVPDGRLGAGNTGVNQIELQEIVFKNYYTAFLSIRVRQHTSIHTPAKWVTCLRNYCLMPDPHSEEGAQEYVSLFKHQMLCDMARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEGLPDPGRVSSEVQQMWALTEMIRASQTSTRIGRFDVDGCYDLNLLSYT	1015338	1011136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012975_1013434_1013549_1013799_1013977_1014872_1015007_1015158
741308	contig_14450_pilon	+	2722	1	Intergenic	novelGene_48989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATGCTGAAGAGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050993	1053715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1051000_1053700
741310	contig_8263_pilon	+	1286	4	Intergenic	novelGene_83117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	46.1976430375211	455	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	119	1285	207884	214322	FALSE	40	AGTGCATTTGTCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMYTCITCRVAFRDAEMQRAHYKTDWHRYNLRRKVADMAPVTAEGFQERVRAQRAMAEQESKGTATYCTVCSKKFASFNACENHLKSRRHVELEKKAVQAVSRRVEMMNEKNLEKGLGADSVDKDAMNAAIQQAIKAQPSMSPKKAPSAPRDESRGPVALADGGRVTHDREPAEKPPRLQWFEQQAKKLLKQQGEESEEEEEDLDGDDWEDLDSDEELECEDAGEMEEGAEEQDAEEDGAGERPPLGAIPVTECLFCSHHSSSLMKNVAHMTKVHSFFIPDIEYLSDLKGLIRYLGEKVGVGKICLWCNEKGKSFYSTEAVQAHMTDKSHCKLFTDGDAALEFADFYDFRSSYPDHKEGEDAGEAEAFPSDKNVEYDDDTMELILPSG	207765	214323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_208509_209805_210070_210315_210479_214207
741315	contig_8122_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_40180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAAATCCACTACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40963	43163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_41000_43200
741316	contig_9653_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_48273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005678	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1005000_1005700
741321	contig_14266_pilon	+	2169	5	Intergenic	novelGene_162249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	41.1126501213434	4	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	86	622	121123	149614	FALSE	20	TTACTGCCTATATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYPLPPALSQLRAGPTGPSRATRAQSLTMASLFKKKTVDDVIKEQNRELRGTQRAIIRDRAALEKQEKQLELEIKKMAKIGNKEACRVLAKQLVHLRKQKTRTFAVSSKVTSMSTQTKVMNSQMKMAGAMSTTAKTMQAVNKKMDPQKTLQTMQNFQKENMKMEMTEEMINDTLDDIFDGSDEEEESQDIVNQVLDEIGIEISGKV	121037	151161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14266_pilon_+_121157_136685_136778_143994_144190_147306_147410_149501
741324	SIRV2	-	679	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10964	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
741325	contig_13051_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_140111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGCCTTGGAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167203	167865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_167200_167900
741326	scaffold_13505_pilon	-	209	3	Intergenic	novelGene_111466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3080	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547466	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540199_541933_542033_547363
741336	contig_12079_pilon	-	3452	1	Intergenic	novelGene_67356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	3081	3452	164242	163871	NA	30	GGAGACCAATCTTTACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRPLVMHFSPWAPEPSGVGLLHLILKLIFIGCGTLECAQDKPVFLCTCVRRERRFSVYMQTHFSWPWKHLFSQLLQEPTDDHSVKGLGSCKSAKQRSIRNKRTRKYLKNDGSSRRVITIIET	167322	163870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_163900_167300
741339	contig_9578_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_67984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATGTTGACAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155232	1156841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1155200_1156800
741340	contig_14322_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_116415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCTGAAGGTACGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671368	671635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
741341	contig_16775_pilon	+	2243	4	Intergenic	novelGene_107753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	386.855126486504	16	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTAATTTTTGGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130233	143186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_141393
741342	contig_2342_pilon	-	2031	1	Intergenic	novelGene_132759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	106	414	262132	261824	NA	60	AAAAAAAAAAATCCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSCNHTVILSWFSLSSFCIPQFSQSVTFCVCILCLLLTAIKSIPTPGNPTCAEWNCSIGFSSLSPFGRSRLVPESSYFVSPEDDLCFSAFFSDAVLFIPT	262237	260206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_260200_262200
741354	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741355	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741358	contig_7189_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_117651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGAAAAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473695	472301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_472300_473700
741359	contig_12884_pilon	-	1883	9	Intergenic	novelGene_105018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	86.4543774195384	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	56	994	1137687	1126202	TRUE	0	TGCTGCTGGCCCCGTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIALGTDAIKIENGQSTATKLGLPPLTPEQQEALQKAKKYAMEQSIKSVLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAQRQRALAIMCRVYVGSIYYELGEDTIRQAFAPFGPIKSIDMSWDSVTMKHKGFAFVEYEVPEAAQLALEQMNSVMLGGRNIKVGRPSNIGQAQPIIDQLAEEARAFNRIYVASVHQDLSDDDIKSVFEAFGKIKSCTLARDPTTGKHKGYGFIEYEKAQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLRVGKAVTPPPCPCSHLPHLEASHPLLLWLPLPPQPRSLHRKQWREQQCWARWPRQDWCRLP	1137742	1125202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1125630_1125739_1126269_1126358_1126552_1126627_1126842_1126918_1127012_1127087_1127250_1130257_1130348_1130454_1130551_1137663
741360	contig_6100_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_168111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427916	426846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_-_426800_427900
741361	contig_20819_pilon	-	2582	7	Intergenic	novelGene_55701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_6	36.3627556711534	15	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	101	1252	123685	121782	FALSE	5	CTTGCAGTCTTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSLGAPHWVAVGLLTWAALRLLVAGHGGHGDLHDDLHEDFHGHSHGDSHEDFHHGHSHAHGHGHTHESIWHGHTHGHDHGRSHEDLHHGHSHGHSHESLYHRGHGHDREHSHGGYGESGAPGIKQDLDTVTLWAYALGATVLISAAPFFVLFLIPVESNSPRHRSLLQILLSFASGGLLGDAFLHLIPHALEPHSHHAMEQPGHGHSHSGQGPILSVGLWVLSGIVAFLVVEKFVRHVKGGHGHGHTHGHTHGSHVRGRQEYSSKEKQNSQEEEKDTGGARKKKGGSTGPKDGPVRLQNPEEETAGSDLRVSGYLNLAADLAHNFTDGLAIGASFRGGRGLGILTTMTVLLHEVPHEVGDFAILVQSGCSKKQVGVDWHQT	124094	120451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_122006_122217_122359_122508_122662_122801_122856_123016_123186_123274_123690_123998
741363	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741369	contig_1090_pilon	+	1615	2	Intergenic	novelGene_131133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCACTAAACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456854	459445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_457316_458291
741370	contig_4315_pilon	+	3430	4	Intergenic	novelGene_46772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_3	37.4165738677394	35	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1224	1601	288452	293317	FALSE	20	CGACTATACTCTGTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTELTGLKDVIKKNKRERDEDSLHHTDLFDSHMLWFLMHHLRQRRHHRRWREPGVGATDADSDESPSSSDTSDEEEGPDRVQCMPS	287228	295146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_288476_291955_292076_292480_292598_293200
741374	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	310	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741375	contig_10779_pilon	-	1193	7	Intergenic	novelGene_165519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	964.533810823769	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1047	145	1191	62053	52861	FALSE	20	CTCCCGGATACCCCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSSVTVRTVTVNKPQRSLLPHLHLQGTPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLDTPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPALLPEGLGSTEPPQHHQDSKGKGSGDSSSTASHEHSESKDPAPKSSSKTTRIPSEGPHPGKRSGPKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASTQADLRASLQVESEPGLLPYGSKDQTSKDKPKVKTKGRPRAGENKEPKPAVPTPSERKKHKSTPPAPSKVLSAPEPTKDNVEDRSPEHFALVPLTQSQGPPNSGRGSRTSGCRQAVVVQEDRQKDKLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDL	84319	52858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_53668_59425_59579_61842_61886_62009_62065_74901_74954_76889_76927_84275
741378	contig_14563_pilon	-	2222	2	Intergenic	novelGene_135058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_1	0	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTAGTCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159400	156838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_158575_158914
741380	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_96296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741384	contig_3956_pilon	+	1091	2	Intergenic	novelGene_14747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	63	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACAAAGATGTAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686850	688419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_687330_687807
741388	SIRV6	+	360	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2874_10720_10819_11031_11109_11205
741390	SIRV6	+	325	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1682	0	-217	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2806	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741396	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741397	contig_5586_pilon	+	3247	15	Intergenic	novelGene_143614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	25	junction_5	27.8270900163044	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	95	2266	800088	854817	FALSE	35	AAATAAGGCAGTATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYAADEKTLFQEIADIIKRYDPDILLGYEIQMHSWGYLLQRAAALSVDLCKMISRVPDDKIENRFSAERDDYGSDTMSEINIVGRITLNLWRIMRNEVSLTNYTFENVSFHVLHQRFPLFTFRVLSDWFDNKTDLYRWKMVDHYVSRVRGNLQMLEQLDLIGKTSEMARLFGIQFLHVLTRGSQYRVESMMLRIAKPMNYIPVTPSVQQRFQMRAPQCVPLIMEPESRFYSNSVLVLDFQSLYPSIVIAYNYCFSTCLGHVENLGKFDEFKFGCTSLRVPPDLLYQIRHDITVSPNGVAFVKPSVRKGVLPRMLEEILKTRLMVKQSMKAYKQDRVLSRMLEARQLGLKLIANVTFGYTAANFSGRMPCIEIGDSIVHKARETLERAIKLVNDTKKWGARVVYGDTDSMFVLLKGATKEQSFKIGQEIAEAVTATNPKPVKLKFEKVYLPCVLQTKKRYVGYMYETLEQKDPVFDAKGIETVRRDSCPAVSKILERSLKLLFETRDISLIKQYVQQQCMKLLEGKASIQDFIFAKEYRGSFSYKPGACVPALELTRKMLTYDRRSEPRVGERVPYVIIYGTPGVPLIQLVRRPVEVLQDPTLRLNATYYITKQILPPLARIFSLIGIDVFNWYHELPRIKKATSSSGSEPEGRKGTISQYFTTLHCPVCDDLTQRGICCKCRSQPQHVAVILNQEIRELERKQEQLVKICKNCTGCFDRHIPCVSLNCPVLFKLSRVNRELSKAPYLRQLLDQF	796038	855798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_796096_800050_800167_808345_808465_818830_818950_820515_820658_822470_822716_823687_823797_826136_826344_829345_829456_835449_835565_845401_845540_846894_847086_847757_848005_849421_849632_854676
741399	contig_1575_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_45183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	520	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155571	152893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_152900_155600
741400	SIRV6	+	561	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	6	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	963	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741401	contig_11594_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_80881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1048	1353	36465	36160	NA	50	ACAAAAAAAATTTTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVFKEVQPECFLEARIMRQHLVYFGNVIRRDQSLEKGIMLGKVENQRKRGRPSVRWIDTVATTMGSSLTVIVRMAQEWAVFRSVLHRVAVSQNQLDGA	37512	35963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_36000_37500
741403	contig_14528_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_111291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCAAGGCTGTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258447	259394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_+_258400_259400
741406	contig_12427_pilon	+	880	2	Intergenic	novelGene_40419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_1	0	2480	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	244	777	209839	210372	FALSE	25	TCTAAGCTCAGAGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	208719	210475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_208743_209618
741407	contig_7300_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_170452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTGCAGGGTGGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309111	309392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_+_309100_309400
741408	contig_15188_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_163078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130929	131290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_130900_131300
741412	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741413	contig_6654_pilon	-	2570	9	Intergenic	novelGene_85703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	50.9458965472196	102	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	838	1647	469036	146756	FALSE	20	TAATAACTGTCCCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKEYRICMPLTVDEYKIGQLYMISKHSHEQSDRGEGVEVVQNEPFHDPHHGNGQFTEKRVYLNSKLPSWARAVVPKIFYVTEKAWNYYPYTITGKSLCSFLPKFSIHIETKYEDNKGSNNSIFDSEAKDQEREVCFIDIACDEIPERYYKESEDPKHFKSEKTGRGQLREGWRDSHQPIMCSYKLVTVKFEVWGLQTRVEQFVHKVVRDILLIGHRQAFAWVDEWYDMSMDDVREYEKNMHEQTNIKVCNQHSSTVDDIESQAKTST	469873	145832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_146762_150801_150921_161384_161449_165211_165368_194545_194642_242423_242496_281027_281128_307583_307733_468988
741417	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741418	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741421	contig_8954_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_130266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATCCTATAGGGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93271	91529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_91500_93300
741424	contig_12019_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_87695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATTTTTTGGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72519	73432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_72500_73400
741426	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741431	contig_15407_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_123100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	548	1003	538465	538010	NA	45	TAAAATGATTTCAACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWLSAWLLTKRLAVRTHQLLRGRKMWQSASVKSYSLGNPMGQFYCVLQGGYELESARWQWVLGQLFSKDLSSFFFPPSNWCFLLWQKKYIKELLPFQHFYDSVTLTMVIILCNHHHYPFPNFSIKRLAVLKTRQTYTCISPTAKTSMLKIS	539012	538009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_538000_539000
741435	contig_4754_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_35883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGGCTTGTGGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53452	52465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_52500_53500
741437	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
741440	contig_14563_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_135062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTCAGTTTGGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164142	161670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_161700_164100
741446	contig_11307_pilon	+	1325	5	Intergenic	novelGene_105239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	82.5753443831753	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTATTTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74028	88535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_78974_79041_79683_79834_87512_87600_87685
741449	contig_5226_pilon	-	2014	6	Intergenic	novelGene_140497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_4	74.3101608126372	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	117	695	28309	9316	FALSE	40	ACCCAGCATAGCCTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGGGGGGGGGCERDRGRRSHHVTFPGRSDACEVEVSVMFSFNMFDHPIPRVFQNRFSTQYRCFSVSMLAGPNDRSDVEKGGKIIMPPSALDQLSRLNITYPMLFKLTNKNSDRMTHCGVLEFVADEGICYLPHWMMQNLLLEEGGLVQVESVNLQVATYSKFQPQSPDFLDITNPKAVLENALRNFACLTTGDVIAINYNEKVRGSALGRTGPHKNTTRHPEQKQLKEI	28425	7996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_9473_11337_11469_15533_15656_17708_17742_18131_18265_28306
741450	contig_4924_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_84720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGCCTCTATACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108519	109071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_108500_109100
741452	contig_11096_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_143481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTATTTTGTGGGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271632	269523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_269500_271600
741460	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
741464	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741465	contig_6069_pilon	+	2292	10	Intergenic	novelGene_8027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	127.089158943584	41	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1545	2087	191502	193647	FALSE	5	TGGAGTTGTGTGTCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIQTRLAYVCCVRQLETVRSSDYCEYLRPPIDSYGTLDFGKFDEICEVGYQHGRTVFDIWVRSGVLDKMLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	171944	193852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_172170_172421_172473_189162_189221_189403_189474_189793_189911_190478_191646_191883_191992_192360_192446_193297_193402_193545
741469	contig_15859_pilon	-	1921	6	Intergenic	novelGene_50196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	133.358164354493	136	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	83	1378	349672	341031	FALSE	30	AACTTCAGCGTTACATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	352686	340487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_352636
741476	contig_10642_pilon	-	1261	2	Intergenic	novelGene_78720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	0	33	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGATGTGGAGGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921494	915906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_916462_920788
741479	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741480	contig_9852_pilon	-	1257	12	Intergenic	novelGene_138467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	14.7665021849069	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	146	1255	321634	293623	FALSE	25	ACCCATTGCTGTCAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGISSGWWLLTAERKKERAYYRTGGAVFSRPPGATPSPDPACRCRAAAMNSGAMRIHSKGHFQGGIQVNNEKNRPSLKSLKTDNNKLEKSKYKPLWGKVFYLDLPSVSISEKLQKDIKDLGGRVEEFLSKDISYLISNKKEAKFAQTLGRISPVPSPESAYTAETTSPHPSHDGSSFKSPDSVCLSRGKLLVEKAIKDHDFIPSNSILSNALSWGVKILHIDDIRYYIEQKKKELYLLKKSSTSMRDVGKRVCTQKTRTGRLKKPFVKVEDMCRFYRPFYLQLTNMPFINYSIQKPCSPFDVDKPPSIQKQTHVKLRIQTDGDKHDGTPIQLHLKEKKKKGYCECCLQKYEDLETHLLCEQHRNFAQSNQYQVVDDIVSKLVFDFVEYERDTPKKKSFILCGMFSKECLWTSADPQTQ	321779	293620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_293687_300720_300846_303702_303818_304294_304424_305727_305774_306538_306570_307458_307536_307750_307821_309131_309183_310643_310824_320319_320496_321588
741487	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	3	407	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741488	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741489	contig_6215_pilon	+	1746	14	Intergenic	novelGene_21174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	23.9298778361787	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	71	1579	161679	211212	FALSE	20	GTACTAGTGTTCATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATAAATSSFGCRIWNPCASLTMKQSSNVPAFLSKLWTLVEEAHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIIKQERDGPVEFQHPYFKQGQDDLLENIKRKVSSTKPEENKIRQEDLTKIMSSAQKVQIKQETIESRLSELKSENESLWKEVSELRAKHAQQQQVIRKIVQFIVTLVQNNQLVSLKRKRPLLLNTNGAQKKNLFQHIVKEPADNHHHKVPHSRTEGLKQRERISDDIIIYDVTDDNADEENIPVIPETNEDVISDPSNCSQYPDIVIVEDDNEDEYVPVIQSGDQSEPARESLSSSTDGTSPLMSSAVQLNGSSSLTTEDPVTMMDSILNDNINLLGKVELLDYLDSIDCSLEDFQAMLSGRQFSIDPDLLVDLFTSSVQMNPTDYINNTKSENKGLETTKNNVVQPVSEEGKKSKPKPDKQLIQYTAFPLLAFLDGNPTSAVEQGCTTSSEVMSSVDKPIEVDELLDSSLDPEPTQRKAKCT	161608	211379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_161772_190232_190342_190495_190624_191275_191401_196036_196113_198910_198973_199892_199981_201233_201383_201781_202022_202665_202772_206988_207043_209829_209915_210335_210510_211192
741493	contig_1863_pilon	-	1904	3	Intergenic	novelGene_156525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_2	11	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62713	54766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_56446_56899_57021_62609
741497	contig_5643_pilon	+	2308	12	Intergenic	novelGene_38984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	23.6608265017053	212	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	103	1407	599543	605319	FALSE	25	CATGATTGTGTCTGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRSLRGRRHSCSLCASAAVATGRACSPEEILGIMSIERIWAREILDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKQRYLGKGVLKAVDHINTTIAPALISSGLSVVEQEKLDNLMLELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAERELPLYRHIAQLAGNSDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFRDAMRLGAEVYHTLKGVIKDKYGKDATNVGDEGGFAPNILENSEALELVKEAIDKAGYTEKIVIGMDVAASEFYLDGKYDLDFKSPPDPSRYITGDQLGALYQDFVRDYPVVSIEDPFDQDDWAAWSKFTANVGIQIVGDDLTVTNPKRIERAVEEKACNCLLLKVNQIGSVTEAIQACKLAQENGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEELGDEARFAGHNFRNPSVL	598229	606220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_598317_599527_599628_600099_600196_600345_600405_600706_600777_601284_601419_601664_601888_603119_603318_604190_604393_604643_604753_604911_604971_605249
741498	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	20	3	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741499	contig_6418_pilon	-	1131	11	Intergenic	novelGene_81114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	426.619373681037	6	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	66	890	106563	68463	FALSE	35	ATGTTAGAAGCAACTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118013	68221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_106515_106575_117959
741500	contig_7171_pilon	-	1343	4	Intergenic	novelGene_101421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_3	43.6450328088878	318	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	118	423	1471745	1470832	TRUE	15	CGGGCAATTTCTGTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGLQRLGSGARREWLGRGKERNSGAGGPFPDLLRDVFRMVLQEAACGPGDGGCVAGAARQRTNRDLCSRLVSRERLVSRERQLVRGAPAVAAAVLQKRRNWSPRQPRGVTALRRRFLVRPRGGAPGRTAAASTGSGSAS	1474213	1468615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1469456_1470751_1470888_1471495_1471746_1474096
741507	contig_6387_pilon	+	2092	2	Intergenic	novelGene_165427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	158	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTTAAAACAATGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74742	92687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_74984_90836
741510	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741518	contig_12427_pilon	+	2202	17	Intergenic	novelGene_40406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	30.4866774181773	123	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	60	1715	6250	60048	FALSE	15	TAATTTGTGCTTACCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVFPFPEVDQEELNEINQFMGPVEKFFTEDVDSRKIDQEGEIPKETLEKLKSLGLFGMQVPEEYGGLGLSNTMYARLGEIIALDTSITVTLAAHQSIGLKGIIIAGNEEQKTKYLPRLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRTRATLSEDKKHYILNGSKIWITNGGLADIFTVFAKTQIVDSNNLIKDKITAFIVERNFGGVTNGKPEDKLGVRGSNTCEVHFENTKVPVENVLGEVGGGFKVAMNILNSGRFSMGSSVAGMLKKLIEMTAEYACTRKQFNKNLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMAYLTAGLLDRPGLPDCSVEAAIVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYMRDYPYERLLRDARILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRVLTSRINEIKQGNVSTIVETVGRRLRDSLSRTVDLGLTGKLGVVHPSLEDSANKLEENVYYFGRTVETLLLRFGKTIVEEQMVMKRVANILINLYSMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANIFCVEAYHQNLFTLSQLDKYSPENLDEKIKKVAQQVLEKRTYICAHPLDRTS	6190	60535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_6284_33630_33733_36185_36293_37394_37496_39300_39380_43868_44044_46431_46506_48983_49060_50697_50769_51046_51167_52617_52747_55689_55770_56575_56703_56999_57078_57996_58126_58843_58917_59947
741521	contig_5988_pilon	+	2298	13	Intergenic	novelGene_16036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	8.09663853432741	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	902	2164	843481	845894	FALSE	10	CTTCTAGTTTTCTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATKDPLPRGVSPTPSKIPILSQRSLPLSTSKPCALDQENQDPRLFASPPRQRLVQKPPFSIHRPLVGTAGPRPKTTHQSERSVESPQLRKPLEELTLSPGEQNVGPGPPPPTEAPGAIEFVADPAALATILSGEGVKSCHLGRQPSLAQRVLVRGSQRSTLQRGQGARASAYLAPRTPNHRLGLARASCFSRLEGPGPRGRTLYPQRLETLIPPSERSFHSSTRPNFLELRRVTGGSNRTSVSQASGLPVETPSQPASCLPEGEREVVTHSDKGRGGPLCLAQRVPLRETHTKDSRDSHLMPSPAPVAQPMPGRMVPPTVTRPSPFGWAQRVPSPHLSAPSRWVSGLSPQSCPEPEEPVLPWEQIAVQLFDQESSMRLQEEPAKPPVAPNELPPNRTPNLQELKMQRISILQQLLRQEVEGLAGDKYAALNGDLSLDMVELHPLLAEISRTLNAPEHNSGTSRLPRLSQHSDLQKPCLPEECGEPQPCPPTEPGVPDSCYKRESEIPETSPQQQPGVLEPCSPAEPEVPDSCYRRESEIPEPSLQQQSGVPEPCPPAEHGPHQHSPQGKTGFPQPHPRVEPGAPEACPREPGSPESIQQPHNNNQCAPVPTSLIFTSQHPLFTSPPIHSLQSLRPLPGQSGPRSLAPRTLALRQRLKACLTAIHCFHEARLDDECAFYTSRAPPPGPTRVCTNPVATLLEWQDALCFIPVGSAASQGSPS	839567	846028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_839698_839778_839987_840514_840673_840761_840900_841088_841172_841624_841678_842123_842234_843459_843601_843938_844005_844262_844395_844506_845210_845478_845673_845846
741524	contig_14666_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_39542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCACTGAGCCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450156	449391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449400_450200
741525	contig_16846_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_82881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGACTTGCCTATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243046	241659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_241700_243000
741526	contig_7979_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_125548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082684	1085250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1082700_1085200
741530	contig_5815_pilon	-	4175	1	Intergenic	novelGene_141172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATCAGCAGGGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89801	85626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_85600_89800
741532	contig_16722_pilon	-	2054	11	Intergenic	novelGene_118271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_1	33.0879132010467	276	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	231	1820	57643	50829	FALSE	15	AGTTCCACCCTTTCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNENANSPAARLNRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDATSPLQENRSNQGTVNWSVDDIVKGINSNNLESQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSPFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNKNPAPPLDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIEMVVKTGVVPQLVKLLGATELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVDILSKADFKSQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYAFQVPDDTPGTFNF	59244	50594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_50922_51582_51733_52784_52968_53193_53428_54004_54269_54360_54456_54715_54985_55663_55753_57284_57423_57568_57667_59037
741533	contig_12468_pilon	-	511	5	Intergenic	novelGene_164876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	285	junction_1	89.7785469920292	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	75	509	46753	10841	FALSE	50	AGAATCCGTCAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQRVSIFFDYAKRSKNTAWSYFLPMLNRQDLFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSDLNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTVSSSDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQYQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDIL	46827	10838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_10983_26889_26988_40622_40677_43865_43971_46717
741537	contig_9471_pilon	+	2336	5	Intergenic	novelGene_21705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAAACTGGATCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77529	105614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_79172_81091_81200_100470_100565_102735_103089_105475
741541	contig_15236_pilon	+	1736	3	Intergenic	novelGene_141668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	13	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	728285	728647	TRUE	20	TACTCCTACCACTGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRGAGGLSAFAPHPLCAVEAGAAVGLSTESAPSGPLLSSSCCRSVGALCPVWATLSPPQANAQSEVGVTEDYRQGSPVWGSVKSSKRITQPSSKSHLELWECWPLSDFERGAATPLCLV	728284	735060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_728791_732963_733034_733900
741546	contig_15108_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_131177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAACAATTAATACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89394	90582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_89400_90600
741552	contig_5590_pilon	+	2331	16	Intergenic	novelGene_163058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	26.9282173358893	669	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	699	2102	523307	530513	FALSE	15	GGGCGAGCCTGTGCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFRPLCKFCASVRRVRDIVPTLRAAMAAAQSGTPGPVFVELPVDVLYPYFMVQKEMLPIKPPKGLLGWAVTWYLENHLANLFAGAWEPQPEGPLPLDIPQAAPQQVQRCVEILSRAKRPLIVLGSQALLPPTPADKLRAAVETLGVPCFLGGMARGLLGRNNPLHIRQNRSAALKKADVVILAGTVCDFRLSYGRVLSRSSKIIVANRNREEMLLNSDLFWKPQEAVQGDVASFMLKLGEGLRGHTWGPDWVEELREADRQKEQTFREKAARPVAQHLNPVWVLQLVDETLPEDSVLVVDGGDFVGTAAHLVRPRGPLCWLDPGAFGTLGVGAGFALGAKLCRPDTEVWCLFGDGAFGYSLIEFDTFVRHKIPVIALVGNDAGWTQISREQVPSLGSNVACGLAYTDYHKAAMGLGARGLLLSRENEDQVVQVLREAQQQCQDGHPVVVNILIGKTDFRDGSIAV	520316	530742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_520509_521400_521546_522770_522973_523064_523193_523275_523416_523492_523605_525724_525825_525957_526056_526175_526313_527811_527947_529036_529152_529239_529410_529483_529555_529635_529708_529851_529958_530334
741553	contig_6837_pilon	+	1366	12	Intergenic	novelGene_149807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.3327337483147	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	204	1211	11753	17185	FALSE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHVTGKPVLPAWLNFSGGRKVLILRSGAVYVCARGITHPAPLTEDPNAVQEGKTSVEKAELDHGGSAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQVIAYSEHRYRIFGETIDIAVGNCLDRFARVLKISNDPSPGYNIEQMAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11279	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11475_11744_11868_13136_13257_13422_13599_15176_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
741554	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	746	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741555	contig_12622_pilon	-	1781	15	Intergenic	novelGene_6030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	402.477860970549	2	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	371	1063	1690387	1686951	TRUE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKTWGSRDVQSCAIPAVPTAAAPVLGAPKRGSSPAGRDPVPPRARQAAEFPPILRLPPRLRLQAPALLAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNW	1691508	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686958_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689960_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690917_1691093_1691276_1691482
741557	contig_6270_pilon	+	1331	8	Intergenic	novelGene_99816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	158.18227667176	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	537	875	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSPPDARTSPRSALEKSLFTGEETDLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	36562	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
741558	contig_3525_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_135111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21939	21573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_21600_21900
741559	contig_12622_pilon	-	2022	8	Intergenic	novelGene_5811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1120	1488	408895	401895	TRUE	45	GTAATGTCAATACTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILQIELSATLTHHLGFTFKKQSSARKSYLMFTDFDDYFRYLCQFVISPIINDAVVQNPLCVSQEGFCAAIHFLFSVLFQCTKVHGMKDVFCVVRMLFQWNGLLECVCPWLFHFLNGKLEQV	410014	349728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_349753_358490_358562_388905_389054_398268_398489_401823_401939_404555_404648_405787_405877_408751
741571	contig_12622_pilon	+	1957	6	Intergenic	novelGene_5873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	32.3196534634887	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	18	635	1207624	1212133	FALSE	35	TACAAAACTACGGTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1207606	1213455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932
741572	contig_4884_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_63787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAACAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177625	180035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_177600_180000
741578	contig_11656_pilon	+	1706	14	Intergenic	novelGene_54027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	165.033258258331	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	411	1385	520424	536565	FALSE	15	ACTTGGTACCAGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLA	485870	536886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513799_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_536558
741580	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_93423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
741581	SIRV6	+	551	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741583	contig_6710_pilon	-	502	2	Intergenic	novelGene_98000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	CTTCTTTAACTTTAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
741584	contig_5916_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_158050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCACTGAAATGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429956	431076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_430000_431100
741587	contig_12977_pilon	+	1379	14	Intergenic	novelGene_122790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	794.684210289119	1	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	428	1084	48712	57283	TRUE	20	GCCTTGCCACGGCCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10806	58696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38206_38274_47231_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
741592	contig_11898_pilon	+	648	4	Intergenic	novelGene_144305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	38.8844441904472	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	12	647	346650	371348	FALSE	25	TTCGGGAGAGCGCCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHKMILDRLNEQREQDRFTDITLIVDGVSKMAFRHLIEFTYTAKLMIQGEEEANDVWKAAEFLQMLEAIKALEVRNKENAAPLEENNAGKNEAKKRKIAETSNVITESLPSAESEPVEIEVEIAEGTIEVEEEGLETLEEVASSKQSIKYIQSTGSSDDSALALLADITSKYRQGDRKGQIKEEDGCAADPTSKQEHMKSHSTESFKCEICNKRY	346638	371349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_346720_355150_355296_370825_371187_371288
741600	SIRV6	+	363	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	408	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2874_10723_10819_11031_11109_11205
741601	contig_2636_pilon	-	900	5	Intergenic	novelGene_52081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	168.058025693509	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	117	632	85555	59826	FALSE	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85671	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_81113_81216_85551
741603	contig_9653_pilon	-	1089	8	Intergenic	novelGene_48223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_4	189.646825355309	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1014	76	1089	529435	522054	FALSE	20	GTAAGTCGGTGTGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETN	529510	522053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429
741604	contig_11933_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_107266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTAAAGGATATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154195	156591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_154200_156600
741606	contig_12038_pilon	+	2237	2	Intergenic	novelGene_165820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	277	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	471	1235	456274	457038	FALSE	50	ATACAGAAGAGTGTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKTPIYLKAANNKKGKKFKLRDILSPDMISPPLGDFRHTIHIGKEGQHDVFGDISFLQGNYELLPGNQEKAHMGQFPGHNEFFRANSTSDSMFTETPSPVLKNAISLPTIGGSQALILPLLSPVTFNSKQESFGPAKLPRLSCEPVVEEKPPEKGSLLENGAVNQGDTSWGSSGSASQSSQGRDSHSSSLSEQYPDWPAEDLFDQPSPCELIKEKTKSEESLSDLTGSLLSLQLDLGPSLLDEVLNVMDKNK	428534	458040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_+_428769_456037
741609	contig_12119_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_88677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAGAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360485	362775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_360500_362800
741611	contig_10331_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_54114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCAAATCCTCAGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330278	329492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_329500_330300
741613	SIRV6	+	566	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741614	SIRV6	+	249	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
741616	contig_10003_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_88237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAACAATTTACTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658826	657896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_657900_658800
741618	contig_10460_pilon	-	1805	8	Intergenic	novelGene_157464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	31.842725757596	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	22	1458	97739	83727	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERYLKLFTFLPLSEINHIMQLHVKEPEKRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLESAKRCTQALYHNSIDALEVMSDEELKELFKEASFSELVLDPGTSVLDTCRKANAIPNGPRGYRMITEGGVSINHRQVTNPESVLVVGQHILKNGLSLLKIGKRNFYIIKWLQL	97760	64341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_64445_65389_65428_65943_66013_83589_83887_86273_86445_86752_86909_95896_96065_96957
741623	contig_6005_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_158883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	498	800	300302	300604	NA	30	AGAGGTTGAGCAGTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERKREKTQKPFAVKLIPLTATLWDRVELPHSFRGAPGGFELPFFWLAAIALNRYTTRASGRGRGHVKEEKESLLLARLSRDKQCAVDEMNLGGKKTWI	299804	302407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_+_299800_302400
741624	contig_17198_pilon	+	1651	11	Intergenic	novelGene_62385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	26	junction_9	94.6869051136428	314	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	331	1188	1063432	1096421	FALSE	40	TAATTGATTGTATAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRKSWKTLDCSFWLACFPVAASSFCLFLISFPGALWHNSS	1047664	1096884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1092386_1092466_1096382
741626	SIRV4	-	263	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1260	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3898	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
741637	contig_6589_pilon	-	1155	2	Intergenic	novelGene_26309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGTCTCAGTACTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2310688	2306577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2307573_2310528
741639	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	44	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741640	contig_20507_pilon	+	2360	4	Intergenic	novelGene_164201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	316.61683818493	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACACTGAAAATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46048	56420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_46254_50610_50734_52471_52543_54459
741647	contig_14441_pilon	-	846	5	Intergenic	novelGene_100642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	169	324	126577	126154	TRUE	5	GCTGCCAGCCTGCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSL	126745	111308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111390_121819_121868_125511_125901_126149_126284_126551
741654	contig_10042_pilon	-	846	2	Intergenic	novelGene_79138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCCGATTCTGAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85431	84474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_84819_84929
741660	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	0	3590	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741661	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741666	contig_14176_pilon	-	2064	14	Intergenic	novelGene_74854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	9.47497482471558	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	96	1898	451628	413308	FALSE	50	AAACTTACCCTAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAPRAPLAQPVRPEPARQYPLGSSGVYGTFMKPPRGLARGDPGATMMQDASLGPLVGPSLSVLFLCRLAASMAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	451723	413141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351
741671	contig_14575_pilon	+	3378	1	Intergenic	novelGene_101922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTTTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381138	384516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_381100_384500
741673	contig_3905_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_170461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	9	308	195971	196270	NA	10	TCTCCCACTCTGTTCGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGMNYKEFHLKFTPCRGKMLKSFTMFVYRTISEMYSVFIIYSLLSTCKYMGHNLIHLMIPPGHHCVAVQAASWGLPQSYMPSLSHTLQASRLLLLYTCLAP	195962	198369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3905_pilon_+_196000_198400
741675	contig_5423_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_85177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	98	484	139154	139540	NA	30	AAAGCTCTTGGCTACTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQLLNLSKDNHAFKNRTFQILHCRAARICSCTIKIAQCVSSIYPRPTEVKQGPSSVRLPSQQDCKAFRSPSVSLAFPSCNHDLTQSVVSFTTPLPQVPSAFLLSSPPPSKIWGKYLIFSHLHLIDQ	139056	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_139100_141100
741676	contig_12050_pilon	+	1386	7	Intergenic	novelGene_62646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	222.40909503785	894	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	445	873	362088	363452	FALSE	5	GCTTGGAGCCCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	359598	363965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_361989_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
741677	contig_6364_pilon	-	1077	6	Intergenic	novelGene_51769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.602638499467	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATGGTTTTAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931339	902341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_902956_903014_903076_904266_904358_906457_906561_929810_929894_931214
741678	contig_7457_pilon	+	2912	13	Intergenic	novelGene_31557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	39.5418203368984	58	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	13	624	849939	851929	TRUE	0	TTTTTTCCCCTGCGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLRMWPPTKSITPDGSVTATYLRAAIASPRYETTHVFGRSLLRSIFTVTRRQLLEKFRVEKDKLVPEKRTLILTHFPKFLSMLEEEIYGANSPIWESGFTMPPSEGTQLVPRPATVSAAVVPSAPIFSPTMGGGSNSSLSLDSGGAEPMPAGEKRKLPENLTLEDAKRLRVMGDIPMELVNEVMLTITDPAAMLGPEPAVSQRSSG	849926	858673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_849970_850067_850261_851166_851274_851461_851573_851658_851799_851899_852104_852312_852440_852937_853447_853897_854481_854586_854624_854702_854767_854900_854986_857964
741681	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_116081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
741682	contig_14744_pilon	+	883	6	Intergenic	novelGene_66087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4247.99898305073	6	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1	486	1382976	1385190	TRUE	50	TAATTAAATAAGTGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRE	1382975	1386669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385181_1385233_1385820_1386006_1386499
741683	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_96360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653821	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741687	contig_91_pilon	+	2541	2	Intergenic	novelGene_127152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACACAAACAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360589	1368545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1361207_1366621
741691	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	3	406	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741694	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
741696	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741697	contig_11311_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_170464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTTAGAGTTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7809	7058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11311_pilon_-_7100_7800
741699	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741702	contig_7694_pilon	+	1918	14	Intergenic	novelGene_159931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	37.6409383077307	8	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	49	1623	185836	217511	FALSE	15	AGAAGTGTCTTGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVLDSQCLSEPRLLGSMAQKPLRLLACGDVEGKFDVLFNRVRAIQKKSGNFDLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYRNHIVLQENAQHATRFIALFSIIPMKLMDAAELVKQPPDVTENPYRKSGKDTTIGKQTPAPEEESACQFFFDLNEKQGRKRSSTGRHGKSSPHPKQPCKPPQPPGSCWFCLASPEVEKHLVVSVGTHCYLALAKGGLSDDHVLILPIGHYQSVLELSTEVVEEVEKYKATLRQFFKSRGKRCVLFERNYKSHHLQLQVIPVPLSCCATDDIKDAFISQAQEQQIELLEIPEHSDIKQIAQPGAAYFYVELDTGEKLFHRIKKNFPLQFGREVLASEAILNIPDKSDWRQCQISKEEEETLARRFRKDFEPFDFTLDN	185787	217806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_191858_191944_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227_199347_200220_200275_201907_202038_202967_203083_203644_203725_209965_210176_213862_213983_214447_214546_217366
741705	contig_14925_pilon	-	931	4	Intergenic	novelGene_55210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	150	407	29675	27020	TRUE	30	TTTGGAAGAGCAAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29824	25803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
741713	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741717	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
741718	contig_10446_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_162507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008474	1010435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1008500_1010400
741719	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
741720	SIRV7	-	249	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91677	0	-91671	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCAAATAAATTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
741721	SIRV7	-	347	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	4	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
741723	contig_14353_pilon	-	1705	6	Intergenic	novelGene_82141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	209.145499592987	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	77	727	407973	402843	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPRNQTVPHRWPAFPPRVNEKEIGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420332	401864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_420261
741727	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741728	contig_12239_pilon	+	2263	10	Intergenic	novelGene_170468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	62.4570963853499	65	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	198	968	24698	74567	FALSE	40	TTATAACTGTTTTCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQRKHLVKDFNPYITCYICKGYLIKPTTVTECLHTFCKTCIVQHFEDSNDCPRCGNQVHETNPLEMLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQELERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENFRCLNCSASQVCPQDGPLYQSYPMVLQYRPRIDFG	22090	75862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_22111_24520_24810_45246_45344_47054_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_67985_68046_74519
741736	contig_7234_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_145921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGACTAATCAATCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405996	408243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_406000_408200
741737	contig_20819_pilon	+	2022	15	Intergenic	novelGene_55667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	27.1620233083635	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	27	1859	54837	62431	FALSE	20	TTGGAATAGTGTGTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHQLVGLMETAPKPGGDVPHKKNKLQSKRKKPRRYWEEEETSPTAAGASPGPSRSKKRKQELRPRRPKNTHIQKKSRISKKPQVPRKSGERRNLVPQRTLSGAQDPFPGPAPVPVEAALKFRRIDKSKKLLHSKSKTRSRLEVADAEEEETSVRAARSELLLAEEPGFLEGDDGEDTAKIRQADIVEAVDIASAAKHFDLNLRQFGPYRLNYSRTGRHLAFGGRRGHVAALDWVTKKLMCEINVIEAVRDIRFLHSEALLSVAQNRWLHIYDNQGIELHCIRRCDRITRLEFLPFHFLLATASETGFLTYLDVSVGKIVTALNARAGRLDVMTQNPYNAVIHLGHSNGTVSLWSPAVKEPLAKILCHRGGVRAVAVDSTGTYMATSGLDHQLKIFDLRGMFQPLSARTLPQGAGHLAFSQRGLLAAGMGDVVNIWAGQGKGSPPSLEQPYLTHRLSGHVHGLQFCPFEDVLGVGHNGGITSMLVPGAAEPNFDGLENNPYRSRKQRQEWEVKALLEKVPAELICLDPRALAEVDVVTLEQEKKERIERLPKPKQKGRSSTASLVKRKRKVMDKEHRDKVRQSLEQQQHDQEKKTKPTGTRPSALDRFVR	54810	62594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_56288_56394_56486_56638_56757_56894_57088_57189_61094_61409_61556_61652_61826_61923_62138_62220_62329
741739	contig_5286_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_157374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTCCTAAACTTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578280	579103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_578300_579100
741747	contig_10599_pilon	-	1715	6	Intergenic	novelGene_49890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	3.44093010681705	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	22	1005	247905	232924	TRUE	15	TTTTATGTATCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCPLLLRMQHLRKPSESGPLSILGGLGREPFGGVQSLYFESSSRDVRNGEGEHEVVRRDAPRAASPPALSRRPGIVIRCLSSVESLRPLASREVSARREREDSNGAQGQFHPAHRGPGDHFDPALDRFATEVEEFPDSSSCSTSREGPFRSGELILAETGKRQTQFKKLFRLSSVGHLNSNWGLVPFSEIVGKFPGQMLKSSSGKHFMLRRPALEDYVLLMKRGPCISYPKDMNMMLLMMNINPGDTVLEVGSGSGGMSLFLSKAVGSKGKVISFEIRKDHHDLAKKNYKQWRDSWKISHVEEWPDNVDFIHKDISGATNDMKSFTFDAHHTGY	247926	231460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_231887_231969_232048_232717_232942_238185_238377_245764_245868_247233
741750	SIRV6	+	527	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
741751	contig_16541_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_126762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGGTTAACAATCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470034	468330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_468300_470000
741752	contig_4496_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_66616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578357	576641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_576600_578400
741753	contig_21414_pilon	+	1094	11	Intergenic	novelGene_170479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	31.1064302034161	330	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	13	960	10629	21747	FALSE	25	TTAAAGCCCCCTTCGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPEVLESDLPGAVTLLKNLQEQVMAVTAQVQALTKKIQAGAFPTEKGLSFLEVKDQLLLMYLMDLSHLILDKASGGSLQGHAAVLRLVEIRTVLEKIRPLDQKLKYQVDKLVKTAVTGSLSENDPLRFKPHPSNMMSKLSSEDEEEDEAEEGQPEASGKKSVKGASKKYVPPRLVPVHYDETEAEREKKRLERAKKRALSSSVIRELKEQYSDAPEEIRDARHPHVTRQSQEDQHRINYEESMMVRLSVSKREKGRRKLASVMSSQLHSVTHFSDISALTGGTPHIDEDQNPIKKQKKMPKKGRKKKGFRRRR	10616	21881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21414_pilon_+_10641_11162_11223_11846_11919_18909_19048_19299_19385_19467_19521_19739_19864_19956_20126_20923_21081_21213_21272_21727
741754	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12996	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
741757	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	182	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741760	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_96363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653834	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741762	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
741763	contig_19744_pilon	-	2144	10	Intergenic	novelGene_120396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	974	1285	219232	215609	TRUE	20	TGGGGGAAGGGATTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGTHLSPGYIRTGTTNELSGIIIVPLSSLSITASFATKICLSAFVADIICISIHGVASWVIIKPHTRSCDRFTLMQTFIFQSHQGLSSDILIEFFDWIKQVF	225780	203199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_203398_205234_205334_206948_207069_211779_211902_212698_212888_213862_213971_215585_215796_218457_218566_219215_219382_224956
741765	contig_9335_pilon	-	1371	5	Intergenic	novelGene_147463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	31.0402963903375	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	84	1166	758602	642197	FALSE	65	AGCCTAGAAATAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVEAGGIFHRARGRTLDAFSAEKEREWKGPFYFIQGADPQFGLMKAWSVGDCDGGGDEWGQEIRLTEQAVQAINKLNPKPKFFVLCGDLVHAMPGQMLPSQWTEPKMRRSWSCCSAHLSAVPSPGEKNNAMYSPNPEHISEGMPWRKEQTEDLQRVLKDVDREIPLVFVSGNHDIGNVPTAESIAEFCQTWGDDYFSFWVGGVLFLVLNSQFFYDASRCPALKQAQDQWLDEQLSIAGERKCQHAIVFQHIPLFLQSLDEEDDYFNLSKSVRQEMADKLTEAGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758685	641991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_671128_671552_687096_687238_737269_737489_758532
741768	contig_5050_pilon	+	1458	4	Intergenic	novelGene_110263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.08248290463863	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATAACACATGGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314892	317500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_314911_315246_315323_315420_315496_316211
741771	contig_16666_pilon	-	1163	3	Intergenic	novelGene_61730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	705	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58243	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56025_56573_56664_58098
741772	contig_6557_pilon	+	3051	18	Intergenic	novelGene_33013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_8	61.3711269646688	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	6	1358	584235	588352	TRUE	25	AGCTCTCTAGTAATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSNSQDRKGKKGLIRNSRLLSYTGTVTSVLNEPAGFYELDGQLGLCLAYQQFHSFQRVVRPGVSLELQDVHLLQSVGGGTKRPVLAPCLGGAVLVRGFSHQKPKTQSSHQAHGASLYEQLVWERQLGLPLYLWASKALEELACKLCPHVLRHHQFLQRSCPGNPSLGLQLLAPTLDILPLPGSPVRNAHKEILEEPHHCPLQKYTRLQTPCSFPTLAALKEEGQSRAWASFDPKALLPLPEASHLPSCQLNHRLAWSWICLLPSAFHPAQVLLGVLVASSHKGCLQLRDQSGSLPCLLLAKHSQPVTDPRLSGCLVRAEKFQLIVERDVRSNFPSWRELNMAAFIQKQQARVYVQFFLADALILPVPRPFHRSATSSRLPQTEPPQPRWTPHRTEPAILAIPQGGPDEAELLCPPRSQSGGAQAHSQFPCVRQLAWGHPEEGGDWMGPT	584229	592654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_584307_584406_584536_585119_585353_585487_585666_585781_585983_587113_587241_587823_587939_588054_588384_588456_588548_588800_588995_589705_589795_589884_590060_590509_590588_590988_591134_591221_591287_591573_591740_591842_591970_592122
741775	contig_501_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_134900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATTAGGAAATGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759822	760448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_759800_760400
741779	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741780	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8132	2	607	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
741781	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	54	520	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
741783	contig_4136_pilon	+	2278	9	Intergenic	novelGene_161244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	10.1458119438515	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	103	1284	113004	133598	FALSE	20	TGTGGATTATGTGCTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTREEVDATLQIAKLNAVELLPAVHCLAFGPGASGAAAGDFCLLELEPALCQQLEAGHSLVIRGDKDEQAVLCSKDKTYDLKIADTSNMLLFIPGCKTPDQLKTEETHSNIIHTEIFGFSNNYWELRRCRPKLKKLKKLLMENTYEGPDSQKEKDSNRSKYTTEDLLDQIQASEEEIMTQLQVLSACEIGGYWRILEFDYEMKLLNHITQLVDSESWSFSKVPLKTCLQELGPLEPEEMIEHCLKCYGKKYIDEGEVHFELSADKICRATAQMLLQNAVKFNLAEFQEVWQQSVPEGMITRLEQLKGLALVDRQTRPEIIFLLKVDDLPEDNQERFNSLFSLREKWTEEDIAPYIQDLCGEKQTIGALLTKYARSSMQNGVKVYNSRRPIF	112901	134592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_113186_117147_117317_120577_120713_122858_122950_124900_125040_125517_125571_127598_127754_130241_130391_133489
741787	contig_5586_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_143599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTACTCATGTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616734	615545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_615500_616700
741789	contig_2062_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_139065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGTGGATGCTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477139	1478155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1477100_1478200
741793	contig_15304_pilon	-	1258	4	Intergenic	novelGene_30629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165.007743926022	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	157	603	66228	65289	TRUE	0	CTCTCCCGGGCCCTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYEILNLEE	66384	64536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65418_65721_66104
741796	contig_91_pilon	+	2223	11	Intergenic	novelGene_127097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAGAGAAGGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309966	380957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_310756_310802_311013_314485_314627_317393_317463_318497_318621_321981_322129_325296_325482_334661_334821_335110_335223_344031_344085_380722
741800	contig_4847_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_156155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	2202	2552	81972	82322	NA	55	CATGAAAAAGAAGATAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSWSHNTRRSCLIFYWPSLFRSQVIFFFYKSVYYCIVSFPLVIPFGSFHRSWNCLSVFLQHYDVTVALMVGFTLQQKWTPVADFTHHAHTASLSAVAVNSRFVVTGSKDETIHIY	79770	82324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79800_82300
741801	contig_1008_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_121610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCTGATTTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767263	768683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_767300_768700
741804	contig_3818_pilon	+	1258	11	Intergenic	novelGene_99302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.450129802642	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	503	1105	982979	990624	FALSE	25	TTCATTTATTGAGTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKEGRKKSVRVLVAVGNGRGAAGFAVGKAAERMDAFRKAKNKAVNFLHYIERYGDHTIFHDVSLTFKRTHIKMKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961604	990777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_967284_967375_968211_968350_973411_973538_982960_983052_986166_986214_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
741807	contig_15108_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_131173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCCAACAATGGCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65313	63302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_63300_65300
741814	contig_2894_pilon	-	2496	7	Intergenic	novelGene_86534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	5.4594464513864	129	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	120	1925	157711	152930	FALSE	10	CTGGGATTTTGTCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCIQAQYGTPAPSPGARDHLASDPLTPELSKPTMDLASPEAAPAAPTAPTALPSFSTFMDGYTGEFDTFLYQLPGTVQPCSSASSSASSTSSSSATSPASTSFKFEDFQVYGCYPGTLSGPLDETLSSSGSDYYGSPCSVPSPSTPSFQPPQLSPWDGSFGHFSPSQTYEGLRAWTEQLPKASGPPQPPAFFSFSAPTGPSPSLAQSPLKLFPSQATHQLREDESYSMPTAFPGLAPTSLHLDGSGMLDVPVTSAKARSGAPSGSEGRCAVCGDNASCQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYICLANKDCPVDKRRRNRCQFCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPKQPPDASPANLLTSLVRAHLDSGPSTTKLDYSKFQELMLPYFGKEDAGDVQQFYDLLSSSLEVIRRWAEKIPGFAELSPGDQDLLLESAFLELFILRLAYRSKPGEGKLIFCSGLVLHRLQCARSFGDWIDSILAFSRSLHSLVIDLPAFACLSALVLITDRHGLQEPRRVEELQNRIASCLKEHVSAMGGEPQPAGCLSRLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPPIVDKIFMDTLPF	160805	152358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_153187_154567_154747_154834_155038_155406_155559_155871_156002_156826_157714_160688
741815	contig_4125_pilon	+	1213	6	Intergenic	novelGene_25197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	102.277270202132	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	127	498	1510873	1517991	FALSE	30	GAGATTATTTTGACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFCT	1505592	1518706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517984
741816	SIRV6	+	532	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	42	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
741820	contig_4151_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_65277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1255	1566	644846	644535	NA	15	GCTGGAGGTTTGAGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGPCLCNTQLAEINVNVFQNQPIELPLAGYSPSTQLCSCMSETQGCVWVPWMLEIICFHKTCYLVTDFRKLYLSTKISRLLLQNVLTELRCREMVNLPTGES	646100	644365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_644400_646100
741822	contig_5780_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_29805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAATTAGTCTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123015	125123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_123000_125100
741828	contig_12638_pilon	-	1570	2	Intergenic	novelGene_33319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1730	junction_1	0	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304741	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534
741831	contig_14441_pilon	+	1045	5	Intergenic	novelGene_100339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4878036686951	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3	443	5977	116621	TRUE	10	GCTTGGCGCTGCCTACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRWCGERPALEDAGAASARGARAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGAIATGCYAVWQPGAALWRGDAALCPRQPDQGEPAQGGRV	5974	117784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6644_6905_113637_113711_116578_116963_117523
741832	contig_5649_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_82452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGGCCACAAGCCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516877	1518035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1516900_1518000
741833	contig_6084_pilon	+	2503	8	Intergenic	novelGene_127058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	906	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTCCAGAGAAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429779	444523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_431399_433032_433099_433811_433891_435337_435490_436606_436732_437314_437459_438023_438240_444421
741837	contig_1331_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_37863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281023	281845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_281000_281800
741838	SIRV6	+	505	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAAGTCGTAGTCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470
741839	SIRV2	+	717	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-51	223	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTGCTGGGAACGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057	1854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1736
741840	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741842	contig_13244_pilon	-	756	6	Intergenic	novelGene_86963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1670.748622624	40842	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299440	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254_297392_298566_298685_299011_299281_299397
741846	contig_18859_pilon	+	2621	1	Intergenic	novelGene_150566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGCTTTCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288284	290905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_288300_290900
741847	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_113988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	26	349	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14434	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
741851	contig_3270_pilon	+	2468	1	Intergenic	novelGene_104475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164572	167040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_164600_167000
741852	contig_14219_pilon	-	1347	11	Intergenic	novelGene_54376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_1	786.248058821133	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	127	1251	1084399	1047262	FALSE	5	GTGCTCTTTGATTCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLRRGCEEQPGGGGGGSLSVSSREERTQGGAPAGTGGGPTMAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLLNLNHLGLILLVLHYFVEFLFHISRLFYFSDEKYQKGFSLWAVLFVLGRLLTLILSVLTVGFGLARAENQKFDLSAGNFNVLAVRIAVLASICITQAFMMWKFINFQLRRWREHSAAQAPAVKKKPTVTKGRSSRKGTENGVNGTVTSNGADSPRNRKDKSS	1084525	1047165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
741853	contig_4392_pilon	-	2704	1	Intergenic	novelGene_117312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCCTTAATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291590	288886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_288900_291600
741860	contig_11396_pilon	-	1093	6	Intergenic	novelGene_71284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	633.887497904794	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	127	429	243035	232299	FALSE	15	CTTTTGCTTTATTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249115	231634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243786_249034
741863	contig_1309_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_73970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180009	181832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_180000_181800
741866	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
741870	contig_3817_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_78389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCAGCCATTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036856	1035929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1035900_1036900
741871	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
741872	contig_6063_pilon	+	1945	14	Intergenic	novelGene_27582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGAGCGGGGCCTCGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16725	70264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_+_17210_18725_18828_20062_20209_25913_26118_27528_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36260_44356_44507_45549_45590_45739_45813_48194_48355_52963_53068_70137
741874	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
741876	SIRV2	-	633	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	312	3	312	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTTTGTTATCCTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4420	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
741877	contig_10904_pilon	-	1518	6	Intergenic	novelGene_22614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	328.277565483845	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	285	905	510205	499746	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGLGLTLFTCGPHTLHSLITILGTWALIQAQPCSCHALALAWTFSYLLFFRALSLLGLPTPTPFTNAVQLLLTLKLVSLASEVQDLHLAQRKEMATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTPAQPPCFHLEIL	514896	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499785_505068_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793
741880	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_90397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741882	contig_10253_pilon	+	1222	9	Intergenic	novelGene_76867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_8	99.1047425706762	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	47	1222	35544	85123	FALSE	40	AAGACACTGACCTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKKVKLSNNTQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTEDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGGVINLSVPIVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNAG	16217	85123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_35540_35656_41577_41814_47123_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84015_84222_84985
741883	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
741884	contig_5799_pilon	-	2788	1	Intergenic	novelGene_50262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225385	222597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_222600_225400
741886	contig_4678_pilon	-	1664	15	Intergenic	novelGene_126064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	64.7995338859527	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	21	1451	578108	571931	FALSE	30	CTGCCATTAAAGCACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESEPERKRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	578128	571717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574819_576989_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
741887	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
741888	contig_7171_pilon	+	1332	7	Intergenic	novelGene_101229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	397.131135632663	688	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGATTTCAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733632	764968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733830_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
741889	contig_15087_pilon	-	1921	16	Intergenic	novelGene_37153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.388936711556	13	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	563	1804	66689	33451	FALSE	30	AGATCAGCATTCCATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLQRLETTLSVCAEEPDHSQLFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRITGCFGAGALSTSTHSHLCQCHPQPGMKATPATSAKAQTEITRP	89751	33333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33592_41142_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66722_69120_69205_71087_71161_72504_72642_73969_74142_89687
741890	contig_7887_pilon	+	1526	6	Intergenic	novelGene_124935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	342.47125426815	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	185	598	583225	585801	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLFSGGVSESESGPLEEVELQVIPGTGSDTELQDAVGDGQDGLRELQASAPLGSVPSLQNMALLLDKLAKENQDIRLLQAQLQAQKEELQSLMLQPKRLEEENARLRGALQQGEASQQALESELQQLRTRLQGMKADCIVWGPDGVCLTWGSGLQGDKATEGQGPREQEPGSGFLEQKEQPVLFVTQPTGLGLRLLK	582322	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_582340_582478_582503_583003_583087_583164_583294_583892_584184_585747
741891	contig_6710_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_98166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	20	ATTTCAGCCTTGCAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
741892	contig_6710_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_97990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
741895	contig_401_pilon	-	1354	2	Intergenic	novelGene_42857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	268	1086	1722791	1721973	FALSE	5	TACTTCTGTGTCTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728001	1721704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1727923
741898	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-22	875	-22	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
741899	contig_5945_pilon	-	1531	7	Intergenic	novelGene_104567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	228.825018057224	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	59	787	249708	219523	TRUE	15	ATATGACTGTGCCTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNAASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249766	215591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
741900	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
741901	contig_15135_pilon	-	1695	7	Intergenic	novelGene_119883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_6	438.934568649538	40	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	40	945	122783	110793	FALSE	60	TAAACGAGAAAAAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGTLQGRRSTELTDLGLDSLDNSIACECAPEETESSESSLHPDFAKYLAETEETVKMTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNKQFCSKLGKYHMPFAWAVR	122822	110042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_110880_113400_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
741903	contig_8375_pilon	+	2466	2	Intergenic	novelGene_141256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	141	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAACAGCATTCAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5580	8197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_5721_5871
741906	contig_14333_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_49090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGAGCGGCTCGTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285148	283243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_283200_285100
741907	contig_2636_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_52098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1512	1820	77626	77934	NA	45	AAAAAAAGCTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREKNGYPYRQNKTIKIDSYLTAYPKINFRFIIHQQEKGKSIKLFEDNVEEHLHDISLVKASFLKTRSTVIKGKIYKYYYIKISNFCPSKDTIKRGKRLSY	76114	78098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_76100_78100
741908	contig_14792_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_170492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	435	429	863	74935	74501	NA	25	GACCAGAGGAGAGCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGTLAFICLKIWELKKKTERDKGKNTGNCKEKSSYPLGYAPSSTMPSLPPFNPRRIKIDLLLRLNMIWGVNRRLSTRIPLLYSYFPTGNGSESTYFRASQHSDLNGFRSKTKGNCHFTGLARKGNWKPKVKANLKAGTNEAGK	75363	74500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_74500_75400
741910	contig_12733_pilon	+	1245	12	Intergenic	novelGene_129600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_7	249.764285571631	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	78	1244	374496	422156	FALSE	20	GTAAGGCTTACCTGCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSAGRRLCGSAAGPAGRGRAHGRLMGFASTSASACSAVSAARKEMVPWVRTMGEKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYLHVLMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSLLPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPALLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENFVYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIELIVKARQKVKNTEFLQQAALEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRPLTLLIREILSGSVFLPSLDFLADPDTVNHLLIIFIDDSPPEKATEPASPLVPFLQKFAEPRNKKPSVLKLELKEIREQQDLLFRFMNFLKQEGAVHVLQFCLTV	374418	422157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_374696_403393_403515_404909_404987_405070_405150_410213_410258_412078_412167_418596_418682_420190_420348_421364_421441_421710_421756_421862_421944_422042
741919	contig_11476_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_170500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	709	2130	45	2174	26869	24740	NA	20	TGTTATTTTTACCATAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDFKLEVEKLSKRIMALEKLEDAFNKSKEECYSLKCNLEKERATTKQLSQELESLKVRIKELEAIESRLEKTEFTLKEDLTKLKTLTVMLVDERKTMSEKLKQTEDKLQAAASQLQVEQNKVTMVTEKLIEETKRALRSKTDVEEKMYSVTKERDDLKNKLKAEEEKGNDLLSKVSMLKDRLQSLEAIEKDSLKNKLKQDSAKSTTTLHQENNKIKELSQEVERLKLKLKDMKAIEDDLMKTEDEYETLERKYASEQDKAQLLSEELEHVKMELAKYKLAEKTESSHEQWLFKRLQEEETKSGHLSREVDALKEKIHEYMATEDLICHLQGDYSILQKKLNQQESRNKDLGREIENLTKELERYRHFSKGLRPSLNRRRISDPQVFSKEVQTEAVDNEPPDYKSLIPLERAVINGQLYEESEDQDEDPNDEEPVLSFKCNSSTPCPVNRKLWIPWMKSKEGYPQNGKIQTKPNGSFVQPGDLVLSHTPGQPLHIKVTPDHVQNTATLEITSPTTESPHSYTSTAVIPNCGTPKQRITILQNASITPVKSKISTEGLTNLEQGMSPITMATFARAQTPESCGSITPERTMSPIQVLAVTGSASSPEQGRSPEPIEISAKHAIFRVSPDRQSSWQFQRSNSNSSSVITTEDNKIHIHLGNPYMQAVASPVRPASPSTPPQDNRTQSLTNGALNKTTNKVTSSITITPTATPLPRQSQITVSNIYN	26913	24398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_24400_26900
741923	contig_19957_pilon	-	3178	1	Intergenic	novelGene_57754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATCCTTGAATGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420125	416947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_416900_420100
741925	contig_10855_pilon	-	1189	9	Intergenic	novelGene_124329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_5	42.2416781745233	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1179	9	1187	532569	514030	FALSE	25	CCAGCGCAGCAGCATCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMLEEAGEVLENMLKASCLPLGFIVFLPAVLLLVAPPLPAADAAHEFTVYRMQQYDLQGQPYGTRNAVLNTEARTMDADVLSRRCVMMRLVDFSYEQYQKALRQSAGAVVIILPPAMAAVPQDVIRQFMEIEPEMLAMETIVPVYFAVEDEALLSIYEQTQAASASQGSASAAEVLLHTATANGFQMVTSGVQSKAVSDWLITSVEGRLTGLGGEDLPTIVIVAHYDAFGVAPWLSHGADSNGSGISVLLELARLFSRLYTYKRTHAAYNLLFFASGGGKFNYQGTKRWLEDNLDHTDSSLLQDNVAFVLCLDTVGRGSSLHLHVSKPPREGTLQHAFLRELDTVTTHQFPEVRFSMVHKKINLAEDTLAWEHERFAIRRLPAFTLSHLESHRN	532577	514027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_514180_514702_514843_514940_515030_516372_516477_518995_519077_520570_520666_522592_522738_524495_524687_532385
741926	contig_10855_pilon	-	2077	7	Intergenic	novelGene_124328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_4	15.5286473618564	152	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	68	562	514011	508174	FALSE	5	CCCGTAGGTGTCTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLPAFTLSHLESHRNGQRSSIMDVRSRVDSKTLTRNTRIIAEALTRVIYNLTEKGTPPDMPVFTEQMQIQQEQLDSVMDWLTHQPRAAQLVDKDSTFLSTLEYYLSRYLKDVKQHYVKADKRDPEFVFYDQLKQVMNAYRVKPAIFDLLLAVCIGAYLGMAYTAVQHFDLLYKTVQRVLLKAKTQ	514078	506658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_508234_508436_508516_509226_509281_510417_510582_512404_512444_512523_512612_514000
741928	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
741930	contig_14694_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_152467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGAGCCCTGGTGGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88686	89390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_88700_89400
741940	contig_10143_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_163323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAATAAAGCATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13532	11551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_11600_13500
741943	contig_11259_pilon	-	2225	9	Intergenic	novelGene_144544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	44.530712716057	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	880	1695	223972	176423	FALSE	70	AAAAGCAAAAAACCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERNVYCGTYNIRILSDTWDRNRVIHYSGGDLVAVSSNRKIQLLDIIQVKEIPIEFRGHAGSIHALFLCEEEKFLLSGSYDLSIRYWDLKSGTCVRIFNGHQGTITCIDLYKNRLVSGARDCQVKVWDLDTGKCLKTFKHKDPILATRINDTYIVSSCERGTVKVWHFATAQLVKTLSGHEGAVKCLCFDEWHLLSGSADGLVMAWSMVGKYERCLMAFKHPKEVLHVSLIFLRVISACADGKIRIYNFLNGNCLKDGDQHGEQYYHVPV	234076	175892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_176468_179971_180072_206384_206528_207456_207606_213355_213478_221297_221499_223916_224042_226913_227037_233389
741946	contig_10163_pilon	+	2688	1	Intergenic	novelGene_82632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTGGTAAAAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119579	122267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_119600_122300
741947	contig_2332_pilon	+	1594	7	Intergenic	novelGene_58710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	28.5525830705385	231	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	96	1010	808593	857531	TRUE	35	CTAATAGCAAAATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTALLKLFVAIVITIILILPEYFKTPKGNVLELSCLEVCLQHNFTYSLSVLNFSFMTLLQPVREGQIIRGIFLNQSSFQNFTKLCQDIMSEFKMCSSCLVCESKGNMDFISQEQTSKVLVMRESMNVKASDFHLPCQHFNFTVASIVDPLEEYNITCNLNTHTRKSAIMVEDSAKENSINHSCRITEGLNSCIHVSLHLEMDIKSVICSMKITWYVLVLLIFILLIIFVIHKILEGHRRMQKWQSHKYKPTSVLLRESDSEKLRTLNVRVILGETMQRQPPTQVNMLLAPIPELEVTSAMYQ	808497	861242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_808681_829351_829622_833045_833307_839941_840062_842350_842435_857439_857546_860672
741948	contig_5968_pilon	-	1078	7	Intergenic	novelGene_112183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_6	472.291135494481	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	154	912	638341	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	691008	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_690866
741951	contig_9345_pilon	-	1393	5	Intergenic	novelGene_24653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1586.58217562155	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001333	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947815_947926_948065_955283_955356_997013_997093_1001156
741957	SIRV1	-	217	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3591	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6775	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
741963	SIRV6	+	336	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	536	-1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
741968	contig_4857_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_48705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGGCTTCCATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170079	1171774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1170100_1171800
741971	contig_6710_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_98296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTGGTTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653568	657830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
741977	contig_7004_pilon	-	2421	9	Intergenic	novelGene_126511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_3	77.4193128360101	530	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	525	1220	457349	455803	FALSE	0	CTGCTGCTGCCTGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATSEAEEEAATAEAVGRLAKTLWLRLRGWEAVLAAAQRLLVWEKPLHSLVTAAALNGLFWLLSSSSLRPFFLLSISLLAYLLLDLWQPRFLSDVPASSPEEPHSDSEGAGSGAQPHLLSVPELCRYLAESWLTFQIHLQELLQYKRQNPAQFCARVCSGCAVLAVLGHYVPGIMISYIVLLSILLWPLVVYHELIQRMYTRLEPLLMQLDYSMKAEADALHHKHDKRKRQGKNGPPGGDEPLAETESESEAELAGFSPVVDVKKTALALAITDSELSDEEASILESGGFSVSRATTPQLTDVSEDLDQQSLPSEPEEALSRELGEGEEAQLAPPEELLGPPQVLSRQALDSEEEDETAKETLLQLSSPLHFVNTHFNGAGSPTDGVRHPPRGTAGDAEPRGSDW	459610	454601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_456105_456351_456488_456644_456740_456885_457030_457330_457416_457810_457947_458312_458344_459026_459134_459426
741979	scaffold_19766_pilon	-	2106	8	Intergenic	novelGene_34258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	59.0022483141316	18	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	108	563	180569	179450	TRUE	25	AAACTGCAGGCTGGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESSPLLAYRLLGEEGVAFPANGAGGPGGTSARRLSTFLGVVVPTVLSMFSVVVFMRIGFVVGHAGLLQALAMLLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVRGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANICGCAICVLGLVEAVLDVFGAGL	181444	171412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_171879_176988_177113_177693_177806_177940_178049_178716_179590_180016_180152_180388_180611_181378
741985	contig_16667_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_153250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATAAAAAAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2678	4388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_+_2700_4400
741986	contig_14219_pilon	-	2010	10	Intergenic	novelGene_54297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	188.147958588414	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	149	724	676735	635889	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIAFLSEWGILDW	883252	627795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_628672_632777_632922_633201_633304_635724_635924_638846_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_883180
741990	contig_10074_pilon	-	2873	1	Intergenic	novelGene_57099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1425	1736	201929	201618	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASVGHPSTRQVRATNVIPPTEESSSPTASVIPPTEEGSSPTASVIPPTEESSSPTANVIPPTEESSSPTANVIPPTEESSSPTASVILSTEEGSSRGGGRS	203353	200480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_200500_203400
742001	contig_13440_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_170516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGGGAAATTAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100188	101469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_+_100200_101500
742005	SIRV6	+	537	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1180_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742011	SIRV2	-	620	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	26	2971	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
742013	contig_8412_pilon	+	2690	18	Intergenic	novelGene_118391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	25.2692079807088	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	313	2256	689323	715040	FALSE	15	TGCCAGTGTGCTATTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEGIARIVETHQPIVETYYGPGRLYTLIKYLQVECDRQVEKVVDKFIKQRDYHQQFRHVQNNLMRNSVTEKIEPRELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	684916	715474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711_686795_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694544_694703_695820_695880_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
742015	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742016	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742017	contig_10331_pilon	+	1288	10	Intergenic	novelGene_54189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	64.5619618163842	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	19	306	604724	608995	TRUE	15	TGTGTTCAGTTTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKCGFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKGKCSSMC	604705	620222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605105_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_617716_617757_618144_618264_619868
742019	contig_13453_pilon	-	2421	21	Intergenic	novelGene_146701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_20	181.891203745536	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2397	23	2419	126079	37839	FALSE	25	AATGTATTCCCATCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAFGDELFSVFEDDSTTAAGTKKDKEKGKWKGPPGSSEKAGKCVDVKLQSESTNSGKKRDADFESTDEPIFGKKIRIEESITEDLSLADLMPRVKVQAVETVEGCTHEVALPADEDYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYAIALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGLMTGDVTINPTASCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIILLPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGGDGLHLVVDENGDFREDNFNTAMQVLRDAGDLAKGDQKGRKGGTKGPSNVFKIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKKMVEEVFSNAIDCLSDEDKKLPQVEHVLPLLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETFAMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSPTIGKQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVEKVKKSEEQYNKIVIPNEESVVIYYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRLVKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSKESLKNSATEAAKPAKPDEKGEMQVVPVLVHLLTAISSVRLYIPKDLRPVDNRQSVLKSIQEVQKRFPDGVPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEH	126101	37836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_37953_38993_39105_44871_45001_49649_49719_50311_50485_54077_54229_55371_55498_62180_62283_63740_63852_65543_65624_66901_67034_68747_68851_69339_69439_70543_70669_75262_75354_76817_76993_102399_102513_103445_103509_112729_112797_114880_115016_125951
742020	contig_9578_pilon	-	1901	10	Intergenic	novelGene_67977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_9	117.522049415271	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	89	1360	1276296	1099466	FALSE	75	GGCCAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPREWSADLARFYTVTEPQRHRRGYTVYKVTARVVSRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEDFSSDSDLVSLTVDVDSLAELDDGMASNPNSPVRTFGLSLSSDSSALGAAASDSEQNKTEEERESRSLFPGSLKHKLGKRDYLEKAGELIKLALKKEEEEDYEAASDFYRKGVDLLLEGVQGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEGRCEPKLFTQRRMSP	1276384	1098924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1182314_1182678_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583_1251620_1276191
742024	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	196	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742026	contig_10627_pilon	+	1058	5	Intergenic	novelGene_59931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_4	100.688566878271	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	323	586	108135	109221	FALSE	40	CTTGAGAAACCACGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	106092	109693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_106116_107835_108139_108453_108573_108962_109005_109122
742030	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_94814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
742051	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
742054	SIRV6	+	534	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	31	3	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742055	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
742057	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742060	contig_19459_pilon	-	1287	8	Intergenic	novelGene_59857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	4	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	167	952	16240	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19126	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18984
742066	contig_7331_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_67234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	258	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	359	1080	25	1104	474002	472923	NA	75	AGACAAAAAAAAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLLQHLERFSEVLAVSRTTHVSTWDPATVRRALQWARYLRHIHRRFGRHGRIRAALERRLHNQWRQEGRSGPGTDPGLTNFQSLGRCDILLAVRLLDNRALGHAAYHHLLQQLFPGPGVPDTDEETLQDCLSRLARRRSAVHMLHLCGYRENPVVQEESLVKTQAELLLERLQEVGKAEAEGPSKFLSRLWERLPQNNFLKVIAAALLLPPSSPRPQEEELELGVPQTPGEGRQELVRWLLGKSDIMVVFCRNLPARLLASVVGRHPALSRVYLGLLTDWGRHLHYDLQKGSWVGAESQDLSWEELYNRFQSLCQASPPLKNEVLTTLESYKAQDGDFEVPGLSIWTDLLLALGSGT	474026	472261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_-_472300_474000
742069	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742070	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	6	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742071	contig_15063_pilon	+	1513	4	Intergenic	novelGene_13939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	198	1370	34808	36661	FALSE	20	ATGCTGGTCCTAAGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34610	36804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
742076	contig_383_pilon	+	3038	8	Intergenic	novelGene_126082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_7	46.5091608268342	60	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	56	1507	21066	44378	FALSE	15	TTTTTGTGTGCATATGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSLGQAEGRKPAESTEEMASCLKADWNRRFQTLVFRAAHLLCFSTLICELMDQREVAAWTYHHSTTAYPWNVSRAFCQKYYTDLVAIQNKNEIAYLNDVIPYYNSYYWIGIRKINKVWTWVGTKKTLTEDAENWADNEPNNKRNNQDCVEIYIKSSSAPGKWNDEPCWKKKRALCYTASCQDMSCSKQGECIETIGNYTCSCYPGFYGPECEHVRECGEVDLPQHLLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCPKGYTLKGPSKLECLASGNWTSKPPQCVATQCPPLEIPEQGSMACLPPEKELQHQSSCSFRCEEGFALVGPEEVRCTASGVWTAPAPVCKAVQCRLLEAPSKGTMDCAHPLAAFAYGSSCKFECQPGYRVRGSDTLRCIGPGQWTAPMPACEAIACDPMESPVHGSMDCSPSSQGFQYNTSCSFRCAEGFLLRGAKMAQCSDLGQWTAPAPVCQGTVTLGYCFYPLQPGRKYRPLHLAPIRHSLRIHYVLGMK	21010	45909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_21069_34860_34952_37371_37759_39957_40066_40538_40725_41553_41740_42327_42514_44073
742077	contig_5549_pilon	-	1924	6	Intergenic	novelGene_81649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_5	176.693406781351	77	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGGAAAAGTGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445663	441970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
742081	contig_10058_pilon	+	1756	11	Intergenic	novelGene_67666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	364.045395520943	85	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	289	1749	31601	47226	FALSE	30	TTGTATCTTTACACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRQEFEADRKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVAVQMEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMQHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDREDKSGKGTLRPAKSMDSLSAAAGASDEPEGLMGPSRPRPSPLLPESLENNSAEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAARAGGTSRSERCAGVHISDPYNISLPLHITSILNMPPNIISNVSLVRLTRLDGSGYGFGYLMEGKWGHSGHGAAFSDRLSHRFHSSKAQCL	31312	47233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38857_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_41898_41977_42737_43053_47098
742082	contig_5826_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_71517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	541	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGTGCTGGTACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174637	185422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_175006_184633
742088	contig_6710_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_97321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
742089	contig_12625_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_140485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCTACAGTAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19009	18522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_-_18500_19000
742090	contig_12625_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_140484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTACTCATTACATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18175	17074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_-_17100_18200
742093	contig_8452_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_47987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTATTGTGATCCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110368	111353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_110400_111400
742100	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
742101	contig_19098_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_65799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGATGGAATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203273	205286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_203300_205300
742102	contig_13904_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_165490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104202	104951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_104200_105000
742103	SIRV5	+	337	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-7	875	-7	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8308	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
742104	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742105	contig_21385_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_170520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9589	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21385_pilon_-_7800_9600
742106	SIRV6	+	559	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742112	contig_6497_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_35629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGTCTTATTTAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721014	720236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_720200_721000
742121	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
742123	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742124	contig_5153_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_74350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921211	923184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_921200_923200
742127	contig_10481_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_170530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAATTTGCAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74930	75733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_74900_75700
742128	contig_12837_pilon	-	1674	4	Intergenic	novelGene_57333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCACTTAAAACCATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166856	158778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_159393_161380_161492_163872_163967_166001
742129	contig_5331_pilon	-	1590	7	Intergenic	novelGene_112837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	143.859499358074	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	158	709	784416	781160	TRUE	20	TTGGCAGTCACGGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSTNFTPPAAAVPASLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAGCEQQAAKQQHLHHRQEERGGPGHAVPVPEADQWHLGAG	789127	778685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781279_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985
742130	contig_3975_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_54866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	0.816496580927726	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	78	353	430	2089059	2089136	FALSE	40	ACAGGTAAGTGGCCATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLRGVDSIEKRVADESGTITLRCKDLRVLQLDIEGVETTLDIACSIKLRRALSSLESVITSFPFLYRPKGLRLGDPWHLHSPESYYKRVAREVGAAVGAWAYGSAGPEGTDSTLLMTSLAQLILDPLSWTMAGFQELVGVD	2085585	2089136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2085625_2085800_2085919_2086294_2086464_2089032
742131	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_97021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742138	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	53	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742139	SIRV5	+	429	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7460	2	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
742145	contig_10074_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_57197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACTTAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589185	590620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_589200_590600
742146	contig_11145_pilon	+	1574	1	Intergenic	novelGene_160512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACACACAGTAAAGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50928	52502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_50900_52500
742149	contig_8878_pilon	-	943	7	Intergenic	novelGene_147862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	389.319242039515	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	221	607	228839	228170	FALSE	35	CCTAAGCAAGTGAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231699	227833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230322_230508_230570_231074_231121_231647
742151	contig_10263_pilon	+	3229	1	Intergenic	novelGene_135816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCGGGAAACGGCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51642	54871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_51600_54900
742152	contig_4392_pilon	-	2016	2	Intergenic	novelGene_117304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATACCTATTTCTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273528	271085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_272964_273390
742154	contig_3394_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_152711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAGTTACAAGTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522995	522051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_522100_523000
742155	contig_3394_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_152710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCCGCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520893	519340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_519300_520900
742162	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_93496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
742163	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742164	contig_13542_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_131473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCAGATTCTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215303	213441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_213400_215300
742167	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
742169	contig_1694_pilon	+	2069	12	Intergenic	novelGene_144923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	32.8407124876153	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	123	1787	436189	469133	FALSE	15	TTGTGACAGCTGCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKESKMQITPETPGRITVLNPFESPGDYSNLHEQTLSSPSVFKSTKLPTPGKFRWSIDQLAVINPVEIDPEDIHRQALYLSHSRIDKDVEDKRQKAIEEFFTKDVIVPSPWTDHEGKQLSEYQSSKCININSESPVGRKLTVHSEKSNAACQTLLSLPVDFNLENVLGDYFRADEFADQSPGNLSSSSLRRKLFLDGNGSISDPLSPASPSSPRSGAQASLEVFYSIDLSPVQCKSPVQTPSSGQFSSSPIQDNVKKYSLGSITSHSPISSPTLSPIAFQIRKAPLSEQRKLTFHSPDASSGTSSNGITNPRIGSPYIDGCSSIKNWSPMRLEMCRGGAQYRTSLIRIPFTLEAHSEDEEDKENTPPTDVSLPAMDTAGVQLRQLNSTHLVVTAMSITQNQFSASEKELALLQDVESEKENNTVDMVDPVEIADENTFHLKEAVDNGSLPMTDFMSGIAFSIENSHMCMVPLAESSVIPCENSNIQMDSGYNTQNYGSNIIDTVGAESYCKESDAQIYEVENKSQAFNTKQDHTTQRCWRKTANPSQCSSP	435160	469415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_435268_436173_436342_438290_438398_441596_441643_444968_445051_456227_456294_456849_456907_457313_457541_458102_458236_460273_460870_466736_466869_469067
742170	contig_19812_pilon	-	1547	7	Intergenic	novelGene_101002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.6871697861508	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	9	614	67090	50060	FALSE	0	CTTCGTGTTTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKEYLEFRKERSQMLQSRRNQLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKLRQGGADG	67098	49126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_50087_54056_54198_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
742171	contig_10986_pilon	-	1790	10	Intergenic	novelGene_71454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224.385470800078	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	302	1051	74333	67286	TRUE	35	ACTTCAGATGAACAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRYGGDRVDTAGRVWPLTL	80393	66363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67334_67427_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_76171_76245_80189
742173	contig_11115_pilon	+	1294	7	Intergenic	novelGene_102802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	158.193359180747	61	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	126	758	155489	157736	TRUE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	155042	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157779_157967
742174	contig_5649_pilon	+	1550	7	Intergenic	novelGene_82257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	146.358483032435	101	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	94	849	12779	35146	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAYLRSFHCSTLCAEGSSVHPA	12685	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26886_35083
742175	contig_14924_pilon	+	1805	8	Intergenic	novelGene_104148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	43.4802324308978	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	199	963	44129	54105	FALSE	20	TGAGCTGAAGTACTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLGQYASQPQSCCSLSGHNGSKGESSLRMAYSGSSPFSSWESEKCEDFCWL	43930	54947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47168_53967
742176	SIRV6	+	443	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	114	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTGCGTTCACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10784_11023
742178	contig_6795_pilon	-	1852	13	Intergenic	novelGene_27769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_12	35.4309775008631	277	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	60	1154	504815	483470	FALSE	35	GAGGAAAAAGCTGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAEITGAATAAGPILTAAMGILEKISEIEKEIARTQKNKATEYHLGLLKAKLAKYRAQLLEPSKSASSKGEGFDVMKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVCHRIHRSLASQFKYALVWGTSTKYSPQRVGLTHTMEHEDVIQIVKK	504874	482771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504751
742189	contig_7909_pilon	-	1058	4	Intergenic	novelGene_155951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	48.9148920745683	156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	148	765	1284956	1262189	FALSE	50	TCAGGAAGACAAACAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVYKEANITINLYIVNKPWLFSLAWCSRIHSVTTDNIKLLSEIDHPYFFMTPRYYMFIWLLIDGISAILIFSIFYFHWWKGKQRDQEYISTNIRKDTQSRGPQERKIRETLSTQPLNRVSESPWTPKALYPGLASSTSHHSSAFRLTVPPKKNKAKKQLFKQNIKPVTPAKDNIKPPEPKKQLFEPTKTSVSCATRRSTLQTALPVLKVHECKIPTNMALHPKTNPTEAPIVQSSSQESFVTADTSFRMSWMKN	1285103	1261895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1262668_1279273_1279327_1280116_1280200_1284953
742190	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742191	contig_6710_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_98183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	15	TATCCCTATTTCAGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742192	contig_7056_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_43676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCTCCTCATCTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805451	804916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_804900_805500
742201	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	3	406	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742202	contig_12969_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_61655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTTTCCCAGTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126134	126757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_126100_126800
742203	SIRV6	+	299	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-17	203	-4	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTAGACCGATCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	1917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
742204	contig_1813_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_105521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATGAAGTATTACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473726	472282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_472300_473700
742206	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	51	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
742207	contig_7380_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_157525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218149	216052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_216100_218100
742209	contig_10777_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_101167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31862	30361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_30400_31900
742213	contig_9345_pilon	-	1574	14	Intergenic	novelGene_24468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.79940806503179	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCTCACAATTTGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631655	586817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_587007_614184_614253_617042_617109_618458_618609_619372_619494_619857_619969_622811_622931_625729_625779_625870_625894_627997_628149_629013_629160_629774_629841_630941_630986_631384
742214	SIRV5	+	387	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-57	875	57	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8258	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
742215	contig_13305_pilon	-	1887	3	Intergenic	novelGene_146786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	604	909	266844	266539	TRUE	55	AAAAAGCACAGGATCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAEEPLEWSWSSPLTGRFPTLLRSWWPAAPPAKVGPFSWEASGSAFFSSGGVWLAGAGLGLVVEEVVGGAGVDVVTEVVRAGVVGWEAVIRTRGGIRGAK	267447	264474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_265145_265438_265601_266392
742218	contig_4364_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_25	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTTTATTTCCTCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279008	279254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_279000_279300
742220	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742224	contig_13481_pilon	-	2235	15	Intergenic	novelGene_119516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_13	455.558011718394	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1971	264	2234	1462670	1415167	FALSE	25	GTGGTGAAGTGCGACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKVAKPKEPITDVSVIIKSLGEEVPQDYVCIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCEIIQSTPYGRPANISGNTSSQRIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFCKVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPMGATIECWPPNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEDNLTEKQRLLLGLASPTDGKPDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHKVPFPSPQRPRILVQLSPHDSLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTEHKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYFDLYDPPPDVSCIDLDTNTISQTGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPRDDGLMDLAMNDYDFHSGKRLHMIDLEIQEAFLCFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDATSLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKVDMDK	1480551	1415165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1415182_1426239_1426386_1427713_1427933_1430770_1430872_1437121_1437298_1437583_1437729_1439916_1439976_1441289_1441357_1444326_1444569_1445295_1445466_1447629_1447700_1459726_1459977_1462359_1462721_1473241_1473321_1480417
742234	contig_10861_pilon	+	2416	2	Intergenic	novelGene_39192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAACAAAATTTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340996	345449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_341980_344016
742235	contig_15327_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_70804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274037	1272506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1272500_1274000
742243	contig_4364_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	81	431	1530895	1531324	FALSE	20	GATGACCCAGGTGACTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANRE	1530444	1531326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
742244	contig_5331_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_112767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAACTCACAGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196181	197382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_196200_197400
742245	contig_6589_pilon	+	797	5	Intergenic	novelGene_25796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1866.21426623526	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	214	705	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668577	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668670_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
742246	contig_6175_pilon	+	2104	15	Intergenic	novelGene_16298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	219.406539537537	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	92	1927	1466806	1511233	FALSE	20	CGTATTTCACGTTAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKSPVLSWRCQQPPFLPMAGCGRLKWSASGNPA	1444477	1511410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1444540_1466776_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1511137
742247	scaffold_16539_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_68315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGCCAGTTCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124405	124999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_124400_125000
742248	SIRV6	+	531	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-22	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
742249	contig_7129_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_169313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTATTCTGATATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961174	960096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_960100_961200
742252	contig_14441_pilon	+	1242	6	Intergenic	novelGene_100675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	386.324733870354	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	640	981	116728	117335	TRUE	15	CTGCCTACGAGTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVHRLPPAQFPTSGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTPCWSAPSC	112631	117792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_113032_113209_113879_114161_116578_116947_117212_117344_117539
742253	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
742254	contig_8075_pilon	+	2046	2	Intergenic	novelGene_42487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	452	junction_1	0	68	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTATATCAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663926	667010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115
742257	contig_5643_pilon	+	1637	8	Intergenic	novelGene_38750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	162.472854875602	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	422	1390	159302	163341	TRUE	20	GGCAAAGCTTCTCCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	157273	163737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_157390_158841_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297_163452_163600
742258	contig_8617_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_73434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62498	62034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
742260	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_94876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653785	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742264	contig_10734_pilon	+	1384	7	Intergenic	novelGene_51364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.0211870175222	142	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACAGATGAGTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781514	1787983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1781700_1781738_1783470_1783581_1784314_1784402_1784530_1784658_1784841_1785051_1787234
742269	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
742271	SIRV6	+	285	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8132	14	607	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
742272	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	124	-9	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3147	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742275	contig_8801_pilon	+	1557	7	Intergenic	novelGene_66315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	106.728237438209	574	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	463	987	615025	620573	FALSE	20	CCAGAGGCCAGCTGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANKSNKPRVRSIRFAAGHDAEGSHSHVHFDEKLHDSVVMVTQESDSSFLVKVGFLKILHRYEITFTLPPVRRLSKDVREAPVPSLHLKLLSVMPIPEGYSIKCEYSAHKEGVLKEEMLLACEGGTGACVRVTVQARVMDRHHGTPMLLDGVKCVGAELEYDSEHSDWHGFD	608452	621143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_608610_614265_614473_614926_615044_616431_616575_619014_619154_620079_620203_620472
742277	contig_7004_pilon	+	2100	13	Intergenic	novelGene_126450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	48.2614407852342	7	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	8	598	273029	274320	TRUE	5	CTCATGCTGCTGGGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMTGRARKEAVQAAARELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFCELKETDSWEIKPESKYFLTRNSSTIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRRSRRSQVGFHQVGVETYGGGIWSTWFDRDLTLAGRVIVKVGTGDLKMDGHPPSGYPWRSPLGKRGRPSWGEGTRKPPWLVSVKWGLSPAGVVHALC	273021	281127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_277342_277410_278171_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
742278	contig_14341_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_111775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	403	741	310306	309968	NA	20	CAGTTTTCATATTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAAQDLSFTSGAHVHHSPREQECPPLTQKKPRLGEARICAQGYTPRGLCACCPMPGKSPTSSPGSPSPSSSQLKHHLLRVCSCPLTTLLLSACLIASLSLQQFATSKYLVC	310708	308830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_308800_310700
742279	contig_11656_pilon	-	3543	5	Intergenic	novelGene_53969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	521	junction_1	409.127959812086	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	32	967	224380	164467	TRUE	30	GAGGGGAAGTGGTAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLYGYTESFTMVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNRDKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGEKYFLKSV	224411	160568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_160802_162123_164578_165175_165292_169387_169497_223780
742283	contig_854_pilon	-	2254	9	Intergenic	novelGene_36089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	110	junction_8	54.8302779037276	547	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	100	1533	17095	4416	TRUE	5	TCTGGTGTCCTGGATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WATSCTGVCPQPLAHGWHSRYAHCGPEWARPCLMWLCWHSRLSDYNKENTLHSYGTQKGSLKAGEQRAGSEVIGRGGLRKAEGQRQSPDYVELSPLTQSSPQRARPLVRAPDRPAKQEELERDLAQRSEERRKWFEATDSRAVETQSGEAPRRGLGAPLTEDQQSRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRSEQRGSSSDSHEALEKEVQCLRAQLEAWRLRGEAPQDAPRFQEDGHIPTGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELNKTRSLQQGPDGLRKQHESDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALTRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHAHLSEEIDRLRSFIASQGTGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELNHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE	17194	2940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_3660_4413_4578_5405_5493_6730_6845_6912_7073_7674_7778_9768_9917_15721_15833_16546
742285	SIRV4	-	263	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1255	3	1255	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
742288	contig_5815_pilon	-	2729	1	Intergenic	novelGene_141218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGGAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568083	565354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_565400_568100
742289	contig_13453_pilon	+	1128	8	Intergenic	novelGene_146720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	154.218503879319	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	732	1127	135825	142017	FALSE	65	AAGAAAAAATAAGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENRLNDALPEGFSQEFEEQQPKSRPKFQSPQIQATISPPVQPKTRKQEEDSKIKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQNEEEKSENSKSLEEEEKFDPNERYLHLSAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKDA	126458	142018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_129696_129771_131069_131184_132536_132667_135654_135847_136355_136502_139216_139346_141918
742302	contig_19647_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_144012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCCTTTCCCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88974	87190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_87200_89000
742304	contig_13760_pilon	+	2515	3	Intergenic	novelGene_61371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0.5	107	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	17	505	494909	496102	FALSE	25	TGATGGAACCATGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKTRMALRKTGQYSGMLDCARKILAKEGIAAFYKGYVPNMLGIIPYAGIDLAVYETLKNAWLQRYAVNSADPGVFVLLACGTMSSTCGQLASYPLALVRTRMQAQASIEGAPAVTMSSLFKQILRTEGAFGLYRGLAPNFMKVIPAVSISYVVYENLKITLGVQSR	494892	498112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_495062_495652_495804_495917
742305	SIRV6	+	455	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10318	53	1081	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
742313	contig_19701_pilon	-	2038	2	Intergenic	novelGene_147895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGGTACCTGTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122806	118637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_120605_122735
742314	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
742315	SIRV2	-	581	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	34	3117	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
742316	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_94195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657493	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657495	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742317	contig_2027_pilon	+	1325	10	Intergenic	novelGene_39897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	245.12964571809	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	249	1130	132640	136487	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117796	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117879_131607_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
742320	contig_15893_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_128517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGGAAGGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92640	94486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_92600_94500
742326	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_96911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742333	contig_7146_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_162059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTGAGACTTACAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225173	224174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_224200_225200
742339	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742341	contig_6048_pilon	+	1698	10	Intergenic	novelGene_73260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_7	50.710507348631	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	706	1500	1976465	1978064	FALSE	10	CTGCAGGGAGCTGGGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRGCSAYCLHASHQSVPGAAASLLKWRGGRTPSIQPAPRVCPPLRFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972066	1978262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974327_1976314_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
742343	contig_4315_pilon	+	1773	9	Intergenic	novelGene_46750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	210.920008534041	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	310	1167	222198	225537	FALSE	20	AAGAGCTTCTTGTCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	221410	226143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_221579_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
742345	contig_6269_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_170540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	113	460	255187	254840	FALSE	55	AAAATAAAACCATACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRNEMTHLKLNGISLQSSEFSDIEEEKKDPLLLVLMKESRKIRSEGWVEKQMWPLILIIINHCDYCWSKYWYLYLLVIVSELHYHCWKINKEKTVLVTQQTWRISICIVSMSVK	259816	253845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_255225_259741
742346	contig_18081_pilon	+	1627	3	Intergenic	novelGene_23774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	409	105	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	89	547	90717	108561	FALSE	85	GTAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVSTCAFYFCLVLFP	90628	109641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417
742347	contig_12603_pilon	+	2113	12	Intergenic	novelGene_105797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	28.9333803048964	115	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1074	1883	605572	612387	FALSE	15	TTCAGTTCTCCATTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYQIQIQEEFEERSEILLKEFLKPEKFADICDALEKGNVEWSSRGPPNKRFYEKAEENKLPDVLKDCMELFRSEALFLLLSNFTGLKLHFLAPSEEDEIEAEREGEAASAAESTEEGTSHSSSESENNLAAVSNTSQESDDQTDSEPEGSEIKKESNVPTCHGELRRWKTGHYTLIHDNSTTEFALDLLLYCGCEGWEPGYGGFTSYIAKGEDEELLTVNPENNSLALVYRDRETLKFVKYINHRSLEQQKTFPHRTGFWDFSFIYYE	591292	612617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_591498_593642_593789_597127_597175_600061_600163_604192_604310_604916_605009_605206_605644_607291_607372_607592_607907_610992_611116_611671_611731_612225
742349	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
742350	contig_8248_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_125015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87150	85423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_85400_87200
742353	contig_19899_pilon	+	1449	4	Intergenic	novelGene_102504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	10.4243305140746	462	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	375	980	134511	135116	FALSE	20	TACAATGCGTTGTTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQIWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFVILGNKVDISERQVSAEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAARRVLATEDRSDHLIHTDTVNLHRKPKPSSSCC	115520	135585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_115674_130681_130771_131290_131390_134477
742357	contig_9527_pilon	+	2240	8	Intergenic	novelGene_134049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	62.2998018144717	326	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	25	1044	412633	419761	TRUE	5	TCCAGGCTTCTGTCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPSTAAPMEFPLAQICPQGSRQIPSPTFSTFLPTDLTRRSCQGLGLLSQPRSQALEAEEVQPSPRALAIEAPVSLQAQGTASNPEGAGKAEEVPGEGGLNLQAETRAWFQKTQAHWLPQHGAAPAWFHGFITRKEAERLLETKPQGCYLVRFSESAVAFVLTYRSRTCCRHFLLAQLRDGRYVVLGEDSAHARLQDLLRHYTGSPLSPYGEKLTEPCARQTPEPIGLPLRTEETDSGSKTQDPDPHYSTVLKQGHAPALLKKEGAGESKEPSQQPRPKPPIPAKPQLCPEVYTGLAPRPRPAPPRKPSNPIYHELDEPIAFYAMGRGSPGGSPQQHLCRGGGALKK	412608	422824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_412667_413212_413374_414398_414584_415418_415509_415644_415814_419182_419333_419530_419832_421698
742359	contig_20165_pilon	-	965	8	Intergenic	novelGene_54471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.687590643713	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	394	963	58053	42097	FALSE	5	CCTCCCGCCTGGCTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADGGRGAGRLDCRKPSSKTRREKERQSCKSCGETFNSITKRRHRCKQCSAVICGKCSEFKTENSRQSRVCKECFLTLSGEPTSPEVAVEPKKGTERPSAMDPQHSLLCGTLQLSEDGKAWSEVWASIPRTDPQALHLWGSSQDGQLPRTIPLPGCKVNAPDLREPSLLPVARMWPKAPPGPVSSRLFW	71240	42094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_42178_42362_42420_46775_46917_48370_48506_49897_50021_58020_58084_70009_70120_70987
742360	contig_11449_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_170551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111936	110238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_110200_111900
742361	contig_14556_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_138528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATCATGCCTTTGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153162	152833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_152800_153200
742362	SIRV6	+	403	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	559	0	380	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742363	contig_15982_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_145971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAACACCAAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39848	38356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_-_38400_39800
742364	contig_12250_pilon	-	1415	7	Intergenic	novelGene_80710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_3	163.930625570697	11	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	73	351	401239	400074	TRUE	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLSLSLPCAHSSLLARRKAPSPAMATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEASWGELGRAS	401311	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399521_399747_399846_399972_400218_400314_400378_400528_400562_401200
742367	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
742368	contig_7179_pilon	-	2094	17	Intergenic	novelGene_78183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	59.9656151473492	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	895	2013	1206411	1181125	FALSE	30	TTTAGGACTAGTCGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVEVKNYDAALRKITFPHRRLISCSKKRHLLLFQFAHHLELWRLGSTVATGKNGDILPLSKNADHLLQLKTKGPENIICSSISPCGSWIACSTASRFFLYRLSYERDSISLQRVPKMPAFLRSALQILFSEDSTKLFVASNQGSLHIIQLSEGCFKHLHTFQPQSETVEAMCLLAVSPDGNWLAASGTSAGVRIYGLKELKPHCTVPAYNFPVTALGIAPNTNNLVIAHSDQQVFEYSIPDKQYTEWSRAIQKQGFHHLWLQRDTPITHISFHPKRPMHILLHDAYMFCIIDKSLPLPNDKTLLYNPLSLTNESDVIRRRTAHAFKISKKYKPLLFMELLDERTLVAVERPLDDIIAQLPPPIKKKKFGT	1224293	1181043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1181242_1182103_1182215_1183677_1183864_1185474_1185571_1194851_1194959_1196691_1196849_1198794_1198918_1200012_1200078_1200814_1200912_1206351_1206444_1206550_1206646_1209852_1210065_1215621_1215712_1217115_1217201_1218689_1218882_1222812_1222974_1224266
742369	contig_5201_pilon	-	1660	6	Intergenic	novelGene_82156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.9184449591772	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	54	578	164256	150768	TRUE	30	ATGTATACAGTCTCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHGAAVAVPAPQRASGMSAAEADRWAWLLVLSFVFACNVLRILLPSFSSFMSRVLQKDAEQESQMRAEIQGMKQELSTVNMMDEFARYARLERKINKMTDKLKTHVKARTAQLAKIKWVISVAFYILQAALMISLIWKYYSVPVAVVPSKWITPLDRLVAFPTRVAGGVGITCWILVCNKVVAIMLHPFS	164309	86091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_87171_150764_150842_152593_152709_154054_154123_154807_154974_164154
742383	contig_5331_pilon	-	2175	13	Intergenic	novelGene_112841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	180.32476489194	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	723	1874	802800	779057	FALSE	15	CAGTTTCAGTTGTGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKCLPPRTASNESAESPEAAPTGAPPAEQPDVIPPQGDLLGDLLNLDLGSVGLGSRV	809821	778755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779084_790601_790720_791290_791551_792042_792142_797687_797854_798194_798311_799347_799444_799920_800042_802651_802874_804438_804599_805845_806098_806907_807044_809720
742385	contig_11898_pilon	-	2056	5	Intergenic	novelGene_144274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	19.7294196569489	284	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	416	838	78726	73766	FALSE	40	AAAAAGTTTAAAGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVWTLLNGNKDDFLIYDRCGRLVYHLGLPYSFLTFPYVEGAIKIAYCEKKCGNCSLTTLEDEDFCKNISSANVEETIEAPKPHHHHSHHHKHGHHHLGNHQLSENQQPGDPDAPQHPPPPGLHHHHKHKDHQRQGHPES	83453	72547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_74015_76946_77065_78670_78884_79632_79849_83411
742389	contig_10135_pilon	+	1189	7	Intergenic	novelGene_106672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	188.681978177273	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	12	521	222438	270079	TRUE	10	CTCATTTTGTCTTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESKMAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMEQFWSKNTGSNRPLSPHITIYSWSLPMVMSVCHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGNFESHLELVKSLCLGPAVIYTAKFALVSPLMYHTWNGIRHLMWDLGKGLKIPQLYQSGVAVFILTVLSSLGLAAM	222426	270818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222458_227989_228047_233654_233757_246597_246660_265108_265273_269974_270242_270312
742390	contig_5003_pilon	+	2423	23	Intergenic	novelGene_120182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	286	585	5113	10917	TRUE	15	CAATTCTGCCTTGGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGGGGGKGGPLLMKGPLVSTGNNGPLTGGRGGGPKPGPVASFPAGRDESGTFKLPRSSLGSFLLDSISEDIGPSALSKEGILKLLSSAGPDSLPELE	3576	81167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_3794_5044_5280_5929_5989_10843_10966_26583_26744_30290_30420_32065_32146_33647_33718_38164_38210_40047_40165_43947_44093_46244_46334_47075_47128_48366_48484_50755_50872_56374_56486_60548_60621_61266_61379_63554_63618_66502_66588_66679_66705_71645_71778_81097
742394	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742395	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	10	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742400	contig_11417_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_103292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTTCATGTTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481022	481530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_481000_481500
742402	contig_10811_pilon	-	1742	3	Intergenic	novelGene_165780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.5	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	153	488	10863	10528	TRUE	10	CTTGCAGCCCTGGTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKGSSQGQPWSKSLQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCLLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGGCGCKQLIALCCYHAKHCQEKKCPVPFCLNIRQKLRQQQIQHHL	16516	8080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_9153_10345_10915_16415
742407	contig_20748_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_138174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATTTGGTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149227	151087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_149200_151100
742409	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	3	11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742410	SIRV4	-	229	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATTATTTCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
742411	contig_7580_pilon	+	1368	6	Intergenic	novelGene_108600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	124.27646599417	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	193	984	103420	109647	FALSE	25	ACCTATTTCATCTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLNVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96451	110031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_105320_105378_106952_107190_109428
742412	contig_15236_pilon	+	2808	3	Intergenic	novelGene_141528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	246	junction_1	53	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	73	957	55474	101384	FALSE	20	GAATGCATCAGTGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVVEKSLEGPLAPSTDEAAQKTGDLVEILNEDKVKFDDTGLSLILQNGLETLRMENALTDVILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFCNDLKEKREKRIVIKGVDAEIMHTLLDYTYTSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEVS	55401	103235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_82174_82341_100925
742413	contig_13702_pilon	-	966	9	Intergenic	novelGene_102597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	39.9804639792987	554	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	505	885	78098	68217	FALSE	10	TGTGGCTTGTCATTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYLAKLIRGMSIDQALAQLEFSDKKGAQIIKEVLLEAQDMAVRDHNVEFRSNLYIAESTSGRGQCLKRIRYHGRGRFGIMEKVYCHYFVKLVEGPPPPPEAPKTAVTLAKEYIQELRNRTIIHTL	99587	68135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_68429_75046_75117_76558_76637_78077_78144_80299_80427_80872_80983_84002_84139_99421_99471_99550
742414	contig_14814_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_137757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGAGAGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413846	415741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_413800_415700
742424	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
742430	contig_9363_pilon	-	1764	11	Intergenic	novelGene_6644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	69.9082255532208	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	11	1564	949591	940024	FALSE	15	TACCAGTGGCTCTGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTAMAAQGAAAAVVAATTGVAGERVSPPTPARGEPEVTVEIGETYLCRRPDSTWHSAEVIQSRVNDQEGREEFYVHYVGFNRRLDEWVDKNRLALTKTVKDAVQKNSEKYLSELAEQPERKITRNQKRKHDEINHVQKTYAEMDPTTAALEKEHEAITKVKYVDKIHIGNYEIDAWYFSPFPEDYGKQPKLWLCEYCLKYMKYEKSYRFHLGQCQWRQPPGKEIYRKSNISVYEVDGKDHKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYFDVEPFVFYILTEVDRQGAHIVGYFSKEKESPDGNNVACILTLPPYQRRGYGKFLIAFSYELSKLESTVGSPEKPLSDLGKLSYRSYWSWVLLEILRDFRGTLSIKDLSQMTSITQNDIISTLQSLNMVKYWKGQHVICVTPKLVEEHLKSAQYKKPPITGGWEAAQGVVCLCVHVHASTRVTSGVGVKTGSKGLLLTLMISNQSDLLSGLQPGAGYSFLGFPAPIPRTQSALLFSPGGGKTWPGPRAAQPGLSRLGLE	949601	939823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_940478_940670_940822_940913_941008_941105_941247_942987_943078_943833_943999_944092_944147_947708_947885_947963_948039_949380_949475_949531
742432	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1719	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
742437	contig_3095_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_75028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152244	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149894_150411_150695_150995_151162_151847
742438	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742440	contig_10711_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_118422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGCTTCAAGGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705834	705406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_705400_705800
742443	contig_11815_pilon	-	1319	3	Intergenic	novelGene_50953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAATTTTGTGACGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489706	473827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_474634_476959_477368_489601
742445	contig_6710_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_94887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742446	contig_2917_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_147593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	538	864	101231	101557	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTKIDLLGISELKWTGVGHSESDNHVVYYVGNDKSKRNGVALIIKKNISRSTLKYNAVSDRIISTRLQGRPVNMTIIPYLYRYANFIKYNQRVSIGVSPVWVFLVP	100693	103102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_100700_103100
742456	contig_2278_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_118146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGAAACATAGCCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447622	1449395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1447600_1449400
742457	contig_8195_pilon	+	2718	15	Intergenic	novelGene_170058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_9	55.8520732080077	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	66	1745	429165	496940	FALSE	20	AGAGAATTTGTGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRVSVLKLYTRSPSKPLARKLMDWEVVSRNSLSDDRLETQSLPSRSPPGTPSHRNSAFTQEGTRLRPSSVGHLVDHVVHTSPSEAFVNHRSPSSTQANSIVLESSPSQETPGDGQPPALPPKQSKKNSWNQIHYSHSQQDLEDHSNETFDVPSSPEKSTPNGGIPHDNLVLIRMKPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPADLCVPRLNEGDQVVLINGRDIAEHTHDQVVMFIKASCERHSGELVLLVRPNAVYDVVEEKLESEPDFQYIPEKAPLDSVHQDDHSLRESMIQLAEGLITGTVLTQFDQLYRKKPGMTMSCAKLPQNISKNRYRDISPYDATRVILKGNEDYINANYINMEIPSSSIINQYIACQGPLPNTCTDFWQMTWEQGSSMVVMLTTQVERGRVKCHQYWPEPTGSSSYGCYQVTCHSEEGNTACVFRKMTLFNQEKNESRPLTQLQYVAWPDHGVPDDSSDFLNFVCHVRSKRAGKEEPIVVHCSAGIGRTGVLITMETAMCLIECNQPVYPLDIVRTMRDQRAMMIQTPSQYRFVCEAILKVYEEGFVKPLTSSSSK	428028	497913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_428063_429133_429260_431235_431395_442950_443111_446236_446321_446411_446469_454526_454684_458376_458544_459658_459750_460178_460241_469033_469181_471377_471507_478124_478274_479578_479715_496853
742458	scaffold_12510_pilon	+	1915	11	Intergenic	novelGene_151415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.72122865364515	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTGTTCAAGCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625638	648876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_625772_626500_626626_627863_627970_628459_628762_628901_629106_629281_629400_631710_631761_632065_632202_633376_633447_633947_634084_648341
742466	contig_614_pilon	+	2263	13	Intergenic	novelGene_132599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	39.8200814776777	190	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	92	1765	274210	373827	FALSE	15	GACACCTGGCTTGTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVCAWSTQDPRLLSGTSPWIPRANSPKSKMAELNTHVSVKEKIYAVRSVVPNKSNNEIVLVLQQFDFNVDKAVQAFVDGSAIQVLKEWNMTGKKKNNKRKRSKSKQHQGNKEAKDKAERPEAGPVQPQAPQIQNGHMHGEKDSSSTDSANEKPLVLPREKKISILEDPSKALRGVTEGNRPLQQKLSLDGNPKPIHGTPERSDGLQWSAEQPCNPSKPKAKTSPVKSNVPAAHLEIKPDELAKKRGPNIEKSVKDLQRCTVSLTRYRIMIKEEVDNSIKKIKAAFAELHNCIIDKEVSLMAEMDKVKEEAMEILTARQKKAEELKRLTDLASQMAEMQLAELRAEIKHFVSERKYDEELGKAARFSCDIEQLKAQIMLCGEITHPKNNYSSRTPCSSLLPLLNTHSAASGKQSSFTRKSSNHNKPSEGKAANPKMVSNLPNTTDTSHQATPANKQNGSSSQRRRFNPQYHNNRLNGSAKSQGGGNEADPMVKGNNRHEHRRQPHNGFRPKNKGGTKNQEAPLGTKTPEAPAHSEKPRRRQHATDNSEARPFRGNVPRVSQCNLCPTRIEVSADAAVLSVPAVTLVA	177575	374325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_177595_197755_197806_274187_274249_309690_309800_314032_314083_317612_317857_329883_330091_331661_331798_354814_354874_361670_361781_364570_364674_367729_367951_373431
742468	contig_17964_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_33909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386869	384351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_384400_386900
742472	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10513	15	1276	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11513	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
742473	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
742474	contig_610_pilon	-	1529	4	Intergenic	novelGene_76738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	812.289904460771	2	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	110	841	252557	214183	FALSE	30	GTCAAAGTGGATTCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252666	213494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235302_252475
742475	contig_7870_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_108898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164928	162676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_162700_164900
742476	contig_17840_pilon	+	1834	3	Intergenic	novelGene_154291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_1	58	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3700	17765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_3776_12390_12454_16069
742477	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742478	contig_10609_pilon	+	2226	3	Intergenic	novelGene_123955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_2	408.5	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCATCAACCATCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498478	503090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_498864_500774_500921_501395
742484	contig_3942_pilon	+	2217	4	Intergenic	novelGene_128878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	8.52447456836295	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	51	395	1531885	1535983	FALSE	25	TGTAGATTGTCTTTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCSKPCDTRTVLPACAMAVLGVQLVVTLLTATLMHRLAAHCSFARWLLCNGSLFRYVHPSEEELRALAGKQRPRGKRERWASEEKPLSVPRDAPFQLETCPLTAVDALGNSPACPQVPAPALRSLLPSPC	1531834	1537805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826
742486	contig_18231_pilon	+	935	7	Intergenic	novelGene_105885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4156	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	546	935	258743	277190	FALSE	30	AAAAGCCACGACCCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFSHKVFNSIRTCSSTPSSRNMSLTSLMTSSITDLYNLGTVFVFAEFAISTHNTNKRGGNPEKQDKNKTKREKTKPKHPEGDRSHRTIGEKFLKSDPEGVERRAVRGGGGNTPPGAKNLENRLSKKKK	246905	277190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_246987_249439_249577_250801_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_276922
742487	contig_8447_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_69435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5068	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGCACCCTGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84491	83767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_83800_84500
742488	contig_20140_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_170562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTGAGCGGACCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35520	34264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20140_pilon_-_34300_35500
742489	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742490	contig_34_pilon	-	1434	4	Intergenic	novelGene_40040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	1961.3023450985	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	47	439	247052	228256	FALSE	45	CTATTATATTAAAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVGSS	247098	227260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_228270_230228_230387_243214_243354_246970
742492	SIRV2	-	375	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4494	38	3319	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
742497	contig_8548_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_170563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTGGCTTCAATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476365	478456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_+_476400_478500
742498	contig_8548_pilon	+	1308	2	Intergenic	novelGene_170565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	328	663	481192	481527	FALSE	85	AAAAAAAAAACAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKVLLLKQTTIFYCPSEATWISQKQLKFNKFKMPLLCWTSGCYACARHTPRSLLLSSPAVIAPDSLFSQILSHWPKPGINTQLLGSHSWQPQVCQSRTVLHRVFSDFQK	478659	482172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_+_478920_481124
742499	contig_14445_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_137367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCTGAGAATACAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323498	325306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_323500_325300
742500	contig_8065_pilon	-	2180	12	Intergenic	novelGene_107316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.0347712218632	2	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	135	1439	112224	90599	FALSE	25	TGTAATTGGAAGTATTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTPTHTPVSRNVPSRFSGSTRWRGVSFTDSVESTPLPSIEDRLAVLCPSQELLEYFQKKMAECETENEDLLKKLELYKEACEGQHKLEWDLQQKEEEIAELQKALSDMQICLFQEREHVLRLYSENDRLRIREVEDKKKIQSLLALVGTDTGEVTYFYKEPPHKVTIPQKTIQAVNVPEQNASSTLKADPKVNKRRSAMREKGESPKQYQRNIQTLILQVEALQAQLEEQTKLSREQVEGLMEDRRIRIEEIQVQHQRNQEKIKELTKNLHHTQELLYESTKDFLQLRFENQHKEKSWMLEKDCLMSKIKQCRLQCKKKEDKTGKVWPVVHQSHHNQNEYIKTLKDKLVQEKKLSNMYQEQCIALEEEVARIREEECVRREIFKTTLNARADQDLAILCEVRDSNRRAHKIQGELKNLKSKVFGLENELRLC	117779	89857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_90746_91761_91888_93586_93807_97690_97840_98991_99084_99661_99735_101337_101435_106932_107076_110200_110421_112186_112241_114885_114941_117716
742507	SIRV6	+	531	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742508	contig_6710_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_98114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653433	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
742512	contig_9202_pilon	-	1316	11	Intergenic	novelGene_168945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	44.8615648411867	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	76	1260	286117	262775	FALSE	60	CTTTAAGAAAAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLEDYLENAMDQLEQRVSEFFMNAKKNKSEWREEQMTSIKKDYYKALEDADEKVQLANQIYDLVDRHLRKLDQELAKFKMELEADNAGITEILERRSLELDTPSQPVNNHHAHSHTPVEKRKYNPTSHHTTTDHIPEKKFKSEALLSTLTSDAAKENTLGCRNNNSTASSNNAYNVNPSQPLASYNIGSLSSGTGAGAITMAAAQAVQATAQMKEGRRTSSLKASYEAFKNNDFQLGKEFSMPRETTGYSSSSALMTTLTQNASSSAADSRSGRKSKNNNKSSSQQSSSSSSSSSLSSCSSTSTAVQEISQQTTVVPESDSNSQVDWTYDPNEPRYCICNQVSYGEMVGCDNQDCPIEWFHYGCVGLTEAPKGKWYCPQCTAAMKRRGSRHK	286192	262718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_262892_265227_265267_267566_267760_267991_268186_268797_268956_269241_269362_270145_270218_272100_272198_281603_281670_282798_282900_286089
742513	contig_4847_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_156141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGGCCACCACTGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6440	7698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_6400_7700
742514	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742515	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
742517	contig_7561_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_170570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAAGGGTATTTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15487	13787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7561_pilon_-_13800_15500
742518	contig_7561_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_170569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13526	12882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7561_pilon_-_12900_13500
742520	contig_3155_pilon	-	1038	3	Intergenic	novelGene_26450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	37	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	556	1038	365091	359106	FALSE	30	GAGATCTGGGGAGGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSFAEYLKEQLDQYVKQLQIVRVVRQQERKGLITARLLGASVAQAEVLTFLDAHCECFHGWLEPLLARIAEDETVVVSPDIVTIDLNTFHFSKPVQTGRVHSRGNFDWSLTFGWEILPPHEKQRRKDETYPIKSPTFAGGLFSVSKSYFEHIGTYDNQM	365646	359105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_359185_363628_363864_364922
742522	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
742524	contig_9127_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_103018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGTACAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207593	209666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_207600_209700
742525	SIRV6	+	305	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8135	-2	604	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTTGTCGAAATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
742527	contig_9177_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_32825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCATGGTGGAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713605	1713803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1713600_1713800
742528	contig_9177_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_32826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTGGGAAAAGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713849	1714091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1713800_1714100
742531	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1481_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742535	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
742536	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742537	contig_7753_pilon	+	998	7	Intergenic	novelGene_41524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	144.311776681215	197	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	320	997	1313409	1345627	FALSE	40	TATTTTCAAAATAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPSSNSTGEIQRSKSASSDVKQMLKCESDLDITADLRKKLHRAKKEKLEITTKHNAELASYESQIAKLRSEVEKGEALRQSLEYDLAVARKEAGLGRRAAEAKLAEADRIQEKLCAQNSELQGKANEMDKAFQTSQQKWKEECRRFERDLEERDNIIQNCNREYDLLMKEKSRLEKTLQEASEKHQQEKNEMESRIRETALEEFRLQAEQWEAERRELQFIVQ	1310429	1345628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1310587_1311881_1311932_1313296_1313453_1318683_1318820_1328372_1328548_1342864_1343056_1345495
742539	contig_3948_pilon	+	1495	2	Intergenic	novelGene_53364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	341	1003	1813956	1814618	FALSE	0	TGCTGGTCTGTGTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWVRTMPLVCLISLASGQRDPQQFFPCNSFSCAR	1812268	1815110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812498_1813844
742542	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742545	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742546	contig_14322_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_116391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
742547	SIRV6	+	500	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742548	contig_10106_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_73858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1686	2045	90777	91136	NA	15	GCAGTTTTGCTGTTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKELWRWPHSRTFLAREEAVSCRLLLWVYARLQAAVATPGLLSQLLLDAQCAQPLRPLLVVVVYGTHAYASTELSSPREQRNGLLTLEKNLGFHMRVVPCPLTLWAQRIGHLPPSTHP	89091	91800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_89100_91800
742553	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	312	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742555	contig_8461_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_163928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGTGGGTTTGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409577	411575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_409600_411600
742558	contig_7815_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_134357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	364	672	133681	133373	NA	20	CTGCCATTCACTTCTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWNLSPHLLLNLALSFLSFSHIFQSLPLYQKLPSSIRTCSSLSHLNLKIQIKRKPLSPTFPWNPACKFGFLVAVTSFSSSTKHSDQTLEVHLFLFSFYISL	134044	133036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_133000_134000
742560	contig_6296_pilon	+	1541	4	Intergenic	novelGene_168789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATCTAGTTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181630	265120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_+_182747_213390_213519_264254_264409_264977
742561	contig_5423_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_85298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	151.5	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	241	339	621192	621290	FALSE	25	CTTTTGACATGAATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVREEHGGPANAASRCRELEYAQLFAALIARTAKDIDVLIDSLPSEESTAALQAASLYKLEEENHEAATCLEDVVYRGDMLLEKIQSALADIAQSQLKTRSGTHSQSLPDS	612656	622600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_612718_620119_620221_621113
742562	contig_12046_pilon	+	2484	12	Intergenic	novelGene_83497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	20.6589783975334	48	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	146	2137	861171	910151	FALSE	40	ATGTTACTAAGTGAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGNHRSNPKCNKTEKKFLRKQIKARHTLLRHEGVETVSCATQSLVVANGGLGNGVSRNQLLPVLEKCGLVDALLMPPNKPYSFVRYKTTEESKKAYVTLNGKEIVDDLGQKIILYLNFVEKVQCKELGLQALPPGLMVVEEVISSEDEKMLLESIDWTEGTDNQNVQKSLKHRRVKHFGFEFHYETNSVDKNKPLPGGLPEICDSILEKWLKEAYIKRKPDQLTINQYEPGHGIPAHIDTHSAFEDEIISLSLGAEIVMDFKHPDGVTVPVMLPRRSLLVMTGESRYLWTHGITPRKFDTVQASESHKVGIIISDIGDLTLSKRGIRTSFTFRKVRQTSCNCIYPSVCDSQRKETPPSFPESDKEASQLEQEYVHRVYEEIAGHFSSTRHTPWPRITQFLKALPSGSIVADIGCGNGKYLGINKELHMIGCDRSQNLVDICRERQFQAFICDALAVPVRSESCDACISIAVIHHFATAERRVAALQELVRLLRPGGKALIYVWAMEQEYNKQKSKYLRGNRNSQGKKEEISSDASVQELLEQMPDMGDQDSACSVPSISDFWEGGCNSSKVTNSKLPVHTNRTSFHSQDLLVPWHLKGNRGKDKPVEQFGTVGSHDPGPVFHRYYHVFCEGELEAACQTLSNVSILQSYYDQGNWCVILQKL	856645	910498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_856784_861163_861300_865237_865476_868588_868721_869475_869572_870926_871032_872152_872224_888014_888122_892733_892886_894869_895127_904693_904844_909596
742563	SIRV6	+	537	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742564	contig_14023_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_165346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAACAGGTTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25286	26440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_25300_26400
742567	contig_6738_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_166133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCTCTCAGTGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49428	50792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_49400_50800
742568	contig_6286_pilon	-	1488	6	Intergenic	novelGene_165661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	3361.36801912555	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	244	1146	364784	357787	FALSE	20	CAGAATTCCCGGTGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLGDGDEAEGALGGPFPPPPPPIDEPFPPAPLEDEIFPSPPPPLEEEGGTEGPTPLRSQPREKVSSIDLEIDSLSSLLDDMTRNDPFKARVSSGYVPPPVATPFSLHSSPRPAAGATAPLPPWKAPSSSQPLSQAQALPQSQTQVPVPPQVRPQARPQVPPQVKLQAQAEPMSSADTQPRGPTAPKFSPVASRFTPVASKFSPGAPGAPGGPVSQPNQKVGSPEAPSSMGTVSPQPPSVTCAQQKEKPHVQEKCSTCGQPITERMLRATGRAYHPNCFTCVLCACPLEGTSFIVDQANRPHCVPDYHRQYAPRCSVCGEPIMPEPGRDETVRVVALDKNFHMKCYKCEDCGKPLSIEADDNGCFPLDGHVLCRNCHTARA	365130	357444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_357886_358289_358411_359979_360144_364172_364662_364754_364848_364950
742572	contig_1275_pilon	+	737	2	Intergenic	novelGene_108827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	88	735	747279	747926	FALSE	15	AACTCTGCATCTTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKE	746549	747928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
742575	SIRV6	+	359	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	14	410	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742583	SIRV7	-	563	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-45	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114961	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70890_70988_78841_78962_114680
742584	contig_3604_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_139997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACGGAGTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54628	55086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_54600_55100
742585	contig_3604_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_139998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTCACTTGTGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55347	55950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_55300_56000
742586	contig_5344_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_125326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACCCCGAGAGTATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6801	7181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_+_6800_7200
742587	contig_5331_pilon	-	1973	8	Intergenic	novelGene_112829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_7	116.755806568012	28	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	158	1018	790559	779458	FALSE	15	GGCGACAAGTGTGTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAESPEAAPTGAPPAEQPDVIPPQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSAQMGAVDLLGGGLDSLIGSTNFTPPAAAVPASLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAEAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSLTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN	790716	778502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985_789127_790517
742590	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
742592	contig_6710_pilon	-	488	2	Intergenic	novelGene_98139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	20	AGCTACCCACCCATCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742593	contig_10437_pilon	-	2355	16	Intergenic	novelGene_38405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	298.990494088952	18	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	866	1627	783630	779194	TRUE	20	TTTGGGATGATATTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQNPASDLQCLSHLWMSFLSRQSA	792978	773844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779261_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426_783687_784334_784556_784800_784885_786428_786573_788616_788752_789435_789628_792945
742594	contig_8616_pilon	+	1159	5	Intergenic	novelGene_72407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.0032325784558	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	242	571	221121	237101	FALSE	15	CTAGCCATGTCGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDSRTSQQLQLIDEQDSYIQSRADTMQNIESTIVELGSIFQQLAHMVKEQEETIQRIDENVLGAQLDVEAAHSEILKYFQSVTSNRWLMVKIFLILIVFFIIFVVFLA	214343	237689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_214387_215051_215191_221061_221169_221372_221495_236941
742597	contig_17108_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_109505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACCAGGCCGAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24279	26612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_24300_26600
742599	contig_9345_pilon	-	1901	5	Intergenic	novelGene_24391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	611.232924096862	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	59	913	176056	142100	FALSE	10	TTTGGAACTGCTTCCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDRFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176114	141111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_173643_173789_175989
742612	contig_12019_pilon	+	2904	2	Intergenic	novelGene_87748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGCTTTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625298	632680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_627390_631867
742613	SIRV5	+	422	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3244_3405_3483
742614	contig_16846_pilon	-	1060	2	Intergenic	novelGene_82941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	19	321	555239	551601	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGEQAGVGGVRGAGVRAERLFHPRGPPTGAAHHHGRPVHR	555257	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_555000
742615	contig_7050_pilon	+	1990	11	Intergenic	novelGene_153626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_10	233.01813234167	203	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	536	1456	714322	846716	FALSE	20	AAATGGTTTGTTCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRSRVVGSGLGATPASRPASDPSARRQELGPPPSQRRGLESAPEDPPRESSERAGQGLVRTGAYTLITPNENRRSQLRRIAEKELEDLEKWKEQNRAKPVNLVPRQLGGSQSEAEVRQKQQLQLMQSKYQQKLKREESVRIKKEAEEAAIRKMKAIQREKSNKLEEKKRLQENLRRDAFREHQQYKTAEFLSRLDKDLPNRSTCQVALRDPQYSTWARSRSYKDSLKEEENRKLQKMKDEQHRKSELLELKRQQEEEERTKTRQTEHRRVNNAFLDRLQGKSQPGGLEESGGYWNMNRGNSWDM	713786	847250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_714507_732208_732268_734460_734545_738683_738758_739460_739545_760439_760514_799721_799816_810822_810907_830795_830870_834426_834527_846707
742617	contig_13301_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_153106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26133	25395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_-_25400_26100
742621	contig_10599_pilon	-	1806	7	Intergenic	novelGene_49892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	4.8904669170404	115	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	29	1432	247905	231843	FALSE	40	AAGATAAATTTTATGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSCPLLLRMQHLRKPSESGPLSILGGLGREPFGGVQSLYFESSSRDVRNGEGEHEVVRRDAPRAASPPALSRRPGIVIRCLSSVESLRPLASREVSARREREDSNGAQGQFHPAHRGPGDHFDPALDRFATEVEEFPDSSSCSTSREGPFRSGELILAETGKRQTQFKKLFRLSSVGHLNSNWGLVPFSEIVGKFPGQMLKSSSGKHFMLRRPALEDYVLLMKRGPCISYPKDMNMMLLMMNINPGDTVLEVGSGSGGMSLFLSKAVGSKGKVISFEIRKDHHDLAKKNYKQWRDSWKISHVEEWPDNVDFIHKDISGATNDMKSFTFDAAALDMLNPQVALPVLYPNLKQGGVCAVYLANITQVIELLNGIHICELALSCEKISEVIVRDWLVCLAKQNRILYRKVEPKINTDLQLHSQKKIGVESEIFQEDDHEESHSDFPYGSFPYIARPIHWQTGHTAFLVKLRKFKPQLN	247933	231468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_231887_231969_232048_232717_232942_233588_233681_238185_238377_245764_245868_247233
742630	contig_18869_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_56194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73727	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
742632	contig_5590_pilon	+	2020	2	Intergenic	novelGene_163055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGATGTATATTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453465	456474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_454684_455672
742634	contig_7356_pilon	+	1255	14	Intergenic	novelGene_60337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_11	50.6441349256443	29	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1200	56	1255	30625	88041	FALSE	40	TTACAAGATGAGGTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKLGELLHDKLFGLFEAMSAIEMMDPKMDAGMIGNQVNRKVLNFEQAIKDGTIKIKDLTLPELIGIMDTCFCCLITWLEGHSLAQTVFTCLYIHNPDFIEDPAMKAFALGILKICDIAREKVNKAAVFEEEDFQSMTYGFKMANSVTDLRVTGMLKDVEDDMQRRVKSTRSRQGEERDPEVELEHQQCLAVFSRVKFTRVLLTVLIAFTKKETSAVAEAQKLMVQAADLLSAIHNSLHHGIQAQNDTTKGDHPIMMGFEPLVNQRLLPPTFPRYAKIIKREEMVNYFARLIDRIKTVCEVVNLTNLHCILDFFCEFSEQSPCVLSRSLLQTTFLVDNKKVFGTHLMQDMVKDALRSFVSPPVLSPKCCLYNNHQAKDCIDSFVTHCVRPFCSLIQIHGHNRARQRDKLGHILEEFAT	27110	88041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_27147_30605_30721_31773_31849_35275_35444_51694_51762_51840_51885_53368_53420_54075_54160_54991_55107_72157_72337_74719_74780_78790_78898_85410_85478_87954
742639	contig_5815_pilon	+	1694	4	Intergenic	novelGene_141221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4142	junction_1	13902.7030705063	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	38	334	1041346	1044311	TRUE	10	TTCGTGCGATTCAGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCALPFHPGPGRMAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRCERSLCCKMNLCSCLEVQRK	1040919	1046058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1045607_1045993
742643	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	3	404	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742647	contig_1535_pilon	-	2066	6	Intergenic	novelGene_127251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_5	335.720717263621	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	352	837	132614	129144	TRUE	5	GCATTGCTTTGCTGGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136101	127066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_135888
742648	contig_11115_pilon	-	1384	5	Intergenic	novelGene_102854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGTCCCAGCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173328	171298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_171759_171843_171981_172339_172595_172712_172962_173045
742649	contig_3832_pilon	-	2247	8	Intergenic	novelGene_161421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	54.4606204855717	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	82	630	47110	38217	TRUE	40	CTGGTCAAGGACAGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFPRRRRETGLLWKVVVNAWPAGLRGMGTPPGLQTDCEALLSRFQETDSVRFEDFSELWRSMKFGTIFCGRMRNLEKNMFTKEALALGWRYFLPPYTFQIRVGALYLLYGLYNTQLCQPKQKIRVALKDWDEVLKFQQDLINAQHFDAAYIFRKLRLDRAFHFTAMPKLLSYRMKKKIQRAEVTEEFKDPNDRVMKLITSDVLEILHM	47191	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_29882_34243_34307_35039_35115_36798_38232_42637_42743_44435_44577_44735_44896_46982
742653	contig_3386_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_34473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28123	27813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_27800_28100
742654	contig_7707_pilon	+	1775	10	Intergenic	novelGene_72151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	491.331524193865	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	908	1774	233929	240652	FALSE	60	CTATTAAAGAAAATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHV	182729	240653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_190409_190457_200052_200124_200805_200901_213078_213179_232192_232293_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626
742664	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_93460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
742670	contig_6489_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_128927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	193	501	155602	155294	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCYHTKTIFKNRFFFLKKDQTYWSDRDWRNPQDMAPRHHHNSELKLLPKFIFQPKIRQAYKTTITHVTNMLLRPIEYTRPNGQHCPKAKTRRQEKRGKLDK	155794	154209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_154200_155800
742674	contig_10019_pilon	-	1638	3	Intergenic	novelGene_86685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAATTTGGTCTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261624	258358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259220_259343_259853_261356
742678	contig_7009_pilon	-	2342	4	Intergenic	novelGene_23578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAAAGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224875	197986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_198053_198156_198266_213810_213918_222815
742680	contig_5217_pilon	-	1586	8	Intergenic	novelGene_135735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_3	107.797429070854	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	173	700	531324	530116	TRUE	15	CTGGAGACCTCCTCACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKQVHYKLPASLSLPARQLLAAILRASPRDRPSIDQILRHDFFTKGYTPDQLPVTSCMTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKNKSKNHTEERDEVSCLVSGLMRTSIGHQDARPKAPAASGPAPVTLVETAPEDSSPRGTLASSGDGFEEGLTVATVVESALCALRNCVAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQLSSRRVAVLFNDGTHMALSANRK	531613	528951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529853_530283_530375_530460_530597_530692_530930_531023_531233_531361_531477
742681	contig_11422_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_99025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGACCTGGCCTATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740	116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_100_700
742682	SIRV7	-	270	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69015	1	35796	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78942	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
742683	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742686	contig_12312_pilon	-	2356	11	Intergenic	novelGene_63991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	33.6221653080226	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	104	1408	440934	436461	FALSE	15	CTGAAGACTTTGGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETGAQEPAEYLPVPSALSPASLPPPPPLPSLAIMRVPLACLLLCALLVRDSDGSGELPRGSGASNCGCLNGGTCVSYKYFSNIQRCNCPKKFHGEHCEIDTSKTCYEGNGHSYRGKANMDTRGRPCLAWNSVSVLLKTYHAHRPDALQLGLGKHNYCRNPDHQKRPWCYVQVGLKQLVQECQVYDCSLGESPISPPEKSEFQCGQKAVKPRFKIVGGEFTTIENQPWFAAIYRKHRGGSVTYLCGGSLITPCWVVSATHCFINYQKKEDYIIYLGRSRLNSNTPGEMKFEVKELILHEDYSSETLAHHNDIALLKIRSNTGQCAQPSRTIQTICLPPQNDDARFGASCEITGFGKENPTDYIYPEQLKMTVVKLVSHKVCQQPSYYGSEVTHKMLCAADPQWETDSCQGDSGGPLVCSNEGRLTLTGIVSWGRGCALKDKPGVYTRVSRFLPWIHTHIGEEENGLSL	441331	435512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_436641_437328_437478_437806_437948_438602_438752_438972_439193_439378_439471_439630_439806_440124_440233_440379_440414_440877_440947_441240
742688	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_97349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742693	contig_10436_pilon	+	1968	2	Intergenic	novelGene_108474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	817	1275	97149	97607	FALSE	35	CCAGAAGCACCTTCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSMTRISPSLELASPSWLVSVLPTSLLSLSVGGAPSGGPVAGGLGASGGVGNTGAGASPPTTATISSSSSSSSSSSSSSESVSLGGARGGPGGGSLSPRSAFFNFRFLLFLIRDLFSPSPGAGRGLRRTPKPAPAPGPNFRFFRSFFRGG	96231	98300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_97032_97132
742696	contig_8663_pilon	+	1448	7	Intergenic	novelGene_58005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	36.8182472876335	207	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	134	652	75665	105105	FALSE	15	CTATGTTGTGATAGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSRVGATCLLGFSFLLLATSSDGQIGLGKGFGDHIHWRTLEDGKKEAAASGLPLMVIIHKSWCGACKALKPKFAESTEISELSHNFVMVNLEDEEEPKDEDFSPDGGYIPRILFLDPSGKVRPEIVNENGNPSYKYFYVSAEQVVQGMKEAQERLTGDAFREKHLEDEL	75531	105901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_75762_88685_88747_98476_98530_99821_99896_101503_101574_102304_102389_105025
742697	contig_9177_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_32698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGAAGCTTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460282	461267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_460300_461300
742699	contig_401_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_42725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTGTGTTCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104114	102678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_102700_104100
742705	contig_5423_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_85316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTTGTGATCCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784495	783242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_783200_784500
742707	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742712	contig_9389_pilon	+	1410	4	Intergenic	novelGene_84103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	104.550891382565	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390440	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1398390_1398531_1408698_1408747_1424175
742718	contig_10377_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_115395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAACTTGGAATACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213075	210620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_210600_213100
742720	contig_7123_pilon	-	972	3	Intergenic	novelGene_170576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	6	junction_1	40	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	277	654	434051	433674	FALSE	25	TGGTGAATGGATTTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNPCQSPTTSNFDDVGVLQKKLVPFVTDLTIHLAQELEKQKEDPGKVEQLQAWLQAWLLPHTNEVSQQINDNLCELQQRLVPCTNHPSVKTVCCCFTSTLQLSHTMSVWPILTGNMGKGVLEM	437381	433355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_434141_437108_437171_437256
742721	contig_10581_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_41420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGATTTACAAATAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641644	640546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_640500_641600
742722	contig_10581_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_41421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643939	642198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_642200_643900
742729	contig_709_pilon	+	1781	5	Intergenic	novelGene_57534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	72.943042848513	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	220	528	1506140	1509497	FALSE	20	TTCTTACAATGTCAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEALRVKMMRKRKPAECPPGLCT	1498423	1510750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1498617_1506113_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1509432
742730	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
742731	contig_16103_pilon	-	1642	5	Intergenic	novelGene_118900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_4	73.6287138282342	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	387	839	762237	759680	FALSE	45	AAAAACTGTATGATTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDAIRASEIPFHAEGRHPRSLMGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	762846	758876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761648_762206_762261_762483
742732	contig_11448_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_66368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGATATGAAAGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276191	276688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_276200_276700
742733	contig_11448_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_66369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTTCTACAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276688	278651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_276700_278700
742743	contig_5019_pilon	+	1059	2	Intergenic	novelGene_109198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACTCATAGCAACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145321	148238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_145707_147564
742749	contig_9935_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_164852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	688	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	6268	5717	FALSE	30	TATAGCAATCCTCCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSSYLHWYQQKPGQAPKLLIYKATNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDAAVYYCQQD	6294	5716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_6001_6219
742750	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_90392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742754	contig_15596_pilon	-	1373	6	Intergenic	novelGene_139548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_5	128.350457731946	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	92	1054	217105	201753	FALSE	60	CGAGGAAAAAAAAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGEETPGRLSHQPSVRLLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKKKTYSEPKFDNKRADGTISSDIKSAKGSHLSVHAENSLKSVTDVCHKRTDRKSRITEKSGSTSRPEFEFTRLDFPELQSPENSGILEIPEQPKWGPLHSAATSVSLLRERKPPAVLAEGEIAVKSKNPAASVADSAASSSSSCTRGKSGYKILFLNIGFFFSRFILNSSAVEICLL	217196	201433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_201930_204476_204710_206206_206328_206575_206826_215682_215829_217069
742756	contig_10074_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_57136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACCCTGTGCCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386218	385426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_385400_386200
742757	contig_10074_pilon	-	2151	6	Intergenic	novelGene_57135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	45.556119237705	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	62	346	384573	381204	FALSE	15	GTTGTTTGAAGTTCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEKALEKSASRDASPFIVSMQKNKWDTTRSLRFNQDAQREDDQRRMSEITGHLIKMRLGDLDRVKSKEAKEFAGGIYSRLEAQVKASVPVSARQSSTEKNTRSRSRFGQGRPA	385410	379398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_381241_382221_382314_383929_384019_384506_384581_384661_384691_385385
742758	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
742769	SIRV6	+	559	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
742771	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
742776	SIRV2	-	419	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4454	34	3279	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
742777	contig_17935_pilon	+	2596	1	Intergenic	novelGene_170593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCTAAATGAGTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18007	20603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_+_18000_20600
742778	contig_3326_pilon	-	873	2	Intergenic	novelGene_170598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	226	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	2	727	214320	212417	FALSE	25	GATAGTGGTCTGATTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPLLLLSLLGVSWAESSCSGYPAIPGIPGIPGAPGSDGNPGTPGIKGEKGLPGLAGDHGEFGEKGDPGIPGNPGKVGPKGPIGPKGSPGPPGARGPKGESGDYRATQKIAFSVLRNIHTPLRRDQVIRFDQVITNENHNYEPRNGKFTCRVPGLYYFTYHASSRGNLCVNLVRGRERVQKVVTFCDYVHNTFQVTTGSVVLKLDQGENVFLQATDKNSLVGIEGANSIFSGFLLFPDIEV	214321	212270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212992_214169
742779	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
742783	contig_854_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_36125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATCAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312757	313292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_312800_313300
742787	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	289	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
742788	contig_11903_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_164733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCAGCTCTTAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58835	57956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_-_58000_58800
742796	contig_6710_pilon	+	503	2	Intergenic	novelGene_98069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGCACAGTGACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653428	657521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
742801	contig_9455_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_161842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGTTAAGAGCTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349914	349300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_-_349300_349900
742804	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	3	404	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742805	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742806	contig_7695_pilon	-	1445	5	Intergenic	novelGene_41552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.992559377347	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	78	1007	380076	375835	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSSAAAAAAAAAVTAASSSYYGRDRSPLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381082	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373987_375826_376074_376241_376521_379664_380089_381017
742809	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742814	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742816	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
742820	SIRV1	-	253	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	8	3569	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
742825	contig_15146_pilon	+	2227	1	Intergenic	novelGene_116929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1112	1486	49502	49876	NA	20	CCCGCTTGTGAGCAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLMGQEFLLIVKGLATDSTAEGAIADVALAVGDEIGLLAEAAVTVGARVGALACVDASMGHQVGLLAEGFAAFRADVGLFTGMDAPVGCQVGLVAESLATVWADEGPLRGMVAPVGCQVATL	48390	50617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_48400_50600
742826	contig_15146_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_116930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	225	142	366	50808	51032	NA	10	ACAGCGGTGGGCTCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAYEGPGLRGAGVAPPQVSSEPLSSPEAPLTSRTCDGPLCSCVGSQMQNQGHPASEALPTGVAGKAQVWGGCSMDLAVQCQEGGVAEAAPTLRAGQGQPGLAPPGMKPQGRPPWEVPPTVG	50666	51032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_50700_51000
742827	contig_1331_pilon	-	1249	4	Intergenic	novelGene_37835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	3	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	15	491	169924	160009	FALSE	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169938	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
742829	contig_8452_pilon	+	1561	3	Intergenic	novelGene_48039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	1	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	70	1068	432928	434013	FALSE	35	TACAAAACTTTGAGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423960	434506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_433296_433382
742834	contig_12327_pilon	+	1315	6	Intergenic	novelGene_140675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	52.791666008945	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACAAATGTTTTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128379	1137643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1128472_1131089_1131157_1131801_1131938_1132821_1132998_1136332_1136479_1136945
742841	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742844	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8469	-1	270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGCAATGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
742848	SIRV7	-	244	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91680	2	-91674	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGCAAATAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
742856	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742861	contig_8447_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_69437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGTTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112820	114960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_112800_115000
742862	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742868	SIRV4	+	324	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCGATTGGCAAGGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
742870	contig_5696_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_117500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281976	280059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_280100_282000
742872	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742873	SIRV1	-	235	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	5	3590	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
742875	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742883	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742888	contig_16666_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_61729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAATGCTTCTTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55096	56016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_55100_56000
742892	contig_2438_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_111995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	423	1272	112	1383	176662	177933	NA	25	GCCTGAGTTATTAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSKHWGEWFLNLRVLPAGVFGVAFLARVALVFYGVFQDRTLHVRFTDIDYQVFTDAAGFITKGRSPYLRATYRYTPLLGWLLTPNIYLSELFGKFVFISCDLLTAFLLYRLLLLKGLGRRQACGYCVFWLLNPLPMAVSSRGNADSIVASLVLMTLYLIEKRFVACAAVFYGFAVHMKMYPVTYILPIVLHLLPERDNEEGVRQSRYSLQGRLYEFLKRLCSWAVLLFVAVAGLTFFALSLGFYYKYGWEFLEHTYIYHLTRRDIRHNFSPYFYMLYLTAESKWSFSLGIAAFLPQFVLLSAVSFAYYRDLIFCCFLHTAIFVTFNKVCTSQYFLWYLCLLPLVMPLVRMPWKRAVALLMLWFMGQALWLAPAYLLEFQGKNTFLFIWLAGLFFLLINCSILIQIISHYKEEPLAERIKYD	176550	178597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_176600_178600
742893	contig_9471_pilon	+	1912	2	Intergenic	novelGene_21708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	241	846	83478	84285	FALSE	80	CAACCAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFDFIPSVKGAVLVCDVSSNFLSKPEDVSIFGVIFAGTPKNFDSAGVMVVIVRDDLLEFALWECPSVLEYKVQAGNNSLYNTLPCFSVYVMGLVLEWIKNNGFATVREQLSSIKSQMIYNIIDNSQGIYVCPVKPQNRSKMNIPFHTGNAKGNDALEKRLLNKALERSMMSLKGHRSMAQIVPFYIILSPLKMLRSWKPS	83237	85351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_83479_83680
742897	contig_11215_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_118968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	1	459	4952	1794	FALSE	25	GTGAGAGATGTGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLLEKDNVSLKCLPEGNSTQWWHNGSLISSQSSSYFIKSARVNDSGEYQCQTSSTLHSDPVQLEVHIGWVLLQAVRQVFLKGETIELRCHAWKSKPLHKVSYFQDDRRKKFSHHNTIFHIPKATGQHNGSYFCRGLIGNRNESSGSLNIYIQ	4952	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_2048_4747
742899	contig_1276_pilon	+	2678	1	Intergenic	novelGene_159761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114596	117274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_114600_117300
742901	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742904	contig_15152_pilon	-	2064	14	Intergenic	novelGene_126956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_13	19.9531996811236	116	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	54	1367	116539	84116	FALSE	25	GGAGCTATTGAAGGCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPGYLGGKDAEWRQVTMEKELRSTILFSASKKEIFTTNNGYKSIQKRLRSNWKIQSLKDEITSEKLIGVKLWITAGPREKFTAAEFEVLKKYLDGGGDILVMLGEGGESRFDTNINFLLEEYGIMVNNDAVVRNVYYKYFHPKEALVSNGVLNREISRAAGKAVPGIIDEESSGNNAQALTFVYPFGATLSVMKPAVAVLSTGSVCFPLNRPILAFYHSKNQGGKLAVLGSCHMFSDQYLDKEENSKIMDVVFQWLTTEDIHLNQIDAEDPEISDYMMLPDTATLSERLRVCLQEGDENPRDFTTLFDLSIYQLDTTSLPKVIKAYEQLNVKHEPLQLIQPQFETPLPALQPAVFPPSFRELPPPPLELFDLDETFSSEKARLAQITNKCTEEDLEFYVRKCGDILGVTSKLPKDQQDAKHILEHIFFQVVEFKKLNQEHDIDTSETAFQSNF	119503	83418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_84164_86368_86515_88404_88514_90100_90189_95672_95828_99227_99297_100532_100620_106314_106442_108208_108281_111343_111420_111713_111844_115670_115759_116420_116546_119456
742905	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742908	contig_3334_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_137678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCTTTATGGACAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775907	778293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_+_775900_778300
742910	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
742911	contig_990_pilon	+	2250	9	Intergenic	novelGene_76046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	58.1032217265101	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	186	977	880846	890739	TRUE	15	CCTCACACTGTCTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQKSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870428	895989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893438_894961_895146_895270
742913	SIRV6	+	521	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	20	20	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742914	contig_3601_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_132878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTATACCTCTACGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161853	160437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_160400_161900
742915	contig_6842_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_130745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273046	1274424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1273000_1274400
742920	contig_14970_pilon	-	972	6	Intergenic	novelGene_45115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.144950402616	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	331	813	291083	264555	FALSE	60	AGGAAAAAAACCCACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLL	315728	264395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_264559_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
742921	contig_11370_pilon	-	3173	23	Intergenic	novelGene_98775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_18	18.9020966085339	2	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	880	2643	16	2658	292047	281536	FALSE	40	TCTTCGTAAATAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPLKMHPLVFAPGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFTWTTKKKFRHFQELHRDLLRHKVLMSLLPLARFAVAYAPAGEAANREIPSLPRAVPEGSTRQAASRQRYLENYLNHLLAMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFITDLGPKGLEGVIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGVISFVQLFDPGFEVQVGKRSTETQYGVRIDTSHRSLILKCSSYRQARWWGQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGSLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDSMLKRKAEEGVRVSVLLFKEVELALSINSGYSKRALMLLHPNIKVMRHPDQMTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDFHYRLTDLGDSSESAAPQPPTLCPDSPTTPDLSHNQYFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPWRDIGMVVHGPPARDVARHFIQRWNFTKTTKVKYKTPMYSYLLPKSSSTASKLPFTLPGAQCATVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESKHFLYIENQFFISCSDGRMVLNKVGDEIVDRILKAHKQGECFRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHRLKAAMGTAWRDYMSICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKMLIADDRTVIIGSANINDRSLLGKRDSELAVLIEDTEMEPSLMNGVEYQAGRFALSLRKHCFSVILGADAQPDLDLRDPVCDDFFQLWQETAENNANIYEQIFRCLPSNAIHSIRALREYVAVEPLALVSPPLARSELTKVKGHLVHFPLRFLEDESLLPPLSSKEGMIPLEVWT	292062	281020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_281761_282029_282145_282505_282660_282899_283035_283314_283365_283528_283643_283748_283838_284076_284182_284289_284404_284493_284613_284804_284932_285325_285497_285678_285790_286844_286924_287068_287153_289773_289924_290370_290524_290614_290708_290848_290908_291049_291116_291209_291316_291719_291863_291966
742922	contig_6241_pilon	+	2381	1	Intergenic	novelGene_156421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGTAATATTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207938	210319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_207900_210300
742926	SIRV6	+	184	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	409	2	-239	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGACGCTTCCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
742935	contig_6445_pilon	+	1266	4	Intergenic	novelGene_77014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_1	748.301187134343	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	219	656	522296	598284	FALSE	80	GAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEEYKYTSCKAFLSTLNEMNDYAGQHEVISENMTSQIMVELARYVQELKQERKSVINIYFFLPKRWTKDNGTVPKTKPNLLPLS	522077	598894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_522320_579451_579568_597277_597335_598043
742936	contig_5918_pilon	-	2673	14	Intergenic	novelGene_99494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_13	115.338195790831	72	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	288	1748	244270	210091	FALSE	25	GCACAAGTGGGTGGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDEDGGSEKKYRKCEKAGCTATCPVCFASASERCAKNGYTSRWYHLSCGEHFCNECFDHYYRSHKDGYDKYTTWKKIWTRNGKTEPSPKAFMADQQLPYWVQCTKPGCRKWRQLTKETQLTPQIAKTYRCGMKPSTAVKTETSDHCALPEDLRVSEVSDHWWYSMLILPPLLKDSVAAPLLSAYYPDCVGMSPSCASTHRAASDATSGKLEHSKAVPSVLVPGMNRYFQPFYQPNECGKALCVRPDVMELDELYEFPEYSRDPTMYLALRNLILALWYTNCKEALTPEKCVPHIIVRGLVRIRCVQEVERILYFMTRKGLINTGVLSVGTDQHLLPKDYHNKSVIVVGAGPSGLAAARQLHNFGIKVTVLEAKDRIGGRVWDDKSFKGVTVGRGAQIVNGCINNPIALMCEQLGIRMHKFGERCDLIQEGGRITDPAVDKRMDFHFNALLDVVSEWRKDKTQLQDVPLGGMGRMTFWSFHCVSF	250834	209165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_210310_211259_211398_215311_215387_215942_216120_219748_219934_222305_222511_225685_225725_239578_239696_242109_242222_242980_243071_244166_244295_245382_245483_250367_250412_250715
742939	SIRV6	+	531	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1504_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742940	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_98092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742944	contig_19769_pilon	+	527	5	Intergenic	novelGene_102261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1575.13920019787	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	36	527	87249	89356	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVRPDDSGEPRLCRRKRTRVGDSIKLVLLP	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_87950_89273
742949	SIRV4	-	253	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1270	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3888	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
742952	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
742953	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_98039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	10	TTCTCCTCTTCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
742958	contig_11978_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_63116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCCTCTGTAAATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886304	1885225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1885200_1886300
742959	contig_11335_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_104945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAAATTATTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457470	455481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_455500_457500
742960	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742963	contig_20819_pilon	+	2005	7	Intergenic	novelGene_55624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	595.218843974401	2	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	29	1000	29817	41330	TRUE	15	TCTACTACTGTATTCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFCPP	29788	43416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_40961_41319_41404_42484
742965	contig_13004_pilon	+	1983	11	Intergenic	novelGene_112698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_6	275.168602860137	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	982	1596	943766	952167	TRUE	45	TCTGGAATAATATGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837744	996821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039_898169_923623_923840_926828_926989_927531_927669_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951_952454_964503_964574_996790
742970	contig_12993_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_136739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTTTAAGCCTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137289	138383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_137300_138400
742971	contig_4845_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_53700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAGAACGAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941371	941877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_941400_941900
742972	contig_6628_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_170613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACATGCTATATAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272570	272105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_-_272100_272600
742976	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
742979	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742981	contig_7020_pilon	-	1492	7	Intergenic	novelGene_57063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	62.7678704080006	444	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	69	1343	98420	83878	FALSE	25	CTACTTCTAAAGGTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGPPLRLNLKVLVIHGNQYWVIMVTGKFINRGQRLGCVLALSVLALVLWGVPGAKALDNGLAMTPTMGWLHWERFMCNVDCKQEPNSCVSEQLFMQMADLMVSDGWKDAGYQYLCIDDCWMAPTRDSKGKLQADPERFPGGIHRLANYVHSKGLKLGIYADVGQKTCAGYPGSFGYYDIDAKTFADWEVDLLKFDGCFCDSVDHLADGYKNMSLALNRTGRSIVYSCEWPLYMWPFYKPNYTEIRQYCNHWRNFGDIFDSWQSIKGILDWTSYNQDTIVDVAGPGGWNDPDMLVIGNFGLSWDQQVTQMALWAIMAAPLLMSNDLRHISPQAKALLQDKDVIAINQDLLGKQGYLLRKEDKFEVWERPLSNLAWAVAIRSLLEIGGPLSHTISVASLGRAVACNPACLITQLLPVKKELGLFEWTSVLKTRINPTGTVLLQIKRPS	98488	83728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_84145_84997_85196_85309_85472_91943_92036_92907_93086_94387_94563_98217
742985	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
742992	contig_20614_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_107574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATCTCACATCTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241074	241448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_241100_241400
742993	contig_7045_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_77490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTGTAGAAATTACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565548	565141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_565100_565500
742996	contig_14023_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_165383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	587	904	282586	282269	NA	75	TAAAAAAAAAAAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNILPRDASRARTGALRVHGPGSSLPRTWNTVPMRGQDSSQPSGVCDRLSARDNHLISESKPLRLRNALKTLSRARVMPTLSDKHVRCGVFLRPRELRTHLQF	283172	282109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_282100_283200
743003	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
743007	contig_11335_pilon	-	1275	7	Intergenic	novelGene_104932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	57.5453927106439	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	302	820	442152	418179	FALSE	20	CATATTGTTTTTGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAVGCCGLQLYKFGETVSIVFWTDTWRPESFFDRVKKNRQNGMHTLCLLDIKVKEQSLENLIKGRKIYEPPQYMSVNQAAQQLLEIVQNQRMRGEEPAITEETLCVGLARVGAEDQKIAAGTLQQMCTVDLGGPLHSLIITGGSMHPLEIEMLSLFSVLEDTSESQSIDGL	459610	417723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_420501_420606_422034_422075_427382_427504_442122_442232_451414_451540_459513
743010	contig_11126_pilon	-	1465	7	Intergenic	novelGene_138156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	519	junction_6	522.583326688992	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	56	634	1001201	989151	FALSE	25	ACAGTGCCATACCTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIALLNIYRNPQNSSQSADGLRCAVSDVEMQEHYDEFFEEVFTEMEEKYGEVEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAEKAVIDLNNRWFNGQPIHAELSPVTDFREACCRQYEMGECTRGGFCNFMHLKPISRELRRELYGRRRKK	1001256	988319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_989248_989354_989489_990028_990128_990285_990336_993941_994009_997708_997797_1001157
743011	contig_11126_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_138153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGGTGTGACTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988368	987796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_987800_988400
743015	contig_15859_pilon	-	2088	5	Intergenic	novelGene_50179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	388	junction_4	51.1028374946049	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	41	529	278658	262220	FALSE	60	CTTTAAAAAAAAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDGGTIPKRHELVKGPKKVEKVDRAAELVAQWNYCTLSQEILRRPVVACELGRLYNKDAVIEFLLDKSSEKALGKAASHIKSIKNVTELKLSDNPAWEGDKGNTKGDKHDDLQRARFICPVVGLEMNGRHRFCFLRCCGCVFSERALKEIKAEVCHTVSS	278698	260660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_262311_264929_265070_267481_267576_268824_268920_278589
743018	contig_5302_pilon	+	2154	3	Intergenic	novelGene_81499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	570	1	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	20	805	342315	355700	FALSE	40	TAAATCCATGATTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342295	357049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353346_353862_355568
743020	SIRV6	+	344	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1663	0	-236	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743021	contig_4232_pilon	-	1519	8	Intergenic	novelGene_63168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	31	468	121280	120421	TRUE	15	CCGGGAGCGCCGAGATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRAVEGASVMVQAQEAAPESAHVAVPESLSLLPEAIQGVDGRRILIQEEPHITQWPVVRAAGFHKLLHQVHKQVSDILIVGQLGSHVHQPPGQVLWGRDPGSSAFCPKGWRLSPEAGGGTGPSLNLSTSLSQPTTPLKRPAERVAAPPTRHSRA	121310	117096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_117270_117471_117668_117879_118006_119043_119145_119627_119764_120101_120689_120776_120887_121220
743024	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	1	1200	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743026	SIRV6	+	222	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	508	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
743027	contig_20375_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_105830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTCTCTTCTCCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48450	50514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_48400_50500
743028	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
743030	contig_12977_pilon	+	2179	2	Intergenic	novelGene_122805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	15	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	1670	2179	57768	58796	FALSE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKHALVQEDWQSLGPPEGHAQGQDLVLCGHGQNESFSCAGVDLLKSTGRGRFKTVTGQSALESPTCSLRITTSWTSLQGTSSRSSWKGRTAGGQWNGMGSVALSLVPTWRSFEEGQELPPGPPPPVEPAVPPPLPWPCHGPRTEPSCPGDGCWPLPMESLPQGIKKCLL	56098	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_57977_58495
743035	contig_11574_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_64047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAAAACATGGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411250	410791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_410800_411200
743038	contig_5947_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_101551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1061	1366	595657	595962	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKNEQISLEEVQPECSLEGRMVRLRLVYSGHVIRRDLSLEKDIMLGKVKGQRERGRPSMRWTDSGCNHGLKHNDCQDGAGPGSASFCCTQIHYESEPT	594596	596444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_594600_596400
743039	contig_8616_pilon	+	1223	9	Intergenic	novelGene_72557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1102.60429637064	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	19	1221	425778	436462	FALSE	15	GGCCTTCCAGCATGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKPASAVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDGKSEGGPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWE	425759	436464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427969_428126_428649_428794_430491_430639_431055_431238_435726_435900_435993_436119_436357
743042	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743043	contig_6710_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_89232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653722	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
743046	contig_13992_pilon	-	1402	8	Intergenic	novelGene_147634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	80.4096653749677	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	120	1337	447540	418592	FALSE	25	CTTTCACAATCATTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPAKKESCPNISRDKDRLLRYSVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHTCTKLKGQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESARQAPTKAEKIKLLKPISGKLRAQWEMGIVQAKEAASMSVDERKAKFTFVYVGDQLHLNPCVAREAGIAMETPGEVVDSSGVSDNLESTKEEGVPVKRRRRAKLRSSAEGQESEPGTVNTTPQKTAEADPKRGVGSPPGRKKATACTPRSRKGDAVSQFLVFCQKHRDEVVSEHPDASGEEIEELLGSQWDMLNAKQKARYNTKFALVTSPQSEEDSGNLNGKKRNHTKRTQDPTEDFEVEEAPRKRLRTDKHSLRKRETINDKTARTNSSKVTEAASSLKSQTATKNLSDACKPLKKRNRASAAAPSTLGFSKSSSPSTSLTENELLWEPTSVKLDLNSAAMYCT	447659	418526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_418655_421233_421359_422522_422605_424865_424985_428017_428163_435392_435864_436347_436515_447494
743047	contig_13992_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_147633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATCCAAAAGTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417726	417522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_417500_417700
743052	contig_9895_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_144706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGATGGCTAAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401747	401049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_401000_401700
743059	SIRV7	-	250	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91676	0	-91670	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAATAAATTGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
743063	contig_8907_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_85826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAAATTAAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423685	423200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_423200_423700
743064	contig_3068_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_137649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAAAATTTTAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357144	358023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_357100_358000
743073	contig_3627_pilon	-	2260	6	Intergenic	novelGene_78543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGACAACATCGATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677829	652949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_653046_660440_660515_661657_661819_667862_668048_674002_674056_676138
743075	contig_12540_pilon	+	1992	5	Intergenic	novelGene_148097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_2	15.5944701737507	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1390	1977	988416	989238	FALSE	5	ACCTTGTCTGCCCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLGATEAPQGSKQPIRSHFLEMLFPEAEAKKGKLRPQVWGSSWSCGLWAPCKHGSLFPSPTPPLMPTCPPMCGASGVTGPRPVDEKQSAAELDLVLQRHQNLQEKLAEEMLGLARSLKTNTLAAQSVIKKDNQTLSHSLKMADQNLEKLKTESERLEQHTQKSVNWLLWAMLIIVCFIFISTILFIRIMPKRK	986517	989253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_986635_986929_986980_987104_987184_987272_988821_989055
743078	contig_10930_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_37079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTGCTTCTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288719	287880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287900_288700
743080	contig_7179_pilon	+	1191	3	Intergenic	novelGene_78063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	566	junction_2	67	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAAGAAAGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397106	402023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_397795_400662_400755_401612
743086	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_89650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653787	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743095	contig_17829_pilon	+	1161	4	Intergenic	novelGene_157022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_3	61.3532576333337	356	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	75	1034	17405	25781	FALSE	5	TTTGTGGCTTTCCTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMYQVKPYHGGGAPLHVDLPTCMYRLPNVHGRSGCPAPGAGHVQGESDLSLQALESRQDDILKCLYELKAAVDGLSKMIQTPDADLDVTNIIRAEPTALKTSALDLNSVLGKDYGALKDIVINANPAEPPLSLLVLHRLLCDHYRVLSTVHTHSSVKSVPENLLKCFGEQTKKQSRHEYQLGFTLIWKNVPKTQMKFSVQTMCPIEGEGNIARFLFSLFGQKHNAVNLTLIDSWVDIAIFQLKEGSSKEKSAVLRSMNSALGKSPWLVGNELTVADVVLWSVLQQTGGANGTVPANVQKWMKSCENLAPFNTALKLLK	17330	25908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_17540_22114_22319_24361_24594_25392
743097	contig_7457_pilon	-	1457	9	Intergenic	novelGene_31430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	161.345126979404	1	37	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAACAATAAATATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468333_468721_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473120
743103	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	461	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743106	SIRV6	+	526	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1763_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743110	contig_3380_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_60132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	366	704	507345	507007	NA	30	ATTTATACATACGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRYCVFSECGRWAFHCRIIQNPHDKLDQLILLYCDDSFNIFSVCGRWAFHCRIIQNPHDKLDQLILLYCDDSFNIFSVCGRWAFHCRIIQNPHDKLDQLILLYCDDSFSI	507710	506663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_506700_507700
743115	SIRV6	+	565	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11203
743116	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1729_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743122	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	122	1	40	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3145	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743124	contig_7004_pilon	-	1693	12	Intergenic	novelGene_126440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	51.255316192728	197	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	176	964	162331	155001	TRUE	15	GAGCTGACTCCCGATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHHVEACAQVPGMQEILLIGFYQPDESLTRFLEAAQQEFNLPIRYLQEFAPLGTGGGLYHFRDQILAGSPEAFFVLNADVCSDFPLSTMLDAHRCQPHPFLLLGTTANRTQSLNYGCIVENPQTHEVLHYVEKPSTFVSDIINCGIYLFSPEALKPLRDVFQRNQQDRQLEDSLGLWPGAGTIRLEQDVFSALAGQGQIYVHLTDGIWSQIKSAGSALYASRLYLGRYQFTHPERLAKHTPGGPRIRGTHPAPALPLVPT	163455	153519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_153816_154110_154281_154523_154617_154830_155140_155259_155395_158683_158815_160570_160631_160963_161151_161409_161514_162298_162398_162508_162570_163407
743133	contig_10299_pilon	-	2090	4	Intergenic	novelGene_79764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.5979797464467	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	113	1579	593453	580210	FALSE	20	TCATCCCCCCCACTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTAEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622496	579698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580422_591057_592259_593399_593496_622426
743135	contig_10765_pilon	+	1770	5	Intergenic	novelGene_122866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.38987316808	6	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	290	1651	18249	34929	FALSE	35	CCAGCAAGATGTTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	17959	35048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_19134_28930_29040_32032_32122_32463_32541_34727
743136	contig_1996_pilon	+	938	10	Intergenic	novelGene_131896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	156.341348606025	1987	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	131	796	251625	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249892	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251552_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
743137	contig_14426_pilon	+	2412	6	Intergenic	novelGene_170631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.63151361133557	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	110	847	199273	205514	TRUE	35	CCAGAGAGATTACCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESRQRAALDAQSTEDQTGLLTVKVEKEEASAFAEEARLSCSPAAGSERSRQRFRSFRYPEAAGPREALSRLQELCRQWLRPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGALQSWVQEQHPESREEAVVLLECLERQLDEPRPQVPDGDRGQELLCCKMTLLTGARGSQSSQFQPMKALLKHESLGSQPLQDRGSPGSWSCPGKKLQRRHSGSCQAHPRVPGFAEGGRCGPDCLPWAGTAGLISGEPL	199163	208236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_199696_201200_201349_203203_203288_205431_205556_206540_207562_207733
743138	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743146	contig_17769_pilon	+	1598	11	Intergenic	novelGene_124249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	143.93693063283	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	36627	43853	FALSE	25	ATGCCATTTATTTCCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLTTPKSTWPRYSKPGLSMRLLETKKGLSSFMFEHSEEYQQVQHKFLAAVESMEPNNIVVLLQTSPYHVDSLLQLSDACRLQEDQEMARDLIERALYSMECAFHPLFSLTSGTCRLDYRRPENRSFYLALYKQMVFLEKRGCPRTALEYCKLILSLEPDEDPLCMLLLVDHLALRARSYDYLIFLFQDWEAHRNLSQLPNFAFSVPLAYLLLSQQADHPQHERSAAREKASVLIRQALTMFPGVLMPLLEYCSVRPDATVANHHFFGPNAQIR	30274	44429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_30335_31842_31918_33819_33848_36592_36676_37784_37916_38560_38661_39508_39603_40697_40791_40858_40965_42217_42378_43761
743147	SIRV6	+	506	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11024_11109_11205
743150	contig_16666_pilon	-	1524	7	Intergenic	novelGene_61719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_6	291.627616433469	286	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	610	1038	42510	24486	FALSE	5	GTTTCTGCCTCTTGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLKRGWGEFEIIIKIFFIDPNERPVTLYHLLKLFQSDTNAMLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47960	23999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_47556
743153	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8470	-1	269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTGCAATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
743155	contig_11630_pilon	+	1964	3	Intergenic	novelGene_147177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	94.5	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGAATGAATGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77680	146265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895_132058_144489
743157	contig_1009_pilon	+	1785	9	Intergenic	novelGene_121752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	36.0615792776745	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	307	1377	260614	272389	FALSE	50	GAACAAAATAAAGTAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVDVVGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVTERGKAEAADLRPGDIIVAINGESVEGMLHAEAHSKIRQSPSPLRLQLDRSRAASFGETNGERSLELLATRFQGSVRTHTDSQSSLRSSYSSPASLSPRPGSPFSPRPATSPHTLTGEGVISRSFQSLALTPGPAADHLSYGGRPGSRQAGLSRAGDSAVLVLPHSPGPQSSSPRLSVDSEGGRHLLEEDSEVFKMLQENREGRVAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQASLSTGRALATPPKLHTCEKCSTSITNQAVRIQEGRYRHPSCYTCADCGLNLKMRGHFWVGDELYCEKHARQHYSASSTLSSSQA	260307	272797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_260707_261459_261612_263744_263815_263909_264062_264225_264302_268833_268917_269119_269266_270765_270884_272208
743161	contig_5041_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_27114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGCATAAACTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605772	604917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_604900_605800
743166	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743167	contig_20822_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_170638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCACCAAAAATAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51407	49841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_-_49800_51400
743170	contig_7963_pilon	+	1798	3	Intergenic	novelGene_58612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_2	12	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	237	617	296830	297210	TRUE	10	CACTGTTTCCTTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEKDGVMSTGLIRNGDWTFQIMVMLEMTPELGDVYTCLVDHSSLLSPVSVEWSESQLLCSLGLTQDHTESIWGLCYLCTLLGHNTNSFP	296593	298818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_297939_298192_298225_298397
743171	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743173	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743174	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	49	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
743177	contig_14681_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_134199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27871	30121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_27900_30100
743178	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743179	contig_2278_pilon	-	1154	3	Intergenic	novelGene_118082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	244	junction_2	17.5	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCTAAATGGAAATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631981	629293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_630292_630585_630682_631921
743183	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
743186	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743188	contig_14727_pilon	+	667	5	Intergenic	novelGene_56629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	298.665678476788	6824	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	34	543	47396	55271	FALSE	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	46225	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51531_54130_54263_55134
743189	contig_6048_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_73340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTACTCTCTATGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2899379	2898297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2898300_2899400
743192	SIRV7	-	366	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-25	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114763	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
743194	contig_7816_pilon	+	2008	14	Intergenic	novelGene_66546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_13	44.8115052851069	70	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	44	1669	312165	351499	TRUE	15	TCATGTTTTTGTATGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQEVLGQAARLASSGLLMQVLFRLITFVLNAFILRFLSKEIVGIVNVRLTLLYSTTIFLAREAFRRACLSGGAQRDWSQTLNLLWLTVPLGVFWSLFLGWVWLHLLEVPDPNVVPYYGAGVVLFGLAAVVELLGEPFWVLAQAHMFVKLKVIAESLSVILKSVLTACLVLCSPHWGLYIFSLAQLFYTTVLVLCYVIYFMKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	312121	354111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_312228_317382_317469_321924_322042_323163_323354_325272_325375_328840_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331_351687_353959
743196	contig_3081_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_133989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCCCCCAAGTTAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2988374	2989981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2988400_2990000
743202	SIRV1	-	253	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	8	3569	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
743211	contig_14683_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_166038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTTGGAGAATCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51415	53504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_51400_53500
743214	contig_2027_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_39954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGAGGTAGACCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643050	645119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_643000_645100
743215	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_96540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743218	SIRV6	+	548	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743224	contig_6164_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_121312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTTTTCAGCTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791384	789248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_789200_791400
743225	contig_4305_pilon	+	2790	12	Intergenic	novelGene_136705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_11	9.12901106227869	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	853	2562	127	2688	780880	803214	FALSE	20	TTGTATCTTGTATATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDQRTRQSQQPVKAISAAKDSASPASQQVSTQRPSSPQGEAMETDVPEGQKEGQNTNQEKLSKALTERPSQNNIGIQTMECSPWAPETVSTATQTVKNVCEQGTNTMDQNCGKQDATVQTEKGSGEKLASAPGDDTESLHSQGEEEFDMPQPPHGHVLHRHMRTIREVRTLVTRVITDVYYVDGTEVERKVTEETEEPVVECQECETEVSPSQTGGSSGDLGDISSFSSKASSLHRTSSGTSLSAMHSSGSSGRGAGQPKGKTSGTEPADFALPSSRGGPGKLSPRKGVSQTGAPVCEEDGDAGLGIRQGGKAPVTPRGRGRRGRPPSRTTGTRETAIPGPLGIEDISPSMSPDDKSFTRIVPRVPDSTRRADVGAGALRRSDSPEIPFQAAAGPSDGLDTSSPGNSFVGLRVVAKWSSNGYFYSGKITRDVGAGKYKLLFDDGYECDVLGKDILLCDPIPLDTEVTALSEDEYFSAGVVKGHRKESGELYYSIEKEGQRKWYKRMAVILSLEQGNRLREQYGLGPYEAVTPLTKAADISLDNLVEGKRKRRSNISSPATPTASSSSSTTPTRKITESPRASVGVLSGKRKLITSEEERSPAKRGRKSAAVKPGAVGAGEFVSPCESGDNLGEPSALEEQRGPLPLNKTLFLGYAFLLTMATTSDKLASRSKLPDGPSGSSEEEEEFLEIPPFNKQYTESQLRAGAGYILEDFNEAQCNTAYQCLLIADQHCRTRKYFLCLASGIPCVSHVWVHDSCHANQLQNYRNYLLPAGYSLEEQRILDWQPRENPFQNLKVLLVSDQQQNFLELWSEILMTGGAASVKQHHSSAHNKDIALGVFDVVVTDPSCPASVLKCAEALQLPVVSQEWVIQCLIVGDRIGFKQHPKYKHDYVSR	780753	803316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_781183_785430_785584_789777_790050_790753_790904_791204_791636_794786_794979_795395_795612_797275_797492_801101_801197_801728_801929_802484_802631_803026
743227	contig_11742_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_166531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2023	2328	63449	63754	NA	25	CTAGATCCTCAACTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFKNLKRLTSLIMREIQMKTVMGYGFIHLLNWQRSKIWYHCIDVVSIKTNMHIYLISNSTAMKLSYSSCLQILIQYFQGFKHTIEIICDMQACHYLISFI	61426	63992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_61400_64000
743228	contig_6102_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_32255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCAGGCAGCCTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309145	1308819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1308800_1309100
743229	contig_990_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_76159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCCCTCCCCACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1878949	1878006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1878000_1878900
743231	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91642	0	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
743233	SIRV2	-	270	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	646	32	646	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4086	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
743234	contig_20028_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_170651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTAACCGAAGGGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55321	55980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_55300_56000
743238	contig_3424_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_55549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319434	317944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_317900_319400
743240	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743241	contig_5999_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_45634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCCAACAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175905	174991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_175000_175900
743244	contig_177_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_41795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1189	1500	394759	395070	NA	55	AAAAGTTTTTGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLKKNRRLNGSYSGRRKIYTLEFLGSGLGLEFSSEHLGDRITKRNRELPISHSPFQGNIPVHQERQTSFLVLKKLFTGVLRQETETTRYNVTGRSFVEDVT	393570	395901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_393600_395900
743246	contig_6710_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_90306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGCTGTGCCCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
743249	contig_14687_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_107979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCAACGCACATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809360	810612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_809400_810600
743255	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743257	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
743258	contig_18272_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_7014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGGGCTCCACAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180168	179582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_179600_180200
743259	contig_16907_pilon	+	1252	3	Intergenic	novelGene_87431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2492	junction_1	41	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCAATGGCGTTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360074	364101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_360152_361003_361100_363022
743261	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	51	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
743264	contig_2219_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_67211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAACCCAGCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371694	370882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_370900_371700
743268	contig_12410_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_167279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGGATTTCATGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128670	130185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_128700_130200
743276	contig_19564_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_29688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGTAATTACACATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109678	109928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_109700_109900
743282	contig_8898_pilon	+	2806	2	Intergenic	novelGene_137260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGTAAATAATATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340063	376989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_340261_374380
743285	SIRV2	-	656	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	3	2958	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
743286	contig_4812_pilon	+	1931	8	Intergenic	novelGene_103684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	103.354946170753	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	124	762	196969	213018	FALSE	15	TGTTTGGTGGTTATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALNWKPFVYGGLASITAECGTFPIDLTKTRLQIQGQTHDAKLKEMRYRGMLHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSLKRLFVERPEDETLLINVVCGILSGVISSAIANPTDVLKIRMQAQSSTIQGGMIGNFVNIYQQEGTRGLWKGVSLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYNHFYGICRANY	187736	214187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_187804_196912_197033_198675_198824_202849_202945_203859_203946_205876_205973_206700_206816_212983
743288	contig_3155_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_26329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAGTCAGTGTTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54027	54540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_54000_54500
743290	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743293	contig_11294_pilon	+	1924	12	Intergenic	novelGene_50054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	132.05646175371	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	18	1190	251378	331252	FALSE	15	CCAGATTTGTTTTGCCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASALKMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGGSNHLAVVLGDIILAVIDSIFVWFCCFGTFLRKEVGSYVPVFVS	251360	331986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693_323788_325734_325805_331187
743296	contig_8978_pilon	-	1447	8	Intergenic	novelGene_49347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	792.846486414872	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	34	1155	194082	190773	FALSE	45	GTTGATAAGAATAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194115	190480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
743298	contig_5586_pilon	+	2611	1	Intergenic	novelGene_143584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAGGAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421873	424484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_421900_424500
743299	contig_16110_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_126788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAGAATTTCTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63294	61995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_62000_63300
743302	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8138	3	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
743303	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	-9	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743304	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	547	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743308	SIRV4	-	332	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1191	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3967	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743309	contig_12477_pilon	+	1692	5	Intergenic	novelGene_84385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	69.6432875444576	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	8	589	6155	19221	FALSE	40	GTATTAAGCATAAAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGVQGVADAYRTCLPKIRLYGPTNFSPIINHVARFAAVATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNAAKLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPSGEAAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATK	6147	20324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12477_pilon_+_6203_6287_6340_14774_14909_16073_16311_19110
743314	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
743319	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743320	contig_3818_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_99304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCGTGAGCAAGGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969061	970672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_969100_970700
743321	contig_11594_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_80949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAGCCCCAGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588560	590450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_588600_590400
743322	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743324	contig_10236_pilon	+	2316	2	Intergenic	novelGene_169127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1527	2129	258766	259368	FALSE	20	GTTACTATTTTTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGRAHRRLVRASGGDGGGRGRNLGAPAQSHPWRDVRRALLGLAPPPPGSVHVCLCAHPRQGGLAWGSGQQCAHRKPKREGTSPHGDPQSLEPHPILPGSTAFFLKPASRCWPGKLRGVLVFGMMPPTGGGGRTRWPNRLAKEWRGARTKVYLATSLPGANYQQRVLAMVGSLLPPPHPIPKLSSPQLPLTLQLLGSAL	257058	259555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_258025_258205
743325	contig_10016_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_117866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTGAGCTGTAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378193	376107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_376100_378200
743327	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_90279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653812	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743328	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743334	contig_17274_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_26563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208769	206820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_206800_208800
743338	contig_5403_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_87977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTGTGTGATACTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426601	427693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_+_426600_427700
743344	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743350	contig_1639_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_74926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATGACAAACTCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364953	363523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_363500_365000
743357	contig_14566_pilon	+	899	6	Intergenic	novelGene_148836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	245.212071480994	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	174	845	88884	100512	FALSE	45	GATGAAAGGAGTTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTGPALEASVHSLLGRITTAE	66803	100566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_88762_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_100453
743366	SIRV4	-	420	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1103	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4055	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
743367	contig_10235_pilon	-	1762	12	Intergenic	novelGene_46360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	135.795361354095	32	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	922	1677	137459	130363	FALSE	15	TGGCTCTTTGGTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEEVEERAPAQNPELTPSGPAPAGPTAAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRLESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACAPPRHLHVVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPTTANAEAPLPGPGQSASLAPSSTTVESSTAGARPLTSPESLSRDLEAPEVQESYRQQLRSDIQKRLQEDPNYSPQRFPNAHRAFADDP	141314	130277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130833_135720_135860_136063_136262_136710_136841_137349_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_141092
743368	contig_5936_pilon	+	2162	5	Intergenic	novelGene_53589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	26	junction_2	5.7227615711298	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	7	1638	466533	506527	FALSE	45	TATGATAATGTAAAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSINNMNNHQLTHLQSLLNNNQMFPPNQQQQQLLQGYQNLQTFQGQSTIPCPANNNPMACLFQNFQVRMQEDAALLNKRISSQPGLTALPENLNTTLLPFQDTPCELQPRIDPPLGQQVKDGLVVGGQGDASVDAIYKAVVEAASKGMQVVITTAVNSTTQISPIPALSAMSAFTASIGDPLNLSSAVSAVIHGRNMGGVDHDGRLRNTRGVRLPKNLDHGKNSNEGDGFEYFKSASCLASRKQWDGEQSPGGEQNRWKCEEFLDHPSHIHSSPCHERSNNVSTLPFLPGEQHPIMLPPRNCQGDKILEENFRYNNYKRTMISFKERLENTVERCAHINGNRPRQSRGFGELLSTAKQDLVLEEQSPSSSNSLESSLVKDYIHYNGDFSSKSINGCVPSPSDAKSISSEDDLRNPDSPSSNELIHYRPRTFNVGDLVWGQIKGLTSWPGKLVREDDVHNSCQQSPQEGKVEPEKLKTLTEGLEAYSRARKRNRKSGKLNNHLEAAIHEAMSELDKMSGTVHQIPQGDRQMRPPKPKRRKISR	466526	507051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_466734_469967_471177_483443_483518_502324_502401_506455
743369	contig_1443_pilon	-	1186	2	Intergenic	novelGene_28166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3	416	344887	344474	TRUE	45	ATTACTGCAAACACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRFYCLEYSAAKLGKVSNLKIWRPGPFFASFLLPSFKTHRDPKERKIISLCPNSYLANSSNTFLLPSVGTRESNRRKEKAEEIITEPVPSEGKSDRKFKRSYLSAQEPNDREGLSAEGGHRQQRRTCTGQHCCSCS	344889	343513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_343931_344120
743375	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	20	-2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743377	contig_1521_pilon	-	1132	4	Intergenic	novelGene_145442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_2	99.3523471735262	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1116	15	1130	191760	160446	FALSE	20	GGGTAAGGTTTCTGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREETKGKRDREKDTREERDYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDTRDARDRRELRDSRDMRDSRDMRDYSRDSKDSRDPRDSRSTRDAHDYRDRESRDAHRKEETYQEESRSYGRNHLREESSRAEVRSDSRNESRSEIRNDRMGRSRGRGPELPE	191774	160443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669_163981_179059_179258_191614
743378	contig_11978_pilon	+	1204	2	Intergenic	novelGene_63118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGGCAGTTTGAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886232	1888613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1886565_1887741
743380	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
743381	contig_14441_pilon	+	639	2	Intergenic	novelGene_100708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	152	637	116728	117774	FALSE	10	CACAGCCTGCTTGGCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPI	116576	117776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117523
743382	contig_14288_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_153817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268939	271706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_268900_271700
743391	contig_12786_pilon	-	1443	10	Intergenic	novelGene_103423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	601.279191945528	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	452	1387	614067	590909	FALSE	20	CCAGAATCTCCTTTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629436	590852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624_615731_628736_628938_629303
743396	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743397	contig_6397_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_146250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAAAAAAACAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442660	442041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_442000_442700
743398	contig_15165_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_145302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCTGGCATGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464	939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_500_900
743403	contig_6446_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_149263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736127	738299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_736100_738300
743404	contig_2227_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_142343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTTTTTTTTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244186	242614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_242600_244200
743405	contig_5083_pilon	+	2566	2	Intergenic	novelGene_151692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	0	24	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	212	568	1367951	1370127	FALSE	70	AAATGAAATAGAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGTRSFSLSGLLPAQTSLEYALLDAVTQQEKDSLVYQYLQKVDSWEQDLSMPEFPEGLEWLNTEGPISVYKDLCGKVVVLDFFTYCCINCIHLLPDLHALEHTYSDKGICPLIPF	1367739	1372125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1368129_1369948
743411	contig_14681_pilon	+	1557	3	Intergenic	novelGene_134207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	119.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65658	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_66388_71088_71167_72461
743415	contig_2380_pilon	+	1748	1	Intergenic	novelGene_117885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACTGTGTAGATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76020	77768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_76000_77800
743416	contig_15974_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_164823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAGTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329438	330543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_329400_330500
743419	contig_11709_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_168204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1172	1588	16471	16887	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPVCVWDWLWEFIRLKGPDESPEREAGKCLFRCLIFAPTSWWTELGVWNRSRRCGCLCTPVPLDIVSCSESEMFCVTPPYPHLRLNTKSPCPCSSQNLSQPAAAPEVTHSEMCVGLRFLLTRCICHWWNVCPWLLV	15299	17355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_15300_17400
743426	contig_9471_pilon	+	1324	9	Intergenic	novelGene_21834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	528.064611932101	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	161	1096	412726	417296	FALSE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	412565	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414065_414680_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
743428	contig_8617_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_73442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAAACATAAAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62470	62043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
743431	contig_6710_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_94776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653681	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
743437	contig_6710_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_89225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653719	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
743444	contig_9981_pilon	+	2593	1	Intergenic	novelGene_121070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	67	492	402123	402548	NA	75	TGGAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCPFRSPIAGPIENLGCQAARLRFSPPSGLKAAGESLGVMTARTLVWAGPAAPCPFLHLGAAPLGRASGPVQPGLLRRGAPCPALAVAQNGGAFFVVATPASLKCYELLLMGFLRVSFIQSFIRPINIKPLFSTGHWGTR	402056	404649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_402100_404600
743445	contig_14441_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_100573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	369	812	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGHRPPVLRRGDTTNHNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111197	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_121638_121684_125517_125902_126496
743446	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91638	4	-91632	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACGAAGTAAGTATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
743448	contig_2027_pilon	+	1105	6	Intergenic	novelGene_39957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	729.102900830877	1824	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	385	1008	661342	664407	FALSE	10	GCAGGCGGTGTCCTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	660209	664504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_660485_661232_661463_662681_662762_662944_663072_663312_663438_664236
743451	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	0	407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743452	contig_8820_pilon	-	2020	3	Intergenic	novelGene_79329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCGACCAATGTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483374	471116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_472299_479319_479631_482847
743455	contig_9363_pilon	-	1323	6	Intergenic	novelGene_6612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_4	1245.4926736035	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	137	754	786587	777382	FALSE	45	TGAAAAAACAAGTTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	787902	776812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
743457	contig_9571_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_136266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAAAAAAAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384979	382867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_382900_385000
743458	contig_12622_pilon	+	1246	5	Intergenic	novelGene_5859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	62.9339931992242	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGTAGATCTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098403	1109625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098707_1099890_1100008_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986
743459	contig_6048_pilon	+	1528	6	Intergenic	novelGene_73093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	170.131713680901	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	136	468	132371	133829	TRUE	45	AAGGAAAAACATTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSMRKLGSETLNDVYS	131110	136357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_131246_132370_132550_133132_133242_133784_134001_134181_134320_135606
743462	contig_13481_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_119263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25843	25324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_25300_25800
743463	contig_3601_pilon	-	1550	4	Intergenic	novelGene_132868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	43.0838974817997	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAACTAACTTGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188349	144039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_169011_169200_187636
743466	contig_10904_pilon	+	1661	12	Intergenic	novelGene_22585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	219.862128098272	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	52	1083	439135	451585	TRUE	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVRMPTRRTWASAWVTWASRAAGVCGRHR	438424	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448436_451500_451624_451716_451816_453838
743470	contig_10780_pilon	-	2200	10	Intergenic	novelGene_155428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	82.8601379985322	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	32	466	113602	104723	TRUE	25	TATTATGCCCTAGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDYPPVEERRRLQEELSEFVESCCRTLEEVTASLGWSLDQLDPGEEETAEDEVVICPYDSNHHMPKSSLAKHMVSCRLRKLDYTKEEEDEMYNPEFFYENVNIPSITLNKDSQLQIIKQARTTDGKDGDCSNQIIGVSIKRN	113633	94745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_-_94946_97504_97670_98429_98519_102076_102199_102784_102974_103753_104752_108010_108086_108921_108983_109208_109323_113446
743472	contig_1516_pilon	+	1582	8	Intergenic	novelGene_49987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1426.29053627848	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	87	953	347241	363092	FALSE	25	ACAGCTGAAGCACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGMTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335195	363721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353607_359983_360125_362116_362303_363031
743473	contig_205_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_144320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	375	1128	770	1897	295868	296995	NA	25	CGTTTTAGGGCCTACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEISRRSHHSISSQTFEHPLVNETEGSSRTRHHVTLRQQITGPELLSRGLFAASGTRNASQGAGSSDATGNTESTGSGQRPPTIVLDLQVRRVRPGEYRQRDSIASRTRSRSQTPNNTVTYESERGGFRRTFSRSERAGVRTYVSTIRIPIRRILNTGLSETTSVAIQTMLRQIMTGFGELSYFMYSDSDSEPSGSVPSRNMERSELRNGRGSSAGNSSSGSSSSSSSSPSSSSSGESSESSSEMFESSNEGSSSSGARREGRHRAPVTFDESGSLPFLSLAQFFLLNEEDDDQPRGLTKEQIDNLAMRSFGENDALKTCSVCITEYTEGNKLRKLPCSHEYHVHCIDRWLSENSTCPICRRAVLASGNRESVV	295098	297185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_295100_297200
743474	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	3	406	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	402	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743475	SIRV2	-	558	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	1	322	1	-300	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4731	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687
743479	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743480	contig_11677_pilon	-	755	5	Intergenic	novelGene_85942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12291.7847031056	119	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATATGCTTCTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598063	594884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_596017_597106_597397_598027
743482	contig_5623_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_154789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTCACCAGGGCGCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124138	125494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_124100_125500
743485	contig_4874_pilon	+	1776	4	Intergenic	novelGene_78625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	34.9316793501575	397	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	26	844	122343	127301	FALSE	15	CCTAAAGTGCCTCCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLERGGAMQYPHPGPGAAAPAVGVPLYAPTPLLQPAHPTPFYIEDILGRGPAAPTPTPTLPSPNSSFTSLVSSYRTPVYEPTPIHPAFSHHSTAALAAAYGPGGFGGPLYPFPRTVNDYTHALLRHDPLGKPLLWSPFLQRPLHKRKGGQVRFSNDQTIELEKKFETQKYLSPPERKRLAKMLQLSERQVKTWFQNRRAKWRRLKQENPQGNKKEDLENLDNPCEQRQDLPSEQNKGASLDSSQCSPSPASQEDLESEISEDSDQEVDIEGDKGYFNAG	122317	128233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_122710_124796_124976_125181_125233_127079
743488	contig_6710_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_89555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743493	contig_10312_pilon	+	1696	7	Intergenic	novelGene_159037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	39.8148492678576	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	206	1594	625757	642192	FALSE	25	AAATTTCTATTGTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVNLELDPIFLKALGFLHSKSKDSAEKLKALLDESLARGIDSGYRPSPKDVEPPKISSTKTVSIKQEPKTSSSLPSGNNNGKVLTTEKVKKEAEKRPADKIKADISEGVDVPKKPRLEKPETRSSPITVQTSKDLAMADLSSFEETSADDFAMEMGLACVVCRQMTVASGNQLVECQECHNLYHQDCHKPQVTDKEVNDPRLVWYCARCTRQMKRMAQKTQKPAQKPAPTVVSVAPAVKDPLVKKPETKLKQETTFLAFKRAEVKASPVISGNSSSTSISSSAASGLTGWAAFAAKTSSAGPSTAKLSSTAQNNSGKPTTSSANQKPVGLTGLATSSKGGIGSKLGSSNSTTPTVPLKPLPPLTLGKTGLSRSVSCDNVSKVGLPSPSSLVPGSSSQLSGNGNSGTSGPSGNTTSKTTSELSSSSSASLKGPTSQESQLNAMKRLQMVKKKAAQKKLKK	620303	642294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_620500_625747_625913_630661_630815_632724_632913_634403_634564_637638_637786_641607
743496	contig_7272_pilon	+	2146	5	Intergenic	novelGene_25397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	130.120136796731	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	670	1083	760875	769117	FALSE	15	CTACATGTCTCTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	760205	770180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_760878_763506_763600_766027_766124_767159_767264_768999
743498	contig_10324_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_7731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTGTTAAATGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55670	54327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_54300_55700
743499	contig_12292_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_167013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATCTGACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336935	337816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_336900_337800
743505	contig_13004_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_112588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGCTAGATTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39952	41158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_40000_41200
743506	contig_11136_pilon	+	1802	2	Intergenic	novelGene_169030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGCAGGCTCTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150470	152641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_151235_151603
743514	contig_13828_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_158286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168457	170895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_168500_170900
743519	SIRV7	-	878	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-4	1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCCTAAGAGATCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147929	56036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114989_147640
743524	contig_14142_pilon	+	2086	10	Intergenic	novelGene_120485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_2	186.756592096124	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	24	1202	268562	274116	FALSE	10	TGTGTCTGAGGGATGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IACPGAAMEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLEDSVTLRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHFNFMCNSSCMGGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRICACPGRDRRTEEENFHKKGETSPEPPPGRSTKRALPTNTSSCTQPKKKPLDEEYFTLQIRGRERFKMFLELNEALELKDAQAGKEPEGSRAHSSPPKSKKGQSTSRHKKLMFKREGPDSD	268538	275000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_269877_269991_270242_270353_270673_270814_270915_270990_273349_273457_274034
743525	contig_7171_pilon	-	1439	17	Intergenic	novelGene_101299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.580691782709	13	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	68	1318	1075756	1057742	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRLRTSEIPMSEAVEAVAMVGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075823	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061147_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
743526	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743528	contig_5551_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_134286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	263	841	807762	807184	NA	25	CCTATAGAGACTGTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGVLPWVFCIWPANEQTGREHGGSYRDFRSLAHVPLTRISHRAAHRCMGAEKGSPDCAQEEDLVGILLNAASVLIFKDFCRRDLAGGCAGTQKTLILALTSPVALSASHSLFWSQIPHLKVRESSQMTHPRCLPILNIYVIKHHFMIFNNHDAVIVAISIICAFVQKCNRNYNINSGGEYYLFCCGSSNT	808024	806196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_806200_808000
743530	SIRV1	-	238	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
743531	contig_9463_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_83813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCACCACATCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37751	39121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_37800_39100
743534	contig_8652_pilon	+	2804	7	Intergenic	novelGene_168787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_5	10.770329614269	135	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	927	1820	663643	673875	FALSE	30	TGTACACATCTGTATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRHPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQFMDSSLVKSYLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLVYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM	662716	674859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_+_663680_668244_668402_669271_669396_670555_670727_671699_671864_671986_672129_673776
743536	contig_11248_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_142531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAGCGCTGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107318	108986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_107300_109000
743537	contig_10569_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_44058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGCGTTCGACATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69532	71418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_69500_71400
743538	contig_2450_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_160319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAGACTTTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786284	783699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_783700_786300
743541	contig_20028_pilon	-	1352	2	Intergenic	novelGene_170653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57747	56125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_-_56937_57206
743543	contig_14553_pilon	-	718	2	Intergenic	novelGene_124992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	62	388	14363	14037	TRUE	30	TGCAGAGAAAGATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEQSGLLEPFSWRRPLSEFRLQDNWDKLAVSRLREEAVSFLFSWILWPECWTSMSSEPEEWEIESRDSFRCSSAPEVVRGSSSESGQSPERASGVSVHSFKMADL	14424	5744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_5834_13795
743549	contig_6418_pilon	-	1045	10	Intergenic	novelGene_81093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	497.748808680854	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	171	791	81719	68463	FALSE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	82057	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73069_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_81995
743550	contig_11855_pilon	-	841	5	Intergenic	novelGene_67135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_4	19.4550764583437	3752	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	328	738	2676275	2674178	FALSE	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTTGALLIPPALFRYNTRGLIRPMSASFLSRSEIPSKQPSYSSSPLQLARREFQTSVVSRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	2677190	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674293_2674641_2674821_2675231_2675310_2676236_2676285_2676872
743552	contig_1372_pilon	-	1609	7	Intergenic	novelGene_140506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	96.3576958813127	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	210	1166	431763	401441	FALSE	30	TCAAACTGACTTCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGLWRVAGNQLQQEGYSEHGYLTREQSRRMAASNISNANPRKQVQGGIDIYHLLKTRKSKEREGFINLEMLPPELSFTILSYLNATDLCLASCVWQDLANDELLWQGLCKSTWGHCSIYNKNPPLGFSFRKLYMQLDEGSLTFNANPDEGVNYFMSKGILDDSPKEIAKFIFCTRTLNWKKLRIYLDERRDVLDDLVTLHNFRNQFLPNALREFFRHIHAPEERGEYLETLITKFSHRFCACNPDLMRELGLSPDAVYVLCYSLILLSIDLTSPHVKNKMSKREFIRNTRRAAQNISEDFVGHLYDNIYLIGHVAA	451271	400997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_401629_403090_403288_407184_407304_427654_427782_431437_431772_435425_435549_451193
743556	contig_302_pilon	+	1893	1	Intergenic	novelGene_145007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAACTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29956	31849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_30000_31800
743558	contig_15114_pilon	+	2572	16	Intergenic	novelGene_121183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	30	junction_6	128.474571630169	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	25	2334	688565	747036	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVMDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDTSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEHTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDEWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFLQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKSLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHATDIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQKFVDYGFFYFDGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALSLAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAKGGKLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDILLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFRNQTLTDWLLDAPRLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVNASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFVEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIKQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVYTYLH	688540	747274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_688689_711862_711950_713497_713766_716869_717096_718946_719031_724371_724434_725471_725569_726677_726848_728042_728125_729509_729663_732182_732349_739678_739871_742162_742248_746016_746158_746433_746627_746856
743560	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743563	contig_1107_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_126591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAGAAGAAAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834294	834590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_834300_834600
743564	SIRV5	-	439	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTAGAGATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
743569	contig_16716_pilon	+	2034	11	Intergenic	novelGene_169278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	21.8268183664042	93	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	6	1202	155441	194835	TRUE	20	TTAAACCTATGGTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMSGTPGETRPTGPGSGSPLVEGARFFCTAGRGLERFLMREVRARLAATQIEYISGKVFFTTCSDLNTLKKLKSAERLFLLIKKQFPLTVFSASKGKIFKELQKLINDDPGSWLNAISLWKSLLELDAKNEKLSQESSPPLKRKVEENEIIVAKKLKTEQMQELQENRECQLEKQTGEETLEQEDFITKREDFQEEEFQNDVEKAIVGHNQKDLTFRVSCRCSGAVGKTFTAQEVGRIIGIALMKQFGWKADLRNPNLEIFIHLNDIYSVVGIPVFRVPLANRAYIQTAGLRSTIAWAMASLAEIQAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIGFLIGPFVYKTQVSTANQIAIAFRKCRYYYF	155435	204873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_155588_164327_164464_166650_167064_168148_168227_170652_170706_177235_177324_183761_183834_184294_184410_186426_186479_194792_194902_204107
743570	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743574	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743577	contig_990_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_76074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCCCCAAAATATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089803	1091903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1089800_1091900
743581	contig_5935_pilon	-	1012	7	Intergenic	novelGene_102664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_4	19.8557296516648	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	55	1011	423849	421951	FALSE	65	ACATTAAAAAAGAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METENGSQDKVMEEENIEKKKDVEKKKRSRVKQVLADIAKQVDFWFGDANLHKDRFLREQIEKSRDGYVDISLLVSFNKMKKLTTDGKLIARALKSSAVVELDLEGTRIRRKKPLGERPKDEDERTVYVELLPKNVNHSWIERVFGKCGNVVYISIPHYKSTGDPKGFAFVEFETKEQAAKAIEFLNNPPEEAPRKPGIFPKTVKNKPIPALRVPEEKKKKKKKKGRVKKEDNVPTKEANMDTSNENVCKLKRSRTTSEGSDVEVTEAQKPPSKKKKKREKAEVSNLPEVRTGKRKRSAFADTECLAPRSKVKKLTQKE	431569	421949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_422262_422333_422428_422509_422675_422837_422922_422997_423099_423647_423851_431516
743582	contig_7391_pilon	-	1977	8	Intergenic	novelGene_112155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	45.8564752955415	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	195	812	425770	411735	FALSE	15	GTGCCCTGTTCTTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELDLMGQDSDGDSDEVVLTPAELIERLEEAWMNEKFAPELLESKSEIVECVIEQLDHMEENLRRAKKGDLKVSIHRMEMERIRYVLNSYLRCRLMKIEKFFPHILEKEKTRSDREPSCLSPEEFAFAKEYMANTETYLKNVALKHMPPNLQKVDLLRSVPKPDLDSYVFLRVKERQENILVEPETDEQRSMFFFLLLQRLCD	426879	410569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_411778_411846_411938_415022_415112_415305_415404_419823_419938_420760_420848_425674_425790_426704
743588	contig_4180_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_8403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACTCTGTCCTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888713	875337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_875362_882858_882935_886080_886187_886317_886467_888084
743591	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1196	3	1196	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743593	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
743598	contig_18251_pilon	+	2675	6	Intergenic	novelGene_50146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1001	junction_3	879.812389092129	156	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1727	2245	44863	53991	TRUE	30	CTTTTATCAAGAATAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35565	55312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_37242_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
743602	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	38	3256	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
743609	contig_10756_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_170672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTGAAACTTTCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197815	198285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_197800_198300
743610	contig_10801_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_74055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGAAGAGGATGGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348066	350342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_348100_350300
743616	contig_6837_pilon	+	1823	8	Intergenic	novelGene_149822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	25.7333262838805	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	106	636	11753	15241	TRUE	15	TTGTATGTTGGTAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11647	17335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15471_15617_15697_16233_16824_16921_17021_17145
743619	SIRV6	+	349	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_10663_10819_11031_11109_11205
743622	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743630	contig_10861_pilon	+	868	4	Intergenic	novelGene_39320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATGCCACGATGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489330	1490607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1489721_1489936_1490213_1490299_1490471_1490576
743633	SIRV6	-	505	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9453	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1546_1655_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
743635	contig_1443_pilon	-	1790	9	Intergenic	novelGene_28280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	521.8445649808	1	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	600	1118	750529	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809528	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767475_767556_776186_776478_808690_808741_809399
743639	contig_20819_pilon	+	1397	11	Intergenic	novelGene_55663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	19.4753690594042	88	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	54	899	54837	61634	TRUE	15	TAGTGTGTCTGGATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHQLVGLMETAPKPGGDVPHKKNKLQSKRKKPRRYWEEEETSPTAAGASPGPSRSKKRKQELRPRRPKNTHIQKKSRISKKPQVPRKSGERRNLVPQRTLSGAQDPFPGPAPVPVEAALKFRRIDKSKKLLHSKSKTRSRLEVADAEEEETSVRAARSELLLAEEPGFLEGDDGEDTAKIRQADIVEAVDIASAAKHFDLNLRQFGPYRLNYSRTGSSPTSPTGSQATCTAFSSAPSKTCWGWGTTGASPACWFLGLLSPTLMAWRITHTGAGSSARSGR	54783	62600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_54930_55030_55247_55355_55437_55580_55694_55806_55895_56026_56089_61293_61409_61556_61652_61826_61923_62105_62220_62329
743640	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
743646	SIRV6	+	566	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	4	-2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743649	contig_5916_pilon	-	2794	12	Intergenic	novelGene_158066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	23.7222216845913	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	248	1822	716986	701444	FALSE	30	CAAATAATTTTGGTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILAQSRADVYRDILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGDVFRVVDTLYDGKLGHWLAVRIGNELEKGLIPNKSRAEQMASVQNAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAAVSVSTKFPAYERVLLREAGFKRPVVFFGPIADIAMERLANELPDLFQTAKTEPKDAGSEKSSGVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVVFFNPDSRQGVKTMRQRLNPTSNKSSRKLYDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKMEGMDDDPEDRMSYLTAMGADYLSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEEPLVSSITRSSEPVQHEESIRKPSPEPRAQMRSAASRDQLRDNSPPPTFKPEPPKARTQNREEFYDFPKSYEYKSTPSAVATNEIPVASTKGYPPPPVAVKPVFGRPILKPSTPVLAPESEEMGEGSEEQENAPKSVLGKVKIFEKMDHKAKLQRMQELQEAQNARIEIAQKHPDIYAVPIKTQKPDPGLPPHTSSRPPETQKGPSRFYQDTRGSYSSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQPARYRDTEL	719105	700471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_701610_703154_703241_704657_704991_706196_706308_707471_707685_709120_709222_714068_714280_714698_714779_715450_715547_716808_716997_718137_718349_719079
743650	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743652	SIRV7	-	235	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91691	0	-91685	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTGACGGCTGAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
743654	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	31	357	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14439	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
743656	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
743660	contig_15866_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_63619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATGCCTTCCGGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416382	415196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_415200_416400
743664	contig_5084_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_64474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAATTTAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64017	62902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_62900_64000
743665	contig_7457_pilon	+	1308	11	Intergenic	novelGene_31309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	61.8737424114624	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	76	1212	183157	195007	FALSE	20	GTGGTTGTCGTATACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKNNLNLLRDLAVHTAHSLRNSPDWGGVVVLHRKEGDSEFMNIIANEIGSEETLLFLTVGDEKGAGLFLLAGPAEAVENLGPRVAEVLEGKGAGKKGRFQGKATKMSQRAEVQALLQDYISTQSAEE	183081	195103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189501_190243_190336_190768_190824_192098_192194_194871
743666	contig_12964_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_131725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAACCCGTTGCTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614284	615620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_614300_615600
743668	SIRV6	+	423	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	539	0	360	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	217	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743669	contig_6589_pilon	-	1998	10	Intergenic	novelGene_26071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_2	8.63384096891663	173	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	127	1008	1832142	1826982	FALSE	5	TCTGTGAGTGCTGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSKLLVPELSEAETIGPETARFEELLLQASKELQQAQTTRPESTQIQPQPGFCIKTNSAEGKVFINICHSPSIPPPADVTEDELLQMLEEDQAGFRIPMSLGEPHAELDAKGQGCTAYDVAVNSDFYRRMQNSDFLRELVVTIAREGLEDKYSLQLNPEWRILKNRPFLGSISQQNIRSQQRPRIQELGNLPTPGYRAAETGPEKPHLNLWLEAPDLLLAEIDLPKLDGAMGLSLELGENRLVMGGPQQLYHLDACISLRINADESKAAFHRKRKQLMVAMPLLSVPSESW	1832352	1825991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1827033_1827166_1827311_1828471_1828548_1828780_1828911_1829249_1829332_1829423_1829486_1830763_1830944_1831259_1831327_1832052_1832147_1832230
743674	contig_7171_pilon	-	1536	13	Intergenic	novelGene_101411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	27.6680471543138	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	428	1192	1454360	1451349	FALSE	10	GCTTTGTGGATCTGATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLLRGAVFEGCGMTPNANPSQIYNIDPSRFEDLNLAGTAEVGLAGYFMDHTVAFRDLPVRMVCSSTCYRAETDTGKEPWGLYRVHHFTKVEMFGVTGPGLEQSTQLLEEFLSLQMEILKELGLHFRVLDMPTQELGLPAYRKFDIEAWMPGRGRFGEVTSASNCTDFQSRRLHILFHTDDGELRFAHTVNATACAVPRLLIALLESYQQKDGSVLVPPALQPYLSTDRITAPAHVPLRYIGPNQPRTPSS	1457543	1451004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451621_1452054_1452148_1452232_1452327_1453350_1453461_1453537_1453626_1453710_1453757_1454009_1454119_1454324_1454373_1455380_1455445_1456373_1456429_1456508_1456650_1457388
743681	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
743682	SIRV5	+	416	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1982_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
743696	contig_6975_pilon	-	2625	1	Intergenic	novelGene_74300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504481	501856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_501900_504500
743697	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
743700	contig_6735_pilon	-	1142	6	Intergenic	novelGene_15765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	774.368801024421	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	325	666	543144	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543264_564189_564232_564784_564869_568198
743701	SIRV7	-	834	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	42	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147876	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
743707	contig_16103_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_118892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGGGATTTCCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736691	736106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_736100_736700
743710	contig_854_pilon	+	936	4	Intergenic	novelGene_36239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1633.40224344431	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543488	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556140_563125
743719	contig_6807_pilon	-	2810	6	Intergenic	novelGene_84571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	121.141900265763	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	524	862	146580	144980	TRUE	40	TGACACTGAATCCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEKEEKENHCVRHGEKLTLFCKLDGKLICWLCERAQERCGHPTFLVEEAPQEYQENLQTAFESLGQEQQKAEKWEADLREERASWKTQIQTERQSVQANFSQLQGILDNE	156059	132529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_132827_133089_134585_144823_145055_145728_145825_146412_146980_155935
743723	contig_8443_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_150611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAACCAACAAACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750535	752646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_750500_752600
743726	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	226	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743727	SIRV5	-	348	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
743729	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_93462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
743731	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743732	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743733	contig_6980_pilon	-	2704	22	Intergenic	novelGene_36080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	107.126157428717	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	31	918	402649	391584	TRUE	35	TATGTAATGAAAGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFQSVSEKLHMECKAEMVAPLVTNPGHVCITDANLYFQPLNGHPKPVVQLTLQDIRRIYKRRHSLMPLGLEVFCTEDDLCSDIYLKFYEPQDRDDLYYCIATYLENHVAKHTAESYMLQWQRGHLSNYQYLLHLNNLADRSCNDLSQYPVFPWIINDYYSSTLDLSNPETFRDLSKPVGALNKERLERLLTRYREMPEPKFMYGSHYSSPGYVLFYLVRIAPEYMLCLQNGRFDNADRMFNSIAETWKNCLDGATDFKELIPEFYGDDVSFLVNSLKLDLGKRQGGKMVDDVELPPWAAIWSDRS	402679	374604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544_376648_377150_377214_378717_378802_380128_380253_380644_380713_382286_382355_386816_386876_388604_388714_390148_390313_390609_390653_391458_391604_391912_392034_392130_392183_393104_393169_393261_393353_394801_394882_396147_396325_398490_398600_400114_400187_402547
743736	contig_9706_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_20999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	797	1300	473950	474453	NA	30	GAATTTACCCAGCAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVSGQGRAPVRTQRRQSTVPLQRHLLPYRRARPPGCGGSQVPWDGCCRLGTSFLPRAGHLAVHLTAVCSPCLPKTPFRLPAESRTQLWIPANNHAQRGFPYIIWLSTGFGLRADCSCGLSIFRSMNHFLSSFFPPKKLFRDLYSHISMLFFHRVSKENDLHLLFS	473153	474775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_473200_474800
743737	contig_12864_pilon	-	1001	5	Intergenic	novelGene_76447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	573.958785541262	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAGAAATAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251994	242263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_249787_249843_251887
743740	contig_4891_pilon	+	926	4	Intergenic	novelGene_124547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	570.91038409427	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	142	423	701017	755930	TRUE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLHFGRRWRLGQSKRSKGAQSHSFSEGRTGSLHTRPSFPRPQKLQATMAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDVSKRWHDRGSPEIRLPQSTY	700875	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707862_755867_756027_756579
743741	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	6	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743746	SIRV6	+	551	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743747	contig_7180_pilon	-	673	6	Intergenic	novelGene_169038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAGAGAGGGAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242178	22185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_-_22232_32788_32879_34702_34813_191894_192086_192885_192991_242047
743753	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1399	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743758	contig_10436_pilon	-	795	4	Intergenic	novelGene_108487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2475.73306764324	6	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	111	491	103480	101897	FALSE	5	CTGATTTTTGCCTTGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSGRGGSHSTKKRCRPPFLTYSSFRLKHHLPSSVPALLNV	103590	101592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102016_102561_102655_102788_102868_103390
743760	contig_6630_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_30694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTTGCTTGGATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356786	355878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_355900_356800
743761	contig_12312_pilon	+	1562	12	Intergenic	novelGene_63973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGCAAGCCAGGGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237738	326162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_237799_237851_237906_241325_241503_242253_242413_245864_246008_246881_246971_256290_256456_257907_258034_259774_259880_260265_260421_278137_278200_325895
743766	contig_5696_pilon	+	1373	9	Intergenic	novelGene_117540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	39.7144101680989	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	145	1011	641853	652960	FALSE	25	TTTATGATTTATTTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFVKSKYSISVLGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGI	641708	653322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840
743767	contig_14300_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_133144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTAAAGTACCTAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461368	466497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_461388_465641
743768	contig_3948_pilon	+	1434	10	Intergenic	novelGene_53417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAGTGACGTACCACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1933183	1975861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1933618_1936666_1936752_1942182_1942284_1944210_1944247_1947250_1947336_1950371_1950428_1951140_1951269_1951356_1951443_1953210_1953302_1975529
743769	contig_3575_pilon	+	2505	4	Intergenic	novelGene_141103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCGGAGTGACAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385381	397925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_387265_387869_388108_390074_390212_397678
743770	contig_2093_pilon	-	2071	11	Intergenic	novelGene_152979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	241.083056227517	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	163	1284	1384563	1346672	FALSE	50	CACAACTATGTGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVAVNGKHTLLYAHRISLEKIDTLGIYGKVNIHSVGFRFSSDLQGTQASSVELIQINRENVQKSGISQLTLPFAARLNSSMGPGRTVVIKGEVNTNAKGFNVDLVAGKSRDIALHLNPRLNSKAFVRNSFLQESWGEEERNITCFPFSPGMYFEMIVYCDVKEFKVAINGVHSLEYKHRFKELSNIDMVEIDGDINLLEDVFCCSLLFKRSSAFRRTDGSRLPNNPLMTGMNVSVGNKALTYTEVLYSKRKKRKKFNLD	1386726	1345884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1346855_1357880_1358016_1364609_1364776_1365572_1365662_1366409_1366437_1367575_1367633_1368504_1368625_1370810_1371022_1372530_1372620_1384518_1384610_1386610
743771	contig_12638_pilon	+	2091	12	Intergenic	novelGene_33268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	223.436015209191	15	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	509	1339	855981	861300	FALSE	35	CTATTAAAGAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEPAESSFRFWQARAVESFLRGTTSYADQMFLLKRGLLEHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	836337	862052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_836372_845372_845540_850769_850902_852617_852677_854778_854823_855908_856013_857044_857136_858213_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162
743772	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
743775	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	8	1160	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
743776	SIRV6	+	541	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743779	contig_7426_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_27461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	263	598	600359	600694	NA	0	TTTTGGCTTTTGTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRTGPSCFRDSGFTALLTQLSFVAFAWLWYQIVGMTEDFPSPAHQCRCCDCHPAPAKCPLPELVTWVVLLCVSYEVPFPEPSSHLDPRVAPALAGVLGFERVWTGLGALK	600096	601735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_600100_601700
743782	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743783	contig_10861_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_39367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCCAGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581171	1583144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1581200_1583100
743785	contig_6710_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_97320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653689	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
743786	contig_7898_pilon	-	2289	2	Intergenic	novelGene_47642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_1	0	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGCCTTTGTCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778140	775134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_776936_777652
743788	contig_1339_pilon	+	981	5	Intergenic	novelGene_163136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	3946.79167172528	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGGCCTCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430921	434175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433188_433797_434046
743796	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
743799	contig_7356_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_60340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATTAGTCGCTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38585	36427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_36400_38600
743804	SIRV7	-	337	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	9	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114729	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78960_114680
743805	contig_2757_pilon	-	2280	11	Intergenic	novelGene_164574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_9	50.0344881057056	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	275	1810	136441	120162	FALSE	20	TACAGAGTCTCGGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAGPGAAVPLELRRERGMVCVEYPGVVRNVSKMLPTLGGEEGVSRIYADPTKRLELYFRPKDPYCHPVCANRFSTSSLLLRIKRKTRRRAAVPGAEACPKVMFEMEILGIISTTYKFQGMSDFQYLAVHTDADGRHTSMYDKVLMLKPEKEDFFNQELPLYIPPPIFSRLDSPVDYFYRPDIQHREGYNNPTISGENLIGLSRARRPHNAIFVNFEEDEVPMQPLEAAVQTWKKVCTNPIDRKVEEELRKLFDLRPIWSRSAVKANISVHPDKLKVLLPFMAYYMITGPWRSLWIRYGYDPRKNPDAKIYQVLDFRIRCGMKYGYTPNDMPVKTKRSAYNYSLPITVKKTSSQLAMQDLKQGLGPSGMASARKSTSNKYKLKDSVYIFREGALPPYRQMFYQFCDLNVEELQKIIHRNDGAENVCTERDGWCLPKTSDDLRNAMSGMIRQALRSKRPALFSSPTKADAGKEQLTYEYVEDEEDDEEEEEFKPSDGSENEMETEILDYV	136715	119691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_120317_121248_121392_121988_122072_123407_123503_123745_123827_124267_124383_125579_125685_126949_127146_132757_132957_134319_134540_136297
743806	contig_9797_pilon	+	1116	5	Intergenic	novelGene_65602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	426.230278136127	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	217	387	188724	191277	TRUE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQAAGAD	183918	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_183989_188577_188734_189277_189422_191260_191771_191917
743807	contig_13021_pilon	-	1546	10	Intergenic	novelGene_8245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	622.432345473272	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	106	1134	236115	210494	TRUE	30	AACTTGCTATGTAAACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHETNDYKTNYVYSDLI	236220	205493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_205595_205933_206217_210465_210541_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
743817	contig_7356_pilon	-	2093	6	Intergenic	novelGene_60376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	744.611737753307	284	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	348	854	410596	408051	FALSE	35	AATAGCTTTGAAGTGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTVKTGSAEKLVPAEHLVPAFLKGDLSYIKIFLGTYRTYATTQQVLDLLFQSPEPRPVPVVKVAQDISLPQELAPGTSHGVHSAPAPALELHSTPPITSPAPAPAPVGEHAGGVDSQPGSPPEPAPGPLADVDPAPAPTPELHTAPAIPSTAPALASEEPAGESDT	457886	406811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_408397_410435_410636_432976_433006_435516_435623_437474_437529_457767
743818	contig_12414_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_59664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAAATGTATAATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780923	782242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_780900_782200
743820	contig_5461_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_156815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226527	224451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_224500_226500
743824	contig_4413_pilon	+	1060	6	Intergenic	novelGene_116979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	150.281069998853	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	284	781	126062	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDIRVRWLVWNTSFCMLKSPFFLLFGSNSGSPLRKLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	125778	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_131813_131906_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
743827	contig_11548_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_66764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106069	105047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_105000_106100
743828	SIRV1	-	214	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3888	2	3614	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6752	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
743832	contig_9554_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_170680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGGCAACCGTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76866	76481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_76500_76900
743834	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743836	SIRV6	+	320	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8115	3	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
743839	contig_10904_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_22465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	114	1082	149100	150068	TRUE	10	GGACTTGTGTGTTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143932	151581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150409_151520
743841	contig_10042_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_79119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGGCTGATTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41688	40683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_40700_41700
743845	contig_13702_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_102622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAATTCTTTGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206531	207533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_206500_207500
743846	contig_7057_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_123406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAACAAAATAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313044	1315225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1313000_1315200
743856	contig_13244_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_86934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243935	241874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_241900_243900
743860	contig_14375_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_170693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGCAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77647	80210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14375_pilon_+_77600_80200
743863	contig_11815_pilon	+	2465	9	Intergenic	novelGene_50923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	62.4434744388875	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	55	1086	251551	267117	FALSE	40	ATTCCCTGATTTAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANAEVSVPVGDVVVVPTEGNEGENPENTKTQVILQLQPVQQGIYEAGSENNTAVVAVETHTIHKIEEGIDASTIEANEDMEIAYPITCGESKAILLWKKFVCPGINVKCVKFNDQLISPKHFVHLAGKSTLKDWKRAIRLGGIMLRKMMDSGQIDFYQHDKVCSNTCRSTKFDLLISSARAPVPGQQTSVVQTPTSADGSITQIAISEESMEEAGLEWNSALTAAVTMATEEGVKKDSEEISEDTLMFWKGIVDVGLMEEVVCNIQKEIEELLRGVQQRLIQAPFQVTDAAVLNNVAHTFGLMDTVKKVLDNRRNQVEQGEEQFLYTLSGVCDLSPFLGVLY	245360	268496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_245386_251521_251679_256626_256710_257410_257536_259864_259969_262316_262475_264083_264216_264670_264809_266953
743865	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
743866	contig_10861_pilon	+	589	4	Intergenic	novelGene_39432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGCTACCTCCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2423656	2432821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2423810_2425542_2425640_2427138_2427241_2432584
743873	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
743877	contig_6101_pilon	-	2640	13	Intergenic	novelGene_114269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	73	junction_1	172.504649695788	186	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	14	1546	187631	108966	FALSE	30	CACAAACTCCTTGATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRVLMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYDAVTNEWTYTAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNGWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL	187644	107871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_108995_110889_111034_114807_114949_115827_115957_117248_117351_117792_117991_125934_126053_131608_131759_134411_134529_138514_138625_147389_147553_179695_179818_187621
743881	contig_12622_pilon	+	1762	10	Intergenic	novelGene_5877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	62.1737906751195	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	258	989	1221335	1227304	TRUE	15	GCTCCACTGGCCACCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWALDVAFVWKAVLTLGLVLLYYCFSIGITFYNKWLTKSFHFPLFMTMLHLAVIFLFSALSRALVQCSSHRARVVLSWTDYLRRVAPTALATALDVGLSNWSFLYITVSLYTMTKSSAVLFILVFSLVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGHRTASAGSWEPLPWRDSRLRFGLLRVPSGLPNL	1215058	1229624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1215082_1221100_1221455_1221992_1222144_1222950_1223015_1223758_1223806_1224396_1224559_1224678_1224763_1227200_1227336_1228537_1228668_1229012
743885	contig_14871_pilon	+	2732	1	Intergenic	novelGene_63715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACCTCACTCACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221993	224725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_222000_224700
743887	contig_12977_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_122792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCCCCAGCTACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15401	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_15400_17500
743890	contig_709_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_57567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGAGGTGCAAGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2094224	2096356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2094200_2096400
743900	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	20	-2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743904	contig_14426_pilon	-	1771	4	Intergenic	novelGene_170627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	44.4322205412044	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	616	915	181770	181017	FALSE	40	TATATCAGATGCTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQLKCDSFRPHQFREQDGESIPENQELAPKQEILKEIEYFGDLSSRLQRDVPLDSKYRKTGRHESKVEKQQGHSSGERHHRCNECGKSFTQSSVLIQH	187352	180160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_181265_181718_181870_182660_183129_187304
743907	contig_18283_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_170698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTATTCAGTATGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49144	49825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_49100_49800
743908	contig_13097_pilon	-	1908	16	Intergenic	novelGene_107718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	701	1006	243916	215377	TRUE	45	GAGTGAACGAAGAAAGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVERLVEEENLKHLFTWWWNQRWSSTDSWRRWKKWRRWKVGGRSSWRKKWRWFAKIVVYFSSRSFRKNLYVAVFICPSSSFYSADSYSLTNNVDCPRQSP	264545	184630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_184810_186115_186163_190437_190497_191577_191681_195136_195202_195749_195855_196261_196397_205978_206082_215270_215380_225263_225358_226994_227161_243873_243937_245486_245544_253985_254198_263404_263515_264244
743914	contig_14225_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_52764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484808	487050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_484800_487000
743915	contig_10855_pilon	-	1613	10	Intergenic	novelGene_124321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	3	junction_1	56.5923259640801	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	30	1538	401138	320212	FALSE	60	TTTTAAAAAAGGAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPLNGSGQLKMSSHCISAQMLTPLPPGLPRLALPPAAKPTTTSEGGATSPASPILVSGITKVSFPRPSSFVPGLLEGSPAGPQPTFSVES	401167	320136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320325_327549_327704_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
743916	contig_6735_pilon	-	724	7	Intergenic	novelGene_15786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	802.514520463995	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	86	616	564868	542104	FALSE	15	GGTTCACCCTTATGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKGNPPPTPAKSAVLSGIPGLLTWEGT	568283	541995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542180_551178_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
743917	SIRV5	+	373	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-43	875	-43	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8272	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
743921	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743928	contig_15354_pilon	-	1882	5	Intergenic	novelGene_65761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTATGCCAGTACCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648359	642971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_643052_644175_644390_645016_645174_646352_646507_647082
743929	SIRV2	-	556	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	126	4	-126	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCGCTGCAAGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
743933	contig_294_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_166746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132281	134282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_132300_134300
743935	contig_233_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_14675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGTGCACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84052	84510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_84100_84500
743940	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_94321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743942	SIRV6	+	534	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743945	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	232	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
743948	contig_10734_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_51395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTAAATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002748	2005114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2002700_2005100
743949	contig_5797_pilon	+	2073	9	Intergenic	novelGene_56932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	86.9510458533996	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	953	1960	254852	273501	FALSE	30	GACTGTACACATTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	250082	273614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_273319
743950	contig_6654_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_85774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656131	653679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_653700_656100
743955	contig_5020_pilon	+	1420	9	Intergenic	novelGene_27857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1067.66298521584	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	474	1019	123186	124987	TRUE	35	AAGTTAGCCCAAATCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTSLAISPLPLGQASVPLSSPPLST	118466	126016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119447_119596_122812_123006_123152_123364_124167_124363_124444_124540_124909_125087_125657_125722_125778
743958	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743960	contig_16228_pilon	+	1886	7	Intergenic	novelGene_147939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	243.703371608464	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	52	1041	47816	71852	TRUE	20	TGTGCTTACACACCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47764	79234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71853_72142_72611_78857
743962	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
743964	contig_8133_pilon	-	1504	7	Intergenic	novelGene_98675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	96.970356295107	674	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	25	918	391898	349215	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRGFVAVMSAAIAALAASYGSGSGSESDSDSEGGRCSLPAADSLMHLTKSPSAKPSLTVAVDSAPEVAVKEDLETGVHLDPAVKEVQYNPTYETMFAPEFGPENPFRTQQMAAPRNMLSGYAEPAHINDFMFEQQRRTFATYGYALDPSLDSHQVSTKYIGSVEEAEKNQGLTVFETGQKKTEKRKKFKENDASNIDGFLGPWAKYVDEKDVAKPSEEEQKELDEITAKRQKKGKQEDEKPGEEKTILHVKEMYDYQGRSYLHIPQDVGVNLRSTIPPEKCYLPKKQIHVWSGHTKVGKFVVML	391922	348628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_349382_350680_350778_351893_352034_357702_357787_360618_360749_366687_366775_391709
743965	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_97963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
743972	contig_12270_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_113930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13857	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
743980	SIRV4	-	331	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1192	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3966	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743983	contig_12113_pilon	-	1506	8	Intergenic	novelGene_134738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	164.377986509689	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	117	803	259537	211148	FALSE	20	ACATGCTGTGTAAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDASGAVTVWEVVSLLGKLLGTVAVLKVVLYLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRDEL	259653	210444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_211161_217859_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_233167_233273_259482
743988	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
743990	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	2	404	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
743991	contig_1521_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_145453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	392	junction_1	0	116	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	16	360	191760	179059	FALSE	30	AAGTAAGATTGTATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPR	191775	179057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_179258_191614
743995	scaffold_19766_pilon	-	1444	9	Intergenic	novelGene_34333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	494.865748840026	3	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	397	1017	622205	598347	TRUE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRSRD	623719	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596710_596919_596973_597196_597247_598328_598360_605103_605300_621454_621815_622153_622285_622561_622736_623576
743998	contig_5018_pilon	-	1241	9	Intergenic	novelGene_47036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	184.389151999243	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	566	1162	1394992	1392342	FALSE	30	TATATTCATGTTTATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAVGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397340	1392262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394422_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395516_1395689_1395852_1397191
744000	contig_10674_pilon	+	1680	5	Intergenic	novelGene_6433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	256.757059299253	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	26	1189	198581	224164	FALSE	10	GTGGAGTCTGTTCCTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQPQESAAMADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKDNNGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPR	198555	224655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782_211888_223316_223412_224014
744003	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
744005	contig_20819_pilon	-	2459	5	Intergenic	novelGene_55707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	52.7967802048572	63	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1314	1652	176777	175493	TRUE	20	CAATATTAGTGTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECKHNHELDKGFTLKQSLAESERLPLQEGTPACHNLLVCHLTDFYPGTIQVWWFRNRQEETAGVVSTELIRNGDWTFQILVMLEMTPPAGRRLHLPHGALQPGQSCHRGVD	181412	173344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_173565_174827_174939_175016_175779_176724_177853_181174
744007	contig_17470_pilon	-	1984	12	Intergenic	novelGene_110504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	28.3575168223626	146	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	90	1301	259024	252954	FALSE	40	AAGAATCAGACCTTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AECAGKRPCGLSEHGQRIEWRKWKKKTTKMERKGPGALGRFPRPLLSAHSAALQSQGRPSSEGLPPQPLLVLPPPPIRIFSYPEKEEKKKWKDLRLMKKLERQRAQEEQAKRQEEEAAALQREDQGRPYTLSVALPGSILDNAQSPELRTYLAGQIARACAIFCVDEIVVFDEEGQDTKTVEGEFMGVGKKGQACVQLARILQYLECPQYLRKAFFPKHQDLQFAGLLNPLDSPHHMRQDEESDFREGIVLDRPTRPGHGSFVNCGMKKEVKIDKNLEPGLRVTVRLNQKQLSESKTYRGKVVSSQDPRTKAGLYWGYTVRLASCLSAVFAEAPFKDGYDLTIGTSERGSDVASAQLPSFRHALVVFGGLQGLEAGVDADPNLEVAEPSVLFDLYVNTCPNQGSRTIRTEEAILISLAALQPSLTQAGARPS	259857	252270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_253023_254045_254194_254365_254469_254997_255097_255215_255289_256250_256382_256622_256673_256766_256857_257050_257211_258735_259033_259147_259194_259822
744009	contig_5988_pilon	+	2640	13	Intergenic	novelGene_16034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_11	6.90963497990708	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	89	2026	839554	845235	TRUE	10	CTGCACTTCTAGTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQATKDPLPRGVSPTPSKIPILSQRSLPLSTSKPCALDQENQDPRRLVQKPPFSIHRPLVGTAGPRPKTTHQSERSVESPQLRKPLEELTLSPGEQNVGPGPPPPTEAPGAIEFVADPAALATILSGEGVKSCHLGRQPSLAQRVLVRGSQRSTLQRGQGARASAYLAPRTPNHRLGLARASCFSRLEGPGPRGRTLYPQRLETLIPPSERSFHSSTRPNFLELRRVTGGSNRTSVSQASGLPVETPSQPASCLPEGEREVVTHSDKGRGGPLCLAQRVPLRETHTKDSRDSHLMPSPAPVAQPMPGRMVPPTVTRPSPFGWAQRVPSPHLSAPSRWVSGLSPQSCPEPEEPVLPWEQIAVQLFDQESSMRLQEEPAKPPVAPNELPPNRTPNLQELKMQRISILQQLLRQEVEGLAGDKYAALNGDLSLDMVELHPLLAEISRTLNAPEHNSGTSRLPRLSQHSDLQKPCLPEECGEPQPCPPTEPGVPDSCYKRESEIPETSPQQQPGVLEPCSPAEPEVPDSCYRRESEIPEPSLQQQSGVPEPCPPAEHGPHQHSPQGKTGFPQPHPRVEPGAPEACPREPGSPESIQQPHNNNQCAPVPTSLIFTSQHPLFTSPPIHSLQSLRPLPGQSGKELVGRG	839212	846023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_839290_839542_839698_839802_839987_840514_840673_840761_840900_841088_841172_841624_841678_842123_842234_843459_843601_843938_844005_844262_844395_844506_845673_845846
744010	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
744017	contig_610_pilon	+	1670	8	Intergenic	novelGene_76797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	148.942668055017	189	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	25	1158	296008	340621	FALSE	30	TATTATTCCCATTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAAGETDAPKFILYLLLVPILLIVFVLGFFTWSGQRDRGKEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTELLLAPVHLPTHSGAGSADGCSGGIASTTVLMILAPPGESCEPGGVIPKWSHSRSRADIRKTFVSS	295983	341133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_306612_306733_309314_309419_313377_313441_321676_321769_340512
744019	SIRV6	-	420	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-234	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2054	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
744024	contig_15118_pilon	+	2188	9	Intergenic	novelGene_74568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.2692658405327	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	571	933	237605	239130	TRUE	45	ACATGAAGATCAGCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGCQPCGPRHAAPAAAAAPAVGGGSLQEYPGYKLQIPELVTVQEGLCVIVFCEFFYPRHVSFTTDQLCIYWYWTGDNTYSNRLVATNCQNLVVKTETQGRFHLLGDPKTNNCSLSIRDARKSDTGIYEFRVWGQYVQYSYRTQLNLQVTDLTEKADIHILEPLQSGSPTNLTCSLPGSCDGGRPLTFSWMGDALNMLDPSTLQSSVLTLTPRPQDHGTYLTCQVKRRWPQVTTERTIRLNVSYAPQNLTIKIFFQNGTVLKVMGNTISVPILEGQSLRLVCVADSNPPCRAELVPGIPSPECLSHLQHE	236748	253176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_236822_236895_237274_237485_237765_238195_238244_238975_239235_239320_239606_239792_239866_240762_240845_252465
744029	contig_19640_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_134864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAATGAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59113	60296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_59100_60300
744039	SIRV6	-	199	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAACAACTTCGACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
744040	SIRV6	-	305	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1337	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3157	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1542_1647_1732_2778_2828_3105
744041	contig_13780_pilon	-	1375	8	Intergenic	novelGene_149021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	57.9183098186135	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	275	829	439784	433545	FALSE	30	ATACTCATCAACACTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCDTKFDFITRKHHCRRCGKCFCDRCCSQKVPLPRMCFVDPVRQCAECALVSQREAEFYDKQLKVLVSGATFLVTFGKSETPETMVCRLSNNQRFLVLDGDGHYEIEITRISTMRILTEGLPPGGGSMRASGMLLQYTVPGAEGVTQLKLTAGEDANTSKRPAVAWLAAMHKAAKLLYESRDQ	457138	432998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_433581_433682_433826_436534_436627_436728_436805_437621_437791_439745_439797_452471_452573_456977
744043	contig_18156_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_101452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTTCAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49046	49508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_49000_49500
744051	contig_8064_pilon	+	986	5	Intergenic	novelGene_164563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	36.5470587051817	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	269	589	117228	118276	TRUE	15	CACTGTGAGTCAGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101626	119202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_116026_116130_117149_117382_118109_118295_118823
744052	contig_12496_pilon	+	2543	1	Intergenic	novelGene_170706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCAATACAAAGGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23124	25667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_23100_25700
744053	contig_12638_pilon	+	1410	7	Intergenic	novelGene_33214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	43.8586745505759	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	119	661	474568	574233	FALSE	35	TGAACAGGGTGAGGAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGTSQISQSLACGGSEQIPGVDIQMSRKYHTTNKLLTVKDSPQPVEEKVGALTKIIEAMGFTGPLKYSKWVNPYILKKNMVLMTDSFYAAILGYDEGILSDDHGLAAALWRTFFNQKCEDPRQLELLVEYVRKQMQYLDSMNGEDLLLTGEVSWRPLVEKNPQSILKPHSPTYNDEGL	438140	574982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_438175_474483_474589_487758_487846_490168_490277_564798_564877_569794_569909_574098
744055	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744066	SIRV4	-	273	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1250	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3908	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
744071	contig_513_pilon	+	2542	1	Intergenic	novelGene_80122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	234	536	275218	275520	NA	45	TGTGTGTGTATCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKSLLTVFGGFTDLLLVGFSSVQMMDNGRNSNRWTVLWHDIGYLVSSVPIFLSLVKSLGSGGRLPGFKPYLCSYLVCDSGQVSYLTFLCLSFHFTSEK	274984	277526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_275000_277500
744076	SIRV7	-	272	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91639	15	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
744079	contig_11386_pilon	+	1627	5	Intergenic	novelGene_82771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	524.290234507567	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	751	1581	17940	23363	FALSE	60	CTTCCAGGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTSQSPVRKTEATPAVWKKGIQHRALFAQVMEELRSQPGRGEAPQRRPRKPLSPCLGWAP	13096	23409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_23188
744082	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
744083	contig_5947_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_101474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90006	91785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_90251_91154
744084	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744085	contig_13021_pilon	-	2807	1	Intergenic	novelGene_8267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAGAAAAATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236176	233369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_233400_236200
744086	contig_11292_pilon	+	2293	10	Intergenic	novelGene_109404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3708994574027	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	56	1129	152876	158194	FALSE	0	GGCTGGCTGCTTCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQRLLFLTALALELLGEAGGSQPALRSRGAAAACRLDSKESESWGALLSGERLDTWICSLLGSLMVGLSGVFPLLVIPLEMGTALRSEAGAQRLKQLLSFALGGLLGNVFLHLLPEAWAYTCSASPGGEGQSLQQQQQLGLWVIAGFLTFLVLEKMFLDSTEKEGPGQAPSKDPTAAAAAPALNRGHCLAQPAAESSLHTVVRSIKVSGYLNLLANTIDNFTHGLAVAASFLVSKKIGLLTTLAILLHEIPHEVGDFAILLRAGFDRWSAAKLQLSTALGGLLGACFAICTQSPKGVEETVAWILPFTSGGFLYIALVNVLPDLLEEDDPWHSLQQVLLLCMGIVVMVLFSLFIE	151488	159358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_151506_152837_153147_155058_155173_155415_155541_155895_156010_156141_156232_157065_157117_157633_157767_157920_158021_158118
744087	SIRV6	+	428	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	531	3	352	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744089	contig_19518_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_170719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTTGTTGAACATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38518	38028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_38000_38500
744090	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
744091	contig_5643_pilon	+	1612	7	Intergenic	novelGene_38923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	44.6268479231455	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	166	795	386563	391299	FALSE	35	ACAAACATGCCCTGAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELAESDFASTFRLLTAVYADVLRGSLDQRNQQLEVDYSIGRDIQRQDLSAIARTLQEWCVGCEVVLSGIEEQVSRANQHKEQQLGLKQQIESEVANLKKTIKVTTAAAAAATSQDPEQHLTELREPVPGTNQRQPSKKGSKGKGLRGSAKIWSKSN	386015	392116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_386138_386519_386725_388242_388285_389883_390012_390678_390785_390942_391095_391259
744092	contig_9833_pilon	-	2227	2	Intergenic	novelGene_68569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313222	310347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_312460_313107
744093	contig_6227_pilon	-	2036	4	Intergenic	novelGene_49667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	931	1260	498231	497902	TRUE	30	GCCCTGGTGAGCAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDANKIPRRFSQTFANTEEDTKDQRREGACPKSPRKLGPKMALPTKNEAQIAHQTVVTPKSPALLGRLAQYRYSRTVSSFRVSPWVVGFRSWRSSSFSCRDTKSLPSV	499351	488697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_488771_495117_495272_497352_498658_498847
744094	contig_5217_pilon	-	1336	9	Intergenic	novelGene_135718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	34.2636833980236	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	448	1266	296982	295104	FALSE	20	TGGAATCTAGTATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298393	295033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297449_297571_297733_298335
744095	SIRV6	+	340	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	532	-1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
744097	contig_12270_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_113983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	9	332	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14417	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
744100	contig_8729_pilon	+	2043	5	Intergenic	novelGene_40099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	71.6881266319605	1	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCTGAACTATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276489	323931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_306155_306214_322203
744101	contig_9727_pilon	-	1569	13	Intergenic	novelGene_86375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	239.01306042883	344	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	141	1334	598065	578319	FALSE	45	TAATATGGAAAGAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622883	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622755
744104	contig_17274_pilon	-	2044	2	Intergenic	novelGene_26542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGAATAGGCAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157773	146461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_148104_157371
744107	contig_4732_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_75484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGACCCAGGTTCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741637	742487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_741600_742500
744108	contig_4732_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_75483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741213	741590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_741200_741600
744109	contig_10196_pilon	-	2370	3	Intergenic	novelGene_132102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	487	junction_1	10.5	19	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	130	465	912067	911732	TRUE	5	TGTCCAGGTTTCCCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHIPGPCGLTWTPHCTPGLALQNPTTTVPRTPAPQTSPAVVPHMDPASRCTPDLTEYPPPPLVPIPWLCPMGVSLGSSASLVSLHPGPYLLGPPPPPHLLHREPHSQSCPLEAPPPHPWPPASLSIRSLWVAIICDLGLLGLSLPTVLCGVGSR	912196	908894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_909044_909341_909482_910115
744110	contig_8580_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_156091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACTTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256699	254835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_-_254800_256700
744114	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_94805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
744116	SIRV6	+	475	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	203	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
744121	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744122	contig_821_pilon	-	1932	3	Intergenic	novelGene_149418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCAGAGGCACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269136	264190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_265772_265946_266047_268885
744124	contig_6710_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_94252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653780	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744127	SIRV6	+	504	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	9	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744135	contig_408_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_84933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCGCAAGAATGTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213621	212963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_213000_213600
744137	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744143	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744146	contig_9646_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_117483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGAAAAAGAAAACAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495336	494013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_494000_495300
744149	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744150	contig_6745_pilon	-	2308	2	Intergenic	novelGene_170742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTCAGTATACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27416	24711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6745_pilon_-_26893_27289
744153	contig_10753_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_105162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGTGACCCTGTAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431552	432468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_431600_432500
744156	contig_6361_pilon	-	755	5	Intergenic	novelGene_24003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	4285.98209282307	33976	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436382	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419451_419591_420870_421003_436288
744158	SIRV4	-	325	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1196	0	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
744159	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_96285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744160	contig_9668_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_58081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77555	75778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_75800_77600
744163	contig_3463_pilon	-	2706	2	Intergenic	novelGene_62009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_1	0	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2234	2620	532339	531232	FALSE	30	CCAGCAGAAGCTCGCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIFIILNFRLEHIFVVNQSPFEVNRIYPFKICILHVRSFKNVLHCQLQKMDDTISFLMAMNFLLLNFFIRCTRPSNEGDEQQYPSVKSQLITRHSVTEPRHANNRGTNNVTSHASISKQGYFAYES	534572	531145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_531256_531976
744165	contig_8885_pilon	+	2624	6	Intergenic	novelGene_115587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	36.7390800102561	82	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	425	1984	348153	351558	TRUE	20	TTCAATGCCTGACTGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPLKEEDCEEGSGEPPGRVKAEPVNPAASVVAKNLALLKARSFDVTFDVGEEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTGQQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPMVPYGEFKSVYVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADRQALSLLGRMLRFEPGARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDHEALTRECIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDIEMPSPWAPGGDCAMESPPPAPRPCPGPAPDTIDLTAQPPLPASELAPPKREGAISDNTKAALKAALLKSPGPPAACATPRAAWPQCPESPALLPIWPTPSRP	347728	352679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_348385_348994_349161_349813_350871_351453_351632_351974_352109_352246
744166	contig_10323_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_123543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCAGGATTATATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253261	255333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_253300_255300
744169	contig_11932_pilon	+	2054	3	Intergenic	novelGene_85396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	20.5	181	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	577	1548	241177	243522	FALSE	30	AAAGGACTAGCTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	235983	244028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_236346_240962_241732_243105
744174	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTAAAAATAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744177	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744189	contig_3509_pilon	+	1422	9	Intergenic	novelGene_160702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_8	82.823607745618	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	54	1181	18763	42271	TRUE	20	ACCATCCACTTGTGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYGAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETLFSKEKESTSAEVLPEIKAGPDESAEFTDPLKLCPREEFQRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFKKLSRRNGAEVDIEGMKRLLEGLGYSVDVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHKSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTMHSEEQPDMLSYDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGEKKGISWHKDSLSVSADSSSQSSENLEEETIHNAHMEKDFIVFWASTPHNLSWRDETQGSPFITRLITCLQKYSWCYHLEEVFQKVQQSFEKPSIKTQMPTIERVTLTRDFYLFPGN	18709	42983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_18770_23880_24130_36139_36250_37092_37267_38722_38958_39788_39933_40576_40687_42172_42277_42747
744190	contig_6710_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_98105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744192	contig_2251_pilon	-	1375	12	Intergenic	novelGene_128465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_11	114.764149094373	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	320	1042	90005	56508	FALSE	25	GAAGGTAACTTGTATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQARSASIRAHTFAPDSSALGFPRRRFWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEYKNISQKDIEDSIKGELSGHFEDLLLAIVHCVRNTPAFLADRLHQAVKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD	145264	56174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_56568_66235_66359_70007_70067_76931_77028_78774_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_145179
744194	SIRV7	-	211	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69058	11	35839	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78899	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
744195	SIRV6	+	251	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8466	-1	273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
744197	contig_11370_pilon	-	1270	4	Intergenic	novelGene_98782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	228.999757399192	74	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	703	1002	301670	301173	FALSE	10	TCTGTGTGACTTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTANGENLGFWACELQSLYPSQANIPHSLK	302913	300904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301398_301595_301726_301843_302379_302801
744199	contig_2793_pilon	-	896	6	Intergenic	novelGene_142862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_4	367.405824668036	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	12	491	85184	79566	FALSE	10	TCCTAGACTGTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	85195	79160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118
744200	contig_5812_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_167496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAGGAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133928	135580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_133900_135600
744201	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_95248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744205	contig_9014_pilon	+	638	2	Intergenic	novelGene_106775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCATGGGTTTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116251	117364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_116259_116733
744215	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744216	contig_4845_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_53730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1802641	1801522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1801500_1802600
744217	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
744218	contig_3584_pilon	-	1080	6	Intergenic	novelGene_108183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	238	300	531158	531096	TRUE	30	AGAGCAGTGCTATGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFLPSTSSCLPSFRVQSCSQPRVSVCLALVVSYDFLNPVQDGGHLHIHSILSRSTALIKAEDPGRIPGVVILVVYSFRMGCTPTGLFGSFFSGTVLPS	531468	527073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_527099_528391_528475_528772_528876_529606_529681_530600_531174_531246
744220	scaffold_16539_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_68314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAGAGACCCACACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124415	123314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_123300_124400
744225	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744227	contig_3745_pilon	+	2416	3	Intergenic	novelGene_85073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_2	121.5	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	107	442	364282	370795	FALSE	65	AAGAAAAAAATTTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCMSAPNWPEESPVPLTRFDGSNTVFPRYANDSVYANWMGSPSAAKLMDKLDS	364175	372769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_364372_369179_369268_370637
744228	contig_8942_pilon	+	1230	3	Intergenic	novelGene_143209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTTAGCCCGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512156	516980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_513147_513979_514031_516791
744229	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	276	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744232	contig_14041_pilon	-	2101	8	Intergenic	novelGene_144035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	24.1686253018162	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	133	1203	80924	44412	FALSE	75	AAGAAAAGAGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCRCQCVCPSLLHCLPSPLPPPPLPESSQPPALRVADTSLDRNFMNKHQKPVLTGQRFKTRKRDEKEKFEPTVFRDTLIQGLNEAGDDLEAVAKFLDSTGSRLDYRRYADTLFDILVAGSMLAPGGTRIDDGDKTKMTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVGRYHCNTLAWEKSHRSCSTGFLSLWEISFILIAVNFICFFLPFKLAQWQSIDSESSILLHSRVFQKLMVIFTQITYFTRLI	104605	43513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73055_73233_80866_80932_104480
744235	contig_14176_pilon	-	2129	15	Intergenic	novelGene_74852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	13.4824148506149	4	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	288	1937	451505	413308	FALSE	30	AGCAACGCTCCATTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	453137	413115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415444_415539_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351_451519_452863
744236	contig_709_pilon	-	893	5	Intergenic	novelGene_57603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_4	38.2777676987569	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	14	583	2349986	2334090	FALSE	60	AACTTGTTAAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSIMAASISGYTFSAVCFHSANSNADHEGFLLGEVRQEETFSISDSQISNTEFLQVIEIHNHQPCSKLFSFYDYASKVNEESLDRILKDRRKKVIGWYRFRAKYAAADVLQRTGYPQTAHPAPWRTRPRLPSLQFHLHCQQLHPCFRVRSLQTKSEVKKALPLAIINGEMLVRVTESQNFETHYVACSSYRL	2349999	2333779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2334393_2337517_2337585_2340273_2340311_2345847_2345939_2349914
744237	contig_709_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_57599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	63	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCAGAGGAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2333683	2329552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2329634_2332076_2332162_2333228
744238	contig_6489_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_128959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCAGCTTTGGGACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391554	389254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_389300_391600
744239	contig_16103_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_118692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	18	518	197687	197187	NA	65	TCCTTAAAAATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAAAGMCNGVLTNGAGPKAASSLSVNIDRMNHHSYSTRAKSGPQPPPEKMINRLHYCPLSELVFSGRRDREGKGVDFASGPWDICLPLLLSCASSELGKFLSRFCRKGISNSDAYHILLLSFTSLLPLGPNFVELSLLPPSLGGDWRTIPRRLRTAPDRRPSPSRFLLLPQ	197704	196868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_196900_197700
744245	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
744253	contig_13481_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_119540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAAAACTACCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484137	1484434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1484100_1484400
744254	contig_2783_pilon	+	1177	9	Intergenic	novelGene_119651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	39	junction_7	40.3513862834971	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1107	70	1176	736910	780852	FALSE	35	TAAGCCCTAAAAAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLGAPSQFVDVDTLPSWSDSCEDELNSSDAEAEKLQEDAIRSPFPYNKDINGKVVLWKGDVAILNCTAIVNTSNESLTDKNPVSESIFMLAGPDLKEDLQKLKGCRTGEAKLTKGFNLAARFIIHTVGPKYKSRYRTAAESSLYSCYRNVLQLAKEQSMSSVGFCVINSAKRGYPLEDATHIALRTVRRFLEIHGENIEKVVFAVSELEQATYQKLLPLYFPRSLKEESRSLPHLPTDIGNAEGEPVVPERQIRISEKPGAPEDHQEEEDEGLRVDLSFIGSHAFARMEGDIDKQRRLILQGQLSEAALQKQHQRNYNRWLCQARSEDLSDIASLKALYQTGVDNCGRTVMVVVGRNIPVTLIDMDK	736840	780853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_737086_738327_738468_756019_756174_756672_756762_762009_762087_764256_764417_767186_767344_779912_779990_780775
744255	contig_16722_pilon	-	2133	3	Intergenic	novelGene_118306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_2	160.5	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1509	1940	165227	164405	FALSE	40	AAATGAGATCAGTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTR	168204	164211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_164541_164931_165288_166756
744258	contig_7412_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_76338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370487	371705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_370500_371700
744260	contig_7207_pilon	-	2083	5	Intergenic	novelGene_72040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_2	62.7908233741205	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	375	575	378923	376267	FALSE	40	AAAAAAGTTATTCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAQVLLWRTNFDELNCKDLIKRNLKRLHFESPPHLLDIYPRTPHLHDGKLETVEINPKLEVIDLQTSNPPVVDVLSFDSTTTTDTSGRTPPEKSEEISRYFLNPSLVSSDCSPATLKKKTEDMSDLPYESQRSIPLAVTDALEHIMEQLNVLTQTVSILEQRLTLTEDKLKDCLENQQRLFTVSQQKS	455262	374758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_376372_378827_379047_430188_430270_454433_454587_455245
744264	contig_18869_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_56406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAAATAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73424	73730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73700
744271	SIRV6	+	510	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	44	7	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744272	contig_4486_pilon	-	2146	8	Intergenic	novelGene_38537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	208.863201006529	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	251	1204	177451	131556	TRUE	30	AAACTGTCTTATGGGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLVSF	177701	130125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131569_132279_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304
744279	contig_6589_pilon	+	1387	7	Intergenic	novelGene_26081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	75.4998160409827	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	42	539	1865997	1872172	TRUE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPGGANS	1865955	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872155_1872787_1874950
744282	contig_2100_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_50621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822852	822110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_822100_822900
744284	contig_14023_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_165354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60481	58501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_58500_60500
744285	contig_10904_pilon	+	765	5	Intergenic	novelGene_22652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	681	junction_1	869.813485754274	21064	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	110	694	530908	535124	FALSE	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530553	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530638_530882_531005_531238_531362_533736_533924_534946
744286	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	641	1083	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCGTCTTCTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
744287	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	618	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744290	contig_5451_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_167185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAAAGAACAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678410	676099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_676100_678400
744294	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744297	contig_11851_pilon	+	1735	5	Intergenic	novelGene_146551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	64.0819787459782	184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	219	704	21555	35451	FALSE	55	GAGAAACAAATTGAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLFPYIKENIKEYLQTHWEEEECQQDVSLLRKQAEEDSHLDGAVPIPAASGNGEDDLQQAIQAVVDNVCWQMSLDRKTTALKQLQGHMWKAAFTAGCMKAEFFEDVVPAVRKWREAGMKVYIYSSGSVEAQKLLFGHSTEGDILELFDGHFDTKIGHKVESESYRKIADSIGCSTNNILFLTDVTLEASAAEEADVHVAVVVRPGNAGLTDDEKTYYSLITSFSELYLPALT	20252	36482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_20357_21440_21644_27168_27302_28781_28906_35311
744299	contig_7816_pilon	+	2686	2	Intergenic	novelGene_66473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACTAAATTTTCGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149540	152810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_150556_151139
744300	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744301	contig_4759_pilon	-	1550	2	Intergenic	novelGene_106326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCCTGACTGAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589876	586089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587560_589796
744312	contig_1154_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_87227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAATATGCCACACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1631209	1624207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1626014_1628432_1628653_1631083
744314	contig_11285_pilon	-	1441	13	Intergenic	novelGene_5689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.225475100838	85	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	25	1251	798530	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLSPLPAQVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798554	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784326_793808_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
744315	contig_13112_pilon	+	2020	6	Intergenic	novelGene_98840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1267	1695	634720	636024	FALSE	20	GCCTAGTGCTCTATGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHTVRIIQDRNAVLGGDVGHDVLIEELKDQRDAVGKHQVLGHVLKLVDVVQLKVLEQQQQDSRNGLNNDLFVAVHVHPQLHALQHCCAGNTISGVSRQHIQHLLSRCTQGEEFLTLLRSKAPASPPIPWTSQKSGAGLYAP	631347	636349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_632274_633048_633256_633887_633994_634692_634757_635430_635532_635733
744317	contig_414_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_115113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGAGCAGCTGGTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377914	379150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_+_377900_379200
744320	contig_12270_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_113138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	31	330	14409	13830	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCW	14439	13827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14081_14360
744321	contig_9290_pilon	-	1864	5	Intergenic	novelGene_77557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	373.948525869537	27	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	55	504	496936	486622	FALSE	80	GGAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKV	496990	485261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
744325	contig_7066_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_42194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	158	343	998654	998469	NA	20	TCCATGTTTTCTTTAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRACRRRCVRAPKGHPSSGCSCWASDFFSRASTSGAGREAEGRWAEVLGISMYSPQVLAWGGQGGEGPTFSVQFGQWPHKAFLLVSHSRCPSTILLLLQQVLLCPALGVVLP	998811	997570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_997600_998800
744326	contig_5121_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_170746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	908	1216	442017	441709	NA	75	AAGAAAATAATAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSRTALQSFLGCNLYRSRSPGHFPTKPLGEFEPPTFQLASEGLTNAPTGLWSFKSHTLKYALKRVLYLMLQDWKLYYKSSEVDFSPFHLLLKGNFRSFGS	442924	441409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_441400_442900
744330	contig_14704_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_82692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAGAAATCCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71918	73587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_71900_73600
744331	contig_6048_pilon	-	2631	10	Intergenic	novelGene_73220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_5	36.2828395311674	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	370	1485	1645874	1624242	TRUE	25	AAGTGAGCAGGCCCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAAWTSPLSSFLSGITISSLYSCGHRLPSSLS	1661993	1608726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624334_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
744333	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744334	contig_14704_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_82711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAACTTGCTGTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111965	109166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_109200_112000
744340	contig_20199_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_82547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	92	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	160	495	43987	41055	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44146	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40785_40847_41250_42110_42171_43906
744343	contig_7457_pilon	+	1280	4	Intergenic	novelGene_31685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGGGGCGGTGCCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174111	1176986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174964_1175539_1175624_1175961_1176133_1176813
744345	contig_12864_pilon	-	1069	6	Intergenic	novelGene_76443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	528.960490017922	26	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTTGCCTGAAAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252176	242246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244774_249812_249843_251887_251999_252111
744346	SIRV6	-	374	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9450	-159	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGACGTTTTGCAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	1703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10725_10825_11035_11109_11205
744348	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744352	contig_2214_pilon	-	1628	13	Intergenic	novelGene_144266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCATAATACACAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334995	319342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_319429_321925_322121_322964_323098_323300_323393_325276_325461_326542_326613_326726_326823_328632_328738_330461_330558_330689_330848_332691_332806_333649_333749_334795
744353	contig_18184_pilon	-	2190	5	Intergenic	novelGene_123882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	8.16624148553054	60	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	61	1986	551413	543728	FALSE	20	CTTCAGTCTTTAAGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKIREQIKAPLCSESPGEETMETLTSRHEERGICSQASAPFPEEEDEIKFQESLTFKDVAVVFTEEELELLDSDQRKLYRDVMLESFRNLVSAGQQPFKSGKISHLEQDKETWVTEREAPADAYPGDKNEKDMEYIQEKELKVLLHKELSYWKLWEQVTGELTGSQDHRGNLQGKEFQFSEDASRCQEWEGRSTQGFQIENVVDSLQGNGPISVENQRFPAWKAVSPVPIQESWALVNEPWNDQGGCKKISREDALYKCDWNNYGFSWISHCRNDHSPPEREKPYECDEYQNHCVDEAILYHHNSSENGFKSEEGGNGFRDDSNPPTHPQVHLEEEPYEYQEYVRQGAYPDRHQSIPLGGLSAASIECGQGSRQSVDSLHTGEKPFKCECGKGFGRSWDLQVHQRVHTGEKPFTCLECGKGFWRISDLHSHKKVHTGERPYVCDVCGKGFIFSSDLLIHQRVHTGEKPYKCAECGKGFSYSSVLLTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFRCTSNLYTHQRVHTGKKPYTCDECGKGFSYSSNLRTHQRLHTGEKPYKCLECGKGFRFSSGLLSHERVHTGEKPYRCDICGKSYSQISHLYGHQRVHTGEKPYRCEECGKGFSQSSSLQVHQRVHTGERPYKCEECGKSYSRSAGLRNHQRVHFK	551473	543523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_545338_547067_547164_547421_547549_551119_551179_551379
744355	contig_14176_pilon	+	2240	9	Intergenic	novelGene_74848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	120.331767937648	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	40	750	246102	271823	TRUE	15	CTTGGAAAGTCTGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRFAKYYKMENGSEYRTLLKAFGIRFDVLVYGNAGKFNIIPTIISAVAAFTSVGVGTVLCDIILLNFLKGADQYKAKKFEEVNETMLKVAASANPVYPSDQTTEEKQSTDSGAYSIGH	246062	273768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_270173_270268_270557_270624_271207_271286_271709_272415_272869
744358	contig_10058_pilon	+	2799	7	Intergenic	novelGene_67662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.5723301886761	96	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	425	1237	24288	28983	FALSE	5	CGCCTGATTGCTGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGQLAILNSKYGLHVSSPYEGRVEQPPPPRDPLDGAVLLRNAVQADEGEYECRVSTFPAGSFQARLRLRVLVPPLPSLNPGPALEEGQGLTLAASCTAEGSPAPSVTWDTEVKGTATSRSFKHSRSAAITSEFHLVPSRSMNGQPLTCVVSHPGLLQDQRITHILKVAFLTEASVRGLEDQKQWHVGREGAMLKCMSEGQPPPSYNWTRLDGPMPSGVRVEGATLSFPRLTTEHSGTYVCRVSNELSSRDSQVDVDVLDLRDASVREVDLVSASVVAVGVIAALLFCLLVVVVVLMSRYHRRKARQMTQKYEEELTLTRENSVRRLHSHNADPRSQSEEPEGRSYSTLTTVREIETQTELLSPGSGRAEDEEDQDEGIKQAMNHFVQENGTLRAKPTGNGIYINGRGHLV	22154	30545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_22373_24081_24373_25559_25681_26674_26824_27068_27226_27869_27946_28758
744361	contig_10296_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_168886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903483	901165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_901200_903500
744363	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744364	contig_10023_pilon	+	1128	6	Intergenic	novelGene_123516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGCGCTTGAGCCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456010	458243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_456131_456305_456714_457083_457166_457288_457435_457681_457889_458078
744365	contig_2834_pilon	+	1027	2	Intergenic	novelGene_27969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1305	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	113	568	213515	213970	FALSE	30	CTTAATAAACATGTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEGYPETQGNRNEVHNGQIRSPPDGMMAEELEVILKPAPRVQVSLEPVGLPPESLDEVSVEDLEAIPQRNPPNPADSLQRFRQFRYEDAAGPRDVLRHLQELAGQWLRPDIHTKEQIVEMLVQEQFQAVLPEELRARVQRYRPGVRITG	209577	214429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_209658_213482
744368	contig_1090_pilon	+	1542	3	Intergenic	novelGene_131125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	69	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406120	459455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_406379_457195_457316_458291
744371	contig_6710_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_97403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744373	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	0	204	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744376	contig_10861_pilon	+	2539	4	Intergenic	novelGene_39436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	32.2937902527543	6	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1582	2208	2433965	2478785	FALSE	30	GCAGAGGAAGTTACTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFVIRTPRVQNSPQKKDPGAKMYKQATIESLKRVVVVEDIKRWKTILELPDQTKENLVEALQELKKKIPSREVLKSTRIGHTVNKMRKHSDSEVACLAREVYTEWRTFMEKHSDRPSIEVRSDPKTEMFRKNAQKLLSEALELKMDHLLVENIERETFHLCSRLINGPYRRTVRALVFTLKHQAEIRAQVKNGLLPVSTFVKNHKK	2432383	2479116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2434067_2451185_2451328_2469337_2469532_2478596
744384	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	467	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744385	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744388	contig_5389_pilon	+	1863	5	Intergenic	novelGene_143009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	18.3507493035026	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	154	762	255025	261970	FALSE	20	TGAAAATGGCTTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDRPLLAVQEALQKCFPVVEEQQGLWRSTLSDCQPLLASLSNLAEQLQAAQNVRFEDVRSLRAFPDLKERLRRKQLSAGDIVLDKLGERLASLLKVRDTVSSHVEQVFQVYEQHANTVDIDAVLQPSVVSPSLADMLEWLQDIERHYRNSYLKRKYLLSSIHWGDLANIQALPKAWDQISEDEQDLVQDILLNVSFFLEA	254687	263071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_254838_255021_255300_259067_259248_261640_261757_261932
744396	SIRV6	-	371	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8966	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10786	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723
744397	contig_6418_pilon	+	2782	1	Intergenic	novelGene_81255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAAAGTTTGAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468613	1471395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1468600_1471400
744399	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
744406	SIRV5	-	480	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
744410	contig_11978_pilon	-	1443	6	Intergenic	novelGene_63042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	11.805083650699	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	354	704	1800665	1797292	FALSE	15	TCATCTCTTATCTCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGLPAGLQWMLSQTTAN	1801992	1796552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1800869_1801117_1801968
744411	contig_11364_pilon	-	2029	10	Intergenic	novelGene_65152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	115.993401259737	331	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	30	476	86578	65112	TRUE	5	CTTTGTGGTTTGTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCSLSDIYQMEKDIAMEQERNTRYRAPKILEPTAFQEPPPKPSRPKYRPPPQTNLLAPKLQFQEEDFIQPSSREEAQQLWEAERVKMRQKLDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNNKSPLTPEKEAGYTEFTGPPQKPPRLGAQVREGLCGSW	90488	60418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64314_64454_64874_65189_66590_66616_67011_67048_67659_67807_85522_85589_86482_86592_90472
744415	contig_9988_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_113063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	228	419	141134	141325	NA	45	CATATAGAAACTCAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKYLKTSIFQKLPTIRSHSTSSSTLDHSYPTSLTLPPITWLLSITFSWLLTNLANAHLKIWQSRHYPIINATQGYMNFLNSPATQLAHAEHAVNKNPKFYFKNAESFYHLPCVTLNAWILDLLQFGFIFLVYVYLPTC	140906	142131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_140900_142100
744417	SIRV4	-	308	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1215	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
744418	contig_8140_pilon	-	3420	1	Intergenic	novelGene_86460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTTTTTAAGACAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886826	883406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_883400_886800
744419	SIRV6	-	344	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTGGCAGTTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
744421	contig_7840_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_69010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287149	289622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_287100_289600
744432	contig_15977_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_137222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAATCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84024	86700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_84000_86700
744433	contig_3153_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_104666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTATGGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201800	203371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_201800_203400
744434	contig_14666_pilon	-	1180	5	Intergenic	novelGene_39540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_4	986.049789564401	3098	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	36	761	475175	449808	FALSE	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLPARLELPCHCSPESPKCLLGTQQPLCRRLSTEHQQLDRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	475210	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_475054
744435	contig_14925_pilon	-	834	5	Intergenic	novelGene_55197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1563.50397744937	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	20	GAGCAAAGGCTGTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26148_26254_26327_27018_27127_27995_28041_29569
744436	contig_17470_pilon	-	1739	12	Intergenic	novelGene_110518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.5760490871227	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	72	788	277215	271576	TRUE	15	AAACTCTTGTTGGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLECGNAP	302611	269591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271605_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302546
744437	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744445	contig_12746_pilon	-	2781	1	Intergenic	novelGene_152198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646931	644150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_644200_646900
744449	contig_17471_pilon	+	1490	4	Intergenic	novelGene_168658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	15.542057635833	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	542	1234	1742	30619	FALSE	10	GGCGCCTGTTGGGGGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLMLTFGDIPLHAPVLLAWTVLRHTLNPEETSNIVRKIGGKAIQLSVFQYLTRLLRSLASGGNDLSPTLLALHHQHRVHVCLWTPFLRSDLAGAAHSGQSAGRQLPWIKGNARTLPRKTWATLSTDSQREDSRAVHWIEALPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA	1200	30875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17471_pilon_+_1962_5054_5145_8100_8208_30343
744450	contig_4884_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_63780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATTAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99610	100449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_99600_100400
744451	contig_12046_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_83456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGATACCTAAACTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155704	157987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_155700_158000
744453	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	82	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744458	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_97848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744459	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
744461	contig_10437_pilon	-	2710	7	Intergenic	novelGene_38504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	29.8700890896265	77	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	728	1384	1309566	1307193	FALSE	45	GAAACAGTCACGTATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSPYKSELTIQKTNLSHSGVYHCSGKGNNQYMYRSAGVSITVKELFPAPVLRAFFSSPLLEGNPVNLTCQTKLSSQSPGLQLYFSFHVGSKNLMGRSTSSEYQILTAKREDSGFHWCEAATEDGNVVKRSPQVELQVLGLQPAVPVWFHVFVYLTVGTVFLVDTVLCVTIQKKLQKKKKSNLQFSLAFGDGEKATSHPQKDSRVEEALKCQEQEEQL	1349481	1305866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1307432_1308254_1308540_1309433_1309692_1317133_1317389_1318762_1318845_1344666_1344757_1349306
744466	contig_8712_pilon	+	2501	10	Intergenic	novelGene_58751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_1	342.097163296924	273	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	108	2279	127297	179786	FALSE	20	GCTTGAATGTCTGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVYIEKFVRRVMKPLLYIPSQSELLDFLSNYEPGVLGYFEFSGSPQPPGYLTFFTSALHSLKKDYLGTVRFGVITNKHLAKLVSLVHSGSVYLHRHFNTSLVFPRKVINYTAENICKWALENRETLLRWLWPHGGKSLLLNNELKKGPALFLFIPFNPLAESHPLIDEITEVALEYNNCHGDQVVERLLQHLRRVDAPVLESLAPEVPARLPDPPLITASPCCNTVVLPQWHSISRTHNVCELCVNQTTGGIKPSSVSMPQCSFFEMAAALDSFYLKEQTFYHVASDSIECSNFLSSYSPFSYYTACCRTMNRSMMGFIDSEQEVFETPAIAFSSLEKKCEVDSLSSVPHIEENQFLFPEVDMDSTNFTGLSCRTNKTLNIYLLDSNLFWLYAERLGAPSVTHVKEFAAIVDVKEESHYILDPKQALMKFTLESFIQNFSVLYSPLKRHLIGSDSAQFPSQHLITEVTTDTFWEVVLQKQDVLLLYYAQWCGFCPSLNHVFIQLARLLPPDTFTVARIDVAQNDLPWEFMVDRLPTVLFFPCNRKDLSVKYPEDLPITLPNLLKFILHHSDRAPAPQNLANPPTKECLQSEATLQQGHISHLEREIQKLRAEISALHQAQVQVEAQLASARRDEHRLLRQQQTLEKQHSLLRLHSEQLRALYEQKTSELEEVARRLQELADASENLLTENTWLKILVATMERKLKDKDAAETLAPPEGGTL	123305	180008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_123385_127268_127399_141092_141187_159077_159191_161300_161502_168244_169038_171353_171497_171825_171936_174675_174757_179251
744467	contig_17427_pilon	-	1822	6	Intergenic	novelGene_30386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1323.66303869225	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	49	357	188879	184561	TRUE	30	AATGTTTGAGTAACACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAASRSKK	204709	182994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_184368_184468_184579_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
744468	contig_348_pilon	-	1450	13	Intergenic	novelGene_67594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	469.688394044392	339	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	79	1209	314169	296436	FALSE	0	CTTTTTGTGGTTCCGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGHPRGADISAVDLVVPLSWVLPAVMKDVQGFLQQSQSSGPGQAAVWHRLEELYTKKLWHQLTLQVLDFVQDPCFAQGDGLIKLYDNFISEFEHRVNPLSLVEIILHVVRQMTDPNVALTFLEKTREKVKSSDEAVILCKTAIGALKLNIGDLQVTKETIEDVEEMLNNLPGVTSVHSRFYDLSSKYYQTIGNHACYYKDALRFLGCIDIKDLPVSEQQERAFTLGLAGLLGEGVFNFGELLMHPVLESLRNTDRRWLIDTLYAFNSGNVEKFQTLKTAWGQQPDLAANEAQLLRKIQLLCLMEMTFTRPANHRQLTFEEIAKSAKITVNEVELLVMKALSVGLVRGSIDEVDRRVHMTWVQPRVLDLQQIKGMKDRLELWCTDVRSMEMLVGHQAYDILT	314247	296194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_296532_297064_297182_297350_297432_298791_298855_300457_300584_300659_300740_301662_301835_304349_304437_304598_304643_304885_304942_305018_305054_312625_312705_314074
744469	contig_9424_pilon	+	1305	3	Intergenic	novelGene_143763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_1	18	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	28	402	6557	15488	FALSE	15	TGGCTGCCTCCCTTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGPDVEAYCLRCECKYEERSSVTIKVTIIIYLSILGLLLLYMVYLTLVEPILKRRLFGHSQLIQSDDDIGDHQPFANAHDVLARSRSRANVLNKVEYAQQRWKLQVQEQRKSVFDRHVVLS	6529	16391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_6641_8475_8611_15332
744470	contig_57_pilon	+	2245	17	Intergenic	novelGene_44894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_9	125.060719627507	1	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2151	93	2243	89494	120465	FALSE	25	GTAAGTGATGACGTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDD	89401	120467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222
744473	contig_15092_pilon	+	2047	3	Intergenic	novelGene_57804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	1	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	56	622	325159	351165	FALSE	20	TATCAAAGGTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325103	352590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
744474	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	552	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744475	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744478	scaffold_19766_pilon	+	2143	17	Intergenic	novelGene_34281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	88.3301468568348	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	3	716	399880	406509	TRUE	20	GGAAGACCTTGGTTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLAAGGEEAATTTSVPGSPGLPGSRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKQFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIGALGSLRQLDVSSNELQSLPPELCSLPSLRDLNVRRNQLSVLPDELGDLPLVRLDFSCNRVSCIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLPRSA	399877	410990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_400082_403613_403759_403924_404052_404238_404345_406219_406337_406492_406616_406759_406860_407110_407202_407291_407369_407644_407765_407964_408034_408124_408229_408356_408441_408674_408762_408943_409082_409180_409259_410617
744482	contig_12425_pilon	-	1807	9	Intergenic	novelGene_46701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	761.721692943033	1	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	27	578	211174	207297	TRUE	20	TGGCTTAAAACTGGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYELQTLLHPSM	211200	203455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207662_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048
744483	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
744484	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	11	340	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14419	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
744486	contig_12756_pilon	-	1645	6	Intergenic	novelGene_153213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_2	169.008875506584	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	729	1355	153039	150438	FALSE	50	AATAAAAAAATATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFTTSQTDVYADHLDWHYRQNRTEKDVSRKVTHRRWYYSLTDWIEFEEIADLEERAKSQFFEKVHEEVVLKTQEAAKEKEFQSVPAGPAGAVESCEICQEQFEQYWDEEEEEWHLKNAIRVDGKIYHPSCYEDYQNTSSFDCTPSPSKTPVENPLNIMLNIVKNELQEPCESPKVKEEQIDTPPACTEESIATPTEIKTENDTVESV	155982	150147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_150654_151334_151371_151864_151958_152356_152513_152913_153098_155312
744487	contig_12638_pilon	+	1584	12	Intergenic	novelGene_33301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	89.0979589047456	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	199	1314	1202238	1283566	FALSE	30	TACCCTGGAACCACAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLIVYLFHFLIDYAELVFMMADALTAIALYFAIQDFNKVVFKKQKLLLELDQYAPDVAELIRTPMEMRYIPLKVALFYLLNPYTVLSCVAKSTCAINNTLIAFFILTTIKGSAFLSAVFLALATYQSLYPLTLFVPGLLYLLQRQYIPVKIKSKAFWIFSWEYAMMYVGSLVVIVCLSFFLLSSWDFIPAVYGFILSVPDLTPNIGLFWYFFAEMFEHFSLFFVCVFQINVFFYTIPLAIKLKEHPFFFMFIQIAVISIFKSYPTVGDVALYMAFFPVWNHLYRFLRNIFVLTCIIIVCSLLFPVLWHLWIYAGSANSNFFYAITLTFNVGQILLISDYFYAFLRREYYLTHGLYLTAKDGTEAMLVLK	1190135	1283836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1190175_1202078_1202241_1205821_1205882_1207256_1207320_1223709_1223820_1226010_1226112_1242583_1242682_1256152_1256308_1257964_1258109_1260881_1261007_1267724_1267868_1283452
744488	SIRV6	-	382	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-158	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACGTTTTGCAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10817_11031_11109_11205
744491	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	2	20	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744492	contig_12046_pilon	-	2140	13	Intergenic	novelGene_83470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	107.88754433308	396	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	213	1496	345717	319447	TRUE	10	TCCAGTTGTGGTATTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLTVLLHGGPRGRSPLLQRLMQEIRYMKRSYVVKPTLNEVVIVSAIRTPIGSFLSSLSSLPATKLGTIAIQGALEKAGIPKEEVKEVYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCTTINKVCASGMKAIMMASQNLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGATPYGGVQLEDLIVKDGLTDVYNKIHMGNCAENTAKKLNISRDEQDTYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTISVKGKPDVVVKEDEEYKRVDFSKVPKLKTVFQKENGTVTAANASTLNDGAAAVVLMTTDAAKRLNVKPLARVAGFADAAVEPIDFPIAPAHAVPKVLKNAGLKKEDVTMWEVNEAFSVVVLANIKMLGIDHQKVNINGGAVSLGHPIGMSGARIVIHMVHTLKQGEYGLASICNGGGGASAMLIQKL	345929	317866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_318051_318986_319568_319937_320096_321962_322028_323275_323390_328104_328201_329128_329280_329920_330065_331755_331857_332089_332186_332477_332596_338465_338514_345645
744494	contig_16724_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_105264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1902	2228	324787	324461	NA	30	GGTCCCCCAGAATATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSYLKEAGSSLEGRKEQAKGGMFSPLYEDMSSLWIDMTSKNIIVLKCFYCPHSLLVLEKHFDKFIVNLKEFGHLCKDTVAIKMAIHWKSFNNLVRSLYKSQMSSPT	326688	324367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_324400_326700
744498	contig_12746_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_152196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631491	629352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_629400_631500
744502	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7456	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
744503	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744506	contig_14577_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_164625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTAGTTGCCATCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40333	40960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_40300_41000
744507	contig_12050_pilon	-	1433	2	Intergenic	novelGene_62746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATAGTTTAGTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693412	685666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021
744511	contig_5485_pilon	-	1601	16	Intergenic	novelGene_37746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.480230740355	7	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	32	1399	478711	459244	TRUE	0	CGGGGTTCCTGTTTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRSRCVSRAFSRSLSAFQKGNCPLGRRSLPGVSLCQGPGYPDSRKTVVNSSSVLSVRFFRTTAACKDDVITVKTPAFAESVTEGDVRWEKAVGDSVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLRKTDAAPAKAKPAEAPAAAAPKAEPMAAAVPPPSAAAIPTQMPPVPSPAQPPASKPVSAIKPTAAPPVADLGAGKGLRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEVDMSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	478742	457791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_457931_459180_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744_462876_466980_467079_468572_468650_469007_469164_470642_470755_471270_471327_471547_471623_471751_471808_474581_474631_477655_477690_478648
744514	contig_6837_pilon	-	1640	4	Intergenic	novelGene_149801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	59.0987873536054	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	432	1388	10764	8936	FALSE	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRGKKGAVAEDGKEPKTEPEAKKSKAAAKKNEKEATGEGTVLYEDPPDRTTSPSGKSATLKICSWNVDGLRAWIKKKGLDWVKEEAPDILCLQETKCSDKKLPAELQDLPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSRQCPLKVSYGIGEEEHDQEGRVIVAEFDAFVLVTVYVPNAGRGLVRLEYRQRWDEAFRKFLKDLASRKPLVLCGDLNVAHEEIDLRNPKGNKKNAGFTPQERQGFGELLQAVPLADSFRHLYPDTAYAYTFWTYMMNARSKNVGWRLDYFLLSQSLLPVLCDSKIRSKALGSDHCPITLLLAL	11195	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_9454_9593_9787_10310_10499_10706
744516	contig_7898_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_47646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785931	783746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_783700_785900
744518	contig_2377_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_67876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCTAACTCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51974	52251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_52000_52300
744519	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
744520	contig_10904_pilon	+	1514	3	Intergenic	novelGene_22477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	919.5	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	178	1146	149100	150068	TRUE	55	ATATAACATTAAAGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	146050	151565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097_150344_151472
744521	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744526	contig_3604_pilon	+	1008	7	Intergenic	novelGene_139993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	859.754373837862	6828	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGCCTGTGTCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45392	51565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47666_47849_47925_48032_48132_48260_48525_51168
744528	contig_9609_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_23078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAATACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452821	456264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_453308_455642
744535	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744539	contig_17198_pilon	+	1938	10	Intergenic	novelGene_62388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	98.8389386955826	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	106	1083	1060803	1093400	FALSE	30	TTTTGTATCAGAGTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVQIISRRLISQPYCGLKSAASAQTKIHPTMARPSSNMADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRKSWKTLDCSFWLACFPVAASSFCLFLSLYFHSLCHKDLC	1047687	1094255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1092386_1092466_1093358
744544	contig_10196_pilon	+	809	9	Intergenic	novelGene_132166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	487.666365843493	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	47	721	1038364	1050708	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPCLIVE	1038317	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1038469_1039041_1039107_1043818_1043871_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506_1050547_1050690
744546	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	34	3256	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
744547	contig_8310_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_75566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	181	558	237061	236684	NA	80	AAAACTTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDAVDAVGVGVGVGAVGVDADAADADVADAVGVRAGVDADAVGVCAGVDADAADVGAVDADVNVGADAGVGVASVGVAAGVGAGAMDADSDGMWMWMSIMARLFAVWVNASLDVAVKVFCRCG	237241	235223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_235200_237200
744560	contig_6710_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_96465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653695	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
744561	contig_16951_pilon	-	2392	1	Intergenic	novelGene_98635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTGCCATTAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85616	83224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_83200_85600
744566	contig_11855_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_67131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2675457	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674100_2675500
744569	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	51	500	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
744570	contig_854_pilon	+	2482	5	Intergenic	novelGene_36756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	27.6077434789589	9	113	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	174	1178	1739485	1745937	FALSE	20	GACTGATATCCTGAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSETQDIIEDVIEYLKNGISQEELQLLLSEDQDWERFQVEADLSRDEADILHEALNKLRMDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722307	1747241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722355_1737993_1738042_1739406_1739516_1743412_1743540_1745090
744575	SIRV6	+	561	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10799_11014_11109_11205
744581	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
744592	contig_19012_pilon	+	2724	2	Intergenic	novelGene_159483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	0	9	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76394	87092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_77987_85960
744595	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744596	contig_10734_pilon	+	2539	18	Intergenic	novelGene_51539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	29.0734661845842	82	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	87	2021	2341861	2433418	FALSE	30	ATAACATCATGGCTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQIKFIVDKLNKDPFRKNYNLITFDSLEPMQLLQVLSDVLAEIDPKQVVDIREEMPEQTAKRMLSLLGILKYKPPGNATDMSTFRQGLVIGSKPVIYPVLHWLLQRTNDLKKRAYLARFLIKLEVPSEFLQDETVADTNKQYEELMEAFKTLHKECEQLKTSGFSTAEIRRDISAMEEEKDQLIKRVERLKKRVETVQNHQRMLKIARQLRVEKEREEFLAQQKQEQKNQLFHAVQRLQRVQNQLKSMHSAAADAKPESLMKRLEEEIKFNSYMVTEKFPKELENKKKELHFLQKVVSEPAMGHSDLLELESKASIISRKKEAKAEELQEAKEKLASLEREVSVKTNQTREFDGAEVLKGDEFKRYVSKLRSKSTVFKKKHQIIAEFKAEFGLLQRTEELLKQRHEDIQHQLQTIEEKKGVSGYSYTQEELERVSALKSEVDEMKGRTLDDMSEMVKKLNSLVSEKKSALAPVIKELRQLRQKCQELTQECDEKKSQYDSCAAGLESNRSKLEQEVRGLREECLQEESKYHYTNCMIKNLEVQLRRATDEMKAYVSSDQQEKRKAIREQYTKHIAEQENLGKKLREKQKTVRESHGPNMKQAKMWRDFEQLMECKKQCFLKQQSQTSIGQVIQEGGEDRLIL	2338845	2433936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2338911_2341839_2342005_2342551_2342656_2343155_2343337_2348647_2348738_2352309_2352376_2352690_2352802_2354904_2354990_2369511_2369676_2380260_2380408_2398346_2398497_2402134_2402264_2408107_2408198_2417280_2417368_2418368_2418441_2418523_2418610_2423642_2423689_2433235
744597	contig_3948_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_53253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247916	1249986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1247900_1250000
744598	contig_4782_pilon	-	2635	1	Intergenic	novelGene_73652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGTTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470878	468243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_468200_470900
744600	contig_15070_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_164901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTTACACTTCAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503924	505861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_503900_505900
744605	SIRV6	+	434	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	528	0	349	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744609	contig_5217_pilon	-	1490	8	Intergenic	novelGene_135714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	36.1380572758618	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	793	1413	296664	295104	FALSE	10	TAGTATGTTGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298373	295026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296992_297229_297293_297368_297733_298335
744610	contig_1275_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_108808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTTTCCTCAGCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585112	586995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_585100_587000
744611	contig_20819_pilon	-	1372	4	Intergenic	novelGene_55705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	50.2283673723215	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATATTAGTGTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176596	173344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_173565_174827_174939_175016_175779_176317
744619	contig_9186_pilon	-	1655	5	Intergenic	novelGene_85365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	22.8951414059839	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	194	811	643909	638458	FALSE	20	TGTGGGCTGAAGAAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGILEKSMFCKDMTVKYDSRLRERKYGVAEGRALAELRALAKAAGEEVPTFTPPGGETLDQVKMRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	645808	637613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_638890_640124_640236_643834_643913_645289_645412_645740
744622	contig_7078_pilon	-	1182	12	Intergenic	novelGene_130179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	340.045475811449	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	119	985	795828	774236	TRUE	75	GAGAAAAAGAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCALKTDRAVAREPAREEPGGRIVSPVCSSRPPAPAARKMADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNSSLFPFLYVDLRSISR	796283	773188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774287_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795858_796194
744624	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744625	contig_9656_pilon	-	1527	9	Intergenic	novelGene_121889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_8	124.836330348981	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	204	1526	97308	71785	FALSE	15	CGTTTTGGGGGAGGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLPSFHLKDALTTIGEKVCVEVSSCLSLCGFTPFTTDQETVLKGQIQAVASPEDPIRRIMG	101202	71783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_71960_73707_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_101023
744633	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744634	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
744641	contig_2799_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_85484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTGTATTTTTACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506306	508279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_506300_508300
744645	contig_6710_pilon	+	505	2	Intergenic	novelGene_98071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653428	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
744649	contig_7580_pilon	+	1157	7	Intergenic	novelGene_108603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	281.158170193695	7	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	695	1000	108161	109647	FALSE	40	AGAGAATGTAGCAATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96541	109804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_105320_105378_106952_107194_108145_108248_109428
744652	contig_987_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_72275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGACATGCTCTCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902833	902298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_902300_902800
744653	contig_12948_pilon	-	2935	1	Intergenic	novelGene_126184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTACTTGAATAACATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199958	197023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_197000_2e+05
744663	contig_6710_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_97756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744664	contig_15610_pilon	+	3385	3	Intergenic	novelGene_154289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	21.5	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	149	478	759521	762590	FALSE	45	TCCCATAAGAAACGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKNPTRESPRRLSAKLGKGTEMKKVARQLGMAAAESDKDSGFSDGSSECLSSAEQMESEDTLSALGWSREDRPRQSSRTANNAFPTLSPMVVMKNVLVKQVRRTNVS	752562	765497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_752660_759469_759657_762396
744665	contig_4232_pilon	+	899	4	Intergenic	novelGene_63196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2220.22025934365	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	79	555	146362	149200	FALSE	25	GTTTAGTTCTGTGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESSRAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146283	149544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148510_148801_148884_149087
744667	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744668	contig_14691_pilon	+	1630	2	Intergenic	novelGene_146793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22952	30558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_+_24249_30224
744669	contig_1399_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_166673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497403	499640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_497400_499600
744677	contig_10424_pilon	+	2130	6	Intergenic	novelGene_56814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGCGGCGGCAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322151	347211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_323828_324272_324387_327209_327310_329327_329460_341003_341055_347154
744682	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	50	AAAAATGAAAATGCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744683	scaffold_16539_pilon	-	1449	9	Intergenic	novelGene_68343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	350.879942964827	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	99	707	502141	498893	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGEPGGGQGSRAWTSQARP	502783	489782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490045_491838_491961_494567_494769_498735_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
744684	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744687	contig_11590_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_125607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCTTAAGTAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862728	864256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_862700_864300
744688	contig_7056_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_43683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGTAGGTTATCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846897	847097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_846900_847100
744690	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	0	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
744696	SIRV6	+	472	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	0	205	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	225	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744697	contig_6710_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_97250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCCCCTGAGGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	653874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
744701	SIRV6	+	555	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
744707	contig_4426_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_15404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAATGGATGGTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810525	809427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_809400_810500
744708	contig_5590_pilon	-	1138	7	Intergenic	novelGene_163033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.86338998124982	53	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCACCTCATGGTCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369364	353564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_353580_358766_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
744709	contig_1090_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_131117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTCTAGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357747	358565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_357700_358600
744712	contig_2054_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_51665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_3	693.770990673435	1564	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	379	813	34719	24955	FALSE	15	CCTCAGTAGTTTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAARSPADQDRFICIYPAYLNNKKTIAEGRRIPINKAVENPTATEIQDVCLAVGLNAFLEKNKLYSREWNRDVQYRGRVRVQLKQEDGSFCLIQFPSRKSVMLYAAEMIPKLKTRTQKTGGGDQSLQQGEGSKKGKGKKKK	35097	24559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_25089_30978_31091_31184_31257_34095_34172_34678
744713	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_96743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744714	contig_15165_pilon	+	2656	5	Intergenic	novelGene_145320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGATCCTGGCAAATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216361	246353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_217251_219100_219212_220014_220190_223366_224773_246278
744717	contig_9863_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_153991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAAGTCAATTCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22310	22907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_22300_22900
744719	contig_6616_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_141751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAAACAGATTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274418	273833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_273800_274400
744723	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10760_10993_11109_11205
744731	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
744732	contig_10951_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_61627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTCAGATGGCGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162535	163085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_162500_163100
744733	SIRV6	+	558	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744734	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744735	contig_6418_pilon	-	1273	12	Intergenic	novelGene_81109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	409.373013842889	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	654	1025	73056	68463	FALSE	30	AAGCAACTACTTTGTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	118020	68214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75161_78205_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
744736	contig_3818_pilon	-	1951	2	Intergenic	novelGene_99286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	123	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	505	819	714973	714659	FALSE	25	GTCAGGAATTGAGCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCCTASHSSGWSAGCRKIHGVFSNPPSEIYRRWLHVLCSPLATRGRPHHTWPSSLLPSGSRGSCFEAKLLLLFFVVTKDVVIFLPHFPYGFPPERCSGEELVC	715927	713526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_715349_715798
744737	contig_4782_pilon	-	1000	2	Intergenic	novelGene_73657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	55	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	218	505	554759	529280	FALSE	35	TTTCTTATAATTGTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGGRLRCFKCVSLSAVLPIIRFHALGSRAGLLRVFGVSHSRVSTRNFPIPVTFRITYIVKIRAWCGFDSSVMSELVRTGSKPGFEAAASRREGFHPASSDSSLPFYTLPETPTYPQSIKTERSAQVLNLYYSFLSPSLSTGGAILTSTPEYCLLGNFEVFGCNQER	554976	528784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_529479_554670
744742	SIRV6	-	544	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1540_1647_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
744744	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744748	contig_9753_pilon	-	1055	7	Intergenic	novelGene_41326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	330.79638752562	464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTATGGGGTACATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93376	69992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_70692_70838_73254_73317_85817_86095_86172_86247_93282
744753	SIRV4	-	241	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	373	3	-373	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTTACGGGTGCAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
744754	SIRV4	-	272	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1251	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3907	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
744765	contig_610_pilon	+	1790	9	Intergenic	novelGene_76792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	157.27439198738	40	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	31	1161	296008	323162	TRUE	30	ACAATTGTGTTGAATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAAGETDAPKFILYLLLVPILLIVFVLGFFTWSGQRDRGKEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTELLLAPVHLPTHSGAGSADGCSGGIASTTVLCWELHIQRRRKCWVPPLENLLVSLGDAALASGEF	295977	324224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_306612_306733_309314_309419_313377_313441_321676_321769_323056_323221_323653
744766	contig_1734_pilon	+	956	2	Intergenic	novelGene_164391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	144	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	129	302	658237	658410	FALSE	40	ATCAGATGCTAAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAQKRRAVRPPLAGVFVAGFSDRPVDCGRSSGILGQIRHTVMMPEINTDGLDEQQVLLLAEMCILIDEDDNRIGAETKKNCHLNENIEKGAVLKYSAL	654703	659064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_654804_658208
744774	contig_8866_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_77785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCTCCCGCAGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346339	344348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_344300_346300
744775	contig_12140_pilon	-	1558	10	Intergenic	novelGene_86516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	76.1664843177978	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	72	1313	84789	8191	FALSE	50	ATAATAAAATCTATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATGTDDVDKLKTKFISAWNNMKYSWVLKTKTYFSRNSPVLLLGKCYHFKYEDENEMLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRAWTWPDALNIENSDSESWTSHTVKKFTASFEGSLSGESELKTPSISLKKMVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITKVLCVCVCACA	84860	7945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_8224_21491_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_45850_46085_64263_64348_84713
744780	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744782	SIRV4	-	272	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1249	0	1249	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
744788	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
744790	contig_6710_pilon	-	469	2	Intergenic	novelGene_98174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744794	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_94116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744795	contig_10424_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_56796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGCTTAACATATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286097	284042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_284000_286100
744805	contig_8476_pilon	-	1944	2	Intergenic	novelGene_121357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGTTTGAGGTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210624	208636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_210125_210168
744806	contig_6503_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_145796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTGCACCATCCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927828	928392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_927800_928400
744807	contig_10627_pilon	+	875	4	Intergenic	novelGene_59928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	176.749037401119	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGAAACCACGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106061	109694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_106116_107835_108030_108949_109005_109122
744810	contig_17500_pilon	-	1223	3	Intergenic	novelGene_157923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCAGAAGACAGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277859	253129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_253248_272678_273142_277217
744811	contig_15991_pilon	-	814	6	Intergenic	novelGene_70865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3186.46251507844	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	376	744	101267	100445	FALSE	5	GTTGTGTTTGTTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106352	100374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102202_105001_105142_106315
744814	contig_5019_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_109195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135723	137765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_135700_137800
744815	contig_11417_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_103283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456242	457962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_456200_458000
744818	contig_15720_pilon	-	987	7	Intergenic	novelGene_41886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1816.45678451209	6	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	64	945	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWVSVGWGGQAEYLAARWNPCQYNLVRVWQVTIGTR	283957	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278586_279652_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
744821	contig_5643_pilon	-	1716	9	Intergenic	novelGene_38928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	100.699351413006	492	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	395	1138	416375	412705	TRUE	20	TAAGTAGGGTTTTGCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRFMRDVEPEDPMFLMDPFAIHRQHMSRMLSGGFGYSPFLSITDGNMPGTRPASRRMQAGAVSPFGMLGMSGGFMDMFGMMNDMIGNMEHMTAGGNCQTFSSSTVISYSNTGDGAPKVYQETSEMRSAPGGIRETRRTVRDSDSGLEQMSIGHHIRDRAHILQRSRNHRTGDQEERQDYINLDESEAAAFDDEWRRETSRFRQQRPLEFRRHEASGGGGRRAEGPPRLAIQGPEDSPSRQSRRYDW	417197	411864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_412418_412679_412893_413501_413662_413835_413965_414363_414418_415036_415073_415925_416053_416325_416555_416982
744822	contig_14322_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_115835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671877	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
744825	contig_3410_pilon	-	1785	7	Intergenic	novelGene_58897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	613.739471509605	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	2	715	57649	14940	TRUE	5	CGTTGAGCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPDSGQPSSKQRQSFSLHVETAGQSQ	57650	13687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14553_14734_15016_30886_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
744826	SIRV5	+	363	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	887	-45	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
744829	contig_11269_pilon	-	1436	2	Intergenic	novelGene_145808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260417	257669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_258273_259584
744831	SIRV6	-	558	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9450	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1173_1459_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
744838	contig_5467_pilon	-	1886	14	Intergenic	novelGene_111968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	170.970809647376	179	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	65	1612	140185	126326	TRUE	10	TGCCGCAGTGCTCCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVALSRTQVCGIYREELHQGGAFHQSDTHIFIIMGASGDLAKKKIYPTIWWLFRDGLLPENTFIVGYARSRLTVADIRKQSEPFFKATPEEELKLEEFFSCNSYVAGQYDDPASYKRLNSHVNALHQGSPANRLFYLALPPTVYEAVTKNIRETCMSQTGWNRIIVEKPFGKDLQSSDRLSNHIASLFREDQIYRIDHYLGKEMVQNLMVLRFANRIFGPIWNRDNIACVILTFKEPFGTEGRGGYFDEFGIIRDVMQNHLLQMLCLVAMEKPASTDSDDVRDEKVKVLKCISEVEANNVVLGQYVGNPDGEGEATKGYLDDPTVPQGSTTATFAAVVLYVENERWDGVPFILRCGKALNERKAEVRLQFRDVAGDIFHQQCKRNELVIRVQPNEAVYTKMMTKKPGMFFNPEESELDLTYGKRYKNVKLPDAYERLILDVFCGSQMHFVRSDELREAWRIFTPLLHRIEREKSRPIPYVYGSRGPVEADELMKRAGFQYEGTYKWVNPHKL	140786	125708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_125914_126256_126417_126492_126586_126698_126776_126883_127120_127540_127728_128061_128156_128423_128550_128773_128933_129359_129578_129945_130055_130148_130187_140065_140194_140730
744841	SIRV6	+	546	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744842	contig_9389_pilon	-	1728	8	Intergenic	novelGene_83870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445.12112545523	2	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	6	797	45836	36611	FALSE	0	CTCGGGCTGGGCGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVALENPEGGSEEAATVAEVSPGGRRMLPALAGSQVKRFSASKRKQHFINQAVRNSDLVPKAKGRKSLQRLENTQYLLTLLESNGGTPGLEDGDLAPPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45841	35679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38044_38119_38206_38582_38657_38850_38975_39409_39535_40050_40188_45753
744843	contig_5485_pilon	-	2053	4	Intergenic	novelGene_37700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	550.638417354498	1	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	253	1248	87802	85491	FALSE	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88054	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87013_87794
744844	contig_14661_pilon	-	2978	3	Intergenic	novelGene_47446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	80.5	44	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCGAGTGCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70894	65823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_66621_67393_69466_70785
744845	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
744849	contig_6710_pilon	+	547	2	Intergenic	novelGene_96700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653367	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
744852	contig_6929_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_139393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATATTCCGTGTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104787	105954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_104800_106000
744858	contig_6595_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_122553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGAAGTTTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700578	700978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_700600_701000
744859	contig_17470_pilon	+	1958	14	Intergenic	novelGene_110534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCTGCGCTACTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269617	302626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_270141_270229_270317_270857_270941_271026_271219_271331_271417_271528_271606_272827_272958_273481_273609_273860_273952_274030_274178_275807_275961_277164_277220_302353_302502_302566
744861	contig_20356_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_159542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108896	110264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_108900_110300
744862	contig_13244_pilon	-	775	7	Intergenic	novelGene_86970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2189.11775735239	958	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCTAGATTGTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299440	296053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254_297392_297999_298222_298562_298678_299204_299281_299397
744866	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744868	SIRV6	+	485	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037
744871	contig_20819_pilon	+	1266	4	Intergenic	novelGene_55655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	779	junction_1	158.764675612122	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41166	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_41210_41309_41400_41530_41569_42519
744872	contig_20600_pilon	+	2171	6	Intergenic	novelGene_137112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.1265395851856	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	304	804	112379	117548	FALSE	10	CCCTTGGCCTAATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMSTALCSRGRVIGLKEEPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111255	118915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111459_112278_112446_114085_114161_114959_115049_116223_116332_117386
744873	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
744878	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
744879	contig_18189_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_170755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTATGGTGAAGAGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42581	41308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_41300_42600
744882	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
744888	contig_8435_pilon	+	2218	4	Intergenic	novelGene_72019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	59.4025813131607	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	464	2152	94334	97944	FALSE	10	CATGCTGTGAGCTGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	93870	98010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_95334_96398_96685_97030_97164_97674
744891	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744894	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744895	contig_9414_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_131081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389819	392105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_389800_392100
744896	SIRV5	+	378	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-59	886	55	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8256	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
744905	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_94286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653831	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
744912	SIRV2	-	232	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	684	32	684	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4048	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
744915	contig_817_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_132455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562858	560961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_561000_562900
744916	contig_8045_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_35470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAAATATCTGAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576138	575342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_575300_576100
744917	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744922	contig_14326_pilon	+	1795	8	Intergenic	novelGene_120644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.7551601284107	53	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	174	629	35413	45955	TRUE	25	AATGGTTTTATATTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKGPSASTSPENSSAGGPSGSSNGAGESAGQDSTFECNICLDTAKDAVISLCGHLFWSPACSGWRLDLTDRCVLFAKPASAEIRSSRSTAGAALGSRTPERRPLPVLRDRGQSQRTEGDFKDSDLEMVASRCLLELGHFPLGYLPQHLT	17886	50716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_47357_47452_48304_48791_50151
744926	SIRV4	-	316	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1207	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
744927	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	91	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744930	contig_7408_pilon	-	1277	5	Intergenic	novelGene_168752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	155.536169426921	49	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	53	322	48211	47334	TRUE	75	AAAACAAAAAACAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSVLPWRRLRAPPQRRMLALPTGRRRRRWLRERRRGRPGVLCGGKLQGPTCGPASPSRAGERTSGATSLFPETSNACSEEPHRELSSVRAPGKPFRPCWSYSARS	48263	36223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_36938_38375_38596_47312_47360_47877_48040_48129
744932	contig_14353_pilon	-	1616	3	Intergenic	novelGene_82153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_2	103	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	480	494	414144	414130	FALSE	65	GAAAAGAATAAATAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPAFPPRVNEKEIVRSRTIGELLAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGMDSL	420303	413007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_414413_415277_415447_420261
744937	contig_5236_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_100903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGGATTAAGTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83138	81890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_81900_83100
744938	contig_15518_pilon	+	1151	3	Intergenic	novelGene_127586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	249.5	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	585	806	15096	24805	FALSE	10	CGTTGGACTGATTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGLCRLSAAQFLLTWKTHPKCYCLPQPARSGLCNLQGAS	11046	25150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_24689
744939	contig_16121_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_6877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAACCCATCTCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51053	53039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_51100_53000
744941	contig_12786_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_103376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTTTGAATGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529639	531094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_529600_531100
744947	contig_11328_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_88370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTGAGGAATTGCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59861	60392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_59900_60400
744948	contig_14289_pilon	-	1123	6	Intergenic	novelGene_110560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.723455869275	80	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	590	1012	58752	51527	FALSE	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66615	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58777_60982_61293_64645_64754_66468
744955	contig_11370_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_98745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTTTTTTTCTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147042	148510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_147000_148500
744957	contig_14519_pilon	-	2956	1	Intergenic	novelGene_66839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCATGTGACAGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390461	387505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_387500_390500
744958	contig_8330_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_72005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGGAGAAGGATGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2195342	2195040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2195000_2195300
744959	contig_7202_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_17515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
744966	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
744968	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	469	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
744969	contig_7398_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_166148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGAGGGAACACAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29394	30199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_29400_30200
744970	contig_10581_pilon	-	1914	10	Intergenic	novelGene_41426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	31.9401446381536	212	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	164	1204	668655	653221	FALSE	30	TTTCTGATTGCATAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNSRPGKNGNPVAGNFRLEEVSLPDNIAEGQVQVRTLYLSVDPYMRCRMNEDTGSDYLTPWQLSQVVDGGGVGIIEESKHTNLTKGDFVTSFCWPWQTKVILDGNVLEKVDPQLVDGHLSYFLGAIGMPGLTSLFGIQEKGHVTPGANQTMVVSGAAGACGSLAGQIGHLLGCSRVVGICGTNEKCLLLTSELGFDAAINYKKGNVAEQLRELCPAGVDVYFDNVGGDITDAVISQMNQNSHIILCGQISQYNKDVPYPPPLPPAVEAIRKERNITRERFLVLNYKDRFEPGILQLGQWFKEGKLKIKETVINGLENMGAAFQSLMTGGNIGKQIVCISEEFTL	678993	652510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_653298_654394_654435_655397_655486_656603_656726_658051_658262_659060_659232_661044_661237_664951_665071_668633_668714_678888
744974	contig_11281_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_125436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGCTTGGTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797926	796807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_796800_797900
744975	contig_5279_pilon	-	1754	2	Intergenic	novelGene_105543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAGAACATTCTTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52325	31849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_33529_52250
744979	contig_9940_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_125357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAGGTGAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257477	258144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_257500_258100
744982	contig_7963_pilon	+	1258	7	Intergenic	novelGene_58599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	95.430603057929	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	82	612	293211	297076	TRUE	40	CTCATAAAAACCTATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCRYNYKLGASFTVGRKVQPEVMVYPERTPSLQHPNLLLCSVTDFYPGNIKVRWFRNGQEEMSTPALWTTPAC	293129	298879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296368_296815_296947_297037_297098_297827_297939_298192_298225_298397
744983	contig_7996_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_165161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1262	1627	330117	330482	NA	65	TTAACCATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFFSRDWSLLITCPKYVRQSLAILASKEHSGCTTSKTDLFLLLAVHGIFSVLCQHHDSKSSILQSSYSLPSFHTDMRRLTIPCMAWVRCTLDFKVTSLLFNTLKRSFAADLPSAVHHLIS	328855	331044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_328900_331000
744984	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
744985	contig_6375_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_73021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415781	413329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_413300_415800
744989	contig_610_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_76807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCGTCAAACCGGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325856	318433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_319951_324626
744991	contig_15120_pilon	+	2426	5	Intergenic	novelGene_108012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	10.3772587902586	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	230	835	199912	206620	FALSE	20	AAAGCCACTTTGTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTLPELIMQFDLTRITCHSALLDLEKLPEFNRLHLRRLMSSEAQRHQLVGKLRALVEEVFGSQLQDRAVLDPAYMERIILLRQGHICRLQDLVSPAYSYLWTRPAVSRAQLGAISEKVDEIAKRVLGLLERPGVSLTQDVLNRELKKLSEGLEDTKHSNVMRLLRVALSGQPQGPPVAEMMVSLGTKEVRERIQKVLSS	199682	208211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_200013_202528_202683_202798_202930_205925_206062_206536
744994	contig_12740_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_159214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTATAGAGACGAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93190	92929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_92900_93200
744999	contig_13542_pilon	+	2574	19	Intergenic	novelGene_131561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	138.166164052162	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2445	103	2547	654493	753868	FALSE	15	GAAGGTGTTGACTGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENKNVTALEACALQYYFLILWRILGILPPSKAYMNQLATNSPEMSECDILHTLRWSSRLRISSYVNWIKDHLIKQGMKAEHAGSLIELASTKCSSVKYDVEIVEEYFARQISSFCGIDCTTILQLHEIPSLQSIYTLDAAVSKVQVSLDEHFSKMAAETDPHKSSEITKNLLPATLQLIDTYASFTRAYLLQNFNEEGTSEKPSKEKLHGFAAVLAIGSSKCKANTLGTTLVQNLPSSVQAVCESWNNINTNEFPNIGSWRNAFANDTIPSESYISAVQAAHLGTLCGQSLPLAASLKHTLLSLVRLTGDLIVWSDEMNPPQVIWTLLPLLLESSTESVAEISSNSLERILGPAESDEFLARVYEKLITGCYNILANHADPNSGLDESILEECLQYLEKQLESSQARKAMEEFFSESGELVQIMMATANENLSAKFCNRVLKFFTKLFQLTEKSPNPSLLHLCGSLAQLACVEPVRLQAWLTRMTTSPPKDSDQLDMIQENRQLLQLLTTYIVRENSQVGEGVCAVLLGTLIPMATEMLANGDGTGFPELMVVMATLASAGQGAGHLQLHNAAVDWLSRCKKYLSQKNVVEKLNANVMHGKHVIILECTCHIMSYLADVTNALSQSNGQGPSHLSVDGEERAIEVDSDWVEELAVEEEDSQAEDSDEDSLCNKLCTFTITQKEFMNQHWYHCHTCKMVDGVGVCTVCAKVCHKDHEISYAKYGSFFCDCGAKEDGSCLALVKRTPSSGMSSTMKESAFQSEPRVSESLVRHASTSPADKAKVTISDGKVADEEKPKKSSLCRTVEGCREELQNQANFSFAPLVLDMLNFLMDAIQANLILECAHLEK	653636	753895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_653664_654417_654601_654747_654871_654959_655190_656657_656780_657756_657855_659035_659194_660153_660364_661399_661502_662289_662391_662622_662822_663180_663370_663792_663857_665016_665209_665809_665881_665967_666116_666565_666794_667491_667554_753828
745001	contig_13571_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_128113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGACATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119703	117517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_117500_119700
745002	contig_9345_pilon	+	2796	1	Intergenic	novelGene_24570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885674	888470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_885700_888500
745004	contig_5502_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_154998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATTAAAAATATTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431786	433678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_431800_433700
745006	contig_16122_pilon	-	475	4	Intergenic	novelGene_134561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	471	junction_3	156.27113190435	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	19	474	296490	295225	FALSE	10	GCTGCCCCAGCCATGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLHGTAPEGLPTPPESSGCKTLTSSQACVVCEEGFSLHQKSCVQHCPPGFAPQVLNTHYSTDNDVETIRASVCAPCHASCATCQGPAFTDCL	296508	295223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_295413_295708_295820_295932_296058_296458
745007	contig_16122_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_134560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	543	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	319	357	293999	293961	NA	10	CAGGCCTGGCCTCCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIIGRDQCKEVLPGRVWAPVPTLHLVPHTAGCQAEQAGPAKADAPVEPRAGVLTTLPSPTLLSCQGPSPCFLSPGLPGLLALTVLEPLGGWWGGTVAQPASPTSHPMLLSPVGISGAV	294317	293246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_293200_294300
745008	contig_9345_pilon	-	2269	23	Intergenic	novelGene_24552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	214.814969390823	1	113	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	843	1550	726614	725216	TRUE	50	ATAAAAAGCAGCTAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCGGDSGTDYNGATSARSLRA	730162	723471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723596_723989_724116_724199_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725376_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726724_727387_727480_727600_727673_728013_728071_728214_728269_728799_728862_729088_729165_729316_729427_729770_729857_730038
745009	contig_16103_pilon	+	2570	17	Intergenic	novelGene_118916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.8998449915	1	107	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	242	2218	773294	799889	FALSE	0	CTCTGGCGTTCTTTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDRFARLQRRCQQSHQRTAGRKPRHAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	771027	800241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_771148_772608_772698_773261_773373_788436_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
745010	contig_14289_pilon	+	2218	6	Intergenic	novelGene_110549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGACCGGAAGCGGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50024	66624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_51711_51943_52052_58621_58691_61206_61292_64644_64751_66460
745011	SIRV5	-	481	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTACAGTAAGGACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10861
745021	contig_9931_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_134826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTGCTAACTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311815	312804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_311800_312800
745026	contig_7457_pilon	-	1385	8	Intergenic	novelGene_31428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	179.390123269177	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	39	467	473193	470447	TRUE	50	TAACAATAAATATTGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKELRADCEGASGQPQ	473231	468266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468518_468873_469384_470289_470492_470904_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
745027	contig_8617_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_73472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCTACCAACCCCATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62973	62728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
745031	contig_12019_pilon	+	2046	4	Intergenic	novelGene_87729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	6.79869268479038	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	100	519	617890	619124	TRUE	5	CCTGAGTTTCTCCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEATSAAEESPPPKRPRVTYLSEVKEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQVTLITQDGAQQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGGTTLTIPSHDNDLVPSGTHTVAMVSADGTQTQPV	617790	621198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_617972_618078_618243_618950_619763_620309
745032	contig_14727_pilon	+	764	5	Intergenic	novelGene_56622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	298.665678476788	7497	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	131	640	47396	55271	FALSE	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	46128	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51531_54130_54263_55134
745034	SIRV4	-	163	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1355	3	1355	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3803	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
745035	contig_6375_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_73044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	583	915	500260	500592	FALSE	55	ATTTTTAATACCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498182	501186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498671_500165
745036	contig_7057_pilon	-	2818	5	Intergenic	novelGene_123433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	31.344856037315	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	170	493	1643958	1637503	FALSE	25	CAGGAAAGTGTATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSVYPCTGEHSGGQENGRGAPESQERVAFGDLAVDFTQEEWWLLSPAQRTLYREVMLETCNHLVSLAGIPFSKPKLITQLEHREEPRRGGEKTSAGPLSRRIKTRNSTLSLLRSGILQSASPQPTWLAQSSTSDILKFTSRKSFPSGETKSRRSETAAGTTF	1655037	1635177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1637693_1643372_1643473_1643924_1644045_1654550_1654609_1655012
745041	contig_7207_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_72058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTCCTCAGATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633674	632240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_632200_633700
745042	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
745046	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
745050	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	6	410	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745053	contig_401_pilon	-	1882	6	Intergenic	novelGene_42922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1952516	1944926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1945310_1945464_1945593_1946389_1947080_1948355_1948492_1948787_1948908_1952091
745065	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	341	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745068	SIRV2	-	232	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	689	27	689	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4043	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
745069	contig_11417_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_103258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACACAGTAGAACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261205	260155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_260200_261200
745071	contig_11986_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_69114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTACTTACATCGTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99664	98660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_98700_99700
745075	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745080	contig_17440_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_7608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTCCGCTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
745082	contig_20004_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_167528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAATTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45639	45388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_45400_45600
745084	contig_1443_pilon	+	1678	14	Intergenic	novelGene_28225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	68.0661877672003	101	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	980	1540	539956	541708	FALSE	30	GAAATGAATTTTGTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSCNSGLLLIFPFCEQILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535985	541846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_539911_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
745085	contig_14322_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_116305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671655	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
745086	contig_3077_pilon	+	1297	8	Intergenic	novelGene_26906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCAGCCCGCCAGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668198	1710486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1668684_1668789_1668903_1670201_1670286_1671176_1671270_1680972_1681174_1681898_1681989_1682202_1682263_1710315
745087	contig_12786_pilon	-	1046	7	Intergenic	novelGene_103393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	569.839158593604	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	340	984	602829	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629446	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602862_628773_628938_629303
745094	contig_10861_pilon	-	1788	10	Intergenic	novelGene_39334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	271.128915626661	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	94	966	1492200	1490156	FALSE	10	TCAGTTTGGGCTTGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAVGLCFSIATTDARTAASSPTWLFARQHLQHRLSPLGGGPRGCSAPSQPLCCGLLIPPEPVPFLLSLPRPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGSSLQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493792	1489333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490207_1490294_1490469_1490572_1490688_1490791_1490826_1490957_1491029_1491107_1491360_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
745095	contig_1154_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_87060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153582	154893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_153600_154900
745098	contig_4857_pilon	+	1413	4	Intergenic	novelGene_48826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	133	junction_3	56.1090208631573	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	72	410	1331453	1410064	FALSE	20	TGTCCTACTTTTTATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDWKQLLPLSCAKISAKGSYPGQKGVF	1331381	1411067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1409988
745104	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_94393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	123	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
745108	SIRV6	+	542	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745112	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
745113	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
745114	contig_8697_pilon	-	363	4	Intergenic	novelGene_83204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2801	junction_3	2649.05278668936	99	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCTGGTGTTTTAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19207	16459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436_18573_19181
745116	contig_11961_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_153688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCACCAAATTTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91655	92456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_+_91700_92500
745119	SIRV6	-	260	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1002	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2822	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779
745121	SIRV6	+	364	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3140_10705_10819_11031_11109_11205
745123	contig_5375_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_169224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGCTATTATATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110887	108119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_108100_110900
745124	contig_6847_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_143857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.252920108595	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	325	741	77788	111729	TRUE	70	AAAAAAAAAAATCCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPLLFVGFSSYFRTMKTKKEL	74054	112352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82113_111667_112255_112299
745129	contig_5063_pilon	-	881	5	Intergenic	novelGene_109994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGGTTAGACAAAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57617	9352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_9527_12182_12313_19752_19855_35529_35653_57265
745132	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
745133	SIRV6	+	337	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	162	70	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847
745137	contig_6710_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_98319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCCATAGTCGCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
745139	contig_5145_pilon	-	779	2	Intergenic	novelGene_131361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAATGACAGAGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270186	260782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_261334_269958
745140	contig_17769_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_124273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTGCTCATGCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112335	112731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_112300_112700
745141	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_89568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653769	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745142	contig_627_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_170763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTTGTTCAAACAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18265	18935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_627_pilon_+_18300_18900
745145	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745147	contig_10861_pilon	+	2569	8	Intergenic	novelGene_39311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	36.6466859598073	12	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	306	965	1472615	1481530	FALSE	20	ACCATCCCAGTATTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADHAEVLKGIQTFPGINYPVLIPNLKGFQTAVAAGAKEVSVFGAASELFTRKNINCSIDESLQRFDEVLKAAQALSIPVRGYVSCVLGCPYEGKISLAKVAEVAKRMYSMGCYEISLGDTIGVGTPGVMKDMLSAVMHEVPVAALAVHCHDTYGQALANILMALQMGVSVVDSSVAGLGGCPYAKGASGNLATEDLVYMLTGLGIHTVSQPAPWWRQP	1462214	1483134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1462294_1468878_1468963_1471804_1471914_1472581_1472711_1473380_1473530_1478105_1478170_1479888_1480078_1481368
745155	contig_5485_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_37768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACAGTTCAGTAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586045	584896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_584900_586000
745156	SIRV6	-	222	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCGTTCATCAATTATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
745158	contig_10197_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_115249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTATTCTAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003379	1004823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1003400_1004800
745162	contig_14807_pilon	+	751	6	Intergenic	novelGene_124701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	157	474	37320	38373	TRUE	55	TGCAACGAAATAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFSATMSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLSAPAQDNILLMRMTWKGWSRTRM	37163	39796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37648_38297_38438_38632_38744_38830_38887_39750
745163	contig_6740_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_142703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCACTTCTGTTTTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652527	650393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_650400_652500
745170	contig_5302_pilon	+	2089	4	Intergenic	novelGene_81496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	473.765999436665	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	38	829	342315	355700	TRUE	20	TGATTTTATTAAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342277	357057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568_355829_355925
745172	contig_9434_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_150494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTGCATCCTGAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158240	160973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_158200_161000
745175	contig_2799_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_85479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTCATTAAAAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479336	480288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_479300_480300
745180	contig_16098_pilon	+	1067	7	Intergenic	novelGene_46010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	70	399	348360	350024	TRUE	30	CGGCTCATCCTAGAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGREVDGLGPSEGPGLLYLVWTVSSNLSKRFCSSCTVAWSFLISSSSRDTASWGNPTMLVSGSKKGSRTPLLVSSSCRDSGSSRCFCVPQRHLPLAHAAEACGQDLSL	348290	352342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348531_349620_349712_349956_350075_350235_350421_350511_350637_350764_350892_352161
745181	contig_9871_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_75655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAAGAAAGCCCGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399547	397908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_397900_399500
745184	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745185	contig_8801_pilon	-	2129	8	Intergenic	novelGene_66248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	41.6648434975276	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	144	1658	199038	181632	TRUE	5	CCTGTGCTCCTCAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEVYNLTQEFFRHGKPVNAESQNSVGVFTREEVRNRIRDDPDDPEATKRLKLAMIQQYLKVESCESSSHSIDEVSLSAFGEWTEIPGAHHIIPSGFMRVVELLAEGIPAHVIQLGKPVRCVHWDQASARPRGPEIEPRREGDHNHDPGEGDQGGEEPREDRRGEDEQWPVLVECEDCEVVPADHVIVTVSLGVLKREYTSFFRPGLPAEKVAAIHRLGIGTTDKIFLEFEEPFWGPECNSLQFVWEDEAESRTLTYPPELWYRKICGFDVLYPPERYGHVLSGWICGEEALVMEKCDDEAVAEICTEMLRQFTGGLEWGRRGEAGQAPAVHGELQGGAWQLLKAAARSPFIFQVPRTVPGP	228100	180728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_181615_181706_183962_184035_187078_187839_188002_188177_194487_194715_198830_199065_227983
745187	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	26	3	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745192	contig_15888_pilon	-	1261	8	Intergenic	novelGene_84438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1605.63764433261	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	62	412	259726	253457	TRUE	10	CACATTTCGGCTCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKRSSC	259787	251600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253473_254037_254066_254198_254282_254527_254685_259659
745196	contig_14142_pilon	-	1676	16	Intergenic	novelGene_120611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	134.319254845395	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	194	1204	598441	589168	TRUE	5	TGCTTTGCTCTTTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSK	598634	584557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585770_589153_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
745197	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
745199	contig_6677_pilon	-	3999	1	Intergenic	novelGene_114164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATACTCCAGCATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403564	399565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_399600_403600
745200	contig_709_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_57657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACCTCTGATTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3762227	3770243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3762542_3764734_3764952_3765205_3765385_3767118_3767287_3769814
745201	contig_15744_pilon	+	677	5	Intergenic	novelGene_83606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	149	463	152344	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149593	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
745202	SIRV6	+	557	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11141
745203	contig_8762_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_145294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAGAATAAACTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138873	137621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_137600_138900
745206	contig_5765_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_141416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGCAGCCATAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882422	880769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_880800_882400
745207	contig_4364_pilon	+	1908	9	Intergenic	novelGene_204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	134.229688873215	387	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	569	1126	1284533	1286814	FALSE	0	TGTCGTTGTCCCTGCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKYKPESDELTADKIKEFCDQFLEGKIKPHLMSQELPEDWDKQPVKVLVGKNFEEVAFDEKKNVFVEFYAPWCGHCKQLAPIWDKLGETYKDHENIVIAKMDSTANEVEAVKVHSFPTLKFFPASPDKTVIDYNGERTLEGFKKFLESGGQDGAGDEDDLEDLEEAEEPDMEEDDDQKAVKDEL	1279850	1287596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1279946_1280080_1280219_1283814_1283910_1284006_1284133_1284418_1284620_1284965_1285087_1285190_1285373_1285758_1285846_1286733
745208	contig_19687_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_170764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	31	501	50528	50998	NA	25	CATTAATGTACAGGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKQLEKKKKMKSLLFTFVGVVHLLCLSSGKAIYGNGISQRTFQEIKEEIATYGDVAKAIINHAIYGKAQNRSYERLALLVYAVGPRLSGSKSLEKAIQIMYQNLREDGLENVHLEPVKIPHWERGEESAVMLEPRIHKMAIFGLGSSIGTPPEGLSFQVNFLPTL	50497	52448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19687_pilon_+_50500_52400
745212	contig_10765_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_122921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATGAGTATGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190253	191951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_190300_192000
745213	contig_10019_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_86694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCCCAGCAATTACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353344	352724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_352700_353300
745214	contig_15025_pilon	+	2014	6	Intergenic	novelGene_155975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	7.2773621594641	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	109	759	71011	98127	FALSE	20	CATTTTCTTATGGCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDAPVAQISELYLDVRPPGGSRCRSLPPARGYEVHGMEKIPEEGPALIIFYHGAIPIDFYYFMAKIFIHKGRTCRVVADHFVFKIPGFSLLLDVFCALHGPREKCVEILRSGHLLAISPGGVREALISDETYSIIWGNRKGFAQVAIDAKVPIIPMFTQNIREGFRSLGGTRLFRWLYEKFRYPFCPMYGGFPVKLRTYLGDPIPYDPKMTAEELAEKTKNAVQALIDKHQRIPGNIMSALLERFHKKQKIN	48311	99382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_48403_70993_71162_73538_73733_89957_90019_92546_92687_98022
745215	contig_6375_pilon	-	2289	4	Intergenic	novelGene_73040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.349430713953	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	20	430	497798	490215	TRUE	70	AAAAAAAGGAAAGAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEGKLRLSVLTRSSSFLSLFPGRWACLTRQSQG	497817	487056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_487690_488988_490422_496143_496210_497660
745216	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745217	contig_817_pilon	-	1690	2	Intergenic	novelGene_132453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAACCAAAAAAATTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567742	556857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_556940_566134
745219	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
745220	contig_5549_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_81651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCTGGAAAAGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444059	441972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442000_444100
745224	SIRV4	+	306	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1465	632	1010	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2465	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
745225	contig_4742_pilon	-	2393	3	Intergenic	novelGene_130968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGATACTGAATAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131008	125126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_127138_130353_130719_130991
745227	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_89192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
745229	contig_7151_pilon	-	805	3	Intergenic	novelGene_40640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.5	11	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6147	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2030_5156_5287_5683
745232	contig_7051_pilon	+	1539	12	Intergenic	novelGene_64276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_11	175.716620097566	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	279	1127	184159	205558	FALSE	15	TGGTAGTCTTCTGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNRNSMSDSPLVAGPEAAR	183880	205970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_205506
745233	contig_10434_pilon	+	1792	17	Intergenic	novelGene_82044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTCCTTTCACTACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132786	152595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_132935_133783_134011_134095_134168_134267_134370_134777_134858_135203_135321_136830_136939_137442_137570_142483_142598_143308_143417_143507_143597_144855_144959_145446_145582_148174_148269_149454_149511_150354_150441_152569
745236	contig_6677_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_114171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	370	1113	145	1257	427708	426596	NA	45	GAAAAATTAACTCAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVPGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQANSSHQVANFNIPAYDQGLLLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATSTFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVDSNGSVQIIEEHPPLMLQNRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKYIRPILQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRQVANIEKRVLD	427852	426438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_426400_427900
745240	contig_17989_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_150822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGAGACTCTATAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215833	214922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_214900_215800
745241	contig_13680_pilon	-	1589	12	Intergenic	novelGene_149592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	177.52760232363	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	37	1116	396643	375317	TRUE	35	TTTAGAGTCCAGACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGGGWRKRRRRMEEGGGGARSLVPGGPVFLVLCGLLEASGGGRALPPLSDDIPFRVNWPGTEFSLPTTGVLYKEDNYVIMTTAHKEKYKCILPLVTGGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKYIRQYHEEKETGQKVNIHEYYLGNMLAKNLLSDKDQEAEEREKSKEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILTPLLCNHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKPIAVGSQPTLTVGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFHGDGVTLLWEWRYL	396679	372804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_373163_374990_375067_375277_375356_380902_381065_385130_385261_385352_385577_388075_388111_388790_388855_388993_389072_389620_389702_390827_390933_396481
745242	SIRV6	+	540	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1593_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745243	contig_9389_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_84133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTCATTGCATGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626953	1625745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1625700_1627000
745246	contig_4125_pilon	-	2178	2	Intergenic	novelGene_25052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290528	288232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_290387_290504
745249	contig_7894_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_170772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78853	81348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_78900_81300
745251	contig_11285_pilon	+	1061	6	Intergenic	novelGene_5577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	102.24402183013	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	38	751	766060	769878	FALSE	20	CACTTCAACTGTCTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763520	770188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766397_769200_769320_769421_769653_769740
745252	contig_3068_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_137654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTGATGGGGTGGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410498	409509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_409500_410500
745257	contig_16119_pilon	-	1435	6	Intergenic	novelGene_164268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	67.6638751476739	712	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	371	925	85327	68292	FALSE	10	TCTTTGTCTGTTTTGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERKVKRRSPKSFSAHSTQVVNTKKSAIPVSKSTGFSNPATQSTSQRPKLKRVTKEKTRPQGGEGKGAQSTPIQHSFLTDVSDVQEMERGLLSLLNDFHSGKLQAFGNECSIEQMEHVREMQEKLARLNLELYGELEELPEDKRKTASDANLDRLLSDLEELNSSIQKLHLADAQDVPNASTS	87344	67781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_68347_72574_72598_73733_73889_78145_78310_85169_85370_87016
745258	contig_9051_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_170819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068187	1069992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1068200_1070000
745259	contig_1213_pilon	-	1935	14	Intergenic	novelGene_76476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	207.660453397669	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	222	1460	85486	71277	FALSE	30	AGACAAATGTTTTAGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGRRWRSPAFYPHQLSYLRTSLRLKKRQDPRDALAIQVDAEGKIKYDAIARQGQSKDKVIYSKYTDLVPKEVMNADDPDLQRPDEEAIKEITEKTRVALEKSVSQKVAAAMPVRAADKLAPAQYIRYTPSQQGVAFNSGAKQRVIRMVEMQKDPMEPPRFKINKKIPRGPPSPPAPVMHSPSRKMTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQRNENRDISEVIALGVPNPRTSNELQYDQRLFNQSKGMDSGFAGGEDEIYNVYDQAWRGGKDMAQSIYRPSKNLDKDMYGDDLEARIKTNRFVPDKEFSGSDRRQRGREGPVQFEEDPFGLDKFLEEAKQHGGSKRPSDSSRPKEHEHEGKKRRKE	101791	70801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_71476_71553_71718_73622_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84386_85233_85341_85432_85529_92927_93006_96704_96776_101761
745261	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745262	contig_7357_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_36772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	105	434	102838	102509	NA	75	AAGAAAAAAAAACCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVVFPVRTTNTHSLRANKTKPVSAELIPTHDGPMCLGVELCSIGYSMADFSKGQIKTKNKEDTYSPPFSFSIHFKKMCKVFLCLFEKTPNYCAEGEGPLWKSIWHFLKKLDIEVPYDPLSEILIQQLWDGPGLASKRHVQPK	102942	101954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_102000_102900
745263	contig_12427_pilon	-	1290	5	Intergenic	novelGene_40533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1196.91465339012	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATCATCTGATTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578120	504674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505585_510584_510617_520312_520440_522284_522346_577960
745265	SIRV4	-	311	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1209	1	1209	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
745268	contig_15118_pilon	+	1058	4	Intergenic	novelGene_74634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	85.7956227839678	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	28	696	438502	452222	FALSE	65	AAAAAGGTAAGAAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPGSDSRKMAELRALVGVKRVIDFAVKIRVKPDKTGVVTDGVKHSMNPFCEIAVEEAVRLKEKKLLKEVIAVSCGPAQCQETIRTALAMGADRGIHVEVPAAEADRLGPLQVARILAKLAEKEKVNLLLLGKQAIDDDCNQTGQMTAGFLDWPQVRLEWGAHKSSFRQKIASFPRAPAKLPGLVLHWCSLSHMSTPEPITVVGGRMFSLGPVLGKKVARPIPAFLEGDRQ	438474	452584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_438559_448781_448941_449190_449350_451928
745271	contig_5331_pilon	-	1633	6	Intergenic	novelGene_112782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	351.074692907364	4	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	440	1033	249471	248559	FALSE	45	TGTGCAATTAAAAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSDSVDSSDTESDILLGLLDNMDPVMFFSCLSPESTSLEELPEGHPEGPSSLPASPSPSLGTSPAKLEAINELIRFDHVYTKPLVLEIPSETESQANVVVKIEEAPLSPSEKDHPEFTISVKEELVEDDFIPELGISNLFSSSHCLKPSSCLVDAYSDCGYEGSPSPFSDMSSPLGVDHSWEDTFASELFPQLISV	253329	247958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253099_253145_253271
745272	contig_1637_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_142388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACCCACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598645	600512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_598600_600500
745273	contig_12019_pilon	+	2354	2	Intergenic	novelGene_87731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	165	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1234	1572	619529	620414	FALSE	10	CACCTGAGTTTCTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIPFWVVPNHLVRRHFYFELEEGESCRWVGKPHSVFQVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	618295	621196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_619763_620309
745274	contig_4429_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_50775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	22.1129910912115	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	117	1001	130245	33847	FALSE	15	TATTGTTTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPIQPAGCRLAQVWLFFTASEHSLPPPATQSDSSTLSLMFRAPRLSYIIDSLVSLGLRCKRDLRKRLFCYLGPASTRVKNCTAIWEAFSVVLDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPRDKSLFWENNHLLVTSYSENTRRITPLCDVLYGRVGDFLSWCRQKNASGLDYQSCPTSDDCENNPVDSFWKRASIQYSMDSSGVIFVMLNGSDPNGAYPVRGFFADYEIPYFQKDKITRFEIWVMHEIGGPNVESCGEGSVKILEERLKEMGFQYSCINDYLPVKLLQCVDHSTHPDCALNSAAASTQREIPSLYEELSASLIIPFLVTLASDAQI	130361	33532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_33953_66306_66367_70911_70999_73811_73905_74650_74728_76955_77039_83513_83650_86560_86688_130129
745275	contig_5954_pilon	-	2063	14	Intergenic	novelGene_28716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	201.313585640199	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	432	1676	970999	962496	FALSE	15	GCCAGGTGGGCGTGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975688	962108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971022_971212_971325_972040_972251_975601
745285	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8141	-1	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
745287	contig_11898_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_144295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGTATGTAAGAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249290	246721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_246700_249300
745288	contig_15042_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_115430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	286.87486383439	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	138	623	35339	10152	FALSE	20	TGGTTATATTGGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKR	43086	10151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_31311_31450_35276_35376_42985
745289	contig_1082_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_170425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACCTTCAATAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35339	37608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_35300_37600
745290	contig_13481_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_119544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCAGAATGCTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497000	1495057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1495100_1497000
745296	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	518	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745297	contig_10399_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_114489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAACAAGGCCTAACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335713	335386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_335400_335700
745298	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745301	contig_6102_pilon	-	1529	15	Intergenic	novelGene_32376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	172.245553243748	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1383	145	1527	1743430	1727329	FALSE	50	AAAGAAGTGATCAAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSRSTGSGGKTSSGALPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEAAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPVASTLPELVQRLITIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIASSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDDRMKKLGKCTWLAGAPKAQHSALPSQGQIQLQVWLLRGQFPPLVFGRTARARPWRQRDSRLYKRRS	1743574	1727326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1727504_1728864_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732541_1732738_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743394
745304	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745309	contig_6287_pilon	-	2724	7	Intergenic	novelGene_160433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1321	1638	193722	193405	TRUE	35	CTGGGAAGAGCAGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLLFRQLFHHCRREVLGRRMSQIPSIHLVKSVSFPMWQKVTANVCTLDSSLFAWNGCRVETSSYSTEKLSGVQPSHLETTECEEMHLHFRQTATREHRLSQGG	195042	180392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_-_180598_181017_181168_181962_182066_183396_183526_184275_184341_184615_184680_193034
745310	contig_5479_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_133568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACCCATTGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102398	103743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_102400_103700
745315	contig_6208_pilon	-	2423	1	Intergenic	novelGene_52990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATAGCAGCTAACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392516	390093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_390100_392500
745316	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	186	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
745318	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
745321	contig_5210_pilon	-	918	5	Intergenic	novelGene_65431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	144	junction_4	30.1527361942494	958	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	89	622	475032	470588	FALSE	15	CTGATATCTTTGTATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKAKGKTRRQKFGYNVNRKRLNRNARRKAAPRIECSHIRHAWDHAKSVRQNLAEMGLAMDPNKAVPLRKRKVHAMEVDVETTKELVRKPYVLNDLEAEASLPEKKGNTLSRDLIDYVCYMVENHGEDYKAMARDEKNYYQDTPKQIRNKINVYKRFYPAEWQAFIDSLQKNKMEVQ	475120	470291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_470732_471333_471441_472753_472821_474725_474835_474925
745322	contig_3571_pilon	-	2079	10	Intergenic	novelGene_88708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.78855526358	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	690	1556	41961	30244	FALSE	65	AAAAAGATACTTGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGWRGLHPPPHHLRQTVGCGGVGIWYKRRRFLPGAVPLRRGSGPEDGVN	100114	29720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30392_33444_33490_36653_36877_38625_38763_40254_40416_41808_42008_42749_42976_45517_45659_49302_49434_99969
745325	contig_7058_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_136020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGGGAAAGTAGGACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136929	134835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_134800_136900
745328	contig_6497_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_35648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780397	782637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_780400_782600
745329	SIRV6	+	1254	5	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1895	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	45	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7104	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7453_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
745330	contig_15744_pilon	+	588	5	Intergenic	novelGene_83574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	149562	153378	FALSE	25	ACCAGACCATTCCTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
745336	contig_14322_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_115654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGTTAGAGGTTTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476285	475929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_475900_476300
745337	contig_14322_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_115653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	955	1320	474828	474463	NA	60	AAAAAAAAAAAGACTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPKELKAGMQTGTCTPGFTAAQFAIAKRWKQAKCVSANEWYTHTKNNEVLTHATTWVNPENIRLSEICLSQKDKCCLISLLRNKPIHRNQRLLVVTRGGRKRERGRFCLGGTEFMLKVVE	475782	474420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_474400_475800
745340	contig_7362_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_147561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCAGAACTTGCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483168	482253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_482300_483200
745341	SIRV6	-	515	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
745343	SIRV6	+	505	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745346	contig_2100_pilon	+	2257	1	Intergenic	novelGene_50627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867971	870228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_868000_870200
745347	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	125	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745350	SIRV2	-	492	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4381	34	3206	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1526	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
745352	contig_6361_pilon	-	701	5	Intergenic	novelGene_23947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	991	junction_4	804.893277087093	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAAGATTCTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368223	351722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351991_354928_355044_359308_359434_360681_360814_368162
745353	SIRV6	+	189	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	513	-1	-343	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGAAGAAGGTAGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
745361	contig_6192_pilon	-	1569	6	Intergenic	novelGene_170321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	228.36076720838	488	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	11	631	117896	112307	TRUE	10	GTTGGCTTGTTCCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC	117906	111228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_112154_112293_112451_114911_115050_115166_115298_116340_116509_117856
745362	contig_4469_pilon	+	2487	1	Intergenic	novelGene_21938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGACCCAGTAGCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638030	640517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_638000_640500
745364	contig_4232_pilon	+	926	4	Intergenic	novelGene_63187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2220.22025934365	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	82	306	146362	148851	TRUE	80	AAAAAAAGACAACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRIPAAAAAALVFSASFCHIPFASANMASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFDLC	146280	149675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148441_148839_148884_149087
745366	SIRV4	-	254	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1264	3	1264	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3894	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
745369	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745371	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	51	515	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
745375	SIRV6	-	570	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
745376	contig_7380_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_157526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260448	257875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_257900_260400
745380	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_96045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745384	contig_6102_pilon	+	365	2	Intergenic	novelGene_31792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360097	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360106_360864
745386	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	91	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745391	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
745392	contig_709_pilon	+	853	3	Intergenic	novelGene_57638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	632	664	2968165	2968197	FALSE	20	AGGAAGCTGAGGTGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLKVGGLNPHCSASEERPGDLLHKDDSQENPAEKLCSLAPGVAVSWNRLDSTGFGFSDLEAKVGNLTPVGKLQEARGTSVTGARTWGEGDGRLGGDEDETVGQAGPLGYSEDAGSEGPGWRQGDPLADCYRIWAREAERGLNWTVAVGRGKGGSPPGAAEGRQGNQPVSKGQSGLADERALCVIPATGALKPAVKSQSEHHHPQTGAIHMTDIKSFLRY	2966449	2968386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2966923_2967217_2967361_2968149
745398	contig_2069_pilon	-	762	3	Intergenic	novelGene_23491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	97	378	1509802	1508747	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRSRARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509898	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
745399	contig_7775_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_37495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242511	240247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_240200_242500
745404	contig_20550_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_142607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAATTTGAATCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3709	4528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3700_4500
745406	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8140	3	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
745408	contig_14691_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_146791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1402	1710	19751	19443	NA	30	CCGGCACAGGAGGAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMRQQAWGQGLWSVFSRGGSSGGLREGGLHCSTLSAPFCHWGRHIQLSHRAGLLHDYGLHRGTGSTEPAGTCTGLPAPMWPEALQLKISVEWEGRKERGIR	21152	19264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_19300_21200
745409	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745412	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_90365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745420	contig_9955_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_21386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	1473	2054	618741	630144	FALSE	40	GGCCGGCAGAAAAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGLDGVVEVSQGTAKLVHGHTHVVQEEEAVMPELRFGVQEVSQGTEGEVGEGGKGDDEERQGMRVSPEVHGTHKDGQPQQHHQGRQQVGPHVHRFVVLLEQSAEVEAPGLVQRPVAHIDVWLPKEGRHLGSVHREDRLWLHRWLRLLANVPQARQEMAELLSRYRGHGCGPRQGAAAGAELEKLQLPSLAHR	617268	630144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_619270_630091
745423	contig_9011_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_159339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTAGTTCTGTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675374	673157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_673200_675400
745427	contig_7530_pilon	+	723	2	Intergenic	novelGene_141828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCCCAATAGTTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128678	130516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_129363_130477
745429	contig_6710_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_89110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653635	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
745430	contig_15304_pilon	-	1068	4	Intergenic	novelGene_30614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	213.113949697235	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	121	933	66283	64554	FALSE	10	GGAGCCCTGGGCTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHWFPEQQFCDLPIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66403	64418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65509_66241
745433	contig_15120_pilon	-	3102	3	Intergenic	novelGene_107999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2489	2800	118176	117865	FALSE	35	ACATCACCAGAATTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQTDEKESPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPVAVSCRLISCSWDLSCQLICQTWDSSICTACEREPCSLTCLSWACQLLRLCDLGEASTLIHGLGTF	125326	117562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_119266_119405_119506_124027
745440	SIRV2	-	454	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	53	3225	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAAGGAGACGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
745441	contig_2364_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_170824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAAAACATAATTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22080	20906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_-_20900_22100
745447	contig_11017_pilon	-	1185	11	Intergenic	novelGene_128083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGCGAGACGGATCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295075	233728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_233921_259258_259308_268803_268854_272060_272123_274941_274998_276702_276811_277771_277821_282290_282370_285447_285550_294557_294593_294672
745449	contig_11507_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_103359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91634	94013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_91600_94000
745450	contig_6496_pilon	-	1789	9	Intergenic	novelGene_103464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	16.5208201975568	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	513	1139	135813	124041	TRUE	10	AGTAGTTGTTTGGTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLIQDTSTYFTVSSFLSLSSFHSFSPFHPPSLPSSPPSFFPLFLLFVPSLLLHPSFLSSVVPSFSRFSFPSSPPSFLHTSPPSFLPSPPSFLSSSCPLSSPPPFFSFLPSSSLPSSCPFFLPPFLLSRNKVSQKGPGVRPTADLLKHYARHRECHRRAASDCAVSLDGMPSEILLKIFSYLDAVNLLCIGCVNRRFYHLASDNFIWVRIYSTAFSPKRSNWKVNSVEKTAVSVNLLSLEDKEAGYWKKEYIAKQIASVKATVAQLLQPVNPYTGLPVKIKEALRVSGLGWVIILRDKSGKEYLTERVHLSVNDTSVSVVWYGKNWPCLATLSTLDLCGVTPVFMDRYKSPTKNGGRKSWLLLWQIFISISLWRGAS	141019	93003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_93373_99465_99591_122908_123052_124027_124111_130326_130537_131093_131337_135709_135815_140400_140506_140613
745456	SIRV6	+	470	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	2	205	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	631	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745468	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	686	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745469	SIRV7	-	877	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-7	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147633
745470	contig_9389_pilon	-	1446	6	Intergenic	novelGene_83873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_5	466.867604359094	33	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	76	516	38959	36611	FALSE	0	CCTCGGGCTGGGCGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	39469	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38975_39409
745478	contig_22_pilon	+	2663	3	Intergenic	novelGene_170830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	64.5	113	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	16	1179	542666	553332	FALSE	5	GGCCTAGTCTCTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHHALAFLLLFVITSGASENASTSRGCGLDLLPQYVSLCDLDTIWGIVVEAVAGAGALITLLLMLILLVRLPFIKDKEKRDPVGVHFLFLLGTLGLFGLTFAFIIRQDETICSVRRFLWGVLFALCFSCLLSQAWRVRSLVRHGKSPSGWQLVGMALCLMLVQVIIAIEWLVLTVLRNAKPACAYEPMDFVMALIYDMVLLVATLGLALCTLCGKFKKWKQNGVCILVTAFLSVLTWVAWMTMYLFGNAALQQGEAWGDPTLAITLVASGWVFVIFHAIPEVHCAILPAPQENTPNYFDTSQPRMRETAFEEDVQLPRTYMENKAFSMDEHNAALRTAGFRNGSLGKRPSAPFRSNVYQPTEMAVVLNGGTIPTAPPSYTGRHLW	542650	554816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_22_pilon_+_543672_551811_551925_553287
745483	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
745484	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745492	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
745493	contig_3817_pilon	+	2131	9	Intergenic	novelGene_78281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	393.079170619609	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	96	932	77948	95372	FALSE	20	ATTTTATGCAATTTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSVSISLY	77852	96571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299
745495	contig_12624_pilon	-	1786	5	Intergenic	novelGene_61111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	770.329596666258	4	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955877	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947879_947917_948826_950590_950768_952913_952985_955644
745496	SIRV6	+	565	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
745499	contig_2069_pilon	+	1422	6	Intergenic	novelGene_23461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.123089182711	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	332	739	1436133	1436586	TRUE	10	GTTGAGGCCTCTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTTTPGGRPCFPVQGPSKPLAKPRPPKPGIQALELPRPVP	1432105	1439450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432232_1432938_1433064_1436052_1436420_1436465_1436748_1437870_1438000_1439057
745504	contig_990_pilon	+	2050	4	Intergenic	novelGene_76125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTGTTAAATATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585439	1601631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1587076_1591044_1591182_1598931_1599015_1601437
745505	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
745507	contig_3426_pilon	-	1074	3	Intergenic	novelGene_57938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGGCTGGCCTTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368778	366814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367348_367383_367842_368695
745508	contig_11448_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_66372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291027	288727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_288700_291000
745509	contig_13145_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_116658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGTAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242382	239494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_239500_242400
745510	contig_8628_pilon	+	2468	2	Intergenic	novelGene_164432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_1	0	29	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	267	374	646321	646428	FALSE	75	TGAAAAAGAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSSTPSSSTSTTTTATSVSQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSTPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGKPTDYNSLFSYVFHIVS	641796	648522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_641872_646129
745515	contig_1275_pilon	+	892	2	Intergenic	novelGene_108857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	9	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	61	750	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746576	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
745518	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_97402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	653885	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653885	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
745523	contig_846_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_136094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	945	1283	94606	94268	NA	60	ATATTAAACAACAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDSNGFGFWVLGTQISFQKENKTSHIQSVPREFSAATMDTRRQWRECLCNFEGNLFPTKNSTPSESIKYEGRIRTFPDIQDFKKFTFTASYFRKLLEDVFHQNEEVN	95550	92903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_92900_95600
745525	contig_12128_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_131978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATGAATTTTGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226781	228198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_226800_228200
745528	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
745529	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_95013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745530	contig_5961_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_144143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTGGGTGCTGTCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190281	191627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_190300_191600
745532	SIRV6	+	468	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	388	0	209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	373	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745533	contig_15034_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_143639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAGTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48797	49840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_48800_49800
745536	contig_12837_pilon	+	2271	4	Intergenic	novelGene_57304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	1282.57891245204	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAAATGTTTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128764	155918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981
745548	contig_10235_pilon	+	1883	9	Intergenic	novelGene_46581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	42.6304981791205	170	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	284	1195	567174	581650	FALSE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	565775	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566051_567165_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
745549	contig_8106_pilon	-	1409	5	Intergenic	novelGene_139725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.6825288497862	47	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCATCATGAGTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85475	62457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_62895_63924_64508_66863_67068_69905_70066_85450
745550	contig_16211_pilon	-	873	2	Intergenic	novelGene_150071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	51	350	121247	97470	FALSE	50	AAGAAATATATTTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVDVGEREGSDSGIGMNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEG	121297	96946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_97609_121086
745560	contig_10456_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_163459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTTCTTTTTGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26055	27027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_26100_27000
745561	contig_6048_pilon	+	1551	11	Intergenic	novelGene_73255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_8	52.8999054819571	729	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	519	1313	1976465	1978064	FALSE	10	GGGGTGACTTGAGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRGCSAYCLHASHQSVPGAAASLLKWRGGRTPSIQPAPRVCPPLRFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFFGHFWQLFNALTLFNLARDPQCKEWQVLMCGFPFLLLFLGNFFTTLRVVHQKFHSQWHRSKKE	1972047	1978302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974209_1974327_1976314_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977627_1977693_1977798_1977868_1977950
745562	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745584	contig_13292_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_142963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAATATTTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400242	400534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_400200_400500
745585	contig_6364_pilon	+	761	6	Intergenic	novelGene_51864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.4688255160345	2923	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	132	476	2485698	2487742	TRUE	5	CTGGCCGGGTCACTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLERLSGKWFYIAAVLRHPEYNQFAKEILTAFFYLTPNVMEDVILLRQYLTTGGQCVYNSSYLQVQRENGTLSRYEWGAEQFANVLLTKNPTTFMFSHYPEDKLNRGAVLLR	2485566	2489310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486060_2486204_2486458_2486530_2487476_2487586_2487738_2487843_2489125
745587	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	10	407	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745588	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745589	contig_19545_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_170833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	286	609	16484	16161	NA	10	TCTGAATCCTCCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLWSHSWSVAELGFEPNYYGALVAQWLSARLLTERLVVRTHPAAPWLSLSVEIDSTAPHNNNSSSRVCSNCCEIQPLAEALNSLGEVSSIIIPILQMRKPRPGEVK	16769	15919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_-_15900_16800
745591	SIRV4	-	461	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1062	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4096	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
745592	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745597	contig_5041_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_27080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529703	527449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_527400_529700
745601	contig_5403_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_87983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451984	450630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_450600_452000
745602	contig_12951_pilon	-	1287	4	Intergenic	novelGene_68132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATTCCTAAATGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95419	73906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_74956_86811_86872_91425_91510_95325
745604	contig_15118_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_74572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTCACAGGCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260391	261285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_260400_261300
745606	contig_2867_pilon	-	2143	12	Intergenic	novelGene_135168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	18.6405760206107	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	688	1530	690451	686589	TRUE	15	AGCCGCTGTTCATCCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTLATLILASITYPPGVGRFLASRLSMKEHLDSLFDNNSWALITRNSSPPWPPEPDSQNLWFEWYHPRFTIFGTLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPVFVFGAAIGRLWGEALSLAFPEGIMAGGVTYPIIPGGYALAGAAAFSGAVTHTISTAILAFELTGQILHALPVLMAVLAANAIAQSCQASFYDGTIIVKKLPYLPWIRGRGISSHGVIVEHFMNCTITTLAKDMPLEEVVKVVTSTDVAEYPPGGEHRVSNPGGRRAKGPVDAGPPD	692016	684693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_685111_685475_685563_686330_686412_686560_686650_687396_687532_688635_688850_689255_689367_689540_689611_689925_690100_690373_690459_691216_691319_691438
745607	contig_7022_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_142134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGCATAAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86258	88429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_86300_88400
745614	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_94245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653717	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
745619	contig_9297_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_69827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTCCATGAATATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512241	512891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_512200_512900
745628	contig_13425_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_170842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCCAAAAAACGAGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59517	60995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59500_61000
745630	contig_1275_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_108866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	206	667	747507	747968	NA	15	GTTTTGTTGCATGGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747301	748094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
745632	contig_10500_pilon	+	3015	1	Intergenic	novelGene_41141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	292	879	1083	1961	64905	65783	NA	35	AAAGAGTTTTCATGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPPKPASVSSPELPNPVPAVSESQKPVPVPSPEPQKLAPVSAEPVKSTLTNTKPQKHSHFPETLGPPSASSPESPVLAASPEPWGPSPAASPESRKSARTVSPEPRKPSPSESPESWKSFPAVSSEPRRPAPAVSPGSWKAGPPGSPRPWKSSPSASSGPWKPAKPAPSVSPGPWKPIPSVSPGPWKPAPSVSPSSWKSSSASPGSWKSPPASPESWKSGPPELRKATPTLSPEHWKAVPPVSSELRKTGPPLSPEIRKPGPPLSPEIRSPAGSPELRKPSGSPELWKISPDQRKTSPAPLDFPESQKSSRGGSPDLWKSSFFIEPQKPPVFPETRKAGPSGPSESPKAASEIWKPVLSMDTEARKPALFSEPTKTAPTASPEPRKRALFPEPRKHALFPELPKSAVFSESQKALELGDELQVDAIDDQKCDILVHEELLATPKRLLEDPLFPCSKKLKKDNQENSDAELSSSEYLKTDLDAIDIKGQESSSDQEQVDVESIDFSKENKMDITSPEQSKNVLQFTEEKEAFISEEEIAKYMKRGKGKYYCKICCCRAMKKGAVLHHLVNKHNVHSPYKCTICGKAFLLESLLKNHVAAHGQSLLKCPRCNFESNFPRGFKKHLTHCQSRHNEEANKKLMEAVEPPLEEQQI	63822	66837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_63800_66800
745633	contig_3015_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_163320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCCAAGCAAATCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263359	261147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_261100_263400
745635	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745639	contig_9807_pilon	+	1607	5	Intergenic	novelGene_32882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	507.5004310343	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	175	621	151799	158783	FALSE	15	CGTTGTGGATCACTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLGLASLSCSAVRANRPRALGERGGNKWRGCRSRSKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109037	159769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_151732_151820_154095_154270_156624_156770_158676
745644	contig_10599_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_49894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAGAATGTAAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235468	234482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_234500_235500
745648	contig_8554_pilon	+	481	2	Intergenic	novelGene_160279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTTAGATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42410	43796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_42494_43398
745650	SIRV6	+	514	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745656	contig_14814_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_137717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	283081	282785	NA	80	AGTACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHPGSPKLLPNKHPLQVRHAPCPPIKTLHLDKVVCPGDHLTLELHSLKHGELLLFFLFYLGLYLGEVNRTETFCGCPSAGGTYIRTQSSFLVLNFIN	283083	282711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_282700_283100
745657	contig_12967_pilon	+	1800	12	Intergenic	novelGene_169800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	102.47168526472	69	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	89	1420	199421	216680	FALSE	55	AAAAAAAAAAACCTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLTLFVGRLPPSARSEQLEELFSQVGPVKQCFVVTEKGSKACRGFGYVTFSMLEDVQRALKEITTFEGCKINVTVAKRKLKHKSKEKGKNENLESPKKVLKPKKAKMADKKARLIIRNLSFKCSEDDLRTVFAQFGAVLEVNIPRKPDGKMRGFAFVQFKNLLEAGKALKGMNMKEIKGRTVAVDWAVAKDKYKDTQSASVSGEGKNPEPKQQGSGKENGQEKEDDDDDDDEEDDAEEDEEDEEEDEGESKMTKPVQIQKRAVKRVAAAESSEEDHSNEDSDLEQRDGIDDGEELAQSDMDTEEREDEDAQISKKKKRKLPSDVNEGKTVFIRNLSFDSEEEDLGELLQQFGDLRYVRIVLHPDTEHSKGCAFAQFLTQEAAQKCLAAASPETEGGGLKLDGRQLRVDLAVTRDEAAKLQTKKVKKPTGTRNLYLAREGCE	199332	217060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_199539_203665_203825_204148_204244_204685_204762_205336_205430_206211_206284_207096_207272_207449_207593_208984_209058_211660_211771_215058_215133_216536
745658	SIRV6	+	500	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1635_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745660	SIRV7	+	380	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
745668	contig_753_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_112928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1	444	451125	451568	NA	50	TAACCAGAGATGAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLYNILFYECTTIYLPFYCYETFGLFPVWGHNKQCSWGTFERAFPGYKPRTRSWVAGYAGFGSALLFSKGLSPFTLPSAVDESCCCSISLQGGQRAFPVWHNHWLEQSQAYPHSANPLDGSQKLRPQSFLLFTCFLQVRIKDSDYP	451124	452238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_451100_452200
745671	contig_10082_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_63847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGTGTCCCCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129517	127653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_127700_129500
745672	SIRV1	-	275	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3829	0	3555	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6811	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
745675	contig_6270_pilon	-	2220	2	Intergenic	novelGene_99884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082298	1080005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1080318_1080390
745677	contig_6503_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_145797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGATTATATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962525	960598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_960600_962500
745679	contig_16036_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_114806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTTGAGACAAAAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41841	40160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_-_40200_41800
745680	contig_5226_pilon	-	680	7	Intergenic	novelGene_140494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	122.902965338062	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	123	680	18252	4962	FALSE	25	GTGAGACTATCCAGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDHPIPRVFQNRFSTQYRCFSVSMLAGPNDRSDVEKGGKIIMPPSALDQLSRLNITYPMLFKLTNKNSDRMTHCGVLEFVADEGICYLPHWMMQNLLLEEGGLVQVESVNLQVATYSKFQPQSPDFLDITNPKAVLENALRNFACLTTGDVIAINYNEKMDWGYEENEPSHPTLVTLFLFKLFLT	28416	4961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_5040_9399_9473_11337_11469_15533_15656_17708_17742_18131_18265_28306
745683	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
745684	contig_14322_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_116450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
745685	scaffold_16539_pilon	-	1477	10	Intergenic	novelGene_68342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	245.098821088078	8	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	115	726	502141	491117	TRUE	10	TGGGCCTGAGTGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHH	502799	489780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491123_498810_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502747
745687	contig_5538_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_23707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAATTTGCAGGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168115	166856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_-_166900_168100
745688	SIRV6	+	536	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1530_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745691	SIRV7	-	193	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69093	0	35874	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78864	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
745693	contig_2093_pilon	-	1920	13	Intergenic	novelGene_152975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	295.661534622878	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	142	1122	1384563	1341993	TRUE	25	CACCCTATTGCTGTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVAVNGKHTLLYAHRISLEKIDTLGIYGKVNIHSVGFRFSSDLQGTQASSVELIQINRENVQKSGISQLTLPFAARLNSSMGPGRTVVIKGEVNTNAKGFNVDLVAGKSRDIALHLNPRLNSKAFVRNSFLQESWGEEERNITCFPFSPGMYFEMIVYCDVKEFKVAINGVHSLEYKHRFKELSNIDMVEIDGDINLLELNAPTEKCTNHTC	1386705	1337039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1337670_1338399_1338528_1341952_1342035_1357880_1358016_1364609_1364776_1365572_1365662_1366409_1366437_1367575_1367633_1368504_1368625_1370810_1371022_1372530_1372620_1384518_1384610_1386610
745694	contig_6710_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_97609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCACTTGCTGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653389	653811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
745695	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745697	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
745701	contig_6710_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_89111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653635	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
745706	contig_6710_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_98317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATAGTCGCTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
745708	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	80	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745709	contig_13479_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_168559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21585	23785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13479_pilon_+_21600_23800
745712	contig_16724_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_105331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAAAAACCCTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575965	574910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_574900_576000
745713	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
745722	contig_19850_pilon	+	1583	10	Intergenic	novelGene_170848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAGAAAAAGCATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3448	35498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_+_3605_6173_6292_6959_7065_18821_18999_19934_20077_22703_22861_29230_29398_30360_30480_32122_32462_35395
745723	contig_9609_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_23037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAAGCAGGGTAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333994	333569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_333600_334000
745728	contig_16156_pilon	-	1890	8	Intergenic	novelGene_137068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	47.3738927499706	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	3	989	160245	99837	FALSE	35	TGTAAAAAGGAGGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160247	98935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_133371_133555_160176
745731	contig_6710_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_98126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	CCCATCTCGTCCCCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745734	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
745735	contig_753_pilon	-	2467	16	Intergenic	novelGene_112919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	10.5556725139719	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	128	1459	402088	355037	FALSE	50	TCTGAAGAATAAGAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLGSFSSDPSDKPPCRGCSSYLMEPYIKCAECGPPPFFLCLQCFTRGFEYKKHQSDHTYEIMTSDFPVLDPSWTAQEEMALLEAVMDCGFGNWQDVANQMCTKTKEECEKHYMKHFINNPLFASTLLNLKQAEEAKTADTAIPFHSADDPPRPTFDSLLSQDMAGYMPARADFIEEFDNYAEWDLRDIDFVEDDSDILHALKMAVVDIYHSRLKERQRRKKIIRDHGLINLRKFQLMERRYPKEVQDLYEAMRRFARIVGPVEHDKFIESHALEFELRREIKRLQEYRTAGITNFCSARTYDHLKKTREEERLKRTMLSEVLQYIQDSSACQQWLRRQADIDSGLSPSIPMASNSGRRSAPPLNLTGLPGTEKLNEKEKELCQMVRLVPGAYLEYKSALLNECNKQGGLRLAQARALIKIDVNKTRKIYDFLIREGYITKA	404709	354028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_355223_357447_357522_359751_359796_360375_360509_362721_362794_364267_364379_366911_366956_368489_368554_379521_379595_381308_381398_382922_383081_384964_385057_392028_392089_393056_393164_402063_402175_404668
745736	contig_10437_pilon	+	2224	3	Intergenic	novelGene_38138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.5	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	353	358	162052	162057	FALSE	0	TGTCTTGCCTTTGGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGERAREPHAGRRRAEPASRSRRLDAREEQGSKSEEDNLVPDCSTLPPGPGSLSGSETSTFTDQLRAPRTLLFLNPSSWGPSFPYLTVPQGLGAGLPQLPLAVAPPGDGIKAAGLTM	156673	163923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160034_161940
745737	contig_5649_pilon	-	1747	5	Intergenic	novelGene_82381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_4	51.1095636843047	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	701	1084	1072982	1069132	FALSE	15	GAAGCAGCTTCCTGTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPYIEHWPRALSILMLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1073682	1068468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949
745744	contig_6102_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_31753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGACTATTTTTAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252907	250618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_250600_252900
745745	contig_5236_pilon	+	1942	6	Intergenic	novelGene_100930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	24	junction_1	22.4641937313584	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	61	1086	965121	986227	FALSE	70	CAGAAAAAAAAACAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTGSQASDINELFGFFNDGAPPTKKPRKLLPSLKTKKPQELVLVIGTGISAAVAPQVPALKSWKGLIQALLDAAIDFDLLEDEESKKFQKCLHEDKNLVHVAHDLIQKLSPRTSNVRSTFFKDCLYEVFDDLESKMEDSGKQLLQSVLHLMENGALVLTTNFDNLLELYAADQGKQLESLDLTDEKKVLEWAQEKRKLSVLHIHGVYTNPSGIVLHPAGYQNVLRNTEVMREIQKLYENKSFLFLGCGWTVDDTTFQALFLEAVKHKSDLEHFMLVRRGDVDEFKKLREDMLDKGIKVISYGNEYADLPEYFKRLTCEISTRGRSGKMHSELEGSEQQL	928532	987083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_928586_965113_965207_969356_969610_979903_980132_983078_983208_985897
745746	contig_5280_pilon	+	2099	8	Intergenic	novelGene_52607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	809.229061186873	1	129	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	842	1201	47466	78235	FALSE	40	TAAATAATTGATCACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKEHGVVYHLTAKKALLLPRFHQLLRNPPQQLFQVQRSQELLRNPPQQLFQVHFRTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38328	79133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38466_39267_39451_40886_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56338_78036
745748	contig_7357_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_36943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCATTACCAGACAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978536	979079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_978500_979100
745749	contig_7357_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_36944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981842	982708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_981800_982700
745750	contig_1309_pilon	-	1362	2	Intergenic	novelGene_73972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCGTTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185879	184270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_184735_184981
745754	contig_14522_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_147346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCTATTTTAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225812	227737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_225800_227700
745755	contig_14522_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_147347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227737	229487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_227700_229500
745756	contig_665_pilon	+	1749	2	Intergenic	novelGene_158229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTCTGTGTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373354	375198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_373671_373765
745757	contig_10404_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_138626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTATCCCCAGAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18732	21037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_18700_21000
745759	contig_17753_pilon	+	2141	11	Intergenic	novelGene_105052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	283.307977296793	1	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	945	1967	131420	143267	TRUE	20	TCCGATGTACCCACGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLRMNKAPTVGFEADVGSKTTHHLVYPESFRELGENVNMVLVPFKTIDLQWVVSATTKGTISHTYVPVPTKIKVKKEKILIYHPAFIKYVFDNWLQGHGRYPSTGILSVIFSLHVCDEVDLYGFGADSKGNWHHYWENNPSAGAFRKTGVHDGDFESNVTAILASIHKIRIFKGR	45468	147818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96221_130836_130918_131011_131726_137748_137946_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093_143398_147774
745760	contig_11338_pilon	-	1405	13	Intergenic	novelGene_6236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	106.504564325771	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	703	1314	13820	12549	FALSE	25	GTTAAAGCTGTAGATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21320	12457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14105_14162_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17114_17177_17288_21286
745766	contig_11855_pilon	+	2017	3	Intergenic	novelGene_66940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	380	1399	1003891	1005016	FALSE	30	TAGTTTATATTAAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQPSQPPLPPPPPPPQQQQQQKTSALSPNAKEFIFPNMQGQGSSTNGMFPGDGSLNLSPLQYSNAFDVFAAYGGLNEKSFVDGLNFSLNNMQYSIFFLS	1001616	1005634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747_1004893_1004998
745769	contig_7202_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_16615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
745775	contig_9363_pilon	-	1368	7	Intergenic	novelGene_6701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	29.3409081128872	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	169	1083	1292794	1288377	FALSE	10	GAGCGGGTGCCCTGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPYCLLWFSFLPNNSPLLSQGGKAALIHIRFFPSLSVFLPLSPVTLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVAVWTVLAAGRVALSTHRIRPLTKSALLRDPYALRPVRRLIDNCAFRLYGHWVKKGEQQNRAALFQHRPPGPFPITGPEEEGDSAAVPEDEAMLVMG	1292962	1288091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1288894_1288965_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291499_1292774
745776	contig_6710_pilon	-	316	2	Intergenic	novelGene_98307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	3	314	657173	653601	FALSE	20	GCCTATCGTCGAGAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLS	657175	653598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
745778	contig_19938_pilon	+	1305	7	Intergenic	novelGene_146566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	122.282119161661	1405	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	81	941	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSAPAQAPPGSPCALCLWGPEKAGRMTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5741	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18535_18953
745791	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	10	-244	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745797	SIRV6	+	522	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1599_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745798	contig_6870_pilon	+	3007	1	Intergenic	novelGene_104008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAGATTTGGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602021	1605028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1602000_1605000
745799	contig_7887_pilon	-	2512	2	Intergenic	novelGene_124849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCAAGGGAGAATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58896	50955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_52050_57478
745802	contig_10042_pilon	+	810	2	Intergenic	novelGene_79084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	10	348	6321	26890	FALSE	30	GTAAGGTTTTCAATGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRYSVLPGNVPSLPSPLVCLGERNSFPS	6311	27352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6384_26614
745807	contig_11708_pilon	+	2143	4	Intergenic	novelGene_138965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCTAACAACAGTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247789	252016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_248356_249277_249413_250376_250540_250737
745809	SIRV4	-	316	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1207	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
745814	contig_7411_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_136969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	362	1089	1207	2295	87309	86221	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	88515	86205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_86200_88500
745817	contig_9437_pilon	+	1947	14	Intergenic	novelGene_141708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	124	junction_11	70.496044624449	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	30	1667	76431	195809	FALSE	30	TAAATATTCTACCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELALAGINMLLNNGFRESDQLFKQYRNHSPLMSFGASFVSFLNAMMTFEEEKMQLACDDLKTTEKLCESEEAGVIETIKNKIKKNVDVRKSAPSMIDRLQRQIIIADCQVYLAVLSFVKQELSAYIKGGWILRKAWKIYNKCYLDINALQELYQKKLTEEPLTSDAANDNHIVAEGVSEESLNRLKGAVSFGYGLFHLCISMVPPNLLKIINLLGFPGDRLQGLSSLMYASESKDMKAPLATLALLWYHTVVRPFFALDGSDNKAGLDEAKEILLKKEAAYPNSSLFMFFKGRIQRLECQINSALTSFHSALELAVDQREIQHVCLYEIGWCSMIELNFKDAFDSFERLKNESRWSQCYYAYLTAVCQGATGDVDGAQIVFKEVQKLFKRKNNQIEQFSVKKAERFRKQTPTRVLCVLASIEVLYLWKALPNCSFPNLQRMSQACHEVDDSSVVGLKYLLLGAIHKCLGNSEDAVQFFQRAVKDELCRQNNLYVQPYACYELGCLLLDKPETVARGRALLLQAKEDFSGYDFENRLHVRIHAALASLRELVPQ	76401	196089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_76484_130484_130534_140918_141048_142526_142642_151570_151926_153762_153932_175815_175910_179162_179271_184931_185042_186528_186653_190862_190961_192107_192213_194006_194046_195719
745820	contig_15029_pilon	-	1454	6	Intergenic	novelGene_128196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	36	junction_1	1282.84583641215	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	58	510	172327	163160	FALSE	45	GATGTTATACAAAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVSLEESSLSWVYRL	172384	162215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163204_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
745829	contig_9440_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_59111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAAAGCTCTTTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703461	1701235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1701200_1703500
745833	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745834	SIRV6	+	543	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745837	contig_7630_pilon	-	1632	7	Intergenic	novelGene_133651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	23.1258633472473	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	246	872	456927	450247	FALSE	15	TTCTTCCACATTGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEKGLLSKARGNGILLEGELVDVSRHSILDAHGRKERYYVLYVQPSRIHRRKFDSKGNEIEPNFSATRKVNTGFLMSSYKVEAKGDTDRLTTEALKRLVNKPELLALTESLTPDQTVGFWMPQTEMEAIELELGAGVRLKTRGDGPFLDSLAKLEAGTVTKCNFAGDGKTGASWTDNIMAQKSSEGAAAETREQGDGAEDEEWDD	458349	449486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_450256_451545_451710_452120_452328_454764_454898_456684_456761_456889_457113_458289
745841	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	3	374	14437	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCLIAGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14149_14360
745842	contig_2069_pilon	-	1310	6	Intergenic	novelGene_23426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	7	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331466	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
745843	SIRV6	+	450	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	110	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTAGATTGCGTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10727_10819_11031
745845	contig_6589_pilon	+	727	5	Intergenic	novelGene_25778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2030.74038222516	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	223	720	669670	672840	FALSE	5	CCCTGACTTTGCCTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENALYHEARRALLCHWLLPALHQRGSIHWSPDLCHPLQGDPEASPAWGQLRLLLCPGLGGLPPCPGQRHHLHPPAEAGVSTLRCLLPALPLHPEAPVPDCLPENKTI	668303	672847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669748_670000_670104_671126_671188_672584
745846	contig_3233_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_56492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27246	25105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_25100_27200
745848	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
745849	contig_14618_pilon	-	2330	3	Intergenic	novelGene_136839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5	54	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTTTTCAAAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187131	1181827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1184094_1186922_1186968_1187112
745852	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	4	14	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745853	contig_15039_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_110181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATAATGAGAGTCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359861	358004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_358000_359900
745854	contig_4962_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_107380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147627	145372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_145400_147600
745856	contig_8660_pilon	-	864	3	Intergenic	novelGene_136497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	589	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	29	325	315338	308633	FALSE	20	AGTTTCCTGTCGTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGLKEITFMNGDQLYLVHQVLYMKVVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315287
745859	contig_10426_pilon	-	1421	9	Intergenic	novelGene_144667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_8	54.831560255021	250	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	104	889	104586	68902	FALSE	40	CAACATTTCATAGAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGKHKCIENVSRQNCPICLEDIHTSRVVAHVLPCGHLLHRTCYEEMLKEGYRCPLCMHSALDMTRYWRQLDDEVAQTPMPSEYQNMTVDILCNDCNGRSTVQFHILGMKCKICESYNTAQAGGCRNTLDQQ	104689	68369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_69031_72438_72560_73498_73526_73618_73678_73789_73835_76253_76333_96657_96774_97008_97129_104496
745860	contig_12496_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_170712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314204	311920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_-_311900_314200
745867	contig_8661_pilon	-	1160	11	Intergenic	novelGene_137934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_8	440.494994296189	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	105	971	315977	301399	FALSE	10	CCCTTTGCTTGGTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316081	301209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
745870	contig_835_pilon	+	1495	2	Intergenic	novelGene_152126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	56	junction_1	0	150	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70840	165580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_164341
745872	contig_14030_pilon	-	1428	8	Intergenic	novelGene_62233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	584.337196474496	11	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	111	542	389093	337410	FALSE	30	ATAACTTTGTGTGAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394375	336523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_389081_389175_394346
745875	contig_8628_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_164417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTTCTGGGGACTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397222	395465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_395500_397200
745876	contig_6364_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_51804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTATCTTTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434843	1436837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1434800_1436800
745877	scaffold_6394_pilon	+	1194	8	Intergenic	novelGene_110993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2363	junction_3	325.062568545484	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	25	1038	398216	406119	FALSE	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398191	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
745878	contig_2892_pilon	-	1771	3	Intergenic	novelGene_118995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	57.5	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130431	88529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_90117_100483_100568_130331
745879	SIRV6	+	534	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745880	SIRV6	+	548	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745883	contig_1270_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_170864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATGCGATACTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22065	22755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1270_pilon_+_22100_22800
745884	contig_4339_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_146082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGATAGTGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042415	1044452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1042400_1044500
745885	contig_11176_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_123444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTATCCAGTTAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68953	70467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_+_69000_70500
745886	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
745887	contig_7285_pilon	+	1616	4	Intergenic	novelGene_143408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	458	junction_2	15.3260852434302	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAATAAGCTTTGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320061	343279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_320415_323968_324018_324673_324715_342106
745892	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745894	SIRV4	-	406	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1107	8	1107	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4051	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
745898	contig_6418_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_81154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273847	276165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_273800_276200
745906	contig_4626_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_158817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACGTAAGTGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20077	18461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_-_18500_20100
745907	contig_2703_pilon	+	1877	13	Intergenic	novelGene_101808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	47.316017959625	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	89	994	891517	1060216	TRUE	30	ACACTAGACAATTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSARALQQHLPSAPRVLPAPAQPPNCLPAMEPGAPRRRHTHQRGYPVTRNPHLNKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPRFVSQHIQVLRVIKNFERLTSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFISIHDKGHIASILNAWPEDVVKAVVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGVNPQECLPVTLDVGTENEELLKDPLYVGLQQRRVRGRAYDDFLDEFMEAISSKYGMNCLIQFEDFANTNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGCLRDCSPDCYGYGKRRFTKGESHRKDMVG	891428	1093679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_891595_920477_920612_925472_925623_961796_961873_964306_964469_992657_992762_1045766_1045877_1060124_1060239_1077592_1077699_1078589_1078733_1082164_1082339_1089683_1089783_1093340
745912	contig_9389_pilon	+	1124	7	Intergenic	novelGene_83915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_6	827.529858474404	158	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	39	773	159587	168046	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQENGGRRVLGNGSAGRGPGHQPGIPTV	159548	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166222_167965
745913	contig_6710_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_96339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGCTGTTCTGGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	653713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
745916	SIRV6	+	546	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	23	-1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	170	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745917	contig_10044_pilon	+	1801	2	Intergenic	novelGene_156382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	58	1146	135357	136529	FALSE	25	GCCTTCTTGGAAACAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLAEHYQTTHKGQNPYKCMECGKAYLYESGLAKHQKTHRGEKPYVCSECGIGFFENADFIIHQQIHTEEKLYICSECGKAFSKKYKLIAHHERIHKRQKHECPECGRAFLYNSQLSKHQKRHMAEKPYICSECGKGFIQKGNLVIHQRTHTGEKPYMCGECGKGFSHKSCLIGHQRFHTGRSPFVCSECGKPYSKKSGLISHQKIHTGEKPFQCSECGKAFNTKPKLIVHQRSHTGETPYGCNECGKTFAYTSSFYLHKRKHTSEKRVESIKMEDSSTPSHSSSHTKDFMQEKSPVNTVTMQIPSVTVQPSVNISGLPTNGNIVLVGQPVARCEPSGDNREFPQERNLMNAVNVVVPMSAVNGVVPSVMNYILFYATQNL	135299	137184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_135676_135759
745918	scaffold_13505_pilon	+	1713	6	Intergenic	novelGene_111573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	66.2311105146214	97	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTCTCATGGCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608660	635989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_609748_610099_623354_623423_635129
745925	contig_5954_pilon	-	1619	8	Intergenic	novelGene_28660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	314.995562003074	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	131	745	959926	945721	TRUE	10	GGACCATCCGTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMKTAPRKLTLKGYRQHWVVFKETTLSYYKSQDEAPGDPIQQLNLKGCEVVPDVNVSGQKFCIKLLVPSPEGMSEIYLRCQDEQQYAHWMAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVR	960590	944724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945725_946209_946335_946673_946908_947097_947205_947435_947561_959906_959941_960474
745926	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
745927	contig_5039_pilon	-	1139	2	Intergenic	novelGene_65048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACAAGTGGAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1817388	1815700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1816731_1817279
745930	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	598	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745931	SIRV6	+	556	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1577_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745933	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
745941	SIRV6	+	487	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	369	0	190	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
745943	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_89193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653709	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
745944	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	60	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
745945	contig_6871_pilon	+	496	5	Intergenic	novelGene_21581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	13.7931142241337	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	18	494	247518	250382	FALSE	35	ATTCAGTACCAAATTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVNENMQINKIKKNEDAKKRLSIERIYQKKTQLEHILLRPDTYIGSVELVTQQMWVYDEDIGINYREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDPKMSCIRVTIDPENNLISIWNNGKGIPVVEHKVEKVYVPALIFGQLLTSSNYDDDEKKVTGGRNGYGAKLCN	247500	250384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_247659_247861_247953_248256_248321_250115_250262_250347
745949	contig_13702_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_102619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTCCACTGTCCCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199361	198224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_198200_199400
745950	contig_7293_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_54269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTCTATTATTAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338088	336615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_336600_338100
745951	contig_5968_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_112205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	88	429	674969	675310	NA	0	GTGTGTGTGTGGTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCVFKYILSSLIDMTRFQRPRCYENRCYVKMADDYIRSQKWRMTTSLYNGQVTSFHNCQVISLHNRQITSLPNCQTTENHGTAKLKHHLNHQSQHYSHLAPQRSLLPDVRH	674881	676493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_674900_676500
745952	contig_12786_pilon	-	1912	1	Intergenic	novelGene_103452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTAAGGCATTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650900	648988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_649000_650900
745953	contig_2100_pilon	-	1081	8	Intergenic	novelGene_50741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	856.102273119758	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	150	737	1180199	1170268	FALSE	20	CATAAGAGTGCTCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1182790	1169923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174284_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727
745959	contig_6364_pilon	-	2668	8	Intergenic	novelGene_51840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGTGCTCTCTGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783318	1707893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1707953_1708166_1708249_1714422_1714535_1719465_1719510_1727357_1727481_1772468_1773438_1781108_1781174_1782104
745960	contig_299_pilon	+	2458	1	Intergenic	novelGene_129490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGGGAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580785	1583243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1580800_1583200
745963	contig_13529_pilon	-	865	3	Intergenic	novelGene_170865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	4.5	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	524	865	53104	50031	FALSE	30	GTAAGACTGACAACTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILQDNPSIEEAILKEPLDLQAKPTFEKESLLKETTIYTEAHFKEPLTLQEKPSIEKEALLKDLTIDKEAYFKEHLALQAKPSIEKVALSKKPLTLQEKPIIEKGALFKEALALQEKPAISEAFFSKDILALNEKPTTAEEFSFKESLPLQENPTTKEDIFLKALLTFQVETNPRMSSTATESRTGESSTATMSSVGKSSTPSKFSVCESSSNKSFSPQGKRTQKEMTSLEDIDKDHSDPFFNSIYAKDIFSYMKEREEKFILKKYMNRQTDINSDMRAILVDWLVEVQ	53627	50030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13529_pilon_-_50124_51345_51442_52951
745976	contig_9482_pilon	+	1346	9	Intergenic	novelGene_44324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	327	671	1236476	1239008	TRUE	30	TCGCGGGAAAGCGCAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLHIDGVHATVLSKGHGDDLQRVGERPHGVLLQGRALVCLLADCQGTGNLRSSSSIHDSVVTNEVPDDTQGVVQGSLGLLDDHFVPPADEDGDGPGVPALLDDQHPVLRRPE	1236149	1253231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236494_1237343_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1240971_1241045_1241112_1245317_1245387_1253059
745977	contig_2278_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_118096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTGATTCCGACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686770	685531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_685500_686800
745978	contig_2278_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_118095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTTTGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685531	683852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_683900_685500
745986	contig_5814_pilon	+	1856	4	Intergenic	novelGene_143046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.7078955472189	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	320	1390	148636	157531	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLDPWNGTDNDTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNTVALYAFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLHWGQAHYARRVAAAVWVLVLACQAPILYFVTTSTHGTRITCHDTSAPELFSHFMAFSSVILGLLFAIPFAIILVCYVLMAQRLLKPTYGATGNLPRAKRKSVRTIAVVLAVFTLCFLPFHITRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKITRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDDKPAINPIPTIQARRRLGMRRLPTAPCPALLYLRLMG	138153	157997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_138178_144494_144786_148631_149655_157479
745990	contig_13740_pilon	-	1190	9	Intergenic	novelGene_34613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3831.52151362549	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	99	584	160838	157474	TRUE	30	GTATATTCAGCGTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	161607	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161574
745995	contig_5671_pilon	+	957	7	Intergenic	novelGene_79415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1908.71629345193	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	124	546	370430	531238	TRUE	35	ATTGCATATATATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368801	531792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205_531374_531516
746002	contig_16411_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_77309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGAAAAGCATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124343	125141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_124300_125100
746003	contig_10082_pilon	+	810	4	Intergenic	novelGene_63911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_2	237.501345025431	4950	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	86	595	580253	584895	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSPGAQSPSRSATSSAELSGAAVAAAMAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	574362	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_574419_580223_580435_583586_583726_584706
746004	contig_3948_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_53236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGCTCTAGTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965705	967411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_965700_967400
746005	contig_12841_pilon	+	1567	16	Intergenic	novelGene_55890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGCACCACCAACTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891206	931882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_891372_892627_892763_893296_893363_909442_909531_910220_910291_910386_910495_914691_914764_914861_914918_916588_916643_918377_918645_920813_920865_922933_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
746019	contig_4626_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_158822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAATGAGTTCCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61644	62089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_61600_62100
746023	contig_8140_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_86457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACGGAAAAGTAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843729	845994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_843700_846000
746024	contig_3602_pilon	-	1664	11	Intergenic	novelGene_60649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.804118245829	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	116	799	1139393	1108743	TRUE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIESHSPLRAVCRLLQRRGVQQLSQQVSAEGGRLRRTAGAVPEGRGHLRAGGDQCHGQPSPQVQRQGLLLQGGPLSLLHRHAQCQAGCPEV	1139508	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107771_1107827_1108689_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112150_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
746027	contig_7202_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_17946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
746030	contig_7816_pilon	+	1587	12	Intergenic	novelGene_66491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1293.25191374175	2	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	91	966	170169	207888	TRUE	45	AGAAAAATGAATTGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLFPHPRGRRALSDGPGGSGHVPVSPHINCLLPK	170078	211758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_192982_196783_196910_207503_207634_207790_207933_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
746031	contig_546_pilon	+	1888	4	Intergenic	novelGene_117183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	432.806602948194	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	118	516	119834	136866	FALSE	65	GGTAAAAGAAAAATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNGNKSFLLSY	61170	138238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61250_119795_119885_123934_124065_136648
746035	contig_16724_pilon	+	2613	1	Intergenic	novelGene_105277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1183	1482	407203	407502	NA	45	TACAGAACTAATAGTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAALFTIEKRWKQPQCPLTDERINKLWYIHTMEYYAMIKNNDEGTSYHQESSAGSRAHPLDWGPCTEKLLVRGNTEERKANREKKPSPGADALNLDF	406020	408633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_406000_408600
746040	contig_7919_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_28058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACCACAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023822	1024541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1023800_1024500
746050	contig_11846_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_105928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCTATCGACTCTCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181655	182469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_181700_182500
746051	contig_12157_pilon	-	2490	1	Intergenic	novelGene_135897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAAAAAGAAAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113672	111182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_111200_113700
746052	contig_12157_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_135896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAGAAAAAAAAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111171	110861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_110900_111200
746060	contig_3153_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_104714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544818	546770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_544800_546800
746062	SIRV6	+	364	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	406	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2874_10721_10819_11031_11109_11205
746063	contig_18113_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_137518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54525	52244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_52200_54500
746066	SIRV4	+	339	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAACTGCACTGGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
746071	contig_7379_pilon	+	1066	11	Intergenic	novelGene_150041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	136.425071009694	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	94	879	604810	638659	TRUE	30	GTGAGTATGGCTTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESWATLVTLRTLPPRLCHRPTSTPGTGNSQEMAAQCVTKVELNISCDNLLDTDVVSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTEKINNCLSPKFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGIYDIDNKTIELSDDDFLGEFECTLGQIVSSKKLTRPLMLKNGRPAGKGTITISAEEIKDNRVVVFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVIKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDHDNDGSHDLIGTFHTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKRL	584681	639397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_584765_604799_604942_605201_605382_621145_621221_623248_623321_628429_628514_630656_630747_634805_634905_637860_637908_638652_638713_639263
746073	contig_12327_pilon	-	2200	14	Intergenic	novelGene_140688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	223.899174265307	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	92	1738	1155014	1141336	TRUE	15	TTTGGAACTCTTGTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLLSASGVSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTLFF	1155105	1139943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141349_1141784_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
746078	contig_8712_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_58876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3	329	906332	906006	NA	40	AGGTGCAAACAATATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVWRHRRKQGRKVRKDVSEQPPRAGTACCPLSTVRLCPAWDLALPWLQSLLCLPVASLLKSGQLCLGLGAPTAPPLTAAPVCSESFQKRNRRPRCKWPLSGGFLFLAV	906334	905119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_905100_906300
746081	contig_6283_pilon	-	1849	5	Intergenic	novelGene_100216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_3	132.78059910996	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	472	957	613285	611758	FALSE	15	CCTGTGCTTGTCATGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPSRTYAWPAGGGLGLAPAHHAPPSRVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	615132	610865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613431_613720_613788_614873
746082	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_92161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	177	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746088	contig_14744_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_66100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTTGAAAATAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490675	1492529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1490700_1492500
746092	contig_6270_pilon	+	1251	6	Intergenic	novelGene_99802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	402.444232161426	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	73	906	27433	47331	FALSE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISANKTIALSC	27360	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_47302
746095	contig_12624_pilon	+	2155	12	Intergenic	novelGene_60959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_11	283.626952058305	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1306	1902	39740	53324	TRUE	40	AATAGTATACATACTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLVYYSKRMQSRTSQRERHIRQGLRGSQT	6109	55209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_53241_53344_54975
746096	contig_12079_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_67490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGATTGCCAGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642654	643307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_642700_643300
746097	contig_10197_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_115311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378259	1376036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1376000_1378300
746098	contig_14341_pilon	-	2891	3	Intergenic	novelGene_111871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23	64	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	521	2011	612317	610167	FALSE	15	TTCTGGGAGTGCCATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDTVDASPATAREAQRGPGPDYCCGVEEAPLEQRVSKEGLFQFGTPEEGSSTQKAKICDMCGPLLKDIWHLAEHQGTHSRQKVYLCGTWGRGFWINANLHQHKSGEKPLRWDKDRVLFVKSFSVPMSEKPFTCREFGKDVQDSHDLLQNQATHSEGKPFRSTEYREVFPHNSSLEQQQGVHTGQKPFKCSDCGKVFLKAFALLDHLITHSEERACRCPTSGSAFKKKSALADHQKSHTGETFYVCKDCGKAYTYLSLLRMHQKVHTGKTHYKCSECGKTFTRKHSLSQHQKIHTGERPYECRQCGKAFTRNFHVVRHQKVHNTERPYECRQCRRVFSCISSFIQHQKIHTGERLYECSECGKAFINSSHLARHQKVHNTERPYECSECGKVFRQTSKLVLHQRIHTGERPCKCNQCGKAFSFPSNLIQHQRIHTGEKPYECSECGKAFSQSSALIQHQKVHTRERPYECNECGKAFSYNSNLAKHRKVHTGKKAL	615669	609286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_611594_612253_612377_615208
746103	contig_6576_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_42328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTAGTTTGATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610887	612283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_610900_612300
746104	contig_8587_pilon	+	2772	22	Intergenic	novelGene_159131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_21	52.7373589113383	157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	55	2397	404791	436771	FALSE	25	CTGTGGAACACAGTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVDLEKLRMSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLISEGYEGLVEGGENINQANWLSVSNIIQLGGTVIGSARCAAFTTREGRLAAAYNLVQRGIANLCVIGGDGSLTGANIFRSEWGSLLAELVKEGKISESTAQTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDGWENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAVDRNGKPITSSYVKDLVVQRLGYDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRVLSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVSLSGNQSVRLPLMECVQMTKLVQKAMDEKRFDEAIQLRGRSFENNWKIYKLLSHQKISKEKTNFCLAILNVGAPAAGMNAAVRSAVRSGISQGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHHVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKSYMEKIVENIRTYNIQALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGHYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFSLGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDPFNIHDLKVNVEHMTEKMKTEIQRGLVLRNEKCHEHYTTDFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVLGHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKALLWMSEKLRAVYRNGRVFANTTDSACVIGLKKKAVAFSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLNLRLMLKMLAHYRISMADYVSGELEHVTRRTLSIDKGF	404736	437146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_404876_413962_414037_416692_416771_417444_417635_419894_420061_420612_420658_421121_421231_424186_424283_424778_424872_425281_425408_427055_427121_427926_427991_429753_429901_430803_430875_431831_431920_432896_433050_433855_434021_434554_434617_434891_435004_435678_435779_435861_435968_436623
746106	SIRV6	+	549	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	10	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746107	contig_10236_pilon	+	1011	4	Intergenic	novelGene_169109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	5.43650214343336	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	17	445	77561	78888	FALSE	5	TGACTTCTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPTAMAAAAVAAGPGAPVSPDELLPKGDAEKTEEDLEEDDDEELDETLSERLWGLTEMFPERVRSAAGATFDLSLFVAQKMYRFSRAALWIGTTSFMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGKI	77544	79454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_77678_77901_78021_78467_78586_78813
746108	contig_14142_pilon	-	1703	13	Intergenic	novelGene_120460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	240.147813278036	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	116	1201	102594	99720	TRUE	25	CCCCTCACTTAATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVVRASKNAKVKGKFRESYLSPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGCTSWPWNDMSGTR	102709	98585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98684_98833_99017_99096_99224_99625_99760_99963_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100818_100894_100960_101080_101287_102074_102181_102304_102432_102541
746109	contig_11572_pilon	-	1844	13	Intergenic	novelGene_100031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_11	59.985183355744	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	94	1509	189402	134069	FALSE	30	GTATATGTTATGATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRSYWELGRKQVRNVLNDAVDLLEFRDRVIKASLNYAHLVVSTSLQCYVFSTKNWNTPLIFDLKEGTVSLILQAERHFLLVDGGGIYLYSYEGRFISSPKFPGMRTDTLNAQTVSLSNDTIAIKDKADEKIIFLFEAATGKPLGDGKLLSHKNEILEIALDQKGLTNDRKIAFIDKNRDLYITSVKRFGKEEQIIKLGTMVHTLAWSDACNILCGLQDTRLTVWYYPNTVYVDRDILPKTLYERDASEFSKNPHIVSFVGNQVTIRRADGSLVHISISPYPAILHEYVSSSKWEDAVRLCRFVKEQTMWACLAAMSVANRDMTTAEIAYAAIGEIDKVHYINSIKNLPSKESKMAHILMFSGNIQEAEIVLLQAGLVYQAIQININLYNWERALELAVKYKTHVDTVLAYRQKFLETFGKQETNKRYLQYAEGLQIDWEKIKAKIEMEITKERERSSNSQSNKGIGVKY	189957	133733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_134180_143476_143601_152951_153125_153686_153777_156397_156570_157847_157996_158411_158548_170052_170118_174872_175037_178262_178338_180854_180974_189363_189430_189891
746111	contig_10958_pilon	+	1508	6	Intergenic	novelGene_5370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	417	junction_4	73.8257407683797	4	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	801	707	1507	806589	809513	FALSE	25	TCTGTGATGATGAACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSQQVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQER	805882	809514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421
746113	contig_10923_pilon	+	937	5	Intergenic	novelGene_66221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_4	332.757700887598	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	54	821	33044	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	32990	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
746114	contig_14525_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_149790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATAAATCTGAAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249472	249800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_249500_249800
746115	contig_14525_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_149791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAAGAAGTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250443	251695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_250400_251700
746116	contig_11417_pilon	+	2009	4	Intergenic	novelGene_103269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	280	junction_3	41.7692071587032	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	73	507	284496	327290	FALSE	30	ACACATTTTGTATATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARG	284423	328792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751_319902_327166
746118	contig_15410_pilon	+	911	6	Intergenic	novelGene_130620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	746.278071498821	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	129	482	146836	148093	FALSE	50	ATGAAAATAAATTAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGAPSRSDGRHYGWVCSVLTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145498	148522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145560_145663_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
746129	contig_1472_pilon	-	1597	3	Intergenic	novelGene_86113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1099	1566	160223	87770	FALSE	60	CTAGAAGATTGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYILNTVKSVRARTRHDCLLFLGITSFPSLTGFTIFLLLSISGKYLSFLSPTGFHLTQVPFSQVLLYYTSKFERHLPSIDGNDFYQWILPNLWQIQSCSPQPFSIILFLTQQSHRVTFNCFLHNFNHTIYLLNPYDTQSFKVVLTRLGLRNTTS	161321	87738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_87835_113736_113784_159867
746130	contig_8102_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_85337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCACATTATCTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155706	158015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_155700_158000
746131	contig_10549_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_110639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481262	479412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_479400_481300
746135	contig_19564_pilon	-	1297	6	Intergenic	novelGene_29667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_5	49.2235715892295	411	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	171	1118	70080	66253	FALSE	30	ATATATGATAGGCTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQSCRGTTRRLSPCLRAYQTRPQNQLSPRALPFPPLWPHSTTTTSPSFPLLWSPPHPCPSTWPLLQAPSLPLPQVQALSSPWVVLPPGNGEEGLGPELHRGCLDGLRSLFEGPPCPYPGALIPFQAPGTTHSSPATPSGDPSMEEHLAVMYEKLRQELPNLFLHSHDYTLYSSDVEFINEILNIRTKGRTWYILSLTLCRFLAWNYFAQLRLEVLQLTRHPENWTLQARWRLVGLPIHMLFLRFYKRDKDELYRTYDAYSTFYLNSNGLICRHRLDKLMPSHSPPTPVKKLLVGALVALGLSEPEPNLHLHAKA	70250	66073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_66367_66452_66523_67072_67274_67454_67544_68286_68689_70008
746138	contig_9014_pilon	-	1456	4	Intergenic	novelGene_106707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	107.492635406649	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	210	554	44144	43272	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHGECPAGPASLPTLHGPPALQAQLSLCSSVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYR	44534	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42113_43177_43559_44086_44240_44420
746145	contig_2504_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_166852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAATTATTGACAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395678	395023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_395000_395700
746146	contig_8259_pilon	-	1302	3	Intergenic	novelGene_148898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_1	87	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	169	387	392235	363007	FALSE	35	GGCTGCCTTAAGATAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAHAESPPSVNNLKTEGKNKDEGEVCNREKKAADTSLEPYPEEKKKKRSGFRDRKVMEYENRIRAYSTPDKIFRYFATLKVINEPGESEVFMTPEDFVRSITPNEKQPEHLGLDQYIIKRFDGKVREL	406656	362091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_363066_392075_392239_406491
746147	contig_15087_pilon	-	1879	5	Intergenic	novelGene_37155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	326.622105804246	44	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	676	1065	41785	38999	TRUE	35	AGTTGAAGATCAGCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	42460	33339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710
746148	contig_7272_pilon	+	1785	7	Intergenic	novelGene_25395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	132.346346967174	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	126	785	759900	769117	FALSE	30	AAAGGTCCCAGGATCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAPHPTHTGCTQTMVTGIIFMCLRLCPHILDRLQRDLPGQELGIEAGVTAATYTPGALHPHLAHYHAPPRLHHLQLGALPLMVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	758078	770117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_758196_759891_760022_760750_760878_763506_763600_766027_766124_767159_767264_768999
746153	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_97134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746156	SIRV6	+	268	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	8143	20	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
746161	contig_8020_pilon	+	2787	1	Intergenic	novelGene_114455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTAAAAGAAGTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377800	380587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_377800_380600
746162	SIRV6	-	334	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11819	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
746163	contig_14925_pilon	-	912	4	Intergenic	novelGene_55168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	122	379	29675	27020	TRUE	20	GCAAAGGCTGTGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29796	25794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
746164	contig_14516_pilon	-	1603	2	Intergenic	novelGene_153957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426153	423584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_425072_426037
746175	contig_14868_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_150466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263150	261787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_261800_263200
746179	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746180	contig_9345_pilon	-	1502	6	Intergenic	novelGene_24671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2071.87995791262	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	229	600	955353	947889	TRUE	40	AATTTTTCCAACTACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLEKIWVPCFVKPRCKHSPHAVNFEVLFINLSV	1001303	946923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947681_947743_947984_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
746184	SIRV6	+	430	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	6	1153	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
746186	contig_4812_pilon	-	1961	3	Intergenic	novelGene_103707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	467	junction_2	214	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	716	1228	935667	931837	FALSE	45	ACAAGCAGTAAAACTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDLGSVQGFEDINKSERTESVEAGDDDSKLDDAQSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDWSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFTKVKETCQRLLEKPKGNSTSLCIMSAVTIKMTLERTLLCSYVA	936382	931103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_932124_933365_933519_935594
746189	contig_2550_pilon	-	1885	13	Intergenic	novelGene_135702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_1	97.2955120581965	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1833	53	1885	1801470	1682096	FALSE	30	CGAACATTCCCAGCCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKASVGKISVSSDSVSTLNSEDFVLVSRQGDETPSTNNGSDDEKTGLKIVGNGSEQQLQKELADVLMDPPMDEQPGDKELVERSHLDGEGDAPLSNQLSASSTVNPVPLVGLQKPEMSLPVKPGQGDSEMSSPFTPVADEDSVVFSKLTYLGCASVNAPRSEVEALRMMSILRSQCQISLDVTLSVPNVSEGTVRLLDPQTNTEIANYPIYKILFCVRGHDGTPESDCFAFTESHYNAELFRIHVFRCEIQEAVSRILYSFATAFRRSAKQTPLSATAAPQTPDSDIFTFSVSLEIKEDDGKGYFSAVPKDKDRQCFKLRQGIDKKIVIYVQQTTNKELAIERCFGLLLSPGKDVRNSDMHLLDLESMGKSSDGKSYVITGSWNPKSPHFQVVNEETPKDKVLFMTTAVDLVITEVQEPVRFLLETKVRVCSPNERLFWPFSKRSTTENFFLKLKQIKQKERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSIRLPQSGSQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLSVRPKQLSSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDHLVEKYRILITKESPQDSAITRDIN	1801522	1682095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1682135_1743881_1744033_1748640_1748735_1752722_1752898_1769461_1769632_1770656_1770760_1771467_1771535_1772085_1772197_1776275_1776434_1777053_1777229_1777997_1778203_1779819_1780055_1801320
746191	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
746192	contig_3975_pilon	-	2741	5	Intergenic	novelGene_54902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	19.6532440070335	3	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2117	2536	2113987	2113017	TRUE	20	GGGAGGGGGGCACTGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPPRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGKECSFEQLEHVREMQEKLARLHFSLDVCGEEEEEEEEDGVTEGLPEEQKKTMADRNLDQLLSNSSLIFVCRVAWCPS	2117409	2112086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2113062_2113492_2113684_2113803_2116039_2117344
746196	SIRV6	+	304	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	601	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
746198	contig_12277_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_139675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACGTTGCCGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99944	100957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_99900_101000
746201	contig_12270_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_113467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14430	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14400
746209	contig_14638_pilon	-	2206	5	Intergenic	novelGene_71575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	167.662421251752	1	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	51	464	277550	254501	FALSE	10	CCTGTTCTGAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277651
746210	contig_15304_pilon	-	1053	3	Intergenic	novelGene_30515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
746212	contig_10235_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_46502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278487	277367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_277400_278500
746213	contig_6885_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_83663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAGAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194363	191999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_192000_194400
746214	contig_3560_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_149494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187079	185368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_185400_187100
746215	contig_7342_pilon	-	1146	3	Intergenic	novelGene_71170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCCACTTGTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470606	469249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_470324_470421_470480_470592
746219	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
746220	contig_6230_pilon	+	2808	2	Intergenic	novelGene_102101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	49	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	172	1458	157884	160002	FALSE	45	ACAATAAAGATCTATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVGLSFGPQEARSRAAGELAAGAYPAAEEGKQVWARRVWREGERPPRGCWAAPRLVEHKTEKLREVNALGQRTRMSRTLDTSARPSTITLSELHNHYHLENERFDPWRTFDEGPGTPLPPYLSLINTFFKPERLTKAEMKFKEKAMVEVMELNNQIKQAQIQQEQLQKDSRQLCTEKLLVQAEHKFVLEYLTNKIEEYRKQPVKMWNNYVQKSGEIELQRQESASRYAKQTSVLKAELLQKEKTQSLLEHQLKAMKDILILKEKQETEVEALQKEKRKVQDETATKTQEVQVQILQEKALLEKQLSEPDVSQLEKRKRRELKRKNQALELAAKQYTLEFYCGINRENHQSQKDLQQLIQQSQELVACQSQLKDRKQQLQQEQWYLEGLIRGRQRMQGRYNWCLKGQDAPKTTLTPPLGTKSRINPK	157712	161352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_158216_159047
746223	contig_7426_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_27485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGTCTCCCTCACTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835112	834394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_834400_835100
746224	contig_7426_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_27486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	20	427	844741	843661	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFGFWDEATGRSGASLLHSSEFWGPWFPMISSSVPTGVRRLAAFSKRELVLHLYFLSTPCWSFIRDLKIQEQRQQNCGHRLKQKDSEENSQIATCSSSPPATPSEENRPLWGLGKEWGCVRLMLVGTSNRGPPE	844760	842552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_844010_844682
746226	SIRV6	+	349	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
746232	contig_7202_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_18632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAATTTTGCCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
746236	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_97095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746237	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	387	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746240	contig_10399_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_114500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCACCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396932	397529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_396900_397500
746241	contig_10399_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_114499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	197	526	395883	396212	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGRSLLPTHFQLVMDRGSWGVVRRWRRRQGWMEGHKRVQICKHGFCSRGTVNPTSPRLFHCQEWTFIPKTLIRKELVRILRKIKKRKNKEYLLADFLDGNLQAERIK	395686	396932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_395700_396900
746247	contig_12092_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_163444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTGCTTTAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160152	157962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_-_158000_160200
746248	contig_7457_pilon	-	2167	4	Intergenic	novelGene_31576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	26.106618998935	3	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	184	759	924001	922396	FALSE	25	CAAAAAGTTTCCCTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCKVVVCGQASVGKTSILEQLLYGNHVVGSEMIETQEDIYVGSIETDRGVREQVRFYDTRGLRDGAELPRHCFSCTDGYVLVYSTDSRESFQRVELLKKEIDKSKDKKEVTIVVLGNKCDLQEQRRVDPDVAQHWAKSEKVKLWEVSVADRRSLLEPFIYLASKMTQPQSKSAFPLSRKNKGSGSLDG	925111	920987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_922636_923245_923488_923907_924002_924928
746249	contig_10297_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_112557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTGGTTCAGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663607	662055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_662100_663600
746250	contig_10297_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_112556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661865	660752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_660800_661900
746255	SIRV6	+	547	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11024_11109_11205
746262	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
746271	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746272	contig_17059_pilon	+	2797	4	Intergenic	novelGene_166093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	61.5918465022405	47	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	13	1938	482449	486142	FALSE	30	TATGTCACAAAGTAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRDVMMETFRNLASVDSQNFNDGEKLSSEHIMMQFMKNNLWSSMLREISDQSHDNKDQLKNQKRHLRSHTVENLCESNEGNKCGKIFSQISNPTVLKRNHPEADPFECCKHGKAFVNHSSHNHHASCHTGCSTCQCKQCGEACNCPSHLTTSMRTLNGKKLHKCKVCRKDFICISTLKTPVTTLTGEKRYECNQCGKDFCSSSSFWTHVRGHKRECKDSCKTYSRHLSLILHKKFHRRNKPSECKECGKAFSRSSYLTKHRRTHSGVRPYNCKECGKAFSRSSSLTYHMRTHSGERPYECKECGKAFSRSSSLTTHTRTHSGERPYECKDCGKAFSQTSSLTTHMRTHSGERPYECKACGKAFRCSSHLTTHIKTHNGQRPYECKECGKAFSQTSSLTKHITSHSGLRPFKCKECGKTFKCSSDLTTHIKTHSGQRPYQCKECGKAFSNSSALTKHRRIHSGEMPYECKECGKVFRQPSNLATHRRIHSGERAYECKQCGKAFRRSSHLNTHVRIHSGERPYECKECGKTFSRSYCLSEHIRTHTGERPYECKECGKAFSCSSSLTHHIRTHTGERPYECKECGKAFSQSSALNTHRRIHSGGRTYECKECRKVFSRSSHLTSHIRTHIGEITLCHKWDVSSILL	482436	487001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_482483_483455_483610_484320_484888_484971
746273	contig_12119_pilon	+	831	4	Intergenic	novelGene_88626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	129.646527999103	38	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	294	473	70066	193636	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKCVSAKETLEADLYKRFILVLNEKKAKIRSLHKLLSEVQELEKNAEHDRETATCSQVSADRDAVYDESTTLREDDSIFSSPDVTDIAPSRKRRQQMQKNLGTEPKMASQEHQLQEKEKLDPSLPQTLKKEHSSAENMSLETLRNTSPEDLFDEI	22110	193994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_22265_23943_24003_69985_70134_193524
746275	contig_10892_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_116746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATGCAGTATCCCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138542	138062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_138100_138500
746279	contig_7171_pilon	-	1546	19	Intergenic	novelGene_101304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.05704029415	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	91	1425	1075756	1057742	FALSE	10	TGCTGTTATCTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RACRERRRCQCLSPVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDGGRLQAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075846	1057620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061008_1068335_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
746280	contig_14528_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_111285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.8767264973791	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	202	672	250227	247022	TRUE	15	CTTCTTGTACTCACTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQFRSYVWDPLLILSQIVLMQTVYYGSLGLWLALVDGLVRSSPSLDQMFDAEILGFSTPPGRLSMMSFILNALTCALGLLYFIRRGKQCLDFTVTVHFFHLLGCWFYSSRFPSALTWWLVQAVCIALMAVIGEYLCMRTELKEIPLNSAPKSNV	250635	246079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_246765_246844_247263_248485_248554_250065_250305_250511
746283	contig_18869_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_56410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAATTCTCAAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73779	73568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73600_73800
746285	contig_10093_pilon	+	2290	14	Intergenic	novelGene_147500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	117.987312526219	55	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	940	1725	102859	125260	FALSE	20	AGACTTTTATTTGATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQRRWETMPVSQSLQTNRRPQSGRIRAVGIVGIERKLEEKRKETDKNISEAFEDLSKLMIKAKEMVELSKSIANKIKEKQGDITEDETIRFKSYLLSMGIANPVTRETYGSGTQYHMQLAKQLVGILQVPLEERGGIMSLTEVYCLVNRARGMELLSPEDLVNACKMLDALKLPLRLRVFDSGVMVIELQSHKEEEMLASALETVSEKGSLTSEEFAKLVGMSVLLAKERLLLAEKMGHLCRDDSVEGLRFYPNLFMTQS	73136	125825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90936_91006_93068_93140_101699_101815_102327_102925_103664_103752_108824_108858_108972_109051_109680_109816_118733_118800_122855_122921_123505_123591_124997_125075_125166
746288	contig_10609_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_123975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGCCAACAAAACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641447	642198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_641400_642200
746292	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1414	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746300	contig_7457_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_31521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1342	1701	686831	686472	NA	40	TAATCCCAGCATTTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILACLPPIRIHPSLTPERRHPLPRVGTGDFRLTVLPRPFGGLTIFRVLYLGFLFPVYGFGFGFWFVFVPIRPCQFSLIYPVHPPETQTIDLFLQGKAQLPPVGKAAASWLPGSFQRLL	688172	686068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_686100_688200
746310	contig_19960_pilon	+	880	6	Intergenic	novelGene_164189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_5	76.8208305083979	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	27	773	35948	60083	FALSE	35	GTAAGCATCTAAGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGLEDERMSLLSGSTIGDHCEEKMHLLLLISLLFWRPGCSVVWGPNVTSGPEGSSLTVQCHYDLGWEPHYKWWCRGAVWATCKILVKTTGSEQEVKEGRVSIRDNHKKRIFTVTMERLTEDDADFYWCGIERFGTNHTVKVKVSIDPDLEFEPINLEVKNLNGKPSAVIVNCQPPLEANGNITALTSVPMRIKRISRGGDLRAIVLNCQPPLTIGGEKTDPNSANIHLEEINREGGAAYCLWELPASSGRQREIC	35921	60190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_36039_37668_37999_41230_41339_44035_44144_51751_51861_60082
746318	contig_16103_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_118738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGAGACTGAGGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304332	302676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_302700_304300
746319	contig_9995_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_47736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAATTATTATACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530224	531391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_530200_531400
746321	contig_14219_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_54346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAGTATAGGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827914	826976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_827000_827900
746322	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8134	2	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
746328	contig_8729_pilon	+	1892	5	Intergenic	novelGene_40101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.1695276765516	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCAACTTGTGACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276494	323851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276650_286899_286999_306171_306214_322203_323139_323190
746332	contig_6710_pilon	-	438	2	Intergenic	novelGene_98113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	662771	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWGPWIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	662771	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653856_662756
746334	contig_5959_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_150209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAGATGGGATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414952	414054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_414100_415000
746341	contig_1337_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_84239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGATAAGAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421114	420712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_420700_421100
746342	contig_20371_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_129178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGATCAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37982	38363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_38000_38400
746343	contig_6544_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_142084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTATTTGAAGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75241	72462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_72717_75201
746344	contig_18869_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_56300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73567	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
746345	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
746346	contig_10135_pilon	+	1026	5	Intergenic	novelGene_106596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	123.74974747449	2670	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCCTGTGGTTCTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67133	71304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_67484_69879_69944_70239_70317_70562_70654_70860
746353	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746354	contig_6710_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_97979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746355	contig_10331_pilon	+	1824	2	Intergenic	novelGene_54133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCAGTGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409516	412073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410481
746363	contig_12886_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_135542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTGGGAGGCCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885160	886044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_885200_886000
746367	contig_6837_pilon	-	1539	4	Intergenic	novelGene_149802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	72.9977168592735	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGCTGTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11195	8683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_9454_9593_9787_10310_10833_11141
746369	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746378	contig_12270_pilon	-	328	2	Intergenic	novelGene_113639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	18	326	14385	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14402	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
746379	contig_6710_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_93413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653676	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746380	contig_7083_pilon	+	1881	5	Intergenic	novelGene_125164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_4	550.400933411272	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTGAGTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169607	183633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_169717_174263_174401_178715_178808_180833_180914_182170
746384	contig_12046_pilon	-	1899	13	Intergenic	novelGene_83471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.88754433308	229	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	59	1342	345717	319447	TRUE	25	TCTTTGTTAAAGCCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLTVLLHGGPRGRSPLLQRLMQEIRYMKRSYVVKPTLNEVVIVSAIRTPIGSFLSSLSSLPATKLGTIAIQGALEKAGIPKEEVKEVYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCTTINKVCASGMKAIMMASQNLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGATPYGGVQLEDLIVKDGLTDVYNKIHMGNCAENTAKKLNISRDEQDTYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTISVKGKPDVVVKEDEEYKRVDFSKVPKLKTVFQKENGTVTAANASTLNDGAAAVVLMTTDAAKRLNVKPLARVAGFADAAVEPIDFPIAPAHAVPKVLKNAGLKKEDVTMWEVNEAFSVVVLANIKMLGIDHQKVNINGGAVSLGHPIGMSGARIVIHMVHTLKQGEYGLASICNGGGGASAMLIQKL	345775	317881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_318063_319070_319568_319937_320096_321962_322028_323275_323390_328104_328201_329128_329280_329920_330065_331755_331857_332089_332186_332477_332596_338465_338514_345645
746386	contig_15087_pilon	-	1789	7	Intergenic	novelGene_37152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	390.202938652867	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	669	1106	41785	34016	FALSE	25	GATCAGCATTCCATGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLSPQKATETALSETRACPWLHHRLAELADLRSPKY	52888	33332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532
746387	contig_14441_pilon	+	952	5	Intergenic	novelGene_100600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.03108891324554	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	419	946	112641	117775	FALSE	5	CCTGCTTGGCGCTGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGSVSSVTPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADAGTLLVHTPLDMQGRDPLPRGALASLNPRGPNQ	111202	117781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112110_112154_112454_112669_116566_116963_117671
746397	contig_8140_pilon	+	3183	14	Intergenic	novelGene_86456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	32.4948789775145	5	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	64	1140	842417	905791	TRUE	5	TCTTTTGTTTGCTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPCGTVNAERGWFVSAQQPEEAEAEESSPLLSNELHRQGSSGVSFGFSVFNLMNAIMGSGILGLAFVMANTGILGFSFLLLIVALLASYSVHLLLSMCIQTAVTSYEDLGLFAFGLPGKMVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAISEFLAGDYSGSWYLDGQTLLIIICIAIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMVFFALVIIKKWSIPCPLPLNHIEEYFQISNATVDCKPKLFHFSKESAYAIPTMAFSFLCHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAVALSFLLYFISALFGYLTFYDKVESELLQGYSKYLPHDVIVITVKLCILFAVLLTVPLIHFPVSTLKGFVA	842353	908013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_842522_843683_843815_846153_846228_865395_865449_868628_868669_881391_881471_888214_888298_888758_888815_892629_892696_892905_892960_895088_895169_895520_895622_905636_907487_907665
746398	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
746399	contig_7318_pilon	+	3968	14	Intergenic	novelGene_152216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	24.3278883967794	150	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	17	1756	236433	253059	FALSE	45	AATAACATTTGTTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQWKSMENRALDPGTRDSYGATSHLPNKGALAKARNNFKDLMSKLTEGQYVLCRWTDGLYYLGKIKRVSSSKQSCLVTFEDNSKYWVLWKDIQHAGVPGEEPKCNICLGKTSGPLNEILICGKCGLGYHQQCHIPIAGSADQPLLTPWFCRRCIFALAVRKGGALKKGAIARTLQAVKMVLSYQPEELEWDSPHRTNQQQCYCYCGGPGEWYLRMLQCYRCRQWFHEACTQCLNEPMMFGDRFYLFFCSVCNQGPEYIERLPLRWVDVVHLALYNLGVQSKKKYFDFEEILAFVNHHWELLQLGKLTSTPVTDRGPHLLNALNSYKSRFLCGKEIKKKKCIFRLRVRVPPNPPGKLLPDKGLVPSENGASSELQKRGKSKSSLLPHEFQQQKRRVYRRKRSKFLLEDAIPSSDFTSAWSTNHHLASIFDFTLDEIQSLKSASSGQTFSDVDSTDAASTSGSASTSLSYDSRRTVGSRKRKLAAKVYMPLRAKRRAAELGGRCPSDSSAEGASGPERPDEGIDSHTFESISEDDSSLSHLKSSITNYFGAAGRLACGEKYQVLARRVTPEGKVQYLVEWEGTTPY	236416	255271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_236619_237095_237178_240820_240917_241405_241507_242234_242384_244487_244584_245260_245330_245526_245648_247125_247194_248489_248652_249268_249357_250124_250211_251318_251412_252716
746400	contig_7720_pilon	+	3371	16	Intergenic	novelGene_155730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	63.9056248611098	187	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	20	1699	164847	238168	FALSE	15	TACTTTGTCATGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALSEEELDNEDYYSLLNVRREASYEELKAAYRRLCMLYHPDKHRDPELKLQAERLFNLVHQAYEVLSDPQTRAIYDIYGKKGLEMEGWEVVERRRTPAEIREEFERLQREREERRLQQRTNPKGTISVGVDATDLFDRYEEEYEDVSGSGFPQIEINKMHISQSIEAPLTATDTAILSGNLSTQNGNGGGSINFALRRVTSAKGWGELEFGAGDLQGPLFGLKLFRNLTPRCFVTTNCALQFSSRGIRPGLTTVLARNLDKNTVGYLQWRWGIQSAMNTSIVRDTKTSHFTMALQLGIPHSFALISYQHKFQDDDQTRVKGSLKAGFFGTVVEYGAERKISRHSVLGAAVSVGVPQGVSLKVKLNRASQTYFFPIHLTDQLLPSAVFYATVGPLVVYFAMHRLIIKPYLRAQKEKELEKQRESTATDILQKKQEAEAAVRLMQESVRRIIEAEESRMGLIILNAWYGKFVNDKSRKNEKVKVIDVTVPLQCLVKDSKLILTEASKSGLPGFYDPCVGEEKNLKVLYQFRGVLHQVMALDSEALRIPKQSHRIDTDG	164827	239840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_164919_188254_188385_190684_190759_196990_197093_215025_215155_216144_216268_217282_217357_220310_220501_221166_221253_221648_221766_231415_231572_232815_232886_233778_233837_233960_234104_234824_234955_238142
746401	contig_5961_pilon	+	1721	5	Intergenic	novelGene_144108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	460	junction_1	397.995838546083	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	170	694	144074	170504	FALSE	60	AAAAGAGAATACAAGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKVFEVCCVR	113726	171531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314
746402	SIRV6	+	333	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	536	2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
746408	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746413	contig_3410_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_58938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCGTCACCCCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53978	56181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_54000_56200
746418	SIRV4	-	338	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1180	3	1180	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3978	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
746420	contig_5419_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_15536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATATAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410113	408819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_408800_410100
746421	contig_7718_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_129410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATGGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263355	260976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_-_261000_263400
746428	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_97524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746429	contig_9579_pilon	+	2463	18	Intergenic	novelGene_150589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	159.777072206147	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	393	1868	806241	818325	FALSE	30	TGAACCCTAACCTCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKENAELLEKLSNYEQKIKESKKHVQETKKQNTILSDEAVKFKDKIKELEENNEVLDDKAKSLRVMLESEREQNVKNQDLILENKKSIEKLKDVISVNASEFSEVQIALNEAKLSEEKVKSECHRVQEENAKLMKKKEQLQQEIKDWSRSHAELSEQIKVFEKSQKDLETALTHKNDNIDALTNCITQLNRLDCESESEDKNRGGSGSDELANGEMGGDRSEKMKNQIKQMMDVSRTKTAISVVEEDLKLLQIKLRASMSTKCNLEEQIKKLEEDRNSLQLTKAGLEDECKTLKQKVEILNELYQQKEMALQKKLSQEEYERQEKEQRLSAADEKAILAAEEVKTYKRRIEEMEDELQKTERSFKNQIATHEKKAHDNWLKARAAERAIAEEKREAANLRHKLLEITQKVATLQEEPVIVKPMPGRPNTQHPARTGPLSQNGSFGPSPVSGGECSPPPPTADPPLRPRSATLSRREMPRNEFGESSHPSLQ	796345	818920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_796545_797303_797459_806202_806292_806563_806642_806730_806842_807900_807973_808157_808263_808895_809019_809115_809228_810379_810436_810525_810617_810789_810929_816661_816764_817425_817487_817586_817623_817696_817765_817889_817991_818155
746434	contig_7179_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_78187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGACCATCCCCACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220050	1221357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1220000_1221400
746435	SIRV6	+	552	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	10	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1281	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746438	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746439	contig_17108_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_109546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGGTTGCCATAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372949	371149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_371100_372900
746442	SIRV6	-	527	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1515_1639_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
746447	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
746448	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746450	contig_9945_pilon	-	1521	2	Intergenic	novelGene_104798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTTTGAATCTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14351	12558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_12597_12868
746453	contig_614_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_132665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGAGTGCTTTCAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170478	1171557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_1170500_1171600
746454	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746457	contig_3449_pilon	+	1842	2	Intergenic	novelGene_73702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGAGGGGTGGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290675	293514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_291213_292209
746459	contig_3627_pilon	+	1161	3	Intergenic	novelGene_78503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5605.5	27	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	234	482	634068	634316	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLELQCAGHHGEAPQVQQTGPGSLPHPASGIFGSRYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621284	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630873_631000_634066
746460	contig_8616_pilon	+	1398	8	Intergenic	novelGene_72502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	118.912761711934	1678	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	703	1305	337780	339244	FALSE	5	CGCGCTTGACTCCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336758	339337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
746462	contig_7457_pilon	+	1280	11	Intergenic	novelGene_31311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	60.5293317326402	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	40	810	183157	189512	TRUE	20	GTGGTTGTCGTATACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183117	195103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189537_189996_190064_190243_190336_190768_190824_194871
746463	contig_14467_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_138224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTAGCATGTATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120210	120758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_120200_120800
746464	contig_20029_pilon	-	1192	6	Intergenic	novelGene_138899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_5	358.262250313929	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	487	1035	7239	5156	FALSE	10	CCAGCATTGTCTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQKKKFPYGYIQALKCRVLELPYQDKDLSMVILLPDDIEDDSTGLQKIEEQLTLENLSEWTKPENLHTMEVNVSLPRFKLEETYDLNSYLARLGVQDLFNSSKADLSSMSGARDLFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIANFCMLVPEETFNADHPFFFFIRHNPSKSILFCGRFSSP	12758	4998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_-_5561_7095_7264_9501_9620_10088_10227_11528_11706_12729
746465	contig_6958_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_69909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTACTTAGTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47633	49940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_47600_49900
746470	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
746473	contig_4125_pilon	-	2665	19	Intergenic	novelGene_25209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	15.4883468739853	71	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	6	1853	1657134	1628078	TRUE	25	AGTGAAACCAGGTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAECGASGSGSSGDSLDKSITLPPDEIFRNLENAKRFAIDIGGSLTKLAYYSTVQHKVAKVRSFDHPGKDTEQDHEPPYEISVQEEITARLHFIKFENTYIEACLDFIKDHLVNTETKVIQATGGGAYKFKDLIEEKLQLKVDKEDVMTCLIKGCNFVLKNIPHEAFMYQKDADPEFRFQTNHPNIFPYLLVNIGSGVSIVKVETEDEFEWIGGSSIGGGTFWGLGALLTKTKKFDELLHLASKGQHTNVDMLVQDIYGGACQTLGLSGTLIASSFGKSATADREFSKEDMAKSLLHMISNDIGQLACLYAKLHHLDRIYFGGFFIRGHPVTMRTITYSINFFSKGEVQALFLRHEGYLGAIGAFLKGAEQDNPNQYSWGENYAGSSGLMSSSPELCPAQRARSGTFDLLEMDRLARPLVDLPLLLDPSSYVPDTVDLTEDPMARKYWLSCFEEALDGVVKRAVASQPDSIDAAERAEKFRQKYWNKLQTLRHQPFAYGTLTVRSLLDTREHCLNEFNFPDPYSKVKQKENGVALKCFQQVVRSLDALGWEERQLALVEGLLAGNVFDWGAKAVSDVLESDPQFGFEEAKRKLQERPWLVDSYNDWLQRLKITVE	1657139	1625624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1626211_1627086_1627156_1627414_1627516_1628021_1628093_1628557_1628608_1629837_1629894_1631137_1631290_1632326_1632415_1632927_1633041_1634251_1634408_1636643_1636745_1637576_1637659_1638916_1639099_1649290_1649445_1649825_1649919_1650275_1650460_1651217_1651433_1651884_1651968_1657010
746475	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746477	contig_5899_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_146975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTGGCATTTACCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141076	139519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_139500_141100
746478	contig_6898_pilon	-	918	3	Intergenic	novelGene_35778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCATCTCCAGCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127701	124422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_124462_124780_124847_126888
746481	contig_11989_pilon	+	1631	15	Intergenic	novelGene_68424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_10	61.2740997985482	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	106	1056	28834	42204	TRUE	30	CCTGAAGCAATGTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALNQLVPQKANLVLLSGANEGKCELKEKWFGTQYNMQDIENSWAELWNSNFELNPDLHLPAENKYIATDFTLKAFDCPETEYPVKIVNTPQGCLWYKKDNKFKIPKAYIRFHLISPLIQKSAANVVLFDIFVNILTHNLAEPAYEADVAQLEYKLVAGEHGLIIRVKGFNHKLPLLFQLIIDYLADFSSTPAVFTMITEQLKKTYFNILIKPETLAKDVRLLILEYARWSMIDKYRALMDGLSLESLLSFVKEFKSQFFVEGLVQGNVTSTESMDFLKYVVDKLNFIPLEQEMPVQFQVVELPSGHHLCKVRALNKGDANSEVTVYYQSGPRSLREYTLMELLVVPCLPYL	28728	44820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_28841_29391_29479_30708_30829_31634_31687_32621_32773_35469_35598_37169_37333_39014_39047_39296_39436_41345_41394_42180_42265_42838_42930_43215_43333_44348_44439_44603
746482	contig_13015_pilon	-	1458	3	Intergenic	novelGene_165551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.5	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTCCTCTCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370196	367981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_368494_369169_369274_369354
746483	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746484	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8142	-2	597	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGTCGCTTTTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
746494	contig_9389_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_84110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396863	1397915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1396900_1397900
746497	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746498	contig_8330_pilon	-	1240	6	Intergenic	novelGene_71984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	346.68544820918	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	373	975	2056084	2039646	FALSE	10	CTTTCTCTTATGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGNDISVARGGG	2056547	2039380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056207_2056297
746499	contig_1813_pilon	+	2704	4	Intergenic	novelGene_105468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	14.6969384566991	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	126	776	94284	97935	FALSE	10	GCGGCTGCTGTGAGGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALCLKQVFSKDKTFRPRKRFEPGTQRFELYKKAQASLKSGLDLRSVVRLPPGESIHDWIAVHVVDFFNRINLIYGTMAERCSETSCPVMAGGPRYEYRWQDERQYRRPAKLSAPRYMALLMDWIEGLINDEDVFPTRVGVPFPKNFQQVCTKILTRLFRVFVHVYIHHFDSILSMGAEAHVNTCYKHFYYFIQEFSLVDQRELEPLREMTERICH	90505	99863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_90597_94249_94702_97244_97448_97905
746500	contig_5945_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_104531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATTTTATTTTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4734	5621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_4700_5600
746501	contig_5945_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_104532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAGATTATACCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6796	7283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_6800_7300
746502	contig_11978_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_62997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	321.186375022354	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	430	1014	1517714	1527267	FALSE	5	CCTACTGCTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPDMDPEHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD	1517284	1527344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517869_1520333_1520442_1523599_1523778_1526094_1526190_1527218
746503	contig_20614_pilon	+	734	7	Intergenic	novelGene_107550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1221.82683124719	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	212	646	153826	155100	FALSE	35	GAAAAGATAGTTTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLYVFLLAFCACAVGLIAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLVALVGCCGACKENYCLMITFAVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVQVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152705	155188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152737_153645_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154820_155031
746504	contig_15047_pilon	+	1148	6	Intergenic	novelGene_52197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	6	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	562	726	4573	21237	FALSE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRRRLHRPEREPAHLDGGGHGCSDHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSSSGGDSAQGSDVSLTASKV	2174	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_3308_3498_4158_4434_4552_4676_21004_21062_21232
746508	contig_17436_pilon	+	2047	16	Intergenic	novelGene_164180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	25.1816511681731	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	820	1851	97405	152520	TRUE	35	TCAGATGTAAAATTATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLLLYEEGLRVVIHTSNLIHADWRQKTQGIWLSPLYPRIVHGTHGSGESTTNFKADLISYLMAYNAPPLKEWIDTIQEHDLSETNVYLIGSTPGRFQGNQKDNWGHFRLRKLLREHTSPIPKAETWPIVGQFSSIGSMGADESKWLCSEFKESLLMLGKEGKALGKSAAPLHLIYPSVENVRTSLEGYPAGGSLPYSIQTAEKQNWLHSYFHKWSAETSGRSHAMPHIKTYMRPSPDFSRIAWFLVTSANLSKAAWGALEKNGTQLMIRSYELGVLFLPSTFGLDSFNVRPKFFSGSQELTASFPVPYDLPPELYGSKDRPWIWNIPYVKAPDTHGNMWVPS	77831	152788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_78415_81547_81592_82800_82857_86293_86391_89607_89643_97400_97494_100419_100588_101058_101138_106653_106840_107459_107509_110438_110506_112318_112427_128543_128647_140932_141042_152446_152530_152601
746509	contig_4232_pilon	+	1548	9	Intergenic	novelGene_63169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_8	37.6129548825933	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	84	1091	117183	120880	FALSE	25	GAGACTGATTCTTACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRQLARSGRCSLLLGVLQRRSVLGVTMTSELDIFVGNTTLIDEDVYRLWLDGYSVSDAVALRVRSGILEQTGATAAVLQSDTMDHYRTFHMLERLLHAPPKLLHQLIFQIPPSRQALLIERYYTFDEAFVREVLGKKLSKGTKKDLDDISTKTGITLKSCRRQFDNFKRVFKVVEEMRGSLVDNIQQHFLLSDRLARDYAAIVFFANNRFETGKKKLQYLSFGDFAFCAELMIQNWTLGAVDSQVDDMDVDLDKEFLQDLKELKVLVADKDLLDLHKSLVCTALRGKLGVFSEMEANFKNLSRGLVNVAAKLTHNKDVRDLFVDLVEKFVEPCRSDHWPLSDVRLFLNQYSASVHSLDGFR	117099	121337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117670_117881_118009_119046_119148_119630_119765_120102_120212_120280_120345_120603_120691_120778
746510	contig_10042_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_79130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68140	66678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_66700_68100
746511	scaffold_16539_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_68419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGAGTTCACTCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950756	948688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_948700_950800
746526	contig_16098_pilon	+	1829	8	Intergenic	novelGene_45813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	66.7658106322971	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	62	1015	150572	152636	TRUE	15	ACTAGCTTGTGTGTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGTGSLGTQGLTPG	150510	154036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_153104_153689
746529	contig_7695_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_41643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTTTGAGGTATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767730	765546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_765500_767700
746530	contig_9706_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_20974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGATTCCGCATCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345900	346696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_345900_346700
746531	contig_9706_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_20973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTGTTAGCAAGTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344669	345243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_344700_345200
746532	contig_3862_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_137413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAAAAAAAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530272	529880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_529900_530300
746539	contig_11105_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_159816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTAGCATTCAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260025	259512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_259500_260000
746540	contig_5039_pilon	+	754	7	Intergenic	novelGene_64929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_1	348.920597462135	5255	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	42	683	1361490	1368757	FALSE	25	CATATTAAGTGTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRAVTGFCLQVRCFSTSVTRPFAKLVRPPVQAHGVEGRYATALYSAASKQKKLDQVEKELLRVAQLLKDPKVSLAILNPYVKRSIKVKSLKDITAKERFSPLTSNLINLLAENGRLNITPGVISAFSTIMSVHRGEVPCTVTTASPLDSASLSELKTVLNSFLRPGQVLKLEVKTDPSILGGMIVRIGEKYVDMSAKSKIQKLSKVMRETA	1361448	1368828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1361526_1362687_1362739_1363908_1364020_1365540_1365671_1366437_1366551_1368233_1368321_1368643
746543	contig_10235_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_46519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAAACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306043	304416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_304400_306000
746544	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746547	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
746552	contig_7457_pilon	+	1664	7	Intergenic	novelGene_31552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	404.393132428774	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	217	867	840844	844700	FALSE	0	CTTGCTCTTGTCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRGGAARPNGPASGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFARAKNWVKELQRQASPNIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNEIFMAIAKKLPKNEPQNAAGAPGRNRGVDLQENNPASRSQCCSN	820308	845497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_820365_833662_833734_840754_841010_842546_842699_842968_843092_843987_844082_844584
746557	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	-9	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746559	contig_3394_pilon	+	2760	1	Intergenic	novelGene_152720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCTTGCACCCAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553329	556089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_553300_556100
746560	contig_18251_pilon	+	1178	7	Intergenic	novelGene_50157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_1	870.320758239296	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	47	799	35708	53991	TRUE	40	GTACACTGTAATTTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYSNGVIELCFICSVMPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35661	55261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
746563	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746567	contig_3386_pilon	-	2098	7	Intergenic	novelGene_34479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	66.4590517202552	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	76	795	119519	86268	TRUE	20	TGATCTGATGATTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVLEDMDLAANELSIYDKLSETVDLVRQTGHQCGMSEKAIEKFIRQLLEKNEPQRGAPQYPFLIALYKVLVTLGLILLTAYFVIQPFSPLPPEPVLSGAHTWLSLIHHIRLMSLPITKKYMPENKGVPPHRDDEDRPFPEFDPWSTNDCEQNESDPIPANCTDCTQNLPLKVMLLEDTPERFEQLHPLVIKTEQPLLSEELQHFLCRYPEVAEGFTEGFFTKWWRCFPDRWFPFPYP	119594	81889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_83070_86144_86269_95083_95224_95349_95505_100748_100963_101427_101636_119517
746568	contig_9578_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_68010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCACTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325422	1323512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1323500_1325400
746571	contig_8452_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_47966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTATCAGCACTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71184	70744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_70700_71200
746572	contig_4519_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_123747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGCTCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257190	1257857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1257200_1257900
746573	contig_9901_pilon	-	3114	13	Intergenic	novelGene_126938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_8	144.021603317774	2	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	249	1142	216214	185991	TRUE	45	TCTAAACAAAATGTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFTLLSPQEIASIRKACVFGTSGNEALYVTDNDEVFVFGMNYSNCLGTGDNQSTLVPKKLEALCGKKIKSLSYGSAPHVLLSTEDGVVYAWGHNGYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249498	176575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_177916_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_207324_207492_215524_215676_216088_216261_245846_245927_249376
746576	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	8	1153	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
746581	contig_15087_pilon	+	937	4	Intergenic	novelGene_37262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	41	622	284653	301944	FALSE	30	CGTAAGAATCACCTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284612	302259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
746585	contig_16882_pilon	-	2192	2	Intergenic	novelGene_148237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	0	284	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	104	1366	435293	434031	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGCGFIPCLPGFLHVLPGPGLRPHVTPQPRSQATMENANGTNQSMTEKSPPAEVGMESIIDQVTQEEQGQLLFHEETIDLGGDEFGSEENETVSEDSNNFIDKLNEQMMESVLISDSPNNSEDDVGELGCLQDVVEPVESEVDNRIENIDKEEIDTLSNISETDRDDTPKDVSDMTPDSRASLKEDPTLEVKGMPVFESEDAADSVPSDEKTNPEEQISEMSSSQSSSKDEPVPMCTIFSQSNTANSQPHLFLHDGFESQMVKSPSFSSASETSAKTPPQMVQPSPSLSKFFGDTTNTNSLASDFFDSFTTSTFISVSNPNAGSSVPEKLSSLTTQGGDKSPDSADPSYSPGIDRSESGISTASLEISQSPKPFSQIRAVFAGSDDPFATALNMSEMDRRNDAWLPSEETRNVLISVATQQYSTVFIDKENLTMPGLKFDNIQVRHQIFSKAFL	443499	433204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_435300_443402
746587	contig_9668_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_58258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAGAAAAAAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630059	629791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_629800_630100
746589	contig_13894_pilon	-	1125	4	Intergenic	novelGene_62036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	274	912	287445	286423	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGAEQDSSHKIPPEKEGGAGGPH	288313	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286488_286774_287123_287219_287538_288132
746590	contig_5649_pilon	-	2205	2	Intergenic	novelGene_82410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	281	631	1286943	1286593	FALSE	65	GAAAAAAAAAAAGCGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFGWAVFLASRSLGQGLLLTLEEHIARFLGTRGTTTMGNSCICRDDSGAEDSVDTQQQQSENSAVPTADTRSQPRDPVRPPRRGRGPHEPRRKKQNVDGLVLDTLAVIRTLVDK	1301143	1285018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1287099_1301018
746595	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
746596	SIRV6	+	479	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	377	0	198	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746604	contig_5590_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_163007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATTTTCTTAGGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262745	263181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_262700_263200
746605	contig_13608_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_52389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	36	349	384	442039	442074	NA	30	GCCAGGGGTTTTAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKACVTQFYSFGSSPFINLRDSKENKYHQKTKKLPHNFTSQIYALLTDHSYECITKLHDNIFCYLYLLTVTCNIDVIQINYKPKKPNPLPSSKFLLTETLKDRTEQPYRVSKAAIFMEADCHIFLLWS	441690	442075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_441700_442100
746611	contig_5039_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_64790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATTCCACTTGGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154963	156805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_155000_156800
746613	contig_9696_pilon	+	2347	3	Intergenic	novelGene_68825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCTCCAGAAGGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533181	549672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_534219_548121_549370_549610
746614	contig_9297_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_69858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGAAAGAAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830492	829467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_829500_830500
746615	contig_13409_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_128449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACCCATCCTCCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65537	64702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_64700_65500
746621	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_89949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653800	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746627	contig_6870_pilon	-	1853	13	Intergenic	novelGene_103961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	10.917302780449	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	14	1477	1332463	1323346	FALSE	20	TGTGTTGAGGTTATAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVAVVGEAVARDVQRLLVQFQDEGGQLLGAPFDVPVDITPDKLQLVCNALLAQEDPLPLAFYVHDAEIVSSLGKTLESQAVETEKVVDIIYQPQAVFRVRAVTRCTSSLEGHSEAVISVAFSPTGKYLASGSGDTTVRFWDLSTETPHFTCKGHRHWVLSISWSPDGKKLASGCKNGQILLWDPSTGKQEGRTLTGHSKWITGLSWEPLHANPECRYVASSSKDGSVRVWDTTMGRCERILTGHTQSVTCLRWGGDGLLYSASQDRTIKVWRAHDGVLCRTLQGHGHWVNTMALSTDYALRTGAFEPAEVSVNAQDLRGSLQELKERALSRYSLVRGQGPERLVSGSDDFTLFLWSPAEDKKPLARMTGHQALINQVLFSPDSRLIASASFDKSIKLWDGRTGKYLASLRGHVAAVYQIAWSADSRLLVSGSSDSTLKVWDIKAQKLAIDLPGHADEVYAVDWSPDGQRVASGGKDKCLRIWRR	1332476	1322969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1323359_1324043_1324115_1324233_1324394_1325436_1325640_1327355_1327403_1327549_1327686_1327992_1328186_1328449_1328548_1328723_1328801_1330079_1330160_1330750_1330969_1332158_1332303_1332439
746628	contig_8377_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_34921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGAAAGAATATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68076	69297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69300
746633	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746637	contig_10855_pilon	-	200	2	Intergenic	novelGene_124394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTGAAGAAAAAATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930198	915717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_915785_930065
746643	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746650	contig_6871_pilon	+	2226	4	Intergenic	novelGene_21529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	643	junction_3	219.806480543429	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1488	2162	68067	72153	FALSE	15	AATGGTGTTATGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	66579	72217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_68220_68898_69001_69656_69868_71944
746651	contig_5280_pilon	+	1117	5	Intergenic	novelGene_52581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	86.2478260595593	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	34	438	38343	40148	TRUE	40	ATGGTCATGTCAATATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSRMKYLSFCTCIGFYGFQLFHIYYFTEIS	38309	41765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40056_40150_40882_41075_41279
746654	contig_7272_pilon	+	2202	2	Intergenic	novelGene_25402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1282	1752	773827	776493	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPDLQTSALLWRKSLSDWLLCFPWLSVIPCPWFSTRYMYDSLCPQEATRCQNLEVALASKFPIEKSTRNSVTGNLGFTNDHKSQPPCCFPKLGNHERPRAHKTIPGNKKLIWCKDWECPGAILILFTLLLKAWVALSHFKSFSRRGIVYSTNIW	772545	776943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_774192_776387
746655	contig_854_pilon	+	2067	2	Intergenic	novelGene_36303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTTCTACTCTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551558	555496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_553571_555441
746658	contig_12638_pilon	+	2260	3	Intergenic	novelGene_33264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	379	junction_2	162.5	28	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	55	552	830585	836478	FALSE	60	AAAGAAAAACACCAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFLQTATLIEDILGVKKEMIRLDEVPNLSSLVSNFDQQQLANFCRILAVTISEMDTGNDDKHTLLAKNAQQKKSLSLGPSAAEINQAALLSIPGFVERLCKLATRKVSESTGTASFLQELEEWYTWLDNALVLDALMRVANEESEHNQGTWGGFPGSPEWKTADQCFLCIWNMNTGEKALSKY	826314	838186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_826366_830581_830790_836185
746663	contig_7996_pilon	-	2385	1	Intergenic	novelGene_165155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230481	228096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_228100_230500
746666	contig_8138_pilon	+	1056	4	Intergenic	novelGene_52435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	492.813239360398	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	204	560	280295	306577	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKSVHWRRRGRVPNCRPTIPPQTTASTPTPRAAPSLPSMEAQTPARSQSRKSPKAGRNSGWRPAKLSGAGQQ	280091	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306364_306779_307643
746667	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
746668	contig_14322_pilon	-	306	2	Intergenic	novelGene_116523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGGCGAGGGAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674888	672845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
746671	contig_6710_pilon	+	559	2	Intergenic	novelGene_95785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGATGGCTCTAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653361	657181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
746672	contig_7749_pilon	-	2407	1	Intergenic	novelGene_170874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	552	1854	2405	41873	41322	NA	80	AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPLRQRKPQQLLLTWRKWSPGGTVVKSSAGNQKVSSLNPPAAPWKPYGAVMLCPIGGCYEWESTLLQWVNWFMEKNTPFLESTGPNVDALGTRTGCPWLCFAYRQIFTKMDAGDLPVICWRNHSTQITLCLQPFYEVNTGIGGGFGIYNWAQMLVSPFANDALKGTIFFFFFTEKTSMPLVF	43726	41319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_41300_43700
746677	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746678	contig_12050_pilon	-	1442	6	Intergenic	novelGene_62744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.087282580093	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACTGCAAAAAGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696723	685562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686487_686540_686709_693021_693120_694067_694177_695000_695130_696709
746680	contig_10140_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_148404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217922	215771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_215800_217900
746682	contig_12623_pilon	-	2041	7	Intergenic	novelGene_138165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	141.136655605677	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	12	1037	177710	51811	FALSE	30	CTTTGGAAAGGAATACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177721	50806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_147430_147540_177617
746684	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
746685	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
746689	contig_16917_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_161922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAGGAAAGTTGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61501	61097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_61100_61500
746697	contig_6488_pilon	-	1041	2	Intergenic	novelGene_44711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3198	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	475	822	28952	28605	FALSE	10	CAGGTGGTTTCTCTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLVPLPHRHLLIYRCSPALPPPPHPWLTAHIHEMQVLFPPGDYRAVVQGTFPSLGSRTVEVVCAVPFSAPVQPVAGDPVLKWPLGEIRGQTWHRRVKEVLVLGLSKGRVSADI	29475	28385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_29368_29416
746698	contig_10734_pilon	-	2301	2	Intergenic	novelGene_51144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTGAGAATTATGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892725	887915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_888122_890630
746699	SIRV6	+	530	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2833_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746713	contig_9919_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_137997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGGTAAGCACTCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841767	840700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_840700_841800
746714	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746722	SIRV6	+	273	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	32	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10723_10819_11031_11109_11205
746726	contig_7078_pilon	-	3828	1	Intergenic	novelGene_130171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGTTGATCTAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751582	747754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_747800_751600
746730	contig_15867_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_170908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTTAGTTTTGGGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284478	284781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_284500_284800
746734	contig_12626_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_80457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATATGCATGTGTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172389	174546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_172400_174500
746737	contig_2069_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_23516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509802	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508889_1509740
746738	contig_7513_pilon	-	2055	12	Intergenic	novelGene_88957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	98.5983588283109	1	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	543	1406	163991	146657	FALSE	45	ACAAGTGCCATTTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKISRDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	168478	146007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147151_147983_148086_152144_152280_154232_154278_161081_161260_163896_164031_164682_164807_164928_165049_166132_166281_167532_167621_168455
746740	contig_7730_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_156290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTGTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388092	390241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_388100_390200
746741	contig_2799_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_85529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAAAAAAAAAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663277	664714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_663300_664700
746742	contig_11751_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_150300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGATGGATTAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156931	158367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_156900_158400
746747	contig_7728_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_64713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_1	151.372241694293	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	39	452	752150	729195	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKVSISYCLLFQMGFFFFFW	752188	727965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_729337_730500_730552_735945_736058_752041
746748	contig_3601_pilon	-	976	5	Intergenic	novelGene_132867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_4	33.1238207337258	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	116	448	169167	144563	FALSE	30	CTAACTTGAAAACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	207153	144034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169200_207070
746749	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	10	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	395	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746751	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	159	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746752	contig_6710_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_89202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746753	contig_4442_pilon	+	2552	15	Intergenic	novelGene_127932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_14	154.374180986012	230	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	74	1627	151365	391178	FALSE	50	AAATAAATAAATGGTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLFHFVSELSCTLENAEFPAYCFMMDYTVSMFLNTLTPKFYVALTGTSSLISGLILIFEWWYFRKYGTSFIEQVSVSHLRPLLGGVDNNSSNNSNSSNGDSDSNRQSVSECKVWRNPLNLFRGAEYNRYTWVTGREPLTYYDMNLSAQDHQTFFTCDSDHLRPADAIMQKAWRERNPQARISAAHEALEINECATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAMIDIFCSAEFRDWNCKSIFMRVEDELDIPPAPQSQHFQN	151291	392103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_151381_255560_255644_274936_275097_295230_295286_295930_296047_297220_297297_301539_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_391058
746754	contig_18869_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_56021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73535	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
746762	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_95700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746765	contig_12479_pilon	-	2419	4	Intergenic	novelGene_56848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCACAGTTCAGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216942	210855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_212967_213173_213343_213528_213644_216918
746767	SIRV5	+	1190	1	FSM	SIRV5A	SIRV504	2473	1	1279	4	1279	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCGACCATGTAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12412	13602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_12400_13600
746769	contig_9609_pilon	+	1926	11	Intergenic	novelGene_23149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_1	9.13016976841066	222	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	495	1538	749304	757537	FALSE	15	CTAATGTTTTTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLWGQMLWALLSGPGRKGGTRGWAFSSCPPHSPLAGLVSATELVSHWTAVFEERGIPEARESSEYIVAHVLGAKTFQSLRPALRTQPLTSQQLQCVQELSSRRLQRMPVQYILGEWDFQGLNLKMAPPVFIPRPETEELVDWVLEEEAQRPCAAGTQDGPLILEVGCGSGAIALSLLSQLPQSQVIAVDKEEAAICLTRENAQRLQLQDRIRIVPLDVTLERWWTHLLPWGPMDLVVSNPPYVFHQDMEQLAPEICSYEDPVALDGGKEGMDVIIHILALAPQLLKGSGSVFLEVEPRHPGLVGSWLRSQPDLHLDLVAVRRDFCGRPRFLHIRRSGPQCGCPVGT	747924	757925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_748249_749133_749532_749925_750018_750274_750369_754607_754743_755056_755122_755388_755439_756056_756166_756924_757021_757194_757309_757476
746771	contig_333_pilon	-	2250	2	Intergenic	novelGene_170912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_1	0	29	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18674	14934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_-_16183_17672
746772	contig_7253_pilon	+	2632	7	Intergenic	novelGene_140205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	54.6526913030517	14	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	463	828	207464	215768	FALSE	40	GAATTGCACACAATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAFFNNTISSAVKQSILAKLQEAVEVNLGTAMTYTLFEYAKDNKERFMENHHPINSTTSISNIISVETPNIGPSSKKKDKKEQLSKAQKRKLADKTDHKGELPRGWNWVDLSKTGSKDDE	201263	217572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_201538_204133_204215_207356_207490_207570_207719_209612_209731_212355_212397_215735
746773	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	262	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746774	contig_614_pilon	+	1497	6	Intergenic	novelGene_132627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	39.0312695156076	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTAATTGATTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588666	641291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619859_620004_639594_639663_640090_640933_640983
746775	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
746778	SIRV6	+	452	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	107	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGTAGATTGCGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11023
746779	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746780	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
746782	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_90558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
746785	contig_4686_pilon	+	1988	2	Intergenic	novelGene_118559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628769	631724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_630215_631181
746786	contig_8045_pilon	-	1143	3	Intergenic	novelGene_35459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	78.5	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	64	438	485420	480088	FALSE	10	TGTTCTGTAGGGTCTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRALPHRGPQRFCSRRSRGLAMSWRRAALVGTRLARNGSSLAGGLGGTAGAAASGMGSNTSSSWGKSAIAPMNQIQETISDNCVVIFSKTSCSYCTMAKKLFQDININYKVVELDMLEYGNQFQDALFKMTGERTVSIFSVVLLP	485483	479382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_480298_481442_481507_485319
746789	contig_14871_pilon	+	2113	11	Intergenic	novelGene_63707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	746.051311908236	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	790	1677	201945	227470	TRUE	30	AAAGAGTTCATGACCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIDLQGQDRRPVPHPLCH	200606	233173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_201331_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227420_227475_227652_227827_230158_230300_233056
746796	contig_14357_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_121672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAGAAAGACAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524585	525067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_524600_525100
746799	contig_2892_pilon	+	1401	6	Intergenic	novelGene_119036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	1563.91879584587	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTGTAGTGTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324819	339510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_324853_325211_325299_325763_325831_328152_328220_331706_331813_338469
746802	SIRV1	-	222	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3880	2	3606	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6760	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
746809	contig_10734_pilon	+	1353	8	Intergenic	novelGene_50986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	502	630	294617	295464	TRUE	50	ACATAATCATAGAATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPFGLLLGPSFVFYELSSPFVFCSLFSFLLQYLLPLLFSDFVFKWNRVCINIHRHKIWKLLPFQLWHLGHLQQGKTSSKTSKIQIFEPEDEVALVLHVGLDVRHKSFHPLFKHSSVSQGHGLQLWKKVRCVFLQPHLLQGAYLLVNCKEFDVGLFHGKEEHQCAASMANAGSAAAAMHEGTCIAGRVVLQNPVDFRNIDSAGHHISAH	293272	302893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_293530_293959_294127_294539_294662_295380_295472_296402_296543_299621_299696_302295_302429_302524
746813	contig_10549_pilon	-	2299	2	Intergenic	novelGene_110629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	1998	2297	389974	389675	FALSE	60	TTCACTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEINNKMEDPSLPAILGKLWYALWFHISWPITIPQQKREQKDPETTLGTSDDVWCGRRNGMSEQNKELSVNTGANSDFYKIFYSFQDFIVTSQEESHLA	392121	389672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_390414_390563
746815	contig_10196_pilon	-	1033	7	Intergenic	novelGene_132244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	247.526878450716	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	87	515	1442405	1433608	FALSE	45	ATAAACTGTTTATAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFVNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448600	1433089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442172_1442335_1442416_1448524
746816	contig_6842_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_130850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2131965	2129695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2129700_2132000
746825	contig_11171_pilon	+	1224	5	Intergenic	novelGene_48594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	534.373172511495	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	109	609	212165	249997	TRUE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEQKRKEGQGPRPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRETDTGSREAASPEMPGPEIGQQLQEASIRFHLHGPAAP	212056	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_239236_239336_249980_250068_251407
746826	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746831	contig_2069_pilon	+	2446	1	Intergenic	novelGene_23336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTTCCTCTTTTCTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592615	595061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_592600_595100
746833	contig_10734_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_51535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGAAGCGGTTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2300802	2301296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2300800_2301300
746834	contig_9955_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_21250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGAAAAGAGTACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10298	9242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_9200_10300
746838	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
746839	contig_7753_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_41488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACTCATGGAGACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046982	1049716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1047000_1049700
746846	SIRV3	+	187	2	ISM	SIRV3A	SIRV303	2018	3	3	3106	3	-2002	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTCTGCCAGACGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	4716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4568
746847	contig_11417_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_103341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGATCTGCAATTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661834	661313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_661300_661800
746850	contig_960_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_108307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGTACTAGAATATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043518	1041758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1041800_1043500
746852	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
746853	contig_8452_pilon	-	2725	1	Intergenic	novelGene_48008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAATACCTACTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312557	309832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_309800_312600
746857	contig_3424_pilon	-	1214	2	Intergenic	novelGene_55551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321349	317959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_319090_321265
746859	contig_8674_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_102940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCCAGCATCTGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473314	472484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_472500_473300
746866	contig_13295_pilon	+	1508	2	Intergenic	novelGene_31231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAACACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87891	89947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_88554_89101
746867	contig_2646_pilon	+	1408	7	Intergenic	novelGene_69684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	187.801905090325	303	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	148	774	2313200	2333563	TRUE	15	CCTCCTGGTATTTAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDIDIGKEYIIPSPGYRNVSQRTSTSGQQREREESKYKRSRPVECQDALETAARAEGLSLDVSVHSQLRILDEEHPRGKYHHGLSVLKPIRTTSKHQHPVDNAGLFSCMTFSWLTSLARVAYKKGELLMEDVWPLSKYESSDVNCRRLERLWQEELNEVGPDAASLRRVVWIFCRTRLILSIVCLMITQLAGFSGPNFQDGCVLRSE	2309556	2335208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2309649_2313144_2313329_2329777_2329936_2330114_2330271_2330951_2331100_2333527_2333603_2334613
746868	contig_19957_pilon	+	2165	1	Intergenic	novelGene_57711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1454	1789	199745	200080	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYFPSTPGLQGVKNGVVIEEMIPQRTYFVFPKGPNCLGEKIQKNQSLTTAQMITRSFLDTQTAQLAFVKLITNSDSLILKIYLEAAHFCFNAELKSVQLAHYQSKKKKNS	198291	200456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_198300_200500
746870	contig_6710_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_89233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653722	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746877	contig_16103_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_118797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTCTTCCCCGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590675	589098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_589100_590700
746880	contig_6710_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_97322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
746881	contig_3916_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_141862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1504	1869	70187	69822	NA	30	CATTGGTCTATCAGATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHYSLVTPNNKKVMLTFAIQITGANTHVPLLPDFPALGFWEPRGLLTYPTVPHWLFLVSDPCSILSRAICFLTVCRWHPRLHLDFLGLLPSLATALLLFPHCPNRDLFVHNKTLLKLRE	71690	68901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_68900_71700
746882	contig_16110_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_126774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAGAAAATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8288	10594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_8300_10600
746885	contig_1154_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_87230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645125	1642995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1643000_1645100
746890	contig_1532_pilon	+	1919	3	Intergenic	novelGene_37405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCTGATATTTGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12365	18582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13518_15732_15889_17971
746894	contig_6710_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_98108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
746900	contig_8538_pilon	+	2552	13	Intergenic	novelGene_5107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	40.1188338979753	141	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	40	1572	889294	969857	FALSE	35	AACAGTCGAGTCTGTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLRSRAGARRADMGSRAGVRWATAALGVTGLLCAVLGAVMIVLVPSLIEQQVLKNVRIDPSSLSFNMWKEIPIPFYLSVYFFHVVNPEEILKGEKPQVQERGPYVYREFRHKSNITFYDNDTVSFLEYRRFQFQPAKSHGLESDYIVMPNILVLTAAMMMEDKPLSQKLLLTLMFSTLGERAFMNRTVEEIMWGYDDPLLSIINNYLPNMFPFNGKFGLFSELNNSHSGLFTVFTGVKDFSRIHLVNRWNGLSKVNFWHSDQCNMINGTSGEMWAPFMTPKSSLEFYSPDACRSMKLVYKEAGVFEGIPTYRFVAPPTLFANGSVYPPNEGFCPCLESGIQNVSTCRFGAPLFLSHPHFYNADPVLAEAVIGLHPSDQEHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYIKAIKGIGQTGSIKPVVLPLLWFGQSGTMEGQTLRTFYTQLVLLPAVLHYAQYVLLALGCALLLLIPVVCQIRSQEKCYLFWSSSKKGSKDKEAIQAYSESLMTSPPKGTVLQEARL	889254	975780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_889420_939685_939844_944023_944166_944573_944778_946502_946599_949137_949254_951881_952049_960037_960157_962507_962582_965576_965629_966444_966595_969728_969858_974800
746901	contig_6677_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_114184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTAATTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486945	488770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_486900_488800
746902	contig_14202_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_157132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4393	junction_2	465.5	50423	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTGTTGTTAATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88214	86144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084
746903	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
746906	contig_10225_pilon	-	177	1	Intergenic	novelGene_86849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCAACAGTCAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36293	36116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_36100_36300
746908	contig_4874_pilon	+	1557	4	Intergenic	novelGene_78627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.5964091158113	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAAGTGCCTCCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123551	128233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_123725_124796_124976_125181_125233_127079
746909	contig_10446_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_162483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATATTTCTTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756670	756169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_756200_756700
746910	contig_10446_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_162482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTGCCTCTTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754713	753842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_753800_754700
746915	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
746916	contig_8330_pilon	-	1359	11	Intergenic	novelGene_71740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	34.3920048848566	699	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	100	1242	526197	515388	FALSE	10	TGCTTTGTCCAATGCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSDWHLAVKLADQPLAPKSILRLPETELGEYSLGGYSISFLKQLIAGKLQESVPDPELIDLIYCGRKLKDDQTLDFYGIQPGSTVHVLRKSWPEPDQKPEPVDKVAAMREFRVLHTALHSSSSYREAVFKMLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGVLQDKDLFSVFADPNMLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	527614	515270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520379_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_527544
746920	contig_8617_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_73403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62337	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
746921	contig_8020_pilon	+	1345	16	Intergenic	novelGene_114407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_15	54.8329179315572	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	132	1343	173375	201355	FALSE	20	GTGCCGGAGGGAGAAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRIPKKAFRGRRHFLKAQAVLSGLCVLSQGRAYPPQITPKMCLLE	167197	201357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_169128_169206_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_200340_200425_201309
746924	contig_12292_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_166997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATGTCGAGTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232388	234154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_232400_234200
746925	contig_14220_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_159857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311912	309857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_309900_311900
746926	contig_5899_pilon	+	2253	1	Intergenic	novelGene_146973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCCCATAGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133425	135678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_133400_135700
746927	contig_10225_pilon	+	2078	12	Intergenic	novelGene_86827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	607.686386059169	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	481	1962	35782	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPAAHTDYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRHEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21307	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21601_34904_34930_35619_35785_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42611_42726_45216_45259_46110_46766_47476
746929	contig_5450_pilon	-	1065	8	Intergenic	novelGene_170921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	116	715	211298	198659	TRUE	30	TTTAATTTTATGATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRSRYCHNVFKTWAAAFTTFRDDLSPLPLVMFTSFSIPPESARALAFSMFLLVTSCKAQQMAAMVSSDRMLGPLPPGSRLTRSRMAYLPISSLLRTSSAIFLKAVATEETTLSLSILRSSTRMGSPFSFRTAARMYAANFQLPADRFWRDPAEPSKVAGLELSARRVRYGFTTDGCHSISTPLGDFDSPGIGPTPSH	211536	192137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_-_192180_195971_196090_198275_198466_198658_198835_203986_204138_207636_207833_211221_211307_211429
746930	contig_5450_pilon	-	796	3	Intergenic	novelGene_170919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTTCTCAATGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158766	151444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_-_151604_152389_152943_158682
746936	contig_3975_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_54685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	150	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	304	561	1053847	1058772	FALSE	5	CCGTTTCTTCTGTGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDLGTQRCRVPSRKGRNTCLCPSLLLEVVIPPVLKKTVSVCSQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQSQRDLELPDMHMRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKLGPALKIYARISMLKDS	1053543	1060067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1053950_1058617
746937	contig_17066_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_130952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGACAGTGCAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210337	208821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_208800_210300
746938	contig_17066_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_130953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213034	211999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_212000_213000
746946	contig_9036_pilon	+	1609	8	Intergenic	novelGene_155445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_7	336.784979547752	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	86	919	94373	169746	FALSE	40	ACACTGAACATTCACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGIQKLASQYLKRDWPGIKADDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRISICENYKNFISEPARTVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLAKGKKKYFETEQMAHAVREKADIEAKSKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNSKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLVNIMKALDGNVYDHLKDYLIAFSQTELETCQAVQNTFQSLLETSSKVIRDYNLQLFLQENAVFHKPQPFQFQPCDSDTSRQLESETGTTEEHSLNKEARKWATRVAREHKNIVYQQRVSIIENPSLHSF	82984	170436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_83066_94368_94514_101675_101810_110016_110072_110908_111038_144325_144449_150080_150177_169590
746949	contig_9112_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_60215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTTGTTGACCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108422	109375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108400_109400
746950	contig_6710_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_93611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACAGAAGCACTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653355	653804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
746951	contig_7933_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_164701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCATTTATCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191727	189921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_189900_191700
746952	contig_14546_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_157447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	135	530	523827	523432	NA	40	TGAAATTACACCTCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLLLTLLRLSDKATKDFILVSEDIIVNIELICNRALQYQESLHLFSTFKKSNHCNQFSILGSLPPCPKTSDNSKRHFSFHMGGGCYRQLVSRCRDATKHYAQDSPPTRNYLAQNINSTEAEKPCSIKWM	523961	521034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_521000_524000
746954	contig_9727_pilon	-	1089	5	Intergenic	novelGene_86295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_2	31.4085975490788	760	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	250	891	252262	245075	FALSE	10	CGATGCCTGGCCATCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRTEEDYNFVFKVVLIGESGVGKTNLLSRFTRNEFNHDSRTTIGVEFSTRTVMLGTAAVKAQIWDTAGLERYRAITSAYYRGAVGALLVFDLTKHQTYAVVERWLKELYDHAEATIIVMLVGNKSDLSQAREVPTEEARMFAENNGLLFLETSALDSTNVELAFETVLKEIFAKVSKQRQNSTRTGAITLGSGQAGQELGPGEKRACCISL	252511	244876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_245203_245515_245597_246255_246450_247948_248145_252219
746955	contig_4068_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_161709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAGGCCACAAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80994	80293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_80300_81000
746960	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
746963	contig_3155_pilon	-	1895	4	Intergenic	novelGene_26382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCGGAGTCACTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262542	258096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_258167_259207_259315_259719_259978_261082
746964	contig_7457_pilon	-	2999	8	Intergenic	novelGene_31454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	33.2670088458674	1	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1977	2699	475867	474462	FALSE	20	TCCAGGTGAATGTATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEEDKVSSSNFRQQMLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVEKAWNLLQKRIPKMPSGP	478167	474161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_477750_478073
746965	contig_11171_pilon	+	1497	6	Intergenic	novelGene_48565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	95.3322610662309	10	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	50	649	70574	106939	TRUE	15	TCCTACCTTTGAGCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDGYFPALAVGG	70524	107858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88391_106906_107481_107551
746968	contig_9389_pilon	-	1640	7	Intergenic	novelGene_83935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCCACTGATCCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168365	163260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_163742_164232_164296_164397_164538_165813_165927_166068_166228_167246_167405_167839
746969	contig_12864_pilon	+	1070	4	Intergenic	novelGene_76409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAACCTGGGGGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242232	245907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242888_243778_243823_244598_244767_245704
746973	SIRV6	+	472	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	381	3	202	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746974	contig_11978_pilon	-	2423	3	Intergenic	novelGene_63129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_2	67	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTAGATAATCTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1979560	1923520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1925588_1940593_1940656_1979266
746975	contig_12113_pilon	+	1563	8	Intergenic	novelGene_134736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGCTGCTACTGCCGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210367	259657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_211153_217854_218030_220158_220248_222276_222389_222747_222855_231872_231903_233165_233282_259508
746976	contig_10437_pilon	+	1077	2	Intergenic	novelGene_38483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGCTTTGCTGGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213244	1215716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1213401_1214795
746981	contig_1143_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_86588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAAAAGAGGAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131269	133227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_131300_133200
746982	contig_13453_pilon	-	2613	2	Intergenic	novelGene_146705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACAGCAGAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61804	58920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_60500_60770
746983	SIRV6	+	470	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	386	0	207	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746984	contig_18919_pilon	-	1504	5	Intergenic	novelGene_156014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	61.8708331930321	1111	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	366	1097	167194	59358	FALSE	0	CGGTGGTGTTCGCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGALEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVLHTPPFGVVPRELKMCGSFRMEAREPLSSEKI	167559	58950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_59460_69111_69255_74958_75061_159885_160216_167139
746989	contig_4315_pilon	-	2375	14	Intergenic	novelGene_46732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	169.008210297396	1	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	13	1482	163741	149329	TRUE	35	CCATACAACTTGTACTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGGVCEAVRGSQGLLRLLSLCVLLAGLCRGNSVERKIYIPLNKTAPCVRLLNATHQIGCQSSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTGLVACL	163753	147234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_148028_149228_149350_150641_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161983_162089_163656
746993	SIRV6	+	378	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	0	405	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	214	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
746994	contig_15327_pilon	-	2425	11	Intergenic	novelGene_70798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_10	74.4143131393417	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	66	1109	1296367	1247150	FALSE	15	CCCGTAAGTACTGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSSVYRYPPKSGSYFASHFIMGGEKFDSAHPEGYLFGENSDLNFLGNRPVAFPYAAPPPQEPVKTLRSLINIRKDTLRLVKCAEEVKSLGEEASKAKVHYNVEFTFDTDARVAITIYYQATEEFQNGIASYIPKDNSLQSETVHYKRGVCQQFCLPSHTVDPSEWAEEELGFDLDREVYPLVVHAVVDEGDEYFGHCHVLLGTFEKHTDGTFCVKPLKQKQVVDGVSYLLQEIYGIENKYNTQDSKVAEDEVSDNSAECVVCLSDVRDTLILPCRHLCLCNTCADTLRYQANNCPICRLPFRALLQIRAMRKKLGPLSPGGFNPIISSQTSDSEEQSVSWAQNHDPLGSKCSVVSLLPFVTFPSFFV	1318952	1245833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1247356_1247540_1247701_1248422_1248495_1252640_1252689_1253496_1253541_1253850_1253918_1255461_1255580_1256021_1256169_1261345_1261435_1296274_1296394_1318913
746996	contig_5526_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_111700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTTTAAGCAAAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314645	314427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_314400_314600
747001	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_93615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747003	contig_3822_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_133290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGACTGTAAAAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207529	205032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_205000_207500
747006	contig_6496_pilon	+	1433	7	Intergenic	novelGene_103489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	75.012036071257	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	219	536	453548	463310	TRUE	20	GCGTCTGAAGGAAGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHPECVCMAREKERDQKNDGSRSCRHHEAWWLRGIGRYCSLMAPRYLFLLFCSASWARIPRRRQCAFTGTWMSSPRPWRMAHTRMCVFSVCGAGDELPDQEVC	451324	468164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_451439_452592_452686_453536_453670_455572_455696_463237_463421_463637_463786_467525
747008	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
747010	SIRV6	+	364	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
747012	contig_5780_pilon	+	1517	5	Intergenic	novelGene_29786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_4	104.67897353337	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	278	760	107519	110295	FALSE	25	CAGATGAGCCTGAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73993	111052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990
747025	contig_5684_pilon	+	1983	3	Intergenic	novelGene_81060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGAGAAATCCCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408655	414368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_408872_408930_409441_413111
747026	contig_10074_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_57134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATTGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372398	374350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_372400_374400
747029	contig_3233_pilon	+	2482	16	Intergenic	novelGene_56525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1867	2208	367609	376768	TRUE	45	AAGAAATGGAGATGGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSPLARFRESAVWRSLMGVIVEKFMEDVGKTAWEVLAMKSAICRRAQMLEELFPFFICSWMRPSSSSLKDGLCKIMVTRFFCSIKLKSCRRSAARLRRRMYSGSSSEKRSK	327606	386196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_328004_337126_337252_340062_340212_342151_342244_343123_343242_344438_344696_349375_349556_354684_354784_356916_357056_358491_358648_367020_367099_367532_367685_374732_374872_376641_376862_382210_382325_386129
747031	contig_8712_pilon	-	944	9	Intergenic	novelGene_58875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	91.0740598359379	44	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	80	943	915910	900657	FALSE	20	ACCTGCCTGGCATGCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVGPPYAKEQKSWLHNVVTQERLEEKMSICQHHRGSGQCAAMELGTLQGGYLELLNSNADPLQLYHFYDQKDLAGEEEIELCLEPDTDTINCDQFSRLLREMEGDEETREAYANIAELDQYVFQDSQLEGPSRDIFIEHMGSEEVIGDSLEASTEAGQKSQKRPFPEELPVDLKHRKIAEPSTGLTVTGSFLVGLESASSALSCLQLPLLLNQEPAPDPTQLEETVHMPVPPSRPLFSCLNLPAGSIQIIPTLTLPQGLCQISGAGAGVSGILIYHGEMPQASQVPPSGSPAVHSLPKSPDRPGSTSPFAPSAA	915989	900655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_900770_901688_901830_902235_902389_903784_903830_906284_906366_906526_906590_911737_911834_912066_912214_915885
747049	contig_1939_pilon	+	3354	8	Intergenic	novelGene_144883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGCACTATCATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918146	961986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_920062_929635_929709_932169_932268_934148_934302_935393_935515_949442_949614_954150_954317_961329
747050	contig_9017_pilon	+	2246	6	Intergenic	novelGene_130342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	168.396437016939	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	15	980	609366	614480	TRUE	80	TAGAAAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLLLWAGSLAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNLTCRATFPGADVTTESTVLLNVSYPPPAVWPLLLLGDQGSALHLLCPSLASPLPVLAGWGQAGGGEQQHLLHGQLFLHWALDQQLIEPQHRAHLWPQAQL	609351	617969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609403_609470_609855_610072_610385_614247_614531_614838_614936_616850
747065	contig_9113_pilon	-	2354	1	Intergenic	novelGene_68617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAAAAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630003	627649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_627600_630000
747066	contig_15323_pilon	+	2979	1	Intergenic	novelGene_148534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATCTTACATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149313	152292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_149300_152300
747069	SIRV6	+	286	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8143	2	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
747077	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	41	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747080	SIRV6	-	306	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1339	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3159	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105
747081	contig_5023_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_7158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGGGAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370609	368613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_368600_370600
747084	contig_12033_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_170923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTGCCTTTCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166629	165270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12033_pilon_-_165300_166600
747085	contig_20402_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_72844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAAGCTGCTCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148726	148095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_-_148100_148700
747088	contig_7704_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_154620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346822	348430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_346800_348400
747090	contig_11590_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_125599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGCAGAAAGAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738760	740207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_738800_740200
747091	contig_10331_pilon	-	3114	1	Intergenic	novelGene_54059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTCTGCTTTTGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49914	46800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_46800_49900
747093	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747095	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747097	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_96012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
747098	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747100	SIRV5	-	397	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAATTTACGGTGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
747101	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
747111	SIRV6	-	508	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1203_1631_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
747113	contig_5643_pilon	+	1139	7	Intergenic	novelGene_38745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.450537176861	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	124	780	152703	156948	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYP	152445	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152531_152664_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823
747115	contig_10982_pilon	+	1912	1	Intergenic	novelGene_87902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1098	1466	299579	299947	NA	35	GCACATTTTTTGAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNIEYTMDCQKNEQICLGRSTARMFLGRKVRFHLMYFGHVIRRDQFLEKDIMLGKVEGHQKRGRPSTRWIDTVAATVGSNVATIVRMVQDQAVFRSVVHSLMLLDESVFSLIVSFTHL	298481	300393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_298500_300400
747117	scaffold_12124_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_22423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTATTGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642698	1640716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1640700_1642700
747120	contig_12270_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_113545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	4	339	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14412	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
747124	contig_3004_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_127506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290783	293005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_290800_293000
747125	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_97733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747126	contig_12948_pilon	-	1826	9	Intergenic	novelGene_126209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	624.397396995695	29	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	77	892	261235	249456	TRUE	85	TAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESDKVPAAVTDRAPRPAWSSSPEAEMENKETLKGLHKMDDRPEERTIREKLKATCMPAWKHEWLERRNRRGPVVVKPIPIKGDGSEMSNLAAEPQAEGQMSAASPVPKGRRSPSPGSSPSGRTVKSESPGVRRKRVSPVPFQSGRITPPRRAPSPDGFSPYSPEETNRRVNKVMRARLYLLQQIGPNSFLIGGDSPDNKYRVFIGPQNCSCGRGTFCIHLLFVMLRVFQLEPSDPMLWRKTLKNFEVESLFQKYHSRRSSRIKAPSRNTIQKFVSRMSNSHTLSSSSTSASSSENR	302301	247893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_248636_248748_248831_249345_249460_256166_256316_256684_256802_257404_257606_259249_259451_261091_261238_302227
747131	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_96490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747142	contig_5988_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_16167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2059936	2059444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_2059400_2059900
747143	contig_10437_pilon	-	2620	15	Intergenic	novelGene_38218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	75.0133321483588	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2472	147	2618	278736	247664	FALSE	30	ACAGTAAATTTGCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIPECVGLEAAAAAVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRQFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELETWVKQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLHYRESSSEDEASRPTEIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGNRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDVHKGTSSQVSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKSLLSGNHIAYDHHPPPDKLYVGSRVVAKYKDGSQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDGYASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYITAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEGTWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGGQLRTRPNMGAVRSKGPVVQYTQDLTSTGTQFKPVEPPQPAAPPAPPLSPQATDTESLESQLAQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSPPTSPTLSENTPGKPGISQTYRSPVGSTTAAPTPPVPPAPPAPPAFHGMLERAPIEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRSEQYRGKNPLLVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCLDPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFINTGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGHKYTHIVYENHRLEGEMQKICDCLHDLEKDTLVFFFFPCCLLVFFLIVVKYI	280319	247661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_247821_248896_249014_249451_250085_250699_250856_250940_251080_251796_251927_252623_252815_253701_253776_254383_254586_254730_254857_255775_255876_256317_256353_277602_277755_278476_278748_280184
747146	contig_7593_pilon	-	1101	7	Intergenic	novelGene_127313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	54.9383492855603	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	45	1100	291713	266474	FALSE	15	TTATCCTGGAGGCCATCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRTQVSYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASSLGRLGGIAVAYFGLTTLGASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLDESGLPPVPKETVDSFLDLARNLLPSNLVVAAFRTYATDYKMVTSNTSSGNVSIEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEELIRFFNAFNDATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIVVLVTSLGKYIFASILGHFIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLTPFATAFATCSSSATLPSMIKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVQLNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIA	291757	266472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_266541_266828_267024_268452_268687_272811_272979_278019_278083_280182_280226_291426
747147	contig_19812_pilon	-	1834	10	Intergenic	novelGene_101009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	18.1291661878495	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	16	774	67090	50202	FALSE	35	AATATTTACTGTAAACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKPGTMIEWGNNWARAIKYRQENQEAVGGFFSQIGELYVVHHLWAYKDLQSREETRNAAWRKRGWDENVYYTVPLVRHMESRIMIPLKISPLQ	67105	49141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_50267_51992_52077_53251_53347_53730_53763_54056_54141_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60436_66992
747149	SIRV6	+	336	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_10682_10819_11031_11109_11205
747150	contig_3386_pilon	+	1329	3	Intergenic	novelGene_34517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGAAGTCCATGACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404154	405883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404940_405102_405188_405424
747151	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_97334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
747152	contig_19851_pilon	+	1044	6	Intergenic	novelGene_29839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	175	690	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
747154	contig_10990_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_7524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTACTCATCTTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792040	791133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_791100_792000
747156	contig_11292_pilon	+	2315	4	Intergenic	novelGene_109448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_2	322.205248595088	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGTGTCTTGTGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329553	334167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_331369_332049_332176_332265_332386_333913
747159	contig_675_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_136356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	226	558	244023	244355	NA	55	ATGAATTCTGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHEPCIEETGEYFRLTYDTRGGFALHRITAEEAKYQQCKMRKIFVGTKGIPHLVVTHDAGTSRHPDPLIKVNDTVVIDLGTDMITDFWWGQSWPCWCDHQQKRISWFF	243797	244554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_243800_244600
747166	contig_10904_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_22798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTGTTCCTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855198	856543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_855200_856500
747167	contig_5779_pilon	-	1082	2	Intergenic	novelGene_106445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	94524	94011	FALSE	75	GTTCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGCSEKPSLHCSWVRLRARRSHLRRAPPLPPRTPAAFSPESPNSRFLCNPLGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94236_94368
747168	contig_7810_pilon	+	2318	10	Intergenic	novelGene_144231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_9	4.14847882279877	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	103	1917	644480	651197	FALSE	75	CCAAAAAAAAAAAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQEILNSASSFRLCSPDDLHTSACPAPRTAPAAKMLVRVLLLCAVLALSHSANPCCSNPCQNRGVCMTTGFDQYKCDCTRTGFYGENCSIPEFLTRIKLLLKPTPNTVHYILTHFKGVWNIVNNSPFLRNAIMKYVLTSRSHLIDSPPTYNVHYGYKSWEAFSNLSYYTRALPPVPHDCPTPMGVKGKKELPDSKEIVEKFLLRRKFIPDPQGTNMMFAFFAQHFTHQFFKTDHKRGPAFTKGLGHGVDLNHIYGETLDRQHKLRLFKDGKMKYQIIDGEVYPPTVKDTQAEMIYPPHVPEHLRFAVGHEVFGLVPGLMMYATIWLREHNRVCDVLKQEHPEWDDEQLFQTSRLILIGETIKIVIEDYVQHLSGYNFKLKFDPELLFNKEFQYQNRIAAEFNTLYHWHPLLPDTFQIDNQEYNYQQFIYNNSILLEHGLTHFVESFTRQIAGRVAGGRNVAPAVQKVAQASIDQSREMKYQSLNEYRKRFMMRPYTSFEELTGEKEMAAELEALYGDIDAMELYPALLVEKPRPDAIFGETMVELGAPFSLKGLMGNPICSPHYWKPSTFGGEVGFNIINTASIQSLICSNVKGCPYTAFSVPDPQLTKAIVINASSSHSRLDDMNPAVLLKERSTEL	644377	651598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_644532_645829_645947_646062_646207_647104_647249_647867_648050_648756_648841_648967_649215_649555_649843_650496_650645_650787
747173	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
747175	contig_753_pilon	+	2914	16	Intergenic	novelGene_112885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_14	56.6555283170927	526	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	12	1856	218165	243501	FALSE	20	TGTAAGCTTTTCTTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGHDLFRRLGAGAKFDVKRFSSDAARFQLGKRKRDFNSSEVLQGLDFFGNKKSVPGKYGASRTHQELQDEEKQEEKLIERKRKQNKKKRKMMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSIANVIQQAGCPVPEYIKGFKKLLSKQKKKMIKKPLERESISTTPKYFLEKAKDKRVPSELLCMHQNLILWLISRLDDKCSSSRKKVTG	218153	244559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_218252_219571_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236184_236308_236440_236592_236763_236840_237845_237918_238494_238588_241600_241685_243482
747181	contig_5765_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_141365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGAAAAAAAACATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426455	427011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_426500_427000
747191	contig_2100_pilon	-	749	5	Intergenic	novelGene_50658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	412.244163087848	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	197	400	1172416	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALELLKNAIGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1174404	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173305_1174375
747196	contig_14876_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_170234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGCATCTATAAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37246	35627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_35600_37200
747207	contig_16525_pilon	+	1748	2	Intergenic	novelGene_133825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGAATCATGACTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156816	159345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_157779_158559
747217	contig_5981_pilon	+	1253	4	Intergenic	novelGene_35477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	244.136573799721	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	101	466	23508	25627	TRUE	15	TTTTTTGTGTCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLK	23407	38419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25634_37638
747218	contig_12005_pilon	-	1752	10	Intergenic	novelGene_160474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	56.4816150575227	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	610	1632	198145	186547	FALSE	20	TTTTTTCCGTTATAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELIVKLGSHGLIHGDFNEFNLILDKDDHITMIDFPQMVSTSHPNAEWYFDRDVKCIRDFFIKRFSYESELYPTFRDIRREDSLDVEVSASGYTKEMQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRDEENMGHVTQYRTRTLSVTSAGSVVSCSTIPLELVKQKVKRQLTKQQKAAVRRRLQKGEANIFTKQRRENMQNIKSSLEAASFWED	216449	186426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_186712_190632_190730_192724_193250_194007_194101_198002_198195_202798_202888_205881_206003_208295_208413_209587_209727_216355
747220	contig_11832_pilon	+	2340	14	Intergenic	novelGene_106961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	39.0446565755238	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	38	2026	446244	459276	FALSE	30	ACTGAAATTTGAGCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYRIRVATGAWLFSGSHNSIQMWLVGARGMAELELQLRPMRGEEEFEQDVPNDLGPLQFVKLRKHHSLVDDAWFCDRITVQGPGACAEAAFPCYRWVRGQGILSLPEGTACLAGDNPLDVFQRHREKELKERQQIYRWATWKEGLPLTIAANSKDELPPNERFHEEKRLDFELTLKAGILEFTHKRVYTLLSSWNHLENFNQIFCSQKSVLAEKVHQCWQDDELFGYQFLNGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGTEELRAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVIQGEKQYLAAPLVMLKMEPNGKLLPMVIQLQPPNSSSSTPPLFLPSDPPLAWLLAKSWVRNSDFQLHQLQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLSELHPLFKLLVPHIRYTMEINTRARTQLISEGGIFDKAMSTGGGGHVVLLHRAGAQLTYCSLCVPDDLADRRLLGLPCALYAHDALRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDVVRGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQAQLCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDVRQACLQMTITWHLGRKQPDMVPLGHHKEKYFSSPKAKAVLKQFQTDLENLEKEITARNEQLDLPYEYLKPSRIENSVTI	446206	459590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_446379_446908_447108_448219_448302_448404_448528_448638_448743_448989_449151_450024_450169_451502_451713_455182_455270_455500_455671_456172_456295_458580_458682_458806_458978_459096
747222	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
747229	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_89268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
747233	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747234	contig_13901_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_146636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTATATTGTCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151467	153790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_151500_153800
747235	contig_6885_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_83685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAGGAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251034	250091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_250100_251000
747236	contig_9771_pilon	-	1649	7	Intergenic	novelGene_156915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	114.301380374672	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	179	652	346973	339000	TRUE	25	CCTCAAATGTTTTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLLSVQTEL	350152	332004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_338905_339023_339573_339756_341990_342198_346911_347067_350067
747237	contig_8452_pilon	-	938	2	Intergenic	novelGene_47969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1405	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTTGCATCATTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79095	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845
747239	contig_3155_pilon	+	1339	3	Intergenic	novelGene_26418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1141	junction_2	718.5	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	170	496	259780	261211	FALSE	30	CTGTACTGTAAACAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	259207	262054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261082
747240	contig_10923_pilon	+	874	4	Intergenic	novelGene_66222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_3	355.621521658443	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	21	758	36556	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	36535	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_36698_37270_37540_38578_38742_42554
747242	SIRV6	+	530	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747243	contig_10056_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_170928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAACAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43475	41987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_-_42000_43500
747245	SIRV6	+	385	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	575	2	396	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747246	contig_4426_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_15344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGAGTTTATCTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	6427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6400_8200
747247	contig_15112_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_124766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTCATAAAAATCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39957	42253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_40000_42300
747251	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747252	SIRV4	+	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCACTGGGGCCGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
747256	contig_3386_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_34488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTAGGAAAATAATGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331889	334088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_331900_334100
747260	contig_513_pilon	+	1616	5	Intergenic	novelGene_80152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	738	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATCTCTTCCACGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445776	451102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_447023_447829_447916_450624_450709_450793_450901_451009
747264	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	9	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747265	contig_6829_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_123767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAAGTGTTCCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22235	20051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_20100_22200
747268	contig_11416_pilon	-	1956	6	Intergenic	novelGene_145375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.6454436304252	338	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	137	847	657908	653744	FALSE	10	GCTGATGGTGTGTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQKLQQLLDKNISLAVATSNPTLARKSTDLQVLAARGAQVRQVPMRQLTGGVLHSKFWVVDGRHVYVGSANMDWRSLTQVKELGAVIYNCSRLARDLEKAFQIYWALGAPQAVIPKVWPRNFSSHINRFQPFWGRFEGVPTTAYFSASPPVLCPHGRTQDLDALLAVMGEARKFIYASVMEYFPTTRFQHPARYWPVLDNALRAAAFSRGVHVRLLVSCWLNTDPTMFPYLRSLGVGAGYRPSPALPESLGQSWASLPCPLRPSLPQGDRCRFSANPPPL	658517	652634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_653888_655913_656035_656141_656282_657027_657229_657803_657932_658404
747278	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747280	SIRV1	-	180	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3924	0	3650	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6716	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
747284	contig_14176_pilon	-	2125	14	Intergenic	novelGene_74855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	10.3672219008194	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	89	1960	451628	413308	FALSE	55	AAAACTTACCCTAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRAPLAQPVRPEPARQYPLGSSGVYGTFMKPPRGLARGDPGATMMQDASLGPLVGPSLSVLFLCRLAASMAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDASLQGKGTPAAGGARLQPVTAFLLRDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	451716	413142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419969_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351
747287	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747288	contig_16999_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_85007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATGGCAGAATGGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221134	218682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_218700_221100
747291	contig_5871_pilon	-	1479	10	Intergenic	novelGene_160165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	573.503290915892	326	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	245	1285	412144	259468	FALSE	25	ACTTTTTAGATCCTGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVPCYSYTNVARKHNRPRIDCGDIQCWQFLVLIHHQRHSLSKTAYQASLSPCSVNVQVLNRHFAAATKPAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIATLDMSSDQIAANLQAIINDVCRHRPLSLGPFVVRAFLRSSTSEGLLLKIEPLLPKEVETKESNKETA	431877	259273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_259587_260970_261053_311832_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113_364226_412047_412177_431665
747305	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_95032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747306	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	233	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747307	contig_6825_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_155113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGAAAGGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20273	19890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_19900_20300
747308	contig_8616_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_72465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTACCCTTACCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313475	315452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_313500_315500
747310	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	20	1159	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
747311	contig_6489_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_128926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	173	577	146617	147021	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPHLTSKGTYSAQFLSLSRFQCTFELASTSLPYLTKRIISFIKISTVLVPVRWRLKMSQMSNFSKLLYHPSSLTSTTPSPFSTVLPIFGFPNSLQCSRELTNCIKEMAHTVVEAGKSQICGSDVGFFLAVSLCPRALRFSCSMGQEAHCAISCRSLLRVSPADLSFLGGGRLFSVPPLGWPILSPSGWQN	146444	148191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_146400_148200
747312	contig_12977_pilon	+	1343	14	Intergenic	novelGene_122784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	630.023132852274	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	174	1334	10887	58782	FALSE	5	TTCTATTTCTCCTTGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAAWFLPGEALRKGRSSHLDLPRPWSQQCPHHCPGLATALEPSLLALGTDAGHSLWSLSHRE	10713	58791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_58600
747313	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
747314	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	134	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747317	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747320	contig_8153_pilon	+	2097	3	Intergenic	novelGene_34803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_1	82.5	203	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	112	591	138411	148980	FALSE	45	CTTAGTTAGAAGCAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAGQMQNLESAGAGQSVSTQTGSMSGHIPRLSKVNLFTLLSLWMELFPVAETQRHKSQKKEEGKHGSLGDNEDRTRVPTDKKQVNFYDLRKKKYTFVVTKQKEWKVPHFHLQESFLYTLIQISCVFTRLTISRPFKKKKIQMGLFYTYTPVSYLFFC	138299	150486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680
747322	SIRV4	-	514	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	105	-2	105	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5053	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
747324	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	51	510	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
747326	contig_4782_pilon	+	850	3	Intergenic	novelGene_73693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACAGTGTTCTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787241	798112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_787826_793914_793964_797895
747327	SIRV6	+	533	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	9	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747328	contig_2214_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_144248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTAGCTTAAGGGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249198	248137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_248100_249200
747329	contig_12570_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_79397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAGGACTGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297357	296908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_296900_297400
747332	SIRV6	+	343	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	534	1	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
747338	contig_6710_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_89115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653640	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
747339	contig_6440_pilon	-	1509	4	Intergenic	novelGene_161650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAGAGGAATGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13766	9802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_9986_10159_10266_12287_12476_12734
747341	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	6	410	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747344	contig_6691_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_60184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1882	2196	452794	453108	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRCISLLLVWEHLSAGTSGPNDVLCFRHCFLGGMRSSCLSARFCLLHLKRDWLKTLCNLVDLINVTATNPSYYVIVIEFTTHREITSDDKMVDNQIILGIMT	450912	453387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_450900_453400
747345	contig_11656_pilon	-	2490	13	Intergenic	novelGene_53989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	132.597841234313	1476	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	19	1713	385556	372983	FALSE	20	TATATTTTTCACATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRSEEMMSKMKRELVCLFLLSGVVFTLSRQESHARFRRGARSYRVTCRDEQTQMTYLQHESWLRPTVRSNRVEYCWCNSGRSQCHSVPVRSCSEPRCFNGGTCRQALYFSDFVCQCPEGFTGKRCEIDTKATCYEDQGVTYRGTWSTVESGAECINWNSSALALKPYNGRRPGALKLGLGNHNYCRNPDRDSKPWCYIFKAGKYTSEFCSTPTCDNGENKDCYFGKGLDYQGTHSLTTSGTTCLKWNSMILLGKIYTAWKSNAQALGLGKHNYCRNPDGDAKPWCHVLKDHELTWEYCDMPQCSACGLRQYKQPQFRIKGGLYTDITSHPWQAAIFAKNRRSPGERFLCGGTLINSCWVVSAAHCFQERFPTHHLKVVLGRTYRLVSGEEEQKFEVEKYVVHKEFDDNTYNNDIALLQLKSDSLHCAQESNTVRPACLPEAGLQLPDWTECELSGYGKHEATSPFYSERLKEGHVRLYPSSRCTSEHMFNKTITNNMLCAGDTRSGGNEANVHDACQGDSGGPLVCMKDNRMTLVGIISWGLGCGQKDVPGVYTKVTNYIDWIQDNMRP	385574	372205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_373142_374456_374624_375761_375903_376101_376239_376342_376539_378102_378189_378740_378916_381003_381096_381237_381413_381790_381902_382616_382755_384514_384558_385481
747348	SIRV4	-	261	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1257	3	1257	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
747353	contig_12970_pilon	+	1252	3	Intergenic	novelGene_50549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_2	43	1269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	428	1003	610964	611539	FALSE	15	GGTCGCCCATGTCCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSIKCVLVGDSAVGKTSLLVRFTSETFPEAYKPTVYENTGVDVFMDGIQISLGLWDTAGNDAFRSIRPLSYQQADVVLMCYSVANHNSFQNLKNKWIGEIRSNLPCTPVLVVATQTDQREMGPHRASCINAIDGKKLAQDVRAKGYLECSALSNRGVQQVFECAVRTAVNQARRRNRRRFFSINECKIF	568128	611788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_568245_610329_610426_610748
747355	SIRV2	-	279	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	647	22	647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4085	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
747358	contig_17440_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_7638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3474	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
747368	contig_7342_pilon	-	1410	9	Intergenic	novelGene_71112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	114.060770534834	9	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	103	1353	86720	76155	FALSE	10	TAGTTTTCTCCTGGCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86822	76097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_83789_83834_83913_83979_86703
747373	contig_3948_pilon	-	2623	17	Intergenic	novelGene_53361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	295.90622854842	252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	182	2374	1792685	1747427	FALSE	45	AGATAGTTAAGAACTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVTTSYSFDAPTDYINFTSLNDEEDNENVDSWFEEKANLENMFLRKNGTGGPFQGKTPLRKSNRQQAIVTPLRPVENTYYKETEKENQLEQSIPSNTCSSLEVGGNTSRNTPAHPLRRSVRLSAQKDLKQKHHVKMKAKRSVTPGITNEIPPSKKMKVSNNKKKPEEEGNAHRDTPEKAKSRHTIPCTPPVRQKVIKSTEEQELEKRTRMQQAVVEMRKKNEEFKKFALAGAGQLVKKSVSQVTKSVDFHFCTDERIKHHKNQEYKEVNFTSELRKHPPSPARVTKGGCTIIKPFNLSQGKKRTFDETASTYVPLAQQVEAFHKQTPSRYHLRSKKDDIGLLPSKSAVAKICRDPQTPVLQTKQRTRPVTYKSAADQEAELLEKLQQYKFKAQELDPRILEGGPILPKKPPVKPPTQPIGFDLEIEKRIQERELKKKPEEEHFEFHSRPCPTKILEDVVGVPEKKVLPITVPKSPAFALKNRVRVFSKEEEEEEEPVMIKAQPVPHYGVPFKPQIPEARTLEVCPFSFDSRDKERQLQKEKKIKELQKEEMPKFKALPLPHFDTINLPEKKVKSATQIEPFCLETDRRGALKTQTWKHQLEEELKQQKEAACFKARPNTVISQDPFVPKKEKKLVAVQEPFQLATEKRAQERQELEKKMAEIEAQKAQRLEEIKQQEEEQEKEELAQLRKELVHKANPVRKYQAVEVKSSDQPLTVPVSPKFSTRFHC	1805596	1747177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1747538_1749489_1749657_1750365_1750478_1755092_1755240_1755628_1755806_1757607_1757704_1770456_1770674_1771185_1771328_1774315_1774491_1775519_1775666_1776753_1776876_1778343_1778446_1779326_1779450_1785358_1785486_1789686_1789810_1792579_1792755_1805484
747374	contig_15575_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_170933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCCAAAAAAAATAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28241	29084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15575_pilon_+_28200_29100
747377	contig_6710_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_97861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
747378	contig_10811_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_165786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGGTGTATGTTCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140444	139977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_140000_140400
747382	contig_6885_pilon	-	2655	1	Intergenic	novelGene_83680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236893	234238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_234200_236900
747384	contig_3700_pilon	+	2492	1	Intergenic	novelGene_138069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	136	315	169712	169891	NA	10	TTTCTGTTGCCCTGTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLNQFFKEASGPNIYKAFKQEESPQSQTFGALIRPTVERHQCGGMGQPPNHRVRSGPISLHPTFPLFPQGTFSCCFKTGKTIYQQCNFFNVSNSPSLSFLTCK	169576	172068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_169600_172100
747385	contig_730_pilon	-	1435	11	Intergenic	novelGene_155620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	32.3426962388728	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	304	1434	212398	207903	FALSE	15	GTATCTGAGTCCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTSKDKRDVYYRLAKENGWRARSAFKLLQLDEEFQLFQGVTRAVDLCAAPGSWSQVLSQKIEGGHVVAVDLQAMAPLPGVLQIQGDITQLSTAKEIIQHFDGCPADLVVCDGAPDVTGLHDVDEYMQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVWKHGQGPQCPFCEPTVTPSQCASFYPQILWFWGPKFSSLPPNSYRTQWVKPTIINRKAQP	214556	207901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211836_211931_212002_212277_212439_214293
747388	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747391	contig_11396_pilon	-	1438	11	Intergenic	novelGene_71258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	468.488217567955	415	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1329	110	1438	155228	121397	FALSE	25	GTTCTGCTCACCCATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSFAEAAEGFCSFAAAAAAAAASVLPFPAFGITAAMNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSPATGGFLWLCRQRLGWGGS	155337	121396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121453_139006_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144292_146250_146407_146608_146786_147254_147334_147886_148006_153256_153426_155157
747395	contig_2940_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_81906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCCAGCAGTCCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468979	467474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_467500_469000
747403	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	399	-1	-229	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACACCACATGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
747404	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	54	517	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
747405	contig_10068_pilon	-	2236	5	Intergenic	novelGene_148710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_3	107.376382412521	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	637	1485	56485	44668	FALSE	10	ATATTTTTGTTTGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	57121	43916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_54327_54436_56355
747406	contig_4492_pilon	+	1519	6	Intergenic	novelGene_166115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	36.0199944475287	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	77	616	394663	455596	TRUE	15	TACAAGTTTGGTCTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLALSAAGAGPCSFSAAQHLHIPTMAKTAMAYKEKMKELSMLSLICSCFYPEPRNMNIYTYDDMEVKQINKRASGQAFELILKPPSPVSEAPRTLASPKKKDLSLEEIQKKLEAAEERRKSQEAQVLKQLAEKREHEREVLQKALEENNNFSKMAEEKLILKMEQIKENREANLAAIIERLQEKERHAAEVRRNKELQVELSG	394586	456891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_+_394682_426611_426708_430567_430741_444213_444406_455536_455608_455999
747408	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	2	409	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747409	contig_10904_pilon	-	1525	8	Intergenic	novelGene_22785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	189	junction_6	197.347926469048	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	17	781	773250	757834	FALSE	15	CTTGGTGCTGGAGTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTPTALLGLVLCLGPAIQAQNGHLPKPSISVKPGCVIPWGTSVTFVCQSPRKAESFRLENVGTNQYLDVKSSPGTETEARFPIDSVKIDTAGHYSCLYSTGNHFSERSEILELVVTDTTGSQILPPELRYILIGISAVFLLCLLLLALFFLHHQRQRKHGIPRSKGEEQNPQERFGPGVDVLKSTPDMATVNGLPENDRKMDTSAPTAGNPQEVTYAQLDHWALTQGAAPAVSPQFTEPMAKSSMYASLTKR	773266	757089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759452_759496_759593_759723_769599_769885_772375_772412_773216
747413	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
747414	contig_5236_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_100972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATCGTTCCCCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039906	1041362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1039900_1041400
747415	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	9	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747420	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCGTAAGCACTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
747423	contig_10500_pilon	-	2262	3	Intergenic	novelGene_41149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	272	31	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	220	681	1206167	1191592	FALSE	45	ACTGTAGCCATACATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWISDHHLSKLKNEEFGMEAEKPLIKHASQRNDIQEKCVKLLPVIAEQLQWMPFVNAKHHEPFVKFIYWSLRQLDAGTQHSTLTSTLRRLGEDIFKGIVTKGIQDNSLEHSGENKPKTAAFFKSPNLPLRFLSTLIVLKTVTQGKLSNMFIV	1206386	1190010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1191814_1197867_1197985_1206044
747428	contig_10437_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_38428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_6	31.6420957305647	441	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	210	1007	833635	836284	FALSE	10	TTGTGGGGGAACGTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVFFGCTFVAFGPAFALFLITVAGDPLRVIILVAGAFFWLVSLLLASVVWFILVHVTDRSDARLQYGLLIFGAAVSVLLQEVFRFAYYKLLKKADEGLASLSEDGRSPISIRQMAYVSGLSFGIISGVFSVINILADALGPGVVGIHGDSPYYFLTSAFLTAAIILLHTFWGVVFFDACERRRFWALGLVVGSHLLTSGLTFLNPWYEASLLPIYAVTVFMGLWAFVTAGGSLRSIQHCLSCRRQEDSRVMLYSALRIPPED	833425	837017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_833748_834291_834463_834628_834703_834936_835060_835210_835339_835761_835886_836219
747429	contig_1107_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_126575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCACAGGCTTGAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591281	590754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_590800_591300
747431	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747432	contig_1262_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_133548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATACAGACAGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195749	196708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_195700_196700
747433	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	55	AATAAAAATGAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747434	contig_1535_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_127240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAATCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121059	121752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_121100_121800
747436	contig_9609_pilon	+	1102	9	Intergenic	novelGene_23058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	781.712503098166	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	97	1101	449884	456258	FALSE	65	GTAGAAAGAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCAPSCPHPRPGSFSVEHFLAFFTCFMELFTWFEIIK	435667	456259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454598_456153
747440	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747445	contig_1719_pilon	-	1290	6	Intergenic	novelGene_87318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	124.433114563608	14	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCATTTTTAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467739	457569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_458402_461153_461258_462091_462173_463117_463208_466480_466617_467692
747446	contig_744_pilon	+	1101	10	Intergenic	novelGene_145074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_9	7.25718035235908	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	21	1100	114644	137146	FALSE	40	GCAGAGTAGCACAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVFVIPMNALVANRVKKLKKSQTKSKDKQIKLLNEIVHGIKILKLYAWEPSYKKKINEIREQELEVHKSAGYLAVFSMLTLTCIPFLVSLATFGVYFLLDEGNILTAAKVFTSMSLFNILRLPLFDLPVVISAVIQTRISLSRLENFLNTEELLQSIETNYRGDHAIGFTNASFSWDKTGIPVLKDLNIKIPEGALVAIVGQVGSGKSSMLSAILGEMEKLTGVVQRKGSVAYVSQQAWIQNCILQENILFGSIMQKPFYERVLEACALLPDLEQLPNGDQTEIGERGVNISGGQKHRVSLARAVYSGADIYLLDDPLSAVDVHVGKQLFEKVIGSSGILKNKTRILVTHNLTLLPQVDLIVVMES	114623	137147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_+_114683_117153_117220_121517_121656_122959_123107_124969_125052_125139_125207_125397_125525_129782_129960_135088_135257_137077
747448	contig_13146_pilon	-	2157	8	Intergenic	novelGene_170036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_7	8.63311138842179	77	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	56	790	60217	49525	FALSE	10	ACTTTGTTTCTTGGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLPQIKQILHPALRINTMTSFSEMVSLAAVLLSSFPANGQDPDFAYLSTQLTQVQMEIVNKHNELRTGVSPEASDMLKMEWDNEAAANAQNWADKCIYKHSDPQKRRTNVSCGENLFMSSAPTSWSSGIQNWYDEERDFVYGVGPKSPNAVVGHYTQVVWSTSFRVGCGIGYCPDQSTFKYYYVCHYCPAGNYINRLYTPYKKGPRCSSCPDYCDNGLCTNGCGYEDVYSNCETLKKMFTCANEWVRNSCKASCNCEGKIH	70663	48157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13146_pilon_-_49653_51568_51658_53118_53217_53686_53833_55850_55939_56648_56766_60148_60220_70610
747451	contig_10404_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_138704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTTATCCAAAAATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205177	1203407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1203400_1205200
747453	contig_2438_pilon	+	1970	12	Intergenic	novelGene_112077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_11	54.2171940645346	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	391	1833	348967	370176	FALSE	25	TCTAAGGAATTGCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEAKDQAFKMEKEAIMDAVTTRKKIMKQKEMVCKNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQILEKRLIQKELETEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELDRKRREERIRGRRHIVEQMQKNKEERSLLAEQREQEKEQMLEYIEQLQEEDLKDMERRHQEKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMAREAEFEAEQERIRREKEKEIARLRALQEKAQDYQAEQDALRAKRNQEVADREWRRKEKENAQKKMETEAMLRKSRLEQVAFKEHALAVQVQRDRDEFERILRAQREQIEKERLEQEKKATGRLQHANELRRQVRENQQKQVQDRIATFEEGRRLKEEAQRRRERIDDIKRKKLEELRATGLPEKYCIEAERKANILPVTSVN	320556	370313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_320737_346411_346538_348882_349026_351267_351413_351706_351878_353064_353244_355300_355431_359142_359290_363559_363674_364281_364476_369553_369779_370097
747454	contig_5018_pilon	+	2121	18	Intergenic	novelGene_47176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	85.1565625093469	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	77	2107	1554949	1569010	FALSE	40	AGAACTTTGTTGAGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRESQEKLQREALLPPPRARPPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYNQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLPSLSITVLCWGLAPKVA	1553477	1569024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1553541_1554935_1555048_1555888_1555965_1556046_1556197_1558371_1558479_1558564_1558699_1558777_1558860_1558935_1559059_1559157_1559277_1560366_1560428_1560523_1560690_1560863_1561017_1562664_1562891_1563097_1563270_1563745_1563833_1563917_1564026_1564128_1564243_1568956
747455	contig_11702_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_141994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1081	junction_3	140.78707327024	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	679	1227	382564	384186	FALSE	5	GTCTCTGCTGTGTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLADWGLETRPGQPLLAPSQARGLLCCTLTAEACAEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	381885	384505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
747459	contig_5649_pilon	-	2378	12	Intergenic	novelGene_82349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	8.65309384312058	9	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	84	1817	846245	822990	FALSE	30	TTCCTCCATGTCATTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLREKVEEEEEAEREEGVERPSRPEKMTKLLRKEATTLTPEMLRDMEQKLSEIKVPVPGEPLTSDTIDIAKLPLSYRINTPKEEQLLQVADNFSRQYSHLCPDRVPLLLYPLNECEVPKFLSTTIRPTLMPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPYQKGNCFDFSTLLCSMLIGSGYDAYCVSGYASQDLCLMDLTREVCPLTMKAKEVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVVGARWAWG	850825	822428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_842588_842748_843519_843646_845532_845702_846054_846258_850754
747466	contig_8122_pilon	-	1652	3	Intergenic	novelGene_40259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCATTCATAGTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744741	736747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_737594_742060_742161_744035
747469	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
747470	contig_5445_pilon	+	572	4	Intergenic	novelGene_135419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2710	junction_3	105.805901956785	83	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	59	412	51744	53758	FALSE	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQKAASPGSLGPSLLAPRKMKVSVAALSFFILAVSLGSQGRVIQELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51685	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53240_53646
747472	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747473	SIRV2	-	644	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	15	2958	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
747474	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_97243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747475	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	191	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
747476	contig_11300_pilon	-	1733	8	Intergenic	novelGene_168645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	81.1662441146162	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	714	1430	87814	80702	FALSE	25	CTTTCTATCATGGATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTSEIFEMYQQYAAFKRWHFEPLEYFPSEIGGLRHASASIGGAEAYKHMKFEGGVHRVQRVPKTERQGRIHTSTTTVAILPQPAEIHLVINPKDLRIDTKRASGAGGQHVNTTDSAVRIVHLPTGVVSECQQERSQLKNREMAMKKLRAKLYSMHLEAAASKRYNARKIQIGTKGRSEKIRTYNFPQNRVTDHRINKSLHDLVTFMQGEYLLDELVQSLKEYADYESLVEVISKKV	93768	80398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_80903_81667_81805_83208_83327_87047_87212_87717_87902_90151_90232_91983_92431_93669
747477	contig_8991_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_170937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTAGTTTTGCTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95484	94476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_-_94500_95500
747478	contig_8991_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_170936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93772	93070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_-_93100_93800
747479	contig_8145_pilon	+	1319	7	Intergenic	novelGene_118660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	33.8743593625359	417	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	13	771	844107	857584	FALSE	10	GGTTGGTGTGAGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRGMEGEMEAQSAGAEDGFTQVTRRGGRRAKKRQAEQLSASGESGDAGRMDTEEARPAKRPVFPPLSGDGLLGGKEETRKIPVPANRYTPLKENWMKIFTPIVEHLGLQIRFNLKSRNVEIRTCKETKDVSALTKAADFVKAFILGFQVEDALALIRLDDLFLESFEITDVKPLKGDHLSRAIGRIAGKGGKTKFTIENVTRTRIVLADVKVHILGSFQNIKMARTAICNLILGNPPSKVYGNIRAVASRAADRF	844094	858132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_844314_844547_844698_851587_851672_851870_851932_852167_852286_856761_856833_857516
747483	contig_5018_pilon	-	1049	8	Intergenic	novelGene_47130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_4	51.6384605913548	662	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	86	982	1494853	1489525	FALSE	25	GCCAAGAGTAGGGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPASSPALAALVPADGGGGRGGGGSGGMDLSELERDNTDRCRLSSPVPAVCRKEPCVLGVDEAGRGPVLGPMVYAICYCPLSRLADLEALKVADSKTLSESERDRLFVKMEEDKDFVGWALDVLSPNLISTSMLGRVKYNLNSLSHDTAAGLVQYALDQGVKVTQVFVDTVGLPEKYQERLQQCFPGIEVTVKAKADALYPVVSAASICAKVARDQAVKNWQFVEKLQDVDADYGSGYPNDPKTKAWLRKHVEPVFGFPQFVRFSWRTAQSILEKEAEGVTWEDSSAEDQEGLGKITSYFLSEGPRPRLPHRYFQERGLESATTL	1494938	1489457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1489658_1489765_1489890_1490836_1490925_1491029_1491168_1494000_1494089_1494220_1494348_1494478_1494551_1494726
747486	contig_7202_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_17989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
747488	contig_9197_pilon	+	1248	4	Intergenic	novelGene_154355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	157.863513482023	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTGTGTTGAGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52365	93171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92373_92786_92857
747489	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
747493	contig_12626_pilon	+	1801	10	Intergenic	novelGene_80456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	281.421436090711	36	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	92	1336	171238	193943	FALSE	30	TTTTAAATATATGACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQALLPEQRAVHADSYRRIGHL	171146	194408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_171243_171350_171421_173060_173277_176134_176249_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_193880
747496	SIRV2	+	294	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	303	-74	-303	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACGCAGTAATGCTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
747504	contig_15327_pilon	-	1511	15	Intergenic	novelGene_70710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	100.131138503261	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	17	1510	953222	946805	FALSE	5	GCCTGCTGCCCCTGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVLVQMCKMKAFGELCPDSAPLPHLVTEALRTGTVEWFHLKQQHHQPMVQGLLEAGKALLSLVQDVTGDLNQCQRTWNKIFHNALKIDLFSTAFQELQWLVAKRVQDYTAAVGGQVSPEMGESLFQLYISLKEFCQLGPDPSKREGVLALDGFHRWFQPAIPSWLQKTYSVALARVQRAVQMDELVPLGELTKHSTSAVDLSTCFAQISHTARQLDWPNPEEAFMITVKFVEDTCRLALVYCSLIKARARELSAGHKDQGQAANMLCVVVNNMEQLRLVMGKLPTQLAWETLEQRVGAVLEQGQLQHTLHAQLQGVLAGLGHEIRTGVRTLAEQLEVGIAKHIQKLLGIRESVLPEDAILPLMKFLEVELCYMNTNLVQENFSSLLTLLWTHTLTVLTEAAASQRSSPLASNRLKIALQNLEICFHAEGCGLPPEALHTATFQALQRDLALQAASSRELIQKYFCSRLKQQAETTSEELGVVTVKASYRASEQKLCVELLSAS	953238	946803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_946901_946995_947080_947578_947651_947726_947833_949380_949461_950773_950843_951005_951213_951319_951419_951541_951686_952242_952364_952477_952609_952682_952735_952815_952914_953005_953063_953144
747506	contig_5059_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_140761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTGAACAATAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507100	509046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_507100_509000
747509	contig_10855_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_124275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACATGATGACCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7416	7165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_7200_7400
747510	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747511	contig_8044_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_132371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTACCTCTAAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359088	358437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_358400_359100
747512	contig_1339_pilon	+	2502	1	Intergenic	novelGene_163114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1084	1509	277347	277772	NA	90	AAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLLHSSHAGRPFCSSWLPLRDSVLAVSPAWDAPVMGLLFSREGLTTMAREGFSSPSFTRSMMGPRTHVTICSAFTTVCKYPMHSWEAGPAHRNKSHHMHMLWQNSSDTTNRIPLTVQRELSEGNISTEARTQRMLTDVS	276263	278765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_276300_278800
747517	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747519	contig_7202_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_17291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
747522	contig_990_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_76113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGTGTAAAGTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587010	1585408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1585400_1587000
747523	contig_1090_pilon	+	1631	4	Intergenic	novelGene_131124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_3	56.8409085860605	21	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	148	525	406262	458346	FALSE	85	AACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKLLQRQTYTCLSHRYGLYVCFVGIVVTIVSAFQFGEVVLEWSRDQYHVLFDSYRDNIAGKSFQNRLCLPMPIDVVYTWVNGTDLELLKELKEVREQMEEEQKAMREILGKNTTEPTKKRYSF	406114	459452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_406379_440789_440876_457195_457316_458291
747524	contig_6735_pilon	-	1322	7	Intergenic	novelGene_15695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	802.518483691601	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	501	842	543144	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_554257_554374_564157_564232_564784_564869_568198
747525	contig_7202_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_17655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
747528	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	14	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747531	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747532	contig_7057_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_123376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGTGTTTCCTGGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134470	1136893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1134500_1136900
747534	contig_16775_pilon	+	2068	15	Intergenic	novelGene_107772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	302.717091944115	3	128	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	116	718	130489	159280	TRUE	20	ATTGTGTAACTCAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQHL	130373	174605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_159271_159436_160117_160233_164974_165045_165188_165276_168016_168146_172805_172871_173216_173325_173984
747536	contig_8017_pilon	+	2008	6	Intergenic	novelGene_65364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.6846097132981	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1401	1988	989721	1001868	FALSE	15	GTGCTGTGTGCAGTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQITSLHSLNAFLLPIKTVGVQGDCRSYSYVCGISSKDQIDWESLIFLARLIPRMCHNINRVVYVFGPPVKEPPTDVTPTFLTTGVLSTLRQADFEAHKILRESGYAGKISQMPVILTPLHFDRDPLQKQPSCQRSVVIRTFITSDFMTGVPATPGSEIPVEVVFKMVAEIKKIPGISRVMYDLTSKPPGTTEWE	988138	1001888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_988471_988652_989787_993537_993654_997251_997383_1000526_1000700_1001766
747538	contig_2069_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_23390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105284	1102956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1103000_1105300
747539	contig_9366_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_166278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCCAGGGATCGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049615	1051269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1049600_1051300
747540	contig_15066_pilon	+	2825	4	Intergenic	novelGene_149525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2241	2549	62632	63123	FALSE	5	CCTGCCAGCCCGCGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPEGEAVVKLPAIGTHAVSLLTRVPEFRDPWGSTLLGPHQSGKKGLRAAGLHAEVDVGAVGTPEEVWSHGRTGGVGGQRRGCGVQRDCSPHTVPRQEPAP	59690	63399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_61631_61872_62078_62536_62759_62941
747541	SIRV6	+	544	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747542	contig_6710_pilon	+	545	2	Intergenic	novelGene_96396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAGCCACAGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	657170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
747543	SIRV6	-	556	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	411	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGCCCCTGAAGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1765_3095_3164_10723_10825_11035_11109_11205
747545	contig_10252_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_162923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAGAATCATACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169959	170766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_170000_170800
747547	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_97401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747548	contig_19098_pilon	-	2063	2	Intergenic	novelGene_65800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13560	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGGGCTCCTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205382	203273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_205049_205094
747553	contig_18613_pilon	+	967	6	Intergenic	novelGene_80219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1658.92717139723	62	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	111	635	24385	31172	FALSE	40	AATATAACGAAGGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLAILWRILMRLPRMRQTDLSQLVKKMKLEEVTWSCYFIL	23704	31504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30164_31058
747571	contig_4924_pilon	-	1883	11	Intergenic	novelGene_84694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	427	junction_2	1081.48433183287	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	20	1369	252576	69027	FALSE	45	CAGTAAAACCTACGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGMQKKPS	252595	68512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_69194_74641_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
747572	SIRV6	+	427	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	533	2	354	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747574	contig_6710_pilon	+	563	2	Intergenic	novelGene_91848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
747580	contig_5643_pilon	+	1738	10	Intergenic	novelGene_38943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_9	125.873049900914	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	135	1571	481872	502897	FALSE	45	AAAGAACTTTGAGAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSQNLLIIVIRPRGEDARPAPESR	462243	503064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_502830
747581	contig_15777_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_75762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCACAGGGCTAACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277158	278762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_277200_278800
747584	SIRV6	+	575	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11201
747585	SIRV6	+	448	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	385	23	206	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747588	contig_17214_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_153466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAATATTCATCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14392	15255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_14400_15300
747589	contig_11855_pilon	-	939	5	Intergenic	novelGene_66900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_4	229.462823786338	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	339	797	738197	733972	FALSE	10	CCATCTCTTGTGCTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738663	733829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071_738202_738329
747590	contig_4964_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_157248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAGAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37442	38922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_37400_38900
747591	contig_1239_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_150399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTCAAAATCTAAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172023	174610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_172000_174600
747592	contig_7840_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_68985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATTCAAGTTAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226839	225960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_226000_226800
747595	contig_10904_pilon	+	1476	12	Intergenic	novelGene_22586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	217.191921071002	185	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	51	809	439135	451499	TRUE	20	GTCCTCGGAGAGTGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKSQPHELWRD	438425	454282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445290_449505_449530_451494_451624_451716_451816_453838
747597	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747600	contig_9121_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_134458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCACATCTCAGCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169307	170505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_169300_170500
747601	contig_15687_pilon	-	1958	13	Intergenic	novelGene_129142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_8	37.0257980632723	177	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	333	1553	198511	187610	FALSE	20	TAAAGTTTTGTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGNEDLRADDFPGPAFESYESMELACPAERSGHVAVSDGLHMFVWGGYKSNQVRGLYDFYLPREELWIYNMETGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRDARMNDLHYLNLDTWEWNELIPQGICPVGRSWHSLTPVSSDHLFLFGGFTTDKQPLSDAWTYCISKNEWIQFNHPYTEKPRLWHTACASDEGEVIVFGGCANNLLVHHRAAHSNEILIFSVQPKSLVRLSLEAVICFKEMLASSWNCLPKHLLHSVNQRFGSNNTSGS	198843	187204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_187734_187947_188001_188102_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190333_190404_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198358
747604	contig_7004_pilon	+	2340	5	Intergenic	novelGene_126452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	13.8089644796415	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	535	954	277029	277448	TRUE	20	CAAACTCATGCTGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFPSLSQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVRGGLGEGIPQPQLTCARWPSCPRAALEPRKRGRRCLCSLSTGDAPLAPCISASSMTMFLVSLLLPHSELFKDEDSAHFILVAPGLSMQQVLLLHACVRVRS	276494	281123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
747606	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
747611	contig_14219_pilon	-	2138	4	Intergenic	novelGene_54311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_3	116.259288756736	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	162	530	676735	673835	FALSE	45	TGAAGAGGGAAGGAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQGKRTDLIFWHVELVSGFPCVPSPFRVLLIHFLCLNY	883265	672226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_674118_676649_676755_767883_767941_883180
747616	contig_6710_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_89500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
747617	contig_6027_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_74421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCCTCCAGTCTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121872	123173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_121900_123200
747618	contig_6027_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_74423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGGTGGTAGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131527	132399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_131500_132400
747620	contig_12250_pilon	+	1716	11	Intergenic	novelGene_80561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	63.5606796691162	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	993	1658	275570	278399	FALSE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	273830	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
747621	contig_18869_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_56069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73579	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
747622	scaffold_7386_pilon	-	1956	10	Intergenic	novelGene_136586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_9	45.4502848732737	343	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	64	1134	309042	297334	FALSE	5	GGGAGCCTCTCTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNRKHAAAAAAGWLVSKEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKPPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEIQPGPSESSTAYLLMYRRESLGPTR	309105	296511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_297890_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308864
747627	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747628	contig_5485_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_37730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGTTTAGGGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316417	316972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_316400_317000
747634	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
747643	SIRV4	+	362	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCGTAACAGTTTCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
747645	contig_20890_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_147055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAACAAAATGTATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57554	56480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_56500_57600
747646	contig_3386_pilon	+	2909	3	Intergenic	novelGene_34490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCACACCTCAGCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331906	341899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_334292_336234_336685_341825
747647	contig_5590_pilon	-	1622	2	Intergenic	novelGene_163050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGGGGGAGAGGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388353	386645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_386972_387057
747650	contig_6361_pilon	+	2172	7	Intergenic	novelGene_23930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_4	271.111703095893	50	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	50	955	284786	325394	FALSE	65	AAAGAAAAAACCAAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVRQDLAQLMNSSGSHKDLAGKYRQILEKAIQLCGVEQLEALKAFVEAMVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDSTAKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDDPVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQQRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGNDHVL	284736	326611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_284860_305941_306022_308749_308902_309697_309802_317331_317486_317640_317792_325203
747651	contig_6823_pilon	-	2016	13	Intergenic	novelGene_131223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	20.8319999573306	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1049	1612	282988	248884	FALSE	15	GTTAGCCAGTTTCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325540	248479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_320648_320750_325392
747657	contig_14142_pilon	+	1382	4	Intergenic	novelGene_120497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	7.25718035235908	90	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGTATCCAGAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308180	311382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308250_308382_308467_309006_310041_311187
747661	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747662	contig_6056_pilon	+	1189	9	Intergenic	novelGene_157878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	78.5855425635021	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	21	983	267066	312153	FALSE	20	TATGATTTTGGAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAVIMASGSSGLAASRLLTRYFLVQRNGIRHCSYASSRNHLYIDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQKALDYGTKLVGGTTPGKGGKMHLDLPVFNTVKEAKEKTGATASVIYVPPPFAAAAINEALEAEMPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRLVGPNCPGVINPGECKIGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	267045	312359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287230_291373_291587_291720_291740_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
747672	contig_7870_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_108972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGCAGCTAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380525	379030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_379000_380500
747675	contig_5018_pilon	-	2424	11	Intergenic	novelGene_46952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	75.085551206607	2	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	286	1800	312744	301750	FALSE	40	GAAATAAACTTTCATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWEGTLWRWVVLEDPAHCTLASSSPVKLDAPRLCPDINFSEDDPLETTVHWAPPTLRPHQKDMVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	313029	301125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504
747683	contig_3193_pilon	-	2687	5	Intergenic	novelGene_126310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	56.6436227654976	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	86	1981	98257	80071	FALSE	10	GTGAGTGTGTCTGAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRGLQGFVGSTCPHICTVVNLRDLAERHRSKHPGCSPTVVVDAMCCIRYWYTPESWVCGGQWREYFSALRNFVNAFAEVGIKLVFVFDGIVEQDKRDEWVKRRRKNSREISRIFQYIKSHGEQPGRHMFFIPPGLAVFTQLALKALGQEAHCSLQEADYEVASLGLQDGCLGVLGEDTDYLIYNTCPYLSIRELCLDTLDTVMLCREKLCESLCLSVTDLPLLACLLGNDVIPQGMFESFRYKCLSAYTSVKENLNKRGNVILAVADHIAKVLRLHQGEKKLEEMLPLGPNKALFYRGVASYLLPGQKSPWFFKKSKAVTTLDKQILSMSSDSESKQEVAMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVPMCTDPESRQEVPMCTDPESRQEVPMYTDPEFKLEVPMCTDPDIKQVTMSSDPEIKQQVTPCSDPEIKHEVTMVSDPEILEVARAHHVWGESYLVYNVMSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVMSVLLPLPRLPPGLSCRPL	113240	79364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_80307_81725_81831_94139_94321_96883_98270_113167
747687	contig_19769_pilon	-	715	5	Intergenic	novelGene_102319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	523	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	89175	88018	TRUE	5	GGCGCGCAGTCGCGCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTNHGSVG	89356	87341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87385_87464_87608_87819_88039_88840_88958_89163
747691	contig_14838_pilon	-	1531	4	Intergenic	novelGene_151917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_3	65.2192882171797	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	30	1373	112817	109062	FALSE	55	GATATCTACACTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPLRSRTMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112846	108903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110129_110895_111007_111351_111461_112760
747695	contig_10015_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_170948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATGGACTTAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27428	26381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10015_pilon_-_26400_27400
747696	contig_7652_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_170953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACATTTGCAAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80727	81856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7652_pilon_+_80700_81900
747697	contig_10323_pilon	-	2855	1	Intergenic	novelGene_123629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	588	887	497293	496994	NA	55	AAACTTAAACACCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWFLLITCPKYMRQSLPLLASKEHSGCTSSKTDLFVLLPVHGIFSIPHQHHNSKESILLRSSLFIVQVSYAYEVIENTMAWVRRTLVLNDIFVF	497880	495025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_495000_497900
747698	SIRV4	-	401	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	213	3	-213	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACTCGCCCCCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
747700	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657172	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
747703	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_94875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653784	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747713	contig_1008_pilon	-	1396	11	Intergenic	novelGene_121633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	110.517374199716	416	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	28	1221	1406535	1345288	FALSE	10	TTCTTCTGCTTTATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPCVFCGAAGFYRFFLGSRVPLAQRPGIWKAAAAAELQTGTRSQIVRLKHVTVVTTKKNVAASRHETYTADFIKKQLEEFNIGKRHLANMMGEDPETFTQEDIDRAIVYLFPSGLFEKRARPVMKHPDHIFPKQRAIQWGEDGRPFHFLFYTGKQSYYSLMHEAYGKLLDIEKRQNQLQAEGLDLEKTKTKDLIGSRWLIKEELEEMLVEKLSDQDYAQFIRLLERFSTLRCGAAEEEFVQRFRKSITVQSKKQLIEPLQYDDQGMAFSTSEGKRKSAKAEVVVYERGNGKIKVNGVDYLLYFPVTQDREQLMFPFHFLDRLGKHDMNCTVSGGGRSAQAGAIRLATAKALCSFVTEDEVEWMRQAGLLTTDPRVRERKKPGQEGARRKFTWKKR	1406562	1345112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1345380_1348387_1348558_1352233_1352343_1353224_1353394_1356351_1356428_1357174_1357261_1366566_1366647_1377655_1377687_1377773_1377837_1399022_1399203_1406397
747714	contig_401_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_42781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTGGTGAGTACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084493	1083695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1083700_1084500
747717	contig_14405_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_85667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCTATGCATAGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740186	740484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_740200_740500
747718	contig_4678_pilon	-	2439	14	Intergenic	novelGene_126061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_4	47.4576111079246	1	112	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	388	1155	577200	573763	TRUE	10	TAGCCTAGCCTGCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVKAGLTRVYLQRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKVPASACTWSPHTHHI	578044	571689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_573021_573153_573226_573495_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897
747719	contig_10904_pilon	+	799	6	Intergenic	novelGene_22653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1291.30808097835	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	69	518	530908	534152	TRUE	20	ACTTTGGAATTGGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHISPAQGSLRLKPYTL	530580	535194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530624_530882_531005_531238_531362_533736_533924_534109_534186_534946
747720	contig_6710_pilon	-	415	2	Intergenic	novelGene_98240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747723	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747726	contig_20365_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_85317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9561	11501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_9600_11500
747727	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
747728	contig_14322_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_115965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
747730	contig_13300_pilon	+	2650	1	Intergenic	novelGene_125792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182979	185629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_183000_185600
747738	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747739	contig_10013_pilon	-	3177	1	Intergenic	novelGene_125096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	2852	3175	535418	535095	NA	35	GCTGCAAAAGACCTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPGVRIDLTATGKRPVCGVGRRLLASSGSRPGVLLNTIQYTGQPPLQRVIQPHMSIVLRLGNPALEAPPPGGPSGFDTLISFYLNQQSTVMEAAVKKSNDMLHWAN	538269	535092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_535100_538300
747740	contig_7612_pilon	-	1620	3	Intergenic	novelGene_170363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	30.5	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	110	1264	174583	165780	FALSE	25	TTGGTTTTAATCTATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPYRSPRSTTAAAAGLVTITPRQEPQPAPVTITATMSSEAEIQQPPAAPALSAADSEPGTTGSGAGTGGPGGLASAAPASGDSVVDTKVLGTVKCFDVRSGDDFVNSAMLEDEPPRLEGTQNTTREKLPRQIRVNLNDAVEVTPPGYPLVIATWNVQSMNVGKLEVVKNEMESINVDILGISELEWAGTGHFESGNHMVYYSGYNALKKNGVAFIIKKTISRSILKYNAVSDRLISIRLQGKPVNTTIIQIYAPTTNATDEEIEDFYKLLQSEIDQTCKKDALLITGDWNAKVGEKEEKPVAGKFGLGDRDEAGDRMIEFCKTNDLFIGNTFFQQHKRRLYTWASPDGLRRDQIAYLCGKIRWKCLMSSVKTRPGASCGTDHRLLMCKFGLMLKKIKANPQRPKHDPGRIPPELTPSQE	174692	165423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_166720_173729_173794_174432
747741	contig_18869_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_56386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGCACTACCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73376	73592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
747743	SIRV2	-	647	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	3	2967	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
747744	contig_12873_pilon	+	1469	3	Intergenic	novelGene_27181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1198.5	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	227	694	17896	19334	FALSE	40	GTCCTAGAAATCTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15980	20109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16198_17886_18014_18984
747745	contig_10627_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_59984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGTAGTCTACCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281183	266542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_268729_281123
747746	contig_16204_pilon	-	2129	4	Intergenic	novelGene_154472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGGTTGAGAACCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78813	70623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_70881_71618_71731_73376_73499_77175
747748	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	34	3403	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
747751	contig_6837_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_149843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	31.8237332819391	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	27	608	146184	151729	TRUE	30	GCCCAAGCAGTAAGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REAESGWEMMADEEEEVKQILQKLQELVDQLYSFRDCYFETHSVEDAGRKQQDVREEMEKTLRLMEEVAGSVQGKARVLMLTGKALNVTPDYSLRAEELLSKAVKLEPELVEAWNQLGEVYWKKGDVAAAHTCFSGALTHCKNKVSLQNLSMVLRQLRTDTGDEHSRYVMDSVRQAKLAVQMDVHDGRSWCECSQKISRRF	146157	152176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_146235_149729_149863_150907_151120_151543_151839_152093
747752	contig_6837_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_149845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGACCTACTACCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152126	153629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_152100_153600
747753	contig_504_pilon	+	1982	3	Intergenic	novelGene_54415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	47.5	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	274	675	139705	152696	FALSE	70	AATTTAAAAAAAATCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCKHRPSGSDVLFHPNSGAAGKYGALQTVRLERYKAFYVTGGAKACDGSVGPEQHHELPLIFNLEDDSAEDVPLERGGTEYQTVLPQVRRVLADVLQDISEDNTSSADYTQDPSVAPCCNPYRMACRCQTT	139431	154003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_139741_142952_143044_152421
747754	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
747762	contig_5947_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_101538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAGAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549434	551359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_549400_551400
747763	contig_7870_pilon	+	3157	1	Intergenic	novelGene_108984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCCAGGGAAGGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415351	418508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_415400_418500
747764	contig_6205_pilon	+	1735	6	Intergenic	novelGene_160334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	80.2196983290264	221	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	89	625	27057	55482	FALSE	35	ACTACCACACTGAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VERWNGGKSGLQARGPEPEHRQGQPSGPSMNDVLCKKRDDYLEWPEYFMAVAFLSAQRSKDPNSQVGACIVNTENKIVGIGYNGMPNGCSDDLLPWRRTAENKLDTKYPYVCHAELNAIMNKNSADVKGCTMYVALFPCNECAKLIIQAGIKEVIFMSDKYHDSEEATAARLMFDMAGVTFRKFTPKCSKIVIDFDSINSRPSQKLQ	24916	56592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_24998_27049_27165_27540_27677_52523_52641_54002_54100_55403
747765	contig_11427_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_79013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCACACCCCATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724301	723922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_723900_724300
747766	contig_11427_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_79012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1108	1449	722865	722524	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAFLPSHLTIILSYRTSGHTGAGSPEKVPRWLNAACVSRLWPWRRMAPRVLHVATGCGAAGGRRVVRPSFLEASWKLFLREGTLHSNCPMPTVSLMCKIVGWDSQFGEART	723972	722007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_722000_724000
747771	SIRV6	-	518	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1213_1631_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
747774	contig_5935_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_102766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387785	1386312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1386300_1387800
747777	contig_7275_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_111229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1542	1841	155582	155283	NA	70	AGAAAAGAAGAAAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGDLTALALRGGSHYNKPLLEKHSSSPLDLRIPTHTEIPGGWGHWQGKSQHSKCLAQKVSVLVLRDTREPNLENSFDPLRQQGSVGAPVAPDKVSTPK	157123	154190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_154200_157100
747782	scaffold_12124_pilon	+	1594	11	Intergenic	novelGene_21985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	169.347837305352	6	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	232	1539	799011	811108	FALSE	40	TGAAGAGAAATGAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKRVENRYKRIENRYMGTKVHGSTIHNRQKVETTKCQPTDEWIHTMGSIHTTQYASAVKTEPGGAVLKSSAANQKVGSWNSSAAPWNPAGQFCSVL	791804	811163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_810825
747786	contig_15134_pilon	+	1982	7	Intergenic	novelGene_140223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAACAGAATCCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189510	207405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_190596_194698_194800_194916_194989_199386_199509_204639_204771_205889_206012_207056
747787	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
747788	contig_3787_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_102424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCTACACTTATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594552	593834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_593800_594600
747789	contig_610_pilon	-	2013	2	Intergenic	novelGene_76695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	105	584	161765	151155	FALSE	90	ACAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPKGLLSLNLLLLLSLAFELSCGTGGHSIDCRKIIQRLGSNIVLPLTYEGINKSMSKSIRIVVTMETSPGSTFKKKIVSLDPSEGGSPPNLEHRYKFHLENLSLEILESRKEDEGWYFMTVEQNFSVQQFCLELRLYGNNCGFPSSQWRAMVVPYPRM	161869	149725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_151559_161689
747793	SIRV4	-	271	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1252	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3906	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
747796	contig_6710_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_97747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
747797	contig_19851_pilon	-	721	4	Intergenic	novelGene_29881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCGAAACCATCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56522	54086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_54144_55648_55755_55842_55880_56001
747803	contig_4659_pilon	-	1843	3	Intergenic	novelGene_118160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGTCCTGTGTGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69195	65520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_67021_68541_68752_69062
747805	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747806	contig_13607_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_170169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTATTTATTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145266	146554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_145300_146600
747807	contig_19769_pilon	+	610	5	Intergenic	novelGene_102272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	269.444799541576	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	32	610	87249	88921	FALSE	15	AACTGTTGGCCACGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKR	86998	88921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841
747809	contig_4156_pilon	+	2755	3	Intergenic	novelGene_88113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	4.5	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGGAAAGTCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366731	380277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_366984_367176_367265_377862
747816	contig_9389_pilon	+	1496	4	Intergenic	novelGene_83928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1075.74511644513	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	223	627	166089	167516	FALSE	40	TAGGGAAAAAAAGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQPVGHDGLRDETPPLRPQEPHPATHGPLHHQPPDGHQQVCQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	159565	168385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_165808_165933_166074_166218_167240
747817	contig_3942_pilon	-	1171	10	Intergenic	novelGene_128803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_1	65.4030240551273	1397	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	25	951	1060159	1050289	FALSE	20	AGACCAGTCCTCGGAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKDSGHPETLINLIVLSQHLGKPPEVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1060183	1050068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1051201_1051271_1052698_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
747818	SIRV2	-	617	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4150	29	2971	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCCAGTTATCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761	1064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
747825	contig_9415_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_109877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2044478	2043420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2043400_2044500
747827	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747828	contig_11855_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_66992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287428	1289618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1287400_1289600
747830	contig_16776_pilon	-	1091	5	Intergenic	novelGene_130512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	369.870923431405	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	291	710	42706	35073	FALSE	10	TTGCCCTTGTCCAACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	58040	34691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42749_57792
747831	contig_2078_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_100191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGATAATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523515	521348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_521300_523500
747833	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
747834	SIRV6	+	519	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747838	contig_19237_pilon	+	1966	5	Intergenic	novelGene_162960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	50.5717312339611	128	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	36	602	61189	97795	FALSE	35	TGAAATAAGTATTTGCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPRWAEPAGMSGGGTETPVGCEAAPGGGVKKKDSLGTAGSPAHLIIKDLGEIHSRLLDHRPVIQGETRYFVKEFEEKRGLREMRVLKNLKNMIHETNKHTLPKCREAMQDNLNEVLQRLQAANHSVCRLQQKEQEQKKLYSDHLLASENQHITQWEDFMREQHSKRAEVDEEHRKAMERLKEQYAEMEKDLAKFSTF	61153	99159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_61304_65614_65698_84742_84873_88979_89039_97615
747839	contig_14142_pilon	+	1939	10	Intergenic	novelGene_120479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_2	182.805908000808	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	159	1427	268562	274116	FALSE	5	GTGTCTGGGACTTGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLVRTGGGKEPGAAGLVGWHPGLFDSRFSQSQSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLEDSVTLRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHFNFMCNSSCMGGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRICACPGRDRRTEEENFHKKGETSPEPPPGRSTKRALPTNTSSCTQPKKKPLDEEYFTLQIRGRERFKMFLELNEALELKDAQAGKEPEGSRAHSSPPKSKKGQSTSRHKKLMFKREGPDSD	261236	274628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_261367_268533_268636_268775_269158_269608_269796_269877_269991_270242_270353_270673_270814_270915_270990_273349_273457_274034
747842	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
747843	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	531	-2	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
747845	contig_4364_pilon	+	1126	6	Intergenic	novelGene_185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	830.773711668827	112	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	70	495	1268714	1270445	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKITV	1267036	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1270434
747847	contig_5981_pilon	+	1242	3	Intergenic	novelGene_35516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	27	junction_1	41.5	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	33	584	146316	165596	FALSE	15	GTATTGCGTCTTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATRAKKVKMATKSCPECDQQVPVACKSCPCGYIFINRKRLKVKHSEKSSLFTDVNSTISLKDLRILFLYEFKLGHSAAEASRNINSVFGGGSVSERTIRWWFEKFRSGHMSLKNEPRGRPKSVLNEDQLRAMVEANPKTAIRGLAADLGVSATTISRHLAAIGKVKKLDRWVGTTPVDGGS	146283	166254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_146382_158059_158157_165207
747852	contig_18108_pilon	+	3055	1	Intergenic	novelGene_33450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	68	610	83376	83918	NA	30	GGAATAAATGCTTCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASCKPSLNLKCGLPYSNSALLMLLSWPHLPSSGIHDSFCSWFSSCFSGSAPQVSERCLLRTLHFALYSSSAFVRIRPACSCPPPQLQAGNFQIGLQLDSLSRAPFPTACWAVSSRFLKLNLSRTELTNYPAPNPLNSYFSVSATPSTHLIQPETRELVQSSFLNLSEHSDHLETLLTHRFLVSTPEILIQQGWVVPENLHF	83308	86363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_83300_86400
747853	contig_7993_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_170955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	35	412	16712	17089	NA	25	AATCCTTGTTTTACTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKV	16677	17630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_16700_17600
747854	contig_13481_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_119409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGCATAACACTTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642434	643448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_642400_643400
747856	contig_2332_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_58643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTTTTCTTGGCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211958	212312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_212000_212300
747860	contig_12450_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_162324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	533	835	377479	377781	NA	65	CGAGAAAAAGTAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHAVVEAGKSQICGTSGWRLLLTHMFAGADNPKSAGQIAGCCLMSQEPEVRGRQVRGRSQRGQLCQNICMYWMQVTPPRKCPFQLIGCSYQITKWRMIT	376946	379079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_376900_379100
747862	SIRV6	+	301	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-6	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747864	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3894	1	3620	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6746	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
747865	contig_4180_pilon	+	1162	6	Intergenic	novelGene_8375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	146	682	875200	888134	FALSE	70	TATTACAAAAGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874279	888614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
747867	contig_5003_pilon	-	2307	5	Intergenic	novelGene_120180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	2.38484800354236	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1135	1887	26753	3627	FALSE	30	CCATAAATGTGGCTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDSRGPGNLLDHQITNERGESSYDRLFGPHRAPSDTGSLSPPWEQDRKMMILPSGQLYPDPAFPPQRQDRYYSNSGRLSGPAELRSFNMPSLDKADGPMSSEMESSKNDPKDDLGNLNVPDSSLPAGNEATGPGFGPPPLPPVKGPLFPVDTRGPFMRRGPPFPPPPPGSMYGASRDYFPPRDFLGPPHPPLAMRNVYSPRGFPHYLPPRPGFYPQPQHPEGRSEFPPGLIPPSNEPATEHPEPQQET	27887	3206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_3794_5044_5280_5929_5989_10843_10967_26584
747868	contig_11115_pilon	+	657	4	Intergenic	novelGene_102858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.534463105943	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	170	571	172756	173241	FALSE	15	CGGAGTCTGTGGCTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	171849	173327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171901_172513_172595_172718_172964_173047
747872	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747874	contig_10904_pilon	-	1227	6	Intergenic	novelGene_22631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	251.871078133239	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	109	618	515110	499746	FALSE	25	AAGACTACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLVSLASEVQDLHLAQRKEMATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTEARSSATARTWTGWSSSPQKSSGRSELLQCASASQPAQPPCFHLEIL	515993	499136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499842_507486_507534_510099_510260_514793_514925_515034_515114_515888
747885	contig_2646_pilon	+	1949	8	Intergenic	novelGene_69644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	26.9655865343748	10	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	1054	1827	2127520	2130275	FALSE	30	AAAGCACTCACTGGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVIFGWGAEPGADPPSPRSLAVSVKMNGLLFAPGLLFLLLTQFGLRGALPKLGICALLQVVLGLPFLLENPTGYLSRSFDLGRQFLFRWTVNWRFLPEAVFLHRAFHLLLLAAHLTLLLLFALHRWHRTGESILSLLKDPSKRKVPPQPLTPNHIVSALFTSNFIGICFSRSLHYQFYVWYFHTLPYLLWAMPARWLTHLLRLLVLGLIELSWNTYPSTSGSSAALHVCHAVILLQLWLGPQPYPKGIQHSKKAP	2124480	2130397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2124682_2126068_2126169_2126655_2126804_2126915_2127703_2128171_2128378_2128534_2128614_2129810_2129954_2130112
747886	contig_13456_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_153273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121698	123202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_121700_123200
747887	contig_414_pilon	-	2221	4	Intergenic	novelGene_115105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	307	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	995	1771	373842	373066	FALSE	10	TGATGGTGTTTTATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384223	372615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376543_376898_382064_382148_383938
747889	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747890	contig_18506_pilon	+	1314	7	Intergenic	novelGene_67956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.954133956753	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	460	720	43587	53823	TRUE	15	TCAGCTAATCCTTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIVAAKRTPFGAFGGLLKDFTATDLTEFAAKAALSAGNVSPETIDSVIFQTASDAAYLARHVGLRVGVPKETPALTVNRLCGSGFQSIVNGCQLEDYLWAPLTDQHVQLPIAVTAENLAVQHKISREESDRYALQSQQRWKAANDAGYFNNEMVPIEVKTKKGKQTMQVDEHARPQTTLEQLNKLPPVFKKEGTVTAGNASGISDGAGVVILASEDAVKKHNFTPLARVVGYFVSGCE	25015	55655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_25163_27177_27313_31643_31792_43557_43734_44530_44637_53815_53971_55208
747891	contig_4531_pilon	+	1365	7	Intergenic	novelGene_47878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	142.889234490683	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	116	856	225395	264405	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGKSCDQRHVAMNKEQHNGSFTDPSSMNEKKRRDREERQNIVLWRQPLITLQYFFLEILVILKEWTSKLWHRQSIVVSFLLLLAVLIATYYVEGAHQQYVRRIEKQFLLYAYWIGLGILSSVGLGTGLHTFLLYLGPHIASVTLAAYECNSVNFPEPPYPDQIICPDEENIEGAISLWSIISKVRIEACMWGIGTAIGELPPYFMARAARLSGAEPDDEEYQEFEEMLEHAETAQVRTVGKKK	211627	264914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_211717_225368_225471_228604_228741_229766_229858_230729_230841_257190_257359_264246
747894	SIRV6	+	224	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	506	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
747895	contig_10235_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_46304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTTTAATCAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87547	88193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_87500_88200
747896	contig_8045_pilon	+	1183	5	Intergenic	novelGene_35383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1292.62571922425	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	542	637	118627	118722	FALSE	25	GTGGTGTGTGAAATGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGYYVPGCPARVLWTNGQERRQWPQERREAGEDEADPKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116067	119268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117250_117349_117450_117513_118075_118243_118527
747897	contig_1084_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_152381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATTCTAGGTGGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503860	504893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_503900_504900
747900	contig_7876_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_144846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAATTTAAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223603	225663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_223600_225700
747907	scaffold_19766_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_34408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATTCTTCAAGACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830514	829110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_829100_830500
747908	contig_15120_pilon	-	2892	1	Intergenic	novelGene_107994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAACAACAAATGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103347	100455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_100500_103300
747909	scaffold_16539_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_68330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTATCCCGGGAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307868	307213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_307200_307900
747910	contig_1734_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_164386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634258	632042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_632000_634300
747911	contig_7253_pilon	-	1188	3	Intergenic	novelGene_140188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	63	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGCTGGTGTATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154160	143984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_144934_147022_147191_154089
747913	contig_4364_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_87	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTCCATCCTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860404	861149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_860400_861100
747917	contig_6740_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_142656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTGTATCATTTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42537	44207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_42500_44200
747918	contig_14322_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_116341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671869	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
747919	contig_7593_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_127341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598878	600946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_598900_600900
747920	contig_12250_pilon	-	1464	6	Intergenic	novelGene_80724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_3	170.348348979378	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACTCTGCCATCAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401268	398626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400562_401200
747928	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
747929	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8115	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
747933	contig_3095_pilon	-	814	5	Intergenic	novelGene_75202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	867.583569461755	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	236	472	248564	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	253654	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248681_253535
747935	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
747936	contig_18299_pilon	+	2222	2	Intergenic	novelGene_135343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	42	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	82	501	47477	47896	FALSE	20	GCTGTTATCTATACATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSARPLPRRLVSRPAELRVLPGAALRMGGAVSAGEDNDELIDNLKEAQYIRTELVEQAFRAIDRADYYLEEFKENAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALDLQPGLSFLNLGSGTGYLSSMVGLILGKSGRRTGGPAGKHRVGTAQGLISFLEKVWLVTVCPV	43773	49617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_43832_47453
747939	contig_5302_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_81384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGTGCTTTCATACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118033	116944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_116900_118000
747942	contig_13680_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_149609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437321	438756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_437300_438800
747944	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8123	-1	616	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACCGGTTATTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
747946	SIRV6	+	446	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
747950	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11043_11109_11205
747952	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
747957	contig_3956_pilon	+	257	2	Intergenic	novelGene_14760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCAGGCCTCTGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794001	795367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794010_795118
747965	contig_4659_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_118256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGCCGGTCGGGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881351	883486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_881400_883500
747969	contig_16185_pilon	-	2037	7	Intergenic	novelGene_144752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	82.8682019165909	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	120	974	127403	96620	FALSE	15	GTCTTTTCTGTTTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALK	134382	95556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
747970	contig_5671_pilon	+	677	2	Intergenic	novelGene_79475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521218	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_521303_531205
747972	contig_7056_pilon	+	2350	17	Intergenic	novelGene_43593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_16	187.129801207611	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	201	2003	661004	718397	FALSE	25	GTTCTAGGGAGTAATCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELALPSYPKPVRVCDSCHTLLLQRCSSTAS	660803	718744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858_716937_718253
747982	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
747983	SIRV2	-	432	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	391	4	-391	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGAAGACGTCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
747986	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
747991	contig_5217_pilon	-	1720	8	Intergenic	novelGene_135796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	212	junction_4	130.139328790182	987	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	64	795	701665	686512	FALSE	10	GCTGATGCCTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLCSSQREGSCLAEDDAVDIEHENSNRFEEYEWCGQKRIRATTLLEGGFRGSGFVMCSGKENPDSDADLDVDGDDTLEYGKPQYTEADVIPCTGEEPGEAKEREALRGAVLNGGPPSTRITPEFSKWASDEMPSTSNGESSKQEAMQKTCKNSDIEKITEDSAVTTFEALKARVRELERQLSRGDRYKCLICMDSYSMPLTSIQCWHVHCEECWLRTLGAKKLCPQCNTITAPGDLRRIYL	701728	685586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_686584_687315_687391_687554_687664_692311_692391_692523_692580_692722_692810_693013_693111_701508
747993	contig_5039_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_64859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAAGTCTCTTCTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349654	349206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_349200_349700
747994	contig_5039_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_64858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGGGGAGGGGGCCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348912	348055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_348100_348900
747995	contig_546_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_117170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49582	49038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_49000_49600
747996	contig_5799_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_50321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTAAAATAAGGTGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644697	645161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_644700_645200
747997	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748003	contig_513_pilon	-	1715	9	Intergenic	novelGene_80177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	415.3609123401	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	148	1119	453421	450262	FALSE	50	AAAATCCCTGTTCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYVKIQFKNFINKIRCLPLQYEGKSTVQNCNLSLESG	454719	449665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_450369_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
748006	contig_7870_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_108968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAGAAGAAGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366952	364870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364900_367000
748008	contig_5569_pilon	+	2584	2	Intergenic	novelGene_86726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCGAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175515	178181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_177737_177818
748012	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748013	contig_11338_pilon	+	898	6	Intergenic	novelGene_6173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	637.217513883603	32	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	446	898	6086	13610	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISLSK	745	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_13280
748014	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
748018	contig_7593_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_127293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	86	385	172637	172338	NA	35	GTTGGCAACAGAACACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTDYVIKIKTCPNKFHVLKLELVQDTSSEHSLFCFQSSKSGIVNLRFMYRLGDVNHLQLYAKCYSMHAHRERVHRGHQMFLRVKNYNSKSSYCKIST	172722	171066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_171100_172700
748020	contig_7057_pilon	-	1225	4	Intergenic	novelGene_123294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	37.4966665185054	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTCGTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898474	896977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_897359_897464_897540_897628_898000_898076
748021	contig_6164_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_121279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCATGGCTTTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565059	562967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_563000_565100
748024	SIRV4	-	308	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1215	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
748025	contig_8520_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_85450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAATAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256255	255696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_255700_256300
748026	contig_11017_pilon	+	1880	5	Intergenic	novelGene_128073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1064	junction_1	327.50305342088	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAAAATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233673	276414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945
748027	contig_11250_pilon	+	2777	5	Intergenic	novelGene_127158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	53.1671891301393	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	184	846	180215	214774	FALSE	70	TTAACAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFATNPFDQDVEKATSEMNTAEDWGLILDICDKVGQSRTGPKDCLRSIMRRVNHKDPHVAMQALTLLGACVSNCGKIFHLEVCSRDFASEVSNVLNKGHPKVCEKLKALMVEWTDEFKNDPQLSLISAMIKNLKEQGVTFPAVGSQVFCKIMCVLLFVSLKSSCLFEFFLFFLQTQEIFTTSEEFLLIIILYLKGPGKYNSVVLMCFNFHFPAVSPSL	180031	216705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_180255_191177_191263_210812_210889_210983_211080_214408
748028	contig_730_pilon	-	1385	12	Intergenic	novelGene_155619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	29.1485224949115	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	343	696	209819	208425	TRUE	20	GCAGTACCTGCAACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYALSSVFYLPVPQTQISTSWMAPPASLCHL	212391	205963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_206363_207827_207870_208085_208284_208374_208514_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211785_211836_211931_212002_212277
748029	contig_6445_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_76993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAACCAGAGTCACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443106	445266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_443100_445300
748031	contig_6266_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_170990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTGAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465214	463644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_463600_465200
748037	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
748041	contig_6710_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_98012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653705	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748042	contig_10000_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_139318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGATATAAATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183093	185579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_183100_185600
748048	contig_205_pilon	+	1947	4	Intergenic	novelGene_144314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	194.541055364214	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	48	1880	292858	296995	FALSE	10	TCCACTTTTTGAGTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDSNDKGSGDQSAAQRRSQMDRLDREEAFYQFVNNLSEEDYRLMRDNNLLGTPGESTEEELLRRLQQIKEGPPPQNSDENRGGGSSDDVSNGDSIIDWLNSVRQTGNTTRSGQRGNQSWRAVSRTNPNSGDFRFSLEINVNRNNGSQNPENENEPSARRSSGENTENNSQGQVENPRSESTSARPSRLERNSTEALTGEAPPTRGQRRARSRSPDHRRTRARAERSRSPLHPMSEISRRSHHSISSQTFEHPLVNETEGSSRTRHHVTLRQQITGPELLSRGLFAASGTRNASQGAGSSDATGNTESTGSGQRPPTIVLDLQVRRVRPGEYRQRDSIASRTRSRSQTPNNTVTYESERGGFRRTFSRSERAGVRTYVSTIRIPIRRILNTGLSETTSVAIQTMLRQIMTGFGELSYFMYSDSDSEPSGSVPSRNMERSELRNGRGSSAGNSSSGSSSSSSSSPSSSSSGESSESSSEMFESSNEGSSSSGARREGRHRAPVTFDESGSLPFLSLAQFFLLNEEDDDQPRGLTKEQIDNLAMRSFGENDALKTCSVCITEYTEGNKLRKLPCSHEYHVHCIDRWLSENSTCPICRRAVLASGNRESVV	275911	297062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_275935_292833_293027_293874_293959_295415
748049	contig_11493_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_143651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCTCTAGGACATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101319	100911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_100900_101300
748050	contig_11493_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_143652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTTGTAAGTGAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103622	102247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_102200_103600
748052	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748053	contig_7171_pilon	+	2000	7	Intergenic	novelGene_101314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_6	110.090366921402	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1296	1967	1079654	1088749	FALSE	5	CTTAGCTCCGCTGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVTQPQNVVVGIGAQTCPPPNLQSLMWPKQWATCWAPGAARGPGGAAVAGSVIPLLRYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDSVSSIMASSQ	1077031	1088782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088717
748060	contig_6842_pilon	+	2704	2	Intergenic	novelGene_130706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	687	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAACAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412088	415844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_414601_415652
748061	contig_10749_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_133424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGAACCGCTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105898	108020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_105900_108000
748065	SIRV6	+	251	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8467	-2	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
748066	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	2	414	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748067	contig_8044_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_132401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	54	575	597760	597239	NA	15	TTTCTACCCCAGATTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSQLNHTENDVNLLQNEMSNCREGKNTEGGGFTKRDEQERTDETLPSRQDPTAHCSQLEERLQRLQSQVLSSLDTCKENTQGVQTEVSMVEGRVSQMEKTCSKLDSLSESLHKIKEGLNKHVSSLWSCVRQMNGTLRLHSRDISGLKSSVQQFYSHVFQISTDLQDLVKFQPLASKLTFTIPFLVFVCSM	597813	596314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_596300_597800
748068	contig_8044_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_132398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGGAGTTTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579588	578368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_578400_579600
748069	SIRV2	-	324	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	34	3374	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
748077	contig_4730_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_71705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGCAACCAATGTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129899	127550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_127582_128395
748080	contig_12150_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_6974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAGTGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190064	187735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_187700_190100
748084	contig_12427_pilon	+	2246	10	Intergenic	novelGene_40595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_4	391.556753687157	488	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	3	1826	624033	656818	FALSE	10	TCCTGAATGTTTTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSAACLFLVLLLGAWAPALGSASSEVLPLVNEDVKRTVDLSSHLAKVTAEVVLAHPGGGSTSRATSFLLALEPELEARLAHLGVQVKGEDEEENNLEVRETKIKGKSGKFFMVKLPFALDPGAKISVIVETVYTHVLHPYPTHITQSEKQFVVFEGNHYFYSPYPTKTQTMRVKLASRNVESYTKLGNPTRSEDLLDYGPFRDIPAYSQDTFKVHYENNSPFLTITSMTRVIEVSHWGNIAVEENVDLKHTGAVLKGPFSRYDYQRQPDSGISSIRSFKTILPAAAQDVYYRDEIGNVSTSHLLVLDDSVEMEIRPRFPLFGGWKTHYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALKMRFVDHVFDEQVIDSLTVKIILPEGAKNIQVDSPYEISRAPDELHYTYLDTFGRPVIVAYKKNLVEQQIQDIVVHYTFNKVLMLQEPLLVVAAFYILFFTVIIYVRLDFSITKDPAAEARMKVACITEQVLTLVNKRIGLYRHFDETVNRYKQSRDVSTLNSGKKSLETEHKALTSEIALLQSRLKTEGSDLCDKVSEMQKLDGQVKELVLKSAVEAERLVAGKLKKDTYIENEKLISGKRQELVTKIDHILDAL	624030	657238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_624294_627551_627617_635029_635337_643626_643837_644727_644921_649146_649247_650460_650600_650876_650997_655080_655327_656635
748086	contig_11978_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_63001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGGTCGTGGAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527337	1526420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1526400_1527300
748090	contig_11823_pilon	-	2314	5	Intergenic	novelGene_171025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	22.0836477965032	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	1186	2052	53948	41304	FALSE	5	AGTCTGCGCCTGCTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHQCNVFVYSSSKGTVRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVNFSHSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECSWNGSDSAIMTGSYNNLFRMFDRNTRRDITLEASRENSKPRAILKPRKVCTGGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPVENIIAVAATNNLYIFQDKIN	55133	41041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_41584_46515_46608_46680_46851_49217_49383_53788
748091	SIRV6	+	308	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8132	-2	607	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
748094	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748095	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91618	6	-91612	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGAGTGACACCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147600_148000
748097	contig_7234_pilon	-	1709	13	Intergenic	novelGene_145926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	191.321918213489	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	138	551	510034	431636	TRUE	35	CCAATTGCTTAGACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQVPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVTIKKDIN	587401	411143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431660_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509995_510089_587318
748105	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748108	contig_9053_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_87960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAGCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338229	336003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_336000_338200
748109	contig_14665_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_171053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGGGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96026	97630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_96000_97600
748110	contig_14665_pilon	+	471	2	Intergenic	novelGene_171054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTTAAACCAGCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97580	99931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_97768_99647
748111	contig_14450_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_49040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACCTAAAACACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292684	1294826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1292700_1294800
748112	contig_6589_pilon	+	769	5	Intergenic	novelGene_25776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	2084.99364507425	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	121	483	669670	672560	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTRAGGKCSLLEGPP	668303	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669650_669748_670000_670104_671046_671188_672519
748116	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748118	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
748119	SIRV4	-	205	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	409	3	-409	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTATCGGCGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
748121	SIRV6	+	538	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748122	SIRV7	-	287	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91639	0	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
748126	contig_10244_pilon	+	2794	12	Intergenic	novelGene_171057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCTCATTATAATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21563	43416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10244_pilon_+_23053_23230_23387_23733_23901_24233_24449_24876_24945_25152_25297_29250_29374_29712_29806_30073_30183_30557_30647_31168_31277_43383
748127	contig_14513_pilon	-	1289	4	Intergenic	novelGene_70369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	20	CATTAGAACTCTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
748132	contig_7428_pilon	-	1768	8	Intergenic	novelGene_77705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	15.0969655012833	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	150	1175	320975	317760	FALSE	20	GGCCCAGTGAGGTCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVPDLLLGSRRELEPEVPARPGSGALRGRAARPEGPGVETLTPVPAPAMTDGILGKAATMEIPIHGNGEAGQLPEDDGLEQDLQQVMVSGPNLNETSIVSGGYGGSGDGLIPTGSGRHPSHSATPTGPGDEVARGIAGEKFDIVKKWGINTYKCTKQLLSERFGRGSRTVDLELELQIELLRETKRKYESVLQLGRALTAHLYSLLQTQHALGDAFADLSQKSPELQEEFGYNAETQKLLCKNGETLLGAVNFFVSSINTLVTKTMEDTLMTVKQYEAARLEYDAYRTDLEELSLGPRDAGTRGRLESAQATFQAHRDKYEKLRGDVAIKLKFLEENKIKVMHKQLLLFHNAVSAYFAGNQKQLEQTLQQFNIKLRPPGAEKPSWLEEQ	321926	317166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_317916_318369_318545_318693_318852_319383_319606_319780_319900_320529_320627_320876_321018_321819
748133	contig_9727_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_86343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427056	428743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_427100_428700
748137	contig_5832_pilon	+	1264	2	Intergenic	novelGene_134148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGTGGCTATGAGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344404	348678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_344482_347491
748138	contig_9727_pilon	+	1775	6	Intergenic	novelGene_86329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	44.2294019855571	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	83	454	409270	421334	TRUE	40	TAAATGTACAAACATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGWLSTAGRHVRGERDASWSRRAPQQMGPTSSSPPFSSSHRRPQVGRSPAVGGSPGGSTAAPSGALDAAAAVAAKINAMLMAKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTSNKSKDDLVVAEVEINDVFLRQRAREGQAVDASTSLSSDRNKNRV	408694	423766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_408765_409257_409477_412065_412147_420643_420674_421280_421373_422483
748142	contig_5485_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_37736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGTTTACATATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348460	348921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_348500_348900
748143	contig_5485_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_37735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTATAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346366	348523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_346400_348500
748144	contig_10500_pilon	-	1395	10	Intergenic	novelGene_41177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_9	404.899743725698	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	256	1233	1345339	1318487	FALSE	60	AAAGAAAAAAAAATGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1414586	1318324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1414335
748145	contig_17158_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_141147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGCTGAGCTGTTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124598	124050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_124000_124600
748146	contig_7867_pilon	-	2292	10	Intergenic	novelGene_162742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_1	91.4184518209171	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	179	1540	262866	210670	FALSE	45	AAATAACATTAGTTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSDATTSKIARTVTQKLGFSKASSSGTRLHRGYVEEATLEDKPSQTTHIVFVVHGIGQKMDQGRIIKNTAMMREAARKIEEKHFSNHATHVEFLPVEWRSKLTLDGDTVDSITPDKVRGLRDMLNSSAMDIMYYTSPLYRDELVKGLQQELNRLYSLFCSRNPDFEEKGGKVSIVSHSLGCVITYDIMTGWNPVRLYEQLLQKEEELPDEQWMSYEKRHLLDELYVTKRRLREIEERLHGLKALSMIQTPALKFKVENFFCMGSPLAVFLALRGIRPGNTGSQDHILPREICNRLLNIFHPTDPVAYRLEPLILKHYSNISPVQIHWYNTSNPLPYEHMKPSFLNPAKEPTSVSENEGISTMPSPVTSPVLSRRHYGESITNIGKASILGAASIGKGLGGMLFSRFGRSSAQASETSKDSVEDEKKPVASPPSTTVATQTLPHSSSGFLDSALELDHRIDFELREGLVESRYWSAVTSHTAYWSSLDVALFLLTFMYKHEHDNDAKPNLDPV	264287	209917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_210852_219432_219622_220651_220905_223091_223242_235489_235566_236837_237101_249061_249169_254684_254792_262831_262980_264222
748147	contig_6102_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_32028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTATTACAGTGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520565	521395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_520600_521400
748148	contig_6102_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_32029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTAAGATTCTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523418	524221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_523400_524200
748149	contig_9485_pilon	-	2014	8	Intergenic	novelGene_103112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_7	17.8953876169024	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	107	853	268883	248156	FALSE	55	AGCTTAGAAGAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVAWFNESWLSRIKEDVGDNRRIKASNLKKVLQGIMSYYHEFLGQQISEELIPDLNQITECSDSVELGRLLQLILGCAVNCEKKQEHIQNIMTLEESVQHVVMTAIQELMNKEMLNSSTNDAVGELEQQLKRALEELQEALAEKEELRQRCQELDMQVTALQDEKNSLVSENEMMNEKLDQLDGSFDDPNTMVAKKYFHAQLQLEQLQEENFRLEAAKDDYRVHCEELEKQLIEFQHRNDELTNLAEETRALKDEIDVLRYGVSKYNYVASKLLLSKFGYSIF	280177	246994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9485_pilon_-_248370_256183_256351_258598_258683_260771_260835_262176_262245_267135_267269_268865_268917_280104
748150	contig_8435_pilon	+	2268	4	Intergenic	novelGene_72018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	59.4025813131607	1	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	529	2217	94334	97944	FALSE	35	ATAAACACTTTTGACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPRGLASGQRRSWLILQREVEGYFLHPTGMELLVDHGSQDANDWVVEQVWYNGKFYRSPEELARKYGNGEVDVVVLEDPPPSGSEEPPVFSSYRPRGAFSTPTTVNGPRLVQPEGHRYQLEGNAVLYGDWSFAFRLRSSSGLQILDVRFGGERVAYEVSVQEAAALYGGHTPAGMQTKYMDMGWGMGSVTHELAPGIDCPETATFLHALHYYDADGPVYYPRALCLFEMPTGVPLRRHFDFNSNGGFNFYGGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMHATGYIHATFYTPEGLHHGMRLHTHLLGNMHTHLMHYRIDLDVAGTKNSFQTLEMKLQNITNPWSPGHRLVQPTLEQTQFHQERQAAFHFGRALPEYLLFTSPKKNTWGHQRSYRVQIHSMASQVLPQGWQEEKAVTWARYPLAVTKYRELELYSSSIYNQNDPWDPPVVFEEFLQNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASKDTVIVRPQDGGPNHVQRWVPEEARGCWMPPPFSYNGTYRPV	93805	97995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8435_pilon_+_95334_96398_96685_97030_97164_97674
748156	contig_14142_pilon	+	1281	9	Intergenic	novelGene_120539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTCATTCCAGTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349388	353612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_349684_349796_349876_350131_350223_350384_350522_350604_350748_351178_351291_351640_351810_352763_352902_353495
748158	contig_3797_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_120100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAGCAGAAATAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385984	386588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_386000_386600
748160	contig_6735_pilon	-	1358	6	Intergenic	novelGene_15663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_1	1004.41903606015	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	24	878	545923	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	545946	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874
748175	contig_10494_pilon	+	1450	8	Intergenic	novelGene_102140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.9965981572669	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	125	934	393409	438185	FALSE	15	GCAGCTCTAGTGCTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGESGSEASDSVSNCGQSGSQNIGKDYPNGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYGIRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPSSSSYSTSETILSTPQPASEIPQPQPQALHYTLANAQQVQIHQIGEDGQVQVGHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQVLQGAQLIAVASSDPTAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAPVTDHTAAAQTAESLQPSMQPEMQLEHGAIQIQ	381470	438701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_381548_393361_393602_396402_396571_403615_403747_405679_405743_408172_408212_437785_437930_438113
748184	contig_11115_pilon	+	1953	7	Intergenic	novelGene_102798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	112.268527300496	376	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	185	1228	154256	157736	FALSE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEQLPTSCAPQKSGPAGKGPVLASSSTSFLDLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	154071	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601
748187	contig_6862_pilon	-	3245	18	Intergenic	novelGene_63761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	1810	2811	252964	244030	TRUE	10	AATGCCCCGCGGCGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALVSRDRGGDECIWAVDQGPTDDQHDYGAGHPALATVVVQEHHGGSQDEHDAAGGGPATGVVRDEPGQDAAYDATNIEECREVPSLLGVKVSYVEDVEGEPVEERVADQLGKEQAQRELYHARDSERPKEADGSRLGARVLGAFGGSVQVALPVRAGVVGRVLGVVLILSRTAMVLRRGTVHVFRVFYEEEEGEGTHGRGNDTRHDKGQAPLLVHPDAGKQGAHDVAHRCVGIPDAHDEPPPSLPKPVAHAGHHGGPACGLDESITDLDEHKVPEHVDVPEIAHAKEGGEKATEQHSGRQVITDGEPLPKNPTDKHADGIGHKEGIVHRPQ	256906	228607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_228843_243258_243342_243788_243884_244008_244086_246431_246569_246981_247059_247936_248106_248730_248769_249067_249220_249525_249616_251370_251434_251794_251882_252339_252388_252608_252682_252952_253033_253138_253237_253479_253546_255329
748189	contig_253_pilon	+	1391	10	Intergenic	novelGene_129669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	937	1389	393143	395597	FALSE	25	GCGAAGGAGACGCGAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRSLQVPGSPSSAFTTRYLGLPSEGLFMKLHLRPVGKPAPPRPRKPDVLISPRIQSGPFSRISFVLYQSPRLWAPFSLQSWRPYRLVKIRSSSFREPNEVFLGAVVSPLKRTDTRAGSDPPSSRRAANITEASPVTSRCHLHVSGPEKP	389815	395599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_389871_390096_390205_390352_390441_390693_390860_391023_391233_391668_391862_393025_393211_394071_394240_394311_394396_395464
748191	contig_10331_pilon	+	2720	17	Intergenic	novelGene_54217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_8	15.7855501567098	71	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	20	1666	1393798	1428750	TRUE	40	AAACTTTTAAATTATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTELINVNLKIEWKRGNPIWRVISPLKNASIRHLQETSTGQEPALGRQIQKVVSMAALAMVCEAIDQKPELQLDSLDAGPMERFLSSLQLNQTLQKPHTEEQSSFFEESSSSQGWGKIVAQYVHDQWVCLSFLLKKYHTLIPTTESEILEPFLPAVQMPIKTLQSALEALTILPSDQVLPVFQCMRILVPKLLTSCESLCMESFDMAWKIISSLSNTQLIFWSNLKAFVQFVFDNKVLTIAAKIKGQAYFKIKEIMYKIIEMSAIKTGVFNTLINYCCQSWIVSASNVSQGSLSSAKNYSELVLEACIFGTVFRRDQRLIQDVQTFIENLGHQCAANIVIENTEREDHYVRICAVKFLCLLDGSNMSHKLFMEDLAIKLLGKDELVSKSRTRYYVNSLQHRVKNRIWQTLLVLFPKFDQGEEKFKTSICTFLSVLSHLDIIIQDIPEKKLTLKQALIVVLQWCFSHNFSIRLYALLALKKIWSMCKTLYVEEFDALTSVIESSLNQVENMHGAGNAKKNWQRIQEHFFFATFHPLKDYCLEAVSGL	1393778	1439059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1393927_1396323_1396512_1396930_1397193_1397296_1397486_1398631_1398823_1399009_1399082_1400459_1400581_1400944_1401056_1413550_1413638_1424004_1424202_1428418_1428501_1428732_1428829_1430694_1430867_1437282_1437475_1437652_1437778_1438235_1438373_1438709
748192	contig_13525_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_145088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74162	77083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_74200_77100
748196	SIRV6	+	431	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	531	0	352	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748200	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
748201	contig_6710_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_94973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
748206	contig_10629_pilon	+	1699	4	Intergenic	novelGene_52953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_3	233.147068511606	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	83	547	447968	451768	FALSE	25	CTCTAAAACATTTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATGNLYL	447885	452920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_451751
748210	SIRV6	+	504	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748214	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748215	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748217	contig_17829_pilon	-	710	5	Intergenic	novelGene_157039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_1	25.2524751262129	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	27	683	44445	39374	FALSE	70	AACAAAACAACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCKYCTDPYIPCWQIKTESDLHLM	44471	39346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439
748218	contig_9633_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_139657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTGGTTGGTGGTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212242	1209871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1209900_1212200
748221	contig_14923_pilon	-	1482	5	Intergenic	novelGene_157750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	140.752220231157	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	417	1463	358253	354615	FALSE	65	AGATATGATGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPGCSDPVQRIEQCTRGSLFMCSIVQGCKRTYLSQRDLQAHINHRHMRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHIMPPQQHYAPPPPPPPPISHPMPHPPQAAGTPHLVYSQAPPPPMTSAPPPITPPPGHIIAQMPPYMNHPPPGPPPPQHGGPPVSAPPPHHYNPNSLPQFTEDQGTLSPPFTQPGGMSPGIWPAPRGPPPPPRMQGPPSQTPLPGPHHPDQTRYRPYYQ	364743	354595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_355651_358242_358317_360540_360625_361005_361094_364562
748228	contig_15182_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_136433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGACATATGTGCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246399	246037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_246000_246400
748229	contig_9243_pilon	-	2050	8	Intergenic	novelGene_60307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	302.488117493051	5	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	4	525	47738	27300	TRUE	45	TTGTATAGATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMLLQENLMSVIDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQV	47741	18771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_27262_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45132_47712
748232	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	6	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	413	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748235	contig_6589_pilon	+	472	3	Intergenic	novelGene_26168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8827.5	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	111	350	1886667	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRYYKNIGLGFKTPKEAPLWNLTQSLSPPPGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1886008	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886062_1886609_1886783_1887705
748237	contig_3817_pilon	+	1404	6	Intergenic	novelGene_78327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	684.017368200545	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	294	524	201804	204532	TRUE	60	AAAAAACCCAATGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPPSALLRLPRVPSIYSHQGGHQWQHHENQGRVRYQPHQVPDPAEHPGGGERDVWSTVAQSGGHAGADVAEKSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178791	205469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199161_201731_201852_204349_205262_205318
748238	contig_15185_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_99426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265704	264456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_264500_265700
748245	contig_15084_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_116703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACCCCATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238817	239422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_238800_239400
748250	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
748255	contig_19342_pilon	+	1329	6	Intergenic	novelGene_41113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.09838667696593	6	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	445	900	4349	6183	TRUE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGSDSAQGSYVSLTA	3665	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3896_4134_4365_5016_5293_5413_5534_6139_6186_6353
748263	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	15	1153	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
748266	contig_9653_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_48353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCAGTAGCACCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131905	1131038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1131000_1131900
748272	SIRV1	-	218	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3590	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
748274	contig_9146_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_79511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAGCTACTAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314735	313642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_313600_314700
748277	contig_3077_pilon	+	1634	9	Intergenic	novelGene_26789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.0623918681884	139	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	470	997	459530	463345	FALSE	20	CCCTAAAGGGTTGTTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDLSVRGAVEDTALCHGDPAACRSRCLLYPQSPVLLASLGVGLLTLLGLALGSYLVRRSRRPQVTLLDPNEKYLLRLLDKTTVSHNTKRFRFALPTAHHILGLPVGTHVYLSARIDGSLVIRPYTPVTSDEDRGYVDLVIKVYLKGVHPKFPEGGKMSQYLDSLKIGDMVEFRGPSGLLTYTGKGNFNIQPNKKSPPELRVANKLGMIAGGTGITPMLQLIQAILKDPEDPTQCFLLFANQTEKDIILRDDLEELQARYPNRFKLWFTLDQPPEDWAFSKGFVTANMIQDHLPAPGDDVLMLLCGPPPMVQLACHPNLDKLGYSQKMRFTY	457875	463982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_457938_458215_458398_458533_458607_459129_459237_459484_459615_460310_460395_461300_461387_462233_462334_463172
748280	contig_10196_pilon	-	2414	20	Intergenic	novelGene_132063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	82.2307408262999	147	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	347	2131	730703	721848	FALSE	20	GGCTAGGAGTGGGAGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPISTPRRSDSAISIRSLHSESSMSLRSTFSLPEEEEEPEPLVFAEQPSVKLCCQLCCCVFKDPVITTCGHTFCRRCALKSEKCPVDSAKLTVVVNNIAVAEQVGELFIHCRHGCRVAGSGKPSAFEVDPRGCPFTIKLSARKDHEGNCEYRPVRCPNNPNCPPLLRMDLGAHLKECEHIKCPHSKYGCTFIGNQDTYETHLETCRFEGLKEFLQQTDDRFHEMQVALAQKDQEIAFLRSMLGKLSEKIDQLEKSLELKFDVLDENQSKLSEDLMEFRRDASMLNDELSHINARLNMGILGSYDPQQIFKCKGTFVGHQGPVWCLCVYSTGDLLFSGSSDKTIKVWDTCTTYKCQKTLEGHDGIVLALCIQGCRLYSGSADCTIIVWDIQNLQKVNTIRAHDNPVCTLVSSHNMLFSGSLKAIKVWDIVGTELKLKKELTGLNHWVRALVAAQSYLYSGSYQTIKIWDIRTLDCIHVLQTSGGSVYSIAVTSHHIVCGTYENLIHVWDIESKEQVRTLTGHVGTVYALAVISTPDQTKVFSASYDRSLRVWSMDNMICTQTLLRHQGSVTALAVSRGRLFSGAVDSTVKVWTC	732486	721564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_721863_721965_722086_722171_722304_722387_722508_722691_722815_722894_723012_723113_723154_724788_724872_725003_725132_725235_725285_725381_725456_725537_725756_726387_726523_726603_726788_727376_727411_727910_728004_728384_728502_730700_730793_732091_732324_732461
748286	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	57	507	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
748287	contig_6871_pilon	-	1997	14	Intergenic	novelGene_21660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	10.5381807935654	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	201	1556	784881	780790	FALSE	25	CATAAGAGTTCTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGMQLYKNYQQAQSRHLRPSCLGSPPLKKTNHRLSLPTPSSGSSLSAAIHRTQPWFHGHISREESQRLIRQQGLVDGKSSIISSCRVRRRAAFTSAWMMARPASLTCCSSWSSTS	789457	780348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781129_781300_781389_781511_781573_781977_782059_782347_782447_782687_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_789262
748288	contig_6710_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_94870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCTGGGGTAGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
748291	contig_14651_pilon	-	1743	11	Intergenic	novelGene_157215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	54.1974169126168	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	60	1112	112577	87171	TRUE	30	ATTAATTGTAAGCCTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVAWGRFFARAWLCRRAWQGCSRQYRAAFCAELKQPLAIEKVDHRPVCPHEVRVNVHFCGVNFADILVCRGQYQEEPHLPFTPGMEFSGIVLETGTDVSTVKEGDRVIGVCGFNGMAEECITDQKSLWKIPEGVALREAAVLPISYGTAVLALEHRARTQPGETVLVTAAAGATGLAMIDVATNVLQAKVIAAAGNEQKCKLAMQRGAQSSVNYSQGSLKEAVRKLVGSGGVNVVIDTVGGDVFLEALRSLAWEGRIVVVGFAGGTIASVPANVLLLKSISATGMSWGQYKNKNFSLFSSILSSVLRYCQQGRIQPYIGAEFKLEEVNDAFLHVTRRKSTGKVLLSLK	112636	84588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_85133_87083_87240_97825_98055_100098_100281_106152_106235_107093_107204_107844_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
748296	contig_6445_pilon	-	1531	4	Intergenic	novelGene_77089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	30.7354301526214	251	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	172	843	926015	923638	FALSE	15	GAAGGCCCTGGCCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSEVIEDEKQFYSKAKTYWKEVPPTVDGMLGGYGHISSIDINSSRKFLQRFLREGPNKTGTSYALDCGAGIGRITKRLLLPLFKVVDMVDLTEDFLVKAKTYLGEEGKRVRNYFCCGLQDFSPEPSSYDVIWIQWVIGHLTDQHLAEFLRRCKRGLRPNGIIVIKDNMAQEGVILDDVDSSVCRDLEVVRRIIRSAGLSLLAEERQENLPDEIYHVYSFALR	933011	922949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_923895_924766_925020_925853_926065_932889
748297	contig_7963_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_58598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACGTTAAGATGAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298878	293128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_293296_296091_296366_296813_297098_297827_297937_298190
748300	contig_854_pilon	-	1410	10	Intergenic	novelGene_36427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	128.954772433335	18	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	505	1242	1074187	1064774	FALSE	45	AAAGGCAAGGTTGAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKKEIAEMRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081794	1064605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074302_1075226_1075395_1075806_1075892_1081657
748301	contig_8044_pilon	+	2340	15	Intergenic	novelGene_132369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_13	165.589253940007	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	343	1812	353086	386963	FALSE	20	CCACCAGAGTGTTTCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKDLGMDDLGVYSCDVTDTDGIASSYLIDEEELKRLLALSQEHKFPTVPIKSELAVEILEKGQVRFWMQAEKLSGNAKVSYIFNDKEIFEGPKYKMHIDRNTGIIEMFMEKLQDEDEGTYTFQLQDGKATGHSTLVLIDDAYKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFAEYLSWEVTSDCNVLLKCKVANIKKETNIVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAFKELMTEVCKTIALSATDLKIQSTAEGIRLYSFVPYYLDDLKVSWSQNGTAVKYTDRVKSGVTGEQIWLQINEPTPNDKGKYVMELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	352743	387491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_353186_353303_353349_362064_362202_364428_364574_365301_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
748305	contig_10369_pilon	+	1897	3	Intergenic	novelGene_171061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305396	313133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10369_pilon_+_305573_310246_310350_311515
748306	contig_50_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_122219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTCTGAGACACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63782	65545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_63800_65500
748307	SIRV6	+	237	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8481	-2	258	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCGGTCTTACAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
748308	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	14	405	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748312	contig_6102_pilon	-	619	6	Intergenic	novelGene_32206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2000	junction_2	1035.63823799626	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	101	511	896355	895000	FALSE	15	AACCCAGTGGGTGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	896907	894891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888
748316	SIRV4	-	264	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1249	8	1249	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
748317	contig_5643_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_38954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTGCAAAGACAGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488529	487280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_487300_488500
748318	contig_6410_pilon	+	1821	7	Intergenic	novelGene_108621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	121.006083409977	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	132	629	300693	313081	TRUE	10	TTGCTGTTGTTTCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299800	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310261_310369_312966_313753_314137
748319	contig_1244_pilon	-	1642	2	Intergenic	novelGene_37984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1699	junction_1	0	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGACTCTTCAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924516	922776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428
748321	scaffold_16539_pilon	-	1293	5	Intergenic	novelGene_68302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	198.414181700805	671	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	327	704	98796	97499	FALSE	20	GAGCTGCACTTAACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVACYPGNGLGYVRHVDNPHGDGRCITCIYYLNQNWDVKVHGGLLQIFPEGRPVVANIEPLFDRLLIFWSDRRNPHEVKPAYATRYAITVWYFDAKERAAAKDKYQLALGQKGVQVPVSQPTTPT	101184	96909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97555_97821_97890_98114_98252_98679_98800_100861
748324	contig_2969_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_157073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876313	874112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_874100_876300
748325	contig_10765_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_122970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAGGGTTCAGCTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405452	404744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_404700_405500
748327	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748328	contig_9706_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_20928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198049	200251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_198000_200300
748329	contig_15063_pilon	+	484	4	Intergenic	novelGene_11777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3143.56287603025	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	229	435	34808	36756	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVVTSRYVCVHVCIQTNHVCG	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35064_36693
748333	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
748334	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
748335	contig_5921_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_142258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATTCGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448946	449805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_448900_449800
748336	contig_1781_pilon	+	340	2	Intergenic	novelGene_168568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	76	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	144750	160399	FALSE	55	TGAGAAAGAACAGCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRHFRARKGKNSLSPPPPARAAPHPTLPLFPGARPLRLFLPFPFPSLSFRPSPRVWRGRQGSQGCGGGACGRGQAVAAAAAVAGTALTVTSNHIRQERFYNI	144748	160426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1781_pilon_+_145018_160355
748337	contig_12765_pilon	+	1936	6	Intergenic	novelGene_106555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	62.3967947894762	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	10	1248	87118	211118	FALSE	35	AATTTTGTAAAGTTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFISDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQIAIYPHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWNGYSKGVNRKLGRTGLYPSYKVREKIETVKYPTYPEAEK	87108	211806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
748339	SIRV6	+	323	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8118	3	621	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTATTGTATGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
748341	contig_5698_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_54991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGTGGGGAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2145	3945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_2100_3900
748346	SIRV6	+	561	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	9	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1014	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748350	contig_12277_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_139706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAATTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347286	346842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_346800_347300
748351	contig_12619_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_73552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	24	326	664894	664592	NA	10	CAGGTGTGGTCCATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVWSLGVMLYTLLVGRYPFHDSDPSALFSKIRRGQFCIPDHISPKARCLIHSLLRREPSERLAAPEILLHPWFESVLEPGYVDSEIGTSDQIVPEHQEDSDISSFFC	664917	662641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_662600_664900
748353	contig_14871_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_63718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	108	452	231869	232213	NA	45	AGCATCCACAGTAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGQKVTVVILSIGIVHRFLLYFAAAFVVRDTLLNFFNERVLLLPLGQEKKLNKDLTEVISWKEQGFVSCAYRVLVAAALGVLHPPLFLHFEGKSEKGKECSHPLGWYSQRSD	231761	232925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_231800_232900
748354	SIRV2	-	628	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	3070	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_1000_1700
748356	contig_6829_pilon	-	2175	9	Intergenic	novelGene_123765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTTCCTCCCTCCCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59690	18344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_18862_33081_33245_34312_34519_52898_52974_54349_54443_56462_56575_57941_58043_58563_58737_58955
748357	contig_2636_pilon	-	796	4	Intergenic	novelGene_52086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_3	132.380763960126	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	116	529	85555	59826	FALSE	35	CATGGTCAAGAAGTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMRKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85670	59558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_85551
748358	contig_9345_pilon	-	795	3	Intergenic	novelGene_24582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1159	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	218	652	945468	944684	FALSE	5	CTGTGTGTGTTTCCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYRRPSPLSQAAWQSLCYFPWGFHQ	945685	944540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_944755_944828_945115_945390
748360	contig_13158_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_107297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTACATATATTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173629	175387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_173600_175400
748362	contig_16220_pilon	+	1404	4	Intergenic	novelGene_163623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	28.7672653471886	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	36	1346	14388	30932	FALSE	35	TCAGATCCTGAAATTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSRSRSPRWKQRSLSPVPRNSDHYKQRQFYGQYGYEYRKDPKRPVTWRMDNEKYGQSKPRIHSRENIYCRSYDYRSPSPNIRRNSSENSYRLHQVYSPGRENVNRRSQYMPKYSEGIPYNEHDERNCYPQKVQGRYFPDDYRVRGSGRGGKPPQRPVEDSFRFEEKWHEDEFRHQWIQEEKYPPLPRRGSEDFEMRSSFQKRYPEDRDFRKYHCISKRPKDMERYENREPAGHPKWKPKPSLPPYQEKKDQRNFGPQTHRHNEREHSEASSVTKISYDYRHKHRKPSDEDQDFTDGGTQRYSEEEDRKYSSQKGSVDRKPYCFNARRGRGTKDGLVREPFKQTKKDCIASTHSNKSDVDWRPSNDKWKEKIKIEEDFRKESNPSSSQLDKSKKLSDAKPSSFSGRKKLLTIKVDMKKSVDTFRKLFFITWHYST	14352	30990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_14429_19992_20563_21083_21747_30895
748371	contig_6102_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_32030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	318	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530103	528163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_528200_530100
748372	contig_13952_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_133277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTGAGGGAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227850	225207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_225200_227800
748375	contig_7202_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_17660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
748376	contig_10140_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_148403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAATTCTATAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214838	214507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_214500_214800
748381	contig_5696_pilon	-	1039	2	Intergenic	novelGene_117560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGTGTTGACTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704812	693128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_693170_703814
748386	contig_3942_pilon	-	1598	5	Intergenic	novelGene_128721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.0411571911557	354	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	87	536	556088	545719	FALSE	20	GATATGGAGCTCCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLSLLKTAQNHPMLVELKNGETYNGHLVSCDNWMNINLREVICTSRDGDKFWRMPECYIRGSTIKYLRIPDEIIDMVKDEVVAKGRGRGGLQQQKQQKGRGMGGRWARCVWRPWPRRDSGHWQGPAGEEAGPTGGQAVSCAYPDHRD	556174	544656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_545840_546611_546797_548374_548474_549783_549826_556085
748388	contig_5988_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_16152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	37	741	1953338	1954042	NA	65	TTTTAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVFRSVAGGAGMAERGLEPSPAAVAALPPEVRAQLAELELELSEGKSQAGRARDLGALRIEGESGERVPAARPGGGAGEWGGECRKSGFGSEGLFSLLPHHLKWVSRVFHCFLLEGVKQGLGGEVLPRPGLFALPAPQSPRQSYALLLLPGRLGRVGVSTASRVADSFLLSSTFRGEGSTPIFHSHLPSTKKKRKTHEKSAAFLLPPLTMRAASPVTGVRQKQGEPLRVIGRLEAVALIQRETRC	1953301	1955775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1953300_1955800
748389	contig_13901_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_146675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTTTTTTACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286448	287329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_286400_287300
748393	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748394	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748395	contig_14341_pilon	+	1006	6	Intergenic	novelGene_111842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2243.29735880021	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	341	955	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_548071_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
748398	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8139	3	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
748406	SIRV6	+	561	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1255_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748409	contig_4519_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_123683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGCAAAATAATGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88012	88532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_88000_88500
748412	contig_9981_pilon	+	1947	6	Intergenic	novelGene_121047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCTCACTCACGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249292	256386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_250542_253080_253186_254386_254509_255644_255721_255896_255992_256086
748413	contig_11512_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_43214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	2	361	3983	4572	FALSE	25	ATAGTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIRQAGQQDGATDSVPRVPVALGLCGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAA	3981	4573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4289
748416	contig_9363_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_6613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTGTGCGTTCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779413	780539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_779400_780500
748417	contig_7356_pilon	-	598	4	Intergenic	novelGene_60394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	357.234750082725	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	68	457	457848	433924	FALSE	40	GAAAACGAAGCCAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	457915	433782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474_437529_457767
748418	contig_10765_pilon	+	1972	7	Intergenic	novelGene_122858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.353912408438	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	859	1809	19059	34929	FALSE	35	AAATGTATTTTAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15649	35092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15771_18248_18529_18601_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
748422	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748423	contig_1428_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_158392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGTAAGCCTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46046	48638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_46000_48600
748429	contig_4686_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_118535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAAGAAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475916	473486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_473500_475900
748430	contig_6576_pilon	+	1399	3	Intergenic	novelGene_42386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	796	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	164	469	1288392	1288791	FALSE	20	TACTTGTACTTACTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTGHYLHLAWLMTTVFFLSPGTKANYAHLWANNTIWDPVIQNKTGKNQDENINTNPITPEVNYKGTVLHQYRTLKTQAKVTVKFSKRMSVMKTTTKQPC	1286440	1289721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1286583_1288370_1288591_1288684
748431	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	441	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748433	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	0	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748434	contig_14322_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_115912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671646	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
748437	contig_1948_pilon	+	1302	6	Intergenic	novelGene_31165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	161.325757397881	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	541	1068	478740	485694	FALSE	15	GAACTTTTAGTTTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIVGSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKEITPPEDINDTQSDIIFFMKNVEGHDEKTQFESSSYPGYFLASEKDADLYRLILKEKNQIGDNSVMFTVDLQELGVKYS	468424	485928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_471047_471323_474126_474214_478739_478891_480516_480654_485454
748441	SIRV4	-	264	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
748442	contig_6270_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_99868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATATAATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045447	1043441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1043400_1045400
748445	contig_14023_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_165387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGGCAGAAAACCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301074	299499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_299500_301100
748449	SIRV6	+	319	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2840_10721_10819_11031_11109_11205
748450	SIRV2	-	571	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	44	3117	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
748451	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
748456	contig_6842_pilon	-	2365	1	Intergenic	novelGene_130694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTAGGCTTTCCATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376935	374570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_374600_376900
748463	contig_6710_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_89158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCCTTGCTGTCCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
748464	contig_16461_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_139206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATGCTGATCAGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373	937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_+_655_873
748466	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748467	SIRV2	-	646	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	-1	2972	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
748473	contig_5690_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_119751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATAATTAGCTTCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092954	1093417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1093000_1093400
748475	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	53	515	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
748476	contig_5696_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_117555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAATAATTCTTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686060	687592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_686100_687600
748477	contig_16261_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_155300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	23	358	46215	45657	FALSE	25	TATGGTTATAGCTATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAEDAAVYYCLYG	46237	45656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
748479	contig_15327_pilon	+	1250	4	Intergenic	novelGene_70503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	8.2192186706253	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	22	444	427355	433690	FALSE	30	CAGCCAGGTAAGGGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLRRGAMEELDGEPIVTSIPGVNSKKKQLCFDWGPGEMLVCETLFNKKEKSEAVPGCPFIYIIRKDVDVYSQILRKLFNESHGIFVGLQRIEEELTGKSRKAQLVRVSKNYRSVIRACMEEMHQVASKDYCVCDSTFVLKNSYVGN	427333	434496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_427388_430560_430655_432411_432575_433557
748480	contig_16525_pilon	-	587	8	Intergenic	novelGene_133810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2175.68527323307	22	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	31	381	97608	91838	TRUE	60	ATAATTAAAAATGCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKPLDRKAMSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPSPHSPPRPVTTPALPDSWFTATSTCTGTAACPTLCASSSPALWAANPNNR	97638	91506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_94085_94130_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
748485	contig_17753_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_105041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGTCCCTGACACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33312	34739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_33300_34700
748486	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
748491	contig_10986_pilon	-	2239	11	Intergenic	novelGene_71461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_7	138.318798433185	1	116	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	74	949	80340	71463	TRUE	25	CCCGTAAGCTCTCATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVCVAVLFL	80413	66790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
748493	contig_5711_pilon	-	1650	2	Intergenic	novelGene_80254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	953	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1128	1526	41149	40751	FALSE	45	GAAGAAATAACATGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVKDASIQPEEISYVNAHATSTPLGDAAENKAIKRLFRDHAYALAVSSTKGATGHLLGAAGAVEAAFTALACYYRKLPPTLNLDCTEPEFDLNYVPLKTQEWNSEKRCIGLTNSFGFGGTNATLCIAGM	44935	40626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_41154_43812
748502	contig_6048_pilon	-	1476	3	Intergenic	novelGene_73201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	25	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	15	926	1511982	1501214	FALSE	20	GTTCCCAGGACCCTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVAEAPEVLQECGCKGIRTCLICERQRGGDPPWQLPPQNPERFTYCSHTGWAVGAQESDFEGWAFPFPGVTLIEDFVTREEEAELVRLMDRDPWKLSQSGRRKQDYGPKVNFRKRKLKAAGFRGLPSFSQEVVRRMGLYPNLEDFRPVEQCNLDYCPERGSAIDPHLDDAWLWGERLVSLNLLSSTVLSMTHEAPGSLLLCPAPPGSLEPLVEGVVAFSRSVLCQDVEVAIPLPRRSLLVLSGAARHQWQHAIHRRHITARRVCATFRELSAEFCSGGRQQELGQKLLQIAFSFQGRPT	1511996	1500663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1501802_1505745_1505944_1511856
748508	contig_6062_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_5294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTACCTACTCACTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767831	766174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_766200_767800
748509	contig_5799_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_50323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	111	431	667965	668285	NA	50	GAAGTACTCTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQVWCTDKYVVEIISAQQLLVSGFISDVMLSCMLLVSTVNNLWQILE	667854	670324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_667900_670300
748515	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	10	1152	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748517	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2422	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748520	contig_17106_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_127671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	35	403	84922	85290	NA	35	TATTAACAAGTATCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDLPSQAQQPVMVLWGSRAPRHWRKRSLEPCLVPASRDVWPPVLASTDPHTRPLQPLCYERPRPESPFPTLTMPARQGTLPSTSSAPALSSARCACGLALACRKVGCGPAPRQHPLQPAPRSPVWKSFSTQCP	84887	85466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_84900_85500
748521	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_96742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748522	SIRV6	+	562	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
748523	contig_7202_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_18592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	216	88	303	29911	28532	FALSE	25	GCAGAACCAGCGAGGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSSALGRHKAPAAAPAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMK	29998	28529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
748525	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
748526	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1108	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748527	contig_10037_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_148968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508411	507489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_507500_508400
748528	contig_2332_pilon	+	2104	11	Intergenic	novelGene_58656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGACAACGCATTCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317954	330613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_318171_320367_320476_321256_321332_322405_322549_323851_324719_325091_325153_325235_325393_326225_326309_327168_327260_329102_329276_330483
748530	contig_10109_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_131322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98288	100319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_98300_100300
748533	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748535	contig_14017_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_165694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTTTTTTGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73629	76004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_73600_76000
748540	contig_14441_pilon	+	800	3	Intergenic	novelGene_100653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	292	798	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGTRLTVVGKTPEQLLGPPRVHFRVALFWCVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	112011	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117523
748541	contig_12042_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_170441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194248	196799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_194200_196800
748546	contig_5229_pilon	-	2403	6	Intergenic	novelGene_117708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	38.6905673259	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	266	1174	657076	655928	TRUE	10	GGATTGTTTCTGTGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGCGQDNSRALDSPMAPASQEEEGAGVAAVAGPGLYSYIREDLFTSEIFKLELQNVPRHASFSDVRRFLGRFGLQPHKTKLFGQPPCAFVTFRSAAERDKALRVLHGALWKGRPLSVRLARPKADPMAKKRRREGEGEPPATHIADVVTPLWTVPYAEQLEQKRLECEQVLQRLAKEIGSTNRALLPWLLTQRHKHNKACCPLEEVRPSPLQVRLAHPVHFKKLLWSVPPDPFPCFAFLPRAHHIITRCWSCPLTTSPMEKPRSHLLPFPRRWRVLDSQGEVRHVSLCPSLTTISHADRVS	657583	652352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652700_653903_654027_655073_655380_655474_656307_656546_657083_657324
748547	contig_7078_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_130160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAGCTAGGTAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567352	567819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_567400_567800
748561	contig_16122_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_134530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	166613	166269	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSRLNVGSVVDPRGRDGAVCACARSSQSQSSSVHHAVEWDVPLEPTTSSELHPATHSFDLKCAPLPGGLRQGAESLRLGVAGARINTKRPGALTVSLAHPGSELICGGNLFQI	166614	164314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_164300_166600
748563	contig_3942_pilon	-	1058	9	Intergenic	novelGene_128813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	121.023499784133	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	44	901	1060159	1050289	FALSE	20	CCCCAACCCCAGGGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1060202	1050131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1052698_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
748564	contig_4496_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_66652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATCAGAATCTACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742114	741080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_741100_742100
748565	contig_14441_pilon	+	851	5	Intergenic	novelGene_100643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	243	671	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTKLKHCGDRGATATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111350	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113156_113209_116578_116963_117220_117344_117539
748568	contig_8153_pilon	+	2045	6	Intergenic	novelGene_34808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	221.436582343569	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	90	1166	138411	164716	FALSE	35	GTAATCTAAAATTTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAGQMQNLESAGAGQSVSTQTGSMSGHIPRLSKVNLFTLLSLWMELFPVAETQRHKSQKKEEGKHGSLGDNEDRTRVPTDKKQVKRTGLVVVKNMKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTEDHKTGVGAVIWAEGKSVSIKIIF	138321	165595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680_148756_153002_153181_158353_158924_164642
748573	contig_8330_pilon	+	1544	11	Intergenic	novelGene_71762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	249.025721563055	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	58	1236	648213	658351	FALSE	15	TCTTAGCAGTTGAGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREHEGRLRYLSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDCYGSSRSHHRRRSREREPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	644822	658659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_644880_648212_648365_649087_649305_651159_651257_651531_651599_653909_654004_656357_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
748576	contig_6544_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_142087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATAAAAAAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85910	84735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_84700_85900
748578	contig_12327_pilon	+	1153	5	Intergenic	novelGene_140666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	54.71288696459	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	162	539	1131147	1137031	FALSE	35	TACAAATGTTTTATGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERKGGFFVDLFVRVSNQVAVNMYKQLGYSVYRTVIEYYSASNGEPDEDAYDMRKALSRDTEKKSIIPLPHPVRPEDIE	1124007	1137645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1131089_1131157_1131801_1131938_1136332_1136479_1136945
748579	contig_15185_pilon	-	1577	8	Intergenic	novelGene_99448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	348.138489919264	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	71	1069	472420	429966	FALSE	5	GCCCATCTGTGTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPVKAALRGCRQQPRRQDSGGPILRARGEAEQVGLPESVSLWRLLRLCEAQGAGVPQHSVDC	472490	429457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430252_430359_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
748581	SIRV5	+	405	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACTTTGGTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3400_3483
748586	contig_9363_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_6474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCTCTGTTTCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297677	298820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_297700_298800
748609	contig_14441_pilon	+	1216	7	Intergenic	novelGene_100608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.342470313716	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	601	1029	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111205	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112113_112154_112558_112665_113948_114048_116558_116963_117220_117344_117539
748612	SIRV4	-	224	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1299	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3859	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
748616	contig_1009_pilon	+	2230	2	Intergenic	novelGene_121745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_1	0	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1550	1885	211987	213490	FALSE	20	CTGATTAACCTTTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGDRLKGGAPGCLCWQQCWWFTHSFSVFIFACHCSCPLTATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPRKDSVHTDGPVKLVTPVHPNAAHRSAPGKKTQ	210437	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_212138_213305
748619	contig_12969_pilon	+	2167	6	Intergenic	novelGene_61701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	45.9059908944355	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	378	1289	605418	611236	TRUE	30	ATTTCTGCTTGTTAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKDVMLENYNSLVSVGCQGTKRDSVFELEQGETPWIVEGAVHSQTSPEEIWAIDSMQWQPGNQNELKSLERCLQSFSLGINFGLSKNLAPLTQRHNMFDLHHRSLQSRLNFVIQNRGDEGKDSDEFSGYEKLSVHMKHDKTFPGIKYHGYFKPTSIRSQLSGQPKTYTEEQPHKCSECGKVLYRKSLLFYHQRIHTGRNPVYAMNMEKPSLGRAGSRDISYLILERRSMDVMNVGNHFPRRHTLFYIIDFTQERSLMNAVNVEEPLLLSQH	599196	612187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_599389_605232_605433_608508_608636_608880_608977_610562_612035_612107
748621	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
748622	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	288	1	57	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
748635	contig_9839_pilon	+	1320	9	Intergenic	novelGene_88555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	317.211655484158	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	391	1290	258981	269866	FALSE	40	TCCATTTGCAATAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	255888	269896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258866_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
748636	contig_7933_pilon	-	477	2	Intergenic	novelGene_164679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189528	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189469
748638	contig_6902_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_135591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATCAGCGGTTCGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460182	458834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_458800_460200
748643	contig_3111_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_129974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	98	367	64416	64147	NA	15	TTTTATCCCAGCCTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQGDHVLRWYRYSKRLLLSGAVESVLTRSDPMHDRTFTVVKGSAGEKWWVPGPSCHGLANKVLSPGQVYAFSVTLLLRKEAVYTRVPPAVGVSPGERHSGVGDHHLRSVRLSNNFDFIFR	64513	62993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_63000_64500
748644	contig_7291_pilon	-	1261	2	Intergenic	novelGene_106313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTTAAATATATGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213306	205184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_206350_213210
748645	contig_6497_pilon	+	2475	10	Intergenic	novelGene_35614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_9	95.6948596991474	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	123	1634	625657	645666	FALSE	25	GAACTAGTTCTTCATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGPPPDARLLASVAPSNPRSGGDLGLQRLRRAEVASAAGMALLGLLQAGGSVLGQAMEQVTGGSLLSTLLIACTFTLSLVYLFRLAVGHLAQLPAGAKSPPYILSPIPFLGHAIAFGKSPIEFLENAYEKYGPVFSFTMVGKTFTYLLGSDAAALLFNSKNEDLNAEDVYRHLTTPVFGKGVAYDVPNPVFLEQKKMLKTGLNIAHFRQHVSIIEKETKEYFESWGESGEKNLFEALSELIILTASHCLHGKEIRSQLNEKVAQLYADLDGGFSHAAWLLPSWLPLPSFRRRDRAHREIKNIFYKAIQKRRQSGEKIDDILQTLLDSTYKDGRPLTDDEVAGMLIGLLLAGQHTSSTTSAWMGFFLARDKTLQEKCYLEQKTVCGEDLCPLTYDQLKDLNLLDRCIKETLRLRPPIMTMMRMARTPQTVAGYTIPPGHQVCVSPTVNQRLKDSWVERLDFNPDRYLQDNPASGEKFAYVPFGAGRHRCIGENFAYVQIKTIWSTMLRLYEFDLIDGYFPSVNYTTMIHTPENPVIRYKRRSK	625534	646507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_625831_627746_627846_630408_630586_632466_632594_634277_634453_638425_638546_638961_639158_641209_641306_641854_642024_645487
748646	contig_299_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_129451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACACCTGGACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944596	945431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_944600_945400
748655	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748657	SIRV6	+	547	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10799_11017_11109_11205
748658	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748661	contig_6175_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_16347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681890	1684502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1681900_1684500
748668	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748671	contig_14807_pilon	-	1685	10	Intergenic	novelGene_124716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	648.989128482819	161	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	49	1683	66404	45209	FALSE	5	TCCTGTGGTGGTCTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVAALGGGADTRDSEMPATEKDLAEDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVSKRIANLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKKMHRKHNQRPTFRQMQLENVSVALEFLDRESIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLIWTLILHYSISMPMWDEEEDEEAKKQTPKQRLLGWIQNKLPQLPITNFSRDWQSGRALGALVDSCAPGLCPDWDSWDASKPVNNAREAMQQADDWLGIPQVITPEEIVDPNVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLRPKLNPKKARAYGPGIEPTGNMVKKRAEFTVETRSAGQGEVLVYVEDPAGHQEEAKVTANNDKNRTFSVWYVPEVTGTHKVTVLFAGQHIAKSPFEVYVDKSQGDASKVTAHGPGLEPSGNIANKTTYFEVFTAGAGTGEVEVVIQDPTGQKGTVEPQLEARGDSTYRCSYQPTMEGVHTVYVTFAGVPIPRSPYMVTVGQACNPGACRAVGRGLQPKGVRVKETADFKVHTKGAGSGELKVTASPTCGLAAFTWKKETREPFGVLPVFFGPVRGGGSCTTTPWFSTPPRGIKFCFC	66452	45206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45371_60732_60858_61309_61511_61596_61760_61848_61927_62007_62127_62649_62798_62881_62980_63084_63334_66112
748672	contig_1090_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_131111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCCATCCCACAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316232	317382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_316200_317400
748675	contig_5643_pilon	+	2467	10	Intergenic	novelGene_38936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	103.62515543779	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	135	1535	481872	501081	FALSE	25	GGCCCTCACAATCCACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPAHLGKATTNRGASFRHLLLVLQLVLLLAVTQGKEVILGEEGKMVELACKTSHKKFMLFSWKYSDGTKILSNQASHFCTPGNSWLKNRLDCRKNLWDQGYFPLIIKNLEMRDSGHYICEVENEKEEVQLLVFRLIAKPGVHLLQGKNLTLTLESPSDSKPSVQWKGPRDYSKNEAKSLSVPQLGLRHSGTWTCTVSQNQKTLQLRVEILVLAFQKDSNTIYKKNGEQVEFAFPLTFTNEDLTGELKWQAEGASSPQTWITFSLKDKKVSPTSVILDKLKMNKTLPLCFTLPQALPQYAGFGNLTLDLAKGKLHQNVSLVVMTVTQLQNNLICDVLGPISPMMTLSLQRKNQTTKVSKQQKQVQVSDPEEGMWLCLLRDKGKVLLESKFEVLPKVFQPPVILLAAGLGGSVGLLFFTGLGIFCCVRHRHQRRQAERMSQIKKLLSEKKTCQCSHRLQKTCSLT	462243	502013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_462358_481851_481957_482082_482251_494961_495121_495529_495764_497915_498249_499454_499656_500129_500252_500592_500661_501050
748676	contig_7707_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_72199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGTAAACAAGTAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660528	659745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_659700_660500
748677	contig_7707_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_72198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658683	657895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_657900_658700
748678	contig_16098_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_45860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACCCCATACCCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235782	235288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_235300_235800
748680	contig_12090_pilon	+	2373	2	Intergenic	novelGene_80501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGGAAAAAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247410	249846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_249465_249527
748683	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_95683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748690	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	19	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748691	contig_987_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_72252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGGCATGTTAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369112	368770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_368800_369100
748698	contig_10414_pilon	-	1204	1	Intergenic	novelGene_146938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCACAGTGTTTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89792	88588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_88600_89800
748700	contig_3424_pilon	+	2411	4	Intergenic	novelGene_55479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	1	144	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	918	2153	169443	170678	FALSE	5	CAGCTTCTGGTTTTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149889	170936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_169077_169122
748703	contig_7004_pilon	-	1338	9	Intergenic	novelGene_126501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	82.3467326309915	129	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	171	974	434925	432521	FALSE	10	GCATTCAGGTCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGAHCSEPSCQRLDFLPLKCDACSGIFCADHVAYAQHQCGSAYQKDIQVPVCPLCNVPVPVARGEPPDRAVGEHIDRDCRSDPAQQKRKIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGLSEDEALQRALELSLAETKSQVPRYLLLVKRGSSQEEEDLALAQALSASEAEYQQQQAQSRSLKPSTCSLC	435095	432156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_432779_432853_433157_433253_433335_433397_433473_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434599_434870
748704	contig_9436_pilon	+	1913	10	Intergenic	novelGene_60930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGCAGAGCCGAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441232	446999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_441847_442181_442260_442545_442658_442803_442970_443879_444110_444807_445086_445309_445430_446346_446452_446667_446779_446900
748707	contig_4469_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_21891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAACTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297938	295569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_295600_297900
748713	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
748719	SIRV6	+	340	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	532	-1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
748726	contig_12841_pilon	-	1404	15	Intergenic	novelGene_55889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_6	77.1862311925792	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	147	728	931768	910463	TRUE	15	CTGTCAGATGATGTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVNQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIESGAEAKKLPGVGTKMAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFEDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEIKKVDSEYIATVCGSFRRDSAVCIYAPE	931914	891127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_891366_892624_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_910387_910495_914691_914765_914862_914918_916588_916641_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
748727	contig_12139_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_146474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGTTTCTTTAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141443	140866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_140900_141400
748728	contig_12139_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_146473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAGAAAAGAAATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140858	140352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_140400_140900
748729	contig_15327_pilon	-	1982	10	Intergenic	novelGene_70811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_5	37.4258113876599	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	222	1379	1424309	1385609	FALSE	10	GTCTCTGTACTGCATGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKLLLLPPLSASAAFRLPRPRPAARLAMNAARTGYRVFSANSTAACTELAKRITERLGAELGKSAVYQETNGETRVEIKESVRGQDIFIIQTIPRDVNTAVMELLIMAYALKTACARNIIGVIPYFPYSKQSKMRKRGSIVCKLLASMLAKAGLTHIITMDLHQKEIQGFFSFPVDNLRASPFLLQYIQEEIPNYRNAVIVAKSPDAAKRAQSYAERLRLGLAVIHGEAQCTELDMDDGRHSPPMVRNATVHPGLELPLMMAKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVESFVAAAEILKERGAYKIYVMATHGILSAEAPRLIEESSIDEVVVTNTVPHEVQKLQCPKIKTVDISLILSEAIRRIHNGESMSYLFRNITVDD	1424530	1385005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1385768_1386657_1386805_1387609_1387681_1394969_1395116_1395941_1395998_1396454_1396571_1397903_1398077_1417083_1417151_1421389_1421443_1424139
748730	contig_6048_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_73148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCATAAGAAGTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035750	1036282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1035800_1036300
748731	contig_6048_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_73149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACAACTGAAGCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037343	1037795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1037300_1037800
748733	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748736	contig_11256_pilon	+	1697	2	Intergenic	novelGene_150892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGTTTTTGTTGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17610	20468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_18466_19626
748742	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
748746	contig_8059_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_111080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGCTAAGAAGTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61490	60768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_60800_61500
748747	contig_14450_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_49009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATCCCCACAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142713	1140763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1140800_1142700
748749	contig_9852_pilon	+	506	2	Intergenic	novelGene_138462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATGCAACAGGGACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38340	40010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_38761_39924
748751	contig_6726_pilon	+	1572	14	Intergenic	novelGene_86228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	677.642362605551	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	13	1104	287836	327083	TRUE	15	CCGTGCTTTATTTTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISIKRQGAHPHRA	287823	333162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_327052_327147_331125_331229_331541_331677_332995
748755	contig_16761_pilon	-	1323	9	Intergenic	novelGene_146898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	750	1178	30888	24269	TRUE	20	ACTGTGCACTTGTGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWISFLLDATLDLGDRHVDVDDHVRRQVLAGGDLLHLSVVVHTLLPDVALVIHRLQEDEVTENGAFQHDTLTCAQQVFQGVGVLQEATRVQPGLQAVAVAVVALWVGVEFLQTAVATKLYVQQLPVSCRSVCVMYACFRKVP	63573	22953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_-_23094_24263_24481_25681_25771_26902_27025_30882_30961_38400_38456_39770_39859_47080_47188_63146
748760	contig_6710_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_94809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748761	contig_8447_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_69422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATACAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75191	75813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_75200_75800
748765	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_89719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
748766	contig_3602_pilon	+	1093	7	Intergenic	novelGene_60492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	132	581	161745	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161613	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_169585_170753
748767	contig_15182_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_136467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCTAGCCTTTTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603531	605678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_603500_605700
748770	contig_16315_pilon	-	1727	16	Intergenic	novelGene_166318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	479	1171	12930	11616	TRUE	65	AATAGAAAAAGATAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTDGNSHSPASKPELGLCTSRSREPPRAPGCSRTQVAEHSSLGGLRLAFRGKLATPRVWSQGFVGGGHSWHCPVLGAHSSTSGLCGRLWEAESCSRFTLWCALHRLCTGHWLQSGRCGVHTVAPSSMAAWLKSPGRAGSTSSWAKLQSCWETRVLLGSAPIARTRHSTRTTFPSTIPVAWPKAMEAMAPAVYRPTPGRSCCRVSAVCGMWPPSSSTTFRAPSCRRRPRE	14430	9397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16315_pilon_-_9497_10201_10321_10866_11014_11101_11142_11248_11324_11457_11500_11581_11654_11734_11848_11934_12035_12115_12261_12340_12405_12592_12781_12885_13025_13119_13279_13480_13518_14242
748773	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	51	499	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
748775	contig_9505_pilon	+	1117	10	Intergenic	novelGene_121849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	123.337637562531	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	69	758	530721	620981	TRUE	15	AGCAACGCCTCTGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSECFSSVCRWRVPGSAHGPSGKLLCPSPQLLPDPRQL	530652	632884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597992_620872_620989_631447_631521_632605
748776	contig_91_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_127083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGCCAGTCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122589	121203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_121200_122600
748781	SIRV6	+	540	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	22	-1	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGAACTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748787	contig_12938_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_99753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85722	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_85700_86300
748788	contig_5485_pilon	-	1505	2	Intergenic	novelGene_37698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	14	700	86314	85491	FALSE	20	CGCAACCAACCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAVEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	86327	84685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86117_86253
748789	contig_16643_pilon	+	1943	4	Intergenic	novelGene_158132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	14.1656862405839	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	47	1642	289248	300244	FALSE	35	TATGTGATTAATTCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGKDQTHVKLHQTPASHQQENHAPELIGTWCLRNREQLRKRKVEAEEKQTSQWLFGEHNRGKRQRTGKGNERCRKRQQTAELKVDPWPQVEKEMMEKAVAPTEQETEPPGSVTEALPPRASKEKAMAEKSFSEICQESIIHQENCSEYEETGAQNHPSETCQDMTEPENLSPKMCQEIAVLRDHPSKMYQDMAEPEDLSSKMCQRTSVVTALPSKTSEDTAGLEGCSPEVYPKPDVPKGYPLETDQKTAEPKEWNSEPDQEMAENESFFPKIQDGAVPKDLSTKTYPGTTEPKYFSHKTYKEVTVSRTPSPKTIRETPGPEEHSPEVYQETPGPEEQSPEVYQEKPRSEEHSPEVYQETPGPEEQSPEVYQEKPRSEEHSPEVYQGTPGPEEQSPEVYQEKPRSEEHSLEVYQETPGPEEQPPEVYQEKPGSEEYSPEIYQETSGPEDLSTKTCTNKNVPKECFPEPYQETGGPEGQDPVTHQEDAKDFYTFPREMKEKSKAEEPEKPANLNSPQEDHPEDDIYSFVLF	289201	300545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_289327_291224_291319_297048_298365_300137
748790	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	56	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
748791	contig_9609_pilon	+	2205	2	Intergenic	novelGene_23144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	20	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	1292	1921	525826	526455	FALSE	70	GGGGAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTVKEENRPSLADSLEGYLKLFSSLLRLHPHLSFPPLSPQFSFLMTEALLVFSPESSLLRSLSRKGRARCHWVLQLLALLCALLGLSLVILHKEQQSKAHLATWHGRAGLLAVLWAGLQCSGGVGLLYPKLLPRWPLAKLKLYHATSGLVGYLLGSASLLLGMYSLWFTATVTGGAWYLAVLCPVLTSLVIMNQVSNAYLYRKRIQP	524055	526739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_524727_525205
748794	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
748795	contig_6958_pilon	-	2100	2	Intergenic	novelGene_69905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	45	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTCTGCTTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21697	18094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_18573_20075
748799	contig_1244_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_37950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTACCATATGATCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848465	847145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_847100_848500
748800	contig_1244_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_37949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCAGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846994	846687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_846700_847000
748804	contig_5093_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_135078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGGTATATCTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507518	509230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_507500_509200
748805	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748806	contig_16228_pilon	+	1289	2	Intergenic	novelGene_147933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	328	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	59	514	47816	60229	FALSE	15	CTCTATGGCGCAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYGE	47757	61004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843
748807	contig_9423_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_99182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAGAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74955	73313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_73300_75000
748808	contig_3233_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_56505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73770	75829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_73800_75800
748809	contig_17144_pilon	-	1736	11	Intergenic	novelGene_29398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2508.997132322	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	540	1265	174965	172639	TRUE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPESRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPGGRQWADPRVPGFLETLRPGWGSPTLQHH	183255	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166433_172528_172732_173128_173200_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174915_175001_175973_176271_179700_179752_181790_181850_183158
748810	contig_14855_pilon	+	1555	2	Intergenic	novelGene_146048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	40	348	654004	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQAVAFWGSSTDNMGHSACSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	653964	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_654205_654340
748811	contig_5549_pilon	+	887	4	Intergenic	novelGene_81588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1055.76796693213	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	392	718	86768	96749	FALSE	20	AAATTTTCTTGGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALSIDSVEDHLAWSKVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82109	96918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82313_86579_86819_93264_93412_96620
748812	contig_11525_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_171070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGATGGAGAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19452	21035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_19500_21000
748822	contig_8475_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_171098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTGTGTGGATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27688	25311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_25300_27700
748824	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_96475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748828	contig_5899_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_146984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGCGGAGCTGTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279548	281036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_279500_281000
748832	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	533	3	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
748833	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	54	509	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
748835	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	-9	37	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748837	contig_11364_pilon	-	2055	12	Intergenic	novelGene_65155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_8	83.6269757577073	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	59	1189	92079	61299	FALSE	25	AATTGTATAATTTGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIEDEEYYKASVTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDIYQMEKDIAMEQERNTRYRAPKILEPTAFQEPPPKPSRPKYRPPPQTNLLAPKLQFQEEDFIQPSSREEAQQLWEAERVKMRQKLDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNNKSPLTPEKEAGYTEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	92254	60432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64315_64454_65141_65189_66590_66616_67011_67048_67659_67807_85522_85589_86482_86592_90472_90678_92018_92109_92225
748838	contig_6633_pilon	+	1589	7	Intergenic	novelGene_143171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	65.2405804184277	381	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	159	1196	89350	105616	FALSE	20	TTACTATTTTATAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALTEANGTFAIRLLKILCEENPSHNVFFSPLSISSALAMVFLGAKRNTAAQMAQALSLDMEKDIHQGFQSLLTEVNKPGTQYLLRTANRLFGEETYDFLSTFKESCLRFYHAELEQLSFAKAAERSRKHINTWVSKKTEGKIRELLPGNSVDPQTRLIFVSAVYFKGRWNEEFNKTYTRKMPFKINQKEQKPVQMMFQEATFKISYVKEVEKNLTFEKFVAWTKPDCMSSTEVEVLLPRFTLEEDYDMEYVLQNLGVVDAFQQGKADFSAMSAKTDLFLSKFVHKSFVEVNEEGTEATAASAAVVVECCLEAGPRFCADHPFLFFIRHNTANSILFCGRFSSP	86844	106009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_86994_89340_89518_99627_99766_100129_100248_101916_102060_103843_103910_105211
748844	contig_9482_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_44281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTCGATTCTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172072	1174570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1172100_1174600
748852	contig_9333_pilon	+	2755	1	Intergenic	novelGene_120321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	173	532	129478	129837	NA	80	AAAGAAAAAAAAAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGGLETLTFQLTVCTTQRLLLEENIGVNLVFGNGFLNTTSKAIKKKLNVKTKKHLCMKAHYRESEKTIYRMRENNWKSYIYNGLISRIYKELLQLNNKKTNNSIKKWAKDFNRHFSK	129305	132060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_129300_132100
748858	contig_15327_pilon	-	1345	5	Intergenic	novelGene_70482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	192.022785106351	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	88	399	390867	381607	TRUE	35	AAGAAGCACTTTATGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKVSVT	390954	372584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_374889_375577_381602_381720_382830_382974_390811
748860	SIRV4	+	345	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGGGGCCGCTTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
748863	contig_11512_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_43255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	2	352	43480	44059	FALSE	25	CAGTATTATAGCTCTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIRQAGAARWCHRLCSSCPCYFAGASGDIVLTQSPASLAASPGETATINCKSSQSVRKYLAWYQQKPGQAPKLLIYSASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISNLQAEDVAVYYCQ	43478	44059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_43547_43775
748866	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
748869	contig_3252_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_61518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTCCACTATGAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738759	740365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_738800_740400
748877	contig_7898_pilon	+	2433	5	Intergenic	novelGene_47561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	5.43139024560011	31	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	211	1149	361514	371600	TRUE	25	TTCTTTTTTTAACAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGLTVRSAQGRWTPNASRQCSHGSVGLFVPASSPLDPEKVKELQRFVTLSKRLLVITGAGISTESGIPDYRSERVGLYARTDRRPIQHWDFVRSAAIRQRYWARNFVGWPRFSSHQPNPAHWALSNWERLGKLYWLVTQNVDALHTKAGSRRLTELHGCMHRVLCLTCGEQTARGVLQGRFEVLNPTWSAEAHGLAPDGDVFLTDEEVQSFQVPSCTRCGGPLKPDVTFFGDTVKPDKVDFVHKRIKEADSLLVVGSSLQVYSGYKFILTAQEKKLPIAILNIGPTRSDHLASLKLDSRCGELLPLIDPH	358600	373513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_358804_361506_362005_371029_371325_371447_371661_372289
748878	SIRV6	+	446	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748879	contig_12964_pilon	-	762	4	Intergenic	novelGene_131649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	60.5768566001535	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	161	373	101562	90214	FALSE	25	GTGGGTTTGAGCTTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTSPPSIRAGAPTAPLWSTEGRSGRRPARETSCAQSVGSASPSPATSGPTHGRMQCCLSLMDSELLKFTPPLPMPPNKGESILTQIPSRQCLSERGPRDECPAPARPLQQLLTGPTVPTASHL	110174	89824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_90353_100411_100480_101556_101662_110113
748882	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1207	2	1207	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748886	contig_14807_pilon	-	2225	13	Intergenic	novelGene_124723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	656.820984405611	450	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	53	1756	66404	45987	TRUE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAVAALGGGADTRDSEMPATEKDLAEDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVSKRIANLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKKMHRKHNQRPTFRQMQLENVSVALEFLDRESIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLIWTLILHYSISMPMWDEEEDEEAKKQTPKQRLLGWIQNKLPQLPITNFSRDWQSGRALGALVDSCAPGLCPDWDSWDASKPVNNAREAMQQADDWLGIPQVITPEEIVDPNVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLRPKLNPKKARAYGPGIEPTGNMVKKRAEFTVETRSAGQGEVLVYVEDPAGHQEEAKVTANNDKNRTFSVWYVPEVTGTHKVTVLFAGQHIAKSPFEVYVDKSQGDASKVTAHGPGLEPSGNIANKTTYFEVFTAGAGTGEVEVVIQDPTGQKGTVEPQLEARGDSTYRCSYQPTMEGVHTVYVTFAGVPIPRSPYMVTVGQACNPGACRAVGRGLQPKGVRVKETADFKVHTKGAGSGELKVTVKGPKGEERVKQKDLGDGTYGFEYYPMVPGTYTVTITWGGQNITRSPFEVKVGTECGNQKAQAQQMPARWWPRAWG	66456	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45623_45932_46038_60341_60385_60521_60646_60719_60858_61309_61511_61596_61760_61848_61927_62007_62127_62649_62798_62881_62980_63084_63334_66112
748890	scaffold_12124_pilon	+	1356	9	Intergenic	novelGene_22243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	3258.25706618968	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	37	360	1473608	1496374	TRUE	10	CCTATATCGTCGTCCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1473571	1504596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1503728
748900	contig_17198_pilon	-	2162	11	Intergenic	novelGene_62415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_10	273.080134759012	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	235	1224	1150359	1117419	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGLSAQGVNMNRLPGWDKHSYGYHGDDGHSFCSSGTGQPYGPTFTTGDVIGCCVNLINNTCFYTKNGHSLGIAFTDLPPNLYPTVGLQTPGEVVDANFGQHPFVFDIEDYMREWRTKIQAQIDRFPVGDREGEWQTMIQKMVSSYLVHHGYCATAEAFARSTDQTVLEELASIKNRQRIQKLVLAGRMGEAIETTQQLYPSLLERNPNLLFTLKVRQFIEMVNGTDSEVRCLGGRSPKSQDSYPVSPRPFSSPSVSPSHGMNIHNLASGKGSTAHFSGFESCSNGVISNKAHQSYCHSKHQSSNLNVPELNSINMSRSQQVNNFTRS	1218972	1116480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1117426_1122034_1122180_1124906_1125098_1126926_1127036_1128153_1128267_1131162_1131348_1144509_1144533_1148908_1149077_1150310_1150364_1199990_1200103_1218854
748901	contig_10074_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_57139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGATAATGAGTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432169	434493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_432200_434500
748903	contig_5959_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_150233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCATTTGCACCACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592566	593450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_592600_593400
748905	contig_6710_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_96591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748906	contig_7446_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_101952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAACCTAGTTAACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198985	197721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_197700_199000
748907	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
748909	contig_5005_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_84327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGTGGTCTCATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525531	527525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_525500_527500
748912	SIRV7	-	889	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-20	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCAGAGCATTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114955_147602
748913	contig_19098_pilon	+	2084	13	Intergenic	novelGene_65816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	149.35423495837	171	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1149	1982	397106	410278	FALSE	30	TATTCACAAACTCCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESVGDYYACARLVGAPAPPRHAINRGIGIEGLGCLLAGAWGTGNGTTSYSENVGVLGITQVGSRMVIVAAGCMLLLMGVFGKIGAAFATIPTPVIGGMFLVMFGVITAVGISNLQYVDMNSSRNLFVFGFSIYCGLAIPNWVNKNSEKLQTGILQLDQVVQVLLTTSMFVGGFLGFLLDNTIPGSAEERGLLAWNQIQEESQETSKAFEVYGLPCGIGTKFCTSSCVQCLPFWPRLEGGGKDEEIIPSVDAKKEKVLKSQPKPCFLALSCTSEEE	345171	410380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_345364_355805_355947_358015_358174_382756_382917_393940_394123_395065_395156_395416_395574_397037_397292_402630_402796_403128_403238_403357_403454_404278_404453_410174
748915	contig_14300_pilon	+	2645	2	Intergenic	novelGene_133080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	0	98	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	128	661	127488	128021	FALSE	50	GATGGGAAAGGAATATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGNPWRKEGVGEFRQDGTSLRQPRGTSTPPKRKRGTVRRSQMAEGTNHLGDPQAGTGALWEALRALLPPTKEGLKLDVGEKVERSVVLLLERAAELFYGGRRSECLQTSEMILDYSWEKLNTGPWQDVDKGWRQVYTFGCLLKAVCLCEMPGDTAAVAAALRVCDMGLLMGAAILGDVLIKVATILQAHLPSEKRPAQGPTWEQPSTKVSGESVTDHP	121544	130005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_121652_127467
748916	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1198	1	1198	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
748917	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	534	-1	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
748918	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
748919	contig_5125_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_43501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030926	1031554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1030900_1031600
748920	contig_3774_pilon	-	1036	8	Intergenic	novelGene_142041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	181.325617582946	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	500	844	175510	144743	FALSE	5	TGCCTGTGTGTTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210547	144550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_167868_167990_175499_175603_191636_191699_200894_200987_210294
748921	contig_9233_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_78250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	194	532	632248	632586	NA	10	GGTGCCTCTAGGTGGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNATLGRCVHPLLGKLGLVFISANLGELYHQEVSCQLQFGIFRLIVTYDKLTCNKSDKYLCAVSPLKFHGEFTWPGGADDEQGMTAHSSTAACPISFCSREEPAPLFPGGLR	632054	633073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_632100_633100
748927	contig_6946_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_59777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTATATACTATATAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419518	421640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_419500_421600
748929	contig_4782_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_73641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAAGTGAGATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410609	408478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_408500_410600
748930	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
748931	contig_7513_pilon	-	2003	11	Intergenic	novelGene_88953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	102.564321281818	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	483	1163	163991	146994	TRUE	90	AAAAAGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKISRDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDTVLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIPSLHRLTTLTW	167583	145968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147031_154314_154428_155879_155971_159536_159697_161074_161260_163896_164031_164682_164807_164928_165049_166132_166281_167532
748933	SIRV6	+	531	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1504_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748935	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
748939	contig_7457_pilon	-	493	5	Intergenic	novelGene_31284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	41	451	160764	157884	FALSE	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161048	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
748940	SIRV6	+	532	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
748941	SIRV6	+	524	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	20	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11031_11109_11205
748942	SIRV6	+	439	4	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	4	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
748945	contig_19007_pilon	+	2838	1	Intergenic	novelGene_168441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	874	1206	29109	29441	NA	65	TTTTATCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFSLAEIAGQVPALHCIPVTHTEVLPKASTSLGVECCSLTGMVCRKPADPVDWPPLVLGLLTLLKQFHSRYTEQFLALIGQFIRSTVEQCTRYRRPTGNKCNLTSQNVM	28235	31073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_28200_31100
748947	contig_14516_pilon	+	2577	17	Intergenic	novelGene_153888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	114.628748575565	5	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	158	1159	34664	388362	TRUE	15	GTATTTTCGTGTTGCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASDLFSRSH	32423	419129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_34643_34736_36352_36417_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285348_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388338_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184
748952	contig_12543_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_168383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCAGAGCTCCAGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362673	363046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_362700_363000
748955	contig_7963_pilon	+	1207	5	Intergenic	novelGene_58504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	184.665914559239	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	61	918	145910	149953	FALSE	20	AATGTGGCTTCTTTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGIRVCWVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWGAHVIPLGGRLLNHASKLTCSPFSPVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145849	150242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149344_149546_149948
748956	contig_10003_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_88278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAGTAGAAAAATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827655	825644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_825600_827700
748958	contig_10937_pilon	+	2206	11	Intergenic	novelGene_67299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	35.4909847707837	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1008	1955	40405	45290	FALSE	25	AAATCTTTAATTTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVSSLLRVAGTQV	33205	45541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40212_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44253_45255
748961	contig_5018_pilon	-	2125	8	Intergenic	novelGene_46954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	70.291230910101	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	374	1360	312555	305611	FALSE	30	ATCCCTAAGTATTTTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNGELPCSLLPAPTRPTPSVYPAPCP	313010	304845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312666_312747
748962	contig_12019_pilon	+	1246	5	Intergenic	novelGene_87783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1213.0826435161	10051	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	812	1213	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764786	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_765591_765772_765922_766639_766813_767133
748964	contig_4857_pilon	-	1478	5	Intergenic	novelGene_48841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	522	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCCTAAGAACAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411069	1331394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331549_1343174_1343251_1405450_1405553_1407010_1407073_1409985
748965	contig_8616_pilon	-	2009	6	Intergenic	novelGene_72455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	55	junction_4	38.6864317300006	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1398	1787	272117	271495	TRUE	15	TGGAAGTGTTATCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIVSLLPASLPVLGRTPGAVDFLPSRVPGGSGLFCQEERMMSGQKAWGWEVGVGLCPSWLHFLFTTPLAVCYWLPDG	274407	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271276_271486_271795_271904_271971_272093_272145_272904_274150_274282
748966	SIRV2	-	624	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	35	2958	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
748968	SIRV4	-	255	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
748969	contig_6199_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_126406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACCTAGGAAAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680063	679505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_679500_680100
748971	contig_6445_pilon	-	2182	8	Intergenic	novelGene_77119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	3.0572763655761	92	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	14	730	1429469	1420488	FALSE	20	GCGGCTTGAGCACATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADGHCSLPASWRPVTLTHVEYPAGDLSGHVLAYLSLSPVFVIVGFVTLIIFKRELHTISFLGGLGLNEGVNWLIKHVIQEPRPCAGLHTAVGTKYGMPSSHSQFMWFFSVYSFLFLYLRMHQTNNARFLDLLWRHVLSLSLLTSAFLVSYSRVYLLYHTWSQVLYGGIAGSLMAIAWFVFTQEVLTPLFPRIAAWPVSEFFLIRDTSLIPNVLWFEYTVTRAEARNRQRKLGTKLQ	1429482	1419035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1420525_1422466_1422557_1423086_1423216_1423770_1423870_1424101_1424202_1424299_1424385_1424642_1424744_1429393
748972	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_89289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748973	contig_6589_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_25840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	912598	912915	NA	45	CCAGGCATTGGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDFIFEPSCRFQLIVTLQDRVELPHRASRRPHFSPLKWLGFKLLTFWLAAEHFTPAPSGLLLVTRGCPNSLAVCPFLHLQSQQHGVFLALVASSLHSDPPASLL	912595	914311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_912600_914300
748976	contig_5797_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_56906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45377	47777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_45400_47800
748980	contig_11572_pilon	-	2442	1	Intergenic	novelGene_100073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	532	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGATGCAGCTTCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359162	356720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_356700_359200
748983	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_93490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
748984	contig_20116_pilon	-	751	2	Intergenic	novelGene_159084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGTTCCAATAGCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15726	13990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_14676_15660
748987	contig_1996_pilon	-	1498	7	Intergenic	novelGene_131935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.961646672418	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	270	920	509912	508725	TRUE	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYRWAGVPAGVPQASVAAGASCHFSPPGVGGPEIGPPTSPQWLHLHPLRGGQ	511074	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508470_508628_508807_509050_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509953_510845
748988	contig_9995_pilon	-	958	4	Intergenic	novelGene_47674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	263	628	250462	224506	TRUE	20	CGGCAAAGGTAGTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVCPLSLNQSTASWIPRQEKASLFPWLMATLLPSITMGLKAPAGLPHSSSGSVPSLHWTESDRPQEPRGTSSGTAAAAAPPAGRPWVAGRLPVWISSRSTSLTRAPSPSLPSTLTTSSWP	258336	216943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_217165_224396_224789_250379_250520_258131
748989	SIRV4	-	188	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	426	3	-426	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCCATGTCACCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
748991	contig_7744_pilon	+	2044	17	Intergenic	novelGene_62564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	187.990982164039	1	109	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	86	1621	882687	890785	FALSE	35	AAGTCTACTTTTTGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGESQIVLSSGSDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQRNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFHKYWADTKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKIHGNLTCDTIFIQHNGLIKIGSVAPDTINNHVKTCREEQKNLHFFAPEYGEVTNVTTAVDIYSFGMCALEMAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQKCLQSEPACRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879842	891208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_885303_885371_886858_886943_887134_887194_887346_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
748992	contig_11629_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_161208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCATCAGCAGCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506539	505585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_505955_506459
748994	contig_14142_pilon	+	1821	2	Intergenic	novelGene_120543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCCCCCACCCCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350367	352619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_350748_351178
749003	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749009	SIRV6	+	528	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	44	2	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	323	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749010	SIRV1	-	963	3	FSM	SIRV1A	SIRV106	973	3	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	49	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	89	270	51	320	10726	7712	TRUE	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTGFYKGELPTSVYGMFQTPPETETIVWSRTFRKIKITTTEGVRRKVHALTPLSARRERSVEDQQARRLYQIQCLGVSEGRNQRKKGNDQHLYSVLSGPNPKRP	10776	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_7552_7809_10553
749012	SIRV1	-	204	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3604	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6762	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
749016	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749017	contig_7202_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_18507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
749018	SIRV6	+	199	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	506	3	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAGTCGAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
749019	contig_14361_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_139256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1209	1538	67193	66864	NA	20	GACACTGGCACCTTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQASSNPAPPPLCSSTEVRAGRARGTGTVVVPRGVGIRRAFGQVLSAFGHQRPVQRRKHGKCKLLPSHTHHLDKFLKVQMWVRVWTNGNSPCCEWNLCQLLCQAVCKIL	68401	66112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_-_66100_68400
749020	contig_5988_pilon	-	1241	9	Intergenic	novelGene_16046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	61.9631947207372	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	216	683	1046880	1042661	TRUE	20	GGTAGTTTCTTTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLKDMRDEVLEHGDPHLPYFPRSPWAEQPRITRLTWTCLWKVQPGRSPGSKVSSN	1048196	1041987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042433_1042547_1042676_1042844_1042957_1043553_1043587_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107
749021	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	42	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
749022	SIRV6	+	319	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8113	-1	626	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTATGAGTAGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
749024	contig_15134_pilon	-	3330	28	Intergenic	novelGene_140226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_27	66.4001669226256	50	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	393	3038	279133	254587	FALSE	10	CCAGGTTTTTTCCAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSRIQGLRWTPLTDSEESLDFSVSLEQASTERVLRAGKQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQAVGICQVLLDEGALCHVKHDWTFQDRDAQFYRFPGPEPEPVGAHETEEELVEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERTSQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMRPDSSAHDPTETFLSDFLLTYSVFMPSAQLCAALLHHFHAEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVNQWVALYGPMLHSDPVATSFLQKLSDLLSRDARLSNLLKEQWPERRRHHRLENGCGSASPQMKARNVPVWLPSQDEPLPSSNCAIRVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDSWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHKLTPHPEQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRTVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGLRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALTKLSPPVIPFMPLLLKDITFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAVRMLHHCRSHSNVPLSPLRSRVSHLHEDSQPSRISMCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSREMEP	279996	254294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_254706_257512_257585_257744_257800_258977_259043_259368_259457_260487_260539_260656_260748_261016_261199_261300_261427_261888_261987_264742_264890_265218_265301_267982_268023_268837_268921_269004_269156_269358_269438_269754_269844_270135_270249_270797_270945_271108_271186_271298_271360_271683_271769_272370_272540_272717_272840_273060_273168_273251_273306_279040_279254_279724
749028	contig_3602_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_60633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	161	691	985131	985661	NA	30	TCACTCAGTAGAAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMWRALCACCTQVPFPDRSPSPSLRPGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDALVLQVRNDWVRGGCILIASSQGGTGKHLDSASLSQGFWATTGRAGQAADGDSPLPNVKLCVEGRIVPQIHRVRKNPTTQ	984970	987126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_985000_987100
749032	contig_16122_pilon	+	2428	23	Intergenic	novelGene_134524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	47.10485928856	2	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1294	2016	154928	159485	TRUE	45	TGCTCATAAGATACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLHIGACESIMKKKTKQDFQELIKTEHALLEGFNIRESTGYIEEHIDRQVSLIESLRLMCLLSITENGLIPKDYRSLKTQYLQSYGPEHLLTFSNLRRAGLLTEQAPGDTLTAVESKVSKLVTDKAAGRITDAFSSLAKRSNFRAISKKLNLIPRVDGEYDLKVPRDMAYVFSGAYVPLSCRIIEQVLERRSWQGLDEVVRLLNCSEFAFTDLHLV	141737	160199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154266_154339_154658_154746_154915_155007_155255_155331_155590_155656_155789_155845_157040_157088_157684_157818_158440_158515_159013_159116_159311_159388_159468_159612_159913
749035	contig_5988_pilon	-	1373	5	Intergenic	novelGene_16004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.641695452624	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	78	1175	693353	689521	FALSE	25	GTATTCCCTGTCTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	693430	689322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_689851_690110_690504_690859_691009_691134_691358_693350
749041	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749042	contig_15866_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_63592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	938	1246	235543	235235	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLNSFCSGTHLYHTWGAQESRYTVSGQVSSFLTKRFCILYMLYVLQYWLIILLFYLITLSKGEVSNILHPKDPIMYLVQKRGKKTFPDLKSSQTGKQKHMC	236480	234595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_234600_236500
749043	contig_10907_pilon	+	1967	4	Intergenic	novelGene_144906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTTAATGTGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14656	18196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_+_14925_15488_15571_16093_16215_16700
749045	contig_14516_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_153926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272041	271753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_271800_272000
749047	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	54	505	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
749048	contig_8616_pilon	+	1533	9	Intergenic	novelGene_72493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_6	518.875090339669	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	167	1279	322373	330805	FALSE	10	TTCGTGCCAGCCACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGEGHLELLPGWSGEEAEPQRKQHWAVVF	322206	331059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638
749051	contig_8138_pilon	+	2275	3	Intergenic	novelGene_52431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	438	junction_2	10	44	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAAGGAAAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280091	290516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507
749052	SIRV6	+	542	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749054	contig_6873_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_129808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAAGCCTACTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104186	102726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_102700_104200
749057	contig_14142_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_120503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325755	323627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_323600_325800
749058	contig_9580_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_167733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAATGGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770308	768260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_768300_770300
749060	contig_960_pilon	-	3098	1	Intergenic	novelGene_108219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTGGTCACAATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310129	307031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_307000_310100
749067	contig_12635_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_60844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCCTCAGATGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539373	541279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_539400_541300
749068	contig_5671_pilon	+	548	4	Intergenic	novelGene_79456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2257.42567245672	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGGCAAGAAGGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369916	392890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376745_392775
749069	contig_5200_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_140171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	97	396	452990	452691	NA	70	TCAAGAGAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGARWALSQCGPGNVATRERTTQAWVAWQEPVAEARKGLLAEAWEILCRGLPAFEAGPSQFQWQSRSLRRCSPPSPPEATVMCEHSIWPKPWCTYPVT	453086	451555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_451600_453100
749070	contig_6050_pilon	-	1698	8	Intergenic	novelGene_123125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_7	83.3811019552111	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	249	557	391484	389438	TRUE	15	TCCAGTGTTTCACACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVIPLLWASVFSSVKWSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSGLIAQLEEKQQQPTRELLQVRHGALC	392587	377075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377904_379934_379962_381537_381571_381701_381818_382659_382683_389323_389693_391430_391650_392504
749074	contig_8598_pilon	-	1091	2	Intergenic	novelGene_22882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	225	599	57802	57188	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLSVSHPLPNLGPLTFLSSQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	58026	56695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_57297_57536
749079	contig_14341_pilon	-	747	5	Intergenic	novelGene_111889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_1	660.019128510682	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	13	681	729247	727088	FALSE	20	TTAGCTCTGAAGACTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	729259	727021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_729079
749080	contig_756_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_134781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAACTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199255	197610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_-_197600_199300
749082	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749083	contig_5286_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_157393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGAAAAGAGACATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674822	675227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_674800_675200
749084	contig_13292_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_142959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381704	382059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_381700_382100
749087	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
749089	contig_9406_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_136170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90244	89261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_89300_90200
749090	contig_5947_pilon	-	2594	1	Intergenic	novelGene_101481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358423	355829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_355800_358400
749092	SIRV5	+	460	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-130	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8185	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
749093	contig_4223_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_117270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAGAGAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158258	156969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_157000_158300
749094	contig_10129_pilon	+	1640	13	Intergenic	novelGene_128163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	205.202677587036	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	20	1618	586326	614326	FALSE	35	CAGATGCTTAGAACAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFCWGAGSRVRLRREAEGGAELQQAASGERHALLLLSDGTVHSCGDNSWGQLGRRDKPHGKRPERIQALETLKVDLLSCGKEHCLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGTGGFEELKFTPKKVNTLADIKIIQVSCGHYHSLALSQDGKVFSWGKNSDGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSVSGTSFGWGSNNAGQLALSGNNVSVQSYKPRSIGALKELGVIYISCGYEHTAVLTQDGKVFTFGDNSSGQLGHSPTAKKKGPQLVEGIDGLVSQIDCGSYHTLAYVYTTPRVVSFGHGPGHTSSSTHPDAMTKNFDVSCLISADDLVNVQVKHIFAGTYANFVTTYQDTSSTSVSRKTLPEISRINQSLTEKWIAVRRGSTEHEEAKSEIGMIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLIADFIPLREVLGIFA	586306	614348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_586519_588123_588284_589293_589371_592929_593158_595360_595456_596710_596839_598064_598202_598697_598766_607103_607226_608274_608335_608643_608738_611511_611702_614279
749095	contig_7342_pilon	-	1118	2	Intergenic	novelGene_71166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1483	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTTGTGGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470439	469246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_470285_470359
749096	contig_15264_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_158865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAGCAATAAAAGGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73841	72423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_72400_73800
749106	contig_11413_pilon	+	576	4	Intergenic	novelGene_103141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3	458	87510	90735	FALSE	25	AGAACCTACTCAGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87507	90853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
749108	SIRV6	+	556	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3162_10721_10819_11031_11109_11205
749109	contig_7345_pilon	-	1625	4	Intergenic	novelGene_159170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	150.645278717921	25	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	80	484	139698	110539	FALSE	30	CCCCCACGCCCACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGSRAPGRHRHLGHCRHRLDPPSPAMAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNRIFS	139777	109397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_110552_118503_118620_119857_120024_139588
749111	contig_3627_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_78424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172072	174414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_172100_174400
749113	contig_3948_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_53337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTCAATAATAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475164	1474036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1474000_1475200
749114	contig_21422_pilon	+	1859	14	Intergenic	novelGene_79079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	120.63456480152	36	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	727	1857	28409	40547	FALSE	30	CCAGCAGCTGCAGAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKSKVEDIKLEQEREAEKSIRLHFQMEQIVYCQDRVYRDALQKVREKEAEKEKNNKGNFTFCQQSSSEESSVEEIFQHLLAYHQEISNRLSSHIPLVIQFFILRMY	19946	40549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_20029_21467_21619_24358_24530_25736_25875_27086_27172_28309_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_38751_38998_40481
749116	contig_11370_pilon	+	660	4	Intergenic	novelGene_98721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2185.92650074669	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	142	564	145831	148303	TRUE	20	CAAAGTGCTGTGTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145689	148544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205_148314_148458
749117	contig_11932_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_85416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACGACCGACGCCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289571	287651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_287700_289600
749118	contig_7291_pilon	-	2225	10	Intergenic	novelGene_106303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_9	242.070237741033	4	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	163	954	206279	173628	FALSE	20	TATCTGGGTAAGTCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEADIMDINEIFKDLGMMIHEQGDVIDSIEANVESAEVHVQQANQQLSRAADYQRKSRKTLCIIISVLVIGVAIIGLIIWGVNKKN	213302	172356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180758_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
749122	contig_16625_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_171109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAACCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33060	30742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_30700_33100
749131	contig_12327_pilon	+	1975	5	Intergenic	novelGene_140630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	798.729733702208	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	78	623	168930	171003	FALSE	15	CATGAGCTTTTCAGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148627	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168911_169078_169396_169508_170312_170438_170841
749135	contig_9345_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_24557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCGATCTCGTCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734709	734424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_734400_734700
749136	contig_6361_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_23923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGGAGAGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244399	242202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_242200_244400
749137	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749139	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749145	contig_15219_pilon	-	2053	2	Intergenic	novelGene_40854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	90	368	72148	71870	TRUE	35	CAGGCATCTGTAACCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQQLLLSSRWGWPGTASAAGCSQGPVCGVMGDAEVHTSGLSFEAHQDGSDGNEHQGSLGTGTGRVAVQLLPKAQPAQSPGPEAVPAPWASGALLPSLFWGRRMASSTIRMMSKLPPTANPR	72237	69783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_71396_71796
749153	contig_5485_pilon	-	1503	8	Intergenic	novelGene_37740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_7	55.6435448334544	237	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	59	1114	357599	352675	FALSE	15	CCTGAGTTGGTTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAAAKGSELSEKIESFVEALKRGGGRRSSEDMARETLGLLRRIITDHPWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGNMVRRVLKIIREEYGRLHGRSDESDQQESLHKLLTSGGLNEDFSFHYAQLQSNIVEAINELLVELEGTTENIAAQALEHIHSNEVIMTIGYSRTVEAFLREAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEIAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTILANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPELITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL	357657	352285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_352833_354028_354096_354566_354705_355166_355263_355909_356074_356936_357086_357193_357315_357436
749155	contig_6634_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_171135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAATCTGAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123324	121422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_121400_123300
749160	contig_2726_pilon	+	1094	4	Intergenic	novelGene_165898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	401	junction_1	142.494444336145	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	11	436	173807	177160	FALSE	30	CAAGAGCCTTAGTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGMMYALYLSAYHERKFWFSNRQELEREITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERGVYELTHNNRTVSLKTINAVQQMSLYPELIASVLYQATGGIEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINR	173796	177818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_173870_176409_176501_176771_176894_177010
749164	contig_12033_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_170924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATAAATGTATTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166629	165293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12033_pilon_-_165300_166600
749167	contig_9014_pilon	-	2638	13	Intergenic	novelGene_106739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_8	125.765213349674	211	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	95	1768	61662	56157	FALSE	25	TCCACTGGATAACTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIQITFEEVPQLPPRASISHVTCIDQSERTMVLHCQLSAEEVWFPVSVTQQSPAAVSMETYHVTLTLPPTQLEVSLEEIPDEGLLVSWAFTDHPDLSLTVLPKLQARERGEEQVELSTIQELIKDAIVSTQPAMMVNLRACSAPGSLAPSEKPPLVPQAQPAIPRPTRLFLRQLRASNLGSELGGSGELCCVAELDNPMQQKWTKPVRAGAEVEWTEDLTLDLGPQSQELTLKVLRSSSCGDSELLGQATLPVGSPSRPLSRRQVCPLTPGPGKVLGPAATMAAELQYEEGSPRNLGTPTPSTPRPSITPTKKIELDRTIMPDGTIVTTVTTVQSRPRVDGKLDSPSRSPSKVEVTEKTTSVLSESSGPSSTSHSSSRESHLSNGLDPVAETAIRQLTEPSGRAAKKTPTKRSTLIISGVSKVPIAQDELALSLGYAASLEASMQDDAGSSRGLSSPPSDPPAMSPGPLDALSSPTSVQEADETTRSDISERPSVDDVESETGSTGALETRSLKDHKVSFLRSGTKLIFRRRPRQKEAGLSQSHDDLSNTAATPSVRKKAGSFSRRLIKRFSFKSKSKANGNPSPQL	61756	55286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_56369_57605_57892_57973_58108_58250_58353_59106_59282_59370_59499_59586_59652_60223_60333_60473_60586_60674_60792_60899_61011_61182_61303_61659
749171	contig_7254_pilon	-	1056	6	Intergenic	novelGene_145832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	66.7005247355671	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	94	804	22057	15135	FALSE	45	ATAATAACGAATGCATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDAGLNSEKVAALIQKLNSDPQFVLAQNVGTTHDVLDFCLKRATVQATQHVFQHSVPQEGKPVTNQKSSGRCWIFSCLNVMRLPFMKMLNIEEFEFSQSYVFFWDKVERCYFFLNAFVDTAQKKKPEDGRLVQYLLTNPANDGGQWDMLVNIIEKYGVVPKKCFPESYTTEASRRMNEILNHKMREFCIRLRNLVHCGATKGEISATQDVMMEEVITIIWIFVTLLKNSQNIPIY	22150	14882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_15294_16859_16949_17828_17971_18654_18765_21542_21741_22044
749173	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749174	contig_401_pilon	-	1462	4	Intergenic	novelGene_42854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.778618972375	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	118	1239	1724288	1721973	TRUE	5	CTTCTGTGTCTTTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1727983	1721702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1721827_1721873_1722981_1724174_1724346_1727923
749175	contig_9272_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_125977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	779	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTCTGTAGTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653129	654752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_653100_654800
749176	contig_15628_pilon	+	1633	12	Intergenic	novelGene_147685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	155.177211413754	127	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	430	1602	52016	116664	FALSE	30	CAAAGATTCCATTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLGIDLQKISDHNGTFEKSTVLQLGIRMLDVLEYIHENEYIHGDVKAANLLLGYKNPDQVYLADYGLSYRYCPNGNHKQYQENPRKGHNGTIEFTSLDAHKGVALSRRSDLEILGYCMLRWLCGKLPWERDLKDPLAVQTAKTNLLDALPESVLKWAPPGSSCCEIARFMECVHSLAYDEKPNYQMLQKILNPGGMPLGPLEFSTHRHGVRVHPPDNPKVDSRKAATKQVNPMQNRLIEKKVHSERRAESCATRRRGQGEEKLSELTDSGAAQGSTRRRQKYHEPQEHWNEVKSSLQKSSCIQPLNSFYKYHQDFTTPDINNKSASANWYTYDTSTVGTRVTELESSLGCWPTISQFTLSEEMKTSVYFYSLLILFLLMLIFLALYFL	26910	116695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_27025_29114_29256_48279_48350_49743_49832_51999_52106_53308_53402_83282_83416_92163_92285_94797_94857_99444_99612_105797_105960_116316
749177	contig_15304_pilon	-	598	2	Intergenic	novelGene_30523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	198	422	54100	53061	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54297	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53261_54075
749178	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
749181	SIRV1	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
749183	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
749185	contig_5317_pilon	+	2863	15	Intergenic	novelGene_76641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_1	39.1086920762938	279	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	129	2072	987269	1020587	FALSE	30	AAAAAGTGCTTTGTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMLGDAIMLIKGLAKLTQAALETHLQHLGLGGELLMVARTLQSTATEQFAVVFGSVQGQERHEEPYAESFDDLEAELHFSGPQAAGDAAHSSAASDPVSPPPLDPTHSEGPAPAYAASGPFREARLPGRAASPLGMVNGKLFADRRDPYSAMGIQRKFFHQDQSPMGGLTAEDIEKARQAKARPEGSKPHKQMLSERARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRPDEHTGKKAVLDSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNSDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARLKGGREVAMKIQYPGVAQSISSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACAKKFRELLKDHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQLHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVLKKSIEMKFLTGYEIKAMEDAHLDAILILGEAFASEEPFDFGTQSTTEKIHNLIPIMLKHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFTCKAMFEEAYSNYCKNQAAGQ	966561	1021378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_966681_987259_987446_991036_991445_991632_991700_1009755_1009831_1014062_1014186_1015306_1015393_1015633_1015775_1016407_1016490_1016884_1016979_1017200_1017343_1017626_1017735_1017988_1018055_1018367_1018455_1020299
749186	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749188	contig_6361_pilon	+	1930	3	Intergenic	novelGene_23897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTATATTATTACATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121269	124308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_122725_122790_122882_123924
749190	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
749191	contig_9571_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_136274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCTAAAACGAATCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419855	421244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_419900_421200
749195	SIRV6	+	560	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
749198	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	398	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749203	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_95902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749204	contig_16122_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_134514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGCCTCAAGCTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134918	136043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134900_136000
749208	contig_6795_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_27760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGTCTTTGGCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373851	372707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_372700_373900
749209	contig_6674_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_148009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCACCACCGAGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173426	174904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_173400_174900
749210	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_93394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657836	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657838	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
749213	contig_9646_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_117457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAGAGAATAGAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317557	315470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_315500_317600
749217	contig_15327_pilon	-	1807	8	Intergenic	novelGene_70731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	313.268353372137	1	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	212	811	963897	960518	FALSE	20	CCTTGATCTGTTTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPAEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967502	959521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961608_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965046_965146_967420
749221	contig_3077_pilon	-	1295	2	Intergenic	novelGene_26900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	226	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGAAGTTGTAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548445	1543615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1544092_1547626
749222	contig_20293_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_153532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAACCCAGAATAATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108427	107996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_108000_108400
749223	contig_18096_pilon	-	2463	1	Intergenic	novelGene_58040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCGTGAGGAAATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42788	40325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_40300_42800
749225	contig_9258_pilon	+	623	3	Intergenic	novelGene_104610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	20592	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	81	473	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96740	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
749226	contig_14638_pilon	-	2025	6	Intergenic	novelGene_71582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151.411228117336	1	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	TRUE	60	AAATGGAGAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_252898_252979_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
749227	contig_6710_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_98182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	15	TCCCTATTTCAGCCTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
749234	contig_19564_pilon	+	908	2	Intergenic	novelGene_29662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1323	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGAGGCACCTCGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44833	46602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_44967_45827
749237	contig_6710_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_97992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	TTCTTTAACTTTAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749238	contig_14322_pilon	-	1980	2	Intergenic	novelGene_115656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	0	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1546	1893	498604	498257	FALSE	0	CTTGCTTTTGGTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEREERGPPGQQKRGPHGTGLVTADARVGEPCLPPARRAWTLPLEVGRDLWRRPPLLRLELPSTKRTWLSEGVDPCQDFLLRDLELGPTLYGSQELLVCKCYRQSILLPALVT	500277	498169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_499868_499995
749239	contig_7963_pilon	-	1026	5	Intergenic	novelGene_58317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39276_39405_39949_40232_43598_43819_48741
749242	SIRV4	-	411	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1112	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749261	contig_11989_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_68450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61835	64137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_61800_64100
749262	contig_8814_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_167751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	367.719851094402	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	301	867	349870	135066	FALSE	45	TTAAATTGAAGTTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGQVSWEDGDVRCADPAGDPQVAACPGTCGSTCRAALTELAHGFPCCLTSWRRASRGREGWSRGCRAPNPGPADPGGGRGRLRLRVSWPLWRSRCAGQLSMKKAVSLINAMDIGRFPRLLTRILQKLHLKAESSFSEEEEEKLQAAFSLEKQDLHLVLQTISFILEQAVYHNVKPAVLQQQLENIHLRQDKAEAFVSAWSTVGQDAVEKFRQRILAPHKLETVEWQLNLQMAHSAQAKLKSPQAVLQLGVSNEDSKSLRKVLMEFSHKELFDFYNKLETIQAQLDSLT	351659	134258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_135105_135836_135897_293657_293769_330491_330648_332548_332660_349780_349872_351360
749268	contig_3727_pilon	-	479	6	Intergenic	novelGene_146735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	422	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAAGAACACAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307457	300431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_300501_301345_301414_301685_301734_302573_302661_303621_303704_307332
749269	contig_6233_pilon	-	1145	8	Intergenic	novelGene_74790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	355.649104756761	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	181	858	149543	143464	TRUE	35	TTAAGCCACAAAGCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDSLWPVCPHRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	149723	136687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145807_147888_147937_148115_148189_149521
749272	contig_1301_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_47357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	150	536	528848	528462	NA	65	AGCAATAATAACAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHNVFCKETFFWQKEKFAKTGKQVKTAKTSVTAELCHYAQGRKRDPILRNITFLKYVRKEGKTQPNKKSPLKGYLTSKILSSAWCITYRNGNPVTNVFDNSCVDQHLLRTSWQTRGKVLSNLGLCSF	528997	526655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_526700_529000
749276	contig_3679_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_112133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTGAAATGAGCAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085592	1088095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1085600_1088100
749277	contig_14638_pilon	-	1542	5	Intergenic	novelGene_71584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	140.166641894568	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	42	353	277550	254501	FALSE	20	TTTTGAAATATGGGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSQIVQKSLGL	277696	253311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254531_258242_258365_262339_262459_277509_277556_277660
749278	SIRV6	+	532	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11031_11109_11205
749290	contig_15658_pilon	+	1566	2	Intergenic	novelGene_157871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	288	1196	71512	72420	TRUE	20	TCATTGTGTTTGACCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSQLCKLFIGGLNVQTSESGLRGHFEAFGTLTDCVVVVNPQTKRSRCFGFVTYSNVEEADAAMAASPHAVDGNTVELKRAVSREDSARPGAHAKVKKLFVGGLKGDVAEGDLIEHFSQFGTVEKAEIIADKQSGKKRGFGFVYFQNHDAADKAAVVKFHPIQGHRVEVKKAVPKEDIHSGGGGGGSRSSRGGRGGRGRGGGRDQNGLSKGGGGGYNSYGGYGGGGGGYNAYGGGGGGSSYGGSDYGNGFGGFGSYSQHQSSYGPMKSGGGGGGSSWGGRSNSGPYRGGYGGGGGYGGSSF	71224	72932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15658_pilon_+_72684_72825
749291	contig_5403_pilon	-	1613	9	Intergenic	novelGene_87967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	52.7630315656711	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	208	1230	433348	424565	FALSE	15	GTTTCAAGACTTCGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRIADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEAEIKGCLDFLHTVYSVFGFTFKLNLSTRPEKFLGDIEVWNQAEKQLENSLNEFGEKWELNPGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTFVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPHQVMVVPVGPMCDEYAQKVRQQFHDAKFMTDVDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKTSGTVNIRTRDNKVHGERTVSETIERLQQLKQSRSKQAEEEF	433555	424181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425305_428401_428475_430942_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432248_433247
749298	contig_5434_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_74651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAAACATATAATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204981	204389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_204400_205000
749300	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749301	contig_6442_pilon	+	1620	5	Intergenic	novelGene_166484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAGAAGAAAAACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264147	318323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_264366_265385_265528_272169_272324_300924_301094_317386
749302	contig_10431_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_117400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAAAGATTAATGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236510	234521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_234500_236500
749303	contig_11088_pilon	+	693	4	Intergenic	novelGene_85031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	57.9271573232759	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGACGAGCCCTGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13625	17372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_16250_16348_17119
749307	contig_12644_pilon	+	959	7	Intergenic	novelGene_44657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4193.43532268659	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	579	878	2680163	2680545	FALSE	30	TGAGAAATATGTGTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675480	2680626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678778_2680107_2680229_2680311
749308	contig_5711_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_80279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAAACCTCAAATATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108417	107467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_107500_108400
749309	contig_2069_pilon	-	1977	15	Intergenic	novelGene_23327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	41.1026589338034	237	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	893	1885	578160	574853	FALSE	15	CAAGGGGCTGATGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSSSSVSSLNSSTLSGSQLSLSREAEAGAVQVRGSVHFALRYEPGTSELRVHVIQCQGLATARRRRSDPYVKSYLLPDKQSKRKTAVKKRNLNPVFNETLRYSVPQAELRGRVLSLSVWHHESLGRNIFLGEVEVPLDTWDWDSEPTWLPLQPRVPPSPDELPSRGLLSLSLKYVPAGSEGAGLPPSGELHFWVKNAQDLVPLRSGSLDTYVQCSVLPDDSWASRQRTRVVRRSLSPVFNHTMVYDGFGPSDLRQACAELSLWDHGALASRQLGGTRLSLGTGSSYGLQVPWMDSTPEEKRLWQILLERPCEWVDGLLPLRTNLAPRT	583277	574760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_574993_575204_575411_576213_576314_576430_576510_576836_576996_577335_577433_577719_577887_578115_578230_578384_578480_578735_578810_579269_579316_579402_579476_579695_579869_580820_581056_583150
749321	contig_9363_pilon	-	1821	3	Intergenic	novelGene_6662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	259	junction_1	5.5	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGTCAAGACAGCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013477	1009684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1011415_1012877_1012949_1013457
749326	contig_1172_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_162032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAATATGAGAATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615626	617269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_615600_617300
749328	contig_14796_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_159377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTATTAGAATAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168847	170501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_168800_170500
749329	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_89211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749331	contig_9463_pilon	+	1728	5	Intergenic	novelGene_83838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	261.992724135614	2	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	985	1353	222660	223028	FALSE	40	AGGAATAAAGTATCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	216043	223403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_216109_216741_216845_217424_217492_219238_219290_221961
749336	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749343	SIRV6	+	356	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2838_10682_10819_11031_11109_11205
749345	contig_3787_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_102451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAAAATTGAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751185	753520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_751200_753500
749346	contig_8663_pilon	-	1190	7	Intergenic	novelGene_57998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	221.299696239185	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	323	799	71195	53470	FALSE	15	CTTTACATTTGTTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQSSLKKLAVNNIAGIEEVNMIKDDGTVIHFNNPKVQASLSANTFAITGHAEAKPITEMLPGILSQLGADSLTSLRKLAEQFPRQVLDSKTPKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN	74399	53078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54145_54985_55188_67192_67307_71141_71209_73559_73813_74343
749349	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
749350	contig_14322_pilon	-	332	2	Intergenic	novelGene_115814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTTGAAGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671839	671351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
749351	contig_7345_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_159178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAGTAACAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123892	124087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_123900_124100
749357	contig_19352_pilon	+	1845	6	Intergenic	novelGene_122361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1523	1843	113293	122989	FALSE	30	GGGACGAAGACCTACTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTISPNFSLYRMVVLPAASNPTIKMRICFLPKRREKREEMVRPMAAAALAMGRSRRGFGRPRAFSFHTPGKLSQREEEELRKNESGRDCSPAGVSDEASGPGQKL	102882	122991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_104089_105885_106011_108444_108512_112793_112905_113279_113363_122738
749358	contig_1472_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_86136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGTGAAAGAAAACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606674	607688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_606700_607700
749359	contig_1472_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_86137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTAAACCTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607845	608308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_607800_608300
749361	contig_14341_pilon	-	624	6	Intergenic	novelGene_111852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGCACAGACAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551686	547755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_547804_548745_548860_549934_550149_550353_550483_551479_551579_551666
749362	contig_10323_pilon	+	2265	8	Intergenic	novelGene_123530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_7	110.128125751929	101	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1347	2165	137028	154457	FALSE	0	GTTTTTGTTTTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDAHVILNDITEKCRPPSSLIARVSYFAVFDGHGGIRASKFAAQNLHQNLIRKFPKGDVVSVEKTVKRCLLDTFKHTDEEFLKQASSQKPAWKDGSTATCVLAVDNTLYIANLGDSRAILCRYNEESQKHAALSLSKEHNPTQYEERMRIQKAGGNVRDGRVLGVLEVSRSIGDGQYKRCGVTSVPDIRRCQLTPNDRFILLACDGLFKVFTPEEAVNFILSCLEDEKIQTREGKPAVDARYEAACNRLASKAVQRGSADNVTVMVVRIGQ	135681	154557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_137093_139389_139497_139902_139997_140267_140356_142521_142644_152356_152477_153993_154076_154316
749365	contig_2854_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_120908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGTAGATACAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321482	1322207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1321500_1322200
749368	contig_6412_pilon	+	3055	22	Intergenic	novelGene_149938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	81.8950990977838	158	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	964	2892	164	3055	90047	212716	FALSE	40	CATAGAGTAGGCCAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFNLDRFRFEKRSKIEEAPEATPQPSQPGPSSPISLSAEEENAEGEVSRASTPDSDITEKTEDSSVPETPENERKASISYFKNQRGIQYIDLSSDSEDVVSPNCSSTVQEKKFSKDTVIIVSEPSEDEESQGHPTMAGRNNDDIAELEDLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFGDAGGGPRKRKVSSSSEPYEDDEFNDDQSIKKKKLDHGEESNESAESSNNWEKQESIVLKLQKEFPNFDKRELREVLKEHEWMYTEALESLKVFAEDQDMHFASQSEVPFGKEVSSRSQNYPKNSSKTKLKQKFSMKPQNGFNKKRKKNVVNPKRVIEDSEYDSGSDVGSSLDEDYSSGEEVMEDGYKGKILHFLQDASIGELTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSEDLIWHCKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNKGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPTLNVLCYYGSQEERKQIRYNINNGYEEYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDQIELCTMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLEKSTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRALGCILSELKQKGNRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRC	89285	212716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_89401_89998_90237_125832_126011_132421_132594_136034_136102_148624_148726_165479_165582_174437_174520_176245_176638_187879_188080_199041_199133_202303_202404_203106_203167_203262_203339_204438_204575_205101_205240_207525_207622_207717_207836_208034_208157_210797_210987_211283_211403_212553
749369	contig_1339_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_163094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTACCAGGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43111	44107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_43100_44100
749370	contig_10732_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_114753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.521427696864	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	51	788	576361	573109	FALSE	10	CACGGTCTCCTTCCATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGCFSAFGGGGGGGDMESGAYGAAKAGGSFNLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASRRSQTSPTRSASCLAPAGEPSAILGAPKCLVQKGASLLPTHSLLKGIF	576411	572496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573256_573395_573510_573617_573758_574129_574368_576262
749382	contig_4754_pilon	+	2219	4	Intergenic	novelGene_35901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	82.3528991596531	60	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	193	1986	119862	143352	FALSE	40	TGAAATAAGTACTGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVQASLTFSDVAVEFTWQEWQLLDTAQKDLYRDVMLENYGNLVSVGYEVSKPDALSRLERGEQPWTVLDESHSRTFSDMCKIDDHLRVHSQNESRVDRMEQCYEHNALESIIHQHRNNFPLRQNHEVFDLDEKVVNLKLTLINQNRSYEIHDSAELNRDKETFLHATHQQFHTEIKFPESQKYNSTKYHLIKHQKTPKIEKPHVRSECGKTFIKKSWFIHHEIIHTEEKPHRCSLCGKAFSKKFKLTEHHQSAHIGEKPYRCMECAKAYLYKSQLNKHQKTHMAEKPFICSACGKGFIQKRNLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKDFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGSLITHQLTHTGEKPYVCGECGKGFSQKSRLIAHQTFHTGKTPFVCSECGKPFSQKSSLIEHQRIHTGEKPFQCSECGKAFATKQRVIIHQRSHTGERPYSCNECGKTFAYMYCLVKHKRIHTREKCVDSGKVEDPSTASHSSLHTNDLTQNKNSVNVTMQMTSVAAQTSVNISELVSNRNVVLVGQPVDRSEPSGDNREFVQQRNLINTVNVVVPMNAVNVVVPSLTNYVFFYASQNL	119669	143585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_119877_121506_121634_121913_122010_141796
749383	contig_5023_pilon	+	1723	11	Intergenic	novelGene_7234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2112.65271400673	5	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	198	1475	608043	647344	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLRRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGHPQEAHGSVTSLSSFPFSTLSPRDFALHPPRKSPLCGPPLLAILVSGPLEHLTSQSACLSPKRFGWSTKVASLLETFPRTGVPNVINFYVFHQEEALCF	580843	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607323_607974_608100_609594_609725_611695_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625666_625845_647042
749384	contig_14209_pilon	+	1581	10	Intergenic	novelGene_88353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	243.153104234277	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	810	1238	38057	40625	TRUE	15	TAGGGGAGCCTGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	35211	41011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37213_37300_37425_37734_37812_37909_38078_40142_40344_40418_40859_40901
749388	contig_11709_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_168228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTCAAGCTCAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221905	223376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_221900_223400
749391	contig_19402_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_80809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCAAATACTTTCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68738	68134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_68100_68700
749395	contig_12270_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_113457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	11	349	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14419	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
749400	contig_5954_pilon	-	1243	2	Intergenic	novelGene_28591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	708	1112	945582	944848	FALSE	5	CGTCCTTCTCTGAGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGGALAHTRPHAPNLGTRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTDHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	946289	944716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945044_945373
749401	contig_15741_pilon	-	973	8	Intergenic	novelGene_159676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	616.475432749492	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	302	748	60544	50105	TRUE	75	TGGACAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVVSTAAFTGGQQAVTQVGVDGAAQRPGPTAASVPPGPAAPFPLAVIQNPFSNGGSPAAEAVSGEARFAYFPASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	61388	49620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_49820_50078_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681_60833_61252
749402	contig_5715_pilon	-	1403	9	Intergenic	novelGene_127978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	105.069024931233	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	200	1135	659441	612269	FALSE	35	TTTCTGTCTGAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELTKELMELVWGTKSSPSLSDTIFCRWTQGFVFSESEGSALEQFEGGPCAVIAPVQAFLLKKLLFSSEKSSWRDCADEERKELLCHTLCDILESACDNSGSYCLVSWLRGKTTEETASISESPAESSCQVETSSTLAVEELGFERFHALIHKRSFRSLSELKDSVLDQYSMWGNKFGVLLFLYSVLLTKGIENIKNEIEDASEPLIDPVYGHGSQSLINLLLTGHAVSNVWDGDRECSGMKLLGIHKQAAVGFLTLMEALRYCKVSCFLRYFECFLLSTALYSIFAPMTAHFSLLCCYSFLISYPKLTG	659640	612000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_612478_626026_626107_627097_627172_630707_630823_631704_631757_635159_635331_637616_637678_645335_645416_659347
749406	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749411	contig_9345_pilon	-	861	2	Intergenic	novelGene_24597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	215	652	945468	944755	FALSE	15	GAGAACTGTGTGTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945682	944545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
749415	contig_4105_pilon	+	2248	12	Intergenic	novelGene_21466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	128.748842568817	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	84	1352	60529	73585	FALSE	25	GAACTGCCGTGACAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVEK	58733	74481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72506_72602_72769_73131_73242_73575
749419	SIRV6	+	475	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	381	0	202	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749422	SIRV7	-	375	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-32	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
749424	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749437	SIRV6	-	319	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1343	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3163	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2780_2828_3105
749444	contig_16098_pilon	+	1495	10	Intergenic	novelGene_45815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	76.8024562364422	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	56	1345	150572	153863	FALSE	35	ATAAACTGTTCTGTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKTRGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150516	154013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151408_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
749450	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749453	contig_6102_pilon	+	2044	3	Intergenic	novelGene_32287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12.5	58	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	17	349	1463004	1463578	TRUE	30	CAGCAAACATCTGTATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQCSWMLVLQFLQRSPNLLLNHPGTDITEFGLLEEMILEFVRLIVDKLRRFWGWLLLLLFFLLLFLIDVVDGPTPSSHCLPIGLGLWGKLHLLCPCRPLPEQLLQPLQLKEGRRE	1462987	1466995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1463049_1463290_1464581_1466302
749458	contig_15146_pilon	-	1943	5	Intergenic	novelGene_116939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.8710791088799	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	138	383	112739	108990	TRUE	20	GTCTCTAACCCTGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACSASCSADACANSPFPGRGPAPTRRFAVFCFGHAGRPGRPPPAMTAHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVTTAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLWE	112876	106245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_106325_106609_108069_108967_109084_111059_111108_112635
749459	contig_19098_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_65830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGTTTGCCAATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388677	389676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_388700_389700
749460	contig_19098_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_65831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389847	390149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_389800_390100
749461	contig_3463_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_62008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526107	528386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_526100_528400
749462	contig_5928_pilon	+	2227	8	Intergenic	novelGene_40370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTGGGAGTTTCTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216847	251841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_217681_220329_220383_221490_221587_225483_226400_229383_229465_230828_230935_249346_249421_251773
749463	contig_6568_pilon	+	2018	11	Intergenic	novelGene_152861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	32.205744829145	182	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	122	1780	148823	181774	FALSE	20	CTGGACTTAGTGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDEEKVSPPVLPHDSDRGSSVSSDLQEEYEELLRYAVVTPNIESSTSQLSHPKGDVVQDVKIPTIIGDILHNQGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	144096	182012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148907_153348_153491_160247_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
749465	contig_11720_pilon	+	1819	13	Intergenic	novelGene_43939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	365.787354741643	1	89	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	13	1578	262271	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKFALPLGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262258	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_266155_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
749468	contig_817_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_132469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654594	656959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_654600_657000
749470	SIRV4	-	415	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1108	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4050	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749479	contig_14687_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_107959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620552	618426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_618400_620600
749485	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749488	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_93722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749492	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749497	contig_15063_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_14461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2776.96048865582	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	12	479	36064	39056	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTDGPWPPPSLSFSS	36052	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266_36600_39015_39092_39506
749500	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749508	contig_14919_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_171156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTCTTCTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46894	49166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14919_pilon_+_46900_49200
749510	contig_4223_pilon	-	2634	2	Intergenic	novelGene_117274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGGAAAAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200755	191400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_193758_200478
749511	contig_2161_pilon	-	2036	7	Intergenic	novelGene_114894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	30.7498870819968	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	217	1251	566164	548061	FALSE	5	TTGGGTGCGCCATCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNLTFHLSYRVRLLLLFTICLTVVGWATSNYFVDAIQEIPKARDFVANFNKATVLDKEETLTNKAPVKKAEVRNCPPRSPYLIGRSKLVFRADLTLEEVQAENPRVHRGRYHPEECKALQRVAILIPHRTREKHLLYLLEHLHPFLQRQQMDYGIYVVHQAGNKKFNRAKLMNVGYLEALKEENWDCFIFHDVDLVPEHDFNLYKCEDQPKHLVVGRNSTGYRLRYKGYFGGVTALTREQFFKVNGFSNNYWGWGGEDDDLRLRVELHRMKIFRPGPEVGKYTMISHTRDRGNEVNIERMKLLHQVSRVWKTDGLTSCSYKLLSVEHNPLYINITVDFWSSP	577995	547275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_548194_550586_550692_553063_553187_558722_558911_561902_562136_565911_566313_577927
749512	contig_10082_pilon	+	1013	4	Intergenic	novelGene_63916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	332.033465515484	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	289	798	580253	584895	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	574766	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_575026_580223_580435_583586_583726_584706
749514	SIRV6	+	403	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	282	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAGTCAAGTCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585	2542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2024_2467
749515	SIRV1	-	204	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3604	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6762	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
749518	contig_405_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_135310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	981	1376	407277	406882	NA	90	CAAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRSQKLCNESSLPSGRGTIGRGRTCRELAAACSSIFSPWAEDCFTSTTRQTPTHRALQQSDLSPNKPRKGDSAVIERIILKNRNSHPAKESCWRRQTIPFIIYTYIIKALKEIQVQYKRLSGNKKITSV	408257	405831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_405800_408300
749520	contig_6740_pilon	+	1526	2	Intergenic	novelGene_142644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAATCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11300	20907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_11447_19527
749522	contig_10904_pilon	-	1025	6	Intergenic	novelGene_22739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	418.541467479627	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	204	602	661760	660357	TRUE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGQLHHEPCELSPCGDLQVLQLTQHISLPVVTTQ	662732	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660458_661462_661763_662310_662445_662665
749523	contig_10196_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_132215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGATGCCCTTCGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308401	1308129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1308100_1308400
749528	contig_18794_pilon	-	1650	8	Intergenic	novelGene_54663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	91.2397603983648	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	118	957	353203	325647	FALSE	45	GCCACTATTAATAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPLLLTVTRSKAGWPRTLAAASPCRCVKLLLLLPFGFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404659	324953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332101_333065_333139_349159_349348_353145_353212_404550
749529	contig_15063_pilon	+	1424	6	Intergenic	novelGene_14309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3748.58653895038	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	326	1099	35271	38994	TRUE	35	TGTGGCCATGAAATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGSEC	34833	39734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38980_39092_39506
749533	SIRV6	+	528	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749535	contig_6278_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_119830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579401	578208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_578200_579400
749536	SIRV7	-	273	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91636	-15	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
749541	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749547	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_96921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749548	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
749550	contig_7457_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_31529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATAAAAAAAAACTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713499	713913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_713500_713900
749552	contig_16666_pilon	-	1348	4	Intergenic	novelGene_61747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	26	472	59688	55974	FALSE	10	ATACCTTGTCTGTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59713	55097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
749554	contig_17440_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_7685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3741	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
749556	SIRV7	-	140	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	77000	0	43781	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70957	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
749558	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	340	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
749559	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	20	2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749563	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
749564	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
749565	contig_5210_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_65462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGAGTGATTGGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659317	657534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_657500_659300
749566	contig_6842_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_130735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGCTTGGCTGCTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227029	1228195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1227000_1228200
749567	contig_6842_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_130736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228343	1229194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1228300_1229200
749568	contig_1443_pilon	+	872	2	Intergenic	novelGene_28175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	102	566	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343647	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
749569	contig_16714_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_161568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGGCTATGATAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765238	766635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_765200_766600
749570	contig_6735_pilon	-	859	8	Intergenic	novelGene_15754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	950.137712897129	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	85	516	564868	543853	TRUE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSSRELSIFRA	568282	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542054_543079_543292_543788_543886_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
749571	contig_7138_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_120969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATGAAAGAAAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78082	76818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_76800_78100
749575	contig_11285_pilon	-	1327	13	Intergenic	novelGene_5705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.225475100838	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1206	121	1326	798530	784064	FALSE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDRKVVRCPRCPLLSTECPAALSTHKLELFHGGLLVSSPSLQSWATFFLLPNKEAKP	798650	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784227_793918_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
749576	contig_3529_pilon	-	2626	2	Intergenic	novelGene_105368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCTTTTTCCTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607300	603114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_605053_606612
749577	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
749580	SIRV6	+	276	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8141	14	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
749590	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749591	contig_10811_pilon	-	1656	2	Intergenic	novelGene_165781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_1	0	1018	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	808	1383	10208	9633	FALSE	45	GAGAGAGAGACGAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGRTGMVTLVSQMAPVGLNVPRPSQVSGPVLSNMQPGQWQQGPLPPQQQMPGMPRPVMSMPAQPAVARPRMPNVQPPRSISPSALQDLLRTLKSPSSPQQQQQVLNILKSDPQLMAAFIRLPQPLMSTSSGSGGQALPRRTQWEGACWAAALMGLAKALPLRDRLSRQPQPTPQGPGVLSGWHGRLSML	16516	9359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_10915_16415
749592	contig_3627_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_78520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATACATATAGCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627930	628712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_627900_628700
749594	contig_5210_pilon	-	1758	2	Intergenic	novelGene_65459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	344	757	649197	648784	TRUE	35	TTGACCAAGTAGTGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGPGLTPARSPSLSFGMNVRNSSFLIYSFGPKLRVGFGGVDFKNFFLFFGLMGAIGTTQDRVPPGRDARRLRLACVHASGWGWGWGWTGQAGVCAQLITAMHCTAHVPRADRDSLLFRAFPPPARARLPPAWASL	649540	647662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_648654_648773
749597	contig_8636_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_141921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTCACCTTCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386376	384315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_384300_386400
749600	contig_8914_pilon	-	690	5	Intergenic	novelGene_112877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_4	2245.2244180705	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	22	690	268944	264845	FALSE	45	GAATGTAAGTGAAATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLSSRMAVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKF	268965	264844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264951_265589_265799_267319_267508_268075_268180_268882
749601	SIRV6	-	533	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	396	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTCGCCCCCATCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10800_11019_11109_11205
749602	contig_5056_pilon	-	1633	6	Intergenic	novelGene_171159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_5	48.5946499112814	275	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	11	571	144787	114174	FALSE	20	GACAGTTGAGTTGGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLMERFTDDTFCEACKSTVGVDFKIKTIELRGKKIRLQIWDTAGQERFNSITSAYYRSAKGIILVYDITKKETFDDLPKWMKMIDKYASEDAELLLVGNKLDCDTDREITRQQGEKFAQQITGMRFCEASAKDNFNVDEIFLKLVDDILKKMPLDILRNELSNSILSLQPEPEIPPELPPPRPHVRCC	144797	113111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_-_114288_115282_115388_116149_116240_118157_118297_125564_125626_144735
749604	contig_1618_pilon	+	920	8	Intergenic	novelGene_141805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	49.9995918350687	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	171	845	727106	742294	TRUE	30	CAACTGGGCTATTGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSDSGSVEWSERGRGFSPGTESRDGDRQ	724153	744125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724217_725942_726044_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742214_742337_744092
749606	contig_5229_pilon	+	1686	10	Intergenic	novelGene_117694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.8344520516639	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	169	846	581989	596228	TRUE	20	CATGGATTTCAGAGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPGIYGLSNALLDTPWRKLSFGKQLFQEVVEQSQALSKDALIAQLLDVLNNEEAQLPDPAIVDQGKEYVQPILSKYAAVCVRCPDYGTRTNTVILVDAEGHVTFTERSMLDKDPTCWETSTYEFKLQS	532720	597244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_532745_550503_550551_565421_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_591290_591445_593087_593193_596107_596488_596663
749608	contig_12864_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_76402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	199	744	226960	226415	NA	35	CATCCAGTAGACCCAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIQQEDITIINIYALNDRAPKYIKPTLTELKRPIDHSTIIVADFNIPLLMKGRKTRKKLKKDTDDLNNTINQLDLIGIYRLLHPPTAQHTFFSSAHGPFSRINHRLGHKASLKKFKNIKIIQSIFSDHNTKKLEINNRKNKKNESNTRKLNNTLVKNHWVIEEIRKFLESNRSTNCL	227158	225000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_225000_227200
749609	contig_6710_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_97331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749615	contig_11068_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_130549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTCATAATTCATCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227874	228911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_227900_228900
749616	contig_9014_pilon	-	2514	12	Intergenic	novelGene_106713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_11	79.8374381410477	1	138	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	269	1009	50583	43800	TRUE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRESDKERVKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51543	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_43743_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_50554_50595_51286
749617	SIRV5	-	305	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCGTTACCAAAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
749623	contig_7070_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_104033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCAATGTCCAGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61783	60575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_60600_61800
749625	contig_7070_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_104032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGAAAGGAGCACAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60216	59247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_59200_60200
749626	contig_10016_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_117873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCGGGTAAAATACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430593	431539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_430600_431500
749628	SIRV6	+	445	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	517	0	338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749632	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_94829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749633	contig_10331_pilon	+	2474	3	Intergenic	novelGene_54164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	628	junction_2	24	7	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAACAGACATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510910	521872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_511961_514501_514582_520528
749642	contig_7695_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_41641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762214	760851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_760900_762200
749650	contig_15866_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_63617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCTCAGTCAGACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416382	415174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_415200_416400
749651	contig_9127_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_103014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAATCAAAAGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188680	189110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_188700_189100
749654	contig_13456_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_153286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAAATCTTTGGGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304142	303628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_303600_304100
749656	contig_13780_pilon	-	2493	14	Intergenic	novelGene_149033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	293.662185665674	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	323	1966	515426	484696	FALSE	40	TAATAAACTCACTCCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDDESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGA	544219	484168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_484702_490695_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162_513394_515177_515440_543910
749657	contig_5482_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_144475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGCTGCCAACCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387658	385539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_385500_387700
749658	contig_6163_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_103855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCTTTACTGTTAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500934	502759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_500900_502800
749659	contig_15970_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_144051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACTCATAGTGACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173395	174603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_173400_174600
749664	contig_11292_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_109432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTATAAAACTAGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263117	264843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_263100_264800
749665	contig_1406_pilon	-	2290	2	Intergenic	novelGene_25562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1738	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	116	427	2159494	2147711	FALSE	20	CCCAGCAGTTCTACTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQVIFITLMEV	2159609	2145847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2147920_2159391
749667	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	10	410	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749668	contig_6497_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_35650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACATCTGAAAATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789485	787826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_787800_789500
749669	SIRV6	+	566	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749670	SIRV6	-	504	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9445	76	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTATTTACAACTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11265	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1546_1647_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
749673	contig_10811_pilon	-	1772	3	Intergenic	novelGene_165779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.5	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	147	482	10863	10528	TRUE	5	GCCCTGGTGGTGCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKGSSQGQPWSKSLQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCLLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGGCGCKQLIALCCYHAKHCQEKKCPVPFCLNIRQKLRQQQIQHHL	16510	8074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_9156_10318_10915_16415
749676	contig_9345_pilon	-	1441	6	Intergenic	novelGene_24386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.426231186611	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	115	741	176056	141808	FALSE	10	GAACTGCTTCCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFREPAGRGEEAGGLGGLLRPRHRRDPGLSVRPPVRLAMAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPRGPGFQGMGCPSQSQTHAAGKWVKLGSCSVGF	176170	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141906_142663_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
749677	contig_21388_pilon	-	847	5	Intergenic	novelGene_136623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	176	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	12	638	28463	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28474	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
749694	contig_4891_pilon	+	1206	7	Intergenic	novelGene_124551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	606.176816888714	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	140	694	701017	733933	TRUE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPW	700877	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733934_754711_754766_755867_756031_756691
749697	contig_10549_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_110633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTGTATACTTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443634	445090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_443600_445100
749698	contig_3123_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_162968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACCATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42640	40405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_40400_42600
749700	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
749701	contig_2114_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_104303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTTGCAGTATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896976	898166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_897000_898200
749702	contig_4754_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_35931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	210	244	453	286449	286658	NA	25	TATAGTCATTGTGGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFVHHRTHRQLSYACIDCGTVFLKKSWLTRHQNTHKVKKYFQCSECGKAFNQKQQLNFHERIHTKKRPYVCSVCGKNFASMLDHFNHKLIHTGEKYVDSVNVEDPSAASHSSSHTSDLTQDKNPVSTVTLQMPSVASQSSLNTSGLLTNR	286205	286660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_286200_286700
749707	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749710	contig_11104_pilon	-	2096	12	Intergenic	novelGene_112466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_7	66.7280158492185	68	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	142	1317	359149	331135	FALSE	60	TAAGTTTAGGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELIPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPVSSVCYSVVFFCHTYPL	359290	330355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_331285_334327_334409_334565_334681_335041_335104_336498_336589_336686_336794_337105_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
749712	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
749716	contig_16907_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_87441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAATGTCAACAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397373	397861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_397400_397900
749717	contig_11328_pilon	-	1420	3	Intergenic	novelGene_88470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	139	1083	902278	901249	FALSE	35	TTTAAAATAGTGTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECACFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAQIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDVHRFEKISNIIKQFKLSCSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLFFCTLFLIFIMLCA	902506	900911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_901295_901379_902295_902384
749720	contig_2799_pilon	+	1891	5	Intergenic	novelGene_85471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	171.222625549312	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	97	762	490477	563797	FALSE	40	ACAAGATCCCAGAATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGVICCGVGSDSTEQNVARSCTTFKIIVSWVMKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKVEDDVVFYLVFSGSTLHHCTSTRKISSDTLETIAPGHDCCETVKVLLCASKEGLPVFVVAEEDFHFIQDEAYDAAQFLATSAGNQQALNFTRFLDRSGPPSGDVNSLDEKVALAFRHLKLPAEWNVLGTDQTLHDGGPRETLMHFAVRLGLLRLTWFLLQKPGGRGALSIHNQEGATPVSLALERGYHKLHQLLTE	421440	564926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_421526_490465_490510_533842_533991_551040_551338_563609
749729	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
749730	contig_6710_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_95991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653674	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749733	contig_6270_pilon	+	2257	1	Intergenic	novelGene_99904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGTGTCATTTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221058	1223315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1221100_1223300
749734	contig_13267_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_146612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTTAACATAAATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136561	138530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_136600_138500
749735	contig_5910_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_168415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTGAGTGTGAATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95762	94054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_94100_95800
749736	contig_5910_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_168414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCCTGAGAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93660	93143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_93100_93700
749738	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	594	0	415	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749739	contig_8289_pilon	-	2545	19	Intergenic	novelGene_171174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTACTCCACCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237482	186894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_186982_187126_187215_187888_188009_192221_192321_192571_192633_197793_197952_198154_198304_199806_199925_200043_200235_200325_200412_200507_200588_200739_200816_200903_201007_203307_203482_204934_205033_205131_205244_205334_205431_212516_212639_236955
749740	SIRV7	+	239	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGTTCAAATCTGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	78911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
749742	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	814	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749743	contig_10549_pilon	+	2310	2	Intergenic	novelGene_110618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	199	681	214370	214852	TRUE	70	ACTTAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSLFASKGECALVLSGDFLKLLNPCCFSPARTSLLLDASLLFLFSLSSSWTVAAYFLSFSFLIYSLSSLLSHLSFQGQGLVHMVCTCGLAQVVERGRTRWSRLMGGLVLGVLCSQPNQCGPRFHLLEIDVDDMKFIAWMLNLVLLLVASVYHVLVLYL	214171	216932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_216320_216770
749745	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
749748	contig_14322_pilon	-	392	2	Intergenic	novelGene_116229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
749755	contig_9578_pilon	+	1688	8	Intergenic	novelGene_68002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	108.49809553487	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	518	1420	1319409	1326867	FALSE	35	GTGATTTTTAAAAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKVSGQEQSSRGQRILSIPIWPPNLGISQNCVYEVQQVPKVEKTDDNLTQTQLEETEVIVTPEKLSSNLQHHFSLSSVYSHYFPDTGIPEVTTCHSRSALTVDYIFYSADKEEAAQESGAAVGLVGGLKLLARLSLLTEQDLWTVNGLPNEHSSSDHLPLLAKFRLEL	1309291	1327135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1309462_1317336_1317594_1318288_1318359_1319388_1319811_1320954_1321082_1321486_1321545_1324878_1325043_1326715
749759	contig_6496_pilon	+	1466	6	Intergenic	novelGene_103467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_2	15.4841854806767	236	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	353	1090	148763	155676	FALSE	20	GAAGCAGCTGCCCTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFLRAVQHAEKLHRATGARLFGPRLVFNKACLNTEPGLKWGPPEQNKTLLPRGILGLTRRTIWTQGQGLRRAKEDGSKQVSVHRSPRGETDVSTSQKVKEAGRDFTYLIVVLIGISITGGLFYVIFRELFSSSSPSKIYGKALEKCRSHPEVIGVFGEPIKGYGETTRRGRRQHVSFIEYVKDGLQHMRLKFYIEGSEPGKHGTVHLEVKENPESGEYEFRYIFVEVEAYPRRTIVIEDNRS	148410	156052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_149064_152081_152145_152244_152343_155023_155098_155185_155292_155580
749760	contig_11413_pilon	-	2364	3	Intergenic	novelGene_103159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	773	1990	368281	366254	TRUE	40	AAGAGGTGAATGTACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMTRATSSGSRGTSLTGATSVSEDGAKSLTGATSVSEDGATSLTGATSVSEDGATSLTGATSVSGDGAKSLTGATSVSEDEATSLTGATSASEDGATSLTGATSVSGGRAIPLAGVISVSGDAATSLTGATTVSADGVKTLSGATSAFGGGAVSLTKVTSASGGGATSLVRTTLVSAGSVTALARATSVSGYRDNSLARDISADVTLSLAIATSISESDTIPSAEAKSILIGSAASVSFNSVKFLPRVTAVSVDSTVSLSKDTFVSVGKTTSFPGTTSVSLGSTMSLTRVKSESMKGSVSLASATSDLVEGSMSLANAISVSVAGPTSLAGAISVSLGGSISNTSVGVLSFADATSTSLAGSSVGCRGCLIDSGEMKDAECGESGASISHPWCTSPVAEANVSQ	369053	364250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_364617_366245_366383_367192
749765	SIRV1	-	205	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3899	0	3625	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6741	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
749766	contig_10752_pilon	-	1967	5	Intergenic	novelGene_153039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCGCCCGGGCAGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221852	182913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_183048_186640_187354_189330_189450_218946_219066_220970
749767	contig_1406_pilon	+	1118	8	Intergenic	novelGene_25608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	491.624047501373	213	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	425	754	2227046	2231664	FALSE	25	GACGTTTAGTGAGCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKAYVGRNVILTSGCIIGACCSLNTFEVIPENTVIYGTDCLRRVQTERPQPQTLQLDFLMKILPNYHHLKKTTKGSSTPVKD	2214512	2232028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2214579_2218160_2218226_2219053_2219192_2225347_2225454_2226996_2227086_2228828_2228877_2229912_2230056_2231565
749771	contig_13571_pilon	-	2863	13	Intergenic	novelGene_128117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.2427908744764	1	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	210	1799	254247	206603	TRUE	30	TGAATGCATTCAGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLYIYIRLLGAYLFIIFHVQGQNLDNMLHGTGMKSDSNQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVVLISMAVCIMAMIIFFSCFCYKHYCKSISNRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI	315898	205498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_206246_206285_206729_206815_206938_208171_208348_214754_215053_223397_223591_227447_227593_229665_229766_229918_230016_240099_240203_247235_247399_254180_254396_315837
749776	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749777	contig_383_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_126090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAGGGCATTACATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69692	70879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_69700_70900
749778	contig_7866_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_171189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169296	171294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_169300_171300
749782	contig_6710_pilon	-	486	2	Intergenic	novelGene_98098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749783	contig_7840_pilon	-	1824	5	Intergenic	novelGene_69044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	302.94141347792	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	251	841	406713	393023	FALSE	30	TTTCAGGCAATACTATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGREGASAREEALAASGRRRLRRKKNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYGKNPGLTYCLSQKCLTAVFFFLF	445694	392039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_445612
749787	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749790	contig_10054_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_171212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81254	82603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_+_81300_82600
749791	contig_12566_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_86011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	991	1335	48699	49043	NA	60	ATGAAATTAAAAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSSLLWRFWVLVSWDIPVNWPNTTFSASVLPPTSLRSSLGLKSFQAAVQGTAIGLLFAWSNRGRRIGRNRRKRNMWLIASMNNCLLCYETRRTGWCLATISNILINESVEES	47708	49763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_47700_49800
749792	contig_3181_pilon	-	1267	9	Intergenic	novelGene_136935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	93.0899262809892	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	108	1097	322396	310415	FALSE	35	GATTTTCACAAACAAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPSPQTKPSNPSNPRVFFDVDLGGERVGRIVLELFADIVPKTAENFRALCTGEKGIGPTTGKPLHFKGCPFHRIIKKFMIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFYYKHDQEGLLSMANAGPNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGMGVARILENVEVKGENPAKVDKILLITEDLKNIGNTFFKSQNWEMAIKKYAKVLRYMEGSKAVTEKADSSKLQPVALSCVLNIAACKLKMSDWQGAIDSCVEALEIDPSNTKALYRRAQGWQGLKEYDQALADLKKAQEIAPEDKAIQAELLKVKQKIKAQKDKEKAAYAKMFA	322503	310244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_310504_311292_311336_311428_311516_313189_313332_315990_316098_317405_317595_319464_319572_320966_321108_322311
749793	contig_3077_pilon	+	1675	9	Intergenic	novelGene_26675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2327.58313492773	2	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	48	1178	9676	17590	FALSE	10	GTGCGGCACTTGCTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRLDNTLRGDFGPRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9628	18087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11488_12992_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
749795	contig_11932_pilon	-	2743	3	Intergenic	novelGene_85394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	3.5	119	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	176	643	125041	122672	FALSE	10	GTACTGGCCTGAGGGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTLRPADLPFSPEALVDRKEFWAVCRVPGPLHSGDILGLVVNADGELHLSHNGAAAGMQLCVDVSQPLWMLFSLHGAITQIRILGSTILAERGIPSLPCSPASTPTSPSALGSRLSDPLLSTCSSGLLGSSTGGTTPNSPVSLPESPLTPGMGQWSDECTICYEHAVDTVIYTCGHMCLCYTCGLRLKKALHACCPICRRPIKDIIKTYRSS	125216	120571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_122911_123431_123579_124959
749796	SIRV6	+	347	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723
749798	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	54	506	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
749803	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
749810	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1440	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
749811	contig_6710_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_97374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATCAGCCCCTGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	653871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
749812	contig_15410_pilon	+	1005	5	Intergenic	novelGene_130609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	812.973362109731	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	153	578	145617	148093	FALSE	55	ATATGAAAATAAATTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145464	148520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147136_147750_147842_148070
749820	contig_10235_pilon	-	1050	5	Intergenic	novelGene_46615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.106074633713	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	113	595	610325	609176	TRUE	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGPHPFQPPHPPWNPGFQPSSQIPATPPPSVSPLQGMEAKRAQEGEEDGEQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSAPPSPPPGNRHTALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610437	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_608795_608990_609314_609537_609738_609955_610056_610280
749828	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749830	contig_16622_pilon	+	2737	5	Intergenic	novelGene_48507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGAACGTACACTTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162954	207568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_163533_164965_165107_204661_204846_204961_205077_205849
749832	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749833	contig_3018_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_78895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAGAAACTGTTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581678	584204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_581700_584200
749836	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749839	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
749854	contig_1274_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_137775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTGCAATTCCCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49749	50261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_49700_50300
749855	contig_14209_pilon	+	2043	13	Intergenic	novelGene_88342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	230.407413919103	1	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1260	1655	40155	40625	FALSE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32344	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35656_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38078_38557_38783_40142_40344_40418
749857	contig_5260_pilon	+	1150	4	Intergenic	novelGene_144342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	122.199290778084	193	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTACTATGGTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63217	84828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_63505_70367_70468_84015_84669_84718
749861	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
749865	contig_7066_pilon	+	1097	8	Intergenic	novelGene_42162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_2	308.625458232771	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	128	913	823546	841366	FALSE	20	TGCTGGGTGACTTATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPELLLDSNIRLWVVLPIVIITFFVGMIRHYVSILLQSDKKLTQEQVSDSQVLIRSRVLRENGKYIPKQSFLTRKYYFNNPEDGFFKKTKRKVVPPSPMTDPTMLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	823418	841550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823701_829906_829965_830302_830397_832776_832882_833878_833961_835771_835852_837208_837292_841237
749866	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749868	contig_12128_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_131988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCCCCCTCTCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398883	401846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_398900_401800
749869	contig_2069_pilon	-	1116	5	Intergenic	novelGene_23438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	949.822713720829	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	82	327	1331269	1327899	FALSE	15	AGTTTGGCTTGGAATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTPGSTKARAPLHPRVQRLRPAAVATMPKRKAEGDAKGDKAKNLSLKRPLQRRERRYPKGKRGKLMLARMGITLQKMEMPKQTRHRKLKVLEMPSEVCAFLITVYFW	1331350	1327109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329481_1330167_1330201_1331254
749871	contig_5302_pilon	+	1781	7	Intergenic	novelGene_81377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	375.838026578235	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	181	1041	92713	116587	TRUE	40	ACTTGTGAACTAAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSL	92532	117908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92815_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046_115209_116464_116602_117182
749876	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749877	contig_10594_pilon	-	1479	9	Intergenic	novelGene_142323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_7	28.7399438934734	832	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	84	1208	526332	513223	FALSE	20	TTTGTATGGAAGTTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKVIATAVCHTDAYTLSGADPEGCFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRVTQGKGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKVDPLAPLDKVCLLGCGISTGYGAAVNTAKVEPGSTCAVFGLGGVGLAAIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFGASECINPQDFSKPIQEVLVEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEEISTRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHSLSFDQINDAFELMHAGKSVRTVVKI	526415	512951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_513248_513391_513531_515663_515800_516583_516845_516999_517220_519835_519924_520432_520575_522251_522354_526320
749878	SIRV6	+	526	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749879	contig_14441_pilon	+	906	6	Intergenic	novelGene_100556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	392.50936294565	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111196	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112102_112154_112454_112665_116558_116645_117236_117344_117539
749880	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749883	contig_1406_pilon	-	2279	2	Intergenic	novelGene_25566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	124	330	2159494	2159288	TRUE	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSLRRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDAGECRWCAQAPPSPFLAAVTRRGEAPMGAHFRSSP	2159617	2157284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2158180_2158233
749885	scaffold_13505_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_111430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGCAGCAGCAAGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521005	520225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_520200_521000
749886	contig_12638_pilon	+	1493	11	Intergenic	novelGene_33297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	88.9359319960161	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	609	1223	1256219	1283566	FALSE	30	TACCCTGGAACCACAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVGSLVVIVCLSFFLLSSWDFIPAVYGFILSVPDLTPNIGLFWYFFAEMFEHFSLFFVCVFQINVFFYTIPLAIKLKEHPFFFMFIQIAVISIFKSYPTVGDVALYMAFFPVWNHLYRFLRNIFVLTCIIIVCSLLFPVLWHLWIYAGSANSNFFYAITLTFNVGQILLISDYFYAFLRREYYLTHGLYLTAKDGTEAMLVLK	1176567	1283836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1176714_1190109_1190175_1205821_1205882_1207256_1207320_1223709_1223820_1242583_1242682_1256152_1256308_1257964_1258109_1260881_1261007_1267724_1267868_1283452
749887	contig_1982_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_151306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1109	1480	98104	98475	NA	30	ATTATAGGACTTGGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGRNIPVTLIDMDNVLLYFVHIIDHIAVKEYVSVYFHTLTSEYNHLDSDFLKQLYDVVDIKYQRNLKAVCSSNILFKDVNMVCHHLFYLRTEGQNPPRGEPPPAIFCHNSRTDRLSSLCS	96995	99095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_97000_99100
749891	SIRV2	-	463	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4409	35	3234	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
749892	contig_8656_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_162360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTTTTCTTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624380	625340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_624400_625300
749893	contig_8656_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_162361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	649	1101	626038	626490	NA	55	GTAAAAAAAAAAGGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGTLYKVHSRLSQNICSVNVQCRGIIRHYGPRYSYNASAVHFQPCRMLFSGSNLLPTVGKFWLVFPSFSNFYLSLNAACVSNYKKKDSLMNCSVLFPYLQSKVREDRQDKFRNYDLNLGKDTFFPPKVFHFQVYIFIINCWMLIDSIK	625389	627169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_625400_627200
749899	contig_8354_pilon	-	2082	21	Intergenic	novelGene_24074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_15	137.744791190085	4	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	878	2080	169820	76143	FALSE	25	CCAGCTTGGAGAACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQLHQQLLEAERRSMTYLKRYNKIQADYHNLIGVTAELVDSLEATVSGKMITPEYLQSVCIRLFSNQMRQSLAHSVDFTRPGTASTMLRASLVPVRKLKDVPLLPSLDYEKLKKDLVFGSDRLKAFLLQALRWRLTTSHPGEQRETVLQAYISNDLLDCHSNNQRSVLQLLHSQSEVVRQYTARLINAFASLAEGRLYLAQNTKVLRMLEERLKEENKDVITRENVLGALQKFSLRRPLQTAMIRDGLIFWLIDILKDPDCLSDYTLEYSVALLMNLCLRSAGKNTCAKVAGLVLKVLSDLLGHENHEIQPYVNGALYSILSVPSIREEARAMGMEDILRCFIKEGSAEMIRQIEFIIKQLNSEELLDGVLESDDDEDEDDEEDHDTMEADLDKDELIQ	198074	76140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_76194_118879_118936_123405_123497_128310_128386_132891_132969_134289_134430_140151_140276_141483_141575_148518_148612_150588_150704_151641_151677_165443_165543_169664_169823_180117_180219_181222_181312_183513_183569_187891_187985_189565_189722_190261_190433_195734_195861_197990
749900	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
749904	contig_18869_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_56402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTTGTAATCATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73740	73408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
749905	contig_7919_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_28086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115035	1117067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1115000_1117100
749907	contig_4626_pilon	-	1910	8	Intergenic	novelGene_158821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCACTTGATTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86633	50172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_-_50211_58396_58443_66615_66747_69644_69760_77295_77447_81517_81589_84373_84413_85314
749908	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_95833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
749910	contig_4232_pilon	+	1035	4	Intergenic	novelGene_63209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	75	575	146362	149200	FALSE	65	ACCTTCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146287	149660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
749911	contig_14973_pilon	+	2408	1	Intergenic	novelGene_171221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171701	174109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_171700_174100
749912	contig_16148_pilon	-	2488	13	Intergenic	novelGene_50366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	559.125110229266	1	126	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	1198	2346	111433	63814	TRUE	50	AAAAACAGCACTTTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRL	153088	59101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63817_74692_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88845_89052_89186_89311_111370_111491_147631_147701_150789_151734_152961
749915	contig_5910_pilon	-	2747	1	Intergenic	novelGene_168416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAAAGTTGACAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100918	98171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_98200_100900
749916	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	826	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
749924	scaffold_6394_pilon	-	1131	8	Intergenic	novelGene_111014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCGCTTCACCGGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406271	398242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_398312_402117_402243_402863_402971_403237_403372_405024_405198_405299_405503_405728_405870_406092
749925	scaffold_13505_pilon	-	1517	3	Intergenic	novelGene_111680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	31	junction_1	25	186	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	162	545	955559	953152	FALSE	10	CCTAGGGTGGGTTTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLQPTSSRLAERVHEELTRELGAGQVPSLGDRPRLPYTDAVLHEVQRLLALIPMGVPRALTQTTCFRGYTLPEGTEVFPLIGSVLHDPEFFERPEEFNPGRFLDEDGQFKKHEAFLPFSLGKRVCLGEGLVRAELFLLFTAILQTFSLESPCPPSALSLQPAISGFANIPPAFQLLVRSR	955720	952179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_953334_953506_953649_955499
749930	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749931	contig_16541_pilon	+	1630	4	Intergenic	novelGene_126755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_3	194.382783874156	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	88	561	441353	473894	FALSE	85	GACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSFLLSEREASDDYLAILLSFLKFWRFSVMFQFVLFSTLFPSVFTELGEPRWVCNSSDISIWYTYCDNMKYPISLNLTPCITLKGSRGLLHIYYIPRRDVEKLYFNLYLSVNSINLPKRKEVICRGSDDSYSFCRALKGETVNTTIPFSFRGIKFSKVLFKIYLVCSQPLEFETSNSQLLKIEIKY	441265	474963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441465_459495_459586_464057_464187_473751
749936	contig_5947_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_101526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATATTGATCCCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507256	509508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_507300_509500
749938	contig_9415_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_109763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGACATTTTCTACATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516961	1518283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1517000_1518300
749939	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	3	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	366	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749940	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_97849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
749944	contig_6710_pilon	-	318	2	Intergenic	novelGene_98310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	2	316	657514	653610	FALSE	5	CCTGTCCTCGCCTATCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHK	657515	653607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
749947	SIRV6	+	518	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749950	contig_15304_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_30636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGTTTATCATGGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102819	101817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_101800_102800
749954	contig_9177_pilon	+	1725	13	Intergenic	novelGene_32650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	38.7395147104349	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	217	1641	100362	109340	FALSE	40	AAAAAGTCATGGTGTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQYSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57889	109424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_99898_100009_100303_100376_105120_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
749955	contig_13760_pilon	-	928	4	Intergenic	novelGene_61350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	157.022999023144	1575	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTGTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355723	352847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354491_355293_355384_355695
749956	contig_4364_pilon	+	1336	6	Intergenic	novelGene_196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	813.698617425395	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	400	618	1269855	1270358	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTGHTSLSVPRFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1268746	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1269985_1270269
749960	contig_12654_pilon	-	2764	1	Intergenic	novelGene_129313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1329	1643	783798	783484	NA	35	TCATAGTAAAATGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSFPNRINPLWPIASSVVLHLLFPSIPKEGALRYNPFTYSTNTACLLCCWNVTGSLPSWRICLHSFYLNVSGLIEYHPIKAQKTNEKSACSPELDVCVRGMP	785126	782362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_782400_785100
749962	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_89239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
749963	SIRV6	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCATTTCTGGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
749964	SIRV6	+	528	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
749967	contig_13301_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_153105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTCCAGATAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24839	26133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_24800_26100
749970	contig_10711_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_118446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGGTTGGCCGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827160	828134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_827200_828100
749971	contig_11855_pilon	+	1627	5	Intergenic	novelGene_67112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	178.034406787003	483	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2440177	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2445373_2445491_2446111
749973	contig_9653_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_48198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAGGAAAAAAAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178751	176575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_176600_178800
749976	contig_9683_pilon	+	1126	2	Intergenic	novelGene_151281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	796	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	69	635	487041	487695	FALSE	20	CGTCTGAGGTCTTACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARGTASRFLTSVLHNGLGRYVQQLQRLSFSLSRDSPSSRGAREFVEREVVDFARRNPGVVIYVNPRPCCVPRVVAEYREWAGLGMEGGLNRGSSGSPSAQSPLPSTRPKSVNGAVREESIHCKSAEDIATLVQKLADQSGLDVIRIRKPFHTDSPSIQGQWHPFINKPTAPGGLRPREFQDAAPAQ	486972	488186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487172_487259
749977	contig_6589_pilon	+	2687	6	Intergenic	novelGene_26311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.0864177325169	8	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	395	1036	2309378	2313372	TRUE	40	TTGTTACATGAAAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLPLLWGIECVGGWGSQAGSQDLDDGYQLQVQNSVTVQEGLCVFIPCTFSYPPSDWDHFKPVLIYWFWKAANNIDHKRDVPVATNNPQRDVRKETKGRFQLLGDPQANNCSLHITGAQKEDSGEYVLRMEKGWTKFNYKKKLTVNVTALTNVPNIIMGSLESGHPSHVTCSVPWACDRGTPLTFFWTGTALRSQGSHSEAYDSSVIMLTPGPQDHGTNLTCRVTLPGAWVTTERTVTLSVSYAPPAVQPLLLLGGPGSALQLLRPSLARPLPALAAWGPPGGGKQQQLLGHGHLPLRGALGQQLPEPPRWAQSRPRNRLRGPERPRRPQRDCPAAARETPV	2308983	2318275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2309436_2310422_2310705_2312853_2313140_2313356_2313454_2314166_2314241_2316779
749978	SIRV6	+	539	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
749980	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
749987	contig_5201_pilon	+	1035	7	Intergenic	novelGene_82192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	122.869849841204	468	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	27	890	388812	405561	FALSE	15	TTTGTAGTTTAATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGAEAAMAATFFGEVVKGPCRAGTEDEEEEEDKRETPEDKDVRRQLMRKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAVAFLSSFVMNSGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDAISLSPTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPKKNMQITILTSRHITDYKTSESTCSLPSPFLRALKTQSFKDPVCCSLLEQPNIVHDLPAAVLSYCQVWRIPAILYLCYTDVMKLDPITVEAFKPILSSRSLKGLVKNIPQSTEMLKKLMTTNEIQSNIYT	388785	405706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_388943_392320_392428_393600_393753_396005_396069_402083_402283_403180_403318_405486
749989	SIRV6	+	326	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	531	14	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
749996	contig_11720_pilon	-	2064	12	Intergenic	novelGene_43900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	156.206051670582	1	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	64	825	124506	118106	FALSE	20	AAACCCTGTATGGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDRNPLYPGPPPSGGYGQPSPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFVEPVGKFVKRNVAVYYASYAVFLATYLTLACCQGPRRRFPWNIILLTLFTLALGFMTGTIASMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYVPWLHMLYAALGAIVFTLFLAYDTQLVLGNRKHTISPEDYITGALQIYTDIVYIFTFVLQLVGDRN	124644	116866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_118253_118641_118696_119758_119855_120209_120298_120477_120516_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122145_122211_123024_123120_124472_124510_124584
749997	contig_8570_pilon	+	3026	1	Intergenic	novelGene_120163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358807	361833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_358800_361800
750001	contig_10196_pilon	-	1077	7	Intergenic	novelGene_132233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	216.207976006642	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	140	406	1442405	1436177	TRUE	5	GTTTTGGTTGCGTTATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLRAERAREGSPETKGSAAAAVVAAAARLSARRDSPGRGRPRTWTMSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNRSY	1448653	1433070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436189_1436357_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
750005	contig_14970_pilon	+	1122	2	Intergenic	novelGene_45099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAATGGATTGAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233480	234820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_233772_233989
750006	contig_6361_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_23948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAACAAGATTCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353297	351723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351700_353300
750009	contig_6137_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_59130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876668	877338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_876700_877300
750011	contig_6217_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_109649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACATTGAGCTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733797	733246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_733200_733800
750012	contig_8671_pilon	+	2283	2	Intergenic	novelGene_126260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	80	1270	499677	500867	TRUE	15	TGCTTGGAATGCTGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNSGILALQPPSVSSSSGLLGVLPPNMPNSAGLVGIQPPNVPNTSGLMGTQPPAGPQNLPPLSISSQRMPAMPMLDIRPGLMPQAPGPRFPLMQPGIPPHRGLPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSHPERPFLAPGRQGVDSVPNPEKRLPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISMPPPVDVRDVVGRPVDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDMRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKHWGHRGDFDEREHRVLPVFGGPKGLHEERGRFRPGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREINGNRLGRDRIPNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPLQVQNDPELYEKLASSSEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT	499597	570057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_500882_569058
750014	SIRV4	-	333	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1188	0	1188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750017	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
750018	contig_14727_pilon	+	683	5	Intergenic	novelGene_56623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	298.665678476788	6791	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	50	559	47396	55271	FALSE	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	46209	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51531_54130_54263_55134
750019	contig_3942_pilon	-	1242	9	Intergenic	novelGene_128866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.9138304628395	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	202	906	1491123	1488049	TRUE	30	GCAGAACTCCAAGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWVRLGPAGGSQQLSGPHPPHSAPLFPSSPSAAREPTHTFWPRSGRVPCRWPARVATRTSWGCCWSGMWTSTSTIGTEEPPCCTPCEGTT	1492111	1486212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488753_1488969_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918
750020	contig_9706_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_20807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACCCCATATCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
750023	contig_9098_pilon	-	1290	10	Intergenic	novelGene_75787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	358.102406209918	9	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	231	542	291755	267487	TRUE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLIKDLIYLRSWKYNREQNNWFLLSQNLKFSEEEKTKQANFSASEDLFEMWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYIRKQPFFLHM	295229	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265398_265552_266729_266813_267336_267515_287999_288160_289190_289280_291720_291814_292840_292905_294101_294181_295200
750025	scaffold_12510_pilon	-	2386	20	Intergenic	novelGene_151359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	404.372315483004	17	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	453	2051	253602	184836	FALSE	45	ATAATAACTAACTCAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLTELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVRLPEELAELPLMRLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQMITLDNNPLQSPPAQICIKGKIHIFKYLNIQACKIAPDLPDYDRRPLGFGSCHEELYSGRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFSDLPLRVAEITKEQRLRRESQYQENRSSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCAAEEEEDEVRQPKGLDSDSLSSQFMAYIEHRRISHEGSPIKPLPIREFQKAEDMRRFIHQSRVPVDPSSLLSVSPSHNQLSHTDLELHRRREQLLERTRREAQRAALQYEEEKLRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQAPLDGESLSGLNNQVGCATTLPHSSAFTPLKSDDRSNASSSSPTAETVHHSPAYSFPAAAIQRNQPQRPESFLFRAAVRVETNKGHGSPLLSSSAPATDSTDSITRQDSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPAVPKLTMAKCRRNVENFLEACRKIGVPQICSAGNCYVVDHVAEPAVALTGPNMPVTAVYLQGAP	300368	184500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_184947_199365_199444_206082_206221_206837_206957_208017_208129_208631_208681_212532_212608_219764_219813_221543_221694_222107_222160_236702_236780_240038_240188_243066_243188_244011_244106_252203_252314_253485_253623_256441_256548_262905_263033_264951_265097_300314
750026	contig_5643_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_38905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAGAAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269701	269434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_269400_269700
750027	contig_10235_pilon	+	2239	7	Intergenic	novelGene_46596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1733	2194	589330	593979	FALSE	5	TTCCTGCTGTCTCTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSSIRRKILHVLDVASSHSTHRDGEHSQEEDPAIVEGHFEEVLGTGAAEPQGGKQEEQQQEEQQQHHPCPWPQLHSGHLQGTGKGQWAWFLAPQWGGGPGGLAPSPARLRQRWWRLAVSLPLSGCRCQRGDGIGGCPSPGRWREGGNGRLGP	586090	594024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_587368_588246_588324_588451_588543_588707_588886_589220_589359_589565_589814_593794
750031	contig_8273_pilon	-	2850	12	Intergenic	novelGene_113077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_6	114.282237255254	1	111	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	52	834	105723	80548	TRUE	40	TAAAACATATGGTGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGGSDEEETGDPSEVGMQSARTQARPREPLDDGDPEDNRTLDDDELAEYDLDKYDDDGDPDAETLGESLLGLTVYGSNDQDPYVTLKDTEQYEREDFLIKPNDNLIVCGRAEQDQCNLEVHVYNQEEDSFYVHHDILLSAYPLSVEWLNFDPSPDDSTGNYIAVGNMTPVIEVWDLDIVDSLEPVFTLGSKLSKKKKKKGKKSSSAEAHTDAVLDLSWNKLIRNVLASASADNTVILWDMSLGKPAASLAVHTDKVQTLQFHPFEAQTLISGSYDK	105774	74405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_74697_75644_75751_77137_77260_77351_77443_79141_80614_81309_81407_94043_94106_94894_95026_96088_96200_100983_101081_101570_101657_105590
750033	SIRV2	-	241	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	683	24	683	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGACGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4049	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
750034	contig_4754_pilon	+	2169	5	Intergenic	novelGene_35891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.5530611238402	106	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	355	1536	99028	102348	FALSE	40	ACAGAGAGTATGTAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYGNLVSMGYEVSKPDALSRLERGEQPWTVLDESHSRTFSEIWIFDNHLPEHMKNENRMDKMKQCYEHNTLENIVHQHKSRLPFTPNHGIFDLHEKFVRSNLTLVKQSKNYEINNSAELNRGEKIFHHADHEQFHTDSKFPDSRISNTTKCQLIKHQKTQKVDKLHVCSECGKAFIKKSWLIRHQKCHKLFQCTECGKSFSQKSSLIRHQKHHRREKPFQCSECGKAFPTKQRLIIHQRSHTGERPYGCNECGKTFAYMYFLVKHRRIHTREKCVDSVKVKDPSAAHHSSSHTSDLMQEKSPVNTVTVHMTSVAAQTSVNMSGLLSNRNVVLLGQPLARSDTSDNNTDLVQQRILMNAVNVVVPMNAVNVVVPSMTNYVLFYVPQNPGIN	90907	102981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_90957_92122_92335_98934_99062_99337_99434_101296
750035	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
750036	contig_9049_pilon	+	1910	9	Intergenic	novelGene_83122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1676.06576168717	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	92	553	88356	107948	TRUE	35	TAAACTCAAGGTCATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRGPGDCSRLPAALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSGSQSVFAGSIASSSPGTCYKCKFSDST	88264	113757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113028
750039	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	34	3255	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
750040	contig_6286_pilon	-	909	8	Intergenic	novelGene_165676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	10.0954627108884	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	32	712	499096	493677	FALSE	20	GCCCTAACTCTGCCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLARIVELYYDVLSPYSWLSFEVLCRYQHVWNVDLQLRPSYIAGIMKDSGNRPPAQLPRKALYMVNDLRRLRQHFQVPVQVPEDFFSVVFEKGSLSAMRFLTAVCLECPEMLEKVSRELWMRIWSLNEDITEPQSILTAAEKAGMSAEQAQEILGKISTPKVKNQLKETTEAACNYGAFGLPITVAHVDSQTHMLFGSDRMELLAYLLGEKWMGPVPPAPKARL	499127	493479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_493727_493986_494081_494394_494512_497764_497801_497934_498036_498244_498374_498504_498587_499024
750045	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750048	contig_19013_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_162086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATGACCAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32882	35034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_32900_35000
750052	contig_5549_pilon	+	819	5	Intergenic	novelGene_81578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1335.25334674735	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	62	649	82155	96749	FALSE	20	AATTTTCTTGGGATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVIISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	96919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91839_93355_93412_96620
750053	contig_6217_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_109674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTAGCCAGGCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795299	797245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_795300_797200
750054	contig_5033_pilon	-	948	8	Intergenic	novelGene_29039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4398.8945967674	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	219	737	534582	532125	TRUE	15	CAGACCTGGGCCTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	536582	530987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531064_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534660_535003_535067_536504
750055	scaffold_13505_pilon	-	1328	5	Intergenic	novelGene_111546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGGGGGTTATGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635982	597357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_597528_607147_607237_608976_609103_609532_609621_635127
750056	contig_6710_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_98257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653518	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
750059	contig_5434_pilon	-	1891	8	Intergenic	novelGene_74662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	111.214996786423	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	110	661	282075	275963	TRUE	70	AAAAAGAAAAAAGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAPTPQATSFPAEGRCGYYVEKKKRFCRMVVAAGKRFCGEHAGAAEEENARKRILCPLDPKHTVYEDQLAKHLKKCNSREKPKPDFFIQDINAGLKDETEIPEQLVPISFLSEEQLENLIKKLRKASVGLNSTLKDQIMSHPVLHDALNDPKNGDSATKHLKQQVCLGHSNSTKWPFIHL	282184	262207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_262893_273748_273822_275490_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
750062	contig_8740_pilon	+	2412	11	Intergenic	novelGene_167605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	55.1510652662304	37	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	96	1253	23197	52715	TRUE	30	TTATTAAGCAGTGAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARPVSRMLRRVLRTSTWSCSSEAPVTQPRPGKSTQPAPTELSRRRQFLREHAAPFSAFLTDSFGRQHSYLRISLTEKCNLRCQYCMPEEGVPLTPKADLLTTEEVLALARLFVKEGVDKIRLTGGEPLIRPDVVDIVAKLHQLEGLRTIGITTNGISLARLLPQLQKAGLNAINISLDTLVPAKFEFIVRRRGFHKVMEGIHKAIELGYNPVKVNCVVMRGLNEDELLDFVALTEGLPLDVRFIEYMPFDGNKWNFKKMVSYKEMLDTVRQRWPELEKLPEEESSTAKTFKIPGFRGQISFITSMSEHFCGTCNRLRITADGNLKVCLFGNSEVSLRDHLRMGASEEELLRIIGAAVGRKKRQHAGMFSISQMKNRPMILIGG	23101	62931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_23320_31363_31491_33098_33267_47562_47728_48334_48397_48746_48859_49271_49385_49899_50011_52042_52164_52659_52723_61779
750063	contig_10235_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_46479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.5548257584	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	121	441	222843	219464	TRUE	30	AATTTAGTGGTGTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYRGTQACKIWRRGS	222963	217920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219493_220337_220481_220677_220788_222804
750069	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
750070	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	2	14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	193	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750072	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750084	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750085	contig_5415_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_146131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATCTGATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143301	140531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_140500_143300
750088	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_97267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
750090	contig_6047_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_24243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAACAATAGGCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280541	281754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_280500_281800
750092	contig_15134_pilon	-	2022	16	Intergenic	novelGene_140228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_10	16.6511928167991	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	823	1620	270230	264711	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EESLDFSVSLEQASTERVLRAGKQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQAVGICQVLLDEGALCHVKHDWTFQDRDAQFYRFPGPEPEPVGAHETEEELVEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERTSQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMRPDSSAHDPTETFLSDFLLTYSVFMPSAQLCAALLHHFHAEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVNQWVALYGPMLHSDPVATSFLQKLSDLLSRDARLSNLLKEQWPERRRHHRLENGCGSASPQMKARNVPVWLPSQDEPLPSSNCAIRVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDSWTKGQVLVKVNSAGGELCLWAGWL	273287	264308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_264890_265218_265301_267982_268023_268837_268921_269004_269156_269358_269438_269754_269844_270135_270249_270797_270945_271108_271186_271298_271360_271683_271769_272370_272540_272717_272840_273060_273168_273251
750095	SIRV6	-	434	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGCGATGCCAATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
750096	contig_10235_pilon	+	2270	6	Intergenic	novelGene_46421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	225.2	1	137	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	25	726	210483	212121	FALSE	25	ACTGCCATGCCTCAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPHHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRSPPHQLRPLSRFALFPPHSSTRQSRESRAAEANNERGAQTPRRPGPGAEPALCGFGPDGPQKPPPAVPRSPC	210458	213665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211279_211662_211704_211815_211924_212047
750100	contig_2924_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_140291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACAAAGTTATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448016	450044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_448000_450000
750102	contig_13365_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_168086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51503	51701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_51500_51700
750106	contig_5375_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_169211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCCAGGGAAAGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69963	69544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_69500_70000
750109	contig_13954_pilon	+	2730	6	Intergenic	novelGene_130053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	81.9502287977282	16	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	41	1060	60851	83004	FALSE	80	ATACAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGIVFDAGSSHTTMYIYKWSAEKVNDTGLVYEIEACKVKGPGISAFASNVQDIPVYLSKCMGRAKELIPKYKHHQTPVYLGATAGMRLLRMENEQSAKRILASVTSFLNSYPFNFRDARIISGSEEGAYGWITINYLLGKLQKKQNSEDPSSRKNESQETYGALDLGGASTQITFVPKDTNISSPIKFMQFRLYGWNYTVYTYSFLCYGQDQALLLKLAKDTVETPSGTLLDPCFHPGYERMVDISDLFNNVCTREYKDLFPFDKLRIQGTGDFLQCQERLHNLFPTTYCRYTSCTFNGVFMPPVHGEFGAFSAYYYTMKFLNLTSDKVTSEDMVIEKMKQYCSRPWKEVSD	60810	84674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_60930_64423_64575_67373_67534_68453_68694_70041_70303_82875
750110	contig_16310_pilon	+	1152	5	Intergenic	novelGene_70086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	5	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	161	493	285976	289927	FALSE	50	TGTCCAACAATAAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285815	290586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
750111	contig_7775_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_37466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTTGGGAGGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88938	121770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_89350_119878
750112	contig_5499_pilon	+	2441	13	Intergenic	novelGene_57001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.138799208752	1	144	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	88	927	803476	834902	TRUE	40	AAGAATTTGTAATGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAADTHCSCYNWVRYGESLIQADAPGPALTLVVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMFLIAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLESGQQRGLLSSGGRSHCPKSHG	803388	841277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803502_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818145_818261_825072_825218_827918_828026_831323_831373_834837_834946_835363_835511_839385_839446_839911_840227_840328
750113	contig_3975_pilon	+	1401	4	Intergenic	novelGene_54891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	79.2730863674565	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	18	392	2099675	2102888	FALSE	20	GACTGAGGTTAGTATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLGQVLALVLVAALWGGTQPMLKRASAGLQRVHERTWAQQLLQEMKTLFLNTEYLMPFLLNQCGSLLYYLTLASTDLTLAVPICNSLAIVFTLIVGKLLGEEIGGKRKSGHWECGKQLLGL	2099657	2103897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2099691_2099973_2100126_2100912_2100980_2102748
750115	contig_5935_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_102739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAATTTGCAAATTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232833	1231178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1231200_1232800
750116	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
750120	contig_13904_pilon	-	958	5	Intergenic	novelGene_165491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	224.261566033951	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGTCTTAGTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124868	107544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_108074_108597_108731_111535_111633_111744_111883_124807
750121	contig_5485_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_37743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	915	1238	356730	356407	NA	45	CAAGACATCGAAATATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLKPQLDPPALNFLLNCYTHTPPPSLSLVFVTRETCKYSFHYRVPPGEKEAGVLCPKLLLLNSSRFLLWLLSNSGGGVVITFWRKSSFRGKLYLTYPGHFRIFQT	357644	355816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_355800_357600
750122	contig_5916_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_158031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGCAATATAGGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285166	287876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_285200_287900
750127	contig_4151_pilon	+	1865	20	Intergenic	novelGene_65292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	97.7769806761208	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1524	341	1864	737913	793005	FALSE	35	AGTTTGCAGATAATGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLGGDFKGDGKSSLAADKVVEEIRRKDGKAVANYDSVEAGEKIVKTALDAFGRIDIVVNNAGILRDRSFARISDEDWDLIHRVHLRGSFQVTRAAWDHMKKQNYGRIIMTSSASGIYGNFGQANYGAAKLGLLGLSNTLAVEGRKNNIHCNTIAPTAGSRMTKTILPEDVLEGLKPDYVAPLVLWLCHESCEENGSLFEVGAGWIGKLRWERTLGAIVRQKNQPMTPEAVKANWAKICDFDNTSTPQSIQESTGSIIGVLSKIDSGGVSTNHTSHTASTTTSGFDGAIGHQLPPFSSAYTELEAIMYALGVGASVKDPKDLKFIYEGSSDFTCLPTFAVTLAQKFMASGALAEIPGLSISLAKSLHGEQYLELYKPLPRTGKLRCEAHVADVLDKGSGLLILLDVYSYSEKELICYSQFSIFVVGSGGFGGKRSSDKVKEAAAIPNRPPDAILTDTTSLNQAALYRLSGDWNPLHIDPNFANLAGFDKPILHGLCTFGFSARHVLK	723655	793006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_723836_726654_726709_737806_737914_740934_741043_743457_743518_744731_744754_744864_744912_746739_746825_748217_748406_752996_753089_755158_755184_757392_757522_760496_760598_763406_763644_766110_766163_768535_768608_769669_769774_775059_775126_792073_792144_792940
750128	contig_14666_pilon	-	231	3	Intergenic	novelGene_39668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1250	41	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGAAGTTTGGTTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492426	488778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488790_490404_490532_492333
750129	contig_4469_pilon	-	2093	9	Intergenic	novelGene_21869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_8	59.994661220812	237	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	235	1089	143745	50606	FALSE	5	CTCTTATTGGTTCCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGWVASFLLPLVLLLRGAAGDEESGAGACAASFAGSCGCGAPQRPGTHGSSAAAHRYSREANVPGPVPGERPLASPKMVPIPAGVFTMGTDDPKIQQDGEAPARRVMIDAFYMDAYEVSNAEFEKFVNSTGYLTEAEKFGDSFVFEGMLSEQVKTDIQQAVAAAPWWLPVKGANWRHPEGPDSTVVHRLDHPVLHVSWNDAVAYCTWAGKRLPTEAEWEYSCRGGLENRLFPWGNKLQPKGQHYANVWQGEFPVSNTGEDGFRGTAPVDAFPPNGYGLYNIVGNAWEWTSDWWTVHHSAEEMVNPKGPPSGKDRVKKGGSYMCHKSYCYRYRCAARSQNTPDSSASNLGFRCAADRLPTVG	153272	49601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_50717_59542_59603_103192_103307_112813_112929_113690_113814_116242_116326_140367_140443_143571_143746_153038
750130	contig_3181_pilon	-	1479	9	Intergenic	novelGene_136937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_8	71.342045807504	576	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	121	1134	322396	311396	TRUE	35	GAATACATTGTGAAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPSPQTKPSNPSNPRVFFDVDLGGERVGRIVLELFADIVPKTAENFRALCTGEKGIGPTTGKPLHFKGCPFHRIIKKFMIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFYYKHDQEGLLSMANAGPNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGMGVARILENVEVKGENPAKLCVIAECGELKEGEDWGIFPKDGSGDSHPDFPEDADIDLKDVDKILLITEDLKNIGNTFFKSQNWEMAIKKYAKVLRYMEGSKAVTEKADSSKLQPVALSCVLNIAACKLKMSDWQGAIDSCVEALEIDPSNTKALYRRAQGWQGLKEYDQALVKFSSKMFNF	322516	310261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_310504_311292_311516_313189_313332_315990_316098_316236_316360_317405_317595_319464_319572_320966_321108_322311
750131	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
750132	contig_12622_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_5753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGATAGATGCCACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12806	11707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_11700_12800
750135	SIRV6	+	305	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8127	-1	612	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAATCACCGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
750137	contig_7411_pilon	+	3355	2	Intergenic	novelGene_136962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	309	1946	76975	78612	FALSE	50	GAGATAAGAGAAAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIDLSPTWALRAQDSACFHVGSTKEEKMVARFPTTWLQKPVTFKDVAVEFTQEEWVMLDPAQRNLYRDVMLENYRNLTSVEYQLCRPTVISQLDQEERRTVERRISQGTYPDRENLLKAKESTPKNIFCEEPSNGMKMMRLTMDDYWSFTLEEDWECYKIRKEHKIPKGHLRQVNFTQRKAACQERFYDHHEIEENSKLGSKLVFSQRVSSSKHCCTYDLDMECLKHNSDINSYQKYSVCEKLCESHEYNRAFWYLERTQITQKECTCFKCEINFKHNIFPVHNNFYMENSDECNKNNKTSCHHSSLNQQEQTHSGEKHKCNQCGKAFKRISNRILHKRSHMGEKQYECKECRKLFHDSSTLRRHVRTHTGEKPYDCNLCGKAFSQKTSLKSHVRTHTGEKPYGCNQCGKSFGTSSYLIVHKRIHTGEKLYECSDCGKAFNTSSHLKVHKKIHTRESIYECNDCGKVFSGLSSLRMHVRTHTGEKPFECKECRKAFSVSSSLRRHVRTHTGEKPYECIQCGKAFSQSSSLIIHKRIHIGRETI	69587	80021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_69757_76835
750138	contig_10299_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_79734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTATCTTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366042	367647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_366000_367600
750141	contig_14060_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_156058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGAATAAAATAATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85049	85401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_85000_85400
750142	SIRV6	+	548	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	14	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750149	contig_7318_pilon	+	1924	8	Intergenic	novelGene_152232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.123942569749	181	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	171	863	331708	343304	TRUE	15	TACCATAGCCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKDFETWLDNISVTFLSLTDLQKNETLDHLISLSGAVQLRHLSNNLETLLKRDFLKLLPLELSFYLLKWLDPQTLLTCCLVSKQWNKVISACTEVWQTACKNLGWQIDDSVQDTLHWKKVYLKAILRMKQLEDHKAFETSSLIGHSARVYALYYKDGLLCTGSDDLSAKLWDVSTGQCIYGIQTHTCAAVKFDEQKLVTGSFDNTVACWEWSSGARTQHFRGHTGGGI	326392	355141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_326434_326535_326645_331687_332198_340980_341177_343297_343432_345626_345714_346358_346529_354464
750150	contig_3095_pilon	-	822	4	Intergenic	novelGene_75241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1726.75475965755	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	33	557	255439	246641	FALSE	20	TATCTGTACTCTGAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWQS	255471	246375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246649_248476_248669_253535_253806_255384
750151	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
750152	contig_12092_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_163448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCCTGATTTGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220965	221218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_+_221000_221200
750153	contig_10196_pilon	+	1884	9	Intergenic	novelGene_132302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	253.798517529161	7	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1094	1681	2368768	2374406	FALSE	20	GTAGCCCACCTGCCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2348156	2374609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348832_2352497_2352597_2364367_2364479_2365373_2365564_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
750154	contig_7815_pilon	+	2126	3	Intergenic	novelGene_134352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	72.5	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	406	1701	173960	175255	FALSE	30	TTTGTAGCAACAACCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLRRRLFPYPTKCYFVVVIFSLVAFSVLIIHQKTEFVSIGHLELIEENPSSDVNCTKVLQGDVDEIRKVKLKMLTVKFRNRPRWTTYDYINMTSDCRSFIKRRKYIVEPLSKEEVEFPIAYSIVVHHKIEMLDRLLRAIYMPQNFYCIHVDKKSEDSFLDAVMGIASCFSNVFVASQLERVVYASWSRVQADLNCMKDLYRMSADWKYLINLCGMDFPIKTNLEIVRQLKSLMGENSLETEKMPAHKAERWKKRYEVINGKLTNTGADKVPPPLETPVFSGSAYFVVSRKYVGYVLENEKIQNFIEWAKDTYSPDEYLWATIQRIAEVPGAFSSSHKYDMSDMQAVARFVKWYYYEGDVSKGAPYPPCSGVHVRSVCVFGAGDLNWMLHKHHLFANKFDMDVDPFAIQCLDEHLRHKALEPVKHLQW	127324	175680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_127440_171442_171589_173815
750155	contig_11115_pilon	+	1710	7	Intergenic	novelGene_102819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	620.168167157551	2	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	647	1621	171704	173241	FALSE	20	AGTCTGTGGCTTAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165370	173330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166513_171276_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
750156	contig_20779_pilon	+	1346	2	Intergenic	novelGene_112365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATGAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10286	48156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_11062_47585
750157	contig_2332_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_58717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGACCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827057	828949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_827100_828900
750158	contig_15732_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_88900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGGATTTAATTTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248954	250607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_249000_250600
750162	contig_5918_pilon	+	1796	9	Intergenic	novelGene_99501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	45.850299889968	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	147	644	258126	277268	TRUE	45	AAAGTAATATAATTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHPRTSLETKEYPDTEIQKNQVLSLEEWQEKWVNHNIPFHQEEGHQLLKKHLDTFLNGRSKLRVFFPLCGKAVEMRWFADLGHSVVGVEISELGIREFFTEQNLSYSEELITQIPGAKVFKSSSENISLYCCNMFDLPRANIGQFDRIWDRGALVAVNPADRQR	251260	283507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_251359_258077_258266_259400_259494_264231_264365_268811_268865_269818_269894_277264_277913_282581_282627_283044
750169	SIRV6	+	196	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	409	3	-239	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGACGCTTCCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
750171	contig_17989_pilon	-	1634	7	Intergenic	novelGene_150807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	33	junction_6	528.881655529435	944	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	244	1101	206853	201145	FALSE	5	GGCCTGGGTGAGTGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAGEEQPMETTGATENGHEAAPEGESPAGVGAGSATGAVAGTAAPPAGNQNGAEGDQINASKNEEDAGKMFVGGLSWDTSKKDLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDSTSVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKKAMAMKKDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKSNKRRGFVFITYKEEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVYQQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGSGGQGSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY	207192	200611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_202346_202465_204529_204662_204856_205016_205676_205846_206644_206878_206973
750173	contig_15410_pilon	-	1606	11	Intergenic	novelGene_130584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	91.706052144883	4	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	595	1461	56848	54277	FALSE	30	TCACTCACTTCCCCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVALVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59445	54131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_56829_57005_57488_57564_57669_57870_59282
750180	SIRV4	-	220	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1301	0	1301	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3857	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
750182	contig_7171_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_101207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59124	57851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_57900_59100
750185	SIRV4	-	203	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	411	3	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAACTATCGGCGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
750187	contig_18081_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_23856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGGGTTTCCAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483093	484460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_483100_484500
750188	contig_3386_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_34493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGGAAGGGCCAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395685	395309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_395300_395700
750189	contig_3386_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_34492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGCAAGTAATTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395359	394908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_394900_395400
750190	contig_5643_pilon	-	912	6	Intergenic	novelGene_39132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.237851895587	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2	571	649521	647313	TRUE	40	TATTACTTAAACTGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	649522	646208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344
750191	SIRV6	+	523	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1222_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750199	SIRV4	+	344	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1427	632	972	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
750203	contig_14341_pilon	-	584	3	Intergenic	novelGene_111893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	278	331	729343	729290	TRUE	0	GTCTGCCTCTCCCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRRPTEGAVVGGRSVYPNEGSVTRKRKRIPVPAPVSGSSRAAGPRRVHGRRRSRGVSPFSIPRAAPQFLACPSGHLFTPFPAHPFSFCKPCMIPALPLALRLGPVPYC	730669	727839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727915_729111_729452_730500
750208	contig_5947_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_101465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTACAAGAGGTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44118	43373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_43400_44100
750209	contig_5947_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_101466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGTCGAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45150	44934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_44900_45200
750215	contig_6795_pilon	-	2957	11	Intergenic	novelGene_27748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	17.5456547327251	117	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	171	1784	340979	334883	FALSE	25	GCTCTTCAAGGGCAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTAALFQTDCEHADSLAQAAEDDWPPFRKVGCFDPYSDDPRLGVQKVALCKYTARMVVAGTAGQVLVLELSDVPAEQAVSVASMDLLQDREGFTWKGHDQLSPSTGPLPWPVGFQPQVLVQCLPPAAITAVTLHTEWGLVAFGTSHGFGLFDYQRKSPVLARCTLHPNDSLAMEGPLSRVKSLKKSLRQSFRRIRKSRVSGKKRALNTSSKLQEANAQLAEQACPHNVEVTPVQRRIEPRSADDSLSGVVRCLYFADTFLRDAVHHGPTLWAGTNSGSVFAYAMEVPAAATGSENRPERAVEAVLGKEVQLMHRAPVVAITVLDGRGRPLPEPYEASRDLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFKVFTLPKVSAKTKFKLTAHEGCRVRKVALATFASVACEDYAETCLACLTNLGDVHVFSVPGLRPQVHYSCIRKEDISGIASCVFTRHGQGFYLISPSEFERFSLSARNITEPLCSLDIRWPRDTTCDSYRLQESPKLSQANGTPGIILAPRSCDGSPSPARSKGAGDTMEPSEATLSPISMDSATSADTTLDTTGDVTMENVKDFLGSSEEPQKNLRNVAQDEAHACTILIR	341219	333709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_334962_335114_335236_335401_335518_335705_335821_335960_336226_336854_337151_339218_339373_339651_339800_340107_340401_340952_341058_341127
750218	contig_12790_pilon	+	2001	10	Intergenic	novelGene_35242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	285.722648907582	1	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	452	1144	309644	312473	FALSE	25	TTTAATTGTTTATAAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKLLEQSEWQPTSVDGKGYLLNEPGVQPTSVYGDFSCKEEPEVDSAGDLKNMDSSWLDSLLTPVRMPSIQAIPCAP	305948	313330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308739_308844_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029_311080_311898_312035_312384
750221	contig_6102_pilon	-	809	9	Intergenic	novelGene_32204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1761.30051382494	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	92	415	905250	896229	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKAQLQIPT	906174	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896254_896293_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
750223	contig_11929_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_171235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATGAAAATGTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54765	55291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_54800_55300
750224	contig_2703_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_101825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGACATGAGTTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171938	1173798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1171900_1173800
750228	SIRV5	+	281	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	44	880	44	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8359	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
750231	contig_8801_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_66257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	859	1242	360218	360601	NA	75	TATTTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVGKPLSGPLPLGPLASQPLNLASALLRQVLQSSLALPISAQRHPTPPVSLSLKALSSLVPGVRQPSSADKCPETPTPPASLLPEDTHLSCSVGQEAHCTVSCQSPCSAIAVSLLLLLTISRRHQC	359359	361739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_359400_361700
750235	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-9	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750237	SIRV6	+	198	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	507	3	-337	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGTAGTCGAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
750238	contig_6958_pilon	+	2271	3	Intergenic	novelGene_69986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	17.5	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGTTGCATCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718489	727000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_723190_723336_724940
750239	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
750244	contig_5758_pilon	-	1332	8	Intergenic	novelGene_119056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	979.146567169594	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	169	948	113963	51502	FALSE	35	TCAGTAAATATCCTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEIGSPPRFFHMPRFQHQAPRQLFYKRPDFAQQQAMQQLTFDGKRMRKAVNRKTIDYNPSVIKYLENRIWQRDQRDMRAIQPDAGYYNDLVPPIGMLNNPMNAVTTKFVRTSTNKVKCPVFVVRWTPEGRRLVTGASSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSPVRAMTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRDKQTNPNPTRCCRVDSDS	179159	51117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_51558_91145_91244_92931_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
750245	contig_11720_pilon	-	1593	10	Intergenic	novelGene_43876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	85.4393149739034	10	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	506	1126	110844	108246	FALSE	15	CATGTATGTGTGGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASQPCCGRRAQLWFTPAAWMALCAFGMLAPAACLPTTGATRPRSWTLLSAKTPPWW	113333	107778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109007_109569_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112683_113170
750247	contig_5260_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_144422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTGTATAAAGTAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545798	544758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_544800_545800
750250	contig_5502_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_155017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATGTGGCGGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532837	534086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_532800_534100
750251	contig_7176_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_107872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTGTCACTGGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648198	645764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_645800_648200
750256	contig_2093_pilon	-	1586	1	Intergenic	novelGene_152949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAATATTCGAGTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967102	965516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_965500_967100
750260	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_93463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
750264	contig_8617_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_73471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62727	62987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62700_63000
750276	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
750284	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750285	scaffold_8345_pilon	+	2566	19	Intergenic	novelGene_106995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_18	21.1869981094276	58	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	122	2548	177328	229996	FALSE	25	AGAATCACTTGTATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELDDFIGQEPQPVDDDLFKEPVKKRRRSDRDQRFRAFPSMEQSALKEYEKLESRTRRVLSNTYQKLIQSVFLDDNIPSGIKYLINRLLALIEKPSLDPIYIGLFGSTGAGKSSLINAIIQQAMFLPVSGENTCTSCIVQVSSGCRDQYEAKIHLLSDQEWKEELKNLTKLLHETEELDKEEDAWDRDDAVEEAIWKLQVLYGNGAESKNYEELLRAKPKGKIPTSRIITLKAEEAGELSVKLDPYIRAQRRDCSAESAGTQIWPLIKHVEVTLPKSELIPEGVVLVDIPGTGDFNNKRDEMWKKTIDKCSVIWVISDIERVSGVRAHEDLLNESIKACQRGFCRDIALVVTKTDKLHLLEYLRERKVGNQAIQSQREAVLERNETLKLQRSRILKEKLKRKLPADSKVLETSDLVYTVSAQEYWQQALLTEEETEIPRLREYIRKQLLDKKRRMVTKYVTEAFGLLLLTDSFNSTDNLPNEYLHMSYLRRFVEEKIQLLEKIIDQCFAHIEQPLEEGVRNARTSYRRILSGCLVRSKGNQGFHQTLKAVCLKNGIYASRTLARIDLNEAITQPIYEQIDPVFGGIFRTGKATGSALMPHIDAFKHSLQEKMTEIGIRNGWKYDSCKKNFLIQEISAILGGLEGHILRKKRRIYESLSISVQNDLKSCYEEAAQITGKKACERMKDVIRRGVDRQVAEGMFERAQERMQHQFQQLKNGITEKVKGSISTMLTLASSQGVGLYKELADVKSEYKEMEKLYRSLREVAENAVLRRGMQEFLLRMSPSKVAPQPQNTTLIPGTQPQGSEK	168759	230014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_168835_177281_177371_180273_180379_180987_181097_182267_182491_183016_183245_186117_186328_195891_196068_197742_197762_197946_198037_200737_200844_202398_202533_206895_207061_212358_212517_214106_214246_215250_215360_215962_216100_225902_225994_229811
750288	SIRV6	+	496	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	171	-2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
750294	contig_57_pilon	-	2036	10	Intergenic	novelGene_44914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	16.7604767308962	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	314	1822	286247	273121	FALSE	20	AGCCCTATGTTTTGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSILLLYCLFLGTIPALAETGGERRLSPEKSEIWGPGLKADVVLPARYFYIQAVDTSGNKFTSSPGEKVFQVKISAPDEQFTRVGVQVLDRKDGSFIIRYRMYASYKNLKVEVKFQGQHVAKSPYILKGPVYHENCDCPLEDSAVWLQEMNCPEIIAQIQRDLAHFPTVDPEKLAAEIPKRFGQRQSLCHYTLKDNKVYIKTHGEHVGFRIFMDAILLSLTRKVKMPDVEFFVNLGDWPLEKKKSNSNIHPIFSWCGSTDSKDIVMPTYDLTDSVLETMGRVSLDMMSVQANTGPPWESKNSTAVWRGRDSRKERLELVKLSRKHPELIDAAFTNFFFFKHDESLYGPIVKHISFFDFFKHKYQINIDGTVAAYRLPYLLVGDSVVLKQDSIYYEHFYNELQPWKHYIPVKSNLSDLLEKLKWAKDHDEEAKNIAKAGQEFARNNLMGDDIFCYYFKLFEEYASLQVSEPKIREGMKRVEPQTEDDLFPCTCHRKKTKDEL	286560	272906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_273139_274871_274980_276381_276472_278806_279017_280544_280783_280903_281077_282202_282281_282454_282661_284639_284846_286065
750297	SIRV6	+	320	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8115	3	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
750304	contig_401_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_42735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAAAAAAAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117848	116230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_116200_117800
750306	SIRV6	+	361	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	10	412	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750309	contig_10163_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_82644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAAGAGATAATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162875	163214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_162900_163200
750312	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
750313	contig_14925_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_55154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1708.08086752355	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	206	463	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRQLVFGKGTRLSVISNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	63356	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26311_27014_27127_27995_28041_29569_29828_63303
750314	contig_10861_pilon	-	1056	4	Intergenic	novelGene_39346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_1	231.603588534855	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	681	1055	1491018	1490331	FALSE	20	CTTACCCAGGCGTCATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFK	1491698	1490329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957
750317	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_96613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
750326	contig_7867_pilon	-	2774	13	Intergenic	novelGene_162741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	17.7216126680265	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	214	1692	48303	23224	FALSE	20	TTTATTTAATACTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVFKAVSDICKTFNIRHPEELSLLKKPRDPTKKKRKKPDDQSEDEALELEGPLITPGSGSIYSSPGLYSKTMTPTYDAHDGSPLSPTSAWFGDSALSEGNPGILAVSQPITSPEILAKMFKPQALLDKAKINQGWLDSSRSLMEQDVKENEALLLRFKYYSFFDLNPKYDAIRINQLYEQAKWAILLEEIECTEEEMMMFAALQYHINKLSIMTSENHLNNSDKEVDEVDAALSDLEITLEGGKTSTILGDITSIPELADYIKVFKPKKLTLKGYKQYWCTFKDTSISCYKSKEESSGTPAHQMNLRGCEVTPDVNISGQKFNIKLLIPVAEGMNEIWLRCDNEKQYAHWMAACRLASKGKTMADSSYNLEVQNILSFLKMQHLNPDPQLIPEQITTDINPECLVSPRYLKKYKNKQITARILEAHQNVAQMSLIEAKMRFIQAWQSLPEFGITHFIARFQGGKKEELIGIAYNRLIRMDASTGDAIKTWRFSNMKQWNVNWEIKMVTVEFADEVRLSFICTEVDCKVVHEFIGGYIFLSTRAKDQNESLDEEMFYKLTSGWV	84570	22141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_23398_24568_24711_25009_25135_28825_29048_29155_29263_35821_35947_37193_37244_38201_38337_42600_42709_47915_48019_48115_48342_57659_57795_84530
750327	contig_3382_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_123984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCTCCCTGGTCTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47055	46153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_46200_47100
750331	contig_7020_pilon	+	2445	15	Intergenic	novelGene_57046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1090	1419	45951	48483	TRUE	35	CAGAGAGGAAGGACAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPLDLFPMITVAKARSGRRILVLLRHWIFEPGYESCRVMLMIVNELRDGAEKVLLSQVILALRCGTDNIMAYHPLRVPCRFSKHRHSVFSSFAGVSNNETSFFPLLL	44350	74738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_45300_45810_45982_46831_46910_47790_47919_48093_48174_48470_48529_49077_49142_49543_49731_51550_51618_51943_52074_58674_58755_60330_60404_62375_62474_63004_63178_74629
750332	contig_7695_pilon	-	966	4	Intergenic	novelGene_41558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.538806526525	1321	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	75	521	380076	378805	TRUE	15	ACTTAGGGTATGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQDLQFLWQEWQL	381079	373561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_378788_378840_379664_380089_381017
750333	contig_7057_pilon	+	1410	2	Intergenic	novelGene_123244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	594	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539930	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155
750336	contig_18039_pilon	+	3048	7	Intergenic	novelGene_171239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	20.4402924527893	37	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	267	2018	79599	99406	FALSE	30	ATACTTGGATTGATATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPQELLTFRDVAIEFSQQEWECLEPAQRALYRDVMLENYRNLISLGISPSEMNIISILKKGTEPWTVKKKMKLAKNSDVLSPCVIKELSAKEIIDKGELFQRVMLERNESHGTGDFNFGQVRENVHEFESQWGKDERNNKGVITPRNKIFTSRRDQRVKRDAGNKYMTCFKNTIELTFQSHKAEMQKFHTGEKMYECHQVESSVNNASSIPSLQRTHPSVQSNISNERGEVFMPSSWFLQHQKTHSREKSYTCNECRKSFSQRSTYTHDQRIPCMQRPYEGSEGVKTIYSGSDLMKHHRIHTREKPCKCNVYGQVFSLQLRLRTHQRFHTVKNPYKCKECGKEFMRHSYLWGHKRIHIGKKPYKCNECGKTFNHDSHLSMPHRVRITHQRLHNGQKPDRCNICGKVFSLSSSLITHQRIHMERNLTNAMNVVRVLPRNQVLWNISEYIVGRNLTNVMNVVRLLAVDQSFGNIREFIVEKNLTNVLNVVRLFLEDQVLWNISGFIVERNLTNVMNVIRLLPENQVFWNINKFIVERNLTNVMNVVRLLLENQVFWNINKFIVERNLTNVKNVVSLLPKNQVF	75678	100436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_75707_78494_78662_79527_79614_83285_83413_84652_84749_97303_98333_98921
750337	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
750338	contig_1856_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_84892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAATTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435290	437402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_435300_437400
750340	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
750342	contig_6208_pilon	-	1750	2	Intergenic	novelGene_52972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	380	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTACTTCCTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337413	334409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_334832_336085
750343	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
750344	contig_4151_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_65273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGACTGTACAGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626289	624445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_624400_626300
750345	contig_7179_pilon	+	2950	4	Intergenic	novelGene_78188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	48.1409966198827	96	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	115	480	1231435	1232470	FALSE	10	CTGCTCATGTCACTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRREVRLSPVGRAAPRSAAAIAVCFQLLFKDRKLMVQIVISSAGAGGLAEWVLMELQGEIEARYSTGLAGNLLGDLHYTTEGIPVLIVGHHILYGKIIHLEKPFAVLVKHTPGEQDCDELGCETGTRYLVTALIKNKILFKTRPKPIITNVPKKV	1224377	1234940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1224457_1231399_1231458_1231719_1231838_1232245
750346	contig_4812_pilon	+	2528	16	Intergenic	novelGene_103695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	54.9761160262648	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	651	1793	267652	299702	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKLDDCITYISSHPSFKDYPVYLLKFKQCLSKALHLMKSYTVNTLQNLTNQLLKRDPSSVPNADNAFTLFYVKFRAAGPKVRTLIEQIEQRSEKMPEYQQVLNDIHQCYLDQRELLLGPSITCTVTELTSQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEEIAQSLKEEQKKVPSEASFSDVQLEEAESNSLTKSGSTESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKV	247831	300437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_248015_262508_262656_264352_264415_265615_265751_266428_266504_267603_267697_268733_268860_270334_270416_274401_274446_274901_275029_276398_276491_277571_277712_279166_279328_287773_287880_296906_297032_299606
750350	contig_16724_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_105272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCAGCCTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347299	349781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_347300_349800
750352	SIRV6	+	523	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	23	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750363	SIRV6	+	443	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	519	0	340	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750367	contig_4686_pilon	-	1752	9	Intergenic	novelGene_118571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_8	496.390455563964	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	356	1303	883895	741340	FALSE	80	AAAGAAAAAAAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRTVSRSRDIANVMQRLQDEQEIVQKRTFTKWINSHLAKRKPPMVVDDLFEDMKDGVKLLALLEVLSGQKLPCEQGRHMKRIHAVANIGTALKFLEGRKIKLVNINSTDIADGRPSIVLGLMWTIILYFQIEEVTSNLPQLQSLSSSMSSVDSTLSAETASPPSKRKVATKVQGNAKKALLKWVQHTVTKQAGIEVKDFGRSWRSGVAFHSVIHAIRPELVDLEKVKGRSNRENLEEAFTIAETELGIPRLLDPEDVDVEKPDEKSVMTYVAQFLKHYPDIHSTAVDGQESDVRICFSSSTDSMLSDSDSGF	893375	740890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_741513_745629_745827_751563_751743_753719_753813_760282_760367_767767_767864_788890_788953_883831_884109_893233
750368	contig_14563_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_135013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATTTCTAGAATTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29987	27666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_27700_30000
750371	contig_6208_pilon	-	1547	3	Intergenic	novelGene_53009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52	1121	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	662	826	458144	457980	FALSE	5	GCCTTTTGTGTCTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHHIGLKRRHPGDGKKEGGGSQICSHSRPPSGTNTGFIFSWERLWRPRKKRLLSPPSCSILHLLGDPRQVPERHPHPACEADGAVALLSTRFGLCQEPSFAGAEIAGKGPLPSRQTPGSRVRVRVLRVCPAPLRFAANSPALSVWHFLPARVVARPWLCGPCAQCPETWLEGARPHLCRDRREARRRVDAERSERSEEISWIWEWNLSNPPLHCAAFVETMFGRLTLPQWLFATILGIAGGVYIYQPIFEQYSRDQQALKEKLKLAQESEEKKS	461045	457258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_458223_460170_460646_460937
750374	contig_3525_pilon	-	1394	7	Intergenic	novelGene_135118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.9480382848084	18	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	358	834	53184	51210	TRUE	35	AAACCCAGCGTGGTAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLLAGVALHKTHKGLLWGVSPILRSDIISAFLSNKDTQNLSSPVTFTFSHHPVTPGPGQGVVCAFWEHEKDGCGHWATTGCRMLGTRDESTTCHCTHLSSFAVLMAHYELQEEDPVLAVTTYMGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAVQNTSTSLHLQL	53541	39545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_39651_41774_41867_42220_42288_50645_50882_51149_51348_52634_52815_53025
750376	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	6	407	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750377	contig_17158_pilon	+	2030	6	Intergenic	novelGene_141155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	125	junction_1	754.652608820774	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	11	799	165610	185950	FALSE	80	AAGGAAAAAAATAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQPPGGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDNAYDPDVNAKQIWIDKTVINGHICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGLYGNGFKSGSMRLGKDAIVFTKNGESMSVGFLSQSYLEAIKAEHVVVPIVAFNNHRQMINLAESKASLAAILEHSLFSTEQKLLAELDAVMGKKGTRIIIWNLRSYKNGATEFDFDKDKYDIRIPEDLDETTGKKGYRKQERMDQIAPESDYSLRVCIQLCFCK	165599	187181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_165649_179698_179772_182053_182187_183117_183332_183877_184027_185769
750378	contig_9982_pilon	+	1861	5	Intergenic	novelGene_55750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	134.74884044028	14	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	288	1112	327980	333533	TRUE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGWF	326754	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_327000_327937_328115_330452_331132_333522_333610_337965
750383	contig_15134_pilon	+	235	3	Intergenic	novelGene_140233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAAGAGGTGATGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333021	333640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_333109_333375_333471_333587
750384	contig_2069_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_23561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTCACTGCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2253971	2254985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2254000_2255000
750386	contig_9345_pilon	+	615	2	Intergenic	novelGene_24586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	724	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGGGGCCGAGGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944543	945434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_945112_945387
750387	contig_9852_pilon	+	1258	6	Intergenic	novelGene_138457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	340.64386094571	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	24	587	21374	32236	FALSE	15	TATTCCTTTTAGTATCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGAVGTMAYPGHPGAGGGFYPGGYGGAPGGPAFPGQTQDPLYSYFAAVAGQDGQIDADELQRCLTQSGIAGGYKPFNLETCRLMVSMLDRDMSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIAKRYSTNGKITFDDYIACCVKLRALTGVFYEVMSLPWAKMSFL	21350	32907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_24546_24617_30839_30884_31683_31832_32069
750388	contig_8020_pilon	+	2058	18	Intergenic	novelGene_114404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_16	47.450866958218	160	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	245	1573	173375	202853	FALSE	30	GAATTTAGTGCACAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETIQRPLDRLFCSVVTVAEQKYQSTLWDKSKKLAEQAAAIVCLRSQGLPRGSAG	167176	203338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_169128_169206_171004_171097_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_202483_202558_202768
750389	contig_13292_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_142917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGGTCAAGGTAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10835	12912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_10800_12900
750392	SIRV4	-	316	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	0	1205	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750394	contig_9429_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_155105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGGTAAGCTCTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86115	87554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_86100_87600
750395	contig_9429_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_155106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTATTGAGTGTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87604	88335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_87600_88300
750396	contig_1008_pilon	+	1950	14	Intergenic	novelGene_121531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	95.7971846753127	211	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	78	1250	217664	329175	FALSE	20	CTGGTTATGGACGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAARFVQQAGPGARQGPRLAPLPGMVSKALLRLVSAINRRRMKLLLGIALVAYVASVWGNFVNMSFLLNRSIQENGELKIESKIEEIVEPLREKIRDLEKSFTQKYPPVKFLSEKDRKRILITGGAGFVGSHLTDKLMMDGHEVTVVDNFFTGRKRNVEHWIGHENFELINHDVVEPLYIEGLAKRVGARLLLASTSEVYGDPEVHPQSEDYWGHVNPIGPRACYDEGKRVAETMCYAYMKQEGVEVRVARIFNTFGPRMHMNDGRVVSNFILQALQGEPLTVYGSGSQTRAFQYVSDLVNGLVALMNSNVSSPVNLGNPEEHTILEFAQLIKNLVGSGSEIQFLSEAQDDPQKRKPDIRKAKLMLGWEPVVPLEEGLNKAIHYFRKELEYQANNQYIPKPKPARIKKGRTRHT	217586	329875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_217758_248477_248506_249827_249892_253727_253772_259214_259276_266009_266191_289286_289347_292120_292243_308208_308329_318553_318598_322911_322973_326154_326213_327713_327818_329043
750397	contig_20609_pilon	-	1406	12	Intergenic	novelGene_118471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	184	651	58756	56082	TRUE	10	CCCGGAAGTCCCCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPEYEGCVPVRREGQGLRHSLSSLDELHIVSRKHAEVAVWPVAAPPALIDHLNSRDEVLGVKGDLCVVSCLVVIQGPGTKSLPKQPCPLLVADAVLRSSIFLLYLWGLLVEILLLQGLLADGLPFHLHWRLRDNGLWVHGLLTGRLLVRPCP	58939	43707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_-_43812_48941_49001_52521_52633_53371_53442_54334_54487_55224_55302_55670_55823_56051_56099_56489_56521_57568_57665_58014_58120_58537
750398	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	222	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750399	contig_12871_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_140373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTTGCATACCAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22529	23141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_22500_23100
750410	contig_12468_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_164882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACAAAAAATGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71009	69357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_69400_71000
750416	contig_12638_pilon	-	2331	8	Intergenic	novelGene_33242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1713	2171	753500	737657	TRUE	30	GACCGGGATGAGCACACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLYSEHGHEILILKQDGSFHQVLKVGIHTSPDARVLRHPLASEHINVVANLGGVFGLPPRPSSGGVQSRAIQPPLPPQPFLTAGEQIGGLLPLGCWFQTQRRSHQYQSPHCPGALQPLFGILRHSPKSARCPEHQSVSEKNCPRCRARRR	756273	737271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_737349_737573_737686_739518_739558_745279_745387_746398_746520_751871_752017_753482_754118_755178
750417	contig_1948_pilon	-	1296	4	Intergenic	novelGene_31180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	289.049399853305	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	31	357	552044	544552	FALSE	35	TAATAGAAGTGTATTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSASKAASLHWTGERVVSVLLLGLLPAAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHGYWTGCY	552074	543612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546756_546900_548485_548594_551992
750418	contig_5649_pilon	-	1840	8	Intergenic	novelGene_82467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	153.082610750816	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	349	1257	1570696	1564135	FALSE	25	TACTATGAATGACCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573898	1563551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570730_1570825_1570897_1573654
750423	contig_12270_pilon	+	364	2	Intergenic	novelGene_113399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATCAGCTCACATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13846	14433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
750424	SIRV6	+	555	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	10	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750428	contig_18145_pilon	+	2397	15	Intergenic	novelGene_37316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22.6612138299099	128	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	281	2116	79359	84552	FALSE	10	TTATCTCGTCTGCCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLWREKNDRLVRQTKQVTQDSDLLLRQQQLAQDALQGFRELLHSLQGLPAAISALPLELTVICNFITLKASHTQGFTEDQDQDIQHGLERVLEAQKQLGPRLECGLRELWDSVLHASSLLPELLPALHHLAGLQAALWLSTDHLGDLALLLQSLNGSQSGASEDLLLLLKTWSPPAEESDAPLTLQDARGLRDVLLTASALRQGLQELITGSLPRALSSLQEAASGLCSWPVLVQVYTALATCLRKMGSPQRALLYLVAALKGGSVWGPPLLEASRLYQQLGDTAAELKSLELLVDALSVTQNSEAPQLLIEVELLLPRPDPASPLYCGTQSQAKHLLASRCLQTGRAEDAAEHYLDLLALLLDGLEPRFSPLPCPPGPCMPEVFLEAAVALIQANRAQDALTVCGELLSRTSSLLPKMPWLWEDARNVAKEPINCPLWVSATYLLQGQAWVKLGDQKQAVSEYSRCLELLFRATPEDKEQGAASNSDQRCRPDAALQQLRLAALISRGLVWVASGQDTKALQDFLLSVQMCPGNRDASFHLLQTLRRLDRRNEATAFWWRLEAQTKLPPEDATWSLPLYLETCLNWIHPPDRETLLEEFRTSLLEPSDL	78861	84833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_79106_79322_79407_79604_79699_80033_80166_80423_80627_81119_81256_81432_81564_81663_81811_81951_82104_82502_82570_82844_83135_83277_83325_83516_83673_84166_84291_84443
750430	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_98030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
750433	contig_11978_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_62829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACATTATCTGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448844	450828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_448800_450800
750435	contig_9239_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_137169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	757	1089	106592	106924	NA	45	TATGAAAATGATGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSTGQCCVSGTQKIAFVSELSSFLETFYLCDEGTFFFPKIGDFGEGLSLVHWTWSRTDFLPCGLGTWILCCSWVEPWEYSLSLGQDILRGWRSRQSYLLTHRSVFHSA	105835	107305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_105800_107300
750436	contig_7622_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_132436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCAACTAATCAGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310250	309477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_309500_310200
750445	contig_4874_pilon	+	1625	4	Intergenic	novelGene_78628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.5964091158113	347	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	397	693	124952	127301	FALSE	15	CCTAAAGTGCCTCCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPRRPRARIGGSTHGLTRAPAPQRFPRSQPRGSLGRECAGWCYNPTLPEHADTRVFGKCYLPRERTCACKKLCINSRTTGKPLLWSPFLQRPLHKRKGGQVRFSNDQTIELEKKFETQKYLSPPERKRLAKMLQLSERQVKTWFQNRRAKWRRLKQENPQGNKKEDLENLDNPCEQRQDLPSEQNKGASLDSSQCSPSPASQEDLESEISEDSDQEVDIEGDKGYFNAG	124158	128233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_124400_124796_124976_125181_125233_127079
750447	SIRV4	-	310	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1211	0	1211	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3947	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
750448	SIRV6	+	552	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10799_11021_11109_11205
750450	SIRV4	-	308	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1215	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
750452	contig_17840_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_154305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGTAATTGTAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97081	98020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_97100_98000
750453	contig_960_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_108244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGTTCTTGAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468258	465057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_465100_468300
750456	contig_9535_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_124468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAACTTAAATTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240082	239393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_239400_240100
750457	contig_9535_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_124467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATTAGTCCAAAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239443	238611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_238600_239400
750458	contig_10196_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_132127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	269	331	926220	926282	NA	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	925951	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_926000_926600
750463	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
750464	contig_17066_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_130949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATATTTGAACCACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122910	125038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_122900_125000
750467	contig_11896_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_88036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAATACTCGTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158038	158741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_158101_158247
750468	contig_7333_pilon	+	1430	11	Intergenic	novelGene_142781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_5	128.772046656097	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	548	967	223622	225101	TRUE	40	TTATTTATAAACCACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPRPLESKLQTVEMAWRHQTF	218358	237385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_221833_221916_222679_222777_223598_223676_224012_224321_225043_225167_230329_230391_236788_236836_237095
750469	contig_9468_pilon	+	1284	10	Intergenic	novelGene_59499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	294.900652867586	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	91	978	347212	356943	FALSE	5	CTTAGTCTTTTTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGDSEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEERKQNKLEAKLRAKQEQEEKQKLAEDAEMKSLEEKMGCLLKFSGDLDDQTCREDLHNLFSNHGEIKWIDFVRGAKEGVILFKEKAKEALDKAKDASNGNLQLRNKEVTWEVLEGEVEKAALKKIMEDQQESLNKWKSKGRKFKGKGKGNKVTQAGSAKGKVQFQGKKTKFDSDNECDENGAAGSVKRAREETDREEPASKQQKTENGSGDQ	345201	357249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_345271_347190_347278_350685_350790_350872_350956_354735_354779_355112_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
750475	contig_18869_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_56031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73544	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
750477	contig_5791_pilon	+	1247	2	Intergenic	novelGene_35840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGAGTTTCAAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043674	1044979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1043682_1043739
750479	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750480	SIRV5	+	375	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7586	1	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
750481	SIRV6	+	517	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1604_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750486	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4430	35	3255	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
750488	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750489	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_18391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
750491	contig_12624_pilon	-	786	2	Intergenic	novelGene_61107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948399	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947964_948095
750494	contig_5236_pilon	+	2277	10	Intergenic	novelGene_100970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	11.4708433392484	46	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	48	1022	1012119	1018466	TRUE	5	CAGTCTTCTGCCCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSRVQRAEVPLGGAMLRKALQLSSCRRLSARGLSTRRGGSTLDWGGKVSEIKKKIRSVLPGGTWDLPYDTSHLPPEHADVVIVGGGVIGLSVAYWLKRLETQRGAIRVLVVERDHTYRQASTGLSVGGIRQQFSCPENIRLSLFSASFLRNINDYLAVVDDPPLDLQFNPSGYLLLASEKGAAVMESNVKVQRQEGAKVCLLSPEQLRSKFPWINTEGVALASYGLENEGWFDPWCLLQGLRRKVQSMGVLFCQGEVTRFISSSAHMENASGEEVTLKRIREVHVKMDHSLEYQPVECAVVINAAGAWSGQIAELAGIGNGPPGTLQGTKLPVELRKR	1012071	1020241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1012204_1014480_1014702_1015572_1015684_1015933_1016053_1017227_1017323_1017623_1017726_1018054_1018132_1018301_1019118_1019454_1019714_1019896
750495	contig_12644_pilon	+	1031	9	Intergenic	novelGene_44669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5708.35543167864	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	33	1031	2675526	2680521	FALSE	40	GAAGAAAAGAAGCCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTT	2675493	2680521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677347_2678084_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679570_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
750497	SIRV4	-	318	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	3	1200	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750500	contig_5816_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_158257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAAAACCAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317536	318655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_317500_318700
750502	contig_6710_pilon	+	518	2	Intergenic	novelGene_97734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653397	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
750512	contig_12864_pilon	-	1246	6	Intergenic	novelGene_76429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	500.798402553363	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	160	651	251873	242831	FALSE	20	AAAGAGTTGCTGCCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252145	242235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_251863_251999_252111
750516	contig_8616_pilon	+	3114	8	Intergenic	novelGene_72537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	12.1873135778521	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	1475	3076	421424	424565	FALSE	35	ATACAAATGCACTCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	409588	424603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_409758_412103_412295_419168_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
750518	contig_15360_pilon	-	2461	7	Intergenic	novelGene_171259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	10.816653826392	83	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	14	886	516512	163688	FALSE	20	TGACCTGGACTGTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQVMLAASYWSLLAPAVEMAMSSGGFGAFAFFPVAVGFTLGAAFVYLADLLMPHLGAAEDPQTALALNLDPQLVKKKSDPEGPALLFPASELSIRIGRAGLLSDKSENGEAYQRRRVTGLPGDPVPPVPSRGNPVQPEGGSWRRIALLILAITIHNVPEGLAVGVGFGAIEKTASATFESARNLAIGIGIQNFPEGLAVSLPLRGAGLSTWRAFWYGQLSGMVEPLAGIFGAFAVVLAEPILPYALAFAAGAMVYVVMDDIIPEAQTSGNGKLASWASILGFVVMMSLDVGLG	516525	162112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_163767_165146_165306_168912_169012_237670_237741_317316_317482_437157_437303_516356
750527	contig_6760_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_150794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGGGAAATATTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170679	168341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_168300_170700
750530	contig_9871_pilon	-	2141	8	Intergenic	novelGene_75717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGGTCCATCGGGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612573	597953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_598143_602106_602292_603273_603394_606549_606662_608255_608411_609135_609278_610794_610911_611451
750532	contig_20739_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_83171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGGGGGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116049	114831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_114800_116000
750533	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750534	contig_16492_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_100305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTGAGTGGAAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159136	159474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_159100_159500
750535	contig_16492_pilon	+	1907	3	Intergenic	novelGene_100306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	25.5	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACCAAATGCAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159681	166615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_160182_164830_166136_166513
750536	contig_10339_pilon	+	2054	3	Intergenic	novelGene_125265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_1	25	656	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	167	1240	328740	329813	FALSE	50	GGAATAAATACGTATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCGEIDHSINMLPTNRKTNESCSNTAPSLTVPECAICLQTCVHPVSLPCKHVFCYLCVKGASWLGKRCALCRQEIPEDFLDKPTLLSPEELKAASRGNGEYAWYYEGRNGWWQYDERTSRELEDAFSKGKKSTEMLIAGFLYVADLENMVQYRRNEHGRRRKIKRDIIDIPKKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292275	330627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292335_308602_308709_328738
750537	contig_7151_pilon	-	960	6	Intergenic	novelGene_40799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	896.75847361483	212	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	277	825	551063	529905	FALSE	35	CAATTATAATCTTGTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVYRMKS	551339	529769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529924_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996
750541	contig_13215_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_145877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACTTAATGTATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19860	21038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_19900_21000
750542	contig_3077_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_26843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655840	656662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_655800_656700
750544	contig_12566_pilon	+	1816	6	Intergenic	novelGene_86020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_5	59.3498104462011	495	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	22	651	128423	342884	TRUE	25	AAAGCCTGGCAGATTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAAAAVMKAVVQRVTRATVTVGGEQISAIGRGLCVLLGVSLEDTHKELEHMVRKILNLRVFEDESGKHWSKSVMDKQYEVLCVSQFTLQCVLKGNKPDFHLAMPTEQAEGFYNSFLEQLRKAYRPELIKDGKFGAYMQVHIQNDGPVTIELESPATSAATSDPKQLSKLEKQQQRKEKTRAKGPSESSKERNVPRKEDRSASSGAEGDVSSEREP	128401	372814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_128466_139078_139170_142368_142605_195781_195889_342731_342907_371671
750548	contig_5566_pilon	-	773	5	Intergenic	novelGene_153672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_4	16.3324829710611	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	62	541	212904	201466	FALSE	45	TAAGGTGGAAAAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGESTSAVLSGFVLGALAFQHLNTDSDTEGFLLGEVKGEAKNSITDSQMDDVEVVYTIEIQKYIPCYQLFSFYNSLGEVNEQALKKILSSVKKNVVGWYKFRRHSDQIMTFRERLLHKNLRKHLSNQELLFLLLTPSITTESCSTHRLEHALHKPQEG	212965	201233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_201664_203509_203577_207285_207323_209857_209949_212817
750549	contig_11386_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_82823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTCTCTTTCTGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179088	179381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_179100_179400
750550	contig_14513_pilon	-	912	5	Intergenic	novelGene_70383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	TRUE	45	AAAAACATTAGAACTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11559_11930_12158_13087_13136_14952_15001_18735
750551	SIRV6	-	446	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9457	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
750553	contig_6533_pilon	+	1955	6	Intergenic	novelGene_114638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	46.1215784638817	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	75	449	113801	148638	FALSE	35	TCAGAGGACAACCTTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVDLCLSSEGTEVILATSSDEKHPPENIIDGNPETFWTTTGMFPQEFIICFHKHVRIEKLVIQSYFVRTLRIEKSTSKEPVDFEQWIERDLVHTEGRLQNEEIAVASARTVHLYSKWFLILQ	103173	150144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_103233_113785_113899_125966_126074_127313_127383_141030_141075_148581
750554	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	520	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750557	contig_7816_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_66573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	502	843	608661	609002	NA	40	AAAGAAACCCATCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGPDCSVWQAVKPGTLGPPSDGPACPPGRGASLGKAFSAHLPPESRLRGAVTSNCAVRGGSARVGTCVAGEGRQVPLARGIGLHLGPCIGSTLISLSASPPPPLPPHPTAA	608159	610697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_608200_610700
750558	contig_12050_pilon	+	1474	11	Intergenic	novelGene_62636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_6	221.219370761242	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	22	534	357478	362088	TRUE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAERAVLEEEFRWLLHDEVHAVLRQLQDILKEASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKPRPGSQQNLPAGGNSRPGPAGHAAVCSTLSPS	357456	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360847_361989_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363046_363410
750566	contig_2069_pilon	-	1757	8	Intergenic	novelGene_23333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	38.7535383506316	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	335	658	590815	588147	FALSE	10	CAGATGGTGCCCTGTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVRDLSTEAGVIMDGPTEDQRALGPS	595468	587047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_588164_588421_588478_588940_589072_589149_589247_590792_590825_591806_591957_592127_592213_595378
750568	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
750569	contig_8693_pilon	+	1740	4	Intergenic	novelGene_150854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	12.3917535302941	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	114	473	1055936	1069118	FALSE	30	ATTACATGGACCTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFDGVSLEEDGQHTIENRGLGCQGRWKSGEVHWLKPWMWVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGA	1055822	1070385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1055942_1056608_1056852_1061608_1061717_1069115
750570	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
750573	contig_4732_pilon	+	1302	6	Intergenic	novelGene_75418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	331.368918276896	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	64	720	596758	608641	TRUE	35	ATCCAACTTCCTGGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRIVSQKQIADRAAHDESPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL	596694	609473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607378_607825_607907_608495_608667_608916
750576	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	0	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750584	SIRV1	-	246	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3057	149	2783	-149	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACGATGAATATCTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7583	6598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6814_7552
750586	contig_13305_pilon	-	1881	3	Intergenic	novelGene_146789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	616	921	266844	266539	TRUE	65	GACTGACGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAEEPLEWSWSSPLTGRFPTLLRSWWPAAPPAKVGPFSWEASGSAFFSSGGVWLAGAGLGLVVEEVVGGAGVDVVTEVVRAGVVGWEAVIRTRGGIRGAK	267459	264492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_265145_265438_265601_266392
750589	contig_2636_pilon	-	1305	2	Intergenic	novelGene_52078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63366	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471
750590	contig_5260_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_144390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCGGTTTCCCAATATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417658	418287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_417700_418300
750592	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	51	502	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
750593	SIRV6	+	504	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3152_10724_10819_11031_11109_11205
750598	SIRV6	+	216	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	514	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
750600	contig_4732_pilon	+	1741	15	Intergenic	novelGene_75434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	621.524261926488	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	394	1593	653092	675284	FALSE	15	GATTCCATTTGACTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634965	675432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_672214_672451_672855_673018_673616_673669_675120
750605	contig_1267_pilon	-	2815	1	Intergenic	novelGene_74464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACAGCCAATACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33187	30372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1267_pilon_-_30400_33200
750606	contig_9290_pilon	-	1494	6	Intergenic	novelGene_77559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	384.866418384353	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	105	587	496936	486174	FALSE	70	CCCCAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVKPSSRRWWLMQ	497040	485266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_486211_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491545_496930
750613	contig_7945_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_161601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1083	1484	388861	389262	NA	20	CTTACCACAGTGTGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFYPFKIWCMGVNSLVYSLCIGHLPWHGCWGQQDEQAHRGFMVQGAWRGGGDELKENTSKDRICREIVSVRRSIQDCGGGSVWVLFCIWWPGQGSQAETRRDYENKSLDVWWKRVVGQGNGKDPEARTGLGV	387778	390268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_387800_390300
750614	contig_1146_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_84797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCCTTTGACATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192407	190681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_190700_192400
750619	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_93558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
750620	contig_13760_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_61334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGTTAAGAAATTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321262	321487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_321300_321500
750621	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_93999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
750622	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750625	contig_4083_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_152342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGATGATGATACTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324318	325659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_324300_325700
750627	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	352	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
750630	contig_6589_pilon	-	1219	2	Intergenic	novelGene_26280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2273441	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272084_2272233
750633	contig_8587_pilon	+	1583	7	Intergenic	novelGene_159121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	77.4655837560569	341	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	178	831	192323	205226	FALSE	30	GGTAAATCAAGTCTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLRRDRDPRGLSDPGPPEPWGADVQIFAPDTPQMHVVDHTKGQPSEGDTRNVLIESARIARGKIADLAQLRAADHDAAIFPGGFGAAKNLSTFAVDGKDCKVNRDVERVLKEFHSAGKPIGLCCIAPVLAARVLRGVEVTVGHEQEEGGKWPYAGTAEAIRALGAKHCVKDVTEVHVDQKNKVVTTPAFMCETALHHIHDGIGAMVRKVLELARK	192002	205978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_192169_192311_192365_194615_194729_195766_195887_200395_200489_203901_204058_205096
750634	contig_9345_pilon	-	1438	12	Intergenic	novelGene_24516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	316.725133068652	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	31	615	671829	669468	TRUE	35	ATCCTCAGCTCAAGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKTITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKDRVRDVFEAKARHGFCGIPITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEVSATGRAHSQVKVAHCK	671859	667212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667255_667334_667479_667585_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_670129_670369_670722_670798_670910_671013_671225_671275_671731
750635	contig_15105_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_150960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAAGAGCCCCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447026	445510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_445500_447000
750637	contig_15039_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_110155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGAACAGTTATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209301	206481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_206500_209300
750638	contig_9177_pilon	-	2285	14	Intergenic	novelGene_32566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1076.89109842631	1	117	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	225	1238	7310	3244	TRUE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRFRRQMSP	7716	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3269_3387_3500_3697_3804_4286_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7410_7591
750639	contig_8045_pilon	+	1325	4	Intergenic	novelGene_35346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1519.34218221791	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116036	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117368_118075_118243_118527
750640	contig_6048_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_73202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	414	962	1501104	1501652	NA	60	AAAAAAGCCAACATAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWEKDPCLGPPLIPVISQSAWSPRAGPHQLRPHEVAHVGLPWKEKAICRSFCPSSCCLPPEQNSADSSLKVAQTRRAVMCLRWMACCHWCRAAPESTSRDRRGKGMATSTSWHRTDLLKATTPSTKGSREPGGAGQSSRLPGASWVMDSTVEESRLRLTSRSPHSQASSRWGSMAEPRSGQ	1500690	1502825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1500700_1502800
750647	contig_5423_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_85284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	360	695	564636	564301	NA	20	CCTATGTTTACATTCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLQSPWCQTSRKAGAGSGNGIVCLSIGLGLLLVIKLFIFSLCTVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGRRSITNVLCAQFIA	564995	563536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_563500_565000
750652	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8115	14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
750655	SIRV6	+	575	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
750656	contig_11115_pilon	+	2054	15	Intergenic	novelGene_102793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	142.855428561143	1	54	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	64	696	150592	154376	TRUE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKVLDPSHHDIALAFYEVASLMSQVSHVHLAFVHGVCVHGSENILVTEYVEHGPLDVWLRREKGHVPVAWKVAVAQQLEDKNLVHGNVCGRNILLARPGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGTLSREERVERIPWMAPECLPGGANSLSTAADKWGFGATLLEICFDGEAPLQGRGPSEKERFYQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPILLMSQL	150447	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_150487_150567_150656_151655_151763_152659_152796_152878_153034_153729_153877_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967_158250_158309
750660	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_97142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
750661	contig_14925_pilon	-	752	4	Intergenic	novelGene_55118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75484	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_75422
750662	scaffold_880_pilon	+	682	2	Intergenic	novelGene_121520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCTAAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577721	579540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_577853_578989
750663	contig_17603_pilon	-	1351	1	Intergenic	novelGene_152778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGCAGGAAAGTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35584	34233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_34200_35600
750665	contig_12864_pilon	-	1102	8	Intergenic	novelGene_76428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	735.152434560899	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	191	700	251873	242831	TRUE	10	AGAGTTGCTGCCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252179	242233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242489_242683_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251996_252111
750666	contig_5419_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_15521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAGAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252258	254351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_252300_254400
750672	contig_4232_pilon	-	1729	7	Intergenic	novelGene_63475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	419.518937461575	31	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1115	1684	614173	607794	FALSE	10	GATCTCTGCTGGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGSSVFCLVALTLSSWGQSIPGYPEVAASLGHRQALIYCCSGVEVLVLFFFFFL	620492	607748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_607954_612043_612075_613618_613698_613873_614983_615283_615392_615783_615945_620456
750680	SIRV6	+	378	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	407	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
750681	contig_11338_pilon	+	478	4	Intergenic	novelGene_6160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.772053159179	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	2	478	747	13374	FALSE	10	TCGCTGTCCTTGAGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEVTSSSSSPQTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQSPGTRHGSVTWLNSSTSRRSKSLRFF	745	13374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6222_6327_13296
750682	contig_10990_pilon	-	1369	12	Intergenic	novelGene_7493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	68	334	736241	731953	TRUE	55	GGGTTATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWTCPIAPSEIWKLELFFDVLSMLVSGASTFFPSLWARLRFNGGSLSPPTETFRFPSLSVRLNLTNGSSPCLLDRVTVLTTVRTFSFSGPGTGWGWNHLASWIFPSFSLI	738930	715671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715753_715792_715994_722232_722432_723510_723636_729698_729796_731217_731421_731549_731668_731941_731997_733057_733137_733942_734004_736158_736261_738882
750683	contig_14184_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_66604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	118	315	120885	121082	NA	20	TGGGGACTCGGGGTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGHVIRKDQFLEKDIRDWRRTCYQEGPVPGEGHQGLEKDMLSGGTSPRRTGYQEGPVPGELVNLRVKRGRSSTRWTDSVCTNGLKHTHYCEDGARLGDISFCCT	120767	122230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_120800_122200
750684	contig_5640_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_27251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97920	96632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_96600_97900
750690	contig_15304_pilon	-	1253	2	Intergenic	novelGene_30430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	197	391	54100	53906	TRUE	10	TTTTCCATCCAGCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGQRARLDRAWRPRSHPSHAWEERQWTGE	54296	52871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
750692	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	54	515	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
750693	contig_7963_pilon	+	1571	2	Intergenic	novelGene_58301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAATGGCATTTGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38326	40260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38872_39234
750701	contig_13224_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_104096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	960	1334	252435	252809	NA	70	AACACCAAAAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTSFSWLIPPVTHMLKGQGEQGKRERAQKVFIPRHEGMRGRDHNCHSGKHFSLFSQGKEVALKTWLDEATETLNSFILSSLVSTPLSCLLAFLQTACFLLANVNTDAQIELISSFPCCVLCT	251475	254157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_251500_254200
750703	contig_3866_pilon	+	2388	1	Intergenic	novelGene_112381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACACAAATTTTGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118333	120721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_118300_120700
750704	contig_12250_pilon	+	1630	9	Intergenic	novelGene_80676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_6	275.370091876369	26	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1101	1589	393102	394948	FALSE	10	GATTACTTCTGGTGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQEKVLERVNAVKTKVEAFQTTISKYFSERGDAVAKASKETHVMDYRALVHERDEAAYRELRAMVLDLRTFYAELYHIISSNLEKIVNPKGEEKPSMY	391593	394989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392998_393101_393133_393218_393317_393885_393955_394108_394177_394326_394382_394687_394775_394867
750707	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
750708	contig_593_pilon	-	2249	4	Intergenic	novelGene_101971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	68.6650485246234	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	3	479	116172	110585	FALSE	20	ACTCATTGTGTTGCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGIEPDREKGFHLDVEDYLSGVLILASELSRLSVNSVTAGDYSRPLHISTFINELDSGFRLLNLKNDSLRKRYDGLKYDVKKVEEVVYDLSIRGFNKETAAACVDK	116174	108814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_110819_113012_113093_113732_113849_116125
750710	contig_10765_pilon	+	2154	2	Intergenic	novelGene_122874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30758	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_32541_34727
750711	contig_4364_pilon	-	1787	15	Intergenic	novelGene_28	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	71.5979420522856	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	132	797	317110	311127	TRUE	15	CATTTGTGTGTTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAVLALAALCGEYYLKEPGEADPAVVDALIRQYLAELQSPEEMTRCGFALALGALPSFFLKGRLQQVLAGLRAVTHISPKDVSFAEARRDSLRAIARICQTVGVSAGGVPDKVLCEANVPQIYSTLLDCMNDYTTDSRGDIGACVREAAMTSLMELTLLLGRSQPQLIGASVCERVLCYVAQQASEKIDRVRAHAGNVLLTLLHFDSPPLPHVPHREELEQIFPRSDVATMNWNSPLPCAAGAGRVRWWPDGVHGQVFDAEPV	320307	283040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_313950_313999_314033_314111_314271_314370_314455_315013_315155_315840_315933_317038_317158_320223
750714	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750715	contig_9197_pilon	+	1117	2	Intergenic	novelGene_154356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGAAAGTGTGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52406	93166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_92373
750718	contig_16970_pilon	+	2833	7	Intergenic	novelGene_157606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	91.9250902758448	35	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	719	1972	124383	166536	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPEDVASEVYHGPDLECTVGHLLPGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCRAPCISCTPDGWVLVSWESPESSGADISEYRLEWGEDEDSLELVYHGTETCFEIRDLLPAAQYCCRLQAVNQAGAGPYSELVHCQTPASAPDPVSTLCVLEEETISAYPDSPSVCLLLNWEEPCNNGSEILAYNIDLGDTSITVGNTTTHVIKDLLPETTYRIRIQAINEIGAGPFSQFIKAKTRPLPPLPPRLECAAAGPQSLKLKWGDSNSRTHAADDTVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRLTEFTCYSFRIQAASDAGEGPFSETYTFSTTKSIPPTIKAPRVTQLEGNACEILWETVPPMKGDPVNYILQVLVGRESEYKQVRASVHADVWLPRVCWLHASVHCHE	123664	167397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_124506_126914_127029_127368_127519_132526_132808_144813_145027_162197_162365_166330
750719	contig_1143_pilon	+	2023	24	Intergenic	novelGene_86569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1233	1532	164063	183538	TRUE	10	CACTGCCCCGCTGGCGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSTRTNKGLWKLNWPAPSVSPVKRLFLASLRFSRSFLSSFTATISAAVPLEHLIIGTAPIVTKKQKRLSTIVSITVSISVSVISGLLMARYETSSLF	85745	201053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_85934_88855_88927_91083_91147_93803_93841_96114_96165_99346_99404_114892_114962_119307_119388_121381_121454_135918_136018_147614_147701_148392_148459_149196_149289_153483_153628_164004_164104_166939_167024_176517_176578_178069_178156_183509_183596_185117_185242_192033_192130_194016_194102_196862_196936_200997
750724	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	3	414	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1177	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750725	SIRV4	-	351	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1172	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3986	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
750727	SIRV6	-	512	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1173_1597_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
750728	contig_11258_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_67803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	288622	288996	NA	65	AGAAAATTAAGAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTPSLNPGRIHSQLLVLWQEPQPQHLDYLPCPLPLAHSWFALPQRVVWGHLWPYLCTSATIALFTLDHLPPCLPPPPVCVLLKVRDCDSREDSAYLLNPGLFNIFSHNGPQASCRHLSPLPSE	288621	289648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_288600_289600
750730	contig_1154_pilon	-	2168	6	Intergenic	novelGene_87192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	57.930993431841	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	296	736	1062369	1059759	FALSE	20	TATACTTAGTTTTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTKGSFTYSSGEEYRGEWKEGRRHGFGQLIFADGGTYLGHFENGLFNGFGVLTFSDGSRYEGEFAQGKFNGVGVFIRQDNMTFEGEFKNGRVDGFGLLTFPDGSHGIPRNEGLFENNKLLRREKCSAVVQRAQSASKSARNLTA	1069372	1058326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1059908_1060161_1060272_1060698_1060814_1062302_1062401_1063951_1064058_1069214
750733	contig_18251_pilon	+	1217	6	Intergenic	novelGene_50170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	97.4543995928352	2629	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	476	1153	110201	119066	FALSE	30	TCACGAGCCATCAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEDGYVALNIKTRRPAFTSVDPASSSLWRVMALVLLILCMGMVVGLVALGIMTVMQQNLLQAENENLSGTVQQLAKRFCQDLIKKSKEEAHKCSPCDTNWRYYGDSCYGFFKHNLTWEESKQYCTGMNATLPKIASQNILEYIKARTGLIRWIGLSRQNSNGVWTWEDGSVFSKNLFELPGDGNPNMKCAYFHHGKIHPSSCKNRHYLVCERKAGMAKVDELL	109725	119130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_110265_110917_111017_112045_112157_112324_112477_116797_116905_118921
750735	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
750739	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657513	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKPVSAEGPKWTSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657467
750741	contig_12119_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_88698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTATTGTCTATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431464	433256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_431500_433300
750742	contig_10734_pilon	-	1567	10	Intergenic	novelGene_51436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	84.5826354651014	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	77	844	2226326	2216993	FALSE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLLRNHTAVPPSHPALQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2226402	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2222925_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
750745	contig_854_pilon	+	1336	6	Intergenic	novelGene_36250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2947.50276675019	2	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	105	899	543600	563353	FALSE	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDRCLFPFQVALQPSQPDGSDPPGLLRKARWCPSWPRSPLPVVFFSSWLQSLVDVFFVLEAGVNLQALRPNPLCSRLPRGKKGSPRIQYATLMLLQSLLAASCGSIYPFTLVPPSA	543495	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_563006
750748	contig_19564_pilon	-	1246	5	Intergenic	novelGene_29640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	638	1075	12638	12201	FALSE	10	TTGTTTGTTGAATGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15682	12029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12728_13140_13259_13554_13666_13945_14055_15472
750749	contig_7202_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_17579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGTTGTCTTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
750750	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
750753	contig_4114_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_15629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTCTGCGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471934	471337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_471300_471900
750756	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
750761	contig_2114_pilon	+	544	2	Intergenic	novelGene_104329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	0	171	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	25	543	1172544	1176924	FALSE	35	AGGGTGATGATGCAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPETVRLRLQFDYPPPVTPDCTVFWLLVDLSRCRVVTDLISLVRQRFGFSSGAFLGLYLDGGLLPPGESARLVRDNDCLRVKLEESGVTESSLIASNGDSTTVLPRKTKKRAFKLEEDEEDELGYKYSRKHWKKQENNNNNEKTLDLEPKAVIDQNVRKKNKRKNKATCEV	1172519	1176925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1172789_1176650
750762	contig_2114_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_104331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTAAACTTACATGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184873	1185616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1184900_1185600
750763	contig_3410_pilon	-	1662	11	Intergenic	novelGene_58914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	473.261333725881	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	109	1320	57649	14034	FALSE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSIPST	57757	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14047_15588_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
750764	contig_7271_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_159948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGGGTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440957	441254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_441000_441300
750768	contig_14755_pilon	-	2204	14	Intergenic	novelGene_129399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	98.0603002504433	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	2	1864	1047882	972909	FALSE	35	CTTTTTTCCAAAATCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEENTTKVTEKPPFDRSNSQYSLDELSMEDYWTELENIKKSSENRQEDQEVVVVKEPDEGELEEEWLKEAGLSNLFGESAGDSQESMVFLSTLTRTQAAAVQKRVETVSQTLRKKNKQYQIPDVRDIFAQQIESKEKAPDGTESQSVRTNENKHQGEDDQASSFLVDKKELSPLVPEEPTASETDINLEVSFAEQAVNQKESSKDRTQKSKGNDAQLPNFRLPKDKTGTTRIGDLAPQDMKKVCHLALIELTALYDVLGVELKQQKAVKIKTKDSGLFGVPLTVLLEQDQRKVPGTRIPLIFQKLISQIEEGGLETEGLLRIPGAAVRIKNLCQELEAKFYEGIFNWESVKQHDAASLLKLFIRELPQPLLSAEYLKAFQAVQDLPTKKQQLQALNLLVILLPDANRDTLKALLEFLQRVIDNKEKNKMTIMNVAMVMAPNLFMCHALGLKSSEQREFVMAAGTANIMHLLIKYQKLLWTIPKFIVNQVRKQNTENHKKDKKAMKKLLKKMAYDREKYEKQDKNPNDADVPQGVIRVQAPHLSKVSMAIQLTEELKASDVLARFLSQESGVAQTLKKGEVFLYEIGGNIGERCLDDDTYMKDLYQLNPNAEWVIKSKPS	1047883	972568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_973001_974423_974486_978243_978369_990236_990378_991781_991989_996958_997042_998652_998813_1003320_1003399_1009356_1009449_1011606_1011773_1030734_1030914_1037715_1037780_1044547_1044784_1047704
750769	contig_5071_pilon	-	1509	7	Intergenic	novelGene_171278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	23.8024275139229	557	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	117	1091	307799	159068	FALSE	20	GTTTGGATTCAGATAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLAERRQKQKWAVDPRNTAWSNDDSKFGQRMLEKMGWSKGKGLGAQEQGATDHVKVQVKNNHLGFGATVNNEDNWIAHQDDFNQLLAELNTCHGQEATDSSDNKEKKSFNLEEKSKISKNRVHYRKFMKGKDLSSQSKTDLDCIFGRRQNKKTSEDNSSPTTPDENETSITTTSALTIQEYFAKRLAELRNKPQIAPTDPDFSGALNEWKRGKKRSKEAKDKNLENNMQPKKEKPQEQEENPKCAVKKKREQVEQQLGDPCCEENSESSAENGEDCGWPPDDQDFTPKSKKKKEKKKIKKQVEAAVNPMLGETPVKKKKSSK	307915	158649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_159572_251079_251157_258097_258191_293754_293834_295391_295485_303075_303186_307780
750780	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750787	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750788	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750794	SIRV6	+	266	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8451	-1	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
750798	contig_10424_pilon	-	3245	3	Intergenic	novelGene_56811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_1	58.5	35	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2221	2535	313508	312261	FALSE	35	TACCCCAGAAGTCGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEE	315728	311550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_312429_312506_312574_313428
750799	contig_17549_pilon	+	2355	4	Intergenic	novelGene_162604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACATATGAGTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326058	448878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_+_327989_374903_375027_436355_436506_448726
750800	contig_7079_pilon	+	2669	6	Intergenic	novelGene_129247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.78273291792038	95	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	24	1262	355057	367175	FALSE	30	AACCAAGATGTGGGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENLKGCSVCCKSSWNQLQDLCRLAKLSCPSLGISKRNLYDFEVEYLCDYKKIREQEYYLVKWRGYPDSESTWEPRQNLKCVRILKQFHKDLERELLRRHHRSKPPRHLDPSLANYLVQKAKQRRALRRWEQELNAKRSHLGRITVENEVDLDGPPRAFVYINEYRVGEGITLNQVAVGCECQDCLWAPAGGCCPGASLHKFAYNDQGQVRLRAGLPIYECNSRCRCGYDCPNRVVQKGIRYDLCIFRTDDGRGWGVRTLEKIRKNSFVMEYVGEIITSEEAERRGQIYDRQGATYLFDLDYVEDVYTVDAAYYGNISHFVNHSCDPNLQVYNVFIDNLDERLPRIAFFATRTIRAGEELTFDYNMQVDPVDMESTRMDSNFGLAGLPGSPKKRVRIECKCGTESCRKYLF	355033	368582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_355076_357231_357378_358598_359262_365915_366063_366147_366278_367041
750808	contig_15668_pilon	-	1735	2	Intergenic	novelGene_169626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	280	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1074	1406	73121	72021	FALSE	20	TTGTGACCATGAATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELATIFESIQKDSSSTNLESMDTS	74194	71691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_72246_73013
750811	SIRV6	+	539	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750816	SIRV6	+	246	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8471	-1	268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
750820	SIRV4	+	323	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	659	966	-27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACATAAGTCAATAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
750822	contig_13224_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_104118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGGCTCCTGCCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321645	318887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_318900_321600
750828	contig_7593_pilon	+	1676	2	Intergenic	novelGene_127294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGTAAAAATACCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174060	176211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_175453_175927
750830	contig_6710_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_98045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750833	contig_5684_pilon	+	1700	2	Intergenic	novelGene_80985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGCCAGTGTGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37220	39297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_38665_39041
750837	contig_1225_pilon	+	2230	4	Intergenic	novelGene_44109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	597.993496805962	3	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	203	568	147032	148934	FALSE	20	GTCTTGCATTGGCGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	134406	150596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_134500_143612_143698_147007_147173_148709
750838	contig_3602_pilon	-	1470	9	Intergenic	novelGene_60643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	377.4251374445	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	132	668	1123679	1110827	TRUE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKVSPAST	1139429	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1110781_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123715_1139333
750839	contig_2480_pilon	+	1818	8	Intergenic	novelGene_63538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	53.2161552883471	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	69	1133	254349	271963	FALSE	70	AATTTAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGTICNPGPRKSMSKLLYIRLALFLPEVVWASLGAAWIQGVECDRTVVNGIIATVVVSWIIIASTVITIIIVFDPLGGKMAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKVEAPGLWSGVFHEGETPRGQEFPTLDLSH	254280	272648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_254356_261836_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795
750848	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
750854	contig_10050_pilon	+	2061	2	Intergenic	novelGene_119619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	126	1517	195337	300728	FALSE	15	AGATGTCCTTCACCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSFLLPPQCLSSAEVQNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRGRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTQQDDLGDGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLPSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPMQTLQDSKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQSNSRVLGQNVMMGPNSVMPTYGSQVPHNKMMTPNSHTHPGHAQQTSAVNGRALPHAVSTMPHTSGLNRLTPGKTPLQVPLPPPMQMNALGGYSSVSSCHGYGRMGVLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDSVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG	195211	301272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_195391_299390
750864	contig_5649_pilon	-	2108	3	Intergenic	novelGene_82392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	36	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	781	1239	1146909	1146451	FALSE	10	CCTGCTTTTGTTCCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIGLPVLQTHAIHFHFGAFAWSIPDTQNALPIISICPTPPALQGIAQPKQPVIKFHFFNFPWPFAHLNSPDHHLPRILRIWGLVLQPHWLNQASQLGNSCLCASSTEHRAWLKGRAQQVAVEWNSKSNVLPPSLSKIQTRGHLERGQLGQL	1190256	1145581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1147354_1149612_1149737_1190044
750865	scaffold_13505_pilon	-	898	6	Intergenic	novelGene_111433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.064135738846	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	23	730	535595	530806	FALSE	25	TTAGCAGGACTCATGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRLLPPMPPGSQHLDPAQDGCSSLFPLSCLHCLYTP	535617	530637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_530912_531119_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
750866	contig_15327_pilon	-	1202	9	Intergenic	novelGene_70730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.636479911511	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	23	817	967479	960518	TRUE	20	CCTTGATCTGTTTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTNQPPPPPYYPPRRQEDPVDP	967501	959521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_959598_960208_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
750872	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750875	contig_10324_pilon	+	1432	2	Intergenic	novelGene_7887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	738	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGCACACCGAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569168	570739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_569243_569381
750876	contig_11106_pilon	-	2748	1	Intergenic	novelGene_167446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119373	116625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_116600_119400
750880	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
750882	contig_11986_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_69136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGAGGGGTAAAAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190332	190987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_190300_191000
750887	SIRV6	+	323	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1658	26	-241	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2782	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750889	contig_14300_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_133126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGAGAAATGATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380005	379548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_379500_380000
750892	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
750893	contig_6760_pilon	+	2698	1	Intergenic	novelGene_150793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTAACTATTTGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168009	170707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_168000_170700
750895	contig_12078_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_74135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAATAAAGTGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726497	727722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_726500_727700
750899	contig_16045_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_130856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGATAAAGATTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14088	12649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_12600_14100
750900	contig_14133_pilon	-	647	6	Intergenic	novelGene_119944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1651.42430647002	75	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209451	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208368_208637_208728_209012_209131_209421
750901	contig_8284_pilon	+	1085	9	Intergenic	novelGene_125692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	362.549306991477	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	330	815	441556	461340	FALSE	15	TTAAGCTATCGGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425048	461610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431897_431956_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
750902	contig_1143_pilon	-	1641	15	Intergenic	novelGene_86590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	236.959233986415	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	19	1413	201037	135842	FALSE	40	AGATTCAAAATGAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFSFQRPLLVLVDRNIDLATPLHHTWTYQALVHDVLDFHLNRVNLEESSGVENSPAGARPKRKNKKSYDLTPVDKFWQKHKGSPFPEVAESVQQELESYRAQEDEVKRLKSIMGLEGEDEGAISMLSDNTAKLTSAVSSLPELLEKKRLIDLHTNVATAVLEHIKARKLDVYFEYEEKIMSKTTLDKSLLDIISDPDGMYHKFEVSGSFTSDASSIFNLSKI	201055	135613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_136016_147612_147695_148385_148460_149197_149289_153483_153624_164001_164102_166937_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
750903	contig_1143_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_86589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCCCAATTGGAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135395	135152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_135200_135400
750905	contig_8322_pilon	-	1858	11	Intergenic	novelGene_143277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	25.1944438319245	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	28	1494	569032	541539	TRUE	10	TCTCTCTTGCTTTGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGTAPPNSFYRALYPKIIRDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR	569059	538779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_539113_541507_541701_551795_551875_554777_554889_556241_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560072_565004_565192_568827
750908	contig_7091_pilon	-	1274	7	Intergenic	novelGene_131786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACTGGCACTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435623	415542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_415661_417080_417229_420792_420943_421226_421314_423934_424008_431519_431685_435090
750909	SIRV4	-	814	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15121	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13923_14968
750911	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-9	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750914	contig_12427_pilon	-	1628	4	Intergenic	novelGene_40567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_3	58.6420402858639	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	221	697	522337	510320	FALSE	30	TCCCATGTTCCAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVSAKDSGNQKQCKGLRTYPAEGHGY	578172	509388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_510617_520312_520440_522284_522346_577960
750917	contig_17522_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_160813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1533	1832	92852	93151	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSRYIGATISYLKAPSYYYRKHTENNLPSSKGVPSGLKTRKFLIKIKFLILLFPDLQKWEGLPPTGKEGLILMVCEIFRILLNTILTLDFHRYRHKG	91319	93553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_91300_93600
750920	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750921	contig_12250_pilon	+	1867	16	Intergenic	novelGene_80553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_9	67.8060633145902	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	212	1279	272853	276000	TRUE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWAARKAGAGTWPWMSSYSGVSCRWRSLRCYSPNLNPVRSCRSWSLRTNGACSPSSC	272492	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
750922	contig_6710_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_94367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
750926	contig_14691_pilon	-	1070	2	Intergenic	novelGene_146794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30659	23654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_24213_30147
750927	contig_14445_pilon	-	515	4	Intergenic	novelGene_137349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	797	junction_3	799.991805513587	1392	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	4	339	250641	244339	FALSE	20	CTGAATTCACTTACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASRPAVAASGRWLKGIRKWYYNAAGFNKLGLMRDDTIYEDEDVKEAIRRLPENLYNDRMFRIKRALDLTMRQQILPKEQWTKYEEDKFYLEPYLKEVIRERKEREEWAKR	250644	244162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_244417_244998_245166_245995_246068_250622
750928	contig_13528_pilon	-	1756	11	Intergenic	novelGene_66875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	201.592683398977	1	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	210	1253	67895	45849	TRUE	20	GCTTGCTGTTCCCAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKEMFEDTVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNTTSKPSHLVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLR	68104	39934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_45807_45930_46533_46612_46739_46867_47595_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67099_67879
750930	contig_4852_pilon	+	1453	6	Intergenic	novelGene_153964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTGCAATCCCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28584	55986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_28629_28872_29022_29873_29899_53854_53972_54424_54705_55148
750934	contig_7171_pilon	-	1097	9	Intergenic	novelGene_101392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	44.2040722106007	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	69	1097	1407706	1399951	FALSE	5	TGCCGAGCGGTGCTGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRPPLGKQQGPDHGPPASCILRMAQLEDKDSAAPTNGERLAPLQVNGAGETPLGVLRSPEPLLRLRRTWGVWQIPELDAQDAKALLELWPLGSFLVTGHSPSQDLVLRTGPSPGEVKTYQINKIPGGVSLESSNVCMPDLPHLLAFLSASRDVLPRRLLLPPPTLGPGNEHTVPPQTGRVQLDASGKALSVVNQLYLEMHKEQRMEQSLPETPPETAQRNSPAPSKPTPHRVSWVEGPLSPEVHYPGPALATLVEKEEEVEDAYRDEEEGPEDALTLHVRALARSWSSYVARQFRHLQDRLTSAAGSSHRPGDPATELLQDVQHLLTDLQEYLVKDPEVRAVFESRGPGAAQKDQDLGAAVEAAV	1408977	1399950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1399974_1400434_1400840_1400923_1401074_1401479_1401545_1401630_1401704_1402651_1402755_1407320_1407481_1407656_1407749_1408951
750943	contig_19564_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_29575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTAGTTTTGATCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10089	8848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_8800_10100
750944	contig_6710_pilon	-	484	2	Intergenic	novelGene_98063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
750948	SIRV4	-	202	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	412	3	-412	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAACTATCGGCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
750966	contig_8576_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_88808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAATAAATTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912694	913893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_912700_913900
750967	contig_7318_pilon	+	3166	7	Intergenic	novelGene_152211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_5	13.2371531011099	253	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	789	2036	177513	196994	FALSE	15	CATACAGTGTGTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSASSPRPAPDENEFPFGCPPTVCQDPSEPKALCCDACLSEDMRNSEDQSCPKCRGDDPHSASPGNLLSQEKDHPEMAETRVGCPFAGVGCSFKGNPKSVQEHEAISQASHLNLLLGFMKQWKAQLGSSQDSGPMALERNLSDLQLQAAVEVAGDLEVDCYRAPCSERQEELALQHFMKEKLLAELEEKLRVFENIVAVLNKEVEASHLALAASIHQSQLDCERILSLEQRVVELQQTLAQKDQALGKLEQSLHLMEEASFDGTFLWKITNVTRRCHESACGKTISLFSPAFYTAKYGYKLCLRLYLNGDGSGKRTHLSLFIVIMRGEYDALLPWPFRNKVTFMLLDQNNREHAIDAFRPDLNSASFQRPQSETNVASGCPLFFPLSRLQSPKHAYVKDDTMFLKCMVETSA	176724	198124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_177653_179648_179734_189349_189416_190104_190516_192041_192220_195385_195535_196775
750971	contig_6902_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_135562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACTCAAATGACTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285612	287860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_285600_287900
750972	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
750973	contig_8538_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_4885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTGTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842779	843126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
750974	contig_3575_pilon	+	2476	1	Intergenic	novelGene_141100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAAAAAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371496	373972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_371500_374000
750975	contig_13894_pilon	+	504	5	Intergenic	novelGene_62166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2999	junction_1	1864.74198952563	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	230	448	526894	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	525713	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
750976	SIRV1	-	659	3	NNC	SIRV1A	novel	744	3	NA	NA	6	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	104	315	21	335	11617	11142	TRUE	30	TGGTCACGTACATTTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRIGVLSAAVPALLHPFPLIADGKVKVYSAVAVDLRFSIKNLLAKTVGASAPLFPAILLPVAFKLAICGFVERPGSIVICIVVTSITDYKISILHSPVRSI	11637	10690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_10774_10900_11243_11403
750977	contig_14322_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_115813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	255	311	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLIWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671351	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
750979	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750982	SIRV6	+	441	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	105	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATAGTAGATTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11037
750983	contig_10795_pilon	+	1975	8	Intergenic	novelGene_171285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	60.1185902858607	180	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	17	1063	16713	80798	FALSE	30	AGATATACTTGAGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRAAMAADGDWQDFYEFQEPAQSLQDENCNASPETGAGAGGAVVGLPALARSLEEKLSLCFRPSGAGAEPPRAAVRPITERSLLQGDEIWNALTDNYGNVMPVDWKSSHTRTLHLLTLNLSEKGISDSLFFDTSDDEELREQLDMHSIIVSCVSEEPLFTADQVIEEIEEMMQESPDPEDDETPTQSDRLSVLSQEIQTLKRSSTSSYEERVKRLSVSELNELLEAIETAIKDYSEELVQQLALRDELEFEKEVKNSFISVLIEVQNKQKEHKEMAKKKKKLKNSGSQNGKHEKSHMPGTYLTTVIPYEKKNGPPSVEDLQILTKILCAMKEDSEKVPSLLTDYILKVLCPT	16696	81710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_16964_23212_23322_37985_38103_40986_41129_42821_43091_70194_70271_78124_78191_80781
750985	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	3	408	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
750986	SIRV6	+	496	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	171	-2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
750987	contig_6710_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_97804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
750988	contig_12000_pilon	+	1337	8	Intergenic	novelGene_43172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	527.26812294068	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	5	832	417192	669327	FALSE	25	ATTTATATCACATGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	417187	669832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417301_449726_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_669224
750989	contig_9919_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_137967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAACCCAATGGGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582613	582813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_582600_582800
750990	contig_10163_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_82650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTAATTATAATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181972	179952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_180000_182000
750992	contig_3382_pilon	+	2157	12	Intergenic	novelGene_124156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	335.880414571261	3	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	72	1451	931459	959593	TRUE	40	CCTCCATGAAAAATTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTAKHGGPKSQLSIPYPTLPVPRLPR	931387	981315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_958639_959086_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971881_971974_978965_979048_981257
750994	contig_10404_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_138631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	802	1230	364368	363940	NA	85	AACCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKISLFSCSPGGYRFKFRASAPGEHFVCQLWRRVLLMHQSSLVWEHLSTGTSGPKDTLCSWHCFLGGMRFPCVSACFSLLHLKRDWIRTLSNHVDLISITATNLSYYIIVIEFTTHKEITSDYKMVYKHTMLGIMTHSS	365169	363150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_363200_365200
750995	contig_5918_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_99637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTAAGCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2260343	2262209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2260300_2262200
750996	contig_3789_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_79885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAGAAAATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567730	569920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_567700_569900
750998	SIRV2	-	235	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	691	22	691	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4041	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
750999	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	658186	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658187	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
751001	contig_9982_pilon	-	1664	14	Intergenic	novelGene_55765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	300.154989549531	1	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1036	1530	343970	339852	FALSE	25	TATCAGAGCCTCAACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	350232	339717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344022_344103_344199_344277_344345_345132_345312_346192_346321_347219_347271_347369_347551_348020_348155_349531_349612_350163
751002	SIRV4	+	329	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGCAAGGCACAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
751014	contig_16303_pilon	-	903	5	Intergenic	novelGene_34106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.113078666587	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	329	430	37218	35759	TRUE	25	GTGAAAGCCATCCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	37669	33144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33221_35361_35764_35980_36029_37169_37302_37424
751018	contig_2940_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_81981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAGTAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113336	1113106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1113100_1113300
751019	contig_10627_pilon	+	1141	6	Intergenic	novelGene_59920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	167.309294422037	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	68	421	105394	108477	TRUE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNG	105326	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108068_108473_108573_108962_109005_109122
751020	contig_13021_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_8090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAACGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35704	32934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_32900_35700
751021	contig_8617_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_73477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAATTCCGCTACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62981	62736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
751027	contig_6710_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_97873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGGGGATCGTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653405	653655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
751031	contig_11422_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_99093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCTCATGTTTGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749	1132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_1100
751037	contig_10734_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_51270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGAGCACAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321565	1322857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1321600_1322900
751040	contig_13201_pilon	-	1840	1	Intergenic	novelGene_130882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1418	1717	159281	158982	NA	65	CACATACAAATTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSQVWCRKLSRLQSSLKKLIHPQTTEQLALFTAVHYLKEKSEGKKLAYLTAKLRNNLSLESGEDDKSMLTIGMQVVAESTSLQIFYLQPIKNAETLST	160698	158858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_158900_160700
751045	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751049	contig_11512_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_43385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	369	458	555771	555860	NA	5	ATGCTTTTTTGTCTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGKPHGAYILYLLSHHSPHKPPPLSRANRSIRRQSKVTRFEQIALKSRLYSSYHSLEAGPDSIIRDSREPGLEPLKLQLHQLHHNQTEPLHLVTQNTAPHPNILSPFSRHLKPSQPVQLIGMFSLLQRMHLQVYRIFLTHENNHSHVSLG	555402	556437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555400_556400
751055	SIRV4	-	260	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1261	0	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
751056	SIRV5	+	461	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	-17	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8184	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8402_8471_8586_10858
751057	contig_1472_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_86117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTCTGTAAGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123660	124045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_123700_124000
751059	contig_8616_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_72607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	254	316	459743	459681	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLAQKVTSPSTLLPRGPASSCTRVSTPASHIPSTSSSPSLLLTFCRTRSGANALPGARPSFLSSLQSLSSSGISVTQSRGKFTRMWTRTVGLLETLTSCHPSNG	459996	458646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_458600_460000
751062	contig_1009_pilon	-	2754	1	Intergenic	novelGene_121770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303084	300330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_300300_303100
751065	contig_8914_pilon	-	726	5	Intergenic	novelGene_112858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3976	junction_4	1628.07422665553	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	194	682	267367	264566	FALSE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268128	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075
751067	contig_987_pilon	+	2688	2	Intergenic	novelGene_72357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298300	1305131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1300200_1304342
751070	contig_7594_pilon	+	1252	7	Intergenic	novelGene_55432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	784.216594230616	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTTCCCAAGTATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539006	557742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_557090
751071	contig_16930_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_139152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAATGCTCCTTAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84701	83689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_83700_84700
751078	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	18	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751083	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
751084	contig_10968_pilon	+	2205	3	Intergenic	novelGene_84271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	143	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	115	816	114414	126536	FALSE	50	AAAAAAAAGGCCGGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFHSGEARRAPESDGVSDAGSEVGPGSRAPTAGAVEEEMAGPNQLCIRRWTTKHVAVWLKDEGFFEYVDILCNKHRLDGITLLTLTEYDLRSPPLEIKVLGDIKRLMLSVRKLQKVHIDVLEEMDYNSDSPMGSMTPFISALQGSEWLCNGDPSHDCDGPITDLNSDQFQYMNGKNKHSVRRLDPEYWKTILSCIYVFIVFGFTSFIMVIVHERVPDMQTYPPLPDIFLDSVPRIPWAFAMTEVCGMILCYIWLLVLLLHKHRYLIYSFKR	75961	127925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_76061_114398_114992_126412
751087	contig_5954_pilon	+	2630	25	Intergenic	novelGene_28498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	136.134118662034	19	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	374	1261	411241	417754	TRUE	30	TGGTATTAAAGATGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTWEPPSPEDCDLETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRPALEVQVLDSPDEAMGTIKRAPFLGPSLPEPPAEDSLSSPPGTPPLPPPGPDSPPLLPTTWATMKHQADLERSSCHGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAEEGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQQVPLSIPTNRLTQRIIPR	410276	420613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_410313_410389_410522_410598_410668_411016_411092_411179_411289_411733_411813_411904_411964_412495_412540_412619_412659_412745_412780_412879_412986_413066_413156_413233_413276_413351_413437_413537_413618_413696_413758_413854_413973_417750_418115_418194_418299_418396_418575_419348_419418_419539_419627_419819_419891_420001_420058_420169
751090	contig_15105_pilon	-	2635	2	Intergenic	novelGene_150988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682789	678807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_679348_680694
751096	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751098	SIRV2	+	306	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	281	-64	-281	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATTTGACTTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
751100	contig_7189_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_117665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAATATGAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579929	580519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_579900_580500
751102	contig_730_pilon	-	1396	11	Intergenic	novelGene_155621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_7	29.0979380712792	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	647	1396	209819	207903	FALSE	20	AGTATCTGAGTCCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVWKHGQGPQCPFCEPTVTPSQCASFYPQILWFWGPKFSSLPPNSYRTQWVKPTIINRKAQP	214640	207902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211785_211836_211931_212002_212277_212439_214383
751103	contig_5018_pilon	+	1533	6	Intergenic	novelGene_47125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	114.963646427903	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	161	556	1448095	1449145	TRUE	10	CAGCTGTTAGCCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALCPLLLAVLMGVPAGTLTCYGDSGQPVDWFVVYKLPAKSGPGDAAGRGLSSPSCSTMTSRLNPAEFGTLLAVGTQRGCCFWTKKGASGWSTVFHASLHLPPLLPIAGLIVLDVMARPCSVCLFPSPSS	1447934	1450985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1448190_1448327_1448391_1448609_1448689_1448986_1449152_1449244_1449443_1450212
751107	contig_5502_pilon	-	1211	2	Intergenic	novelGene_155022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537286	535577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_536713_537210
751108	contig_8050_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_114807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAAATTCAAACCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233810	232575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_232600_233800
751109	contig_8710_pilon	-	2540	2	Intergenic	novelGene_73548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	0	782	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGATCTTGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521142	516372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_518757_520986
751114	contig_5921_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_142241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGGGGTCTTAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158302	157147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_157100_158300
751115	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
751116	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	-9	37	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751117	contig_9150_pilon	-	1647	5	Intergenic	novelGene_140901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157.457137024652	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTGCAGTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59167	46242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_47386_47543_47801_49153_49253_57679_57770_59109
751121	contig_3077_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_26832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAATAAATAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507801	509333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_507800_509300
751122	contig_8616_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_72460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274363	272306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_272300_274400
751123	contig_12884_pilon	-	1870	11	Intergenic	novelGene_105016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_2	81.0780488171737	630	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	133	1122	1137687	1126202	TRUE	15	GTCCTGTGTCTGACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIALGTDAIKIENGQSTATKLGLPPLTPEQQEALQKAKKYAMEQSIKSVLVKQTIAHQQQQLTNLQMAAVTMGFGDPLSPLQSMAAQRQRALAIMCRVYVGSIYYELGEDTIRQAFAPFGPIKSIDMSWDSVTMKHKGFAFVEYEVPEAAQLALEQMNSVMLGGRNIKVGRPSNIGQAQPIIDQLAEEARAFNRIYVASVHQDLSDDDIKSVFEAFGKIKSCTLARDPTTGKHKGYGFIEYEKAQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLRVGKAVTPPPCPCSHLPHLEASHPLLLWLPLPPQPRSLHRKQWREQQCWARWPRQDWCRLP	1137819	1125186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1125630_1125739_1125976_1126132_1126269_1126358_1126552_1126627_1126842_1126918_1127012_1127087_1127250_1129376_1129428_1130257_1130348_1130454_1130551_1137663
751124	contig_7744_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_62493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTGTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673424	675234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_673400_675200
751126	contig_6108_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_171295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATTAAGGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683448	683159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6108_pilon_-_683200_683400
751132	contig_2114_pilon	-	1445	11	Intergenic	novelGene_104324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	105.596827603863	1	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	599	1219	1147929	1139050	FALSE	45	TAATCAAAACAAAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1167588	1138823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148034_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157957_1160961_1161031_1167437
751133	contig_10437_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_38470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAGGACAAATGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154813	1156942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1154800_1156900
751134	contig_1146_pilon	+	1132	6	Intergenic	novelGene_84844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	224.185102091999	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	75	581	937672	945408	FALSE	15	TGTCCTACTTTCTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKMYFMTMIISLAAVAWVGQQVHKSGIGGRDCAGV	937597	945959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_943731_943794_945371
751136	contig_3380_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_60110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTTCAGTCACTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426190	425686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_425700_426200
751137	contig_3380_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_60109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425325	423040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_423000_425300
751139	contig_16237_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_162671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1329	1709	17140	16760	NA	25	AGATCGTCTAAGATTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETPDEVCFSAASSAREHHHQGCSQEPCRTRGATVCVVCHPSECYMKPSNSRSCDSINTVGTKPSCPPIPRQARSREPARPGLCAGGRRPGDSFISSRGQAWFSCLSLSLISHVHPPRPVSTLSA	18468	16157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_-_16200_18500
751141	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751142	SIRV6	+	504	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751145	contig_517_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_171301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72597	71843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_-_71800_72600
751146	contig_8064_pilon	+	1205	6	Intergenic	novelGene_164564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.4589866255513	32	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101631	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_112219_112333_116026_116130_117149_117382_118000_118295_118823
751147	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751148	SIRV6	+	301	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	598	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
751151	contig_9785_pilon	+	2772	5	Intergenic	novelGene_157901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	23.878599205146	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	55	1497	497213	539412	FALSE	15	CTAATGGTGCTATTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRNRFLLLLALAALLAFVSLSLQFFHLIPVSAAKNGAGGKSRKRVMPNPVTEPPVMDPIYEALLYCNIPSVAERSMEGHAPHHFKLVSVHVFIRHGDRYPLYAIPKTKRPGIDCTLVANRKPYHPKLEGFVSHMSEGSGTSFESPLYSLPLYPNHPLCEMGELTQTGVVQHLRNGQLLRDIYLKKHELLPSNWSTDHLYLETTGKSRTLQSGLALLYGFLPDFDWKKIYFRHQPSALFCSGNCYCPVRNQYLEKEQRRQYLLRLKNSELERTYGEMAKIVNIPTKQLRAANPIDSLLCHFCHNISFPCTRNGCIDMEHFKVIKTHQIEDEKERREKKLYLGYALLGAHPILNQTISRMQRAAEGRKEEIFTLYSAHDVTLSPVLSALGLTEARFPRFAARLIFELWQNREKPSEHSIRILYNGVEVTFHTTFCQDHRKLSHKPMCPFENLVHFVQRDMFAALGGSSTSYYDACHREGV	497158	540687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_497292_523791_523951_525285_525413_533302_533443_538474
751158	contig_5217_pilon	-	1281	10	Intergenic	novelGene_135713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	32.3102246554237	338	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	204	1202	297599	295104	FALSE	10	GTATGTTGTTTTGTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGRYLPEFRETRATQDFFSTCRSPETCCELTLQPLRRFPLDAAIIFSDILVVPQALGMEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298405	295024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297293_297368_297449_297571_297733_298335
751163	contig_12540_pilon	+	1719	1	Intergenic	novelGene_148067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233356	235075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_233400_235100
751164	contig_10642_pilon	+	1341	4	Intergenic	novelGene_78703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	18.3726850393609	435	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	86	367	713436	722585	FALSE	20	CCAAATGTCTTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGSRTGVRSRWEFTELAFSWKILQPITMSSNTDVSLSSYDEDQGSKLIRKAKEAPFVPIGMAGFAAIVAYGLYKLKSRGNTKMSVHLIHMRVAAQGFVVGAMTFGMGYSLYQEYCAKPKP	706055	723559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_706119_713413_713533_721701_721837_722535
751166	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
751180	contig_6710_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_97812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	45	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751181	contig_12279_pilon	+	1163	6	Intergenic	novelGene_50080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	1956.80607112713	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	63	665	68297	77128	FALSE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57420	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57477_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
751183	contig_20759_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_163722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATAAGAAAAAATCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36138	34656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20759_pilon_-_34700_36100
751184	contig_19769_pilon	+	866	6	Intergenic	novelGene_102277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1767.55544184617	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	405	833	87839	89322	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRWAPCLRAPSCAVWRRSLETEASWREPPGTTPRSCSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87609_87825_87951_87997_88040_88841_88958_89163
751185	contig_4315_pilon	-	1245	3	Intergenic	novelGene_46805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	25	342	333557	327997	FALSE	65	TTAAAAAAGAAAGAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYVSSVPVMPYPAATVRSPGGTTFMNLAAKYYVSPGPTSAQAATEWPPKASSQPAAAHRHSIQLDLAGLEELNKALSRAVQAAKSVRSTTKQMSRSLSADLRQARGLRGSCLF	333581	327093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_330730_330773_333534
751186	contig_11681_pilon	+	2694	3	Intergenic	novelGene_102972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	41.5	2	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	210	2576	163570	165936	FALSE	35	ATAAAAATGTGTGCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	158837	166054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_158897_161361_161445_163502
751188	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751189	contig_11292_pilon	-	1280	11	Intergenic	novelGene_109409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	303.922095281011	9	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	411	1208	165314	161842	FALSE	5	CCTGCCACCTGTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167452	161769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165371_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
751191	contig_6504_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_158783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTGAAATGGTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228822	229082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_228800_229100
751194	contig_12622_pilon	+	2175	6	Intergenic	novelGene_5799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	84.2178128426522	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	59	751	349741	404682	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKVGLYQRTSTL	349682	406106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_404556
751195	contig_7035_pilon	-	2372	8	Intergenic	novelGene_83545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	21.2766039947878	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	792	1580	2371	775044	773698	FALSE	10	ACAGCTTGTCTGGTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCQLRCLPFRALHFVFSPGFINHISGTPHALIVRRYLSLLDTAVELELPGYRGPRLPRRQQVPIFPQPLITDRARCKYSHKDIVAEGLRQLLGEEKYRQDLTVPPGYCTDFLLCVSSNGAVLPVRTQDPFLPYPPRSCPQGQAAWNPTTQDPTQRVVLMLRERWHFCRDGRVLLGSRALRERHLGLMGYQLLPLPFEELESQRGLPQLKSYLRQKLQALGLRWGPEGGGEGKHSGLRWPPHGGQTVCTLAPILVLIKGPFLP	778102	773696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_773905_773980_774096_774171_774308_774390_774483_774702_774863_774962_775177_775985_776166_776835
751200	contig_6710_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_95678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCTGTTCTGGAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	653714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
751201	contig_12270_pilon	+	308	2	Intergenic	novelGene_114079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGCCCCTGCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13879	14410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
751208	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
751216	SIRV4	-	267	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1254	0	1254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3904	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
751218	contig_6684_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_168592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAAGTGCTTTATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70580	70345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_70300_70600
751219	contig_6710_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_92994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751221	contig_935_pilon	-	2747	3	Intergenic	novelGene_45517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	10	11	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAATATTCATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32102	24603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_27193_31616_31707_32034
751225	scaffold_19766_pilon	+	2562	4	Intergenic	novelGene_34380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.62466929133727	4	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1333	2130	726532	727329	FALSE	35	AATAATTACTTCTACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722586	727761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_723305_723435_723738_723925_724236_726529
751232	contig_14219_pilon	-	4136	1	Intergenic	novelGene_54321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	130	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGACTAGTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719254	715118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_715100_719300
751241	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_95830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751245	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751246	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	2	406	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	705	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751248	SIRV4	-	267	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1256	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
751249	contig_5056_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_171157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTTGACAGGATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108964	109793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_+_109000_109800
751255	SIRV4	-	414	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1104	3	1104	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
751256	contig_15092_pilon	-	1761	16	Intergenic	novelGene_57776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_12	113.710079686113	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	793	1266	304389	297845	TRUE	40	AGAGTCATGGAAATATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISLLNYEDGVLDPSSIVPLIDGGTEGFKGNARVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATR	317673	296460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304101_304383_304449_304779_304824_310062_310144_312141_312491_312713_312797_316605_316687_317578
751257	contig_7677_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_78269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCAGTACTTTTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478006	475889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_-_475900_478000
751260	contig_3009_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_132520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAACAGAGGGTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97600	97847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_97600_97800
751265	contig_12644_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_44434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAACCTTGGGTTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190266	190494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_190300_190500
751268	contig_9113_pilon	-	1621	2	Intergenic	novelGene_68602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTTGACTCCAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383740	376373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_377467_383212
751269	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751270	contig_10432_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_171312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190166	187854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_187900_190200
751275	contig_6202_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_139826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTCTTCTGGTAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479975	480491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_480000_480500
751282	contig_10182_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_134624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1070	1390	339774	339454	NA	15	TGACCACTGTCGAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGARLSLPSTVSAVAPHPTAIPGASEGQPAPCLVKGKPLMARSLQRLRGRRRGAPPRETPGAVVLSNCGQSLTGSGVAGSCGMAGSHWSTQRSITHGPSPAPPL	340843	337916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_337900_340800
751283	contig_3077_pilon	+	1768	10	Intergenic	novelGene_26597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3331.79297742889	1	118	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	147	1289	9676	17590	FALSE	50	ATACAAAAGATTAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGFGFGGVEWDGYKKEVGGLGTRPCQAAEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9529	18069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17045_17449
751286	contig_10904_pilon	+	2299	6	Intergenic	novelGene_22587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	258.297038310547	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	46	666	439135	442881	FALSE	20	TCTCCATCATCATCGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGYVHSREKDPGPASDPPIRRRQSQDPSGAGS	438430	444514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680
751287	contig_9363_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_6502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	18	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTAAAATGACGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446621	454443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_446841_452706
751292	contig_8674_pilon	+	1601	7	Intergenic	novelGene_102921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_6	574.81023438658	28	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCCACTAAGTTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427635	477840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_457759_457844_460249_460397_476127_476227_476400_477378_477729
751295	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751299	contig_9516_pilon	-	2477	7	Intergenic	novelGene_106188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_3	33.698005216267	71	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	514	756	953333	946485	FALSE	25	AAGTGCCTTGGTAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDHKIQHRTFIKPKELEGLPPGTKVTIRASLGPLQSKPSTTLSSDTPSTSLQVSPPISKTKTGKNTTKSNASKSKTSKPHATTSTASKPKASKASGVGSKFKPQASYKLKKQRNRKSKISTALKNLRFRRGVHKCIECRSKIKDFASHFSTYGHCNFCKYNSNCSKAFVNHMMSCHSSNPSKRFCIFKKNSGAIRGITLVCLKCDFLTDSSGLDLMAKHLSQRKTHTCQVIKESVSENTSTSAPTSDCLLN	958016	944763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_946501_946627_946665_946817_946937_950679_950743_953325_953467_953862_954171_957944
751300	contig_7580_pilon	+	2211	3	Intergenic	novelGene_108592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	151.5	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCCTAGGGACTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96440	105901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052
751301	SIRV6	-	220	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCATCAATTATACGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
751304	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
751305	contig_5153_pilon	+	1956	16	Intergenic	novelGene_74371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	299.967657515865	1	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	374	1507	1010261	1022263	FALSE	90	AAAAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGRHFGGLPEDSAEDLWWQRLTRAWWSLLPTCQQQKAKECLFLPPPESSP	956678	1022712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010036_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020551_1022114
751306	contig_15354_pilon	-	1063	5	Intergenic	novelGene_65742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	17.4266319178434	505	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGGTTGCAGCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621798	617553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_618125_618410_618613_620396_620490_621007_621110_621703
751311	contig_9937_pilon	+	1998	3	Intergenic	novelGene_129219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14	72	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	154	801	237766	251284	FALSE	25	TGTGGCATATGTACCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASETEKIHALLQPCSTESLISSLGLGILCLVADRLLQFPIIQQNDWLRALSDNAVHCMIGMWSWAIVIGVKKKTDLGEIVLAGFLASVIDIDHFFLAGSVSLKAALTLPRRPFLHCSTVIPIVALTLKFVMHLFKLKGSWCFLPWMLFISWTSHHIRDGIRHGLWICPFGKTSPLPFWLYVIITSSLPHICSFVMYLTGTRQMMSSKRGIHIDV	218047	252481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_218128_237692_238078_250948
751316	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
751322	contig_12150_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_6963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCTCTGACTGAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99825	98118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_98100_99800
751324	contig_12948_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_126221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCCAGCAGGATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311071	312385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_311100_312400
751329	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751333	contig_6710_pilon	-	465	2	Intergenic	novelGene_98138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	15	GCTACCCACCCATCTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751334	contig_5482_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_144513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTACAATAATGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731344	732004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_731300_732000
751335	contig_1759_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_171335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTAGAAATGTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58120	60805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_58100_60800
751336	contig_8907_pilon	-	702	5	Intergenic	novelGene_85801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	51450	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179864	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178797_179269_179544_179839
751339	contig_14559_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_83725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	538	1050	277941	277429	NA	70	AAAAAAAAGAAAATTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDISSQCLPQKDLYATEEEADTLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKNPGEQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEPKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKKSGADSAARTKSRKARCAPFSLL	278478	276208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_276200_278500
751341	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_97461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751342	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	133	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751348	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	476	-2	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAAATAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
751353	SIRV6	-	357	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9444	-173	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGACCGTAGCGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11264	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11111_11206
751355	contig_8729_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_40132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAAGGAATATAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581088	580233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_580200_581100
751356	contig_8729_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_40131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAACAGTTAGTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580083	579069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_579100_580100
751357	contig_5217_pilon	+	699	6	Intergenic	novelGene_135806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	44.7186761879195	229	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	102	698	1025137	1078871	FALSE	15	TACTGTGTCTGAGCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWGFPALTEHSASPAASLGIFEVRRVLDASGCSMLAPLQTGAARFSSYLLSRARKVLGSHLFSPCGVPEFCSISTRKLAAHGFGASMAAMVSFPPQRYHYFLVLDFEATCDKPQIHPQEIIEFPILKLNGRTMEIESTFHMYVQPVVHPQLTPFCTELTGIIQAMVDGQPSLQQVLERVDEWMAKEGLLDPNVKSIFVTCGDWDLKVMLPGQCQYLGLPVADYFKQWINLKK	1012395	1078872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_1012474_1025113_1025392_1043751_1043869_1050172_1050233_1054813_1054906_1078798
751358	contig_7840_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_68974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAATTGTGTTGCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174938	175820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_174900_175800
751362	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751363	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
751364	contig_15047_pilon	+	979	5	Intergenic	novelGene_52268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3251.26752205967	3	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	376	489	4573	20995	TRUE	20	TTCCAGAATCTGCATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSEL	3417	21656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4434_4552_4676_20984_21062_21232
751365	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751367	contig_8571_pilon	-	2510	15	Intergenic	novelGene_169168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_13	121.19433289775	156	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	103	2148	423270	379107	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPTEAATPPVARTSPAGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGSTPSGPVLASPQAGIIPTEAVAMPVPAASPTPASPASNRAVTPSTEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPSETSPSFSKAENKGVSPIVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSDSVDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSTKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNSEHKRGPEVTSQGVQTSSPGCKPEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSTMMHPASAAGPPIVATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVPSSATQFGAHEQTHAMYVSTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPTAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL	423372	378744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_379136_379964_380134_382304_382533_383145_383292_393535_393669_393989_394175_406983_407045_407394_407548_408131_408196_409255_409561_417312_417384_417656_417765_418151_418350_420335_420519_423257
751368	contig_12951_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_68153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCATGACAATAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196488	195328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_195300_196500
751369	contig_6589_pilon	+	656	4	Intergenic	novelGene_25961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_2	9812.04981415991	32	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	187	654	1296229	1297361	FALSE	10	TCAGGCTGGGTTGGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQIRQNYSSEAEGNVNLLVNLHLKASYTYLSLGYYFDRDDVALEGVEHFFRELAKEKREGAERLLKLQNQRGGRAVFQDVPPPAKEWNGILDAMEAALALEKSLNQALLDLHAVATAHTDPHLCDFLENHFLDEEVKLLKKMGDHLTNVRRVAS	1296042	1297363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1296641_1296972_1297096_1297265
751377	contig_8020_pilon	-	862	8	Intergenic	novelGene_114368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	88.89112808971	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	258	803	106472	104794	FALSE	20	AAACAGGGCTGTGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107167	104734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
751378	contig_10134_pilon	-	1078	3	Intergenic	novelGene_16268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	67	junction_1	316.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGATGGTCACATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	37491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_37774_38558_38817_39142
751379	contig_3394_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_152714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	17	334	539974	540291	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVAGNRPSNTLLTTPLCLGSEESPEPLPIPTLLVGYDKDFLTISPFSLPFWERLLLDPYGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRDLSAVYEVRKILGKSFL	539957	542357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_540000_542400
751383	contig_6795_pilon	-	2253	12	Intergenic	novelGene_27749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	17.240640052547	102	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	167	1780	340979	334883	TRUE	35	AGCATTTAATAGCTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAALFQTDCEHADSLAQAAEDDWPPFRKVGCFDPYSDDPRLGVQKVALCKYTARMVVAGTAGQVLVLELSDVPAEQAVSVASMDLLQDREGFTWKGHDQLSPSTGPLPWPVGFQPQVLVQCLPPAAITAVTLHTEWGLVAFGTSHGFGLFDYQRKSPVLARCTLHPNDSLAMEGPLSRVKSLKKSLRQSFRRIRKSRVSGKKRALNTSSKLQEANAQLAEQACPHNVEVTPVQRRIEPRSADDSLSGVVRCLYFADTFLRDAVHHGPTLWAGTNSGSVFAYAMEVPAAATGSENRPERAVEAVLGKEVQLMHRAPVVAITVLDGRGRPLPEPYEASRDLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFKVFTLPKVSAKTKFKLTAHEGCRVRKVALATFASVACEDYAETCLACLTNLGDVHVFSVPGLRPQVHYSCIRKEDISGIASCVFTRHGQGFYLISPSEFERFSLSARNITEPLCSLDIRWPRDTTCDSYRLQESPKLSQANGTPGIILAPRSCDGSPSPARSKGAGDTMEPSEATLSPISMDSATSADTTLDTTGDVTMENVKDFLGSSEEPQKNLRNVAQDEAHACTILIR	341215	333720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_334193_334881_334962_335114_335236_335401_335518_335705_335821_335960_336226_336854_337151_339218_339373_339651_339800_340107_340401_340952_341058_341127
751384	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751385	contig_9706_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_21055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGAGGCGCCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727387	727115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_727100_727400
751386	contig_6710_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_90505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
751389	contig_16882_pilon	+	2254	6	Intergenic	novelGene_148240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	17.749366185867	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	193	1137	445854	607399	FALSE	55	TAGGAAAAAAAATTAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDAPVIYGLEFQARALTPQTAETDAIRFLVGTQSLKYDNQIHIIDFDDENNIINKNVLLHQVGEIWHISASPADKGVLATCYNKTSDSKVLTCAAVWRMPKELESGSPESPDDSSSTTQTLELLCHLDNTAHGNMACVVWEPMGDGKKIISLADNHILLWDLQESSSKAVLASSASLEGKGQLKFTSGRWSPHHNCTQVATANDTTLRGWDTRTMRSVTLELSFERGAGTRALGSSSSLSSISFLSEQNHDHDGDDYKSNAFGGTWLVCLHLTFVKHHKSYFVSSPQIKPAHPLLWNSYTSVDRLIFHIDIP	445661	608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_445896_459574_459659_478552_478686_555368_555526_585050_585151_606970
751395	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	19	342	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14427	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
751399	contig_11160_pilon	+	2415	10	Intergenic	novelGene_168800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	11.8977121983832	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	96	1424	202929	313907	FALSE	15	CACTGTTTACTATCGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSDFQQELTDVTVCTKAKLWLAKRQNPCLVTRAVYIDILFLLTCCLDKPAKGNQPVLESLGFWEEISRIITGSELITGFPYTFTVPGLPQYLQSLTKLAIAAVWAVTAKAGEQTRNVPISFSQLLESTFSEVRLLTLEALLERFSAAASGLAEKGLPPLLHNMGEKFLMLAMKEKHPECFCKILKILHCMDPREWLPQTEYCVHLTPKEFLIWTMDIASTERSEIRSVALRLASKVVAHHTQTREENRDSMAPELKQWVQLVVSSCEDHLPPESRLAAAEVLASITPYFLTNPHPIIGLQDTLALWRCVFTLLQSEEQAIRDAAAEIVTTALSQENTSQSTEFAFCQVDASIALALAVAVLCDLLQQWDQLAPGLPILLRWLLGENDDLVVCAESTCQVEEDYLFEKADVNLWAETLVSVRYLYKHLSWLLSKSSWHPPRP	142800	314898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_142854_202886_203003_226236_226332_253545_253926_254547_254667_255007_255081_257691_257846_263505_263638_312502_312673_313775
751403	contig_6031_pilon	+	1038	7	Intergenic	novelGene_56724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_1	536.108638451408	2071	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	147	887	149114	165819	FALSE	40	CTTTTGGAAAATAATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLVALAERD	148967	165970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_165761
751404	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
751408	contig_9098_pilon	-	1086	10	Intergenic	novelGene_75797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	510.494845864599	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	596	961	267418	264388	FALSE	45	TACCGATAATCAAGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295215	264262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_287999_288160_289194_289280_291720_291814_292837_292905_294101_294181_295200
751411	contig_10627_pilon	-	1507	8	Intergenic	novelGene_60009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	148.455311766999	22	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	157	1185	402038	373138	TRUE	15	GCTCAATTTCTGCTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRCRASVLGRPCLPRLPSDSSVPGPAHSSTRVPPAASGCGPGPHCGPSAATMSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVYDIAFSRAGGGRDMFASVGADGSVRMFDLRHLEHSTIIYEDPQHHPLLRLCWNKQDPNYLATMAMDGMEVVILDVRVPCTPVARLNNHRACVNGIAWAPHSSCHICTAADDHQALIWDIQQMPRAIEDPILAYTAEGEINNVQWASTQPDWIAICYNNCLEILRV	402194	368367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_368624_373071_373311_375715_375834_376928_377139_380441_380561_380960_381073_381786_381946_401900
751412	SIRV5	+	381	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-56	880	-56	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8259	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
751415	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	369	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751417	contig_9482_pilon	+	1071	6	Intergenic	novelGene_44234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	338	junction_1	51.2343634682817	2511	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	77	640	263283	289957	FALSE	5	CTCGGGGTTTGCTTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPRQRRKWSHRFFSPSRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGYRLSDQFHDILIRKFDRQGRGQIAFDDFIQGCIVLQRLTDIFRRYDTDQDGWIQVSYEQYLSMVFSIV	263206	290388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_278052_278098_285421_285581_288833_288944_289858
751418	contig_6710_pilon	-	175	2	Intergenic	novelGene_98336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGACCAGACAAAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657511	653746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751420	contig_10426_pilon	-	1534	8	Intergenic	novelGene_144664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_7	53.9890389480181	260	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	100	720	104586	73619	TRUE	25	TTTCATAGAACATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGKHKCIENVSRQNCPICLEVSLKTNFVGFLKSPHLNLKYLDIHIVFIGAVAFISFVGYSHISCCCSCLAVWTSFT	104685	68364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_69031_72438_72560_73498_73526_73618_73835_76253_76333_96657_96774_97008_97129_104496
751421	contig_19957_pilon	-	2172	1	Intergenic	novelGene_57713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205189	203017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_203000_205200
751423	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751427	contig_10023_pilon	-	1045	6	Intergenic	novelGene_123521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_5	386.599534402203	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	24	569	458219	457237	TRUE	10	CTTGCAGAGTGGTTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAIVTKMEAFLESRSGLWAGGPALGQFYRIPPSPSSFVDVASAPYGGPSTRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGERLIGVHITCLTAQLVPA	458242	456013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_456714_457083_457436_457682_457890_458079
751428	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	35	3253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
751429	contig_10482_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_152823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGCTGATGAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105051	106833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_105100_106800
751430	SIRV6	-	570	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1262_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
751433	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	3	1206	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751439	contig_9706_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_21047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACCTAATGAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700324	700821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_700300_700800
751443	contig_2933_pilon	+	3335	17	Intergenic	novelGene_111330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	10.8410028941053	191	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	1473	2912	646532	676537	TRUE	40	AATAATTTACCTTGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSDVDLMRAKLRRLEEENSRKDRQIEQLLEPTRGSDFVRTLAEKRPDTGWVVNGLKQRILKLEQQCKEKDNTINKLQTDIKTTNLEEMRIAMETYYEEIHRLQTLLASSEATGKKLPMEKKVGLKRQKKMSSVLLNLTRSVQELTEENQSLKEDLDRLLSNSPTISKIKGYVEWSKPRLLRRITELEKKISSLESPKSHSAELVKASSVPHSSSNSTVHRQPQVDHQEECERLQGVLKSLKGEQTALHTQLLDKDLEVKQLLQTKADLEKELEHVKASEKERREREETLREQVQTLTKKLQELEEVKKEEKDDPMETAYETQEDLRPPTPTSICSWQDSEPDASAACSRPPSACSAGKREDERRNAAARILQAQWRACVHKKKEALLDEAAIVLQAAFRGHLVRAQLLAKRAFGSPTPSTPSPPREAPCHTPQPETRHPRQRGAGESCYAGPVCLPGTPGADQARCSWSKDNHCSFC	645059	680906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_646637_646754_646806_652134_652206_653416_653490_653725_653776_654535_654700_654886_654943_656446_656647_657948_658054_659689_659781_665477_665661_668299_668324_672375_672488_674822_674939_676498_676603_677595_677686_680638
751444	contig_1428_pilon	+	1726	4	Intergenic	novelGene_158403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.3843770844345	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	318	1349	127726	155725	FALSE	25	ATCTCTTTATCATAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSVKIRRMDPFSTKERIEIIAPSPVRSRSFSVGISCGQTSSSLSPFSPLEFSGADHRDVSGSVDPVCNLQDSCLTDCEGEDGTMDGNDEGHSFELCPSEASSVRSRERTSSSIVFEDSGCDNASSKEDLKTNRLHIGNHYANKLTGCKHASSKSSSEPTLSVSPPRPTTLSLDLTKTTAEKLQPSSPKVYLYIQMQLCRKENLKDWLNGRCAIEERERTVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKIGDFGLVTAMDQDEEEQTVLTPMPAYARHTGQVGTKLYMSPEQIHGNNYSHKVDIFSLGLILFELLYPFSTQMERVRVNLK	127408	156102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_128473_132955_133124_140936_141043_155714
751445	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_96101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
751447	contig_2278_pilon	-	2134	11	Intergenic	novelGene_118112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_9	107.864034784538	274	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	153	1046	956893	940418	FALSE	25	TTCTACTCTCAAGACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	964016	939329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_956857_956913_963151_963250_963981
751448	contig_19132_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_170002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGATTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418166	415694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_415700_418200
751449	contig_7635_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_171356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCCTGCTAATTAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_1700_3700
751454	contig_5686_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_45467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTTCCCTGAGATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223767	222459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222500_223800
751459	contig_15122_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_162697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGCTTCAGGATTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263106	264469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_263100_264500
751460	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_93723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
751461	contig_14868_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_150446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCTGAGTCCCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128197	130342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_128200_130300
751466	contig_1406_pilon	-	1648	8	Intergenic	novelGene_25624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	271.733512914429	436	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	149	1027	2692029	2614118	FALSE	20	GTAATTTGAATGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSVSSESSSSSLSKKKKAKLEHGGSSGSKQNSDHNNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNLKDKKALLRLLDKHDQRGLGGILLEDIEEGLPNSHKAVKALGDQIIFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDDEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKVAPVQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITPGK	2700411	2613496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2635836_2635931_2644012_2644196_2645903_2646012_2660128_2660221_2691860_2692034_2700267
751467	contig_7057_pilon	+	2251	2	Intergenic	novelGene_123285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	823	1239	831663	834899	FALSE	30	GTGACGGAGTTCAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSGVWPASSVYMWVLWWGSLFLHLDPASGSSLSDIQFLGLEPAACRLTCRFWDSPAFAATWARSLSSDLIHWLPQPSEPAACCLACQFRLVGPCGHVSHEKPTPDLWIWDLPASTTMKSDKSKNQPLKTLRTTVLL	830840	835911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_832019_834838
751471	contig_12250_pilon	-	1057	6	Intergenic	novelGene_80658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.016420343085	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	27	473	379717	377358	TRUE	30	GAGGAATCAGTATCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKHPGGQQPPRPLRAAPLPHPHLLGCTPDPTWSRPTSAAQ	380548	375690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377475_379043_379194_379537_379719_380523
751477	contig_12080_pilon	-	1477	6	Intergenic	novelGene_128387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	19.2	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	55	570	175931	171125	FALSE	35	GTGTTATAAAGCCTATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	175985	170217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_171262_171760_171895_172266_172323_172443_172501_172629_172712_175881
751479	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751480	contig_10037_pilon	+	1227	9	Intergenic	novelGene_148940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	221.171843540266	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	165	842	115453	445150	TRUE	15	CTGACGTTGTAGCCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTASTRRVTFEADENENITVVKGIRLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERSAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFKRYDFHPVCADLQAQILQCYRQHTHQTLSCSALAAQYMHCVNQAKQGTLEKGG	115288	445817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_378523_378595_425456_425593_445126_445375_445656
751481	contig_2480_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_63518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAATCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136290	133994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_134000_136300
751482	contig_6497_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_35596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366570	364370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_364400_366600
751490	contig_4125_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_25138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827549	825587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_825600_827500
751494	SIRV6	+	240	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8470	-1	269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTGCAATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
751496	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
751497	contig_16204_pilon	-	1483	9	Intergenic	novelGene_154484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	176.89222530965	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	421	1323	205576	197969	FALSE	15	TAAGGGGCGCGAGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPPCCWWRCWSAPPSSGSRPTWCSTSTARIPYCAPTLYAALLLLALAASSVRTNLTSFGADQVTSLGRSATHRFFNWFYWSLNLGAVLSLLVVAFIQQNISFLLGYSIIVGCVGLAFFIFLFSTPVFIIKPPTGSQVSSMLKLALRNCCPQLCCRYSARDPQGAQLLPDQRSPQPGASPQEDVTNFQVLVKILPIMVTLVPYWMVYFQMQSTYVLQGLHLQIPNIFPVNPANSFTALRTQPNSYTIPEAWLLLANVVVVLILVPLKDRVLDPFLLRHKLLPSALKKMALGMFFGFTSVIVAGVLEMERLDYIHHNETVSQQIGQDLYYAAPLSIWWQIPQYLLIGISEIFASIPGLEFAYSEAPRSMQAAIIGIFFCLSGVGSLLGSSLLSLLSLPGGWLHCPEDFGNINNCRMDFYFFLLAGNPSCHILPISLDCWPL	210298	197808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_198070_198530_198687_200099_200259_202329_202499_203202_203314_204771_204920_205517_205808_209840_209938_210206
751499	contig_6710_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_89188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653708	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
751500	contig_7123_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_170588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGGACTGTCTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554343	552833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_552800_554300
751501	contig_7457_pilon	-	2363	1	Intergenic	novelGene_31659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034189	1031826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1031800_1034200
751502	contig_12427_pilon	+	821	3	Intergenic	novelGene_40417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_1	50	7068	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	185	718	209839	210372	FALSE	25	TCTAAGCTCAGAGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	208687	210475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_208743_209618_209737_209827
751505	SIRV4	-	314	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	8	1199	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751507	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
751515	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751516	contig_2227_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_142347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263035	261046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_261000_263000
751517	SIRV6	+	575	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
751523	contig_2637_pilon	+	1943	7	Intergenic	novelGene_100022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	28.5929284186765	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	156	554	38745	47120	FALSE	35	CTAATCTAGGTTAAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNRNAKKCDKEEKAEKAKIKKAIQKGNTEVARIHAENAIRQKNQAINFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRSMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASTEQDELSQRLARLRDQV	13322	48509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_13391_38657_38805_39177_39247_39328_39437_42093_42138_46322_46396_47075
751533	contig_9345_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_24449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAAGGGCTTGATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428082	428575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_428100_428600
751534	SIRV6	+	533	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751537	SIRV6	+	551	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751538	contig_987_pilon	-	1177	11	Intergenic	novelGene_72291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	278.813270846278	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	90	1022	945143	920155	FALSE	15	ACTTGATCTTGGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFAPPSATPFRFRLARTWVSKVTGGVVAMGKSDFLTPKAIANRIKSKGLQKLRWYCQMCQKQCRDENGFKCHCMSESHQRQLLLASENPQQFMDYFSEEFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEKEF	945232	919999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_920170_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_945029
751543	SIRV6	-	537	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9424	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11244	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
751545	SIRV6	+	392	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	483	3	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	961	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
751548	SIRV4	-	349	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	10	1162	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751554	contig_10986_pilon	-	1419	13	Intergenic	novelGene_71473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	175.272387221211	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	92	1201	80232	67011	FALSE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80420	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189_80236_80332
751563	contig_1062_pilon	-	1745	3	Intergenic	novelGene_171378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.5	272	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	69	602	120445	114165	TRUE	40	CTAAAATACATGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRLAEFRAARKRAGLAAGLNTSNQISQTSGEKAEASPGWLKRFLVWKARPASPRAQPSHAQKAAQPGGSTSQPPRNKAIPLPPRHDQSLLTNITVLKVLLWLVLLGLFVELEFGLAYFVLSLFYWMYVGTRSPEEKKVGEKSAYSVFNPGCEAIQGTLTAEQLERELQLRPPEGR	120513	111745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1062_pilon_-_112413_113688_114510_120256
751567	contig_7594_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_55412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471536	470139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_470100_471500
751569	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751573	contig_7066_pilon	-	2460	1	Intergenic	novelGene_42214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	443	973	1117861	1117331	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRVGLGMSALEAKWNASWQEGAGGHAAQVMQYWIRHGSRKERGPGLSLPAVEDQTGPEGGRDGMEVTESQLRYLHVPGVPLRLSRDIQSESSIVGKVSAGEVAKAEGAWRREWQRCNPFIGSQAAECLRCRNWSWCCSYRGLQTSLQASRLVVRVPGRGRRDLRAASVPQCAFLL	1118303	1115843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1115800_1118300
751578	contig_1276_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_159776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACATATTTTTGGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220928	220624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_220600_220900
751579	contig_5247_pilon	+	1871	12	Intergenic	novelGene_81808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_5	151.755675755363	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	231	1532	152883	161215	FALSE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	151056	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
751580	contig_4891_pilon	+	1101	7	Intergenic	novelGene_124568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.572985425359	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	199	750	707907	756631	FALSE	5	GGTCTCCCACTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCLDCKRPAVYFCSSPSHGTPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	701840	756982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701904_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
751582	contig_4136_pilon	+	2062	3	Intergenic	novelGene_161255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	246	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	913	1314	226628	238097	FALSE	15	TTGATCATGCTGCTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELARKGTGKEQSPLEMSMHPAVAPPLSVFSKESTSSKHSDHHHHHTHTHRHTDTHTHTQTHTHTHTHTHTQQTSCHMSHRHWQSHSRLAVHVLWSKVMFKTEAPAKPVVKPLLPMRYCVTPFGPTEKVEAFL	225715	238845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_226653_237274_237385_237830
751584	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
751588	contig_500_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_30933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190608	1191511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1190600_1191500
751590	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	5	1156	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGAACATTTAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751592	contig_10246_pilon	-	2202	3	Intergenic	novelGene_46883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	340	1671	70557	69226	FALSE	40	ACTCAGAATAGAGGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLLAYIKHLDGQNETALECLQQAEELIQREHADQAEIRSLVTWGNYAWVYYHMGKFSEAQDYVDKVKQTCEKFSNPYSIECPELDGEEGWTRLKCGGKHNERAKVCFEKALEEKPNNPEFSSGLAIAMYCLDDKPQKQSPVDTLKQAIELSPDSQYLKVLLALKLQKMNREAEGEPLVEEALEKAPSQTDVLRSAAKFYKTKGDLDKAIELFLRALESMPNNGYLYHQIGCCYRKKIMQMQNTEEYVANGNREKIEELRECAVDYLKKALEKELNYPLAYAKLAELLAQRGQYREAEECYQIAFSKELTDTERQQLHQCYGNFQEYHMKSEDTGVQHDLEGLQISKKSAEKEKMKCQLQNTAGDQLLFNTANYWYHQGLIHKENGDVLQAVECYEKELGCLLRNAPSGIGSLFLPALELEEGSEEMGQSTHRSTPREPSNT	78836	68694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_70709_73067_73177_78757
751593	contig_12503_pilon	+	2770	9	Intergenic	novelGene_143809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	55.6977052938449	88	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	22	993	31100	71558	FALSE	70	TCTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRTKNFMWYGVLGTRELLQRSYKNLEQRVQLEMFTAPSFDDKILEVVAIFDSVQMAVSRVIKLQHHRIAQCRAVKITIFGDEGLPVQVDGEAWVQPPGIIKIVHKNRAQMLTRDRAFENTLKSWEDKQKYDSGKPVIRTHLYIHHAVDLATEEVSQMQLCSQAAEELITRICDAATIHCLLEQELAHAVNACSHALNKANPKYPESLTRDIATEIAMNVKTLYNETESLLVGRVPLQLESPHEERVSDALHSVEVELQKLTEIPWLYYIFHQNEDEEPPMDCTKRNNRSTVFRIVPKFKKEKVPKQKTSSQHGPRDTESGSCEAYSPGN	31078	73335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_31178_37177_37292_37775_37911_38405_38570_51901_52008_53016_53110_56291_56412_56974_57084_71505
751594	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_90738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
751595	contig_10734_pilon	-	2034	2	Intergenic	novelGene_51041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCTGTAGCTAAATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391690	388705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_388770_389720
751596	contig_5649_pilon	-	1645	10	Intergenic	novelGene_82372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.5539510420646	2	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	33	587	1064307	1057321	TRUE	30	ACAGTAGTTGTCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064339	1055386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056214_1056301_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
751597	contig_4654_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_103033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACACTCACTTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14175	12702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_12700_14200
751598	contig_4654_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_103032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGAAAATAAAGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12211	11557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_11600_12200
751599	contig_11088_pilon	+	653	3	Intergenic	novelGene_85043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	25	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_16250_16348_17119
751601	contig_990_pilon	+	863	12	Intergenic	novelGene_76029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGAATGCCTTTGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726009	849319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_726073_803708_803776_808856_808951_811852_811905_829144_829221_829890_829998_833877_833956_834528_834572_835681_835725_840428_840544_848156_848260_849297
751602	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_97716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
751604	contig_9871_pilon	+	735	6	Intergenic	novelGene_75706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	1698.93206456291	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGTATTGCTTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572877	584417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_579914_579992_581756_581826_582912_583040_583534_583630_584117
751609	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
751610	contig_4339_pilon	+	2169	9	Intergenic	novelGene_146101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCGGCGAGGAGGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207741	1231473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1208631_1209680_1209768_1212609_1212695_1215396_1215561_1219289_1219340_1221088_1221247_1223052_1223207_1225856_1226011_1231045
751612	contig_14220_pilon	-	1171	6	Intergenic	novelGene_159866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	402	junction_5	289.127238426268	595	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	198	1007	422880	331841	FALSE	25	TATTGTTTTAGTAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLGNFFCLSPIFLHPHFSFLHSSIMIN	423077	331676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_332090_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
751614	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
751617	contig_678_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_167795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	114	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1418	1738	42963	43283	NA	35	TCCTTTTATTAACAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEDFLELTEAEYKRLIYRTPQDIRKEISRNSEHATEEIKKIREEHNDKFNRLQGSIQRQQPETQKINNKISELDNSIESHRSRTEAVEVRM	41545	43900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_41500_43900
751619	contig_4364_pilon	-	1431	7	Intergenic	novelGene_181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	966	1274	1269683	1268791	TRUE	15	GAACCCCACCCGCCCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFRPDTISLFTWKEIFIRYSTPSFSEKDCFLKLSRSPVRSSSRGPRAVLHTRVRRVTTTLGTLGSVETATRPSRASLYLRRLSSSLSSSWISWMLFWAGGL	1271067	1267026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1267080_1268686_1268901_1268997_1269083_1269487_1269565_1269646_1269713_1269837_1270623_1270916
751623	contig_13721_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_169485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTTCCTGACATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62580	63286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_+_62600_63300
751624	contig_2100_pilon	+	2966	1	Intergenic	novelGene_50608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCTTGTCAGGATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736712	739678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_736700_739700
751625	SIRV6	+	715	4	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10564_10630_10819_11031_11109_11205
751629	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_89874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653797	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751633	contig_3269_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_117019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATGTAGTTTTTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104920	105675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_104900_105700
751636	contig_3270_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_104480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198522	199260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_198500_199300
751637	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
751638	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
751639	contig_14322_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_116111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671658	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
751641	contig_18869_pilon	+	2650	12	Intergenic	novelGene_56455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_9	126.734706968585	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	107	2254	176729	189734	FALSE	45	TCATCTCTAATAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LERLQTEGQFALSRRVAELAELPVDNLVIEEITQEMQTLKHIEQWSLKQARIDFWKKCHENFKKNSISSKAASSFFSSQALEACASPAEEQQSGIEERHLLLTLAGHWLAQNDLVPLEELEELEKQIWLCRITQHTLRGNQEDTDPRFSRQISTSGQLSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNGLPSKDSCENRLDGKEEESLNFLIGRLLDDGCVREASRVCRYFGFYNRDVVLVLHCGALASGEAGADDLHAEVQALLQRAELLEEEEESAVAARKVRSTSSLDTQSLKTAPPSDQVVADLKTLTSKCLHGKNSCRQVLCLCELAQDLGCPYTDVAAWGGEAVLRAILASQQPDRCKRAQAFISTQGLKPDAVAELVAEEVTRELLTPSEGAGHKPTFSPAEESQTFLQLTMLCPDLTLVGRKLLDKISSVPHGELACTTELLILAHHCFTLTCHMEGIIRVLQAARLLTDNHLAPNEEYGLVVRLLTGIGRYNEMTYIFDLLHKKHYFEVLMRKKLDPSGTLKTALLNYIKRCHPGDSEKHNMIALCFSMCREIEESLKDGHRLKQLLLKALTLMLDAAESYSKDFCVRQALRCHRLTKLITLQIHFLNTGQNTMLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	176046	190130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_176141_176716_177471_180985_181126_181983_182183_182498_182637_184431_184566_185235_185344_186722_186832_187841_187931_188134_188291_188948_189101_189553
751642	contig_12622_pilon	+	1578	7	Intergenic	novelGene_5881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	42.3415346386448	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	323	1078	1223766	1229143	FALSE	20	GTTGCCTGAAACCCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGLHLSTSEKIFRFQDTGLLLRVLGSLFLGGILAFGLGFSEFLLVSRTSSLTLSIAGIFKEVCTLLLAAHLLGDQISLLNWLGFALCLSGISLHVGLKALHTRGDGGQKPLKGLGSSPDLELLLRSSQQDEEDNEEEQYFVAQGQQ	1222699	1229643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1223015_1223758_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227159_1227336_1228537_1228668_1229012
751653	contig_4125_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_25164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAAGATTTTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915042	914136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_914100_915000
751659	contig_4151_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_65240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTGTGAAAAGACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533079	531360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_531400_533100
751660	SIRV6	-	563	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9450	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
751662	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACCTGCTCATGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
751663	SIRV6	+	526	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751667	contig_5671_pilon	-	1075	4	Intergenic	novelGene_79460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	34	474	531410	392767	TRUE	35	TTCCAGAAGAGGACTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGGQVQILQSLLMEDFKKHYKNFEKIVMTGYIGTEHLYRMEHLSADLRKLGAKILLRLRVHSLDSLPQKAFHKPHCQDPQAYLEEFLPVRLLLHSCPSDPSCQSQWRPQWCLLLLLSFVLLLSHLSPPPLQHLSPVLWSSQPLG	531443	369974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_-_370566_392756_392917_521216_521301_531203
751670	contig_12622_pilon	-	967	7	Intergenic	novelGene_6024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_2	342.042719878997	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	36	593	1688059	1685486	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1688175	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156
751672	contig_10937_pilon	+	2505	1	Intergenic	novelGene_67314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTTAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74874	77379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_74900_77400
751681	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	98	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751686	contig_2069_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_23210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.886026579589	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	820	1788	109104	102624	FALSE	20	TGAGGTTGGTATGAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	109969	102465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_102921_103028_103694_109097_109262_109307
751687	contig_9345_pilon	-	1593	4	Intergenic	novelGene_24332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.9185482500507	263	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	118	1350	113740	110961	FALSE	35	TCAATTTATATCAGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGRSSVFAMQHIVCVPHVLVRRGLLGRDLFMTRTLCSPGPSQPGEKRPEEAALGLYHRLTTLGRALGHSIQRHVSSTAKNWWDRYEEFVGLNEVREAQGNVTEAEKVFMVARGLVREAQGDLEVQQAKLKEVRDRLDRVSREDNQYLELATLEHRMLQEEKRLRTAYLRAEDSEREKFSLFSAAVRESHEKERARAERTKNWSLIGSVLGALIGVAGSTYVNRIRLQELKALLLEAQKGPVSLQEAIREQASSYSLQQRDLHDLMVDLRGLVHAGQGQGSASQTGTSPTQVKDTEVLSAALQEQISHSRQVHSCLKGLQEQLDGLEKTFSQMAGVVQLAKAAVHPGLAEQADRAPPSSLLEQGSMLLALSDMEQRLEAQVNRNAVYSTLVTCVMVAATLPVLYMLFRAS	117782	110717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_111717_112255_112421_113428_113749_117673
751690	contig_14516_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_153921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGCCATTTTGTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245249	245807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_245200_245800
751693	contig_12622_pilon	+	2217	9	Intergenic	novelGene_5875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	57.4847805945191	249	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	283	1437	1221335	1228855	FALSE	25	CACCTTGAGTTGCCTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWALDVAFVWKAVLTLGLVLLYYCFSIGITFYNKWLTKSFHFPLFMTMLHLAVIFLFSALSRALVQCSSHRARVVLSWTDYLRRVAPTALATALDVGLSNWSFLYITVSLYTMTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGLHLSTSEKIFRFQDTGLLLRVLGSLFLGGILAFGLGFSEFLLVSRTSSLTLSIAGIFKEVCTLLLAAHLLGDQISLLNWLGFALCLSGISLHVGLKALHTRGNRGHFLKSGFLMICARPVTSDFPSPHPWASPGRASLVACGCPTVVRPGRSTVQLPLCWPCL	1215033	1229635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1215082_1221100_1221455_1221992_1222144_1222950_1223015_1223758_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227159_1227336_1228537
751694	contig_11429_pilon	+	2386	8	Intergenic	novelGene_60475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	57.0935501557554	201	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	1116	2297	61142	67460	FALSE	5	TGGCTGGCTCCCAGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFEDDPRALGARGHRRSVSRGSYQLQAQMNRAVYEDRPPGSVVPTSAAEASRAMAGDTSLSENYAFAGMYHVFDQHVDKAVPRVRFANDDRHRLACCSLDGSISLCQLVPAPPTVLRVLRGHTRGVSDFAWSLSNDILVSTSLDATMRIWASEDGRCIREIPDPDGAELLCCTFQPVNNNLTVVGNAKHNVHVMNISTGKKVKGGSSKLTGRVLALSFDAPGRLLWAGDDRGSVFSFLFDMATGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	60026	67549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_61148_61759_61870_61989_62121_62735_63044_63853_64035_64134_64277_66731_66851_67275
751699	contig_8330_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_71734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAAACCTGTCTGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464338	466026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_464300_466000
751705	contig_1275_pilon	+	1674	8	Intergenic	novelGene_108804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	31.4765866987525	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1	759	548346	649566	TRUE	15	TACTGAGTGTCTGGTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILVFLCSAAAVLVWGFLWAWDALERMKSWEQTGQLRAGSRTLLVIAHPDDEAMFFAPTVLSLARLRHRVSLLCFSTGNYYNQGEIRKKELLQSCDVLGIPYSSVMIIDNRAFPDDPGVQWDTEHVASDLLQHIEANGINLVVTFDARGVSGHINHITLHAAVRTLHSEGRLPKGCSVLMLETVNVVRKYISFLDLPFSWLQTQNVLFVLSSKEVAQAKRAMSCHRSQLLWFRHLYVFFSRYMRINSLHFL	548345	653817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_548581_566667_566768_622417_622509_625821_625890_630866_630899_632022_632157_649467_649682_653017
751707	contig_3942_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_128839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGGCTATTCTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280969	1280023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1280000_1281000
751713	contig_7378_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_120229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGGCAGTTCAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44473	45937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_44500_45900
751714	contig_11702_pilon	-	1204	8	Intergenic	novelGene_141958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	162.625273533472	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	160	873	319845	289501	FALSE	20	AATCGTGCTTCAGGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	320508	289169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_320390
751715	contig_11560_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_117917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCACTTAACCACAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154887	155922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_+_154900_155900
751721	contig_17198_pilon	+	1869	11	Intergenic	novelGene_62391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.2185827631411	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	628	1443	1063432	1096458	FALSE	40	TAATTGATTGTATAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1047913	1096884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1048196_1048660_1048757_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
751726	SIRV2	-	424	1	Genic_Genomic	SIRV2A	novel	NA	NA	NA	NA	3309	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCAACGTGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1423	999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_-_1000_1400
751727	contig_15720_pilon	-	1096	8	Intergenic	novelGene_41901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1646.70471189077	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	104	1054	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283997	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282580_282750_283785
751732	contig_10023_pilon	-	1275	6	Intergenic	novelGene_123522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_5	385.293965693728	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	11	658	458219	457012	TRUE	25	AACACTTGCAGAGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTKMEAFLESRSGLWAGGPALGQFYRIPPSPSSFVDVASAPYGGPSTRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQVSSQVGVREAKAVGVTVCSSLEF	458229	456017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_457166_457288_457436_457682_457890_458079
751734	contig_4350_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_136376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTTTGTTTCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89796	87996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_88000_89800
751739	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
751745	contig_4486_pilon	+	1206	7	Intergenic	novelGene_38644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	266.118655657376	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	161	568	1016066	1037331	FALSE	50	GCCTTAAAAAAGCAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGQGKQIWRYLG	1014136	1037969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1037297
751747	contig_348_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_67618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATTACATTCTTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343150	343651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_343200_343700
751749	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751750	contig_5479_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_133597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGACCTCGTCTCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282099	280162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_280200_282100
751752	contig_9267_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_162002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACCCAGCGAATACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156253	157997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_156300_158000
751755	contig_11933_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_107272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAACCAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211688	210005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_210000_211700
751756	contig_9646_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_117487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATTTGCCAACTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554653	553759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_553800_554700
751757	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	9	1159	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751759	SIRV6	-	238	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGCACTTCTTCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
751761	contig_12570_pilon	-	1978	6	Intergenic	novelGene_79370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	24.6787357860973	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	36	1040	300289	280932	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300324	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_293908_294088_300198
751762	contig_2550_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_135687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTTAATATGCTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587686	1586301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1586300_1587700
751764	contig_20402_pilon	+	1861	9	Intergenic	novelGene_72846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_5	32.7201677104504	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	290	898	184839	232299	FALSE	30	AGCAGAAACTTTCTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSKASGEQNTKLVDLKLKKLLEAQPQVANSLSGAAQKAVAESSEQDIKNGTEDLRAERRQKATERFRNPVVFSKDSTVRKTQLQSFSQYVENRPEMKRQRSIQEDTKKGNEEKAALTETQRKPSEDEVLNKGFKDTSQYVVGELAALENEQKQIDTRAALVEKRLRYLMDTGRNTEEEEAMMQEWFMLVNKKNALIRRMNQLSLLEKEHDLERRYELLNRELRAMLAIEDWQKTEAQKRREQLLLDELVALVNKRDALVRDLDAQEKQAEEEDEHLERTLEQNKGKMAKKEEKCVLQ	171061	233262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_171085_181985_182111_184547_184687_184836_184944_187595_187720_224301_224402_225530_225605_231867_231983_232208
751770	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751772	contig_7286_pilon	-	792	5	Intergenic	novelGene_108674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4409.998490646	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	115	468	291382	288503	TRUE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGKQPL	291496	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289236_289422_290758_290857_291315
751774	contig_11106_pilon	-	1223	7	Intergenic	novelGene_167451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	151.839462005838	710	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	203	997	161983	133474	FALSE	25	TCTAAAGCATATCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVPCVEPAPELTGFTLLMPAVSVGNVGQLAIDLIISTLNMFKVGYFYTDCLVPMVGNNPYATTEENSTELSINTEVYSLPSRKLVALQLRSIFIKYKSKSFCEKLLSWVKNSNCARVIVLSSSHSYHRSDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNWEEMEKSQCIPGIEDSEFCVRIPGGGITKALHEESCCREIPMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQIIKPCMDDSTVSALPWKIPSSWRLLFGSGLPPALF	162185	133247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_133567_134427_134549_151410_151585_152477_152597_155942_156002_159246_159419_161926
751776	SIRV4	-	294	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1219	8	1219	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
751780	SIRV4	-	319	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	3	1199	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751782	contig_4678_pilon	-	1736	13	Intergenic	novelGene_126040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_9	75.1230472107077	333	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	91	1095	551815	542940	TRUE	15	TCCCCAGGCATCAGTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGDGRPIPTRLFGAGGQAAPQRGQAGAGTMDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGALTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPAQSKLQKAPAPAADPPRYTFAPSASLNKTARPFGASPPADSAPQQNGQPIRPLVPNASKQRLMEDTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASATTQEPWPGPTNPSPTSRPPWAMDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQNRTSIVQAAAGGGIGDGSGSSGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPLL	552855	535644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_536000_536164_536281_536373_536495_542890_543073_544078_544317_544453_544516_545466_545504_545644_545782_546411_546531_547042_547074_547151_547304_551719_551827_552776
751787	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751791	contig_9239_pilon	-	1651	6	Intergenic	novelGene_137173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	55.0875666552808	427	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	13	1119	152733	147127	FALSE	5	CCGTTTTCCATGTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAAVAMTAAGCGGAGAARSLSRFRGCLAGALLGDCVGAIYEAQDPVSLTSVLRHVQNLDPDPGSPGSARTEALYYTDDTAMSRALVQSLLAKEAFDEVDMAHRFAQEYKKDPDRGYGAGVVTVFKKLLSPKCHDVYEPARAQFNGKGSYGNGGAMRVAGISLAYSSVQDVQKFARLSAQLTHASSLGYNGAILQALAVHLALQGELSSEHFLEQLLGRMEKLESDAQSLSDAKELGMEERPYSSRLKKIAKLLEQDSVTREEVVAELGNGIAAFESVPTAIYCFLRCMEPDPEIPSTFNSLQRTLIYSISLGGDTDTIATMAGAIAGAYYGMEQVSESWQQSCEGYEETDILAQSLHRVFQKSL	152745	146594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_147420_148042_148144_148504_148690_149050_149259_149524_149622_152510
751793	contig_13145_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_116652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213814	212534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_212500_213800
751794	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	79	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751795	contig_14467_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_138258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	463	558	307871	307966	NA	35	TTAGCCATTCTTAATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLRVSGLLGTVGSHLLVFTPFLVPEFYTHCHSLSILSLASAHKPCITLSSHPLQSPFPQITALISPHLLCPSIISVLCCIPPPVPAQLLAPHHLAPSISPHSHDLNLSASLCHLPFQPLLSSFGVRICCRRLGEFESLFKPPQPLEACCNLPVMEMIKGLENLCVCVHVCKCLCVRIFILETTK	307408	308519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_307400_308500
751796	contig_14467_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_138259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGTGACAGCACTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308852	309840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_308900_309800
751797	contig_10023_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_123503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAACAAAAAGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407104	407359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_407100_407400
751801	SIRV4	-	319	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1202	0	1202	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751804	contig_7457_pilon	+	1614	3	Intergenic	novelGene_31538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	724	junction_1	56	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	21	647	759164	762942	FALSE	45	TGGTAAACTCACGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNNCCVMEHLQATGTLSAHFRNMVRVEDGEGGSPRRSEGLIAVLSPLQSLKRIKRSDRRGAESVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATATVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSSRGLTKENLVFLAQKLFNSSSNHLEDYSNMSVSWSQFNRVRTTAASCYLRSISQNQMPSGISLS	759143	763909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_759413_760428_760522_762657
751807	contig_14976_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_139965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22374	19844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_19800_22400
751808	contig_6710_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_97994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	30	TTCTTTAACTTTAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751809	SIRV6	-	241	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTCTTCTTTTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
751812	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	202	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751813	contig_2043_pilon	-	2284	10	Intergenic	novelGene_169912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_3	163.259242454795	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	743	1801	782192	694005	FALSE	50	AAAGAAACACCGAATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSYSRHSSYERDGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVIRRSAKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEAAKAAEAAAKAAKASNTSTPTKGNTETGVSASQTNHVKDVKKLKTEHAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVDNNLIVDKATKKAVVAGKESKPAAAKEEPVSLQEKTRSLTPSVGGKEKEQHVTIVTSTLPPLPLPPMLPEDKDADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGEDLSKSPEEKKAATQSHSKRRPKICGPRYGEIKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVL	835440	693521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_694126_704762_704841_704936_705039_718409_718467_719490_719681_773230_773402_775086_775227_776673_776845_782163_782824_835329
751822	contig_546_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_117193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCGGCAGTTCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72627	69948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_69900_72600
751834	contig_6871_pilon	-	2060	14	Intergenic	novelGene_21661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	11.6395571196171	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	266	1621	784881	780790	FALSE	25	CACATAAGAGTTCTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGMQLYKNYQQAQSRHLRPSCLGSPPLKKTNHRLSLPTPSSGSSLSAAIHRTQPWFHGHISREESQRLIRQQGLVDGKSSIISSCRVRRRAAFTSAWMMARPASLTCCSSWSSTS	787709	780350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781129_781300_781389_781511_781573_781977_782059_782347_782447_782687_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_787449
751836	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
751837	contig_854_pilon	-	2206	3	Intergenic	novelGene_36175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	37	1	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1236	1808	471014	470442	FALSE	35	TAAAGCTCATGATCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	474275	470043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241
751844	contig_12786_pilon	-	1308	8	Intergenic	novelGene_103394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	789.405899059152	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	641	1246	600902	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629462	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602804_602956_604600_604719_628731_628938_629303
751847	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	706	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751852	contig_4486_pilon	+	1505	8	Intergenic	novelGene_38643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	465.875476048776	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	373	861	1027888	1037335	FALSE	40	AGCAAATAGTTGTGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQGPDPNIEESPKRKNITYEELRNKNRESYEVTLTQKTDPSVRPMQERVPKKEVKVNKYGDTWDE	1014122	1037979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029856_1033761_1033915_1037297
751857	contig_1639_pilon	-	1551	9	Intergenic	novelGene_74915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	53.6107207095745	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACATTCTTTTGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339657	331874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_332077_332460_332568_333095_333217_335007_335105_335826_335873_335959_336029_336879_336926_338135_338210_338868
751858	contig_10861_pilon	+	1869	3	Intergenic	novelGene_39402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_1	327	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	214	342	1910254	1910382	FALSE	30	AAAGTTTCTAGTGGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVFKAPRADSHGPGRRPLLCPGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKVKLELDSFNEIKFND	1903811	1911909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226
751859	contig_6710_pilon	+	567	2	Intergenic	novelGene_96435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGCACAGTGACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	657521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
751861	contig_7562_pilon	-	1794	1	Intergenic	novelGene_140877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99735	97941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_97900_99700
751862	contig_3789_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_79861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	9	297	305	468638	468646	NA	30	CCCAATGGACTTGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGRGAAGLEEHRPYWLSRTAFPTPLECICHSPHKRAVVLSQTLETITGHSEGFLPLLFVQTCCASVYCVNVFNLIFSVCRVINELIGNLVGHLYFFLMFR	468341	468648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_468300_468600
751865	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751868	contig_11121_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_167049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAGCTTTTGTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13776	12790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_12800_13800
751869	contig_990_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_76031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTCCACCAATCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757371	756131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_756100_757400
751871	contig_10235_pilon	+	1167	4	Intergenic	novelGene_46335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	222.519412386625	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	80	415	109120	109734	TRUE	15	ATCCAGTCAGCTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQASWQKKAKPASFVCLLTSASICGAMSQIRDLQGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKSELGGRGRMGGGGGGSRISTEGEGDAESQNLLLSWEEERLPLLSARLQSLSLACPSQSTL	109040	111323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_110308_111144
751872	contig_10734_pilon	+	2194	2	Intergenic	novelGene_51145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890417	892718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_890850_890956
751873	contig_6576_pilon	-	1006	10	Intergenic	novelGene_42237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_5	52.971923613911	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	269	1006	252452	230385	FALSE	30	GTACAGGTAAGAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRAQSLLNTDREASIDILHSIVKRDIQENDEEAVQVKEQSILELGSLLAKTGQAAELGGLLKYVRPFLNSISKAKAARLVRSLLDLFLDMEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSR	261305	230384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_258751_258854_261240
751877	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_95588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657818	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657820	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
751879	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751880	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751886	contig_9727_pilon	-	1019	5	Intergenic	novelGene_86320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	271	342	314385	314314	TRUE	60	TTTGGAGAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIFIRKPHLVSASLTQNRDWVASKSPTAFIFHPLLRTEDEGWGGVRQSLKCPLLDPREFTLPAICPTVPQWGTRGPSGLKAVTKGVPVCMASGWNQGGSQTPRPLGLFLHSG	314655	309190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_309345_309986_310088_310904_311013_312911_312991_314078
751890	contig_12270_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_114078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	27	335	14409	13878	FALSE	20	CCGCAGTTTATTACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAED	14435	13876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
751892	contig_9516_pilon	-	2004	15	Intergenic	novelGene_106177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	122.233967689603	1	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1002	1316	884684	881734	TRUE	35	TAAATTAAAATCTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVEMLRASTI	913291	877769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_878020_878363_878565_880053_880179_881621_881761_883611_883753_884205_884295_884626_884735_888743_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898245_898381_899602_899703_905481_905625_913084
751897	contig_12277_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_139667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTATTTTGGGACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37704	40239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_37700_40200
751906	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751910	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	6	1151	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751913	contig_1399_pilon	-	1713	3	Intergenic	novelGene_166662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	16	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	454	861	82083	74308	FALSE	30	TGAGTTTACTGATGGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIAASSVQGFSTVWQGLECAAKCIVNNVSAETVQTVRYKYGHKAGEATHYAVDSAVNVGVTAYNIDHIGLKAMVKKTAKQTGHTILEDYKIVDNSQGKDREGGASVKVTGQKEEQLEVEEQKEELEKKAKKKEK	82536	73455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055
751915	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751919	contig_9706_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_20943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAACCCGTTGCCATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258407	255867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_255900_258400
751925	contig_7870_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_108899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	872	1321	180025	179576	NA	35	AGTAGAATGGAGGCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDMTTSSCQKILPRIYLLLSLDSACLWVSFIFIQDLSSWQQEGSSRVVLYQLSIIRSKEEFFFFFAVGIEESQESFFFSWLRPLVYSLFVPDPFTMAEECMTLISQAWDACPPLEPGVRSTPLKPQRLGVGERQFPPKMVLQKRKKE	180896	178869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_178900_180900
751930	contig_18438_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_171385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCTCCCATAAGGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92367	92590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_92400_92600
751932	contig_7816_pilon	+	1306	9	Intergenic	novelGene_66495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1276.84072396482	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	90	1205	170169	211658	FALSE	45	GAAAAATGAATTGTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170079	211759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_195870_195950_196744_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
751937	contig_3095_pilon	-	1227	5	Intergenic	novelGene_75037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152246	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149909_150434_150694_150995_151169_151855
751938	contig_10641_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_171402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTACTTTATAGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207517	208264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_207500_208300
751939	contig_10641_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_171403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATGACCTTGCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208415	209321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_208400_209300
751943	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
751945	contig_7171_pilon	-	1406	9	Intergenic	novelGene_101366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.4068003371425	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	797	1267	1354262	1353537	FALSE	10	CCTGCTGACCTTGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEARSSGLVSRVFPDKEVLFHAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFRPITVRLPFQCSQSELSSLLYAVCSDWWAIGYPPIFIGPTLIFPASSVAVTLFLPRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1361017	1353397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356350_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1357446_1360023_1360113_1360257_1360465_1360899
751948	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_96050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653801	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
751950	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8141	-1	598	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCGCTTTTGTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
751953	contig_3081_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_133903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	787	1497	22217	22927	NA	30	TTTTATGGAAATAGTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGREYQKNVYLCFTDCGKASDCMDHDKLWITLGRMGIPEHLIVLMRNPYIDQEAVVRTEEGDKVSMCQDCILPPYLLNLYAEQIIGEAELYEEERGIRIGGRLINNLHYADDTTLRAEGEEDLKHLLRKIKDYSLQYALHLTIKKTEILTTGPISNIMLKGEKIEVVKDLILLGSTINAHGRSSQQIKQRIALGKSIAKDLFNVLGKAMIFSVASYTCERWTMNKEDQRRIDGL	21430	23684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_21400_23700
751954	contig_6489_pilon	-	2339	1	Intergenic	novelGene_128960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAGAGTCCAGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391600	389261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_389300_391600
751956	contig_13453_pilon	+	917	7	Intergenic	novelGene_146719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	151.847968559199	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	447	857	132546	145330	FALSE	30	AACCTCTTTTGGCTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQAFSFKTKDIEDAMTNTLLHGGDLHSALDWLCLNLSDDALPEGFSQEFEEQQPKSRPKFQSPQIQATISPPVQPKTRKQEEDSKIKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQNEEEKSENSKSLEEEEKFDPKWKL	126452	145390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_129696_129771_131069_131184_132536_132667_136355_136502_139216_139346_145315
751961	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
751964	contig_9029_pilon	+	1858	2	Intergenic	novelGene_155134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	158	472	732997	733311	FALSE	35	TACGTTTATAAGATGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVTGTLVLLLPAGFLGCSAESREAPVIVPSYYTTSDAVSAPETVFIVEFSLTWKNGRQSIPLYANVRGKQFPVTRGQDVGRYQVSRSLEHRHPLRHLRGQVL	730168	734697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_730310_732980
751972	contig_4742_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_130967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCGTAAAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59955	59266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_59300_60000
751973	contig_9389_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_84040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	32	99	221	319	585482	585580	NA	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLTARGPCDVQVYLGVASWRRWNRLSRADPSVGWCLKPLNGSGFGLGLGYSQIALLSDSFFHSLQESQWFLNMSKSGQIFATRCQGTPAWECGMLLVHHREERC	585261	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_585300_586300
751974	SIRV6	+	562	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
751976	contig_7962_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_149305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGACTTATAAGGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394850	396931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_394800_396900
751979	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
751981	SIRV6	+	237	3	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	487	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
751983	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
751984	contig_8138_pilon	+	1331	7	Intergenic	novelGene_52425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	383.750099529484	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	217	528	280295	305581	TRUE	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGESES	280078	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_305564_305654_306364_306796_307634
751985	contig_20895_pilon	-	1048	2	Intergenic	novelGene_171407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAAAATAGTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2686	996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20895_pilon_-_1943_2584
751986	contig_20895_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_171406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTAAGTCAGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952	72	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20895_pilon_-_100_1000
751990	contig_7622_pilon	+	1274	7	Intergenic	novelGene_132403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	124.95554765151	1235	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	119	457	252072	255078	TRUE	30	GGTTATTTTTGACATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPLPPSLGAGDPAALSCRCGACCSRSRRGLGGRGLWAGMNRAPGGSRAAEPEPCGNPNEQWFKGSSCRIFSPCFPHRGQHSGSGWADHCCRRICRPLCFASHEACGTSSKTGFSESAKICLQWWLLQRWIRTQNDKTRSSIDTGCKPYCQ	251953	257135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252810_252882_252974_253027_253105_253180_254141_254222_255063_255135_256374
751991	contig_9696_pilon	-	1412	3	Intergenic	novelGene_68751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAGAGAAAAAAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68240	47357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_48512_65991_66097_68087
751992	contig_12638_pilon	+	1193	13	Intergenic	novelGene_33163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	184.606544815965	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	268	993	269821	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFKPLPPPAKGPAQFPQA	235649	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269523_269773_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271404_274209
751995	contig_3529_pilon	+	1151	7	Intergenic	novelGene_105380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAGATGGCCGCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777093	790209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_777508_778712_778894_784507_784633_785189_785354_786998_787118_789783_789822_790099
751997	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_97133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752004	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752005	contig_6233_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_74751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112900	115035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_112900_115000
752006	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	410	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752008	contig_18799_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_171415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	221	607	12645	12259	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWEETASIVNPNSDFCNMGEPELLFLQSLKWQRMLAEHRRCLPGRQQTSLNTQYKGPTEVLPLYTFQQHKKARARYVCSRDGRKNLCCPVEPQGPLFNTRGTPLGNKPPLPTPWKELARIKNHQGR	12865	10617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_-_10600_12900
752009	contig_12270_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_113574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	ATGCTGCTTATAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
752011	contig_14790_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_127905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTTCCTTAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140366	139604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_139600_140400
752014	contig_8020_pilon	+	2330	16	Intergenic	novelGene_114353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	39.6734447990368	243	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	160	1992	55752	66641	FALSE	20	TGGAATATGTGTGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGDAQGRRAGGGLRAAGGLSTVTGVPLSGSDAAGRCAEAEERTSAGAEPAAGPMDSCASIDIEDATQHLRDILKLDRPAGGPSAESQRPSNTYNGDLNGLLVPDPLSSGDGTSTSKPGLRAMPPINLQEKQVICLSGDDSSTCIGILAKEVEIVASSDSSISSKARGSNKVKIQPVAKYDWEQKYYYGNLIAVSNSFLAYAIRAANNGSAVVRVISVSTSERTLLKGFTGSVADLAFAHLNSPQLACLDEAGNLFVWRLTLVNGKIQEEILVHIRQPEGTPLNHFRRIIWCPFIPEESEDCSEEGSPTVALLHEDRAEVWDLDMLRSSHSTWPVDVSQIKQGFIVVKGHSTCLSEGALSPDGTVLATASHDGYVKFWQIYIEGQDEPRCLHEWKPHDGRPLSCLLFCDNHKKQDPDVPFWRFLITGADQNQELKMWCTVSWTCLQTIRFSPDIFSSVSVPPSLKVCLDLSAEYLILSDVQRKVLYVMELLQNQEEGHACFSSISEFLLTHPVLSFGIQVVSRCRLRHTEVLPAEEENDSLGADGSHGVGAVESAAGVLIKLFCVHTKALQDVQILSQPVLLSLIQQLASDLGTRTDLKLSYLEEAVMHLDHSDPITRDHMGSVMAQVRQKLFQFLQAEPHNSLGKAARRLSLMLHGLAAPSLP	55592	66979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_55834_58412_58570_58976_59089_59383_59484_59746_59937_60037_60186_60270_60376_60678_60789_60871_60956_61050_61147_61242_61346_61466_61648_61741_61815_61923_61947_66149_66226_66448
752015	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752016	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_96835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752018	SIRV4	-	302	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1204	15	1204	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
752019	contig_6589_pilon	+	1384	11	Intergenic	novelGene_26217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	76	junction_1	152.841879077693	1189	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	73	1188	2048791	2059863	FALSE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMENFVATLANGMSLQPPLEEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048718	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051047_2051102_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
752020	contig_12179_pilon	+	2759	1	Intergenic	novelGene_128007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525729	528488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_525700_528500
752023	contig_1406_pilon	+	1276	2	Intergenic	novelGene_25514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTAAGTATCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604926	1608440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1604948_1607185
752024	SIRV6	+	547	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1586_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752033	contig_14814_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_137751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTCTGTTGCTGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402223	401723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_401700_402200
752036	contig_10765_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_122952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	69	485	331823	331407	NA	80	AAACAGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLCQEIWKTTTWPTDWKRAIFMPIPKKGGPMECGNYRTILLISHASKILLKNVQKWLQQYIDRELPEIQARFRGGPGTRDITADVRGILAESREYQKDVSLCFIDYAKAFDCVYHNKLWITLLRMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVRTEQGDTAWFKVR	331891	329377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_329400_331900
752041	contig_14687_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_107892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCTAGTCCCAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415335	417042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_415300_417000
752045	SIRV4	-	244	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1270	7	1270	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3888	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
752046	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752047	contig_5947_pilon	+	1742	2	Intergenic	novelGene_101620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAAGGAGGCTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003732	1007418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_1003794_1005737
752049	contig_4087_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_156069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTGTTAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59777	59087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_-_59100_59800
752055	contig_3789_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_79893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	643	1032	591005	590616	NA	85	ATACAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLIQVALPALDKSLVYIVSNSVFVSYCCCKKCVTNSGASNNTNLLSYILEVMGLTGLKSRCQQGCVPFWGLKGRIHFLAFSTFWRPSEFLGLWPPSHFKASSGQWSLSQLYPSDPDSCLVITLGPSG	591647	589593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_589600_591600
752058	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752063	SIRV7	-	254	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91668	4	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
752066	contig_776_pilon	+	2510	3	Intergenic	novelGene_139913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGCGACGGAGTCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732946	788052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_735246_748603_748781_788018
752067	contig_12010_pilon	-	1085	10	Intergenic	novelGene_160935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_9	40.4084088547525	278	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	13	1029	68491	44910	FALSE	10	TGTTTGGGTGTGCTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVTLGGRGLRLWRVARGGGAGWKFIATSPASQLSATELTEMRNELFNKEKSRQLSLTPRTEKIEVKHVGKTDPGTVFVMNKNISTPYSCAMHLSEWYCKKSILALVDGQPWDMYKPLTKSCEIKFLTFKDRDPREVNKAYWRSCAMLLGCVIERAFKDEYVVSLVRAPEVPVIAGAFCYDVVLDKRLDEWMPTKENLRSFTKDAHALIYKDLPFETLEVEAKVALEIFQHNKYKIDFIEEKASQNPERIVKLHRFGDFIDVSEGPLIPRTSVCFQYEVSAAHSLQATQPGLVRRFQGLSLPTHLRAHFTIWNKLLERSRKLVTEDQTKPTEESAPT	68503	44853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_44958_49058_49107_53133_53288_54214_54281_56126_56240_59413_59482_61445_61546_63993_64134_67290_67498_68418
752073	contig_8651_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_168177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAATTTAATAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174705	172758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_172800_174700
752075	contig_18584_pilon	-	2245	12	Intergenic	novelGene_171429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_11	20.2039191026751	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	84	2180	37392	20492	FALSE	30	AGTTTACGATGGAATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKTGCFLWNLRQFSTLVPASRRTVRLVDLLGFCRPKIVHPNRNPRNLFLNDFDNRVHSSIRYLFQNALTFKSGDEGFQTNGISTVTVPTVDRLLCPRRLSFDSKHFFVSVGTPDDGVKKINFHHEVSNEDVLINEAKPTPITYRRLSQECNSVSDVLDAFSKAPAFPSSNYFTAMWKIAKSMSEDQKHFEKQLMFNHPSFNQLCEQMIREAKIMHCDCLLFSLQAMVKLGIPQNTLLVQTLLRVVQERINECDEKCLSVLSAVLEAMEPCKNVDVLRAGLRMLVDQQVWKIEHVFTLQTVMKCIGKDAPIALKKKLEMKALRELDRFSILNSQRMFEVLAAMNHRSIVLLNECSKMVIDNIHGCPFKILLSILQSCKDLRYRNLDLFKGIADYVATTFDIWKLKQVLLLLILFETFGFRPIGLMDLFMKKVVDEPRFLNMKSTIAILHVYSSLNHFHKCQNKEFLDIMAGALTGYLHQISSENLLYAVCSFCLMNHFPLAAINQLLQKDIISELLTSDHVERNVHKLHLLDTCLELDDTPYHRSIDISLPQVLSAPVHPNTKVEEVLSSLLGGEGYFSKNVQLPHNYYIDFEIRMDANRSQVLPFSDVDGVLSATDTQRVGVLCVRRSSYCLDSTHPRGLLAMKMRHLNVMGFHVILVNTWEIEKLEMKDAVMFLKTKIYSTEALPTAEVNLQSTY	38157	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18584_pilon_-_20612_21831_21947_23613_23702_24110_24327_25308_25473_30640_30814_31918_32059_32294_32419_32715_32825_33511_33616_36648_37461_38142
752076	contig_10135_pilon	+	2596	10	Intergenic	novelGene_106667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.02254900194121	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	211	1137	126543	129137	FALSE	40	GGTGAAACAGCATTAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTLGLAPIGPLPRRSPRREEPLPNPGSFDELHRLCKDVFPAQMEGVKLIVNKVLSSHFQVAHTVHMSALGLPGYHLHAAYAGDCQLSPTEVFPTVVGDMDSSGSLNAQVLLLLAERLRTKAVFQTQQAKFLTWQFDGEYRGDDYTATLTLGNPDLIGESVIMVAHFLQSLTHRLVLGGELVYHRRPGEEGAILTLAGKYSAVHWEATLNVGSGGAHASYYHRANEQVQVGVEFEANTRLQDTTFSFGYHLTLPQANMVFRGLVDSNWCVGAVLEKKMPPLPVTLALGAFLNHWRNRFHCGFSITVG	126119	130596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_126194_126406_126658_126952_127021_127310_127404_127676_127779_127925_128032_128217_128341_128455_128533_128755_128859_128997
752079	contig_13112_pilon	+	594	4	Intergenic	novelGene_98824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_2	242.612173368664	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	56	331	222004	227655	FALSE	25	GGAAAGTTTGGATCTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKEATCCGKLGPGLTAGGMETTLEQHLEDTMKNPSIVGVLCTDSQGLNLGCRGTLSDEHAGVISVLAQQAAKLTSDPTDIPVVCLESDNGNIMIQKHDGITVAVHKMAS	221948	227918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_222039_223786_223849_226376_226495_227594
752086	contig_10506_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_125173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11581	14236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_+_11600_14200
752093	contig_10575_pilon	-	1014	4	Intergenic	novelGene_141810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCCAGCGTCAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379328	293736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_293812_300844_301044_301770_301897_378714
752094	contig_1948_pilon	-	1379	2	Intergenic	novelGene_31145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACAATCTAGCTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115206	113603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_113953_114176
752096	contig_7049_pilon	-	1499	5	Intergenic	novelGene_171433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGGGAATGAGGCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93489	90387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_90534_90810_90880_91081_91656_92022_92673_93429
752097	contig_3721_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_123840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTAAAAAAAGAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365445	363971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_364000_365400
752098	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752101	contig_12080_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_128372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTCCGGATGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140324	138277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_138300_140300
752103	SIRV6	-	199	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGAACAACTTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11104_11201
752104	SIRV6	-	267	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1008	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2828	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1542_1647_1735_2779
752106	contig_4952_pilon	+	302	2	Intergenic	novelGene_145543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGTTTGTGTGGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534546	538451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_534716_538318
752112	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-9	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752114	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
752116	SIRV5	-	264	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACCCAATTCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
752119	contig_14034_pilon	+	1865	7	Intergenic	novelGene_72637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7.40870359029762	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	36	581	152621	157240	TRUE	45	TTGATTCACAAGAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRAGVATLEVAMATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKADVKGKPCEDHCILQHSNRICVITLAGSHPVLQSGKTIKSISYQISTNCSRLQNKVSGKFKRGAQFLTELAPLCKIYCSDGEEYTISSCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152585	158671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_154464_154595_156785_156863_156941_157012_157102_157326_157472
752120	contig_11846_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_105947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGGCCTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270129	268173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_268200_270100
752121	contig_11364_pilon	+	1845	2	Intergenic	novelGene_65171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1370	1708	123352	123690	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSRRVAGRFEPLTFQLAVEHHQGSLTGQYSGIRALPFHLDLGELSLLGHPSSRALCGIGSGLCCSCIKVQHLPLPNPASFSPPGDFMRLLPSTLSANEPPSHSWLPRNLT	120446	123827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_121802_123337
752126	contig_13004_pilon	+	1976	1	Intergenic	novelGene_112692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACACACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824685	826661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_824700_826700
752127	contig_3942_pilon	-	2371	19	Intergenic	novelGene_128674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	21	371	401737	399708	TRUE	10	TCCCGCTGCGGCAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGSPRMKMGLSAPTRVGPAASSSDEKANLGIVSRLMVLRRDGLGPCSAWDEDEWQEEPEDVQDRRRTSVLSRRLDSTSLLRSQPSSRSSLKLLSAKVGVGWAARNSELLPTLLNRWEQEEN	401757	388502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_388577_388658_388731_389186_389264_389741_389899_390014_390092_390358_390573_390654_390754_391143_391274_392742_392807_393362_393450_393839_394048_394599_394739_396640_396774_396945_397113_397835_397937_398746_398872_399631_399748_401248_401379_401556
752128	contig_3822_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_133334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTGTTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320818	318692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_318700_320800
752131	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	44	3410	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
752132	contig_7272_pilon	+	2006	2	Intergenic	novelGene_25400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	82	318	772576	772812	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVAIYFRKDLQPWKPYGDSSTLSYRVAMNRIGPDGSGFGLIEMEDCQHMSYFPCLRPSRQEPACPSIPVNAVLQAATTSGSELAQAMKTFTFSDQKGIFNGKTNT	772494	776945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_774192_776636
752133	contig_7513_pilon	+	2041	3	Intergenic	novelGene_88942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.5	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	227	367	128719	128859	TRUE	50	TAACTGTAAAAGAATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCVALTPVPSVSPAFSSARAQLPGAATLPFFLLPLCLEVLGSRERWRLSPLSGWASRKCHGCGSGSSSAGGGRQMKSGWFKLFIPPEFERNRAAAEPSVLELPAPNVTPPLLGRTPRVGI	128492	131418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_129165_129418_130154_130784
752134	contig_11846_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_105922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAGAGCTGTTTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163936	164197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_163900_164200
752135	contig_11846_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_105923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164604	166156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_164600_166200
752137	scaffold_16539_pilon	-	1182	9	Intergenic	novelGene_68398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.6472074831583	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	54	896	800534	795221	TRUE	10	TCCTGCTTCATTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGRIWQGHTAAGLVTMEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRLCGPAR	800587	794779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795940_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
752143	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752144	contig_5799_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_50242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACATGATATCAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158121	157567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_157600_158100
752146	contig_6086_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_171463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTACACCTAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82313	80075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_80100_82300
752147	contig_9696_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_68757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGTCTGAGAGTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131810	130882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_130900_131800
752148	contig_6710_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_89757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752150	contig_11328_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_88374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTGGCGCAAAGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581850	583118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_581800_583100
752153	contig_11016_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_163287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCAGGGCTGGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33445	31035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_31000_33400
752154	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752155	contig_1085_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_171470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCACAGCCTTTCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817857	817497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1085_pilon_-_817500_817900
752158	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752165	contig_14142_pilon	+	2247	11	Intergenic	novelGene_120477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_3	188.085193462962	648	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	193	1371	268562	274116	FALSE	15	ATCACCTGTGTGTCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQSDLSTELPLSQETFSYLWELLPEKPVLSPSLPPAVEVVEVADDLLLTEDAATWLESQVGAQEISAGPAPATPTPVALIPATSWTLSSSVPSQKTYPGTYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPDLNKLFCQLAKTCPVQLWVTSPPPPGTRVRTMAIYKKSEHMTEVVKRCPHHERCSDYSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLEDSVTLRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHFNFMCNSSCMGGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRICACPGRDRRTEEENFHKKGETSPEPPPGRSTKRALPTNTSSCTQPKKKPLDEEYFTLQIRGRERFKMFLELNEALELKDAQAGKEPEGSRAHSSPPKSKKGQSTSRHKKLMFKREGPDSD	261202	274992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_261367_268533_268636_268775_268798_268887_269158_269608_269796_269877_269991_270242_270353_270673_270814_270915_270990_273349_273457_274034
752167	contig_6497_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_35600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465208	463084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_463100_465200
752168	SIRV6	+	236	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8459	14	280	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
752170	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_93988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752175	contig_9696_pilon	+	1559	3	Intergenic	novelGene_68798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTGAGTCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353628	358093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_353965_356779_357007_357097
752176	contig_15323_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_148535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156844	155214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_155200_156800
752179	contig_11898_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_144298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAACCATGGTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259520	261229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_259500_261200
752180	contig_11304_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_156697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	535	846	355640	355951	NA	50	CCTGAAGAAAGAAGAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSVANSYLENIFYRHHGKIICLAWSWDNEHFVSGGMDVMVYIWILSHPETGVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDTSVKEWTVNLQRPPLPPPWPD	355105	357092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_355100_357100
752181	contig_6504_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_158779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAACCAACTTGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220868	220163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_-_220200_220900
752182	contig_16098_pilon	-	1351	4	Intergenic	novelGene_46069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	18.1903515328563	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	668	1018	446699	445488	FALSE	10	TTTTCGGGTCTGTGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	447458	445154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668_446796_446887
752183	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_98163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCTTGCAGCTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653824	653458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653800
752184	SIRV6	+	532	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752193	contig_9706_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_21023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATCACCCAACTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574564	576472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_574600_576500
752194	contig_5620_pilon	-	1894	7	Intergenic	novelGene_161355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_5	224.833024462353	76	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	148	846	410961	389356	FALSE	5	TCGCTATTTTCCTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFSVEEEDSSEDGVHLIVCVHGLDGNSADLRLVKTYIELGLPGGRIDFLMSERNQNDTFADFDSMTDRLLDEIIQYIQIYSLTVSKISFIGHSLGNLIIRSVLTRPRFKYYLHKLHTFLSLSGPHLGTLYNSSALVNTGLWFMQKWKKSGSLLQLTCRDHSDPRQTFLYKLSKKAGLHYFKNVVLVGSLQDRYVPYHSARIEMCKTALKDKQSGQFYSEMIHNLLHPVLQSKGCNLVRYNVINALPNTADSLIGRAAHIAVLDSEIFLEKFFLVAALKYFQ	413210	388307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_389562_391482_391597_405114_405226_406762_406915_409445_409544_410943_411036_413137
752199	contig_15146_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_116950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAAGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474418	476476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_474400_476500
752202	contig_5019_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_109190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112227	114381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_112200_114400
752204	contig_7457_pilon	+	1642	8	Intergenic	novelGene_31729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	34.415231559083	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	60	1382	1326236	1330119	FALSE	5	TTTTTGATTCTGGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGPVKLLSAPACHLTLVMSCRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRSVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFVGGAGSGFVGGAGSGFGSVFGGGFGGGFGSGFGDFGGGDGGLLSGNEKFTMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIREWHLKQSPTSPEHDYSNYYKTIEELRGKILVATTDNNRVILEIDNARLAADDFRLKHENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLVKTDLEMQIESLNEELVYMKKNHEEEMKEFSNQVAGQVTVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDAEEWFNNKSAELSKEVTSSVTMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLESTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEQQLSDLRSEMECQNQEYNVLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMTGFTSGGGKVSTTTTTTTSRLTSETRRT	1326176	1330379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1326719_1327741_1327825_1328016_1328174_1328339_1328502_1328612_1328739_1328829_1329051_1329704_1329731_1330054
752205	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752207	contig_15882_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_144801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	118	528	39674	40084	NA	75	AATAAAAAAAAAAAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPGPWLLPKGTQPSCSMGWEAHHTISCHFSATASHHPQGYSLHSVSWVQELHSAGILSPKDVLAPGCSFLVVAYLLFPVSGVACFKASRIAKLTNFFGEPQLPYYTGPPNHLGGSYKTMAGKATQKRSMTPLEW	39556	41091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_39600_41100
752208	contig_15327_pilon	+	1661	6	Intergenic	novelGene_70449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.2387049982682	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1	588	275426	276013	TRUE	15	TAGGCTTCCTTTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAWCLRWGVSRAGAWLLPPPACCPRRTLHKQVDGAEFQSIYSLDKLYPESNGPDTAWKVPVSREPGNTEGAFPCRFWVTSGIWVRIGLACSCVEALPCAPRDVRRAGELVTPATGASVWSGCLGAGCSSGSFRLGRANWICSFQGHQLFRVSFPAHGPKFLSRRQMGSFWSSRVDKKGQSLHTCLLNGRLHCP	275425	280802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_276399_276943_276981_279030_279091_279626_279710_279797_279968_280464
752209	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752211	contig_9332_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_60713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTTTTTTTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79932	80489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_79900_80500
752217	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752219	contig_6710_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_91253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGAAGGAAGCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
752221	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	0	1206	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752222	contig_4180_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_8413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAACAGAGTTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889347	888304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_888300_889300
752224	contig_18869_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_56004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTGATCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73557	73333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
752228	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
752230	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_90107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653805	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752231	contig_8065_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_107343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACAGGTTAGACTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255066	257358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_255100_257400
752232	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752233	contig_5059_pilon	+	2853	9	Intergenic	novelGene_140723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	181.164591946108	17	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATGCATGTGGTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232141	259568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232206_243396_243504_244759_244828_250083_250134_250448_250558_251589_251698_253218_253315_253949_255964_259331
752235	contig_3233_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_56606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGTTTAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963236	962134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_962100_963200
752237	SIRV2	-	246	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	680	22	680	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4052	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
752242	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
752245	SIRV6	+	324	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
752248	SIRV6	+	528	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	40	6	27	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	234	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752251	contig_10861_pilon	+	2056	8	Intergenic	novelGene_39400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	379.580864445326	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	218	937	1910254	1930717	FALSE	40	CTTATTAAACTATGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLVVFKAPRADSHGPGRRPLLCPGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKG	1903807	1931836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1930711
752255	contig_8420_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_69366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCCTTACGAAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224173	223370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_223400_224200
752257	contig_2069_pilon	+	2340	7	Intergenic	novelGene_23253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	179.425704215793	7	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	266	850	341330	344966	FALSE	35	TATCACTACCATTTACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGTTGQPQATPNKGRGEDHSGASAAG	323999	346456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_341239_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_344889
752261	contig_6710_pilon	+	511	2	Intergenic	novelGene_97813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
752267	contig_753_pilon	+	1879	2	Intergenic	novelGene_113033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	617	916	1436646	1436945	FALSE	65	AAAACAAAATAATAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKSYFYDVYEVGLLAVMLMRQESICKIRLCLKSISFEISEQRDMGISLPPSKKKEEACILWTRVSRAEKLLDQGKIDDKDLPPELTERVSPSLELVP	1424901	1437908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1425447_1436574
752273	contig_5686_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_45469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTACTGATAACTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223674	222558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222600_223700
752274	SIRV6	+	542	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752286	contig_9571_pilon	+	1317	2	Intergenic	novelGene_136264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTATTGTGACCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374592	375982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_375535_375607
752291	contig_4156_pilon	-	2452	17	Intergenic	novelGene_88077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	96.2435062744495	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	69	2129	433553	161269	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWGGSKPRKSAPKSGPLLTMLWMKDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKTEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGKSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYEVICQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQEDLLLFSCAGAHPRHQRICPCRDFIKGQVALCKDCL	433621	160945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_161468_169170_169329_182021_182097_187879_187997_196659_196807_209648_209799_272130_272265_299446_299581_305919_306055_310022_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_415875_415949_433550
752292	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752304	contig_15629_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_122438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTGCTCAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74989	72927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_72900_75000
752312	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752318	SIRV2	-	614	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	45	2958	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
752320	contig_3153_pilon	-	1310	4	Intergenic	novelGene_104677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_3	103.11913282973	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAACTGAATAAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247654	223896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_224999_229052_229138_233949_234037_247618
752321	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752324	SIRV6	+	545	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1120	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
752327	contig_7333_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_142780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1388	1690	217233	217535	NA	20	ACCAATATGGCCCTTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYLSWSLLQRCFGHNFRSHLHQGKYLKIIPVHLLMLLLYVWQVYSCYFLQVTYGTLAFFFSPLRTWLTLLTPVLIRCVWTLNPSELGTFTVQLKSHLSS	215845	218062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_215800_218100
752332	contig_11699_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_171472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	485	853	19716	19348	NA	15	ATACCCTTCGTCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSPGTRLHSILAPLNFGSAWFPVSYIGPLCLSFCICEIEVIVPTSQGCHEGQISGIYHGVWCTVSSQLLYIIVENVLKISLRAYKEKSLQGKDQRIWCLTLVFFSSGSRVRPYVTVGVI	20200	18698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11699_pilon_-_18700_20200
752333	contig_11699_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_171471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCTTTAATGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18079	16980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11699_pilon_-_17000_18100
752334	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
752335	contig_10940_pilon	+	496	2	Intergenic	novelGene_49244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCGCGGCAGTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874035	917155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_874293_916916
752345	contig_11476_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_170512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTATCTCACGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363926	363636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_363600_363900
752351	contig_5981_pilon	+	1313	5	Intergenic	novelGene_35531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	129.712181386329	55	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	50	559	289114	298029	FALSE	50	GTGACAAAAATTTAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLARGGCSCCRLGGFAMPTTQQSPQDEQEKLLDEAIQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYELYMAISDELHYLEVYLTEEFAKGRKVADLYELVQYAGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFPQSRKDILKDLVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEPAE	289064	298783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_289117_294391_294491_296426_296524_297238_297363_297842
752354	contig_14720_pilon	-	1997	1	Intergenic	novelGene_164981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCCATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156842	154845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_154800_156800
752357	contig_17989_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_150835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	59.9648657462596	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	496	1497	271542	266567	TRUE	20	CTGCATCTCTGGTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQCCRKIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDRNFDSEICGVVSDAVWDSREKQQQILQMAIVEHLYQQGMLSVAEELCQESTLNVDLDFKQPFLELNRILEALHEQDLGPALEWAVSHRQRLLELNSSLEFKLHRLHFIHLLAGGPEKQLEALSYARHFQPFARLHQREIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLSVSFASGCVALPVLMNIKAVIEQRQCTGVWSHKDELPIEIELGMKCWYHSVFACPILRQQTSDSNPPIKLICGHVISRDALNKLINGGKLKCPYCPMEQNPADGKRIIF	283763	265934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_266045_266157_266631_266714_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269823_271169_271311_271437_271597_272727_272819_278208_278360_283564
752358	contig_6445_pilon	-	1454	16	Intergenic	novelGene_76987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_2	138.980030539962	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1446	7	1452	511941	413899	FALSE	15	CCAGGTATGCTGCATGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVLFCSSGFRCSPLAASLRLLRLLGLLQLLAEPGLGRVHHLALKDDVRHKVHLNTFGFFKHGYMVVNVTSLSVNKPEGATDKDPTIGFSLDRTKNDGFSSYLDEDVNYCILRKQSVSVTLLILNISRREVRVKSPPEAGTQLPKIVFSKDEKVLDQSQEPSGNPVSAGNQTQKNEDSGKSKRSTVNSKPMGEKSFSVHNNDGAVSFQFFFNISTDDQEGLYSLYFHKCRGNETQSSDKVSFSLDIEITEKNPDSYLSAGEIPLPKLYISMAFFFFLSGTIWIHILRKRRNDVFKIHWLMAALPFTKSLSLVFHAIDYHYISSQGFPIEGWAVVYYITHLLKGALLFITIALIGTGWAFIKHILSDKDKKIFMIVIPLQVLANVAYIIIESTEEGTTEYGLWKDSLFLVDLLCCGAILFPVVWSIRHLQEASATDGKAAINLAKLKLFRHYYVLIVCYIYFTRIIAFLLKLAVPFQWKWL	511947	413896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_413977_415434_415485_433580_433625_440892_441024_445873_445992_446430_446505_447823_447900_454080_454215_454572_454684_458144_458202_460227_460266_462440_462581_464510_464591_464844_464896_465247_465371_511800
752364	contig_5018_pilon	-	1903	11	Intergenic	novelGene_46988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	52.9698027181525	108	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	737	1765	649963	643667	FALSE	15	TCCCTGCCTCCAGTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYNIWCDGCKNHIGMGVRYNAEKKKVGNYYTTPIYRFRMKCHLCVNHIEMQTDPANCDYVIVSGAQRKEERWDMEDNEQVLTTEHEKKQKLETDAMFRLEHGEADRSTLKKALPTLSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRAKKKAIKEEEERDQALQTKASLAIPLVPETEEDRKLAALLKFHTLDSYEDKQKLKRTEIISRSWFSSASGSGAGSGNSKAGSVLKKLAQNRRSTAASSPITVGDLGIVRRQSREVLESPQDASGTPKSREPQVPKGTVQDRPTFPQDCSQETAETPESCCQDRPLPPQGSPQEAADTSDAPHPCSLSTSLVADYSDSESE	656284	643528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_644131_644237_644377_646983_647157_647239_647383_648077_648139_649914_650268_650897_650981_652225_652280_653429_653656_655111_655157_656260
752370	contig_4180_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_8328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGGTCCCTCCTGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805606	804227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_804200_805600
752372	contig_2703_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_101664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGCACGTCAGGACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3069	2864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_2900_3100
752373	contig_14553_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_125004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	96	632	13891	14427	NA	30	TTGAATAGATAGTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	13795	15000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_13800_15000
752375	contig_504_pilon	+	1856	4	Intergenic	novelGene_54411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	32.0659043568433	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATCAACAATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124138	154009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_124195_135936_136058_142952_143044_152421
752376	contig_8259_pilon	-	2395	8	Intergenic	novelGene_148868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_6	35.3258880616884	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	71	1201	167682	149797	FALSE	30	GAACACCGCACAACTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNKDEAERCISIALKAIQSNQPDRALRFLEKAQRLYPTPRVRTLIESLSQKPQPAGDQPQPTGTTCATRRKASGPEVPSANGEAGGGESTKGYTAEQVAAVKRVKQCKDYYEILGVSRGASEEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATEAFKAIGTAYAVLSNPEKRKQYDQFGDDKSQAARHGHGHGDYHRGFEADISPEDLFNMFFGGGFPSSNVHVYSNGRMRYTYQQRQDRRENQGDGGLGVFVQLMPILILILVSALSQLMVSSPPYSLSPRPSVGHVHRRVTDHLNVIYYVADSFSKEYTGSSLKTVERNVEDDYIANLRNNCWKEKQQKEGLLYRARYFGDTDMYHKAQKMGTPSCNRLSEVQASLHG	167752	148602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_149919_150404_150578_151958_152069_153140_153221_153351_153538_155598_155745_156985_157167_167549
752380	contig_8822_pilon	-	1391	7	Intergenic	novelGene_117918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	127.498583870131	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTCTCTCTTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104584	45081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_45933_57093_57174_60739_60836_61525_61653_77031_77173_103708_103778_104557
752384	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_94863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752385	contig_11227_pilon	-	2266	17	Intergenic	novelGene_163211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	7.78996750635072	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	115	1860	480646	438653	FALSE	15	ATGTGTGGCTGATTACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESSLAERGDRSEEQVSGAKVVAQALKTQGVEYVFGIVGVPVTEIAVAAQGLGIWYIGMRNEQAACYAASAIGYLTGRPGACLVVSGPGLIHALGGMANANMNCWPLIVIGGSSDRSQETMGAFQEFPQVEACRLYSKFSARPSSIEAIPTIIEKAVRSSIYGRPGACYVDIPADFVNLEVNANSIKYVECCMPPPVSMAETSAVRMAASVIRNAKQPLLVIGKGAAYARAEESIRKLVEQCKLPFLPTPMGKGVVPDNHPNCVRAARSRALQFADVIVLFGARLNWILHFGLPPRYQPDVKFIQVDICAEELGNNVRPAVTLLGDINAVTKQLLEQFDKTPWQYPPESTWWKTLREKMKSNEAASKELASKISLPMNYYTVFYHVQEQLPRDCFVVSEGANTMDIGRTVLQNYLPRHRLDAGTFGTMGVGLGFAIAAALVAKDRHPGQRVICVEGDSAFGFSGMEVETICRYNLPIILLVVNNNGIYQGVDASSWKEMLNFREAAAMAPPFCLLPNSHYEQVMTAFGGNGYFVQTPEELRKSLRQSLADTAKPSLINIMIEPQAMRKAQDFHWLTRSNM	480760	438246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_438686_442909_443097_446712_446821_448206_448366_448967_449123_450851_450954_452088_452173_453805_453912_457888_458025_459771_459885_461239_461335_463375_463454_467565_467639_470762_470844_472615_472657_480265_480371_480556
752386	contig_5549_pilon	+	909	5	Intergenic	novelGene_81560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	114	788	82155	96749	FALSE	5	GGTCTTTAGGTTGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAYSAAKGDRRFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82041	96870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
752387	contig_12157_pilon	-	2965	1	Intergenic	novelGene_135918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAAAAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204860	201895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_201900_204900
752389	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1440	632	985	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2440	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
752390	contig_3326_pilon	-	1272	2	Intergenic	novelGene_170605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	497	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	387	749	232177	231815	FALSE	15	AGGCCCATACTTGGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNVVIFDTVITNQEGPYQNHSGRFVCAVPGYYYFTFQVVSKWDICLSIMSSTRSQVQRSLGFCDTNSKGLFQVVSGGTVLQLQHGDQVWIEKDPTKGRIYQGSEADSIFSGFLIFPSI	233606	231291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_232391_233433
752392	contig_1154_pilon	+	1849	2	Intergenic	novelGene_87124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	811	1494	445315	445998	FALSE	70	TTTGGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	441980	446353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_442505_445028
752397	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752398	contig_3817_pilon	-	1842	9	Intergenic	novelGene_78342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	59.1713613160962	1	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	114	923	514602	469880	FALSE	10	ATTACGTTGCTTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWSMARALPSLDIVVWSELPTGAGLGSSAAYSVCLAAALLTACEEIPNPLRDDDHVSRWTQKDLELINKWAFRGEKVIHGNPSGVDNAVSTWGGALRYQQGQISSLKKPPALKILLTNTKVPRRTKALVAGVRNRLIKFPEIVAPLLTSINAIALECERVLGEMAADPTPEQYLHHLNALGVGHASLDQLCRVTMAHGLHSKLTGAGGGGCGITLLKPDVEQPAVEATKQALTGCGFDCWETSIGAPGVSVHLATSLDAPIRQALDGL	515647	468960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_470032_471989_472123_475308_475417_475814_475906_482218_482265_482895_483000_491023_491180_514582_514675_515606
752400	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752401	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	623	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752403	contig_12119_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_88636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAATGGTATCTATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94419	95263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_94400_95300
752404	SIRV6	+	521	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	20	20	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	509	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752407	contig_17270_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_67219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	23	298	32362	43379	FALSE	55	TATTGAAAGAAATGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPVWAMALRLVADFDLQKDVLPGLLAQRAVLAVAGARGGGVGAGDAPRGRLAWGRTGVLSLSYLGEPRLGWWARARSGAACGPCQPVKVGASEGVF	32339	43407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_32629_43370
752410	contig_17106_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_127660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGCCATATCAACAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24703	23902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_23900_24700
752414	contig_5302_pilon	+	2120	2	Intergenic	novelGene_81551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTTATAAACACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657042	1659313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1657784_1657934
752417	contig_16098_pilon	+	2813	1	Intergenic	novelGene_46176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2048	2425	536637	537014	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVCEPGRLLEVLTEVSSLVSTRPSWLQIRIHSSAILGLTVAFPASSSGQAMGGWLEGRMSGAALKYRQVPGVLPVVTLAVMRTSSLALDPVRSPGEKMRGGMRAIHLQISIHFQGFLQYQTFWH	534589	537402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_534600_537400
752418	contig_20561_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_166367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGTGTATTTTTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56362	56043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_-_56000_56400
752422	SIRV6	+	523	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752424	contig_10861_pilon	-	1458	11	Intergenic	novelGene_39318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTAAAAGCCGACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489268	1484409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1484472_1486247_1486373_1486543_1486659_1486742_1486855_1487320_1487502_1487777_1487891_1487991_1488060_1488150_1488238_1488325_1488403_1488613_1488738_1488874
752429	contig_9981_pilon	+	2198	5	Intergenic	novelGene_121071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22.561028345357	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	651	1253	408875	413375	FALSE	35	AAAATAGGTCTTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLFGKISWQFCGLKKLPWSCDSRSFWGWLNAVFNKVDYERIRDVGPDRAASEWLLRCGAMVRYHGQERWQKDYNNLPTGPLDKYKIQAIDATNSCIMNIGFDHMEGLQHVEKIKLCKCHYIEDTCLERLGQLENLQKSILEMEIISCGNVTEKGIIALHHLRNLNYLLLSDLPGVREKEKIVQAFQISLPSLKLKLDLK	402059	414320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_402705_408869_408982_410426_410636_411180_411353_413260
752437	contig_5727_pilon	+	1810	3	Intergenic	novelGene_7929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	18	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACCAATATCAGTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126496	146573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_126690_128339_128456_145072
752438	contig_15248_pilon	-	1318	10	Intergenic	novelGene_149146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.9720795566769	101	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	307	1317	209849	5723	FALSE	30	TATATACAAATTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEEPADGGQSLPPVYIYSPEYVNMCDSLAKVPKRASMVHSLIEAYALHKQMRIVKPKVASMEEMATFHTDAYLQHLQQVSQEGDDDHPDSIEYGLGYDCPATEGIFDYAAAVGGATITAAQCLIDGKCKVAINWSGGWHHAKKDEASGFCYLNDAVLGILRLRRKFDRILYVDLDLHHGDGVEDAFSFTSKVMTVSLHKFSPGFFPGTGDVSDVGLGKGRYYSVNVPIQDGIQDEKYYYICESVLKEVYIAFNPKAVVLQLGADTIAGDPMCSFNMTPVGIGKCLKYILQWQLATLILGGGGYNLANTARCWTYLTGVILGKTLSSEIPDHETN	210155	5721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_5729_29413_29509_32449_32623_96877_96987_97783_97862_101886_102000_205024_205167_205881_206013_209143_209197_209738
752441	contig_18637_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_81859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1343	1675	202807	202475	NA	60	AAGTCATTAATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNHLMLYHLSFPPPFPLSTLPSFSYSCPGSFPYSSYPPPQTPPLLFFKSPIFMAGGICRMGREKVGMDGNIPFLQVTTARLNLWVNCDGCLGRKEEAEKDKIIKVNPT	204149	202408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_202400_204100
752442	contig_6724_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_167971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAGGTAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301222	299311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_299300_301200
752443	SIRV6	+	537	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752444	contig_675_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_136347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTAGTACTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154866	155062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_154900_155100
752446	contig_10437_pilon	+	1499	6	Intergenic	novelGene_38472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	52.8847804193229	288	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	48	1187	1169851	1173746	FALSE	0	TGTTTTTTCTTCGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLYGKPIRVNKASAHNKNLDVGANIFIGNLDPEIDEKLLYDTFSAFGVILQTPKIMRDPDTGNSKGYAFINFASFDASDAAIEAMNGQYLCNRPITVSYAFKKDSKGERHGSAAERLLAAQNPLSQADRPHQLFADAPPPPSAPNPVVSSLGSGLPPPGMPPPGSFPPPVPPPGALPPGIPPAMPPPPMPPGAGGHGPPSAGTPGAGHPGHGHSHPHPFPPGGMPHPGMSQMQLAHHGPHGLGHPHAGPPRLWGAATTPTTTWNASSWTPSNGHAPPEGLRSDHPWVTQVLCPHMACEDPLH	1169803	1174058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169885_1170349_1170479_1170741_1171285_1171596_1171804_1173320_1173497_1173695
752447	contig_2689_pilon	-	2016	2	Intergenic	novelGene_100814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	236	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	730	1143	42753	42340	FALSE	30	TGTACAGAACCACGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRSISRGKHKGPRTGGRVRVLADRSRCGGPGKVWAQPHLGFRGAQAKPHGWAWPSPVAHTPREALSTMAPPPWDWRGQDGGWGGPRTNGLDSALSLCASVWCQVHGWYPKGVFAHRHGEAGFVSQAILDFNFRCIS	44373	41466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_43445_44335
752448	contig_7512_pilon	-	1781	13	Intergenic	novelGene_153196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	129.334917301297	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	91	1065	140730	108364	TRUE	25	AACCACTTCGAGAGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKIKVLQKLGKADETKDEQFEQCVQNFNKQLTEGTRLQKDLRTYLASVKAMHEASKKLNECLQEVYEPDWPGRDEASKIAENNDLLWIDYHQKLVDQALLTMDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSKLNQNLNDVLISLEKQHGSNTFTIKAQPSDGAPAKGNKSPSPPPDGSPAATPEIRVNHEPEPAGMAAPGATLPKSPSQSSLPAVVVETISATVNGAVEGGSGAGRLDLPPGIHVQGTGPA	140820	105717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_116678_116827_120235_120319_121698_121775_122012_122099_126699_126808_128472_128569_128951_129047_129306_129362_134475_134557_140712
752455	contig_6589_pilon	+	639	4	Intergenic	novelGene_25955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	14235	junction_2	3315.92383641254	426	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	210	638	1296229	1297319	FALSE	25	AGATGGGCGACCACCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQIRQNYSSEAEGNVNLLVNLHLKASYTYLSLGYYFDRDDVALEGVEHFFRELAKEKREGAERLLKLQNQRGGRAVFQDVPKPPAKEWNGILDAMEAALALEKSLNQALLDLHAVATAHTDPHLCDFLENHFLDEEVKLLK	1296019	1297320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1296641_1296969_1297096_1297265
752457	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
752458	contig_8580_pilon	-	1295	8	Intergenic	novelGene_156087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	430	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	803	1111	266410	256897	TRUE	25	GGAAGCGAAGGCGCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVFGELVYLCQQNHFEVSLRACLELLRLRHRFQHLLNHHPVTVASITGINFKVIITCNGADFNLLFRWSCDGLMFNSQLLHSNAIQLTQNTHYSCLFPSA	273197	252954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_-_253094_256851_256993_260718_260784_262173_262273_266361_266546_267528_267837_271124_271195_272908
752461	contig_9306_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_171478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGAAGAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77760	75876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_-_75900_77800
752462	contig_3523_pilon	+	1528	4	Intergenic	novelGene_171482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	6.68331255192114	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	311	472	54303	55220	FALSE	60	ATCTGTAAAAACAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWQSSQWRVSELEKQTDDLRGEIAVLEATVQNNQDERRALLERCLKGEGEIEKLQTKVVELQRKLDNTTAAVQELGRENQSLQIKHTQALNRKWAEDNEVQNCMACGKGFSVTVRRHHCRQCGNIFCAECSAKNALTPSSKKPVRVCDACFNDLQG	53112	56276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_53242_53527_53649_54242_54342_55097
752464	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	10	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752465	SIRV6	-	277	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACGAGCAGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11253	3105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10818_11031_11109_11205
752466	SIRV6	-	220	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	84	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640
752472	contig_15118_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_74559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTCCCGAAAGGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173263	173837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_173300_173800
752474	contig_16703_pilon	-	1192	2	Intergenic	novelGene_72796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGCCCAAGGGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44796	43420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_43488_43671
752477	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-7	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752480	contig_13952_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_133257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGAGAATTGATGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162347	160557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_160600_162300
752490	contig_17440_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_7687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3743	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
752492	contig_12427_pilon	+	2336	8	Intergenic	novelGene_40506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_6	175.566604606517	5	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1361	2032	414506	419950	FALSE	20	TCTGAAATTTGTCTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLPLSSLIQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	411310	420254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_411362_412480_412585_413035_413162_413426_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
752496	contig_9177_pilon	+	1278	9	Intergenic	novelGene_32810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	22.7152894544622	219	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	53	1021	1633066	1647158	FALSE	15	GAGTATCCGCTTACCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFITRRIPPEGRAALAQAADCEVEQWDSDEPIPDKELERGVAGAQGLLCLLSDRVDKRLLDAAGANLKVISTLSVGVDHLALDEIKKRGIRVGYTPDVLTDATAELAVSLLLTTCRRLPEAIAEVKNGGWTSWKPLWMCGYGLTQSTVGIIGLGRIGQAVARRLKPFGVQRFLYTGRQPRPQEAEEFQAKFVSAPQLAAESDFIVVACSLTPATKELCNKDFFQKMKKTAVFVNISRGDVVNQDDLYQALASGHIAAAGLDVTTPEPLPTNHPLLTLKNCVILPHIGSATHRTRNTMSLLAANNLLAGLRGEPMPSELKL	1633013	1647415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1633131_1635368_1635500_1636400_1636474_1637030_1637148_1638320_1638410_1639562_1639668_1640976_1641113_1644461_1644593_1647036
752502	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752505	contig_7333_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_142759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATTTATCCTTCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143512	145492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_143500_145500
752506	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752507	contig_15882_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_144798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGCTAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22847	21113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_21100_22800
752510	contig_10324_pilon	-	2279	1	Intergenic	novelGene_7813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184356	182077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_182100_184400
752511	contig_401_pilon	-	1285	3	Intergenic	novelGene_42887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84.5	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	91	753	1779305	1778455	FALSE	20	TTTAATGCTCAGATGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTSDANFSCYHESVLGYRYVAVSWGIVVAVTGTLGNVLTLLALAIQPKLRTRFNLLIANLTLADLLYCTLLQPFSVDTYLHLHWRTGANFCRVFGLLLFASNSVSILTLCLIALGRFLLIAHPKLFPQVFSAKGVVLALVGTWVVGVASFAPLWHIYILVPVVCTCSFDRIRGRPYTTILMGIYFVLGLSSVGIFYCLIHHPGGELIRSGKRGQEQDG	1779892	1777922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1778511_1778698_1779314_1779810
752513	contig_3612_pilon	-	1489	11	Intergenic	novelGene_87814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_6	166.720154750408	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	10	678	881794	873082	TRUE	30	AACGTTTTCAGCATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARTVLLPAARRWLRGFTERILVGGAAGRSLYFGGSRLRSTQAAAQVVLNVPETRVTCLENGLRVASEDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLNAYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSFP	881803	868828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_868909_868997_869074_869260_869511_871145_871307_872192_872337_872981_873095_874616_874816_878786_878917_879316_879404_880323_880465_881695
752514	contig_6628_pilon	+	1271	10	Intergenic	novelGene_170608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_8	36.4278417466776	451	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	410	1132	252329	257143	FALSE	20	GGTACTGTGTACAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNAKQPEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGVGRAAGRGVPAGVPIPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAVAATASIAGAPTQYPPGRGTPPPPVGRATPPPGIMAPPPGMRPPMGPPIGLPPARGTPIGMPPPGMRPPPPGIRGPPPPGMRPPRP	213234	257282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_+_213344_221655_221752_223823_223965_252265_252332_253161_253314_255219_255332_255785_255939_256388_256528_256864_256991_257105
752520	SIRV6	+	533	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	32	3	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752524	contig_15087_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_37247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCTCTGCTGCGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209778	211077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_209800_211100
752525	contig_8322_pilon	-	1855	11	Intergenic	novelGene_143278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	25.1944438319245	100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	28	1494	569032	541539	TRUE	15	GAATCTCTCTTGCTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGTAPPNSFYRALYPKIIRDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR	569059	538782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_539113_541507_541701_551795_551875_554777_554889_556241_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560072_565004_565192_568827
752526	contig_15775_pilon	-	2542	1	Intergenic	novelGene_148378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACAGCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24912	22370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_22400_24900
752527	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	507	3	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTAGGTAGTGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
752530	contig_6576_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_42423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTCTAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298389	1297831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1297800_1298400
752531	contig_4402_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_140827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	299	685	459523	459909	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLWVLYAQKDFQIFQGKNHIFVTDNIKQFKARQRFQFLAVWPPINYLTSVYLQFFICKIGIIVSTLKVLQGSDTLIHVKSLEKGAWQIINNLTIVKLLTIKFSYFHSSPFQCLVPYLEHRRCSKNAC	459224	459940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_459200_459900
752535	SIRV6	-	397	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-146	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	177	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGGCGTCTTGTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1732_2774_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
752538	contig_8864_pilon	+	1383	2	Intergenic	novelGene_135993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAAAGAGGCAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508540	537022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_508972_536070
752539	contig_14467_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_138230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTGAAAACCACAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173394	175363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_173400_175400
752540	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752543	contig_14441_pilon	+	810	4	Intergenic	novelGene_100690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	448.223406597895	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	196	624	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	114114	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114161_116578_116963_117220_117344_117539
752546	contig_2365_pilon	+	1657	10	Intergenic	novelGene_103727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	385.756111782792	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	179	1522	248944	319997	FALSE	45	AGATAATAAATGTGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLMYSVQEALNARPWWIRVGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVSFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICQFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCAGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESNCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYETSAQEELLSDSELSRTYLP	116725	320132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_248941_249030_254096_254242_256889_257044_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_319819
752550	contig_4654_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_103055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGGCAGCACCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429668	430287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_429700_430300
752552	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	19	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752553	contig_11258_pilon	-	2504	3	Intergenic	novelGene_67807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	1	45	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	223	549	307220	304807	FALSE	15	CTTGACTGTTACTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTMEKLSREDADIYWCGIEKSGSDLGVQVKVTVGSAKAVLTTPTNLSSKPLAKSSTSYVRTHYMLLVFVKVPILLILLGAVLWLKGSQRVQRSNGIDLTVWTCPGTL	307442	302851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_304952_306936_307010_307111
752555	contig_7078_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_130124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68859	68300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_68300_68900
752557	contig_15664_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_171504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATGGGAGAAAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37142	38699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_37100_38700
752559	SIRV6	+	379	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	387	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10863_11189
752560	contig_1210_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_171517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCACTTAGTTTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263996	264481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_264000_264500
752561	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	381	196	202	115	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTGCGTTCACAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	11083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
752562	contig_11386_pilon	+	1364	5	Intergenic	novelGene_82772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	516.317913208519	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	294	1055	17940	24897	FALSE	5	CTTTCACTGTTGCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	13549	25206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_13742_17838_18037_19625_19980_20816_21022_24791
752566	contig_8617_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_73421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
752567	contig_11720_pilon	-	2413	4	Intergenic	novelGene_44009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	569	919	272327	271841	TRUE	75	ATAAAAAAAAAAATCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272895	269650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_269905_270031_270697_271265_271958_272093
752569	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	0	407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	299	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752572	SIRV1	-	265	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	1	3564	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
752573	contig_1379_pilon	+	1743	4	Intergenic	novelGene_134579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	5.35412613473634	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	283	696	384164	396207	FALSE	40	CCAGCAAGACATGTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRETLPGIRRPLSSAQSQTTTREVHVSGTAEVSADPDRAQVAVRVSSTKAAAAEAKKSVYRRLDYITQSLQQQGLQAENVTVTKDFRRVENAYHMEAEVCITFTEFVKMQNICNFLVEKLDRSVVISPPQFYHTPGSVENLRRKACLVAVENAWRKAQEVCNLVGQTIGKPLLIKEEETKEWEGQIDDHQSSRLSSSLTVHQKIKSATLHAVSKVFITFEVKGKEKKKKHL	362650	397254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_362879_384109_384176_395706_395838_395936
752574	contig_5039_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_64816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTACAGAACAAACTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229017	228269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_228300_229000
752575	contig_12270_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_113831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	4	333	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14412	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
752579	contig_500_pilon	+	1158	9	Intergenic	novelGene_31003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1187.13656938661	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	351	746	1496605	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493692_1495396_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
752580	contig_15449_pilon	-	1362	7	Intergenic	novelGene_33667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	121.294064158144	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	207	1205	196078	191125	FALSE	20	AGAGATGTGGCAGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQGGHAEKSSGLDIQR	196284	190967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191169_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
752583	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752584	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752585	contig_513_pilon	+	1714	5	Intergenic	novelGene_80121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_2	30.9868923901704	394	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	127	912	275057	287317	FALSE	25	ATTACTGTTGTCATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIETYSQPSPRSVTTGPPVSMKIFMYLLTIFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNLHEDFVFMKMIQRCAKGEGSLSLLNCEQIKSQFGGFIKDIMLNEEAKKKEKTFEMQKGDQEPQIAAHVISDASSKTTSVLQWAEKGYYTMSTKLVELKYKKQLTVQRQGLYYIYAQVTFCSNREASGQMPFIASLCLRSPSESERILLRAANTHSSSKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL	274930	288119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_275213_277266_277399_281619_281678_283961_284025_286940
752592	SIRV7	+	345	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56068	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
752596	contig_6589_pilon	+	995	7	Intergenic	novelGene_26014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	923.906500800932	29	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	119	994	1725483	1731804	FALSE	25	CTGCGTTTTGGTAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRGLQAEPPEVAAEQPHLHSGHLSGRRSTRARLHDALDIPVQELGPRLRPDQSIPIGSAPSQSPAPSQSPSPPRPTPDPFRCPGHSPMSCKYLFIPQYTLPGTEHTASSLPWEPRCLPALAPKGPGASEHQLSVPKDKLRSLSHLVAYHLPARLFSAQTSNKF	1725364	1731805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728251_1730067_1730152_1731406
752597	contig_6278_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_119802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320600	320273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_320300_320600
752602	contig_2892_pilon	+	1560	6	Intergenic	novelGene_119032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1406	junction_1	922.051278400502	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	209	520	324837	331810	TRUE	10	GTTTTTGCTGTAGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRFSTYFPGYFDGQYWLWWVFLVLGFLLFLRGFINYAKVRKMPETFSNLPRTRVLFIY	318534	339507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_318671_324764_324853_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
752610	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752613	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752616	SIRV6	+	422	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	540	0	361	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752620	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752623	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
752625	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	9	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	449	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752626	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752627	contig_7411_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_137033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAAAAGAAAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365067	366113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_365100_366100
752628	contig_8689_pilon	-	2508	1	Intergenic	novelGene_170032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1857	2165	141481	141173	NA	35	AAAAACCCCGTGGGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLVYHSVSTQDANVKHQFLRLWHANLSPQPTVTPAHVPSASSKSFPHPFPHLGHSHLSLVLACIVCPTANHLAPPIPVQALKLWLSSALLWCRCARLLW	143337	140829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_140800_143300
752631	SIRV4	-	215	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1308	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
752632	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657503	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRRDQSGHQTDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653878_657471
752634	contig_6710_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_90584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653861	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
752637	contig_2332_pilon	+	1851	4	Intergenic	novelGene_58639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.1287534296626	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCCAAAAGAGCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187852	233209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_187997_211956_212006_228805_228949_231694
752640	contig_10319_pilon	-	2764	9	Intergenic	novelGene_147240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_6	51.8043193179874	14	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	259	1101	250190	59074	FALSE	35	AGTGGGGTGGGAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQVCENLGMLYI	251599	57410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_59227_63369_63502_67769_67878_71419_71525_79991_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
752641	contig_5690_pilon	-	1567	2	Intergenic	novelGene_119686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTTACAGAGTAGAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359548	351278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_352371_359073
752644	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	0	204	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	383	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752647	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
752648	contig_5217_pilon	-	1588	7	Intergenic	novelGene_135715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_6	33.2837130674382	13	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	533	1195	296982	295847	TRUE	10	TAGTATGTTGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMVRMGMGDLRWACGAFWASLACTIMTTGGQQRYSSERLVGMARPSGLSYLPFPLDHLC	298403	295026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297685_298335
752649	contig_6954_pilon	-	1712	8	Intergenic	novelGene_64412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.7441046850138	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	112	1248	46863	18637	FALSE	75	AGCAAAATGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSGIGGNAREPSVSRKEPGLSWARQDGWRLSKGNRIMAADDDNGDGTSLFDVFSASPLNNDEGSLDIYAGLDSAASDFASKSCVPSRNCLDLYEEILTEEGTAKEATYNDLQVEYEKCQLQMKELTRKYKEIQTQNFSLKSENQSLKKNISALIKTARVEINRKDEEINNLHQRLSEFPHFRNNHKTARASDTVKTKDLKSRSPHLDDCSKTDPRVKSDVSRDLHHSASLPNLGKEGKSHSEKRSTSVLPPSIEKRCANGIWSRSHYHVGEGNSGEDNRREKKDIRHSQYSGGTDRIRKDFSTSCGSGELRNTETDQRLQGRSEKYGKGEPKAESKNSKFKSNTNSDYQSEHISSSREKEISRERSHIRVESQNDKRLERQSERSQNINKKDLKCTGLKIRGKENKKAKKKADM	64080	18172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_18699_19017_19680_31423_31540_32424_32500_33020_33122_33755_33822_46808_46892_63997
752651	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752656	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_17331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATGCAGGTAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
752657	SIRV4	+	334	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	648	966	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
752667	SIRV1	+	182	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTCCCACAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
752670	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	571	46	392	-37	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752671	scaffold_13505_pilon	-	1267	5	Intergenic	novelGene_111492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5224.4606599629	30	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	302	661	547805	541845	TRUE	10	TTCGTAATCTTGGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	548596	540198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_542033_547363_547465_547734_547806_548295
752672	contig_8558_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_123161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAGCAGATTTATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529665	530363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_529700_530400
752673	contig_8558_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_123162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGCTAAATTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530469	531212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_530500_531200
752677	SIRV2	-	497	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4375	35	3200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
752683	contig_3382_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_124136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCTCACAACTGGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817631	817395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_817400_817600
752689	contig_5954_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_28812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAATAAAGCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514029	1514682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1514000_1514700
752691	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_96645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752694	contig_14744_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_65928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAAATGGCAAACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159368	159714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_159400_159700
752700	contig_17108_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_109535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTAACCAGTGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85237	84317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_84300_85200
752705	contig_6914_pilon	+	1876	12	Intergenic	novelGene_151736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	60.7951444342133	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	270	1328	126550	129956	FALSE	5	TGTGTGATCTGTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWTVHLEGGPRRVNHAAVAVGHRVYSFGGYCSGEDYETLRQIDVHIFNAVSLRWTKLPPVRPATRGQAPVVPYMRYGHSTVLIDDTVFLWGGRNDTEGACNVLYAFDVNTHKWSTPRVSGTVPGARDGHSACVLGKTMYIFGGYEQLADCFSNDIHKLDTNTMTWTLICTKGNPARWRDFHSATMLGSHITEAWLDCPPTPVLPEGRRSHSAFGYNGELYIFGGYNARLNRHFHDLWKFNPVSFTWKKIEPKGKGPCPRRRQCCCIVGDKIVLFGGTSPSPEEGLGDEFDLIDHSDLHILDFSPSLKTLCKLAVIQYNLDQSCLPHDIRWELNAMTTNSNISRPIVSSHG	124125	130504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_124336_126490_126704_126882_127060_127214_127331_127512_127585_127715_127772_127861_127930_128008_128096_128249_128359_128472_128547_128667_128747_129889
752706	contig_3948_pilon	+	1104	2	Intergenic	novelGene_53396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1814304	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1814386_1861021
752707	SIRV7	-	263	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91661	2	-91655	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAACCGATTTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
752709	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
752714	SIRV6	+	547	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752715	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_95834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752723	contig_2969_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_157084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACTTGCAATAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986160	986909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_986200_986900
752724	contig_2969_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_157083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTTAAAAAGTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985412	986016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_985400_986000
752725	contig_1154_pilon	+	1841	6	Intergenic	novelGene_87208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	53.5402652216068	327	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	332	409	1174034	1175708	TRUE	0	TGCTTTTGTCCTGGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPGSVEEAEEAEPDEEFKDAIEEDDEGAACPAEDELALQDNGFLSKNEVLRSKVSRLTERLRKRYPTNNFGNCTGCSATFSVLKKRRSCSNCGNSFCSRCCSFRVPKSSMGATAPEAQRETVFVCASCNQTLSK	1167543	1177177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1167614_1169233_1169379_1173544_1173592_1173964_1174047_1175643_1176267_1176303
752726	SIRV6	+	521	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752727	scaffold_19766_pilon	+	2373	3	Intergenic	novelGene_34452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	13	214	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	28	1245	875309	878773	FALSE	30	GAAGGAGAGATTGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDKDSFGNEMLAAALLKAKSRELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDGENDQEISEDTGSHGVLLGRFQKGISQGLKFEEAYEQEVGLKRQLENSGERLNRKIKDFGQVTAEEKLTPMRDRSEKYSDFGNSFTVSSNLISHQRLPMGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNVMGMNKSSPRVTAELNIKEST	875281	879901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_875345_875636_875764_877718
752728	contig_20378_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_159573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	352	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATGAATGAAGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98966	97655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_97863_98618
752731	SIRV4	+	218	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1553	632	1098	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2553	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
752734	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752737	contig_14924_pilon	+	2060	10	Intergenic	novelGene_104147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	58.2370634180292	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	199	864	44129	48265	TRUE	15	CCTGCTGGTCTGAGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLGQTENLHHWQEEASSS	43930	54937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47161_48219_48277_53695_54599_54655
752740	contig_5967_pilon	-	1592	10	Intergenic	novelGene_44388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	595.075428355178	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAAAAAGATGTACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517577	388063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389300_403376_403487_412540_412605_423963_424037_430704_430782_465476_465533_482468_482550_488455_488583_517515
752742	contig_9871_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_75721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	88.7886935300066	178	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	82	645	598042	608330	TRUE	40	TACTTAATACAGAAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQFAVPFCKRCRSGINDNERDPDRA	597960	615341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606635_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_614614
752753	SIRV6	+	274	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10551	1	1314	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11551	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
752760	contig_17108_pilon	+	1912	2	Intergenic	novelGene_109539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGTCTATACTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153033	155478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_153116_153648
752763	contig_3233_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_56498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45449	48213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_45400_48200
752767	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1209	0	1209	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
752774	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752778	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752781	contig_6710_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_98274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	15	ATGTCTGGTCCTCAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
752783	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
752796	contig_9871_pilon	+	817	7	Intergenic	novelGene_75709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2412	junction_1	872.457767204554	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	44	580	572939	584180	FALSE	10	CGTCTGTATTGCTTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLKKLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDEVMRAYLQQLRQETGLRLCEKVFDPQNDKPSKWWTCFVKRQFMNKSLSGPGQ	572895	584417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_579914_579992_581756_581826_582912_583040_583534_583630_584117
752799	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
752802	contig_5959_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_150223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTTTAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488898	490086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_488900_490100
752803	contig_6001_pilon	-	1944	15	Intergenic	novelGene_128038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.4576053908986	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	70	1911	608483	587470	FALSE	30	TAATAAAGCTGTGGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFDDPGIFYSDSFGGDPGADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGLTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPTGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDTMSHLVKIPGIVIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTITNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTSRRGYDRVGVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAITPQEEEEFRRLATLPNIYELISKSIAPSIFGGMDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDMMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLATLKKFIAYCRARCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSAMSCLTASGPLPP	608778	587436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_587511_592291_592390_594363_594477_595424_595602_595797_595864_596214_596359_597722_597835_598987_599160_600775_600943_602665_602822_604854_605028_605835_605965_606044_606172_608316_608492_608717
752804	contig_4769_pilon	-	2245	3	Intergenic	novelGene_117969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_2	16.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATCTGAATATTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419485	407968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_408495_412412_412482_417835
752807	SIRV1	-	235	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3573	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6793	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
752808	contig_8059_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_111104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAGAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216184	217780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_216200_217800
752811	contig_8322_pilon	+	2532	22	Intergenic	novelGene_143216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	93.6573820658014	35	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	69	1772	65624	149585	FALSE	40	CCAGTAATAGTAATGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRGGLLRKSSASKKPLKEKVVLMYDEIFMTEDPSKCSPRFWEELFLMKVNLEYLEGKLESLDGEELMKIKDNINCLFQHCIQALGEEHPIRVVNALQTLCALIRGVHQKNKSTSGFDIINMLMGFDKAELCMKNLMESLDSLLCAEGSESLKSLCLKLLLCLVTVTDNISQNTILEYVMINSIFEAILQILSHPPSRREHGYDAVVLLALLVNYRKYESVNPYIVKLSIVDDEATLNGMGLVIAQALSEYNRQYKDKEEEHQSGFFSALTNMVGSMFIADAHEKISVQTNEAILLALYEAVHLNRNFITVLAQSHPEMGLVTTPVSPAPTTPATPLGTTPPSSDVISSVELPLDADVQTSNLLITFLKYSSIVMQDTKDEHRLHSGKLCLIILTCIAEDQYANAFLHDDNMNFRVNLHRMPMRHRKKAADKNLPCRPLVCAVLDLMVEFIVTHMMKEFPMDLYVRCIQVVHKLLCYQKKCRVRLHYTWRELWSALINLLKFLMSNETVLLAKHNIFTLALMIVNLFNMFITYGDTFLPTPSSYDELYYEIIRMHQSFDNLYSMVLRLSTNAGQWKEAASKVTHALVNIR	65555	150345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_65645_68469_68527_68645_68793_71004_71113_76380_76474_77245_77321_77441_77529_80760_80818_81914_81959_83001_83063_84678_84726_85243_85320_88109_88204_91406_91509_99898_99958_101645_101712_102627_102698_103726_103788_118418_118508_134781_134865_135829_135957_149505
752813	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752814	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	6	414	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752815	contig_9609_pilon	+	1709	11	Intergenic	novelGene_23151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	10.4134528375559	220	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	275	1321	749304	757537	FALSE	15	CTAATGTTTTTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLWGQMLWALLSGPGRKGGTRGWAFSSCPPHSPLAGLVSATELVSHWTAVFEERGIPEARESSEYIVAHVLGAKTFQSLRPALRTQPLTSQQLQCVQELSSRRLQRMPVQYILGEWDFQGLNLKMAPPVFIPRPETEELVDWVLEEEAQRPCAAGTQDGPLILEVGCGSGAIALSLLSQLPQQSQVIAVDKEEAAICLTRENAQRLQLQDRIRIVPLDVTLERWWTHLLPWGPMDLVVSNPPYVFHQDMEQLAPEICSYEDPVALDGGKEGMDVIIHILALAPQLLKGSGSVFLEVEPRHPGLVGSWLRSQPDLHLDLVAVRRDFCGRPRFLHIRRSGPQCGCPVGT	747936	757925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_748041_749133_749532_749925_750018_750274_750369_754607_754743_755053_755122_755388_755439_756056_756166_756924_757021_757194_757309_757476
752818	contig_1154_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_87217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGATAACAGAGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575922	1577884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1575900_1577900
752819	contig_16411_pilon	+	2134	2	Intergenic	novelGene_77328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3021	junction_1	0	70	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	656	988	167213	167545	FALSE	70	AAAAAAAAAACCCTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSGRPITTCLLPTAASLCTSSGSSTLTSSPITATMDPRTGERVPGQSGLGLRVRGAATCLLQTRPSARRFIPMTGISLSPCLVQALYWRLGMAALSKQTPSCLLEPSG	160412	168691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_160992_167136
752820	contig_7494_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_167441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAATGTACAATTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42289	42588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_+_42300_42600
752821	contig_10042_pilon	+	1871	2	Intergenic	novelGene_79122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	902	junction_1	0	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	495	1202	46861	50063	FALSE	65	AAAAATGCTACAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKK	46366	50732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_47035_49529
752822	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	395	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752823	contig_7945_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_161593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGCAAATTATACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367218	367668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_367200_367700
752830	contig_12943_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_140361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57517	60052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_57500_60100
752831	contig_500_pilon	+	776	6	Intergenic	novelGene_31098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	269.438675768717	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	153	587	1512837	1524409	FALSE	5	GGGTCCTGTGTTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVKRSRKAPPDGWELIEPTLDELDQKMREAETEPHEGKRKVESLWPIFRIHHQKTRYIFDLFYKRKAISRELYEYCIKEGYADKNLIAKWKKQGYENLCCLRCIQTRDTNFGTNCICRVPKSKLEVGRIIECTHCGCRGCSG	1510909	1524598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1510917_1512157_1512275_1512808_1512931_1522521_1522645_1522858_1523026_1524358
752832	SIRV6	-	537	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1213_1612_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
752833	contig_5643_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_38723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCACTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32460	33989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_32500_34000
752834	contig_17162_pilon	-	885	5	Intergenic	novelGene_171527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	96.3363249247136	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	60	548	10457	3600	FALSE	25	CAAACCTCAGACTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKFQPESQEEDQGEGYVSEMEDQPHSGECDDGFNIQETPLMDILFSHAASSKLSDLGQNDPVQDHLLFKKTLLPVWKMIASHRFSSPFLKPVSDRQAPGYKDVVKRPMDLTSLKRNLSKGRIRTMAQFQRDLMLMFQNAVMYNDSDHHVYHMAVEMQREVLEQIQVLSIWLDKRRDLSSLE	10516	3262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17162_pilon_-_3651_4226_4405_6507_6577_7161_7252_10356
752836	contig_6568_pilon	+	1883	10	Intergenic	novelGene_152859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	32.799427878178	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	264	1652	160292	181774	FALSE	35	AGAGAAACTGGACTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	144082	182005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148907_160247_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
752841	contig_14481_pilon	+	2153	7	Intergenic	novelGene_153847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.0138840697041	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	445	1596	108970	122917	FALSE	65	AAAAAAAGGAAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKQWWRGQLAADIHQALRYKELKLPSYKGQSPQLSLRRYFADLIAIVSNRFTLCPSARHLAVYLLDLFMDRYDISIQQLHLVALSCLLLASKFEEKEDSVPKLEQLNSLGCMTNMNLVLTKQNLLHMELLLLETFQWNLCLPTAAHFIEYYLSEAVHETDLHDGWPMICLEKTKLYMAKYADYFLEVSLQDYAFLNYAPSLVAAACVASSRIILRLSPTWPTRLHRLTAYSWDFLVQCIERLLIAHDNDVKEANKQRGQAGPQSAQLSVFQTTSQPSRPVHFQQPQYLHQTHQTSLQYRHPVSEQPSCQQIVSTTHTSSYTLQTCPAGFQTSVQGLGHVQTGVGMSLAIPVEVKPCLSVSYNRSYQINEHYPCITPCFER	108084	123474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_108258_108584_108815_108928_109039_113719_113931_121338_121639_121722_121883_122505
752848	contig_9727_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_86367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTAGATTCCCCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571134	570561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_570600_571100
752850	contig_1301_pilon	-	1633	13	Intergenic	novelGene_47315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	548.232836535313	1	103	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	408	1631	305285	269148	FALSE	65	AGAGAAGCAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQD	322913	269145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309747_309912_322794
752852	contig_12270_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_114131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCGGTTCAGTGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14468	13947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
752853	contig_5023_pilon	+	1735	10	Intergenic	novelGene_7134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	258.610150374155	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	971	1432	359358	402047	TRUE	35	CAGCGAGGAGAAGACACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSTH	323630	405529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369823_369885_370404_370538_373062_373139_402039_402194_403088_403180_405463
752857	contig_5479_pilon	-	2532	1	Intergenic	novelGene_133586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTTCCCATCCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229522	226990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_227000_229500
752862	contig_12277_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_139684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATCATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221586	219615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_219600_221600
752869	contig_10197_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_115236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGGAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948047	950415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_948000_950400
752870	contig_6102_pilon	+	708	7	Intergenic	novelGene_31952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	1291.56206028032	33595	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	51	506	413086	415290	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEAFVRHILSG	413035	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_415261_415307_416018
752871	scaffold_880_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_121451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTTTTTTTTTTTTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440106	438788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_438800_440100
752872	contig_9389_pilon	+	1287	5	Intergenic	novelGene_83929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	981.569502124022	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	18	374	159587	167479	FALSE	35	AAAAAGTGGCTGGAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNGP	159569	168392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164497_167469
752875	contig_1996_pilon	+	826	9	Intergenic	novelGene_131893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_6	158.48536012831	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	121	684	251625	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249871	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254882_254937_255054_255147_255320
752876	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_97239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752882	contig_610_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_76789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281801	280250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_280200_281800
752883	SIRV6	+	556	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	966	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
752885	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752888	contig_10861_pilon	-	1867	3	Intergenic	novelGene_39416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	17.5	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1138	1554	2193614	2191815	FALSE	5	GTCCTATCTTTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSRWRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAGEHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSPSM	2194751	2191501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2192001_2192692_2192840_2193530
752898	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752899	contig_10299_pilon	+	1018	8	Intergenic	novelGene_79783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	9.34814179941879	445	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	66	695	670221	679027	FALSE	10	CTGGATTCATCTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLAGKKIVFVTGNAKKLEEVIQILGDKFPCTLVAQKIDLPEYQGEPDEISIQKCQEAARQVQGPVLVEDTCLCFNALGGLPGPYIKWFLEKLKPEGLHQLLAGFEDKSAYALCTIAFSTGDPSEPVRLFRGRTLGQIVVPRGCRDFGWDPCFQPDGYEQTYAEMPKAEKNAISHRFRALHELQEYFDSLTLPGARGSPSGLGSGEN	670155	679350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_670287_672453_672512_672601_672667_673298_673373_674236_674269_675516_675633_677664_677742_678885
752901	contig_4782_pilon	-	1568	6	Intergenic	novelGene_73634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	17.1464281994822	161	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	89	583	418385	397181	TRUE	10	CTTTACTGTCTCGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICQFFLQGRCRFGDRCWNEHPGAKGASGGRQQPQQQPSGSNRRGWNAANHRYSSVIQPSSFSKSTPWGGSRDQGKSSLGSFESGTSASRDREFGLSQNPFASLSPDEQKEEKKLLEGIVKDMEVWESSGQWMFSVYSPMKKEPNISAKFHSTVNRSMEEKGK	418473	391672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_392536_393199_393285_397143_397231_412788_412884_414170_414400_418264
752902	contig_11448_pilon	-	2589	1	Intergenic	novelGene_66389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAGAGAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409108	406519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_406500_409100
752903	contig_14023_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_165343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGGGAGACAAGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21778	19974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_20000_21800
752905	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	6	414	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752908	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
752909	contig_7202_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_16606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
752912	contig_953_pilon	+	2506	12	Intergenic	novelGene_130010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_9	46.9765195435949	85	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	329	1783	339772	346560	FALSE	15	TGTTCAGCAGGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKQSSRLVHYCATALLFDPAAWLHGPPETSGHPEGQRRHRPESGSGSREAPPGCESCDVPLPGAREEPWLKELSLAFLQQYVQYLQSIGFVLVPLRPPSPARSASRLRAMAILGTEGRGSFSCPKTKTDGSPKSTGSAVTTYHLQRALPGGIILMELAFQGCYFCVKQFALECSRIPMGQAVNSQLSMLFTEECDRVRDLMHVHSFSYDFHLRLVHQHVLGTHLVLRHGYHLTTFLRHFLAHHPDGPHFGRNHIYQGTLELPTPLIAAHQLYNYVADHASSYHMKPLRMARPGGPEHNEYALVSAWHSSGSYLDSEGLRHQDDFDVSLLVCHCAAPFEEQGEAERHVLRLQFFVVLTSQRELFPRLTADMRRFRKPPRLPPEPEIPGSSAGSPGETSGVGLAPGPAPLFPPLAAEVGVARARLAQLVRLAGGHCRRDTLWKRLFLLEPPGPDRLRLGGRLALAELEELLGAVHAKSIGDIDPQLDCFLSMTVSWYQSLIKVLLSRFPQSCRHFQSPDLGTQYLVVLNQKFTDCFVLVFLDSHLGKTSLTVVFREPFPVQPQDSESPPAQLVSTYHHLESVINTACFTLWTRLL	337960	347283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_338070_338193_338394_339752_339844_340096_340178_340260_340336_342878_343093_343519_343674_343835_343959_344075_344482_344624_344742_346202_346272_346416
752914	contig_15449_pilon	-	1267	7	Intergenic	novelGene_33659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	121.846100562235	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	78	1109	196078	191125	FALSE	15	GAGATGTGGCAGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQAEGPAEPFPSTGGHAEKSSGLDIQR	196155	190966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191202_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
752916	contig_11978_pilon	+	1449	4	Intergenic	novelGene_62922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_3	57.913728942281	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	751	1422	862940	866962	FALSE	20	TACACTCTGACTCTATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFERQKLMALTEYIPPKLAINPRCLPPPPSPPQEETGLIRLLRREIAAIFRDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGGCIDDTILSRQGFINYSKLPSLDLVQGELVRGLSFLTAQTHSLLQHQPLQLTALLDQYIRQQHEGDSVQPASRKLDPPDSVLDS	862189	866989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_863045_865281_865447_865690_865836_866705
752917	contig_2069_pilon	+	1298	4	Intergenic	novelGene_23460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	387.777714103783	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	168	1235	1436133	1439381	FALSE	15	TGATGAGTTGAGGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432105	1439444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432193_1436052_1436748_1437870_1438000_1439057
752920	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
752922	contig_9468_pilon	+	905	10	Intergenic	novelGene_59453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	193.28102740713	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	198	905	172913	200520	FALSE	55	AATTCCCGAAAACACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRK	150450	200520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189933_200359
752923	contig_1009_pilon	+	2367	3	Intergenic	novelGene_121758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	5	144	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTAATTGTAAGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281260	284592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_281324_281541_281649_282395
752925	contig_5003_pilon	+	2004	4	Intergenic	novelGene_120196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	54.9241901776136	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTCATGAGTAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81894	87819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_82693_85517_85583_86621_86974_87030
752930	SIRV6	+	538	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752933	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
752934	contig_1759_pilon	-	2293	17	Intergenic	novelGene_171325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_2	996.564989021664	12	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2055	237	2291	97828	15721	FALSE	35	GTAAGTAAGAATTTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNWSFDHGEESEGDTDKDGANLLSVDEDEDSETSKGKKLNRRSEVVATSSGDFILKTYVRRNKSESFKTLKGNPIGLNMLSNNKKLSENTQNASLCSGTVVHGRRFHHANAQISVVKTAAQSSLDRKERKEYPPHVPKIEINPVGLSRPHSVECIMKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPIILSSDDDDDSDRTNRRESVSPQPADSACSSPAPSTGRVEAALNENTCRVEHELRSIPADSELNTVTLPRKARMKDQFGNSIISTPLKRRKVVSQESSVDPMSLSCQSSFDSVILNCRSIRVGTLFRLLIEPVIFCLDFIKIQLEEPESDPVAITLNTSDLTKCEWCNVRKLPVVFLQTIPAVYQKLSVQLQMNKEDKVWKECKGINKLTNLEEEYIILIFQTGLDHQANMVFESIITEIGIKNNISNFFAKIPFEEANSRLVACTRTYEESIKGSCVQKENKIKNVSFESKIQLRNKQEFQFFDDEEETGESHTIFIGPVEKLIVYPPPPAKGGISVTNEDLHCLNEGEFLNDVIIDFYLKYLVLEKLKKEEADRIHIFSSFFYKRLNQREGRNLHETTNLSIQQKRHGRVKTWTRHVDIFEKDFIFVPLNE	109740	15718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_15812_16816_16940_28010_28128_28214_28325_29890_30118_38870_39066_39454_39489_43310_43482_45375_45606_50292_50681_56768_56915_64867_64939_92396_92418_96839_96945_97802_97949_107686_107748_109685
752935	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752938	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752942	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	0	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752944	contig_8228_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_81778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43705	45312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_43700_45300
752951	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	6	405	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
752953	contig_12050_pilon	+	1565	7	Intergenic	novelGene_62638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	216.966779331153	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	72	887	359783	362921	TRUE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTVSAPDQPLLQEAGTLQSRAIFPVRDMGVLESPICSQSEFYVYAWFSGKEFLASVLCLPSMLTLLESGVPIPGGAARYLGHPGGVRQPSSTPAHGRSISRTGVKWHTVQPWGRGPAVVVCCTHLPAMTPAANVRPGPARGPAGECLHQSQQALLDRVPAACPAAQLHQELPPSWRRRAPQPRGHV	359049	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359106_359767_359849_360750_360847_362084_362686_362766_362817_362918_363046_363410
752954	contig_3243_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_147535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATATATGATTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31692	32351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_31700_32400
752956	contig_7342_pilon	-	1608	5	Intergenic	novelGene_71169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	219.270381036746	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTTGTGGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482769	469246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_469456_476285_476762_480882_481479_482357_482474_482558
752957	contig_2310_pilon	-	1360	11	Intergenic	novelGene_71614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTGCTCTGCAACACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127738	106092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_115001_118109_118168_118358_118428_122874_123052_124479_124635_126506_126679_127455
752960	contig_3789_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_79889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCTGCTTCTGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579354	578904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_578900_579400
752961	contig_10021_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_168667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	887	1234	1082400	1082053	NA	65	GTAAAAAAAAAAAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNPWDETKVFAKCLVTGVFKSFQDALHGAPSSDQRKGTVQEKERFQGLLWSTWRNSKPRTPSLAFLKGKSEMCSSVFTKLEGLGSTFIIFCHIHELPPVLLKQNKTNPLPLSQF	1083286	1081253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_-_1081300_1083300
752965	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
752967	contig_9554_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_170688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCCATTGAAAACTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98329	99181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_+_98300_99200
752968	SIRV2	-	485	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	34	3213	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
752975	contig_6217_pilon	+	2978	1	Intergenic	novelGene_109586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTCTAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203085	206063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_203100_206100
752976	contig_7580_pilon	+	1316	6	Intergenic	novelGene_108602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	289.455074234327	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	115	912	103420	109647	FALSE	20	CATGGGCTGATACTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96529	110051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_106952_107190_108184_108248_109428
752979	SIRV4	-	268	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1255	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
752981	contig_19577_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_119841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAACCCTGTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54323	53221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_53200_54300
752982	SIRV7	-	907	5	FSM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	42	0	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	179	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAGGCTACAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147608
752983	contig_10263_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_135821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGATAATTTTAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374204	374494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_374200_374500
752989	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
752990	contig_10599_pilon	+	2335	7	Intergenic	novelGene_49860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	504.904859024615	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	160	909	123528	158687	FALSE	85	AATAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQV	123153	160113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529
752993	contig_6217_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_109624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436255	437962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_436300_438000
753002	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	581	10	402	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753003	contig_7179_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_78212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAGATTAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688485	1688692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1688500_1688700
753008	contig_6710_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_98034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753009	contig_8017_pilon	-	2474	2	Intergenic	novelGene_65387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1	486	1629090	1628605	TRUE	15	GCAACCTCCGCGCCGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLCTTLLKTTYPILNGGRGEKKFKKKNKKPGFYNVNSALAPRIHIRTQKANIKTKRIRQLGNGSSLQFPDSLCTWVIVRQLIREQGDSQGLSSPGLLGYLGLSVSSPHTDHTSQYYTRPFLIWEAVRLPSWSPKSGRTGRSPLLPHIISILTLGHTQTAIY	1629090	1623897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1623958_1626676
753012	contig_9202_pilon	+	1683	11	Intergenic	novelGene_168947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGGCTCCAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264796	286228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_265264_267563_267760_267991_268186_268797_268960_269245_269362_270145_270217_272099_272195_281600_281669_282797_282902_285767_285839_286089
753014	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753015	contig_16525_pilon	+	1627	3	Intergenic	novelGene_133828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	57	911	156877	158626	FALSE	25	TGGACTGGAATCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTAIYESLPSLSPDLAGTRGGTESSLGWPSWGPWSSSDSSPAGVAPRLPGRSTSLVEGRACAWVPPPPGFAPLAPRPGPELSPSPTSPTATPATSSRYKTELCRTFSESGRCRYGAKCQFAHGLSELRQANRHPKYKTELCHKFYLQGRCPYGSRCHFIHNPSEDLATPGHPHVLRQSISFSGLPSGRRASPPPAGLPGPSLSSYSFSPSSSPPPPPGDLPLSPSAFSAAPGTPVPRRDPTPTCCPSCRRATPSLWGPLGFWATPATCSLPPTPHLQSHLRF	156820	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_157685_158446_158555
753017	contig_4305_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_136649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATGAAACAGTAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42226	43668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_42200_43700
753018	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	585	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753019	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
753020	contig_6309_pilon	-	1637	3	Intergenic	novelGene_171531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8	525	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCCATAATCATGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48259	42681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6309_pilon_-_43537_43673_44193_47996
753021	contig_3602_pilon	+	1459	11	Intergenic	novelGene_60672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGAGCTTAGGGACCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106195	1139474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1106785_1107771_1107826_1108693_1108763_1110847_1110955_1111711_1111795_1111892_1111948_1112147_1112226_1113548_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
753024	contig_6710_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_96498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753025	contig_6217_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_109590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262518	260456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_260500_262500
753028	contig_854_pilon	-	2512	1	Intergenic	novelGene_36122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACTCCTTCACCCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303176	300664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_300700_303200
753030	contig_2278_pilon	+	2719	2	Intergenic	novelGene_118150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	0	56	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1550	1861	1467688	1469637	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLVDCDRPADRTEDPDSHRSGRLRIPQTAVHPNQPRWSWNWEGDPGFTGDIQRQAAHIHHLRQPCPWQDPDRHGFCFCRAFAGEGRRPAAPGGRVLCGLWR	1466138	1470495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1467905_1469542
753033	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753034	contig_15888_pilon	-	1372	9	Intergenic	novelGene_84432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	92	901	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRARARGFRRFLLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259817	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251806_252044_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
753035	contig_17108_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_109502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	466	798	21277	20945	NA	65	ATTGAAAAAAAAAATTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICFITGDANFDYLVKVVSARFLYCEVTICPFVMNKYLVGRYIETVYISLPETILWCLPNGDFSISIMPSTFINWNCTIRKRFPFSPFTSLWYLLTRQTLNWHIGSLLP	21742	20696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_20700_21700
753038	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8469	-1	270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGCAATGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
753039	SIRV6	+	173	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	559	51	559	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10796	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
753041	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	39	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753042	contig_6138_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_159687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	165	485	571104	570784	NA	65	CCAAAAAGAAAAGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFFVVAVLFFMPCLREAAIFPTALGWKANHRSLACYTLKCFSPELQDSQCFILSKQDSIYSQEVLLLNYTHSVHLTFTTFNYKKFVVSWYLFCEQMITQHELLQ	571268	569280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_569300_571300
753051	contig_11816_pilon	-	2773	1	Intergenic	novelGene_98526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGAAAAAAAAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002627	999854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_999900_1002600
753056	contig_16098_pilon	-	1249	8	Intergenic	novelGene_46141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1595.92812226258	2	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	380	1207	458816	456113	FALSE	15	AAGGGGGAGTCTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEGIIRGSRPLFPVTLATLVTLVRGVVCKC	460506	456070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456200_456882_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
753057	contig_13456_pilon	-	2103	2	Intergenic	novelGene_153297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	892	1209	346328	346011	TRUE	60	AAAAAAAACCAACCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREGDAGRRGSSTDCLPQPASGHLTNTRLAPHGRYAKPQRALNTSSERTDRKHHNQDSNSGRQLLPALGTMFCRQASTPHAITGAGQVKRGLTQILREGSLPSG	347219	343995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_344572_345692
753065	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	3	1164	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
753067	contig_11846_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_105921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGAAGTCCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158958	157214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_157200_159000
753068	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753070	SIRV2	-	660	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	-1	2958	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
753071	contig_15327_pilon	-	1848	12	Intergenic	novelGene_70712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	79.02745626031	190	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	13	1071	958210	954693	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHLSHSQRRPPLLRQAVKIRRRKAQDVQDPLPQMAQEVEPQSHHFSPEERTLLYEEALYTVLHRLGQLEPNHVAESSELLRYLQEAFHLEPEEHQQMLQQALELEKPMFFLKATVKQAKDILGKDVSGFSDPYCLLGIEEGVGMPGGSAGARRRQKAVVRDTIPEEQIHRTQVITQTLNPVWDETFILEFKDIANASFHLDMWDMDTVESVRQKLGELTDLHGLRRILKEVRKDKGQDDFLGSLVLRLQDLHCREDQWYPLEPCTETHPDRGQCHLQFQFIHKRRATRASRSQPSYTVHLHLLQQLVSHEVTRHQAGSTSWDGLLSPQAATILFLHATQKDLSDFHQSMA	958222	953915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_954801_954875_954969_955069_955175_955357_955428_955546_955616_955753_955799_956215_956397_956647_956715_956810_956871_956963_957072_957317_957354_958093
753075	SIRV6	+	299	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8136	3	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
753079	contig_15666_pilon	-	1794	1	Intergenic	novelGene_70112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1260	1604	92370	92026	NA	50	CATGAAAAAAAATTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEIQPECSLEARTVRLRLMHFGHVIKRDQSLEKDIMVCKAESHRKRGRPSTRWIDTVAATMGSNLAMIVRVVQYHTVFRSIVYRVAVSWNQHPTAPNNTNTSVIRSEF	93629	91835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_91800_93600
753084	contig_10324_pilon	+	2600	1	Intergenic	novelGene_7900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAATTTGGCACGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757462	760062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_757500_760100
753085	contig_11846_pilon	-	1224	11	Intergenic	novelGene_105942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	100.080217825502	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	427	1191	254835	248626	FALSE	20	GGTTAACTTTTATTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263854	248592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254824_254997_257438_257519_258037_258083_263714
753087	contig_4689_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_165396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGCCATGTTAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084051	1082055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1082100_1084100
753088	contig_4125_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_25242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATATATTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2801617	2800205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2800200_2801600
753089	contig_16766_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_153365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149183	149642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_149200_149600
753091	contig_12622_pilon	-	2075	2	Intergenic	novelGene_6056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	123	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	180	1550	1699036	1697666	FALSE	25	TGCACATTCCAACTCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTMLIEPPIKDPTPHMLLYQLSKTSQVEILNYQSCSMQGIFAQFPEILFIHRTYNPIGKVLYTFLVDGPQVRLEGPLARAVYFAIPAKEDAEGLTQMFQVFKKFNPAWERVCTILVDPHFLPLPTLAMEFPAAEVLLSAFHICKFLQGKFYQLCLERPVERVLLTSLQSTMCSATTGNLRKLHALLNSCIPPAQLPELYSHWLLNDRIWLAHRWRSRAESSLYFQGLEVTTRTLSQFFSTTPCVEQGMASLLQYMQQNSGDRASFSLCLSPQNSPAPSDTTPKSPHVVQLVESRIQHSLNAICTEPAAQLCLGEFAVVQKSVHLIGSGSEKVNIQILEDTHRVQPQPPASCSCYFNQAFHLPCRHILAMLSARRQVLQPDMLPAQWEAGCAASLEGILGSQWSEMLEKRLVVAFLTEEVRRLLQHCSQEEFERRYNTLRELADSWIGPYEQVQL	1701035	1697140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1699182_1701001
753095	contig_839_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_171535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTCACTAAGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450296	449630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_-_449600_450300
753096	contig_2689_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_100838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGAAGTATATAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232476	231348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_231300_232500
753101	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	0	407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	186	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753108	contig_13547_pilon	-	1684	10	Intergenic	novelGene_104882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_9	352.141315628881	40	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	36	1238	223705	98097	FALSE	30	TATAGGTCAGAGTAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKVSGFYLFWSLIKFSFA	223740	97650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
753109	SIRV6	+	550	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	9	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753110	contig_6227_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_49645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAGAGAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402712	400418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_400400_402700
753111	contig_12586_pilon	-	1917	3	Intergenic	novelGene_121793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_2	40	104	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	91	522	33020	19876	FALSE	85	GAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEERQNLHTFRNYVRKTLDPTYILSYMSPWFREDEMQYIQTEKNNKGTMEAASLFLNILEELKEEGWFRGFLDALKHAGYTGLYEAFENWDFQKIEKLEEHRLLLRRLQPEFKTRINPLDILPEISQCLINQECEEIIQVN	33110	18480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_20067_23780_23916_32914
753112	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	31	-2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753113	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	14	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753117	contig_10951_pilon	-	1714	3	Intergenic	novelGene_61621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTTCTTTCTTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161889	130504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_130668_159181_159304_160460
753125	contig_15327_pilon	+	1661	5	Intergenic	novelGene_70420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.4470958122162	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAATTAAATTGCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31739	34351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_31758_32351_32409_32498_32566_32768_33444_33507
753126	contig_8616_pilon	-	765	4	Intergenic	novelGene_72395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATCACAACCTGGGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199006	197246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_197273_197612_198122_198538_198586_198823
753128	contig_2689_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_100847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTGAAGAAAAAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314115	316273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_314100_316300
753132	SIRV6	+	435	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	524	3	345	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753133	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753134	contig_14034_pilon	-	1408	2	Intergenic	novelGene_72643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCGGATGGTAAACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220592	215784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_216917_220316
753136	contig_6227_pilon	-	1950	18	Intergenic	novelGene_49767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	431.946243291252	1	97	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	375	1004	1222052	1205919	TRUE	35	GCCACAAAAGAGGTTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALHVGFDNFEQLLSGAHWMRAPGEERPRPAGSAGHLVHQLFWV	1225022	1202630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204210_1204370_1204501_1205857_1205994_1206142_1206187_1206579_1206641_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222118_1223376_1223446_1223755_1223838_1224864
753137	contig_593_pilon	+	1919	11	Intergenic	novelGene_102013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	149.164204821398	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	133	1104	383582	481427	FALSE	45	TAAAGCAATATGTATGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSARDLEESINKIREILSDDKHDWEQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLG	383347	482242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_383465_383566_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016_479091_480193_480287_481277
753144	contig_5502_pilon	+	2200	3	Intergenic	novelGene_154966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	516	junction_1	198	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	81	473	357713	362970	FALSE	65	AACATCATTGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVSVAWRAEKTYIVTETCQASVRWL	357632	364697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720
753149	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
753150	SIRV6	+	318	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8117	3	622	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
753152	contig_151_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_132573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGGTTCTGGGCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225047	225703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_225000_225700
753153	contig_10331_pilon	+	1319	11	Intergenic	novelGene_54191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	63.9781212603184	2	11	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTCAGTTTCAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604713	620222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605010_605366_605501_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_617716_617757_618144_618264_619868
753157	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
753158	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
753164	contig_6102_pilon	+	1454	7	Intergenic	novelGene_32012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	14.8660687473185	381	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	420	1127	475084	478956	FALSE	5	CTGGACTCCTGTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTETFVKDIKPGLKNLNLIFIVLETACIWDGRARPEYTALAWRLSKLWLGRVTKTKDGHEVRTCKVADKTGSINISVWDDVGNLIQPGDIIRLTKGYASVFKGCLTLYTGRGGDLQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPEYSAQQAPNKAVQNDSSPSAPPPTTGPPAASPASESQNGNGLSTPPGPGGGPHTPHTPSHPPSTRITRSQPNHTSAGPPGPTSNSVSNGKETRRSSKR	474664	479283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_475163_475246_475319_475568_475708_475818_475891_476065_476148_476240_476305_478756
753165	contig_6191_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_107867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGACCTCTGACAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516206	514026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_514000_516200
753167	contig_8284_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_125713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGCAAAGCTGCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432197	431343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_431300_432200
753170	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
753179	contig_960_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_108277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1959	2450	974356	973865	NA	85	GAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEEAEEQQGVSYQPRLKAAVHYTAGCLCEEVASEEEMQFSKQTIAAISEVTSRQCENFAKDLEMFARHAKRSTINTDDVKLLARRSNSLLKYSMGKGEEIAQFNAEQKAEKKKKSENGNKDSREPAEAGVVESENSTFRHLEKQSSVGRTAQKCMLSQRGF	976314	973639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_973600_976300
753181	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_97236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753184	contig_8443_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_150613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772867	775179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_772900_775200
753186	contig_16578_pilon	-	1347	2	Intergenic	novelGene_148678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACACACAGCACAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291779	290031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_290264_290664
753189	contig_2311_pilon	-	1903	4	Intergenic	novelGene_169819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	35.2167889254858	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	146	814	355808	350615	FALSE	10	TTGTTCTGTAGCACTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAGFRRCGAQLHQPRTWPCTAMLSLLFIPVCSKALDVSQPAVVLASNRGVASFVCEYESLHKVKEVRVTVLRQAHGQMTEVCASTFEVENELTFLDDPACTGTSSGNKVNLTVQGLTATDTGLYICKVELMYPPPYFMGMGNGTQIFVIDPEPCPDSEFLLWILAAVSSGLFFYSFLITAVSLSKMLKKRSLLTTGVYVKMPPTEPECEKQFQPYFIPIN	355953	349525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_350720_352007_352118_352592_352941_355702
753191	contig_8587_pilon	-	1898	7	Intergenic	novelGene_159127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	28.8005594081473	285	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	186	1100	325655	307667	FALSE	20	AGCTGCTTGGAGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAETRGVHKAEPGSPVRVSAARGLPRPEVPHDRRSLPVRSLPWPEVSRGPRSPRPRGQPTMRLRSPGLFLLLLSGLQADIQKKEEVQGIVGSSVELNCVYPEGSSFDLNDFYIYWQTAMPETVVTYYLPGNTSPRYKDNRYQHRAQLSLDSMEQGNFSLRLYNITPQDEQTFHCLVFQKSLELKKVLQVNVTLHVAANYSIPVVSNPIGPSEDEELTFMCKSTNGYPRPNVYWINQTDNSLLDEALQNSTVSVNEHGLYDVVSTLRVRRAPNVNVKCCIENVLLHQNLTVSSQTEPSSGTKDKITDKPARPQEKNITVFIVFGILCVLVAVAVAAGWFYRNRRSSGSYIGALCAKPELKLTGHV	325840	306868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_307678_308817_308854_310615_310781_318223_318518_319635_319990_323141_323183_325641
753192	contig_11832_pilon	-	1576	14	Intergenic	novelGene_106945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	955.390424855371	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	482	1138	86997	84249	FALSE	25	CTTTTAATAGGCATGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	92444	83810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87854_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
753193	contig_14160_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_171545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAAGAAACCACTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23654	21537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_21500_23700
753197	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	9	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753198	contig_10050_pilon	+	2522	1	Intergenic	novelGene_119610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCATCACCTTGGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100355	102877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_100400_102900
753199	contig_7912_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_129569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	304	915	77	991	101644	100730	NA	15	ATCATTCATCTTTGGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNVTQYQKKHSGEKPFRRDVDRALFMKSYRFQVSGQPFTHGEVETDSLISSGLLQHQAMPNSEKPRSSTKCGEAFHNRQSHYKWREYRKASSHKHTLDHHQSDCPAERLYECDECGKSFSHHSSLSRHRRVHTVERPFECSECGKAFTRKFNLTQHQKRHTRVKPYECSECGKSFSESSILIKHRRIHTGERPYECTECGKTFRQRSGLTDHQRLHTGAKPYQCAECGKSFSHSSSLFLHQRVHTGERPYECNICGKAYSRSSHLIVHKRIHTGERPYECSECGKFFSSRSQLNVHKRVHTGERPCKCSECGKSFSQHSGLTKHWRIHT	101720	99810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_99800_101700
753202	contig_20670_pilon	-	2567	16	Intergenic	novelGene_144829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	7.79743547584717	46	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	68	1894	41021	29034	FALSE	15	TAGCATTAGTGTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQIVLELHFSHCAAMGAALLILIENALITQSRLILLESVLIFFNLLSVLSYLKFSNLQKHSPFSLSWWFWLMLTGVACSCAVGVKYMGVFTYLLVLSVAAVHAWHLIGDQTLSNVCVFCHLLARTVAFLVIPILMYLLFFYIHLILLYRSGPHDQIMSSAFQASLDGGLARITRGQPLEVAYGSQVTLRSVFGKPMPCWLHSHQNTYPMIYENGRGSSHQQQVTCYPFKDVNNWWIVKDPGRHQLVVNNPPRPVRHGDIVQLVHGMTTRLLNTHDVAAPLSPHSQEVSCYIDYNISMPAQNLWRLEIVNRESDTDIWKTIMSEVRFVHVNTSAILKLSGAHLPDWGFRQLEVVGEKLSRGFHESMVWNVEEHRYGKSQEQKERELELHSPTQADVSRNLSFMARFSELQWRMLMLRTDDSEHKYSSTPLEWVTLDTNIAYWLHPRTSAQIHLLGNIMIWASASLAMVAYALLFFWYLLRRRRSICDLPEDCWLRWVLAGTLCCGGWAVNYLPFFMMEKTLFLYHYLPALTFQIILLPMVLQHVSDHLCRSQLQRSVFSALVVAWYSSACHVFNTLRPLTYGDTSLPPSELRALRWKDSWDILIRKY	41088	28360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_29209_30022_30201_31144_31272_32061_32176_32812_32911_33338_33460_33779_33873_34759_34857_35402_35496_37107_37204_37626_37758_39048_39205_39361_39456_39545_39612_39996_40109_40945
753209	SIRV1	-	216	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3886	2	3612	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
753210	SIRV1	+	262	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6453	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
753211	contig_14680_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_132734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	5128	4814	NA	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEETNRTTCLRYPVAAAQEYLCILHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFLSCYY	5130	4258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_5100
753213	contig_12119_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_88640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATAAAGTGGATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115217	115803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_115200_115800
753214	contig_8616_pilon	+	2604	10	Intergenic	novelGene_72544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	23.0506688261606	256	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	833	2502	58	2559	410601	424565	FALSE	20	TGCACTCCAGTTTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDSDVESLPRGAFRCCLCRITTANRPSLDAHLGGRKHRHLVELRAARKAQGLRSVFVSGFPRDVDSTQLSEYFQAFGPVARRPSCPSPSTAWEDVACEGAAPDSHQLARALAEVPDVEAQMVKLVGLRELSEAERQLRSLVVSLMQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410543	424610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412272_419209_419262_419314_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
753215	contig_14142_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_120566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGCCGTTGAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451425	449975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_450000_451400
753221	contig_504_pilon	-	1516	9	Intergenic	novelGene_54420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.818721514894	10	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	252	1118	166980	154422	FALSE	20	TTGTTGATTTTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYIYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSETTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSTSSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPYNLVPWKSEGQNEAIMMSSTLQKSGHPLSGGSGENEVEEWRALV	167753	154023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_154556_157946_158049_158690_158810_159462_159571_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167535
753223	contig_18108_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_33447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCATTGAACACTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70644	72800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_70600_72800
753225	SIRV6	+	353	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1654	0	-245	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2778	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753226	contig_7241_pilon	+	1641	2	Intergenic	novelGene_171547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	56	1300	194938	196182	FALSE	60	GTACACATGAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRSLLKTRHKNRSPTKDMDSEEKEIVVWVCQAEKIVCGLTKHTTSADVIQALLEEHETTFGEKRFLLGKPSDYCIIEKWRGSERVLPPLTRILKLWKAWGDEQPNMQFVLVKADAFLPVPLWRTAEAKLVQNTEKQWELSPANYMKTLPPDKQKRIVRKTFRKLAKIKQDMVSQDQDNMETLVHLIISQDHTIHQQVKRMKELDLEIEKCEAKFHLDRVENNGKNYVQDAYLMPSFSDVEQKLDLQYNESEILEDLSKSDGIVQLEERLKYYRMLIDKLSTEIEKEVKSVCFEINEDAEGAAAGEPECSNLESVKCDLEKSMKTGLKIHSHLSGIQKEIKYSDSLLQMKAKEYELLAKELNLLHINNKDECPLKENKGKESEVPNSSGDVPPFTQRVFNAYTNDTDSDTGISSNHSQDSETTVGDVVLLST	160954	196523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7241_pilon_+_160994_194921
753228	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
753230	contig_9011_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_159311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGGCTTCCAGTGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496791	494986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_495000_496800
753244	contig_15185_pilon	-	1166	8	Intergenic	novelGene_99462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	414.897380968709	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	509	1039	434127	429911	FALSE	25	TGGGTCTCAAAAGGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472423	429783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434158_435509_435683_444528_444701_472290
753247	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	886	-23	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
753250	contig_10626_pilon	-	1085	2	Intergenic	novelGene_138205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	42	776	282462	279002	FALSE	35	TGAATGGCTATAATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHRKLDRLEKKKKRDRKKKKLQKSRSKHKKHKSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSIETSESSSESDDKQKKIQKQKRKKNKCSGYNSSDFEEKDKSKKRKLYEELSSSHSNKEKDREKPRFLKRESSGKNSKWSHSNSDRKSKSRNYSPKKRGSERNERSSRSQSRDEKGRRSRSRSHSSYKQREIRKWTQCSPSEEQNRNDTRSRGTDTHRGEKMHRENSGDKHTKVTQRERSRSREKIKRDYM	282503	278692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_279723_282448
753251	contig_13937_pilon	+	1562	9	Intergenic	novelGene_167349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	58	417	33460	36877	TRUE	25	GCTGGGAAGTAGGGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLNRVNVDQFQCNEQQNQVEDRGQELNAPQHAQVVLPLPRPQGLLHPLSVPQLRGGDDLVAHLLALCADFSEHGKHFENNSGAVQSRDGCAAEHPERLGPLLSRKIIQVIKTTVIPR	31003	49226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_31035_33433_33548_36079_36297_36822_36951_37711_37786_44214_44301_45273_45445_47015_47101_48570
753252	contig_10749_pilon	+	1275	15	Intergenic	novelGene_133505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	43.2494544025985	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	243	968	292847	300658	TRUE	25	AGGGGCTCATGCCCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPPPPRDQVTLYEHNNELVTGNSYESPPPDFRGQWINLPVLHLAKDPLKTPGRLDHGTRTAFIHHRERVWKRCITTWRDMGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNWNSCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVSSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSLSTRPSSGCAQVLSHPGHTPVTSLAWAPSGGRLLSASPVDAAILVELPTCSGPRMAAKSWLPPLQLCFEFGRPRCGLVRGGLRCWGDVRLAAGAQMETDCCSLY	288723	301534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_288831_289428_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293798_293883_294227_294378_299644_299766_300159_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513
753260	contig_10801_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_74025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACTTTTGCCCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225858	224797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_224800_225900
753261	contig_383_pilon	+	791	7	Intergenic	novelGene_126152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	31	junction_3	5.7662812973354	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	37	789	387180	527059	FALSE	30	TAAGTGCTGTGTTGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSERYVFIAEWYDPNASLLRRYELLFYPGDGSVEMHDVKNHRTFLKRTKYDDLRLEDLFIGNKVNIFSRQLVLIDYGDQYTARQLGSRKEKTLALIKPDAVSKAGEIIEIINKAGFTITKLKMMMLSRKEATDFHVDHQSRPFFNELIQFFTSGPVIALEILRDDAICEWKRLLGPANSGVARTDAPGSIRALFGTDGIRNAAHGPDSFASAAREMELFFPSSGGCGPANTAKFTNCTCCIIKPHAISE	387143	527061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_387183_450278_450387_451172_451340_479481_479593_495989_496041_498612_498821_526954
753262	SIRV4	-	192	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	422	3	-422	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGTCACCAATAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
753263	SIRV4	-	326	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1197	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3961	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
753264	contig_1639_pilon	-	986	3	Intergenic	novelGene_74907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313508	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_312049_312577_312679_312825
753267	SIRV6	+	299	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	600	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1783_3106
753272	contig_3233_pilon	+	1172	8	Intergenic	novelGene_56546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	248.511815511817	26	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	348	1043	740857	747909	FALSE	20	ACTCCCCAATGGGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738553	748038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_746936_747016_747718
753274	contig_16322_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_87546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTTCCACACCGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88148	87573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_87600_88100
753281	contig_8864_pilon	-	2079	10	Intergenic	novelGene_135983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	33.3999334663343	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	223	1212	156918	137751	TRUE	15	TTTTCTGGCTCAATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQEHPSIPDAKLQRSQDADDQQESFVPEVPQLDLAALCDGKSWEEPVPTFSTWQRESINSDEARLSPQAGRLIRQLLDEDSDPLLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEERKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRKQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQELVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTIPIINRLS	157140	129792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_130145_136023_136108_137319_137766_137851_137948_145581_145666_146305_146527_147385_147468_148398_148538_149075_149290_156779
753282	contig_12765_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_106554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAAGTATTTACTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86738	87331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_86700_87300
753283	scaffold_6394_pilon	+	1141	8	Intergenic	novelGene_111002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	991.876411820813	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	11	697	398216	405393	TRUE	10	TACTGTGTTTTGATTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAMSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPVRLQDHRHGRLLPQHG	398205	406277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405343_405501_405717_405864_406086
753285	contig_8942_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_143207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTATCTAATCAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495952	493982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_494000_496000
753292	contig_17976_pilon	+	1208	4	Intergenic	novelGene_32500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1335.96041192178	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	185	1024	41843	48725	FALSE	30	CCAATGAGTGGCTGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQEFLLVVTMGGEGGGKRR	41658	48909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45530_45585_46443_47166_48676
753293	contig_5640_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_27300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGCATTTCAGCAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324972	1326504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1325000_1326500
753294	contig_20890_pilon	-	1195	5	Intergenic	novelGene_147043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	896.387855506755	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	136	600	42641	21744	FALSE	10	TTCTTGCTCGATAGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTIFAPPNTSDMEAVWKEAKPDELMDSKLRCVFEMPNENDKLNDMEPSKAAPLNASKQDGPMPKPHSVSLNDTETRKLMEECKRLQGEMMKLSEENRHLRDEGLRLRKVAHSDKPGSTSAASFRDNVTSPLPSLLVVIAAIFIGFFLGKFIL	45633	21148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_21903_29614_29789_42125_42207_42590_42677_45533
753298	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
753301	contig_11978_pilon	+	1422	12	Intergenic	novelGene_62797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	69.7247243815466	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	122	535	299759	545620	TRUE	15	GTTCATTGCCATGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKR	299637	589567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540042_545619_545686_547581_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587387_589201
753302	contig_8312_pilon	+	1587	6	Intergenic	novelGene_152883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	839	junction_3	326.970090375251	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	38	379	264927	273150	FALSE	20	GACATTTTTGGCATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEEELLATQVDMRAAQVAQDGEIARLLMAEEKKAYKKAREREKSSLDKRKHDTEWKPKTSKSANPKSKESDEPHRSKNNRPARPPPPAGTDAKDLDYPHFTNQRNSTRHFSKWESSHKGFHYKH	263784	274358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_263807_264911_264957_265066_265172_266972_267053_271660_271768_273130
753303	contig_6589_pilon	-	1381	10	Intergenic	novelGene_26270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	55.3489491574999	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	871	1329	2228821	2227865	FALSE	15	TTCTTCAAGCTTGGCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHLTAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2231098	2227812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228864_2229065_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737
753305	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753306	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	384	-1	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
753307	SIRV6	+	373	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
753308	contig_6496_pilon	-	1889	10	Intergenic	novelGene_103461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	20.0166597280032	77	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	470	1786	135813	93103	FALSE	5	GTTGTTTGGTGCCTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEILLKIFSYLDAVNLLCIGCVNRRFYHLASDNFIWVRIYSTAFSPKRSNWKVNSVEKTAVSVNLLSLEDKEAGYWKKEYIAKQIASVKATVAQLLQPVNPYTGLPVKIKEALRVSGLGWVIILRDKSGKEYLTERVHLSVNDTSVSVVWYGKNWPCLATLSTLDLCGVTPVFMDRYKSPTKNGDVRRPRWRSLIAKYSLSDLSESTLMGCDGLIRVFGLSPGLLVGLWKREEELAFVMANLHLHQLMERSILGSATIPYDLPPHSPFLDDAPEYGLHGYQLHVDLHSGGISYLCGTFRNLFSKKGYIENGYMKLVVINFNNNTQHVPLIGKVGLSWRTNIFEGRIESCSIMDVTLLDDSGKPFWCFSSPVCMRLSTSPCDTCDFLGQRYCIDYVDSEGRVHVDLVWIEETEEYFVVNLALYLSVVKINHWFGTEY	140976	92999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_93373_99465_99591_122908_123052_124027_124111_125946_126086_130326_130537_131093_131337_135709_135815_140400_140506_140613
753316	contig_7815_pilon	-	1919	19	Intergenic	novelGene_134400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_18	16.9681073389658	95	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	84	1883	878656	835130	FALSE	30	ATATGTTCTATTATGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEELQSIIKRCQILEEQDFKEEDFGLFQLAGQRCIDEGHIDQLLEIIQNEKNKIIIRNMGWNLVGPVVRCLLWNDKESDKRKDYLLMLDLLVKLCNPKELLLGLLELIEEPSGKQISQIILLLLRPLQTVIQKLHNNKAYSVGLALSTLWNQLSLLPVPYSKEQIQTDEYGLCQCCKASIEFTKPFVEEVIDAKENSLENEKLKDELLKFCFKSLKCPLLTAPFLEQPEEARNDPLKYFASEIIGFLSAIGDPFSKMIFNHRRKKRIWKHLEFEEEEDKQLADSMASLAYLVFVQGISIDQLPMVLSPLYLLQFNMGHIEVFLQRTEESVFYKGLDLLENGLLRIEDNSLLHQYLEIKSFLTVPQGLVKVMTLCPIETLRKKGLAMLQLYINKLDSQGKNTLFRCLLNTSNHSGVEAFIIQNIKNQIDVSLKRSHDNKWFTGPQLISLLDLVLFLPEGAETDLLQNSDRIMASLNLLRYLIIKDNENDNQTGLWTELGKIANNFLKPLHIGLNMSKAHYEAEIKNNHENSHEAQKSKDICSVTVGGEEIPNMPPEMQLKVLYSALFTFDLMESVLARVEELIEIKTKSTSEENTGIK	879615	835093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_835247_835363_835447_836244_836369_855610_855675_856407_856518_857036_857122_858741_858816_858915_858958_859849_859940_860045_860077_861502_861557_862810_862999_867114_867218_868554_868796_869842_869952_871176_871297_878125_878252_878617_878684_879559
753318	SIRV7	-	270	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69014	2	35795	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78943	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
753321	SIRV2	-	426	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	49	3257	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGACGTGGTGATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
753323	contig_18168_pilon	-	1524	5	Intergenic	novelGene_122082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	153.796944052865	12	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	22	585	27110	25045	TRUE	35	TGGAAGAAATATGTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNGERRRPGSHVTGPLVPTDESPRVSGTRPRTWSLWRPGLWGTGPSRNGQLWWCPLERSRDIRVMCSTRGCPSLSP	27131	23461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24935_25038_25196_26410_26754_27040
753328	contig_14519_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_66828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGGGAAAAAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283327	282071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_282100_283300
753332	contig_11720_pilon	-	1039	2	Intergenic	novelGene_43764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATTGGCCCTTCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16825	14947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_15922_16760
753334	contig_14744_pilon	-	1145	9	Intergenic	novelGene_66152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACAGCGGTCTCGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681769	1669283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1669441_1670152_1670257_1675319_1675470_1676014_1676141_1677963_1678207_1678613_1678735_1679037_1679108_1680471_1680570_1681693
753337	contig_9848_pilon	-	1423	9	Intergenic	novelGene_79953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	646.793328177556	1	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110046	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99386_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105858_105909_106409_106497_107128_107190_107354_107399_110003
753338	contig_12464_pilon	+	2537	1	Intergenic	novelGene_68706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAAAACCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342740	345277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_342700_345300
753339	contig_10569_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_44086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	826	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363833	362563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_362600_363800
753344	contig_10864_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_107119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAACGTAGGACATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152619	1151652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1151700_1152600
753345	contig_8330_pilon	+	2214	6	Intergenic	novelGene_71772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_5	199.139549060452	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1588	1905	657181	658351	FALSE	15	CTTAGCAGTTGAGCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	654914	658660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
753350	contig_3095_pilon	+	1224	5	Intergenic	novelGene_75068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	101	817	147280	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147179	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147316_149651_149896_150413_150696_150996_151163_151848
753351	contig_13004_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_112741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	139	522	940637	941020	NA	20	CACCGAGGGTTTGACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLQLLLLLPRLLQNPSGQPGAHILFLFFSGPAAPPLFPDPLPHCIRSQDLLRQGRMFFPIPSPTCRLKFGHFSRKSCREDSHVGTQERSRVRLRTELPVPKRPRKEHTAPQRSEARSTIRFTPPR	940498	941205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_940500_941200
753353	contig_6929_pilon	+	1000	8	Intergenic	novelGene_139367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	382	junction_2	115.079741652367	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	483	800	79910	90425	TRUE	0	TGTTTTGGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77977	96489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356_90447_96310
753354	SIRV1	-	242	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5560	3564	-111	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTAGGTTTGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
753356	contig_8330_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_71950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACGTCTAGCGCGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452255	1451941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1451900_1452300
753357	contig_14553_pilon	+	2007	4	Intergenic	novelGene_124997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_3	135.534333493604	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	43	474	5787	6218	TRUE	35	AACAAACCCAAGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVGEQGRVRVGKERPPFHQLFSLLNEWALSRKRGFRLRKVTAEARSEEILPFLHHLTGDKMGVYKSGFEIGFLCGRTCVCQQVELHPLECFSKGLCYVWHYLGHQEEAGGISEGIAETVRVLRHSGHQ	5744	23551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_6387_13796_13937_14294_14424_22455
753358	contig_15039_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_110190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAACACCATCTTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364890	363725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_363700_364900
753359	contig_5226_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_140496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGAATTTTTAAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7715	7363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_7400_7700
753367	contig_11003_pilon	-	1692	13	Intergenic	novelGene_105409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	103.19345371141	26	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	26	1246	27839	14135	TRUE	20	GGATTCTGTGTTCATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRSFGGDVSWDKSLCIGATYDITDSCITHQIVDRPGQQTPIIGRHREAGGQAAAGPGGGE	27864	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_13089_14048_14187_15307_15434_15827_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
753368	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
753372	contig_3602_pilon	+	1521	9	Intergenic	novelGene_60659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCGGAAGGCAGATCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106033	1139458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1106785_1107771_1107828_1108576_1108747_1110836_1110955_1111711_1111795_1111892_1111948_1112147_1112226_1113548_1113597_1139296
753384	contig_2161_pilon	+	1969	2	Intergenic	novelGene_114893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCTCAAAAGAGATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547275	551637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_548193_550585
753388	contig_6710_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_96495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753390	contig_7165_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_116852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGATTAGACAGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320307	319853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_319900_320300
753391	contig_4496_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_66614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGCGAGGGCCACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575950	573310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_573300_576000
753399	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_93927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753403	contig_7904_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_160022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400787	402393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_400800_402400
753405	contig_5255_pilon	+	2090	2	Intergenic	novelGene_171559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGAGAAAACTTACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75061	77910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_75145_75903
753411	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753414	scaffold_7386_pilon	-	2320	10	Intergenic	novelGene_136591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	62.0258806994565	2	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	330	1358	308755	298000	TRUE	10	CTGGGACCCTTTTCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTRSLPCLPTFTLSSWGAGQEEASRDPPRPLEAPNPAPLAPSVRTPAAGHTPRLRERAPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEERTIFSCKDLQ	309084	296559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_298036_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308577
753415	contig_5728_pilon	+	754	2	Intergenic	novelGene_126706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAAGTGTTGTCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371804	381169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_371937_380547
753418	SIRV4	+	332	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGCACAAACTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
753424	contig_4857_pilon	+	1505	2	Intergenic	novelGene_48724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	991	1503	1192845	1193404	FALSE	20	GCTGCATGGCAGGGAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGSAILDSYQRPANRGYEKAASRSFQGETKQPVIGDICFPTPHPSSSRLGLLCFLWPQSLDRETAAAWIPHTRMGGSVSAICWLLVLLFFRFFLFLPCLSPPPLPFTRVPRSVRHLCFFLRGCGAPFKCGAASWFGLLCWWDPGTFVHLFVLNCFFSFPFLELGALSGQT	1191854	1193406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1192848_1192894
753426	contig_17311_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_57875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTATTTTCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212980	213574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_213000_213600
753427	contig_2058_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_171565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGCACTGAAGGTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114525	112431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_-_112400_114500
753434	contig_5071_pilon	-	1409	8	Intergenic	novelGene_171279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	49.9726455785808	550	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	298	1164	303096	159068	FALSE	15	GCTCTTCACCGTGAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWSKGKGLGAQEQGATDHVKVQVKNNHLGFGATVNNEDNWIAHQDDFNQLLAELNTCHGQEATDSSDNKEKKSFNLEEKSKISKNRVHYRKFMKGKDLSSQSKTDLDCIFGRRQNKKTSEDNSSPTTPDENETSITTTSALTIQEYFAKRLAELRNKPQIAPTDPDFSGALNEWKRGKKRSKEAKDKNLENNMQPKKEKPQEQEENPKCAVKKKREQVEQQLGDPCCEENSESSAENGEDCGWPPDDQDFTPKSKKKKEKKKIKKQVEAAVNPMLGETPVKKKKSSK	307915	158822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_159572_251079_251157_258097_258191_293754_293834_295391_295485_303075_303186_303653_303727_307780
753439	contig_1986_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_64159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTTTCTCTTAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410246	408894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_408900_410200
753440	contig_12638_pilon	-	2889	1	Intergenic	novelGene_33291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105862	1102973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1103000_1105900
753441	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_93536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753444	scaffold_13505_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_111625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAATAAACCCTGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731803	730000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_730000_731800
753448	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_94743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	470	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657490	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657492	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753450	contig_6710_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_97834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653799	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753452	contig_14744_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_65929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	623	952	161238	160909	NA	35	ATTGAAGGGAAGGATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNPPSPSPTLPFKLNYFLCQQFSSLYNINQTTLVCQLFTCTPITILKLHLFPIIQILHNNGLQEKEAGKMERHEYLHINIFSYLTHPSENVLKITFVFIFQVQRKERS	161860	160174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_160200_161900
753456	SIRV4	+	351	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCGCTTGCACCCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3636	3987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
753459	contig_3529_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_105356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTAGCAGGACGTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536243	538466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_536200_538500
753461	contig_12977_pilon	+	1435	15	Intergenic	novelGene_122785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	762.973386007076	2	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	169	1176	10887	57283	TRUE	45	CACAGGGAATAAAGAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10718	58770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53618_54013_54102_56950_57007_57242_57361_58588
753463	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753464	contig_12622_pilon	-	1334	9	Intergenic	novelGene_5885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	17.599715906798	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	136	834	1469326	1462438	FALSE	15	TATGATGTGTTGTCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDCTDGVDTVCEPCQAGEFLDTLNREMRCHQHKYCDPNLGLRIQTEGTSETDTTCTCKEGQHCTSDTCESCAPHSSCHPGFGVEQIATGTSDTICTPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCKTKDLAELKAGTNTTDVLCGPWPRTRALVAIPITLGILFVIFVSAYINKVVKKPDNKAYPGEGVRKAPEEMIFLDDIPGHNPVAPVQETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ	1473099	1461937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1462606_1463320_1463350_1463458_1463543_1464886_1464949_1468407_1468502_1468831_1468979_1469211_1469338_1469723_1469757_1473008
753467	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	262	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753469	contig_8896_pilon	-	1115	2	Intergenic	novelGene_171568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGAGAATTGACAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18725	7645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_8724_18688
753470	contig_8896_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_171567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAACTAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7592	6652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_6700_7600
753474	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
753477	SIRV2	-	431	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1414	0	251	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4481	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
753479	contig_10904_pilon	+	1280	4	Intergenic	novelGene_22459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	137	1105	149100	150068	TRUE	10	GGACTTGTGTGTTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143909	151581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150175_151512
753482	contig_9177_pilon	+	1817	11	Intergenic	novelGene_32823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	18.9739294823186	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	454	1599	1697502	1712630	FALSE	15	ATTTGTGTTGGTTTACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHPATLCHYSQVDEDIPATPSPQLCPGPCRPLIHHLFYLPHSPLPWVESPFVFLDLDQAFSVISVRQVIPSCHRLSLGLPSSLHPFSTGSGPLSVLYIRAWAPSPSSFLQSLLPNDTLFPLHIHCGSFYSHPVLGNLTVQFSNGKLQNPGNMHFTLYKSKDFTNPRKRSQRILAAETDRLSYVGNNFGTGALKCNTLCRHFVGILNKTSGQMEVYDAELFNMQPLFSGESLESELPSQSQTKTFREKMDSCIEAFGTTKQKRALNSRRMNRVGNESLNLAVAKAAENIIDTKGVTALVSDAIQDDLQDDSLYLPPCYTDADKPEDVYKFEDLLSPVEYEALKSPSEAFRNVTSEEILKMIEENSHCSFVIEALKSLPSNEESRDRQARCIWFLDTLIKFRAQKVIKRKSALGPGVPHIINTKLLKHFTCLTYNNGSLRNLISDSMKAKITAYVIILALHINDFQIDLTVLQRDLKLSEKRIIEIAKAMRLKISKRRVPVAADREEEHRLGTLSIPLPPAQTLDHQLKRRRVT	1697048	1712848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1697568_1699090_1699168_1700268_1700355_1702291_1702351_1703096_1703242_1704951_1705060_1708307_1708405_1708906_1709041_1709953_1710036_1710797_1710930_1712470
753483	contig_7173_pilon	+	1200	3	Intergenic	novelGene_37537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16	418	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	27	506	243730	249486	FALSE	30	GATTAAGTAACTTGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADEKDPLSYFAAYGSSSSGSSAEEDDSEPEETSRRAPDPANPAGGCGNKAEKRLPGPDELFRSVTRPAFLYNPLNKQIDWERHVVKAPEEPPKEFKVWKSNYVPPPETYTTEKKPPPPELDMAIKWSNIYEDNGDDAPQNAKKARLLPEGEETVESG	243703	250180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_244006_244645_244845_249481
753487	contig_3004_pilon	+	2137	5	Intergenic	novelGene_127498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	68.8235969708065	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGCAGAAAAAAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282994	287170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_284415_285297_285751_286379_286451_286738_286875_287113
753488	SIRV4	-	241	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	370	6	-370	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACGGGTGCAAGCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
753489	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
753493	contig_14333_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_49100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306258	304197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_304200_306300
753494	contig_13481_pilon	+	1622	5	Intergenic	novelGene_119443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_4	80.6423430959195	141	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1215	1604	1091943	1093268	FALSE	35	CTTCCATGAACTAATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066915	1093286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071054_1071222_1083899_1084701_1091839_1092052_1092987
753496	contig_6007_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_87913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69342	67483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_-_67500_69300
753499	contig_1836_pilon	-	1085	2	Intergenic	novelGene_71041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692324	683731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_684762_692269
753501	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_95682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
753504	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753507	contig_5947_pilon	+	1835	2	Intergenic	novelGene_101568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATGTGATGTGAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786381	789330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_788055_789168
753512	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_96373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753516	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753521	contig_13592_pilon	-	2195	10	Intergenic	novelGene_33736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	144.089478372912	103	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	20	1267	351476	276396	FALSE	20	AGAGTTTGCTCTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQELDRMKAGKLLKHAQHKAVPAVHFINDSLKNQDRKLWGQSIQLASQKLYGLSDENNDDRVLKCCLQYQELFPCSLVILCTDDRNLRNKGLISGVKSLSKEELSAELLNLSLNTDECHQPCISKHQLKAEATSLKESFEEKSANSGLSILLESIISELEKSLGTALSLILETEMKIAFGNLWMEMLYLKPPWTLIHLVQCFKKHWLAVFGLVMEKNLLLTIESLYENLCKANNAVDFTTAKFLLQDSKSLLHAFSTRSDYDGILPQAFAQVNKLLQTFTEVKAKLKPNPSENTVGKKQEDTSLMTSSNQEITLFSGSQLPQPNRHQEIWSILENVWITIYQNSTDVFQRLGSNSALSTSKIASFEEAFLYLQKLMVAVKDILEGIQRILAPNSNYQDVETLYNFLIKYEGKVNHWMPPAG	351495	275467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_276432_298294_298362_308909_309042_326680_326869_332877_333027_337466_337606_339905_340070_341523_341670_348351_348446_351343
753526	contig_1694_pilon	+	1926	2	Intergenic	novelGene_144933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497403	501950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_498766_501386
753527	contig_9400_pilon	-	834	8	Intergenic	novelGene_146590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	348	junction_7	424.958965606068	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	204	608	135537	121567	FALSE	30	TGCCCAATTGAGATCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRNN	163311	121340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539_158630_163221
753540	contig_8375_pilon	-	2094	11	Intergenic	novelGene_141265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	711	1187	41444	37185	TRUE	25	GGCCATTGCTGGAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTAISPFFHGARKTFDCQLVALGEASGEVGSIGGRAVILSFLLLASLCLVPNCLGVICSGLMEGLVLIFSVKPIGDWTRPFIHTALEHKGLSRLHLLTQHDSQLDLLNRGYHLDPQDLADDFPMRMAIFRNTLVFSVFCWFVFEHCRITGAFLKAL	55567	19704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_19938_31067_31356_35204_35456_37049_37325_40522_40812_41396_41517_43344_43430_45559_45615_46932_46996_51080_51139_55190
753542	contig_4442_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_127951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTATCTCCTAGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303784	304536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_303800_304500
753546	contig_2487_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_148443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88537	90653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_88500_90700
753548	contig_6589_pilon	+	772	5	Intergenic	novelGene_25758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	636	junction_1	1596.74152573295	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	189	680	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668235	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669650_669748_670000_670104_671046_671188_672584
753551	contig_14556_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_138522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCAGCTCCTGTAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122659	123904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_122700_123900
753552	contig_14556_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_138524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATTGAAACGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123853	125471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_123900_125500
753554	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_95041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753555	contig_1996_pilon	+	1998	11	Intergenic	novelGene_131958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	408	1214	524469	525787	TRUE	5	CCGCGCTTCCCGTGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATSFSAIQPLSGACVLTTCGCCAEEPGLPRRWPAASAPRPQLHPRGSAGQPRADLAQAGSREPSPQPVRSTGAPRARPAPHPVPGGGEAHVQGSPQPPQDPLRLHGAASSQDEKQEARGGHVEADGDEAREGGQQVEEEGLVQPLQQVVELAEHALQGLAHGYQVILVLTKTIDATQRQGLHAIAQEEAMGAVGTAGGLPQNHQQQRLQALQWPVQRRPVLGLQLGGVETGSHNASHGPPPPHRQPHLALQRAQQPPFSGRRSGRG	523854	527329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_524143_524349_524525_524598_524792_524923_525008_525193_525341_525460_525929_526034_526131_526202_526359_526591_526702_526785_526971_527233
753556	contig_9785_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_157894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225554	223424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_223400_225600
753560	contig_12079_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_67354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACAGAGAAAAAATGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113242	114310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_113200_114300
753570	contig_3774_pilon	-	1914	10	Intergenic	novelGene_142027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	183.134100498602	15	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	515	1426	175510	106701	FALSE	20	ACATGCCCACTGGCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQATVSMCDLEFGSGKVKEQSMSGWWHVPWCKQFVQPCLVELLGSTLFIFIGCLSVIQNQQNTRTLEPALAQGLALSLVVAILGNISGGHFNPAVSLVAVLIGGLNLILLFPYWICQLCGGLIGAALAKALSSEEKFWNASGAAFVTVQEPGQVVGAVVAEVILTILLALVVCMGVINEKTQDTLAPFFVGFSVIVAILAGGTVSGACMNPARAFGPAVMANHWDFHWIYWLGPLLGSLFVGVLVRVFSGNGKTTLILKGW	210502	106212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_106750_107996_108132_109809_110025_112486_112614_115855_116110_167868_167990_175499_175603_198895_199018_200894_200987_210294
753571	contig_19564_pilon	-	2020	5	Intergenic	novelGene_29693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.20060973342836	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	582	1121	138056	137265	FALSE	15	GCATTTTCTTTAATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLLFRGQAMGVLPGEASTKSKETLEGSKAGLSSRIPAHPRMDHRLWKTNPTALSADTLPKRAIVDTKTSVPSTTQASMDLLCETVPSRPGWNEPSDLAAIISLWPCDGYCEAPAQHPESATHPPPSTTSLFGVQRCVSSLVRSVRSSDRASRDSSLGPHLCSLQLPPGSSSPLPNDC	141022	136365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_137658_137909_138201_138505_138726_140133_140198_140869
753572	contig_16776_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_130527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTACATAAACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50582	53064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_50600_53100
753578	SIRV7	+	229	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCGCTAATTTGGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147711	147940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_147700_147900
753585	contig_8617_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_73456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCTGCATCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62440	62059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62400
753586	contig_6595_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_122562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATAGACTGAGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734519	733685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_733700_734500
753589	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_92079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753590	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_90046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753591	contig_3747_pilon	+	1045	2	Intergenic	novelGene_24842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	141	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200986	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201424_204575
753596	contig_2332_pilon	+	2266	3	Intergenic	novelGene_58720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	22.5	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1906	2232	860887	861213	FALSE	25	AGCAAAATGTTTCCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKLWKPTERAREFLISLLNSLTWAQGVNFEEPNAGSRVTILPLIGTHHRFRFDGFSSADGLFPCDRLLKRVWVVCFYIYSNLYILPLVGIASFFFFFKKIKDTKIK	840849	861247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_842435_857439_857546_860672
753602	contig_14209_pilon	+	1722	10	Intergenic	novelGene_88343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	193.362641456697	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	910	1338	38057	40625	FALSE	15	CTTAGGGGAGCCTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32346	41009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418
753604	contig_11417_pilon	+	1010	5	Intergenic	novelGene_103265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	116.259408221442	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	158	529	319759	333747	FALSE	5	TCCCTGACTGTGTTTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARGFVPYIGIVTILMNDYPKFKYAVLFLLGLFVLVHRE	284396	334228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_319751_319902_327166_327287_333430_333489_333696
753605	contig_13894_pilon	+	832	4	Intergenic	novelGene_62060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGGCCGCGTTGTCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286222	288310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_286293_286856_287123_287219_287537_288131
753606	contig_16643_pilon	+	1392	4	Intergenic	novelGene_158139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	44.1134900002256	321	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	103	1212	306589	318119	FALSE	10	GCAACTGCCTTTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVREAGSGERILFVFHKNGRLSCKAKVQPPRLNGAKTGVFSTRSPHRPNAIGLTLAKLEKVEGGAIYLSGIDMVHGTPVLDIKPYIADYDSPQNLIEPLGDVNLQDNKHKPKTSFEFRSSGVTDNCDQQQLSGCVEPHPCTSTKEKPTCPEDRTSEEIHVEHDDTAKIRHSLKHGEEIAAGYGSESRSDQSLSVAEKQVGSCHQEKSFSEEGTDKRSRRGQEAAILRGNSVQTEPGALRYPSGAADEARHSVVPAWVRDAPVTTLEVRFTPHAEMDLRHLSSDVGQTAFKYFQSAEEAKHAIEAVLSADPRSVYRRKLCQDRLFYFTVDIAHVTCWFGDGFAEVLRIQHASEPVQMTDPAESLVSLGS	306486	318299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306621_314690_314849_315641_316302_317859
753610	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
753611	contig_8712_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_58739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATTTTACATGTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83667	82189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_82200_83700
753613	SIRV4	-	212	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1306	3	1306	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
753614	contig_7728_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_64712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGAACTGCCTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727594	726664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_726700_727600
753615	contig_4315_pilon	+	1682	2	Intergenic	novelGene_46779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	58	402	324480	324976	FALSE	10	CAGGCTGGCCGGGTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWGTEHFAYVLLTKDPKTFMFSYYPEDELNRGLSFYADKQEVTEEQLREFHEALKCMGLRETEILYTDGKKVNKRNRAWPVLTVSLGLTLPRAALGAQRGKAVSRGCTAEQDILLLSSCSLAGAMEPHVGLWW	324422	326256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_324532_324683
753616	contig_13456_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_153263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCTGACTCACAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19750	19306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_19300_19800
753623	SIRV2	-	358	3	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3319	-1	-689	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGACAGTCATGTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5788
753625	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
753628	contig_12993_pilon	+	2795	1	Intergenic	novelGene_136727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACATGTTGCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80196	82991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_80200_83000
753629	SIRV6	+	332	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	537	2	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
753631	contig_11417_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_103308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	772	1137	541445	541810	NA	70	CAAAAAAAAAAAAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAQTDLIKPLPLHKISETTNDSAIDNVVENHVADHLPSDILPDAVDTGFSTSSSPASLLERPTNCAEAQGYGHLGTNDLTAGGFLENHEEPRDKEQCTKENIAASLLNKGKKLMHCRSG	540673	542282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_540700_542300
753632	contig_15410_pilon	-	1283	3	Intergenic	novelGene_130561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	21	549	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	217	582	53301	50948	FALSE	20	CTTCAGCCTCCTGAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYVRPLHTLLSALVVAVALGVLVWAAETRAAVRRCRRSHPAACLVAVLAVGLLVLWAVGGACTFLLSIAGPVFLILVHASLRLRNLKNKLENNMESIGLKRTPMGLLLEALGQEQEAGS	53517	50246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_51088_51485_51704_53293
753633	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
753634	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
753639	contig_13700_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_68288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTCTTTCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136676	136900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_136700_136900
753640	contig_500_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_30932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGAGGACTGGCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187135	1188492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1187100_1188500
753644	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_98086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753645	contig_14341_pilon	+	2448	7	Intergenic	novelGene_111773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	55.64370784035	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	395	2050	316386	328668	FALSE	20	TATTTCTGTGGCAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGWETTVESKELTPTPDASEQEPTHSLKVDESSKGGPMSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	299910	329066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_300006_300969_301093_301861_301961_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327742
753647	contig_5649_pilon	+	1701	5	Intergenic	novelGene_82335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	60.1929190187683	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	227	838	480530	494244	FALSE	5	TTTGTCCTATTTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNTFQSGFLSILYSIGSKPLQIWDKKVRNGHIKRITDNDIQSLVLEIEGTNVSTTYITCPADPKKTLGIKLPFLVMIIKNLKKYFTFEVQVLDDKNVRRRFRASNYQSTTRVKPFICTMPMRLDDGWNQIQFNLSDFTRRAYGTNYIETLRVQIHANCRIRRVYFSDRLYSEDELPAEFKLYLPVQNKAKVSWLPHGKARQ	480303	495107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_480614_492102_492183_492851_492964_493558_493748_494097
753648	contig_14094_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_145911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294403	296041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_294400_296000
753652	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	35	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
753653	contig_3233_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_56585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1623	1970	747173	747520	NA	45	TTTTTTTTTAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQAKALSPPPASKLLYKVPSQLQWTLEKMIFSKGLNNNYFLKMEDKSNLKSDFLMCVITCGDILSHHNPSQKEHDFLAIGALFQAVVRFPLDIPEVAQGPPLLLWSSSRQVPWV	745550	747994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_745600_748000
753654	contig_10523_pilon	-	2226	9	Intergenic	novelGene_120935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	544.487832738253	1	103	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	135	1025	39240	15001	TRUE	40	AATAAAACAAGTGCCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	95272	12753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12994_14039_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26645_31080_31138_39162_39255_95152
753664	contig_11937_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_171582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAATTCCGGAGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122131	77695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_77759_121942
753665	contig_10451_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_138332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTGGCTGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482417	483160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_482400_483200
753668	contig_8729_pilon	+	911	2	Intergenic	novelGene_40064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTCAAAAACAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43016	44161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_43539_43772
753671	contig_2770_pilon	+	1337	7	Intergenic	novelGene_107494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_5	144.376821777828	372	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	784	1335	845211	855046	FALSE	5	TGAGGTGCCTCTCGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIDGVAVSSKTEPPSSEPASFIPVKDSDDVAPSVTTWLNPLGIYDLSITQWSQGQGPGEQESKPPDSQPDRECRSQGQGEEFNRKIRENPQDTQLWMAFVTFQQCHFLRQAGHSEKAISLLQAVIDFTFFQPDSVKDLPTKEQVEFFELFWDTGVPQAMEKGAQGWRAWMHQQEWGGWIVVNP	818983	855048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_819161_830373_830483_831499_831711_834922_835073_845074_845523_848433_848554_854926
753676	contig_5643_pilon	+	821	6	Intergenic	novelGene_39144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.3527205878183	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	137	658	655176	656645	FALSE	0	GTTGTTCTTTGGGCGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNGRDPGEVRPDIAHQSLLMLMDSPLNRAGLLQVYIHTQKNVLIEVNPQTRIPRTFDRFCGLMVQLLHKLSVRAADGPQKLLKVIKNPVSDHFPVGCMKIGTSFSTQVVSDVRELVPSSDPIVFVVGAFAHGKVNVEYTEKVVSISNYPLSAALTCAKLTTAFEEVWGVI	652677	656808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_652769_655130_655233_655340_655483_655851_655911_655994_656145_656531
753683	SIRV6	+	360	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	409	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2856_10707_10819_11031_11109_11205
753690	contig_19352_pilon	+	2376	1	Intergenic	novelGene_122414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATCTTACTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337053	339429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_337100_339400
753698	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_95684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
753699	contig_15787_pilon	-	1551	8	Intergenic	novelGene_143960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTCGATGACACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111917	56128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_56259_79239_79309_84146_84298_88284_88410_90607_90766_95811_96019_98167_98319_111357
753702	contig_13702_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_102615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGTTTAAAATGAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155632	154633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_154600_155600
753703	contig_18869_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_56060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTAAGCAGCCGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
753705	contig_9177_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_32780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTGTAAGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394860	1392752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1392800_1394900
753706	contig_10940_pilon	-	999	5	Intergenic	novelGene_49229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	907.032110787705	328	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	131	559	917000	875564	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917130	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874231_875318_875675_893147_893306_916664_916748_916923
753709	contig_6069_pilon	+	1926	9	Intergenic	novelGene_8075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	83.7838550975067	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	54	1139	560908	564879	TRUE	25	TAGAGCAGTGTAGAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIDCDEAARGNPAGAGGSHDDRL	560854	566833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564695_564813_564896_565907_566043_566197
753711	SIRV6	+	363	6	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
753714	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_97144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753718	contig_2924_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_140238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCTAGCCAGGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2336	909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_900_2300
753719	contig_12270_pilon	-	241	2	Intergenic	novelGene_114142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCGGGCATCTGGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
753720	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753722	contig_5482_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_144439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252752	251606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_251600_252800
753724	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	9	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753725	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753726	contig_3380_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_60077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATAGCTACTTGAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58417	59128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_58400_59100
753727	contig_4364_pilon	+	2215	2	Intergenic	novelGene_4593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAGAAAATACCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2152571	2155464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2152754_2153431
753728	contig_3155_pilon	-	1624	9	Intergenic	novelGene_26432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	994.484508426351	63	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	62	1387	310368	295041	FALSE	25	TATATATATGGATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNDLLWEDYEEKLTDQVVRTMENYIAQFSEIKERIAKRGRKLVDYDSARHHLEAVQNAKKKDEAKAAKAEEEFSKAQIVFEDLNQELLEELPILYNSRIGCYVTIFQNISNLKDVFYREMSKLNHNLYEVMSKLEKQHSNKVFVVKGLSSSSRRSLVISAPLRTSTASSPLTSPISPSALSLKSERESISAAEEERAPDPAQEEDNSEMEEEPLKDKEIEGGGAKASSSEEEEPLPAYNGPTQTQPSPTTEGGESQEEVFSCSPAPSSGRALIPSEQPSSSFPEVVLQTHTTSEGSEQPKRASLSRTSAPPSRPPPPRASPSPRLSSGSIPSSPTTSEGGSPTSSRAFFGAGTPSPRTSIEVSPDPELPEKPERNPEAREKETTHHLNPEELCTSPTLMISQVFSEPSEAGKMEDKEENNEFTSADSPEGQGLELQVSTVAGESSVIAPEPQEENVRLRDI	310429	294803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295065_295600_295676_298123_298205_299936_300694_306112_306196_307222_307299_308408_308495_309008_309117_310332
753730	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753739	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753741	contig_15952_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_154100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750223	749379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_749400_750200
753743	contig_7357_pilon	+	2662	1	Intergenic	novelGene_36952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTATAAGCCAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221104	1223766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_1221100_1223800
753744	contig_8447_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_69412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57899	60820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_57900_60800
753745	contig_5686_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_45299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTCATCAAAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95461	93905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93900_95500
753747	contig_4418_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_98393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGAAGGCTTAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912317	914430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_912300_914400
753749	contig_6710_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_94782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTGAAGCTGTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
753751	contig_5918_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_99576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACCTGTCCACCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831445	1832584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1831400_1832600
753752	contig_15185_pilon	-	1174	5	Intergenic	novelGene_99440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	311.25261043082	348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	330	716	444619	429911	FALSE	0	TCTGTGTGCTGTCTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472538	429452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430507_444615_444701_472290
753753	contig_8357_pilon	+	2642	2	Intergenic	novelGene_39715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTACAGAAAGAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473609	476864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_476119_476731
753759	contig_3153_pilon	+	796	5	Intergenic	novelGene_104698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	140.824358688403	1769	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	116	415	448580	456427	FALSE	50	ACAGGAGTGAAAATACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKTQFEDRN	448234	456808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448314_448543_448616_448707_448756_454168_454312_456354
753761	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_98103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
753764	contig_15423_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_171592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGGCTTCCCTTCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320906	320294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_-_320300_320900
753765	contig_3861_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_57904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATATATATACACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178691	178297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_178300_178700
753766	contig_16098_pilon	-	1631	15	Intergenic	novelGene_45871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	59.2160089358082	1	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	123	1367	253306	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPNCCYLLRNAQLLLKTPVLPVGANPELSLTLAPLGDSNLMPWLAARALGGAFRIPRIAPKRRSPLLDRQGAFWKNAMGFWLLGLCNNFSYVVMLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253613	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249987_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_253023_253095_253255_253379_253563
753767	SIRV6	-	338	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGATACGTCCCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	2779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2833_10680_10825_11035_11109_11205
753769	contig_13004_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_112671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657205	654562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_654600_657200
753770	contig_17134_pilon	-	793	2	Intergenic	novelGene_171596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	1229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	238	297	25400	25341	FALSE	15	AGCCGTCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRVSVSPLGAGSRPSPAGGGAGRPEAGTDLRPVLLRILGRKPRGGCGSLQPCCSHHRESKPRLLGTQIPTPVSSHPGRMALALTGRDPNHSLMLATT	26769	24844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17134_pilon_-_25580_26711
753773	contig_3627_pilon	+	1358	10	Intergenic	novelGene_78480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	72.8727963265061	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	37	1143	444171	483447	FALSE	20	TCTTTTCACTATGCGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESPEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNPSSNSRQRSGWSGGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDSRRRSGFD	444134	483662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_444201_448415_448566_459448_459611_460276_460397_461159_461234_461460_461621_476760_476896_478112_478158_483177_483399_483437
753774	contig_14483_pilon	-	642	4	Intergenic	novelGene_133762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	283.458403767937	36	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	38	361	117857	111743	FALSE	5	TGGTGTTTGCATTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHVRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQREKANGGYHQAKIGQGSEKNS	118300	111461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_111793_112592_112699_117689_117867_118272
753775	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
753777	SIRV1	+	255	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6457	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6465_6554
753780	contig_4364_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_4124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
753782	contig_5643_pilon	+	1439	5	Intergenic	novelGene_38759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	36.5273869856578	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	120	749	157978	160534	FALSE	10	TCGTTGGCTTTACTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEAWCLLLCLALSRAAEAKPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAEMSSTGLLVQARKQGQWSSR	157858	161224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_159501_160367_160415_160519
753783	contig_7657_pilon	-	2885	1	Intergenic	novelGene_30037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCACCACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222161	219276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_219300_222200
753787	contig_10183_pilon	+	2215	2	Intergenic	novelGene_169505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGATAGAACTAAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50656	53218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_51717_52063
753789	contig_12709_pilon	-	1103	9	Intergenic	novelGene_147401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	519.582148822494	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	78	1013	59003	29115	FALSE	25	AACAACTGTGTGTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLVALTLLGVGLALIGERLWALRRRMNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59080	29024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33680_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
753790	contig_6137_pilon	-	2577	1	Intergenic	novelGene_59145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTCATTTCTACTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021064	1018487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1018500_1021100
753793	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
753796	SIRV6	-	237	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACGCAAGGTATCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2081	1844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_1800_2100
753797	contig_12701_pilon	-	1321	7	Intergenic	novelGene_169548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_5	36.9177012646598	749	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	189	1160	40561	26442	FALSE	40	AGATATGAGAGAGATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKSFLPVRTALMIARYLDIFHLMDGVMKKKDEKTSSTSDAIRYPNPT	52393	26280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26578_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_52219
753800	contig_6589_pilon	-	1462	8	Intergenic	novelGene_26190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	104.558156847112	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	545	1423	1949686	1936442	FALSE	10	TCGACCGACGTGTGGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPPSHCLSLSPAASGYGTQNIRLSRDAVKDFDCCCLSLQPCHDPVVTPDGYLYEREAILEYILHQKKEIARQMKAYEKQRGARREEQKELQRAAAQDQVRGFLEKEAAIVSRPLNPFTPKAASSGNGPDDAQPGPSAGPASKDKDKALPSFWIPSLTPEAKATKLEKPSRTVTCPMSGKPLRMSDLTPVRFTPLDSSVDRVGLITRSERYVCAVTRDSLSNATPCAVLRPSGAVVTVECVEKLIRKDMVDPVNGEKLTDHDIIVLQRGGTGFAGSGVKLQAEKSRPVMQA	1953407	1936402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1936514_1936951_1937061_1937166_1937355_1937504_1937624_1937714_1937878_1941840_1941923_1949540_1950199_1953375
753801	contig_11370_pilon	+	704	4	Intergenic	novelGene_98711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2185.92650074669	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	75	497	145831	148303	FALSE	25	TGGGTTTTTTTCTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKWRCPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145662	148510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145679_145772_145963_147422_147616_148205
753804	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	309	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753806	contig_5018_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_46925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCGCTTTTTGGCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30908	31854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_30900_31900
753809	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753810	contig_5279_pilon	-	2120	2	Intergenic	novelGene_105568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	507	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAGAGAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340019	337296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_339283_339885
753812	contig_7229_pilon	+	2944	1	Intergenic	novelGene_39858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAGAAGATTCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419454	1422398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1419500_1422400
753815	contig_12886_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_135460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGTCTTTTAAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255547	255209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_255200_255500
753816	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	20	3	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753820	contig_9177_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_32642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTGGCATTTGTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54482	56559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_54500_56600
753821	contig_2114_pilon	-	403	2	Intergenic	novelGene_104252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	46	297	286102	285851	TRUE	55	CCTCAACATCAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLEACTRGRCAITNMTNSRGNVVKHNHPEPGKSTRKSLTWFTRPHPGEYLTGSDPPKEERDLLRTPGFQHSPREDAPHGFQPAPCHDQHLRLNTTSC	286147	281471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_281560_285832
753822	contig_14225_pilon	-	2810	1	Intergenic	novelGene_52761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGGTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470664	467854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_467900_470700
753823	contig_7457_pilon	-	1996	11	Intergenic	novelGene_31339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1635	1982	285270	281180	FALSE	5	CCCCCGGCCCGGGGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPSDASPIRVKLLALSVDIILAGGMNLRETPSWRVSINGSSPELASSSWVSPGFTWGVATNGAKVSSWMVTRSRILKLVSSFRGWLQRWHTKLTCMVLLDVLGPSIPVAVERR	291254	281165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_281329_283500_283573_284480_284539_285201_285302_285396_285528_285691_285881_286783_286921_288203_288348_289030_289096_289580_289719_290455
753824	contig_3386_pilon	-	2812	11	Intergenic	novelGene_34545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	175	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1878	2303	506629	497782	TRUE	10	CGACTTTCCGGCGGCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVNTFKKRITFDFLNSRGSNSMFPFTAESDPWLSQRWELLEEKSKFLSSSSPSYMSLEGSQNRKVELTDQHLIHDHPKRPPITELVVPGLHEHLRSNVVRSAYCGESLLTSISLPGFCFSFGIHILEMKSLGRLWFRFL	510015	470024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476273_476399_485246_485297_486415_486424_497733_497820_498659_498718_504778_504907_506001_506110_506535_506630_507647_507738_508228
753830	contig_9288_pilon	-	2378	17	Intergenic	novelGene_171599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	17.1896589553138	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	147	2195	45320	12995	FALSE	20	TATGGACTCTATATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTVSALLACGILGLCLASSDKTVRWCTTSKLEHDKCNDMRNVLPVLCVKTNSYYDCIQAIVEKRADAVTLDAGWVYEAGLAPHNLKPVVAEFHDSKNPQTGYYAVAVVVKDSGFQLKDLRGKRSCHTGLARSAGWNVPIGRLLCDLPEPRVPIENAVANFFSGSCVPCADRNKFPNLCQLCAGPDKCACNSHERFFGYSGAFKCLQEGVGDVAFVKYETILETLPNKADRDRYELLCPDNTRKPVDEYKECFLARIPSHAVVARSVDGKEDLIWELLNKAQEQFGKDKSGEFHLFSSPHGKNLLFKDSAEGFLKVPPAMDAWLYLGYEYVTAIRNLKEGKCPEDEGCRKVKWCAVSHHERAKCDEWSVNSAGKIECESAESTEDCIAKIMKGEADAMSLDGGFIYTAGKCGLVPVLAENYKGDPGCTLDDSGYLAVAVVKTSNPSITWKSLKDKKSCHTAVGRNAGWNIPMGLIYNETKSCAFDKFFSESCAPGSEPDSNLCALCAGSQSNKCAPNNKEKYYGYTGAFKCLVEKGDVAFVKKQTVLDNTGTGKDWKEEDFQLLCLDGTRKPVNDANCYLARVPNHAVVSRKDKAACVRQVLHNQQEQFGRQGSECLAGRFCLFQSETNDLLFRDDTKCLAELKGKTTYEKYLGEEYMTAVANVAQCSTSKLLEACTFHRS	45466	12811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9288_pilon_-_13030_14374_14568_15712_15877_20824_20890_21210_21347_23777_23934_25338_25372_25949_26041_27346_27496_28930_29109_29910_30090_30541_30598_31402_31545_32257_32435_33198_33305_42690_42837_45277
753831	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8136	-1	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
753833	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
753834	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_89558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653766	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753836	contig_14868_pilon	+	2998	1	Intergenic	novelGene_150430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAATCTACTGAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86569	89567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_86600_89600
753838	SIRV6	+	360	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	9	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753839	contig_12570_pilon	-	1242	8	Intergenic	novelGene_79358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	232.344220359995	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	179	1099	211353	190389	FALSE	20	ACAATGTTAGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFALLFCLAAAAPGSLCSVCPYPPASAPSLGSCAWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228664	190245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211430_228562
753841	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	325	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
753842	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_93725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753844	contig_7376_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_108096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	175	639	170174	170638	NA	65	TGAAGGAAATGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTPMLSHLHWRLGPIQAHLHAVMPMAIHVMCSHASRSATGDSRLHPTIPTQPHPLVIHSTRSCAVGSVTGGSCWLTPNTPALHCSSCPRTSGTSFHGVDPVTSDLCTLALITWQLPVHMYRTQPSTQQEHSLYPCPGEQPDRHITSPAMPVIS	169999	172469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_170000_172500
753845	SIRV6	+	486	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753854	contig_10549_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_110622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGCTTTGCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236292	236640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_236300_236600
753859	contig_9833_pilon	-	1810	13	Intergenic	novelGene_68549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCACGGCGTGGGTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260337	230912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_230947_244833_244944_246612_246752_248747_248815_249382_249473_250046_250179_251067_251182_251785_251891_252272_252455_254641_254799_256805_256951_258491_258607_259917
753860	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
753866	contig_3095_pilon	-	1126	6	Intergenic	novelGene_75243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1187.07347708556	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	71	793	255481	246709	FALSE	20	TATCTGTACTCTGAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVDWALSSIIGIRKDLMELHQQGSCTDS	255551	246375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247893_248481_248759_253535_253806_255384
753868	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_94118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653770	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753871	contig_10953_pilon	+	542	5	Intergenic	novelGene_42558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	347	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	36	491	422508	426254	FALSE	15	TTTCGACTCATCTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419998	426305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
753872	SIRV5	-	361	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10856
753873	contig_6228_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_164496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208553	207212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_207200_208600
753874	contig_5125_pilon	-	1944	2	Intergenic	novelGene_43450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAGATCCAACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39761	37627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_38875_39064
753876	contig_12765_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_106568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTAAAATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184114	185190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_184100_185200
753877	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
753882	contig_9629_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_171604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGTTTGATATAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71827	72527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_+_71800_72500
753883	contig_9629_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_171605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTTTGTTTTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73482	73720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_+_73500_73700
753884	contig_10196_pilon	+	3316	1	Intergenic	novelGene_132306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACGCTTTGGTTGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2348178	2351494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348200_2351500
753885	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_97896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
753888	SIRV4	-	321	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	0	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
753891	contig_11447_pilon	-	2474	1	Intergenic	novelGene_168097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGCTTCTCCCGCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479994	477520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_477500_480000
753892	contig_5988_pilon	-	1619	10	Intergenic	novelGene_16052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.2834716700396	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	338	1405	1050018	1042206	FALSE	25	CAAAGGTAGTTTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTVQPLPKGDQVLNFSDAEDLIDDSKLNHRPHPGRGCQDHTAVRDGGRLLGPSWPWFPLPFQILQLGTEAPGKACPELAAEDPTASPWI	1052825	1041991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042393_1043967_1044044_1046369_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1052598
753894	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
753900	contig_5023_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_7313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCCACACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608413	606237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_606200_608400
753901	contig_20324_pilon	+	2023	6	Intergenic	novelGene_100868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.3315314986267	445	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	137	946	7068	13026	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTMPLAMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQACISEVGKDGGSVCPVCRHKFLLRNIRPNRQLANMVNNLREMSQSAKEGAKGGQCGVHGEKLHLFCEEDGKILCWVCAQSRKHRNHSMVPIEEAVQEYQEKLQVELEKLRRRRELAEKLEVDVTEKRTAWKKKVETQKSRIHAEFVQQKNFLAEEEQRQLEKLEKEEKDQLRILGETEAQLAQQRQALQELISELEWRSRGSALELLQGSQSLFPSGVRPGTLRSWTLSAQT	5728	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_+_5817_7019_7476_7941_8038_9140_9372_12951_13078_13411
753902	contig_2377_pilon	-	1197	3	Intergenic	novelGene_67877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	1.5	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	227	853	92953	87872	FALSE	20	TGTCTGTGTAACTCTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPPVTMMPVTGGTINMMEYLLQGSVLDHSLESLIHRLRGLCDNMEPETFLDHEMVFLLKGQQASPFVLRGRRSMDRTGAPWHLRYLGQPEMGDKNRHALVRNCVDIATSENLTDFLMEMGFRMDHEFVAKGHLFRKGIMKIMVYKIFRILVPGNTDSIEALSLSYLVELSVVAPAGQDMVSDDMRNFAEQLKPLVHLEKIDPKRLM	93973	87527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_88426_92880_93028_93821
753907	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753908	contig_5084_pilon	-	2070	1	Intergenic	novelGene_64582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774926	772856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_772900_774900
753912	contig_8122_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_40201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255700	257576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_255700_257600
753918	contig_6710_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_89181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653705	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
753919	contig_13460_pilon	+	2678	6	Intergenic	novelGene_162179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	32.4123433278126	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	556	2013	190434	270436	FALSE	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRLQMGNGLVPQKIVSVHLHESTLKELKDQASNKQAQIIQPNPESSVEIKPERDAMAHIGKDDSKVLGEEPKPVQDSTSGREPSRESDRGAGSVEHYHLHLSSCHECLELENSTIESVRFASAENIPDLPYDYSSSLESVADEICPKKEGRRGNITGKAPNILVYVGPDSKEALDRCQQVRALLADCVDTDCYTVYQLQEESALRDPWLDNCLLLVIATKESVPKVLYRKVMAYLSQGGKVLGLSSSFIFGGFQVTSKGKLQKTVQNLVFSKADCSEVKLSVLTSGCIYEEVPGDQLSLGKLQGHLDNEDKDRTIVQVPFGTCGGVAVLCQVHLELPPSSLIVQTQEDFDLLKSSNCRRYEVLKEILTTLGLSCEMRQVPALTPLHLLSAAEETWDPFMQWLGKHVDPEGVIQSSKLSLKFVSSCTSDIEITPSCIPVVTDSEGFSSENFNLEIYRQNLQTERLGKIILFAEVTPTTMSLLDG	139947	271101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_140254_181704_181843_190322_190486_200575_201523_216257_216441_270160
753920	contig_10904_pilon	+	3182	8	Intergenic	novelGene_22443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2206	2604	86927	87325	TRUE	10	GAGAGGCTGGGCGTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMLQQVVELLQSLGSGGDEQRQLRKQLLPNQAAKKELCGPFLLPVEAPGALRIVGRRLELVKAINDEKEAFGNPDKLWEKHTLLWPTAGDEVLQASLGLLVHLPAVDVEEEIKPALEEPPFGPVQHHLVS	70723	96488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_71250_73007_73177_74999_75174_78003_78176_82593_82766_85934_87631_93272_93345_96287
753921	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_96008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
753923	contig_16775_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_107798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACAATTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200512	199865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_199900_200500
753926	contig_5643_pilon	+	1808	4	Intergenic	novelGene_38958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	114.719948860983	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCATGTTCTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499614	502639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_499656_500141_500252_500592_500661_501050
753927	contig_9727_pilon	-	1004	6	Intergenic	novelGene_86294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	31.7905646379551	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	90	806	251632	245075	FALSE	10	CGATGCCTGGCCATCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRKGLSSGRWPSVPGTDAEGANSWRLPADHTPCSWAAMVLIGESGVGKTNLLSRFTRNEFNHDSRTTIGVEFSTRTVMLGTAAVKAQIWDTAGLERYRAITSAYYRGAVGALLVFDLTKHQTYAVVERWLKELYDHAEATIIVMLVGNKSDLSQAREVPTEEARMFAENNGLLFLETSALDSTNVELAFETVLKEIFAKVSKQRQNSTRTGAITLGSGQAGQELGPGEKRACCISL	251721	244876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_245203_245515_245597_246255_246450_247948_248145_250354_250471_251630
753928	contig_9239_pilon	-	1678	11	Intergenic	novelGene_137186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_10	128.278174293213	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	536	1465	235844	205036	FALSE	35	TAGTGCAAATACCACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQR	279130	204822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_205200_212054_212240_218398_218533_218860_218984_234936_235057_235500_235649_235788_235877_238796_238935_240383_240519_265907_266001_278993
753931	contig_11512_pilon	+	364	2	Intergenic	novelGene_43219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	4011	4569	FALSE	25	TTATAGTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYA	3984	4571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
753933	contig_6084_pilon	-	2165	9	Intergenic	novelGene_127055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	62.5959263850292	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	386	1336	438209	430603	FALSE	25	GTTTACAGAGGGTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWKLEGSAWETKSHVLLGQECLLEDIGEDDVSESFQLLQIDMECESQERRSLPTGSASWCSKNVQRKQKHWEKMVAAKKSKRKQEKERRKANRAENPGIRPQHSKRFLRTLTKERLLEAKHSGPRLCIDLSMTDHMSKKELSRLAGQIRRLYGSNKKADKPFWICLAGFSRDSPLYEECLRMNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQVFDILSTYFETRNWPEALKKGVSSGKGYVLQNSVE	445452	429773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430710_431272_431397_433030_433099_433811_433891_435337_435491_436607_436733_437315_437425_438023_438240_445097
753938	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753939	contig_2455_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_119227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACGTCAGGCATGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1428774	1429746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1428800_1429700
753940	contig_2455_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_119228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	384	683	1430234	1430533	NA	75	ATGAAAAGAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSTPPPVQYHPLPPLCWGHLLGGKVPQVNWVFASLLFWSRLSLVPFMLQFLTSAFLIFNDPSKVENYLAASIRVSALDLFVCLAELPFAKLKGRCLK	1429850	1431803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1429800_1431800
753944	contig_7123_pilon	+	934	3	Intergenic	novelGene_170579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAGTGTAAAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433395	437381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_434140_437107_437166_437249
753946	contig_2403_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_71013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATGTTTGCCTGAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148805	147207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_147200_148800
753947	contig_2403_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_71012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAACCACACCCTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147146	146401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_146400_147100
753952	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	887	-30	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
753954	SIRV6	+	344	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	531	3	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
753957	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	15	1152	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
753959	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	573	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753964	contig_10506_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_125178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACACGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68294	66078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_66100_68300
753965	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_18280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
753966	contig_859_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_132814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTTTTGTGGAGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52307	51751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_-_51800_52300
753969	contig_2596_pilon	-	1452	5	Intergenic	novelGene_53472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.2996175894241	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	111	1088	722501	662746	FALSE	15	CACTGAGTACTTTGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQRHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	722611	662381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_685929_685991_694845_695036_696168_696243_722456
753972	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
753973	contig_7035_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_83516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTTCACTTTACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263138	261725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_261700_263100
753974	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8140	3	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
753976	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLCASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14369
753978	contig_15354_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_65708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGCTGTTCCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217467	219521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_217500_219500
753986	SIRV6	+	297	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_2780_2829_3106
753988	contig_4664_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_171608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAGACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44404	42803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4664_pilon_-_42800_44400
753989	contig_12635_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_60831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATCTGATGTGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262760	262113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_262100_262800
753991	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
753995	contig_9733_pilon	+	639	2	Intergenic	novelGene_160569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGCCAGGAACTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5219	6206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_5227_5574
753996	contig_6846_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_107307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGAGAACTTCTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322408	323211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_+_322400_323200
753997	contig_10437_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_38395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGAGCCCTAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699963	700549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_7e+05_700500
753998	contig_6175_pilon	+	1321	5	Intergenic	novelGene_16356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGGCCTTGAGCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713289	1793704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1713994_1719479_1719717_1746007_1746160_1770752_1770886_1793609
754003	contig_18869_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_56339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
754006	contig_8900_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_171619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208535	206331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_206300_208500
754007	contig_14522_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_147330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTTGAGATATGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135537	136838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_135500_136800
754009	contig_10404_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_138706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAATAATAATGAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211936	1209820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1209800_1211900
754012	contig_4845_pilon	+	2251	12	Intergenic	novelGene_53609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_11	63.2703761318658	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	60	1811	151555	168460	FALSE	25	TAATTTTAAGAGTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKQVEEKPQRTQNISSSANMLRKGPAEDMSSKLNQARSMSGHPEAAQTVRREFQLDLDEIENDNGTVRCEMPELVQHKLDDIFEPVLIPEPKIRAVSPHFDDMHSNTASTINFIISQVASGDINTSIQALTQIDEVLRQEDKAEAMSGHIDQFLIATFMQLRLIYNTHMADEKLEKDEIIKLYSCIIGNMISLFQIESLAREASTGVLKDLMHGLITLMLDSRIEDLEEGHQVIRSVNLLVVKVLEKSDQTNILSALLVLLQDSLLATASSPKFSELVMKCLWRMVRLLPDTINSINLDRILLDIHIFMKVFPKEKLKQCKSEFPIRTLKTLLHTLCKLKGPKILDHLTMIDNKNESELEAHLCRMMKHSMDQTGSKSDKETEKGASRIDEKSSKAKVNDFLAEIFKKIGSKENTKEGLAELYEYKKKYSDADIEPFLKNSSQFFQNYVERGLRMIEMEREGKGHIPTSTGISPQIEVTCVPTPTSTVSSIGNTNGEEVGPSVYLERLKILRQRCGLDNTKQDDRPPLTSLLSKPAVPTVVSSTDMLHSKLSQLRESREQHQHSDLDSNQTHSSGAMTTSSSCTANIDDLKKRLERIKSSRK	151495	168900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_151599_152770_152945_153394_153516_159217_159398_160151_160340_160649_160726_161681_161871_161964_162103_162626_162711_162804_162965_167915_168068_168214
754021	contig_6164_pilon	+	2349	1	Intergenic	novelGene_121310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCACCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786465	788814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_786500_788800
754023	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754024	contig_12119_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_88631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74773	77151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_74800_77200
754026	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754027	contig_7412_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_76292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	31.3089444089065	559	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	8	742	280907	285846	FALSE	10	CTGGCTGAAGTGTGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENFTALFGAQADPPPPPAALGFGPGKPPPPPPPPPGGGPGTAPPPSAATAPPGTDKSAAGCGPFYLMRELPGNTELTGSTNLITHYNLEHAYNKFCGKKVKEKLSNFLPDLPGMIDLPGSHDNSSLRSLIEKPPILGGSFNPITGTMLAGFRLHTGPLPEQCRLMHIQPPKKKNKHKHKQSRTQDPVPPETPSDSDHKKKKKKKEEDPERKRKKKEKKKKKNRHSPDHPGMGSSQASSSSSLR	280899	286170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_281124_284648_284906_285072_285170_285484_285580_285777
754028	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754029	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
754031	contig_11227_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_163186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187391	189653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_187400_189700
754032	contig_3077_pilon	+	1587	9	Intergenic	novelGene_26788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	17.1464281994822	142	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	53	943	457923	463345	FALSE	5	GGGTTGTTGCATCTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQPSPVLLASLGVGLLTLLGLALGSYLVRRSRRPQVTLLDPNEKYLLRLLDKTTVSHNTKRFRFALPTAHHILGLPVGTHVYLSARIDGSLVIRPYTPVTSDEDRGYVDLVIKVYLKGVHPKFPEGGKMSQYLDSLKIGDMVEFRGPRNFNIQPNKKSPPELRVANKLGMIAGGTGITPMLQLIQAILKDPEDPTQCFLLFANQTEKDIILRDDLEELQARYPNRFKLWFTLDQPPEDWAFSKGFVTANMIQDHLPAPGDDVLMLLCGPPPMVQLACHPNLDKLGYSQKMRFTY	457870	463989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_457938_458247_458398_458533_458607_459129_459237_459484_459588_460310_460395_461300_461387_462233_462334_463172
754034	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754035	SIRV2	-	281	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4139	376	2960	-376	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTAAAAGTCAGGTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772	1411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
754037	SIRV2	-	649	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4142	5	2963	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	294	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATTCGCTCTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
754044	contig_18869_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_56261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73564	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
754047	SIRV4	-	256	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1267	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3891	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
754051	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754052	SIRV6	+	441	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	104	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTATAGTAGATTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3160_10727_10819_11031
754058	contig_6795_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_27691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCGTGGGGTTGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76796	75289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_75300_76800
754062	contig_15744_pilon	+	1093	5	Intergenic	novelGene_83594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	53	355	149562	153292	FALSE	50	TATAAAGTACTAATAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILKA	149509	154030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152637_153282
754065	contig_12790_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_35195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAACCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278517	278967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_278500_279000
754066	contig_14666_pilon	-	589	3	Intergenic	novelGene_39665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1250	7	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCCTGCTGTTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492417	488764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490174_490532_492333
754070	contig_10016_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_117854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311400	313224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_311400_313200
754071	contig_16766_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_153366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACAGAGTTTCTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150519	149903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_149900_150500
754076	contig_5590_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_163053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	373	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	3	584	450962	451543	NA	10	GTGTAGTTGGTCTGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVAATATAVSLAQLGGAGRVGLGRQPPGGCVLSLGLLNPVAVPLDWARLPPPAPPGPSFLLPLAPGPQLLNPGTPVSPQERPPPYLAALGHSEEYAAAGPHSSPRKAHFLRVPSEHPYLTPSPESPEHWASPSPPSLSDWSDSTPSPATASGATAAGTLPAQTLSLTVPGPLTQTQTQVGSHPEVPPKRQVLA	450959	452532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_451000_452500
754077	contig_10734_pilon	-	2102	5	Intergenic	novelGene_50979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_4	15.1904575309633	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACATTCATATTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271883	265606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_266503_266582_266620_266733_266870_267699_267769_270919
754080	contig_5797_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_56966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACATTCATTTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750448	748828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_748800_750400
754082	contig_6589_pilon	+	804	5	Intergenic	novelGene_26174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.606080068147	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	84	803	1901836	1910742	FALSE	20	TGGAGCAGTTCTACTCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKGNLRTLGSAKGLRLATNLKVGGLNPPSSTMEKRVYSQENP	1901015	1910743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901085_1901821_1901909_1903195_1903448_1903648_1903925_1910623
754083	contig_3241_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_146392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1446	1799	769188	768835	NA	5	CCCTCCTTTTCTGAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPVLSSDARFRQHREPKLGSRNGAKDSAHNDYIKTGESLRQGKKDANYKDLLQSHLLKVNRKSRKPLMCAKISFLGARRSNRSISNLQFNSISKFTGKQKTRMGFERGQHTDSSF	770633	768477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_768500_770600
754086	contig_15543_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_164366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTTTTATTTAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228239	230056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_228200_230100
754088	contig_348_pilon	+	1759	9	Intergenic	novelGene_67597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3614369177253	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	534	1340	320222	345268	FALSE	40	CAGTATAAAAACTGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314468	345687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_318990_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
754090	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754091	contig_6418_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_81147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTCTGATACCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237568	236974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_237000_237600
754092	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754093	contig_8452_pilon	-	843	5	Intergenic	novelGene_48100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_4	889.024887165708	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	53	538	991128	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991180	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
754094	contig_6929_pilon	+	972	10	Intergenic	novelGene_139361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	373.267256057164	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	320	775	77977	90425	TRUE	0	GTTTGTTTTGGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIELFADVVPKTSENFRQFCTGEFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77532	96486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77840_77964_78030_78374_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356_90447_96310
754095	contig_10050_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_119641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTCAGATATTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302123	303860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_302100_303900
754097	SIRV4	+	186	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1585	632	1130	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
754101	SIRV2	-	452	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	47	3233	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
754103	contig_7457_pilon	+	2016	12	Intergenic	novelGene_31336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	284.347215289644	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	100	1314	281205	290536	FALSE	25	GATTTGCTGCAGTCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRSRRLLFHQNPV	280847	291238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289730_290503
754104	contig_7467_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_69487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119669	121977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_119700_122000
754108	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	1	1161	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754110	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
754111	contig_10733_pilon	-	1752	10	Intergenic	novelGene_109957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	45.4299080255494	163	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	291	1697	72159	63126	FALSE	0	CTGGGCTGCTTCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGADVRDILELGGPEGDAASGTISKKDIINPDKKKSKKSSETLTFKRPEGMHREVYALLYSDKKDAPPLLPSDTGQGYRTVKAKLGSKKVRPWKWMPFTNPARKDGAMFFHWRRAAEEGKDYPFARFNKTVQVPVYSEQEYQLYLHDDAWTKAETDHLFDLSRRFDLRFIVIHDRYDHQQFKKRSVEDLKERYYHICAKLANVRAVPGTDLKIPVFDAGHERRRKEQLERLYNRTPEQVAEEEYLLQELRKIEARKKEREKRSQDLQKLITAADTTAEQRRTERKAPKKKLPQKKEAEKPAVPETAGIKFPDFKSAGVTLRSQRMKLPSSVGQKKIKALEQMLLELGVELSPTPTEELVHMFNELRSDLVLLYELKQACANCEYELQMLRHRHEALARAGVLGGPAMPASGPAPASAEPVVPEPGPGPDPTKDTIIDVVGAPLTPNSRKRRESASSSSSVKKAKKP	72449	63070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_63186_63401_63698_63836_63910_64235_64308_64470_64657_64833_65002_65134_65294_70918_71115_71378_71471_72054
754114	SIRV4	-	186	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	428	3	-428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGCCATGTCACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
754116	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
754120	contig_14208_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_129093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGTAACAGATTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194594	193475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_193500_194600
754122	contig_9481_pilon	-	750	7	Intergenic	novelGene_149692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	81.6285625392376	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	19	729	600300	578661	FALSE	20	CTCACACTCAGGGTAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGGGERMNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKSQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNYTFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKSGGKWIIRLRKGLASRCWENLILAMLGEQFMVGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKAWEEFHGLVNSSGR	600318	578639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_578707_585236_585374_585465_585619_587035_587141_591476_591612_592669_592785_600280
754129	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
754133	scaffold_2602_pilon	+	2372	1	Intergenic	novelGene_127690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29353	31725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_29400_31700
754134	contig_7915_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_42978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131781	129441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_129400_131800
754135	contig_6842_pilon	+	1334	5	Intergenic	novelGene_130797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	50.8969547222621	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	165	782	1654859	1676059	FALSE	20	TGTGGATCTTCTGCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVAAMVWRRVLRKRWVLALVFGLSLVYFLTSTFKQEERAVRDRNLLQVQDHDQPIPWKVQFNLGNSSRPSNQCRNSIQGKHLITDELGYVCERKDLLVNGCCNVNVPNTKQYCCDGCLSNGCCSAYEYCVSCCLQPNKQLLLERFLNRAAVAFQNLFMAVEDHFELCLAKCRTSSQSVQHENTYRDPIAKYCYGESPPELFPA	1654694	1676611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1654970_1670080_1670238_1673461_1673614_1673979_1674094_1675975
754136	contig_7876_pilon	+	1878	4	Intergenic	novelGene_144852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAAGCTGAGTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512486	524533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_514080_514557_514660_522701_522785_524433
754137	contig_16716_pilon	+	2061	11	Intergenic	novelGene_169282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	22.4232022690783	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	511	1230	166845	194835	TRUE	20	TTTAAACCTATGGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELQENRECQLEKQTGEETLEQEDFITKREDFQEEEFQNDVEKAIVGHNQKDLTFRVSCRCSGAVGKTFTAQEVGRIIGIALMKQFGWKADLRNPNLEIFIHLNDIYSVVGIPVFRVPLANRAYIQTAGLRSTIAWAMASLAEIQAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIGFLIGPFVYKTQVSTANQIAIAFRKCRYYYF	156574	204872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_156755_164327_164464_166650_167064_168148_168227_170652_170706_177235_177324_183761_183834_184294_184410_186426_186479_194792_194902_204107
754139	SIRV6	+	349	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
754140	contig_13894_pilon	+	2388	1	Intergenic	novelGene_62184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1942	2304	709895	710257	NA	40	CCCTTCCTAAGATAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSSCELLASGDRWQSKVLSQRDPGSSSILAPSFFLGSTYISPKINKTNAQITNSNPWSSGETYTQLYLNVMRAQPGKAVWQSPLRSVLQAARRLCPLTGDAACPGMSVYLREAHPRT	707953	710341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_708000_710300
754141	contig_13206_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_161906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCCTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198387	200509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_198400_200500
754146	contig_14807_pilon	+	622	7	Intergenic	novelGene_124710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	39	560	37341	38886	TRUE	20	GAAGCTCCCACGCCTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLPSTGQHLVDADDMEGMEPHSDVKAVFATTFHHVLVSANTGGLQASEESCSYSSDTMWPQSGNSSTFAFFRPRSKMRILASGTPRQKRDLGYGLFLQYR	37302	39917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37651_38305_38437_38632_38744_38830_38887_39750_39796_39900
754150	SIRV4	-	371	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1150	0	1150	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4008	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754152	contig_15449_pilon	-	1540	7	Intergenic	novelGene_33670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	133.269672302274	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	353	1243	195171	191270	FALSE	30	ACTTAAGAGATGTGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196243	190972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195425_195567_196069
754154	SIRV4	-	245	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	369	3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
754156	contig_7695_pilon	+	1123	8	Intergenic	novelGene_41618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	48.5848720891428	392	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	162	1043	669566	673393	FALSE	5	TTTCTCTGACCCTCGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHLGYGAHGSKHRARTAPDPPPLFDDTSGGYSGEPGGYPAPGADVAFNVNHLLGDPMANVAMAYGSSIASHGKDMVHKELHRFVSVNKLKYFFAVDTAYVAKKLGLLVFPYTHQNWEVQYSRDVPLPPRQDLNAPDLYIPTMAFITYVLLAGMALGIQKRFSPEVLGLCASTALVWVVMEVLALLLGLYLATVRSELSTFHLLAYSGYKYVGMILSVLTGLLFGSDGYYVALAWTSTALMYFIVRSLRTAALSPDSIAGPAPRQRLQLYLTLGAAAFQPLIIYWLTFHLVR	669404	673473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_669597_670224_670437_670630_670736_670869_670949_672358_672417_672523_672680_673069_673164_673246
754158	contig_7234_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_145932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTGTCTGATGCAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412315	411409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_411400_412300
754167	contig_7963_pilon	-	987	6	Intergenic	novelGene_58318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1352.39926057359	19	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48839
754172	SIRV4	-	262	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1261	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
754173	contig_4469_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_21867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAATAAAGTATGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8425	9345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_8400_9300
754174	contig_12951_pilon	+	2946	1	Intergenic	novelGene_68135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	2150	2530	108677	109057	NA	75	TTTAAAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKIGTGTCPFLCTSQPPSSGGGHLGLLCKQFVVQMARRGALPCYRHICLPSCSVFPSTPLSRSLKALFSWLTACLIVPINRMEKKRKLVPVQYFPPYLPFTEGENKKLSIVMKLSRWALSSSMGS	106527	109473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_106500_109500
754183	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754186	contig_9482_pilon	+	2549	2	Intergenic	novelGene_44335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACAGCTGCAAAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273146	1275832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1273260_1273396
754194	contig_253_pilon	-	1916	14	Intergenic	novelGene_129638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	123.373824580889	505	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	107	1840	260304	249651	FALSE	15	TCAGGAACTGCGTTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGLRRRERSSASGRAHSEGQSGAEQCCEQPTPGTMGTMFRSEEVVLAQLFLPTAAAYTCVSQLGELGLVEFRDIRKMKAVYLALNQCSVSATHKCLIAEAWCPTRDLPTIQQALQESSSEVGVSAVVHCIPCRDMPPTLIHTNRFTASFQGIVDAYGVGRYMEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAEDQPAVKAAQNEIWRTFFGGRYLLLLMGLFSVYTGFIYNECFSRAATIFRSGWSVAAMANHSGWSDAFLAQHPILTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSIILGVIHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLEFLPQLTFLLGLFGYLVFMVVYKWLRVSAAGAAEAPSILIHFINMFLFSRSPTNRPLYSGQEVVQSTLVVLALAMVPILLLGTPLYLRWQHRRHSLRRPSGPQLDEDKAGFMDSRDSGASVNSWGSDEEKGGPPGDEEQAKFAFSEVFMHQAIHTIEFCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMRTGLGMGSRVGVTAAVLVPLFAAFAMLTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLTPFTFAVEDE	263791	249574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_249730_249813_249992_250164_250283_250358_250470_250724_250854_251200_251415_251497_251617_252198_252290_252525_252684_252757_252898_255913_256059_256661_256797_260187_260309_263689
754196	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_96801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754201	contig_7234_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_145961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATTTAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542262	539927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_539900_542300
754206	contig_6412_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_149969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTAGAGGATTACTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482508	480156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_480200_482500
754207	contig_6412_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_149968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGGCTATGTTACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480156	479699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_479700_480200
754209	contig_3602_pilon	-	1405	9	Intergenic	novelGene_60654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	360.149947070661	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	179	751	1113579	1106687	FALSE	10	GCATGAGTCTCTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKVAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAAQLEQYQKAVDIYEQVGTNAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139456	1106032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111942_1112144_1112227_1113549_1113597_1139295
754210	contig_11115_pilon	+	1521	6	Intergenic	novelGene_102839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	534.191576122275	5	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	606	1433	171704	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQGEQRWGCGSGRASPGGGGACLHSALLRTDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165579	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166478_171073_171336_171695_171981_172339_172506_172856
754212	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754221	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_89698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754222	contig_5222_pilon	-	2003	15	Intergenic	novelGene_59000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	31.4815300564296	210	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	120	1079	216927	203505	TRUE	20	TCTAAATCTGATTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKAFRVKSNTAIKGSDRRKLRADVTAAFPSIGTDQASELVPGKEELNVVKLYAHKGDAVTVYVSGGNPILFELEKNLYPTVYTLWSYPDLLPTFTTWPPVLEKLAGGADLMLPGLVVPPAGLPPVQKGDLCAIALVGNRAPVAVGVAAMSTAEMLTSGLRGRGFSVLHTYQDHLWKSGDRSSPPSIAPLAVSPPDLSEEKGCVLVDPGLHEDMRHLHLKGVDEENGEVLQLRGEKALSEASEDTSVGVLNQDSAGSKALHEQMDELLQRCFLHALKSRVRKADLPLLTSTFLGSHMFSCCPEGQQLDIKKSSYKKAL	217046	193154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_193351_195007_195183_199851_199973_201671_201768_202692_202783_203139_203290_203408_203513_203905_203953_205664_205783_206278_206536_208303_208412_211807_211899_212402_212487_215489_215681_216871
754228	contig_12566_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_86031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319317	317267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_317300_319300
754229	contig_6710_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_96491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754235	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1559	648	1104	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2559	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
754236	contig_10541_pilon	-	1600	8	Intergenic	novelGene_144650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	177	junction_7	174.03436207736	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	354	1022	312553	269572	FALSE	70	CAGAAAAAAAAAAATAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKAL	394532	268993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_374167_374310_394487
754239	SIRV6	+	546	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	19	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754241	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	3	403	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754243	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
754244	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	-9	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754245	contig_5684_pilon	+	2009	3	Intergenic	novelGene_81053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	4	423	403659	441865	TRUE	45	AGGGCAAGGGAAGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403655	443532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_443389_443469
754246	contig_3575_pilon	+	2290	3	Intergenic	novelGene_141105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1822	2157	397922	400168	FALSE	55	AAAAAAAAAACTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGVTNFRSSEAGEKCSSHSAWIFLRKVSVNNKNFLCSSSCSCLMYFCSSLTIIPATLSAHQGPRTTNTARQSDSICFEIKVESLSFECTDMLQSLIKLSASSNSISSLS	388633	400301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_390212_397678_398152_400062
754250	contig_8580_pilon	+	1248	9	Intergenic	novelGene_156083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_8	46.7972688839851	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	87	1157	253010	273102	FALSE	5	CCGATTTTTTGTGTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRENAPSLPVWSRARGPFERGTRQPAAMSLWVDKYRPCSLGRLDYHKEQAAQLRNLVQCGDFPHLLVYGPSGAGKKTRIMCILRELYGVGVEKLRIEHQTITTPSKKKIEISTIASNYHLEVNPSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETSSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCRLILCCNSTSKVIAPIRSRCLAVRVPAPSIEDICHVLSAVCRKEGLTLPAELARRLAEKSRRNLRKALLMCEACRVQQYPFTADQDIPETDWEVYLREAANAIVSQQSPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	252923	273193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262176_262275_266363_266546_267528_267666_267739_267839_271126_271197_272910
754251	contig_7521_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_160558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCTCAAATTCACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341451	342859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_341500_342900
754252	contig_7887_pilon	-	1376	11	Intergenic	novelGene_124879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	20.4195984289603	555	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	59	1318	239082	228721	FALSE	10	GACTGCGGTTATGTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSRWLRYVGAFLLPAPCWAPRVRWLGLLRQPSLVHGCPVLGAWHSARRWCQAWTEEPRALCSSLRMNGDQKSDAYAQEKRDFIQHFSQILNVLTEETGQPETGDAIARLKEVLEYNAIGGKYNRGLTVLAAFQELVEPKKQDADSLQRVLTVGWCVELLQAFFLVLDDIMDSSLTRRGQLCWYKKPGIGLDAINDALLMEACIYRLLKLYCREKPYYLNLIELFLQTTYQTETGQTLDLITAPQGDVDLDRFTEKRYKSIVKYKTAFYSFYLPVAAAMYMAGIDGEEEHANAKKILLEMGEFFQIQDDYLDLFGDPSVTGKVGTDIQDNKCSWLVVQCLQRASPEQRQILQENYGQKEAEKVARVKALYEELELPAVFRQYEEDSYSCLMGLIEQYAAPLPPAIFLGLACKIYKRKK	239897	228662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_228922_229418_229554_229655_229734_230434_230508_230600_230690_231172_231296_231450_231532_236391_236533_238666_238827_238903_239120_239876
754253	contig_762_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_135933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATCTATCCTTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116001	115404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_115400_116000
754258	contig_10494_pilon	-	2123	9	Intergenic	novelGene_102119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	31.882352093282	121	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	26	1366	182001	144239	FALSE	5	CTAGTCTGCTCCTTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKGKKEKKGRGAEKTAAKMEKKVSKRSRKEEAVVVPQGGGQLWVFGGEFASPDGEQFYHYKDLWVLHLATKSWEQVRSAGGPSGRSGHRMVAWKRQLILFGGFHESTRDYIYYNDVYTFNLDTFTWTKLSPSGMGPTPRSGCQISVTAQGSIIIYGGYSKQRVKKDVDKGTLHSDMFLLKSEDGREGKWAWTRMHPSGAKPTPRSGFSVAMAPNHQTLLFGGVCDEEEEETLEGDFLNDLYFYDTARNRWFAGQLKEPKTEKRKRRRGRKGELRGSDEQAGEEPSPQEPLEVVRKVTTEDGTVITIKQVLPAPGVAGRPPSKDEDDDGAEEAGASLVAPCPRSSAMLAVKHGLLYVYGGMFEAGDRQFTLSDLYCLDLQKMDGWKALVEMDPDTQEWLEETDTEEEGDEVEDGDDDKEEEDTGEGSSEEGSVLMGPRAGEAILA	182026	143481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_144280_147661_147779_148662_149072_149922_150132_150988_151065_153533_153694_156981_157075_167871_168009_181902
754260	contig_3386_pilon	-	1099	3	Intergenic	novelGene_34525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGTTTAACTTCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412207	404159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_409398_409607_412096
754261	contig_5871_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_160175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACCCCACACAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344800	343760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_343800_344800
754263	contig_5023_pilon	+	1635	8	Intergenic	novelGene_7137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	275.85547828158	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAAGGTACTGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323648	388279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359536_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224
754264	contig_5023_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_7163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAATTAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388279	388995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_388300_389000
754265	contig_18869_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_56171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73603	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
754268	contig_11117_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_148574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTAGGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26757	28882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_26800_28900
754275	contig_10196_pilon	-	982	6	Intergenic	novelGene_132344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	113.749901098858	710	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTGAAAGTCAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476050	2473801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474169_2474605_2474681_2475090_2475197_2475338_2475430_2475554_2475701_2475853
754282	contig_6630_pilon	-	1433	8	Intergenic	novelGene_30707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_7	372.396650503361	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	75	431	380081	378033	TRUE	75	CTTAAAAAAACAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRKFADGEVVRGRWPGSSLYYEVEILSHDSNSQLYTVKYKDGTELELKENDIKPLTSFKQRKSGSSSSSPSRRRGGVGPGHVPGPQAGHQRVPAGLRLRPTRPALRRQRGNSWKLN	384183	367384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379916_380096_384123
754290	SIRV6	+	513	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754292	contig_7866_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_171192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204323	204719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_204300_204700
754294	contig_20614_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_107554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCCAAGACTCTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156440	156135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_156100_156400
754299	contig_14814_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_137689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	55961	56263	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRPGLGVAGIPRPGLGVAGIPRPGLGVAGIPRPGLGVAGTSPSFCLIYLGPLRTPALPHRAAEHTQDGARALTPRIPGGLRDRKEQGPENRAVAYGQSR	55960	57933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_56000_57900
754306	SIRV4	-	321	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	0	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754311	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754314	contig_11933_pilon	+	751	4	Intergenic	novelGene_107245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_3	60.6098635170511	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCGATGGCAATGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82847	86482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_83058_85042_85091_85207_85325_86106
754315	contig_8820_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_79264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78131	76105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_76100_78100
754319	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754321	contig_4156_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_88094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257080	259540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_257100_259500
754322	contig_5302_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_81371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAACTGTTGAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37598	35689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_35700_37600
754324	contig_7963_pilon	+	934	4	Intergenic	novelGene_58501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	165.029290329525	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	65	643	145910	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLGIRVCWVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGAHVIPLGGRLLNHASKLTCSPFSPVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145845	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_149344_149546_149948
754330	contig_16846_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_82999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATACTCTGATGACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588922	589629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_588900_589600
754335	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754337	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	581	35	402	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754341	contig_5261_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_102473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAAACCCTATGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636146	634597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_634600_636100
754342	contig_6724_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_167968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286693	284802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_284800_286700
754343	contig_13004_pilon	+	2871	7	Intergenic	novelGene_112680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_6	153.385860568118	522	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	23	640	681436	690483	FALSE	35	TAAATGCCTATGTCTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARAAIGAVCHRLWQGSGNFSVNNSKSGTARNGGFLLSTNMKWIQFSNLYVDIPKDLTKPTITISDEPDTLYKRLSVLVKGHDKAVLDSYEYFAVLAAKELGISIKVHEPPRKIERFTLLKSVHIFKKHRVQYEMRTLYRCLELEHLTGSTADVYLEYIQRNLPEGVAMEVTKTKLERLPEHIKEPIWETVPAEKEDSKSQNLS	681413	692714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_681484_684340_684406_684499_684573_686880_687018_687982_688092_689798_689889_690387
754344	contig_17440_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_7622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCTGCATCCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3096	3982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
754345	contig_4924_pilon	+	3037	1	Intergenic	novelGene_84764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGTGGGGAACAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221186	224223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_221200_224200
754346	contig_6227_pilon	-	764	3	Intergenic	novelGene_49656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	70.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	16	453	450602	443266	FALSE	20	GTCGACTCGATGGCAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKSMHALPGFLWLIRSLYEMQEEQLAQEAVRGLEVEHLKLTFCGVGPAECAALAFALQHLRRPVALQLDHNSVGDIGVEQLLPCLSVCKALYLRDNNISDRGICKLIEHGLHCEQLQKLALFNNKLTDGCARSVAELLACKQNFLALR	450617	442954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_443354_443545_443630_450336
754347	contig_3018_pilon	-	1937	14	Intergenic	novelGene_78873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	461.809843291529	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	509	1651	600079	568037	TRUE	70	CAGAAGGAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKSFMG	625093	562941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568050_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
754349	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-64	875	50	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8251	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
754355	SIRV1	-	218	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3590	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754359	contig_5050_pilon	-	1696	11	Intergenic	novelGene_110268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	221.190325285714	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	25	1371	716384	507209	FALSE	15	CTTGGATGTTTGCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716408	506883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636131_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
754361	SIRV6	+	423	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	433	0	260	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
754362	contig_401_pilon	+	1153	11	Intergenic	novelGene_42830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1439.55378155872	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	56	622	1711949	1713609	TRUE	20	AAATTGTGTTTAGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMAT	1711893	1718306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713510_1713604_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715447_1717919_1717970_1718177
754367	contig_16492_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_100281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTACCTTGTTTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87933	86527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_86500_87900
754373	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_89081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CTGTGGTTTTGCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
754377	SIRV6	+	223	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	511	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11208
754378	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754379	contig_1146_pilon	+	2158	5	Intergenic	novelGene_84848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	239.15619895792	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	49	459	937672	944265	FALSE	20	TACTTTCTTTATAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDNRSTNLLAAETASLEEQLQGWGEVMLMADKVLRWERAWFPPAIMGVVSFVFLTIYYLDPSVLSGVSCFVMFLCLADYLVPILAPRIFGSNKWTTEQQQRFHEICSNLVKTRRRAMGWWKRLFTLKEEKPKM	937623	945964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_937708_939828_939963_940858_940979_943131_943250_944262
754380	contig_14722_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_110228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACACAACAGAATGAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120216	121808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_120200_121800
754382	SIRV1	-	252	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3852	0	3578	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
754384	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
754386	contig_14333_pilon	-	1553	4	Intergenic	novelGene_49140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	177.60067567439	148	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	80	529	446908	433856	FALSE	15	GTGAGCCAGTTTGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYKREK	446987	432831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_433875_443131_443248_445731_445820_446681
754394	SIRV6	+	171	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	561	51	561	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10798	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
754395	SIRV6	+	564	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	6	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754396	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
754399	contig_3243_pilon	+	1247	4	Intergenic	novelGene_147532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	304.895974974344	370	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAATGGAGTTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23881	34141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_24076_28044_28142_28539_28696_33341
754406	contig_19769_pilon	+	782	5	Intergenic	novelGene_102311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	8	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	293	748	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87274	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
754407	contig_5210_pilon	+	2416	8	Intergenic	novelGene_65469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	146.9717451674	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	269	856	807530	812511	FALSE	15	GAGTGTATGTCTGGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRLRFSGRRAAAHHARQTPALPGTRGRLLWEILPVWLQHRLLGAGSPVPGHWPLGLGGEGKGVLSNISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQFSLCLPLRIKRDDGYKLLK	803770	814071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_803902_807297_807354_807448_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_812451
754408	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754411	contig_4350_pilon	+	1730	6	Intergenic	novelGene_136364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	55.4955854100126	21	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	241	915	31883	71139	FALSE	55	AGTATCTAAAAACTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIEFVELKHLQPEILVHAVLRVVDITILTEALYSYRGQKQKKVVLTVEQTQGQHYVLVLWGAGAAWYPQLQRKKDYIWKFKYLFVQRNCILENLELHTTPWSSCECLFDDDIRAIKFKAKFQTSAPSLVKMSDLAAHLEDKCSGVVLIKAQILELVFPITAVQKKQITLNVHSSLKSIFSSLPNIIYTGCAKCGLELETDENKIYKQCFSCLPFAVKKMYYR	20801	71954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_20839_24544_24647_31781_31977_32123_32259_51616_51824_70900
754412	contig_8920_pilon	-	1477	5	Intergenic	novelGene_146065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	15.8192920195564	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	303	857	93918	90809	FALSE	15	TTAACCTGTCTACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEMLVQEAAGSPRVQFQSLDTQSEGLSPEPQFVQETDMEQGPTGAPPVPQVPALPHSGSPGDQAAALLTARYQEFVTFEDVAVYLTREEWGCLDPVQRDLYREVMLENYGNVVSLGILLRLPTTRIHNVNSCPALSHTQASAFSGESLAVLSAGISKRWLKYRLPINIAHPCSETPFPRLLRY	94911	90188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_91015_92000_92128_92532_92619_93782_93946_94636
754413	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_97510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754415	contig_5797_pilon	-	2533	1	Intergenic	novelGene_56934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGACACTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272207	269674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_269700_272200
754418	contig_14441_pilon	-	1469	3	Intergenic	novelGene_100794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAAATTCATGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137444	134648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_135576_136407_136866_137360
754421	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754426	contig_10196_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_132117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	200.905173872872	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	20	304	922274	924513	TRUE	20	CAGGCCCAGTGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922254	926561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925946
754428	contig_15732_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_88894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGTCTCTGTCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227689	225735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_225700_227700
754432	contig_8248_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_125016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTATTCCACTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89056	87209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_87200_89100
754435	contig_6552_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_163583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGACAGACAGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52075	51422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_51400_52100
754441	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_3189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAAGGCTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
754445	SIRV4	-	268	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1253	0	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
754451	contig_13905_pilon	+	1491	3	Intergenic	novelGene_130426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	11	996	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	47	367	218514	226369	TRUE	25	TGATTCAATGACTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218467	229556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438
754452	contig_6589_pilon	+	1009	5	Intergenic	novelGene_25828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.2990200673015	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGGTTTGCGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820046	825384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_820421_824041_824183_824426_824499_824588_824744_825117
754455	SIRV6	+	354	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	425	94	259	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
754458	contig_5816_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_158240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTACAACAATGGGCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150480	152151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_150500_152200
754459	contig_15063_pilon	-	684	2	Intergenic	novelGene_14456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTATGTGGGTATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36800	36007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36156_36264
754460	scaffold_16539_pilon	+	1345	2	Intergenic	novelGene_68335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	359	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	108	701	438928	439521	FALSE	15	GTGGTGGTGCTGCCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRGGERRPQPSAGGSKRCRRSGRLSLLSQAAEGIMVGGLKRKHSDLEEEEEEKWGWGPAGLRSYQQALLRISLDKVQHSLGPHAHCLRRHVLIHNTLQQLQAALRLAPAPALPPEPLFLGEEDFSLSATIGSILRELETSMDEAEHPPNPVTPPGPQDEALPQPDPVFLESLSSQYLGDSGLDDFFLDIDTSAIEKEPVLAPPEPSHSLFCAPGSWEWNELDHIMEIILGS	436963	440165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_437065_438921
754464	contig_1428_pilon	+	1129	2	Intergenic	novelGene_158404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	101	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	135	1070	127726	133144	FALSE	40	CCCACATTCTCATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSVKIRRMDPFSTKERIEIIAPSPVRSRSFSVGISCGQTSSSLSPFSPLEFSGADHRDVSGSVDPVCNLQDSCLTDCEGEDGTMDGNDEGHSFELCPSEASSVRSRERTSSSIVFEDSGCDNASSKEDLKTNRLHIGNHYANKLTGCKHASSKSSSEPTLSVSPPRPTTLSLDLTKTTAEKLQPSSPKVYLYIQMQLCRKENLKDWLNGRCAIEERERTVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKIGDFGLVTAMDQDEEEQTVLTPMPAYARHTGQVGTKLYMSPEQVSLFSF	127591	133203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_128473_132955
754465	contig_1428_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_158406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATGAAGAGACTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133153	134630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_133200_134600
754467	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754468	contig_9995_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_47767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGAGCCTAGCGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706583	705162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_705200_706600
754471	contig_17603_pilon	-	991	2	Intergenic	novelGene_152789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2006	junction_1	0	5545	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	356	799	61820	60596	FALSE	10	GTGCGTGTGTGTGTAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHTSQHFLTSAGTGLSPAYEMLKEEHEVDVLAAPRGPAAPVRSTVINIRTETSVPDHIVWSLFNTLCMNWFCLGFVAFAYSVKSRDRKMVGDVIGAQSYASTAKCLNICALLLSLLLTVGAIILLATGALISMEAISRMVNHLDGN	62175	60403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_60788_61568
754474	SIRV4	+	224	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1544	635	1089	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2544	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
754476	contig_11551_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_168459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAAGAACGGAGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337278	336987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_337000_337300
754477	contig_11551_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_168460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340963	341526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_341000_341500
754478	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
754481	SIRV6	+	453	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	214	-2	97	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATTTAGGTATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
754486	contig_1288_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_147913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTTGTCCAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87998	90208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_88000_90200
754488	SIRV6	+	529	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754489	SIRV6	+	389	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	490	-1	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
754494	contig_7057_pilon	+	2388	5	Intergenic	novelGene_123409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	12.2167917228706	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	185	1783	1335339	1350645	FALSE	40	TAATATCAAATCTGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESVVFSDVSIAFSQEEWAHLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFVSKPDVISLLEQGKEPWKIVRKGRRRYPDLETRYETKKLFSENDIYEINLSQWKIMERMKNHGLTSLVLKNDWEYKSKFEGQEGPQEGYFSQVNITPEKVSSNQKHTSLTPRQRNHFVEKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMVFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYKCKECGEAFVCGPDLRVHQKIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTRHQKLNIADKLYECKECGEAFLCGSGLRVHHKIHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHSVKI	1328749	1351250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1328856_1335260_1335348_1336564_1336692_1337746_1337840_1349275
754495	contig_1349_pilon	+	1041	3	Intergenic	novelGene_171640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197179	229432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_+_197314_223091_223143_228576
754496	contig_6740_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_142726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736459	734042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_734000_736500
754498	contig_16228_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_147947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67349	66546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_66500_67300
754499	SIRV7	+	435	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAACGACAGAACGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	114838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
754501	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754504	SIRV1	-	259	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	2	3569	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
754505	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
754507	SIRV6	+	307	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8125	-1	614	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
754517	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
754518	contig_4364_pilon	+	2290	10	Intergenic	novelGene_49	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_5	60.3000726818144	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	83	622	583085	596966	TRUE	30	AAGTGACTAATTTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPARPDPTAASRAACGAEERRTDGGTMNLLPCNPHGNGLLYAGFNQDHGCFACGMENGFRVYNTDPLKEKEKQEFLEGGVGHVEMLFRCNYLALVGGGKKPKYPPNKVMIWDDLKKKTVIEIEFSTEVKAVKLRRDRIVVVLDSMIKVFTFTHNPHQLHVFETCYNPKATTPCWPSRAHTRATCSLWTWPALRSRPWTSPHMRAS	583002	600942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_583152_588635_588711_591549_591652_592467_592556_593930_594026_596853_597020_597709_597796_598672_598775_599207_599330_599637
754520	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754526	contig_14450_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_49017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185166	1183407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1183400_1185200
754531	contig_8122_pilon	+	1521	11	Intergenic	novelGene_40199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	100.843443019365	318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	100	1017	239303	258858	FALSE	10	TGTCCCCTGCCATACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQYSILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAASSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDGKYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGHAMPIRSLTFSPDSQLLVTASDDGYIKIYDVQHANLAGTLSGHASWVLNVAFCPDDTHFVSSSSDKSVKVWDVGTRTCVHTFFDHQDQVWGVKYNGNGSKIVSVGDDQEIHIYDCPI	236875	259362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_236936_239263_239315_240450_240479_242477_242584_243181_243355_248545_248695_248887_248982_252367_252462_254896_254990_255698_255778_258768
754534	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_89372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
754536	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	2	1295	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
754537	contig_16870_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_155540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACCAAAAATCTTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366689	366945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_366700_366900
754540	contig_12279_pilon	-	1150	6	Intergenic	novelGene_50106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	442	744	77185	75050	TRUE	25	TCAACTCTGACTTCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77626	57554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57597_68290_68471_69358_69440_71625_71709_75029_75094_76926
754541	contig_4364_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_24	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAGTGGAATCAGTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276300	279064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_276300_279100
754545	contig_10324_pilon	-	1689	5	Intergenic	novelGene_7791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAATCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131616	128228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_129524_130121_130232_130661_130760_131327_131442_131544
754548	SIRV6	+	529	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754555	contig_11449_pilon	+	1438	9	Intergenic	novelGene_170546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_3	75.7194657931499	123	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1419	18	1436	38285	241760	FALSE	20	TAAGGTGATTTGAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAAGGKYRSTVSKSKDPSGLLISVIRTLSASDDVEDRENEKGRLEEAYEKCDRDLDELIVQHYTELTTAIRTYQSITERITNSRNKIKQVKENLLSCKMLLHCKRDELRKLWIEGIEHKHVLNLLDEIENIKQVPQKLEQCMASKHYLSATDMLVSAVESLEGPLLQVEGLSDLRLELHSKKMNLHLVLIDELHRHLYIKSTGRVVQRNKEKGRWSSLVKDASPGPLIDVTNLPTPRKFLDTSQYSTPGSSGVREINLQEIKEDLELDPEENSTLFMGILIKGLAKLKKIPETVKAIKERLEQELKQIVKRSTTQVADSGYQRGENLTGENQPRLLLELLELLFDKFNAVAAAHSVVLGYLQQTVGTSLTQQEEIKLYDMADVWVKIQDVLQMLLTEYLDMKNTRTASEPSAPLSYASTGREFAAFFAKKKPQRPKNSLFKFESSSHAISMSAYLREQRRELYSRSGELQ	38267	241762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_+_38371_59403_59594_74822_75018_98471_98657_105618_105729_127560_127805_145449_145625_236347_236494_241672
754557	contig_15752_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_148778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAACCAGATGTCCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337315	338357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_337300_338400
754559	contig_6182_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_171651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCCCAGCAAGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109488	107597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_107600_109500
754563	contig_9945_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_104807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTTATACACCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46982	49385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_47000_49400
754564	contig_3942_pilon	+	3418	25	Intergenic	novelGene_128820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_21	48.9117508887179	124	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	288	1091	1175288	1177080	TRUE	10	AGCAGCCTTGCCTCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDPSKVTLVKVVPTPNNGSTELVALHRDEDEDGQEVLSFEFQKIKYSYDALEKKQFLPVAFPVGNVFAYYQSNRGFQEDAEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKERATAPFFVFQVLCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHVIQVYRSRKWRPVASDEVVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDLDPKRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHMPPQKATTGLKPVDNGCVAFVLRTGFNTSQGRLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAVAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPRAAH	1174049	1182921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1174139_1174225_1174417_1175280_1175354_1175498_1175655_1175748_1175819_1175920_1176028_1176255_1176386_1176475_1176532_1176796_1176924_1176988_1177128_1177201_1177323_1177632_1177791_1177981_1178158_1178230_1178342_1179251_1179378_1179603_1179713_1180038_1180239_1180317_1180415_1180503_1180663_1180734_1180850_1181185_1181383_1181877_1182021_1182190_1182303_1182389_1182534_1182609
754566	contig_8122_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_40202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	1	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	4	549	269174	265135	FALSE	25	GAGAGACAAGTGGCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMKDGQKILFHGEGDQEPELEPGDVIIVLDQKDHSVFQRRGHDLIMKMKIQLSEALCGFKKTIKTLDDRILVITSKSGEVIKHGDLKCVRDEGMPVYKAPLEKGTLIIQFLVLFPENHWLSPEKLLQLEALLPPRQKVRITDDMEQVELKEFNPNEQNWRQHREAYEEDDDGPRAGVQCQTA	269177	263371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_265351_265447_265549_268945
754569	contig_5338_pilon	-	1558	8	Intergenic	novelGene_114585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	16.4825201164068	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	441	590	389656	389507	TRUE	20	TGGAAAGGGCTTTCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQEQLGLVATYFLGILRAKGTLRLPERQALFGPWELIYGASQDLLPYLEGGHWGQGLEGFCPHLELYTQYAANAESSWTTLQEQLKKNKRFRRFVQLQEGRPEFGGLQLQDLLPLPLQRLQQYENLVVALAENTGPNSPDHQQLTRMFLFLHSSCRRLPLLYSFSSSHLQQCLVCPYLPLTRVQRPYCSAPFSRS	391391	387541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387965_388106_388196_388459_388690_389280_389730_390314_390434_390691_390813_391079_391175_391359
754570	contig_361_pilon	-	1925	2	Intergenic	novelGene_166618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	0	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021206	1010503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1012073_1020850
754571	contig_3193_pilon	-	1791	10	Intergenic	novelGene_126301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	72.8895663925152	285	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	112	1086	94269	47316	FALSE	10	GGCGTCACTTTGTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVDTLGLEDLQALIAQALCLQGKSTAQLVDLQLDHINPRAVQLGSLFVRGLTTLVFVNSACGFPLDMSDFMPWNIFDGKLFHQKYLQSEKGYSVEALLEQNRSLLMRFHSLKSVVVKACLRENRRIKSRQRWGSHHTGRWSRQGSGSQQPSSGYGRPGQGQPWRYPGPGRRQCEHDQWRRYSSSSGWSR	113227	46610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47329_50395_50448_61027_61121_62913_63023_64886_65094_79015_79109_80133_80307_81725_81831_94139_94321_113167
754572	contig_6551_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_155547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAGAAATATTAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208814	207759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_207800_208800
754573	contig_6551_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_155546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATTTTAAAAAATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206239	205243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_205200_206200
754575	contig_5302_pilon	+	2165	3	Intergenic	novelGene_81493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	379	1	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	41	832	342315	355700	FALSE	60	ATAAACGGCAAAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGRVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342274	357033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355568
754576	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754580	contig_8357_pilon	-	1752	11	Intergenic	novelGene_39703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_6	60.9133811243474	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	5	1549	333125	312261	FALSE	35	GCCATGTAATAAAGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVLDLDLFRVDKGGDPALIRETQEKRFKDPGLVDQLVKADSEWRRCRFRADNLNKLKNLCSKTIGEKMKKKEPVGDDESISENMLNLDDLTADTLTSLKVSQIKKVRLLIDEAILKCDAERIKLEGERFENLREIGNLLHPSVPISNDEDADNKVERIWGDCTVRKKYSHVDLVVMVDGFEGEKGAVVAGSRGYFLKGVLVFLEQALIQYALRTLGSRGYTPIYTPFFMRKEVMQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333129	312057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318125_318967_319112_320100_320260_321801_321883_325429_325501_332989
754583	contig_8554_pilon	+	1311	3	Intergenic	novelGene_160278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	150	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCGCCATTTGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40428	43773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40486_40575_41458_43401
754584	contig_12464_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_68739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1093	1392	423713	424012	NA	30	TAGATTAAGCTTTACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPVYSAGTSENFRHQLEDVKKPENFKHPQGDFRQSDRRPPEDFRHSPEDFRRPPEDFRHSPEDFRHPQEEHFRRPPEEDFRHLREEEWRRPPEEDWRRPPKEDFRRPPKEDWRQPAEGDFRRPPDEDWRRPPEEDFRRPPQGDWRRPPEGDFRRPPEEDFRRPPEEDFRRPPEEDFRHSPEEDFRRSPQEHFRRPPQEHFRRPPQDHFRRPPQEHFRRPSQDHFRRPPQEHFRRPHQEHFRRPPQEHFRRPPQEHFKRPREEDFRHPPDEDFRGPPDEDFRHPPDEDFRSPREEDFRCPSDEDFRQLPEEDLRGALEEDPRLPDNFRPAGEQFRSPPDDFRSHRPFVSFGRPEGGKFDFGKRNMGDFPEGRFMPDPKLNCGSDRVTPIKIMNLPFKANVNEILDFFHGYKVIPDSVSIQYNEKGLPIGEAIVTMINYNEAVAAIKDLNDRPVGPRKVKLILL	422620	424608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_422600_424600
754585	contig_7356_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_60410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAATACAGAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468760	466192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_466200_468800
754587	contig_10235_pilon	+	1304	5	Intergenic	novelGene_46412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.242468305682	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2	523	210457	211686	TRUE	15	TCTGATTGGCCTTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLPTTSQPWPWFCSCCCSQELKGTRGLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHIPPSLPPRAHVPAAPDPAVRRRVGAGTRSTGRGPVVAQALSPAPA	210455	212591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210741_211046_211171_211285_211662_211924_212047
754591	contig_8420_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_69354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTTTCATTTTGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63360	63681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_63400_63700
754598	contig_7694_pilon	+	1987	14	Intergenic	novelGene_159927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	33.2797004424388	287	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	87	1703	185836	217511	FALSE	15	TTCTGTGGTTGAGAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKPLRLLACGDVEGKFDVLFNRVRAIQKKSGNFDLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYRNHIVLQENAQHATRFIALANVGNPDKKKYLYAFSIIPMKLMDAAELVKQPPDVTENPYRKSGKDTTIGKQTPAPEEESACQFFFDLNEKQGRKRSSTGRHGKSSPHPKQPCKPPQPPGSCWFCLASPEVEKHLVVSVGTHCYLALAKGGLSDDHVLILPIGHYQSVLELSTEVVEEVEKYKATLRQFFKSRGKRCVLFERNYKSHHLQLQVIPVPLSCCATDDIKDAFISQAQEQQIELLEIPEHSDIKQIAQPGAAYFYVELDTGEKLFHRIKKNFPLQFGREVLASEAILNIPDKSDWRQCQISKEEEETLARRFRKDFEPFDFTLDN	185749	217795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_191858_191944_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227_199347_200220_200306_201896_202038_202967_203083_203644_203725_209965_210176_213862_213983_214447_214546_217366
754604	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	532	3	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
754610	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	-9	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754613	contig_13607_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_170185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTCTTTAGAGCACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226981	225706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_225700_227000
754616	contig_1443_pilon	-	1098	7	Intergenic	novelGene_28324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	589.287328521118	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	196	819	776427	748649	FALSE	30	TTTTATCAACTGTCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRYEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809514	748369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748964_766773_766826_767440_767556_776186_776462_808694_808741_809399
754617	contig_11552_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_171670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTTCCAACCGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134629	136422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_134600_136400
754618	contig_6434_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_61851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAGAAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795812	793685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_793700_795800
754620	contig_7202_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_18776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29868	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29900_30100
754621	contig_5643_pilon	-	2402	11	Intergenic	novelGene_39165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	24.5389486327349	102	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	180	2297	769032	760240	FALSE	50	AAATATACTGTGTAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLSYLLVAGLFCSMGGSIFIPQKLFGEVTSPLYPKPYPNNFERTTVITVPQGYRVKLVFWQFNLEPSEGCFYDYVKISADKKNLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSRGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYRGFLAYYQAVDLDECASQPNSVEEDPQPWCQHLCHNYIGGYFCSCHPGYKLQTDGHSCQAECSSELYTEPSGYISSLEYPKPYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPFEIDDHQQVHCPYDQLQVYANGKNIGEFCGTQRPPDLDSSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKLHYTTEIIKCPQPKALDEFTIIQDLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLMEGNKMLLSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRSLPNGDFKYTTTKGVNTYQASIQYYCHEPYYKMLTRAESSESARGKYTCTAQGIWKNGQEGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQTQRIIGGQRAQLGNFPWQAFTNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHDSPNNATVDVFLGHTSVEEIMKLGNHPIRRVSIHPDYRQDESNNFEGDIALLELENSVALGPNLLPICLPDNETFYDNGLMGYVSGFGITAERIASNLRFVRLPVARREACENWLRGLKRKDVFSQSMFCAGDPSLKQDSCQGDSGGVFAVRDPNSDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKLLNYVDWIKKEMEEEG	769211	760134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_761010_761464_761540_762643_762800_763175_763255_764972_765095_765205_765354_765647_765845_765939_766087_766391_766585_768053_768283_769030
754623	contig_6710_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_94683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657826	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653694_657789
754624	contig_8866_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_77892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTATTTCCAATACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063654	1064306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1063700_1064300
754625	SIRV6	+	420	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	434	2	261	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
754634	contig_14530_pilon	-	2153	2	Intergenic	novelGene_108445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTAGGGCCACGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15969	9968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_10056_13903
754635	contig_11448_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_66376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGCCAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301966	303723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_302000_303700
754642	SIRV4	-	215	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1306	0	1306	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
754648	contig_7171_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_101203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGGAAAAAAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44286	46528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_44300_46500
754653	contig_19402_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_80868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGTTAAAAATTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188232	186113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_186100_188200
754657	contig_1428_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_158393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61274	63414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_61300_63400
754659	contig_1996_pilon	+	945	10	Intergenic	novelGene_131892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	122.031973142844	211	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	138	803	251625	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249854	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
754663	contig_3942_pilon	+	1204	5	Intergenic	novelGene_128737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_1	212.081794362458	887	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	86	619	785130	790398	FALSE	20	GGGAAGGTTGCCTATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPDSASRVFCSRVLSMVNADDVNAIILAQKNMLDRFEKTNEMLLNFNNLSSARLQQMNERFLHHTRTLIEMKRDLDSIFRRIRTLKGKLARQHPEAFSHIPEASLLEDEDEDPIPPSTTTTIATSEQSTGSCDTSPDLISLPLSPGFEDLSQARPGSPTINGHGPTDDDEETPGE	778893	790983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_778958_785108_785231_786164_786318_789060_789108_790165
754664	contig_8729_pilon	-	1805	2	Intergenic	novelGene_40151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTCTTTTAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766651	764789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765392_765448
754667	contig_11338_pilon	-	1594	8	Intergenic	novelGene_6303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	91	junction_2	156.602968668919	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	72	1049	250534	212034	FALSE	25	CCCAGCAATTCCACTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQVQCKCLIPLANTL	250605	211488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_212244_213718_213904_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_250509
754668	contig_1694_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_144976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATCACTTAAGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1611278	1611730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1611300_1611700
754673	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754674	contig_7025_pilon	-	2559	2	Intergenic	novelGene_104387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2750	junction_1	0	100	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1334	1639	58855	54415	FALSE	60	TTTTAAAACAACATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGKDHVFSLL	60188	53494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_54607_58741
754676	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754677	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754680	contig_11448_pilon	+	1735	1	Intergenic	novelGene_66370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGTGCTCCATAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283038	284773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_283000_284800
754682	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8138	3	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
754690	contig_13958_pilon	+	2340	17	Intergenic	novelGene_129541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_16	194.383952768098	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	94	1803	187484	286233	FALSE	30	TAACCTTTAACATGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGLAAATAAHRCSWSSWCRLRLRCRAAARGSGYQQEWQNLVTFGSFSSMVPCGHPYICALNQVKLYSTNIQKEGQGSQTMKGGKVPTFDETAENIGAELKAPLLKQEPLQVRVKAVLKKREYGPKYTQNNFITGVRAINEFCLKSSDLEQLRKIRRRSPHEDTESFTVYLRSDVEAKSLEVWGSPEALAREKKLRKEAEIEYRERLFRNQKILREYKDFLGNTKPRSRMTSVFFKGPGKVVMFAICINGLNCFFKFLAWIYTGSASMFSEAIHSLSDTCNQGLLALGISKSVQTPDPTHPYGFSNMRYIASLISGVGIFMMGAGLSWYHGVIGLLNPQPMESLLWAYCILAGSLVSEGATLLVAINELRRSARAKGMSFYKYVMESRDPSTNVILLEDTAAVLGVTIAATCMGLTSITGNPLYDSLGSLGVGTLLGVVSAFLIYTNTEALLGRSIQPEQVQRLTELLENDPSVRAIHDVKATDLGLGKVRFKAEVDFDGRVVTRSYLEKQDFDQMLQEIQEVKTPEELEIFMLKHGENIIDTLGAEVDRLEKELKVRGINMIMSTFF	187390	286770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_187596_216716_216885_230747_230811_233315_233416_235681_235775_236201_236285_249608_249668_257283_257352_260342_260446_264511_264568_266567_266704_272991_273032_274905_274978_275439_275548_278315_278482_283884_284015_286080
754692	SIRV4	+	228	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1543	632	1088	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
754693	SIRV4	-	201	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	413	3	-413	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAACTATCGGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
754695	contig_5092_pilon	-	829	6	Intergenic	novelGene_62277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_5	563.927513072381	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	17	610	259043	232507	FALSE	35	AGCAAACTAATGATTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLRHCGASSLVYGAPSAVGGTLSGLRSGGLSHRVGAEIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGNHYSYSENRVEKDGLILTSRGPGTSFEFALAIVEALSGKEVADQVKAPLVLKD	259059	232287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_258929
754696	SIRV6	-	515	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	74	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGTATTTACAACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1736_2777_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
754697	contig_20819_pilon	-	807	8	Intergenic	novelGene_55679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1741.37670144243	222	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	385	765	66706	65441	FALSE	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWCHATSGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	70278	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_66682_66787_68115_68266_69616_69725_70232
754700	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	576	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754705	SIRV4	-	310	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1211	0	1211	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3947	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
754706	contig_4678_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_126031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395725	396400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_395700_396400
754707	contig_13894_pilon	-	1406	3	Intergenic	novelGene_62046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	3	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	271	1329	287445	286290	FALSE	10	GTACTTCTGCAGGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
754710	contig_10933_pilon	-	647	3	Intergenic	novelGene_171671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTATAAAGAACAAGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129653	23570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10933_pilon_-_23578_31382_31692_129322
754711	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_97008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754712	contig_8885_pilon	+	2820	7	Intergenic	novelGene_115588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	29.0081406198712	154	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	143	2542	348153	352400	FALSE	20	CTTCAATGCCTGACTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPLKEEDCEEGSGEPPGRVKAEPVNPAASVVAKNLALLKARSFDVTFDVGEEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTGQQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPMVPYGEFKSVYVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADRQALSLLGRMLRFEPGARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDHEALTRECIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDIEMPSPWAPGGDCAMESPPPAPRPCPGPAPDTIDLTAQPPLPASELAPPKREGAISDNTKAALKAALLKSLRNRLKDGPSAPLEAPEPRKPVTAQERQREREEKRRRRQERAKEREKRRQERERKERGAGATGAPSTDPLAGLVLSDNDRSLLERWTRMAQPPAPAPPTVQPASPTPGPVAQQTGPPPQPAGSTPGPASQPACPPSEPAPHPTGPPGPVPAPLQSTTSSLLAPQPLVPPPGLPGPSALRVLPYFPSGPLPPDPEEAPQLSTSESPDVNLVTQQLSKSQVEDPLPPVFSGTPKGSGAGYGVGFDLEEFLNQSFDMGMADAPQDGQADSASLSASLLADWLEGHGMNPADIESLQREIQMDSPMLLADLPDLQEP	347730	352678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_347868_348147_348385_348994_349161_349813_350893_350996_351632_351974_352109_352246
754713	contig_5988_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_15853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257796	255853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_255900_257800
754717	contig_14017_pilon	+	1984	3	Intergenic	novelGene_165681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	20.5	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	33	662	29686	49525	FALSE	80	GAAGGAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKGCIKVKNFNFIVPDGMNLDFTYATVSANDNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVRVVGKHDFY	29653	50847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524_34712_49339
754719	SIRV6	+	254	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	10	31	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754721	contig_16790_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_171673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTATTTTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5262	5768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_+_5300_5800
754725	contig_15456_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_139481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGTAAAAAAAAAAAATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55205	54184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_54200_55200
754727	scaffold_13609_pilon	+	1596	9	Intergenic	novelGene_124429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	189.312407147551	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1545	52	1596	798936	813172	FALSE	40	GTAAGAGTGGAAAGGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSV	798884	813172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_799045_807204_807394_807483_807597_809351_809556_809639_809879_810538_810798_810887_811029_812725_812809_812964
754728	contig_5718_pilon	+	2197	5	Intergenic	novelGene_110349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_4	102.70680357211	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	102	1094	651634	710115	FALSE	55	GAAACAGAATGGAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQRKPRILFSPFFHPGNSVHTQPEVVLHQNHEEDNCVQRTPRPSVENVHHNPPTIELLHRSRSPITTNHRPSPDPEQRPIRSPLDNMIRRLSPAERAQGPRLHQENNHQESYPLSVSPMENNHCPPSSESHQKPSSPRQESTRVIQLMPSPIMHPLILNPRHSMDFKQSRLSEDGLHREGKPINLSHREDLAYMNHIMVSVSPPEEHAMPIGRIADCRLLWDYVYQLLSDSRYENFIRWEDKESKIFRIVDPNGLARLWGNHKNRTNMTYEKMSRALRHYYKLNIIRKEPGQRLLFR	651532	711218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_651698_669623_669759_692101_692648_708547_708691_710010
754730	contig_6278_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_119808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346611	346347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_346300_346600
754732	contig_10629_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_52894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGGGCACAAACATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245853	246696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_245900_246700
754736	contig_11832_pilon	+	828	3	Intergenic	novelGene_106964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	855	junction_2	247	13285	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGTGTCCGTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461665	463588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_462080_462773_462851_463251
754739	contig_11548_pilon	+	1528	5	Intergenic	novelGene_66778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	178	768	112832	119638	FALSE	20	GAGCCTCTGCTTCAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112654	120398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
754740	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754747	contig_9332_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_60735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565701	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_563800_565700
754748	contig_7895_pilon	-	1879	9	Intergenic	novelGene_154434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	39.6403755658293	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	594	1199	435242	426514	FALSE	20	CCCATGGAATTGATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLGEGESLLDRLLLDRTEQLQARAYRTDDCQPWVLPVVRKVQQKIANDNSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALKDKRVGAVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFSAAGFKDIRSYHYWDAEKRGLDLQGFLNDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASIMKRRFLFPFFDSAYQGFASGDLERDAWAVRYFVSEGLELFCAQSFSKNFGLYNERVGNLTVVGKETDSVLRVLSQMEKIVRITWSNPPAQGARIVACTLSNPELFKEWTCNVKTMADRILTMRSELRARLEALKTPGTWNHITEQIGMFSFTGLNSKQVEYLVNEKHIYLLPSGRINMCGLTTKNLDYVATSIHEAVTKIQ	455504	425833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_426654_431625_431769_432535_432702_432786_432938_435236_435342_435590_435704_436648_436773_443593_443776_455429
754749	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	89	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
754750	contig_4531_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_47933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGAAGAAAGTAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652510	650265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_650300_652500
754751	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754754	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754755	SIRV6	+	536	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1233_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754758	SIRV6	+	447	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	220	-2	91	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGTCACATATTTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
754761	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_89200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653712	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
754762	contig_17493_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_122195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAGCAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109094	110892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_109100_110900
754766	contig_5125_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_43503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATAGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045991	1047976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1046000_1048000
754771	contig_17171_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_147356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGCTCAGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61685	62920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_61700_62900
754776	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754780	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_89450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653752	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754781	contig_6302_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_171712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACAGAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242780	240822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_240800_242800
754782	contig_1938_pilon	+	1794	5	Intergenic	novelGene_114886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	57.9973059719156	197	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	277	537	261561	301902	FALSE	40	CCATACTGGCCAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPLSDRTVDSNISNWTRSLSALALAELSKKKQPRVLFLVSVIELARNASTADIQNSVKTLPLETSYPLAALQSSDLAASRTQRKQAFWRSKMGRKDASTVKLPVDQYRKQIGKQDYKKTKPILRATKLKAEAKKTAIGIKEVGLVLAAIWALLLAFYAFFYLRLSMDVDPDLERDED	203307	303159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_+_203394_213151_213321_261539_261622_296243_296330_301788
754784	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
754788	SIRV6	+	275	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	8137	19	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
754792	contig_15104_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_163356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAGCATTAACTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611783	614031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_611800_614000
754795	contig_10892_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_116759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTTCATATATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175764	174859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_174900_175800
754797	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754799	contig_12948_pilon	-	1380	6	Intergenic	novelGene_126185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	32.3542887419891	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	20	919	209678	203502	FALSE	5	TTGGTGTGTGTGTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRGTAMPGRLLRGLWQRWRRYKYRFVPWIALNISHNPRTLRYVPEESKDKVISDEEVLGTLLKVFQALFLNDFNKQSDILTVLPEPVKSKYQDFLAVQHQREKLLENRHQQQSIFKPEEVLYKTLGFSVARATSSLISAGKGVFVTKGFVPKGAVVSMYPGTVYQKYEPVFFQSIGNPFIFRCLDGVLIDGNDKGISKVVYRSCNGRDQLGPLKMSDSTWLTSEMHNPLAVGQYVNNCSNDKAANVCYQEFDVPAVFPVELKQYLPNIAYSYDKQSPLRCVVLVTLRDIKQGEELFSNYYTIVS	209697	203040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_203590_204892_204999_205869_205986_206247_206372_207563_207932_209580
754800	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_93714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
754804	contig_7760_pilon	-	3080	1	Intergenic	novelGene_138427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTTGTTGTTGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14359	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_11300_14400
754806	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_93983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754807	contig_15939_pilon	-	1651	9	Intergenic	novelGene_160250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	137.355776634985	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	336	968	50659	30441	FALSE	15	GTCTTGGACTTTTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDQGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTL	112640	29757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_30472_35009_35150_36881_36996_40035_40147_41066_41169_42441_42519_50601_50680_73147_73261_112438
754808	contig_18919_pilon	+	1939	2	Intergenic	novelGene_156035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAATTAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146879	154437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_148297_153915
754809	contig_9258_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_104619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98870	100334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_98900_100300
754813	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754815	contig_16643_pilon	-	1193	7	Intergenic	novelGene_158125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1501.37081806372	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	33	821	255301	231365	FALSE	10	CATTTTGGGTCTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPRGRPGKAMGLGEENFELLARRGPFPEGARVRELVLDNCKSNDGKIEGLTAEFVNLEFLSLINVGLISVSNLPKLPKLKKLELSDNRIFGGLDMLAEKLPNLTHLNLSGNKLKDISTLEPLKKLECLKSLDLFNCEVTNLNDYRESVFKLLPQLTYLDGYDREDREAPDSDAEVDGVDEEEEDEEGEDEEDEEDEDGEEDFDEEDEEDEDEDVEGEEDEDEVSGEEEEFGPDGEVDDDEEDEDEDEDEEEEESGKGEKRKRETDDEGEDD	255333	230992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_231433_232651_232722_234526_234649_237584_237775_243220_243344_247251_247402_255235
754816	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
754817	contig_14526_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_111223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTAGATAAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383380	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_383400_385500
754818	contig_835_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_152169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344763	342624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_342600_344800
754819	contig_12102_pilon	-	1839	3	Intergenic	novelGene_151060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_2	233	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	670	990	95241	88479	FALSE	20	GAAATGTGTATTTGGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVVIYDLRDMPANHQTFLRQRTFSVPVKQEMKRSVNKENIQHAEERLLRYLIHLRFQSSKSGKIYLHRDVRLLFSRKSMEVDSGAAYELKSYTESPTNPQFSPRC	98862	87629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_88633_95074_95275_98226
754827	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	8	1153	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754828	SIRV2	-	581	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4292	34	3117	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
754835	contig_3721_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_123835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATCTTCAGGGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307398	305744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_305700_307400
754836	contig_7356_pilon	-	2578	2	Intergenic	novelGene_60356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1441	1800	105605	105246	FALSE	5	GTGGGATTTGCCTGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIQFHLSSFWHLKLPHLLWTVEASPLFIWTFRFLCLSCPCPCSAVFLSLGSTWKGALQISVRSPWGSDFAHSASLHHGYLMMGCHGSLPSSAATCTLGQHAFWCVPVGSLEFCSQLR	113796	104467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_106248_112998
754839	contig_17194_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_155361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTCTAAAAAACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79908	78931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_78900_79900
754847	contig_253_pilon	+	1377	7	Intergenic	novelGene_129731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	349	junction_3	109.310973323308	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	44	1036	582199	585056	FALSE	5	GCCACGGCCTCTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGPELQGRTGGAAMSDTEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK	582155	585397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_582254_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
754848	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754850	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
754851	contig_2798_pilon	+	2666	1	Intergenic	novelGene_120008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACAAAAAAACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107583	110249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_107600_110200
754852	contig_5968_pilon	-	2806	1	Intergenic	novelGene_112199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCTTTAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636154	633348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_633300_636200
754856	SIRV6	+	496	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	171	-2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
754858	contig_6445_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_77079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGGCTAGAAGGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743035	742091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_742100_743000
754865	contig_6710_pilon	+	487	2	Intergenic	novelGene_98075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACAGTGGTTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653430	657829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
754867	contig_9305_pilon	+	2795	1	Intergenic	novelGene_148193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAGATTGCAGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173943	176738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_173900_176700
754874	SIRV2	-	315	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4558	34	3383	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
754877	contig_4519_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_123729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCGAATCCACTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761283	763450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_761300_763400
754891	contig_10765_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_122968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGTATACAGAAACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402955	401911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_401900_403000
754899	contig_9552_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_167941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAATTCACACAATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166974	169361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_167000_169400
754902	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
754903	contig_10312_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_159026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCGAGAAGGTAGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220213	221405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_220200_221400
754905	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_94705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653815	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754908	contig_6710_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_89613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653779	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754910	contig_6270_pilon	+	1322	5	Intergenic	novelGene_99814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	173.038290560211	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAATTGCTGGGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36356	47671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39481_40398_40558_47302
754912	contig_4429_pilon	-	1815	5	Intergenic	novelGene_50787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTCGCCGCGGGGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173381	154497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_154613_165206_165425_166679_166776_168309_168497_172182
754913	SIRV6	+	352	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724
754918	contig_3424_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_55508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	127	630	170175	170678	NA	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	170048	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_170000_170900
754919	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
754922	contig_16010_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_165259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCACTCTTAAAACGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23026	24996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_+_23000_25000
754924	contig_15631_pilon	+	1662	2	Intergenic	novelGene_151543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATAAACTGTAGAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391938	393794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_393301_393494
754937	contig_5057_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_151520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	962	junction_3	231.800965269776	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	434	844	514257	508795	TRUE	25	TGCCTGAAGAAATTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKVS	514690	507043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508900_511016_511140_511243_511321_514151
754939	contig_14780_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_166386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101892	99974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_1e+05_101900
754940	contig_13457_pilon	+	2054	13	Intergenic	novelGene_118319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	232.02422945795	3	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	735	1778	55314	57730	FALSE	20	GACAATTCCCGATGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52094	58006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53073_53180_53293_53413_53513_53595_55047_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57493_57583
754942	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	-7	37	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754947	contig_2455_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_119192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTCCTTGGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168055	169753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_168100_169800
754948	contig_2455_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_119191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGCATATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164806	165397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_164800_165400
754954	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
754959	contig_1154_pilon	+	1092	6	Intergenic	novelGene_87171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_5	33.2301068310049	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	79	624	919915	924251	FALSE	10	GATCTGTGGCTTCTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGTDISRTLATVTEPVSLPHRCVLKMDHHCPWLNNCVGHYNHRYFFSFCFFMTLGCIYCSYGSWDLFREAYAAIETYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGRHWLTRVLLPSSHLPHGNGMSWDPPPWVAAHSASVMAV	919836	924719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_919931_920589_920724_921741_921828_922770_922895_923093_923165_924136
754960	contig_3193_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_126311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGTTCTGTAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82621	84263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_82600_84300
754962	contig_18419_pilon	-	1244	4	Intergenic	novelGene_141458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.019530504999	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	29	370	31572	29508	FALSE	15	GTGTCCTAGTTGGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCLFQKWQRMVAPPAEPARQQPSKRRKRKMSGGSTMSSGGGNTNNSNSKKKSPASTFALSSQVPDVMVVGEPTLMGGEFGDEDERLITRLENTQFDAANGIDDEDSFNNSSWVMSWGRHAVG	31600	28633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29547_30351_30490_31209_31359_31556
754969	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_96077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653818	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
754972	contig_14925_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_55278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112745	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112100_112700
754973	contig_10042_pilon	+	1669	8	Intergenic	novelGene_79215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	89.7740928948995	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	15	668	1066614	1090129	FALSE	20	ATGAGGTATATTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSADLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1066599	1091130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
754975	contig_12250_pilon	-	2127	10	Intergenic	novelGene_80539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.3313312907079	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1444	2007	247717	246434	FALSE	25	TAGAAATGTGTCTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYEVYYGLVEEEEAVPAEHQVEMAAARPLGEVTVLGSLLLQHLLHFSTPGLVLRSLGALTGPQLLALAQNPAGSHVLDAVLTSPSVTRKQCRCLLQTLKGQYVALACSRHGSRVLDAIWSGATLGARKEIAAELGERNQELIRDPFGHHVARNVALTTFLKRREAWEQQQGAVAKRRRVLNSILED	252296	246313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_246592_246927_247034_247247_247485_247654_247781_248145_248287_249705_249899_250026_250169_250413_250525_251294_251743_251951
754977	contig_3916_pilon	+	1190	11	Intergenic	novelGene_141852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	375	713	14651	32231	TRUE	35	GTAAAACTTGCTGGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQVKKVTWIPRSCGFDLKLSLEEKLALKSYLAWLICSRWELFQMEANCFLWDEYSFHLHLRQAQHNQPHPQGALWAWVGLEVSEEKRGTAEWRRALLLMKASWAYWEVSC	6121	86489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_+_6220_7008_7100_10705_10800_13236_13284_14606_14703_23331_23406_24718_24800_32099_32265_33309_33468_62073_62141_86270
754992	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
754994	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
754995	contig_11977_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_171718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTTTCAGAGCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266	1776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11977_pilon_+_1300_1800
754996	contig_11977_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_171719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAACCCATAGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3001	4628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11977_pilon_+_3000_4600
754999	contig_6795_pilon	-	1739	12	Intergenic	novelGene_27661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.441839980119	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	232	1290	129029	46012	FALSE	30	CATGCTGTGGATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVVVVTNTIPHEIQKLQSHPSDSQWRVYVLPFQKYRFRRLNSFPFLEPPRAKLELHGEDRGLQWIMLDFAYFTGAILFSPNTLSSC	134331	45562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46223_46266_46311_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
755003	contig_7963_pilon	+	1637	4	Intergenic	novelGene_58576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	168.147422090128	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1059	1415	256515	257509	FALSE	55	AGGAAAACAGTTATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254705	257731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_256578_256972_257178_257420
755005	contig_10235_pilon	-	1354	4	Intergenic	novelGene_46625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	160.513758496481	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	130	717	610325	609176	FALSE	25	AATTCCCCTCTGGACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSIWPPAGPHPFQPPHPPWNPGFQPSSQIPATPPPSVSPLQGMEAKRAQEGEEDGEQEGRYREETGCSPSPPAHSTSSTHPCLTGTDISRHQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSAPPSPPPGNRHTALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610454	608538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609738_609955_610161_610280
755006	contig_3252_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_61520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	704	1060	749226	748870	NA	10	GCCATTGTCTGTCTGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAEEEAELTRETSPEKLQQYRQVHLLPGLREQGWCAITASLLALPEHDAREKVLQTLGTLLATCQDHYRQDAQLSRTLASLQAEYQALAALELQDGEEEGYFQELLGSINSLLQGLR	749929	748707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_748700_749900
755009	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	-9	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755012	contig_17440_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_7617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAACACTGGCCCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3060	3935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3900
755015	SIRV4	-	351	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	15	1155	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
755016	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755018	contig_6137_pilon	+	1634	5	Intergenic	novelGene_59316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	48.8690853198625	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	221	583	1686568	1693045	FALSE	25	TTAATGATTGTATGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLTFREKLATEASRLWGTSFFPDVMRSNLLKFKKSPPKIPYKAIALATVLFLIGAFLIIIGSLLLAGYISKMGADRAVPVLIIGILVFLPGFYHLRIAYYASKGYRGYSYDDIPDFDD	1683983	1694096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684103_1686466_1686588_1686963_1687043_1688000_1688124_1692904
755021	contig_5643_pilon	+	1079	6	Intergenic	novelGene_39142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	69.2600895177013	508	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	615	920	655953	656645	FALSE	5	CCTAGTTGTTCTTTGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGLMLLSFFFFKVIKNPVSDHFPVGCMKIGTSFSTQVVSDVRELVPSSDPIVFVVGAFAHGKVNVEYTEKVVSISNYPLSAALTCAKLTTAFEEVWGVI	651680	656804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_651861_652800_652890_655130_655233_655340_655483_655851_656145_656531
755022	contig_14450_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_48928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATAGTCTATTTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412055	409554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_409600_412100
755027	contig_6633_pilon	+	1615	8	Intergenic	novelGene_143162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_1	226.301586744913	185	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	339	1475	23500	36061	FALSE	20	CATTCCTGGTTCAGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLSEANGTFALNLLKKLGENNSQNVVFSPMSISSALAMVFLGAEGNTATQISQALSLNKSRGGGGDVHQGFQSLLTEVNKPGTQYMLRTANRLFGEKTYDFLSSFKDSCRKFYQAEMEELDFANATEESRKHINTWVAKKTEGKITELLSSGAVNSITKLVLANAIYFKGNWDTQFNKEQTKERPFKISKNEEKPVQMMFKKSTFKITYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDGNTDLSTVEKELTYEKFMEWTRPDMLDEEEVEVFLPRFKLEENYDMEDVLRSLGMADAFDQGRANFSGMSSKRDLYLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCVRITPRFCADHPFLFFIQHTKTNEILFCGRVSSP	18890	36201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_19087_22389_22522_23489_23665_25832_25983_28985_29104_30715_30859_32189_32346_35656
755028	contig_7022_pilon	-	1187	2	Intergenic	novelGene_142137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCCATTCCCACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99088	97343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_97957_98514
755031	SIRV6	+	344	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	536	-2	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
755034	contig_10323_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_123544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGAACTGCCAACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260353	261472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_260400_261500
755035	contig_10323_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_123545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATCTGCATTATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261573	262189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_261600_262200
755046	contig_10986_pilon	-	1044	8	Intergenic	novelGene_71484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_7	137.39560044051	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	2	841	74333	67011	FALSE	40	AAACATGTAAAACTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	74334	66807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224
755047	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
755048	contig_1847_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_171732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTCTCAGTTTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113602	115695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_+_113600_115700
755053	contig_12270_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_113389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGCTGATCAGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13846	14427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
755057	contig_7730_pilon	-	1224	5	Intergenic	novelGene_156249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	611.200202470516	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	212	700	43591	2339	TRUE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSYTPSKIRHA	43802	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2086_2205_2445_4051_4177_7798_7895_43429
755061	contig_15304_pilon	-	1140	4	Intergenic	novelGene_30679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	5	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	405	1001	106308	105631	FALSE	20	CAAGACTGGCATGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107222	105491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
755062	contig_7091_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_131792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGACCTGTCCCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444219	443589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_443600_444200
755064	contig_13571_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_128126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284778	286714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_284800_286700
755065	contig_6488_pilon	-	2550	1	Intergenic	novelGene_44725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1094	1393	43554	43255	NA	15	TCTCTAGAGCTGAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCRVELPHRVFRTVTFQKQIARPFFQGTSGCVQTASLSVSSRAHNHNIKTKPNLLLSSRFQFIVTLEGRVELPHRVSKALNLYRSRLPHLSPVEHWWV	44647	42097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_42100_44600
755067	contig_6870_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_103972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACCTATTTTGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432753	1430778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1430800_1432800
755069	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_93478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755073	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_96468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755076	contig_16322_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_87570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGCTATGCCGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204173	203708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_203700_204200
755077	contig_9345_pilon	-	1520	6	Intergenic	novelGene_24437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_5	47.6889924406042	161	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	186	1463	361096	353865	FALSE	20	GTCAGGGAGGCGTGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAFRAMDVESRTKGILLEPFVHQVGGHSCVLRFNETTLCKPLVPREHQFYETLPAEMRKFTPQYKGVVSVRFEEDEDRNLCLIAYPLKGDHGTVDSVDNSDCEPKSKLLRWTNKKHHVLETEKTPKDWVRQHWKEEKVKSHKLEEEFEWLKKSEVLYYSVEKKGNVSSQLKHYNPWSMKCHQQQLQRMKENVKHRNQYKFILLENLTSRYEVPCVLDLKMGTRQHGDDASEEKAANQIRKCQQSTSAVIGVRVCGMQVYQAGSGQLMFMNKYHGRKLSVQGFKEALFQFFHNGRYLRRELLGPVLKKLAELKAVLERQESYRFYSSSLLVIYDGKEWPEVALDSDAEDLEDLSEESADESAGAYAYKPIGTSSVDVRMIDFAHTTCRLYGEDSVVHEGQDAGYIFGLQSLIDIVTEISEESGE	382153	353807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_354366_354816_354993_357479_357656_358722_358946_360894_361223_382094
755079	SIRV4	-	620	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	-1	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5159	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
755082	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755088	contig_12654_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_129316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794487	793072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_793100_794500
755089	contig_8762_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_145292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACCCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109208	109592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_109200_109600
755091	SIRV6	-	221	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCGTTCATCAATTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
755093	SIRV5	+	338	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-8	875	-8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8307	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
755094	contig_3942_pilon	+	1495	4	Intergenic	novelGene_128857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	39.5333895446481	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	304	720	1485082	1485878	FALSE	35	TCTTAGCAAACCAAACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSLVCPETVSRVSSVLNRNTRQFGKKHLFDQDEETCWNSGQGPFQWVMLEFPQCVRISRLQIQFQGGFSSRRCRLEGSQGSQALFGIVDFYPEDNNSLQISCEVMGCMVVRASENQGLPRPGSESGTRPRSPLLHL	1484778	1486653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1485120_1485242_1485334_1485516_1485623_1485696
755095	contig_1008_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_121631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAAAATGTTAGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197106	1199813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1197100_1199800
755102	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755108	contig_5569_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_86731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218922	217491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_217500_218900
755110	contig_14289_pilon	-	1256	5	Intergenic	novelGene_110567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	422.286854519532	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	83	754	66533	53966	FALSE	30	TAAATTTCTGTTCCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGCFQQKHVPGFSQETSDAAFSNREFRSCDSTMEIAAHGSCRMVPVSRLSGQGLGPQVVRWWSESPTSEDQHLQENSSGVSGWRHNVCSFYVTTCV	66615	53463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_54253_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
755135	contig_9668_pilon	-	1782	3	Intergenic	novelGene_58163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	61	336	476982	476707	TRUE	75	ACAGAACAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSACGRRQGSIVKVFLSTAVMFKSESPKEPEQLQKLFIGGLSFETTDGSLRSHYEQWGTLMDCVVMRDPNTKRSRDFGFVTYSTVEEVDAVMDPRPHKVDGTVVEPKRAVS	477042	464366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_465101_465480_465808_476321
755137	contig_6710_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_89198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755138	contig_6533_pilon	+	602	3	Intergenic	novelGene_114608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	20	TTCCCTTTCTTAGCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
755139	contig_9415_pilon	+	636	2	Intergenic	novelGene_109821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGACGCTGATGTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1812081	1812755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1812514_1812551
755142	contig_13148_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_162932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTTTGTTAAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143811	145823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_143800_145800
755143	SIRV6	+	433	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	529	0	350	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	276	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755146	contig_6365_pilon	-	1619	5	Intergenic	novelGene_134000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_4	86.1234578962085	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	170	637	12349	10994	TRUE	20	CCCACTCTTGACTATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKVAKKIKEKTKTPRKSSNQGRSCPVTSTTATQEGQVSLRKKDRLEVSQKKLPRWLLHSFSPFRHLLH	17696	9778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_11194_12081_12368_17459_17529_17614
755147	contig_2069_pilon	+	1781	2	Intergenic	novelGene_23470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7873	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTACACCTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1464956	1468065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1466625_1467952
755148	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755149	SIRV1	-	237	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	5	3588	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
755159	contig_6217_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_109630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTACAGACAACACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457197	457590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_457200_457600
755166	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755172	contig_9727_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_86268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGGTGTGTTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97863	96789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_96800_97900
755173	SIRV7	-	820	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	22	-14	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	39	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGCATTAACATGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147896	56051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147622
755174	contig_4071_pilon	-	1961	2	Intergenic	novelGene_151873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133387	100157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_102005_133273
755175	contig_12454_pilon	+	1118	2	Intergenic	novelGene_171736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	0	541	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	62	1072	110006	111522	FALSE	20	TGAAGTGGATGGTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATDSAVPALLSACPEPSSAMGNCLYPVQPSPSVSNNWTKLNLENYSWEEWDMPYEPLDYNDPSIEAAAPCHSCNLLDDSSLPFFIVASVLGTLASGTVLLALLKPLFHWELCRGRPILIQLPVGSAAFSVVVPILAPGLSSSHSTTLCCLGHWVWYSAAFAQALLIGCRACLGPKLDVFQVSRLTLGLTVGVWGMAALLALPITLASDTSQGLCTLTSSRGLGTLQYMHAAVCFAVFFLLPLGLVGAKGLKKTLDRGPGPWVDILWVWFTFWWLHGVVLGLDSLVRSGVLPLQTCLAQQILDLVLQLAEALAIFHCVAMPLLLALFCHRTSHTSFSSLPLHARQSSHVDTFGGKS	109944	111568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12454_pilon_+_110027_110532
755177	contig_15974_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_164821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAAACGAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326225	328421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_326200_328400
755179	contig_13828_pilon	-	2714	12	Intergenic	novelGene_158279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_11	25.9022319469715	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	280	1665	323602	45251	FALSE	40	TAATAAGCATATCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRYMPKHKITHLKKMLSLERNNGAAPSMALPSQQEQRGSESVLKNFTGESGLCGAVSGLGTIQQESLGSSLMQLSDLNQSNSSDDSNSYQEEKKQNPTLNPSDTLGGVDDQQRPLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMRLKELGLKFHVSVLGETFTDVPDIFSEAKKALGSSALHWGYLPSKDDYFQVLCMADVVISTAKHEFFGVAMLEAAYCGCYPLCPKDLVYPEIFPAEYLYSTPEQLSKRLQNFCKRPDIIRKHLYKGEMAPFSWAALHGKFRSLLTTEPKEDL	354308	44201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_45335_50296_50389_51088_51160_55519_55665_72609_72720_115165_115529_246998_247173_250617_250786_323423_323628_325387_325510_326949_327017_354243
755180	contig_5549_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_81612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGAAGGAGAACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311653	312514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_311700_312500
755187	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_89302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755188	contig_14415_pilon	+	1949	4	Intergenic	novelGene_77622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	76	441	33410	37984	FALSE	10	CTGCCTTTTCTCTCAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33334	39492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
755189	contig_7933_pilon	-	1486	2	Intergenic	novelGene_164704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4810	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	58	429	238534	234215	FALSE	25	TACTGGAGCGTCAGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKVLVTALAPPNDPSTKPGPGRRASNEGPAAAPHTPGRMAPVCPGAHLTPLCPLQAGWSIEQPRLSHLPRGEL	238591	233157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_234584_238531
755193	contig_10331_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_54196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCACACTACCAAACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615788	614667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_614700_615800
755194	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	0	411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755197	SIRV6	+	503	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755200	contig_5997_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_168612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAACCTATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308664	310228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_308700_310200
755201	contig_14341_pilon	+	734	6	Intergenic	novelGene_111821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2244.17040351218	8	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	70	684	548758	551737	FALSE	5	CTACCTGTGTCTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547704	551787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547749_548732_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
755204	contig_1516_pilon	+	3068	2	Intergenic	novelGene_49936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAAAAAGAAATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146255	149435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_149080_149191
755205	SIRV7	-	252	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91668	6	-91662	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAACCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
755206	SIRV7	-	442	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	78	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114838	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689
755207	contig_9058_pilon	-	1611	6	Intergenic	novelGene_149362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	726	1043	56478	47432	TRUE	30	TGAGCTCTTCTTGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRWRRLGNCWLLRSGAWNLVGLPDPFFSGYSVSSYLQLFIISPGALFSLLADTENEQCHKDDKDDASSSNADDERDIQTILCTADVGYTGFLKDFVFCHAAAE	57245	41893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_41982_42124_42435_47261_47500_51835_51960_56352_57138_57179
755215	contig_5718_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_110446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	412	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1225	1530	1623930	1622618	TRUE	20	CACGGACTCCGGAAGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEKRNVFRSRGITLRILSTSVSKSIFNIRSASSMTKYLRALKLKPFVFSKWSISRPGVAITICGFFARARDWDIESIPPTITALCTPIEDPRASNCSEI	1631590	1617853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1617944_1618673_1618771_1622479_1622670_1622889_1622960_1623154_1623275_1623866_1623939_1624076_1624194_1624744_1624891_1625474_1625614_1628561_1628631_1629210_1629345_1630979
755218	contig_6589_pilon	-	1577	11	Intergenic	novelGene_25886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_10	9.75961064797157	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	29	1216	1155176	1138646	FALSE	20	CTTAAGCCGTCATCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGHSYRCTDMAAAALGQPQTWARKLLPVPWLLCGSRRCVSSSFKATDLHLEMTQEPHKKPNPSEPLVFGSTFTDHMLMVEWTREKGWGHPQIKPFQNLTLHPACSGLHYSLQLFEGMKAFKGQDQRVRLFRPWLNMDRMLRSAQRLCLPSFDKVELLECIRRLIEVDKDWVPEDPGTSLYVRPVLIGNEPSLGVGLSTQALLFVILCPVGSYFPGDAVTPVSLLADPTFVRAWMGGVGDCKLGGNYGPTVFVQQEAKKRGCQQVLWLYGPDHQLTEVGTMNIFVYWTHEDGVLELVTPPLDGVILPGVLRQSVLDLAQSWDEFRVAQRKVTMKELLRALAEGRVREVFGSGTACQVCPVHKILYQGKQLHIPTMENGPELILRFQKELKAIQYGTRAHEWMLPV	1155204	1138284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1138685_1139613_1139689_1139764_1139906_1140120_1140207_1140397_1140541_1141879_1142044_1142286_1142407_1142496_1142608_1149994_1150199_1150524_1150606_1155152
755219	contig_8616_pilon	+	1403	10	Intergenic	novelGene_72564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	2	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	18	1331	425778	436516	FALSE	15	GAACCTTTTCATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
755224	SIRV2	-	303	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4570	34	3395	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
755227	contig_10196_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_132029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	679	85	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	140	562	408534	404095	FALSE	10	TCCCCTGTCCACGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKSAVSCLGWLGKLCRGLGPESRKDRGTEEGGSVWRTGGQTGRRRRMGGSAVWRLVEALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLNDKISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK	408673	403566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404300_404421_404606_408500
755229	contig_817_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_132463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAGAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615226	617387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_615200_617400
755231	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
755232	contig_14814_pilon	+	755	3	Intergenic	novelGene_137710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.5	7431	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279385	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279541_282788_282992_283413
755243	contig_10438_pilon	+	2515	3	Intergenic	novelGene_161681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	2	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	86	1714	85416	88750	FALSE	25	AGTGGTGGCAGGAGAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIEDVVVVFTQEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRNLNDENKLSSEHIIVRLMNNYTWSSMLEEISESHGSKDQHNNQWRHLRRHTVENLCESNEGNQRRKAFSWIPNLTEVKIKPSEVNPYKCCECGKAFKDHSSYKHHTRSHTGCNTYHCKKSGEAYSCPSYLSTPMRTLTGEKPSKVCGRDFISTSTLESPGTTVTGEKRYECNKCGKDSCSLSSFQTHLRGHKQECKECCKTYGRPTSLCLHKKFRNTGKPYQCKECGKAFRYASNLTKHIKTYNGQRPYECKKCRKTFTCYSFLSKHLRIHSGEMPYECKECGKAFSLSSRLSQHRRSHNTEKPYECEECEKAFSHASLLTRHKRTHSGERPFECKDCGKAFSQLSYLSKHRGTHNTVRSYECKKCGKAFSCSSLFAIHKRTHSGERPHECKQCGKTFSYVSDLSKHKRIHSRERPYECKECGKAFSYVSDLTKHKRIHSGERPYECKQCGKAFRHASNLAKHKRIHSGERPYECKQCGKAFRRVSDLNIHKRIHSGERPYECKECGKAFRQSSHFTYHLKIHSVKAL	85330	89551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_+_85450_86799_86951_87306
755246	contig_8259_pilon	+	1130	4	Intergenic	novelGene_148859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.194275948266	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAATTGATTTCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53159	64575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53337_57922_57986_62754_62830_63760
755249	contig_9807_pilon	+	1574	7	Intergenic	novelGene_32922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	431.988297166589	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	433	1038	147193	157176	TRUE	35	AACCACGTGTGGAGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	146760	159005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_157171_157384_158676
755253	contig_11720_pilon	+	2269	16	Intergenic	novelGene_44047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	26.7149562771285	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	317	1993	580436	588257	FALSE	25	CTACCTTCAGAGAGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSASFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSHFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWENSSRQKWIVKPPASARGMGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYSPSVKSLGNKFMHLTNYSVNKKNVEYQANADETACQGHKWALKALWNYLSQKGINSDIIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYNCHELFGFDVMLDENLKPWVLEVNISPSLHSNSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPSAEDILSSSSSSSSSTTSLTSTPRDKFRMAPEHFTAQKMKKAYYLAQKIPDQDFYASVLDVLMPDDVRVLVEMEDEFSRRGQFERIFPSRISTRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHSNKLKGVDLLRSWCYKGFHTGVVSDSAPVWSLPTSLLTVPKGDVMLNAFCKSEIGNLGKPNSSKDIEDTSKEPSLSSQMLPLIKYSGQTSRLSASPISQSTSDFLLAAVSP	548951	588533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_549099_579804_579930_580391_580503_580873_580951_581674_581867_581961_582045_582287_582417_582793_582917_583219_583319_583639_583775_584231_584370_585660_585764_586645_586857_586988_587060_587459_587546_588094
755254	contig_9955_pilon	-	1269	5	Intergenic	novelGene_21301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	716.307676560848	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	208	921	49317	45240	FALSE	25	TAAATTATTTTGGTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFENSVAKPALEKAAKATAGETSSGSPKVNKKKSPYELWLPV	49837	44891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47737_48794_48908_48982_49380_49692
755255	contig_15114_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_121144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAGGAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131024	129302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_129300_131000
755261	contig_19352_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_122400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTTATTTTTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278773	279438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_278800_279400
755262	contig_19352_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_122401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAAAAAGAATGTTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279705	280846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_279700_280800
755266	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_97648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
755269	contig_10775_pilon	-	880	3	Intergenic	novelGene_157935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_2	6.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	182	880	26002	7117	FALSE	45	TAAGCCAACTACCTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGKEGRRQTGRGATVKVREVNPVAGPGAEQGAESGGARAGAGAVGLKTLALDDSWCHSEMSSLSGKVQTVLGLVEPSKLGRTLTHEHLAMNFDCCYCPPPPCHEATSKETIMMKNLFWIQQNPYSHKENLQLNQETEAIKEELLYFKANGGGALVENTTSGISRDMQTLKWLAEETSVHIISGAGFYVDATHSSETRAMSIEQLTDVLINEILYGADGTNIKCGVIGEIGCSWPLTASERKVLQATAQAQAQLGCPVIIHPGRNRSAPFQIIQVLQEAGADISKTVMSHLDR	79592	7116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_7384_25570_26042_79450
755272	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
755282	contig_17127_pilon	+	2628	2	Intergenic	novelGene_168288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGCTTGCCCCCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3464	41510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_3804_39221
755287	contig_10734_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_51158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGATTTAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958859	960432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_958900_960400
755289	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	1	1156	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755291	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	594	6	415	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	246	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755293	contig_10331_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_54171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAAATGGAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540337	539161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_539200_540300
755294	contig_10331_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_54174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGTCAAGCTCCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548974	548390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_548400_549000
755295	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
755296	contig_7202_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_16450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27810	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
755298	contig_13894_pilon	+	1239	9	Intergenic	novelGene_62133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2810.68415826112	4	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	155	823	521729	525785	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGHQPLAHQEATPQDPPRAAQGCLYWGLASCPCGLLCGTCWAEGLPSPH	521574	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525014_525637_525816_526510_526580_526851_526948_527459_527580_528072
755299	contig_7593_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_127352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	282	464	647911	647729	NA	65	AAAAAAAAAAAACAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGGHTQPWLHRTCPRALRYAILYPLLLTCRPGRLASLGQPGDQVLVRLLAHRLVEILSFILLLLLRSVSPPPQQGPGSSASTSPSASSRAFFMPTRCFFLWASPCSCLCCTLWACWACLWAVSRSLSSLATRMACSSSLSCAGNCGTAHSPP	648192	645778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_645800_648200
755301	contig_9354_pilon	+	2021	10	Intergenic	novelGene_108051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCGGAAACGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206286	229894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_206612_212552_213440_214200_214277_214414_214534_219692_219827_223361_223431_224006_224137_225189_225235_225963_226110_229804
755307	contig_14030_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_62248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373473	373687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_373500_373700
755308	contig_11702_pilon	-	2667	20	Intergenic	novelGene_142006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	205.242603559274	270	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	742	1881	511195	508213	TRUE	20	ACCTGATGATTCTCCGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRDEIMPRAQNIQSRLGRQTIETEEVNKTLKATLQALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAGRRRGQQQETETFYITKLQEYLSGRSVLAKLQAKHKQLQEAIQRGDKEEREMSWTQYSQRKVQRSRQPRPSSQYSQKLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGGCPAGQHGGGE	527512	506020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506403_507258_507359_507568_507653_507909_508098_508180_508249_508330_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277_509339_509956_510060_510269_510298_510545_510631_510707_510900_511114_511217_518380_518570_518801_518863_519090_519254_519327_519536_527413
755309	SIRV4	-	202	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	412	3	-412	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAACTATCGGCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
755312	SIRV4	-	263	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1255	3	1255	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3903	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
755316	contig_14289_pilon	-	1091	7	Intergenic	novelGene_110553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	238.645948821447	3342	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	105	872	66533	51527	FALSE	15	GCTCTTCCTTATGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKDTYCNVHVFAKAVWCVRGSAGVGGILLCLSMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66637	51307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_60193_60284_61210_61293_64645_64754_66468
755318	contig_7728_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_64714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGATCTCTTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730061	727984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_728000_730100
755320	contig_3382_pilon	-	441	2	Intergenic	novelGene_124211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGCAATTGTGAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448207	1447361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1447715_1448119
755321	contig_3382_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_124210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAATAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446546	1445159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1445200_1446500
755324	contig_6217_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_109635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527749	528100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_527700_528100
755325	contig_709_pilon	-	1980	4	Intergenic	novelGene_57658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_2	48.996598521394	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	233	877	3769893	3764733	FALSE	50	AAATAACGGAAAAGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPK	3770125	3763629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806
755327	contig_16098_pilon	+	743	4	Intergenic	novelGene_46214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	351	743	766291	766787	FALSE	10	GGTGAGCTGGGCTGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPESPSPQHLLGAPALGGKAPQPRH	764893	766787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766619_766722
755328	contig_6710_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_95002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
755329	contig_5201_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_82194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATTTTGAAGGGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404826	405660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_404800_405700
755330	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_97761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
755332	SIRV4	-	459	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
755333	SIRV6	+	505	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1550_1657_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755339	SIRV6	+	333	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	19	-244	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755341	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
755342	contig_14811_pilon	-	1517	3	Intergenic	novelGene_74470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	506.5	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	48	659	375703	357434	FALSE	30	CCCCAAAGTGTCTCGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	375750	356575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375176_375343
755346	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	54	508	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
755349	contig_14666_pilon	-	1085	6	Intergenic	novelGene_39538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1195.59518232552	3275	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	238	666	458202	449808	FALSE	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	475134	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450859_452063_452102_453686_453867_458195_458360_475054
755350	SIRV6	+	349	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724
755354	contig_9290_pilon	+	1291	5	Intergenic	novelGene_77512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	212.606443928682	520	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	533	1060	46400	49973	FALSE	30	GAATAATTGCAGGCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTHQLDLFPECRVTLLLFKDVKNAGDLRRKAMEGAISGSLINPTVIVDPFQILVAANKAVHLYKLGKMKTRTLSTEIIFNLSPNNNISEALKNFGISANDTSILIVYIEEGEEQINQEHLISQVEGHQVSLASLPEITNITEVRKIYKLSSQEESIGTLLDGTICRMSTKDVL	45556	50204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_45610_45920_46541_47448_47572_49008_49186_49886
755359	contig_17936_pilon	+	1179	9	Intergenic	novelGene_29924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	966.216259113352	3	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	55	1131	50646	126534	FALSE	25	TACCAGCCTAGTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKTMHLSSL	50591	126582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95299_106374_106472_110997_111167_114800_114902_126508
755364	contig_3942_pilon	+	2174	3	Intergenic	novelGene_128874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	15.5	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492864	1497625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1492914_1495128_1495242_1495613
755366	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755367	contig_5744_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_149347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGTTATCCTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672719	673066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_672700_673100
755372	contig_13542_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_131476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243195	245381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_243200_245400
755373	contig_6740_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_142677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAGTTTCCTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612989	610944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_610900_613000
755374	contig_10135_pilon	-	698	4	Intergenic	novelGene_106647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCGAGCAGTTCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120165	116647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_116761_118668_118837_119157_119205_119795
755375	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755376	contig_9808_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_165953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACACAGAATAACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32776	33819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9808_pilon_+_32800_33800
755379	SIRV6	+	428	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	383	45	204	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755380	contig_1107_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_126586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATGTTCTGTTCCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826777	826411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_826400_826800
755382	contig_8354_pilon	-	2360	1	Intergenic	novelGene_24154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	234	551	558926	558609	NA	50	TTTTAAAAAAAAAATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCTPSHAHPWLMPSFPPESPSPGVACQSLHSQGLLRPLFHDIPAFEKELKFLAEPFLPVLCLTGFHCACGRHAGLPCGAHVSGAHVLLRVGTRRACPWVLCIVL	559159	556799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_556800_559200
755384	contig_8476_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_121341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGGTCAGCAGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138493	140123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_138500_140100
755386	contig_57_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_44922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCACAGATTTGAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301211	299697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_299700_301200
755389	contig_854_pilon	-	1691	8	Intergenic	novelGene_36144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.823104402639	2	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	63	608	509201	471108	FALSE	0	CGTGCCTGGGGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARQSQAAAGSVGNWNTGFRMDLCHPDPAELSSGETEELQQIKWHRKQLLEDIQKLKDEIAEVFAQIDCFESAEESRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQV	509263	470024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471115_487004_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_495173_495239_497487_497571_509182
755392	contig_16204_pilon	+	1848	6	Intergenic	novelGene_154504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.4508594807368	7	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	399	836	286695	288360	FALSE	25	CTGGAGTGTGGAGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKPSRAGSRCPPLEEDPPTLAPQHHPGHSSGSSTSSGEDYCNSPRSKLPAWNPQVFSSEKNLLLHQPPNLELAGSQPILSEGDAPGLPAGPSADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPLLVQQSECPGSPSPQPDSTDNDDYDDIGAA	277113	289372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_277430_284886_284945_286670_286744_287149_287345_287610_287740_288295
755393	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_97009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
755395	SIRV6	-	291	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGCGAACTTTGACGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
755405	contig_13995_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_164087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATGAAGATAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61854	60836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_-_60800_61900
755406	contig_17281_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_105185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2165_2345
755407	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755408	contig_15888_pilon	-	1567	8	Intergenic	novelGene_84439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_7	1285.85843636356	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	53	862	259726	252475	TRUE	10	CCACATTTCGGCTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259778	251601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
755411	contig_16204_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_154493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGGAGGTCCTGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249212	250237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_249200_250200
755414	contig_12624_pilon	+	434	4	Intergenic	novelGene_61005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	110.671686633132	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAAAATGCTAGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759521	822962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_759764_766246_766353_820981_821010_822904
755417	contig_3975_pilon	-	2972	1	Intergenic	novelGene_54678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGGTTTATCTTTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043499	1040527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1040500_1043500
755420	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	3	1173	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755422	SIRV4	+	351	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCGTAACAGTTTCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3646	3997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
755423	contig_14322_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_116240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGTATATTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
755424	contig_7457_pilon	+	2569	10	Intergenic	novelGene_31386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	85.6699091474558	8	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	4	1404	446391	463076	TRUE	30	AATCTTTTAAGAGACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAEPEGVAAAPGPSSGPTFRGRRALSGSWERDQQVEAAQRVLVEVLGPYEPLLSRVQAALVWERPARSALWCLGLNAAFWFFALTSLRLVFLLAFGLMIIVCIDQWKNKIWPEIRVPRPDALDNESWGFAHPRLLSVPELCHHVAEVWVSGTIFIRNLLLFKKQNPGKFCLLSCGILTSLAILGRYIPGLLLSYLMLVTVMMWPLAVYHRLWDRAYVRLKPALQRLDFSVRGYMMSRQRERQLHRRGLHREHAVDNHSDSEEELAAFCPQLDDSTVARELAITDSEHSDAEVSCTDNGTFNLSRGQTPLTEGSEDLDGHSDPEESFARDLPDFPSINVDPPGLDDEDDTSIGMPNLMYRSPPGAEEPQAPPASRDEAALPGLLLGALPAGSNLTSNLASLVSQGMIQLALSGASQPGPSGPAPRRATRGFLQAPSSDLDTDAEGDDFELLDQSELNQLDPASSRSH	446387	464772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_446630_455291_455399_456967_456999_457906_458034_458669_458755_459596_459735_460798_460882_462074_462208_462618_463085_463615
755425	contig_6710_pilon	+	568	2	Intergenic	novelGene_95625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACACAGTGGTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653906_657806
755426	contig_7457_pilon	-	1102	7	Intergenic	novelGene_31361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.962726895732	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	25	549	321514	317540	TRUE	40	AAAAATTTCAACTCCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321538	316937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317478_317526_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
755427	contig_17157_pilon	+	918	8	Intergenic	novelGene_171739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_3	38.8066899345135	96	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	239	916	20141	31675	FALSE	80	AAAAAGGAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYVAAFAVSAYASSYFRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPISACHAESRNFVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPAFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLNDDSCHCKVNFIKAKYWSTNSHEIEGTVFDKRGKPVHRLFGKWHESIYCGGSSSSACVWRANPIPKGYEQYYGFTQFALELNEVDPLSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRERRRVLEENNLEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLDHPVLW	5177	31677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17157_pilon_+_5317_16049_16114_20105_20185_21497_21643_22845_22991_26192_26320_27998_28122_31581
755429	contig_1964_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_130912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACTCAAAAATGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158904	160573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_158900_160600
755430	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
755431	contig_3627_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_78468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCTTTAATTAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333161	334250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_333200_334200
755433	contig_7151_pilon	-	1095	8	Intergenic	novelGene_40681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	138.22312633225	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	260	373	6069	5693	TRUE	35	CAATAAATACTCTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWTVALPWKPCRRLHLAQEMGASGWTRCGAEAGSLPCGPVLRSPGGRTTVRGQHLP	13680	1842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5979_6125_13476
755436	contig_13206_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_161898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCTCTTCTCATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122427	121262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_121300_122400
755438	contig_1443_pilon	-	590	2	Intergenic	novelGene_28393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCTGGGCGGCTAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052455	1051721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1052094_1052237
755442	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
755445	contig_11115_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_102782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAAGAAAAAGCGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53886	52654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_52700_53900
755446	contig_3269_pilon	-	1105	6	Intergenic	novelGene_117035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	619.87256754917	30	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	253	690	191911	187357	FALSE	15	TGCTGACTGCTCTGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDISISVISRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLYKANVNSTITVTMKVGSNYILSFHYFKDTGINSLSGNNIFK	238315	186941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_187537_188192_188263_191236_191320_191725_191816_191896_192014_238165
755448	contig_11849_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_171751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATAGGTTCCCTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142473	121786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_-_121845_128523_128573_132348_132554_141488
755449	contig_11849_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_171750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121786	121057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_-_121100_121800
755456	SIRV6	+	539	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755458	contig_15273_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_140445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATATTCATCCATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168548	168178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_168200_168500
755465	contig_10120_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_171760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	93	485	263486	263878	NA	15	CTTGAATGTATTCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLPTSAQTIWTPFEPVNPLSSFGSDPSGNMKTQRRGSQPSTPRLSPTFPESIEHPLARRVRSDPPSTGNHAGLPIYIPAFSNGTNSYSSSNGGSTSSSPPESRRKHDCVICFENEVIAALVPCGHNLFCMECANKICEKRTPSCPVCQTAVTQAIQIHS	263393	265685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10120_pilon_+_263400_265700
755467	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
755468	contig_14637_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_114561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGTTAGAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387823	385913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_385900_387800
755469	contig_12970_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_50510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATTGGTCTCTATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34158	33487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_33500_34200
755471	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755472	contig_5261_pilon	-	2404	2	Intergenic	novelGene_102462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCTGAGGTGTTGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107043	92681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_92720_104677
755473	contig_5261_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_102461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTCCGTGTCATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92530	92086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_92100_92500
755475	contig_2487_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_148458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAACAATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128971	131269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_129000_131300
755478	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
755484	SIRV6	+	568	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
755485	contig_7357_pilon	+	2394	13	Intergenic	novelGene_36890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	106.227317840354	1	125	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	170	322	256833	260087	TRUE	30	TATACAAATGGCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TINQYLQQVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTYIIPASISGPQRRKLGFAYHVCSST	250874	273698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_257995_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_269206_270136_270238_271244_271314_271479_271606_272519_272644_273221
755489	contig_9345_pilon	-	1686	13	Intergenic	novelGene_24510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.163280835758	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1213	1629	667843	667167	TRUE	40	TGAAAAAAGTAATGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAILPKPWPLGPPQMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHS	671872	667025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667166_667255_667334_667479_667568_667709_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669655_670161_670369_670735_670798_670910_671013_671225_671275_671731
755491	SIRV6	+	512	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	38	11	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755501	contig_8674_pilon	-	1629	12	Intergenic	novelGene_102946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	45.5736621052769	186	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	341	1255	723870	707008	FALSE	20	TCCTGCTCTTCTGTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727642	706633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_727434
755506	contig_2854_pilon	+	2118	6	Intergenic	novelGene_120798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	131.075550733155	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	40	1956	68068	86814	FALSE	45	AAAATCCAGGTTTGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKAGTPVSELTKQMDTIFSSSPAVPFVPVNGLPPDEEALLKERICHKRRSSDSEERHTKKQFSLENVQQGEPVCDGRTSARSVTADLSGSPDSEHVSPDAKDTTEEMEYNILVNFFKTMGYSQDVVEKAIREFGPSAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLRDMQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	68028	86976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_82393_82502_84541_84650_86465
755507	contig_7119_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_40988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	241	819	139647	140225	NA	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	139406	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_139400_140900
755508	contig_2069_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_23572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTCTGAATTTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2282093	2282733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2282100_2282700
755509	contig_9578_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_68007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATATAAACAGAGATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319970	1318260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1318300_1320000
755511	contig_10354_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_50867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGTTTGTTTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451747	451041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_451000_451700
755514	contig_9206_pilon	-	1831	3	Intergenic	novelGene_137485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGAGAACAAAATGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188933	131625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_131693_186709_188195_188654
755517	contig_16541_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_126725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAGAAATAGATCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218989	218708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_218700_219000
755518	contig_14441_pilon	+	739	6	Intergenic	novelGene_100633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	392.50936294565	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2	550	111295	117610	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLAAPPGFAGRGRWEGPFLYKAEALWGQGSHGSHLRPGVQADGCSCPDPGWLWRPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111293	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112113_112154_112454_112483_116772_116963_117220_117344_117539
755520	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755524	contig_5039_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_64895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATAAAAATATCATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585140	584537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_584500_585100
755530	contig_18231_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_105900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	367	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	178	522	423322	421134	FALSE	45	CCACTTCATAAAGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLDHVIATRQSEWVSFSEESPYPVSSEGGTEEQLPGLSSSSDQSETSSGENQIVEGGSQDLSPSEQDDSSEKIGLISEAASPAGSPEQPTPDLASAISNWVQFEDDAPWASTS	423499	421133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_421391_423234
755534	contig_12250_pilon	-	905	7	Intergenic	novelGene_80660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.536894108333	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	13	546	379609	376326	TRUE	35	CATTTTAAATAAACTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNVSWGGVGRGLRARHASAPSPSPGMHPRPHLVQAHICCPVMSAWSSSKQPTSAETSSGISRAWAPCPSSKLP	379621	375715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_375772_375873_376118_376266_376383_377316_377435_378585_378758_379078_379194_379537
755535	contig_1986_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_64127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGGGTGGGGGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272445	274433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_272400_274400
755542	contig_17108_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_109531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTAGGAGGGGAGCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81868	80762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_80800_81900
755544	SIRV6	+	179	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	553	51	553	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10790	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
755546	contig_16647_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_170302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGGTATCCCTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275954	273811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_273800_276000
755549	contig_16714_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_161580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCGGGTCAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939366	938193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_938200_939400
755550	contig_16714_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_161579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937036	936595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_936600_937000
755552	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755555	contig_6102_pilon	-	2738	3	Intergenic	novelGene_32227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	60	junction_1	1641.5	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	899	2697	41	2737	905250	899855	FALSE	30	CATCCCCCCAAAAGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETAVHPVSSSLSVTAALGQPGPTQQCPLATTNQPSPFPPPSNVASTPFEAPFLQSSSGIALPLGASPSPSGTPAFLPDLIGPPISPAALALASPVIAPALKGAHSPSPPLALVALAPPAVQKSSAFPPNPLTSPPVAKAESVSVTSPSTTIAPPSPKTCSIQVPSQVVPNPKSTCSPPGIVSAAQSHLVIPLAPDQSGLASCPEMPPITPIAITSPQVTGIPIPPALTSPQNLVTLKESIGPPAALSLSTQCIPVATSQNTVAPSDPVFLTSVASHLAPLCQSSFGSSVQPSGQTDQNNLSNPTTVASIPVGHSSMGVSSPSQRSVIPPLHSRNEVVPAGGAPTSLLPLNVDTVPSAITSIASHSPSGSPLSPTDSLILQGSPNADYHQPLVAWIPGASPGSPSLKEAPVSSLGATPLVMTNPSTISVAPTAFEVTTCMSPPVSPGSISSKDPTSHSALITGPVTPKEFPTAQEDFQTIPISPVEAPVSPAQAGLPTKKDSTPLALSVPKDSSPQSALSSLEMSLSPEATLAKKSLVEPLPLVKPASAPPSPLSVLHSPASIIKTNPCASPDPASLLLKSSPTTPPVATTAAPAGIPNKKDPATPAGVALITTKGTSTPTTTACPSLEGDVSLVPKSHLAKEGTSSLATLPLVPSASESCPMAPALTSSPQDVSAFPATLARASEIPKSVPFPSLPPAGTPLDAKEIDSISHTSALVPAASSPEGPPNEKDSGAFVTASSEETLTDLIDSPSPLRTSVSPQTKRPPTKKGSATSPATLTLALSVSKNEPVIPGSPIGNLSSPVSPLEASLPSDASLSFQGPKGSPAKKHSIPPSPKRAPTSPPVTPASPKEDPTVPSPKDTHTSPAMTPSSAKGSPGT	906123	899853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_902482_905180_905253_906085
755559	contig_14546_pilon	+	1353	8	Intergenic	novelGene_157444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_7	123.885727464417	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	834	520	1353	518176	529137	FALSE	20	GGCAACCTGCCTCATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSVANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEPEERQQTPEVVPDDAGTFYDQTVSNDLEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKSEPVLEETAPEDGQKSSSPAPADIAQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQRDQRVREQRINIPPQRGSRPIREAGEQGDVEPRRIVRHPDSHQLFI	517266	529137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_517768_518157_518332_523716_523808_525315_525410_526579_526782_528373_528476_528722_528835_529060
755560	contig_14546_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_157449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGGAGCTTAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529087	529865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_529100_529900
755562	contig_6241_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_156437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCGTGCAGCTCAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340016	338756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_338800_340000
755564	contig_8045_pilon	+	1193	5	Intergenic	novelGene_35362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1075.25563820889	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	27	440	116067	118665	FALSE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKI	116040	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118208_118663
755566	SIRV2	-	276	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	650	22	650	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4082	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
755568	contig_3846_pilon	+	1648	3	Intergenic	novelGene_137149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	1.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	105	581	189311	196960	FALSE	70	TAGTAAATATAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSPFIIIHSISLLKDEEHSIAALLLRIEKEELDMKGSGFYVSLEWVTISKKNKDNKKYEIIKHEILRGKSVPHYAALEPDGNGLMIVSYKSFQFIQTGQDLEENKNENMSEKIKEPLYYWQQTEDDLTITTQLPEDTTKEDIQVQFLPDHISIVLNGQLFLEGKLYSSVDHESSTYIIKENNRYFYSFIYI	189206	198027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_+_189372_192969_193153_196727
755569	contig_6710_pilon	-	1007	3	Intergenic	novelGene_93406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	72	437	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659352	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152_658365_659084
755571	SIRV6	+	381	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	581	0	402	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	301	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755572	contig_8106_pilon	-	2547	6	Intergenic	novelGene_139726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_2	55.9478328445347	980	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	72	824	85457	64191	FALSE	30	TCGATCTGCAGAATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDKIILQLNRYYPQILTNKEAEKFRNPRAALRVRLCNLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSCLPSRHALQNSDGTELDSGVERWELSDRGPLGFLACLSVAAGLALLMYCCPPDSKVLPGARRVLGFSPVIIERHISRYLLTFLAEDLGGSLIRPWTLDFACRSAQRLPPASRLAYCHHPACSLPTLRGDQSVSFSKGFFLTIYHFCETHLDLAYEGA	85528	62467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_64508_65256_65329_65644_65705_66863_67018_69922_70066_85450
755573	contig_7135_pilon	-	1023	7	Intergenic	novelGene_136951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	18.6674106994575	785	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	151	735	319193	309633	FALSE	15	GTAACTTGTGAGTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVRNAGTVFLRSWARPPTTGVVADAPARTIHTSLQQLQEAAAKKKVEEEAAAPSRSSFSIYPPVPGQESSLRWAGKKFEEIPIAHIKASYNNTQIQVVSATNQPLAHASCGTEGFRNAKKGTGIAAQTTGIAAAAKATGKGVTHIRVVVKGLGPGRLSAIKGLSMGGLEVISITDNTPIPHNGCRPRKARRL	319460	309344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_309741_310666_310733_312258_312389_313231_313331_318902_319020_319128_319277_319393
755574	contig_15066_pilon	-	1785	11	Intergenic	novelGene_149544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160.997795015957	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	58	735	114591	113263	TRUE	10	AAGGTCTCTTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRY	114648	111683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112188_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
755575	contig_1639_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_74928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAGAAATGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377793	378033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_377800_378000
755578	contig_16098_pilon	-	952	12	Intergenic	novelGene_45767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	264.579879047319	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	269	682	35038	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRRGGVELRHGCLSTPFPALPALSSPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36331	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35794_36293
755579	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_96954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755580	contig_12697_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_122833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259474	257663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_-_257700_259500
755581	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
755582	contig_4812_pilon	+	3107	1	Intergenic	novelGene_103706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGGGAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918947	922054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_918900_922100
755584	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
755592	SIRV6	+	156	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	53	787	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
755593	contig_6136_pilon	+	1004	7	Intergenic	novelGene_154106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	324.404925294847	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	527	991	470815	494274	FALSE	30	AGACGAGACTAGAGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEHWKDTHPRGYGNRQNMG	460089	494287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460680_460975_470793_470992_472546_472627_473367_473481_494125_494168_494221
755598	contig_10196_pilon	+	901	4	Intergenic	novelGene_132110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGTGTCTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922244	926563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925780_925939
755599	contig_10494_pilon	-	1880	4	Intergenic	novelGene_102173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	29.4052149569879	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1096	1458	939854	939492	FALSE	10	TCACTACTGTTGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQDLLPHVPPGAPRGIRLLPWPLSDGWSALEEKRGPSWGPKAGILPGNMCHLEPRGAPCWAMTSPPICWPLSHCHLPPLVRAGKSGGSGLQADPGLPSKPPTPFSPGEVPRLHPNRHHV	950123	939069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_939964_944315_944934_949069_949299_949984
755600	contig_10938_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_171761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32966	30194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_-_30200_33000
755603	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_94251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
755604	contig_11300_pilon	-	1569	7	Intergenic	novelGene_168644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_2	42.4712320936838	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	414	833	87814	81862	TRUE	40	GGTGTATGACAATAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWEAARCLRSRGALVPARRSLSSGSPPLEELFARGGPLRAFLERHAKSEVQLQARGPELAVVAKLLSEKELELRETEHLLHDENEDLRKLAENEITLCQKEITQLKHQIILLLVPSEETDENDLILEVTAGVGGQEAMLFTSEIFEMYQQYAAFKRWHFEPLEYFPSEIGGLRHASASIGGAEAYKHMKFEGGVHRVQRVPKTERQGRIHTSTTTVAILPQPAEIHLVINPKDLRIDTKRASGAGGQHVNTTDSAVRIVHLPTGRRKRMRRKRSVP	93915	80360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_80903_81667_81903_83208_83327_87047_87212_87717_87902_90151_90232_93669
755605	contig_14450_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_49067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGAAGGAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486561	1484473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1484500_1486600
755610	SIRV4	-	416	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1107	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4051	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
755613	contig_3397_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_154582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAGAAAGTTTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139544	138947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_138900_139500
755614	contig_5539_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_104776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAATCAAGGGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266387	265651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_265700_266400
755622	contig_3584_pilon	-	1153	4	Intergenic	novelGene_108190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	87.6850424340815	172	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	180	629	539059	534865	FALSE	25	TCTCTACTGATAGCGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSHLSKMAAIYLVDVDQTPVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPKNIPKYDLLYQDI	541813	534340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_535031_536549_536702_538927_539061_541635
755623	contig_14273_pilon	-	1823	17	Intergenic	novelGene_21164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	26.3483277457982	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	536	1822	298889	279456	FALSE	40	CAACAAGCAAGCAGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGLQLNPSNHLQLYSCSFDGTIKLWDYIDGILIKTFTVGHKLHALFTLAHTKLDIFQLVSVKLPKSSSQEIEAKETAFVLDYINQSPKCIAFGNEGEYVAAVRDFYLSVYFFKKKTTSRFTLSSSRNRKHAKNNFTCVACHPKEDCIASGHKDGKIRLWRNFDDDKKYTYTCLHWHHDMVMDLAFSVTGTSLLSGGRESVLVEWRDATEKNKEFLPRLGATIEHISVSPAGDLFCTSHSDNKIIVIHRNLEASAVIQGLVKDKNIFTGLIIDPRTRALVLNGKPGHLQFYSLQSDKQLYNLDIVQQEYISDNDLIQIELRKAAFGCQGHWLATVEQRQEKETELELQMKLWAYNKKTQGFVLNTKVSMPHEDHITALCFCNAEKFENPTLVTASKDGHFKVWILTDDSDIYKKAVGWTCDFVGSYHKYQATNCCFSEDGSLLAVSFEEIVTIWDSETWELKCTFCQRAGKIRYLCFGRWTCSKYLLGATENDILCCWNLLSCALEWSTKLNVRVMEPDPNSENIAAISQSSVGSDLFVFKPSEPRPLYIQKKISREEVHWGVFVPRDVPESFTSEAYQWLNRSQFYFLTKSQSLLTFSAKSPEEKLT	307778	279454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_279501_280222_280393_281543_281640_282520_282616_283481_283663_284135_284294_285172_285349_286402_286519_286608_286669_287688_287848_298858_298948_299825_299946_301011_301083_303482_303612_304499_304554_305437_305504_307741
755631	contig_10078_pilon	-	1480	2	Intergenic	novelGene_159993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	0	754	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	300	1193	57163	56270	FALSE	30	TCAATCAATTTGTCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDQPVTNTKEAKWQKVLYERQPFPDNYVDRRFLEELRKNIYARKYQYWAVVFESSVVIQQLCSVCVFVVIWWYMDEGLLAPHWLFGTGLASSLIGYVLFDLIDGGEGRKKSGRTRWADLKSALVFITFTYGFSPVLKTLTESVSTDTIYAMSVFMLLGHLIFFDYGANAAIVSSTLSLNMAIFASVCLASRLPRSLHAFIMVTFAIQIFALWPMLQKKLKACTPRSYVGVTLLFAFSAFGGLLSISGVGAILFALLLVSISCLCPFYLIRLQLFKENIHGPWDEAEIKEDLSRFLS	58498	55982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_57381_58416
755632	contig_14546_pilon	-	1659	10	Intergenic	novelGene_157404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	110.902470778118	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	83	1567	78938	20116	FALSE	25	AGGGTTTCCAGGGCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTESVRGLQGAVSLKLDFMSPPESAKELQNKASSFLEGSPSESPGLQKTKGITGFQTLVHLVKGNMGTGILGLPLAIKNAGILMGPLSVLAMGFVACHCMHILVRCARHFCHRLNKPFMDYGDTVMHGLESSPSSWLQNHAHWGRCVVIFFLTVTQLGFCCAYIVFVADNLKQVVEAINGTTNNCHHNETVTLTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIQNLRVLSIFSLLANISMLVSLVIIIQYIVQGIPDPGRLPLVASWKTYPLFFGTAMFSFESIGVVLPLENNMKDARRFPAILSLGMFIITTLYVVIGALGYLKFGDDIKASITLNLPNCWLYQSVKLLYIVGILCTYSLQFYVPAEIIIPFILSRVPKRQAQVLDLSIRLTMVCLTCSIAILIPRLDLVLTLVGSVSGSALALVIPPLLEITTYYSEGMSPFTITKDALISILGFVGFVAGTYQAIHELIQPAHSLTFPNSTMFLQWEQHCSSPPCP	79020	20023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_20421_30741_30912_32170_32338_59343_59443_62207_62427_67589_67675_71344_71441_74551_74641_75454_75546_78774
755633	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9664	558	514	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
755634	contig_4812_pilon	-	656	5	Intergenic	novelGene_103680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_4	5262.92734606892	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	141	656	82626	80222	FALSE	35	GTAAGTATGAGGAAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82766	80221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
755635	contig_1996_pilon	-	1483	6	Intergenic	novelGene_131883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2.99332590941915	154	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	192	1433	167445	165576	FALSE	20	GCTGCTGCTGGAAAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKLLLMAGLYLVQGLPYGLQSGLLPVLLRARGLSLTRVGLAKGLYAPWLFKLVWAPLVDTRGSPRVWLALSTAALGVVCGLLASLPPAEEGQVGLPTITAVLLLLLNLGAAVQDVALDTLAVQLLEPAELGPGNTVQVVAYKLGAALAGGGLLALVPTLSWPLLFLLMAVTYLLAAALAWASPALELLPQPQPSEAAPRPGHHLQALLAVPGTLWTAGFVLTYKLGEQGAGSLFPLLLLDRGASAPELGLWNGMGAVACSIAGSSLGGALLARHRQPLPLLRPVLQLRLVGLACQTALLFRLDALGTGVGLGTVLKGVSLLSLCLQHFLGGLVTTVTFTVMMRCSQLAHSALQATHYSLLATLELLGKLLLGTLAGVLADSLGLRPCFSLFLALSAVPTLYLGLAPSSLAR	168006	165525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_165753_165825_165936_166006_166132_166224_166373_166763_167584_167953
755636	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755638	contig_10377_pilon	+	1885	9	Intergenic	novelGene_115356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	747.214159394748	7	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	135	536	219517	245181	TRUE	30	TTTAAGAAGTCTGATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRPEAPTYRLQDFDTLSTVGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRCLFFSQVPSIFR	180891	261745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_180955_219445_219615_227487_227752_245141_245257_251691_251754_252537_252616_255017_255169_256868_257234_261127
755640	contig_4470_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_171778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCCTTTCTTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253249	254497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_+_253200_254500
755642	SIRV6	-	439	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-105	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCTACTCTTTCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
755645	contig_13481_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_119538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATATTTTAGTCAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481003	1482063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1481000_1482100
755646	contig_13481_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_119539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAGACAAAATATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482410	1483191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1482400_1483200
755648	SIRV6	+	350	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10682_10819_11031_11109_11205
755649	contig_7457_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_31687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTACCATTGCAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174112	1175618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174975_1175547
755650	SIRV4	+	285	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCCAATAAGTCGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
755652	contig_14362_pilon	+	997	4	Intergenic	novelGene_142516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	472	792	37414	37861	TRUE	20	CAGGTGTTGGCAAAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYQFGDAGMRRLNLGAQGKSHLGEGPGSQRWYGKGAIVLEPWFGRAWAQEPCFRALPGCSPGTALGLRWARSLGPPGRWSSGRRRSSCGASGGLQRTHTCPHQVL	36942	40093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_37728_37854_37964_39881_39947_40055
755654	SIRV6	+	355	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
755661	contig_9272_pilon	-	2451	15	Intergenic	novelGene_125950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_2	36.309398906889	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	26	1813	475970	453257	FALSE	15	TTTTCAAGTTTGTGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REVCEAAVMAAAGNGPGPGAGAGPGPTAAASAAAAEEGETKPVTAVAAAPTGEGTSAAPAAEPSSGEAESGDANLVDVSGGLETESSNGKDTLEGAGDTSEAMDTQAGSVDEENGRQLGEVELQCGICTKWFTADTFGIDTSSCLPFMTNYSFHCNVCHHSGNTYFLRKQANLKEMCLSALANLTWQSRTQDEHPKTMFSKDKDIIPFIDKYWECMTTRQRPGKMTWPNNIVKTMSKERDVFLVKEHPDPGSKDSEEDYPKFGLLDQDLSNIGPAYDNQKQSGAVSTSGNLNGGIAAGSSGKGRGAKRKQQDGGTTGTTKKARSDPLFSAQRLPPHGYPLEHPFNKDGYRYILAEPDPHAPDPEKLELDCWAGKPIPGDLYRACLYERVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDILGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP	475995	452618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_453365_453470_453531_455795_455889_458697_458892_459181_459350_462224_462443_463396_463491_465686_465763_466666_466763_467390_467487_470334_470430_470698_470788_474813_474960_475078_475146_475782
755663	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	57	513	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
755664	contig_3382_pilon	-	2142	10	Intergenic	novelGene_124201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.796118656971	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	622	1200	1393913	1382459	TRUE	40	GAAGGCACCTAATAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPIRIKQENSGPPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNTSYPRSILTSLLLNSSQGSASEEAAPRSDAPDSTGDQPGLHQESPSNGKSQWLDTAQKSPLHVGDTRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLANFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKSEGLGRLMPIDKV	1401368	1378887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1379613_1380458_1380609_1382391_1382467_1391050_1391179_1392175_1392505_1393799_1393972_1395002_1395077_1397716_1397853_1400313_1400488_1401189
755666	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755667	contig_7919_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_28067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTGTTTGCTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058239	1056844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1056800_1058200
755671	SIRV2	-	442	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	34	3256	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
755672	contig_5643_pilon	+	1081	6	Intergenic	novelGene_39140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	41.9075172254334	878	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	188	922	651693	656645	FALSE	5	CCTAGTTGTTCTTTGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSGGFQPRERRGGEQEQGWDVVAPKRPRLGAGSKIGGRRLIVVLEGASLETVKVGKTYELLNCDKHKSMLLKNGRDPGEVRPDIAHQSLLMLMDSPLNRAGLLQVYIHTQKNVLIEVNPQTRIPRTFDRFCGLMVQLLHKLSVRAADGPQKLLKVIKNPVSDHFPVGCMKIGTSFSTQVVSDVRELVPSSDPIVFVVGAFAHGKVNVEYTEKVVSISNYPLSAALTCAKLTTAFEEVWGVI	651505	656804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_651861_655130_655233_655340_655483_655851_655911_655994_656145_656531
755673	contig_5643_pilon	+	2135	10	Intergenic	novelGene_38726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	54.9453151262324	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	201	1457	95096	100762	FALSE	20	TAATTTATTTTTTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPEPSGGALEPRPGRSRPPGARQPRVRSPVPAPGLRKLPPPLPRASWPPTFLPGLPVWLIDQLAAMRLPWAASPRGLAWGPLLLGLCGLLAAFQPQLVPPYHSENQTCQDQEKEFYQPNHRICCSGCPPGTFVTTQCSRTQDTACSPCAKNSYNEHWNYLTKCQLCRPCDAVMGFEEIVPCTRIQETQCRCQPGMFCAHRDSECTHCEPLSNCPPGTEAELKGEDRETDNNCVPCKAGHFQSTSSPSARCQPHTRCEDQGLVEAAPGTAQNDTSCRNPSKPLPGTMLVLAVLLPLVSLLLLTTVLACTWKSHPSLCRKLGFLLKRHPEGGDTNADASWEPQRTNPHFPDLVEPLLPNSGDLPPASARHPTTPGLEEEVLQQRSPPGQARELEAELGEQGPVAHGTNGIHVTGGSMTVTGNIYIYNGPVLGGARGPGDPPVPPEPPYPIPEEGAPGLPGLSTPHQEDGKAWHLAETETLGCHAL	94895	101440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_95192_95328_95426_95745_95872_95950_96104_96461_96559_96755_96842_98874_98983_99300_99327_99931_100158_100520
755679	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
755682	contig_9011_pilon	+	2525	1	Intergenic	novelGene_159293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAGAAACAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358158	360683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_358200_360700
755683	contig_11370_pilon	+	1236	7	Intergenic	novelGene_98756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	54.3108337872534	137	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	40	888	153583	155515	FALSE	5	CCCCTGCTCCACTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAASPGASVMDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLVRKEGHEPVLVGRMPGGGL	153543	155863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153678_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403
755684	contig_3004_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_127533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAATCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506476	504112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_504100_506500
755688	contig_4228_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_151171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAGAAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448606	449663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_448600_449700
755691	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
755694	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-10	408	3	-238	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGACGCTTCCACACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
755697	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4598	34	3423	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
755698	contig_8286_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_139807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTGGTTGTTTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196232	196581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_196200_196600
755699	contig_366_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_51569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	101	499	748848	749246	NA	35	GGCCTCAAAAATGCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSAARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSHTHIKTRFYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPIKPNGTNEVQQSRDKGQKAEGDKEAGDREPKVEEGYC	748747	749724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_748700_749700
755700	contig_5649_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_82369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.0984880832233	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACAATATAATCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064345	1055344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
755701	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
755704	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755705	contig_15327_pilon	-	501	3	Intergenic	novelGene_70709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	79	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	34	432	946524	945045	FALSE	10	GCAGCCCACCTGCCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFVQLTLEPRHMFPELAPRETQKHKKDLHPLFDETFEFLVPTEPCQEDGACLLLTVLDHDTLGANDLEGEAFLPLCSVPGFPGDEEPSELPQTRLPLTYPTPSGDPILQLLESRKGDREAQAFVKMRQQRAKQAAQHTPRPGC	946557	944975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_945167_945836_946034_946444
755708	scaffold_16539_pilon	+	2051	7	Intergenic	novelGene_68413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	85.1058164874763	9	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	234	485	913956	914300	TRUE	0	GTCTGCTGCTGGTTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRGRGGFGDRGGFGGDRGGRGGRGGFGGGRGRGGGFRGRGRGGGGGGRGGGGGFQSGGNRGRGRGGKRGNQSGKNVMVEPHRHEGVFICRGKEDALVTKNLVPGESVYGEKRVSISVRPGPLFELPGPQLMVQPAVWSPCFRTTPLEPRVSHLTARQCS	913616	918859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_913770_913875_913981_914073_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
755709	contig_12948_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_126199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAATTTTAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233245	231931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_231900_233200
755712	contig_5092_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_62263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGTGTCTGACGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228765	227181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_227200_228800
755714	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_96564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
755715	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	2	14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755716	contig_5033_pilon	-	943	6	Intergenic	novelGene_29100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	80.491987178849	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	62	586	859134	789799	TRUE	15	CTGTGTTTTTCTTATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGVDGSIFQKPKKLHLTIGMLVLLSEQEIQQTCEMLQQCKQEFIDDICGGQPLEAEMAGIEYMNDDPGMVDVLYAKVHMKDGSNRLQELVDRVLERFQSSGLIVKEWNSVKLHATVMNTLFRKDPNAEGRYNLYTPDGKYIFKERESFDGRNILKLFENFYFGALKLNSIHISQRFTVDSFGNYASCGQIDFS	859195	788658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_788974_789756_789916_812829_812916_825673_825799_846033_846154_859057
755717	contig_2646_pilon	-	2232	19	Intergenic	novelGene_69640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	335.180755546748	1	89	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	56	1876	2078053	2070812	TRUE	5	GTGCTCGTCTCTTTCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEQELSEEDKQLQDELEMLVERLGEKDTSLYRPALEELRRQIRSSTTSMTSVPKPLKFLRPHYGKLKEIYENMDPGENKRFAADIISVLAMTMSGERECLKYRLVGSQEELASWGHEYVRHLAGEVAKEWQELDEAEKAQREPLLTLVKEIVPYNMAHNAEHEACDLLMEIEQVDMLEKDIDENAYAKVCLYLTSCVNYVPEPENSALLRCALGVFRKFGRFPEALRLALMLNDMELVEDIFTSCKDVVFLELSEDVDEYEDLTEIMSNVQLNSNFLALARELDIMEPKVPDDIYKTHLENNRFGGSGSQVDSARMNLASSFVNGFVNAAFGQDKLLTDDGNKWLYKNKDHGMLSAAASLGMILLWDVDGGLTQIDKYLYSSEDYIKSGALLACGIVNSGVRNECDPALALLSDYVLHNSNTMRLGSIFGLGLAYAGSNREDVLTLLLPVMGDSKSNMEVAGVTALACGMIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQWLCWASPLSPWGRRLVQRWRCEPLATC	2078550	2070170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071127_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890_2072054_2073170_2073259_2073435_2073564_2073761_2073869_2074038_2074186_2074614_2074676_2074853_2074957_2075143_2075303_2075590_2075816_2075986_2076109_2077145_2077311_2078032_2078090_2078531
755718	contig_5019_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_109227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATGGTCTGACTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343802	341557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_341600_343800
755719	contig_3233_pilon	+	1448	9	Intergenic	novelGene_56572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	329.999242423373	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1004	1318	746379	747909	FALSE	15	CTCCCCAATGGGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738741	748039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_742724_742836_743705_743819_745289_745812_746340_746424_746936_747016_747718
755720	SIRV6	+	501	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755723	contig_7297_pilon	+	1868	3	Intergenic	novelGene_169690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	8.5	175	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	23	610	5144	6686	FALSE	15	TATCTTGATGTTTTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGERLVMAGCRRLELAEALALGPGWRHACHALLYAPDKGLLFGRIPLRYVVLMQMRFDGRLGFPGGFVDAQDGSLEDGLNRELREELSEAAAALRVERTDYRSSHAASGQHVVAHFYAKRLTPEQLAAVEAGAPSAKDHGLEVLGLVRVPLYTLRDGVGGLPAFLENSFIGAAREQLLEALQDLGLLESRSLQGLKISARH	5121	7944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_+_5282_5388_5659_6506
755724	contig_14727_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_56644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGGGGTTGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262503	260456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_260500_262500
755725	contig_2414_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_158519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGTAAGTTGAGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811995	868644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_812264_868029_868201_868588
755726	contig_16122_pilon	-	3526	13	Intergenic	novelGene_134546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_12	4.31727794899621	97	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	229	1809	258844	250239	FALSE	45	GAAAATATAGACTATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSNFALLTEARRTLGLFQHHDAITGTAKEAVVVDYGVRLLRSLVSLKQVIINAAHYLVLGDKETYHFDPAAPFLQMDDTRLNHDALPERTVLQLDSSPRYVVLFNALDQERLSVVSLLVNSPWVRVLSEEGQPLAVQISAHWSSATDMAPDVFQVSVPVRLPALGLGVLQLQQGLDGHRTLPSSVRIYLHGRQLSVSKHEVFPVRVIDSGTTDFTLSNRYMQVWFSGLTGLLKSIRRVDEEQEQRVDVEFLVYGTRTSKDKSGAYLFLPDGEAKPYVPKDPPVLRVTEGPFFSEVVAYYEHIHQVVRLYNLPGVEGLSLDMSSLVDIRDYINKELALRLHTDIDSQGTFFTDLNGFQVQPRRYLKKLPLQANFYPMPVMAYIQDMKNRLTLHTAQALGVSSLGNGQLEVILDRRLMQDDNRGLGQGLKDNKRTCNRFRLLLERRTVGSEVQDGRSTSYPSLLSHLTSMYLNTPALALPVAKRQLPGPGLRSFHPLASSLPCDFHLLNLRTLQAEDDALPSAETALLLHRKGFDCGLEAKNLGFNCTTSQGKVALGSLFHGLDVGFLQPTSLTLLYPLASPSNSTDIYLEPMEIATFRVRLG	259270	248521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_250392_251020_251132_251276_251472_253666_253801_255487_255630_255837_255972_256257_256373_257142_257266_257540_257778_258262_258429_258544_258613_258841_258957_259154
755728	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755729	SIRV6	+	533	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	26	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755733	contig_6215_pilon	+	1374	7	Intergenic	novelGene_21235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336.958289538763	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	254	898	582949	599783	FALSE	30	TACCTGTTAGTAGAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPSGGLVPPPRLRDAPGACRHVTDLHLDPTYHITDDHTKVCASSKGANASNPGPFGDVLCDSPYQLILSAFDFIKNSGQETSFMIWTGDSPPHVPVQELSTDMVINVIANMTTTVQSLFPNLQVFPALGNHDYWPQDQLPVVTSKVYNAVANLWKPWLNEEAISTLRKGGFYSQKVTTNSSLRIISLNTNLYYSSNIVTLNKTDPANQFEWLENTLNNSWQNKEKVYLIAHIPVGYLPFSRNTTAMREYYNEKLIDIFRKYSDVIAGQFYGHTHRDSIMVLSDKKGYVAVLPEPDRS	571357	600259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571420_582757_582963_584025_584171_588153_588251_590620_590791_591255_591437_599745
755734	contig_3410_pilon	-	2224	13	Intergenic	novelGene_58950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	19.589360774552	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	18	1049	267758	257666	TRUE	15	CAGAGTGGGAGCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKFEMGHVRVRNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRRLKGIRDEALPTVLVGIFIEQPTPFLLLFFQRLLRLHYPWKQMRLFIHNHEQHHKAQVEQFLAEHGSKYQSVKLVGPEIRMASADARNMGTDLCRQDQSCTYYFSIDADVALTEPDTLRLLIEQNKNVIAPLTTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRIGVWNVPYISNIYLIKGSALRADLQQKDLFHYSKLDPDMSFCANIREQDVFMFLTNRHTFGHLLSLDSYQTTHLHNDLWEVFSNPEDWKEKYIHENYTKAYLHGGSLQRASGGDGTLRPVVSR	267775	253713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_254609_255350_255477_256317_256465_257658_257738_258404_258447_259093_259208_260225_260368_260658_260785_261235_261341_262897_263020_265758_265891_266463_266566_267683
755735	contig_8597_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_158724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAACCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131547	133620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_131500_133600
755737	contig_16098_pilon	+	1780	9	Intergenic	novelGene_46055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	105.927377835005	275	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	11	1144	421411	427166	TRUE	15	ACGTGGACGACCCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAATEGGGEPRGADGVCLGVPGEVEIVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAPTLEAMRDVYIVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHVCYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILSILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDPKALELLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFDMELDDLPKERLKALIFQETARFQPGVLEAS	421400	428690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_421575_422655_422839_424803_424994_425638_425756_426045_426161_426543_426676_426843_426954_427043_427199_428086
755738	contig_7457_pilon	+	1571	14	Intergenic	novelGene_31579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	187.079801344255	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	99	1568	927933	954165	FALSE	35	GAATAAAATGTTTTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGRGAAELLDAPAGSALHRPPPTRLSGPGGKMAAASECDVVMAATEPELLDDEEAKREAESFKEQGNAYYAKKDYNEAYNYYTKAIDMCPKNASYYGNRAATLMMLGRFREALGDAQQSVRLDDSFVRGHLREGKCHLFLGNAMAACRSFQRALELDHKNTQAQQEFKNANAVIEYEKIAETDFEKRDFRKVVFCMDRALEFAPACHRFKILKAECLAMLGRYPEAQSVASDILRMDSTNADALYVRGLCLYYEDCIEKAVQFFVQALRMAPDHDKACVACRNAKALKAKKEDGNKAFKEGNYKLAYELYTEALGIDPNNIKTNAKLYCNRGTVNSKLRKLDDAIEDCTNAVKLDDTYIKAYLRRAQCYMDTEQYEEAVRDYEKVYQTEKTKEHKQLLKNAQLELKKSKRKDYYKILGVDKNASEDEIKKAYRKRALMHHPDRHSGASAEVQKEEEKKFKEVGEAFTILSDPKKKTRYDSGQDLDEEGMNMGDFDANNIFKEAACEFLLYCLTLLRKKKK	927834	954168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_928010_939267_939357_940399_940525_941145_941260_941795_941871_945670_945790_946687_946842_947373_947539_948394_948487_951589_951664_952018_952166_952384_952538_953360_953386_954104
755740	SIRV6	+	345	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1662	0	-237	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2786	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755741	contig_16113_pilon	-	1875	2	Intergenic	novelGene_140541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	51	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAGAAAGAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30084	4689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_6508_30027
755742	SIRV6	+	349	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
755743	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
755745	contig_6710_pilon	-	502	2	Intergenic	novelGene_98047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	10	CTTCTCCTCTTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
755749	contig_19908_pilon	+	2587	24	Intergenic	novelGene_167611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	100.673948250442	135	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	118	2499	11642	57628	FALSE	15	CATATTTTTATTGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEGGGRGSGSCRAWPSGSGGGLIPVSAPWQLALFPQLTMKRRIDPECTAPIKKQKKRVAELALNLSSTSDPPHEPPSSINHSAKASATSLSGSDSETEGKQHSSDSFNDAFKADSLVEGTSSRYSMYNSVSQKLMAKMGFREGEGLGKFSQGRKDIVEASNQKGRRGLGLTLRGFDQELNVDWRDEPEPSACEQVSWFPECTTEIPDTQELSDWMVVGKRKMIIEDETEFCGEELLHSVLQCKSVFDVLDGEEMRRARTRANPYEMIRGVFFLNRAAMKMANMDFVFDYMFTNPRDSCGKPLVKDREAELLYFADVCAGPGGFSEYVLWRKKWHAKGFGMTLKGPNDFKLEDFYSASSELFEPYYGEGGIDGDGDITRPENITAFRNFVLDNTDRKGVHFLMADGGFSVEGQENLQEILSKQLLLCQFLMALSVVRTGGHFICKTFDLFTPFSVGLIYLLYCCFERVCLFKPITSRPANSERYVVCKGLKVGIDDVRDYLFSVNIKLNQLRNTDSDVNLVVPLEVIKGDHEFTDYMIRSNESHCGVQIKALAKIHAFVQDTTLSEPRQAEIRKECLRLWGIPDQARVAPSSSDPKSKFFELIQGTEIDIFSYKPTLLTSKTLEKIRPVFDYRCMVSGSEQKFLIGLGKSQIYTWDGRQSDRWVKLDLKTELPRDTLLSVEIVHELKGEGKAQRKISAIHILDVLVLNGSDVREQHFNQRIQLAEKFVKAVSKPSRPDMNPIRVKEVYRLEEMEKIFVRLEMKIIKGSGGTPKLSYTGRDDRHFVPTGLYIVRTVNEPWTMAFSKSFKRKFFYNKRTKTSTYVLPTDSIAPP	9381	57716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_+_9494_11636_11781_19380_19533_21049_21209_23730_23824_25176_25249_26918_27014_27131_27205_31720_31920_32929_33049_40291_40389_40664_40798_41533_41714_47460_47518_48258_48317_48762_48832_49792_49925_50929_51053_51740_51833_52543_52613_53508_53557_54527_54641_55249_55347_57615
755752	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755753	contig_4429_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_50802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	169381	169085	NA	20	GCTCATGCATTCTGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHLQVYTPTPLGLRCSWEGAGNLTTHLAPPRWRLQAQFSSLWDVIKLAHISSKHPLQCLFLSSPFPPHSHFELQGFRPHRRWELRTGGRWLGTAWVCA	169381	167511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_167500_169400
755756	contig_2054_pilon	-	2208	4	Intergenic	novelGene_51689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_2	43.7340447096615	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	321	746	150933	130935	FALSE	70	AGGAAAAAAGAAAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKER	203936	129472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_131141_132268_132354_150798_150952_203634
755757	contig_14618_pilon	+	2755	1	Intergenic	novelGene_136849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATACATGGCTTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248522	1251277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1248500_1251300
755760	contig_8823_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_53069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68104	66723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_66700_68100
755766	contig_12622_pilon	-	702	5	Intergenic	novelGene_6023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	614.791580537665	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	116	328	1686921	1685486	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFLNKKPY	1687840	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685507_1685904_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765
755769	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755772	contig_6375_pilon	+	1505	10	Intergenic	novelGene_72950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	68.7329776906415	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	366	1280	197712	201553	FALSE	20	ACTGCTTCTGGTACTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVDLGLPWWGAIAASTVLARCLVFPLIIKGQKEAAKIHNHLPEIQKFSTRIREAKLAGDQAEFYRACSEMTLYQKKHDVKLFRPLILPLTQAPIFLSFFIALREMANLPVPSLQTGGLWWFQDLTVSDPTYVLPLVVTATMWAVLELGAETGVQSSDLQWMRNVIRVMPLAVLPITIHFPSAVFMYWLSSNMFSLGQVACLRIPAVRTVLKIPQRVVHDPDKLAPREGFVKSFKRGWRNAEIAHQMQERERRMQNHLQLAARGPLRQTFAHNPLLQPGKNHPSTTPDSSSKPKSKQPWQDTLG	196322	201778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_196392_196745_196929_197598_197758_199548_199693_200148_200235_200431_200597_200802_200908_201018_201182_201262_201344_201428
755773	contig_8268_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_147002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGAATTTACAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141682	140379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_140400_141700
755774	contig_10554_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_166964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	93	323	59953	60183	NA	25	ACCAACCTGTAGGCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVWQRRRSLAPLLGVWNFFPGNPRSLQNDNMVCSQEPNSRARSGPCKGGWESWPHIVCKPSNLTLVQLPLALARSWQRVCQHCYCWCRMFSQASVLRDQLGIIDND	59860	62205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_+_59900_62200
755775	contig_7165_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_116832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTCATGTCTTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252275	252884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_252300_252900
755776	contig_8330_pilon	-	2211	6	Intergenic	novelGene_71954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	21.8595516879921	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	48	731	1485391	1476697	FALSE	65	AGTAAAATAATTTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELSQALASSFSVSQDLNSTAAPHPRLSQYKSKYSSLEQSERRRRLLELQKTKRLDYVNHARRLAEDDWTGMESDEDEDKKDDEEMDIDIGKKLPKRYANQLMLSEWLIDVPSDLGQEWIVVVCPVGKRALIVASRGSTSAYTKSGYCVNRFSSLLPGGNRRNSTTAKDYTILDCIYSEVNQTYYVLDVMCWRGHPFYDCQVRMGTPLLSFPVSSVLLGKWLSMWV	1487630	1475216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1476873_1478202_1478300_1478588_1478694_1482962_1483111_1485233_1485397_1487588
755777	SIRV6	+	529	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1783_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755780	contig_1154_pilon	-	2711	12	Intergenic	novelGene_87205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1359	1658	1175794	1169359	TRUE	10	CGAAGCTCTCTGCGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHRARGEESGDLLLAPGTGAQLHPVLSSHLLKVWLHEAHTNTVSLWASGAVAPMEDLGTLKEQHREQKLFPQLLQLRFFFSTEKVAEQPVQFPKLLVG	1177152	1151295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1151356_1152994_1153184_1156376_1156449_1158090_1158279_1163577_1163674_1165445_1165557_1166583_1166722_1167539_1167612_1169231_1169378_1173543_1173590_1173962_1174044_1175640
755785	contig_821_pilon	+	2865	1	Intergenic	novelGene_149401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2306	2656	194114	194464	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSAASSCLPYNEKVRKSIPRASEKQKGVVLYRGEEDFSLLEESYFVFEPEGNAMRGSWSPCGPTRLCHSKEPSPGMWNVSHWHMSRRTQRTALELPSMREAWAQFLASAAHEVPD	191808	194673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_191800_194700
755786	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
755787	contig_12654_pilon	-	1162	9	Intergenic	novelGene_129327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	191.510402785332	18	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	457	1098	823900	808478	FALSE	15	CTTTTACAGAGTCCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISCSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827357	808413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809830_810625_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_824115_827115
755790	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	524	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755793	contig_4350_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_136373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGACGTTCAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77873	79909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_77900_79900
755798	contig_8740_pilon	+	2300	10	Intergenic	novelGene_167607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	44.4833163343153	70	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	62	1087	23197	52118	TRUE	10	CCCTGGTGGCGCAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARPVSRMLRRVLRTSTWSCSSEAPVTQPRPGKSTQPAPTELSRRRQFLREHAAPFSAFLTDSFGRQHSYLRISLTEKCNLRCQYCMPEEGVPLTPKADLLTTEEVLALARLFVKEGVDKIRLTGGEPLIRPDVVDIVAKLHQLEGLRTIGITTNGISLARLLPQLQKAGLNAINISLDTLVPAKFEFIVRRRGFHKVMEGIHKAIELGYNPVKVNCVVMRGLNEDELLDFVALTEGLPLDATSGTSRRWSATRRCWTRCGSGGLSWRSCRRRNPAQPRPLRSLASEARSASSRPCLSISVGPATGCESQLMGISRSAFLGTQRYLYGITCEWGPPKKSC	23135	62947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_23320_31363_31491_33098_33267_47562_47728_48334_48397_48746_48828_49271_49385_49899_50011_52042_52164_61779
755799	SIRV6	+	423	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	105	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATAGTAGATTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10976
755803	contig_2114_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_104266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTCTTTATTTGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513592	511477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_511500_513600
755806	contig_7933_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_164678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189509	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186147_189402
755811	contig_9839_pilon	+	2678	1	Intergenic	novelGene_88601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAAACATGTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563230	565908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_563200_565900
755817	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755823	SIRV5	+	339	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-12	878	-12	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8303	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
755824	contig_1213_pilon	-	1077	11	Intergenic	novelGene_76477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	205.892714781267	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	204	1076	93032	73728	FALSE	50	GAAATGAAAATCGAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTQLSQDQLEAEEKARSQRSRQTSLVSSRREPPPYGYRKGWIPRLLEDFGDGGAFPEIHVAQYPLDMGRKKKMSNALAIQVDAEGKIKYDAIARQGQSKDKVIYSKYTDLVPKEVMNADDPDLQRPDEEAIKEITEKTRVALEKSVSQKVAAAMPVRAADKLAPAQYIRYRVIRMVEMQKDPMEPPRFKINKKIPRGPPSPPAPVMHSPSRKMTVKEQQEWKIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQTVHINENFAKLAEALYIADRKAREAVEMRAQVERKMAQKEKEKHEEKLREMAQKARERRAGIKTHVEKEDGEARERDEIRHDRRKERQHDRNLSRAAPDKRSKLQ	96767	73726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_73741_75371_75469_77894_78037_81099_81217_82677_82744_83399_83470_84280_84337_85229_85341_85432_85529_92927_93090_96621
755827	contig_11285_pilon	+	934	6	Intergenic	novelGene_5596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	557.916481204848	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	35	496	766060	769760	FALSE	10	GTCTCTTGACTTGGCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCSDYPGHLLYR	763523	770198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767136_769726
755828	contig_7057_pilon	+	2166	3	Intergenic	novelGene_123399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	150	548	1278454	1279189	TRUE	15	ATTTGGAGTTTGTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSLQPEAYLIKHHNIHTGEKPYECNKCGKAFSRITSLIVHVRIHTGDKPYECKICGKAFCQSSSLTVHMRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHMRIHTGEKPYQCNECGKAFSQKSHHIRHQRIHTH	1278304	1280870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1278481_1278817_1280078_1280140
755829	SIRV2	-	619	2	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	2963	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATTGTGAAGATTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769	1076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1662_1735
755831	contig_13740_pilon	-	1450	11	Intergenic	novelGene_34693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3498.25615986022	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	251	631	161951	160666	TRUE	40	CTAAAGGAAATTGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGENLQTVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165408	156809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157067_157139_157296_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161723_161922_162031_165237
755835	contig_6710_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_89146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGACTGTAGGTACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
755838	contig_12270_pilon	+	294	2	Intergenic	novelGene_113577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGAACAGAGTCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13850	14384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14124_14363
755839	contig_8587_pilon	-	1780	6	Intergenic	novelGene_159125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.6715148309965	71	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	90	968	325655	307667	FALSE	10	TCCACTGGACTTTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRSPGLFLLLLSGLQADIQKKEEVQGIVGSSVELNCVYPEGSSFDLNDFYIYWQTAMPETVVTYYLPGNTSPRYKDNRYQHRAQLSLDSMEQGNFSLRLYNITPQDEQTFHCLVFQKSLELKKVLQVNVTLHVAANYSIPVVSNPIGPSEDEELTFMCKSTNGYPRPNVYWINQTDNSLLDEALQNSTVSVNEHGLYDVVSTLRVRRAPNVNVKCCIENVLLHQNLTVSSQTEPSSGTKDKITDKPARPQEKNITVFIVFGILCVLVAVAVAAGWFYRNRRSSGSYIGHV	325744	306854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_307678_310615_310781_318223_318518_319635_319990_323141_323183_325641
755842	contig_3426_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_57965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	488	904	445191	444775	NA	30	AGGAGCACCATCACTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSVASYACESWTMNKEDQRRIDASELWCWRTILNIPWTAKRMNKSVLEEVQPECFLEVRVVTLCLTCFRHVIRRDQSLEKGIMLGNVEGQQKRRPSTRWIDTVAATVSSSITRIMRMAQDWAVFHSVMHRVTMSRN	445678	443740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_443700_445700
755845	contig_4125_pilon	+	2182	3	Intergenic	novelGene_25257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1696	2049	3012260	3012613	FALSE	20	TGAAACGGTGTATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANKWTGARPHSSSGKCKSEVHKIPRSIHQNGTNGEDWQYQVLVRMWSSFHMLLGGCQLGSNHCGTQSFSKAEHSHSNSTLGYMPQSAFMCAPEDTHESACSNTTHRSPPLETTRIP	3009086	3012746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_3009175_3010427_3010497_3010721
755852	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1678	3	-221	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2802	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755853	contig_9955_pilon	+	1789	2	Intergenic	novelGene_21335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	934	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	677	1009	77765	78097	TRUE	40	TAAAGTGCTCTAAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHVTFLLKTLQWLLMSLLMSENQSSPYDLPGSIGSSPTTHPPHYLLFSPLPMWLFLCYTRHASTAWLLHLLFPLLESPSPQIAAQLLPSLPSHAYSCYLLRRSSWPPR	77088	84941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_78512_84575
755855	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755859	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	53	503	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
755860	SIRV6	+	231	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	8484	1	255	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTTCGGTCTTACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
755861	SIRV6	+	348	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
755862	contig_10235_pilon	+	636	3	Intergenic	novelGene_46358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTCCTGGGGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130275	131731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_130459_130749_130897_131425
755865	SIRV6	+	306	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	8131	1	608	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
755867	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
755872	contig_15442_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_119147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCCAAGAATTGAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260913	260019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_-_260000_260900
755874	SIRV1	-	181	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	1	3648	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
755876	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
755877	contig_12638_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_33195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271975	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_272000_274500
755878	contig_6439_pilon	+	2341	1	Intergenic	novelGene_154256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAATATAACTAAGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404276	406617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_404300_406600
755882	contig_2703_pilon	+	1327	13	Intergenic	novelGene_101713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	877.643134891524	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	288	1199	559489	610870	FALSE	45	AAATCTGATTAGAACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526179	610998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578769_599692_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
755883	contig_9797_pilon	-	1623	4	Intergenic	novelGene_65595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	719	1036	191434	189402	TRUE	35	TGGGAAGAGCAAGATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSCCCSSV	192152	183679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_183987_188577_188734_189277_189421_191135
755884	contig_3270_pilon	-	2267	14	Intergenic	novelGene_104450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	84.9719758884689	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	217	2259	68067	48840	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAGTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAETFGGIIYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMVCYEEKEVLVKTSWDPGF	78132	48831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68088_70709_70822_78048
755887	contig_13760_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_61276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	47	361	87031	86717	NA	45	ACGTATAATTAAAAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNRQQVITHCLESQFMKYRGAGVKAPIQNQELGARLVWALGRKERRHFHKPQCIAPAPPTLLVRQGNRKRALRHNPTKMAPNLWLNKNDNENHTRIQCFYFIRSVLWSRQETVARVQSE	87077	85869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_85900_87100
755888	contig_13760_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_61275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGCTCCATACCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85760	85455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_85500_85800
755889	contig_11126_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_138112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACCCCACCCCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139905	140892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_139900_140900
755894	contig_7963_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_58408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAAAAAGTCATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55845	54894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_54900_55800
755896	contig_5375_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_169198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACCCACAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18915	20114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_18900_20100
755901	contig_11396_pilon	-	1404	10	Intergenic	novelGene_71409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_3	76.8418288867897	545	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	59	1282	1648829	1644244	FALSE	10	ACCCGCTCACTCTGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGSVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGTLGASGSGSHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649975	1644121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1644896_1645138_1645372_1645524_1645607_1646269_1646357_1646708_1646833_1647806_1647924_1648616_1648831_1649918
755904	contig_6445_pilon	-	2295	8	Intergenic	novelGene_77120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	4.91976438792073	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	422	844	1424169	1420488	FALSE	15	GGCGGCTTGAGCACATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSHSQFMWFFSVYSFLFLYLRMHQTNNARFLDLLWRHVLSLSLLTSAFLVSYSRVYLLYHTWSQVLYGGIAGSLMAIAWFVFTQEVLTPLFPRIAAWPVSEFFLIRDTSLIPNVLWFEYTVTRAEARNRQRKLGTKLQ	1429475	1419036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1420525_1422466_1422557_1423086_1423216_1423770_1423870_1424101_1424202_1424299_1424385_1424642_1424744_1429272
755909	contig_14157_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_171782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACCCTGTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285926	288481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_+_285900_288500
755911	contig_567_pilon	+	1699	3	Intergenic	novelGene_33970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_2	16.5	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	72	707	338793	370756	FALSE	30	TTACCCAGTTTAACTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLFSTPKLVSAVASARSLSGCMSRSQRKYSLQPILERKIPNRYLGQPSPLTHPHLLRPGEVTPGLSQVEYALRRHKLMSLIQKEAQGQRGTDQTVVLLSNPTYYMSNDIPYTFHQDNNFLYLCGFQEPNSILVLQSLPGKQLPSHKAMLFVPRRDPSRELWDGPRSGTDGAVALTGVDEAYPLEEFQHLVPKLRGNKWEQKSSHRPDWG	338721	371748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338857_358266_358384_370301
755912	contig_12977_pilon	+	1985	3	Intergenic	novelGene_122804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	244	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1511	1816	56968	58627	FALSE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVPRWRQPQLLPPPERPRPPPPEKSDAVYAAIAVQDGLRTPTAPAQDYRALYDYTAQNHDELDISAGDILQVVLEGEDGWWTVERNGQRGFVPGSYLEKL	55457	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_57007_57242_57378_58495
755914	contig_5286_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_157355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	517	825	539932	539624	NA	40	ATGGTGGTTAGAATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYKCSPSLFMQSMISSIVNSTYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKTKDMMGKQKTLAAVATYHYLSFGGLSKSHLKPGLLIAPLEINLECFFGGVGVGMSIMR	540448	538135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_538100_540400
755916	SIRV2	-	239	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	687	22	687	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4045	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
755918	contig_5145_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_131451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTGGACACAACATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928296	928708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_928300_928700
755922	contig_7457_pilon	+	2449	13	Intergenic	novelGene_31558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	33.4697209761632	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1246	1977	853354	858158	FALSE	20	TGGCATTAATCCCTTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLKEYHIKHNILYFLTYADEYAIGYFKKQGFSKDIKVPKSRYLGYIKDYEGATLMECELNPRIPYTELSHIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKEGVRQIPVESVPGIRETGWKPLGKEKGKELKDPDQLYTTLKNLLAQIKSHPSAWPFMEPVKKSEAPDYYEVIRFPIDLKTMTERLRSRYYVTRKLFVADLQRVIANCREYNPPDSEYCRCASALEKFFYFKLKEGGLIDK	850122	858630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_850261_851166_851274_851461_851573_851661_851799_851894_852104_852312_852440_852937_853447_853897_854042_854365_854481_854586_854624_854702_854767_854900_854986_857964
755924	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755927	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_98223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
755930	SIRV6	+	441	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	42	2	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGCGGTCGTTGAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
755934	contig_6838_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_171793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTATATTTCATGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118656	117952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_-_118000_118700
755935	contig_4103_pilon	-	2270	3	Intergenic	novelGene_51945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	3	53	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGCCAGAATAAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98003	94701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360_95529_96288
755937	contig_9345_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_24531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCCAAGCCCCATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706415	705387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_705400_706400
755938	contig_7887_pilon	+	1981	11	Intergenic	novelGene_124895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	95.4038259190898	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	291	1919	336888	341054	FALSE	15	CCCGTGCTGTCTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGQTSRGRNESEEEEGPKHLSRIDTMAASLTVLLLLQAVSWASGARPCIPQSFGYSSVVCVCNATYCDSLDPLTLPALGNFSLYESTRSGRRMELSTGTVQTSRTGTGLLLTLQPEQKFQKVKGFGGAMTDAAALNILALSPAVQNLLLKSYFSEEGIEYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADITNDFQLHNFSLPEEDTKLKIPLIHRALEMTQRPISLFASPWTSPTWLKTNEAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLRFWAVTAENEPTAGLLSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPILANSTHRDVHLLILDDQRLLLPGWAQVVLADPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPAKATLGETHRLFPTTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGTQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDSPIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASAKNDLDTVALVRPDGSAVVVVLNRSSKDAPLTIADPAVGFLETMVPGYSIHTYLWRRQ	336597	341116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_336933_337150_337239_337503_337696_337808_337956_338262_338397_338619_338793_339030_339269_339579_339805_340204_340369_340720_340838_340948
755941	contig_18869_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_56054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACATCCTAAGCAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
755942	contig_8597_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_158710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTCTGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78937	80182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_78900_80200
755945	contig_12292_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_167022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGACTTAGGAACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436213	437695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_436200_437700
755946	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
755947	scaffold_6394_pilon	+	828	6	Intergenic	novelGene_111013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1229.37050558406	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	360	674	405365	406119	FALSE	10	CCTGTACTGTGTTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	398223	406273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402872_402953_405302_405501_405717_405864_406086
755953	contig_15361_pilon	-	3078	1	Intergenic	novelGene_167879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	135	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTCAGTATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510666	507588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_507600_510700
755954	contig_16775_pilon	+	2156	15	Intergenic	novelGene_107773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	269.78653693282	1	123	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	357	1046	144011	165213	TRUE	45	AATAATAGTACATTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGDFRKKSPNSLQHCREMLCTSNLPRSAGCLLT	130379	174734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134226_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160223_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
755961	contig_4103_pilon	-	1518	4	Intergenic	novelGene_52030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	81.7978538159094	293	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATAGGTCTCACATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619606	542281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_543381_577146_577338_585000_585078_619455
755962	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
755967	SIRV6	+	372	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	409	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_2777_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755969	contig_8594_pilon	-	2067	8	Intergenic	novelGene_140053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	250.746721548552	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	449	1270	496028	461703	FALSE	45	ACATTGATGTCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	525432	460905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_495973_496086_509555_509750_525235
755971	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
755973	contig_13464_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_125255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTGGATTTCCCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594033	592549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_592500_594000
755974	contig_13464_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_125254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGCAATATATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592193	591010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_591000_592200
755975	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
755978	contig_9785_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_157891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACTTGCTCAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200511	201616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_200500_201600
755980	contig_8616_pilon	+	1760	4	Intergenic	novelGene_72469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_3	135.016871373749	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	374	736	320431	322588	FALSE	25	TGAATCTTCTGGCAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYR	318035	323612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318107_318278_318439_320288_320473_322267
755983	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
755984	contig_14441_pilon	+	982	5	Intergenic	novelGene_100552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.738747058205	10	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	390	797	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113163_113209_116578_116957_117220_117329_117539
755989	contig_6710_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_97214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
755997	contig_10711_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_118454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTTCTTTCCTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860818	861456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_860800_861500
755998	contig_10711_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_118458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCCTCAAAAAGTTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868014	869863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_868000_869900
755999	contig_17194_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_155356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	58.1475613322596	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	278	1111	190975	272479	FALSE	80	AGAAAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCESPDADDYFEHSPLSEDRFSKLNEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLTSSSTLADSSMLSPPQATLHRNVSPGAPQRPPSTGNAGGMLNTSDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLIGTTGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLVN	75833	273111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_190807_190996_232839_233044_256239_256372_259309_259530_260448_260509_272282
756000	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	2	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	273	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756007	contig_12278_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_152599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGAGTGTATCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201659	203732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_201700_203700
756016	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_94520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756019	contig_7935_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_171794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCCTAGACTCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876	1405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_+_900_1400
756020	contig_7935_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_171795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1020	1433	4091	4504	NA	20	GTCCTGATGTACCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISFRNRGVRHAMSPASHRTEIFQVASRGIITKVTSKSEAAKWAKCRRTGEGQIWLGCGHVTDHCTARFPQAEETNSTMVTPTRTLVAAEKVGSSNPSTSTLDPAQASSPAADSQGMPLPADMVAWKRKCRDEMWM	3071	5026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_+_3100_5000
756023	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756025	contig_5050_pilon	+	2167	2	Intergenic	novelGene_110261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299065	316712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_299213_314692
756027	contig_1244_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_37951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACATGATCATCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859572	861937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_859600_861900
756028	contig_10453_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_162046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTGAACTAAGCACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230932	232693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_+_230900_232700
756030	contig_7057_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_123373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTTTCCTTATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119062	1121747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1119100_1121700
756033	contig_6710_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_97908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
756040	contig_12638_pilon	-	1222	12	Intergenic	novelGene_33205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	263.535058906263	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	76	315	333499	327136	TRUE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVSGSGPEAAGCGAGRLASLFRLVPMEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDSSGKLR	333574	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_333035_333096_333202_333274_333411
756041	contig_17212_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_88621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAATTTCGTATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143261	141354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_141400_143300
756050	contig_4469_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_21913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGAACATGAGTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461910	461182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_461200_461900
756051	contig_1275_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_108872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	79	540	747507	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747428	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747400_748100
756052	contig_7963_pilon	-	655	4	Intergenic	novelGene_58300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2245	junction_2	415.315408923012	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	197	415	40037	38897	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	40233	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949
756056	contig_18162_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_122341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACCTTCCAGAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	16227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_16200_16600
756058	contig_20398_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_155201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACAAAACGCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84013	83628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_83600_84000
756059	contig_854_pilon	+	1210	4	Intergenic	novelGene_36208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1386.34507488816	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATATAACTTCAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543474	563791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543662_557623_557752_562271_562405_563029
756060	contig_1406_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_25631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGCTTCTGGTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2617609	2617183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2617200_2617600
756061	SIRV6	+	514	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756064	SIRV6	+	294	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756066	contig_15304_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_30609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	130	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	532	1212	65331	64554	FALSE	10	AGCCCTGGGCTGTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLLTSDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66246	64416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65721_66104
756067	contig_8576_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_88738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACTTGTTTAACCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643826	643070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_643100_643800
756068	contig_6065_pilon	-	830	8	Intergenic	novelGene_132698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	221.647633574978	114	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	76	669	503230	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	507478	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497_499621_501763_501897_503223_503260_507432
756071	contig_15105_pilon	+	1577	14	Intergenic	novelGene_150938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	184.716638899669	614	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	61	1386	312508	338459	FALSE	5	GTGCTTTTCTCATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLTRAGILSRFYSLKVAPKVTATAAPTGAPPQPQDLEFTKLPNGLVIASLENYAPTSRIGLFIRAGSRYEDSNNLTTKGASSFRITRGIEAVGGKLSVTTTRENMVYTVECLRDDVDILMEFLLNVATSPEFRHWEVAALQSQLRIDKAVAFQNPQARVIENLHAAAYRNALANSLYCPDYRVGKVTPEELHYYVQNHFTSARMALVGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKALYRGGEIREQTGDSLVHAALVTESAAVGSAEANAFSVLQHLLGAGPHVKRGSNATNSLYQAVAKGVHQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQAEAAGDVLKAAYNQVKTIAEGNLSDTVIQAAKNKLKAGYLMSVESSDGFLDEVGFQALVAGLYVPPSTVLQQIDSVAAADVKNAAVKFVSGKKSMVASGNLGHTPFVDEL	312447	338650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_312541_315576_315661_315757_315872_316439_316505_317948_318006_318254_318380_321025_321124_323169_323228_324221_324318_325249_325450_327725_327807_333914_333992_336811_336966_338375
756073	contig_3077_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_26841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645887	648439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_645900_648400
756076	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	657	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756079	SIRV6	+	542	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
756083	SIRV2	-	238	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	688	22	688	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
756085	contig_1867_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_54500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	489	1233	1721	26872	27360	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVQKTSSIPSIPYGWSRGTYDEQYFNSINFILNSTIKIPYHSCQKSTKYQTQPSGEKSARRNSSNIPSRKRSRIQGRTGSYRSKRGIFQLIFSCSESNGTQICIRTTWLPVQGISETQSGQSVILKAHLHRAVVRLNTLSFSNEIWSYLEKHLWDVNLEFNT	25639	27361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_25600_27400
756087	contig_6710_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_94880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
756088	contig_7428_pilon	-	2188	12	Intergenic	novelGene_77743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	183.376819285426	1	111	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	745	1179	440961	439573	TRUE	35	ACCCTCCAAAGATTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGANISTWVYSRHEAQEPFLQWLLLLSNESALPHVHTVSYGDDEDSLSSAYIHRVNTELMKAAARGLTLLFASVGLGVGLSLEDTSSVPASLPPAPMSPQWEARPSRIPSASQMRLLTISVVVASAMCFHGLHIRRKLYPSF	443705	438188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_438938_439113_439240_439438_439598_439707_439829_440266_440330_440577_440767_440924_441040_441303_441483_441615_441744_441950_442102_443214_443359_443641
756093	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	271	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756094	contig_13740_pilon	+	949	7	Intergenic	novelGene_34715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	562	894	160875	161667	FALSE	65	TTTAAAACCAAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGMVFLQYNFIHGIMVIKSNKAKASFLSRLPISNYLNGINFSIFLEIISKMMFLSIFFNSTNKQLLHSYVSAWLSRFLSCYSTFWLNHSPINGMGSCSHGRINLSHG	157398	161722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157531_158265_158393_158639_158783_160643_160729_160800_160904_161058_161269_161573
756097	contig_5253_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_61574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240577	238354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_238400_240600
756103	contig_11512_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_43226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	26	355	4011	4563	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCA	3985	4563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
756108	contig_9455_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_161831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTGCCTGTTGGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226212	224328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_-_224300_226200
756110	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_94047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756112	contig_10399_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_114474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	940	1383	103869	103426	NA	5	GCCCCCCAGCTCTGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYTVSLFFFFTKITVPLKEIYHRISFLIHPTSILLPPFILLVSSCWASFRLGPGPAEAEWELDPASLRIPLGVFSRAVPRCPFTMKCRPGPNKYITDNVVEHTEVKEKGLLMFRENSVTLRVFICRSSPKLILCPLSSGLQVREPA	104808	103278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_103300_104800
756113	contig_10667_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_137317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73365	75343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_73400_75300
756115	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
756120	contig_7202_pilon	-	174	1	Intergenic	novelGene_16440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27796	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
756133	contig_4678_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_126034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGTAGCTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425279	426602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_425300_426600
756134	contig_3270_pilon	+	641	5	Intergenic	novelGene_104436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2675	junction_1	3621.23979977852	726	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	137	607	44259	46726	FALSE	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44122	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
756138	contig_15047_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_52295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	620	1072	130501	130049	NA	5	CGTGTCTGGCTCTTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSG	131120	128717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_128700_131100
756140	SIRV7	-	831	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	-14863	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCACAGTATCTAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	70900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_70988_78841_78964_114686_114961_147608
756141	contig_15022_pilon	+	2622	13	Intergenic	novelGene_171823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.0516220815594	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	24	1397	224339	231764	FALSE	5	CCCTCGCCCATGGGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPEDTVGGQGSARPLHRPVLAPLLRPAEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAFSIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDESTKLLYNGIQPVAAIDSNFASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMHAFSVSHFCYLLYKNLELANYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYSSEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDLQKMAEVGYDRTNKQHHSLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAMGNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSHKFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPKLDGAGAPVNGCCSLDAE	224315	232989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_224537_225474_225553_226503_226627_227482_227554_227849_227973_228329_228418_228870_228919_229906_229982_230135_230236_230476_230590_230929_230969_231106_231214_231553
756142	contig_4364_pilon	-	1676	14	Intergenic	novelGene_129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	165.085310561884	572	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	41	880	1097596	1093366	TRUE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCFLLASFDHCDFPEL	1097636	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093372_1093639_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1097563
756143	contig_3627_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_78545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATCCACTAAACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658908	658073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_658100_658900
756146	contig_1084_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_152392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTATTAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543038	542768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_542800_543000
756152	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756153	contig_5569_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_86740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAATCACTACGGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451953	450635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_450600_452000
756154	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
756160	contig_7202_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_18480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
756161	contig_5229_pilon	-	2594	10	Intergenic	novelGene_117715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30.3534731675526	1	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	266	1174	657076	655928	TRUE	15	GTACAGCTGGGCCTCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGCGQDNSRALDSPMAPASQEEEGAGVAAVAGPGLYSYIREDLFTSEIFKLELQNVPRHASFSDVRRFLGRFGLQPHKTKLFGQPPCAFVTFRSAAERDKALRVLHGALWKGRPLSVRLARPKADPMAKKRRREGEGEPPATHIADVVTPLWTVPYAEQLEQKRLECEQVLQRLAKEIGSTNRALLPWLLTQRHKHNKACCPLEEVRPSPLQVRLAHPVHFKKLLWSVPPDPFPCFAFLPRAHHIITRCWSCPLTTSPMEKPRSHLLPFPRRWRVLDSQGEVRHVSLCPSLTTISHADRVS	657583	652397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653672_653715_653903_654027_655073_655380_655474_655590_655758_656307_656546_657083_657324
756166	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756175	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8142	3	597	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGTCGCTTTTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
756177	contig_8476_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_121351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTCTAACAGAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184716	185288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_184700_185300
756178	contig_12922_pilon	+	2964	7	Intergenic	novelGene_157776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	19.7434940057619	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	64	1530	73264	83393	FALSE	35	GCAAAGGACCCACTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETGLLEAGASAASTVAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALNLFCYEDQEPVCLICAISHTHRVHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLDPLEQKLQDITRCKSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQMLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSISIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCQDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE	70952	84827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_71009_73256_73717_75272_75369_79798_80030_81402_81426_81968_82085_82845
756179	contig_11937_pilon	+	1433	3	Intergenic	novelGene_171577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0.5	280	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	348	1202	34002	34856	FALSE	25	TGTCCATGCTTGTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATQAPGRGSIRKTRPLVVKTSLNNPYTICWSTLEREDMHFILQTLENRFKYIGLRKIEDKKKRKKQPSFQKQSREKCNTDVDISEDLKEKKPDDNQQVSGWTPVHVRKQLAIGVNEVTRALERNDLLLVLVCKSAKPAIITSHLIQLSLSRTVPACQVPRLSERIAPVIGLKCVLALGFKKNTTDFADEIKVIIPRVPSLNVPWLPDRVEDSRENLGTESLERQDKEILETSFEDLSKHKRKLVEGQQASAVALQPLKIKKLIPNPNKIRKPPKSKKTTLK	28920	35087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_+_29204_31367_31422_33991
756180	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_96568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756181	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756182	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
756183	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756187	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756192	contig_5196_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_38678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGAGAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120996	120441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_120400_121000
756193	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
756196	contig_9014_pilon	-	1790	11	Intergenic	novelGene_106737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	85.5315146598024	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	150	1535	46579	41867	FALSE	35	GAGATATTATCAGGCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSTCSSTSTALRRRRRKRRMTCWRKNSPACGKNVAFVLWIVLLTSSAMSTSTATTPSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDQQRFQCSHCSKRFATERLLRDHMRNHVNHYKCPLCDMTCPLPSSLRNHMRFRHSEDRPFKCDYCDYSCKNLIDLRKHLDTHSKEPAYRCDFENCSFSARSLCSIKSHFRKVHEGDSEPRYKCHVCDKCFTRGNNLTVHLRKKHQFKWPSGHPRFRYKEHEDGYMRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	51587	41611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44240_44420_44533_44785_44846_44916_45016_46504_46693_51551
756202	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756203	SIRV4	+	603	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	335	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAACATCTGATGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	5142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
756204	contig_5935_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_102730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATTATTAATGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189128	1188728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1188700_1189100
756206	contig_15105_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_150968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	437	784	582844	583191	NA	65	ACAAATAAAATTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGDQRIDALELWCWRRIFNIPWAARRTNKSVLEEVQPESSLEARMVRLHLTHFGHVISRDQSLEKDVMLGKVEGQQKRGRPSMRWIDTVAITMGSSTIMIMRMAQDRAVFHSM	582407	584353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_582400_584400
756208	contig_11160_pilon	-	1788	3	Intergenic	novelGene_168858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	10	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	105	1739	849630	845673	FALSE	50	ATTTTAATAAACATACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPLACIIGYLEIHPAKKPNAIRSTPSLQTPTTKRMLTTPNHMALSILGKRNYSHHNGLDAYSFTAMDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKTQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNVKKERDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNVPISGRILQAKAKETAKLLKVDGFSASNGWLQSFKKNHGITCNVACGESNEGDKDIVQNWFTKLKEIIRGYDPKDVANADETALFYRAMPNRTLKMKGEKCAQGRFSKERLTVLLTTFADGTFEKPWVIGKSERPRCFKNIKINQLSVEWKWNKKAWMTGAIYEEFLNKLNNSMKTQNRSILLFVDNAICHRSLPLSNIKLVFFPPSTTSVLQPLDNGIIQNIKVNYRKLLLQKVVANIEMCKMASEISGKIDVLDAISFLKRSIKMIKEETIRKCFKNCGFLFGSGDSIQNETVIEPDNIMQIQDAINDIYSGVSENRVSAASYVDIDKEIATEMDEINLQEIVDSQFKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVLSYVKALKEFGKAKGDQEFLDKATDLEICFNNFIKKPKQTKQLTLDVFIKK	852601	845623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_847232_849554_849702_852568
756212	contig_8284_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_125726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	299	811	469984	470496	NA	15	GTTTTTCTGTTCCCACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEPCLPESKEILQNRQKWETDKGAGRAMSVRVQGNITEQAKVGNGQACWQSHVCPSPRKYYRTGKSGKRTRVLAEPCLPESKEILQNRHKWETDKGAGRAMSARVQGNITEQAKVGNGQACWQSHVCPSPRKYYRTGKSGKRTSVLPQLYLSPRNITESSVCINVTNE	469685	471084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_469700_471100
756214	contig_6589_pilon	+	888	5	Intergenic	novelGene_25784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2098.35559129048	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	117	449	669670	671198	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSKH	668307	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669650_669748_670000_670104_671046_671228_672436
756218	SIRV6	+	327	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	530	14	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
756221	contig_14443_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_126679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAGTTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39011	37485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_37500_39000
756227	contig_11566_pilon	-	2148	17	Intergenic	novelGene_166696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	288.049251159849	10	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	222	1907	246031	169417	FALSE	80	ACAAAAAAAAAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDNTNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFTKGDIIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREIKSSEKPVSPKSGALKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSAYLRPLQTSEKLSSANTSYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEEKNERYLLLFPNILLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHKNSFEISGSMIERILVSCNNQQDLHEWVDHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPITPSSKHADSKPVPLTPAYHTLPHLSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKASDEEFAVRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSNLWISTV	259300	169175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_169440_177028_177119_183372_183467_186196_186422_189026_189167_189368_189448_191619_191707_194821_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203342_223964_224061_224290_224386_234704_234794_245832_246035_255113_255245_259213
756228	contig_7171_pilon	+	743	8	Intergenic	novelGene_101311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	167.071168997539	1180	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	81	545	1077108	1084465	TRUE	0	GCTCCGCTGTGTCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETMKTWTSWKALRVLKTLSENLSATSWASLTSTLTAGCWPRCLGI	1077027	1088786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081187_1084220_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088717
756229	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
756230	SIRV6	+	537	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756237	contig_12079_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_67448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	658.535243298843	3	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	140	343	638707	580901	FALSE	15	GCCATGTGCGGAGGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVFF	638846	579727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580913_601782_601879_609189_609274_638695
756240	contig_1867_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_54526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGATACAGAACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217563	217316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_217300_217600
756247	contig_10331_pilon	+	529	5	Intergenic	novelGene_54107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTCAAAGATAATGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304608	310346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309600_310283
756248	contig_20614_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_107540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1688	2119	105939	106370	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRTLPTWNCKNLREAINFVDEFGKIFLKGVMVEELDRKISWKNTLVSRFGFLSIQTYSSSSARPSATFNSPFPFLMGPHRIKKNADSRIVGGKKLSISLLGHYISRTFGRKPPPNLDCHFSQKCFHLKKLRFKQEEKKLRVG	104251	106402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_104300_106400
756250	contig_4125_pilon	+	2179	6	Intergenic	novelGene_25224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	88.9350324675265	6	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1100	1522	1708054	1710864	TRUE	25	GAGATGCTTTGAGATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSAWPPLPPGSYAPAPP	1706954	1711790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710817_1710920_1711115_1711581_1711653
756253	contig_15687_pilon	-	1833	12	Intergenic	novelGene_129148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	38.5542442808326	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	355	1080	198511	190393	TRUE	30	CAGTAACTGTCCTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGNEDLRADDFPGPAFESYESMELACPAERSGHVAVSDGLHMFVWGGYKSNQVRGLYDFYLPREELWIYNMETGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRVSI	198865	187423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_187734_187947_188001_188102_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198358
756255	SIRV4	-	268	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1253	0	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
756260	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756265	contig_12786_pilon	-	846	5	Intergenic	novelGene_103439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	986	junction_3	393.736825176411	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	629462	615730	TRUE	35	TTGATCCATTACAAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAQPFFARPVREPSESCHFLSPWVFVAGVAARIWRSGSKRSPRSVLQIRTDLLVSLLRPLQPAAHSPLRPRVRIRSGGGSEEGGQGRRSSAPRESSPVPLEGVWRALWNVPGAHGRAGKN	629462	604401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_604719_614020_614079_615624_615731_628731_628938_629303
756266	contig_12786_pilon	-	152	1	Intergenic	novelGene_103437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGAGTCACTTCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604450	604298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_604300_604400
756268	contig_500_pilon	+	1486	11	Intergenic	novelGene_30969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	530.422671084108	4	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	344	1186	1461386	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446856	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461395_1461435_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
756271	contig_9727_pilon	+	2226	5	Intergenic	novelGene_86304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	26.910732059905	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	213	731	275488	277981	TRUE	10	ATTGTGAGGGTGTCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPRAEQPTPETQHCPEFCFLSLSHLGPRDTLKPLEKLARFPVGGAREAEDVGEFLGQRAQLPLLPFPWQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGMARTPAPSAGSSAGSVPEAPNSSPSTPATSSPAGAPSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNNMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS	275275	279699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_275551_275748_275865_276091_276279_277828_278898_279120
756276	scaffold_6394_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_111032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	723	1157	404942	404508	NA	30	AAAACGTGCAGCCCGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLKVPGQIPAPAPGAVCPPPPPPMFSLLLLTSCLQPTSCLPPPRLHPASCPVCTPPLGLPPAPHLLSYLYATSWPPPPTPPVPRLLLCPEVKAGALRLCWAPPSTLPLKLCAVHLDILRWVPELRAMPHLCHVAGGEMLTGQ	405664	403881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_403900_405700
756279	contig_16228_pilon	+	1400	3	Intergenic	novelGene_147918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	0.5	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTATGGCGCAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47749	61004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843
756281	SIRV6	+	322	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1685	0	-214	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2809	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756285	contig_2036_pilon	-	1179	3	Intergenic	novelGene_131852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	365.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	264	677	661441	647829	FALSE	25	TGATCTATCTTGTGATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDK	679226	647326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_647936_661134_661550_679071
756286	contig_11258_pilon	+	1984	7	Intergenic	novelGene_67768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	202.921509182464	1	116	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	35	928	278958	291823	TRUE	35	GAGTTATTTAAATAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSHLLPALVPAPAFRAK	278923	293415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291773_291915_292450
756297	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	6	410	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756301	contig_15031_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_138401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	748	1137	72867	72478	NA	50	AATATATTTTTTAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQVTVLH	73614	71937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_71900_73600
756302	contig_4114_pilon	+	1531	3	Intergenic	novelGene_15598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	163	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTTAAAAACTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265334	278161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_265393_267494_267584_276777
756306	contig_16948_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_166406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246970	249117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_247000_249100
756307	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
756310	contig_7695_pilon	-	944	3	Intergenic	novelGene_41553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	188.5	796	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	99	530	380076	373971	FALSE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGGMCGG	381103	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_379664_380089_381017
756311	contig_10134_pilon	-	2372	5	Intergenic	novelGene_16230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	725.72928837136	1	139	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33430_33529_33731_34922_35128_38558_39155_39602
756317	contig_5201_pilon	+	988	7	Intergenic	novelGene_82191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	150.533957040338	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	35	697	388812	403246	TRUE	15	TTTGTAGTTTAATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APQLGPGAEAAMAATFFGEVVKGPCRAGTEDEEEEEDKRETPEDKDVRRQLMRKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAVAFLSSFVMNSGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDAISLSPTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPKKNMQITILTSRHITDYKTSESTCSLPSPFLRALKTQSFKDPFSVIVKYGEFLQFCTCVILMS	388777	405706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_388943_392320_392428_393600_393753_396005_396069_402083_402228_403180_403318_405486
756321	contig_9554_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_170687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTCAATTCTGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97333	96427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_96400_97300
756324	contig_9273_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_171824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTGAAGAATGACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47463	46592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9273_pilon_-_46600_47500
756325	contig_11978_pilon	-	584	5	Intergenic	novelGene_63099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTGGGGTCCAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831966	1829159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1829187_1829999_1830113_1830661_1830785_1831161_1831272_1831755
756326	contig_10765_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_122972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTCACTTTGATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405459	406465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_405500_406500
756331	contig_15354_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_65726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCTTGGTACTTCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569064	567258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_567300_569100
756332	contig_6946_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_59770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396157	394255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_394300_396200
756333	contig_3529_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_105373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAACATAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629003	630392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_629000_630400
756337	contig_12951_pilon	+	1754	3	Intergenic	novelGene_68238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	636	junction_2	140	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGAAATGATCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815335	827873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_816958_819990_820090_827840
756338	contig_504_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_54447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	233	736	245879	245376	NA	40	GCATGAATATTCTTAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVEQWEGLGQGLRPERHEESHLQMPTLDGPGSKFSPSLQEIWTATIMRCSQSLGMMASLFTLTMPEGKCDFLCPHTPLLQPFFLCSCSGKPNAPRVRSLHCHVPCLLLSLFTISFFLLIFAKYHMILLQPKSTSVPPSEKFSIIFYQTIRSWRQRTWLYSGAGPL	246111	244270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_244300_246100
756339	contig_12638_pilon	-	1295	13	Intergenic	novelGene_33200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	258.655967884413	19	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	34	1152	333499	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLASLFRLVPMEALGKLKQFDAYPKTLEDFRVKTCGGATVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTAARAIQKKIDLGKTT	333532	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320000_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332789_333007_333096_333202_333274_333411
756346	contig_5649_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_82301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTATACATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166877	166534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_166500_166900
756350	contig_6137_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_59306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTCATATCTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632257	1631317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1631300_1632300
756351	contig_10500_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_41147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATGTGTTTGCCGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186032	1185624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1185600_1186000
756352	contig_11378_pilon	-	2678	3	Intergenic	novelGene_112293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	1.5	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	95	1627	573439	565100	FALSE	25	AAAATGGGCCATTTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKEAVVVDPSSNLYYHWLTIIALPVFYNWGMLVCRACFDELQSEHLMMWLVLDYSADVLYGLDVLVRARTGFLEQGLMVKDAERLWKHYTKTIHFKLDVLSLVPTDLAYLRLGMNYPELRFNRLLKFARLFEFFDRTETRTNYPNVFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISNPEYGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGETPAPVKDEEYLFVVIDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLEMRVIRWFDYLWANRKTVDEKEVLKNLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPAVFSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEDLAKAGSDPKDIEEKVEYLESSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKVKQRLSQLESQVKTCGRSFQSDGEAPGDATKTEDKQQ	573533	564048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_566512_570029_570137_573425
756357	contig_4350_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_136372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGATCCAGTTGTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73591	75058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_73600_75100
756361	contig_9199_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_65628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGACTCGAATTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68656	68101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_68100_68700
756363	contig_9199_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_65627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGCTCTTGGCTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67948	66892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_66900_67900
756366	SIRV2	-	237	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	688	23	688	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
756369	contig_5968_pilon	-	1237	8	Intergenic	novelGene_112194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_7	235.192322518038	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	21	1079	732362	622680	FALSE	20	TTTTCATAGTCTTGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732382	622521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
756370	SIRV6	+	293	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106
756372	contig_14822_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_145413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_2	164.548625032238	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	188	490	186140	190065	FALSE	10	CTTTGATGTTTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	181674	190346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181708_183384_183502_186102_186226_186462_186594_189979
756376	contig_14441_pilon	+	1231	4	Intergenic	novelGene_100490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.064333633354	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	327	1229	92508	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWYHQPPGQSLILIATANQGSEATYESGFTKDKFAINHPDFTFSTLTVKNSSPEDSSVYLCSAGAHNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	92181	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92708_113161_113209_116578_116963_117523
756380	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756383	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
756387	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_89311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653739	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
756392	contig_15672_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_171828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1546	1866	125865	126185	NA	60	TTCCCTAAAAGATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIFPLFLLFYKDPSQMRLGLTLSLYALMLTDNIFRDPVSKQGHIHRYWGLGFEHIFLGDTIPSITHWKAWLVSKLYHEVSRSFRSSLLFPSCVFQSVIHTEVLHD	124319	126266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15672_pilon_+_124300_126300
756396	contig_4426_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_15456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTATTTAAAGACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904297	902498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_902500_904300
756398	contig_9708_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_67283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACTATTTGTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793393	793641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_793400_793600
756399	contig_8452_pilon	-	2219	8	Intergenic	novelGene_48019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	246.539312591443	2	119	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	61	543	550776	416586	TRUE	15	TACTTTTCAGTATGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATASPPPSPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFAVSSGFCLHFLTSSSLKLCSIHLVSLQPVICLLDSWHLCLLCLYHFTAPYQESKWHKFWASFPSPTRH	550836	314908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_416565_416690_504315_504409_504963_505091_509599_509728_550745
756404	contig_13244_pilon	-	2701	7	Intergenic	novelGene_86903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_6	42.9612228255513	36	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	83	901	187238	36535	FALSE	25	TTCAACTAATGGTGTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRKPGRRRASSEIVTEGKRRKSSSSDLREFRITKMLNAKPEDIHVQSSLSKLRSSERWNLPLQELKRSLRNKVISLDHKSKKGVCGHPVTSKASSERQLKVMLTNVLWTDLGRKFRKTLPRNDANLCDANKVHSDSLPSTSVDNLEACQKLEPLHQSLNLSERIPRVILTNVLGTELGRKYIQTLPVTEHSMGDTDNLQSEQLSSSPDGNLESCQNLNPPKSCFLSERGSQSSKTTVNNKSAKQAAHTKEKQRDDDGISLVMSDTQPKGL	187320	34734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_36665_89967_90163_103530_103729_134656_134755_152886_152992_175957_176011_187198
756405	contig_15039_pilon	-	1589	15	Intergenic	novelGene_110105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	27.5815118497585	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	394	1479	163198	121358	FALSE	10	TTCTGTGGCCGGGCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGLETTLNSFMGLGQAAWKEARALLQSLLSASEARLRDDMELRKSAFISQASATMHLPATIGDYTDFYSSRQHATNIGIMFRGKENALMPNWLHLPVGYHGRASSVVVSGTPIRRPMGQISPDDSKPPIYSTCKLLDMELEMAFFVGPGNKLGEPIPVSKAHEHIFGMVLMNDWSARDIQKWEYVPLGPFLGKSFGTTISPWVVPMDALMPFAVPNPVQDPRPLPYLCHDQPYTFDINLSVALKGEGMSRAATICRSNFKHMYWTMLQQLTHHSVNGCNLQPGDLLASGTISGPEPESFGSMLELSWRGTKPIELGNGQTRKFLLDGDEVIITGHCQGDGYRVGFGQCTGKVLPPFTPA	169606	121247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_121438_134004_134123_134849_134952_137891_137939_140603_140680_142436_142568_143556_143657_145457_145511_145619_145718_153248_153340_160156_160207_160720_160843_163180_163287_163620_163732_169412
756406	contig_2251_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_128471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAATCGTGGTATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73368	72671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_72700_73400
756408	contig_18081_pilon	-	1367	3	Intergenic	novelGene_23846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_2	13.5	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	241	738	435960	430068	FALSE	10	CGTATTTTCTGCTCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLNQLCMLQVEPASLVCPCPASLPWGRQHPSALSSPLQNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQDHSRTGGRDAEWTETPGSSNFCRSVPHPQAEGTDGQVSAVYCRVSDLL	436200	429438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_430107_434819_434927_435608
756409	contig_13992_pilon	+	2916	1	Intergenic	novelGene_147624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	371	706	327775	328110	NA	20	CATTTCAATCGGGGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICVDWWPAPQVMHPVNQGWAAEFMVCVDPGWTPQVMPSVDWGWVPLVMLPVDRGWAPERMFLLYCGVVTVDDVPMDLGWAPQVVLFVDRERVVLPVTWGQAAELILVDPG	327404	330320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_327400_330300
756411	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756413	contig_10019_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_86706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAGAGTAGAACTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453240	454129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_453200_454100
756414	contig_10019_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_86707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTAACATACCTGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454237	455170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_454200_455200
756415	contig_14575_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_101936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461481	459985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_460000_461500
756417	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756418	contig_3948_pilon	-	1262	3	Intergenic	novelGene_53398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	642	1091	1861398	1860949	TRUE	10	TGCATCTCCTTGTCTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQADLPVGCEAADTINSSGAPVLGPAGPSVMVMGARGEEGTGVVLNCKGHPSFGRGASCSNSPPSWVGLASSRRPLEDPGWDWRALARPEVGRRSWSLPLCKQPESLISHKWPLSGSRRWRWKEGKPRSRREWEMINSEATNIKTKAI	1862039	1814434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1814516_1860428_1860489_1860918
756422	contig_7521_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_160539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTAAACTTTCACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211547	211200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_211200_211500
756423	contig_11512_pilon	+	339	2	Intergenic	novelGene_43237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	4011	4560	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	4000	4562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
756424	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_93452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
756425	SIRV6	+	303	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8137	-2	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
756428	SIRV4	-	320	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1203	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3955	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756437	contig_11337_pilon	-	1897	13	Intergenic	novelGene_107184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.262310627667	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	71	1459	212877	174786	TRUE	15	TTTAGGAATTCGGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGKNAAKDNSLDTEVAYLIHEGMFISDAFTEGELTPTAVDATSQRNASPNSEPCSSDSVSEPECTTDSSSSKEQTSSSVTPGGVDIMVSEDMKLTDLELGKLANNIQELLYSASDICHDRAVKFLMSRAKDGFLEKLNSTEFITLSRLMETFILDTEQICGRKSMSLLGALQSQANKFVNRFHEERKTKLSLLLDNERWKQADVPAEFQDLVDSISGGKITLPEKKSGATEERRPAEVLIVEGQQYAVVGTVLLLIRIILEYCQCVDNIPSVTTDMLTRLSDLLKYFNSRSCQLVLGAGALQVVGLKTITTKNLALSSRCLQLIVHYIPVIRAHFEARLQPKQYNMLRHFDHITKDYHDHIAEISAKLVAIMDSLFDKLLSKYEVKAPVPSACFRNICKQMAKMHEAIFDLLPEEQTQMLFLRINASYKLHLKKQLSHLNVINDGGPQNGLVTADVAFYTGNLQALKGLKDLDLNMAEIWEQKR	212947	174248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_174613_174711_174892_181343_181439_183804_183913_194769_194851_194963_195086_195654_195743_196641_196748_199470_199535_207832_207946_208725_208908_209561_209692_212683
756438	contig_14151_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_171833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34129	35400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_34100_35400
756440	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
756441	contig_10013_pilon	+	1447	16	Intergenic	novelGene_125082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	264.127410332379	2	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1	1050	470350	475450	TRUE	15	CCTGCCAGTCCGCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIVDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVEDINKRREPIPSLEAIYLLSPMEKSVQALIADFRGTPTFTYKAAHVFFTDTCPEPLFSELGRSRLAKALKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAGERTRQLEVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEHDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWMELRHMHIADVSKKVTELLRTFCDSKRLTTDKANIKDLSHILKKMPQYQKELNKAILRICI	470349	479362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_470387_471683_471734_471973_472056_472615_472693_473247_473327_473411_473516_473893_474043_474229_474315_474393_474525_474618_474727_475078_475137_475264_475333_475428_475510_475838_475878_478470_478629_479221
756447	contig_10453_pilon	-	2212	8	Intergenic	novelGene_162042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	7.38172039015075	124	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	195	1202	241902	222789	FALSE	30	GAAAACAATGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLARHHLSRKAGGAENQTSSERFGAGQTGADLAPRAHAFGRVGFLVVGPSGKAVCGRAATRGAMATFVSELEAAKKNLSEALGDNVKQYWANLKLWFKQKISKEEFDLEAHRLLTQDNVHSHNDFLLAILTRCQILVSTPEGAGSLPWTGGSAAKPGKPKGKKKLSSVRQKFDHRFQPQNPLSGAQQFVAKDPQDDDDLKLCSHTMMLPTRGQLEGRMIVTAYEHGLDNVTEEAVSAVVYAVENHLKDILTSVVSRRKAYRLRDGHFKYAFGSNVTPQPYLKNSVIAYNNLIESPPAFSGPCAGQNPASHLPPDDAEQQAALLLACSGDTLPASLPPVNMYDLFEALQVHREVIPTHTVYALNIERIIMKLWHPNHEELQQDKIHRQRLAAKEGLLLC	242096	221778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_-_222942_223372_223536_228922_229075_230734_230945_232346_232445_236247_236314_236568_236661_241828
756448	contig_4496_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_66682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTCTGCTCTGTCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909465	910328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_909500_910300
756449	contig_10951_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_61630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAATTTACAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167586	168878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_167600_168900
756453	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_94780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
756455	contig_4125_pilon	-	1394	7	Intergenic	novelGene_25102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	22.0409971542931	142	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	77	661	738372	736983	TRUE	20	GAGGGAGAGGCTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVRHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGVLKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAIDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSDIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSDLPAVKKMTFTEYPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNK	738697	735993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_736338_736593_737136_737292_737410_737522_737631_737820_737943_738287_738394_738642
756461	contig_10437_pilon	-	1165	3	Intergenic	novelGene_38426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	130.5	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACAATCTGGTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828621	823001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_823074_823709_823812_827630
756463	contig_12677_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_110843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGGGTTGTGAAGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3600
756471	contig_6446_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_149170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCATGTACTCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114407	114902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_114400_114900
756477	SIRV5	-	472	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGGGTGACTACAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
756481	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756488	contig_3147_pilon	+	1769	13	Intergenic	novelGene_142266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.2984340253279	451	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	428	1498	60358	83545	FALSE	10	TGTTGATGTGTTTCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS	54777	83816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_54917_58006_58137_59789_59932_60341_60455_60549_60600_62108_62202_63668_63849_66431_66573_68233_68408_75870_75958_81622_81737_83158_83240_83491
756490	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
756492	contig_16103_pilon	-	1766	7	Intergenic	novelGene_118898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_4	69.1560232774815	492	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	197	958	766451	759680	FALSE	25	CTGTATGATTAATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSNWLSGVNVVLVMAYGSLVFVLLFIFVKRQIMRFAMKSRRGPHVPVGHNAPKDLKEEIDSRLSRVQDIKYEPQLLANDDARLLQLETQGNQNCYNYLYRMKALDAIRASEIPFHAEGRHPRSLMGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	766647	758871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761648_762206_762261_762483_762602_765904_766007_766385
756494	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
756497	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756501	contig_11338_pilon	+	1129	13	Intergenic	novelGene_6258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	101.480156790489	752	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	284	928	148941	150508	FALSE	5	CCCAGGCTCTGTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCRSCLWAPQPHCTSGPLFIYLLFYFRVPFIYGHKYDFTSSRHTVVHLACICHSFHYIKRLLETLFVHRFSHGTMPLRNIFKNCTYYWGFAAWMAYYINHPLYTPPHLRSSAGEAGARHLCNLPARQLFHPCGPAEPAAGRVQDKEDPIPHQEPLHVALPAGVLPQLHLRGRLLDWLHHHDTVPPSGSLLPGWLHPNDHLGQGQAPKLPEGVP	119040	150709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_119152_147568_147620_148324_148377_148784_148830_148916_148990_149122_149217_149301_149408_149503_149578_149664_149709_149804_149863_149940_150030_150264_150311_150423
756504	contig_10477_pilon	-	2450	2	Intergenic	novelGene_112500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469332	409019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_-_411057_468919
756506	contig_7815_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_134379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACATTTGGGTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432861	431511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_431500_432900
756507	contig_7815_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_134380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGGCACAGCATTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434693	433977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_434000_434700
756515	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756521	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8139	-2	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
756522	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
756523	contig_6065_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_132692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	108	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAATATTTAGTAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460500	463115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_460842_461600
756524	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
756527	contig_7457_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_31334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTACTTCCCGGTCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283071	280839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_280800_283100
756528	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
756532	contig_10523_pilon	-	2195	8	Intergenic	novelGene_120931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	979	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	174	1157	39240	15001	TRUE	5	GTTTTGCCAGGTTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39413	12735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13270_14496_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
756536	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756537	contig_7457_pilon	-	1059	3	Intergenic	novelGene_31718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2393.5	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	88	315	1176842	1174996	FALSE	30	GAGCTTGCAACTTACTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDVPSPLPAFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKVGLLASKMDF	1176929	1174251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1175025_1175963_1176132_1176811
756541	contig_3426_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_57972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1202	1555	548148	548501	NA	30	AGTTACCTGTATACTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEQDGARSQQLWVSARVEGGAHFGLKRQQHSEKAEDEVRVTAKLPGGEKQPCMKVQGFLTMTHLRKQLGVLSHMALSSKPGLAIPQGRVEQWSGKWVQHSPNGQYSRPWCPSGER	546946	549179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_546900_549200
756548	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
756551	SIRV6	+	510	7	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
756553	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	124	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756554	contig_17549_pilon	-	1978	7	Intergenic	novelGene_162602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	39.4743235815666	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	226	1215	217062	186398	FALSE	30	TCATGTGAACCACAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFNKGPSYGLSAEVKNKIASKYDHQAEEDLRNWIEEVTGMSIGTNFQLGLKDGIILCELINKLQPGSVKKVNESSLNWPQLENIGNFIKAIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAKTKGFHTTIDIGVKYAEKQTRRFDEGKLKAGQSVIGLQMGTNKCASQAGMTAYGTRRHLYDPKMQTDKPFDQTTISLQMGTNKGASQAGMLAPGTRRDIYDQKLTLQPVDNSTISLQMGTNKVASQKGMSVYGLGRQVYDPKYCAAPTEPVIHNGSQGTGTNGSEISDSDYQAEYPDEYHGEYPDDYPRDYQYGDQGIDY	217287	185634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_-_186740_188019_188167_190108_190226_190562_190701_191518_191586_191779_191902_217005
756556	contig_6100_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_168120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACCCCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487671	490269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_487700_490300
756557	contig_7066_pilon	+	1485	8	Intergenic	novelGene_42176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	11.3317325800297	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	330	1058	946606	953407	TRUE	20	TGATATTGTCTTGAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQQETPPVASPVLSRHQLQPRGSSKRSGPPRDQPFPGLLRLEDLSREELVDVLRAAVVDQKGPLVTVNKPQGLPVTGKPGDLTLLSVLPELSQSLGLGERELQVVRAPGKDCSGLVLLSSCPQTVSRIQKFFTHSRRVQRPTATYCAITDGIPATSEGKIQAALKLEHIPKGHPGRCQEDCQPLSCDGHRLWLCPGPAAAANSVPQSATGAHDTAALPCARGPHVLCPCQHRPGPALPTAS	946276	954642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_946793_947711_947757_947892_947993_949560_949669_949754_949821_950081_950187_953289_953430_954237
756565	contig_846_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_136110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTAAGTACAGTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217734	216055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_216100_217700
756567	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756569	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
756571	contig_12644_pilon	+	1011	9	Intergenic	novelGene_44670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5644.43493628902	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	169	945	2678184	2680545	FALSE	40	TGATCAAAGAGGCAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675499	2680611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677340_2678160_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680187_2680353
756572	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	155	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756573	contig_11978_pilon	-	2122	4	Intergenic	novelGene_63117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_2	149.38094479105	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1701	2081	1891044	1886265	FALSE	60	AGAAAAAAAAAATGGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRVKMAASLSSSGVLSTFFKFFCFFLFFQI	1893634	1886223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1886565_1887741_1887799_1891020_1891066_1891955
756575	contig_12313_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_171845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGGGTGGAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71146	72490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_+_71100_72500
756580	SIRV6	+	537	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	10	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756583	contig_15087_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_37294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTTAGAAATGCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303730	302178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_302200_303700
756584	contig_8704_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_156344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCTTAGGGACTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611081	609611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8704_pilon_-_609600_611100
756586	contig_14341_pilon	-	2963	1	Intergenic	novelGene_111788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATGAAACTGCTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343726	340763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_340800_343700
756587	contig_8210_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_30258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAGATCAAGTACTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169067	168426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_168400_169100
756590	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	351	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756591	contig_11003_pilon	+	1439	2	Intergenic	novelGene_105456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	234	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGCAGGCGATCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446630	448339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_447973_448242
756596	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	10	TTCTCCTCTTCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756601	contig_20844_pilon	+	1558	12	Intergenic	novelGene_78591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_6	48.2632245397591	265	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	25	1410	198086	201588	FALSE	10	TCAGTCTGTGTGGGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRKRSRHQKRARAQAQLHNLEAYAAQPHSFVFTRGRAGRSVRQLSLDVRRVMEPLTATRLQVRKKNSLKDCVAVAGPLGVTHFLILSKTETNIYFKLMRLPGGPTLTFRINKYALVRDVVSSLRRHRMHEQQFAHPPLLVLNSFGTHGMHVKLMATMFQNLFPSINVHKVNLNTIKRCLLINYNPDSQELDFRHYSIKVVPVGASRGMKKLLQEKFPNMSRLQDISELLATGAGLSDSEAEPDGEHNITELPQAIAGRGNMRAQQSAVRLTEIGPRMTLQLIKIQEGVGEGNVLFHSFVHKSEEELQTILAAKEERLRLKAQRQDQQAHNVQRKREQREAHKKKSLAGMKRVQAEADGDSDAEDPGAPPEAEPEREEDEAEYFRQAVGEEPDEDMFPGLTRRRQPTRPPRKKQRVKDRRPDRDKDWRLPKPKGGSRRAQTKLGPRGAAQGRARLPKTAA	198061	201736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_198104_198191_198363_198877_198980_199172_199224_199329_199501_200059_200137_200329_200438_200536_200661_200756_200836_200943_201074_201155_201311_201388
756605	SIRV6	+	560	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756607	contig_21357_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_171857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAATCTTTGGACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82815	82257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21357_pilon_-_82300_82800
756609	contig_12790_pilon	+	2622	9	Intergenic	novelGene_35177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	25.743931323712	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	152	1426	8971	22030	FALSE	20	CATCATGTCATGGTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAEPESRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGETGIGKSTLMNTLFNTTFETEEASHHEECVRLRPQTYDLQESNVQLKLTIVDAVGFGDQINKDESYRPIVDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNAHLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHSRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVKETELELKEKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQAFHATSQQPLRKDKDKKNRSDVGGVHQSGMSLSNSKVMMTKASVEPLNCSSWWPAIQCCSCLVRDATWREGFL	7523	23226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_7646_8941_9138_9488_9676_10725_10888_11495_11593_11832_12002_12213_12347_12489_12681_21861
756615	SIRV6	+	187	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	545	51	545	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10782	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
756616	contig_3627_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_78434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAATACTGTAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268301	269879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_268300_269900
756619	contig_12864_pilon	-	1236	6	Intergenic	novelGene_76387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	576.936530304677	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	50	460	223293	217842	TRUE	25	CCATAATGTATTTGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRTSDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223342	214848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215607_217823_217908_218501_218546_219914_220137_220625_220650_223238
756622	contig_7356_pilon	+	2254	6	Intergenic	novelGene_60419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACATTTTGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481265	487886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_482528_483360_483436_483606_483721_484518_484608_485069_485173_487275
756623	contig_9036_pilon	+	1643	6	Intergenic	novelGene_155444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	408.762522743952	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	86	556	94373	118139	FALSE	15	TGCTTCTGATATTCTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGIQKLASQYLKRDWPGIKADDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRISICENYKNFISEPARTVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLAKGKKKYFETEQMAHAVREKADIEAKSKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNSKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLVNIMKFVV	82984	119226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_83066_94368_94514_101675_101810_110016_110072_110908_111038_118127
756624	contig_6494_pilon	-	814	7	Intergenic	novelGene_108555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	990.353935048812	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	31	813	8286	2104	FALSE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTDLEFGCCSVKTFNKIFLKD	8316	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2160_2639_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
756626	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756628	contig_6710_pilon	-	454	2	Intergenic	novelGene_98189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756629	contig_2067_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_158920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCCTATAGGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588229	589802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_588200_589800
756632	contig_9354_pilon	+	2061	10	Intergenic	novelGene_108061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	26.4743062022197	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	135	1910	233330	263373	FALSE	20	GCATGTTGTCATGCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAKTRLFLLSPHHLKQLKESPGPRLKWQRLLHQQQPLHPEWAALAKKQLKGKNPEDLTWHTPEGIAIKPLYSSRDTKDFPEELPGMKPFTRGPYPTMYTFRPWTIRQYAGFSTVEESNKFYKDNIKAGQQGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVRGDVGMAGVAIDTVEDTKILFDGIPLERMSVSMTMNGAVIPILATFIVTGEEQGVPKEKLTGTIQNDILKEFMVRNTYIFPPEPSMKIIADIFQYTAKYMPKFNSISISGYHMQEAGADAILELAYTIADGLEYCRTGLQAGLTIDEFAPRLSFFWGIGMNFYMEIAKMRAGRRLWAHLIEKMFQPKNSKSLLLRAHCQTSGWSLTEQIKSSRDQALADQCLAALTDCAASGDGNILALAVDAARARCTVGEITDAMKKVFGEHRANDRMVSGAYRQEFGESKEITFAIKRVDNFMEREGRRPRLLVAKMGQDGHDRGAKVIATGFADLGFDVDIGPLFQTPREVAQQAVDADVHAVGVSTLAAGHKTLVPELIKELSSLGRPDILVMCGGVIPPQDYEFLYEVGVSNVFGPGTRIPKAAIQVLDDIEKCLEKKQQSM	230036	263524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_230131_233289_233715_234873_235242_238363_238522_239133_239306_255182_255299_256771_256904_258046_258195_259837_260006_263244
756634	contig_15304_pilon	-	672	2	Intergenic	novelGene_30443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	433	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	600	629	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53725	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
756635	contig_9578_pilon	-	1875	9	Intergenic	novelGene_68004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACACAGCGCCACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327147	1309426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1309465_1311498_1311819_1317334_1317598_1318292_1318358_1319387_1319809_1320952_1321038_1321463_1321552_1324881_1325041_1326711
756636	contig_3832_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_161454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCAATCAAATGATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321557	320125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_320100_321600
756640	contig_5020_pilon	+	958	5	Intergenic	novelGene_27821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	364	894	122915	126023	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSLRQWRQPSQALLPFFSFPSLFISLPSPPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	118461	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123333_125798
756643	contig_9839_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_88575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAAAAACCTGTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268331	267133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_267100_268300
756645	contig_7004_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_126455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTATGCCTTTTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289034	288406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_288400_289000
756652	contig_15236_pilon	+	2083	2	Intergenic	novelGene_141526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	353	802	100935	101384	FALSE	35	ATACAGATCATTTGGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEVS	55390	102665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_100925
756653	contig_12837_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_57412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505723	507056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_505700_507100
756658	SIRV4	-	307	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1216	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3942	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
756661	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	54	505	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
756665	contig_8552_pilon	+	1615	11	Intergenic	novelGene_80068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_10	376.685080670844	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	255	1511	385286	447433	FALSE	10	CAGTTTCTTCTGGTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDPFRIMPGIKRKSYTADFKLKVVARAEETSNRVAASEFDVGESSIREWRKEKKELEKMNPRKRARRGPKAKWPELENDLKEWIISRREQNQAVSTVAIQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRNGLSLRVRTTVGPQLPDD	354810	447537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167_438225_446996
756666	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756672	SIRV6	+	632	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	138	13	138	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10375	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
756673	contig_10196_pilon	+	1214	4	Intergenic	novelGene_132106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	359	junction_1	70.2012978670781	3919	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	33	317	922274	924513	TRUE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922241	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701
756674	contig_7410_pilon	+	1841	8	Intergenic	novelGene_106086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	198.266363814965	1	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1247	1621	408113	411958	FALSE	20	TAGAATTTTGATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSNLKNRSRSRSHSRSRGRRYSRSRSRSRGRRSRSASLRRSRSVSLRRSRSASLRRSRSGSVKGSRYYLGQGQDQDPGLFHDQEAADQSPDHHLQKEVARHQEVHAEVQVLKEWTEVLKFSF	405245	412178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406788_407110_407929_408002_408214_408298_408406_410366_410421_411209_411246_411881
756675	contig_5698_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_55046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAATTACAATGGTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20889	20099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_20100_20900
756678	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
756679	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
756681	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
756684	SIRV6	+	624	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	347	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
756686	contig_14341_pilon	+	658	6	Intergenic	novelGene_111822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	80	658	548758	551701	FALSE	15	GACGAGCTTGAGCGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKK	547736	551701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
756691	contig_12032_pilon	+	1461	7	Intergenic	novelGene_139275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGTGAAGAATGCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96450	117523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_+_97127_101163_101373_105048_105145_106744_106831_109141_109185_110301_110531_117401
756692	contig_4271_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_171872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTACAAAAAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581831	580974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_-_581000_581800
756693	contig_11258_pilon	+	328	5	Intergenic	novelGene_67742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5543	junction_4	1699.91167049938	44	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTGTCTTGTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49140	53625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49173_49379_49422_50092_50154_52748_52872_53555
756694	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756696	contig_15570_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_137865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAGAAAAAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728543	730730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_728500_730700
756700	contig_13894_pilon	-	1168	2	Intergenic	novelGene_62026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1628	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	30	1088	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	287474	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219
756701	contig_5967_pilon	-	1967	5	Intergenic	novelGene_44409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1102	junction_2	114.770423019173	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	146	616	488569	430647	FALSE	65	AAAAAAAAAAATTATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYRYHFSSLLFDRSFETKN	517647	429295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
756703	contig_6794_pilon	-	2019	5	Intergenic	novelGene_148997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	68	junction_2	142.099217098477	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	43	849	20671	13983	FALSE	30	CCAAAGGAGAGCTACGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAAAEADRTLFVGNLETKVTEELLFELFHQAGPVIKVKIPKDKDGKPKQFAFVNFKHEVSVPYAMHLLNGIKLFGRPIKIQFRSGSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20713	12812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15945_18732_18827_19426_19590_20575
756704	contig_10904_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_22666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535136	533062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_533100_535100
756706	contig_3627_pilon	+	1134	3	Intergenic	novelGene_78508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	3	476	621315	634316	FALSE	55	TAAAGCAGAAGTATAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621312	634974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
756712	contig_5725_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_167146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTATGACTTGGGCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246263	246671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_+_246300_246700
756714	contig_11294_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_50073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343774	342017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_342000_343800
756717	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756724	contig_504_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_54449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251239	251967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_251200_252000
756728	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756729	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756734	contig_13699_pilon	-	2017	2	Intergenic	novelGene_158305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16958	13869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_15799_16870
756736	contig_10765_pilon	+	2021	6	Intergenic	novelGene_122863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_1	100.670551801408	2	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	89	1849	18249	34929	FALSE	30	TTAAATGTTTTTATAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15678	35101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
756740	contig_8145_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_118653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGGAAAAATAAGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748644	749251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_748600_749300
756741	contig_6309_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_171530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	553	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTATAGTCTGTGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48266	42668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6309_pilon_-_44193_47996
756746	contig_9133_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_109306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGGGTTATGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292004	294063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_292000_294100
756747	contig_3797_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_120086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATCCTCATGCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338085	338414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_338100_338400
756749	contig_6101_pilon	-	1980	2	Intergenic	novelGene_114296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	365	1744	558605	557226	FALSE	25	CAATTTTTTCTTAACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFAVSLADLQAEAYCPICLDYLRDPVTIACGHNFCRSCIHQSWEGLRDIFPCPICLHHCCNGNLKQNTQLCNMTDIVKQIPTMRSKRKRQEEKPLCEKHNQELSLFCEKDLELLCPQCKISNHQDHHLMPIDQAATSHRRKLKYYVELLKKQVGNAEKELKIQVSKSFELKIKVENQMGELYSDFEQVKDVLEKEKDVILFTLQIEEKDIQKKLSESRVIFSEHISTLKNLLVEITEKCVQSELELLTGIESIYNKYENLSTPTVFSYELKKKYISSSEQYFNLQKKINLFKVNLTLDIETAHPNLVISEDRKSVTLRKMNPNYLQNSKKFSFLPALLSSQGFVSGRHYWQVEVRGKGEWAVGVCKESFPRDTITSPSPKDGCWQIRLWSYTFDALNRIKSRRVGIFLDYELGEVSFYNLNNKTLIYTFNDTFREKLRPYFYVGPYSDLLTIQIVNLE	565200	556989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_558922_565152
756750	contig_14925_pilon	-	993	5	Intergenic	novelGene_55117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1710.07200140813	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	9	776	75465	26007	FALSE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSMLTFGGGTRLMVKPHIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSSHQDCRKSHAPSLLLLVVHPLPLQAEKRTLCPPWKRRLPLTLWPHLAMPPTGSYPALVIKMLKSYQIYCKSLCSLIAAFHHPVFSARGGLLPPLLAVEKHPPPKRL	75473	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27024_27127_27995_28041_29569_29828_75422
756751	contig_4392_pilon	-	1524	2	Intergenic	novelGene_117315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316331	313886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_315260_316180
756754	contig_20609_pilon	+	1146	5	Intergenic	novelGene_118480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	52.251794227567	813	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	9	497	56554	58681	FALSE	5	GCTACTGCCTCCTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTSIPSPQPGRLRSPFLQKQLTQPETPVTREPVPASLRPSTDFLEDPEPIVPQSPVQVEGEAVCKEPLEEENLYEEPPLVQQEDAASEHSICYKQGTGLLGKGLCARALYDYQAADDTEISFDPENLITGIEVIDEGWWRGYGPDGHFGMFPANYVELIE	56545	59330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_56588_57337_57434_57554_57668_58017_58124_58541
756762	contig_8712_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_58726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCCAAAAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960	3242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1000_3200
756771	contig_2069_pilon	-	2152	4	Intergenic	novelGene_23226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	54.5527267879434	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAAGTGTGATTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260485	234744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_236619_254735_254773_258947_259013_260309
756772	contig_11309_pilon	-	961	9	Intergenic	novelGene_149864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3139.07876613506	1	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	349	915	62883	55879	FALSE	30	AAAGCTGTCCAATGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLIVLVCCWPAGYLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRSI	65797	55832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_55888_56349_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62838_62978_64220_64335_64427_64498_65727
756773	contig_7898_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_47618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACAGGCAGAGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580398	581333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_580400_581300
756778	contig_11929_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_171231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGGACAAGCGACGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44462	45978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_44500_46000
756786	contig_5057_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_151516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTCAAACCCACCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506496	523534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_507112_508156_508261_508809_508900_511016_511099_514139_514275_523329
756787	contig_14467_pilon	-	250	3	Intergenic	novelGene_138270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	3	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGTGGGTGAAACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351771	341109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_341247_347829_347889_351717
756793	SIRV6	+	439	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10367	20	1130	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11367	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
756797	contig_10855_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_124348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	770	1072	565395	565697	NA	60	AAAAAAAAGAGCCTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKSVLEEVQPERSLEGRMVRLHVMYFGRVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRRRRRPSTRWTDTVAATMGSGVMIVRMGQDRAVFRSAVHGVAVSLNGLKGT	564625	565884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_564600_565900
756800	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	99	-2	99	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	211	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5059	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
756804	contig_6740_pilon	-	1311	2	Intergenic	novelGene_142636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTGAGAATTAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12142	9754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_10226_11302
756805	contig_6740_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_142635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATAAAAAATAAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9303	8639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_8600_9300
756807	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4404	34	3229	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
756810	SIRV5	+	634	4	NIC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	1	-55	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACAATCTAACATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_1150_1987_2316_3298_3405_3483
756811	contig_20819_pilon	+	2259	7	Intergenic	novelGene_55608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	37.1259118855461	1	124	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	78	2066	22495	25305	FALSE	0	TTTCCTGTCTTTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	21113	25498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22476_23309_23427_23643_23798_23998_24175_24654_24809_25033_25245
756812	contig_6199_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_126373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231529	228918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_228900_231500
756815	contig_5236_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_100977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAATAAATTAAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072979	1072118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1072100_1073000
756817	contig_9609_pilon	-	2194	18	Intergenic	novelGene_22955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1559	1900	288478	282860	TRUE	35	TTATAGCAGCACCTGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSLGLFGRQALPFEKEADTFLLLSSGAPSVVLVLLPTSWIQVPYQLTVGAGWAVFLTVLVQMFSEAEGMILIPALPLPLDPCRTNMKIGVHQCWPYTVCSTKNLDLVHTRG	300583	211357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_211465_220027_220116_221345_221415_282829_282906_286500_286561_288242_288515_288892_289053_289839_289937_290637_290681_290873_290958_291206_291291_291830_291978_293111_293205_293837_294102_295729_295805_296547_296645_299500_299632_300336
756821	contig_987_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_72324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTGGTGGTAAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046353	1046663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1046400_1046700
756822	contig_12969_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_61657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	110	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTATTAGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150232	145156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_146668_150137
756826	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756830	contig_10838_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_129170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCACCTGGGGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92853	93653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_92900_93700
756831	contig_8260_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_163272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553778	552543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_552500_553800
756835	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
756841	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	19	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756842	contig_3233_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_56613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989456	988187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_988200_989500
756846	contig_12079_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_67573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGAACTGTGCATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988710	988429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_988400_988700
756850	contig_1996_pilon	-	2184	3	Intergenic	novelGene_131881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	151	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	88	1011	157365	156238	FALSE	5	CTTGTATTTGTGGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTLVFLSTRQVLQCQPAACRALPLLPRELFPLLFKVAFMDKKTAVLRELVHTWPFPLLSFQQLLQECAHCSRALLQERPSTESVQAVILGLTARLHTPEAEADAGTQPLCRKHVLRVLDMTGLLDDGVEQDPGTMSMWDCTAAVARTCIAQQQGAAVEPGPAPTPVEVRVDLRVNRASYAFLREALRSSVGSPLRLCCRDLRAEDLPMRNTVALLQLLDAGCLRRVDLRFNNLGLRGLSVIIPHVARFQHLASLRLHYVHGDSRQPSVDGEDNFRYFLAQMGRFTCLRELSVGSSLLSGRLDQLLR	159090	155064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_156827_157030_157391_159028
756860	contig_10734_pilon	-	1186	2	Intergenic	novelGene_51081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCGGGTACATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540307	526121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_527246_540245
756865	contig_16122_pilon	-	2917	14	Intergenic	novelGene_134531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGCTCCCCGTCGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201651	166798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_166897_182547_182683_182961_183083_184478_184713_184790_184960_185583_185737_186054_186203_192445_192582_194493_194587_195322_195473_195690_195802_197707_197819_198425_198526_200493
756873	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
756874	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756875	contig_1301_pilon	-	2038	2	Intergenic	novelGene_47360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1063	junction_1	0	515	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	240	542	552091	551789	FALSE	25	CAGCGCAAGCATGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VICKSDAPTGDVLLDEALKHVKETQPPETVQNWIELLSGETWNPLKLHYQLRNVRERLAKNLVEKGVLTTEKQNFLLFDMTTHPLTNNNIKQRLIKKVQEAVLDKWVNDPHRMDKRLLALIYLAHASDVLENAFAPLLDEQYDLATKRVRQLLDLDPEVECLKANTNEVLWAVVAAFTK	558973	550292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_552214_558856
756878	contig_5018_pilon	-	1973	3	Intergenic	novelGene_46981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_2	50.5	3973	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	41	331	634721	632275	FALSE	35	CACGTCTACCATTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNCGPAVSCARAAMAQGQCKFQAKKPGKSKAAAAASERNRGPRKGGRVIAPKKARVVQQRKLKKDLEVGIRKKIEHDVVMKASSSLPKKLALLQAAGKKKEMASAKTSS	634761	630632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_632413_634465_634522_634624
756881	contig_3525_pilon	-	1988	7	Intergenic	novelGene_135113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	60.0101843208486	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	3	566	53184	50657	TRUE	55	ATACAATTAGAAAATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLLAGVALHKTHKGLLWGVSPILRSDIISAFLSNKDTQNLSSPVTFTFSHHPVTPGPGQGVVCAFWEHEKDGCGHWATTGCRMLGTRDESTTCHCTHLSSFAVLMAHYELQVLCTIVAGALHYLYLATFTWMLLEGLHLFLTVRNLTEVSYSSVWRRMRKLMFPAGCGVPAVILAISAASRPHLY	53186	31498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_32640_39533_39645_41774_41867_42220_42288_50645_50882_52634_52815_53025
756882	contig_8330_pilon	+	1356	2	Intergenic	novelGene_71731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	322	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	645	977	459587	459919	FALSE	10	GGACATGTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGLNSFFVLAVSVGTGLILLQYNSQGSDLKHTSLVFIRVSCLSRSAGSSTEYHPHAGTTSVTCRMKERPRITHWLLPASARKLHSSPPLTSHRSEQMTLLCLTSKEET	456936	460298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_457079_459084
756883	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_92011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657499	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657499	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756884	contig_7342_pilon	+	2169	13	Intergenic	novelGene_71191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_11	15.7768730178772	147	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	20	1951	653290	665051	FALSE	0	CCGTGTGGCTGCCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESVLQMMQAGQRVVDNPIYLSDMGAALTGAESYELQDVLEETNIPKRLYKALSLLKKEFELSKLQQRLGREVEEKIKQTHRKYLLQEQLKIIKKELGLEKEDKDAIEEKFRERLKELVVPKHVMDVVDEELSKLGLLDNHSSEFNVTRNYLDWLTSIPWGKYSNENLDLVRAQAVLEEDHYGMEDVKKRILEFIAVSQLRGSTQGKILCFYGPPGVGKTSIARSIARALNREYFRFSVGGMTDVAEIKGHRRTYVGAMPGKIIQCLKKTKAENPLILIDEVDKIGRGYQGDPASALLELLDPEQNANFLDHYLDVPVDLSKVLFICTANITETIPEPLRDRMEMINVSGYVAQEKLAIAERYLVPQARALCGLDESKARLSSDVLTLLIKQYCRESGVRNLQKQVEKVLRKSAYKIVSGEAESVEVTPENLQDFVGKPVFTVERMYDVTPPGVVMGLAWTAMGGSTLFVETSLRRPQDKDGKGDKDGSLEVTGQLGEVMKESARIAYTFARAFLMQRDPANDYLVSSHIHLHVPEGATPKDGPSAGCTIVTALLSLAMNRPVRQNLAMTGEVSLTGKILPVGGIKEKTIAAKRAGVTCVVLPAENKKDFYDLAAFITEGLEVHFVEHYREIFHIAFPHEEAQAVAAER	653270	665269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_653404_653898_653983_655211_655433_657460_657600_658425_658605_660943_661032_661390_661514_661587_661705_662526_662668_662747_662914_663135_663354_663434_663600_664874
756890	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756896	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_97240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
756897	contig_5832_pilon	+	2196	15	Intergenic	novelGene_134152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	95.2758615595701	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	18	1760	422377	447866	TRUE	30	CTGCAGCACAAACTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVRGLRVSVKAEATAGPALGLPSPEAEPGLERGEPEPMEVEEGELEIVPVRRSLKELIPDTSRRYENKAGSFITGIDVTSKEAIEKKEQRAKRFHFRSEVNLAQRNVALDRDMMKKAIPKVRLETIYICGVDEMSTQDIFSYFKEYPPAHIEWLDDTSCNVVWLDEMTATRALINMSSLPALDKIRSRDANEDKSSEKSKKDKQEDSSDDDEAEEGEVEDENSSDVELDTLSQVEEESLLRNDLRPANKLAKGNRLFMRFATKDDKKELGAARRSQYYMKYGNPNYGGMKGILSNSWKRRYHSRRIQRDVIKKRALIGDDVGLTSYKHRHSGLVNVPEEPIEEEEEEEEEEEDQDMDADDRVVVEYHEELPAVKPARERSASRRSSASSSDSDEMDYDLELKMISTPSPKKSMKMTMYADEVESQLKNIRNSMRADSISTSNIKNRIGNKLPSEKFADVRHLLDEKRQHTHPRPPVSNTKSDIRQRLGKRPYSPEKAFSSNPVIRREPFSDVHSRLGIPRQDIKGLYSDTREKKSGSLWTRLGSAPKTKEKNTKKVEHRAPATEEDDSELQRAWGGSD	422359	449471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_422560_424491_424558_426514_426621_434495_434622_436689_436819_437054_437132_437858_437968_440846_440947_441237_441342_443496_443792_445145_445301_446712_446875_447735_447900_448370_448534_449231
756898	contig_9668_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_58269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCAGTATTCTTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670050	672284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_670000_672300
756899	contig_6210_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_171890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTCTGCCTGCTCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106151	107194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_106200_107200
756906	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	518	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756910	contig_6710_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_97832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653742	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
756911	contig_6228_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_164502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCAGGCCTTTCTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218750	218162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_218200_218800
756918	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756920	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
756921	contig_5799_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_50230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACCCTGAGTCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126610	126166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_126200_126600
756926	SIRV6	+	482	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11031
756929	contig_5445_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_135432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAAGAAGATAGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126443	127117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_126400_127100
756931	SIRV6	+	520	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACGTAAATTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756932	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
756937	contig_14353_pilon	-	2410	10	Intergenic	novelGene_82095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	500.674014839798	1	148	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	589	1035	83281	80452	FALSE	40	ATTAATCAAAGTATGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104394	79076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_86256_86354_87365_87447_88561_88750_90961_91054_104333
756943	contig_19722_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_171903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACAGAGCTGGCGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190454	190134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_190100_190500
756945	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
756947	contig_8357_pilon	+	1116	8	Intergenic	novelGene_39679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_7	290.672478566373	1082	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	88	582	120504	143446	TRUE	5	TTTCTTTTTTTTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMVSVTLVSSFFPVLWDLGRLSYAHIFSSPTAP	120416	153271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_120533_126020_126088_136292_136420_142263_142332_143242_143550_144117_144221_145401_145489_153030
756954	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_98011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	25	CTCTTCTTTAACTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
756959	contig_11396_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_71267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAACTTACAAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214634	216130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_214600_216100
756962	contig_2480_pilon	+	1655	5	Intergenic	novelGene_63521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	412	junction_1	189.718706246906	550	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	142	474	238783	243429	TRUE	35	ACGTAGAATAAATTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVILLLKIWKTRSCAGISGKSQLLFALVFTTRYLDLFTSFISLYNTSMKLIYIACSYATVYLIYMKFKATYDGNHDTFRVEFLVVPVGGLSFLVNHDFSPLEILWTFSIYLESVAILPQLFMISKTGGGGDHHYPLPVLPGPLPRFVSCQLDLALLL	227684	245727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_227731_238687_238789_241936_242096_243261_243516_244632
756963	contig_14638_pilon	+	1857	4	Intergenic	novelGene_71579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	380	745	253154	253519	TRUE	60	GAGAAAGAAAAAAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLQPVTVNTVKLCVWSQESRTLPLGTLWEGRERMMGSEIYCVSCRTPIFQKKKFLLYAACAGGRARGPAGDRPLLLRVAPGTEDTGSSDCQAPCTSGTITSALAPGLGPRGHLPQPRSQ	252774	277560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_+_254328_258230_258365_262339_262458_277508
756964	contig_14441_pilon	+	820	3	Intergenic	novelGene_100760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	337	780	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121244	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121432_125517_125902_126496
756965	contig_16162_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_171904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	294	885	607	1491	12169	11285	NA	15	ACTGTGTTACTCATCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPKPELYPCSSCLLAVSCQQFLPGLCTENHFHPEDSSLEHQKQPEQQDCDQRCWSENTEGQEREVSKPLCGRIWERETSRAFSSPAQGRAASPREGNTVVGTGPNSAQRVNSVETDEGLKELETSRFGAVRYREDQPDCGLKSKFITNQRALLREKPYVCSECGRDFSHKSNLVTHQRTHSGEKPYVCSECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPYVCSECGQGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCGECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPYMCNECGRGFSQRSDLIRHQRTHSGEKPYICSECGRGFTQKSYLLIHQRTHSGEKPYVCSECGRGFNQKSHLLIHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSQKSYLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFYQKPHLHIHQRTHSGEKPYVCKECGRGFNQKSHLLIHQRTHSGEKPYVCKECGRGFNRVSNLIRHQRTHSGEKPYLCLGVGRMLARRQAPSTRGHTQEKPRVQEV	12775	10553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16162_pilon_-_10600_12800
756966	contig_14333_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_49107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGAGTCAAATCATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345811	343933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_343900_345800
756969	contig_12327_pilon	+	1906	5	Intergenic	novelGene_140632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	620.554993534014	5	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	94	639	168930	171003	FALSE	10	CTGTTTTGTATACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148631	172270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841
756971	contig_4519_pilon	-	1897	8	Intergenic	novelGene_123735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	23.4015523643459	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	553	1491	802412	761707	FALSE	45	AACACATTTTAAACACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAVMIPGLLRGSVGTTCTRAALLRLTPRSLRHLTLTSVMKSKRKTDHMERTADVVRREVVSTAKVCGAANESPSVKRLHLLVAEKDFSFKAGQWVDFFIPGVSVVGGFSICSSPRLLEEERIIELAVKYTNHPPALWIHNQCTLDSEVALRVGGQFFFDPQPTDASRNLVLIAGGVGINPLLSILRHSADLLRERANKGSGFEIGTIKLFYSAKNTSELLFKKNILDLVNEFPEKIACSLHVTKQTTQISADLKPYITEGRIMEKEIRDHISKETLFYICGPPPMTDFFSKQLENSHVPKEHICFEKWW	810921	761300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_762654_763395_763639_768630_768773_788185_788293_801943_802008_802293_802421_810377
756973	contig_19957_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_57735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTCAGCAGATCAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301582	300990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_301000_301600
756975	contig_16103_pilon	-	1170	2	Intergenic	novelGene_118718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1084	junction_1	0	322	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	743	1048	208768	207292	FALSE	10	TGAGGCTGCTGGTCTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	209510	207169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627
756979	contig_7887_pilon	+	1687	3	Intergenic	novelGene_124932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.5	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	38	664	578008	585706	FALSE	5	TGCCTGTCTCGTATTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWQPPKPGASAAMASCPDSDKSWVLAGSEPPRKNGSPHSPGEKQKHPRWKEGAKDRHNPLPPWGELLRQKYQAPQGCSGVDECARQEGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	577970	586729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_578059_584639_585122_585612
756981	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
756983	contig_10058_pilon	+	1049	5	Intergenic	novelGene_67700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.226836028883	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	53	370	52368	53244	FALSE	5	GTTGTTTCTCGTTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWSAAVETRSTTGLCSFPRSSPTALWRVPSLARVKVEFCPKPVIISRSFGRVTTGCLRNFRGLTSCSWTMMCFDSVEDLKNKNLLLRAQLRHHGVEVVIKNDNN	51389	53923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_51397_52322_52374_52522_52618_52837_52965_53154
756986	contig_14546_pilon	-	1659	11	Intergenic	novelGene_157405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	110.477192216312	82	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	96	1280	78938	27440	TRUE	10	CCCACTGCCGTTGCGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTESVRGLQGAVSLKLDFMSPPESAKELQNKASSFLEGSPSESPGLQKTKGITGFQTLVHLVKGNMGTGILGLPLAIKNAGILMGPLSVLAMGFVACHCMHILVRCARHFCHRLNKPFMDYGDTVMHGLESSPSSWLQNHAHWGRCVVIFFLTVTQLGFCCAYIVFVADNLKQVVEAINGTTNNCHHNETVTLTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIQNLRVLSIFSLLANISMLVSLVIIIQYIVQGIPDPGRLPLVASWKTYPLFFGTAMFSFESIGVVLPLENNMKDARRFPAILSLGMFIITTLYVVIGALGYLKFGDDIKASITLNLPNCWLYQSVKLLYIVGILCTYSLQFYVPAEIIIPFILSRVPKRQAQVLDLSIRLTMVCLTS	79033	20087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_20421_27393_27445_30741_30912_32170_32338_59343_59443_62207_62427_67589_67675_71344_71441_74551_74641_75454_75546_78774
756987	contig_1443_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_28394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAAATATCTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059124	1058244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1058200_1059100
756988	SIRV7	+	369	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56044	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
756989	contig_5018_pilon	-	1028	9	Intergenic	novelGene_47039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	175.07850917517	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	71	955	1397263	1392342	FALSE	35	TATATATATATTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397333	1392268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395463_1395833_1395852_1397191
756997	contig_5084_pilon	-	2109	11	Intergenic	novelGene_64523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_2	263.517001349059	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	59	1471	467740	423423	FALSE	20	ATTATGGTAGATTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEWRQSFEPRSESGRPSSMRSPGLQIAMTAPSLEELDSFKYCDLQKLAKSLGLRANLKADKLLKALKAHLKQEARRENENQETADECLPLQDGSQTCASSCDESEIQVREQDHAERKTGSYITKSRRRRRTVQGIPDSQQDHSERKMSDLTEFQNQEQPENQDLKTAGEAPTPPDESQGDENADSMEESRINGNEDSKIPSERKKYLCTDAFLKAGKNNKTGSTTPNFKKLHEAHFKKMESIDQYIERKRKHFEEHSNSLNELKKQPFHKGAVTAPTVTPVPVRGRSSGARAPGHGRSQRGSQGTAGRSILGPRRSVKPFALSATKMNVRFSAATEDNEQKRSLTKTPARKSPHVLVSGSTPKGPAVLGTHKLKTTKADPATVITPLKLTAEAVQTPSSNKKPVFDLKASLSRPLTYEPHKGKLKPWGQSKENNPLNEYVSRVSFRKKTYKQPHLQTREEQRKKREQERKEKKAKVLGARRGLVRAAS	467798	422784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_423517_424820_424930_426950_427068_430465_430624_432182_432380_439640_439754_440829_440932_442982_443143_444435_444610_448313_448383_467620
756998	contig_348_pilon	+	1735	8	Intergenic	novelGene_67606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	11.141025490483	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	429	1307	320222	345268	FALSE	20	AACTGTATCTCTTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKTWPVRSGARLVCLWKTDLNIPMFQLHAGTGRRGSPHSQEGH	314478	345696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345142
757001	contig_14225_pilon	-	2271	4	Intergenic	novelGene_52733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	180.495613981799	97	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	44	451	334571	135080	FALSE	30	TTTAAAAGATCCCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVAGREQLLAQQRMHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLAIKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPSSLFFVE	334614	133259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_135104_217374_217495_221790_222033_334549
757002	contig_9821_pilon	+	2467	2	Intergenic	novelGene_171905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246383	249027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9821_pilon_+_248701_248877
757003	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
757006	contig_10042_pilon	+	1632	12	Intergenic	novelGene_79222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	260.385823077033	2	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	155	577	1094897	1095319	TRUE	40	TACACTTGAAAAGGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSSRVLRHRGRTQVQPEPGSGAVGSARGPRTGGDTPGHGFCYCPGSLKRKRSSGAFCYCHPDSETDEDEEEGDEQQRLLNTPRRYLGGRAHTGPLPHLLGHGAPPPRAPATRPGDEPSARCAWEVRRSPACKERTCP	1094742	1136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1095324_1105095_1105220_1107155_1107253_1108989_1109088_1111263_1111340_1115848_1115915_1117491_1117583_1118643_1118782_1129053_1129124_1131831_1131908_1135430_1135577_1136612
757008	contig_7078_pilon	+	1707	3	Intergenic	novelGene_130114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	218.5	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACTGAATGAAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29762	183804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_106254_106398_182312
757012	contig_11429_pilon	+	1711	10	Intergenic	novelGene_60473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	53.5193515249795	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	200	1657	60117	67460	FALSE	30	TGTGTTTGTAAATAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVWQQVLAVDARYNAYRTPTFPQFRTQYIRRRSQLLRENAKAGHPPALRRQYLRLRGQLLGQRYGPLSEPGSARAYSNSIVRSSRTTLDRMEDFEDDPRALGARGHRRSVSRGSYQLQAQMNRAVYEDRPPGSVVPTSAAEASRAMAGDTSLSENYAFAGMYHVFDQHVDKAVPRVRFANDDRHRLACCSLDGSISLCQLVPAPPTVLRVLRGHTRGVSDFAWSLSNDILVSTSLDATMRIWASEDGRCIREIPDPDGAELLCCTFQPVNNNLTVVGNAKHNVHVMNISTGKKVKGGSSKLTGRVLALSFDAPGRLLWAGDDRGSVFSFLFDMATGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	59579	67514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_59733_60070_60158_60906_61148_61759_61870_61989_62121_62735_63044_63853_64035_64134_64277_66731_66851_67275
757014	contig_15691_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_60782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119028	119520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_119000_119500
757015	contig_7530_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_141834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGGTTAAATAGAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143223	145143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_143200_145100
757016	contig_7530_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_141835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTTTTCACTTACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145240	146299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_145200_146300
757017	contig_11538_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_152302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACATCTCTGCTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228316	226997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_227000_228300
757020	contig_9609_pilon	-	1986	2	Intergenic	novelGene_22960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239160	237138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_237418_237453
757022	contig_6589_pilon	+	869	5	Intergenic	novelGene_25761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_1	1470.55999112583	8720	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	288	779	669670	672754	FALSE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668287	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669650_669748_670000_670104_671046_671188_672584
757026	contig_9871_pilon	-	1302	8	Intergenic	novelGene_75632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTCTGAGGAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352636	341401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_341498_342254_342385_344555_344792_348534_348638_349786_350011_350217_350348_351357_351424_352319
757027	contig_6710_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_89842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
757030	contig_3825_pilon	-	1211	9	Intergenic	novelGene_78018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	865.652752262707	2	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	33	818	1470962	1462191	FALSE	15	TTTGATTTGCATTTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGDQGPPGIPGKAGPKGERGPHGEKGEPGHSEYCRTAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGECLTMTRVLQAVLRGSREPGGTTTVTHPT	1470994	1461797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462273_1463654_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
757032	contig_8729_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_40130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTATCAGGAAACTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570268	569552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_569600_570300
757034	contig_16578_pilon	+	2018	3	Intergenic	novelGene_148690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	632	junction_2	235.5	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	543	959	341015	344752	FALSE	70	GAAAAAGAAAAGGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEEAISLCKELAEQYEMEIFDYELLSQNLIQQAKFYENIMKILRPKPDYFAVGYYGQGFPSFLRNKVFIYRGKEYERREDFQMQLMSQFPNAEKMNTTSAPGDDVKNAPGQCILGECHSQGPGMGSPGWDLAHKVPS	340472	345811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_341105_342681_342787_344530
757037	contig_13490_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_129125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62379	62130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_62100_62400
757038	contig_3560_pilon	-	1497	6	Intergenic	novelGene_149491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.2321486325355	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	84	527	210973	87886	FALSE	20	GGCTTATTCCATTAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRRRDAPRDSVGSGFREGVAAGTAGKMPVAVMAESAFSFKKLLDQCENQELEAPGGIATAPVYGQLLALYLLHNDMNNARYLWKRIPPAIKSANSELGGIWSVGQRIWQRDFPGIYTTIGAHQWSETVQPIMAALRDATRGRAFALVSQAYTSIIVDDFAAFVGLPVEEAVKV	211056	86915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_87891_203206_203315_206569_206703_207915_207965_209277_209349_210895
757039	contig_938_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_143916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCTTACAACTAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91364	91048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_91000_91400
757042	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757043	contig_11631_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_104175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTAGCGTGGTCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52003	52729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_52000_52700
757048	contig_12638_pilon	+	1650	13	Intergenic	novelGene_33178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	222.5670155007	4	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	90	890	269238	270918	TRUE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQDAQTMTVMAHMTLLALSTLAWPSSSQSRPSLNVSTLRSSRKRKATRTLELSVSRLAR	235704	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270608_270692_270827_270921_271699_271746_273449_273584_273761_273999_274124
757055	contig_7389_pilon	+	2009	7	Intergenic	novelGene_171908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAGAAAAAATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381632	419265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7389_pilon_+_382935_385776_385917_389316_389413_399663_399728_409101_409168_415628_415778_419073
757059	SIRV6	+	346	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	411	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10682_10819_11031_11109_11205
757061	contig_9653_pilon	+	3065	1	Intergenic	novelGene_48312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	112	420	1012244	1012552	NA	65	CGTATCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRHSGCNNGLKIPMITRMAQDGTMFCSVVHRVAMSQNQLDSTQQQQQQCTSEGRIKTFSDCYLLSVLLRELLEDVFHDKGVSQESKDMQCKKQDVAQACLG	1012132	1015197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1012100_1015200
757062	contig_7816_pilon	+	1120	8	Intergenic	novelGene_66503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1174.43954501624	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	79	1014	170169	211658	FALSE	35	ATGAATTGTCCCCAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170090	211764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170238_196807_196910_207503_207661_207803_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
757063	contig_6164_pilon	+	2262	4	Intergenic	novelGene_121308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	11.2249721603218	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGTTTCTTTTTGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781908	795409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_781955_791057_791090_792278_792364_793310
757064	SIRV6	+	305	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8135	-2	604	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTTGTCGAAATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
757067	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	1	1154	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757071	contig_15474_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_136225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	186	539	24930	25283	NA	10	CTCAGCGTGTCCGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAASGQRNRAGQCTLCPVQSPLYTLLGSDKGKAWLSQGTPILMWLPHLSLLATWEQHKAPGAACGGLGSWTPGRLLPASREVGGWVAMLEHSPKNPGVGTVWFAEDPGRATEHQIP	24744	26350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_+_24700_26400
757073	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	136	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
757074	contig_5649_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_82385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTATAAAGATTCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078097	1077699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1077700_1078100
757080	contig_17964_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_33849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCTGGTGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135040	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135000
757081	contig_15596_pilon	-	2240	7	Intergenic	novelGene_139517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1492	1992	105683	55257	TRUE	40	TGGCACCAGTAAACACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRTSPDNTAGHTRAEPPQTNTSAWGGKEKLHNFLKRHFPLPSVVKCETHSPLLPGSVLCCSSGHCFFLGSRAVPQRPRHPDTFLQETPVPTAQCPQASLQRQLLPARDPGTSGYGGDFHTSSDEGRSSGKPEYCSALLMTSKKSFNLRLEDADTREYTSQLQYGG	111370	36149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_36328_55186_55259_104274_104361_104474_104609_105404_106700_107311_107551_111134
757082	contig_10324_pilon	+	2177	21	Intergenic	novelGene_7703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1527.8248557999	2	124	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	554	1183	69577	73452	TRUE	30	TGAGTCGATTCCAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVYPPPDPWHG	51781	79531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68066_68126_68713_68799_68964_69050_69374_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73482_74487_74751_74831_74927_75797_75906_76009_76071_76201_76271_76440_76530_78365_78480_79365
757083	contig_4845_pilon	+	2284	7	Intergenic	novelGene_53623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	409.987567562183	1	113	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	117	746	219349	221846	FALSE	20	TATTTCACCATTTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	218835	223384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_218951_219347_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657
757084	contig_6102_pilon	+	524	3	Intergenic	novelGene_31806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	4090	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCGTCTTGTCTGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360112	361219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
757086	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8131	2	608	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
757090	contig_4426_pilon	+	2255	1	Intergenic	novelGene_15367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGCACCATGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115520	117775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_115500_117800
757091	contig_13365_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_168080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAGAAAGAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21454	21286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_-_21300_21500
757093	contig_2377_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_67919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCACATTTTTAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271195	272402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_271200_272400
757095	contig_10372_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_112524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90144	88025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_88000_90100
757096	contig_10962_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_103897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCAGTGGGAAATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316781	318428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_316800_318400
757097	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	61	503	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757098	SIRV7	-	462	2	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	0	58810	0	-58810	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTGTAGTCCCAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	114847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_114961_147608
757099	SIRV6	+	516	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1233_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757102	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	536	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757104	contig_2550_pilon	+	1052	8	Intergenic	novelGene_135628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	147.926622736699	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	389	934	401163	478483	FALSE	35	GAAAACCAAATTGGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKTLVSEAIAAGVFNDLGSGSNIDLCVISKSKLDFLRPFSVPNKKGTRFGRYRCEKGTTAILTEKVTTLEIEVLEETVQTMDTS	397204	478601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397367_397613_397708_398493_398592_401128_401270_409544_409661_436086_436146_473100_473253_478371
757110	SIRV4	+	332	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCTTGCACCCGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3657	3989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
757114	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
757115	contig_15613_pilon	-	3127	5	Intergenic	novelGene_147229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1.6393596310755	42	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1221	1604	363204	362821	FALSE	35	AAGAAATGTGTCATGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSHVPTKKHCYQSLANEVILWSFLIKGQKNQRTVGTSGHHYAVLNEMTKMTSLSLQLESPPPSNSFLSHVKSHFLTGLPPERPGTHQNSTNLGEWCLASPFGGFCPALMNSPGGLMRCYCLTFTC	381216	361297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_363696_374573_374760_377725_377888_380433_380610_381011
757129	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757130	contig_2988_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_136537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTGTTCTGTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36919	36005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_36000_36900
757131	contig_5210_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_65461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGGTTTCCCTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659245	654546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_654848_657784
757133	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757134	contig_13740_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_34751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAGAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680171	682375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_680200_682400
757135	contig_10003_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_88228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCTTTCAATTAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623926	625785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_623900_625800
757137	contig_10324_pilon	-	1999	9	Intergenic	novelGene_7914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	11.7898261225516	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	224	1537	885096	876129	FALSE	0	TTCTCGCTCTCGTTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWVQAILLARGLSRGWGGICGPTLTGAPFSQVASQVLRGLHCSAATHSSHSDSSLVPDPPELSRRPIKALVPHEELFGQAPSGERDKASFVQAVQNFRQHSVRKRGHVDFIYLALRKMRQYGVERDLAVYNMLLDIFPKEVFRPRSIIQHIFVHYPRQQECGVAVLEQMENHGVMPNKETEFLLIQIFGRKSYPMLKFLRMKLWFSRFKNINPFPVPRDLPQDPVDLAKLGLRHMEPDLSARVTVYQMPLSKDSTGAADPTQPHIVGIQSPDQQAALACHNPARPIFVEGPFSLWLQDKCVYYHILRADLLAPEEREVEEIPEEWNLYYPMQLDLDYGRSSWDDYEFDIEEVEEGPVFAMCMAGAHDQATLAKWIQGLQETNPALARIPVVFRLAGSTGELLAASPGLEEPPPPPPAQGQEEEDDNLQRRQQQGQS	892303	875666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_876386_877008_877115_877263_877413_877524_877583_881124_881349_881598_882023_885000_885118_891918_892059_892241
757138	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
757140	contig_6364_pilon	+	1005	5	Intergenic	novelGene_51867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.6984250992003	2501	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCTGGCCGGGTCACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485574	2489307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486060_2486530_2487476_2487586_2487738_2487843_2489125
757143	contig_20944_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_167535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23483	22969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_23000_23500
757144	contig_8907_pilon	-	382	4	Intergenic	novelGene_85805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1806.20861352047	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	100	336	178678	173397	FALSE	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179474	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391
757146	contig_5718_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_110398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	742	1047	1297249	1297554	NA	70	TAAGGAAAAAGGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQEGTGTGRMDTGNLGWKGGVCCHIVGTATNVTKQYVYKFFYEKLTFRYTFSPKAQLKKKKVSHDYSARKHPLIQMALNTQMWCRPTSLFFRQLHQYPP	1296507	1298023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1296500_1298000
757150	SIRV4	-	419	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1104	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
757152	contig_3155_pilon	-	2317	16	Intergenic	novelGene_26326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	27.9176566988627	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	109	1545	73282	54649	TRUE	20	ATTGTAGCTTTTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLALAPGKWSCRRGGSLLGGCGAESYSKDTGTPVSIMVLGAEQKMPDDNASGDHGDTASLGAINPAYSNSSLTQSTGHSEEPFTTYFDEKIAIPEVEYSCFSFRKLWAFTGPGFLMSIAYLDPGNIESDLQSGAVAGFKLLWVLLLATIVGLLLQRLAARLGVVTGLHLAEVCHRQYPKVPRIILWLMVELAIIGSDMQEVIGSAIAINLLSVGRVPLWGGVLITIADTFVFLFLDKYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVTVKPSQSQVLKGMFVPTCSGCDTQQIEQAVGIVGAVIMPHNMYLHSALVKSRQINRANKREVQEANKYFFIESCIALFVSFIINVFVVSVFAEAFFGKTNEQVVQVCKNTSIAWTGLFPDNNSTLTVDIYKGGIVLGCYFGPAALYIWAVGILAAGQSSTMTGTYSGQFVMEGFLNLRWSRFARVILTRSIAIVPTLLVAIFQDVQHLTGMNDFLNVLQSLQLPFALIPILTLTSLRPVMSDFANGMVGNV	83752	48211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_48946_54610_54665_61109_61184_61623_61774_61928_62049_63201_63289_64439_64599_65464_65621_66761_66830_66955_67027_67553_67661_69829_69950_70306_70433_70992_71142_73248_73321_83682
757158	contig_6217_pilon	+	1229	7	Intergenic	novelGene_109631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGTGAGGGAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462606	494682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_463217_463889_464006_464380_464552_466578_466672_467011_467095_468432_468522_494615
757160	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	51	505	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757161	contig_11292_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_109455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAAAAATAGTTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385410	384551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_384600_385400
757164	contig_10904_pilon	-	2198	8	Intergenic	novelGene_22618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	277.930324552976	280	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	487	1518	510205	499813	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	515801	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515706
757169	contig_7870_pilon	-	1516	6	Intergenic	novelGene_108941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_1	354.065304710868	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	240	734	496465	295191	FALSE	60	GGGAGGGAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAISKYLTYRSSWWNDLALWNY	497931	294408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
757170	SIRV5	+	425	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7464	2	-71	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCGTTCTTTTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
757177	contig_366_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_51628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367738	1370325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1367700_1370300
757180	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	182	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757182	contig_7202_pilon	-	405	2	Intergenic	novelGene_18601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAACTGATGAAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	28546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
757184	contig_10404_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_138632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAATATTCTTTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412806	414847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_412800_414800
757191	contig_7887_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_124861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACATCACACAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142935	141883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_141900_142900
757193	contig_4364_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATCCGACTGCATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015298	1014583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1014600_1015300
757199	contig_12970_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_50551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTCGTAGAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570403	571293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_570400_571300
757202	contig_14536_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_69277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACATATGCTAGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51433	50668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_50700_51400
757203	contig_14536_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_69275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAAAGAAAACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49665	48572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_48600_49700
757204	contig_8914_pilon	-	666	4	Intergenic	novelGene_112869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4224	junction_1	1483.93628195044	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	137	625	267367	264566	FALSE	20	TGATGCTGTGCTTCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	267503	264524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319
757216	contig_8954_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_130323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATATGAAGGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673280	671516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_671547_672850
757218	contig_8138_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_52501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAGGTGAAGGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463342	464030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_463300_464000
757226	contig_10404_pilon	-	1126	5	Intergenic	novelGene_138659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATTCTCCTCCTCCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100474	1085380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1085483_1097963_1098109_1098196_1098303_1098720_1098851_1099831
757232	contig_11815_pilon	+	2171	10	Intergenic	novelGene_50922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	59.7118595660821	77	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	70	1761	251551	270244	FALSE	25	CTAAGAGTACTTTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANAEVSVPVGDVVVVPTEGNEGENPENTKTQVILQLQPVQQGIYEAGSENNTAVVAVETHTIHKIEEGIDASTIEANEDMEIAYPITCGESKAILLWKKFVCPGINVKCVKFNDQLISPKHFVHLAGKSTLKDWKRAIRLGGIMLRKMMDSGQIDFYQHDKVCSNTCRSTKFDLLISSARAPVPGQQTSVVQTPTSADGSITQIAISEESMEEAGLEWNSALTAAVTMATEEGVKKDSEEISEDTLMFWKGIVDVGLMEEVVCNIQKEIEELLRGVQQRLIQAPFQVTDAAVLNNVAHTFGLMDTVKKVLDNRRNQVEQGEEQFLYTLSDLERQLEEQKKQAQDHRLKSQTVQNVVLMPVSTPKPPKRPRLQRPASTTVLSPSPPVQQPQFTVISPITITPVGQSFSMGNIPVATLSQGSSPVTVHTLPSGPQLFRYATVVSSAKSNSPDTMTIHPSSSLALLSSTAMQDGGTLGNMTTMVSPVELVAMESGLTSAIQAVESTSEDGQTIIEIDPAPDPEAEDTEGKAVILETELRTEEKVVAEMEEHQHQVHNVEIVVLED	245342	270654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_245386_251524_251679_256626_256710_257410_257536_259864_259969_262316_262475_264083_264216_264670_264809_266953_267077_269543
757235	contig_11294_pilon	+	1870	10	Intergenic	novelGene_50059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	108.118248022966	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	416	1135	306332	325920	FALSE	35	TTACTAGAACTGGGTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGGSNHLAVVLGDIILAVIDSIFVWFISFAMSFGKVSCVIKDRLFLICNNRKKYSYVIIVTLI	251374	326655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693_323788_325734
757238	contig_9345_pilon	+	716	2	Intergenic	novelGene_24588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	743	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGCGAGCCCAGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944543	945535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_945112_945387
757239	contig_3382_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_124180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTCATCACTGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959217	959870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_959200_959900
757240	contig_12638_pilon	-	2120	13	Intergenic	novelGene_33154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAAGCGGCGGCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232970	204240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_204360_204943_205052_206672_206790_207169_207255_209558_209712_216680_216774_217384_217526_227199_227355_227781_227887_227961_228045_228969_229054_229498_229589_232183
757245	SIRV6	+	521	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1156_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757254	contig_12837_pilon	-	2723	1	Intergenic	novelGene_57325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCCTGCAGCTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142680	139957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_140000_142700
757256	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	2	414	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757266	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	15	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	658186	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658186	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
757267	contig_14666_pilon	+	1678	5	Intergenic	novelGene_39607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	80	1435	477340	484940	TRUE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477260	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_485115_485162
757269	contig_10205_pilon	-	1797	15	Intergenic	novelGene_143112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_13	59.2702217278919	1	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	105	1706	242615	220058	FALSE	30	TAATACTCTCGGATCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIGGVTLLRAAAKNHARVTVVCDPEDYAAVSMEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDLPESAVRDLIIATIAVKYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	255767	219966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398_224492_229372_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694
757272	contig_1867_pilon	-	2466	13	Intergenic	novelGene_54611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	183.315358967363	1	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	113	1768	553353	517583	FALSE	20	GATGAATGTTATTTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEELPLFCGESGKPVQATLSSLKMVDVGKWPIFSLCSEEELQLIRQACVFGNAGNEVLYTTVNDEIFVLGTNSCGCLGLGDVQSTLEPRRLDSLSGKKIACLSYGSGPHIVLATTEGEVFAWGHNAYSQLGNGTTNHGLVPCHISTNLSNKQVIEVACGSYHSLVLTSDGEVFAWGYNNSGQVGSGSTANQPIPRRVTGCLQNKVVVNIACGQMCSMAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566866	516884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972_551129_553311_553377_566777
757273	contig_12050_pilon	+	1017	4	Intergenic	novelGene_62775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	22.3059533657621	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	56	1015	928147	931301	FALSE	15	ACTCTCCCAGCAGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSELRQHEITDAEIISKPMVLFLGPWSVGKSTMINYLLALENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKTIEGIVMAADSTRSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIENRKQQERGYPFNDVCQWFIDRADLIFVVFDPTKLDVGLELELLFRQLKGRESQIRIILNKADSLATQMLMRVYGALFWSLAPLINVTEPPRVYVSSFWQQDYKPDTHRELFLEEEISLLEDLNQVIENRLENKIAFIRQHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKMTFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTILAKTNVSKFDLPNREAYKDFFGINPISSFK	923133	931303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_923166_928123_928241_928496_928731_930669
757274	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	3	1205	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757275	contig_17500_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_157928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278074	278466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_278100_278500
757276	contig_6546_pilon	-	786	5	Intergenic	novelGene_140963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	215	538	591527	589629	TRUE	20	TGTCGGAGACGAACTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRAGVPQDDSEECFWHGFEGITNTNENVLLFLGLSQLTASCAWVVRDADSRVPAEIPLSSPQPWNTLFLHRSIHTLYHLVGQVLLWKISAFDYHLVILVLKSQYQ	591741	588422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_588626_589583_589668_589842_589925_590561_590634_591396
757277	contig_6546_pilon	-	2145	17	Intergenic	novelGene_140962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGAGCCGGGTGGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584662	562828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_562937_564728_564798_565898_566027_571879_571987_572192_572331_572522_572633_573068_573240_575575_575687_575838_575960_577267_577371_580480_580562_580646_580768_580954_581081_581376_581538_582971_583128_584032_584209_584504
757289	SIRV4	+	330	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGCACAAACTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
757291	contig_1957_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_154258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAGAATGAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196573	197027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1957_pilon_+_196600_197000
757293	contig_6215_pilon	+	1505	2	Intergenic	novelGene_21230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	156	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTGTTTTATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503030	514080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_503394_512938
757295	SIRV4	-	321	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757300	contig_16594_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_53855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128682	129066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_128700_129100
757306	contig_3150_pilon	-	2657	10	Intergenic	novelGene_171912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	11.8112731252607	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	44	1576	275943	252186	FALSE	15	TTTGCAAAGTGTGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSKEEYACWLQRHMEAESALDNREELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETIAKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDQDEEVITFNAESQEACAALLDQCLRYVQSKGPGSAQEKTSKDISVAFSPLSPPSVSTASGRSPSLVIDGRSLAYALEKSLEDKFLFLAKQCGSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPRFRYLERLLIVHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFYCGFSASAMIDQWYLIFFNLLFSSLPQLVTGVLDKDVPADVLLAQPQLYQSGQNREEYRPRAFWTNMADAAFQSLVCFFIPYLAYYDSDVDIFTWGTPITAIALLTFLLHLGVETKTWTWLNWIACGFSILLFFIVALIYNSSCATCYPPSNPYWTMQTLMGDPRVLLDLYHSARGCTAAQIVYQSPPGDPFPHPTPAGTPVGQEVRQEAQHSQRHLCSGTAPERTEEQQQL	275986	251104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_-_252342_252480_252670_253376_253482_253556_253638_255156_255358_259175_259302_262823_262901_265678_266007_269270_269456_275858
757307	contig_12638_pilon	-	941	7	Intergenic	novelGene_33225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGGAGCTGACTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616980	610327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_610388_610531_610649_610782_610870_613328_613504_614062_614241_614436_614617_616836
757308	contig_15825_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_160197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATACTGAAGGAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52662	54378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_52700_54400
757309	contig_16492_pilon	+	583	4	Intergenic	novelGene_100287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	95.7635978160108	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCCACTTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113345	154638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_113481_149405_149465_153431_153619_154436
757314	contig_13525_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_145084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGGATGTAGAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49496	49822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_49500_49800
757315	contig_12635_pilon	-	1351	12	Intergenic	novelGene_60817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	469.967908171126	5	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	960	1343	189679	180251	FALSE	30	GAAAATCTACCTTTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262860	180242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192725_197118_197174_201014_201159_206834_206898_206935_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_262709
757316	contig_504_pilon	-	1206	2	Intergenic	novelGene_54445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTAAGTTTGAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241978	240344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_241471_241898
757318	contig_12886_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_135490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439767	437928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_437900_439800
757326	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
757327	contig_15787_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_143998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCTCGTATCTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110184	111886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_110200_111900
757331	contig_5047_pilon	-	1522	6	Intergenic	novelGene_158012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	27.6014492373136	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAAGCTTCTCTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682640	1665870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1666300_1666837_1667078_1668204_1668626_1671814_1672052_1674021_1674095_1682518
757332	contig_10235_pilon	+	2064	13	Intergenic	novelGene_46567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCCCCCACCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537156	546924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_537824_538325_538409_538547_538660_538882_538955_539167_539249_539462_539577_539726_539906_540346_540442_540529_540707_541372_541511_541668_541803_541893_542027_546845
757333	contig_12414_pilon	+	1585	10	Intergenic	novelGene_59631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_1	410.604011574397	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	10	1518	653015	679987	FALSE	45	AAATGGAAAATATAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVMDLAAAADPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPARHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGVRGLRALGVRDLSYRLVFLACSVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDIRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKVCVSVPVPSFVG	653005	680054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653122_655641_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_679840
757336	contig_14811_pilon	-	834	2	Intergenic	novelGene_74497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	130	768	375703	375065	FALSE	20	ATAGGTTTTACTTCCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGTIFVLLLIRGC	386596	374998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_375765_386528
757348	contig_5084_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_64693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	606	1004	1862651	1863049	NA	35	TAGCCAATACAGGCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASFQNKESKNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRILQEISKEIKQNAEHSTEEIKKIREESNDTFNGLQESIERQQSEIQKINNKMSELDNSVESRTEAMEGRISEIEDKALDTNLFKEKSDKRILKNEETL	1862045	1863867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1862000_1863900
757349	contig_6634_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_171131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTCCTTCTAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58888	61120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_58900_61100
757350	contig_1443_pilon	+	1526	14	Intergenic	novelGene_28248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	60.224530573847	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	503	1369	538016	541665	FALSE	45	ATAATAAATTTTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRFVSLCPGQLLGRSSTCDHSV	536016	541822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541601
757351	contig_5019_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_109223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCCTTTATAATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333089	331934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_331900_333100
757352	contig_21388_pilon	-	786	5	Intergenic	novelGene_136630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	788.967996816094	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	14	580	28487	21603	FALSE	10	TAACCTGCGTGTGGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28500	21396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21682_22353_22499_26756_26851_27534_27649_28352
757353	SIRV6	+	562	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11020_11109_11205
757360	contig_17440_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_7581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTAGGCCTACTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2143	1924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1900_2100
757361	contig_11259_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_144541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCTACCTAGCACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174767	173864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_173900_174800
757362	contig_9955_pilon	-	1454	5	Intergenic	novelGene_21292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	851.777112864627	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49898	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_46954_46999_47590_47737_48794_49381_49695
757363	contig_7695_pilon	+	1409	10	Intergenic	novelGene_41615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	38.9893939361228	378	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	141	530	626072	626876	TRUE	5	GCCTGATCTGTGTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPEESDLHSASGSLAVRPVSAPLGAYRGVLDVRPEGPPPTSPRAQMPGQPPSKDTEEMEPEADSAAEMNGEEEESEEERSGSQTESEEESSEMDDEDYERRRSECVSEMLDLEKQFSELKEKLFRERLSQLRLRLEEVGAERAPRVHRASRGGCSGASRFAFRWQASTRASVWM	622727	630265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_622861_626064_626211_626302_626394_626573_626704_626846_626927_627006_627104_627636_627730_628879_628945_629280_629321_629731
757366	contig_6595_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_122542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTTTCAATAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595398	596846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_595400_596800
757372	contig_15410_pilon	+	621	6	Intergenic	novelGene_130625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	875.617724809177	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	103	606	145617	148505	FALSE	55	ATATGAAAATAAATTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGSVRASLATMPTLPSPFGSKDIQQPCRLQAPDCDPLQITSLVGGFLWRDK	145514	148520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147763_147832_148070_148080_148432
757373	contig_10235_pilon	-	1130	3	Intergenic	novelGene_46617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.5	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	351	479	609304	609176	FALSE	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKHLAPSWPPPLPAPTPPLESRVPALFPNPSHPSPISFSPPGDLSPALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610454	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609749_610324
757374	contig_6710_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_98119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CATCTCGTCCCCCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
757376	SIRV4	+	330	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTGCACTGGGGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3647	3977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
757378	contig_6102_pilon	-	1668	4	Intergenic	novelGene_31984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	422.391866504185	39	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	19	360	438578	418292	FALSE	5	TCTTGTGGATGCCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEPEKMAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ	438596	416983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_418369_418971_419006_436270_436391_438467
757379	contig_13494_pilon	+	2777	1	Intergenic	novelGene_167513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTATGCAAAGATGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31478	34255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_31500_34300
757380	SIRV7	-	505	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	53	58748	14	-58742	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATACTTAAAACGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147904	114779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_114989_147608
757386	contig_5253_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_61601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTTTCATTATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370525	369744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_369700_370500
757387	contig_19210_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_168936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGAGGTTTCAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202926	203319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19210_pilon_+_202900_203300
757388	contig_19210_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_168935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGACACCCTTTTAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202872	202270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19210_pilon_-_202300_202900
757391	contig_2537_pilon	+	1849	2	Intergenic	novelGene_33413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	0	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	81	395	205895	228694	FALSE	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKYVPIFVGDITSPRRSTMFLLHCLLVIIDQHQKMKMK	205814	230148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454
757398	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
757399	contig_18850_pilon	+	886	5	Intergenic	novelGene_142454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	6.75925291729789	697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	248	751	253252	254888	FALSE	15	AGCGAGGCCAGGTGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLTLVVLGTPTCWAGTMYGYGGGKYFSASAGSEDEITGIRFCVGPAGLFKSVQLRVGSSWSERHGAPGGNCQEFILWPDEHIVSVYGTYGLFLRSLVLYTDQGRVATFGSDSGQSFFAYPEEDGQVLTGVSGQHKLLGISGLIFKWNFPPGEATAASRSTTTIT	252516	255023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_252660_253055_253134_253225_253307_253488_253595_254545
757402	contig_14770_pilon	-	1270	2	Intergenic	novelGene_169468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATATGTGTATGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60404	41064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14770_pilon_-_41989_60058
757409	contig_10904_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_22510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATAAACAGAAAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344081	343623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_343600_344100
757411	SIRV6	+	409	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	553	0	374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757412	contig_5684_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_81005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGTAAAAGTAGAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311569	311292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_311300_311600
757418	contig_18869_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_56100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73587	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
757419	contig_5649_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_82341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	773	1102	579938	580267	NA	10	GCATGACTTGTTCTCGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQMRSQGCVYLESGQPSQRGLEKFSGTLGWGRCHPGERSKGSHFWLRADSAVWEAPFPLLQRHWCCGGQSALNQIELVCEEGLLDHRGWEEAGQTQGLPSGYTQVSFP	579165	581407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_579200_581400
757421	contig_7426_pilon	+	2304	12	Intergenic	novelGene_27521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_10	228.821631064406	92	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	50	1531	1011980	1016723	TRUE	10	TGGCTCTGCCATGCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPAADSTFGTQVLAVMRPPLGEPQLQEEPPVPVSILCRFPFSSTLQRMAVVVTWPRATQPEAYVKGSPELVSGLCRPETVPTNFAQTLQSYTAAGYRVIALASKPLPIAPNLEAAQQLTRDTMEQDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQALRRTHIRAVMVTGDNLQTAITVARGCSMVGPQEHLVIVHAIPPEQGQPASLEFLPVESSAAVNGTKDPGQAVSCTMELDPRSSHLALSGSTFTILVKHFPKLLPKVLVQGTIFARMTPEQKTKLVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSSFTSSAASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDMQFLTIDLVITSTVAVLMSRTGPALVLGRARPPGALLSVPVLCSLLLQVALVAGVQLGGYFLTMAQPWFVPLNRTVPAPDNLPNYENTVIFSLSSFQYLILASAMSKGAPFRQPLYTNGAAAWGGGKDRAERGGREG	1011930	1017576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1012013_1012100_1012261_1012365_1012487_1012605_1012731_1013438_1013600_1013721_1013839_1013929_1014010_1014671_1014825_1014907_1015005_1016203_1016428_1016512_1017077_1017156
757423	contig_13051_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_140118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAACAGAAGAACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337543	336547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_336500_337500
757427	contig_19012_pilon	-	2220	2	Intergenic	novelGene_159484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACGGATGAGCAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87069	76903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_77985_85930
757434	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
757436	SIRV2	-	223	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4623	61	3448	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
757438	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_93663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
757439	contig_9706_pilon	+	1774	2	Intergenic	novelGene_20909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100931	105920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_101151_104365
757440	contig_1594_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_138840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAACCCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670197	671392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_670200_671400
757442	contig_10082_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_63905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATTAAAGTAGCCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508110	509205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_508100_509200
757443	contig_10082_pilon	+	1003	5	Intergenic	novelGene_63906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	12.5499003980111	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	394	1002	532638	534981	FALSE	45	AATGTAAGGAATGTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METFRNLASVESQNLDGEKLYIERIIAQIMNNDSWSSMLGEIFESLGSEDQPKNEGQHLSMLPVFNRRRTEEILHGSNESSPCENTFSQISNLNVLKRNDSEVKPFEGGDCGKAFMEHSSLKLHIRSFTRRNTCQSKERGEACSLPSNQSTSMRTLAREKPYKKHYQCNKCWKDFCSVSSFQRHVRDSKHECKEKFQNGNKPY	511301	534982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_511521_525894_525973_532541_532669_534075_534224_534551
757444	contig_6048_pilon	+	1775	2	Intergenic	novelGene_73358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	328	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	135	1226	3020745	3033043	FALSE	40	CAGACATGCGCATATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGTVARRPRGGAVTCVHTAWAACREQWRVLQQRSPTCRRAGGRRPGAAPRAAGPSAMWGCDALNGTVGGSDLPLCRDLPLALWALSLLYLLVGLPLGLGYNALLVLANLYSRRSMSMPDVYFVNMAVAGLVLGALAPAYLLGPAHARWALWRLSSEAQVTLLTLFHVSALVTMYSTALLSLDCYIERALPRTYMSSVYNTRHVCGFVWGGALLTSFSSLLFHICSHVSSRLAECAEMRSTEAADAIMVLVGYVVPALAALYALALIARLRKEDTPLSRGDAGRLDSSMHRLLGVTVGTQLGLWTPYYVTLLGQVLVATRGEACGRALHGGPAPRQGCCPAPGLLQQLGDAPALPPHGQELP	3020610	3033592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3020886_3032092
757445	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757454	contig_14954_pilon	+	1894	2	Intergenic	novelGene_165163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	72	1247	32521	45122	FALSE	5	GGCATGTGTTTTTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREAGMKMLPGVGVFGTGSSARVLVPLLRAEGFTVEALWGKTEEEAKQLAEEMNITFYTSRTDDVLLHQDVDLVCINIPPPLTRQISVKALGIGKNVVCEKAATSVDAFRMVTASRYYPQLMSLVGNVLRFLPAFVRMKQLIAEHYVGAVMICDARIYSGSLLSPSYGWICDELMGGGGLHTMGTYIVDLLTHLTGRRAEKVHGLLKTFVRQNAAIRGIRHVTSDDFCFFQMLMGGGVCSTVTLNFNMPGAFVHEVMVVGSAGRLVARGADLYGQKNSATQEELLLRDSLAVGAGLPEQGPQDVPLLYLKGMVYMVQALRQSFQGQGDRRTWDHSPVAMAASFEDGLYMQSVVDAIKRSSRSGEWEAVEVLTEEPDANQNLCEVLQRNNL	32449	45769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_32798_44223
757459	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	152	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757465	contig_19076_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_74216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1235	1537	113532	113230	NA	30	CATAGCAGTCCAGGGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRGHNRGFWTELEKDVEHNSNSQRKDQIYWPKGDWKNPESMAPRHPFSSEVKSLPRFTIQPGIGQPLKTKQDK	114766	113227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_113200_114800
757466	contig_6533_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_114624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAGAAAATCAATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25821	25187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_25200_25800
757467	contig_7898_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_47651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCTGGGCTAATGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848643	849564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_848600_849600
757468	SIRV5	-	470	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
757473	contig_7707_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_72191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTGAGCATGGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620772	619809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_619800_620800
757475	contig_1948_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_31167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAACAGAGACTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475409	475860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_475400_475900
757476	contig_2161_pilon	+	1281	4	Intergenic	novelGene_114913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGCACGGTGATGACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778299	792871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_778869_782626_782853_791192_791379_792571
757477	contig_11978_pilon	+	887	6	Intergenic	novelGene_63052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_5	2755.83806490875	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	280	870	1827946	1831883	FALSE	20	TGTCTGTACATAATGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827666	1831900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
757481	contig_9186_pilon	-	1215	10	Intergenic	novelGene_85342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	77.1434450300938	1091	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCAGCAGCATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310856	274081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299111_302208_302387_310798
757483	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757484	contig_3449_pilon	+	2300	2	Intergenic	novelGene_73701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290059	293564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_291140_292344
757487	contig_854_pilon	-	2960	1	Intergenic	novelGene_36562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACATATTCCATGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670619	1667659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1667700_1670600
757489	contig_4350_pilon	+	2209	2	Intergenic	novelGene_136361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	325	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	8	1717	15182	20906	FALSE	65	CCAGGAAATAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETMMGGSQVYIFWGAPVLPLKMTVSQEPTSVIPTADPWKKIQLLYSQHSLHLKDEKYKHKNPENYQVLDNIDPLGLNSHCSLSSRKRSVHLKDDLICCISETQNIKSQKCSPSGMNGLTDSSVQVCGFKSRVQHVTGEEKNQKLVTENKKITVEQHQEQSSICAPNLTKTPLQLGHKCAAILDLVCSTKQINIGPEAVETTYVPRVHHEMQNLCVEFLFSKTVDKPRSKRGVKKVSNLKISTDTEFLSIMTSSQVAFLAQRKCKGQNSLNKETINMEIGPKASHEEVRGTEDNLIQHSDDFAEGYKSGQNEAYSLELFSPVGPETKNNHILINSDTNLEENIGSQELFSPEETLPPNEICIESFSSGILCSQLNTFHKISIERSLISEDKLGHSKAPSKGFQVSKKTKLLSNARDLAVTLDRRNVSEFKYIKKTSLIKNCNCKSQKYNCLVMVLSPCHVKEVNIKSGPPSGSAVPVAATTVIDQSEIKKKVFMWRTAAFWALTVFPGDIILLTDVTVHEDQWVGETVLQSTFTSQLLNLGSYSSVEPEECKTHFKCNNFLAFKIYKHIRKK	15174	21398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_16716_20730
757492	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
757493	contig_9653_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_48340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGATTCCCACCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087230	1088682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1087200_1088700
757500	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	299	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757501	contig_16761_pilon	+	1414	10	Intergenic	novelGene_146897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	83.2145820554707	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	489	1040	25740	63217	FALSE	15	TATGTGAACGCCTCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNQGYIRKQCVNHYREVKKITASEYLPPHVVIYVDVPVPEIQSRIQKKGDPHEMKITSAYLQDVENAYKKTFLPEMSENCEVLQYSAWEAQDAEKVVEDIGYVKLEKGPWLKQDDRTFYHLRMLVQNKLKVLNYTTIPVYLPEVTIGAHQSDRVFHRFRELPGRRYEPGYNADVGDTWIWLK	17799	63591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_17900_22928_23098_24266_24435_25688_25771_26902_27025_30882_30963_38402_38458_39772_39859_47080_47190_63148
757504	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
757506	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2290	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
757507	SIRV4	-	190	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	424	3	-424	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCATGTCACCAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
757509	contig_854_pilon	+	1266	6	Intergenic	novelGene_36723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2270.57819949016	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	51	500	1711616	1713159	TRUE	15	ACCAGCACCCCCTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWQLPSVPSARPSRSGMSWPTRLPIAAAKALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKYRAPGGLQTGASGREEAEGRHAAGG	1711565	1715421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1711656_1711756_1711879_1712278_1712492_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
757513	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	45	AACTTTAATCATACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757515	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757516	contig_18272_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_7011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGTTGCTCCTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170741	171640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_170700_171600
757517	contig_18113_pilon	+	2537	1	Intergenic	novelGene_137550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250593	253130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_250600_253100
757518	contig_16461_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_139201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	30	365	919	365	FALSE	25	GGTAGCTATACTCCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQNSY	948	364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
757520	contig_11978_pilon	+	1986	2	Intergenic	novelGene_62916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	165	329	862940	863104	FALSE	45	CATTACTTTGGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLFLWWRWLWPGLGCCEGVSCPRRVRSSPSPHGRLPTIQTVRYGSKAVTRHRRVMHFERQKLMALTEYIPPKLAINPRCLPPPPSPPQEVRGRMSVHHLAMGWWIKVI	860822	864761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860922_862874
757524	contig_17936_pilon	-	1162	5	Intergenic	novelGene_29990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	98.5697722428129	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	73	906	272759	270267	FALSE	5	GTTTTTGCTTGCTTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDAALSFAKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQITAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGVLSFWRGNLVNVIRYFPTQALNFAFKDKYKEIFLGGVDKRTQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKAAAEREFRGLGDCLLKIIYRATYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIFISWLIAQTVTSVAGLTSYPFDTVRRRMMMQSGRKGTDIMYTGTIDCWRKIARDEGGRAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKFT	272831	270010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_270425_270820_270962_271185_271229_271291_271673_272648
757525	contig_3956_pilon	-	1779	11	Intergenic	novelGene_14812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	53.391104127935	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	30	1577	1259540	1233121	FALSE	70	GAAAAGAAAAACGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALGTLVAKMAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKELYETRYAKKNAEPVPQPHRPLDPLTMHSAYDRAGTLPRTPLSGPNIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSRELQPGIRAVQVVLRICYSDTSGPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVPLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEGADEIEFLADGSWCPIRAEKERSCSPQCPILVLGTSDASGLLSAPDINGGGGVSSAAGGSGGGGSTVSSAENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEDEEDEDEEGPRPKRRCSFQKGLVSAC	1259569	1232918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1233396_1233772_1233904_1236756_1236918_1237141_1237216_1239238_1239345_1239424_1239554_1239714_1239806_1240152_1240195_1240973_1241059_1253552_1253980_1259513
757533	SIRV6	+	287	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8133	11	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
757542	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
757549	contig_5063_pilon	+	877	5	Intergenic	novelGene_109999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	208.300714113034	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	50	577	9407	57319	FALSE	20	TATAATTTCTCTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKSTERETRQEYALAMIQCKVLKQLENLEQQKYDDEDISEDIKFLLEKLGESVQDLSSFDEYSSELKSGRLEWSPVHKSEKFWRENAVRLNEKNYELLKILTKLLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVRHYPRGKRVIEQLGGKQLVMNHMHHEDQQVRYNALLAVQKLMVHNWEYLGKQLQSEQPQTAAARS	9357	57619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_9532_12187_12314_19754_19857_35531_35646_57258
757550	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-11	875	-11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8304	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
757552	contig_12120_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_21438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGAATTCTCCCACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242750	241349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_241300_242800
757553	contig_5728_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_126689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAACCCACCCCAAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238638	240938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_238600_240900
757556	contig_16156_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_137081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGAATATTTTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249511	248940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_248900_249500
757558	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757565	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1170	3	1170	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3988	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757566	contig_15092_pilon	+	1356	3	Intergenic	novelGene_57801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	66	632	325159	351165	FALSE	80	TAAAAAAAAAACCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325093	351889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
757567	contig_7357_pilon	-	2147	2	Intergenic	novelGene_36898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	855	1184	272846	271596	FALSE	45	AATAATTTTTACTGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENGNTYYTHSLTVKSFEYYGISWSKISYIRKYLHKSKGLFNNFNATKDSNSILNSCFKIKTERSYTIYMRLAKIHWTSSISTSSTCMNFKATRKASRDNWCVLITLS	273700	270632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_271610_272530
757568	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	0	3590	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757572	contig_10557_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_171919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14579	12394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_12400_14600
757575	contig_20719_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_140577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75516	73721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_73700_75500
757576	contig_5286_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_157361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCCTTCACGAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553019	553628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_553000_553600
757577	contig_16360_pilon	+	993	6	Intergenic	novelGene_170075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_5	62.9939679651949	913	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	324	869	128224	136142	FALSE	30	TGCTGTTAGCTTCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKKFDEKENVSNCIQLKTSVIKGIKNQLIEQFPGIEPWLNQIMPKKDPVKIVRCHEHIEILTVNGELLFFRQREGPFYPTLRLLHKYPFILPHQQVDKGAIKFVLSGANIMCPGLTSPGAKLYPAAVDTIVAIMAEGKQHALCVGVMKMSAEDIEKVNKGIGIENIHYLNDGLWHMKTYK	127900	136266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_128235_129369_129523_130077_130176_133137_133272_135066_135135_136060
757584	SIRV1	-	257	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	4	3569	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757587	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
757588	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757593	SIRV2	+	528	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-68	63	-68	-63	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTCTTCTGCCACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040	1568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
757594	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757597	contig_4305_pilon	-	1132	2	Intergenic	novelGene_136676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_1	0	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	612	941	513480	513151	FALSE	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDCLLSVSSLLLVLGWEYSSHMLNLVPSTSILPFVPFIPLHLVPFALWYLPVPHHLYPQGLGDHAAEAEKSKREEGGTQVALWLRVQPSCPSPVCLEPVPPRSRFLL	514696	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_514044_514648
757598	contig_11872_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_143153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTTAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93854	91812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_91800_93900
757600	contig_17274_pilon	+	3056	8	Intergenic	novelGene_26586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	152	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGGTGGCGCCATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231660	254011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_231966_237102_237221_240092_240179_243022_243106_246143_246310_246873_247036_251742_252231_252363
757602	contig_4519_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_123705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	48	395	606749	606402	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQACIVLLFIFFPGHAVDPGGQIFAKKLYSYLSSTLKIETQVKVVIPWRLLLVNLLWTDSNPESLFILHLFPPLVCQFVILWWLVCCCDAGRYASGISNISRVSHGGQVSADLSD	606796	605494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_605500_606800
757603	contig_8354_pilon	-	1887	2	Intergenic	novelGene_24165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCGTAATTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618812	576997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_578731_618658
757605	SIRV6	+	446	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	107	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGTAGATTGCGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3171_10747_10819_11031
757608	contig_19013_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_162088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCACACGAGACCTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38488	37791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_-_37800_38500
757609	contig_19013_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_162087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTATATCTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37136	36345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_-_36300_37100
757610	contig_9481_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_149658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCTGGTGACACAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168974	167771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_167800_169000
757611	SIRV7	-	914	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	1	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	41	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78959_114680_114961_147608
757614	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	415	3	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATAAAAACTATCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
757616	contig_12000_pilon	+	2525	6	Intergenic	novelGene_43164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.6	1	160	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	311	325	488595	490244	TRUE	70	CATGAAAAGAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGCVLRKPVVKNPPILLGATLRGKCGIARGFASLLPGQNANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQIRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLMHSI	416879	671250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417002_484110_484190_488485_488596_490230_490304_490573_490689_669224
757617	contig_9548_pilon	+	1557	4	Intergenic	novelGene_141086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	77.7045687202497	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	90	1361	308859	321224	FALSE	65	AAAAAATTAAGGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQRQVKLLPGLQKFTAPPPPVAGVIPETQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIYAHKVVLASISPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCHDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLCAVGGKSGLFTCLDSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDVWLDSAGMIYCRCNFGLTAL	296623	321420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_296713_308858_309758_319956_320166_321060
757619	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	528	51	528	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10765	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757621	SIRV6	+	554	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757628	contig_7694_pilon	+	1010	5	Intergenic	novelGene_159925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	90.8666605527022	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	174	572	175141	180869	FALSE	30	AACAAACTTGTGCTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELICSSKDDAAVETAEEAKEPAEADINELCRDMFSKMATYLTGELTATGEDYKLLENMNKLTSLKYLEMKDIAINISRNLKDLNQKYAGLQPYLDQINLIEEQVAALEQAAYKLDAYSKKLEAKYKKLEKR	174967	181307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_175166_175252_175370_178578_178699_179449_179555_180837
757633	contig_7549_pilon	+	1883	4	Intergenic	novelGene_164522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16.3367343397905	104	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	178	903	692328	696474	TRUE	5	CCGCCCTCCTGTGCATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLENDGAPSESIFDLDYASWKIRLTLGIAGFFFYLGVFVVCHQLSSSLTGTYRALAAKEKVFWNLAATRAVFGVQSTVAGLWALLVDPVLHADKAVNQQNWCWFNVATATGFFFFENVAVHLSNLFFRTFDLFLAVHHLFAFLGFLGSAINLKAGHYLAMTTLLLEMSTPFTCVSWMLLKVSCLQGGILIKSFSRRKAETVNVEEVHITCEVKTKLVEVSACSLEQDMEMIWEECHLEHP	679675	702667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_679727_692201_692875_696295_696476_701688
757634	contig_10106_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_73884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGGCCCGATCAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141209	143211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_142550_142857
757637	contig_5947_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_101621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	42	335	1005845	1006138	NA	25	CAAGGAAGGAGGCTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSGAGIWEDRAAMQPSREVAEVSAPTAQELPSLLPHLCEDKPVPDSRMNQLFGPRLAHAPHFCQKPEGCWAPTELMGAANAWLLPPIPQDMGQTWGGAAAGALPTRLLG	1005803	1007417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_1005800_1007400
757638	contig_15304_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_30504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGATGCTGGACACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52884	53589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493
757639	contig_10115_pilon	+	1422	4	Intergenic	novelGene_171930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	743	1126	8314	9318	TRUE	15	TGCCATCTTGCTCTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLYIVLISFSIPWRQIWITNCSGNGYTLIFYNDLHINTSCIFESPLYRCFLTQTLVTVDTCWQQIIILKISCHKHQSFSELFPLWFIPKLEICSNVGPVYHHCQNTHRVFQLPGLGKGQRTDSHK	7571	20236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_+_8636_9256_9322_15808_15947_20081
757640	contig_7426_pilon	-	2557	15	Intergenic	novelGene_27475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	96.7121755414446	2	144	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1727	2314	642214	637491	FALSE	40	TTTTTAAAAAAGTTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSDLSVSCLQGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	659434	637247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_651600_651784_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250
757641	contig_9197_pilon	+	1023	3	Intergenic	novelGene_154367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	170.5	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80197	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80263_80734_80892_92373
757642	contig_1759_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_171345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGATTAGTTTCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95838	95433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_95400_95800
757643	contig_11258_pilon	+	1069	4	Intergenic	novelGene_67739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_1	4370.1361026352	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTTCAGTGTCTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49139	53622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49232_49379_49422_50092_50154_52748
757645	contig_18420_pilon	+	1611	13	Intergenic	novelGene_109357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCAGAGGCAGAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108948	135200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_109203_109391_109549_110723_110799_110956_111153_112306_112401_112603_112678_118224_118344_119706_119902_124360_124430_127611_127692_128817_128904_129152_129288_135123
757646	contig_15459_pilon	+	730	4	Intergenic	novelGene_106364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	306.279102925565	276	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9151	10958	TRUE	15	TTGACTATTTGTCTTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKADTNKDRIENANARAKKLIES	8161	17108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892_11009_16800
757649	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757650	contig_11815_pilon	-	943	6	Intergenic	novelGene_50914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	209.226766930047	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	107	502	201832	190956	FALSE	25	GACACAGGATGTGTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSTTVVKIPGTPGTGGRLSPENNQVLTKKKLQDLVREVDPNEQLDEDVEEMLLQIADDFIESVVTAACQLARHRKSSTLEVKDVQLHLERQWNMWIPGFGSEEIRPYKKACTTEAHKQRMALIRKTTKK	217103	190514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_190992_192707_192797_196139_196255_199989_200068_201754_201862_217026
757660	contig_15500_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_128981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206986	205364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_205400_207000
757664	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
757665	contig_16210_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_147672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	813	1169	45978	45622	NA	60	GAAAAAAAAAAACTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNPDLGHIKTKPVAIKSIPTHSNPIGQSRTAPYGFQGCKSLQKQTATSLSCGAAVGFKSQTFQLAAEHLTIAPRGLLWLHSSKNQTCCHLVNCFTLGLLKYNLAELFNSSIVVPFK	46790	44676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_44700_46800
757666	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
757668	SIRV6	+	307	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	45	-244	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757670	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1661	0	-238	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2785	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757671	contig_5539_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_104788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGCAGCTCCTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295054	296166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_295100_296200
757672	SIRV2	-	560	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4297	50	3122	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1610	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
757675	contig_10766_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_151192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAATTTCACCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118132	118621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_118100_118600
757679	SIRV4	-	272	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1251	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3907	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
757682	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757684	contig_20819_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_55708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACTGAAATGTGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174736	173470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_173500_174700
757685	contig_20839_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_171935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	40	483	61839	61396	NA	0	CTTTCTTTGTCTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVTYLGKVSTTGMQFLSGCTEKPVIELWKKHTLAQEDVFPANALLEIRPFQVWLHHLDHKGEATVHMDTFQVARIAYCTADHTVSPNIFAWVYREINDDLSYQMDCHAVECESKLEAKKLAHAMMEAFKKTFHSMKSDGRIHRNSSSKEVFQELESDDG	61878	59531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20839_pilon_-_59500_61900
757686	contig_10801_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_74036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252825	254841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_252800_254800
757691	contig_12032_pilon	-	1689	8	Intergenic	novelGene_139263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	129.830344555296	19	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	225	1382	117424	96750	FALSE	15	CTTGGCAGTCTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMMTPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	117648	96442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117406
757694	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757697	contig_10235_pilon	+	745	6	Intergenic	novelGene_46493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTGAGACGGCGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218072	222842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_218323_219303_219418_220089_220193_220350_220480_220676_220787_222803
757702	contig_8138_pilon	+	2019	6	Intergenic	novelGene_52453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	517.821590897869	1	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280108	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364_306848_306940
757705	SIRV4	+	361	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	67	-888	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTATCATCTTTTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522	1883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_1500_1900
757708	contig_3832_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_161450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	489	845	306849	307205	NA	30	CCATGCACTTATCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVCVYYINKPVAVQLILTHGDPMCVRVELHSMGFSMADFSQADHQAFLLRHLWVDSNYQPFSQQPRVLTVCTTQVNTSGIPCIIQVNISIYFNLNSQHKRHQCLRKVHDDKTCSSKG	306360	308747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_306400_308700
757716	contig_13760_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_61279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCATCCACAGTGTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111943	113686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_111900_113700
757717	contig_6102_pilon	+	1997	16	Intergenic	novelGene_32349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.4942697524598	5	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	871	1920	1711393	1714849	FALSE	10	GCTGAGACCCTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1699093	1714926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699172_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1710845_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
757719	contig_18620_pilon	-	3178	1	Intergenic	novelGene_168573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41783	38605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_38600_41800
757721	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
757723	contig_16098_pilon	+	1305	11	Intergenic	novelGene_45905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_9	50.7295771715081	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	333	1214	321962	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294677	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306428_306572_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
757725	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_95957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757729	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757730	contig_14450_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_49001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGACCTTTCTTCCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103122	1102255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1102300_1103100
757737	contig_8696_pilon	+	2440	4	Intergenic	novelGene_153335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	17.4610678049451	107	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	60	509	984957	995807	FALSE	65	GAACAACAACGAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAVEPQAPTLGSEPMMLGSPTSPKPGVNAQFLPGFLMGDLPAPVTPQPRSISGPSVGVMEMRSPLLAGGSPPQPVVPAHKDKSGAPPVRSIYDDISSPGLGSTPLTSRRQANISVLQSPLVGVTTTTPGTGKQLLLAKKRYSLLFE	984897	997738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_984997_988039_988211_992399_992528_995696
757738	SIRV6	+	472	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	384	0	205	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757739	scaffold_16539_pilon	-	1071	8	Intergenic	novelGene_68310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	105.62312671929	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	128	871	126401	107667	FALSE	10	CTGTGTCTTAGCCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAAPARGVGRSRVAAGVEWLPAEDQAQPRRHTEALSGRYRVMAETYDFLFKFLVIGSAGTGKSCLLHQFIENKFKQDSNHTIGVEFGSRVVNVGGKTVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNSLAAWLTDARTLASPNIVVILCGNKKDLEPEREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFLKCARTILNKIDSAAAASECSGSDPSALWLLRLNGASSPVLQDQPCPSGWSPDPGPGRPCPPPALAPKKLPCHLSPFPGLDVGQD	126528	107466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_107815_120764_120835_120985_121082_122380_122536_122615_122679_124586_124702_124967_125049_126385
757742	contig_2278_pilon	-	1947	10	Intergenic	novelGene_118119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	123.876681012874	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	50	490	956893	942106	TRUE	45	AAATGGAAAATCCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYKGKRCPTCHNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLNWYW	964011	939348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942119_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948865_948936_950258_950358_956857_956913_963981
757743	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
757747	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	53	490	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757748	contig_6842_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_130708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	266	595	429644	429315	NA	30	CCAGGACTATCGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLATDLETTVANSRWHLSAKSTSSGPRLLAHVTRLNGTTMCPNSTSSCQGSRGKLRKETILEALGSLLKFSDACRFLLFPAPIVTGETLKSDSGLGPFPAACPLYL	429909	428920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_428900_429900
757749	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
757752	scaffold_6394_pilon	+	1109	5	Intergenic	novelGene_111027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1122.61689257734	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	245	613	403262	405283	TRUE	10	CTGTACTGTGTTTTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGASAFQEGGPVPGPGRAAGGGLPRLPG	402750	406274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402973_403239_403372_405024_405446_405717_405864_406086
757757	contig_6842_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_130748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGTTTGTTCATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305427	1302635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1302600_1305400
757758	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	10	411	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757765	contig_6724_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_167966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCCTCTGCTTTCTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261078	263039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_261100_263000
757766	contig_7513_pilon	+	2082	3	Intergenic	novelGene_89028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	135.5	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATATGTGCTGACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690166	692365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_690195_690278_691511_691543
757770	contig_6589_pilon	-	787	4	Intergenic	novelGene_25971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	25155	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	72	608	1297514	1296318	FALSE	30	CCTGGAGAGGAGGTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQKEALLFTFGPGLGEGVEGGVQMLIQGWREKFRQKPDEDRRMQESSQVARLWRLLVVLEGEPLKEILAQPSLRAGHSADVGQVVAHLLQEFHLLIEEMVLQKVTEMRVCVGSSHGVQIQKGLVQALLQGQGSFHGVQDSIPLLCGRLLHVLEHCAAAALVLQLQETLGTLAFLLRQLAEEMFHAFQRHIVAVEIVALRER	1297585	1296138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1296328_1296488_1296639_1296967_1297096_1297265
757772	contig_8554_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_160288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTGTTGCTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105372	102769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_-_102800_105400
757774	contig_7870_pilon	-	657	6	Intergenic	novelGene_108956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.667534351801	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	240	512	496465	370830	TRUE	50	TCTGACAGAACAGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKTLMEYIELVAIWQQYRS	497931	331955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_332083_370811_370884_402905_403001_441672_441796_496464_496595_497821
757780	contig_5018_pilon	-	2487	6	Intergenic	novelGene_47120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	37.1623465351692	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1255	2001	1432570	1429090	FALSE	30	CATCTGCAAGTCCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAGAFGCLNNARYGITWGVLGAAEFCLHTARQYTMDRIQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGKAITGIQAFKAGK	1433824	1428603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1431777_1432207_1432425_1432505
757783	contig_16907_pilon	-	1147	6	Intergenic	novelGene_87449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	28.3196045170126	874	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	27	740	474492	449131	FALSE	15	ATTCTGTTGGGAACTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLSRAVAMAVSEVVRCGSYLLCPRVLLFGDSITQFSFQQGGWGASLADKLVRKCDVLNRGFSGYNTRWAKIILPRLIRKGNSLDSPVAVTIFFGSNDSALKDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGCKLNRLNLVVGEYASACLKVAQDCGTDVLDLWTLMQKDNQDFSSYLSDGLHLSPKGNEFLFSHLWPLLEKKTSSLPLLLPYWRDVAEA	474518	448723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_459295_459418_467610_467773_471189_471339_472567_472621_474411
757784	contig_12919_pilon	-	1508	5	Intergenic	novelGene_75893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	495.423808471091	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	70	612	743659	720131	FALSE	20	ATACTTATTGATTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTGNVMTLKFLSDASVTAGGFQIKYVAVDPVSKSSQGKNTSTAPTGNKNSLAGRFSHL	743728	719234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_720301_728831_728873_730980_731210_734916_734996_743635
757785	contig_16882_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_148258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611582	613057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_611600_613100
757789	contig_12638_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_33340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359830	1361636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1359800_1361600
757791	contig_12644_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_44507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAAAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101861	1099944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1099900_1101900
757793	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
757798	SIRV6	+	492	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031
757799	contig_13740_pilon	+	2574	8	Intergenic	novelGene_34738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	115.867975537256	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	299	784	346425	356270	FALSE	10	CTTTGGTTTGTTGGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	273387	358060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_273491_321856_321904_324964_325017_342727_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
757800	contig_7171_pilon	+	1178	9	Intergenic	novelGene_101358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	114.335853956666	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	12	638	1321960	1325907	TRUE	15	CCTGGTGACCTTGGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRMAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKVTLGLGGRPHCPPLLAGPEPTAPFSSSAPSPSSQPSMGTSATVPRTRSSR	1321948	1328785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325638_1325867_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
757803	contig_10753_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_105166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGGGTCCTCAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440001	437715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_437700_440000
757813	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757815	contig_16360_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_170084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	318	957	1141	2097	150792	149836	NA	10	TTTAGCTGTGTTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESSSFLKGMMLGSIFCALITMLGHIRIGHGNRMHHHEHHHLQAPNKEDILKISEDERMELSKSFRVYCIILVKPKDVSLWAAVKETWTKHCDKAEFFSSENVKVFESINMETDDMWIMMRKAYEYAFAKYKDQYNWFFLARPTTFAIIENLKYFLLKKDPSQPFYLGHTIKSGDLEYVSVEGGIVLSIESMKRLNSLLSIPEKCPEQGGMIWKISEDKQLAVCLKYAGVFAENAEDSEGKDVFNTKSIGLFIKEAMTNQPQQVVEGCCSDMAVTFNGLTPNQMHVMMYGVYRLRAFGHIFNDALVFLPPNGSDND	151932	149412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_149400_151900
757819	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757828	contig_753_pilon	+	2182	10	Intergenic	novelGene_112924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.7227195168993	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	301	1431	405333	534734	FALSE	20	TACTCTTACCTACCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILSASSFWRWISAQTVRIVRALRGHFEGIMDEPSPLAKPLELNQHSRFIIGSVSEDNSEDEISSLVKLDLLEEKEGSLSPASVSSDTLSDLGISSLQDGLALQMRSSMSGMHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNSIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIPTLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLKAAEKVGYPVMIKASEGGGGKGIRKVNTADDFPNLFRQVGYKLFLFI	405032	535485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_405353_484604_484652_487740_487994_521427_521561_522567_522707_527749_527860_529193_529276_530244_530344_531718_531826_534593
757833	contig_11579_pilon	+	1978	6	Intergenic	novelGene_171940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	19.5099974372115	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCATGCTTGGTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54831	89527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_55138_66399_66505_77476_77633_85985_86115_87105_87257_88396
757834	contig_15407_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_123095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGAAAACATGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525345	527224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_525300_527200
757835	contig_9070_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_171954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATTAAAAGAATAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194744	195315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_194700_195300
757839	SIRV6	+	530	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	32	-1	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	382	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
757848	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757849	contig_5779_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_106519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	803	1177	296437	296063	NA	20	TTATTTTCATTATTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIREVTGYSSGSRTLRVQFFHQDSFSLALLTGTPLPGPQSLSRGTQLSLSVDGEVHCIVSCCRVTAACFSFLGGGGGLLLSALKIGSFKAKLTSPLGLPYHTVLPNHLGGSYKTMARKATQK	297239	295398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_295400_297200
757851	contig_5779_pilon	-	169	1	Intergenic	novelGene_106521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301852	301683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_301700_301900
757856	contig_8687_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_169655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGACACTGTTCTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31304	32604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_31300_32600
757860	contig_10159_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_30822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509923	509214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_509200_509900
757861	contig_6102_pilon	-	960	5	Intergenic	novelGene_32207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2000	junction_2	1157.25826309428	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	170	439	896355	896086	TRUE	15	AACCCAGTGGGTGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKVSKVFLGVVLNQNFSTLALLTFWGNNFSPLRIAADLSDFLQ	896976	894891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_896359_896627_896706_896888
757862	contig_14505_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_171962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCAAGCTCCCCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15389	15669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14505_pilon_+_15400_15700
757863	contig_17106_pilon	-	1975	9	Intergenic	novelGene_127677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_8	47.1215184390317	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	912	1664	91913	88603	FALSE	0	CTGTCTGTCGTGTGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASRTSSRRSLRSNSLPLCYLLKDSTALLPCPLAPILPGEDPVPFDSAQRLGEGSPTCPHPTIGRFSPRHYKTDFDKNKIWYEHRLIDDMVAQVLKSAGGFVWACKNYDGDVQSDILAQGFGSLGLMTSVLVCPDGKTIEAEAAHGTVTRHYREHQKGRPTSTNPIASIFAWTRGLEHRGKLDGNQDLIRFAQTLEKVCVQTVESGAMTKDLAGCIHGLSNVKLNEHFLNTTDFLDTIKSNLDKALGKQ	109637	88291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_88691_89398_89492_89583_89682_89863_89977_91552_92011_93376_93766_95773_95940_96841_96934_109470
757865	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757866	contig_10140_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_148405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACAAATGGGTAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218963	218185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_218200_219000
757869	contig_6710_pilon	+	534	2	Intergenic	novelGene_97314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
757870	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
757873	contig_12142_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_147837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTCATGAACCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211446	211075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_211100_211400
757874	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
757875	contig_11328_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_88463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855713	857567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_855700_857600
757884	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757885	contig_5389_pilon	+	1386	2	Intergenic	novelGene_143030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	299	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437145	439792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513
757889	SIRV6	+	196	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	506	-1	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAGTCGAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
757897	contig_10982_pilon	+	1591	9	Intergenic	novelGene_87874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	265.739534130697	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	259	723	145192	185452	TRUE	5	GTTTGCATTTCTGTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYSTIQKI	141969	202133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_145185_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_185432_185469_190709_190893_190980_191141_201624
757902	contig_13145_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_116647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTCAATATATTTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179457	180311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_179500_180300
757903	contig_13457_pilon	-	1352	10	Intergenic	novelGene_118340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	3	479	71293	68869	TRUE	30	CTCACGGAACCGGAAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWDSQAAIQEKSEWLCLVSSLLGHPSSLASPATELLWNGQGQALARDCLRPPVGTQGQCQVGAAQSHHLTPASLEPGHVPVGLWAWLRGTPEWARAGAGGQRQASFDDDRVRAALLHPQTLPRHWAAAASARKDGHWRLRPGRGGRRQTRQRPQSSLV	71295	59237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_-_59383_60744_60885_67347_67463_67568_67734_67817_67906_68147_68189_68532_68682_68838_68941_70744_71057_71200
757904	SIRV6	+	341	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	534	3	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
757906	scaffold_9100_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_83293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTAAATTAAAAGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654994	655727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_655000_655700
757912	contig_4686_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_118511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGATTTCATGTATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407559	408324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_407600_408300
757913	contig_12292_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_167014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCCAGTACAATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339931	338726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_338700_339900
757915	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
757917	contig_18272_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_7010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAGCAAGGGAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170339	170083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_170100_170300
757919	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
757923	SIRV6	+	346	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	429	98	263	72	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
757925	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1198	3	1198	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757926	contig_7119_pilon	+	1871	10	Intergenic	novelGene_41018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	78.3479103852068	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	209	1507	198455	217266	FALSE	35	CAAGATAGACACAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERKCGSQTLLVPGCASYYWLIYFLCQGRFVSKSLPTLTNSVL	198246	217630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063
757927	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757929	contig_9937_pilon	+	1083	6	Intergenic	novelGene_129213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	580	junction_1	777.791488768037	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	408	824	168016	177905	FALSE	45	TGAAATGTTGAAAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIIQRIENVVLDANCSRDVKQMLLKLVELRSSNWGRVHATSTYREATPENDPNYFMNEPTFYTSDGVPFTAADPDYQEKYQELLEREDFFPDYEENGTDLSGAGDPYLDDIDDEMDPEIEEAYEKFCLESERKRKQ	164001	178164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_164358_167964_168072_168570_168689_169460_169516_175554_175649_177811
757932	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757933	contig_50_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_122223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77221	79333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_77200_79300
757935	contig_10940_pilon	-	1715	2	Intergenic	novelGene_49216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	694	1074	875054	874674	FALSE	15	CAGTTTGATTTTCTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917141	874032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875599_916992
757938	contig_15731_pilon	+	605	4	Intergenic	novelGene_171966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	102.704538469447	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	84	581	15182	17595	FALSE	75	AAAAAAGAAAACATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSDHMPGPVCLIENIDGKLMVNQEALTILSALTQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKQGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPEKPNHTLVLLDTQGLGGVEKEDNENDSWIFALAILLSSTFIYNSMGAINQQAMDQLQYPFVAKDSPKARGISVLNKPVAV	11622	17619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_11691_15166_15369_15886_16015_17412
757941	contig_5586_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_143512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGGAGACCCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242130	242770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_242100_242800
757948	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
757963	contig_6445_pilon	+	1781	8	Intergenic	novelGene_77078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_4	299.966664814609	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	746	1273	737012	740867	FALSE	35	AAAATTCTATCACTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKYIETELKKRKGIVEHEEQKVKPKNAEDCLYELPENIRVSSAKKTEEMLSNQMLSGIPEVDLGIDAKIKNIISTEDAKARLLAEQQNKKKDSETSFVPTNMAVNYVQHNRFYHEELNAPIRRNKEEPKARPLRVGDTEKPEPERSPPNRKRPSNEKATDDYHYEKFKKMNRRY	727262	741375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_727355_727707_727768_736269_736322_736470_737014_737748_737947_738626_738764_738856_738956_740775
757964	contig_15498_pilon	-	1509	2	Intergenic	novelGene_42619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	0	435	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCTGTGTCTCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516218	513035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_514337_516010
757965	contig_5586_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_143577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396763	394525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_394500_396800
757966	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1167	0	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757971	contig_9415_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_109949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAACCCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2495510	2497600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2495500_2497600
757973	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
757974	contig_7151_pilon	-	1832	13	Intergenic	novelGene_40662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	128.916855203482	1	109	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	59	1054	18221	5953	TRUE	25	ACCCAATGTTTTTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGREMGASGWTRCGAEAGSLPCGPVLRSPGGRTTVSTRRMLE	18279	1819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6073_6208_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160
757978	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_97011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
757979	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
757982	contig_9290_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_77577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAAAGCTTCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511715	513407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_511700_513400
757983	contig_1150_pilon	-	1785	4	Intergenic	novelGene_61461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	151.373709738514	116	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCATTCATCTTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349766	341947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_343280_344822_345121_346557_346616_349669
757994	contig_12694_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_171992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGGTGGGTTCAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380119	381124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_380100_381100
758001	contig_10319_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_147244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81698	83379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_81700_83400
758002	contig_3767_pilon	+	893	1	Intergenic	novelGene_111143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGACTGAATAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446456	447349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_+_446500_447300
758004	contig_5539_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_104773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATCACACATGAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258158	258474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_258200_258500
758007	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	51	521	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758010	contig_6589_pilon	-	982	8	Intergenic	novelGene_25912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	249.086822007828	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	177	554	1178015	1160509	TRUE	30	AAGGAGGGCATCATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKALALDESQYGVRVNW	1178516	1158487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160497_1160557_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177927_1178100_1178424
758012	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758013	contig_14405_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_85669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTAAAAAAAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743363	740866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_740900_743400
758014	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758015	contig_7695_pilon	-	1285	4	Intergenic	novelGene_41541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.651803615609	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	307	480	379725	376205	TRUE	20	GGTATGTGTGTTTTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHCLRV	380031	373555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373974_375817_376221_376423_376521_379664
758021	contig_15326_pilon	-	1478	10	Intergenic	novelGene_157695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	278.422318886832	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	240	941	89535	15820	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTVAEKVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEMLAELTGRPMRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSEYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	93276	14315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_14835_15801_15972_19883_19928_20501_20634_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83619_83742_89514_89576_93077
758022	contig_6137_pilon	+	1707	5	Intergenic	novelGene_59317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	66.8482423104751	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAAAACTTCTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683994	1694084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684103_1686466_1686588_1688000_1688124_1688870_1689046_1692904
758023	contig_6048_pilon	+	2092	6	Intergenic	novelGene_73189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	221.987747409626	1082	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	30	590	1449652	1477565	FALSE	25	ACATTTTGAAACCCGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLGSRKAAMASSAASSVRPPRPKKEPQALVIPKNAAEEQKLKLERLMKNPDKSVPIPEKMSEWAPRPPPEFVRDVMGSSAGAGSGEFHVYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDAEFQKRLERNRIAAEEQTAKRRKKRQKLKEKKLLTKKMKLEQKKQKEGSSLSQEQQSSSSEEASGTEEEEEDEPSFIMRR	1449622	1479067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1449778_1450546_1450626_1451714_1451816_1456961_1457048_1457767_1457836_1477464
758030	contig_14322_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_116559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGCAGCGAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
758032	contig_6710_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_89481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758034	SIRV4	-	317	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1201	3	1201	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
758038	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
758047	contig_14911_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_171995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	52	309	21539	21282	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSVNLKLFIESGTGGKMGGSNNSELDLCSLFYHLCHCSDFLRIVYYWVFSARLFSWELCLLLLVSVSHTTLSQPIFSSAFSSQLPWTLPLNLWTCSALSGA	21590	20760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14911_pilon_-_20800_21600
758049	contig_8122_pilon	+	2414	7	Intergenic	novelGene_40206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.8860686282393	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1009	1608	397575	398906	FALSE	20	TTAATGTGTGAGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRVPTLEGVPEGVDPSYQGGHRCNKHCQGWLVDLAGAHLPVLQITWTARYSSQAGDIHPAEIQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLQEVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLSCPGRYRGQGAGGLGRQQGWVITSVSSHGPHRSGLSWPH	351755	399712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_351874_372465_372567_384847_385069_385968_386090_397038_397120_397208_397887_398618
758051	contig_6102_pilon	-	1841	12	Intergenic	novelGene_32275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	456	779	1448758	1448249	TRUE	25	AGCAGCAGGAGCGGTCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPSSIKSTTLRKSSSRNCREVKAGAPSRRPPGVMALWSPGQVFLLAVIDTSSNTRSARAPSRPLGRRSTSTRWLSVPTPVSSLALAGHQPWPERFSEPAGSIPGT	1449328	1444324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1444390_1445507_1445716_1446177_1446250_1446427_1446631_1446941_1447024_1447182_1447302_1447416_1447550_1447903_1448072_1448236_1448336_1448425_1448580_1448675_1448782_1448896
758052	contig_7694_pilon	+	1638	2	Intergenic	novelGene_159941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	60	junction_1	0	794	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTTTGAATCTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257734	260130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_258127_258884
758058	contig_5881_pilon	+	1964	2	Intergenic	novelGene_129040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333919	336448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_335002_335566
758059	contig_11078_pilon	-	1843	9	Intergenic	novelGene_171997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_8	6.59071316323203	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	182	1603	268082	243949	FALSE	5	GAGCTGCTGTTTGTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DALFFIGNQLVATSHTGKVGVWNAVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRMKDNDLLVTELYHDPSNDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILSLEETESHGSYPSGNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVDCTTISSFTVRECEGSSRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSQEKDVGGPTEEELLKLLDQCDLSTSRCATPNISPATSVVQHSRLRESTSSLQLQHHEAIHEAATYGSVRPYRESPLLARARRTESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGSVAPVQAEVKWAPGECNGAERKSPGTEIKSLREAESGLEAHKIAEGFSESKKRSSEDENENKVELRKKGGFEGGGFLGRKKVPYLSSPSTSDGGADSPGTASPSPTKTTPSPRHKKRDSSGQEYSL	276658	243708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_-_244508_245264_245404_245482_245668_248619_248717_256688_256845_265740_265912_267967_268085_268216_268305_276567
758060	contig_7398_pilon	+	2234	3	Intergenic	novelGene_166147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	15	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1757	2155	59961	60359	FALSE	30	TTACGTACTAAGAGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTHTYAFTVPIVAFVPLLPSAPSLLCSGSQGRCYCRLQLLVPLVSWIQAGLASGEPSKRLEVGGKEQWGISPSPCLWPRLWLGLSMAPVLRGRSPCSQLPLGDPSPWLQLLLFPLLLLPQDRNGFLPLGIP	20798	60438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_20975_23431_23583_58531
758061	contig_9438_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_154268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAACTTCATATGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239295	237532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_237500_239300
758062	contig_15063_pilon	+	939	3	Intergenic	novelGene_14416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	65	808	35349	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35284	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
758069	contig_614_pilon	+	2076	12	Intergenic	novelGene_132598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	40.5625728233502	201	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	120	1586	274210	373827	FALSE	15	CTGCATTTGACACCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELNTHVSVKEKIYAVRSVVPNKSNNEIVLVLQQFDFNVDKAVQAFVDGSAIQVLKEWNMTGKKKNNKRKRSKSKQHQGNKEAKDKAERPEAGPVQPQAPQIQNGHMHGEKDSSSTDSANEKPLVLPREKKISILEDPSKALRGVTGPNIEKSVKDLQRCTVSLTRYRIMIKEEVDNSIKKIKAAFAELHNCIIDKEVSLMAEMDKVKEEAMEILTARQKKAEELKRLTDLASQMAEMQLAELRAEIKHFVSERKYDEELGKAARFSCDIEQLKAQIMLCGEITHPKNNYSSRTPCSSLLPLLNTHSAASGKQSSFTRKSSNHNKPSEGKAANPKMVSNLPNTTDTSHQATPANKQNGSSSQRRRFNPQYHNNRLNGSAKSQGGGNEADPMVKGNNRHEHRRQPHNGFRPKNKGGTKNQEAPLGTKTPEAPAHSEKPRRRQHATDNSEARPFRGNVPRVSQCNLCPTRIEVSADAAVLSVPAVTLVA	177547	374317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_177595_197755_197806_274187_274249_309690_309800_314032_314083_317612_317857_331661_331798_354814_354874_361670_361781_364570_364674_367729_367951_373431
758071	contig_500_pilon	+	2986	12	Intergenic	novelGene_30921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	79.9300313859276	831	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	998	2311	1079833	1089765	FALSE	25	AAGGATTTATCGTCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHNLISKLKKWIKILEAKTKQLPKFFLIEEKCRFLSNFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPALRCRAAGEHGQPAAGLPGPEGGDRHCDAPAQPGAVRGWGEQGEHPGGRGQQPGQPVPHGPRLAPVAVTPCAAHPGM	1064166	1090440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1064271_1069626_1069829_1071515_1071681_1073181_1073273_1074629_1074776_1075645_1075908_1079805_1080033_1081309_1081528_1083490_1083676_1086061_1086263_1086347_1086543_1089450
758072	contig_6958_pilon	-	1628	3	Intergenic	novelGene_69936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	120.5	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	101	601	161022	149618	FALSE	20	TGTAAACGGCATCCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSSQRGCLTHHLCLLLLPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITALHIILQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	161122	148590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149960_154524_154590_160928
758073	contig_1244_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_37941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTCCATTCCTAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782370	780257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_780300_782400
758074	contig_14822_pilon	-	2034	10	Intergenic	novelGene_145394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	128.276129627062	5	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1242	1946	55511	53461	FALSE	15	CCACACTGCTTACTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHRVAGWADRAGAWHLCPHSGGCPTLRQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69984	53372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_56220_56390_56511_58295_58346_58481_58558_69603_69703_69796
758077	contig_13633_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_15334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCCTTTCGTAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37210	49489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_37282_49019
758078	contig_1699_pilon	+	2346	14	Intergenic	novelGene_72820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.82147220487	2	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2211	136	2346	81177	99766	FALSE	30	AGTTTAGGTGAAGACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQELTIVLQRTGDPANLNRLRPHLELLANIDPNAVSPTWEQLENAMVAVKTVVHGLVDFIQNYSRKGHETPQPQPNSKYKTSMCRDLRQQGGCPRGTNCTFAHSQEELEKYRLRNKKINATVRTFPLLNKVGVNNTVTTTAGNVISVIGSTETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDFSESVSGTKFEEDHLSHYSPWSCGTIGSCINAIDSEPKDVIANSNAVLMDLDSGDVKRRVHLFETQRRAKEEDPIIPFSDGPIISKWGAISRSSRTGYHTTDPVQATASQGSATKPISVSDYVPYVNAVDSRWSSYGNEVTSSAHYVERFIVADLSGHRKHSSTGDLLSIELQQAKSNSLLLQREANALAMQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQ	80919	99766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_81017_81138_81258_82789_82903_89240_89550_93132_93348_94520_94955_95512_95684_97598_97746_98067_98282_98526_98612_98882_98959_99044_99180_99438_99547_99643
758082	SIRV6	+	336	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	536	-1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
758086	contig_14744_pilon	+	1001	2	Intergenic	novelGene_65909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	0	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	49	369	69238	137099	FALSE	65	TCACTGAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESDQGVSRGFQTMPSLPPLYDSGSHFQSIWRLVEPFCFLPLPKLLSLWQNHPRLVDSHPLVTSNITHLQKITFL	69189	137731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_136799
758090	contig_9482_pilon	+	980	5	Intergenic	novelGene_44237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	182.316174543017	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	186	551	285424	289957	FALSE	10	GACTCGGGGTTTGCTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTASSPRHGWCLKLGPWQPTPTAPAPPLPRARRCRTRASCGTSSRGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGYRLSDQFHDILIRKFDRQGRGQIAFDDFIQGCIVLQRLTDIFRRYDTDQDGWIQVSYEQYLSMVFSIV	263233	290386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_278052_278098_285421_285581_288833_288944_289858
758093	contig_10857_pilon	-	1127	8	Intergenic	novelGene_160877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1271	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	613	975	61903	58794	TRUE	5	GTGCTTCTCGGGCGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPATISLQEGPLDVDWVCTSPVSHRLFVLATAMLGSSMEVWRASLGVRPAVSTAWVYCSRRSSILEIGWAGSDFFTLLLFSMERFKDSVLSMSLVVGLRGGGLCSAVPSKAKGLGVLGC	66898	21824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21964_58780_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61960_62092_62197_66446
758095	SIRV1	-	197	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3611	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6755	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
758099	contig_15732_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_88895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233948	232457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_232500_233900
758100	contig_9903_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_172023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCTGTGTGCTAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177260	176306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_176300_177300
758106	contig_11498_pilon	+	2522	1	Intergenic	novelGene_65523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	152	589	236989	237426	NA	80	AAAAAAAAAAATGAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGGGSGGTRCAVRAPRGGWSGRGERPGQVGCLKWRRQETVGCGTGGRGGMKVGVSPAGPGPQTAPAAPQPLLLKRSGFLGNYRVFPESLVGERPGETALLCCPSTKARILRPSSAKFSPYPIRPGMAARRSVAGPPPRRAKWGRRQIPKTGAAGKGGGRISSCASPHRVHPLAPRAEGLTRLPSPPAPYTKAIL	236837	239359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_236800_239400
758107	contig_9713_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_170251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAGGAACCAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240524	238240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_238200_240500
758109	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758112	contig_10627_pilon	-	2062	8	Intergenic	novelGene_60073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	30.6241201456283	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAGGAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364013	1351244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1352444_1354139_1354280_1356035_1356097_1360070_1360121_1361234_1361594_1362686_1362731_1363587_1363683_1363899
758115	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758123	contig_3077_pilon	+	1525	9	Intergenic	novelGene_26681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3959.29791756064	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	378	488	13867	15163	TRUE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNVAEGGSDRSLGWPRCWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDRISSLS	9666	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9722_11310_11479_12013_12071_13019_13114_13863_13958_15143_15262_16144_16328_16936_17054_17449
758124	contig_8020_pilon	-	1817	5	Intergenic	novelGene_114453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	25.9470614906582	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	18	944	382128	376003	FALSE	25	TTTGTTACCAGAATTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASRTAVLRVKRKRGAEPAEALVLACKRLRSSTVESATQRTSPEGLPRAAENNVFQLVATVRSQKEPVQPLVRAALRRSGGSQQRIRRNLRALAREIRQEGRYRVVSSHRSSGTPLGCPESEDAPENPEGASDAGFQLFDLVHEEGDPEATAAGSFQMSDPDVILCNSTELIRERLTISEEGPGVGHQEEEKDGDYVYDIYYLQMATPVWIENILSVQPYSQEWELVNDDQQPEDVYEDEDDENSENNWRNEYPEEDSSDEEEDSIGSDEDDDLSEEEGGSSRLQMWSKYPLDVQKEFGYDSSLDSD	382145	375129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_376128_377091_377213_378150_378358_381532_381812_381933
758127	contig_13481_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_119417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTGAAAATTACTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737030	738189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_737000_738200
758135	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758137	contig_17194_pilon	+	1688	3	Intergenic	novelGene_155354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAATAACTATCACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75833	114167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_112492_112711_112807
758140	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_96946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657167	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657169	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758145	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	60	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758146	contig_614_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_132633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTGTTAATTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639700	641288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_639700_641300
758153	contig_3818_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_99236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGCAACTTTTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418372	419018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_418400_419000
758154	contig_3818_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_99237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGGTGATCATGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419115	420072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_419100_420100
758161	contig_14501_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_172034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGGAAAGATTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321314	321987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_321300_322000
758165	SIRV7	+	380	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
758166	contig_8597_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_158729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTCCTCCTACCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176929	177961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_176900_178000
758167	contig_19957_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_57717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTAAGAAGGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213525	214209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_213500_214200
758171	contig_8631_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_121966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACTGGGACGGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762584	763540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_762600_763500
758172	contig_15152_pilon	-	1100	5	Intergenic	novelGene_126970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	479.269952636299	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	185	832	204362	203318	FALSE	10	GCTCATTTAGTTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	205141	203049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512_204638_205088
758173	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_95021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758174	contig_1450_pilon	+	1302	3	Intergenic	novelGene_27425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	137	1159	419840	424944	FALSE	35	AAACCATGATGGTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDDTH	419703	425087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423249_424933
758175	contig_1443_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_28355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTCAGAAGGTTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918877	918379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_918400_918900
758176	contig_10902_pilon	-	1692	10	Intergenic	novelGene_65681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTGGTTCAAACAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234694	160602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_160841_178809_178883_189007_189180_196148_196298_196626_196759_201872_202058_209424_209781_218450_218577_233942_234140_234630
758177	contig_5566_pilon	-	2128	3	Intergenic	novelGene_153654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58	101	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	153	1328	176330	172886	TRUE	40	ATTCACAGATAGCTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGGSRIIRRVSLRKRNRPSLGSVCAAPAAAELKPGNVEDEEMVAGSRRRKTVGVQPVEYDSEEDMFGDYDSFTENSFLAQVDDLEQKYMQLPEHRKHDTDLAIEDLCSESIKDSKLNITTVDNFTALKTDEPTKNQCGQEDVAIEPGTDLLYDVPSSQVLYFENLQNSSNDWGNQFTKEKDWNSSSHQTVNEELSHSCIEQPQQNDQSSSEVRTSSDTTRRKSLKDHLKSTMTGNAKAQTPVFSKTKQLKESLLSEEINVAKKTLESSSDDRGPFYSLPSKVRDLYVQFKGIEKLYGNAFYCNEKNGFCRYCNTNANQWKTNACMVVFLILKTKQNGSPLSTFHLYPLTNEPFSFPSRSHFTTQLSFLSLSSPQISPQLTPILHSRLLL	176482	170762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_171512_172834_173882_176150
758178	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3650	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758179	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	887	-30	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
758181	contig_15706_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_172041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTAAGCTCATCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88776	91023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_88800_91000
758182	contig_14855_pilon	-	1699	7	Intergenic	novelGene_146029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	40.5150863533847	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	674	1402	535978	531925	FALSE	25	GTGATTAGGAATGGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCVSEVSVPEVLEEDEEPDTTERACDTLLMCIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNKTDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRLLQDKLNSTMKLVSHLTVQLNELKEQMTEQRKRRQRLGFVDVQNCMSR	537123	531627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_531994_532472_532635_533802_533964_534665_534832_535720_535849_535935_536041_536512
758184	contig_12694_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_171988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAAAAAAAATTATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365889	364427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_364400_365900
758187	contig_10437_pilon	-	2065	11	Intergenic	novelGene_38208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1610	1954	229498	229154	FALSE	20	CTTCCCCCTACAATTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGPFSLATPCSRTEAVSRLALKEGVPSQPRGKSGETVLHCELETSGCRPTGRGLNPGITAGLLLQPPRPAPPEMRLRNPSQLACHVTGQYSSSRTLPSCPPRLLALVTALLG	233478	229042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_229839_230247_230378_230568_230681_230900_230962_231067_231116_231342_231435_231616_231749_231945_232052_232160_232316_232508_232648_233184
758188	contig_10937_pilon	+	1560	5	Intergenic	novelGene_67341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.0201547384922	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATAAAAATTTGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180619	185952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181654_181931_182017_183833_183891_184579_184669_185657
758191	SIRV6	+	347	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	532	-1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
758193	contig_753_pilon	-	1502	7	Intergenic	novelGene_112956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_6	65.6302775655667	421	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	131	913	1177782	1169508	FALSE	15	CATTGACTTCGGAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGRSAVAVAAVTGERPGLSDLGRSSPIQVPGSRNEVGGRLGTMARAGMERWRDRLALVTGASGGIGAAVARALVQQGLKVVGCARTVSNIEELAAECKSAGYPGTLIPYRCDLSNEEDILSMFSAVRSQHSGVDICINNAGLARPDPLLSGSTSGWKDMFNVNVLALSICTREAYQSMKERKVDDGHIININSMSGHRVVPQSVIHFYSATKYAVTALTEGLRHELREAQTHIRATCISPGVVETQFAFKLHDKDPEKAAATYEHMKCLKPEDVAEAVIYVLSTPPHVQIGDIQMRPTEQVT	1177912	1168918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1169550_1169672_1169739_1169941_1170035_1170711_1170842_1171527_1171623_1174580_1174791_1177635
758194	contig_7202_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_17527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
758198	contig_4759_pilon	-	1466	2	Intergenic	novelGene_106340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTTTCAATAAACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589870	586133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587539_589809
758200	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_94138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758201	SIRV6	+	554	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1567_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758202	contig_13481_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_119412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1145	1549	648950	649354	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASWPPQGFLLTGKMLLEALLVSDLGVGALDLPDGLPQTAGSASEALAGLCVFLQSLGPRMLAGCRACCFSQDWWPMREGPREKLPQQGGPESPPARMAPQTMSKAETEPQIMSKAETEPDRSEQEPGPETRT	647805	649908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_647800_649900
758203	SIRV4	-	130	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	1370	21	-1370	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACGGGATATCCACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	5007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_5000_5100
758205	contig_10734_pilon	+	1895	3	Intergenic	novelGene_51295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	235	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	15	524	1368595	1377653	FALSE	50	GGAAGAAGACAGAGAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRGMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKVSVLLLSLLQQGRSMEHLSQKLANHGPKAKSSLLPVFLVLLEHSQAYVCIYCYCLWLLLCYNSRLE	1368580	1379024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320
758206	contig_11933_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_107239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70693	70236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_70200_70700
758207	contig_3223_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_151826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAGAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949248	951816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_949200_951800
758208	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	325	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758209	contig_15498_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_42707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAATAATAAAGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920532	919778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_919800_920500
758214	contig_16322_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_87569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCATCAGGAGGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196868	195120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_195100_196900
758217	contig_9389_pilon	+	1292	3	Intergenic	novelGene_83865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	1	1017	25327	29151	FALSE	30	ATCACTGACAGGACTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSHPLNGWLTEDSSHQLNGWLTEDSSHQLNGWFIKDSSHQLNGWFIKDSSHQLNGWFIKDSSHQLNGWFTEDSSRQLNGWLTEDSSRQLNGWLTEDSSRQLNGWFIEDSSRQLSGWVTEDSSHQLNGWLTEDSSRQLNRWFIEDSSHQLNGWLTEDSSHQLNGWFIEDSSHQLNGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSHQLNGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSHQLNGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSRQLNGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSRQLNGWFIEDSSHQLNGWLTEDSSHQLNGWLTEDSSHPLNGWLTEDSSHQLNG	25326	29426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_25900_26295_26716_29127
758219	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	594	0	415	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	553	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758220	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	157	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758221	contig_8452_pilon	-	762	6	Intergenic	novelGene_48097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1114.28387765416	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	28	513	991128	962919	TRUE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991155	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_962837_962892_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
758223	contig_9481_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_149619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGCATAACTACACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35031	37247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_35000_37200
758225	SIRV4	-	330	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	20	1171	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
758226	contig_12701_pilon	+	2085	4	Intergenic	novelGene_169556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTCAAGCGTTTATCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31693	52267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_33253_35586_35717_40226_40575_52219
758230	SIRV6	+	278	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	171	-244	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
758233	contig_11176_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_123448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGGGTTCGAAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112693	111957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_112000_112700
758234	contig_11176_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_123447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATTTTCCTAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111401	110947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_110900_111400
758242	contig_10424_pilon	-	1971	4	Intergenic	novelGene_56813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	314.495716275366	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1	438	329459	323679	FALSE	40	CCAGCATCACTGCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSGPSDSDLPSRTRPKSPRKHNYRNESTRENLCDSPHQNLSRPLLENKLKAFSIGKMSTAKRTLSKKEQEELKKKEDEKAAAEIYEEFLAAFEGKEHETDEKRGKIYKPSSRFADQKNPPNQSSNERPPSLLVIETKKPVSHA	329459	322145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_323828_324329_324388_327210_327310_329327
758243	contig_11933_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_107265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGGAGTATATTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154287	153014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_153000_154300
758248	contig_13244_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_86952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	990	1415	284375	283950	NA	30	AATCAGCTATGGACTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQYMLQLPSNSNIKVDLYTCFSIVGILKQVKDYIKQCSKCQEKLDRSRPISDASEMLEELGLDLESGEESNESEDDLSNFTSPPTTASKPVRKKPVSKHELVFVSGTFHSTLTFVDSMSVFADLENFIFLKSPRLSDCWH	285364	282960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_283000_285400
758251	contig_15021_pilon	-	2114	10	Intergenic	novelGene_26992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.718853358304	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	17	1102	428082	398662	FALSE	35	TGTCAGTGTCAGCCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAERGSGQQQSQEMMEVDRRVESEESGDEEGKKHSGGIVADLSAQSLKDREEHSEVDAGEEQELPVDMEAISLDGDAEDVDLNHYRIGKIEGFEVLKKVKTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRAIENIDTLTNLDSLFLGKNKITKLQNLDALTSLTVLSMQSNRLTKIEGLQSLVNLRELYLSHNGIEVIEGLENNNKLTMLDLASNRIKKIENISHLTELQEFWQPGLLEKWLIPRLEQGKYEVKLERLLHQKTRKCPETNGAVSKGHQSQLEGAYAGQTCDN	428098	397649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_398842_411764_411852_416003_416109_417090_417208_419336_419500_420184_420316_420895_420962_421592_421649_426120_426250_428030
758253	contig_9727_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_86354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGATTTTCCTACGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502265	500320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_500300_502300
758254	contig_11285_pilon	+	1250	8	Intergenic	novelGene_5601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	522.542918850515	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	32	928	766060	769878	FALSE	10	CTCTTGACTTGGCCACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCPQAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763526	770200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767318_769413_769653_769740
758256	contig_10861_pilon	+	2887	3	Intergenic	novelGene_39387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	12	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	310	1722	1884022	1888218	FALSE	50	AAAAAAGTCAACACTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPHRPGSRPGRDRARGLSSWIPAVPPPHGGGDAEGGFRSRVREESDPAPVQGHPRSPCSQNSSPGEWAGPVFRASRPAFPFLQRCLLAAFPALSPGKRTLAPEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDPTQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRNENEVNPKQEISEDVEFGTTSKRPVGNAEENPESEEAFESGERSERHWGDLTAEEWVSYPLQQVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD	1883712	1889383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1884055_1884832_1884960_1886965
758258	contig_11702_pilon	+	738	5	Intergenic	novelGene_141990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_1	170.820629608956	6920	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	319	663	383507	384186	FALSE	25	GTCAGGACACAGGACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRQSTQGGPKSVSALTAAPTPPHPTQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	381080	384261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382657_382777_383402_383681_383828_383895_384081
758259	contig_3612_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_87828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGTAAAGGCCTCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952669	953208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_952700_953200
758260	contig_18869_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_56228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGGCTAAGCATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
758269	SIRV6	+	488	7	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	140	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034
758271	SIRV6	+	372	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3171_10724_10819_11031_11109_11205
758272	contig_5590_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_163012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	50	352	291306	291004	NA	30	TTTTTAAAATAGTTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPQVERHLKYTAAATMYSSIPTTLKMTQDRLTFWSVVHGVATVGADLTATNNNKRWARGAPGRGKEKLKVTQDSNLGPTAEETGRYTVINLWEKTAKLSPDWMPRGCSSFPSHLP	291355	290408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_290400_291400
758273	contig_5590_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_163011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289136	288573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_288600_289100
758274	contig_1516_pilon	+	2128	19	Intergenic	novelGene_49948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	53.2904051772044	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	461	2014	294451	330390	FALSE	10	CATTATTTCCGTTCCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKGQFWNDDDSEGDNESEEFLYGVQGSCAADLYRHPQLDADIEAVKEIYSENSVSIREYGTIDDVDVDLHINISFLDEEVSTAWKVLRTEPIVLRLRFSLSQYLDGPEPSIEVFQPSNKEGFGLGLQLKKILGMFTSQQWKHLSNDFLKTQQEKRHSWFKASGTIKKFRAGLSIFSPIPKSPSFPIIQDSMLKGKLGVPELRVGRLMNRSISCTMKNPKVEVFGYPPSPQVSGHCKNIPTLEYGFLVQIMKYAEQRIPTLNEYCVVCDEQHVFQNGSMLKPAVCTRELCVFSFYTLGVMSGAAEEVATGAEVVDLLVAMCRAALESPRKSIIFEPYPSVVDPTDPKTLAFNPKKKNYERLQKALDSVMSIREMTQGSYLEIKKQMDKLDPLAHPLLQWIISSNRSHIVKLPLSRLKFMHTSHQFLLLSSPPAKEARFRTAKKLYGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVNASYTKLQILIEAPSHSHARCIRILPVCALSLGWKVPKCTQADNFFFS	291589	330504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_291853_294253_294454_295129_295208_296183_296279_296705_296767_297006_297098_297540_297608_300556_300707_301707_301859_302435_302490_304171_304268_304858_304952_305754_305881_306835_306902_307828_307897_309115_309165_309414_309525_310249_310323_330267
758282	contig_14681_pilon	+	1700	9	Intergenic	novelGene_134194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	141.509716980849	749	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	224	931	50409	71147	TRUE	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	23060	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_50350_50634_56129_56208_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
758284	contig_3956_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_14723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTCTATTAGAGTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246499	244828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_244800_246500
758286	contig_3956_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_14722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAAGAAAAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243734	243408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_243400_243700
758288	contig_5222_pilon	+	2460	4	Intergenic	novelGene_58969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	99.8009129328095	50	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	26	499	12253	19317	FALSE	30	TGTCTTTAAACCACACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPNPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSAEDSAQDVTTEHHMSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTLIS	12227	21278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_12453_16150_16231_18347_18529_19304
758290	contig_5779_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_106478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGAAACCATCTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150649	149907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_149900_150600
758291	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	127	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758294	contig_8865_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_164461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTAAGGGGCTTCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412645	411153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_411200_412600
758296	contig_1735_pilon	+	1284	9	Intergenic	novelGene_106887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	621.570880411076	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	89	1279	126256	139773	FALSE	5	CCTGTCCGGCTCGCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSQDHSDTDNEVAYSSLNFNAQLPKKPTSAFPSQTATETIYSEIKRK	126167	139778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132347_134375_134426_136630_136761_137703_137757_138447_138468_139653
758300	contig_3269_pilon	-	921	6	Intergenic	novelGene_117036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_5	392.76384762348	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	266	907	238182	187357	FALSE	55	AAAAAATTCTTTAATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRSSVVLEKTKVVEPLDYENVVTQRKTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVISRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLYKANVNSTITVTMKVGSNYILSFHYFKDTGINSLSGNNIFK	238447	187342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_187537_188192_188263_191236_191320_191725_191816_191896_192014_238080
758301	contig_3942_pilon	+	2370	9	Intergenic	novelGene_128616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1131	1433	143184	144629	TRUE	20	CCCTCTCGAGCCAGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFALGISQEAEISCPWPLPPACTPQQVQLGAQGAEGWPVLWARGPAQLHELMNLAGQPAGAGSLWPSASSSSRQKRTGASRSHPIIRRNSAEGLQLRSL	142053	147432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_143350_144271_144377_144597_144720_145143_145313_145602_145728_146096_146287_146395_146537_146849_147001_147361
758302	contig_1406_pilon	-	2651	1	Intergenic	novelGene_25497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGTTTCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1371016	1368365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1368400_1371000
758304	SIRV4	+	617	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	195	138	195	-138	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTATTACAGCTGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
758307	contig_4732_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_75388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGCCCTCGAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438595	439960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_438600_440000
758312	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758319	contig_1406_pilon	-	1372	8	Intergenic	novelGene_25628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	272.855198198007	335	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	88	966	2692029	2614118	FALSE	30	TTTTAAAGATGTTAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSVSSESSSSSLSKKKKAKLEHGGSSGSKQNSDHNNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNLKDKKALLRLLDKHDQRGLGGILLEDIEEGLPNSHKAVKALGDQIIFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDDEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKVAPVQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITPGK	2700464	2613711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2635836_2635931_2644012_2644196_2645903_2646012_2660128_2660221_2691860_2692034_2700381
758324	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	51	510	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758325	SIRV6	+	507	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758326	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_93680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653846	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758331	contig_5145_pilon	-	2214	12	Intergenic	novelGene_131428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	133.918872690931	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	98	607	946991	936187	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGELLRGASALLNARPFPPLLPRLLPKLSAAAMSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	947088	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917115_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
758333	contig_12079_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_67498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTTCATTTCTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845523	843323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_843300_845500
758339	SIRV7	-	648	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	71660	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43078	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1407_2596_2676_2993_3112_43028
758340	contig_11855_pilon	+	1487	5	Intergenic	novelGene_67037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	299.980416027447	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	346	426	2004104	2007299	FALSE	25	AGCTGTTTGAAGTTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRDGGGRAASVPCSVAPEKSVCRPQPPQVRRTFSLDTILSSYLLGQWPRDADGAFTCCTNDKATQTPLSWQELEGEQASSCTHKPPLQVTRPSWKRAAHLQSLPLLPPLGPITAMSSNGSPQKAVRGCGYLKRRRPQVLT	1959172	2008360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1959201_1986608_1986779_1995528_1995586_2004013_2004165_2007279
758342	contig_10129_pilon	-	2598	16	Intergenic	novelGene_128154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	25.5522123417045	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	201	2168	336461	291451	FALSE	45	GTATTAGAAGTATTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGRRFVLSTLSAQGVRRNHSSEPLAFAELTCSPPVPACCQPSLTVTPGPGTFPGRSPRVKAETLQMSSNNAQVFIPMSRNTNGLRGTMTSNDLKTRTGGAVLSFHNICYRVKVKSGFLFCRKTVEKEILKDINGIMRPGLNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPHGLSGDVLIDGAPRPSNFKCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLPTTMKNREKNERINKIIQELGLEKVADSKVGTQFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIFSIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFASAGYNCEPYNNPADFFLDVINGDSSAVMLNRDEDSEPRGAEELSQNGKTIMEKLAEFYAISTFFRETKTELDGLFGVQKKKKSSAFKEITYATSFCHQLRWITRRSFKNLLGNPQASIAQLIITAILALIIGAIFYGIENDQTGIQNRAGVLFFLTTNQCFNSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFFGKLASDLLPMRMLPSIIFTCIIYFLLGLKPTAEAFFIMMFSLMLVAYTASSMGLAVAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMLFSGLLVNLRTIVPWLSWLQYFSIPRYGYVALQHNEFLGQHFCPDLNATTNSTCNYAICTGEEYLTNQGIDLSPWGLWRNHVALACMIIIFLTIAYLKLLFLKKYS	371833	291020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_291599_293868_293952_294824_294915_300323_300479_301933_302059_303289_303380_308105_308189_314197_314449_314837_314940_316867_317020_321243_321402_324468_324622_325341_325457_326094_326155_336258_336481_371652
758345	contig_14525_pilon	+	1939	5	Intergenic	novelGene_149785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	25.6612548407127	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	123	1007	235549	245090	FALSE	40	TTTATGAATATCTAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQELVHQAASLYSDRIAVCFDECNSQHPIYYTYKTLVNDASKLSNFLQLHCDFQGIQEIGLYCRPGINLPSWILGILQVPAAYVPIDPDSPPPLSTYVMKKCNLKYILVEKKQVDKFRSSHDTLLNYDTFTVEHNDLLLFRLHWKNVEVKLMLSDGKEKSEKEKLKNSRGSGNSNEGNSEEYIDLRLKHCLAYVLHTSGTTGIPKIVRVPHACIVPNIQHFRMLFEITQEDVLFLASPLTFDPSVVEIFVALSSGASLLVVPTSVKVLPSKLAAVLFSHHRVTVLQVHLRSK	234649	246022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234736_235512_235779_237244_237366_240415_240736_244876
758346	contig_15245_pilon	-	456	3	Intergenic	novelGene_145215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	841	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	88	390	131120	42888	FALSE	40	AATAAATTGTTTATTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWDTTASSALSSSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQRSTFSTGFSEVRSLKFFCLGFFCIKSWDPFHSSLFLTTAVCSSRMRM	131207	42821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_43032_56801_56908_131067
758352	contig_8317_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_19953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTCATATCTCGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	16409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
758353	contig_14744_pilon	-	1649	4	Intergenic	novelGene_65969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_3	28.4057897071863	334	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	695	1108	781716	781303	FALSE	10	TGCTTACTGATGTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRNSVPSSGRPPATPRGSHSPRPRETPLRAVHPADASKTEPRVAADSQKLPSDGLDAPDPPWRGRSQSLTNLSVPSTACPPTSAAHANGPRDPKSPLSGVTFRSPLLTPRAHSISVSVPATPRRGGAPQKPKPPWK	783510	780761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_781812_782100_782454_782895_783030_783398
758357	contig_2867_pilon	-	971	2	Intergenic	novelGene_135249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTATGTGTGTGTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286128	1285017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285783_1285922
758362	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	53	509	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758365	contig_19362_pilon	-	920	3	Intergenic	novelGene_157796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACTGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55988	51399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_51498_54104_54181_55242
758366	contig_19362_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_157795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTACTGACACAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51452	50206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_50200_51500
758367	contig_5623_pilon	+	2266	12	Intergenic	novelGene_154791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	70.6696423304055	14	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	175	2043	183167	204584	FALSE	20	TGTCCGTTGTGCTAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAASGTAELLPSPSSSLNWTAGLPTDNGHDSDQVFEFNGTQAVRIPDGVVSVNPKEPFMISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLLRQDPSEEKKYKPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYLDGVSHEPFSVMEDYPLHPSKIETQLVVGACWQGGDLHMTQFFRGNLAGLTIRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLKVPKDSGKGMKIQANPSQSMLTLEGEDIGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTVKCFSEAPCISIPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGIHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPERDDDEDPTVQESLVSEEIVHDLDTCEVTVEGEELNQEQESLDVDMTRLQQKGIEMSSSDLGVVFTGVDTMASYEEALHLLRYRNWHTRSLLDRRFKLVCSELNGRYVSNEFKVEVNVIHTANPVEHASHLAAQPQFVHPEHRSFVDLSGHNLASPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHQRTMRDQDAGKESEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEESEEGEEEDSATPTLLVPRIHDVQNHSASRSADPPWCLLSTPAWCIGLRYPSLPGSHLNYVRSDPHALRRHLARRSDPLCLDTHTWCPQAPLGL	182992	204807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_183243_183619_183742_190082_190246_195550_195709_196314_196464_196685_196913_200208_200380_200803_200950_202580_202717_203157_203343_204074_204147_204320
758368	contig_2311_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_169814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGCTAACCAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271370	271746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_271400_271700
758369	SIRV6	+	334	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	535	2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
758371	contig_3584_pilon	+	1150	6	Intergenic	novelGene_108184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1172.65841573751	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	563	997	530947	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527084	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602_530851_530908
758372	contig_10307_pilon	+	2284	1	Intergenic	novelGene_170294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626356	628640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_626400_628600
758374	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
758375	SIRV4	-	214	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1307	0	1307	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3851	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
758376	contig_7412_pilon	+	1697	2	Intergenic	novelGene_76293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	83	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	200	517	281108	284950	FALSE	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENFTALFGAQADPPPPPAALGFGPGKPPPPPPPPPGGGPGTAPPPSAATAPPGTDKSAAGCGPFYLMRELPGNTELTGSTNLITHYNLEHAYNKFCGKKVKEKLSNFLPDLPGMIDLPGSHDNSSLRSLIEKPPILGGSFNPITGTMLAGFRLHTGPVSPRLGRKKANGEA	280908	286130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_281124_284648
758379	contig_12050_pilon	+	2050	17	Intergenic	novelGene_62609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	347.917712074278	15	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	28	1689	321302	356399	FALSE	15	CTTGGTAACAGTTGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIH	321274	356760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631_354706_356398
758382	contig_4686_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_118534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471278	473127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_471300_473100
758385	contig_3269_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_117030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGTCACTATGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177279	176951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_177000_177300
758386	contig_11292_pilon	+	1597	6	Intergenic	novelGene_109482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	352	690	475628	477206	TRUE	60	AAAAAATGAAGTCAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRLFVCSNSNSILCSHPRLLANLPSQFRPLPVNTECHTATLTFGLSLFHLKQWKKGQMLRIPWALDEVELEAEQKLLQELQAEELLWHQSPLGSWPMYCQYQLTGFHLPL	474279	480890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_474451_475350_475473_475569_475718_476726_476913_477143_477281_480057
758387	contig_8576_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_88745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGATATTAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690290	693025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_690300_693000
758389	SIRV4	+	256	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1512	635	1057	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2512	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
758397	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758398	contig_5452_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_101015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACAGTATAACTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439339	441388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_439300_441400
758399	contig_15744_pilon	+	767	5	Intergenic	novelGene_83579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	149562	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
758401	contig_7095_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_166464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCAGCTTCATTTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485451	484356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_484400_485500
758403	SIRV2	-	244	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	682	22	682	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4050	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
758404	contig_10627_pilon	-	3242	2	Intergenic	novelGene_59983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGCTTTTTTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280354	265618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_268729_280222
758414	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_97114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758416	contig_4812_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_103690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210964	209432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_209400_211000
758418	scaffold_8345_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_106996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180340	179485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_179500_180300
758419	contig_6199_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_126371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224572	223128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_223100_224600
758422	contig_13894_pilon	-	1176	3	Intergenic	novelGene_62047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	707	1099	286682	286290	FALSE	10	GTACTTCTGCAGGTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286917_287219_287527_288148
758434	contig_8059_pilon	+	1461	2	Intergenic	novelGene_111083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAGCCCCTCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90280	175328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928
758436	contig_2577_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_172059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACCGAGATGGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116978	118488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_117000_118500
758438	contig_2577_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_172062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGCAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138281	138566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_138300_138600
758445	contig_6427_pilon	+	1247	4	Intergenic	novelGene_162587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_3	51.8802038889166	701	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	85	492	1297483	1303136	FALSE	10	CGATCCCGTGTCGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKFDHLEEHLEKFVENIRQLGIIVSDFQPSSQAGLNQKLNFIVTGLQDIDKCRQQLHDIMVPLEVFEYIDQGRNPQLYTKECLERALAKNEQVKGKIDTMKKFKSLLIQELSKVFPEDMAKYRSIRGEDHPPS	1297398	1303891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_+_1297605_1298530_1298615_1299331_1299435_1303037
758448	contig_6898_pilon	+	2518	2	Intergenic	novelGene_35672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59519	62075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_61564_61601
758451	contig_5419_pilon	-	1032	2	Intergenic	novelGene_15566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCAAGATATAAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608074	602600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_602710_607151
758464	SIRV1	-	226	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3878	0	3604	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6762	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
758478	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8138	3	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
758479	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9664	558	514	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
758483	contig_8914_pilon	-	761	5	Intergenic	novelGene_112859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3976	junction_4	1628.07422665553	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	34	717	268130	264566	FALSE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268163	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075
758486	contig_6208_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_52976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356918	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_354700_356900
758487	contig_9345_pilon	-	1927	6	Intergenic	novelGene_24405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	238.30283254716	1	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	93	1031	176056	142100	FALSE	25	TCGTTTCACCAGAAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPFPAPRVLLLLLLLRPPPGAHGELCAHSLFLESCPMFCCGTCYDQYCCSDVLKKFVWNEEECPMPEDSVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176148	141203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_173643_173789_175989
758493	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	0	1166	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
758495	contig_11656_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_53959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGCTCCCTTCCCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141464	141814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_141500_141800
758497	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
758501	contig_10135_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_106631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	129	junction_1	0	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	641	982	90686	91027	FALSE	15	TTGCTGTGGAGTCAATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSPQNSLSQPPSAHIAFPGVSLAQLFTVLSSTFRFVLLYFTLILHNCNRGAKITEKSLGAHLANRNPPSYSCHSTVSMGSPYSVLGAHLLSWHLSHRSGIFVLPDFLSTRL	89644	91783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_90060_90460
758504	contig_12638_pilon	+	2320	3	Intergenic	novelGene_33196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	354	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACAAGTGTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272790	277964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_273584_273761_273999_276674
758507	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758509	contig_7816_pilon	-	1907	3	Intergenic	novelGene_66453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGGGGCGGAGTCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101113	94359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_94519_97121_97162_99405
758510	contig_5062_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_157847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTAAAATAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638870	639811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_638900_639800
758514	contig_8801_pilon	+	1374	6	Intergenic	novelGene_66314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	87.4679369826452	366	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	282	806	615025	620573	FALSE	25	TACCAGAGGCCAGCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANKSNKPRVRSIRFAAGHDAEGSHSHVHFDEKLHDSVVMVTQESDSSFLVKVGFLKILHRYEITFTLPPVRRLSKDVREAPVPSLHLKLLSVMPIPEGYSIKCEYSAHKEGVLKEEMLLACEGGTGACVRVTVQARVMDRHHGTPMLLDGVKCVGAELEYDSEHSDWHGFD	608426	621141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_608610_614926_615044_616431_616575_619014_619154_620079_620203_620472
758515	contig_10734_pilon	-	1825	10	Intergenic	novelGene_50987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	35.2024129363771	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	267	1010	304571	294524	TRUE	75	GAAAAGAAGAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLAFVIPILEILLRREEKLKKCQVGAIIITPTRELAVQIDEVLSHFTKHFPQFSQILWIGGRNPGEDVEKFKAQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVKSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRISVKEKGVAASSTQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEALVKRVTILCIHGKMKYKRNKIFMEFRKLQNGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYVKFLAINQKVCCLLF	306653	293278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_293530_293959_294660_295378_295472_296402_296535_299615_299699_302298_302489_304461_304612_305497_305561_305639_305732_306582
758516	contig_10159_pilon	+	1994	3	Intergenic	novelGene_30880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	127.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974929	978149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_975299_976399_976519_976643
758517	SIRV6	+	408	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	554	0	375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758519	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
758522	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8475	-2	264	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTACAAATGTTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
758525	contig_3612_pilon	+	1752	6	Intergenic	novelGene_87821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	75.8567070205397	344	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	290	1474	955615	978135	FALSE	25	TAAAGCATTCTGCTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEHYLEPRVKLCEALERYGLNTEDFFVLNHGESRYLNTDSENVK	932463	978413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_953607_953719_955598_955909_965350_965998_969734_969850_978006
758526	contig_10581_pilon	-	1400	6	Intergenic	novelGene_41400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	68.7528908483127	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	157	645	619681	609845	FALSE	30	GGACAAAATTTGTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	627437	609089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_627357
758527	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758529	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758532	contig_5643_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_38764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATGAAAAGTTTCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186004	185714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_185700_186000
758533	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
758538	contig_5551_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_134277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTAACACAGCGCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766189	768026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_766200_768000
758539	contig_6823_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_131231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTCACAGTGACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309834	308719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_308700_309800
758542	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	55	488	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758549	contig_9471_pilon	-	1557	6	Intergenic	novelGene_21720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	223.522168922906	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	137	865	153444	147722	TRUE	5	CCTCTCTATGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGVSLEQLCGIAA	166998	146973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_147343_147398_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_166912
758550	contig_14925_pilon	-	2039	7	Intergenic	novelGene_55337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	986.677547800361	1	120	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	457	765	116065	114761	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKGR	163910	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114769_115150_115208_115821_116101_129436_129491_163391_163684_163835
758551	contig_11780_pilon	+	282	2	Intergenic	novelGene_134304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	272	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTTTTATATTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54014	56761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_54155_56619
758552	contig_7202_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_18093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27830	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
758553	contig_7733_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_147151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182922	181160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_181200_182900
758558	SIRV4	-	612	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	7	-2	7	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5151	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
758559	contig_5935_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_102673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCTATTAAAGAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628157	627510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_627500_628200
758560	contig_6710_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_89391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATCCACCTTCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
758561	contig_4812_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_103715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTTGGCTGTTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937461	936748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_936700_937500
758562	contig_4812_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_103712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	428	754	936173	935847	NA	20	GCTACTTGTGATTGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHFISILLDINSLYMVYLFQIARIQEAIVQEEVLLSQTDRSIQDPGHLIAEIGFKNVIDMNMIETGRERGGIQGRESGTEMLIKIGHGTGTEIDCGSERENETKGES	936600	935299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_935300_936600
758564	contig_15063_pilon	-	1260	4	Intergenic	novelGene_14307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	771	1094	35891	35108	TRUE	30	AAGAGTACCTGAGAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36791	34830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34921_35031_35380_35839_36146_36275
758566	contig_854_pilon	+	1105	3	Intergenic	novelGene_36472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	3	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	115	309	1517484	1526706	FALSE	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG	1514758	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1514830_1517440_1517565_1526592
758569	SIRV6	+	346	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727
758572	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	47	3380	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
758573	contig_5005_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_84325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTTTTCCTAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523209	523960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_523200_524000
758574	SIRV1	+	252	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATGACTCAGGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
758575	contig_15570_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_137854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGCTCCAATGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667232	667556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_667200_667600
758576	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758580	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	-9	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758581	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
758582	contig_6217_pilon	-	1785	9	Intergenic	novelGene_109628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_1	325.392743465493	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	126	1220	559453	452281	FALSE	40	TAATATTTTTAAAACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPVTTTFRWKTYRFDLPGQVALQACRRLPDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEVNICCL	559578	451715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_559359
758583	SIRV6	+	550	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037_11109_11205
758586	contig_5921_pilon	+	1608	2	Intergenic	novelGene_142261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTTTTGCTGAGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477905	479561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_478224_478271
758589	SIRV6	+	349	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
758592	SIRV2	-	512	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1099	26	-64	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4796	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
758593	contig_8663_pilon	-	1043	6	Intergenic	novelGene_57997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	194.569267871368	71	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	109	642	75397	53470	FALSE	20	GTTACTTTTTTTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSRDREGKGGPRRFTNSMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQSSLKKLAVNNIAGIEEVNMIKDDGTVIHFNNPKVQASLSANTFAITGHAEAKPITEMLPGILSQLGADSLTSLRKLAEQFPRQVLDSKTPKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN	75505	53068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54145_54985_55188_67192_67307_71141_71209_75353
758597	contig_6871_pilon	+	2746	8	Intergenic	novelGene_21612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	4.99795876701026	64	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	616	2451	483602	490291	FALSE	0	GCTGGCTTCTGTGGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLDSNNNTGGVITYIGSSGSSPSRTSPESLYSDSSNGSFQSLTQGCPTYFPPSPTGSLTQDPARSFGNVPSSLSDDSPSSSSSSSSSSFYNGSPPGGLQVAMEDSSRVSPSKSTSNITKLNGMVLLCKVCGDVASGFHYGVHACEGCKGFFRRSIQQNIQYKKCLKNENCSIVRINRNRCQQCRFKKCLSVGMSRDAVRFGRIPKREKQRMLAEMQSAMNLANNQLSSQCPLDTSPTQHPTLGSMGPSPPPVPAPSPLVGFSQFPQQLTPPRSPSPEPTVEDVISQVARAHREIFTYAHDKLGTTPGNFNANHASSSPPATTPHRWESQGCPPAPNDNAAMAAQRHNEALNSLRQTPSSYPPSWAPGPAHHSCHQPNSNGHRLCPTHVYPAPEGEASANSPRQGNSKNVLLACPMNMYPHGRSGRTVQEIWEDFSMSFTPAVREVVEFAKHIPGFCDLSQHDQVTLLKAGTFEVLMVRFASLFNVKDQTVMFLSRTTYSLQELGAMGMGDLLNAMFDFSEKLNSLALTEEELGLFTAVVLVSADRSGMENSASVEQLQETLLRALRALVLKNRPLETSRFTKLLLKLPDLRTLNNMHSEKLLSFRVDAQ	482986	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_483633_486269_486600_486885_486975_487080_487226_487585_488230_488538_488725_489237_489449_490091
758600	SIRV6	+	519	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758602	contig_12638_pilon	+	1843	11	Intergenic	novelGene_33241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	45.0199955575298	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	42	1025	737245	759297	TRUE	35	AGAAAGGGTCCGTGGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLEYNKAIRNYTRFDDWYLWVQMYKGTVSMPVFQSLAYRASLGTLTMP	737203	764653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878_752021_753484_753587_759259_759386_760535_760658_764045
758605	contig_5018_pilon	-	1241	9	Intergenic	novelGene_47035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_6	137.452207603225	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	71	1159	1397263	1392342	FALSE	35	ATTCATGTTTATTTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397333	1392259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
758609	contig_1406_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_25494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	365	676	1359743	1360054	NA	45	TAGAGAAGTTAATTTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLKLFFSIQHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRVEVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTCMYLYPKLCIACCKLKYHISVSLLVFCLI	1359378	1360785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1359400_1360800
758610	contig_1406_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_25495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAATTTTTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361229	1362789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1361200_1362800
758612	contig_15570_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_137837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATTGGGCAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475524	476310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_475500_476300
758615	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_98130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CACCCATCTCGTCCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758616	contig_7657_pilon	+	2747	1	Intergenic	novelGene_30019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146301	149048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_146300_149000
758627	contig_4891_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_124526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTTAGTTGTTGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86623	85197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_85200_86600
758635	contig_11752_pilon	-	917	6	Intergenic	novelGene_37661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCCAGCAGTCGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105928	87195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_87247_87437_87547_88670_88775_92873_93058_96440_96574_105592
758637	contig_5419_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_15537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCCCCTATTTATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410816	410387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_410400_410800
758643	SIRV6	+	214	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	506	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
758644	contig_3077_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_26835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	318	683	543616	543251	NA	70	TTACCAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSEFNSVYVLIPRSMFIPPLYNATNSKTESSTPNPWKPNQGDWGSSTNLWTKSHKNIHKTKTLTDSPFFYEKRSAFGGRGASCSCNETCEGWHSMGTALFFQVSRISAFDSLTNFYHLF	543933	543019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_543000_543900
758647	contig_6710_pilon	-	261	2	Intergenic	novelGene_98320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACAAAAGCCATAGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657175	653653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758649	contig_11258_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_67760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1204	1506	154809	155111	NA	45	CTCCTTCTTAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRRRCMLKMQIYSHTPPEILSQLVCGGAWKSAFYMNHSPRISSRSPLPHPGPSESYSEVRTRPGHQPGYSSVLSRQLGLGGFTSSAGSILAFSIQPGS	153605	155189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_153600_155200
758651	SIRV6	+	478	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATGCGGTAAACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758653	contig_14243_pilon	-	2149	16	Intergenic	novelGene_57430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	282.354544657756	830	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	40	2127	671471	594448	FALSE	40	CTTGAAAAAAACCAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQSLWDSLQPWCPLHLSVAWVDTVWELDFTETEPLDSSIEAEIIENGLDAFTRLYESLFPFATEEHGSTENLWTFFTENNISHSVLVALFYHFVQIVHKKNISVQYREYGLHAAGLYFLLLEVPGSVANQVFHPVMFDKCIQILKKSWPQESNLNRKRKKEQPKSSQGNPRGNRKRGKPLRREDIEMDVILQEQEDEENICFSARDLSYIRNAIFHLLKNFLRLLPKFSLKEKPQCVQNCIEIFVALTNFEPVLDEFHVSQARNLNEAKYIPELAYHGLYLVCSPIHGEGDKVISCVFHQMLNVILMLEVGEGSHRTSLTITSQVINSRNQAVQFISLLVEELKESIFPVLRILLQHICAKVIDKSEYRTYAAQSLVHLLSKLPSVEYATFIAWLYRYSRSSKIPHRVFTLDVALALLELPEREVDNTLSLEHQKFLTHKFLVQEIMFDRCLDKAPTVRSKALSSFAHCLELSVTNTSESVLELLINSRAVSGIESHPGTLLRNSLGFSFQKQTFNPSGASEMTSTDKSAETARSGERCVMAMLRKRIRDEKTNVRKSALQVLVSILKHCEISGMREDLSILQDQCRDPAVSVRKQALQSLTDLLMAQPRCVQIQKAWLTGITPVVMDCESTVQEKALECLDQLLLQNIKHYSKFHSGDDSQVLAWALLPLLTTEGQELRYVNCVTCFPYRRP	671510	594425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_594712_595518_595654_600733_600808_608932_609023_609264_609322_609776_610030_610156_610283_611047_611121_612507_612642_628844_628933_629119_629182_629296_629465_630128_630314_645348_645512_659673_659829_671410
758655	SIRV6	+	490	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	23	164	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758656	contig_17829_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_157037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGTAAAAAAAAAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38028	36363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_36400_38000
758658	contig_13680_pilon	-	1795	10	Intergenic	novelGene_149596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	145.165635494063	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	177	1283	396643	380011	FALSE	20	TACACATTGACTTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCRALRKETWRWLGPRLPLLFVVPPPPPPPPLPLLPLISSVGRGDRGGGWRKRRRRMEEGGGGARSLVPGGPVFLVLCGLLEASGGGRALPPLSDDIPFRVNWPGTEFSLPTTGVLYKEDNYVIMTTAHKEKYKCILPLVTGGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKYIRQYHEEKETGQKVNIHEYYLGNMLAKNLLSDKDQEAEEREKSKEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILTPLLCNHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKPIAVGSQPTLTVGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFHGGVGWWKYEFCYGKHVYQYHEV	396819	379498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_380077_380902_381065_385130_385261_385352_385577_388075_388111_388790_388855_388993_389072_389620_389702_390827_390933_396481
758661	contig_17493_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_122196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATACAAAATCTTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119846	117569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_117600_119800
758664	contig_13021_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_8285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260173	261550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_260200_261600
758666	contig_6710_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_98292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	3	317	653879	653565	NA	25	TAGAGGGAGGCCTACTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
758676	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758679	contig_16722_pilon	+	1937	2	Intergenic	novelGene_118281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	938	1312	96331	96705	FALSE	55	AAAAAGCTCAAGAATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQELLHTGKKGSHLDCSNGSYQKFWSYPPQIPSAFHNIVFVLFLPWWQGLKNTKRTTLSKLLAFSSTTVSIPGASNMTNKNIYCPSSPGTKPVPHWMLMLQLMKKIEALFQFVFDWCGGESEI	91010	97330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_91909_96291
758682	contig_9363_pilon	+	1050	9	Intergenic	novelGene_6834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	193.251738349232	6	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACGCGAGTCTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1622475	1625970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622743_1622991_1623037_1623429_1623537_1623619_1623738_1624354_1624445_1624573_1624674_1624905_1624969_1625613
758683	contig_10299_pilon	+	1644	14	Intergenic	novelGene_79701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.756631054709	1	60	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	628	1482	337976	340377	FALSE	15	CATGCTTGTCTCATGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKLALSKAIESGDTDLVFTVLLHLKNELNRGDFFMTLRNQPMALSLYRQFCKHQELETLKDLYNQDDNHQELGSFHIRASYAAERIEGRVAALQMAADAFYKAKNEFAAKATEDQMRLLRLQRRLEDELGGQFLDLSLHDTVTTLILGGHNKRAEQLARDFRIPDKRLWWLKLTALADLEDWEELEKFSKSKKSPIGYLPFVEICMKQHNKYEAKKYASRVGPEQKVKALLLVGDVAQAADVAIERRNEAELSLVLSHCTGAADGATADKIQRARAQAQKK	320511	340539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_335152_335254_335378_335435_335741_335874_337924_338034_338123_338222_338304_338410_338732_338811_338906_339077_339158_339256_340019_340124_340232
758687	contig_18869_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_56008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATAATTTGTTTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73573	73339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
758690	contig_7333_pilon	-	1228	9	Intergenic	novelGene_142789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGCAGCTGTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237538	218476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_218563_218730_218794_219139_219205_222947_223024_223596_223675_224011_224319_230327_230391_236788_236836_237095
758692	SIRV6	+	354	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	23	406	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758700	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_97191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758704	SIRV4	-	321	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	0	1200	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
758705	contig_8064_pilon	+	1425	3	Intergenic	novelGene_164561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	48	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	177	497	117228	118276	FALSE	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSAFSQASEPVSCTWWQLHLDPHLNVYSPSLPGNSNPRRNQLINLNHYATKKSVAESMLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101615	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_117149_117382_118109
758707	contig_12123_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_144610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGGGCTTGCTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143667	144073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_143700_144100
758709	contig_7391_pilon	-	2061	7	Intergenic	novelGene_112154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	37.195056421818	105	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	113	511	425770	415302	TRUE	15	GTGCCCTGTTCTTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFEVVLGRAQAASPQASSLPPAASECLSASQFLVSEKMAEELDLMGQDSDGDSDEVVLTPAELIERLEEAWMNEKFAPELLESKSEIVECVIEQLDHMEENLRRAKKGDLKVSIHRMEMERIRYVLNSYLRCRLMKIEKFFPHILEKEKTRSDREPSCLSPEEFAFAKE	426797	410569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_411750_411846_411938_415022_415404_419823_419938_420760_420848_425674_425790_426704
758711	scaffold_19766_pilon	-	850	2	Intergenic	novelGene_34264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	589	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	182	604	288455	288033	FALSE	10	CCCCACTGCCACTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENREHRGAVEAELDPVEYTLRKRLPHRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGARGQNACTELYIHGLGLAINRAINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDAREPLIRTRNNSAIHIRVFRVTPK	288872	287786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_288466_288701
758713	contig_6241_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_156398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTCAATAAATTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179521	176770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_176800_179500
758714	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
758715	contig_3721_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_123792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGAAAATACCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58918	58433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_58400_58900
758716	contig_9389_pilon	+	779	2	Intergenic	novelGene_84038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1	447	584805	585936	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSGAKEEADLPQVHLPRRGPGPAAGHVLVRGDRGRGRAGVWSDLLGPGDVWTPQRAADAALQRATAAAAQPRPAPEAALTPEAAAQGQEGGAAHGEARGGEDALARHDHPARDGGQHGWRVQWQDLQPSGDQGEQCVSWAGPATCPP	584804	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584964_585648
758718	contig_9515_pilon	-	1677	6	Intergenic	novelGene_73836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	34.8172371103739	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	443	913	91887	78307	FALSE	25	GAATCGTTCTAGTTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKTLLMAQEIFQLSRHHIQQFPFCLMSVNITRIAIQALREECLTRECNRQQKVIPVVNSFYAATFLRLAHVWRTQQKTISDSGFVLKDLEALAKKNPRRLLKTLEIYLARVSKGQASLLGTLKCYGPQTPHSKDLTFTGVCDLSLHSSEGAWPI	96005	77542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_78510_78993_79122_79453_79531_91824_91956_95358_95482_95754
758721	contig_8978_pilon	-	2444	3	Intergenic	novelGene_49453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATACATAAATGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670232	1666773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1668561_1669119_1669185_1669640
758722	contig_3861_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_57906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTACCACCTATCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182704	181585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_181600_182700
758723	contig_3861_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_57905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181174	179518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_179500_181200
758725	SIRV5	-	476	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	22	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTAAGGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
758729	contig_18869_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_56373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	65	310	73707	73462	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73771	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
758731	SIRV2	-	541	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1096	0	-67	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4799	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
758736	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
758741	contig_15182_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_136458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAACATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522757	525196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_522800_525200
758745	SIRV4	-	464	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
758746	contig_9656_pilon	-	1253	11	Intergenic	novelGene_121925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	349.740132098105	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	59	721	446594	436985	TRUE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRVYCSGTERSKCIPF	446652	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437031_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
758747	contig_6710_pilon	-	420	2	Intergenic	novelGene_98235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	GCCTCTGGCCCCTTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758748	contig_15062_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_162283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	648	989	6150	6491	NA	55	TGTTAAAAAAAAAGCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNIEYTMDCQKNQQICLGRRTARMLLRSKTSSHILWTCYQEGPVLEKDIMLGKVEGQRKRGRPSKRWTDTVAATMGSNVTTIVRMVRDGAVFCSVVHRVAMSQNRLDGT	5502	7057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_5500_7100
758754	contig_6677_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_114205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584427	586351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_584400_586400
758755	contig_12570_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_79335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTGTAGATAAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54636	52554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_52600_54600
758756	contig_4838_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_144794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275635	275026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_275000_275600
758757	SIRV3	-	259	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTCGCAGTTAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7213	6954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_7000_7200
758758	contig_12118_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_168900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCTGGAGAAGGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6434	6759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_+_6400_6800
758761	contig_10331_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_54071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCTACCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78809	81016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_78800_81000
758762	contig_15063_pilon	-	868	5	Intergenic	novelGene_10179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTCACATTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39765	27131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34939_36465_36597_38972_39081_39504
758763	contig_5484_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_151085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59754	57755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_57800_59800
758764	contig_8873_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_162902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCATATTAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374290	373391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_373400_374300
758765	contig_8873_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_162901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAATTCACTTACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372782	372176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_372200_372800
758767	contig_4156_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_88084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221572	219311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_219300_221600
758768	contig_2703_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_101798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCACTCCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615145	615909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_615100_615900
758771	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
758772	contig_5031_pilon	-	1907	14	Intergenic	novelGene_133212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	416.583881322255	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	1185	1907	99066	88288	FALSE	30	TTCAAGCAAGCCTCTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQKKNPTEVTLSPSLVNPEDFMPLDPTQEPIFPPELLRLKDVPQKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQYPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNKLFPVIICPAWIPELNSVEHVPEGISFGAACPLSSVEKTLVDAVAKLPAHKTEVFRGILEQLRWFAGKQIKSVASIGGNIINASPISDLNPVLMASGAKLTLASQGTKRTVQMDHTFFPGYKKTLLNPEEILLSIEIPFSREGEFLSA	117064	88287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_88306_90741_90852_92327_92422_93663_93816_94581_94675_97342_97485_98635_98726_99042_99112_102695_102762_103672_103800_105906_106070_107305_107466_110278_110337_116499
758775	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
758777	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	57	509	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758778	contig_2969_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_157068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATATAATGAAAGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855633	857449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_855600_857400
758780	contig_9389_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_84070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1647	1991	1006889	1006545	NA	15	TTTCACCGCCTAGGTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWASLSKRLNHQTLPFSQSICSRMGGAPVSCVQAGGPTQRLGGVPSNASNGRHVANQWVLPQLVGVCIVCGAASEPPNILRSDDIHTQKCPTHTLLGLPNTTGPLEMFTWVTR	1008535	1006370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1006400_1008500
758782	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8135	3	604	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTTGTCGAAATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
758789	SIRV7	-	223	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91678	-7	-91672	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAATAAATTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
758791	contig_1694_pilon	-	3428	21	Intergenic	novelGene_144929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_7	40.7093355386697	98	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	956	2871	62	2932	502378	473418	FALSE	25	ATGGAATTCTGTAATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGATGCAACGRAHEGPALELQPQDPASSLCPRPHYLLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNHEKHFYTFTNEHHRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSAENQLEVIFITNDRKNKEKAIEEGIPAFTCEEYIKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKVIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWVHGDAEENKEIILQGLKNLNRAIHEDIVAVELFPKSQWVAPSSVVLHDEGQDEDDVEKEEERETILKTAVNEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASALEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVKNLGDAGDKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKYREDLRHLCVCSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLRCNVDRLAFSCIWEMSHNAEILKTRFTKSVINSKASLTYAEAQMRIDSATINDDTTTSLRGLNKLAKILKKQRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAAKSKNLEIRTDTAKSLADSLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADSTYPELTDKHKLADLCKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEGYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPKPWLVYDDEIPSLKIEDTVFHIFDKVKVRIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISTDISNMDINEPERKKKKLQK	502439	472921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_473496_474184_474308_475090_475250_475355_475525_475632_475848_480662_480820_483493_483581_486346_486475_488085_488171_488259_488325_490029_490132_490400_490518_490897_491045_491722_491861_491994_492109_493254_493420_494289_494458_497904_497979_498565_498760_501382_501541_502150
758796	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	8	1155	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
758798	SIRV4	-	321	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
758801	contig_14341_pilon	+	1617	5	Intergenic	novelGene_111768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	45.8659732263472	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	90	326	299952	327775	FALSE	20	TATTTCTGTGGCAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRGPPGAIVWRGRGIGILRILPTPTRDMLRSEERIVSGLPKAWSGEPVTFEDVTLGFTPEEWELLDPMQKTLYREVMLENYRNLVSVEHQLSKPDGGKLQWKAKS	299407	329066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_299457_299911_300006_300969_301097_301864_301888_327742
758807	contig_9460_pilon	-	1256	8	Intergenic	novelGene_155306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_7	408.394417199844	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	316	1254	82608	42509	FALSE	25	GCAGGTGACTTTTTAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVTLKTLQQQTFKIDIDPEETVKALKEKIESEKGKDAFPVAGQKLIYAGKILNDDTALKEYKIDEKNFVVVMVTKPKAVTTPAPATTQQSNPATTTAVSSSTAAAVAQAPAPAPALASPCTPTSVTPASTTASSEPAPASATKQEKPAEKPAETPVATSPTSTDSTSGDSSRSNLFEDATSALVTGQSYENMVTEIMSMGYEREQVIAALRASFNNPDRAVEYLLMGIPGDRESQAVVDPPQAASTGAPQSSAVAAAAATTTATTTTTSSGGHPLEFLRNQPQFQQMRQIIQQNPSLLPALLQQIGRENPQL	82923	42506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_42631_44293_44430_45931_46060_52115_52172_56814_57084_61247_61328_62682_62765_82542
758809	contig_11413_pilon	+	705	4	Intergenic	novelGene_103128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1157.74992502219	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	17	304	87465	88008	TRUE	30	AAAGGTGTTGGAATTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDLGSSPCFATLGCMILANSLPFSGPQFGPG	87448	90699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_87915_88248_88420_88508_90624
758810	contig_401_pilon	+	605	4	Intergenic	novelGene_42776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTACAGAAGCTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079532	1083761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1079792_1081570_1081768_1082306_1082381_1083686
758813	contig_8357_pilon	-	1295	1	Intergenic	novelGene_39760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAATTCAGTTTTACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881969	880674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_880700_882000
758818	contig_9199_pilon	-	1986	11	Intergenic	novelGene_65647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.546013461696	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	484	1842	159682	156771	FALSE	10	TCACTGCCTTTCCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSGWLVVGKDDIDNSKPGPGLNRPGSSPLVNQYSLTVGLDLGPHDTKSLLKCVESLSFIVRDAAHITPDNFELCVKTLRIFVEASLNGGYKSQEKRSKSHKYDSKVNRFKKKSKEGSVLRRPRTFSQHATRGGHSDDDEDEGVPASYHTVSLQVSQDLLDLMHTLHTRAASIYSSWAEEQRHLETGGQKIEADSRTLWAHCWCPLLQGIACLCCDARRQVRMQALTYLQRALLVHDLQKLDALEWESCFNKVLFPLLTKLLENISPADVGGMEETRMRASTLLSKVFLQHLSPLLSLSTFAALWLTILDFMDKYMHAGSSDLLSEAIPESLKNMLLVMDTAEIFHSADARGGGPSALWEITWERIDCFLPHLRDELFKQTVIQDPMPMEPHAPKPVASAHLTPAAGDTKTPGHPPPPEMPSEPGACDFEKPEGPRATSSSSPGSPVVSSPSKLSPTPDGPPPLAQHPLILQPLASPLQAILAPPTPSCPRSHKLYRPSPSCCCCHLDEDQKKRKTFTAPPGTYNQTAGPPSSSALHSWGPNLRAHSGIICSLCLQPGSSGQASLCQPCGAHVSLLPWSGNEIQAQPLCTFVSLSHTHSHQPWATSSSSSSFIN	161264	156626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_157179_157335_157491_157998_158128_158289_158471_158611_158726_158999_159102_159305_159437_159543_159695_160527_160734_160865_161113_161246
758819	contig_13740_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_34746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGAGTGTTTTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328279	326904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_326900_328300
758820	contig_1337_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_84267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648591	646789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_646800_648600
758821	contig_4469_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_21872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGCATGGACACATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78125	79076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_78100_79100
758824	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
758827	contig_10642_pilon	-	776	3	Intergenic	novelGene_78719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_2	29	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGATGTGGAGGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921248	915906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_916462_920788_920866_921104
758828	contig_4845_pilon	+	1690	13	Intergenic	novelGene_53619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	322	junction_1	281.785921499914	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	78	1397	205637	221846	FALSE	15	CCCAGCAGCCCTTTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGSSGRARFLFSFCRVRLWGTGLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGDDKYGRKIIVFSACRMPPSHQLDHSKLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHGLTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGRKIFYVNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPIPLVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQIVREVQQKYNVGLPVDFNQYNELHLPAVILKTFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQRVEVTLQVLQTLPEENYQVLRFLIAFLVQISAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLWAKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFLSPDSKQL	202026	222139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991_206088_212882_212971_218065_218198_218576_218664_218838_218938_219293_219402_219488_219566_219797_219876_220346_220476_221450_221555_221657
758829	contig_7361_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_163383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCCCTCAAAACCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284327	282054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_282100_284300
758832	contig_4114_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_15615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTCACACACCAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374739	373413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_373400_374700
758836	SIRV6	+	543	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1570_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758839	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
758843	contig_4131_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_127850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAATTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104511	106267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_104500_106300
758844	contig_1331_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_37888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGGTTTTAAGACAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485955	484125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_484100_486000
758846	contig_5643_pilon	+	1544	1	Intergenic	novelGene_38916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351353	352897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_351400_352900
758847	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
758848	contig_5954_pilon	-	2122	14	Intergenic	novelGene_28707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	198.831765585676	2	101	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	84	1652	975610	962561	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEDT	975693	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962571_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
758854	contig_11227_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_163205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	725	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1169	1516	316413	316760	NA	35	AAAAGTTGCCGTTGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFASLLFTEDSMCCLKNGCCADICVCHFVPELRAEVDIIEQMSSSGSSSSDSESSSGSDDDSSSSGGEDDAPASPPQPSHQQAYNSRPAVANGTSRPQGSNQLMNTLSKCAVLL	315244	317579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_315200_317600
758856	contig_7840_pilon	-	1398	8	Intergenic	novelGene_69041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_7	170.224581548216	142	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	171	1157	427684	378748	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSRWFLFDNFLVV	445725	378506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609_427738_445608
758861	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	166	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758864	contig_13565_pilon	+	1685	10	Intergenic	novelGene_162369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	149.45679420265	71	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	266	979	173055	199761	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTREIENYPHFFLDFENAQPTEGEREIWNQISAVLQDSESILADLQAYKGAGPEIRDAIQNPNDIQLQEKAWNAVCPLVVRLKRFYEFSIRLEKALQSLLESLTCPPYTPTQHLEREQALAKEFAEILHFTLRFDELKMRNPAIQNDFSYYRRTISRNRINNMHLDIENEVNNEMANRMSLFYAEATPMLKTLSNATMHFVSENKTLPIENTTDCLSTMTSVCKVMLETP	86266	200467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_86325_132326_132369_134059_134215_173044_173125_195305_195428_196635_196742_198595_198733_199214_199293_199471_199589_199677
758865	contig_9366_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_166255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955155	953404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_953400_955200
758869	SIRV6	+	245	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8473	-2	266	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
758871	SIRV2	+	439	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	158	-74	-158	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACCACTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
758873	SIRV7	-	380	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	2	-32	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
758875	SIRV6	+	539	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10814_11031_11109_11205
758876	SIRV5	+	394	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-67	878	47	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8248	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
758878	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_89218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653717	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
758880	contig_9146_pilon	+	1693	5	Intergenic	novelGene_79517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	10.0249688278817	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACAGTGATACAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359598	373201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_359763_360662_360930_363942_364064_371930_372044_372173
758883	contig_12756_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_153204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	379	735	47160	47516	NA	40	AGAGAAGGCTACTTTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGATGFLRTADVSRLSCGEVRQGSVSSMPKLQRREMTPVYRAFAGERERECHALFPVLPRALETQLLDPGAGGMRTGKRTEDLCAESDSLKAWCSCFLFCQTGPVPALLQVCQEQT	46781	48833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_46800_48800
758884	contig_10531_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_114537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTCCCAAAAAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488812	489339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_488800_489300
758886	contig_6842_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_130820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTAAAATGGCAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765124	1764576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1764600_1765100
758887	contig_11386_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_82798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGACACTTGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88067	89985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_88107_88168
758889	contig_5041_pilon	+	1897	9	Intergenic	novelGene_27123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.1400290662232	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	201	1106	729281	841205	FALSE	20	TGCTGATAATACTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKTPVGFIGLGNMGNPMAKNLMKHGYPLIVYDVFPDACKEFQDTGEQVVSSPADVAEKADRIITMLPTSINTIEVYSGANGILKNVKKGSLLIDSSTIDPAVAKELAKEVEKMGAVFMDAPVSGGVGAARSGNLTFMVGGVEEEFAAAQELLGCMGSNVLYCGAVGTGQAAKICNNMLLAISMIGTAEAMNLGIRLGLDPKLLAKILNMSSGRCWSSDTYNPVPGVMDGVPSANNYQGGFGTTLMAKDLGLAQDSATNTKTPIFLGSLAHQIYRMMCAKGYSKKDFSSVFQFLREEETL	710861	841996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_710925_713775_713899_729266_729428_742654_742765_745409_745532_825377_825512_829621_829699_836408_836566_841046
758890	contig_11003_pilon	-	1991	12	Intergenic	novelGene_105412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	99.3571069966502	41	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	46	1203	27839	15713	TRUE	15	GTTGGATTCTGTGTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRWGGQEHWAVPCSALGLPQPGQPWVLISTFGWVRRRFM	27884	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_12930_14988_15174_15307_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
758891	contig_10890_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_166789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCAGTTGCCAAGAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146555	145699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_145700_146600
758892	contig_5718_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_110310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGCTTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431410	428817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_428800_431400
758894	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	20	1159	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
758895	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_95822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653761	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758901	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
758902	contig_7933_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_164676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187987	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_185700_188000
758903	contig_10988_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_104720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACCAGGCATCAATAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41839	41577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_41600_41800
758906	contig_11396_pilon	+	1363	5	Intergenic	novelGene_71248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	154.124138278207	674	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	243	839	88067	90215	FALSE	15	AAGTCTCTCTTCTGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDAAPPAVPAAPGRNPCCLCWCCCCSCSWNEERRRAWWTSRETKLQPLPSCEACAAPSPEEVRSWAQSFDKLMHSPAGRNVFREFLRTEYSEENMLFWLACEELKAEANKHVVDEKARLIYEDYVSILSPKEVSLDSRVREGINKRMQEPSAHTFDDAQLQIYTLMHRDSYPRFLGSPVYRALLLHGSTPSFSEA	85263	90739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_85470_88030_88162_89479_89555_89701_89937_90023
758907	contig_4105_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_21511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCGAGCACAAAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112441	114202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_112400_114200
758912	contig_6102_pilon	-	1028	5	Intergenic	novelGene_32364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	151.497524732254	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	232	807	1718642	1715078	FALSE	5	TTCTTTTTCATTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQKEVYLHTSPHLKTEPDPTAEMEAESLSFSFGTLSSWELEAWYEDLQEVLSSDESGGTHVSPPANEKEESKTFTTLDPACLAWLTEEPGPAEVTSSSQSPQSPDSSRSSLAQEEEEEDQRRPRKRKQSGQSQARAGKQRLKEKEQENERKVAQLAEENERLKQEIERLTREVEATRRALIDRMVNLHQA	1719030	1714856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1715447_1715529_1715688_1716395_1716444_1718641_1718785_1718941
758916	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
758921	contig_14341_pilon	+	2438	3	Intergenic	novelGene_111759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5	71	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	297	1709	218687	220099	FALSE	30	TGTTATTGTAAAGTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGTHGKRQKPDSNADEKTYAKEKPYECRECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECGKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCNQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKGFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECQDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYECRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG	207594	220828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_207623_218365_218452_218504
758922	contig_1009_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_121726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCGTAGAGTTGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117787	117535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_117500_117800
758928	contig_6710_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_97617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
758932	contig_5231_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_65884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTGACCTTTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125611	126624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_125600_126600
758934	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758935	contig_9014_pilon	-	1186	11	Intergenic	novelGene_106813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	30.4144702403313	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	4	669	160706	155284	TRUE	20	CATACAGTTGGTTGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMAPAHHCPLCRQTFFCGRGHVYSRKHQRQLKVALERLLPQVEAARKAVRAAQVERYVPEHDRRCWCLCCSCEVRKHLSHGNLTVLHGGLLEHLASPEHKKATNKFWWENKAEVRMKDKFLISPQDYARFKKSMVRGLDSYEEKEDEVIKEMAAQIREVEYSRQEMVRSVLEVGFPRRIQSTSGSARPRRGLFDTWKLETEKQSIFQLTAALRLGPANSPRA	160709	152442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_152663_152746_152880_152957_153048_154044_154076_155240_155344_155528_155594_155910_156002_156077_156145_158771_158871_160304_160469_160586
758936	contig_3161_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_84533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGTTGGAATTCAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503441	505969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_503400_506000
758939	SIRV6	+	348	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10723
758940	contig_10082_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_63859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	598	906	190979	191287	NA	60	AAAAAAAAGACCAGATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDTLYRQTQRCEGCPNYNHQERSGFWHFEGALVVQWLRAQLLTKWLAVQIHQLLLGNPIGQLYSVPQGRYETELTRRQQVSAILRATQQKKHEWIFQSPSS	190381	192397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_190400_192400
758941	contig_1813_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_105514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTAATCCACACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423058	421656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_421700_423100
758942	contig_8254_pilon	-	2043	2	Intergenic	novelGene_48367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACACACCAGGCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29839	22292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_23693_29196
758943	SIRV2	+	325	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	272	-74	-272	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGATGTTCTATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
758947	contig_14441_pilon	+	884	4	Intergenic	novelGene_100654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413.966450599831	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	270	698	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKTPEQLLGPPRVHFRVALFWCVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112033	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117220_117344_117539
758951	contig_16156_pilon	-	1987	10	Intergenic	novelGene_137071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.7626728046147	3	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	5	1195	160245	99837	TRUE	10	TTGTTTTCTATTTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKAVESIQAEDESAKLCKRRIEHLKEHSSDQPAAANVWKKKRMDRMMVEHLLRCGYYNTAVKLARQSGIEDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160249	98958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99288_99373_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_123176_123381_133371_133555_160176
758953	contig_5590_pilon	+	1642	11	Intergenic	novelGene_163060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	28.2835641318417	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	178	669	521411	523302	TRUE	15	GGGCGAGCCTGTGCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPTAAAPAGSLIPSILLLASGTVVVALLGAAHHLGLFYQLRHKVDKASVRHGGENVAAVLRAHGVRFLFTLVGGHISPLLVACEKLGIRVVDTRHEVTAVFAADAVARLTGTVGVAAVTAGPGLTNTVTAIKNAQMAQSPVLLLGGAASTLLQNRGGTPGH	520341	530742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_520509_521400_521546_522770_522973_523064_523193_523275_523416_523492_523605_525724_525825_525957_526034_529649_529708_529851_529958_530334
758954	contig_18869_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_56472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAGAAAAAAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206377	205440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_205400_206400
758971	SIRV4	+	238	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1533	632	1078	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2533	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
758972	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
758975	contig_9935_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_164848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAAAAAAGTGTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2744	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_1900_2700
758977	contig_4232_pilon	+	965	5	Intergenic	novelGene_63190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1981.19854822781	5	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	82	582	146362	149200	TRUE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146280	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087_149212_149307
758979	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_89493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653756	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
758982	contig_10980_pilon	+	1994	2	Intergenic	novelGene_162552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	587	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCCAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104688	169274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_104880_167471
758984	SIRV6	+	149	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	60	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
758988	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_1135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
758989	contig_14341_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_111867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	575	1728	54	1781	595650	593923	NA	25	TCACCTTTAATACTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILHLVEHQGTHPKEKSYMCGACGRDFWFTVNLHQHKKEHSGDKLFRWDKDRDSFVKSSNIHLSEKPFTCGKSGKDVPDNHILQHQAIHSRGKPHNTKCREAFLYRSNLGQLPGTHTAQELSKCSDCGKAFLRSSTLLSHLKTHSEKRTYSCPTSRNSFKEKSTLVNHQKFHIGETSPVCKDCGKAFSHLSKLRKHQKFHTGIKHYECTKCGKTSSHKLTLVHHKRIHTGERPYECSECGKAFNNRSHLIRHEKVHTGERPFECSRCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECNQCGKAFSRSSALIQHWRVHTGERPYECSECGRAFSNNSNLAQHQKVHTGERPFECNECGRNFSQSSHLLRHQKVHTGERPFECSECGKAFSNNSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIHTGERPYECSECGKAFAHSSSLIEHWRVHTREKPYECSECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEKPYECSECGKFFSRKSSLIYHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHHRVHTQERPYECSQCGKAFSERSTLARHQIVHTRERTFECGQCGKIFSRLCNLAQHKRIHT	595703	593379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_593400_595700
758990	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
758991	contig_2757_pilon	-	2105	2	Intergenic	novelGene_164594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAGTTTGACTTAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264766	261716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_262138_263082
758992	contig_9186_pilon	+	1891	14	Intergenic	novelGene_85351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_11	838.103628621003	340	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	70	1728	440908	491002	FALSE	40	CATACTGTACAGACTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNRERFCNREREFVYKFKVGSQYLELKVPLKFPVQEDASHLHGRLMLLHNLPCFIENDLKEGLSQFIEEESLRDYDRDAEASLEAVKSGEVDLHQLASTWAKAYAETTLEHARPEEPSWDEDFADVYHDLIHSPASETLLNLEHNYFVSISELIGERDVELKKLRERQGIEMEKVMQELGKSLTDQDVNSLAAQHFESQQDLENKWTNELKQSTAIQKQEYQEWVIKLHEDLKNPNNSSLSEEIKVQPSQFRESVEANGRIYEEQRKLEESFTIHLGAQLKTMHNLRLLRADMLDFCKHKRNHRSGVKLHRLQTALSLYSTSLCGLVLLVDNRINSYSGIKRDFATVCQECTDFHFPRIEEQLEVVQQVVLYARTQRSSKLKESRDSGNRNGGSDDKTKNTDRNYLNILPGEFYITRHSNLSEIHVAFHLCVDDNVKSGNITARDPAIMGLRNILKVCCTHDITTISIPLLLVHDMSEEMTIPWCLRRAELVFKCVKGFMMEMASWDGGISRTVQFLVPQSISEEMFYQLSNMLPQIFRVSSTLTLTSKH	437182	491165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_437227_440882_441086_442499_442646_448627_448810_452725_452826_453302_453425_461214_461322_461692_461891_462735_462865_469614_469690_477358_477562_489510_489569_490169_490238_490909
758993	contig_9389_pilon	-	1891	8	Intergenic	novelGene_84087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.9285058977168	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	590	1225	1256305	1242138	FALSE	40	TTAATGAGTGAGTGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVLEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQNLNEGEKLSSEHIMVRFMKNNTWSSVLGEISELHGNKHQQKNQRRHLRSRVVENLCESNEGNQCGKTFSRIPNLTVLKRNSPEVNLFACSECGKAFVDHSSYKHHTRSHTGCNARQCKECGEACSCPSHLTTPMRTHNGKKPHKSYAGLANKSPEVGELRELPSW	1264837	1241471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1242203_1245375_1245666_1246244_1246396_1247296_1247424_1256302_1256532_1256678_1256715_1260828_1261050_1264731
758994	contig_9519_pilon	+	2230	9	Intergenic	novelGene_172080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	13.7152971167234	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	948	1763	479900	485957	FALSE	35	CAATTTAAAATGAGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDVQPTKLKLGIDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDLNSEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPKPQASFLPENTFSTNLNFFPTPNPDPFRDDPFTQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENLSSLSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQAGQWPFPSTQTQPAMRTQNGVSEREQNSFHVKSSPNPFVGSPSKGLSVSNGVKQDLESPVQSAPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKVNCLLHISIGRMHVRYQRVV	438010	486424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9519_pilon_+_438232_473022_473213_475450_475591_476384_476484_478398_478531_479133_479219_479819_479936_480346_480410_485240
758996	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
758999	contig_10609_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_123910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCCAGAATGATTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249078	246976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_247000_249100
759000	contig_9972_pilon	-	805	5	Intergenic	novelGene_162802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	346	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAAGGAAACAGCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363560	334141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_334183_338440_338517_353866_354104_361316_361594_363386
759001	contig_8920_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_146063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	19.6134520164096	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	209	763	93918	90809	FALSE	60	TAAAAAAATTGGATGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEMLVQEAAGSPRVQFQSLDTQSEGLSPEPQFVQETDMEQGPTGAPPVPQVPALPHSGSPGDQAAALLTARYQEFVTFEDVAVYLTREEWGCLDPVQRDLYREVMLENYGNVVSLGILLRLPTTRIHNVNSCPALSHTQASAFSGESLAVLSAGISKRWLKYRLPINIAHPCSETPFPRLLRY	94863	90044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_91015_92000_92128_92532_92619_93782_93946_94682
759002	contig_15628_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_147704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACAGAAACAATCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164550	167343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_164600_167300
759008	contig_5954_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_28461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGGCTCAGGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131138	131842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_131100_131800
759019	contig_990_pilon	+	1089	9	Intergenic	novelGene_76063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	116.217939127314	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	66	932	1067214	1091532	FALSE	15	CATTTGTTTAGATTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGLGLGRPPPPGPAWAPAFAMPLLVEGRRVRLPRSAVDLVRAHPSLEERARLLRGQSVQQVGPQGLLYVQQRELAVTSPKDGNGATCLTHCDGTDTKAEVPLIMNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIAVNIKTAEIYRASFPDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067148	1091689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082171_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087593_1087692_1090825_1090940_1091352
759020	SIRV7	-	236	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91675	15	-91669	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAATAAATTGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
759021	contig_8278_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_165307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTGTCCTTCATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267914	267620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_267600_267900
759022	contig_12638_pilon	+	2055	11	Intergenic	novelGene_33189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	205.969924989062	1	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	216	341	269821	270173	TRUE	10	GCTATTGCTGCTCTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKVTS	269455	274395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_269638_269787_269863_269950_270025_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271746_273449_273584_273761_273999_274124
759023	contig_4364_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_4105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533070	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
759025	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
759026	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759027	contig_11630_pilon	+	552	4	Intergenic	novelGene_147169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	145.222434752884	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	97	399	96051	144604	FALSE	45	TTCCCATCTGAAAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFPNLCYHSQTVYTKLSQITVHWDLMPLLKYDKPVSNQEERFPLQFYKCHIHLHKIFGRARIFHHSADSLTSPRKLKQLEETLSHHCIYLPACLHVPKL	77617	144757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_131895_131998_144489
759035	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	20	1156	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
759039	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759040	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	2	3619	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759043	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759044	contig_177_pilon	+	1346	2	Intergenic	novelGene_41851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418740	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_419148_419208
759051	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
759053	SIRV6	+	507	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3180_10748_10819_11031_11109_11205
759057	contig_2027_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_39961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	582	junction_2	614.367967914995	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	661342	664407	FALSE	10	GCAGGCGGTGTCCTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAEPTMAPFTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	661322	664504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_661463_662681_662762_662944_663072_663312_663438_664236
759058	SIRV6	+	489	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
759060	SIRV6	+	446	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759065	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_97048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
759066	contig_34_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_39965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGAAAAAAAAAATGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13070	12166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_12200_13100
759071	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759084	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	19	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	119	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759087	contig_8242_pilon	+	1163	9	Intergenic	novelGene_80183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_5	454.872355034904	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	125	643	3532	31993	TRUE	50	ACTTCAGAAAAAGATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKQAQAGGSKKAEQKKKEKIIEDKTFGLKNKKGAKQQKFIKAVTHQVKFGQQNPRQVAQSEAEKKLKKDDKKKELQELNELFKPVVAAQKISKGADPKSVVCAFFKQGQCTKGDKCKFSHDLTLERKCEKRSVYIDARDEELEKDTMDNWDEKKLEEVVNKKHGMQAFP	3407	35168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702_30760_31973_32157_33656_33804_33959_34062_35060
759088	contig_4852_pilon	-	2864	12	Intergenic	novelGene_153970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	65.6039960484166	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	46	1443	99919	84651	FALSE	20	CTAAAAGTTTCCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDEGTSPITVPDLVLMLLRLLLLICAPLCEPTELFLTASPAHPIEGSSVTLTCAIQLPLQTTDSQLQYRFVRNGWPLRLAWSSSPKLQIPSMWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFWYKGAMGLKLGTKTQSSLTAEFEILTARESDAEQYYCAADNGYGPSLSELVSITVRIPVSHPVLTIRATGAQAVAGDTVELHCEVQRGSPPILYRFYHEDIILGNSSAPSSGGASFNLTAEHSGNYSCEADNGLGTQHSEAVPLNITVPTKNRREFITTGVIEGLLGALGPFTIVLLFCYWLKRKIAYMPFPQRDFTWPPSLRLFSFIILHQRTKFLASCSITAGKQSASDPLRSPPSPVPQEITYLNSPTPVPLQPVYENVNLVSGDDIYSLVYCSQQEWKAAAERPRTPTEDEVSLDIYSKLKQASDSDGDYEDAM	99964	83229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86248_86278_86872_86945_87165_87249_88776_88805_89315_89430_90256_90374_90697_90971_91135_91424_93959_94230_95971_95993_99888
759089	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
759090	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759091	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_97919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
759092	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_94712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
759093	contig_8671_pilon	-	2150	2	Intergenic	novelGene_126278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCTCAGAAACTCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573197	570792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_571572_571826
759100	contig_7963_pilon	+	1446	7	Intergenic	novelGene_58507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	207.76328677929	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	48	1157	145910	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCWVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	145862	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_195026_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
759101	contig_854_pilon	-	1371	4	Intergenic	novelGene_36331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60.8111831820431	304	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	163	1056	789074	778756	FALSE	10	GAATGGGGCTGCCTCGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQQLFRALVSAQWVAEALRAPRAGPPLQLLDASWYLPKMGRDARREFEERHIPGAAFFDLDQCSDRTSPYDHMMPSEAYFAEYVGHLGVGAATHVVVYDASEQGLYAAPRVWWMFRAFGHRAVSLLDGGLRHWQHLGLPLGSGKSHPVPAEFRAELDPAFIKTFEDIKENLESRSFQVVDARAAGRFRGTEPEPREGIEPGHIPGTVNIPFTDFLTKEGLEKSSEEIHHLFQEKNVDLSRPLVATCGSGVTACHVALGAYLCGKPDVPIYDGSWVEWYMRARPEEIISEGRGKTL	793192	778440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_779055_788479_789099_789375_789464_793142
759102	contig_17194_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_155366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGATGGATATCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141229	141926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_141200_141900
759103	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759106	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_90388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
759108	SIRV4	-	325	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1196	0	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759109	contig_11933_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_107253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTGGGGGCCCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109074	108479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_108500_109100
759116	contig_8357_pilon	+	998	9	Intergenic	novelGene_39676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_8	289.354642912465	1216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	110	835	120504	153108	FALSE	5	TTTCTTTTTTTTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI	120394	153271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_120533_126020_126088_136292_136420_142263_142332_143242_143351_143490_143550_144117_144221_145401_145489_153030
759117	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759118	contig_18184_pilon	-	2263	6	Intergenic	novelGene_123883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	9.3893556754444	89	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	140	2065	551413	543728	FALSE	35	CACAAACTTCAGTCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGAFPRENCIEEERITSELFPLELQLRKIREQIKAPLCSESPGEETMETLTSRHEERGICSQASAPFPEEEDEIKFQESLTFKDVAVVFTEEELELLDSDQRKLYRDVMLESFRNLVSAGQQPFKSGKISHLEQDKETWVTEREAPADAYPGDKNEKDMEYIQEKELKVLLHKELSYWKLWEQVTGELTGSQDHRGNLQGKEFQFSEDASRCQEWEGRSTQGFQIENVVDSLQGNGPISVENQRFPAWKAVSPVPIQESWALVNEPWNDQGGCKKISREDALYKCDWNNYGFSWISHCRNDHSPPEREKPYECDEYQNHCVDEAILYHHNSSENGFKSEEGGNGFRDDSNPPTHPQVHLEEEPYEYQEYVRQGAYPDRHQSIPLGGLSAASIECGQGSRQSVDSLHTGEKPFKCECGKGFGRSWDLQVHQRVHTGEKPFTCLECGKGFWRISDLHSHKKVHTGERPYVCDVCGKGFIFSSDLLIHQRVHTGEKPYKCAECGKGFSYSSVLLTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFRCTSNLYTHQRVHTGKKPYTCDECGKGFSYSSNLRTHQRLHTGEKPYKCLECGKGFRFSSGLLSHERVHTGEKPYRCDICGKSYSQISHLYGHQRVHTGEKPYRCEECGKGFSQSSSLQVHQRVHTGERPYKCEECGKSYSRSAGLRNHQRVHFK	563065	543529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_545338_547067_547164_547421_547549_551119_551179_551379_551477_562989
759119	contig_1964_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_130931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAGAGAACTGTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675572	674823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_674800_675600
759122	contig_6589_pilon	+	851	7	Intergenic	novelGene_25896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTCAGAAACCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158485	1178465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1158808_1158899_1159000_1160515_1160581_1176856_1176938_1177210_1177250_1177927_1178130_1178423
759123	contig_4519_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_123691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499119	497378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_497400_499100
759124	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	121	-9	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759130	SIRV1	-	234	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3870	0	3596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759131	contig_9197_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_154366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	234	569	67790	67455	NA	30	CTTTTTTTTTAAATCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIPWTAKRMNKSILEEVQPECCLAARMEKLRLTYFGHVIRRDQSLEKDVMLDKAEGQRKRGRPSMRWIDTVAATTDSSITRIVRMAQDQAVFHSVVHGVTMSRNRLNST	68023	67090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_-_67100_68000
759135	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	54	508	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
759138	SIRV2	-	651	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	-1	2967	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
759139	contig_3233_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_56536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTTGGGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729959	730539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_730000_730500
759141	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759143	contig_11386_pilon	-	991	7	Intergenic	novelGene_82802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	691	990	90889	90590	FALSE	10	CAGTGTCTTCCTCATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLLELVWGRESERVGKPLRRGNQELVRSQSSKSSMPEMEELRKARPQVGRGRPVEEGRPWPLCGPSSRWVYNWAWNHLSPGAEPRLQGSLCCCSAALC	100021	90588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_90941_91203_91249_91350_91545_93217_93282_96622_96763_98901_98963_99886
759146	contig_15744_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_83605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	165	479	152344	153378	FALSE	5	CAGTTGTGTCTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149577	153590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
759152	contig_10711_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_118461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	48	335	879630	879343	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSVSLIPHVVPILGMTLVFFPESRGGMTCYSSLKDDDISVFIFSCKFYSAHKQTHLKQPPGELFPSPSFHLDTFGLEQHSVSIITFEQDAAVLIHRSKGVSAWARKLLW	879677	877266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_877300_879700
759158	contig_6576_pilon	-	1674	14	Intergenic	novelGene_42232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	104.485213132355	2	58	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	373	1347	252452	229096	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261343	228768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252554_256018_256085_258751_258854_261240
759166	SIRV6	+	557	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759170	contig_11027_pilon	+	2290	17	Intergenic	novelGene_169612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	13.0968448013252	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	85	2022	28511	73590	FALSE	45	AAAATTGAATCAACAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGVSAGVLRFGNSAPGSCQEAGSKVISMKRSSVSTGGAGRLSVQELRLQDLNKQGLYTPQSKEKSAFGKLSINKPTSSTSERKVSVFGKRTSGTGSRNSQFGIFSSSEKIKDPRPLNDKAFIQQCIRQLCEFLTENGYAYSISMKSLQAPSVKDFLKIFTFLYGFLCPSYELPDTKFEEEVPRIFKDLGYPFALSKSSMYTVGAPHTWPHIVAALVWLIDCIKLYTAMKESSPSFDDGQPWGEETEDGIMHNKLFLDYTIKCYESFMTGADSFEEMNTELQSRLKDLFNVDASKLESLAAKNKALNEQIARLEREREKEPNRLESLRKLKASLQADVQKYQAYMSNLESHSAILDQKLNGLDEDIARIEVECETVKQENTRLQNIVDNQKYSVADIERINHERNELQQTINKLTKDLQAEQQQLWNEELKYARGKETIEAQLAEYHKLARKLKLIPKGAENSKGYDFEIKFNPEAGANCLVKYKAQVYAPLKELLNQTEEEINKVLNKKMGLEDTLEQLNIMVTESKRSVRTLKEEVQKLDDLYQHKVKEAEEEDKKCANELESLEKHKHLLESGVNEGLSEAMNELDAIQREYQLVAQTTSEERRKVGNNLQRLLEMVATHVGSVEKHLEEQLAKVDREYEEYMSEDLLENIREITDKYKKKAALLKPSDE	27105	73858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11027_pilon_+_27181_28501_28612_30292_30380_33584_33709_33807_33981_34846_34950_39130_39221_41379_41474_42670_42778_43488_43634_46521_46728_55450_55604_58377_58468_60933_61027_62021_62153_64872_64976_73452
759175	contig_7963_pilon	+	1115	6	Intergenic	novelGene_58521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.252834300513	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	212	826	194098	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAEYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	193886	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195203_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
759176	contig_11594_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_80882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGTTCTTTAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54485	55536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_54500_55500
759177	contig_11594_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_80883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCAGCCTCTCGGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55639	56806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_55600_56800
759178	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759186	contig_9345_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_24530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCAGTCACCTTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704440	705397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_704400_705400
759187	contig_9345_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_24529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702230	701830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_701800_702200
759189	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759193	contig_15021_pilon	-	1595	11	Intergenic	novelGene_26988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	136.710058152281	374	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	10	918	428082	396907	TRUE	25	GGTGCAAGATGATCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAERGSGQQQSQEMMEVDRRVESEESGDEEGKKHSGGIVADLSAQSLKDREEHSEVDAGEEQELPVDMEAISLDGDAEDVDLNHYRIGKIEGFEVLKKVKTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRAIENIDTLTNLDSLFLGKNKITKLQNLDALTSLTVLSMQSNRLTKIEGLQSLVNLRELYLSHNGIEVIEGLENNNKLTMLDLASNRIKKIENISHLTELQEFW	428091	389113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_389727_396842_396910_411764_411852_416003_416109_417090_417208_419336_419500_420184_420316_420895_420962_421592_421649_426120_426250_428030
759197	contig_11983_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_172084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34281	35306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11983_pilon_+_34300_35300
759207	contig_10848_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_133521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATTGAAGAGCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33902	33290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_33300_33900
759210	contig_15185_pilon	-	1020	4	Intergenic	novelGene_99429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	12.684198393627	340	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	130	660	376283	375523	FALSE	20	TATGGCCTGATTGGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSTDVAGLEESFRKFAIHGDPKASGQEMNGKNWAKLCKDCKVADGKAVTGTDVDIVFSKVKGKSARVINYEEFKKALEELATKRFKGKSKEEAFDAICQLVAGKEPANVGVTKAKTGGAVERLTDTSKYTGSHKERFDESGKGKGIAGRQDILDDSGYVSAYKNAGTYDAKVKK	378999	375162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_375712_375827_375982_376095_376290_378876
759213	contig_13428_pilon	+	1169	9	Intergenic	novelGene_143429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	336	junction_8	225.410597576955	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	743	946	50306	52039	FALSE	20	GTGGGCATTTGTGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVSVLFFPLQIHIMQ	40733	52262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921
759214	contig_709_pilon	+	1704	3	Intergenic	novelGene_57579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	16	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGGCCCAGTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2204562	2207267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2204682_2205213_2205342_2205810
759217	contig_15449_pilon	-	835	4	Intergenic	novelGene_33641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	53.4748123470813	1880	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	57	626	107058	104664	FALSE	15	CTCCTTCTCTCTGCAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHTCTPRQPTLAELAPEAMRLSPLQLLLLLGAWVIPGGLGGRSPLTATAPQLDDEERYSTHMPTHLRCDACRAVAYQMWQHLSEAEAKLHTPESGRRRELSESGYTDVLDRSCSQSWQGYGVREVNQVKHLTGPGLSKGPEPSISVMVTGGPWPIRLSMTCLRYLGEFGEDQIYEAHQQGRGALEALLCESPRGACSKDEPVTKEEL	107114	104454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_104821_104907_105019_105397_105523_106881
759219	SIRV7	-	317	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33251	1	32	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114706	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
759221	contig_12969_pilon	+	1697	5	Intergenic	novelGene_61705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	53.1760049270345	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	276	1079	608602	611236	TRUE	55	TGAAATATAGACAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYNSLVSVGCQGTKRDSVFELEQGETPWIVEGAVHSQTSPEEIWAIDSMQWQPGNQNELKSLERCLQSFSLGINFGLSKNLAPLTQRHNMFDLHHRSLQSRLNFVIQNRGDEGKDSDEFSGYEKLSVHMKHDKTFPGIKYHGYFKPTSIRSQLSGQPKTYTEEQPHKCSECGKVLYRKSLLFYHQRIHTGRNPVYAMNMEKPSLGRAGSRDISYLILERRSMDVMNVGNHFPRRHTLFYIIDFTQERSLMNAVNVEEPLLLSQH	605299	611989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_605433_608459_608636_608880_608977_610562_611417_611551
759225	contig_10235_pilon	-	937	3	Intergenic	novelGene_46385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	247	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTGTTTGGTGTGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172875	168605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_169084_171276_171445_172584
759227	contig_13048_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_138938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTAGTTCTGCTGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504528	503553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_503600_504500
759231	contig_6735_pilon	-	1048	9	Intergenic	novelGene_15748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	980.148322640507	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	75	377	564868	552935	TRUE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKCCGP	568272	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542291_545874_545945_547205_547355_551180_551235_552840_552950_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
759233	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	281	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759236	contig_1996_pilon	-	1826	5	Intergenic	novelGene_131884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.3166247903554	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	562	1803	167445	165576	FALSE	10	GGCTTGGCTGTGTGGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKLLLMAGLYLVQGLPYGLQSGLLPVLLRARGLSLTRVGLAKGLYAPWLFKLVWAPLVDTRGSPRVWLALSTAALGVVCGLLASLPPAEEGQVGLPTITAVLLLLLNLGAAVQDVALDTLAVQLLEPAELGPGNTVQVVAYKLGAALAGGGLLALVPTLSWPLLFLLMAVTYLLAAALAWASPALELLPQPQPSEAAPRPGHHLQALLAVPGTLWTAGFVLTYKLGEQGAGSLFPLLLLDRGASAPELGLWNGMGAVACSIAGSSLGGALLARHRQPLPLLRPVLQLRLVGLACQTALLFRLDALGTGVGLGTVLKGVSLLSLCLQHFLGGLVTTVTFTVMMRCSQLAHSALQATHYSLLATLELLGKLLLGTLAGVLADSLGLRPCFSLFLALSAVPTLYLGLAPSSLAR	168006	165552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_165753_165825_165936_166006_166132_166224_166373_166763
759237	SIRV6	+	509	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759238	contig_10331_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_54193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCTAAAAAAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604720	606800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604700_606800
759243	contig_20241_pilon	+	980	3	Intergenic	novelGene_159737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	6	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	422	901	217465	221924	FALSE	25	TATATTTTATTTTATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLYAYAYALGSKTGETVSKRRKGAKNTETAAKVALMKLKMHADGDKSLPQTERIYFQVFLPKGSKEKSKPMFFCHRWSIGKVIDFAASLASLKNDNNKSTAKKLRLCHITSGQALPLDNILGTWMAKEDCPLHNGGNIILEYLNDEELFLKNVDSYLE	217043	222003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_217618_221499_221656_221753
759245	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759246	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_97116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	37	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759247	contig_7051_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_64357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAGTGAAATGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328607	327644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_327600_328600
759248	contig_7051_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_64358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAGTTGCAAACAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329385	329035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_329000_329400
759250	contig_10748_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_150746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCAGGCATTCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154265	154648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_154300_154600
759251	contig_13004_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_112596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACATTTTCTGGTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76831	75259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_75300_76800
759252	contig_5039_pilon	-	2707	1	Intergenic	novelGene_65047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCAATTCAACTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1817354	1814647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1814600_1817400
759253	contig_9414_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_131070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAAACTGGAGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257182	256383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_256400_257200
759258	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	9	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	196	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759261	contig_5947_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_101525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAAATTTACCTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500289	502592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_500300_502600
759263	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8138	-2	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
759265	contig_11269_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_145830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347382	349594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_347400_349600
759266	contig_9434_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_150516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCCCTAGAACAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449756	449236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_449200_449800
759267	contig_16071_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_165998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATAATTGCTACCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68959	67211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_67200_69000
759273	SIRV6	+	226	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	511	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
759277	contig_18272_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_7005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATACGACCAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157920	157198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_157200_157900
759279	SIRV6	+	286	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8143	2	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
759286	contig_14426_pilon	+	1876	4	Intergenic	novelGene_170622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	5.09901951359278	54	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	176	1267	128596	135751	FALSE	25	TCTCAAAGGCTGATGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVLDSDQAKKQKRLVEEMAPLKTVQEQQVQLKYEVPKPEQEKDFFPHALKKSDWWYIFNVSDEERRNENGKLVIETDSCRGVESSGKISEPVEACYEYSNLERQQAKPMEKPDYKCSRCGEGFVQHSDLIKHEGVHMGEELCDSEVCHSSILTGHQKIRSREKGHQCHQCGKAFQRSSHLVRHQKIHLGEKPYQCKECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCSHCGKNFRRSSHLNRHQRIHSQEEPCECKECGKTFNQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGEKPFKCNVCQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYECNECGEAFRQRSGLFQHQRYHHRDKLA	123712	136360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_123826_128533_128611_129326_129445_134792
759289	contig_11978_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_62855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCCTTCATTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576026	573975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_574000_576000
759292	contig_18822_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_111733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATAGCGACCCTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197930	196577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_196600_197900
759293	contig_18822_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_111732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195523	194483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_194500_195500
759295	contig_5779_pilon	+	2064	2	Intergenic	novelGene_106503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTGCTAACTGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207685	209799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_209425_209474
759299	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	51	495	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
759304	contig_12327_pilon	-	1760	10	Intergenic	novelGene_140695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	245.855472951584	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	3	812	1155014	1148050	TRUE	65	AGAAAAAGAAATAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEVQ	1155016	1145340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1147756_1148059_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
759305	contig_10904_pilon	-	1453	5	Intergenic	novelGene_22533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	370.487854051924	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	122	937	362437	352112	FALSE	15	TTCAAGATCTGTTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362558	351595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_362403
759310	contig_8864_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_135968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACGTAAAAAAAAATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74633	77080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_74600_77100
759315	contig_15172_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_158766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCTGGCTCCCCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249335	250535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_249300_250500
759316	contig_7004_pilon	-	2430	14	Intergenic	novelGene_126492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	37.603506068438	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	63	2228	414092	408487	FALSE	20	GAAACTGCACTTGTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPASAAAPAPTSISLFDLNADALVLQGLSLVSHAPTEALAQALHCPGSGERASPERKLLKCPPDISEKLYCSTCDRTFQNHQEQREHYKLDWHRFNLKQRLKEKPLLSALDFEKQSSTGDLSSISGSEDSDSASEEDLQIVDEKAEFEKPNQQRGFHSHQVLFQNAQGQFLSAYRCILGPRQVPPEEAGLLLQNLQSGGPGYCVVLMATAGHFAGAVFQGREVVAHKTFHRYTVRAKRGTAQGLRDARGRAPHSAGANLRRYNEATLYKEVRDLLARPGWAEALREAGTILLRAPRSGRSLFFGGCGAPLQRGDPRLWDIPLATRRPTFRELQCVLHKLTTLHVHGEDPRETVRSDSPQTHWKTVKEERKEAIEEERRKVPSNENEALGKNAESPKQGLEGEDTFQVELELVEMTLGTLDLREFEVLPKQSRKKRNKKERSRNLEAGAHRTLPQQPQEDEALTESALADTTPLGPLLDEAKAPGHPELWDVLLAACRAGNTGMLKLQLAASLTDPGVTSLLSAPLGSGGFTLLHAAAAAGRGSVVRLLLEAGADPTVQDSRAQPPYTVAADKSTRNEFRRFMEKNPDAYDYNKAQVPGPLTPEMEARQATRKRQQKAAHRLREEQQRKQREQEKQEQEQQQRFAALSDREKRALAAERRLAAQLGAPTSQIPDPVIINVRRCWSCGTSLQGLIPFHYLDFSFCSTRCLQDHRSRAGRPSS	414521	408284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_408611_408831_408918_409054_409223_409356_409469_409615_410097_410782_410939_411126_411356_411636_411785_411877_411991_412398_412590_412707_412811_413189_413303_413950_414095_414461
759317	contig_12864_pilon	+	733	6	Intergenic	novelGene_76397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	743.168729159132	9355	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	158	646	227129	229231	FALSE	15	GCAGTTTCTGGGTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIHNFPLPTQQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	224960	229318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225076_227086_227169_227822_228030_228490_228623_228901_228946_229165
759318	contig_8674_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_102908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCATTCCAACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178364	178663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_178400_178700
759319	contig_10235_pilon	-	1042	6	Intergenic	novelGene_46488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	925.820587371009	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	51	560	220777	219405	TRUE	60	GTAATAAAATACAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRLGTAPSPRDCSWCSGSRESPSTSPLLTPRGGPTSVPLNTPRIHTCTHKYSPTRVLPSTSSSRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	222844	217940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220494_220593_220788_222804
759324	SIRV6	+	202	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	503	3	-333	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTCGAAGTACTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
759325	contig_14925_pilon	-	690	3	Intergenic	novelGene_55066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
759329	contig_5125_pilon	-	1596	9	Intergenic	novelGene_43472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_8	165.297789988251	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	48	1325	182056	75819	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVGRPSSEELRNLSLSGHVGFDSLPDQLVNKSTSQGFCFNILCVGETGIGKSTLMDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINKDDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	182103	75547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_110198_110395_121095_121211_182029
759330	SIRV4	-	193	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	421	3	-421	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTCACCAATAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759335	SIRV6	+	284	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8133	14	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
759341	contig_17522_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_160803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79755	80105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_79800_80100
759342	contig_7457_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_31530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATAAAGGAGTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715135	713826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_713800_715100
759343	contig_709_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_57601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTGAAAGCATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2330898	2330011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2330000_2330900
759345	contig_1596_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_131607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAATAAAGGTAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149215	150507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_149200_150500
759347	contig_9206_pilon	-	1618	5	Intergenic	novelGene_137487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	81.7293551913876	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	10	1143	185643	171809	FALSE	5	TTGTATCTTGGTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGMALSQGLLTFRDVAIEFSQEEWECLDPAQRALYRDVMLENYRNLVSLGISSSEMNGISILKKKTEPWTLYTMMDIAYDPDVFSTSVIQELSPKEIINKGELFQRVMLERYESHGTEDFDFSGSTLSEHQILHTGKKLYKCNVCGKVFSQNGHLEDHVRIHTGEKPYRCSICGKAFNFGSNLTRHQRIHTGEKPHKCNICGKTFSRYSGLTAHQRIHTGKKLYNCDVCGKVFSQNGHLEAHLRIHTGEKPYTCNVCGKSLTKGSHLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKFFSRNSGLTTHQRIHTGERPYKCIQCGKAFIRRTHLVEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFTQRANLIEHQRIRLAQRTYKCNMRSKAFNSAKRR	185652	171333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_172581_172688_172813_177222_177319_178238_178366_185628
759348	contig_2703_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_101671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTATTACTAGATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164690	166585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_164700_166600
759352	contig_10734_pilon	-	1889	11	Intergenic	novelGene_51451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	78.0358891792744	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	741	1172	2222890	2216993	FALSE	10	TCTTAATCCGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234419	2216275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225629_2226095_2226169_2226275_2226348_2229766_2229876_2234340
759353	contig_11378_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_112304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTCATACATTTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059135	1057015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1057000_1059100
759357	contig_16185_pilon	-	2001	12	Intergenic	novelGene_144743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.4768635756657	4	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	94	1416	127403	82386	TRUE	25	TGAACGTTGGTATCAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134356	81719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82050_82130_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
759359	contig_11253_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_126849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTGACTTTAGACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280604	281359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_280600_281400
759363	contig_5696_pilon	+	2224	9	Intergenic	novelGene_117494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	5.22015325445528	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	114	1391	256557	266507	FALSE	25	CTGCACCGAGAAGCTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRVTRNTKINAENKAKTSMAGAKRVPVATAAVSKPGLRPRIALGDIGNKVSEQPQAKMPLKKETKISAAGKVIAKKLPKPLEKAPLHEPEPDPELEPEPVKEEKLSPEPILVDNPSPSPMETSGCAPAEEYLCQAFSDVILAVSDVDAEDGADPNLCSEYVKDIYAYLRKLEEEQAVRPKYLVGREVTGNMRAILIDWLVQVQMKFRLLQETMYMTVSIIDRFMQNNCVPKKMLQLVGVTAMFIASKYEEMYPPEIGDFAFVTDHTYTKHQIRQMEMKILKALNFGLGRPLPLHFLRRASKIGEVDVEQHTLAKYLMELTMLDYDMVHFPPSQIAAGAFCLALKILDNGEWTPTLQHYLSYTEESLFPVMQHLAKNIVMVNQGLTKHMTIKNKYATSKHAKISTLAQLNSALVQDLAKAVAKV	256443	267340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_256578_257194_257366_257455_257603_260108_260292_264182_264342_264698_264936_265305_265447_266103_266215_266399
759364	contig_1380_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_138889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAACGTGGCCCAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152266	153880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_152300_153900
759375	contig_6346_pilon	-	2788	6	Intergenic	novelGene_172086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	19.2976682529263	45	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	11	1093	245952	90027	FALSE	15	ATCAACTGTCTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHLMRKRCGCWGFIRALHTATETARDPKRDGMKRVFSGIQPTGIPHLGNYLGAVESWVRLQDEYGSVLYSIVDLHSITVPQDPATLRQSILDMTAALLACGINPEKSILFQQSQVSEHTQLSWILTCMVRLPRLQHLHQWKAKTAKQKHDGTMGLLTYPVLQAADILLYKSTHVPVGEDQVQHMELVRDLAQGFNKKYGEFFPVPKPILTSMKKVKSLRDPAAKMSKSDPDKLATVRITDSPEEIVLKFRKAVTDFTSEVTYDPASREGVSNIVAIHAAVTGLTVDDVVRQSAGMDTARYKLVVADAVIEKFAPIKNEIEKLKMDKDHLEKVLQLGAAKAKELAYPVCQEVKKLVGFL	245962	88331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_-_90476_92349_92469_117593_117680_120906_120988_183345_183604_245862
759376	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759377	contig_16846_pilon	-	907	5	Intergenic	novelGene_82978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	57	575	555239	551492	TRUE	10	GCACTACTTCGGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558706	550867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550993_551284_551665_552661_552824_555055_555278_558688
759389	contig_3386_pilon	+	2134	2	Intergenic	novelGene_34478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	14	367	81895	82248	TRUE	15	GGCTTCTCTCCCTACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIKRMQLYIITENKILHLVCQHKRNRFKTEDHTVTHPAGKHFVSGVPPPTTLQHRFDTSVKHFSLQNCSLKIKPREAPSPKPAKSSPSEDTFEGSTMGRSSAALALRAPPGQGREGQELNV	81881	87090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_83069_86143
759393	contig_5317_pilon	+	2091	12	Intergenic	novelGene_76622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	127.469134167018	268	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	166	1518	896836	924411	FALSE	10	TTGGGATGTTGTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTGVRFLGGSLGSPARRTPGEAAWNAALGAAACGVLDVKTLPLQSPQRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMEEDSYDSFGEPSYPEVFEPPPAWLPGGGAGGRGGKGREARPRGLHLLQRAGGQGGGHGQWGLEHHAGMLRGHPYWFVFDPPAAGRVQESAARPPHLHHVRPHLLLLHRQPGSPFHGHLGLPSALYLT	885310	924984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885369_893291_893377_896813_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_918631_918735_921985_922105_924250
759394	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759396	contig_6870_pilon	-	650	5	Intergenic	novelGene_103931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.48746859276655	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	30	644	1157922	1139716	FALSE	15	GTATGTATGCCAGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAALIVCCMAAVKAINSKAEVARAQAALAVNVCAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGTGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRVITEGFEAAKTKALEVLDEVKIKKEMKREILVDVARTSLRTKVHAELADVLTEVDQRISFGSWCPSSRYEEASRGCIYPYLQCITRI	1157951	1139709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1139821_1150044_1150219_1155363_1155499_1156056_1156121_1157785
759399	contig_12270_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_113262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
759401	contig_6837_pilon	+	1383	12	Intergenic	novelGene_149810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29.1836589620497	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	171	701	11753	15241	TRUE	15	TTGTATGTTGGTAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLNFSGGRKVLILRSGAVYVCARGITHPAPLTEDPNAVQEGKTSVEKAELDHGGSAMPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11312	17335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11475_11744_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
759402	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
759404	contig_16907_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_87463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAGTCTCAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472254	471777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_471800_472300
759405	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	19	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759407	contig_10082_pilon	-	2431	12	Intergenic	novelGene_63894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	40.317131276669	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	432	1589	424919	404694	FALSE	25	GTTATGGTGTCAGTAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQTIRNVFSVETGYRLSDDQIVNHFPNHYELTRKDLMVKNIKRYRKELEKEGSPLAEKDENGKYLYLDFVPVTYMLPADYNLFVEEFRKSPSSTWIMKPCGKAQGKGIFLINKLSQIKKWSRDSKTSSFVSQSSKEAYVISLYINNPLLIGGRKFDLRLYVLVSTYRPLRCYMYKLGFCRFCTVKYTPSTSELDNMFVHLTNVAIQKHGDDYNHIHGGKWTVSNLRLYLESTRGKEVTSKLFDEIHWIIVQSLKAVAPVMNNDKHCFECYGYDIIIDDRLKPWLIEVNASPSLTSSTANDRILKYNLINDTLNIAVPNGEIPDCKWNKSPPKEVLGNYEILYDEELAQGDGADRELRSRPGQSLGPKGSRSRDSGRTVLTTWK	441225	403851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_404824_408234_408399_413696_413784_417888_418033_421696_421806_422060_422196_423662_423844_424711_424921_430299_430437_430563_430681_434677_434752_441123
759411	contig_4659_pilon	-	1884	8	Intergenic	novelGene_118245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	243.361493105484	9	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	42	983	859958	821106	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNSAFVITFRLFQLWPLRALTSWLLCPFDKLEPSSFQLPSSFNKKYLLYARQALCYWPRI	859999	820204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_821200_823858_823940_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916
759413	SIRV6	+	389	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGCAAATAAGAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724
759415	contig_12437_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_169066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTTGCCTCCTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30698	31910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_31108_31211
759416	contig_5643_pilon	+	1165	6	Intergenic	novelGene_38731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	326.025765852946	438	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	480	812	156118	156948	FALSE	20	ACCACACGCTGCAGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYP	152287	157301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152456_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823
759419	contig_7963_pilon	-	751	4	Intergenic	novelGene_58344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1815.85021408705	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATAATCAAAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48928	38345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38356_39949_40232_43546_43819_48741
759420	contig_4103_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_51962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	324	975	265	1239	161777	160803	NA	25	GTCCTAATAAAGTGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEDGGLPGLGRPRQARWTLMLLLSTAMYGTHAPLLALCHVDGQVPFRPSSAVLLTELTKLLLCAFSLLVGWQTWPQGAPPWRQAIPFALSALLYGANNNLVIYLQRYMDPSTYQVLSNLKIGSTALFYCFCLRHRLSTRQGLALLLLMAAGACYAAGGLQDPRNTFPGPPTAAAAGPMPLHITPLGLLLLILYCVISGLSSVYTEMLMKRQRLPLALQNLFLYSFGVLLNLGLHAGSGPGPGLLEGFSGWAALAVLSQALNGLLMSAVMKHGSSITRLFVVSCSLVVNAVLSAALLRLQLTAAFFLATLLIGLAVHLYYGSH	162041	159916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_159900_162000
759423	contig_3822_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_133321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGCCATGAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291061	290813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_290800_291100
759424	contig_3825_pilon	-	2017	6	Intergenic	novelGene_77974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	98.2637267764662	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	127	936	39691	27914	FALSE	25	ATCCTGTATTTAAAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRTSSETGRALPVEAVRARAPSRPSAEQASEPASPRASAAAMGQNDLMGTAEDFADQFLRVTKQYLPHMARLCLISTFLEDGIRMWFQWSEQRDYIDSTWNCGYLLASSFVFLNLLGQLTGCVLVLSRNFVQYACFGLFGIIALQTIAYSILWDLKFLMRNLALGGGLLLLLAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	39817	26832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_28181_29179_29367_30072_30117_30782_30860_31393_31581_39643
759426	contig_5280_pilon	+	1220	3	Intergenic	novelGene_52608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	722.5	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	12	614	38343	41172	FALSE	30	TATAACAGCTGGCGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCESEYGFKEYLWVFEGSNISSLVHTGTQCACVII	38331	41778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882
759427	SIRV6	-	227	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAATTATACGCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
759432	contig_1406_pilon	-	871	2	Intergenic	novelGene_25539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTTCAGTCTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139886	2136618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139850
759433	contig_14176_pilon	-	2159	15	Intergenic	novelGene_74858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	12.4024767111827	10	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	257	2005	451505	413308	FALSE	75	AAGAAAAAAAAAAAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDASLQGKGTPAAGGARLQPVTAFLLRDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	453106	413153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419969_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351_451519_452863
759437	contig_10958_pilon	-	2446	2	Intergenic	novelGene_5391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATGTTATTCTGACTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886936	882761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_885129_886857
759438	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759447	SIRV4	-	351	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	18	1152	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCGGTATTACTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
759454	contig_8269_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_106250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCAGGATTCCTCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345913	346716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_345900_346700
759455	contig_8269_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_106251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCTTATTGGTAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346818	347469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_346800_347500
759460	contig_13112_pilon	-	2874	11	Intergenic	novelGene_98847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	129.305258980445	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	80	847	667077	661883	FALSE	45	GTTAAAATGATAAGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIVEESVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRVVLLAEGRLLNLSCSTVPTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVASLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY	667967	659855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_661890_662445_662567_663701_663781_664261_664331_664724_664824_664906_665002_665369_665441_665787_665877_666683_666748_667003_667121_667931
759462	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759465	contig_8020_pilon	+	2399	19	Intergenic	novelGene_114400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_16	51.7300686255102	136	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	454	1833	173375	202533	TRUE	15	ACCCATGGCTGGCTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETSDFSKTQMTSYPSAFRIKLQHFNMEHETPHMPFHLKSHPLSPLLQPHHLVPLPDSTPPRSSVLLCCYCC	167150	203310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_168035_169128_169206_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_201924_202085_202483_202558_202768
759467	contig_11815_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_50920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCAGCATATCCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217117	215387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_215400_217100
759470	SIRV6	+	450	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	36	-1	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
759473	contig_12479_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_56837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGTTGAACAGTAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133222	134529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_133200_134500
759474	contig_6710_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_94369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
759478	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	192	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759479	contig_6069_pilon	+	1870	9	Intergenic	novelGene_8081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	83.7838550975067	27	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	141	1079	562568	564879	TRUE	20	GCAGTGTAGAGTGTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIDCDEAARGNPAGAGGSHDDRL	560914	566837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564695_564813_564896_565907_566043_566197
759486	SIRV6	+	522	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759487	contig_5189_pilon	-	1231	9	Intergenic	novelGene_34872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1303.67177977242	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCACCATCCACCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235785	198697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199069_199150_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218559_228076_228245_230388_230485_235736
759488	contig_4213_pilon	+	1542	6	Intergenic	novelGene_124838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	15.9072310601185	195	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTAGTGCTTTTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254456	275916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_254869_268299_268400_269325_269434_272293_272434_272897_273011_275247
759489	contig_6710_pilon	-	466	2	Intergenic	novelGene_98078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	657487	653562	FALSE	0	GTCCCCCCTTCTCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657487	653431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759491	SIRV2	-	485	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	34	3213	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
759494	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
759496	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759502	contig_10765_pilon	-	2730	5	Intergenic	novelGene_122864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	143	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGGACACACTGCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35425	15687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15769_18193_19515_28912_29043_32040_32541_34727
759503	contig_1443_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_28214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTCTAATGAGTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344324	344889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344300_344900
759504	contig_9668_pilon	+	2024	11	Intergenic	novelGene_58105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	462.091603472731	1	88	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	616	1506	282781	359175	FALSE	15	TGATGGTGCTGGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGYKRQG	214009	359693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_220571_220766_281470_281518_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348328_348503_355527_355677_359157
759505	contig_8576_pilon	+	1134	7	Intergenic	novelGene_88787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	464.903454732509	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	15	1133	893619	915761	FALSE	25	GTTTTTTTTGTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVILPRVCLLRPHLPPRSVVFSLFKNVTKINLEV	893604	915762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914233_915662
759506	contig_6471_pilon	+	2737	1	Intergenic	novelGene_172093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACTGTTTATATTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72321	75058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_72300_75100
759507	contig_10197_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_115333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	56	385	1663461	1663132	NA	70	TGCAACTATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEECRSVIQEQAAALGLAMFSLLVQRCTYLLKESAKGKQVKGAPDCGFSSCLGPAQTSLRVPCYFLGVFPLYFPVFLFPPCSSFGPLITPISFCGLITSRTLFPPCGTISSLFSPLVVEIFIVPVSF	1663516	1663123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1663100_1663500
759508	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	2	3619	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759509	contig_16411_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_77279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGCAGAGGTGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24486	24803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_24500_24800
759511	contig_13863_pilon	+	2169	7	Intergenic	novelGene_42003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_5	138.867642819421	58	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	1462	2169	70318	77620	FALSE	70	GAGAAGAAAAAACAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNK	68856	77620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545
759513	contig_8900_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_171631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361738	363973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_361700_364000
759515	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759516	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
759522	contig_14815_pilon	-	1453	6	Intergenic	novelGene_127204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	332.476405177871	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	110	805	22065	17106	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRPLQDSLRIAQQCLCFYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23290	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22135_23250
759523	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
759524	contig_14341_pilon	+	2318	6	Intergenic	novelGene_111808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	28.5825121359198	30	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	373	1368	473414	489051	FALSE	35	AGGTGAAAACAATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPRSPLSLTSWEQESFLQVKVEDDEAGVSQGQESGLGGHTAHPDAARLRFRQFHYQEAAGPHEALAQLHELCHQWLRPEMRSKEEILELLVLEQFLDVLPPEIHAWVGAQCPESGEEAAGLVEDLTQVLDKRVLLTEDSELPPDGNFGNRWAGTKPLTVKYQEAASPKPGQEQRHNLNPGRVASTHSGELDSSGAPQFLEPFRIMAGIKHKSCIADFKLKVIVRAEETSSRAAATEFEVGELSIHKWRKEKKELEKMNPRKRTCCRPKTKWPELENDLKKWIISRREQNQAVSTVVIQIKVTLLVDERGIPDFKAGFTWISKFIKRNSP	471114	490001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_471272_472806_472970_473361_473817_474986_475076_486714_486827_488659
759525	contig_15087_pilon	-	1311	15	Intergenic	novelGene_37181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.687667298579	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	98	1309	158925	110644	FALSE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFPERLKSRSHRFRPPPLHICFLSLFPASVPRHSLCPGLDFLKSKNILSLSL	181137	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110797_116821_116908_118079_118174_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_150487_150572_158907_158952_181066
759526	contig_19941_pilon	+	2957	19	Intergenic	novelGene_139760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	24.4467801914362	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	47	2719	41588	49940	FALSE	35	ATTTGAATCTCAAATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKCLGFRTKTALAVMSQGILSPPVGLLSDEEVAVSPMFESTAADLGSVIRKDLLSDCSVISTSLEDKQQVLSEDSTEKVKVYLRIRPLLPSELERQEDQGCVHIENTETLVLQAPKDSFALKSNERGIGQATHRFTFSQIFGPEVGQASFFNLTMKEMVKDVLKGQNWLIYTYGVTNSGKTHTIQGTIKDGGILPRSLALIFSSLQHQLHPTPDLKPLLSNEVIWLDSKQVRQEEMKKLALLNGGFQEDELSNSLKRSVYIECRMGTSTSFDSGIAGLSSTSQFTSSSQLDETSHRWAQPDTATVSVPADIHFSIWISFFEIYNELIYDLLEPPSPQRKRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTLLNQNSSRSHSIFSIRILHLQGEGDIIPKMSELSFCDLAGSERCKDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIASQLVHAPPVQLGLPSLHSFIKEHSLRASPSLETGAKPDPGLDDDTENETDISMYGKEELLQVVEAVKALLLKERQEKLQLEMQLREEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEETYEEKLKILKESLTSFYQEELQERDEKIEELEALLKEARQQPVAYQQSGSELSLRRSQRLASSCTQQLQEVKAKLEQCKGELSSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPFTTDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAEKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQNNMMLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQASSTKKRLGANQENQQPNQQPPGKKPFLRNILPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY	40907	50178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_+_40933_41566_41753_43201_43292_43388_43509_44116_44256_44378_44567_44652_44783_44958_45154_45261_45374_45478_45548_45755_45900_46043_46210_46318_46484_46611_46752_46871_46975_47296_47493_48335_48428_48805_48944_49619
759528	contig_5881_pilon	-	2107	2	Intergenic	novelGene_129041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCGGGAATTCATCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336462	333919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_334991_335426
759529	contig_2703_pilon	-	2410	12	Intergenic	novelGene_101806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCGGACATGCCCTCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781613	766195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_766239_767833_767919_768659_768767_771102_771313_773181_773330_774063_774175_774799_775036_775122_775295_775578_775738_777251_777447_777562_777699_780805
759531	contig_10437_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_38351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACGGACTGAAGAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533361	535235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_533400_535200
759533	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759535	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
759546	contig_7816_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_66554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAAATAACATAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329477	328885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_328900_329500
759553	contig_4951_pilon	+	1858	3	Intergenic	novelGene_122128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.5	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	348	1133	407637	408422	FALSE	25	CCTTAAGCTTTACCATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGRVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGCKNVCYDHFFPMSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNEFKDIEDIKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEASFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQTNHPNHALRESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS	397225	409147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_397399_400036_400196_407621
759554	SIRV6	+	475	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	381	0	202	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	414	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759556	contig_12080_pilon	-	1908	9	Intergenic	novelGene_128397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	102.680861775698	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	83	709	199983	195785	TRUE	40	TTGGAACCAAAAGGCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQVRGKRKLWAAPVVPWLLAISLSAPCAHLCQPLTLSPA	200154	193882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195407_195447_195651_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120
759557	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8138	-2	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
759561	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_93467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
759562	contig_12938_pilon	+	2191	3	Intergenic	novelGene_99721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51956	56438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52127_52691_54418_56143
759567	contig_3469_pilon	+	1067	7	Intergenic	novelGene_34173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	201.126549438131	42	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	14	433	427985	479543	TRUE	10	CTCTTTTATCAGCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLKMVASRAIGSLRHFTASRTFRSPGYICRNFTRSSALLARTHINYGVKGNVAVIRINSPNSKVNTLNKELHTELVEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAGCKTSQEVVQISQEGQKIFEKLEKSTKPILL	427971	480265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464_443562_479534_479681_479768
759568	contig_15570_pilon	+	1599	13	Intergenic	novelGene_137850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	376.926928889702	77	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	604	1479	709160	740309	FALSE	5	TGGGTTTTTATTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMKREYRGQRSVKALADYIRQQKSDPVQELHSLEEITTLDRSKINIIGYFEQKDSDKYRVFERVASILHDDCAFLSAFGSVSKPERFSGDNIIYKPPMLSAPDMVYLGSMTNFDATFSWIQDKCVPLVREITFENGEELTEEGLPFLILFHMKEDTESLEIFQNEVARQLISEKGTINFLHADCDKFRHPLLHIQKTPADCPVIAIDSFRHMYVFGDFKDVLVPGKLKQFVFDLHSGKLHREFHHGPDPTLDIAPGQESQDVASSPPESSFQKLAPSEYRYTLLRDRDEL	655860	740429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_656127_686130_686204_687918_687959_692177_692294_694457_694504_709097_709283_710296_710413_713399_713458_715164_715282_723505_723618_724579_724722_737313_737420_740207
759570	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759572	contig_6020_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_155565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAAGAGGGAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292046	290806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_290800_292000
759575	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
759576	contig_9363_pilon	+	1813	6	Intergenic	novelGene_6499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	23.8293936137704	169	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	267	848	452827	486456	FALSE	5	GTTTCTGTGGGGACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDVDWRSSLAYAKRFGRQLPGQLTEGDPYLCPFQRQLSVNTRILPLVKDQAVDAVLLTARWKELLSFEDVAVFFTKEEQENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDLPRARNRKATRSACPGSEARHKMKKLTSLQKISEELVSYEVSVVKQEKAKKTSEKLYKCNEL	446545	487421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_446692_452706_452947_455011_455090_482124_482252_485034_485149_486313
759580	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759589	contig_5331_pilon	-	1432	6	Intergenic	novelGene_112835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	145.741689299939	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	225	656	782829	779458	FALSE	20	CAGTCACGGACACTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAEAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSLTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN	791476	778681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782864_791286
759593	contig_14191_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_153764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31651	31160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_31200_31700
759602	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759604	SIRV6	+	172	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	222	486	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
759605	contig_12464_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_68665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137808	140080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_137800_140100
759606	contig_12635_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_60797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155030	153953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_154000_155000
759608	SIRV6	+	199	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	405	-2	-235	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGCTTCCACACCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
759614	contig_15952_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_154094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCCAAACTGATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721174	720673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_720700_721200
759615	contig_15952_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_154093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACATCGGTTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719143	718753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_718800_719100
759622	contig_12157_pilon	-	2218	1	Intergenic	novelGene_135893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95998	93780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_93800_96000
759624	SIRV7	-	951	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56148_70893_70988_78841_78964_114686_114961_147602
759631	contig_10235_pilon	-	1372	3	Intergenic	novelGene_46300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_2	39.5	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	10	381	85430	84476	FALSE	25	TTAGTGCTGCCAATGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSMEALGLEGRGGRPQGRGCLLLAVAGAIVLGSVVLSVPITVLTVLALVPQERGGLVTETADLGGQTQQQLEFQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGKDFADLHKRLHSRREISQGSSGLSSLLQG	85439	83484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84640_84830_84877_85268
759636	contig_5954_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_28746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTTATGTGTGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285055	1285954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1285100_1286000
759637	contig_19744_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_120411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCCTAGTCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257677	256572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_256600_257700
759646	contig_14225_pilon	+	2691	1	Intergenic	novelGene_52751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACACACACACACACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329076	331767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_329100_331800
759647	SIRV6	-	386	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-158	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACGTTTTGCAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
759651	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759655	contig_14953_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_137287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATGTGACCCTAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274963	275249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_275000_275200
759657	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759662	SIRV4	-	321	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1202	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3956	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759663	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
759665	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	3	1163	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759669	contig_12355_pilon	-	895	3	Intergenic	novelGene_172103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	28.5	195	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	94	309	242712	233315	FALSE	20	GCAGCTGTTAATGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFVETLDKCFENVCELDLIFHVDKVHNILAEMVMGGMVLETNMNEIVTQIDAQNKLEKSEAGLAGAPARAVSAVKNMNLPEIPRNINIGDISIKVPNLPSFK	259519	232728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12355_pilon_-_233444_242625_242734_259447
759670	contig_6102_pilon	+	724	7	Intergenic	novelGene_31962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	1344.89388263742	33897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	172	522	414294	415290	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEAFVRHILSG	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414194_414364_414613_414788_414877_414956_415261_415307_416018
759671	contig_20493_pilon	-	1462	11	Intergenic	novelGene_86409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90.4350042848454	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	31	1401	54655	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKAALSPHPQVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55232	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38060_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49235_54457_54665_55211
759674	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759675	contig_6946_pilon	+	3558	2	Intergenic	novelGene_59772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAGAAAAAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408998	413075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_411004_411522
759676	contig_2377_pilon	-	116	1	Intergenic	novelGene_67887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAACTAAAACATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191195	191079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_191100_191200
759678	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759681	contig_3916_pilon	+	1156	10	Intergenic	novelGene_141850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	375	713	14651	32231	TRUE	30	AGAAAGTCCGACTGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQVKKVTWIPRSCGFDLKLSLEEKLALKSYLAWLICSRWELFQMEANCFLWDEYSFHLHLRQAQHNQPHPQGALWAWVGLEVSEEKRGTAEWRRALLLMKASWAYWEVSC	6121	37405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_+_6220_7008_7100_10705_10800_13236_13284_14606_14703_23331_23406_24718_24800_32099_32265_33309_33466_37151
759687	contig_18613_pilon	+	1506	2	Intergenic	novelGene_80231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3591	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGTATATGGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28988	31358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_30195_31058
759688	contig_11277_pilon	+	1859	7	Intergenic	novelGene_80302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	132.3064624272	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	141	1145	250372	267180	FALSE	50	TAGAGCAAAAAGAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGKPLHFDTQFSVHNVLKPSEMLSYPNGGNSLRVILKDCLKAMCHFDWILLFCVMTIFTNDKPLLLVFPNTSKTG	248197	267894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767
759696	contig_12977_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_122806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTATTTCTCCTTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56144	58792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_57378_58495
759703	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
759704	contig_2724_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_172105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGAACTATTTTTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16259	16672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2724_pilon_+_16300_16700
759705	contig_5765_pilon	+	2275	2	Intergenic	novelGene_141395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684949	687309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_685896_685980
759707	scaffold_13505_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_111638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769137	770632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_769100_770600
759708	SIRV6	+	385	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	487	-1	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGTAATAGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
759709	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	51	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
759711	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759712	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759714	contig_5338_pilon	-	1314	4	Intergenic	novelGene_114576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	127.794974688192	1572	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	208	537	381598	381085	FALSE	15	GTGTTTAGATTTTTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLRGCDAAAFHLTGCTLVPMDHWPEQEPSRAGTVSGGQHKDGSIKSFILPRSPHSSPKLCVAALEGLWKRPPYMGTCIICKQDGCLKNQGQSSRNQLLGAPPGLQRR	381916	380307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_381101_381180_381243_381346_381630_381740
759716	SIRV4	-	352	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1171	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759718	SIRV5	+	459	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-129	875	-15	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8186	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
759721	contig_19311_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_144078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAGCTGCAGTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102980	100950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_101000_103000
759722	scaffold_12510_pilon	-	2460	19	Intergenic	novelGene_151358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	407.123820913927	45	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	20	2119	300576	184836	FALSE	30	ACTAACTCAGTGATGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVGWEMAAAGLAAVATAAEYPGQEASGGNLSGVNCGPSSGAGPGPGPGSWSRSLDRALEEAAVTGVLSLNGRKLREFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLTELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVRLPEELAELPLMRLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQMITLDNNPLQSPPAQICIKGKIHIFKYLNIQACKIAPDLPDYDRRPLGFGSCHEELYSGRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFSDLPLRVAEITKEQRLRRESQYQENRSSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCAAEEEEDEGSPIKPLPIREFQKAEDMRRFIHQSRVPVDPSSLLSVSPSHNQLSHTDLELHRRREQLLERTRREAQRAALQYEEEKLRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQAPLDGESDDRSNASSSSPTAETVHHSPAYSFPAAAIQRNQPQRPESFLFRAAVRVETNKGHGSPLLSSSAPATDSTDSITRQDSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPAVPKLTMAKCRRNVENFLEACRKIGVPQICSAGNCYVVDHVAEPAVALTGPNMPVTAVYLQGAP	300595	184494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_184947_199365_199444_206082_206221_206837_206957_208017_208129_208631_208681_219764_219813_221543_221694_222107_222160_236702_236780_240122_240188_243066_243188_244011_244106_252203_252314_253485_253623_256441_256548_262905_263033_264951_265097_300314
759723	contig_12638_pilon	+	2091	13	Intergenic	novelGene_33282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.77931596930472	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	61	1485	911735	935510	FALSE	5	GTTCTGTGATTCCTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGWGSLLQDEQQLEELARQAVDRALAEGVLLRTSQEPSSSDVVSYAPFTLFPSPVPSSLLEQAYAVQMDFNLLVDAVSQNATFLEQTLSSTVKRDDFTARLFDIYKQVLKEGIAQTVFLGLNRSDYMFQRNTDGSPALRQIEINTISASFGGLASRTPAVHRHVLSVLSKTKEAAKILSNNPSKGLALGIAKAWELYGSANALVLLIAQEKERNVFDQRAIENELLAWNIHVIRRRFEDVFEKGSLDQDRRLFMDGREVAVVYFRNGYMPSQYSLQNWEARLLLERSCAVKCPDIATQLAGTKKVQQELSRMGMLEVLLPDQLEVVARLRATFAGLYSLDMGEEGDQAITEALAAPNQFVLKPQREGGGNNLYGEEMVQALERLKDSEERASYILMEKIEPEPFGNCLLRPGSPPQVVQCISELGIFGVYVRQGKTLVMNTHAGHLLRTKAIEHADGGVAAGVAVLDNPYPV	908159	936116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_908214_911728_911864_917097_917244_919462_919539_919833_919974_920690_920808_926313_926395_926493_926572_928541_928609_931262_931458_931936_932019_933799_933990_935386
759724	contig_15067_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_154318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTACAGAATACACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22121	23893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_22100_23900
759725	contig_14575_pilon	-	2201	2	Intergenic	novelGene_101937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464209	459990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_460042_462059
759727	contig_401_pilon	+	1814	7	Intergenic	novelGene_42795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1028	1456	1124983	1127647	TRUE	40	AAAAACAGCACTCCGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWMSSSSSRIRAIWSPCCRLRISLSSVSSPWDWESPLYCSISSVCSCLALARVVSSSRTWLLSSVTFPSSCSFSCIRSFRSCWLSSSWFCSTVALGTTSRMSEPPSASSRVTSSSMGLGSRNWKGGLCPHTRPWRFTYRKW	1122272	1131684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1123263_1124945_1125092_1125500_1125661_1127487_1127681_1128470_1128574_1128905_1129086_1131642
759728	contig_7728_pilon	-	1447	9	Intergenic	novelGene_64706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	366.853491703432	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	748	1185	725083	713693	FALSE	25	ATTTTTCTAACTGATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	752202	713430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726717_729217_729337_730500_730552_735945_736058_752041
759730	contig_12120_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_21416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATACACTATACATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50182	52216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_50200_52200
759734	SIRV6	+	225	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	531	337	-40	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724
759735	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	54	511	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
759739	contig_16594_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_53817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	99	488	115812	116201	NA	45	ATAAGTAATATTCTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHNQPSRVCTHAIILVT	115713	116820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115700_116800
759741	SIRV4	-	265	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1253	3	1253	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
759744	contig_6418_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_81252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGTAAAACTTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452515	1452007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1452000_1452500
759748	contig_7657_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_30048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTAGGAAAAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321491	323002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_321500_323000
759756	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759757	contig_5136_pilon	+	2351	8	Intergenic	novelGene_126656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	7.24780051083761	55	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	481	1380	378146	390190	FALSE	35	AATAAGTTTTAATATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPKDLLKRKWGPKPSNSKSETALEKFKGEIAALKTSVDEITSGKGKLTDKDRHRLIEKIRLLEAEREKNAYHLTEKDKEIQRLREQLKARYSSTALLEQLEEKTKEGERREQLLKSLSEETDLLKKQLSATTARLAELESKASTFRLSQTASASCLNSSMSNIHEMEIQLKDALEKNQQWLVYDQQREVYVKGLLAKIFELEQQSETAAQPFPQQTKKTESEGYLQEEKQKYYSHLLANAKKDLEVERQTVTQLSFELSEFQRKYEETQKEVQDLNQLLCSQRKADVQHLEDDRHKTEKIQKLKEENDIAREKLEEEKKRSEELLSQVQFLYTSLLKQQEEQTRMALLEQQMQACTVDFENEKLDRQNMQHQLHVILKELRKARNQITQLESLKQLHELAFTEPLVTFQGETESRVKVTSPKSPAALNDSLVECPKCNIQYPATEHRELLAHVEYCSK	373911	391161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_374086_377468_377745_378115_378185_384106_384258_385473_385788_387404_387477_388170_388297_389992
759762	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	54	512	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
759763	contig_5084_pilon	+	2553	23	Intergenic	novelGene_64675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	911	1219	1775051	1779851	TRUE	25	CTGTTGGGCGGGAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRTAADILSIAMLTPMAVGTGPRACGPLNRGICRSYLPPAARISGTALCLRLINATNWKMIPLCCCTLYTKPKLIKTCNFTPSFFNSPTTFSRSSKPYFTN	1756657	1804363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1756897_1757454_1757573_1759069_1759117_1759651_1759715_1760957_1761058_1765636_1765750_1772725_1772815_1774485_1774610_1775033_1775152_1779149_1779284_1779777_1779947_1782038_1782105_1784729_1784846_1786835_1787006_1788097_1788148_1790965_1791087_1791509_1791581_1793575_1793825_1796485_1796538_1798568_1798671_1801771_1801856_1802382_1802435_1804257
759764	contig_11512_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_43225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	26	352	4011	4560	FALSE	15	CTTATGCTGCTTATAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	3985	4561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
759767	contig_5331_pilon	+	775	5	Intergenic	novelGene_112836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCGGCGGGGGCCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778682	782905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_779046_781145_781283_781386_781472_782417_782508_782805
759768	contig_2438_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_112053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATAGCCCCGAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310498	310176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_310200_310500
759770	contig_14322_pilon	-	389	3	Intergenic	novelGene_116509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6339	junction_1	257	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGCGGGCGCAGAGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672327	671444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241
759777	contig_3095_pilon	+	1144	5	Intergenic	novelGene_75007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3677.13817900552	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	404	715	150513	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHGLKMENLSPQECQRQSSCPGKTTFSASSTISPSCPQWTSSMTARWITGVSTSRFPRVRSASPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147176	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149766_150371_150680_150987_151163_151848
759778	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	16	363	14409	13839	FALSE	15	GCTGCTGGTACCACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14424	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
759779	contig_10482_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_152852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCTAGTAAATTAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215344	213799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_213800_215300
759780	contig_10437_pilon	-	985	6	Intergenic	novelGene_38423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	1193.9998324958	2538	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	33	464	830634	823713	TRUE	30	CCCCTTCTTTTTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFHSNSAQSRMDVLVVAILAVPLILGQEYEHEEILEEDDYYQVIYYYTVTPNYDDLGANFTIDYSMFESEDRLNRLDKEVTEAGETNINLETEAGETNLNPETERQDHLKPVTRKPATMETQSPDLKDAVSSLQSPVSLILSWALIQGGMSFT	830666	822555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_823074_823709_823812_827630_827775_828698_828758_829177_829262_830588
759781	contig_4114_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_15604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGACATTATATCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314283	314506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_314300_314500
759782	contig_4114_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_15606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	452	868	314958	315374	NA	15	CTCCAGAATTGCTGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVTPAKGRPSFSPRRQSIAISSLVTCVEGQGGLSEWPHVCAWGGQALARGREAKGHSRLACGLWGEVFFSKKVSFQVPLGMPPFWVISTSPCNAEVSGERNKSLTHENQNQKRTARECGVKTWVRGEMVRDKVSLV	314506	315708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_314500_315700
759785	contig_6364_pilon	+	1524	9	Intergenic	novelGene_51757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	113.981358124914	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	155	1048	656052	694889	FALSE	30	CTGCTTGTGAATACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNVNTRGTYLTSKACIPYLKKSKIAHILNLSPPLNLNPLWFKQHCAYTIAKYGMSMCVLGMAEEFKGEIAVNALWPKTAIHTAAMDMLGGAGIESQCRKVDIIADAAYSIFKKPKNFTGNFIIDENILKEEGIQNFDVYAVKPGHSLMPDFFLDELPGAVNMKMESPDAAPAIKEGKQAPQPKGGSPVEETFRIVKETLSEDAVKATQAVYQFELSGDDGGTWFLDLKSKGGNVGRGEPLDRADVVMSMSTEDFVKMFSGKLKPTMAFMSGKLKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARL	638908	695365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_638983_655971_656087_660441_660546_661701_661801_674476_674672_676819_676892_682957_683105_685567_685697_694776
759786	contig_15118_pilon	+	1950	4	Intergenic	novelGene_74584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	147.732490972328	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	614	1060	377560	378861	FALSE	20	GGGCCCCTAACACGAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVQLNVSYAPENLTICAFQGNSTDGLRSSSVFSPLSLGPSHQPPAWPTSLQSHPLGHSSDLKRTAIQEKVEDVPLLQAHDLTLFFLYSEPSHGSLWPQEKAQECHLSWPLHVFPYKWSDLPVLISLHGFADQAPSCSNVLSHILM	376598	379751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376995_377342_377591_377789_377838_378493
759793	contig_16211_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_150076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118956	120768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_119000_120800
759794	contig_11548_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_66753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATCCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71481	72867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_71500_72900
759797	contig_14516_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_153947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAATTCAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388359	390463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_388400_390500
759800	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	419	3	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759807	contig_2278_pilon	-	2206	10	Intergenic	novelGene_118116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	149.530210829174	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	256	1122	956893	940418	FALSE	30	TTAATTCTACTCTCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQESAVHVKMMPEFQKGSVRIKNPARVEEIICGLIKGGAAKLQIITDFDMTLSRFSYNVIDSCKLVTDECRKKLLQLKEKYYAIEVDPVLTVEEKYPYMVEWYTKSHGLLVEQALPKAKLKEIVEESDVMLKEGYENFFDKLQQHSIPVFIFSAGIGDVLEEVIRQAGVYHPNVKVVSNFMDFDENGVLKGFKGELIHVFNKHDGALKNTEYFNQLKDNSNIILLGDSQGDLRMADGVTNVEHILKIGYLNDRVDELLEKYMDSYDIVLVKDESLEVANSILQKIL	999159	939333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_940520_941168_941370_942020_942184_943363_943454_946614_946701_947434_947482_948892_948936_950258_950358_956857_956913_998923
759808	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	59	802	147241	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWVRSASPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147182	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150998_151163_151848
759810	scaffold_19766_pilon	+	2194	6	Intergenic	novelGene_34287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGGTAGGTGAGAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420192	424974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_421404_421755_421841_422622_422755_423790_423876_424065_424152_424379
759812	contig_10297_pilon	+	1667	9	Intergenic	novelGene_112544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	105.798673786584	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	115	585	553283	557266	TRUE	75	GAAAAAAAAAAAAAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLLFREVSFLHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEAGANMIVSGSAIMRSEDPRSVINLLRNVCSVIHSSD	544601	561224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_544634_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554385_554473_557036_557128_557246_557305_558563_558617_560233
759813	SIRV6	+	568	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
759816	contig_3307_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_86900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTACAATAAAAATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188221	190461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_188200_190500
759817	contig_6914_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_151713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCGACTGGAATCGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14335	15193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_14300_15200
759818	contig_7327_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_172130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1120	1458	247291	247629	NA	55	GGAACATAACAAACAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCLLSCSCYFQLDLDPELSTSRINPIIMNMVCEFCVPVAINYQTQQSRVSWEGRLVSEVVKKKLENGGMSDPHLTGISFGLIPMVIILSLCEVRGPLTLLLHYTTAPSNT	246171	247766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_246200_247800
759820	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
759825	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	3	407	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759826	contig_935_pilon	-	1793	9	Intergenic	novelGene_45558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	334.200164572072	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	508	1005	362211	358165	FALSE	25	GCTTTGAGGTGATAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKR	377439	357376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368102_368226_368292_370637_370822_377395
759829	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_92393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759830	contig_14275_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_162875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGCAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430803	429090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_429100_430800
759832	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
759833	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_97162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759834	contig_7078_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_130162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571829	572705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_571800_572700
759835	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759836	contig_3956_pilon	+	572	4	Intergenic	novelGene_14824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2031	junction_2	764.728419476846	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	84	572	1281682	1284143	FALSE	15	CTGCTGGAGCTGCAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRA	1281598	1284143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054
759837	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
759838	SIRV6	+	510	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3208_11003_11109_11205
759840	contig_15365_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_111129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAACAAAAATACAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37866	35132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_35100_37900
759847	SIRV4	+	286	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCCAATAAGTCGTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
759849	contig_6595_pilon	+	2441	1	Intergenic	novelGene_122560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714359	716800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_714400_716800
759854	contig_5084_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_64690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGATCAAAGAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1837643	1836188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1836200_1837600
759855	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
759856	contig_11496_pilon	-	2192	4	Intergenic	novelGene_172132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	4.10960933531265	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327782	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11496_pilon_-_203068_238781_239102_310467_310536_327631
759860	contig_11493_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_143661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125595	127823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_125600_127800
759861	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759862	contig_5574_pilon	-	2011	4	Intergenic	novelGene_155845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1278	junction_3	319.451961264218	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	22	516	132928	120849	FALSE	50	CATGGAAAGAAGAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQVMYGKPMWALSSKDLLTSSS	132949	119353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_120989_123198_123382_131363_131517_132909
759864	contig_11285_pilon	-	1636	15	Intergenic	novelGene_5685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	398.820736160793	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	477	1094	796157	786144	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQVRALSQQGPDRSFAFPAGLEAARPQPVPCLPQASQAGAQTGSAARLTAALQAPRTHSSELRLGALYCSAV	798468	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787198_794590_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796509_796604_796727_798342
759865	contig_9335_pilon	-	1780	12	Intergenic	novelGene_147424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	991	1464	44683	38713	TRUE	40	GAGAGAACCAATGATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEERSELSSELSPATGIFLNMSPEFCSSSSSSNEIMLVTFFFFFRSFLHLASALTFLDRTGRGSVSWSDLMRMETAEDAVISLRRLLTPCVDSFNKEVTFCVDSFKRSETVGANLLCPFKSLLSMLIAKSMEFRPAAMVGSMLDLSSSITKDQSS	265555	19463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_19591_34735_34922_38709_38775_41192_41444_44522_44893_50897_51020_59562_59636_61928_62015_109879_109941_112023_112152_184124_184211_265330
759867	contig_5643_pilon	+	1227	7	Intergenic	novelGene_38728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	298.050564315669	1180	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	677	1027	156118	157107	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152090	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152456_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
759869	contig_8241_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_157503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAGAAGAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629329	629790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_629300_629800
759872	SIRV6	+	483	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10737_10819_11031
759873	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759874	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_96511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
759875	contig_10803_pilon	-	2748	1	Intergenic	novelGene_170115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6465	3717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_3700_6500
759880	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
759881	contig_12270_pilon	+	365	2	Intergenic	novelGene_113931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	9	357	365	14431	14439	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGTCNQSPEQQGHEEQSLWHHLAAPACLMLI	13857	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14149_14365
759882	contig_5302_pilon	+	2093	3	Intergenic	novelGene_81502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	191	1	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	64	765	342399	355700	FALSE	65	AAAAAATAAACGGCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRGAAQGKLLPWLSIQAPGGMARPLVLALLFASATLPSALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	342335	357028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_342454_353340_353862_355574
759883	contig_18850_pilon	-	1105	4	Intergenic	novelGene_142448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	199.215684344604	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	22	450	193164	191238	FALSE	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFLMIRRHKTTIFTDAKESSTVFELKRIVEGILKRPPDEQRLYKDDQLLEDAKTLGECGFTSQTARPQAPATVGLAFRADMEAEAQRLSSRLPGPAGASTMPGSFCGAFQLLPELHCTVQTWSVPILQMSKLSPGSWVTC	193185	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_191423_191759_191866_192915_193051_193161
759888	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759889	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
759892	SIRV4	-	317	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1204	0	1204	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759893	contig_15752_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_148781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	51	476	348426	348851	NA	20	TGCCTAACTTCATTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALSVAAKDWKPPKFPSRDVWLNKALHHCEKACSRGRSVEMEWSLSYLIKDKSQGQTSGEGTISWMHPNQKTKSIAVESILTHSNPIGQSRTAPQGFQGMTGGFELPTFSLAAVVLNHCTTRAPVDVWGALKGLYVHI	348375	349411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_348400_349400
759896	contig_7164_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_172142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCATACTCTTAGGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475605	474704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_474700_475600
759898	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_95006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
759899	contig_9548_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_141073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181115	179267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_179300_181100
759901	contig_12672_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_141486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171639	173365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_171600_173400
759902	SIRV6	+	483	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1174_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
759906	SIRV6	+	439	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	98	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGGTATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3249_11031
759912	contig_6710_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_95800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653675	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
759913	contig_3584_pilon	+	961	6	Intergenic	novelGene_108169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1172.65841573751	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	31	819	527096	531381	FALSE	10	CTTTTGACTCATTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527065	531523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602_530769_531023
759914	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	415	3	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATAAAAACTATCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759917	contig_6654_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_85768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTATATTCAGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620037	621688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_620000_621700
759918	contig_6654_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_85769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCCAAGAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622169	622849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_622200_622800
759921	contig_16724_pilon	-	1170	10	Intergenic	novelGene_105314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	777.252108074448	123	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	283	1032	569099	541872	TRUE	20	CTAATATGTGTGCCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575937	541290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541869_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
759927	contig_6975_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_74257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	398	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATCTAAGAGGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160436	158905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679
759931	contig_15293_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_146540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	585	890	136792	137097	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVLFSWLFRGSNNWWGCSVLGTHRLLISLGCSPATTRERQVQAGRQCGRAGLRRQKHGLQTRLHLTCCVTWDIFLNPPEPLLPYLKISNNNSAYFTGSL	136207	137646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_136200_137600
759935	contig_9535_pilon	-	2645	1	Intergenic	novelGene_124477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGATAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287318	284673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_284700_287300
759938	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
759942	contig_4845_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_53667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	88	423	530353	530688	NA	10	GACCAGTCCTGCTCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLISGIAGTQTQKSAARSTLSTPYSLPLDASVKQNSHESLFIALHFVPGSLSTRNTIPLFCSVNSPSSFSSHLVRLGSDMGSAGKFSPAPFPGGQLSHAQALWVTLDCQH	530265	531043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_530300_531000
759947	contig_8954_pilon	+	1793	5	Intergenic	novelGene_130307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	136.530216435777	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	52	549	618527	632345	FALSE	80	AAAAAAAAAAACCAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRGLGSQLKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQMEFKAVQQVQRLPFLPSSNLSLDILRGTDETIGFEDILNGKYPSAPFYGDPAMYRATRESKTDKILVLVELAACWIQLCLFTAIG	618475	633589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_618530_621521_621620_623284_623346_627018_627121_632111
759950	contig_11115_pilon	+	1830	11	Intergenic	novelGene_102794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	140.78139081569	8	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	550	1338	155012	157736	TRUE	20	TTATTCTGGTGTTGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	151736	158458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_151784_152659_152796_152878_153034_153729_153881_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967
759953	contig_5549_pilon	+	2445	2	Intergenic	novelGene_81619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	74	334	350683	353176	FALSE	60	TAAGAAAAGTAGAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVER	350609	355287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_350796_353028
759954	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_93497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
759958	contig_6710_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_93419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
759960	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	584	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
759961	SIRV6	+	426	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	536	0	357	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759965	contig_17194_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_155364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAAAAGTCAGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105068	107513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_105100_107500
759966	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
759969	contig_854_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_36415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065947	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064600_1065900
759970	contig_10734_pilon	+	1688	4	Intergenic	novelGene_51368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	62.6578007912822	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	35	370	1798293	1799702	TRUE	20	GCCACATCCATTCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTHLVLICYDVMNPTSYDNVLIKWFPEVTHFCRGIPMVLIGCKTDLRKDKEQLRKLRAAQLEPITYMQGQSACEQIRAALYLECSAKFRENVEDVFREAAKVALSALKKAQRQKQRRFCLLL	1798258	1801253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1798329_1798409_1798545_1799537_1800164_1800396
759974	contig_665_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_158224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGTCTTTTTGCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347612	347318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_347300_347600
759975	contig_1861_pilon	-	2529	7	Intergenic	novelGene_77671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_3	82.3441288469042	15	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1324	1998	105785	101672	FALSE	35	ATACCCAGTGGTAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVDSLALLDFFLLCGDQPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEHKEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLVSLGTGASSLFQGSLGPGLGAM	115244	101140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_106923_112515_112582_115124
759976	contig_2890_pilon	+	2083	8	Intergenic	novelGene_60283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCCAAGACCGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305872	320485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_307367_308617_308750_312122_312225_315242_315306_315756_315868_315992_316067_319980_320023_320420
759981	contig_14220_pilon	+	1612	8	Intergenic	novelGene_159853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	214	336	292208	293643	TRUE	10	CTATTTCATCCTCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAAADAAAGEEADAGEEVDVAADVVVGVGAEVGAGAGVGADDAVADAGAAAADAEVAAVEAEAEADVEVAMEDAILGCPCVGRNGCPGPGKNGCLGGIKGRVFADPGWLK	291994	359472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_292222_293534_293873_294242_294378_313692_313753_319547_319834_325916_326126_331917_332089_359286
759982	SIRV2	-	465	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	34	3233	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
759991	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	2	537	2	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
759996	SIRV6	+	490	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	23	164	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
759997	contig_14815_pilon	-	1495	7	Intergenic	novelGene_127208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	686	junction_1	102.115403125853	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	71	859	22749	17106	FALSE	30	CACTGAAAATTATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23305	16469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702_22765_23250
759999	SIRV6	+	389	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	611	11	-21	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGCCTCACGAGTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
760001	contig_3747_pilon	-	827	5	Intergenic	novelGene_24985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	418.180209359553	174	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	303	680	271128	270395	FALSE	25	TTTAAAATTGCTTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEYGEIKNIHLNLDRRTGYLKGYTLVEYETYKEAQAAMEGLNGQDLMGQPISVDWCFVRGPPKSKRRGGRRRSRSPDRRRR	271674	270247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546_270684_270796_270934_271070_271345_271588
760003	contig_7730_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_156300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTTGGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421683	420340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_420300_421700
760005	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760007	contig_11130_pilon	-	935	7	Intergenic	novelGene_53101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	882.256891286332	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	253	366	62581	61286	TRUE	5	GTCCTGTTGTTTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYVFSHNPLGAVPTTKKKENEVFVSGTQTSQIICSHRAHQEQLLILKQQVYNFLLLWPKPPQDQENRLTHIFSEPGIIGIIFGVMVGIVGTVLSIAYCVRFLIKRTSVKAKPQSSIDADAA	76243	55709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_60397_60488_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884_66978_76150
760009	contig_8330_pilon	+	1362	7	Intergenic	novelGene_71782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	669.699787632903	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	408	926	852673	857111	FALSE	30	GAAGTACGAATCTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLLPAAP	837343	857547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855032_857090
760013	contig_8020_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_114452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1122	1424	375728	376030	NA	30	TAAACTATTCCTGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCLLTRQNAWIMKLEEPSFLQHFFRLRGHFRLRQRAPTVRRKNSFPWHSLYCGGMVLLDILFSYTLTRNPEDVTRAADAVTEPSWLLQGHQSESRELS	374606	376451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_374600_376500
760017	contig_7815_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_134384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTCTTAGCTCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499417	499168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_499200_499400
760018	contig_7815_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_134383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAGAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497726	497418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_497400_497700
760024	contig_6065_pilon	-	802	7	Intergenic	novelGene_132699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	210.060308800433	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	171	641	501780	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	507486	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497_499621_501763_501897_507432
760027	contig_14546_pilon	+	2720	1	Intergenic	novelGene_157427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1500	1877	197615	197992	NA	5	GATGGTGGTCTGCGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFQLNLGTCPEEHGLASSVRLLRSCPQSQVPLFTLCGLSPADACQCEHVLASKLHLTTLSCASTFPASFTGWCPYVLSAPMEGEVCSFITSFKVLILSRCPEKPFSPFLFSLTFFSPNCFPPKL	196115	198835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_196100_198800
760028	contig_11386_pilon	+	1799	2	Intergenic	novelGene_82794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATTTCTGTGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30550	32432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_32297_32379
760031	SIRV6	+	382	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	580	0	401	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760033	SIRV6	+	457	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	207	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11052_11109_11205
760037	contig_1735_pilon	+	1641	9	Intergenic	novelGene_106888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	707.309415584863	2	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	76	1293	126256	136637	TRUE	15	ATGCAACCTGTCCGGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKCEL	126180	139772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132267_132490_134146_134430_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
760040	contig_1008_pilon	-	2263	1	Intergenic	novelGene_121588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCCCGCGCCCCACGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703811	701548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_701500_703800
760041	contig_9848_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_79933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGGGAGCAGATAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86870	87416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_86900_87400
760045	contig_7171_pilon	+	1355	9	Intergenic	novelGene_101337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	84.4408076702254	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	56	1075	1301684	1315163	FALSE	25	AAGAACCTGCTGACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQPPGDDVARKSWYLRNIITRYQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFSPITVPLPFQSSQSEISSPLHAVSSDWWATGHPPLSLVQP	1301628	1315443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874
760055	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_92669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760056	contig_5684_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_81061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATGAGGTATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438397	440453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_438400_440500
760058	contig_12886_pilon	+	1968	2	Intergenic	novelGene_135493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458970	464134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_459833_463028
760059	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
760066	SIRV4	-	316	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1198	7	1198	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760067	SIRV7	-	241	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	21	91664	-11	-91658	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAAAACCGATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147936	147695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
760078	contig_6710_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_89107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653628	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
760080	contig_10205_pilon	-	1486	8	Intergenic	novelGene_143120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	71.2509219417617	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	93	800	256249	232772	FALSE	70	TAGAAAGAAAAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEPPPGPNPYLRTWITAAACPSAPDAPSAIMAPGQLALFSVSDKTGLVEFARNLTSVGLNLVASGGTAKALRDAGLTVRDVSELTGFPEMLGGRVKTLHPAVHAGILARNIPEDNADMARLDFNLIRVVVCNLYPFVKTVSSPDITVEAAVEQIDIVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVF	256341	232085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_232867_233925_234034_234911_235038_237897_237987_241682_241750_242569_242647_255694_255822_256230
760082	contig_10496_pilon	+	3025	2	Intergenic	novelGene_59441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195420	202528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_195528_199610
760083	contig_6557_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_32964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	480	331	810	378691	378212	NA	10	TTGTCTGTCTTCCCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYICGRSGKSRLLAPDPDSSSSSSALQFLGFEPAACHIACQCWHSLASAACEPAACHLTCQCLGHQPLQLCESGYTSSLTSDPWTWDLPASTAYVSHFLEINLSLYIGVCIYIYIYIHTHEHQCYFHPEIAPATLYPLTLVIFLHSTYYVQAEINLFICL	379021	378211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_378200_379000
760086	scaffold_13505_pilon	+	1741	5	Intergenic	novelGene_111627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	42.1811569305537	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	5	697	733912	739702	FALSE	15	CCCGGTTCAAATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAPRASLCLVAPVWNRGTRGVRGLNRMVAPQGNQRKRRTLVQFLADHFYDVQALREYFLHKQALKVHQENRFQGQEWIRPNGRGHFSLDFLKFQAVPVEAVDASGCTLNYSGLDNLLPLKELQSLWLQRCPHVDDWCLSHLHPLADSLQELSLAGCPRISERGLACLHHFQKLRKLDISDLPSVSNPGLTRILVEEMLPNCEVLGADWAQGLKSAPEEQRRDAAGPVPA	733907	740746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_733930_735281_735479_737892_738030_738222_738386_739524
760087	contig_1172_pilon	-	2570	11	Intergenic	novelGene_162020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	11.4	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	96	1409	43511	8652	FALSE	25	ACTTTAACTTTTCTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIPSFSTETWILLVTSLVLLYLYGTYSHNVLKKLQIPGPKPLPFMGNLLAYRKGWWKFDMKCYKKYGKIWGFYDGRQPVIAITDPDMIKTVLVKECYSTFTNRRVLGPMGFMKSAISVSSDEEWKRIRTLLSPTFTSGKLKEMFPIIRQYGDVVVKHLREEVQKGKPVTLKSIFGAYSMDVTTSTSFGVNIDSLSNPQDPFVENVRKLLKLDIFDPFIFLIVLFPFLTPICEALSISVFPRAVTDFFIKSVKTIKESRLKDNKKHRVDFLQLMIDSQNSKETASHKALSDMELIAQSIVFIFAGYETTSTALSFLMYLLATHPDIQQKLQKEIDAALPNKAPPTYDVMLQMEYLDMVVNETLRIFPIIGRLERVCKKDVEINGVIIPKGALVIIPVFVLHRDPELWPEPEKFLPERYKTPKKGTPPLIQACSSTI	43606	7490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_8940_11554_11716_16415_16483_17575_17704_21006_21156_22085_22175_22430_22545_37369_37470_39188_39242_40667_40762_43440
760088	contig_6710_pilon	-	586	2	Intergenic	novelGene_89070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GGTTTTGCTCTCCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760092	contig_3095_pilon	+	1546	2	Intergenic	novelGene_74962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAATAGTGTTTCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5960	8208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_6690_7391
760099	contig_15245_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_145230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGACTGTGAAATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129189	127111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_127100_129200
760108	contig_2867_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_135199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGTGAGTCAGATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879573	881600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_879600_881600
760114	contig_16310_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_70091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	27	359	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285949	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
760116	contig_50_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_122215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61230	59394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_59400_61200
760117	contig_18919_pilon	-	1771	3	Intergenic	novelGene_156026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	12	267	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	277	810	167194	74912	FALSE	60	GCAAACTCAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGALEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKLSIISSTNKYPCI	167470	73950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_75061_159885_160216_167139
760118	contig_5125_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_43502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031581	1033708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1031600_1033700
760119	contig_8773_pilon	+	2907	1	Intergenic	novelGene_74530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCCTTTTTTAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53367	56274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_53400_56300
760124	contig_5566_pilon	-	2459	6	Intergenic	novelGene_153647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_4	19.231224609993	173	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1567	2352	148538	131373	FALSE	25	GGAACTATGGATGATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDLAYCGILYRDLKKGLEGLVLESLLHLIYLITPYDMVFLYDPDWMIYFRQFSQLSPAEQKVAALVGVSESFIGKKASGQAIKKKVDKDIVNRLYLSFILNTLLKETNIWSVSEKYNMPRGYIQNLLTGAASFSSCVLHFCEELEEFWVYRALLVELTKKLTYCVKAELIPLMEVTGVLEGRAKQLYNAGYKSLMHLANANPEVLIKTVDHLSRRQAKQIVSSAKMLLLEKAEALQEEVEELLRLPSDFPDTVASPIEKA	150104	131265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_131481_140998_141134_142158_142273_144562_144737_147385_147485_148382
760125	contig_2480_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_63540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	767	1144	260764	260387	NA	40	GGGTGTACAAACACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVLIKKRRDRYRGKMVMWRPWPETGVMQPQVKERLGYRQPGETRKDLPLEPSERAWLCQHTECRLPASRTVRQSISVALSHTVCGTLLWQPEKTNTVIPWYPWGIGSRTPHGYKNLQMLRSRI	261530	259119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_259100_261500
760126	contig_14822_pilon	-	1937	7	Intergenic	novelGene_145397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	125.328124891777	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1178	1882	55511	53461	FALSE	45	CCAGAAAGGGAGTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHRVAGWADRAGAWHLCPHSGGCPTLRQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69952	53405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_56220_56390_56511_69603
760127	contig_8452_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_48068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTATGTTTGCAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550998	552875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_551000_552900
760128	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760133	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760140	contig_13700_pilon	+	1814	3	Intergenic	novelGene_68291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145366	152850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_145615_148680_149126_151729
760141	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_89214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653716	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
760142	SIRV6	-	550	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9453	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
760144	contig_13403_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_158095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTTTGTTTTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78049	76692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_-_76700_78000
760148	contig_7004_pilon	-	825	3	Intergenic	novelGene_126504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	57.5	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	290	373	433245	432830	TRUE	35	CAATAAAGCATTCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYKHRPQPKSDLGFIYLSQQVGLPISPLPFFFLHTSHLNLLNVCHRATTHSPSPTAPPVIALQNGLVSWGEVGWTDANPQSKVNSNWSSLSSCRVRMRLCNEPWNCRWQRPSPRSLVLRRKKT	433534	432163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_432779_432853_433184
760150	contig_1442_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_172166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAATGTCCTTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500647	499977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_5e+05_500600
760152	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
760156	contig_15897_pilon	-	1707	2	Intergenic	novelGene_49549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGTAGATGGAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660358	658442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_660110_660318
760157	SIRV6	-	506	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	77	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10808_11027_11109_11205
760158	contig_13924_pilon	+	1789	1	Intergenic	novelGene_147776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCAGGGTTTTTTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34147	35936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_34100_35900
760159	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
760160	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	60	515	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
760163	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760164	contig_19934_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_166630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	508	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTGTGGAATTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259254	202714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_203778_205320_205352_259097
760167	contig_8122_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_40238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGACCATATACTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706748	705554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_705600_706700
760168	contig_6958_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_70028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAACATCCACCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838773	839899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_838800_839900
760175	contig_6760_pilon	+	2525	7	Intergenic	novelGene_150784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_6	34.927305459578	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	398	1939	132806	144486	TRUE	65	GAAAAAGAAAAAGAACTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEICRICARELCGNQRRWIFHTASKLNLQVLLSHVLGKDVSRDGKAEFACSKCAFMLDRIYRFDTVIARIEALSIERLQKLLLEKDRLKFCIASMYRKNNDDSGADTTAGNGTVDISGLPDVRYSALLQEDFAYSGFECWVENEDQLQEPHSCHTFEGPGNRPRRCRGCAGLRVADSDYEAICKVPRKVAKSISCGPSTRWSTSICTEELALSEAGPPDLTSTKVAPDGESMEEGTPGSSVESLDASVQASPPQQKDEEAERSVKELVKCDCCLDEQAPQHLCNHKLELALSMIKGLDYKPIQSPRGSKLPIPVKSSPPAAKPGHNMTDGVSSGFLNRSLKPVHKTAVSYPLEITDLQELWDDLCEDYLPLRIQPMTEELLKHQKLNSNETTVTQQHVSDSQLVELQEKIQQTEATNKILQEKLNEMSFELKSAQESSQKQDGTIESLKETLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQSQLGQLHVCESRIEQEERLLLGMCHSQSQS	132408	147969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_133931_143076_143209_143925_144046_144321_144767_146241_146401_147625_147740_147936
760176	contig_9177_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_32655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATCAACAACCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68468	69562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_68500_69600
760178	contig_9177_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_32654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAAAGTTTCTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65537	66107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_65500_66100
760179	contig_9306_pilon	-	2905	1	Intergenic	novelGene_171477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	75804	75493	NA	70	GTTAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSHSIFQLPLHVPSVIITVYVCDTQESPVLTRTPEISLVAKSNIFIGGQKINCFCFNIELYHAFTLPNSPEENTTLRLTVSLEFQKFCFSLWPLAGCFIINTE	75804	72899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_-_72900_75800
760180	contig_6047_pilon	+	1923	8	Intergenic	novelGene_24245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTAAATAGCAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280557	296542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_281673_282295_282376_283168_283250_284771_284971_286830_286962_288457_288552_295660_295738_296396
760182	contig_10437_pilon	-	1989	9	Intergenic	novelGene_38413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	371.430006865358	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	476	1447	786446	781690	FALSE	50	TTTAGAAAAATAGATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPGNVDYSVMSVAASPNRTFYGNGNGPYLCCPV	789554	781147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_781865_782612_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428_786576_787256_787353_788620_788752_789435
760183	contig_6743_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_33556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	451	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248193	249343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_248200_249300
760186	contig_12021_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_172194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGGTATTGCTATAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54872	52716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_52700_54900
760189	contig_12464_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_68718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAGTGACAAAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	376976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375200_377000
760190	contig_10286_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_98427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445273	446832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_445300_446800
760191	contig_10058_pilon	+	1597	11	Intergenic	novelGene_67669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	364.045395520943	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	178	1536	31601	47188	FALSE	30	AAATAGTGTGGAGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPQRQELRPVAQATLHPQFGALPPWGRAKPRGWLGIPWGAGRGLGGQRWLGQSPGAPAMKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRQEFEADRKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVAVQMEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMQHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDREDKSGKGTLRPAKSMDSLSAAAGASDEPEGLMGPSRPRPSPLLPESLENNSAEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAARAGGTSRSERCAGVHISDPYNISLPLHITSILNMPPNIISNVSLVTQATGLLFQTG	31423	47249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38857_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_41898_41977_42737_43040_47149
760192	contig_1759_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_171350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTCATATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111764	113117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_111800_113100
760193	contig_7138_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_121002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGTGAAGTGGCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335702	336484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_335700_336500
760194	contig_366_pilon	+	1477	4	Intergenic	novelGene_51563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	227.640554871539	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	244	1173	645259	649345	FALSE	10	AACTTCTGCCTTGGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQRSVAESLLQVGVTQRFIDDVISAVLRASYGQSAAMPAFAGAMSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	643989	649649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_644197_645222_645386_647843_647985_648683
760197	contig_10058_pilon	+	1932	2	Intergenic	novelGene_67681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	470	931	45785	46246	FALSE	30	GTAAATAGTGTGGAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGNLGKSEEL	45263	47247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_45667_45718
760199	contig_10976_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_155604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAAACACTGCTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229518	229927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_229500_229900
760200	contig_9548_pilon	+	1909	5	Intergenic	novelGene_141059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	266.867944871616	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTGATTCGTTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133274	141970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_134519_137204_137341_137799_137868_139965_140064_141607
760203	contig_8823_pilon	+	2226	6	Intergenic	novelGene_53060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	33.7496666650206	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	619	927	84378	84686	FALSE	20	AGCCCAATACCTGTGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	51794	85985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64599_76219_76301_76878_76985_77837_77899_84353
760204	contig_13547_pilon	+	2909	4	Intergenic	novelGene_104875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82921	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_84962_88970_89177_91158_91268_93754
760205	contig_7630_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_133649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCTCCTTCCAGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447010	445608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_445600_447000
760206	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7478	2	-85	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
760208	contig_6059_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_44782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99061	100786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_99100_100800
760211	contig_10732_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_114700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACCTTATTTATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104391	103908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_103900_104400
760212	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	42	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
760215	contig_2114_pilon	-	1806	12	Intergenic	novelGene_104318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	116.996008973394	1	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	812	1270	1145556	1139050	FALSE	30	TTTAATGACTACTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169418	1138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147901_1148024_1152951_1153025_1157410_1157486_1157834_1157987_1160945_1161021_1167437_1167587_1169367
760218	SIRV6	+	760	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	2	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3107	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10805_11025_11109_11205
760219	contig_12570_pilon	-	1847	6	Intergenic	novelGene_79369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	42.5581954504652	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	325	909	284104	280932	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300298	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_286406_286481_300198
760222	contig_10594_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_142311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGAGGCCCCTAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234830	236005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_+_234800_236000
760223	SIRV7	-	376	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	6	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
760225	contig_9753_pilon	-	879	7	Intergenic	novelGene_41323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	369.405265257549	3158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	35	355	93294	70810	TRUE	30	TATGGGGTACATTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRRRRNYFLA	93328	69988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_70692_70838_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
760229	contig_9243_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_60323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.617124063666	4	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	29	463	64617	32907	TRUE	50	GCAAATTGTAATATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTIW	64645	19295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21206_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32916_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
760230	contig_1948_pilon	+	1062	6	Intergenic	novelGene_31166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	127.033224000653	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	271	825	475012	485694	FALSE	10	CTTTTAGTTTTGTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVKYKFISLSLQRSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKEITPPEDINDTQSDIIFFMKNVEGHDEKTQFESSSYPGYFLASEKDADLYRLILKEKNQIGDNSVMFTVDLQELGVKYS	468425	485931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_474126_474214_475005_475052_478752_478891_480516_480654_485454
760231	contig_12474_pilon	+	2687	1	Intergenic	novelGene_172212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98957	101644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12474_pilon_+_99000_101600
760233	scaffold_13505_pilon	-	1653	10	Intergenic	novelGene_111393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	295	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTCGGCCAGCCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192887	185580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_185623_187118_187206_187369_187481_189097_189229_189322_189431_190331_190429_190508_190613_191011_191194_191520_191613_192188
760234	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	74	505	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
760235	contig_414_pilon	+	3110	2	Intergenic	novelGene_115114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	128	2875	395436	398183	FALSE	35	AAAGTAATTCCTTATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAAASQTSRAVASHVPFADLCSNLERIQRSKGREEKIRHFKEFLDSWRKFHDALHKNQKDVPDSFYPAMRLILPQLERERMAYGIKETMFAKLYIELLNLPREGKDALKLLNYRTPTGTRGDTGDFAMIAYFVLKPRCLQKGSLTIQQVNDILDSVASNNAAKRKNLVKKSLLQFIAQSSALEQKWFIRMILKDLKLGVSQQAIFSVFHNDATELYSVTTDLEKVCRQLHDPSVGLSDISITLFSAFRPMLAAIADIQHIEKDMKHQSFYIETKLDGERMQMHRDGDVYKFFSRNGYDYTDQFGDSPQKGSLTPFIHSAFKTNIQNCILDGEMMAYNPDTQSFMQKGNKFDIKRMVEDSDLQTCYCVFDVLMVNNKKLGHETLRKRYEILSSIFTPVPGRIEIVQRTPAHTKTEVIDALNEAIDKREEGIMVKYPLSIYKPDKRGEGWLKIKPEYVSGLMDELDILIVGGYWGKGSRAGMMSHFLCAVAEKPPPGGKPSVFHTLCRVGSGYTMKELYDLGLKLANHWKPFHRKAPPSSILCGTEKPEVYLEPCNSVIVQVKAAEIVPSDMYRTDCTLRFPRIEKIREDKEWHECMTLDDLEQLRGKASGKLASRHLYIDGDDEPQEKKRKAAAPKMRKVIGIIEHFKAPNLSNVNKVSNIFEDMEFCVMSGVDGHSKPDLENRIAEFGGYIVQNPGPDTACVIAGSENIRVKNIISSNKHDVVKPDWLLECFKTKSCVPWQPRFMIHTCPSTKQHFALEYDCYGDSYFVDTDLKQLKEVFSVIKHSNEQTSEEMASAIADLEYRYSWDSSPLSMFRHHMIYLDLYATVNDLSTKIEGTRLATKALELRFHGAKVVSCLAEGVSHVIVGEDHSHVAHFKAFRRTLRRKFKILQEAWVTDSIDRCELQEEDQYLI	389356	398418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_+_389465_395416
760236	contig_16098_pilon	-	2305	13	Intergenic	novelGene_46205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	5.31441958783417	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1541	2233	713703	711163	FALSE	10	CCGGTGCTTCAGCCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERLLSLDRLLGSQGSQGTPLLSTPRRERMVLMKTVEEKDLEIERLKVKQKELEAKVLAQEAADPKEKENCSPTMLRPLAHRTVSVAKPLKKAVVMPLQLLQEQAASQNTEVHILKKKGRKRKLESLDASEPEEKAEDCWEPQISRELLAHGRQKILDLLNKGSARDLRSLQRIGQKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGISGKQMESFLKANILGLAAGQRCGPS	723166	711090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_711211_711301_711362_711458_711672_712439_712508_712899_713069_713568_713738_715464_715601_715708_715863_715994_716226_716306_716899_716987_717116_719746_719943_723097
760237	contig_7362_pilon	-	1983	4	Intergenic	novelGene_147552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGCCGAAATACAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426175	373671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_373792_401897_402039_424030_424137_424559
760249	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	6	407	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760250	contig_4131_pilon	+	651	2	Intergenic	novelGene_127884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1369	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	240699	241064	TRUE	5	TTTCTTTGTGTGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240698	248865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248714
760253	SIRV4	+	262	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGTTGTCAGAATGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	3907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
760256	contig_18272_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_7036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCACCCCATTCTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237206	238151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_237200_238200
760258	contig_10197_pilon	+	1609	8	Intergenic	novelGene_115287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	45.9840256202619	560	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	229	1485	1255988	1263353	FALSE	15	TTAACTTTTGTTACCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALILLLWTGAFLGHGSSQNTGGSLEEGSPAPDTTGIPVEEEDPFFKVPVNKLAGAISNFGYDLYRVRSSMSPAANVLMSPLSVATALSALSLGAGQRTESTIHRALYYDLINNANIHSTYKELLATVTAPQKNLDSAFRIMFERKLRIKTSFVSPLEKSYGTRPRFLTGNPHVDLREINNWVQAQTKGKIASSTREMPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1253747	1263477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1253969_1255980_1256072_1257966_1258166_1258884_1259041_1259455_1259660_1260794_1260938_1261911_1262123_1263093
760259	contig_15047_pilon	+	1256	7	Intergenic	novelGene_52157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2875.21074106848	1	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATCTGCATCTTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2167	21660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2263_2555_2750_3334_3478_4219_4434_4552_4687_21013_21062_21232
760264	contig_10930_pilon	+	813	6	Intergenic	novelGene_37112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8041.64688605512	24	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTTTTGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339434	342105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339971_340543_340639_340994_341098_341522_341625_342020
760265	contig_16185_pilon	-	1669	12	Intergenic	novelGene_144748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	86.4768635756657	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	94	1416	127403	82386	TRUE	40	ACTCAATAAATATTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134356	81743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_81796_82184_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
760266	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
760275	contig_15405_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_112091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATCCCCAGGGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23114	24604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_23100_24600
760276	contig_15304_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_30517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	193	1017	54100	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54292	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
760277	contig_14322_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_116594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCGGCGGCCACAGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
760280	contig_10753_pilon	+	2136	1	Intergenic	novelGene_105170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGTGGTTTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452719	454855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_452700_454900
760284	contig_12270_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_113196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	23	370	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14431	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
760288	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_98146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	CTTGCAGCTACCCACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
760296	SIRV6	+	768	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	9	6	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACTATGGGGAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
760301	contig_7308_pilon	+	1228	7	Intergenic	novelGene_159626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	246.655461457205	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614490	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_615491_615661_615913_616120_616248_616536_616604_616998_617125_617325
760302	contig_14711_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_68924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCACATACTGTTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86165	86523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86200_86500
760305	contig_14822_pilon	-	1247	7	Intergenic	novelGene_145390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	116.112971808589	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	510	1154	56093	53461	FALSE	10	CTGCTTACTTGTCTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWPHAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	58559	53367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_55429_56070_56511_58467
760309	contig_10857_pilon	+	862	7	Intergenic	novelGene_160899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1159	junction_6	978.655100408492	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	209	457	61421	62184	TRUE	5	TGCTGCACCCCTCTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSCKDIVAGDMSKRSLWEQRGGSKTSSTVKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVDEDVAP	58847	66839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61962_62094_62198_66447
760310	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
760314	contig_10902_pilon	-	1964	6	Intergenic	novelGene_65674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	28.2347303865293	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	436	903	159633	158691	TRUE	55	AAACAACCCAAGAAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNSKRNNNSRVSDIDLNSVNTEEKKKESRNNFVELLPPEVTLNIFHQLDIQSLCRASMACRSWNDMIKNSDSLWKPHCLTVRAVCQREIDGDLESGYSWRVILLRNYQKSKVKHEWLSGRYSNICSPISLPEKIMYPMDADTWGEILEAELER	168009	153232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_154226_158622_158853_159327_159670_161967_162198_164676_164794_167957
760315	contig_18251_pilon	-	1030	5	Intergenic	novelGene_50158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	307	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCCGTTGCTGTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55322	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_35797_48575_48792_50694_50878_53918_54027_54915
760316	contig_5009_pilon	+	2986	9	Intergenic	novelGene_119248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTATTAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29450	38348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_+_29468_29957_30051_30847_31008_32254_32385_32847_32945_33467_33640_33926_34036_34656_34767_36250
760317	contig_3424_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_55538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAGACTCATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274459	273866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_273900_274500
760319	contig_6440_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_161673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGGAATAGAGGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56892	57241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_56900_57200
760320	SIRV6	+	539	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760324	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
760329	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
760330	contig_11677_pilon	-	435	4	Intergenic	novelGene_85931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	44	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	180	392	595842	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597342	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
760331	SIRV4	+	615	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	126	209	126	-209	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1061	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAATAGGTTTATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581	2562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
760333	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_97241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
760334	SIRV4	-	185	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	429	3	-429	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAAGCCATGTCACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
760335	SIRV4	-	339	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	26	1156	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAAGGTGGCGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
760336	contig_7202_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_18783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
760337	contig_13244_pilon	+	1490	3	Intergenic	novelGene_86967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTACCGACTGTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296051	298560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_296174_296857_296919_297253
760338	contig_4742_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_130966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCATGCCCTGATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44545	44989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_44500_45000
760340	contig_4802_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_172219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTTCTTTAGGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573360	575559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_+_573400_575600
760341	contig_16930_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_139163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAATCCACTTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169696	171622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_169700_171600
760352	SIRV6	+	342	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2874_10721_10819_11031_11109_11205
760353	contig_6506_pilon	-	1772	7	Intergenic	novelGene_153484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGCCATCTTCCCTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215856	107242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_107854_154510_154662_158699_158865_161155_161320_164816_165175_165636_165777_215673
760354	contig_4742_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_131001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCACCACGAAAGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235068	233965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_234000_235100
760355	contig_19564_pilon	+	1177	7	Intergenic	novelGene_29682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	178.801022244157	536	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	848	1177	100027	102947	FALSE	20	GGTAAGCTCTTTCATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRCTYLNILLQTRSPEILVKFIDVGGYKLLNNWLTYSKTTNNIPLLQQILLTLQHLPLTVDHLKQNNTAKLVKQLSKSSEDEELRKLASVLVSDWMAVIRSQSSTQPA	92193	102947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_92213_92437_92964_99187_99306_99842_100092_100257_100394_100795_100848_102870
760356	contig_5964_pilon	-	2051	3	Intergenic	novelGene_80348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	182	1267	22372	8829	FALSE	70	GGATAGAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFFLQELWLQLRYSSLLGFVGPPSLCRSCDPSVTGVSPGPPLGPLVSCCRSTRRPFLQLRMRALGLVRHLYGGDTEARSASQLRSPLPKQEKPRGPHRSPASQYWPLLSTESRDGGGAEAPGAGDKAKLESTEPTAPEPVLSDGASVQAQLTPGASRDSQLRREKDQEGPPEVQDQHLQPGVDPQKEQLPGKMSPEHDGFGTDDGACSRILQERVSPQVAVHDGDSHGPDKDAMTHKERHPYVCNECGKVFNRKHLLVQHERIHSGTKPYECTECGKTFSKSTNLLQHHVIHTGEKPYECTECGKAFSFRSHLTRHQQFHTREKPYVCTECGKAFSHRSHLAQHQRSHTGQKPYKCTECGKTFSRSSYFTRHQWIHTEEKSNKCIECGKAFSRRSHLARHQRIHTEEKPYVCTECGKTFHK	22553	8044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_8854_9188_10060_22182
760357	contig_7286_pilon	-	491	4	Intergenic	novelGene_108717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	109.776540703781	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	242	490	288495	286948	FALSE	30	ATGATCTCTAGTTGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	290816	286946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758
760359	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760360	contig_10311_pilon	-	995	6	Intergenic	novelGene_50399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1345.52199536091	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68900	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65663_67545_67582_67823_67964_68264_68409_68643_68754_68873
760361	contig_10135_pilon	+	663	5	Intergenic	novelGene_106656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	3519.66148940491	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	101	346	118713	119864	FALSE	30	TTCATTTACCATATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDPQLGPQPAAQDDFSSGLALTPFGWTSRSSLMPLTPWASSIPSEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116673	120181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118702_118842_119162_119196_119619_119641_119801
760363	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760364	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760367	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760368	contig_7816_pilon	-	1909	16	Intergenic	novelGene_66534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	235.646571514772	37	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	3	1715	260299	245864	FALSE	15	GTCTAGCTGTCGGGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSSFDAHIYEGRVIQIVLMRAAEDPMSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKLSIRGEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKEFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTMFQKERFNIDMPHRFKVYNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCADCGMNVHHKCQKKVANLCGINQKLLAEALNQVSQRSSRRSDSGSSEPVGIYQSFEKKPGVSGDDGPDNGTYGKIWEGSTRCTIENFTFHKVLGKGSFGKVLLAELKGKREFFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLALAWENPFLTHLFCTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEILCGLQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELLWYSLCELCVNLPSLCRQREIVNSVLHYLNVVIY	260301	245669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_245967_250018_250135_250283_250423_251947_252011_252582_252675_252987_253162_253381_253480_253687_253785_254312_254414_255134_255265_255541_255628_256796_256829_256931_257095_257278_257340_258951_259152_260241
760369	contig_18869_pilon	+	162	1	Intergenic	novelGene_56378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTTGATGTTGAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73376	73538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73500
760372	contig_7753_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_41481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGCCCCCAGCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011698	1011948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1011700_1011900
760375	contig_6069_pilon	-	2499	11	Intergenic	novelGene_8064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	39.9435852171535	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	114	1859	515909	498920	FALSE	20	GACGTCTAACATGTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPSLQPPPHRDFISVTLSLGESYDNSKGWRRRSCWRKPRKHSRRGPPSLQIRAPDKDVKDRIQDRVEQEQEEPGNAHKENSQRTVISWRGAVIEHEQGTESPSRRADVPTNRPGPESRTQKASAPLNKRQKAVVEAFRHAWKGYRKYAWGHDELRPLSKSFGEWFGLGLTLVDALDTMWILGLTKEFEEARKWVSQKLQFQKDVDVNLFESTIRILGALLSTYHLTGDSLFLEKAKDFGNRLLPAFKTPSKIPFSDVNIGTGIAHPPRWTSDSTVAEVTSIQLEFRELSRLTGNEKFQEAVVEVTRRVHSLSGKKDGLVPMFINTHSGHFTHLGVYTLGARADSYYEYLLKQWIQGGKKETQLLEDYVEAIEGVKTHLLRSSEPSKLTFVGELAHGRFSAKMDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	516022	498279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980_500179_500444_500566_501430_501622_505367_505557_505922_506072_506906_507093_508364_508475_509812_509965_515795
760379	contig_9609_pilon	+	1230	2	Intergenic	novelGene_23124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	192	614	520917	521423	FALSE	20	ATCTTCTGGACGTGGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLAADLIVAVTTRVKPGRVAPLLPRHPHRVLLQPPDEVLHKPKLDQLPGVGFGERGVMSCLGLYPARQILSGHLPSSFVSVARMASKPITSRKPCLDWQCHMILLTGNPLPPLEPGLLRDVEGLSALRQPPHAPGIPL	520725	522039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_520925_521008
760380	contig_14807_pilon	-	2310	10	Intergenic	novelGene_124731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	5.05769185632935	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	323	1762	114761	95395	FALSE	10	GCTGCTTGATTCAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDGESSEGSVWEALAFASHYHLDNLVAIFDVNRLGPSSALPLEHCTAIYQKRCEAFGWNTYVVDGHDVEALCQAFWQASQVKNKPTAVVAKTFKGRGIPNVEGAEKWHGKPMPKERADAIIKLIESQIETSKDLVPKPPIEDSPQINITDIKLTTPPAYKVGDKVATRKAYGLALAKLGHANKRVIALDGDTKNSTFSEMFQKEHPERFIECFIAEQNMVSVALGCATRGRTIAFASTFAAFLTRAFDQIRVGAVSQTNVNLAGSHCGVSVGEDGPSQMALEDLAMFRVIPSCTIFYPSDAVSTEHAVYLAANTQGMCFIRTTRPETAVIYAPEERFEVGQAKLVRHSASDKVTVIGAGVTLHEALEAADELSKEGISIRVIDLFTLKPLDAATIISSAKVTGGHVITVEDHYREGGIGEAISAAVAMEPDILVHQLAVSGVPQSGPPSDLLDMFGISARHIIETVRRIVNKPVELIS	115083	94846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_95586_96714_96835_96951_97049_98316_98401_100660_100792_102466_102624_105650_105816_111826_112021_114378_114507_114588
760381	contig_3825_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_78004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463682	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664
760386	contig_2504_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_166861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTGCTTGTAAACCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416063	417370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_416100_417400
760390	SIRV4	-	351	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	9	1161	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760391	contig_3449_pilon	+	2331	2	Intergenic	novelGene_73700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATTGCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289990	293565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_291140_292383
760392	contig_12931_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_166760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAATTCAAGTTTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58265	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_58300_60000
760393	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	20	389	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760395	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	10	410	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760396	contig_2463_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_43017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAAAAAGAGTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442830	440615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_440600_442800
760397	contig_4884_pilon	+	1028	2	Intergenic	novelGene_63800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	392	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAGTCAAGTAGGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258087	259212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_258356_258452
760403	contig_9186_pilon	+	2056	9	Intergenic	novelGene_85349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1172	1525	410340	417275	TRUE	15	CGACGATCTCCGCCCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEERQAFFGEGLDSDLTAAGAESTEVTKALHLDLGFFSFFSTGGFTFTSFFFISLALLFLTVKASSLSSLSPKSESSSELLSKSGSELLTLSPSLPSKRIFLCCTTALEAAFLFP	406938	436775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_408044_410273_410425_414410_414570_417165_417316_417837_417924_419271_419382_423103_423245_433098_433150_436672
760409	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760411	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
760412	SIRV6	+	385	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1537_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724
760416	contig_13283_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_154026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCTTATCTTGTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139547	139143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_139100_139500
760417	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_90579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760419	SIRV6	+	571	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	329	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11205
760425	contig_13863_pilon	+	1228	12	Intergenic	novelGene_42078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	384.048356975873	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1035	193	1227	474588	490030	FALSE	45	GTTTAAATGTGGAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEV	455735	490031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481406_482089_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
760426	contig_5799_pilon	-	1872	3	Intergenic	novelGene_50239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158144	153401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_154450_156231_156648_157736
760429	contig_8317_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_20176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
760430	contig_3679_pilon	-	1769	7	Intergenic	novelGene_112128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	42.3582603776669	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	75	1031	1076676	1056275	FALSE	50	TCATTAACAGGAGATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSALTEELESITNELHAVDVQIQELMERQQELIQKKAVLTKKIKQCLEDSDAGASNDCDSSPDAWNKEDFPWSDKVKDVLQNVFKLQKFRSLQLETINVTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSKLKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNTSLIGLTATATSHVLKDAQKILCVDKCFTFTASFHRPNLYYEVFHFTCISYFCEGFQQSSYLCTLLYLRNS	1078899	1055536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1056532_1060849_1061049_1065296_1065404_1069661_1069842_1070923_1071122_1076660_1076709_1078857
760432	contig_15918_pilon	+	1943	6	Intergenic	novelGene_132721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	101	junction_1	58.7795882938967	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	27	974	195890	213306	FALSE	15	CCGTTTATCCAGCCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTAESLDPGSRPDPVRSFNRWKKKHSHKQNRKKQLRKQLKKPEWQVEREVISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSADGLGILIISPTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETICFHATNLQMLVLDEADRILDMGFAETMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHEKAKYRYALFETIFDSIKKIKVLFFSLRIWCFKLILLF	195863	214275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_196076_208109_208171_208520_208652_210044_210204_211291_211413_213016
760434	contig_15134_pilon	+	2430	3	Intergenic	novelGene_140221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCACCAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189413	196064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_190596_194698_194802_194919
760436	contig_14483_pilon	-	1433	2	Intergenic	novelGene_133740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_1	0	245	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTGTAAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39278	15294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_16616_39166
760437	contig_8258_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_130442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTTAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20615	21397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_+_20600_21400
760440	contig_19899_pilon	-	3145	1	Intergenic	novelGene_102509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGCAGTCGAAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119674	116529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_116500_119700
760441	contig_8682_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_165273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAACATTATTGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70807	69187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_69200_70800
760442	contig_7230_pilon	-	1121	8	Intergenic	novelGene_52550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	407.230967909477	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	152	718	177508	134622	TRUE	35	TGCAAATACGGAATCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177659	132819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_132925_134323_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
760443	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCATTCTTTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27700_27900
760446	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
760447	contig_504_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_54396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTCAATAAAACTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13446	12902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_12900_13400
760456	SIRV6	+	272	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	114	-9	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760458	SIRV6	-	321	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1344	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105
760463	contig_14618_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_136846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGTTGTAGACTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235893	1236397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1235900_1236400
760466	contig_6710_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_97604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
760467	contig_8843_pilon	-	3093	1	Intergenic	novelGene_156640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAATTTGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31782	28689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_28700_31800
760468	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_97637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	657529	653562	FALSE	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657530	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760470	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	0	411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	270	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760475	contig_14807_pilon	-	577	5	Intergenic	novelGene_124693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9090.02245253003	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	182	484	37635	37247	FALSE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38677_38741_38827_38887_39750
760479	contig_3818_pilon	+	1337	4	Intergenic	novelGene_99271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_1	704.887855540787	4265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	411	671	569573	569942	FALSE	20	CAGCAGCCTCCCAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSASVAELGADSPARVLLAALLHETRAGPTAVGFLRGGFEGFHACCPDLCSESPIQAPPPTGAENSLPDPRAPSYDQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLRACGITAVLNVSASCPNHFEGLFRYKSIPVEDNQMVEISVWFQEAIGFIDSVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMQSRRVRLDEAFDFVKQRRGVISPNFSFMGQLLQFETQVLCH	568649	570608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_568764_568893_569016_569398_569619_569727
760484	contig_9727_pilon	-	1463	13	Intergenic	novelGene_86381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	242.455651729457	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	133	945	598065	582365	TRUE	35	GTTCTGTTAAATTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSDCSRGTSAYSPPQKNGEK	622875	578098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583149_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622755
760485	contig_8452_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_48117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	481	795	990704	990390	NA	50	TTGGTTAAAAAAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTFALSTFASFCLNVKVCGEKAVAVCLHEDDSLGNPIGQFFPVLWGHCESESTPRQGVGYRSVCVFLRESGFFSSWSFCHLVRSNLRAEPGQTDNWGPAAEPW	991184	989793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_989800_991200
760488	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
760489	contig_6710_pilon	+	573	2	Intergenic	novelGene_95964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGTGACTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	657525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
760492	SIRV6	+	534	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760493	contig_20614_pilon	+	1577	6	Intergenic	novelGene_107551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2124	junction_5	402.651412514597	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1057	1491	154034	155100	FALSE	30	CTGAAAAGATAGTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152802	155186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
760497	contig_10182_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_134638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	955	1299	463611	463955	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCLGCAPHLSLEFGTAAPHWCPFLQSLPITQPPHCLRSPNRNLISSSPCIVKTSHSSPAYFQIKPTILKLTLRVTDANRSCPHRNTQSLRSSVSSYLTFPKHTGTFSLNVLPP	462656	464740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_462700_464700
760500	contig_10003_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_88268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	9	563	788647	789201	NA	35	CGTGAAGGTAAAATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSTIIVGDLNSSLTIIDRTGRQKSNKEIENMNNTMIQLDLTDIYRTPNPTTAEYMFFSRTHGTISRIGHVLDQHIFLHNFKRIEIIQCMFSVDNEIKLGINNRKKFGKFPNMLKVNTTLLNNQWVKEEITREIRKYFEMNENQDISYKTIWDVAKAVLRGKFIAANTSIKKGKKKYRSLILS	788638	789501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_788600_789500
760501	SIRV4	-	522	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	97	-2	97	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5061	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
760502	contig_9482_pilon	-	2433	15	Intergenic	novelGene_44260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	61.0197358505042	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	380	1711	759903	738770	FALSE	15	ACGGACAGGTTGTGGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKERLLALKRSMSFMQDMDFSQQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKVTFLSSASTALSMRHNSVFGDLKADETELLYSAYGDETGVQCALSLQEFVKDAGRYSQKLVDDLLDQITGGDHSRMLVRLKQRRSIPMKPPDEVKVGDSLGDGGGSVLDFMSMKPYSDVSLDISMLSSLGKVKKELDHDEGHLGLDETTKLLQDLHEAQTERGGSRPSSNLSSLSNTSERDAHHLGSPSHLSVGEQPDVAHDPYEFLQSPEPAASTSS	773094	738047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738871_740661_740830_742838_742942_744776_744816_747459_747572_748086_748220_749002_749099_751176_751253_754752_754886_757436_757613_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970
760511	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
760512	contig_11986_pilon	-	2202	4	Intergenic	novelGene_69259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	10.7082522694727	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTCCTCATTTTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845862	839882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841749_841860_841950_845153_845244_845705
760514	contig_4315_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_46765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257123	255337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_255300_257100
760516	contig_6494_pilon	-	227	2	Intergenic	novelGene_108540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2829	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2677
760517	contig_11815_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_50947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATGATTTTTGTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463626	463015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_463000_463600
760521	contig_10500_pilon	-	1249	10	Intergenic	novelGene_41178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	395.378143734843	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	114	1091	1345339	1318487	FALSE	75	TAAAAAAGAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1406426	1318328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1406317
760522	contig_5586_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_143612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAATTTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771791	771345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_771300_771800
760523	contig_14621_pilon	-	1359	3	Intergenic	novelGene_105849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6	226	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1	480	343703	313147	FALSE	0	CCCTGCCTCTGTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNHFRESGTAARERLALESVESGDLRQRRFVPWPLTWTSHLPRCLSPRSWRTCCGTDSSWGPSSSSSACWPSLYLFPSPTRRRQSHLSPEVLRGRGSPRLLLLLQARGPRRRPRRSGRRGSLWSWVGGPWPGGAALLESTSSSHSPPQTQGLRGAGNTL	343703	312267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_313382_328088_328295_343664
760524	SIRV6	+	537	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1271_1654_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760525	contig_13865_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_122740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCTCACAGCAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7329	8241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_7300_8200
760528	contig_10324_pilon	-	1142	2	Intergenic	novelGene_7697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3112	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	137	571	23791	22912	FALSE	15	CCACAGCGCGAGTGGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSIFLRYSGEHPHYIAGEYSLEKVMMFGSPTIALELLKQGASPNVQDISGTTPAHDAARTGFLDTLKVLVEHGADVNIPDGTGALPIHLAVREGHTAVVSFLAAESDLQHRDARGLTPLELAQQRGNRDLMDILQGHTVASL	23927	22340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_23272_23716
760530	SIRV6	+	246	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8472	-2	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
760535	contig_11052_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_115451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2271.10961622043	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	124	447	103010	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRSLLTEALVLTFPALLRCPFARLLVCSPTPPTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102790	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_102889_102984_103136_106346_106461_107445
760537	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	147	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760543	contig_9011_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_159359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACCCCCAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784712	782264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_782300_784700
760546	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	579	0	400	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760547	contig_4982_pilon	-	1454	14	Intergenic	novelGene_172226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	132.251508643424	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	1	1269	80188	20301	TRUE	35	GTGAGAGATTTATACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFLVALQTKNRTEANWARVDEQDLWQWGLTGIQLRSYQLEGVNWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLARRLNDEGPFLILCPLSVLGNWKEEIERFAPSLSCVVYTGDKEERAHLQQDLKQESCFHVLLTTYEICLKDASFLKSFPWSVLVVDEAHRLKNQSSLLHKTLSEFSVVFNLLLTGTPIQNSLQELYSLLSFVEPDIFSKEQVEDFAQRYQDIEKESESATELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSAMQKKYYKAILMKDLDAFENEMTKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEIGDHLIEASGKLHLLDKLLAFLYSRDHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQQPIFIFRRIPRSTGKLLARVP	80188	18373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_18489_20230_20351_23123_23214_24591_24666_34419_34517_35931_36025_36956_37113_37733_37897_39258_39341_43972_44005_44628_44744_54312_54420_63954_64068_80091
760550	contig_10331_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_54172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGGAAGATAGAGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540621	542030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_540600_542000
760552	contig_13055_pilon	-	749	3	Intergenic	novelGene_104964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_2	12.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTGGCCTCTATACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159243	142080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_142643_143034_143154_159175
760553	contig_13055_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_104963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141982	140739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_140700_142000
760556	contig_6710_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_98040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	10	TTCTCCTCTTCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
760559	contig_15991_pilon	+	994	6	Intergenic	novelGene_70921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3	332	100388	101060	TRUE	30	CAGCAGGCCGGAAATGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLFPSTSLLFSKITLCKGSLRPLGGGSHPLGGLSRGGCRPVFSCRLSTPVFCRELLNGHRGHLHALGPVCHLRLSSCKFRSRSSPFTLKFFLGHSLFSSRLLFLFNLVF	100385	106361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100543_100885_101078_101954_102271_103581_103702_104974_105139_106316
760562	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
760563	contig_6710_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_97449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760569	contig_18272_pilon	-	2127	4	Intergenic	novelGene_6994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.214864331688	1	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTCTCAGAAATGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264280	120755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122428_172712_172796_184338_184551_264120
760570	contig_8317_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_19392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
760571	contig_14326_pilon	-	2036	4	Intergenic	novelGene_120679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	146.111829318049	1	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	252	569	123955	116744	FALSE	40	TGAAAAAGGACTCCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDPRGPWCYVSGKAGAPEKRRCEDLRCPEIPSQAPPAPITETEEAFEVPGEDEAQVFPPANALPARREAAAVQPVIGISQRVRMNSKEKDLGTLGYVLGITMMVVIIAIGIGIILGYTYKRGKDLKAQHEQKACEREMQRITLPLSAFTNPTCEIVDEKTVAVHTSQTPVSLQEGCTPLMDQAGTPGA	125169	115276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_116949_123741_123821_123921_124120_125082
760573	contig_5434_pilon	+	2251	11	Intergenic	novelGene_74646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_8	12.4515059330187	36	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	12	1460	152853	205026	FALSE	35	GATAAACTTTTAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARVLSAWNRNARQLIWVRYFQTCSSVHVLKPKYVYFSGYPSFKYSHPHRSLKTTAVLHGQVVQFKLSDIGEGIREVTVKEWYVKEGDTVSQFDSICEVQSDKASVTITSRYDGVIKKLYYNLDEIAYVGKPLVDIETEALKVSEEDIVETPAVSHDEHTHQEIKGQKTLATPAVRRLAMENNIKLSEVVGSGKDGRILKEDILNYLAKQTGAILPPSPKAEIMLPPPKPKDRTIPIPISKPPVFTGKDRTEPLKGFQKAMVKTMTAALKIPHFGYCDEVDLTELIKFREELKPIAFARGIKLSFMPFFLKAASLGLLQFPILNASVDEACQNITYKASHNIGIAMDTEQGLIVPNVKNVQICSIFEVATELNRLQQLGSTGQLGTTDLTGGTFTLSNIGSIGGTYAKPVIVPPEVAIGAFGSIKALPRFNQKGEVYKAQIMNVSWSADHRVIDGATMSRFSNLWKSYLENPAFMLLDLK	152841	205817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_152904_155387_155512_159241_159318_165571_165754_183872_183995_186990_187208_188070_188238_197839_197918_200233_200426_201601_201674_204858
760574	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760575	contig_14513_pilon	-	662	3	Intergenic	novelGene_70292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	184	477	18880	11473	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSELCSTGFSWLLFRSRSQGLSTEALLSGLESPTL	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11574_13087_13136_18735
760578	SIRV6	+	494	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760579	SIRV6	+	523	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1511_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760580	SIRV6	+	519	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1591_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760584	contig_4151_pilon	-	731	2	Intergenic	novelGene_65288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTCCAGTGGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721077	719681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_719825_720489
760587	contig_12635_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_60861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAATGCATTACGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605208	606110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_605200_606100
760590	contig_14322_pilon	-	401	2	Intergenic	novelGene_115791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
760594	contig_14755_pilon	-	1557	11	Intergenic	novelGene_129379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	53.5295245635528	186	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	777	1322	225859	128904	FALSE	15	TTAAGGACCCTTTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNRLAFLPLDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	368731	128668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_225825_226033_232058_232145_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
760596	SIRV5	+	289	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	244	135	130	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8445	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
760599	contig_10722_pilon	+	1493	2	Intergenic	novelGene_70994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1095	junction_1	0	93	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	560	1414	31560	32414	FALSE	5	TGGTTTTGTTTCTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKGRDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNVPISGPILQAKAKEMAKLLKVDGFSASNGWLQSFKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30594	32493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31137_31542
760612	contig_5526_pilon	+	2304	6	Intergenic	novelGene_111698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	83.059978328916	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	145	567	294351	333776	FALSE	40	AACATCATTAGCTTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRIQKELSDLQRDPPAHCSAGPVGDDLFHWQATIMGPPDSAYQGGVFFLTVHFPTDYPFKPPKIAFTTKIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTVSKDTTDMQENGLRNMQCKFKKIFHIYQSTVKSRFFSILAVN	294206	335513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_294375_324079_324144_324236_324269_326867_326946_328602_328709_333657
760616	contig_9345_pilon	-	1159	4	Intergenic	novelGene_24374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	628.618061040778	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCTTCCCTCGTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144529	141105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_141868_142692_142781_142955_143072_144336
760618	contig_12644_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_44509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTATTTCACTTAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109168	1108065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1108100_1109200
760619	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
760623	SIRV3	+	417	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5367	1211	3308	-94	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGGATTTAGTAGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7311	7728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7300_7700
760625	contig_16187_pilon	+	1134	7	Intergenic	novelGene_101074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	192.386257882995	406	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	311	712	59901	64410	TRUE	20	TACTTTATGGATTCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAENIKKYLDQEKEDGKYHKQIKIEENATGFSYESLFQEYLNETVTEVWIEDPYIRHTHQLYNFLRFCEMLVKNPCKVKIIHLLTSLDEGSGKEQQSNGLQEIKESLRSHGVLLELEYSSSIHDREIRHSP	53294	64910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_53552_59847_59950_62054_62192_62316_62404_63110_63227_64397_64618_64695
760635	contig_3241_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_146410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCACCATACTGTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876216	878266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_876200_878300
760637	contig_15327_pilon	+	2833	3	Intergenic	novelGene_70781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCATCAAGTTCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135904	1150470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1137381_1138469_1138566_1149209
760640	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760645	contig_15327_pilon	+	1871	6	Intergenic	novelGene_70735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	68	595	959632	960159	TRUE	40	ACCTGCAGGGAAAGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQINREFSLNNHLLTSGPVQERMRAYFSASGAYYQPGRKRKGKGPFSQPPGSPGDMMGWTCPLQFQSEKPLLEEKKCEKARETNSRNTRREAEGLSLSHRGLGLMPPKPWQPTLKSHRGGNRMTKDRKGKGRPCDRGWGWAWARNGMWTDSWAGLWPPTARARPAQGMWVGLAGAPWRKGLDSLPGLVCQAQGVRGS	959564	963925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_960581_960689_960770_961487_961608_961817_961950_962807_962906_963500
760646	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
760648	SIRV6	+	483	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
760650	SIRV6	+	320	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	32	-244	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760655	contig_7580_pilon	+	965	3	Intergenic	novelGene_108609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	707	junction_1	37.5	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	14	559	106965	109647	FALSE	20	TGGGCTGATACTGTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	106951	110053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_107190_108145_108248_109428
760656	contig_3900_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_84210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559828	560624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_559800_560600
760660	SIRV6	-	518	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	387	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGTCCACAATTGTCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1173_1585_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
760664	contig_8616_pilon	-	1729	11	Intergenic	novelGene_72415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	314	643	245634	244846	TRUE	5	GTTTCTACTCCCGGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDRSSSRYSLLLLKFKDNSSGMFSSMIRREAAIQLLRFRTTSMFWATKSGSVRRPLRSSACWEPSYLLLMISFSCSTCSGFSSFCTVWGGAEGLMMIDILRFSRSTIL	246126	239592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_239700_242453_242939_243481_243662_243883_244040_244576_244659_244769_244876_244995_245076_245159_245230_245371_245461_245573_245682_245860
760666	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	505.486124658454	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121650	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121691_125517_125902_126159_126283_126514
760668	contig_19960_pilon	+	1796	6	Intergenic	novelGene_164188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_5	76.8208305083979	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	46	792	35948	60083	FALSE	80	AAGGAAAAAAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLSGSTIGDHCEEKMHLLLLISLLFWRPGCSVVWGPNVTSGPEGSSLTVQCHYDLGWEPHYKWWCRGAVWATCKILVKTTGSEQEVKEGRVSIRDNHKKRIFTVTMERLTEDDADFYWCGIERFGTNHTVKVKVSIDPDLEFEPINLEVKNLNGKPSAVIVNCQPPLEANGNITALTSVPMRIKRISRGGDLRAIVLNCQPPLTIGGEKTDPNSANIHLEEINREGGAAYCLWELPASSGRQREIC	35902	61087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_36039_37668_37999_41230_41339_44035_44144_51751_51861_60082
760670	contig_5260_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_144380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTTATGACCCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339891	338112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_338100_339900
760673	contig_8020_pilon	+	2087	18	Intergenic	novelGene_114402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	50.0625905819759	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	304	1632	173375	202853	FALSE	10	CCACCCATGGCTGGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVNSLSLCYHNKLILAPMVRVGTLPMRLLALDYGADIVYCEELIDLKMLQCKRVVNEVLSTVDFVAPDDRVVFRTCAREQSRVVFQLGTSDAERALAVARLVENDVAGIDVNMGCPKEYSTKGGMGAALLSDPDKIEKILSTLVKGTCRPVTCKIRILPSLEDTLSLVKRIERTGIAAIAVHGRKREERPQHPVSCEAIKAIAETLSIPVIANGGSHDHIQGYLDIEDFRQTTAASSVMVARAAMWNPSIFLKEGLRPLEEVMQKYIRYAVQYGNHYTNTKYCLCQMLREQLESPQGRLLHAAQSSQEICEAFGLGAFYEETTRELDARRAKLLARTPEEAREPVEDTSGVVKMAVKFDRRAYPPQITPKMCLLEWCRREKVAQPVYETIQRPLDRLFCSVVTVAEQKYQSTLWDKSKKLAEQAAAIVCLRSQGLPRGSAG	167168	203308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_167759_167903_169128_169206_173357_173501_180602_180649_183362_183455_184166_184211_185408_185470_189405_189454_192570_192637_192816_192888_194858_194946_196430_196600_198668_198791_200044_200195_201309_201398_202483_202558_202768
760674	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760675	contig_5083_pilon	-	1797	6	Intergenic	novelGene_151700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_5	266.227421577868	675	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	278	1531	1646782	1638488	FALSE	65	GAAACTGAAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHTIKKLIKENKKHQELILDICSEKDNLREELKKRTETEKQHMSIIKQLESKIEELNNEVKASKDKLVAQDIAAKNAIQQLHKEMAHRMEQASKKCEEARQEKEAMVMKYVRGEKESLDLRKEKEILERKLRDANKEFEKNTNKIKQLSQEKGRLHQLYETKEGETSRLSREIDKLKEDVNSHIIKVKWAQNKLKAEMDSHKVSTIISHNY	1656621	1638221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1638638_1640224_1640438_1641769_1641899_1643849_1643977_1646147_1646844_1656405
760676	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
760677	contig_4783_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_108404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293948	292027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_292000_293900
760678	contig_11370_pilon	-	912	5	Intergenic	novelGene_98785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	315	junction_1	182.048585547925	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	44	409	302369	301551	TRUE	35	TTGTTAAAAGAGAATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNWENQEVSTGTTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAASLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVRTPQEDRALKPCL	302835	300918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301124_301252_301726_301843_301976_302310_302379_302801
760679	contig_8138_pilon	+	1848	2	Intergenic	novelGene_52484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305199	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_306833_307719
760680	contig_5083_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_151620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAAAGGGTTTCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47262	46307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_46300_47300
760681	contig_5083_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_151621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49979	47959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_48000_50000
760684	contig_10958_pilon	-	1979	8	Intergenic	novelGene_5375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	79.1327997735452	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	294	986	821651	812500	TRUE	60	GTTATAATAAATAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAVRGFTVAEQRQRQRQDECKPGPRGSFNGSLSTVPVHDLGAAVIKEVLKRAGVAPAEVSEVIFGNVLTAGCGQNPVRQASVGAGIPYTVPAWSCQMICGSGLKAVCLAAQSVGTGDSNIVVAGGMENMSKAPHLVHLRTGVKMGEMPLLDSLLCDGLTDAFHHYHMGVTAENVAKKWQVSREDQDKVALLSQNRTESAQKAGHFDKEIVPVFVSSRKGLTEVKTDEFPRHGSNIEAMSKLKPCFITDGTGTVTPANASGINDGAAAVVLMKKSEAADRGLTPLAQIVSWSQAGVDPSVMGTGPIPAIKQAVSLTIFVLTCLKPDQ	830135	811132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_811512_811885_812703_813842_813966_816412_816557_819639_819758_821546_821729_828081_828217_830054
760688	SIRV4	-	221	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1300	0	1300	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3858	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
760689	contig_14450_pilon	-	2002	1	Intergenic	novelGene_48962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATAAAAATAAAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038709	1036707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1036700_1038700
760690	contig_7171_pilon	+	953	8	Intergenic	novelGene_101316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	147.39340665895	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	64	726	1077108	1088214	FALSE	15	AGATGCTGTTGGCAGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDTVPARSAAPARVWKASVVMAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDTALGDQDPEEQH	1077044	1088441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088176
760691	contig_5023_pilon	+	1974	4	Intergenic	novelGene_7130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	315.146879336533	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGGGTTTGTCATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323609	360340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330
760693	contig_7202_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_18343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCCAGACGCCGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27638	27839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
760695	contig_5047_pilon	-	1343	6	Intergenic	novelGene_158011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	17.7696370249929	214	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	379	996	1671909	1666216	FALSE	15	TTAAGCTTCTCTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDNAGLRLDCTFSLPRSSQLNTTGSTRRRDSYRNSKTKIVPTPTNQFKIPKFSTGESPFSATPQHPREQRPQSCASAGRVVHSTPVRHWSGPTSQSLLPSARTPVSTKRLLAVPTPASHRLSGLPLMTLRTMPRALASPWCASARRLSSEPKKRSGARNQPTTESSTKGTSRPSDPSSDSFSPPSAVPQALNFSPEKRDFTFSKNITEATLTEAKTTGNTPLNEALLVDTQLNQLTIAPKAESGPLADPLLIDFCNTPEANGGQLLLKPSVALESESKPLIDLMINTPDMNKDVALKPLQVVGQLIDLASPLIQLSPAADKENVDSPLLKF	1682681	1665868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1666300_1666837_1667078_1668204_1668404_1671814_1672052_1674021_1674095_1682518
760699	contig_11269_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_145811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268605	266150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_266200_268600
760700	contig_6102_pilon	+	2428	13	Intergenic	novelGene_32236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1898	2260	919736	926192	TRUE	30	CAAGAATTGGCGGGAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSPSRIYPETMLKSKVLLQCSVDDAHGHCHEGPTLRTYVCRTTTSPHIIIVCHINVKHQLFFLSLESSQLHCIVLTGSVGIYCTYINLVWIHFLHLLFQITLVVEGLVTNVNIIFQCE	909465	927137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_910626_912576_912676_914069_914153_914802_914875_916456_916597_916761_916855_917934_918047_918992_919049_919653_919792_920568_920643_920713_920821_926066_926225_927001
760701	contig_9828_pilon	-	2513	12	Intergenic	novelGene_172256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_11	99.9652832299277	143	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	188	1762	242525	220693	FALSE	35	AAGACAGAATTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSFLVLAIGACLTNSLVPEKEKDPNYWRVQAQETLKTALELQNLNTNVAKNIIMFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHKPGEETILEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVGVSAATERSQCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSDNEMPPEAVSQGCKDIAYQLMHNIKDIEVIMGGGRKYMFPKNRTDVEYEMDEKARGTRLDGLNLINIWKSFKPRHKHSHYVWNRTELLALDPHAVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNTTDPSLSEMVRVAIKILKKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEVVEMDQAIGQAGTMTSVEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMVSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAIFSKGPMAHLLHGVHEQNYIPHVMAYAACIGANHNHCALDNSVGSPSPGPLLLLLALLPVSILF	290736	219941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_220959_221886_222007_222538_222731_225008_225144_227756_227827_230196_230341_233853_234030_235028_235204_236911_237028_237305_237426_242464_242620_290643
760702	contig_12746_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_152195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621576	623766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_621600_623800
760703	contig_5947_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_101553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAGTTTTGAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615109	612365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_612400_615100
760705	contig_6805_pilon	-	1340	5	Intergenic	novelGene_163896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	68.287535465852	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAACGCATGTACACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448111	432727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_432998_434586_435017_442598_442695_446227_446383_447722
760708	contig_6710_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_96589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653703	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
760712	contig_12414_pilon	+	2288	9	Intergenic	novelGene_59629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_1	289.811900204253	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	26	1402	653015	678202	FALSE	40	ACAATGATTCAGCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAAAADPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPARHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGVRGLRALGVRDLSYRLVFLACSVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNVRIF	652989	679088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653122_655641_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045
760713	contig_6048_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_73226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCCCAGCGGCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1757059	1755853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1755900_1757100
760714	contig_16525_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_133878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCAGCTGTCTTATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186057	187952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_186336_186423
760716	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760717	contig_6589_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_26144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_2	7966.42822516256	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	185	424	1886667	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPSGREDGGHSDRACLPKAADHLPKQKEGPAGRNWQGEAPALLQEHRFGFQDTQGGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885100	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886652_1886783_1887705
760718	contig_8153_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_34812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACTAATTAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152171	151621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_151600_152200
760719	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	183	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760720	contig_8064_pilon	+	923	4	Intergenic	novelGene_164558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_3	51.8459255872629	1566	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	204	524	117228	118276	TRUE	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYGAQYGFSLSAFSQASEPVSCTWWQLHLDPHLNVYSPSLPGNSNPRRNQLINLNHYATKKSVAESMLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101588	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_117149_117382_118109_118295_118823
760722	contig_6589_pilon	+	995	7	Intergenic	novelGene_26077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	54.911039165383	534	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	6	707	1865919	1874896	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVGPPLALLSLSRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRGL	1865913	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868960_1869046_1872601_1872787_1874884
760723	contig_8658_pilon	-	1312	6	Intergenic	novelGene_55817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1174.91963980521	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	52	477	55624	29954	TRUE	20	GAAGCAGTGTGATGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQQIVLQGPGPWGFRLVGGKDFEQPLAISRVTPGSKAAIADLYIGDVITAINGENTSNMTHLEAQNKIKGSSPTSTTTQLASTLLKTSPTSTTPWSQRRQPAGWRQMAARKSAQEYSSRPALGEVSHTWTRFAQAGERR	55675	5700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13116_13265_29919_30166_36555_36674_55528
760725	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760727	contig_8377_pilon	+	1324	11	Intergenic	novelGene_34916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4654.60908777526	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	987	1322	161364	172961	FALSE	30	TGTTCTCTACAAAATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSLIAFLVFLIIVTAIALL	68060	172963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_140770_140976_142257_142387_143450_143593_154887_154992_161226_161386_164383_164584_169245_169307_172908
760729	contig_7202_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_18298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
760733	contig_16870_pilon	+	907	2	Intergenic	novelGene_155491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	3563	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	250	597	104689	107688	FALSE	10	CTGCACCTCTCTTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGARFGAWKGPKNPLLSHPWVSAELQAPPRGCRASACERVLGKCSIGKLDDLPRFTEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQQQLGEASSDATH	104439	107998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104864_107515
760734	contig_9389_pilon	-	1277	4	Intergenic	novelGene_83878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.685646582908	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCGGGCTGGGCGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45302	35681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36504_39394_39535_40050_40206_45142
760735	contig_7410_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_106037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21670	19521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_19500_21700
760736	contig_13245_pilon	-	510	4	Intergenic	novelGene_148827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	119	478	26752	25454	FALSE	25	GTAAATTTTGTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26870	25421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
760739	contig_12123_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_144591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	331	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68964	67648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_67600_69000
760742	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_92156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760743	contig_6102_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_31986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1155	1454	418143	418442	NA	5	CTCACCCCCTTCTCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGALEGQEELSLRSDELSRLGRGPSGGGGLFLEPRSPWGRWVRGVWLAPHCGGGTGVTVPGLGAVGSGGSGVPGSVEKRKTISYREQGRGILATRQQN	416988	418937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_417000_418900
760750	contig_9554_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_170689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAAGAATAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101280	99345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_99300_101300
760754	contig_7962_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_149311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTTTTGTCTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444831	446294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_444800_446300
760755	contig_753_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_112896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAACCTAAGTGCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254301	252971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_253000_254300
760756	contig_13201_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_130878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATATAAGTGGGATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137221	136947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_136900_137200
760760	contig_10019_pilon	-	1758	2	Intergenic	novelGene_86680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1460	junction_1	0	22	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTCTGACTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261615	258353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356
760761	contig_9609_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_23085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455489	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_455500_456300
760762	contig_9651_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_162851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTCTATGGTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69008	67679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_-_67700_69000
760764	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	2	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760765	contig_7286_pilon	-	725	6	Intergenic	novelGene_108685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	5358.15555578596	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	24	614	293122	286991	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGQQTMDLSSPRKRYPPHHC	293145	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
760766	contig_5643_pilon	+	611	5	Intergenic	novelGene_38883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5483	junction_4	1746.9184296927	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	86	403	237390	237983	FALSE	10	GCCACCTCTTTGTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	237208	238191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
760767	contig_3866_pilon	+	1159	6	Intergenic	novelGene_112378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	127.040780854023	235	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATTTCAATGCACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101651	128919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_101767_104947_105038_105194_105327_126561_126627_127157_127254_128258
760772	contig_8616_pilon	+	1281	9	Intergenic	novelGene_72494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_6	518.875090339669	10	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	70	1014	322541	330805	FALSE	10	CTTCCTTGACTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPQGPEELTQSDVPEDGESPGDPSGTEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGEGHLELLPGWSGEEAEPQRKQHWAVVF	322471	331072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330467_330546_330638
760776	contig_16798_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_172266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAAAAGACCCAGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207244	208050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_+_207200_208000
760778	contig_9297_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_69880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	367.492162904079	1	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	952	2001	910891	912661	FALSE	45	ATTGAAGATTTCAAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDAD	909028	912661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910624_910714_911101_911207_911446_911700_911869_912227
760782	SIRV4	-	419	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1104	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
760784	contig_9609_pilon	-	1539	3	Intergenic	novelGene_23102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	1.5	256	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	78	419	504563	502955	FALSE	35	CACAAGAGTGACATCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASGSKARGLWPFASAAGGSGSEAPGAAGADQALMRSRGRAVPPFVFTRRGSMFYDEDGDLAHEFYEETVVTKNGQKRAKLRRVHKNLIPQGIVKLDTPRIHVDFPVILYEV	504640	501834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_503021_503190_503312_504408
760792	contig_8616_pilon	+	2690	9	Intergenic	novelGene_72545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	19.0849253338859	19	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	56	2674	410601	424565	FALSE	30	GGGCAATAAAGCTGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDSDVESLPRGAFRCCLCRITTANRPSLDAHLGGRKHRHLVELRAARKAQGLRSVFVSGFPRDVDSTQLSEYFQAFGPVASVVMDKDKGVFAIVEMGDVGAREAILSQPQHGLGGRRLRVRPREQKEFQSPAFRSPRGAAPDSHQLARALAEVPDVEAQMVKLVGLRELSEAERQLRSLVVSLMQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410545	424581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412295_419168_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
760793	contig_16411_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_77282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTGCTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37405	38045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_37400_38000
760795	contig_5602_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_133004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTGAAATTTTACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352875	353202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_352900_353200
760796	contig_4982_pilon	-	2158	12	Intergenic	novelGene_172227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	148.526370199464	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	742	1188	37008	23083	FALSE	35	AGCATTATGTTTGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAMQKKYYKAILMKDLDAFENEMTKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEIGDHLIEASGKLHLLDKLLAFLYSRDHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQQPIFIFLLSTRAGRPCRH	80228	22112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_23214_24591_24666_34419_34517_35931_36025_36956_37113_37733_37792_39258_39341_43972_44005_44628_44744_54319_54420_63954_64068_80091
760797	contig_401_pilon	+	1858	1	Intergenic	novelGene_42737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAAAACTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133968	135826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_134000_135800
760798	contig_14353_pilon	-	1619	2	Intergenic	novelGene_82107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAGAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81605	79827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80203_80361
760799	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760800	contig_9482_pilon	-	1474	4	Intergenic	novelGene_44328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	155.371240009927	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	62	373	1244459	1242438	TRUE	35	TTACCAATACTTAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGSWPEPCWRRQNSCWTAGSTPSGSPMAMSRPPASPLSTWTSSATVSSWTWWTPSP	1245375	1240166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1241234_1242403_1242603_1244312_1244471_1245325
760801	contig_5083_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_151646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTGAGACCCCCGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257259	255894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_255900_257300
760802	contig_16883_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_161722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACATACGTAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164023	166403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_164000_166400
760805	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760806	contig_6302_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_171706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCAACCTACTTGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224988	222894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_222900_225000
760807	contig_4486_pilon	-	1840	8	Intergenic	novelGene_38544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_7	195.655465613639	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	656	1762	177451	130815	FALSE	25	ATTTATAACTTTCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMEHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	178298	130736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132279_132604_143870_143994_156241_156397_162084_162163_177304_177724_177915
760816	SIRV6	+	340	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	532	-1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
760818	contig_10235_pilon	-	1278	5	Intergenic	novelGene_46621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	138.791885569726	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	145	627	610325	609176	FALSE	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKRAQEGEEDGEQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSAPPSPPPGNRHTALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610679	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609738_609955_610056_610280_610329_610538
760819	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	384	-2	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
760821	contig_1406_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_25646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCTTCTGTGAGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2717012	2718047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2717000_2718000
760822	contig_15570_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_137858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694365	692389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_692400_694400
760826	contig_11227_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_163200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTATGGTTAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288181	289466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_288200_289500
760832	contig_9505_pilon	+	1492	13	Intergenic	novelGene_121816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	47.8402288874123	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	125	1327	404142	447348	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNVFQHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404017	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_423399_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
760833	contig_8303_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_154923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46830	48375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_46800_48400
760834	contig_6589_pilon	-	702	8	Intergenic	novelGene_25918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.855776140733	54	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	69	701	1178015	1158509	FALSE	40	TAAAAACCACCTGCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNWTLPPRTQTTRSPPPIITCLSSAAPDHPQVP	1178083	1158507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158600_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
760840	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
760841	contig_19352_pilon	-	1828	5	Intergenic	novelGene_122363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	697.841314340159	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCTGTAATAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123102	102901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_113281_113363_122738
760845	SIRV6	+	543	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
760846	contig_13894_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_62209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTTGCAATCTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754269	754006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_754000_754300
760859	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1206	3	1206	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3952	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
760868	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760875	contig_10196_pilon	-	1443	11	Intergenic	novelGene_132028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	41.3193659196266	254	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	103	1332	403287	396110	FALSE	10	CCTGTGCCATGGACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGGEGPSRAPVLQFTNCRLLRGGRLLREDLWVREGRILDPEKLFFDERRLADRQQDCGGCILAPGFIDVQINGGFGVDFSLATEDVGSGVALVARKILSHGVTAFCPTLVTSPPEVYHKVLPQIPVKRGGPHGAGVLGVHLEGPFISRQKRGAHPEAYVRSFEANAFHDVLATYGSLDNVCILTLAPELDRSHEVIQELTARGIRVSLGHSVADLRTAENAMQSGATFITHLFNAMLPFHHRDPGIVGLLTSDQVPPGRHIFYGMIADGIHTNPAALRIAHRAHPQGLVLVTDAVPALGLGNGRHTLGQQVVEVDGLSAYVAGTKTLCGSIAPMDTCVRHFLQTTGCSVESALESASLHPAQLLGLEKHKGSLDFGADADFVVLDDALHVQATYISGERVWQAEVAGQ	403389	395998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_396199_396402_396505_396714_396784_396934_397043_397115_397261_397336_397426_397495_397709_397886_397942_402735_402876_402952_403090_403204
760876	contig_18719_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_172269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTTTAAAACGACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18719_pilon_+_0_600
760878	contig_16110_pilon	+	1522	6	Intergenic	novelGene_126767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_5	358.315280165387	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	115	720	6170	53407	FALSE	45	AAAAAAAAGGATTGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPTKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNGKLHLLKLVLCGYLILRTKTYMLSK	6055	54209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_6193_7704_7769_9530_9615_14413_14538_32691_32771_53175
760883	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	410	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
760884	contig_8075_pilon	+	2108	5	Intergenic	novelGene_42492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	242.920125761535	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTTTTTCAAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664002	690847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_676710_676802_677759_677808_685219_685372_689105
760885	contig_8415_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_141683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGTAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40833	42032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_40800_42000
760886	contig_1443_pilon	+	980	2	Intergenic	novelGene_28170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	216	680	344128	344592	FALSE	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343533	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
760889	contig_14353_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_82071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTGTGTTTCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43286	42308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_42300_43300
760902	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
760903	contig_7272_pilon	+	1919	5	Intergenic	novelGene_25398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.6205226928793	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTTTGTGTTTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760845	770646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_760874_763506_763580_766056_766124_767159_767264_768999
760905	contig_6375_pilon	+	1755	9	Intergenic	novelGene_72947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	47.9868145952615	22	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	18	890	196329	200635	TRUE	15	CACTGCTTCTGGTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLMCGRREILLLLRSQRQFHRVAGPSHWPQKPLTSRLPFPAGQNYGRPHYVLAAAGPRCLSTSAVSFAEAQVQASPPAVPVTPSPTAVTEVAPGETADVVQAAAEQSFAELGLGSYTPVGLIQNLLEFMHVDLGLPWWGAIAASTVLARCLVFPLIIKGQKEAAKIHNHLPEIQKFSTRIREAKLAGDQAEFYRACSEMTLYQKKHDVKLFRPLILPLTQAPIFLSFFIALREMANLPVPSLQTGGLWWFQDLTVSDPTYVLPLVVTATMWAVLEVSPGWPVPGLQS	196311	201777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_196392_196745_196905_197540_197758_199548_199693_200148_200235_200431_200908_201018_201182_201262_201344_201428
760906	contig_11413_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_103212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTACACTATCTGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798473	800613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_798500_800600
760912	contig_11986_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_69126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGACCGGGGACCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134144	132666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_132700_134100
760919	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
760922	contig_10135_pilon	+	1456	7	Intergenic	novelGene_106669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	222.790197769611	4008	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	24	701	222438	270079	FALSE	30	CTCTCCTTGAAATCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMEQFWSKNTGSNRPLSPHITIYSWSLPMVMSVCHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGNFESHLELVKSLCLGPAVIYTAKFALVSPLMYHTWNGIRHLQRLTQLTNQIKGMAHMVVEAGEFQIRGSGVGFSIPSCLQGPAGQTIGCWLTRLRKLMWDLGKGLKIPQLYQSGVAVFILTVLSSLGLAAM	222414	270834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222458_227989_228047_233654_233757_246597_246660_265108_265273_267181_267350_269974
760927	contig_10904_pilon	+	1589	3	Intergenic	novelGene_22482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	919.5	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	76	1044	149100	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	146152	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097_150542_151512
760931	contig_12969_pilon	-	2434	6	Intergenic	novelGene_61686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	212.50694106311	5	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	776	2119	494387	493044	FALSE	25	GTGGAAAAGCCTTGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHCQGHNVFGNIVYQRKSHFPLRQNHDIFDLCGKTLKSNLYLVNQSRSFEVKKPHKANGGGKSFLHTKHEQFHPEIKFPECGKPLNTKSQFIKHQRTHKIDKPHVCSECGKAFIKKSRLIDHLRVHTGEKPHGCSVCRKAFARKSRLTEHQKSHIREKHYACTECDKTFPKKSQLIIHQTAHTGEKPYVCNECGKDFVKKSRLINHQRVHTGEKPHGCSICEKAFARKSRLIEHQRTHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKTHTGEKSYICSDCGKGFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLLIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKTCLISHQRFHTGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYICSDCGKAFRDKSCLNRHRRTHTGEKPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCIGSVKV	512311	492728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_494450_501410_501559_504289_504386_504665_504793_508997_509204_512175
760932	contig_11702_pilon	-	1092	7	Intergenic	novelGene_142013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	51.9660679888542	894	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	304	978	535169	531292	FALSE	10	TCTGTGTGTGAGTGTGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMQHCNLLCLPENYQMKYYFYHGLSWPQLSYIAEDENGKIVGYVLAKMEEDPDDVPHGHITSLAVKRSHRRLGLAQKLMDQASRAMIENFNAKYVSLHVRKSNRAALHLYSNTLNFQISEVEPKYYADGEDAYAMKRDLTQMADELRRQLELKEKGRHVVLGPIENKVEAKGNSLPSSGEACREEKGLAAEDSGGDSKDLSEVSETTESTDVKDSSEASDSAC	535472	531177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_531529_532311_532397_533590_533636_533818_533935_534024_534071_534740_534800_535082
760935	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
760937	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	6	409	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760939	contig_13865_pilon	+	2062	2	Intergenic	novelGene_122746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGTACTTGTATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67659	70066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_68173_68517
760944	contig_6227_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_49676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841450	840470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_840500_841400
760946	SIRV6	+	379	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	581	2	402	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
760947	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
760949	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_96002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
760952	contig_11115_pilon	+	1422	7	Intergenic	novelGene_102843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	632.53574778207	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	638	1408	171704	173314	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFRPELRASGIPGQRPRGCWLYPWSPHQ	165633	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172872_173232
760955	contig_9753_pilon	-	1131	6	Intergenic	novelGene_41324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_3	309.966836935824	51	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTATGGGGTACATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93286	69991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70838_73254_73317_85817_86095_86172_86247_93251
760959	contig_7452_pilon	+	982	6	Intergenic	novelGene_109143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	579.883781459699	3153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	22	471	118756	192732	TRUE	25	TGCTGTATTCCAAGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLTAALLIWALLLPKGGSGEAWPIHTACKDSSLEVLYQSCDPLQDFGFSIDQCSKDLKPNLSIRLGLILRENIKELFLDIALLTKGSSILNFSYPICEGDHPKFSFCGRSKGEQLYYVGPVNNPGLLVPEPPPHPLVLFVTIQSSSW	118734	196827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_118883_155887_155975_158022_158152_191492_191546_192678_192790_196373
760961	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	15	1151	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
760963	contig_11417_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_103262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCTCCCACAGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275939	274069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_274100_275900
760967	contig_7870_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_108991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447349	446007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_446000_447300
760970	contig_9389_pilon	-	446	4	Intergenic	novelGene_83941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1	444	167414	163690	FALSE	15	AGGCCGGTGAGTTCCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRTVLGVIDLPAQAKDLAALVGALRVTHLQGHGGVVTLVGAQLGVIDVPPGPWGCHAHLAGTLVGAHLEADGGVVHGWQDVVLGVVEVASHPVGRHARLAGTFVGAHLQPDDALARLHGGIVEVPLLPLRVFNTDVHAALQPLCLGR	167414	163687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_163696_165815_165927_166068_166228_167246
760975	contig_11285_pilon	-	1554	4	Intergenic	novelGene_5498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	0.816496580927726	346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	42	836	508480	505872	FALSE	10	ACATTTGGCTTTGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLIMQLGSVLLTRCPFWGCFSQLMLYAERAEARRKPDIPVPYLYFDMGAAVLCASFMSFGVKRRWFALGAALQLAISTYAAYTGGYVHYGDWLKVRMYSRTVAIIGGFLVLASGAGELYRRKPRSRSLQSTGQVFLGIYLICVRGFSACWRVFEQTVCLQAYSLQHSKEDRQAYLNHLPGGELMIQLFFVLYGILALAFLSGYYVTLAAQILAVLLPPVMLLIDGNVAYWHNTRRVEFWNQMKLLGESVGIFGAAVILATDG	508521	505153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_506232_506861_507009_507875_508057_508373
760979	contig_10636_pilon	+	1965	4	Intergenic	novelGene_172277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	18.5472369909914	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	87	548	119959	132654	FALSE	35	ATTTCAAAAGCTCTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGLCRDSGAAGLVLLRAGRGERGGGANMNVGVAHSEVNPNTRVMNSRGMWLTYALGVGLLHIVLLSIPFFSVPVAWTLTNVIHNLGMYVFLHAVKGTPFETPDQGEARLLTHWEQLDYGVQFTSSRKFFTISPIILYFLASFYTKYDPTHFILNTASLLSVLIPKMPQLHGVRIFGINKY	118184	134071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_118264_119951_120133_126019_126172_132518
760983	contig_610_pilon	-	1305	3	Intergenic	novelGene_76750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.5	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	56	424	252557	214383	FALSE	30	TCATATTGTCAAAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVAQAHLN	252612	213501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214403_220517_220785_252475
760990	contig_13421_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_166798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTATGATGCCCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33601	35498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_33600_35500
760992	contig_8289_pilon	-	818	2	Intergenic	novelGene_171184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCAGTAGTTCGGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252109	250666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_251361_251985
760993	contig_6272_pilon	-	2606	2	Intergenic	novelGene_160454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTCCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172608	169492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_170940_171449
760995	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	53	523	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
761000	SIRV4	-	252	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1266	3	1266	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3892	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
761001	SIRV6	+	501	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761003	contig_5231_pilon	-	1338	10	Intergenic	novelGene_65895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	142.664330198936	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	22	1164	222247	209022	FALSE	50	TAACATAGAATGTGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSYFFLMLLPILPSKEYKEELPHTYAPWISIARNLPVLIENGQLRAEVEKLSQLSIDELRGHKLQRLAHLVLGYITMAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEL	222268	208847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209028_209151_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283_219380_222211
761004	contig_14300_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_133100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169965	172021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_170000_172000
761005	SIRV6	+	524	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	23	14	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761006	contig_12873_pilon	+	1727	7	Intergenic	novelGene_27199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1328.47423970341	1	101	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	348	959	16357	18994	TRUE	25	CTTAATATATGTTTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKA	16009	20350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18989_19264_19611_19703_19851_20187_20277
761008	contig_14441_pilon	+	906	4	Intergenic	novelGene_100584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	9	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	291	719	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111198	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111317_116555_116963_117220_117344_117539
761014	contig_2890_pilon	-	1254	11	Intergenic	novelGene_60289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	495.372627423034	8510	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	100	927	370865	336651	FALSE	25	AAACTCTGTTTAGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGFSSEERAAPFTLEYRVFLKNEKGQYISPFHDILPRWSNAKMEIATKDPLNPIKQDVKKGKLRYVANLFPYKGYIWNYGAIPQTWEDPGHNDKHTGCCGDNDPIDVCEIGSKVCARGEIISVKVLGILAMIDEGETDWKVIAINVDDPDAANYNDINDVKRLKPGYLEATVDWFRRYKVPDGKPENQFAFNAEFKDKDFAIDIIKSMHDYWKALVTKKTDGKGISCMNTTVSESPFKCDPDAAKAIVDALPPPCESACTIPTDVDKWFHHQKN	370964	336323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_336683_337286_337330_338549_338620_341426_341513_341986_342115_351451_351579_352504_352592_355560_355681_356537_356567_368271_368314_370801
761015	contig_6327_pilon	+	1824	5	Intergenic	novelGene_147476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	305	junction_3	58.0215477215146	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	333	1220	17019	33871	FALSE	75	GCAAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEVPSQPPSPSSSPPTSPEPELVQLRRKVEKLERELRSCKRQVQEIERLLHHTERLYQSAESNNQELRTQVEELSKILHCERNEDNKKSDVEVQTENHTPWSISDYYCQTYYKDISFPNKATELSVQQSQDTEASTFNSKEQSQIEDDAYTGADITENVECRQEDTFPSNSQESASVLTTEDTSLEGSSLAESLRAAAEAAVSQTGFSYDENSGLYFDHSTGFYYDSENQLYYDPSTGIYYYCDVESGRYQFHSRVDLQTYQTCSMRQSKDKKLKKKRKDPESATSEEKVISS	16686	34475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_17235_20376_20480_21489_21693_24031_24197_33670
761016	contig_14925_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_55059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAACGTATAATCTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6678	7469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_6700_7500
761017	contig_14925_pilon	+	2900	1	Intergenic	novelGene_55060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCCCAGTCTTATCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7419	10319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_7400_10300
761018	contig_10235_pilon	-	1358	11	Intergenic	novelGene_46544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	28.9939648892662	461	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	955	1287	414495	412423	FALSE	5	TCCCTCAGCCTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTLLRGAFSPFGNIIDLSMDPPRNCAFVTYEKMESADQAVAELNGTQVESVQLKVNIARKQPMLDAATGKSVWGSLAVQNSPKGCHRDKRTQIVYSDDVYKENLVDGF	418209	412351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_412521_413882_413986_414227_414283_414418_414564_414689_415016_415194_415233_415339_415415_415912_416059_416159_416230_417555_417702_418124
761019	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761020	contig_10437_pilon	+	952	5	Intergenic	novelGene_38304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	118.897014260241	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	48	737	431167	444012	FALSE	15	ATTCTTCCTGTATATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMVRHKEMFCADP	431119	444227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748
761021	contig_6589_pilon	-	1510	4	Intergenic	novelGene_26054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGAAATGACTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1731812	1725983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1727039_1727174_1727248_1727816_1727929_1731542
761022	contig_14415_pilon	+	780	5	Intergenic	novelGene_77600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	208.927469472063	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	169	621	33410	46724	FALSE	15	AACCTTCGTAGTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWVTAFKSTRSQGQKTPDKAESFLPSENFQCGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEENPQDHQMLRQGSLRKPALILERRKPTRLQRAQDHNLPSLRGCSFRSPLKKNQNAPPNKDYAFSTLTQLEMDLVKFVSKVRSLKVAVATSSNLRLQRAGLPADPDNNVTIYEIWGEEESD	25119	46883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_25210_33331_33446_35937_35993_36100_36199_46460
761023	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
761024	SIRV6	-	535	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1203_1616_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
761025	contig_10103_pilon	+	1763	14	Intergenic	novelGene_86156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAATAAAAGAAGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638335	656032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_638628_642594_642735_644396_644500_644796_644899_645101_645238_645636_645751_649862_649967_651344_651456_651629_651734_653442_653646_654456_654569_654693_654772_655131_655243_655979
761026	contig_14142_pilon	-	1197	7	Intergenic	novelGene_120634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	422.885097343895	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	151	615	622927	620914	TRUE	20	AGTCCCCAACTCAGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625167	620097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620278_620340_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625038
761027	contig_13292_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_142967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420538	418540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_418500_420500
761028	contig_10531_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_114543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540215	540674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_540200_540700
761029	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761030	contig_9363_pilon	-	1843	6	Intergenic	novelGene_6486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_3	77.8562778457845	145	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	521	1744	377097	372391	FALSE	20	AATGATGTTTCTGTGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDLPSAGNRKASSSACPGSEARYKMKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	405787	372291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_374687_376997_377125_391162_391288_397284_397367_405501
761031	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_94394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
761034	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
761037	contig_5236_pilon	+	1914	2	Intergenic	novelGene_100874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGGGTTTAGTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34272	36306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_35702_35821
761039	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_92059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761046	contig_2310_pilon	+	2190	8	Intergenic	novelGene_71620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	33.5340217129544	119	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	469	999	175685	184473	FALSE	10	TGTTGCCAGCACCCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPKSSSEPVVHAPGPPSTSATLSPDSSLSSSGELVQPSTDRTPQASPGLITNTRGSPGSQAAKPCSGTVPTPILLVGDRSPAPSPGTSSPQLQVKSSCKENPFNRKASPAASPTTRKATKGPKPARPPAPGHGFPLIKRKVQADRYIPEEDIYGEMDTIERQLDALEHRGVQLEEKLRSGVNESHEDDMLVDWFKLIHEKHLLVRRESELIYVFKQQNLEQRQADVEYELRCLLNKPEKDWTEEDRSREKVLMQELVTLIEQRNAIINCLDEDRQREEEEDKMLEAMIKKKEFQKESEPEGKKKGKFKTMKVLKLLGNKRDTKSKSPEDKS	172085	185664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_172374_174919_175055_175639_175767_175882_175974_176134_176209_182458_182574_182839_182887_184351
761048	contig_8284_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_125727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAAATTGGGAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481339	482008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_481300_482000
761057	SIRV4	-	267	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1256	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
761058	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761059	contig_8420_pilon	+	1028	6	Intergenic	novelGene_69340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	342.557206901271	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10932	58932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14842_39069_39177_41728_41918_51048_51183_58546
761063	contig_500_pilon	+	1277	6	Intergenic	novelGene_31118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.7962956610126	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	102	815	1706339	1737122	FALSE	40	AAAATTTTTTACAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQNAVLSQGENVKEKEMDDGTQIVRSQESVTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKSLYRDVMLENYRNLVALGHQLYKPEVITQLEQEEQWIMESKSLPDTHPGDQSHIMSVVRSSVHAKWIVGRVIGTAMQKTAKVRVTRLVLDPYLLKYYNKRKTYFAHDALQQCTVGDIVLLKALPVPRSKHVKHELAEIVFKVGKVIDPVTGKPCAGTAYLESPISSEPTHLTERLKELTISAQ	1685825	1737584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1685926_1706337_1706426_1723465_1723593_1724325_1724419_1735057_1735198_1736855
761065	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
761067	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
761073	contig_7866_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_171193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGAACATAATTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217797	218132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_217800_218100
761074	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
761075	contig_6375_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_73039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCAGGTCTTTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484733	488365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_486624_488036
761076	contig_8907_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_85829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGCACCTTGGAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430520	430915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_430500_430900
761077	contig_14196_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_169967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATCCCATACAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56426	55761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_55800_56400
761078	contig_4797_pilon	+	677	6	Intergenic	novelGene_6915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3510.01908826718	3782	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368346	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368848_369707_370026_370914_371016_371676
761079	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761080	contig_14101_pilon	+	2617	15	Intergenic	novelGene_122755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	40.2056575367097	119	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	221	1654	197325	247459	FALSE	30	AGTGCTGGTAAGTATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLTEDITRYYLCLQLRADIITGRLPCSFVTHALLGSYAVQAELGDYDAEEHVGNYVSELRFAPNQTRELEERIMELHKTYRGMTPGEAEIHFLENAKKLSMYGVDLHHAKDSEGIDIMLGVCANGLLIYRDRLRINRFAWPKILKISYKRSNFYIKIRPGEYEQFESTIGFKLPNHRSAKRLWKVCIEHHTFFRLVSPEPPPKGFLVMGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPFFERSSSKRYTMSRSLDGAEFSRPASVSENHDAGPDGDKREEYGESGGRQSEADDGEVRTPTKIKELKFLDKPEDVLLKHQASINELKRTLKEPNSKLIHRDRDWERERRLPSSPASPSPKGTPEKANEPVKTETMTVSSLAIRKKIEPEAVLQTRVTTVDTTQVDGSAPGGKEFITTTPSITTETISTTMENSLKSGKGAAAMIPGPQTVATEIHSLSPIIGKDVLTSTYGATAETLSTSTTTHVTKTVKGGFSETRIEKRIIITGDEDVDQDQALALAIKEAKLQHPDMLVTKAVVYRETDPSPEERDKKPQES	194533	248422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_194558_197128_197348_200345_200434_201264_201418_202623_202722_203605_203782_206409_206559_209229_209413_223081_223187_225325_225407_237560_237648_238505_238590_240688_240770_241110_241228_247450
761085	contig_567_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_33996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCTAAAACAGATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457010	458806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_457000_458800
761086	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
761087	contig_8020_pilon	-	2541	9	Intergenic	novelGene_114380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	70.8147892392543	1	127	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	126	593	151654	151187	TRUE	0	CCCTGTCTCTCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCAVSAAARPVWTGLEMALWAPRYHRDTQGAMTWLLGYDGECRGPRDQNRLVTWELSYHSDAKSAMTRMLGAAGARVSQLGRHQGTTEQTAFPMWPLGPLGAVLVVEALRNPESSKAAPPCPSPLLVFSPVLVSLCPMPDPRTGCCAPHPGAD	153240	146876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148428_149108_149185_149828_149914_150255_150315_150547_150618_150901_151044_151127_151708_153168
761089	contig_3077_pilon	+	1458	2	Intergenic	novelGene_26897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTTCCTAGTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522868	1525061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1522955_1523689
761092	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_93464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
761094	contig_13245_pilon	-	799	3	Intergenic	novelGene_148819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	4226.5	16729	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26870	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26457_26749
761096	contig_5434_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_74685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAAAGAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360337	360735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_360300_360700
761105	contig_15410_pilon	-	990	7	Intergenic	novelGene_130582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	97.4965811366395	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	196	837	57724	54277	FALSE	20	TTCCCCAAGCAATTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59266	54123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55407_57700_57870_59216
761106	SIRV6	+	180	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	404	11	-234	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCTTCCACACCACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
761113	contig_5765_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_141397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTCAAACTGCTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690333	691200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_690300_691200
761114	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_96098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653844	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761116	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761118	contig_16870_pilon	+	2388	11	Intergenic	novelGene_155531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_6	23.8807453820018	116	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	166	1701	269340	288901	FALSE	15	CTTGACTCCCTCTAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFASTVQRHPDKTALIFEGTDTHWTFRQLDDYSSSVANFLQALGLASGDVAALFMENRNEFVGLWLGMAKLGVEAALINTNLRRDALRHCLTTSQARALVFGREMAPAICEIHASLDPSMSLLCSGPWDPSEVPAGTKHLDPLLEDAPKHPPSAPDKGFTDKLFYIYTSGTTGLPKAAIVVHSRYYRMAALVYYGFRMRPDDIVYNCLPLYHSAGNIVGLGQCLLHGMTVVIRKKFSASRFWDDCIKYNCTIVQYIGELCRYLLNQPPQEAENQHRVRMAIGNGLRQSIWTNFSSRFHIPQVAEFYGATECNCSLGNFDSQVGACGFNSRILSFVYPIRLVRVNEDTMELIRGPDGVCIPCQPGEPGQLVGRIIQKDPLRRFDGYLNEGANNKKIAKDVFKKGDQAYLSGDVLVMDELGYLYFRDRTGDTFRWKGENVSTTEVEGTLSRLLDMADVAVYGVEVPGTEGRAGMAAVANPAGSCDLEHFAKVLEKELPLYSRPIFLRFLHELHKTGTYKFQKAELRKEGFDPAVVKDPLFYLDSRKGCYLPLDQEAYTHIQSGEQKL	269174	289588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_269500_272650_272810_276155_276226_276320_276413_280382_280493_280777_280988_281140_281268_281980_282119_282358_282524_282609_282757_288743
761120	contig_12503_pilon	+	2252	2	Intergenic	novelGene_143839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGACGCCTGGCCTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178213	180504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_178427_178465
761121	contig_10197_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_115248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999779	1001988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_999800_1002000
761122	contig_12265_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_149444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTGTAACACAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50211	47597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_-_47600_50200
761125	contig_11250_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_127165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232333	229952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_230000_232300
761130	contig_7207_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_72062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGTTAAGAGTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655360	656453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_655400_656500
761131	contig_7207_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_72063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTCAATCACAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656903	657650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_656900_657600
761135	contig_10197_pilon	-	1115	7	Intergenic	novelGene_115216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1291.08680532677	120	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	96	863	952331	910531	TRUE	30	AAATATTATTGCGCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952426	909615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_909801_910463_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
761136	contig_14341_pilon	+	2918	9	Intergenic	novelGene_111873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_8	98.9254770016299	53	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	160	1128	643603	654022	TRUE	15	TCTAGTGATGCTCTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGTGAVLEESELCLRTEDVRNARRLRTLVRSLKKLVKLHRVLNRVSCERKFVSMGRTRENPCREFFKYEKIENKSTCKICNTDMVGDHAANLERHLKRHHTDEYNAVQSKKTKKIEESVRSVPNKQQKTLDEFAEYAVPECLKVPPGSSNKTSHTRMPSPLGPLRLPPVDPTATLEELEAARLSFRQFRYQEAAGPHEALARLRELCHQWLRPEVHSKEQILELLVLEQFLGVLPPEIQAWVREQLPGSPEEAVALVEELQHDPGRLLGWITAHVLGREVLPAAQKTEESSGSPLPSGTVEPSGPAPGEGPQVAQMEGPAQLICSVKKEPDADGQEMAPPGPLLPAQSPERRLEHQKPTSTSFLPPRIQVSSPRW	642291	657325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_642316_642679_642814_643601_643873_652987_653369_653458_653661_653906_654557_655653_655739_656050_656153_656256
761137	contig_7912_pilon	+	2224	4	Intergenic	novelGene_129572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1617	1922	199508	200915	TRUE	40	AAAAGTACGCCGCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWWVFWVHGPAMGVLICDTPSTETLCSEGVSSSSTPCQQPGPGPLWAVLAGAGIISTWSGIQGSSPCSSWVTLCNLEDAIPSEAISAKFSSITLRYSSL	197891	216008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_199635_200206_200326_200855_200986_215776
761145	contig_8801_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_66274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417574	419273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_417600_419300
761149	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761150	contig_1275_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_108877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	138	371	747735	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747597	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747600_748100
761153	contig_10299_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_79806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTTCTCCCCTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845330	845776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_845300_845800
761154	contig_3424_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_55556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGTACTGGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377971	379874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_378000_379900
761157	contig_7657_pilon	+	988	3	Intergenic	novelGene_29997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_2	400	2794	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	244	684	64638	75050	FALSE	20	ACATGTCAGTGTTTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQAAKRANIRLPPEVNRILYIRNLPYKITAEEMYDIFGKYGPIRQIRVGNTPETRGTAYVVYEDIFDAKNACDHLSGFNVCNRYLVVLYYNANRVSIARVLVAWRAHLRISVELHRDGKCVLCIFVLFFFLASAIGEILLVVDH	64394	75354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_64668_66643_66763_74758
761159	SIRV4	-	317	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1204	0	1204	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761160	contig_10196_pilon	-	2479	21	Intergenic	novelGene_132062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_6	73.4564496827882	170	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	183	2195	733441	721848	FALSE	20	GCTAGGAGTGGGAGCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGQNARYNRFSGGPANLPAPDVTTGTRMETTFGPAFSAVTTITKADGTSTYKQHRRTPSSSSTLAYSPRDEEDSMPPISTPRRSDSAISIRSLHSESSMSLRSTFSLPEEEEEPEPLVFAEQPSVKLCCQLCCCVFKDPVITTCGHTFCRRCALKSEKCPVDSAKLTVVVNNIAVAEQVGELFIHCRHGCRVAGSGKPSAFEVDPRGCPFTIKLSARKDHEGNCEYRPVRCPNNPNCPPLLRMDLGAHLKECEHIKCPHSKYGCTFIGNQDTYETHLETCRFEGLKEFLQQTDDRFHEMQVALAQKDQEIAFLRSMLGKLSEKIDQLEKSLELKFDVLDENQSKLSEDLMEFRRDASMLNDELSHINARLNMGILGSYDPQQIFKCKGTFVGHQGPVWCLCVYSTGDLLFSGSSDKTIKVWDTCTTYKCQKTLEGHDGIVLALCIQGCRLYSGSADCTIIVWDIQNLQKVNTIRAHDNPVCTLVSSHNMLFSGSLKAIKVWDIVGTELKLKKELTGLNHWVRALVAAQSYLYSGSYQTIKIWDIRTLDCIHVLQTSGGSVYSIAVTSHHIVCGTYENLIHVWDIESKEQVRTLTGHVGTVYALAVISTPDQTKVFSASYDRSLRVWSMDNMICTQTLLRHQGSVTALAVSRGRLFSGAVDSTVKVWTC	741284	721563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_721863_721965_722086_722171_722304_722387_722508_722691_722815_722894_723012_723113_723154_724788_724872_725003_725132_725235_725285_725381_725456_725537_725756_726387_726523_726603_726788_727376_727411_727910_728004_728384_728502_730700_730793_732461_732520_733360_733479_741139
761163	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761164	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761168	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_95681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653732	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
761171	contig_17440_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_7606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGAATTCCGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
761173	contig_19640_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_134867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAATTGTTTGATAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84252	84933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_84300_84900
761176	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761177	contig_7933_pilon	-	687	3	Intergenic	novelGene_164699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	17682	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCTTTTTTAATAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198027	185679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
761179	contig_15236_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_141660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAATTGTACATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717854	715842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_715800_717900
761180	contig_10923_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_66224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_2	130	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	146	685	37327	42718	FALSE	10	CTTGTAGGTAGCTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	37181	42836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_37540_38578_38742_42554
761181	contig_8122_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_40272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCACAGAAGAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767019	766090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_766100_767000
761184	contig_19459_pilon	-	743	5	Intergenic	novelGene_59853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4665.13720993284	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19057	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6950_15512_15702_16203_16265_17587_17730_18988
761185	SIRV4	-	518	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	99	0	99	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	486	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5059	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
761187	contig_2027_pilon	-	996	2	Intergenic	novelGene_39879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	310	627	55814	53670	FALSE	20	GACTAGCTAGTGTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLPAVHVRWESTASRTVVAPPAITGKRPREPIIRWQEDPDPEDENLYEKNPDSHGYDKNPVVDLWNMRVVFFFGFSIVLVLGSTFVAYLPDYRCMGCPREWGG	56123	53300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_53835_55661
761188	contig_8697_pilon	-	1206	2	Intergenic	novelGene_83206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7372	junction_1	0	104	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATCTGGTGTTTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19222	16460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131
761193	contig_2791_pilon	+	1746	9	Intergenic	novelGene_172283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	13.2759180473518	111	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	172	1359	1399	29728	FALSE	20	AATTTTATTTTATTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVPEVTNVQNRKPTIQVLSSTVLPSTYHIRITTCKTELQQLIQQKREQCNAERIAKQMMENAEWESKPPPPGWRPKGLLVAHLHEHKSAVNRVRVSDEHSLFATCSNDGTVKIWNSQKMEGKTTTTRSILTYSRIGGRVKTLTFCQGSHYLAVASDNGAVQLLGIEASKLPKSPKIHPLQSRILDQKEDGCVVDMHHFNSGAQSVLAYATVNGSLIGWDLRSSSNAWTLKHDLKSGLITSFAVDIHQCWLCIGTSCGTMACWDMRFQLPISSHCHPSRARIRRLSMHPLYQSWVIAAVQGNNEVSMWDMETGDRRFTLWASSAPPLSELQPSSHSVHGIYCSPADGNPILLTAGSDMKIRFWDLAYPERSYIVAGGTSSPSVSYYRKIIEGTEVVQEIQNKQKVGPSDDAPRRGPESLPMGHHDIITDVATFQTTQGFIVTASRDGIVKVWK	1227	30115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2791_pilon_+_1442_3880_4047_13623_13789_18209_18422_20140_20273_23996_24098_24766_24856_25173_25283_29557
761196	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	0	406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761197	contig_9058_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_149369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCGGGAGTGACTTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82135	81913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_81900_82100
761198	contig_8122_pilon	+	2738	14	Intergenic	novelGene_40205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.0133953490118	61	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	319	2172	384937	408439	FALSE	20	TTTGATTGTATTTAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYQALDKYGNLSALGFKRQGKWERISYFQYYLLSRKAAKGFLKLGLERAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFAGGIVTGIYTTISPEACQFIAHDCRANVIVVDTQKQLEKILKIWKHLPHLKAVVIYQEALPKKMANVYTMEEFMELGNELPEEALDTIISAQQPNQCCVLVYTSGTTGSPKGVMLSQDNITWTARYSSQAGDIHPAEIQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLQEVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLSCPGSDLKPFMTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKSFYGAAPMTTETQHFFLGLNIRFYAGYGLSETSGPHFMSSPYNYRLYSSGKVVPGCRVKLVNEDAEGIGEICLWGRTVFMGYLNMEDKTCEAIDADGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMEVPIISNAMLIGDQRKFLSMLLTLKCTLDPDTSEPTDNLTEQAVEFCQRVGSKATTVSEIVGKKDEAVYQAIEEGIQRVNLNAAARPYHIQKWAILERDFSISGGELGHTMKLKRLIVLEKYKDIIDSFYQEQKK	351745	409005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_351874_372465_372567_384847_385069_385515_385605_385968_386090_397038_397120_397208_397359_397709_397887_398618_398801_399768_400000_400769_400988_405891_406032_406570_406818_408353
761199	contig_16870_pilon	+	815	4	Intergenic	novelGene_155499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	14.3836326735943	116	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCACCACTGCACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104501	107989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104578_104672_104864_107350_107425_107515
761200	contig_9609_pilon	-	1800	11	Intergenic	novelGene_23088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	38.0178905253829	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	133	1242	481425	477306	TRUE	0	TTCTGTGGTCCTGGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARKGNAPRKGSQRRGGGARSSAQADSGSSEDEAASEARSTTSECPSLLSVTAEDCLGGDAVDEQAQQEDLEDKLKEYVDCLTDKSAKTRQGALENLRLALASHLLPDFLLERRLTLADALEKCLRKGKGEEQALAAAVLGLFCVQLGPGPKGEELFHSLQPLLVSVLNDGTASPAARLHCASALSLGCYVAAADVQDLVSCLTCLEGVFSRACSVGGSTAPVAPASFHGLLCAALQAWALLLTICPSTHISHILDRKTLFMRRWRPSVVPCAPWPLTATSTGPRLTAGASAQLSALCCTLSRAASVRKRQSASGSRCSMWTAGPGAVSTPPSRMCWVLACTTTSRTMSYSVTSLVWALYWCWMLLL	481557	476604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477134_477276_477373_477447_477577_477649_477788_478265_478445_478528_478580_478748_478907_478988_479114_479222_479308_479392_479513_481367
761206	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	408	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3160_10727_10819_11031_11109_11205
761207	SIRV5	+	426	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7456	1	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
761210	contig_7045_pilon	+	1817	2	Intergenic	novelGene_77425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1443	1757	201005	201319	FALSE	40	TTACTCAGAAATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGTSVVGGGCNRAGQHFGHGCRTNLKILLDHLVAYPQEPLAGPSVTEAASPHLDVVKTGHFIHLQIEYDIEPMLEMPSFTLSAWNSFRSAIGPLFPKNKMKI	195342	201379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_195395_199614
761212	contig_17964_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_33935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTGGACATTGACTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660179	661396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_660200_661400
761213	contig_6710_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_90393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761216	contig_2062_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_139036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGATCAGGGGTGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181532	1183545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1181500_1183500
761221	contig_7106_pilon	+	1620	11	Intergenic	novelGene_148308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_3	220.771850560709	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1266	355	1620	421601	487839	FALSE	25	GTGGCAATCTCCTTGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDVCATCHEHATCQERGGKKICICNYGFVGNGRTHCADKNECQFGATVVCGNHTSCHNTLGGFYCICLEGYRATNNNKTFIPNDGTFCTDIDECEVSGLCRRGGQCVNTHGSFECYCMHGYLPKSGPEPFHPARDATSCTEIDCGTPPEVPHGYIIGNYTSTLGSQVHYVCKEGFFSGPEDTVSTCTALGTWESPELYCQEIDCGSPPEVQHAVLVGNHRSSLGSVAHYACQEGFESPGGKITSVCTEKGTWRESTLTCTEIITEISDVLVFNNTCMRWKINPGRMNARIVYVISIKGQRLNSMESVHKETVNLTTDSRTPEVCLDLYQGTNYTVSISTAPPRRSVPAFIGFQTAEDDILEDDGTFNISIFNETCLKLKRHSMKVGSEQVYQFKVLGQRWYLNNFYHATSFNFTTREQAPVVCLDLYPATDYTVNITLLASPKQHSVQIATKTIPAVKQTIVNISVFNETCLTWRSLKTADIEEMYLFHIRGQRWYQKEFAQEMVFNVTTSSQAPEMCLDLHAGTNYSVTFLALSSEFP	400585	487839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_400701_403892_404049_421517_421671_422316_422497_436951_437132_451215_451314_451925_452113_459256_459367_465028_465222_486390_486483_487683
761222	contig_7106_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_148314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_1	60.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTACAGATCATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513244	535102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_513272_534381_534476_534827
761229	contig_20844_pilon	-	901	6	Intergenic	novelGene_78596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	328.068895203431	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	84	404	206899	205759	TRUE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGDACGLAGSTWAGLGPEPPAPWAGLSLHLRQGGAFP	206982	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205866_206592_206783_206875
761231	contig_9363_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_6786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACAGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538008	1539561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1538000_1539600
761232	contig_19769_pilon	-	751	6	Intergenic	novelGene_102287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	89175	88018	TRUE	35	GAAAGAGGAAACGCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTNHGSVG	89356	87001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87017_87235_87333_87497_87608_87819_88039_88840_88958_89163
761235	contig_19146_pilon	+	2829	3	Intergenic	novelGene_172288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	27.5	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	458	799	21589	21930	FALSE	45	AAAAAATAAATTTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMKSPLSLQRTDLNASSSTIIHSFLGKESCRAALSSSPPAAPGFGPSASSLSGAPRSRLTSWPPYSSRISLAAIFGSGTGVNGTPPSGLSATDRATLILCVSLVPGVARRLG	20103	23960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19146_pilon_+_20296_21175_21308_21455
761236	contig_5167_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_164105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504507	505045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_+_504500_505000
761237	SIRV6	+	577	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	204	2	204	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10441	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
761239	SIRV6	+	562	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
761243	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	26	-2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761244	contig_16907_pilon	+	1427	9	Intergenic	novelGene_87481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	49.3696199600524	503	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	549	1151	530225	540528	FALSE	45	CTAACTGCAATAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKGKKRHSSSSSQSSEISTKSKSVDSSLGGLSRSSTVASLDTDSTKSSGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	524935	540804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525201_526611_526752_528591_528703_530192_530297_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
761245	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
761247	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761252	SIRV2	-	436	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	38	3258	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
761256	contig_10135_pilon	-	2161	9	Intergenic	novelGene_106623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.8940255287076	1	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	549	1664	88066	84292	FALSE	5	TGTCTCATCTCTGTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89570	83794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86053_86257_86390_87014_87251_87804_88231_88500_88681_88920_89057_89502
761258	contig_5981_pilon	+	1140	5	Intergenic	novelGene_35493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	211.472811491217	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	79	534	23508	37804	FALSE	20	TGTAAATTATTTTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAACGSGFAPSAPPPSFLRAARPAAMANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCPGVQCAHQ	23429	38410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_28186_37775
761260	contig_10626_pilon	-	1609	8	Intergenic	novelGene_138206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	103.276130754756	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	112	1302	303295	279002	FALSE	40	ATTGAATGGCTATAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISCMRPHQELKKKEETEGETEYKFEWQKGAPREKYAKDDMNIRDQPFGIQVRNVRCIKCHKWGHVNTDRECPLFGLSGINASSVPTDGSGPSMHPSELIAEMRNSGFALKRNVLGRNLTANDPSQEYVASEGEEDPEVEFLKSLTTKQKQKLLRKLDRLEKKKKRDRKKKKLQKSRSKHKKHKSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSIETSESSSESDDKQKKIQKQKRKKNKCSGYNSSDFEEKDKSKKRKLYEELSSSHSNKEKDREKPRFLKRESSGKNSKWSHSNSDRKSKSRNYSPKKRGSERNERSSRSQSRDEKGRRSRSRSHSSYKQREIRKWTQCSPSEEQNRNDTRSRGTDTHRGEKMHRENSGDKHTKVTQRERSRSREKIKRDYM	305232	278694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_279723_281165_281252_282448_282556_301020_301139_301971_302021_302382_302448_303250_303325_305150
761261	contig_5200_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_140166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAATAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381899	382425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_381900_382400
761268	contig_10734_pilon	+	1268	7	Intergenic	novelGene_51302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.160600825411	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	488	877	1378305	1389108	FALSE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSHICSLEWGGPGAPQLSLHRGEAAGCGLSGQRPLCVECQPLRLWSQACTLTH	1368673	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368848_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739_1388819_1388951
761273	contig_10011_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_68061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGAGTCAAAAGCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232413	231831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_231800_232400
761276	contig_9161_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_160645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAACTGGTATAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87296	85283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_85300_87300
761279	contig_6710_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_89569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATGTCTCTGGGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
761281	contig_7644_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_64234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAAGTATGTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128681	126721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_126700_128700
761286	contig_8660_pilon	-	900	4	Intergenic	novelGene_136493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	482.515860418656	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	TRUE	40	TAAAATGTGCAGGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	292215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_292580_308477_308731_310288_310437_315231
761287	contig_675_pilon	+	1672	2	Intergenic	novelGene_136351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	634	1332	210681	211608	FALSE	20	TACCTAGTGTTGTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRVLQLNHLGRKVQTRNEEIISTWDTYLQLEMGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	210047	211948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_210688_210916
761288	contig_5569_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_86714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCGGGGGCCTAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37322	38598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_37300_38600
761289	contig_5569_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_86715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGGATGCCAGCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38626	39686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_38600_39700
761291	SIRV4	-	209	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1312	0	1312	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3846	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
761292	contig_11081_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_167072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13663	15788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_13700_15800
761294	contig_12586_pilon	-	2503	2	Intergenic	novelGene_121804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	24	junction_1	0	2	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2430	74	2503	48144	45715	FALSE	70	CATCATAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSFLSRRELATSAPAGSAPASSGIMASAAKEFKMDNFSPKAGTSKLQQTVPADASPDSKCPICLDRFDNVSYLDRCLHKFCFRCVQEWSKNKAECPLCKQPFDSIFHSVRAEDDFKEYVLRPSYNFATPDVRRFRYRTTVTRDRNTSVYSPSGTVNRRTTTPPDSGVLFEGLGISARPRDGEIPQLTRQIAMRRPATADERSMRKIQEQDIINFRRTLYRAGARVRNIEDGGRYRDISAEFFRRNPACLHRLVPWLKRELTVLFGAHGSLVNIVQHIIMSNVTRYDLESQAFVSDLRPFLLNRTEHFIHEFISFARSPFNMAAFDQHANYDCPAPSYEEGSHSDSSVITISPDEAETQDLDINVATVSQAPWDDETPGPSYSSSEQVHAAMSSLLNTSDSSDEELVTGGTTSQIQGAQTNDDLNNDSDSSSDNCVIVGFVKPLAERTPELVELSSDSEELGSYEKMDTVKTQEQEQSYSSGDSDVSRCSSPHSVLGKDEHINKGHCDSGTRIKSKKEEKQSSSSSPRDLSSSVRDRVYSPHNHRHRKRGRSRSSDSRSQSRSGHDQKNRRKHHGKKRMKSKRSRSRESSRPRGRRDKKRSRTRDSSWSRRSQTLSLSSESTSRSRSCSSDHGKRRSRSRNRDRYYLRNNYGSRYKWEYTYYSRNKDRDGYESSYRRRTLSRAHYSRQSSSPEFRIQSFSERTNARKKNNHSERKYYYYERHRSRSLSSNRSRTASAGPDRVRSEKPGGKRKYKTRHLEGTNEVGQPSREFASKVKDSRYQKSSSKLDGNYKNESDSFSDSRSSDRETKHKRRKRRTRSLSVEIVYEGKATDTTR	53714	45714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_48148_53644
761296	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761307	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761308	contig_16400_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_150904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTCAGAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27127	26233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_-_26200_27100
761310	contig_19559_pilon	-	2185	15	Intergenic	novelGene_163435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_14	25.8219966347314	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	457	1947	94417	79836	FALSE	20	CCAGAAGCCTCTGTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSGIVNLGTSENKLCFDLLSWRLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGEAFLIPTPYYGAITQHVYLYGNVRLVYVYLDSEVTGTDTRPFQLTVEKLEMALQGAHSEGVKVKGLILINPQNPLGDIYLPGELQEYLGFAERHKLHVIVDEVYMLSVFEESAAYSSVLGLERLPDPQRTHVMWATSKDFGMSGLRFGTLYTENQDVAIAVASLCRYHGLSGLVQYQMAQLLQDRDWINQVYLPENHARLKAAHTYVSEELRALRIPFLSRGAGFFIWADLRQYLSEGTFEEEMLLWRRFLDNKVLLSSGKAFGCKEPGWFRFVFSDKAHRLCLGMQRVRQVLEGKSQVAEDPPSSQTQEPSS	95818	79597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_79925_80050_80205_80321_80465_81870_82013_82126_82173_83811_83902_84589_84691_85656_85735_86258_86357_88369_88437_88896_88967_90108_90180_91357_91418_94135_94418_95362
761311	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
761312	contig_6494_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_108587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	494	913	138637	139056	NA	20	TGTGACAGAGGATTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTDCTGPGILPSWSGQLHPICPPAETEWLTCGAGALLSIIPCHVISKRASAKGAVPSPLLSLFIPKRKSKHRSPGPIICRHSDTMVFKPGAVEPLVFHRALSGAAKVGRWEWRQSISLQLCPHSHFHQNNSAFICLAY	138143	140438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_138100_140400
761316	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	-9	37	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761318	contig_13700_pilon	-	2292	4	Intergenic	novelGene_68275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_1	150.315224334286	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	318	899	102848	98293	FALSE	80	AAGCAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMSNEEKNIITSLSKCDFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCVMDNHRERIANFKIEPPGLFRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVRHDNKVTWLVSWTENIQGSIKYIMLNPSSRIKVRG	103165	96899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_98450_98709_98898_100905_101029_102734
761319	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761320	contig_16722_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_118299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAAGTATTTTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155913	154248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_154200_155900
761322	contig_7945_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_161617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGAAAGAAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707805	709513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_707800_709500
761324	contig_18272_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_7035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	167	691	236618	236094	NA	60	GATACAAAGAATAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAELRSLHLPLFLGLLLLSWGELRSSARQAGAIGMQGAVGHCPVTGENGKSCAGLRNTGSCRVGTGRGGSSESHQRCRETMPACRSPRATCRCVFPSLLLGLHFLKCMVYVCFFFLRKVLIWFLFLVISKVTHHLHIKFGKYRKSQKKYAKATMVSQPKNSLLIFCCISSQSF	236784	234760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_234800_236800
761325	contig_6375_pilon	+	2161	7	Intergenic	novelGene_72933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	243.296800910602	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGCGCCTTTTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16559	30331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327_22429_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840
761326	contig_12654_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_129267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146062	144422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_144400_146100
761327	contig_12775_pilon	+	1812	5	Intergenic	novelGene_172290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	14.2894191624432	95	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	822	1352	27985	33157	FALSE	20	GCAAATCCTGGTGGCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGPLSLKEEIEVSMAEELCPGGQEQSQDHPVMIEMVDRGSRSQGSASHRRQKLEHKAAGSSAVPPAWNTTRPKKAGSRGAKEPGHGDVRAQEFPGGFQGMRFQYERPDVDLMAEIGLEELNGLEMEVMRRQLRVITERLQDLEEQASTWHYRETLFFTIMVSGCMANLWLWMRR	27163	33617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12775_pilon_+_28091_28983_29109_31973_32066_32462_32539_33025
761330	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761334	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
761335	contig_11328_pilon	+	864	7	Intergenic	novelGene_88416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2527.39958587214	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	32	403	643683	645256	TRUE	30	ATCATCTTTACACAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKEGYSRTD	643651	648037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645233_645376_646488_646535_647064_647223_647899
761336	SIRV6	+	249	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10496	5	1346	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11583	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
761339	contig_3679_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_112125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGTCTTGGTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031278	1030520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1030500_1031300
761340	contig_3679_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_112124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAATAAGATATCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030158	1029790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1029800_1030200
761342	SIRV4	-	321	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1197	3	1197	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3961	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761344	contig_2036_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_131823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607851	609226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_607900_609200
761348	contig_5797_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_56918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATGAATGCAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186712	184139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_184100_186700
761351	contig_1084_pilon	-	1633	6	Intergenic	novelGene_152390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.8847512512984	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	114	770	565857	538640	FALSE	45	TATTAACCTGAATATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGWLLDVDYFRSSSFGRAGGSEGLNFLFWKLCIIIMRLVILDNYDLASEWAAKYICNRIIQFKPGQDRYFTLGLPTGSTPLGCYKKLIEYHKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGLPRNHPESYHSYMWNNFFKHIDIDPNNAHILDGNAADLQAECDAFEKKIKEAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSRTRLKTLAMDTILANAKYFDGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREGLMHVHNKLVDPLYSMKEGN	569115	537776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_538703_551706_551892_559741_559925_560979_561082_565733_565896_569040
761356	contig_5814_pilon	+	1947	6	Intergenic	novelGene_143050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	16.181470884935	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	39	809	309858	313089	FALSE	10	GTGTTGTGAGGAGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAVVAIVPVFCLMGLLGILVCNLLKRKGYHCTAHKEVGPGPGGGGSGINPAYRTEDANEDTIGVLVRLITEKKENAAALEELLKEYHSKQLVQTNHGPVPRLPPGTPSMPHICPHRHHLHTVQGLASLSGSCCSRCSQKKWPEVLLSPEAAAAITPAPSFLPSSARAPKAGAKTGRQGEITILSVGRFRVARIPEQRTSSAASEVKTITEAGPSGGDFPDSSQPGLPAEQRALLSSGTNHTKWLKPPLEKKAEESRYVVRLSESNLVI	309819	314227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_309961_311334_311416_311712_311795_311958_312217_312694_312894_313041
761360	contig_15326_pilon	-	1806	3	Intergenic	novelGene_157705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.5	48	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGGTTTACTTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93207	82126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_83742_89514_89576_93077
761363	SIRV6	+	506	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761367	contig_7027_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_164325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTGTCTCCCAGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6007	7262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_6000_7300
761368	contig_18420_pilon	-	1446	10	Intergenic	novelGene_109367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	429.241219702113	13	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	55	885	129150	110737	TRUE	10	TGCCAGTGGCCTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIDTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIPFHCVHRTY	129204	108953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109502_110723_110767_110980_111160_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147
761373	contig_16098_pilon	-	1220	8	Intergenic	novelGene_46070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	100.489820786151	616	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	138	887	453637	445488	FALSE	10	TTTTCGGGTCTGTGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	453995	445154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668_446796_447714_447817_448030_448082_449233_449286_453539_453702_453922
761377	contig_5484_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_151094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTGCTTCTCAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242440	241516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_241500_242400
761378	contig_7207_pilon	+	1431	5	Intergenic	novelGene_72085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGAGGAGGCGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671696	758025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_671787_675713_676193_686423_686620_696313_696743_757788
761379	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_97120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761384	contig_5018_pilon	+	1811	13	Intergenic	novelGene_47111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	32.6313584693551	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	15	1541	1406371	1412829	FALSE	5	CTCATCTCGTGCCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSAVAELLLRRLETADGGLDSAELAAELGVEHQAMVGAVKSLQALGEVIEAEQRSSKRWELTTEGEEIAREGSHEARVFHSLPPEGLAQSELMRLPSGKVGFSKAMSNKWIRVDKSTADGPRVFRVVDRVEDEVQRRLRLVQGGEAEKLGEKERSELRKRKLLSEVILKTYWVSKGSAFSTSISKQETELSPEMISSGSWRDRPFKPYNFSARGVLPSSGHLHPLLKVRTQFRQIFLEMGFTEMPTDNFIESSFWNFDALFQPQQHPARDQHDTFFLRDPAEALQLPMDYVQRVKRTHSQGGYGSQGYKYTWKLAEARKNLLRTHTTSASARALYRLAQKKPFTPAKYFSIDRVFRNETLDATHLAEFHQIEGVVADHGLTLGHLMGVLREFFTKLGITQLRFKPAYNPYTEPSMEVFSYHQGLKKWVEVGNSGIFRPEMLLPMGLPENVSVIAWGLSLERPTMIKYGINNIRELVGHKVNLQMVYNSPLCRLDTEPVPSRMQKAV	1406356	1413099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1406518_1408384_1408523_1408602_1408702_1408782_1408902_1409548_1409642_1409738_1409868_1409949_1410066_1411130_1411216_1411306_1411407_1411491_1411661_1411759_1411838_1411966_1412082_1412690
761385	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_96870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761388	contig_12939_pilon	+	2415	1	Intergenic	novelGene_166209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATATTTCATTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150601	153016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_150600_153000
761389	contig_8689_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_170030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACTGAAATTCTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139539	139897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_+_139500_139900
761390	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	31	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
761391	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
761395	contig_1694_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_144949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCAGGGGGTCGGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722290	720298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_720300_722300
761403	SIRV6	+	419	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	432	5	259	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
761407	contig_18544_pilon	-	1468	3	Intergenic	novelGene_152760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_2	6	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTAATTGCTTTAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158516	151991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_152870_156615_156715_158025
761413	contig_12019_pilon	-	473	3	Intergenic	novelGene_87648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	147	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8377	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
761414	contig_15104_pilon	+	1325	4	Intergenic	novelGene_163361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	65.8094893528957	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	133	450	662456	662888	TRUE	25	TGAATGTGCTTGATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVEKGKKIFVQKCAQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQSPGFTYTDANKTKGITWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKAERADLIAYLKKATNE	661416	663800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_661541_662447_662625_662739_663464_663500
761415	contig_8873_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_162904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAAACAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386026	388292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_+_386000_388300
761416	contig_11171_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_48621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGTGACAACAACTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362024	364765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_362000_364800
761417	SIRV4	+	366	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	411	173	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
761420	contig_1154_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_87040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	940	1269	44976	45305	NA	20	CATTTTTTCTCCGGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKLCLHYCHRGTSSAVKQKYSPPFVRINLELCEVLKNTFCAKNVTGIHLRDFALSQGIPGWYKWLTYSAANQKVGGLRPTRGALEERPGDLLLKNQPLETLRSTVEL	44036	46021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_44000_46000
761421	contig_11720_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_44028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAATACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403924	401681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_401700_403900
761428	contig_15449_pilon	+	1113	3	Intergenic	novelGene_33653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	3.5	244	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	477	590	188144	188257	TRUE	20	GGGCGTGTGGGGAGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRRRGSSTSGLSQATSSLLAAATCPKGVLCWLDNAPVPFKFLSLFWSFSVCTCPCHPLSLSLPSQVCHYLWPSPAVNSSLGQEPQKQLPEVLGGAWGTPQGDGLPQLTIIVTIFVLLAVCIVVAVHFGPRLHQGHATLLKEPSAPKPEGGIYLIHWRMLSPQNSHKEAQQGTPAPDHYPAPDGPRPSIDEITYL	186287	191485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_186402_187781_188724_191428
761429	contig_15003_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_137332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTGACCGTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214746	213863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_213900_214700
761434	contig_14441_pilon	+	775	5	Intergenic	novelGene_100419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	193	621	116728	117610	FALSE	50	CAAACCAATAAACACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPWAPPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81878	117764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_112127_112154_116578_116963_117220_117344_117539
761441	contig_9852_pilon	-	1811	4	Intergenic	novelGene_138469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	3.74165738677394	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	98	595	321634	309087	FALSE	45	ATAGTGATTTTCTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAYYRTGGAVFSRPPGATPSPDPACRCRAAAMNSGAMRIHSKGHFQGGIQVNNEKNRPSLKSLKTDNNKLEKSKYKPLWGKVFYLDLPSVSISEKLQKDIKDLGGRVEEFLSKDISYLISNKKEAKFAQTLGRISPVPSPESAYTAETTSPHPSHDGSSFKSPDSVCLSRGKLLVEKAIKDHVSWNFKNSHCIFCY	321731	307870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_309183_310643_310824_320319_320496_321588
761442	contig_1694_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_144991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683791	1689038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1684671_1685250_1685291_1688632
761444	contig_3081_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_133908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53085	51090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_51100_53100
761450	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
761452	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
761454	contig_4759_pilon	-	1346	4	Intergenic	novelGene_106330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.297723388781	1431	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	116	652	589639	586785	FALSE	20	TTGGAGCCTGACTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEMYQTPMEVAVYQLRNFSISFFSSLLGGDVVSVKLDNSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTSSTASLDDCSYEEATCVLSRGNLSLLPCLAKAGGTDRRDRAKSAFCWLIWYNAWLCAQPSVGLQLWDDRLQSSVWLVLA	589754	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_587026_587509_587632_588757_588810_589517
761458	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	34	3407	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
761462	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761467	SIRV6	+	350	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	158	23	-29	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGAGAGTTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2443	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
761476	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761477	contig_14441_pilon	+	912	6	Intergenic	novelGene_100587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	382.969450478756	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	386	814	116728	117610	TRUE	10	ACAGCCTGCTTGGCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111199	117777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111382_113656_113711_116578_116963_117220_117344_117539_117627_117695
761478	contig_10140_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_148418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGGCCTCTGTACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263694	264716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_263700_264700
761481	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
761482	contig_7389_pilon	-	1993	8	Intergenic	novelGene_171910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.45229884959845	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	34	1146	419232	382541	FALSE	5	TCTATGTCTTTTTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLFVSFMLRAASIFVKDRVVHAHIGVKELQSMIMQDDLQNSIEAHSVEKSQYIGCKIAVVMFIYFLATNYYWILVEGLYLHSLIFVAFFSDTKYLWGFILIGWGFPAAFAAAWAVARATLADARCWELSAGDIKWIYQAPILAAIGLNFILFLNTVRVLATKIWKTNAIGHDTRKQYRKLAKSTLILVLVFGVHYIVFVCLPHSFTGLGWEIRMHCELFFNSFQGFFVSIIYCYCNGEVQSEVKKMWSRWNLSIDWKTAPPCGSHRYGSVLTTMTHSTSSQSQMAASTRMVLISSKVAKTVSRQPDSHVTLPGYVWSNSEQDCLPPSIHEDAKEGNGNQGDDIPMKESSKPLEFSLDAEGSKGEMEDAL	419265	381693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7389_pilon_-_382937_383705_383748_385778_385918_389317_389413_399663_399731_409104_409166_415623_415778_419073
761483	contig_7171_pilon	+	1783	15	Intergenic	novelGene_101329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	321.511076712731	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1689	93	1781	1143114	1172439	FALSE	75	AAAAAAAAGGAAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFTAWCNSHLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNCWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKQRDYETATLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQRICDQWDALGSLTHSRREALEKTEKQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADKEREAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPTPPCQSRPLVRTRFSLQFSKDQKNKNKKKEEKSHKKK	1143021	1172441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1143139_1143292_1143413_1146846_1146934_1147899_1147988_1149761_1149841_1150885_1150968_1151796_1151883_1156322_1156416_1158263_1158495_1159643_1159792_1163553_1163705_1166391_1166501_1166701_1166843_1166923_1167058_1172324
761484	contig_15327_pilon	+	1126	2	Intergenic	novelGene_70463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	196	570	311774	312148	FALSE	15	CTTGAAACCTCTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPVPIMLISLGPWSLSAFWGLPGSRHGLEWMPPVPTPALSPGSARRRGEGWRADVGQGPHGCVFILTFQNSTTGPVKRPQLSPKLSALRSTQMTQLLEGGFHQDPSSLQPSGNWNCPSTPGI	311436	312704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_311489_311630
761486	contig_14519_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_66841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390448	392287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_390400_392300
761491	contig_10569_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_44088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1631	1933	377753	377451	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWSPSIHYLYGHYGYLFIPHPCLKRVCSLKCLDEFCIKSQKVAVFNDSNIVNDSIYYTHYNSFFMRLSPPDCELLDSRDRILVTGMSQGQALCLQSFTE	379383	377361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_377400_379400
761493	contig_6062_pilon	-	1253	7	Intergenic	novelGene_5252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_6	61.5710971154486	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	18	1103	597983	541389	FALSE	30	CTAGAATTATACTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598000	541238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597863
761494	contig_3571_pilon	-	2573	5	Intergenic	novelGene_88713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_4	14.0245320777557	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	18	782	100098	40251	FALSE	40	ACCATTGATTTAGAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCR	100115	38459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_99969
761495	contig_10877_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_166219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAACACAAATCAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121185	119348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_-_119300_121200
761496	contig_5770_pilon	-	623	7	Intergenic	novelGene_74182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7662	junction_6	2781.93576189914	62964	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	34	588	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265791	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
761500	contig_7272_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_25418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCCCTTCTGGCCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904498	903925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_903900_904500
761504	contig_13608_pilon	+	2020	6	Intergenic	novelGene_52383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTGCGCACGCGCGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410451	470359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_411809_416273_416378_453179_453376_456289_456419_466411_466478_470191
761507	contig_8050_pilon	+	2037	2	Intergenic	novelGene_114879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAGTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448815	450931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_450146_450224
761508	contig_12756_pilon	+	1339	4	Intergenic	novelGene_153216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGACGGCTTTTCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162561	165358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_162651_163578_163672_163793_163975_164382
761511	contig_10196_pilon	+	978	9	Intergenic	novelGene_132159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_4	223.494267264286	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	116	898	1038364	1050606	FALSE	15	CTCGTGTTTAATCGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034594	1050686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
761512	contig_10904_pilon	+	682	4	Intergenic	novelGene_22660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1930	junction_1	569.461929270859	19222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	27	611	530908	535124	FALSE	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530881	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531005_531238_531362_533736_533924_534946
761517	contig_1719_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_87315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTCTTAACATGACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445067	445924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_445100_445900
761520	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761521	contig_16098_pilon	-	1438	10	Intergenic	novelGene_46071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	113.054668301187	968	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	419	1105	447780	445488	FALSE	10	TTTTCGGGTCTGTGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL	454000	445154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_445618_445702_445893_446668_446796_446887_447062_447714_447817_448030_448082_449233_449286_453114_453154_453539_453702_453922
761525	contig_13457_pilon	+	1744	10	Intergenic	novelGene_118317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	221.831322861469	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	422	1474	55314	57730	FALSE	35	AACGAGGACAATTCCCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52064	58000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_55084_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
761526	contig_5590_pilon	-	1351	7	Intergenic	novelGene_163032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.86338998124982	11	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAGTTTAGACTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369477	353468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_353580_358766_358989_359433_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
761527	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
761530	contig_2342_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_132746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACCTCAAAAAAGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55475	52724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_52700_55500
761531	contig_5894_pilon	-	2941	1	Intergenic	novelGene_83026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	42	374	325345	325013	NA	20	GCATGTTAAGTTAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNITGSEEYPIVCGWISGVDQESEQKKKLEVFPSALGAPTRTATVDKAVAYPVPSVCKTFLSPCLVHSNSSFGSQLKCYLLRDVLPDCLTQTPLYYVCLSSTALIIPHVW	325386	322445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_322400_325400
761533	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	266	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761537	SIRV4	-	257	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1266	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3892	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
761542	contig_9505_pilon	+	1345	12	Intergenic	novelGene_121832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	212.82942380311	1203	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	87	740	482124	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDESFLGKLGGTLARKKRAKEVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	482037	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_482194_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
761545	contig_5260_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_144364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCAAATTCCCGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221348	221114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_221100_221300
761546	contig_5260_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_144363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221108	219052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_219100_221100
761547	contig_14362_pilon	+	1029	9	Intergenic	novelGene_142503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	94.9772999195071	542	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	614	817	10276	18437	FALSE	20	TCAGCATTTCTTCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETSSALTHAGAHLDLSAFSSWEELASLGLDRLKSALLALGLKCGGTLEERAQRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYEDSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL	4682	18649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_4753_5174_5243_5400_5509_6338_6409_8660_8826_8930_9042_10254_10346_17259_17316_18359
761548	contig_7202_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_18476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27644	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
761550	SIRV4	-	357	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1166	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761551	contig_16442_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_172293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACATTTCAAATCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4443	3852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16442_pilon_-_3900_4400
761552	contig_16310_pilon	-	800	2	Intergenic	novelGene_70098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATCTTCATCTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290634	289587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_289631_289877
761554	contig_14526_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_111214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGCTATGAGTCGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354846	355455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_354800_355500
761556	contig_7171_pilon	-	773	8	Intergenic	novelGene_101193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_1	230.529027788392	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	60	524	49603	37659	FALSE	5	GCCCTGTGTCTCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGPLPATLPCRLGTPSSDMSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50424	37409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_50365
761559	contig_4469_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_21901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAATCAAAATGGTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420543	418888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_418900_420500
761570	contig_8650_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_162629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCAGAGATGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296521	295825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_295800_296500
761573	contig_1069_pilon	-	1031	2	Intergenic	novelGene_172297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAACTTTCAGGGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43570	40304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1069_pilon_-_40653_42887
761579	contig_12402_pilon	-	1880	4	Intergenic	novelGene_133372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	47.4856703531591	7	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	620176	617157	TRUE	35	CTTGAATGTGGAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGPVLAGGGCCVSRRLSWSNTTVPGSKGAAPCLLRSAGLFALPRLLQSRATSCSRTLPRASRGHRPVQKLRHLAHALLDRGCLLHGLGCTLSLGALTGPRVARRELVQSRQLGS	620177	596458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_596607_597128_598324_616968_617210_619881
761581	SIRV4	-	318	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	3	1200	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761582	contig_2940_pilon	+	2522	12	Intergenic	novelGene_82007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.2915751265372	129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2226	295	2520	1341254	1367368	FALSE	25	CATCAAGGCGTACATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLDDPGEVREGFLCPLCLKDLQSFYQLQSHYEEEHSGEDRDVRGQIKSLVQKAKKAKNRLLKREGDDRAESGTQGYESFSYGGVDPYMWEPQELGAMRSHLSNFKKHRAARIDHYVVEVNKLIIRLEKLTAFDRTNAESAKIRAIEKSVVPWVNDQDVPFCPDCGNKFGIRNRRHHCRLCGSIMCKKCMEFISLPLANKLTSASKDSLSTHTSPSHSPTSVHGSRRGSISSMSSVSSVLDEKDDDRIRCCMHCKDTLLKREQQIDEKEHTPDVVKLYEKLRLYMEKVDQKAPEYVRMATSLNAGETTYSLEHANDLRVQVQKAYELIDALSKKILTLGLNQDPPPHPNTLRLQRMVRYSATLFVQEKLLGLMSLPTKEQFEELKKKRKQEMEKKMILERQAALESQRRLTERQSDLASRATNGEVASFRRGPAPLRKAEGWLPLSGGQGHSEDSDPLLQQIHNITSFIRQAKAAGRTDEMRTLQENLRQLQDEYDQQQTEKAIELSRRQAEEEDLQREQLQMLQEREWEREREQFQATSLHTRTRSLDFQEVRPFQLEPGREPRTHLAYAPDPGSPPVQSSTVPKTLSPSSAGEPIRVWSGPPALSQEFFPQSTMSQQNEVPALNPFDEEDLSSPTEGTGGSPAAEASFGPSAQIPKEYNPFEEEEEEEAVAGNPFTTPDGPVSNPFDEKDEHHPQRLSPPVPGNPFEEHTSTNPFEMDSDSGPEAEEPIEEELLLQQID	1338473	1367370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1338596_1341081_1341402_1345715_1345857_1348347_1348449_1349335_1349382_1349493_1349656_1352031_1352274_1353882_1353954_1362242_1362330_1363275_1363379_1365634_1365740_1366348
761587	contig_11399_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_172299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	16	345	45034	44705	NA	25	TGTGTGCATCCACTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMKNTEYTMDCQKSQQVCPGRSTARMLLRKEDGETLSYILWTCYQEDQSLEDITLGKAEDQRKRGRPSTTWIDTVAATMGSNIVMIMRMVQDRAVFHSVVRGITMSWK	45049	44333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11399_pilon_-_44300_45000
761588	contig_20293_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_153523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAAAAACCTGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76115	76945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_76100_76900
761592	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
761593	contig_15066_pilon	-	2139	12	Intergenic	novelGene_149562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	9.78360916351746	126	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	486	1664	120832	118502	FALSE	25	TCTTCAGAACCCAGGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEKRVNTAFYRKLRKRAAKASARRPKPLGRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYHANDTVRCPGGTPVVVSCVAGPLYTLSSAQKNQQQWKPQEEVRVRLKGGSHPGEGRVEVLKAGTWGTVCDRKWDLLAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQEPSLWNCPHKNITAEDCSHSQDAGVRCNLPYTGVETKIRLSGGRSRYEGRVEVQIGGPGALRWGLICGDDWGTLEAMVACRQLGLGYASHGLQETWYWDSGNITELVMSGVRCRGTELSLDQCAHHGPHITCKKTGTHFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGHRRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHKASFCLEDTECYEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVVINPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANKRFEHYPGQTNNQII	131566	118026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_118576_118747_118860_118964_119102_119178_119295_119396_119641_119836_120000_120136_120305_120532_120688_120822_121004_121228_121449_124385_124443_131529
761594	contig_546_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_117253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTACTAAAATAATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725484	726969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_725500_727000
761595	contig_11846_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_106004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGTGGCACAACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425485	426100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_425500_426100
761600	contig_13481_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_119519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTAAGATGACTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1422788	1421657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1421700_1422800
761601	contig_7171_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_101328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129725	1131102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1129970_1130793
761605	contig_18620_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_168574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43058	44280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_+_43100_44300
761606	contig_18620_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_168578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCCCTGAACAAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44637	45194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_+_44600_45200
761610	contig_14023_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_165347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAGGAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28331	30108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_28300_30100
761613	contig_12113_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_134741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTACTGTTTTTCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216238	215815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_215800_216200
761614	contig_5300_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_144236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20231	22588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_+_20200_22600
761615	contig_7619_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_162160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	18	356	411283	411621	NA	15	CAGAGCCTCCTGCTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPGCMWQRVSQCAVRLPLCTLVAPGKRLECSQQLVLSRSLALSPSVNEDMRLRHERAFGGWAGCCRPKLRRMARRMLVKGEERLFHMESSSAGDTCACGCVCGGSISGGRLPEKRV	411265	413412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_411300_413400
761617	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761618	contig_3584_pilon	+	1199	5	Intergenic	novelGene_108173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	917.231806851463	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	30	1073	527096	531381	FALSE	30	CTCAATAAAGAGCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527066	531507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602
761619	contig_3409_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_172303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28895	27546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_27500_28900
761621	contig_13707_pilon	-	1881	11	Intergenic	novelGene_43510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	118.597006707589	100	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	622	1353	126052	117289	TRUE	15	CTTGACTTGTTCTAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETSGSEEVKILEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKDDESQKTIKQMQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESSSEKETVSVSLNQTITQLQQLLQAVNQQLTKE	128503	108250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_108760_117269_117388_119119_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906_125000_125128_125219_126019_126101_127930
761630	contig_9727_pilon	+	2486	10	Intergenic	novelGene_86332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	81.956326822112	560	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	260	1111	415005	421288	TRUE	25	CAAACATTCTGCTTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYVQDKLFVGLEHAVPTFNVKEKVEGPGCSYLQHIQIETGAKVFLRGKGSGCIEPASGREAFEPMYIYISHPKPEGLAAAKKLCENLLQTVHAEYSRFVNQVNTAVPLPGYTQPSAISSVPPQPPYYPSNGYQSGYPVVPPPQQPAQPPYGVPSLVPPAVSLAPGVLPALPTGVPPVPTQYPITQVQPPASTGQSPLSGPFIPAAPVKTALPAGHQPPPPPQPPLPPQPQAQKRRFMEELPDERESGLLGYQVQASPVRVRLKVQDRSRQVPQAKSERGTGS	412582	423774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_412678_414118_414283_415004_415217_415795_415857_416895_416954_417192_417447_419228_419403_420588_420674_421280_421373_422483
761631	SIRV6	+	535	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761637	contig_5643_pilon	+	973	9	Intergenic	novelGene_39009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	912.481292616457	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	447	971	640257	641554	FALSE	10	GGTCATGCCCTTCTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKNLSPDPCRGLQWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPG	631196	641556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631892_638110_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641214_641412
761641	SIRV1	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
761644	contig_7909_pilon	+	1899	2	Intergenic	novelGene_155883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	72	665	154719	155354	FALSE	10	CCCGACCTGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRHHTSSAIPVPKRQSSIFGGADMGFPGGIPSPDKGPRKRASSENERLQYKTPPPSYNSALAQPVTAIPSMVASERKTTSLSSSLDTSLDFSKENKKKGVDLDNSLNAGHVSVNTSQEPTEEAPSGHPATNAQLPGEFHPVSEAELCCTVEQAEEIIGLEATGFTSGNQLEAFNCIPVDSAVAVECDEQVLGEFEEFSRRIYALNENVSSFRRPRRSSDK	154647	156588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_155040_155081
761647	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
761653	contig_16632_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_154143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	407	1015	139447	140055	NA	35	GACAGTGTGGATCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLYIYQEAVLQTEQGDTAWFNVRKGMRQSCILLPYLFNLYAEQIIREAAAYKEECGIRIGGRLINKQQYADDTTFLAESEEDLKHLLMKIKDCSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTDIFKDFILLGSTINAHRSSSQEIKQSIALGKSAAKDLFKVLKSKDGTLKTRVCLTQAMAFSITSYACESWTMNKRD	139040	140512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_139000_140500
761656	contig_7416_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_134335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875893	874116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_874100_875900
761660	contig_9955_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_21368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAAAGGGTCCTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299345	298053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_298100_299300
761680	contig_13460_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_162187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTGGGATATATACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244712	244033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_244000_244700
761681	contig_10446_pilon	-	2999	1	Intergenic	novelGene_162485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771629	768630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_768600_771600
761684	contig_2438_pilon	+	1808	8	Intergenic	novelGene_112081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	65.1469296972589	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	70	1149	339859	359325	FALSE	15	TTTTTCGTGGATTCCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSTSGILSSASTTSNLSRSKTRYRTKAVSSEVDENLFGVIKPLSQAPSDSPIVLLRDKHAIQRSLTAPRMDHKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEAKDQAFKMEKEAIMDAVTTRKKIMKQKEMVCKNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQILEKRLIQKELETEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELDRKRREERIRGRRHIVEQMQKNKEERSLLAEQREQEKEQMLEYIEQLQEEDLKDMERRHQEKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMVATWFLMPWDF	339789	359984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_339862_346411_346538_348882_349026_351267_351413_351706_351878_353064_353244_355300_355431_359142
761691	contig_10434_pilon	-	1986	9	Intergenic	novelGene_82035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	266.551794919862	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1114	1899	137443	132856	FALSE	35	TGTTATAATAAAGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	140256	132768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139271
761692	contig_13481_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_119265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCAAAGAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27964	30320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_28000_30300
761693	contig_19957_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_57744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTCCTAATGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377675	377438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_377400_377700
761703	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91665	2	-91659	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACAAAACCGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
761705	contig_10609_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_123906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGTTGTGTTTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233789	233039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_233000_233800
761707	contig_15970_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_144042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAGTTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130945	130347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_130300_130900
761712	contig_12677_pilon	-	589	2	Intergenic	novelGene_110687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_79_192
761717	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
761719	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	61	510	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
761723	contig_5350_pilon	+	1059	7	Intergenic	novelGene_99337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	51.7751549168775	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142187	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
761726	contig_7019_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_149485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	989	1330	1874842	1874501	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCSLTVLGKIKQSPQISCSLCISSAKISGSKRSVSMVRKHFPFQKTKYLHVYLSHLNFTVFWGIIIILIFSQNSNPGVPTLTPLFLPLNYPCKINNMLLECRVVDNDVQRTN	1875830	1874155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1874200_1875800
761729	contig_4654_pilon	+	2157	10	Intergenic	novelGene_103069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTCTTTTTCCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464330	481947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_464371_465652_465764_466270_466402_467014_467108_469054_469262_473483_473587_476102_476233_478958_479054_479222_479366_480843
761730	SIRV6	+	396	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	468	7	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAGTAAGACTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
761733	contig_10930_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_36960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATATTTTATTAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255836	255591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_255600_255800
761739	contig_11978_pilon	+	2006	8	Intergenic	novelGene_63030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1285.57843726758	1531	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	112	903	1608423	1646860	TRUE	5	CCTGCTGACTTGGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNCARCDKIVYPTEKVNCLDKFWHKACFHCETCKMTLNMKNYKGYEKKPYCNAHYPKQSFTMVADTPENLRLKQQSELQSQVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1608311	1649714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1608492_1616197_1616293_1625946_1626032_1633574_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1647037_1648787
761742	contig_12019_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_87694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACCCTTGCAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69784	70321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_69800_70300
761744	contig_3130_pilon	-	2173	5	Intergenic	novelGene_103565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	147.347378666877	18	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	366	839	75018	73733	FALSE	55	GAGAAAGAAAGAGAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSDETKMSEEILALVDEFQQAWPLEGFGGALEMKGRRLDLQGIRVLKKGPQDGVARSSCYGDCRSEDDEATEWITFQVKRVKKPKGDHKKTPGKKTESNQVENTHRYQSNLEITGPKVASPGPQGELECLYAISSFRLECLSSYKGYAYDLKYFS	118200	72398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_73982_74793_75054_115926_116108_116475_116554_118129
761747	SIRV6	+	283	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8134	14	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
761749	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761750	contig_15866_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_63655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAATTTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544258	541728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_541700_544300
761751	contig_12145_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_172323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAATATGAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166695	164532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_164500_166700
761754	contig_13224_pilon	+	2396	2	Intergenic	novelGene_104074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	433	735	107927	108229	TRUE	75	AATAAAAAAAATGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHLQLYTSVTPPEDTIFLTLPSILEFSVWSLRIWKLLPQSRVIISVTKGVSSFWKKQDITREGVKKWPIQGMHVPSFEYIKDIWKPPAVFRSHTRGSE	107494	111410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_108468_109987
761755	contig_10196_pilon	+	1083	5	Intergenic	novelGene_132092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4174	junction_1	4075.25146463381	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	457	1041	907413	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKDEVLKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	906956	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_907491_907737_907912_907991_908152_908260_908353_908475
761758	contig_16883_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_161743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTTAGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360273	358449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_358400_360300
761759	contig_18869_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_56035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73548	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
761768	contig_14219_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_54329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTAACCAAAAGGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751148	751543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_751100_751500
761770	contig_6227_pilon	-	1255	9	Intergenic	novelGene_49787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	83.2056939157411	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	682	1254	1254536	1246136	FALSE	20	TGAACCGCTGGAGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVVVDTAQIENKEAYAPQISLEGSRIVVQVPSTWCLKEDPATMSLLQRSLDPEKTLGLVDVLYTAVLD	1308750	1246134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1246239_1250370_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1291831_1292061_1308695
761771	contig_3774_pilon	-	1585	8	Intergenic	novelGene_142050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	166	junction_6	134.46128340416	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	122	988	210407	152999	FALSE	45	ACTACTGGAACACTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQVRKQRLGHALVPLANQGRVFSLHR	210528	152401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
761772	contig_12654_pilon	-	1064	8	Intergenic	novelGene_129322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_7	163.14761063878	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	408	995	817780	808478	FALSE	15	ACAGAGTCCTTGGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827466	808408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_827115
761773	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	503	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
761777	contig_11507_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_103350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCTCTAATGCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25822	24490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_24500_25800
761779	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_16805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
761782	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1200	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761785	contig_15327_pilon	+	1630	6	Intergenic	novelGene_70733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	108	635	959632	960159	TRUE	40	GGAGTAAATACAGATCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAYFSASGAYYQPGRKRKGKGPFSQPPGSPGDMMGWTCPLQFQSEKPLLEEKKCEKARETNSRNTRREAEGLSLSHRGLGLMPPKPWQPTLKSHRGGNRMTKDRKGKGRPCDRGWGWAWARNGMWTDSWAGLWPPTARARPAQGMWVGLAGAPWRKGLDSLPGLVCQAQGVRGS	959524	963655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_960581_960689_960763_961487_961605_961817_961950_962807_962899_963494
761786	contig_13349_pilon	-	1673	3	Intergenic	novelGene_161124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAAATGCACCTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227186	223597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_223766_224207_224281_225754
761788	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	53	515	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
761791	SIRV6	+	515	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761793	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1170	3	1170	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3988	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761797	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
761801	contig_19342_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_41063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	29	349	3263	6320	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWGLRQRGHDWVMEILFDLDILIIWWAVQSGNTYSD	3234	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3775_6215
761802	contig_11285_pilon	-	1168	13	Intergenic	novelGene_5704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.225475100838	64	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1140	29	1168	798530	784063	FALSE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAESWCPPLPYRAGPPFSCCLIKRLSP	798558	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784135_793893_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
761805	contig_4336_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_152357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGGAAGACAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317266	316996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_317000_317300
761806	contig_4336_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_152356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	229	588	316615	316256	NA	30	ATTCCCAGCTTAAGTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAECCTRLGLHPGHRNSGLRVELTRKGPPSSPHCPLGLTWWPRCDNWASPILSPTLCLMHISVNWVPAQITCSAQHSRLGTDGETECCGLKFRPGYTRTSPTLAGTPLGLWLGPLDTGP	316843	316028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_316000_316800
761808	contig_11396_pilon	-	945	7	Intergenic	novelGene_71413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	72.1864868856276	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	70	945	1648829	1645119	FALSE	15	AGCTTGAGGCTGGGTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGSVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGTLGASGSGSHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQGKGTRAV	1649986	1645118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1645372_1645524_1645607_1646269_1646357_1646708_1646833_1647806_1647924_1648616_1648831_1649918
761810	SIRV4	-	311	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1210	0	1210	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3948	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
761816	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761821	contig_8310_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_75545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTACTCTGATTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176860	176379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_176400_176900
761824	contig_14450_pilon	+	2042	2	Intergenic	novelGene_48919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCAGTCATTTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13099	30060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_13136_28054
761825	contig_13828_pilon	-	2314	11	Intergenic	novelGene_158282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	29.8270011901968	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	217	1602	323602	45251	FALSE	45	TCTTAAAGAAAGTTGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRYMPKHKITHLKKMLSLERNNGAAPSMALPSQQEQRGSESVLKNFTGESGLCGAVSGLGTIQQESLGSSLMQLSDLNQSNSSDDSNSYQEEKKQNPTLNPSDTLGGVDDQQRPLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMRLKELGLKFHVSVLGETFTDVPDIFSEAKKALGSSALHWGYLPSKDDYFQVLCMADVVISTAKHEFFGVAMLEAAYCGCYPLCPKDLVYPEIFPAEYLYSTPEQLSKRLQNFCKRPDIIRKHLYKGEMAPFSWAALHGKFRSLLTTEPKEDL	428079	44538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_45335_50296_50389_51088_51160_55519_55665_72609_72720_115165_115529_246998_247173_250617_250786_323423_323628_326949_327017_427955
761826	SIRV2	-	307	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4141	348	2962	-348	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAGTGATAGAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	1383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
761827	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4576	38	3401	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
761828	contig_2069_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_23345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATAAAAACAAAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726516	724823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_724800_726500
761829	contig_15118_pilon	+	2049	3	Intergenic	novelGene_74573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	221	526	293491	295217	FALSE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQLQDPGRSGVVSKRDQKLKPSGAMPIDMNLPWRPQVLGPEEQDKSYKVCGVKGPVSFEDVTVDFSREEWQQLDPAQRHLYQEVMLENYSHFLSMGEHS	289905	296740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_290013_293377_293641_295061
761841	SIRV3	+	364	3	NNC	SIRV3A	novel	436	3	NA	NA	8	-516	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	213	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACCAAGTAATTATACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4011	6202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4081_4578_4772_6100
761843	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_94551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
761846	SIRV1	-	218	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3886	0	3612	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
761849	contig_14142_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_120482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGCTTTCAGGACGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264667	262429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_262400_264700
761851	scaffold_19766_pilon	-	1322	7	Intergenic	novelGene_34345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	472.201728313464	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	293	1129	622205	596633	FALSE	30	AACTTCCTCACTCTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGTWSRTPPCPEASQLVFPGHTLILPKDRIQTPSWTTRMMVSSMPPLSSPVQPPQEHLPANLPMGSPRQRPYTLS	623649	596439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_605042_605300_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
761855	contig_1982_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_151345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	405	1218	15	1232	701507	702724	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRVGGGWDTLQGFLLKYDPCRILQFATLEQKILAFQKGVSNESVPDSSTRTPQPPEMNPLSAVNMFQKQNSKPGTPVGIPRSKEKQVHPPGVLPPAPSSRKGGHPGSVSVRPKLHNSPAASSHLKSSKGVTKKPQTPSNSVSSRKCISSPSTPNKARLIPPQKSRDVPASTLLPSKCSGKTEPQHLKHNHVSSRDNAVSHPAAHLTPSSACLKLPKANIHVRHKPSPSFQAPAKLTKSSSKSTAARSQPPDGAPQAGANTAQKLKSTLNLNQPICMSSISPAKASQELKDKQLVSVAKKQPQNKSTRQQTGPSSSRSPGRTPLAIVSLPQSSAKTQTVTKSAQTASKGQCSAEGPPKSVKAPASTRKPPSSGKEAVSGDKKPTAKKKEDDDHYFVMTGSKKPRK	701492	703348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_701500_703300
761856	contig_9429_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_155103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTACCTTAACGTTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73956	73408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_73400_74000
761859	contig_5145_pilon	+	1051	7	Intergenic	novelGene_131450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGCATTCTTCTTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923087	939134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_923474_923897_923973_924433_924574_925544_925676_936150_936297_937356_937494_939098
761860	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1201	0	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761863	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
761867	contig_13901_pilon	-	2237	19	Intergenic	novelGene_146637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	254.179726440433	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	379	2097	215793	153637	FALSE	15	CTTGATTCCCTAATTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDIEITLFHTENEQFTCNFENITRNQDLTTILCKIKGIGDANSIAASSKKVRVKLGNLELFVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIFAAVGVTRYKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKHFALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQSSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPGFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLELQVGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIEVFKKIANFTSDVEYSDDHCHLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVRVLFDEKKKCKWITRGL	222487	153496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_153653_157029_157131_158312_158388_158480_158622_161336_161485_163875_164040_165269_165378_165477_165510_168717_168773_182381_182486_185157_185336_203281_203429_209864_210064_210988_211114_211327_211367_215706_215811_216105_216208_219817_219921_222331
761868	contig_3018_pilon	-	2661	1	Intergenic	novelGene_78776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGAAGTTTTAACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378313	375652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_375700_378300
761871	contig_14528_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_111282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	787	1107	211647	250150	TRUE	10	CGGCTGTGGAGGCGAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYYLWEVSVTRDAGGTGGRQTLSPAVKCPQRISAAPEGGAAGAPGLPEDLGPCQLLVRALRMKDIMESRPGGVEKPRISASNIWSSEGLLRTSPSTSASHRPKEP	209646	250686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_+_210319_211532_211668_211862_212013_248488_248554_250065_250307_250511
761877	contig_15741_pilon	-	961	5	Intergenic	novelGene_159679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	625.266543163793	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	92	496	57230	50105	FALSE	40	ATTTTCTTTATGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRDERRRAQHNEGSLYLEPIHNLHPWLSWMRHLRLSLSQTKLAVFPPQRPPCVTCLSLKVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60154	49639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_57139_57278_60110
761878	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
761879	contig_16846_pilon	+	422	2	Intergenic	novelGene_82992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGCTCATCATGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551360	552778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_551671_552666
761880	contig_3980_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_172330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTGTATTCCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56016	57009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_+_56000_57000
761883	contig_3721_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_123823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTCATGTAACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212990	212395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_212400_213000
761884	contig_3721_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_123822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGTAGAGAAAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212198	210953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_211000_212200
761885	contig_10428_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_162598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGGAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189659	187668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_187700_189700
761887	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	2	413	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
761889	SIRV4	-	166	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1357	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3801	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
761890	contig_9988_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_113061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCATAAGGGATGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124918	123520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_123500_124900
761895	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	20	1159	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
761906	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8115	3	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
761912	SIRV5	+	328	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	2	875	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8317	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
761915	contig_5978_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_152402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATTCCTAATGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379792	380744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_379800_380700
761916	contig_5978_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_152403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACTATCTGAATGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380794	381995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_380800_382000
761917	contig_2710_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_161784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTGCAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959606	962380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_959600_962400
761924	contig_9528_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_172343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225630	224898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_-_224900_225600
761926	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761928	contig_5896_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_159238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATGAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108061	109907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_108100_109900
761930	contig_11285_pilon	-	1473	7	Intergenic	novelGene_5747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	93.6549518178297	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	39	659	1229333	1214287	FALSE	35	ACTCCCCCCACCCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGREAKDLDEMDDDDDDDDIGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQEVSVSWENRWLPAPDPTRSSSFLGKVGEPLW	1230716	1213472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
761932	contig_8330_pilon	+	2221	7	Intergenic	novelGene_71718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	175.742946752731	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	44	1894	111957	147531	FALSE	25	CTTCCAAACTGTGCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQEPAPARSSGPQKDPALPDLPTMPPPESPFEDHQPSPSPSPSPSPSPTEQTVEEEFQFLCCQCCKAEAKCPKLLPCLHTLCSGCLEAAGVHCPICQAPRSPGADAQALDNVFFESLQRRLSMYREIVSLHAACTRCKEPADFWCFECEQLICTKCFEAHQWFVKHEARPLASLRSQSVHEFLDGSRKSNNIFCSNSKHHTPELTSIYCRGCSKPLCCSCALLDTGHSELKCDIRAEIQQRQEELDTMTQALQEQDGVFGAAHAQMRSAIGQLDRARADTEELIRARVRQVVAHVQMQEHKLIQSLKARYQSESEEMTRRLSRLDAVLQRIRTGGALVQRMKRYASDQEVLDMHSFLREALHRLRQEEPQSLQAPVPTNSFDEFKVRLRDLVSCITQGTDAALPRRASPEAASTPRNSFDVDLPEEAQRAQAQVMGLSEAQPMAVVQQEPGAHPVPMYAFSIKDPSYREEAPSPLTPQKRKSCQTEGPRKIIKLESEEEKEERLARSSPEQPRPSTSKAVSPPHLDEPPSLGSPDTGNKVLLLNNNHVTSEPGEEAEERVVVISSSEDSDAENSVSGPAVQPRTPASAHSGSQGAQAQQVTLRLALRLGSFPARQ	111913	147858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_112110_113297_113765_135042_135624_137089_137161_144962_145101_146068_146331_147352
761934	SIRV1	-	204	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5598	3564	-149	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACGATGAATATCTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
761935	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
761936	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
761941	SIRV4	-	316	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1207	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
761943	contig_19680_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_132020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTCGCTGGTTTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217205	217720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_217200_217700
761945	SIRV6	+	215	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9658	564	508	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
761948	contig_14326_pilon	+	1717	7	Intergenic	novelGene_120642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5448202856921	135	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	338	754	35571	48402	TRUE	25	TATTATTTTGAGCTGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLLVTCLQWLETRPNRQVCPVCKAGISRDKVIPLYGRGSTGQQDPREKTPPRPQGQRPEPENRGGFQGFGFGDGGFQMSFGIGAFPFGIFATAFNINDGRPPPAVPGTPQYVDEQFLSRLFLFVALVIMFWLLIA	17880	50726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_48304_48791_50151
761950	contig_2365_pilon	+	1526	13	Intergenic	novelGene_103735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_2	358.562988422769	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	172	1479	130213	212260	FALSE	25	TTATCTCTCTTAAGCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQV	116763	212307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137
761951	contig_8420_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_69360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTGGCTGACTTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135811	137907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_135800_137900
761953	SIRV6	+	209	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	516	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10805_11024_11109_11205
761954	SIRV4	+	376	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAAAACCACTTCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	4013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
761959	SIRV4	-	369	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	0	1152	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
761961	contig_2069_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_23216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	1660	2037	109335	108958	NA	50	ATAAAGATTCCCAAATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQSELPRLGELGGISRERSDLGSCSDGRPPHEVESLGISGILPNIHNVT	110994	108955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_109000_111000
761962	contig_2069_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_23215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGATTCTTTGGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109005	108446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_108400_109000
761963	contig_1893_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_172350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTTTTGGTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204149	205870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_+_204100_205900
761964	contig_10627_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_60075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGGTTTCCAAGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364013	1362358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1362400_1364000
761967	contig_18473_pilon	+	327	4	Intergenic	novelGene_169642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	169.401561058005	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	41	325	42148	68983	FALSE	25	AGCTAATTCTACACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARGYLGTTGHGFMIFCRFFAKMATSDAVLKRLEQKGAEADQIIEYLKQQVALLKEKAILQTTLREEKKLRVENAKLKKEIEELKQELIQAEILNGVKQIPIPSGTQL	42107	68985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_42150_59510_59645_66184_66299_68948
761968	contig_10803_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_170122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCCACAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88453	86909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_86900_88500
761969	scaffold_13505_pilon	-	560	6	Intergenic	novelGene_111485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5237.06517049387	120993	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	84	521	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548378	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
761970	contig_9871_pilon	-	1946	10	Intergenic	novelGene_75729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	396	752	616817	616461	TRUE	50	AAGAGGCAATGAAAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGWSGSVLKNEVTTRNTEQGAETPAAITCCNHVLPGVGSYGRLQSTVPCSAQEVSVAQVWPPASLHAEPLLLVSPLGRLTVAALQVPFFPTPFHVVHILLLSGIRGTLLLLHLLHPL	617212	603273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_603388_606549_606663_608255_608411_609135_609278_610794_610911_611451_611547_611589_611651_613742_613966_614611_614761_616434
761972	contig_13244_pilon	-	1059	5	Intergenic	novelGene_86971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3014	junction_2	674.28234998404	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATAACTCTAGATTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299427	296057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254_297392_298566_299281_299397
761973	contig_15410_pilon	+	919	6	Intergenic	novelGene_130608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	746.278071498821	15	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	155	622	145617	148093	TRUE	25	TTAATCCTTTGATCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145462	148533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070_148150_148292
761975	contig_19735_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_167881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTTTGTGTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48940	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_+_48900_50700
761976	contig_4964_pilon	+	1037	2	Intergenic	novelGene_157247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTACAAGTCAGAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35071	36271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_36010_36172
761978	contig_12626_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_80438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141999	136417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_138094_141803
761984	contig_4797_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_6900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320711	322512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_320700_322500
761987	contig_7426_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_27509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCTGGGCAGGTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965671	963469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_963500_965700
761988	contig_7912_pilon	-	2798	4	Intergenic	novelGene_129571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	3.55902608401044	173	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	439	2193	215562	198181	FALSE	15	CTTTAATCTGGGAGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSREYSGDLEWSSRLQGPVIFEDVFVYFSQEEWGLLDEAQRLLYRNVMLENFALIASLGIASSRLHKVTQLEQGEEPWMPDQVDMIPAPARTAQRGPGPGCWHGVEEEETPSEQSVSVEGVSQIRTPMAGPCTQKTHHCDICGSILKDILHPAEHQGSKARQKLYMCWACEKQFWFSANLSQHQKQHSGEKFIKRDECRDPGKSCRVYMPEETYTYREGGKDFPTTTGLLQPEVPHSGVKPHKNTQCGGTFCTGQRHCKCSKCRKAFSPKDSLVQHQRIHTLDRSYECSECGNFFSCNSNLVRHQKVHTGARPYICSKCGKAFNCKDTLVRHQRIHTGERPYECSECGKLFSQSSDLFKHQTVHTGERPYECSECGKFFRQISGLTEHRRVHTGERLYQCGECAKFFSSKSNLIRHQEVHTGARPYVCNECGKEFNRKHTLILHKRIHTGEKPYVCSECGKAFSQSSHLIVHWRTHSSDYECSKCEKAFSCTSKLIQHQKVHTGEKPYECNKCGKAFTQRPNLIRHWKVHTGERPYICSECGKEFNRKHTLVLHQKIHTGDKTSVQQMWKIISPKQPSGERA	216000	197575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_199632_200203_200327_200856_200984_215508
761992	contig_6726_pilon	+	1619	10	Intergenic	novelGene_86239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	868.832564244319	5	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	578	1135	308170	327083	TRUE	15	TTGTGAATTTCCTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISIKRQGAHPHRA	301023	333182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_301545_308113_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_327052_327143_331125_331229_331541_331677_332995
761994	contig_9698_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_82499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213338	211439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_211400_213300
761997	contig_3942_pilon	+	2611	23	Intergenic	novelGene_128607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_11	61.3628451127437	17	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	443	1606	94973	109131	TRUE	25	AGCTGACCATGACTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSVCVQVCPPGLRLLQNLLRGPGTLPALGFQFLLHLPSPSSTGRTVGVSPPQAHTCFSLWAGTGQEPAGVSTAAIRMSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPVSTKELAEFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASNGTPVGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKSKEEVVGTLDAVQVFAGVNQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAEAKTKKAAESLRRSVEKYNSARADFEQKMMDSALRFQAMEETHLKHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNIENVSVEMLLRKFAETKGTGQEKPGPLDFETYSAAALQEGNSETFAGCQGLSPSRTEPAGATCSCRLRGT	89354	114673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_89408_94440_94548_94690_95234_100708_100801_102070_102146_103074_103217_105002_105156_105389_105495_106708_106808_106893_106991_108228_108278_108393_108467_109113_109139_109545_109604_110061_110241_110324_110350_110722_110775_111328_111421_111716_111991_113435_113549_113656_113730_113877_113987_114650
761998	contig_8616_pilon	-	417	3	Intergenic	novelGene_72436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	584.5	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTGGTACTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254372	253303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253516_254087_254223_254302
761999	contig_11978_pilon	+	821	6	Intergenic	novelGene_62996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	352.703274722535	1481	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	100	744	1517714	1527267	FALSE	5	CCTACTGCTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVVDTRGHSAMTFYSTFSSHHSAQRLKFRLNLYELKEGRQIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPDMDPEHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD	1517283	1527344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683_1517869_1520273_1520442_1523599_1523778_1526094_1526190_1527218
762001	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
762002	contig_16775_pilon	-	1982	11	Intergenic	novelGene_107799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	67.4389353415369	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	334	870	227954	203129	FALSE	75	TGAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNIKPLLSTFSQLPGSENEKKCTLDQAFRGVLEEEIINHSSCENVLAIISLAIGGVTEGICTASTPFVLLGDVLDCLPLDQCDTIFTFVEKNVATWKSNTFYSAGKNYLLRMCNDLLRRLSKSQNTVFCGRIQLFLARLFPLSEKSGLNLQSQFNLENVTVFNTNEQESTLGQKHTEDRDEGMDVEEGEMGDDEAPTTCSIPIDYNLYRKFWSLQDYFRNPVQCYEKISWKTFLKYSEEVLAVFKSYKLDDTQASRKKMEELKTGGEHVYFAKFLTSEKNPILMFDCLY	233446	202016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_203162_209277_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219486_227461_227558_227944_227994_228445_228565_231987_232055_233245_233307_233399
762003	contig_9440_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_59059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATCCAGTCTTAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501581	500082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_500100_501600
762005	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762006	contig_5936_pilon	-	1560	7	Intergenic	novelGene_53572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGAAGAAACTGACATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446842	223990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_224055_251613_251762_351319_351442_428228_428904_439998_440102_441240_441424_446577
762009	SIRV2	+	649	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGGCCTACGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1739
762011	contig_12566_pilon	+	1733	1	Intergenic	novelGene_85990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	5	18	412	429	12481	12498	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDSTAPNNNIHAYSCSPKGFFGSGWRWQLTDPNLSLFLTFTSEVKILENRDWSNKNSVAFNLLYFLIGIWSRDIRYKSNLPLTEINKILKNLESKKLIKAVKSVAVSSFLFSAPKYSLNVCCFKCIRGFYCSLSYVMIENK	12069	13802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_12100_13800
762014	contig_8581_pilon	-	1290	7	Intergenic	novelGene_22844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	610.750540091634	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	24	791	366792	306855	FALSE	35	TTTGTACCAACTCAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDMILPHPPCHSA	366815	306355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306889_339321_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650
762016	contig_3426_pilon	-	1956	14	Intergenic	novelGene_57920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	202.668149195242	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	134	1642	196454	146453	TRUE	15	TGGGCCTCTTGTGTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVNYYEKHALYRKMKLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSTPQRTVKALYDYKAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGARIQQYFPSNYVEDISTVDVEELEKQIIEDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDKNPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLRRGTLLFLSPASEAARRAEQPAFFVRHTPELAQHQPGPGRPG	196587	145115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146582_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179602_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403
762021	contig_14167_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_105537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAACAGATGAAAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53591	54696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_53600_54700
762023	contig_12464_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_68677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTGTAGCAATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178938	179342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_178900_179300
762025	contig_12644_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_44540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGACTGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480199	1478045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1478000_1480200
762027	contig_10434_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_82050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCGAAAGCAGATTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160172	160503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_160200_160500
762028	contig_10434_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_82060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAACTAGATGGTGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165026	165741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_165000_165700
762030	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
762031	contig_14666_pilon	+	1327	13	Intergenic	novelGene_39492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1212.08226480989	2	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	72	809	307541	322710	TRUE	30	GCAAAAGATGTGACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAYATLGARVRAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGDSEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLQNLLATLLLRMLLPSPARTLA	304089	323511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_304123_307502_307576_315320_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322353_322398_322434_322677_322746_323028
762033	contig_9706_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_21043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTGGCTCAGCAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678488	677543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_677500_678500
762034	contig_11505_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_140941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	741	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1286	1606	336310	336630	NA	60	ATCAGAAGGCAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLTPKTVKPPTIQHPPIFWLYQKINKQMISPLKKKKYLPLKNEMRWDFLLLKNVSRATKKLGFTKQLIKIFFWVVQEGDTGTTDKTWWVSIHQTWLLLSCFFRG	335024	337088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_335000_337100
762035	contig_10377_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_115348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGACAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119091	118053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_118100_119100
762037	contig_2487_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_148472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCCTCCAAACAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166377	165914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_165900_166400
762043	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	3	1165	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762046	SIRV1	-	243	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	0	3587	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
762047	contig_6710_pilon	-	501	2	Intergenic	novelGene_97987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
762051	SIRV6	+	528	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	19	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762061	contig_14563_pilon	-	2269	2	Intergenic	novelGene_135048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	821	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTCCAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126710	122135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_122953_125258
762065	SIRV4	-	224	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1299	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3859	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
762066	contig_6710_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_97950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
762067	contig_3948_pilon	-	1156	3	Intergenic	novelGene_53303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_2	409.5	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	357	833	1473341	1468245	FALSE	20	TCATCAACAGGTTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1473697	1467921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199
762068	contig_15114_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_121212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCACTTACTGCTCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944408	945344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_944400_945300
762069	contig_2703_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_101679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189057	189970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_189100_190000
762073	contig_854_pilon	-	1369	10	Intergenic	novelGene_36424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	135.240526470433	24	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	462	1199	1074187	1064774	FALSE	40	AGGCAAGGTTGAGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKKEIAEMRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081779	1064603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075879_1081556
762074	contig_7963_pilon	+	814	4	Intergenic	novelGene_58387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1605	junction_2	854.026281146481	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	747	67	813	51450	57919	FALSE	10	ACCGGGGGCCTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPR	51383	57920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782
762075	contig_12528_pilon	-	1614	11	Intergenic	novelGene_81335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_10	557.381458249196	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	664	1488	966228	933323	FALSE	10	CCTTTTAATTTGGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968119	933196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956166_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967137_967293_967656
762077	contig_14666_pilon	+	1296	4	Intergenic	novelGene_39529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	88.3830049022749	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	18	443	447510	448384	TRUE	10	GGTATCGAGTCCGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVSRALSVARLVPLTLALPWRHEFARFVSG	447492	449327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_447609_447970_448067_448153_448769_448858
762078	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
762079	contig_14954_pilon	-	2333	25	Intergenic	novelGene_165174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	26	junction_10	35.4659216322123	33	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2295	38	2332	71262	64746	FALSE	30	AGGTCTGCCACCAAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGPPRPPWPGPMAQIPDGISCELRGEITRFLWPKEVELLLKAWLPEREGADRSHVLALLRWRAYLLHTCLPLRVDCTFSYLEVQAMALQETPPQVTFELESLPELVLEFPGVTALEQLAQHITVAIKKVFPRSALGKLFRRPTPPSMLAQLERSSPSEATTPGSPCGGFLETYEALCDYNGFPFREEIQWDVDTIYHGQGCRHFSLGDFSHLGSRDLALSVAALSYNLWFRCLSCVDMKLSLEVSEQILHMMSQSSHLEELVLETCGLRGDFVRRLAQALAGNSSSGLQELSLAGNLLDDRGVAALSRHLEQRPGALRRLSLSQTGLTPKGMRALGQALATNVAFDSALIHLDLSANPGALGPSEDDGGLYGFLSRPNVLTFLNLAGTDTALDTLFAALSHGCCANLTHLDASRNVFSRIKSRATPAALQLFLSRAGALRHLGLANCKLPPDALRALLEGLALNTHIGDLHLDLSACELRSAGAQVIQDLVCDAGAVSSLDLADNGFGSDMVTLVLAIGRSRSLRHVALGRNFNVRCKETLDDVLHRIVQLMQDDDCPLQSLSVAESRLKLGASVLLRALGTNPNLTALDISGNAMGDTGAKMLAKALRVNTRLRSVVWDRNNTSALGLLDVAQALEQNRSLKAMPLPLHDVSQAQRSRPELTARAVHQIQASLWRNNRADPANSDHASCLQPRGLVSNPSEQEVNELCQSVQEHVELLGCGAGPQGEAAVRQAEDAIRNANFYLSVLPILYKAGSSPSHRWQLQQKLEVLLGQVG	71299	64744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_64836_64914_65044_66267_66370_66450_66614_66858_67032_67167_67226_67305_67403_67504_67587_67724_67795_67994_68100_68182_68260_68384_68463_68571_68685_68771_68859_68932_69028_69151_69241_69318_69395_69530_69605_69719_69791_69985_70078_70218_70344_70449_70513_70708_70760_70870_70966_71222
762092	contig_9318_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_172352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGAGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33507	35872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9318_pilon_+_33500_35900
762094	contig_9706_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_20922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1306	1722	163261	162845	NA	60	AAAAAAAAGCACTAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWLEKPNVTLAPHQHQQLHRTKQKLEKVILAFFISSPIEMHVVEYKVHYVPKRAHKIQLPPVKHKINSDFRQKLWERIPLSSTQNNPAHTNVSSKNNITEFTFFLKQDFLKQLLNINTIQWAISTLKDFLSLSGFLF	164566	162521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_162500_164600
762096	contig_8571_pilon	-	2716	1	Intergenic	novelGene_169167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATCAAGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381452	378736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_378700_381500
762102	SIRV6	+	343	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
762103	contig_6410_pilon	-	2037	8	Intergenic	novelGene_108624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTGGGCAGCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314654	299805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_299909_300669_300772_301579_301637_306339_306396_306809_306944_310257_310369_312963_314090_314306
762107	contig_5649_pilon	-	2393	9	Intergenic	novelGene_82262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	148	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGTAGGTAAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35837	12697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_12865_21098_21258_23145_23292_25890_26066_26796_26889_28295_28456_28944_29096_33633_33779_34639
762112	contig_6479_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_160628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAATCTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710504	712495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_710500_712500
762113	contig_15327_pilon	-	784	4	Intergenic	novelGene_70697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2915.88709581759	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	127	537	901528	900904	FALSE	25	ATGTTTCTGTATGTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	900656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902040
762114	contig_16846_pilon	-	1023	5	Intergenic	novelGene_82958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	97	639	555239	551246	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDDYKDMGGSR	558746	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551271_551492_551665_552661_552824_555055_555278_558688
762115	contig_9727_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_86292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAATTATTATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242936	242160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_242200_242900
762121	contig_4413_pilon	+	1128	7	Intergenic	novelGene_116981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	110.400281803183	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	516	857	139615	152361	FALSE	20	TGTATATATTGCTTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	125862	152632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131813_131906_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
762123	contig_366_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_51606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCCAGGGGGAGCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803536	802827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_802800_803500
762136	contig_6710_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_89092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGACGATAGGCGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653600
762138	contig_5279_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_105559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCCCCAGAAAAGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295406	294585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_294600_295400
762139	contig_5279_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_105556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAGAAGAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293712	292819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_292800_293700
762141	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	437	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762142	contig_12528_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_81349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984760	982784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_982800_984800
762145	SIRV6	+	270	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	32	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11033_11109_11205
762150	contig_7272_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_25355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAAAGACGAAGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597759	598897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_597800_598900
762152	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8135	-1	604	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTTGTCGAAATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762153	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	51	520	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
762154	contig_18869_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_56230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73534	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73500
762155	SIRV6	+	527	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	14	20	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762157	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	8	1155	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762158	contig_16261_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_155301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	46215	45657	FALSE	25	TATGGTTATAGCTATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQSGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAEDAAVYYCLYG	46241	45656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
762160	contig_10617_pilon	-	1312	5	Intergenic	novelGene_172355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTCGTCCGAGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106887	87294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10617_pilon_-_87423_91883_92043_98397_98572_100549_100625_106111
762162	SIRV2	-	235	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	689	24	689	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGACGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4043	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
762164	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762167	contig_18734_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_172359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4184	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18734_pilon_-_1600_4200
762168	contig_12644_pilon	+	1502	3	Intergenic	novelGene_44696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	80	junction_2	29	668	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	124	423	2681962	2684473	FALSE	20	CACACTTTGGGGTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRLQELRKEEETLLRLKAALHDQLNRLKVEELALQSMINSRGGDEMLSSQSAPEQSQDTLVHVDNEASINQTALELSTRSHALEEEEEEEEEEESDS	2681838	2685552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2682052_2683290_2683381_2684353
762170	contig_5105_pilon	-	2800	2	Intergenic	novelGene_168906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAATATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81661	77588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_-_80306_81578
762171	SIRV4	-	321	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1197	3	1197	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3961	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762172	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
762173	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762176	contig_6058_pilon	-	1572	8	Intergenic	novelGene_172416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	423.912197300819	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	283	1155	398054	390684	TRUE	30	GCTGTAACCAAAATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQENRQCSFGLAELWAPDGVLILPRKRRQLIWQRYYPEQTSVFAVCHQNAGEPSRRWEQ	401574	386357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_386685_387840_387923_390675_390857_390978_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
762177	contig_12125_pilon	+	1578	2	Intergenic	novelGene_76226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	212	601	384800	385745	FALSE	50	AAAAGTGATTCATTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLDVVELAEPEEVEVLEPEEDFEQFLLPVIHEMREDIAALTRERGRAYLRTRGKLWEMDNMLLQIKTQVEASEESALNHLQNADDGAAARGEKAEEKAREMAKMAEMLVELVRRFTASGSGQLMEIG	384588	386722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_385147_385702
762178	contig_10477_pilon	-	2425	18	Intergenic	novelGene_112496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	63.7531463366324	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2139	287	2425	469011	315042	FALSE	40	TTTTCAAAGGTAAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSDPNFWTVLSNFTLPHLRSGNRLRRTQSCRTSNRKSLIGNGQSPALPRPHSPLSAHTGNSPQDSPRNFSPSASAHFSFARRTDGRRWSLASLPSSGYGTNTPSSTVSSSCSSQEKLHQLPYQPTPDELHFLSKHFCTTESIATENRCRNTPMRPRSRSLSPGRSPACCDHEIIMMNHVYKERFPKATAQMEERLKEIITSYSPDNVLPLADGVLSFTHHQIIELGRDCLDKSHQGLITSRYFLELQHKLDKLLQEAHDRSESGELAFIKQLVRKILIVIARPARLLECLEFDPEEFYYLLEAAEGHAKEGQGIKTDIPRYIISQLGLNKDPLEEMAQLGNYDSGTAETPETDESLSSSNASLKLRRKPRESDFETIKLISNGAYGAVYFVRHKESRQRFAMKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMYCSFETRRHLCMVMEYVEGGDCATLMKNMGPLPVDMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLVTSMGHIKLTDFGLSKVGLMSMTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVILRQGYGKPVDWWAMGIILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVISDEINWPEKDEAPPPDAQDLITMLLRQNPLERLGTGGAYEVKQHRFFRSLDWNSLLRQKAEFIPQLESEDDTSYFDTRSEKYHHMETEEEDDTNDEDFTVEIRQFSSCSHR	469297	315041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_-_315146_315364_315488_324865_324968_326998_327165_328035_328169_329567_329707_331134_331344_338679_338766_341793_341862_347283_347417_348952_349055_354985_355196_358030_358107_360657_360816_367596_367676_371539_371610_410967_411057_468919
762183	contig_19215_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_172427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14578	15587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19215_pilon_+_14600_15600
762185	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762188	contig_7630_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_133641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGCTCTGTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422778	424250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_422800_424200
762189	contig_9995_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_47737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCATAGGATATTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531551	533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_531600_533100
762199	contig_6870_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_103933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTCATCAGAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163295	1161799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1161800_1163300
762202	contig_21013_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_38519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGCCACAATGCTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51586	49708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_49700_51600
762203	contig_6227_pilon	+	1425	2	Intergenic	novelGene_49618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAATGATACAGAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331252	336303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_331762_335387
762204	contig_6247_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_172428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAACAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66212	68664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6247_pilon_+_66200_68700
762205	contig_10732_pilon	+	2575	7	Intergenic	novelGene_114665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	27.5600354781259	26	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	808	1221	24572	25737	TRUE	20	CGTGGGAAGGTAATGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDIHHVGSKKKKRKRVEGLHGEQDHRRDPAMHSRCSPSADTQPDAAAESPRKKRKKKQRKHESQQEVEENEHQNGQRWDRQNDPPVPELSSHLPTVNVFLPRAGHVLNRLAACSSAKTLSKTWPGGQDAAHTTFKA	20772	28928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_20968_21647_21779_24090_24673_25273_25468_25618_26883_28070_28173_28821
762209	contig_3602_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_60632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976621	978545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_976600_978500
762210	contig_10734_pilon	-	1248	6	Intergenic	novelGene_51291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1396	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGACGCCACCTACCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389499	1368559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1368651_1369478_1369599_1377317_1377451_1378314_1378360_1378531_1378628_1388736
762215	contig_3018_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_78825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAACTTCACATAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549233	550632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_549200_550600
762217	SIRV4	+	293	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1462	648	1007	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACTTTAACCGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2462	2755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
762219	contig_6710_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_94307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
762222	contig_19890_pilon	-	1442	7	Intergenic	novelGene_138541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.72890292891	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	23	1198	107277	96005	FALSE	20	TTCAATTTGAACTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLELGEMAESAALVWIRGPGSGCKAVRCASARCSVWDFIHRYCQDQDVPVEYFFVKCNGALINTSDAVQHGAVYSLEPRLFGGKGGFGSMLRALGAQIEKTTNREACRDLSGRRLRDVNHEKAMAEWVKQQAEREAEKEQKRLERLQRKLAEPKHCFSSPDYQQQCHEMAERLEDSVLKGMQAASSKMVSAEISERRKRPNKSRTSGGASAEKRKCFWLGMDGLASAEGSSSESSDDDSDPAPSTSGTCCQSPRNGSDGVEMAAEFPIGCHRPEVLSADSGSPEKLQKNSVIDSGKDTSKDSRAKLEETWTEEQTERKMPIETEEAQENKEAESKAARAGPNGEEETKEMTDGERAAKVARGQDRENIPAYWSGNCRFTGIQLCCRIGVAGFGSTQV	107299	95760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_-_96091_98286_98742_101036_101152_101934_102105_102422_102535_103342_103461_107157
762224	contig_18081_pilon	+	1384	4	Intergenic	novelGene_23777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	26	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	70	621	90717	112338	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90647	113101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
762226	contig_8122_pilon	+	2394	7	Intergenic	novelGene_40214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	33.7906134237832	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	989	1588	397575	398906	FALSE	20	TTAATGTGTGAGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRVPTLEGVPEGVDPSYQGGHRCNKHCQGWLVDLAGAHLPVLQITWTARYSSQAGDIHPAEIQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLQEVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLSCPGRYRGQGAGGLGRQQGWVITSVSSHGPHRSGLSWPH	371333	399712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_371432_372465_372567_384847_385069_385968_386090_397038_397120_397208_397887_398618
762233	contig_10197_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_115258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAACAGAAAAAGCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059894	1060946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1059900_1060900
762234	scaffold_880_pilon	+	1443	8	Intergenic	novelGene_121462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_6	239.728417768345	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	65	1165	456080	492591	FALSE	5	CTTGGGGGGTGGGGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLRLEISPAPEILNCCLTPEMLPLRPFSENRTRPHKEILEFPTREVYVPHTVYRNLLYVYPRRLNFASKLASGRNITIKIQFMCGEDASNALPVIFGKSSGPEFLQEVYTAVTYHNKSPDFYEEVKIKLPAKLTANHHLLFTFYHISCQQKQGALVESLMGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAERVPLQNPPIKWAEGHKGVFNIEVQAVSSVHTQDNHLEKFFTLCHSLESQVTFPLRLLDQKISEGMLEHELKLSIICLNSSRLEPLVLFLHLVLDKLFQLLVQPMVIAGQTANFSQFAFESVAAIANSFHNSKDLSKDQHGRNCLLASYVHYVFRLPEPHRDAPKSGRVAGGESGGGGRPHSPPSPCTSK	456015	492869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_456181_479497_479616_482290_482362_484798_484938_485540_485643_488541_488638_490479_490715_492352
762238	contig_11364_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_65185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTGTTTACAATGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219458	217303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_217300_219500
762239	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762247	contig_5485_pilon	-	1468	8	Intergenic	novelGene_37741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	48.1396777246023	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	57	677	357599	355208	TRUE	15	TTCCTGAGTTGGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAAAKGSELSEKIESFVEALKRGGGRRSSEDMARETLGLLRRIITDHPWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGNMVRRVLKIIREEYGRLHGRSDESDQQESLHKLLTSGGLNEDFSFHYAQLQSNIVEAINELLVELEGTTENIAAQALEHIHSNEVIMTIGYSRTVEAFLREAARKRKFHVIVAECAPFCQQVLRQLS	357655	352287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_352833_354028_354096_354566_354705_355166_355232_355909_356074_356936_357086_357193_357315_357436
762248	SIRV2	+	545	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-71	49	-71	-49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCGTCTAACTTCGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	1582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1600
762249	contig_3975_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_54813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACATTGTTATATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2042549	2042997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2042500_2043000
762250	contig_10235_pilon	-	1457	3	Intergenic	novelGene_46371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	12	476	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	201	1277	151992	150122	FALSE	15	TTTTGTGATCTATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPSLITFTPASDSSDLWKDGQQQQQQPQPKEPEPALDGSAVRAFYESLIGSESSPPEPQRSQSEPARERNRKKRRLMREAVAAVAAAASGGRGQEGSLEAEDKMTQWILRAAQEGDLAELRRLLEPREAGGAGGNINTHDAFWWTPLMCAARAGQGAAVRYLLGRGASWVGVCELGGRDAAQLAEDAGFPEVARMVRESHGETRSPENRSHSHSSQYCETCDAHFQDANHRTSTAHLLSLSQGPWPPNLPSGVPASSPGFKLLLRGGWEPGMGLGPRGEGRANPIPTVLKRDQEGLGYRSAPQPRVTHFQALDTRAVAGRERAPRVTMLSQKEERRREEKSRAWERDLRTYMNLEF	152635	149941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_150567_151360_152100_152542
762251	contig_12570_pilon	-	2051	4	Intergenic	novelGene_79389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.6749164809655	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	32	844	300289	282529	FALSE	60	AAAAAAAGTACAGTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLQLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVGEPRSRLGGVGCRKRGLGWVLQGDTEMGQPHPCLHRAYILDWNRNTSR	300320	281321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_282875_283523_283699_284049_284259_300206
762253	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762258	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
762261	contig_348_pilon	-	2212	10	Intergenic	novelGene_67620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	44	junction_9	37.9876523148649	131	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	138	1742	351183	346839	FALSE	20	GGCGAGAACGTGTGCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRAPDVGLRRQGGAGGLGPDLAGTGNRGPPAHRPEPPSAGPRDAMDPRAVANAVETGEEDAIMDALRTYNRENSQSFTFDDAQQEDRKRLAGLLVSALEQGLPPSRRATWLQSLRILSRDRGCLDRFTSRPSLQALARYAGILPSEGPDPEPPEMDVVLESLKCLCNLVLSSPAAQVLAAEARLVVKLSERVQLYGQRSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQQLFRELQGVRLLTHVLELTLGASPEESPPKLLPAQETERAMEILKVLFNITFDLVKREVDEEDTVLYRHLGTLLRHCVMVSAAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLECLDVLLTPELHAGSLEFMGVNMDLICALLDFLERRLDQTHRLKESVAPVLSVLTECARAHRPARKFLKAQVLPPLRDVSTRPEVGGLLRNRLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCAESVPRFVKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRASAQYSEEEDTDTEEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMDGMTEEQKEHEAMKLVNMFDKLSRHQVIQPMSISPCGHLTSLQDAMGQTMEGQLSSDPDSDPDSDPD	351320	346368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_346972_347234_347355_347599_347745_347811_347957_348039_348136_349147_349299_349683_349776_350160_350752_350837_350886_351099
762264	contig_205_pilon	+	1831	2	Intergenic	novelGene_144322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTGTGCTTGATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300298	302302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_301906_302078
762265	contig_10011_pilon	+	2141	8	Intergenic	novelGene_68105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	97.177094806863	2	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	163	1134	326103	332126	TRUE	30	GCTGGGCTTCATGAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQYSVLSPGPRQ	325940	334185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_332093_332229_332413_332447_332994_333402_333720
762268	contig_5964_pilon	+	2600	4	Intergenic	novelGene_80353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	14	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTGAAAAATGAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22766	34173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_23448_24583_24651_31471_31619_32468
762269	contig_15304_pilon	-	1044	3	Intergenic	novelGene_30528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	181	1005	54100	52925	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54280	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
762271	contig_7630_pilon	-	1983	2	Intergenic	novelGene_133665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	0	63	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAGTTGTAAGAGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547866	545795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_546962_547049
762272	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
762273	contig_8304_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_153185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTGTCTTAAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161989	160196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_160200_162000
762274	contig_500_pilon	+	914	5	Intergenic	novelGene_30982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	608	junction_1	492.197305457882	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	66	614	1466134	1480676	FALSE	0	GTTTTTGGTTTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1466068	1480976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
762275	contig_7202_pilon	-	144	1	Intergenic	novelGene_16427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27766	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
762278	contig_6102_pilon	+	2144	11	Intergenic	novelGene_32272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	48.7381780537599	1	92	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	52	1260	1444370	1448424	TRUE	30	AGCCCACACCAGACGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGEPGGLVRASLASGRLRTHHSLIIARPP	1444318	1449521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448581_1448676_1448785_1448901
762281	contig_10732_pilon	-	3535	1	Intergenic	novelGene_114712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	205	543	134696	134358	NA	15	CCACTCTCTCCGTAGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRAHLRGLRTRVCSFLGSAHNRTPTHAGLPRTPVTGPNPDRCSGLGRAWERGQGSKKQNGRESKRKSKAGKFLITEGGYVPGVPCCVAETSAMEHHCGPRGTFHVERKQT	134900	131365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_131400_134900
762282	contig_5423_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_85186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTTGACCTGTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190783	189727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_189700_190800
762290	contig_8907_pilon	-	767	4	Intergenic	novelGene_85807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1806.20861352047	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179859	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391
762291	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
762292	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
762301	contig_14513_pilon	-	1050	5	Intergenic	novelGene_70390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1456.8293268259	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	198	374	18880	14965	TRUE	55	TTATATATAGGAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKTLLLLKLHKLI	19077	11321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11559_11778_12158_13087_13136_14952_15001_18739
762304	contig_18799_pilon	+	2853	1	Intergenic	novelGene_171426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCTAACGTCTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74296	77149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_74300_77100
762305	scaffold_19766_pilon	+	2413	5	Intergenic	novelGene_34373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.27760839478607	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1179	1976	726532	727329	FALSE	20	TTACTTCTACTTGATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722154	727766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722248_723435_723738_723925_724236_725832_726071_726296
762309	contig_8850_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_172430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTGGGTCTCCCACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22147	22373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_22100_22400
762310	contig_3975_pilon	-	849	8	Intergenic	novelGene_54887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_5	113.885728621603	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	141	794	2096423	2091957	FALSE	35	ATTAGTCTGGAAATACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSYSSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2097539	2091901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473
762311	contig_2770_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_107415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	169	312	186802	186945	NA	25	ACTCGACTTGATGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLVSSLAWIQPPRVCLVWHTTIACPPNLPPHLTWQSLCLLSELSFSSTRLLSFAHMSSKCVPCIWHRIYTDSLNRTLQEISTRLTPLLQTAFELSQPPPGLK	186633	187187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_186600_187200
762312	contig_12622_pilon	-	2288	7	Intergenic	novelGene_5768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_6	176.164459147317	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	104	1009	104350	99825	FALSE	65	TGGAAAAAAAAAAAGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLGENSLDPLTTDSRKRKLPCDTPGQGLTCSGEKWRREQESKYIEELAELISANLSDIDNFNVKPDKCAILKETVRQIRQIKEQGKAISNDDDVQKADVSSTGQGVIDKDSLGPLLLQALDGFLFVVNRDGNIVFVSENVTQYLQYKQEDLVNTSVYSILHEEDRKDFLKNLPKSTVNGVTWTNETQRQKSHTFNCRMLMKTPHDVLEDISPSPEMRQRYETMQCFALSQPRAMMEEGEDLQSCMICVARRITTAERVFPSNPESFITRHDLSGKNFVCVYSFLKCFISVSVSTACIVI	125349	98545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_100007_100175_100365_100739_100915_102625_102727_103191_103365_104264_104370_125265
762315	contig_9272_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_125994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGTGTGCTAGTATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814941	816811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_814900_816800
762319	contig_7593_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_127323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGATGACTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454014	455277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_454000_455300
762320	contig_2036_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_131840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1509	1841	621489	621157	NA	50	GTGCTTAAATAATAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIDTSIICPVARAKNLDVVFDSLCVCVCVCVCVCVLSSPTSNPSPSYLENISHLCPVLSICSAILRHRVVIFPVDYRVSQLTSCSTLALMQSRLSRGIIVMALYPLPT	622997	620168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_620200_623000
762321	SIRV5	+	316	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-25	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8290	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8569_10875
762326	contig_6227_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_49637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGACTCCAAGCGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365512	364683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_364700_365500
762330	contig_1443_pilon	+	1550	14	Intergenic	novelGene_28223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	57.0591927675983	2	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	23	1414	536007	541708	FALSE	30	TGGAAATGAATTTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFASGFMVAASGLKYLLTLGGWRRGRGVVPQSRALAILVPGMSQVDNKSDFLEKKPHRQHPGILQLPHVRLPQALANAAQLLLLESSVSNVEKQVQALTNYLWSRHLPVEPEELQRRAMHLEKKFLENPDRAQAEEKLHGAVLSALRRTTYHWQELRYNEKLSLVYMAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535984	541844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536468_536604_537644_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
762333	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762335	contig_7744_pilon	-	2045	9	Intergenic	novelGene_62479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	42.4911755544607	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	255	1511	490626	487677	FALSE	25	GTAAGTTCCTGGACAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRRAPELYRAPFPLYALQVDASAGLLIAAGGGGAAKTGIKNGVHFLQLEQINGRLSASLLHSHDTETRATMNLALAGDILAAGQDAQCQLLRFQTHWQKGSNKAEKAGSKDQGPRQRKGAAPAGQKSGAETHCEGVELSVEDLQVVQTDFSADPLQKVVCFNHDNTQLATGGTDGYIRVWQVPSLKKVLEFKAHEGEIEDLALGPDGKLVTVGQDFKASVWQKDQLVTQLHWQENGPTFSNMPYRYQACRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	490880	487142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_488678_488866_488992_489090_489172_489350_489572_489750_489944_490491
762336	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762338	contig_10000_pilon	-	380	2	Intergenic	novelGene_139349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	67	378	343543	338718	FALSE	25	TCAGCACAGCCAAGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHNMMGPSPGPPSVSHPMPPMGSADFPQEAMHPMHKPIDGMHDKGIVEDIHCGSLKGTGMRPPHPGMGPPQSPM	343609	338715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_338832_343345
762339	contig_10000_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_139347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332676	331436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_331400_332700
762341	SIRV6	-	376	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8956	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	473	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10776	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723
762342	contig_3627_pilon	+	1865	8	Intergenic	novelGene_78540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	240.052885329675	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	440	805	670480	676255	FALSE	50	TAAACATTAAATTCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	642295	677315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_660439_660516_661658_661776_670412_670520_672027_672097_673913_674057_676141
762345	contig_12250_pilon	-	1330	8	Intergenic	novelGene_80721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_4	172.533226613642	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	87	650	401239	399347	TRUE	30	TGTTACCCATCAACCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401325	398588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
762346	contig_5264_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_165060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATACAGATGGCTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261521	263843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_261500_263800
762351	contig_9406_pilon	+	1093	2	Intergenic	novelGene_136171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATATTCCTCCCTCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90456	92370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_90479_91299
762352	contig_2100_pilon	+	1362	3	Intergenic	novelGene_50595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	542	850	671150	671458	FALSE	15	AGGGCATGGACCCCTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDHYEFLRVGQYNEEFVCEGQNSRACPGRFWGLMSPHLHLGAASMDAHNWLDLIWESTPMMPSCLAQASCRIPSPLSHALRSELLAVCMCHTSDLKCRAWA	668983	671970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_669101_670290_670493_670927
762353	contig_17500_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_157930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAAAAAAATCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285075	287088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_285100_287100
762355	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762356	contig_4413_pilon	+	910	5	Intergenic	novelGene_116984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	38.7653195524041	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	11	484	126062	139689	FALSE	25	TGACAGTCCATGGTACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSMAAVDIRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQGR	126051	140115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572
762358	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762359	contig_5758_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_119080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1906	2289	148206	148589	NA	30	AAATCCACCAGCCACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANLIKIQTNTSRPLPKISQYLLKKKAKEGLAPIIQDILAKVLIIPCTSPVTPVFPVKKPNNRGWRFVQDLQAINCIVIPGLPVVTIPHLFLSNVPPEAIHFTVVHLCTVFFSIPISPMKPGWNSG	146300	148607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_146300_148600
762363	contig_12950_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_114798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATATAAATCTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204391	201529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_203702_204291
762365	contig_12257_pilon	+	1962	5	Intergenic	novelGene_152106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	24.914855006602	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	170	1834	151413	158899	FALSE	25	CCGTTCTATAGGAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYCKKSFKRLKSHLPYCKMVGATVAAEQKVCQAKPATLSHTDKRNGPIKDVIKAKETTLETEREERTTKLIRNKPKRTTKSLPLLGLKKASNTKTEKYIKNQIQLSPKMLKNTEPKITLQAETKAQFHASENTSPKRELATDVPKSGDSRNNPSEAEASLLLGPMEPFSSNQDRQSSPGLARDVQTPSASLKSDKINLLRQELLVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLKLPRWRK	148854	159027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149449_149522_151405_152947_157405_157514_158876
762366	contig_414_pilon	-	2074	3	Intergenic	novelGene_115108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	857	1633	373842	373066	FALSE	25	TGAAATGCATGATGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384168	372624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376543_376898_383938
762368	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762372	contig_1618_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_141786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202302	204530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_202300_204500
762373	SIRV6	+	239	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8471	-1	268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTTGCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
762375	contig_15664_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_171507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57033	58391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_57000_58400
762377	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762378	contig_12697_pilon	+	1368	8	Intergenic	novelGene_122835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	90.9386426921684	219	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	164	1366	304354	346288	FALSE	25	GTAAGATGACCCAGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRPGLRPWRPAFSCGAAGPSASRCCLSAAVPVPAPAIWDSLRSPSRAWPCSAAMPRARRASPPALLRTDGFVGGRWLPARAVFPVYDPASGAELGKVADCGAPEARAAVRAAYEAFCSWREVSAKERSSLLRKWYDLMIKNKEDLAKIITAENGKPLKEAQGEILYSALFLEWFSEEARRIYGDIIYTPAKDKRSLVLKQPVGVATVITPWNFPSAMITRKVGAALAAGCTVVVKPAEDTPLSALALAELAKQAGIPPGVYNVVPCSRKKAKEVGEALCTDPLVSKISFTGSTATGKILLHYAADSVKRVSMELGGHAPFIVFDSANVDQAVAGAMASKFRNSGQTCVCSNRFLVQRGIHDSFVKKLAEAIKRDLRVGNGFEEGTTQGPLINEKAIEKVEKHVSDAVSKGATIETGGKRHRFGKNFFEPTLLSNVTRDMLCSHEETFGPLAPVM	304190	346290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_304570_309571_309656_312046_312218_314050_314168_325296_325441_337814_337959_340032_340192_346120
762381	contig_6589_pilon	-	1540	3	Intergenic	novelGene_26284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	146	1480	2274715	2272133	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEEAAKEQSGTIYLQHADEERENRPAESQVSLLVFTLCCLL	2289803	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272191_2273438_2274793_2289735
762385	contig_16951_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_98611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_3900_5100
762387	contig_15457_pilon	-	2170	6	Intergenic	novelGene_168451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	6.01996677731696	123	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	21	1055	21483	16330	FALSE	20	TGGTCTCAATTCCTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPAPRMVRPRHQPGGLCLLLLLLCQFMEDRSAQAGNCWLRQAKNGRCQVLYKTELSKEECCSTGRLSTSWTEEDVNDNTLFKWMIFNGGAPNCIPCKETCENVDCGPGKKCRMNKKNKPRCVCAPDCSNITWKGPVCGLDGKTYRNECALLKARCKEQPELEVQYQGKCKKTCRDVYCPGSSTCVVDQTNNAYCVTCNRICPEPTSSEQYLCGNDGVTYSSACHLRKATCLLGRSIGLAYEGKCIKAKSCEDIQCTGGKKCLWDFKVGRGRCSLCDELCPESKSDEPVCASDNATYASECAMQEAACSSGVLLEVKHSGSCNSISEDTEEEEEDEDQDYSFPISSILEW	21503	15214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15457_pilon_-_16413_17146_17378_18095_18321_18678_18898_19337_19530_21398
762389	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762390	contig_20939_pilon	-	2043	9	Intergenic	novelGene_172443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.5893762558247	274	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	13	867	102283	82224	FALSE	20	TATGGAGTCAGCTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPYHHDQLDRIFNVMGFPADKDWEDIKKMPEHSTLMKDFRRNTYTNCSLIKYMEKHKVKPDSKAFHLLQKLLTMDPIKRITSEQAMQDPYFLEDPLPTSDVFAGCQIPYPKREFLTEEEPDDKGDKNQQQQQGNNHTNGTGHPGNQDSSHAQGPPLKKRSNPHAAYPNPGPSTSQPQSSMGYSTTSQQPPQYSHQTHRY	102295	81047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_82350_85491_85588_85710_85790_86517_86616_89137_89211_89905_89976_92361_92506_99758_99891_102246
762392	contig_10982_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_87855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTAAAATTTATCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65928	68427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_65900_68400
762396	SIRV4	+	290	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAAGTCGTCCAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
762399	contig_12837_pilon	+	1972	6	Intergenic	novelGene_57303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3514.8	1	110	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTGGATTTTGTTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128681	167469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128721_129663_129811_159278_159404_161387_161494_163874_163973_166012
762402	contig_8617_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_73476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAATTCCGCTACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
762406	contig_13481_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_119473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGTAGAGGAAGAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297029	1297634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1297000_1297600
762407	contig_13481_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_119474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAACAAAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298367	1299942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1298400_1299900
762410	SIRV4	-	349	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1174	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3984	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762414	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	214	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762415	contig_16775_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_107783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATAAAAAAGGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143420	141227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_141200_143400
762416	contig_14184_pilon	-	1291	7	Intergenic	novelGene_66585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.057861755238	278	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTGTGTTGTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126314	88544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89179_91302_91348_91951_92112_103407_103502_105799_105915_109168_109327_126229
762419	contig_7707_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_72201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	84	326	676624	676866	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKNIDDGPYSHALVAGIDRYPRKVTAVMGKKKIAKRSKIKTFVKVYNYNHLMPTRYSVDIALDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	676540	676895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_676500_676900
762424	contig_15293_pilon	-	2852	1	Intergenic	novelGene_146530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGGGGACAGGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116216	113364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_113400_116200
762426	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762429	contig_16625_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_171108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTCACAGAATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25605	25372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_25400_25600
762430	contig_3130_pilon	-	2704	1	Intergenic	novelGene_103558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50634	47930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_47900_50600
762440	contig_9468_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_59478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTCATGGAAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206084	203697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_203700_206100
762443	contig_9535_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_124497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	112	411	609884	609585	NA	25	TAGATTGTCAACTTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHPPSPGSLALPRFPSRLDKAHPPYTQCPSLSWHTEHHCVSVCICFLSLSYFKKSKLDVHKHYLKSTVYKHLLSYFPGGSLFQPLANFSDIYSHVSE	609995	608741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_608700_610000
762444	contig_7720_pilon	-	1902	17	Intergenic	novelGene_155778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.541101317886	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	205	1308	860670	798987	TRUE	5	TCTCCGAGGCTCCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYSTRYGSPKRQLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872339	795752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796089_798728_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_859303_859346_860593_860723_872187
762447	contig_5765_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_141418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGAGCCCTGGTGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890813	891061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_890800_891100
762451	contig_18850_pilon	-	1135	4	Intergenic	novelGene_142446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	200.549799855852	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	16	480	193164	191238	FALSE	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAASAMDVFLMIRRHKTTIFTDAKESSTVFELKRIVEGILKRPPDEQRLYKDDQLLEDAKTLGECGFTSQTARPQAPATVGLAFRAALGAKPCCYLFADMEAEAQRLSSRLPGPAGASTMPGSFCGAFQLLPELHCTVQTWSVPILQMSKLSPGSWVTC	193179	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_191459_191759_191866_192915_193051_193161
762460	SIRV6	+	362	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11023_11109_11205
762461	contig_15474_pilon	-	1932	12	Intergenic	novelGene_136235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	38.4159488229426	136	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	159	1736	79269	70025	FALSE	15	CATGTGTGGCCCGAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPADASRRQRREKRRQLDARRSKCRIRLGGHMEQWCLLKERLGFSLHSQLAKFLLDRYVSSGCILCAGPEPSPPKGLQYLVLLCHAHSRECNLVPGLRGPGGRDGGLVWECSAGHTFFWDPSLGSTPPEVPRPVPLRCSARRSWCSETRSGQEEPAGLESDDGERTQESKLPRAVGPPPETSLHPGEEEKEEEEDEEDMLSDASPWTYSSSPDDSEPDAPRSPRPPPAPLPHSLKEEDTPPAPSDRPNLPATPSSSVSSLGSGLPLTVEIRIQPNLSGTPQVAQETEPPASPGSQTQSAPAPAWDEDTAQIGPKRIRKAAKRELLPCDFPGCGKIFSNRQYLNHHKKYQHIHQKSFSCPEPACGKSFNFKKHLKEHMKLHSDTRDYICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHRRKHAETAAALLFPCEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPAPLLGPQESSGPLNPSPSISIPGLLGSTEAPGAMQLGARPSVSPQAQALLPQK	80056	69828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_70350_70511_70612_73878_73994_75758_75838_75939_76018_76107_76339_76691_76815_76902_76952_78096_78364_78770_78803_79090_79283_79911
762462	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
762467	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
762468	SIRV2	-	442	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	4	-378	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCTCAACGCTATGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4477_4687_4801_5751
762470	contig_11815_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_50900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCCAAATTCAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146267	145283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_145300_146300
762471	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762474	contig_6975_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_74237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAATGACTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26149	26586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_26100_26600
762475	contig_6975_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_74238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGATTTTAATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26804	27234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_26800_27200
762477	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_93726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
762480	contig_14816_pilon	-	2536	10	Intergenic	novelGene_172450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	12	junction_9	13.0336695987691	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	56	652	65680	40533	TRUE	30	ATTTGTAGTGTCTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVAGLGAASGKRRRGWKMPVHSRGDKKETNHHDEMEVDYAENEGSSSEDEDTESSSVSEDGDSSEMDDEDCERRRMECLDEMSNLEKQFTDLKDQLYKERLSQVDAKLQEVIAGKAPEYLEPLATLQENMQIRTKVAGIYRELCLESVKNKYECEIQASRQHCESEKLLLYDTVQSELEEKIRRLEEDRHSIDITSELWNDELQSRKKEEGSFQS	65735	31367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_-_32994_34424_34552_36587_36628_38374_38440_40506_40592_41588_41686_52514_52595_56932_57061_60511_60603_65538
762486	contig_10143_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_163342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCTGCTATAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220298	218533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_218500_220300
762487	contig_10143_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_163341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGCAGTCATTGTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218126	217800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_217800_218100
762492	contig_5484_pilon	+	2325	1	Intergenic	novelGene_151090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139165	141490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_139200_141500
762493	contig_990_pilon	-	2079	5	Intergenic	novelGene_76124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.367093490257	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	442	474	1591046	1587039	FALSE	75	AATAAAAAAAAATTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMARKGEGEKY	1605900	1585433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587068_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
762494	SIRV5	+	2226	1	FSM	SIRV5A	SIRV504	2473	1	67	180	67	-180	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAGGAGGGGTCACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11200	13426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_11200_13400
762498	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
762499	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_94049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657812	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657812	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
762500	contig_6710_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_97201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	200	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
762501	contig_17601_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_172457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTAGGTTAACTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2901	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17601_pilon_+_2900_3500
762502	SIRV6	+	320	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	537	14	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
762511	contig_10324_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_7784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGCACCATGTGAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116290	115638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_115600_116300
762513	contig_13593_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_156110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGTTCCTCCAGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14749	16233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_14700_16200
762516	SIRV4	-	255	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1266	0	1266	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3892	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
762519	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762520	contig_15304_pilon	-	392	2	Intergenic	novelGene_30470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54295	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53186_54207
762521	scaffold_880_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_121511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGCTGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567018	564884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_564900_567000
762525	contig_8885_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_115572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAGACCTTTCTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59783	58742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_58700_59800
762527	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8136	2	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762530	SIRV6	-	326	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
762534	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762537	contig_15929_pilon	+	2140	3	Intergenic	novelGene_172465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	22	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	993	1340	88094	88441	FALSE	30	GTGTGCACAGGAACCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQASERRVDSEHRINTGRAVGAEPLANWIPDGAECSGRSMGGHWASALAAAQLSALEQVLLSSLPPWALSPSSWLLSCLAALRSAPLWPGIFCSSTDQPSAQQAQYPPTPGLC	82264	89241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_83350_83512_87310
762541	contig_8153_pilon	+	2642	1	Intergenic	novelGene_34813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGGAGAAGAAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152301	154943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_152300_154900
762542	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
762546	SIRV5	+	477	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
762550	contig_10196_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_132341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_3	70.2440191206499	532	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	139	381	2475895	2475087	TRUE	25	GCTAACATATCCTGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGPAADAALEGAEAEARPEASEDNEDDDEALPHSEVVDVFQEGLAMVVQDPLLCDLPIQVTLEEVNSQIALEYGQAMTVRVCKMDGEVMPVVVVQNATVLELKKAIQRYVQLRQEREGGIQHISW	2476033	2473785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474169_2474605_2475197_2475338_2475430_2475853
762553	SIRV6	+	249	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
762555	contig_9843_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_114316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGAAAAAAAAAAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43170	42086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_42100_43200
762556	contig_6710_pilon	-	484	2	Intergenic	novelGene_98110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
762557	contig_11493_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_143699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAAATCATAGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214032	212502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_212500_214000
762558	contig_8064_pilon	+	1647	2	Intergenic	novelGene_164548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGAAAAGAGAAAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22889	25732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_22939_24134
762561	contig_2438_pilon	+	2098	10	Intergenic	novelGene_112076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	52.9880023690432	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	391	1533	348967	364479	FALSE	20	TGTGTACCATTTTGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKPETIQLITRDMVRELIVPTEDPSGESLIISPEEFERIKWASHVLTREELEAKDQAFKMEKEAIMDAVTTRKKIMKQKEMVCKNNKKLSDLEEVAKERAQNLLQRANKLRMEQEEELKDMSKIILNAKCHAIRDAQILEKRLIQKELETEEKRLDQMMEVERQKSIQRQEELDRKRREERIRGRRHIVEQMQKNKEERSLLAEQREQEKEQMLEYIEQLQEEDLKDMERRHQEKLKMQAEIKRINDENQKQKAELLAQEKLADQMVMEFTKKKMAREAEFEAEQERIRREKEKEIARLRALQEKAQDYQAEQDALRAKRNQEVADREWRRKEKENAQKKMETEAMLRKSRLEQVAFKEHALAVQVQRDRDEFERILR	320556	365044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_320737_346411_346538_348882_349026_351267_351413_351706_351878_353064_353244_355300_355431_359142_359290_363559_363674_364281
762562	contig_10437_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_38496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGAGGCCAAATAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248378	1248102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1248100_1248400
762563	contig_10437_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_38495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATGACAAATTGGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247790	1246000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1246000_1247800
762564	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
762572	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
762573	contig_13048_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_138927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458133	456174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_456200_458100
762577	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762585	SIRV4	-	413	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1110	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4048	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762587	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762592	contig_20420_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_172478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGATGCCAAAACACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30527	28489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_28500_30500
762599	SIRV6	+	216	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	507	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11216
762600	contig_18822_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_111735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	804	1106	220108	220410	FALSE	20	AAGGTTTCCTCAGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRAPGPLEVNSMLMCKQLQPLFFLRTLGQDGALGLGGGFRFWQAHGMFIASETHGRQDASSRRQSAAPVPLRAAAPPAGLWGLSPSFAESTTASAPSWK	212532	220412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_212993_219764
762610	contig_9633_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_139628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCAATACACAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041384	1043728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1042241_1043611
762611	contig_5765_pilon	-	1881	11	Intergenic	novelGene_141361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	78.0873869456521	3	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	55	1029	580695	392705	TRUE	35	TAAGTGAGTCCGTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKQESPDEVGSQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELENNIRKALSFDNRGEDHRAAASTDGQLGSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKVLGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYSAPENSTSPAHGSMLQRSPQPSCSSTNMESSTGI	583237	379649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_380181_385901_386091_392572_392713_461246_461342_463984_464140_556479_556654_559952_560153_563192_563290_568125_568269_580592_580723_583210
762612	contig_7165_pilon	-	2423	11	Intergenic	novelGene_116820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	28.5028068793233	131	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	393	1094	176278	171065	FALSE	20	TAATCTTTTTTCTTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAQAPVAKKPAQPLVPSSRPPPEPKASSSKESLSPSVREQLVLLEARKLQYQRAALQAKRGQNLEQAKAHLRVVKGLEAQILQARAGRPVSLSKVPSPLTDEEGDFILIHHEDLRISQKAEEVYAQLQKMLLEQHEKCLLFSKQFMHQGNVAETTRFEKLAQDRKKQLEILQLAQAQGLDPPSHHFELKTFQTVRIFSELNSTEMHLIIVRGMNLPVPPGVTPDDLDAFVRFEFHYPNADQAQKHKTAVVKNTNSPEFDQLFKLNINRNHRGFRRVIQSKGIKFEIFHKGSFFRSDKLVGTAHLKLERLENECEIREIVEVLDGRKPTGGKLEVKVRLREPLSGQDMQTVTENWLVLEPRGL	177127	169735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_171194_172413_172505_172668_172769_173423_173476_173709_173769_173906_173981_174362_174480_174571_174631_176257_176384_176765_176939_177013
762615	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
762616	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762619	contig_7357_pilon	+	1476	14	Intergenic	novelGene_36884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	121.08039287375	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	33	587	250864	269107	TRUE	20	GAGGCTTTGTCTTTAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRWNRQSASMAHITINQYLQQVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKSN	250831	273588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269098_269206_270136_270242_271244_271319_271484_271606_272519_272644_273221
762621	contig_2114_pilon	-	1717	11	Intergenic	novelGene_104320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	117.497404226647	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	158	922	1167512	1143570	TRUE	30	TTTAATGACTACTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGGYKRLYEHGGRLHEASYQHCGRVAGSRGQCDRV	1169448	1138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143671_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1147965_1157433_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167589_1169367
762623	contig_4151_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_65261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCCAACTTACCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601925	599751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_599800_601900
762627	contig_5482_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_144479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATTAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490825	491689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_490800_491700
762628	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
762631	contig_11908_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_133238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	423	974	742065	742616	NA	80	AAAAAAAAAAAAATCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSFLQEDIIILNVYVPYSFEICETKTNRTARTYTQIQYYRRRLQHPLTVIDRSSRQKISKDIVELNSTINQLDLIDVYRILHSTIAEYIFFSSLHGAFTKIDHVLDHKMQLNKFKRKEIIQSMLLDHNGVKLEVNNRKITRKTQNIWKLNSVLLNNTWVKEKVSREIKKYFGDTRTKTVE	741642	743862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_741600_743900
762632	contig_1759_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_171349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1832	2158	101141	100815	NA	25	TTTTCATGCCCAGCAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLSLLDLKSPITSFSCPLLPSSPCPSAGVPLQSLSLLWACLISGQRVNLRSDFVTELKGCLGTILLVSSVSVRPVSLVFFISCILIHHLSPNFLAAGIVSCVFVIV	102972	100394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_100400_103000
762636	contig_6418_pilon	+	1621	4	Intergenic	novelGene_81195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	137.375398088595	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACTCCTTGAGAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341011	1376270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1361198_1361892_1375717
762644	contig_7308_pilon	+	977	6	Intergenic	novelGene_159627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_5	123.298986208322	1830	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	251	928	614741	617480	FALSE	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGDLKTPAGLQVLNDYLADKSYIEGYVPSQADVAVFEAVSSPPPADLYHALRWYNHIKSYEKEKASLPGVKKALGKYGPANVEDTTGSGATDSKDDDDIDLFGSDDEEESEEAKRLREERLAQYESKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMAKLEECVRSIQADGLVWGSSKLVPVGYGIKKLQIQCVVEDDKVGTDMLEEKITAFEDYVQSMDVAAFNKI	614490	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_615491_616120_616248_616536_616604_616998_617125_617325
762645	contig_8864_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_135962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATATATAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40163	42302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_40200_42300
762646	contig_7963_pilon	-	1067	5	Intergenic	novelGene_58308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	42	338	48841	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48882	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38571_39276_39405_39949_40232_43546_43819_48741
762648	contig_6710_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_96560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTACTCCAAGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653366	657512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
762652	contig_4884_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_63807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCCCTAGATCTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285013	286230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_285000_286200
762657	contig_10437_pilon	+	1579	1	Intergenic	novelGene_38500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAATACACGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302345	1303924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1302300_1303900
762659	contig_7333_pilon	+	1279	10	Intergenic	novelGene_142785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	111.235929891225	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	65	589	218455	224226	TRUE	20	GAGTACCCTTCCGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTAASAAVVPTLAPPLEQLRQFAGELRLLMPRVRVGEALETTEEFNREKFWSRLNEAAVTVAGEATTLTAAFSRLPLPSPQETQRFCESIRVATEAIIAVYYSLPKDQGITLRKLVRDAVLDIVDGMAQLVEGLFITPTQSPENKDLIFCNTVWAACQQVPRLPRGARPKPA	218390	237583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_221833_221916_222679_222777_222951_223030_224207_224321_230329_230391_236788_236836_237095
762660	contig_821_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_149412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAATTAATTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233287	230951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_231000_233300
762661	contig_6270_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_99845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309015	311561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_309000_311600
762663	SIRV6	+	324	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762669	contig_16322_pilon	-	901	2	Intergenic	novelGene_87501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTGCAGTGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57635	31684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_57465
762670	contig_3018_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_78802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATCCAAAAACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497068	498512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_497100_498500
762672	contig_7202_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_18669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGTCCATGGTGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29800_30100
762673	contig_8661_pilon	-	912	10	Intergenic	novelGene_137940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_7	450.538552905654	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	804	108	911	315977	305350	FALSE	20	GCTTCCGGATGACTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKN	316084	305348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
762678	contig_2596_pilon	+	1415	5	Intergenic	novelGene_53489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	82.0712343028908	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	683	1249	729054	739418	FALSE	40	GGGAAATAGCAGTTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFTVASAVRAASGILRPLNILASSAYQTYAKKACLISALSTRCFSHIQMPVVSSAPRLTTPVGNLTCRHTTIILNRVAPLLPNILKLPVRTVTYFSSRKGKRKTVKAVIYRFLRLHSGLWLRRKAGYKKKLWKKTPARKRRLREFVFCNKTQSKLLDKMTTSFWKRRNWYANDPYQIYHDRTNLKV	722730	739584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_723380_729020_729097_735202_735393_736062_736208_739229
762679	contig_2987_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_125842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTGAGTTCTGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466895	466000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_466000_466900
762686	contig_5935_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_102728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGATTACAGCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111553	1111093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1111100_1111600
762687	contig_6414_pilon	-	1284	10	Intergenic	novelGene_157012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	415.185366901206	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	8	1093	85578	44945	FALSE	25	TTTATTTTTATAAAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTANAPGRKSWGKGKWKSKKCKYSFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSHPLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSASCENAIVCWKPGKMEDDIDKIKPSESNVTILGRFDYSQCDIWYMRFSMDFWQKMLALGNQVGKLYVWDLEVEDPHKAKCTTLTHHKCGAAIRQTSFSRDSSILIAVCDDASIWRWDRLR	85585	44753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095_46170_47136_47296_63319_63412_67557_67640_69124_69251_70319_70386_72834_72928_74835_74989_85464
762689	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	244	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762690	contig_6823_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_131200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACTGCTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23778	22559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_22600_23800
762693	scaffold_13505_pilon	-	1791	8	Intergenic	novelGene_111667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	413.657800011319	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	130	663	904535	897086	TRUE	5	AGGGCTTCGTGTGCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FELPPPLECPPPFPPSPPDRKGLRGTEPWEARPGSGAAPRARAMDVRRLKVNELREELQRRGLVTRGLKADLAERLQAALEAEEPDDEPGRPGHSNEEVETEGGSELEGTAQPPPPGLQPHPEPGGYSGPDGHYVMDNITRQNQFYESQVIKQENESGYERRPLEMEPQQQAYRPEMKTEMKQEAPTSFLPHEASQPKPDRQQFQSRKRPYEDNRGRGVL	904664	869544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870254_889878_889966_891947_892048_893568_893709_895241_895316_897067_897223_900568_900695_904264
762695	contig_10718_pilon	-	1954	5	Intergenic	novelGene_164618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	28.6476438821764	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	390	974	114129	110301	FALSE	60	AATTAAAAATGAATGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIITFHPQELSQEELCVQKETVKEFFTKGPGAVCDLTSLYFQESTMTHCSHQQSPYQLLFGEPHIFEDLLDLKIRISPDAFFQVNTAGAEMLYRTVGELSGVNSNTILLDICCGTGVIGLSLARHTSKVLGIELLEQAVEDARWTAAFNGITNCEFYAGRAEKILPQLLKSKNDGQLIVAVVNPARAGLRKDK	114518	109320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_-_110435_111574_111677_111842_112058_112392_112488_114090
762697	SIRV6	+	356	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	15	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1537_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
762698	SIRV6	+	269	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	117	-9	35	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3140	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762703	contig_3679_pilon	+	1008	9	Intergenic	novelGene_112121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_8	47.6181097377878	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	52	945	1025707	1044592	FALSE	20	TGCCGCAGGTGATATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHCILTEDGNQHVYKKLCLCAGAKPKLICEGNPYVLGIRDTDSAQEFQKQLTKAKRIMVIGNGGIALELVYEVEGCEVIWAVKDKNIGNTFFDAGAAEFFTSKLITEKSEAHVAHKRTRYTTEGKRKEAKTKAKASNVGSALGPDWHEGLNLKGTKEFSHKIHIETMCEVKKIYLQEEFTILKKESLIFPRDHHNKLVKTTDKV	1025655	1044655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211_1032332_1034957_1035087_1037196_1037271_1040377_1040539_1041248_1041350_1042779_1042919_1044587
762704	contig_7870_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_108933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAATCCAAACAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286306	284493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_284500_286300
762714	contig_1107_pilon	+	1715	1	Intergenic	novelGene_126526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAACCCCAAGGGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25877	27592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_25900_27600
762717	contig_15039_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_110159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGCCTGTTTGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239936	240510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_239900_240500
762726	contig_6674_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_148033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383561	383870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_383600_383900
762727	contig_10629_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_52939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGTTGTGTTAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359599	360327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_359600_360300
762732	contig_1532_pilon	-	1936	8	Intergenic	novelGene_37395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1253.05531907137	1	127	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	67	813	32217	13487	FALSE	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQKRPSPMRS	34927	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13514_15732_15889_17971_18097_27311_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
762733	contig_6842_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_130701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATGATCCTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391058	391641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_391100_391600
762737	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	14	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	138	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762742	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
762743	contig_12178_pilon	+	1466	9	Intergenic	novelGene_156538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	20.0296654989543	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	77	1222	8264	64734	FALSE	45	TATAAATGGTATCCATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETASVCSGSLDGVEYSRRKEKGIVKMTMPRTLAFCYLSLLWQRETITLSDLLRFVEEDHIPYINSFQHFPEEMKLYGRDKGIFAIESWPDYEDIYKKIIEVATFLDLPRFPDITEDCCLHPNILCMKYLMEVNLPDEMHNLTCQVVKLTGIGEVDFLTFDPIAKMAKTVKYDIQAIAIIIVVLKLLFLLDDNLEWSLSNLAEKHNEKNKEDKPWFDFRKWYQVMKKTVDEKKQKWEEARAKYLWKSEKPLYHSSIDKSVVYKRREMVVNLQKQFSTLVDSTPTVEKKSPSSFQFNWSEEDTDRTCFHGHSLQGILKKKGQLLTTKNSLYWLSTQKFCKSYCKHVTTYEESNYSLSYQFILNLFSFLLRIKTSFLHEEVSLVEKRLFKAKYSKIKKKSSRSKKVRRY	8187	64978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_8347_14071_14172_36645_36794_40503_40682_41472_41520_46023_46115_51584_51656_57564_57788_64529
762747	contig_7945_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_161585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135075	133827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_133800_135100
762750	contig_5031_pilon	-	2658	3	Intergenic	novelGene_133220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_2	140.5	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACTACAGTCATTAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117072	105438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_107466_110278_110337_116499
762758	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8467	-1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
762760	SIRV1	-	243	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-110	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGGTTTGTGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
762761	contig_5690_pilon	+	1515	7	Intergenic	novelGene_119747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	628.776700338752	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086479	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1086568_1087638_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103522_1103632_1105450_1105597_1105702
762765	contig_12019_pilon	+	1375	4	Intergenic	novelGene_87737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	208.135105693927	70	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	7	459	623205	642306	FALSE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMEDKLDPAPEN	623198	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634023_642273
762766	contig_7359_pilon	-	2279	21	Intergenic	novelGene_139868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_20	54.3788561851019	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	246	1544	387792	363372	TRUE	20	TTCTACTGTTTTCTCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVMHRNVRYNCRVIFLNRRILLIRPKMALANEGNYRELRWFSPWSRSRQVDEYFLPRMIQDVTKQETVPFGDAVLATWDTCIGSEICEELWTPHSPHVAMGLDGVEIFTNASGSHHVLRKAHARVDLVSMATTKNGGIYLLANQKGCDGDRLYYDGCATIVMNGSVFAQGSQFSLDDVEVLTATLDLEDVRSYRAEISSRSLAASRVDPYPRVKVDFALSSRDDLLLPLSEPIEWKYHSPAEEISLGPACWLWDYLRRSQQAGFFLSLSGGVDSAATACLVFSMCCQVCEAVRNGNQQVLADVRNIVGQVTYTPQDPRDLCGRLLTTCYMASENSSQETCERARDLAQQIGSHHIGLSIDPAVRAVVGVFSLVTGKRPLFAVHGGSSRENLALQNVQARIRMVLAYLFAQLSLWSRGIRGGAPRAWICQCG	394063	352855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_353080_354571_354749_355960_356090_359775_359846_360730_360863_363368_363477_364586_364723_365802_365972_368904_369008_370009_370059_371576_371702_373383_373459_377131_377264_379218_379337_379644_379734_382097_382150_384172_384263_386369_386424_387790_387908_391168_391230_393994
762767	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8136	2	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762769	contig_15410_pilon	+	1117	9	Intergenic	novelGene_130570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	331	801	55201	57526	TRUE	15	GGCTCTGGTGTTTACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGADEVPGFVLARSTSCRLPHLCPGKTSSCFSRLGQRSQSPRGCPGCQIQTAFGDCWGRSTRRCGSSARSQSLSWRIRTASTGLVKVNSSTSLSLESLPSRASSQISTEISENLGLLPPPTRASRLERCSISTRPMLPTCSWSRCPFSINGSTL	54115	59301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_54328_55082_55247_55354_55441_56117_56209_56334_56440_57295_57401_57488_57555_57666_57870_59216
762771	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	121	-9	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762772	contig_15327_pilon	-	2281	7	Intergenic	novelGene_70741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	27.022624266015	96	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1430	2074	1008580	1007545	FALSE	0	GCTGGTCTGGGTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGTWSSASEPHLAMELEPYIRRFAEFHFLLYLMIKMVLGSVSWSCSHPEGAGGWSAPSAGHSQTFPPTRTNIPGNRVAEGQETCPYLQPFPARGSGFHRFAFLLFKQDKPIDFSEDTRPSPCYQLAQRTFHTFDFYKKHQEAMTPAGLAFFQCRWDDSVTHVFHQLLDMREPVFEFVRPSPYHPKQKRFPHRQPLRYLDRYRDSHEPTYGIY	1012684	1007337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1007682_1007861_1007999_1008209_1009244_1009372_1009446_1010350_1010778_1012304_1012485_1012598
762775	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4431	38	3256	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
762776	contig_15596_pilon	+	2197	6	Intergenic	novelGene_139526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	11.9766439372639	22	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1710	2015	107507	111175	FALSE	55	AAATATGTAACAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHPEVTLGECGQASPANEEEKKARFPWCLRGAHRHPRLSPTPVEMGGWSTGAFAQTQRRTFMPHAVPAARKALAGNFLLSDPQPTCYEQLMGLNRRPFS	104275	111357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_104363_104476_104614_105409_106702_107313_107554_110287_110509_111137
762780	contig_4531_pilon	+	1379	9	Intergenic	novelGene_47879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_7	164.328130199914	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	107	1303	225395	304012	FALSE	70	AGTAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGKSCDQRHVAMNKEQHNGSFTDPSSMNEKKRRDREERQNIVLWRQPLITLQYFFLEILVILKEWTSKLWHRQSIVVSFLLLLAVLIATYYVEGAHQQYVRRIEKQFLLYAYWIGLGILSSVGLGTGLHTFLLYLGPHIASVTLAAYECNSVNFPEPPYPDQIICPDEENIEGAISLWSIISKVRIEACMWGIGTAIGELPPYFMARAARLSGAEPDDEEYQEFEEMLEHAETAQDFASRAKLAVQNLVQKVGFFGILACASIPNPLFDLAGITCGHFLVPFWTFFGATLIGKAIIKMHIQVIIPSASMPNDDERLKHISVDHFKILVLLWLIACLGIKAWNVTWRFLNSLSLMENWIRLLFFSLFSFLLFSSLLPFFFPSFLFPFLHFILFFAF	211636	304088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_211717_225368_225471_228604_228741_229766_229858_230729_230841_257190_257359_264246_264379_301983_302065_303610
762781	contig_10523_pilon	-	1463	8	Intergenic	novelGene_120924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	6	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	182	1132	39240	13060	FALSE	5	CAGGTTGTGTCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFTWGNESVGRQRTGRRDGREKEELEWRG	39421	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13144_15117_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
762782	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_94830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
762791	contig_15784_pilon	+	690	2	Intergenic	novelGene_172487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	297	650	99851	101571	FALSE	20	CATGCTTTTTTTTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLEEKDVDEFSSNGLKCPTCFAVRGGDCDTVLKWCAKDKIKCVEFHGIINTGISNIAIEMKSCIKADLCKESVTSYMDLPVANESIRCRSATTNGAKIRPSTPIFFILFLEKLFH	99554	101611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15784_pilon_+_100011_101377
762792	contig_16724_pilon	-	1295	7	Intergenic	novelGene_105316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	574.734914740894	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	311	1003	569099	541589	FALSE	20	GTTTATCTAATATGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVCRFIVHDLRNVFLPERRGTTSVCGSKGIFCHSAVFTFNQFCCNTYLKSPFACFVNRLQFVLERN	575965	541296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541787_543946_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
762794	contig_6710_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_98290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657177	653562	FALSE	25	AGGCCTACTGAGGCATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRRWDQAGTQTGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653884_657142
762795	contig_5145_pilon	-	1342	11	Intergenic	novelGene_131446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	133.856677084111	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	37	468	941273	936187	TRUE	30	AACACTCTGGGTGGTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	941309	916281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923896_923965_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152
762796	contig_6710_pilon	-	331	2	Intergenic	novelGene_98300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	1	330	657173	653583	FALSE	25	TCATCAGGGACGAGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVES	657173	653581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
762797	contig_14513_pilon	-	1120	2	Intergenic	novelGene_70225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18983	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12108_18691
762799	contig_11448_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_66358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAATAAGACAGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200905	198523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_198500_200900
762800	contig_12080_pilon	+	2159	3	Intergenic	novelGene_128328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	8.5	170	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	124	384	34318	40598	FALSE	25	TCTGAAAGGTCGAACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDETGTWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK	24646	42373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_24715_34262_34352_40371
762801	contig_9471_pilon	-	1149	3	Intergenic	novelGene_21864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1001	junction_2	267	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	104	403	445281	442678	FALSE	30	TTTTTACAGTAACATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLGKYLGFCGLNNLRKCTVWN	446587	441931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_442914_445217_445292_446494
762803	contig_5916_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_158035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGTTTGACTGGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324857	322795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_322800_324900
762806	contig_11994_pilon	-	2746	2	Intergenic	novelGene_129341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	143	298	93273	91595	FALSE	15	TAATTTCACTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGSLLLLRAFQGSLRLRLPFRVVPAWNSDSARTVTPEPPCRPISKAMSRTSRCLLQRSLTRLRGYPDSHLGYLLEARMSELTPHSSPEVPVSSGGGG	93415	89146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_91679_93201
762807	contig_9363_pilon	-	1325	10	Intergenic	novelGene_6660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	113.342592214386	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	692	1090	1011210	1009478	TRUE	75	GAAATTAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEELEQMLDSGQSEVFVSNILKDTQVTRQALNEISARHSEIQQLERSIRELHEIFTFLATEVEMQGEMINRIEKNILSSVDYVERGQEHVKTALEYQKKARKKKILIAICVSVTVLILCVIIGITIAVG	1014430	1009136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009359_1009464_1009562_1009641_1009753_1010764_1010903_1011144_1011415_1012877_1012949_1013457_1013533_1013669_1013770_1013887_1013990_1014291
762816	contig_13740_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_34777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATGACAATAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780910	783584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_780900_783600
762822	contig_5832_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_134154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATATAGGAAAGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439398	441466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_439400_441500
762827	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	2	1157	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
762828	contig_6589_pilon	+	1446	7	Intergenic	novelGene_26176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	37.3452361977624	1951	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	133	876	1901836	1911490	TRUE	15	TTGATTGTGTTCTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901312	1913577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901431_1901821_1901909_1903195_1903448_1903648_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
762830	contig_8269_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_106244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	200	349	330516	330367	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANHDSTSDQALLDTRLHYLHPHQALSEDLGEAQRGQGAAQGHATGRWQSWLPTSSSWNLASPLQPDMWLLGQAWLGSLPEAIFMSGRLPQLQGCPPPLHITFSGSICLVFLPLPL	330715	328339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_328300_330700
762834	contig_5832_pilon	-	2873	13	Intergenic	novelGene_134179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	31.7991745175877	6	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	379	1482	590172	573341	FALSE	25	CCTTAATTAAAGCCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKSWLLIFILFPLKLVEKCESTVDLIVPPVVRLENGSSTSVSIALRHPLNATLVVTFKITFRSKNITILELPDEVVMPPGATNSSFQVMSRNVGQVTVYLHRNDSNQTGPRIRFLVIHSNVVSIMNQVIGWIYFVAWSISFYPQVYENWRRKSVIGLSFDFVAMNLMGFAAYSVFNIGLLWVPSIKEQFFHKYPNGVNPVDSNDVFFSLHAVVLTLIVILQCFLYERGAQRVSWPALGFLLLSCLFALVTMVVAAVGAITWLQFLFCFSYIKLAVTLLKYFPQAYMNFYYKSTEGWSIGNVLLDFIGGSFSLLQMFLQSYNNDQWTLIFGDPTKFGLGVFSIFFDIVFFVQHFCLYRKKPGYDQLN	592839	571949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_573475_573734_573853_576268_576440_577683_577804_577890_577991_580642_580775_580887_580992_584354_584440_585683_585763_590111_590192_591301_591407_591676_591829_592737
762838	contig_20844_pilon	+	1430	2	Intergenic	novelGene_78594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	383	1159	203681	204457	FALSE	10	TCCGAGCCTTTTTTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSIIFITCISLNRYLGVVHPFFTRSHLRPKHAWAISATGWALAALLAAPTLSFSRLKGNYTKDGLENYVKCLGTAEDNRLEAYRAYSLVLAGLGCGLPLMLTLAAYGALGRALLHSHGMKVAEKLQVAVLVASGVVLYASSYVPYHVMRVLNVYARQRWNAQCPNFANEDEAKAALDQGAYMGYQLMRGLMPLAICIHPLLYMAVVPSLGCCCQHRPGCRGYKDPGVPQSSSQALPLDVTATTPKTSEPWSSEPTP	202068	204728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_202134_203363
762839	contig_19816_pilon	-	1657	5	Intergenic	novelGene_156474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	282.945555716997	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1047	1544	124800	117638	FALSE	35	TTTATTCAGGGAGACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKEKPARSCPWSMHRHPQGDPQQEMSRHYGGNAQARHRILSPAIQSQEPLLRVPT	125846	117524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658
762840	contig_10299_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_79733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCTCTGCCTACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360907	360298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_360300_360900
762842	contig_6842_pilon	+	1067	7	Intergenic	novelGene_130772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	360.103881616896	748	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	487	858	1366898	1377191	FALSE	25	AATGAGCATGGAGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1345252	1377400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1345594_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
762843	contig_12297_pilon	-	788	4	Intergenic	novelGene_161383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	88.5889383614004	206	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1	534	766981	752267	FALSE	10	GGGTGTGGACTGATTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLQLIRETGEDYKNITLPYLAAQSLSIQWVYNILEKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGHQVTAGPDPRAPADAEEHPPGGAGSHPAALPGDGGPPPGVPALPSLLLSPARTLHSPGLRGPWLWGGAGAPAGRGD	766981	752012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_752428_754618_754731_759520_759635_766834
762848	contig_7182_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_117108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTCTGCCTCATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143239	142250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_142200_143200
762851	contig_2100_pilon	+	1859	17	Intergenic	novelGene_50592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	33	353	667982	669050	TRUE	35	CGACTCTCGATATACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGDVLRLSWSMSLGSLLPSSLTLRLSELSPSPSDGELGRLISWVLVFLELVLSTSSVSEATFSRWRLVLLRGDEASSLTFLADFFTVSDLLSLLEVLAALGEFRPLERMSSLMGEA	667949	927493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_668076_668331_668449_668940_669101_670290_670493_670927_671020_672051_672211_740028_740097_742541_742625_781495_781591_813557_813657_814881_815010_822283_822333_847792_847896_868566_868664_870263_870370_918244_918369_927442
762856	SIRV4	-	328	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1195	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
762857	contig_7066_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_42125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGCAAAGGGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619011	617404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_617400_619000
762862	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	2	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
762865	contig_10404_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_138735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCCAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1594574	1595833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1594600_1595800
762868	contig_1076_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_101116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGACTCGAAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93842	93558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_93600_93800
762870	contig_14275_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_162878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCCCCGTAGGGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463587	464366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_463600_464400
762873	contig_12128_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_131977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCATGTAAAATTGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223116	225610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_223100_225600
762883	contig_7440_pilon	-	1212	12	Intergenic	novelGene_61153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_1	383.631064159864	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	75	956	74491	54265	TRUE	10	TCCACTTGTTTTTCCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEETILTLLTSRSNAQRQEIIAAFKTLFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	74565	53502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_53748_54253_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070_71185_72915_73011_74478
762887	contig_19769_pilon	-	745	5	Intergenic	novelGene_102315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	182	409	89175	87936	TRUE	30	ACGTGCGCGCGGAACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTTALLAEEMTFLEPEGSFTRVFLVSGLWEMTVA	89356	87307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87385_87464_87608_87819_88035_88840_88958_89163
762890	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	51	505	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
762891	contig_11656_pilon	+	1053	3	Intergenic	novelGene_54001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	22	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	167	535	465719	466754	FALSE	60	TACGGATTAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQEPGCREQSGASRMLASHVRRSLQIATLLHHLVGRHSRPCLNPVSSEWTEQPLEECWSWRAAYSSAGGNILSPNVETRIPTNPMAEEA	464938	467272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_466490
762892	contig_7291_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_106309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGGAGAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181673	181388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_181400_181700
762893	contig_8587_pilon	+	1880	13	Intergenic	novelGene_159119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	17.3317306951409	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	362	1267	176796	184295	TRUE	15	TCCTGGGTGTGAGGAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVRGTATPAEEEKKGKVKYTRLAKYFFNKEGDFNNLTAAAYHKKTHLLVTGFASGTFHLHELPEFNLIHSLSISDQSISSVAINSTGDWVAFGCSGLGQLLVWEWQSESYVLKQQGHFNSMVTLAYSPDGQYIATGGDDGKVKVWNTLSGFCFITFTEHSSQNILVGGLSKFVCIYHVKEQILVRKFEISCNLSLDAMEEFLNRRKMTEFGNLALIDQDAGEEDGVVIPLPGVRKGDMSSRHFKPEIRVTSLRFSPTGRCWAATTTEGLLIYSLDARMTFDPFELDTSITPSRIRAALRQRDFTRAILMAFRLNEQALVQEALESVPQDEVEVVSSSLPELYVEKVLEFLATSFEVSRHLEFYLLWTRQLLMQHGQKLKSRAGTLLPAVQFLQKSIQRHLNDLSKLVLGLFAPGDVLCGSC	174282	188507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_174355_175056_175201_175969_176041_176721_176859_177477_177536_180020_180137_180453_180563_181284_181351_182663_182883_183008_183160_183283_183359_184246_184332_187930
762894	contig_11492_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_152252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322079	319908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_319900_322100
762896	SIRV4	-	344	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	20	1157	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
762899	contig_4845_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_53715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGACAGAGCGGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017876	1018475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1017900_1018500
762901	contig_4845_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_53712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGTAGGGGCAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010320	1011160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1010300_1011200
762905	contig_19007_pilon	+	2299	6	Intergenic	novelGene_168439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_5	161.253341050659	91	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	34	687	19822	29441	FALSE	30	CCATAGCATCATTGGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRAVQDTLKTLMNAVSPLKSIVANSNKIYFSAIAKTQKIWTAYLEAIMKVGQMQILRQQIANELNYSCRFDSKHLAAALENLNKALLADIEAHYQDPSLPYPKEDNTLLYEITAYLEAAGIHNPLNKIYITTKRLPYFPLVNFLFLIAQLPKLQYNKNLGMVCRKPADPVDWPPLVLGLLTLLKQFHSRYTEQFLALIGQFIRSTVEQCTRYRRPTGNKCNLTSQNVM	19788	31053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_19856_19943_20024_24081_24186_25166_25297_27121_27219_29232
762906	contig_12951_pilon	-	1596	5	Intergenic	novelGene_68169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	294.852929441103	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	122	439	307115	296988	TRUE	15	TACAGGTTTTATTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTGSGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	326201	295611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_296395_296613_297135_298383_298510_307070_307220_326184
762909	contig_20119_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_172488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACAGAGGGTTCTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103464	103195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20119_pilon_-_103200_103500
762910	contig_6446_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_149218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCAGCATGCTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383277	381149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_381100_383300
762915	contig_12622_pilon	+	1899	2	Intergenic	novelGene_5897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	297	548	1540833	1541084	FALSE	5	GCTGTGCTCATCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPASHSGATSGASLKTQPSSQPLQSGQALPSAPPTPAVTSTSQQELQAKILSLFNSGTVAANSSSASPSVIAGSAQQRSQASGSQPPNILGQAGSARNMGPRPGAPSQGLFGQPSSRLASASKMASQRPVSSTGINFDNPSVQKALDTLIQSGPALSHLVSQTTAQVGQPQAPLGSYQRHY	1540497	1542435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1540728_1540766
762922	contig_15304_pilon	-	1029	3	Intergenic	novelGene_30572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	195	1019	54100	52925	FALSE	30	CACCCCTCGAATAAACTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54294	52914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
762923	contig_7887_pilon	-	2568	2	Intergenic	novelGene_124848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTCCACAGCTACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58896	50899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_52050_57478
762925	contig_3509_pilon	+	587	3	Intergenic	novelGene_160705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	56.5	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCTGCTGGAAAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66604	73810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_66825_67901_68153_73694
762927	contig_3509_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_160707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTTAACAGAGTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78857	79477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_78900_79500
762928	contig_6364_pilon	+	1420	4	Intergenic	novelGene_51847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_3	362.833601286075	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	151	1305	1772471	1782231	FALSE	35	ATAACTAACATTTATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLTRPPGAATATAACSPARLPTGGAGWRPGQAGWQENKPRVTRLPDGVYWMFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLAEEAPRKARELGWKRIPRSGAVHGSRGQASRRAEGQPHA	1754991	1782346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1755142_1772470_1773440_1781110_1781176_1782110
762937	contig_6740_pilon	+	1602	3	Intergenic	novelGene_142638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	67	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10143	20903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_10227_11303_11447_19527
762938	contig_1786_pilon	+	1212	8	Intergenic	novelGene_142582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_7	218.50064213234	502	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	29	1105	26683	40074	FALSE	10	CTTCCCTTCAGTTTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPRWPQRIMATLRSRVLLWRPLICSRGVEQFSLCARTQPITLLQRLPQPCGAGSPYRRVASEAAASGNSEIKKPTFMDEEVQSILIKMTGLNLQKIFKPAVQELKPPTCKLMTQTQLEEATTQAVEAAKVQLKMPPVLEERAPINDVLAEDKILEGSETAKYVFTDISYNIAHRERFIVVREPSGTLRKASWEERDRMIQVYFPKEGRRILTPIIFKEENLKTMYSQDRHADVLNLCIAQFEPDSTEYIKVHHQIYEDIDKHGKYDILRSTRHFGGMAWYFVHEKKIDGLLIDQIQRYLVDDATSLVQLYHMVHPEGLSAQEAKEQAAEGLNLITVFAKTEAQMGAYVELMLQAYQGAFISHSAAS	26654	40181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_26849_27764_27932_29190_29356_31212_31357_31691_31776_35614_35761_38646_38756_39978
762940	contig_8195_pilon	+	991	6	Intergenic	novelGene_170057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	64.7252655459983	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	73	654	429165	446495	FALSE	85	AAAAAAAAAAGAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISSRVSVLKLYTRSPSKPLARKLMDWEVVSRNSLSDDRLETQSLPSRSPPGTPSHRNSAFTQEGTRLRPSSVGHLVDHVVHTSPSEAFVNHRSPSSTQANSIVLESSPSQETPGDGQPPALPPKQSKKNSWNQIHYSHSQQDLEDHSNETFDVPSSPEKSTPNGGIPHDNLVLIRMKPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPVSYLKFAM	428021	446832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_428063_429133_429260_431235_431395_442950_443111_446236_446321_446411
762941	contig_6494_pilon	+	726	7	Intergenic	novelGene_108553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	470	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGTGGCTCGTGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2102	8314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_2177_2630_2826_3294_3375_5565_5660_6395_6489_6750_6883_8256
762942	contig_1813_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_105465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTGTAAGGGGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66555	67036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_66600_67000
762943	contig_1813_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_105466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATCTTATTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67036	68973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_67000_69000
762944	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
762948	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
762952	contig_1301_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_47358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCATGCCTTGAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531900	529896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_529900_531900
762953	contig_11548_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_66719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28875	26832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_26800_28900
762954	contig_6589_pilon	+	1255	8	Intergenic	novelGene_26006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	990.222485822541	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	135	1253	1725483	1731819	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEQAEPPEVAAEQPHLHSGHLSGRRSTRARLHDALDIPVQELGPRLRPDQSIPIGSAPSQSPAPSQSPSPPRPTPDPFRCPGHSPMSCKYLFIPQYTLPGTEHTASSLPWEPRCLPALAPKGPGASEHQLSVPKDKLRSLSHLVAYHLPARLFSAQTSNKFPAFW	1725348	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728247_1728996_1729234_1730072_1730152_1731406
762956	contig_4364_pilon	+	1343	6	Intergenic	novelGene_188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	830.773711668827	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	67	726	1268714	1270459	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYILQAPASAVVIVVSVLLLLLPVLWARRPRPHFPFCTQVPASFLAGGWYGVSQVLSAPLSPCGCPGCLPPLPQPPGPGRPPVAVSHRVTMMP	1267039	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269683_1270184
762957	contig_5649_pilon	-	2100	8	Intergenic	novelGene_82280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAATGGCGCCGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149819	94501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_94597_126346_126625_145420_145527_146101_146201_146614_146684_146771_146828_147491_147695_148625
762958	contig_3822_pilon	-	1396	11	Intergenic	novelGene_133320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1090.90868545447	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTTTACAAACTAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306343	277368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277510_277901_277996_281136_281227_284585_284734_285165_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985
762960	contig_11932_pilon	-	1695	3	Intergenic	novelGene_85413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCAGCCGTTCAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291287	285588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_285667_289577_289677_289769
762961	contig_5686_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_45493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCCCATCAGGCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251897	250657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_250700_251900
762962	contig_7229_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_39863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGTACACACACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467572	1469629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1467600_1469600
762963	contig_7816_pilon	+	1623	12	Intergenic	novelGene_66504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1271.23951355614	1	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	78	1004	170169	207888	TRUE	45	ATGTTTTGAGAAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPVSAPFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQRGRRALSDGPGGSGHVPVSPHINCLLPK	170091	211750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182138_182993_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195847_207803_207935_209066_209155_209284_209379_210627_210751_211482
762965	contig_10557_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_171922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAATTTAATTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46575	47521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_+_46600_47500
762966	contig_12050_pilon	-	1853	6	Intergenic	novelGene_62742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	140.26061457159	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	214	708	697920	686686	FALSE	25	ACCTAAATTGTGGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	698133	685540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694159_695000_695130_696748_696775_697799
762967	contig_5649_pilon	-	2329	6	Intergenic	novelGene_82357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	84.7830171673549	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	378	785	980735	970776	FALSE	20	ATAAGATTTTGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLAKRKCWVQNPKVRSVLVMGYGGLTSLFNLVVLTWALQVLRRLRAREKALGARACRDAVTVLGLTVLLGTTWVLAFFSFGIFLLPQLFLFTIFNSLYGFFLFLWFCSQRCCTEAEAEAGTEMEAFSSSQMMQ	995819	969231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_970883_971447_971726_980712_980774_980982_981081_990838_991020_995759
762968	contig_10541_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_144641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1300	1635	229708	229373	NA	80	CCAAAAGAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQKCVYQFGWAMIPSIVWLSSIFCDCNFMLKRIRVRLCNTLTKVTSLIHCKGSFPRVWPVPPFILQETKGKGSKQRVGDFIPPKKQCWEQSMSFGPEVPVLSCSQTRED	231007	228848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_228800_231000
762973	contig_21024_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_172489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1997	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21024_pilon_-_0_2000
762979	SIRV4	-	464	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1057	0	1057	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4101	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
762984	contig_2704_pilon	-	1966	5	Intergenic	novelGene_75291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	24.4578719434051	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	166	612	15953	7994	FALSE	55	AAAAAGGCCAAAGTATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQRDKQPNAQPQYLHGSKALNLAYSSIYGSYRNFVGPPHFKVICRLLGYQGIAVVMEELLKVVKSLLQGTILQYVRTLMEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIVEYAELKTVCFQNLREVGNAVLFCLLIEQSLSLEEVCDLLHAAPFQNILPRVHVKGECALRCPRNLTTHYNSGPRSVWQCQGQEWVWFVSLVPV	40301	6639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_8186_12969_13101_14254_14346_15920_16065_40247
762985	contig_13244_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_86944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269061	270422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_269100_270400
762986	contig_15087_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_37216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCTGGGGAATTAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112943	111853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111900_112900
762988	SIRV2	-	197	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	729	22	729	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
762989	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
762991	contig_14513_pilon	-	1149	2	Intergenic	novelGene_70272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	161	313	18880	12124	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGM	19040	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12126_18729
762996	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8142	3	597	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGTCGCTTTTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
762999	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763004	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763009	contig_3326_pilon	-	1101	3	Intergenic	novelGene_170601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_2	25.5	2297	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	202	957	214350	212417	FALSE	25	GGGATAGTGGTCTGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILWGGVLALLPLLLLSLLGVSWAESSCSGYPAIPGIPGIPGAPGSDGNPGTPGIKGEKGLPGLAGDHGEFGEKGDPGIPGNPGKVGPKGPIGPKGSPGPPGARGPKGESGDYRATQKIAFSVLRNIHTPLRRDQVIRFDQVITNENHNYEPRNGKFTCRVPGLYYFTYHASSRGNLCVNLVRGRERVQKVVTFCDYVHNTFQVTTGSVVLKLDQGENVFLQATDKNSLVGIEGANSIFSGFLLFPDIEV	217655	212272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212992_214169_214374_217477
763010	contig_13905_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_130413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTATTTCCAGGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71557	70365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_70400_71600
763012	contig_5063_pilon	-	2122	4	Intergenic	novelGene_109979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGAGATTCTTGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35856	7955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_9527_12187_12306_19748_19855_35529
763013	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763014	contig_5814_pilon	+	1971	4	Intergenic	novelGene_143047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.3553390593274	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	194	1255	148636	156615	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLDPWNGTDNDTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNTVALYAFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLHWGQAHYARRVAAAVWVLVLACQAPILYFVTTSTHGTRITCHDTSAPELFSHFMAFSSVILGLLFAIPFAIILVCYVLMAQRLLKPTYGATGNLPRAKRKSVRTIAVVLAVFTLCFLPFHITRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKITRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDDKPAINPIPTIQARRRLGMRSARSTLPLLFWIPF	144596	157997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_144786_148631_149655_156572_156814_157479
763019	contig_7347_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_172492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCAGGGCTCTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16624	16064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_16100_16600
763022	contig_628_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_130241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAATGTTACTGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172614	174404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_172600_174400
763023	contig_10323_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_123627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGTGTTCTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490421	492308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_490400_492300
763025	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	10	410	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	426	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763029	contig_10581_pilon	-	2126	10	Intergenic	novelGene_41399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	96.539124033398	2	98	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	620	1363	627511	609845	FALSE	35	TTTGTTTTCTTAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGERSHSFVKPKGVAAPLLSILAYENIWWFTQERNLINAKSVGRPSLRVGAGMCTSESIIYKWEQLGVRNRSKLLLNQGDLTERRT	649688	609081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_615220_615347_618992_619083_619573_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
763031	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1198	1	1198	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763034	SIRV6	+	408	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10417	1	1180	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11417	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
763048	contig_6710_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_94905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
763053	contig_3529_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_105364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATGAAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567378	565934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_565900_567400
763054	contig_1594_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_138797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCATGGTGACCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201711	200395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_200400_201700
763055	contig_9014_pilon	-	2011	11	Intergenic	novelGene_106735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	79.2280884535276	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	61	762	46682	43800	TRUE	45	TAAAATCCATAGTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCESSFDNPEWFYRHVEAHSLCCEYQAVGKDNHVVLCGWKECTCTFKDRCKLREHLRSHTQEKVVACPTCGGMFANNTKFLDHIRRQTSLDHEETEAQRG	51601	41560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42291_42835_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_43743_43829_44086_44240_44420_44533_44785_45016_46504_46693_51551
763060	contig_4232_pilon	+	666	2	Intergenic	novelGene_63228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148809	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_148884_149087
763065	contig_5959_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_150236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628565	629540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_628600_629500
763066	SIRV2	-	559	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4310	38	3135	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1597	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
763071	contig_9839_pilon	+	1281	5	Intergenic	novelGene_88583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	27.761258977215	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	627	1070	335855	336298	FALSE	35	CAGGAAATAACTTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTINRSMDPKNMFAIWRVPAPFKPITRKGVGQRMGGGKGAIDHYVTPVKAGRLIVEMGGRCEFKEVQGFLNQVARRLPFAAKAVSRETLEKMQKDQEERERNNQNPWTFERIATANMLGIRKVLSPYDLAQKGRYWGKFYMPERV	331253	336509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331425_331783_331850_333891_334090_334831_334981_335812
763073	contig_6344_pilon	+	1952	10	Intergenic	novelGene_157113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_1	65.5175030802956	460	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	240	1364	1176029	1215531	FALSE	5	GCTCTGTGTTTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGVDDSTGVINCICWKKLSDIRSSSAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALSNPGTLDLASLTCLLSEKAKEFLVENRVQTFYQQELEMVESLMALANQPVIHSACSNLVDFKNDTASQAIHSIFKNAIQLLQEKGLVFQKEDGFDNLYYVTREDKELHRKIHRIIQEDCQKPNHVEKGCHFLHILACARLSLSPGLSEAVLRQVLELLEDQSDIVSTMEHYYMAF	1175338	1216119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1175515_1175965_1176162_1179726_1179823_1183172_1183242_1195076_1195254_1196152_1196277_1198753_1198926_1204896_1205020_1208082_1208156_1215373
763074	contig_11026_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_167692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACCAAGCAACATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301910	301217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_301200_301900
763075	contig_10958_pilon	-	1291	5	Intergenic	novelGene_5332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_3	116.330348576801	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	392	868	505495	503411	FALSE	80	CGAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVGTSDKTKYYIQDGDLDVVFSSSSKCGKDKTKSVSSTIFFHCDPSVEGGIPEFSHETADCQYLFSWYTSAVCPLGVGFDGESAGEDRPEHQGLSGRSQAVGAVLSLLLVALTGCLLTLLLYKKEQRETVMNKLTNCCRRSSNVSYKYSKVNKEEEADENETEWLMEEIQMPAPRPGKEGQENGHITTKSVKADALTSLHGDDQDSEDEVLTIPDVKVHSARGPGVDSSHKTRSPPRMADPEQDGDRMGLIRGEKARKGRRRPGQQKPGNSAHPVSFHDDSDEDLLHV	509691	502987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_503828_505435_505506_505677_505831_508306_508494_509650
763076	contig_3942_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_128615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATGGAAAAGACGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143484	142026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_142000_143500
763077	contig_17427_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_30273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCAAAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79960	78685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_78700_80000
763078	contig_6102_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_31983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414658	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414821_416018
763079	contig_11968_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_172508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGAATTGTGTCCCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47258	46130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_-_46100_47300
763083	contig_7976_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_169411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAACCAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775428	775052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_775100_775400
763087	contig_15273_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_140426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCCGACTCCTACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52578	55066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_52600_55100
763088	contig_7919_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_28057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1240	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGAGTGACAGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986012	987869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_986000_987900
763089	contig_9415_pilon	-	2274	2	Intergenic	novelGene_109823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	36	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACTCTGATGCGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1921530	1912841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1913934_1920348
763090	contig_10324_pilon	-	1924	8	Intergenic	novelGene_7905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.1779514893354	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	991	1587	793210	792614	FALSE	30	CACTATAATTTACGCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTVCGGAPALPSWRTHPPPWKSSLSAAGGVTQAIEPGAEDEGPLLEPVGSEQARDTYLVLDKWLLPQSPPSGALPGPGGSVDTAAMDEGSEASSCSSALALKPRPEGASAASFEYTILDPSSQLLRPRALPLALPPTPPHLKYLYLVVSDSGISTDYSSGDSQGTPGGSSDGPYSNPYENSLVPAPEPLPPSYVACS	797728	792276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_793227_793306_793399_794810_794899_795014_795230_795661_795820_795896_796076_796553_796687_797619
763092	SIRV2	-	542	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4331	34	3156	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1576	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
763094	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	51	502	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763098	contig_14184_pilon	+	1477	6	Intergenic	novelGene_66587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCTAATCAGCGGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88544	126326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_89449_91996_92117_103420_103502_105799_105912_109163_109326_126228
763100	contig_5602_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_132986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTATGTATATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3988	1764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_1800_4000
763101	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
763102	contig_4151_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_65253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTAAATGTGTATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566963	564471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_564500_567000
763104	contig_1719_pilon	-	2058	7	Intergenic	novelGene_87385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	286.278225197485	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1246	1980	851446	847238	FALSE	50	CGGAAAATGAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVDYSQWGQWNQVYGNPQQYGQYMANGWQVPPYGVYGQPWNQQGFGVDQSPSAAWMGGFGAQPPQGQAPPPVIPPPNQAGYGMASYQTQ	852691	847159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848273_848617_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392
763105	contig_3077_pilon	+	1717	9	Intergenic	novelGene_26624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3746.37269360311	1	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	130	1224	9719	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9589	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13878_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
763106	contig_15087_pilon	-	1495	16	Intergenic	novelGene_37211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	914.35090273556	1	79	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	405	878	141733	118119	TRUE	30	TTCTCTGTAAAATGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSNGVDVNDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQTSPVETKLPWRHVS	148069	110653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110774_110838_111066_113390_113522_116807_116908_118079_118164_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132712_133432_133502_141700_141787_143040_143133_144010_144089_145209_145267_146896_146965_148013
763111	contig_7189_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_117662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAAAATGTGTGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547749	549155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_547700_549200
763112	contig_10986_pilon	-	1310	11	Intergenic	novelGene_71466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	215.058224674157	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	86	562	80340	72203	TRUE	20	CCCCGTAAGCTCTCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKPRDPGNDQQVHD	80425	66791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67336_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72241_74272_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
763113	contig_6062_pilon	-	1950	10	Intergenic	novelGene_5296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	23.0603074085706	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	32	1360	791577	770133	FALSE	70	ACATGCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLRTGVGTLCAAARAVIPCLWRGKCFSSGKELGENSPVTPMLRHLMYKIKSTGPITVAEYMREVLTNPAKGYYVHHDMLGEKGDFITSPEISQIFGELLGIWLISEWMATGKSSTFQLVELGPGRGTLTGDILRVFSQLGSVLKNSDISVHLVEVSQKLSEIQAVTLIEENVPLEQNAGSLVYMKGVTKSGLPISWYRDIQDVPKGYSFYLAHEFFDVLPVHKFQKTPQGWREVFIDIDPQASDKLRFVLAPCATPAEAFIWSGETRDHVEVCPDAGVIIQELSQRIARAGGAALIADYGHDGTKTDTFRGFCGHKLHDVLIAPGTADLTADVDFSYLRRMTQGKVASLGPITQQMFLKNMGIDVRLKVLLDNSDEPSTRQQLLQGYDMLMNSKKMGERFNFFALVPHQRLPNGSHQMNARKSNPSPAPVAGFDELAWR	791608	769542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_770349_770837_771012_772256_772401_774626_774738_775433_775493_776297_776512_783038_783150_784740_784822_791045_791210_791522
763114	contig_17144_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_29170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGAACAGAGAGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159008	161508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_159000_161500
763115	contig_6710_pilon	+	577	2	Intergenic	novelGene_94762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGTGACTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653358	657525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
763116	contig_8354_pilon	-	1551	7	Intergenic	novelGene_24127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	565.750141159702	70	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	72	875	513617	500999	TRUE	10	CTGTGACTTGGGGGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	513688	499976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500452_500797_501091_501670_501822_502359_502471_503634_503824_505824_505966_513497
763119	contig_20844_pilon	-	1068	11	Intergenic	novelGene_78608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	426.012628920787	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	99	959	208366	204834	FALSE	15	CCTCCACGTGCTCCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHQRAPQGDPSGRWRPPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	209171	204724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208317_208367_208934_208982_209120
763120	SIRV6	+	172	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	560	51	560	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10797	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763122	contig_14855_pilon	+	1592	8	Intergenic	novelGene_146035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	43.5355824444271	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	266	904	650839	654448	TRUE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648574	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_654964_655229_655381_655633
763125	contig_8914_pilon	+	640	5	Intergenic	novelGene_112878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	246	362	265781	267418	TRUE	25	GACGGAAGTGCAACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264896	268967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264950_265588_265799_267319_267508_268075_268179_268881
763141	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763142	contig_18145_pilon	+	1769	8	Intergenic	novelGene_37303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	32.6927564841298	12	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	894	1637	58238	60118	FALSE	35	AAACCAGGAACTATCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHNGDAAASLTVAEQYVSAFSKLAKDSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTKAPVPAAQDLVSSGSSRDVPGTDTSLDEELDRVKLS	57101	60250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59211_59432_59562_59980
763147	contig_12464_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_68688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228428	226163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_226200_228400
763150	contig_8453_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_125143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAATTAAAAGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278387	278212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_278200_278400
763151	contig_7979_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_125543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAAACTGTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054473	1056459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1054500_1056500
763154	contig_753_pilon	-	2161	3	Intergenic	novelGene_112959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	4	30	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	39	500	1174700	1170595	FALSE	35	ATTCCAAGCAACCTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCDLSNEEDILSMFSAVRSQHSGVDICINNAGLARPDPLLSGSTSGWKDMFNVNVLALSICTREAYQSMKERKVDDGHIININSMSGHRVVPQSVIHFYSATKYAVTALTEGLRHELREAQTHIRATVRAWPSPGRDRVGTGPPSICHPSHTTQEAQVQGVLGLD	1174738	1168933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1170842_1171527_1171623_1174580
763155	contig_4783_pilon	-	2144	1	Intergenic	novelGene_108407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGGAAATAAATTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318782	316638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_316600_318800
763158	contig_1786_pilon	-	2360	4	Intergenic	novelGene_142584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGGCAGATGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38451	30356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_31355_31689_31774_35612_36765_38325
763159	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	417	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763161	contig_8980_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_73993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10566	12655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_10600_12700
763164	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763165	contig_1694_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_144978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613584	1615940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1613600_1615900
763167	contig_5021_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_167110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTTGTTGGTCTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577813	578394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_577800_578400
763169	contig_14829_pilon	-	835	6	Intergenic	novelGene_163812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	111.787298026207	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	463	834	125026	49172	FALSE	25	TAAGTGAGATCTCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDALTNPQKLMVLIHGSGVVRAGQWARRLIINEDLDSGTQIPFIKRAMEEGYGVIVLNPNENYIEVEKPTIHVQSSSDSSDEPAEKRERKDKVPKETKKRRDFYEKYRNPQREKETMQLYIR	261550	49170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_49391_124873_125066_134655_134722_194926_195029_213457_213581_261418
763170	contig_10196_pilon	+	1177	6	Intergenic	novelGene_132286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	21.4158819570897	209	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	91	861	2233555	2235774	FALSE	10	CGGGGACTGTGTGTGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHKFPVHLWKQLRLREGIYSRLPQHYLRTLKEAPTPTPVHYRPHGAKFKINPKNGQRERVEDVPIPLYYPPESQLGLWGGEGWILGHRYVSNHKRSKRVRKIWKPQLFQRELYSEILDKKFSVTVTMRTLDLIDEAFGFDFYILKTPKEDLCSKFGMDLKRGMLLRLAQQDPQLHPDDPERRAAIYDKYREFVVPEAEAEWVGLTLDEAVEKQRLLEEKDPTPLFKDYVDELVGQLQRQALSEPVVLQKRAIRK	2233203	2236090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2233284_2233544_2233843_2234547_2234701_2234866_2235002_2235095_2235183_2235666
763171	contig_6544_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_142067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTGTCCCCAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22010	23947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_22000_23900
763172	contig_14029_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_151938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_3	194.117232619878	604	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	31	384	131703	133603	TRUE	15	GTTATATTTTGTTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQNNKNSLEILLGR	131672	135629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_133472_133564_134319_135245
763174	SIRV6	+	538	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
763175	contig_13823_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_145256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATTTCTATAACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237361	236958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_237000_237400
763177	contig_13740_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_34747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAACAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336834	337462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_336800_337500
763181	SIRV4	+	319	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	196	435	196	-435	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCAATTGCTCGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	2336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
763184	contig_10436_pilon	-	621	2	Intergenic	novelGene_108490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3501	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102657	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535
763188	contig_9871_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_75659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	240.584473499203	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	442	840	416286	419187	FALSE	15	TAAACTCTCTCCTTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	408519	419835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_408949_416273_416506_418632_418746_419121
763189	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
763190	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	51	516	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763192	contig_18392_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_143096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	414	770	131982	131626	NA	15	CCTTTCGGTTAGCAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVRQSLTIITSKEHSGCTSSKTDFFVLLAVHGIFNILHQHRNSKASILLQSSLYVVQLSCAYEATENTVAWVRRTLVLKVTSLFFNTLKKSFAEDLPDAKYVI	132395	130913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_130900_132400
763194	SIRV6	+	310	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8130	-2	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
763196	contig_2114_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_104328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	468	231	698	1166405	1165938	NA	10	GCTTGGCAGTTTGATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIIPVGAYISTLFPFIADVYILFIHSSTDGHLSCFHLLAILNDAAVNIHVQVFVWTYAFISLEFIPRSGLAGSYSNSGALVKQWLRGWLPTRSQQFESTSRSLETPWGSSTLNYRVAMSSNGLDGNGFVFFFVYLVERGTVVAQRLNTWLLTE	1166635	1165936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1165900_1166600
763200	contig_12292_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_166995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215550	217790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_215600_217800
763201	contig_3426_pilon	-	1321	1	Intergenic	novelGene_57964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	139	477	443457	443119	NA	75	AAAAAAAAACAGAAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIWCRDREHCLYQPRRKQKPVLSPAFRAGGLAWGPAPSTWQRKSIFGYSICIFKFIWWVVINQECFLRKCRLVLMMVYLRGPYCSLDYRVQVLLRAPSIMLSLEKPVPP	443595	442274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_442300_443600
763202	contig_5549_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_81685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAGAACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613420	611332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_611300_613400
763203	contig_20199_pilon	-	662	5	Intergenic	novelGene_82603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1146.27091038724	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	202	339	42169	41171	TRUE	15	TCTGGTCCCAGCACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGQRDSQQEEKRKSQCSLFLTPVPPHQALASGTLSHHAVPPRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44146	40702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40776_40920_41250_42110_42171_43906_44028_44067
763204	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763207	contig_13464_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_125250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	669	980	476242	476553	NA	60	AAAAAAAAGCTCACAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKDWSLLITCPKCVRQSLAILASMENSGCISSKTDLFVLLSVHGIFSILCQHHNSKASVFLPSFLFIVQLLYAYEAIENTMTGQAHLSPQSDIFVFFFKT	475573	477180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_475600_477200
763210	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	26	370	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGESASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14434	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14354
763212	contig_10456_pilon	+	1688	4	Intergenic	novelGene_163452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	42.9444085093999	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	305	565	36382	37250	FALSE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFFELLLFFGRDEFYEEPLKDILGSFQECQNHLRRYGNVNLELVTRIIRDGGPWEDPVLQAVLKAQPASQEIVNKYLSSENPLFFELRARYLIACERIPEAMALIKSCINHPEISKDLYFHQALFTCLFMSPVEDQLFQEHLLKTDCRSGIDIICNTEKEGKTMLALQLCESFLISQLQNGDMYYIW	12072	38373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_12155_33549_33686_36295_36499_37106
763213	contig_6445_pilon	-	1628	16	Intergenic	novelGene_76963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	805.548359814605	1	101	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	628	1428	77905	43105	FALSE	45	GGGGAGCAGTAAAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88206_88473_88584_89945_90107_96306
763221	contig_6302_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_171702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGTAGCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146560	145208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_145200_146600
763224	contig_16098_pilon	-	1646	5	Intergenic	novelGene_45895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	40.5246838359043	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAGCTTCCTGGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255206	251864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_253103_253255_253379_253563_253743_254222_254292_255169
763228	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763237	contig_6589_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_26185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATGTTGTATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1909469	1910437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1909500_1910400
763239	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763241	SIRV1	-	203	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3897	4	3623	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6743	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763244	contig_12543_pilon	+	2033	4	Intergenic	novelGene_168376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.35412613473634	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	177	1715	310720	319603	FALSE	30	CTCATGTGCAACCTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSKEAVTFNDVALVFTEEELGLLDSAQRKLYRDVMVENFMNLVSMGSKIQSEMETTPEAQPHEELSCWQIWQQIARVLTRYQDSMINRSQFCKQGDSSCQVEAGPSIIHTGEKSYQCNECTETFSDVSSFDLHQQSHSGEKSHTCIECGKSFRYSSILRIHQRVHMKKKLCKCVDCGKEFSQSSHLQMHQKVHTIEKSPKCEESGKGFSHRSALNVHCKVHTQEKTCNCEECQRSFICALHLPERQKINTGKKRFKCDACGENFRRRSALNTHYLLHPGEKPYKCEECGKGFNQASHLLIHRRGHSGEKPFKCEECGKRFVQKSHLRSHQGIHAREKPYKCEECGKSFMTKYYYEFHLVAHTGDKPYKCEVCGKGFSRRGDHKIHCRIHIGEKPYNCEECGRAFIRASRLREHQRIHTGEKPFKCDACGKNFHFRSSFINHYRMHTGEQPYKCEHCGKGFSFRSKLYIHKRVHTGEKPYNCKECGKGFTQASYLLTHQKVHTGEKPFKSK	304438	319921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_304551_310655_310735_311118_311246_318206
763245	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
763246	SIRV6	+	348	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	531	-1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
763247	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763249	contig_6589_pilon	-	1896	15	Intergenic	novelGene_26262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_12	47.983415502289	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1380	1838	2228821	2227865	FALSE	15	AAGCTTGGCCAGCGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHLTAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233752	2227806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
763250	contig_3960_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_138019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCAGTAATAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425690	427428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_425700_427400
763252	contig_6412_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_149940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93563	90655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_90700_93600
763256	contig_7816_pilon	+	1029	9	Intergenic	novelGene_66511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1091.20500336784	4	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	366	941	182111	211658	FALSE	45	ATATATGTTTTGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRSRNKLSPTWLYPSDGVSTEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKDKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVCSAVMGEPSITVTRLAISQVPRSGKPNELLKMFGIDKDTIVQAVRGLVTKA	170125	211746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183010_207875_207935_209066_209151_209284_209379_210627_210751_211482
763257	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763260	contig_11816_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_98479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTATTATAAATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459054	461264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_459100_461300
763263	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	20	1156	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
763265	contig_16103_pilon	-	1945	2	Intergenic	novelGene_118788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	410	1033	575911	575288	FALSE	20	CTGTAAGTCTGTATAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFLVLVMEQITLAYKEQSGPPPREETRALLGTVNGGPQHWHGGPGVPQASGVSAAPSALRACVLVFSLALHSVFEGLAVGLQRDRARAMELCLALLLHKGILAVSLSLRLLQSHLRAQVVAGCGILFSCMTPLGIGLGAALAESAGPLHQLAQSVLEGMAAGTFLYITFLEILPQELAASEQRILKVILLLAGFALLTGLLFIQV	578003	574375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_575945_577627
763270	SIRV4	-	350	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1173	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763271	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
763277	contig_11338_pilon	-	1213	9	Intergenic	novelGene_6214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_3	74.4089208361471	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	37	1077	16734	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	16770	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641
763281	contig_10346_pilon	-	1951	9	Intergenic	novelGene_161218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	198.290151986931	192	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	83	1354	277815	261973	FALSE	25	CTCACCTCGTTTCAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVRCLRGGSRGAEAVHYIGSRLGRNLTGWVQRTFQSTQAATASPQNSCAADDKATNPLPKDCPVSSYNEWDPLEEVIVGRAENACVPPFTVEVKANTYEKYWPFYQKHGGHYFPKEHLQKAVAEIEEMCNILKLEGVTVRRPDPIDWSLKYKTPDFESTGLYGAMPRDILLVVGNEIIEAPMAWRARFFEYRAYRSIIKDYFQRGAKWTTAPKPTMADKLYDQDYPIDSVADRHKLAAQGKFVTTEFEPCFDAADFIRAGRDIFVQRSQVTNYLGIEWMRRHLAPDYRVHVISFTDPNPMHIDATFNIIGPGLVLSNPDRPCHQIDLFKKAGWNIVIPPLPVIPDDHPLWMSSKWLSMNVLMLDEKRVMVDANEVPIQKMFEKLGISTVKVNIRHANSLGGGFHCWTCDVRRRGTLQSYFD	277897	261375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10346_pilon_-_262086_265066_265184_265633_265698_266924_267090_267229_267368_268345_268537_269329_269526_275714_275934_277746
763292	contig_7744_pilon	+	1020	7	Intergenic	novelGene_62484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	375.851773383545	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTGTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670693	675234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_670909_671777_671897_673753_673826_674032_674105_674198_674321_674595_674694_674912
763293	contig_7333_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_142822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAACAATACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399649	397219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_397200_399600
763294	contig_18145_pilon	+	2260	12	Intergenic	novelGene_37317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	11.5636935390239	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	453	1976	79314	84552	FALSE	15	TCTCGTCTGCCTACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAPLDSSSPRASCMDLWREKNDRLVRQTKQVTQDSDLLLRQQQLAQDALQGFRELLHSLQGLPAAISALPLELTVICNFITLKASHTQGFTEDQDQDIQHGLERVLEAQKQLGPRLECGLRELWDSVLHASSLLPELLPALHHLAGLQAALWLSTDHLGDLALLLQSLNGSQSGASEDLLLLLKTWSPPAEESDAPLTLQDARGLRDVLLTASALRQGLQELITGSLPRALSSLQEAASGLCSWPVLVQVYTALATCLRKMGSPQRALLYLVAALKGGSVWGPPLLEASRLYQQLGDTAAELKSLELLVDALSVTQNSEAPQLLIEVELLLPRPDPASPLYCGTQSQAKHLLASRCLQTGRCLELLFRATPEDKEQGAASNSDQRCRPDAALQQLRLAALISRGLVWVASGQDTKALQDFLLSVQMCPGNRDASFHLLQTLRRLDRRNEATAFWWRLEAQTKLPPEDATWSLPLYLETCLNWIHPPDRETLLEEFRTSLLEPSDL	78861	84836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_79407_79604_79699_80033_80166_80423_80627_81119_81256_81432_81564_81663_81811_81951_82104_83277_83325_83516_83673_84166_84291_84443
763296	contig_14034_pilon	+	1943	1	Intergenic	novelGene_72665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCGCTGTCTATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358731	360674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_358700_360700
763298	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
763301	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763302	contig_6710_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_93788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	653888	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653889	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763304	contig_8050_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_114870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTATCTTTATGGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426307	424798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_424800_426300
763305	contig_5260_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_144351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAAAGCATAATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84064	82984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_83000_84100
763306	contig_6446_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_149221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTAGAACTGCCCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396750	395846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_395800_396800
763307	contig_6446_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_149220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAAAACTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392200	391283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_391300_392200
763308	contig_10953_pilon	-	1989	11	Intergenic	novelGene_42614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_10	33.2361249245456	256	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1653	336	1988	484591	467872	FALSE	80	AGAAGAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVSVPAVGKAVAVAAQAKTGAVRRPQEEDSESSEEESDSEEEAPAQVKPSGKASQVKAASASTKGSPGKGAPPAPPGKTGPAAIQAGKPEEDLESSSEEESDSEEETSAAVMPAQILSPRKEDNCKPARSKTLAPASPEKKAEGSSESSEEELPSGQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPVPAQAVSAPRKAQASESTARSSSESEDEDVIPATQCSTPPVIRTNVVASSSEESRRVAEGEQQKAPATQVTKNPASLPLTQAALKVLAQKANEAQSPTARTQTSSGVGSALGKPPGLSPQSSPVQARGTNKLRNPKLPEAQPAAATPSRRPKAKASGTSEDSSDSSSGSEQDVEGAQRAKSAHRPVGPVPTGKETLVEETTESSEDEVVEPSQSLLSGYVTTRLTPASSKASKATPRPDPKPSVSSPPATKDALDGKLEAEPQQAVATTSAKTGKREATSGTKPRKPRKPKKGAVSPQASPLALQSDIAQRLLSEPWPLSEAQVQVSVAKVLAELLEQERKKAADAAKESSKKARVGLKRKLSGDQPAAETPKSKKKKKLAAEGGGEVAPSLEKAPKAPKGKSKRDKASGDIKEKKGKGSPGSREAGEKPEGGLGVVKVDGGDQSNPKSKKEKKSDKKKKDKEKKEKKKKTKKASTKDPDSPS	485128	467870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_467949_469549_470102_472071_472253_472807_472891_473138_473377_473806_473918_475531_475618_476888_477076_482497_482624_484579_484787_484988
763309	contig_13780_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_149047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	603860	581699	FALSE	30	GCAGCGGGTTAAATTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWRLRTKIFFPQLCRAFAGRRCQLAAERRDAAPGPVSRFCPPKTSCHDWIGPPDKYSNLRPVQFHIPEDESPLEQKLRELRQETQEWNQQFWANQNLTFSKVNLKGGLV	603860	581525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_581924_603749
763310	contig_13780_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_149046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAAATTTATTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581525	579513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_579500_581500
763314	contig_3601_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_132896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCTCTATTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186366	185956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_186000_186400
763318	contig_4213_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_124827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165978	162876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_162900_166000
763322	contig_8412_pilon	+	2744	18	Intergenic	novelGene_118390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	28.5386886069568	291	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1038	2312	697756	715040	FALSE	15	GATGCCAGTGTGCTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	684916	715472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711_686795_687497_687613_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694544_694703_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
763326	contig_9505_pilon	+	1138	7	Intergenic	novelGene_121843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	78.9755588070695	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	51	719	530637	597995	FALSE	20	AGAACTATCTGTTGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSASSAKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530586	598414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932
763328	contig_675_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_136350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	273	875	211006	211608	FALSE	15	TCTACCTAGTGTTGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVEGWACPGGCRRSHRSRLRSRRGRSERPPASGQRVNAPTVTVGPGCESRGAASIGRAAGVLQLNHLGRKVQTRNEEIISTWDTYLQLEMGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	209852	211946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_210036_210916
763330	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763334	contig_13295_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_31232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAACACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88079	89947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_88100_89900
763335	contig_8775_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_166831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCCCCATAGGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176959	178451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_177000_178500
763336	contig_2114_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_104260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACAACAACAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463721	461289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_461300_463700
763337	contig_11473_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_159257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136975	136568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_-_136600_137000
763338	contig_19032_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_172531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGGATGCAGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150436	150896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_150400_150900
763339	contig_8045_pilon	-	3000	1	Intergenic	novelGene_35438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434755	431755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_431800_434800
763341	contig_3825_pilon	+	765	7	Intergenic	novelGene_77961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1676	junction_6	714.269965302569	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	453	725	14814	15603	FALSE	20	ACCCTTCAGCCAGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	13056	15643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
763348	SIRV4	+	227	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCTAAAGACATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4027	5158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
763349	contig_14925_pilon	-	744	4	Intergenic	novelGene_55124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86536	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_86482
763353	contig_9801_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_167561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAACTGGGTTTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93847	96061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_93800_96100
763356	contig_6001_pilon	-	1599	5	Intergenic	novelGene_128040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	37.9835490706174	183	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	154	996	623579	615898	FALSE	20	CAGCAGTTTGAAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQDLSEALKEATKELHTQAENAEFMKNFQKGQVTRESFKLVMASLYHIYVALEEEIERNKENAVYAPLYFPEELHRRAALEEDMAFWYGPDWQEAIPYTAATRSYVRRLHEVGCMEPELLVAHAYTRYLGDLSGGQVLKKIAQKALDLPSSGEGLAFFTFPNIASATKFKQLYRARMNTLEMSPKVRQRAIEEAKTAFLLNIQLFEELQGLLTQDTAGQSSSTTPRLRRQEGGGVQESTPTKTPRGKPQLNIASQSLLLRWVLTFSFLVATVAVGLYAI	625989	615294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_616029_618194_618295_621029_621522_623459_623581_625837
763360	contig_5041_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_27003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGCAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7909	9693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_7900_9700
763361	contig_11413_pilon	+	2604	17	Intergenic	novelGene_103215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	190.137850897053	10	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	106	1764	806962	852189	TRUE	35	TTTAAAAATCACATCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTERLREKISRAFYNHGLLCASYPIPIILFTGLCILACCYPLLKLPLPGTGPVEFTTPMKDYLPPPVDSDHKQGEPNDQPEWYVGAPVAYIQQIFVKSSVSPWPKNLLAVDVFRSPLSRAFQLVEEIRNHVLRDSSGTRSLEDVCLQVTDLLPGLKKLRNLLPEHGCLLLSPGNFWQNDRERFHTDPDIIGTIHQHEPKTLQTSATLKDLLFGVPGKYSGVSLYTRKRMVSYTITLVFQRYHAKFLGSLRARLMLLHPSPNCSLRAESLVHVHFKEEIGIAELIPLVTTYIILFAYIYFSTRKIDMVKSKWGLALAAVVTVLSSLLMSVGLCTLFGLTPTLNGGEIFPYLVVVIGLENVLVLTKSVVSTPVDLEVKLRIAQGLSSESWSIMKNMATELGIILIGYFTLVPAIQEFCLFAVVGLVSDFFLQMLFFTTVLSIDIRRMELADLNKRLPPEACLPPAKPVGRPARHERQLAVRPSMPHTITLQPSSFRNLRLPKRLRVVYFLARTRLAQRLIMAGTVVWIGILVYTDPAGLRTYLTAQPAQWLP	806856	853567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_807084_829206_829337_839421_839580_840352_840574_840891_840998_841889_842063_842456_842584_844973_845087_846178_846274_847560_847660_847775_847995_848858_848934_852168_852224_852350_852509_852663_852745_852915_853123_853207
763363	SIRV6	+	521	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	44	3	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763367	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763369	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763371	contig_6418_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_81190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	1183260	1183586	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVAPPISAWRHSTLPGSLVHTGTQLSCSVGQLQHCVALVSWFCCCQFSAAAHPLLLPVLCCCPSSAAASSLLLPVLCCCRFSVAAGSLLLLLTICAISTVAALLISF	1183258	1184389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1183300_1184400
763372	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763375	SIRV6	+	283	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8137	11	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
763378	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_89255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653728	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
763381	contig_12619_pilon	-	2759	1	Intergenic	novelGene_73571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAATGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837365	834606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_834600_837400
763382	contig_7457_pilon	-	1608	8	Intergenic	novelGene_31422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.772616771871	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	209	676	471570	469327	TRUE	25	AATATTGCCGAATGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473226	468258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468352_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471290_471559_471667_472730_472768_473151
763385	contig_13021_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_8095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCTAAAGGAGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51715	51349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_51300_51700
763388	contig_5526_pilon	-	1699	2	Intergenic	novelGene_111707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCTATGCACCCAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370366	368236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_369019_369449
763395	contig_1274_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_137807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGGTGTATAATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452034	451285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_451300_452000
763397	contig_9258_pilon	+	577	3	Intergenic	novelGene_104611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6290	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	35	427	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96740	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96748_97210_97376_99327
763402	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763403	contig_14687_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_107935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACTGGCTATGTTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504036	504782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_504000_504800
763404	SIRV6	-	470	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9421	74	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGTATTTACAACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11241	1470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1546_1655_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
763405	contig_14876_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_170247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCCAGCACTCAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177747	178968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_177700_179000
763409	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8130	-1	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
763411	contig_15991_pilon	-	964	6	Intergenic	novelGene_70918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3528.75913601368	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	80	619	105108	101983	TRUE	15	TCTAAAGGTTGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	106361	100381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101961_102271_103583_103703_104975_105142_106315
763413	contig_12886_pilon	+	2408	23	Intergenic	novelGene_135454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTGAGCCACCGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233037	483460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_233185_234278_234318_235304_235383_239325_239450_240137_240255_240500_240630_241878_241998_243643_243784_255196_255329_258972_259060_259811_259883_265912_266071_268274_268405_271026_271128_279558_279642_282916_282971_283783_283872_307007_307106_308666_308879_309225_309266_375601_375711_479087_479122_483342
763416	contig_11335_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_104905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGCTGTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309443	308578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_308600_309400
763417	contig_11335_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_104904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCAGAATGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308622	307579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_307600_308600
763419	contig_8594_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_140043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGGGGCATTACATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423026	423367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_423000_423400
763420	contig_678_pilon	-	2846	20	Intergenic	novelGene_167844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGGATTTCGGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528923	489835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_489894_495847_495958_496143_496209_496962_497151_498907_499250_501163_501281_503700_503851_505523_505676_507808_507945_508735_508892_511209_511316_512447_512565_514056_514219_516808_517059_518332_518502_519206_519360_520917_521068_524602_524733_526135_526225_528877
763424	contig_13592_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_33739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGACTTTTTTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291017	291937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_291000_291900
763429	contig_14363_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_112532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157269	156353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_156400_157300
763430	SIRV6	+	537	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	10	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763431	contig_211_pilon	-	1902	7	Intergenic	novelGene_129858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.0748733550727	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGGTTTGAGTAGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153105	77513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_78636_92993_93223_95861_95993_96865_97075_97505_97619_125030_125077_153053
763433	contig_19402_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_80847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146097	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_146100_146700
763435	SIRV4	-	452	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	732	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
763441	contig_9515_pilon	-	2344	13	Intergenic	novelGene_73835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	35.2156057578013	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1093	1563	91887	78307	FALSE	5	GTTTCTGTTCCCTGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKTLLMAQEIFQLSRHHIQQFPFCLMSVNITRIAIQALREECLTRECNRQQKVIPVVNSFYAATFLRLAHVWRTQQKTISDSGFVLKDLEALAKKNPRRLLKTLEIYLARVSKGQASLLGTLKCYGPQTPHSKDLTFTGVCDLSLHSSEGAWPI	108122	77525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_78510_78993_79122_79453_79531_91824_91956_95358_95482_95754_95879_97303_97396_98393_98463_102119_102190_102600_102679_105877_106138_107123_107276_108066
763443	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763444	contig_10475_pilon	-	2187	2	Intergenic	novelGene_148729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	2	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	170	1204	84427	83393	FALSE	50	AAATGAATAAACATTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPETTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQSPTEAESSMDDD	90088	82409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_84503_89994
763445	contig_5467_pilon	-	1767	9	Intergenic	novelGene_111961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	23.5584379787795	190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	167	577	113214	109300	TRUE	30	AATGAAGCGCATTCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLAGPLRIVALIITAGLTWIVISILLGRPGSGFPRIQQLFTSPENSVTAEPRARKYKCGLPQPCPEEHLAFRMVSGAANVIGPKICLEDKMLMSSVKDNVGRGLNIALVNGVSGELIEARAFDMWAGGEWQPQRS	113651	107272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_107992_108751_108879_108955_109377_109734_109794_109913_110038_110546_110571_110948_111063_113201_113275_113545
763446	contig_10953_pilon	+	1970	3	Intergenic	novelGene_42562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2754	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	706	1011	423183	425337	FALSE	15	CGTACTCTGTTTCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAFVPRETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIGKCLPLANTYFALKH	420003	426296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_423365_425213
763447	contig_14528_pilon	-	1644	9	Intergenic	novelGene_111267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	121.529253165647	2	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	495	1412	196728	190953	FALSE	0	GTTCTTTGCCTCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	198115	190720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196721_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057
763449	SIRV4	-	369	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	0	1152	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763453	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763454	contig_10541_pilon	-	1745	13	Intergenic	novelGene_144639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	215.7071059459	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	342	1592	312553	204225	FALSE	35	AAAGGTATTTAATCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEIVNVHKEIQLSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQDIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSKTYEKKSDIVLLLSQKQTLEELKQSIQQLRCTESKFAAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMKYSS	394520	204071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_204240_234189_234380_243494_243618_259379_259500_260014_260153_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_350466_350501_374167_374310_394487
763456	contig_20819_pilon	+	1253	3	Intergenic	novelGene_55620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	17	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	28	402	23958	24646	FALSE	0	TTTTCCTGTCTTTTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGKDGNKSPMSAPQFSPELDLESGKGMNRSSVEQQNKRLTVSPSSLSEEPLALSSTDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPGEIPAPPARNFGRRRRTQGQGH	23930	25497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_24004_24175_24436_24577
763458	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_90440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
763471	contig_12010_pilon	-	483	4	Intergenic	novelGene_160946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_3	24.6891789161883	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	84	410	189529	183382	FALSE	30	TATTTCACGATTGTCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILQRLFRFSSVIRSAVSVHLRRNVGVTAVAFNKELDPIQKLFVDKIREYRSKRQASGGPVDTGPEYQQDLEKELFKLKQMYGKADMNTFPSFAFEDPKFEAVEKPQS	194700	183308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_183420_184223_184349_189365_189543_194630
763473	contig_5586_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_143505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTAGAATTAACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207664	210181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_207700_210200
763477	contig_12654_pilon	-	1265	7	Intergenic	novelGene_129335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	209.814733091416	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	515	1075	823900	812546	TRUE	50	TTCCAGAAGAAGACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISCSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKVIMTFFCRLICVIPCFSASNMPV	827362	810637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_810681_812398_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_824168_827115
763479	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763484	contig_12964_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_131709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563989	565916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_564000_565900
763488	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_89608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653776	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
763489	contig_9548_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_141085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	5	junction_2	86.0475885774843	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	186	1031	308953	321224	FALSE	65	AAAAAATTAAGGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVTSFFDVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIETNVLRAGITVRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDVWLDSAGMIYCRCNFGLTAL	296621	321420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_296713_308858_308979_317580_318028_319956_320166_321060
763490	contig_13740_pilon	+	1851	6	Intergenic	novelGene_34726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	475.941593055282	233	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTTAGACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166351	178062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_166484_167674_167727_170859_171003_173085_173232_176358_176454_176779
763494	contig_18184_pilon	+	2121	5	Intergenic	novelGene_123869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	309.065527032699	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	297	1910	127269	142740	FALSE	55	TAATAGAACTTTAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFMEAVTFKDVAVVFTEDELGLLDPAQKKLYRDVMVETFRNLVSVGDKNPRQVETVLQAGAHEDLSSLHIWQQIASDLTRCQDSMINRSQFYKQGDSPSPVVGGLSNIHTGEKPNPCNEYTKTVNDVSSFDLHQRLYSEEKSLTCSECGKRFRYISVLRNHQRVHMRKNCRNHDKCDKEVSQSSHLQSHLNVHTIENLHNCEECGKHFRQRATLNVYRRDHTGAKPYNCEECRGDFLYPWLFKEHQKIHTEERPFKCDTCGKNFCHRAQLNTHCRIHTGEKPYKCDECGKSFRVNSQLLSHRKVHSGEKPFKCEDCGKYFSRKSNLQTHRRIHTGEKPYNCEECGKGFRQAVHLLIHQSVHSTDKPFKCEECGKYFSTRANLRVHCRIHSEDKPYKCEVCGKGFRQASQLLTHKRVHSGEKPFKCEECGKSFSQNSVLQSHQRVHTDEKPYRCEQCGNSFRWSKNLSMHWRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQYHKSVHTGEKPYKCNVCDKVFSRSSQLQSHQRVHTREKPQ	119955	142951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_120108_124439_124521_127205_127284_130217_130345_141268
763498	contig_9609_pilon	+	2409	10	Intergenic	novelGene_23156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	147.482411589976	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	138	1007	796792	827576	TRUE	5	TTCCCACTGGTTCCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRALRGSRLLRPPPLPLARVAARCRATRWSWKRQAGATSECPAGAMDGEIAAEQGDPAPPPGAPGGPGSGGDPALGGRREPKKYAVTDDYQLSKQVLGLGVNGKVLECFHRRTGQKCALKLLYDSPKARQEVDHHWQASGGPHIVRILDVYENMHHGKRCLLIVMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAGIMRDIGTAIQFLHSRNIAHRDVKPENLLYTSKETDAVLKLTDFGFAKETTQNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILQAADSPSAEDRPHREADHHTVHEPSLDQSIDGGASDPTSHSPSAAGGQRPLG	796387	829644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_796473_796739_797017_821262_821403_822031_822097_822528_822609_824341_824466_825638_825715_827134_827221_827502_827584_828249
763502	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	43	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763504	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	126	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
763506	contig_3394_pilon	+	2958	1	Intergenic	novelGene_152670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAATGAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388428	391386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_388400_391400
763514	contig_4469_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_21880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAACAAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194946	197225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_194900_197200
763515	contig_10134_pilon	-	973	4	Intergenic	novelGene_16188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	497.974564276798	130	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTAGAATATACCACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	31184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_31501_34922_35178_38558_38817_39584
763521	contig_5247_pilon	-	1444	7	Intergenic	novelGene_81822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.899421472687	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	66	458	416518	367348	TRUE	15	ATATCAGTGGTTTGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIESCFHLQF	416583	342098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342652_342701_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367374_376192_376490_416448
763523	contig_12327_pilon	+	1064	6	Intergenic	novelGene_140620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_5	772.712469163013	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	134	694	168930	171985	FALSE	15	CATGAGCTTTTCAGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWCVVLLCDHSAEQRAPFLPALTQTPWPEQQTPGT	148591	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841_170916_171882
763526	contig_177_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_41801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTATGTGTGTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412302	413605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_412300_413600
763527	contig_10197_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_115228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAGTTTACATTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927042	927701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_927000_927700
763528	contig_17106_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_127663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTGAAATATGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36054	35482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_35500_36100
763531	contig_21404_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_169135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTCAGAGGAAGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11072	10090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_10100_11100
763535	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763536	contig_12010_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_160956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCCATAAGTAGCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220687	221170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_220700_221200
763539	contig_5217_pilon	-	1294	10	Intergenic	novelGene_135716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_9	27.5954012987582	283	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	114	1217	298355	295104	FALSE	10	TAGTATGTTGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKELGRQDFPELKNDTFLRAAWGEATDYIPVWCMRQAGRYLPEFRETRATQDFFSTCRSPETCCELTLQPLRRFPLDAAIIFSDILVVPQALGMEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298468	295026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297293_297368_297449_297571_297685_298335
763540	contig_9515_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_73833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCCTGGCCTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71585	71055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_71100_71600
763547	contig_11742_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_166551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGCTGTCTGTCTCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174141	174864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_174100_174900
763548	SIRV6	+	338	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	537	3	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
763550	contig_6946_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_59779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAACTCACTTTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426810	426256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_426300_426800
763551	contig_6946_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_59778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTCTTTTTTATCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426110	424605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_424600_426100
763552	SIRV4	-	201	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	413	3	-413	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAACTATCGGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
763554	contig_20719_pilon	-	1550	2	Intergenic	novelGene_140575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	0	340	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAGAATGGACCCAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91815	71068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_72440_91636
763555	contig_9982_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_55774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613048	610965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_611000_613000
763556	contig_5514_pilon	+	2206	15	Intergenic	novelGene_75286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	115.12887632243	9	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1159	2040	94265	95955	FALSE	30	AGGACTGCACTGATCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACTRTLLGDPPPLLAPLRPPLSGALASISETIHIHHKENILEAGTRKATSASPVEGSTLGQAKSETAVMELTQDKSLEAATGGAVLDQTTSEGPVGDTKLASRTDNQTTPSSPVQETTPHISPSNLIESLRTLELSNKAQKAPDSQTPEEEKLLGEAAGGRRDLDDSMLMGFGDTDKATFYAVTPLPWCPHLMAVCPIPATGLDVTQPCRDCGSLQENWVCLSCYQVCCGRYINAHMIQHHEDSGHPLVLSFVDLSTWCYHCQAYVHHQALLDVKNFAHQNKFGEDMPQPH	77271	96121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_77682_78043_78173_78250_78380_78511_78601_80966_81052_81148_81190_81917_82015_82183_82282_93942_93990_94231_94380_94627_94939_95017_95129_95259_95407_95509_95639_95886
763559	contig_12120_pilon	+	1379	2	Intergenic	novelGene_21399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18780	20511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_19879_20230
763562	contig_6710_pilon	-	406	2	Intergenic	novelGene_98268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	657526	653562	FALSE	15	GTCCTCAGTCCCAGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657528	653532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763568	SIRV6	+	141	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	794	61	794	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11031	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
763570	contig_2480_pilon	+	2325	7	Intergenic	novelGene_63516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	936	1301	128623	130100	TRUE	20	GCGGGCAGGCAACCGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPEGHPTLPEHRLHPQSPERNHCPASTSSGHRSSGRQMSLLLDLWDITLQTKHTWSFVGGSWGRECHTYCSAWIELASLNHKWDTLRSSETSSHQIHTLEETVIHLLLLWFLGWLHNSG	127687	138427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_128965_130076_130253_132973_133221_135093_135314_136226_136352_137757_137900_138289
763574	SIRV6	+	563	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2615	5	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763580	contig_6710_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_98077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	GTCCCCCCTTCTCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
763581	contig_12250_pilon	-	1412	7	Intergenic	novelGene_80642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	158.67436956092	11	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	86	1150	379717	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380607	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_379009_379194_379537_379719_380523
763584	contig_4114_pilon	+	1490	5	Intergenic	novelGene_15590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	475.48205802112	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	118	414	222996	247883	TRUE	25	TTCTAATTCTAGGTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRQAVMLPEGEDLNEWIAVNTVDFFNQINMLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDVSHFPKTLCLWQRLF	222878	250552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_223042_232345_232440_234095_234205_247835_248000_249592
763585	contig_14801_pilon	+	1241	9	Intergenic	novelGene_166524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	43.0825878401008	160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	7	942	6017	70951	FALSE	10	CTCAGCCTAGCCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVMQKAWRERNPPARIKAAYQALELNNDCATAYVLLAEEEATTILDAERLFKQALKAGETIYRRSQQCQHQSPQHEAQLRRDTNVLVYIKRRLAMCARKLGRIKEAVKIMRDLMKEFPPLTMLNIHENLLESLLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSAAICYTAALLKTRTVSDKFSPETASRRGLSTAEINAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLQHWKRIEGALNLLQCTWEGTFHHVSVYPKKELPFFIHFTAGLCSSTAMIALLTHQFPEIMGVFAKAVLGLWRP	6010	71250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_+_6094_13311_13467_14973_15072_15367_15483_17749_17823_19144_19248_41596_41748_54264_54405_70927
763586	contig_5033_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_29097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAATAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765585	763444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_763400_765600
763587	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763590	contig_9505_pilon	-	1289	12	Intergenic	novelGene_121842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	648	1037	597953	560401	TRUE	10	CTCCATCTGGGCAGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEAFPFPHDHDLHRDMFRKPDRGPEVHGQRDEEMEDGYEILPVNCVDIPAEHPAVGPQQLVHSLQHCLQLLFLPDFRLGHLGHVQLAVPQFLQELLQHLPIVQVLLQLLHDDPFLHQDIVDPVDEDLD	632889	525603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_525704_555855_555943_560335_560408_577830_577935_589573_589715_593381_593498_597931_598010_614985_615047_617655_617724_620883_620987_631445_631519_632603
763591	contig_9008_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_58613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCACAGAAATCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61277	62782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_61300_62800
763592	contig_4982_pilon	+	2311	6	Intergenic	novelGene_172237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	11.2142766151009	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	44	1465	122474	165432	FALSE	35	CCCTAGCAACACAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKRIAVIGGGMSGLTSIKCCLEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVIVNTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNSQVLEYFRMYAKEFDLLKYIQFKVFLSTRRGAWILNRVGDHGYPFDVLFSSRLNYFKKKIVSQSLLNTLLENKMNQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTINDDLPNHIISGLVKVKGDVKEFTETAAIFEDGSREDDVDAVIFATGYSFSFPFLDDSVKVVKNKISLYKKVFPPNLEKPTLAIIGLIQPLGDIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEIMAEISKAQEEIEKRYVESQCHTIQGDYVDTMEELADLVGVGPNLLSLAFTDPKMALQLLLGPCTPIHYRLQGPGKWDGARKAILTTEDRIRKPMMTRVVERNNCMTSTVTMFKVMLAVAFFAIIIAYFQLSHCHCPCFHWEASSKYLQNLKKLKNSQSHCTEILLFFFFP	122430	166278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_+_122609_132999_133189_152316_152517_155796_156150_162213_162287_164960
763595	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	67	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
763596	contig_12638_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_33329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTCCAAGGATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302207	1303029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1302200_1303000
763597	contig_3975_pilon	-	2356	3	Intergenic	novelGene_54892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	11.5	36	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	831	2078	2110916	2109316	FALSE	15	GATTCTGAGCCTGGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGFSSGALITLISQKVKSHRTWKAGERVTNPEKELGSHFPCKEPEEMVLKKSGESSANPGSLPCREDNPLLQDEQSRKTSHGETRDSSRTGNPETTDPGLPYSQLDLQEVQHLRSHLAMELLWLQQAISSRKEYLILKQTLSSPEAGQTRDGPTVCPNHLGQACERSHTQPSPPLEDHSYRDRTTRELDHVDDSCWRVKSQSHKSPESLVVTDKTTVGAKYREPRYRRAGSQLPTPSDNQATGDKLTKEPDHGEQASRGTCLKLMKYPEDQTPRGLKPRGHCSEKTRTQLLMLPEKPAIKDKSPRGPDYQEPDCQSAGAQESGLSEDRIIWDGNLAGPEHSGLDLWRTKPPKGQTPSDRTSKDGLSNEPSHEGWTNQRTELWRSRPSKYLSSTRSDHTGEDHQQGRPWKTGPPG	2111746	2109037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2110162_2110280_2110400_2110633
763598	contig_6199_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_126334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGGCAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68625	70883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_68600_70900
763603	contig_20314_pilon	+	821	7	Intergenic	novelGene_125623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	360.445750271645	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	154	762	13110	24277	FALSE	25	GAAATTCCAGCCCCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9253_13109_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
763605	contig_826_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_154941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGTAAAACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320567	318797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_318800_320600
763607	contig_7202_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_17244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
763611	contig_9825_pilon	+	1060	4	Intergenic	novelGene_172559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	25.4602086052377	728	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACGTGGATTTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28975	34103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9825_pilon_+_29012_29775_29856_30630_30666_33194
763616	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763617	contig_10263_pilon	+	2211	9	Intergenic	novelGene_135833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	17.503124721032	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	1446	2210	867684	875390	FALSE	35	GTCAGTAGGGGCTAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGGQKVCYIEGHRVINLANEMFGYNGWAHSVTQQNVDFVDLNNGKFYVGVCAFVKVQLKDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQAVLPAPPVKHSTPVTAVPEPLAEKDSLA	858820	875391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_866403_867705_868279_868374_868550_868619_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165_874273_875307
763624	contig_1867_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_54529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGATGCATATCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290743	294129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_291014_294047
763625	contig_2710_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_161810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1435	1755	1238139	1238459	NA	35	AAAGCCTTATAAAGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNHKKFGVQERIVDYLKHTEYICDASVTVLANNFPTPATNHGDGTGLGNIPFLCGWVHHGLEIDSMTAKTTPPPPTSQSSCLQQLGLARCVIGSDLNPERKFHNF	1236704	1239075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1236700_1239100
763626	contig_13014_pilon	-	1802	4	Intergenic	novelGene_169368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	48	junction_1	33.3199973322661	316	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	403	423	539017	538997	FALSE	30	CCCAGTATTAACTCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAGEALKAKERNEEEAERRKEEDQATLVEQVKRVKEIEAIESNSFVQQTFRSSKEVRKSVEPSEVKLAAAASGPASGAADPPSVEKEADPSCIPTAIKYQDDNSLAHPNLFIEKAEAEEKWFKRLIALRQERLMGSPVA	608878	537617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_539090_539739_539893_546952_547060_608808
763628	contig_7230_pilon	-	1346	3	Intergenic	novelGene_52522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	43	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	797	1129	20330	15131	FALSE	45	TCAAAACAAATTTCCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCVKEEIFGPVMSILSFDTEAEVLQRANDTTFGLAAGVFTRDIQRAHRVVAELQAGMCFINNYNVSPVELPFGGYKKSGFGRENGRVTIEYYSQLKTVCVQMGDMESAF	21126	14913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_15226_17154_17268_20205
763629	SIRV2	-	441	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	38	3253	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
763637	contig_6710_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_94884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653790	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
763640	SIRV6	+	323	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1681	3	-218	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2805	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763643	SIRV6	+	244	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8469	3	270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGCAATGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	2810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
763646	contig_17068_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_172569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	390	845	35340	112709	FALSE	15	GCACAAGCTCTTTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEETHPDEAPSLDMGALATRPFKKKKASVGPNSPAVKENEELQSHKESISPRDRKGRINQRLHQPETRRTRRCPATTNDRPDREHNRESLMEQEKKEVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGSPENMAPGLSVNPELKPFPRPTLQTKIKLDYRT	34950	113671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_35366_112279
763647	contig_1435_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_115499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAATCCACCAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515869	513973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_514000_515900
763650	contig_15666_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_70110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTAGATTGGAGCGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76735	75181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_75200_76700
763652	contig_5018_pilon	+	739	5	Intergenic	novelGene_47156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	506.259567810822	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	85	588	1498209	1500370	FALSE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTQHDLGKGRQKALLGALTRSGSQLSVMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLIQERPDLPP	1498124	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499551_1500340
763653	contig_3866_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_112410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACATAATGTTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199511	197833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_197800_199500
763654	contig_3602_pilon	-	773	8	Intergenic	novelGene_60637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.709908706191	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	109	495	1123679	1106308	FALSE	10	TGAGTCTCTTTTCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSSANKCLLKVAGYAARLQTS	1139351	1106029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106327_1111752_1111795_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
763657	contig_835_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_152137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTGAATAATCGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91611	91959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_91600_92000
763662	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763664	contig_6497_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_35656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	377	1134	554	1687	840536	841669	NA	20	ATGCTTACAGACTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRNLLYMRSNFLLGSRCWMIRFSTEILFKSVSFRLFGVKRNNADGESLEKDELLNNLLTMGVDIDMAKKRQPGVFNRMVTNEQDLKMFLLSKGASKQVIASIISRYPRAITRTSESLSKRWDLWRKIMASDLEIVNILERSPESFFRSNNNLNLENNIKFFYSVGLTRKCLCRLLTNAPRTFSNSLDLNKQMVEFLQSVCLSLGHKDPADFVRKIIFKNPFILIRSTKRVKTNIEFLQSAFSLNSEELLALICGPGAEILDLSNDYAKRNYTNIKEKLFSLGCTEEEVQKFVFSYPDMIYLAEKKFNDKIDCLIQEKINISQIMESPRVLDSSLSTLKSRIKELVNAGYNLSTSNITPLSWSLKRYKAKLKKLNG	839982	842457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_840000_842500
763666	contig_12032_pilon	-	1681	8	Intergenic	novelGene_139276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.241477343497	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	68	805	122315	101367	TRUE	25	GTAGATAACTTGGCAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRRVVSGELGLLLPKSRLRGHMAQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPERKMQPRCTKIFRSSPASSKTSWCILFWLLPDKP	122382	96450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_101164_101373_105048_105147_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
763667	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
763668	SIRV1	-	166	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3938	0	3664	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6702	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763671	contig_13201_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_130888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGCCCAGCATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449126	450650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_449100_450600
763673	contig_12528_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_81271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATAGATGAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196072	193657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_193700_196100
763674	contig_4876_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_137906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472776	472486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_472500_472800
763675	contig_11719_pilon	+	178	1	Intergenic	novelGene_154761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAGAAAGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75335	75513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_75300_75500
763676	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763677	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
763679	contig_14441_pilon	+	1155	5	Intergenic	novelGene_100486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	420.323982185171	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	541	969	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	92175	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92708_116550_116963_117220_117344_117539
763684	contig_1694_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_144973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTTTCTTATTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599475	1598448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1598400_1599500
763685	contig_7694_pilon	+	903	5	Intergenic	novelGene_159922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_4	32.783379935571	1741	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	31	459	174784	180869	FALSE	10	CTTGTGCTTTGCAGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQNRKRRWFGMAAAAEAIPANRTEEPARDDAAVETAEEAKEPAEADINELCRDMFSKMATYLTGELTATGEDYKLLENMNKLTSLKYLEMKDIAINISRNLKDLNQKYAGLQPYLDQINLIEEQVAALEQAAYKLDAYSKKLEAKYKKLEKR	174753	181313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_174839_175252_175370_178578_178699_179449_179555_180837
763687	contig_10235_pilon	+	1112	6	Intergenic	novelGene_46601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.33676245696	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATGTATTGGTGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596457	598938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_596681_596789_596824_597608_597737_598026_598082_598160_598279_598384
763689	contig_6710_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_98204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653479	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
763690	contig_3956_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_14775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	97	333	951417	951181	NA	80	CGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLTSSSFWWLLVILGLPCLWPHHCSLCHHVHMVIFPVGLCLFSYKDTSPCTRARPTPLGGPGRCKQWTRSAVNQKVGSLSPPNGTLEERPGNLLPKNQPLKTLWSTVLL	951513	949960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_950000_951500
763692	contig_7342_pilon	+	1877	6	Intergenic	novelGene_71221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1184	1537	700559	703201	TRUE	20	GAACCGGGCCGGTTGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGELLRKFLHLPLNQLSTVRQGLREVVSIIVLNTICNAPIIYFCLIQHTDIHHVNVLQVLQTGFNILLSISRVFLQPVVFHTFFFWFTPSWAATTHPSVEACMLYDAEQVSAELPD	697670	716549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_698850_700554_700765_700855_700918_703115_703232_712238_712324_716324
763693	contig_17796_pilon	+	1619	12	Intergenic	novelGene_33823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	435.383102888699	2	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	344	985	75600	110627	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAGTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGERRIKINSPRLIPTRQRPDKPPLSAIIIVTSCPSHSTFSWVQ	72459	111373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_72571_72904_73008_74577_74664_75556_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_110496_110637_110685_110841_110903
763694	contig_16775_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_107796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTGCTAAAATCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197558	198273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_197600_198300
763696	contig_16122_pilon	+	2401	3	Intergenic	novelGene_134501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	7	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	275	1432	116739	117896	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPYDSNEVSYLLPSNKEDWEEQGIPDFVYGQEELLMREIQWPRNASGVPGALPLSRFDSAVCSAWRQRMELGLFRYHLGELQTQTLPGAVGFVAQLNVERGVQRRRPQSIRSVRQPFDPEQFNFNKVRPGEILFRLHREPDLPGAVQQEDILVMINVSPLEWGHVLLVPEPARGLPQRLLPGALRAGVEAVLLSLHPGFRVGFNSLGGLASVNHLHLHGYYLAHRLPVEGAPSEPLDPGGHLHFLQALPAPGFLFYTGGPGPDLEALVSRVCRATDYLTDHEIAHNLFVTRGALPGKTSPSSALTGVRVILWARKSSFGIKEGEAFNVALCELAGHLPIKTSQDFTSLTEAAALTLIQDCLLPPAQAEEVQAALVALVAQEEQ	111038	118865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_111247_115852_115910_116729
763698	SIRV6	+	532	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1564_1681_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763701	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	51	499	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763702	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	0	3590	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763703	contig_9594_pilon	-	2067	6	Intergenic	novelGene_73936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1588	2004	310783	301268	FALSE	5	TTCTCCACGCTCCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPKAGSAQAFSTSGPTQSFKNRTSLPSKDLSSTATASKEYLSGMGTPSGRPRWLIRTTDLAPLSKQNLMLGVAALILWLFVIWLFFIGTLKSTLMTTRFPFTSSLSRVSLLERDILAIQRRRVARESHSGSEQQPR	317613	301204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_301398_307476_307528_310431_310590_310705_310858_315255_315352_316196
763704	contig_9724_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_172584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAATTTAAAAAGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24852	22760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_22800_24900
763709	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	3	414	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763710	contig_18869_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_56382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73582	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
763711	contig_2069_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_23497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509070	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942
763712	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763714	contig_3153_pilon	-	1273	10	Intergenic	novelGene_104674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.041102663966	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	31	543	247624	214636	TRUE	20	TCTGTATTTCCAGCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILAGVVQRLMMGTIHLFRKPQRSFFGKLLQEFRLVAADRRSWKILLFGAINLICTGFLLMWCSSTNSIALTAYTYLTIFDLFSLMTCLISYWVMMRKPSPVYSFGFERLEVLAVFASTVLAQLGALFILKESAERFLEQPEIHTWNNSSDSNSANIKPLKQTTPPFHLLVSLHTAQEIT	247654	209033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_209693_212233_212292_214622_214745_217133_217170_217855_217937_221159_221226_224955_224999_229052_229138_233949_234037_247618
763715	contig_3153_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_104672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCTAATATGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209084	208245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_208200_209100
763717	contig_6552_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_163611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATATCACTGAACTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181066	180402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_180400_181100
763719	contig_6710_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_93651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
763724	contig_9434_pilon	-	3182	1	Intergenic	novelGene_150504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2208	2516	353824	353516	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELGRTSSKPCITVTKNQRIILAKFIEHLLYPRHCAKNIIRVFSQQLYEVTPLITMRELSSETLSNFPKVTQPSRRRGKLFISVCLILKPTHHPASHGKTM	356031	352849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_352800_356000
763727	SIRV6	+	534	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	19	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763728	contig_10629_pilon	-	2465	13	Intergenic	novelGene_52911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	450.520154623766	2	154	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	270	647	256957	253815	TRUE	20	ATCTATTTGTTCTTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISGLNYRVIQVPCGPAP	267707	245854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247759_248124_248173_252283_252440_253096_253216_253749_253864_254653_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_257145_267625
763729	SIRV1	-	222	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3881	1	3607	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6759	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763730	SIRV6	+	343	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	526	2	-35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTTGTTCAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
763732	SIRV6	+	195	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	14	-214	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642
763739	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_98151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653800
763740	SIRV6	+	528	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	19	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763742	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	20	-1	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	203	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763749	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763751	contig_19007_pilon	-	2122	2	Intergenic	novelGene_168438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATTGTTTGATAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11295	9059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_9323_9436
763754	SIRV4	-	265	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1258	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3900	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
763755	contig_14357_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_121674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529636	532549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_529600_532500
763757	contig_11978_pilon	+	583	5	Intergenic	novelGene_63097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	145	510	1830113	1831883	FALSE	10	TTTTACCTGCCTGCCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829155	1831956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
763758	contig_11846_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_106000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTAACCCAGTATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410483	408796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_408800_410500
763759	contig_11171_pilon	+	1162	9	Intergenic	novelGene_48530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1481.95971921473	1208	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	38	943	31058	65739	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAGSSAILGAAEGAGQGPPRLAGSPAHLHLAALGVLSSQLDCFRCLASQPGPPARWWG	31020	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_65566
763765	contig_5815_pilon	-	2992	1	Intergenic	novelGene_141184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAATATGTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184629	181637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_181600_184600
763766	scaffold_13505_pilon	-	1745	1	Intergenic	novelGene_111642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTATGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786393	784648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_784600_786400
763767	contig_2834_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_28017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATAATGTAAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306428	306634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_306400_306600
763768	contig_1093_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_139978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAGATAAAATATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176642	177743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_176600_177700
763769	contig_1093_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_139979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177835	179009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_177800_179000
763770	contig_10183_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_169506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATGGAAAAAAACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61542	62634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_61500_62600
763784	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121198	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
763785	contig_4847_pilon	+	824	5	Intergenic	novelGene_156160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.090905746302	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	84	371	99616	109612	FALSE	35	ATAAACAACATTTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPAPRPGRNTRGAPFPVGLRVHALRPMLAWLPELTSGEQFGCQPVSSLSWTEWEENNAEGAQPTSALALAGLWLRSTGCFCWDLGWHHGNEILPLWKIYACRLNRRCQFADGRQAWIYCFH	99532	110065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_101400_101451_108575_108658_109570
763790	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
763791	scaffold_8345_pilon	-	2048	8	Intergenic	novelGene_107002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.20076521462973	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	102	872	557611	546529	FALSE	25	ATGTGGGTTCTTATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENKAASPESVVYPIFSVSSVNTKRSVAEEQSPMGSVISTNFLKQTSTQKSARDTNKEIKDQFIIDAGQKHFGATMCKSCGMIYTASNPEDELQHVQHHQRFLEGIKYAGWKKERVVAEFWDGKIVLVLPHDPNYAIRKVEDVQELVDNELGFHQVIPRRPDKTKTFLFISDEKKVVGCLIAEPIKQAFRVLSEPTGPESARSKECHRAWQCSNVPQPAICGISRIWVFRLKRRKRIARRLVDTLRNCFMFGCFLSTDEIAFSDPTPDGKLFASKYCNTPNFLVYNFNS	563761	545352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_546662_549135_549312_553317_553462_554127_554218_556116_556249_557515_557637_560499_560558_563743
763796	SIRV4	-	457	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	8	1056	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
763797	contig_2646_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_69554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCTCCTAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851259	852153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_851300_852200
763798	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
763807	contig_11719_pilon	+	2015	8	Intergenic	novelGene_154747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3089.2737671115	109	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	1	876	13921	133661	FALSE	20	CTCTGGGATGTGAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFVLLVSSSRHPDRWIVPGGGMEPEEEPGVAAVREVCEEAGVKGTLGRLVGIFENQERKHRTYVYVLIVTEVLEDWEDSVNIGRKREWFKIEDAIKVLQYHKPVQASYFETLRQGYSANNGTPVVATTYSVSAQSSMSGIR	13920	134800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_106844_106956_130464_130510_131325_131411_133482
763810	contig_10923_pilon	+	1232	8	Intergenic	novelGene_66169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	899.078008465407	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	73	699	21667	37441	TRUE	25	CAACACTTGTAGGTAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRTLVLWSLCGSLRERKAKS	13806	42831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23116_29348_29572_30133_30178_37385_37535_38578_38742_42554
763814	SIRV6	+	415	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763815	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	9	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	924	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763816	contig_14450_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_48926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATGCACAGGAAACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378569	379574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_378600_379600
763817	contig_14450_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_48927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTATGCAATCTAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379576	379928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_379600_379900
763821	contig_5640_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_27292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTATTTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257838	1260472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1257800_1260500
763822	contig_401_pilon	-	2680	20	Intergenic	novelGene_42731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	77.6445127495228	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	35	2380	156146	115367	TRUE	15	GTGTAAGTAGTTTCCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRRGPGSASAMLPYTVNFKVSARTLTGALNAHNKAAVDWGWQGLIAYGCHSLVVVIDSNTAQTLQVLEKHKADVVKVKWARENYHHNSGSPYTLRLASADVNGKIIVWDVAAGVAQCEIQEHVKPIQDVQWLWNQDASRDLLLAIHPPNYIVLWNADTGTKLWKKSYADNILSFSFDPFDPSHLTLLTSEGIVFISDFSPSKPPSGPGKKVYISSPHSSPAHNKLAAATGAQKALNKVKILITQEKPSAEFITLNDCLQLAYLPSKRDHMLLLYPREILILDLEVNQTVGVIAIERTGVPFLQVIPCFQRDGLFCLHENGCVTLRVRRSYNSICSTSDEELDPDPVQELTYDLRSQCDAIRVTKTVRPFSMVCCPVNENAAALIVSDGRVMIWELKSTVCNRGSRNSSSGVSPLYSPVSFCGIPVGVLQNKLPDLSLDNMIGQSAIAGEEHPKGSILQEVHLKFLLTGLLSGLPPPPFAVRMCPPLTTKNIHMYQPLLAVGTSNGSVLVYHLTSGLLHKELSVHSCEVKGIEWTSLTGFLSFATSTPNNVGLVRNELQLVDLPTGRSIAFRGERGNDESPIKMIKVSHLKQYLAVVFKDKPLELWDVRTCTLLREMSKNFPAITALEWSPSHNLKSLRKKQLATREAMARQTVVSDAELSVAESSVISLLQEAESKSELSQNISAREHFVFTDNDGQVYHLTVEGNSVKDSARIPPDGSMGSITCIAWKGDTLVLGDMDGNLNFWDLKGRVSRGIPTHRSWVRKIRFAPGKGNQKLIAMYNDGAEVWDTKE	156180	111751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_111859_115173_115370_115719_115835_116262_116370_121185_121334_122008_122134_124024_124134_128831_128908_130918_131026_135687_135773_139311_139489_142805_142910_143205_143402_144457_144573_144953_145120_147371_147559_148926_149101_150029_150184_154922_155035_156060
763823	contig_9332_pilon	+	432	2	Intergenic	novelGene_60712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77968	79210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_78054_78863
763824	contig_20602_pilon	-	1226	7	Intergenic	novelGene_133717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	343.437241557885	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	7	879	29552	10026	FALSE	15	TTATTTTTTTTTTTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLVRFRFGRMLNSYVSFILRHLAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29558	9678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19222_21146_21282_23430_23626_29458
763827	contig_14322_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTCACTCCAAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
763830	contig_4469_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_21889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAAAATACATAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271474	272041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_271500_272000
763832	contig_3948_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_53244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCCACAGTTAGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152914	1154887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1152900_1154900
763833	contig_5684_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_81086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTGCATCAACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482099	482737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_482100_482700
763834	contig_8286_pilon	+	2056	4	Intergenic	novelGene_139781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	110.755988049807	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	208	534	27258	30831	FALSE	70	GGAAAAAAAAAAAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVGVEKKLLLGPNGPAVAAAGDLTSEEEEGQSLWSSILSEVSTRARSKLPSGKNILVFGEDGSGKTTLMTKLQGAEHGKKGRGLEYLYLSVHDEDRDDHTRCNVWILDGDLYHKGLLKFAVSAESLPETLVIFVADMSKPWTVKESLQKWASVLREHIDKMKIPPEEMRELERKCK	24915	32353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_25020_25182_25257_27228_27346_30592
763836	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
763838	contig_15185_pilon	-	1268	3	Intergenic	novelGene_99465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	289.5	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	237	539	444599	435457	FALSE	20	GCCAATGAGTCTTCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLGELLYWRREETGWWGRC	472490	434727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_435689_444528_444693_472347
763839	contig_13828_pilon	+	4378	1	Intergenic	novelGene_158288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACTAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219637	224015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_219600_224000
763841	contig_10003_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_88183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACATGTGAACTCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443677	442068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_442100_443700
763843	contig_13697_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_165916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	476	862	133648	134034	NA	45	GAGTTAAATAGCAGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSLGKDVMLGKVEGQCKRGRPSMRWIDTVTETMGLNITVLVRVALDCVVFCSVVCQVAMSQHDSTALTNNSRYREREKFISRKWLKSQVRGLVSGWNLLLIRIAAGEMNPQSAGQTAGSWLTGCGW	133172	135602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_133200_135600
763846	contig_3602_pilon	+	1335	6	Intergenic	novelGene_60486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1134.59709148226	4	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	246	587	168543	169451	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161597	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161752_168451_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170003_170935
763848	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	314	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763849	contig_3018_pilon	+	1590	2	Intergenic	novelGene_78912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	116	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTGCTATTGATAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625250	673147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_625370_671676
763854	contig_6102_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_32311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTCTAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1559369	1559685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1559400_1559700
763856	SIRV6	+	435	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	527	0	348	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763860	SIRV6	+	437	6	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	337	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
763861	contig_7119_pilon	-	1464	4	Intergenic	novelGene_40896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	433	1020	139678	138880	TRUE	50	TGAAAGAAGGAAGCGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140110	127455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127604_136974_137093_138701_139453_139663
763867	SIRV2	-	558	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4315	34	3140	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
763870	contig_312_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_128318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGACTGAAGGAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443584	443884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_443600_443900
763871	contig_312_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_128319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGGAGGAAGCAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443831	444803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_443800_444800
763875	contig_9900_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_159508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCCCAGCAGAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128141	130392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_128100_130400
763876	contig_15952_pilon	+	1362	5	Intergenic	novelGene_154034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	61.1611600609406	381	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	49	840	62239	64155	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWARAWRLPHGGRGASRPSFPRVPVANSSSSGGGGGVELRPLPLSFTLLDGEAGRPALVFLHGVCGCKNNFNSVAKALARRTGRKVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVQ	62190	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344_63519_63695_63867_63969
763877	contig_12761_pilon	-	2537	1	Intergenic	novelGene_164057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	52	561	233039	232530	NA	20	GGAGGCTCTGCCTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELRLTGISFGLTPTLIPQASRQAPTLPMLQPSVDGWTAPWLRSEPLNCTPEEGLTRHVNSTSIKPLLKEIPSQKMKAQEPQSSDQYFRAVFKSHLNASKTPCLPTSSTTKEAPTCLPPGALAPCHPNQCHLGNVRGSHGKGHSQQPSHNPAASLRKNHCRQVNSNSL	233090	230553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_230600_233100
763884	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
763885	contig_4531_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_47865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTAACTTTTAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180101	178270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_178300_180100
763886	contig_11832_pilon	-	1380	13	Intergenic	novelGene_106935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	990.657732547198	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	479	1126	86997	84055	FALSE	10	GCATGAGTGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPNAQPTPAPDPPAGPAAEEAGPACPPLFFSQYPRICLALSPCSQAQRTRGRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNNFLNQPLPAFSHPLKYALDPSPVESGH	89440	83800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84140_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418
763890	contig_5947_pilon	-	2494	2	Intergenic	novelGene_101569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	48	299	792946	792695	TRUE	5	CCTTTCTTTTCTTCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQIIPLTSRSNPRRAMIILLSQMRKPGLQEAEGLVQGQTQDLIPGYLVLDSGPLTISQERKSPSDTLLVKTASLKSDANRIIQLVYTHSNSIYSHTHM	792993	789278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_790984_792204
763891	contig_19769_pilon	+	550	4	Intergenic	novelGene_102324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_1	94.0224559465568	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	118	549	87859	89298	FALSE	40	CTGTGCAGGAGAAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTK	87529	89299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87609_87820_88040_88841_88958_89163
763896	contig_10196_pilon	+	1291	2	Intergenic	novelGene_132054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	904	1290	657101	657487	FALSE	45	AATAAAGTTTTATTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSREFRLLPSLSTCWVQRQSLCVNMTVSIHQQASDNFLLLKKIQKCYRVKKPKRAAMQSIPTPSDPQDRAELPHRVSKAVIFTEADCHIFLPQSGWWVQTTGLSVTSRAPYPLRHGGGQIWPTSYFC	655604	657488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_656292_656884
763905	contig_990_pilon	-	2013	4	Intergenic	novelGene_76071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGAAAAAAGCTAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087215	1081589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1082722_1084380_1084457_1085874_1085927_1086462
763910	contig_6241_pilon	-	1694	5	Intergenic	novelGene_156413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	179.935405076377	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	285	872	194495	182242	FALSE	65	ACAGAGAAGACAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYQKAASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365493	181419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_189896_194227_194559_365114_365246_365403
763912	contig_5935_pilon	+	1174	5	Intergenic	novelGene_102725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	28.0757902827329	1441	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	10	507	1105392	1114767	TRUE	5	CTTTCCCGTGGGTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKMDALRAREQLRRRYLFPQDAEAQLNSESGPGAETSTAVEKKEKPLPRLNIHSGFWILTSIAVTYYVDFFKTIKENIHTSSWFLFGGALLLVSLSVAFYCIIYLEWYCGVEDYDAKHPSLIPITTATFIAAGICFNIALWHVWSFFTPLLLFTQFMGVVMLISLLG	1105382	1116659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1105489_1107351_1107494_1111358_1111518_1114667_1114777_1116001
763914	contig_610_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_76805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGGTCCACCCAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313748	314102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_313700_314100
763919	contig_12619_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_73566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817123	815322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_815300_817100
763927	contig_1618_pilon	+	1372	9	Intergenic	novelGene_141806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	44.2801803858114	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	171	1175	727106	745924	FALSE	10	CTTCTGTTTCTGAGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESILKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEAFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL	724153	746121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724217_725942_726044_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742218_742337_744092_744217_745756
763929	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763930	SIRV6	+	412	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	550	0	371	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	498	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763934	contig_5480_pilon	+	1629	9	Intergenic	novelGene_107225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_8	128.705514159262	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	19	1371	79527	103586	FALSE	25	TACTTGTGAAGAATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKTGKRPKANIIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKYDGYTSCPLVTGYNRVILAEFDYNGQPLETFPFDQSKERLSMYLMKADFMPFLYWNMMLRGYWGGPAFLRKLFHLGMS	79508	103844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89918_92258_92469_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
763935	contig_2125_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_147719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419279	418058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_418100_419300
763938	contig_14980_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_78223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCGAGCACAGAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298396	301043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_298400_301000
763939	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763942	contig_1275_pilon	-	826	2	Intergenic	novelGene_108836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	308	718	747710	747300	TRUE	30	ACTGATATGGGAAGGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGFHLQGDGLSR	748017	746550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_746634_747274
763944	scaffold_19766_pilon	-	1378	4	Intergenic	novelGene_34358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	144.569091517593	751	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	50	1081	678336	676963	FALSE	0	GCCTTGGCTGTGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVLSPVAPEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGRSDEERGPGREGKDSGTRDGREGLMDPSCPSGASLSVADLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHWSVPRLLPPHTSPWTQRRAQPAGQTSRASLHIPYTTVNTNYFCPAALEMAHHHQQLSRWPPLPIPTTSQTQALAPWAPLPASAHSSFISVENVLYAQAGGSPPHSGPGSPNLIPFPDPLEPKPRRNA	678385	676665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_677548_678138_678275
763945	contig_2933_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_111337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACCCAGCCCCGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684283	683206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_683200_684300
763949	contig_17727_pilon	+	1123	9	Intergenic	novelGene_172587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	3.90512483795333	228	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	111	761	44691	60253	FALSE	20	TGACTTGTGTTATATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEPWPENATLYQQLKEEQILLSDNAASLAVQAFLQMCNLPIKVVCRSNAEYMSPSGKVPFIHVGNQVVSELGPIVQFVKAKGHSLSDGLDEVQKAEMKAYMELVNNMLLTAELYLQWCDEATVGEITYARYGSPYPWPLNHILAYQKQWKVKRKMKAIGWGNKTLDQVLEDVDQCCQALSQRLGTQPYFFNKQPTELDALVFGHLYTILTTQLTNDELSEKVKNYSNLLAFCRRIEHHYFEDHGSSSVRLS	19814	60615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_+_19866_20844_20892_44678_44752_48086_48164_49435_49529_50039_50079_50465_50592_51812_51890_60075
763952	contig_10235_pilon	-	1362	10	Intergenic	novelGene_46578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	58.2999904707444	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	11	541	546922	538920	TRUE	15	GGTGGTGGGGGGAGATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLNPEDWGLRNCTLYTGLDEVAEEQTQLFRCLEQDVPFDSSSLDVGMDASPPEPPWDPLPLFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSEGPGETEVSAMEEVASS	546932	537233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539186_545150_545287_545811_545904_546165_546245_546384_546465_546831
763954	contig_10813_pilon	+	1938	11	Intergenic	novelGene_87020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.3859495863536	1	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	12	1367	55923	85000	FALSE	30	TCTCAGTATTGAAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKMLSRNPDNYVRETKLDIQRDYDPTLHPFEVPREYVRALNATKLERVFAKPFLASLDGHRDGVNCLAKHPKSLATVLSGACDGEASVTLNVDVRIWNLTKRKCIRTIQAHEGFVRGICTRFCGTSFFTTGDDKTVKQWKMDGPGYGEEEEPLHTVLGKKTVYTGIDHHWKEAVFATCGQQVDIWDEQRTSPICSMTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVILDMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55911	85571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_62546_62762_63303_63412_66126_66217_67995_68155_71471_71550_74196_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912
763957	contig_1107_pilon	+	2983	5	Intergenic	novelGene_126569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGGAGTCGCTGCCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494528	511566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_496910_497729_497955_501697_501852_504360_504481_511463
763961	contig_11572_pilon	-	2718	20	Intergenic	novelGene_100032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	60.939186797451	2	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	1013	2383	189897	134069	FALSE	30	GTATATGTTATGATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRNVLNDAVDLLEFRDRVIKASLNYAHLVVSTSLQCYVFSTKNWNTPLIFDLKEGTVSLILQAERHFLLVDGGGIYLYSYEGRFISSPKFPGMRTDTLNAQTVSLSNDTIAIKDKVIFLFEAATGKPLGDGKLLSHKNEILEIALDQKGLTNDRKIAFIDKNRDLYITSVKRFGKEEQIIKLGTMVHTLAWSDACNILCGLQDTRLTVWYYPNTVYVDRDILPKTLYERDASEFSKNPHIVSFVGNQVTIRRADGSLVHISISPYPAILHEYVSSSKWEDAVRLCRFVKEQTMWACLAAMSVANRDMTTAEIAYAAIGEIDKVHYINSIKNLPSKESKMAHILMFSGNIQEAEIVLLQAGLVYQAIQININLYNWERALELAVKYKTHVDTVLAYRQKFLETFGKQETNKRYLQYAEGLQIDWEKIKAKIEMEITKERERSSNSQSNKGIGVKY	252671	133733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_134180_143476_143601_152951_153125_153686_153777_156397_156570_157847_157996_158411_158548_170052_170118_174884_175037_178262_178338_180854_180974_189891_189996_212134_212273_213936_214027_219367_219478_233191_233261_235371_235483_242638_242859_245211_245300_252583
763964	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
763967	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
763968	contig_5945_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_104595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGCAGGCAAATATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339982	339190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_339200_340000
763969	contig_5945_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_104594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAGAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338882	337425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_337400_338900
763972	contig_5013_pilon	-	1253	5	Intergenic	novelGene_110089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	659	junction_2	49.7242395618073	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTATCTGAATTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216373	173835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933_187998_205757_205926_216282
763979	contig_8978_pilon	-	3174	4	Intergenic	novelGene_49437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	10.8012344973464	54	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	146	724	1075043	1056887	FALSE	50	TGAGGAATAAAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVCAIFGGSRGIGRAVAQLLAQKGYRLAIVARNLEVAKAAAGELGGGHLAFSCDVAKEHDVQSTFEEIEKHLGRVNFLVNAAGINRDSLLVRTKTEDMIAQLHTNLLGSMLTCKAAVKTMVQQQRGSIVNVGFVHTDMTKDLNEDHLKKNIPLGRFGEPIEVAHAVVFLLESPYVTGHVLVVDGGLQLII	1075188	1054436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1057066_1070067_1070205_1073444_1073566_1074901
763980	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
763981	contig_15118_pilon	+	1146	6	Intergenic	novelGene_74633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	119.270448980458	1858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	31	537	438502	457375	TRUE	10	CGTCTGTCTCTGTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVPGSDSRKMAELRALVGVKRVIDFAVKIRVKPDKTGVVTDGVKHSMNPFCEIAVEEAVRLKEKKLLKEVIAVSCGPAQCQETIRTALAMGADRGIHVEVPAAEADRLGPLQVARILAKLAEKEKVNLLLLGKQAIDDDCNQTGQMTAGFLDWPQACIQQWNIKDYSVPKEPWWHSG	438471	458980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_438559_448781_448941_449190_449350_451928_451992_457306_457772_458767
763982	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
763988	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
763989	contig_7839_pilon	+	2089	4	Intergenic	novelGene_45748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_2	89.6263850040204	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	108	602	1079288	1086530	FALSE	15	TATGGTTGTCTCTGTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIMIKGGVWRNTEDEILKAAVMKYGKNQWSRIASLLHRKSAKQCKARWYEWLDPSIKKTEWSREEEEKLLHLAKLMPTQWRTIAPIIGRTAAQCLEHYEFLLDKAAQRDNEEETTDDPRKLKPGEIDPNPETKPARPDPIDMDEGKCVLGGICFFGKLLRCL	1079180	1088017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1079333_1082113_1082218_1083655_1083818_1086346
763999	contig_5815_pilon	+	1134	6	Intergenic	novelGene_141207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	392.654759298802	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	92	442	561980	567824	TRUE	35	TGAATTAAGCTTTATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGFPSVP	561888	572244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_566997_567804_568014_571741
764004	SIRV6	+	417	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	114	0	-73	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	59	298	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2399	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
764007	contig_10074_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_57094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATATCAACCAACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180430	179932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_179900_180400
764008	contig_14513_pilon	-	817	5	Intergenic	novelGene_70298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	185	574	18880	11531	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLFQK	19064	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11544_12021_12158_13087_13136_14952_15001_18735
764009	contig_9527_pilon	-	2080	7	Intergenic	novelGene_134053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_6	32.4396876269383	319	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	237	1718	454865	428622	FALSE	10	GATGCCGCCTGCCCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVAYASSDESEPDEAEPEPEPEEEEVAALTSGPTLGGLFASLPAPKGPALLPPPPQMLAPAFPPPLLLPPPTGDPRLQPPPPLPFGLGGFPPPPGVSPAEAAGVGEGLGLGLPSPRGPGLSLPPPIGGAGPPMGLPKPKKRTEPVKIAAPELHKGDSDSEEDEPTKKKTVLQGSGEGTGLSALLPQPKNLTVKETNRLLLPHAFSRKPSDGSSDTKPSRLAPKTKPSSLAPVVGTTTTTPSPSAIKAAAKSAALQVTKQITQEDDDSDEEVAPENFFSLPDKAEPPGVEPYPYPIPTVPEELPPGTEPEPAFQDDAANAPLEFKVAAGSSGAPWMPKPGDDYSYNQFSTYGDANAAGAYYQDYYSGGYYPAQDPALVPAQEIAPDASFIDDEAFKRLQGKRNRGREEINFVEIKGDDQLSGAQQWMTKSLTEEKTMKSFSKKKGEQPTGQQRRKHQITYLIHQAKERELELKNTWSENKLSRRQTQAKYGF	455101	428259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_428709_430114_430181_432178_432323_434190_434287_437260_437828_440915_440964_454391
764012	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_90560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653850	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
764013	SIRV1	-	234	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	8	3588	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
764015	SIRV6	+	340	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3156_10724_10819_11031_11109_11205
764018	contig_12603_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_105821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAGTGTCGTCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769443	768677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_768700_769400
764021	contig_4847_pilon	-	1558	10	Intergenic	novelGene_156148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	225	599	92764	90245	TRUE	10	GAGCAGGGGCTTTCCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSNIFAILLFLDTRRLSFSGFSPSPVKPPFSAVGFDCLSSSCTSSPDSFRWILDGSPLLTGEGSAAGGRLSFASVTLSNHTPRQVSLALVFTSQRREGGASLSWLSFHILRNPSLDAVTIT	92988	79640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_79905_82204_82367_85408_85532_85605_85679_86201_86255_86674_86821_86911_87012_90206_90307_92288_92412_92574
764023	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764025	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
764027	SIRV6	+	357	5	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	414	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1761_3092_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764034	contig_14755_pilon	-	1457	1	Intergenic	novelGene_129383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	543	1031	176445	175957	NA	40	AACAACCCAGTATTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIRELTDYSSGSGMLKIQFFHQDSLFSAMPTGMPPWALQPLPCLGKCYKALLALPISAQRHPTLPVSLGLKVLSSVTLWVCTPMAAASLRGPGSPPCHLLLVSWFGCLCSCHFSATVSHCLSLSLVLQLCLSLSSGSTRSQCSDHRSNRHAPLLALLSWW	176987	175530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_175500_177000
764037	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	51	525	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764043	contig_8195_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_170060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434242	432802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_432800_434200
764044	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91642	0	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
764046	SIRV7	-	634	3	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAATCCTAAGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56052_114685_114961_147608
764048	contig_5302_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_81391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152098	154139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152100_154100
764050	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764062	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_98060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764063	contig_10599_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_49888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGTGATGTGTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162383	163240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_162400_163200
764065	contig_10235_pilon	-	966	6	Intergenic	novelGene_46487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	794	junction_5	706.278868436541	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	18	479	222843	219405	TRUE	60	AAAATACAGAATGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	222860	217935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804
764066	SIRV6	+	513	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1531_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764069	contig_16666_pilon	-	1073	5	Intergenic	novelGene_61754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	736.041099395951	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATACCTTGTCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59711	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55427_55572_56041_56584_56647_58206_58264_59552
764071	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764074	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764075	contig_16103_pilon	-	1811	8	Intergenic	novelGene_118897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	124.43094962464	548	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	158	787	766451	760151	TRUE	25	CTGTATGATTAATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSNWLSGVNVVLVMAYGSLVFVLLFIFVKRQIMRFAMKSRRGPHVPVGHNAPKDLKEEIDSRLSRVQDIKYEPQLLANDDARLLQLETQGNQNCYNYLYRMKALDAIRASEIPFHAEGRHPRSLMGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATASCCCYFLELSFEKTPFELGA	766608	758871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_760130_760215_761334_761394_761480_761648_762206_762261_762483_762602_765904_766007_766385
764076	contig_5549_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_81614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325844	324950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_325000_325800
764077	contig_13894_pilon	-	1412	3	Intergenic	novelGene_62037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	5	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	274	1332	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
764078	contig_12841_pilon	-	1599	8	Intergenic	novelGene_55847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	272.012454696847	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	35	583	289372	263466	TRUE	20	TGCTATAGTAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEGVGEGAQDSDPGQPEQPPPQPHPPPPQQQQQQEEEMAAEAGEAVASPMDDGFLSLDSPTYVLYRDRAEWADVDPVPQNDGPNPVVQIIYSEKFRDVYDYFRAVLQRDERSERAFKLTRDAIELNAANYTVWHFRRVLLKSLQKDLHEEMNYITAIIEEQPKNYQVWNLNFGIMNCNM	289406	253918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_254588_254861_255034_257953_258017_263353_263503_273718_273824_275596_275712_286368_286455_289166
764079	SIRV6	+	340	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	532	-1	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764089	scaffold_13505_pilon	-	815	4	Intergenic	novelGene_111434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	205.365257258595	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	132	407	532469	531050	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	532812	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707
764090	contig_2646_pilon	+	1832	2	Intergenic	novelGene_69670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGATGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2183020	2184984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2184143_2184274
764091	contig_8696_pilon	+	854	2	Intergenic	novelGene_153332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACTAACCAAAAGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952953	960032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_953242_959466
764098	contig_18081_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_23797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTTTAAGCCTAGCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125456	123446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_123400_125500
764101	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764103	contig_5643_pilon	+	1244	8	Intergenic	novelGene_39118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAGGAGAAAGGGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646192	651393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646549_647312_647381_648451_648552_648661_648790_649342_649530_650490_650570_650869_650958_651155
764107	contig_91_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_127122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCGCAGAAGCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684829	685624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_684800_685600
764116	contig_4442_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_127936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCCAAATCTCATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171494	169548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_169500_171500
764119	contig_19185_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_163659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATCATGAGAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155031	152604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_152600_155000
764121	contig_5500_pilon	-	1565	3	Intergenic	novelGene_159646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_2	74	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	18	335	648597	634467	FALSE	30	GGAAGACGGTACATAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQPRKMAAAVTFCRLLSRSRLAALSLPQAARCFGVRTSPTGEKITHTGQVYDEKDYRQMRFVGRQKEVNENFAIDLIAEQPVSEVESRVISCDGGGGALGHPRVYINLVP	648614	633236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_-_634599_647064_647119_648465
764124	contig_10948_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_124976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCTGGGTGGTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148900	150717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_148900_150700
764127	contig_12671_pilon	-	2684	3	Intergenic	novelGene_19212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	368	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCCCCGACCCGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206103	197215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_197342_200234_200408_203718
764129	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
764130	contig_3956_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_15294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431072	1432556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1431100_1432600
764131	contig_10581_pilon	-	1618	11	Intergenic	novelGene_41411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	77.6454119700578	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	586	1455	627511	609845	FALSE	25	TAGGAGGGCTTCTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649663	609681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627542_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
764133	contig_5196_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_38694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTGTGTCCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253648	252694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_252700_253600
764139	contig_9505_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_121831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAATTTGATGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448579	449185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_448600_449200
764142	contig_10263_pilon	+	2318	7	Intergenic	novelGene_135832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.4704994315353	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1527	2099	868338	874310	FALSE	35	GAAATGAGCCTTCTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGHTLSHSRMWDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQGQISVERKSQCV	858820	874529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_866403_867707_868279_868374_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165
764147	contig_16125_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_155280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGGGTCTTCCCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170264	170777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_170300_170800
764148	contig_11071_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_131043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAATGGGTTTGGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194110	195700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_194100_195700
764149	SIRV6	+	495	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	20	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764150	contig_12622_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_5771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTCAGCAGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100268	101000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_100300_101000
764157	contig_13800_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_153727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAATTGAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109989	111987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_110000_112000
764161	contig_2988_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_136530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12996	10985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_11000_13000
764162	contig_2988_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_136529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCCACCTTGGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11038	10721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_10700_11000
764163	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764167	contig_15897_pilon	-	1837	4	Intergenic	novelGene_49503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACTCCCCAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74973	69368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_70976_71383_71454_72736_72797_74873
764169	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764170	contig_12352_pilon	+	1890	3	Intergenic	novelGene_57467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	459	junction_2	2	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	197	301	284787	284891	FALSE	10	AGCTCGTTTGCCTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STWRKIGIIDRQNRKPCGFICHLQNNQQKSCPSHVYEESQAHYYHHHCINCVHLYHCVSCLWWIYMAKLYKEIRTKKLLTKDRREQGVKSNPCDSSLCC	268138	286480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_268198_277208_277302_284742
764171	contig_12250_pilon	-	858	10	Intergenic	novelGene_80690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	283.391279477599	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401256	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400023_400250_400378_400528_400562_401200
764172	contig_4426_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_15385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGTTTAGAATGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433001	432621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_432600_433000
764180	contig_9335_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_147436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCAATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201310	199178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_199200_201300
764188	contig_4156_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_88085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223365	224573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_223400_224600
764190	contig_9482_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_44232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	238	717	234803	235282	NA	75	AAAGTAAAAGAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSGIVPVTPSVRSCPSHTQCQELSQSHPVSGVVPVTPSVRGCPSHTQCQGLSQPHPVSGVVPVTPSVRNCPSHTQCQELSQSHPVSGVVPVTPSVSCHPSHTWCQELSRSHPVSGIVPVTPGVWSCPSHTWCQELSQSHLILGIVTVTPGILCATSSF	234565	235282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_234600_235300
764192	SIRV4	-	189	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	425	3	-425	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCATGTCACCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
764198	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
764199	contig_10074_pilon	+	898	6	Intergenic	novelGene_57113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	338	junction_5	199.584969373949	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	17	880	260301	281713	FALSE	70	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSHYSMWLLVSWSHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLIPETAVRHESCNGLCKLSLSGLDGGDSINRSFLLLAASTLLKFLPDAQALKPIRIDDYEEEPMLKPGCKEYFWLLCKLVDNIHIKDAGQTTLLDLDALARHLADCIRSREILDHQDGSIEDDGLTGLLRLATSVIKHKPPFKFSREGQEFLRDIFNLLFLLPSLKDRQQPKCKSHSSRAAAYDLLVEMVKGSVENYRLVHNWVMAQHMQCECSSPSRVFQVCAEKRRFGGYCLKKKFTLHTLYHYVLLLLGCY	260284	281731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_260412_261466_261620_262593_262699_264116_264173_264266_264388_281395
764200	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	530	2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764206	contig_14577_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_164643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCGCCAAGCTATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71699	72090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_71700_72100
764210	contig_15354_pilon	+	1722	9	Intergenic	novelGene_65735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	111.991071072653	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	118	1347	591728	613131	FALSE	15	TGGGGTGTGAGCTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTEPPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQVIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVLNGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRECVRVPRGGIPPRAHSRDSSDSADGRATPSENLVPSSARVDKPPSVLPYFNRPPSALPLMGLPPPPIPPPPPLSSSFGVPPPPPGIHYQHLMPPPPRLPPHLAVPPPGAIPPALHLNPAFFPPPNASVGPPPDTYMKASAPYNHHGSRDSGPPPSTVSEAEFEEIMKRNRAISSSAISKAVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIKQSRVANDERCRVPIPTSTSGTRHPARPAKC	590989	613506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_591056_591676_591782_598174_598394_599232_599337_599700_599874_602548_602964_603669_603789_606055_606144_613073
764212	contig_818_pilon	-	2012	2	Intergenic	novelGene_167993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATCTAAATGCCGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672680	670590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_-_672272_672349
764220	contig_10627_pilon	-	1572	8	Intergenic	novelGene_60071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	26.9163481163097	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1041	1367	1352442	1349383	FALSE	20	GAATTTGTCGTACTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKAINRLSKLLRPGGMMLLRDYGRYDMAQLRFKKGQCLSENFYVRGDGTRVYFFTQDELDTLFTAAGLEKVQNLVDHRLQVNRGKQLTMYRVWIQCKYRKPLLSNTG	1364016	1349177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1349538_1350439_1350506_1352336_1352444_1354139_1354280_1356035_1356097_1360070_1360121_1361234_1361594_1363587
764226	SIRV6	+	255	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	213	412	98	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGGTATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
764228	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
764231	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764232	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764237	contig_6497_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_35649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCGGCTTCGTAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786719	786211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_786200_786700
764238	contig_20610_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_67654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91249	93421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_91200_93400
764241	contig_11846_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_105914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1789	2154	140718	141083	NA	65	GAAAAGACAGGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCIKMDILGISKLKWTGIGHFDSDSHMVSYDRNDKLKRNGVAFIIEKNISGSVLKYNAVSDRIIFIANTVFQQHKQQLYTSTLLNGKHRKQINNIYGKRRWRSSILSVRSRPRTDCGTDC	138929	141286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_138900_141300
764242	contig_9505_pilon	+	1115	11	Intergenic	novelGene_121854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	242.748759008156	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	52	516	530721	597995	TRUE	20	AAGCAACGCCTCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLGEWTCGTAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530669	632883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577957_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
764246	contig_6589_pilon	+	1085	8	Intergenic	novelGene_26025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	855.401779330411	9	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	114	557	1725483	1729204	TRUE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRAGSDRWCDPDAIPTSA	1725369	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728251_1729154_1729234_1730067_1730152_1731406
764249	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	3	1166	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764251	SIRV6	+	616	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	167	0	167	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10404	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764252	contig_6102_pilon	-	1582	14	Intergenic	novelGene_31746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCTGGTTACAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229248	217484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_217554_218013_218066_218402_218477_218670_218791_218885_219000_219526_219620_219751_219870_220088_220187_220356_220445_220704_220752_227979_228157_228270_228395_228584_228648_228903
764253	contig_21007_pilon	+	443	2	Intergenic	novelGene_161514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	48	443	589	984	FALSE	35	AATAATTGCTTTCACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQY	256	984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
764254	contig_15744_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_83580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	133	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	59	379	149562	153280	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGWMASMWSLGK	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152630_153245
764255	contig_15491_pilon	+	1855	4	Intergenic	novelGene_75988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	12.2836838484589	412	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	207	560	131600	140109	FALSE	30	CCATGGTTTCAGAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFQYKEDHPFEYRKKEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARVPDLDKRKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRPEDALFFFVNNTIPPTSATMGQLYEDNHEEDYFLYVAYSDESVYGK	131393	141404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_131690_136113_136193_137621_137741_140043
764256	contig_302_pilon	-	2726	1	Intergenic	novelGene_145009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTTATTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40853	38127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_38100_40900
764259	contig_15221_pilon	-	1156	5	Intergenic	novelGene_133072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	46.6764126727837	467	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	255	689	182332	140413	FALSE	30	TATAAAGATGTCACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEGVVSPSDLDLVMSDGLGMRYAFVGPLETMHLNAEGMLSYCDRYSESMRHVLKTFGPIPEFSGATVQKVNQAMCEKVPDDPQHLAARRKWRDQCLLRLYKLKREMPSE	190693	139945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_140527_141050_141158_149435_149542_182224_182420_190526
764260	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_94544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764263	contig_2770_pilon	+	2614	16	Intergenic	novelGene_107426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_15	50.5611181310962	78	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	122	1879	435425	610298	FALSE	5	CCCCTGGCCAGTGTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVGRFREILRAVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQSYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGANTKTYTLTRRPRVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISESMANRDAVLSRIPEHKSDRLISLQSASVVYDLLTIALGRRGQYEMLSECLERAMKFAFEEFHLWYQFALSLMAAGKSARAVKVLKECIRLKPDDATIPLLAAKLCMGSLHWLEEAEKFAKTVVDVGEKTSEFKAKGYLALGLTYSLQATDASLRGMQEVLQRKALLAFQRAHNLSPTDHQAAFYLALQLAISRQIPEALGYVRQALQLQGDDANSLHLLALLLSAQKHHHDALNIIDMALSEYPENFILLFSKVKLESLCRGPDEALLTCKHMLQIWKSCYNLTNPSDSGRGSSLLDRTIADRRQLNTITLPDFSDPETGSIHATSVAASRVEQALSEVASSLQSSAPKQGPLHPWMTLAQIWLHAAEVYIGIGKPAEATACTQEAANLFPMSHNVLYMRGQVAELRGNIDEARRWYEEALSISPTHVKSMQRLALILHQLGRYSLAEKILRDAVQVNSTAHEVWNGLGEVLQAQGNDTAATECFLTALELEASSPAVPFTIIPRVL	408058	611033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_408104_435348_435428_443765_443939_450074_450139_456699_456838_476878_476963_477998_478104_480712_480831_482069_482128_489239_489313_492107_492269_526894_527012_535586_535685_553255_553397_570954_571158_610076
764266	contig_987_pilon	-	2226	2	Intergenic	novelGene_72323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043014	1040425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1041270_1041632
764267	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764271	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
764274	contig_1759_pilon	+	848	2	Intergenic	novelGene_171347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACAATTGTTGCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98213	99718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_98875_99531
764275	contig_1759_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_171352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACAGCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123210	123787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_123200_123800
764277	contig_9609_pilon	-	1673	5	Intergenic	novelGene_23104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	42.3637521945354	220	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	98	880	512248	506367	FALSE	5	CTGCTGCTTTTGGACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWSSTTSSGYCSQEDSDSELEQYFTARTSLARRPRRDQDEPVEWETPDLSQAEVEQKIKEYNSQINSNLFMSLNKDGSYTGFIKVQLKLVRPVSVPSSKKPPSLQDARRSPVRGTAVRRRTSFYLPKDAVKHLHVLSRTQAREVIEALLRKFLVVDDPRKFALFERAERHGQVYLRKLSDDEQPLRLRLLAGPSEKALSFVLKENDSGEVNWDAFSMPELHNFLRILQREEEEHLRQILQKYSCCRQKIQEALHACPLG	512345	505573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_506514_507150_507267_507390_507689_507898_508004_512131
764280	contig_5092_pilon	+	2485	14	Intergenic	novelGene_62287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1727	2143	434561	435596	FALSE	5	ACTTGCCCTGGCCGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRWEVLFHLLDYHHNFFRNSDPIPVFTVAVLPVFPGQLVVLAPHRIGFGSEGLLPAGQGSFKFFGLVFPGVASLTAGQVHTFAELHLLLGVPHVCRLLLVYFGAPDRSLFLLLVPAIALGKVSCHHARGINDLWSP	403785	435938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_404108_405182_405316_408592_408720_409314_409444_411681_411787_416260_416423_416673_416779_420447_420532_422428_422557_423914_423967_432141_432343_433558_433676_434499_434648_435266
764282	contig_17194_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_155385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAGAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306977	308585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_307000_308600
764283	contig_1274_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_137811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATCAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477503	479474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_477500_479500
764284	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	9	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	464	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764285	contig_3161_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_84508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCCAAGGTAACCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356917	356029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_356000_356900
764286	SIRV6	+	352	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
764287	contig_15063_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_14472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	636	968	38655	38987	NA	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRRLFQKDQEVLASKGKQGRWCGSLWETVPQPHAACCVDTNPSMASALSASPRYCPLTSAGLAPHHGCNPGAGVVSGAGCAVALSLTQPWVHAKLTLLCVLSPLQRGK	38019	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_38000_39800
764289	contig_91_pilon	-	2161	8	Intergenic	novelGene_127121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	33.0515984978837	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	191	1159	689474	675794	FALSE	30	AAGGTTTTTAATTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSGRRLLGTYFRVAFFGQGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTDFERSHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVAEQCKRRTVLTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCASAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQICPLEEKSSVLPNSLHIFNAISGTPTSTVVHGMTSSSSVV	690237	674791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_675917_677827_677967_678081_678183_679766_679958_683470_683682_687700_687848_689417_689530_690102
764297	SIRV2	-	506	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-61	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4793	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969_4095_4338_4480_4687
764298	contig_8616_pilon	-	1205	6	Intergenic	novelGene_72457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	38.6905673259	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	76	774	274294	271495	FALSE	20	CATGGAAGTGTTATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIVSLLPASLPVLGRTPGAVDFLPSRVPGGSGLFCQEERMMSGQKAWGWEVGVGLCPSWLHFLFTTPLAVCYWLPDG	274369	271063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271795_271904_271971_272093_272145_272904_273065_274039_274150_274282
764299	contig_8616_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_72450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCTAAACATTCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270916	269855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_269900_270900
764301	contig_1759_pilon	-	1869	12	Intergenic	novelGene_171327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_6	811.539929917955	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	182	1810	97828	29876	FALSE	20	AGCTCATTTTGGTGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GANLLSVDEDEDSETSKGKKLNRRSEVVATSSGDFILKTYVRRNKSESFKTLKGNPIGLNMLSNNKKLSENTQNASLCSGTVVHGRRFHHANAQISVVKTAAQSSLDRKERKEYPPHVPKIEINPVGLSRPHSVECIMKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPIILSSDDDDDSDRTNRRESVSPQPADSACSSPAPSTGRVEAALNENTCRVEHELRSIPADSELNTVTLPRKARMKDQFGNSIISTPLKRRKVVSQESSVDPMSLSCQSSFDSVILNCRSIRVGTLFRLLIEPVIFCLDFIKIQLEEPESDPVAITLNTSDLTKCEWCNVRKLPVVFLQTIPAVYQKLSVQLQMNKEDKVWKECKGINKLTNLEEEYIILIFQTGLDHQANMVFESIITEIGIKNNISNFFAKIPFEEANSRLVACTRTYEESIKGSCVQKENKIKNVIMF	107747	29816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_30118_38870_39066_39454_39489_43310_43482_45375_45606_50292_50681_56768_56915_64867_64939_92396_92418_96839_96945_97802_97949_107686
764304	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657175	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
764305	contig_990_pilon	+	3428	1	Intergenic	novelGene_76018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTACTATGATTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563386	566814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_563400_566800
764307	contig_4364_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_1165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTCGGTGAAGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
764308	SIRV6	+	690	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	335	558	162	-15	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTAGGTAGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	10773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
764309	contig_12429_pilon	+	1393	6	Intergenic	novelGene_136212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	72.2700491213338	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTAACCACTAATAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296134	352313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_296164_305373_305453_327891_328041_334090_334217_351023_351476_351755
764314	contig_6048_pilon	+	1752	6	Intergenic	novelGene_73117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	440	junction_1	326.547025709927	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	54	620	909094	1187865	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKER	909040	1188997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737
764315	contig_13744_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_77211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	153	464	1079323	1079634	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESHSSLREFRILEHWTSAPNFALNSLPWHNARADWCFGDHGRWMQPWGPAFLLVCVRATSPWYLVARAVNRGTQGLGQVQVTWGPWTDVSLTHSEFLGAGG	1079170	1080329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1079200_1080300
764317	SIRV6	+	371	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	406	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
764318	contig_1982_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_151317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAATCGGGGTAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154359	155828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_154400_155800
764319	contig_12427_pilon	-	2443	5	Intergenic	novelGene_40429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	332.459302020563	7	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	114	704	264797	229828	TRUE	30	AGCCAATGACGCCAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTLEIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPNWIEDVRKYAGSNIVQLLIGNKSDLSEHREVPLAEAQSLAEHYDILCAIETSASVSHWPAKPSPELTLQGTSGSRAAGEILELPIP	264910	227581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_227785_228291_229930_230115_230217_230601_230786_264593
764320	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764321	contig_16098_pilon	+	960	10	Intergenic	novelGene_45780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGAAGCTGTGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31092	36347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_31344_31502_31589_31682_31745_32113_32173_34565_34669_34979_35072_35214_35309_35570_35628_35906_36011_36295
764322	SIRV6	+	200	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	403	-1	-233	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCTTCCACACCACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
764323	SIRV6	+	366	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
764324	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	505	2	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764325	contig_14219_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_54285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583680	584571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_583700_584600
764327	contig_10437_pilon	-	2187	10	Intergenic	novelGene_38408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_4	67.7070669397239	250	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	563	1981	783828	774056	FALSE	30	TTAAATTTGGGATGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFSQHVVLFSVTCLPYCSIRGLFVYGLFFRKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAIQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESAD	784390	773849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527_777612_777881_778001_779088_779203_779373_779474_780253_780398_781784_781865_782612_782780_783426
764332	contig_7357_pilon	+	1948	15	Intergenic	novelGene_36882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	114.253589234917	2	72	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	483	1490	257391	273311	FALSE	40	TTAAAGATTGAATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250826	273769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256948_257240_257396_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
764333	contig_3679_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_112126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041311	1040899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1040900_1041300
764335	SIRV6	+	521	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764338	SIRV4	-	349	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	15	1157	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
764341	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764345	contig_9406_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_136172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTGGGGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92581	92989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_92600_93000
764347	contig_12512_pilon	+	1434	4	Intergenic	novelGene_24186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588317	592640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_588386_590666_590826_591105_591263_591590
764350	contig_3307_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_86890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTGATAGTGAAGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143218	144132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_143200_144100
764351	contig_3307_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_86891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144082	144429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_144100_144400
764352	contig_5039_pilon	-	2505	20	Intergenic	novelGene_64943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	43.7331368371596	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	96	2423	1545169	1475917	FALSE	60	AAAGCTAAAATGCTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERVKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLAQIWALADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVTISSAPAFGIGGIASMPPLTAVAPVPMGSIPVVGMSPPLVSSVPPAAVPPLANGAPPVIQPLPAFAHAAATLPKSSSFSRSGPGSQLNTKLQKAQSFDVASAPPVAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPAEYIPPSFRRARSGSGISAVSSSSVDQRFPEEPVLEDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAEQERKERERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQELLNQRNREQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNKSRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLLTVKRALEAKELARQQLRDQLDEVEKETRAKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSIEAERLKQKEQERKILELEKQKEEAQRRAQERGKQRLEPMQREDEHQRPRKLHDEERLKRDECVKKKDMEDKGRPEVQDKLTRLFLQHPEPAKAAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMIPFLMRP	1549182	1475834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1475941_1477867_1477990_1479885_1480116_1481900_1482029_1496769_1496910_1497048_1497137_1501310_1501452_1501534_1501685_1503513_1503777_1506430_1506547_1508844_1508983_1511914_1511979_1517150_1517252_1520336_1520434_1522111_1522292_1528681_1528843_1542605_1542670_1543600_1543694_1545141_1545202_1549119
764355	contig_10864_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_107060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCATTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778811	780492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_778800_780500
764357	contig_9668_pilon	-	1739	5	Intergenic	novelGene_58087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	44.6507278776058	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	492	995	134664	121609	FALSE	25	TACATTTATTCCTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVAVEGKGEVKRGGEDGRSNSGTPPNEKRGGENLEFCNVRRGRGHRMQPLGEGAKGRQVGSGGDGERWGSDRGSRGSLNEQIAIVLMRLQEDMQNVLQRLHKLETLTASQAKSSTLQTSSQPSSLRPSWWPFEMSPAVLTFAIMWPFIAQWLVHIYYQRRRRKLN	135155	120864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_121622_123176_123287_123619_123665_129339_129540_134528
764358	contig_10940_pilon	-	1540	3	Intergenic	novelGene_49270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1129.5	3	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	701	1081	875054	874674	FALSE	55	AAAAAGAAAGATGAGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	893280	874214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875188_875240_875675_893147
764362	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764364	SIRV7	-	692	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	173	-4	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	39	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147745	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114689_114955_147602
764367	contig_14441_pilon	+	474	4	Intergenic	novelGene_100790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125725	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125787_125842_125902_126159_126283_126514
764368	contig_7035_pilon	+	2473	16	Intergenic	novelGene_83533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4.83965104343508	63	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1401	2258	733410	737281	FALSE	25	CCCAGAGCCTGAGCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSPCIPLSGGSFIPKEDLHGAITFQNVGFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKTVALVGQSGGGKTTVASLLERFYDPTAGVVLLDGRDLRTLDPSWLRGQVIGFISQEPVLFGTTIMENIRFGKLEASDEEVYAAAREANAHDFITSFPDGYGTIVGERGATLSGGQKQRLAIARALIKQPTVLIMDEATSALDTESEGVVQEALDRASAGRTVLIIAHRLSTVRGAHHIVVMADGRVWEAGTHEELLKKRGLYAELIRRQALEAPLTSTPPLEKPKGPRNRHP	720252	737496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_720442_723964_724290_724675_724832_724904_725000_725154_725261_726040_726203_726313_726400_726513_726612_729499_729606_732996_733031_733366_733505_733752_733848_734056_734191_734971_735120_736156_736408_737146
764369	contig_1008_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_121545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505331	505012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_505000_505300
764371	contig_5965_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_154670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAAAATGAGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220494	219392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_219400_220500
764372	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764379	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764384	contig_675_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_136355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1068	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	99	536	244466	244029	NA	45	CGAAACGCTGTGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTKKGNPRFITFANDKNVGKPGAKLLPLASFTCTISKEPRYPFLLVITPTWPRLAPPKVGYHVSSQINHYCVIHLDKRIWVTAGSSIMCHHQVWDSLCTHKYLPHFALLVLCLFSCDTVKGKTSPGVIGQAKILTCLLDAGFM	244564	243793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_-_243800_244600
764388	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	59	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
764389	contig_7294_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_172596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACTCAGCAGCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155998	154764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_-_154800_156000
764391	contig_8907_pilon	-	1889	9	Intergenic	novelGene_85839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_7	79.9428506809708	391	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	139	1170	605435	489040	FALSE	30	CAGAATTTAGTGTGTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQPIFTTRAHVFQIDPSTKKNWVPASKQAVTVSYFYDVTRNSYRIISVDGAKVIINSTITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVFGLGFSSEQQLTKFAEKFQEVKEAARLARDRSQEKIETSSNHSQASSVNGTDDEKASHTGPADTHLKSENDKLKIALTQSAANVKKWEIELQTLRESNARLTTALQESAASVEQWKKQFSICRDENDRLRNKIDELEEQCSEINKEKEKNTQLKHRIEELESELREKETELKDLRKQSEIIPQLMSECEYVSEKLEAAERDNQNLEDKVRCLKTDIEESKYRQRHLKVELKNFLEVLDGKIDDLHDFRRGLSKLSSDN	605573	488320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_489229_490838_490920_492252_492364_495100_495258_497739_497847_501751_501845_519185_519318_536833_536991_605430
764396	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
764409	contig_14101_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_122769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	536	958	286982	287404	NA	55	GTAAGGAAGAAAATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQKHGASEWEENFESISVQFDRRGNGGPERVSDWYQVAQQVSARVEMKPEPSLHPHRLRLGPSVEDWRKKHWTKARIFRTVFEKSKQKAKWRRGAGFPLSSASASSGHSLSTALSRPPALLTSCFPAAHGLPKTVSAS	286446	287698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_286400_287700
764410	contig_11978_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_62845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACCATCCTAGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516742	518762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_516700_518800
764411	contig_12113_pilon	+	3068	8	Intergenic	novelGene_134750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	45.1785573122508	61	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	47	1189	263023	278600	FALSE	30	ATGTTAATCTATAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVVLLAVSAAVAFGMKEIYAKFVSQKISKTRWRPVPPGSLQTAETFATGSWDNEENYVSLWSIGDFGNLDSDGGFEGDHQLLCDIRHDGDVMDLQFLDQERIVAASSTGCVTIFLHHQNNQTLSVSHQWTTAHCHTGPGGPSCSGAPCTGVVCNNPEIVTVGEDGRINLFRADHKEAVRTIDNADSSTLHAVTFLRTPEILTVNSIGQLKIWDFRQPGNEPSQILSLTGDRVPLHCVDRHPNQQHVVATGGQDGMLSIWDVRLGTMPVSLLKAHEAEMWEVHFHPSNPDHLFTCSEDGSLWHWDSSTDVPEKSSLFHQGGRNSTFLSHSISNQANVHQSLISSWLSTDPAKDRIEITSLLPSRTLSVNSLDVLGSCLVCGTDAEAIYVTRQLFS	262976	280479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_263143_263461_263585_264448_264527_265680_265862_268162_268299_268968_269121_273049_273173_278370
764415	contig_16378_pilon	-	425	2	Intergenic	novelGene_163376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2009	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	79	423	17265	16812	FALSE	25	TGCATGGTATATCCACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLEAVVFSFLWAVGLGQWKLEQPDMSISKAASKSAHITCNVAVEDFENAYIGWFRLKPNQGVEYLIYIHSTTTPNYASLGGKSKKLEASKNSRSSTSILKINSVEKEDEAMYY	17343	16809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16378_pilon_-_17114_17222
764417	contig_14363_pilon	-	1267	3	Intergenic	novelGene_112531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	57	246	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATCACAATTAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168390	149477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_150344_151901_152004_168091
764421	contig_6710_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_98258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCTCACCCCCTCCCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
764425	contig_5954_pilon	+	1888	6	Intergenic	novelGene_28484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	539.101103690208	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	175	1770	344839	366968	FALSE	10	AGCTGGCTCCTGGTGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQKASARVVPYACAVWAAPAPGPVATPSAGRPGPASAPALVQLSAARLPAAGSPVSRNMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYSQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGMVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIADNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPNLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESQMPTQAVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLIPPSKR	344664	367086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_345243_348617_348716_360707_361121_364255_364421_364858_365369_366962
764426	contig_9759_pilon	-	2691	4	Intergenic	novelGene_167228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	60.4225859169308	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACTAAGGGAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124260	84700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_86972_97990_98173_99886_100002_124137
764429	contig_7864_pilon	-	2971	16	Intergenic	novelGene_164859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_15	24.7490516092144	113	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	229	1980	113372	90096	FALSE	25	GTGAAGACTGAGACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEDIAKLAETLAKTQVAGGQLSFKGKSLKLNTAEDAKDVIKEIEDFDGLEALRLEGNTVGVEAAKVIAKALEKKSELKRCHWSDMFTGRLRSEIPPALISLGEGLITAGAQLVELDLSDNAFGPDGVRGFEALLKSSACFTLHELKLNNCGMGIGGGKILAAALTECHRKSSAQGKPLALKVFVAGRNRLENDGATALAEAFGIIGTLEEVHMPQNGINHPGVMALAQAFAINPLLRVINLNDNTFTEKGAVAMAETLKTLRQVEVINFGDCLVRSKGAVAIADAVRGGLPKLKELNLSFCEIKRDAALAIAEAVGDKAELEKLDLNGNTLGEEGCEQLQEVLDGFNMAKVLASLSDDEGEDDEDEEEEEGEEEEEEDEEEEEEEEEEEEEPQQQGQGEELTTPSRKILDPNSGEPAPVLSSPPPVDVSTFLAFPSPEKLLRLGPKSSLLIAQQTDTSDPEKVVSAFLKVSSVFKDEATVRMAVQDAVDALMKKAFSSSSFNSNAFLTRLLIHMGLLKSEDKVKAIANLYGPLMALNHMVQQDYFPKALAPLLLAFVTKPNGALEACSFARHNLLQTLYKV	116197	89104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_-_90166_92051_92174_92423_92513_93763_93867_94153_94274_95741_95917_96988_97074_97185_97286_98141_98256_99315_99475_101525_101661_103159_103340_105759_105820_109168_109297_113260_113411_116007
764433	contig_665_pilon	-	2659	2	Intergenic	novelGene_158199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAATGAAGTCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152519	140298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_141538_151099
764434	contig_15063_pilon	+	569	3	Intergenic	novelGene_8573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3444	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	245	568	34808	35243	FALSE	30	GGCCACAAACCTTCCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGS	26351	35244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037
764435	contig_17270_pilon	+	1054	8	Intergenic	novelGene_67229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_7	26.5867851169927	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	131	868	107824	120028	FALSE	60	AAATGATAAAAAGTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSELKDHLLRHLQGVEKKKIEQMVLDYISKLLDLICCILEASWRKHNLHPWVLHFDRRGSAAEFAVFHLMTRILEATNSLFLPLPPGFHTLHMVLGVHCLPLHNLLHYIDNGVLLLTETAVTRLVKDLDNTERNEKLKFSIIARLPPLIGQKISRLWDHPMSSNIISRNHVKQLLQNYKKQPRDSMTDKSSFSVEFLPLNYFIDILTDIESSNQALYAFEGHDNVDAKFVGEAALKHTTMLLGL	107693	120214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_107920_110175_110247_110710_110806_116857_116978_117835_117898_119125_119228_119382_119483_119936
764436	contig_13481_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_119501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCCTAATACCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392237	1392819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1392200_1392800
764438	contig_17964_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_33888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCCAACCTTTTGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334996	333910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_333900_335000
764442	SIRV4	-	252	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1266	3	1266	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3892	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
764444	SIRV4	-	319	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1204	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
764446	contig_13004_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_112649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGGAAAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439410	441699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_439400_441700
764448	contig_2758_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_166434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAGCACTGCTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46839	46230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_-_46200_46800
764451	SIRV6	+	225	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8470	14	269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTGCAATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
764454	contig_5684_pilon	-	1602	2	Intergenic	novelGene_81009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGCATTTCTAATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326579	314862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_316350_326464
764455	contig_7992_pilon	+	2929	13	Intergenic	novelGene_115535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	117.347862500061	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	84	1004	606395	645353	TRUE	20	AAATTCTCTCTTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSGGGGGSAEPDLGVRWRRPKEASRTMSGELPPNINIKEPRWDQSTFVGRASHFFTVTDPRNILLSKKQLENARKTIHDYRQGIVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRSTPAVLFWQWINQSFNAIVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVISRVLMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPVQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEADLQANL	582328	647386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_582403_606385_606559_609963_610135_611209_611309_614478_614555_615800_615887_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235_645276_645344_645883_645990
764457	contig_3004_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_127492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACTCCTTGGAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277441	276849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_276800_277400
764458	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764459	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
764460	contig_10159_pilon	-	1434	2	Intergenic	novelGene_30905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	593	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAACCAGAATTCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006288	1002870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171
764461	contig_14514_pilon	+	1774	5	Intergenic	novelGene_137450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.5452793557793	1485	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGGTTACTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8382	36321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_8430_24702_24764_30105_30203_31668_31750_34833
764462	contig_5125_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_43499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000811	999488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_999500_1000800
764463	contig_8801_pilon	-	2216	2	Intergenic	novelGene_66303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	162	junction_1	0	2	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	811	1548	548049	545797	FALSE	10	CGGCTGTGTGATTTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRWANRSHSQILLGQTLSAGAPRWGFTLISPRSLTSLHTCLGAMVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	548859	545128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738
764466	contig_5481_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_144559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCACTAAGGTCTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46650	47439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_+_46600_47400
764467	contig_6445_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_76988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTAGTTGAAGAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425217	424355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_424400_425200
764470	contig_4151_pilon	+	1996	4	Intergenic	novelGene_65220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_3	75.7011668778406	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	51	542	458347	464019	FALSE	80	ACCAAAAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDSPPHPDIQNNNVYVMHTLAASLSACIYQCLCGSHNYSSLQTNQFTGMVYQTVLLPHRHSLKTGSSDEAVIPNTSPAQWPGITSLIQLLNSSGEEAHPGLTVLLCEILTAVYLSLFIHGLATHSSNELFRIVAHPLNEKMWSAVFGGGAHVSSKEQTHSKGLSGEFLMFLPFFFLKKG	455779	465473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_455821_458337_458415_460430_460559_463723
764471	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
764472	SIRV4	-	316	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	0	1205	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764474	SIRV6	+	160	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	785	51	785	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11022	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
764481	contig_5018_pilon	+	1350	4	Intergenic	novelGene_46938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	27.6204433144888	573	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	304	720	267545	268151	FALSE	45	AGAACAAAATGCTAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAASSRASRSKRGGEERVLEKEEEEDDEDDEDEDEDDVSEGSEVPEGDRPAGAQHHQLNGERGPQSVKERVKEWTPCGPHQGQDEGRGPTLGSSTRQAFSMAAMNKEGGSASATTGPDSPSPVPLPPGKPALPGADGTPFGCPSGRKEKPADPVEWTVMDVVEYFTEAGFPEQATAFQEQVSSWPGCPDSPRTSAGAGSDLVLSVFHPGNRRQVFAAHAAHRCADRPVHSSRPSPENL	266842	268781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_266879_267277_267576_267662_267760_267862
764484	contig_12429_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_136211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCACAAAGACACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249696	243938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_244491_245260_245468_247372_247602_247963_248101_249043
764489	contig_5337_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_136564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCATGAAATCTGTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345392	343683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_343700_345400
764490	contig_7179_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_78123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGGAGCAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770267	772402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_770300_772400
764491	contig_3241_pilon	-	2120	2	Intergenic	novelGene_146414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAAGGAGGAAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915040	912121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_913656_914454
764492	contig_12969_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_61697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTCCATGACTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586659	587097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_586700_587100
764494	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
764495	contig_7179_pilon	+	1610	7	Intergenic	novelGene_78054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	429	junction_1	172.172071551173	2091	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	101	1075	392344	402057	FALSE	15	GTTTTTAAGTCTGTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELAVQKVVVHPLVLLSVVDHFNRIGKVGNQKRVVGVLLGSWQKKVLDVSNSFAVPFDEDDKDDSVWFLDHDYLENMYGMFKKVNARERIVGWYHTGPKLHKNDIAINELMKRYCPNSVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392243	402592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_392418_395399_395492_396250_396344_397029_397128_397713_397795_400662_400755_401612
764497	contig_14322_pilon	-	652	5	Intergenic	novelGene_115673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	3677.74254808571	180	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3	455	674785	671886	TRUE	5	GACCTGTGCTGCCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATASPERRKEIKPAPPPTPAAPCRSSACTAAAATAARVPGSLSIAVVTWVQGLGGAPDVPHPPLKIPGGRGNSQRDHNLSANLFYSDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674787	671126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671256_671817_671904_672241_672416_672787_672934_674670
764500	contig_4531_pilon	-	1960	7	Intergenic	novelGene_47905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	20	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	138	1295	369728	348571	FALSE	40	CTCATTAGCCATTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVTVQLGQCGNQIGFEVFDVLFSDSYCSQGLCSKKENEAYQASCKERFFSEEENGVLAARAVLVDMEPKVINQTLSKAAQSGRWKYGQHACFCQKQGSGNNWAYGYSVHGPRHEESIMNLIQKQVEKCDSLSGFFIIMSMAGGTGSGLGAFVTQNLQDQYPNSLKMNQIIWPYGTGEVIVQNYNSILTLSHLYRSSDALLVHENDAIHKICVKRMNIKQISFSNINQVLAHQLGSIFQPTYSAEGSFHCRRNPLGDLMEDLVPHPEFKMLGVRNIPQMSENSLAYSTFTWAGLLKHLRQMLISNAKMEEGINWQVRPPLSGLPALGKMSFNKELHFNTSIANLVILRGKDAQSADLGKRKLRCTFYIDDDNKGSLDLFLRKEK	370855	347905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_348795_360839_361005_366812_367045_367865_368083_368909_369058_369556_369765_370754
764503	SIRV4	-	265	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1256	0	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
764505	contig_9049_pilon	+	1309	7	Intergenic	novelGene_83142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_6	1729.92244527512	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	163	672	95983	113120	FALSE	35	TAAACTCAAGGTCATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMEFPDCRRSVGGEGCKTYPAVVQYNMFYR	88341	113757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95970_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_113028
764506	contig_19974_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_130460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCTAAACGTAATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119363	117948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_117900_119400
764509	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
764514	contig_14133_pilon	+	2439	6	Intergenic	novelGene_119914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	131.691153841099	1	123	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	386	871	145660	146886	FALSE	5	GAGCTTTTGTGTGTCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRCVARLLPTPSPAVDGLLPRTAPASSFLLTAAASASELLIPAQSSGLGVSLSQIWWWVCADVSLHKLLWVIAVT	136621	148454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142282_142361_142941_143093_145626_145735_146042_146256_146688
764516	contig_10750_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_172612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTCTTTTATCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165834	167811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_165800_167800
764517	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764522	contig_18173_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_160768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATGGCCCTTGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45995	46447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_46000_46400
764523	contig_7180_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_169039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	28.6845874217419	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	139	678	34705	244057	FALSE	45	AGGACATAATAACAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGSYLAEFLLDKGYEVHGIVRRSSSFNTGRIEHLYKNPQAHTEGNMKLHYGDLTDSTCLVKIINEVKPTEIYNLGAQSHVKISFDLAEYTADVDGVGTLRLLDAVKTCGLISSVRFYQASTSELYGKVQEIPQKETTPFYPRSPYGAAKLYAYWIVVNFREAYNLFAVNGILFNHESPRRGANFVTRKISRSVAKIYLGQLECFSLGNLDAKRDWGHAKDYVKA	22185	245077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_22234_32790_32879_34702_34813_191894_192088_192887_192993_242049_242178_244051
764524	contig_6446_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_149216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTTTCATTCATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378937	380207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_378900_380200
764527	contig_6710_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_98143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	20	TGCAGCTACCCACCCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764528	contig_1309_pilon	+	2162	2	Intergenic	novelGene_73965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	15	junction_1	0	28	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	494	799	136486	136791	TRUE	75	GACCAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKDVELENQKGRARLTFLKLKELKKKIQVLSCNIEGFYRQNIEQCRKHQKRWKEYTESLYQKIIGRRSTISRGSISSRTDGIERSPSSTEDIGKKQASRN	135992	140153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_137440_139438
764530	contig_11815_pilon	-	2071	4	Intergenic	novelGene_50927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCGACTCGACGACGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323107	294716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_294920_296006_296080_299066_300649_322894
764531	contig_12750_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_172629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTCAAGGCAGACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119054	118850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_118800_119100
764534	contig_8357_pilon	-	1245	4	Intergenic	novelGene_39681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAAAGGCAATCGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153225	142689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_143550_144117_144217_145397_145487_153028
764536	contig_4857_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_48889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTAAACAGTTACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426233	1424744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1424700_1426200
764538	contig_10159_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_30857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACTCAGCATCAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773829	774979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_773800_775000
764539	contig_10494_pilon	-	2103	5	Intergenic	novelGene_102199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	29.5761728423405	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	685	1269	1071413	1061204	FALSE	15	AGGCATTTTAGCTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRFQVSHQLGSLMDLFTTSLSLAGLEPPSDREIDGLDLLPVLLQGKLIDRPIFYYRGNELMAATVGQYKAHFWTWTNSWEEFRQGINYCPGQNISGVTTHTQEEHTSLPLLFHLGRDPGERYPLSFVSAEYQDALLRITPAVWQHRKALVPGQPQLNVCNPAVMNWAPPGCEKLGKCLTPPESVPEKCSWPH	1072097	1060369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1061291_1064780_1064899_1065985_1066108_1070255_1070359_1071258
764542	contig_6102_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_31820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATCGTCTTGTCTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360894	361218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360900_361200
764548	contig_19640_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_134852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCATTTTTATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20320	19943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_19900_20300
764549	contig_15248_pilon	-	2836	7	Intergenic	novelGene_149161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	40	junction_1	28.6089535324559	119	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	132	797	254962	235490	FALSE	25	CCAATTAAGTTTATGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HILSGKEFGVERSVRPTDSNVSPAISIHEIGAIGATKTERTGIMQLKSEIKQVEFRRLSISTESQSPGTSVTPSSGSFASTYGQQTSVDNRQGQWQRRRRLDGALNRVPVGFYQKVWKVLQKCHGLSVEGFVLPSSTTREMTPGEIKFSVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTMLADIEIHSIGSIIAVEKIVHIANDLFLQEQKTLGADDIMLAKDPASGICTLLYDSAPSGRFGTMTYLSKAAATYVQEFLPHSICAMQ	256004	233450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_235664_236877_237079_240262_240317_241762_241934_254776_254816_254935_255052_255962
764550	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764552	contig_5649_pilon	+	2320	9	Intergenic	novelGene_82247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	152.800881460154	1	135	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	812	1375	28327	34768	FALSE	10	TTTGCTTGTCACCTGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12675	35713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23325_25897_26060_26799_26895_28299_28451_28928_29095_33635_33787_34645
764555	contig_11855_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_66926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863483	861338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_861300_863500
764556	contig_11328_pilon	+	1738	9	Intergenic	novelGene_88440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	249.061206081959	2	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	129	1493	830591	857309	FALSE	35	GTATAATCTTGAATCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829323	857554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833274_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
764559	contig_8921_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_161625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAAAAAGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43823	44957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_43800_45000
764562	contig_10765_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_122898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	505	834	94423	94094	NA	70	ATCAATAAAAAAAAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKWLPFPLFFFLLLLCRQPIKIGGTYDQPRSLPDRHDPGGGPRGSSGRASSRGFTALTFSDDRDPPQLREDGRRQLQTSTSPDHTETRVGFVFSFPALVSLSTPCPGT	94927	93500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_93500_94900
764564	contig_6870_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_103948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241827	1239797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1239800_1241800
764566	contig_12864_pilon	+	650	6	Intergenic	novelGene_76396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	743.168729159132	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	82	570	227129	229231	FALSE	15	TCATTCAGCAGTTTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIHNFPLPTQQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	224958	229311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_224998_227086_227169_227822_228030_228490_228623_228901_228946_229165
764568	SIRV6	+	343	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3161_10721
764570	contig_12528_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_81279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	983	1291	252923	252615	NA	60	GCACAATCATTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVRQSLVILASKKHSGSTSSKTDLFILLAIHSIFNVLHQHLTQRHQFFFSLPYSLSSFRMHMRRLKTRWLESGAPQSSKCHLNIPRR	253905	251782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_251800_253900
764575	contig_5549_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_81620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGGGAGAAAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360599	361083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_360600_361100
764576	contig_19890_pilon	+	2297	6	Intergenic	novelGene_138544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTCTGAAACGCTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95767	107301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_+_96091_98236_98740_101034_101150_101932_102105_102422_103466_107160
764578	contig_10838_pilon	-	3168	1	Intergenic	novelGene_129158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2029	2358	27066	26737	NA	45	ATGTAAACTTTCATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAALFTIAKRWKQPKCPSADEWINKMWYDGILLSQKEKGSLDTCYNMYGARRHYAERSQSIPKGQIVYDLTSIKRQEQHSNSNQKKKKCGYKCMYLCKYTEHESTCV	29094	25926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_25900_29100
764580	contig_401_pilon	-	2032	13	Intergenic	novelGene_42939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_9	125.123577802995	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	210	1865	2248554	2196850	FALSE	40	AAAATCCTATATTACACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVLSPTSWEKRRAWLRQSRHWQTQVLEEEAAAALQDVSEAEPSSLDNVFQEGNPINKIEDWLQDCGYSEEGFSEEGGQLIYNGCPSHGTSFEDDLTLGAEATLLAANGKPFSRSFLETARPCQLLDLGCSLASSSMTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRKDPSTTTSKNDTDEVIPLPPLLSKPIKINGIWIPPFLIPEIPQNNGSV	2262056	2196682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2196916_2198421_2198461_2199247_2199289_2232153_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2238849_2239118_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
764586	contig_7853_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_172636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	510	992	43539	44021	NA	20	GATGGTGACCATGTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQALHSSQCPEEDHHCSWTLSFCLQSDLAAELPLVACLLPKSKLTDVKMFPFLALFLLLCATESIPTHSDPIGQSRTASLGFLGCNLYGNRSPGLFSLRATGGFKLPTFWLAAERLLNHYTQGSFPCFRKHYWIVVENIASSVRQIWVKDMHHHSRAA	43029	44244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_+_43000_44200
764587	contig_9706_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_20800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATATTTACCATTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
764591	SIRV6	+	352	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	21	410	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764593	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764594	contig_12250_pilon	-	1187	9	Intergenic	novelGene_80718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	269.800128567427	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCCATCAACCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401303	398586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399848_399972_400019_400106_400562_401200
764595	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	2	3590	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
764597	SIRV6	+	347	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	428	98	262	72	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
764598	contig_4232_pilon	+	1461	9	Intergenic	novelGene_63172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_7	37.7152157623419	557	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	78	1028	117183	120476	TRUE	25	GAGACTGATTCTTACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLARSGRCSLLLGVLQRRSVLGVTMTSELDIFVGNTTLIDEDVYRLWLDGYSVSDAVALRVRSGILEQTGATAAVLQSDTMDHYRTFHMLERLLHAPPKLLHQLIFQIPPSRQALLIERYYTFDEAFVREVLGKKLSKGTKKDLDDISTKTGITLKSCRRQFDNFKRVFKVVEEMRGSLVDNIQQHFLLSDRLARDYAAIVFFANNRFETGKKKLQYLSFGDFAFCAELMIQNWTLGAVDSQVDDMDVDLDKEFLQDLKELKVLVADKDLLDLHKSLVCTALRGKLGVFSEMEANFKVCGPVQPPPLGRLQSQVHHPHWPTLVMPESDGWVVLLLSLQAF	117105	121337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117670_117881_118009_119046_119148_119630_119765_120102_120212_120280_120691_120778_120877_121216
764601	contig_2114_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_104286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717497	714755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_714800_717500
764602	contig_2463_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_43008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395760	398369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_395800_398400
764603	contig_19564_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_29632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	19	393	12575	12201	NA	10	GAATGTCTCCTCTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	12593	12020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12000_12600
764604	contig_8386_pilon	-	2225	2	Intergenic	novelGene_82209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCAGGAAGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19866	16703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18822_19759
764605	SIRV6	+	582	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	201	0	201	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10438	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764610	contig_6710_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_94295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653850	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
764613	SIRV6	+	520	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1222_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764614	contig_8631_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_121947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTGCCACATCTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679298	680175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_679300_680200
764620	SIRV4	-	421	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1102	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4056	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
764621	contig_12970_pilon	+	1964	4	Intergenic	novelGene_50526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAAGCTAAATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200008	211871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_201685_203825_203902_205870_206000_211788
764622	contig_10765_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_122934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212868	211320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_211300_212900
764623	SIRV6	+	317	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	534	20	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764627	contig_1275_pilon	+	921	2	Intergenic	novelGene_108823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	90	779	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
764630	SIRV4	+	336	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	173	441	173	-441	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCCATTCCAATTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628	2330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
764633	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764639	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_97473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
764643	contig_5988_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_15907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTGTTTTGTAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625584	626229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_625600_626200
764646	contig_13780_pilon	+	2135	4	Intergenic	novelGene_149141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	51.4090350900393	228	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	126	545	962215	964240	FALSE	25	CGAAGAGCTTCAGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGCRRLPSNAQLGTAFSAHAAVCGPASPACEDFFHSVFCRMETDCNPMELSSMSAFQEDSELNGFEGTDTKDMRLEAEAVVSDVLFAVNNMFISKSLRCADEVAYINVETKEGSRYCLELTEAGLRVVGYAFDQVNDHLQTPYHETVYSLLDTLSPAYREAFGNALLQRLEALKRDGQS	944634	965830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_944673_957957_958034_962203_962473_964078
764649	contig_4103_pilon	+	1234	3	Intergenic	novelGene_52014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	46.5	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCTCTTCTTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462014	527903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_462075_464788_464956_526896
764656	SIRV2	-	239	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	687	22	687	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4045	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
764657	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
764658	contig_990_pilon	+	1165	10	Intergenic	novelGene_76061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	100.65170357276	691	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	78	1010	1067214	1091532	FALSE	15	GGCATTTGTTTAGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGAAGGLGLGRPPPPGPAWAPAFAMPLLVEGRRVRLPRSAVDLVRAHPSLEERARLLRGQSVQQVGPQGLLYVQQRELAVTSPKDGSISILGSDDATTCHIVVLRHTGNGATCLTHCDGTDTKAEVPLIMNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIAVNIKTAEIYRASFPDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067136	1091687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082171_1082245_1082312_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087593_1087692_1090825_1090940_1091352
764659	contig_16666_pilon	-	1350	4	Intergenic	novelGene_61750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	59688	55974	FALSE	10	CATACCTTGTCTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
764662	contig_854_pilon	-	1037	2	Intergenic	novelGene_36100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1704	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	520	987	92191	91429	FALSE	15	GAACGAGCCTCGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLRPREGRDLLQVTQQVGSNEFSQVGALMVALGGTDAGVFSLTPFPLSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVCISFEEADLSIKLPDGYTFKFPNRLNLETINYLEAEGDFKVKCVAFE	92710	91378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91870
764664	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764665	SIRV6	+	245	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8472	-1	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
764669	contig_5551_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_134235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATCCGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387283	388631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_387300_388600
764679	scaffold_12510_pilon	-	1035	4	Intergenic	novelGene_151355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_3	723.41658507084	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	71	451	148136	146216	FALSE	25	TTACATTTTTCTTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLFPPSWSLWRPAGNRTSKPTNMSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVVSKIITKLALCLVKLLKGLGFDL	149128	145631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_146433_147758_147912_148125_148171_149092
764682	contig_6533_pilon	+	2546	10	Intergenic	novelGene_114652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_9	94.0638081304388	18	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	164	904	215455	236125	TRUE	65	AGAAATAAATCAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLKLLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQIFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDLYGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKVSIAATVIYAYAWLVPLALWGFLMWRNSKVMNIVSYSFLEIVCVYGYSLFIYIPTAILWIIPQKAVRWILVMIALGISGSVLAMTFWPAVREDNRRIALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTATANQTVTAAKSS	214571	258551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_214602_214928_215001_215393_215473_224459_224541_224786_224875_227139_227257_230502_230670_231042_231226_236038_236134_256917
764685	contig_10331_pilon	+	1315	3	Intergenic	novelGene_54053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	746	junction_2	347	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	841	1314	29905	33190	FALSE	10	TACCTTCTGCTCCCCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFQKWSVIPILGLIETSLYDNILLHNALLLLLQILNSCSKVADLLLDNGLLYVLCNTVAALNGLEKNVPLNEYKLLACDIQQLFIAVTIHACSSSGLQYFRVIEDLIVLLGYLQNSKNKRTQTMAVALQFRVLQAAIEFIRTTANQDSENVANSFQ	29064	33191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_30111_32301_32469_33089
764687	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764689	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764692	contig_8357_pilon	-	1045	2	Intergenic	novelGene_39716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	0	353	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGATTTGGCAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477262	475604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_476119_476731
764693	contig_3789_pilon	+	2152	6	Intergenic	novelGene_79859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	199.104997425981	2	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	187	564	465838	472341	FALSE	10	CTGTCTTATGTTCTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	457297	473929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_457374_464035_464101_465792_465913_467056_467110_468585_468697_472202
764694	SIRV5	-	410	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGTGGTAATTTCGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10858
764696	contig_18473_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_169641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	396	698	42487	42789	NA	65	GTAACAAGGAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCLSVPLKVGCSNPPAALGRKDLALCCGDLLAYRLQPRKPYGAVLLCLKRIAVSRNRLQSTQQQHAGPDGLHSTTNLKVGSLNPPSDAGRKGLVIYFH	42091	44382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_42100_44400
764704	contig_9014_pilon	+	1261	6	Intergenic	novelGene_106802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2516.8932436637	6	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	53	433	150693	152625	TRUE	20	TCTTTGTATAGTCATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGFSFP	150640	153646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152316_152608_153323_153515
764705	contig_10531_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_114528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453360	451119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_451100_453400
764706	contig_7213_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_172640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTCTTCATAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3545	5546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7213_pilon_+_3500_5500
764709	contig_6710_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_95059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
764713	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
764716	contig_19744_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_120392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGTAGTGCTAATAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180701	181626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_180700_181600
764722	contig_10103_pilon	+	1825	12	Intergenic	novelGene_86147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACGCGCTCCGAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441184	484725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_441558_444375_444446_444530_444633_448237_448349_449627_449756_452759_452965_453612_453690_460365_460462_474367_474630_475632_475905_483427_483501_484669
764727	contig_3095_pilon	-	1012	4	Intergenic	novelGene_75231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1507.2253389	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	97	825	255481	246561	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPEDILTGIASCSSVMSASSLLRVLAACVCLVPLGDLSPSVVLAQLPGHLL	255577	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246712_248547_248759_253535_253806_255384
764728	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
764729	contig_13868_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_172661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCTTCTACCAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112876	114441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_112900_114400
764730	contig_12450_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_162320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACTGGCAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357408	355184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_355200_357400
764731	contig_10599_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_49882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1223	1570	146678	147025	NA	75	AATAAGAAAACGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFWLLFLGGMRSPCLSARFLQQVGKSHPMTNDGQSHSTGNHGLAELTHILGRHNSVHNTDHFIHCFSVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGM	145455	147267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_145500_147300
764733	contig_6710_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_96000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653724	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
764736	contig_11336_pilon	-	2446	24	Intergenic	novelGene_172665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	12	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATGTAACAAATAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107553	10082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11336_pilon_-_10208_11331_11464_15896_16013_20712_20754_24793_24854_25026_25120_25779_25838_62210_62290_63412_63594_65609_65751_68394_68495_68597_68692_69902_69992_74410_74519_77604_77713_80254_80360_84289_84392_86153_86243_87662_87717_88027_88104_90204_90279_93016_93059_95555_95609_107227
764741	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764744	contig_3948_pilon	+	2736	1	Intergenic	novelGene_53339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGGATTTGCATAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478129	1480865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1478100_1480900
764745	contig_10354_pilon	-	1370	2	Intergenic	novelGene_50874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGATAATAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476497	475054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_475063_475135
764746	contig_8628_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_164412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACGGAGGAGGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383051	381344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_381300_383100
764748	contig_3745_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_85106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTTTGGGAAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494525	492918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_492900_494500
764750	contig_20493_pilon	-	1737	2	Intergenic	novelGene_86419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1211	1588	42827	42450	FALSE	45	AGATAGAGAGAGAGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSTCSVNELPLHPLFFSLKSHFFKGLYSPGCFPFCLPISTLLSSPEIHMGHLGVKVFRFLSRNTCIILHPVLTQQTLLHCAQLNLHAQRCAQFHSVLQSQEGAISRSRVPGAPSLVWEQSQLT	46524	42300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_43445_45931
764752	contig_10063_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_127752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATATAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457338	459120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_457300_459100
764756	contig_9272_pilon	+	1569	3	Intergenic	novelGene_125979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	11.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	358	1014	665457	666113	FALSE	35	TCTGCTAGAAAACATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRTLQLVELANETWLVTGRHPLPVITAAAFLAWQSLQPSGRLTCSLARFCKLANVDLPYPASSRLQELLTVLLRMAEQLAWLQILKLNKRSVVKHIGDLLQHRHTLVRKAFRDAAGEREAYERELQGQRQGEEEVGNSSLDLPVRKRPPSPALLLPPCMLKPPKQLRPTPAVCTVTGDENISDSEIEQYLRTPEEVRDFQRAQAASQAAKSVPNPL	662584	666668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_662821_663505_663566_665395
764757	contig_19899_pilon	-	2555	5	Intergenic	novelGene_102520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	47	junction_4	67.3363757563473	3	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1093	1515	144526	140028	FALSE	20	GATGTTTGTCCAAGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156620	138987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_145554_156555
764758	contig_8538_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_4703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
764759	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764761	SIRV6	+	316	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	535	20	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764762	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764763	contig_9389_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_84047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGTCCACGCTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619310	617405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_617400_619300
764767	contig_9027_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_156362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTACTGAGCCTACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151713	150053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_150100_151700
764771	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764776	contig_6589_pilon	+	1021	5	Intergenic	novelGene_25824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	27.367864366808	866	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGCGCATCCCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819975	825389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_820421_824105_824183_824426_824499_824588_824744_825117
764778	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764779	contig_12951_pilon	+	2315	2	Intergenic	novelGene_68195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	870	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCCACTTACATAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755114	815391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282
764783	contig_7548_pilon	+	2014	7	Intergenic	novelGene_117626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_6	131.951274677014	126	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	246	983	193023	211815	FALSE	30	AATTCAATTTCCTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIK	192777	212846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_211812
764785	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	0	406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764786	contig_13456_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_153296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCACAACTCGGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344095	342894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_342900_344100
764787	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
764793	contig_9415_pilon	+	1396	11	Intergenic	novelGene_109952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	120.902812208815	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	151	825	2519604	2525997	TRUE	35	AGGTCACATGACTCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVKVGKEDSSSAEFLEKRRAALERYLQRIVNHPAMVQDPDVREFLEKEELPRAVSTQTLSGAGLLKMFNKATDAVSKMTIKMNESDIWFEEKLQEVECEEQRLRKLHAVVETLVNHRKELALNTAQFAKSLAMLGSSEDNTALSRALSQLAEVEEKIEQLHQEQANNDFFLLAELLSDYIRLLAIVRAAFDQRMKTWQRWQDAQATLQKKREAEARLLGSLG	2512843	2527693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2512870_2514592_2514715_2519601_2519681_2520123_2520200_2521258_2521373_2521587_2521682_2522712_2522919_2525318_2525411_2525981_2526063_2526531_2526604_2527259
764794	contig_20823_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_159911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAAGTTTTCTGTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36175	37266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_+_36200_37300
764797	contig_18487_pilon	+	2118	8	Intergenic	novelGene_172674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	54	junction_1	30.1824384673726	100	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	17	757	213079	231478	FALSE	20	ACTCATTGCCTCCAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTKRVLYVGGLAEEVDDKVLHAAFIPFGDITDIQIPLDYETEKHRGFAFVEFELAEDAAAAIDNMNESELFGRTIRVNLAKPMRIKEGSSRPVWSDDDWLKKFSGKTLEESKEEEGSEPPKAETQEGEPTAKKARLNPQVYMDIKIGNKPAGRIQMLLRSDVVPMTAENFRCLCTHEKGFGFKGSSFHRIIPQFMCQGGDFTNHNGTGGKSIYGKKFDDENFILKHTGPGRTRSVSMVTELGYG	213062	232839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_213110_214325_214425_216739_216784_217251_217279_220713_220796_221282_221384_223712_223837_231245
764800	contig_4232_pilon	+	873	4	Intergenic	novelGene_63215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2521.54278171123	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	59	373	146362	148542	TRUE	30	AAGATTCATTAATGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFW	146303	149694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148600_149084_149337_149503
764808	contig_10629_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_52925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATATAATTATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246933	246001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_246000_246900
764811	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764812	contig_6710_pilon	-	389	2	Intergenic	novelGene_98264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	10	GTCCCAGCCTCACCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764823	contig_14924_pilon	+	1663	13	Intergenic	novelGene_104152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	53.146809248847	5	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	23	1258	44129	54550	FALSE	15	AGTACTGTCCTCTCTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPSKTEIQTLFKRLRAFPTNKACFDCGAKNPSWASITYGVFLCIDCSGVHRSLGVHVSFIRSTELDSNWTWFQLRCMQVGGNASAMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGLGAKKGLGAQKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPKYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISESGHSGPYVPAP	44106	54955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44201_44368_44488_45052_45126_45618_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_48758_48896_49018_49151_51163_51293_51371_51507_54516
764824	contig_8581_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_22856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCATAAACAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361050	360249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_360200_361000
764826	contig_2940_pilon	-	2217	7	Intergenic	novelGene_81947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_6	280.921103989477	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	193	1506	765078	759349	TRUE	45	TCCTAAAAATGTATATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPSTGDCGADPSVAASERLDPDRPCHLREEDVALGSERVREDEKQTVIKSSSECNPLLEEPIASQFGGTAATECHKSVPCGWKRVVKQRSSGKTAGRFDVYFVSPQGLKFRSKSSLANYLHKNGETSLKPEDFDFTVLCKRDIKSRCKDCSISPLTSQVQKESNNSNWNLRTRRGRKNDVFPMPHGSSELQDGRGLSNLTAIHLSLKEDEGVNAVDSRKVRKSKGKMTILKGIQIKKTKKRCSKSLSDSVQNNRKRESVCSEADVEGEPVAQESQLGRTLYISDVKASDETLVVTNEEKRLVKEKSLQSESNVHFEKLTSGSINKLCLTKEAEHNKKCENTFLDCEEIKTEVEVGERKKHLHTDVLKCGSEMDNSCLQAEKNFTSVKKFQEDTPVPRTQIEKRKTSLYFSSKYNKEGISFPIRKSGVKSISGIQL	765270	756612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_756917_757853_757958_758454_758605_759195_759486_762008_762869_763289_763518_764989
764829	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	534	-1	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764830	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	57	508	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764831	contig_253_pilon	+	1078	7	Intergenic	novelGene_129732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	349	junction_3	109.310973323308	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	32	1024	582199	585056	FALSE	10	GCGCTGCCATGGGGGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQGRTGGAAMSDTEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK	582167	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_582254_582710_582843_582967_583199_583865_583971_584394_584619_584700_584836_584945
764832	SIRV4	-	626	2	FSM	SIRV4A	SIRV405	626	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	682	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTCTCTTTTCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13937	8629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_8991_13672
764834	SIRV7	-	225	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69055	0	35836	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78902	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
764835	contig_10765_pilon	-	2360	1	Intergenic	novelGene_122878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCTATTTTAAGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41489	39129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_39100_41500
764836	SIRV6	+	391	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	481	-1	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	638	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764841	contig_17198_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_62434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTCTTCAAAATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282317	1279491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1279500_1282300
764843	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764847	contig_7171_pilon	+	1911	2	Intergenic	novelGene_101327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTGAAGACAGTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129080	1133005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1129538_1131551
764848	contig_15732_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_88908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGAACAATATGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291376	289235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_289200_291400
764849	contig_15732_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_88907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTTAAACTGACTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289235	288805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_288800_289200
764852	contig_16722_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_118304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	445	759	157747	157433	NA	15	TTGGTTTATGTGTTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSAPIKVIASETLWVSPTVSCRVTLSRNGLDGSGFGFLVCESLMEYVHYTSCMQLIGMSSQPGGGWTLGSHSSLKPLAALREKDVTVCFHKDCSLGNPVGSL	158191	156942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_156900_158200
764853	contig_10078_pilon	-	1282	3	Intergenic	novelGene_159994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.5	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	337	1008	56941	56270	FALSE	60	AAATAACAACACATCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGLLAPHWLFGTGLASSLIGYVLFDLIDGGEGRKKSGRTRWADLKSALVFITFTYGFSPVLKTLTESVSTDTIYAMSVFMLLGHLIFFDYGANAAIVSSTLSLNMAIFASVCLASRLPRSLHAFIMVTFAIQIFALWPMLQKKLKACTPRSYVGVTLLFAFSAFGGLLSISGVGAILFALLLVSISCLCPFYLIRLQLFKENIHGPWDEAEIKEDLSRFLS	58448	55995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_57116_57250_57381_58416
764860	contig_9484_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_105687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCGTCGGAGACCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202957	203574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_203000_203600
764864	contig_6589_pilon	+	1215	10	Intergenic	novelGene_26223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188.866077053897	2	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	393	1019	2055152	2059863	FALSE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048770	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051047_2051102_2052650_2052792_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
764865	contig_10436_pilon	-	1749	3	Intergenic	novelGene_108472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	18	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	329	1150	97741	96819	FALSE	15	ATAGCCCTTATTGTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPPEKRRRTIEDFNKFCSFVLAYAGYIPPSKEESDWPASGSSSPLRGESAADSDGWDSAPSDLRTIQTFVKKAKSSKRRAAQSGPTQPGPPRSTFSRLQAPDSATLLEKMKLKDSLFDLDGPKVASPLSPTSLTHASRPPVPLTPVPLSQGDLTQPPRKKDRKNRKLGPGAGAGFGVLRRPRPAPGDGEKRSRIKKSKKRKLKKAERGDRLPPPGPPRAPPSDTDSEEEEEEEEEEEEEEIVAVVGGEAPAPVFPTPPEAPRPPATGPPEGAPPTDSESKEVGSTETSQDGDASSSEGEMRVMDEDIMVESGDDSWDLITCYCRKPFAGRPMIECSLCGTWIHLSCAKIKKTNVPDFFYCQKCKELRPEARRLGGPPKSGEP	98671	96219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_97034_97134_97973_98574
764869	contig_13904_pilon	-	1416	7	Intergenic	novelGene_165485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_6	68.6701050919054	62	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATTTTCTAGATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71444	58998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_59524_61361_61392_63518_63578_65030_65067_67280_67363_68747_68831_70843
764875	contig_10629_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_52958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	55	621	447968	452372	FALSE	20	AACATTTTTGTGTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447913	452926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_451868
764881	contig_6959_pilon	+	2359	1	Intergenic	novelGene_172680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209605	211964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6959_pilon_+_209600_212000
764882	contig_10734_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_51288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACAATGTTTTGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363963	1364782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1364000_1364800
764884	SIRV4	-	374	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1149	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4009	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
764885	SIRV6	+	521	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764888	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
764889	contig_12740_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_159209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCCCATAGAACCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52754	53496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_52800_53500
764891	SIRV4	-	351	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	8	1162	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
764894	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
764897	SIRV6	-	541	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1179_1574_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
764901	contig_8978_pilon	-	1435	8	Intergenic	novelGene_49349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_3	792.846486414872	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	24	1145	194082	190773	FALSE	45	CTGTTGATAAGAATAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGLVISLVFVYCWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194105	190482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
764903	contig_753_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_113041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAACATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483792	1484904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1483800_1484900
764907	contig_14191_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_153756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTATATGGAAGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2822	3841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_2800_3800
764909	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
764910	contig_16103_pilon	+	1686	10	Intergenic	novelGene_118790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	28.4986462749755	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	245	1432	584607	588701	FALSE	30	GAAATTGTATCCAGGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFGNSDLLDVWLEPPEDVFSTGSFLELGLHCPPPEVPLTRQQEQGLQGWTSSGGHGCGLQESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSESGISEDPGHPDSPPAPRAPSSPALYEVVYEAGALESMQGEVGPAVGLISIQLDQWSPPFMMPDACMVSELPLDAHAHILPRAGTIAPAPPATLRPCQTLFLTDEEKHLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQTKVQELERRNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLVLIILPSLSPFQGLPEAGPEDYQHHGVVSRNILTHKDMPENLETLLVESRLRGPSGAKGTNGSMRTRPEKMAGKTGPSRLLRTVLHADEM	583953	588955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_584194_584602_584781_585218_585466_585619_585742_587393_587487_587617_587725_587848_587918_588040_588126_588276_588374_588507
764911	contig_9112_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_60209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.551661385832	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTCCTGGGGTGGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108409	114740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111569_112128_113625_113750_114251
764912	contig_2403_pilon	+	1298	13	Intergenic	novelGene_71005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	207.981753339619	1	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1239	59	1297	128872	169337	FALSE	35	TCAAGAATAGGTACTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLPLEKRTLILTHFPKFLSMLEEEVYSQNSPIWDQDFLSASCRTSQLGIQTVISPPPVAGTISYNSDSSSLEQLNGRSTSPACKASSGLEVNPGEKRKMNDTHPLEEAKKPRVTGDIPMELINEVMSTITDPAAMLGPETNFLSAHSARDEAARLEERRGVIEFHVVGNSLNQKPNKKILMWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYITRLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPSQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHDILNFLTYADEYAIGYFKKQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGIRETGWKPSGREKSKEPKDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSER	123975	169338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_124024_128861_128969_133770_133897_135756_135894_138651_138861_139830_139958_148218_148330_151046_151191_161036_161116_163533_163571_163812_163877_163974_164060_169314
764913	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
764915	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	535	-2	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
764917	contig_17194_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_155380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGGCAGGACACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285357	286833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_285400_286800
764920	contig_19330_pilon	+	1452	2	Intergenic	novelGene_163699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGAGACAGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72929	77121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_73429_76168
764922	contig_6654_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_85691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGAGCTGCCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96131	97795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_96100_97800
764923	contig_817_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_132454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTAGTAGCCCAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556870	558217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_556900_558200
764925	contig_2087_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_65562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACGACCTCTGGCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49614	47473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_47500_49600
764928	contig_19564_pilon	+	1481	7	Intergenic	novelGene_29652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	27.5242317482856	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	93	1481	19890	28556	FALSE	20	CGAAGGCTGCTGGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDTQVIDWEADEEEETEQSTESVGCHLEPLGRLHIFSSAHGPEKDFPLYLGENVVGRMPDCSVALPFPSISKQHAVIEILALNKAPILRDCGSLNGTQILRPPKVLSPGVSHRLRDQELILFADLPCRYHRLDVPLPFASRGPLAIEETPRVQGGTRPQGLLLAEDSDGEVDSLSESCVVKDSRTTSSPLATVVPESDEEGASSARDGPGVPFAFSLNSDTDEEEGQQPASRQASSAARRGAPAEPEQSDVDGVTAELQLEKDQPLAKERDSDTKVERDAGNVVVPVGVILERNHPVGEDSDTDVDEDSRPPGRPPEGHLERGQLSGFIDSDTDVEEEGIPATPAVVPMKKKQIFYGVGMHGLRVLFTGVVDARGERAVLALGGSLAGSVTEASHLVTDRIRRTVKFLCALGRGIPILSLDWLHQSHKAGCFLPPEEYVVTDPEQEKNFGFSLRDALRRARK	18131	28556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_18221_19886_20026_20647_21029_21114_21191_21469_21972_28025_28209_28445
764930	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
764931	contig_5643_pilon	+	1007	8	Intergenic	novelGene_38744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.394310849168	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	136	810	152703	157107	FALSE	15	ACACGCTGCAGCTGTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152433	157304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152531_152664_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
764932	contig_10479_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_147114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142913	141468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_141500_142900
764933	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_94139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
764937	contig_9436_pilon	-	1326	5	Intergenic	novelGene_60894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	12.9301005409857	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	331	1158	384426	375862	FALSE	40	AAAGAGAGTAGAATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRRKTGYSFVNCKKALETCGGDLKEAESWLHKQAQKEGWDKAVKLHGRKTKEGLIGLLQEGNTTVLVEVNCETDFVSRNSKFQQLVQQVAVGTLLHCQNLKDQLATYSKGFLNSTELSELRAGPDREGSLKDQLALAIGNLGENMILKRAAWVKVPSGFYVGSYVHGAMHSPSLHNLMLGKYGALVICETSEQKANLEDLGRRLGQHVVGMAPLSVGSLDDEPGGETETKMLSQPYLLDPSITLGQYVQPQGVSVVDFVRFECGESEEAAEAE	384756	375693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_376269_378315_378404_381797_381921_382645_382775_384345
764938	contig_12414_pilon	-	1082	10	Intergenic	novelGene_59675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	321.117070302259	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	254	1081	931820	905333	FALSE	55	GAAGCAAATCTATAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIITVKDESQTMKDLEAEVKDKTKVENLIKSENYGKILAEKNERCIDNSIDLQRPLQSFGQTGKRSKSSSKLKLVRSLAVCEESPPLPAAEISQENQEKIQIQLTQSYEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRIPDKKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDR	933647	905331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_905360_905446_905556_909063_909205_909286_909347_916187_916267_917554_917670_921684_921775_922248_922291_931655_931867_933440
764939	contig_12733_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_129584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATTTGTCAATTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278978	281029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_279000_281000
764940	contig_13900_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_115095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGACCAGGATCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83450	83163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_-_83200_83400
764941	contig_6929_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_139370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGCAAAGAAAAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93383	91746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_91700_93400
764943	contig_9434_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_150506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCCATAGGGTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356556	356080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_356100_356600
764946	contig_19564_pilon	+	1427	2	Intergenic	novelGene_29681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGTGTCGTTAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92192	93844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_92213_92437
764947	contig_4951_pilon	+	2170	4	Intergenic	novelGene_122127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	52.6645569197687	95	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	649	1434	407637	408422	FALSE	20	ACCATGCATTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGRVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGCKNVCYDHFFPMSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNEFKDIEDIKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEASFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQTNHPNHALRESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS	397189	409158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_397399_398635_398901_400036_400196_407621
764948	contig_3469_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_34174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	462	junction_4	33.4393106986373	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	11	469	427985	443609	FALSE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKMVASRAIGSLRHFTASRTFRSPGYICRNFTRSSALLARTHINYGVKGNVAVIRINSPNSKVNTLNKELHTELVEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAGCKTSQEVVQISQEGQKIFEKLEKSTKPIVAAISGSCLGGGLEV	427974	444661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_428052_436871_436914_437006_437078_438405_438540_443464
764955	SIRV2	-	240	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	686	22	686	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
764956	SIRV6	+	123	2	ISM	SIRV6A	SIRV611	454	3	204	214	204	-214	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640
764959	contig_8059_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_111120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAGAGCATAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308949	308677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_308700_308900
764960	contig_6616_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_141756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAGAAGGGATTCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282767	283098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_282800_283100
764961	contig_14537_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_158660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGATAACTAAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95141	96035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_95100_96000
764962	SIRV6	+	284	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8136	11	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
764964	contig_9098_pilon	+	1774	9	Intergenic	novelGene_75809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	68.0238928612587	9	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	270	386	311424	322465	TRUE	10	GCTTTTTTCTCAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPSRLELELVISSGVLSGVGAPLWAYIACACGLFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAVQLGTNPDWMFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGMLLHISSKML	295413	332854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_295479_309869_310018_311367_311510_322434_322576_324228_324314_330314_330440_330825_330985_331488_331615_332071
764966	contig_5988_pilon	+	1466	4	Intergenic	novelGene_16014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_3	73.1452132557027	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	103	1452	779480	786813	FALSE	10	TTGTACACTCCGTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779377	786827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838
764967	contig_8696_pilon	+	1719	10	Intergenic	novelGene_153338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.1691128154907	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	212	1144	988051	1016099	FALSE	25	CATTTTTTGAAAGCGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGSPTSPKPGVNAQFLPGFLMGDLPAPVTPQPRSISGPSVGVMEMRSPLLAGGSPPQPVVPAHKDKSGAPPVRSIYDDISSPGLGSTPLTSRRQANISVLQSPLVGVTTTTPGTGQSMFSPANIGQPRKTTLSPAQLDPFYTQGDSLTSEDHLDDTWVTVFGFPQASASYILLQFAQYGNILKHVMSNTGNWMHIRYQSKLQARKALSKDGRIFGESIMIGVKPCIDKSVMENSDRCALSSPSLAFTPPIKTLGTPTQPGSTPRISTMRPLATAYKASTSDYQVISDRQTPKKDESLVSKAMEYMFGW	985441	1016674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_985559_986474_986558_988039_988211_992399_992528_995696_995758_1009925_1010068_1012248_1012319_1013309_1013439_1014875_1015041_1016021
764968	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
764972	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764973	contig_1308_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_172682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGTACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55145	54879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1308_pilon_-_54900_55100
764975	contig_11483_pilon	-	2865	1	Intergenic	novelGene_172692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAAGTCTGGTGTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142536	139671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_-_139700_142500
764983	contig_13608_pilon	-	1677	10	Intergenic	novelGene_52369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	109.099343108319	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	674	1096	383065	369353	FALSE	30	ACAGCAAAATGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNLSIGRQLEITLVLRWLGWISSKSKPESSSLILKFLSLKDFLFSPNLSFLFYKVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLSKSTGEVTKKKPKLLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYSGSTIAAGVVTEIKE	393533	368771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370991_373610_373712_374807_374842_382428_382481_382986_383078_385449_385555_391792_391862_392468_392587_393164
764986	SIRV6	+	369	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	411	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
764989	contig_8710_pilon	+	2284	12	Intergenic	novelGene_73514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	66.3329941710947	9	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	2	979	347357	441554	TRUE	50	AATCAACACCAAAATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKVQTTKRGDPHELRNIFLQYASTEVDGEHYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTTIHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKNKSGLISGLDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTLAGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNATGRLTLADIERIAPLAEGALPYNLAELQRQLSPERCACCFSGDPC	347355	444568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_347369_348358_348413_368559_368703_378227_378344_386208_386349_398322_398470_401126_401266_401941_402036_403627_403713_441506_441680_441813_441905_443479
764993	SIRV4	-	606	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	8	3	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
764995	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	579	0	400	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	257	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
764996	contig_7376_pilon	-	729	3	Intergenic	novelGene_108078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	896	15	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAAAAGTCTCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79860	72024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75558_79498
764997	SIRV6	+	289	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8143	-1	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
765013	contig_7361_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_163388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471912	474478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_471900_474500
765015	contig_15744_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_83627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201902	203468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_201900_203500
765016	contig_1154_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_87117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAGAGAAAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424038	426636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_424000_426600
765018	contig_16122_pilon	+	1794	5	Intergenic	novelGene_134517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_4	37.7557942573057	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	382	753	142082	147968	FALSE	30	TTCAATCTCTGTTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKVSGS	141700	149009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885
765020	contig_3602_pilon	-	1578	2	Intergenic	novelGene_60682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACAATGGCCGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1250035	1246771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1247700_1249385
765023	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
765027	contig_11855_pilon	+	2465	1	Intergenic	novelGene_66925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGTTGACCTAGCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854052	856517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_854100_856500
765028	contig_6159_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_128242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTTGCCTCTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99512	99240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_99200_99500
765029	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
765030	contig_14744_pilon	+	1121	3	Intergenic	novelGene_65911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGACTACTGAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69189	137788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_114018_114075_136792
765033	contig_6710_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_94111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653659	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
765034	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8132	2	607	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
765036	contig_14289_pilon	+	1420	8	Intergenic	novelGene_110573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.4877301880738	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	221	943	75661	84192	FALSE	35	TCAGATGGTGTGATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQNNSLPPYAPPGATGQTPQLFHSQTLTTAPLPGTTPLYPSPMTPMTPITPATPASESSGIVPQLQNIVSTVNLGCKLDLKTIALRARNAEYNPKRFAAVIMRIREPRTTALIFSSGKMVCTGAKSEEQSRLAARKYARVVQKLGFPAKFLDFKIQNMVGSCDVKFPIRLEGLVLTHQQFSSYEPELFPGLIYRMIKPRIVLLIFVSGKVVLTGAKVRAEIYEAFENIYPILKGFRKTT	72564	84669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_72633_75508_75691_76127_76298_78983_79072_80612_80705_82143_82312_83282_83378_84112
765038	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_98061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765039	SIRV2	-	568	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4305	34	3130	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
765040	contig_2684_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_172705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCACTCCTTCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197038	197851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_197000_197900
765049	contig_3469_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_34217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGTTGGAGGCTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552301	551998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_552000_552300
765050	contig_14525_pilon	+	1804	2	Intergenic	novelGene_149783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	0	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGACTCTTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234637	237218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234736_235512
765051	contig_20176_pilon	+	1414	6	Intergenic	novelGene_172707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_5	52.4389168461745	177	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	81	950	48421	56172	FALSE	20	TTTTTGTGCAACTTGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQFTYEDYQKTAEWLLSRTTHRPQVAVICGSGLGGLAEKVTQAQSFDYSDIPNFPLSTVPGHAGRLVFGLLNGKACVVMQGRFHLYEGYSVWKVTFPVRVFRLLGVDTLVVTNAAGGLNPKFEVGDIMVLRDHINLPGFSGQNPLRGPNEDRFGVRFPAMSDAYDRQLRKMAHITWKQMGEQRELQEGTYVMLVGPNFETVAESRLLRQLGADAVGMSTVPEVIVARHCGLRVFGFSLITNMVVMSYDRLEKANHEEVLEAGKQAAKKLEQFVSTLMSCIPPPCNAS	48340	56636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_+_48432_51838_52009_54479_54584_54977_55154_55270_55462_55954
765052	contig_14814_pilon	+	752	5	Intergenic	novelGene_137702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	627.646944945962	67	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCTTTGCCAACTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279153	283797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279206_279244_279406_279468_279522_282889_282992_283413
765053	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
765057	contig_6710_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_89108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653628	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
765058	contig_9363_pilon	-	1563	10	Intergenic	novelGene_6703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	71.786893126053	224	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	87	722	1298867	1289103	TRUE	10	AGAGCGGGTGCCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGEPGVPAASRRPRTLSPPPQAPTSFKMTLDVGPEDELPDWAAAKEFYQKYDPKDVIGRGVSSVVRRCVHRATGSEFAVKIIEVTAERLSPEQLEEVREATRRETHILRQVAGHPHIITLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETPGPVG	1299279	1288092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1288894_1288965_1289120_1289257_1289321_1291183_1291348_1291432_1291499_1292774_1292830_1293102_1293279_1298772_1298886_1299211
765059	contig_3153_pilon	+	1111	6	Intergenic	novelGene_104696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	134.525833950212	137	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	383	682	448580	456427	FALSE	5	GCCATTTTTTCTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKTQFEDRN	447997	456856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448252_448352_448445_448543_448616_448707_448756_454168_454312_456354
765063	SIRV6	+	491	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	171	3	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
765070	contig_14182_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_76183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACTTATCGTTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66981	65598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_65600_67000
765071	contig_7426_pilon	+	2381	8	Intergenic	novelGene_27488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_5	77.2747549663022	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	86	1027	881984	916215	FALSE	45	AGTACGGAAACAGAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYWTGGTCGRWLGADRERNRARTGTAGKMLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAEAQTFSLKHSERVRVEVVRDGHAEEVAANGKQRWPLLPTTTLRLTMSQASIEASSDKVTVNYYEQEGNTPIDQAGLFLTAIEISLDVDADRDSVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRDTPWLPKEDSSDEKVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRQKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLRFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAEEIPLTPIFTDTVTFRVAPWIMTPNILPPVSVFVCW	881898	917569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_882076_894003_894188_896536_896610_903430_903493_906113_906232_906717_906844_913446_913626_916107
765072	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_96028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
765073	contig_14528_pilon	-	1773	12	Intergenic	novelGene_111264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	130.45362685771	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1182	590	1771	197232	188881	FALSE	15	GCATACTTTGTGTCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPGGWGRAEPPRDSLREELVITPLPSGDVAATFQFRTRWDSELQREGVSHYRLFPKALGQLISKYSLQELHLSLTQGFWRTRYWGPPFLQAPSGAELWVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRAQIHPINTSVGSNLLTTSTAIKEAFPSLTRLKIPTPATSSFLSCCISSVTLDTV	201806	188878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_189042_191155_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_198057_198159_198459_198588_200925_201104_201663
765074	contig_13004_pilon	+	2106	2	Intergenic	novelGene_112700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTTGGGTTACCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837785	900014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039
765076	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
765077	contig_12008_pilon	+	2678	13	Intergenic	novelGene_25014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	95.8657553850986	87	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	147	1844	74387	78661	FALSE	20	AATGAGATGGGCTGGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDLGFGLRMVQGVVHVYTHREPDEHCSELELPYPDLQEFVADVNVLMALIINGPIKSFCYRRLQYLSSKFQMHVLLNEMKELAAQKKVPHRDFYNIRKVDTHIHASSCMNQKHLLRFIKRAMKRHLEEIVHVEQGREQTLREVFESMNLTAYDLSVDTLDVHADRNTFHRFDKFNAKYNPIGESVLREIFIKTDNRISGKYFAHIIKEVMSDLEESKYQNAELRLSIYGRSRDEWDKLARWAVMHRVHSPNVRWLVQVPRLFDVYRTKGQLANFQEMLENIFLPLFEATVYPASHPELHLFLEHVDGFDSVDDESKPENHVFNMESPLPEAWVEEDNPPYSYYLYYTFANMAMLNHLRRQRGFHTFVLRPHCGEAGPIHHLVSAFMLAENISHGLLLRKAPVLQYLYYLAQIGIAMSPLSNNSLFLSYHRNPLPEYLSRGLMVSLSTDDPLQFHFTKEPLMEEYSIATQVWKLSSCDMCELARNSVLMSGFSHKVKSHWLGPNYTKEGPEGNDIRRTNLPDIRVGYRYETLCQELALITQAVQSEMLETIPEEAGLTPSPGPQ	73941	79495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_74024_74322_74467_74576_74667_74874_75005_75169_75365_75443_75576_76300_76465_76729_76857_76933_77098_77397_77519_77800_77975_78180_78292_78451
765078	contig_16892_pilon	-	1898	9	Intergenic	novelGene_172712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_1	161.961993998592	482	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	77	1306	198210	188132	FALSE	0	CGTTGGTGTGTTTTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPPLLLLALGLLLGPAAALIRIPLYKFTSIRRTLSEVGVSVENLISKNPVSKYSQRGSAVAQGPVPEMLKNYMDAQYYGEIGIGTPAQCFTVVFDTGSSNLWVPSIHCKLLDIACWIHHKYDSAKSSTYVKNGTTFNIHYGSGSLSGYLSQDTVSVPCSSASALGGVKVERQTFGEATKQPGVTFIAAKFDGILGMAYPHISVNNVVPVFDNLMEQKVLEKNVFSFYLNRDPTVQPGGELMLGGIDSKYYKGPLNFIKVTRKAYWQIHMDRVDVGNGLTLCKGGCEAIVDTGTSLMVGPVEEITELQKALGAVPLIQGEYLIPCEKVSSLPPISLQLGSKAYTLESEDYVLKVSQAGKTICLSGFIGMDISPPGGPLWILGDVFIGRYYTVFDRDNNTVAFAEATRI	198286	187539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16892_pilon_-_188300_188478_188578_188669_188815_189216_189340_191166_191391_192986_193106_193558_193683_195550_195711_198142
765079	contig_16303_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_34128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTAGAGATCTGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58079	57786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_57800_58100
765080	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
765082	contig_14326_pilon	-	2118	17	Intergenic	novelGene_120660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	1449	2117	99124	54915	FALSE	5	TCAGCTCCCGCCGCCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPGWMALRLLELICIRLTLFYLHSGGVVGAGTLYGHGEASSALSGGWHRDERDGVGQLVLYGLRGKPLKHGCQYQLVVAFPTVEGGVLHQCICVPILDDHLAAHTGKALWVVLELTSHLDGPCHQQGAPVAELPKLPPVVLVAVELPVLLVVPISEGILAFGTPKARTVPGFVDSPVQPLAGSDMVPTTPTPPGIFTRLCVHGSNGPEEWEEEEAGAVAAP	115247	54913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_54987_66313_66414_96068_96204_96882_96992_97584_97776_99062_99169_99478_99676_101710_101906_102779_102858_103543_103677_103914_103972_105793_105858_106990_107168_107860_107911_109995_110158_111829_111935_115061
765083	contig_11003_pilon	+	986	3	Intergenic	novelGene_105417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_1	40.5	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	490	984	56015	61112	FALSE	35	GGGAAGTATCTACCACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGEGTPSAGPRNTWEGSWGNSL	55525	61114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874
765084	contig_1699_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_72802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23887	26152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_23900_26200
765089	SIRV5	+	218	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	299	151	185	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8500	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
765090	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765091	contig_9727_pilon	-	2088	2	Intergenic	novelGene_86299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	380	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	30	401	256641	255967	FALSE	15	CCAACCTTCTGCTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLGLGAAGMLRPKALTQVLSQANTGGVQSTLLLNNEGSLLAYSGYGDTDARVTAAIASNIWAAYDRNGNQAFNEDNLKFILMDCMVWKGEPGFFCPPRGFPEGYPDPILDGWRGRNRISERVLRVDRQQHL	256670	254279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_256271_256573
765093	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
765094	contig_3942_pilon	-	1181	9	Intergenic	novelGene_128860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.9138304628395	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	189	839	1491123	1488049	TRUE	15	CTCCAAGGACTTGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWVRLGPAGGSQQASREPTHTFWPRSGRVPCRWPARVATRTSWGCCWSGMWTSTSTIGTEEPPCCTPCEGTT	1492098	1486206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1488961_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918
765095	contig_9482_pilon	-	1426	10	Intergenic	novelGene_44286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.723913034529	1	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	79	1242	1253080	1236365	TRUE	5	TTTCTCTTCTGCTTTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARIAIEHLDLISDSVLVDMVDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHQQMAEIAVNAVLTVADMQRRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1253158	1236135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236308_1236352_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1240887_1240966_1241040_1241234_1242403_1242603_1244305_1244471_1245325_1245387_1253059
765100	contig_14405_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_85670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751956	750289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_750300_752000
765104	contig_11978_pilon	+	2366	8	Intergenic	novelGene_63031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1285.57843726758	39	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	112	903	1608423	1646860	TRUE	5	CCTGCTGACTTGGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNCARCDKIVYPTEKVNCLDKFWHKACFHCETCKMTLNMKNYKGYEKKPYCNAHYPKQSFTMVADTPENLRLKQQSELQSQVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1608311	1649714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1608492_1616197_1616293_1625946_1626032_1633574_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1647370_1648760
765105	contig_20969_pilon	-	2003	3	Intergenic	novelGene_121251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_2	60	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	207	875	12975	11367	FALSE	10	TGTTCTCTTGTCATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGERAERTRRRQPEEERQIAVQWGARRLPEAAVAGVRAQDRVAAWNPSSASPAPRLWGAAATEGTLEMATPQSVFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASDRQIKKAFHKLAVKYHPDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTNGKGQRDSGSPFEQSFNFNFDDLFKDFGFFGQNQNTRSKKHFENHFHTRQDGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKMFSFSGFDSTSQHTVQTEKRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ	14829	10238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20969_pilon_-_11819_12758_12986_14633
765108	SIRV4	-	208	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	406	3	-406	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCGGCGGCAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765110	contig_3747_pilon	-	771	2	Intergenic	novelGene_24988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATTTAAAATTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271129	270252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546
765111	scaffold_19766_pilon	-	1108	7	Intergenic	novelGene_34319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_6	472.216640489887	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	243	884	621659	596625	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPGVRRSLILDHPHSPGGFTPNSVNPPDNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622371	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622284
765112	contig_348_pilon	-	1611	7	Intergenic	novelGene_67589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.2651638650078	6	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	79	1065	254084	252385	FALSE	0	GTGTGGTGCTTTCTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVAEFWCSRVEWSPGEEKYHLRGVMPPDEFHPGVNNSVYTNVLVQNRSGPGPTLTCPRHVGPTPVWAQPYPHMGLPTSTPPTRGPSPTSPTWAYRHRFPSACTLLLPSPRTWVCLSPTGGWWWLTRSRCPLTRSGTSTPSLMGTSLVREEVKQADVVLLGYPVPYPLSPSIRRRNLEVYEAVTSPHGPAMTWSMFAVGWMELKDPGRVQGLLDRSFANITEPFKVWTENADGSGAVNFLTGMGGFLQAALFGFTGFRITRAGITFDPMCPAGVSAVFVSGLSYQGSKVNFSFSEDSVTIEVTARAGPWAPPTGGRAEAITGSAPPAPRTQGLVSPIRWPDTKVPPVAASLRK	254258	251838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_252461_252588_252802_252876_252975_253145_253242_253334_253469_253714_254090_254185
765114	SIRV6	+	321	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	31	-244	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765115	contig_5231_pilon	-	1393	8	Intergenic	novelGene_65896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	123.491716651898	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	164	1114	219086	209128	FALSE	50	GTAACATAGAATGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTYAPWISIARNLPVLIENGQLRAEVEKLSQLSIDELRGHKLQRLAHLVLGYITMAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	219368	208848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283
765118	SIRV1	-	180	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	2	3648	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765119	contig_13674_pilon	-	2078	2	Intergenic	novelGene_140300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1432	1839	9607	9200	FALSE	50	AGATTGAAAAGAAAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIIAPILVRFRASEILGNFTELQGSKSQTHICQILYSSLLPSRSRKNRYPGHPESPLGTRRATTHQGTEMYLYTGGKWNIDMIPCRECQGCPAQHKDLGSIRNQGKIQKPPGKKQLRSFKVSQVPGLAGVSGMI	15652	8960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_10679_15292
765122	SIRV6	+	440	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	97	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATTTAGGTATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3160_10721_10819_11031
765123	contig_9871_pilon	-	1191	5	Intergenic	novelGene_75682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	4.32290411644765	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	66	611	519990	510912	FALSE	25	CTTTAGAGTCTTTCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEVTLAVTPLNVCLKSSNEESMDLTNSVYSEMFVGPDEFDFFQIGVDTEVTFCFKELKGMLTFSEAIHAPISIYFDFPGKSDLILSNSEAGKNVTNKAPECILRKVAPKRLHPTESPTKTSALENRSSPRRKRADREGSDVPESSVGKAEEAPRSPYLRKFSRMFFGAVSSGQQEHFNHPSESLVNDSQEDMNNGSFSTFNI	520055	510331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_511041_514200_514442_516215_516281_516372_516480_519986
765130	contig_14333_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_49129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATTCCAACTCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419123	417614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_417600_419100
765131	contig_9609_pilon	+	1687	2	Intergenic	novelGene_22933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATATTTTTTAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70865	84779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_71077_83303
765133	contig_15991_pilon	-	967	7	Intergenic	novelGene_70896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3245.72818828414	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	77	898	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGHENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106358	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103633_104971_105142_106315
765134	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
765135	contig_8616_pilon	-	2162	5	Intergenic	novelGene_72458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	55	junction_3	43.2456645225854	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1346	1735	272117	271495	FALSE	20	TTCTCATGGAAGTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIVSLLPASLPVLGRTPGAVDFLPSRVPGGSGLFCQEERMMSGQKAWGWEVGVGLCPSWLHFLFTTPLAVCYWLPDG	274355	271067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271795_271904_271971_272093_272145_272904_274150_274282
765138	SIRV6	+	353	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	20	410	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765141	SIRV6	+	324	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	533	14	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
765142	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765145	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_95132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765147	contig_15172_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_158772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCACTATAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272565	273096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_272600_273100
765148	contig_4364_pilon	-	1880	6	Intergenic	novelGene_45	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_3	12.8623481526508	239	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	19	948	519079	509986	FALSE	25	CATGTGAGATTATTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELLRRELGCSFVKATGHTGGGCISQGQSYDTDKGRVFVKVNPKAEARTMFEGEMASLTAILRTGTVRVPKPLAVLDGPGGGSMLVMEHVDMRYLSSYAAKLGAQLADLHLENRRLGEALRKEGGTVGRGGGQVERTFVDQFGFDVVTCCGYLPQVNDWQKDWVVFFARQRIQPQMDMVERASGDREARELWAALQLKIPELFQDLEVIPALLHGDLWGGNVAEDASGPIIFDPASFYGHSEYELAIAGMFGGFSSAFYSAYHGRIPKAPGFEKRLQLYQLFHYLNHWNHFGAGYRGSSLNIMRNLVQ	519097	509053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_510325_510484_510608_513254_513338_515272_515365_515680_515833_518938
765150	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	88	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
765151	contig_7293_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_54235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGGAGTGTGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222838	221560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_221600_222800
765154	contig_11258_pilon	-	1103	3	Intergenic	novelGene_67852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	68.5	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	367	819	360591	352136	FALSE	60	ACAACAAAGAATATTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGPCSAASTSCS	360957	351851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_354741_355099_360530
765157	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	8	1153	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
765160	contig_9656_pilon	-	1272	11	Intergenic	novelGene_121912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	386.297929065119	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	262	693	442253	438023	TRUE	25	CTATAGTCTGTACATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHR	446623	430421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437026_438021_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446509
765161	contig_15613_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_147192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55787	53209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_53200_55800
765162	contig_15165_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_145318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	850	1149	217109	216810	NA	35	AAAATTTCACTTTTCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYGHFWSVQSHSPPVANWPDLLSRCGCGLHSNQEELSWSFLRSTHHPFVPQNSLPHEAASSANNLTLDCFTAKLSGLQVAVETANLILDLAYVIEDKN	217958	216326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_216300_218000
765163	contig_8330_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_71733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	505	837	459587	459919	NA	10	GGACATGTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGLNSFFVLAVSVGTGLILLQYNSQGSDLKHTSLVFIRVSCLSRSAGSSTEYHPHAGTTSVTCRMKERPRITHWLLPASARKLHSSPPLTSHRSEQMTLLCLTSKEET	459082	460298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_459100_460300
765172	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
765173	contig_9199_pilon	-	1916	14	Intergenic	novelGene_65651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_9	91.5643143841478	73	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1752	165	1916	182028	170868	FALSE	55	GAACTGATTGAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSEIEPNVFLRPFLEVIRSEDTTGPITGLALTSVNKFLSYALIDPIHEGTAEGMENMADAVTHARFVGTDPASDEVVLMKILQVLRTLLLTPVGAHLTNESVCEIMQSCFRICFEMRLSELLRKSAEHTLVDMVQLLFTRLPQFKEEPKNYVGTNMKKLKMRAGGMSDSSKWKKQKRSPRPPHHVTKVTPGSELPTPNGTTLSSNLTGGMPFIDMPTPISSASSEAASAVVSPSTDSGLEFSSQTTSKEDLTDLEQAGFPGYSTAADPVSNELGVPEQPDPQQEVVQVEKAQSASVESIPEVLEECTSPADHSDSASVHDMDYVNPRGVRFTQSSQKEGTTLVPYGLPCIRELFRFLISLTNPHDRHNSEVMIHMGLHLLTVALESAPVAQCQTLLGLIKDEMCRHLFQLLSIERLNLYAASLRVCFLLFESMREHLKFQLETYIKKLMEIITVENPKMPYEMKEMALEAIVQLWHIPSFVTELYINYDCDYYCSNLFEDLTKLLSKNAFPVSGQLYTTHLLSLDALLTVIDSTEAHCQAKVLSNLTQQEKKEAARPSYETVDSTREASNTERAASDRKAVGMAPDIPGLHLLAGGWLLAEHGKPGCSDLEEAGDSGADKKFTRKPPRFSSLLPDPR	186138	170867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_170927_171241_171383_171979_172170_172404_172600_173227_173327_173663_173876_174317_174487_175002_175227_175570_175719_179452_179508_180733_180795_181306_181416_181938_182058_186003
765174	SIRV6	-	460	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	32	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCATAACTGTTTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
765177	contig_9609_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_22970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACTCCAGCCCCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274734	274192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_274200_274700
765178	contig_8570_pilon	+	1617	14	Intergenic	novelGene_120143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_11	451.277673347063	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1590	27	1616	284365	367931	FALSE	25	GCAGTTTTTCAATATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWRKTDKERQGVAIYNFQGQGVPQLSLQIGDVVRIQETCGDWYRGHLIKHKMLEGIFPKSFIHIKEVTVEKRRNTENIIPAEIPLAQEVTTTLWEWGSIWKHLYVASKKERFLQVQSMMYDLMEWRSQLLSGTLPKDELKELKQKVTSKIDYGNKILELDLIVRDDDGNILDPDNTSVISLFHAHEEATEKITERIKEELSKDQPDYGMYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAVMDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPVRDSATALGDRATIVGAYAHKNLFFLARIMLSKCQVPLGLLLSKMIYPFKAWLALCPIIRLHFVLSLHQ	284338	367932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594_361731_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599
765179	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765181	contig_5018_pilon	+	932	6	Intergenic	novelGene_47146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	412.486896761582	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	82	678	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497679	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497752_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
765182	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
765183	contig_15118_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_74625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	117.680358032539	2332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	275	766	430861	432703	FALSE	15	TTTGCTGGGATTTGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPCRSLALLTGSLGLVSMVVALSTNFWIVAMGPSMSAHTGLWPSEGSVAVYIRVTQSFSILATLCILVSVVILALSFFPLLSAPGRSPLFAAITALTAALFMIVAMAVYTSERWVQVPGSQIQVFFGWSFYVGWVSVLLLLCTGALTMDAYCGARRPGYEAV	430586	432890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_431012_432159_432307_432391_432527_432644
765185	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765186	contig_5598_pilon	+	2446	14	Intergenic	novelGene_148288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	40.3583064487137	185	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	262	1704	587950	599425	FALSE	10	GCCAACTGCCTGTGGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLQPQHRGERTITFEAKSHLSKYEESQACQGSRKTLCWAPAHHLVSGKEVLQASDESRSSHLCHPKGERRFSLTGVCAPQNSPNDLQMLSDAPAHHLFCLLPPVPPTQNALPEVLAVVQVCLEGEISRQSILNSLSRGKKASGDLIPWTVSEQFQDPDFGGLSGGRVVRIAVHPDYQGMGYGSRALQLLQMYYEGKFPCLEEKVVETSQEIRTISSEAVSLLEEVITPRKDLPPLLLKLNERPAERLDYLGVSYGMTPRLLKFWKRAGFVPVYLRQTPNDLTGEHSCIMLKTLTEEDETDQGAWLLAFWKDFRRRFLALLSYQFSTFSPPLALNIIQNKNMGKPAQPALRREELEALFLPYDLKRLEMYSRNMVDYHLIMDMIPAISRMYFLNQLGDLSLSAAQAALLLGIGLQHKSVDQLEKEIDLPSVQLMGLFNRIIRKVVKLFSEVQEKAIEEQMVAVKDVVMEPTMKTLSEDLDEAAKEFQEKHKKEVGKLKNMDLSQYIIRGDDEEWNEVLNKAGQNASIVSLKSDKKRKLEAKQEPKQKKKLKKNRDMKNKKDTKLKRRK	587688	600167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_588046_588928_589031_589126_589202_589803_589921_590929_591064_591278_591328_592589_592687_592761_592873_593815_593989_594505_594626_595006_595106_595771_595846_596889_596974_599313
765191	contig_7963_pilon	+	1619	8	Intergenic	novelGene_58545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	165.030238416591	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	892	1566	247452	251647	TRUE	20	GCCAGTTATCAGGGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIHP	246077	251974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250231_251640_251683_251956
765197	contig_7695_pilon	-	2686	19	Intergenic	novelGene_41596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	35.1635069670564	1	150	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	268	2289	524436	504301	FALSE	5	TCTTTGCCATGTGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTQYILPNDIGVSSLDCREAFHLLSPTERIYAHHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYTLLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSMAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGVTTYFSGDCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEAGQDGKPRYEVRLASVLGTEPAVDSEVTSKLKTYEFQGSCFQVTRGDYAPILHKVVEHLEKAKAYAANSHQEQMLAQYVESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAMVNKAMSAKFKWLVESAEQLLKELPWPPAFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYIRWKGPSFDVQVGLHELLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEEFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	525584	503903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510627_512349_512421_512505_512569_513892_513986_514282_514396_514584_514780_516932_516992_517069_517201_517279_517411_519632_519727_520312_520388_521064_521203_521999_522090_524166_524445_524575_524634_525001_525168_525549
765200	SIRV4	+	339	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAACTGCACTGGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
765202	contig_6654_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_85712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCGGCATACAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211272	209208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_209200_211300
765205	contig_7730_pilon	-	1074	5	Intergenic	novelGene_156241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	611.200202470516	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	418	474	2401	2295	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKKKKTFRDY	43582	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2321_2370_2445_4051_4177_7798_7895_43429
765206	contig_8174_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_160070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352451	353590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_352500_353600
765207	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	14	407	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765209	contig_6871_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_21531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTTAATGGTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70123	72209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_70100_72200
765212	contig_8330_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_71935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATACTCTCGGGGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317938	1317584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1317600_1317900
765215	SIRV6	+	307	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8134	3	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
765216	SIRV6	+	261	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	40	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3145	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11033_11109_11205
765220	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
765223	contig_11594_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_80934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAGAATGGGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548979	546284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_546300_549000
765224	contig_12427_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_40487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325981	324175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_324200_326000
765229	contig_4974_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_161402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71904	69583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_69600_71900
765230	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_97718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765232	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765235	SIRV6	+	386	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	400	514	227	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
765236	contig_2114_pilon	-	1842	13	Intergenic	novelGene_104323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_5	59.2018088124566	10	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	16	1374	1169443	1139050	FALSE	25	CTAATTTGTTCCCATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGRCSYPVPRLLLLLLLLLSLNGGAVLSWPTEEGKEVWDYVTVRKDAHMFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169458	1138581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
765239	SIRV6	+	393	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	569	0	390	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	184	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1693	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765245	contig_10377_pilon	-	2863	5	Intergenic	novelGene_115346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	27.2488531868774	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	271	2541	131197	113448	FALSE	20	ATATTTGGTTTATGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFPSTSRRWSKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDIAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSQNFIDGEKLSSEHIMMRLTKDNTWSSVLGNIFKSHGSKNEPKIQGKLLRSVTVENLCESNDGNQYLTSFSQIPNLTGLKKNLAAVNAFECCECGKTFMDLSSHNHHTGSHTGCNTCQCKECGEACSCPSQLTTPMRTLNGKNPQNCKVCGKVFICISNLKNPVTTLTGEKYYKCNECGKDFFSFSSFWTHERGHKCECKERCKTDSLSCLILHKFLNTDKPYVCKECGKAFRCSSNLTKHTVTHSGERAYECKECGKDFRHASSLTTHIRTHSGEKPYVCRECGKAFSCSSHLTSHIKTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHIRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSVLTTHKRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDLTTHKRTHSGERPYECKECGKTFSQSSHLTTHIKTHNGQRPYECQECGKAFSWPSDLTTHVRTHSGVRPYECKECGKAFSQASSLTTHLRTHSGVRPYNCKECGKAFSQASSLTTHMRTHSGVRPYSCKECGKSFRCSSHLSNHTRTHSGERPYECKECGKAFSDFSAFTKHIRIHSGEKPYECKECGKTFSQASNLTSHTRTHSGARPYKCKECGKAFSDSSSLTSHMRTHSGERPYECKECGKTFSRSSHLISHRRIHSGERPYECKRCGKAFSQASALTTHIRTHSGERPYECKQCGKAFSQASALTTHKRTHSGETTL	133680	113125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_115399_118831_118983_119952_120080_131155_131395_133607
765247	SIRV6	+	516	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	31	14	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765253	contig_7171_pilon	-	2498	28	Intergenic	novelGene_101295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	117.162590882636	1	136	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	332	1258	1074341	1066799	TRUE	10	GCTGTTATCTTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDGRHIEFRRLGGMESRPPTHTALHQPPGDSRSSSPRRHQSESDDDYDDVDIPSSVLHRTMVLGMKGS	1075847	1057619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061372_1061436_1061853_1062067_1062927_1063008_1063091_1063201_1065002_1065072_1066061_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1068327_1068373_1068453_1068498_1068575_1068635_1069160_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072143_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075277_1075423_1075475_1075657
765257	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_91498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
765262	contig_11413_pilon	+	1251	6	Intergenic	novelGene_103119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	17.2673101553195	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	480	815	46238	47264	FALSE	5	GCTTTCTCTGTATCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGPIRAYILARKDAIQLWRTLMGPTRVFRARHVAPDSIRGSFGLTDTRNTTHGSDSVISASREIAVFFPDFSEQRWYEEEEPQLRCGPVCYNPEGGIHCAAGTGGSGPA	41420	47700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_41598_43712_43810_45379_45483_46135_46246_46667_46829_47097
765266	contig_8027_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_158849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCCCTGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421612	423715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_421600_423700
765270	SIRV6	+	335	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-244	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11114_11221
765271	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765272	contig_10948_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_124964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69809	68609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_68600_69800
765278	contig_13558_pilon	+	1096	3	Intergenic	novelGene_123011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	154	861	40701	41660	FALSE	65	AAAACAAAAAACCTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAMCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36709	41895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655_41281_41532
765285	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
765288	contig_7753_pilon	-	2629	1	Intergenic	novelGene_41465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556848	554219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_554200_556800
765289	contig_15899_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_128907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAACAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22084	20416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_-_20400_22100
765290	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	-9	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765293	contig_10937_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_67326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141672	143179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_141700_143200
765294	contig_10674_pilon	-	1957	13	Intergenic	novelGene_6438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	1580	1957	208919	198573	FALSE	0	TCTCCTGCGGCTGCCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYDLHLHHHYGLLIHCADLHLKGHCLQGQNAQKLLIYCQIFPSDYHSHYDEKLPHPHCHLQTVPYYLAFLNHLFHLDRFHFQRHYCQKQHSLDQNLSQIQNQNLYVQHRYRRRCQRDPPYPPLPH	251409	198572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_198637_208605_209116_209217_209355_211778_211896_223315_223411_224011_224158_224943_225029_236826_236923_237450_237586_238934_239076_241063_241251_243631_243702_251235
765296	contig_10434_pilon	-	1964	9	Intergenic	novelGene_82034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	544	junction_6	128.68250658112	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1197	1877	136834	132856	FALSE	35	TGTTATAATAAAGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	139870	132768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_137572_139146_139201_139465
765301	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
765302	contig_8059_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_111106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCAATATTCCCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222497	222746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_222500_222700
765303	contig_5669_pilon	+	1928	7	Intergenic	novelGene_86033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	98.9354447214052	39	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	14	988	4109	20531	FALSE	10	TGTTTACATTCGTTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLIIMDLRQFLMCLSLCTAFALSKPTEKKDRVHHEPQLSDKVHNDAQSFDYDHDAFLGAEEAKTFDQLTPEESKERLGKIVSKIDGDKDGFVTVDELKDWIKFAQKRWIYEDVERQWKGHDLNEDGLVSWEEYKNATYGYVLDDPDPDDGFNYKQMMVRDERRFKMADKDGDLIATKEEFTAFLHPEEYDYMKDIVVQETMEDIDKNADGFIDLEEYIGDMYSHDGNADEPEWVKTEREQFVEFRDKNRDGKMDKEETKDWILPSDYDHAEAEARHLVYESDQNKDGKLTKEEIVDKYDLFVGSQATDFGEALLRLEDERTRREGSLV	4095	21471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_4330_9177_9372_13206_13374_14081_14143_17622_17823_19079_19164_20483
765304	contig_5171_pilon	+	1794	8	Intergenic	novelGene_161225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_7	51.7071818325194	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	42	1238	15871	157548	FALSE	35	AAGATTCCCCCAGTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEHIDYCGYAVLPMAVEQDMLIAVEPVKTQTIRLINTNPLYPDFSTSVNNIQIDKTKPQWHNYFLCGFKGIQERFCLSNLTGMNCLVDGNIPPSSGLSSSSALVCCAGLVTLTALGMSLSKVELAEICAKSERYIGTEGGGMDQSISFLAEEGTAKLIEFSPLRATDVKLPSGAVFVIANSCVEMNKAATSYFNIRVTECRLAAKLLAKYKSLQWDEVLRLEEVQAKLGVSLEEMLLITEDALHPEPYSPEEICSCLEISLEELRTQILSPNTQDVLHFKLYQRAKHVYSEAARVLQFKKICEEAPDNVVQLLGELMNQSHVSCRDMFECSCPELDQLVDICRKFGAQGSRLTGAGWGGCTVSIVPADKLSSFLANVQEAYYQRSDRSSALGTQSLFATKPGGGALVFLEA	15829	158104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_15957_22610_22702_25641_25789_85609_85709_87854_88008_100600_100812_143662_143865_157340
765307	contig_5039_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_65025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCCAGCTGTCCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775873	1778052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1775900_1778100
765308	contig_8907_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_85849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAATATTTGTTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690179	691956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_690200_692000
765309	contig_10130_pilon	-	802	3	Intergenic	novelGene_172719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_2	125.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	584	739	48839	19813	FALSE	50	TATAAATTTTAGAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLQRALGCRGKSRKNRERKALSWPCVVFFRRRRRRRSPRRLGERCLASHTQRPRILPLPHRWCPGERCLAPSPDNGKLCEASIKSVTVDENGKSFAVILYSDSLERKVPLRRLQEVKSVKDCSRSFIFDDEDLEKPYFPDRKFPSSAIAFKLSEDGDCIPHTINRYLRDYQREGAQFLYGHYIQGRGCILGDDMGLGKTVQVISFLAAVLHKKGTREDIENNMPEFLLRSMKKETPSCTARKVK	56943	19749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_19945_48815_49241_56761
765310	contig_10130_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_172717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCCCAGAAGTAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19121	18384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_18400_19100
765312	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	15	1153	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
765314	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765316	SIRV6	+	327	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1680	0	-219	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2804	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765317	SIRV6	+	335	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10490	1	1253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11490	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
765326	contig_15859_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_50184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATATAATCGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289357	288609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_288600_289400
765327	contig_15859_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_50182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCATTTATACCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288659	287963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_288000_288700
765329	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
765330	contig_12427_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_40587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAATAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574105	573522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_573500_574100
765336	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765339	contig_10475_pilon	-	2183	2	Intergenic	novelGene_148720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	0	816	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	221	1255	26008	24974	FALSE	35	TGTCTTGATAAAACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHTPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPESTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQTPTEAESSMDDD	32194	24045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_26084_32049
765340	contig_5084_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_64531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCGTTGTGTGTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497200	495267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_495300_497200
765345	contig_18414_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_170020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140404	138293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_138300_140400
765353	contig_3161_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_84523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAAGTAATGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416023	417079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_416000_417100
765354	contig_13148_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_162933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACAACTAGAATAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168783	169783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_168800_169800
765357	contig_3948_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_53293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTACTCACAGTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444983	1447280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1445000_1447300
765359	contig_6102_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_32185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879974	880512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_880000_880500
765366	contig_13760_pilon	-	1558	5	Intergenic	novelGene_61282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	11.2249721603218	177	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	543	1022	157356	155100	FALSE	20	CGAATGTTGGCTGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLPPGLMEVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFISNTGGEQINQVVLEAWRSRRDREEIRLQELEPAISRAVLDNPQHGFWRSGIVEEHLLDAVVPFLPLQRHHVRHCVLNELAQLGLEPRDEVVQAMLESTTFFPEDEQLFSSNGCKTVASRIAFFL	159277	154563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_155345_155672_155801_157249_157426_158168_158436_159071
765367	contig_3601_pilon	-	2257	3	Intergenic	novelGene_132891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4	4	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1772	2248	184819	180164	FALSE	45	AAATGAATGAACAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIRERQSSIPVLCRRCSGVLSVSCYLRVSPGSSWLTGPPGAGLALWDHASCRSHLPAPGFPASWPPVSSVTETCALCGHLPPSLPPSTLGRPSCLNSDLPVPTSSPSTLFLSDRVYLFAHCWASPQEHKPQEGRGFIWFSAVSAYQKHSPSMVGFQ	188289	180154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_180639_184817_185938_187636
765372	contig_11003_pilon	-	2576	18	Intergenic	novelGene_105450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_12	54.5388341373901	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	59	2401	409866	394953	FALSE	50	TATTTTTTAAAAGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPERRSFRAYAAVLYIDPRMRIFIHGHKVQTKRLSCCLYKPRMYKYTSSRFKTRAEQEVKKAEHVARIAEDKAREAETKARTLELRLGGDLTRDSRVMLRQVQNMAITLRREADVKKRIKEAKQRALKEPKELNFIFGVNIEHRDLDGMFIYNCSRLIKMYEKVGPQLEGGMACGGVVGVVDVPYLVLEPTHNKQDFADAKEYRHLLRAMGEHLAQYWKDIAIAQRGIIKFWDEFGYLSANWNQPPSNELRYKRRRAMEIPTTIQCDLCLKWRTLPFQLSSVEKDYPDTWVCSMNPDPEQDQCEASEQKQKVPLGTFRKDLKTQEEKQKQLTEKIRQQQEKLEALQKTTPIRSQADLKKLPLEVTTRPAPEEPARRPQRPRSPPLPAVIKNAPSRPPPLPALRPTTQLRRAPVVSSALKPPALAAGEEASTSRLLPSPEVPRKPANTPVRAVPRPTPLLQLPSPSLPNSKILRETSVPRAVKTPVVKKPEPPTKLSPATPGRKRSFGVSDEEEAEEEAERRKERSKRGKLAVKEEKKESNELSDSAGEEDPADLKRAQKDKGLHVEVRVNREWYTGRVTAVEVGKHVVRWKVKFDYVPTDTTPRDRWVEKGSEDVRLMKPPSPEYQSPDTQQEGGEEEEVVAVAPQAVAMVEPSTSDCIPIEPDTTAPSTNHETIDLLVQILRNCLRYFLPPSFPISKKELSSMNSDELISFPLKEYFKQYEVGLQNLCHSYQSRADSRAKASEESLRNSERKLRETEEKLQKLRTNIVALLQKVQEDIDINTDDELDAYIEDLITKGD	409924	394777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_395022_396219_396409_399923_400018_400109_400338_400489_400632_401033_401089_401579_401712_402274_402653_402734_402810_404784_404918_405242_405349_405865_405995_406125_406281_406376_406518_407697_407784_408312_408396_409119_409200_409798
765374	SIRV1	-	239	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3588	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6464_6553
765375	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765376	contig_6735_pilon	-	1052	10	Intergenic	novelGene_15737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	819.747311261823	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	369	860	554315	542177	FALSE	35	ATGCTGAGCTAAATAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEACSWTLILWSCLILHECFL	568252	541984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542236_545916_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564245_564699_564869_568198
765379	contig_15084_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_116712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACAGTTTTCCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249413	250530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_249400_250500
765380	contig_15084_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_116713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATTGAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250681	251271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_250700_251300
765382	contig_7816_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_66472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGACCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146875	149080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_146900_149100
765384	contig_6027_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_74416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTCAGCCCCTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108059	106823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_106800_108100
765385	contig_12080_pilon	+	2037	14	Intergenic	novelGene_128384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGTAGAAATAGGCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166326	177496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_166953_168251_168415_168730_168808_169040_169103_169247_169334_170533_170600_170759_171260_171758_171891_172262_172322_172442_172501_172629_172715_175884_175936_177316_177363_177470
765387	contig_5095_pilon	+	1412	8	Intergenic	novelGene_74960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_7	27.2209403187461	336	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	118	1122	461700	466291	FALSE	15	TAGAGGTAGGGTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSLFLAALCLGIASAALKHDQSLDAHWNQWKSTYKKPYAVHEEDWRRAVWEKNMKMIELHNREYSQGKHGFTMAINAFGDMTNEEFRQVMNGFQNQKRNKGKMFHEPVFGNIPKSVDWTQKGYVTPVKNQGECGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSRPEGNEGCSGGLMDSAFQYVKDNGGLDSEESYPYLATDTQDCHYKPEYSAANDTGFVDIPQQEKALMKAVATVGPISVAIDAGQTSFQFYKSGIYYDSDCSSKDLNHGVLAVGYGFEGTDSKNNKYWLVKNSWGTSWGTDGYIKMAKDRKNHCGIATAASYPTV	460770	466581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_460877_461688_461826_462111_462235_462340_462488_462674_462900_463551_463718_464783_464902_466191
765390	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765392	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765401	contig_11677_pilon	+	2477	12	Intergenic	novelGene_85977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.760632634421	1	139	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	192	1676	727781	736807	FALSE	40	TTGAAATGATATGAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASQKAVTSSERAFFDPSLLHLLYFPDDQKFAIYIPLFLPMAVPILLSLFKIFLETRKSWKKPEKID	727249	737608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727292_727547_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531
765403	contig_11104_pilon	-	1617	15	Intergenic	novelGene_112464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	74.0252645785097	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	133	1371	359149	327498	FALSE	35	CAGTAAAATGCTTTCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLNTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELIPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP	359281	327251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_327579_329045_329133_331188_331285_334327_334409_334565_334681_335041_335104_336498_336589_336686_336794_337105_337201_344111_344210_344488_344590_349659_349726_349776_349835_349977_350055_359124
765408	contig_9515_pilon	+	1223	10	Intergenic	novelGene_73809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	296.805959808387	3	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	76	1188	65880	72618	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQRVPSSSNSSRTGNESPRLPAPHSAAWTPPACFVPSGEWSMRT	57267	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72489
765409	contig_3122_pilon	+	2199	3	Intergenic	novelGene_64401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	7	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	428	928	429075	436764	FALSE	20	TTTACATTGGACTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQLTVTPATAFADEPVHIRMTGLPPSQMVTFKVSLKDVKGNLFRSKAFYRANETGEVDQEQDRAFGGDYVGVHPMGLFWSLKPERAFRRLLKQDMMNIPFWVTLDLYDSVCFQDLATAQPRASQALQRSFSGPGMQRVQIWEGRVRGALFLPPDPKVRNRSDLRV	428061	438035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_428454_429039_429538_436726
765410	contig_11815_pilon	-	1672	4	Intergenic	novelGene_50905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	71.6147098483731	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATATCATTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156959	153846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153979_154794_154850_155177_155255_155551
765411	contig_4857_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_48904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATGCAAAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494360	1496788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1494400_1496800
765417	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
765422	contig_15067_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_154322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAGCGTGTCAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52868	55232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_52900_55200
765423	contig_11396_pilon	+	892	7	Intergenic	novelGene_71433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	504.807361497653	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	118	672	1782334	1789659	FALSE	35	TTTAAAAGAGAGCGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GESAAAAHECALLRRNAGGVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIATPQAPTTPGRLMPLVAGPSQCVSSWRRTTRMKPSRLTTWPSSWLSRPFWRWSSQAAKTSSLRSCGGISPSRF	1782216	1789879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787352_1787929_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
765432	scaffold_13505_pilon	-	1090	5	Intergenic	novelGene_111451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	309.352852742625	6	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	535595	531132	FALSE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEVRLLHV	535617	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531149_531295_531369_532376_532496_532707_532999_535516
765433	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	170	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
765435	contig_3469_pilon	-	1842	2	Intergenic	novelGene_34220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTTGTTTTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563883	562004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_563717_563753
765440	contig_17976_pilon	+	1769	2	Intergenic	novelGene_32459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	580	945	9181	9546	FALSE	40	TAGAAACAGCCCAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCHRNYMKVNRSRSQVPNPQVMLAPLGPERLVNAASYREHSHHGAENNPGGATAAAEVVAVPADCSVEGAAHRTEAISSNVKTVCSCPGPGCLGPASSLWPQVESSDSHSAGLCPPANPR	5930	10370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_6167_8837
765441	contig_10235_pilon	+	932	6	Intergenic	novelGene_46324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1237.39102954563	374	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	367	909	91803	93353	FALSE	25	TCCTCCTTACCAATCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSTPADGAAHGHREKTEGIECSPKEEQRPIPCADAQAQHLHPAQVDSGVIDSGVPYVQLSLVVTEEADRAKGDQAAPELWGPVPHLLPMGHLVPVPRDRANGRSPLAGIEEAGQGGGGTLLGPNLRRLDHPESTGSWGTERRPREIPPQLHQSERTRQLGIRYLVVPPWKAHRDKHFG	89962	93376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91627_91825_92608_92671_92894
765442	contig_7894_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_170777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169173	168006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_168000_169200
765444	contig_14525_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_149793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTGAGTCCAGTACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271813	272255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_271800_272300
765445	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765452	contig_233_pilon	-	1185	3	Intergenic	novelGene_14478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTTGGCTTCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13017	11715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_12367_12419_12626_12689
765454	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_90719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	653870	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653872	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765456	contig_14441_pilon	+	1979	3	Intergenic	novelGene_100462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5	28	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	18	500	85423	87484	TRUE	20	TTTTTTCAAATAGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDPAMRALPLACALLCLLQPGLMGAQVIQTPRYSVRRSEKRVLLECTRQNVLVSTRPSFGAAADPCSYDVDSTEKGDALDGYSVSRKTKGGFSLTLGLASPNQSSVYLCASSESTARCSHIFSEQKAGAGSHITLHQLETVTLRYPACRHTSWQAKHGMPFRPC	85405	97313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_87050_87795_96144
765466	contig_10196_pilon	+	1110	9	Intergenic	novelGene_132134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	384.287896634802	49	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	18	920	1034566	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034548	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043913_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
765467	contig_18108_pilon	-	1468	4	Intergenic	novelGene_33497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	933	junction_1	105.378682221153	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	891	1256	269954	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	270844	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897
765480	contig_18081_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_23847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGGCTCTTCGCAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430776	430274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_430300_430800
765482	contig_4845_pilon	-	2166	7	Intergenic	novelGene_53710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	45.5045785242174	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	67	849	1031821	1019447	TRUE	25	TCGTCAAGTGGAGCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTRLTFEYDSEPFGKERDAAIMKMAKEAGVEVVTENSHTLYDLDRIIELNGQKPPLTYKRFQAIISRMELPKKPVGSVTSQQMESCRAEIQENHDETYGVPSLEELGFPTEGLGPAVWQGGETEAMARLDKHLERKAWVANYERPRMNANSLLASPTGLSPYLRFGCLSCRLFYYRLWDLYKKVKRNSTPPLSLFGQLLWREFFYTAATNNPRFDRMEGNPICIQIPWDRNPEALAKWAEGKTGFPWIDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTQTQAGSS	1031887	1007549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1008783_1019362_1019470_1021832_1022107_1023223_1023365_1029004_1029094_1029982_1030168_1031750
765483	contig_11978_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_62809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGAAGGATTAAATGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371815	374186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_371800_374200
765484	contig_5871_pilon	-	1108	2	Intergenic	novelGene_160184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACTTTACATTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431889	411849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_412734_431665
765485	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
765487	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765490	contig_9687_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_172728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCATTGTATCCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63678	65452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_63700_65500
765495	contig_7612_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_170364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAAGCTGTGTCATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196026	196301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_196000_196300
765496	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	536	3	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
765499	contig_17753_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_105042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	340	645	39389	39694	NA	85	ATTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFNQSFRVESCLLWRVCKEEYWKKTRNTPWDHTKKGLHCWAQKRGITSLWQRGAVEVLRVLSLTMSGRRAAEESGYSFVSVINHLALNSTNVTVTGLNKK	39049	40338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_39000_40300
765500	contig_14322_pilon	+	371	2	Intergenic	novelGene_116355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCGGGCCCGCGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671625_671796
765501	contig_18723_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_172733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACATCATACCTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122269	122783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18723_pilon_+_122300_122800
765502	contig_20944_pilon	-	2030	2	Intergenic	novelGene_167540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43815	39011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_40266_43039
765507	contig_18804_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_163799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGAAATGCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44102	45794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_44100_45800
765510	SIRV6	-	506	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1602_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
765511	contig_15991_pilon	-	956	6	Intergenic	novelGene_70880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2882.23707560638	4	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	3	887	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105110	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103586_103703_104975
765513	contig_7562_pilon	-	2353	11	Intergenic	novelGene_140879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	94.3381683095448	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	73	1113	143632	129780	TRUE	10	TTTCTTGTCTGTTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACEGEQVTLSPPIHLLERPASRHIMKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIKISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVYLYWVVFAIKTKTFFHSTFGT	143704	125578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_125802_126240_126320_128841_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_141978_142093_142214_143084_143180_143566
765516	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765517	contig_9225_pilon	-	1907	11	Intergenic	novelGene_160160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	26.0117281240597	86	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	29	781	47449	30513	TRUE	25	GAATGTGTTAATGCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSGARPPAMQAPKEETAAVLQGAGVGEEKEDVSQQAKERLNKTGNRQDNLGSTGCSKIRTMDLKFNNSRKYISITVPSKTQAMSPHIKSIDDIVVLGINLSRFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQELIFSVEGFKSYGWYLTLVQFGFYSIFGLIELQLIQDKRRRIPGKTYMIIAFLTVGTMGLSNTSLGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMLGGVFIQGKRYNVADVSAAVCMSLGLIWFTLADSTIAPNFNLTDPT	47477	19891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_20520_21666_21737_25587_25700_26119_26213_29397_29496_30387_30524_30632_30741_32028_32184_35968_36091_39243_39535_47383
765522	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1209	0	1209	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
765523	contig_5084_pilon	-	2070	2	Intergenic	novelGene_64681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTTCTGTCTTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775580	1773275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1773409_1773643
765527	contig_15146_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_116963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGTGTGAGTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591510	592701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_591500_592700
765531	SIRV4	-	316	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1207	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765533	contig_5643_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_38897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAATACGAATGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261988	261386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_261400_262000
765535	contig_5643_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_38896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259371	259092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_259100_259400
765536	contig_12008_pilon	+	1398	8	Intergenic	novelGene_24991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_3	551.32408336473	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	30	CTATGCACATGATGTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	39728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39215_39300
765541	contig_15423_pilon	+	654	5	Intergenic	novelGene_171588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	8.04285397107271	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	75	653	276513	280460	FALSE	40	CTAAAGATGACCTAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREKEDQIKELQKYIDSQKLENIKMNLSYSAEDTEDLKQMKQTLLDAETVTLDAKRESAFLRSENLELKEKMKEHENACKQMENDIWVFQSQLEAKKKMQADLEKELQSAFNEITELSSLVDGRVSKDLLCNLELERRITDLQKELNKEIEENAALRKEVNLLSELKSLSPEVEILRKEVHDKSEELNLITSEKDKLFSEVADKESRIQGLLVEIGK	276438	280461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_276534_278289_278413_278492_278659_279019_279175_280346
765545	SIRV3	+	246	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4551	2198	2492	23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGGTGATCGTGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6495	6741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6500_6700
765546	contig_11026_pilon	+	2591	18	Intergenic	novelGene_167663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	222.795668796775	20	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	41	2110	158680	213284	TRUE	30	CATTTGTTACATTTATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGIKEADEGLLSGGTGHVLTQERQQNLNGFEEGVEFLPVNNAKKVEKQGRRCWVVLAAVVIGFFLLSLVVGVLVWHFQHRNERIPKVFNGHLRIKNENFVDAYENSNSTEFAYLANRVKEALKLLYSGIPALGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSFPKHLVEEAERTMAEERVVILPPRARAHHSTVLTSVVAYPTDPRTALKTRDNSCNFALHARGGEWMRFATPGFPDSPYPAHAHCQWALRGDANSVLSLTFRSFDLAACDQRGSAVVTVYDSLSPIEPHAVVRLCGTYPPSYNLTFLSSQNVFLVTLISKSKRRHPGFEATFFQLTKMSGCGGYLHQAQGTFSSPYYPGHYPPNIDCTWNIEVPNKQYVKVRFKVFYLVEPNVSPVICTKDYVEVNGEKHCGEKSEFVVTSNSSKITVHFHSDQSYADTGFLAEFLSYDSRDPCPGMFTCKTGRCIRNALRCDGWADCTDHSDELNCVCNATHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFKCGNGKCLPLSQQCDGKDNCGDGSDEASCDQVSTVTCTQHTYRCHNGLCVNKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGQRSFSKQSRVVGGQNADEGEWPWQVSLHALGQGHVCGASLISPTWLVSAAHCHIDDKGFRNLSFVLRFSCILSGTIYWVPGRDRQ	158639	213850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_158758_194602_194763_195115_195244_195440_195512_196436_196595_196795_196832_197071_197313_199622_199763_200167_200266_200929_201040_201145_201277_203408_203514_203776_203888_203999_204114_204482_204606_205415_205603_213205_213322_213406
765552	SIRV6	+	216	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	518	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
765556	SIRV4	-	608	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	9	0	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765562	contig_1472_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_86135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCCACCTGGGCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601432	601881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_601400_601900
765565	contig_14526_pilon	+	3144	13	Intergenic	novelGene_111204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	39.4175475588672	76	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	61	915	228114	315429	TRUE	15	CTGACAGGCCGTTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARERSGANCAAPALRPLPAMAACRSALLVGLAFSLATLLQRGFGDTGDFRLEDALQETSSVKQKWDHVATTTTRRPGTTRAPANPAGNGFDLADALDNRDDGRRKPSAGGGEDLDVHFFDPQTTPRTYPKKTDRWDRFTTTTTRRPATTRAPANLPGIDDFDLADALDDRNDRDDGRRKPSAGGGGFSDKDLENVLGGGDYKPDRNKGDGPYGGSDDPESGMSAEAGTIAGVASALAMALIGAVSSYISYQQKKFCFSIQQGLNADYVKGENLEAVVCEEPQVKYSSLQAQTAQPPAPEPPRI	228053	317981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_228181_269734_269798_283300_283373_284379_284455_290093_290157_290999_291072_291198_291286_295098_295165_300709_300749_301280_301401_314249_314316_315364_316291_316613
765566	contig_5502_pilon	-	1626	8	Intergenic	novelGene_155005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	187.799176282126	264	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	195	1196	462262	449795	FALSE	75	TAGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGRRQRRHLTGLPVSRRLVVALPPGFGTCLRLLGRGAWKEAYRGDSRTIRGRSGPPLAAPRSAMSWMFKRDPVWKYLQTVQYGAHGNVSRLSYPTFFPRFEFQDIIPPDDFLTSDEELDSVLFGTLRGHVVGLRYYTGVVNNNEMVALQREPDNPYDKNAIKVNNVNGNQVGHVKKDLAAVLAYIMDNKLAQVEGVVPFGANNAFTMPLHMAFWGREENRKVVLDQLKKHGFKLIPPPKTLGFSLESNWGSGRAGPSYSMPVHAAVQMTTEQLKTEFDKLFEDLKEDDKTHEMEPAEAIETLLLPHQKQALAWMVSRENSEDLPPFWEQRNDLYYNTITNFSEKDRPENVHGGILADDMGLGKTLTAIAVILTNFHDGTPLPVERIKKNQLKKVKY	462456	449364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_449903_452469_452662_452815_452891_454154_454253_455347_455482_457100_457268_460885_461094_462242
765567	SIRV1	+	211	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTACGGTAGGAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
765568	contig_1154_pilon	+	2901	4	Intergenic	novelGene_87036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAGAATTTGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37226	43983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_38923_39048_39133_39652_39798_43007
765578	contig_15596_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_139552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAACAAAAATCGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212905	214984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_212900_215000
765580	contig_10074_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_57095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATGTTCCTCACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180437	181937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_180400_181900
765581	contig_3103_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_146201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCTCACGAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88250	89629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_88200_89600
765591	SIRV4	-	262	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1256	3	1256	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
765595	contig_6589_pilon	+	384	2	Intergenic	novelGene_25803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	671060	672840	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPHGALPHPLLPLLHPVHVPALYHEARRALLCHWLLPALRGSIHWSPDLCHPLQGDPEASPAWGQLRLLLCPGLGGLPPCPGQRHHLHPPAEAGVSTLRCLLPALPLHPEAPVPDCLPENKTI	671059	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_671182_672584
765598	contig_10042_pilon	-	1132	11	Intergenic	novelGene_79213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTTTGATGGTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090338	1060020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1060076_1062018_1062109_1066549_1066663_1067524_1067618_1069287_1069366_1072054_1072114_1076254_1076351_1082121_1082217_1082806_1082866_1084868_1084992_1090067
765599	contig_9471_pilon	-	966	7	Intergenic	novelGene_21842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCCCAGCAATTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417520	413990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_414084_414633_414728_414804_414930_415618_415741_416201_416276_416937_417026_417150
765600	SIRV1	-	180	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	2	3648	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765601	contig_15185_pilon	-	1912	6	Intergenic	novelGene_99399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	28.3097156467528	117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	530	859	171550	170451	TRUE	35	TAAAAATATTATTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPKECEEWVGSAYLFVESSVDKVILSDTYANPQKKVAVYSALRTALAESSGSPDQLQMLKIHRSDPQLILQLRFCGRQPCDRFLRAYREGGRCAPRCRGAWRRHLP	175172	169134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_169937_170077_170160_170200_170269_170349_170630_171399_171559_174651
765602	contig_5566_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_153664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACATAAGAAGACATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182573	181031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_181000_182600
765609	contig_6710_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_94726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653358	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
765610	contig_11538_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_152298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCCAATAATATTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210392	208892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_208900_210400
765611	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765612	contig_13645_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_146164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTAAAAAAAACAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18330	19928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_18300_19900
765618	contig_10331_pilon	+	2427	4	Intergenic	novelGene_54049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1980	junction_2	578.263492420771	35	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	1113	2189	22053	28575	FALSE	65	AAAAAAAAAAGATTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLRHCSSGGKFVTSPRFMVISPSGFTASPPEGNNSSNLIPQRMIAHMLRSRSLPAFPTSSPLMQPRKLTTSLGSSIDKLQNIADSYVATQPEKWDPLGSSEILKKGKEDALISSCESAKTVCETEAVLSAQTSVSGVPKGKVVFPVVEVDHKEVGSELRSDDDSPGDESCPRRPDFLKGLASFQRSHSTIASLGLAFPSQNGSAAVGRWPSLVDRNADDWENFAFSLGYEQNYNRTANAHSITEDCLVPICCGLYDLLSGVLLILPDIMLEDVMDKLIQADTLLVLVNHPSPAIQQGVIKLLDAYFNRASKEQKDKFLKNRGFSLLANQLYLHRGTQELLECFIEMFFGRRIGLDEE	20940	28813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_22150_25154_25783_26519_26698_28401
765619	contig_10689_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_118606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGAAAAAAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44584	42180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_42200_44600
765620	contig_8322_pilon	-	2021	2	Intergenic	novelGene_143222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150345	134775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_135955_149503
765622	contig_5039_pilon	+	774	2	Intergenic	novelGene_65059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACCGTGAGTCAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829906	1858878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1830522_1858719
765629	contig_11574_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_64077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATGTTATTAAAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450036	449231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449200_450000
765630	contig_11574_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_64056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAAACTCAATTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448093	447841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_447800_448100
765631	contig_12250_pilon	+	741	3	Intergenic	novelGene_80592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1504	junction_1	74.5	325	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAATCTTTTTTGTATCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322739	332463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_328400_328687_332096
765636	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
765639	contig_5317_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_76616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTCTTCTGAACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763864	763436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_763400_763900
765644	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	8	1159	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
765645	contig_7171_pilon	-	1067	10	Intergenic	novelGene_101196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_9	391.931116396746	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	357	821	49603	37659	FALSE	0	CTTGCCCTGTGTCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50446	37412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_49818_50062_50264_50365
765650	contig_15114_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_121179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658860	656476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_656500_658900
765651	contig_6488_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_44712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3088	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	491	838	28952	28605	NA	10	CCACAGGTGGTTTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLVPLPHRHLLIYRCSPALPPPPHPWLTAHIHEMQVLFPPGDYRAVVQGTFPSLGSRTVEVVCAVPFSAPVQPVAGDPVLKWPLGEIRGQTWHRRVKEVLVLGLSKGRVSADI	29442	28388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_28400_29400
765652	contig_15066_pilon	-	1665	11	Intergenic	novelGene_149534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	138.106480658947	2	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	891	1517	113086	111830	FALSE	0	GGTCTCTTTTGCCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGWQPLPWVPPTWPWIVFCRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114602	111681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113369_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
765653	contig_8330_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_71902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATTCTGTGTCTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122442	1124813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1122400_1124800
765654	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765657	contig_8420_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_69365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAGAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193947	191072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_191100_193900
765660	contig_4232_pilon	-	2402	12	Intergenic	novelGene_63490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	372.429459736121	1	123	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	50	436	615916	614837	TRUE	50	ACAAATAAACATTTTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620477	607771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613083_613126_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
765661	contig_10436_pilon	+	1598	7	Intergenic	novelGene_108514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_3	11.8039541397505	265	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	304	1020	111967	117322	TRUE	65	TATTTAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSLLALRGFVLLRDSVECEGRSLLKALIKKSALCGEQVHILGCEVSEEEFREGFDFDINNRVVYHNLFRDPLNWSKTEEALPGGPLGALRALCRRTHPGPVTIALDSLSWLLLHLPCTTLCQTLHALSHRDFCPDGSSSVEQVCVLGLLHEELHGPGLVGALSSLAQAEVTLSGMLSQTSASIVYRRPRQRPTRQTQCFSILPDFSLNLQGVLPLESQPHPGPPTTQVSKRDRARE	111663	118574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_112013_112254_112316_112401_112483_114548_114770_116488_116671_117196_117536_118209
765662	contig_9871_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_75640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	254	403	361928	361779	NA	75	CACAAGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIYFVCKNAAFGPSNNNLCLSTFPSLHNTCRSGSTICRVVYAVPPISKPISVTDSQWWVNSTQPLALVPVEDRVLGREAPVPCIMSTTTSLHYLCPEFGECLSVGNRASKSGTWAEKGYLRPVTDQGMLHREL	362181	359848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_359800_362200
765663	contig_12596_pilon	+	2071	8	Intergenic	novelGene_172737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	39.0739748452097	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	138	968	76066	88581	FALSE	10	CATGCCTTGGTCATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSITVLCIACPCSLGLATPTAVMVGTGVAAQNGILIKGGKPLEMAHKIKTVMFDKTGTITHGVPKVTRFLLLVDVAVLPLRKVLAVVGTAEASSEHPLGVAITKYCKEELGTETLGYCTDFQVVPGCGISCKVSIMDSILTLSMQAGHQNSVGSTPAEKDTAPETFSVLIGNREWMRRNGLTISGDISDMMTDHEMEGQTAVLVAIDGVLCGMIAIADAVKQEAALAVHTLKSMGVDVVLITGDNRKTARAIATQVGINKVFAEVLPSHKLAWP	75928	89684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_+_76072_76196_76338_77721_77905_79165_79320_82278_82423_83766_83910_84844_84890_88566
765666	contig_9505_pilon	+	1202	11	Intergenic	novelGene_121846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	133.57623291589	35	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	82	666	530721	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSASSAKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530639	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_620886_620989_631447_631521_632605
765667	contig_15122_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_162707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGATTCAGGAAGACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499671	499162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_-_499200_499700
765668	contig_6069_pilon	+	1599	11	Intergenic	novelGene_8025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	129.9990769198	36	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	53	1390	171996	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGCVFLRRAHFSQLEQMLENTAVRAQKQLILLHREEGPEPARTVEWLNMRSWCSGHLHLCCPRRVFSRRSMPKLVEMYERVFQRPPDRHSDFSRLARVLTGNAIALVLGGGGARGCSQVGIIRALAEFGIPVDMVGGTSIGAFMGALYSEERNYSRMRIRARQWAEDLWLPYFTITTDITASAMRVHRDGSLWRYVRASMSLSGYMPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADVARSMGAKVVIAVDVGSQDETDLTNYGDALSGWWLLWKRWNPLATKVKVLNMAEIQTRLAYVCCVRQLETVRSSDYCEYLRPPIDSYGTLDFGKFDEICEVGYQHGRTVFDIWVRSGVLDKMLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	171943	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_172170_172421_172541_187715_187873_189403_189474_189793_189911_190478_190628_191492_191646_191883_191992_192360_192446_193297_193402_193545
765669	contig_19185_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_163662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGCGATGCCTCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160963	159543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_159500_161000
765674	contig_2463_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_43026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGGATAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518502	516691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_516700_518500
765678	SIRV5	+	410	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	886	23	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
765680	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	10	407	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765682	contig_12145_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_172324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGTACCAAAAAAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166348	165738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_165700_166300
765683	contig_7342_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_71194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	500	823	665675	665352	NA	20	CATGGGGCTCCAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGGLLVLGAGQGTQADLTGPPCPAGGDTHPSQEEARGAEQCPGRHEEGGCQEGLSAFPPLAAVPPYKLIKPFQK	666174	665351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665400_666200
765688	contig_12566_pilon	-	1665	4	Intergenic	novelGene_86018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	1340	1663	142524	128389	FALSE	10	CTCCGGCCTCGCGACGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARWKSGLFPLRTHWRVNWLTHSTSYCLSITLFDQCFPLSSSNTRRFKIFRTMCSNSLCVSSRETPSNTQRPRPMALICSPPTVTVARVTRCTTAFMTAAAAAGRRRV	197040	128386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_128464_139076_139170_142368_142603_195779
765689	contig_4924_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_84725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAGGGTTTTCATTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118979	119411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_119000_119400
765693	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
765694	contig_7720_pilon	-	1915	16	Intergenic	novelGene_155775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.171879689481	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	175	1236	860670	798987	TRUE	5	TCTCCGAGGCTCCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872309	795752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796090_798644_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_860593_860723_872187
765697	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
765698	contig_7758_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_163534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGTTTAGTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129628	130893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_129600_130900
765699	contig_4769_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_118001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1824	2135	906903	906592	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLSHTVWLRDFLEVTELVSGRAGPETPISWFPEQQAIYETCVDHLQKIAHYSESNRIWSEVRDELKSPKCCKTDQAVNILASLCSRDPPHTPPKTKPVTWS	908726	906104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_906100_908700
765704	contig_7919_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_28106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTAAGAAAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384879	1387279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1384900_1387300
765705	contig_9186_pilon	-	1178	10	Intergenic	novelGene_85345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	77.1434450300938	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	26	337	310847	298975	TRUE	25	AATTTCTGCAGCAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVHRLLVRALPMSRSGITAIATSVFHGPPRCQLHHAVMPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGMEWKRQRFYPKSSGAQQCGHQSCWARMGN	310872	274083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_302215_302387_310798
765706	contig_6102_pilon	+	296	2	Intergenic	novelGene_31798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6957	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360106_360932
765709	contig_3956_pilon	-	1693	4	Intergenic	novelGene_14712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_2	58.5396351960694	153	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	397	1551	217140	210770	FALSE	15	TTTGCCTAGTCAAGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFGKQDKATCREIVEPPQTFHQQQQQEKLPVRQGVVRSLSYEEPKRHSPPLEKQLCPAIQKLMARSADLQPLSELPENRPCENGSPRSAREIFPRLVQPACSHNIGMSHCVQSASRAQSLLEKLQSAPGAEMKYDTSTPGPSSSAAPNFSRTLTAATPVAPGKALAQPQLVYFNGSLPPETLGHQAPGKEQSAFPRTTLPLSCNQTSSCGVVSPQELLRKLQIVQQEQQLHASNRPALAAKFPAVTQSSRTAKPLESWIDKTSSTERQAPLFQVISPQRIPATVTPSLLMSPMVFTQSTSAPSKERDSGLLPLGSQEPTAASTSLFLPLKNPEPPAITSSPLTKLQLQEALLYLIQNDDNFLNIIYEAYLFSVTQAAVKKTM	219590	210627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_210851_213273_213523_216315_217174_219227
765718	contig_1150_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_61466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCAATGACATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418316	416086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_416100_418300
765722	contig_14326_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_120704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAAGGTCCCTTGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236714	236122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_236100_236700
765734	contig_15866_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_63659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACAACTTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573651	575279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_573700_575300
765738	contig_9727_pilon	+	1018	6	Intergenic	novelGene_86313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	289.320306926424	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	41	559	309192	314189	FALSE	50	TAGAAACAAACACCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308425	314648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311008_312939_312991_314078
765740	contig_1639_pilon	+	2097	11	Intergenic	novelGene_74906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_10	133.98540965344	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1450	2049	314903	329095	FALSE	55	CAATAACTATGAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTTIPLSTMVTSITTGTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAGRFFMALYAEFTKSI	309196	329143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_313997_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942
765742	contig_9335_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_147450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACACTGGCCATCCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410668	411341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_410700_411300
765744	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
765747	contig_5071_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_171283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATTTTAAAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221131	220773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_220800_221100
765752	contig_7815_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_134406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAATTACAAGACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868012	868871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_868000_868900
765753	contig_12270_pilon	-	342	2	Intergenic	novelGene_113451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	4	342	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14412	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
765758	contig_10795_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_171286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGTGCTGGGTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70545	72813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_70500_72800
765760	contig_4732_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_75376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGTACGTTTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209436	209153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_209200_209400
765761	contig_4732_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_75375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACCTTTTCTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209203	207307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_207300_209200
765764	contig_1090_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_131134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAACCACTAAACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457568	459442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_457600_459400
765768	contig_10968_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_84277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCCGGAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94243	94060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_94100_94200
765769	contig_10774_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_158670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTATTATTGTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6870	9020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_6900_9000
765770	contig_10774_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_158671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAGGTAATGTTGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9427	9831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_9400_9800
765771	contig_18251_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_50155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	1226.11732207811	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	103	612	35708	54023	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKAVHSLSSITKLLGGAELYSQPRKLDSREWFQVLH	35605	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_44812_44912_48577_48794_53919_54027_54917
765772	contig_3004_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_127523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAACTCAAAACCCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385610	386511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_385600_386500
765773	contig_3004_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_127524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTGGCCAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387070	387788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_387100_387800
765774	contig_13048_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_138937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGCAATGATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501276	501591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_501300_501600
765776	contig_5499_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_56993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	329.334514167923	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	134	787	803476	840336	FALSE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKCTHF	803342	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_827980_840320
765778	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
765779	contig_5936_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_53584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATTCTCAACAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389295	390799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_389300_390800
765781	SIRV4	-	310	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1213	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3945	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
765782	contig_13633_pilon	+	1706	12	Intergenic	novelGene_15316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	442.738883551315	2	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	379	489	22853	28350	TRUE	15	AACTCTGCCTTTCGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	5037	49487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_39324_39433_49019
765783	contig_16492_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_100293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAATATCTGGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134293	132137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_132100_134300
765786	contig_1406_pilon	+	2283	2	Intergenic	novelGene_25468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGCAAAAACCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830483	832881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_830758_830872
765789	contig_6192_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_170344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTTGCCTCATTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830269	831017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_830300_831000
765793	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
765796	SIRV6	+	496	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	45	20	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765804	contig_13707_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_43524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTCGAACACCAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134814	133638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_133600_134800
765808	contig_3081_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_133962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACACAGCCAGGAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138871	1138526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1138500_1138900
765809	contig_9683_pilon	-	2031	2	Intergenic	novelGene_151277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	591	1076	483731	482321	FALSE	0	CTGCCTTTGTTTCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSFCLCPVTSLLGWDRIAAQDYIVGAFRKFATDNSCHVTLVIHPRKEDDDKELQTASIFGSAKASQEADNVLILQDRRLVTGPGKRYLQVSKNRFDGDVGVFPLEFNKSSLTFSIPPKSKARLKKIKDDNGLVAKKPSSGKKGAVSQNSETCLDQAPNA	484321	481365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_482612_483536
765810	contig_6710_pilon	+	534	2	Intergenic	novelGene_97196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653378	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
765814	contig_8552_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_80075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1258	1680	462647	463069	NA	65	TTGGAAAGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVKRKSYTADFKLKVVTRAEETSNRVAASEFDVGESSIREWRKEKKELEKMNPRKRARRGPKAKWPELENNLKEWIISRREQNQAVSTVAVQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRSGLPLRMRTTVGLQVPDD	461389	463463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_461400_463500
765816	contig_17753_pilon	-	2534	3	Intergenic	novelGene_105087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	514	1089	89088	88513	TRUE	15	GAAACCCTGTGGGGCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLLEAGVLFAGCKLHLQDCLGLCLALPLPSWATLRKFLTPLCFRFLSEKIGMIVTHSVLIKSLKKPKLVSEGIRQTNARQTVLGAFGKAHGEGEWGSEGQSKKEGDQSIWGRMKRVLEQRRPLRRAFVAQRTCRQCWGCRGWRWRLCPGHCTNKDMETWNAGPLVSHWAGENTEGPAAASAASWGDRLD	89601	82464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_82569_84567_85274_87877
765817	contig_18859_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_150531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAGCACCATACTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41524	39482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_39500_41500
765821	contig_3789_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_79892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589618	587783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_587800_589600
765822	contig_10494_pilon	+	1630	10	Intergenic	novelGene_102224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.5722588773235	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	868	1266	1297715	1303944	FALSE	20	AGTGATCATTCCTGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDGRYWIRGRTSVDIIKSGGYKLSALEIEQHLLAHPSITDVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLRDGHSLSQQELREWARGVLAPYAMPSELLVVEEIPRNLMGKINKKELLCQFYPRDPGPPAGVQISGRAG	1240322	1304308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1240390_1255279_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259841_1259993_1277331_1277445_1283905_1284033_1297703_1297839_1298214_1298327_1303781
765825	SIRV4	-	263	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1260	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3898	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
765826	contig_15866_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_63596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	375	833	248830	248372	NA	55	GTTGAGGATCAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKELLYPILTKAVRSGSSFLFPLGRIQFLHKSSELGCDSYVFSLGKTPPTGSIKAGEVGRSPPSREKSRKITRPEPAGAVEHLKWSIHTHHLLSRFGLPAAVFLKTMRLRCDKATWQYTTSSIKMVLHSLCPSISLLEIYPKEITQQGKYG	249204	247912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_247900_249200
765829	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765831	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
765832	contig_15918_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_132723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAAGAAGGGAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215487	216143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_215500_216100
765835	contig_15354_pilon	-	2230	3	Intergenic	novelGene_65716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	368	1510	224900	223758	FALSE	30	AGTAACTGGAATGCTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQGLAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	227760	223037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_224922_227372_227660_227701
765836	contig_19850_pilon	-	1834	6	Intergenic	novelGene_170860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	46.5557730040003	13	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	111	446	39513	37764	TRUE	50	TTTAAATTTTTAAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRQHTVFLKKMTQFILQEMPKARYSSLLNDFVESNYFVIDGDSLLVTCLGDKSFKRGQDLHFFYLVECYLVDLMRNGAQFGIIFFEKVLYEMKHTNPKCTTQHLTYALR	39623	29544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_30478_32120_32463_37650_37836_38256_38447_39010_39081_39509
765842	contig_10196_pilon	+	936	4	Intergenic	novelGene_132109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	67	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	280	654	925908	926282	FALSE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGQAGGSSWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	922243	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925756_925882
765843	SIRV1	-	212	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3596	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
765844	contig_14681_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_134201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33171	30805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_-_30800_33200
765845	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_96366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653855	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
765847	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	528	51	528	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10765	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
765848	contig_18794_pilon	-	2501	6	Intergenic	novelGene_54665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	51.8281776642783	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	333	848	349249	330020	FALSE	20	GCATTATTTCCCAGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLVSDWASFSQDLLPGGH	404718	328366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145_353212_404550
765850	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765852	contig_7004_pilon	+	1337	4	Intergenic	novelGene_126462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_2	97.3390409285446	20	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1278	59	1336	392109	395662	FALSE	35	CCCTGGAGAAAGATTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFTTFFCETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEIRNGPYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDPVLDRIRKLSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMA	392050	395663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_392112_393837_394061_394364_394514_394759
765853	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
765856	contig_2894_pilon	-	1072	5	Intergenic	novelGene_86531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.18928343562	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	260	784	136491	133851	FALSE	20	GAGATTGGGTTGAGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCRSEVLEVSVEGRQVEEALLAVLHTVLLHRSTGKFHYKKEGTYSIGTVGTQDVDCDFIDFTYVRVSSEELDRALRKVVGEFKDALRNSGGDGLGQMSLEFYQKKKSRWPFSDECIPWEVWTMPTQSEVDNVFDTGLRDVQPYLYKISFQITDALGTSVTTTMRRLIKDTLAL	140031	133562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_134007_134138_134256_136239_136566_139540_139665_139970
765860	contig_7035_pilon	-	1779	10	Intergenic	novelGene_83543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_9	29.6339811619393	439	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1515	263	1777	777106	773698	FALSE	5	CAGCTTGTCTGGTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVQGLQRLLEQARSPGELLRWLGQNPTKVRAHHYPVALRRLGQLLGSQPRPPPVEQVTLQDLSQLIIRNCPSFDIHTIHVCLHLAVLLGFPSDGPLVSALEQERRFRLPPKPPPPLQPVFRGGQRLEAALSCPHFLRHPRQHLIRSLAEARPEELTPHVMVLLAQHLARHRLREPQLLEAIAHFLVVQEAQLNSKVVQKLVLPFGRLNYLPLEQQFMPCLERILAREAGVAPLATVNILMSLCQLRCLPFRALHFVFSPGFINHISGTPHALIVRRYLSLLDTAVELELPGYRGPRLPRRQQVPIFPQPLITDRARCKYSHKDIVAEGLRQLLGEEKYRQDLTVPPGYCTDFLLCVSSNGAVLPVRTQDPFLPYPPRSCPQGQAAWNPTTQDPTQRVVLMLRERWHFCRDGRVLLGSRALRERHLGLMGYQLLPLPFEELESQRGLPQLKSYLRQKLQALGLRWGPEGGGEGKHSGLRWPPHGGQTVCTLAPILVLIKGPFLP	778120	773695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_773905_773980_774096_774171_774308_774390_774483_774702_774863_774962_775177_775690_775831_775985_776166_776835_777260_778011
765863	contig_13224_pilon	-	1557	7	Intergenic	novelGene_104102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	34.3689136025889	188	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	396	791	263277	262566	TRUE	5	CACTGTTGTGTTGTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGQGNPQIWRVVQGSSARAHVLSWYQQLKGSGPTFLLSQREGPPPTYGLGVNPRFLAELGLAQNGACRTVGNASPADEGICYCAMWFSGQCIFGEGTRLLYQERMLEAPREDTCGRDKLRVHALLNKLG	283308	260545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_260922_261650_261717_262070_262365_262535_262649_262964_263325_281780_282020_283199
765868	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765875	contig_8330_pilon	-	1470	2	Intergenic	novelGene_71750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCGTGCCTATTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566391	555097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_556288_566111
765876	contig_5690_pilon	+	1447	10	Intergenic	novelGene_119738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	581.69694286057	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	561	965	1088292	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044685	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073887_1077645_1077744_1086506_1086568_1087638_1087806_1088266_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
765879	contig_8228_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_81788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTTGCTTTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186942	184457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_-_184500_186900
765883	contig_20609_pilon	+	1165	10	Intergenic	novelGene_118475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.3613512519004	152	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	126	1025	48974	59181	FALSE	10	CTCATGCCTGCTACTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVWLAPGGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKERAMSTTSIPSPQPGETKGATFRCSELRQLCLAAFMTKVRLDLGDFEGKERVSGAGSVALSLEGVGGGE	43718	59321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52522_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56594_59020
765885	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	447	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
765893	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
765905	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765906	contig_19237_pilon	-	1176	5	Intergenic	novelGene_162955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	786	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGCTGGCGGAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45329	23855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_23990_28456_28658_35763_35862_39430_39515_44670
765910	SIRV6	+	289	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8143	-1	596	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
765912	contig_7357_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_36846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTTCATTCTAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158734	160959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_158700_161000
765913	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	490	11	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
765916	contig_10629_pilon	+	1890	5	Intergenic	novelGene_52956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	192.679786173849	814	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	83	1336	447968	452372	FALSE	20	AACATTTTTGTGTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATVVAQKKFSVTIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGRDKVTFTFEAGRRCFSGEGNFEFETQQGNEIFLALEEAISAQKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447885	452926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_450546_450732_451751
765920	contig_15327_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_70574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCTCGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691679	691287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_691300_691700
765925	contig_8671_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_126251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGTTGCTATGAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450585	452521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_450600_452500
765926	contig_8671_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_126252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCACCCAGAGGCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452536	453244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_452500_453200
765927	contig_10217_pilon	-	2373	5	Intergenic	novelGene_87403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAATGAGCTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92677	72373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_72501_72634_73961_79664_79875_90575_90774_92165
765928	contig_10217_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_87402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAAAATGGCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72414	71001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_71240_72373
765930	SIRV4	-	343	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	20	1158	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
765931	SIRV4	-	581	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	35	1	35	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	224	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5123	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765933	contig_15952_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_154065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAGGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276508	278734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_276500_278700
765936	SIRV4	-	305	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	309	3	-309	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGTTGGACGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765938	contig_6233_pilon	-	1276	8	Intergenic	novelGene_74782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	322.002598544465	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	253	1095	149777	136863	FALSE	30	CACAAAGCTTTGGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELSLCCEEAQATWRSHV	250338	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136911_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250178
765940	contig_6069_pilon	+	2093	8	Intergenic	novelGene_8016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.2107839771171	207	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1368	2030	106777	117589	FALSE	10	GGCTGCCTCACCTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVCSIQSNPHRENILATGSYDEHILLWDTRNMRQPLSDTPAQGGVWRLKWHPSHPHLLLAACMHRGFKVLHCQKAMEEKQDTCLVSVSHTLHSSLTYGADWSWLSLQPSPKAQPLVPSASFLHSDTGARPADLLHSLKVQGTSVATAPDRVGDEDGEGQASQAQHVADDVRKVGSQLHVAGGKPCDYDATLEGMNLDISLLATCLFYDHALHLWKWEVS	100172	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_100537_101282_101420_101799_101828_104035_104794_106623_106697_106769_106836_107053_107227_117158
765942	contig_19769_pilon	-	2511	3	Intergenic	novelGene_102336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	4	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	111	2150	147950	138557	FALSE	30	GACAAGCATAGTAGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPRARPEEVEMEPVAPGPSPGTPSAQACSPAVTYPGSALLSPVCCSDTEPGAVPPHRHHSDYDIGTEDKEFLQKEDVSEDLESEAEIAENYVSDASQAPELRELRDDILEGDWRVSDGERLVQSLCREGDFTPMTVLFKETPIEEKNLDCNGFGRHFSLSPNPIACPGIPAEERPCPYSTCGQSFHYSTDLTGREEGHTTDSPFICSECGKTFRGSSGLTQHQIIHSGGKSFVCNECAKAFSQNSVLKNHWRAHLSEKPYQCSECGKAFNVRSNLVRHQINHSGEKPHVCNECGKAFSQNSSLKKHQKSPMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGDKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRIHTGEKPFECNECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYECGVCGKAFSHSSALVQHQGVHTGDKPYECRECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKSFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYGCTTCGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE	151595	138195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_140410_147763_147960_151494
765945	contig_20614_pilon	+	817	8	Intergenic	novelGene_107544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1232.26695027283	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	83	724	152671	155100	FALSE	25	GATAGTTTGTCTTCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGMKCIKFLLYVFLLAFCACAVGLIAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152030	155193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152659_152737_153645_153778_154024_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
765946	contig_3335_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_165001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	359	1080	292	1371	326940	325861	NA	5	TGTTGTGCCTCTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADYSTLRAHHRIHTGERPYECNECGKAFAQNSTLRVHQRIHTGEKPYECNDCGRYFAHNSALRVHKRIHTGEKPYECNVCEKTFAHNSALRVHQRIHMGKKPYECSDCEKTYSHSSALRAHQKMHTGEKLYQCNECGKTFSQKTHLNTHHRIHTGEKPYECNECGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNECGKTFVYKAALVVHQRIHTGEKPYGCNECGKTFSQRTHLCAHHRIHTGEKPYGCNECGKTFADNSALRAHQRIHTGEKPYECSECGKTFSKTSHLTAHLRIRTGEKPYKCNECGKTFSQKSYISAHQRIHTGEKPYGCNICGKTFGHNSTLRVHQRIHTGVKSYECNECGKTFSQKSHLSAHLRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVHQKIHTGEKPYECNECGKTFVRKAALRIHHTRIHTREKILACNEFGEGLMKEVLPY	327231	324914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_324900_327200
765947	SIRV6	+	418	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	462	-2	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAGACTGTATCGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
765951	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4544	34	3369	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
765953	contig_11253_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_126839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAATCCTTACACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193367	192191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_192200_193400
765957	contig_13456_pilon	+	2732	18	Intergenic	novelGene_153313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_17	41.9127450865729	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	11	2437	593256	640368	FALSE	30	TAAGATTCTATAAGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTLLSSAWFPLDLSAHQDALTLAGNLLAASAPKSLRSSWTAEEEANPAATKQEEVWPALSDRTLVPMVEQLFSHLLKVINICAHVLDDVAPGPAVKAALPSLTNPPSLSPIRRKGKEKEAGEQASAPLSPKKGTEAGPASRQSDTSGPVTTSKSSSLGSFYHLPSYLKLHDVLKATHANYKVTLDLQNSSEKFGGFLRSALDVLSQILELATLQDIGKCVEEILGYLKSCFNREPMMATVCVQQLLKTLFGTNLASQFDGLSSNPSKSQGRAQRLGSSSVRPGLYHYCFMAPYTHFTQALADASLRNMVQAEQEPDASGWFDVLQKVSSQLKTNLTGVTKNRADKNAIHNHIRLFEPLVIKALKQYTTTTSVQLQKQVLDLLAQLVQLRVNYCLLDSDQVFIGFVLKQFEYIEVGQFRQSEAIIPNIFFFLVLLSYERYHSKQIVGIPKIIQLCDGIMASGRKAVTHAIPALQPIVHDLFVLRGTNKADAGKELETQKEVVVSMLLRLIQYHQVLEMFILVLQQCHKENEDKWKRLSRQIADVILPMLAKQQMHIDSHEALGVLNTLFEILAPSSLRPVDMLLRSMFVTPSTMASVSTVQLWISGILAILRVLISQSTEDIVLSRIQELSFSPYLISCPVINRLREGGSNSTPEEHSEGRETKNLPEETFSRFLLQLVGILLEDIVTKQLKVEMSEQQHTFYCQELGTLLMCLIHIFKSGMFRRITAAATRLLTSDSSDGSFYALEGLNSHVRAMIPTHPSLVLLWCQLLLLANYTDYRWWAEVQQTPKCSPPALGPACSGRPVPF	593245	640663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_593347_594950_595154_597676_597804_598768_598897_604105_604217_613837_613916_614487_614712_616412_616492_616647_616810_619513_619570_620493_620643_622203_622341_624626_624744_628012_628136_628469_628706_629889_630033_638087_638296_640313
765962	contig_5394_pilon	+	1714	2	Intergenic	novelGene_172740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATAGTAATTTTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18252	20747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5394_pilon_+_18719_19499
765963	contig_9297_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_69812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTTTGAAAATGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300112	301666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_300100_301700
765964	SIRV4	-	201	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	413	3	-413	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAACTATCGGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
765966	SIRV6	+	545	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	14	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
765970	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
765971	contig_14275_pilon	-	1815	2	Intergenic	novelGene_162881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	77	853	484731	471853	FALSE	45	TTAAAAAGGGTCTGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGAAGRQPIGAPPAGNSWHFSRTMEELVHDLVSALEESSEQARGGFAETGDHSRSLSCPLKRQARKRRGRKRRSYNAHHPWETGHCLSEGSDSSLEEPSKDYRENHNNNKKDPSDSDDQMLVAKRRPSSNLNNNVRGKRPLWHESDLAVDNLGNRTLRRRRKVKRMAVDLPQEVSNKRTVTQPLEGCRDQDMDNDRAYQYQEFTKNKVKKRRLKIIRQGPKIQDEGVVLDSEEISQINKDKMEYEEQKVSDELMSER	484807	470890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_472574_484675
765973	contig_18108_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_33435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGTTTGGTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42230	40567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_40600_42200
765974	SIRV4	-	300	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1218	3	1218	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3940	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
765979	contig_3571_pilon	-	2305	9	Intergenic	novelGene_88701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	26.5279922911629	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	38	1444	100098	30560	FALSE	60	GAAGGAAAATGAAACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWSTTTTTRPPGTRQQACSTSAAGTALPPWEARCSSAGATTALASSALPRCTARWQTSGA	100135	29698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_33384_33490_36653_36877_38625_38763_40254_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_99969
765983	contig_91_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_127101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTTGGCAATTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333930	331713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_331700_333900
765984	SIRV6	+	565	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1239	165	1	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAAATAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	10803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10200_10800
765985	contig_3601_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_132915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATCTAAGTAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259791	261822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_259800_261800
765987	contig_8017_pilon	+	1923	15	Intergenic	novelGene_65360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	250.434082328737	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	208	1365	964053	989770	TRUE	15	GTGCTGTGTGCAGTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKVIDRRVRELFVQSEIFPLETPAFAIKEQGFRAVIISGGPNSVYAEDAPWFDPAIFTIGKPVLGICYGMQMMNKVFGGTVHKKTVREDGVFSISVDNTCSLFRGLQKEEIVLLTHGDSVDKVADGFKVVARSGNIVAGIANETKKLYGVQFHPEVGLTENGKVILKNFLYDITGCSGTFTVQNRELECIREIKDRVGTSKVLVLLSGGVDSTVCTALLNRALNQDQVIAVHIDNGFMRKRESQSVEEALKKLGIQVKVINAAHSFYNGTTTLPISDEDRTPRKRISKTLNMTTSPEEKRKIIGDTFVKVANEVIGEMNLKPEEVFLAQGTLRPDLIESASLVASGKAELIKTHHNDTELIRKLREEGKVIEPLKDFHKDEVRTLGRELGLPEELVSRHPFPGPGLAIRVICAEEPYISTYFATESQSLYNRRGSGEADADYQPAFPECLPAAN	959748	1001888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_959847_963943_964059_971099_971198_975239_975344_978441_978636_978874_979041_981558_981711_982218_982393_984485_984592_986962_987011_989660_989787_993537_993654_997251_997383_1000526_1000700_1001766
765990	contig_13699_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_158326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	30	533	73682	74185	NA	40	GTCCAGGTTAACATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KERVNSGCVMMENKLEGIGQFHCRVREMFSQLADLDDELDGMGAIGRDTDSLQSQIEDVRLFLNKIQVLKLDIEASEAECRQMLEEEGTLDLLGLKRELEALNKQCGKLTERGKARQEQLELTLGRVEDFYRKLKVLNDMTTAAEEGEALQWVVGTEVDVINQQLADFKVSLMLVC	73652	75758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_73700_75800
765996	contig_18859_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_150550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	800	1132	148233	147901	NA	50	GCCATATAATGAGATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILLEVSQGQFSLRIGWFVFKTKQSIVYYMYLFMYLFVCYIYTLLDIVQMVKYLTTSQKVGGLNLPRGALEDRPGNLLLKSHSLKNPMEQFYCAHVRLPAMSWNQLDSN	149032	147462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_147500_149000
765999	contig_11321_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_86643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGATTTCCACTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6730	5047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_5000_6700
766002	contig_15410_pilon	+	2789	16	Intergenic	novelGene_130635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	64.4517390507554	123	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1577	2518	230128	233096	FALSE	20	GCTGAGGCATGGATTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASSQRPEQDTWAAQEQELESLREQLEGMNHNIEEVKANMRTLGISLVQVETECRQSELSTAEQEQALRVKSRAVELLPDGAANLAKLQLVVESSAQRVIHLAGQWEKHRVPLLAEYRHLRRLQDRRELESSRRLAEIQELHQSVRAAAEEARRKEEVYKQLVSELETLPRDVSRLAYTQRILEIVGNIRKQKEEITKILSDTKELQKEINSLSGKLDRTFAVTDELVFKDAKKDDAVRKAYKYLAALHENCSQLIQTIEDTGTIMREVRDLEEQIETEMGKKTLSNLEKIREDYRALRQENAGLLGRVREA	210425	233367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_210553_211571_211750_226511_226645_227415_227523_227655_227723_227809_227990_229343_230158_230251_230372_230974_231095_231175_231293_231397_231500_231582_231691_231968_232065_232319_232380_232459_232535_232982
766004	contig_11448_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_66413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGCAGTGCCACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531280	531818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_531300_531800
766005	contig_13528_pilon	+	1000	7	Intergenic	novelGene_66870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCCACAATTTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39844	47700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_40285_41023_41142_43528_43584_45852_45928_46531_46612_46739_46867_47595
766006	contig_6710_pilon	-	416	2	Intergenic	novelGene_98236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	AGGCCTCTGGCCCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
766007	contig_10246_pilon	-	2044	4	Intergenic	novelGene_46914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	353	667	176485	175079	TRUE	40	GAAGGTTATGGGACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTQTVFLSRKGLQRDALRNAQTFLTWTFTTPDRTPGVPTWLQCIMFCTEVPAGECVIYTSTLDHIQIFLIKSTQNKHDIFTQLPQNDLATNMGTQPLHNCILR	176837	168567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_169781_171153_171286_175046_175202_176293
766013	contig_15897_pilon	-	929	4	Intergenic	novelGene_49504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	271	489	74934	72639	FALSE	65	GTTCCAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDFFDHFSISSYHNPNSKPRHRYLYFKWVSSDSKRLVCSRRQWAILDHNHFHTCPLLQLLYCFPSFADHQTHFRRWDKNLLDCAVSVYVIMKARSIPTAVHNLPQEPFGLFNTFWGSGKYTGPLWNPRTLYKKNQEDDVCWWASGNCVPLPLCTDCLSVAGV	80311	72198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_72797_74873_75035_78112_78217_80245
766014	contig_9375_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_136039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTTTTCTTCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122055	123406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_122100_123400
766015	contig_9375_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_136040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTATATGCCTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123510	124041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_123500_124000
766016	contig_1836_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_71088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATATGGATTTCAGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139326	1138786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_1138800_1139300
766017	contig_10058_pilon	+	2787	8	Intergenic	novelGene_67663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.64130361329658	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	382	600	24288	26724	TRUE	15	CATGTTACGCCTGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVSSPYEGRVEQPPPPRDPLDGAVLLRNAVQADEGEYECRVSTFPAGSFQARLRLRVLVPPLPSLNPGPALEEGQGLTLAASCTAEGSPAPSVTWDTEVKGTATSRSFKHSRSAAITSEFHLVPSRSMNGQPLTCVVSHPGLLQDQRITHILKVAFLTEASVRGLEDQKQWHVGREGAMLKCMSWMGPCPVGSEWKGPP	22197	30538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_22373_24081_24373_25559_25644_26674_26824_27068_27226_27869_27946_28360_28436_28758
766018	contig_4125_pilon	+	3455	4	Intergenic	novelGene_25232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2756	3178	2230214	2230636	TRUE	20	GGAAACTCTGTGGGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGGADSRSPGTELCACVRVCMRACGVSMYTSMCTYMYVRTCVCAYVCTCVCTLHQLLVLESGLCSAEWNAQPSPTKRAVGGPGQIATSLTPHRQGGHHQAGPRVDENDPPFAEGKWDEKYCCVSFWRPIFNAGNSFSH	2226424	2233948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2229036_2230069_2230686_2232768_2232845_2233796
766019	SIRV6	-	354	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	2	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGATACGTCCCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	2779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
766025	contig_6568_pilon	+	1816	6	Intergenic	novelGene_152867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	17.8280677584532	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	583	1578	163689	181774	FALSE	20	CTGGACTTAGTGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEMYVPRVVTSAQQKAGRTITARITGRCDFASKNRISSGLAIMGVSPPMSSVVVEKHHPVTVQTIPQATAAKYPRAIHPEGSASASRSLGTRSAHTQSLTSIHSIKVVD	163106	182012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_163740_165393_165574_169003_169158_172556_172847_178799_178977_181630
766026	contig_5484_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_151103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTGACTGAAAAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289909	289507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_289500_289900
766027	contig_7396_pilon	-	1754	12	Intergenic	novelGene_79592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3473.35956880581	1	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	58	1212	254680	246442	FALSE	25	AGTCATTTTTCAAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEVGSCFLFIYLNTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	255142	245899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_251417_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105
766037	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766040	contig_18272_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_7004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154558	152796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_152800_154600
766041	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_97135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
766049	SIRV6	+	380	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	0	403	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766050	contig_20748_pilon	+	1609	5	Intergenic	novelGene_138175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_4	125.575425541783	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	122	754	149380	168022	FALSE	10	TACCCCTTCCTCACTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIARVADGLPLAASMQEDEQSGRDLQQYQSQAKQLFRKLNEQSPTRCTLEAGAMTFHYIIEQGVCYLVLCEAAFPKKLAFAYLEDLHSEFDEQHGKKVPTVSRPYSFIEFDTYIQKTKKLYIDSRARRNLGSINTELQDVQRIMVANIEEVLQRGEALSALDSKANNLSSLSKKYRQDAKYLNMRSTYAKLAAVAVFFIMLIVYVRFWWL	149258	168877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_149440_158593_158704_161658_161820_164010_164158_167867
766051	contig_3797_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_120116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTATGCCATACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563001	561170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_561200_563000
766054	contig_8027_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_158830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCCAGCACCATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224361	222131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_222100_224400
766055	contig_7887_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_124850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70730	72774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_70700_72800
766058	contig_10882_pilon	+	1287	4	Intergenic	novelGene_172751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	79	489	25782	29543	TRUE	30	AGTTGCAGCAGGCTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDKYNGNRVDYDHSPTNHRFLYKSIHSKFLPQRFVQNSETPVTLPEILQQVPHLPSGIPCALCFLALRTSFAETKKMRFFASKGSTTLSSSTKKFRHLSMCCLRTSSIYSGSDAEASQRLFKIKILGLESRSFTL	25703	31556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_25946_26093_26245_29447_29557_30771
766059	contig_15304_pilon	-	788	2	Intergenic	novelGene_30662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10721	junction_1	0	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	50	646	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	106357	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040
766060	contig_1244_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_37957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTTAACAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887706	887198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_887200_887700
766061	contig_1244_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_37956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887140	885817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_885800_887100
766068	SIRV4	-	419	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1102	0	1102	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4056	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
766069	contig_9895_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_144716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTGCACAACATTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525637	526087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_525600_526100
766071	contig_16930_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_139167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGCCCTTACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215864	218557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_215900_218600
766072	contig_15236_pilon	-	1953	2	Intergenic	novelGene_141648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1763	junction_1	0	71	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTGAGGGAGAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685425	682853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_683475_684093
766074	SIRV6	+	349	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3143_10705_10819_11031_11109_11205
766075	contig_18869_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_56328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	73776	73462	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73779	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
766078	contig_13680_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_149580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTACTAGAAAAGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292098	293776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_292100_293800
766079	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766080	contig_10968_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_84281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGCTCCCATTGGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115844	118030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_115800_118000
766081	contig_16098_pilon	-	1415	8	Intergenic	novelGene_45791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	418.010838644753	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	205	378	36010	35560	TRUE	5	CTGGTGTGGTCTGTAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKGLPEPVLTPTQPCQGREPRDPPGGHSCPRSRFPSLAPCWAQSEPCCSSALRGLQRDSQAWSNISLQMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPRE	36214	31104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31632_32109_32173_34565_34799_34989_35100_35296_35603_35720_35749_35907
766082	contig_6344_pilon	+	1885	6	Intergenic	novelGene_157115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	38.6025905866433	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	176	778	1176029	1196280	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGVDDSTGVINCICWKKLSDIRSSSAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALR	1175402	1197387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1175515_1175965_1176162_1179726_1179823_1183172_1183242_1195076_1195254_1196152
766083	contig_13366_pilon	+	731	2	Intergenic	novelGene_99768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40204	44172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_40317_43553
766084	contig_6710_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_89109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653630	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
766089	contig_19680_pilon	+	1434	6	Intergenic	novelGene_132017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2034	junction_5	853.488043267157	4165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	271	477	215487	216765	FALSE	15	GTTCGCTGGTTTCGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQAIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSDSALGHVNCTIKELRRLFLVDDLVDSLKFAVLMWVFTYVGALFNGLTLLILALISLFSVPVIYERHQAQIDHYLGLVNKSVKDVVAKIQAKIPGLKRKAE	203224	217722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_203344_207103_207243_215474_215545_216030_216078_216275_216335_216722
766091	contig_14333_pilon	+	2252	2	Intergenic	novelGene_49093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	744	junction_1	0	37	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	98	349	288895	290167	FALSE	60	CATTTAGTTAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSSWRAAVDGVLSKYVITVDSRFTEDEQRTNMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDK	288797	292070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_289036_290056
766092	SIRV1	-	235	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	5	3590	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
766096	contig_13699_pilon	+	466	2	Intergenic	novelGene_158338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_1	0	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	172	348	137581	137757	FALSE	60	AATTAAAAAAAAAAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSQSEAKNPRINQLSARWQQVWLLALERQRKLNDALDRLEELKEFANFDFDVWRKKYMRWMNHKKSRVMDFFRRIDKDQDGKITRQEFIDGILASSESSRNSKHRSHLGLLALTL	135766	137875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_135890_137532
766099	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
766100	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
766101	contig_16541_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_126720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	507	818	187149	186838	NA	20	CAGACATTGGGTCTGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSKLLYHSIISNINSSLHPQHSPPAFGFPDYLQLLTELTNRIKEMAQVVVEAGKSQIRGSCIGFSRPTHMAAGADDPKPAVQTVGCRLTRPWKLANQVTG	187655	186067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_186100_187700
766103	SIRV4	-	222	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATTATTTCCATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2762	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
766104	contig_9011_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_159327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576808	575431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_575400_576800
766105	contig_614_pilon	+	2561	3	Intergenic	novelGene_132616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	1.5	31	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2508	53	2560	435544	443867	FALSE	65	ATGAATCAAAAACAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVLPASQKKRVSKQCNLMRLPFARVPLTSNDDEDDEDDKDKMQSDNNVMSKSSPDISSLASIRQPLSTQYNLELSFLKESNLNVHGLEDSEHISSVVDVLYKESRSHSDQSFKSSQMSETKSVQSISHRKENPSPSNVTERKKHVPSWESNNPSANTPFVADLDQQVIPSPDLNWSNEINNQTNETNTKMQREVQCVPGSSSESVSEPNAEGMDKVQGNDDLQLQKTVYDADMDLTAGEVSKIITVSTHAKNRSNKKTNDCGMKTFRKVKDSNSKKKRERSKRQFKNSLDVDIEEKIQNRPEGSAFVDGKGDSEDPDFIFNSEQLAHLNILKKITLHNDLDRDDRQSTQYDEKKRTYLMNEQEEICSFSQSCDKFQQENKFDMGQISLTCNKSKASRQTFVINKLEKRNLIPNHKDKETISENIEITNEFQTADLSTKDNGNLHNCETQHMLGLKKHVTNMQPIQQSESKVNKKLRQKVNRKTEIISEMNQIYENNDKDVHDLEKVDFFFQTQENKETISGNVEVSSEFKTLTLSTRDNGNLCNWEIQNVLGLQKQITGMYPVQQNESNVNKKLRQKINRKTEIISEMNHTDNDKGVHCPEKGNFFLLTQKDKETILENLEDSNGFQIPDLSTKDTGNLCDHETQNILRVKKHVHDIQPACQNESKIDKLRQKVCRKTEIISEMNQIYENNPEKGNFFPVTQKDKETTPENLEDANGFQIADSSTRSNRNLCNYETQNMLGLKKHVTDMQPAQQNESKINKKLRQKVNRKTEIISEMKLINDYNNESVHDPVKGNFFSLTQKDKETISKDLETANEFQTTDPSTRDNGNAYDYETQNMFSLKKQVTDMQPAQQ	435491	443868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_435564_440409_440646_441615
766109	contig_9609_pilon	-	1563	9	Intergenic	novelGene_23090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.8318876504309	45	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	671	1204	477766	476965	FALSE	0	CTTCTGTGGTCCTGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALCSALRTLATDSNKYRAKADRRRQRSTFRAVLHFVEGGECEEETVRFGLEVLYVDSWARRRVYTAFKDVLGSGMHHHLQNNELLRDIFGLGPVLVLDAAALKAYKISRFEKVITRCPSSTCTTLPPSKPGPRHAAACGTSGQTFCEAGPAGEETVHTLARVFLTEDSAMTGFRQ	481578	476605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477157_477276_477373_477447_477577_477649_477788_478081_478188_478265_478445_478528_478580_478748_478851_481367
766111	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	15	1158	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
766114	contig_14768_pilon	+	1612	2	Intergenic	novelGene_115076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTGATCTCTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175468	189280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_176398_188597
766115	contig_15866_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_63643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAGCTAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494712	496061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_494700_496100
766116	contig_6710_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_95999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTGTTCTGGAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
766118	scaffold_16539_pilon	-	1521	10	Intergenic	novelGene_68402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_5	39.7215617660711	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	12	1292	800534	795046	FALSE	20	CCAGGGTTGGTTTATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQEVSDDFSLDPWQGVCDDPSFPFWPPWGLGVSLPLPSPGVRSGGSRF	800545	794816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795240_795469_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
766125	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
766128	contig_10575_pilon	+	1574	1	Intergenic	novelGene_141825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAAAAGTTTTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769423	770997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_769400_771000
766129	SIRV6	+	194	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	402	-1	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTCCACACCACATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
766132	SIRV6	+	398	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	561	3	382	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766133	contig_5499_pilon	+	1160	3	Intergenic	novelGene_57008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.5	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	803406	840419	FALSE	40	GTAAAGAATTTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRSPEGTQLPARHPRTAFRRHQHGCGPARCGRSAPRPAGARQLEGTAAVEVPVGGSGRSNSHGNSPTGHTFLKYRFWFLVSKKHPARFQRRLVRWLGCL	803403	841274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809605_840323
766135	SIRV2	-	400	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1104	133	-59	-133	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTGACTGCGCTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4791	3798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
766137	contig_10019_pilon	-	1283	6	Intergenic	novelGene_86664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCCACCGCCCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218871	187671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_187846_200184_200867_211824_211918_216213_216351_218599_218712_218786
766140	contig_10054_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_171210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGAAACTATGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73640	72267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_72300_73600
766141	contig_5039_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_64914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTTGTTGTGAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831914	830950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_831000_831900
766142	contig_9366_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_166261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGCGACCCTATAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008418	1007700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1007700_1008400
766143	contig_12528_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_81283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257173	260932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_258084_259889
766145	contig_10019_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_86689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGATTTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339522	342142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_339500_342100
766149	contig_15360_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_171264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGTGGCAGGGTGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212410	213501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_+_212400_213500
766154	contig_18438_pilon	+	908	6	Intergenic	novelGene_171397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	264.783232097503	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	343	906	312387	332755	FALSE	10	GTAAGTTTTTCGTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSGCKNGPERTKDPEDGARPGEVTSQWATFARVWYLLDGKMQPPGKLAAMASIKLQGLHKPVYHQLSDCGDHVVIMNTRHIAFSGNKWEQKVYSSHTGYPGGFRQVTAAQLHQKDPVAIVKLAIYGMLPKNLHRRTMMQRLHLFPDEDIPEDILKNLVEELPQPRKVPRRLDEYTQEEIEAFPRVWS	312044	332757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_312465_315925_316050_323945_324040_325723_325785_331057_331145_332635
766156	contig_4732_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_75374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTACAAAAATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207369	206888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_206900_207400
766157	contig_8354_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_24117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCTCATCTGATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261740	262626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_261700_262600
766158	contig_3822_pilon	-	1215	3	Intergenic	novelGene_133327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	258.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	217	624	306185	298814	FALSE	60	GTTAAGGTTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEVEKANAKPFQMTEKQWVLCSYRGF	306401	298222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_298888_299561_299696_305985
766159	contig_5649_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_82313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCCATGGTAGATGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186355	186988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_186400_187000
766160	contig_4659_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_118246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821596	820209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_820200_821600
766165	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1201	0	1201	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766166	contig_4742_pilon	+	1188	5	Intergenic	novelGene_130972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1911	junction_3	287.173619087826	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	18	491	135591	139907	FALSE	60	AAAAAAAAAAGCCTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTYKNMRFLITHNPTNATLNKFIEELKKYGVTTIVRVCEATYDTALVEKEGIHVLDWPFDDGAPPSNQIVDDWLSLVKIKFREEPGCCIAVHCVAGLGRAPVLVALALIEGGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFKESNGHRNNCCIQ	135573	140604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_135648_137327_137421_137943_138075_139008_139084_139789
766167	contig_8383_pilon	-	3037	1	Intergenic	novelGene_172762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATAAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319529	316492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_-_316500_319500
766169	contig_5023_pilon	-	1927	2	Intergenic	novelGene_7378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636859	634027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_635092_635996
766172	contig_6163_pilon	+	1229	6	Intergenic	novelGene_103774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	42.054250676953	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	176	1123	9706	16461	FALSE	50	CATAGTTCTAAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	9530	16567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678_13842_16300
766175	contig_16204_pilon	+	1374	3	Intergenic	novelGene_154509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	25	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	287149	288360	FALSE	25	GGAAACTGGAGTGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPTLAPQHHPGHSSGSSTSSGEDYCNSPRSKLPAWNPQVFSSEKNLLLHQPPNLELAGSQPILSAGPSADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPLLVQQSECPGSPSPQPDSTDNDDYDDIGAA	287147	289367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_287345_287634_287740_288295
766177	contig_8631_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_121985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844667	842287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_842300_844700
766178	contig_5718_pilon	+	2130	2	Intergenic	novelGene_110376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	24	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTTTAGAGAAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173321	1178612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1173340_1176500
766184	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
766187	contig_8710_pilon	+	2103	6	Intergenic	novelGene_73510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	57.5687415182927	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	60	695	347357	398493	FALSE	70	ACGAAAAAAATGAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKVQTTKRGDPHELRNIFLQYASTEVDGEHYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTTIHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKNKSGLISGLDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSVSKKQVF	347297	399901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_347369_348358_348413_368559_368703_378227_378344_386208_386349_398322
766188	SIRV6	+	520	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766189	contig_10005_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_148916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_4	139.216557923259	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	484	1035	138325	132120	FALSE	35	GAGGAAGATTTTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGLFQVNGNAETVEWLRQRYDNGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPDVFQ	180652	131754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_132302_137513_137727_138168_138361_139667_139835_180371
766191	contig_16666_pilon	-	1256	4	Intergenic	novelGene_61768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	28	396	59688	57239	TRUE	25	TCTTCTAAGGCTTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNAHFLEVELLNKKLLGNFFFYIA	59715	55834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_57307_58098_58264_59552
766194	contig_15327_pilon	+	1941	11	Intergenic	novelGene_70571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.295630140987	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	20	1597	687868	694648	FALSE	0	GTTCTCCCTCCTGTCGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADGGLMEPNAESSGVDVPAGRVLSARELLAARARPQKLPQRSHGPKDFLPDGSEAQAERLRRCREELWQLLAEERVERLGSLVAAEWRPEGGFVELQSPAGKFWQTMGYSEQGRQRLHPEEALYLLECGSIQLFHQDLPLSIQEAYQLLLTEDTVTFLQYQVFSHLKRLGYVVRRFQPGSVLSPYERQLNLDGSTQHLEDRKGKRKRRSSSSRSIPKKSRTPESPLQGVNGTPESQATSSLAPCSQNSPFPEEKAQELSPRKDAELLGSLDPWPGLARDRVGCSQESGKVENGAPGACKPRWNFEHISFPNMASDSRHTLLLAPAPELLPANIAGREIDAESWCQKLNQRKEKLSRREQQAGARHFREDVNMDPEVQRCSSWQEYKALLQRRHLWKTQSRPPHLWDQPVTPLLSPDQADSPATVLQHISVLQMTHLADGGARLLEKTGSLEISFDVYQANAVATFRKSNPGKPYARMCVSGFDEPVPGLSTLKRLSYQSGDVPLIFALVDHGDIFFYSFRDFTLPSDLEH	687848	694992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_687924_688047_688213_688307_688372_688453_688538_688842_688942_690222_690276_691982_692085_692284_692911_693551_693613_693905_694023_694497
766196	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766203	contig_11338_pilon	-	1658	10	Intergenic	novelGene_6373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.434873776391	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	299	1339	319426	295341	FALSE	35	GCAGCCTCAAAGAACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARLIRKLF	323314	295021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
766209	contig_13721_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_169479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTATTGAAAAATAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9842	10276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_+_9800_10300
766213	SIRV6	+	348	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	509	14	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTTAGGTAGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
766215	contig_5485_pilon	-	1365	2	Intergenic	novelGene_37712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	150	893	87935	85491	FALSE	50	AGAAAAAGATATGACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88084	85018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86094_87794
766216	contig_3745_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_85096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTTTACCATATACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440128	440898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_440100_440900
766217	contig_3745_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_85097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGATGCCAAAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442858	441260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_441300_442900
766218	contig_10196_pilon	+	1037	8	Intergenic	novelGene_132147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	495.118373807348	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	546	875	1046427	1050606	FALSE	50	GAAATTTAAAAAGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034558	1050768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038422_1043831_1043937_1044831_1045029_1046392_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
766222	contig_12125_pilon	+	1279	3	Intergenic	novelGene_76228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291	4736	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGAACCAAAAAGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384625	386713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_384743_385032_385184_385702
766229	contig_15093_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_143300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98326	96037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_96000_98300
766230	contig_2733_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_128572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAGGAATCCCAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717382	714873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_714900_717400
766231	contig_10627_pilon	+	1650	2	Intergenic	novelGene_59913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	46	540	29280	31949	FALSE	10	AACCTGTGCCCTTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPDPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGEWEPRGLERAFTPSPLGEEPCPVFCWLGDRDQDLHI	29234	33059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_31515
766232	SIRV6	+	335	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	537	-1	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
766233	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	51	505	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766234	contig_1276_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_159774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194688	196617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_194700_196600
766244	SIRV4	+	479	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	60	411	60	-411	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCTTAGACGACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
766247	contig_7594_pilon	+	1364	7	Intergenic	novelGene_55435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	715.466456236769	102	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	38	754	539045	554556	FALSE	25	GTGTTTGGAAAATAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPDPRYSSFSIEDDFNYGSCVASASVHIRMDFLRKVYSILSLQVFLTTMTCTVSLYFESIRTFIHESPALILVFALGSLGLILALTLNRHKHPLNLYLLFGFTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKLFFYSETVELVLAAGGALLFCGFIIYDTHSLMHRLSPEEYILATISLYLDIINLFLHLLRLLEAVNKK	539007	555166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_544579_544689_545738_545845_549197_549232_551173_551292_552953_553000_554349
766249	contig_14807_pilon	-	661	7	Intergenic	novelGene_124673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7482.56383757154	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	40	564	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37555_38324_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
766252	SIRV6	+	532	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766255	SIRV4	-	264	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
766257	contig_12123_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_144590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68671	67644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_67600_68700
766258	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766259	contig_13740_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_34767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTACTCAAGGGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722092	724288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_722100_724300
766264	contig_13901_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_146641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169201	167013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_167000_169200
766265	contig_1735_pilon	+	863	7	Intergenic	novelGene_106876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	544.350581478109	29	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	373	696	134293	137764	TRUE	10	CAACCTGTCCGGCTCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLIRTTGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	22486	139775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_22509_132285_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
766267	contig_14033_pilon	-	1501	5	Intergenic	novelGene_167429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.1497508298772	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	224	739	284801	277752	TRUE	20	TTTATTTGTCATTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVEPFLRPWWSGTGGAERGLRRLGTSGRPSLSRDLTLQPPRRPKSTNPFTRAQEENWRRRNKTVLTYVAAAAVGMLGASYAAVPLYRLYCQTTGLGGSAVAGHTSDQIESMVPIKDRIIKVTFNADVHASLQWNFRPQQTEVYVVPGETALAFYKAKNPTDKPVIGISTYNVVPFEAGQYFNKIQCFCFEEQRLNPQEEVDMPVFFYIDPEFAEDPRMVNVDLITLSYTFFEAKEGHKLPVPGYN	285024	276938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_277676_277726_277935_278326_278453_279983_280140_284750
766276	contig_15449_pilon	+	1306	4	Intergenic	novelGene_33630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	809.475687645336	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGATGGTTGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62267	89899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84948_86104_86181_88888
766277	contig_987_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_72326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAGAAAAAGGGAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078645	1078293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1078300_1078600
766278	contig_19730_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_142485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTCAGCAGTTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111164	113149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_111200_113100
766280	contig_5566_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_153655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTCAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173234	175133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_173200_175100
766281	contig_11815_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_50949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCAAACCCGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467929	466480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_466500_467900
766283	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766288	contig_8636_pilon	-	2255	7	Intergenic	novelGene_141943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	11.9721899973786	11	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1257	1856	500447	495810	FALSE	15	GGGACGGCACGTGTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVSWAGGGVPCHPRGQAAQATLGACVPCQTIQNHLGEELLQDLINFCLSYMALLRLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCTLEERIEFSELDKKEKIREKFVEALKTEFAGKGLRFSRGGMISFDVFPEGWDKRYCLDCLDQDSFDTIHFFGNETSPGGNDFEIFADPRTVGHSVVSPQDTVQRCRELFFPETAHEA	506510	495410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_495933_496317_496434_497330_497407_499954_500055_500262_501474_501871_501990_506398
766296	SIRV6	+	415	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	263	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTATCTGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566	2534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
766297	contig_8689_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_170031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTCCTATGGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140686	140281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_140300_140700
766298	contig_9389_pilon	+	1669	3	Intergenic	novelGene_83944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2282	junction_1	358.5	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	67	807	165615	167516	FALSE	40	CTGTTTTTAGGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLARLGLVLPEVGKAGHPQSSMMGGLTWRRPSGGAEQQAEGAEPRGFLGEARGTCSPAPVPALGLHALAWIKGVPMPPDNPSSPCPSQAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCASQVGMTAPGTRRHIYDTKLGTDKCDNSSMSLQMGYTQGANQSGQVFGLGRQIYDPKYCPKGPAADGAPAGASDCPGPGAAPEFPPYYQEGADY	165548	168378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_165933_166074_166222_167240
766303	contig_9995_pilon	+	1765	2	Intergenic	novelGene_47682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCAGCTTTCTCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263976	265826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_264695_264779
766307	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_93491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
766309	contig_2114_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_104268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTAAGGGAAAATCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549715	550366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_549700_550400
766310	contig_7202_pilon	-	177	1	Intergenic	novelGene_16442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27799	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
766311	contig_8020_pilon	+	949	4	Intergenic	novelGene_114349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_1	48.359762888859	788	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	77	310	47467	51477	TRUE	30	TTGTTTTAATTAGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGCRRRCRHRASPLGFSEAGRHSRMGDKPIWEQIGSSFIQHYYQLFDNDRTQLGAIYIDASCLTWEGQQFQGKAAIVEKLSVSNGQGQVRAASFPAPVALA	39938	53781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_39986_47437_47566_51342_51603_53267
766315	contig_7004_pilon	-	1331	9	Intergenic	novelGene_126498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	64.1958672735247	285	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	188	964	434925	432521	FALSE	5	TTCAGGTCTGTGCGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGAHCSEPSCQRLDFLPLKCDACSGIFCADHVAYAQHQCGSAYQKDIQVPVCPLCNVPVPVARGEPPDRAVGEHIDRDCRSDPAQQKRKIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGLSEDEALQRALELSLAETKSQVPSSQEEEDLALAQALSASEAEYQQQQAQSRSLKPSTCSLC	435112	432153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_432779_432853_433184_433253_433335_433397_433473_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434599_434870
766316	contig_8452_pilon	-	928	6	Intergenic	novelGene_48102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	887.154462311947	974	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	56	562	991128	962980	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQRVFNGCDLSEEDHQDLLSKCLWVDPNLLHTWVHIRETHHPIPVPHVPRWYTQLLPHPLFRK	991183	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_964356_964439_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
766319	contig_1856_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_84865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	802	1143	122965	123306	NA	20	CCCCTCAGGTGAGTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSPREDCVLVFLLPPLPRLRPLRGPLLLRGRGVPHLPLSKVGLVACSTLMVFPSQEFPFISLAASLASARLSKVTKANPLDLLVSQYFIKSISTIHPCLPNTASRASHLFPC	122163	123352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_122200_123400
766322	contig_5375_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_169226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	584	910	114070	113744	NA	75	ACAACCCAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVLLGTSDTCHSVTYLGATSTDGRRTRNFVLACGAMISHTNAENSVSPKRYLTVGIRLPVMDGQRVLSGGAENNAFHFTCHCAVTFPLHNRKHFSKRVLGYLAENK	114653	112359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_112400_114700
766323	contig_1090_pilon	-	680	2	Intergenic	novelGene_131145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGGGTGGTCCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492241	488566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_488876_491870
766324	SIRV6	-	426	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-243	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2063	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
766325	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	492	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
766326	contig_1275_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_108743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381362	381712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_381400_381700
766327	contig_14341_pilon	+	615	6	Intergenic	novelGene_111846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2164.48950101404	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	76	564	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547740	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550136_550466_550485_551481_551581_551668
766329	SIRV4	-	326	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1197	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3961	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
766331	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
766333	SIRV2	-	494	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4375	38	3200	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
766334	SIRV4	-	186	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	428	3	-428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGCCATGTCACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
766335	SIRV4	-	278	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1241	2	1241	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3917	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
766338	contig_5549_pilon	+	815	6	Intergenic	novelGene_81565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1276.53509156623	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	92	745	82155	96844	FALSE	30	ACTAAAATTTTCTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGDRRFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKSCFPVAVP	82063	96914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620_96700_96815
766339	contig_5935_pilon	+	1718	5	Intergenic	novelGene_102665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCGGAGGCTGTGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421954	431650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_422264_422332_422430_422511_422674_422836_423854_431517
766343	scaffold_12124_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_22139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTTTTGGTCAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946783	947539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_946800_947500
766346	contig_7171_pilon	-	2520	28	Intergenic	novelGene_101291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	120.089689847554	1	137	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	53	823	1075756	1069560	TRUE	10	GCTGTTATCTTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVALLAPWAQAQLQPPGMDFVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVTGDLMALKMVKMEPDDDVSTLQKEILILKTCRHANIVAYHGTYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKVVDWRCDPPCTISASLRVSAPRMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATNWCPSLG	1075808	1057619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1061016_1061098_1061189_1061381_1061436_1061853_1062026_1062654_1062743_1062948_1063008_1063091_1063201_1065002_1065064_1065154_1065232_1066088_1066174_1066538_1066622_1066696_1066851_1067293_1067337_1068327_1068404_1068575_1068635_1069148_1069228_1069470_1069582_1070332_1070405_1070513_1070577_1070994_1071173_1072500_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075423_1075482_1075657
766349	contig_9995_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_47821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAACAAAAAAAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900089	898049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_898000_900100
766352	SIRV1	-	164	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3667	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6699	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6557
766353	contig_6544_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_142086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCCTAGTAGGACACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78861	78422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_78400_78900
766354	contig_4103_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_51984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	172	429	202183	201926	NA	35	AAAGCTGAACCTTACTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTTTTIGISATSATFTNVFGKKRANVVTTPSTNRKNKKNKTKETPPTAHLILPEQHMSLAQQKADKNKINGEPRGGGAGGNSDSDNLDSTDCNSESSSGGKSQELNFTMDVNSSSDRRYPSVLLHSQEEKTSTTTSKTQAR	202354	201398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_201400_202400
766355	contig_19737_pilon	-	3029	10	Intergenic	novelGene_158979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	57.4316555718917	160	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	415	1311	73354	59808	FALSE	30	CTGAAAACAAGTTTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVFLVYQTITDFREKLKHPVMSVSYKEVNRYDAPGLALYPGQAQLLSCQHHYEVIPPLRSPGQPGAMNCTTHRINYTDPFSKQTVKSALIVRGPQEVKKRELVFLQFRLNQSSEDFSAIDYLLFSSYQEFLQSPDKVGFMQACESAYSSWKFSGGFRTWVKMSLVETKEEDGREAVEFRQEILVTIYNTPRQLWKPRSGRGVAPAQTSVVNYIDQRPAAEKSAQLFFVVFEWKDPFIQKVQDIITANPWNTIALLCGAFLALFKAAEFAKLSVKWMIKIRRRYHKRRGQATNHIS	88560	58089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_59970_61593_61702_61802_61878_65229_65375_68002_68146_71730_71883_73242_73453_82791_82889_86696_86774_88418
766356	contig_1450_pilon	+	1797	3	Intergenic	novelGene_27429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	123	1139	419840	423253	TRUE	35	CCCCAAGTTTTTTCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419717	425070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423770_424928
766358	SIRV2	-	240	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	686	22	686	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
766363	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	53	521	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766365	contig_8241_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_157491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCCACCGGCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265861	263436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_263400_265900
766366	contig_6069_pilon	-	1313	4	Intergenic	novelGene_8046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.2662676809642	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	527	1168	360663	360022	FALSE	5	CCTCCGCCTCTCCATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362325	359876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360795_361539_361671_361753_361863_362170
766367	contig_9036_pilon	+	1893	1	Intergenic	novelGene_155459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACATAAAAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149452	151345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_149500_151300
766374	SIRV6	+	333	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	19	-244	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766381	SIRV4	-	302	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1216	3	1216	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3942	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
766382	SIRV4	-	328	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1195	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
766384	contig_7963_pilon	-	908	5	Intergenic	novelGene_58326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1215.48570538695	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43804	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546
766386	contig_20561_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_166360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21527	23556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_21500_23600
766389	contig_4180_pilon	-	978	2	Intergenic	novelGene_8412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAACAGAGTTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889344	888304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_888685_888746
766392	contig_10159_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_30846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630773	628710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_628700_630800
766402	contig_8674_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_102951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_11	50.1567789968499	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	570	1484	723870	707008	FALSE	15	TTATCCTGCTCTTCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727646	706636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726959_727434
766404	contig_16098_pilon	+	1252	3	Intergenic	novelGene_45897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74	465	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	52	444	255638	259512	FALSE	25	TATCTGTCAAGGATTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLRLHLPGLHQALMGALALLPGSRLDVSIPRSRALLSRSSSQRRSRPSFRRTPPSGPQEEPSSPAPEAELSAPQQRLLQSVEPPESSPPRPEGTPVPARRRPLGHGFGLAHSGMMQELQARLGQPKPQ	255586	260320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_255695_259088_259355_259442
766407	contig_15122_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_162694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	75	365	142321	142031	NA	50	GTATATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYKKSLLISDLHHTFQYLISVPVYMIMFLLLFQVYVSFLSKKISAPCNLEWYLKLLCDANRTSLELVNLYVNNTSGLTSISVQNQFCCLPAHSSSKTQNSYSLNAEEPEARLHMDISFVP	142395	141625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_-_141600_142400
766409	contig_5649_pilon	-	2719	17	Intergenic	novelGene_82346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_16	6.16314651781053	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	96	2510	846245	818352	FALSE	20	TCCATTTGCATCTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLREKVEEEEEAEREEGVERPSRPEKMTKLLRKEATTLTPEMLRDMEQKLSEIKVPVPGEPLTSDTIDIAKLPLSYRINTPKEEQLLQVADNFSRQYSHLCPDRVPLLLYPLNECEVPKFLSTTIRPTLMPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVKITERFRRNPAKPADEDVAERVFLIVEERIQLRYHCRDDHITASKREFLRRTEVDSKGNKIIMTPDMCISFEVEPMEHTKKLLYQYEAMMKLKNEEKLSRHQAWESELEVLEILKLREEEEEGHMLTISIYDTKRNEKSKEYREAMERVMHEEHLRQMETQLDYLAPFLAQLPPGEKLTRWQAVRLKDECLSDFKQRLIDKANLIQARFEKETQELQKKQQWYQENQVTLTPEDEDLYLSYCSQAMFRIRILEQRLNRHKEMAPLKYLALEEKLYKDPRLVELLKVFA	850837	818142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_818446_818538_818679_819577_819773_820969_821081_821163_821275_821841_822058_823016_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_843519_843646_845532_845702_846054_846258_850754
766412	contig_10898_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_172768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGAGTGCAATGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201501	200043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_2e+05_201500
766414	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_97502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
766421	contig_6533_pilon	-	1312	1	Intergenic	novelGene_114657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243748	242436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_242400_243700
766424	contig_12250_pilon	+	1891	17	Intergenic	novelGene_80544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	62.7820821871177	6	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	131	1834	272853	278399	FALSE	15	CTCCCTCGGTTCACCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	265152	278456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_265230_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
766425	contig_14029_pilon	+	1268	7	Intergenic	novelGene_151943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_3	263.906180720009	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	7	360	131703	133603	TRUE	45	ACACAAGAAAGTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQNNKNSLEILLGR	131696	135619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_133472_133564_134021_134104_134162_134258_134319_135245
766427	contig_6102_pilon	+	2240	12	Intergenic	novelGene_32233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1846	2208	919736	926192	FALSE	40	CTGCAAAATAAATTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSPSRIYPETMLKSKVLLQCSVDDAHGHCHEGPTLRTYVCRTTTSPHIIIVCHINVKHQLFFLSLESSQLHCIVLTGSVGIYCTYINLVWIHFLHLLFQITLVVEGLVTNVNIIFQCE	909440	926224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_910582_912568_912676_914069_914120_914809_914875_916457_916599_916763_916855_917934_918047_918992_919049_919653_919792_920568_920643_920713_920821_926066
766428	contig_12724_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_146853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTAGAGCATTTTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113355	115166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_113400_115200
766434	SIRV4	-	256	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1262	3	1262	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3896	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
766435	SIRV6	+	589	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10222	15	985	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11222	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11800
766437	contig_15062_pilon	-	2665	2	Intergenic	novelGene_162303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	0	6	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGTTTAAAAAAACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253262	248592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_250341_252345
766438	contig_11417_pilon	+	1124	6	Intergenic	novelGene_103267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	140.761358333884	1116	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	96	530	284496	327290	TRUE	10	CCCCTTATCCCTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARG	284400	334221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751_319902_327166_327302_333430_333489_333696
766441	contig_6552_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_163600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123922	121234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_121200_123900
766449	contig_13101_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_172775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTATTTACACCAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54786	53423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_53400_54800
766450	SIRV2	-	394	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	673	4	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
766452	contig_7707_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_72183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCACTATTTACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553816	552199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_552200_553800
766454	contig_2933_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_111306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTTGCTTGTTTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257885	256801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_256800_257900
766457	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766458	contig_5643_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_38904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTGGCTGTTTTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265467	265959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_265500_266000
766459	contig_18272_pilon	-	2893	1	Intergenic	novelGene_7060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTGACTTCTCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494366	491473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_491500_494400
766463	contig_8866_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_77879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982109	983407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_982100_983400
766470	contig_13244_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_86986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATCAAGCATTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406614	405748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_405700_406600
766472	SIRV4	-	262	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1259	0	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
766473	contig_11081_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_167070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACCTTTAAAACAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10060	10513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_10100_10500
766476	contig_2940_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_81909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATTTTAAGTCTAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497405	495632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_495600_497400
766478	contig_1594_pilon	-	2341	19	Intergenic	novelGene_138833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	63.3324561342761	13	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	44	2128	777962	618749	FALSE	55	GATACCAATGCAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEYSAFDMSAPTPAHCCPAVGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESIPLIQGPVGLHQKFSPKQIQALEHTYDDLCHTEGVTALPYFLIKYDENTVLVSLLKHCSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSHFQSVEVLCFRDRTMQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKVSYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKAKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEVN	810144	618535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_618758_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_771341_771460_777250_777306_777805_777976_810114
766479	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
766481	contig_13937_pilon	+	2330	9	Intergenic	novelGene_167353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGACGCAGCCCCTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49234	64462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_50674_54169_54290_54960_55091_55513_55616_57597_57686_57973_58080_59683_59822_61949_62119_64424
766482	contig_1076_pilon	+	1527	11	Intergenic	novelGene_101135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	133.357264519035	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	227	1300	974036	996806	FALSE	15	TCCACTTGTGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAERDRDLELAARIGQALLKRNHVLSEQNEALEEQLGQAFDQVNQLQHELSKKDELLRIVSIASEESETDSSCSTPLRFNESFSLSQGLLQLDMLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEEISSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELRLHLQASKDAQRQLTVELHELQDRNRECLGMLHESQEEIKELRSRSGPAAHLYFSQLYGDFSGPYKR	945731	997033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945919_973996_974073_980669_980865_988168_988246_989739_989857_990860_991071_991716_991796_993263_993395_993833_993909_995092_995231_996791
766483	contig_1154_pilon	-	2091	2	Intergenic	novelGene_87242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1092	1472	1851841	1850911	FALSE	20	AACCCACACCTGCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKQGKKRPLIFPSTAGPSHVSDSSPRSPPHPWPPCSHGLFLLPQGYKLQIIEVPVLSDDSVPIGMLGGDYYRKLLRYYNKSHPAEAVKCYELLALHLSVIPTDVVVQQAGELARRLWEASRIPLL	1852932	1850291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623
766486	contig_5649_pilon	-	2295	11	Intergenic	novelGene_82351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	8.96660470858396	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	524	1900	843612	822990	FALSE	55	ATTTGGAAAATATGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPPTYLYSSTTVLKYQKGNCFDFSTLLCSMLIGSGYDAYCVSGYASQDLCLMDLTREVCPLTMKAKEVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVVGARWAWG	850815	822594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_842588_842784_843519_843646_846054_846484_850754
766499	contig_5526_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_111692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	267	653	227612	227226	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPGLAATAAELREPGAALHRELGRGAPAPHRRNGPPPRASASTIGGYPRASSRPSLSERPSGSPPHLSSSLFFLLSPLPPSPLQLSVMATEPPSPLRLEAPGSPEMKIPPASEAVPEGTPQPAGGRLRFLNGCVPLSHQVAGHMYGKDKVGKWGWRGARRYPSASASPLADRGSPVLAGRAGRPSRAARPPTPVFSAFPRSLGLVLKGLIKWGGF	227878	225628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_225600_227900
766500	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_89076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	TGTGGTTTTGCTCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
766501	contig_14443_pilon	-	800	4	Intergenic	novelGene_126669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	925.756027375584	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTGGCCATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39538	29092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29592_37784_37863_38988_39045_39371
766502	contig_3822_pilon	+	2849	7	Intergenic	novelGene_133336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	64.4092815947791	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	29	1009	320969	336112	FALSE	25	CTCTGATAGCAACCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLKGAAGWDPRAGFRAERRECTTSVPQGLLKAARKSGQLNLSGRNLSEVPQCVWRINVDIPEEANQNLSFGATERWWEQTDLTKLIISNNKLQSLTDDLRLLPALTFLDIHDNQLTSLPSAIRELENLQKLNVSHNKLKILPEEITYLRNLKGLYLQHNELTCIPEGFEQLSSLEDLDLSSNRLTTVPASFSSLSSLVRLNLSSNQLKSLPAEISRMKRLKHLDCNSNLLETIPSELAGMESLELLYLRRNKLHSLPQFPSCRLLKELHVGENQIEILGAEHLKHLNSILVLDLRDNKLKSVPDEITLLQSLERLDLSNNDISR	320940	337952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_321120_327731_327914_328517_328592_330479_330610_332858_332983_334535_334679_335935
766503	contig_14822_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_145408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	223	531	127624	127932	NA	55	AAGAAGGAAGGGAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWITKVQSPTCHGHGAGPGSMSFHCEWGHHKLGTNSRVANNIKAFDWALRTQKLISSVLCLQSSELRGANVEQVECRPRGERTEAALWDAGEEAETDEG	127401	128010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_127400_128000
766504	contig_14822_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_145407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	453	806	124970	125323	NA	20	CACCTATGCCATACCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKEHQYLRSGRKRKSPKSRQRRHSLRGRKRPSECGISESKEKELFRKEGERKFIVFGHPVSVPPSLENFFLPIESDLTVINSDTCPPLANELVNNPRYAKTVKCFLLIRPCKATWF	124517	125324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_124500_125300
766505	contig_2768_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_57469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAGTTATTCTCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532799	530965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_531000_532800
766506	contig_13863_pilon	+	1595	5	Intergenic	novelGene_42050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301691	313041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_301766_302368_302535_307706_307849_310942_311065_311950
766507	contig_401_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_42933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTGCAGCAACGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1974739	1976341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1974700_1976300
766511	contig_6513_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_117759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAATAACTCATAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117811	118665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_117800_118700
766514	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	579	0	400	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766516	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
766522	scaffold_12124_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_22019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	278	837	731	1567	814364	815200	NA	20	AAAGAGCTTGTTGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKERRGKEKREGATEEREREGGKRVTERAKKTERGTETQGDRSTDRERDREAEERQRSRETEKKTAERERRTQIQGDRQRDREAERERAQIRPCGGDQRGWRRTAQAHLCPENPFVTPSCPSPGLPSTGCPPECPSVLPPTTVPPLPPAVLTPCRHHFPWPTLPSPLSALTSGAHPAQPQALPFCPSSTSKPSVASGPLHWLCPLGISLPTAAPELPSGVSLNVSLRGHTCSSSQHSGLVQHPTPALPPPQVSWNELMPGTGKAENEEVITVEEVA	813633	815409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_813600_815400
766524	SIRV6	+	285	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8132	14	607	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
766528	contig_5640_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_27265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACCAAGGTCATCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867524	868566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_867500_868600
766529	contig_11968_pilon	-	2394	1	Intergenic	novelGene_172504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATAACTCCAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12859	10465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_-_10500_12900
766530	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	51	515	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766531	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766532	contig_5945_pilon	-	1033	8	Intergenic	novelGene_104575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	292.013069318928	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	51	779	249708	219523	TRUE	25	TTTAATCTCCAACCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249758	215719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_215800_216161_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
766533	contig_13937_pilon	-	1925	16	Intergenic	novelGene_167344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	68.2428995085447	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	393	1922	55615	30851	FALSE	25	CACTTGTAAGTCAGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLKVFVGSPSGLNLRNVLWHGFAAPQEIPPKYCSVMVLLTAGLGQLLKRFLRQTNRTLWHRSFLALTNLEDWIVFPDVTSEALSVLEDVMKKSTFVFKTMLPYWEAAVIKFRSHRFADCVILLLTQLEAGLRRAFATVNRCPQRLLTAESTVLYTTFDEMLAKELNDGTINQLPLLLGEPVMEFLWDFLNHQEGPRIRDRLSHGEVNLNEFPGEAANQLLAFSTVLLLRFTSGDVVSVLKEKAAIKSLISIAEGYSSHFHPASQLKKQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGSIKLLSPVLYLILLLIALELVNIHAVQGKHTCEYQRYLKFLKSVLQYTENLATYTSQEKNKWDETVSLTHGVLLKIWTYSEKKQMLMHLAEKPTDKAVS	59881	30847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36079_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274_45449_47031_47101_48570_48601_50572_50676_54171_54287_54957_55095_55517_55616_57597_57688_57975_58078_59681
766535	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	15	1156	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
766538	SIRV6	+	552	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	10	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766540	SIRV7	-	920	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
766544	SIRV4	-	219	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1304	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3854	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
766545	contig_361_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_166620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGTCTTCAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016349	1017599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_1016300_1017600
766546	contig_361_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_166621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAGAAACTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017800	1018558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_1017800_1018600
766551	contig_5779_pilon	-	161	1	Intergenic	novelGene_106470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAACAAAGAGCAAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129934	129773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_129800_129900
766552	contig_11281_pilon	+	2128	2	Intergenic	novelGene_125419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAAAGCATTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41916	45148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_41983_43086
766555	contig_14559_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_83717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAATTGGTGAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239656	240199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_239700_240200
766556	contig_14559_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_83718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAGGTCTTTACTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240248	241003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_240200_241000
766557	contig_5302_pilon	-	2441	1	Intergenic	novelGene_81521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTAAAATTTGGAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446757	1444316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1444300_1446800
766558	contig_11832_pilon	-	1657	14	Intergenic	novelGene_106946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1021.64170006593	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	582	1043	86997	84828	TRUE	35	TAAACCTTTTAATAGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVGCLRGAAFCSYAPQAP	92458	83815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84981_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88646_88708_89418_89450_92387
766559	contig_7898_pilon	-	1673	9	Intergenic	novelGene_47638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	827	1183	735892	733933	TRUE	25	CGAAAAACGTCTCGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWWLMAVAASDAASLAIAASLMKGFLLSFNMAARQVSPDAQLVFLLAQREPRRWHGNQEGADALLLCRDLSVLAKTTAAEASQELVIQALVPFRTQESPSATAVVEAAPASLPYLVR	736718	725309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_725383_727024_727186_733429_733586_733832_733949_734367_734515_734823_734906_735426_735475_735697_735755_735885
766561	contig_2251_pilon	-	1296	12	Intergenic	novelGene_128462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	115.118336527934	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	85	960	138003	56508	FALSE	15	GGTAACTTGTATGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLIHCVRNTPAFLADRLHQAVKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD	145225	56171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_56568_66235_66359_70007_70067_78774_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988_138042_145179
766562	contig_12624_pilon	-	1909	12	Intergenic	novelGene_61067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1356.57408189506	1	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	126	860	903621	875480	TRUE	5	GTGTGCTTTTCTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTENSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQDPVSDPLQGSGRGGSPCAVSVCT	903746	862080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_874052_874163_875385_875552_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888799_900249_900333_903447
766563	contig_13112_pilon	-	2580	4	Intergenic	novelGene_98842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_3	2.62466929133727	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1460	1912	633253	632026	FALSE	40	GTAAAAACAATCCCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVFKSAPILKRALKVKQAMMQLYVLKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQAEECALRANIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREVFSKPISWEELLQ	636084	631357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_632274_633048_633992_634689_634757_635430
766564	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766565	contig_7909_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_155946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAACCCTATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053249	1052673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1052700_1053200
766569	contig_6488_pilon	-	2402	7	Intergenic	novelGene_44716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	729.135427902267	17	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	156	1328	91238	31233	TRUE	50	TAAAATCTAGTAATATAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGVPSPLQGGSNSAATLGKPSGELRAGGASPPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFKGMSVSRPNAVVGKCRMIRHSRDRKNEPNPQRFDRIAHTKETMRLDGLNTLTYKVLDTQRYPLYTKITVDIGKPS	91393	28433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_28715_30439_31366_31558_31664_34242_34366_36841_37030_53885_54122_90850
766571	contig_8140_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_86449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCAGAAATGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800599	801180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_800600_801200
766572	contig_5018_pilon	-	1494	10	Intergenic	novelGene_47079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	706.503440268419	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	69	797	1402792	1400937	TRUE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEVGQARAHP	1402860	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399151_1399532_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400960_1401048_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
766573	scaffold_13505_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_111504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545423	545902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_545400_545900
766574	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	878	-45	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
766575	contig_1443_pilon	+	449	2	Intergenic	novelGene_28187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	93	449	344128	344484	FALSE	25	TACAGCAATGCTGCCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCS	343656	344484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
766577	contig_6199_pilon	+	1281	7	Intergenic	novelGene_126379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_4	40.9620420497915	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	185	919	342318	346544	FALSE	10	TGTCTTATTTCGTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALQIIDLFKNIFQLVGLDLFVFPYRVVATAPGCGVIECIPDCTSRDQLGRQTDFGMYDYFTRQYGDESTLAFQQARYNFIRSMAAYSLLLFLLQIKDRHNGNIMLDKKGHIIHIDFGFMFESSPGGNLGWEPDIKLTEEMVMIMGGKMEATPFKWFMEMCVRGYLAVRPYMDAVVSLVTLMLDTGLPCFRGQTIKLLKHRFSPNMTEREAANFIMKIIQNCFLSNRSRTYDIIQYYQNDIPY	342133	346906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_342420_342521_342648_342874_342996_343440_343601_344479_344570_345199_345284_346492
766578	contig_4364_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_80	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCGTCAGATAAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818619	819632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_818600_819600
766579	contig_2940_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_81887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCATTTTTGTGCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427273	428497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_427300_428500
766583	contig_12864_pilon	+	799	6	Intergenic	novelGene_76399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	743.168729159132	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	227129	229231	FALSE	15	AGCAGTTTCTGGGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIHNFPLPTQQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	224967	229317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225070_227006_227169_227822_228030_228490_228623_228901_228946_229165
766584	contig_16883_pilon	+	1846	3	Intergenic	novelGene_161752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_2	69.5	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	472	792	519520	529972	FALSE	40	AAAAAAATCACCGTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDGGVKLLKERLEKFFHRYLQTLHLQSCDLLDIFGGISFFPLDKMTYLKIQSFINRMEESLNIVKYTAFLYNDQLIWSGLEQDDMRILYKYLTTSLFPRHIEPEV	519048	531026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_519577_526114_526291_529884
766585	contig_13565_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_162376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGGCATTTATTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113801	111599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_111600_113800
766586	contig_12943_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_140362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTCAACAATTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62447	64985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_62400_65000
766587	contig_16666_pilon	-	1303	4	Intergenic	novelGene_61762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	22	468	59688	55974	FALSE	65	AAAAAAAAATGCAAACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59709	55138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
766593	contig_11386_pilon	+	1165	5	Intergenic	novelGene_82832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	54.3248331796794	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATACCTTTTTCTTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230583	245110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_230794_231608_231685_232027_232173_233457_233517_244435
766597	contig_14618_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_136841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACTAGCAAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197342	1195539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1195500_1197300
766604	contig_7004_pilon	-	1419	6	Intergenic	novelGene_126506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	85.2314495946185	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	507	818	434061	433470	TRUE	45	AATCAATAAAGCATTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRKKVRVSAKTNLPTPPQIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSR	435075	432166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_433184_433253_433335_433570_433849_434268_434503_434599_434870
766605	SIRV6	+	198	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	504	-1	-334	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAGTCGAAGTACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
766620	contig_19007_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_168436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACTTATTCATTCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4539	3255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_3300_4500
766621	contig_17198_pilon	-	2624	14	Intergenic	novelGene_62411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_13	395.739813513879	527	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	268	1767	1150359	1105575	FALSE	20	CTAGAGTGTCAGTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEQEKELQRRLKRLYPAVDEQETPLPRSWSPKDKFSYIGLSQNNLRVHYKGHGKTPKDAASVRATHPIPAACGIYYFEVKIVSKGRDGYMGIGLSAQGVNMNRLPGWDKHSYGYHGDDGHSFCSSGTGQPYGPTFTTGDVIGCCVNLINNTCFYTKNGHSLGIAFTDLPPNLYPTVGLQTPGEVVDANFGQHPFVFDIEDYMREWRTKIQAQIDRFPVGDREGEWQTMIQKMVSSYLVHHGYCATAEAFARSTDQTVLEELASIKNRQRIQKLVLAGRMGEAIETTQQLYPSLLERNPNLLFTLKVRQFIEMVNGTDSEVRCLGGRSPKSQDSYPVSPRPFSSPSVSPSHGMNIHNLASGKGSTAHFSGFESCSNGVISNKAHQSYCHSKHQSSNLNVPELNSINMSRSQQVNNFTSNDVDMETDHYSNGVGETSSNGFLNGSSKHDHEMEDCDTEMEVDPGQLRRQLCGGSQAAVERMIHFGRELQAMSEQLRRECGKGTANKKMLKDAFSLLAYSDPWNSPVGNQLDPIQREPVCSALNSAILETHNLPKQPPLALAMGQATQCLGLMARSGIGSCAFATVEDYLH	1219215	1104717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1105706_1110203_1110316_1117273_1117426_1119094_1119217_1122034_1122180_1124906_1125098_1126926_1127036_1128153_1128267_1131162_1131348_1144509_1144533_1148908_1149077_1150310_1150364_1199990_1200103_1219064
766624	contig_14041_pilon	-	1573	10	Intergenic	novelGene_144025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	26.2974438977547	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	158	1141	64940	26842	FALSE	15	TGTGGGCTTATATTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNHCVFSANEDHETIRNYAQVFNKLIRRYKYLEKAFEDEMKKLLLFLKAFSETEQTKLAMLSGILLGNGTLPATILTSLFTDSLVKEGIAASFAVKLFKAWMAEKDANSVTSSLRKANIDKRLLELFPVNRQSVDHFAKYFTDAGLKELSDFLRVQQSLGTRKELQKELQERLSQECPIKEVVLYIKEEMKRNDLPETAVIGLLWTCIMNAVEWNKKEELVAEQALKHLKQYAPLLAVFSSQGQSELILLQKVQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKADVLSEEAILKWYKEAHVAKGKSVFLDQMKKFVEWLQNAEEESESEGEEN	73190	26409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_26871_30653_30777_41195_41335_42583_42731_44660_44832_49882_49993_54488_54625_58208_58275_64877_64982_73074
766631	contig_6871_pilon	-	1978	6	Intergenic	novelGene_21635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	38.1229589617595	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	464	1204	663492	657382	FALSE	55	CAAAACATTGGAAAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKRAKKETVDPTYVWIGPNENKLTGNNRINITNTGKLMVKDFLESLSGPYTCTFSYKSVKAETQEEKTVKKTYEFIMFAYREPDYSYQMAVRFTTKSCVGRYNDLLFRVLKKILDNLISDLTCHVIEPSYKCHLVKIPKHGLIHELFIAFQVNPFAPGWKAACNQSVDCEDNTNRNILQARDRIEEFFRSQAYIFYHDLNKTLPAMHFIDHSFQVVRMDSCRPGFGKNEAMHSNCASCCGNYEI	665127	656607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_657580_660195_660279_660817_661037_662595_662758_663413_663540_664711
766636	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766638	SIRV6	+	356	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	23	404	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766640	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	53	486	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766641	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	4	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766642	contig_1982_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_151341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTCAGGTATCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423366	421746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_421700_423400
766643	contig_13300_pilon	-	2219	6	Intergenic	novelGene_125788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	45.9321238350678	143	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	132	1658	167148	157619	FALSE	15	CTTGCACATGCGTCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPRKEGFRARGQAHRRLPQREGTRLQGSHRSYLGRIKAPGTAMAIPQLLWIWLLVAGTHGLEDGSMRLMDGNMANEGRVEIFYRGQWGTVCDDSWDLTDASVVCRALGFENATQALGSAAFGPGAGPIMLDDLECTGTEPSLADCRSRGWLNSNCQHEEDASVTCTSKTISYPAVHILDFSSELSTALSGVFDSQQSCDLSIQVWARGEEALSVCAHTLILSTNPEARDLLRESGSNVTMEVDAECVPVVRDFIRYLYSRRLNISMSSVKCFHQLASTYGAERLQDYCARLFTIVLLQDPSFRTPLDLHAYALATGDALLEALCVQFLAWNFEALTRAKAWPSTPLALLRTLLSRSELAVSSELALLKAVGAWGWENRASHEVIAGLLEEIRFPMMLPMDLFELQFNMSLFRDHEPLFRKKVLQALEFHTVPLRLLAQYRGLNFSEDTYRPRLYMAPTWSASVSGNIQNSWLAEKSRRVASIPSTHTTLLTPRPPLTIDITPIDLSRHPSTPASSSTTCSSPGLSPTSPPSRAAGTTGSRVPPTRSLPWA	169251	157057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_158508_161631_161894_164504_164637_166209_166402_167096_167171_169142
766648	contig_9415_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_109861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACACTGGGTTGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2001098	2002020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2001100_2002000
766649	contig_11115_pilon	+	1727	10	Intergenic	novelGene_102795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	173.304484778797	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	52	1239	152902	157736	TRUE	5	CTTGTTATTCTGGTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPECLPGGANSLSTAADKWGFGATLLEICFDGEAPLQGRGPSEKERFYQKQHQLPEPSYPELATLTSQCLTYEPAQRPSFRTILRDLTRLQPHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	152850	158454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_153034_153729_153881_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156140_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967
766652	contig_15304_pilon	-	1317	3	Intergenic	novelGene_30630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	53.5	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	109	954	66228	64912	FALSE	10	CCCTATCCTACCCTCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKPGAGGGGLGLGGLNWAGQLGQAR	66336	64548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_65310_65396_65721_66104
766654	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
766657	contig_16666_pilon	-	1204	4	Intergenic	novelGene_61731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	664.680374315355	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59617	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56009_56584_56664_58098_58247_59552
766658	contig_5782_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_162125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAACAAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269960	271860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_270000_271900
766659	contig_6824_pilon	-	478	4	Intergenic	novelGene_172790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	336.191744230713	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	11	478	14497	1018	FALSE	30	GTATGACATTTTTAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCQMLLNQLREITGVQDPSFLHEALKASNGDITQAVSLLTDERVKEPSQDSVATEPSEVEGSAANKEVLAKVIDLTHDNKDDLQAAIALSLLESPKIQADGRDLNRMHEATSAETKRSKRKRCEVWGENPNPNDWRRVDGWPVGLKNVGNTCWFNAVIQ	14507	1017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6824_pilon_-_1178_2111_2218_13255_13389_14428
766662	contig_18096_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_58063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTACCTTTATGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121225	119834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_119800_121200
766663	contig_17194_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_155379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAATTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278368	279351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_278400_279400
766665	SIRV6	+	341	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	531	-1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
766666	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766668	contig_5210_pilon	-	1831	8	Intergenic	novelGene_65457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	66.1272736964909	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	358	1008	652471	648391	FALSE	10	AATGCTGTCTTTGGCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPATQQSPFMVDLHDQVHQGPVPLSYTVTTVTTQGFPLPAGQHIPGCSAQQLPACSVMFSGQHYPLCCLPPPQLPVPYQAYPHLISSDHYILHPPPPAPPPQPTHMAPLGQFVSLQTQHPRMPLQRLDSDVDLRGDQHPLGSFTYSTSAPGPTLSPSVPLHYLPHEPLPQELPFGMPYSHVMPRRLNTQRYRLQQPLPPPPPRKTQSLTVYNSR	657961	647567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_648430_650946_651025_651120_651283_651377_651528_651850_652019_652417_652544_652784_652936_657827
766669	contig_15732_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_88919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCAACTTTAAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367313	369408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_367300_369400
766675	contig_7730_pilon	-	1151	6	Intergenic	novelGene_156246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	677.563753457931	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	185	664	43591	2302	TRUE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSKKKNFP	43775	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2086_2205_2325_2370_2445_4051_4177_7798_7895_43429
766680	contig_7695_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_41568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	58	699	390227	388811	FALSE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	390284	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793
766682	contig_8354_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_24168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCTAAGGTTCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598446	597047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_597000_598400
766683	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
766684	SIRV4	-	341	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	23	1157	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
766690	contig_12644_pilon	+	1090	9	Intergenic	novelGene_44632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5178.11286661222	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	327	1034	2678055	2680545	FALSE	50	ATAAAGACCTTGATCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGSRRVERSVAFPKACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675515_2677216_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680472
766693	contig_12638_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_33266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832854	830282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_830300_832900
766696	contig_401_pilon	-	1189	3	Intergenic	novelGene_42886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.5	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	96	995	1779305	1778115	FALSE	20	TAATGCTCAGATGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTSDANFSCYHESVLGYRYVAVSWGIVVAVTGTLGNVLTLLALAIQPKLRTRFNLLIANLTLADLLYCTLLQPFSVDTYLHLHWRTGANFCRVFGLLLYCLIHRQVKRAAQALDQYKLRQASVRSNHVAGIDEAMPGRFQELDSGLSSGGPSEGISSEPVSAATTQTLEGNSSEVGNEGKSKMAKQMAEGSPPEAPAKARPTKGAQKAQDSSSEFGKVTRMCFAVFLCFALSYIPFLLLNILDARVQAPRVLHMLAANLTWLNGCINPVLYAAMNRQFRQAYGSILQRGPQSFCRLR	1779897	1777920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1778714_1779004_1779314_1779810
766697	contig_9752_pilon	+	2145	2	Intergenic	novelGene_122001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCGCCAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17585	21671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_17677_19617
766701	contig_19899_pilon	-	1617	6	Intergenic	novelGene_102521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	1	junction_4	87.9554432653261	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	156	578	144526	140028	FALSE	25	AGATGTTTGTCCAAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156638	138988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_145500_145554_156555
766702	contig_3986_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_52712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATAGCCACCCTGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61581	62990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_61600_63000
766707	contig_5260_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_144395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443586	441695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_441700_443600
766713	contig_12919_pilon	-	1919	16	Intergenic	novelGene_75884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_15	118.502770713037	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	94	1851	683435	667822	FALSE	55	TAAAAAAGAAAAGTATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASGHSPLAPLLETLEDASASNAEQTDAYLTLASRITGEEGKEIIMEVEKNLPQLYKVFKTHISSQNSELSSAALQALGLCLYNPKISSGLSESNIQELLSKLNDTVKTSDKNVRTRALWVISKQTFPTEVVGKAVSSIIETLEIVLNKGEMHSAIVDFEALNVIIRLIEQAPIQMGEESVRWAKLVIPLVVHSAEKVHLRGATALEMGMPLLLQKQHEIASITEQLMTAKLISELQKLFMSKNETYVLKLWPLFVRLLGKTLHRSGSFINSLLQLEELGFRSGAPVIKKIAFIAWKSLIDNFALNPDILCSAKRLKLLMQPLSSIHVRTESLALTKLEVWWYLLMRLGPHLPANFEQVCVPLIQSTISIDSNASPQGSSSRVTTPNLNPMTPVHKGASPYGAPVTPRMNLSSNLGGMATIPSIQLLGLEMLLHFLLGPEVLSFAKQNKLALSLEALEHPLISSPSFFCKHANTLITAVHDSFVTVGKDASDSVINAVWKELINLVKSVIESGNKKEKPSSDVLTLVLKSLESIVKSEVLPVSKTLVLMEITIKGLPQKVLGSPAYQVANMDILNASILNVMTD	683700	667753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_667939_669617_669719_669995_670059_670788_670900_671132_671307_671991_672107_673449_673602_674447_674587_675459_675553_677549_677740_678656_678752_678848_678977_679888_679986_682512_682592_683331_683446_683617
766714	contig_10766_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_151194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGCTCAGCTGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125290	124797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_124800_125300
766715	contig_2940_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_81977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGACCATGCCTAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096475	1094102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1094100_1096500
766717	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766722	contig_4782_pilon	-	1489	7	Intergenic	novelGene_73635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	3	junction_6	18.7171935218219	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	306	1202	412864	391964	FALSE	20	ACAACTTTACTGTCTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVWESSGQWMFSVYSPMKKEPNISGFTDISPEELRLQYHNYLTSNSLQSYLNSIQQLIDQWRKRVNELKTLNTSTKVTLLSDVKAGVSQVAPAFGFGSGQTSTFESAGFPVNNISSDNARNFSFKPSSAFVTAPSGNPSVFGSLPAFGAAPSASITTSASAFGFGKPKITSASSFSFKSPAASGFGSPGFSVFPASLAAGPVGAPAAAGFGSGSSVAGCGGPGSHSNTAFSKPSNNISGNSNIATSLPVSNGCIITDNVLFTPKEQLTAEELEQFQSRKFTLGKIPLKPPPVELLNV	418015	391676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_392536_393199_393285_397143_397231_397970_398048_412788_412884_414170_414400_417958
766729	contig_6279_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_164764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAATTATAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85981	85076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_85100_86000
766730	contig_3243_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_147534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATTGTATATCTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29797	27614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_-_27600_29800
766732	contig_1641_pilon	-	1847	3	Intergenic	novelGene_172794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	17	147	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	147	485	20633	12883	FALSE	20	TGGGTTATCTAGTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEEAHSGGEGGSGGARGRGSGGGSTSKTCNYEGCSETTSQVAKQRKPWMCKKHRNKMYKDKYKKKKSDQALQCGGAASASSAGNVKLEESADNILSIVKQRTGSFGDRPARPTLLEQVLNQKRLSLLRSPEVVQFLQKQQQLLNQQVLEQRQQQFPGAPM	20779	11520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_-_12994_15349_15458_20513
766733	SIRV4	-	245	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	369	3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
766738	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_93499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
766745	contig_11986_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_69238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784877	786104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_784900_786100
766746	contig_8683_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_150245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510715	512253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_510700_512300
766749	contig_6576_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_42454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATTCCTTTAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336678	1337489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1336700_1337500
766750	contig_5445_pilon	+	1061	4	Intergenic	novelGene_135428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	108.542874273513	1451	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGCTGGCTCCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124384	131343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_124603_124700_124922_126545_126658_130833
766753	contig_12119_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_88651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213155	212832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_212800_213200
766754	SIRV1	-	241	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	2	3587	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
766755	SIRV7	-	537	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-38	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114954	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78935_114680
766757	contig_6028_pilon	+	2083	1	Intergenic	novelGene_156559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTCTTGACCTTGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215402	217485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_215400_217500
766759	contig_7179_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_78179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGATGGGACAGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168002	1169083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1168000_1169100
766761	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
766762	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
766765	contig_3601_pilon	+	1676	3	Intergenic	novelGene_132923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2	128	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	153	305	355434	355925	TRUE	30	AAATTTTGTCAGTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAGLLEAGLTGSLNPSPQAATAGADLLRSGSAHCAALRRCAVTPAIANGMMLVNVEGVDSAASHVPWAGARQGARAVPSGDPAVLPGTERGGSGPRRFD	355281	364264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_355577_355915_355968_362935
766773	contig_11986_pilon	-	1933	2	Intergenic	novelGene_69248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCACCCAGTTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810523	804676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_805399_809312
766781	SIRV6	+	517	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1604_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766782	contig_10734_pilon	+	1183	7	Intergenic	novelGene_51297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.796022608326	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	204	545	1377357	1388787	TRUE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAEQTRPLSLLRTTSSW	1368584	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377340_1377453_1378250_1378362_1378533_1378621_1388739_1388854_1388927
766783	contig_9683_pilon	-	3401	5	Intergenic	novelGene_151279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.40758586040012	77	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	425	2131	486025	483589	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLLRGGSPFRTLLPLRGEWMGRRGVPRSLVPGPPRRRYRKEALPALDVPVLPVTATDIRQYLRTHGIPFQDGHSCLRAPSPFAGASQHKDHAGGTTSFSLFIDKTTGRFLCMASLAEGSWEDFQASVEGRGDATKEGVLLSKAPEPVDSEEVRRIWDRAVPLWELPDPQEAQLARVMFGLSKVTDDTLKRFSVRYLRPARSLVFPWFSPGGLGLRGLKLVGAEGQGDGVHYVETTIPRPGAFHNLFGLPLINRRDVEVVLTSRELDSLALNQSMGLPTLALPRGIACLPPALLPYLEQFRRIVLWLGDDLRSWEAAKLFARKLNPKRCSLVRPGDQQPRPLEALNQGLNLSRILRSALPAWHRSIVSFRQLREEVLGELSNVEQAAGVRWSRFPDLNRLLKGHRKGELTVFTGPTGSGKTTFISEYALDLCTQGVNTLWGSFEISNVRLARVMLTQFAVGRLEEQLDKYDEWADRFEDLPLYFMTFHGQQSIRTVIDTMQHAVYVYDICHVVIDNLQFMMGHEQLSTDSNLFVGLGQDCSSRLHCRGLPEVRYRQQLPCDIGHSPP	486449	481393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_482612_483536_483704_483996_484105_484348_484590_484782
766784	contig_18859_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_150535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCAATTACAACACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56866	58434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_56900_58400
766792	contig_5894_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_83057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAATAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569775	569396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_569400_569800
766793	SIRV7	-	258	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69007	15	35788	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
766794	contig_6031_pilon	+	866	8	Intergenic	novelGene_56730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	581.020636115308	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	69	866	149114	165981	FALSE	20	TAATAGCATCCTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAPGLKKEPLPLLLPLKWLGLCINKNSAFGK	149045	165981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_165761_165787_165891
766795	SIRV6	+	503	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766796	contig_12239_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_170469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	79.2162223066918	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	187	1059	24698	74567	FALSE	45	TAAATGCAATATAGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQRKHLVKDFNPYITCYICKGYLIKPTTVTECLHTCPGAAWPGTGCHLCHQPDSCDQPAHAVSSHLPKEDVCKTCIVQHFEDSNDCPRCGNQVHETNPLEMLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQLERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENFRCLNCSASQVCPQDGPLYQSYPMVLQYRPRIDFG	24511	75644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_24810_41218_41324_45246_45344_47054_47111_47225_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_67985_68046_74519
766798	contig_13924_pilon	+	1707	6	Intergenic	novelGene_147781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87.9408892381695	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	746	1180	45587	60812	FALSE	30	TCTTTGAAGATGAATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYNNEIVGKGRNEVNQTKNATRHAEMVAIDQVLDWCHHSGKSPSEVFEHTVLYVTVEPCIMCAAALRLMKIPLVVYGCQNERFGGCGSVLNIASADLPNTGKPFQCVPGYRAEEAVEMLKTFYKQENPNAPKSKVRKKECQKS	38870	61339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_39571_45541_45647_48444_48596_51867_51975_60600_60674_60768
766799	contig_5935_pilon	-	1935	3	Intergenic	novelGene_102707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	9.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	689	1435	1028481	1021110	FALSE	10	TACTGTGTGTTTCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRKLVKHRIRHTGERPYSCSACGKCFGGSGDLRRHVRTHTGEKPYTCEICNKCFTRSAVLRRHKKMHGKADMESRSAPEGFSRVIEAPDLDRSQSSDSFSQDMSVTLMPLSVKLPVHPAENSTTEFDSHSAGPYCKLRPMIQSHGISDQEKLSLDPVKLAKPQMQPTAHPAYAYGDVEASAVDEPLPADSMSIIRSSLAALDNHCSDALGSRAPSTAYRNSEGQFFSSMTLWGLAMKTLQNESELDQ	1029258	1020609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662
766802	contig_7020_pilon	+	2148	2	Intergenic	novelGene_57057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	12149	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTATCAATACAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79468	81759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_80017_80159
766803	contig_7057_pilon	-	1320	6	Intergenic	novelGene_123224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_5	34.4034881952397	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539741	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537616_537717_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539654
766806	contig_11171_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_48616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245852	244091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_244100_245900
766807	contig_3975_pilon	-	1521	9	Intergenic	novelGene_54860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	193.045169584737	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	503	1237	2064115	2056837	FALSE	45	GGACCACAAGAGAGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2065303	2056552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059848_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204
766808	contig_12586_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_121797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	114	542	38393	37965	NA	30	TTGGATTGTAATACCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQAILTIMGFIREVTGYNSGSGISGNSSSIRTASCQSCHRHATLWPLGLCPALSSVTKLLALPISAQRHPTPPVSLGPEALSCLTPWAGKSTVPSPAGPGASQHRDPGSKRHAPLLALLRCCWWIPLSALELVLFSA	38506	37476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_37500_38500
766809	contig_8330_pilon	+	1624	6	Intergenic	novelGene_71979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	703	1047	2038893	2040639	TRUE	45	GAGAAACATGGCAGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFSLSWGLAKIILCSLFIYESMVSTVGVSPLPEARACWQSCWSTPAAGSPSAAVGLCCGSAPGLHPPPASPLLCACSPRAFAGLHSSLQTPCWTSEADGALLPGLCCGSGILL	2038190	2056547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2038995_2039683_2039897_2040609_2040688_2052210_2052364_2055968_2056101_2056303
766810	contig_8589_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_107367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277271	274724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_274700_277300
766811	contig_17198_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_62405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	22.6163657557973	534	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	33	497	1100207	1102744	TRUE	30	TTTTAAGGGGTCGTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRRSSAAWAMVQLRPRASCTPAEADAMVDEGQPASEEVAEHGLLLGQPSSGAAAEPLEEDEEGDDESDDEAPEELTFASAQAEAREEERRVRETARRDKILLKEKRKRREELFIEQKKRKLLPDAVLEKLTTTSQTNIKKSPGKLKEGTTHRSNLSGERQVRL	1100174	1103961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1100470_1100544_1100606_1101271_1101331_1102662_1103458_1103786
766812	contig_1948_pilon	+	1073	5	Intergenic	novelGene_31160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	143.285335955917	770	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	309	836	478740	485694	FALSE	10	CTTTTAGTTTTGTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIVGSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKEITPPEDINDTQSDIIFFMKNVEGHDEKTQFESSSYPGYFLASEKDADLYRLILKEKNQIGDNSVMFTVDLQELGVKYS	468381	485931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_474126_474214_478739_478891_480516_480654_485454
766814	SIRV6	+	355	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
766816	contig_6673_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_164032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAATAAATATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160427	161829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_160400_161800
766817	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	81	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
766818	contig_18173_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_160764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGATTTCTGAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33959	35270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_34000_35300
766819	contig_8377_pilon	+	1920	5	Intergenic	novelGene_35162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGGGCAGAGAAAGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339267	425261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_340321_350795_350985_352217_352635_381078_381243_425164
766820	contig_7376_pilon	+	2723	1	Intergenic	novelGene_108092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGCAACATTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133785	136508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_133800_136500
766822	contig_18970_pilon	-	727	3	Intergenic	novelGene_157816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	13.5	3188	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38926	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31813_33342_33462_38787
766824	contig_5424_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_172816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATGAGATTAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148751	149169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_148800_149200
766825	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	23	361	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14431	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
766826	contig_16907_pilon	+	1958	4	Intergenic	novelGene_87446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	14.7271480229163	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	971	1315	417826	426888	FALSE	30	TTGCATATCTGAAAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSYPNEEKDAWDVKTLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKVCSFYFLTSVMPHLFL	414935	427531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_415852_417771_417886_426491_426637_426748
766829	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	16	342	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14424	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
766830	contig_7202_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_18759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30105	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
766831	scaffold_12124_pilon	-	1170	2	Intergenic	novelGene_22127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGAATAGTTCATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939374	936967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937111_938347
766834	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1681	0	-218	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2805	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766835	SIRV6	-	415	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-127	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCTGGTTTCGACTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10722_10825_11035_11109_11205
766838	contig_14683_pilon	-	2847	2	Intergenic	novelGene_166046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	72	329	151603	151346	FALSE	45	ATCCCTTGAAAGACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLLEAGADANRVNCFGRRPIQVMMMGSTPVAELLLLHGAEPNCADPVTLTRPVHDAAREGFLDMLMVLHRAGARLDVRDAWGRLPVDLAEERGHRDVARYLRAATGD	154097	148827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_151607_154029
766839	contig_401_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_42868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGTCCAGCACACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725186	1724487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1724500_1725200
766840	contig_21416_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_172818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116828	114756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_-_114800_116800
766841	contig_15498_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_42705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGCCAGGCACCATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907739	908178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_907700_908200
766849	contig_3380_pilon	-	1268	6	Intergenic	novelGene_60082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90.7493250663607	102	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAGCTGACTTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325104	60429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_61224_84891_84950_221344_221403_221495_221612_226563_226680_324978
766850	contig_15691_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_60768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65379	67081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_65400_67100
766851	contig_1918_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_168325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCCAAAGGCCACATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37172	36636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_-_36600_37200
766852	contig_8330_pilon	-	2162	10	Intergenic	novelGene_71738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	40.8520365329427	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	50	595	526197	519079	TRUE	10	TACCTCTCAGTCCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRREDQRRKRERERERMSLSDWHLAVKLADQPLAPKSILRLPETELGEYSLGGYSISFLKQLIAGKLQESVPDPELIDLIYCGRKLKDDQTLDFYGIQPGSTVHVLRKSWPEPDQKPEPVDKVAAMREFRVLHTALHSSSSYREAVFKMLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGVLQDKDLFSVFADPNMLDTWLPV	527614	514283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519763_519822_520379_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_527594
766857	SIRV4	-	251	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1272	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3886	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
766860	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
766862	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
766865	contig_6710_pilon	+	550	2	Intergenic	novelGene_95246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAGCCACAGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
766866	contig_11227_pilon	+	2078	2	Intergenic	novelGene_163206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	455	junction_1	0	738	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1163	1534	316413	320251	FALSE	15	CTAGAGTGTCAGCTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFASLLFTEDSMCCLKNGCCADICVCHFVPELRAEVDIIEQMSSSGSSSSDSESSSGSDDDSSSSGGEDDAPASPPQPSHQQAYNSRPAVANGTSRPQGSNQLMNTLRNDLQLSESGSDSDD	315250	320795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_316738_320204
766872	contig_12123_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_144608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	2	9	401	409	140946	140938	NA	45	AACTGCTAACCGAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNKRSRHCQHVVQCQDFSLNTEACVRILLLDTEEGNLAWREPDSKPDCLHTPSDGDDNVNPHKCLPLKRKIIIKNPSETLKEQPLEISVNSSKQERLSLSPYHSEILSSDSELNGNKKVSWYYFLSQCRCVSNMF	141346	140168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_140200_141300
766873	contig_13854_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_154116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29771	28630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_-_28600_29800
766875	contig_9098_pilon	-	2016	12	Intergenic	novelGene_75850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	173.947365459823	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	707	1576	345261	335775	FALSE	20	CTTGCTATTTATATCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350567	335334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347767_347832_348546_348660_349535_349712_350328
766876	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657822	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWHQAGAQNDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653878_657793
766879	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	51	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766881	contig_10042_pilon	+	1178	7	Intergenic	novelGene_79201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	67.143503036407	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	247	684	1060566	1067625	FALSE	10	GTTTTTGTCTCAGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHKMEPSSYAAEPVSDSGLPALSPPSLRCVPPPAAAVIVPTYSTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQRM	1028995	1068119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1060511_1060696_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526
766884	contig_5935_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_102752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322823	1320727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1320700_1322800
766885	contig_4392_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_117303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	261	425	273265	273101	NA	10	TATTTCTTCTTTGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRVVLGAGSLERISSLSGDEHAPSSQRETHLSERTEGTGAQNPTRNWSLGSHGAGPDGVHAPHVVLGPDAGLWRPPARERHRGVAMGGALGCPAEPDEKVALCCPAPCAGSLFALWHPSLLPTAMGDPEWAEGVHVPAL	273525	271079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_271100_273500
766889	contig_11931_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_159902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAGATGGGAAAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132361	132081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_-_132100_132400
766890	contig_16999_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_85015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGACAGTCTACTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375903	377048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_375900_377000
766892	contig_8587_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_159111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTCAGCAGCTGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126795	124685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_124700_126800
766893	SIRV7	-	299	3	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	35774	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70995_78841
766896	contig_10609_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_123948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	503	838	470292	469957	NA	65	AAAAAAAAAATCAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQGIQVKSNSKLTFYPTQKNLPVNGSVKLFPYISQKQQGWWQERRSVFFLSTWVFLSLQLQQPPLMSEDFLFIFKGVVITRLSYTAITGDANWNLAPLSSPLPLVILLC	470794	468642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_468600_470800
766897	contig_12427_pilon	-	1316	3	Intergenic	novelGene_40443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	20.5	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAACCTCCCTGTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282935	277732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_278516_278880_278968_282489
766900	contig_15304_pilon	-	612	2	Intergenic	novelGene_30441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	367	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	540	569	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53665	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
766903	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	51	502	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766906	contig_6710_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_93566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653793	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
766907	SIRV6	+	532	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	38	-2	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766908	contig_12270_pilon	-	289	2	Intergenic	novelGene_114119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGACTTCACTTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14431	13919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
766909	contig_1339_pilon	-	1954	7	Intergenic	novelGene_163095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	34.5912641508742	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	114	1118	69567	44871	FALSE	20	TTTCAACCATTTTTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYLLPLSLLGTAVGGAVLLKDYVGGGACPSKATIPGKTVIVTGANTGIGKQTALELAKRGGNIILACRDMEKCEAAAKDIRGQTLNHHVNARYLDLSSLKSVRDFARKIIEEEERVDILVNNAAVMRCPHWTTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLDKLKASAPSRIINLSSLAHVAGHIDFDDLNWEKKKYDTKAAYCQSKLAIVLFTKELSRRLQGTGVTANTLHPGVARTELGRHTGMRTSTFSSFTLGAIFWLLVKSPQLAAQPSTYLAVAEELESVSGKYFSGLKEKAPAPEAEDEEVARRLWAESARLVGLDMSDGSSDGGQPLPK	69680	44034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_45116_46538_46641_48221_48435_59283_59389_65090_65247_66412_66532_69502
766910	SIRV6	+	708	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10241	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10748_11031_11109_11205
766911	contig_8762_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_145286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGACAACCCCGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67343	67980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_67300_68000
766913	contig_9668_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_58249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAATAAAGCAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603796	603126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_603100_603800
766916	contig_2710_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_161796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066930	1069238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1066900_1069200
766920	SIRV6	+	170	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	562	51	562	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10799	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766922	contig_14513_pilon	-	1270	4	Intergenic	novelGene_70299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	185	640	18880	11918	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGNVSWIPCGCSSPTPLRITPTSSSFSRVPSTWPSWDSVCSEERQSMAVERVRNRWWHKGAIFSSSCILPRAVC	19064	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12136_13090_13136_14952_15001_18735
766923	contig_16098_pilon	-	343	2	Intergenic	novelGene_46005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1211	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348961	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845
766924	contig_12532_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_111158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATACTGTGGTTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128405	127182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_127200_128400
766928	contig_7410_pilon	+	1164	9	Intergenic	novelGene_106091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	237.668328506345	932	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	103	516	405351	407457	TRUE	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405248	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407537_408138_408214_408298_408401_410366_410421_411209_411246_411881
766930	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	70	501	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766935	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766937	contig_15073_pilon	-	2636	8	Intergenic	novelGene_172823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	7.04504457482169	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	475	2115	405213	281334	FALSE	30	CAATTTATTTTATTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIYSPDMSEEAAERSSSPSTQLSPDPSVDGLPAAEDMPETQTEDGRTPRLVGLAVPCCVCLEAERLRGCLNSEKICIVPILACLVSLCLCIAGLKWVFVDKIFEYDSPTHLDPGGLGQDPIISLDPTAASAVWVSSEAYTSPVPRAQSETEVQVTVRGTSAAVSSEPSAAPTPKNRIFAFSFLPSTAPSFPPPTRNPEVRTPKSAVQPQTTETNLQTAPKLSTSTSTTGTSHLVKCAEKEKTFCVNGGECFMVKDLSNPSRYLCKCQPGFTGARCTENVPMKVQNQEKAEELYQKRVLTITGICIALLVVGIMCVVAYCKTKKQRKKLHDRLRQSLRSERNNMVNMANGPHHPNPPPENVQLVNQYVSKNVISSEHIVEREAETSFSTSHYTSTAHHSTTVTQTPSHSWSNGHTESIISESHSVLMMSSVENSRHSSPTGGPRGRLNGVGGPREYNSFLRHARETPDSYRDSPHSERYVSAMTTPARMSPVDFHTPSSPKSPPFGNVSTCVQHDGLHALHACQPLHGRRETLTAGDTTTASGEEA	405687	280812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15073_pilon_-_281542_284273_284481_285472_285604_288296_288424_290792_290896_303214_303283_317072_317203_404546
766945	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8137	-1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
766947	contig_4812_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_103698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTGTGGGATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301450	299551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_299600_301400
766950	contig_11012_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_163688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTATGGGTTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427365	425503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11012_pilon_-_425500_427400
766951	contig_8310_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_75548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTACGACTATTATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185870	185559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_185600_185900
766952	contig_5921_pilon	-	1940	2	Intergenic	novelGene_142252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	470	796	395777	395451	FALSE	10	ATTGTCTTTGTTCTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTQPLSALAIIYLLLKIDLFFREPCWILNSCGPLPDHLLMSWKKWQGLYQCLSLRERQCEKRQDSSILCSDQQVSESVLCASDFDTFFFHFTFFSFFSFPEYQLCI	399916	394306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_396187_399856
766953	contig_10324_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_7872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAACAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504865	502739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_502700_504900
766955	contig_5799_pilon	+	1514	2	Intergenic	novelGene_50324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_1	0	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	252	620	671828	675080	FALSE	85	ATTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMGKGIQ	671576	675974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_672050_674933
766957	contig_6079_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_160119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGATATTTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502701	504111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_502700_504100
766958	contig_10235_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_46534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGGCCAGAAAACGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362332	360784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_360800_362300
766962	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
766963	contig_14575_pilon	+	2171	20	Intergenic	novelGene_101886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.514065109416	1	91	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1122	1847	32830	54480	TRUE	40	GGTGATAAACATGACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLRHRSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQYLKLKTSLGRFLHCTLMKDLIVWPTVESEACI	19979	59966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20124_20871_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_32691_32850_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_54381_54491_57257_57379_59266_59376_59882
766965	contig_7993_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_170968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAAACCTGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39605	40912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_39600_40900
766970	contig_13457_pilon	+	1013	6	Intergenic	novelGene_118331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	148.366303451963	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	134	733	56157	57730	FALSE	25	ATTCCCGATGGCCTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	56023	58010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56786_57348_57502_57583
766972	contig_5602_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_133046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATTGGGTTTTCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688625	687521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_687500_688600
766973	contig_13905_pilon	+	1535	3	Intergenic	novelGene_130420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	11	1690	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	88	408	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218426	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438
766974	SIRV6	+	270	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1642_1736_2780_2829_3106
766978	SIRV6	+	333	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	19	-244	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
766979	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
766980	contig_5936_pilon	+	2212	6	Intergenic	novelGene_53591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	12.0332871651931	59	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	18	1688	466551	506527	FALSE	45	TATGATAATGTAAAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNHQLTHLQSLLNNNQMFPPNQQQQQLLQGYQNLQTFQGQSTIPCPANNNPMACLFQNFQVRMQEDAALLNKRISSQPGLTALPENLNTTLLPFQDTPCELQPRIDPPLGQQVKDGLVVGGQGDASVDAIYKAVVEAASKGMQVVITTAVNSTTQISPIPALSAMSAFTASIGDPLNLSSAVSAVIHGRNMGGVDHDGRLRNTRGVRLPKNLDHGKNSNEGDGFEYFKSASCLASRKQWDGEQSPGGEQNRWKCEEFLDHPSHIHSSPCHERSNNVSTLPFLPGEQHPIMLPPRNCQGDKILEENFRYNNYKRTMISFKERLENTVERCAHINGNRPRQSRGFGELLSTAKQDLVLEEQSPSSSNSLESSLVKDYIHYNGDFSSKSINGCVPSPSDAKSISSEDDLRNPDSPSSNELIHYRPRTFNVGDLVWGQIKGLTSWPGKLVREDDVHNSCQQSPQEGKQCWINEVLWINKQTSAFKKVEPEKLKTLTEGLEAYSRARKRNRKSGKLNNHLEAAIHEAMSELDKMSGTVHQIPQGDRQMRPPKPKRRKISR	466533	507051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_466734_469967_471177_473578_473636_483443_483518_502324_502401_506455
766985	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_90554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
766989	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	54	525	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
766997	contig_4232_pilon	-	801	7	Intergenic	novelGene_63163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	131.439466422127	471	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	73	690	90898	88928	FALSE	5	TCGGTGTCTCTCCCAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKQARGPGGCGRRRWARRVGRGPEMPSKKKKYNARFPPARIKKIMQTDEEIGKVAAAVPVIISRALELFLESLLKKACQVTQSRNAKTMTTSHLKQCIELEQQFDFLKDLVASVPDMQGDGEDNHMDGDKGARRGRKPGSSSRKNGGMGSKGKDKKLSGTDSEQEDESEDTDTEGEEETPQPPPQASHPPAHFQSPPTPFMPFTSTVPLPPAPPGPSAPDAEDEEDYDS	90970	88816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_89034_89375_89465_89719_89814_89927_90048_90362_90457_90547_90621_90856
766999	contig_12270_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_114061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTTATTACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
767005	contig_8020_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_114444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327088	325697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_325700_327100
767006	contig_1154_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_87187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGCGTGGTGCAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007959	1007686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1007700_1008000
767007	contig_1154_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_87186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTAGAACATAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006972	1006719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1006700_1007000
767008	SIRV6	+	543	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	26	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767012	contig_16211_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_150093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGGAGACTTTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191940	190007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_190000_191900
767013	contig_8615_pilon	-	2174	6	Intergenic	novelGene_165224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	59.0978849029303	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	272	817	276688	250672	FALSE	10	GGGAAGCTTGTGTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDAASYERFSGAVRRQVHSLRVILDNLQAKGKERQWLRHQATGELDDAKIIDGLTGEKAIYKRRGELEPQLGSPQQKPKHLRLVVDVSGSMYRFNGVDGRLERSMEAVCMVMEAFENYEEKFKYDIVGHSGDGYNISLVPMNKIPKDNKQRLEILKTMHAHAQFCMSGDHTLEGTKHAIKEITKEEADEYFVIVLSDANLSRYGIHPDKFAQILTSNPQVNAFAIFIGSLGDQATRLQRTLPAGRSFVAMDTKDIPQILQQIFTCTMLSSV	308967	249314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_250781_252896_253136_254028_254128_276589_276749_279038_279165_308882
767014	contig_6132_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_163619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGAATCTAGACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176290	178130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_+_176300_178100
767019	SIRV6	-	418	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-127	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCTGGTTTCGACTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3165_10723_10825_11035_11109_11205
767022	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	10	404	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767023	contig_2214_pilon	-	1489	13	Intergenic	novelGene_144246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_12	37.4685052929642	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	7	1410	277156	231326	FALSE	45	TTTAAGACAACAACAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLMNSLAVKLRENLALPKKKKPIALKPLLRQTVNVDGFICRACTFLVQCSSQKDYVILATRTPPKEEQNESLKHPKDKMDNLDEEWVTEHANQVSRMLPGGLLVLGVFIITTLELANDFQNALRRLVFAVEKSMNKKKLWSFTEEEVSERVTLHICSSTKKIFCRTYDIRDPKSSARPADWKYQNGLSTSWLSLECTVHINIHIPLSTTAVSYALEKNTKNGLTRWAKQIENGVFLINGQVKDEDCDLLQGQKKSSRGNPQVTYQSFDVRVLTQLLLSSDHRSTATVQICSGSVNLKGAVKCRAYIHNSKPKVKDAVQAIKRDILNTVADRCEILFEDLLLNEIPEKKDSEKELHILPHRVFVPISGSTVMLCDYKFGDEAAEEIRDHFIEMLDQMIQIEDLEIAEEINTACMSSSMDSEASLDFTDDEQAKQPLKTTIVLKIQQNIGVITAFAVAVLAAGISFHYFSD	277162	231246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_231394_232734_232846_243949_244136_249120_249212_250377_250507_254150_254220_255796_255893_256703_256845_257771_257809_259060_259168_261250_261347_265712_265848_277018
767026	contig_13305_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_146770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAACTCACCCACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67245	67471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_67200_67500
767028	contig_13015_pilon	+	1208	11	Intergenic	novelGene_165565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_10	31.5620024713262	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	14	1021	396085	427161	FALSE	45	CAATTGAAAATAATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGALEAAAVAVVEVGSARQFEELLPLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMTELAKEHPQVSFVKLEAEAVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQSIDRLDGAHAPELTKKVQRHASGSAFPPSTKEHPKEDLNLRLKKLTNAAPCMLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAPKLEERLKALTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTDVEYETFDILEDEEVRQGLKAYSSWPTYPQLYVKGELVGGLDIVKELKENGELLPILRGEN	396071	427348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411107_411310_416546_416720_416945_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
767034	contig_7357_pilon	+	1687	13	Intergenic	novelGene_36875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	118.212731970799	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	685	1224	269181	273311	FALSE	30	GATTGAATTTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250812	273774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258041_260054_260110_263525_263646_268170_268233_269085_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
767035	contig_3627_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_78423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAGGGTATTTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171541	171836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_171500_171800
767038	contig_10765_pilon	-	1623	4	Intergenic	novelGene_122853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1228	1527	18497	15716	FALSE	30	AGCCGTAACTCCGTACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLQQIRSFAFVPLRRTSSFEINGGYRDPIIPSFLLDSAEVSSSMMGENPGLLSWFQSFVVWSTDEFFSMTQGFHFHLSIRHLTLQLCIDLYLLIKTF	35082	15619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15765_18246_19328_32493_32549_34740
767039	contig_5954_pilon	-	1057	5	Intergenic	novelGene_28606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	617.291412138546	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCGTCCTTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960590	944720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_959808_959941_960474
767048	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
767050	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	53	513	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767051	SIRV6	+	511	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	39	11	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767055	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-29	878	-29	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8286	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
767062	SIRV4	-	468	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1055	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
767063	contig_16125_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_155211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTGTCATGTATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48427	47677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_47700_48400
767068	contig_10235_pilon	+	2174	4	Intergenic	novelGene_46427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	194.444507936498	1	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	18	680	210483	212204	FALSE	20	CGAATGTCCTTGGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRHSSPPFRACSMRIWTRWPSEAPAGCPPQSLLMPPPSMQLLSEGKPLLQISQSEAHSSP	210465	213698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_212026
767069	contig_7657_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_30001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAATGGGTGGTGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71508	71794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_71500_71800
767073	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
767078	contig_3018_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_78777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380983	379128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_379100_381000
767079	SIRV6	+	477	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	485	0	306	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767091	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
767092	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	42	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
767093	contig_6102_pilon	+	1055	2	Intergenic	novelGene_32226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATTTGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896026	897348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_896363_896629
767095	contig_2854_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_120887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATTAGCAATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124935	1125110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1124900_1125100
767096	contig_2854_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_120888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125924	1127460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1125900_1127500
767101	contig_16685_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_115045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAAAACACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444181	445808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_444405_444591
767102	contig_9578_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_67985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGAGAACACTGTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176444	1175559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1175600_1176400
767107	SIRV6	+	456	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	102	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGGTATAGTAGATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10726_10819_11031
767108	contig_6217_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_109565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTACCTCCCTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40171	38060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_38100_40200
767111	contig_3018_pilon	+	1609	2	Intergenic	novelGene_78769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAGAAAAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370838	456622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_455281
767115	contig_11173_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_156906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATCGACAATCTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432333	431777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_-_431800_432300
767116	contig_1009_pilon	-	1961	9	Intergenic	novelGene_121769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_8	32.8212488336443	581	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	76	837	356355	301449	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIPFKIGQPKKQIIPKTVERDFEREYGRLQQLEDQTKRLQKDMKKSTDADLAMSKSAVKISLDLLSNPLCEQDQEFLKMVTALDTAMKRMDAFNQEKVNQIQKTVIEPLKKFGSVFPSLNMAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356430	300324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_312563_313138_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_356347
767119	contig_500_pilon	-	1607	11	Intergenic	novelGene_30960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGAGACGCTGACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480949	1446838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1446943_1452276_1452358_1454477_1454590_1460704_1460789_1461319_1461548_1464028_1464133_1466064_1466283_1468833_1468910_1469129_1469323_1477833_1477924_1480632
767124	contig_1450_pilon	-	1356	3	Intergenic	novelGene_27432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	397	738	423081	422740	TRUE	5	CCCCTCGCCTTTCTCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKRKVVGEPPPGSPILGAKRLASSWLEKAKGLLVPSGRVGEPRRSSALRMGGGVMDVGLSSSPVAAAVAAALGNPAKLKLCWRRGRSAERSRAPARARRSSALWMKWQRGP	425090	419724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_419895_422291_423295_424907
767131	SIRV1	-	241	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	1	3588	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
767132	SIRV4	-	377	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1146	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767135	contig_10235_pilon	-	1461	7	Intergenic	novelGene_46264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.61876193118	68	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	158	991	25335	19534	TRUE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27155	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14114_19219_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
767136	contig_4816_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_115609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAATTAAAAGAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659199	661027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_659200_661000
767137	contig_3787_pilon	-	1628	2	Intergenic	novelGene_102435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGTAAGAAGTTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646412	641056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_642647_646374
767140	contig_6710_pilon	-	482	2	Intergenic	novelGene_98097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767145	contig_5346_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_161852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTGCAGACAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133911	132877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_132900_133900
767146	contig_19459_pilon	-	820	5	Intergenic	novelGene_59874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4395.20775248452	1325	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	168	551	16240	6939	FALSE	10	CTGTCTTCTTGTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAEVILASDIIQ	19131	6669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6964_12579_12704_15503_15702_16203_16265_18988
767151	contig_10792_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_161007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAAGGCAAACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143295	142721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_142700_143300
767154	contig_16882_pilon	-	930	5	Intergenic	novelGene_148201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4018	junction_4	583.05124131589	1821	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	405	896	188737	181967	FALSE	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	189141	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187625_188683
767157	contig_2069_pilon	-	1232	6	Intergenic	novelGene_23435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	5	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	128	400	1331269	1327936	FALSE	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFINPPEPEQCEEEARTTPGSTKARAPLHPRVQRLRPAAVATMPKRKAEGDAKGDKAKVKDEPQRRSARLSAKPAPPKPEPKPKKAPAKKGEKVPKGKKGKADAGKDGNNPAENGDAKTDQAQKAEGAGDAK	1331396	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
767158	contig_13366_pilon	-	2264	14	Intergenic	novelGene_99763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	270.768291082286	6	116	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	62	1429	177621	38241	TRUE	30	CTTTTGCCCCAAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPGGAGRTAPRSAHASTRAMGGSASSQLDESKCAYIRGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVITGDEVQILSNLVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELADGKCSIHI	177682	26922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_27456_29836_29949_35679_35788_38158_38274_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49267_56149_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113726_116845_116977_177566
767162	contig_5020_pilon	+	799	2	Intergenic	novelGene_27954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	739	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTGCTTGATCACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198458	201811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_198614_201167
767166	contig_19604_pilon	-	1410	11	Intergenic	novelGene_77228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_10	34.3075793375167	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	129	1106	266343	255934	FALSE	0	TGGCTGTGTTTTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTTPDELLSAVLTAVLQDVNLSPAELGDICVGNVLQPGAGALMARIAQFLSDIPETVPLSTVNRQCSSGLQAVANIAGGIRNGSYDIGMACGVESMSLADRGNPGNITSRLVEQKKARDCLIPMGITSENVAERFGISREKQDAFALASQQKAARAQSKGCFQAEIVPVTTTIRNDKGTERSVTVAQDEGIRANTTMEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGLTVGDVDIFEINEAFASQAVYCVEKLRIPPERVNPLGGAVALGHPLGCTGTRQVVTLLNELKRRGKRAYGVVSMCIGTGMGAAAVFEYPGK	267736	255629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257036_257273_257454_257635_257827_258469_258551_261862_261962_263725_263769_264035_264116_266317_266376_267640
767167	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767176	contig_7695_pilon	-	1077	8	Intergenic	novelGene_41585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	37.4498303857089	323	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	89	913	423117	410001	FALSE	10	TCATGTGGGACTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDSAALRRCWELRFSTRAHLILQPVAGSRMSSASGDNGTSCTLEFAVQMTCQSCVDAVRKSLQGVAGVQGVEVQLENQMVLVHTTLPSPKVQALLESTGRQAALKGMGTSLLQNLGAAVAILAGVGPVQGVVRFLQLSPERCLIEGTIDGLEPGPHGLHVHQYGDLTRNCASCGDHFNPDGMSHGGPQDANRHRGDLGNVLADADGRVVFRMEDEKLKVWDVIGRSLVIDEGEDDLGRGSHPLSKVTGNSGKRLACGIIARSAGLFQNPKQICTCDGLTIWEERDRPISGEGRKQPAQPPAHL	423205	409836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_410155_410252_410357_410427_410506_416413_416475_416919_417098_417316_417455_422698_422772_423078
767177	contig_9705_pilon	+	1644	14	Intergenic	novelGene_41715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAGGGAGAGGAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136933	236812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_137026_138204_138313_142252_142333_142413_142514_143289_143414_144686_144761_146549_146702_148862_149065_152272_152353_156966_157065_162930_163096_166745_166827_170662_170801_236662
767180	contig_6710_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_98116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGTCCCCCCTTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653694	653435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
767182	contig_1759_pilon	-	1850	9	Intergenic	novelGene_171333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_1	928.820219418161	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	578	1723	125747	50228	FALSE	70	GTAAAAAAAAAAAAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGKSGGGAGEISFLEALARSESKRDGGFKNNWSFDHGEESEGDTDKDGANLLSVDEDEDSETSKGKKLNRRSEVVATSSGDFILKTYVRRNKSESFKTLKGNPIGLNMLSNNKKLSENTQNASLCSGTVVHGRRFHHANAQISVVKTAAQSLDRKERKEYPPHVPKIEINPVGLSRPHSVECIMKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPSKYCTSYSISDINTVSFHMYF	126324	50100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_50681_56768_56915_64867_64939_92396_92415_96839_96945_97802_97949_107686_107748_109685_109780_125695
767183	contig_5815_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_141188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACAGAGTAGAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197542	196791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_196800_197500
767184	contig_5815_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_141187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGGATTTGCAGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196747	196054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_196100_196700
767187	contig_6048_pilon	+	1204	11	Intergenic	novelGene_73258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	67.1342684476416	2	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	312	824	1974298	1977815	TRUE	45	GCCTTAATAAAGGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYLPKKNGLYLSLVLGNVNVTLLSKQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILILISFTCRFLLNSRVTDAAFNFLLVWYYCTLTIRESILINNGSRIKGWWVFHHYVSTFLSGVMLTWPDGLMYQKFRNQFLSFSMYQSFVQFLQYYYQSGCLYRLRALGERHTMDLTVVLAAF	1972052	1978278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1972180_1973884_1974004_1974232_1974327_1976314_1976375_1976604_1976701_1976778_1976869_1977086_1977153_1977244_1977307_1977409_1977503_1977798_1977868_1977950
767188	contig_3529_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_105389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAGAAAAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782144	781953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_782000_782100
767189	contig_10930_pilon	+	931	5	Intergenic	novelGene_37093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_4	5372.76192939907	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTGTGTTTTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339418	342109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341625_342020
767190	contig_17311_pilon	-	780	5	Intergenic	novelGene_57841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9209.77628324923	41154	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	37	360	126865	121854	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARDGAEEKKMWEPSEL	126901	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118894_121530_121899_123344_123555_123642_123709_126862
767191	contig_5954_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_28790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397982	1399580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1398000_1399600
767193	contig_19737_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_158964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGACATTCACAGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23911	24321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_23900_24300
767194	contig_9646_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_117461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTGTTCAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343366	344855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_343400_344900
767197	contig_16685_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_115052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGGAAATGAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484550	485849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_484600_485800
767202	contig_18869_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_56344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73753	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
767207	contig_15135_pilon	+	1520	2	Intergenic	novelGene_119850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGCTTAACCACTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24623	29259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_25374_28489
767208	SIRV6	+	518	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767209	contig_9682_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_125306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACTTCCAACACTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411567	410369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_410400_411600
767212	contig_10593_pilon	+	3538	6	Intergenic	novelGene_172829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.44580418759451	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	106	1563	116913	125629	FALSE	20	TTTTGACAATTTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGGDWHGLSPSAALPCTNSGRYSTYRTRTHNICMVSDFFYPNMGGVESHIYQLSQCLIERGHKVIIVTHAYGNRKGIRYLTNGLKVYYLPLKVMYNQSTATTLFHSLPLLRYIFVRERVTIIHSHSSFSAMAHDALFHAKTMGLQTVFTDHSLFGFADVSSVLTNKLLTVSLCDTNHIICVSYTSKENTVLRAALNPEIVSVIPNAVDPTDFTPDPFRRPDSVMTIVVVSRLVYRKGTDLLSGIIPELCHKYPDLNFIIGGEGPKRIILEEVRERYQLHDRVRLLGALEHKDVRNVLVQGHIFLNTSLTEAFCMAIVEAASCGLQVVSTRVGGIPEVLPENLIILCEPSVKSLCEGLEKAISQLKSGTLPAPESIHNVVKTFYTWRNVAERTEKVYDRVAGEAVLPMDRRLDRLISHCGPVTGYIFALLAVFNFLFLIFLRWVTPDSIIDVAIDASGPKGAWTHRYSYSKKRGQNNEISKTR	113525	127604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10593_pilon_+_113569_116850_117631_120420_120554_121303_121437_121597_121805_125362
767213	contig_7342_pilon	+	2135	14	Intergenic	novelGene_71155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	96.1764896415091	134	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	203	1111	391628	420915	FALSE	25	ACTAAAACCCTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPAIAPPVFVFQKDKGHKRSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSVSKNNVFMPSTFCESSAGNSDSEPEEKSSGFRLKPPTLIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKASSQTVPSTGTNGVSIPTDCTGPVTSTLPNNPARRSPSESADEARALEEKEPQKNESSSTSEEENCERKEQAAQQAFVFGQNLRDRVKLINENTDVADVENAGHPSSETPTATNYFLQYISSSLENSTNSADSSSNKFVFGQNMSARVLSPPKLNEVSSDANRENTAAESRSESSSQEATPEKESLAESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQIQCKLFVFDKASTATAC	374953	421939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_375012_389060_389098_389178_389266_391607_391680_401006_401073_401988_402082_403298_403427_409403_409524_411476_411581_412888_412968_414068_414172_414733_414844_416559_416592_420893
767219	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	10	408	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767220	contig_6958_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_69910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49986	52013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_50000_52000
767221	contig_12635_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_60829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255232	253146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_253100_255200
767222	contig_5684_pilon	-	763	3	Intergenic	novelGene_81022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	47	16968	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361521	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_357535_357653_361315
767223	contig_6710_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_97167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653374	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
767231	contig_2100_pilon	+	1094	11	Intergenic	novelGene_50596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.6	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTCGGGCTTTAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669005	847830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_669101_670290_670493_670927_671020_672051_672215_742540_742625_754115_754161_781491_781591_813557_813657_814881_815010_822283_822333_847792
767234	contig_5588_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_172853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGCTCAGCATTATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081165	1079980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1080000_1081200
767236	SIRV4	+	225	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1546	632	1091	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2546	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
767237	contig_19342_pilon	+	1205	7	Intergenic	novelGene_41090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.33749739908346	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	375	782	5070	6183	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3255	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3878_5021_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
767238	contig_12327_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_140657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGATGGACTCATTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020399	1020853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1020400_1020900
767239	contig_10103_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_86178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCAGATCTCTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701444	700790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_700800_701400
767246	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1198	3	1198	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
767249	contig_12619_pilon	-	745	4	Intergenic	novelGene_73581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	33.5890193697616	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	120	569	987941	906400	FALSE	45	AATTCCCCAGCAAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRSTSGSTGFISFSGVESALSSLKNFQSCISSGMDAASSVALDLVETQTEVSSEYSMDKAMIEFAIMDRELNHYIKAVQSAINHVKEERPEKIPDLKLLVEKNFVALQNKNSDTDFEKNEKFVQFKQQLKELKKQCKSACFALFWLL	1004997	906223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_906592_936811_936919_987790_987956_1004892
767259	contig_16883_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_161746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367210	366958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_367000_367200
767261	contig_3975_pilon	+	2266	6	Intergenic	novelGene_54745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	67.1595116122802	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	10	381	1732342	1753479	FALSE	50	GTTCAATAAAAACAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIMAQGGEDVRDYNLTEKQKAVKAKYPPVNRKYEYLDHTADVQLHAWGDTLEEAFEQCAMAMFGYMTDTGTVEPLHTVEVETQGDDLQSLLFHFLDEWLYKFSADEFFIPRVGGRIFIVQAPSGN	1732332	1755364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1732439_1740689_1740715_1740981_1741104_1741327_1741411_1749928_1749966_1753471
767262	contig_5196_pilon	-	2008	5	Intergenic	novelGene_38662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_4	248.863793067614	1	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	42	803	14523	9642	FALSE	25	ATACTTAATTGTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16047	8436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
767265	contig_10148_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_172866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1278	1607	290154	289825	NA	65	AAAAAAAAACCAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKPYVHFHILPFTKILLLSNIPFVRFLASSSSIPSLVPPSLTSSPWATSICALATNLNICYLKKKKNHLTAKCPPGQKVLRIQHPQKTTTGKRNAHLFQLSNFYLYND	291431	289654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_289700_291400
767266	contig_2940_pilon	-	2005	2	Intergenic	novelGene_81960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	0	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	3	1073	1145010	1006003	FALSE	50	AAAAAAGAAAAGTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVMQSGRPRSSSTTDAPTSSAMMEIACAAAACLPGEEVTAERIERLEVSSLAQTSSAVAPSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVEQNGIPRQPKDVFRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGLSSFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNISNLKDSLEEGQVEDGGKTLGVISNFQSSPKYGSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEHYQRDYSLIMQALQEERYR	1145012	1005070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1006942_1144878
767268	contig_13366_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_99787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCGCTAGTATAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135312	135703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_135300_135700
767270	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
767271	contig_8045_pilon	-	1327	12	Intergenic	novelGene_35430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	179.281439950553	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	500	1117	401967	380007	FALSE	20	GCTTGCCCAAATTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLALSNSDVIRQVHNSFARQQMFEFDAKTSAKEEDAFHFVSYVPVNGRLYELDGLREGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEKRIQKYSEGEIRFNLMAIVSDRKMIYEQKIAELQRQLAEEEPMDTDQGNNMLSAIQSEVAKNQMLIEEEVQKLKRYKIENIRRKHNYLPFIMELLKTLAEHQQLIPLVEKAKEKQNAKKAQETK	434833	379796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_380052_388099_388199_390871_390986_392296_392400_399315_399380_401391_401523_401905_401968_402049_402176_413301_413408_414824_414889_423526_423666_434769
767273	contig_19938_pilon	+	1424	7	Intergenic	novelGene_146569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	126.73024720072	31	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	62	1060	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPPGSPCALCLWGPEKAGRMTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLVSCQGGTAGQVWIGLVKLWGLGEHWDQEHRWSEVMLDLFQLLPCTRLFPLSEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5760	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18685_18965
767275	contig_13300_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_125777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	123	518	55887	56282	NA	65	GGGAACCACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTAKVNASPTTKSSVLESARVSSPLHLLTHSLATHTFPHMNLSFIFSHVFSCLPASRGNASVYFLRTGAQRRYGSPARAPLTYATCNEIFLLSSNVQRDPAHGRGWGGVDKLDILVRPLKHLKKRRQGNVSRSQAVSQRVPFPPERDGPAQPPPLFHCKGGRRSKGGQNV	55764	56431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_55800_56400
767280	contig_14300_pilon	-	2071	10	Intergenic	novelGene_133133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_3	224.057917997298	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	101	1552	429800	394083	FALSE	35	AAAAGGGAAGATGCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELQRDLHSTAFKVDAGKLHYHRKILNKNRLITMQSHVIRLPSGAQQHSILLLLNRFHVDRRSKYDILMEKLSGVLSTRSNQIETLGKLREELGLCERTFKRLYQYMLSAGLAKVVSRPLQEIHPECGPCKTKKGTDVMVRCLKLLKEFKRRYEDDQDEDDDEEVISKAVPPVDIVFERDMLTQTYELIERRGTKGISQAEIRVAMNVGKLEARMLCRLLQRFKVVKGFMEDEGRQRTTKYISCVFAEESDLSRQYEREKARGELLTTVSLASVQEESVPPEGEDTFLSESDSEEESRRSKRKGKGLQGDRRHHSTPAKGGWKVLNLHPLKKQSSCTPGAAEEKSCWSSVSGDGLLHSSGFSDAHCMESNTGDIAVIEEVRLENPKESSSSQKSGKQGQDKPHETYRLLKRRNLIIEAVTNLRLIESLFTIQKMIMDQEKQEGVSTKCCKKSIVRLVRNLSEEGLLRLYRTTIIQDGIKKKVTTDSHDTAKASLSLLRVFLCSLSGHCISVFLCCQ	430526	393563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_394345_396028_396160_398865_399066_399603_399881_400886_401003_402564_402727_422708_422833_427256_427354_429717_429862_430487
767282	contig_19579_pilon	-	1067	8	Intergenic	novelGene_59398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	654.794187948724	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	88	927	13090	7943	TRUE	30	GATTCCAGATTCTTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13177	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_7836_7884_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12900
767283	contig_7963_pilon	+	377	3	Intergenic	novelGene_58297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTCCAGTCTCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38326	40049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284_39368_39999
767286	SIRV6	-	369	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAATAGGTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11809	11440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
767287	contig_8487_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_111910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	576	923	116519	116172	NA	5	CAGGGTGGGTCTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGFPTFPAVIRLFSSVNSLMFHKAGVMAKELPAFTTLIRPFSSVDSLVLNKCGIMPEGFSTVFARKWLFSSVNSPVLKEVSVAAKGFSTVTAPIRPFSSVNYLVFMKVIFIAK	117094	115707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_115700_117100
767288	SIRV1	-	183	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5619	3564	-170	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGACTTTACTGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
767290	contig_14060_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_156063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATCTGGGATACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157892	157609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_157600_157900
767295	contig_776_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_139925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGGATTCTGTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825481	824323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_824300_825500
767299	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767304	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	69	486	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767310	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767312	contig_4125_pilon	-	922	4	Intergenic	novelGene_25078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	79.6255123827924	1146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	259	858	527566	526557	FALSE	5	CCTGTCCCCAGGCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVRLTSQLVRAASRAGRSLPWPVSGVPGAHAWKPCYSTQPVGPSKAASLPGREAQLELEEMLVPRKMSISPLESWLTARCLLPSLGAGIPGTVTPSQLYECPPSHVGEGAEQGDEGVLDVPQVQCKNVLKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLKRKQMKFERDLRRIWLRAGLKEAPEGWQTPKIYLKGK	528280	526492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_526659_526769_527216_527514_527676_528131
767316	contig_12340_pilon	-	2316	5	Intergenic	novelGene_122095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.9381964386195	20	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	845	1183	5507	3862	FALSE	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	14352	2728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_7311_7438_12392_12960_14209
767318	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	61	499	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767320	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	51	523	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767323	contig_20199_pilon	+	968	3	Intergenic	novelGene_82542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGACAGACACCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40646	44128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42218_43870
767324	contig_2036_pilon	-	926	4	Intergenic	novelGene_131845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	608	junction_2	63.3315789230688	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	112	825	661441	631740	FALSE	20	GTAATATAGTCGGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLRK	661552	631638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_631872_636558_636731_647832_647936_661134
767325	contig_7657_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_30021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAACTATTTTGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159752	160977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_159800_161000
767326	contig_15888_pilon	-	597	6	Intergenic	novelGene_84455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1951.44606894477	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	48	329	259726	252475	TRUE	25	GTCTGAATGAAGCCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRLVAAGSEDGRGDMADPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259773	251953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252021_252105_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253589_259719
767327	contig_9363_pilon	-	1289	10	Intergenic	novelGene_6657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	114.091689356618	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	641	1039	1011210	1009478	TRUE	30	AAAGAGCTTGGAGAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEELEQMLDSGQSEVFVSNILKDTQVTRQALNEISARHSEIQQLERSIRELHEIFTFLATEVEMQGEMINRIEKNILSSVDYVERGQEHVKTALEYQKKARKKKILIAICVSVTVLILCVIIGITIAVG	1014430	1009121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009359_1009464_1009562_1009641_1009753_1010764_1010903_1011144_1011415_1012877_1012949_1013457_1013533_1013703_1013770_1013887_1013990_1014308
767330	contig_7050_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_153634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTTTGAGTCCATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809568	810119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_809600_810100
767332	SIRV4	-	252	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1271	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3887	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
767333	contig_17470_pilon	+	1711	12	Intergenic	novelGene_110532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	866	1243	271345	273587	TRUE	35	TGGAGACAGCAAGAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRVLVHSPQVLHELIWAQDPAHLPASGAKGLAGAANGQGAFPHSREAGNADVLVPVEDQPLVNLITDAHHVMLLAQAGHQLQFCLGEDLSQRVAGCVEDQGFGARCELVGQLCGVQLPVAAVI	269609	277222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_270149_270243_270285_270858_270939_271026_271219_271331_271414_271528_271609_272834_272958_273481_273609_273860_273941_274021_274173_275799_275961_277167
767335	contig_3095_pilon	+	972	4	Intergenic	novelGene_75112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2952.89654407329	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	38	556	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147203	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_150413_150696_150996_151163_151848
767338	contig_1594_pilon	-	2302	18	Intergenic	novelGene_138820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	69.6259904540884	1	83	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	153	2081	777252	503479	FALSE	20	ATTGCTCTGGGAATTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEYSAFDMSAPTPAHCCPAVGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESIPLIQGPVGLHQKFSPKQIQALEHTYDDLCHTEGVTALPYFLIKYDENTVLVSLLKHCSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSHFQSVEVLCFRDRTMQGVRDIAHSIVFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKVSYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKAKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEDFCICTHERHWPVIFLSRNSLVIFWSQCSSVFLKMSQIWDMSDDETV	777904	503257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_567997_568109_653304_653428_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_771341_771460_777250_777306_777805
767339	contig_7241_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_171550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCAAGTTGTAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197668	200003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7241_pilon_+_197700_2e+05
767342	contig_3382_pilon	-	1461	9	Intergenic	novelGene_124053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	656	junction_1	141.734567061109	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	94	1089	344734	224870	FALSE	30	CGATTGGCATAACATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDCLFLPPCAARGSSKASLSLEDPVLWSGGPMEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344827	224497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
767343	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767344	contig_17274_pilon	-	2053	2	Intergenic	novelGene_26514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	655	966	127104	126793	TRUE	70	CACCACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWIALSPNKGQGDTSVGPVGSGESGGQGSHLHQPRYPCSKFQGPAPSLSGPDFGIRDHPNLRIQSSLKFFHSENLDLCQAFLTVCLLAIGPEVCLSAAQEGL	127758	115312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_115419_125811
767345	contig_19938_pilon	+	1406	8	Intergenic	novelGene_146563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	129.091804068078	1137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	182	1042	8802	19091	FALSE	35	TCACAAGTGGCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSGCVSGLLTLAGITTVLVAVVLCVNSLTWQTDDFFYIDSVCDRPTPDTTTSGYRWMRQSRSDSDWRENQCRSYMQMLMNMFLGIRALLLAVCVLQAIVSLTSLGVGLQSLHSHSSQPLNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	5737	19455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_6438_6536_8796_9006_16532_16644_16947_17005_17241_17473_18414_18535_18953
767349	contig_4783_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_108428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447194	449398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_447200_449400
767350	contig_11498_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_65502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTTGGTTTTTGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140341	140661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_140300_140700
767352	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	0	409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	949	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767353	contig_7119_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_41035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399753	398401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_398400_399800
767354	contig_6870_pilon	-	2734	2	Intergenic	novelGene_103969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	118	1305	1428000	1426813	FALSE	45	CAACTATGGGAATAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSALFPAPQTALPLSGRRLAGQSTALASLSSDATSEAARMNMEKHNSSLVVELSHPDLVINVGKVTLGEKNRNKLQKAQREQEKMRVMQAVCALLNSGGGVIRMEMANEAEHPVEMGLDLEQSLRKLIQSSDLQAFFETKQQGRYFSIFVKSWSSDLFPEESSIKFRICSLFSSLYSRSGTSVFLMDSREAFDFLKIKKRNAESSSGKEPSSKNTRVIPQGLHKSDPVFLVFQRDRFEYGEILGFPESQYTEFKQFSTKHIHTYVENIIPVYIPAFANTGGGYLFIGVDDKSKRVLGCAKENIDPDYLRKRIEKAIYKFRYFHFCQSSCGINFTLKIFDVFAKGELYGYACVIRVEPFCCAVFSEVPRSWMVKGKHICNLTTEEWVSRMMGAEPGKREKALPSLSFLFLWHLPTRYVFLCPVTLNFSHPLNWVF	1442107	1425383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1428002_1441991
767361	contig_2550_pilon	+	1538	4	Intergenic	novelGene_135625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	117.230068194508	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	623	994	398536	409719	FALSE	70	CAAAAAGTTAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGECNVSLLFQILLFTRMVS	397127	410263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397708_398493_398592_401128_401270_409544
767363	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767365	SIRV6	+	217	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	513	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11107_11205
767368	contig_3233_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_56518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGATCCAGTGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227301	244441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_227550_244137
767370	contig_10734_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_51087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAATTGAACCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539735	539333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_539300_539700
767371	contig_16457_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_172878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTTATAGCAGCACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45016	44250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16457_pilon_-_44200_45000
767373	contig_3822_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_133339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACATCATCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348049	346219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_346200_348000
767374	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767380	contig_8377_pilon	-	1591	3	Intergenic	novelGene_35160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	39	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGGTGTTTTGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425534	339263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_340324_381079_381241_425164
767384	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767385	contig_10926_pilon	-	2696	1	Intergenic	novelGene_137505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	11	364	133553	133200	NA	55	ACAAGGAAGAGGTACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFNMDKKENNSHLRVVVSPYHNRWVSRDHLRYGEDVVWEEGEGLLRETKKRDWEERRPLHLQKLLLLLNSGYTGFPGNPMLGAGKERSTSNLGYVVEWLPARRRMFKDTFDKRPAPTLVR	133563	130867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_130900_133600
767386	contig_12635_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_60840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537488	535572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_535600_537500
767387	contig_15327_pilon	-	894	4	Intergenic	novelGene_70689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	20	TGTTTAACAATTGGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	900551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
767389	contig_14537_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_158656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGCACCTCGCATCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82332	81918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_81900_82300
767391	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767392	contig_6710_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_98008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	CTCTTCTTTAACTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767394	contig_8140_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_86433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCTGAGATCCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185746	188032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_185700_188000
767397	contig_9698_pilon	-	750	2	Intergenic	novelGene_82490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTAATTTTTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317399	144301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_144813_317160
767398	contig_10377_pilon	+	1696	4	Intergenic	novelGene_115393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	66.9394419523265	87	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATGTGTGTTATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209154	228700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_226930_227187_227487
767403	contig_13004_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_112747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATCTGATCTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954213	955913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_954200_955900
767404	contig_7549_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_164525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTGCAGTCAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680405	682639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_680400_682600
767406	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767408	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767410	contig_15498_pilon	-	1550	11	Intergenic	novelGene_42651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	134.355684658298	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	528	1295	691001	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697693	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692431_692509_697262_697374_697554
767411	SIRV2	+	465	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-105	163	-105	-163	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCTATAAATACCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
767412	contig_19744_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_120358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATCCAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62453	63855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_62500_63900
767413	contig_1624_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_138378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191944	194492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_191900_194500
767415	contig_8106_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_139732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70926	72938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_70900_72900
767416	contig_16650_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_61979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATCACCTAGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255232	252982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_253000_255200
767419	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
767421	contig_9888_pilon	+	1895	4	Intergenic	novelGene_162267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	15.2534149181967	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	65	1666	119674	132267	FALSE	30	TAAAAGTTTTTAGTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHDLVMFTDVAVDFSQEEWECLDSYQKNLYRDVILENYNNLVSLAGCSISKPDVVTLLEQGKEPWLIGRDKKIRWSPDLESKYDANKLFQEKESYEMNLSQWEIRKRIKNHGLKDSSVGKDCEFKNKFEGQKCPREGYFSQVKTTCEKMPTCRKRASFSLYQKSNNREKPYECEECGKAFRVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKTFRQCAHLSRHQRIHTSDKLYECKKCEKIFACGPELRVHQRIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLNLHQRIHTGEKPYDCKECGKAFRQYAHLTRHQRLNIADKCYECKECGQTFLCSTGLRIHHKLHTGEKPYECQECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYHCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECQKFFRRYSELISHQGIHIGEKPYECKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPYKCKECEKTFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTYHQRIHNVI	119609	132496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_119683_121296_121424_124260_124360_130900
767428	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_93612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
767429	contig_6842_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_130793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	51	311	1419927	1419667	NA	20	GATCTGACAATCTGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKALVPIFSLAFKIRGMRFLSWLPALHSHTSKISLLLQPGRGNPDYATLIPDQGLAVSSPLPFLSLHVLPRKGQCWSIHPKIPLITRSLTNGLSFIEFPPFS	1419977	1418334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1418300_1420000
767430	contig_6842_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_130791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGGTTAACAACCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1415000	1414611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1414600_1415000
767431	SIRV6	+	304	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8137	3	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
767433	SIRV1	-	238	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3570	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6796	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
767434	contig_11480_pilon	-	407	3	Intergenic	novelGene_172879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGAAGTGGTGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232989	73856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11480_pilon_-_73933_183209_183279_232727
767438	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
767440	contig_8322_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_143260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTATCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395718	393610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_393600_395700
767442	contig_15629_pilon	-	2128	8	Intergenic	novelGene_122479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAATTAGAAGATGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208441	180706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_181335_192025_192178_195236_195303_197178_197302_200800_200954_202288_202432_206535_206609_207651
767443	SIRV1	-	278	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3826	0	3552	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6814	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
767444	contig_7915_pilon	-	890	6	Intergenic	novelGene_42987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	363.247243623403	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	242	781	151603	142263	FALSE	90	AAAAAAAAAGAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSAAILGQPEEDPEGASGAVATATATAATGSTSPRPARVPAGPRPTAPASSLSASAFLFLVLTPPSRPESCPATSNPPVMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC	167302	142153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_148028_151427_151606_167063
767445	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767448	contig_21162_pilon	-	1468	2	Intergenic	novelGene_152769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTTGAAGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30509	28905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21162_pilon_-_30277_30412
767449	contig_1867_pilon	+	1260	5	Intergenic	novelGene_54516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5569.01119477237	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCATATCTGTGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194897	221546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194982_215585_215811_218786_218898_219457_219609_220857
767450	contig_12626_pilon	+	1933	2	Intergenic	novelGene_80451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1511	junction_1	0	59	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1132	1731	164931	166715	FALSE	55	GTTGCTTTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGR	163799	166917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_165021_166205
767458	SIRV6	+	491	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	171	3	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
767464	SIRV6	+	283	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8134	14	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
767465	SIRV6	+	207	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9669	561	519	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
767466	contig_5727_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_7969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTAGACTTAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181180	180016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_180000_181200
767472	SIRV6	+	487	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767474	contig_6441_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_172884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACAATAAAATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259463	257119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_257100_259500
767477	contig_5780_pilon	-	1931	8	Intergenic	novelGene_29804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	31.16185527997	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	306	1133	135457	121155	FALSE	20	CCCAGCACCCAAGTTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYIEFPCYRWITGEGEIVLRDGRAKLARDDQIHILKQHRRKELETRQKQYRWIEWSPGFPLSIDAKCHKDLPHDIQFDSEKGVDFVLNYSKAIENLFINCFMHMFQSSWSDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDSMFGYQFLNGCNPVLIQRCRKLPEKLPVTTEMVECSLERQLTLQEEIEQGNIFIVDFELLDGINANKTDPCTHQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQVPGDKNPIFLPSDAKYDWLLAKIWVRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQLICEYGLFDKVGAPCPGPWRALSGWHPLLLRISLASIHDQETRSLVLTMAEAWEE	175517	120356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_121380_122016_122221_128336_128484_134216_134390_135378_135486_144378_144502_165648_165731_175445
767484	contig_9468_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_59487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTATTTCAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274459	276294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_274500_276300
767487	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767490	SIRV2	-	227	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	699	22	699	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4033	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
767497	contig_7230_pilon	-	2357	3	Intergenic	novelGene_52530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	39	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	94	597	67689	43427	FALSE	35	GTCTTCTAAAGAGAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLDLSCAQQQGGPGSSLGPSTLSLAVAPPSMFFRAGLSAKSQLLRVFQPASVATMSTGTFVVSQPLNYRGGSRVEPADASGTEKAFEPATGRVIATFTCSGEKEVNLAIQSAKSAFKIWSQKSGMERCRILLEAARIIRERRDEIATVETINNGKSIFEARMDIDTSWQCLEYYAGLAGSMAGKTCDQLTRKQKNRV	67782	41666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_43604_65630_65777_67508
767498	contig_7334_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_50569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCCAGCATATCAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116758	118121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_116800_118100
767500	contig_4732_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_75392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGCTGCTGGCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486758	485456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_485500_486800
767501	contig_15491_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_75987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCGAAACAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88038	86794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_86800_88000
767504	contig_4519_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_123714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGATGTGAGTGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661348	662904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_661300_662900
767505	contig_4519_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_123715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAAAAGAAGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662904	663558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_662900_663600
767506	contig_2342_pilon	-	2587	14	Intergenic	novelGene_132748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_2	127.094476344016	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	707	1894	414875	73092	FALSE	70	TGAAAAAAGAGAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSFKETGSESGNVSLPDVENPSAAFSPVTQASVEESESTTSARRRDSGIGEETATAVRSHVDAAPQTAPPSVSAGPDAVSEVLCTLSLEVNKSQETKNDGGNELDNKAAPSVPVSKNVNVKDILRSLVNIPADGVTVDPALLPPACLGALGDLSVEQPVQFRSFDRSVVIATKKSAALPSTPSTNIPTSAVSVVSSYDSAQASDVGESPGSRSSQAKLPSVPAVGSVPQDPVSNMSITERLEHALEKSAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGTSLVCMKSSSSVVELVMLLCSQEWQNSIQKNAGLAFIELVNEGRLLSQTMKDHLVRVANEAEFILSRQRAEDIHRHAEFESLCAQYSADKREDEKMCDHLIRAAKYRDHVTATQLIQKIINILTDKHGAWGNSTVSRPREFWRLDYWEDDLRRRRRFVRNPLGSTHPEATLKTAVEHAADEDILAKGKQSIKSQALGNQNSENEILLEGDDDTLSSVDEKDIENLTGPVSLSTPAQLVAPSVVIKGTLSVTSSELYFEVDEEDPNFKNIDPKILAYTEGLHGKWLFTEIRSIFSRRYLLQNTALEIFMANRVAVMFNFPDPATVKKVVNCLPCVGIGTSFGLPQTRYCII	448399	72398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_73211_75603_75722_162896_163034_165573_165721_174038_174164_257887_258055_327773_327883_361976_362042_400368_400431_411609_411744_414870_414950_431287_431419_442882_443331_448346
767507	SIRV5	+	354	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	152	48	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
767508	contig_1964_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_130922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAGAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489896	490546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_489900_490500
767509	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	283	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767511	contig_16098_pilon	-	1390	9	Intergenic	novelGene_46136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1971.86478998942	1	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	231	689	458816	457124	TRUE	5	GGGGGAGTCTGTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGLRSSLMGTMT	460357	456068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457158_457672_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
767513	contig_2214_pilon	+	2113	6	Intergenic	novelGene_144267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_1	175.948401527266	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	28	561	326554	330867	FALSE	50	CTTTGTCAGAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPPVQRIQMTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESATSDASEHASQSVPMVTTSTGTLSTTNETATGDDGDEVFVEAESEGYVFTW	325444	332419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_325463_326544_326614_326727_326823_328632_328740_330463_330560_330691
767516	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767519	contig_6710_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_98279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	15	GCATCCATGTCTGGTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
767520	contig_10766_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_151238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572679	570467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_570500_572700
767524	contig_5999_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_45624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCCAACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146376	148697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_146400_148700
767528	contig_1150_pilon	-	2762	1	Intergenic	novelGene_61467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCCTTTGTTTGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449802	447040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_447000_449800
767532	contig_10197_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_115241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAATATCACCAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980614	981365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_980600_981400
767533	contig_13794_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_168554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAAGAAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84134	84599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_84100_84600
767535	contig_12644_pilon	+	1056	7	Intergenic	novelGene_44677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	86	junction_1	4919.2832472492	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	321	1028	2679092	2680545	FALSE	30	TGAAAGCATTTTGGACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677218	2680573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
767538	contig_19098_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_65808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268365	270322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_268400_270300
767539	contig_817_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_132483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGATGGTCCCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735666	734998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_735000_735700
767542	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767543	contig_1939_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_144889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTCAAGTACACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970817	971545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_970800_971500
767544	contig_6325_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_143358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTCAAGGTAGAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393032	392345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_392300_393000
767545	contig_14530_pilon	-	770	5	Intergenic	novelGene_108458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	353	487	89643	87659	TRUE	30	TGCGCACGCGCAGAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPAGSEGRAEGAFACGFSFSLCLKKDLASLDVASTSLATLTSSPAKSNTLVILTFSVSLGFSSSSALTNNLLEVVSSVSSPLLTCVLGGTFDFGPTSLRKLAQSSSSFFFLASSDPMPFSCSATASSSSLLLPPDSAVASSSSSPSNERPLCFLFLAGML	102194	80274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_80454_87554_87674_89523_89745_90057_90186_102071
767546	contig_9002_pilon	+	1834	11	Intergenic	novelGene_116726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAGACAAAAGCAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316750	331880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_+_317086_317507_317666_317754_317837_319664_319766_321071_321210_322695_322826_324212_324314_324587_324799_328176_328390_331417_331504_331601
767547	contig_12123_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_144612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGTGGCATCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151998	154158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_152000_154200
767548	contig_6710_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_94566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
767553	SIRV6	+	322	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1685	0	-214	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2809	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767554	contig_12638_pilon	+	1864	4	Intergenic	novelGene_33277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_1	126.560481808326	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	72	815	858079	861026	FALSE	20	TGACTGATGTGGACCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWSAYMPALGGNLDECGLGAAAPSAVGPRAQQHSWCHPVLSLPQHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENVSTLPPWSGMQA	858007	862075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_858355_858997_859107_859709_859823_860780
767556	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	3	406	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767564	contig_6102_pilon	-	2108	12	Intergenic	novelGene_32403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.5495623306956	10	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1002	1616	1819420	1817503	TRUE	5	GTTGGGGCTGTGCATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGKGWFAGRNLAVSQVTTKYVLWVDDDFVFTARTRLERLVDVLERTPLDLVGGAVREISGFATTFRQLLTVEPGAPGRGNCLRQRRGFHHELVGFPGCVVTDGVVNFFLARTDKVREVGFDPRLSRVAHLEFFLDGLGSLQVGSCSDVVVDHASKVKLPWVSRDAMSEAYARYRYPGSLDESQVAKHRLLFFKHRLQCVTTE	1824810	1816828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1817184_1817365_1817721_1818314_1818556_1818782_1818924_1819405_1819597_1819737_1819837_1821722_1821904_1822045_1822087_1822955_1823056_1823180_1823346_1823892_1823979_1824657
767572	contig_5816_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_158270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	342	464	396832	396710	NA	75	AGGGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGHESPSLSLNVKDSTGAPLIARTDSGALGPSWEFGKNRTRTQFQNKERCSPPIPSAPTSLFLECIDHQAASSSNILILPAVSAGKIIISHLGSGFRRLSVCAENTLLSHSLMAKCFREFKKHQEGEGRTLGTKEEPEGGLGRGSKESKSVV	397173	395815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_395800_397200
767575	contig_6871_pilon	-	2404	12	Intergenic	novelGene_21592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_11	50.0764704483252	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	125	1807	343922	335606	FALSE	20	TTCTTTGTCTTTCTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRTRSQSQATINFPKKKLSRTLDKAKNCSDTKLEPTRVQAIPRSPCEKILPLSPRKRLGADNLCNTPRLPSCSPPKQGKKENGPPSSHMPKGRKLVFDNQRTVKSPSKREQASIHRNKILSSVRKGQEITTNSELRCPLEKESECIGLFKQEGSCYQQAKLVLNTAVPDRLPARETEMDVIRSFLREHICGKKAGSLYLSGAPGTGKTACLSRILQDLKKELKGFKTIMLNCMSLRSAQAVFPAIAQEICQEGVSRPAGKDMMRKLEKHMTAEKGPMVVLVLDEMDQLDSKGQDVLYTLFEWPWLSNSRLVLIGIANTLDLTDRILPRLQAREKCKPQLLNFPPYTRNQIATILQDRLNQVSRDQVLDNAAIQFCARKVSAVSGDVRKALDVCRRAIEIVESDVKSQTILKPLSECKSSSEALVPKRVGLTHISRVISEVDGNRMTLGQEGAQDSFPLQQKILVCSLVLLSRQLKIKEVTMGKLYEAYSNVCRKQQVASVDQSECLSLSELLEARGILGLKKNKEARFTKVFLKIEEKEIEHALKDKAFIGNILTTGLP	344907	335008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_335696_336058_336200_336528_336732_339131_339197_340344_340446_340936_341077_341516_341624_342038_342215_342469_342670_342794_343077_343744_343936_344796
767577	contig_9516_pilon	-	1976	12	Intergenic	novelGene_106205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	52.1038378371054	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	186	1823	1371562	1305244	FALSE	15	TTCTCTTGTGAGAGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLNQLPFDPASNNEPLQFGSASGPLVTEGLIENGGESSKKRKRTNTPSADNSRTLNVDSTAMTLPMSDPTAWATAMNNLGMTPMGIAGQPILPDFDPALGMMTGIPPITPMMPGLGIVPPPIPPDMPVVKEIIHCKSCTLFPPNPNLPPPATRERPPGCKTVFVGGLPENGTEQIIVEVFEQCGEIIAIRKSKKNFCHIRFAEEYMVDKALYLSGYRIRLGSSTDKKDTGRLHVDFAQARDDLYEWECKQRMLAREERHRRRLEEERLRPPSPPPVVHYSDHECSVVAEKLKDDSKFSEAVQTLLTWIERGEVNRRSANNFYSMIQSANSHIRRLVNEKATHEKDMEEAKEKFKQALSGILIQFEQIVAVYHSASKQKAWDHFTKAQRKNISVWCKQAEEIRNIHNDELMGIRREEEMEMSDDEIEETKETEESALVSQAEALKEENDSLRWQLDAYRNEVELLKQEQGKAHREDDPNKEQQLKLLQQALQGMQQHLLKVQDEYKKKEAELEKVKDDKLQAEKMLENLKEKESSASRLCTSSQDSDYPLEKTLNSSPIKSEREALLVAVARERSTTAINLMARTIKAVRAAASHPRVMLSGKKAHS	1473988	1305090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1305363_1308192_1308302_1310088_1310197_1312522_1312705_1321920_1322027_1332467_1332575_1334277_1334491_1337286_1337521_1342665_1342873_1355880_1356037_1371465_1371601_1473841
767578	contig_4686_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_118531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTCTATTCCTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464546	465333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_464500_465300
767579	contig_3747_pilon	-	833	5	Intergenic	novelGene_24986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	418.180209359553	132	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	309	686	271128	270395	FALSE	25	TTTAAAATTGCTTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEYGEIKNIHLNLDRRTGYLKGYTLVEYETYKEAQAAMEGLNGQDLMGQPISVDWCFVRGPPKSKRRGGRRRSRSPDRRRR	271680	270247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546_270684_270796_270934_271070_271345_271588
767580	contig_5018_pilon	+	1589	5	Intergenic	novelGene_47126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_4	107.616216250154	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	103	411	1448095	1448541	TRUE	10	GCTGTTAGCCTTTTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALCPLLLAVLMGVPAGTLTCYGDSGQPVDWFVVYKLPAKSGPGDAAGRGLRYKYLDAGSGGWRDGAGLISSSAGAVGRSLLPLYRSNASEVKGRGDKSRV	1447992	1450987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1448190_1448327_1448689_1448986_1449152_1449244_1449443_1450319
767582	contig_18096_pilon	+	2365	8	Intergenic	novelGene_58034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	408.946730725933	29	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	71	1084	40382	66852	FALSE	25	AAAGTATTTCCCACTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVLVGLGITSSHYLTTSWISLPECSISLITGILHPVYFD	40311	68133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642
767585	contig_517_pilon	-	2001	1	Intergenic	novelGene_171299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	109	336	47743	47516	NA	70	GATTTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDQLNSPAPRAQHTTLYKHVLYILSQKVKGKKKFSMLQKKKSTDDTKCLYEAIISLPICLSRNTCFSGQSFTGSSSRKNIPENSHLSLFPNIFRENCHSQAFCTFTRCCL	47851	45850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_-_45800_47900
767586	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
767587	contig_6710_pilon	-	487	2	Intergenic	novelGene_98128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	10	ACCCATCTCGTCCCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
767589	contig_4426_pilon	-	628	2	Intergenic	novelGene_15403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	300	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGCATGTGTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806943	802067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_802654_806901
767590	contig_9415_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_109948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTACTGTTGATAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2492939	2494314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2492900_2494300
767591	contig_10016_pilon	+	2281	3	Intergenic	novelGene_117846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	945	1271	261169	261495	TRUE	15	CCGTCCTCTCTGACAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSGIPCGLEEMWHGLTHHQREALKIKNPDFELVSIIPDQKDQSAGSLPRAVRTLASGGQFSGISCQRHSVPERTRSLLRSRLRRRYDRFPSFWRWWRWGFGFSSDR	260224	264392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_261508_262159_262268_263502
767592	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
767594	contig_16791_pilon	-	2107	2	Intergenic	novelGene_172896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATATACTTTACTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29437	25535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16791_pilon_-_27362_29156
767600	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	51	505	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767601	contig_9696_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_68843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTCGTCTGGCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586838	586066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_586100_586800
767602	contig_9698_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_82508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACACATATATGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260504	258400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_258400_260500
767606	contig_14184_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_66581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43626	42153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_42200_43600
767609	contig_10011_pilon	-	2322	4	Intergenic	novelGene_68079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	5.55777733351102	163	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	603	1436	300445	299612	FALSE	45	GAAACATGAAAGTGTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVECGDIFGGNSHFLSLHRAQLGEEAHKCLQCGKSFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKSFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSACGEAGSDCTPFLTNHGAPKVEKKLFECLTCGKSFGQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG	307905	298725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_300781_304162_304281_305840_305968_307883
767610	contig_19352_pilon	-	940	6	Intergenic	novelGene_122375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	596.253838562067	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	209	577	122805	105923	TRUE	30	TCTTTTGAGCCCACGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGCCYFLQTNKICQMLWPSVK	123013	103687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104031_105902_105983_108465_108517_112796_112907_113281_113363_122738
767611	contig_10926_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_137510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276213	274598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_274600_276200
767615	contig_8487_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_111924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTAAACCTTGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306488	308700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_306500_308700
767621	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767622	contig_11378_pilon	-	255	2	Intergenic	novelGene_112333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	850	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACTGGTCTTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246768	1245911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1246111_1246712
767625	contig_8538_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_5086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842859	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
767628	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
767629	contig_7009_pilon	-	2121	2	Intergenic	novelGene_23581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGACTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207997	202039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_203637_207473
767633	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	584	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767636	contig_5549_pilon	+	2075	11	Intergenic	novelGene_81610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	27.1626581909798	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	14	838	304420	346434	TRUE	75	AGAAAAAAGAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWCMEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTTETW	304406	369611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_304443_334007_334582_342493_342653_344005_344060_346419_346540_350611_350796_353028_353173_365250_365385_366192_366402_367383_367491_369257
767638	SIRV4	-	214	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1309	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
767639	contig_14160_pilon	-	2516	5	Intergenic	novelGene_171540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	63.1124987621311	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	95	1723	27093	4034	TRUE	20	TGTGGGGTCGCTGACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDVEEGEFLLSFLQGLTSLSFQLSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIRRNRKLTASSLSLDTASSSQLSCSLNSDSGLHQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQEVLSEFSKAQVNSVPTNGLSQETETSTLQSSLSCRGLDTSAYLHLDVPAEPLPAQASSRTPDGDHKQEPLFQMPGTLDLLQLSAAQTAPSGDTSAQKPSGPVREKTRAVRQGSGPEKPLEGDRVGLNLVVSSPTSPKSKSWISEDDFYRPPQERPPESLSDHSISSAKWTPESRPGLHRHFSLGPRKSHSMGALDRACVPSPGSRKTKAAPMQEHKNFCVVHRRQMGLSNPFRGLMKLGTLERRGAMGIWKELFCELSPLEFRLYLSNEERTCVENCSLLRCESVGPAHSDGRFDLVFSGKKLTLRASSQDEAEDWLDRVQEALHKCRPQQEDEWVNIQYPDQPEDLPEAPQGGLPLPLRPTLRA	27187	849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_1140_3530_4453_7428_7700_14681_15088_26560
767640	contig_9363_pilon	-	1509	10	Intergenic	novelGene_6656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	95.529841501407	453	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	277	816	1014186	1011253	TRUE	20	AGAGCTTGGAGAGTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDRTHELRQGDDSSDDEDKERIALVVQPGPARRESPDDEFFQKVRTIRQTIVKLESKVRELEKQQVTILATPLPEESMKQDLQNLREEIKQLGREIHTQLKAIEPQKEEADENCNSVNTRMRKTQHGILSQQFVELINKCNSMQSEYREKNVERIRRQLKISVCGAQPQCGGGVGGVP	1014462	1009119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009359_1009464_1009562_1009641_1009753_1010764_1010903_1011144_1011415_1012877_1012949_1013457_1013533_1013669_1013770_1013887_1013990_1014156
767642	SIRV6	+	347	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	26	410	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767643	contig_6710_pilon	-	402	2	Intergenic	novelGene_98261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	10	CAGCCTCACCCCCTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
767644	contig_7066_pilon	+	2040	9	Intergenic	novelGene_42175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	6.59545297913646	212	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	9	1094	946264	954480	FALSE	5	ACTGTTTTTGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCCIWGHIWSSWRRGPGARAALKAAGFGTWTRHQLQPRGSSKRSGPPRDQPFPGLLRLEDLSREELVDVLRAAVVDQKGPLVTVNKPQGLPVTGKPGDLTLLSVLPELSQSLGLGERELQVVRAPGKDCSGLVLLSSCPQTVSRIQKFFTHSRRVQRPTATYCAITDGIPATSEGKIQAALKLEHIDGVDLVVPVKPPSRKDILEGVKRTVSHFRVMATGSGCALVQLQPLTVFPSQLQVHMILQLCPVLGDHTYSARVSTVLGQRFLLPAERTKPQKQVLDEALIRCLRLTPSQAAQLPLHLHLHCLLLPGPRPQDTPIELLAPLPPLFLQDPTVPGAPPTIVIPLSLMPTGREAGDL	946255	955426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_946365_946652_946793_947711_947757_947892_947993_949560_949669_949754_949840_950062_950187_953289_953430_954237
767645	contig_15839_pilon	-	1907	8	Intergenic	novelGene_136409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	85.7716474728338	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	193	720	105924	48146	FALSE	0	TTGGTCTGGTCTTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMGVKSGQIRNLESARVSMVGQVKQCEGITSPEGSKSIVEGIIEEEEEDEEGSELVNKRKKEDDMETKKDHPYTWRIELAKTEKYWDGWFRGLSNLFLSCPIPKLLLLAGVDRLDKDLTIGQMQGKFQMQVLPQCGHAVHEDAPDKVAEAVATFLIRHRFAEPIGGFHCVFPGC	106116	46958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_48165_48620_48689_49307_49373_52016_52062_52575_52706_54667_54792_56097_56164_105913
767646	contig_1535_pilon	+	2248	2	Intergenic	novelGene_127227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCTTGGTGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52575	55659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_52734_53569
767650	contig_19409_pilon	+	2325	9	Intergenic	novelGene_172897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2.36841191518705	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	15	2117	48805	64733	FALSE	20	TTTTAATGTTATCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEDREEAALTRKLRDSRYRFQRRMQQLIEKYNHPFEDTPLVEMATLTYQTPQGLRLWGGGLIQERSKGQSQVEGSPVTPVSWVDGSGRAALEDSKNSDVDATFDQGDEVAMAVTPAVLQSPLENELRRKYLTQVDKLLQHISFSERADSGGLENSQVTLVPLLAEPAHGDYGDVSAKNLGGPVKSASPLRKRDPSANLALVPRNDGLVSQGASSHSFLSSQSFEAEDVCDVTISDLYEGMLHSMSRLLSTKPSCIISTKTFIVQNWSCRRRPRWKSRMNRTYCKGGRHVQRGSREQRLPWSQPEKEAGALRDPKNSLKVSCRKTGFQLKKVLLEVNNPQVHELVPSWKEPKVTPQKHSLLTYLDPSAGYDLDQENRFMALKWLISPVKIMSKSRTLQGLGGNRHREIEVKFDKLHQEYCPNRVSQPGPSGSWAVDVYRGGPVSHGCLQGLETHWSSIPVPQRLQEGLEKPGEKSIQGSGCLPKRDSSSLLLSKTGPAQSTGHAEQTLDSLLQESSLGMFRRSLPSTKAISKPSIQSLSCGRNRYDDIKERFDKLHQEYCQRSPQRMKETFCTGQSPDRASVEAQYKKDFQGKMTADSAFESPQKSLSLPSWSIKSPSGSTAIEIHPSTCIAHAPRRDQQSPAKRRRLSDPQVCGWWAESWNSTGVGRAIPRPREETHPLQLDLEEKERRTQDGKVILC	48790	64941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19409_pilon_+_48901_49367_49435_52471_52528_53517_53582_56030_56096_56911_57005_57916_57987_59442_60996_64694
767651	contig_7744_pilon	+	2116	16	Intergenic	novelGene_62544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	224.596131360765	1	109	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1134	1595	889342	890699	FALSE	20	TGCTAAAAGCGTCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPSEPCLTELFSPRLTRAD	879799	891220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884744_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887371_887446_889021_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890292_890650
767652	contig_15123_pilon	-	2205	12	Intergenic	novelGene_110908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_5	195.704491348268	487	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	82	1884	227068	217521	FALSE	10	GTGCTGAGCTGCCTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVRADAETRLAEVRQEAQNAARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEELSKKLADHDQASKMQQQKLKAQGSESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHYKLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRGLEQLQKENKELRAEAERLGQELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVHSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLAITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPVSQRLPPKVESLESLYFTPISTRSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFHSTQSAPASQASLRTTSSTQSLPSLSSANDGNSALLSLPGYRPTTRSSARHSQARVSSGAPSAPTLAPASLLSTGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQRRNRVCPPHLKTCYPIESRPSLSLATITDEEMKTGDPQETLRRASMQPAQIAEGTGITTRQQRKRVSSESHQGPGTPESKKASSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTKAQEKAAPAVKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGSSKKAPSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAASAAAATPRAKGKAKH	227149	217199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_217920_218128_218254_218369_218656_218834_219236_219410_220063_220293_221228_221476_222752_222911_223020_223240_223326_223438_224870_224940_226981
767653	contig_3825_pilon	-	858	5	Intergenic	novelGene_78006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	521.981560977014	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	139	813	1465452	1461838	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTGLCHSPPGALWVPPLSQAPASPSHPDSSVLPLSPHPLPAHPAPMSWCPFPCSPPAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSFRFCPHASQLCQPRFAKPALLILRSQRACVPKRYQNEEYCF	1465590	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1461963_1462199_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290
767656	contig_6048_pilon	-	2468	16	Intergenic	novelGene_73293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	98.6782425641821	1	142	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	110	1936	2006289	1979135	TRUE	40	TAATTTTAAATAACCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKMLGRRCSTMAAAGLMKTTCTARSWPSSTRTAPSPSSTWPSPGSRPTRSMCSTY	2049107	1978499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979378_1979455_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006294_2049002
767657	scaffold_16539_pilon	+	1568	10	Intergenic	novelGene_68365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCCCGCACGCACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489793	516031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_490277_490382_490488_494561_494767_498733_498866_498949_499069_500547_500733_501688_501834_501919_501988_502109_502204_515999
767658	SIRV6	+	488	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	171	-1	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
767661	contig_7207_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_72099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747913	745480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_745500_747900
767662	contig_17753_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_105038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	988	1317	28767	29096	NA	40	ACAAACAAGATACGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGHLFNSVLKLLLKFTIQPKIRQAYKTNNNRCSSSMCMRVGPAHRTSQWTHQPKGKMQREEVTGKLDERKWGTWEREGESVDTSQGLQPLSQNSMCINCLMRNEFAL	27779	29711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_27800_29700
767663	contig_4232_pilon	-	1281	2	Intergenic	novelGene_63459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGTTTCCGATCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557345	555909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_556283_556437
767669	contig_610_pilon	-	2235	5	Intergenic	novelGene_76820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_3	33.101170674162	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	39	1394	343470	333164	FALSE	40	TACAAAGTAGAACCGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSGKCLLRNPLHPGQPLPIPQHLCLPSLGL	343508	332322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338808_343421
767670	contig_12671_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_19208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191225	188811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_188800_191200
767671	SIRV2	-	202	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	1073	4	-1073	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGGTAAAACTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
767677	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	54	512	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767680	SIRV6	-	540	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9449	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1188_1574_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
767681	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767682	contig_9114_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_155180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTACAAAGATCTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83334	84413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_+_83300_84400
767683	SIRV6	+	335	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	534	2	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
767685	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767688	contig_9871_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_75627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGGAGTTTCATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333358	332823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_332800_333400
767689	SIRV5	+	293	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	37	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
767697	contig_3153_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_104689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGTTACTTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333878	332515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_332500_333900
767698	contig_401_pilon	-	1752	2	Intergenic	novelGene_42856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	666	1484	1722791	1721973	FALSE	5	TACTTCTGTGTCTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1723953	1721704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722941_1723437
767699	SIRV6	+	321	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1683	3	-216	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2807	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767708	contig_19941_pilon	-	2010	14	Intergenic	novelGene_139751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_11	50.7616544463454	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1965	44	2008	21698	8296	FALSE	45	GATGAAAAAGTGAAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAMKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTSATLDEATSGVSENEMAVTPGHLNSTGVLLEVGGVLPVIHGGEMQQTPNTVAASPAASVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSNEISMIINSIKEECFRSGVAEAPGGSKAPSIDGKEDLDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKAVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSIEIKVEPTEPEQGISGAEIAAVVPALSMEPPELRSHSLDEDPRSTATGEIAEADVSSGKGDETQLTTVKTEASPESLLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQDSSEKDGGTRGRRCAIEADM	21741	8293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_8341_10605_10711_11965_12144_12519_12589_12784_12878_13071_13287_14070_14118_14325_14420_14709_15160_15533_15815_17307_17453_18602_18740_21162_21228_21657
767710	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	842828	843061	NA	25	GCATTCCCAAATAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842758	843120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
767716	contig_6870_pilon	+	1499	6	Intergenic	novelGene_103991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	528	junction_3	73.7791298403553	251	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	88	825	1488054	1521638	FALSE	35	CGAAGTACTTCTGAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQRSVCSSG	1481093	1522312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1493506_1493613_1502310_1502447_1504248_1504495_1521425
767719	SIRV7	-	368	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	14	-32	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACATGAAAAATCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
767727	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767728	contig_2917_pilon	-	1909	2	Intergenic	novelGene_147590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_1	0	26	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAAAAATTGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95315	92793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782
767732	contig_8907_pilon	-	1685	2	Intergenic	novelGene_85818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	0	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGACACCATCCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179540	173360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972
767733	contig_10163_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_82639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCTAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148985	151074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_149000_151100
767740	scaffold_6394_pilon	-	1926	11	Intergenic	novelGene_110966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	110.547003577664	295	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	673	1878	250850	248602	FALSE	0	GGTGGTGGTGGTGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDNSGDPADPHKVYAVSPAPGWGGQGSDRTEEEAPTDGRLMRGEPPGPFLGEAGERPEPVLGWAGATGQRSEPCTSSPQPTPAADARDLLHQALQHTHLGDHLLEEAWRMDSAPQQPPGPALVSEELYLPWAEAAPSCPPQPPAQHQALMTDAAWTPALEPSQEAGPAPSPLTGAPLAEGGLAVLEVTILYKGRPVLQEVVGRASCVLLYRTPGPAAEAVDAQLVAFPSPAELPDQKQLRYTEELLRHVDPGLQLELRGGSLWARRLGKCKVYWEVGGPLGSASPSSHACLLHRNFDTPIFDFGVFFRELVEFRERRRQGSPHYTIYLGFGQDLSAGRPKEKSLVLVKLEPWLCRMYHEGAQREGTSSLNSSSLGLCVSSSNSLYDDINHFLMELGQPP	252561	248553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_248758_248834_248954_249028_249419_249495_249577_249650_249750_250025_250255_250350_250407_250774_250983_251068_251233_251312_251643_252515
767743	contig_12977_pilon	+	1209	11	Intergenic	novelGene_122778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	717.811702328682	45	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	191	814	10887	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKSPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10696	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49467_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
767747	SIRV6	+	348	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	4	-244	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767748	contig_13901_pilon	-	1991	9	Intergenic	novelGene_146639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	632	junction_2	133.604301483897	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	335	904	165299	158301	FALSE	80	AAAAAATAAAAATAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLELQVGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIEVFKKIANFTSDVEYSDDHCHLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEVRF	185222	157213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_158388_158480_158622_161336_161485_163875_164040_165269_165378_165477_165510_168717_168773_182381_182486_185157
767751	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767753	SIRV6	-	221	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGTTCATCAATTATACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
767756	contig_4131_pilon	+	1944	7	Intergenic	novelGene_127841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	86.5282548586812	1	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	436	1836	87286	97745	FALSE	45	AAATATGCATTGAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLVRLCSRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85394	97853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85845_87139_87694_91474_91571_93097_93337_94417_94540_97209
767757	contig_4213_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_124836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTACTGTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251966	250833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_250800_252000
767759	contig_11855_pilon	+	1029	8	Intergenic	novelGene_67120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	167.792996861962	1286	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	102	878	2642479	2650829	FALSE	45	AAAAAAATTTTTTAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPGLPCWGAAGGSQEAETRVPGSRTARGPSAGMHRRGVGAGAIAKKKLTEAKYKERGTVLAEDQLAQMSKQLDMFKTNLEEFASKHKQEIRKNPEFRVQFQDMCATIGVDPLASGKGFWSEMLGVGDFYYELGVQIIEVCLALKHRNGGLITLEELHQQVLKGRGKFAQDVSQDDLIRAIKKLKALGSGFSIIPVGGTYLIQSVPAELNMDHTVVLQLAEKNGYVTVSEIKASLKWETERARQVLEHLLKEGLAWLDLQAPKEPHYWLPALFTDLYSQEITAEEAREALP	2642377	2650980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2642533_2642911_2642963_2644485_2644625_2645566_2645672_2646491_2646565_2647812_2647955_2648833_2648909_2650691
767760	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
767762	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	33	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
767763	contig_5643_pilon	+	1568	3	Intergenic	novelGene_38979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	618.5	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAAGCCTTGTGGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550955	552911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_551892_552152_552231_552357
767766	contig_6673_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_164027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCTCTGTCCTATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136702	135171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_135200_136700
767769	contig_8954_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_130269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106248	104619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_104600_106200
767770	contig_16067_pilon	+	2045	8	Intergenic	novelGene_169845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	198.582733491148	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	975	2045	66573	102226	FALSE	45	GTAAATAATAGGAGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRKELNALIGLAGDSRRKKPKKGSGHRLLRTEPPDSDSESSSEEEEEFGVVGNCSRFVKGDYLRCCKICYPLCAFVILAACVVACVGLVWMQIALKEDLDALKEKFRTMESNQKNSFQEIPKLNEELLSKQKQLEKIESGELGLKRVWINITEMNKQISLLTSAVNHLKASVKSASDLISLPATVEGLQKSVASIGNTLNSVHLAVEAIQKTVDEHKKTIEILQSGMNQHLLKDTSGSNEITPPPSVTSEADNKTHSENSKQDILYLHNSLEEVNSALVGYQKQNDLKLKGMNETVSSLTQRVNLIESDLVAMSKVEKRASLSFSMMSDRAATLKRESLDQETNRTDSLKTQSIK	65598	102226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_+_66755_68208_68358_81573_81720_93277_93377_96433_96545_99367_99473_100510_100703_102139
767775	contig_5964_pilon	-	2968	3	Intergenic	novelGene_80361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	381	2069	70903	52759	FALSE	35	AAAATAGTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVALRDRAQVYVTFEDVAINFTREEWGQLDLTQRTLYLEVMLEICGLLVSLGGKAKLESTEPTTPELALSEGASDQGRLTQVVSKDCQLGRYRGQEGPLEMQDQHLRPGIDPQEGQLPGKMSPEHDGLGTDDGACSRILQEQVSPGDAVRDSDSHRPAKDAMTHEKRNPYVFKECGKVFNKRLLTQHERIHSGVKLYECTECGKTFSKSTNLIQHIKVHIGEKPYECTECGKSFSFRSRLARHQQFHTGEKPYACTECGKAFSHKSKLTEHQRIHTGEKPYECTECGKAFSHRSQLTQHQRIHTGQKPYECKECGKDFSHRSKLAEHQRIHTGEKPYECTECGKAFTHRSQLAQHQRIHTGEKPYECVECAKAFSRRSQLKRHQRIHTGEKPYECIECAKAFSCRFQLTQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFSFRSHLTRHQQFHTGEKPYECIECGKVFSHRLQLAQHQRIHTGKKPYECIECAKAFSRRSQLTRHQRIHTGEKPYECIECAKAFSCRSQLTQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSQKAHLIKHQRSHTVGDAL	71283	51859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_54291_69878_70006_70873
767780	contig_11720_pilon	+	774	2	Intergenic	novelGene_44002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1128	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	5	331	266571	268041	FALSE	55	CAAGTTAACAAATACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTGVGREM	266566	268484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_266610_267753
767784	contig_10765_pilon	+	1890	6	Intergenic	novelGene_122842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_1	100.670551801408	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1719	171	1889	18249	34887	FALSE	20	TCGGCTCACACGGTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGP	15596	34888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
767785	contig_7457_pilon	-	2097	10	Intergenic	novelGene_31384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_6	31.8193201656237	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1440	1916	437993	437249	FALSE	40	TAGCTATAAATCAAGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	442318	437067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438566_438678_438766_438987_439115_439569_439651_439898_439968_441329_441498_441683_441797_442096
767786	contig_12580_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_172900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAGAGAAACGCACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134361	135155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_134400_135200
767787	contig_7119_pilon	-	872	5	Intergenic	novelGene_41005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_4	315.700312796804	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	139	426	194918	188651	FALSE	15	CTAGTAAGCCTTGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196726	188204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196690
767788	SIRV3	+	116	2	ISM	SIRV3A	SIRV306	2373	3	22	4212	3	-2638	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTGTTCTGAATCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	4080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4003
767790	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767791	SIRV6	+	363	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11210
767796	contig_9177_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_32696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACTGTGATAGAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454213	453117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_453100_454200
767797	contig_9258_pilon	+	622	3	Intergenic	novelGene_104607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	84	476	97238	99582	FALSE	10	ACCAGTGCTTGGCTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96737	99728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
767801	SIRV6	-	314	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1344	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105
767802	contig_12626_pilon	-	1141	3	Intergenic	novelGene_80440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATCAACTCTATGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155886	147067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_147767_149280_149472_155635
767807	contig_6164_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_121255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24802	22859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_22900_24800
767810	contig_5084_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_64480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69548	67839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_67800_69500
767811	contig_15045_pilon	-	1499	4	Intergenic	novelGene_130067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_3	176.081420560679	426	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	321	1346	166048	157201	FALSE	40	AAGTCAGTGGAAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLCLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGVISIPLYIPYTLYNWDLGDKLCTFWLIIDYLLCTASVYNIVLISYDRYQLVLNAVSYRAKQTEILKIVALMVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKECEPGFFLVWYIIAITSFFEFLVPVISVAYFNMYMYWSLWKRGSLGRRQSHPGLNSPDSSNDCGHSFKCRPFSRTSLPELKETEVPLRSEKQRRKSSFLHSFRTQVNTCTIASKMCSFSHSHSVTHQREHLELLRAKKLAKSLAILVGVFAICWTPYSVSAIVLSDKHPKPYWYEIAFWLQWLNSFVNPFLYPLCHKRFQKAFLKIFCMKKKTILSQS	166993	157047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157987_164354_164519_165972_166107_166731
767817	contig_16883_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_161728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAACTCTGTAGCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263859	261554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_261600_263900
767818	contig_11071_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_131034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTACAGCATCTCTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142964	143641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_143000_143600
767819	contig_6497_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_35598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371052	373321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_371100_373300
767821	contig_2733_pilon	+	779	6	Intergenic	novelGene_128591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	97	junction_5	21.2753378351555	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	18	779	895193	900154	FALSE	45	AAAGAAGATGAGCTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAV	895175	900154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_895240_895763_895960_896251_896420_896647_896828_899894_900006_900094
767831	contig_987_pilon	+	1348	3	Intergenic	novelGene_72355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_2	277	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	15	470	1295567	1304627	FALSE	10	GGTGGTGTACTCTGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNINRPLTMKKEGIQTRNRKMSSKSKKCKKVHDTLEDFPKSSSFNPAALSRHMSSLSHISPFSHSSHMLTTPTPMHPPSSLSFGPHHPSSMVTAMG	1295552	1305505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1295612_1300073_1300200_1304342
767832	contig_6544_pilon	-	1445	6	Intergenic	novelGene_142082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	201.630354857596	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	1026	1445	75261	70954	FALSE	65	ATTAGGGAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPAATFEKHGEHLSRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLRTTGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGGAYAGITGNPSGWHGSSRGHDGMSQRSGGGTGNHRHWNGSFHSRKGSAFQEKPPLE	107180	70953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_71184_71956_72087_75201_75317_75995_76110_76307_77031_107047
767835	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767837	contig_12864_pilon	-	1272	6	Intergenic	novelGene_76415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	755.917879137675	4	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	419	865	244752	242640	FALSE	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNSELGLRRFPPRGTHPEGPAGPVCWPESEKHLRASDDPCLPPPRSGSSLGPLLLPVPWTNLGPRKRIVPLPCGEHTLYSLFPSSLLPAFSTGVRT	252157	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_244553_244759_245701_245915_246329_246348_251863_251999_252111
767839	contig_13542_pilon	+	2277	3	Intergenic	novelGene_131486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	467	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	99	317	346638	454110	FALSE	35	ATTAGAGATGTAAATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYR	346539	456070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984
767843	contig_15456_pilon	+	1146	5	Intergenic	novelGene_139502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	751	junction_1	348.198488652665	57	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	93	398	131507	142382	FALSE	15	TTTCATTTATTTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCEKCEKKLGTVITPDTWKDGARNTTESGGRKLNENKALTSKKARFDPYGKNKFSTCRICKSSVHQPGSHYCQGCAYKKGICAMCGKKVLDTKNYKQTSV	131414	143130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_137564_137620_141935_142040_142317
767844	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
767845	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1692	561	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
767848	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	3	404	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767849	contig_13765_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_165870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCCATTCGAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16164	14042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_-_14000_16200
767852	contig_9668_pilon	-	2113	2	Intergenic	novelGene_58164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	28	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	50	325	476982	476707	TRUE	40	TTCCAAATAACAGTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRQGSIVKVFLSTAVMFKSESPKEPEQLQKLFIGGLSFETTDGSLRSHYEQWGTLMDCVVMRDPNTKRSRDFGFVTYSTVEEVDAVMDPRPHKVDGTVVEPKRAVS	477031	464404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_465808_476321
767855	contig_12379_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_148935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCACGCAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200019	197872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_197900_2e+05
767856	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767860	contig_10235_pilon	+	1871	14	Intergenic	novelGene_46551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	22.200271867838	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	102	1820	422144	429472	FALSE	20	CATGTGAGCTCAAGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDVIRDLEWVIFDEVHYINDAERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVARPVPLEHYLFTGNSPKTQGELFLLLDSRGVFHMKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHHGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLQRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDTMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQSLAELTKRLGALEEPDVTGQLVDLPEYYSWGEELTEARSLIQRSIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPMSEDPQDKGPATPDVPFPDDLVGFKLFLPEGPCDHVMAKLQPGDVAAITTKVLRVNGEKILEDFNRRQQPKFKKDPPCAAVTTAVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ	421849	429523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_421921_422113_422221_422554_422702_422777_422875_423052_423266_423346_423458_425691_425923_426544_426683_426838_426977_427079_427185_427441_427590_427680_427808_428049_428084_429319
767861	contig_5696_pilon	-	1517	7	Intergenic	novelGene_117579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGCTAAATTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738203	716362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_716743_730447_730595_731912_732064_732416_732504_732629_732787_734428_734592_737771
767862	contig_10341_pilon	+	1083	5	Intergenic	novelGene_47217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	479.211331251672	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTTATAAGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63178	65376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_63854_63907_64154_64484_64615_64936
767864	contig_14133_pilon	-	1513	12	Intergenic	novelGene_119906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_2	18.4404334758394	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	32	943	129584	123313	FALSE	20	TGCAGTGTCACTCGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPEPESEQIRLKCIRKKGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTDEVVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCITLQVLRGLQYLHRNFVIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTPTQTTSIDMWAVGCVLAELLAHKPLLPGSSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGDCWGLPGELLLQGEAPALRAGAHAHLPPPPQQAGCLRR	129615	122742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_123380_123620_123674_124246_124371_124641_124702_125128_125199_125328_125382_125889_125958_126305_126388_126575_126679_126799_126872_127642_127716_129497
767865	contig_7565_pilon	+	1100	8	Intergenic	novelGene_172907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	9.95500079439105	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	242	1099	127467	141353	FALSE	45	CCAAAATTAACAGGTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNNQPASIIHFSDPQRNHFQQFGTSQSPSCQALEPCKVTYKPYQSSAQNNGSPAQEIAGRDSFEGLQQQFLEANENSADNMQIIQLQVLNKAKERQLDNLAEKLNESERQIRYLNHQLLIIKDEKDGLALSLRESQKLFQNGKEREIQLEAQIKALETQIQALKVNEEQMIKKCRTTEMALESLKQQLLDLHHSESLHRAREQHESIVTGLTKKYEEQVLSLQKNLDATVTALQEQEDTCSRLKDHIKQLERIQEATKLEKTEIIGRLTRSLEESQKQCASLLQSGSVQEVAQLRLQLQQAQKAYTMTENMNKAFQEELTELKNEISLYESAAKLGILPSDSEGELNIELTESYVDLGIKKVNWKK	123562	141354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7565_pilon_+_123624_124994_125161_127452_127594_128755_128896_130814_131016_137791_137940_140078_140171_141203
767866	contig_740_pilon	-	2044	8	Intergenic	novelGene_158937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	20.8718148003767	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	467	976	109383	106027	FALSE	25	TTTTCATTCCAGTGGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGGCEGNANNFETLAACDEACWRIEKVPKICRLEVSEKQCEESRQEYFFNLSSMTCEKFLSGGCHNNENRFLDEATCRGFCTPKRSPSFCYSPKDEGLCSANVTRYYFNPRHKICETFTYTGCGGNDNNFVSIQDCKKVCAKALKKKKKKIRKFVLASRSLKLQKKQL	165145	104958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_106107_106458_106630_108198_108379_109304_109488_113105_113211_116826_116894_130358_130455_165051
767867	SIRV7	-	302	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91622	2	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
767882	SIRV4	-	271	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1252	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3906	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
767888	SIRV4	-	256	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1265	0	1265	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3893	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
767890	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_95519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
767893	SIRV6	+	187	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	406	2	-236	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGCTTCCACACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
767894	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
767895	scaffold_12510_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_151356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTACTCTCTTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147869	145642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145600_147900
767897	SIRV1	-	161	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3666	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6700	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6557
767900	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
767902	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767905	contig_3004_pilon	+	2181	13	Intergenic	novelGene_127491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	200.756485989038	110	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	201	980	277854	281328	TRUE	40	AAACAAAGTCAGCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275587	287249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275706_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_284415_285297_285751_286379_286451_286738_286875_287113
767908	contig_10861_pilon	-	2761	10	Intergenic	novelGene_39353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	146.819953567055	2	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	4	1746	1535543	1521112	TRUE	20	TATTGTCCCCAGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESALQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLSTLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHEHVGNFARDLVAQWKKLVPVERNTEPDEQDFEKSNSRKRPRDALQKEEEMEVDYQENWKASSSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSYSHERQDERKRCNRVSPAYSSDHESSDYGHVQSPPSSTSPQMCVDHYRSPEEDHEPIVLHQKPGKGHSNAFQDRLGVSQERHLGEPQSKGVVSQSKEHKSSHKEKRLLDAKGDEKSSAVSREKSHKAVSKEENRRPLSGDSTKEKPPPSGAKKEREREGSSIKKKSLPPLEVASDNHLKKPKHKDSEKTKSDKNKQGLDSLDIGKGAGDLVPKVKEKVSNSLKSQEGKLKTSSLDRKSAGSLPKAEEADMDDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGEKGLKKSDSKSTSKNLDSVRKLPKMNESKSEKLQPSGADSAKLKKVPTDILPVLPDLPLPMIQANYRPLPSFELLSSLQTKRKALSSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDCKSHTSLLLSSAL	1535546	1517378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1517760_1518732_1518915_1519505_1519613_1519942_1520124_1520947_1521309_1522064_1522180_1522550_1523743_1524776_1524884_1530182_1530240_1535468
767910	contig_776_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_139908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAAAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475469	474620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_474600_475500
767913	contig_7129_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_169309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTATGAATACATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941440	939879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_939900_941400
767914	contig_6710_pilon	+	537	2	Intergenic	novelGene_97279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653379	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
767919	contig_9673_pilon	+	1198	12	Intergenic	novelGene_119157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	648.541873731736	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	466	1197	114479	183875	FALSE	70	ACAAAAAAAAAGATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEIDSKKYYKYSKEKTLKWLEKKVNQTIVALKTNKINVGARVQSAAFFPGDQASSDKEEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKKNSKMTAAQKALAKVDKSGMKSIDSFFGAK	58984	183876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_84698_84875_87676_87825_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_183785
767921	contig_5317_pilon	+	985	4	Intergenic	novelGene_76532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3454.92373287747	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTATACCTGTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33705	43838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35263_35410_36684_36851_43225
767925	contig_3942_pilon	+	1986	8	Intergenic	novelGene_128825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	164.793253279771	699	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	8	1471	1187481	1194392	FALSE	10	GTGTCATGTGTACTCTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIMKIAEAGKGSIHQQSHMPLQYIYTLFLEHDCFLTCHKRCLETLLILCGHRRLPARTTLFGVDFLQLPRDFPEEVPFVVTKCTAEIEHRALDVQGIYRVSGSRVRVERLCQAFENGRTLVELSGNSPHDVSSVLKRFLQELTDPVVPFHLYNAFISLAKTLHVDPGDNPGTPSPSLEVIRSLKTLLVQLPDSNYNTLRHLVAHLFRVAAQFEENKMSANNLGIVFGPTLLRPPGCPGAAGAGPVACLLDSGHQAQLVEFLIVHYEQIFGMDELPLATEPSSHNPSPAPGALTTSLQPVPPQLVQDPLPPALASDPGPDPEPQCVLEKDPAAVPAESPTLQSDQREEAATDTRDGGGEASNRGPEDSLLGTQSRGHFSRQPVKYPRGGVRPVTHQLSSLALVASKLCEETPVTSVPRGSLRGRGAGPAAASPEGSPLRRTPLPKHFEITQETARLLSKMHNEAVPRTTCCMDPQPEVVDPQPEEAEDHL	1187473	1194907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1187523_1187613_1187662_1190638_1190828_1190934_1191073_1191170_1191368_1191696_1192085_1193797_1193865_1193997
767928	contig_11016_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_163293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATAGAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134919	133339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_133300_134900
767933	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
767935	SIRV4	-	467	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1056	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
767945	contig_9363_pilon	+	1542	9	Intergenic	novelGene_6661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	580	921	1010817	1011400	TRUE	15	CCCCCCACTATCAGCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSSCWISLCRAEISFRACRVTCVSFSILDTNTSLCPLSSICSSSSSDTIPALAVKERPGCVWGQGTPPTPPPHWGWAPHTLIFSCLRILSTFFSRYSDCIELHLLMSSTNC	1009145	1014414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1009562_1009641_1009752_1010763_1010903_1011144_1011421_1012882_1012951_1013458_1013532_1013668_1013768_1013885_1013988_1014155
767946	contig_16303_pilon	-	1674	8	Intergenic	novelGene_34107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.285506120041	5	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	99	1082	45428	37221	TRUE	25	GTGAAAGCCATCCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWGLFSPPSQSRNNFLAWVLELWSLQL	45526	33144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33217_35342_35764_35980_36029_37169_37298_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
767956	contig_8464_pilon	-	2032	2	Intergenic	novelGene_125368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	274	894	786512	785892	FALSE	5	AGCTTTGGTTTTTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDPMTYEAQFFGFTPQTCMLRIYIAFQDYLFEVMQAVEQVILKKLDSISDCDISPVQIRKCTEKFLSFMKGRFDNLFGKMEQLFLQLILRIPPNILLPEDKSQETHSYSEEEFQLLQKEIEQLQRKYKTELCAKQALLAELEEQKIVQAKLKQTLTLFDELTNVGRDHGISDFRESLVSLVQNSRKLQNIRDNIEKEGERLKTS	791891	784753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_786545_791650
767958	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	9	1158	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
767959	contig_2027_pilon	+	1491	13	Intergenic	novelGene_39953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	106.198189982483	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	80	712	639829	643655	TRUE	25	CTCAAAGGTGTACCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDGMSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPGPSSCTQHRDLEHFPFLAPANVPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPTDSSLIQLTAQSFSTDAWAVAW	639584	648729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_639646_639810_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641390_642951_643094_643195_643224_643635_643737_646146_646324_646427_646475_647011_647130_647372_647505_648505
767960	contig_7657_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_30026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTCTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176990	178338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_177000_178300
767961	contig_8354_pilon	-	1285	6	Intergenic	novelGene_24131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	536.206079786494	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	64	681	505899	500999	TRUE	15	ACTTCTGACTGTGACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	505962	499984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500429_500838_501091_501670_501822_502359_502471_503634_503824_505824
767964	SIRV6	+	348	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	4	-244	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767966	contig_14683_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_166059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGTAACGTTTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191692	189838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_189800_191700
767971	contig_18113_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_137528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122930	122040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_122000_122900
767973	contig_8357_pilon	-	1369	3	Intergenic	novelGene_39723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGCTCTAAATGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510922	499209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_499256_507469_507567_509696
767976	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
767978	contig_7045_pilon	-	1967	7	Intergenic	novelGene_77438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	26.4868940337586	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	29	841	279183	255564	FALSE	30	AGGAGTTTGGCTAGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPVLETSHVFCCPNRVRGSLSWSPGPGGLLAFGTSCSVVLYDPQKRVVITNLNGHTARVNCIQWICKQDGSPSTELVSGGSDNHVIHWEIENNQLLKAVHLQGHEGPVYSVCAVYQRRASDVTLHTLIVSAASDSTVRIWSKKGSEVTCLQTLDFGNGFGLALSLSFLPNTDGRDLFLASCSQDCLIRIWRLYIKSTSLEIQDDDNIRLKENTFTIENESIKIEFAVTLETVLAGHENWVNAVHWQPSFYKGRKKGTHVFLISIKCHA	279211	254437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_255713_256874_257016_260770_260849_261668_261826_272262_272334_275191_275271_279045
767979	contig_7045_pilon	-	588	2	Intergenic	novelGene_77437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTAAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254187	250818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_251296_254076
767985	contig_1516_pilon	+	1089	7	Intergenic	novelGene_49993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1053.05423517605	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	98	712	353572	359968	TRUE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLQVFPAFASQPKPVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQAFWRNSQRGLPAGGCAHAAPDCP	335209	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335256_353520_353693_354793_355065_356022_356178_356468_356526_359957_360091_363478
767989	SIRV4	+	357	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCACCCGTAACAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
767991	contig_4364_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_3670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
767993	contig_348_pilon	-	1668	6	Intergenic	novelGene_67592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	14.2744527040444	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	77	604	254084	253053	TRUE	35	GCTTCACCATAAAAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVAEFWCSRVEWSPGEEKYHLRGVMPPDEFHPGVNNSVYTNVLVQNSLHFAAALAEDLGLPVPNRWLVVADKIKVPFDPERNFHPEFDGYQLGEEVKQADVVLLGYPVPYPLSPSIRRRNLEVYEAVTSPHGPAMTWSMFAVGWMELKDPGRVQGLLDRSFANITEPFKVSVAGFTGPWQRLSGAVAGWQWGGSGAVCT	254256	251860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_252461_252588_253242_253334_253469_253718_253856_254016_254090_254185
767994	contig_348_pilon	+	1861	9	Intergenic	novelGene_67599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_7	9.82344135219425	147	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	506	1432	320222	345268	FALSE	15	ACTGTATCTCTTCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEKPEVNLCCPLRPPRQAMGCWSLSGVPCPPRDARFLSGAFQVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314468	345697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_319018_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342659_342990_345214
767997	contig_10494_pilon	+	2901	1	Intergenic	novelGene_102126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1262	1726	266132	266596	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGVWGLLVSPAALHVICPGAWSSTRSQGSQQAGRDLVEAVGGGGPSSAATKSQAQDSPSGGGGGRERRELARHQRMSCPKKKTSGCCISVLGHALPQGQGLALWATSQSPLHSHPPGPSHTPWRLGGQPTHHHPTLRILLKHCECSVSSQPA	264870	267771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_264900_267800
768000	contig_19012_pilon	+	1618	2	Intergenic	novelGene_159487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	375	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAAAAAAGGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85003	101860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_86101_101339
768003	contig_151_pilon	-	1806	2	Intergenic	novelGene_132577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTTAGAATAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253666	244837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_246535_253557
768009	contig_10749_pilon	-	921	5	Intergenic	novelGene_133517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	53.6487418305406	1053	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGGTCTTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314645	311715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_311926_312685_312792_312891_312967_313916_314354_314552
768010	contig_10225_pilon	+	1380	3	Intergenic	novelGene_86864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	510	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	617	1264	46299	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFEREQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	44830	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_45259_46110_46791_47480
768011	contig_9843_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_114320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAAATTGAGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58344	56795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_56800_58300
768012	contig_12580_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_172901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACGTCACACTAAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179383	179947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_179400_179900
768013	contig_12580_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_172903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181265	181755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_181300_181800
768017	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
768018	contig_14341_pilon	+	1245	2	Intergenic	novelGene_111772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATCATGCTTTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299423	301123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_299457_299911
768019	contig_3956_pilon	+	1099	6	Intergenic	novelGene_15100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1519.04280387354	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	78	902	1281682	1290816	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGCIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281604	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283868_1286409_1286606_1287276_1287400_1290602
768021	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
768024	contig_10003_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_88242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGGACCACAAGGCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677411	677101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_677100_677400
768025	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	524	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768027	contig_14467_pilon	-	1160	3	Intergenic	novelGene_138252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGGGCTCAAGAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319730	306510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_306557_318506_318881_318990
768028	contig_11126_pilon	-	3003	1	Intergenic	novelGene_138158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCCACTATCAAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994788	991785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_991800_994800
768029	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_114004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
768030	contig_13244_pilon	-	2622	2	Intergenic	novelGene_86914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTGCACTTGGCACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183409	180626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_182900_183060
768033	contig_15952_pilon	-	1729	11	Intergenic	novelGene_154047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	24.9441375878181	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	38	757	105377	98128	TRUE	5	TTCTGTGGCACTCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGRRPEHGGPPELFYDENEARKYVRNSRMIDIQTKMAGRALELLYLPEGQPCYLLDVGCGSGLSGDYLSDEGHYWVGIDISPAMLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQVSPVAAGGTGKGRDPEQVSSPVPHLPSCCGGVTDKDPDAEWWEGGHAHMRVAPDGMSYASYPETVLQMV	105414	93281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93708_93799_97043_97103_97395_97442_97625_98389_99262_99360_102536_102634_102732_102816_102901_102998_105197_105236_105329
768035	contig_14441_pilon	-	655	2	Intergenic	novelGene_100719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	117794	116874	FALSE	15	TGCAGGGGGAGGGGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGLKKRSARPQTTALTFWVTGLGRVSPHSSSAESP	117796	116577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_116962_117525
768039	contig_7963_pilon	+	939	5	Intergenic	novelGene_58511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.811274307287	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	10	648	145917	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWIMSRTRELRCYSCYNFYGYCPTPGPPLKNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145907	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_148122_148271_148907_149187_149419_149546_149948
768040	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
768043	contig_8571_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_169194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTGAAATGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547644	545506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_545500_547600
768047	contig_3004_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_127536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515975	517346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_516000_517300
768050	contig_12179_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_128006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCATTGTCCAATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523138	521247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_521200_523100
768051	contig_12179_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_128005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTTCACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520797	518529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_518839_520568
768052	contig_12270_pilon	-	656	2	Intergenic	novelGene_113325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	150	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	312	656	14409	13842	FALSE	25	TATAGCTGCTGGTACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14720	13841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
768053	contig_5643_pilon	+	1033	8	Intergenic	novelGene_39023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	970.138281748682	5	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	145	822	631341	641217	TRUE	10	TGTGTAGCCTCTACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631991_640236_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641418
768056	contig_11855_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_66924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGCCCATTATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850013	851322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_850000_851300
768060	contig_11364_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_65167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102173	104361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_102200_104400
768061	contig_13547_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_104885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAAAAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101898	100073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_100100_101900
768063	contig_6710_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_97668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653687	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
768072	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_96160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	138	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657161	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657163	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768073	contig_9345_pilon	-	834	2	Intergenic	novelGene_24603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	212	649	945468	944755	FALSE	35	CACTAATAAAGTGCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945679	944569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
768074	contig_15327_pilon	-	1366	8	Intergenic	novelGene_70595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	18.2812494549102	386	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	27	1244	888378	882963	FALSE	15	GCCTGCCTGCCCCAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSHPQVAELLAEARRAFREEFGVEPQLAVSAPGRVNLIGEHTDYNQGLVLPMALELVTVLVGSPRMDRLVSLLTTSEDADEPRRLQFPLPTAQRSLEPGTPHWANYIKGVIQHYPAAPLPGFNAVVVSSVPLGGGLSSSASLEVAMYTFLQQLCPGPQPPHHTPPCAADSGKIATRAQVCQQAEHSFAGVPCGIMDQLIALMGQKGHALLIDCRSLETTLVPLLDPRLAVLITNSNVRHSLGSSEYPLRRRQCEEVAHALGKESLREVKLEELDAGKELVSKEGFRRARHVVGEIRRTAQAADALNRGDYRAFGHLMVESHHSLRDDFEVSCPELDQLVEAALSVPGVYGSRMTGGGFGGCTVTLLEAATASRTMQHIQEQYSGTATFYLSQAADGAMVLPL	888404	882840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_883035_883137_883301_883389_883541_885928_886111_886237_886413_886570_886691_887140_887331_888213
768081	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	8	1158	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768083	contig_4678_pilon	-	2139	17	Intergenic	novelGene_126060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	52.3324707996861	379	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	28	1896	578108	571931	FALSE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESEPERKRARTDEGTAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAEEEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWMPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	578135	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495_573628_573810_573974_574789_574927_575004_575159_575279_575353_576886_577024_577144_577206_577285_577361_577438_577599_577897_578009_578081
768084	contig_20819_pilon	+	2337	15	Intergenic	novelGene_55659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	3	junction_13	54.9135219955812	211	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1146	1802	48590	51734	FALSE	15	TGAATTCATCCCCCCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRQLQNKCRGYDLRPDPDIQQWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGISDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGGPTPFVSWDRPSMGGDEVPGTPAPLLARLAQVTSQDKAPSVISRVLEKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPPSANVFYAMDGASHDFLLRQRRRPSAATVVLTSGPSASGTPPE	46224	52269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_46288_46529_46709_46843_46895_46983_47284_47553_47806_47901_48006_48113_48199_48295_48365_48547_48623_49478_49512_50012_50135_50232_50329_50409_50522_51346_51462_51588
768085	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1092	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768086	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
768087	contig_7839_pilon	+	2205	14	Intergenic	novelGene_45714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_12	18.328688671107	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	193	1590	922840	928945	FALSE	10	AATCCCTCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATMYFTTRLDKSHNVSLDTAEVNKDIQASAPPAAPSTERSSLSATFNNVMTLCAMLPLLLFTCLNSFLHQRIPQSVRILGSLLAILLVFMITAILVKVQMDALSFFVITMIKIVFINSFGAILQGSLFGLAGLLPISYTAPIMSGQGLAGCFSSVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPHLKFYRYYQQHKLEGPGEQETKLDLISKDPSTTSHPPGEEPRAGKEEPRVSAPNSQPTSNKPSVRAILKNISVLAFSVCFVFTVTIGLFPAVSAEVKSSIAGASAWGNYFIPVSCFLTFNVFDWLGRSLTAVFMWPGKDSHWLPSLVVARVVFVPLLILCNVHPRYYLPVVFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLCMCYGPKKVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV	919487	929560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_919525_921685_921787_922785_922869_924883_924966_925081_925285_925381_925522_926103_926239_926332_926431_926575_926655_927053_927179_927429_927539_927758_927845_928236_928437_928833
768093	contig_15105_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_150986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAACCCGTTGCTGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670124	671079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_670100_671100
768096	contig_11702_pilon	-	1245	12	Intergenic	novelGene_141978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	80.3711432117089	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	204	1154	376758	372981	FALSE	20	CAACCACAGTCTCGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380790	372889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374057_374201_374269_374525_374660_374903_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
768097	contig_4659_pilon	-	1990	8	Intergenic	novelGene_118240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	193.567264056415	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	194	1087	860030	819799	FALSE	35	AAATATTTATATTGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884162	818895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853879_853937_859916_860039_883977
768098	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	60	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768099	contig_20493_pilon	-	1807	14	Intergenic	novelGene_86410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	80.8622175360784	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	40	1746	54655	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWNTCIILHPVLTQQTLLHCAQLNLHAQRCAQFHSVLQSQEGAISRDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55241	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_42504_42637_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
768102	contig_12970_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_50545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACAAGGACTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560411	560043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_560000_560400
768104	contig_11816_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_98586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	262	588	1353574	1353900	NA	45	GCTGAATAAATAAATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIPKSFSSALTFLLVPDSYLDIRWTSQTCVATDSSNFLPPLSTLPSIILLRFICTLSFVLQTWESSLTPLFSSPSTFSQSSPPVKFSSPFLLPSAPKSAWILPVIS	1353312	1354391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1353300_1354400
768105	contig_6446_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_149265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTACAGTTAATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780342	781888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_780300_781900
768110	contig_9609_pilon	+	1738	9	Intergenic	novelGene_23126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	192	599	520917	522016	TRUE	55	AAAGTCAACAACAGCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLAADLIVAVTTRVKPGRVAPLLPRHPHRVLLQPPDEVLHKPKLDQLPGSSTCCSCWGWRPMRSRTVVPGLRLQYSWNTSRRLALFVGQTRLLQGLVIYQVLDLGCRAVHIGILEGMTVALLTVSSGWQCAPG	520725	523939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_520925_521008_521154_521427_521538_521640_521730_521960_522081_522171_522309_522696_522808_522953_523488_523646
768114	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_96536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	36	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	657158	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657160	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768115	contig_15120_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_108019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAGGGCAGAATAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226828	228527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_226800_228500
768116	contig_1301_pilon	-	812	5	Intergenic	novelGene_47344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	505.545930158675	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	80	592	322831	296915	FALSE	60	GATGAAGAAGAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLKLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKK	322910	296694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_297011_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
768121	contig_10627_pilon	+	1247	4	Intergenic	novelGene_59911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	49.4323330984443	413	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	59	844	29148	32658	FALSE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARSTGSQLVWWLPVTTQIMRGNAIINSKNAGNTGLQLLAATPDLHPPSLRRRPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYG	29089	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30300_31515_31837_32653
768125	SIRV6	+	570	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768127	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	54	503	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
768130	SIRV4	-	358	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAGAAGGTACGCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360	1641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
768140	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_94998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653809	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
768142	contig_5229_pilon	-	1333	6	Intergenic	novelGene_117724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	43.7062924531468	377	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	344	940	896733	890385	FALSE	5	GACCTGTGCTTGGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERYSAAFEEAADGARQQERHYQLLSALQSLVKELPSSFQQRLSYTTLSDLALALLDGTVFEIVQGLLEIQHLTEKSLYNQRLRLQNDHRVLRQALRQKHEEAQQACRPHNLPVLQAAQQRELEAVEHRIREEQRTMDEKIVLELDRKVADQQSTLEKAGVTGFYVTTNPQELTLQMNLLELIRKLQQRGCQVGKAAL	897577	889991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_890469_890923_891065_891999_892101_896378_896540_896623_896840_897340
768145	contig_593_pilon	-	1750	5	Intergenic	novelGene_101968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	136.976959741411	20	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	103	678	118610	109886	FALSE	20	CTCATTGTGTTGCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSEIFVELQGFLAAEQDIREEIRKVVQSLEQTAREILTLLQGVHQGAGFQDIPKRCLKAREHFGTVKTHLTSLKTKFPAEQYYRFHEHWRFVLQRLVFLAAFVVYLESETLVTREAVTEILGILAPGFCFTAIKIEKIPTANAGSTDYAEVLVLKDLVRSCYWLYLKEHVGRWGVGLNVLKRFCFLLLP	118712	108813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_110089_113732_113849_116125_116223_117343_117438_118544
768146	contig_16999_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_84984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	786	1127	102731	102390	NA	35	ATCCTAACCCCTACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVCEPYSWGFSSLCQTSKSGLFFVSLNFVLYFSHALSRTPIAISEQSVVVARHHLVVLGSVWQKLLLWSNLFLVSLVFFFLLCSSLDGTSRCILDSLLQAFKTPDATHRSQM	103516	102111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_102100_103500
768148	contig_11328_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_88469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	313	942	225	1166	902278	901337	NA	25	TTCTGTCCTATACTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECACFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAQIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDVHRFEKISNIIKQFKLSCSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIRNARKHFEKLERVDGPKHSLLMR	902502	900309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_900300_902500
768151	contig_3095_pilon	+	818	4	Intergenic	novelGene_74999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3476.64407151494	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	68	430	147241	151865	FALSE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRCASWACWWVWWASLLAPFSSSRACAKAMLLNVVGLCEAPEGYGLS	147173	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149791_151039_151163_151848
768152	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_97127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
768155	contig_11642_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_172913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGTCAGCTCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197589	197861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_197600_197900
768157	contig_5643_pilon	+	888	7	Intergenic	novelGene_38880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5483	junction_6	1546.62468513427	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	58	678	236700	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236642	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
768162	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768163	contig_12050_pilon	+	1266	6	Intergenic	novelGene_62648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	284.472423971112	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	359783	362921	TRUE	5	GCCCTCTGTCTGTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKQTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTK	359631	363972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362033_362184_362571_362686_362918_363046_363410
768168	contig_13868_pilon	+	1816	5	Intergenic	novelGene_172659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	44.073801742078	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	145	882	98239	111855	FALSE	20	CTTGCACTTGACTATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKEFAINAEDEELRGLDYPINECTSFIPEVQAVLDLVDQCPKQVQKGKFPVIVIEGLDATGKTTVTQSVSDSLKAVLLKSPPSCVAQWRKIFDDEPTIIRRAFYSLGNYIVASEIAKESTQSPVVVDRYWHSTATYALATEISGGLQHLPPAHHHIYQWPKDLLKPDLVLLLTVSPEERMRRIAGRGMEKTREEVELEANNVFRQKVEVSYQRMENPSCHVVDASPSREKVLQTVLSLIRNNCN	98094	112789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_98308_101955_102071_104303_104506_109979_110214_111737
768170	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	10	-244	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768172	contig_5286_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_157379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTATTCCAGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600181	599375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_599400_600200
768173	contig_3948_pilon	+	1308	5	Intergenic	novelGene_53353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	7.01338006955277	242	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	49	450	1609927	1615816	FALSE	20	TAGCAGGCTCGCATCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPEAQRVLRYLVEVEELAEEVLSNKRQIVDLDTKRNQNREALRALQRDLSVSEDVMVCFGSMFIKMPHPQTKEMIEKDQAHLDSEIEKLRKQLKLKVNRLFEAQGKPELKGFNLNPLSQDELKAVKVILKG	1609878	1616674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1610014_1611834_1611911_1612994_1613070_1615003_1615085_1615733
768177	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	3	414	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768183	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10462	25	1225	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11462	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
768187	contig_14341_pilon	+	2109	3	Intergenic	novelGene_111874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_2	151	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	499	954	643603	644797	FALSE	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTRENPCREFFKYEKIENKSTCKICNTDMVGDHAANLERHLKRHHTDEYNAVQSKKTKKIEESVRSVPNKQQKTLDEFAEYAVPECLKVKLDKQTIVDACVELITVNGCLFELIEYSGFHKTLNLYGFIWSKTFDQLIEYYGNDISLVI	642316	645952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_642814_643601_643977_644715
768188	contig_13067_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_141351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGGTCAGTAAAAACTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71460	73041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_71500_73000
768195	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768196	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768198	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768200	contig_9527_pilon	+	1199	6	Intergenic	novelGene_134063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	46.2488918786169	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	69	719	486523	487885	FALSE	35	CTTACATAATATTCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484535	488365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486513_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
768202	contig_11677_pilon	+	1330	5	Intergenic	novelGene_85982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	41.3581914498204	356	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	62	790	738548	743763	FALSE	5	TCTCGTTGTGGGCCCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQLAQAVAAAAGEPRAREAMKVKKGGGGAGTGAEPALGASGPSVEPKPEPKSQAESESGSESEPEAGPGPRPGPLRRKQRIGPEDVLGLQRVTGDYLCSPEENIYKIDFVRFKIRDMDSGTVLFEIKKPPASERLPINWRDLDPNAGRFVRYQFTPAFLRLRQVGATVEFTVGDKPVNNFRMIERHYFRNQLLKSFDFHFGFCIPSSKNTCEHIYDFPPLSEELISDMIRHPYETQSDSFYFVDDRLVMHNKADYSYSGTP	738486	744303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_738774_742327_742442_742907_743011_743182_743356_743650
768203	contig_17042_pilon	+	1248	2	Intergenic	novelGene_140180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_1	0	1131	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	28	891	4885	10091	FALSE	30	TATATTAGTATTTATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKYPEIKSLMKPDSNLIWIITVMVLTQLVAFYLVKDLDWKWVIFWAYAFGSCINHSMTLAIHEVSHNSAFGHCKAMWNRWFGIFANLPVGVPYSISFKRYHMDHHRYLGSDGIDVDIPTDFEGWFFCTTFRKLIWVILQPLFYAFRPLFINPKPISYLEIINTIAQISFDIIIYYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKNLPLVRKIAAEYYDSLPQYTSWIKVLYDFVMDDTISPYSRMKRHQKGQVELE	4857	10448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_5602_9944
768207	contig_18473_pilon	+	989	6	Intergenic	novelGene_169640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	272.531833003046	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	64	414	42148	77005	TRUE	40	TGTAACTCAAAATATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREAVPATRARGYLGTTGHGFMIFCRFFAKMATSDAVLKRLEQKGAEADQIIEYLKQQVALLKEKAIKQIPIPSGTQLQANSTLSGNEIQSAPPTTISSGGKEQINREGEEKKVKEKTEKRGEKKEKKTAAVSSRKC	42084	88214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_42150_59510_59645_68948_69114_76955_77172_80412_80582_87974
768211	contig_6740_pilon	+	1222	2	Intergenic	novelGene_142643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGGTCTGCAACGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11300	20603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_11447_19527
768212	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768213	contig_6710_pilon	-	453	2	Intergenic	novelGene_98178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	15	CCCTATTTCAGCCTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768219	SIRV4	-	264	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
768221	contig_8829_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_140952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAACAACTAGCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108335	109955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_108300_110000
768224	contig_8330_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_71929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAGAAAGAAATTGACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307863	1307041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1307000_1307900
768225	SIRV2	-	199	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	1076	4	-1076	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAAATGGTAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
768226	SIRV2	-	277	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	649	22	649	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
768227	contig_10940_pilon	-	1520	2	Intergenic	novelGene_49252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	505	885	875054	874674	FALSE	30	CAAGAACAGTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	917153	874038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_875324_916918
768231	contig_253_pilon	+	1797	3	Intergenic	novelGene_129700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	172	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGCTCTGAGCCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488431	490477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_488715_488881_488983_489064
768237	contig_11977_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_171720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACAACTATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8150	6047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11977_pilon_-_6000_8200
768238	contig_10482_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_152825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGTTAACAGCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109957	108308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_108300_110000
768239	contig_10482_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_152824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTTTTTCCTTGCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108000	107303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_107300_108000
768242	contig_12250_pilon	-	960	10	Intergenic	novelGene_80672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	859	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTCACAGCTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394994	390248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_390495_391980_392014_392626_392692_392910_393020_393216_393314_393881_393953_394106_394177_394326_394381_394686_394775_394867
768243	contig_7870_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_108896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156496	154837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_154800_156500
768248	contig_5758_pilon	-	1005	2	Intergenic	novelGene_119124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATTGAAGACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562757	556501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_557410_562660
768249	contig_18108_pilon	-	1213	10	Intergenic	novelGene_33509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	456.15908531028	18	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	300	1001	297156	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRSSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335421	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272063_297093_297189_298776_298895_316667_316759_335363
768253	contig_1331_pilon	-	1261	4	Intergenic	novelGene_37837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2559.73488210531	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	33	503	169924	160009	FALSE	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQFFKRSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169956	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160210_160869_160949_166406_166534_169860
768254	contig_4604_pilon	+	1136	7	Intergenic	novelGene_19190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	137.376611303865	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	291	722	535559	548080	FALSE	45	TACCAGACAAGACTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNEFERLAARQPIELLSMKRYELPAPSSGQKNDITAWQECVNNSMAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNEKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	526619	548494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_532468_532546_535549_535621_540751_540914_545868_545950_547953
768255	contig_3825_pilon	-	841	4	Intergenic	novelGene_78013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	139.640809062235	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	22	561	1465317	1462075	FALSE	15	GATTTGCATTTCTTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1465338	1461794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290
768256	contig_9698_pilon	-	1440	6	Intergenic	novelGene_82496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGTTACTAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215185	189992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_190106_191298_191425_191630_191802_206424_206629_208375_208803_214786
768258	contig_6842_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_130652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGCAGTACAGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227676	227994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_227700_228000
768261	contig_16098_pilon	+	1081	8	Intergenic	novelGene_46034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	488	1054	350058	352260	FALSE	5	GGCCTTGGCTGGCTGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTILLSYHSAFAGLDDAHTLVTAGGADEATVMAPVHAVDCVRVHVRAQRQHSRPSAHVPHQNHPATAPALSSTFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSRRGSVKPPSGISHTCDCAVLGATGDDIVIVWAPGNVQHGGCVATDSRHVLVHTSSLAQGQHQESPSPTGLTDQGHKLGVDGAEATVPGGL	348303	352287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348437_349342_349499_349614_349712_349956_350075_350235_350411_350499_350647_350768_350889_352152
768263	contig_8153_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_34799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28145	26588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_26600_28100
768265	contig_5643_pilon	-	2296	13	Intergenic	novelGene_38909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	53.6114493368721	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1026	1586	319239	315184	TRUE	0	CCTGTGTGGCCTCTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPISSHVTATERQAFQPWPERLSNNVEELLQSSLSLGGQEQVSDRKQEQGQEHKQEQGQEHKQEEGQEQEEQQEEQEEEAKQEEGQGTEEALETVSGLQTDPESKFQPESLPSNPSSFTPRVREVESTPMMIENIQELIRSAQEMDEMNEAYDEDSWKNANRGRSVTILGGDTHLPVPSVTSAP	324439	312735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_313078_313591_313676_314778_314947_315067_315248_317978_318445_319208_319327_319800_319896_320107_320327_323031_323273_323382_323445_323709_323888_324116_324227_324406
768267	contig_1867_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_54550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTCCTCAGTCGCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412547	412325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_412300_412500
768268	contig_7379_pilon	-	1087	10	Intergenic	novelGene_150027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.1878128714522	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	118	1035	569807	536814	FALSE	50	CAAACTATAAATACATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLARKRVEGVLSGRFGVCFIRPGSVAARRIERSGPSVWVMALVARLWHFLPLGRGTVLGLRLLMGASGSRGRCGLWRLRGFEVMGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	569924	536761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537448_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549784_553209_553328_569678
768271	contig_15952_pilon	+	1535	4	Intergenic	novelGene_154033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	34.1207007873845	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	534	1013	63396	64155	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVQ	62187	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62670_63344_63519_63695_63867_63969
768275	contig_7457_pilon	+	2014	6	Intergenic	novelGene_31456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	162	758	474454	475510	TRUE	40	ATTTAACAAAATTTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHGPDGIFGMRFCKRFQAFSTFGQVRMLEGGKEGKGRAGSHLETPSPQPSHSLGINLALGDLWLPQRAQHHVALVHKLLPTHLALQPALRCNFTQAITLHNAPDRYLSLRDDNGPHLMDHVLPAGFKQHGGINHAHTLSTARSISSWANFAIIGHIMSVSIFSCFLFPNTRLPRIFLLMMPSLWRISGPKASTTGW	474292	476887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_474774_474875_474977_475072_475152_475329_475395_475478_475669_475789
768284	contig_6031_pilon	-	1457	3	Intergenic	novelGene_56745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0.5	126	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	148	432	207906	207622	TRUE	50	GTAAAATTATGCCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPQPVDDKPPAAWFPASSQNTRAAAQRLLLSLLSPVQGEAEPLQGGARSMSPMDAEQVRSQEQFWGAPEVIHDRGGPSAGSRAGQPRASRLRNPGVTNKLFFLLGRSSHSTPLVRTDSPSYQAQDPTGEFATLRERCSARQFF	208053	205673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_206442_206951_207080_207492
768287	contig_6595_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_122533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTGATGAATGCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419685	418246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_418200_419700
768292	contig_8570_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_120168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCAATGAGTTAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393522	393333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_393300_393500
768296	contig_6589_pilon	-	569	8	Intergenic	novelGene_26119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGGAAAGAAGGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1880527	1876585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1876611_1878466_1878540_1878956_1879026_1879200_1879303_1879496_1879583_1879756_1879817_1880148_1880272_1880496
768298	contig_16205_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_156864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCAGTTTCTGCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75144	74041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_74000_75100
768299	contig_6576_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_42309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	151	411	518326	518066	NA	10	TGTGGAATTTTTTGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLQGHYELESNQRQQVWFGFGLLTERLCLSSWLSGIISSLFFKIPGEENVMALISGNHQDVISGNYSWSFSLTTFCLNYHILIIGPASSHHLRSGPSPLSSASTLWVQTLITCLPDYCSLSSSISSQPGSLDGVNG	518476	515865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_515900_518500
768302	contig_7887_pilon	+	1498	3	Intergenic	novelGene_124933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.5	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	37	480	578008	585706	FALSE	25	CAAAATGCCTGTCTCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWQPPKPGASAAMASCPDSDKSWVLAGLAFFGMELAPVRQQELASLLRTYLARLPWAGQLTKELPLSPAYFGEDGVFRHDRLRFRDFVDALEDSLEEVAVRQTGDDDEVDDFEDFIFSHFFGDKALKKRSGKKDKPFRSPRVLGPREEHSHHHSHRHRG	577971	586724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_578050_584813_585122_585612
768303	contig_13778_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_70843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCCCCAGCCACTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44204	43110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_43100_44200
768307	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	457	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768315	contig_15897_pilon	+	2254	13	Intergenic	novelGene_49562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	206.339458713602	18	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1120	1863	856171	867085	FALSE	20	CCTCCCAGCACTTCGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAFMCSPQSSENQGTVERGSFPLPQLRLEPRVPFRQFQMNDQDGKENRLGMARPIRPLRQLVERAPRPTIINAENLKGLDDLDTDADDGWAGLHEEVDYSEKLKFSDDEEEEEVVKDGRPKWNSWDPRRQRQLSMSSADSADAKRTQEEGKDWGETVGMSRVVRKMPESQPPSRKLHSWASGPDYQKSSMGSMFRQQSIEEKEDKPPARQKFIQSEMSEAVERARKAPGRRGAPSPGREVGCLCR	806583	867476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_806751_842299_842470_843312_843491_845315_845373_846505_846609_849570_849644_853911_854056_855943_856186_856652_856775_857229_857373_860536_860628_862642_862836_866905
768320	contig_57_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_44909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAGATTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128329	129548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_128300_129500
768321	contig_5797_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_56916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTTGCTGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178322	179197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_178300_179200
768323	SIRV4	-	323	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTAAAAATAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768326	contig_91_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_127151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357859	1360067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1357900_1360100
768330	contig_1379_pilon	+	1720	5	Intergenic	novelGene_134578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	14.2016724367238	127	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	362	775	384164	396207	TRUE	35	TAGTATATCAAATGTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQAPSSRVFVELVPWADRGQENSLVSGRETLPGIRRPLSSAQSQTTTREVHVSGTAEVSADPDRAQVAVRVSSTKAAAAEAKKSVYRRLDYITQSLQQQGLQAENVTVTKDFRRVENAYHMEAEVCITFTEFVKMQNICNFLVEKLDRSVVISPPQFYHTPGSVENLRRKACLVAVENAWRKAQEVCNLVGQTIGKPLLIKEEETKEWEGQIDDHQSSRLSSSLTVHQKIKSATLHAVSKVFITFEVKGKEKKKKHL	362571	402964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_362879_384109_384176_395706_395838_395936_396726_402537
768332	contig_2596_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_53527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080146	1082097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1080100_1082100
768333	contig_7562_pilon	+	2313	19	Intergenic	novelGene_140876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	13.4824989441045	30	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	81	2258	75231	115244	FALSE	55	AATAGAATTATAAACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNLNRADYLQVGVTAQKTMKLLPASRPRATQKVVIGDQDGVVMCFGVKKGEAVTVFKTLPGQKIARLELGGVLNTPQEKIFIAAGSEIRGFTKRGKQFLSFETNLTESIKAMHISGSDLFLSASYIYNHYCDCKDQHYYLSGDKINDIICLPVERVSRITPVLACQDRVLRVLQVAVICVFIIWGSDLMYEVEVPGPPTVLALHNGNGGDSGEDLLFGTSDGKLGLIQITTSSPIQKWEIRNEKKRGGILCVDSFDIVSDGVKDLLVGRDDGMVEVYSFDNTNEPVLRFDQALSESVTSIQGGCIGTDGYDEIVVSTYSGWVTGLTTEPVHKESGPGEELKINQEMQNKISSLRSELEHLQYKVLQEREKYQQSSQSSKAKSAVPSFSVNDKFILNKDDASYSLILEVQTAIDNVLIQSDVPIDLLDVDKNSAVVSFSSCDSESNDNFLLATYRCQANTTRLELKIRSIEGQYGTLQAYVTPRIQPKTCQVCQYQIKPLSLHQRTHFIDHGRPMNTLTLTGQFSFAEVHSWVVFCLPEVPEKPPAEECVTFYFQNTFLDTQLESTYRKGEGVFKSDNISTISILKDVLSKEATKRKINLNIAYEINEVSVKHTLKLIHPKLEYQLLLAKKVQLIDALKELQVHEGNTNFLIPEYRCILEEADHLQEEYKKQPAHLERLYGMITDLFIDKFKFKGTNVKTKVPLLLEILDSYDQNALIAFFDAA	75150	115299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_+_75267_76983_77050_81298_81362_82921_83098_85281_85499_86679_86753_87198_87316_88923_89055_92394_92480_93430_93534_95162_95356_96563_96639_98958_99025_103136_103277_108064_108230_111506_111617_111713_111818_111954_112079_115110
768334	contig_9014_pilon	-	1955	3	Intergenic	novelGene_106771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_2	35	26	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	17	481	90631	89946	FALSE	25	ATGATTTGGGGTTTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHEQYRQVIAVCERHGEQEPSLWEQALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSIIRDYLVQKLQKQSQQIAQDELCVWRYREETTRIRQEIQELKARYLVSGSVEGPLG	90647	88471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_90158_90287_90491_90581
768335	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
768337	contig_11413_pilon	+	2742	20	Intergenic	novelGene_103227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	919	1431	858030	858885	TRUE	10	CAGCCGCGCGCTCTACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFWMSSRSCCSRDTRWSRISCTLARMRFRFCSTALSSGVRAGVGRAARTWSRGPLSRRRLPTCRFMARCSSLLVKEAFSWTSMYLAHSRLTSASSALGAAGLAPAWPTASWNFCSSSSSSSSRSLMSFREASTSVNTPDSTCMDWTRFLTVSGRTLRAAHFSMSCGGM	856845	907800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_857394_857485_857662_857744_857899_857989_858145_858218_858531_858799_858948_859313_859379_859477_859591_859710_859789_859921_859989_860104_860158_860555_860606_860689_860820_860905_860992_861235_861364_861520_861570_862253_862339_862495_862621_897822_897898_907655
768338	contig_4519_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_123755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCAAAAAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405546	1407231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1405500_1407200
768340	contig_6299_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_172947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTTTAAGAAAGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966940	967483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_966900_967500
768342	contig_4857_pilon	+	1432	8	Intergenic	novelGene_48660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_4	58.0098513801135	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	59	844	1015035	1077906	FALSE	75	AAAGAAAAAATAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWNQVQQLEIKFLEQVDQFYDDNFPMEIRHLLAQWIENQDWEAASNNETMATILLQNLLIQLDEQLGRVSKEKNLLLIHNLKRIRKVLQGKFHGNPMHVAVVISNCLREERRILAAANMPVQGPLEKSLQSSSVSERQRNVEHKVAAIKNSVQMTEQDTKYLEDLQDEFDYRYKTIQTMDQVDKNSVLMNQEILTLQEMLNSLDFKRKETLSKMTQIINETDLLMNSMLIEELQDWKRRQQIACIGGPLHNGLDQLQNW	1012035	1078494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012093_1015033_1015163_1017558_1017704_1068871_1068971_1070838_1070932_1074171_1074251_1077039_1077126_1077750
768344	contig_7605_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_172951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCCGAAATGGAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233045	230755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_-_230800_233000
768345	contig_4496_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_66715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATTGTGTGTTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333827	1336022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_1333800_1336000
768346	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
768348	contig_6048_pilon	-	1638	11	Intergenic	novelGene_73273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	92.5894702436513	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	55	939	2006232	1979334	TRUE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDGALLWLPPV	2006286	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979366_1982555_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984969_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110
768351	contig_8885_pilon	-	1538	6	Intergenic	novelGene_115563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.586157515486	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	60	449	75477	49174	TRUE	30	TTAGAAAACTCATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75536	45840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_46401_46797_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
768352	contig_6175_pilon	+	1913	4	Intergenic	novelGene_16276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	24.0554914035583	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	418	840	555583	556005	FALSE	20	GGCTGTCTGGAACGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEQRRNWGVAVALLSPPVCQALWHMPLPRLDLVTSGAHSTNEEAETQGDRLVQSLISHVQTGVITPPPLGQCTGRHGTHSRWHWGESGSCCAWWRSRESSAASYLDIAERTRPAWPEGACSSPSHLSFKTRSSPRLLP	545622	557078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_545792_547354_547461_548998_549070_555511
768353	contig_12638_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_33054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATATTAAAAAGAGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9490	10726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9500_10700
768355	contig_6710_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_95223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
768356	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
768359	contig_5815_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_141196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCACTTGCCAGTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232407	234388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_232400_234400
768360	contig_5023_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_7383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAATAACGGATGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639859	639341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_639300_639900
768361	contig_7730_pilon	-	1120	3	Intergenic	novelGene_156244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	503.5	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	113	400	43591	2415	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHDRCARARCPRGGRQQRRPWNAEGAEGVRGGGCNSEMAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKGRWSSSGTE	43703	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2445_7798_7895_43429
768362	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
768366	contig_14142_pilon	+	1039	2	Intergenic	novelGene_120576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	595	junction_1	0	253	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	24	443	526719	527138	TRUE	15	ACTCTGGAGTCTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGQGTGAGTGIVDIPGTTFGVWCRGGAYGKCPISHRPGSPRRLKPFKVPHPGPVGSQNCPMCVSTNQKPLLIPTWVPRERGRPGLAVGLGVHPNLCLSSLQVPSSGMPTERR	526695	527840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_527503_527608
768368	contig_5947_pilon	-	2078	5	Intergenic	novelGene_101547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_4	72.4064051034161	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	114	596	589186	584442	FALSE	50	GGAGCTCAGAGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQNYPLLLLTLLEKSQDNVIKVCASVTFKNYIKRNWRIVEDEPNKICEADRVAIKANIVHLMLSSPEQMQKQLSDAISIIGREDFPQKWPDLLTEMVNRFQSGDFHVINGVLRTAHSLFKRY	601458	582959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_584595_584681_584784_586374_586518_589101_589198_601356
768371	contig_7151_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_40696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAGGAAGAGAGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24361	23122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_23100_24400
768372	contig_2069_pilon	-	693	3	Intergenic	novelGene_23524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	35	316	1509802	1508747	FALSE	10	ATTGGCATTGTGTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509836	1508369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
768373	SIRV6	+	293	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	601	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1544_1657_1736_2780_2829_3106
768376	contig_7914_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_165023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTTAAAGCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110936	111169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_110900_111200
768377	contig_7025_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_104390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGATTTACTTCAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59262	58898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_58900_59300
768378	contig_3975_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_54923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239314	2241443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2239300_2241400
768384	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768385	contig_4232_pilon	+	1210	10	Intergenic	novelGene_63170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_8	36.8071383307473	611	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	84	1157	117183	121286	FALSE	20	GACTGATTCTTACTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRQLARSGRCSLLLGVLQRRSVLGVTMTSELDIFVGNTTLIDEDVYRLWLDGYSVSDAVALRVRSGILEQTGATAAVLQSDTMDHYRTFHMLERLLHAPPKLLHQLIFQIPPSRQALLIERYYTFDEAFVREVLGKKLSKGTKKDLDDISTKTGITLKSCRRQFDNFKRVFKVVEEMRGSLVDNIQQHFLLSDRLARDYAAIVFFANNRFETGKKKLQYLSFGDFAFCAELMIQNWTLGAVDSQVDDMDVDLDKEFLQDLKELKVLVADKDLLDLHKSLVCTALRGKLGVFSEMEANFKNLSRGLVNVAAKLTHNKDVRDLFVDLVEKFVEPCRSDHWPLSDVRLFLNQYSASVHSLDGFRYQALWDRYMGTLRGCLLRLYHD	117099	121339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117670_117881_118009_119046_119148_119630_119765_120102_120212_120280_120345_120603_120691_120778_120877_121216
768387	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
768388	contig_10976_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_155599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208907	210915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_208900_210900
768391	contig_15063_pilon	+	1054	3	Intergenic	novelGene_14392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	91	912	35271	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35180	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
768392	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768394	contig_10958_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_5374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTAACACACAGCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809544	809193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_809200_809500
768397	contig_11427_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_78999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598614	596897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_596900_598600
768398	contig_6795_pilon	-	1592	9	Intergenic	novelGene_27671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	103.637288173707	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	389	892	119175	46282	FALSE	40	TAAAGTGTCAGTGAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPRGGYQHNST	134283	45581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
768401	SIRV6	+	509	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1589_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768402	SIRV6	+	437	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10311	2	1161	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11398	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
768403	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768405	contig_5988_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_16124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCTGAGCCATGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335026	1333751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1333800_1335000
768406	contig_14871_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_63740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATATTAAAGGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315351	314604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_314600_315400
768407	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
768408	contig_14326_pilon	-	2675	5	Intergenic	novelGene_120690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87.8151467572651	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	55	1602	177435	161220	FALSE	20	TACTCTACCTATTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKQSNVQILVPPARADIMLFRPPGTSDLGFPLDMTNGAALAANSNGIAGSMQPEEEAARAAGTAIASQASLPVLPGVDRLPMVAGPLSPQLLTSPFPNVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSMFGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPISEDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMSYHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQTCNASFATRDRLRSHLACHEDKVPCQVCGKYLRAAYMADHLKKHSEGPSNFCSICNRGFSSASYLKAHVKTHHGVPLPQVSRHQEPIPNGGAAFHCARTYGNKEGQKCSHQDPIESSDSYGDLSDASDLKTPEKQSANGSFSCDMAVPKNKMESDGEKKYPCPECGSFFRSKSYLNKHIQKVHVRALGGPLGDLGPALGSPFSPQQNMSLLESFGFQIVQSAFASSLVDPEVDQQPMGPEGK	177489	160146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_161639_162988_163127_169072_169245_175279_175344_176680
768410	contig_15327_pilon	+	1692	15	Intergenic	novelGene_70502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	9.96012457917335	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	45	1661	427355	443454	FALSE	25	GACAACCTGGGGCCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELDGEPIVTSIPGVNSKKKQLCFDWGPGEMLVCETLFNKKEKSEAVPGCPFIYIIRKDVDVYSQILRKLFNESHGIFVGLQRIEEELTGKSRKAQLVRVSKNYRSVIRACMEEMHQVAIAAKDPASGRQFSSQVSILSAVELIWNLCEILFIEVAPAGPLLLHLLDWVRLHVWEVDILSAEVLGSENPSKHERFWNLVTILVLQGQLDEARQMLSKEADASPASAGTCKVLGDLMRTMPILSPGNTQTLTELELKWQHWHEECERHLQDGTFASSPHLETLCKIMLGDEEALLGQKELLSNWYHFLVTRLLYSHPTVKPTELHFYAQSSLDLFLGGDSSPEPLDNILMAAFEFDIHQVIKECSIALSNWWFVAHLTDLLDHCKLLQSHNLYFGSNMREFLLLEYASGLFAHHSLWQLGVDYFDHCPELGRVSLELHIERIPLNTEQKALKVLRICEQRQMTEQVRSICKILAMKAVRNNRLGSALSWSIRAKDAAFATLVSDRWVCHARGLGGLAGLRLRLCSHLGWALQVPQGLL	427310	443485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_427388_430560_430655_432411_432575_433557_433629_434459_434504_436289_436360_437492_437615_438050_438186_438266_438390_438601_438734_438943_439051_441749_441834_442048_442115_442316_442469_443233
768411	contig_15449_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_33665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_5	127.773862741955	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	152	1042	195171	191270	FALSE	20	AGAGATGTGGCAGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196183	190967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_196069
768412	contig_11136_pilon	-	2686	3	Intergenic	novelGene_169009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	902	1231	69908	69579	TRUE	0	GCTCCTTGTCGGCGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPGGPPWPYFQQGRAPNSCLGEWKRGGKDRECQSHLHSPPITTADIIAGQCSAKWAGPTVGDAGMTGVRHLESSKPSLPEGPAVETEASHMCKTHLVKINTGSVFSI	70809	63838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_63987_65502_65939_68707
768414	contig_15219_pilon	+	825	3	Intergenic	novelGene_40844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	9	6174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	224	529	61074	63995	FALSE	0	TCCCTGTGTGTGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDASGGRGDDRVRDLQSEVEGVKNIMTQNVERILARGENLDHLRNKTEDLEATSEHFKTTSQKVARKFWWKNVKMIVLICAIVFIIILFIVLFATGVIPV	60850	64291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_61077_62372_62532_63851
768419	contig_12173_pilon	+	1077	2	Intergenic	novelGene_172964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	9	398	204548	204937	TRUE	25	GAGAGGTAGACTGCCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFISNYSHFFALEWLYFSKEGARGFMASWRIRSHFRLLILKRASGRAGGCSGRVLGLWEGTGCSAVALLCGICSASLTEKQELLGYLPLHSMCSKAGNELMRANVRNELIRQAPNLGPEFLQQPNRGS	204539	207180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_205385_206948
768420	contig_12173_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_172966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGGGCGTTTTCATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207893	208124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_207900_208100
768425	SIRV6	+	233	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8477	-1	262	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCTTACAAATGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
768426	contig_9180_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_109124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497436	496502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_496500_497400
768428	contig_5434_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_74647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163714	162585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_162600_163700
768430	contig_15122_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_162702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCATGACCCCACAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453340	454283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_453300_454300
768434	SIRV6	+	340	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727
768437	SIRV4	-	376	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1147	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4011	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768438	contig_15123_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_110922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGTATTTTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246624	248041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_246600_248000
768443	contig_3588_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_72888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTAGGAGTTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128314	127659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_127700_128300
768446	contig_7224_pilon	-	1808	3	Intergenic	novelGene_172970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	162	junction_2	113.5	331	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	266	358	66670	66578	TRUE	40	AATATTTTATCTGAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNLADINDVSPSGGFVAELLRPELDPVYIPPQQPPPPGGGLLGKFVLKSSLSAPGSEYGSPSVISVSKGSPDASHPVVVAPYSGGLPRMCPKIKQEAVSSCTVGRPLEAHLGGGPPAQ	66935	63642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7224_pilon_-_64715_66100_66266_66364
768447	contig_10404_pilon	+	1091	6	Intergenic	novelGene_138672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	33	482	1085448	1099868	FALSE	20	TGCCCAACTGTTGCTCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085415	1100477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
768448	contig_3095_pilon	+	1075	5	Intergenic	novelGene_75177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_4	877.457263916597	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	32	799	220513	226800	TRUE	25	AATCCCTCAGCGATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220481	227254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_227001
768458	contig_12624_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_61076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCACACCCCAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872662	871991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_872000_872700
768463	contig_7286_pilon	-	874	7	Intergenic	novelGene_108698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4087.57262932416	11	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	24	809	293122	286948	FALSE	10	TAATTGCCTTGTGGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293145	286882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292028_292101_293119
768464	contig_8552_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_80099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGCCCCACTCTGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537298	536998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_537000_537300
768466	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
768469	contig_9995_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_47673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACTTTTAGGTCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216929	218965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_216900_219000
768476	SIRV4	+	200	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1566	637	1111	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTCTTTATATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	2766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
768477	contig_12654_pilon	-	920	8	Intergenic	novelGene_129324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	170.899660261661	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	205	855	827177	808478	FALSE	15	TTTTACAGAGTCCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYSYVKSTKLVLKGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827381	808412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817798_827131
768478	contig_7753_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_41489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATCACACTGTGAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049673	1050669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1049700_1050700
768482	contig_12340_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_122106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	9.2135166407235	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	27	848	43058	68740	FALSE	75	TCCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGASKAAAMGTVGAGLVDCHCHLSAPDFDRDLDDVLEKAKKANVMALVAVAEHSGEFEKIMQLSERYSGFILPCLGVHPVQGLLPEDQRSVTLKDLDIALPIIENYRDQLLAIGEVGLDFSPRFASTDEQKEEQRQVLIRQVQLARRLNLPLNVHSRSAGRPTINLLLEQGADKVLLHAFDGRPSVAMKGVRAGYFFSIPPSVVRSGQQKLVEQLPLTSVCLETDSPALGPEKQVRNEPRNIYISAEYIAQVKGISVEEVIEVTTQNALKLFPKLQQLLRK	43031	69531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_43124_53563_53597_55686_55761_55940_56026_59536_59600_61820_61931_62566_62623_64091_64205_65708_65787_68596
768485	contig_14034_pilon	+	1480	5	Intergenic	novelGene_72634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	5.35607132140714	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	212	553	152621	156866	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKADVKGKPCEDHCILQHSNRICVITLAGSHPVLQSGKTIKSISYQISTNCSRLQNKVSGKFKRGAQFLTELAPLCKIYCSDGEEYTISR	152409	157884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_154464_154595_156785_157012_157102
768486	contig_10176_pilon	-	1686	10	Intergenic	novelGene_72733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	255.953603048639	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	547	1302	268640	261068	FALSE	10	CCTTTTTTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270441_271910_272048_273752_273857_274897
768491	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	0	1155	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768492	contig_1009_pilon	-	1770	2	Intergenic	novelGene_121724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGCAGGGACTAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127902	107039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_108625_127717
768495	contig_3270_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_104479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATGGTGTCAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198573	196632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_196600_198600
768500	contig_4301_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_65129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_1	1.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	176	493	551260	547215	FALSE	25	TCGGCTGCTAACTGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEAGWHRPSLLCLISGLCCHQLTFREPKG	575650	546617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_547521_551248_551329_575543
768502	SIRV6	-	435	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCGATGCCAATTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
768507	contig_2365_pilon	+	2286	14	Intergenic	novelGene_103726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_2	348.99008988829	21	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	222	2240	130213	220184	FALSE	60	GAAGCATACTTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQDYDLVSKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEEPSGNSGDLRKDVVMKENVSFKGDEDEKPTFVDLAKEETKDNDKLLQQQLDDQNRTISLVHGVNNDIVKALDRITLQNIPSQTSPAFTAGMKKDYSLPLTVLSCTKACPHMASCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVDVPDGPTLHDSDLYVEIVKSTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQR	116713	220230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137_212255_219467
768510	contig_19606_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_148277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATATGTGGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52607	54509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_52600_54500
768514	scaffold_19766_pilon	-	1692	5	Intergenic	novelGene_34371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_3	22.6605383872493	97	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3	413	696067	689919	TRUE	15	TTCCTAGGAGCTGGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPNLAFLELLSEFSPRLFHQDKQLLLSYLENCLQHVPQAPGHPWGPVTTYCHSLSPLENTAEASPQGYPRSKKRRIKGPSRLNGEDTSPSREESLQLSSIPPTPTLTSTAVKSRQPLGGLEEVEEEEGLESEFTQG	696069	687203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_687655_687873_687946_689162_690098_695734_695893_695993
768519	contig_294_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_166758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491772	492582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_491800_492600
768520	contig_9389_pilon	-	1405	6	Intergenic	novelGene_83919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	668	1120	166272	164402	TRUE	20	TGGACCGGAGGGACCACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAREDGGEAGQGSGEAHLAGTLVGAHLEADGGVVHGWQDVVLGVVEVASHPVGRHARLAGTFVGAHLQPDDALARLHGGIVEVPLLPLRVFNTDVHAALQPLCLGLPRQGEKRHLHLGHVPTLKQVVGLEQVHGVHAVADHGLDEVGEVL	166939	159553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_159649_163618_163742_164232_164296_164397_164538_165813_165927_166068
768522	contig_6710_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_94124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACTATGCACACTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653356	653793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
768526	contig_5585_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_143061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATGAGAAAAAATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312490	312946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_312500_312900
768527	contig_10734_pilon	-	2110	8	Intergenic	novelGene_51441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_7	86.6680272002052	28	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	583	912	2222890	2218369	TRUE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKVAPLNPLCSHPGLGQEPSPYPLSAPTYP	2234359	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2234332
768532	contig_8383_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_172758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCAATATTTTTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301040	298888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_-_298900_301000
768535	contig_7549_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_164536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTAACATATACTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712307	712789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_712300_712800
768541	contig_19769_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_102305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1649.41070916252	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	262	558	87859	88957	FALSE	30	GTGAGTAGCTCGGAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRHGPRNSLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMN	87238	88957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87265_87331_87387_87466_87609_87820_88040_88841
768548	contig_818_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_167995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	944	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676530	674519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_-_674500_676500
768549	contig_14643_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_99144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGGTGATGGACTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160715	162910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_160700_162900
768551	contig_6873_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_129835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTGGAACAGAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583242	582991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_583000_583200
768556	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768557	contig_16461_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_139202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	22	354	919	368	FALSE	25	TATGGTAGCTATACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQAEDVAVYYCQNS	940	367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
768559	contig_15146_pilon	-	2136	5	Intergenic	novelGene_116938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.8710791088799	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	79	324	112739	108990	TRUE	15	TGCTGGAGAGTGGCCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPAPTRRFAVFCFGHAGRPGRPPPAMTAHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVTTAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLWE	112817	106234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_107917_107960_108069_108967_109084_111059_111108_112635
768566	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
768573	contig_5019_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_109201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167151	164663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_164700_167200
768581	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768583	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	0	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768587	contig_20157_pilon	+	1168	9	Intergenic	novelGene_145864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.716801427435	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	398	1024	48801	53749	FALSE	20	CGCCATCTTATGTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTRWPHRLRQRVLLPPLQPQHRLRRRLQPQPQLRLRPRPRLQLLLLPLRHPQTRRQQRQRPRPQRRPFPGGRVVRLHPVILASIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDMEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHLTVDTSLQNGRMSIKAYVSTLMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVDLIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSADNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIALNEKLVNL	40952	53893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_41153_41220_41335_48495_48567_48788_48869_49551_49690_51049_51142_52576_52714_52849_52964_53671
768590	contig_9609_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_22951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCAACTGCACATCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198261	197012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_197000_198300
768592	contig_4131_pilon	+	971	2	Intergenic	novelGene_127879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	73	465	240672	241064	TRUE	30	TAATTTCAGTGAATCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240599	280486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_280114
768593	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
768595	contig_665_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_158218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGAGCAGTTTTGCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337134	339257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_337100_339300
768599	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768604	contig_3627_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_78432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATTTACCTTCATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262178	262726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_262200_262700
768605	SIRV6	+	527	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	44	3	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768607	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
768610	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
768619	contig_6215_pilon	+	1438	3	Intergenic	novelGene_21226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	39	157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	146	382	503225	513006	FALSE	30	TTTTCATTTTCACATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRIPLDGRGGSELEPASPLRARREAGRAGARWNLAQARRAALRATDAAMRKDSSEMTDVESVVTSFASSARAGRRNALPDIQSSAATGRTSDLPAKLEALSVKEDVKKKDEETTKDQVENPPNEEK	392031	514062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_392169_503216_503394_512938
768620	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_98225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
768621	contig_5643_pilon	+	1033	6	Intergenic	novelGene_38743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	247.668003585445	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	156	833	152580	157107	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPYKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152424	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156823_156945_157085
768622	contig_21416_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_172822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCAATGCTTGTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131634	133407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_+_131600_133400
768623	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8115	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
768625	contig_10460_pilon	-	1751	7	Intergenic	novelGene_157467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	36.3532055746884	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	15	1451	97739	83727	TRUE	25	TCTGGTAAGCAATCTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVLCCFFRGRCFGTPGWLTVLPMGLRKAHSGPQGLLATQKKRGLFKEFFPDKITETELPELFDHGTAGNFPQTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHFQRAGHNVIALVGGATARLGDPSGRTKEREAMDAKRVQANALALRRGLESLAANHHQFFADGRTWGSFTVLDNSAWYQSQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRLSVQTRLKSPEGMSLAEFLYQVLQAYDFYYLFQHYGCRVQLGGSDQLGNIVSGYEFIHKLTGEDVFGITVPLITSTAGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQQDDSVERYLKLFTFLPLSEINHIMQLHVKEPEKRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLESAKRCTQALYHNSIDALEVMSDEELKELFKEASFSELVLDPGTSVLDTCRKANAIPNGPRGYRMITEGGVSINHRQVTNPESVLVVGQHILKNGLSLLKIGKRNFYIIKWLQL	97753	65947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_66013_70018_70117_83589_83887_86273_86445_86752_86909_95896_96065_96957
768634	contig_6513_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_117766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160609	162301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_160600_162300
768638	contig_14450_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_49011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACACTCTTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148019	1149497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1148000_1149500
768643	contig_19918_pilon	+	1371	14	Intergenic	novelGene_172975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16.6249972193796	291	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	524	1171	184847	191016	FALSE	30	AAATAGTATTTCTGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLVPPKIPDGERVDFDDIHRKRMEKDLNELQTLIEAHFENRKKEEEELISLKDRIEKRRAERAEQQRIRNEREKERQTRLAEEKARREEEENRRKAEDEARKKKALSNLMHFGGYIQKTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSIYNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTCGKAKVTGRWK	170713	191216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_170967_175515_175589_179622_179653_182157_182242_182714_182757_183672_183707_184839_184901_185187_185305_186165_186244_186742_186854_188085_188196_188710_188802_190588_190630_190970
768644	contig_9515_pilon	+	1219	9	Intergenic	novelGene_73813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	291.210592827596	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	368	1099	66468	72530	FALSE	0	CTTTCCTTGGCTCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRLWPEQGASSKATTTNALPSGSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57289	72650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57334_66046_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
768646	SIRV4	-	261	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1260	0	1260	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3898	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
768647	contig_8174_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_160069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352410	353586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_352400_353600
768650	contig_16156_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_137090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACCCACCCAGCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666121	667649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_666100_667600
768651	contig_12503_pilon	+	3537	15	Intergenic	novelGene_143808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	62.6967515351571	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	385	1416	26072	53042	TRUE	50	GGATCTCTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVIVEEDPVESSSEESLCESKEQLTDDVTSSQKTIKPTEIVLRANSLKKAVRQVIEQAKKATDEQIVHPCEPVNQSPEYNSTEIADPKEESKDDDAKESLPVKTAPRSPDCRTSHSHFQTESSSSAPTMASCKESLPVLNTRIICPGLRAGLAASIAGSSIINKMLLANIDPFGATPFIDPDPDSLDGYTEKCVMNNYFGIGLDAKISLEFNNKREEHPEKCRSRTKNFMWYGVLGTRELLQRSYKNLEQRVQLECDGQYIPLPSLQGIAVLNIPSYAGGTNFWGGTKEDDMFTAPSFDDKILEVVAIFDSVQMAVSRVIKLQHHRIAQCRAVKITIFGDEGLPVQVDGEAWVQPPGIIKIVHKNRAQMLTRDRAFENTLKSWEDKQKYDSGKPVIRTHLYIHHAVDLATEEVSQMQLCSQAAEELITRICDAATIHCLLEQELAHAVNACSHALNKANPKYPESYERHCH	20461	73330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_20643_21455_21579_25991_26127_29720_29839_30832_30944_31080_31178_35124_35233_37177_37292_37775_37911_38405_38570_51901_52008_53018_53110_56291_56412_56974_57084_71505
768656	contig_9871_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_75645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	204.604835937201	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	133	882	408711	419187	FALSE	15	TATGAGGCGTTGTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384436	420007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384454_384900_384977_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
768658	contig_19640_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_134862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCTTAAACATGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58755	58098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_58100_58800
768660	contig_6589_pilon	-	1665	13	Intergenic	novelGene_26248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	55.6122488506104	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1147	1605	2228821	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHLTAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233207	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2231914_2232215_2232513_2232568_2233110
768662	SIRV4	-	327	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1196	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768676	contig_8616_pilon	+	909	5	Intergenic	novelGene_72435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1613	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	182	421	253483	254091	TRUE	20	CGAGCGTGGAGACGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRKSFNILVQKQPQDEKWLSPRFPCGRKTGFRHQWGCKGAGRLQALGQGCRKQSGYSSGMGTVRPKESICLRAPLGVPLLQRPVWGGFQLPLHNLAHQDHTPQYQIHPRRDLQHYVDWSKTARRFPGVSMKFSGLLGS	253301	255538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_253641_253828_253909_254089_254222_254298_254493_255374
768677	contig_20372_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_172978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	222	881	21406	20747	NA	25	TAGGACACCTTGTTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGRKSRRRRNARAAEENRNNRKIQASEASDTLKAALAVPCTHQDDLSGREEDPGTPEEASTTPEEVSSTAQAQKPSVARSNFQGTKKSLLMSILALIFIMGNSAKEALVWKVLGKLGMQPGRQHSIFGDPKKVVTEEFVRRGYLIYKPVPRSSPVEYEFFWGPRAHVESSKLKVMHFVARVRNRCSKDWPCNYDWDSDDDAEVEAILNSGARGYSAP	21627	20200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20372_pilon_-_20200_21600
768680	contig_3095_pilon	-	899	4	Intergenic	novelGene_75232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1507.2253389	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	107	712	255481	246561	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPEDILTGIASCSSVMSASSLLRVLAACVCLVPLGDLSPSVVLAQLPGHLL	255587	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246712_248670_248759_253535_253806_255384
768681	contig_14160_pilon	-	1639	2	Intergenic	novelGene_171544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	95	1162	27093	14553	FALSE	60	TTAAGTAAAATATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDVEEGEFLLSFLQGLTSLSFQLSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIRRNRKLTASSLSLDTASSSQLSCSLNSDSGLHQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQEVLSEFSKAQVNSVPTNGLSQETETSTLQSSLSCRGLDTSAYLHLDVPAEPLPAQASSRTPDGDHKQEPLFQMPGTLDLLQLSAAQTAPSGDTSAQKPSGPVREKTRAVRQGSGPEKPLEGDRVGLNLVVSSPTSPVSGTAVQGAALVTCLRADAGFSLLATPSNLCLLHTALSLPAW	27187	14075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_15088_26560
768685	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
768686	contig_3095_pilon	-	933	6	Intergenic	novelGene_75264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	776.609296879712	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGCCAGGTCACCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255483	246584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253804_255380
768704	contig_8138_pilon	-	3429	1	Intergenic	novelGene_52481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1757	2062	285805	285500	NA	75	TCTTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLYTRLRIQFEKHFQTTDLSNLVTLLPHSSFKWRASCQTYHCLVNCLHLLATLFEGAKTSELRKKNWAKTSSVRHLRSSHKFKTDLKKGRGANNCVLNK	287561	284132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_284100_287600
768705	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
768709	SIRV6	+	470	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	167	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10811_11037_11109_11205
768710	contig_6445_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_77036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTCATTTGAGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551761	552439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_551800_552400
768714	contig_10000_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_139312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGATGAAAGCAATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164160	163711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_163700_164200
768716	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
768718	contig_10311_pilon	-	1386	11	Intergenic	novelGene_50391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCAGGGCGGGAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65123	50867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_51078_52475_52622_56175_56255_59300_59380_61183_61305_62478_62621_62820_62942_63583_63721_64629_64702_64770_64886_64959
768721	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768727	SIRV6	+	330	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	425	118	259	52	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTATTGTCGGCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562	2002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
768730	contig_20429_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_169245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGTATATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103590	103938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_103600_103900
768733	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768738	scaffold_12510_pilon	-	1464	3	Intergenic	novelGene_151381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_2	66	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	21	563	300576	262897	FALSE	30	GAGGTCACGTGTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVGWEMAAAGLAAVATAAEYPGQEASGGNLSGVNCGPSSGAGPGPGPGSWSRSLDRALEEAAVTGVLSLNGRKLREFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLTELVS	300596	261995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_263033_264951_265097_300314
768739	contig_7870_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_108938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAGAAAGGTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295958	294392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_294400_296000
768740	contig_11978_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_62873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGAGACAAACTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647563	647267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_647300_647600
768742	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768748	contig_10734_pilon	+	1182	5	Intergenic	novelGene_51308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	245.132999614495	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	269	619	1378305	1388936	FALSE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1369524	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369607_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
768749	contig_13894_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_62073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATGGTGCTTTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400042	397865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_397900_4e+05
768750	contig_1637_pilon	+	1768	2	Intergenic	novelGene_142387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598645	600503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_599338_599427
768753	contig_16870_pilon	-	1840	3	Intergenic	novelGene_155475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	22	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	354	1235	12509	11628	FALSE	10	GGTGACATGGTCCTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLMIGAGACYCVYKLTIGREDSDKLEEEEEEEEWDDDEELDEEESKMSFDFTTMARPWSDDEDWTEPGAPGGNEDRRSGGGKADRPHPTKQRPFPYGHKNTCSAQSFKNVSCVLELSKSPFIQVKVLFAQPKDAGFSHSHNIDSHSASLSIVGNMIPTPDLTVEEKVFCALGDLNVSAENQGQTEMYINQVCRETVSRCCNSFLQQAGLNLLISMTAFNNTLAKSVSDLKLPLISEGSRCAKAQVLKPLMGLCEKPALAGGLLGAPMLLLFMPLFIRNGNREILPDTLAP	14033	11022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_12683_13523_13602_13931
768754	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
768757	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
768759	contig_513_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_80136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATCTAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325998	323779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_323800_326000
768760	contig_12180_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_160347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74317	74060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_74100_74300
768765	contig_14225_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_52750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326120	327749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_326100_327700
768766	contig_9471_pilon	+	914	7	Intergenic	novelGene_21840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	555.623498623143	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413988	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414084_414633_414701_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
768775	contig_5482_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_144506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAGGCACGTCTTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645661	645112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_645100_645700
768783	SIRV4	-	356	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1167	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768785	contig_7963_pilon	-	915	4	Intergenic	novelGene_58339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1206.32416870425	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCAATGTTGTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43821	38332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39276_39405_39949_40232_43546
768787	SIRV6	+	282	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1517_1642_1736_2780_2829_3106
768789	contig_16098_pilon	+	1198	7	Intergenic	novelGene_45816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	79.4867214627002	45	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	40	1026	150572	153863	FALSE	15	GACTAGCTTGTGTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYPRVPDVLFCSFPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150532	154035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151501_152453_152596_152725_152878_152983_153104_153689
768790	contig_5039_pilon	+	2117	4	Intergenic	novelGene_64896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	42	junction_1	72.4077957742734	169	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	233	586	691391	698173	FALSE	25	GGAAAAGTTATCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALQDLPSATIACRLDPRVLADGLCRAKFESLFRTYDKDITFQYFKSFKRVRINFSNPLSAADARLQLHKTEFLGKEMKLYFAQTLHIGSSHLAPPNPDKQFLISPPASPPVGWKQVEDATPVINYDLLYAVSRLGPGEKYELHAATDTTPSVVVHVCESDQEDKDDEEVERRKRPKPQIVQTRRPEYTPVHLR	590544	699704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_590624_691237_691412_693361_693522_698000
768795	contig_12950_pilon	-	2210	2	Intergenic	novelGene_114792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	684	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGGGTGATGGCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106783	104535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_105258_105295
768797	contig_5549_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_81616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCATTTCTGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332152	330791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_330800_332200
768798	contig_7171_pilon	-	1208	9	Intergenic	novelGene_101390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_6	946.911030667612	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	397	1134	1367042	1363653	FALSE	25	TTTTGCAAAAGTTCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1370925	1363578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233_1367306_1370596_1370670_1370754
768799	contig_854_pilon	-	703	4	Intergenic	novelGene_36102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1871.80144958451	8742	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	68	532	94569	91550	FALSE	15	GAACGAGCCTCGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVSVVLSGPTRKAGLLSGLRGGKCRPQATGRGRGRSSEAPAAGSTPTPTPAQLTVLPHPPGVHLLRGG	94636	91378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91754_91870_92043_93127_93208_94560
768802	contig_15668_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_169629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAATTATGCACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103374	102750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_102800_103400
768803	contig_152_pilon	+	850	7	Intergenic	novelGene_162645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.381772359649	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	53	679	723004	731492	FALSE	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGERRRQFSGRGGGHFPTHDLWDKRCRRSSKLVDECEVQDCKASPARCPHVVRRRSIASKRIPTVYVDGSCKNNGRDGAKAGCGVFWGPNNPLNVSERVSGRQTNQTAELRAAHKAIEQAKSLNMDKLIIETDSKFVIQGVTKWMDNWKQNGWKTASGRDVVNRSDFEKIDQASRGMDIQWKYVPGHQGIKGNEEADRLATEGSRK	722951	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_723684_723823_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
768806	contig_6710_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_96014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
768807	contig_7963_pilon	-	969	6	Intergenic	novelGene_58350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	55	351	48841	43622	TRUE	25	GCTGTAAACCAGTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48895	38436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
768809	contig_2799_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_85512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607571	606375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_606400_607600
768810	contig_2799_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_85511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCATATATGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606214	605668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_605700_606200
768816	SIRV2	-	277	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	45	3410	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
768819	SIRV7	-	548	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-19	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114935	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56099_70877_70988_78841_78964_114680
768820	contig_4125_pilon	-	1851	9	Intergenic	novelGene_25042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	142.861602608959	193	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	29	649	200651	195747	FALSE	20	AAGCTATTTGGAGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCQDMALPHVILLAGVLVEVAGTSTESVVQQPECCVEVADANATCPGTGLCGPGCYRHRAENGSISCLQCHNTTFPATTTNSSRCRSPSGRGGPFPMNRSTGTPGLPGSGGPWVVASLFLGTLFISSSLILTVAVFFYLKRASKLPDVCYGRNKVPALQPSEAAAMIPPPQSSVRKPRYVRHERPPDRPAGTSAIPSVEARVSSV	221814	194544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_195845_197427_197459_197547_197574_197715_197851_198085_198152_198331_198434_199225_199302_200564_200652_221786
768821	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_97719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768823	contig_8260_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_163245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGAACTTAGTTCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152623	152447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_152400_152600
768825	contig_8260_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_163244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCCAGCAATTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150991	149910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_149900_151000
768829	contig_9436_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_60916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGACGGTCCAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440633	441224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_440600_441200
768833	SIRV2	+	484	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	113	-74	-113	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAACTTGGACGACCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
768836	contig_5968_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_112196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	535	855	626039	625719	NA	35	CACCTCACCCCATTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVYKTEIGVQSNRVLLVASVREVFLLLEVEKNNEILFSLNFSISSDASRRICSARVEENPRSPRRTCLNSSSHPSPLPGWIRCSLQVLLASAETWSVFSVRLGS	626573	624403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_624400_626600
768838	SIRV6	+	430	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	426	0	253	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
768841	contig_5696_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_117502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	140	397	301672	301929	NA	55	AAAAACCTAATGCAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLIAVAHERPGSYPYSRGHDGQQSGVRQQGRSGKELGRLSAPCFVGMVLTIATALGRKGYGGGCAVIAALSRAGGGAQGCVCDNWTFEPVGLGSEPGSGAEGSSPAAECGIWAGRHRVALGFLDSPPLGPC	301532	303773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_301500_303800
768842	contig_2161_pilon	+	1841	7	Intergenic	novelGene_114918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	10.2699670020026	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	46	864	804160	820844	FALSE	25	CAAGCTGTTTGCATTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRRSCRESAVGLLAMCGWTCSPLCLWLLLLLLSPALGRQESGSKWKVFIDQINRSLENYEPCSSQNCSCYHGVIEEDLTPFRGGISKNMMVEVVRRKLGTHYQIIKNRLYRENDCMFPSRCSGVEHFILELIGRLPDMEMVINVRDYPQVPKWMEPAIPVFSFSKTSEYYDIMYPAWTFWEGGPAVWPIYPTGLGRWDLFREDLARSAAQWPWKKKNSTAYFRGSRTSPERDPLILLSRENPKLVDAEYTKNQAWKSMKVITSHLNRTTAVNILTQRTLPPGRISY	804114	821821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_804242_805105_805197_806232_806377_810900_811037_813340_813463_819159_819220_820660
768845	contig_3155_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_26348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAATGTTAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179469	180275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_179500_180300
768848	contig_14030_pilon	-	1221	5	Intergenic	novelGene_62232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	658.711763596188	21	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	326	331	337415	337410	FALSE	15	CTTTGTGTGAATAGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLASYNNGAIFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	344382	336519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344247_344350
768853	SIRV6	+	229	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	502	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
768857	contig_16360_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_170070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGACAAAGAAATCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5339	4144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_4100_5300
768858	contig_2710_pilon	-	2003	5	Intergenic	novelGene_161805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	4.54835134966506	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	365	1528	1150701	1149538	FALSE	50	CTTAATGACTCTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIEEQFANLHIVKRSSENKEPTYLLGIDTSKTVQAEKGSLVAVLCSNGSIRIYDKERLNVLREFSGLPGLLNGVRFANSCDSVYSACTDGTVKCWDARLASEKPVQLFKGYPSNIFISFDINCNDHVICAGTEKVDDDALLVFWDARINSQDMSTVRDPLGTYSETHSDDITQVRFHPSNPNMVVSGSTDGLVNVYDIGVDDEEDALVTTCNSVSSVSCIGWSGKDYKQIYCMTHDEGFCWWDLNHLDTDEAITRLNIQDVREVVNVKEGILDYLIGGLYHEKMDKLFVVGGTNTGRIQLLSCTPSGLNHVMSLQGGHAATVRSFCWNTQDESLLTGGEDAQLLLWKPGAIEKTFTKKDSMKIASSVLQRMRVHSNDSYKRRKKQ	1193064	1149062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1150733_1151235_1151374_1161853_1161926_1162284_1162341_1192997
768859	contig_6227_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_49702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACCCCAGAAACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123045	1122431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1122400_1123000
768864	contig_19986_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_159225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	814	1125	23842	23531	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFWWPLDCSCHLLHCTLKGQDCPPMWSVNRQCPYGYLLGYYALGVSDPSGLHSPSLQSDILDECEVCCGGRELLCCNTCWRSLGMVTVSGALTLAHFPSDLP	24655	22701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_22700_24700
768865	contig_15087_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_37220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGGCCACTGATTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124180	125635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_124200_125600
768866	contig_5999_pilon	-	1229	1	Intergenic	novelGene_45618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117828	116599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_116600_117800
768868	contig_10436_pilon	-	794	3	Intergenic	novelGene_108489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1750.5	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	117	359	103480	102032	FALSE	15	TGAACTGATTTTTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVRRVAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103596	101596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102610_103377
768870	contig_10937_pilon	+	1537	4	Intergenic	novelGene_67339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	6.0184900284226	331	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTAATGTGTGTGATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180610	185977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181654_181931_182017_184579_184669_185657
768876	contig_14722_pilon	+	1999	17	Intergenic	novelGene_110212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCCCAGCTCTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37838	97378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_37891_45771_45889_47984_48068_49475_49516_51671_51754_58191_58299_61760_61819_63327_63390_64689_64761_65719_65803_67251_67326_71307_71373_78971_79089_92468_92554_93304_93356_93643_93736_96618
768877	contig_8322_pilon	-	1913	7	Intergenic	novelGene_143282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	22.2086069401532	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	28	1146	569032	556238	FALSE	85	AAAAATTAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGTAPPNSFYRALYPKIIRDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIR	569059	555470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560072_565004_565192_568827
768878	contig_10861_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_39288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAACATTAATTAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353210	1354631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1353200_1354600
768881	contig_8552_pilon	+	1667	11	Intergenic	novelGene_80095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_3	230.133548184527	214	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1006	1542	542152	545273	FALSE	20	TACAGAGACTCTGCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHRPEAQEGGLPGGEPYVTIKAYTAVEEDEVSLGEGETIEVIHKLLDGWWVIRKEDVTGYFPSMYLQKSGQDLAQAKRQIKSRGAPPRRSSIRNAQSIHQRSRKRLSQDTYRRNSVRFLQQRRRQARPGPQGAVAPLQEQPQAERPKPQPAVPPRPSADLILHRCSESTKRKLASAV	528379	545398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_528495_535667_535749_538479_538556_538695_538863_540320_540377_541022_541146_541764_542195_542826_542945_544151_544260_544823_544970_545151
768884	contig_13625_pilon	-	1426	10	Intergenic	novelGene_150147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	133.465860063423	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	516	1319	35055	27060	TRUE	50	TATAATGGAGATGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43682	12079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_12139_19781_19822_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_39877_40001_43361
768886	SIRV4	-	413	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1110	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4048	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
768887	contig_12624_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_60992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATTCCAGGATATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106406	106164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_106200_106400
768888	contig_6028_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_156570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTGACTTTGGCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295533	296489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_295500_296500
768892	contig_13844_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_79399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	77	301	53716	53940	NA	65	GAACGATACTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPYHLSWKVFQVHLPLSFFEEEQAMGAHSLCSFSETSPLLPAGWGVATFTCGWGGYSLRWRRFLFRSASNKRNVNRIVQITSVFCERLGFALLIRTLL	53639	54710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_53600_54700
768893	contig_9609_pilon	+	1776	3	Intergenic	novelGene_23145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	27.5	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	860	1489	525826	526455	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTVKEENRPSLADSLEGYLKLFSSLLRLHPHLSFPPLSPQFSFLMTEALLVFSPESSLLRSLSRKGRARCHWVLQLLALLCALLGLSLVILHKEQQSKAHLATWHGRAGLLAVLWAGLQCSGGVGLLYPKLLPRWPLAKLKLYHATSGLVGYLLGSASLLLGMYSLWFTATVTGGAWYLAVLCPVLTSLVIMNQVSNAYLYRKRIQP	524058	526742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_524146_524574_524727_525205
768894	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
768895	contig_13015_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_165538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1564	1920	81352	81708	NA	35	CAAAGTGATTCTAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSPSQKERPAPGMDGKKLTDRGGDITCPLSTRVQGEARYAGTRHVRGTSASVTLPVASGPSSAYGGDHAPPLGMRKQSEGARRKWVQQEEGRYNQHIVSSLNAKEPSAQKFIILLE	79788	81727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_79800_81700
768896	contig_14441_pilon	-	1065	6	Intergenic	novelGene_100436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	160	687	126577	125565	TRUE	30	ACAGCAGAGGAGCCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLTCTAPDHGTDVLGDGLGPGLAPLVVGREPVELDLAAEVVAGIVPEGGRHSQAAAQAVAGVIGAGLQPRLGVRADPAEGHLAIHPPAQLHVVGVEAGGQAHERGLLGSGDLDL	126736	81910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_81946_82086_82332_121187_121237_125515_125905_126157_126282_126513
768897	contig_16510_pilon	-	1082	9	Intergenic	novelGene_139082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	73.2081791878476	552	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	86	961	288583	277112	FALSE	5	TTTTGCCTCCATCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRREARLRREYLYRKAREEARQTAHEKKERLRRALEENRLIPTELRQEALALQGSLEFDDAGGEGVTSHVDDEYRWAGVEDPKIMITTSRDPSSRLKMFAKELKLVFPGAQRMNRGRHEVGALVRACKANGVTDLLVVHEHRGTPVGFIVSHLPFGPTAYFTLCNVVMRHDIPDLGTMSEAKPHLIMHGFSSRLGKRVSDILRYLFPVPKDDSHRIITFANQDDYISFRHHIYKKMDPHNVELTEVGPRFELKLYMIRLGTLEQEATADVEWRWHPYTNTAHKRVFLSAE	288668	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_277390_277488_277584_277660_277816_277901_278035_278140_278251_278978_279063_287990_288100_288580
768898	contig_13547_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_104899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGCACATAGGATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224931	224428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_224400_224900
768899	contig_13547_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_104900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCATTTTTACTCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226144	225248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_225200_226100
768903	SIRV4	-	467	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1056	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
768904	contig_14326_pilon	+	1516	10	Intergenic	novelGene_120699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.9445925360264	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	262	1323	222863	248940	FALSE	10	CTGGTCTGCCAGCTGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQLLDLPGIIEGAKDGKGRGRQVIAVARTCNLILIVLDVLKPLGHKKIIENELEGFGIRLNSKSPNIGFKKKDKGGINLTATCPQSELDAETVKSILAEYKIHNADVTLRSDATADDLIDVVEGNRVYIPCIYVLNKIDQISIEELDIIYKVPHCVPISAHHRWNFDDLLEKIWDYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPDSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKK	221801	249133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222327_222454_222856_222987_223790_223967_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_248840
768905	contig_2332_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_58634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	159920	160216	NA	75	AAAAAGCAGATAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIKTEVGEDAGAGEQQRQPSSSGGVRSGRSFPEAPFGLSAEPWSRPSPSPPRRLLSGRVSVSPLSPPFAGPPFPLHRLFLGVPQALTAAAERVCFLG	159919	161584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_159900_161600
768907	contig_21416_pilon	+	2475	4	Intergenic	novelGene_172819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	43.70608907489	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	25	2028	122817	130957	FALSE	35	GACTGGAAGAATTCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNEEKSNWMRYVNPAHSAREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWYCRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQNNPKQPSTEKSELCPKNVPKREYSVKEILKLDSSSSKGRDLYHSNVSSLTSEKDMDDFRKDGSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYRMERPTYITHSPIQSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPLAPGCQEHRDSYPYLNAPYGTEGLGSYPGYAPPPHLPPAFIPSYSAHYPKFLLPPYGINCNGLSAMSNVNGINNFGLFPRLYPVYSNLLSGGNLPHPTLNPASLPSSLPSEGARRLLQPEHPRDVLVPAPHSAFSLTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATSEHVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCAQCHKSYIHLCSLKVHLKGNCPVAPATGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDMEDNIDVTSVVEKEILAMVRKEEEDTGLKVSLQRNMGNGLLSSGCNLYESSEPALMKLPHSHPLPLVPVKVKQETVEPMDP	122792	131404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_+_123007_128222_129332_129844_129974_130381
768912	contig_1836_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_71062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCCAGCTCTTTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920683	921382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_920700_921400
768913	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_94567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657518	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRSQFRRRDQRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657484
768917	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8138	-2	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
768920	contig_7619_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_162150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25739	24961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_25000_25700
768921	contig_6048_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_73224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640857	1639146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1639100_1640900
768922	contig_15866_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_63676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCAACACTTAACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619970	618785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_618800_620000
768923	contig_13608_pilon	-	2525	1	Intergenic	novelGene_52359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1804	2142	365839	365501	NA	40	TAATTTAAACATATGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLPPVTTMLLGGPAWLLRLLLCCWSSLASAAGSCHTTQACRALFPPRYQGPHCMGDTQASFAPHKRYSCSTSAGKPSAQRHLAPSYCRKTSAQDPSRQPLHRAHSGLCPA	367642	365117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_365100_367600
768924	contig_2703_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_101810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACTCTTGCTCTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945251	944778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_944800_945300
768925	contig_7629_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_153569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGACCTGGAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292408	293529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_292400_293500
768927	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_93786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
768934	contig_3122_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_64394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTACTGGGATGGTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317745	316765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_316800_317700
768936	contig_18970_pilon	-	1049	3	Intergenic	novelGene_157817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	79	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38931	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31813_33342_33462_38470
768938	SIRV4	-	318	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	3	1200	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
768940	contig_14513_pilon	-	1216	2	Intergenic	novelGene_70250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	183	668	18880	11833	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGIPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19062	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12170_18731
768945	contig_15165_pilon	-	1839	2	Intergenic	novelGene_145324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTGTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242482	238854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_240558_242346
768948	contig_14559_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_83721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATTTCAGAGGATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251178	253398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_251200_253400
768949	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	350	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
768950	contig_6489_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_128924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAACAGCTGCTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125469	127786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_125500_127800
768953	contig_3151_pilon	+	2000	6	Intergenic	novelGene_139191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_4	39.6252444787411	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	726	1274	1999	200400	222208	FALSE	40	GTTGGATGAATTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLHSPSCHSVSVKWQQLSTNLPEPLQAPAWVQSLFHNDRLLVYGFIPHCTQATLCALIQEKEFCTMVSTTELQKTTGTMIHKLTARALVRDFEYGILHENETHHQMKKQILKSLIIKISKENSLLTQFTSFVAVEKRDENESPFPNIPNILELIAKEDVDFLPYITWQEEQSGASMTQIISASSEWNEDLQHKSLTERKVKSPKPEVSEDVEVFNLATQLPVQPLILNSECGLVAKPLDL	199126	222209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_200559_201049_201131_202469_202551_203650_203747_206056_206180_222022
768954	contig_3077_pilon	+	548	4	Intergenic	novelGene_26755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4736.87339450355	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	11345	17801	FALSE	45	ATGCAAAGCCCAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSEPDHCPVESQAEPQLRDLGSALGNKEVGWGYGTARASGPAR	11343	17979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13072_17675
768957	contig_12090_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_80508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCAGAGAAGTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294798	297027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_294800_297000
768958	SIRV6	+	351	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	530	3	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
768959	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768960	contig_13456_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_153270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGGGAGAAATGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91785	90491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_90500_91800
768963	contig_11396_pilon	+	1469	6	Intergenic	novelGene_71246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	162.808353594034	772	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	281	943	87831	90215	FALSE	5	GTCTCTCTTCTGTCTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPHEAETQHTGPEEADQPPPMSRHDAAPPAVPAAPGRNPCCLCWCCCCSCSWNEERRRAWWTSRETKLQPLPSCEACAAPSPEEVRSWAQSFDKLMHSPAGRNVFREFLRTEYSEENMLFWLACEELKAEANKHVVDEKARLIYEDYVSILSPKEVSLDSRVREGINKRMQEPSAHTFDDAQLQIYTLMHRDSYPRFLGSPVYRALLLHGSTPSFSEA	85256	90741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_85470_87763_87861_88030_88162_89479_89555_89701_89937_90023
768965	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	54	510	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
768966	contig_7963_pilon	+	1350	5	Intergenic	novelGene_58398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1291.70882458083	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	55	1146	51450	64131	FALSE	60	AGGAAAATATGCAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPLMAPDNSQGVHRKWDPMRGPESNFNRSGCITRLLHQPGGGSYQEVLIDKGLCASRSILVITSNDSYDLLLKRLRQFLLNDPMGIEHDQSSPSHQLPDSFSHHQFHHELHL	51395	64335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63800
768971	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_97486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	82	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	80	AAAAAGAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
768975	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8470	3	269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTGCAATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	2809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
768978	contig_5816_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_158272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACACACGGATCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414934	414058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_414100_414900
768979	contig_5331_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_112773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	738	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	397	990	249471	248559	FALSE	0	GTGTCTTTGTTCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSDSVDSSDTESDILLGLLDNMDPVMFFSCLSPESTSLEELPEGHPEGPSSLPASPSPSLGTSPAKLEAINELIRFDHVYTKPLVLEIPSETESQANVVVKIEEAPLSPSEKDHPEFTISVKEELVEDDFIPELGISNLFSSSHCLKPSSCLVDAYSDCGYEGSPSPFSDMSSPLGVDHSWEDTFASELFPQLISV	249867	247934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435
768986	contig_15353_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_151972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377323	375716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_375700_377300
768987	contig_1275_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_108865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	2	691	747279	747968	NA	25	GTTGCATGGTAGCATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747277	748099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
768988	contig_8576_pilon	+	1573	8	Intergenic	novelGene_88803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	366.077832696596	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	107	1363	902723	915551	FALSE	30	AGTTTTTTTTGTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893704	915761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
768997	contig_7914_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_165039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTCCCCATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276887	278924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_276900_278900
768998	contig_1699_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_72805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACTGTTTTAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30716	28798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_28800_30700
769002	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	10	405	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	216	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769003	contig_9888_pilon	-	1365	4	Intergenic	novelGene_162253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	1.24721912892465	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGGATTCAGTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38221	19259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_19638_19952_20080_22080_22166_37446
769004	contig_11378_pilon	-	601	4	Intergenic	novelGene_112335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	191.165431556603	15615	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	52	336	1247699	1246177	FALSE	10	TTGACTGGTCTTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLWRPFPEVLLPVAGVMASRLLRGAGALAAQALRARRPNGVAAVRSMASGGGVPTDDEQATGLEREVLLAARKGLDPYNILPPKAAAGTKEDPNLVPSITDKRIVGCICF	1247750	1245911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1246185_1246712_1246813_1246991_1247066_1247596
769005	contig_17042_pilon	-	817	2	Intergenic	novelGene_140181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	561	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAAAGAAATAGAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10698	4857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_-_4920_9943
769009	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769011	contig_15459_pilon	+	2417	6	Intergenic	novelGene_106383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	83.5234098920776	380	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	183	794	43417	53379	FALSE	20	TGAAATTTTGTAGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNISKKSASCFVNFSRLQQITNIQAEIYQKNLEIELLRLEKDTADVVHPFFLAQKCHTLQSMSNHLEAVLKEKRSLRQRLMKPICQENLPIEAIYHRYMVHLLELAVNFIEKLETHLETIRNIPHLDANLKNMSKALAKMDILVTETEELAENILKWWEQQREVSSCIPKILTEENYLHKHDIIMPPLSFNSKVPVQTINAK	20638	55002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_20818_43413_43507_43874_43945_49451_49585_50943_51053_53169
769012	SIRV6	+	470	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	386	0	207	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769013	contig_7412_pilon	-	1733	4	Intergenic	novelGene_76283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	51.4587213210744	199	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAAAGTATTTGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271424	268962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_270292_270432_270579_270657_270792_271300
769014	contig_5461_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_156823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCTTCTAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285530	287099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_285500_287100
769017	contig_5222_pilon	+	2062	3	Intergenic	novelGene_59007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	1	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	308	1825	262178	263695	FALSE	15	TGTATCTTTGTTATTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEQLFQEFSNSRPDTFQSAGITNSEKCSPTVSQGRSSDSLNMAKSSSSSKAPRMVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIVNYPEIYFVGPNAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVLRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLGQYVALKVVRSEKRFRRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCIAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSATKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGLPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGSKDWVTALKGCDDYLFVEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTGKVAGKRVVHPTNAFQGLGSKLPPVVGIASKLKANLMSEANGGIPLCSVLPKLIS	256333	263932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_256402_259500_259683_262120
769018	contig_6557_pilon	+	650	4	Intergenic	novelGene_32986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	5617.45333758991	719	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	37	369	435138	436795	TRUE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFAAIAEAAAAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVGVFENT	434248	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435306_436630_436825_439831
769027	contig_3223_pilon	-	3193	1	Intergenic	novelGene_151832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACCTTCTCTGGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977060	973867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_-_973900_977100
769028	scaffold_880_pilon	-	1269	16	Intergenic	novelGene_121392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	275.898741489619	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	27	1214	311045	271971	TRUE	10	TGTGTATCTTGAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQANGAEAEEEEQAEEDCPELVPIETKRREEEEKPGPGAKIPVTIISGYLGAGKTTLLNYILTEQHSKRIAVILNEFGEGSAVEKSLAVSQGGELYEEWLELGNGCLCCSVKDSGLRAIENLMQKKGKFDYILLETTGLADPGAVASMFWVDAELGSDIYLDGIVTVVDSKYGLKHLAEEKAGGLINEATRQVALADLIIINKTDLVPEEDLSQLRTAIRSINGLGKILETQRSRVDLSNVLDLHAFDGLSGISLQKKLQYVSATQPHLDQNIITVTFEAPGNAKEESLNVFIQNLLWEKNVRNKDGHCMEVIRLKGLVSIKDRAQQVIVQGVHELYDLEETPVSWDDDAQRTNRLVFIDRFRKAIYPSASLVPRASTQKLRKESLGYHVCVNV	311071	270806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_270831_271939_272078_272251_272382_275217_275284_275386_275456_277107_277160_281388_281446_286467_286513_289339_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
769029	contig_10734_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_51377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTACACATATTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871157	1872183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1871200_1872200
769030	contig_6001_pilon	-	1910	8	Intergenic	novelGene_128051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	10.8345629862049	604	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	357	1910	756765	725388	FALSE	70	TATTAAAAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRWRRSAALRRDPGEPSEDCFDDDHSFEDIGLAAGRSQREKKRSYKDFLREEEEIAAQVRNSSKKKLKGSELYFLGTDTHKKKRKHSSDDYYFGDISSLESSQKKKKKSSPQSADTAMDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKPKKKNMSAYQVFCKEYRVTIVADHPGIDFGELSKKLAEVWKQLPEKDKLIWKQKAQYLQHKQNKAEATTVKRKASSSEGSMKIKASSIGVLSPQKKSPPSTILLPTSPAKAPETEPIDVAAHLQLLGESLSLIGHRLQETEVSTTVSSMSPVSYVTCIQSLTQLYSLNNFIPVMPGAQDTVIKKNDGNRNIWRFGIYLLAVKVYTNSILLKHWHQKKLESTLYF	763656	725387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_725807_728557_728664_729837_729903_730968_731051_755883_756834_757621_757701_757972_758122_763596
769031	contig_16525_pilon	-	2730	10	Intergenic	novelGene_133817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	78.2263256499457	248	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	287	946	144371	143257	TRUE	10	TCCCAGGCCCTGTGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNSLPDIPFDPKFITYPFDQNRFVQYKATSLEKQHKHDLLTEPDLGVTIDLINPDTYRIDPNVLLDPADEKLLEEEIQAPTSSKRSQQHAKVVPWMRKTEYISTEFNRYGISNEKPEVKIGVSVKQQFTEEEIYKDRDSQITAIEKTFEDAQKSISQHYSKPRVTPVEVMPVFPDFKMWINPCAQVIFDSDPAPKDTSGAAALEMMSQAMIRGMMDEEGNQFVAYFLPVEETLKKRKRDQEEEMDYAPEDVYDYKIAREYNWNVKNKASKGYEENYFFIFREGDGVYYNELETRYSAHSHLGLAWACASQDPGA	145309	141395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_141939_142015_143450_143533_143651_143736_143841_143956_144026_144112_144219_144300_144403_144496_144564_144657_144780_145243
769034	contig_2062_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_139018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	509	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	137	349	1009571	1009783	NA	15	CTTGTTTTCTAGAGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNPKHSGGSSTPSGSGGSSTPGGSGGTSGGAGGSNSGGGGNSSSNMPASVSHVPAAMLPPNVIDTDFIDEEVLMSLVIEMGLDRIKELPELWLGQNEFDFMTDFVCKQQPSRVSC	1009434	1010653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1009400_1010700
769042	contig_7035_pilon	+	2033	10	Intergenic	novelGene_83541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	20.7102288796361	146	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	13	1767	769306	773212	TRUE	0	TCCCTGGCCTTTTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLQMVEAAGTAEDDPLRRTGRPFGGLIRDVRRRYPHYLSDFRDALDPQCLAAVIFIYFAALSPAITFGGLLGEKTQDLIGVSELIMSTALQGVIFCLLGAQPLLVIGFSGPLLVFEEAFFSFCSSNNLEYLVGRVWIGFWLVLLALLMVALEGSFLVRFVSRFTQEIFAFLISLIFIYETFYKLIKVFQEHPLHGCSVSNSSEADSGENKTWAGPEATLRPGNGSSAGQSGQGRPRGQPNTALLSLVLMAGTFFIAFFLRKFKNSRFFPGRIRRVIGDFGVPIAILIMVLVDYSIEDTYTQKLSVPSGFSVTAPEKRGWVINPLGETSPFPVWMMVASLLPAILVFILIFMETQITTLIISKKERMLQKGSGFHLDLLLIVAMGGICALFGLPWLAAATVRSVTHANALTVMSKAVAPGDKPKIQEVKEQRVTGLLVALLVGLSIVIGDLLRQIPLAVLFGIFLYMGVTSLNGIQFYERLHLLLMPPKHHPDVTYVKKVRPLLEGAPGPLPILVCSGHSPAPSPHVSQPSFAVHAVQPGLWFGPSGCTCSQPCSCSAWPCSGLSCPQLPPWPSPSSSSSRCRSAWWC	769293	773593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_769511_769591_769741_770243_770439_771057_771313_771425_771516_771678_771846_772283_772538_772626_772925_773070_773245_773359
769044	SIRV6	-	357	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8955	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10775	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1542_1647_1729_2772_2828_3105_3164_10720
769055	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769058	SIRV4	-	369	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	0	1152	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769061	contig_5451_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_167180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGGGAACTCAGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616866	619413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_616900_619400
769066	contig_10986_pilon	-	1500	12	Intergenic	novelGene_71480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183.017273266896	2	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	72	1187	80340	67294	TRUE	20	AACTTTCCCCGTAAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELFLENWEIGSIRPEGCGH	80411	66797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67349_67446_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
769067	contig_1107_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_126524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATTAAATCATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16556	16221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_16200_16600
769068	contig_6710_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_89171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653700	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
769069	contig_8273_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_113078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	165	584	78289	77870	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLRLFADKLSLVLKSQIFREVIRIKLFTSFPPVSKEETSLLFCFWSPPQPNLQDCTPLIVLSFSLSPVWAVALSLCSGSSLFFSIFDCLLSLSSFISSPLLESVRAHCDLPFAPYLSESLCHNVDNVDPSFFQKLCP	78453	76146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_76100_78500
769071	contig_3825_pilon	-	1144	7	Intergenic	novelGene_78011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1080.50368912939	6	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	359	862	1465317	1462075	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470995	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464784_1465302_1465402_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
769075	contig_299_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_129493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGAAAAAAAAAAAATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590808	1591765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1590800_1591800
769076	SIRV5	+	263	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-3	945	-3	-68	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGTTCGGTGAGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8312	10921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
769079	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769080	contig_6361_pilon	+	1144	4	Intergenic	novelGene_23935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	30.2250815640844	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	288	776	325221	345856	FALSE	35	AAAATAGTACTTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAMEAQMAQ	324933	346224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_325375_341173_341290_341875_341961_345722
769081	contig_5649_pilon	+	1730	6	Intergenic	novelGene_82264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	99.9839987197952	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	70	651	12779	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHSSRILSGVAAAFHPGLAAAASSRASSWWAHVEMGPPDPILGVTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12709	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_25958_34681
769082	contig_10930_pilon	+	208	3	Intergenic	novelGene_37119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3700	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339809	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339866_341556_341625_342020
769085	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
769086	contig_5918_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_99618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGATTAGGCTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2160682	2162456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2160700_2162500
769087	contig_7286_pilon	-	896	7	Intergenic	novelGene_108700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3438.67186893752	6	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	41	832	293122	286948	FALSE	10	TTAATTGCCTTGTGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEEAGPLSVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293162	286883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
769090	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769093	contig_14030_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_62241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	931	1341	349875	349465	NA	70	GGCAATAAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAESLSVFKFLADKTDFEIYYVRIHDLWESVWVAGFGAELLPFGYMRHLWFCLISQLFCFSECFFPFTFHHFTSPPGGKHFQREKCTPKELQRHKKWVGYRMLHESRKGLNHSKWFKCFRQVPLFSFKPCNDPFE	350805	348407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_348400_350800
769096	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769098	contig_6069_pilon	+	975	7	Intergenic	novelGene_8028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	141.945607736046	28	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	434	766	191950	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	172421	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_172541_187715_187835_191516_191646_191883_191992_192360_192446_193297_193402_193545
769102	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8134	-1	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
769104	contig_10235_pilon	-	1637	5	Intergenic	novelGene_46529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	36.3275033548963	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	744	1121	328688	328214	FALSE	40	GAGAACGAACATTTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	331918	327697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328943_329127_331063_331257_331623
769106	contig_10629_pilon	-	2002	10	Intergenic	novelGene_52919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.832023391381	1	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	2	694	254682	247382	TRUE	35	ACTCTGCTTGGAATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFSYFQLGKDNLERRDGEVIAYPEESSLPARPNTLPYLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	254683	245892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247318_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248406_252333_252440_253125_253216_253749_253900_254170_254228_254588
769107	contig_4232_pilon	-	696	6	Intergenic	novelGene_63177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	12.6806939873179	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	163	570	122417	121686	FALSE	35	AAGACAAGACCCCCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRGSLRAQAPGPQPLELKEVFTLFQIQYNRSYSSPSEKCQAKKHKNVAWIQDFIMLMDNEQAIASHLATHGPITVTINMKLLQHYQEGVIRATPTTCNPNLVDHSVLLMGFGKTKSVARMPAEASQGGALTRPRRSTPYWILKNSWGPKWGEKGYFRMHRGSNACGITKYPLTARVDKPAKQLSVSCPP	124934	121559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_121797_121875_122086_122166_122232_122395_122471_124560_124646_124910
769112	contig_2768_pilon	+	1830	2	Intergenic	novelGene_57494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	465	791	695823	696206	FALSE	60	ATGAAAAAAAATCAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRLFPHSHSRLKVQIQGVISRGSLSLSAFSSVFTRTRSFVAQGPLSKGRLCSWQCFLDGMRFPCLTAHFCLLYLKRLPQDTVQCCRSRIYNTQRNHTVPGIMAQPN	695358	697245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_696092_696148
769116	contig_11855_pilon	+	2591	6	Intergenic	novelGene_67095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	163.384944226817	12	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1300	1905	2445507	2446458	FALSE	45	AAGGAGGTGAAGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGPRDRFREFRACPFAGEERVRSHPYLCS	2431665	2447144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2432380_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2445373_2446029_2446374
769119	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769120	SIRV6	+	251	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8466	-1	273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
769123	contig_10235_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_46259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	556	junction_1	126.957560713107	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1414	1740	15042	14151	FALSE	25	TGGTATCTGTAAATGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	16455	13944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025
769126	scaffold_12124_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_22168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041382	1041894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1041400_1041900
769136	contig_3751_pilon	-	827	2	Intergenic	novelGene_158638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	46	396	171742	153354	FALSE	25	GAAGTAATCACTCTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QITYITRSSFCSKIIMSRSRQPPLVTGISPNEGIPWTKVTIRGENLGTGPPDLIGLTICGHNCLLTAEWMSASKIVCRVGQAKNDKGDIIVTTKSGGRGTSTVSFKLLKPEKIGILHDFILNKKIKMGFVF	171787	152922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_153587_171624
769150	SIRV6	+	406	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769153	contig_9121_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_134422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13863	15949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_13900_15900
769155	contig_10042_pilon	+	1495	9	Intergenic	novelGene_79092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	304.23253852933	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1485	10	1494	6321	54076	FALSE	85	TAAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIKNKQQNCIYEGKNQWEIYIQ	6311	54077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50021_54015
769157	contig_11816_pilon	-	1464	14	Intergenic	novelGene_98515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	430.060378312258	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	35	1213	1125299	990798	TRUE	40	AAAGATTTTTATCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFPGSSGNPGASSSCRTPSRKQQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLSKTNLYIRGLPPNTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPNGRPWHREGEAGMTLTYDPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQVAKETRENKYRGSAIKVQSPSWMQPQPYILQHPSAVLTPSMEHTMSLQPASVISPLAQQMSHLSLGSTGTVVHACNISYARSLFATVCSHADNGSSC	1125333	986059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986310_990796_990878_992050_992166_995414_995466_996352_996401_999066_999161_999284_999335_1000393_1000501_1015122_1015203_1017129_1017288_1027665_1027758_1033126_1033186_1086495_1086672_1125230
769158	contig_9682_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_125325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTTCTTATAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594636	592856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_592900_594600
769163	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769164	contig_9014_pilon	-	957	5	Intergenic	novelGene_106782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	50.1765632541728	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	33	692	149986	147517	FALSE	20	GTATTTGCTGTGTTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRNPGGVAEAMAIFSVYVVNKAGGLIYQLDSYAPRAEAEKTFSYPLDLLLKLHDERVLVAFGQRDGIRVGHAVLAINGMDVNGKYTADGKEVLEYLGNPANFPVSIRFGRPRLTSNEKLMLASMFHSLFAIGSQLSPEQGSSGIEMLETDTFKLHCFQTLTGIKFVVLADPRQAGIDSLLRKIYEIYSDYALKNPFYSLEMPIRCELFDQNLKLALEVAEKAGTFGPGS	150018	147251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_147596_147868_147996_148877_148982_149517_149693_149811
769165	contig_10057_pilon	-	2181	3	Intergenic	novelGene_162348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_2	11	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	23	373	64936	52054	FALSE	55	CTAGAAAAAGAAAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGKVKSLPSQSLCPCEWTIYRMKEAA	64958	50245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_52232_63462_63555_64855
769166	contig_4769_pilon	-	3088	5	Intergenic	novelGene_117946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2148	2447	362995	362696	TRUE	10	AGCGGGTTGCAGTGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRGTSGHWGLQANRPALMDQKPLRDKGKPESPVRQPQWSDLTASSPFKQQAGGSPTLVQNAFCSSSPRPRHTWTPTASPKPVASSEAREGIKKTNQQQ	365142	301831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_301960_320364_320438_331410_331508_338547_338691_362495
769167	contig_14638_pilon	-	2098	5	Intergenic	novelGene_71583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	1	135	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	45	GTATTTATTAAATGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	252857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
769168	contig_17470_pilon	+	1133	2	Intergenic	novelGene_110505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATACCCGTCCTTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252272	254427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_253018_254039
769171	contig_3575_pilon	-	2382	2	Intergenic	novelGene_141109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	298	junction_1	0	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	202	597	407535	406504	FALSE	60	GTGAAAAAAAGAAAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPALQPLSMAGLQLMTPASSPMGPFFGLPWQQEAIHDNIYTPRKYQVELLEAALDHNTVVCLNTGSGKTFIAVLLTKELSYQIRGDFNRNGKRTVFLVNSGNNRLFYQIVWRLDEILCLSRFSLWILNY	407736	404718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_406756_407391
769172	contig_10968_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_84280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTTGAACCTGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109002	106681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_106700_109000
769173	contig_10968_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_84279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTACTAGTTCAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106237	105760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_105800_106200
769176	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769177	contig_9771_pilon	-	1995	4	Intergenic	novelGene_156922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	86.6807680835579	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	64	525	350071	341987	FALSE	50	GTAAAGCTGCTGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVGSADRGASLFLREAFERPMAVDIQPACLGLYCGKTLLFKNGSTEIYGECGVCPRGQRTNAQKYCQPCTESPELYDWLYLGFMAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPL	350134	340516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_342198_346911_347067_347659_347752_350067
769179	contig_4091_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_173047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCTGCATGCACTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79003	79663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_79000_79700
769181	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769187	contig_987_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_72243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAATAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234957	237158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_235000_237200
769188	contig_5419_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_15467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42064	42760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_42100_42800
769192	contig_14332_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_173051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTACTCAGAGGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56204	55095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14332_pilon_-_55100_56200
769195	contig_3956_pilon	-	1778	11	Intergenic	novelGene_14813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	62.4907193109505	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	17	1603	1259540	1233121	FALSE	80	AAAAAAAAAAGAAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLVAKMAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKELYETRYAKKNAEPVPQPHRPLDPLTMHSAYDRAGTLPRTPLSGPNIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELGELGRTLTPCLTSVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSRELQPGIRAVQVVLRICYSDTSGPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVPLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEGADEIEFLADGSWCPIRAEKERSCSPQCPILVLGTSDASGLLSAPDINGGGGVSSAAGGSGGGGSTVSSAENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEDEEDEDEEGPRPKRRCSFQKGLVSAC	1259556	1232945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1233396_1233772_1233904_1236756_1236918_1237141_1237216_1239238_1239345_1239424_1239554_1239714_1239806_1240152_1240195_1240973_1241098_1253552_1253980_1259513
769201	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769202	contig_7234_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_145937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCAAAAAGCAAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414670	415462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_414700_415500
769205	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_94614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769207	contig_9886_pilon	-	1177	2	Intergenic	novelGene_147083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	147	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACATCAATCTTTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226265	219527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_-_220265_225825
769208	contig_6102_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_32072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGACCAGTGGTTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776378	777269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_776400_777300
769209	contig_6710_pilon	-	497	2	Intergenic	novelGene_97968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769214	contig_14536_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_69286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTTAGTTTGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57477	57182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_57200_57500
769215	contig_9440_pilon	+	3239	1	Intergenic	novelGene_59067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGCCCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539889	543128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_539900_543100
769221	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	0	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769222	contig_11815_pilon	-	1352	4	Intergenic	novelGene_50903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.820288257194	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATATCATTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156865	153846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_154850_155177_155255_155551_155640_156681
769227	contig_2069_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_23303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCCCTCCTCTGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484971	483674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_483700_485000
769229	contig_9036_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_155452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129214	128598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_128600_129200
769230	contig_10801_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_74059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356434	358750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_356400_358800
769233	contig_10106_pilon	-	2426	2	Intergenic	novelGene_73856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70220	67263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_69448_69978
769234	contig_5429_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_127790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTATTAATAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159306	160773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_159300_160800
769235	contig_15410_pilon	+	1070	5	Intergenic	novelGene_130612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	302.224254486631	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	147	614	145617	148093	FALSE	35	TGTGGATAAATTTCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145470	148549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
769236	SIRV4	+	234	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGCCGTTTGAACGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
769237	contig_4519_pilon	-	2211	10	Intergenic	novelGene_123732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	29.5597323698605	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	850	1788	802412	761707	FALSE	15	TTCTTAGTAGTTTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAVMIPGLLRGSVGTTCTRAALLRLTPRSLRHLTLTSVMKSKRKTDHMERTADVVRREVVSTAKVCGAANESPSVKRLHLLVAEKDFSFKAGQWVDFFIPGVSVVGGFSICSSPRLLEEERIIELAVKYTNHPPALWIHNQCTLDSEVALRVGGQFFFDPQPTDASRNLVLIAGGVGINPLLSILRHSADLLRERANKGSGFEIGTIKLFYSAKNTSELLFKKNILDLVNEFPEKIACSLHVTKQTTQISADLKPYITEGRIMEKEIRDHISKETLFYICGPPPMTDFFSKQLENSHVPKEHICFEKWW	810872	761283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_762654_763395_763639_768630_768773_788185_788293_801943_802008_802293_802421_804667_804820_809552_809747_810377
769238	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769239	contig_504_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_54442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240238	239806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_239800_240200
769240	contig_9471_pilon	+	1638	7	Intergenic	novelGene_21757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	861	1163	380415	381587	TRUE	40	CCGAGAAAAGGAGCTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGVRGTSSKSFSQPAVDSLGSSIIGCVRRIDTDSILQSPDHQALLPGVPGYALQGSENRRMVGKNEIRLLLQCLLHHFLGQVIGQEERVYSMWWAWLYQ	369287	384476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_369657_374070_374164_375797_375932_377176_377308_380281_380440_381309_381988_384401
769241	contig_10904_pilon	-	1927	9	Intergenic	novelGene_22629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.531025089333	2	99	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	438	1316	510205	499746	FALSE	15	GACTACTCTGTGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLRPLASPQKSSGRSELLQCASASQPAQPPCFHLEIL	516010	499134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499852_500068_500198_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
769245	contig_6434_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_61870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAATCCACCAGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845562	846627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_845600_846600
769246	contig_11250_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_127167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATACAACATTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249652	250606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_249700_250600
769247	contig_11250_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_127168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGGAAATTTCATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250606	251934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_250600_251900
769248	contig_16870_pilon	+	2160	16	Intergenic	novelGene_155537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	59.8573860661044	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	224	2056	368019	395222	FALSE	20	TACCTTGTGTTTGCACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDTVNVRRSVRVKTKVPWMPPGKSSARHVGCKWENPPHCLEITPPSSEKLVSVMRLSDLSTEDDDSGHCKMNHYDKKIDSLMNAVGCLKSEVKMQKGERQMAKRFLEERKEELEEVAQELAETEHENTVLRHNIERIKEEKDFTMLQKKHLQQEKECLMSKLVEAEMDGAAAAKQVMALKDTIGKLKTEKQMTCTDINTLTRQKELLLQKLSTFEETNRTLRDLLREQHSKEDSERLMEQQGALLKRLAEADSEKARLLLLLQDKDKEVEELLQEIQCEKAQAKTASELSKSMESMRGHLQAQLRCKEAENSRLCMQIKNLERSGNQHKAEVEAIMEQLKELKQKGDRDKETLKKAIRAQKERAEKSEEYAEHLHVQLADKDLYVAEALSTLESWRSRYNQVVKDKGDLELEIIVLNDRVTDLVNQQQTLEEKMREDRDSLVERLHRQTAEYSAFKLENERLKASFAPMEDKLNQAHLEVQQLKASVKNYEGMIDNYKSQVMKTRLEADEVAAQLERCDKENKILKDEMNKEIEAARRQFQSQLADLQQLPDILKITEAKLAECQDQLQGYERKNIDLTAIISDLRSRVRDWQKGSHELARAGTRIPR	363524	395326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_363639_366640_366732_368000_368127_373398_373570_374562_374724_375607_375738_376276_376409_379903_379976_381128_381201_381324_381442_382288_382475_382992_383103_384936_385073_393643_393755_393929_394035_395000
769251	contig_7521_pilon	-	1759	2	Intergenic	novelGene_160560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGTGTCTCAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361032	347569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_347635_359338
769254	contig_9515_pilon	+	2373	3	Intergenic	novelGene_73830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	126.5	9	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	692	1141	68062	68511	TRUE	20	AGCAAATGCTTTCCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPQWTALLRGEREVKTLPPSCLPPYCMGSRAQAAALTALPTSLQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVEGTLGWVAGSLCLEVARRGGDHLGGMWVAGGGWQEGSGVLMRSVAGSQGAYV	67370	72642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_69477_71788_71878_72464
769255	contig_19604_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_77260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTATTTATGCAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284508	285064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_284500_285100
769257	contig_13680_pilon	-	1890	4	Intergenic	novelGene_149601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCTGTCCTAGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424629	414148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_415714_416301_416408_417359_417396_424446
769258	contig_2455_pilon	-	1319	7	Intergenic	novelGene_119243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATATAGCAATGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504190	1493468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1494005_1494978_1495119_1495212_1495331_1496493_1496723_1500061_1500121_1501405_1501554_1504101
769259	contig_5728_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_126685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212969	211871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_211900_213000
769262	SIRV4	+	192	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1579	632	1124	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
769266	contig_20614_pilon	+	2225	9	Intergenic	novelGene_107514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	8.92678553567856	125	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	42	1502	46467	51394	FALSE	30	ACTTCATGTTCTTAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRQLLELLPGGTMNWQWLWLGFLLPLTVSSRPLEPAEMEAAVDYLLQYGYLQKPLEGPDDFKPEDITEALRVFQEASELPVSGQLDNATRARMKQPRCGLEDPFNKKTFKYRLLGRWRKKNLTFRILNLPSTLPPHIARAALLQAFQYWRNVAPLTFREVQAGWADIRLSFHGRQSPYCSNTFDGRGRVLAHADIPELGSVHFDEDELWTEGTYKGVNLRIIAAHELGHALGLGHSQYTQALMTPVYTGYQPYFKLHQDDIAGIQALYGKKSPEKEEEMEVPSVPPVPKEPSTMPDPCNGELDAILLGPHGKTYAFKGDYVWTVTDSGLGPLFPVSALWEGLPGNLDAAVYSPRTQRTHFFKGNKVWRYINFKMSPGFPKMLNRIEPNLDAALYWPLNKKVFLFKGSGYWQWDELARTDFSSYPKPIKGLFTGVPDRPSAAVSWRDDRVYFFKGKHYWRLNQQLRVEKGYPRDTAQNWMHCHPQSPDTTPQVGTPLLQ	46425	52117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_46557_46851_46938_48062_48194_48406_48623_49097_49344_49746_49864_50482_50648_50804_50933_51112
769273	contig_10627_pilon	+	1142	7	Intergenic	novelGene_59905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	43.7251516737094	40	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	170	970	29280	34696	TRUE	25	AGGAAGTGTCTGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYEPMQDNQMIIIVTVVSVLLFLFVTSVLLCFVFGQHWHQKRTGGETEAQRG	24172	37618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515_31837_32744_32868_34667_34723_37472
769276	contig_10982_pilon	+	2184	7	Intergenic	novelGene_87875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	255.094372515132	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	248	1000	145192	201711	FALSE	30	CAACTCAGAGTATCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNRSCSRMSQKEERICEMPGKSSCRSGKSK	141980	202895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_145185_145285_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201626
769279	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	6	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769280	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
769282	contig_11850_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_125192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179686	182159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_179700_182200
769284	contig_11708_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_138988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTATTACAGCACAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389050	388763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_388800_389000
769285	contig_11708_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_138986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCAAGAAGATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375738	374921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_374900_375700
769286	contig_4732_pilon	+	2056	10	Intergenic	novelGene_75387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	28.540203395851	65	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	74	907	475542	481675	TRUE	35	CAAATTCGCCACCTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLNEWLWQDKLWLPPNTSWAVLEDRDGMVYAHPRDLLAALPLALTLVAVRVTFERFVGLPLSWWLGVRDRSRRPVVPNPTLEKHFLTQGRRPQEHQLALLATQCGLTLRQTQRWFRGRRNQDQPHLTKKFCEASWRFLFYLCSFVGGLSVLYHESWLWTPSTCWDNYPDQPLKPALYWWYLLELSFYVSLLITLPLDVKRKRQPVAHRLSRAAAARHLRRPAGGGPQPACSLPSPLPCSPTCPWRQHPAPSPPSWEVRPRPILLSWEAKPFAVR	430283	485516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_430356_475540_475715_479246_479365_479976_480096_480189_480248_480615_480667_481009_481103_481453_482234_484846_485004_485082
769287	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
769288	contig_12919_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_75885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717903	715524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_715500_717900
769289	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769290	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
769292	contig_5485_pilon	-	1446	7	Intergenic	novelGene_37739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_6	56.298805986944	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	497	1057	356011	352675	FALSE	15	CCTGAGTTGGTTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIGYSRTVEAFLREAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEIAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTILANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPELITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL	357492	352285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_352833_354028_354096_354566_354705_355166_355263_355909_356074_356936_357315_357436
769293	contig_15412_pilon	-	246	2	Intergenic	novelGene_165472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	104	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAGGAGAAAAAGACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132718	126104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_126213_132580
769296	contig_14142_pilon	+	1117	11	Intergenic	novelGene_120622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	222.47033510111	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	102	1031	617485	619797	FALSE	0	CCCTGGCTGCTGCTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAEKAKSRRAPSEVWQSVIEPGAHGPSVPSGTMPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGFLQPGGALSLQKQMEHANQQTGFSDSASPQLPVQMQPAGKSGFAATSQPGPRLPFIQHSQNPRFYHK	617188	619883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619167_619267_619348_619489_619532_619713
769298	SIRV6	-	215	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCGACTTCGACTCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11029_11109_11205
769299	contig_7009_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_23653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAGATAATCCTTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482184	484661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_482200_484700
769300	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
769301	contig_9199_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_65645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150529	152237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_150500_152200
769309	contig_12740_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_159213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83618	84882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_83600_84900
769313	contig_8866_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_77897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACAATAAAAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091249	1088767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1088800_1091200
769314	contig_6710_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_91499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
769323	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769326	contig_12079_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_67484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATCTGATTCCATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620932	621428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_620900_621400
769329	contig_13097_pilon	+	1953	17	Intergenic	novelGene_107720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	649.987905536518	1	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	644	1024	196348	225343	TRUE	35	GTTAAAAATCTGTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDLQEIVWGNRRYWSDYNYQQSRRKTTGK	184648	264553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184848_186124_186165_190439_190498_191585_191680_195137_195199_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206079_215273_215351_225260_225346_226996_227161_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263539_264246
769333	contig_4716_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_166627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCATAAACATTCAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838900	837736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4716_pilon_-_837700_838900
769334	contig_14441_pilon	-	718	3	Intergenic	novelGene_100658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACACACCAGAACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117796	112109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_112160_116617_116963_117473
769337	contig_4125_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_25227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATACCGCATTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712200	1712894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1712200_1712900
769340	contig_12790_pilon	+	1857	10	Intergenic	novelGene_35253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	305.328764319688	1	101	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	312	740	309644	311042	TRUE	25	GTTTAATTGTTTATAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEGFCNR	306046	313329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307343_308783_308842_309578_309756_309873_309918_310032_310166_310370_310498_311029_311080_311898_311983_312333
769341	contig_15777_pilon	-	2297	16	Intergenic	novelGene_75735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	37.6082733214677	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	182	2170	141177	88613	FALSE	35	AATTTTTTTATTAGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAAHVRGRPRVNPLGALRGGGADSVGYALSLSQLALPSGPRRRRPLLPGSLKCFLGALKMETTGMAGVSLKRGSLAVKDNDSQAPGEEVKRQKVSECCLSEGQDGLESDSLPSDENVPAVPEAVSAGEGKNNSDAPLEDEEEEEEDGLSEEGEEEEEVESFADMMKHGLTELDVGITKFVSSHQGFSGILKERYSDFVVHEIGKDGRISHLDDLSVPVDEEDPSEDVFTVLTAEEKQHLEELQLFKNKETSVAIEVIEDTKEKRTVIHQAIKSLFPGLETKTEDREGKKYIVAYHAAGKKALANPRKHSWPKSRGSYCHFVLYKENKDTMDAINVLSKYLRVKPNIFSYMGTKDKRAITVQEIAVLKVTAQRLAHLNKCLMNFRLGNFSYQKNPLKLGELQGNHFTVVLRNITGTDEQVQQAMHSLKEIGFINYYGMQRFGTTAVPTYQVGRAILQNSWAEVMDLILKPRSGAEKGYLVKCREEWAKTKDPAAALKKLPIKRCVEGQLLRGLSKYGMKNIVSAFGIIPRNNRLMYIHSYQSYVWNNMVSKRIEEYGLKPVPGDLVLKGATATYIEEDDVNNYSIHDVVMPLPGFDVIYPKHKISEAYREMLTADSLDIDNMRHKIRDYSLSGAYRKIIIRPQNVSWEVVAYDDPKIPLFNTDVDNLEGKPPPVFASEGKYKALKMDFSLPPSTYATMAIREVLKMDTSIKNQTQLNTTWLR	152502	88485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_88750_96014_96107_97082_97213_99693_99796_101518_101646_102629_102791_103665_103728_110781_110908_111303_111433_125163_125242_127325_127438_133496_133642_136261_136364_139709_139795_140776_141210_152353
769342	contig_5260_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_144393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAAAAAAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431364	429275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_429300_431400
769343	contig_11253_pilon	+	2665	9	Intergenic	novelGene_126848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	85.1739947108271	735	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	146	934	268605	275086	FALSE	55	AAAACAAATGAATACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNMAEEEDYMSDSFINVQEDIRPGLPMLRQIREARQKEEKQQEANLKNRQKSLKEEEQERRDIGLKNALGCENKGFALLQKMGYKSGQALGKSGDGIVEPIPLNVKTGKSGIGHEALLKRKAEENLESFRRKVHMKNQAQEKAAEQFRMRLKNKQDEMRLEGDLKRSQRACQQLDTQKNIQVPREAWYWLRPEEESEEEEEKEQDEDEVKSEDLSVLEKLRILTGYLREEHLYCIWCGTAYEDKEDLFSNCPGPTSTDHD	262311	276817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_262444_268591_268664_269779_270007_271282_271325_271988_272110_272240_272332_273188_273300_274231_274314_275030
769345	contig_5374_pilon	+	1032	3	Intergenic	novelGene_166393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_1	27	517	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAATGTGTGGTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209886	211744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5374_pilon_+_209911_210238_210335_210832
769346	contig_14017_pilon	+	1449	9	Intergenic	novelGene_165684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_8	85.2906794438877	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	760	1449	55777	72967	FALSE	45	AAAGCTGTGAAGGAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRNEIWWTIDGKKADDTNMDVTVNESISYTKTEDETRIQILSIRKVTPEDLKRSYVCHARNAIGEVNRTATVKQKVVTPRYTVELACGFGVTVLLVVILIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYARNAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIITDETLSFIKKSRRLLVVLSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGTINVILVQY	29653	72967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524_34712_49339_49506_52284_52358_55732_55860_58753_58903_68352_68503_69803_69948_72803
769348	contig_1331_pilon	-	929	5	Intergenic	novelGene_37831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	95	571	169924	160009	TRUE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	170018	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159590_159991_160214_160867_160949_166406_166534_169860
769351	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
769352	SIRV1	-	172	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3636	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6730	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
769357	contig_2733_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_128568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAACACTGCCCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612340	613648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_612300_613600
769359	contig_9909_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_42462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAGATGTTTGTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541131	541677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_541100_541700
769360	contig_3077_pilon	+	1721	7	Intergenic	novelGene_26817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	871.678027331958	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	143	1009	475601	481662	FALSE	35	GACACTTGACATTCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQRVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	474083	482374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479637_481023_481218_481557
769363	contig_15453_pilon	+	1645	5	Intergenic	novelGene_112483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	299.615899945247	1858	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	24	485	6981	17260	TRUE	25	GTAGAATTGGTATCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGRRRKMAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLQSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6957	18481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103_17830_17890
769367	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	117	-6	35	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3140	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769368	contig_6589_pilon	-	2093	12	Intergenic	novelGene_26274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.28420619217	1	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	101	1132	2233261	2229137	TRUE	30	TAAATGCTATTTTTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWKILYPEIPRKLRELETKGYKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLVRPPPPFLPSGSPLAPLLTSALTPSSPSTSA	2233752	2227824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2228119_2228208_2228489_2228749_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2230878_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
769369	contig_12520_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_161071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAAAAAAGAACTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475192	473807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_473800_475200
769375	contig_18055_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_117835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCTGTGACTAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87989	87690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_87700_88000
769385	contig_18404_pilon	-	2615	2	Intergenic	novelGene_173054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	2060	2569	14257	5939	FALSE	35	TGAACAAATTCTGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKTNFFATRNVCTELLPVIKPHGRVVNISSLEGLKALDNCSEDLQERFRCEMLTEEDLVDLMKKFVEDTKNEVHEREGWPSSAYGVSKLGVMVLSRIQARNLDEKRKGDRILLNTCCPSWVMTYMAEDYSSRAAEEVVETPVYLALLPPDATEPHGQMVWDKVVQIW	16316	5892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18404_pilon_-_6376_14184
769388	contig_5083_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_151686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671086	668627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_668600_671100
769390	contig_19851_pilon	+	727	3	Intergenic	novelGene_29822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4223	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53452	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53971_56097
769392	SIRV4	-	299	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1219	3	1219	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
769399	contig_6829_pilon	+	2004	5	Intergenic	novelGene_123764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	9.20597631976098	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	282	407	18531	18656	TRUE	25	TTATTTCAGATTTCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILGSVGLRPCLLSISIIGRRNTCERGREEAQPSKKASGQSAVGQNWTVWRVPRGRSWSAPHSSKVWFRQSSGRSSGEDSSSAREFHHRGTGSMQSGEEKMSAQLPGSTLTGRSCGSSRSRKLSAHRGGSLSRW	18249	53910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18868_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898
769401	contig_9099_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_149890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCATCTTATGATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241768	240373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_240400_241800
769404	contig_10813_pilon	+	1739	11	Intergenic	novelGene_87015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	76.2947573559285	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	443	1219	68104	85000	TRUE	30	TCAGTATTGAAACTTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWGFDSISSVKFNPIETFLLGSCASDRNIVLYDMRQATPLKKVSFSFVFYMRTNTICWNPMEAFIFTAANEDYNLYTFDMRALDTPVMVHMDHVSAVLDVDYSPTGKEFVSASFDKSIRIFPVDKSRSREVYHTKRMQHVICVKWTSDSKYIMCGSDEMNIRLWKANASEKLGVLTSREKAAKDYNQKLKEKFQHHPQIKRISRHRHLPKSIYSQIQEQRIMKEARRRKEVNRRKHSKPGSVPIVSEKKKHIVAVVK	55833	85573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_55993_63303_63402_66126_66235_68026_68155_71471_71572_74206_74280_78576_78742_82191_82328_83536_83701_84912_85468_85520
769406	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769409	contig_12644_pilon	+	1362	10	Intergenic	novelGene_44645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4563.55289085755	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	402	959	2678137	2680133	TRUE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALPWLPQPCQRHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRRSIAES	2675477	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675533_2677238_2677396_2677585_2677693_2678054_2678177_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680111_2680229_2680311
769410	contig_11548_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_66725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1078.31079007863	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	502	834	118990	119638	FALSE	35	AATGATGTTTCCCCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63623	120411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_117733_117856_118975_119121_119346_119402_119491
769411	SIRV6	+	245	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8465	-1	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
769413	contig_3270_pilon	-	2278	15	Intergenic	novelGene_104451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	83.1055389985824	2	78	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2109	169	2277	68067	48894	FALSE	50	GTTATGAAGAAAAAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKGPVTTAIIQRGTLKKGSILVAGKCWAKVRLMFDENGNTVSEACPSMPVGITGWRDLPSAGDEILEVESETRACEVVDWRKYEQEQARNKDHLKIIEEKRKEHQEAHRKDREKYGSLHWKERSLLKYQLKKEQKPLKPKEKAERDSNALPVIIKGDVDGSVEAILDIMDTYDASHECKLELVHFGVGDVSENDVNLAYGFNVTAGNVIQQSAAKKRVKIKLHKVIYRLIEDLQEELSSRLPCTVEEHPVGEASILATFSVTEGKKKVPVAGCRVQKGQLEKKKKFKLIRNGHVIWKGSLTSLKHHKDDVSVIKTGMDCGLSVDEENIEFKVGDEMV	78084	48892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_50386_50528_53677_53835_54887_55016_55516_55770_56136_56342_57154_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68088_70709_70822_78048
769417	contig_6557_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_32994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGAGCTCATCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441808	442173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_441800_442200
769419	SIRV6	+	304	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	48	-244	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769421	contig_14029_pilon	+	1364	6	Intergenic	novelGene_151941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_3	246.942422438916	1021	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	9	362	131703	133603	TRUE	15	GTTATATTTTGTTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQNNKNSLEILLGR	131694	135629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_133472_133564_134162_134258_134319_135245
769424	contig_3233_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_56611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAGAAAAAAGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980813	982511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_980800_982500
769426	contig_14483_pilon	-	822	4	Intergenic	novelGene_133753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1927	junction_3	81.773399641258	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGAAATCTGGTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96484	53120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53621_62296_62425_87781_87830_96338
769428	contig_14017_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_165691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1247	1549	64321	64019	NA	65	ACTTGGCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDARTCKHSLPQNPWLFFAKLLGLLANFWNCGNDHFSELKQRECFILMTVSQRPMTKLTCRPTLLGCYHSVLKLVHSGFQLLALEHSLIDTSSPSFHSI	65567	63870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_63900_65600
769429	contig_12019_pilon	+	1712	6	Intergenic	novelGene_87757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.316330701034	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	132	800	639678	642306	FALSE	45	AAAATATGTTACATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLRLQQLQEEKERKLQELELLQEAQRQALECQLREAEQARASMQAEMELKEEEATRQRQRIEELEEMQQRLQEALQLEVKARRDEEAVRLAQTRLLEEEEEKLRQLLQLKEDQERYIEQAQQEKQELQQEMAQQSRSLQQAQQQLEEVRQNRQQADQEVEAAQRKLRQASTNVKHWNVQMNRLMHPIEPGDKRPTTSSSFIGFQAPLLARRDSSLKRLTRWGSQGNRTPSPISSERQKSLNGGDEAPIPASTPQEDKLDPAPEN	637956	643218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_638040_638102_638139_639665_639833_639942_640142_641782_641874_642082
769430	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_94147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
769431	contig_5718_pilon	-	1081	2	Intergenic	novelGene_110458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_1	0	1719	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	10	354	1766376	1755405	FALSE	20	GTGATCGTGAGGCTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGMGMTVPVSFAVFPNEDGSLQKKLKVWFRIPNQFQSNPPVPSDEDIKIEEREGITVYSMQFGGYAKEADYVARAAQLRTALEGTATYRNDVYFCTGYDPPMKPYGRRNEIWLMKT	1766385	1754677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1755577_1766203
769436	contig_7342_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_71128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATTAATTCAATAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77849	78962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_77800_79000
769439	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	3	1164	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769443	contig_11318_pilon	-	967	9	Intergenic	novelGene_48155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_7	446.720392835384	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	254	967	49795	32330	FALSE	10	GTGGCCCCGCTGATCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFP	58278	32329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071_52142_58143
769446	contig_13966_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_158150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAATTCCCAGCAAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426824	426548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_426500_426800
769447	contig_11307_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_105252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98707	96582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_96600_98700
769451	contig_7207_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_72049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGGAAAATATTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616809	614423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_614400_616800
769453	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769461	contig_10857_pilon	+	1491	2	Intergenic	novelGene_160866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCCTCTGCAGCTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20381	22130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21752_22009
769467	contig_10864_pilon	+	913	3	Intergenic	novelGene_107073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	183	461	891212	891528	FALSE	20	GTGTATCTTAACATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCTLGCGVRWAVVYAWAVVYAGLWCTLGCGVPWAVVYPGLWCTLGCGVRWAAVVYAGQEAMYTGLLCTLARKPCTLGCAVHRPGSRVRWAVAYASQKAVYAGLWHMLGGYGVRWPGSHVHWAVVYAGQEAMYTGLWCTLGCGVHWAVVYAGL	890927	891980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_890935_891036_891363_891400
769468	contig_11507_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_103366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTAATGGTTAAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123880	121942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_121900_123900
769472	contig_2100_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_50624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839292	836878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_836900_839300
769473	contig_7457_pilon	-	1860	2	Intergenic	novelGene_31596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	40	666	960838	956608	FALSE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEWVSSTGASSTPWAMGAGC	960877	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956666_960269
769486	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	15	1158	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
769487	contig_15456_pilon	-	1662	6	Intergenic	novelGene_139498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.4219113343415	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	89	733	129171	115495	TRUE	20	TTTCCAGTTTGCAGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDNDIKRLLYAHLLCIFSVILSTFIPSLFLERFSILETHLTWLCICSVFVTAVNLVLYLVVKPNAPSKRSSLSHKVARFLKCCIYFLMSCFCFHVIFVLYGAPLIELVLETFLFAVILSTFTTVPCLCLLGPNIKAWLRVFSRNGVASIWENSLQITTISSFIGSWLGAFPIPLDWERPWQVGFRNLKQQIKCLYIDNKTGRANYCVYKLLFN	131210	113731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_114222_115055_115703_126116_126234_127751_127844_128943_129193_131143
769493	contig_17964_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_33911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCATTCAGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387132	388951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_387100_389000
769494	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
769498	scaffold_880_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_121510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCACCCAGGGACTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562277	561479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_561500_562300
769499	scaffold_880_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_121509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAAAAAGAAAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561376	560785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_560800_561400
769504	SIRV6	+	390	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	482	-1	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAATAGTGCAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769505	contig_5649_pilon	-	2187	5	Intergenic	novelGene_82406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_3	28.9006920332369	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	74	634	1274169	1270842	FALSE	80	AAAAACAAGAAAAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGLLSPGILEYLLQCLKLQSHPTVMLFALIALEKFAQTSENKLTISESSISDRLVTLESWADDPDYLKRQVGFCAQWSLDNLFLKEARQLTYEKVDLNNIRAMLNSNDVSEYLKISPHGLEARCDASSFESVRCTFCVDAGVWYYEVTVITSGVMQIGWATRDSKFLNHVSMSTLGTAQMRATTVYFFVGEWVEDSQAYLFFREVYAVIS	1276066	1269288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1271112_1272067_1272184_1273155_1273288_1274126_1274194_1276017
769506	SIRV4	-	570	5	FSM	SIRV4A	SIRV408	570	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1555	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGATATTTAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15122	8323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_8373_8629_8748_8846_8991_13672_13829_15019
769509	contig_6710_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_98222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
769514	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769517	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_91851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769519	contig_14704_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_82688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67207	68271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_67200_68300
769521	SIRV6	+	347	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10805_11034_11109_11205
769522	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
769527	contig_4782_pilon	-	2736	1	Intergenic	novelGene_73696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAAAAAAGCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802743	800007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_8e+05_802700
769530	SIRV2	-	587	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	89	10	89	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5806	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
769531	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
769532	contig_4228_pilon	+	1704	7	Intergenic	novelGene_151168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	36.545633574113	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	80	1369	385304	592934	FALSE	30	ACCACTCCACCCCCTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSHTLSSRLLTGWVGGCVWYLERRAGQESPQKFMRLFRTVNKQWITFQHFNFLKRMYVTQLHRSLSQQVKPKPEPTASSVLEKTSSGQAKAEIYEMRSLSPPSLSSSRKPNEKELIELDSASIIEGSVEVGKETQDEKQWKEMKLHLDDLPGILARLSKIKLTALVVSTTSAGFALAPGPFDLPCFLLTLVGTGLASCAANSINQFFEVPFDSNMNRTKNRPLVRGQISPLFAVSFATCCAVPGVAVLAWGVNPLTGALGAFNIFLYTCCYTPLKRISIANTWVGAVVGAIPPMMGWTAATGSLNAGAFLLGGILYSWQFPHFNALSWGLREDYARGGYCMMSVTHPALCRRVALRHCLALVGLSTAAPPPGRHHVDLPRHLPPHQPVHLLPWLPLLHPGRPEELPETVLLQPVAPALAPAAHAHL	385224	593269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_385347_390437_390572_392318_392641_437954_438080_527977_528049_572524_572758_592572
769533	contig_6871_pilon	-	2020	15	Intergenic	novelGene_21670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_9	78.8829215110752	152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	103	1440	858092	850409	FALSE	35	CAAAACAACAGCCCTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLPGELARDLERSLPAVASLGSSLSHSQSFSSHFLPPPEKRRAISDVRRTFCLFVTFDLLFISLLWIIELNTNTGIQKNLEEEIIHYNFKTSFFDIFVLAFFRFSGLLLGYAVLRLRHWWVIAVTTLVSSAFLIVKVILSELLSKGAFGYLLPIVSFVLAWLETWFLDFKVLPQEAEEERWYLAAQAAVARGPLLFSGALSEGQFYSPPESFAGSDNESDEEVTGKKSFSPQEREYIRQGKEAMAVVDQILAQEENWKFEKNNEYGDTVYTIEVPFHGKTFILKIFLPCPAELVYQEVILQPERMVLWNKTVTACQILQRVEDNTLISYDVSSGAAGGVVSPRDFVNARRIERRRDRYLSSGIATTHCAKPPTHKYVRGENGPGGFVVLKSASNPRVCTFIWILNTDLKGRLPRYLIHQSLAATMFEFAFHLRQRIRELGARA	867796	849828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_850514_850952_851047_852243_852349_852443_852524_852863_852960_853116_853180_853859_853953_854326_854383_854614_854714_854927_855046_855455_855510_855623_855702_856194_856273_857873_858144_867745
769535	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	53	516	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
769538	contig_13868_pilon	-	981	2	Intergenic	novelGene_172657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	86	400	98723	84550	FALSE	25	AACCAGAAGGTTGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGKLHWLTLQLLLHCYCCCCFLCFLPSWPLGPDLLGEKKGKRSKTCLF	98808	83968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_84855_98713
769539	contig_13868_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_172656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTACATCATTACATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83665	82591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_82600_83700
769541	contig_5586_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_143564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACGAAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382089	384028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_382100_384000
769543	contig_5551_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_134293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCAGGGTAAGGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823075	824535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_823100_824500
769544	contig_7202_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_18471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27897	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
769545	contig_4339_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_146086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCCAGGTAGCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060678	1058817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1058800_1060700
769546	contig_12123_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_144598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCACTAATAAGTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87788	90131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_87800_90100
769547	contig_19680_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_132016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTACAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201231	199297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_199300_201200
769549	contig_6445_pilon	-	1314	5	Intergenic	novelGene_77112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.261770886237	454	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	17	415	1370648	1358171	TRUE	10	CACCTGTGTGAGGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYLEVMRKLQKTYRMEPAGSQGVWGLDDFQFLPFIWGSSQLIDHPYLEPRHFVDEKAVNENHKDYMFLECILFITEMKTGPFAEHSNQLWNISAVPSWSKVNQGLIRMYKAECLEKFPVIQHFKFGSLLPIQPVTSC	1370664	1356664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1357399_1358005_1358249_1365038_1365147_1369355_1369457_1370536
769562	contig_4496_pilon	-	2407	1	Intergenic	novelGene_66703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984933	982526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_982500_984900
769565	contig_10864_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_107055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	539	862	748968	748645	NA	65	TGTATAACCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPAESRWQSVWTHGGGGDVVIFAVYHSCNSVFRTVTWCCFAEASNDDGPVDESEIFQRACEQLEKCMDSGNRSLRKHFPKQDTVQRFLCLLSSLQGNICHNIQRC	749506	748383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_748400_749500
769568	contig_11413_pilon	+	1215	7	Intergenic	novelGene_103118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.7841340873958	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	219	779	43720	47264	FALSE	5	GCTTTCTCTGTATCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILRSPQALQLTLALIKPDAVAHPLILEAVHQQILSNKFLIVRMRELLWRKEDCQRFYQEHEGRFFYQRLVEFMASGPIRAYILARKDAIQLWRTLMGPTRVFRARHVAPDSIRGSFGLTDTRNTTHGSDSVISASREIAVFFPDFSEQRWYEEEEPQLRCGPVCYNPEGGIHCAAGTGGSGPA	41078	47700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_41095_41402_41598_43712_43810_45379_45483_46205_46246_46667_46829_47097
769570	contig_2892_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_118993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTAGTCCAAAGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79767	78562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_78600_79800
769571	contig_10095_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_57250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATACAGCTATCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313421	314052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_313400_314100
769572	contig_2114_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_104311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGAGAAACTAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087502	1088438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1087500_1088400
769573	contig_16951_pilon	+	1867	5	Intergenic	novelGene_98620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	287.029941817923	1	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	63	821	46585	106818	FALSE	40	TCTAGTCCTCAACAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLLPVSDLSPHSVRLAPAEMQSQRIPGRKRGRPPLHSTPLKMAVPNLYSSSPGCLPAVKTPKKRGRKPGYKLKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	46522	107864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_46741_65743_65874_68468_68670_103952_104099_106692
769574	contig_2854_pilon	-	1758	3	Intergenic	novelGene_120817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	367	789	90356	89934	TRUE	40	TTAAATCTGACTAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEVDGQGHDAQGGLTLMHWPQVTELGAQREVWDGEGELGPRWADRSGLVLGAGGHRGLHGWERRGRSRCRPGGESEQSQSPQAVLEMHVWRTGPEVGLKVTANGDGGIEGEATFLQMGPVDHPHGNHPSNPLELQVPR	90722	88801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_88872_88939_89143_89237
769579	SIRV6	+	315	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769582	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
769585	contig_6546_pilon	+	638	4	Intergenic	novelGene_140975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4656.39839360852	366	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	127	600	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTVSAGPGRRRRRPAPHVSYEAGRIRRGAHPAHVPARKGLDSRTAEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597576	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597904_598338_598414_599246_599365_599577
769591	contig_6175_pilon	+	2051	15	Intergenic	novelGene_16302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	219.563109796872	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	86	1798	1466806	1522796	FALSE	20	TCATTCTGTGACAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLSLRFKCFKCHCS	1444483	1523049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1444540_1466776_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505164_1522751
769592	contig_9455_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_161835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272266	270440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_-_270400_272300
769594	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
769596	contig_7035_pilon	-	1063	2	Intergenic	novelGene_83549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	33	605	779796	778935	FALSE	5	TACTTTCGCTGTGCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTSAQPSKAMAATDSIRGAAPGTEAPSLRHRGQAAQPEPSMGLPATPPPDSPQEPLVLRLKFLNDSEQVARAWPQDTIGSLKRTQFPGREQQVRLIYQGQLLGDDSQTLGSLHLPPSCVLHCHVSTRVGPPHPPCPPGSEPGPSGLEIGSLLLPLLLLMLLLLWYCQIQYRPFFPLTATLGLAGFTLLLSLLAFAMYRP	779828	778476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_779287_779575
769598	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_98087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
769601	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769602	contig_11512_pilon	+	309	2	Intergenic	novelGene_43251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1	309	4029	4560	FALSE	15	GCTTATGCTGCTTATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	4028	4560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
769607	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769610	contig_8050_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_114865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCCAGCAGCTAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402288	404840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_402300_404800
769611	contig_9363_pilon	-	1243	9	Intergenic	novelGene_6767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.972887157356	198	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	176	976	1548961	1505594	FALSE	10	TGCCCAGTTGTTGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITGPNT	1549136	1505326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505608_1539104_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
769613	contig_10331_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_54126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATGGAGGTAAGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408789	408204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_408200_408800
769618	contig_6031_pilon	+	990	8	Intergenic	novelGene_56729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	491.711795461445	213	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	69	761	149114	165450	TRUE	45	TAGGACTCTGTATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFSCN	149045	165943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846_162026_163488_163584_165440_165498_165761
769619	contig_15384_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_85130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	496	1491	34	1524	86766	88256	NA	15	CATGGCTGGAGCCTTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWLVLLGTLLCMPRVGLGTRDYSEALLPPPSHNCPDKCVCAADLLSCAGLGLQDVPAALPVAAADVDLSHNALQRLHPGWLAPLSRLRALRLGHNELRALGRGVFTNASGLRLLDLSSNALRALSRHDLDGLGALEMLLLFNNRLAHLDEHAFHGLNALSRLYLGCNELVSFSFNHLHGLGAAHLHTLDLSSNQLGHIPVPELATLPAFLKNGLYLHNNPLPCDCRLYHLLRRWHQRGLSAVRDFAQEYVCLAFKVRASRVRFFEHNRIFENCSAATGQGLERPEEQLHVWMGQSLRLHCNASALAIRTAWVSPQHELLLAPGSRDGSIKLLADGSLAISNVQPQHQGIFVCLATGPRLHNQTHEYNVSVHHPRPEPEVFSTSYTTLLGCAVGLVLVLLYLFLPPCRGCCRCCLRACRCRRWSQAPSPLQELSAQSSVLSTTPPDAPSRKASTHKHVVFLEPGRRGLNGRVQLAIAEDFDLCNPGGLQLKVSSESASSTGSEGPVMT	86732	89189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_86700_89200
769621	contig_6938_pilon	-	650	8	Intergenic	novelGene_69064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	388.970698230127	31	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	64	648	169148	141963	FALSE	30	GGTATTCTTTAAAAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFGPRGRGASAAHVRHRALEMAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGKLIENVDPEKAVQLYQQTANVFENEERLRQAVELLGKASRLLVRGRRFDEAALSIQKEKTIYKEIENYPTCY	169211	141960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_142039_157629_157701_157886_157954_158074_158185_162374_162406_163983_164090_165469_165538_169092
769622	contig_8617_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_73427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62922	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62900
769625	contig_8452_pilon	-	2057	2	Intergenic	novelGene_47980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1062	1604	78034	77492	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPCCCISAWLASGADSQILDETSWWEDCVCWFYMIELLESTAVDLNKWSVKQQWPAKQRITAVFVHLYLCVHKCIYGIIYSRPMHKKTMILVNICCLPRHVVVRCCQVSSDSQRPCVQQNETLPGPGPSLQPLLCLSPLLQPLCQSILLRVFLFFTDPVLYQAWIKKMTVQAQPKFYCS	79095	75782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75905_77160
769628	contig_6677_pilon	-	2133	4	Intergenic	novelGene_114163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	515	junction_2	118.693817118762	22	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	1618	2133	401979	397921	FALSE	20	TATAATTCCCTAGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVATLHPQVATITPQYAVPFTLSCAAGRPALVEQTAAVLQAWPGGTQQILLPSTWQQLPGVALHNSVQPTAVIPEAMGSGQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLTNHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLDVLPSQVYSLVGSSPLRTTSS	403596	397920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_397994_398497_398681_399090_399234_401862
769629	contig_10765_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_122876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33902	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_33900_35100
769632	contig_6445_pilon	+	1890	10	Intergenic	novelGene_77131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_6	198.698605436649	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	33	1196	1470295	1488667	FALSE	15	GCAAGCTGCCTGGCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLTRADSTRNWTEKILRQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMAEAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKRLGGAERDFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASAAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS	1470262	1489361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1470358_1475866_1476009_1476816_1476946_1481292_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559
769633	contig_12998_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_168966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAACACTGGTAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31208	31692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_+_31200_31700
769637	contig_11003_pilon	+	1224	6	Intergenic	novelGene_105428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	196.275928223509	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	148	927	56015	72741	FALSE	5	GCCGCAGCGTCCTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTGPKPRPPGAESQAPSSKSL	55867	73038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64600_72681
769638	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	875	-40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
769639	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
769641	contig_9036_pilon	-	2283	14	Intergenic	novelGene_155472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	31.003340152179	88	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	3	1460	252662	245501	FALSE	15	AACCAGTGTCTGCTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQVVEKSAALGTLELELEERQGRLAALEASAAQLKEARAGLTEQVEAWQALNAAQRATYDKLREHAGLQEVALRRLEEEARDLLEKLVQRKARAAAERNLRNERRERAKQARVSQELKKAAKRTVSISENPDVLCDGVREGAETVALATPPESLESEACEKWKRPFRSASATSLTLSRCVDVVKGLLDFKKRRGHSIGGAPEQRYQSIPVCVAARLPTRAQDVLDAHLSEVNAVRFGPNSSLLATGGADRLIRLWNVVGGRLEANQTLEGAGGSITSVDFDPSGSQVLAATYNQAAQLWKVGEAQSKETLSGHTDKVTAAKFKLTRHQAVTGSRDRTVKEWDLGRAYCSRTINVLSYCNDVVCGDHVIISGHNDQKIRFWDSRGPRCTQVIPVQGRVTSLSLSHDQLHLLSCSRDDTLKVIDLRVSNIRQVFRADGFKCGSDWTKAVFSPDRSYALAGSWDGALYIWDVDTGKLESSLRGPHW	252664	244677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_245607_245754_245803_246219_246370_247197_247304_247641_247763_247879_247952_248247_248319_248975_249082_249511_249621_250221_250285_251314_251429_251753_251820_252052_252305_252588
769645	contig_6227_pilon	+	916	5	Intergenic	novelGene_49663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	133.625175397453	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	119	916	493479	497962	FALSE	30	AAGCCCACCACCCAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPEHPGSPGWTGHPVAQCAARTKQEASATGPDLLNPGPAGHLDTTSSLSPNSNMTTRELQEYWRNEKCHWKHVKLLFEIASARIEERQASKFVMYQIVVIQTGSFDSNKAILERRYSDFERLQKNLLKIFREEIEDVTFPKKHLMGNFTEEMICERKLAFKEYLSLLYAIRCVRRSREFIDFLTRPELREAFGCLRAGQYTNALDILVRVVPLQEKLTSHCPVMVVPALCAMLVCHRDLEPRLAYTLGKDFVSLQEKLEERQLL	488664	497962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_488774_493469_493612_495120_495273_497353_497796_497891
769648	contig_17603_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_152795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	186	422	69904	70140	NA	65	ATTAAACCAAAAATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTQVLVSAVKSVPTDVQHNETLPSPVSPSRSLLCLSPLWQPLGQSISSRVFLFFVDSLLIMMSFSSDWSLLMTRPKYTKHIKIDILGMSELKWTDIGHFETHNRMVLLRWEGQTEEERHCVHHQKEHFKIYPEVQRCQ	69718	70196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_69700_70200
769653	SIRV4	-	214	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1304	3	1304	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3854	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
769656	contig_9011_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_159313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501884	499937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_499900_501900
769657	contig_6017_pilon	-	739	2	Intergenic	novelGene_152556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	0	2567	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	334	654	467484	467164	FALSE	5	CCTTTTGTATGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF	468315	467078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_467516_468013
769659	SIRV6	-	187	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATCGGTCTAGAAACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_1900_2100
769662	contig_6060_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_173056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTACGCATGAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37644	39698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6060_pilon_+_37600_39700
769664	contig_13067_pilon	-	1770	5	Intergenic	novelGene_141334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.775466367045	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	211	567	75166	36326	TRUE	20	TTGTGCTACAGCTCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDKEFMWALKNGDLDEVKDYVAKGEDVNRTLEGGRKPLHYAADCGQLEILEFLLLKGADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVKLLLSKGADKTVKGPDGLTALEATDNQAIKALLQ	75376	33253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_34390_36258_36413_52559_52644_53605_53720_75094
769665	contig_8138_pilon	+	1790	4	Intergenic	novelGene_52447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	492.813239360398	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	198	554	280295	306577	TRUE	10	TTAGTAGTGGTGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKSVHWRRRGRVPNCRPTIPPQTTASTPTPRAAPSLPSMEAQTPARSQSRKSPKAGRNSGWRPAKLSGAGQQ	280097	307939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306364_306833_306958
769666	contig_20646_pilon	+	1523	10	Intergenic	novelGene_145020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_5	200.875552654675	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	218	1321	33838	40819	FALSE	20	GCTACTCTTCCAGAGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	31251	41021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_38470_39122_39278_40684
769669	contig_13440_pilon	-	596	3	Intergenic	novelGene_170519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	15	700	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	31	327	256966	250414	FALSE	30	TATGCCATTGTATTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGSQHPFGAMNIVRTPSVAQIGISVELLDSLAQQTPVGNAAVSSVDSFTQFTQKMLDNFYNFASSFAVSQAQMTPSPSEMFIPANVVLKWYENFQRRLTQNPLFWKT	256996	250144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_-_250469_251460_251580_256843
769671	contig_9678_pilon	+	1671	13	Intergenic	novelGene_146369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTCACAACTTCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238398	259722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_238734_240385_240465_243467_243650_243886_243948_244723_244812_249160_249249_249354_249483_250119_250325_251679_251778_252229_252286_255070_255161_257587_257674_259547
769676	contig_12624_pilon	-	1538	5	Intergenic	novelGene_61147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.929785587507	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	69	482	955789	948779	TRUE	40	AGAAATTCTGCAAACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGVALVEVAPRGGLCHRWGSEMSKNTVSSARFRKVDVDEYDENKFVDEEDGGDGQGNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955857	947584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948017_948154_948842_950590_950768_952913_952985_955686
769681	contig_11850_pilon	-	1068	7	Intergenic	novelGene_125220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1137.06426330656	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	106	789	286397	282879	TRUE	25	CTTCTGTGTCAGGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286502	281434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283440_284285_284335_285098_285261_285361_285531_286311
769682	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	47	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
769686	contig_1331_pilon	-	1177	3	Intergenic	novelGene_37818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6242	junction_2	1081	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	371	415	160053	160009	FALSE	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	166535	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406
769687	contig_15029_pilon	+	2084	16	Intergenic	novelGene_128211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	1592	2083	237626	239265	FALSE	25	TGTGACAGGAGCTGGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPSGSLPATTACADDTGVMPSSSSATFSAHEVASRAPTPCRSEGSLRPGHSRCTRAHRASPSAQEEDRSVTWTPAYPAVCSWHQCSSASWHRWPAFLHLSCHSSAQAPWLAHHTGLVPKVGKSGGGRGSDLVGGHSPEVQVGIAGGWVQPILGHIAVHVFRGC	233456	239266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_233778_234224_234301_234401_234500_234712_234814_234938_235050_235335_235446_235591_235872_236123_236201_236532_236690_236805_236876_237115_237160_237296_237385_237567_237766_238236_238370_238937_239026_239134
769690	SIRV2	-	237	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	689	22	689	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4043	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
769692	contig_15066_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_149561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACCCCCACCCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118055	117650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_117600_118100
769694	SIRV6	+	177	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	555	51	555	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10792	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
769695	contig_11630_pilon	-	1704	2	Intergenic	novelGene_147183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTCACTTACAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155584	132753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_-_133580_154706
769698	SIRV5	+	451	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-124	878	-10	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8191	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
769700	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	3	1165	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769703	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
769705	contig_6278_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_119812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAACTATTTTTACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375702	373830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_373800_375700
769714	contig_7179_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_78113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGATATTAGATAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698131	700102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_698100_700100
769716	contig_2504_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_166842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAGTTACTGGGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378498	381021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_378500_381000
769718	contig_7963_pilon	-	802	6	Intergenic	novelGene_58319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	456	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	64	411	48838	39970	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLDLPDLGDAGNDPPAGRCLYLPCGAPQPG	48901	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40061_43658_43819_48741
769719	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769727	contig_2332_pilon	+	1333	6	Intergenic	novelGene_58711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	37.8872010050888	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	96	749	808593	857531	TRUE	35	CTAATAGCAAAATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTALLKLFVAIVITIILILPEYFKTPKGNVLELSCLEVCLQHNFTYSLSVLNFSFMTLLQPVREGQIIRGIFLNQSSFQNFTKLCQDIMSEFKMCSSCLVCESKGNMDFISQEQTSKGVICSMKITWYVLVLLIFILLIIFVIHKILEGHRRMQKWQSHKYKPTSVLLRESDSEKLRTLNVRVILGETMQRQPPTQVNMLLAPIPELEVTSAMYQ	808497	861242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_808681_829351_829622_839941_840062_842350_842435_857439_857546_860672
769730	SIRV2	-	455	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4418	34	3243	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
769735	contig_366_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_51547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACCCACTGCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31505	29383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_29400_31500
769736	contig_15720_pilon	-	995	7	Intergenic	novelGene_41918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2240.02138506657	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	82	822	283894	279102	TRUE	60	CAGAGCTTTAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVSLEPGHEAFTSQKLLELHLDGWPGHAVGPQRRQAPLYSRWRGHHQCPVLQPQPLLALCCHGPQHQDLGLGG	283975	278531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_281395_281556_281786_281935_282580_282750_283785
769737	contig_5136_pilon	-	2020	3	Intergenic	novelGene_126650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	684	junction_1	99	1302	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	130	369	360194	329053	FALSE	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPSLFTGRNPPCLLSRSGAARSSSAATFLTSFAETYFLPVRAMLRVIVQSASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPIWNEILEFDLRGVPLDISSSLGIVVKDFETIGQNK	360323	327401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_329149_331432_331489_360106
769739	contig_2027_pilon	+	918	6	Intergenic	novelGene_39956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	106	junction_1	701.963417850247	6083	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	195	818	661342	664407	FALSE	5	GGCGGTGTCCTTGTGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	660186	664507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_660373_661333_661463_662681_662762_662944_663072_663312_663438_664236
769742	contig_3942_pilon	-	996	9	Intergenic	novelGene_128810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	150.079145786482	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	15	833	1060159	1050289	FALSE	20	CCCCAGGGCACCCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1060173	1050125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1052698_1052816_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
769745	contig_9305_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_148192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTCCCATCAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166824	165966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_-_166000_166800
769746	contig_16098_pilon	+	2058	14	Intergenic	novelGene_46203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	118	918	711203	715578	TRUE	15	GAGCCCCGCGTCCATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAFRNDSICFPDMPSTRSRSSTWLKGPWSSLQPTMSWAFFWPMRCRLRRSRAEPLFSRSRIFWRPWASSSRLICGSQQSSAFSSGSEASRDSSFLFRPFFLRMWTSVFWDAACSCSSCRGITTAFFRGLATETVRWARGRSIVGEQFSFSFGSAASWASTLASSSFCFTLSLSISKSFSSTVFMSTIRSRLGVLSRGVPWLPWEPSRRSKLRRRSSMAGSMLLSFCRGLSFWASEAGAARASGLPISSSSGPRALFASVGPSSSF	711085	723140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_711210_711300_711365_711461_711672_712439_712508_712899_713071_713570_713743_715469_715601_715708_715862_715993_716224_716304_716519_716745_716898_716986_717118_719747_719942_723096
769748	contig_8896_pilon	-	1623	2	Intergenic	novelGene_171571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	119	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGAAAAGTACACAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27671	22072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_23510_27485
769750	contig_10003_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_88217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATTTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553280	551208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_551200_553300
769752	contig_6677_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_114231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTAAGCATCCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826325	824976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_825000_826300
769753	contig_6497_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_35655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	60	1250	837129	841669	FALSE	35	AAAATGCTTACAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSYPPISIPKGLGYLTIMAPRNLLYMRSNFLLGSRCWMIRFSTEILFKSVSFRLFGVKRNNADGESLEKDELLNNLLTMGVDIDMAKKRQPGVFNRMVTNEQDLKMFLLSKGASKQVIASIISRYPRAITRTSESLSKRWDLWRKIMASDLEIVNILERSPESFFRSNNNLNLENNIKFFYSVGLTRKCLCRLLTNAPRTFSNSLDLNKQMVEFLQSVCLSLGHKDPADFVRKIIFKNPFILIRSTKRVKTNIEFLQSAFSLNSEELLALICGPGAEILDLSNDYAKRNYTNIKEKLFSLGCTEEEVQKFVFSYPDMIYLAEKKFNDKIDCLIQEKINISQIMESPRVLDSSLSTLKSRIKELVNAGYNLSTSNITPLSWSLKRYKAKLKKLNG	837069	842454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_837155_840504
769756	contig_3787_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_102347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGACTCCGACTCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13030	11514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_11500_13000
769757	contig_3787_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_102346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11110	10297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_10300_11100
769759	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769762	contig_12638_pilon	+	851	7	Intergenic	novelGene_33105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	840.468321830157	12	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGGAAAGAGATGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170806	182955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171771_172954_173132_173509_173560_178085_178281_180954_181009_182931
769763	contig_7707_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_72130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAAAAGCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78806	77653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_77700_78800
769764	contig_6795_pilon	+	1359	8	Intergenic	novelGene_27745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	283.164479497305	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	216	740	331565	332823	TRUE	50	CAATATTAAAAATCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHSSTPCLTPPTASRSSTKARSPKTSSGWALGHRNLMTTTRST	331349	333728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_331693_331766_331990_332117_332166_332632_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
769765	contig_6227_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_49639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAACTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369146	367699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_367700_369100
769768	contig_9389_pilon	+	1245	3	Intergenic	novelGene_84033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	6690	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	878	1216	585665	586236	FALSE	20	GTGGCCCGAGTCCAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584385	586265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_585890_586122
769771	SIRV6	+	446	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031
769772	contig_14954_pilon	+	1534	11	Intergenic	novelGene_165170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	7.98060148109151	154	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	12	572	56390	57601	TRUE	30	GCTGTGAGTTTTTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGSLILRPWIRELVLGLEALSGPRAGQLLEVLQEAEAPGPSRAPDALFVGAALLVSDGTHSIRCLLTRKALNTSDWEKEFGFRGTEGRLLLLQDCGVRVQVSERGAPAEFYLQVERFSLLPTEQPLIRVAGCNQDPEVQKKLCDCLEEHLSESTSPNPGLTLSQLLDEVQEDQEHRGGAGALG	56378	59038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_56489_56566_56704_56799_56891_56977_57055_57183_57229_57338_57374_57524_57679_57756_57839_57932_58020_58190_58583_58714
769773	contig_6489_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_128920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAACAATCTAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108647	110290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_108600_110300
769774	contig_7866_pilon	-	2428	1	Intergenic	novelGene_171198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTAGAACAAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412739	410311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_410300_412700
769779	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_89577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
769782	SIRV6	+	234	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	51	498	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
769783	SIRV6	+	567	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1179	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769784	SIRV4	+	290	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAAGTCGTCCAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
769787	contig_5671_pilon	+	904	4	Intergenic	novelGene_79414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368800	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368902_370402_370555_392746_392841_531241
769791	contig_7457_pilon	+	1673	12	Intergenic	novelGene_31482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	360.533053470314	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	206	1375	641631	671695	FALSE	15	TGAGAGCGTGGCACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGSNVAPEGASPNRILDEHPSLVFLLPVCWERPRGLREPRGPHPGPSAASACRASAGETVGTPDSSRMAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKFSGADIVKFMILGSMCICL	612209	671993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_612392_641607_641759_642572_642718_643349_643449_648697_648794_648955_649038_649226_649322_649492_649645_651964_652124_652278_652372_653188_653249_671634
769792	contig_10437_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_38247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390209	391239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_390200_391200
769796	contig_12000_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_43194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	1175	1567	592937	592545	NA	25	GCAGGACTGGGCAACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLDFGMLNYVLLGVCKDIFQGLIITLSTTCLLKLLYCGGSHVAVMLEAMPPVFQIPAGSLMVDRFQWSFQTKRPGRKAGDLLGKSASENPMDHNRILSNIVLEDEPSGCKAQHNGCNNGLKYNNDHEDD	594111	592544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_592500_594100
769797	contig_7695_pilon	-	1551	4	Intergenic	novelGene_41670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	15.195028426722	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	25	558	912821	910560	FALSE	75	TTTAAAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEHPEPPKGELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGSREELVERLQTYTRQTGMVLNRPVLRRDDGDKAAPPPMSAQLSGIPMPPPPMGLPPLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAGGPHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQEERAKQVGQVGACG	912845	909566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_910836_912102_912181_912460_912508_912688
769801	contig_11832_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_106956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTTGGAAGAAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379411	380770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_379400_380800
769808	contig_953_pilon	-	2028	9	Intergenic	novelGene_129990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_7	108.742815854658	388	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	162	1079	13622	5843	FALSE	5	CATCTTTTGGTTTTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTPPVSGSESDSDDSFVTDRELQDAFSRGLLKPGLNVVLEGPKKAANDVTGLKQCLAEFKRDLEWVERLDVTLGPVPEVSGPQSAPQNKDQKAVDPEDDFQREMSFYRQAQAAVLAVLPRLHKLKVPTSRPTDYFAEMAKSDQQMQKIRQKLQTKQAAMEKSEKAKQLRALRKYGKKVQTEVLQKRQREKTHMMNAIKKYQKGFSDKLDFLEGDQKPVARAAKEKAKGQQMKKGPSAKRRYKNQKFGFGGKKKGSKWNTRESYDDISSFRAKTAHGKGPKRPGKKGSNKRPGKRTREKMKNRTH	13783	4893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_5894_6043_6207_8058_8153_8370_8447_11025_11116_12436_12561_12977_13148_13388_13473_13556
769811	contig_10674_pilon	+	2642	5	Intergenic	novelGene_6471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1215	1589	434114	447704	TRUE	70	TCAAACCAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYRPFATFSASRFFIELWIVEQIVYSKNSCKVVEFSVRGTSQSFFQFWVESHFFFFVSFYRLFFGDKDSPFFSPVKGTKSSLSFCFKASFSRYMRRCSRSKGPVAVFCVWSFCRNPAGSSAL	432899	450576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_434119_440728_440816_444948_445070_447542_447706_449524
769815	SIRV4	+	340	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTGGGGCCGCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
769818	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
769820	contig_19688_pilon	-	1651	2	Intergenic	novelGene_173059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	255	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	228	1130	61489	60587	FALSE	20	GTCTGTGTCAGTAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEGYLSGLAYWNDVHWNCASHNEQVAEEKGEETNADAVLSYSSVDETQVRSLYVSCKSSGKFISSVHSRESQRSRNQRVTVLQTNPNPVFQRPSLTTVEICGDHSTSRETYLVPPSCKSICKNYNDLHIAGGQVMAINSVTTDFPSESSFEYGPLLKSSEIPLPMEDSISTQPSDFPQKPIQRYSSYWRITSIKEKSSLQMQKPISNAVLNEYLEQKVVELYKQYIMDTMFHESSPTQILASELIMTSVDQISVQVSREKNLETSKARDIVISRLLQLVSSEISTPSLHISQYSSMNS	71335	60065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19688_pilon_-_61491_71109
769821	contig_6823_pilon	+	1985	3	Intergenic	novelGene_131248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_2	362	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	719	1414	447733	450275	FALSE	15	TCTCAGTTTGTCACTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLQWAKHLGNAVKVTINDLNENSVTLIQENCHLNKLKVVVDSKEKEDGDNVLEEGEENLANIKVTKMDANVLMHLRSFDFIHLDPFGTSVNYLDSAFRNIRNLGIVSVTSTDISSLYAKAQHVARRHYGCNIVRTEYYKELAARIVVAAVARAAARCNKGIEVLFAVALEHFVLVVVRVLRGPTSADETARKIQYLIHCQWCEERIFQKEGNMVEGKFKFLMAVFCLLNM	447014	450846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_447978_448361_448575_450037
769822	contig_9720_pilon	-	2912	1	Intergenic	novelGene_116771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217661	214749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_214700_217700
769830	contig_9753_pilon	-	823	4	Intergenic	novelGene_41327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_3	329.891227864916	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTTATGGGGTACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93331	69993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70838_73254_73317_93251
769832	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769835	contig_10569_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_44071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1015	1347	266438	266770	NA	60	GTACTATTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVLPETAIKRYQLLSTKKLVQMYMKKALNFSSERSVIERNIAASLILWSPPHLLVAGKLSLAYFVAFDFGYILTVGSIVNSLFMCVRVCAHASMHERDVQLFRAAIVKH	265423	267534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_265400_267500
769836	contig_19459_pilon	-	598	7	Intergenic	novelGene_59899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_5	8098.19448498656	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	106	597	16240	7099	FALSE	40	TATCAAATGTTGAAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSL	19069	7097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_16203_16265_18988
769837	scaffold_13505_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_111619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	315	758	667674	667231	NA	40	TGAATTATATCCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLVTNGPCRTDPVLFSMNISVFLIRYLDISFKSSFRDILSLSGTSIGAVSITRIHICFNQVVAQFSGNVITLSPRNTLNLSMRDSVAISMRKSMALSFISEIIESWQYRMSCSGGCRHRTDLGPGESCLLKKYPLLMSYIQNRNC	667988	665989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_666000_668000
769838	contig_4659_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_118265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGAGCTCTTTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906770	904637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_904600_906800
769839	contig_2799_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_85472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGGAAATTTATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425043	425481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_425000_425500
769840	contig_9609_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_22954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAGTTGAACTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211633	211232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_211200_211600
769843	contig_7963_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_58512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGGTGTTCTGTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161994	161122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_161100_162000
769844	contig_15897_pilon	-	1598	2	Intergenic	novelGene_49568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813617	809951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_811125_813192
769846	contig_6710_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_93679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653845	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
769848	contig_7286_pilon	-	567	4	Intergenic	novelGene_108692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	109.776540703781	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	253	501	288495	286948	FALSE	10	AATTGCCTTGTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	290827	286881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758
769849	contig_7202_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_17977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
769850	scaffold_13505_pilon	-	1939	2	Intergenic	novelGene_111490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2309	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	769	1332	542408	541845	TRUE	10	TCGTAATCTTGGTCTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCTYWLLTVTLGQGTVCYSRSSEKSRWPPQGHTTCPTPKGRRERVKGVRHRAWQAELRTSFTLGTSTVWGVSAYSTFARLHPQYLRFSLWQGSCVPVTEALSLSLPHLWRGCQRRVLTSPCPAPASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	543176	540197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297
769853	SIRV6	+	257	4	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	39	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3144	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3162_10721_10819_11033_11109_11205
769854	contig_14876_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_170249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCACCAAACGTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201507	203708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_201500_203700
769856	contig_5095_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_74937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGGCTGCTAACCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128492	127878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_127900_128500
769859	contig_1275_pilon	+	917	2	Intergenic	novelGene_108831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	88	777	747279	747968	FALSE	20	TAGCATAATTGTGTCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
769861	SIRV6	+	350	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	23	410	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769862	contig_2062_pilon	-	914	4	Intergenic	novelGene_139051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	71.6534871602368	2680	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTTATTTTGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324936	1313302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1313896_1314188_1314348_1319148_1319216_1324841
769863	contig_19132_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_170005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAGTAGAACTATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438688	441046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_438700_441000
769866	SIRV4	-	338	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1180	3	1180	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3978	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
769872	contig_18231_pilon	+	1182	2	Intergenic	novelGene_105894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCACGACCCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275733	277190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_276596_276870
769873	contig_2009_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_165437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCATTCTGAACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13500	14229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_13500_14200
769878	contig_10765_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_122873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAACCCTATGGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29775	29279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_29300_29800
769879	contig_10765_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_122872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28871	27865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_27900_28900
769880	contig_9363_pilon	-	1544	5	Intergenic	novelGene_6518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17.3637553541853	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	771	1403	543823	543191	FALSE	40	TCTCATTCAGCATCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTSMQTISEELVSYKVSVVKQEKAKKTSEKLFKSNDFVNNFRFALPTSGDEYKKGFFQNFNFIEDQNAQTKKQGKYDEYGKPFSQRSLLVRHKQILTGPKTYECSECGMVLRCETDFVQHQRLHTSENPFECNICGQAFKQMSALTVHKCHPPKKPHKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSREFNPYSTSVYP	570972	543049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_543844_544887_545096_547316_547444_558644_558723_570635
769881	contig_9982_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_55785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	674489	674809	NA	35	CATTATAATTGATTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALTYQGTSTFFSPGVRFSLVPSFRFLCCSDSNKAWYKLPGPSLEENLNIPAKLHLNHLFLTTIIWGAPQFSCLRGGDIQNVYLQVSCLEYCHGLNCVPKNICQLG	674488	675748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_674500_675700
769883	contig_8259_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_148881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGAAAATTTGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224069	225552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_224100_225600
769884	contig_15063_pilon	+	801	3	Intergenic	novelGene_13839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3530	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	200	502	34808	36504	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLTCGLQQLCHQHPDARASGPGLLLHLQHPERV	34608	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35128_36409
769891	contig_5145_pilon	-	2151	14	Intergenic	novelGene_131429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	177.032808780224	2	112	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	101	1327	946991	916594	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGELLRGASALLNARPFPPLLPRLLPKLSAAAMSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQNTLRSWRRRASVTTLSSSMSCWMSSWTSATRRPQTARSCRSTSLRRATSWRRGPHGPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVNLLGKYPGVGLLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVCALPEDH	947091	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915648_915741_916420_916540_916617_917113_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_934779_934816_936149_936299_937358_937480_939095_939164_941152_941310_946949
769893	contig_19564_pilon	+	1970	12	Intergenic	novelGene_29696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	24.9256746387805	83	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	35	1864	142112	151531	FALSE	15	GTATCCCCTTCCCCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGRARCLVRAMPRKKPFSVKQKKKQLQDKRERKRGLQDGLRSSSNSRSGSRERREEQTDTSDGESVTHHIRRLNQQPSQGLGPRGYDPNRYRLHFERDSREEVERRKRAAREQVLQPVSAEVLELDIREVYQPGSVLDFPRRPPWSYEMSKEQLMSQEEQSFQEYLGKIHGAYTSEKLSYFEHNLETWRQLWRVLEMSDIVLLITDIRHPVVNFPPALYEYVTGELGLALVLVLNKVDLASPALVVAWKHYFHQHYPQLHIILFTSFPRDIRSPQDPGSVLKKSRKRGRGWTRALGPEQLLRACEAITAGKVDLSSWREKIARDVAGATWGNGSGEEEEEDDAPAVLVEQQTDSAMEPIGPTRERYKDGVVTIGCVGFPNVGKSSLINGLVGRKVVSVSRTPGHTRYFQTYFLTPSVKLCDCPGLVFPSLLPRQLQVLAGIYPIAQIQEPYTAVGYLASRIPVQALLRLRHPEAEDPSAEHPWCAWDICEAWAEKRGYKTARAARNDVYRAANSLLWLAVDGRLSLCFHPPGYSEQKGTWESHPETMELVVLQGRVGPAGDEEEEEEEEEELSSSCEEEGEEDRDADEEGEGDEDTPTSAPGSSLATRNPYALLGEDEC	142077	151637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_142185_142607_142774_143116_143254_143413_143566_143677_143750_144769_144978_145145_145242_145619_145815_150033_150213_150292_150456_150747_150889_151283
769894	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769895	contig_21027_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_127566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	587.838838458297	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	72	398	1865	8046	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTGRQHPGLEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEQGRGQVLHFHPLTEWPHHQLRVGCLPWLVPLHRV	1652	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1686_1826_1879_5171_5261_6365_6482_7938
769897	contig_19744_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_120365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGTGCAACTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110473	111480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_110500_111500
769898	contig_15304_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_30532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	198	383	54100	53061	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPAPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54297	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53220_54073
769899	contig_14362_pilon	+	757	8	Intergenic	novelGene_142504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	120.659920133119	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	4684	10316	TRUE	20	TCAGCATTTCTTCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETSSALTHAGAHLDLSAFSSWEELASLGLDRLKSALLALGLKCGGTLEERAQRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQAKHRPLC	4682	18649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_4753_5174_5243_5400_5509_6338_6409_8660_8706_10295_10346_17259_17316_18359
769900	contig_6710_pilon	-	471	2	Intergenic	novelGene_98136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	15	GCTACCCACCCATCTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769901	contig_8260_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_163259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	233	583	209262	209612	NA	30	AAAACCTCAGGGCCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTHWAANEKVGGSNPQASPLEEDVAVCFHKDLQHWKQYRPVLLCPIKLLGVRIDSVVPGLFFFGFWVRSSCWARNMPGDFTLINSCSQGARKCTECWIHRTPSSRRGNQRPHKKKK	209029	209613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_209000_209600
769902	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769903	contig_8740_pilon	+	2364	9	Intergenic	novelGene_167609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	60.9420831609816	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	148	708	48349	52715	TRUE	70	TAGTATTATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGITTNGISLARLLPQLQKAGLNAINISLDTLVPAKFEFIVRRRGFHKVMEGIHKAIELGYNPVKVNCVVMRGLNEDELLDFVALTEGLPLDVRFIEYMPFDGNKWNFKKMVSYKEMLDTVRQRWPELEKLPEEESSTAKTFKIPGFRGQISFITSMSEHFCGTCNRLRITADGNLKVCLFGNSEVSLRDHLRMGASEEELLRIIGAAVGRKKRQHAGMFSISQMKNRPMILIGG	47594	64269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_47728_48334_48397_48746_48859_49271_49385_49899_50011_52042_52164_52659_52723_61779_62468_63308
769904	contig_11656_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_53977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCAGAGACGTTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194313	195228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_194300_195200
769905	contig_3818_pilon	-	1054	4	Intergenic	novelGene_99307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	98.3948959832549	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	92	553	1057148	1027212	FALSE	10	TCCTGTTCTACCCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASASGGSTLPSGFAVLTTFPDLLFIFEFVFGGLVWILIASSLVPIPLVQGWVMFVSVFCFVGTTALLILYMIGAHSGETSWVTLDAAYQSVASLFYLSASVLEALATILMQDGYTSKHYHENISAVVFSYVATLLYVTHAVFSLIRWKSS	1057239	1026710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1027287_1031842_1031969_1033398_1033567_1057055
769911	SIRV6	+	209	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	521	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
769912	contig_13760_pilon	-	1327	6	Intergenic	novelGene_61340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.7641129363949	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	122	802	333942	324174	FALSE	5	CTGCCTCTGTGTGGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGSSAAGAPQPTCLVPGSHLFASRALKKAAPGLLSGSSSMKAPGRLLLIILCSLVFLAVYILICGWACLPLCLATCLEPHLPTSSRPTMLGPLHFSGYSSVPDGKARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRRQSGSFLSTGWFTMILALELCEEIVVYGMVSDSYCREESHPSVPYHYFEKGRLDECQMYLAHERAPRSAHRFITEKAIFSRWAKKRPIVFAHPSWWAQ	334511	323648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325726_327791_327977_330568_330755_333930_334018_334465
769914	contig_3147_pilon	+	1721	12	Intergenic	novelGene_142263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	71.8002279054372	487	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	575	1456	62151	83545	FALSE	20	CTTAAATGTTGATGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS	54745	83810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_54917_58006_58137_60341_60455_60549_60600_62040_62202_63668_63849_66431_66573_68233_68408_75870_75958_81622_81737_83158_83240_83491
769917	contig_826_pilon	-	1801	4	Intergenic	novelGene_154933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	621.468332973522	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	45	926	16566	12819	FALSE	50	AAAATGGTGATCATTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFLVAFLLVSVAAPEVRSPVVNALDLEASAAGNMTNTSKKEETSAERHSDNHTTEPPSKEEHSSTPYLRPASTNGTSDSPDLEQTSQKVDPDRPVSEHATLKDPTDNEQSSISDPNAVPDKGDDQHASRTESGEKVSTDSEPASPQQKGEDKSSDLAEDVEPKEAEEDDAEPKEAEEDDAEPKEESPPKEGVSGQASSENREGPPLGSMSSEKDDLFKDNPGSASAESSHFFAYLVTAATLVAVLYVAYHNKRKIIAFVLEGKRSKVTRRPKASDYQRLDQKVWVEAMQLHF	16610	11943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_12852_13256_13341_15627_16347_16520
769919	contig_12570_pilon	-	1927	6	Intergenic	novelGene_79367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	24.6787357860973	2	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	231	989	293932	280932	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVVGKPIEVRKILRPSQEEVDHLHQRYIKELCNLFEAHKLKFNIPIDQHLEFC	300273	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_282875_283523_283699_284049_284255_293908_294088_300198
769922	contig_7915_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_42961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAACACTAAAATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72924	72518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_72500_72900
769923	contig_7915_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_42960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAACCACATTCCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71820	70522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_70500_71800
769924	contig_5585_pilon	-	2325	7	Intergenic	novelGene_143080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_6	43.0687434999753	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	65	835	497788	432871	FALSE	45	GTGTTTTATGTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLSGHPTLPCNVLKFKSTTIMLDCGLDMTSTLNFLPLPLVQSPRLSNLPSWSLKDGNAFLDKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQVIYKFSFNSSALCYLTQILTVSRVPSAVFKSS	497852	431380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_467045_467107_497723
769925	contig_13293_pilon	-	1996	2	Intergenic	novelGene_146436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	35	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAATTACCACCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160920	156006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_-_157795_160712
769927	contig_5039_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_64901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTTCCCTAAACGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609126	608456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_608500_609100
769928	contig_5039_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_64900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGCAATGGGTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607888	607137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_607100_607900
769930	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	387	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
769931	contig_12050_pilon	-	1195	5	Intergenic	novelGene_62676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	140.216573556766	11	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	461673	446929	FALSE	30	ATCATGCAGCAATATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCPICRLPFRALLQIRAVRKKPGALSPVSFSPVLAQSVDHDEHSCPFKKSKSHPASLASKKPKRETSPDSVPPGYEPISLLEALNGLRAVSPSRGTGAGNSYDWWKSLCWP	461674	446070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446994_455009_455083_456700_456767_458809_458920_461651
769932	contig_12886_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_135517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGAGGTGCGCTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650016	650526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_650000_650500
769935	contig_12630_pilon	-	833	3	Intergenic	novelGene_173085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_2	36	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	52	660	100972	81553	FALSE	40	AGATATTTTTTGTAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRGK	101023	81379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_81810_81934_82253_100938
769936	contig_12630_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_173084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTCAAACAAAATACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80234	78783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_78800_80200
769937	contig_13051_pilon	-	1811	16	Intergenic	novelGene_140093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	924	1232	145301	124671	TRUE	25	ACTGCCGTAAAGCGCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTSLQYSLLASKGIFAFSLFSSHCRSPCWAASVHISGRNSAMFSTIARVLWTPFASSFTDSSRRSKFCTSSATTCPSTKASMSTSAPSSLSWRVSISVNS	245547	60108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_60221_99792_99982_103692_103803_112338_112479_124642_124740_133402_133497_136171_136263_145246_145321_145546_145607_147308_147456_173372_173555_212569_212668_214756_214840_233732_233828_234065_234148_245390
769939	contig_14322_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_116440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAATTAGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
769945	contig_348_pilon	+	1790	9	Intergenic	novelGene_67611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3614369177253	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	559	1365	320222	345268	FALSE	35	AAAAACTGTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314501	345693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_318932_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
769949	contig_5551_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_134258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTAGGAGAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595478	595876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_595500_595900
769953	contig_10734_pilon	+	1349	5	Intergenic	novelGene_51519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTAATGGTTGGGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270711	2281508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2271050_2274374_2274506_2275752_2275884_2277108_2277192_2280842
769956	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
769959	contig_12010_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_160953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210252	211412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_210300_211400
769961	contig_8475_pilon	-	1886	4	Intergenic	novelGene_171100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	10.4986771653491	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	141	1184	74209	65685	FALSE	5	TCTCTCTTCCTCCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALEPEEQNGLLILKVEDHYGGQNSISQKNCHHRRELFRQRFRKLCYQDSPGPREALTQLWELCRQWLRPEYHTKEQILDLLVLEQFLRILPKDLQAWVQAHHPETGEEALTVLEDLERELDEPEKKVPANSERQDILLDNLAPLGRPHESLTIQLHPKKNQLEQESVEPQRNGDKTRTRNEELTQKEDMPKDIESLGEKNNRFNKDIPQHAESKDATENERLEWQQRERRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDMCGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKEFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHHRIHTANKLY	75009	64982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_66203_72315_72455_73822_74293_74952
769965	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
769966	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
769968	contig_8284_pilon	+	1200	9	Intergenic	novelGene_125708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	482.943562308268	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	441	926	441556	461340	FALSE	20	GCTATCGGTCTTCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425072	461614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425281_426587_426685_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
769971	contig_9646_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_117476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAAAGCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412707	410514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_410500_412700
769976	contig_1545_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_149742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCTAAAAACTGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130311	129665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_129700_130300
769979	contig_17964_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_33905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGCTCATTTACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363460	365633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_363500_365600
769982	contig_15039_pilon	-	1415	3	Intergenic	novelGene_110203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	8.5	257	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	124	780	955477	941933	FALSE	10	GACTTGTGCCTTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGAPSSAPPVLLLLLLLLWAERPRGAELTFELPDNAKQCFHEEVDQGVKFSLDYQVITGGHYDVDCHVEDPLGNTIYRETKKQYDSFTHRAEVKGVYQFCFSNEFSTFSHKTVYFDFQVGDEPPILPDMGNRVTALTQMESACVTIHEALKTVIDSQTHYRLREAQDRARAEDLNSQVSYWSVSETIALFVVSFGQLLLLKSFFTEKRPMSRGVHS	955600	941297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_942170_953771_954021_955306
769983	contig_10980_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_162558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTAACTGGGACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158675	157071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_157100_158700
769985	contig_3277_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_74743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTCTCTGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291069	288719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_288700_291100
769986	contig_17936_pilon	+	984	9	Intergenic	novelGene_29898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	958.118917136594	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	918	67	984	50646	114813	FALSE	45	TATGAGGCCAAAAGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMDCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQET	50579	114813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79106_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111062_111109_111167_114800
769989	SIRV6	+	416	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	464	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTAAGACTGTATCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
769992	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
769994	SIRV4	-	237	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	368	12	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
769997	contig_7657_pilon	+	805	4	Intergenic	novelGene_29998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_2	368.493630278131	2824	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	240	617	64638	75169	FALSE	20	TGTCAGTGTTTACTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQAAKRANIRLPPEVNRILYIRNLPYKITAEEMYDIFGKYGPIRQIRVGNTPETRGTAYVVYEDIFDAKNACDHLSGFNVCNRYLVVLYYNANRAFQKMDTKKKEEQLKLLKEKYGINTDPPK	64398	75357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_64668_66643_66763_74758_74898_75079
770002	contig_14142_pilon	-	1139	6	Intergenic	novelGene_120638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_1	247.10758790454	69	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	137	601	622927	620914	TRUE	15	TCAGGCATCTGGGAGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625153	620204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625038
770004	contig_6674_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_148006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTAAAAAAATATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162046	161403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_161400_162000
770007	contig_9199_pilon	+	1161	8	Intergenic	novelGene_65637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	49.3268979071546	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	63	686	120933	122011	TRUE	25	AAAGTGTGAGTGCATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKVLVVEENTDEGKEEVLPLVNISAHRQQVLRRSCCQGWMYSWRCSPPVQWGRPNGRWPKLGGTWKRLCRCW	115832	122835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_122035_122230_122293_122367_122429_122506
770008	contig_10749_pilon	+	1771	16	Intergenic	novelGene_133502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_14	35.6199694303943	328	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	118	1749	288708	301943	FALSE	15	CGTACCAGACCTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLGLFPPPPPRDQVTLYEHNNELVTGNSYESPPPDFRGQWINLPVLHLAKDPLKTPGRLDHGTRTAFIHHRERVWKRCITTWRDMGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNWNSCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVYNANSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSLSTRPSSGCAQVLSHPGHTPVTSLAWAPSGGRLLSASPVDAAILVWDVSTETCVPLPWFRGGGVTNLLWSPDGSKVLATTPSAVFRVWEAQMWTCERWPTLLGRCQTGCWSPDGNRLLFTVLGEPLIYSLSFPERYGEGKGRVGGAKSATIVADLSETTIQTPDGETRLGGEAHSMVWDPSGERLAVLMKGNPRVQDGKPVILLFCTRNNPVFELLPCGIVQGEPGAHAQHITFHPSFNKGALLSVCWSTGRIAHIPLYFVNAQFPRFSPVLGRSRDPPVGGGVSIHDLPLFTETSPTSALWDSLPGLLPAQPHSHL	288590	301965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_288831_289428_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293798_293898_294233_294378_299644_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513_301599_301727
770009	contig_20614_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_107584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	862	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGAGCGCACAAACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292137	293235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_292100_293200
770010	contig_3787_pilon	-	817	4	Intergenic	novelGene_102413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_3	150.665929201735	281	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	35	574	565100	559769	FALSE	55	TAAAGAAAAACTGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAAAEGEPAVMAFSGPAAYLTHQQKVLRLYKRALRHLESWVIHRDKYRYFACLMRARFEEHKNEKDMVKATQLLREAEEEFWHCQHPQPYIFPDSPGGTSYERYECYKVPEWCLDDWHPSEKAMYPDYFAKREQWKKLRMESWEREVKQLQEETPPGGPKTEALPPARKAGDLPPLWWHIVTRPREQPM	565134	559525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559901_561481_561596_562118_562312_564999
770011	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_93626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770015	contig_16103_pilon	-	778	4	Intergenic	novelGene_118884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	12	395	743628	723303	FALSE	45	CGACCAAACTAATATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHSSANVFRSLL	743639	722919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723338_735891_735975_737495_737630_743496
770016	contig_8058_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_149507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCCTTCTTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57900	59954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_+_57900_60000
770017	contig_4315_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_46826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	82	528	369978	369532	NA	60	AATAAAAATTTAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVTLVPTAAAPSPEDEAAQVKCGPGPMASSGTEVHWAELGLGKGPRRRRRRWAWAEEEKDADGNRTRSCGEEGPFPNAASPELLEDFHLAQQHLLPMEWDPQAGGCQDSESGESAGEGETDFPSPQFCPPTLSYLLASLHPHLTVWYGEWWKVLYIFLIKICNLNFKLNLKSII	370059	369479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_369500_370100
770019	contig_10569_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_44079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293109	295195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_293100_295200
770023	SIRV4	-	254	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1264	3	1264	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3894	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
770024	contig_8452_pilon	-	2065	8	Intergenic	novelGene_48025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	299	junction_7	133.59304637898	66	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	40	1029	550776	331967	FALSE	65	TCAAAATAAAAAAGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGFLAPVFALFVPFYCSIPRVQVAQILGQFSITNKTLIYILGLQLFTSGSYIWIVAISGLISGMCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVISNTWSLTCTHALNFTQF	550815	330930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
770025	contig_15066_pilon	+	1290	3	Intergenic	novelGene_149523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	4.5	284	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	145	405	57293	58473	TRUE	10	TGCTTGTGGATTTGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKLRTRSDGGAREDGPGRDHGGGGRGGRGGAAGGRGDSGVQGAVGGGMARASSANDSEEAWGALRAPQQQLRELCPGVNNQPYLCESGHCCGETGCCTYYYELWCESPRDCPQVPLPTLPWTSEFQPSRTFSA	57148	59530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_57362_58281_58687_58858
770026	contig_12588_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_173087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCCAGTCTCCCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53062	52222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12588_pilon_-_52200_53100
770027	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_90424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770036	contig_8044_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_132362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTATTTCCTGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238974	240002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_239000_240000
770039	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770048	SIRV4	-	214	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1309	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
770052	SIRV2	-	284	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	645	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4087	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
770053	contig_6710_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_94771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653612	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
770055	contig_3601_pilon	-	1276	8	Intergenic	novelGene_132872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_7	218.350775644351	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	13	876	355137	144563	FALSE	35	TGTGAAGTTATGTCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATASGALGALQASRARLVAAWCARLGLGLGLPGSVTSTRAGPAMWAQGWAPAAGGAVLRRGYSSEVNAENELRVRYLEEENRGADLKERVKMHSSEVGPFVSKIRAVVNDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLELALACDVRVAASCAKMGLVETKLAIIPGAGGTQRLPRAIGMSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	355149	144162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169200_252871_252929_254568_254662_274999_275087_354875
770058	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
770060	contig_8843_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_156655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCACAGAGCGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88076	86122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_86100_88100
770064	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
770065	contig_401_pilon	-	1651	3	Intergenic	novelGene_42943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	142.5	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	12	695	2233942	2225588	FALSE	25	AAAACCTTGGTATGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRSKISLPSQQHLL	2233953	2224631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2225622_2232149_2232248_2233390
770067	contig_3095_pilon	+	1128	5	Intergenic	novelGene_75134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	2	712	147280	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147278	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150687_151002_151163_151848
770068	scaffold_8345_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_107014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579643	580865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_579600_580900
770069	contig_7020_pilon	+	1520	3	Intergenic	novelGene_57073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	321	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	291	1364	102436	103509	FALSE	30	TCCTTCCTTTTTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98796	103665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106_102358_102424
770070	contig_19096_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_173092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAATCCACTTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8661	7643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_7600_8700
770075	contig_9848_pilon	+	1152	9	Intergenic	novelGene_79918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	184.961313522585	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	6	887	58813	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQESSGGAEELGAQDPSPAPSKAPSSTGHYELPWCLPEKGTCPTLSLLGIDVVRNKIKMFAQQKVTLPKGRHKIIILDEADSMTDGAQQALRRTMEIYSKTTRFALACNASDKIIEPIQSRCAVLRYTKLTDAQILARLMNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58807	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_77678_77721_79977_80080_81702_81804_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
770077	contig_11304_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_156710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAGTAAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398736	399198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_398700_399200
770078	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
770079	contig_5039_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_64958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	441.146800963126	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	119	478	1657705	1654775	FALSE	5	TGTGGTGTTTTATTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSWPVHRKYRSPGSDTRTVGQYRCPSLDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLRNGSPYQPNCMFFLNRY	1662326	1653712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654835_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1662244
770081	contig_3153_pilon	+	689	3	Intergenic	novelGene_104647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	149.5	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	167	664	111160	190713	FALSE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPTPELSLVLQVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	101888	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_101979_111083_111365_190420
770082	contig_10864_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_107088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTGCAGTTTATGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917036	916035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_916000_917000
770083	contig_20293_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_153529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGTAGATATCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97969	99080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_98000_99100
770084	contig_2596_pilon	-	2354	7	Intergenic	novelGene_53454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	12.3153021346074	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	173	1342	317105	290076	FALSE	20	AGTTAATTTGAGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEYNCVKLRSDCSRPSLQWYTRAQNKMRRPNLFKNILKCILLVFGLWILYILKLNYTTEECDMKKMHYVDPDRVKRAQRYAQQILQKQCRPKFAKTSMAQLFERRYSTDLLPFVKQTTTMNGAEYKYDPPFGFRKFSSEVQTLLELLPEHDFPEHLRAKKCRRCVVIGSGGILNGLELGHALNQFDVVIRLNSAPVQGYSEHVGNKTTIRMTYPEGAPLSDLEYYSNDLFVAVLFKSVDFIWLQAMIKNETLPFWVRLFFWKQVAEKIPLHPKHFRILNPVIIKETAFDILQYSEPRSRFWGRDKNVPTIGIIAVVLATHLCDEVSVAGFGYDLSHPKTPLHYFDNQCMAAMNFQTMHNVTTETGFLLRLVKEGVLKDLSGGIHCEF	360277	289063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_290325_294086_294246_295726_295914_299969_300314_314100_314213_316986_317108_360107
770095	contig_8362_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_150693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327852	328283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_327900_328300
770097	contig_6710_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_95877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
770100	contig_4103_pilon	-	1426	3	Intergenic	novelGene_52028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_1	72.5	416	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGGTCTCACATGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619589	542279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_543381_577146_577338_619455
770101	contig_6589_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_25783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	1861.95815943861	112	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	646	1137	669670	672754	FALSE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668307	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669121_669748_670000_670104_671046_671188_672584
770102	contig_252_pilon	+	2755	2	Intergenic	novelGene_99933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	3	683	380695	381375	TRUE	80	AAATAAAAGTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEKGARVPKVNNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPAFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMMKYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQCNPYFRNEALVKEYERRSSGRVVCLATPIRWHRGQDPQTHVHRNQDGNTIHSFFSWFSDNNLLEFDKIAEIIKEELWPNPLQYYLMGEGARRGMRGPGRQPVENPMSFRFQSG	380692	383748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_382116_382416
770104	contig_6710_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_95986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653647	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
770110	contig_6364_pilon	+	919	4	Intergenic	novelGene_51869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	11.5758369027902	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAATAAAGTTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485977	2489279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2486530_2487476_2487586_2487738_2487843_2489125
770111	contig_3627_pilon	+	1330	7	Intergenic	novelGene_78452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	149.789852793839	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	582	875	304392	304781	FALSE	15	TTTTATTAGCTTGACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKGIMGNNISLLFMFHINV	294397	305236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535
770116	contig_9883_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_87575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCAGGATAAGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53133	53876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_53100_53900
770117	contig_9883_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_87576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTAGGTGGAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54122	55380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_54100_55400
770119	contig_6364_pilon	-	1912	10	Intergenic	novelGene_51824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	9.02397355744309	4	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	661	1152	1589109	1586979	FALSE	55	CAAATAAAGCAGTTACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYSGPRRAASDWQRWHWPMLRQVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1596977	1586218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1589040_1589381_1589757_1589855_1590376_1590428_1591357_1591545_1596923
770125	contig_5217_pilon	+	1772	3	Intergenic	novelGene_135793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	3.5	129	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	32	868	664082	683085	FALSE	20	TGAATGAGCTTACTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPALRAGVFTMVSAELDYTIEIPDQPCRSRESSPEQGRKEAGTRQPVVILLGWGGCTDKNLAKYSAIYHKRGCIVIRYTAPWHMVFFSESLGIPSLRVLAQKLLELLFDYEIEKEPLLFHVFSNAGVMLYRYVLELLLTHRRFCHLRVVGTIFDSGPGDSNLVGALRALAAILEHRPAVLRLLLLVAFALVAVLFHILLAPLTALFHTHFYDRLQDSASRWPELYLYSRADEVVLARDVERMVETRQAHHVLVRSVDFVSSAHVSHLRDYPTYYSSLCVNFMRSCVQC	664050	683989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_664143_677445_677568_682431
770127	contig_2892_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_119003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158291	158553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_158300_158600
770133	contig_15236_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_141588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACTGGAGGAATTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450048	449180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_449200_450000
770135	SIRV2	-	513	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1100	24	-63	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACACAAGACATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4795	3689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
770138	contig_8452_pilon	-	2062	5	Intergenic	novelGene_48114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	850.280247918297	39	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	29	487	991128	967786	FALSE	45	CAAAAAAACCCTTATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQRRWQRESSRAVVRLPRHLDWGVWILVKEILILTEETLELQHATVP	991156	966210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_967922_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
770140	contig_13496_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_107627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGAATGGGAGCTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231441	231972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_231400_232000
770143	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
770144	contig_5153_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_74374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGGAAAGATGAGTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960073	959321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_959300_960100
770145	scaffold_12124_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_22098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGCTTACTGGATACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864791	862885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_862900_864800
770148	SIRV5	+	295	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	878	32	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
770150	contig_7919_pilon	-	2106	1	Intergenic	novelGene_28099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGCTAATCAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300701	1298595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1298600_1300700
770151	contig_14142_pilon	-	1470	9	Intergenic	novelGene_120455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_7	144.248916807025	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	314	1276	100587	98732	FALSE	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRTEELAQAYDAFTLVSPAVRVGGRSEPDGGLGWSPGACLEPPTCFLPAGPS	101213	98537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080
770154	contig_11396_pilon	+	1798	15	Intergenic	novelGene_71264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_8	27.3637627201392	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	29	1678	175655	190332	FALSE	10	TTTTTTTATTCTCCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCSDTPSSMAAPPALASATPSAPPPPTADRDPPDQPGEKSDTAREDCSNAESLDRLLPPVGTGRSPRKRTTSQCKSEPPLLRTSKRTIYTAGRPPWYNEHGTQSKEAFVIGLGGGSASGKTTVARMIIEALDVPWVVLLSMDSFYKVLTTQQQEQAARNNFNFDHPDAFDFDLIISTLKKLKQGKSVKVPIYDFTTHSRKKDWKMLYGANVIIFEGIMAFADKTLLELLDMKIFVDTDSDIRLVRRLRRDISERGRDIEGVIKQYNKFVKPAFDQYIQPTMRLADIVVPRGSGNTVAIDLIVQHVHSQLEERELSVRAALASAHQCHPLPRTLSVLKSTPQVRGMHTIIRDKETSRDEFIFYSKRLMRLLIEHALSFLPFQECVVQTPQGQDYSGKCYAGKQITGVSILRAGETMEPALRAVCKDVRIGTILIQTNQLTGEPELHYLRLPKDISDDHVILMDCTVSTGAAAMMAVRVLLDHDVPEDKIFLLSLLMAEMGVHSVAYAFPRVKIITTAVDKRVNDLFRIIPGIGNFGDRYFGTDTVPDGSDEEEVACMS	175626	190452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_175771_184200_184392_184550_184658_184780_184952_185058_185131_185765_185956_186688_186751_187386_187404_188962_189062_189131_189226_189314_189378_189528_189652_189756_189865_189955_190113_190252
770157	contig_5526_pilon	+	1474	2	Intergenic	novelGene_111704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	44	361	332197	332514	TRUE	20	TTTGTCTTGATTACTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTVRELHRGQVEDRISRCMVCLYNTRHLIVHRHSSKLWRLNAECGSGGRSLVTPLSLFGVRAASLMARCKTNSERCICFSPVFVKVKILFGFLLISKNRYKCR	332153	334538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_332747_333657
770158	contig_12427_pilon	-	537	4	Intergenic	novelGene_40482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1169.06315768938	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	138	536	316061	315386	FALSE	35	CCAAAGTGAAGTGCTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDC	325976	315384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_315568_315748_315842_315937_316079_325856
770159	contig_7870_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_108919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCACAAATGAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241718	243896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_241700_243900
770160	contig_1301_pilon	+	789	2	Intergenic	novelGene_47267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGACTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213222	214728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_213905_214621
770161	contig_12624_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_61019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTGCCAAGTCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840875	841556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_840900_841600
770164	SIRV6	+	219	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-8	384	-1	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
770166	contig_16776_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_130539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	227	568	97172	96831	NA	20	AACTTTTCTAGGGCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELPQEQGSPRAILWLVTKASQGSGWPSSLLFASLSLGTAATAVSGSVGVVAFILLLVGLLSVTLKKWRHESELNKLTLGLGMKKGEKLGVGMGVRVSFLWGSFGEVVVGRL	97398	96449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96400_97400
770167	contig_3095_pilon	+	685	4	Intergenic	novelGene_75196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1300.49913494781	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1	510	226165	227138	FALSE	10	GTCTTTTATTGCATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLEVSRDTKGPCELHPTRKKGTMSIYKNRRVDLLCDLALLSGQVHHIPSLLLRLFLSLLLWDLRC	226164	227313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_226409_226645_226720_226768_226824_227001
770170	contig_9682_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_125311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCCCCCGCTTTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456419	454636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_454600_456400
770173	contig_9571_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_136332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2292	2594	750783	750481	NA	45	ATCACAAATCGGCAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSQVVQVKLRRVGKHSDGWNSNGVAARLRGVKLSDFRPSPETKRDQVEEVQSGTSPRACGKTCQSRALASRNLLGHLFERPPHACQGIHSGCFPSYQS	753074	750471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_750500_753100
770176	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
770181	contig_1154_pilon	+	1886	2	Intergenic	novelGene_87210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1470	1796	1176755	1177081	FALSE	5	TTCTGATGCTTTTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGNLWHKEQDEEDGGASPTMGLFPGVMGCLGPRTHRRLRCFDTPSWDPRRQVRETRHPSQASFLARPTSLAGTRQPGVASGQLRCESLGTRQALASPFGLLHPVKK	1173688	1177171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1174047_1175643
770182	contig_14151_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_171839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGTTGTTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162529	162781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_162500_162800
770184	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
770187	SIRV6	+	496	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1595_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770191	contig_13894_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_62071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAACCAAGAAGGCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299936	299270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_299300_299900
770193	contig_10446_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_162489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	288	638	798472	798122	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYGFYLKRYKYPSASLSFGFLSAKPKYKSNQSKVLGNAGYLVVDVIRISWAFRHTWRGLSVLHLYSLSLMYLEAHLMCSTDNFKITVENTCVTVPLDNQASTLPFFYSAHVLLH	798759	798015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_798000_798800
770196	contig_14882_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_115004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAAGTATTAGCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257643	258677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_257600_258700
770199	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_90078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653804	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770200	contig_8161_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_156780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACGGAAAGAAACACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461105	462594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_461100_462600
770201	contig_8262_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_166102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGATATTTCTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120166	118901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_-_118900_120200
770202	SIRV4	+	220	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1547	636	1092	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTCTTTATATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	2767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
770203	contig_13947_pilon	-	1331	5	Intergenic	novelGene_173102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	41.9702275428666	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	129	623	31072	11312	FALSE	35	AGGGGCACTGTGACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESQAQIKAMLIAETRRRFEAEYLADKSDKYDPRDVERLQQDDNWVESYLSWRHDVIDETLKMLDESFQWRKEFAVNDLSESSIPRRLLEIGGIYLHGYDKEGNKLFWIRVKYHIKDSKTALDKKKLIAFWLERYAKRENGKPITVMFDLSETGINNIVSIFH	31200	10603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_-_11485_13579_13667_16112_16269_30839_30910_31063
770209	contig_2940_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_81962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTACTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018642	1017428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1017400_1018600
770211	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
770212	contig_10904_pilon	-	1532	9	Intergenic	novelGene_22605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	18.7932833746528	230	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	616	1305	490545	488436	FALSE	20	GGTGGTGCAATGGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKLLLFDLLTGLAVSLLIQFPRKLLCGLFPGALGRLAGTQEFQVPDEVLGLIYAQTVVWVGSFFCPLLPLLNTAKFLLLFYLKKLTLFSTCSPASRTFRASMVNCFFPLVLVLGLAISAVPVLCSIFLIPPSKLCGPFQGQPSIWAQIPESIYSLPQATQNFLFFLGTQAFAVPLLVISSILMAYTVSLANSYGRLISELKRQIETEAQNKVFLAQRAVALSSANGAL	492073	488208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_488505_488603_488683_488965_489122_489219_489351_489965_490150_490474_490573_490979_491113_491377_491542_491782
770213	SIRV6	+	495	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	171	-1	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
770215	contig_4071_pilon	-	2994	6	Intergenic	novelGene_151881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGTGTTCCATGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234852	210686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_210706_215277_215420_223825_224004_226692_226926_230038_230199_232590
770219	contig_18869_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_56016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73531	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
770220	contig_10523_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_120914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGACACCTGCCACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11166	12651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_11200_12700
770224	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	77	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
770229	contig_15244_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_118066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTGAGGTGGTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681933	680057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_680100_681900
770230	contig_9074_pilon	-	1934	17	Intergenic	novelGene_156623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	229.807766132914	149	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	17	1759	111461	61565	FALSE	20	TAAAGTTTGTGTTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPERQIPFHDVRFPPPVGYNKDINESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKPATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKESAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKRAHMLIDMHFRSLRTKLSLILRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKNGKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIIPPNSLPSSNSRVGPNPSEEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRVLVVSSIVAGESQKPELKAWQGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSESDHRDELSDWSLAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	111477	61389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_61607_62803_62887_63085_63233_64807_65004_67449_67537_70247_70311_70814_70950_71841_71952_76158_76238_76326_76498_78722_78840_78924_79019_79641_79791_80067_80140_82886_82981_88322_88376_111410
770232	contig_5083_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_151627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACATAATTTAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87458	87151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_87200_87500
770235	contig_12970_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_50515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAGAAATGCAGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102980	101836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_101800_103000
770236	contig_10074_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_57111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGAACAAAGCTGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258447	256807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_256800_258400
770237	contig_2377_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_67938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCTCACATCTTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868438	869414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_868400_869400
770238	contig_4486_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_38545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132559	134463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_132600_134500
770240	contig_4059_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_140603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGGTGAATTAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409165	410659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_409200_410700
770242	SIRV6	+	219	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	515	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10827_11037_11109_11205
770246	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
770248	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
770252	contig_10855_pilon	+	1121	2	Intergenic	novelGene_124303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	723	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAAAGCCTCTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303463	306661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_304035_306111
770258	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
770260	contig_1154_pilon	+	2759	1	Intergenic	novelGene_87081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320327	323086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_320300_323100
770265	contig_9127_pilon	+	2234	2	Intergenic	novelGene_103020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	727	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCATTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214899	218714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_215176_216756
770267	contig_18363_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_157720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTCCTATACAAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295336	294078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_-_294100_295300
770271	contig_5791_pilon	-	1434	4	Intergenic	novelGene_35809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	1066	1434	328523	325661	FALSE	25	TTAGCATGACCCGGATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSAYQSSRRLGSAIAGDFTLLEASVFRYRRCHPGGFSLLLHRHLPPSPAGRAGEQAEKQSLQPAPAWPSPAATHCQISFLSFSAWGSGGSSPVDTAVPSPREEITRTAYHPHQSQAPKARS	335720	325660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_325862_325928_326046_328472_328565_334696
770272	contig_10940_pilon	+	2280	13	Intergenic	novelGene_49294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	102.946149623103	197	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	77	1432	996374	1057794	FALSE	20	GCGTGCATATTTCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQDGGGGGSSVRSLEARRVPLKRAAMALHSPQYIFGDFSPDEFNQFFVTPRSSVELPPYSGTVLCGTEAADELPDELLETVTLIHKPVSLQPRGLINKGNWCYINATLQALVACPPMYHLMKFIPVYSKAQRPCTSTPMIDSFVRLMNEFTNMPVPPKPRQALGDKIMRDIRPGAAFEPTYIYRLLTVIKSSLSEKGRQEDAEEYLGFILNGLHEEMLNLKKLLSPNNEKLTVSNGPKSHLVNEEEQEEQGEGSEDEWEQVGPRNKTSVTRQADFVQTPITGIFGGHIRSVVYQQSSKESATLQPFFTLQLDIQSDKIRTVQDALESLVARESVQGYTTKTKQEVEISRRVTLEKLPPVLVLHLKRFVYEKTGGCQKLIKNIEYPVDLEISKELLSPGVKNKNFKCHRTYRLFAVVYHHGNSATGGHYTTDVFQIGLNGWLRIDDQTVKVITQYQVVKPTAERTAYLLYYRRVDLL	996297	1058642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_996395_1016193_1016263_1025108_1025170_1041374_1041467_1041956_1042067_1042451_1042508_1042721_1042826_1043938_1044039_1046223_1046402_1049234_1049401_1052683_1052829_1054301_1054368_1057606
770273	contig_6628_pilon	+	1227	10	Intergenic	novelGene_170610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	40.0638379478441	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	418	1092	253207	257143	FALSE	30	GCAAGGTACTGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNAKQPEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGVGRAAGRGVPAGVPIPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAVAATASIAGAPTQYPPGRGTPPPPVGRATPPPGIMAPPPGMRPPMGPPIGLPPARGTPIGMPPPGMRPPPPGIRGPPPPGMRPPRP	213237	257278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_+_213344_221655_221752_223823_223965_252265_252332_253198_253314_255219_255332_255785_255939_256388_256528_256864_256991_257105
770275	SIRV6	+	446	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770277	contig_20693_pilon	+	1795	14	Intergenic	novelGene_60252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	752.074275571457	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	27	647	14748	27005	TRUE	30	ATTATGTATAGTCCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEEDFLHAKKYLSLFLVL	14721	34771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14793_19365_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_26022_26227_26274_27000_27064_27356_27447_27875_27968_28870_28998_29789_29968_32928_33015_34254
770279	contig_3529_pilon	-	1285	3	Intergenic	novelGene_105391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_2	38	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	800	1102	785346	784487	FALSE	40	CAGTAGAAGTTACAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRVGFRSC	787790	784303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_784634_785190_785355_786999
770280	contig_6513_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_117757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAATCAGCAAGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111879	109403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_109400_111900
770282	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770283	contig_7031_pilon	-	1986	7	Intergenic	novelGene_132790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	594	junction_6	259.745815921814	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	78	1574	257848	213905	FALSE	45	AATGGTTAAAATGTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLPLAAQGKLVRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRNLVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDRNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNDVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKVFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVSLYSDYILNKSIEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER	257925	213492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_214053_241210_241285_241379_241536_243685_243851_244508_244715_247778_247924_257245
770288	contig_11171_pilon	+	995	9	Intergenic	novelGene_48545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1782.07648808209	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	399	917	51117	65886	FALSE	5	GCTGTGTGTGGTCTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPCPRPGLGETLSSASCPRDVQILGGRHVAFRQQLC	41814	65964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49026_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64843_65779
770290	contig_7870_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_108952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313027	315244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_313000_315200
770291	contig_9609_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_22952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205508	204632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_204600_205500
770293	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770294	contig_987_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_72318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTGACCTTATGTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014806	1012670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1012700_1014800
770307	contig_2069_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_23371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGACGTTTGTGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057944	1056792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1056800_1057900
770308	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_96421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657185	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657185	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
770316	contig_10489_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_165641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637711	639748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_637700_639700
770317	contig_12886_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_135523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACCCATGGTCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805089	806855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_805100_806900
770322	contig_5799_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_50229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126173	123854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_123900_126200
770324	SIRV6	+	566	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770325	contig_12270_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_113377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
770331	contig_12922_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_157775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAGATTATTCGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70884	69302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_-_69300_70900
770334	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_93639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653814	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770338	contig_19342_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_41071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.5	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCTGTGTTTGCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3236	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3717_6194
770340	contig_6823_pilon	-	1195	6	Intergenic	novelGene_131210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	271.742966790311	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	208	912	193837	187659	FALSE	30	TTAAAGCTTTTGTTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIASACLYIACRQEGVPRTFKEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAVELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL	227677	187375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_187793_189479_189762_191013_191144_191275_191423_193825_193960_227592
770344	contig_610_pilon	+	1108	3	Intergenic	novelGene_76753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCCAGGCTCGTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213510	235246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214264_220677_220785_234998
770345	SIRV6	+	446	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770346	contig_15449_pilon	-	1498	7	Intergenic	novelGene_33677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_6	90.1585024030211	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	60	1223	196078	191270	FALSE	40	GTAAACTCTAAATACTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEMPHSSLHPSIPRHRGHGIQKAAFVLLVACLVALWELGEPPGHTLQWLVCQLASLQLGLLLKVICSLAEELCHVHSRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPGLQDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196137	190994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_192053_192241_192896_193136_194660_194770_195024_195209_195339_195567_196069
770348	SIRV4	-	302	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	20	1199	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
770349	SIRV5	+	371	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	135	48	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
770350	contig_2069_pilon	-	722	3	Intergenic	novelGene_23494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	58	339	1509802	1508747	FALSE	5	ATTGTGTCTGTTTGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509859	1508363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
770351	contig_14711_pilon	+	2048	12	Intergenic	novelGene_68889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	316.820803432482	1	126	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	51	1538	82000	89329	TRUE	20	TCAGACCTCAGTTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALLTVLGFLLALSRGERELDTKIPSPGGGHGMGGILTCLYWGPASQLPPVEMPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHR	70416	90808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70464_81996_82160_84855_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89360_90032_90194_90489
770355	contig_4845_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_53683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809568	808609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_808600_809600
770359	contig_5145_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_131406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCGAGCATGTTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722928	723203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_722900_723200
770360	contig_13592_pilon	-	1565	11	Intergenic	novelGene_33722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	39	junction_2	144.239245699636	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	358	1209	339938	266600	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENNDDRVLKCCLQYQELFPCSLVILCTDDRNLRNKGLISGVKSLSKEELSAELLNLSLNTDECHQPCISKHQLKAEATSLKESFEEKSANSGLSILLESIISELEKSLGTALSLILETEMKIAFGNLWMEMLYLKPPWTLIHLVQCFKKHWLAVFGLVMEKNLLLTIESLYENLCKANNAVDFTTAKFLLQDSKSLLHAFSTRSDYDGILPQAFAQVNKLLQTFTEVKAKLKPNPSENTVGKKQEDTSLMTSSNQEITLFSGSQLPQPNRHQEIWSILENVWITIYQNSTDVFQRLGSNSALSTSKIASFEEAFLYLQKLMVAVKDILEGIQRILAPNSNYQDVETLYNFLIKYEVNKSIQFTAQELYNCVSQTEYRNESTIHLCCSQTRSCVLHRRHGLFY	348431	264233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_264461_266470_266679_294373_294439_298294_298362_308909_309042_326680_326869_332877_333027_337466_337606_339905_340070_341523_341670_348351
770361	contig_2036_pilon	-	827	3	Intergenic	novelGene_131844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	309.5	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	112	468	661441	636681	TRUE	15	TATAGTCGGTGTGTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILDLSSVNLHLWLAIASR	661552	631634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_631872_636558_636731_661134
770363	SIRV6	+	362	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	10	411	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770366	SIRV5	+	402	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-72	875	42	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
770368	contig_18108_pilon	-	1845	13	Intergenic	novelGene_33519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	325.362831654481	2	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	46	1644	287542	266909	FALSE	20	GGAGTGTGTTAGCCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSRDGGQTAPASTRLFQVRASSSGATRAIEVIPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	287587	266707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_271247_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277875_278092_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287476
770369	contig_6269_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_170539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTAAGGCCTCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253207	255438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_253200_255400
770373	contig_5643_pilon	+	1098	7	Intergenic	novelGene_38738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	304.448682046745	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	173	904	152580	157107	FALSE	20	ACCACACGCTGCAGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152407	157301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152973_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
770376	contig_7695_pilon	-	1379	4	Intergenic	novelGene_41543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	91.1201892496328	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	335	937	379725	375835	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLRRATAPVPTVGEGYGYGHESALSQASAAARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	380059	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_375997_376140_376521_379664
770379	SIRV2	-	314	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	345	2958	-345	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTGATAGAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
770384	SIRV6	+	340	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3162_10721
770386	contig_6862_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_63755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAATTTATACATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106256	107952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_106300_108000
770387	contig_7915_pilon	-	1514	7	Intergenic	novelGene_42984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	392.173431022552	57	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	167325	154756	TRUE	45	GGCATTATAACAGTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEGDRKPCAGSAAILGQPEEDPEGASGAVATATATAATGSTSPRPARVPAGPRPTAPASSLSASAFLFLVLTPPSRPESCPATSNPPVPPWQLHRTTTLTSLNILLLGTWE	167327	141489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_148028_154716_154771_155911_155971_167063
770390	contig_14661_pilon	+	1903	13	Intergenic	novelGene_47440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAGTAAAAGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46119	68709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_+_46260_46801_46996_47430_47571_48278_48387_49116_49221_49761_49862_49948_50101_63314_63410_64388_64488_66232_66322_66528_66620_67392_67447_68172
770396	SIRV6	+	355	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	19	409	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770398	SIRV6	+	419	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	461	-2	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
770400	SIRV1	+	238	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGTTACCCTAGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6451	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
770401	contig_211_pilon	+	2503	17	Intergenic	novelGene_129857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCGGAGAATCGCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77459	153069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_77843_80547_80608_81081_81185_82162_82306_86086_86238_87062_87191_87563_87739_90156_90368_90933_91074_91424_91571_92393_92500_92982_93222_95860_95992_96864_97075_97505_97613_125023_125076_153051
770405	contig_10003_pilon	+	2505	1	Intergenic	novelGene_88159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAAAAAAACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384693	387198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_384700_387200
770406	contig_854_pilon	-	1383	11	Intergenic	novelGene_36428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	143.076343257717	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	478	1215	1074187	1064774	FALSE	45	AAAGGCAAGGTTGAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKKEIAEMRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081832	1064605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1074587_1074639_1075239_1075395_1075806_1075892_1081657
770410	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770413	contig_2854_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_120892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTACACAGACTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138949	1136637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1136600_1138900
770414	SIRV4	-	205	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	409	3	-409	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTATCGGCGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
770416	contig_9646_pilon	-	3471	1	Intergenic	novelGene_117423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGCCAAACTAAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115858	112387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_112400_115900
770419	contig_20058_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_109288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGAAGGTGCTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42702	44209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_+_42700_44200
770423	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	3	405	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770425	contig_8020_pilon	-	1392	10	Intergenic	novelGene_114360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	145.094605152791	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	380	925	106472	104794	TRUE	15	CCTCTCCTGTCTCAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASAGAPRGLLLRKLPEAYARKRWSPGRGWGVGGLGLGDPGRTETWATTSLSRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107182	101059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_101444_101870_101953_104792_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106999_107130
770428	contig_3825_pilon	-	1247	8	Intergenic	novelGene_78012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	906.04980265875	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	426	965	1465317	1462075	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470995	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1467912_1467975_1469010_1469125_1470880
770433	contig_9185_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_166907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	841	1146	430150	429845	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPITTVFKAENVSAIVLEDTVTKGRNEAVCALERVTTGAGCGLESRMECPNNRIVNIHKTLSHIGSLVLLYLWSQGAWQVGSEGGLTRPLCEERCPLPDA	430990	429688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_429700_431000
770439	contig_11512_pilon	+	313	2	Intergenic	novelGene_43234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	2	313	3998	4539	FALSE	20	GATGCCGCAGTTTATTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGQQDGATDSVPRVPVALGLCGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAE	3996	4539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4289
770440	contig_6710_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_89203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
770441	contig_14722_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_110206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAACGTGTGGGTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39023	37093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37100_39000
770442	contig_2036_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_131859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTTTCTTTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693868	695918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_693900_695900
770444	contig_6217_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_109629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAAATGGTAATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452889	451724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_451700_452900
770445	contig_934_pilon	-	2190	2	Intergenic	novelGene_129023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152087	148392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148669_150173
770446	contig_1225_pilon	+	2239	2	Intergenic	novelGene_44204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	147	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274514	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_275959_276003
770447	contig_753_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_112903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277351	275224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_275200_277400
770449	contig_12250_pilon	+	1667	12	Intergenic	novelGene_80556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	65.5847190426309	84	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	408	1145	275404	278399	FALSE	40	AGAACCACTGAAAATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272526	278921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272651_272799_272856_273020_273132_273484_273580_275382_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
770452	contig_312_pilon	+	1410	6	Intergenic	novelGene_128305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	272.831816326469	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	78	686	402673	424719	FALSE	35	TTTAAGATGTAGACATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVAAGARRAVEFKPRESGTAAGALSMARLVLSLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKVATALKDIVKVGAVDADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRAEDYQGGRTAEAIVDAAISAVRQLVKDRIGGRSGGYSSGRQGEMEEFGLQTEKALQAKGAGIRGQNKEEIWITFWPVSGNWPTSRRKFYING	402595	425443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415_409558_414598_414657_415103_415231_424174_424282_424563
770453	contig_8050_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_114841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTGTTTCCTTATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343164	344464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_343200_344500
770454	contig_16951_pilon	+	1781	5	Intergenic	novelGene_98648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	276.134478108041	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGTTTAATTCAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85840	107898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91172_91463_103952_104099_106692_107203_107251
770455	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
770456	contig_8570_pilon	+	1667	3	Intergenic	novelGene_120159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1084	junction_2	10.5	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	1215	1667	343215	361834	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAGNDTLYTINFYWSAHLAWLNFKDYFVPSSLLLYHT	342000	361834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_343346_347293_347376_361594
770458	contig_253_pilon	-	1563	4	Intergenic	novelGene_129738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	11.323525167642	127	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	161	889	648817	646916	FALSE	25	CATATTAAGTTGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREIDNFYPERFIYHNVRLWDEESAQLLPHWKETHGFIEAARAQGTRVLVHCKMGVSRSAATVMAYAMKQYGWSLEQALQHVQELRPIARPNPGFLRQLQTYQGILTASRQSQVWEQKVGGVFSEEPLAPEVSAPFSIPLQEPGGSGEVKAMGLEESEAATKEEPGPRPRINLRGVMRSISLLESSSELESASEAADLPEVFSSNESSDQDPPQPFPQPSKANTGWGDRRGRKGPWPALKSRQSVVALHSAALVASRTQAFQGQELGEAGCPSTPRIRKVVRQASVDDSGEEEEA	649115	646241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_647204_648276_648551_648650_648852_648989
770459	contig_13112_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_98820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTTAAATCTGAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211404	210722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_210700_211400
770460	contig_16831_pilon	-	1731	1	Intergenic	novelGene_134793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCCAGTGCCTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382047	380316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_380300_382000
770461	contig_4876_pilon	-	1298	9	Intergenic	novelGene_137877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_7	137.582645617098	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	168	1298	93277	14787	FALSE	15	GTGAGTAATGTCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEMWTPELAILRGFPTKAERQQWKQEGIVGSESGSFLQLLLEGSYESIFLNSVTQNILNAMTIAEEGIDSYLEKQIVTFLDYSTDLEKSERQQLIFLLGVSSLQLFVQSNWTGPPVDLHPQDFLPSVLFQQFSEAKGLDAVVLSLLILDGESVYSLTLKPILLLLARVILVNVRHKLTAIQSLPWWTLRYVNIHQQLLEERSPQLFALAEYCIDQVMKLENLFVDDSGRYLAVQFHLECAYIFLCYYEYKKAKDQFNVAKNIGKLQINLTGALGKRTRFQENYVAQLILDVRREGDVFPGYELSPAPTPQEHLTNNFELNDDTVLNEIQLADCEQFQMPDLCAEELAVILGVCTNLQKNNPVHKLTEVELLAFTS	93444	14786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_14854_19822_19936_28267_28402_30828_30994_44904_45008_52282_52424_88582_88713_91581_91760_93177
770463	contig_8138_pilon	+	1369	6	Intergenic	novelGene_52415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	219	701	280295	306552	TRUE	0	TCTTCCTTTCTTTCCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306972_307269
770466	contig_19769_pilon	+	803	5	Intergenic	novelGene_102296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1613.15227117591	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	14	781	87249	89322	FALSE	10	GTTCTCCTGCCACTTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87235	89344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87381_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
770467	contig_5428_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_160403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38976	40921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_39000_40900
770468	SIRV6	-	131	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAATGCCGTTTCGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	11051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11109_11205
770470	contig_1143_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_86640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370562	1369176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1369200_1370600
770471	contig_12050_pilon	-	1686	6	Intergenic	novelGene_62739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	135.878769496931	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	134	538	696748	686686	FALSE	20	TAAATTGTGGTCATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKRSTGN	697301	685537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697194
770480	contig_14526_pilon	-	2017	5	Intergenic	novelGene_111219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.282890519352	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	12	470	391034	377123	FALSE	15	CCCTCGATTGTCAGGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHADADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLITILDHLYSCRFGTFLYNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTSKPFPNDAPCANSLLSGNLAPSSISE	391045	375575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_377205_381547_381625_384951_385066_386093_386187_390941
770485	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	0	1154	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770490	contig_8866_pilon	-	1523	10	Intergenic	novelGene_77885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	29.9851815253987	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	91	1062	1023553	1009538	FALSE	30	ATTTAATTCTAACTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSHAVLMRLVASAYSIAQKAGMIVRRVLAEGDLGIVEKTCATDLQTKADRLAQMSICSSLARKFPKLTIIGEEDLPSEDVDQELIEDGQWEEILKQPCPSQYSAIKEEDLVVWVDPLDGTKEYTEGLLDNVTVLIGIAYEGKAIAGVINQPYYNYQNNEKQKLREQRAEAKAGPDAVLGRTIWGILGLGAFGFQLKEAPAGKHIVTTTRSHSNKLVTDCIAAMNPDAVLPVGGAGNKIIHLIEGKASAYVFASPGCKKWDTCAPEVILHAVGGKLTDIHGNGLCYNKEVKHMNSAGVLATLRNYDYYASRVPESVKNALVP	1031181	1009076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1009687_1010841_1010948_1013227_1013426_1016169_1016215_1017318_1017411_1018918_1018968_1020870_1020979_1021671_1021777_1023433_1023562_1031099
770491	SIRV2	+	536	4	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-363	340	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTAGTCCACGCACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3670	4797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4338_4480_4686
770494	contig_6217_pilon	+	1729	13	Intergenic	novelGene_109620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	589	939	450407	452388	TRUE	20	AGCATGCACCCTTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSVSVNQAESCCSCLFCSSISTSCSLRLSFHTLHPERLPSRIQQGHLLLNLKLLFICQSSLCDQLVSRLQDTPHTALVCSQLHHKRFMDCKLVFDFFNIIRNVVLLLEGVLSRE	435487	467058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_435611_439645_439818_446013_446117_448529_448650_450336_450490_451199_451380_452300_452506_458988_459081_463053_463217_463889_464006_464380_464556_466587_466671_467014
770500	contig_3382_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_123991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTATTTACATACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60152	59098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_59100_60200
770505	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	16	354	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14424	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
770506	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_97895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTAATCATACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653786	653408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770507	contig_6364_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_51780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	6.5	358	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTATGTGGTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101377	1090619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1091500_1099429_1099587_1100102
770509	contig_13744_pilon	-	2258	14	Intergenic	novelGene_77188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	1920	2258	739339	732013	FALSE	35	ACATCTCCAAGAAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWPILSRQLRGWINLKKKAENTGFLEDKDLEAKENPSKILPMYRRSFSDSFWLLYCLGAVQPYSPSPGSSSFKTVSYLDRVSVAYISSSSSSRAPTPKAWPEIPSFLPLLSP	761164	732012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_732051_733055_733204_735924_736007_739268_739498_741271_741569_742559_742746_743023_743152_743963_744095_744454_744627_749299_749519_751190_751299_753453_753550_757760_757910_760889
770510	SIRV2	-	647	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	35	4	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACGACGACGTCGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
770511	contig_10734_pilon	+	1365	7	Intergenic	novelGene_51306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	330.577987100708	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	814	1164	1378305	1388936	TRUE	5	GTGTGGGTGTCTCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368795	1389499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369296_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739_1389026_1389387
770512	contig_2227_pilon	+	1000	3	Intergenic	novelGene_142333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3432.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	105	479	230510	231819	TRUE	25	TTGGCATTTTAACCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230405	232753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230517_231451_231999_232411
770514	contig_5947_pilon	-	2003	2	Intergenic	novelGene_101533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1399	1824	537839	536172	FALSE	20	TTTGTTAATGTTCTTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVRGRVLHNRRRPTCITNSLRRGRPRSVRSMYSGSFSFFACWIWASLLIGFIPWPYSGPVCSLTMDFVFFLILGFTRSTVGRGGNFFSSSRTAIAAFFFEIFLLFPSPSPMNCPTDTLVTKLFMWGGPLSRATCFRGKD	539237	535992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_536407_537648
770521	contig_6954_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_64457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAGAATTTTCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769343	768567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_768600_769300
770528	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	0	1165	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770529	contig_1009_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_121781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCCAGCTGCCATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314802	312770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_312800_314800
770530	contig_3774_pilon	-	1369	11	Intergenic	novelGene_142046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.50985628263	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	207	1187	210407	144735	FALSE	5	GTTGCCTGTGTGTTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLFEGDHLLIC	210613	144552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146402_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
770531	contig_6102_pilon	+	1374	6	Intergenic	novelGene_32013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	8.18779579618349	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	418	1053	475084	478956	FALSE	10	TCTGCACTGGACTCCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTETFVKDIKPGLKNLNLIFIVLETGRVTKTKDGHEVRTCKVADKTGSINISVWDDVGNLIQPGDIIRLTKGYASVFKGCLTLYTGRGGDLQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPEYSAQQAPNKAVQNDSSPSAPPPTTGPPAASPASESQNGNGLSTPPGPGGGPHTPHTPSHPPSTRITRSQPNHTSAGPPGPTSNSVSNGKETRRSSKR	474666	479277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_475163_475568_475708_475818_475891_476065_476148_476240_476305_478756
770538	contig_10235_pilon	-	661	3	Intergenic	novelGene_46387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_2	144	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	19	369	172699	168920	FALSE	30	CTCCAAAATATATTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLVMKSLVFGKFAVINREAPPPLELPKYLRCYRCLFETKELGCLLGSDTCLAPRGGSCITLHIKNSSSTDIMVSDCRRKEQMSDCSYTRTSPVFGFWMYSRCCFLDFCNDPQSRAIYNP	172717	168627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_169084_171276_171445_172680
770539	contig_9390_pilon	+	1216	6	Intergenic	novelGene_153085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	9.89949493661167	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	21	899	811737	861905	FALSE	45	ACTAATAAAGTATATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSMRSLFTDHRRYAESFRRFLNNSTEHQCMQEFMDKKLPGIIARIGDTKSEINILSIGGGAGEIDLQILSKVQAQSPGIHINNEVVEPSAEQITKYKELVAKTSNLENIKFTWHKETSSEYQNRMMEKKELQKWDIIHMIQMLYYVKDIPATLKFFHSLLATNALILIIVVSETSGWDKLWKKYESRLPRDDLCLYVSSSDLTQMLDNLGIKYKCYDLLSTMDISDCFIDGNENGDLLWDFLTETCNFNTTAPPDLKAEIMKDLQEPEFSVKKEGKIFFNNNLSFIVVEA	811716	862222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9390_pilon_+_811874_822859_822913_847417_847526_848540_848672_853874_853969_861549
770540	contig_14768_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_115071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTAGAGGTTCAGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11386	9976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_10000_11400
770541	contig_12327_pilon	+	1350	7	Intergenic	novelGene_140674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_5	61.2798680010183	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	23	400	1124059	1132894	TRUE	35	ACAAATGTTTTATGGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFRGGGAMTTLRAFTCDDLFRFNNINLDPLTETYGIPFYLQYLAHWPEYFIVAEAPGGELMGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERHSHDAVLGWWRFKSTQRCLGRKA	1124036	1137646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1131157_1131801_1131938_1132821_1132998_1136332_1136479_1136945
770548	contig_6270_pilon	+	1468	9	Intergenic	novelGene_99801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	394.813880201798	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	80	1012	27433	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27353	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_45713_46896_46935_47302
770553	contig_14953_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_137295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCAAGCCTTGTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330091	330295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_330100_330300
770555	contig_5936_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_53557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAATGAAAAAATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133944	134833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_133900_134800
770559	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_97889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAATCATACTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653707	653407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
770562	contig_6710_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_96392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653364	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
770565	contig_3394_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_152695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481009	479703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_479700_481000
770567	contig_12709_pilon	-	865	6	Intergenic	novelGene_147398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	606.712913988156	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	291	773	33720	29115	FALSE	15	CAACTGTGTGTCTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59060	29022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_57378_57450_58929
770571	SIRV4	-	594	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	3	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
770572	contig_11493_pilon	-	2526	1	Intergenic	novelGene_143671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAATTTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148042	145516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_145500_148000
770576	contig_13456_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_153295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCTGAGAAGATAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339230	340961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_339200_341000
770580	contig_5084_pilon	+	1952	2	Intergenic	novelGene_64598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	0	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTGTGTGTGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954915	963674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_955130_961936
770583	contig_11416_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_145349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCCTTTGTTCATTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187626	185297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_185300_187600
770584	contig_1443_pilon	-	2150	11	Intergenic	novelGene_28345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.336585158097	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	1	1350	906459	896718	FALSE	0	GTTGTTGTTGTTGTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESVSSCHLLPGHQWLPTSYSLVSRSCISKTLVHGDP	906459	895917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_896822_898805_898936_899547_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340
770586	contig_14341_pilon	+	2246	5	Intergenic	novelGene_111780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.7224845011376	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	203	1858	316386	328668	FALSE	30	ATGAACTATATATTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVEAQLDPHADLLPDGEGDSNPLRKIEVAEVLTLNQEAARSRNAQIRALYAEDGGLNSELPGEPAGQPGEHSADPEAARQRFRQFCYQVAMGPQQALAQLRELCHQWLRPEARSKEQMLELLVLEQFLGVLPRKLRTWVESQHPADCQEAAALVEVVTWISTEEALPSQGPASSLEITDWQEEEKEEKVADCPAKELPEEAVTFQDVAVDFSREEWKLLGPTQRTEYRDVMLETFGNLVSVGWETTVESKELTPTPDASEQEPTHSLKVDESSKGGPMSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSAIFQHLRTHTGAKPYPCGDCGKAFRQSSHLVRHQRTHTGERPYVCNKCGRAFNQSSHLIGHQRTHNRGLCKKKVKKKPLTS	313798	329056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_313924_316308_316885_320823_320928_324492_324620_327742
770588	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
770589	contig_7426_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_27478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGAGAAACCTCCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641700	640953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_641000_641700
770590	contig_12270_pilon	-	327	2	Intergenic	novelGene_113578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	16	327	14385	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14400	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
770592	contig_10626_pilon	-	1292	7	Intergenic	novelGene_138194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	99.5757667976167	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	147	878	197995	59098	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAAAVVRAARRRGGLALSLLLPPGLPLPAVLIFRCRWDPESSPVPSTMPPKKGGDGIKAPPIIGRFGTSLKIGIVGLPNVGKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKW	199475	58683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
770593	contig_3095_pilon	-	1200	5	Intergenic	novelGene_75260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1322.24288615973	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	87	884	255481	246716	FALSE	50	TCACAATTAAACATAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGKELWREPGLLH	255567	246399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247834_247970_248476_248759_253535_253806_255384
770595	contig_10311_pilon	+	970	4	Intergenic	novelGene_50402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACTGAAAAGACAGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65124	71548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65920_70279_70360_70448_70493_71497
770597	contig_10148_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_172872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	690	1031	323158	322817	NA	30	GTAATGTCACTGATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHLGHGDSEVRLAASKNQFLLTRQVFCQHCQPGQDFISVNNHNPLLDLAGEPTYSHNAFIFILAAYLKISAWVPQKKKGTSVITGPESLSPSFLFHPPSSLSSTLDTPPGY	323847	321685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_321700_323800
770598	contig_8122_pilon	+	2915	3	Intergenic	novelGene_40228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_1	4.5	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	179	934	577009	583575	FALSE	10	CCCAGCTTCTCCTCCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGSYKNRHSSGDPSAEGPSSGGSISKLSSEMQLQVQSQQEELERLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCDGVPKDTLELLHQKDDQILGLTSQLEKFNLEKENLQQEVRKLKSKVGEVNEQLGMLMETIQAKDEVIIKLSRQLSECEGNPSSPAALPGSPSTTLASRDQLELDRLNDNLQGYKTQNKFLNKEILELAALRRNAERREKDLMAKVSKGGYVLLSGGRYDEETILKWTCSKIS	576830	585556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_577171_577889_578286_583377
770603	contig_8907_pilon	+	1986	3	Intergenic	novelGene_85790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	44	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	492	1196	88680	96198	FALSE	30	CACTTCACTCCCACAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPEIFYCKVTGQKENCPEGFLASKAIPHFEKISCFQQTLDPVDEVAALLAATIHDVDHPGRTNSFLCNAGSELAILYNDTAVLESHHAALGFQLTIRDDKCNIFKNMERNDYRMLRQGIIDMVLATEMTKHFEHVNKFVNSINKPLALLEENRETDKDQEAINTMLRTPENRILIKRMLIKCADVSNPCRPLEFCIEWAARISEEYFSQVRCCFLSSLYVKGLLPVPTYQTR	88188	96988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_89012_90860_90994_95958
770604	contig_19606_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_148264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACTGAAGCCAGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19679	20311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_19700_20300
770605	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
770606	contig_11708_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_138989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGCTTTTTCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393338	394697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_393300_394700
770607	contig_8866_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_77804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	360	53	412	417311	417670	NA	10	GCAGCTTCTGCTTTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLWYRKSTQDSTEQAEELRASPWYSFQMWPAHPSTHHLKGQGRPEASQVLSQIVPSDSPVRGAFQKVMKEDVTHRSKRTTGLSKKPVCKQKGSPQIYTEDKPHFASSVSFSTCLCLFRL	417258	417671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_417300_417700
770616	contig_18637_pilon	+	2813	9	Intergenic	novelGene_81841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	21.0293693438486	58	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	203	994	121657	131150	FALSE	40	AGTCAATTGAAAAATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQDLEKELGIKHSLHRKKLQLALQALGSEEETNHGKLDFNWVTRWLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRMLHYMTVDDLLSLKVVSVLHHLSIKRAIQVLRINNFEPNCLRRRPSDENSITHSEVQQWTNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVLEPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHFNLLVGVEAQQQKRDAMELPDYVLLTATAKVKPKKLTFSNFGNLRKKKQEDGEEYVCPMELGQTSGSASKKGFKAGLDMRLYDDDDLDRLEQMEDSEGTVRQIGAFSEGINNLTHMLKEDDMFKDFAARSPSASITDEDSNV	120626	132969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_120649_121360_121473_121588_121678_124815_124939_126112_126239_127204_127394_129755_129936_130853_130920_131063
770617	contig_10341_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_47221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACTTAGCTGTGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64314	65367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_64300_65400
770622	contig_1575_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_45184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGCTACAATTCAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157551	159772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_157600_159800
770624	contig_10258_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_155048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCACAATCATTGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94827	95733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_94800_95700
770640	SIRV6	+	316	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_10682_10819_11031_11109_11205
770641	contig_5210_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_65448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAGCGCATTTAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605759	608138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_605800_608100
770644	contig_15866_pilon	-	2357	1	Intergenic	novelGene_63608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353586	351229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_351200_353600
770648	contig_7321_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_53130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAAACCAGTTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153237	153700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_153200_153700
770652	contig_15172_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_158771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAATACATGTTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272001	272455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_272000_272500
770653	contig_15422_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_173111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCTGAGCTGCCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82655	84519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_+_82700_84500
770654	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
770656	contig_11574_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_64045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGTTGGAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373338	374475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_373300_374500
770658	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	180	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770662	contig_1443_pilon	-	3238	1	Intergenic	novelGene_28371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCATTGAAAAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997093	993855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_993900_997100
770663	contig_12250_pilon	+	1577	3	Intergenic	novelGene_80652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	313	939	376002	377713	FALSE	20	CCTGCACCTGGAAGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFKGERRKRGEEAGGSSRLGDGVAACFSKCRAKACSICTVIRLCGVWPGSGLSSQKFKVTWNLGRGPKPWIYLLTSAEVGCFEELHALITGQQMWAWTRWGLGCIPGDGDGAEALHEEALGVAGHQDAPLELAQQALCGLQWVRLGENHLLHADLGARGLSHKAAVEAVHLGLPNHTPAVDEGEQQRVVWGQRTAQLYLALRELAS	375689	378351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_376120_376268_376375_377310
770669	contig_15570_pilon	+	400	3	Intergenic	novelGene_137844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4	336	518346	555878	FALSE	25	TAAAGCTGTTCTTCCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMSKGLGSAYNRAQPSLLLFCLFSLAFFLSLLGSSIFSQLFMLHEEIFPVSESFPDLVPFVDSLDFEGSNVLDSCNGQGTVLQHELDHFMALTKQSIVKGCLTSLHCSPSD	518342	555942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_518436_539344_539555_555845
770670	contig_15570_pilon	+	290	2	Intergenic	novelGene_137848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTGAAATGATGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633267	652743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_633436_652621
770675	SIRV5	+	357	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	149	48	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
770676	contig_14516_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_153896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTCAATCCCCTTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53149	53862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_53100_53900
770679	contig_6710_pilon	-	452	2	Intergenic	novelGene_98173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
770680	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	3	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770681	SIRV4	-	242	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	372	3	-372	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTACGGGTGCAAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
770686	contig_13744_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_77177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648836	647136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_647100_648800
770687	contig_20646_pilon	+	1542	11	Intergenic	novelGene_145017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	213.953639838167	47	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	35	1324	25749	40819	FALSE	0	CCCTTCTGTCCTGCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIQRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	25714	41037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_25752_31252_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37740_38312_38470_39122_39278_40684
770688	SIRV6	+	417	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	536	9	357	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770689	contig_1863_pilon	-	2206	9	Intergenic	novelGene_156532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	171.826902361068	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	51	995	81194	68179	FALSE	20	TGTGCTTGTGCTTCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDYQGLVVDIEARLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIDADILDITGPESQPDSLEVNGNKLRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSENSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKDSMTEYTAAEEKEDGRRWRLFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKSEQ	81244	66967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_68231_71638_71738_71837_71925_73209_73342_74067_74171_77381_77559_79249_79427_79924_79993_81144
770690	contig_10299_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_79778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATGCTTACGGCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648680	649501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_648700_649500
770691	contig_10299_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_79780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAATACAGCTCAGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651611	652152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_651600_652200
770692	contig_3627_pilon	+	1296	3	Intergenic	novelGene_78550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	20	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	51	539	681063	698948	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVPGLLLAPVGPAASMSLPRCALWWARHPAGRQAGHRATVCSALRAHVRPLPGAVGRVPAVAAASSSASGGSKAPNTSLFVPLTVKPLGPSADGDVGAELTRPLDKNEVKKILDKFYKRKEIQKLGADYGLDARLFHQAFISFRNYILQSYSLDVDIHIVLNDICFSAGKCVEFVFF	681012	699705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_681337_698032_698111_698811
770694	contig_1719_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_87349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAGAAAGAATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678263	680254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_678300_680300
770702	contig_3525_pilon	-	1562	5	Intergenic	novelGene_135114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	58.1866608424989	9	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	231	560	50654	32589	FALSE	40	ATATGTAAATGATTATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVHHRCWCLTLPLPGHLHLDASGRTAPLPHCEKPDRSQLLQRVETNEKAHVPCGLRSSGCDFGNFCSIQTSPLLNMCPLLAPLRQRIYMDLPWTCVHHLLYEFGFLSDDILDCEKQTHLAQRGCVYPPEHKVWKQYRKWFRGIRKFRAESEMYMLSSRVVSDSSKPSVENYDEQLNQMILSPGK	50884	31586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_32640_39533_39645_41774_41867_42220_42288_50645
770704	contig_15236_pilon	+	1263	2	Intergenic	novelGene_141568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	599	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1074	190	1263	419232	426621	FALSE	25	CCTGAATCCAGAGGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVSGAESDRFPASSVFNEMNSCVFGLPHDAQFKGGSILEHKPIKIETNRECLEREGTHHTCKYAQSSLLVSLGSEFSSGPSPVLSLQITPDSQLLL	419042	426621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596
770705	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
770707	contig_5620_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_161337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTTCATTTCAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173649	174245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_173600_174200
770717	SIRV6	+	151	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	794	51	794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11031	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
770720	contig_253_pilon	-	2249	18	Intergenic	novelGene_129746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_9	146.520402585109	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	182	1330	679264	674518	TRUE	20	TTGTTGAATTTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMAVELPDSFSPELRSLLGGLLQRDVNRRLGCLGRGAQEVKESPFFRSLDWQMVFLQKVTEQVAGPGGQPVASPQPDANPYSRSTLPR	680673	673092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_673304_673391_673506_673757_673895_674060_674678_675192_675294_675610_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641
770725	contig_5588_pilon	-	1532	4	Intergenic	novelGene_172848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	10.1980390271856	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	26	529	1077373	1064415	FALSE	55	AATTTCTATAAATAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGPGGRIMWWIPGSQQSVELLQVDLRLWSPRLWMWQRQELCWQRRVPALPLGTYSLRCMRSGRHRGCQDYLQVSSLEWQRSVWGVSSFLVLTTKLAACCWDLAERPHESEAAQHPRLSKKGTAVRTISLPMSSCPPFEQNTVLKSNSAKITTLRMCPLWYRLAGMKSSACVPES	1077398	1063411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328
770726	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	80	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
770730	contig_8045_pilon	+	1399	5	Intergenic	novelGene_35365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	1187.08516438375	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATAAATAATGTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116041	119398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116239_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
770732	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	878	-45	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
770735	contig_15888_pilon	-	1187	6	Intergenic	novelGene_84444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1874.09288990701	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	59	400	259726	252829	TRUE	15	ACTCCACATTTCGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEWVPLLCQRLPGHRGRGPRASHHHLHLREAVEARGGPGR	259784	251604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253487_254497_254685_259659
770736	contig_7839_pilon	+	2167	14	Intergenic	novelGene_45713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	18.9823960802304	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	193	1563	922840	928945	FALSE	10	CTTTTTTTTTTAATCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATMYFTTRLDKSHNVSLDTAEVNKDIQASAPPAAPSTERSSLSATFNNVMTLCAMLPLLLFTCLNSFLHQRIPQSVRILGSLLAILLVFMITAILVKVQMDALSFFVITMIKIVFINSFGAILQGSLFGLAGLLPISYTAPIMSGQGLAGCFSSVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPHLKFYRYYQQHKLEGPGEQETKLDLISKGEEPRAGKEEPRVSAPNSQPTSNKPSVRAILKNISVLAFSVCFVFTVTIGLFPAVSAEVKSSIAGASAWGNYFIPVSCFLTFNVFDWLGRSLTAVFMWPGKDSHWLPSLVVARVVFVPLLILCNVHPRYYLPVVFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLCMCYGPKKVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV	919487	929549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_919525_921685_921787_922785_922869_924883_924966_925081_925285_925381_925522_926103_926239_926332_926431_926575_926655_927080_927179_927429_927539_927758_927845_928236_928437_928833
770737	contig_16126_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_141882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	320	670	65837	65487	NA	15	GACCTGTTAGGGACGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEYWWFSGRILASHSAGLIPGQCISCTATTHLSVRLAGFSGASRLRQASRKKGLAICFRKAANENPRIKTVQSPTDHGMAWNQTAFRSVVREVTMSWGPARQQLTTTEIHTLPA	66156	64440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_64400_66200
770738	contig_2739_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_165835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAACAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205273	203274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_203300_205300
770739	contig_12638_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_33248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTATCTCAACTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764590	757710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_759409_764042
770740	contig_2093_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_152998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAATAATAATTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411699	1411244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1411200_1411700
770744	contig_11846_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_105996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404446	402733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_402700_404400
770748	contig_7004_pilon	+	1046	2	Intergenic	novelGene_126459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTATGCTCTGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358854	360057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_359855_360011
770749	contig_7004_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_126460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGCCCTGTTTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360057	361073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_360100_361100
770750	contig_253_pilon	-	761	7	Intergenic	novelGene_129680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_6	436.090204735977	11724	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	54	686	421711	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421764	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
770751	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	416	6	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
770753	contig_6227_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_49705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTGACCGAGATCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147147	1146467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1146500_1147100
770754	contig_14441_pilon	+	804	5	Intergenic	novelGene_100477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	221	769	125667	126705	FALSE	0	GCCTGGCCGTGTGTCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVRQQLGTDPQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	87305	126740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_87326_121639_121691_125517_125902_126159_126283_126514
770756	contig_5643_pilon	+	1867	4	Intergenic	novelGene_39145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	25.8499946271217	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1060	1395	655110	655922	TRUE	40	CCTATAAACATAATTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAFPQVGKTYELLNCDKHKSMLLKNGRDPGEVRPDIAHQSLLMLMDSPLNRAGLLQVYIHTQKNVLIEVNPQTRIPRTFDRFCGLMVQLLHKLSVRAADGPQKLLKVRY	654050	656781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_655233_655340_655483_655851_656145_656531
770757	contig_2278_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_118132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATCCCACCCAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031138	1030785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1030800_1031100
770764	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_93678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653844	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770767	contig_9739_pilon	+	1175	4	Intergenic	novelGene_165093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	99.7496867163	2630	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	126	401	204183	204458	TRUE	40	AGAAAGTAAGGACTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRVCPRYSRASRRPNPTPIRLRDDPGQPRFTLYLIFPVHTMDTSPRSGRSLPGGAGFQWLTCEGRSWPLAPLPAAPDPRAQAPHPCLAVQPGPGVECLEARGSLSPCRPEGRWFQRYPGPVISALFPGPEL	204057	234651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_204672_206141_206286_224819_225015_234429
770769	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_17314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
770772	contig_6873_pilon	-	2899	6	Intergenic	novelGene_129832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	92.828013013314	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	12	761	596050	520971	FALSE	70	TCACATTAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RETMMAAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVSNEQRQHAEHIFLSFRKSKSPFAVCKHILETSKVDYVLFQAATAIMEAVVREWILLEKGSIESLRTFLLTYVLQRPNLQKYVREQILLAVAVIVKRGSLDKSIDCKSIFHEVSQLISSGSPTVQTLACSILTALLSEFSSSSKTSNIGLSMEFHGNCKRIFQEEDLRQIFMLTVEVLQEFSRRENLNAQMSSVFQRYLALANQVLSWNFLPPNYILLSTE	596061	518832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_521148_521907_522025_547917_548057_553144_553287_559119_559226_595981
770773	contig_12429_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_136219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCATCGCCTACTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329984	327963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_328000_330000
770779	contig_6110_pilon	-	1711	8	Intergenic	novelGene_163275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_7	5.48839220351387	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	57	791	341275	337974	TRUE	30	TCTTAAATAATTGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAQFRSPGAVVQGLRRVMASPSRRLQTKPVITCFKSVLLIYTFIFWITGVILLAVGIWGKVSLENYFSLLNEKATNVPFVLIGTGTVIILLGTFGCFATCRASAWMLKLYAMFLTLIFLVELVAAIVGFVFRHEIKNSFKNNYEKALKQYNTTGDYRSDAVDKIQNTLHCCGVTKYTDWEDTKYYSEQGYPKSCCKTECSSTRDASKVNSEGCFIKVMTIIESEMGVVAGISFGVACFQLIGIFLAYCLSRAITNNQYEIV	341331	336695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_337578_337935_338043_338668_338753_339061_339194_339429_339529_339805_339881_340131_340321_341188
770789	contig_9505_pilon	+	1868	14	Intergenic	novelGene_121825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	41.6161666356211	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1081	1707	423416	447348	FALSE	20	CCCAGACACGCTGTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404080	447509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419604_422552_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
770790	SIRV6	+	339	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	673	-1	-83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAATCGCACAAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
770791	contig_8120_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_159714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29742	28509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_28500_29700
770793	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770799	contig_8616_pilon	+	2729	9	Intergenic	novelGene_72539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	19.0849253338859	36	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	87	2705	410601	424565	FALSE	40	AAGCTGCTAGTTTAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDSDVESLPRGAFRCCLCRITTANRPSLDAHLGGRKHRHLVELRAARKAQGLRSVFVSGFPRDVDSTQLSEYFQAFGPVASVVMDKDKGVFAIVEMGDVGAREAILSQPQHGLGGRRLRVRPREQKEFQSPAFRSPRGAAPDSHQLARALAEVPDVEAQMVKLVGLRELSEAERQLRSLVVSLMQEVFTEFFPGCVVHPFGSSINSFDVHGCDLDLFLDLGNLEEPQPAPKAPESPSLDSALASPVDPQALACIPASPPGSQPPASPQDSEALEFETPSSSLAPQTPDSALASETLASPQSLPPSSPLQEDRGEGDLGKSLELAEALNGEKTERGAMLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410514	424589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412295_419168_419485_419854_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
770800	contig_2940_pilon	-	931	12	Intergenic	novelGene_81926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	94.981163856858	1174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	170	787	613834	595880	FALSE	20	CTAAGTGGTGTTAACGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFHEQDGKAGLFSQEQNEKAKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSESRDEDQHPRVTRKRRQSPGAGQSHRNSSPGAEHGKPDISKDELQLYEDVPGEMVPSGESGLRQRGSDPASGEVEASPLRRVNIKKDDEFFHFVLLCFAIGALLVCYHYYADWFISFGVSLLTFASLETIGIYFGLLYRIHDVLQGFIPLLQKFKLLGFRRTD	636671	595735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_595900_596704_596768_597258_597334_597738_597811_602034_602083_602447_602481_603102_603139_605244_605299_607090_607181_613707_613843_614467_614549_636591
770810	contig_19145_pilon	+	2829	18	Intergenic	novelGene_164137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_17	20.3241891439698	69	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	1518	2741	118228	124764	FALSE	25	GCAAAGATCTCAGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWQSVPPEDNLPTCQWGDTFAVSEVKMLEKQTSPPDYLTEAELITLMEKHGIGTDASIPVHINNICQRNYVTVESGRRLKPTNLGIVLVHGYYKIDAELVLPTIRSAVEKQLNLIAQGKADYRQVLGHTLDIFKRKFHYFVDSIAGMDELMEVSFSPLAATGKPLSRCGKCHRFMKYIQAKPSRLHCSHCDETYTLPQNGTIKLYKELRCPLDDFELVLWSSGSRGKSYPLCPYCYNHPPFRDMKKGMGCNECTHPTCQHSLSMLGVGQCVECESGVLVLDPTSGPKWKVACNRCNVVAHCFENAHRVRVAADTCGACEAALLDVDFNKAKSPLPGGETQHTGCVFCDPVFQELVELKHAAACHPMHRGGPGRRQSRGRARGRRPLGKPSPRRPKDKMSALAAYFV	85307	124852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_+_85346_103652_103836_105264_105397_107153_107261_108406_108482_110247_110445_111823_111981_113661_113776_115400_115492_117041_117197_117320_117428_117969_118117_118213_118388_120463_120593_121100_121251_121776_121878_122383_122586_124282
770812	contig_10115_pilon	-	1612	5	Intergenic	novelGene_171929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.975623019209	6	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	5	427	20242	8576	TRUE	50	AACAAACAGAAATTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEEPESVLQLPPSTAVGGEGLTEVSPEAVTSEPPSSAAVSPGTEEPAGDTKKKIDILLKAVGDTPIMKTKKWAVERTRTIQGLIDFIKKFLKLVTSEQLFIYVNQSFAPSPDQEVGTLYECFGSDGKLVLHYCKSQAWG	20246	7321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_-_7907_7975_8636_9256_9320_15807_15945_20079
770813	contig_6102_pilon	-	1070	4	Intergenic	novelGene_32367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_3	65.7486797501584	1245	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	349	855	1715667	1715078	FALSE	10	CCCGTATTCTTTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAESLSFSFGTLSSWELEAWYEDLQEVLSSDESGGTHVSPPANEKEESKTFTTLDPACLAWLTEEPGPAEVTSSSQSPQSPDSSRSSLAQEEEEEDQRRPRKRKQSGQSQARAGKQRLKEKEQENERKVAQLAEENERLKQEIERLTREVEATRRALIDRMVNLHQA	1719221	1714862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1715447_1715529_1715688_1716395_1716444_1718941
770816	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1131	20	1131	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4027	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
770817	contig_6266_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_170977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAAACTGCTCCGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14031	12825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_12800_14000
770818	contig_19640_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_134854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATGGTTCATGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26277	27243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_26300_27200
770819	contig_4782_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_73682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTACCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674453	676424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_674500_676400
770821	contig_10446_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_162480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGGCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750815	751254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_750800_751300
770823	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
770824	scaffold_12124_pilon	-	1371	7	Intergenic	novelGene_22177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	89.4998448167494	296	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	65	1120	1368160	1229338	FALSE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARRLPLRGPGPRPQTPPPRVMGGSSGIRAPAAIDQVAPSAAGDSAVIARSLAPPFPRGEEGASARPRPQPRVVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1368224	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368003
770825	SIRV6	+	417	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	3	363	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
770826	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
770827	contig_4131_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_127847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCTTTATTACTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97875	95973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_96000_97900
770828	contig_9345_pilon	-	864	2	Intergenic	novelGene_24598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	218	655	945468	944755	FALSE	15	GAGAACTGTGTGTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945685	944545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
770831	contig_10002_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_157662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428054	429569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_428100_429600
770834	contig_6364_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_51807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTTTGCTTCAATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472285	1469951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1470000_1472300
770837	contig_8452_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_48118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATAACCTTCCACCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055361	1055135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_1055100_1055400
770838	contig_709_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_57574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCTGGAACTCAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2170062	2170623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2170100_2170600
770840	contig_15029_pilon	+	2835	1	Intergenic	novelGene_128218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCTCCTCCAGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261710	264545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_261700_264500
770841	SIRV5	+	346	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-16	875	-16	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8299	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
770842	contig_7426_pilon	-	1818	13	Intergenic	novelGene_27479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	66.7696600260927	3	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	21	1643	668289	642227	TRUE	35	AGGACATTTTGTCAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGPGWMMAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLISLGISLLDTSDSETPEALVFQDSVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRKVQSGGLPGGGHVPPSWVPMSDSFSLTSGVGEWRRQPTWDQVCTPHTLS	668309	641164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_641189_642075_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650047_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
770845	contig_9739_pilon	+	2748	1	Intergenic	novelGene_165089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183497	186245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_183500_186200
770848	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
770854	contig_16578_pilon	+	3108	1	Intergenic	novelGene_148642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147841	150949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_147800_150900
770856	contig_8263_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_83079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACTGCTAGAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117850	119829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_117800_119800
770859	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770862	contig_9871_pilon	+	1796	8	Intergenic	novelGene_75624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	295.545845747788	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTTTAATGAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331194	352680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_341139_341261_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350355_351364_351426_352321
770863	contig_1867_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_54580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTGAAGATATAACGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469654	470403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_469700_470400
770864	contig_1867_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_54581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGTTAATCCAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470548	471763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_470500_471800
770866	contig_9235_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_156235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACTCCATGAACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60010	61334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_60000_61300
770868	contig_2770_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_107493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGACCGAAGAACAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748290	747788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_747800_748300
770873	contig_5062_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_157858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	637	954	720179	719862	NA	55	AAAAAAAGGCCATCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVANQKRSAVRIYQLLLGNPVGQFYSVLKVYTNLLISTFNKILSGDKQTKNKPIAVKAIPTYSDPTGQGRTAPKGFQGAVGGLELPAFWLVAELLTTAPPGKLVH	720815	719320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_719300_720800
770876	contig_3627_pilon	+	1327	2	Intergenic	novelGene_78498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGTTGAAATAATTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621261	622686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_622098_622195
770877	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	0	1215	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
770879	contig_9696_pilon	+	1879	14	Intergenic	novelGene_68841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	643.411147964848	1	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	453	1472	606715	626143	FALSE	35	ATAAACTTCAAAGTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKMGGIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDPRVLHHMGGMAGLQSMMRQFQQGAAGNMKGMMGFNNM	578140	626550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597098_603099_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614244_618819_618991_624292_624389_626051
770880	contig_15025_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_155980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGGCTGAAAGCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65288	64800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_64800_65300
770881	contig_7179_pilon	+	2382	7	Intergenic	novelGene_78175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCGGCCCCGGAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060037	1071632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1060438_1060727_1060818_1061213_1062710_1062824_1062890_1064932_1065072_1065162_1065286_1071563
770882	contig_5057_pilon	-	1427	4	Intergenic	novelGene_151498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	33.1595469745224	127	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	48	494	371370	365024	TRUE	30	AAAGGTTTAATTGAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQGQVSQATLPLAQAHFEKGQYAKAEALYSAFIRHCGWTASARAGPGSKCSPEDLATAYNNRGQIKYFRVDFYEAMDDYTSAIEVKPSFEVPYYNRGLTLYRLGYFDEALEDFKKVLDLNPGFQDAALGLKQTILDKEEKQMRNY	371417	359025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_359893_364957_365152_365902_366070_371218
770883	contig_5341_pilon	-	1743	5	Intergenic	novelGene_168031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	720.141782915003	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	237	1097	340653	338480	FALSE	50	ACAGAATAAATTATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEVGSLDVGSLRALRDSTVALAAGALCREARTTQVFFLKGGYEAFSAFCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340889	337833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340028_340286_340363_340605
770894	contig_5643_pilon	+	1927	9	Intergenic	novelGene_38986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	24.1191702800905	166	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	197	1024	600746	605319	FALSE	20	TGATTGTGTCTGAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKQRYLGKGVLKAVDHINTTIAPALISSGLSVVEQEKLDNLMLELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAERELPLYRHIAQLAGNSDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFRDAMRLGAEVYHTLKGVIKDKYGKDATNVGDEGGFAPNILENSEVVSIEDPFDQDDWAAWSKFTANVGIQIVGDDLTVTNPKRIERAVEEKACNCLLLKVNQIGSVTEAIQACKLAQENGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEELGDEARFAGHNFRNPSVL	600097	606222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_600196_600345_600405_600706_600777_601284_601419_601664_601888_604190_604393_604643_604753_604911_604971_605249
770898	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770899	contig_10235_pilon	-	2707	17	Intergenic	novelGene_46576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_16	50.1297924766301	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	383	2296	546217	537592	FALSE	55	AAATAAACAATTTAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASPPEPPWDPLPLFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSDVQTKIEPVSPSSSINSEASLLSADSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNETLSGRGATGDYEEMMQIECEVMDTRVIHIKTSTVPPSLRKQPSPTPSNTTRGPLPAPAGSQAHQASHQPLYLSHP	546739	537180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811_545904_546165_546245_546384
770900	contig_9696_pilon	-	2687	3	Intergenic	novelGene_68830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	9.5	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	29	481	577481	552522	FALSE	20	TGTTCTTCTCTAATACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRADVCSKMEFCSGRRAVLQLLRAVAPADRPALLQWMRTTRDFDEFIQDNNDVMLKSIAEDLRNCLPLEAMLSSEHLALQKIQQQPEPTVHFDAFLYDEDFIDSLCEEGRMSRNYCMVCGSHQTAPLGRHSSKSDNCKCILPYMSCVCKFLTKSFDVF	577509	550315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_552756_564332_564455_577384
770901	contig_14243_pilon	-	1175	7	Intergenic	novelGene_57440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	73.7580504080741	455	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	322	1002	707783	702878	FALSE	30	CAGCATTGGGTACAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPRKRLTGAAGPDKKGPSGKRTKTGNPDETSAKMENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	708104	702704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_707740
770904	contig_6291_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_164806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAACCATAATAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407729	406743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_406700_407700
770905	contig_6291_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_164805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTGCAAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402817	402343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_402300_402800
770907	SIRV6	+	249	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11207
770909	contig_6403_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_139885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATTTTTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979098	978165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_978200_979100
770910	contig_12142_pilon	-	996	6	Intergenic	novelGene_147817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAGAGAAGAGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135985	121395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_121499_121923_121980_122255_122410_124834_124903_128212_128331_135488
770913	contig_15839_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_136414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106164	104051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_104100_106200
770914	contig_4900_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_159043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTACTACAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185644	183235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_183200_185600
770915	contig_15114_pilon	+	1407	7	Intergenic	novelGene_121202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_5	51.2978773656593	502	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	344	1216	785166	800648	FALSE	45	CCAAAAGAATCTGCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVKRGDESQFLLQAPGSSELEELTVQVTRIYNGRLKVQRLCSEMEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQAELSVIKESEAQLWWAAKELRRTKKLSDYVGKNEKTKIIVKIQQRGQGAPAREPVISSEEQKQLMLYYHRRQEELKKLEENEDDSCLNSPWADNTALKRHFHGVTDIKWRPQ	784822	800839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_789237_789406_791308_791377_793688_793848_795328_795461_800171_800268_800537
770922	contig_4754_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_35971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATACAACAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414447	413565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_413600_414400
770926	contig_16098_pilon	+	1956	13	Intergenic	novelGene_45872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	95	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCAGAGGTCTTCGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244090	253642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_244475_244573_244724_247059_247525_248282_248404_249229_249378_249456_249516_249984_250074_250209_250284_250681_250769_251548_251643_253026_253104_253254_253381_253560
770927	contig_10711_pilon	+	1013	2	Intergenic	novelGene_118444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTAGGCAAGGTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816902	826970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_817477_826531
770929	contig_16846_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_82873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214983	215422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_215000_215400
770930	contig_11436_pilon	-	2473	1	Intergenic	novelGene_173117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGAGTGCTTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174042	171569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11436_pilon_-_171600_174000
770931	contig_5551_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_134228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAGAACAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287162	287383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_287200_287400
770933	contig_14322_pilon	-	1599	3	Intergenic	novelGene_115657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	67.5	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	231	656	500039	499115	FALSE	0	GGCTTGCTTTTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLEEIVACDNAAQKMQTVSAAVEELLVAAQRQDRLTVGVYESAKLMNVDPDSVVLCLLAIDEEEEDDIALQIHFTLIQSFCCDNDIDIVRVSGMQRLAQLLGEPIETQGTAEPRDLHCLLVTVSGAPAPPGHLGYVCQQS	500269	498171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_499395_499765_499868_499995
770934	contig_14727_pilon	+	811	5	Intergenic	novelGene_56624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	701.142460559906	541	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46209	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51612_54083_54263_55134
770937	contig_6871_pilon	+	1954	12	Intergenic	novelGene_21621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.1250835875525	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	115	1590	541929	548319	FALSE	15	AGATCTTTGTGGATCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAENANIQPNPGLILRAEPTVTNILKVIRALLFDISFLMLCHVAQTYGSEVILSESSTGAEVPFFETWMQTCMPEEGKILNPDHPCFRPDSTKVESLVALLNNSSEMKLVQMKWHEACLSISAAILEILNAWENGVLAFESIQKITDNIKGKVCSLAVCAVAWLVAHVRMLGLDEREKSLQMIRQLAGPLYSENTLQFYNERVVIMSSILEHMCADVLQQTATQIKFPSTGMDTMPYWNLLPPKRPIKEVLTDIFAKVLEKGWVDSRSIHIFDTLLHMGGVYWFCNNLIKELLKETRKEHTLRAVELLYSIFCLDMQQVTLVLLGHILPGLLTDSSKWHSLMDPPGTALAKLAVWCSLSSYSSHKGQASSRQKKRHREDIEDYISLFPLDDMQPSKLMRLLSSNEEDANILSSPTDRSMSSSLSASQLHKVNMRDPLNRVLASLFLLISSILGSRTAGPHTQFVQWFMEECVDCLEQGSRGSILQFMPFTTVSELVKVSAMSSPKVVLAITDLSLPLGRQVAAKAIAAL	540175	548683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_540258_541896_541965_542360_542540_542657_542758_543072_543249_544600_544866_545293_545476_545649_545741_546141_546242_547428_547510_547871_548021_548202
770938	contig_1275_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_108727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACCGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329724	328060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_328100_329700
770941	contig_7619_pilon	-	1019	7	Intergenic	novelGene_162142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	62.803927690339	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	223	708	30763	23773	TRUE	20	TATTTATACGCTTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	31598	8376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_8664_23748_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_31421
770948	SIRV6	+	206	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	524	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
770950	SIRV4	-	220	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1293	8	1293	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
770952	contig_5669_pilon	-	2546	9	Intergenic	novelGene_86095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	261.144595961701	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	305	1606	284753	226043	FALSE	35	AGCTGCTCTTTGGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAKPTLQLVYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWEISDQLLQIRQDVESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIVTQLALAIADLALQMPSWKGCVQTLVEKYSNDVTSLPFLLEILTVLPEEVHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDEKMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVETNLPLAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLLICAGHPQYEVVEISFNFWYRLGEHLYKTNDEVIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHEGVPEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQVSLFGDYCQSY	285057	225102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_226187_228431_228579_237834_237974_238509_238686_241752_241897_253893_254051_256853_256928_257825_258027_284633
770955	contig_9656_pilon	-	1357	6	Intergenic	novelGene_121895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_5	149.638765030991	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	294	1124	97308	81749	FALSE	20	TAAACTGCATTCTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPSMFNVLWCSFIVCVFSFQLL	101292	81515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_101023
770956	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_89429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653750	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
770958	contig_9548_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_141076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTACCAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231620	233295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_231600_233300
770961	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	10	1166	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
770965	contig_13421_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_166818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTAATCTTACGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364146	365131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_364100_365100
770966	contig_8138_pilon	+	1172	5	Intergenic	novelGene_52457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	182	637	280295	306552	TRUE	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280113	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306558_307404
770967	contig_9656_pilon	-	1704	8	Intergenic	novelGene_121890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	140.263745734053	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	200	1351	97308	73704	FALSE	35	AAACTTACCCTAACTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLP	100783	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_100608
770972	contig_3942_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_128896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGAGGAAACCGAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659543	1660184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1659500_1660200
770980	contig_16870_pilon	+	878	7	Intergenic	novelGene_155484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	112	junction_1	1006.03254033964	1965	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	294	683	96164	98992	FALSE	10	GCCCTGAGACTGTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYATTYELKEDGSYNVTSTLLKNEDCYHWIRTFVPSFLPGQFNLGNIKSFPDLHSYTVRVAATNYNQFAIVFFKKVTKNQEYFKTTLYGRTKELTTELKERFVRFAKSLGLTDDHIIFSVPIDQCIDDA	95488	99187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95530_95640_95823_96093_96229_97484_97565_97734_97855_98087_98190_98969
770981	contig_12050_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_62779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	87	305	938968	939186	NA	20	AATTCGCCTTTTGTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNLYSDKVEDQQKRGRPSTRWSDTVPTKMGSNIARIVRMVQGQGSVSFCCTQGCCESESARRHLTTAIVTAADHQVFLPLDAAKLPSRETVSVHIPNSSA	938881	939444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_938900_939400
770984	contig_5718_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_110314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGCCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450501	447983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_448000_450500
770988	contig_6440_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_161654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAAATTTCTGAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16767	17690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_16870_17264
770991	contig_8260_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_163231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGACTGCTACTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68441	70787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_68400_70800
770994	contig_6589_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_25782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1883.61718178084	14	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACTGTCTTCCAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668307	672809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669548_669802_669939_670104_671046_671188_672584
770995	SIRV6	+	292	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8140	-1	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
771008	contig_15350_pilon	+	970	3	Intergenic	novelGene_164262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	73	480	254333	254740	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCKLLILSQPGRNTSIAPSSSSKTMYRIRAAIKFRSTLSSSIICKTFTVLAEYLSELNRHNKTRGKDYVVYYDKVSCDLNCYKILILNSTCNWGNILWREENHWVIAFESQTAPFSWSTRCAVLQLNMHKDNPCFGLVVQPLGSHFQTHYTYLLRSSLT	253877	259221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_253936_254318_254858_258848
771012	contig_14150_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_173119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGAGGGAAAAAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42295	40539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14150_pilon_-_40500_42300
771013	contig_12810_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_145708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	0	198	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	272	349	630140	630217	TRUE	20	TTTGTGACAATTCGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLAICVCCCFALNTLGAAVLPCELCPSEDRVRKALCLPCFKCSQWHAVLVDAVSRDAFPWSEHWGRSSRNRADLRPTSSHLTSANWPEALMAPVVWPAAQKPSENRSSTATQCVS	629868	736047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_630686_734749
771015	contig_5033_pilon	-	1834	4	Intergenic	novelGene_28952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1057.50870760796	5	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456871	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451478_451947_453124_456495_456604_456698
771020	contig_5649_pilon	-	2111	6	Intergenic	novelGene_82378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_4	45.7138928554548	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	894	1442	1073420	1069132	FALSE	10	GCTTCCTGTTGCGTAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGNDGSELILHFVTQCNARLTRVLEEEQKLVQLGQAEKRKTDRFLRDAVETRLRMLIPYIEHWPRALSILMLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1074313	1068462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949_1073035_1073307
771024	contig_7594_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_55406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTCGTTAAAGCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448578	446905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_446900_448600
771030	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
771031	contig_15360_pilon	-	2275	6	Intergenic	novelGene_171258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_3	7.91454357496375	71	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	479	697	165286	163688	FALSE	15	CCTGGACTGTGTTGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAEDPQTALALNLDPQLVKKKSDPEGPALLFPASELSIRIDKSENGEAYQRRRVTGLPGDPVPPVPSRGNPVQPEGGSWRRIALLILAITIHNVPEGLAVGVGFGAIEKTASATFESARNLAIGIGIQNFPEGLAVSLPLRGAGLSTWRAFWYGQLSGMVEPLAGIFGAFAVVLAEPILPYALAFAAGAMVYVVMDDIIPEAQTSGNGKLASWASILGFVVMMSLDVGLG	437303	162109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_163767_165146_165306_168912_169012_237670_237741_317316_317482_437178
771033	SIRV5	+	405	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-78	878	36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8237	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
771034	contig_7057_pilon	-	767	4	Intergenic	novelGene_123214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	4.18993502999218	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACATGCCTACTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536145	534235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534688_534758_534852_535074_536039
771037	contig_9548_pilon	-	3468	15	Intergenic	novelGene_141049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	81.4245613047652	14	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	106	1887	125993	103532	TRUE	25	GTGTTCCCAGGAATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRQRTLFQTWGSSVVRSVDASGRSSGTERPQSPGSSKSRFPAPAEAAEAQPESDDDVLLVAVYEAERQLSPKDGGFCKSAGAVWIYPTNCPVRDYQLHIARTALFCNTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPSGKVVFMAPTKPLVAQQIEACYRVMGIPQSHMAEMTGSTQAFTRKEIWHNRRVLFLTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVVDEAHKALGNYAYCQVVRELVKYTNHFRILALSATPGSDIKAVQQVITNLLIGKIELRSEDSPDVLPYSYERRVEKVVVPLGEELAAIQKAYIQILEAFATSLIQRNVLMRRDIPNLTKYQLILARDQFRKNPSPNIVGLQQGIIEGEFAICISLFHGYELLQQMGMRSLYLFLCGIMDGTKGMTRTKNELVRNEDFMKLYNHLECMFADTCSASASGVSALRKGDKDKKFFYSHPKLKKLEEVIVEHFKSWNDQNTSEKKCDETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLFQHQPVIKVMTFVGHSSGKTMKGFTHKEQVEIPKGTELTFNHDYRFSVYSEVFHIKGKSFDPCYWKRFIRELNMISLYLLFLFLRLLFLTLELV	126098	93998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_94066_96584_96741_97769_97928_100238_100423_102076_102284_102722_103724_108812_108998_111841_111929_112451_112578_112917_113051_115298_115431_117823_117983_121546_121625_124706_124880_125476
771040	contig_3068_pilon	+	1454	9	Intergenic	novelGene_137605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	41.6171163705512	216	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	12	779	162547	187446	TRUE	30	GTTTTTAGCAAAAGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGADGTGQMAAADTALCLFDVDGTLTAPRQKITKEMDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCSQEERIEFYELDKKENIRQKFVADLRKEFAGKGLTFSIGGQISFDVFPDGWDKRYCLRHVENDGYNPIYFFGDKTLPGGNDHEIFTDPRTVGYTVTAPEDTHRICRELFC	162535	188935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162640_167639_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175363_175530_175607_178805_178922_187344_187489_188302
771046	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	415	3	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATAAAAACTATCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
771050	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	0	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771051	contig_3797_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_120109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACTCCTAAGGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512241	513897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_512200_513900
771052	contig_8156_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_98904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77790	76621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_76600_77800
771057	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	2	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771059	contig_6608_pilon	-	2236	4	Intergenic	novelGene_162544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	35.1409858838492	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	75	941	254585	249448	FALSE	30	AAATTTGGCAATTTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSMWYIMQSIQSKYSLSERLIRTIAAIRSFPHDNVEDLIRGGADVNCTHGTLKPLHCACMVSDADCVELLLEKGAEVNALDGYNRTALHYAAEKDEACVEVLLEYGANPNALDGNRDTPLHWAAFKNNAECVRALLESGASVNALDYNNDTPLSWAAMKGNLESVSILLDYGAEVRVTNLKGQTPISRLVALLVRGLGTEKEDSCFELLHRAVGHFELRKNGTMPREVARDQQLCEKLTVLCSAPGTLKTLSRYAVRRSLGLQYLPDAVKGLPLPASLKEYLLLVE	257833	248152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_250081_252879_252985_254456_254621_257794
771060	contig_16666_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_61777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	25	1158	106098	117928	FALSE	35	AAGGTCAGCAGTTAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASATARMRTGWLIGTSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106073	118110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851
771061	contig_5479_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_133584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAAAACCTAGATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202674	200849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_200800_202700
771062	contig_6589_pilon	+	1832	10	Intergenic	novelGene_25941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	318.619747049483	37	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	14	1033	1228758	1257861	FALSE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHAAMPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPVSGPALLSSQDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPNVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKLDSQKL	1228744	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228920_1231854_1231963_1234419_1234553_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256398_1257840
771064	contig_6710_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_97589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	60	TGTGGAAAAAGAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
771065	contig_15500_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_129000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAGGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262732	264027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_262700_264000
771067	contig_10286_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_98432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCGACCCTATAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477140	475363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_475400_477100
771068	contig_5484_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_151086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59684	57760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_57800_59700
771080	contig_15385_pilon	+	1063	6	Intergenic	novelGene_173121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.45221864364618	47	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	316	615	29559	31443	FALSE	65	AAAAATAAAAATAACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKNEQICLGRSTARVLLRNEEKDVAVCFLKITALETLWARSTLSYRVTMRQNGLANNGFSLVTSLINSITMASDATTRLQNLKTPKCCRKGNRFLH	19674	31891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15385_pilon_+_19809_19950_20049_28498_28554_29530_29628_30996_31147_31362
771081	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
771082	contig_9199_pilon	+	1067	9	Intergenic	novelGene_65634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	69.9178088901533	117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	76	882	120933	122653	FALSE	15	GTGTGAGTGCATTCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKAAGAEEELLPGVDVLLEVFPTCSVGQAQWALAKARGDLEEAVQMLVEGKDGPNQDLPRRLRGPQKDELKSFILQKYMMVDSAEDQKIHRPMTPKEVVSTKGERFKDMRNPEAEEMKATYINLKPARKYRFH	115819	122838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_121799_121872_122035_122230_122293_122367_122429_122542
771084	contig_11978_pilon	-	1692	2	Intergenic	novelGene_62801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAACTCTGCCGTCGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381418	299649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_299829_379905
771086	SIRV4	-	269	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1254	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3904	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
771087	contig_8616_pilon	-	1235	4	Intergenic	novelGene_72433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	476.537744803308	466	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255502	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254668_255372
771088	contig_10095_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_57236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGGACTGTATTAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212679	214724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_212700_214700
771091	contig_7961_pilon	+	2273	2	Intergenic	novelGene_173123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	118	1074	171438	172394	FALSE	20	GAAACTGTCTCTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQNQHGSGSSLVVIQQPLDSRQRLDYEREIQPAAILSLDQIKAIRGSNEYTEGPSVVKRPAPRTAPRQEKHERTHEIIPINVNNNYEHRPTSHLGHAGLTNNARGAILSRSTSTGSAASSGSNSSASSEQGLLGRSPPTRPGPGHRSERAIRTQPKQLVADDLKGSLKEDVTQHKFICEQCGKCKCGECTAPRTLPSCLACNRQCLCSAESMVEYGTCMCLVKGIFYHCSNDDEGDSYSDNPCSCSQSHCCSRYLCMGAMSLFLPCLLCYPPAKGCLKLCRGCYDWIHRPGCRCKNSNTVYCKLESCPSRGQGKPS	168227	173593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7961_pilon_+_168290_171382
771093	contig_10196_pilon	-	1572	8	Intergenic	novelGene_132309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACCAACAAAAGCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2369555	2348362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495_2352591_2363538_2363641_2363944_2364011_2364367_2364477_2365371_2365516_2368747_2368926_2369144
771094	contig_15304_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_30463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
771097	contig_6635_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_127008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGTTAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348607	347351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_347400_348600
771099	SIRV4	-	432	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1091	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4067	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
771100	contig_12050_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_62773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTTTGAGTGAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891664	890855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_890900_891700
771107	contig_7870_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_108935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291319	293142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_291300_293100
771109	contig_7562_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_140886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCTGCCATTTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277343	279280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_+_277300_279300
771110	contig_3787_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_102399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496359	497336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_496400_497300
771113	contig_4392_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_117289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGAAAAAATTCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41105	41557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_41100_41600
771117	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4448	34	3273	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
771118	contig_12629_pilon	-	2490	6	Intergenic	novelGene_150645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	26.2495714250728	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	3	845	81596	29065	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWRLGCDPRLLRCLLGFRGRRSPGLVKGAAGCSGCRVANWRWFHSTQWMHGDPIKILMPSLSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSAGDALCEIETDKAVVTLDAGDDGILAKIVVEEGAKNIRLGSLIGLMVEEGEDWKHVEIPKDVGPPSPAAKPSVPHPPPEPPISIPVQKEHTPGKLQFRVSPAARNILDKHALDASEGTATGPRGIFTKEDALKLVELKQMDKITESKPTPVPLAPPTTPTAPLPTPASGGPSYPRPMIPPVSTPGQPNAVVTSFK	81598	27419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_-_29267_40368_40468_42271_42472_50820_50922_63738_63820_81436
771119	contig_9345_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_24590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945661	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945063_945586
771120	SIRV6	+	195	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	507	-1	-337	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGTAGTCGAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
771124	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
771133	contig_13481_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_119425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772584	770854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_770900_772600
771135	contig_2480_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_63561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCTATTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357865	359275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_357900_359300
771138	contig_14450_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_48952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564277	565780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_564300_565800
771139	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
771145	contig_9423_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_99180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGGTGTATCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72011	72369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_72000_72400
771146	contig_13216_pilon	+	1057	7	Intergenic	novelGene_47496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.96745588888	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	149	622	243787	258523	TRUE	25	ATCTGACTCAGAATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGLMPVRIFLIISVIFLRQFLIRQVLFGPELKLGLDKKNLPMWSQKNLLCVNKGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSEVCQKASQIGGTLQRKSQKNIVLPFSLDSSCFCCPICTTYLHIRILSD	229714	260816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229760_242994_243096_243784_243952_245969_246141_256211_256274_258447_258573_260430
771150	SIRV4	-	319	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1167	35	1167	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACAGTTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
771151	contig_6735_pilon	-	946	9	Intergenic	novelGene_15656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	814.781939769777	87	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	88	747	564868	542177	FALSE	30	GCTAAATAGTACTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDSIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRLILWSCLILHECFL	568285	541977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542222_546586_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554377_564157_564232_564784_564869_568198
771152	contig_17470_pilon	+	2020	10	Intergenic	novelGene_110503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCTGGAGTAGGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252265	259189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_253018_254039_254193_254364_254467_254995_255097_255215_255288_256249_256669_256763_256856_257049_257210_258734_258862_259147
771156	contig_5981_pilon	+	1342	5	Intergenic	novelGene_35525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	38.6611885487242	112	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	229	606	271511	276427	FALSE	30	CAAGACCCCGAGCAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSMGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHDWLNNLPAKASESKVRLKSQLLLQKYMAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP	271060	277163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_271192_271413_271543_272668_272822_274430_274564_276367
771159	contig_14483_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_133781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTCAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223983	226177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_224000_226200
771162	SIRV7	-	382	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	0	-32	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
771164	contig_3602_pilon	-	1651	12	Intergenic	novelGene_60636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	5.72799418255395	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	53	1363	1101774	1093201	FALSE	15	GCTTTCACGGTTGTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSSGECRKGDWLRVVMGEAAVAAGPCPLREDSFTRFSSQSNVYGLAGGASGRGELLAATLKGKVLGFRYQDLRQKIRPVAKELQFNYIPVDAEIVSIDTFNKSPPKRGLVVGITFIKDSGDKGSPFLNIYCDYEPGSEYNLDSIAQSCLNLELQFTPFQLCHAEVQVADQLETVFLLSGNNPAIHLYKENEGLHQFEEQPVENLFPELTNLTSSVLWLDVHNLPGTSRRLTALGCQSGYVRVAHVDQRSREILQTWTIQQDGPISRVIVFSLSAPEETKERPQQEEYSVLVASMLEPAVVYRDLLHQGLEDQLILPGSDQFDSILCGLVTDMDLDGRLEVLVATYGQELLCYKYWGPESGLPKAESGFRLLWQRSFSSPLLAMAHVDLTGDGLQELAVVSLKGVHILQHSLIQASQLVLTRLRHQVEQRRRQQQQGLGGRVGPGAAETPAS	1101826	1092912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1093333_1095500_1095684_1095766_1095903_1096720_1096797_1097665_1097744_1097828_1097939_1098328_1098403_1098523_1098600_1100719_1100775_1100863_1100949_1101069_1101153_1101551
771166	contig_2867_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_135150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTAAAGCATTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425426	426446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_425400_426400
771167	contig_7049_pilon	-	2348	9	Intergenic	novelGene_171449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_3	100.391732727352	206	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	54	1745	224468	221675	FALSE	20	AACCCACCCAGTCTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCSRWEAAAGRLGHYVTMDEGGTPLLPDSLVYQIFLSLGPADVLAAGLVCRQWQAVSRDEFLWREQFYRYYQVARDVPRHPAATSWYEEFRRLYDTVPCVEVQTLKEHTDQVLHLSFSHSGCQFASCSKDCTVKIWNNDLVVSLLHSADMRPYNWSYTQFSQFNMDDSLLLVSGVFLGPHNSSAGEIAVISLDTFALLSRVRNKPYDVFGCWLTETSLISGNLHRIGDITSCSVLWLNNAFQDVESENVNVVKRLFKIQNLNASTIRTVMVADCSRFDSPDLLLDVGGPAAPSCQVFDLGSDGDDEAPAPARAKEGLRRFLDDILDGRVQPPLSENALETRVAELLAQGRTRPPEPVAGGGRKYLVFTTGCLTYSPHQIGIKQILPHQMTTAGPVLGEERGADEFFDSLDHVIDVHGHVIGMGLSPDHRYLYVNSRSWPSGAVVADPMQPPPIAEEIDLHVFDLKTMREVKRALRAHRAYTPNDECFFIFLDVSRDFVASGAEDRHGYIWDRHYNICLAKLRHEDVVNSVAFSPREQELLLTASDDATIKAWRSPHTVRALQAPRPRPRSFFSWFASQRR	225175	221071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_221919_222010_222224_222296_222445_222738_223151_223226_223376_223448_223624_223927_224086_224275_224493_225146
771170	contig_7230_pilon	-	1974	12	Intergenic	novelGene_52523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	104.445960561842	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	91	1065	67689	24148	TRUE	35	TTCCTCAAAACAAATTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLDLSCAQQQGGPGSSLGPSTLSLAVAPPSMFFRAGLSAKSQLLRVFQPASVATMSTGTFVVSQPLNYRGGSRVEPADASGTEKAFEPATGRVIATFTCSGEKEVNLAIQSAKSAFKIWSQKSGMERCRILLEAARIIRERRDEIATVETINNGKSIFEARMDIDTSWQCLEYYAGLAGSMAGEHILLSGGSFGYTRREPLGVCVGIGAWNYPFQIACWKSAPALACGNAMIFKPSPFTPVSALLLAEIYTEAGVPSGLFSVVQGGAATGQFLCQHPDVAKVSFTGSVPTGTKIMEMAAKGIKPVTLELGGKSPLIIFSDCVMENAVKGALMANFLTQGESLPTLTSALKIQPD	67779	14917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_15226_17154_17268_20205_20348_23126_23215_23458_23648_24078_24193_28168_28310_28991_29189_32632_32768_43473_43604_65630_65777_67508
771172	contig_9527_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_134074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_2	30.4179223485103	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	311	961	486523	487885	FALSE	40	TGAAATCTTACATAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	486212	488359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
771176	contig_12468_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_164880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	8	379	71002	68719	FALSE	25	ATCAGCCTTGAGGATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQMISAEDCEFIQRFEMKRTPEEKQDILQAEGSQRRSSAKEMSLKLCAVPLPSERRTQEHIHARRPVHLGNCFQKKEKESHLEPRAQKVTVSDTTLETPLFTNSSDGNFKVFQQVHFYKLKTVQI	71009	68535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_68995_70906
771179	contig_10436_pilon	-	2364	19	Intergenic	novelGene_108467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1771	2187	83056	81483	TRUE	15	CCCGCCTCCCAAAGCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPEGDAHAKVMHAHDFHQAGVLGVAEAHTAQLTGHLETKGPQLLEALQSGLLHLLQSVILGRIIHFLETGHGPHQLFEELCLLLVEHYGYGNTWSVVSWPLNIPAAKDLDSALAWLSLAEASEERDSDLSTAAEQPH	86916	81230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_81347_81421_81499_81760_81826_81916_81988_82080_82141_82408_82544_82986_83133_83369_83500_83594_83722_84076_84277_84654_84756_85173_85262_85346_85412_85515_85618_85697_85797_85884_85956_86038_86114_86193_86266_86352
771180	contig_13744_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_77212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	408	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTACCTCAACTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099197	1096976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1097000_1099200
771183	contig_19564_pilon	-	1936	13	Intergenic	novelGene_29676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	71.127184598358	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	2	715	83587	74966	TRUE	35	ACGAGAGCTATTCTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPFDVDALLPERITVLDQHLRPPARRPGTTTPARVDLQQQIMTIVDELGKASAKAQQLPAPITSASRMQSNRHVMYVLKDTSARPAGKGAIIGFLKVGYKKLFVLDDREAHNEVEPLCILDFYIHESFQRHGHGRELFQHMLQKERVEPYQLAIDRPSQKLLKFLNKHYKLETTVPQVNNFVIFEGFFAHQHRPPSSSLRATRHARAAAVDPTPTGRRGSAPHPLSPDLSKAIRD	83588	70449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_70783_71152_71196_71288_71369_74005_74248_74442_75028_76159_76229_76341_76388_82060_82163_82336_82451_82561_82623_82748_82841_82952_83014_83480
771187	contig_7943_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_173146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCCCCCCAAAATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189533	189914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_189500_189900
771190	contig_15752_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_148798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACTAAACCAAATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437153	437960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_437200_438000
771192	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771193	contig_3942_pilon	+	476	4	Intergenic	novelGene_128662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_1	571.038235730907	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178399	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179177_179714_179825_179974
771195	SIRV4	-	264	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
771196	contig_10456_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_163471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGCAGGAGAAAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61342	63361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_61300_63400
771198	SIRV2	-	497	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4376	34	3201	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
771202	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
771206	contig_7707_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_72195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCAGAGTGGACACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648836	648167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_648200_648800
771208	contig_6102_pilon	-	2966	11	Intergenic	novelGene_32026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	112	junction_1	65.3103360885549	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	164	1564	545300	514588	FALSE	25	AATTCTTGAGCCTGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTAAARFFGAKHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNLYREGSSIGAIDTKLDWSHNFTNMLGYTDAQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQEVLVWLTQLQKEVGKDVSDEKLRDYIWNTLNSGRVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPNDPMFKLVAQLYKIVPNILLEQGKAKNPWPNVDAHSGVLLQFYGMTEMNYYTVLFGVSRALGVLAQLIWSRALGFPLERPKSMSTDGLIKSVDSKSG	545463	513185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514759_515065_515276_515614_515717_515835_515966_516535_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_545258
771210	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
771213	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1148	3	1148	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4010	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771214	contig_6102_pilon	+	684	6	Intergenic	novelGene_31963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1222.8278047215	33416	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414358_414577_414788_414877_414956_416018
771215	contig_12605_pilon	+	750	5	Intergenic	novelGene_64198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2960.6692972198	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	346	750	5056	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPDPGRLPLPEVFLHRRVPADGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4305_4837_5072_5728_6005_6124
771216	contig_8063_pilon	+	1801	8	Intergenic	novelGene_152418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_5	50.3441219234669	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	208	1284	49427	60472	FALSE	15	GCTCGGTGATACTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLAIMECCCMFCLYYLLEMIVVIGTNEFAVPPADTASKQGPIEAIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEEVSRLGLQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPIPEKLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFIKVCTDEE	49219	60989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_49725_50785_50857_51917_52035_52911_53072_55304_55428_56797_56905_58860_59041_60451
771217	SIRV6	+	348	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	4	-244	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771219	contig_12019_pilon	+	1129	6	Intergenic	novelGene_87691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	47.1211205299704	2094	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	46	525	66581	80104	FALSE	80	AAGAACAATAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAARNGAGNGWWSSMPKFYCDYCDTYLTHDSPSVRKTHCSGRKHKENVKDYYQKWMEEQAQSLIDKTTAAFQQGKIPPTPFSAPPPAGAMIPPPPSLPGPPRPGMMPAPHMGGPPMMPMMGPPPPGMMPVGPAPGMRPPMGGHMPMMPGPPMMRPPARPMMVPTRPGMTRPDR	66535	80708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_66589_66928_66972_72165_72275_74438_74529_76915_77021_79979
771220	contig_10923_pilon	+	1286	8	Intergenic	novelGene_66200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	814.448931010711	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	487	1170	29537	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANELPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13831	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23122_29407_29572_30133_30284_37367_37540_38578_38742_42554
771221	contig_1594_pilon	+	1563	10	Intergenic	novelGene_138794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	13.4494940012213	120	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	923	1507	208930	256701	FALSE	25	CAGAACAGTGTTTGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENATLRAALDKNLKSAVNAAFLLLPESFSEEELFIEIARLSYSGDFRMVVGEDKTKVLNIVKPNIVHFRELYGTILQENPQVVHKIQQGRLELDKSPEGQFTQLMALPKTLQQQINHIMDPPGKNRDVEETLFQLANDPDCSEVVRLGLSAIVRPSSVRQSTKGIFTAGMKKSVIYSSLKLHKMWRGWLRKT	191483	256757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_191862_194310_194494_199775_199869_205357_205507_208294_208399_208914_209066_233142_233289_238756_238923_240170_240234_256627
771225	contig_2577_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_172071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTAAAAAAATAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234181	236548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_234200_236500
771226	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91642	0	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
771227	contig_9653_pilon	+	1621	2	Intergenic	novelGene_48237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATATGCAATGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818179	821036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_818310_819545
771229	contig_8617_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_73372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1869	2270	12000	11599	NA	60	AAATTCATCCAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILPLDITAVLLFFGGEGATLHAGCTQQPPTQAQADGLTWAKPLPLLEAQGGWGGAASNNLHCIFIFFCKALPLSLRLIVWQGGMWKGMFKVTELLSKRARPSNYGPSILRSCLCYSFPRRFGSFPQGNEMK	13868	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_11300_13900
771233	contig_18342_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_154558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	200.545855105509	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	179	694	38342	63358	FALSE	35	TCAACAGCAGTTGAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSLGIIMMCVSLPFSVLNPISVYPGYPVWGSVMFIVSGSLSIAAGNRTTRGLVQGSLGLNITSSVVAAIGIILTALSLTIFSSSHLYCDSNRMPENCAMIWSMLMGMDGIVLILSVLEFCIAVSLSAFGCKVTCCNASGIVFIMPSNAYVAETAPTATLSGDSLPPTEQ	26155	63556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_38317_38447_54740_54798_56452_56612_60655_60758_63265
771234	contig_8616_pilon	+	1583	11	Intergenic	novelGene_72487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	618.228469095366	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	300	968	322290	328382	TRUE	25	TAAACTATTTTCGTGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGGVQVAEQLGTQGLNLGPGPLLSQPWSMTHHYLLYCGPRRWATSWQAVPASCCCSLGCSSAPSSSCSGCLCSSMVPSTIPTCRPSATSAPCISTTGPTVIPPPPHSAPSLLPMSRWLRVDVIVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSQRLE	318345	331050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323870_326955_327100_328047_328183_328367_328459_329944_330087_330236_330292_330583_330720_330844
771235	contig_8260_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_163240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAGGGGGGAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125279	126192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_125300_126200
771236	SIRV6	+	529	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1612_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771237	contig_8538_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_4678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATCTTTGCCTTGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
771240	contig_12227_pilon	+	1457	13	Intergenic	novelGene_127398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	101.3282619345	1	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	489	1079	123433	142650	FALSE	10	TTTCTTCATAGTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNELKVVSSSIVDKYIGESARLIREMFNYARDHQPCIIFMDVIILGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSDGFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV	114837	143028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_114884_115858_115928_116032_116067_116307_116361_118433_118484_118963_119079_123311_123448_124848_124958_125327_125402_127297_127419_127993_128075_132517_132590_142531
771243	contig_19579_pilon	-	1563	7	Intergenic	novelGene_59361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	699.592976903952	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	12922	8825	TRUE	35	GGGATCACATTGACAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTGKCRCVTFTLCSRKYLLFSNS	12923	7156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8850_11972_12301_12900
771244	SIRV6	+	553	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	6	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771247	contig_10135_pilon	+	1606	14	Intergenic	novelGene_106635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.0557379367595	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	218	1384	110532	115842	FALSE	25	AAACTTCTGGTATATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIILQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGTTYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAILGTQDIVFGEVDR	106806	116064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107815_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_113618_113894_114015_114473_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
771253	contig_19899_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_102530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCAATACTTGTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198032	196355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_196400_198000
771254	contig_19743_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_173159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTTTTCAGCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264545	263538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_263500_264500
771255	contig_6175_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_16278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTGTGTTTGTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558795	560233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_558800_560200
771256	contig_8138_pilon	-	1295	6	Intergenic	novelGene_52454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAACCACCTCCTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307913	280109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280237_280274_280331_288507_288615_304971_305096_306362_306718_307387
771259	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	51	518	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771265	contig_2715_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_173175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAAAACTGTACAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120365	120961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_120400_121000
771266	contig_10541_pilon	-	1639	8	Intergenic	novelGene_144648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	229.663551611429	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	295	975	312553	266448	FALSE	20	CTTTGTTAAAGCCATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKALFSHL	394507	265783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_266464_269575_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_374167_374310_394487
771268	contig_9434_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_150491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAGTAACTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127525	127073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_127100_127500
771269	SIRV5	+	321	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	875	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
771273	contig_5434_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_74693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACTTTTTAGACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399233	400092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_399200_400100
771274	contig_12884_pilon	-	929	9	Intergenic	novelGene_104995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	549.854512007495	16	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	77	871	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915304	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899915_900195_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905761_905834_906224_906349_915235
771277	contig_8798_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_143190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTGGAGCTGCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72644	70867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_-_70900_72600
771278	scaffold_19766_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_34466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGCTAGACACTGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919940	921097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_919900_921100
771281	contig_6375_pilon	-	2318	16	Intergenic	novelGene_73009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_10	45.2445208469121	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	25	1218	334545	330591	TRUE	10	TCCCTACCCATCTCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGGAGGSRVSSGRDLNCVPEIADTLGAVARQGFDFLCMPVFHPRFKREFTQEPAKNRPGPQTRSDLLLSGRDWNTLIVGKLSPWIRPDSKVEKIRRNSEAAMLQELNFGAYLGLPAFLLPLNQEDNTNLARVLTNHIQTGHHSSMFWMRVPLVAPEDLRDDIIENAPTTHTEEYSGEEKTWMWWHNFRTLCDYSKRIAVALEIGADLPSNHVIDRWLGEPIKAAILPTSIFLTNKKGFPVLSKTHQRLIFRLLKLEVQFIMTGSNHHSEKEFCSYLQYLEYLSQNRPPPNAYELFAKGYEDYLQSPLQPLMDNLESQTYEVFEKDPIKYSQYQQAIYKCLLDRVPEEEKDTNVQVLMVLGAGRGPLVNASLRAAKQADRRIKLYAVEKNPNAVVT	334569	327294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722_328788_328997_329115_329275_329370_329613_329724_330332_330718_330806_330866_330970_331049_331223_331386_331851_332016_332240_332291_332427_332541_332992_333128_333302_333389_333701_333821_334444
771282	contig_6837_pilon	+	1839	10	Intergenic	novelGene_149818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	21.2968437932844	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	140	916	11753	15837	TRUE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQVIAYSEHRYRIFGETIDIAVGNCLDRFARVLKISNDPSPGYNIEQMAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEVSVGEVRRWGHFRASLRKHTCFAHHCISSIWHTVVHIRCSINSFSK	11613	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15176_15273_15420_15471_15617_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
771287	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
771288	contig_537_pilon	+	1317	4	Intergenic	novelGene_167594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.3414622058798	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	310	1131	547218	549477	FALSE	25	TCACTTATGATTCCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFNVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	544558	549663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_544580_546658_546877_547147_547288_548725
771292	contig_12570_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_79341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAATACACCACGACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158856	158065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_158100_158900
771296	contig_7657_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_30057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAACTCCATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391405	389015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_389000_391400
771304	contig_10082_pilon	-	1571	2	Intergenic	novelGene_63903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	0	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	118	486	496479	496111	FALSE	10	TCACCCTGAGCTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVCEVANYLFPDCRVISGHLEALQFLQKNSSRYHFRRTKMLPVSGGFHTRLMEPAVEPLTQVLKTIDFKEPLVSVHSNVHGNKYTHPKHIQKLLVKQLVSPVKWEQTIRAIYERKKGTEFPKTFEVGPGKQLGAVLKSCNLQAWKSYSHVEVLEADEAQDL	500300	495025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_496534_500237
771305	contig_9839_pilon	-	2039	2	Intergenic	novelGene_88565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATCTCTCCAGCAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258735	255910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_256835_257620
771310	contig_6589_pilon	-	1269	8	Intergenic	novelGene_26008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAAGAGGAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1731815	1725353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1725545_1725645_1725714_1726906_1727039_1727174_1727248_1728195_1728268_1728993_1729232_1730065_1730150_1731404
771312	contig_5711_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_80296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTCTTCTTCTTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234999	232869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_232900_235000
771313	contig_7171_pilon	+	1540	8	Intergenic	novelGene_101236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.772147840974	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGATTTCAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733962	764968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734332_734404_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
771319	contig_14326_pilon	+	2789	8	Intergenic	novelGene_120733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	147	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	980	1366	441913	442989	TRUE	15	CATTCAGACGCCGGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVIGSYPARLHTAQRQPLTWTPCGVSCLIYPRISLPLETIPQQPQPGRDLKGAQSLPKTNLLSCFQLEVEVLGGLKDEHDGGAQVEFTQVLALAHGDALLVGVRHEAEVVVGAFAVPRAVCVQRSK	440933	493250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_442288_442977_443140_443412_443923_444089_444337_445745_445899_473558_473739_487115_487194_493145
771325	contig_17727_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_172589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATATATTTTGCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40133	42290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_+_40100_42300
771327	contig_3948_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_53428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2082793	2082166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_2082200_2082800
771332	contig_10968_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_84288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165992	167519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166000_167500
771340	contig_11130_pilon	-	1410	3	Intergenic	novelGene_53088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	364	86	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCATGGGTGTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66969	53905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55191_64167_64208_66884
771344	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_95093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
771345	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
771346	contig_9761_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_173180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGGTAAGATCCACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143478	145877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9761_pilon_+_143500_145900
771348	contig_2596_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_53499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCTTTGGCTATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001769	1001342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1001300_1001800
771350	contig_17074_pilon	+	1346	4	Intergenic	novelGene_145178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	69.2964645562817	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTGTGAGTATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591369	605044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_591475_596961_597071_602777_602946_604080
771356	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
771358	contig_10436_pilon	-	756	4	Intergenic	novelGene_108496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2475.73306764324	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	124	393	103480	101962	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTIS	103603	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_101970_102561_102655_102788_102868_103390
771359	contig_9297_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_69849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAACAAGAACTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723327	724197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_723300_724200
771367	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
771377	contig_7657_pilon	+	1998	3	Intergenic	novelGene_30004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	36	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	124	432	116764	118443	FALSE	0	TGTTTGTTGTGGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLCRGKLRLSTVQQTFGLSLIEMLHDSLWILLSADSEGFIPLTFTATQEIIIRDGKLSRSDVFKDSFSQSLDPGPSLEIFRDHTAQSLDTTGCSNHLGSTA	92840	120009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_92925_116724_116843_118213
771379	contig_12032_pilon	-	1103	4	Intergenic	novelGene_139284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	50.3388517946129	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	418	885	117404	108949	FALSE	25	GATGAGTCTATTACGCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRRQCQGDASGRERGAGVAFAEVPAARTHGPASRGLRPPPDSDTRFAITLNNKDALTEDEETLASYGIVSGDLICLILEDAIPAPNLPSSTDSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINGDWIAESWSLVHEYLHVSLQMFYSHFSDWLS	122403	108730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_109186_110302_110531_117401_117697_122278
771380	contig_6710_pilon	-	331	2	Intergenic	novelGene_98304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	1	330	657833	653592	FALSE	25	TCGAGAGCTTCATCAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPI	657833	653590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
771381	contig_11068_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_130553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTAGGGTGGTGTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328117	329191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_328100_329200
771382	contig_16204_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_154497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTAGGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256649	256045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_256000_256600
771384	scaffold_12510_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_151383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAAAATGACATAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287741	286424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_286400_287700
771386	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	56	529	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAGCCTGCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771390	contig_5461_pilon	+	2626	14	Intergenic	novelGene_156842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	62.7634801287327	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	63	1862	839776	884314	FALSE	15	GTACTTTTCATTAGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYNGNKTPRSQVFKVRKVYDVVRKIDVKEMNLTKHTFINQKPHEQNPLELLWHSLDEWLVLIATELMKNKKDSTDITSILLKQKGQDHQDATSIPPFEPPGPESNENLSTGTRESKPDALAGKQEANADCQDVISMTANRLSAVIQAFYMCCSCQMPPGMTSPRFIEFVCKHDEVLKCFVNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMHIIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQSADGTTFQPNSNSYVNPDHLNYFRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKNLQWILDNDISDLGLELTFSVETDVFGAMEEVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWDVVEDITQEERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA	839713	885078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_839917_847665_848004_848497_848567_848812_848901_855694_855807_855902_856001_856180_856269_859943_860094_860622_860820_873609_873742_878380_878480_878768_878840_883585_883700_884211
771392	contig_6434_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_61825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCTGTTTGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551827	550734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_550700_551800
771393	contig_2125_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_147735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	269	328	642590	642531	NA	45	ACCATCATCAACACGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSQAERTEKKIQASSCNTEGFCGYKLNDVGSIKRRWNTEPLYQKELVDAHPFQEAVYDQEPLILKEDVQAALKALAKNKALGIDRIPTEMLQQTNVTLEALSCLCQEI	642858	640176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_640200_642900
771395	contig_17198_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_62362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATGCCCTTGTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772065	770168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_770200_772100
771396	contig_8920_pilon	-	2618	1	Intergenic	novelGene_146068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCAACATAAATACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94850	92232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_92200_94800
771397	contig_12622_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_5777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACAAGCGTTAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134012	135691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_134000_135700
771401	contig_8505_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_173183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9420	8975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_9000_9400
771402	contig_8589_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_107369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCAGTTCGAATCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283903	285973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_+_283900_286000
771404	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_96024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653759	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
771407	contig_6233_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_74819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383625	384145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_383600_384100
771410	contig_5039_pilon	-	1198	4	Intergenic	novelGene_64889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	21.5458168149231	36	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTCTGCCTTCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585110	576547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_577036_579525_579973_584747_584888_584987
771411	contig_2733_pilon	+	2287	1	Intergenic	novelGene_128546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAATTTAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518130	520417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_518100_520400
771412	contig_14925_pilon	+	434	2	Intergenic	novelGene_55058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	586	junction_1	0	4799	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGCCTCTGGCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3187	12119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_3364_11861
771413	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
771419	contig_6589_pilon	-	1205	2	Intergenic	novelGene_26281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	54	1145	2274715	2272133	FALSE	25	TTGTGAATGTGGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFNFGSAGAPTGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSTPGTGGFNFGAPSQPAASTASTNLFTLTTQAPTTQTPTFSFGTTTFASGGTGFSLGINTPKLNLGNPTATQATVNPSAFGLGSSTLTNAIASTSGQAAASGGFVFGSSTTSAPASTTSGGFSFTGGSTAQPGTSSFSVCSMGSSAQPTALAGLPFTPATPAATAAGATQPAAPAPTATTTSTGPALFASIATTPASSATPSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVSLLVFTLCCLL	2274768	2272072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272172_2273662
771427	contig_3942_pilon	-	1443	9	Intergenic	novelGene_128868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	15.9138304628395	6	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	220	738	1491123	1488922	TRUE	30	GGGTCGTCCCAAGAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPVPVGVLFSPFRLPGQERSCEGTRALRVQVPVGPLYIKWRRKVCALSPQVLEDPVLRRGGTEEAREEVASCMEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWVRLGPAGGSQQASRWGSWLHLLGTGL	1492774	1486246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918_1492062_1492706
771428	scaffold_12124_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_22142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAACCTAAAAAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952864	953515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_952900_953500
771429	contig_8318_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_173193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTCCCGTGGCACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42656	41365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8318_pilon_-_41400_42700
771430	contig_8318_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_173192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCAAAATAAAGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41376	41111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8318_pilon_-_41100_41400
771436	contig_12080_pilon	-	1641	7	Intergenic	novelGene_128386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	38.2520878152059	57	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	26	715	177526	171125	FALSE	75	GCAAAATTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKPYQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGLFEFCSRYTGASLQGATQLNNKASGFCYVNDIVIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFFPGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSKCCRFFPAHCPFFLSLN	177551	170198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_171262_171760_171895_172266_172323_172629_172712_175881_176025_177280_177364_177471
771438	SIRV4	-	245	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	369	3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
771446	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771451	contig_18869_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_56234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
771452	contig_19722_pilon	+	1132	2	Intergenic	novelGene_171901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	173	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	584	1087	157212	157715	FALSE	20	GAATCTTAATTGTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKGPIRAPEHLRATVRWDYQPDICKDYKETGFCGFGDSCKFLHDRSDYKHGWQIERELDEGRYGIYDDENYEVGSDDEEIPFKCFICRQTFQNPVVTKCRHYFCEGCALQHFRTTPRCFVCDQQTNGVFNPAKELIAKLEKNRAAGEGGASDFPEDPSEDPIPII	156581	157760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_157066_157112
771455	SIRV4	-	260	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1253	8	1253	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
771456	contig_17198_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_62413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTACAATAAAACCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110489	1112874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1110500_1112900
771461	contig_10013_pilon	-	1722	10	Intergenic	novelGene_125092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	178.556419827819	864	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	770	1288	524733	520669	FALSE	20	GATTTGGCCCTGTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	528544	520234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714_524778_525330_525801_526929_527050_528409
771463	contig_6589_pilon	+	1378	7	Intergenic	novelGene_26175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.2510162500868	1611	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	69	812	1901836	1911490	TRUE	20	TGAATTGATTGTGTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901030	1913573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901085_1901821_1901909_1903195_1903448_1903648_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
771464	contig_299_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_129462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008217	1006009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1006000_1008200
771468	contig_13055_pilon	-	2700	15	Intergenic	novelGene_104952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	44.6443999733403	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	83	1801	143110	88287	FALSE	15	GTTATCTTTATATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDAAIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVTGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHSGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD	159214	87387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88371_89894_90042_103038_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115979_116548_116625_119247_119368_138770_138846_139427_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_159175
771469	contig_2487_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_148466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAAAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148776	146296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_146300_148800
771472	contig_8671_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_126253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCGCTCGTCTGCTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455454	454888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_454900_455500
771475	contig_14577_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_164653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTACCAATAAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96621	93519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_93500_96600
771476	SIRV7	-	286	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	4	91636	4	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
771478	contig_10541_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_144642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATTAAGAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232635	232362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_232400_232600
771486	contig_6710_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_97574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657167	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657169	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
771487	SIRV6	+	535	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	35	-2	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771491	contig_9435_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_156960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGATAAATAACTTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356677	357780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_356700_357800
771492	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8467	-1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
771497	contig_10235_pilon	+	1137	6	Intergenic	novelGene_46424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	166.11489999395	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	19	738	210483	212152	FALSE	25	GTCCTAATGGCCACACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210464	212551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047
771500	SIRV4	-	229	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1294	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3864	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
771504	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_96865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653763	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
771505	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1619	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
771506	contig_20460_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_163953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATAATCACTGCTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18464	19620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20460_pilon_+_18500_19600
771507	contig_10907_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_144910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAAGCAAACCCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36084	37895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_+_36100_37900
771512	contig_11253_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_126823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAACACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108441	110079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_108400_110100
771514	contig_13547_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_104852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACTCCATGTCTACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15199	14645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_14600_15200
771520	contig_5649_pilon	+	2210	11	Intergenic	novelGene_82347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	1764	2210	843626	850811	FALSE	15	CACCCCTTTGAGGGGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLKNLGTSHSFSGYSKRGTRSGHRWLYWREKLSATCSSCSSLGVLILYERGSLAMSMVSLVKGSPGTGTLISDSFCSMSLSISGVRVVASFRSSLVIFSGLEGRSTPSSRSASSSSSTFSLRTSILAQHLHHSVRQGLATCGPLRPP	822422	850811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_823238_824259_824385_824606_824740_825742_825819_828028_828155_836703_836926_837886_838045_843517_843646_845532_845701_846053_846256_850754
771521	SIRV2	-	567	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	83	2967	-83	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATGCGGCAAATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
771522	contig_253_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_129767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAATACATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781177	779111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_779100_781200
771524	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
771531	contig_13021_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_8256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTCCCTAATAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220405	221792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_220400_221800
771532	contig_266_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_166308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718408	720630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_718400_720600
771533	contig_8354_pilon	-	2076	20	Intergenic	novelGene_24071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	145.443271251559	1	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	874	1995	151667	65549	FALSE	40	TTAAAAATAAAGCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRASLVPVRKLKDVPLLPSLDYEKLKKDLVFGSDRLKAFLLQALRWRLTTSHPGEQRETVLQAYISNDLLDCHSNNQRSVLQLLHSQSEVVRQYTARLINAFASLAEGRLYLAQNTKVLRMLEERLKEENKDVITRENVLGALQKFSLRRPLQTAMIRDGLIFWLIDILKDPDCLSDYTLEYSVALLMNLCLRSAGKNTCAKVAGLVLKVLSDLLGHENHEIQPYVNGALYSILSVPSIREEARAMGMEDILRCFIKEGSAEMIRQIEFIIKQLNSEELLDGVLESDDDEDEDDEEDHDTMEADLDKDELIQPQLGELSGEKLLTTEYLGIMTNTRKPIAKQRKGPAAVQWSADKPLRRPITPGGHRTGHPV	195862	65467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_65678_76088_76194_118879_118936_123405_123497_128310_128386_132891_132969_134289_134430_140151_140276_141483_141575_148518_148612_150588_150704_151641_151677_152216_152245_165443_165543_169664_169823_180117_180149_187891_187985_189565_189722_190261_190433_195734
771534	contig_12437_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_169086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAGGGTAGAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134312	132047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_132000_134300
771541	contig_15327_pilon	-	685	4	Intergenic	novelGene_70481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	208.846567816876	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGCACTTTATGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382969	372583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_378885_379059_381602_381720_382830
771543	contig_6710_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_98194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	30	AACACCTATCCCTATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
771547	contig_6544_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_142108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTATGAGGCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300013	298091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_298100_3e+05
771548	contig_2069_pilon	-	707	3	Intergenic	novelGene_23500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	44	325	1509802	1508747	FALSE	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509845	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
771556	contig_14666_pilon	+	2234	12	Intergenic	novelGene_39521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5082105872024	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	329	1162	443672	446376	TRUE	70	GCAAATTAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKVLPGRWTSCSALGAPGMGLQESSSWASVHRTVTVLNSSRNVCAVSLILVQTLM	440716	449288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_440824_441064_441154_441955_442067_443650_443759_444230_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446664_447982_448067_448153_448295_448638_448769_448858
771558	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771561	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
771567	contig_755_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_119782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGATTTCAACTCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545893	546407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_545900_546400
771568	contig_7056_pilon	+	2493	18	Intergenic	novelGene_43587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	201.160181659098	337	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	145	1947	661004	718397	FALSE	35	GTGCAGAAAATGAGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSPILTLARRATGNLSASCGSALRAAAGRGVGDGVGDGAARAAAKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELALPSYPKPVRVCDSCHTLLLQRCSSTAS	651567	718943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_651698_660989_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858_716937_718253
771570	contig_1406_pilon	-	2637	3	Intergenic	novelGene_25450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	14.5	1	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	96	1214	586902	585784	TRUE	25	AAAGCCCTGGCTTGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRALKILWLSGAELGFLPSSFCELASLESLMLDNNGLQALPAQFSCLQRLKMLNLSSNLFEEFPAALLPLAGLEELYLSRNQLTSVPSLISGLGRLLTLWLDNNRIRYLPDSIVELTGLEELVLQGNQIAVLPDNFGQLSRVGLWKIKDNPLIQPPYEVCMKGIPYIAAYQKELAHSQPAVQPRLKLLLMGHKAAGKTLLRHCLTEDRVEGNQGGGDKEKSSPPSPPPVSKGIEVTSWPADASRGLRFIVYDLAGDESYEVIQPFFLSPGALYVLVVNLATYEPCRFPTAVGSFLHRVGARVPHAVVCIVGTHADLCGEWELEEKCLDIHRQIALQEKHDAEGLSHLAQVVDEALARDFELRSASPHAAYYGVSDKNLRRRKAHFQYLLHHRLQILSPRAAC	586997	484666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484848_498646_498774_584668
771571	contig_4336_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_152353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACCTGCTAGTGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305645	302931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_302900_305600
771574	SIRV5	-	294	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
771579	contig_9058_pilon	+	1230	5	Intergenic	novelGene_149365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	156.001602555871	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	85	681	47327	56652	TRUE	10	TCCCCAGTGTCTGCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNDEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPPPSHRSQARGHRPPPPGHRVQHQQQKRPPPPSGTQVHQQKGPPLPRPRVQQKPLPGAAENS	46626	57250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_46655_47270_47502_51837_51961_56353_56848_56896
771580	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
771581	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771583	contig_10432_pilon	-	2431	1	Intergenic	novelGene_171310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	366	1101	1138	2238	150346	149246	NA	20	TAGTGCTGACCCCTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDAAVLKRRGYIMGINLGEGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKAPTDFLEKFLPREIEILAMLNHRSIVKTYEIFETSDGKVYIVMELGVQGDLLEFIKTRGALHEDDARKKFHQLSSAIKYCHDLDVVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDDSGRLTLSKTFCGSAAYAAPEVLQGIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSNIKKMLRIQKEHRVNFPRSKHLTGECKDLIYRMLQPDVNRRLHIDEILSHCWVQPKARGLSSVAINKEGESSQGTESSWTPDCTPDKKSATKLEPREEAGPKTSPEEEPVEVSRQSETLGFDGEHMASEPEERAPQPPQQPSEMHSQ	151483	149052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_149100_151500
771586	contig_15120_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_108023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248198	246187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_246200_248200
771589	contig_5415_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_146145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAACATATCAGATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226728	227783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_226700_227800
771590	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771591	contig_5050_pilon	-	1766	12	Intergenic	novelGene_110271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	213.191761737473	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	764	1444	636111	507209	FALSE	20	AGACTTGGATGTTTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVNELDGIPLILDNCSIDDSNPFLTQWVVYTVRNLTEDNSQNQDLIAKMEEQGLADPSALKKMGFEVEKQGEKLILKSTSEAPQP	716404	506886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_507212_507713_507902_548361_548426_623124_623295_625244_625354_635964_636117_646832_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
771594	contig_4782_pilon	-	2125	2	Intergenic	novelGene_73594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	524	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAATGGCGCCGCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77430	64179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_64367_75492
771600	contig_19647_pilon	-	2195	3	Intergenic	novelGene_144008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	744	junction_1	161.5	1	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATCGTGACTGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89529	73381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284
771601	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8467	-1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
771604	contig_7202_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_17585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27806	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
771608	contig_12622_pilon	-	1289	12	Intergenic	novelGene_6031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	342.815566152843	104	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	77	1096	1691275	1685305	FALSE	10	CCCTGTCTTCTCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTAPHVDNPG	1691558	1685111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685331_1687847_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
771609	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
771610	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
771612	contig_3948_pilon	-	1884	13	Intergenic	novelGene_53304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	473.322146287987	129	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	140	1561	1494311	1468245	FALSE	20	TCATCAACAGGTTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSNSTLQSPTYVPDPTSSGKRVRTPSHVPPFPAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1510904	1467921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485713_1485887_1485988_1489829_1489929_1490738_1490872_1494190_1494250_1494291_1494313_1510766
771615	contig_6445_pilon	-	1195	3	Intergenic	novelGene_77111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	216	116	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	371	718	1357489	1357142	FALSE	10	CACCTGTGTGAGGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPFGGTGLLGGLRQGLSPSLTSFPCLEGGGRDSGRGLGPVVCVENLDSLWWLYFWTLLLPPHCFLLFLPRPLGPASLLPWVVSGPQQEGLRKQQLHSMFSHLLGIRHGLCGMR	1365088	1356664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1357583_1358021_1358249_1365038
771617	contig_14426_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_170620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	537	839	95411	95109	NA	35	ATTAAGTGTACCAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVKTVARPSLGALPLSFIRESTLVRSHMSVKSAARSSVTVQTLLNTREPTLGRNPMSVMTVGKRSARAAASLNITKSILGRSPISATCVAKPLGGIHIS	95947	94371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_94400_95900
771621	contig_2969_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_157063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCCTTCCCAGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804678	806496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_804700_806500
771623	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
771624	contig_14209_pilon	+	1175	11	Intergenic	novelGene_88334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	196.058052627277	99	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	36	854	32366	37768	TRUE	10	GGGGAGCCTGAGCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32330	41013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38023_40848
771625	contig_500_pilon	+	1286	4	Intergenic	novelGene_30980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	328.357528719332	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	373	945	1466032	1480636	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPLSPCLLNCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITAMDRQSSVIICVFLPS	1465659	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1480584
771627	contig_14441_pilon	+	582	4	Intergenic	novelGene_100580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	54	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	116	346	116876	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPATTSAARSSSMGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111198	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111280_116841_116963_117220_117344_117539
771628	contig_9727_pilon	-	1915	14	Intergenic	novelGene_86359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.26767123282468	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	37	1743	561878	557882	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGAREVLTLQLGHFAGFVGAHWWNQQDAALGRPTDGKERPGELCPDVLYRTGRTLRGQDTYTPRLILMDLKGSLSSLKQEGELYRDKHLDAAIAWQGKLTTHKEELCSKNPYLQNEGRPEGVLRSDGVWRVKSIPNGKGPLPLRTAKTADPLTPTEGSIRVWSDFLRVHLHPRSICMIQKYNHDGETGRLEAFGQGESILKEPGYLEELEDRLHFYVEECDYLQGFQILCDLHDGFSGVGAKTAELLKDEYSGRGIIAWGLLPGPYSLGEPQKNIYRLLNTAFGLVHLTAHSSLVCPLSLGGSLGLRPEPPVAFPHLHYDATLPCHCSAILATALDTVTVPYRLRSSPLSMVHLADMLSFSGKKVVTAGATIPFPSGQSLPDTLMQLGGATPWIPLSACGDPSGARCFAQSVVLRGLDRARHTSQLTPGTPLPSPLHACATGEEVLAQYLQQQQPTALSSSHLLLTPCKVVPPYPRLLSSCSQLGLLTDAPPTRAAAASIPVFGALCSSSSLHQALGGLARELARLDLRRWASFMAAGVEQDDLEEMLQELYSLAQCYRDGSGLVD	561914	557709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_558097_558361_558472_558557_558663_558884_559064_559136_559269_559542_559696_559803_559939_560023_560142_560311_560451_560537_560593_560809_560886_560973_561044_561555_561692_561794
771637	contig_15063_pilon	+	480	2	Intergenic	novelGene_13344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	202	342	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34880_36592
771638	contig_6630_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_30744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1449	1820	836212	836583	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGADGLSRDTPQTPQSGVKKKGKGRRCRGRLLTGVEVPPGSGLTPGQVIPVGASRRSRHRQGRRGQATKAKEEAKRKKRNRQVRNVGSHTDHRQGLFTECQSWAHWIHPKTEAPRLDNLPKD	834763	837315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_834800_837300
771642	contig_8153_pilon	+	1565	7	Intergenic	novelGene_34800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.283687470007	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	847	1563	30030	38139	FALSE	25	TCCAAAATCTGTCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQICYCGPGLSYELKGLSPATTYYCRVQALSVVGAGPFSEVIAWATPPSVPAIVTCLQEISDDDIESSHYSPSTCLAISWEEPCDHGSEILAYSIDFGDKQPLTVGKVTSYIIDSLQPDTTYRIRIQAFNSLGAGPFSHVIKLKTKPLPPDPPRLECVAFSHQNLKLKWGEGTPKTLSTDSIQYHLQMEDKNGRFISLYRGPCHTYKVQRLNESTSYKFCIQACNEAGEGPLSQEYVFT	26588	38141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_26953_27094_27397_29109_29224_29963_30114_30202_30487_30606_30820_38003
771645	contig_4783_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_108399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTTTTAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262952	264522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_263000_264500
771652	contig_10003_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_88216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACTTTTAATGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553280	551194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_551200_553300
771654	SIRV6	+	401	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
771656	contig_14441_pilon	+	707	3	Intergenic	novelGene_100688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	197	706	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPLYFGQGTRLTVTDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGESLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	114113	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114161_116578_116971_117528
771657	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	54	519	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771658	contig_11794_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_173196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAGAGACCCAGAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88045	85890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11794_pilon_-_85900_88000
771660	contig_6654_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_85708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGAACGCCTTTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172264	174719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_172300_174700
771661	contig_3975_pilon	+	2867	1	Intergenic	novelGene_54718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	282	308	1482055	1482081	NA	45	TTAAGAGAGAAAATGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSDLTKVRCSFHCTIAVVTSDPPSTILGCLHQEGEHAFCRIPKAVSCWLIGAIIFTIFLFQSDGALVAQWLRAWLLTKRLTVQIYQPLLGNSMGQFYSVL	1481773	1484640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1481800_1484600
771662	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771672	contig_12080_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_128348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54198	52033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_52000_54200
771673	SIRV4	-	606	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	8	3	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1389	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
771675	contig_6278_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_119821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAGGAAAGGTGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498100	496170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_496200_498100
771676	contig_12005_pilon	-	1686	8	Intergenic	novelGene_160476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_7	44.8043365248117	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	37	1557	216421	192601	FALSE	35	ATAAGGTTTTAAGATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLWKNLLGSAAMGKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPCSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKHKLIAWEHTKTVQGYRLTNAGYDYLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGHQFALKLHRLGRTSFRNLKNKRDYHKHRHNMSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYERKFPVPKPIDYNRHAVVMELVNGYPLCQIHHVEDPASVYNEAMELIVKLGSHGLIHGDFNEFNLILDKDDHITMIDFPQMVSTSHPNAEWYFDRDVKCIRDFFIKRFSYESELYPTFRDIRREDSLDVEVSASGYTKEMQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRYRFLLIDFFFTFILKPVLFSILVKSIFSNGVTALYSATIV	216457	192471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_193250_194007_194101_198002_198195_202798_202888_205826_206003_208295_208413_209587_209727_216355
771684	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
771686	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
771689	contig_18869_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_56263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73568	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
771692	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_96099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
771696	contig_2730_pilon	+	1397	4	Intergenic	novelGene_135355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	328.54663122438	84	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	187	402	379372	390814	TRUE	5	TTTCCTGTGCAGTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THTTAAATAASSSYYCWAGLGWAGRAAPEHSSTDQLQREEKSHSPQTKLQELSVSENTASSPMASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL	291585	394316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_379343_379459_390685_391144_393650
771697	contig_10109_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_131335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCCAGCATTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201249	203825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_201200_203800
771698	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
771700	contig_14243_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_57429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCCCAGCCCCCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594066	592625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_592600_594100
771702	contig_1984_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_173201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAGAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232869	230958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_-_231000_232900
771704	contig_7606_pilon	+	1500	3	Intergenic	novelGene_162835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	65	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGCAAAACTGTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55888	110064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7606_pilon_+_56053_108565_109775_109937
771705	contig_8587_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_159142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCTCAGCAAGCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479980	481394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_480000_481400
771718	contig_21027_pilon	+	861	4	Intergenic	novelGene_127571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	649.644176111474	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	24	437	1763	8405	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILKCPLSHLISLILLLFHSEAACGPAQQRPYKMQTFRIWDVNQKVFYLSNNQLVAGYLQAANAKLEEKMNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLHAPSRIVFLKCKPDYYTPLPQSFSVNCASRIKP	1739	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_5261_6365_6475_8305
771719	contig_15456_pilon	+	914	2	Intergenic	novelGene_139511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1580	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATTTATTTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141938	143130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_142040_142317
771721	contig_7323_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_173213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAATGAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57399	56148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_56100_57400
771723	contig_4782_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_73628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267487	265638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_265600_267500
771724	contig_8538_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_4729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	75	308	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842753	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
771726	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771733	contig_6102_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_32060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1005	1322	589420	588940	FALSE	85	AATGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPQSGRKETQALGLSTGLTPASCHLVRTPSLDHHQARQQQLLQETINELDKRRKEVLDAVKALLGRLTTLIELLLPQLEEWKVQQQKACIGAPLDRGLEQLEKW	590424	588655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_589093_589255
771736	contig_5936_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_53565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGATGCAGCTGAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188268	188621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_188300_188600
771737	contig_5936_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_53566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGGGCCCAGTGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188934	189492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_188900_189500
771738	contig_5936_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_53567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAGAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189689	190730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_189700_190700
771739	contig_11734_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_173220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCCCGTATCAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2914	3768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11734_pilon_+_2900_3800
771745	contig_6710_pilon	-	456	2	Intergenic	novelGene_98193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	25	ACACCTATCCCTATTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
771748	contig_15084_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_116677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAATTATTTTCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142867	142183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_142200_142900
771751	contig_14441_pilon	-	1010	2	Intergenic	novelGene_100793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAACTTGTGCCCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137432	134637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_135576_137360
771753	contig_15185_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_99375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	744	1112	40274	39906	NA	10	GTGTAGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLVSFAIPLGLKGANPRSREGTSLPSEEEPGMEHFLWTQGVFTENLLDPGDRESCLTQEIEAAASTTEYIGRQMAAAEPGYWHRMAWWASRPMEQNGYSGYADRQSERAEHLMARGLLVE	41017	39688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_39700_41000
771754	contig_13608_pilon	-	2280	2	Intergenic	novelGene_52394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	344	1564	451329	450109	FALSE	20	AGTGTTTTCAAGCATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGVLFSSSEVSADNVQSHCPSSANHLGSSSTLFDFSGPVVKCGLYHNSPVVPSHGLLHKKKKLDRPKSEKKLESCKLTEELSLADLINDMPRDSFYESYKSQPSVRLSSTDSLESLLSKSLDAELLRPHASECISKGDTQFKGVSDLKSLMIKSTPDKSLFIQNKSLPDFQNIPVQNSLRNLNNPSHLTSSLENMTLDNLNASKKTEFESVPLAEQSTKNSIFKKDNLQFSQCESPSLAELCQEHKENNPNQCFTSSSDLCNPSSASFTDLSLGSFPLSQLANRHQSSTGVSELTGSLSSLAFCKASPTRDLNNLSLSDLIAETIDVDKSQIKNDSYKFSSSEMRTSGIDSNIDLSVLIKTPDFVPKPVVDQSAAPAPGTKVLNSKLGKNSNSAKDNKKNSKGSLTRKPPFSLSWTKALAARPSAFASTLCLRYPPKSCKRHTLDLYKTFLYSRQVQDVKDKEKSPLIAITPFDFKSASPDDIVKANQKKAFTRE	453260	449392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_451593_453180
771755	contig_11825_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_155412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATACGACCCTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86446	85085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_85100_86400
771756	SIRV6	+	512	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	47	2	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCGGTAAACGTAAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771760	contig_9633_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_139661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGTCTTCCGCAATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228363	1229474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1228400_1229500
771761	contig_9633_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_139662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232341	1233970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1232300_1234000
771764	contig_5988_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_16160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGCTGGTGGGTTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1988058	1987064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1987100_1988100
771772	contig_10627_pilon	+	2550	7	Intergenic	novelGene_60056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTAGAAAATGAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205089	1224143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1205401_1208024_1208110_1209965_1210064_1211769_1211833_1215547_1215702_1219544_1219683_1222442
771773	contig_10437_pilon	-	1911	7	Intergenic	novelGene_38455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_4	9.56846672960488	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	107	823	1030186	1021467	FALSE	70	TATGAAAAAGTAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERLDSQNREVMKHLKAICFLRPTKENVDYLIQELRRPKYSVYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVTEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTALLLSLKKCPMIRYQLSSEAAKRLAECVKQVITKEYELFEFRRTEVPPLLLVLDRCDDTVTPLLDQVQDRPLSAA	1030292	1020378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1021608_1022051_1022190_1022311_1022381_1023404_1023485_1027648_1027710_1029382_1029518_1030093
771774	contig_6494_pilon	+	633	6	Intergenic	novelGene_108565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGTGGCTCGTGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2104	8314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_2177_2630_2828_5578_5660_6395_6489_6750_6883_8256
771779	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	327	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
771784	contig_16578_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_148695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGTTTCTCACAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357240	354897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_354900_357200
771787	contig_19816_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_156456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATCATTTTGTGATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22311	20706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_20700_22300
771788	contig_19816_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_156455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCAAATAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15092	14365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_14400_15100
771789	contig_6710_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_98133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	TACCCACCCATCTCGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
771790	contig_13780_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_149049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAAAAAAAAAAGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600851	602924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_600900_602900
771792	contig_6914_pilon	-	1441	7	Intergenic	novelGene_151743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	23.3357141642495	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1437	4	1440	140620	137684	FALSE	25	AATATATGGCCTGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMLAQLQRCLETVLVFSGLEIATTFEHYYQHYMADRLLGVGPSWLEGAVLEQIGPCFPNRLPQQMLQSLNTSEELQHQFHVYQLQQLDQALLKLDDTEKKIQVGPEASGQENEREEEEEAGATAAAEAVEKEEEEEEENENEDLYYEGAIPEVSVLVLSPSCWPISSINHILNPKTCLPSYLRGTLNRYSNFYNKSQSHPGLETGPQRRLQWTWLGRAELQFGDQILHVSTVQMWLLLYLNDLKAISVDKLLELSGLSPDMLNPAIGPLTSSRGPLDLQEQKDAPRGVLKIRDDSEEPRPRRGNVWLIPPKMYLKAEDEEGQNLEKRRNLLNCLIVRILKAHGDEGLNTDQLVCLVLEAWQKGPCPPRDLVNSLGQGSACSSTDVLSCILHLLGKGTVRRHDDRPQVLSYAVPVTVMEPHTESLNPGSSGPNPPLTFHTLQIRSRGGALCLLHHHPDLLYLPVALEMWSGAFYRNKMQEF	140623	137682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_138059_138295_138502_138577_138705_138850_138997_139790_140071_140171_140389_140534
771793	contig_16666_pilon	-	1340	4	Intergenic	novelGene_61742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	726.337999067162	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	29	463	59688	55974	FALSE	5	TACCTTGTCTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59716	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56652_58098_58264_59552
771796	contig_5903_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_173222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCATTCAAGCATTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363564	362203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_-_362200_363600
771797	contig_3472_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_166957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	474	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTTATTGAGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063249	1064520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_1063200_1064500
771799	contig_16870_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_155520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAGGGCAAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206072	206478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_206100_206500
771800	contig_16870_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_155521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAGCTGCAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207084	207579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_207100_207600
771801	contig_5230_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_173232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAAATTTGAATACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34478	35233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5230_pilon_+_34500_35200
771804	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	54	516	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771807	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
771812	contig_5514_pilon	+	1723	6	Intergenic	novelGene_75289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	131.469235945144	137	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	345	1352	94265	95955	FALSE	35	TCTGGAAAAAGCCTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACTRTLLGDPPPLLAPLRPPLSGALASISETIHIHHRYWRSLRIKKVEDKEEETSNSELVTKEPQPANPGSAEGMATPEENILEAGTRKATSASPVEGSTLGQAKSETAVMELTQDKSLEAATGGAVLDQTTSEGPVGDTKLASRTDNQTTPSSPVQETTPHISPSNLIESLRTLELSNKAQKAPDSQTPEEEKLLGEAAGGRRDLDDSMLMGFGDTDKATFYAVTPLPWCPHLMAVCPIPATGLDVTQPCRDCGSLQENWVCLSCYQVCCGRYINAHMIQHHEDSGHPLVLSFVDLSTWCYHCQAYVHHQALLDVKNFAHQNKFGEDMPQPH	93920	96326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_94407_94528_94939_95017_95129_95259_95407_95509_95639_95886
771813	contig_7839_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_45746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	234.034185537071	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	291	773	1079288	1086890	TRUE	80	AAAAAAAGAAAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIMIKGGVWRNTEDEILKAAVMKYGKNQWSRIASLLHRKSAKQCKARWYEWLDPSIKKTEWSREEEEKLLHLAKLMPTQWRTIAPIIGRTAAQCLEHYEFLLDKAAQRDNEEETTDDPRKLKPGEIDPNPETKPARPDPIDMDEGRLFNLCEKATPQD	1078997	1096674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1079333_1082113_1082218_1083655_1083818_1086346_1086475_1086846_1086987_1087916_1088017_1096616
771818	SIRV6	+	537	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	10	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771819	contig_6533_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_114662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283400	284296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_283400_284300
771821	contig_12010_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_160957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTACTTCTAATTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223227	221079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_221100_223200
771831	contig_8452_pilon	-	854	4	Intergenic	novelGene_48092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	1489.41875314574	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	247	549	981695	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGASRRRGHWPLSGSTLPIPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	982015	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_981637_981738_981811
771834	contig_11378_pilon	-	2013	3	Intergenic	novelGene_112233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	60	494	322446	322012	TRUE	45	ATAAATATGAATTCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLQKQRNINGCQGLRNKGWQEKWVYLYKGNMRASSGDGNGLSFDYQRQILVGIFYFRWQGVTIEGSWVMSTQDGSVLFLTTACECTISQNQSLIFKQVNCSLGKKACKINVSSQNEIFCYPTSINSLIYSFQVFSIYVMYVK	322505	316298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_316378_320448_320556_320678
771835	contig_6710_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_98278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	15	GCATCCATGTCTGGTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
771836	contig_4900_pilon	-	1329	7	Intergenic	novelGene_159056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	86	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	20	GCACAAGCAGGCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1178022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1178444_1181396_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
771840	contig_9995_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_47743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACACCCCACAAGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580753	578958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_579000_580800
771847	contig_5217_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_135754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCCAAACCCTAGCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557369	558464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_557400_558500
771849	SIRV6	+	359	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3177_10727_10819_11031_11109_11205
771850	contig_13097_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_107676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGATAACATGTCCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68988	69393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_69000_69400
771851	contig_20718_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_169151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111731	113015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_+_111700_113000
771852	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	3	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	139	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771854	SIRV6	+	491	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10784_10993
771861	SIRV2	-	240	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	686	22	686	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
771864	SIRV6	+	292	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	412	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2840_10682_10819_11031
771865	contig_9895_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_144693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGAAAAAAAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157120	156569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_156600_157100
771868	contig_5954_pilon	-	2020	15	Intergenic	novelGene_28407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	111.778753776907	12	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	22	666	41040	38145	TRUE	15	CGTCTCATGTTTCCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQVRQLRMAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVHSAQGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGQHLGGL	42770	16056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16373_20379_20458_21235_21276_21425_21647_24546_24725_35373_35535_35645_35721_36230_36317_36623_36708_38029_38200_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_42750
771870	contig_5549_pilon	+	811	5	Intergenic	novelGene_81591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1408.35702149704	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	166	639	86768	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLPPCLEVCFLGTRPPTSRPTALSAVSRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82140	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82223_86684_86819_91687_91835_93264_93412_96620
771875	contig_10940_pilon	-	2061	2	Intergenic	novelGene_49191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	29	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTCGTGTGCGGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402860	399584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_400455_401669
771879	contig_987_pilon	-	2266	1	Intergenic	novelGene_72352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1154	1552	1293468	1293070	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEGGRASGQGGTSCSLSHEAGRPCSLCAPSEQSVSPISGGTATLTLSWPGLPGPPLILPRQSRSGSQPFFSFPSWALDRRPREASLAPCLLLHQQQQHNSGPGCSCGEEGWGLLSIPLFLGTQGTGGDLPA	1294621	1292355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1292400_1294600
771880	contig_1639_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_74902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCATGTTAAAAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296782	296460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_296500_296800
771881	contig_5643_pilon	+	951	8	Intergenic	novelGene_39075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	836.780540804689	6	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	161	742	631498	641217	TRUE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASWLGPVARTRATSPSRSGSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631250	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631563_638110_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
771882	contig_8801_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_66275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATGAAAGAATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420207	422533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_420200_422500
771884	contig_3861_pilon	+	1586	2	Intergenic	novelGene_57898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1004	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGAAAAACGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151384	157506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_152949_157484
771886	contig_7057_pilon	+	1630	10	Intergenic	novelGene_123192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_5	129.715167545503	327	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	69	1502	401608	410055	FALSE	10	CCATCCCTGGCTGGGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPAPGLPGAGGPVVPGPGAGIPGKSGEERLKEMEAEMALFEQEVLGAPITGIPTAVPAVPTVPTVEAMQVPAAPVIRPIIATNTYQQVQQTLEARAAAAATVVPPMVGGPPFVGPVGFGPADRSHLDSPEAREAMFLRRAAVAPQRAPILRPAFVPHVLQRADSALSSAAGGPRPMGLRPPHQALVGPPLPGPPGPPMMLPPMARAPGPPLGSMAAMRPPLEEPAAPRELGLGLGLGLKEKEEAVVAAAAGLEEASAAVAVGAGGTPAGPVVIGPSLPLALAMPLPEPEPLPLPLEVVRGLLPPLRIPELLSLRPRPRPPRPEPPPGLMALEVPEPLGEDKKKGKPEKLKRCIRTAAGSSWEDPSLLEWDADDFRIFCGDLGNEVNDDILARAFSRFPSFLKAKVIRDKRTGKTKGYGFVSFKDPSDYVRAMREMNGKYVGSRPIKLRKSMWKDRNLDVVRKKQKEKKKLGLR	401539	410183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_401736_401970_402116_403663_403749_403838_403914_405336_405403_405479_405656_406250_406584_406911_407030_409662_409858_409942
771890	contig_15327_pilon	-	3814	1	Intergenic	novelGene_70442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1020	1460	93021	92581	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATDEGKFHQALPGRWGGGVQNKESVQDMLQGTPWCCRGRQALLKGSPFECCRGPPSSSPHYQTQIPKLQVPALQVSVADSHFSHQNLHTESQNQLWVLVSLCWTVGREWMDPLHYPPGPGPESWVWVKPDWPNANERKESCGI	94040	90226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_90200_94000
771892	contig_13542_pilon	-	2023	7	Intergenic	novelGene_131543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_6	16.1701027276336	20	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1235	1813	568558	566165	FALSE	25	AAAGGAGCCTTTGGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSKLKDIRNAWKHSRMFFGKNKVMMVALGRSPSDEYKDNLHQVSKKLRGEVGLLFTNRTKEEVNEWFTKFTEMDYARAGNKATFTVSLDPGPLEQFPHSMEPQLRQLGLPTALKKGVVTLLSDYEVCKEGDVLTPEQARVLKLFGYEMAEFKVTIKYVWDAQSGRFEQMGDDLPESASESAEDSEEDDDD	571747	565954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_566315_566455_566533_566915_567068_567426_567495_567761_567844_568508_569572_571526
771894	contig_4832_pilon	+	1964	13	Intergenic	novelGene_163391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	331.359405412847	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	141	1412	248049	295025	FALSE	45	AAAATCAGAGATTGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVWLVGGCPRGGPRARAACARGSVARVCRGLGSREWRHEPSLHFTMSFLIDSSIMITSQILFFGCGWLFFMRQLFKDYEVRQYVVQVIFSVTFAFSCTMFELIIFEILGVLNSSCILVHKQRLLFSCLLWLTFMYFFWKLGDPFPILSPKHGILSIEQLISRVGVIGVTLMALLSGFGAVNCPYTYMSYFLRNVTDTDILALERRLLQTMDMIISKKKRMAMARRTMFQKGEVHNRPSGFWEMIKSVATSAPGSENLTLIQQEVDALEELSRQLFLETADLYATKERIEYSKTFKGKYFNFLGYFFSIYCVWKIFMATINIVFDRVGKTDPVTRGIEITVNYLGIQFDVKFWSQHISFILVGIIIVTSIRGLLITLTKFFYAISSSKSSNVIVLLLAQIMGMYFVSSVLLIRMSMPLEYRTIITEVLGELQFNFYHRWFDVIFLVSALSSILFLYLAHKQAPEKHMAP	247908	295577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_248091_263349_263410_264470_264575_266318_266432_275886_276008_279287_279369_284328_284439_286314_286404_287347_287441_291614_291711_293618_293709_294615_294682_294818
771897	contig_7234_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_145965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGGGGAGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564464	566843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_564500_566800
771898	contig_12092_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_163447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAGAAAGAAGAGCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218579	219479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_+_218600_219500
771899	contig_15866_pilon	+	1760	13	Intergenic	novelGene_63637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.005153987976	2	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	673	1089	623258	633133	FALSE	15	TAAGTGTGGCTTGGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	459036	633804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459072_581409_581475_581685_581701_601010_601094_608107_608223_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623219_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
771903	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
771906	contig_8844_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_173236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCATGTCTCTGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77511	78388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8844_pilon_+_77500_78400
771907	contig_9706_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_20908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCCCACGGAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100818	99625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_99600_100800
771908	contig_1379_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_134585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425372	426683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_425400_426700
771909	contig_8538_pilon	+	1386	3	Intergenic	novelGene_5110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	3.5	152	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	135	404	966454	969857	FALSE	25	CAGTCGAGTCTGTGACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAGCLQHRLWGRSEGGAEGGGGGGPQPAAPAHRSAVLPPQSGTMEGQTLRTFYTQLVLLPAVLHYAQYVLLALGCALLLLIPVVCQIRSQEKCYLFWSSSKKGSKDKEAIQAYSESLMTSPPKGTVLQEARL	966319	975782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_966595_969728_969858_974800
771913	contig_5936_pilon	+	2113	5	Intergenic	novelGene_53590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16.8226038412607	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	7	1449	466533	502342	TRUE	30	TAAAAGATGCTGTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSINNMNNHQLTHLQSLLNNNQMFPPNQQQQQLLQGYQNLQTFQGQSTIPCPANNNPMACLFQNFQVRMQEDAALLNKRISSQPGLTALPENLNTTLLPFQDTPCELQPRIDPPLGQQVKDGLVVGGQGDASVDAIYKAVVEAASKGMQVVITTAVNSTTQISPIPALSAMSAFTASIGDPLNLSSAVSAVIHGRNMGGVDHDGRLRNTRGVRLPKNLDHGKNSNEGDGFEYFKSASCLASRKQWDGEQSPGGEQNRWKCEEFLDHPSHIHSSPCHERSNNVSTLPFLPGEQHPIMLPPRNCQGDKILEENFRYNNYKRTMISFKERLENTVERCAHINGNRPRQSRGFGELLSTAKQDLVLEEQSPSSSNSLESSLVKDYIHYNGDFSSKSINGCVPSPSDAKSISSEDDLRNPDSPSSNELIHYRPRTFNVGDLVWGQIKGLTSWPGKLVREVEDTNRRFGSLQQSPEKEQKKWKAK	466526	507061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_466734_469967_471130_483455_483518_502324_502401_506455
771917	contig_7861_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_77405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCTCCAAAGATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70133	69270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_69300_70100
771919	contig_12964_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_131734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTGATTGTAATATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633050	634175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_633000_634200
771920	contig_9415_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_109842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACCCTGAGACCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1944463	1944018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1944000_1944500
771926	contig_5217_pilon	+	492	4	Intergenic	novelGene_135728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.816496580927726	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	2	490	506327	507097	FALSE	15	CAGTGAGTCCTTGGGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAGWPGPDRCGASGHQGTCLPERPAQHFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLEGIQAAFDQDWASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDKEGLIPPELFYVGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGENF	506325	507099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_506408_506495_506584_506673_506817_506920
771927	contig_5217_pilon	+	1479	5	Intergenic	novelGene_135729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_2	4.33012701892219	108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	231	890	507486	509786	FALSE	30	CTCATCTCAAATGACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLRGLQKTADFVEAIEGARAACAEASRAGVRAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLVCTFLVCALLLLNPWMAGLIVLVLAMMTVELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFTVHVALGFLTTQGSQNLRAARALEHTFAPVTDGAVSTLLGLLMLAGSSFDFIVRYFFVVLTVLTLLGLLHGLVLLPVLLSILGPPPEVVQIYKESPEILSPTAPQGGLRWGASPTLPQSFARVTTSMTVALHPPPLPGAYIHPASEEPAWSSAATPAAYVPDNLSSRGLCTDTE	507255	510375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_507501_507587_507726_508776_508920_509003_509104_509522
771928	contig_8772_pilon	+	620	4	Intergenic	novelGene_21128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6562.7131753736	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20530	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_20663_21478_21523_21966_22053_23063
771931	contig_7347_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_172491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGCCATGGTGGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13467	14673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_13500_14700
771933	contig_10235_pilon	+	814	6	Intergenic	novelGene_46375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	237.349194226566	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	178	672	155614	158044	FALSE	5	TGAGCTGGTCTGCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPGFACRGRVHGLRCSCRCRPLEAAAPLPAPVPALVLQDKFNLTGLNEQVPHYRQALDMILDLEPDEELEDNPNQSDLIEQAAEMLYGLIHARYILTNRGIAQMLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153828	158186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_155553_155636_156206_156323_156763_156840_156980_157171_157953
771935	contig_15354_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_65724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTGTGAATAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566325	559863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_561022_565326
771936	contig_19769_pilon	+	721	5	Intergenic	novelGene_102292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	21	719	87249	89247	FALSE	10	AGTGGGTCTTATTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRPAAMGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGR	87228	89249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
771939	contig_16204_pilon	+	1883	12	Intergenic	novelGene_154529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	60.631252340114	36	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	977	1720	483478	489638	FALSE	35	CCTACTGAAAAATGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGILGYDTVQVGGIEDTNQIFGLSETEPSSFLYYSPFDGILGLAYPSISASGATPVFDNIWDQGLISQDLFSVYLSSNDDSGSVVIFGGVDPSYYSGSLNWVPVSSETYWEITVDSVTINGESVACSDSCQAIVDTGTSLLAGPTSAISSIRDYLGIKLDIDGELVVSCSDVNSFPDIVFTINGVEFPLSPSAYILKEDFFCIAGLEGVDLDTGSGDLWILGDVFIRQYYTVFDRANNQVGLAPVA	454737	489801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_454992_457373_457491_459323_459469_459559_459659_479679_479837_482446_482565_483391_483511_484251_484452_486336_486454_487592_487738_487837_487937_489488
771940	contig_8453_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_125148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAAGCCACCAACCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325917	323447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_323400_325900
771942	SIRV4	-	217	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1301	3	1301	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3857	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
771943	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
771944	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
771945	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
771948	contig_9463_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_83836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	383	715	193634	193966	NA	75	CATTAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNPSQWATQRGPAKLEGLVTERDPMGRVQPREGSAAMIWGRDPCPARRLSSNLQGNAGNSVRVPLAPETPGLLACGHHLLSPFHPQPLSPLSSTALLWNFVKRPVISS	193251	195425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_193300_195400
771950	contig_8063_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_152412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30001	29762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_29800_30000
771951	contig_6230_pilon	-	2007	2	Intergenic	novelGene_102102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	143	355	181988	166056	FALSE	10	TGCTGTTTGCAGTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182130	164403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166258_181977
771955	contig_14176_pilon	-	1481	13	Intergenic	novelGene_74859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.6084187042715	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1446	36	1481	451463	416393	FALSE	40	AATAAGAGCTAAAGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVRWSHLLRHNSLHVNPLLRTLHGFLSHS	451498	416392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_416475_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351
771956	contig_4982_pilon	-	2105	11	Intergenic	novelGene_172228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	149.080381003001	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	690	1136	37008	23083	FALSE	30	CAGCATTATGTTTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAMQKKYYKAILMKDLDAFENEMTKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEIGDHLIEASGKLHLLDKLLAFLYSRDHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQQPIFIFLLSTRAGRPCRH	80222	22113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_23214_24591_24666_34419_34517_35931_36025_36956_37113_37733_37852_39258_39341_43972_44005_44628_44744_54312_54420_80091
771958	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
771960	contig_6870_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_103985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTCAGCTACCATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472554	1474323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1472600_1474300
771965	contig_5039_pilon	+	2448	1	Intergenic	novelGene_64922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAAGTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151821	1154269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1151800_1154300
771967	contig_5684_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_80982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26712	25095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_25100_26700
771971	contig_2114_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_104273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	822	1133	572314	572003	NA	45	CTGTGTCGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWVGLGALGGLRQSGSRWEHLIFWPICLEPNISVAALPVSRFPEACQPRTGPRYHRNLCSYSPVLLFSIPSTSISVQFTLRNPTGLEPVGQSLPSLLPTPT	573135	570938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_570900_573100
771972	contig_12042_pilon	+	1814	13	Intergenic	novelGene_170440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	62.4554841467104	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	14	1081	194251	210031	TRUE	30	CATATATATATTTACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAGWAGLLGPPGDFAKRLLVTGGAGFIASHVIVSLVEDYPNYMIINLDKLDYCASLKNLETISTKQNYKFIQGDICDSHFVKLLFETQKIDIVLHFAAQTHVDLSFVRAFEFTYVNVYGTHVLLNAAYEAQVEKFIYVSTDEVYGGSLDKEFDESSPKQPTNPYASSKAAAECFVQSYWERYKFPVVITRSSNVYGPHQYPEKVIPKFISLLQHNRKCCIHGSGLQTRNFLYAADVVEAFLTVLQKGKPGEIYNIGTNFEMSVVQLAKELIQLIKETNSESEMDNWVDYVNDRPTNDMRYPMKSEKIHGLGWKPKVPWKEGIKKTIEWYRENFHNWKNAEKALEPFPVQSACV	194237	211139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_194337_196693_196761_198510_198580_199736_199828_202096_202240_203663_203763_204748_204809_206042_206087_206674_206841_207484_207544_208232_208331_209945_210482_210856
771973	contig_15707_pilon	+	1658	5	Intergenic	novelGene_173237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	8.06225774829855	24	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	67	672	11437	65598	FALSE	15	TATCTGTCTCCCACCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKQFKCTVCDYTAAQKPQLLRHMEQHASFKPFRCAHCHYSCNISGSLKRHYNRKHPNEEYTNVGTGELAAEALVQQGGLKCPVCSFVYGTKWEFNRHLKNKHGLKLVENEGDPKWEPATETPEEPSTQYLHITEAEEDVQGTQAAVAALQDLRYTSDSGDRLDPTAVNILQQIIELGTETHDATAVASVVAMAPGTVTVVKQVRTLRSRSSPLPSCSLISPRP	11370	66584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15707_pilon_+_11461_41183_41323_53023_53143_61979_62107_65401
771974	contig_12644_pilon	+	2393	7	Intergenic	novelGene_44463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	52.5103164467072	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	135	1070	984268	1000182	FALSE	5	GCTGGCGGCTGCTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVARRRQHARAAGGAGAQPGATFLQARHGSIKADEAAPAPFHVDLWFYFTLQNWVLDFGRPIAMLVFPLEWFPLNKPSMGDYFHMAYNIITPFLLLKLIERSPRTLPRSMIYVSIITFIMGASIHLVGDSVNHRLLFSGYQHHLSVRENPIIKNLKPETLIDSFELLYYYDEYLGHSMWYIPFFLILFMYFSGCFTPTKAESSMPAAALLLVVPSGLYYWYLVTEGQIFILFTFTFFAMLALVLRQKRKRLFLDSNGLFLFHSFALTLLLVALWVAWLWNDPVLRKKYPGVIYVPEPWAFYTLHVSSRH	984133	1001505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_984354_991204_991317_994865_994965_996041_996231_996567_996624_998179_998303_999911
771975	contig_3916_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_141854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24760	23308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_23300_24800
771976	contig_10319_pilon	-	2332	3	Intergenic	novelGene_147251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	72	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	353	745	250190	147675	FALSE	80	GTAAAAAAAAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGKLPPHFWASHDHPPPPARMIPVWFLECLGCEGWACCSNTWIESDLQRDRNGSSKLSFKWPSLFT	251693	146087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_148033_250155_250273_251423
771977	SIRV6	+	299	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8130	2	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
771984	contig_9955_pilon	+	1447	5	Intergenic	novelGene_21387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	959	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAACAGCGGCACGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663300	669381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_664249_664633_664827_666950_667129_667620_667685_669317
771988	contig_9091_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_32434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54093	55565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_54100_55600
771992	contig_12603_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_105803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGTCTAAATAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600860	598599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_598600_600900
771994	contig_15449_pilon	-	937	9	Intergenic	novelGene_33651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	2.98956518577535	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	49	615	177208	169639	FALSE	15	GCCTGCAGTCTAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPLPSGCLPTTHPADMVTVGATQLCWAILGFLLLQGHNCQPTTTQTSSSQGAFSNLSLTIEPTSPNTGTGAPRSSSSRSSGSPSGDTFQNITPESTTMSLRTGGYLTILPSPTSESVLTVAAFGVISFIVILVVVVIILVSVVSLRFKCRKNKESEDPQKPGSSGISESCSTANGEKDSITLISMKNINTNNSKECSSAEKVL	177256	169316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_169648_169838_169936_170617_170655_170866_170966_171362_171477_172154_172209_173444_173496_173808_173854_177147
771999	contig_7396_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_79525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAAATGGTGATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204643	203446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_203400_204600
772002	contig_15031_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_138413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGGCAGTTAGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106677	108355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_106700_108400
772004	contig_5196_pilon	-	1171	2	Intergenic	novelGene_38681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	117	533	132835	132419	FALSE	75	TATTTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSTASDACESWTRNKEDRRRTDAFKFMVVAKNIEYAMHCQKNKQVLEEVQPECSLEARMMRLHLTYFGYVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSMRWIDTVAATMGSSRTMIVRMAHDWEVFCSVVHRQSRYEL	144708	131780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_132876_144632
772006	contig_4339_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_146084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTAACAGAAGAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047731	1050600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1047700_1050600
772014	contig_15720_pilon	-	1652	2	Intergenic	novelGene_41861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	0	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1110	1412	260343	260041	FALSE	25	TCAAATTCTCTTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	261784	259800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_260733_261064
772015	contig_11316_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_122687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139641	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139600_140500
772016	contig_5935_pilon	-	2628	1	Intergenic	novelGene_102702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCTGGAACAGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945971	943343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_943300_946000
772017	contig_13015_pilon	-	2129	2	Intergenic	novelGene_165553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_1	0	63	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTCCTCTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370787	367982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_368494_369169
772025	contig_15185_pilon	+	1877	10	Intergenic	novelGene_99407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_6	101.349901179704	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	997	1152	209119	209372	FALSE	20	GACCATGCCTAAGGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCNTREIADKLIELKAEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDICRCFAGDTLLAIRAPSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAWSSPPVAVPVPPPEDLLQGPPVVSTPPPLPKPTLAQPQEASCPSSPQLATPAPVPSSIEGQGVTGPAAESTVRGGPGTDSKDSGELSSLPLGLTALDTRPLQSSALLDSSSNSSSSGPNPSTSFEPIKADSTGVLELPKELSEIFDPTPECMSSELLEELMSSEVFAPLLRLSPPPGDHDYIYNLDESEGVCDLFDVPVLNL	203742	210097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_203824_204298_204409_204551_204714_205023_205068_205819_205882_206098_206397_206855_207042_208882_208931_209113_209159_209256
772027	contig_14536_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_69294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAGAAGCAAAAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91114	89605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_89600_91100
772031	contig_5999_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_45606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAAAGTAATATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69128	70730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_69100_70700
772032	contig_2636_pilon	-	703	3	Intergenic	novelGene_52059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	12.5	58	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATCGAATTTGGTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85677	59542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471_62624_85551
772036	contig_14822_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_145425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATGACCAAGCACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186537	187305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_186500_187300
772038	contig_8907_pilon	-	1306	4	Intergenic	novelGene_85845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_3	120.809307956336	335	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	26	490	657324	653617	FALSE	45	TAAAATTTCAAGACGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLRRGQRQLCSGLGVLTSARLPFGAEMPKKAGATNKGKSQSKESERPLPSLGPVAVDPKGCVTIAIHAKPGSKQNAVTDLTAEAVNVAIAAPPSEGEANAELCHYLSKVLELRKSDVVLDKGGKSREKVVKILASTTPEEILEKLQKQAENK	657349	652800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_653713_655098_655227_655815_655943_657210
772042	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
772047	contig_10753_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_105129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAACCCAATTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55524	54156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_54200_55500
772050	contig_5715_pilon	+	2357	11	Intergenic	novelGene_127973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCGGCAAGGTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599653	659560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_+_601014_602210_602285_605209_605287_612404_612463_626020_626107_627097_627171_630706_630826_635159_635331_637616_637663_645335_645415_659346
772052	contig_16525_pilon	-	675	4	Intergenic	novelGene_133858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_2	697.486917440033	7876	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	53	397	181436	178378	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKCKPEWVLPVGGVEEQL	181488	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178476_178588_178686_181150_181253_181388
772055	contig_8616_pilon	-	962	6	Intergenic	novelGene_72431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	446.218511494088	2355	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255496	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302_254507_254584_254668_255372
772056	contig_16766_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_153349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGTAAGGAAGCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99997	97920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_97900_1e+05
772057	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	51	523	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772058	contig_9482_pilon	+	2192	10	Intergenic	novelGene_44263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1088	1453	748971	756994	TRUE	5	CGCTCGTGGTCCGACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCSPSLSRTFVSPLVFEAQRGEAREQLAGEGAQVHGNCLLLFSVRLSHVDHTVEQAPVTVLLEVAHLAPRQEAVDPVSRLISCMLHQRQHVLLCGAVCQAAGIPLGLKHAAASKKATMV	747883	773058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_749099_751176_751253_754752_754886_756965_757050_757408_757553_758160_758272_759818_759964_769311_769374_771772_771903_772966
772063	contig_14441_pilon	+	1782	2	Intergenic	novelGene_100805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACAGCACATGAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155698	157533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_157405_157457
772066	SIRV7	+	836	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	29	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGTGTATATGTAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56048	147877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683_114977_147607
772067	contig_11115_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_102852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	385.016305571018	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	266	985	171704	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYHGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	171078	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171336_171695_171981_172714_172964_173047
772071	contig_15888_pilon	-	1052	8	Intergenic	novelGene_84421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1782.44666749078	9	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	59	382	259726	253457	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGESSC	259784	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251847_252025_252297_252468_252539_252807_252833_253402_253470_254194_254282_254527_254685_259659
772074	contig_16148_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_50379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAATATTCCAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86028	83838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_83800_86000
772077	contig_10432_pilon	+	1584	8	Intergenic	novelGene_171307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	12.5551843101256	377	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	344	970	93516	95120	FALSE	0	GCTTCCTGCTCCTGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSGPRSAGLRAGPLERWPARAEVFAGEGRPGGRAQNPVPVGGLAGGIEICITFPTEYVKTQLQLDERSHPPRYRGIGDCVRQTVRSHGVLGLYRGLSSLLYGSIPKAAVRFGMFEFLSNHMRDPQGRLDSTRGLLCGLGAGVAEAVVVVCPMETIKVKFIHDQTSSKPKYKGFFHGVREIVREQGLKGTYQGLTATVLKQGSNQAIRFFVMTSLRNWYRGDNPNKPMNPLVTGVFGAIAGAASVFGNTPLDVIKTRMQGLEAHKYRNTWDCGLQILRNEGLRAFYKGTVPRLGRVCLDVAIVFVIYDEVVKLLNKVWKTD	93012	95734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_+_93249_93334_93435_93508_93648_94050_94136_94245_94351_94551_94668_94754_94829_95005
772078	contig_11171_pilon	+	1663	9	Intergenic	novelGene_48538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1593.89604722987	13	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	50	973	41803	65045	TRUE	15	TTAACCTGCAGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	41753	65954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_65380_65598
772080	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_95455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
772088	contig_15327_pilon	+	1736	10	Intergenic	novelGene_70411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	170.54552992611	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	15	686	25249	32853	TRUE	10	GGGTCTGTAGCATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTPGAAATQDGEAPGRSPPCSQSYDLTGKVMLLGDSGVGKSCFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADVNSERVIRSEDGETLAREYGVPFMETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRARGQADEPSFQIRDYVESQKKRSSCCSFV	25234	34328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_28869_29900_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31758_32351_32409_32488_32566_32747_33451_33875
772089	contig_5586_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_143533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTTTGTTTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309167	307334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_307300_309200
772091	SIRV7	+	405	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAACCATACTATGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56058	114813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56111_70889_70987_78840_78963_114679
772092	contig_3942_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_128657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_1	571.038235730907	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGGCCCAAATGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178331	180121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179177_179714_179825_179974
772095	contig_6589_pilon	-	1105	9	Intergenic	novelGene_25893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	229.757888874354	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	85	957	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFEDHHKTGVTRGQEDCSAPLQMATREQQRLLPVLCWECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNADPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178099	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176089_1176151_1176854_1176938_1177276_1177382_1177927
772096	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1168	0	1168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3990	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772097	contig_15828_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_173243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAAAAGTGTTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33054	32074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15828_pilon_-_32100_33100
772102	contig_11316_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_122689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139723	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139700_140500
772103	contig_12841_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_55869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1309	1656	403470	403817	NA	65	AAGAAAAAAAAAACCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKYIKRCLTSLKKRKLKLQCRQPTDWERIFRNRILSKGLILKIYIKLLQLNNKRTNNPIKKQTKDLNRQFTKEDIQMANKHMKRYSTTLAINKTNPLLPSQLTHNDPIGFPRL	402161	403942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_402200_403900
772104	contig_5039_pilon	-	2303	14	Intergenic	novelGene_64939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_13	16.4147429764297	72	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	287	1942	1480078	1444166	FALSE	85	AAATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQREDEHQRPRKLHDEERLKRDECVKKKDMEDKGRPEVQDKLTRLFLQHPEPAKAAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKISENEVPAPAKPATGPASAPAPKLALRETPAPFAGPASEPSTTPNNWADFSSTWPTSTSEKPETDNWDAWAAQPSLTVPSTGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPVRRSTSTESASPESPRLKRVASPAAKPAALGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWTGTVDDRSGVFPSNYVRLKDSEGSGTTGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTDPPKSTAVPAVCQVIGMYDYAAQNDDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVSGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQ	1495427	1443804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1444168_1444512_1444705_1446781_1446900_1450881_1451004_1453255_1453302_1456631_1456799_1460819_1460900_1461725_1461932_1464674_1464835_1469130_1469379_1477867_1477990_1479885_1480116_1481900_1482029_1495306
772105	contig_2377_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_67927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTGTATATATATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320078	319460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_319500_320100
772106	contig_7202_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_18635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGATGATGTGGCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
772107	contig_3386_pilon	-	572	5	Intergenic	novelGene_34486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	15.8961473319795	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	52	570	298865	285276	FALSE	30	GAAGCTGAGGCAGGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGQRVSRKARKLGSSRRWQTREPADGQDAAVAPEPESWSFQAAVELQDFFQDCGAKQRGFVTREDMAAAKFSFLGSEQEPEMIFDWVDVERKGHLSLEEFSSGLKSIFGSSPSTHRLRRRRPLTSKRVSAAASFPAMEEANTEEKEAFLALMEKLGANHLLPEQAEIWQLW	304452	285273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_285301_286721_286897_288845_288958_298658_298878_304413
772108	contig_3386_pilon	-	1865	6	Intergenic	novelGene_34484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	4.12795348811006	241	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	34	1026	281037	269774	FALSE	20	ACCCACTTGAGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKQEDQGGQDMGSEQSVEAQGLEAEHSEHSLQDVLPATPPHGLPQPQAEAEATAPGKPSALGSPFPMGAQPDDGAGPQEPTQTLPITAELEAQSRPPPTAAQAEGEQGAPQSREPRAESRPEDPGTDSREAGRSPFPGDLPANEPPADPDYIFHVIFLGDSNVGKTSFLYLLHQNSFATALTATVGVDFRVKSLLVDNKHFALQLWDTAGQERYHSITRQLLRKADGVVLMYDVTNYESFAHVRYWLDCLQDAGSDKVVILLLGNKMDCEEERQVPTEVGRQLAKELGVSFGECSAALGHNILEPVVNLARSLKMQEDLLRCSLVEVVPKKSPKRTGCCS	281070	268934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_269865_271679_271757_273806_273909_275006_275122_276209_276292_280511
772111	contig_5871_pilon	-	520	4	Intergenic	novelGene_160171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	459.754282198654	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	86	478	342910	311874	FALSE	40	TAAGTTATAGTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKNPLAVTYPKCLNYLKLDMKLR	342995	311831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_311940_338469_338542_339568_339653_342739
772119	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
772121	SIRV4	-	331	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1192	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3966	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
772123	contig_7758_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_163530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCAAGCCAGTTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118959	116828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_116800_119000
772129	contig_4857_pilon	-	2247	6	Intergenic	novelGene_48644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	88.0272685024362	1	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	416	1030	448153	441598	FALSE	25	CAGACCTATAATTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVNDPLLFIKDIKPGLKNLNVVFIVLEIGRVTKTKDGHEVRSCKVADKTGSITISVWDEIGGLIQPGDIIRLTRGYASMWKGCLTLYTGRGGELQKIGEFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448568	440380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_444997_445070_447620_447760_448062
772130	contig_15185_pilon	-	2377	2	Intergenic	novelGene_99466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	385	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	66	371	472420	444525	FALSE	25	GCACCCCTTAAATTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFIT	472485	442518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_444701_472290
772134	contig_5959_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_150232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGATTCAGGCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590014	588728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_588700_590000
772135	contig_5959_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_150230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTATTGGCGAGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588624	588232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_588200_588600
772136	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8128	7	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772137	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	54	526	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772138	contig_10143_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_163337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAGAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169793	170391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_169800_170400
772139	contig_5958_pilon	-	2287	4	Intergenic	novelGene_140082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.3960780543711	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	273	1262	116728	110844	TRUE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLPKSSKEFGSVDYWEKFFQLRGKKAFEWYGTYLELCGVLHKYIKPREKVLVIGCGNSELSERLYDVGYQNIVNIDISEVVIKQMKEHNASRRPQMSFLKMDIMQMQFPDASFQVVLDKGTLDAVLTDEEEKTLQQVDRMLAEVGRVLQVGGRYLCISLAQAHILKKAVGHFSREGWMVRVHQVTNSQDQVLEAEHQFSLPVFAFIMTKFRPVPGSALQIFELCVQEQGKPTRLESAERLAEAVLERQQYAWLCSQLRRKSWLGSVSLDLCNGDTGEPRYTLHVVDSSAVKPSRDNHFAIFISALSICGWGHRHPDGSAPRLQPLEW	117000	107581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_108488_110724_110921_114152_114913_116575
772141	contig_10734_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_51268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314337	1316034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1314300_1316000
772143	scaffold_12510_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_151389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTGAAGTATCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306701	308703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_306700_308700
772146	contig_13015_pilon	-	2151	4	Intergenic	novelGene_165546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	15.369522511198	62	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	52	357	371542	346653	FALSE	60	AAATCATTAAAATGACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVALHRWRRRRPEELQVLGDAKRVCRRPEAAVHEWGCSQLSRCARQSWSPEEVTPLPSGPPPAHGPESSRGKPASKIPLNGGTSLAQPCPRCMAGESHL	371593	344858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_346662_351800_351864_351964_352130_371473
772151	contig_18473_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_169635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCAACACCTAGATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24132	23312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_23300_24100
772152	contig_18473_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_169634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAACTAGAGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21864	21384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_21400_21900
772153	contig_14925_pilon	-	1369	5	Intergenic	novelGene_55161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1465.51823171873	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	275	871	103374	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRPLENGFLNHFVPVLPLQRSRIRPGLKKACQEEDIQPAGWQLFCAFSSIPRQEHHSGHPRTSGLGKDLAKGPSDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETGILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	103648	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26285_27014_27085_27995_28041_29569_29828_103145
772156	contig_5350_pilon	+	1110	7	Intergenic	novelGene_99332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	51.5945733580577	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	273	665	184722	225365	FALSE	20	ACTGCACTTTATGTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPGLCWRTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILATPGVLKYLDFLRRV	142163	225810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
772157	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	31	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
772158	contig_5019_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_109196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGATTTACCCTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141984	139496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_139500_142000
772162	contig_8044_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_132395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGATGCTGAAGTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561158	560092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_560100_561200
772163	contig_7091_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_131790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGTAGATTTGAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426726	424544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_424500_426700
772165	contig_6375_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_72992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	145	456	301771	302082	NA	55	GTATCAGGGAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPVTLTYALSLRLTHTHSLSLCEHSILSRSRDSQECRKILTHKHSLEMLTLGGGARERVAPLIHTSMDTQHVSSQKANSLPWEQAPHKVFDSAGIHLQSLSSSFSFSAPLPHLSLGTASSESSGRQGLLVEGGEAWDQRPSLGVCLCVSV	301626	303336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_301600_303300
772166	contig_5526_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_111682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	335	679	98849	98505	NA	65	GACTTTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTIHTTLILLSQSSSTALTEIPQVDGFNKEKFIFSQSCRLEVQIQGVSSRGRLSLSVGSGGRSFSSIFPWTRSVSAQEPRVQRTCSAPSTAFLVVGGPQFSTCFPFLLSLVR	99183	97001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_97000_99200
772174	contig_9515_pilon	-	1673	9	Intergenic	novelGene_73837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	43.2534319447602	131	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	60	440	105931	97364	TRUE	15	TGAGTATTGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEISGSFHNEKELKDGPVERVSAGNSPPYDKENHVLPTFRGIPYSRWAMFVWMRGCGFHPHTKAQLLLQISELKNHSILWALTAEANGWEPGVVSTEVLRAQEEWETVDSIQPETGSRASSDQPG	105990	82231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_83027_91824_91956_95358_95482_95754_95879_97303_97396_98393_98463_102119_102268_102600_102679_105877
772178	contig_19899_pilon	-	1008	4	Intergenic	novelGene_102537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.6316371938716	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	217	678	419823	407915	FALSE	40	CTTGACAGAAAATGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMQSHHHAYRKAMESYFNSLWSFPSAVLPYSYYANQGGYPQSFYDRHSASQDSHCTYPHFRGSGQHPHDSHWLQASTREEQALSSEEEVESESDGEVECDLSNMEITEELRQYFAETERHREERPGRLRERRPRPVLQHPPVSGAPVREPQ	429987	407584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_407998_419444_419902_420536_420582_429894
772182	contig_563_pilon	+	755	2	Intergenic	novelGene_169780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCCATCCACTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791886	792749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_792566_792673
772185	contig_9609_pilon	-	1932	4	Intergenic	novelGene_22938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	12.7279220613579	32	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	195	566	76893	76522	TRUE	35	CATAAGTGGAGAGGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRGRHSNRSTNGWCSPPPCSHTCSLEPTHLPLLWVSLQDMHLLYVLAAANLYGQMHGLPGSKDQTALRGLLKLLPLPSSQHLAPIFASDLELAQASTKFGEAPGPAPYAATHRSDPTLSLC	77087	72841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_73060_73491_73766_75368_75748_76026
772187	contig_4847_pilon	+	768	5	Intergenic	novelGene_156169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	384.971102811627	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	99634	109612	FALSE	5	TTTTCTGTGGTGTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTSGEQFGCQPVSSLSWTEWEENNAEGAQPTSALALAGLWLRSTGCFWWDHWLCKSSYVWDLGWHHGNEILPLWKIYACRLNRRCQFADGRQAWIYCFH	99631	110075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_101400_101478_108569_108658_109570
772188	contig_16516_pilon	-	1585	2	Intergenic	novelGene_173252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCTCCAGTGTGTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26252	24376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_-_25912_26202
772190	contig_12042_pilon	+	1992	14	Intergenic	novelGene_170443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	63.8037857569837	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	140	1270	195442	210031	TRUE	45	AAATACTTGATCATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGECMNNKWETLLPSRNSTSSGGRGNMGILLYCPLTCSVTSSYLTVTWRSASHVIVSLVEDYPNYMIINLDKLDYCASLKNLETISTKQNYKFIQGDICDSHFVKLLFETQKIDIVLHFAAQTHVDLSFVRAFEFTYVNVYGTHVLLNAAYEAQVEKFIYVSTDEVYGGSLDKEFDESSPKQPTNPYASSKAAAECFVQSYWERYKFPVVITRSSNVYGPHQYPEKVIPKFISLLQHNRKCCIHGSGLQTRNFLYAADVVEAFLTVLQKGKPGEIYNIGTNFEMSVVQLAKELIQLIKETNSESEMDNWVDYVNDRPTNDMRYPMKSEKIHGLGWKPKVPWKEGIKKTIEWYRENFHNWKNAEKALEPFPVQSACV	194285	211128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_194337_195353_195591_196693_196761_198510_198580_199736_199828_202096_202240_203663_203763_204748_204809_206042_206087_206674_206841_207484_207544_208232_208331_209945_210482_210856
772191	contig_7009_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_23594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412006	410702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_410700_412000
772196	contig_12000_pilon	+	1377	9	Intergenic	novelGene_43166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	591.746342933355	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	46	867	417192	669327	FALSE	20	TATCACATGTTGCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTLFPGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYNLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	416908	669837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490670_558462_558603_669224
772199	contig_7426_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_27503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCCACCCCTTCGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953290	952228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_952200_953300
772201	contig_3818_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_99207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAGGCCTGGTGATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109924	110555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_109900_110600
772202	SIRV6	+	421	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1748_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
772205	contig_7513_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_88936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCGACTGGTTGATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58136	57540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_57500_58100
772208	contig_4364_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAATGAGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025764	1026546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1025800_1026500
772209	contig_15991_pilon	-	984	6	Intergenic	novelGene_70884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2882.23707560638	5	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	547	915	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105146	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103594_103703_104975
772210	SIRV6	+	375	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	304	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
772214	contig_11978_pilon	+	702	6	Intergenic	novelGene_62979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	54.5028439624943	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	267	701	1485755	1486943	FALSE	10	TGGGCGCTGGGGAGGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGTSALPRLSRSPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPVGPVNPLLTQAESSHTEPDLEDCSFRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGSGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQSDGEAGVNIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYGLPPQAGSSDSLSTSKSPPGKNSLGLDNSLSTSSE	1484116	1486944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1484209_1484436_1484546_1485689_1485757_1485948_1486095_1486553_1486752_1486854
772219	contig_10437_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_38103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTATCTCTGGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68881	67995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_68000_68900
772221	contig_6557_pilon	-	1480	12	Intergenic	novelGene_33008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	36.4263096272166	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1059	421	1479	562259	556090	FALSE	5	GTGCCGCTCTGGCCGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPKDPTQPSCFQEQQGLRHVVFTAETHNFPTGVAPFSGATTGTGGRIRDVQCTGRGAHVVAGTAGYCFGNLHIPGYSLPWEDRSFPYPGNFAQPLDVAIEASNGASDYGNKFGEPVLAGFSRSLGLRLPDGQRREWIKPIMFSGGIGVMEAKHMSKEAPEPGMKVVKIGGPVYRIGVGGGAASSVQVQGDNASDLDFGAVQRGDPEMEQKMNRVIRACVEAPNGNPICSLHDQGAGGNGNVLKELSDPAGAIIYTSRFQLGDPTLNALEIWGAEYQESNALLLRPPHQDFLCRVSARERCPACFVGTITGNRKIVLVDDRECPVGKSGQGDIPSTPPPTPVDLELEWVLGKMPQKEFFFQRHPPVLQPLTLPPGLSVRLALERVLRLPAVASKRYLTNKVDRSVGGLVAQQQCVGPLHTPLADVAVVALSHQELVGAATALGEQPVKSLLDPKVAARLAVAEALTNLVFALVTDLRDVKCSGNWMWAAKLPEE	563435	556088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_556141_556302_556534_556806_556939_557080_557207_557469_557632_558018_558081_558365_558523_558626_558701_562195_562325_562477_562610_563076_563206_563341
772222	contig_13244_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_86942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAAGAATTTTAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258565	260245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_258600_260200
772224	contig_14142_pilon	+	795	5	Intergenic	novelGene_120423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	15.0561449249135	796	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	81	518	22531	23846	FALSE	15	GCCTGAGTTTGTCATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVHNLYLFDRNGVCLHYSEWHRKKQAGIPKEEEYKLMYGMLFSIRSFVSKMSPLDMKDGFLAFQTSRYKLHYYETPTGIKVVMNTDSGVGPIRDVLHHIYSALYVELVVKNPLCPLGQTVQSELFRSRLDSYVRSLPFFSARAG	22341	24123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22422_22530_22630_22780_22852_23285_23425_23717
772225	contig_8616_pilon	+	1214	8	Intergenic	novelGene_72385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	55.6769105406086	65	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTGTAGTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196832_197236_197268_197609_197657_197845_198124_198540_198588_198825_198858_198952
772226	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772229	contig_2078_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_100165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAACAAATCAGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490348	488746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_488700_490300
772233	contig_10064_pilon	+	1051	3	Intergenic	novelGene_122723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	138.5	486	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	139	429	395972	404100	FALSE	25	AGTATTCAGAGGGTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDPRGERLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQFPSRDGCRVPFAVTRLPCRVCDPLLPTNPPASGAPLRPQETPPRQAPSRSRQVRALSVSSPV	395833	404722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403057_403911
772234	contig_6847_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_143876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCTGCAGTTCGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96364	95873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_95900_96400
772235	contig_6847_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_143875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92443	91180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_91200_92400
772236	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772237	contig_6760_pilon	+	1453	1	Intergenic	novelGene_150792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGAGATTGAGAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164437	165890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_164400_165900
772240	contig_10779_pilon	+	2169	5	Intergenic	novelGene_165514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	1440	2105	33389	38307	FALSE	35	CCTCCAAGTACTTAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLFLRLSMCKKVPKALNQLGRPLRCFGNLFQPLKTLSCIVHQVHQTAVEGQGTHTCAELSKEFFILPYKDLSLFPKIKGGKDMGSDGDVGRCHVLDGDWGTDGGGHPTTPHTASTWLGPSRAGRRRHGGKRGWCACAYLAMHGEDTWATLEELLKCSLRVREYFIAVSFLQRNIAMFKMDWQRMHKTANILSCVGVVASEKDFNDITNLMRSIVSEYTE	31949	38371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_33583_34547_34770_36822_36965_37609_37682_38271
772241	contig_9437_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_141710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCTCCTGGATGTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85559	83683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_83700_85600
772242	contig_253_pilon	-	876	8	Intergenic	novelGene_129686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1166.24469725592	9	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	385	807	420812	418769	FALSE	25	AGAGAAGCTGTGCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEISPCTSPTPSCVTSAVPSDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	470606	418699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420291_420752_420841_420948_421056_421318_421340_470275_470395_470497
772243	contig_2310_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_71590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	292	876	55125	55709	NA	25	GAAAGCACCTGAGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENSTSAPAAKPKRAKASKKSTDHPKYSDMIVAAIQAEKNRAGSSRQSIQKYIKSHYKVGENADSQIKLSIKRLVTTGVLKQTKGVGASGSFRLAKGDEPKRPVAFKKAKKEIKKVATPKKAAKPKKAASKASSKKPKATPTKKAKKKPVATLKKAKKPKTVKAKPVKASKPKKAKSVKPKAKSSAKRAGKKK	54833	56956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_54800_57000
772244	contig_7022_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_142128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39275	38361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_38400_39300
772252	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	11	34	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772257	contig_14472_pilon	-	2955	1	Intergenic	novelGene_111196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	488	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2189	2578	552001	551612	NA	65	AAAAAAAAAATCACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTWTCTQVCTLGTTPRKRTEKQPLPSPTPNTFRTPDTKEYSCLENTVVRQYNLFRLKSKHHHFTNYTTLDKWFNLPHRVMRIKLVTICLLGALVAQWLSVQLLTERSAVWIPQALLGNPMGQFYSVL	554189	551234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_551200_554200
772258	contig_11259_pilon	-	2249	9	Intergenic	novelGene_144545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_8	42.005208010436	54	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	743	2074	226973	176080	FALSE	80	AGAAAAAAGAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDGKRMRVKNQKWKLRTKTDYNLWTAYQNQETLSVQMEERNVYCGTYNIRILSDTWDRNRVIHYSGGDLVAVSSNRKIQLLDIIQVKEIPIEFRGHAGSIHALFLCEEEKFLLSGSYDLSIRYWDLKSGTCVRIFNGHQGTITCIDLYKNRLVSGARDCQVKVWDLDTGKCLKTFKHKDPILATRINDTYIVSSCERGTVKVWHFATAQLVKTLSGHEGAVKCLCFDEWHLLSGSADGLVMAWSMVGKYERCLMAFKHPKEVLHVSLIFLRVISACADGKIRIYNFLNGNCLKVMKANGRGDPVLSFFIQGNRMVINTESNIIMFQFENIKWQYSQDRVKQKKNKDKEEEKEDNSLADAVSKSSIQAHSLRDSASSKQIVGQEALSSKPHRSRVLLKAAMLSTGKRVKSQAISVVTSRVDDVCQDWFLCGIFWPMRGFLMI	234068	175904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_176468_179912_180072_206384_206528_207456_207606_213355_213478_221297_221499_223916_224027_226913_227037_233389
772263	contig_6059_pilon	-	2321	2	Intergenic	novelGene_44794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTAATTTTAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391152	387286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_388759_390303
772267	contig_6445_pilon	+	2778	1	Intergenic	novelGene_77026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	155	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAGGTGCCTCCAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534509	537287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_534500_537300
772269	contig_10235_pilon	+	2043	2	Intergenic	novelGene_46506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	373	1761	286302	288227	FALSE	35	CAAAATATCAAGCGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	285929	288509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_286425_286961
772270	contig_8907_pilon	-	1988	10	Intergenic	novelGene_85838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	125.27037425771	340	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	81	1142	605435	489167	FALSE	30	CAGAATTTAGTGTGTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQPIFTTRAHVFQIDPSTKKNWVPASKQAVTVSYFYDVTRNSYRIISVDGAKVIINSTITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVFGLGFSSEQQLTKFAEKFQEVKEAARLARDRSQEKIETSSNHSQASSVNGTDDEKASHTGPADTHLKSENDKLKIALTQSAANVKKWEIELQTLRESNARLTTALQESAASVEQWKKQFSICRDENDRLRNKIDELEEQCSEINKEKEKNTQLKHRIEELESELREKETELKDLRKQSEIIPQLMSECEYVSEKLEKKAFWKLILERKSTRLKSPLRTHSCLIFHSRQIHPEGPALAEQGPSSVEHLHGGREGQSKPGRQSAVSKDGH	605515	488320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_489229_490148_490306_490838_490920_492252_492364_495100_495258_497739_497847_501751_501845_519185_519318_536833_536991_605430
772271	SIRV6	+	283	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8134	14	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772279	contig_16098_pilon	+	1131	10	Intergenic	novelGene_45792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAGCCTGGGCTGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31106	36229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_31355_31524_31589_31682_31745_32113_32181_34568_34645_34740_34800_34989_35072_35214_35304_35567_35618_35895
772280	contig_14530_pilon	-	2513	3	Intergenic	novelGene_108456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAACCTCCTTCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78320	60257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_60363_72816_72987_76082
772282	SIRV4	-	325	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1198	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3960	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
772285	contig_4659_pilon	+	1622	6	Intergenic	novelGene_118196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_5	21.5313724597388	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	242	943	191727	199741	FALSE	10	TCCCCAGCTTTTGCCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKIHGGSVVEMQGDEMTRVIWELIKEKLIFPYVELDLHSYDLGIENRDATNDQVTKDAAEAVKKYNVGIKCATITPDEKRVEEFKLKQMWKSPNGTIRNILGGTVFREAIICKNIPRLVSGWVKPIIIGRHAYGDQYRATDFVVPGPGKVEITYTPSDGAQKVTYLVHDFEDGGGVAMGMYNQDKSIEDFAHSSFQMALAKGWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEIYDK	186954	200420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187105_188123_188199_191710_191849_195021_195314_198152_198259_199559
772290	contig_5084_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_64689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAATGAATGCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1821388	1823428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1821400_1823400
772292	contig_4125_pilon	+	1970	7	Intergenic	novelGene_25219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	80.7184750984694	13	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	484	1059	1708054	1711283	FALSE	25	CGACTCAGTGGCATTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1702109	1712194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702379_1703843_1703970_1707965_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
772299	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	8	1160	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772300	contig_4496_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_66674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869082	870222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_869100_870200
772309	contig_1016_pilon	-	1987	4	Intergenic	novelGene_173254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1613	1969	620472	620116	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSRTAHRVSKAVIFREGTLVVQWLKELTANRKFGSLKPLAAPQEKDVAVCFCKDLQTWKPYGVPRTRNLFQGSGFGGLIFTEADCHRFLPQSDWWFELRTFRLAVECFKLLCHQSS	649312	620097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1016_pilon_-_621307_628220_628364_645907_646137_648906
772314	contig_10437_pilon	+	1912	2	Intergenic	novelGene_38485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTGGATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213560	1215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214373_1214621
772317	SIRV4	-	254	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1269	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3889	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
772318	contig_500_pilon	+	1442	10	Intergenic	novelGene_31044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	916.267441684663	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485766	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492012_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496726_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
772319	contig_7963_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_58597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGCAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293119	294120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293100_294100
772320	contig_8420_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_69376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTCGCAGAAGCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339182	338228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_338200_339200
772321	contig_602_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_134938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACAAAGTACCCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245186	244414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_244400_245200
772333	contig_16999_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_84982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCACATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92409	93593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_92400_93600
772334	SIRV4	+	305	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCGTTTGAAAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
772336	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
772337	contig_348_pilon	+	2615	8	Intergenic	novelGene_67612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	9.20292766194652	3	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1396	2202	320222	345268	FALSE	50	AAACTTCAGTATAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	318087	345681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_319225_319670_319792_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
772340	contig_13456_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_153276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGCCACTCCTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159258	159850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_159300_159800
772342	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772344	contig_14925_pilon	+	1667	5	Intergenic	novelGene_55272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCACAGCACTCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112091	129479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_113278_114666_114774_115144_115196_115820_116101_129436
772345	contig_14704_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_82678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTTTTTGTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13431	11982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_12000_13400
772346	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
772347	contig_9011_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_159270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAACACTTACGTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103518	104903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_103500_104900
772349	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
772350	SIRV4	-	401	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	213	3	-213	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACTCGCCCCCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
772352	contig_4803_pilon	+	1216	4	Intergenic	novelGene_150721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46804	48948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_46980_47113_47207_47702_47742_48039
772356	contig_14546_pilon	+	1451	12	Intergenic	novelGene_157434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_11	153.562112234918	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1353	99	1451	514567	533894	FALSE	30	AAACCAGGATTTGGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKEIHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSVANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEPEERQQTPEVVPDDAGTFYDQTVSNDLEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKSEPVLEETAPEDGQKSSSPAPADIAQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQRDQRVREQRINIPPQRGSRPIREAGEQGDVEPRRIVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKDFFQNYGNVVELRINSGGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKTRAAREGDRRDNRLRGPGGPRGGLGGGMRGPPRGGMVQ	498478	533894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_498559_514548_514662_517685_517768_518157_518332_523716_523808_525315_525410_526579_526782_528373_528476_528722_528835_529060_529190_529581_529692_533732
772362	contig_7234_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_145920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACAGGCACACTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405137	403967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_404000_405100
772364	contig_6710_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_89104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653623	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
772365	contig_3153_pilon	+	1209	8	Intergenic	novelGene_104628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	313.638424343207	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	438	1190	95088	190713	FALSE	25	AACAAATGCTCTGGGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	57728	190732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_63010_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
772366	contig_12951_pilon	-	2321	5	Intergenic	novelGene_68257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	18.8065812948553	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	210	581	922498	860668	FALSE	25	CAACCGCACGCATTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAMSVRVRFLSPGDAGAVGTVGRSASFAGFSSAHSRRIAKSINRNSVRSRMPAKPSRMYGTLRKGPVCLDPKPQQVKKIFEALKRGLKEYLCVQQAELDYLSGRHKDTRRNSRLVKCKEID	922707	858927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_860692_861336_861416_864892_865040_872883_873003_922495
772369	contig_8138_pilon	+	1477	5	Intergenic	novelGene_52442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	554.521415276272	2	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTAGTAGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280097	307935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280357_288507_288616_304973_305098_306364_307060_307644
772372	contig_5338_pilon	-	1942	5	Intergenic	novelGene_114586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	14.543039572249	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1066	1680	388825	387805	FALSE	20	TTGGAAAGGGCTTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSPLYTSSSIQPAHIPYFLSCSFLLFPWVTVLELYNNNSPTPLGRWFLRQGWLLVVPPRGEPRPRMFFLFTDVLLMAKPRPPLHLLQSGSFACRALYPMAQCQLHRVFGHSGGPCGGLLSLSFPREKLLLMSTDQEELSRWYHSLTLAISAHASAWTVFSLQQPEELEDSTNSRTQNASRIGQSQEYKGILFSAKTLTRLVV	390733	387542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387965_388106_388196_388459_389730_390314_390434_390691
772373	SIRV4	-	258	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1263	0	1263	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3895	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
772374	contig_11815_pilon	-	2203	4	Intergenic	novelGene_50884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	288	617	58887	54697	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVWPFFNMAWLNFPGSSSPCSGSSTRTPLLISSSLGFRIDIFRSKTSDVSLNLSLLFFFRHFQGLKILPKPENLLFLLVGGVVSPASTLSMIMLGSAVDWPASSVAW	59700	53110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_54883_55433_55516_58825_58990_59515
772377	contig_10082_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_63862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGGAAATGATGGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197717	197462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_197500_197700
772378	contig_10082_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_63860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATATTTCCTGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196890	195547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_195500_196900
772384	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_16419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
772385	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
772391	contig_859_pilon	+	769	5	Intergenic	novelGene_132820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	384	junction_3	111.46411978749	4761	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	200	583	94720	130974	FALSE	20	GCTTTTCTCTTAACATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGARGLRATYHRVLDKVELMLPEKLRPLYNHPAGPRTVFFWAPIMKWGLVCAGLADMARPAEKLSTAQSAVLMATGFIWSRYSLVIIPKNWSLFAVNFFVGAAGASQLFRIWRYNRELKAKANK	94520	131160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_94829_111900_111942_118678_118764_119225_119338_130937
772398	contig_9678_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_146367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATATAAAGAAAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237111	236653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_236890_236971
772404	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	158	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772408	contig_1719_pilon	-	2067	2	Intergenic	novelGene_87253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCCATGTCAATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91974	89699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_90987_91194
772409	contig_8820_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_79327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	74	385	434590	434279	NA	80	GCTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQYREYAENYRNHFKGVNCTACELYLNKAATKRLKNKHKRMSSLRGKSDHTTYPTQDSSVAPQGLEDKSQMPPRGLQGPVLSDLSLAPSSISTPLHKASKL	434663	433099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_433100_434700
772411	contig_2894_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_86537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAATTGTAATATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218439	216888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_216900_218400
772412	contig_14209_pilon	+	1915	12	Intergenic	novelGene_88328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	191.838646043237	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	45	986	32366	37893	TRUE	20	CACTTAGGGGAGCCTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEVVRFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPCDWGSFPSPTPMASTAALTSASVWLIAASSATRCPPHPSTPIRKPWAVPQGTGLGPGPS	32321	41007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37218_37300_37425_37718_38078_40142_40344_40418_40857_40901
772413	contig_19680_pilon	+	1378	2	Intergenic	novelGene_132001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	181	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAACCCTGGTGGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43654	45442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_43754_44163
772423	contig_11855_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_67091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2356302	2358480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2356300_2358500
772424	contig_10011_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_68052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTGGGGTCCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202375	203229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_202400_203200
772426	contig_8712_pilon	+	1663	2	Intergenic	novelGene_58826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTACTTTGTTTTTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320154	323201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_320323_321706
772431	contig_9995_pilon	+	391	3	Intergenic	novelGene_47726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	8	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTTATGTGATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485858	642331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_486036_606460_606635_642291
772432	contig_9995_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_47754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACGTCTCCACTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655234	656605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_655200_656600
772433	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
772436	contig_12694_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_171986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGTGGCCACAGCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352832	353881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_352800_353900
772438	contig_9440_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_59097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACTGTGGACATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699689	1698666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1698700_1699700
772440	contig_7004_pilon	-	890	6	Intergenic	novelGene_126442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	8.27042925125413	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2	553	155450	154158	TRUE	25	GAGCCAGAGCTGACTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWPPSQDSAGERLSFLSDSEDSLGLWPGAGTIRLEQDVFSALAGQGQIYVHLTDGIWSQIKSAGSALYASRLYLGRYQFTHPERLAKHTPGGPRIRGNVYIHPTAKVAPSAVLGPNVSIGEGVTVGEGVRLRESIVLHGATLQEHTCVLHSIVGWGSTVGRWARVEGTPNDPNPNDPPSPHGQ	155451	153525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_153816_154110_154281_154523_154617_154830_154878_155041_155140_155259
772444	contig_7943_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_173140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165593	167015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_165600_167000
772446	contig_294_pilon	-	1353	8	Intergenic	novelGene_166745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	543.892696500075	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	254	835	154059	131639	TRUE	25	ATGCTTGTTTGGAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHAEDLRAKAEWEGKGTASRSKLLDKLQTYLPPSVMLPPRRLQTLLRQAVELQRDRCLYHNTKLDNSLDSVSLLIDHVCSRRQFPCYTQQILTEHCNEVWFCKFSNDGTKLATGSKDTTVIIWQVDPDTHLLKLLKTLEGHAYGVSYIAWSPDDNYLVACGPDDCSELWLWNVQITRFTSGTNGVSCQSQS	162418	128322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_128709_131506_131693_141877_142019_147444_147584_152756_152914_153968_154067_156953_157093_162311
772449	contig_10140_pilon	-	1421	2	Intergenic	novelGene_148414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1366	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAACTGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246606	244815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_245555_245924
772453	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_90879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
772454	contig_5649_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_82453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGTGAAAAAAGAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519969	1517969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1518000_1520000
772455	contig_14333_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_49159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAGAAGGAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462087	462731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_462100_462700
772457	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8130	-1	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772458	SIRV6	+	171	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	555	57	555	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10792	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772462	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
772466	contig_8375_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_141330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTCAGTTTCGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321452	324218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_321500_324200
772467	scaffold_15027_pilon	+	2387	3	Intergenic	novelGene_163574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_2	41	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1461	1772	88193	88504	FALSE	15	ACTTTTTCTTTTTAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLCFDSRSSSMKSGGTVLMVYYLEIVPFLRSPPKLPLGPTRLSCGPCTNTSLVSKRNLRKLRSISSIMVFKCSSLLLIRRTTLMPFRLLIDARYKSYAANK	81370	89119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_82700_83479_83574_88155
772471	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772472	contig_19812_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_100999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.5871263786673	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	72	1295	46806	31599	TRUE	25	AAAGCCTCTTTGAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKGPAAASPAPTLLWGTQCTETVASQRRLCPRKNLFHISVFPPCFAWSLFIFKS	48270	30041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_30489_31485_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
772473	contig_6102_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_32014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	163	495	479085	478753	NA	40	ATCAAAAATACCCCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFGGKIPLRLPPSQQPSRRLSCSPAETLGLSAQWQAGMKSVLLSLAAPSGFFAVTDRVAGGARRASRCMVGLAAGDSGAGWVGGSVRGVWATTRARWGAQSVPILALRG	479247	476937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_476900_479200
772475	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	3	1159	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772491	contig_7057_pilon	-	1132	7	Intergenic	novelGene_123233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_6	31.7227573412737	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	313	753	538082	537363	FALSE	10	CGTATTTGCTAGCCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRYLGTGLPRLLIPRGQPGYPESGLILSLSDSTPSPLCPEASPSYILRSAPES	539741	536983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539654
772493	contig_5003_pilon	+	514	2	Intergenic	novelGene_120191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAACCTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33648	38611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_33716_38164
772494	contig_11413_pilon	+	808	3	Intergenic	novelGene_103131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2074	junction_2	1568.5	19493	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	17	460	87465	88388	TRUE	25	AGAACCTACTCAGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGVRSSDPSSLYPIPRLSSEFLALFFGYLRTRSPVCPDFYAALVPSRR	87448	90853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88508_90624
772498	contig_3077_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_26911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGAATCCTGTCTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743789	1742097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1742100_1743800
772502	contig_16846_pilon	-	695	5	Intergenic	novelGene_82974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	134	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	86	691	555239	550868	FALSE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILLYTLPSHQNTPHPTSGVSSRRCMQCGIWARGGKSQIEG	558735	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550985_551521_551665_552661_552824_555055_555278_558688
772505	contig_12250_pilon	+	2044	16	Intergenic	novelGene_80550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.3794323148657	9	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1203	1988	275593	278399	FALSE	20	ACTCCCTCGGTTCACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKHTDKERALDCGHQATGIGGLRLGEMISDQTLGTANPPRLPTLRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272454	278455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272478_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_274054_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
772506	contig_1535_pilon	+	1202	3	Intergenic	novelGene_127237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	39.5	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	57	308	116139	121214	FALSE	20	GTTGCAAGTTCACAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVRTANSVRWQVGGDWSMSAPFEERSGVVPCGTPWGQWYQTLEEVFIEVQVPPGTRAQDIQCGLQSRHVALAVGGREIFKGKLFDSTIADEGTWTLESWF	116082	122108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_116328_118207_118257_121200
772510	contig_7873_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_169574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67696	68004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_+_67700_68000
772511	contig_6175_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_16315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475498	1473482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1473500_1475500
772514	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772515	contig_6533_pilon	+	1623	3	Intergenic	novelGene_114656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	10	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	735	1070	230977	236125	TRUE	15	AATTCCTGTGTCTGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKCLSEMPPKSPSFPSFLFFQILWIIPQKAVRWILVMIALGISGSVLAMTFWPAVREDNRRIALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTATANQTVTAAKSS	230242	246785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_231226_236038_236134_246240
772518	contig_7815_pilon	-	1797	2	Intergenic	novelGene_134370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322427	317492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_319126_322263
772520	SIRV5	+	531	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	2	135	2	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9974	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8203	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
772524	contig_15752_pilon	+	2583	15	Intergenic	novelGene_148759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	58.7700899215558	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	112	2151	193923	203535	FALSE	20	TCTTCGCATCAAAGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPKRPQHLPGHPGWYRKLCPRLDDPEWTPGPSLISLQMRVTPKLMALTWDGFPLHYSERHGWGYLVPGRRDNLAKVPVGTDLASAGVACPYGAIESLYRKHCLEQGKQQPEPQEAGMAEEFLLTDNSTMWQMVEELGCLELEAEAKMENFQAAVLGQPSVLLTWPQLQALVPPPTPWPSLNAGAGSGPDLGVWPPQTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEFMTSRVNWVVQSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTRCMFAHKLGLSDLPQSVAFFSAVDIDRCLRKEVTMDCKTPSNPTGMEGRYGIPQGEALDIYQIIELTKGSLEKRSQPGP	192860	203967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_192899_193849_194087_196001_196123_196336_196424_196619_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201812_202782_202944_203458
772531	contig_6163_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_103843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTTAGTTTCCCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430095	431342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_430100_431300
772534	contig_14142_pilon	-	1810	9	Intergenic	novelGene_120456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	198.315050803009	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	627	1157	100563	99622	TRUE	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIK	101502	98539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98608_98956_99017_99096_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080
772535	contig_16110_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_126796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGGGTTTCCAAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97539	98598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_97500_98600
772541	contig_7644_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_64231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGTAAATTACATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109851	109085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_109100_109900
772542	contig_7644_pilon	-	1689	4	Intergenic	novelGene_64226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCACGTCACTTTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109134	75632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_75694_104706_104818_106260_106368_107724
772544	contig_6576_pilon	-	2222	11	Intergenic	novelGene_42296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	44.1117898072613	133	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	656	1237	462691	445221	FALSE	20	AACTGCTGTGTACTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNFFQRICFNTPLAPQALEDVKNVVRKHISDGVADSGLTLKGFLFLHTLFIQRGRHETTWTVLRRFGYDDDLDLTPEYLFPLLKIPPDCTTELNHHAYLFLQSTFDKHDLDRDCALSPDELKDLFQVFPYIPWGPDVNNTVCTNERGWITYQGFLSQWTLTTYLDVQRCLEYLGYLGYSILTEQESQASAITVTRDKKIDLQKKQTQRNVFRCNVIGMKNCGKSGVLQALLGRNLMRQKKIRDEHKSYYAINTVYVYGQEKYLLLHDISESEFLTEAEIICDVVCLVYDVSNPKSFEYCARIFKQHFMDSRIPCLIVAAKSDLHEVKQEYSISPADFCRKHKMPPPQAFTCNSADAPSKDIFVKLTTMAMYPHVTQADLKSSTFWLRASFGATVFAVLGFAMYKALLKQR	471106	444235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_445339_459010_459214_460207_460328_461868_461953_462634_462766_465563_465665_467723_467870_468246_468332_469605_469727_470453_470563_471087
772549	contig_5231_pilon	-	1569	8	Intergenic	novelGene_65890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	123.491716651898	737	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	332	1282	219086	209128	FALSE	30	GAATGTGGAAAACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYVWNRGDEDVCKVLPRNIAVPYCELSKKLGLPPILVYADCVLANWKKKDPNGYVNHENMEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	219536	208840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430_216565_219044_219165_219283
772550	contig_14909_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_155712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATGCAAATAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129250	128685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_-_128700_129200
772552	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772554	contig_7229_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_39860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426975	1424799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1424800_1427000
772559	contig_9903_pilon	-	2691	1	Intergenic	novelGene_172014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2056	2367	97842	97531	NA	25	GGCTCCTTCTGGGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTINNASVALIQSRLIFSGCPKDVLSPDTTAWLVLSLESFLIEQFLIPSFFLCCLTPSYSPRYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEVSQHHYSRS	99897	97206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_97200_99900
772562	contig_16504_pilon	+	2029	4	Intergenic	novelGene_167949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	6.54896090146283	32	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	135	443	694646	695166	TRUE	25	AAGATCTTGTTTTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEERQQLRPLHPFPKELVERSPLPLPQLPNSPPGAGETALHLAAEITGRTASASPVGCAATRNAGNQGDGLLAAVDDSQHVIAGQAGHPDPLHLQKQLPLA	694511	699943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_+_694791_694913_694974_695062_695362_698552
772565	contig_11642_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_172926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAGAGAGAGAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409107	407203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_407200_409100
772568	contig_15236_pilon	+	2102	7	Intergenic	novelGene_141577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	448.005456315979	7	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	80	1357	419232	450343	TRUE	20	GAAGTGTTCTTGTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	419152	452550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425599_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_450829_452290
772571	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772576	contig_9609_pilon	+	652	2	Intergenic	novelGene_22949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_1	0	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTCCTGGATACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196208	211925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_196281_211345
772580	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	504	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772581	contig_5515_pilon	+	1007	7	Intergenic	novelGene_52308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	114.155960568572	320	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	150	947	38249	49784	FALSE	20	CCCATGAGGCCTGAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVALQTRLAKRGILKHLEPEPEEEIIAEDYDDDPVDYEATRLEGLPPSWYKVFDPSCGLPYYWNVDTDLVSWLSPHDPNSVVTKSAKKLRNSNADAEEKSDRSHDKSDRGHDKSDRGHDKSDRSHDKSDRGHDKLDRDRERGYDKVDRERERDRDRDRDRGYDKADREEAKERRHHRREELAPYPKSKKVASRKDEELDPMDPSSYSDAPRGTWSTGLPKRNEAKTGADTTAAGPLFQQRPYPSPGAVLRANAEASRTKQQD	37699	49844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_37831_38230_38316_48213_48326_48565_48679_48868_49154_49390_49455_49627
772584	contig_5649_pilon	-	2272	10	Intergenic	novelGene_82348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	7.7746025264604	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	524	1705	843612	822990	FALSE	35	CATGTCATTATAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVVGARWAWG	850815	822422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_843519_843646_846054_846484_850754
772585	contig_8866_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_77902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAGATTTCACCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124041	1124388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1124000_1124400
772586	contig_8520_pilon	-	2144	1	Intergenic	novelGene_85456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGAAACAGAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291517	289373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_289400_291500
772595	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_98154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
772596	contig_20600_pilon	+	2177	6	Intergenic	novelGene_137116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	63.5156673585345	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	32	694	111355	117437	FALSE	10	GGCCTAATTTTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRCLSLGAVMAKSKFEYVRDFEADDTCLAHCWVVVRLDGRNFHRFAEKHNFEKPNDSRALRLMTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVMLL	111323	118920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111459_112268_112446_113990_114161_114959_115049_116223_116345_117435
772598	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
772599	contig_11413_pilon	+	696	4	Intergenic	novelGene_103124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2127.97415397838	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	103	606	87465	90767	FALSE	10	CCTACTCAGTGTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPKKILQEGEEGYQKADSKERCWNSGVQEILRWLSAWHHLY	87362	90857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88498_90643
772601	contig_1516_pilon	+	987	6	Intergenic	novelGene_50009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1315.54469327347	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	53	871	347304	363617	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLEADWPWPLPASPATQPLPLPPCCLCIGHLCFLHSP	347251	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_355001_363507
772603	contig_2310_pilon	-	2631	5	Intergenic	novelGene_71608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAGGCGAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117165	106072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929
772604	contig_5896_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_159247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCTTTCATTCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352602	350317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_350300_352600
772607	contig_18173_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_160772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTGCAAATGTGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53606	52505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_52500_53600
772608	contig_7171_pilon	-	2136	10	Intergenic	novelGene_101267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	58.9169744347349	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	872	1774	909974	901469	TRUE	20	AAGACACGGCCCTTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCHKSLLPSPFKAPLVVEWAPSVTPKPDRVTLAQHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDFERLSGSFPFACHGLHPPPCQGPGSFSREELTGYLLRASAVCSKLGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFFWGGNQARLPLPGLWALLPQTLQRPGEGGV	910845	899212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_899382_901155_901269_901388_901524_901626_901665_902352_902498_905383_905503_905646_905752_905828_905910_908204_908481_909890
772612	contig_2114_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_104275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598214	595761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_595800_598200
772615	contig_8182_pilon	-	2350	11	Intergenic	novelGene_173257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.781854737034	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	845	2290	377569	254720	FALSE	25	ATAGATGGACTTTTTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDGMEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKKQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNQGQYLVPDGIVQSQVFEFAEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK	417610	254659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_254902_260075_260145_272886_272951_272992_273131_280197_280330_288166_288297_293553_293787_332473_332654_344351_344544_377443_377624_416820
772616	contig_3018_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_78784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1140	1445	417684	417379	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILVTSIAKLTMLLKLQFFQNSAPITHHIFISHLDSSSLHLRDSPEIYPLLNSQTSTKKKPCLSISSLPIPGEVPDRHTIKAKPSIQKKKLEVINGNNNN	418823	416839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_416800_418800
772617	contig_8310_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_75615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGACCTTCAGCCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326329	327836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_326300_327800
772620	contig_13542_pilon	-	1423	4	Intergenic	novelGene_131546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	19.3448241713959	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTCCTTTTCACCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571778	567468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_567495_567761_567844_568508_569572_571526
772621	contig_13542_pilon	-	686	3	Intergenic	novelGene_131544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	1.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	123	479	567045	566165	FALSE	35	GAAAAAGGAGCCTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRATVHLWGSLTSGGLAGQSESRLLPLLFALRWFTKFTEMDYARAGNKATFTVSLDPGPLEQFPHSMEPQLRQLGLPTALKKGVVTLLSDYEVCKEGDVLTPEQARVLKLFGYEMAEFKVTIKYVWDAQSGRFEQMGDDLPESASESAEDSEEDDDD	567167	565957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_566315_566455_566533_566915
772622	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
772624	contig_7806_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_157551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289864	287127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_287100_289900
772625	SIRV6	-	526	8	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	380	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCATACGGTCCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10816_11036_11109_11205
772628	contig_8122_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_40273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGAACTTAGGCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768329	766940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_766900_768300
772629	contig_16846_pilon	-	1144	5	Intergenic	novelGene_82976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	61	579	555239	551492	TRUE	5	CTACTTCGGGTCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558710	550864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551098_551159_551665_552661_552824_555055_555278_558688
772634	contig_610_pilon	+	1993	1	Intergenic	novelGene_76801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTCGTGTTGAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297387	299380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_297400_299400
772635	contig_8020_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_114410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1305	1622	170878	171195	NA	80	AAAAAAAAAGAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKEMRLLWKVGLDPVCDVKELYQQWGSLPRMEMSRPGLCLERPLWLLEGAWIGRHEPGSRETGLEAVTNVQVRDDGSGRAEKLLEVKSLVISISLPLIPRKVP	169573	171925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_169600_171900
772642	contig_10569_pilon	-	1989	3	Intergenic	novelGene_44092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_2	0.5	95	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGAGATCGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448341	405706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_407460_411051_411148_448201
772644	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1213	0	1213	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3945	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
772645	contig_6509_pilon	-	2552	1	Intergenic	novelGene_145651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	690	1043	173206	172853	NA	30	AAAAAACCCTGTTGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLLPLLRVEGRGRRHQMRLWVVSWHLCHRGGWLPNREGGLRGTESSRAGLKQGIQPRNCLVVGQLWPVDQIQPVACFCLTRLLRMVFTNLNCCLKQQQKTEYVEETICGLQNPKY	173895	171343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_171300_173900
772647	contig_10058_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_67675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATAGTGTGGAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43249	47247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_43948_46581
772648	SIRV2	+	488	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-66	101	-66	-101	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCGTAGTACGCATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	1530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
772662	contig_3602_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_60523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGGGCATGCAATAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170670	169935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_169900_170700
772664	contig_5556_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_173278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	135	314	227154	226975	NA	35	ACAAATGTTTTTGTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSKTHVDVTSDILLTFTIATLHSREGNAALQSITGLFSILSSLMLAFRFRRVGGLGLKFSCARKRERRHLSTTSFSNKEGLFCIPNCTVDKSFMRMYKMFVL	227288	226385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_226400_227300
772666	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772668	contig_8616_pilon	+	793	7	Intergenic	novelGene_72561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1076.65495349666	55	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	413	718	435878	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425759	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428052_435787_435900_435993_436119_436357
772669	contig_6202_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_139825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGTGCCCGGCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475254	473581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_473600_475300
772670	contig_5454_pilon	-	2824	1	Intergenic	novelGene_145498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111655	108831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_108800_111700
772671	contig_2596_pilon	+	2255	10	Intergenic	novelGene_53514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	99	junction_8	92.450587402737	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	76	1632	1033881	1048715	FALSE	25	CATGTAATATTTTGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTQFQSHSARRLMSDLPFRMLFHLDVFDFVLFLEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCDQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP	1033805	1049338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1034157_1034520_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046105_1046180_1046321_1047742_1047920_1047994_1048130_1048634
772673	contig_3202_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_167391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTACCTGTTACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24718	25164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_24700_25200
772674	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
772677	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772684	contig_15752_pilon	+	2062	10	Intergenic	novelGene_148761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_9	66.8962712795796	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	5	1249	196379	201492	TRUE	40	ACAAAAAACCCTTCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMENFQAAVLGQPSVLTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEVSWPLLEHGERAPGGAGLLPSLTDVCR	196374	203952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_196424_196724_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201812_203458
772686	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	3	412	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772689	contig_10732_pilon	-	1368	3	Intergenic	novelGene_114759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	587	junction_1	27	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	2	568	574352	573306	FALSE	10	TTTCTCATTCACGGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	574353	572505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574129
772690	contig_10855_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_124326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAATAACAGCTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353305	354498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_353300_354500
772691	contig_3068_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_137613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTGACATGGAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170965	171207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_171000_171200
772692	contig_3068_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_137614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGGCAGCGTAATTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171653	173310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_171700_173300
772696	contig_5210_pilon	-	1471	11	Intergenic	novelGene_65484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_9	249.373394731675	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	347	1219	1152624	1101153	FALSE	35	TGTATGAAATCTTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESSAEEITVCPETQLSSSETPDFEREVSPSSRETPDEVRIIMADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAMYCNGLMEQDTVLTRRQKEAKSKSKSDTGTAAQTSLDIDKSEKCYLCKSFVPFREYQCHVDSCLQLAKGDQGDGPSGSDSVCPVAEGKQQQRLRSTKEKGQNEGRLLSVLEQSEQQSADAEIKTTSSETGAFRVSSLGMEEAGCSREMQSSLAHLDINDSPIKSFVSISEATDCLVDFKKQFTVRPGSRARTKAGRGRRRKS	1204115	1100900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141824_1141979_1147997_1148102_1152584_1152662_1154692_1154758_1173672_1173761_1203959
772697	contig_5260_pilon	+	1735	2	Intergenic	novelGene_144357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCAGCCCTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105690	109396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_106505_108475
772700	contig_3825_pilon	-	1214	9	Intergenic	novelGene_78009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	871.875268817163	866	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	33	932	1470962	1462075	FALSE	15	TTTGCATTTCTTGTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVVELSRATMALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRGDQGPPGIPGKAGPKGERGPHGEKGEPGHSEYCRTAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1470994	1461792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464766_1465290_1465419_1465864_1465898_1466905_1466933_1467929_1467975_1469010_1469125_1470880
772701	contig_15720_pilon	-	761	7	Intergenic	novelGene_41912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1911.22346649702	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	288	722	281554	278542	FALSE	15	TGACTTTTTGGAAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIQSGCLVSASHPTAATPSLSPVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	282715	278502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280316_281482_281556_281786_281935_282577
772704	contig_8254_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_48368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATATGCATGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22372	29847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_23692_29195
772706	contig_12080_pilon	-	390	3	Intergenic	novelGene_128424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	6	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	47	388	590008	586269	FALSE	25	TTATCAATATCTGTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAVAEATAEGVLDKMKLIILENYSQASEWAAKYIRNRIIQFNPGPDKYFSLGLPTGSTPLSCYKKLIEYYKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGESFKSLPDSRRIVLLLFTGSALERKRHVSEALMSGDRL	590952	586266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_586487_589884_590015_590912
772707	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
772710	contig_5894_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_83004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209996	210769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_210000_210800
772716	contig_10196_pilon	-	1026	6	Intergenic	novelGene_132234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_5	131.893290200829	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	14	490	1442405	1433608	FALSE	5	GGTTTTGGTTGCGTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTWTMSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1442418	1433071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339
772717	contig_12279_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_50137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88717	90883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_88700_90900
772718	contig_5965_pilon	+	903	3	Intergenic	novelGene_154667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	24.5	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTATTTGCTCTCATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217342	222328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_217423_221319_221485_221670
772719	contig_5965_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_154673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACAGTCAGAGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233156	234073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_233200_234100
772721	contig_6842_pilon	+	926	8	Intergenic	novelGene_130759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	353.612724861074	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	341	712	1366898	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1306780	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306906_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
772722	contig_18081_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_23824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCCTGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198731	197612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_197600_198700
772732	contig_12299_pilon	-	3069	9	Intergenic	novelGene_29743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	100.652558338077	21	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	678	1601	354891	275506	TRUE	35	ACATCCAATGCACACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDFISISMLSLAMLVGCYVAGIIPLAVNFSEERLKLVTVLGAGLLCGTALAVIVPEGVHALYEDILEGKHHQTSETQNVIASDKAAEIPVVHEHEHSHDHTQLHAYIGVSLVLGFVFMLLVDQIGSSHVHSTDDPETARSSNSKITTTLGLVVHAAADGVALGAAASTSQTSVQLIVFVAIMLHKAPAAFGLVSFLMHAGLERNRIRKHLLVFALAAPVMSMVTYLGLSKSSKEALSEVNATGVAMLFSAGTFLYVATVHVLPEVGGIGHSHKPDTTGGRGLSRLEVAALVLGCLIPLILSVGHQH	355568	265834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_267088_270791_270871_275369_275737_277431_277567_278093_278180_281081_281151_289529_289728_324112_324222_354795
772738	contig_19737_pilon	-	2634	6	Intergenic	novelGene_158980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	51.9746091856399	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	320	772	73285	59966	FALSE	50	TTACATTAAAAGCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSYKEVNRYDAPGSLALYPGQAQLLSCQHHYEVIPPLRSPGQPGAMNCTTHRINYTDPFSKQTVKSALIVRGPQEVKKRELVFLQFRLNQSSEDFSAIDYLLFSSYQEFLQRPALLTTSTRGQPPRKVLSCFLWSLNGRILSSRRSKI	82891	58103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_59970_61593_61702_68002_68146_71730_71883_73239_73505_82791
772739	contig_6228_pilon	-	1695	11	Intergenic	novelGene_164500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	17.5809556054271	2	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	82	1437	244530	212908	FALSE	15	GCTCGCCATCTGGGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSVVWSRNLAPLAVPLLFRRRAYDVVMPARLLRALVRSHCILSKAYQCRRLVYLTLKPLKKCENTAGSTLAISQNLDLVFPDTAVHGLNKSQILEMNQKISNTSIFSPINAVRCQDEKAHLPATKSLGIHRKVTHKPNLLGSKWFIKILKKHYSSVSTETLVPKQDFPQIKRPLKASRTKQPSRTNLPVLSVNEDLMHCTAFATADEYHLGNLSQDLTAHGYVEVTSLPRDAANILVMGVENSAKEGDPGTVFFFREGAAVFWNVKDKTMKHVMQVLEKHEIQPYEVALVHWENEELNYIKTEGQSKLHRGEIKLNSELDLDDSILEKFAFSNALCLSVKLAIWEASLDKFIESIQSIPEALKAGKKVKLSHEEVMQKMGELFALRHRINLSSDFLITPDFYWDRENLEELYDKTCQFLSITRRVKVMNEKLQHCMELTDLMRNHLNEKRALRLEWMIVILITIEVRGILSPQSLPV	252225	212649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_213064_220286_220408_223376_223454_224914_224980_226260_226368_229106_229208_231141_231182_233938_234015_236213_236323_244026_244545_252158
772746	SIRV4	-	270	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1250	1	1250	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3908	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
772749	contig_5020_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_27871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1084.68380646159	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	357	887	122915	125717	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKHCLWGRLLYHCHRLPCRRSQDEIHELCPGPVQQRWPLCPYHAPEGGAPGLLQRVHALLSSLGFLECGDVRHL	118468	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123341_124933_125091_125657
772751	contig_6446_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_149261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTGCCTGAAGTAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727511	728974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_727500_729000
772754	contig_14450_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_48992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGCTCTTAGAGACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068692	1067639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1067600_1068700
772755	contig_10196_pilon	-	1144	3	Intergenic	novelGene_132032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	936	junction_2	220.5	3350	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	215	616	409216	404095	FALSE	10	TCCCCTGTCCACGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLNDKISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK	409430	403566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404300_404421_404606_409203
772756	contig_14243_pilon	-	946	8	Intergenic	novelGene_57448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	106.787792621915	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	227	802	705976	702878	FALSE	40	TTAATGTCAAAGTTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	707784	702733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_706267_706388_707740
772759	scaffold_12124_pilon	+	894	8	Intergenic	novelGene_22273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3277.26277025601	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	33	323	1473608	1497040	TRUE	15	ACGCCATTGGTATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGKTLSLRRLNPPGSSLGS	1473575	1508443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490381_1490409_1491906_1491999_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
772760	contig_6710_pilon	-	484	2	Intergenic	novelGene_98145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	20	TTGCAGCTACCCACCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
772761	contig_10063_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_127758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTTTGTGGGTCTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687303	685002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_685000_687300
772765	contig_13868_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_172643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	313	642	25361	25032	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILMLLGSNEEQHDTDRERQPVQGPRDVAGQCHGHQLGEALALNFLAFTRMVISIARKLTFSCRVWEKLVILVKEHEEGIYQRQCGFIYQDVSYVYSHLNICYSDDLL	25673	23458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_23500_25700
772768	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	61	508	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772769	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772770	contig_10074_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_57133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368580	370335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_368600_370300
772775	contig_9235_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_156237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	159	491	115665	115997	NA	30	TTCTAGGATGTTAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTAGSVSGLAGCEVSGNTQRVDHSCLEKDVPVPGFHICPRRTLESQFDLFIKREMLYNFSSIMYLPPDNVSQMRLHSKVENFCVGEISTGSTANGNVIYVEKCPLLII	115506	117283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_115500_117300
772776	contig_7378_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_120236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTTGACCAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133278	135630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_133300_135600
772778	contig_5479_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_133616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTTTATAACTTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396895	397927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_396900_397900
772781	contig_11579_pilon	+	2122	7	Intergenic	novelGene_171942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	25.3733236994201	75	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGCTTGGTATATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54850	89530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_55138_66399_66505_77476_77633_85985_86115_87105_87257_87591_87752_88396
772783	contig_7657_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_30018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAACCTCAAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144986	143976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_144000_145000
772787	contig_11413_pilon	+	2686	3	Intergenic	novelGene_103208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	25	24	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729317	739196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_729435_734375_734447_736698
772788	SIRV5	+	383	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3271_3405_3483
772789	contig_9955_pilon	-	868	6	Intergenic	novelGene_21389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.72525152761	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	130	579	667630	664178	TRUE	10	GGTGGCAGTGACTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLALLCAPGCVGAQSVARRLGPSRVFLTSGLHRIYCQSLLFTMASSDIQVKELEKRASGQAFELILSPRSKESVPEFPLSPPKKKDLSLEEIQKKLEAAEERRKSHEAEVLKQLAEKREHEKEVLQKAIEENNNFSKMAEEKLTHKMEANKENREAQMAAKLERLREKDKHIEEVRKNKESKDPADETEAD	669392	663735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_664014_664166_664250_664634_664827_666950_667124_667617_667686_669318
772793	contig_12799_pilon	+	3277	1	Intergenic	novelGene_173283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGTCAAACATGTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32622	35899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_+_32600_35900
772797	contig_14353_pilon	-	1941	3	Intergenic	novelGene_82115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	1	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	53	490	104372	88443	FALSE	35	TTAGAAGAGTGACTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVSKNPPISFPLHPQAPSPSSPITLSAWPLNNHIH	104424	86991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_88750_90961_91054_104333
772800	SIRV4	-	311	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1207	3	1207	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772801	contig_3948_pilon	-	1105	8	Intergenic	novelGene_53413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	198.006081126983	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	322	765	1950411	1933521	FALSE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVAKSFEAPIKLVFPQDLLEKGLEADNFAMLGLGDIVIPGIFIALLLRFDISLKKNTHTYFYTSFAAYIFGLGLTIFIMHIFKHAQPALLYLVPACIGFPVLVALAKGEVTEMFSYEESNPKDPAAVTESRKGAEASKGMEKKEK	1975852	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951142_1951169_1975575
772802	contig_14441_pilon	-	881	4	Intergenic	novelGene_100771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	169	351	126577	126154	TRUE	5	GCTTCTGCTCACGGCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGLHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSL	126745	121833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_121859_125511_125888_126024_126271_126511
772803	contig_8491_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_154222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAAAAGATTAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274769	275632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_274800_275600
772804	contig_8491_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_154223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATCTCGAGTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275631	276617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_275600_276600
772805	contig_5698_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_55032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCAAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6273	8217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_6300_8200
772807	contig_6674_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_147996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAGATTAAAGCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113892	116115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_113900_116100
772810	contig_14814_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_137731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344702	343972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_344000_344700
772814	contig_16411_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_77286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGTCAATTTTCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45546	46941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_45500_46900
772816	SIRV5	+	371	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	135	48	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
772824	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_97145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
772829	contig_4857_pilon	+	1297	3	Intergenic	novelGene_48832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	27	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAACTGTTAATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1339922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1336704_1336828_1338905
772833	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_96477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
772835	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772838	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
772840	contig_17144_pilon	-	1646	5	Intergenic	novelGene_29127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	936	1403	12299	11832	TRUE	10	CCAGTGGCCGGCGGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFSKSSRSLYLLGD	16035	10049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10113_11651_12356_13328_13501_14252_14365_15440
772842	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	51	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
772847	contig_4125_pilon	-	2681	19	Intergenic	novelGene_25034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	80.429038580065	283	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	18	2246	62274	50223	FALSE	20	AACATCTGGTTTTTTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSRKKRLAELTVDEFLASGFDSESESEPEGAPAAEAPTAARSPRGPGGGPSASRRKGRASEHKDQLSRLKDKDPEFYKFLQENDQSLLNFSASDSSEDEEEQFHSLPNMLEEASEEEEEEDGMEAGDRVPRGLQGKKSGSAPVTLAMVEQWKQAAKQHLTPKLFHEIVQAFRAAVATTQGDQEGAEASRFQVMDSAVFNAMVTFCIRDLLSCLQKLLFGKAPSSSPLWGKLRLDIKTYLSSVTQLAGCLTEATVAAAVLQHISSVVPYYLTFPQQCRVLLKRMVVLWGTGEETLRVLAFLVLVKVCRHKKDAFLGPILKRMYITYVKNCKFTSPSALPTITFMQRTLTEVLALDSGAAYQHAFLYIRQLAVHLRNAMAMRKKETYQSVYNWQFMHCLHLWCRVLGTLCPSGALEPLIYPLAQVIIGCIKLVPTARFYPLRLHCLRALTLLSESTGTFIPVLPFLLEVFQQVNFNKKPGRMSAKPINFAVILKLSNVNLQEKVYRDGLLEQLCDLTLEYLQGQAHSIAFPELVLPAVLQLKSFLRECKVANYCRQVRQLLEKVQENVEYVRCRRQAVSFGVSDQPTVDAWEKQTRAEGTPLTKYYSHWRKLRDREIQLEISGKERLEDLNFPEIKRQRTEKRKEEDRKEFKDLFDLDSDDEEDVSGLSGTGAPGSLRVRHGAEEEEDDEDGGSSSGSEEEVSDLDDGGADAEAGLGPGELQRLAQGPEDELEDLQLSEED	62291	49787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_50330_50564_50670_51064_51201_52120_52235_52322_52467_53652_53755_54129_54244_56303_56416_57281_57422_57610_57800_58080_58195_58685_58797_58876_58943_59460_59538_59641_59763_60313_60449_60537_60713_61960_62105_62251
772850	contig_5718_pilon	-	2552	1	Intergenic	novelGene_110356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	870	1169	686224	685925	NA	30	GTGTTATAGACTAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPSKLCFSLQSRRPRTEWAVTFPPCCLLPAASVITSWQQGMETRETRAGRQRSSGHRKCTERTVGALNPPDVGVFCLKQEDFFGLALMSGFVLGELPS	687093	684541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_684500_687100
772853	contig_5814_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_143053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAGAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329237	331224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_329200_331200
772856	contig_6375_pilon	+	2802	9	Intergenic	novelGene_73032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCGCAGCGCCTGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471578	497742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_472301_479909_480020_480559_480778_481265_482543_483228_483321_489767_489896_490316_490424_496145_496213_497661
772858	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	51	516	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
772861	contig_12411_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_145669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATAGGTTGAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129360	127742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_127700_129400
772862	contig_11396_pilon	-	969	8	Intergenic	novelGene_71256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48.6528728937596	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	105	857	127439	121478	FALSE	20	AGTGAGTCAGGGTGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLAAVKLESENNEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVLGNLAAAQELCEEALKHYEDFPKLWMMKGQIEEQEELVEKAREAYSQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKVGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAVFLEARPQRKTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSERKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCENAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGEVLVLVAARIKNTF	127713	121365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121631_122169_122236_122274_122297_124392_124508_125485_125578_126107_126242_127268_127446_127615
772864	contig_10766_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_151206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCAAACCCCTTGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147342	147593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_147300_147600
772865	contig_16846_pilon	-	865	5	Intergenic	novelGene_82948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	86	604	555239	551492	TRUE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550982_551350_551665_552661_552824_555055_555278_558688
772866	contig_5415_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_146135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	706	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTTGCTTGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165826	164682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_164700_165800
772867	contig_17470_pilon	-	1937	14	Intergenic	novelGene_110535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.2236933752972	1	97	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	342	1607	277215	270076	TRUE	35	ACTTGTTCACAATAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKAIPVSIFYSVPHQKHFDHYVRFCFIKDEATLQAMDKKLQKWKAELTP	302587	269621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_269672_269795_270142_270230_270309_270858_270939_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302355
772869	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8115	3	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772872	SIRV2	-	258	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4615	34	3440	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
772875	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
772878	contig_9113_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_68607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGAGGAGTCCCTACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391947	391502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_391500_391900
772880	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
772882	contig_6007_pilon	+	1306	2	Intergenic	novelGene_87905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28838	40039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_29504_39398
772884	contig_405_pilon	-	1620	4	Intergenic	novelGene_135291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_3	34.322004603461	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	158	775	190847	138031	FALSE	40	CATGCATATTTACCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPGRLGGGFAAATGLRPTLPPPPPPPLSAIVPGPGPQRVHWGVPSTPASLTMPDQALQQMLDRSCWVCFATDEDDRTAEWVRPCRCRGSTKWVHQACLQRWVDEKQRGNSTARVACPQCNAEYLIVFPKLGPVVYVLDLADRLISKACPFAAAGIMVGSIYWTAVTYGAVTVMQVVGHKEGLDVMERADPLFLLIGLPTIPVMLILGKMIRWEDYVLRLWRKYSNKLQILNSIFPGKALKCGCNIHATLILLFRNI	191004	137185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_138280_150337_150469_165723_165927_190812
772887	contig_7291_pilon	-	1360	4	Intergenic	novelGene_106308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	362.7515219357	132	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAACTCCAGTGCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213283	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_181570_183797_183868_206194_206350_213210
772899	contig_1719_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_87309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCATCACCTCTAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427572	425499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_425500_427600
772904	contig_6710_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_89213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
772913	contig_6710_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_97740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
772914	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_96578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657815	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657817	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
772915	contig_10774_pilon	+	1328	3	Intergenic	novelGene_158687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	5	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTTGGGATATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97510	100305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_97797_98726_98790_99326
772917	contig_8576_pilon	-	1535	3	Intergenic	novelGene_88768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	75	junction_2	63	87	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	24	341	763004	761002	FALSE	15	GAGATTGCATTGCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVRTRAVMSALTRLAPFVRGGGRLFRSCRKRTAGSGGVRHAGGGVHIEPTYRQFPQLTRSQVLQAEFFSATMWFWILWRFWHDSDAVLGHFPYPDPSQWTDEELGIPPDDED	763027	759807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_761077_762178_762324_762906
772919	contig_8701_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_173287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACAAAGTATTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120824	119746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8701_pilon_-_119700_120800
772920	contig_5003_pilon	-	2390	22	Intergenic	novelGene_120181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	254.181956716407	1	74	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	369	1955	60618	5153	TRUE	40	TGAATCTTACGAGTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPYGFPWELVTGAAIFGFFAVLLFLWRSFRSVSREKKLAVKLSTLIEEKCKLLEKFSLVQKEYEGLESSLKDGKESTEAQSLETTYEKLDRSKSELEDEILFLEKQLKEEKSKRSEKDELGMDISERIQSLEDESKSLKSQAKMTFKIFQMNEERLKIAIKDALNANSQLQESEKQLLQEAEEWKEQLSELNKQKITFEDYKVHVEQVLSDKENQIKSLTEHLLKMKDWTAVLGEDVVDDDSLELEMKSESEYGTYLDDQPRGALKKLIHAAKLNASLKTLEGERNQIYIQLSEVDKTKEELTERIKDLQTEQSSLQSENAQFENENQKLQQKLKVMTELYQENEMKLHRKLTVEENYRLEKEEKLSKADEKLSHAAEELEIYRKRAKDLEEELERTILSYQGQITSHEKKAHDNWLAARTAERNLNDLRKENAHNRQKLTETEFKYELLEKDPYALDVPNTFGREHSPYGPSPLGRPSPETRAFLSPPTLLEGPLRLSPLLPGGGGRDSRGPGNLLDHQITNERGESSYDRLFGPHRAPSDTGSLSPPWEQDRKMMILPSGQLYPDPAFPPQRQDRYYSNSGRLSGPAELRSFNMPSLDKADGPMSSEMESSKNDPKDDLGQLALALVLHLFLQSKVHCFQWTQGGLS	71745	3466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_3794_5044_5237_5929_5989_10843_10967_26584_26744_30290_30420_32065_32146_33647_33716_38164_38201_39044_39106_40063_40166_43948_44088_46242_46334_47075_47123_48362_48484_50755_50879_56381_56487_60558_60622_61267_61379_63554_63618_66502_66592_71643
772924	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
772926	contig_2367_pilon	-	1641	3	Intergenic	novelGene_65324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	673.5	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACATAATTTAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213292	192229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208625_213112
772930	contig_7887_pilon	+	964	5	Intergenic	novelGene_124938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	13.4536240470737	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	36	614	601734	617241	FALSE	20	CGCTCAGAGTTGGACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQTCSPRLVLLFSGKRKSGKDFVTEALHSRLGADVCAVLRLSGPLKEQYAQEHGLDFQRLLDASTYKEAYRKDMIRWGEEKRQADPGFFCRKIVEGVSQPVWLVSDTRRVSDIQWFREAYGASAQTVRVVASEQSRQQRGWVFTTGVDDAESECGLDNFGDFDWVIENHGDEQCLEEQLGSLIEFVHSRL	601698	617591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_601829_609380_609445_612030_612184_615671_615802_617104
772932	contig_4103_pilon	-	1784	2	Intergenic	novelGene_51977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	345	719	178402	178028	TRUE	30	TTCAAAGAAATGCCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGLEPSFRVILGWNPSLWPGFWTPCSSTRPSRRCSQRVGAESPTEHSLSGKHQLLQSAYSGTWAVRDWGRFAAVWLGEQPGITSSSWAPDPGVPATWGRRAGVRTGQSPLRTRFRPSSSGLG	178746	176815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_177160_177306
772933	contig_9443_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_167129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGACACACAATCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148130	148987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_148100_149000
772934	contig_9443_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_167130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTACCCAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149446	151136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_149400_151100
772936	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772938	contig_5338_pilon	-	1299	4	Intergenic	novelGene_114577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	122.321979491286	1525	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	267	743	381535	380867	FALSE	25	AAAGTGTTTAGATTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHWPEQEPSRAGTLWRVCGRGPPIWEPALSANRTAVSRTRARAAGTSSWGPHQGESARVEEEGREVGQRSRVLLTALHLQAAEEVMRYTSLQLRPPQSRVPSPGAPIKYSEVVLDSEPKAQALGPEPELYASVCSQTRRARASFPDQAYANSQPAPS	381912	380310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_381243_381346_381406_381493_381630_381740
772939	contig_10235_pilon	+	1697	8	Intergenic	novelGene_46591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	37.7678191489171	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	98	1009	567174	581650	FALSE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWLGCRASVPKGGGIVISLTGLLIIPFSGGSMLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	567076	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
772944	contig_13894_pilon	-	1284	4	Intergenic	novelGene_62059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	767.4465598478	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	399	1217	287445	286290	FALSE	25	TGTAGTGAAAGTACTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288240	286222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286645_286884_287123_287219_287538_287934
772945	contig_253_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_129617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAAAAACTCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118908	116478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_116500_118900
772952	SIRV6	+	557	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4036	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772953	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
772955	contig_15327_pilon	-	817	7	Intergenic	novelGene_70453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	1122.86341555863	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	259	744	293006	289810	FALSE	0	GCTGTGTGTCTGCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVKSCAEFLAVSKTRIGEYEKQLEKLRNIIPFDQMTIDDLNEAFPETRLDKTKYPYWPHQPIENF	294485	289736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_290158_291454_291527_292481_292579_292884_293016_294073_294262_294424
772957	contig_14687_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_107902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGATCATGCATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423790	421052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_421100_423800
772961	contig_4429_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_50815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACGTCACCAAAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194145	192224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_192200_194100
772963	contig_13457_pilon	+	1359	9	Intergenic	novelGene_118326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	145.696388081517	4	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	297	1079	55746	57730	FALSE	25	ATTCCCGATGGCCTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52345	58010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53386_55604_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
772965	contig_17068_pilon	+	1859	2	Intergenic	novelGene_172568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	398	853	35340	112709	FALSE	35	TTTAAAAAATGTCATCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEETHPDEAPSLDMGALATRPFKKKKASVGPNSPAVKENEELQSHKESISPRDRKGRINQRLHQPETRRTRRCPATTNDRPDREHNRESLMEQEKKEVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGSPENMAPGLSVNPELKPFPRPTLQTKIKLDYRT	34942	113715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_35366_112279
772966	contig_15991_pilon	-	873	7	Intergenic	novelGene_70892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	292	804	103618	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102140_103610_103703_104975_105142_106315
772968	contig_8358_pilon	+	443	2	Intergenic	novelGene_173290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	249495	251691	FALSE	10	GTGAGTTCCTTGATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRTSSSRGPTAAEKRQQQRTNSSRTRRPVQDSTGADPWSERAECLCAGGFLAEWGASGHLYRWSYGALEHLPQQGRCGREARGSRGHRKQKLKRQGTQEAELLQPQKLITIKKTLDNICKSFT	249492	251760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8358_pilon_+_249816_251640
772971	SIRV4	-	415	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1104	2	1104	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
772972	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8123	-1	616	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACCGGTTATTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
772975	contig_9535_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_124476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279426	281556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_279400_281600
772976	scaffold_13505_pilon	+	1035	5	Intergenic	novelGene_111386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	16.9558249578132	1203	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	302	997	128320	130608	FALSE	0	GTCTCCCGCCTCTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEENPASKPTPVQDVQGDGRWMSLHHRFVADSKDKEPEVVFIGDSLVQLMHQCEIWRELFSPLHALNFGIGGDSTQHVLWRLENGELEHIRPKIVVVWVGTNNHGHTAEQVTGGIKAIVELVNRRQPQARVVVLGLLPRGQHPNPLREKNRQVNELVRAALAGHPRAHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSRLGYTPVCRALHSLLLRLLAQDQGQSVPLVEPTP	128018	130646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_128398_128585_128676_129406_129524_129614_129738_130320
772978	contig_18869_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_56032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73544	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
772981	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
772982	contig_6842_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_130829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1786176	1787790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1786200_1787800
772984	contig_17964_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_33912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390463	391431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_390500_391400
772985	contig_408_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_84930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAGGAAATTTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209035	207805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_207800_209000
772988	contig_12270_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_113537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14346
772993	contig_10235_pilon	+	505	5	Intergenic	novelGene_46338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	606	junction_1	140.139885471624	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	136	417	109941	111229	FALSE	15	CTCCTGATCCAGTCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKKKYMEFDLNGNGDIDIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKMILMYEEKAREQEKPMGPPAKKAISELP	109333	111317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109394_109485_109553_109932_109975_110144_110308_111144
772995	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
772996	contig_9435_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_156961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCTAATTTTGGGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359732	360904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_359700_360900
772999	contig_9673_pilon	+	1527	10	Intergenic	novelGene_119154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	660.208384611337	142	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	117	881	59036	203445	FALSE	35	TTAAAAGATTTGTCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGVDCGDGLRARQYVFLLPEYLKDASKKMKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEIDSKKYYKYSKEKTLKWLEKKVNQTIVALKTNKINVGARVQSAAFFPGDQASSDKEEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKAAAQRQRRNK	58919	204091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_203412
773001	SIRV4	-	349	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1174	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3984	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
773002	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773004	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	3	412	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	340	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773008	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
773009	contig_10857_pilon	+	847	5	Intergenic	novelGene_160887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	511.010946555942	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2	532	21918	66572	FALSE	5	CGTGTGTCCCATGCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRPQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLCLRPVVEPQEEPGLEETEPRDLEELAQDPQGLPSLPAPL	21916	66887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56561_58201_58360_66543
773012	contig_3132_pilon	-	1513	2	Intergenic	novelGene_127454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	579	1007	369684	369088	FALSE	85	ATCAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADLSGFNIDAPRWDQCTFLGRVKHFFNITDPRTVLVPEQELDWAKMMVEKSRMGAVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNIIGRMSFQVPGGMIITGFMLQFYRWDLEQGSDRCSCLDLVGREPYSDNNNNSQLY	370262	368581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_369356_369523
773015	contig_9363_pilon	-	1655	6	Intergenic	novelGene_6705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	31.8810288416168	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	142	1206	1293016	1288546	FALSE	15	AGGGAGAGCGGGTGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLPFFWLCSTSMSGQPLGPYCLLWFSFLPNNSPLLSQGGKAALIHIRFFPSLSVFLPLSPVTLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVSLRVSGPGPVPLPHGPSVMDTPLEFTLSPFPGGSVDSAGCWTSGLKHPPHTAPDQECTVEGSLCTAASAAPH	1293157	1288096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288894_1288965_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291499_1292774
773017	SIRV6	+	353	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	407	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1761_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773018	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
773026	contig_5210_pilon	+	2143	7	Intergenic	novelGene_65474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	80.7370560661102	1	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	56	682	807530	812511	FALSE	10	TCGTGGCTCCTGGCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	807474	813972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474
773028	contig_7345_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_159166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCTTTATTTTTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109002	108258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_108300_109000
773029	contig_2312_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_160738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTCATTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234506	234155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_234200_234500
773035	contig_12142_pilon	+	2063	2	Intergenic	novelGene_147807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	263	junction_1	0	79	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	897	1229	97570	99095	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFQGPIRQEAPAPAVLGVGSPAPRWRQSRQAELKPMPSSHFQACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTEVG	96673	99929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_97828_99020
773036	contig_7580_pilon	+	1259	6	Intergenic	novelGene_108604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	365.499329684748	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	133	870	103468	109647	FALSE	20	TTTCATCTATATTTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRDLHRPLLFLQFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96548	110036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96647_103433_103563_105292_105378_106952_107190_108145_108248_109428
773038	contig_19957_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_57752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTCATAGTGACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414391	413641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_413600_414400
773039	SIRV6	+	199	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	506	3	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAGTCGAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
773042	contig_18869_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_56376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	73776	73462	NA	40	AAAATTCATTTTTCTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73779	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
773045	contig_4364_pilon	+	1141	3	Intergenic	novelGene_4561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTTCCCTAAATAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534938	1538328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1535360_1536204_1536239_1537642
773046	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	0	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773047	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	2	379	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773048	contig_10930_pilon	+	1221	3	Intergenic	novelGene_37120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1195	junction_1	9590.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTGGTGCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340097	342099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_340639_340994_341098_341522
773049	contig_8616_pilon	-	1128	5	Intergenic	novelGene_72426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	424.372772453653	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTACTGAGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255477	253301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302_254668_255265
773050	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
773054	contig_2799_pilon	-	3280	1	Intergenic	novelGene_85465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTACTTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394481	391201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_391200_394500
773055	contig_14176_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_74869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGCCCTTTGGGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499778	499131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_499100_499800
773056	contig_14176_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_74868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	89	364	498541	498266	NA	20	TGTGGACCACAATTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQRQLAWPRGWGRGAGWRGLKNEIGTLQPMQWPAPGCRLGCCTLHGRGKLFIPIETGLREGLPPAAQLMEPTGGSSTMHSLLLSQDSMGSEEGSGTGAVRYDGCGRGPLTPHTSSSHQTG	498629	497753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_497800_498600
773060	contig_4385_pilon	+	1504	11	Intergenic	novelGene_141520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_2	57.5013912875158	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	7	999	461663	473797	FALSE	10	TTCTCTCTGCTGTCCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSMRLFTHAVCNAARAAWRESFPLGGRDPARWFPGHMAKGLKKMQSSLKLVDCIIEVHDARIPLSGRNPLFQETLGLKPHLLVLNKMDLADLREQKKILQHLEGEGLKNVIFTNCVKDENIRQIIPTVTELIESSYRYHRGENLEYCIMVIGIPNVGKSSLINSIRRLHLRKGKASRVGGQPGVTRAVMSRIQVCERPLVFLLDTPGVLAPRIESVEMGLKLALCGTVLDHLVGEETMADYLLYTLNRHQLFGYVQHYGLDSACDDVESVLKRVALKLGKTQKVKVLTGTGNVNIMQPNYAAAAGHFLRAFRSGLLGPVMLDRDVLACCVDR	461656	474302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_461775_463456_463522_465327_465433_466487_466569_468044_468102_468286_468378_469448_469511_469989_470087_470532_470615_472693_472807_473669
773063	contig_10857_pilon	-	1776	2	Intergenic	novelGene_160865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGTTATTATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22151	20192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21497_21679
773064	contig_10904_pilon	-	1821	5	Intergenic	novelGene_22789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_1	72.885183679538	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCTATGGCAGCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760409	757109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_757981_759069_759123_759334_759373_759452_759496_759593
773066	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
773067	contig_1450_pilon	+	1175	3	Intergenic	novelGene_27428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	125	1042	419840	424949	FALSE	40	TCAAGAAACCATGATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSHTHTHIHTHTHTLR	419715	425082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423110_424904
773068	contig_12250_pilon	+	1988	4	Intergenic	novelGene_80659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1194	1826	377063	378324	TRUE	20	GCCCTCAGACCCCTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPEMWYSCTGLNLNLLFHGLAWGRRVARLLVWSHRVYTAQVQGCIAQATMEDLLADRVWQGLPSGVHRVPRGQGQGLSWNSLTSAEVGCFEELHALITGQQMWAWTRWGLGCIPGDGDGAEALHEEALGVAGHQDAPLELAQQALCGLQWVRLGENHLLHADLGARGLSHKAAVEAVHLGLPNHTPAVDEGEQQRVVWSGGSRSSRDT	375715	378591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_376105_376258_377663_378291_378357_378461
773069	contig_10323_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_123625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	474	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1163	1474	486163	485852	NA	10	TAGGCCTGGAGTCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTTGRSNCRKRPNRITCELSLKKRAGTRRARGMLLQDEGPGEQGRCPCRLAGEAPGGWSIGCCLGHSRGLTTPQQQLHLFVQKVVLSEFEIPMYLSEETKL	487325	484938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_484900_487300
773070	contig_7202_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_17276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
773072	contig_7587_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_163713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGCTATATTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144580	142324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_142300_144600
773074	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773080	contig_18055_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_117833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85085	85625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_85100_85600
773081	contig_9058_pilon	+	1341	4	Intergenic	novelGene_149364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	392.617144585183	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	23	781	41923	56687	FALSE	20	ATATCCCCAGTGTCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTAEEASSSFRHTSAPAERPTPPQTSSSTETSPRGCRKLIILSPEIGNPFL	41900	57247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47502_56538
773082	contig_15084_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_116687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCACTGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170808	169259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_169300_170800
773083	contig_5217_pilon	-	1741	3	Intergenic	novelGene_135743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_2	60	12	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAAACTGGAGACCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530944	528958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_530460_530597
773085	contig_13510_pilon	-	2663	1	Intergenic	novelGene_164200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81223	78560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_-_78600_81200
773086	contig_10733_pilon	-	2399	6	Intergenic	novelGene_109968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	5.03587132480567	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	156	1397	304174	302337	FALSE	5	CTTTTTCCCCTTCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LADLDRVYELERVVGFVRDLGCQRVALQFPDQLLGDAGAVATRLEEITGSKMFILGDTAYGSCCVDVLGAEQAGAQALVHFGPACLSPPARPLPVTFVLGQRSVALELCAKAFEALNPDATAPVVLLSEPACAHALEALATLLRPRYLDLLVSSPALPLPTGYLNSVPEPLERFGRCFPLAPGRCLEEYGAFYVGGSKDSPGSDLDPDLSRLLLGWAPGQPFSSCCPETGQCQDESARAGRLRARRQYLVERARDAHVVGLLVGTLGVARYREALTHFRNLTQAAGKRSYVLALGRPTPAKLANFPEVDVFVLLACPLGALAPQPSGGFFRPVLAPCELEAACNPAWPPPGLAPHLTHYADMLPGSPFHVPLPPPDSELWDTPDVSLITGELRPAPTWKPPNAPGCSALTPRPQLELAESSPAALFLSSRSWQGLEPRLGQTPVTGAVSGRRGIAIAYEDEGNS	304547	301334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_302462_302543_302721_302807_303492_303686_303911_304142_304256_304473
773087	contig_2463_pilon	+	2108	3	Intergenic	novelGene_43036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	4.5	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	207	1535	544034	557207	FALSE	80	TATAAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELPAPSSAPRKTEEPGPRAEVMEEVTSCSFNSPLFQQEDKRGITYRIPALLYIPAARTFLAFAEKRSTCRDEDALHLVLRRGLRTGHLVQWGPLESLMTATLPGHRTMNPCPVWERKSGRVYLFFICVRDHVTERQQIVSGRNAARLCFIFSQDAGCSWSEVRDLTEEVIGPEMKHWATFAVGPGHGIQLQSGRLIVPAYTYYIPYRLFCFRLPCKARPHSLMIYSDDLGVTWHHGRLIRPMVTVECEVAEVIGKAGHPVLYCSARTPNRRRAEAVSTDHGECFQRSALSQQLCEPPHGCQGSVVSFRPMEIAHECQDPGGKDAPVGEQSPPLDSSLRLEQETGTLSESWLLYSHPTNKKRRVDLGIYLNQAPLGAPCWSRPWILHCGPCGYSDMAAVDEKGLFGCLFECGIKRECEQIAFRLFTDREILSHVQGELHQP	543827	557780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_544098_548724_548937_556154
773093	contig_8942_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_143205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGATATTCTGTACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478907	479406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_478900_479400
773094	contig_9668_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_58137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAGCCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294905	292663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_292700_294900
773095	contig_8660_pilon	-	907	3	Intergenic	novelGene_136504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	15	CTCCTGAAGGCTTAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
773097	contig_7408_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_168756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTAATCTGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55304	53695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_53700_55300
773099	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
773101	contig_610_pilon	+	2351	10	Intergenic	novelGene_76825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	186.729817360158	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	16	1932	350011	375649	FALSE	45	AGGCTGGAAATAACCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVAYTCTAKNPVSQSTSSPIHAQQFCADLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	349995	376068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_363029_363303_363794_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
773102	SIRV6	+	505	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773108	contig_2646_pilon	+	1810	8	Intergenic	novelGene_69646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	29.0341108325489	62	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	955	1728	2127520	2130275	FALSE	10	CGTCTGTGCAGCCTACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVIFGWGAEPGADPPSPRSLAVSVKMNGLLFAPGLLFLLLTQFGLRGALPKLGICALLQVVLGLPFLLENPTGYLSRSFDLGRQFLFRWTVNWRFLPEAVFLHRAFHLLLLAAHLTLLLLFALHRWHRTGESILSLLKDPSKRKVPPQPLTPNHIVSALFTSNFIGICFSRSLHYQFYVWYFHTLPYLLWAMPARWLTHLLRLLVLGLIELSWNTYPSTSGSSAALHVCHAVILLQLWLGPQPYPKGIQHSKKAP	2124542	2130357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2124645_2126068_2126169_2126655_2126804_2126915_2127703_2128171_2128378_2128534_2128614_2129810_2129954_2130112
773109	contig_10861_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_39225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTCACAATAATTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585610	586469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_585600_586500
773113	contig_12019_pilon	-	395	3	Intergenic	novelGene_87680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGGCTGAGTCTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8345	5162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
773116	contig_10904_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_22442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	58	378	71396	71076	NA	30	TAATTTTTCCAATTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWPLFICSFSLLTISQHHSAQRLAHKPSQEEFAQGKNQILFWGSCLSRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLW	71453	70647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_70600_71500
773117	contig_10432_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_171313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190166	187854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_187900_190200
773123	contig_13300_pilon	-	1809	3	Intergenic	novelGene_125819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8.5	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	1222	1809	247599	244186	FALSE	40	TGGAAAGGAAAAGAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAAGLCRKNKWTPWRQGDSSMPPPCGISLNCILLSGQAPELPKAMCPCLLPPGCSLDPCRHFQETKQEWKYKLKDWDWALTCSEEVAERPYEAPVRLRSEQGWDPVLGSSTTEVSVWPVSFSPSCLLPPWSPGHRIVQLGPTKRRQPPEPHWRSTHICCFGFSTFVDFSISAFPLFFLSNVITTLFFLLNANLHQ	248984	244185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_247267_247977_248140
773133	contig_9843_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_114310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17283	14928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_14900_17300
773138	contig_1406_pilon	-	1289	5	Intergenic	novelGene_25527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	79.0897433299666	374	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCTGAAGTCTTAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058919	1828981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1829712_1857392_1857533_2008288_2008459_2012379_2012515_2058805
773141	contig_14441_pilon	+	931	5	Intergenic	novelGene_100390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47264	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47571_111997_112040_116578_116818_117257_117344_117539
773142	SIRV6	+	532	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	10	19	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773145	contig_6344_pilon	+	2173	9	Intergenic	novelGene_157119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_4	60.5593716942308	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	461	1585	1176029	1215531	FALSE	5	GCTCTGTGTTTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSESSRCEEETPPLFWGLDPVFLAFAKLYVRDILNLKESQQVPGIFFYNGHPVKQVDVLGTVIGVRERDAFYSYGVDDSTGVINCICWKKLSDIRSSSAQTATAAPGTARDLSLTSQLKKLQETIEQRTKIEIGDLIRIRGYVRTYREEREIHATAYYKVDDPVWSIQISRMLELPVIYRKVYDQPFHSPALEKEKALSNPGTLDLASLTCLLSEKAKEFLVENRVQTFYQQELEMVESLMALANQPVIHSACSNLVDFKNDTASQAIHSIFKNAIQLLQEKGLVFQKEDGFDNLYYVTREDKELHRKIHRIIQEDCQKPNHVEKGCHFLHILACARLSLSPGLSEAVLRQVLELLEDQSDIVSTMEHYYMAF	1175568	1216119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1176162_1179726_1179823_1183172_1183242_1195076_1195254_1196152_1196277_1198753_1198926_1204896_1205020_1208082_1208156_1215373
773149	contig_854_pilon	+	1758	9	Intergenic	novelGene_36431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1061	1405	1075847	1081957	FALSE	30	TGAGAATGTGGAAGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEMGMSSGSCSKSLSARSCWGWIMAVRVQGNRWQRVSCPQARLSLPLTSVQPPCGLGVPRSCLWEGPTLVSLNLRRGSSSRLFGVGCGQHFLLPHLSAAQQLAKCLPWELSL	1064615	1082310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1064974_1067515_1067661_1069788_1069891_1070787_1070849_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075393_1075804_1075892_1081657
773152	contig_2636_pilon	-	786	4	Intergenic	novelGene_52073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	293.574522055304	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	116	391	85555	59950	FALSE	35	GTCAAGAAGTCATGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQILAFW	85670	59554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471_62624_81113_81216_85551
773153	contig_15697_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_173295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAACAAAAACCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19066	20135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_19100_20100
773154	contig_10962_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_103921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATAGTTCTGTGCCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412211	413570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_412200_413600
773161	contig_5671_pilon	+	663	2	Intergenic	novelGene_79476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521232	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_521303_531205
773162	contig_14219_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_54278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACAAAGAGGGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271582	271080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_271100_271600
773164	SIRV6	+	526	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10781_11007_11109_11205
773166	contig_1516_pilon	+	1913	17	Intergenic	novelGene_49949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_16	51.2162998956387	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	384	1748	294451	309528	FALSE	20	TGCTCTTTACTCTCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKGQFWNDDDSEGDNESEEFLYGVQGSCAADLYRHPQLDADIEAVKEIYSENSVSIREYGTIDDVDVDLHINISFLDEEVSTAWKVLRTEPIVLRLRFSLSQYLDGPEPSIEVFQPSNKEGFGLGLQLKKILGMFTSQQWKHLSNDFLKTQQEKRHSWFKASGTIKKFRAGLSIFSPIPKSPSFPIIQDSMLKGKLGVPELRVGRLMNRSISCTMKNPKVEVFGYPPSPQVSGHCKNIPTLEYGFLVQIMKYAEQRIPTLNEYCVVCDEQHVFQNGSMLKPAVCTRELCVFSFYTLGVMSGAAEEVATGAEVVDLLVAMCRAALESPRKSIIFEPYPSVVDPTDPKTLAFNPKKKNYERLQKALDSVMSIREMTQGSYLEIKKQMDKLDPLAHPLLQWIISSNRSHIVKLPLSRQLKFMHTSHQFLLLSSPPAKEARFRTAKKLYGSTFAFQ	291666	309693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_291853_294253_294454_295129_295208_296183_296279_296705_296767_297006_297098_297540_297608_300556_300707_301707_301859_302435_302490_304171_304268_304858_304952_305754_305881_306835_306902_307828_307897_309115_309165_309411
773167	contig_5947_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_101601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAGAGAGCCTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929200	930338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_929200_930300
773168	contig_3822_pilon	-	1572	2	Intergenic	novelGene_133292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTCACTTTGAGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217878	216053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_216163_216415
773169	contig_6557_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_32963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTTATTTTTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376923	375977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_376000_376900
773171	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2501	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
773172	scaffold_9100_pilon	-	1427	11	Intergenic	novelGene_83223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	15.6601404846828	185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	29	1405	416503	156764	FALSE	25	CATTTCCCAGAGAATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAPAERRRMERERCASGAASAALFAWGANSYGQLGLGHKEDVLLPQQLNDFCEPGCVRRITGGGGHSAVVTDGGGLFVCGLNKDGQLGLGHTENVLYFTPCTSLLGCPIQQVACGWDFTIILTEGGQVLSCGSNLFGQLGVPHGPRRCVVPQVIELLREKVVCIAAGLRHALAATASGIVFQWGTGLASSGRRLCPGQTLPLFLTAKEPSRVTGLENSKVRCVLAGSDHSASLTDAGELYVWGSNKHGQLATQAVFLPVPQKIEVHCFQNEKVTAIWSGWTHLVAQTETGKVFTWGRADYGQLGRKLEAQEGWKQEEQDSSLPCLTPQNSVPSSLLCLTGATEVSCGSEHNLAVIGGSCYSWGWNEHGMCGDGTEANIWAPMPVQALRSSLGLHVGCGAGHSLALCQLPALPALGQGLKVMDPFPDATEDAESQDSGQREKLEGKTIRNFNQSEGSRSGGLVTESI	416531	156741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_157099_250418_250456_345462_345630_384406_384566_396964_397028_399381_399496_403873_403935_406879_406975_410235_410392_412574_412711_416449
773173	contig_14882_pilon	-	2113	4	Intergenic	novelGene_114978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	258.983911984252	7	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	12	479	66569	39935	TRUE	25	TTGTTTTTATATTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLISSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALKRRKANSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKARQQQAELAQQEWLQMQQAAQQAQLAASASASNQAGSSQDEEDDDDI	66580	38139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_39772_39932_40079_57893_58058_66409
773174	contig_11378_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_112226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGATTATGAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297819	296610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_296600_297800
773175	contig_14954_pilon	+	1116	6	Intergenic	novelGene_165171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	8.16333265278342	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGATAAACAGAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57342	59012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_57679_57756_57839_57932_58020_58190_58583_58714_58807_58885
773181	contig_14508_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_79065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTCCCTGTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130949	131789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_130900_131800
773185	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	322	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773188	contig_7816_pilon	+	2318	14	Intergenic	novelGene_66563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	10.316873064184	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	251	1672	462329	517856	FALSE	45	ATCCAAAGGATAGTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEQQLDADTGSGVEEVELSWEDYLEDTGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVKADPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRKADFWCDIRKTDLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWAAFLRQTLTGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLQSSDNFEHWLYYLDPFLHHIGWATQQGYELQPPLAIRHLKKEAEWQEIVAKVREEEEEPLPSYLFKDKQVIGTHAFSVNMKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQA	385798	518502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_385922_462201_462357_479393_479489_494932_495174_502521_502611_506455_506703_507389_507485_507957_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560_517604_517849
773190	contig_10904_pilon	+	1289	11	Intergenic	novelGene_22580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	217.123375065883	139	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	69	1175	439135	454161	FALSE	25	AAGATCCGTCCTCGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLATAWGPSREASAEVWPSFPKN	438407	454275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448434_449228_449320_454090
773198	contig_10135_pilon	+	1971	12	Intergenic	novelGene_106599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	2	junction_2	31.2801259746782	102	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	625	1200	73574	76322	TRUE	40	TTAAGAAAAAGTGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANNAAPSPPRRGGGLLEEAELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFL	72949	78065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_73577_74379_74440_74642_74740_74963_75076_75266_75423_75918_75984_76239_76345_76528_76616_76887_76967_77185_77294_77378_77494_77705
773199	contig_2033_pilon	+	2021	2	Intergenic	novelGene_71551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414772	418862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_414850_416918
773200	SIRV4	-	461	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1057	3	1057	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4101	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
773201	contig_6272_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_160447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACACTCCTTGGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142839	141032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_141000_142800
773202	contig_8365_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_150911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATACTTTCCCTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63233	65298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_63200_65300
773203	contig_6069_pilon	+	1737	9	Intergenic	novelGene_8015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	13.6930639376292	230	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	568	1674	101412	117589	FALSE	10	GGCTGCCTCACCTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWCHSPVAGHAVLALADASGSIQLLHLVDSEKTACALWPFSSLVLGEQSLALSLDWSTGKTGRASGQPLKIISSDSKGQLHLLTVNEAGPGLQAVDSWQAHHFEAWIAAFNYWQTETVYSGGDDGLLKGWDARRPHDAPLFTSTRHSMGVCSIQSNPHRENILATGSYDEHILLWDTRNMRQPLSDTPAQGGVWRLKWHPSHPHLLLAACMHRGFKVLHCQKAMEEKQDTCLVSVSHTLHSSLTYGADWSWLSLQPSPKAQPLVPSASFLHSDTGARPADLLHSLKVQGTSVATAPDRVGDEDGEGQASQAQHVADDVRKVGSQLHVAGGKPCDYDATLEGMNLDISLLATCLFYDHALHLWKWEVS	100142	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_100537_101238_101420_101799_101888_104147_104243_104620_104794_106623_106697_106769_106836_107053_107227_117158
773207	contig_10042_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_79132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGAATTCCCTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73759	71830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_71800_73800
773210	contig_13457_pilon	+	1576	5	Intergenic	novelGene_118330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_2	115.239967025334	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	622	1299	56315	57730	FALSE	25	ACAATTCCCGATGGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTVMTRTCRSSVSPVGTPSTHVLPCATWNAAMPRLGCHSEGADGVGTSVGPEGTDLLSGKDAATSSSFLLCSFLQYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	55614	58007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_56232_56310_56596_56721_56819_57348_57502_57583
773211	contig_3285_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_153382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCCAGCTATCACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70650	70862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_70600_70900
773214	contig_2550_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_135661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTCTGTTATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153776	1155194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1153800_1155200
773217	contig_10078_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_160004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGGGGAGAGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203304	202643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_202600_203300
773219	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	257	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773220	SIRV6	+	565	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	4	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773221	SIRV5	+	362	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-32	875	-32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8283	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
773222	contig_6165_pilon	+	2142	2	Intergenic	novelGene_167423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	508066	508401	TRUE	85	GTAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAVGRPRSSTHPCPEIVPATLPASLRNGVLCEPSNDLEDSCSASRGGRWGSGSPSPEPQGPFRVTWEGVSQALIESVEGGEGQSRDGPGRAGFLEKVCHALASAPRPGET	508065	510948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_510190_510930
773223	contig_10134_pilon	-	1086	4	Intergenic	novelGene_16263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTCAAAATATATTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39685	33262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38831_39594
773228	SIRV6	+	502	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	45	14	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773230	SIRV6	-	198	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTTCGACTTCGACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	10763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
773232	contig_12786_pilon	-	1054	7	Intergenic	novelGene_103400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	694.137294296549	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	387	992	600902	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629519	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_614020_614079_615624_615731_629303
773235	contig_11396_pilon	+	1457	6	Intergenic	novelGene_71436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	569	junction_3	391.187218605107	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	831	1316	1787748	1789745	FALSE	25	GAGAGCGTGTTATTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVWGCRWYFLWLVWGLAPMLTRLVCRQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782236	1789886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
773240	contig_2793_pilon	-	1176	8	Intergenic	novelGene_142870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_4	411.7412502323	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	124	804	118367	79566	FALSE	55	CAATTTGATACATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118490	79193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
773242	contig_9727_pilon	-	2575	11	Intergenic	novelGene_86281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	317.157311124937	1	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	159	1133	157863	138798	TRUE	30	GACAAAGCTTATGACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTSDRRVPPQGGDEQEHQCSSGGGDPAVPYPRACSKPAAGSHPGAPGSRT	158524	136921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_138286_138719_138821_139381_139501_141237_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486
773245	SIRV7	-	287	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91639	0	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
773249	contig_5777_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_173325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTGAGATTGGGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65550	65117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_65100_65600
773250	contig_8660_pilon	-	1029	3	Intergenic	novelGene_136495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	45	TGAATTACTAAATTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	307984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
773254	contig_15327_pilon	+	999	8	Intergenic	novelGene_70583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	74.6983047645251	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	165	689	836751	841890	FALSE	40	GAGACCGACCCCAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGYEEEDDENSRQSEDDDSETEKPEADDPKDNAEIEKRDPQELVASFSERVRNMSPDEIKIPPEPPGRCSNHLQDKIQKLYERKIKEGMDMNYIIQRKKEFRNPSIYEKLIQFCAIDELGTNYPKDMFDPHGWSEDSYYEALAKAQKIEMDKLEKAKKERTKVSGGQTPRWKGQASGVPGPAGKARRVPDGSPSPGPMPVPSDALSSPRDASWTHRPCRRPASSVSA	809932	842200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_809980_812492_812541_831760_831804_836724_836814_839110_839203_840064_840126_840599_840652_841633
773259	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	-9	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773262	contig_13366_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_99789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTCCAATAAAAAGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138875	139896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_138900_139900
773263	contig_9633_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_139595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTACTGATTTTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53743	54354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_53700_54400
773265	contig_8712_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_58885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	1446	2090	1016604	1017248	NA	35	CCCAGACCAGGTCAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYCTPTPPSPECETQVLSLPLLQKVVKLHFFHLQRFALNCSQPFCSTHCPCSDPHGLSWRQEQHLAGLPPLSNDTQSHIGCHSNTPTAAFKSCCFPTQWSHQSIQMVQLGPASPSALHSSTHCRLPFSQVCLAAPPLCLCLLSAPLHVPSYSWALPRCPLPVISPLSKFLEDVLARVYHYIPWVIPTTRHYNVPYTFHREALLAHLMARDVAL	1015158	1017425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1015200_1017400
773266	contig_15787_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_143986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGACATCAAACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79848	78832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_78800_79800
773271	contig_835_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_152135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTTAATTAAATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89353	88205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_88200_89400
773272	contig_11566_pilon	+	2232	2	Intergenic	novelGene_166690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCCTCAGGATGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160464	162861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_160903_161067
773273	contig_8823_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_53079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCTGATAGGCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82499	80483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_80500_82500
773275	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3213	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
773282	SIRV6	+	343	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3155_10721_10819_11031_11109_11205
773283	contig_8156_pilon	+	2291	2	Intergenic	novelGene_98915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATTACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151946	154463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_152611_152836
773285	SIRV6	+	281	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8136	14	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
773288	SIRV2	-	358	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4505	44	3330	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
773289	contig_14925_pilon	-	1035	5	Intergenic	novelGene_55123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1712.81747057297	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85794	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26311_27014_27127_27995_28041_29569_29828_85695
773292	contig_9955_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_21323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTAAGAAAATTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57202	58211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_57200_58200
773294	contig_16122_pilon	+	2338	3	Intergenic	novelGene_134522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_2	10.5	45	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141726	149027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_146054_147636
773299	contig_15123_pilon	-	1906	6	Intergenic	novelGene_110937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	61.0278624891942	855	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1274	1639	320397	318930	FALSE	20	ACTGATTGATTATTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI	321929	318662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319292_319627_319688_320277_320408_320544_321683_321804
773301	contig_16122_pilon	-	1100	7	Intergenic	novelGene_134496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	198.555337934346	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	251	865	111114	104536	FALSE	15	TTCGATCCTGTGTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDIVWKSLRWAGGQPTGSGHSANLEISQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSQLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFVSSFKIVL	111364	104300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_104996_105116_105255_105407_108757_108867_110332_110368_111024
773302	contig_730_pilon	-	156	1	Intergenic	novelGene_155613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCGAGAAGGGAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195097	194941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_194900_195100
773303	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	171	14	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
773305	contig_10437_pilon	-	1398	7	Intergenic	novelGene_38424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1007.22501072115	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCTCCGTGAGGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831230	822978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_823074_823709_823812_827630_827775_828698_828758_829211_829262_829942_830654_830993
773306	SIRV6	+	277	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	610	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGAAATCACCGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1725_2780_2829_3106
773310	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773313	contig_14925_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_55236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1487	1882	58408	58803	NA	20	CTCCCCACTTAACTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNPVRNTAGAQTIADYNCYPLISIPWYFEFLRPVEKLFQDPWFLILLELYEPVTSTCLCFQIYQRGITILESPSKEALAIMWFYWLELWQSGPQGQVITYIWGQFPETIPLVPSGLLPSTPPRALSGMRR	56921	59259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_56900_59300
773322	contig_18291_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_173327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGTTAGACAGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7282	6375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18291_pilon_-_6400_7300
773323	contig_6069_pilon	+	1663	9	Intergenic	novelGene_8017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	14.3129093827915	216	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	158	1600	100330	117589	FALSE	10	GGCTGCCTCACCTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGGPTADCHPAEGFATGARVRLLQTVDTEYTADSVEWCPLEGYRHLLACGTYQLRKLADTPDRENKSGADLDGEPPVRLGRLYLYSFSEESPASPLVEVQRRDTSAVLDMKWCHSPVAGHAVLALADASGSIQLLHLVDSEKTACALWPFSSLVLGEQSLALSLDWSTGKTGRASGQPLKIISSDSKGQLHLLTVNEAGPGLQAVDSWQAHHFEAWIAAFNYWQTETVYSGGDDGLLKGWDARRPHDAPLFTSTRHSMGVCSIQSNPHRENILATGSYDEHILLWDTRNMRQPLSDTPAQGGVWRLKWHPSHPHLLLAACMHRGFKVLHCQKAMEEKQDTCLVSVSHTLHSSLTYGADWSWLSLQPSPKAQPLVPSASFLHSDTGARPADLLHSLKVQGTSVATAPDRVGDEDGEGQASQAQHVADDVRKVGSQLHVAGGKPCDYDATLEGMNLDISLLATCLFYDHALHLWKWEVS	100172	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_100537_101282_101420_101799_101888_104147_104243_104620_104794_106623_106697_106769_106836_107053_107227_117158
773327	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	54	504	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
773332	contig_13481_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_119328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATATTCAGTAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323858	322545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_322500_323900
773333	contig_6710_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_97806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
773335	contig_9319_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_154649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCACCACCTCTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98424	99161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_98400_99200
773336	contig_18392_pilon	+	2699	8	Intergenic	novelGene_143093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	84.1934119289918	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	377	871	126740	134747	FALSE	20	TTGAAATTTGGGGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKAVATSQLQKKLGQLLYLTNLEKSQDKTSGGINPEPCPICARQLGKQWAVLTCGHCFCNECISIIIEQYSVGSHRSSIKCAICRQTTSHKEISYVFTSEKANQEEDIPVKGSHSTKVEAVVRTLMRIQLRDPGAKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNIEFAQISRVKTFQENLSAFKHDPEINILLLPLHTGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATIEERMQAMLKTAERSHTSSSAKHSEASVLTVADLADLFTKETEDIE	109426	136575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_109500_111024_111097_113850_114040_126697_126791_127836_127924_128716_128896_133473_133555_134650
773338	contig_8156_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_98921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCCGACTTATAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203060	203995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_203100_204000
773342	contig_11855_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_67004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTTCTTTCCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373829	1373157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1373200_1373800
773343	contig_4385_pilon	-	2151	12	Intergenic	novelGene_141501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	72.5952210252333	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	164	1096	336962	327475	TRUE	30	CCTGGCCTTGAGGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLSLLHDRSFNYTGDSQAQELCLYLTKAASGPYFEILEKWIYRGIIDDPYSEFMVEEHELRKEKIQEDYNDKYWDQRYTVVQPHIPSFLQKMADKILSTGKYLNVVRECGHDVTCPVAKEITYTLKERAYVEQIEKAFNYASKVLLDFLMQEKELVAHLRSIKRYFLMDQGDFFVHFMDLTEEELKKPVDDITPPRLEALLELALRMSTANTDPFKDDLKIDLMPHDLITQLLRVLAIETKQEKVLVSAEPTELTLSGLEAFSFDYVVKWPLSLIINRKALTRYQMLFRHMFYCKHVERQLCSVWLSNKAAKQHTLPSAKWFAGAFTLRQRMLNFVQNIQYYMMFEVMEPTWHILEKNLKSTY	337950	323256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_323558_324951_325116_325777_326150_326726_326790_327319_327484_327802_327924_328907_329037_329215_329389_333687_333869_335676_335858_336823_336970_337794
773347	SIRV6	+	210	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	520	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
773348	SIRV1	-	154	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3654	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
773350	contig_10235_pilon	-	1150	9	Intergenic	novelGene_46468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	895.236691816751	6	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	185	646	222843	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	224453	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804_222899_223290_223370_223755_223780_224427
773351	SIRV4	-	205	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	409	3	-409	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTATCGGCGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
773352	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773353	contig_8045_pilon	+	1272	5	Intergenic	novelGene_35366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1549.45684031534	3	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACACTTGAGTTCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116041	119414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116187_117259_117349_117450_117513_118153_118243_118527
773355	contig_9239_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_137207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTAGTTCAGGTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266458	265918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_265900_266500
773356	contig_9239_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_137205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTTAAGAATTGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264916	264418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_264400_264900
773361	contig_7416_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_134319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACAGCTACCAAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79853	80227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_79900_80200
773366	contig_15114_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_121113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTCATTTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88923	89875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_88900_89900
773368	SIRV6	+	373	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	483	0	310	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
773369	SIRV6	-	393	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-148	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGGCGTCTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
773372	contig_7035_pilon	-	1453	3	Intergenic	novelGene_83550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	64.5	428	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	258	995	779961	778935	FALSE	5	TACTTTCGCTGTGCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSRPRSGTLATYGHRGSLPSPPRGARRRRGCAERGLQLPQCPRPPGKGGACRCLWPRRLRPEVPTGPTWSWRGWALGSAAGKVGAMALIEGVGDEVTILFAVLACLLVLALAWVSTHTAERADPLPQPSGTPTSAQPSKAMAATDSIRGAAPGTEAPSLRHRGQAAQPEPSMGLPATPPPDSPQEPLVLRLKFLNDSEQVARAWPQDTIGSLKRTQFPGREQQVRLIYQGQLLGDDSQTLGSLHLPPSCVLHCHVSTRVGPPHPPCPPGSEPGPSGLEIGSLLLPLLLLMLLLLWYCQIQYRPFFPLTATLGLAGFTLLLSLLAFAMYRP	781000	778476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_779287_779575_779992_780773
773376	contig_14727_pilon	-	1904	12	Intergenic	novelGene_56677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	97.0055804818882	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	5	1543	414836	371686	TRUE	55	GGAAGAGAAAAAGGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMPTVIGASVAPRTGAEPISPGPIPHPAQDKTTEAGGGNQSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYLDPEFPPDESSLFYSQKFPVQFVWKRPPEICKNPQFIIGGANRTDICQGDLGDCWFLAAIACLTLNERLLFRVIPHDQSFTNNYAGIFHFQFWRYGDWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRDEFWSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVTEFFDIKEAPRDMYKIMKKAIERGSLMGCSIDTIVPVQYETKMASGLVKGHAYSVTGLEETLFKDEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDNDEKARLQYQVTENGEFWMSYDDFIYHFTKLEICNLTADALESDKLQTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSQVVCSFLVALMQKNRRKERKLGANLFTIGFAIYEVPTDAWEQEAPAEGLLPVQCLQGQEQNLHQHAGSVPALPPASQRVRHRALHL	414840	370448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_370750_371625_371843_372979_373152_376104_376266_377287_377366_378996_379083_380192_380277_385120_385290_386013_386148_388019_388139_390301_390372_414527
773380	contig_8671_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_126283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGGTATTGCTATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649488	650145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_649500_650100
773381	contig_2932_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_47954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGTTTTTGTCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221284	223186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_+_221300_223200
773385	contig_10074_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_57084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGTACACCTTTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69246	70655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_69200_70700
773386	contig_16103_pilon	-	2120	12	Intergenic	novelGene_118782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	91.6261718719102	292	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	412	1686	567709	563539	FALSE	5	CCCTTTCTGTGCTTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGSLPDLTSLHFPPPLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISGGLGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSNSQPQLQGSHSHPSLPASSWARHALPATSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAHPYPPSTHGASPRHRRVPLSPLTLPAGPADARRSQQQPPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLPTDQRLPPYPYSAPSLVLPTQQPTPKPLQQPGLPSEVCSVQPPGGQPPGRQPHYGTLCPPGSSGHWQQPYHRPANDFSPGTLEQFRMEDPSTSLVLDPSEFSEGPGVLGGEGPVGGLQDPHALNHQNLAHCSRHGSGPNIILPGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSKGLELGLGLEDELHMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEDSFRSDRLQ	570225	563104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_563757_563872_564060_564489_564760_566654_567062_567516_567762_567884_567935_568053_568134_568287_568318_568417_568470_568688_568758_569387_569448_570207
773387	contig_8412_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_118398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	11.6344316577992	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	205	771	718185	716812	FALSE	10	CCTTTCAAGGTTGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFELHTWSELPHGSGLGTSSILAGAALAALQRAAGQSVGTEALIHAVLHLEQVLTTGGGWQDQVGGLMPGIKVGRSRAQLPLKVEVEEITVPEGFVQKLNDHLLLVYTGKTRLARNLLQDVLRSWYARLPAVVQNAHSLVRQTEECAEAFRQGNLPLLGQYLTSYWAQKKLMAPGCEPLAVRRMMDVLAPHVHGQSLAGAGGGGFLYLLTKEPRQKETLEAVLAKTEGLGNYSIHLVEVDTQGLSLQLLERGAST	720194	715747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_716899_717075_717300_717845_717946_718029_718218_719854_719975_720142
773394	contig_6726_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_86238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301601	299239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_299200_301600
773395	contig_10082_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_63908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGCTCAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527322	525308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_525300_527300
773397	contig_8312_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_152897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAAAAGAGGTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277223	275740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_275700_277200
773399	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	0	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773401	contig_19744_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_120356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	247	570	35549	35872	NA	20	TTGGGACCTATTGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPLCCPLLPTYLPVTAVHSLKTSHLVQCLLTPGVVTIVNDFSTHVSDPIQYCYPDTLCLVTSTLIEVIPMTTAWIQHSFNYEFLSLNVLFSNDNFFISFFLFCLL	35302	36555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_35300_36600
773411	contig_8616_pilon	+	1423	4	Intergenic	novelGene_72475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_2	526.637973901954	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	526	999	320431	323904	FALSE	35	AATGCAGGATGGGAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVSMGAGERFH	318055	324328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320473_322267_322585_323789
773413	SIRV6	+	605	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	540	544	367	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
773414	contig_6710_pilon	-	461	2	Intergenic	novelGene_98180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657832	653562	FALSE	15	CCCTATTTCAGCCTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIVSAVAPSWSSKVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657834	653465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657789
773420	contig_5602_pilon	-	2806	1	Intergenic	novelGene_133032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATTGGCCTAGCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560492	557686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_557700_560500
773421	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
773425	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773431	contig_7870_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_109037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTTTAAATAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608835	606552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_606600_608800
773433	contig_19016_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_173337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAAAGTGGTGAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27048	27450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_+_27000_27400
773437	contig_4125_pilon	-	948	3	Intergenic	novelGene_25269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	37.5	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	78	773	3086875	3079023	FALSE	25	AGACTGGAGGGACATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRKLTDGVRSSARLRSRGCPAAELASAQEVDVPKSSKALCLTSSSHKSTDKRTSKKFKYDKDNLVKSELQKLIPKSAGASLPKIAPKTPCANEPLELGGHHAEPPGNEAGASAQQEGEGPLLGHCGILKDGCPTQTDDGLSLPKHSAASEAEVSNSSSTARDESALEAEGAQKPPLQMDSSVFLDDDSNQPMPVSRFFGNVELMQVRSASSCLHQQTVGSNYVFLNDRM	3086952	3078847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3079590_3080429_3080544_3086860
773438	contig_15354_pilon	-	1942	2	Intergenic	novelGene_65723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTGTGAATAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566286	559863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_560922_565402
773441	contig_3095_pilon	-	839	3	Intergenic	novelGene_75148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGGAGCGGGCACATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152245	150412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_150691_150998_151157_151842
773442	contig_21113_pilon	-	2027	5	Intergenic	novelGene_151116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31.3807265690264	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	438	1214	7003	6043	FALSE	40	ATGAATGAAAGTGTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQCYEHNASENIVHQHKNHFPLRENHAVFDLHEKAVKSNLTLPAVNQSRSNEIKNSAEPNGDKKSFLHADQKQFCTEMQFPESQKSNSTDFQIIKRRKTHKIQKQHVCNECGKAFLRKFLLTEHQFIHTGEEPYKCNLCGEIFFKKFKLSEHYHTTHKGEKPYKCTECDKAYLHKSHLNKHQKTHMAEKPYVCGECGKGFNQKGHLTVHQRTHTGEKPYTCSECGKGFSLFIREFILVRNPTYVVNVVKPSVKSHAS	12602	5229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21113_pilon_-_6133_6316_7066_10653_10803_12127_12224_12472
773447	contig_14005_pilon	+	1788	2	Intergenic	novelGene_154724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	164	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTGTTCACAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775	18706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_892_17034
773450	contig_15777_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_75761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACACCTATGAGAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274051	275667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_274100_275700
773455	contig_8317_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_20742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAAAGTGGCTAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18868	20848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_18900_20800
773456	contig_4065_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_133401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_1	0	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGGTAAGACTGACCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560105	557842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_558272_559953
773457	contig_2933_pilon	-	2358	7	Intergenic	novelGene_111368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	62	junction_1	192.398891195696	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	298	930	944675	940497	TRUE	40	AACAGATTTTTAACAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDKQQANTIFWSPQGQFVVLAGLRSMNGALAFVDTSDCTVMNIAEHYMASDVEWDPTGRYVITSVSWWSHKVDNAYWLWTFQGRLLQKNSKDRFCQLLWRPRPPTLLSQDQIKQIKKDLKKYSKIFEQKDRLSQSKASKELVERRRTMMEDFRKYRKMAQELYMEQKNERLELRGGVDTDELDSNVDDWEEETIEFFVTEEIIPLGNQE	944972	938299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_939713_940481_940601_941363_941473_941930_942009_942507_942634_943585_943725_944598
773464	contig_10940_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_49195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	0	10	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412638	410214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_411212_411884
773465	contig_2069_pilon	-	773	2	Intergenic	novelGene_23474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509769	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508826_1509459
773469	contig_12873_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_27226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	505	834	19916	17899	FALSE	20	TGGGGAAGGGGGTTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASCSKRRRVMRRLTVAPHINSLPKPKYKANEKHQGHDHCQDDPGHGVVMVCQHTARTKTGATGQPSFRLHFSLEIHLPFLQKSQDEAWAEVTYEPVHYFHDALVLTE	20420	17733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_18012_18982_19041_19607_19700_19849
773471	contig_4857_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_48886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGATTGTATTTGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1412044	1413343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1412000_1413300
773472	contig_2069_pilon	-	729	3	Intergenic	novelGene_23536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	226	360	1509011	1508747	FALSE	15	TCCATTCCATTGGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASSPGRAAAAIAACRSVGPSVHPQHEWPARLQHVGHRFPRSKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509881	1508377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509106_1509750
773473	contig_7202_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_18609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAGGGAGCACGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	28562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
773474	contig_13123_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_136910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGAAGAAAGGGTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446885	445838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_445800_446900
773481	contig_9594_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_73951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGATACTATTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308209	307001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_307000_308200
773482	contig_10626_pilon	-	1817	9	Intergenic	novelGene_138192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_8	101.725657407559	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	95	1108	197995	16025	FALSE	50	GAAAAATAATGCTAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLLLPPGLPLPAVLIFRCRWDPESSPVPSTMPPKKGGDGIKAPPIIGRFGTSLKIGIVGLPNVGKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKWLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSALPKIIKAGFAALQLEYFFTAGPDEVRAWTIRVRFILIHQLYPVPHY	199423	15315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_16170_16855_16997_59101_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
773486	contig_6929_pilon	+	409	2	Intergenic	novelGene_139421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8749	junction_1	0	63	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130928	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948
773487	SIRV6	+	291	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8144	3	595	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTCGCTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
773489	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_97406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
773491	contig_11061_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_173341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTTATTTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19476	17737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_-_17700_19500
773494	contig_1719_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_87285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371036	368746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_368700_371000
773495	contig_12411_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_145671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153343	154519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_153300_154500
773497	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773501	contig_16934_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_132528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCATTCCACATCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181523	182779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_181500_182800
773508	contig_11281_pilon	-	2012	10	Intergenic	novelGene_125431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	5.39089309809254	50	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	181	1569	502167	476995	FALSE	10	CTCTGTGTTGGCAGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSHQNGNCNQICYNKLGSFHCACYGGYTLSSDSRTCEDIDECADVDACGEARCKNLMGSYSCLCDEGYKYDSEKKVCQDVNECEDKLCEQTCVNSPGSYTCHCDGHGGLKLSQDMNTCEDILPCVPFNVAKSVKSLYLGRMFSGTPVIRLRFKRLQPTRLVAEFDFRTFDPEGVLFFAGGHQDSTWIVLALRAGRLELQLHYNGIGRVTSSGSVINHGMWQTISVEELERNLVIKINKDAVMKIAVAGDLFQLDRGLYHLNLTVGGIPFKDKDLVQPINPRLDGCMRSWNWLNGEDSTIQDTVKVNTKMQCFSVTEKGSFYPGNGFAFFSLNYVRTSLDVGTEMTWEIEVIARIRPATDTGVLLALVAKNHTIPLSVALVDYHSTKKLKKQLVILAIENVALSLMEIKVCDGQEHVVTVSVKEGEATLVVDGTKGQSEVSPTQLQERLAVLKRHLQDSVHTFVGGVPDVPVTSAPVTAFYHGCMTLEVNKKALDLDEAVYKHSDITSHSCPPIGHPAP	509798	476551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_477150_478337_478567_480763_480937_485834_486004_487287_487453_496755_496946_497627_497747_499654_499777_502100_502224_509674
773509	contig_7249_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_169434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAACTCAATGGCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26807	27901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7249_pilon_+_26800_27900
773511	contig_5649_pilon	-	2388	12	Intergenic	novelGene_82350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	7.85193559334152	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	96	1865	846245	822990	FALSE	20	ACCCCCTTATCATCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLREKVEEEEEAEREEGVERPSRPEKMTKLLRKEATTLTPEMLRDMEQKLSEIKVPVPGEPLTSDTIDIAKLPLSYRINTPKEEQLLQVADNFSRQYSHLCPDRVPLLLYPLNECEVPKFLSTTIRPTLMPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPPTYLYSSTTVLKYQKGNCFDFSTLLCSMLIGSGYDAYCVSGYASQDLCLMDLTREVCPLTMKAKEVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVVGARWAWG	850837	822466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_842588_842784_843519_843646_845532_845702_846054_846258_850754
773517	contig_6364_pilon	-	2592	4	Intergenic	novelGene_51800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	23.8932812499432	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	135	566	1426712	1416901	FALSE	50	AGTATTTAAAATAACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFGSSRRASLRYCRKTVRHAAFYDDGSEGAFENLRLPSRGKASPMFSAGDEDDSDFLSPSGGARLASLFGLDQTAAGHGNEFFQYTAPRQPKKGQATTTTGNQATQKIAPTTAGTSTVLFATAVHAYRYINGQYVKQGKLGAAVLGNHTAREVRVPPHLMYIQVSQIILMSWLLSSGFAQCPCVSED	1426846	1414874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1417079_1417539_1417625_1421731_1421848_1426659
773519	contig_11449_pilon	-	1102	2	Intergenic	novelGene_170557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTATGGACGTCAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248543	245212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_245312_247540
773522	contig_5671_pilon	+	1210	6	Intergenic	novelGene_79459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2262.30197807455	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	254	709	370430	531275	FALSE	40	AATAAAACGTTATCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEAIKTMNPKPKKYLCSQFPEIC	369969	531776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531209
773527	contig_7629_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_153582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	481	945	337393	337857	NA	5	TTTTTGTGGTTTTGTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLITSALAPKSRSTNTECDFISMFWILLRIALWPKMWSTLENVPCALEKNVYFAVVGWSILYMSMRSSWLTVPFTSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIVELSIFLFSVVKSLFYVFWGPVIGCVDVYYGYVGFFFEEGPGWRYFYTKIL	336912	338257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_336900_338300
773528	contig_14288_pilon	+	1715	1	Intergenic	novelGene_153819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAGCTGATTCTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280646	282361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_280600_282400
773531	contig_1594_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_138843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATTTAAAAAAATTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684359	683876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_683900_684400
773532	contig_5588_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_172830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACCTCGTGGTGGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379143	376896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_376900_379100
773535	contig_16643_pilon	-	1186	6	Intergenic	novelGene_158115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	18.5213390444644	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	88	1167	215930	195110	FALSE	20	AACTCTGAATCGCCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSWAANQTDLRRRPPDRSGTCGTRAQAAAMPLELELCPGRWVGEQHPCFIIAEIGQNHQGDLDVAKRMIRTAKECGADCAKFQKSELEYKFNRKALERPYTSKHSWGKTYGEHKRHLEFSHAQYRELQKYAEEIGIFFTASGMDEMAVEFLHELNVPFFKVGSGDTNNFPYLEKTAKKGRPMVISSGMQSMDTMKQVYQIVKPINPNFCFLQCTSAYPLEAEDVNLRVISEYQKLFPDIPIGYSGHETGIVISVAAVALGAKVLERHITLDKTWKGSDHSASLEPGELAELVRSVRLVERALGSPTKRLLSCEMACNQKLGKSVVAKVKIPEGTVLTLDMLTVKVGEPKGYPPEDIFNLVGKKVLVTIEEDDTIVEESVENHGKKIKF	216017	195090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_195320_197745_198013_201658_201814_202726_202827_211444_211661_215798
773536	contig_10722_pilon	+	2042	6	Intergenic	novelGene_70979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	109	420	4077	4388	TRUE	30	ACTCCAGATCACATTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDYESIHHTADRQNQEGMLAWRRVSACAGRVLSGWRHGACLCGTSQRSETFPACPCDVPFHACVSWQHLSDPETCSEIENEIFSFCVHVYLNFSNHLWCAWP	3968	7709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_4495_5556_5627_5716_5843_6185_6330_6424_6529_6637
773537	contig_6914_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_151751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCTGCTAACCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176800	176208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_176200_176800
773538	contig_12270_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_113523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13847	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
773539	contig_7866_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_171190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCACAGCATTTGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179892	181289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_179900_181300
773541	contig_17618_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_173357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25347	23249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_23200_25300
773542	contig_10196_pilon	+	951	3	Intergenic	novelGene_132050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	85	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	584	949	643616	647884	FALSE	30	AAGCAGGGCTGCAGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMNHLALGLSGISVAPLDPLLGCAVVSGCGQAGVRSHTLPSPSRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSNSSR	643032	647886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_643906_644528_644589_647868
773547	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
773548	contig_9883_pilon	+	2229	2	Intergenic	novelGene_87583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	181	381	73083	73283	TRUE	20	TCTGTTTTTTAAAGCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPFITIRNKFLKGAPASLKTAVIAILCKSDLTVGTALTELRHISTVGLIRFLTSGTRAIMVGKPKWNPSELPLPRKIINQKKYCTPGGIAEISATINDLKDTEVVIPPHPRSTHLFGLCKKQMDL	72902	77842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_75098_77808
773549	contig_15732_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_88887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAGGAAAAAAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215765	214312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_214300_215800
773550	contig_19730_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_142477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCCTCTCCATTAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3111	2050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_2000_3100
773556	SIRV4	-	463	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	3	1055	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
773561	contig_15456_pilon	-	3191	1	Intergenic	novelGene_139478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGAAAAAAAAGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38422	35231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_35200_38400
773562	contig_17753_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_105040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAGCAAAAGAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32879	33206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_32900_33200
773563	SIRV6	+	401	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	561	0	382	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773564	contig_10436_pilon	+	1521	8	Intergenic	novelGene_108512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.4558631842665	267	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	221	937	111967	117322	TRUE	65	AAAAAAAAAAACTGACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSLLALRGFVLLRDSVECEGRSLLKALIKKSALCGEQVHILGCEVSEEEFREGFDFDINNRVVYHNLFRDPLNWSKTEEALPGGPLGALRALCRRTHPGPVTIALDSLSWLLLHLPCTTLCQTLHALSHRDFCPDGSSSVEQVCVLGLLHEELHGPGLVGALSSLAQAEVTLSGMLSQTSASIVYRRPRQRPTRQTQCFSILPDFSLNLQGVLPLESQPHPGPPTTQVSKRDRARE	111658	118580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_111755_111842_112013_112254_112316_112401_112483_114548_114770_116488_116671_117196_117536_118209
773565	contig_2799_pilon	+	1527	2	Intergenic	novelGene_85531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674969	676591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_675696_675790
773567	contig_7398_pilon	+	2008	13	Intergenic	novelGene_166145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	10.8253175473055	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	133	1692	20913	118404	FALSE	30	TTAAGAAAGCTTTTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQSSMAPQPLITAQKPRKGEHEWAAVVGLEIHAQISSNSKLFSGSQVHFAAPPNSLVSFFDASLPGTLPVLNRRCVEAAVMTGLALNCRINKKSLFDRKHYFYADLPAGYQITQQRLPIAMNGSLTYGVRVGTKRSQVITRTVRIKQIQLEQDSGKSLHDDLRSQTLIDLNRAGVGLLEVVMEPDMTCGEEAATAVRELQLILQALGTSQANMAEGQLRVDANISVHHPGEPFGVRTEVKNLNSARFLAKAIDYEIQRQINELENGGEILNETRSFDSRLGCTMPMRDKEGKQDYRFMPEPNLPPLVLYDSASLPSGADLQQVINIDYIRERLPELPSVTREKLVEQYGMLPEHSFTLLNEVGLLEFFQNVIKETRAEPKLVTSWVLNTFLGYLKQQNLAVSESPVTPSALAELLTLLDGKVISSSAAKQVFEELWKSKSKTAAQIVSEKKLELMEDREALEQLCQAVMEGHPQVAMDVKKGNLKAINKLIGLVRKATQGRADPTVIKKILEEKLSS	20780	118720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_20975_23431_23583_68126_68241_70595_70795_71409_71533_80409_80524_82888_82974_83842_83888_85739_85930_97683_97818_108332_108412_116635_116771_118275
773572	SIRV5	-	300	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8450_8590_10863
773573	contig_8476_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_121346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTCCTCCTCCTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171877	172275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_171900_172300
773577	contig_1596_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_131612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATATCTATAACTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157597	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_157600_159800
773578	SIRV6	+	430	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	22	107	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGTAGATTGCGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	11075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3163_10724_10819_11031
773580	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_94624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
773581	contig_18420_pilon	-	1922	12	Intergenic	novelGene_109369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_11	300.046663037602	1	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	110	1504	142813	109372	FALSE	10	TGCCAGTGGCCTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTASLRVCRLRRPQVPPRLARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY	142922	108953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
773585	contig_15087_pilon	-	1424	13	Intergenic	novelGene_37227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	932	junction_2	989.280406266202	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	126	1106	158925	138311	FALSE	50	CATCCTGTTAAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCSANGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDE	181165	137992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
773587	contig_8160_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_136399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTGTATTTTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28533	30320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_28500_30300
773588	contig_11850_pilon	-	1232	8	Intergenic	novelGene_125218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	1065.1462484618	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	105	848	286397	282879	TRUE	25	CTTCTGTGTCAGGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	281434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282374_282480_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285361_285531_286311
773589	contig_6710_pilon	-	241	2	Intergenic	novelGene_98327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTAGCACATTGACGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657510	653683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657467
773590	SIRV1	-	202	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3625	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6741	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6557
773593	contig_7898_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_47557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335068	332655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_332700_335100
773598	contig_12250_pilon	+	1943	5	Intergenic	novelGene_80618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	60.5366624451662	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	143	1390	350196	354405	FALSE	50	AAGAAAAAGAATCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPSLWSCTTSLPQSGVGSSIRCTASSSLSSPSC	349750	354958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349876_350178_350544_351354_351968_352256_352443_354304
773602	contig_11602_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_166582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46082	48336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_46100_48300
773603	contig_5765_pilon	-	2873	1	Intergenic	novelGene_141391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAACAAAATAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671135	668262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_668300_671100
773604	contig_12050_pilon	+	1333	6	Intergenic	novelGene_62651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	178.206172732596	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	146	601	359783	362766	TRUE	5	GCTTGGAGCCCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKVRDPCPARPHTLHLLGGPDRAACSPA	359637	363965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362817_362918_363046_363410
773605	contig_10494_pilon	+	2077	12	Intergenic	novelGene_102136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	30.1152057910072	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	164	1564	361794	438185	FALSE	20	ACAGCAGCTCTAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAKLQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRCAVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHNEDGESGSEASDSVSNCGQSGSQNIGNNVTLITLNSEEDYPNGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYGIRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPSSSSYSTSETILSTPQPASEIPQPQPQALHYTLANAQQVQIHQIGEDGQVQVIPQGHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQVLQGAQLIAVASSDPTAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAPVTDHTAAAQTAESLQPSMQPEMQLEHGAIQIQ	344569	438698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_344646_361706_361861_366496_366589_369323_369524_381404_381581_393361_393602_396402_396571_403615_403747_405670_405743_408172_408212_437785_437930_438113
773611	contig_11448_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_66439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650955	649901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_649900_651000
773613	contig_10526_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_142579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	12	317	314038	314343	NA	25	AGCTCATGGATCACGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKITYNGVWHTVSLAASPSIHTLPKSRSQFSISILSHSSVASSLKQFFYLACGIPLALGSLTSLTGCSFSVFCYIFMTSKYWSAQRANSLNLFSDSLYDLI	314026	315430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_314000_315400
773615	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773622	contig_5217_pilon	-	239	4	Intergenic	novelGene_135786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982.67400805635	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAGAATGCAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559895	558362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558373_558758_558851_559273_559374_559858
773627	contig_15952_pilon	+	1700	6	Intergenic	novelGene_154055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	20.591260281974	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	84	692	214424	235230	FALSE	15	TCTTGTTGGTATCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSVRAETRSRAKDDIKKVMAAIEKVRKWEKKWVTVGDTSLRIFKWVPVTDSKEKEKSKSNSSAARESNGFPSDASANSSLLLEFQDENSNQSSVSDVYQLKVDSSTNSSPSPQQSESLSPAHTSDFRTDDSQPPTLGQEILEEPSLPASEVADEPPTLTKEEPVPLEAQVVEEEEDSGAPPLKRFCVDQPTVPQTASES	214340	236238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_214516_218611_218688_231262_231360_233466_233638_234781_234862_235137
773629	contig_10766_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_151207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATTCACATATATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154752	152706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_152700_154800
773630	contig_16846_pilon	-	846	5	Intergenic	novelGene_82980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3706.91033746434	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	78	392	555239	551492	TRUE	10	GCACTACTTCGGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558727	550867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550980_551149_551665_552661_552771_555206_555278_558688
773633	SIRV6	+	275	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	111	-9	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773635	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	0	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
773640	contig_15570_pilon	-	2547	4	Intergenic	novelGene_137843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	73.5224833337093	195	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	56	901	505930	495144	FALSE	20	AGGAGGTACCATGGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANRRRDTVPKPKYAPQKMRGQEPKGARCSPAGSSRPGSAKGEVLHAGQNHLHHRASRNKVTQDKLAGGVYSDLPQSTEVVRSGPRKLGTSTVSKETDPPPGLLSGQSVNIDLLPVELRLQIIQKERSRKELFRKKNKAATIIQRAWRSYQLKKHLSHLLHMKQLGADMDRWNQECAALLLKVWRKELELKPPKTITAGRTTKSPSKGSSGIKSTKHSVLKQIYGCSQEGKVHHPTRSPKAPSVLRLNSVSNLQCIQLHENSGRSKNFSYNLQSATQSKSKTKLRVPISEDCVRGSWNS	505985	493497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_495296_498103_498179_498900_499128_505538
773641	SIRV1	-	181	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3648	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6557
773642	contig_10904_pilon	-	1277	7	Intergenic	novelGene_22748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	406.422057581634	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	136	771	662171	660442	TRUE	15	TCTACTGTTGTTGAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPLPLPSTFIGRTILGPFRSTSP	662725	651951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660508_660598_660634_661462_661763_661936_662222_662640
773644	contig_11292_pilon	-	873	9	Intergenic	novelGene_109414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	290.167947058251	1	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	255	803	164507	161842	FALSE	5	TCCCTGCCACCTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRSFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167453	161771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163473_164397_164547_164662_164670_166391_166476_167109_167194_167413
773648	contig_15610_pilon	-	2204	2	Intergenic	novelGene_154276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	45	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	21	368	461180	459863	FALSE	20	CTGTTGGTCATTTATTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISCPSMAAQRSPPCPWVLARQWITSSSQLSPVIMGTELIAGCIEMELSSFWAVSPSSLKRFSGLPMAYPTPSTLQTTSACWPALEWKSPPHDGAPRGRGLLLQKSSLDQRLWKYPMLLET	461200	458026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_460112_461081
773651	contig_12951_pilon	-	2636	3	Intergenic	novelGene_68140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2084	2470	127665	127279	FALSE	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFCFLGATWKGTGQSWPCPQWWEKRHCVGAWVRKAQMGGWADSDRTSHQDGSWGKGETSIPIRNSLYSHPETRRKASRMAVLCKECGVGSDKPGPVTLKGTLDCVLRALGSKGVMRRMCPVEGGCW	132970	127112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_128590_130833_130980_131957
773653	contig_6635_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_127028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAGTAAACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502436	500933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_500900_502400
773654	contig_14711_pilon	+	2602	14	Intergenic	novelGene_68903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	433.719157626577	1	159	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	1137	2360	86227	90570	FALSE	15	ACCTCAGTTGTCATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTTRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	81997	90812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_82203_83630_83833_83928_84100_84807_85050_85439_85593_85920_86009_86151_86242_87717_87865_88112_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
773655	contig_8773_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_74509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTAGTCAGTTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18452	16592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_16600_18500
773657	contig_12689_pilon	+	2198	6	Intergenic	novelGene_145058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	84.4857384414671	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	126	1382	291739	352614	TRUE	50	CATGGAACCGAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTERPGFSDGVGPGSCRLHASPGASDAEVVTLVATQSRKQMSRDICVHTWPCSYYLEPEKQWVPGELSLTSLSLKFIADKTGKILVSFPLSSIIEIKKEASHFIFRSITILEKDHVKHWFSSLQPSRNAVFNIIEHFWRELLLCQPGATVQASSSPMTKGKELTGLMACSQKRLEDTAKVLHHQGEQFDNIMEGLDKIESDLDVADRLLTQLESPSWWPFSSKLWKTPSETKPAEGASASGSEALGKEGIVIKIPAVISQRTESHAKPGKLIVLVSGLEVRDSDSLLMHRFEREDVDDIKVRTPYEVSIRQRFIGKPDITYHLISAKMPEVIPILEVQFSKKIEFLEDALMLRSTRASSPAEKGCSTWHAAPGLMDRVRPREPSGSPGGQSQLQMSEPFISEEEAHELTQILRKLKSLALDTETELERQDEALDSITSSVDRATLGIDKHSRRMERLT	272645	354372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_272727_291694_292239_318845_319337_329283_329403_352467_353089_354030
773659	contig_960_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_108264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGTTGTAACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636340	634653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_634700_636300
773662	contig_14481_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_153858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGCACCAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211006	211872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_211000_211900
773672	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_95687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
773675	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	0	408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773677	contig_14034_pilon	+	2677	11	Intergenic	novelGene_72645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAATAAGCTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220682	266083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_221356_232471_232668_235289_235465_236882_236984_248427_248577_248717_248838_252770_252903_254771_254871_258310_258402_260976_261056_265221
773682	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_98238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
773683	contig_16098_pilon	+	1747	9	Intergenic	novelGene_45915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	50.0574669754673	17	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1114	1656	335192	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294781	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_321945_322037_328159_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
773688	contig_6630_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_30731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1946	2287	779585	779926	NA	25	CCAGTGATCCTTAGCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLCFATTLVCRLQALLCLLETSFLLCPTPPPQDLHWRIDKTRLRPPLEESYFHYGFNSNYLKKILSYWRNEFDWKKQVDIINKYPHFKTKIEGRLPNPQLEGGVCHGNGLLA	777639	780042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_777600_780000
773689	scaffold_19766_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_34361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	297	464	677712	677545	NA	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQGRSDEERGPGREGKDSGTRDGREGLMDPSCPSGASLSVADLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHW	678008	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_676700_678000
773691	SIRV4	-	358	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1165	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
773692	contig_18822_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_111716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124806	122895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_122900_124800
773693	contig_19155_pilon	+	1613	9	Intergenic	novelGene_173363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	73.2525596822391	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	297	1106	480493	601783	FALSE	25	GTTCCCAGCAACACTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDDDFGGFEAAETFDSGNGETQTISPAIPWAAFPTVSGVHLSPASPEIVLDNDHSLPSVGCLSSDPIVSSPENTHADNSIVGQTVPKAQIQQSTHTHLDISLFPLGLTDEKSNGTIALVDDSENPGANVSNIQLQQKISSLEIKLKVSEEEKQRIKKDVEALMDKHSILEKGFLKEKEQEAISFQDRYKELQEKHKQELEDMRKAGHEALSIIVDEYKALLQSSVKQQVEAIEKQYISAIEKQAHKCEELLNAQVIKVHIYHRFILFF	378479	602290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_378668_464808_464903_480478_480523_483087_483167_527704_527866_529045_529250_530637_530743_570474_570553_601630
773695	SIRV6	+	338	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	531	2	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
773698	contig_6410_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_108639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTTTACTATTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349316	348641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_348600_349300
773700	contig_9727_pilon	-	2037	13	Intergenic	novelGene_86358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.09945795874961	68	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	672	1865	560188	557882	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPVCKSWVMFTCGRETGRLEAFGQGESILKEPGYLEELEDRLHFYVEECDYLQGFQILCDLHDGFSGVGAKTAELLKDEYSGRGIIAWGLLPGPYSLGEPQKNIYRLLNTAFGLVHLTAHSSLVCPLSLGGSLGLRPEPPVAFPHLHYDATLPCHCSAILATALDTVTVPYRLRSSPLSMVHLADMLSFSGKKVVTAGATIPFPSGQSLPDTLMQLGGATPWIPLSACGDPSGARCFAQSVVLRGLDRARHTSQLTPGTPLPSPLHACATGEEVLAQYLQQQQPTALSSSHLLLTPCKVVPPYPRLLSSCSQLGLLTDAPPTRAAAASIPVFGALCSSSSLHQALGGLARELARLDLRRWASFMAAGVEQDDLEEMLQELYSLAQCYRDGSGLVD	561866	557709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_558097_558361_558472_558557_558663_558884_559064_559136_559269_559542_559696_559803_559939_560023_560451_560537_560593_560809_560886_560973_561044_561555_561692_561794
773701	SIRV1	-	210	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3894	0	3620	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6746	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
773707	contig_15087_pilon	-	1350	15	Intergenic	novelGene_37183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1076.48491652703	4	44	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	111	1208	158925	110784	FALSE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGLRLSELRRVHQSVRLSVRKKRPPLRVSSVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMKGSHPDGPGGGPARSQPCSCLSD	181150	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110857_136616_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
773708	SIRV6	-	330	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGGTTAGCCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
773710	contig_567_pilon	-	1865	12	Intergenic	novelGene_33963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1107.94686897108	2	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	527	1132	317552	308820	FALSE	50	CATAGGGAAAAAAGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSEIVTEPLKLILIRLSLTSGEGLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338282	308086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317478_317579_317732_317789_322250_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338114
773713	contig_7870_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_108997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467523	469589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_467500_469600
773716	contig_8065_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_107330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130025	127612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_127600_130000
773717	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
773718	SIRV7	-	293	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91622	11	-91616	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGTAGAGTGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
773721	contig_13305_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_146775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTATGTGTCTGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127723	129625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_127700_129600
773728	contig_6175_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_16331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	387	731	1515823	1515479	NA	50	TCATGAAAAGAAAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTAHCLKMELGPPSVPCDVTVGCELPSKGVWLPTRLKQPSGPLNLTPKGCFRLFSALLSKPQDQGNTAPFKQRPAEPPTHPFETWSSGLFCLFKEASDIASTNFLPYPPSAY	1516209	1515363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1515400_1516200
773736	contig_10988_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_104722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCAGCTTCCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52120	51676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_51700_52100
773737	contig_6233_pilon	+	1349	7	Intergenic	novelGene_74788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	301	624	144337	145616	TRUE	15	GACAGCGGCGCTAGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARLSPALPRCVSAAPPHHRHLEPVLLPGACLPQKLCPLGGLAAGYYHHYCHCHWHWHWHCHLSSCLTWVGLLLLSNLLQAAQQGINVGLDLRQLCLDGLQLTAL	136685	250353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_136974_144324_144541_144760_144880_145615_145785_148116_148191_149522_149789_250136
773741	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	61	511	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
773742	contig_10235_pilon	-	871	3	Intergenic	novelGene_46294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_2	197.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	645	698	83700	83647	FALSE	35	AATGTAGATGCTGAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHGGTGAGGPGWEAPGEGLSPAGCGWSHCTRVCGAVCAYHCPDCAGLGAPGAGRTEFQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGSWKTGQGLGWETKKEEAFLRSGTQFLGAEGLALPQDGLYYLYCYVGYRGRAPPAGRGPLGRSVTLRSSLYRAGGAYGPGIPQLLLEGAETVTSVLDPARRHEYGPLWFTSVGFGGLVQLRRGERVYVNISHPDMVDYRRGKTFFGAVMVG	85439	83473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84102_84567_84640_85268
773743	SIRV6	+	255	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8455	-1	284	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTACGTTTGGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
773745	SIRV2	-	278	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	381	2958	-381	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGCGACTAAAAGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
773746	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	50	3368	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
773747	contig_11933_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_107274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAGCTTACATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222462	220928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_220900_222500
773748	contig_6710_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_98316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTACTCCTGCGAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
773752	contig_11493_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_143659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGAGTAGGTGGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122126	122772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_122100_122800
773753	contig_12079_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_67485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAATATAAATTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622682	623040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_622700_623000
773754	contig_14333_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_49083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTAAATGGAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261213	260767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_260800_261200
773755	contig_14333_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_49081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256147	254800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_254800_256100
773759	contig_15042_pilon	-	2001	6	Intergenic	novelGene_115422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	97.3377624563047	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	35	988	35339	10047	FALSE	30	ATGTGCAAACCTTACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKRWLYWQPILTKTGFVSVLLVGAFVGWTLFFQQNVL	35373	9033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276
773762	contig_11512_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_43216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	206	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	30	353	4011	15004	FALSE	20	CAGTATCTTAGCTATCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTSLQAEDVADYYCQ	3981	15004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282_4518_14964
773765	contig_4769_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_117944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGCTACTTTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270010	271904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_270000_271900
773769	contig_14441_pilon	+	609	4	Intergenic	novelGene_100441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.107647738325	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTGAACCCCCGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82239	117745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112085_112154_116578_116939_117677
773771	contig_8898_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_137233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAACATAAAAAGGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213249	211300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_211300_213200
773772	contig_3424_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_55523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATCATTCTGGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238318	237190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_237200_238300
773777	contig_8702_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_157739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCAGATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136204	138194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_136200_138200
773778	contig_14563_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_135054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134964	140523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_136024_139994
773780	contig_1146_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_84813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGCACAGTACCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509368	507015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_507000_509400
773784	contig_14441_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_100635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	266	616	116728	117560	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAAPPGFAGRGRWEGPFLYKAEALWGQGSHGDSTLREDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111296	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111413_116578_116935_117220_117344_117539
773785	SIRV6	+	447	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	212	-1	99	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTAGGTATAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
773792	contig_6418_pilon	+	1799	2	Intergenic	novelGene_81207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	0	187	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAAATAATATGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341083	1343361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716
773794	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
773795	contig_8866_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_77859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674357	672227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_672200_674400
773797	contig_16594_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_53887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	738	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215600	214422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_214400_215600
773799	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	530	54	530	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10767	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
773801	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
773802	contig_9609_pilon	-	1917	12	Intergenic	novelGene_23089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_11	34.2113025642184	236	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	144	1469	481425	477053	FALSE	0	TTCTGTGGTCCTGGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARKGNAPRKGSQRRGGGARSSAQADSGSSEDEAASEARSTTSECPSLLSVTAEDCLGGDAVDEQAQQEDLEDKLKEYVDCLTDKSAKTRQGALENLRLALASHLLPDFLLERRLTLADALEKCLRKGKGEEQALAAAVLGLFCVQLGPGPKGEELFHSLQPLLVSVLNDGTASPAARLHCASALSLGCYVAAADVQDLVSCLTCLEGVFSRACSVGGSTAPVAPASFHGLLCAALQAWALLLTICPSTHISHILDRQLPRLPQLLTSESVNLRIAAGETIALLFELARDLEEDFIYEEMEALCSALRTLATDSNKYRAKADRRRQRSTFRAVLHFVEGGECEEETVRFGLEVLYVDSWARRRVYTAFKDVLGSGMHHHLQNNELLRDIFGLGPVLVLDAAALKAYKISRFEKHLYNAAAFKARTKARSRVRDKRADIL	481568	476604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477134_477276_477373_477447_477577_477649_477788_478081_478188_478265_478445_478528_478580_478748_478907_478988_479114_479222_479308_479392_479513_481367
773803	contig_10196_pilon	+	1547	12	Intergenic	novelGene_132290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_4	227.701304997404	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	492	1349	2364371	2374406	FALSE	10	GCCTCGTAGCCCACCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2346686	2374604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497_2352597_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
773804	scaffold_6394_pilon	+	950	6	Intergenic	novelGene_111029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1038.37673317539	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	272	790	405059	406119	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	402861	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402973_403239_403376_405034_405201_405302_405501_405717_405864_406086
773806	contig_18145_pilon	+	1625	7	Intergenic	novelGene_37306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	45.1506736752989	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	876	1490	58238	60118	FALSE	25	CCAGGAACTATCCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHAMGVYGALTKAPVPAAQDLVSSGSSRDVPGTDTSLDEELDRVKLS	57119	60253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59211_59980
773808	contig_5229_pilon	+	1680	9	Intergenic	novelGene_117699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	61.6948133962653	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	12	842	555782	596228	TRUE	20	GGCTGTGCTGAGTACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRPMCILFFKFDPCPVSKNAYRLVLAANRDEFYHRPSKLASFWGDNNEILSGLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLSTTKGDVVCYYGNRGQPEPVVLTPGIYGLSNALLDTPWRKLSFGKQLFQEVVEQSQALSKDALIAQLLDVLNNEEAQLPDPAIVDQGKEYVQPILSKYAAVCVRCPDYGTRTNTVILVDAEGHVTFTERSMLDKDPTCWETSTYEFKLQS	555770	597230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_555838_565421_565511_581980_582101_582738_582854_587604_587676_591290_591445_593087_593193_596107_596663_596826
773809	contig_10753_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_105128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGCCATATCCATGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46872	45354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_45400_46900
773810	SIRV6	+	410	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	7	124	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAAGAAATTTAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3177_11003
773812	contig_366_pilon	-	1620	9	Intergenic	novelGene_51599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1092	junction_2	302.430958030093	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	481	1491	803057	764196	FALSE	60	AAAAAAAAAAAGACGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKG	803537	764066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
773814	contig_10196_pilon	+	1627	13	Intergenic	novelGene_132294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_5	219.19035043136	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	567	1424	2364371	2374406	FALSE	20	GTAGCCCACCTGCCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2346706	2374609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497_2352597_2363547_2363643_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
773817	contig_12786_pilon	-	890	5	Intergenic	novelGene_103413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	660.161485925982	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	129	641	602829	591100	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRVS	602957	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591108_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796
773818	contig_10129_pilon	+	2136	19	Intergenic	novelGene_128165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	185.575622667405	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1254	883	2136	608285	639754	FALSE	35	TCTGTGAGTACTAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLKKCWASLHESSLNTLVQMLRTAIISQLSYWTDTSQSQCNAKALLGMMKEVYKVNKANSRLPENAFNINELSNSLNFYIERCRVISRNKNPVPADNLSPLIFTDFPFAFNFLSKMKLLEADSFIKMQGSIEKAYQEHMQMFIQRKSEFPSPPKFILKVRRSHLVEDALRQISQVEVNDLRKALVIEFTEEIVSEAGGVRSEFFHCVFEEMTRPEYGMFMYPEDGSYMWFPAKPKVEKNRYFLFGVLCGLSLFHLNVVNLPFPLALFKKLLGQKPSLEDLKELSPLLGKSLQEVLNDEADDLGELYIFF	586432	639754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_586519_588123_588284_589293_589371_592929_593049_593140_593158_595360_595456_596710_596839_598697_598766_607103_607226_608274_608335_608643_608738_611511_611702_614301_614457_620225_620340_620664_620773_626277_626449_626856_627001_637583_637751_639693
773826	contig_8616_pilon	+	1735	3	Intergenic	novelGene_72394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	26	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCTTTTTTTTGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196678	199019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_197657_197845_198124_198540
773827	contig_14566_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_148847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAACCCTAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114327	116128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_114300_116100
773829	contig_16535_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_167713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCATGTGTCTAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363976	364424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_364000_364400
773830	contig_9752_pilon	+	1282	2	Intergenic	novelGene_122008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	101	1183	69100	72144	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKNEKRHEEPAITNGPRITNAFSITETENSNNMFSPLDLRASFKKVSDSMRTSGLCLERTNVCQEPEPVRTLAEHSYAVSSAAEAYRSQPVCEEMSEMFDEASDQDSTDKPWRPYYNYKPKKKSRQLRKMRKVSWRKEHGNRSPSNKCKYPAELDCAVGKAPQDKAFEEDDNKEMPKLQCELCDGDKGATPGSQGRPHRHLTARPHTCELCAKQFQSPSTLKMHMRCHTGEKPYECKTCGRCFSVLGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCSKAFTLNETLKIHERIHTGEKRYHCQFCFQSFLYLSTKRNHEQRHVREHNGKGYACFQCPKICKTAAALGMHQKKHLFRSPGQQEKMEGDVYQENSNPLENPHCIDSEDNDQKDDAHAIVENVVL	68999	72243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_69286_71247
773831	contig_9839_pilon	+	2831	1	Intergenic	novelGene_88563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAAAATTGTGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255895	258726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255900_258700
773834	contig_15304_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_30502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	318	347	52954	52925	NA	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53271	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52900_53300
773840	contig_5988_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_15862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGAGAACTCATGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274152	273160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_273200_274200
773843	contig_8617_pilon	-	149	1	Intergenic	novelGene_73492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTATGACTCAGACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63598	63449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63400_63600
773844	contig_9218_pilon	+	2644	10	Intergenic	novelGene_157680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	96.3419834640007	119	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	163	1260	264852	303097	FALSE	40	AGAACCCAGCTTTTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSVEQKKGPTRQRKCGFCKSNRDKECGQLLISENQKVAAHHKCMLFSSALVSSHSDNESLGGFSIEDVQKEIKRGTKLMCSLCHCPGATIGCDVKTCHRTYHYHCALHDKAQIREKPSQGIYMVYCRKHKKTAYNSEADLEESFNEHELEPSSPKNKKKSRKGRPRKTNFKGLSEDTRSTSSHGTDEMESSSYRDRSPHRSSPSDTRPKCGFCHVGEEENEARGKLHIFNAKKAAAHYKCMLFSSGTVQLTTTSRAEFGDFDIKTVLQEIKRGKRMKCTLCSQPGATIGCEIKACVKTYHYHCGVQDKAKYIENMSRGIYKLYCKNHSGNDERDEEDEERESKSRGKVEIDQQQLTQQQLNGN	260766	304481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_260883_264805_264990_265209_265312_279861_279996_280262_280307_290833_291001_291154_291299_292787_292893_295644_295779_302967
773845	contig_19237_pilon	+	1018	4	Intergenic	novelGene_162954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	127.444105395267	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	57	500	23905	44811	FALSE	0	TTTTTTGTTTGTTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSPCYPGRAPVGSSRRKMAAAAELLLLEKSLGLSKGNKYSAQGERQIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVKQANKEYLLGSTPEEKADLNLYLEDKVYLTGYHFTLADILLYYGLHRFIVDLTVQEKEKYLNVSRWFCHIQHHPGVRQQLPSVVFIKNRLYTSSH	23848	45329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458_28579_35765_35862_44670
773852	contig_10016_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_117879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAACGTAAAGTTACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496501	494741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_494700_496500
773855	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
773856	contig_12437_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_169072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGATCTACTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38767	40098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_38800_40100
773858	SIRV2	-	425	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	50	3257	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
773859	contig_15732_pilon	+	1372	3	Intergenic	novelGene_88844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	523	junction_1	69	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	48	758	11208	97836	FALSE	60	TTAAAAAAAAAAATTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCEVSKDNLLFKWSQCFNKYCISLECKLQHS	11160	98450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594
773868	contig_3163_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_168065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGGCCACCTGATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181867	182983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_+_181900_183000
773869	contig_14855_pilon	+	2017	7	Intergenic	novelGene_146041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	38.6584042896525	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	218	856	650839	654448	TRUE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648622	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_654687_654732
773870	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_97115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	83	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
773871	contig_2332_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_58694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTAGATATTTGTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547762	545441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_545400_547800
773874	contig_16098_pilon	-	1372	8	Intergenic	novelGene_46149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2383.07045122678	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	595	1161	457605	456286	FALSE	20	ATTGAAGGGGGAGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVNLPRKVHPKRSGWGRSQPIPLHL	460261	456074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456356_456469_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_458382_458618_458704_458838_460148
773878	contig_6031_pilon	-	1797	1	Intergenic	novelGene_56784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGGTTCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582942	581145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_581100_582900
773881	contig_2739_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_165834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATGAGCCAGCAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183825	185003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_183800_185000
773885	contig_998_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_153801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACTGGAAAACTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369986	372300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_370000_372300
773888	contig_8606_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_159406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCAGTCTGGGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124873	127029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_124900_127000
773894	contig_14683_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_166037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACTTTCTTTACCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51322	50850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_50800_51300
773895	contig_12427_pilon	+	2247	17	Intergenic	novelGene_40401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	30.4866774181773	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	130	1785	6250	60048	FALSE	60	TTAATAAAAAGAGTATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVEKFFTEDVDSRKIDQEGEIPKETLEKLKSLGLFGMQVPEEYGGLGLSNTMYARLGEIIALDTSITVTLAAHQSIGLKGIIIAGNEEQKTKYLPRLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRTRATLSEDKKHYILNGSKIWITNGGLADIFTVFAKTQIVDSNNLIKDKITAFIVERNFGGVTNGKPEDKLGVRGSNTCEVHFENTKVPVENVLGEVGGGFKVAMNILNSGRFSMGSSVAGMLKKLIEMTAEYACTRKQFNKNLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMAYLTAGLLDRPGLPDCSVEAAIVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYMRDYPYERLLRDARILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRVLTSRINEIKQGNVSTIVETVGRRLRDSLSRTVDLGLTGKLGVVHPSLEDSANKLEENVYYFGRTVETLLLRFGKTIVEEQMVMKRVANILINLYSMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANIFCVEAYHQNLFTLSQLDKYSPENLDEKIKKVAQQVLEKRTYICAHPLDRTS	6120	60510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_6284_33630_33733_36185_36293_37394_37496_39300_39380_43868_44044_46431_46506_48983_49060_50697_50769_51046_51167_52617_52747_55689_55770_56575_56703_56999_57078_57996_58126_58843_58917_59947
773896	SIRV7	+	364	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGCGTTTTAAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78962_114683
773897	contig_5092_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_62291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTTTACATCAACTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443175	444813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_443200_444800
773900	contig_11396_pilon	-	1399	4	Intergenic	novelGene_71373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	96.4030889316082	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	185	721	1043268	1042235	FALSE	40	AACGACCAAAATGGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGVEPSVDLETLDERIKIREMVLKGRIQEAIARINSLHPELLDTNRYLYFHLQQQHLIELIRQRETEAALEFAQTQLAEQGEESRECLTEMERTLALLAFDSPEESPFGDLLNTMQRQKVWSEVNQAVLDYENRESTPKLAKLLKLLLWAQNELDQKKVKYPKMTDLSKGVIEEPK	1043589	1041556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1042409_1042609_1042808_1043103_1043301_1043437
773901	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	CAGTATGGTTATGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
773904	contig_5084_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_64479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAAGAAAGAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67877	67335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_67300_67900
773906	contig_5954_pilon	-	1332	2	Intergenic	novelGene_28774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392261	1390875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392100_1392153
773909	contig_6266_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_170984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACATAAGATTTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265986	264455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_264500_266000
773910	contig_2834_pilon	+	1981	6	Intergenic	novelGene_28005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2294.97532884343	4	115	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	41	634	274763	290779	FALSE	20	CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRSIILKAMFKSN	274722	292126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_290692_290745
773911	contig_14196_pilon	-	1834	6	Intergenic	novelGene_169964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_3	25.8658075458703	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	474	1220	114010	17795	FALSE	30	TTAGGAACGGCCAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFLPTVSTMGDVGGELSSGDDSGDVDESPQSPETEASRSLTELFEKAAAHLQGLIQVASREQLLYLYARYKQVKVGNCNTPKPSFFDFEGKQKWEAWKALGDSSPSQAMQEYIAVVKKLDPGWNPQIPVKKGKEANTGFGGPVVSSLYHEEIIREEDKNIFDYCRENNIGHITKAIKSKNVDVNMKDEEGRALLHWACDRGHKELATVLLQYRADINCQVRVMKISIFFLIEIKSHNIKFSILTF	114483	17180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_17966_36878_36985_52120_52204_103247_103345_106756_106822_113785
773913	SIRV4	-	413	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1105	3	1105	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4053	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
773921	contig_13044_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_99974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGTTGTATCTGGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22961	23362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_23000_23400
773922	SIRV6	+	274	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	112	-9	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3135	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773925	contig_10603_pilon	+	2610	1	Intergenic	novelGene_173375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66404	69014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_66400_69000
773932	contig_9706_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_21018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563642	562500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_562500_563600
773933	contig_9389_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_83890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACTCAGTATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100115	97788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_97800_100100
773934	contig_9389_pilon	+	1226	6	Intergenic	novelGene_83992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	515.084692065295	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	65	472	383487	384766	FALSE	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	383422	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_383488_383585_383684_383774_383914_384011_384091_384307_384382_384749
773938	contig_6164_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_121288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTTAATTTCAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574518	575182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_574500_575200
773940	contig_12119_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_88648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCTATGAACATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178069	180365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_178100_180400
773943	contig_6175_pilon	+	2161	7	Intergenic	novelGene_16292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38.6724133660618	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAAAAGAAGTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389917	1401466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154_1396213_1397562_1397662_1397764_1397851_1399127_1399292_1399417_1400981_1401374
773950	contig_15047_pilon	-	1595	7	Intergenic	novelGene_52287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	22.4406624976477	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	251	1096	84499	82103	TRUE	20	TTTGTCTGTGTATTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRTQRWRLKSLRSSAFRAPILDSTVFVITSRWSPRRSVQPRFIAEGYIDGKLFLHYDSEKDRAEPQGPWGEANLGAETWDLETMDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRGLHSLQETLDCEIQEDNGTWGFWDYRYDREPFLSYLPETQRWTVPQSLAQTLALEMKKTWDADRDKHKYYGHHVQGDICKRLWSYLDSGRDFMERIAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPAFMRKPRKRSMSQVHGMASEPPA	96191	79348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82051_82174_82700_82842_82958_83229_83873_84162_84423_84686_96127
773954	contig_13571_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_128108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTACGTTAATACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81635	83404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_81600_83400
773957	contig_13051_pilon	-	3085	1	Intergenic	novelGene_140104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1129	1431	121016	120714	NA	90	CATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAQHGKHNYCQKIVHKKRLKWPFFGIYILPQQIKKRERGRGISERTDKESKLEDRSHVTFICEPSLPHVFSELNYPKIMTSHVILQKPLYFLTAQFPHL	122144	119059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_119100_122100
773958	contig_2069_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_23542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	123	404	1509802	1508747	FALSE	20	TACTGGCTGACAGGTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSRAEQEGNRSRARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509924	1508474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
773959	contig_9484_pilon	-	1139	9	Intergenic	novelGene_105598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_7	260.013461189993	473	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	13	885	75875	61414	FALSE	0	GTTGTTGGTTTTCTCGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAMAAQQEPGPPQEKGDQPEKGAQVAAWLKKIFGDHRIPQYEVNPRTTEILYHLSERNKARDRDVSLVIEDLKQKASEYESEAKHLQDLLMESVNFSPASLSSTGSRYLNALVDIAVVLETKDTSLTSFIPAVNDLTSDLFHTKSKNEEIKLELTKLENNLTGTLVLEKCLQEDLKKAEQHLSTERARVDHRLQNMDFLKAKSEEFRSGIKAAEEQLSARGMDASLSHQSLVALSEKLAELKRQTRPLKKKLESYLDLMPNPSLAQVKIEEAKRELDTIEAELTQKVEMMEL	75887	61159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_61465_62644_62693_62936_63009_63818_63885_64259_64384_65430_65566_68276_68413_74863_75039_75809
773963	contig_3320_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_133062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1799	2134	137851	137516	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYRGRLNEFSPATHKYLKMWFQFLFLFLKMVLIFFQITSKNEGPSDVKRVYTSAYTLKSLPLLGSDFCIQIMESYLDKVLEMIKRGQIQIYTLKKSRSRCQLTHLCIFFK	139649	137422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_137400_139600
773967	contig_5643_pilon	-	2029	5	Intergenic	novelGene_38957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAACCAGCATATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502624	498183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_498233_499443_499656_500128_500253_500590_500661_501050
773969	contig_9720_pilon	-	1252	3	Intergenic	novelGene_116786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1708	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGAAGCCGTGAGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393990	391631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_392082_392393_392464_393258
773973	contig_4486_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_38652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	562	918	1031794	1032150	NA	60	CTACTAAATAAAATAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSLLQLKSVLFYIFVFLPALYNLPKIVNHTPYTGQVEQWLSAQLLTKRWAIHQLLSRRKMRQSASVKIYSLGNLWGTSALSCRVTESESTHRQQLWFFGVFVAVDYTMQNILAWFL	1031232	1033333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1031200_1033300
773974	contig_5744_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_149323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGCAGCACCGCCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288373	288603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_288400_288600
773980	contig_10437_pilon	+	1350	6	Intergenic	novelGene_38473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	52.8847804193229	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1311	38	1348	1169851	1174062	FALSE	0	TTCTTCGTGGTGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLYGKPIRVNKASAHNKNLDVGANIFIGNLDPEIDEKLLYDTFSAFGVILQTPKIMRDPDTGNSKGYAFINFASFDASDAAIEAMNGQYLCNRPITVSYAFKKDSKGERHGSAAERLLAAQNPLSQADRPHQLFADAPPPPSAPNPVVSSLGSGLPPPGMPPPGSFPPPVPPPGALPPGIPPAMPPPPMPPGAGGHGPPSAGTPGAGHPGHGHSHPHPFPPGGMPHPGMSQMQLAHHGPHGLGHPHAGPPRLWGAATTPTTTWNASSWTPSNGHAPSSPQTHSPASGSPSWPTPGPSPSVECPSPPSWWTLPVPFPFLRPVRVAVAPWAKALIPLRPFFFFSMSVPSVLQMHRENKTQLV	1169813	1174064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169885_1170349_1170479_1170741_1171285_1171596_1171804_1173320_1173461_1173804
773981	contig_7376_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_108067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	12	398	53088	53474	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGGENGGGGKKGLKRKATSEDPEETVVSGDGTAEGGAQSPKAAAFPPGFSISEIKNKQRRHLMFTRWKQQQRKVSVGRMRRGACAVSLAQGVGAWEGGRGGVSHMRDRPCGIPGGRDLSSVVNRKG	53076	54559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_53100_54600
773984	contig_13490_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_129122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	905	1264	45892	45533	NA	40	TTTAATTGATTTCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSASILPPSLLSSAWGLESLQMDIQVTTIDLYSPGAIEEGGKVRNRRRIWNVCLFASMNNCVLCHETRRTEWCPATITEWLDQSFYRRILIKRGNTQRRISNSYEIQTFWSHGGWMNP	46796	44900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_44900_46800
773985	contig_501_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_134898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGTACAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755256	753108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_753100_755300
773995	SIRV6	+	329	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	23	-244	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
773999	contig_8686_pilon	+	698	3	Intergenic	novelGene_154682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	29.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGAAATGTCTATGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236584	244222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8686_pilon_+_236653_239290_239382_243683
774001	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774004	contig_5643_pilon	+	924	7	Intergenic	novelGene_38741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	303.67293261007	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	380	730	156118	157107	FALSE	20	ACCACACGCTGCAGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQRSTCHLKQGNSVRNLGHCQGGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152415	157301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152484_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
774005	contig_11816_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_98490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGGAAAAAAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501099	498648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_498600_501100
774006	contig_10437_pilon	-	1144	3	Intergenic	novelGene_38119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	126	698	80783	80153	FALSE	35	ACATGAACAGGGCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEENHRQRLAF	82821	79706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80182_80239_80838_82750
774010	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
774011	contig_6304_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_122259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1110	1427	176056	175739	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGLYEDLSYHLYKHVSNPEFATHSVVVVFARTIEAISTPLEILQILLQDHRHHEKFTNTYQNFNILKHHVIGECYRGMSFFFFPSRPYKEVFAYCNDSQYLFGQ	177165	175113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_175100_177200
774014	contig_14142_pilon	-	1229	6	Intergenic	novelGene_120512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	393	junction_1	201.578173421628	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	26	1012	347473	345639	FALSE	25	AAGCCATGAGTTTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLAVFFSGALLGLLAAKGAGNDCPHKKSATLLPSFTVTPTATESTTSSGTTSHRTTKSHETTSHRTTTTNTTSHRPTTVTHNPATTTSHGNATVHPTSNSTATSPGITTSPEPGPPPPSPGPTPGSKEAIGDYMWHNGSQPCVRLQAQIQIHVLYPTQDGGEMWGVSVLNPNKTKVQGSCEGAHPHLLLSFPYGQLRFGFKQDPIQSVVYMNYMAVEYNVSFPKATQWTFSAQNSSLRDLQAPLGQSFSCRNASITLSPTFHLDLLFLKLQAAQLPSTGVFGPSFSCPSDRSILLPLIIGLVLLGLLTLVLVAFCIVRRPPSTYQPL	347498	345421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_345773_346105_346277_346387_346461_346602_346723_346896_347337_347424
774016	contig_10235_pilon	+	1791	6	Intergenic	novelGene_46564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	43.4308646011106	19	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	67	588	432382	438716	TRUE	10	CTATGAGGTTTTCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKRHRLVSETFGLKRRREREDGEVDPLRGESGSARAAVAELVRLFPRGLFEDALPPIALRSQVYSLLPDRTVADRQLVRGVGVIDGESSPASLPLWRLPRHSDARRSFKSRGRSESSSWASTWMPMGLSSPRTTGPKSLRPVMADHLLEPCRSFWLRCFQPVGTLASSRTR	432315	440547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_432482_432629_432850_438244_438341_438610_438751_438838_439052_439591
774025	contig_10296_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_168892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATATATTTATAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969706	968749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_968700_969700
774026	contig_10296_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_168891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACATATAAATAAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968749	968387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_968400_968700
774027	contig_3789_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_79888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACAATAAAAGAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578384	576325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_576300_578400
774028	contig_3150_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_171916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	934	1245	313583	313894	NA	40	AAACCCACTCATTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVHVSKDWQCIKTLSNKRCSLEKQLQNLIEGCSLKLPLRRICIYSNLVPWHDGTYSTSAELICIARFQVSLSQPQAERKRGRPSTRWIDIVATTAGSSITTW	312649	314186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_+_312600_314200
774031	contig_7057_pilon	+	882	8	Intergenic	novelGene_123326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	858.545019798268	207	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	12	857	936984	943696	FALSE	10	GCATCTGCCTCCCGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAASAHTSHTPSQSLSFTLCQAQRLGCCHTPRAFSVLEESLLSLHPVTPVPVTPPAAVLPGPRPTCPVPLFLLCFQPARPRKK	936972	943721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_943451
774033	contig_16633_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_165075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGAGTTTCTGTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88924	89909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_88900_89900
774034	SIRV5	-	343	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCTGGCTCTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8455_8590_10859
774035	contig_14184_pilon	-	1001	4	Intergenic	novelGene_66584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	349.675405038571	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTGTGTTGTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126304	88544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89198_105799_105915_109168_109327_126229
774039	contig_10627_pilon	-	1991	4	Intergenic	novelGene_59949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	15.1730755689881	16	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	889	1206	169525	168907	TRUE	25	CTCTGGAAGTGAGATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGNCGQEHEKQVEVWPGT	170413	167907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_167950_168059_168544_168647_169087_169387
774043	contig_1244_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_38079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATAGTTGTTTATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301310	1300828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1300800_1301300
774044	contig_1244_pilon	-	2629	1	Intergenic	novelGene_38077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCAGCAACCAGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300628	1297999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1298000_1300600
774046	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
774049	SIRV6	+	542	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	29	3	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774050	SIRV6	+	496	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	171	-2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
774054	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
774061	contig_19185_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_163641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97947	95680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_95700_97900
774062	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774066	contig_19469_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_134987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66509	64107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_64100_66500
774068	contig_2414_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_158518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAATTTGTGTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807556	806544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_806500_807600
774069	contig_8259_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_148896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCGTGATGTCTCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344934	344347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_344300_344900
774070	contig_13894_pilon	+	2148	5	Intergenic	novelGene_62213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.87228132326901	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGTTTCTGCTCTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766804	771751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_767021_767106_767344_768642_768883_769132_769262_770425
774071	contig_10500_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_41179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCCAGCATTAGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321656	1319684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1319700_1321700
774073	scaffold_12510_pilon	-	2862	1	Intergenic	novelGene_151423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCCCAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687587	684725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_684700_687600
774076	SIRV4	-	416	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1107	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4051	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
774083	contig_9515_pilon	-	1153	9	Intergenic	novelGene_73810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	151	585	72499	68196	TRUE	20	CCCGCCTCCAGAGATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSRPWGRISHLSVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEAAAWAFVWSAVRSSSGLPSFRGGLGPRTWIISAGSSPSVTISTWALPCRSLSRMARAKSRALLRSRMLDLPPHQAKMV	72649	57283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_57340_66053_66246_66343_66489_66676_66852_68195_68347_68727_68815_69404_69476_71787_71881_72466
774084	contig_11846_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_106005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCCAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426207	427990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_426200_428000
774086	contig_17964_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_33927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1198	1590	468932	468540	NA	35	AATCCCAGCATAGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVKTSSLFQL	470129	467980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_468000_470100
774087	contig_3774_pilon	-	1069	9	Intergenic	novelGene_142034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	151.995014309681	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	430	876	175510	144743	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210477	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_200894_200987_210294
774092	contig_3948_pilon	+	2496	1	Intergenic	novelGene_53291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAGAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433242	1435738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1433200_1435700
774096	SIRV6	+	401	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	3	379	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774099	contig_16776_pilon	-	1111	6	Intergenic	novelGene_130538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.4028339268103	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	36	797	129630	96103	FALSE	20	CCTTTGCCATTGTAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLVQETGSHEEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEKDCFQLKEPACPENLNTWGKNPRDGLIGEMKWLSCKLQDCRASNASLDSPTGLGLLCSGSREEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEEDCFQLKEPSCPENLSTWGKNPQDGLIGEMKWLSCKLQDCRTSNASLDSPTGLGLLCSENTTILKSERKYNGLSSLGTAATAVSGSVGVVAFILLLVGLLSVTLKKWRHESESLPAMPMLYIPT	129665	95788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96143_96951_97063_97348_97398_99707_99975_100905_101173_129602
774100	contig_7976_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_169408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAGAAAGAAAAAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758825	756793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_756800_758800
774101	contig_7201_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_152538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTGATCTTGTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990429	989115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_989100_990400
774104	contig_8843_pilon	+	1813	3	Intergenic	novelGene_156661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	499	junction_1	89.5	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	677	1267	107363	112843	FALSE	65	AGGAAAAAAAAAAAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSDGSEAMLNRVMTKDNIGVAVVLEVHKELFGAGMKPIHAADKQLLIVANAHMHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKVSGSLLADVEMISNTSM	106686	113389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_107469_110287_110516_112586
774106	contig_7202_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_18082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCTGTTGTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
774109	SIRV2	-	533	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1104	0	-59	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4791	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
774110	contig_2069_pilon	+	2079	10	Intergenic	novelGene_23446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	700	1041	1334364	1334705	TRUE	35	GCGCAGGAAAATCACGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGAAAEKLGACSPNLLVTKARFSVLVGDSHSQPSQGATVPSSPKVSLASRPGLGGSPAKQREPNSSSGERCLSPRKERGVGPWRQRAGQGGRWPASLRLMQCPDVPTSQPA	1333664	1361622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1334896_1340454_1340499_1343022_1343123_1345592_1345645_1350404_1350502_1351476_1351595_1354911_1355061_1359039_1359154_1360917_1361027_1361557
774111	SIRV6	+	338	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	531	2	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
774113	contig_9571_pilon	+	1924	7	Intergenic	novelGene_136325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_6	88.0146768063903	116	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	224	1252	746108	780167	FALSE	25	GTACGTGAAGAATTTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTARLSRPLSQLPGKALSFYDRENGASHTLLFSSTSAPVRCRTYTNQVNPVGSKAVLITGCDSGFGFTLANHLYSQGFLVFAGCLLKHKGDSGVQKLDNLRSDRLRTIQLNVCKSEEVEEAVEVIRSSLKDPEKGLWGLVNNAGISTFGEVEFTSMETYKEVAEVNLWGTVRTTKSFLPLIRRAKGRVVNISSVLGRMASLARSPYCITKFGVEAFSDCLRYEMRPLGVKVSVVEPGNFIPGTSLYNPERIQAIAKKMWDELPEVVRRDYGRKYFDEKIARMESYCSSGSRDTTPVIKAVTHALTAATPYTRYHPMDYYGWLQMQVMTHLPAAVSDKIYGL	731094	780839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_731274_746063_746191_758287_758358_759070_759182_771119_771262_778525_778679_779697
774114	contig_9833_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_68485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGACTGACACAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183743	184565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_183700_184600
774116	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
774118	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774120	contig_14811_pilon	-	1099	2	Intergenic	novelGene_74471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAAAGTGTCTCGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386590	356575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_386528
774122	SIRV7	-	570	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	14	-58674	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGAATATAACAGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147904	114711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_114989_147611
774125	contig_935_pilon	-	2775	2	Intergenic	novelGene_45518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	72	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAATATTCATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32220	24603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_27193_32034
774126	contig_12250_pilon	-	2165	10	Intergenic	novelGene_80741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	6.12422834645363	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	88	2010	437636	429384	FALSE	20	TTTTGCATAACATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAYRPGLRLNWHVMSPWGWSSHRSLQTPRVLSGDLGQLPAEVRDFVERSARLCQPEGIHICDGTEAENTATLTLLEQQGLIRKLPKYNNCWLARTDPKDVARVESKTVIVTPSQRDTVPLPAGGARGQLGNWMSPAEFQRAVDERFPGCMQGRTMYVLPFSMGPVGSPLSRIGVQLTDSAYVVASMRIMTRLGTPVLRALGDGDFVKCLHSVGQPLTGQGEPVSQWPCNPEKTLIGHVPDQREIVSFGSGYGGNSLLGKKCFALRIASRLARAEGWLAEHMLILGITNPAGKKRYVAAAFPSACGKTNLAMMRPALPGWKMECVGDDIAWMRFDSEGQLRAINPENGFFGVAPGTSATTNPNAMATIQSNTLFTNVAETSDGGVYWEGIDRPLASGVTVTSWLGKPWKPGDKEPCAHPNSRFCAPARQCPIMDPAWEAPEGVPIDAIIFGGRRPKGVPLIYEAFNWCHGVFVGSAMRSESTAAAEHKGKVIMHDPFAMRPFFGYNFGHYLEHWLSMEGRKGARLPRIFHVNWFRRDEAGRFLWPGFGENARVLDWICRRLEGEDSARETPIGLVPKEGALDLSGLGAIDTTQLFSLPKDFWEQEVRDIRSYLTEQVNQDLPKEVLAELEALEGRVRRM	437723	429228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_429839_430106_430203_430505_430644_432738_432958_433229_433393_433695_433884_434257_434462_434548_434734_435186_435433_437607
774133	contig_7933_pilon	+	403	2	Intergenic	novelGene_164665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCGAAGGTAATAGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109779	111498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_109986_111301
774134	contig_13464_pilon	-	835	2	Intergenic	novelGene_125232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATCTGAACTTCTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103464	102309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_103068_103387
774137	contig_8616_pilon	-	1106	5	Intergenic	novelGene_72437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	424.372772453653	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTGGTACTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255493	253303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_253907_254087_254223_254302_254668_255301
774140	contig_12919_pilon	-	1162	3	Intergenic	novelGene_75905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1087	junction_2	97	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	76	495	743659	734891	FALSE	40	TTATGCTTTTGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHGLLKRIIL	743734	734223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_735079_737596_737735_743565
774142	contig_2932_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_47953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAACCCAATTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125622	123362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_123400_125600
774145	SIRV7	-	629	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113283	4	113105	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAGTGTTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633	1004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_1600
774147	contig_15500_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_128972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAAAAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153419	155398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_153400_155400
774148	contig_9706_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_21017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGATATGTTCTTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562311	563956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_562300_564000
774150	contig_16578_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_148658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAATCAATATGCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199928	199281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_199300_199900
774152	contig_6031_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_56733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTTGCCTCCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157706	155811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_155800_157700
774153	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
774155	SIRV6	+	407	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	447	2	274	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1577	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
774157	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774162	contig_12270_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_113719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13852	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
774163	SIRV4	+	369	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGTTTCCGAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
774167	contig_5485_pilon	-	1960	2	Intergenic	novelGene_37742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	80	385	357599	357172	FALSE	60	TCTCAAAAAAGGAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAAAKGSELSEKIESFVEALKRGGGRRSSEDMARETLGLLRRIITDHPWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGNMVRRVLKIIREEYGRSGPRFA	357678	355596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_357315_357436
774170	contig_10617_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_172358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAGAGGCAGGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96422	95478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10617_pilon_-_95500_96400
774172	contig_17976_pilon	+	1477	3	Intergenic	novelGene_32520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	176	1192	41843	47385	FALSE	20	CCCCACCCGCAAAGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41667	47670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
774175	contig_7753_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_41469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACCTCTTTAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568052	568452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_568100_568500
774178	SIRV6	+	268	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10727_10819_11031_11109_11205
774180	SIRV6	+	403	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	476	-1	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAAATAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
774183	contig_6509_pilon	+	1775	2	Intergenic	novelGene_145645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128576	132519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_129806_131973
774185	scaffold_13505_pilon	-	1265	3	Intergenic	novelGene_111669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.5	90	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	136	585	904535	870229	FALSE	10	ACTGAGGGCTTCGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHFELPPPLECPPPFPPSPPDRKGLRGTEPWEARPGSGAAPRARAMDVRRLKVNELREELQRRGLVTRGLKADLAERLQAALEAEEPDDEPGRPGHSNEEVETEGGSELEGTAQPPPPGLQPHPEPGGYSGPDGHYVMDNITRQNQFYESQVIKQENESGYERRPLEMEPQQQAYRPEKQNVEGGSSDFFLFFL	904670	869548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870282_900568_900695_904264
774186	contig_8636_pilon	-	1028	7	Intergenic	novelGene_141936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	39.701665232358	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	44	703	468713	458644	FALSE	25	CGGCCAGTGTCATGATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCVWEPEPPAQARMFVLVEMVDTVRIPPWQFERKLNDSIAEELNKKLANKVVYNVGLCICLFDITKLEDAYVFPGDGASHTKVHFRYVVFHPFLDEILIGKIKGCSPEGVHVSLGFFDDILIPPESLQQPAKFDEAEQVWVWEYETEEGAHDLYMDTSEEIRFRVVDESFVDTSPTGPSSAEATSSSEELPRKEAPYTLVPCLWVKGACPLSTRQGSISEPGLGLLSWWTSN	469035	458318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_458743_459739_459942_461427_461492_461996_462084_465963_466061_468602_468734_469012
774187	contig_14341_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_111776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313598	312091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_312100_313600
774188	contig_7119_pilon	-	3006	2	Intergenic	novelGene_41028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	75	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	171	1202	234099	233068	FALSE	10	TGCCTGAGAGTTTGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRSRLDRAQHAVTKCTSPSTGLSVKSRDTGLLVVKTKASPASKLESRAALNQALEMKRQGKRGKAHKLFLHALRMDPDFVDALNEFGIFSEEDKDIIQADYLYTRALTISPYNKKALVNRDRTLPLVEEIDQRYFSIIDSKVKKVMSIPKGNSALRRVMEETYYHHIYHTVAIEGNTLTLSEIRHILETRYAVPGKSLEEQNEVIGMHAAMKYVNATLVSRIGSVTISDVLEIHRRVLGYVDPVEAGRFRTTQVLVGHHIPPHPQDVEKQMQEFVQWLNSEEAMSLHPVEFAALVHYKLVYIHPFIDGNGRTSRLLMNLILMQAGYPPITIRKEQRSEYYHVLEVANEGDVRPFIRFIAKCTETTLDTLLFATTEYPVALPEAKPNHSGFKETLPMKP	235781	231263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_234144_235655
774190	contig_6710_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_97186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774191	contig_1694_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_144994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	565	900	1691012	1690677	NA	40	GTGAATAGTCAGCACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTASSIIALFFFRNAVFSSQKQGGLSQRSSVNQFKVMKDKRPACTYYALYQFSTGGSFSKQLFPLAALRQDASFDLVLRECFLETPPPACVGSFPDQIRSLNHWVHKKI	1691576	1690220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1690200_1691600
774192	contig_9027_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_156346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11848	13276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_11800_13300
774194	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	51	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
774195	contig_7342_pilon	-	1904	5	Intergenic	novelGene_71131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.17944947177034	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	91	1272	94017	88610	FALSE	15	CACGTTTCTGTGGAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAAAAAAAATAAAASSLCAAAASAISATSMREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGHLHRQQHGHPGAVQAHLRAVHGHVPAQGLPALVHGRGHGRDGVHRGREQHERPGVRVPAVPGRHGRGGRVRGGGGGGGGLELLPP	94107	87977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_88867_89036_89685_93133_93245_93352_93462_93960
774199	contig_9389_pilon	-	709	6	Intergenic	novelGene_83939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	3	572	167408	164402	TRUE	15	CGATCCAGCTGCGGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLGVIDLPAQAKDLAALVGALRVTHLQGHGGVVTLVGAQLGVIDVPPGPWGCHAHLAGTLVGAHLEADGGVVHGWQDVVLGVVEVASHPVGRHARLAGTFVGAHLQPDDALARLHGGIVEVPLLPLRVFNTDVHAALQPLCLGLPRQGEKRHLHLGHVPTLKQVVGLEQVHGVHAVADHGLDEVGEVL	167410	163671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_163742_164232_164296_164397_164538_165813_165927_166068_166228_167246
774202	contig_4580_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_173383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGGAGGCCTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61314	59415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_-_59400_61300
774205	contig_7201_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_152501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTGCAAGCATATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140545	139371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_139400_140500
774207	contig_2867_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_135212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1280	1696	983287	983703	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKEHRRQYTALRSKLLGLEAGVGGQQEARSINHTNKHMLLERSQPFSSTHNKNSLSSLGPKAKPSSPASQPGRDLSPVGFALPPERRASQSTKSKGFQKGMSSEPTNLHNSLSAVTKGILTHFSIKNYNINAKLFFF	982007	984082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_982000_984100
774208	contig_11574_pilon	-	2733	8	Intergenic	novelGene_64046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_7	54.1162769282166	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	262	2004	418299	391705	FALSE	40	CAGACTGGCTGAACAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGPGCEPCTKRPRWGAAATSPPAPSDARSFPGRQRRVLHPKDASVQFRVLPSSPGCVPGRAGPHRGSATSLVLKQKPITSWMDTKGIKTAESESLHSKENNNTRVESMMSSIQKDNFYQQNMEKLENVSQLNLAKSPIEKTTQYLNQHQTATTCKWQNEGKHMEQLLESDPPTVTLVPEQFSNANVDQSPQNDDHSDTDSEENRDNQQFLTPVKFANAKQTAEGELAREARSNQKFSKSCHAVEECASCQQEEIGVPESPLSDVGSEDIRTAPKNANKLRGQESSLGNSLPLEKESEPESPMDVDNSKNSCQDSEGDEEPSPGSDEQEDGPSSQTADKPSRFQAREIDTQTRKQHSTKGGEVRLHFQFEGGESCTGINDVNARLPGSTPTLNVECRNSKQPGKKDSKITDHFPRMSKAEDKRKELRRESQMGSRNSKGLDKKWLGTPIEEMRRMPRCGTRLPPLRPSANHTVTVRVDLLRAGEVPKPFPTHYKDLWDNKHVKMPCSEQNLYPVEDENGERTAGSRWELIQTSLLNRFTRPQNLRDAILKYNVAYSKKWDFTALVDFWDKVKVCLFLEL	418560	390975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_391810_396223_396308_396544_396668_408536_408644_408795_408849_409880_410865_411470_411538_418079
774211	SIRV4	-	192	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	419	6	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACCAATAAAAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
774213	contig_6710_pilon	-	480	2	Intergenic	novelGene_98129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	10	ACCCATCTCGTCCCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
774216	contig_11978_pilon	+	669	5	Intergenic	novelGene_63088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	3	587	1829081	1831883	FALSE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829078	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
774219	contig_8259_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_148895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338323	335644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_335600_338300
774225	contig_10904_pilon	+	1454	4	Intergenic	novelGene_22457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	165	1133	149100	150068	TRUE	30	TAAAGAAGGACTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143881	151574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150337_151521
774226	contig_12450_pilon	+	1711	2	Intergenic	novelGene_162313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	501	908	253941	255109	FALSE	20	TTGTGACATTGGTTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITSLDIIEKYGCTKGGSSPSKPTWASLGKTGTVQPPLCKPENGQGRKSSPGLLDSFKGRRDLNPHSARRMHPEICWVSAPSLHPPPHPSQQKASCREFWLKFPSATYICVTWTRDSPSLHSAFPSVKCGRGCTD	253440	255912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_253985_254745
774228	SIRV4	+	295	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1476	632	1021	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
774229	contig_3465_pilon	+	725	7	Intergenic	novelGene_173394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	58.0277711291949	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	235	723	759424	784789	FALSE	15	GTATGTCCCCAGGCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDVLHRHCKGDDNGKKASNPNHCNCIIDQIFTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGSMVNGENHASGTTTLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKITTYVSFPLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQLTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRQHKDQWFKCDDAIITKASIKDVLDSE	754942	784791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_754971_756943_757050_759323_759483_780298_780426_781632_781725_783798_783862_784641
774234	contig_12970_pilon	-	1208	7	Intergenic	novelGene_50500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	765	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGATCCGCGCATGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74922	15607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_15861_45020_45115_49407_49467_61720_61805_70869_70969_73991_74121_74432
774235	contig_16411_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_77339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTATCCAGTCAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203573	202658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_202700_203600
774236	contig_16411_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_77338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202658	201874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_201900_202700
774245	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774246	contig_10749_pilon	+	1610	16	Intergenic	novelGene_133503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	42.0840428983085	1	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	39	1007	288708	300658	TRUE	25	CACTCACGTACCAGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLGLFPPPPPRDQVTLYEHNNELVTGNSYESPPPDFRGQWINLPVLHLAKDPLKTPGRLDHGTRTAFIHHRERVWKRCITTWRDMGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNCCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVYNANSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSWLGPPAGAGCSQLRLWMLLSSCGMSQQRLVFPFPGSEEVELPTCSGPRMAAKSWLPPLQLCFEFGRPRCGLVRGGLRCWGDVRLAAGAQMETDCCSLY	288669	301959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_288831_289428_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293804_293898_294233_294365_299701_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513_301599_301727
774250	contig_3789_pilon	+	2446	6	Intergenic	novelGene_79832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	6.52380257212004	125	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	23	898	297427	307842	TRUE	45	TAAAAAATGACTTCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGCWLVGCEFEDSVFEDGRQRRAGPPASYCAKRCEPQWFYEETGSSDNVEALTIKKFRGDLAYRRQEYQKALQEYSSISEELSLTSFAMKRDVQEGQARCLTHLGRHAEALEIATNLETKATNTDHLTTVLYLQLAICSSLQNLEKTIFCLQKLISLHPFNPWNWGKLAEAYLNLGPALLASSQKRNSFTSSDKAIKSSSPHSGKDCLLCIPEISPESSKFSMDASSSDSQQNEKALKNTQNSVSEKREAVLIETQIKACAAFVRTRVTVSGNQLNGNGYRCLASTAPR	297404	315455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_297544_299628_299725_300672_300817_303684_304134_307772_309071_315135
774253	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	20	1159	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
774260	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	489	51	489	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10726	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
774266	contig_11328_pilon	+	1384	6	Intergenic	novelGene_88459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_5	254.984705423678	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	290	1030	836590	853019	FALSE	10	GTCCCTCCCCTTCAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLERVVVLTQRSVV	833287	853373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_852980
774268	contig_602_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_134931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGAAAATGAACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137313	138764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_137300_138800
774271	contig_8801_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_66287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTATATTAAGAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455581	456337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_455600_456300
774274	contig_9706_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_21049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGAGGGAGTTATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705883	708143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_705900_708100
774276	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	53	486	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
774278	SIRV6	+	299	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8140	-1	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
774283	contig_9535_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_124498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTACATGTTTTCGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611115	611625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_611100_611600
774284	scaffold_13505_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_111547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.9640544244725	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTCTCATGGCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597357	635989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_597531_607150_607238_608977_609105_609537_609623_634895
774292	contig_5514_pilon	+	2358	16	Intergenic	novelGene_75287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	110.355707701153	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	8	1273	89136	94359	TRUE	25	GCACTGATCAATTGTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATPAGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNCRSLAEGVSASLHTLLGDPCPMLESPGAPCLSARTSISCTLVALEPFWEVLMQSAETLEEDYVENDKEEGPWEPPVPQILAWPVLRARTGLVYDQRMMSHYNLWDNHHPEMPQRISRIMYHLEELGLAERCLTLPARPATDAELLTCHSAEYMARLRATENMKTRELHREGASFDSIYICPSTFTCAQLATGAVCRLVEAVLAGEVLNGTAVVRPPGHHAEWDAACGFCFFNSVAVAARHAQAISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHIFEDDPSVLYMSLHRYDHGTFFPMGNEGASSQIGQAPGMGFTVNVAWNGPHMGDPEYLAAWHRLVLPVAYEFNPELVLVSAGFDAAQGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMGLANGRIILILEHL	89128	96127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_89220_89562_89670_89757_89826_90068_90223_90321_90451_90612_90782_91066_91201_91725_91795_91917_92111_93839_93990_94350_94407_94528_94939_95017_95129_95259_95407_95509_95639_95886
774297	contig_14909_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_155713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCCAAACTAAAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141535	142399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_+_141500_142400
774298	contig_6710_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_89222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653718	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
774305	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774306	scaffold_16539_pilon	-	1332	11	Intergenic	novelGene_68396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.6055863742488	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	40	1197	800534	794915	FALSE	10	TCCTGCTTCATTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIWQGHTAAGLVTMEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPHKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK	800573	794779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795225_795553_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
774311	contig_14577_pilon	+	1412	15	Intergenic	novelGene_164639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATTTCTTCATCAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59279	84909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_59320_64581_64651_65700_65811_66511_66718_67034_67176_67384_67479_68060_68125_68264_68354_70386_70552_70949_71005_72982_73078_77949_78052_78685_78752_83233_83289_84848
774312	contig_1594_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_138838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	564	968	639659	640063	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRKEPYQYQLLPSQFQLMATPRMSKQNCAPQSSHGCDLSKADCQAFLLKVPLGGFEPPTSWLATKLLTTVPPGLPPNLLVSSQAFSCLHHSGTPEGNHTIQECSCKDTDKRQHCFSKLLKVEILSIKQDASV	639095	641235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_639100_641200
774313	contig_12622_pilon	-	697	4	Intergenic	novelGene_6043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_2	175.644211088464	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	18	332	1686921	1685486	FALSE	25	AGCTTAAAACCCTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1686938	1685120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885
774315	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774316	contig_14142_pilon	-	1735	16	Intergenic	novelGene_120608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	136.168751514027	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	85	1650	598441	584636	FALSE	25	CTCTTTCCTTCATAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVHHQLPCWTTSPPAHLASRACSPQQPEMTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKVRGRQACGLVLCPAHLPSDPLVPQELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTSPPSDDLGSLHSGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGSQENATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598525	584550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586388_589230_589273_589369_589422_590496_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
774319	contig_8050_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_114844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTGAAAAAGAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350417	352716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_350400_352700
774320	contig_12079_pilon	-	902	5	Intergenic	novelGene_67387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	46.4831958884068	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	206	529	467883	462454	FALSE	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTAFVVDEVSNIVKEAIESAIGGNAYQHSKVNQWTTNVVEQTLSQLTKLGKPFKYIVTCVIMQKNGAGLHTASSCFWDSSTDGSCTVRWENKTMYCIVSAFGLSI	468088	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_462525_462981_463060_463673_463798_467104_467147_467874
774321	contig_16625_pilon	-	2031	1	Intergenic	novelGene_171124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102858	100827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_100800_102900
774325	contig_10948_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_124957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCCCAGCTCCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17682	17060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_17100_17700
774326	contig_6654_pilon	+	1775	1	Intergenic	novelGene_85733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATGGGAAAGATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424726	426501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_424700_426500
774327	contig_11186_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_98863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82101	82973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_82100_83000
774328	contig_9161_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_160637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGCAACTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56192	55347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_55300_56200
774331	contig_5145_pilon	-	2067	13	Intergenic	novelGene_131441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	150.358091087761	1	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	643	1317	925621	916397	TRUE	25	AATTCCATTCATTCGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947085	915570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915776_915851_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936245_937354_937490_939095_939164_941152_941310_946949
774334	contig_4640_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_147970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATGTAAAAAGGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405224	405537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_405200_405500
774335	contig_12019_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_87645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	116	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	296	310	5215	5201	FALSE	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIPEVDEQPHPKEEQTQNQAPDSTQHLALCRFRLCPPFRCERARQAWVLHLAGVNLSTLRNGFKHHRVWKVQSPFWIRPVETTPASSSWPFRNHVTSMWPG	6225	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114
774337	contig_15105_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_150936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTCATTTCAATTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312442	314877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_312400_314900
774338	contig_10734_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_51390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGCGTGTCCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1958127	1959395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1958100_1959400
774339	contig_17814_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_168522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGTCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92149	90384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_-_90400_92100
774340	contig_6954_pilon	+	1147	2	Intergenic	novelGene_64434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTACAAAGCTTTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257139	259535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_257209_258457
774343	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774344	contig_10877_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_166215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGCGATATCAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81506	83929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_+_81500_83900
774345	contig_11702_pilon	-	974	8	Intergenic	novelGene_142014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	83.2284782501563	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	336	866	534742	531292	FALSE	15	GGGGAATCTGTGTGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDPDDVPHGHITSLAVKRSHRRLGLAQKLMDQASRAMIENFNAKYVSLHVRKSNRAALHLYSNTLNFQISEVEPKYYADGEDAYAMKRDLTQMADELRRQLELKEKGRHVVLGPIENKVEAKGNSLPSSGEACREEKGLAAEDSGGDSKDLSEVSETTESTDVKDSSEASDSAC	535769	531183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_531529_532311_532397_533590_533636_533818_533935_534024_534071_534740_534825_535017_535182_535680
774346	contig_10951_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_61632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178255	179412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_178300_179400
774347	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
774358	contig_10148_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_172862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACAACTGCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251153	249525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_249500_251200
774360	SIRV4	-	413	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1106	2	1106	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4052	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
774363	SIRV6	+	339	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	7	-73	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTCGGTCGCCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1847
774365	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	3	1173	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774366	contig_9679_pilon	+	1884	1	Intergenic	novelGene_173409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46029	47913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_46000_47900
774367	contig_12919_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_75901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	98	316	730995	731213	NA	30	AGTAGAACTGTTCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINKINQRNIRQNTRCSFNFLYRETTVPSHKAMNIIVTVIYLNIVSQTSWVIFKVKVQKNQVNPLSILESNVPVADLVIFILIWEAWRFKNSLWICKDTTTLLC	730897	732392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_730900_732400
774368	contig_12919_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_75902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATAATATATAGCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732444	732894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_732400_732900
774371	contig_16970_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_157603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTTCATATTCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95922	93763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_93800_95900
774372	contig_5936_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_53556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTAGCCAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118078	117570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_117600_118100
774374	contig_9440_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_59051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAGAAGAAGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475325	473406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_473400_475300
774376	contig_14441_pilon	+	854	6	Intergenic	novelGene_100616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.745719354084	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	367	789	116728	117610	TRUE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGNTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111214	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111385_111992_112040_116578_116957_117220_117344_117539_117622_117743
774380	contig_10541_pilon	-	1521	7	Intergenic	novelGene_144651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	177	junction_6	200.672549747648	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	295	963	312553	269572	FALSE	50	CACACATCTATACAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYATSLQNLCNQVDKESTVQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGIHQQIEAEMIKVTKTELEKLKSNYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKEIEKAKERYDKATMKLHILHNQYVLALKGAQLHQNQYYDTTLPLLLDSLQKMQEEMIKAL	394507	269013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_269760_291958_292059_295162_295337_312346_312616_344086_344157_374167_374310_394487
774382	contig_5551_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_134226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCTGGCAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230549	232825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_230500_232800
774384	contig_3529_pilon	+	1094	7	Intergenic	novelGene_105348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCCCTGAACAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525463	544866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_525990_526073_526140_529070_529187_538753_538900_540621_540760_541783_541844_544824
774388	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774389	SIRV2	-	546	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4317	44	3142	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
774390	contig_15350_pilon	+	2231	17	Intergenic	novelGene_164257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	922	1329	254333	254740	TRUE	10	TTCCTGGCCCTCAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRIRAAIKFRSTLSSSIICKTFTVLAEYLSELNRHNKTRGKDYVVYYDKVSCDLNCYKILILNSTCNWGNILWREENHWVIAFESQTAPFSWSTRCAVLQLNMHKDNPCFGLVVQPLGSHFQTHYTYLLRSSLT	235440	269870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_235515_236554_236642_236775_236953_239985_240082_240778_240897_247254_247401_248392_248458_250253_250308_253845_253936_254318_254858_258848_258924_261463_261637_261788_261867_262588_262665_265017_265190_266574_266615_269699
774391	contig_10297_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_112548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570169	567862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_567900_570200
774392	contig_3233_pilon	+	936	8	Intergenic	novelGene_56565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_3	307.590836093957	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	335	808	743801	747909	FALSE	20	CACTCCCCAATGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738721	748037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
774397	contig_12278_pilon	-	1801	4	Intergenic	novelGene_152581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	63.8035178410163	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	774	1268	110010	107788	FALSE	20	AATTTGAGTTTTATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAQPPHNGPVLQVRRPRLRGYANEVGEAFRSLVPAAVVWLSYGVSSSYVLADAIDKGKKAGDMSSPEASRSTRVTVAVVDTFVWQALASVAIPGFTINRVCAASLYVLGTATRWPLTARKWTTTALGLLLIPVIVHPIDRSVDFLLDSSLRKLYPSVEKPSSS	110783	107254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_107861_108921_109155_109695_109824_109949
774399	SIRV6	+	338	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	14	-244	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	155	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774402	contig_14647_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_167375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATACACATTCTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61335	60842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_60800_61300
774403	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	6	409	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	596	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774405	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774410	contig_15371_pilon	-	2118	3	Intergenic	novelGene_151449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164151	154610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_155213_160079_160241_162796
774411	contig_91_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_127148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207378	1209285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1207400_1209300
774412	contig_5799_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_50287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCATAAGGAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343602	341992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_342000_343600
774416	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_96788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774418	scaffold_19766_pilon	-	1771	4	Intergenic	novelGene_34312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	12.7627931460511	233	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	42	1235	562906	559754	FALSE	15	CAGTGGCCCCCACACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHAVPSPPSLLHFMGRVPRSSSSSSGIEARTGMPLSLMNSTQPSTAGMRWCLPFQLPYRVPRAHFQSLQLPQLPLHPRLPPLDIANVAGLPASRRQGPGVEARVPRKKAEGVGGGRYHHHPLPAAGFKKQQRKFQYGNYCKYYGYRNPSCEDGRLRVLKPEWFRGRDVLDLGCNVGHLTLSIACKWGPSRMVGLDIDARLIHSARQNIRHYLSEELRLPSQTPEGDPGAEGGEGTATIRKRSCFPASLTASRGPIAAPQVPLDGADTSVFPNNVVFVTGNYVLDRDELVEAQTPEYDVVLCLSLTKWVHLNWGDEGLKRMFRRIYRHLRPGGILVLEPQPWSSYGKRKTLTETIYKNYYRIQLKPEQFSSYLTSPEVGFTSYELVATPHNTSKGFQRPVYLFHKARSPSH	562947	559217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_559807_559931_560059_560244_560464_562111
774425	SIRV6	+	155	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	54	787	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
774426	contig_20951_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_43124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242894	244911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_242900_244900
774435	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774436	contig_16724_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_105324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCCAGCTCAAACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556468	554295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_554300_556500
774438	contig_9516_pilon	+	2538	7	Intergenic	novelGene_106183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTACCTTTAACACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882356	898375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_884297_884628_884735_888747_888857_889790_889861_890726_890818_896961_897060_898251
774439	contig_8058_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_149514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	123	575	61884	61432	NA	40	TAGATCAATTCTAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	62006	60637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_60600_62000
774440	contig_5084_pilon	-	2073	13	Intergenic	novelGene_64657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAGGGAGCAGAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486013	1476036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1476110_1480064_1480168_1480326_1480440_1480578_1480725_1480906_1481066_1481335_1481421_1481689_1481773_1482384_1482548_1482685_1482798_1482924_1483022_1484416_1484511_1484649_1484770_1485288
774441	contig_17522_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_160804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACTGACTGTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80744	80173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_80200_80700
774442	contig_6375_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_72990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAAGTTGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297680	299302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_297700_299300
774443	contig_14744_pilon	-	2381	2	Intergenic	novelGene_66102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	157	384	1495554	1495327	FALSE	35	TGAAACTCTAAGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKADFLLNVRANLIFWCHQQLPKKQSRPSNDVSIPFSLWAEEKFKHHLTTRMQRIIQVSPLTMAFSMMSQILLRWCASIGCCLPKTLVIGRLGLVARRLSWCMHIAPTWCNNWFITSLVVIASSRR	1496095	1493329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1495564_1495948
774447	contig_12278_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_152592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGGTTACTCAGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189303	188781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_188800_189300
774448	contig_13868_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_172644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30076	32383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_30100_32400
774450	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_95773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
774454	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	440	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774455	contig_6364_pilon	+	1395	5	Intergenic	novelGene_51770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	976	1395	929858	931339	FALSE	10	CTTCCGCCTCCCGACTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSNWSTLYNQLKRVCDRAGLARRFKRVSARGRGGRAEGEGSAGTAAHTKKGRRGEKRLEARPAERPLLCGKRRQGRINPATHLQRLATRPDRLSYLPGMLRRLGRPCCRIAAFREAQLLRDPQARPTGLHYIPPAHAA	902341	931339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_903076_904266_904362_906461_906559_929808_929896_930957
774456	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_93512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653754	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774460	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
774462	contig_12279_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_50139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAACCTTTGGAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103525	104941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_103500_104900
774464	SIRV4	-	215	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1308	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
774465	contig_7694_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_159942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1225	1560	307205	307540	NA	10	AGTGATTTTGTGTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDLFHLDFFPLNVNFPDTVYPIVRPEFVQLVKTLLVYTLRKPNRSHGTTAKKASSCTSALQSQDSLWIVPNTEFGKGRKSQILMGLFPGSYMSEALIIWRESFFFFFLLN	305980	308008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_306000_308000
774466	contig_10904_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_22447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGGCAGCAGAACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134738	135257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_134700_135300
774471	contig_9895_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_144692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTAAAAAATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155930	156433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_155900_156400
774475	contig_13702_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_102656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTGCTAAATCTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246283	245233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_245200_246300
774476	contig_13702_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_102655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGGGTCTCAGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245233	244304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_244300_245200
774481	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	33	365	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14441	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
774482	contig_6710_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_93485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
774483	contig_990_pilon	-	2050	5	Intergenic	novelGene_76126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	100.579570490234	1	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	4	528	1605903	1586999	FALSE	20	TTGTTTGTACTTAGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTIPLLYGILAHFLHGSKDGIQNAFLKGPSLQHPSPNFGRQPSRRKQMDDHLGKGKGKSINVEDLDVSQAVKR	1605906	1585476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1587076_1591042_1591180_1598929_1599015_1601437_1601636_1605875
774484	scaffold_880_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_121470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464311	464999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_464300_465000
774485	contig_1641_pilon	-	2857	1	Intergenic	novelGene_172792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	742	1230	6145	5657	NA	40	AGGGGAACTTTAAGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPDNPQRCHQITSKSTSRRSTHLRHHHLKGKLPQKIHNPVPIKDFSRSPVRETGFLEESIPLHLLYIAIYNKHLAAYLTPVSELAIAEGGSNLRYCGNKFGGPYGELKPLETQWPQGRACDRLTALLTSGCERFHLPLGRLSARPGSVTAPLVPNCAKRGG	6886	4029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_-_4000_6900
774488	contig_12790_pilon	+	2196	15	Intergenic	novelGene_35300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	19.8762754692777	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	178	1782	647032	672907	FALSE	40	CCAAAAGCCTTAAAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPQVSMLLMAWFGVLRCVGAEFFTSIGHMTDLIYAEKDLVKSLKEYILVEEARLSKIKSWANKMEALTSKSAADPEGYLSHPVNAYKLVKRLNTDWPALEDLVLQDSAAGFIANLSVQRQFFPTDEDEMGAAKALMRLQDTYKLDPDKISKGELPGTKYQATLSVDDCFGLGRLAYNEGDYYHTVLWMEQVLKQLDAGEEGTTAKTQVLDYLSYTVFQLGDLHRALELTRRLLSLDPSHERAGGNLRYFEHLLEEEREKVLSNQTTEAEPATQEGIYERPVDYLPEREVYESLCRGEGVKLTPRRQKRLFCRYHHGNRTPQLLIAPFKEEDEWDSPHIVRYYDVMSDEEIERIKEIAKPKLARATVRDPKTGVLTVASYRVSKSSWLEEDDDPVVAQVNRRMQHITGLTVKTAELLQVANYGMGGQYEPHFDFSRRPFDSGLKTEGNRLATFLNYMSDVEAGGATVFPDLGAAIWPKKGTAVFWYNLLRSGEGDYRTRHAACPVLVGCKWVSNKWFHERGQEFLRPCGSTEVD	638942	673321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_639102_647013_647114_647640_647738_648111_648264_651173_651312_652327_652568_653833_654031_654826_655004_660367_660439_660684_660785_664682_664737_665172_665233_667265_667335_667912_668010_672836
774493	contig_7057_pilon	+	770	4	Intergenic	novelGene_123354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_3	262.553275017133	108	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	331	768	943281	943718	FALSE	5	GGCATCTGCCTCCCGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLF	941207	943720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_941288_941405_941523_942970_943030_943206
774495	contig_17212_pilon	-	2082	3	Intergenic	novelGene_88603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	3.5	94	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	374	712	30530	30192	FALSE	15	GTGTGGGAGTGATCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCSPGLCSAAQPSCWDGSSSTMQFFKSPLTLLFASPVVFCHCEDFGLAQGSASVLSEEGLQERPTSPSFPPHPLVSLALHVSGNQYLIDTLEPFQNILLGHSSWKTLVLA	120850	28821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_30743_38529_38674_120833
774501	contig_11631_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_104192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGTTCTACAGATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119929	120274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_119900_120300
774507	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	900	-30	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
774508	contig_6446_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_149270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820715	818312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_818300_820700
774510	contig_8520_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_85459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTCCAAGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320897	319911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_319900_320900
774511	contig_10765_pilon	+	1937	4	Intergenic	novelGene_122902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	74.9414586342047	224	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	157	546	112611	117362	FALSE	20	ACATTTACAGGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTPTSWRKLTNGTRKEALENNYEVLFREPATRWKFNVPELARRNIHGVPREKIHRMKEQYEHGVTFHSVLHAEKPSWATGSQDRNTAAPSEGAGDWRACAEFPSRRAPGGFASDSFFSRRGGCHRGY	99768	118753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_99851_112536_112665_115931_116009_117103
774512	contig_7272_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_25327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554654	556164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_554700_556200
774514	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	0	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774520	contig_13740_pilon	+	2504	1	Intergenic	novelGene_34605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTGATTACAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151358	153862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_151400_153900
774522	contig_1551_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_173424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTCTGACTCATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402930	403813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_402900_403800
774525	contig_12638_pilon	-	745	5	Intergenic	novelGene_33324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	713.149484680456	557	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325637	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534_1303703_1304003_1304087_1310601_1310678_1325582
774530	contig_5988_pilon	-	2201	2	Intergenic	novelGene_15866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295589	291662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_293614_295339
774533	contig_5551_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_134212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23464	21316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_21300_23500
774535	contig_20634_pilon	-	1794	1	Intergenic	novelGene_173428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGACTAAAAAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230536	228742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20634_pilon_-_228700_230500
774538	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	3	412	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774540	contig_6494_pilon	-	1013	3	Intergenic	novelGene_108543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1265	junction_1	845.5	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	113	406	3457	3164	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGEQLGMLRVEGILGIRVVFHVHLRVWEIHLRSSSAMFVFLGFIG	5648	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_3486_5564
774544	contig_13850_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_141171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1841	2206	99311	99676	NA	90	AAAAAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRMWMLSETWSTAPGASWSSLCKAGPELPAWQGVMCGDAVFQNIAQSLTHCGYPVHTSCCNIIPIKPKPIAVESILTHSNPIGQSRTAPQDFQGVPGGFELPTFWLAAEPLTTVPRGFPL	97470	99947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_+_97500_99900
774546	contig_2444_pilon	-	578	4	Intergenic	novelGene_83758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	1717	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	86	394	229702	227685	FALSE	20	GGTTAATTTTTGTTTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTCLESGIAGLFLRWDRESRVPAAATRGMAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229787	227500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
774548	contig_14017_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_165686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	99	467	32324	32692	NA	55	TAAATCAGAAAATATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILTKRNIFSHSLVDYKSKFRVSAPGGSFLCQLWRKVLVINISLVKKLLSTGTPGPKDTLCSWCFFLGGVRSPTLCFLPFPFISCKVKGDAGHTPGKLPSHWIRDVTLVRVLQSNPKSSNII	32225	32915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_32200_32900
774550	contig_6871_pilon	-	2052	14	Intergenic	novelGene_21659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	8.81902193721016	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	189	1667	784881	780734	FALSE	25	CATAAGAGTTCTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGMQLYKNYQQAQSRHLRPSCLGSPPLKKTNHRLSLPTPSSGSSLSAAIHRTQPWFHGHISREESQRLIRQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL	789445	780348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781196_781300_781389_781511_781573_781977_782059_782347_782447_782687_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_789262
774552	contig_8873_pilon	-	2589	20	Intergenic	novelGene_162894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	89.9222193907947	65	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1281	2438	109555	90274	FALSE	75	ATAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMDFCRQDEKCNYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMASVYLIKGETLRSEMSERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEMYINRDYSKIFTENLVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGQWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQIGLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP	191174	90122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_90430_90602_90729_90840_90988_92171_92277_93268_93335_95895_96010_97035_97099_98272_98415_104115_104242_107794_107900_109547_109670_111263_111390_115840_115943_122893_122992_131520_131585_133878_133992_137123_137289_148379_148517_152452_152545_190905
774555	contig_13700_pilon	-	2135	8	Intergenic	novelGene_68269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	303	junction_1	239.932728667254	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	691	1581	85406	75730	FALSE	10	TATCGGCAGTGTTTTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEEGETADTVGCCSLRVEHISLHPELDGQEYVVEFDFLGKDSIRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLNTGILNKHLQDLMEGLTAKVFRTYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNHQRAPPKTFEKSMMNLQSKIDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMKLEVQATDREENKQIALGTSKLNYLDPRISVAWCKKWGVPIEKIYNKTQREKFAWAIDMADENYEF	86096	75175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_75833_77159_77310_77539_77635_81021_81150_82446_82562_83117_83187_84246_84433_85361
774558	contig_7202_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_18299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27634	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
774559	contig_13481_pilon	-	1426	7	Intergenic	novelGene_119415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_6	260.415479997296	387	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	381	845	737129	726193	FALSE	10	TTGAGTGGCTTTTGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKIWSLYDAGPRSIRCPLIFLPPVSGTADVFFRQILALTGWGYRVIALQYPVYWDHLEFCDGFRKLLDHLQLDKVHLFGASLGGFLAQKFAEYTHKSPRVHSLILCNSFSDTSIFNQTWTANSFWLMPAFMLKKILLGNFSSGPVDPMMANAIDFMVDRLESLGQSELASRLTLNCQNSYVEPHKIRDIPVTIMDVFDQSALSTEAKEEMYKLYPNARRAHLKTGGNFPYLCRSAEVNLYVQIHLLQFHGTKYAAIDPSMVSAEELEVQKGNLSISQEEQ	747647	725611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_726310_727424_727566_736198_736307_737030_737140_740361_740508_742598_742680_747504
774560	contig_12079_pilon	-	1351	4	Intergenic	novelGene_67388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	3.29983164553722	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	23	304	471245	463585	TRUE	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGAGGKMEDYQAAEETAFVVDEVSNIVKEAIESAIGGNAYQHSKVNQWTTNVVEQTLSQLTKLGKPFKYIGNGLLFLTDFASGSLHTDWRLVRARKEES	471267	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_462525_462981_463798_467104_467147_471218
774562	contig_7157_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_131306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAAGCAGGGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938772	940184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_938800_940200
774563	contig_19132_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_170006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	782	1105	455237	455560	NA	25	AAGTAGATTGCCAGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCPPNDNICEDSQLSSLILPFCSLSNRDQFSPTNTVKHQDVSDNHYSHEDPKFSTPAQIPITRTLPQEVMWHKKKKKKKKIQMRKNKGQKGIRLSQWGQASLKWD	454455	456083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_454500_456100
774569	contig_7457_pilon	-	1846	5	Intergenic	novelGene_31464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	207.706975087502	311	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	34	534	517045	498985	FALSE	10	CTGGGAAGGCTGCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVVALLCVPWMLLFKPLVLRHQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLALFFIFAAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE	517078	497672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_499079_505780_505953_506246_506324_512202_512304_516988
774570	contig_19182_pilon	-	1873	2	Intergenic	novelGene_165579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCGCACAATTAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17432	14407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19182_pilon_-_14756_15907
774571	contig_253_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_129671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	111.73281622792	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	105	599	395536	393040	FALSE	70	AGAAAGAAAACCACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARRLLGGSLPARVSVRFSGDTTAPKKTSFGSLKDEDRIFTNLYGRHDWRLKGAQSRGDWYKTKEILLKGPDWILGEIKTSGLRGRGGAGFPTGLKWSFMNKPSDGRPKYLVVNADEGEPGTCKDREIMRHDPHKLVEGCLVGGPGHGRPCCLHLHPRRILQ	395640	392336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_393209_394069_394241_394312_394396_395464
774572	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
774574	SIRV6	+	306	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	603	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_3065
774575	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	57	520	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
774577	contig_57_pilon	+	706	5	Intergenic	novelGene_44910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	254.493123679207	35	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	145	705	129609	145445	FALSE	40	TAAGTGATATTTAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQ	129464	145446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_129617_135169_135264_136312_136444_143094_143303_145325
774580	contig_5062_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_157846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCAGTTTCTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636244	638958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_636200_639000
774581	contig_8065_pilon	+	2496	1	Intergenic	novelGene_107335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTGACTCAACGGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143387	145883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_143400_145900
774585	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	495	-1	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
774587	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
774590	contig_5954_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_28743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTCTCTGCCCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259451	1258300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1258300_1259500
774591	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
774593	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	133	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774595	contig_10861_pilon	-	879	6	Intergenic	novelGene_39360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1868.4912202095	86	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	19	300	1585418	1583098	TRUE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVRLRA	1585436	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1583107_1583232_1583349_1584525_1584677_1585412
774597	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774598	contig_8801_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_66311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	337	495	585164	585322	NA	20	AAGGGTGCATCCTTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEELGEEEEVEEEGDVDDSDEEEEEEEEESSSEGLDAEDWAQGVVEAGGSFGGYGAQEEAQCPTFHFLEGEEDSESDSEDEEEDEEEDDEDEDEEDEEDGDEVPVPTFGEAMAYFAMVKRYLTSFPIDDRVQSHILHLEHDLVHVTKKNHARQVGVWGFGHQS	584827	586143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_584800_586100
774600	contig_14326_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_120663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAAAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56482	56130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_56100_56500
774602	contig_13412_pilon	-	1513	2	Intergenic	novelGene_79999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	24	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACATCCTCGACAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179564	160904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_162284_179430
774603	contig_8122_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_40190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTACCCTCCCAGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81402	79623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_79600_81400
774604	contig_2069_pilon	-	1737	7	Intergenic	novelGene_23334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	37.6386326354541	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	372	710	590815	588076	FALSE	10	CCAGATGGTGCCCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVSVGAFVKTWLPFILLLGIILTISLVLNLR	595508	587048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_588164_588940_589072_589149_589247_590792_590827_591806_591952_592127_592213_595378
774605	contig_7165_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_116857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGAGCTCGCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367923	365772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_365800_367900
774607	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	51	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
774610	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_95064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653844	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774611	contig_2093_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_152945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCAGTTCTGGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961082	962720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_961100_962700
774612	contig_6837_pilon	+	1407	11	Intergenic	novelGene_149814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	29.69579094754	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	147	578	11753	15096	TRUE	15	GTATGTTGGTAATTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQKVQWPC	11606	17337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15075_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
774613	contig_2867_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_135218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034078	1035420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1034100_1035400
774624	contig_17993_pilon	-	2387	3	Intergenic	novelGene_61941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACTTTAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105417	102313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_102931_103166_104202_104682
774629	contig_2380_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_117905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516828	515285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_515300_516800
774633	contig_13293_pilon	+	1999	2	Intergenic	novelGene_146435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCACGGGTGGAACGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156005	160919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_+_157790_160704
774634	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	384	-1	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
774637	contig_15248_pilon	-	1000	11	Intergenic	novelGene_149145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	48.817619769915	83	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	37	999	209849	5723	FALSE	30	TATATACAAATTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEEPADGGQSLPPVYIYSPEYVNMCDSLAKVPKRASMVHSLIEAYALHKQMRIVKPKVASMEEMATFHTDHPDSIEYGLGYDCPATEGIFDYAAAVGGATITAAQCLIDGKCKVAINWSGGWHHAKKDEASGFCYLNDAVLGILRLRRKFDRILYVDLDLHHGDGVEDAFSFTSKVMTVSLHKFSPGFFPGTGDVSDVGLGKGRYYSVNVPIQDGIQDEKYYYICESVLKEVYIAFNPKAVVLQLGADTIAGDPMCSFNMTPVGIGKCLKYILQWQLATLILGGGGYNLANTARCWTYLTGVILGKTLSSEIPDHETN	209885	5721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_5729_29413_29509_32449_32623_96877_96987_97783_97862_101886_102000_205024_205167_205881_205910_205957_206013_209143_209197_209738
774638	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8130	-1	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
774640	SIRV6	+	343	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	429	101	263	69	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
774643	contig_8453_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_125104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAACAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46614	49024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_46600_49000
774644	contig_9871_pilon	+	953	7	Intergenic	novelGene_75701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1577.48728644287	8819	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	90	320	572939	579939	TRUE	25	TAACATTCTACGTCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTPPEQPDRKRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRESKSESFSITFTFGGRMPGNPLTLSDQGSSRLSPLKRYRYCR	572849	584407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575275_579914_579992_581756_581826_582912_583040_583534_583630_584117
774649	contig_7051_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_64307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGAAGGTCTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210184	210663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_210200_210700
774650	contig_7051_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_64308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGAATCTTCTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210613	210961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_210600_211000
774652	contig_7410_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_106123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATAAAATACCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630699	629334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_629300_630700
774653	contig_6533_pilon	+	1349	8	Intergenic	novelGene_114655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	37.320454532744	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	64	804	215455	236125	TRUE	20	CCTCACATAATTCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLKLLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQIFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDLYGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKVSIAATVIYAYAWLVPLALWGFLMWRNSKVMNIVSYSFLEIVCVYGYSLFIYIPTAILWIIPQKAVRWILVMIALGISGSVLAMTFWPAVREDNRRIALATIVTIVLLHMLLSVGCLAYFFDAPEMDHLPTTATANQTVTAAKSS	215391	246777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_215473_224459_224541_224786_224875_227139_227257_230502_230670_231042_231226_236038_236134_246240
774654	contig_11378_pilon	-	1456	6	Intergenic	novelGene_112241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	64.1230067916345	610	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	95	874	350123	341973	FALSE	20	TGGGAACTGTACTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGPGGCWARLPDGGGGLAGPESRPQQGSRKMLPSISVNSHMQGNGALNSRDAARHTAGAKRYKYLRRLFRFRQMDFEFAAWQMLYLFTSPQRVYRNFHYRKQTKDQWARDDPAFLVLLSIWLCVSTIGFGFVLDMGFFETIKLLLWVVFIDCIGVGLLISTLMWFISNKYLVKRQSRDYDVEWGYAFDVHLNAFYPLLVILHFIQLFFINYVILTDTFIGYFVGNTLWLIAVGYYIYVTFLGYSALPFLKNTVILLYPFAPVILLYGLSLALGWNFTHMLCSFYKYRVK	351280	341390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_342110_343679_343782_343867_344008_348976_349098_349843_350128_351190
774655	contig_10058_pilon	+	633	2	Intergenic	novelGene_67683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGAAATTGCACCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47340	48077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_47857_47960
774656	contig_6434_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_61875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864567	863009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_863000_864600
774657	contig_11978_pilon	+	2437	1	Intergenic	novelGene_62804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304152	306589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_304200_306600
774662	contig_4364_pilon	+	983	3	Intergenic	novelGene_180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	1277	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267023	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268743_1270204
774663	contig_15897_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_49531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATTTCCCGCTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549316	547811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_547800_549300
774664	contig_5649_pilon	-	1810	9	Intergenic	novelGene_82383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	68.6308057653413	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	20	766	1081983	1073009	TRUE	50	AGTCTTTAAAAGCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPASKMAAAAVCGAVGRAGWRLLQLRCRPVSRCRPPLAPRAFHASAVRLRSSDEQKQQTPPPLSPQHSETRGAEGPTPESSRSPPRYTDQGGEEEEDYESEEQLQHRILTAALEFVPAHGWTAEAIAEGAQSLGLSSAAANMFGNDGSELILHFVTQCNARLTRVLEEEQKLVQLGQAEKLIQAEPTESSIEQPCCFGGTEAQDRVSDSSSQASIRAAGTSALGVSKRQAHAFDPETHCFLFPLPGRGRQTGS	1082002	1068497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949_1073235_1073307_1073451_1076875_1077012_1078583_1078753_1081910
774665	contig_11742_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_166545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATCAACTCATAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129386	128495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_128500_129400
774667	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774668	contig_1146_pilon	-	305	3	Intergenic	novelGene_84861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCAGGGGAGATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956103	950973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_951112_951650_951730_956015
774669	contig_7171_pilon	+	1349	2	Intergenic	novelGene_101420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	417	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	296	715	1463736	1466970	FALSE	20	CATACATTGTTGTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSGLLRGLNTSLSCGLALAPRLWATRPMATLNQMHRQGPPKRQPRKLGPTEGRPQLKGVVLRTFIRKPKKPNSANRKCCRVRLSTGQEAVCFIPGEGHNLQEHHIVLVQGGRTQDLPGVKLTVVRGKYDCGHVQKKK	1463440	1467604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1463785_1466599
774672	contig_6710_pilon	+	519	2	Intergenic	novelGene_97689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCACAGTGATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653394	657174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
774681	contig_7816_pilon	-	1238	9	Intergenic	novelGene_66507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCGACTCTGGAAGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211765	170106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_170275_181010_181128_182011_182126_182984_183088_192900_193089_209098_209149_209282_209377_210625_210745_211480
774682	contig_4845_pilon	-	1112	8	Intergenic	novelGene_53682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1	495	937611	923330	TRUE	15	ACTCCATCCTCTACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWFGCSRWGDGTALCLLLICFCVGFNCLFFKAWLTKLYSLRSSESGPWSSYHNAGELGHGERFGYGCSLSIDDTDGVDGILGCGEGCRGELGQHDRPLDKLRSCKHGRRCWGNGNVILGHRLWSNLWKKVWTWSESGRGNKLWYFDGLRRCCLNPEPSHVGTHE	937611	803041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_803086_807468_807502_810593_810661_916630_916838_923063_923362_924520_924607_930190_930485_937528
774683	contig_15741_pilon	-	1080	5	Intergenic	novelGene_159664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	633.850682337725	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	389	541	50351	50105	FALSE	0	CCCCCGCCTTGTCTGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLFPVRTGALVPGTGPWEGLRLGLVEKDVFWDETWAVQYTAGTLCICCFVSASAVKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60486	49565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60318
774686	contig_7695_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_41544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	91.1201892496328	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	11	490	380076	376401	TRUE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVHAIGAGKRGTGPKSVR	380086	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376450_376501_376521_379664
774687	contig_5286_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_157370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCCCAGAAATTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573161	572460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_572500_573200
774691	contig_9345_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_24610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947909	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_946900_947900
774693	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	6	410	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774696	contig_5794_pilon	+	1688	12	Intergenic	novelGene_69797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	1286	1687	746963	749514	FALSE	10	CGCCTCTTCCAACTCGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTKIFFTVRWAPGFTESYKNSSLWFHYTPINLVWSCTHCCIHLFNTRVSHKTKAPGTFCLGVSHHLQNVPHFSKCSLKLSSVVSKLRPPINSFRNCSGSFGSWPSSPRRRRRRPESGWGRPGGGFTSILRPD	742777	749515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_743007_743210_743603_743709_743766_743881_743975_745177_745276_746054_746118_746213_746321_746402_746495_746807_747025_747105_747253_747345_747453_749428
774698	contig_6062_pilon	-	1895	3	Intergenic	novelGene_5295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	58	junction_1	17.5	55	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774900	769534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_771012_772256_772401_774626
774699	contig_8888_pilon	-	1530	6	Intergenic	novelGene_167762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	11.1427106217473	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	50	1015	162305	154697	FALSE	35	AAGCTATGAACACATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKKCTVIGGSGFLGQYMVEQLLATGYSVNVFDIRQDFENPQVQFFLGDLCSQQDLYPALKGVSTVFHCASPPPSSDNRELFYRVNYIGTKNVIETCKEAGVQKLILTSSASVIFEGVDIKNGTEDLPYAMKPIDYYTETKILQERAVLGANDPEKNFLTVAIRPHGIFGPRDPQMLPILIEAARKGKMKFVIGNGENLVDFTFVENVVHGHILAAERLSQDSAVCGKAFHITNDEPIPFWTFLSRILTGLNYEAPKYHIPYWLAYYLALLLALLVMVVRPVLVLRPTFTPMRIALAGTHHYYSCERAKSVLGYQPLVPMDKAVERTVQSFRHLRRVH	162354	154181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_-_155030_155968_156072_157256_157400_157652_157782_159707_159855_162194
774700	contig_3707_pilon	+	1763	3	Intergenic	novelGene_173431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	87	111	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	198	1373	405796	407526	FALSE	35	CAGTTCAGTAAAGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPSPLLSGGGRSWRPGSSGSGGRGGQRYKSSAPPEDLASVPTGFRPSTSQQERISSQRKTTSEVPMHRSAPSQTTKRSRSPFSTTRRSWDDSESSGSSLNIDNEDYSSTSRWRDTANTDEVHSDGLARRGRGESSSGYSELKYPEEKREARNDQVKPEKVPRRRRTMADADFWTYSDDYYKYCDEDSDSDKEWTAALRHKYRGREQNLSSSGESWETLPGKEEHEPEQPRANASASPSPGASASASNNGSNYLEEVGESSLQEEEPASLEEGEIPWLQYNGNESSSEGDNDSGHEFMHPGVFMLDGNNNLEDDSSVSEDLEVDWSLFDGFADGLGVAEAISYVDPQFLTYMALEERLAQAMETALAHLESLAVDVEVANPPASRESINSLPEILVTEDHSAVGQEMCCPICCSEYVKGEVATELPCHHYFHKPCVSIWLQKSGTCPVCRCMFPPPL	403189	407916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3707_pilon_+_403320_405728_405924_406478
774708	SIRV6	+	338	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	14	-244	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774711	contig_7022_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_142152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213694	215939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_213700_215900
774721	contig_14300_pilon	+	2322	15	Intergenic	novelGene_133130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	650	1189	398924	402567	TRUE	20	ATTGCTACTTCTATCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWASEKPLEWRRPSPLTELQQLFSSAAPGVQDDCFFNGCRFRTFHPPFGRGGMMTSVPLQSFAFPLASSALLLTVRLGEERVFSLRWNGLLLHGGQAHCGQELTSGLLSFILPAEITLFGKNAGDVLGGPLPTFVFHESLDNFESLKKTTQHSCFQFPHIHSHSDFSLGNSFSASALN	388980	442546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_389023_390598_390761_391532_391633_394188_394344_396027_396159_398864_399068_399604_399880_400885_401005_402565_402726_422707_422836_427259_427353_429716_429861_430486_430663_435726_435937_442322
774723	SIRV2	-	326	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4547	34	3372	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
774724	contig_7179_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_78214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGCTAGTAGTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695810	1694099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1694100_1695800
774725	contig_7179_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_78213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAAGGGTGTTGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1693795	1693255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1693300_1693800
774726	SIRV6	+	395	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	565	2	386	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	245	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774729	contig_3424_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_55601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTGTAATTCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340043	1342516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1340000_1342500
774732	contig_12427_pilon	+	2157	4	Intergenic	novelGene_40592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	86.6140866141299	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	15	863	624033	643842	FALSE	60	TCAGATATTTAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPVMEVSAACLFLVLLLGAWAPALGSASSEVLPLVNEDVKRTVDLSSHLAKVTAEVVLAHPGGGSTSRATSFLLALEPELEARLAHLGVQVKGEDEEENNLEVRETKIKGKSGKFFMVKLPFALDPGAKISVIVETVYTHVLHPYPTHITQSEKQFVVFEGNHYFYSPYPTKTQTMRVKLASRNVESYTKLGNPTRSEDLLDYGPFRDIPAYSQDTFKVHYENNSPFLTITSMTRVIEVSHWGNIAVEENVDLKHTGAVLKGPFSRYDYQRQPDSGISSIRSFKV	624018	645136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_624294_627551_627617_635029_635337_643626
774733	contig_13460_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_162190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGAGGCTATATCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288141	287720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_287700_288100
774734	contig_18637_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_81858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTCATTTTAGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189259	191256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_189300_191300
774736	contig_16907_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_87428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAAAAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348403	347300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_347300_348400
774737	contig_2480_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_63547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	629	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGGTAATACTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284525	283550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_283600_284500
774739	contig_10196_pilon	+	1710	8	Intergenic	novelGene_132308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	251.906283189213	114	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	563	1489	2352501	2374406	FALSE	0	CTGGGGTCTCGGCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2348272	2374627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348832_2352497_2352597_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2373412_2373581_2374264
774740	contig_7091_pilon	-	1967	4	Intergenic	novelGene_131768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGACCCACTTCCGGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373535	349678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_349871_354239_354394_368184_368283_372012
774741	contig_4654_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_103042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAATTTCCAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368135	370087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_368100_370100
774742	contig_10074_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_57204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACATTCAATTTATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603681	603408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_603400_603700
774743	SIRV6	+	249	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	31	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3161_10721_10819_11031_11109_11205
774746	contig_11115_pilon	+	1207	5	Intergenic	novelGene_102816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	707.033724443184	4	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	535	1116	172456	173241	FALSE	15	TCTGTGGCTTAATTCCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165341	173332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166438_172454_172595_172714_172964_173047
774751	SIRV1	-	179	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3648	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6464_6553
774753	contig_9345_pilon	+	1695	4	Intergenic	novelGene_24716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	11.6141675934562	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1164	1478	1004893	1005207	FALSE	20	TGGAAGCGGATCAGTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSLITSHLDLEQQEPHPKSPKVQLLLTSTISVQKSHRPGRPAISLVGQGSFQKCVLQNIPKEALVPESSVALYLPHSLIATPLPASAGPLATSVSCCLLPLC	1001766	1005424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1001995_1002351_1002407_1003969_1004234_1004276
774756	contig_20878_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_173445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGCTTATGAAAATACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29155	28164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_28200_29200
774768	contig_7229_pilon	-	1365	6	Intergenic	novelGene_39825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_5	219.093952449628	305	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	78	659	978686	899041	FALSE	20	ACCACCACCCATGCCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAARRSQTQREGLFAGWGGGFAMSDDDSRASTSSSSSSSSNQQTEKETNTPKKKESKVSMSKNSKLLSTSAKRIQKELADITLDPPPNCSAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFTPEYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYMTNRAEHDRMARQWTKRYAT	979888	898334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_899139_899986_900135_902753_902887_973898_973950_978534_978720_979844
774769	contig_6102_pilon	+	730	6	Intergenic	novelGene_31975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1222.8278047215	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGATTTGGTCCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413057	416201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414393_414550_414788_414877_414956_416018
774770	contig_16776_pilon	-	1086	4	Intergenic	novelGene_130506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	426.091017924053	141	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCCTGTCTGTTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57984	34680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_57706
774771	contig_2367_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_65331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGTAGGTAACCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223939	223133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_223100_223900
774774	contig_10196_pilon	-	1478	2	Intergenic	novelGene_132340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	45	422	2456023	2452194	FALSE	20	AGGAGGATGAGTTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSAPGAPDRRSHLMPARSGAQLSRRVGQKKQRLSEAERSRSLPDVARTPSPEEPCSGPHTCLGPPATTGPQRSIYFLSPKDHPARLGSEFFDQPGVRLARALLGQVMHTWLLGQMRPLQKKSSPRRCPWPGSHRQAYV	2456067	2451137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2452548_2455999
774775	contig_14017_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_165688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCCATTTTCATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50753	48801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_48800_50800
774777	contig_15182_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_136453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	69	305	465387	465151	NA	40	ACATCCAAAGCACTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSRRTNKSVLEEVQPEFSLEGRMARLHLMYFGHGIRKDQSIKKDIVFGKAEGQQKRGRASVRWTDTLATTLDSNIARILRMEQGGAVFPSVVYRVTMSWN	465455	463524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_463500_465500
774778	contig_990_pilon	+	1120	10	Intergenic	novelGene_76062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	108.723002892786	589	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	78	965	1067214	1091532	FALSE	15	GGCATTTGTTTAGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGAAGGLGLGRPPPPGPAWAPAFAMPLLVEGRRVRLPRSAVDLVRAHPSLEERARLLRGQSVQQVGPQGLLYVQQRELAVTSPKDGSISILGSDDATTCHIVVLRHTGNGATCLTHCDGTDTKAEVPLIMNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067136	1091687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082171_1082245_1082312_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087638_1087692_1090825_1090940_1091352
774781	contig_15084_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_116669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCATAACACAGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18791	69741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_18976_59154_59248_69616
774782	contig_6710_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_98284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	15	GAGGCATCCATGTCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
774789	contig_9578_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_67974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCTTCCCCGTAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074404	1075420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1074400_1075400
774790	contig_4732_pilon	+	1220	1	Intergenic	novelGene_75449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGGCTGGAAGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654142	655362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_654100_655400
774791	contig_12728_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_155807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTAAAGAAGAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191123	188683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_189980_190221
774793	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
774796	contig_20615_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_146918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATATCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212134	210131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_210100_212100
774797	contig_5642_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_153026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGGGAAGTCTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72503	71703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_71700_72500
774798	contig_5642_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_153027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTAAGCAAGTATGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72952	72445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_72400_73000
774801	contig_13945_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_173453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGAAGATACTGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61809	62939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_61800_62900
774810	contig_6102_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_32070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAAGCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727366	729463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_727400_729500
774811	contig_16666_pilon	-	1119	3	Intergenic	novelGene_61745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	270.5	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATACCTTGTCTGTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58195	55097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098
774814	contig_14322_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_116473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671373	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
774815	contig_6975_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_74274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	227	544	164861	165178	NA	60	AAAAAAAGTAATATATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLCLLSNFHSYSDLTIYLHSYANSLKLEFIQKLSVVPLSTHIKSVSQKQNEYYFDVGGKKWSLQKPEVNSEHIKLLLKGGGVYTSILTNSTLNTPQEQELKND	164634	165308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_164600_165300
774816	contig_4865_pilon	-	2175	5	Intergenic	novelGene_158165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	29.7689015585056	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	106	504	52874	22442	FALSE	40	AAGAAGTGTCTTGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGDSEPTPGCSGLGSGGARSRGGGSCDSWAPEDAWMGTHPKYLEMMELDIGDATQVYIAFLVYLDLMESKSWHEVNCVGLPELQLICLVGTEIEGEGLQTVVPTPISASLSHNRIREILKASRKLQGDPDLPMSFTLAIVESDSTIVYYKLTDGFMLPDPQNISLRR	52979	20770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4865_pilon_-_22463_22974_23117_49262_49399_49713_49796_52856
774823	contig_821_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_149386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84068	86171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_84100_86200
774825	contig_7728_pilon	-	1096	8	Intergenic	novelGene_64701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	463.342162104501	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	246	833	736028	713693	FALSE	25	TTTTTCTAACTGATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	752148	713429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716068_725023_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736065_751939
774828	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_95584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	657529	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657529	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
774832	contig_6710_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_96471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGGTCGGCATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653366	653734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
774836	SIRV2	+	406	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	116	1	-116	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCAACTTGGACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
774838	contig_4469_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_21920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACGGTCACCTGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505845	507887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_505800_507900
774841	contig_7035_pilon	+	698	5	Intergenic	novelGene_83540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	39.6319000301525	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	36	698	767969	769074	FALSE	15	GTGGCTCACTTCCAGCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGIAHQVVEQMVISDQIKAEDRANVLRALLLKHSHPSDEKDFSFPRNISAGSLGSLLGHHHGQGVESDPHVTEPLIGGVPETRLEVERERELLPPAPPAGITRSKSKHELKLLEKIPENAEATVVLVGCVEFLSRPTMAFVRLREAVELDAVLEVPVPVRFLFLLLGPSSANMDYHEIGRSISTLMSDKQFHEAAYLADEREDLLTAINAFLDCSVVLPPSEVQGEELLRS	767933	769074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_768040_768142_768309_768435_768551_768645_768831_768948
774842	contig_8050_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_114842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGTGGAAAATAATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344885	346250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_344900_346200
774845	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_93505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653751	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
774846	contig_10765_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_122906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCAGCAGAACGTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112555	115329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_112600_115300
774850	contig_14363_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_112525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAATCTGAATATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10460	10797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_+_10500_10800
774854	contig_9578_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_67964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGACACCACTATCGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052330	1054724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1052300_1054700
774857	contig_1337_pilon	-	2297	3	Intergenic	novelGene_84252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_1	21.5	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAAAGATTTAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450284	442865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_444523_445308_445630_449965
774860	contig_20141_pilon	+	1492	11	Intergenic	novelGene_173465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_10	22.1936927977297	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1086	405	1490	15621	39592	FALSE	45	TGTGGAAATCAAAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLSEDPLGKILASIYLPKSLRERLHLNNLQTILFNFFGQTSLFKIKNFTKALTTYVVSASISDTSIQNLADPVVITLHHIEGSPNYGQVHCAFWDFGKNNGLGGWNSSGCKVNETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDTVNERILVLITYAGCGISSIFLGIAIVTYIVFHKLRKDYPSKILINLCTALLMLNMMFLVNSWSASFQKVGLCITAAVALHYFLLVSLTWMGLEAVHMYFALVKVFNIYIPNYILKFCLVGWGIPAVMVAIILSVKKDLYGTLSSGTPFCWIKDDSIFYISVVAYFCLIFITNLFMFCAVIVQLNSVKAHSQKTRRKMILHDLKGITSLTFLLGLTWGFAFFAWGPVRILFLYLFAIFNTLQGFLIFVFHCAMKENVREQWQIHLCCKWFRLDNSSDVSSRCGLNVGYKQEKSRKTFEHKLLTPSLKSTTTNSTFKSLGCTQGTPSEISFPSDGFDEDPLSCEVVANCGRSIL	6934	39594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20141_pilon_+_7072_12034_12155_13309_13356_15519_15624_18320_18443_22450_22720_26749_26829_29201_29483_35827_35930_37077_37246_39530
774863	contig_10003_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_88176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAAAAAAAAAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423763	425487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_423800_425500
774866	contig_1225_pilon	+	1487	4	Intergenic	novelGene_44159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	246.54456437371	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTGACAGTTGTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250601	276760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253552_274360_274947_276232
774868	contig_8064_pilon	+	1549	3	Intergenic	novelGene_164556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	92.5	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	204	365	117228	118008	FALSE	25	TCTGCAAATCCACTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYGAQYGFSLSAFSQASEPVSCTWWQLHLDPHLNVYSPSLPGNSNPRRNQLINLNHYATKKSVAESMLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIDL	101588	119192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_117149_117382_118000
774873	contig_4114_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_15594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242880	240848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_240800_242900
774879	contig_12864_pilon	+	1172	5	Intergenic	novelGene_76400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	819.08832704416	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGCAGTTTCTGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224987	229314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225085_227086_227169_227822_228623_228901_228946_229165
774880	contig_3942_pilon	+	1764	14	Intergenic	novelGene_128816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	157.314256022552	373	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	27	1460	1060476	1072979	FALSE	10	TCCCTGGTCCAACTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFRELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCIPAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKLSEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIAEQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSSTFSIKKIRFLVLDEADRLLEQGCTDFTADLEAILGAVPACRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVRTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQGFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFNFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGMAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLDEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEATSFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKTELAKIRQKNRRFKEKVEQTLQRQKARVPQSPAHPGPGLSPPQPPST	1060449	1073283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1060591_1067851_1067976_1068944_1069031_1069113_1069236_1069385_1069574_1069654_1069796_1070818_1070895_1071136_1071214_1071329_1071428_1072218_1072294_1072448_1072538_1072617_1072690_1072769_1072873_1072911
774881	contig_4626_pilon	+	2322	6	Intergenic	novelGene_158816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11682	40224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_12258_15748_15993_23916_24115_35203_35287_36761_37245_39485
774883	SIRV5	+	326	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-1	880	-1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8314	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
774884	contig_10734_pilon	+	1938	9	Intergenic	novelGene_51214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	62.7443971602246	4	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	295	585	1151426	1160121	TRUE	45	CCGCTAATGCCAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFGDLELFEAFDHPEESIPKPVHTRFKDDDDDDDEEEEEENGVGDAELRERLRQCEDTIERLRAENQELKRKLNILTRPSGILVNNTKLDGPLLQILFMNNAISKQYHQEIEEFVSNLVKRFEEQQKNDVEKTSFNLLPQPSSIVLEEDHKAEEPCAITNNTEAFSAKAPLFQLWFGRASNERLPNASECCSNI	1147095	1163037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1147292_1148784_1148828_1151370_1151446_1153410_1153517_1154923_1155002_1159501_1159563_1160095_1160239_1160513_1160657_1161944
774886	contig_5954_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_28608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_1	466	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	178	393	945420	945083	FALSE	10	CCATCCGTCCTTCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	946280	944721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209
774891	contig_8597_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_158705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAGAGTAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51839	52685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_51800_52700
774892	contig_12080_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_128373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTGTAGGACAGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141890	141485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_141500_141900
774893	contig_11825_pilon	+	2137	2	Intergenic	novelGene_155423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	0	53	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACACCTCTCCTGTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129566	132142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_131061_131499
774894	contig_19098_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_65835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCCTGGGGCAGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399436	398838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_398800_399400
774895	contig_1867_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_54542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAGAAAGGTAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363676	361648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_361600_363700
774897	contig_10235_pilon	+	808	5	Intergenic	novelGene_46334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	606	junction_1	140.139885471624	235	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	273	713	109310	111229	FALSE	10	TCCAGTCAGCTTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLCTPSGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKKKYMEFDLNGNGDIDIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKMILMYEEKAREQEKPMGPPAKKAISELP	109037	111324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109394_109485_109553_109932_109975_110144_110308_111144
774898	contig_5988_pilon	+	2015	4	Intergenic	novelGene_16021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	175.74476442336	2	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	534	1424	785923	786813	FALSE	25	TGGCAAGGGCTTGGAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779389	787404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783511_783653_783803_785838
774900	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	23	1156	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
774902	contig_10756_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_170660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTCAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55061	55959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_55100_56000
774903	SIRV6	+	241	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8476	-1	263	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTACAAATGTTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	2803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
774911	contig_12644_pilon	+	1050	7	Intergenic	novelGene_44442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	299.888544110789	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	143	685	335374	372183	TRUE	5	CTCTTTATTTTTCTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDKRIHLELRNRTPSDVKELVLDNCRSIEGKIEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSVANLPKLNKLKKLELSDNRISGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDLFNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDGGGGR	335231	375375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_335428_367593_367744_367994_368118_370700_370900_372166_372212_374741_374806_375102
774914	contig_14142_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_120442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTATTGCCACTCTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84918	85965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_84900_86000
774921	contig_16205_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_156888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTAGAACTCAATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109575	110027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_109600_110000
774923	contig_7704_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_154625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAATGGTTAAGCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356431	356230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_356200_356400
774924	contig_4845_pilon	+	1977	9	Intergenic	novelGene_53604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	59.9039595936696	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	96	1199	96050	114135	FALSE	55	AATAAATTCAGAGAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDDSEWMKLPVDQKCEHKLWKARLSGYEEALKIFQKIKDEKSPEWSKYLGLIKKFVTDSNAVVQLKGLEAALVYVENAHVAGKTTGEVVSGVVSKVFNQPKAKAKELGIEICLMYIEIEKGEAVQEELLKGLDNKNPKIIVACIETLRKALSEFGSKIILLKPIIKVLPKLFESREKAVRDEAKLIAVEIYRWIRDALRPPLQNINSVQLKELEEEWVKQPTGAPKPTRFLRSQQELETKLEQQQSAGGDAEGGGDDGDEVPQIDAYELLEAVEILSKLPKDFYDKIEAKKWQERKEALEAVEVLVKNPKLEAGDYADLVKALKKVVGKDTNVMLVALAAKCLTGLAVGLRKKFGQYAGHVSYTPV	71929	114913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_71988_96012_96107_100721_100916_102411_102619_105993_106166_106782_106916_107302_107404_109208_109323_114009
774925	contig_8308_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_173471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACATTTTTGTACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36290	35292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8308_pilon_-_35300_36300
774926	contig_8308_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_173470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCCAAGCCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34336	33541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8308_pilon_-_33500_34300
774927	contig_4364_pilon	+	2415	10	Intergenic	novelGene_151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	44.5723160495917	235	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1218	2036	1221901	1224643	FALSE	20	CTCATCGTCACGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIACLHEQKLVRHVVSQNCDGLHLRSGLPRTAISELHGNMYIEVCTSCIPNREYVRVFDVTERTALHRHQTGRACHRCGAQLRDTIVHFGERGTLGQPLNWEAATAAASKADTILCLGSSLKVLKKYPRLWCMTKPPSRRPKLYIVNLQWTPKDDWATLKLHGKCDDVMQLLMGDLGLEIPTYSRWQDPIFSLATPPCVLVKKVAIARSRYAEAEKSGRVTRVPRPAQPPFAGAGWAGAAPSAQRGKESRSLVLRDEHKWHFANGQNSYSG	1219227	1225022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1219334_1219404_1219543_1219867_1220730_1221672_1221744_1221860_1221934_1222412_1222512_1222707_1222945_1223102_1223184_1223345_1223453_1224381
774938	contig_6316_pilon	-	1697	15	Intergenic	novelGene_134701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	1304	1696	145295	136291	FALSE	10	CGGCACCGCCGTCTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDECPLQQSAKLQEGCTWSTIRFFKLRMWFFTMPVLLCATVRPPLPFVTSTVAFMPPAFSAIPIRAVSAFGMPHLLYPTSLFSDHLAVISKSICYTSGVLSAEAKGPLGEKSRQTVVFPLQPLRQTLHKM	157182	136289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_136380_139484_139562_140477_140643_144110_144166_145288_145505_146605_146709_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149304_149540_149672_153044_153122_155943_156030_156847_156939_157021
774942	contig_9888_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_162251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAAATTTATTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19195	20402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_19200_20400
774944	contig_3956_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_14772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	233	553	929728	930048	NA	25	GCACGTCCCAGGAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKHFKPQAFLPAARSLAGPEASLPAFVLATPQWPFMCAGKCKVVFARSLKLSLESWMEACVGPSSSRSPSHSLFLSLFLGPFTGVDLATTFPELCSLVTFLLISC	929495	930903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_929500_930900
774945	contig_11518_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_109131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGATGAAGCATCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301527	301049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_301000_301500
774950	contig_7171_pilon	+	1107	10	Intergenic	novelGene_101395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	616	921	1410317	1414821	TRUE	40	GGAGGGAGCAATCGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPRPIIMPRKGSVWPVFSLLMSRRGVERGALLMRDAKGCTCREVPMTISRSTFRKSDCMQEKKCAGRFSPKNTMSEASPRSDISHTWESPRRRSSLSSS	1409310	1421124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1409548_1409688_1409975_1410083_1410151_1410291_1410363_1412334_1412384_1412462_1412540_1412677_1412740_1412986_1413044_1414806_1414937_1421053
774957	contig_16535_pilon	+	1367	11	Intergenic	novelGene_167703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	58.6062283379506	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	371	1195	256839	258873	FALSE	20	TAAACAGCTTCTTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERSRSLGRAEPQPWRRRGQLWPEAGPSGAARPATAWNCPSARTRPRSGDARLRCHRTPSAEPTSGAGSTWAGPGVGGGLSNLLFRCSLPEHLPSHGEEPREVLLRLYGAILQGVDSLVLESVMFAILAERSLGPQLYGVFPEGRLEQYIPSRPLKTQELREPVLSAAIATKMAQFHGMEMPFTKEPHWLFGTMERYLKQIQDLPPTGLPQLNLLEVYSLKDEMDNLRKLLDSTPSPVVFCHNDIQEGNILLLSEPENADNLMLVDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWVYDYTHEEWPFYTARPADYPTRGQQLHFIRHYLAEIRKDKTPSPEEQRKLEEDLLVEVNRYALASHFFWGLWSILQSSMSTIEFGYLEYAQSRFQFYFQQKRQLTTLHPKS	255744	259045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_255976_256382_256492_256808_256923_257112_257247_257442_257539_257684_257744_257830_257913_257992_258102_258215_258320_258562_258645_258798
774958	contig_6710_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_90313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGCTGTGCCCAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
774960	contig_6929_pilon	+	401	2	Intergenic	novelGene_139423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8749	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130936	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948
774962	contig_7455_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_168655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATATTTTTACCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387418	385428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_385400_387400
774963	contig_7229_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_39868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTGAAAAATACCGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502206	1500824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1500800_1502200
774966	contig_12624_pilon	-	836	5	Intergenic	novelGene_61044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1171.99509384639	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	166	750	903621	862114	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSEAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKGQDGVVSGAGDLFFALGPGYTGMFTL	903786	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862198_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
774969	contig_14445_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_137376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTTTGCCACCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340878	338947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_338900_340900
774971	contig_5815_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_141199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTCCCCACCACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241040	239892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_239900_241000
774972	contig_5815_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_141198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGGTTAATGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239541	239092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_239100_239500
774973	SIRV2	-	586	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	100	0	100	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5795	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
774974	contig_12638_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_33284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	208	549	985776	979486	FALSE	55	AAAAAACTTGGAGATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPEERGRSGNGSEGREEAGAGSQARSWAPPPEVSRSAHVSSLQRYRELHRRSVEEPREFWGGIAKEFYWKTPCPGPFLQYNFDVTKGKIFIEWMKGATTNICYNVLDRNVHE	985983	979485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_979650_985598
774976	contig_1734_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_164383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTTCAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645536	615335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_617407_645361
774979	contig_2770_pilon	-	2081	3	Intergenic	novelGene_107505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	107	298	846686	846495	TRUE	30	GATTTTTCAAAGAGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISFCNSLTRVAGSQNSVQSFSLASYRSTLLWLLSMACSRMASFFSRMSYRDHFRFSCSPSSKADRPGLAFSEPHPQQQNTSLQMQMGLGEPQNFYRA	846792	831497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_831709_834920_835070_845071
774983	SIRV6	+	528	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	20	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1541_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
774988	contig_3394_pilon	+	2319	3	Intergenic	novelGene_152698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	639	junction_1	100	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	547	1053	504542	508216	FALSE	65	AAAAAAAAGAAACCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQYFYPMVLKKKEELKEEEELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSGASAGGHITVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQVLIGEYNPRCPGWKRAQKILEREQMRKFTLRNS	503995	509482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_504573_507352_507548_507935
774989	contig_6424_pilon	-	1075	5	Intergenic	novelGene_109250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.993035119487	106	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	55	465	21039	6307	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILSFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21093	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7911_8039_9173_9280_12062_12098_21012
774994	contig_19899_pilon	-	1795	7	Intergenic	novelGene_102516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	23	junction_5	75.156872976166	626	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	320	742	144526	140028	FALSE	20	GATTGTGGTACTTTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSFYFVIVGHHDNPVFEMEFLPPGKAESKDDHRHLNQFIAHAALDLVDENMWLSNNMYLKTVDKFNEWFVSAFVTAGHMRFIMLHDIRQEDGIKNFFTDVYDLYIKFAMNPFYEPNSPIRSSAFDRKVQFLGKKHLLS	156649	138974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_140127_141577_141660_142080_142230_144433_144546_144638_144792_145500_145554_156555
774995	contig_9571_pilon	+	2227	3	Intergenic	novelGene_136271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGACTTACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412188	417400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_413494_414097_414198_416578
774998	contig_3122_pilon	-	1810	14	Intergenic	novelGene_64390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	138.036570062271	1	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	78	1772	276393	258061	FALSE	45	GAGAAGGGGAAACATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDREREGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEQKNENENGGRKRGSEKKKENGRRKRRENERSRN	277563	258022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258162_258261_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269878_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277512
775000	contig_7704_pilon	-	1047	8	Intergenic	novelGene_154610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_7	202.391719601532	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	39	938	230301	217271	FALSE	15	CGCGGGAAGATCTGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGKDEEGVPQPPGPPQRKKFIIPLDEDEVPPAGAKLLFKSTRSLPTVETPAQVAPQTYAEYAISGPPGGAAVTCPSPTGPDPPAGETPNQAPKPGAKSNSIIVSPRQRGNPVLKFVRNVPWEFGDVLPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHQRLQSLGKNFALRVLLVQVDVKDPQQALKELAKMCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGVRSNSPAPIGIFSPWPFLGSPTPTRFLPPSHLARSLPSP	230839	217161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_228371_228594_230196_230309_230808
775001	scaffold_13505_pilon	-	960	6	Intergenic	novelGene_111443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	352.748295530964	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	24	401	535595	532432	TRUE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRATPQTLPGHGGGHQEPHHHS	535618	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_530847_530933_531164_531299_531369_532376_532496_532763_532999_535516
775005	contig_9982_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_55720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAATGAGGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253608	252588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_252600_253600
775006	contig_20693_pilon	+	1184	7	Intergenic	novelGene_60264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	715.866006239218	78	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	80	583	27396	32930	TRUE	30	ATTATGTATAGTCCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGED	26992	34771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_27064_27387_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29948_32928_33015_34254
775017	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	2	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
775018	contig_12078_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_74086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTAAGTGCTACGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158821	157676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_157700_158800
775029	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775033	contig_12619_pilon	-	542	4	Intergenic	novelGene_73582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	38.1837661840736	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGGTCAGTGGTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004993	932401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_932571_936811_936919_987790_987956_1004892
775034	contig_6327_pilon	-	2140	4	Intergenic	novelGene_147486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.24721912892465	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	334	696	66365	66003	FALSE	60	AAAGTTAAAATAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHHLSVETYISMMLLNRFQQSFQTDMARKKDLVIYFQKPAKENLWITMAKTVTHYGNGAGLGSISSLCAWSRHESETYAMAATTLFSRHYSPYCLLHALILEPNTDSPVKNRSCLFVN	94515	64558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_66442_71193_71270_82852_82980_94461
775036	contig_1406_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_25634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAATAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2634439	2632402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2632400_2634400
775037	contig_11429_pilon	+	802	4	Intergenic	novelGene_60470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1292.95561494671	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46186	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_46265_46512_46588_48475_48530_48899
775038	contig_6102_pilon	+	535	4	Intergenic	novelGene_31978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2756	junction_1	306.293976434405	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	28	378	414294	416047	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	414266	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414364_414613_414788_414877_414956_416018
775042	contig_720_pilon	-	2001	6	Intergenic	novelGene_155163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	91.5065025011884	451	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	12	992	190635	162408	FALSE	15	TGTCCTGCTGTGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKKLGADFHGTFSYLDDVPFKIGDKFKTPAKVGLPIGFSLPDCLQVVREIQYDFSLEKKTIEWAEDIKKIQEAQREAERKAEEAEATKVNSKSGPEGDSKMSFSKTHSTATMPPPINPILASLQHNSILTPTRVSSSATKQKVLSPPHTKADFNPADFECEEDPFDNLELKTIDEKEELRNILVTPPNFSMSQVPNTSSCPQAYSELQTLSPSERQCVETVVNMGYSYECVLRAMKKKGDNIEQILDYLFAHGQLCEKGFDPLLVEEALEMHQCSEEKMMEFLQLMSKFKEMGFELKDIKEVLLLHNNDQDNALEDLMARAGAS	190646	161398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_162549_163166_163269_163993_164177_179820_180217_183857_183983_190601
775043	contig_14219_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_54361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCAGCACAGTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875061	874093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_874100_875100
775046	contig_14925_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_55152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	1559.6368968449	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	199	456	29675	27020	TRUE	20	AAGGCTGTGCTCCTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKWIFGSGTRLLVRPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	46428	25791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_46382
775050	contig_1406_pilon	-	2536	4	Intergenic	novelGene_25516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1570	1881	1680518	1680207	TRUE	30	CTGAAGCAGCACACAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKHLSSIPPPSDLPNSKLKKPRRLGLIIRKQENLVPRWGGGGLGDNILNGLVKWVVRSWLQSGLGRLQRKEPTLSPPTHPPTLLLSSLDPRAPEDCKSSLG	1682087	1604931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1604947_1610664_1610912_1633748_1633866_1679930
775055	contig_11336_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_172666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28683	31167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11336_pilon_+_28700_31200
775056	contig_18113_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_137547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTATTTATTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241016	243353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_241000_243400
775058	contig_11994_pilon	+	2010	10	Intergenic	novelGene_129345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	82.6128857315182	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	394	1467	95169	108340	FALSE	30	GAAAAAGGCTTTGTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYCSVIKFENLQELKRLCHWGPIIALGVIAICSTVAMIDSVLWYWPLHTTGGSVNFIMLINWTIMILYNYFNAMFVGPGFVPLGWKPENSQDSMYLQYCKVCQAYKAPRSHHCRKCNRCVMKMDHHCPWINNCCGYQNHASFTLFLLLAPLGCIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93705	108883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93885_94954_95436_97358_97451_98566_98727_100323_100486_102990_103045_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
775060	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
775062	contig_13051_pilon	+	1499	13	Intergenic	novelGene_140142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	47.0732290042747	87	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	423	1169	692133	709585	FALSE	10	TTCTGAGTGCTGGTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPPLATANSLDLQLKGEFFSLAHRTPSRISPSALVFPTERDRMVYLGISDYFFNTAGFVYQRAGVLKLTLTDDMIPKESKFRLTTKLFGTLIPEVTRRFPNMKVRILLSVTSPPHLTVDSTGLALTPELEAQTFVVLPNSSLAPLFQLGLSTNVSVMVGVNSDRLIGQLTMDKLQLKLKHSDVGPFSVQSLQTVMNYLLPLLVLPSVNERLQKGFPLPLPARIRLFNLVLQPRQDFLLFGADVYYG	659714	709915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_659852_661933_662050_684565_684630_690355_690420_692091_692184_695464_695642_696735_696796_697731_697900_699209_699278_701884_701928_706424_706489_707612_707690_709546
775063	contig_953_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_130022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGAAGCTTCTGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599781	601762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_599800_601800
775064	contig_14133_pilon	-	2538	17	Intergenic	novelGene_119966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	47.5432369007412	280	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	294	2363	227234	213631	FALSE	15	TGGTTTAATTTTGCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRNKDNDKSRAKTPEDDEEERKRKEREDQMYRERLRTLFIIAVVMSLLNSLSSSGGNISWNDFVNEMLAKGEVQRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEVKDRIPVSYKRTGFFGNALYALGMTAVGLAILWYIFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTVVDGKMGKGISFKDVAGMHEAKLEVKEFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARHRAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSSFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDSALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTRASSFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTSNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQRVVAFHESGHALVGWLLEHTEAVMKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	231386	213455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220461_220587_221852_222027_222355_222519_222935_223062_224401_224505_225467_225608_226191_226434_227173_227264_228605_228709_231225
775065	contig_10235_pilon	-	1199	11	Intergenic	novelGene_46543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	29.3477426729894	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1143	56	1198	417693	412353	FALSE	5	TCCCTCAGCCTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALPEIVGLRLPPPSGVTMLVIPPGLSEEEEALQKKFNKLKKKKKALLALKKQSSSSTANQGGVKRSLSEQPVVDTATATEQAKQLVKSGAISAIKAETKNSGFKRSRTLEGKLKDPEKGPVPTFQPFQRSISADDDIQESSRRPQRKSLYESFVSSSDRLRELGPDGEESEGPGAGDGPPRSFDWGYEERGSARSSASPPRSHSRDRSRERNRDRDRERERDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDREGPFRRSDSFPERRAPRKGNTLYVYGEDMTPTLLPVPSSLMKRWSQQIRPLLSLMGPRWSPYSSKSTLPANNPCWTLPLASLSGAPSLSRTALRVATGTRGPRLSTVMMSTRRILWMASREWSWIPCASCAPNAGLSKTLRWM	418171	412351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_412521_413882_413986_414227_414283_414476_414564_414689_415016_415194_415233_415339_415415_415912_416059_416159_416230_417618_417702_418124
775067	contig_7457_pilon	-	1924	8	Intergenic	novelGene_31450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_6	26.8054213219061	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	840	1733	475819	474349	FALSE	15	GGTGAATGTATTGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVDAQGMAGLWGGSLQVATCSTLALFSSFQHSDLPKGGESLEPFAEAHSKDAIRPMNDHEFSVGSDWPLELTRDTVVIGVEPQCLPWLGPRGL	477731	474157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_475922_476355_476410_477048
775069	contig_7202_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_18818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCCAGAACTACAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30066	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
775070	SIRV6	+	365	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	403	-1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11210
775073	contig_5816_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_158267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAGCAAACTCAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380534	379591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_379600_380500
775080	SIRV6	+	454	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	213	-2	98	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	182	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGGTATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
775084	contig_756_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_134765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCTTCTTGGAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134211	135740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_134200_135700
775086	contig_6440_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_161672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55475	54934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_54900_55500
775087	contig_7318_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_152234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	109.34413056442	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	369	674	332095	343304	TRUE	15	TACCATAGCCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSVCARREVPGRGALAQKNETLDHLISLSGAVQLRHLSNNLETLLKRDFLKLLPLELSFYLLKWLDPQTLLTCCLVSKQWNKVISACTEVWQTACKNLGWQIDDSVQDTLHWKKVYLKAILRMKQLEDHKAFETSSLIGHSARVYALYYKDGLLCTGSDDLSAKLWDVSTGQCIYGIQTHTCAAVKFDEQKLVTGSFDNTVACWEWSSGARTQHFRGHTGGGI	326591	355141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_326645_331779_332198_340980_341177_343297_343432_345626_345714_346358_346529_354464
775093	SIRV6	+	496	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	171	-2	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
775094	contig_10902_pilon	-	1140	7	Intergenic	novelGene_65688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCAGCCGTTTCCGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218579	168453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_168587_178811_178883_189007_189180_196148_196296_196626_196759_209424_209781_218450
775095	contig_16126_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_141888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAATAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97953	99604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_98000_99600
775101	contig_12277_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_139699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTACAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288343	286789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_286800_288300
775102	contig_6227_pilon	-	2785	1	Intergenic	novelGene_49801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	446	901	1263964	1263509	NA	50	ATGGTATTATACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSGTGDPASGLKSPFQAFSFLEGAEIALFPWSLPCIRPSESFPSIFLFRRGRDSSFPLIVTSESLFLSISPLVYILLAAPGSVYLLVCILSLPCEREQMVHGISSSPSPLPVAGQDAEEGEGGRIYVPEDPALLLLFVCIVRRFRTPSF	1264409	1261624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1261600_1264400
775106	contig_7057_pilon	+	613	7	Intergenic	novelGene_123343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	778.624142674471	45	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	35	613	938907	943715	FALSE	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	938720	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941482_943480
775107	contig_16532_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_110055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGACGCCTGGCATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233259	232403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_232400_233300
775111	contig_8045_pilon	-	1116	2	Intergenic	novelGene_35458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	116	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGTCTCACCCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479285	477756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_478792_479204
775112	SIRV5	+	280	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	893	32	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
775114	contig_12078_pilon	-	2765	1	Intergenic	novelGene_74093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTACTAGAAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193666	190901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_190900_193700
775115	SIRV6	+	292	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8149	3	590	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGGTCTTGTGGTCGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
775117	contig_3862_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_137411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	324	1022	504762	504064	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQTMLTVMGFIREVTGYNSGSGKAQDTVLWSGELLSYAHRQACLSLLALDPLACPLPCSASVTKLFSSASKCLESPHSASKPQPEDAQLSCSMGWHARCTTSLCISHAGLLVLLPFLCHHFSQSLAVSGVNSSLSLSWVCEVLSTGTPGPKDASIPSFSFMVVVSSPLCSGIGSLLSLVGMAKLTNPLARFPYTLFACSHLHKGAIHLIRIVGNAVQSPWATSILLA	505085	503830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_503800_505100
775119	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	51	518	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775124	SIRV6	+	239	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	51	493	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775125	contig_17753_pilon	+	988	2	Intergenic	novelGene_105119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	56	298	146973	147215	TRUE	5	TCTTTTGGGTGTGATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDVRCNCSLKVTQTRRKMEEKNAHSLTWLWSSALSPGMPTALRWLNALHVPSGPSNCLHSSGELSDISPSPLALWFPANTAICQPSGQPWKSSSCFS	146917	148325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_147777_148196
775127	contig_8710_pilon	+	1297	3	Intergenic	novelGene_73512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	25	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAGTTTGAGAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347348	369782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_347369_348358_348413_368559
775128	contig_11338_pilon	+	1292	12	Intergenic	novelGene_6257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	12	junction_8	94.533565686069	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	97	900	119137	150314	FALSE	10	GGACCCAGGCTCTGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHYEVEILDAKTREKLCFLDKVEPHATIAEIKNLFTKTHPQWYPARQSLRLDPKGKSLKDEDVLQKLPVGTTATLYFRDLGAQISWVTVFLTEYAGPLFIYLLFYFRVPFIYGHKYDFTSSRHTVVHLACICHSFHYIKRLLETLFVHRFSHGTMPLRNIFKNCTYYWGFAAWMAYYINHPLYTPPHLRSSAGEAGARHLCNLPARQLFHPCGPAEPAAGRVQDKEDPIPHQEPLHVALPAGVLPQLHLRGRLLDWLHHHDTVPPR	119040	150706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_119152_147568_147620_148324_148377_148784_148830_148916_149021_149100_149217_149301_149408_149503_149578_149664_149709_149804_149863_149940_150030_150264
775129	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775130	contig_6743_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_33539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCATTTCACAATAATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175515	174792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_174800_175500
775134	contig_10494_pilon	-	1876	10	Intergenic	novelGene_102200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	15.4488403016753	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	267	1043	1076549	1061204	FALSE	20	AAGGCATTTTAGCTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPTGTPGTHTHPRTSWGGIPDSERLLPELLKEASYATKIVGKWHLGHRPQFHPLKHGFDEWFGSPNCHFGPYDNRAKPNIPVYRDWEMVGRFYEEFPINLKTGEANLTQIYLQEALDFIKRQQSQHRPFFLYWAIDATHSPVYASKPFLGTSQRGRYGDAVREVDDSVGQILQLLRGLRIAEHTLVFFTSDNGAALVSAPKQAGSNGPFLCGKQTTFEGGVREPAIAWWPGHIPAGQGINYCPGQNISGVTTHTQEEHTSLPLLFHLGRDPGERYPLSFVSAEYQDALLRITPAVWQHRKALVPGQPQLNVCNPAVMNWAPPGCEKLGKCLTPPESVPEKCSWPH	1079073	1060370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1061291_1064780_1064899_1065985_1066108_1074273_1074378_1074978_1075119_1075310_1075439_1075514_1075582_1076538_1076683_1078185_1078290_1079044
775137	scaffold_16539_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_68334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422907	421898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_421900_422900
775145	contig_2054_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_51691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTATGAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141870	140387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_140400_141900
775147	contig_4125_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_25166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCCATTTAAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916589	917142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_916600_917100
775148	contig_6364_pilon	-	1745	4	Intergenic	novelGene_51827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	2.62466929133727	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	603	1001	1588512	1587638	FALSE	15	TTTAGAACTGTGCCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGKQARVGFFDLCLGD	1589114	1586893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465
775151	contig_6344_pilon	+	2651	1	Intergenic	novelGene_157111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094220	1096871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1094200_1096900
775153	contig_12638_pilon	+	1880	7	Intergenic	novelGene_33230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	15.5500982490644	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	102	977	737245	752052	FALSE	65	CTAAATCATAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRVLIPVGLLCALPPLHHGAPGPDGTAPDPAHYRERVKAMFYHAYDSYLENAFPYDELRPLTCDGHDTWGSFSLTLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVLQDNVDFDIDVNASVFETNIRVVGGLLSAHLLSKKAGVEVEAGWPCSGPLLRMAEEAARKLLPAFQTPTGMPYGTVNLLHGVNPGETPVTCTAGIGTFIVEFATLSSLTGDPVFEDVARVALTRLWESRSDIGLVGNHIDVLTGKWVAQDAGIGAGVDSYFEYLVKGAILLQDKNLMAMFLGKKGRARAFP	737143	752955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_737352_737576_737688_739520_739561_745282_745389_746400_746527_750462_750675_751878
775160	contig_9901_pilon	-	2173	14	Intergenic	novelGene_126928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	147.39192209285	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	235	1287	216214	185991	TRUE	25	TTTGGTGGTTTTATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFTLLSPQEIASIRKACVFGTSGNEALYVTDNDEVFVFGMNYSNCLGTGDNQSTLVPKKLEALCGKKIKSLSYGSAPHVLLSTEDGVVYAWGHNGYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVFAWGYNNCGQVGSGSTANQPTPRKVTNCLHIKKVVGIACGQTSSMAVLDNGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249464	171081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_204141_204301_207324_207492_215524_215676_216088_216281_245846_245927_249376
775162	contig_5836_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_106279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86549	84435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_84400_86500
775165	contig_10511_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_126909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603195	602917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_602900_603200
775166	contig_7996_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_165149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTATTGTAGTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213383	212294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_212300_213400
775167	contig_19026_pilon	+	520	2	Intergenic	novelGene_173473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTATGGTCAGGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	18311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19026_pilon_+_8793_18259
775169	contig_6576_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_42449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAACCCACTAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307328	1307039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1307000_1307300
775173	contig_10058_pilon	+	1340	9	Intergenic	novelGene_67667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	341.166725187261	55	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	289	1314	31601	47226	FALSE	20	TAGTGTGGAGTCTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRQEFEADRKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVAVQMEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMQHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDRGKWGHSGHGAAFSDRLSHRFHSSKAQCL	31312	47252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38857_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_47140
775176	contig_2703_pilon	+	2351	2	Intergenic	novelGene_101747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAGAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542472	545894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_543099_544169
775177	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	52	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
775178	SIRV6	+	319	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775181	contig_14322_pilon	+	396	2	Intergenic	novelGene_115842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	144	252	395	671606	671905	FALSE	20	AAGCCGGGCCCGCGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVELLLGKLKDNCEA	671354	671906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
775185	contig_6048_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_73267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_3	48.6894923640272	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	285	680	1976388	1976783	TRUE	20	CATGTAAGTGGTATCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWVSVLPRTLPEFFTLHPSFPGAEPWGPGAALHTASMPATKVCLEQQHPSSSGGEGGPPASSLPHESAHPSGLPTRTSTRSSSSTSPSSLSSSPSPAASSSTPGGCPSSRLDPVPSSGSLAPTFCTLFPG	1974115	1977689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1974327_1976314_1977307_1977409_1977503_1977627
775189	SIRV5	-	419	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10861
775191	contig_6048_pilon	+	2547	15	Intergenic	novelGene_73207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	13.5217134525872	209	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	91	1353	1512212	1515675	TRUE	10	AGCTTGTGGAGTGCTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLSTRLLIQRGRPKSDRLGKIRSLDLSGLKLRSEHLDPKLLGRLRQLQELDLSNNQLDTLPANLGLSHLRILRCANNQLGDVTFLCQFPQLEELSLEGNPFLTVSDNLKVSFLLPKLRKVNGKEASSTSSQVENLNRELTSRVTAHWEKFMAALGPKEEAEKAQADFVRSAVRDVRYGPESLSEFTQWRVRMISEELVASGGTQVPKADNPERPVEAAAPHEPRTRLAALKRPDDAPLNLSPNKRVCTSPSAQVEGSPMGSDGSQAGLKLEPLHFLQCHSKNNSPRDLETQLWACAFEPTGEEGHSGATSQTVATCGGEAVCVIDCQTGIVLHKYKVPGEEFFSVAWTAVTVVTQAGHKKRWSVLAAAGLRGLVRLLHVRAGFCCGAIRAHKKAIATLCFSPTHETHLFRSDMGFVVN	1512121	1518944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1512292_1512857_1513093_1513184_1513302_1513789_1513931_1514154_1514260_1514475_1514599_1514675_1514791_1515001_1515112_1515303_1515512_1515646_1516094_1516190_1516332_1517975_1518068_1518207_1518364_1518450_1518564_1518670
775193	contig_6710_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_94703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653798	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
775195	contig_1309_pilon	+	2626	1	Intergenic	novelGene_73974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAAAAATTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184313	186939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_184300_186900
775198	SIRV4	+	369	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGTTTCCGAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
775200	contig_2444_pilon	-	514	4	Intergenic	novelGene_83760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	38	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	96	404	229702	227685	FALSE	20	ATGATATCTAGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229797	227574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
775204	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775208	SIRV2	-	513	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	310	4	-310	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACAGTGGTTGTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
775211	contig_2596_pilon	+	1991	8	Intergenic	novelGene_53450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	196.218849081055	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	983	1534	45924	61358	FALSE	20	TTTAAACTAGCCTCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA	36951	61815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_36996_42489_42717_44873_44952_45290_46062_48753_48897_58522_58659_60346_60434_61310
775213	contig_19851_pilon	+	1043	6	Intergenic	novelGene_29849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	174	689	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
775215	SIRV2	-	289	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4584	34	3409	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
775216	contig_16578_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_148681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTTTTGTTGGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294250	292005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_292000_294200
775219	contig_6710_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_97097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653884_657143
775220	contig_3942_pilon	+	1683	12	Intergenic	novelGene_128877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	9.98428517287157	158	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	61	1491	1531885	1551132	FALSE	20	GAATGGGGTCTGAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLGVQLVVTLLTATLMHRLAAHCSFARWLLCNGSLFRYVHPSEEELRALAGKQRPRGKRERWASEEKPLSVPRDAPFQLETCPLTAVDALVLRFFLEYQWFVDFAVYTGGVYLFTEAYYYATCPAREANIAVCWCLLAVAFSIKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMAEDRPGLQLLLHASFLSPLFVLWLWTRPIARDFLQQAPLGGTSISLLSDEAFDSVRLWVLVALCLLRLAVTRPHLQAYLGLAKVRVEQLRREAGRIEACEIQRRVVRVYCYVTVVSLQYLTPLILTLNCTLLLKSLGGYSWGLGLAPTLPPVPSSADAASAGPEGDSAQETAAQIVGALGGLLTPLFCRGILSFLVWWTAACQLLSSLFGLYFHQHLGGS	1531824	1551324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1535916_1536004_1536162_1536941_1537094_1549644_1549706_1549824_1549969_1550064_1550179_1550283_1550459_1550671_1550769_1550878
775221	contig_2062_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_139021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATAAACAAAATACGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158313	1157669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1157700_1158300
775223	contig_5696_pilon	+	1778	3	Intergenic	novelGene_117591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751890	762713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_753187_756908_756961_762283
775232	contig_6919_pilon	-	1065	4	Intergenic	novelGene_163977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	38.3173879879908	320	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	32	406	39023	32544	FALSE	5	TACCTGGTGTGTTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRLCCGRNWSCPSTLRRKKKTGSQARPSSKQQQQRQNGRKGPETRGHTYERVLEKPESPKRRPGVTSEDSSVHYADIQVCSRTRSRSAREVKDQQVANATEYATLCFPQATPRYDRKNGTLV	39054	31884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_32793_33013_33070_34796_34835_38991
775235	contig_3602_pilon	-	1650	11	Intergenic	novelGene_60650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	339.441541358744	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	687	995	1110937	1106687	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKVSEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139508	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106789_1107775_1107817_1108686_1108763_1110847_1110953_1111709_1111795_1111892_1111949_1112153_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
775237	SIRV4	-	264	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1257	0	1257	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
775239	contig_1172_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_162023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGACAGAGTAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564864	564066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_564100_564900
775240	contig_18869_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_56022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGGTTGATGTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73500
775241	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775243	contig_16594_pilon	-	2488	5	Intergenic	novelGene_53860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_4	1573.40244375049	4	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	291	1001	165546	132969	FALSE	30	GAAATGACAGCTTCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGKELGFINE	306538	131481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306350
775244	contig_9389_pilon	+	1155	7	Intergenic	novelGene_83923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	11	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	29	661	159587	167903	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPSCIPSLPFSLKISLWFL	159558	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166148_167850
775247	contig_11416_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_145353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACATTAATTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216311	217012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_216300_217000
775254	contig_3825_pilon	+	749	8	Intergenic	novelGene_77928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1340.01628074179	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	20	361	12232	14454	TRUE	20	TTGTGGGTTGAAGGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKNRT	12212	15669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14114_14443_14471_14780_14912_15231_15302_15498
775256	contig_5779_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_106528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCATGGGTGAGCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336092	334379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_334400_336100
775257	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_98218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	25	TGGCCCCTTCCCCACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
775261	contig_8461_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_163932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGGTAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441398	442950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_441400_443000
775263	contig_3942_pilon	+	1624	6	Intergenic	novelGene_128873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	14.6342065039414	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	378	740	1492877	1499848	TRUE	25	ATATAGGCCAGGCTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEMQVKGKKVTDKFTESVYVLANEPSVALYRLQEHVRRSLPELAQHKADMQRWEEQSQGAIYTVEYACSAVKNLVDSSVYFRSVEGLLRQAISIRDHMNASAAQGHSPEEPPPLSSA	1492499	1500957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1492914_1495128_1495242_1495613_1495679_1498449_1498564_1499814_1499888_1500112
775265	contig_10750_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_172606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATATTTTAAATTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82037	83696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_82000_83700
775266	contig_9609_pilon	-	1548	3	Intergenic	novelGene_23153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88	278	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	153	632	786296	785817	TRUE	10	TCCAGTTTGGTAGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAQPESEQLKVLDPEEDLLCIAKTFSYLRESGWYWGSITASEARQHLQKMPEGTFLVRDSTHPSYLFTLSVKTTRGPTNVRIEYADSSFRLDSNCLSRPRILAFPDVVSLVQHYVASCAADTRSSSPDPAPAPALPTPKEDGTSNPVLPAPAATAVHLKLVQPFVRRSSARSLQHLCRLVINRLVADVDCLPLPRRLADYLRQYPFQL	786655	784811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_785484_785572_786350_786556
775267	contig_11989_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_68456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCAGTGTTTAATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88201	90247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_88200_90200
775268	scaffold_880_pilon	+	1702	13	Intergenic	novelGene_121433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	111	junction_11	383.892228438602	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	106	1320	420237	453964	TRUE	30	TCTGCATAACTATAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRHFVVCTNLHAVKLYLLTPQFYDPVEPVDFEGLLMTHLNSLDVELAQELEDFTDDDPDVVFTPKECRTLQPSLPEEGVELDPHVRDCVQTYIREWLIVNRKNQGSPETCRFKKTGSRKDFHKTLQKQTFESETLECAEPSAQTGPRSLRVLCDVSGKGPVTACDFDLRSLQPDQRLENLLQHISVEDFERQNEEARRTNRQAELFALYPSVDEEDAVEIRPVPECPKEHLGNRILVKLLTLKFEIEVEPLFASIALYDVKERRKISENFHCDLNSDQFKGFLRAHTPSVAASSQARSAVFSVTYPSSDIYLVVKIEKVLQQGEIGDCVEPYMVIKESDGGKSKDKIEKLKLQAESFCQRLGKYRMPFAWAPISLSSFFNVSTLDREVTDVEAIVGRSSVGERRTLSQSRRLSERNLSLEENGVGSNFKATTMTINNFF	408723	456301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_408781_420188_420365_424873_424946_433473_433598_437562_437776_439125_439212_441361_441429_443432_443583_447600_447682_450971_451132_453830_453969_455117_455212_456017
775272	contig_4874_pilon	+	1376	5	Intergenic	novelGene_78621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.6393596310755	7	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTACGAATGAGACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16482	35997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_16511_22213_22348_31867_31907_33128_33166_34859
775277	contig_15327_pilon	-	1128	6	Intergenic	novelGene_70456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1063.79520585496	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	581	1066	293006	289810	FALSE	15	AATTCTATGGTGCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVKSCAEFLAVSKTRIGEYEKQLEKLRNIIPFDQMTIDDLNEAFPETRLDKTKYPYWPHQPIENF	294644	289747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_290158_291454_291527_292481_292579_292884_293016_294073
775279	contig_12250_pilon	-	1769	9	Intergenic	novelGene_80722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_6	170.407416211854	8	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTACCCATCAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401323	398589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528
775282	contig_18869_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_56254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
775288	contig_9995_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_47749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAAAGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626433	625455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_625500_626400
775289	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8115	-1	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
775291	contig_327_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_164316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	637	948	20622	20311	NA	10	CTCCATTTTTGTCTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRENTFYSQRKDCSHHSIECIFGLECRILITRREKKLANWRFKGSTCFQFRILWLSLTFSRNTVINPGIYKCTLKSFLFSQIKRHLIQIFQIPAEYRTLNW	21258	19407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_327_pilon_-_19400_21300
775292	contig_13780_pilon	-	2708	16	Intergenic	novelGene_149069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1301.44380678623	90	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	328	2154	699220	657588	FALSE	20	CTCTCATTGTCTCCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKVNADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727619	657033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_660148_660194_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686622_688698_688760_694786_694858_699201_699268_702173_702217_713180_713237_727438
775293	contig_12414_pilon	-	1077	9	Intergenic	novelGene_59676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_3	265.673642604983	232	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	254	937	931820	907302	TRUE	55	ACAGAAGAAGCAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIITVKDESQTMKDLEAEVKDKTKVENLIKSENYGKILAEKNERCIDNSIDLQEKIQIQLTQSYEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNPRDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIVNKTSNTRMQITRSSLEPVVLWMSTTRCPLGCLNGAGSWRLQGSKFRHL	933647	905337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_905360_905446_905556_907292_907426_909063_909205_909286_909347_916187_916267_917554_917670_931655_931867_933440
775294	contig_4951_pilon	+	1991	2	Intergenic	novelGene_122129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	489	1274	407637	408422	FALSE	20	GCCCTATTCCTTAAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGRVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGCKNVCYDHFFPMSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNEFKDIEDIKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEASFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQTNHPNHALRESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS	399735	409139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_400209_407621
775296	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	224	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775298	SIRV4	-	466	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	0	1055	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
775301	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775302	contig_1143_pilon	-	943	9	Intergenic	novelGene_86595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_8	267.627276963691	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	3	752	201037	166922	FALSE	40	TAATAGAAATTTATGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRAINRPDITDTEMETVMDTIVDSLFCFFVTLGAVPIIRCSRGTAAEMVAVKLDKKLRENLRDARNSLFTGDTLGAGQFRYYIS	201039	166730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_167024_176517_176574_178065_178156_183509_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
775306	contig_5084_pilon	+	1599	4	Intergenic	novelGene_64604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	5.73488351136175	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	12	470	982509	1015322	FALSE	75	GAAAAAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VITMAVTKELLQMDLYALLGIEEKAADKEVKKAYRQKALSCHPDKNPDNPRAAELFHQLSQALEVLTDAAARAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLGRWPLALGRGFAPPAVSIHLVNLLPGASVQSLHASPPRLWQNPVPRGRIFQGYS	982497	1016451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_982587_1014389_1014460_1014754_1014814_1015070
775309	contig_7912_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_129562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTCAGAGTAAGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61775	60611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_60600_61800
775310	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_97727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775311	contig_10475_pilon	-	1917	3	Intergenic	novelGene_148728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	160	1194	84427	83393	TRUE	45	AATGAATAAACATTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPETTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQSPTEAESSMDDD	90078	82408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_82547_82807_84503_89994
775312	contig_12079_pilon	+	2772	1	Intergenic	novelGene_67371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGAGCTTAATGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312237	315009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_312200_315000
775314	contig_17108_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_109533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTTGGGTTCTGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82337	83196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_82300_83200
775316	contig_13645_pilon	-	1736	5	Intergenic	novelGene_146161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	55.7107485140884	36	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	78	494	23717	15023	FALSE	55	TGTATTAAAAATGAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLEQAEDLKAFERRLTEYIHCLQPATGRWRMLLIVVSVCTATGAWNWLIDPETQKVSFFTSLWNHPFFTISCITLIGLFFAGIHKRVVAPSIIAARCRTVLAEYNMSCDDVSTLFSFENYVYERTEMFRKTLSLWN	23794	13780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_15159_15278_15389_19509_19584_22530_22603_23692
775317	contig_4213_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_124820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTGGGAAAGTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64107	65295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_64100_65300
775319	SIRV5	+	319	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	199	150	85	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCGCCAAAAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8400	10992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
775321	contig_12277_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_139711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGGGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392464	391381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_391400_392500
775322	contig_9812_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_173476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26952	26381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9812_pilon_-_26400_27000
775326	contig_9727_pilon	-	1253	11	Intergenic	novelGene_86373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	256.22226679194	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	65	1018	598065	578319	FALSE	45	TAATATGGAAAGAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622876	578083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_622824
775331	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
775333	contig_12841_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_55845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCTTCCCTGACCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224557	223233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_223200_224600
775335	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
775336	contig_9594_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_73922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAGAATAAATAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160484	161831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_160500_161800
775339	contig_15548_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_173485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAGACTTGAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276379	275295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_275300_276400
775340	contig_15548_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_173484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAATGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275166	274004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_274000_275200
775344	contig_11548_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_66790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTACTCACACCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122842	127941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_124588_127629
775346	contig_7963_pilon	-	1081	6	Intergenic	novelGene_58315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1608.70228445166	4	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48899	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39399_39945_40232_43546_43819_48741
775349	contig_8254_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_48387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATAATGCCCCAATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80675	79422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_79400_80700
775353	contig_2757_pilon	-	2223	15	Intergenic	novelGene_164583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCGTCGTGAAATGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247609	203140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_203222_213894_213956_223155_223345_224567_224677_225727_225876_228065_228211_230082_230238_230808_230883_242246_242424_243084_243199_243527_243637_243956_244081_245900_245968_246651_246759_247046
775354	SIRV5	+	357	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	149	48	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
775357	SIRV6	+	485	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	292662	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACAAGTCAAGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
775359	SIRV4	-	324	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1197	0	1197	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3961	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
775360	contig_9363_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_6482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAACAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356504	355614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_355600_356500
775363	contig_7945_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_161605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAAAAAGATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429860	430958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_429900_431000
775365	contig_10982_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_87867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCGTGCTAATCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92409	91626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_91600_92400
775366	contig_10982_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_87866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAACAAAATGCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91676	90827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_90800_91700
775374	contig_7758_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_163533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCTCCTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126414	125423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_125400_126400
775376	contig_5690_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_119677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277087	274872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_274900_277100
775377	SIRV6	+	294	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	601	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1540_1645_1736_2780_2829_3106
775380	contig_7630_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_133648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGTGGTGGATTCGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444549	442489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_442500_444500
775381	contig_8843_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_156641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTCTAACTCACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39500	39151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_39200_39500
775382	contig_10855_pilon	-	1429	10	Intergenic	novelGene_124323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.7537232862735	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	50	1309	401138	320307	TRUE	65	AAAACTTTTAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPSWYLG	401187	320141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320247_320291_320325_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
775383	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
775384	SIRV6	+	375	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11037_11109_11205
775385	contig_405_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_135317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473755	476044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_473800_476000
775386	contig_500_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_31132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCACCAAGAAAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765323	1766254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1765300_1766300
775387	contig_1154_pilon	-	2163	2	Intergenic	novelGene_87097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGCAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348885	345011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_346052_347762
775389	contig_504_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_54412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137166	134861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_134900_137200
775390	contig_1666_pilon	-	1500	7	Intergenic	novelGene_160580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_6	193.641421188753	292	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	138	1274	648698	637051	FALSE	15	ATGAATTTGTTTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPAWFDQAKFGIFIHWGVYSVPGFGSEWFWWYWQEKQIPEYVKFMKHNYPPDFKYEDFGPQFTAQFFNASQWADLLQASGAKYMVLTTKHHEGFTMWGSKYSWNWNAVDEGPKRDIVKELEVAIRNRTDLHFGLYYSLFEWFNPLFLEDKFSSFHKRQFPVSKMLPELYELVNNYWPEVLWADGDGGAPDSYWNSTGFLAWLYNESPVRDTVVTNDRWGAGSICKHGGYYTCSDRYNPGHILPHKWENCMTIDKVSWGYRRNAGICDYFTIEELVKQLVETVSCGGNLLMNIGPTQDGTISPIFEERLRQMGAWLSVNGEAIYGTHTWRSANDTVTPDVWYTTKPKENLVYAIFLKWPTLGQLLLGQPKAIWNSTMVKLLGYGQPLKWTSLEPNGIVVKLPQLTISQFPCKWGWTLALTNVI	650933	636824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_637192_638470_638580_641318_641510_641737_641949_643268_643609_648553_648742_650839
775391	contig_1331_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_37871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGATTCTAGTAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329036	331729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_329000_331700
775394	contig_15323_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_148506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCATTTTAATAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41436	40165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_40200_41400
775397	contig_14666_pilon	-	1175	7	Intergenic	novelGene_39545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.69619552939	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	205	762	458202	449808	FALSE	35	ACATAAGCACTGAGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTCTFGDPIV	475101	449394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449835_449888_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_475054
775401	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
775405	contig_3754_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_146833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATACTCTTTATTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243743	242976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_243000_243700
775408	contig_1090_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_131159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGCCATCTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887494	886801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_886800_887500
775410	contig_4364_pilon	-	1608	14	Intergenic	novelGene_127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	165.085310561884	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	29	952	1097596	1093063	TRUE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKSCSATSSPAVPSSCSWSWSPRYGTSSSSSMSPSMPRVSRCWMR	1097624	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093359_1093682_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1097563
775412	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	54	508	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775415	contig_12778_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_173490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	205	327	9256	9378	NA	10	GGGTTGGGCATTGGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEDFKLQPLACRAPGIVTVQGENKLEQPLRDREIGTDGPLTKPRLFCEVGCPPSLTSSSRGQTEEVLIMEVDYMHSSNSERLFEWRLGLQESRAGKVLKGNSRPGHFS	9051	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12778_pilon_+_9100_11000
775417	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	10	408	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775419	contig_8729_pilon	-	788	4	Intergenic	novelGene_40074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	719.796421836681	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	113	502	73296	69771	FALSE	20	GATGTGGTGTCTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPASRSPQMRAAPRPAPVAQPPVVAPPSAVGSPAAAPRQPGLMAQMATTAAGVAVGSAVGHTLGHAITLQEPQGAQPAYEQQQQQQFGPCHYEMKQFLECAQNQSDLKLCEGFSEVLKQCRFANGLA	73408	69484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_69782_70467_70637_71444_71638_73279
775423	contig_10734_pilon	+	1430	7	Intergenic	novelGene_51359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	17.0293863659264	34	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTCAATAAAAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781326	1787955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781397_1781473_1781580_1783470_1783581_1784314_1784402_1784530_1784658_1784841_1785051_1787234
775424	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
775427	contig_15327_pilon	+	1319	12	Intergenic	novelGene_70579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	128.557219469332	233	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	23	1069	808394	843400	FALSE	5	CTTAGCGCTTGGCCTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWAYGSKMAGKKNVLSSLAVYAEDSEPESDGEGGVETAGSATEEKGGLVSEAYGEDDFSRLGGDEDGYEEEDDENSRQSEDDDSETEKPEADDPKDNAEIEKRDPQELVDASSTPLSSCDSEKCLQTLPSVPAEPRHPQWRTTDTNGILASFSERVRNMSPDEIKIPPEPPGRCSNHLQDKIQKLYERKIKEGMDMNYIIQRKKEFRNPSIYEKLIQFCAIDELGTNYPKDMFDPHGWSEDSYYEALAKAQKIEMDKLEKAKKERTKIEFVTGTKKGTTTNATATTTTTASTAVADAQKRKSKWDSAIPVTTIAQPTILTTTATLPAVVTVTTSASGSKTTVISAVGTIVKKAKQ	808371	843650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_808500_809869_809980_812492_812541_831760_831804_833617_833738_836724_836814_839110_839203_840064_840126_840599_840652_841633_841693_842872_842958_843218
775428	contig_14472_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_111195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAGATTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547699	548374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_547700_548400
775433	SIRV6	+	421	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	435	0	262	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
775437	contig_7202_pilon	+	1322	7	Intergenic	novelGene_19110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_6	41.0352152289822	122	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	22	1023	158538	166865	FALSE	40	GATTAATAAAGTATATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARERVEQMKEEKKKQMEQKFAQIDEKTEKAKEERLAEEKAKKKAAAKKMEEVEARRKQEEEARRLKWLQQVRAQEEEERRHQELLQKKKEEEQERLRKAAEAKRLAEQREQERQLAEQREQERQLAEQREQERQLAEQEKRKELERKRERERLQAEREAQEREKALRLQKERLQRELEEKKNKEEQQRLAEQRLQEEQEKKAKEAAVANKGPNVTMDVQSPVCTSYQMTPQGHRGPPKINPDNYGMDLNSDDSTDDEAHPRKPIPAWASGTQLSQAIIHQYYHPPNLLELFGTILPLDLEDIFKKSKPRYHKRTSSAVWNSPPLHGTRVPGSLIYNLKKY	158516	167164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_158604_158996_159132_161267_161516_163475_163555_163715_163824_165016_165168_166650
775438	scaffold_880_pilon	-	1694	15	Intergenic	novelGene_121396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	264.437302086324	258	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	86	1273	311045	271774	FALSE	40	ATGATTAGATAATGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQANGAEAEEEEQAEEDCPELVPIETKRREEEEKPGPGAKIPVTIISGYLGAGKTTLLNYILTEQHSKRIAVILNEFGEGSAVEKSLAVSQGGELYEEWLELGNGCLCCSVKDSGLRAIENLMQKKGKFDYILLETTGLADPGAVASMFWVDAELGSDIYLDGIVTVVDSKYGLKHLAEEKAGGLINEATRQVALADLIIINKTDLVPEEDLSQLRTAIRSINGLGKILETQRSRVDLSNVLDLHAFDGLSGISLQKKLQYVSATQPHLDQNIITVTFEAPGNAKEESLNVFIQNLLWEKNVRNKDGHCMEVIRLKGLVSIKDRAQQVIVQGVHELYDLEETPVSWDDDAQRTNRLVFIGKNLDKDVLKQLFMATVTETGKQRTTHSKEGQVCP	311130	271352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_272251_272382_275217_275284_275386_275456_277107_277160_281388_281446_286467_286513_289339_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
775440	SIRV6	+	379	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	431	46	258	-46	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGCTAAAGTGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	2494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
775443	contig_500_pilon	-	1225	7	Intergenic	novelGene_31095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.191493785024	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCGTAATGCTTGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510611	1500076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500643_1500712_1500796_1501999_1502152_1504329_1504452_1506281_1506358_1507655_1507752_1510481
775444	contig_10115_pilon	-	1006	2	Intergenic	novelGene_171933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	234	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5	310	20242	15802	FALSE	35	GGGATATATTTTCTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEEPESVLQLPPSTAVGGEGLTEVSPEAVTSEPPSSAAVSPGTEEPAGDTKKKIDILLKAVGDTPIMKTKKWAVERTRTIQGLIDFIKKFLKLVTSEQLV	20246	15105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_-_15945_20079
775445	contig_10115_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_171932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACCTGAAAATAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14798	13935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_-_13900_14800
775447	contig_5434_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_74650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTCACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194593	193029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_193000_194600
775456	SIRV4	-	613	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	272	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
775457	contig_6691_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_60161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTAGCAGGGCAGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372545	370502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_370500_372500
775466	contig_8045_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_35412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGGATATTCAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139669	141411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_139700_141400
775467	contig_6164_pilon	+	2899	19	Intergenic	novelGene_121272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_1	63.0835473845383	58	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	56	2590	437009	471325	FALSE	30	AATATTTGAATCCTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSHFASRHRKDLSTDMIRAKIARRKSLSQKENRYKEYERNRHFGLKDSNIPILEHRILAPLDETPQELVPEKANVKPRSAKSVLGDQRKQMLQKYKEEKQLQKLKEQREKAKRGVFKVGLYRPDVPGFLLSLSKSNAVKAEPKKAVSSSVRITRSKAKEQMEQTKINNGNIRAIQSGQRLTSEKKVLDKEKKAVRMTRSATQAANQIARTVSSTTIRKPVSRAANGNELERKAPNKGRPVKKIEAKPDKDISFKVDNKENMLDSQTSATNEVDPDGTLSKVENLPKTNTAKMKGKNSFAPKDFTFQPLDGLKTYQATTMIPTRANAFLTPSYTWTPLKAEVDETEEAKKEILAQKCRTHCTETVQQDSNTAQCPFGSPTVWNKEHVLNKNETATKNSSGLLIYEVPSLEINEGQISQPQHDVPYFRNILQSETEKLTSRCLEWDKKLELDIPDDAKDLIRTTVGQTRLLMKERFKQFEGLVNDCEYKRGEKETTCTDLDGFWDMISFQIDDVNKKFNDLSKLEESGWQQSNNTSKKVVRKKVVSSIASKPKQDDGGRIAARNRLAAIKNAMKERIKQEEHAEAAVSVIPKEVDKIVFDAGFFRIESPVKSFSGLSISSERLSQRPRTPKSVGKAVFQSRAEMNLLRQTMTPENPDPQSIKSEHIVDKTLLPIIPENRNSMVEDAQCPGLQDLVEVNHDANKINFEMDCLPSERMNLLLLAGEVADNTKKMEDMSDVMEGMELKSPIIAQDVLMSSPEKHIPSQNNISQEEETKISLCQSVLFDNKSLTTECHLLDSPGLNGSNPFAQMEGRHQEHARHISFGGNLIAFSPLRPLSGEQPEEF	430681	471634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_430736_437007_437247_439278_439479_441868_441932_443035_443118_443226_443326_444105_444177_447456_447732_448481_448610_448997_449125_451487_451574_452301_452463_456075_456169_460977_461198_463694_463888_466428_466490_467113_467361_468620_468671_471184
775468	scaffold_19766_pilon	-	2141	4	Intergenic	novelGene_34375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCGCCCGGCTCCTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727768	722191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_722245_723431_723736_723923_724234_726294
775472	contig_8060_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_104836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226382	228737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_226400_228700
775482	contig_7119_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_40868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1590	1988	65648	66046	NA	40	CCAAGGCCTTTACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASSLPSPSSALEMSRQPALCALPCRLSSRCSSLMGPQQPASRPDRALTVVFTIYGHQRALLWGCQPARIISFLGFDWLHVSSKNGGIWECVVKGSHRVKCKERLTLSWFSGVRSEHVDKCCGQKLSAQNT	64058	66423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_64100_66400
775484	contig_5479_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_133612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366330	364216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_364200_366300
775486	contig_2704_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_75311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGTCCGGGATACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243752	244698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_243800_244700
775489	contig_1679_pilon	+	1418	8	Intergenic	novelGene_173494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_2	157.58794111122	692	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	5	1063	128771	147485	FALSE	20	GCCGGCAAGGATGAGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMKMASRGFQLLLLPLLLLGPAPAAGHGGKYSREKNEPAPPAKREPEAFRMEKLNQLWEKAQRLHLSPVKLAELHADLKIQERDELSWKKLKIEGLDEDGEKEARLIRNLHVILAKYRLDGRKDAQVVNTNYLQDGTEEEGLEDPRLEKLWHKAKTSGKFSSEELEKLWRELKHHTEKVREYSVLLETLSRTEEIHENVISPSDLSHIKEEVLQSRHAELKEKLRSINQGFARLRKVSHLGYGTEHEFEEPRVIDLWDMAKSANFTQKELESFREELKHFEAKIEKHSHYQKQLELSHQKLRHVESLGDREHLSRSREKYALLEEKAKELGYKVKKHLQDLAGRVSRGRHNEL	128766	147840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1679_pilon_+_128957_133892_134038_136698_136824_140447_140569_141738_141898_143026_143110_144921_145099_147422
775491	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	53	514	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775498	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775499	contig_9771_pilon	-	1514	6	Intergenic	novelGene_156917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	73.0084926566766	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	169	915	346973	332612	FALSE	50	ATAAAAAACCTCAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACLGLYCGKTLLFKNGSTEIYGECGVCPRGQRTNAQKYCQPCTESPELYDWLYLGFMAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLYYAFPYIILVLSLVTLAVYMSASEIENCYDLLVRKKRLIVLFSHWLLHAYGIISISRVDKLEQDLPLLALVPTPALFYLFTAKFTEPSRILSEGANGH	347734	332012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_339573_339756_341990_342198_346911_347067_347659
775500	SIRV6	+	326	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	531	14	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775502	contig_10126_pilon	-	2610	1	Intergenic	novelGene_105705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1305	1757	88642	88190	NA	60	ATATCACTGTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHALCPGVPDISALWALGSLHLSSLFLSLPCLHQGLTPGTPRSTMPLYARAARPLALELVAPLVALPRSLLSLSSIWLTCRVGATIVPAPLAVGEVRGAQGCENALQTRHLVGAHRILPLTMPASCSSLRPSARPRNLGGCSDPKSLLG	89946	87336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_87300_89900
775504	contig_12626_pilon	+	1858	2	Intergenic	novelGene_80442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	743	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAGAGGGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147857	155879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_149474_155637
775505	contig_663_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_163743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAAGGGGCACCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78792	80408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_+_78800_80400
775508	contig_5482_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_144507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654829	652618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_652600_654800
775513	contig_9345_pilon	-	749	2	Intergenic	novelGene_24595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	221	538	945468	944755	FALSE	10	GAACTGTGTGTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQVFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945688	944543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_944992_945387
775514	contig_10864_pilon	+	968	10	Intergenic	novelGene_107079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1	510	894710	903722	TRUE	10	CCGCTTCCTCGTCTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVRLAFIFSSRLARWLLVSSISSTLSSAVRTSLCSFLFSAFSSSSTFSAFSAAVLYRSTCPSSRPILCSKVVISCSAFESLNLYSLICLLASLCISISCKSVPFCSPARSPTALSLLGPFCRSSSSCSFSFLICDSSSSFSPASFRSLTSVAPLLLTPRPGRLPETRR	894709	927863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_894801_895371_895481_896060_896140_896983_897106_902002_902056_903666_903798_911646_911740_919442_919611_924359_924432_927813
775515	contig_5059_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_140714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGACTAAAAAGCAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195554	193778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_193800_195600
775516	contig_9579_pilon	-	1580	10	Intergenic	novelGene_150581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	14.0712472794703	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	39	1328	727133	704088	FALSE	55	ATAAAAAAGTAAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVAKAVRVETSMLSGTGMYIPWLRKEMETVETGGKQEKDFAKTTNACLDLIQEALLKHQWQKAAEYMHSYLQILEDSDTSKRQAAPEIIWRLGSEILYYHPKSNVETFSTFADRMKNIGVMNYLKISLQHALYLLHHGMLEDANRNLSQAETWRYGEKSSSQEILINLIQAYKGLLQYYTWSQKKMELSKLDEEDYAYSTATQNMLNHSCKTSVNLGALIQIPGVWDPFVKSYVEMLEFYGDQDGAREVLTNYAYDEKFPSNPNAHIYLYNFLKREKAPKEKLISVLKILYQIVPSHKLMLEFHRILRNSEKEEHRKLGLEVLFAVLDFAGCTKNITAWKYLAKYLKQTLMGSHLAWVQEQWHSRRNWWPTFHFSYFWAKSDWTEDKALACEKALVAGMLLGKGCRYFRYISKQGHQALKKKIKRMNKSVKRYSIVNPGL	727171	703835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_704201_706507_706663_708165_708290_709010_709078_714971_715131_716163_716295_718175_718375_718842_718957_723646_723817_727075
775518	contig_19061_pilon	+	984	6	Intergenic	novelGene_173498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	10.4192130221049	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	158	982	26218	29921	FALSE	20	TGCGCAGTGGCAGACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEAGSEEDLYEDVCGSSHHYSHSGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRITDGEGWFPATFVRLRVNQDEPVDDETLQARDDGRVVHGEAEDGSLVQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYIRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFIKALEQKFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQRMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDK	10489	29923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_10593_26163_26344_27374_27567_27644_27825_29291_29525_29827
775522	SIRV4	-	254	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1267	0	1267	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3891	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
775523	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	54	523	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775525	contig_7887_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_124867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170467	170752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_170500_170800
775532	SIRV6	+	176	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	556	51	556	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10793	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775533	contig_11105_pilon	+	2329	4	Intergenic	novelGene_159823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_3	18.2086670449969	219	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	224	826	401745	423502	FALSE	15	ACTTGATTCCATGTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLPPLKQGERIIWPLGGLSDSQLLLEPGDRSHWCVVAYWEEKTRVGRLYCVQEPSLDIFYDLPQGNGFCLGQLNSDNKSQLVQKVRSKIGCGIQLTREVDGVWVYNRSSYPIFIKSATLDNPDSRTLLVHKVFPGFSIKAFDYEKAYSLQRPNDHEFMQQPWTGFTVQISFVKGWGQCYTRQFISSCPCWLEVIFNSR	393922	425005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_394080_395361_395416_401732_401809_422963
775534	contig_6510_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_173523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223693	221561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_-_221600_223700
775535	contig_13456_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_153311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTGTGTATTGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574994	575369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_575000_575400
775536	contig_6808_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_173534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTTTGTTTTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330401	329187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_-_329200_330400
775537	contig_8303_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_154922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAACAAAAAAAAACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30759	33103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_30800_33100
775538	contig_5247_pilon	-	889	8	Intergenic	novelGene_81809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	106	489	161449	156408	TRUE	15	TTCTGCTGAGGAGAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFHLLEGIHPKGYTHARAVGKESSKGSLFKEAKYQDLVLHPLLEDRIPPRLADDQVSPLHHHDADKEGSVAGELHNLPLLIGPLLPVAVLHIVYPAVIPAHSHAQQVNREEAILSQNHKVSEEAS	161554	154877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_154908_155499_155670_155809_155966_156363_156412_157773_157901_158020_158153_158462_158571_161436
775541	contig_19185_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_163658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAGTGTGGTAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152319	151385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_151400_152300
775542	contig_11855_pilon	-	707	4	Intergenic	novelGene_66902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	460	junction_1	115.42096863222	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	109	567	738197	733972	FALSE	15	TACCATCTCTTGTGCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738305	733831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071
775543	SIRV4	-	613	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5962	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
775546	contig_20199_pilon	-	1029	4	Intergenic	novelGene_82541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	141	368	43987	41931	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQR	44127	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40991_41030_41288_41870_42078_43906
775547	contig_11337_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_107201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAATTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275631	277813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_275600_277800
775548	SIRV6	+	318	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	533	20	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775549	SIRV6	+	171	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	561	51	561	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10798	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775552	contig_10855_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_124312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGACATAGGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317479	316764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_316800_317500
775554	contig_9578_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_67996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTCATATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228523	1230433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1228500_1230400
775556	contig_11883_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_163783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAAAAAAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129816	132042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_129800_132000
775558	contig_401_pilon	-	2063	10	Intergenic	novelGene_42893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.2565782966318	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	61	921	1831260	1809547	TRUE	15	GAATCGGTGTCCTTCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRTPRSPLHVVQPRWSPRRRTLLPPLPLLLPLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGADGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGISASQCTPIEFDSKGSRMLESSLSSPEGEEIVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINCPKRNFKWPRPCSGPRQRGAMASHCGSLS	1831320	1807752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1808842_1809493_1809617_1810193_1810215_1820753_1820818_1821088_1821135_1821227_1821290_1821509_1821631_1821731_1821845_1823551_1823683_1831027
775560	contig_12969_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_61663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAGTTGTAACCTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277931	277181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_277200_277900
775561	contig_10437_pilon	-	1638	2	Intergenic	novelGene_38362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAGAACATCTGTGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561332	558763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_558800_559730
775563	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	101	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
775568	contig_18898_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_77629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	764	1165	20784	21185	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFNQNCFIKNFYRKVIEDVSQSSSAAPTEIPQVDGFTKRNLFSHSPAGYKSKFRASAAGERFLCRLWREVHVISIPLVWELLCTGTSGPKDTLCSQHCFLGGMRFPCVSAHFSLLYLKRDCIKTLILSTSSI	20020	21689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_20000_21700
775572	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	0	412	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775579	contig_15666_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_70196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAAAAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114308	116030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_114300_116000
775580	contig_10311_pilon	-	1791	11	Intergenic	novelGene_50464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1204.89802058099	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	32	619	71526	68377	TRUE	35	TTGAATGTTGAATAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNSREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPFSILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSCVAICHNAN	71557	65158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65909_67180_67261_67491_67582_67823_67964_68264_68409_68651_68754_68868_69038_69807_69891_70233_70358_70446_70496_71497
775582	contig_7933_pilon	-	554	3	Intergenic	novelGene_164709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4810	junction_2	276	25164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	86	388	238534	233326	FALSE	30	CATACTGGAGCGTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGKISAGSRPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	238619	233159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430_234584_238531
775584	contig_299_pilon	+	1887	10	Intergenic	novelGene_129457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	187.939706643735	18	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	83	1195	974207	992228	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDENSNAKIKQNRVLVCAPSNAAVDELMKKIILEFKEKCKDKKNPLGNCGDINLVRLGPEKSINNEVLKFSLDSQVNHRMKKDLPCHVQEMHKRKEFLDHQLDELSRQRALCRGGREVQRQELDEKIAKVSKERQELASKIKEVQGRPQKTQSIIILESHVICCTLSTSGGLLLESAFRGQGGVPFSCVIVDEAGQSCEIETLTPLIHRCNKLILVGDPKQLPPTVISMKAQEYGYNQSMMARFCKLLEENVEHNVIGRLPVLQLTVQYRMHPDICLFPSNYVYNRNLKTNRVTETNRCSSDWPFQPYLVFDVGDGSERRDNDSYINVQEIKLVMEIIKLIKDKRRDVTFRNIGIITHYKAQKMMIQKDLDKEFDRKGKTLDQMTSLVNSTKCLKKR	974124	992920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_974265_980749_980852_981043_981160_982238_982311_984211_984362_985542_985651_988196_988385_989175_989269_991474_991640_992167
775588	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	0	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
775591	contig_10235_pilon	-	880	4	Intergenic	novelGene_46299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	262.908095475713	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	3	845	85340	83519	FALSE	25	TAGTGCTGCCAATGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVLSVPITVLTVLALVPQERGGLVTETADLGGQTQQQLEFQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGVPGLDCSYQDRIPRKPTDHFFCRLLEDWAGVRLGDEERRSVSEKRHAVLRRGGAGPAAGRPLLPLLLRRLPGPGAPCRPRTPRPLGHAAQLAVPCWGRLRARDSPAAARGCRDCYIGFGPGQEARIRTPLVHERRVRRSGAAPEGREGVRQHQSPRYGGLQEREDFLWGCDGGVRAARVLGNTTAWYNCVNQPRYWELRHLGAHGSGKKCRKQFGN	85342	83483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84172_84567_84640_84830_84877_85268
775592	contig_15918_pilon	+	1905	11	Intergenic	novelGene_132720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	101	junction_1	45.377196916513	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	88	1512	195890	250656	FALSE	25	AATGTCTCAAATTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTAESLDPGSRPDPVRSFNRWKKKHSHKQNRKKQLRKQLKKPEWQVEREVISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSADGLGILIISPTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETICFHATNLQMLVLDEADRILDMGFAETMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFMRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRLRPGISILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAILFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEGGEALLILLPSEEKGMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKMESFLAQDKDLKERAQRVSP	195802	251049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_196076_208109_208171_208520_208652_210044_210204_211291_211413_213016_213207_214818_214946_219352_219516_226449_226535_248772_248875_250556
775596	SIRV6	+	474	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1210_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775598	contig_3147_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_142290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAACAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321283	322590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_321300_322600
775600	contig_6870_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_103997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTAGACTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503522	1501392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1501400_1503500
775611	SIRV6	+	550	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1168_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3177_10734_10819_11031_11109_11205
775612	contig_5642_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_153030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAATGAAAACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89766	91174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_89800_91200
775613	contig_3132_pilon	-	2024	9	Intergenic	novelGene_127451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	17.7253349756782	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	216	848	368021	361121	FALSE	35	TGAACTGTCTGCAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVVFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNLLTKRAPPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIQGICVKDKNHSEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMAAPGMILLPVLMEQLEKLHFMKKVKVLHAPLQVMLSGCSLIFMVPVACGLFPQTCELPVSYLEPKLQDTVRAKYGELVPYVYFNKGL	368236	359944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_361221_362047_362096_363923_363974_364326_364377_365018_365086_365467_365529_366805_366892_367360_367437_367926
775614	contig_5549_pilon	+	1046	6	Intergenic	novelGene_81585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1600.6009371483	4	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	59	622	82155	93655	TRUE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKVVWTN	82096	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_93637_93779_96620
775615	SIRV2	-	277	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	23	648	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
775618	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775623	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
775626	SIRV6	+	187	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	545	51	545	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10782	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775627	contig_1154_pilon	+	1556	2	Intergenic	novelGene_87211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAATAAAAGGACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291975	1293633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1292400_1292501
775628	contig_12724_pilon	+	1755	2	Intergenic	novelGene_146858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	68	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	90	335	153870	160010	FALSE	30	CTGTCACAAGAAGGAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSVLVGNINIWICRLETILTWQQQLQNLQMTKQVNNGLTLSDLPLHMLNNILYRFSDGWDIITLGQVTPTLYMLSEDRQLWKKLCQYHFAEKQVSTTAELPPSRVHEFSR	153780	161430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_153879_159773
775631	contig_6589_pilon	+	1260	12	Intergenic	novelGene_26225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	178.340560086316	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	15	1130	2048791	2059863	TRUE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVKMAAAEAANCIMENFVATLANGMSLQPPLEEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048776	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051047_2051102_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779_2059916_2059981
775632	contig_12427_pilon	+	1640	11	Intergenic	novelGene_40504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_9	149.46989663474	19	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	217	1329	411330	419950	FALSE	30	TTTGTCTATCTGGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	410249	420261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
775639	contig_4402_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_140787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGCAGTAAAAAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152960	150828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_150800_153000
775641	contig_1865_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_103245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGCCTTTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156554	155862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_155900_156600
775646	contig_15221_pilon	-	1353	3	Intergenic	novelGene_133075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	184	junction_2	1	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	255	494	182332	149410	FALSE	15	TTTTGAAATGTGTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECVPENLELKKKIFVQLDPVIDDKVVISSSSSCLLPSKLFAGLTHVKQCIVAHPVNPPYYVPLVELVPHPETDPSTVDRTHALMKKIGQTPIRIQKEIDGFALNRIQYAIISEAWRLVDEGVVSPSDLDLVMSDGLGMRYAFVGPLETMHLNAEGTVCSIWS	190693	148550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_-_149542_182224_182420_190526
775647	contig_12050_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_62658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGTTTGCTGTGTAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386584	388067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_386600_388100
775651	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775655	SIRV5	+	402	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1141_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
775656	contig_3817_pilon	+	1652	3	Intergenic	novelGene_78373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	65	670	832431	833837	FALSE	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSSPWSSERGCGGQAGGVVSLARGPVSGRAGSRGGWAVHGRQEVDDLGPLSWADVLAQVDDAVHGHLGVLLDQASDGLEDKVALQVLDVLADGGVQAVPPLPVLLQPLHHHLVVVPQVGLDSPLSLHEPAAQHGLCVHVAQLPAGLQDLLLDLVLQQQAAQAPVQKLARRLPLQDVLQTNPGLSPRQGREETGRGGQAR	832366	834819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_832657_833358_833495_833593
775658	SIRV2	+	374	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	305	1451	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTACCTGGTTGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4338	5908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_4479_4686_4800_5787
775659	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775661	contig_14353_pilon	+	1123	7	Intergenic	novelGene_82108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	343	705	80171	82583	TRUE	45	ACTGTTCTGCTAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQPAQRAPSWMSPPHFQVVDGRQVLQAVAVFTQVLAIHGHLEAVAFTQYPHREVLAAAEGHFPRQAALLRPPGIVDLCVADHSILIEAGVEVEGDVTARAQVDVEPVGRQLTSATFAH	79828	86347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80203_80495_80621_82377_82785_83259_83299_83900_83951_84504_84542_86256
775662	contig_10569_pilon	-	1272	4	Intergenic	novelGene_44099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	13.6707311029399	125	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	88	342	466480	466226	TRUE	40	CTTAAAATTTGGAAGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGRGQQVRLWARYKSAFDCWGRASSWWNMANSGYGNCSDHEENSFLYFAYGSNLLKERIHLQNPSAAFCCVACLQVSAPPPALQNVVPRLQTKEKNKRVAVRSVLTHSDPIG	466567	454834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_455398_457154_457290_458214_458365_466143
775665	SIRV4	+	299	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTGGGCCGATTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3652	3951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
775671	contig_16846_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_82977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTTCCTCATCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550866	551591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_550900_551600
775673	contig_6589_pilon	+	1197	8	Intergenic	novelGene_26044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	963.97658537065	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	429	1181	1728220	1730817	FALSE	10	CCATTGCGGCTCTGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSIANTFLSCPLCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCGLVLHIPADLVQGPGHLRNPHHGPRPLRLCGGTQGAPLPPGFVFWDAAAPVCHPDHPGNPHLHAKDLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVSVVGLSLLLPRSALYREPQAQVPATSGSSPAPGLSADGGGGRGGMLSSSGRNSSLWGGWGMGGACPNWGDKAPQGKLPMALGPWPLWDQDEEQRETGSVGAEVEAEGEADEPLE	1725413	1730833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727247_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1730469
775674	SIRV6	+	351	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	528	-1	-37	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCGAAGTTGTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775679	contig_5711_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_80281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTTTTTAGTGGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121893	122717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_121900_122700
775681	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1041	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775682	contig_8580_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_156094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	119	316	266410	266213	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHTDRQAPTTNGCYHFGGGIAAQDQPAGGHVLLHGSAQGMLSVFGELVYLCQQNHCSQKQENKRSLGYLSSAPPRHSEILNKPGLLYDSLPFGNSKLKLEVWLQ	266528	264430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_-_264400_266500
775683	contig_16643_pilon	+	2066	12	Intergenic	novelGene_158103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_6	82.7703184712655	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	49	1626	114473	153858	FALSE	60	CTAAAAAAAAAATTCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPDAAAATATCAALSKMSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAFLVIPLHQTGKLDPHFPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFQIASCSEDTTIKIWDIPKQLLSKNLTVFKKELVGHSRRVGLLEWHPTAADILFSSGYDYKVMVWNLDTKECVIMRPVRTIDCHQDVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRILDPRVGTVLKEANYKGHRANKVLFLGNLKKLLSTGTSRWNNRQMALWDQDDLSVPLIEEDLDGSSGVLFPFYDVDTNMLYVVGKGDGNIRYYEVSSEKPHLNYLSEYRSYHPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPVSMIVPRRSESYQEDIYPSTAGAQPSMTAQEWLSGMNRGPLLVSLRPGSELLTPRPQPPGRPLSNSMAPASPRSPDLMGKLAPEGGRRLFSLLEEKVPRRAAEHRLEEKKAWLTNGFDVFECPPPKTENELLQMFYRQQEEIRRLRELLTQREVQAKQLELEIKNLQMGSGRF	84003	154298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_84052_114472_114674_141931_142049_144665_144816_145624_145805_146528_146646_147799_147905_148956_149054_150082_150196_150513_150605_151619_151895_153726
775688	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775689	contig_9414_pilon	+	1985	5	Intergenic	novelGene_131076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	201.158364230772	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	659	1033	393112	396291	FALSE	30	CTTTGGGTAAAGGTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDSGTSLCHNSILWSHSHNQSQKKEETVSNPEAIVQTQHPHYSREELNSMTLAEVQQLNAKLRQQIQEVFEELTHQVQEKDSLASELHVRHVAIEQLLKNYSKLPCLQVGRTGMKSHLPINN	369484	397243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_369642_370401_370511_392719_393257_394244_394308_396124
775692	contig_14326_pilon	+	2140	5	Intergenic	novelGene_120735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	969	1403	441913	443033	TRUE	25	TGCAGGCCACAGGGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVIGSYPARLHTAQRQPLTWTPCGVSCLIYPRISLPLETIPQQPQPGRDLKGAQSLPKTNLLSCFQLEVEVLGGLKDEHDGGAQVEFTQVLALAHGDALLVGVRHEAEVVVGAFAVPRAVCVQVPVKVNADGTHVGGSHGSQ	440944	444332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_442290_442975_443154_443418_443655_443788_443932_444094
775697	contig_8712_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_58886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGCACAATAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017425	1015170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1015200_1017400
775698	contig_13172_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_146329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAAGTTTATCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80218	78526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_78500_80200
775699	contig_6735_pilon	-	1263	6	Intergenic	novelGene_15827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_2	14.8781719307178	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	205	924	675494	657030	FALSE	25	GACTTGTCAGGCATACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNLHKAACVIQAYWKGFQTRKRIKKLPSAVTTLQRSFRTKRTKILLKLNRQKEEEDHRLQLQLQRQRAMRLSRESRLSLLEIVHPGQVEKHNREMEEKSALIIQKHWKGYRERKKFHQQRPSLMEYKAAVTLQRAALKFLAKCRKKKKVFVPWQGLRGLTDARRVELKQQVDDYVRRHPSSPMSDVASRELHAQAQERLQHYFMGRALEERAQQHREALMAQISTNIEQLMRAPSLKEAEGKEPELFISRSRPLAAKAKQGHLATLKHIQAPWWKKLGEEPGDEIDVPKDELSIELGTLFIGGTKPP	680433	656690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_657260_658167_658325_660619_660752_667078_667228_675442_675586_680320
775700	contig_13528_pilon	+	1756	9	Intergenic	novelGene_66853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_8	458.268735978138	21	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	18	1466	12393	36332	FALSE	40	TTAAAATTGCAGTCAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAGICGLGVKADMLCNSQANDILQHQDSNCDVTSNKHSLEEDEGSAFITNNRNLVSPAYCTQESREETPGQEARTDPPDGQQDSECNRNKEKTLGKEVLLLMQALNTLSTPEEKLAALCKKYADLLEESRNVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQSEHSKAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQVQLEQHDVHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKEADEKHQREREFLLKEATESRHKYEQMKQQEVQLKQQLSLYMDKFEEFQTTMAKSNELFTTFRQEMEKMTKKIKKLEKETIVWRTKWENNNKALLQMAEEKTVRDKEYKAFQIKLERLEKLCRALQTERNELNEKVEVLKEQVSVRAADVELVTPASQPCTAPESHKEPSQAGGGGVPRAPLAAEPEAAQETLWAGTVPSIDSVD	12375	36622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_12682_13900_13993_21896_22068_25270_25466_27587_27708_29216_29292_32284_32378_34947_35044_36014
775702	contig_16907_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_87445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416133	414307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_414300_416100
775705	contig_8254_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_48389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCATGAAAAGGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82915	83518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_82900_83500
775707	contig_12837_pilon	+	1459	4	Intergenic	novelGene_57405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTGTATATTAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463878	480042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_465176_470112_470154_474263_474342_479999
775710	contig_6356_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_126424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTAAGGGTTCTCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31546	29779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_29800_31500
775711	contig_8182_pilon	-	2238	10	Intergenic	novelGene_173261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	35.4216227469139	14	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	881	1627	377569	280314	TRUE	55	AAATAAAATTATATTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDGMEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHRVRTS	417646	254675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_254902_260075_260145_272886_272951_272994_273131_280197_280330_293553_293787_332473_332654_344351_344544_377443_377624_416820
775712	contig_10864_pilon	-	1840	3	Intergenic	novelGene_107084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1132	junction_2	214.5	90	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	683	982	924384	911633	FALSE	75	TACTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMDELKEGLRQRDELIEVCA	925066	910774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_911738_919440_919612_924360
775720	contig_6710_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_97575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
775724	contig_16204_pilon	+	2239	10	Intergenic	novelGene_154502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	110.971467804417	463	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	234	917	277830	287228	TRUE	25	CTGGAGTGTGGAGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGTDPCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYSPEAEVLCRTLGCGTLNRVPKGLPHSLLGMMYYSCTGGEPTLSDCSWRFNNSNLCSQSLAARVICSGVRNLSSLEVPASFQPVTVESSVTVRMEDKESLQLILLIPCIILGILLLGSFISIVFLLLKVKGKYALPIMANHQHLPTTTPVGINSYQEASITIPKEEVPKLPIQVRAPPPEDSDSGSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDDEAQQSRFQMPPLGGRSPYPGSSAPPRTQQWLQHIFRGGLL	276362	289372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_276405_277638_277942_280214_280272_283083_283225_283554_283654_284821_284945_286670_286744_287149_287345_287610_287740_288295
775728	contig_11281_pilon	+	1438	2	Intergenic	novelGene_125415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTAGGCTTCCCATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8545	27346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_9423_26785
775729	contig_6138_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_159691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGCCCCAGGTCACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596210	597994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_596200_598000
775730	contig_5502_pilon	-	2308	20	Intergenic	novelGene_154993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	140.3473925006	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1521	788	2308	445753	417618	FALSE	20	GCAGGTGGAGTTGGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFSSSRPKRRKTADKYIESSDSEEFETTELPQKTKGKLKNAKSETKSRGKGLSAVEESKKTDLGEKPRTTLIICPLSVLSNWIDQFGQHIKSEVHLNFYVYYGPDRIRDPALLSKQDIVLTTYNILTHDYGTKGDSPLHSIRWLRVILDEGHAIRNPNAQQTKAVLDLEAERRWVLTGTPIQNSLKDLWSLLSFLKLKPFLDREWWLRTIQRPVTLGDEGGLRRLQSLIKNITLRRTKTSKVKGKPVLELPERKVFIQHITLSDEERKIYQSVKNEGRATIGRYFNEGTVLAHYADVLGLLLRLRQICCHTHLLTSAVSSSGPTGNDTPEELRKTLIRKMKLILSSGSDEECAVCLDSLTVPVITHCAHVFCKPCICQVIQNEQPNAKCPLCRNNIDGNNLLECPPEELASNTEKNTNMEWTSSSKINALMHALIDLRTKNPNIKSLVVSQFTTFLSLIETPLKASGFVFTRLDGSMAQKKRVESIQCFQNTAAGSPTIMLLSLK	457156	417617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_417742_418063_418177_418527_418654_420495_420675_421567_421693_426622_426803_428391_428528_429245_429385_430295_430440_436176_436275_443718_443764_443855_443936_445721_445816_447105_447179_449806_449904_452469_452662_452815_452891_454154_454253_455347_455482_457100
775742	contig_10494_pilon	+	2096	8	Intergenic	novelGene_102222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	62.5156306985113	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	155	1549	1254686	1295355	FALSE	15	TCTCTATGCATTTGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLVTLPLRRLAWAWASGWPAPLKHRGRGLLHTASTTCPDSSAPVFTRALAFGDRTALVDQHGHHTYKDLYQRSLRLSQEICRLRACTSGDLGEERISFMCSNDASYIVAQWASWMSGGVAVPLHSKHPAAQLEYFIQDSRSSVVMAGPEHLELLGTVASKLGVPLLPLLPDIYSGAAEGLVGGEAPAPSWKEWGWKERGAMIIYTSGTTGLPKGVLSTHCNVSSMVTGLVDKWTWTPDDVILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTADNLG	1240302	1295902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1240418_1254646_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283905_1284033_1295338
775745	contig_5331_pilon	-	1501	7	Intergenic	novelGene_112834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	98.1014214417349	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	62	724	784416	779458	FALSE	20	AGTCACGGACACTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAEAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSLTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN	789031	778680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985
775746	contig_1230_pilon	-	1234	5	Intergenic	novelGene_28882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCAATCTCAATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408995	406669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_406859_407164_407348_407584_407787_408002_408243_408575
775747	contig_10386_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_173540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTAACTGTGTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95303	93041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_-_93000_95300
775748	contig_8978_pilon	+	2202	15	Intergenic	novelGene_49362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	152.571629213351	21	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	138	1970	215493	222003	FALSE	15	GGGAGTGTGTGAGTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPADPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQTAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPNTNIFGRF	214648	222235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_214685_214875_214966_215481_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218251_218449_218625_218704_218794_218850_218924_219010_220556_220750_221301_221476_221675_221758_221959
775753	contig_934_pilon	-	1013	7	Intergenic	novelGene_129021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	303.195573113388	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	347	688	158890	150570	TRUE	20	TTTCACTGTTTTGGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVVEGEKGAEAANVTGPDGVPVEGSRYAADRCRYRRGYYGRRRGPPRNYAGEEEEEGSGSSEGFDTPATDGQFSGAQSQLRRPQYRPQYRQRRFPPYHVGQTFDRRSRVFPHPNRMQADEIGEMKDGVPEGTQLQGPVHRNPTYRPRYRRAPPRPRPAPAVGEAEDKENQQAASGPNQPSARRGYRRPYNYRRRPRPPNAPSQDGKEAKAGEAPTENPAPATEQSSAE	163619	148143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153_151326_152947_153046_158884_159092_161354_161478_163597
775754	contig_2537_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_33433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAGCAACAAAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289354	290408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_289400_290400
775755	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
775756	contig_3103_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_146216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAAACTGAGGGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505040	506199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_505000_506200
775757	contig_14980_pilon	-	1156	9	Intergenic	novelGene_78216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.856406460551	430	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	28	1023	240461	203038	FALSE	5	TGGTTTGGTCTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVALSEAEKVYIVHGVQEDLRVDGRGCEDYRSIEVETDVVSNTSGSARVKLGHTDILVGVKAEMGTPKLEKPNEGYLEFFVDCSANATPEFEGRGGDDLGTEIANTLYRIFNNKSSVDLKSLCISPREHCWILYVDVLLLECGGNLFDAISIAVKAALFNTRIPKVRVLEDEEGSKDIELFDDPYDCIRLCVENVPCIVTLCKIGYRHVVDATLQEEACSLASLLVSVTSTGVVTCMRKVGKGSLDPESIFEMMEVLQRTQHSGNASNSEAGASGHSVGCYPNLCNLLPASPRSRTGKRVGKVLHTSLQSVLHKEESLGPKRQKVGFLG	240488	202904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_203143_204281_204402_206114_206271_207925_208050_212379_212451_216619_216786_228506_228602_228877_228980_240404
775758	contig_15691_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_60767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1677	2039	59250	58888	NA	45	TCTGATAAATTACTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADCHIFLPWSSWWAQTANLLVSSRHLTTSPPPVLLLPMPPPITVNQLLPWFPNCTKAPLGSRSKLIRGTVGHLTFQGKRGRVCQTTHELASPLDCTVSLPIGSICEVRFLVGAVMESK	60926	58171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_58200_60900
775760	contig_16578_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_148661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCGCTCCTTGGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208134	206320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_206300_208100
775763	contig_14362_pilon	+	2001	6	Intergenic	novelGene_142529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_2	384.344845158615	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1060	1416	59441	62432	FALSE	25	ATGATTGTGTAATGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSFLTPKKEVEHFDVATHLRTAPELVDRVFNRPTVETLRKEKVKGVTHQTQFKRIAKERQKQYNHLTQRIKREKELFVVAQKIQTRKDLLDKTQKVKVKSATVNSPAIYKFQSRRKR	57498	63017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_58380_58783_58898_59376_59472_59572_59704_61578_61690_62348
775764	SIRV5	-	297	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
775765	contig_16156_pilon	-	2111	9	Intergenic	novelGene_137070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_5	25.5819760769179	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	28	1218	160245	99837	FALSE	35	TATTTCTGTGTAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKAVESIQAEDESAKLCKRRIEHLKEHSSDQPAAANVWKKKRMDRMMVEHLLRCGYYNTAVKLARQSGIEDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160272	98943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_123176_123381_133371_133555_160176
775767	contig_6710_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_93642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653817	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
775768	contig_8357_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_39755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAGATAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784190	786806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_784200_786800
775769	contig_9988_pilon	-	1513	7	Intergenic	novelGene_113066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	17.6894507169292	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	6	818	532674	244432	FALSE	30	AACTTGTCATATAGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMIQKPHKAATFFGCIGVDKFGEILKTKAAEAHVDAHYYEQNEQPTGTCAACITGDNRSLVANLAAANCYKKEKHLDLEKNWLLVEKARVCYIAGFFLTVSPESVLKVARHASENNRIFTLNLSAPFISQFYKEPLMKVMPYVDILFGNETEAATFAREQGFETEDIKEIAKKAQALPKVNSNRSRTVIFTQGKDDTIVATESDITSFAVLVQDQREIVDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIHAGHYAASVIIRRTGCTFPEKPDFH	532679	243736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_244557_285008_285096_348842_348958_367853_367890_428008_428180_528981_529091_532504
775776	SIRV6	+	490	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1175_1465_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775777	contig_4832_pilon	+	1584	13	Intergenic	novelGene_163395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	327.506859554965	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	74	1006	248049	293664	TRUE	55	AGAAAAAAATGCACTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVARVCRGLGSREWRHEPSLHFTMSFLIDSSIMITSQILFFGCGWLFFMRQLFKDYEVRQYVVQVIFSVTFAFSCTMFELIIFEILGVLNSSSRYFHWKMNLCVILLILVFMVPFYIGYFIVSNIRLLHKQRLLFSCLLWLTFMYFFWKLGDPFPILSPKHGILSIEQLISRVGVIGVTLMALLSGFGAVNCPYTYMSYFLRNVTDTDILALERRLLQTMDMIISKKKRMAMARRTMFQKGEVHNRPSGFWEMIKSVATSAPGSENLTLIQQEVDALEELSRQLFLETADLYATKERIEYSKTFKGKYFNFLGYFFSIYCVWKIFMVTSFWLE	247975	295286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_248091_263349_263410_264470_264575_265796_265904_266329_266432_275886_276008_279287_279369_284328_284439_286314_286404_287347_287445_293644_293709_294615_294682_294818
775779	contig_9505_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_121837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498749	497408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_497400_498700
775782	contig_11258_pilon	+	1485	5	Intergenic	novelGene_67801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	220.110625595404	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTTGTCAAGAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285312	293393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_285795_288174_288304_291798_291915_292450_292527_292711
775786	contig_10058_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_67708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCACAATACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54256	55649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_55600
775788	contig_14467_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_138282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGAGATGGACTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366330	363864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_363900_366300
775790	contig_11427_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_79028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGCTGTTGTGGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832641	832335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_832300_832600
775792	contig_10793_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_83445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGATAGATTGACTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165507	166367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_165500_166400
775796	contig_3837_pilon	+	2365	2	Intergenic	novelGene_104014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	249	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGCATAGAGGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66992	70146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419
775797	contig_3837_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_104021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGGGTAGTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70146	70340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_70100_70300
775798	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
775799	contig_9415_pilon	-	2035	4	Intergenic	novelGene_109882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_3	37.4966665185054	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1361	1930	2055038	2051762	FALSE	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCMRAFLERLPMMLQEQYAYEKPHVVCGDQLVHSPYMQCLASLAVGLHLDQLLCNPPVPPHHQNCLPDPASWNPNEWAWLECFSTTIKAAEALTNGAQFPESFTVPDLEPVPEDELVFLMDNSKWINGMDEQIMSWATSRPEDWHLGGKCDVYLWGAGRHGQLAEAGRNVMVPAVAPSFSQAQQVNG	2056398	2051656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2051900_2052047_2052114_2053310_2053605_2054966
775800	contig_6710_pilon	+	485	2	Intergenic	novelGene_98067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTCTGCTGTACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653428	657503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
775803	contig_6929_pilon	+	571	2	Intergenic	novelGene_139420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8749	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGCCTTTGTGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130763	132312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948
775804	contig_2716_pilon	-	2220	10	Intergenic	novelGene_173558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	63.4713894912552	12	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	123	998	723553	694806	TRUE	35	CCAATGTGTATAATGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPVWTAFERSGNLFALPSTRYTFVLFDFRLCQIRNGISKMHCLWQSLDNKNAGFWSTFVPLWLAASPNSKGSPQSYGKGKLPPGPTPLPIIGNILHVDVKDISSSLRNFSKAYGPVFTLYFGMKPTVVLHGYEAIKEALIDLGEEFSGRGHSPVAERASKNFGVIFSNGKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSTEDRIQEEARCLVEALRETNASPCDPTFILACAPCNVICSIIFQKRFEYTDQDFLNLLEKLDENTQIVSSPWMQFCNAFPMLIDYFPGSHNKLLNNVAYLRSYFLEKVKEHQESLDINNPRDFIDCFLIKMEQGQVPP	723675	666393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_667244_678339_678482_691890_692079_694763_694824_702787_702965_704082_704244_709137_709288_709460_709624_711234_711337_723448
775805	contig_19459_pilon	-	1175	8	Intergenic	novelGene_59871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5713.61951830886	4	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	49	813	16240	7032	FALSE	10	CTGTCTTCTTGTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGVVVKRLAGKQNKIMASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSAVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQVDWPSSAVFYQMLKVKMLSLYSTTTDHLSL	16817	6669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7784_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12707_15503_15702_16203_16247_16775
775806	contig_3270_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_104507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGAAAGCTTGAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382078	382910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_382100_382900
775807	contig_3270_pilon	+	539	6	Intergenic	novelGene_104439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1374	junction_1	4370.44833398131	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	35	505	44259	46726	FALSE	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAICGGAATKMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44125	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44241_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
775808	contig_18072_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_173566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTATTTTTATCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226617	229172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18072_pilon_+_226600_229200
775809	contig_18072_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_173567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTTAAGTGAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229323	229832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18072_pilon_+_229300_229800
775810	contig_6710_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_96858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653699	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
775821	contig_5424_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_172809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCCACTGGGCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109129	107435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_107400_109100
775822	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
775829	contig_12644_pilon	+	1179	8	Intergenic	novelGene_44652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4910.39956809701	1	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	384	1091	2679092	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGSRRVERSVAFSPCHGVCSSTDISVLRKGRIIWQKCYFACCVHGSHSTGYCELCPHQLAKKQQAALCCQVTSVELALPGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677384_2678691_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
775830	contig_11978_pilon	+	1255	3	Intergenic	novelGene_63037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	473.5	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTGACTCAAATAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645324	1649685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1645382_1646686_1646976_1648776
775837	contig_15084_pilon	-	1793	2	Intergenic	novelGene_116689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGGAAAGTAGATCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174622	172155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_173305_173978
775840	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	51	520	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775841	contig_14618_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_136858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	130.968698550455	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	38	769	1279836	1353959	FALSE	5	ACCCCTCCCCGTGCGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVEQVLSLEPQHELKFRGPFTDVVTTNLKLGNPTDRNVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDAGASINVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQSMFAPPDTSDMEAAWKEAKPEDLMDSKLRCVFELPAENDKPHDVEINKIIPTTASKTETPAVSKSLSPSLDDTEVKKVMEECKRLQGEVQRLREENKHFKEEDGLRMRKTVPSNSPVSVLATAGREEGLSTRLLALVVLFFIVGVIIGKIAL	1279798	1354082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1279894_1327229_1327383_1344838_1344943_1348517_1348599_1350878_1351056_1353800
775846	contig_610_pilon	+	1450	6	Intergenic	novelGene_76798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	163.203431336476	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	22	915	296008	340593	FALSE	25	TTATATATTATTCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTNDSGSTWRIVRTRRSHPKVESQPKPC	295986	341128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_309314_309419_313377_313441_340512
775850	contig_1734_pilon	+	2169	14	Intergenic	novelGene_164373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1020	1448	580709	597083	TRUE	60	AAGAACTGGGGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLPQVAGWDVYNNVLILDHVSQRMYKFRCLHVIQIRGSVPGGCHCLLPSNQPIGCYDHSLVAFKRCQRNSNGRAITGNISISIRFIFIRKLYFIFSRYLLTSIRNWLGYRQLYHISPNMSSLISRSCESQLLRGMKFYRIY	516150	646259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_516840_521377_521493_521990_522127_580629_580771_582198_582440_588211_588292_590495_590540_597081_597159_598598_598732_602350_602418_602748_602843_612425_612523_617227_617407_646183
775851	contig_17436_pilon	+	2232	17	Intergenic	novelGene_164175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	29.4297362373501	161	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1044	1877	100517	141012	TRUE	50	TCACAATGTTAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYNAPPLKEWIDTIQEHDLSETNVYLIGSTPGRFQGNQKDNWGHFRLRKLLREHTSPIPKAETWPIVGQFSSIGSMGADESKWLCSEFKESLLMLGKEGKALGKSAAPLHLIYPSVENVRTSLEGYPAGGSLPYSIQTAEKQNWLHSYFHKWSAETSGRSHAMPHIKTYMRPSPDFSRIAWFLVTSANLSKAAWGALEKNGTQLMIRSYELGVLFLPSTFSMQSCFQSMQCPTLTEKSENRRTQQVFCRLWPGQLQRETEILLRQPGADSVLSCAV	68773	152772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_68813_77834_78415_81547_81592_82800_82857_86293_86391_89607_89643_97400_97496_100419_100588_101058_101138_106653_106840_107459_107509_110438_110506_112318_112427_128543_128647_133332_133424_140932_141042_152446
775855	contig_8914_pilon	-	486	3	Intergenic	novelGene_112857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4224	junction_1	1718	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	5	442	265795	264566	FALSE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	265799	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589
775856	contig_1399_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_166675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATCTGGCTATGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573908	575060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_573900_575100
775858	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
775859	contig_5361_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_167220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	107	307	578127	578327	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPRATVPNPNQLAPRSRPSPHFQTTAQLGRSVAAMESENLRIQRAPPDRLYLRQHNESYRRLFRGTLSRYRCNFMCSIYNCLSSFEKVQLEKTIFSISQP	578020	580883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_578000_580900
775860	contig_6589_pilon	-	975	7	Intergenic	novelGene_25903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_5	214.287708985425	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	204	827	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFDPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178543	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1177927_1178100_1178424
775861	SIRV6	+	337	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	11	670	4	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCGCACAAGTCGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	1870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
775865	contig_12993_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_136732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGATTTCACACAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95445	93665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_93700_95400
775866	contig_11518_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_109127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	313	732	51648	52067	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFFKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRILLFVPRRAPFDLFENRKKKNVKLYVHRVFITDNCEELIPEYLNFIRGMVDSEDLPLNISCERFQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELVEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNWKKLSELLRYYTSASGAMIVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLQKHVLEVSDLYDRAH	51335	53359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_+_51300_53400
775867	contig_6589_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_25931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTGGTTTATTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211579	1213302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1211600_1213300
775869	contig_6344_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_157112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAGATGCAAATCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125931	1126587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1125900_1126600
775870	contig_5549_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_81702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAATAAAATATGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850944	849903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_849900_850900
775872	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	505	-1	-335	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAGTCGAAGTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
775878	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
775879	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775880	contig_6589_pilon	-	1378	13	Intergenic	novelGene_26252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_12	58.0356691086515	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	308	1318	2231995	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSAGRVVGRVSWAGILWSEVAPEPEQRAQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233753	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2231914_2232215_2233665
775882	contig_11050_pilon	+	924	3	Intergenic	novelGene_173572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2	667	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	225	566	98338	98679	FALSE	15	TGGGGACCATTTCTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAELSVQSSHQSGYQLPAARRTADWHRARANRSRSEGRSSTPGGEDREEEETARIGPGILVLKEQQPGKENFIMANMHQENEEMEQAPIQNGEEARPLGRGEGHQPAGNNRRGQARRLAPNFRWAIPNRQFNDRMGGDGDDMEMFMEEMREIRRKLRELQLRNCLRILMGELSNHHDHHDEFCLMP	97420	99037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11050_pilon_+_97527_97910_97982_98290
775884	contig_13481_pilon	-	1805	10	Intergenic	novelGene_119258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	242.549422226115	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	162	1085	40189	5137	FALSE	60	TGAGCAAAGGAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLYTNEYVAIKLEPIKSRAPQLHLEYRFYKQLGSAGEGLPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDLFDLCDRTFTLKTVLMIAIQLLSRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRQGNKKEHVIHIIDFGLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGSLPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRNTPIEALCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYEYLRTLFTDLFERKGYTFDYAYDWVGRPIPTPVGSVHVDSGASAVTRESHTHRDRPSQQQPLRNQVVSSTNGELNVDDPTGAHSNAPITAHAEVEVVEEAKCCCFFKRKRKKTAQRHK	75765	4416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_5192_12429_12537_32615_32724_33372_33522_33796_33882_35757_35844_38516_38752_40090_40243_69962_70033_75727
775886	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
775888	contig_9484_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_105693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCGAAGAATATGGTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239348	237534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_237500_239300
775889	contig_9484_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_105691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237534	236379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_236400_237500
775892	SIRV6	+	206	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	515	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11210
775893	contig_15105_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_150997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGAAATTCCCAGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795513	795809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_795500_795800
775897	contig_12837_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_57381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTGCTGGCCCGTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377361	377835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_377400_377800
775899	contig_13437_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_131642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTATTTTTATAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12631	13093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13437_pilon_+_12600_13100
775900	contig_1639_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_74893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAACTAAAAAAAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283525	280960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_281000_283500
775906	contig_9097_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_173578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	721	2163	33	2195	211672	209510	NA	60	AAGAAGATAAAAAGGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLARSLLQLDHGRLRLYHDSTSIDKVNLFILGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYLLSQLWTAAFKPHGCFCVFNSIESLNFIGEFIGKLRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQLANKLQCPFVDVPGGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHSLDVVSPVPTNKDVSEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESAHHSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPPPTDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIIKIQNSFVNNTQGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKI	211704	209508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_209500_211700
775907	contig_12970_pilon	+	902	7	Intergenic	novelGene_50501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	867.807662381987	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAAATACTTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15610	74707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_15775_45022_45117_49409_49469_61722_61806_70870_70971_73993_74123_74434
775910	contig_8663_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_57993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGATGGCTACCTCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51834	74385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_53517_54084_54144_54984_55072_55132_55190_67194_67302_71126_71216_74352
775915	contig_16098_pilon	-	669	5	Intergenic	novelGene_46027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.19254594361	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	90	551	349429	348413	FALSE	25	TCTGGTACCAGACTCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCPCRSWTRAVASCCPSLTPTPTLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349698	348294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349443_349622
775917	contig_17427_pilon	+	1818	8	Intergenic	novelGene_30286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	240.342527681318	1	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	342	827	152216	175576	FALSE	75	CAATAAAAAAAAAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWDSPREAKAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147935	176567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152245_152575_152644_155691_155795_171334_171426_173596_173669_175453
775921	contig_10596_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_173584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATGTTTCACAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342742	343817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_+_342700_343800
775922	contig_5120_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_169613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAGAAAAAGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187742	188218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_+_187700_188200
775923	contig_12969_pilon	+	1387	4	Intergenic	novelGene_61698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	10.9645894689324	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	137	1207	590538	594778	FALSE	45	GAATGGCGTTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDIHLRLHWNVLFQGSLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPDSIFKLEQRETPWIVEGAIHSQSSPEKIWAIDHMQQHPENQNELKSLERCLQSFALGDNFGLSKNLVPSTQRHNMVDSHCGNLKPHLDFVTQNRRDARNDSDKFSDYGKSSVRLKHDKASSGIKYHGCVKPSNTKSQLNNHQKTSTEEKPHECSECGKVFSRKSLLLIHQRLHTGEKPYECSECGRSFVFKSDLTKHQRIHTGERPYKCSECEKAFRSKSELIQHQRTHTRERLYGCSECGKDFTHMSFLIKHKETHAKEKAINSVKVRKPSGRHSSLYMCQLIQEQNPMNTVPLEMLSSGTQPLNICELQGGKNVVIVEQPFQEVRPQYIIGNFHRE	590401	594958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_590572_590858_590955_593669_594096_594263
775929	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
775934	SIRV6	+	414	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	461	3	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775937	contig_8291_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_99937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAGAAAAACAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18019	19829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_18000_19800
775938	contig_6195_pilon	+	1797	4	Intergenic	novelGene_71021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	52.5758711028379	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	91	630	94384	102964	FALSE	80	AATAAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHGRRVRALGPGSRTQLWAPVKTRLPVASAMEAVVAREVENEDGDSSCGDLCLLDKGLRSISELSLDSTLHTINLHCNKISKIKAIDHIWNLQHLDLSSNQISQIEGLSTLTNLCTLNLSCNLITKIEGLEELINLTKLNLSYNQISDLSGLIPLHGIKHKLRHIDLHSNCIDNIHHLLQCMIGLHFLTNLILEKNGDDNPVCHIPGMN	94293	104131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_97122_97329_97627_97694_102785
775939	contig_6975_pilon	+	2150	10	Intergenic	novelGene_74286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	89.9851839656581	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	320	1594	403362	464595	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKKVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGCNDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLLGSEECIRVPRNIKSLADIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGLDCKKQASPKLIKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTQIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWLPYNGQCPPDIDYEDYFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPDPSKQIWTVNEALVQKWLSYPSGRVPVEIAK	401245	465151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_401486_403282_403588_427502_427663_437079_437157_440405_440628_441781_441874_448648_448780_457464_457626_464105_464183_464466
775940	contig_6217_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_109574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAATATACCTCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92013	90513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_90500_92000
775941	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_97192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
775942	contig_7410_pilon	-	2017	1	Intergenic	novelGene_106062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGGAAGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306384	304367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_304400_306400
775944	SIRV2	-	199	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	1076	4	-1076	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAAATGGTAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
775945	contig_408_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_84904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTGAATCCTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133055	131319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131300_133100
775946	contig_8674_pilon	-	2849	1	Intergenic	novelGene_102954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727564	724715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_724700_727600
775947	SIRV1	-	152	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3948	4	3674	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6692	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
775948	contig_9014_pilon	+	1968	8	Intergenic	novelGene_106779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	11.5121940673747	7	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	310	1437	141410	145866	FALSE	25	CACTGTCAGTAATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGYGYYRTVIFSAMFGGYSLYYFNRKTFSFVMPSLVEEIPLDKDDLGLITSSQSAAYAISKFVSGVLSDQMSARWLFSSGLLLVGLVNVVFSWSSTVPVFAALWFLNGLAQGLGWPPCGKILRKWFEPSQFGTWWAILSTSMNLAGGLGPILATILAQSYSWRSTLALSGALCVVVSFLCLLLIHNEPADVGLRNVDPTPSKGKKGSSYMSALEVGGLVGSIAAGYLSDRAMAKAGPSIYGNPRHGLLLFMMAGMTVSMYLFRVTVTTDSPKLWILVLGAVFGFSSYGPIALFGVIANESAPPNLCGTSHAIVGLMANVGGFLAGWPFSTIAKRYSWSTAFWVAEVICAASTAVFFLLRNIRTKMGRVSKAE	140098	146397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_140212_141213_141558_142401_142635_142956_143201_144071_144158_144683_144798_145428_145568_145702
775949	contig_7895_pilon	+	1542	4	Intergenic	novelGene_154458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	11.0252236056942	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	776	1150	739547	760427	FALSE	10	TTTTGGTTTAGTCTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHDPVAALETLLTLGFERVLTSGCDSSALEGLPLIKRLIDQAKDRIVVMPGGGITDRNLQRILEGSGATEFHCSARSARDSGMKFRNFCVSMGASLSNSEYSLKVTDVTKVRTLNAIAKNSLV	738771	760819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_739673_744310_744339_759397_759504_760312
775950	contig_11216_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_173601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGAATCTTAAGGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152103	153764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_+_152100_153800
775953	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
775962	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAACTTCGACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10812_11024_11109_11205
775966	contig_6710_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_96982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	657490	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657492	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775967	contig_17171_pilon	-	1016	5	Intergenic	novelGene_147385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	72.1664742106749	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	73	345	350839	334259	FALSE	15	TGCAGATGGCTCCTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTSSPDSTVSARPRCDRCPGRAKMQLRLWLLLTVQLAVDALPTTAQPTKKTKLKKKVCRIPKLPSQKGSSCSSLTLGLLVAGVLVLLVSLSVAIHLYFLRRRARLRFMKQFCR	350911	333587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_334272_337314_337352_338784_338875_343889_343980_350796
775968	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	54	512	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775969	contig_12157_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_135887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77012	74924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_74900_77000
775970	contig_20878_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_173435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGCTACCACCACTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1890	291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_300_1900
775971	contig_15866_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_63587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTACACAGCGATTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205587	203891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_203900_205600
775972	SIRV6	+	336	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	536	-1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
775975	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	51	525	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
775979	contig_7612_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_170357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAACAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48112	47406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_47400_48100
775980	contig_10494_pilon	+	1503	9	Intergenic	novelGene_102228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	59.6289306880477	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	62	1138	1255364	1303944	FALSE	15	GTGATCATTCCTGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGTTGLPKGVLSTHCNVSSMVTGLVDKWTWTPDDVILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKLLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTGDTVMFKDGRYWIRGRTSVDIIKSGGYKLSALEIEQHLLAHPSITDVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLRDGHSLSQQELREWARGVLAPYAMPSELLVVEEIPRNLMGKINKKELLCQFYPRDPGPPAGVQISGRAG	1255302	1304309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283938_1284033_1297703_1297839_1298214_1298327_1303781
775982	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	3	408	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775983	contig_8027_pilon	+	2323	3	Intergenic	novelGene_158829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221824	224967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_221960_222663_222787_222902
775985	contig_253_pilon	-	1723	10	Intergenic	novelGene_129725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	33.9098295957069	324	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	58	1404	580837	575265	FALSE	25	CCTGGGGTTGAATCAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQALGEDLVQPSELQDDSSSLGSDSEVSGPGPYRQADRYGFIGSSSAEPCPGHASADLIRQREMKWVEMTLHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQENSPRTYQELASAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEAYLPGYYGPHMEAVQLDAQVFAALLRRLLPRVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRIWDAFLSEGAKVLFRVGLTLVRLALGTAEQRLACPGILETLGALRTIPPTQLQEEVFMSQVHSVALSEHDLQREIRAQLGQLPKSAPGPPPRPQARLAGAPAIFEAQQLAGAQGGARPGPEVPRIVVQPPEEPRTPRRKPQTRGKTFHGLLTRAWGPPLEGPSRAHRGSTSFLDTRF	581150	574945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_575619_575919_576075_577856_578047_578198_578265_578867_578983_579136_579244_579326_579435_579841_579942_580685_580865_581120
775987	SIRV4	-	302	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1204	15	1204	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3954	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
775991	contig_13625_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_150164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCTTCCCTGGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27476	27766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_+_27500_27800
775992	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_94541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
775994	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	26	-244	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
775996	contig_7457_pilon	-	600	3	Intergenic	novelGene_31634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	4.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	109	426	989405	987684	FALSE	20	CTCATTCCAGGGGATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDPENESLRSTFPSYMAEGERLYLCGEFTKAAQSFSNALHLQNGDKNCLVARSKCFLKMGDLENSLKDAEASLQGDPTFCKVTRSVGELNHAFTTAIACSSLWL	1001994	987509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_987888_989291_989426_1001906
775997	contig_12279_pilon	-	1113	5	Intergenic	novelGene_50117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	449	751	77185	75050	TRUE	40	CTATTTCAGACAGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77633	68290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_68471_69358_69444_71631_71709_75029_75094_76926
776001	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	52	511	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776002	contig_14725_pilon	-	2735	12	Intergenic	novelGene_173604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_9	90.4130101074741	73	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	222	1664	460087	421431	FALSE	30	ACACACATTTTAACTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQVYKNETQGITSSGFASLTFEGTLGAPVIPRTSSKYFNFTTEDHKRVEALRIWASNHIPSSSTLLKLCDVQPMQYFDLTCQLLGRAEVDGTSFLLKVWDGTRTPFPSWRVLIDELVLEGDLSHIHQLQNLAIDILVYDNHVRVARSLKIGCFLRLYSLHTKLQSVNSETQSTFLCLEFHLHGGTSYGRGIRVLPESNSDVDQLKKVLASADLTANQHLDSVWLSKCEDSFPAASSSGSVSLFEVERCQQLSATILTDHQYLEKTPLCAILKQKAPQQYRIRAKLRSYKPRRLFQSVKLYCPECHTLQEVPHDGDLDIILQEGATKTPDTKLQNTSLYDSNVWTTNDQGERKVAIHFVKNNGILPLSNECLILIEGGALSEICKLSNKFHSVIPVRSGNEDLELLDLSAPFLIQGNIHHYGCKQCSRLKSIQNLNSLVDKTSWIPSSVAEILGVVPLQYVFVMTFTFDDGTGVLEAYLMDSDKFFQIPASEILINDDLQKSMDMIMDMFCPPGTKIDAYPWLECFIKSYNVISGTEQKICYQIFDTMVAEDLI	460308	420359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14725_pilon_-_421544_423153_423260_424659_424752_427994_428084_430833_430970_433949_434156_436382_436540_440331_440389_448418_448508_449809_449980_456934_457091_460015
776003	contig_6418_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_81169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTTCTCTCTCTCTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542980	544878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_543000_544900
776004	contig_15304_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_30464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	189	965	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53300_53519_53813_53991
776005	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	10	-244	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	301	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776007	contig_6842_pilon	-	2132	2	Intergenic	novelGene_130752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTACACAATAAACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306640	1302662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1304422_1306267
776011	contig_12270_pilon	-	197	2	Intergenic	novelGene_114148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGAAACCAGGACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14435	14015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
776012	contig_9633_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_139594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCATCTCAGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47692	48754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_47700_48800
776014	contig_16775_pilon	+	1415	9	Intergenic	novelGene_107786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	348.7881699542	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	128	748	160119	174074	FALSE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDGLNLMMIKSASLHQKISCGFLVVETGI	159002	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_159053_159349_159426_160117_160224_165001_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173988
776017	contig_5832_pilon	+	766	6	Intergenic	novelGene_134163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.04648658313239	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	495	545	520196	520246	FALSE	30	GCAGCACCTTTAATATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKFQLQICVPLRIQAFQVVRVKNLTKTQANTVCAQSQGSVCGSDRVQYVQEWHSVNCTITSDKENVTVAAELSLSYSEQLLRNITELQILGEISFNRSLYEGLNAENHRTKITVIFLKDEKYHFLPVIIGSSVGGLLVLIVIIVILFKCGFFKRKYQQLNLESMRRAQLKSEDLFIEEN	509747	520467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_509837_513207_513265_513436_513533_514695_514792_519445_519557_520150
776018	contig_8452_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_48082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1341.63507209176	79	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	221	442	968728	962919	FALSE	5	GTGGTTGAGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGLGCQGAEQFSLGTLTPTWIKKRWGTLSCWPLSPSSAWSSQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991188	962603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_991062
776019	contig_3754_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_146817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63273	61169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_61200_63300
776021	contig_6634_pilon	-	559	6	Intergenic	novelGene_171154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTATTCATAAATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552255	473887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_473949_474173_474257_513597_513660_526705_526857_528325_528365_552092
776022	contig_6031_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_56739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATATGGTATGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205199	204674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_204700_205200
776023	contig_6710_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_98288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653553	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653600_653900
776027	contig_8991_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_170944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAAAGAAATTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242537	244775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_242500_244800
776035	SIRV6	+	423	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	433	0	260	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
776041	SIRV4	-	325	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1196	0	1196	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776042	contig_15866_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_63609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359238	361487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_359200_361500
776043	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	26	337	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776044	contig_10863_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_59332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATATAAAGATTGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77005	76404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_76400_77000
776048	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776051	contig_11292_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_109461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATAATAAATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428101	426004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_426000_428100
776053	contig_13800_pilon	+	1533	15	Intergenic	novelGene_153713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	368.121818790177	11	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	368	916	114337	139655	TRUE	25	CATGTTAATGGACCTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKAPVGP	95597	162308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_95668_98357_98435_99183_99332_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139638_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154908_159543_159684_162246
776056	contig_14508_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_79064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATGCTCTGTCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129828	130367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_129800_130400
776058	SIRV4	-	314	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1207	0	1207	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776059	contig_8019_pilon	+	2194	11	Intergenic	novelGene_126976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	17.0129362545094	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	336	1787	195310	278504	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLKLLSDAAILRSQQIHTSDQQEVNLHTRCYDLQKEVLDLQGQVEALGLKLQKAVTERDNYKEMCTNKSNEADDCQRKLRKLKFESIVSESRHTRLLKEKEESLMACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKIEAELAKQRAQHLVEFEEQALLFKEEAKLILDTEKEKYQEMIQKYQKEQEELQMKISDLIEGATRDLRLEVVTLQEKLCESQVRYTQESESKEKEIENLRSLVAEFESRLKKEIDSNDSMSEDLRKGVKQKSDELERVLLAQTQLMEQFNQSQEENTVLQETVRRECEERFELTEALSQAREQLLELRKLSGSLPLSPCSLSQGNLTFSAAAVSNHGEKSLARANSKKGIKIPSLQPVSKPTVSPEKPKRMGSSGLPVFPQPNPPRGRTSSGNETRQRQAAILWRRLSRQ	91575	278911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_195244_195431_215116_215199_231345_231424_231758_231963_240500_240595_251912_252078_259081_259382_278096
776060	SIRV2	-	561	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4299	47	3124	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
776061	contig_10211_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_173607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTATTTTATCAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32429	31784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10211_pilon_-_31800_32400
776063	contig_11816_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_98536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	434	793	1053844	1053485	NA	35	CTGAGAGATCAGTCCCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNFLNVLLFENLDFCSLCSASPFHRRFATILQYLIRMTFLVLMCLKEICNLHGMLIAVSRTCFPCLLFHTSQEIIPSIPVYNWAHCHPYKHTWPGLSGAEIYLMLGHQVLDQRDCLFS	1054277	1053007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1053000_1054300
776064	SIRV6	-	207	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTTCATCAATTATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11260	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11111_11205
776065	contig_3975_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_54907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1579	1950	2138198	2137827	NA	40	AATGTACAATTGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLASSGPGVGYWLLYPAFVETAFDWITREGKGGIGPQPSNRADVPPKQVRFPVTDPRKVNPTLLLLTGISFRIQLCFYFSKNHKLWLFFMFSGPLGRQTQLDDFRGDIGQETMALSVLSPDK	2139776	2137525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2137500_2139800
776066	contig_6710_pilon	-	441	2	Intergenic	novelGene_98200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
776067	contig_17074_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_145194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGAGCCTTCTGGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639414	638258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_638300_639400
776071	contig_116_pilon	-	2851	9	Intergenic	novelGene_154895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1516	1821	236842	236537	TRUE	40	TAGATACAGAAGCAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVDMGDTPPGILQVDGEPLDWVLRSYSGDSGHCLGLLQTRSQVLEKKLTCPCSLYWHSLLPLGTLIQEPERPLPSLVPHVSMDSESRLGFLGWQSLMLA	249417	231521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_231565_233026_233165_233909_234374_236151_236919_240017_240164_240887_241023_242207_242375_245658_245859_248626
776072	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_98002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TCTTCTTTAACTTTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776073	contig_3942_pilon	+	381	4	Intergenic	novelGene_128778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	13	381	793521	795389	FALSE	60	AAAAAGAAGGTCAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRP	793508	795389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
776074	contig_14871_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_63742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323984	322095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_322100_324000
776075	contig_11413_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_103187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505922	505573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_505600_505900
776077	contig_13145_pilon	+	1274	4	Intergenic	novelGene_116619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	496.297177998111	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	69	641	35323	43689	FALSE	60	TAAAATATAAACAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNVRPSKPSFI	35254	44322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396
776078	contig_1964_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_130917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTTAAATCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187000	184741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_184700_187000
776079	contig_12046_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_83507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCCAGGACAGGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978642	979219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_978600_979200
776080	contig_7157_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_131305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	696	995	923763	924062	NA	15	CCTTTCGGTTAGCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKRLAQVRQTFLKYFIKSTHIKEKDKTSSKFKTFALQKIPLKKQVLDEEKIFANNISDQGLASIFFFKFSKLSKMMTNNPIRKWGNALTRYFTKEDI	923067	924252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_923100_924300
776084	contig_14807_pilon	-	512	5	Intergenic	novelGene_124712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13282	junction_2	4207.32399364489	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	21	512	39773	37486	FALSE	15	GTAAGCAGTGCTCCCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQK	39793	37485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
776085	contig_19851_pilon	+	649	3	Intergenic	novelGene_29883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_2	364	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	10	300	55674	56177	FALSE	20	TTTAATTGTTCCGTGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	55664	56526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_55753_55840_55882_56006
776090	contig_10902_pilon	+	1975	5	Intergenic	novelGene_65693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	168.18052057239	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	1184	1975	201964	234658	FALSE	25	GTTGCAGCGTAATGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYSLVDYESKFRASAPGEGFLSLSALEEGPCDPSVFPLSGSISAQEPQIQRMHSAPSTAFLVFQTQTSSLFHF	200780	234658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_202060_209426_209783_218452_218579_233944_234123_234622
776091	SIRV5	+	380	5	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7588	2	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCACCCCCGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
776094	contig_2892_pilon	+	1675	8	Intergenic	novelGene_119015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1095.6084322123	2	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	363	674	324837	331810	TRUE	60	AAATACAACAGAACATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPSASRPSSATAPAHLARSFALLRNEEELGEPEQAGSDAPPPYSSISTESAAYFDYKDESGFPKPPSYNVATTLPTYDEAERTKAEATIPLVPGRDEDFVGRDDFDDADQLRIGNDGIFMLTFFMAFLFNWIGFFLSFCLTTSAAGRYGAISGFGLSLIKWILIVRFSTYFPGYFDGQYWLWWVFLVLGFLLFLRGFINYAKVRKMPETFSNLPRTRVLFIY	264993	339468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265071_305218_305301_318539_318671_324764_324853_325763_325889_328152_328220_331706_331813_338469
776095	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776096	contig_366_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_51549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122892	124343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_122900_124300
776097	contig_9434_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_150481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55868	56786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_55900_56800
776102	contig_13244_pilon	+	1907	2	Intergenic	novelGene_86947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTCTAAGGAAACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278518	280667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_278871_279112
776103	contig_13014_pilon	-	1887	6	Intergenic	novelGene_169333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	621	junction_1	100.197005943292	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	35	619	308816	301087	FALSE	40	GCAAATATCCTTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAAPVGSRRRMEEEDEAARALLADGPGVLPALCDPSRLAHRLLVLALMCFLGFGSYFCYDNPAALQIQIQRDMQVNTTKFMLLYAWYSWPNVVLCFFGGFLIDRVFGIRWGTIIFSCFVCIGQVVFALGGIFNAFWLMEFGRFIFGTGGESLAVAQNTYAVSWFKGKELNLVFGLQLSMARIVSMLTNILKPNRSKRLTLGVIS	308850	299818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_301265_303161_303230_303537_303581_305334_305448_306899_306953_308686
776104	contig_2933_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_111299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCAGCAGAACATACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218249	219096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_218200_219100
776110	contig_6710_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_96335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653694	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
776111	contig_9038_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_143323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCACTGCATTCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349998	351003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_350000_351000
776113	contig_11186_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_98879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAGCCTTCACCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253985	256021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_254000_256000
776118	contig_1275_pilon	+	691	3	Intergenic	novelGene_108833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	88	549	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747399_747626
776132	contig_14744_pilon	+	1665	6	Intergenic	novelGene_66155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_5	8.93532316147547	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	341	1174	1677940	1685489	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWGCFCLRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLEDTTEIQERIENSLKSLLEQLKDVFSKCKGDLLEVKDGSLKTHPTLLENLVFFVETISIILWVSSYCESVLRPYKLNLQKKKKKKKETSIIMPPVFTSFQDYVTGLQTLISNVVDHIKGLETHLIAFKLEELILEDTSFSPVRDCI	1677599	1685980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324
776133	contig_3557_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_173610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9082	9755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_+_9100_9800
776134	contig_16714_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_161567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764177	762159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_762200_764200
776136	contig_10197_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_115269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128697	1127536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1127500_1128700
776137	contig_6546_pilon	+	510	4	Intergenic	novelGene_140969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	349	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	128	472	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597575	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
776140	contig_9720_pilon	+	379	2	Intergenic	novelGene_116778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	157	321	388841	389005	TRUE	30	CCTCCAAAAGGGGCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPRPGQRAAAAAAAANSSPVRDHSGGHRRNGHSCENKTRGKKGEKSQLRQMCRKDLENSTPPAGSSPPPPVASHKDCKAGPGPSPGAPDPELLLITADRAWTQM	388684	390124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_389044_390104
776148	contig_12540_pilon	+	1827	9	Intergenic	novelGene_148103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	40.5399108903806	296	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	109	1098	1027807	1035226	FALSE	45	ATTAAAATACTTTTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAEPSSPTEEEEEEEEQSAEPRPRTRSNPEGAEDRALGIQASVGSRSEGEGEAASADDGTPNPPGAGPKPWQVPPPAPEVQVRTPRVNCPEKVIICLDLSEEMSLPKLESFNGSKTNALNVSQKMIEMFVRTKHKIDKSHEFALVVVNDDTAWLSGLTSDPRELCSCLYDLETASCSTFNLEGLFSLIQQKTELPVTENVQTIPPPYVVRTILVYSRPPCQPQFSLTEPMKKMFQCPYFFFDVVYIHNGADEKEEEMSWKDMFAFMGSLDTKGTSYKYEVALAGPALELHNCMAKLLAHPLQRPCQSHASYSLLEEEDEATEVEATV	1026775	1035955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1026832_1027754_1028092_1028909_1028969_1030643_1030765_1030840_1030920_1032403_1032429_1033885_1034016_1034207_1034295_1035022
776151	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
776158	SIRV4	-	209	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1314	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3844	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
776159	contig_7887_pilon	+	2059	13	Intergenic	novelGene_124884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	170.485642112955	171	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	218	1717	286508	293116	FALSE	15	CTGACCCCCATCCCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAAPSGSWGRERSRGGRDWSGARERGGRSQGPGLGGRSCTSSPRGCRDSGRSAAAITDFLWDKRTGLAARTMPHPRRYHSSERGSRGSYHEHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRHRREDSYHVRSRSYEDRSSDRRAYDRRYCSSYRRNGYSRDRGEACCDADYRHSCEYHRENSSYRSQRSSRRKHRRRRRRSRTFSRSSSQHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGRVVQCVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFFTRLRAEPPNAKLWDSSRDISR	284708	293458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_284926_286507_286678_287432_287659_288350_288439_288772_288840_289008_289126_289884_290052_290799_290895_291549_291680_291780_291864_292048_292129_292310_292402_292930
776160	contig_6102_pilon	+	2580	23	Intergenic	novelGene_31739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	198.978278643426	1	124	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	206	1672	216236	226903	TRUE	25	ACTAGGCTATCTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTIHAAPRALTTPEQIPGRKKLKGSLFTPYFWPAPSATPAKAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGKWDRIWERSSRI	210290	229247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221709_226869_227023_227264_227330_227565_227600_227976_228161_228274_228396_228862
776165	contig_5502_pilon	-	1432	7	Intergenic	novelGene_155006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	220.698889892994	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	591	1004	454193	449795	FALSE	65	TTTAGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVHAAVQMTTEQLKTEFDKLFEDLKEDDKTHEMEPAEAIETLLLPHQKQALAWMVSRENSEDLPPFWEQRNDLYYNTITNFSEKDRPENVHGGILADDMGLGKTLTAIAVILTNFHDGTPLPVERIKKNQLKKVKY	462431	449366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_449903_452469_452662_452815_452891_454154_454253_455347_455482_460885_461094_462242
776167	contig_2892_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_118998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTCGAACTGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106063	106308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_106100_106300
776170	contig_13740_pilon	-	1083	6	Intergenic	novelGene_34661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5331.90988671039	70	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	161718	157286	FALSE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEEPILSFFLFDMGFTV	162032	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157487_160829_160904_161058_161270_161574_161722_161915
776172	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
776173	contig_1867_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_54574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	540	658	1197	449145	448606	NA	40	ATGGTGCTAAGAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSS	449802	448605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448600_449800
776176	SIRV2	-	231	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	695	22	695	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4037	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
776178	SIRV6	+	460	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	207	-2	104	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	133	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTATAGTAGATTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
776179	contig_11883_pilon	-	2209	2	Intergenic	novelGene_163785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATATTGCAACTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385621	372495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_374497_385413
776182	contig_8885_pilon	-	2221	6	Intergenic	novelGene_115566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	157.57740954845	1	129	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	124	435	75477	54095	TRUE	35	CATTAGAAAACTCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLREVTL	75600	45842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_53882_54107_58183_58308_63031_63130_75399
776184	contig_50_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_122227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101439	103582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_101400_103600
776186	contig_13460_pilon	+	2590	6	Intergenic	novelGene_162181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	32.0599438552222	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	24	1925	170039	270436	FALSE	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLITLCYLYLWARWGCRPLALVRTTVRRLFASRCSFTFCGAGAQPRGARVCLSRGGRVFCVGETQSIDDLNKWALFLVSPFILEAEHIAFVTESIWVQSENLQRPSPSSETIVKWSDCCLPLACRPGDPYQLIAEASVDDFSKLGVAFMEDRLQMGNGLVPQKIVSVHLHESTLKELKDQASNKQAQIIQPNPESSVEIKPERDAMAHIGKDDSKVLGEEPKPVQDSTSGREPSRESDRGAGSVEHYHLHLSSCHECLELENSTIESVRFASAENIPDLPYDYSSSLESVADEICPKKEGRRGNITGKAPNILVYVGPDSKEALDRCQQVRALLADCVDTDCYTVYQLQEESALRDPWLDNCLLLVIATKESVPKVLYRKVMAYLSQGGKVLGLSSSFIFGGFQVTSKGKLQKTVQNLVFSKADCSEVKLSVLTSGCIYEEVPGDQLSLGKLQGHLDNEDKDRTIVQVPFGTCGGVAVLCQVHLELPPSSLIVQTQEDFDLLKSSNCRRYEVLKEILTTLGLSCEMRQVPALTPLHLLSAAEETWDPFMQWLGKHVDPEGVIQSSKLSLKFVSSCTSDIEITPSCIPVVTDSEGFSSENFNLEIYRQNLQTERLGKIILFAEVTPTTMSLLDG	170015	271101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_170234_181704_181843_190322_190486_200575_201523_216257_216441_270160
776197	contig_14807_pilon	-	746	5	Intergenic	novelGene_124687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5463.6301576882	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	37	651	38792	37247	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38812_39900
776201	contig_19744_pilon	-	2514	4	Intergenic	novelGene_120418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	325	junction_1	52.7067358124178	10	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	184	1005	283137	277519	FALSE	30	TGTCTCGAGTTTAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWRWALGLLWLTAAPGWSQVSGDRTRRQWPVPYKRFSFRPEPDPYCQAKYTFCPTGSSIPAMKGDDVIEVFRLQAPVWEFKYGDLLGHMKIMHDAIGFRSTLTGKNYTMEWYELFQLGNCTFPHLRPEMNAPFWCNQGAACFFEGIDDIHWKENGTLVLVATMSGNMFNKMAKWVKQDNETGIYYETWTVQASPEKGAETWFESYDCSKFVLRTYKKLAELGAEFKKIETNYTRIFLYSGEPTYLGNETSIFGPVGNKTLALAIKRFYYPFKPHLSTKEFLVSLLQIFDTVIIHRQFYLFYNFEYWFLPMKFPFIKITYEEIPLPNRNRTLSGL	287832	276009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_278031_281952_282179_283053_283220_287731
776205	contig_15434_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_56714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	1399	1776	68480	68103	FALSE	40	AATAAACACACCCCTAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSGRHPRGRTAQSLGSEVRPGPRAALPRTPPQDSKGRKLLRLSLPRSGRSCTQTGAGETSEAAATPSRPCWSLMAQAPHLQLPQPFYPDIKHPIHSLSPPVRFRTAEYSKPARRPRMDRARPRT	76225	68100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_68890_72150_72331_72465_72657_73316_73513_75803
776207	contig_10466_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_173624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGCTATGTGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90995	89017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_89000_91000
776209	contig_5375_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_169212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTGGAATGAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72266	71422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_71400_72300
776215	contig_13894_pilon	+	2524	1	Intergenic	novelGene_62185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	664	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAAAAAAGCTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712357	714881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_712400_714900
776216	contig_10068_pilon	-	1514	8	Intergenic	novelGene_148711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	130.473705224854	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	283	1200	57243	44668	FALSE	15	TTTGATCTTAGTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61146	44353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_54327_54436_56355_56498_57186_57276_58180_58376_61091
776220	contig_1545_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_149741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	161	607	128064	128510	NA	25	AAGTTGCTGTTGAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTCAQLHRTDVPENFERRCSQSACVQFPCPDASDFRLGNVKQTQKQDPAMRVLGWVTEAVSKYWDYISPIAMVTKTGWILAERERTKMRKTMSPRRMSECVHEGLVVRRKAGRAKRRDSMERSTSIPLCLCGWCNGCARLLIERLVV	127903	129691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_+_127900_129700
776221	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8115	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
776222	contig_5018_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_47193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	505	957	1592247	1592699	NA	15	TAGCCTTCCTCTGCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTWKVGQRVGQALKQLGGCLWQKGGVFIFGSTSRARCLGSERTSSGQGVGSGTGIGYEGAGPEGFLLTRPELCQMESVGANLCWEMWLALSEACRGSLAASHRPNPYIHLLLLSTYSSPAEVVCLGRCILLLHQLRQFPELGGYQADDE	1591742	1593186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1591700_1593200
776223	contig_5988_pilon	-	2119	17	Intergenic	novelGene_15906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_5	67.7236745440618	108	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	124	1572	636762	625047	FALSE	15	TTTTAAAGGGCCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAADYEVLSVREQLFHERVRECIISTLLFATLYIFCHIVLTRFKKPAEFRTVDDEDATVNKIVLELCTFTLAVALGAVLLLPFSILSNEVLLSLPRNYYIQWLNGSLIHGLWNLVFLFSNLSLIFLMPFAYFFTESEGFAGSRKGVLGRVYETVVMLVLLTLLVLGMVWVASAIVDNKASRESLYDFWEYYLPYLYSCISFLGVLLLLVCTPLGLARMFSVTGKLLVKPRLLEDLEEQLYCSAFEEAALTRRICNATSCWLPLDMELLHRQILALQTQRVLLEKRRKASAWQRNLGYPLAMLCLLVLTGLSVLIVAIHILELLIDEAAMPRGMQGASLGQVSFSKLGSFGAVIQVVLIFYLMVSSVVGFYSSPLFRGLRPRWHDTAMTQIIGNCVCLLVLSSALPVFARTLGLTHFDLLGDFGRFNWLGNFYIVFLYNAAFAGLTTLSLVKTFTAAVRAELIRAFGLDRLPLPVSGFPPGI	636885	624499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_625097_625284_625447_627615_627683_627789_627881_628117_628192_628371_628450_629047_629125_629222_629307_629397_629471_630149_630215_630351_630421_630938_631063_631655_631760_631951_632092_633131_633166_634287_634373_636690
776224	contig_990_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_76163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCGACCTACAACGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1888715	1886388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1886400_1888700
776226	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_98184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
776227	contig_18168_pilon	-	1200	4	Intergenic	novelGene_122064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	210.624995878668	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	150	959	26220	23694	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGYSIPFRFQFRSKRALPSPGRSVVVGAGLTAGAGLTAGAGPVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGIGVGPDMRLLPCVALSDTKFVHHHHPPPLDFVTSRKPDFVFCSWCLNVSVFLSA	26369	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24804_24935_25038_25315_25964
776228	contig_2463_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_43022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508284	507056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_507100_508300
776229	contig_6557_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_32940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAGGCAGTAAGATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300537	300829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_300500_300800
776230	contig_2251_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_128478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140212	142157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_+_140200_142200
776234	SIRV6	+	525	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1588_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776236	contig_3832_pilon	+	3339	1	Intergenic	novelGene_161501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511899	515238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_511900_515200
776237	contig_6589_pilon	+	779	5	Intergenic	novelGene_25756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	106	junction_1	1821.54254685418	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	214	705	669670	672754	FALSE	40	AAAACCATCTAACCACGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668158	672828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668251_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584
776238	contig_7887_pilon	+	1766	9	Intergenic	novelGene_124885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	174.26591570069	162	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	601	1419	289898	293116	FALSE	15	CCCCATCCCTGGAGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDWFDYHGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFFTRLRAEPPNAKLWDSSRDISR	288369	293463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_288840_289008_289126_289884_290052_290799_290895_291549_291680_291780_291864_292048_292129_292310_292402_292930
776240	SIRV6	+	276	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	32	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10823_11031_11109_11205
776244	SIRV5	+	409	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-79	875	35	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8236	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
776245	SIRV6	+	202	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	520	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11114_11208
776246	contig_5495_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_157672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCTAAGCTTTCGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568342	567366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_-_567400_568300
776247	contig_6677_pilon	+	2469	10	Intergenic	novelGene_114183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	38.0966930939072	3	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	149	1513	474189	481594	TRUE	25	CACATTATTTTGTGACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLGSEDVVKELKKAMCNPHIQADRLRYRNVIQRVIRHMTQGLDMSSVFMEMVKASATVDIVQKKLVYLYMCTYAPLKPDLALLAINTLCKDCSDPNPMVRGLALRSMCSLRMPGVQEYIQQPILSGLRDKASYVRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIVVVNCLRSLEEILKQEGGVVINKPIAHHLLNRMSKLDQWGQGEVLNFLLRYQPRSEEELFDILNLLDSFLKSSSASVVMGTTKLFLILARNFPHVQKDVLVQVKGPLLAACSSESRELCFAALCHVRQILHSLPGHFSTHYKKFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQVLEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIARTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTGEAGTYLATWGPRGKNSQCSLCVGGLCRECEVRDVSSCKDGATHCTAAPFPLTTC	473933	483002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_474006_474112_474302_475740_475966_476662_476794_477180_477329_477797_478295_479323_479408_481427_481636_481825_482108_482369
776248	contig_6710_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_98314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCCTGCGAGGTCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657503	653634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776249	contig_4654_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_103078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTGTGAGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493322	492558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_492600_493300
776250	contig_15039_pilon	-	1451	6	Intergenic	novelGene_110134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_5	421.247385748565	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	58	681	200602	185257	FALSE	25	AGAATGCTCCTTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRNLNPKSLYFYQSVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	208441	184486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401
776251	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
776253	contig_8138_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_52417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	535.99014916321	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	219	674	280295	306552	TRUE	25	ATTGTCTTGCAAGTTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306806_306972_307040_307420
776255	contig_14807_pilon	-	695	7	Intergenic	novelGene_124706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	39773	37247	FALSE	15	GCACTGTCCCGCTTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
776256	contig_11929_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_171237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGGGCAGTACTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94616	94278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_-_94300_94600
776261	contig_7019_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_149462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCTCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533868	533111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_533100_533900
776264	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
776265	contig_15327_pilon	-	1882	6	Intergenic	novelGene_70519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_4	16.1616830806695	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	433	1389	488304	478231	FALSE	15	TCTTTGTTGTTGTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	488736	477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172
776266	SIRV5	+	380	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	153	135	39	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8354	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
776267	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	6	389	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776269	contig_8712_pilon	+	1172	3	Intergenic	novelGene_58724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_1	4	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	362	394	2416	2448	FALSE	35	AAAGTTGTGGACAACTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYAIRPDLAEVCLFTKDEPNLTPEKTEHFYRNLLNKHNIKTVSQIIPLRTLKKEYKPYEAKLRLLGSFDFFLTDARIRRLLPSIIGKHFYLRKKVPVCVNLLAKDLSKEINDCIGGTIMNISKNGSCR	960	3226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1100_2104_2254_2342
776275	contig_10500_pilon	+	1965	12	Intergenic	novelGene_41146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143423	1231410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1143935_1146044_1146185_1191620_1191817_1197870_1197985_1206044_1206208_1208236_1208345_1208454_1208534_1217967_1218131_1224614_1224803_1226729_1226855_1229882_1230006_1231355
776278	contig_12697_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_122837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAATTTTATCGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312142	313654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_312100_313700
776282	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	6	875	6	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8321	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
776283	contig_9656_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_121909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAGAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226486	224069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_224100_226500
776293	contig_11427_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_79016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCGTCAAGTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772276	771407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_771400_772300
776294	contig_8259_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_148877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAACTGCCCCATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180372	181842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_180400_181800
776298	contig_10404_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_138634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTTTAGTTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419525	418180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_418200_419500
776302	contig_8020_pilon	-	931	8	Intergenic	novelGene_114365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	126.528209325439	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	351	869	106445	104794	FALSE	5	CAGGGCTGTGTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107328	104731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106842_107175
776304	SIRV4	-	459	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1064	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4094	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
776305	contig_13558_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_123036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579609	581162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_579600_581200
776306	contig_8744_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_173639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTTTTTGTTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25157	26068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_+_25200_26100
776308	contig_15063_pilon	+	697	2	Intergenic	novelGene_14455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	67	555	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35997	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
776309	SIRV6	+	384	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	8	492	2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
776311	contig_18406_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_88048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	50.395312281997	1189	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	117	620	61017	42431	FALSE	20	ATGTCTTTTGAGCCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLALRNELVVDKTKRKKRRELSEEQKQEIKDAFELFDTDKDEAIDYHELKVAMRALGFDVKKADVLKILKDYDREATGKITFEDFNEVVTDWILERDPHEEILKAFKLFDDDDSGKISLRNLRRVARELGENMSDEELRAMIEEFDKDGDGEINQEEFIAIMTGDI	61133	42053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_42475_49582_49775_57039_57155_58991_59128_61000
776319	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	50	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
776320	contig_10779_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_165521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAAAGTGAAAAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60749	84319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_62065_74901_74956_76890_76926_78249_78337_84274
776322	contig_8978_pilon	-	1544	6	Intergenic	novelGene_49415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTACAGACAAGGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348138	343640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_343831_344170_344259_344690_344795_345355_345388_345632_345740_347115
776323	contig_4952_pilon	-	1318	3	Intergenic	novelGene_145519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	934	1317	352130	349775	FALSE	40	TAAGGAAGAGGGTCAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNTASGLVKDSLTTCDMQVIQPCLLKSQEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHFNIKKTKILITGPISNIMINRNSEIVKDFILLGPTINAHGSNSQEIRSIAHQPKIRQASGKSINNFQSSHMHAKAGQ	354014	349773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_349835_351806_352804_353754
776324	SIRV6	+	266	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	120	-9	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776326	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776329	contig_11285_pilon	-	1385	12	Intergenic	novelGene_5708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	393.605121581944	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	25	891	798530	794949	TRUE	5	CCCCTCCGCCAGCGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTGKKSP	798554	784064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784201_793882_793961_794413_794467_794607_794662_794775_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
776331	contig_10372_pilon	+	945	2	Intergenic	novelGene_112523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1183	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	632	943	85084	85596	FALSE	50	AAGACTCCAATTGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDSLFMMKELAGAK	84452	85598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_85192_85392
776332	SIRV6	+	196	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	524	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
776333	SIRV6	+	299	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8121	11	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCGGTTATTGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
776334	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	51	499	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776336	contig_6192_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_170350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900369	901580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_900400_901600
776338	contig_16883_pilon	-	2847	1	Intergenic	novelGene_161731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	358	1077	129	1205	277110	276034	NA	60	CAGAAAAAAAAAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPAPDSASDTDTAAAGDGDHRGLPPNPVIVISDAADGHRGAEMTTTQTLVTTQTPAPSSQSSYRDSAYFSDNESEPEKKSEEVPGTSLPASMSLPEPVPSEHSVGAKDSCLETNKSQPDPSCLLALQNSSSLELRGLLEPVQTHVSSQMPPPEDEAGSPLSLLNSELCSSDDFETQEDHPCTLTSTGTNTNELLAYTSSTLLSGGPADRAIDKSLSGHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGVDADEEDGDSDDSDDDLRAFSLHSLSSESEGEVEHPVPVILSNSEDGRRLRSLLKPSAPVSMDQLPDAWRKEKKAVTFFDDVTVYLFDQVSVLPKCHAENPRTCLQILSVVCSNCHCEATDSFMITLKKFNFGLVAALRLCRNVVCTGNSY	277238	274391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_274400_277200
776344	contig_20241_pilon	+	2208	3	Intergenic	novelGene_159747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	55.5	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAATAAAAAAGTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235290	241312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235754_236036_239404
776347	contig_5947_pilon	+	2127	15	Intergenic	novelGene_101609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	210.950630165797	1	93	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	61	1446	987204	1005787	TRUE	50	CAAAAAATACCAGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVLSYTSVRSNSSYLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKQDKLHGCLEHLFNQVDSINALLKGPVLSRAFEETKHFPMDHSLQEFKQKEECTIRGRSLIQVSIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGSTASASHQWMETSEP	987143	1006633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_987214_988514_988598_988756_988848_990802_990932_992359_992402_993750_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003794_1005737_1006137_1006301
776351	contig_4832_pilon	-	1950	13	Intergenic	novelGene_163398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCACATTGCATCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295595	264218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_264331_264468_264573_265794_265904_266329_266431_275885_276006_279285_279367_284326_284439_286314_286402_287345_287440_291613_291711_293618_293707_294613_294680_294816
776352	contig_17493_pilon	+	1222	6	Intergenic	novelGene_122191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	524.472077426435	69	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	125	475	92066	119145	FALSE	15	TTCTTTTGTGAATGGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGVPHHLVVVGWATSNLYQLLLRWLMAEKSPQRELLRMVKKE	50001	119892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_118496_118590_119116
776355	contig_7321_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_53131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156540	155536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_155500_156500
776356	contig_2854_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_120827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCCGTTGCAGTCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246260	245473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_245500_246300
776357	contig_5084_pilon	+	2192	13	Intergenic	novelGene_64612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	27.3536509852382	171	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	40	1455	1038568	1054133	FALSE	15	TTATATTCTCCTTTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLGVLGGARTGLGLLLGTAAGLGFLCALYIQRWKRTQRHGRSQSLPNSLDYTQTSESGREVMLLPAAPREAGDAVAPSRLTREGQQEVLGRLDSVLTSLAVLRREVEELRSSLQGLAGEIVGEVRSHMEEHQRVARRRRFPFARERSDSTGSSSVYFTATSGATLTDAESEGGYTTANAESDYDQDADKESEDGEDEVSCETVKMGRKDSLDLEVEAASGPGPGTLEDGGVSGQEDVLPLLRQADELHQGSERDKREGFQLLLNNKLVYGSRQDFLWRLARAYSDMCELTEEVSEKKSYALNGKGEAEAALEKGDESAECHQWYAVLCGQLAEHEGIQRRIQTGFSFKEHVDKAIALQPGNPSAHFLLGRWCYQVSHLSWLEKKTATALLESPLTATVQDALQSFLKVEELQPGFSKAGRIYISKCYRELGKNSEARQWVKLAQELPSVTNEDSAFQKDLEELEVVLGE	1038128	1054870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1038161_1038560_1038755_1041697_1041891_1042317_1042462_1047539_1047826_1048553_1048657_1050970_1051032_1052565_1052642_1052786_1052865_1053119_1053219_1053518_1053573_1053708_1053790_1054079
776364	contig_10609_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_123899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAAGAGATGGCTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152258	150822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_150800_152300
776365	contig_1008_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_121570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCACATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638516	640946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_638500_640900
776366	contig_6710_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_94179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCCACAGTGATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653356	657173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
776369	contig_3986_pilon	-	1801	8	Intergenic	novelGene_52708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	132.127334995682	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	155	643	93453	52406	FALSE	40	TTGTAGAACACTTCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPLQQPPNKSPCFQTCTLQSLLCTAARGNFLNIFQIFALEGWRGASIYSTMMPGNLRRMGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKAL	108497	51247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_52414_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_93430_93507_108396
776374	contig_6710_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_98275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	10	CATGTCTGGTCCTCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776379	contig_17522_pilon	-	1666	3	Intergenic	novelGene_160814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_2	118	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTATAGCATGGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96542	91538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_92966_94250_94332_96384
776382	contig_14142_pilon	-	1308	12	Intergenic	novelGene_120457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	197.076274196667	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	519	1274	100563	98574	FALSE	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLGPSPSTPLAAPLT	102329	98539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98616_98956_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080_101264_102074_102181_102304
776384	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776386	SIRV4	-	209	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1309	3	1309	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
776390	contig_8174_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_160056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCATTGTCTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256748	257366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_256700_257400
776391	SIRV5	+	337	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	169	48	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
776397	contig_2940_pilon	+	2245	6	Intergenic	novelGene_81895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCCAGTCCCAGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452225	459020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_453255_453466_453602_453741_453873_454235_454356_455835_455885_458239
776405	contig_14060_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_156056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCACAGCAACAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67218	68605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_67200_68600
776406	contig_15991_pilon	-	1010	7	Intergenic	novelGene_70917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3629.0314134766	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	73	567	105108	101289	TRUE	15	TCTAAAGGTTGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPLL	106354	100381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100892_101049_101159_101299_102037_102271_103583_103703_104975_105142_106315
776409	contig_13894_pilon	-	1188	3	Intergenic	novelGene_62050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	318	1112	287084	286290	FALSE	15	AGTACTTCTGCAGGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288307	286213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287320_288128
776416	contig_6086_pilon	+	2029	2	Intergenic	novelGene_171467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGTTCTTTTGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117529	120961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_+_117618_119020
776422	SIRV4	-	223	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1298	0	1298	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3860	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
776427	contig_20006_pilon	+	1579	1	Intergenic	novelGene_157306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGGAAAAAAAAAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58658	60237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20006_pilon_+_58700_60200
776428	contig_19442_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_169606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACTGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11846	13876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19442_pilon_+_11800_13900
776429	contig_5640_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_27281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068651	1066987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1067000_1068700
776432	contig_7057_pilon	+	1034	3	Intergenic	novelGene_123275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGCCACTGGATGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705643	707640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_705874_706663_706712_706884
776433	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_96478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
776436	contig_9272_pilon	-	1809	4	Intergenic	novelGene_125933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	25.3026129524645	132	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	29	1294	421635	379667	FALSE	25	ATATAGTCTTATTCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKRFGAVEPMSALRRSGYGPSDCPPYGRYYGAGGGDVPVHPPPPLYPPGSEPPQPPISWRVRGGGPTETTWQVEVGGGDGYYPSGGAWPEPGRTGGSHQSLNSYTNGAYGPPYHPGPGANTASYSGAYYTPGYTQTNYSTEVPSSYRSPGSSPTPASRWMYPQQDCQTEVPPLRGQVPGYPASQNPGMTLPHYSYGDGNRTVPQSGPSVRPQEDAWASPGAYGMGTRYPWPSPAPSAPPGNLYMTESTSSWPSSGSPQPPPSPPPQQSKDSSYTYIQSDQGVNRHGFPCSVHQYESSGTMNSDNSDLSDSQVQYSAEPQLYDNATNENPSNQDQSSNHPEERLSSDEGTPPSIKKIINVLEKVQYLEQEVEEFVGKKTDKAYWLLEEMLTKELLELDSVETGGQDSVRQARKEAVCKIQAILEKLEKKGL	421663	379151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_380153_380852_381108_383472_383728_421365
776439	contig_18184_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_123881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAACTACTTCAGGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542729	543004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_542700_543000
776444	contig_753_pilon	-	2534	2	Intergenic	novelGene_112904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATAGAAAAGCATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278643	275251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_275414_276271
776445	contig_10734_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_51079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTCCACTTGCATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490348	491645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_490300_491600
776448	contig_5916_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_158024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACTTCATAAAACGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249631	250751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_249600_250800
776449	contig_5084_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_64615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077308	1079599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1077300_1079600
776452	contig_4156_pilon	-	1627	9	Intergenic	novelGene_88100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_8	89.103871969741	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	268	1383	433791	305916	FALSE	15	TTCCTCTCCCAGCACACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQ	434864	305671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_306055_310022_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550_433925_434730
776453	contig_3270_pilon	+	867	5	Intergenic	novelGene_104431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1374	junction_1	4166.09472407913	742	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44087	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44241_44652_45124_45211_45934_46067_46576
776454	contig_7720_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_155793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCCACCCAACACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842462	843011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_842500_843000
776456	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776458	contig_3602_pilon	-	2315	15	Intergenic	novelGene_60531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_12	59.1798107465713	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	217	2088	250278	226476	FALSE	30	CCACACGCTTGAATCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCLTDELSVSTTELLARRPPSSSSSSSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCATRVPNDCLGEALINGDVPMEEATDFSEADKSVLMDESDDSGIIPGSHSENALHASEEEEGEGGKAQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNNTTNRYYKEIPLSEILAIESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGETPGGAPGGPSGQGAEAARGWEMAIRQALMPIILQDAPRAPGHTPHRQASLSISVSNSQIQENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPSPWSHISKGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHSWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFITEHPLPGPGLPFDAELSGILPLQEHEMQGLAERVSVL	250586	226248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_226689_226970_227057_231337_231606_234511_234611_238853_239016_239810_239918_241285_241359_241496_241550_243615_243875_245375_245454_246877_246996_248383_248538_248617_248696_250154_250378_250469
776461	contig_1335_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_166515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427357	428342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_427400_428300
776464	contig_5797_pilon	-	2048	8	Intergenic	novelGene_56937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_6	21.3990272523528	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	73	1641	318960	296670	FALSE	50	CCATAACAATGAATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSGKNGDLHLKQIAYYKRTGEYHPTTLPSERSGIRRAAKKFVFKEKKLFYVGKDRKQNRLVIVSEEEKKKVLRECHENDTGIHHGISRTLTLVESSYYWTSVTNDVKHWVYACQHCQVAKNTVILTPKQHLLKVENPWSVVTVDLMGPFHTSNRSHVYAIIMTDLFTKWVVILPLCDVSVSEISKAISNIFFLYGPPKKIIMDQRDEFIHQINVELYGLFGTKQIVISHASQTVDPTESTPSTIKMFLSKYCADHPNNWDDHLSAVSFAFNIIHLESAKNTPYFQMFNRNPYMPETSDSLHEVDGGNTSMFSKILDAIKEADKIMANKTTSADQMQNNNFNEVSKSKIIVKKKPKQLNPFHLKVGHEVLRQRKNWWKDGRFQSEWVGPCVIDYITESGCAILRDNTGARLKRPIKMSHLKPYVRESTEQDSLYLLQGSIVADHDYIRLPEIPVGAYQANILVEDATIAVVDNELLTSTKDRELLEYRNAKVSPLIEDHGTLDKQTFSLLDSSNQVLEYLS	322453	296262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_296945_301643_301930_302375_302553_302643_302836_313901_314208_316305_316500_318821_318968_322388
776465	contig_4364_pilon	-	1307	2	Intergenic	novelGene_17	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261552	260071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_260877_261050
776466	SIRV6	+	265	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10727_10819_11034_11109_11205
776474	contig_5331_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_112846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1039	1467	801158	801586	NA	10	AGCCATCCTGCTCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPEKRGGRRRNEDRQHGREKTRQRGRRYPGTQCYYCASGGEVLAKPGVFGVPCWGGKNLSCAAGRRDFCNQHLVKAARPHVRTGPSSASVTWTTSNEIYCVKYSTGCRFPLIWIFRSLQLTKAGDQGHWCAKPHTATLNP	800119	801929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_800100_801900
776476	contig_5484_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_151088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90661	88991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_89000_90700
776479	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776480	contig_6102_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_32288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1521	1904	1463659	1463276	NA	35	AGTGTGATGTCCAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTRKYPVSFSLTCSREGDSYFNIGFPSLPPSLLQLQRLKQLFRKGSTGTKEMELPPEPQANGEAVGAGGGPIYYIYEEEEEEEEEEEEPPPEPPKLVNDKPHKFKDHFFKKPKFCDVCARMIVRES	1465179	1463261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1463300_1465200
776481	contig_5936_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_53548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGCAACATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92529	94552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_92500_94600
776483	contig_17989_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_150823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATTGAACCCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216885	217933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_216900_217900
776485	contig_13215_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_145894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATACTACTCCCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149163	147993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_148000_149200
776486	contig_4732_pilon	-	1819	13	Intergenic	novelGene_75367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	53.8523573197023	318	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	590	1357	157095	149382	FALSE	35	CAGAAGAGCAACTTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPYRRPERLRKRTEFAGEKIKEEKVFEPNEEALGVVLHKDSKWYQQWKDFKDNNVVFNRFFEMKMKYDESDNAFIRASRALTDKVTDLLGGLFSKTEMSEVLTEILRVDPAFDKDRFLRQCENDIIPNVLEALIAGELDILKDWCYEATYSQLAHPIQQAKALGLQFHSRILDIDNIDLAMGKMMEQGPVLIITFQAQLVMVIKNPKGEVVEGDPDKVLRMLYVWALCRDQDELNPYAAWRLLDISASSTEQIL	168358	148919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_149502_149785_149897_150766_150857_153390_153442_155535_155661_155743_155837_156574_156661_157003_157144_158647_158770_160698_160780_163059_163231_165422_165528_168296
776487	contig_16776_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_130500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	426.973067066296	81	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTCTGTTGTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57978	34677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41517_57792
776491	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776494	SIRV7	-	366	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-14	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114752	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
776495	contig_16098_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_45861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCTACAAGGATGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237325	235783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_235800_237300
776498	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776500	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776504	SIRV6	+	255	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	212	413	99	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTAGGTATAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
776505	contig_16310_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_70067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	2153	2545	246624	247016	NA	20	TACCGGCTCACAGCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSILPAHMGSSMVRHSSPPPAFPRLPQPGAGRVKAAGVAVAELTLSGALSTLSKKSHVDSLSGWASLLSPLQPHLGSPAGLGGGALGQQPCFHVTQVLPPLLHGDGFGLVSVHLQGHGLGPPRKLSLEM	244471	247086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_244500_247100
776506	contig_5988_pilon	+	1347	3	Intergenic	novelGene_16025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	342	1232	785923	786813	FALSE	20	TCAGACTGGCTTCTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	783308	786928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_783461_783690_783812_785854
776508	contig_2251_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_128472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTCAAAGTATACAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76251	75125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_75100_76300
776514	contig_10855_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_124327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGTGATAAATATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395660	396372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_395700_396400
776517	SIRV6	+	252	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11025_11109_11205
776519	contig_9389_pilon	-	1692	9	Intergenic	novelGene_83876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	465.104826893895	2	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	7	816	45836	36557	FALSE	0	CCTCGGGCTGGGCGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALENPEGGSEEAATVAEVSPGGRRMLPLPGCLPALAGSQVKRFSASKRKQHFINQAVRNSDLVPKAKGRKSLQRLENTQYLLTLLESNGGTPGLEDGDLAPPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSATIC	45842	35680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36569_36631_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38975_39409_39535_40050_40206_45753
776523	SIRV4	-	264	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1259	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
776524	contig_12327_pilon	+	1969	5	Intergenic	novelGene_140628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	798.729733702208	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	86	631	168930	171003	FALSE	25	TCTCTTAACTATTTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148625	172341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168905_169078_169396_169508_170312_170438_170841
776525	contig_10296_pilon	-	2165	9	Intergenic	novelGene_168870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_3	83.5374167663808	52	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	71	1219	190643	41028	FALSE	55	TTTTAAAGGAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSKFHGYAYDGIWVIAKTLQRAMETLHSSNRHQRIQDFNYTDHTLGRVILHAMNETNFLGVTGQVVFRNGERMGTIKFTQFQDSREVKVGEYNAVADTLEIINDTIRFQGSEPPKDKTIILEQLRKISLPLYSILSALTILGMIMASAFLFFNIKNRNQKLIKMSSPYMNNLIILGGMLSYASIFLFGLDGSFVSEKTFETLCTVRTWILTVGYTTAFGAMFAKTWRVHAIFKNVKMKKKIIKDQKLLVIVGGMLLIDLCILICWQAVDPLRRTVERYSMEPDPAGRDISIRPLLEHCENTHMTIWLGIVYAYKGLLMLFGCFLAWETRNVSIPALNDSKYIGMSVYNVGIMCIIGAAVSFLTRDQPNVQFCIVALVIIFCSTITLCLVFVPKVPTPPWLLSPS	190713	40081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_41289_44426_44538_90785_90909_98361_98470_108895_109029_111844_111996_116795_116877_130050_130112_190523
776528	contig_7056_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_43688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAAACTGCCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861286	862960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_861300_863000
776530	contig_4519_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_123660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAAGACAACTGCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63541	61722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_61700_63500
776531	contig_1535_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_127234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75628	73814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_73800_75600
776532	SIRV6	+	498	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	358	0	179	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	657	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776536	contig_19145_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_164150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	445	747	225245	224943	NA	80	ATTAAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISCNVPEGSNNIQIRNRKTSRRKVTCTSLGNVEAEPRLRCPDSQASLPSLRCFSPNSSTSSCKCLPKGDSSASDSSVERNSIFNYKKVTNIVQPNFTP	225689	224213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_224200_225700
776542	contig_6286_pilon	+	1569	4	Intergenic	novelGene_165652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	23.0988215187606	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	17	1003	142912	147607	FALSE	40	GTCGTAAAAATTCAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRAPMVTHQCCMDQPRRSVSCLWGGLLYIIVLKGSTLGPVPITFRGVVPAPYYRLGQTSQEEWRRLIQESPAPWGELVTDNIILTVPTTNLRSLENPEPLLRLWDQMMAAVARLGAQPFPFCRPERIVADVQISAGWMHSGYPIMCHLESVPELTNEAGMRSSGLWGPVHELGHNQQRSGWEFPPHTTEATCNLWSVYVHETVLGIPRAQAHPELKPPEREKRIKTHLGKGAPLSNWSVWTALETYLQLQEAFGWEPFTQLFAEYQTLSGLPKDNASKMNLWVKKFSEKVQKNLAPFFKAWGWPVQKEVSDSLACLPEWQENPMRGDLLSQK	142895	148173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_143066_144036_144277_145304_145643_147352
776547	contig_2054_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_51663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGTAGTTTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26262	24559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_24600_26300
776548	contig_11227_pilon	+	2106	4	Intergenic	novelGene_163222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	8.65383665716478	112	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	146	1108	512456	541716	FALSE	5	GCAGTGTTTTGTTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTEVRFMVSIMSGASSKLALFLFGCYVAALGAHTGKHRVAEHRMAEHHVAEYYVAAVYEHQSILSPDPLALTSRKQALELMNQNLDIYEQQVMAAAQKGVQIIVFPEDGIHGFNFTRTSIYPFLDFMPSPRLVRWNPCLEPHRFNDTEVLQRLSCMALRGEMFLVANLGTKQPCHSSDPGCPNDGRYQFNTNVVFSSNGTLVDRYRKHNLYFEAAFDTPPKVDYITFDTPFAGKFGIFTCFDILFFEPGISLLRDFKVKHIVHPTAWMNQLPLLAAIQIQHGFAIALGINMLAANIHHPSLGMTGEWHTHPSAVLLAP	512310	542714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_512476_525876_526157_539918_540069_541203
776549	contig_5039_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_64847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATCTGCTAACTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325805	326601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_325800_326600
776551	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_96004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
776552	contig_5945_pilon	-	1274	6	Intergenic	novelGene_104574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	250.132764747044	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	118	591	235639	219523	TRUE	25	GTGCTTCAGATGAGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	235756	215652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617
776555	contig_2078_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_100164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488726	488529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_488500_488700
776556	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_97964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776558	contig_5836_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_106290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCAGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128014	126332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_126300_128000
776561	SIRV6	+	533	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	26	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	123	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776562	contig_10013_pilon	-	962	7	Intergenic	novelGene_125090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	210.287699751238	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	10	528	524733	520669	FALSE	20	GATTTGGCCCTGTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQMAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	524742	520234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714
776567	contig_1225_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_44195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	55	321	253442	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGPGRGLRSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251474	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274646_276218
776570	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
776574	contig_5375_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_169200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATATAGAATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31422	29456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_29500_31400
776580	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776585	scaffold_16539_pilon	+	826	2	Intergenic	novelGene_68403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTAGGTTTGCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800798	802795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_801525_802695
776591	contig_13863_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_42042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGCCATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113490	112107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_112100_113500
776595	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
776597	contig_15449_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_33668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	170	517	192189	191842	FALSE	25	CTTAAGAGATGTGGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQGEGLVGWRVGGVRGPRVPHGVRRSYGSALTQALPEVRAFKLCLFLPWERPPPPCPSIFDCFLRSLAIDPG	193014	190971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_192241_192896
776600	contig_7056_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_43621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1214.5	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724732	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722649_723705_723817_724504
776604	contig_5171_pilon	+	1115	5	Intergenic	novelGene_161232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	11.0538454847171	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	143	1057	457793	485910	FALSE	25	GCTTTGCTTATTCTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFNQPVFLKESEEKNSKFVEIQQSQTTSVVSEDPLQNLCLASQEVLQKAQQSGRSKCLKCGGSRMFYCYTCYVPVENVPTEQIPVVKLPLKIDIIKHPNETDGKSTAIHAKLLAPEFVDIYTYPCIPEYEEKDHEVALVFPGPKSVSVKDISSHLQKRIQNTVRGKNDDSDKPSFKLKKTEGQEGCDLNDSKWKSTTLKKVIFIDSTWNQTNKIFTDERLQGLLQVELKSRKTCFWRHQKGKPDTFLSTIEAIYYFLVDYHTDVLKEKYIGQYDNLLFFYSFMYQLIKNAKCSGDKETRKLIH	452716	485968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_452804_457737_458057_463193_463338_481691_481951_485662
776605	contig_16870_pilon	+	927	7	Intergenic	novelGene_155489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1185.69079724297	2399	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	265	732	96164	98992	FALSE	10	GCCCTGAGACTGTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYATTYELKEDGSYNVTSTLLKFLALATGWSGAAAFVEQGAEEGTFGENEDCYHWIRTFVPSFLPGQFNLGNIKSFPDLHSYTVRVAATNYNQFAIVFFKKVTKNQEYFKTTLYGRTKELTTELKERFVRFAKSLGLTDDHIIFSVPIDQCIDDA	95628	99187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95823_96093_96229_96869_96948_97484_97565_97734_97855_98087_98190_98969
776606	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	891	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776607	contig_4659_pilon	-	2220	2	Intergenic	novelGene_118172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1345	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAGGCTTCACTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91094	88764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_90924_91033
776609	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776612	contig_11702_pilon	-	1135	6	Intergenic	novelGene_141960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	169.550464464123	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAATCGTGCTTCAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318273	289172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297830_313698_313853_318184
776613	contig_18039_pilon	+	3090	3	Intergenic	novelGene_171247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	3.5	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATCTTCCTTTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142451	149821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_142490_144654_144741_146855
776619	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776620	contig_8617_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_73416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62564	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
776621	contig_13301_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_153108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCGTTTTCCGTTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131303	133589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_131300_133600
776626	contig_6027_pilon	-	2237	13	Intergenic	novelGene_74449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	100.866626734956	42	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	821	1771	283869	272512	FALSE	35	AACTATGCCATGAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNDGASVLTASATTSLTSPNLLL	290891	272045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_272577_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274_288757_289209_289339_290862
776634	contig_14037_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_173643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGACCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6874	5868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14037_pilon_-_5900_6900
776639	contig_6424_pilon	-	864	5	Intergenic	novelGene_109252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.685098095886	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	226	435	7936	6307	TRUE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLEARSPYRCHAGALGLVRDGAARREPEGNPPGSLDADNLFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21100	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6099_6279_6423_7842_8039_12062_12098_21012
776640	contig_10765_pilon	+	958	2	Intergenic	novelGene_122919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCTAAAGTAAATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187570	188749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_187703_187923
776644	contig_17144_pilon	+	461	2	Intergenic	novelGene_29141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTAACCTCAGTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71231	97029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_71319_96655
776646	contig_12079_pilon	-	1928	2	Intergenic	novelGene_67488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCAAAAAAGAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635915	631524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_631903_634365
776648	contig_5728_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_126695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTAAGATTTGAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289994	289338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_289300_290000
776652	contig_5954_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_28766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACACAATAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392870	1390862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390900_1392900
776657	contig_14822_pilon	+	1130	4	Intergenic	novelGene_145421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	326	junction_3	433.230500619089	3792	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	13	399	183396	186229	TRUE	10	CTTTGATGTTTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNKMSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFR	183383	190346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_183502_185583_185738_186102_186594_189979
776660	contig_5317_pilon	+	2029	15	Intergenic	novelGene_76643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_14	43.4399068853063	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	82	1749	987269	1021098	FALSE	30	AAAAAGTGCTTTGTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMLGDAIMLIKGLAKLTQAALETHLQHLGLGGELLMVARTLQSTATEQFAVVFGSVQGQERHEEPYAESFDDLEAELHFSGPQAAGDAAHSSAASDPVSPPPLDPTHSEGPAPAYAASGPFREARLPGRAASPLGMVNGKLFADRRDPYSAMGIQRKFFHQDQSPMGGLTAEDIEKARQAKARPEGSKPHKQMLSERARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRPDEHTGKKAVLDSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNSDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARLKGGREVAMKIQYPGVAQSISSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACAKKFRELLKDHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQLHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVLKKSIEMKFLTGYEIKLVI	966608	1021378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_966681_987259_987446_991036_991445_991632_991700_1009755_1009831_1014062_1014186_1015306_1015393_1015633_1015775_1016407_1016490_1016884_1016979_1017200_1017343_1017626_1017735_1017988_1018055_1018367_1018455_1021086
776661	contig_715_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_167555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129638	127492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_127500_129600
776663	contig_6102_pilon	+	466	3	Intergenic	novelGene_31805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5834.5	138	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360104	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360932
776665	contig_1686_pilon	-	1808	10	Intergenic	novelGene_165592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	9.63148130345304	74	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	30	1253	294571	276241	FALSE	30	CTGACACACAATTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESRISFQRKTDFSCQPGDAFHVVCPNSEEEVQSLLQRLQLTHQREHRILLEIKENTRKKGAALPPHIPESCSLQSILTWCLEIRAVPKKAFLRALADHTSDVAERRRLQELCSKQGAADYTRFVRDARVGLGDLLHAFPTCRPPLSLLLEHLPKLQPRPYSCASSSLFHPGKLRFVFNVVEFLSYTPAAVLRNGLCTGWLAAQATSLLQPGVHLSPADDRTALAPQIFISPRATNSFHLPDDPAVPVIMVGPGTGVAPFISFLQHREKLQEQHPDRNFGAMWLFFGCRHKDRDYLFRDELRHFLKHGVLTHLKVSFSRDVPVGEEAAPAKYVQDNLQLHSKQVARILLQENGSVYVCGDAKNMAKDVNDTLVEIISKEAGVEKLEAMKTLATLKEEKRYLQDVWS	294600	275685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_-_276386_277673_277857_277973_278067_279395_279515_284975_285163_286291_286335_287545_287727_292128_292218_293186_293341_294541
776667	contig_14537_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_158657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACCCCCGCAAGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84640	84083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_84100_84600
776669	contig_2043_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_169924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCAAGCAGTAGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785262	786603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_785300_786600
776671	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776675	contig_5696_pilon	+	703	4	Intergenic	novelGene_117608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_3	37.6061460697879	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	26	703	921381	929931	FALSE	25	GTTGTTAATACTCAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSVGQDVMCLSNSGRDDSEKPPANLDLISRKRPHCRLEESDCVPPAKISSFTSRDDCQEYTSEVSSEELVNVFEETGESYRGQNIFPTSGSTYATPEPQKEQLEPTLQNTETRSVGKIIDTHKERNTPQLPQDGMIVSDKEERTGAASKSEQMDNRTSSSKTPLSRPGRRPLGFLSLICSKNSLESDEPTQVRSKKRLKPLIPVSRKNLKRSNPPIESQEKNQEPSDQLPSSS	921355	929931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_921549_925706_925747_928113_928382_929729
776679	contig_9673_pilon	-	1227	1	Intergenic	novelGene_119173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCAACCAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148377	147150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_147200_148400
776681	contig_6589_pilon	-	591	7	Intergenic	novelGene_25858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1356.16744500408	152	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	29	589	959104	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	959132	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957315_957758_957846_959101
776682	contig_7839_pilon	+	2336	11	Intergenic	novelGene_45669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	18	junction_5	15.5769059828966	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	160	2289	24480	32210	FALSE	25	AATATTTCTGATGTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPHPSQYGTQRKQRRGWRWRRIHLAACCKKKAKKEGAVAFHVYRAYWRAVGWGMALAILFSLLLMQATRNAADWWLSHWISQLKAAKNSSQEVPAPTSPVSSGLFSPQLLLFSPGSFYAPVLPLPKVAPNGSSDIHFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLFAAGTLQAAATLHRRLLHRVLMAPVTFFDSTPMGRILNRFSSDVACVDDSLPFILNILLANAAGLLGLLAVLSSGLPWLLLLLPPLSIIYYRLQRHYRASSRELRRLGSLTLSPLYTQLADTLAGLPVLRASGATYRFEEENQRLLELNQRCQFATSATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAMLVSVERLEEYSCDLPQEPQGHPLQLGIGWLTQGSVEFQDVVLAYRPGLPNALDRVTFRVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFRLLEPSAGRVLLDGVDASQLELAELRSQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHEDRALWQALEQCYLSEVIVSTGGLDGELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKVLCIDEATASVDQKTDQLLQQTIRKRFASKTVLTIAHRLTTILNSDRVLVLQGGRVMELDSPRCPAQSAPLTVPAAATEQPAGSPPTPLPEGLDLTLQASPIILPLLLQPLQLLGQHRDGDHLFTFSSEALPLPHLPNRVERAPWTPLQKPLLLGGYNPEASPEPGLCPSPLASGTPGRCFWDRTPLGFS	24320	32257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_24520_24948_25103_25257_25448_27701_28046_28375_28546_29017_29179_29510_29765_30716_30863_31006_31105_31362_31476_31750
776692	contig_4131_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_127886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCTTTGTGTGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246952	248863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_247000_248900
776695	contig_15304_pilon	-	1419	4	Intergenic	novelGene_30624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	154.106024108945	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	186	1292	66228	64554	FALSE	5	GCCTGCCTGGAGCCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66413	64426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65721_66104
776697	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
776698	contig_11293_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_134668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	499	834	40985	41320	NA	15	ACCTGCTTTTTCCCTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICVLGWVLSRRKPVKGINIYIEREIYIKEMAHGCRGCNIPSPWVRKEASDSHSHRGWQTEDRQAGEQGCCSQAEKINTSPRSAGKAAGKLLAQVPRTRGQMNKSQPQDPK	40486	42318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_40500_42300
776700	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776710	contig_12086_pilon	-	1214	5	Intergenic	novelGene_74706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	40.8105378548237	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	140	943	14945	10689	FALSE	70	TAACTAGTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVVRRCPFLSRVPQTFLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEAGAKPAPRALSTSAVHCQQVKETPPANEKDKTAKAEVQQASDGSQKTPDGAQLPSEHLSPATSQGTASKCPFLAAQMSQRGSSVFRKASLELQEDVQEMHALRKEVVQTSVNPRVISVKTDGEEPSGLLKNFQDIMRKQRPERVSHLLQDNLPKSVSTFQYDRFFEKKIDEKKNDHTYRVFKTVNRRAHIFPMADDYSDSLITKKQVSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVM	16099	10417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_10916_11333_11484_12644_12873_14746_14967_15981
776711	contig_16103_pilon	-	2270	6	Intergenic	novelGene_118762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_5	208.820880182035	32	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1273	1872	444621	442437	FALSE	40	ATAGAATGAGAATATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPGAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKVCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQVGVLTSVCLGLPKARLF	448068	442038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_442694_443771_444088_444594_444767_445744_445877_446221_446354_447205
776712	contig_11126_pilon	+	548	3	Intergenic	novelGene_138124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	5	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTAGGATTTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276857	292167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_276878_282536_282765_291867
776713	contig_9807_pilon	+	942	7	Intergenic	novelGene_32874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	749.862209564753	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	102	800	109130	158865	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDVTIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQPTGSGTRTSLQQNVFFLSMFL	109028	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109683_122899_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_158799
776717	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
776720	contig_8676_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_142189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	30	299	11103	11372	NA	20	GGAGCTTTCCAAGCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSSSPALWMVCGDHPASHHMVVGTRAFVLLTSSMVGPHGAELDKPGKAVGSQNFWHQHCPAGQRLLRCPGQGSFVLLACPSQQSSWFRSEIIGSPYL	11073	12124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_11100_12100
776721	contig_8676_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_142190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCAGCTAGGTACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12274	14470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_12300_14500
776723	contig_9363_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_6711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297411	1296347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1296300_1297400
776724	contig_10749_pilon	-	1645	8	Intergenic	novelGene_133425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	11.259463140136	137	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	103	1209	116862	112666	FALSE	15	AGGTCTGTTTCCCTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEEQGSGITTGCGLPSIEQMLAANPGKTPISLLQEYGTRIGKTPVYDLLKAEGQAHQPNFTFRVTVGNTSCTGQGPSKKAAKHKAAEVALKHLKGGSMLEPALEDSSSFSPLDSSLPEDVPVFTAAVAATPVLSAVPTRSSPMEVQPPVSPQQSECNPVGALQELVVQKGWRLPEYTVTQESGPAHRKEFTMTCRVERFIEIGSGTSKKLAKRNAAAKMLLRVHTVPLDARDGNEVEPDDDHFSTGVGSRLDGLRNRGPGCTWDSLRNSVGEKILSLRSCSLGSLGALGPACCSVLSELSEEQAFHVSYLDIGMAGWGSGLGTGPEQACVGIRESGGDEDDVNAHHPGAASQPNTASLFSLGLQRS	116964	112229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_113032_113426_113555_113872_113991_114207_114281_114870_114967_115528_115632_116091_116262_116809
776728	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776730	contig_987_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_72354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAAGAAGTGTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295156	1296994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1295200_1297000
776731	contig_4364_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_1055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
776734	contig_7919_pilon	+	1414	7	Intergenic	novelGene_28097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_4	726.09168765996	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296846	1374822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1297072_1340603_1340686_1344110_1344269_1350138_1350441_1352985_1353064_1372226_1372328_1374354
776735	SIRV6	+	305	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1683	19	-216	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2807	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776737	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_93476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653738	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
776738	contig_11429_pilon	+	1187	4	Intergenic	novelGene_60477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	53.8165608546498	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	475	1128	63827	67460	FALSE	30	TTGTAAATAAAGTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVCGSHPQVGNAKHNVHVMNISTGKKVKGGSSKLTGRVLALSFDAPGRLLWAGDDRGSVFSFLFDMATGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	63352	67519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_64035_64134_64277_66731_66851_67275
776744	SIRV5	+	371	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	135	48	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
776745	contig_11304_pilon	+	2013	2	Intergenic	novelGene_156700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTTGGTTTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362500	368314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_363394_367194
776746	contig_13868_pilon	-	1979	9	Intergenic	novelGene_172642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	129.211974580532	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	135	884	98723	74161	TRUE	25	ACCCAGCTGTTCTAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAKSPAGRGARGPWLWDARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKMKDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEAAIKFSGFDEKMFLKRGGKYVWSKADLKLDW	98857	13458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_14006_60112_60222_68586_68701_73835_74326_76205_76239_80320_80471_82044_82275_84692_84855_98713
776747	SIRV1	+	243	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACCCTAGTATGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
776752	contig_6952_pilon	-	1233	3	Intergenic	novelGene_173644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	6.5	240	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	103	630	36218	30236	FALSE	20	GTATATACATGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQPQWAHAPCVPEVAQRWCFLTCGVNLRASCCKKMGGSVTRAVRNFNLENRAEREISKMKPSLAPRHPSTKNLLREEMSRHPEVKGEITRKDDKLLSLLKNVYVDSRDPVSSAQVKDDGAHQKPKEFRLPKGHHFDVVNITNIPKGKISIVEALTLLNNHKLYPDMWTAEKIAQEYHLELKDVNSLLRYFVTFEVKIFPPEDKKAIQPK	36320	29632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_-_30524_35402_35507_36082
776753	contig_14219_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_54319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACACTCAGCATTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707901	705818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_705800_707900
776755	contig_4136_pilon	+	3064	25	Intergenic	novelGene_161256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8.23061696080892	38	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	66	2648	342890	431481	FALSE	15	ACATTCAGTTTTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAFSVRKEDTLREAFQESSEMARRSSFPSRQVVSLFTFAIGVNICLGYTVNRSKRTEGWDEGPPTAVLSDSPWISTSGSCKGRCYELQELEPPDCRCDNLCKSYSSCCHDFDEHCLKTARGWECTKDRCGEGRSEENACHCSEDCMAMGDCCTNYHVVCKGESHWVDDDCEEIKTPECPAGFAGPPLIIFSVDGFRASYMKKGSKVMPNIEKLRSCGTHSPYMRPVYPTKTFPNLYTLATGLYPESHGIVGNSMYDPVFDATFHLRGREKFNHRWWGGQPLWITAAKQGVKAGTFFWSVVIPHERRILTILQWLTLPDDERPSVYAFYSEQPDFAGHKYGPFGSEMTNPLREIDKIVGQLMDGLKQLKLHRCVNVIFVGDHGMEDVTCDRTEFLSNYLTNVDDVILVPGSLGRIRSRFSNNPKYDPKAILANLTCKKPDQHFKPYMKQHLPKRLHYANNRRIEDIHLLVERRWHIARKPMDVYKKPSGKCFFQGDHGFDNKLNSMQTVFVGYGPTFKYKTKVPPFENIELYNVMCDLLGVRPAPNNGTHGSLNHLLRTNTFRPTMPEEVTRPNYPGVTYLQSDFDLGCSCDDKSKLDELNRRLNIKGSTEERHLLYGRPAVLCRTRYDILGHTDFESGYSEIFLMPLWTSYTVSKQAEISVIPEHLTSCVRPDVRISPSFSQNCLAYKNDKQMSYGFLFPPYLSSSPEAKYDAFLVTNMVPMYPAFKRVWNYFQRVLVKKYASERNGVNVISGPIFDYDYDGLHDTQDKIKQYVEGSSIPVPTHYYSIVTSCLDFTQPADKCDGPLSVSSFILPHRPDNEESCNNSEDESKWVEELIKMHTARVRDIEHLTSLDFFRKTSRSYSEILALKTYLHTYESEI	342824	431897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_342923_343266_343370_356736_356896_358695_358822_360835_360897_364108_364207_364613_364694_365442_365563_374349_374406_387338_387405_388104_388178_394966_395076_397806_397933_404541_404574_405271_405400_407919_408008_408170_408259_409304_409478_412756_412809_420747_420885_421773_421910_423369_423448_426194_426328_428216_428374_431310
776756	contig_5125_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_43489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478974	478631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_478600_479000
776764	contig_4151_pilon	-	2075	2	Intergenic	novelGene_65299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGTAAAATAACATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789203	783307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_784003_787823
776768	scaffold_12124_pilon	+	1367	10	Intergenic	novelGene_21995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	158.483087075211	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	201	1046	799011	813966	TRUE	5	GAGCTTGTTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPVPRDARFIPSNSEDQR	791835	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_813915_813998_815122
776769	contig_5039_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_64890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580527	579178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_579200_580500
776770	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776773	contig_7202_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_17928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
776775	contig_3326_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_170600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.7826889938944	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	96	803	214350	212417	FALSE	25	GGGATAGTGGTCTGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILWGGVLALLPLLLLSLLGVSWAESSCSGYPAIPGIPGIPGAPGSDGNPGTPGIKGEKGLPGLAGDHGEFGEKGDPGIPGNPGKVGPKGPIGPKGSPGPPGARGPKGESGDYRATQKIAFSVLRNIHTPLRRDQVIRFDQVITNENHNYEPRNGKFTCRVPGLYYFTYHASSRGNLCVNLVRGRERVQKVVTFCDYVHNTFQVTTGSVVLKLVGIEGANSIFSGFLLFPDIEV	217549	212272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212482_212529_212992_214169_214374_217477
776782	contig_6375_pilon	+	1221	4	Intergenic	novelGene_72930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.274551494344	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	11	634	16563	29784	FALSE	15	CTGCTGGCAGTGATGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLEQQPQGWLSSWLPTWRPTSMSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWSHGSVRYESMAELRLEPRSADTQCSLQTPFAKPPGRHHCHVTGPGHWLRTSPPHPHIAVPLCRGAVVLPYVSALAA	16552	30371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327_22604_29548
776783	contig_9955_pilon	+	2619	1	Intergenic	novelGene_21356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCCTCTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150971	153590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_151000_153600
776787	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
776789	contig_9653_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_48332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTACTGAACTCAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040051	1039573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1039600_1040100
776790	contig_9653_pilon	-	637	2	Intergenic	novelGene_48331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGAGTCCCAGAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039522	1038774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1039300_1039410
776791	contig_762_pilon	-	1048	8	Intergenic	novelGene_135935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_6	35.700568794417	187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	441	926	259754	255361	FALSE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP	266751	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_256436_256765_256905_257514_257668_259724_259837_263480_263602_263903_264056_266666
776793	contig_14322_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_116543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGCGAGAGGTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
776794	contig_804_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_138793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTCAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229584	228185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_228200_229600
776796	contig_6975_pilon	+	974	3	Intergenic	novelGene_74263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCCCCACCCAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159232	161140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_159535_159678_159943_160732
776797	contig_6191_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_107860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207684	205823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_205800_207700
776800	contig_13904_pilon	-	939	6	Intergenic	novelGene_165481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	156.840555979632	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	67	426	81931	59509	FALSE	35	CATTTTCTAGATCAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPGWRRAAARERPRLWPGVGTMDKLRRVLSGQDDEEQGLTTQVLDSSSLSYTTRLKWFAICFVCGVVCSILGTGLLFLPQGTKLFAVFYTLGNIAALASTCFLMGPMKQLKKMFETTRLLATVFMLVQFIIHPICKGCSH	81997	58995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_59524_61361_61392_67280_67363_68747_68831_70843_70931_81868
776801	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776803	SIRV6	+	217	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	379	-1	-209	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACGCCGTTAGCCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
776815	contig_13806_pilon	+	2122	7	Intergenic	novelGene_173658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	40.0988362258391	141	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	334	1155	105222	117985	FALSE	15	TGTGTTTTGGTGTAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRRFFNWFYWSINLGAIVSLGGVAYIQQNVSFVIGYVIPTVCIGVAFVVFFCGQSFFITKPPDGSAFTDVFKILAYSFCPQKRIGEHRSNGQGTGVCQQSSKHSLFDSCKMSRGGPFAEEKVEDVKALVKIVPVFLALIPYWTVYFQMQTTYVLQSLHLKIPAISSITTTPHTFPAAWLTMFDAVLILLLIPLKDKLVDPVLKRNGLLPSSLKRIAVGMFFVMCSAFAAGILESKRLDLVKEKTINQTIGNVVYYAADLPIWWQLPQYVLIGISEIFASIAGLEFAYSAAPKSMQSAIMGLFFFFSGIGSFVGSGLLALVSVKAIGWMSSHADIGNINSCYLNYYFFLLAAVQGATLVLFLIVSVKYDRQRSRANGVPTGGRA	99866	118952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_100142_105163_105333_105797_105876_106344_106514_113910_114067_115124_115284_117836
776817	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8139	-2	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
776819	contig_19098_pilon	-	2717	2	Intergenic	novelGene_65874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	12	junction_1	0	100	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	202	510	502790	502482	TRUE	20	AGTTGGGGAGGTGACCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCWPAVLTACLLKSRRRGRSRSLILLVLCESPGSSPSFCKYLPCQQQFPRCPRSWKEQLSRLIYSLAMTIGEIIGPAVPVTFPSSLVGRIICPPPLFSISLPPPSLASPCAPLAQNWGRHCQFSWAEMPGTLGTAGSCTLAQEMSVAGGLEPSSGTAARERPPNSRARL	502991	499871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_500288_500690
776820	contig_7494_pilon	-	2070	6	Intergenic	novelGene_167439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGCATGTATACATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49882	31851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_-_32149_35973_36151_42381_42606_43374_43523_46665_46882_48874
776825	contig_5643_pilon	+	1160	7	Intergenic	novelGene_38974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_3	538.363389253847	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	278	781	551251	552476	FALSE	10	CACCTGTGTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549633	552855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
776827	SIRV2	-	439	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	34	3259	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
776831	contig_9909_pilon	-	1414	9	Intergenic	novelGene_42472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGACTTCTGGGGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688790	662981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_663125_667924_668017_675292_675444_677304_677487_679710_679877_681358_681564_683046_683176_685475_685628_688596
776838	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	2	379	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	148	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776844	contig_9482_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_44276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGCCTAGTTTTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100339	1098279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1098300_1100300
776848	contig_2757_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_164595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTCTGCTGTGTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262624	264767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_262600_264800
776850	contig_4301_pilon	-	988	9	Intergenic	novelGene_65085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_1	184.095041690427	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	101	781	441884	420112	FALSE	50	ACTCTATAAAAGCAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAESYAGFSSLHSAARFKPKLQLVAHWPSKAFAMALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDQETYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD	441984	419904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_420175_421107_421196_422457_422553_424140_424210_424761_424852_432023_432091_432714_432825_434847_434914_441851
776853	contig_6048_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_73153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGGGGAACCTCTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068185	1070324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1068200_1070300
776854	contig_6496_pilon	+	1247	6	Intergenic	novelGene_103468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25.4982352330509	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	148492	148854	TRUE	25	TCTTTTTGTATATAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGGESRNVSVEGKPIVSAPIERGPNGGDPQLLSRYLRPKHAAGAGVFARVVRWDPGVDVLTSPCPVSVQWTVKLFWLWLASTLRRAALCDHDLYFFASCAACREAAQGHRGATVWAPLGV	148490	155998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_148995_152097_152145_152244_152343_155023_155098_155185_155292_155580
776855	SIRV2	-	529	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4344	34	3169	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
776861	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	520	51	520	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776863	contig_11492_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_152259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATGATTCCATCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405829	403793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_403800_405800
776864	contig_13300_pilon	+	1223	2	Intergenic	novelGene_125776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	181	546	54806	55171	FALSE	15	TCCTGACACACTCGCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGPCGSHWVALRVHCLPLSVHVDLFGDQPTYHRLSQSSSAAITEIPQGDGFNKQKFILSLSSRLEVQIQAASFRGRISLSVGSEGRSLHSIFPGQGASQRRDPTSKRTCYSPGSCFLVI	53960	55848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_54075_54739
776867	contig_205_pilon	-	2694	1	Intergenic	novelGene_144319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1730	2044	290873	290559	NA	20	TCTCCTTACATCATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITLQCNDMLKGKYQENNLTEFYKCLLRNEYVSLKAYAYGLILVSGSTCTCEKVLSKMKYVKFHFNSALIDEHLQKILIRSTNLELQLSEMLSPQKKNAILLTS	292602	289908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_289900_292600
776869	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	51	510	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
776870	contig_12142_pilon	+	1637	15	Intergenic	novelGene_147801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	71.2715416773148	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	14	646	87452	100349	TRUE	65	AAAAAGCAGAAGTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPARRCCLGWDFSTQQKLGKCCLPLLENAFQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTEDFFGQ	87438	135887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88878_89007_94352_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100331_100403_102360_102480_104919_105002_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
776871	contig_4131_pilon	+	1095	3	Intergenic	novelGene_127881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2.5	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	69	461	240672	241064	TRUE	10	GTTTATTTCTTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240603	248860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248007_248362_248714
776872	contig_6710_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_97878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
776875	contig_3747_pilon	+	1942	5	Intergenic	novelGene_24980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	24.1699710384601	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCATACCTTCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261343	265657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_261410_261520_261641_262927_262994_263920_264420_264466
776877	contig_10494_pilon	-	895	5	Intergenic	novelGene_102189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	33	junction_3	12.9301005409857	1415	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	69	611	1059298	1056579	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPIPGVLFRDMSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1059366	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057302_1058719_1058827_1059218
776879	contig_8544_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_55912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTAAGTCACATGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25978	25333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_25300_26000
776883	contig_14483_pilon	+	2656	1	Intergenic	novelGene_133743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAACTAAAAGGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29557	32213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_29600_32200
776884	contig_5047_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_157996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTTCTCCAAAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118503	1118106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1118100_1118500
776895	contig_16525_pilon	-	640	6	Intergenic	novelGene_133801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2034.71310999856	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGATCGCCAGTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97128	91485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96733_96927_97065
776897	scaffold_6394_pilon	+	996	7	Intergenic	novelGene_111022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1215.91535021517	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	345	863	405059	406119	FALSE	30	ATGCATTAAAGCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTEHMFSAENGK	402166	406252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_402243_402874_402973_403239_403376_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406086
776898	contig_11987_pilon	-	1107	5	Intergenic	novelGene_168958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	1.73205080756888	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	19	957	438791	431444	FALSE	55	ATAAAATTTTGAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFICKMVPFVQSTAIVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSPMWHVQRLEIKYDFLYEKEHVCCLEEWTSPVHQKTYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKIGYELWMKKRVGDGSVLRTIHGKEKSKIVRKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVFHMMIEYSNFEKDYDDVTVKMVFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNFLSAVCYCIVKESLSPARRHGNSGITMMRKKGKFSRRENPVEETKGEGFSDGNIEVKLCEQPAERKNLKRHLALFSSELPESSALGSGR	438809	431293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_431845_432558_432657_434261_434498_436206_436269_438649
776902	SIRV6	+	556	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	6	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776903	contig_4426_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_15407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAAAAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814799	817004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_814800_817000
776904	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_96367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776905	contig_12786_pilon	-	1018	8	Intergenic	novelGene_103424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	722.570694232243	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	186	962	614067	590909	FALSE	20	CCAGAATCTCCTTTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629492	590852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_615624_615721_629414
776906	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
776909	contig_6710_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_97715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776912	contig_7229_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_39829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACTTCCCAAGCTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915381	917119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_915400_917100
776914	contig_10324_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_7883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	322	447	565426	565551	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVPVVIRSTGLSEQRCVQTTLRKCLFSQRLNLQRPLRGPPQLDPQSGRQSALWPRSQSTRPARQLPAPPGSPRPALSSPRQRWLQCPIKVKAGPTLALAHRDEQCVWMSCFRVCECLGEELEMVLGPRSVIAISDMGCASLEPHFPYL	565104	566220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_565100_566200
776915	contig_20550_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_142625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21937	19945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_19900_21900
776919	contig_5222_pilon	+	2115	3	Intergenic	novelGene_59005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	151	1914	253910	263695	FALSE	40	CCTGCAATATACATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGARSCSVWLRIPGKVSRPWKQPFQRRWTRPAGATNRRPSPVGVSSLWMGGAARGPGRKDAGPPGAGLPPQQRRLGDAVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPLPRRLSVTTEQLTSEHTQHFLNGGEMKVEQLFQEFSNSRPDTFQSAGITNSEKCSPTVSQGRSSDSLNMAKSSSSSKAPRMVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIVNYPEIYFVGPNAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVLRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLGQYVALKVVRSEKRFRRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCIAFELLSIDLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSATKVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGLPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRGPPGSKDWVTALKGCDDYLFVEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTGKVAGKRVVHPTNAFQGLGSKLPPVVGIASKLKANLMSEANGGIPLCSVLPKLIS	253759	263896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_253987_256289_256402_262120
776921	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
776922	contig_18869_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_56362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	73776	73462	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73779	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
776923	contig_12312_pilon	+	2112	19	Intergenic	novelGene_64003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	66.9653494330565	4	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	25	1437	477005	535276	FALSE	40	GGCATCTATAGACTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKVRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQTASLLLFPCCTSVSVPV	476980	535951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_526427_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533568_535221
776927	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
776935	contig_1699_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_72809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37279	35086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_35100_37300
776936	contig_6506_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_153480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34453	32998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_33000_34500
776938	contig_9921_pilon	-	2066	2	Intergenic	novelGene_23761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAACAACTTCAAGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326593	324478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_324725_324773
776942	contig_11986_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_69098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCATACGACCCTATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42788	41484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_41500_42800
776943	contig_935_pilon	+	1754	6	Intergenic	novelGene_45521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	276.441964976376	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	11	568	32331	70064	FALSE	60	TTTACCGACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PANMEGGDGGVAVAGLGALGSGAAAATVREILQDECYSDFLNEDFDVKAYTSQSIHQAVIAEQLAKLAQGISQLDKELHLQVVARHEDLLAQATGIESLEGVLQMMQTRIGALQGAVDRMKAKIVEPYNKIVARTAQLARLQVACDLLRRIIRILYLSKRLQGQLQGGSREITKAAQSLSELGKSFFG	32320	71250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_32425_38644_38785_42660_42719_54776_54832_54940_55011_69923
776944	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_94164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	653885	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653887	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776949	contig_14219_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_54343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	170	505	818573	818908	NA	30	CACTTGGGGAGGAGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKHSAANQKVSSSNQPSTPWEKDMAVSFPKDYRIGNLIGQFYPVLQGPYELESAQQQGVLSSVIMPSFTFSKSPEDFLPMPVIQLIQHFICFPRHSNQCFKIITILQVCF	818403	819606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_818400_819600
776950	contig_14530_pilon	+	1801	5	Intergenic	novelGene_108438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	6.36396103067893	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	96	812	9663	26836	FALSE	25	TACATTAAGGTTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYELFSHPAERGYRAGLCSKAALFLLLAAVFTYIPPLLVAFRSHGFWLKRSSYEEQPTVRFQHQVLLVALLGPERGGFLAWSTFPAFNRLQGDHLRVPLVSTREEDKNQDGKIDMLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNGESWVEFIQPLLRNFPG	9567	27825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10058_23780_23910_24255_24400_26701
776951	contig_1443_pilon	+	757	3	Intergenic	novelGene_28178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	344128	344592	TRUE	20	TTCTGTGCATTCTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344657_344751
776957	contig_8544_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_55916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACGGTGTATCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82371	80779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_80800_82400
776959	contig_7861_pilon	-	1764	5	Intergenic	novelGene_77401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_4	30.7194970661956	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	93	644	135970	45980	FALSE	15	CATTCCTATTGTGTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARHAAEGEIYTKLNQKIDEFVQLADYDWTMSEPDGRASGYLMDLINFLRSIFQVFTHLPGKVAQTACMSACQHLSTSLMQMLLDSELKQISMGAVQQFNLDVIQCELFASSEPVPGFQGDTLQLAFIDLRQLLDLFMVWDWSTYLADYGQPASKYLRVNPNTALTLLEKMKDTSKKNNIFAQFRKNDRDKQKLIETVVKQLRSLVNGMSQHT	136062	44859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_46113_47231_47345_83138_83213_103047_103190_135880
776962	contig_6710_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_98286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	TACTGAGGCATCCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
776963	contig_7179_pilon	-	1321	5	Intergenic	novelGene_78158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.2517730050561	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGATAAGAATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041391	1038920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1039687_1039933_1040059_1040747_1040883_1040978_1041072_1041189
776967	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
776969	contig_7370_pilon	+	2699	1	Intergenic	novelGene_173667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTTCTCAGTATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55650	58349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7370_pilon_+_55600_58300
776970	contig_10426_pilon	-	2431	2	Intergenic	novelGene_144669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_1	0	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	501	827	78683	77408	FALSE	30	TACAATCTTTTTTCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLFSHSLVGYKSKFRASAPGEGLSLLPLEESPCCQSSPGLGASLHRNPRSKGCVLLPALLSWWYEVPMSLCLLLSFISQEIGLRCYLVDFINVTATNPSYHL	79183	75803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_77417_78365
776973	contig_7635_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_171371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAACGAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134227	135982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_134200_136000
776978	contig_19098_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_65821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTCTGCTTTAGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360518	361212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_360500_361200
776981	contig_3095_pilon	-	1185	6	Intergenic	novelGene_75223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	158	junction_5	721.479202749463	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255543	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253789_255384
776982	contig_10494_pilon	+	1787	3	Intergenic	novelGene_102206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	29	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACACACCTGCAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083263	1087134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083306_1085096_1086314_1086606
776984	SIRV4	-	326	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1195	0	1195	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
776987	contig_15063_pilon	+	972	3	Intergenic	novelGene_14408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	10	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	20	841	35271	36661	FALSE	25	TCAGTTCACAAGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35251	36792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
776991	contig_21399_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_173669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGTGCAATAATCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131515	130505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21399_pilon_-_130500_131500
776992	contig_5696_pilon	-	2377	8	Intergenic	novelGene_117595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_3	409.041687411951	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	4	888	773044	756911	FALSE	40	TATTAAATTGAAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMGGGGGVLEQEDSVLFRRGTGQSDDSDIWDDTALIKAYDKAVASFKHALKNGDICEASDKPRGTPKRKPIKKNKSQKKNTTTPLKQWKVGDKCSAIWSEDGCVYPATIASVDFKRETCVVVYTGYGNREEQNLSDLLLSTFGGVSNGDQNAQENAQENENESQISTDESENSSRSPGNKPNNLKSKAAPWNSFLPPPPPMPGLGVGPGKPGLKFNGPPPPPPPPPPPSFLSCWLPPFPSGPPIIPPPPPICPDSLDDADALGSMLISWYMSGYHTGYYMGFRQNQKEGKCSHFN	773047	755421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_756959_762282_762394_763244_763344_764527_764684_764836_765050_765887_766008_767711_767784_772978
776994	contig_9828_pilon	-	2478	1	Intergenic	novelGene_172260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAGGAGAGGCAAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379732	377254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_377300_379700
776995	contig_18869_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_56425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAAGCTCAACTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91528	93056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_91500_93100
777000	contig_5684_pilon	-	565	3	Intergenic	novelGene_81030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3156	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAAGCTCCATCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361523	351263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351552_351626_351696_361315
777002	contig_10286_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_98437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAATTACATAAAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492994	493258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_493000_493300
777003	contig_14566_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_148829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	273	617	1436	1780	NA	35	GAAATGGCAAATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNQGWERVEGFKRFPKTCRIKAVSQVLIQMPLGQVLKFGCELPLGQVLKLSTIEVWDQIALGFGDHRMHCRVLSCIPGLHPLDASSILSPVVTVRNVWLVLMVAQHDEHNQCH	1163	2211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_1200_2200
777004	contig_11316_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_122700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCCTCGTAGTATAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140032	140525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140000_140500
777008	contig_16622_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_48513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGCCGTTGTAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200804	202267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_200800_202300
777011	contig_6189_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_164942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	110	511	91014	94750	FALSE	55	CAAAAAAAAACCCACCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGQATPQKHICDTPNRSGKTSSSGGGDSQLLPDTPQPGLGVGQLHCQVLLVFAGEAAGGAGGGVGAGGLEAFSFITKNVLILLPSLTLTFLWKALRSPRSGLPGELVFKKLILKPHPRLKTLVWDANLRLNK	90904	95895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_91226_94560
777012	contig_10599_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_49879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136648	137939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_136600_137900
777013	contig_4232_pilon	+	2205	11	Intergenic	novelGene_63240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	163.023587250434	677	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	96	941	302477	306735	TRUE	10	GCCAGAGCTTCGCCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRISASGEWLGCSARRGPSCDPGPAPGTPAMDDLFPLIFPSEPAQATGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVCFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPLCRSQPAGSRARLHAAAAAFRPGAQ	302381	311915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_302484_303089_303117_303212_303365_303528_303678_304720_304813_305173_305306_306230_306336_306553_306768_309524_309606_309695_309738_310806
777014	contig_6048_pilon	-	1202	7	Intergenic	novelGene_73268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	146.101182594651	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	424	831	1979532	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVCLRSQRAGTAAQDGLLLGRGQAQELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDKEHLWKLIHEASAHIYVCGDARNMARDVQNTFCDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	1980569	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979280_1979321_1979383_1979459_1979731_1980040_1980196_1980499
777015	contig_15047_pilon	+	794	3	Intergenic	novelGene_52272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3857.5	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	247	369	4573	21201	FALSE	55	GAGAGGAAATAAATGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGTYQHLQ	4207	21626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_4434_4552_4676_21181
777019	SIRV6	+	290	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8142	-1	597	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGTCGCTTTTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777023	SIRV2	-	528	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1099	10	-64	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4796	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
777025	SIRV6	+	378	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	402	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	4	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
777027	contig_4519_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_123724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCATGAAACAAAAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724084	726161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_724100_726200
777032	contig_11851_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_146560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAATAAAATGTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298124	299568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_298100_299600
777034	SIRV4	-	269	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1251	1	1251	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3907	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
777035	contig_3602_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_60593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779389	780616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_779400_780600
777040	contig_8273_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_113080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGGAAAAAAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96893	94909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_94900_96900
777041	contig_15326_pilon	-	1499	12	Intergenic	novelGene_157697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	250.720713211051	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	33	974	93203	15820	TRUE	80	ATAACCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGGCEQGRTKMAVQVVQAVHLESDAFLVCLNHALSTEKEEVMGLCIGELNDDTRSDSKFAYTGTEMRTVAEKVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEMLAELTGRPMRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSESPHGPRDFWSSSQHISIEGQKEEERYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	93235	14327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_14835_15801_15972_19883_19928_20501_20634_41216_41292_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83619_83742_89514_89570_91776_91794_93089
777043	contig_10892_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_116732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGTCATGGTCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18500	17693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_17700_18500
777045	contig_9332_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_60705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAGAAAAAGAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54416	53960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_54000_54400
777046	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
777048	SIRV4	-	369	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1154	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777049	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777057	contig_10734_pilon	-	2118	5	Intergenic	novelGene_51066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	429	743	467146	466832	TRUE	10	ACGCCCCTCCCCCAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDATPSPTSFMLNSEHLQSQTLPFQPFPSSQVSWLLSRKHGVTSSSVPINASAPSPKCPLQSPSIFKILAPLHLPKIKSSQAMQVHRDLITKLVILLMSSTLYF	467574	452571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_452711_460685_460815_461377_461485_463211_463525_466144
777061	scaffold_19766_pilon	+	2157	13	Intergenic	novelGene_34414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCGGGAGCCCGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839375	843562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_839855_840032_840143_840281_840333_840567_840617_840902_840994_841093_841584_841685_841756_841855_841915_842139_842223_842314_842431_842579_842860_843181_843271_843372
777064	contig_6279_pilon	-	2634	1	Intergenic	novelGene_164770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGCTGAGTTGGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109683	107049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_107000_109700
777068	contig_6446_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_149181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCATTTCCTTAATAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166946	167823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_166900_167800
777074	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777082	contig_12701_pilon	-	1265	6	Intergenic	novelGene_169554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	31.9912488033837	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	118	957	40561	29679	FALSE	30	TTTAGGAAAAATGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKR	52322	29370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_52219
777088	contig_14871_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_63719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTGTGGCCGAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233553	234218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_233600_234200
777092	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8133	2	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777094	contig_8020_pilon	-	1106	7	Intergenic	novelGene_114371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	132.202706309499	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	77	478	107186	106347	TRUE	20	CTAAACAGGGCTGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRCCGRG	107262	104736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105084_105837_105897_106000_106507_106616_106715_106803_106892_107130
777099	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777100	contig_3394_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_152724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTGGCAGTGAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567184	565885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_565900_567200
777101	SIRV6	+	453	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGCAGTTGCTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1637_1736_1845_2027_2470
777102	contig_16503_pilon	+	1780	9	Intergenic	novelGene_162063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	100.601239430735	409	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	113	910	123420	146861	FALSE	10	GCCTGCCACAGGGGGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPRAARSDADWGGSRCRWACSAEQKPEPTGSSRTSRMGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPVYEEGCMEKVQAWLQENMGVILGVCVGVAVIELLGILLSICLCRHIHSEDYSKVPKY	92053	147731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145653_146335_146420_146783
777106	contig_13806_pilon	-	2529	1	Intergenic	novelGene_173659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2200	2502	101511	101209	NA	40	ATCAAGAATTCCTACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQSTRMVRKEVCQNPTREPAPDSRDVLRGEKKQGHKSYCDAASSLPRGRFPLHSSKYTHKTMPRAQGEIWGLACGRAPRQSRCPPMVWAALRREAPRD	103710	101181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_101200_103700
777107	contig_15327_pilon	-	2116	9	Intergenic	novelGene_70742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	28.7608675112556	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	82	795	1012665	1009194	TRUE	5	GTAGCTGGTCTGGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPWWRAALYGSRRWRAFSTSAACSRRTAPLGPMPNEDIDVSNLERLEKYRSFERYRRRAEQEARAPHWWRTYWEHFGEKSDPKDKIDIGLPPPKICRTQQLLERKQVLRELRANVEEERAARLRTAQIPLEEVRAEWERTCGPYHKQRLAEYYGLYRDLFHGATFVPRVPLHVAYAVGEEDLMPVYHGNEVTPTEATQAPEVAYEADQDSLWTLLLTSLDGHLLEPDAEYVHWLV	1012746	1007340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1007682_1007861_1007999_1008209_1008369_1008509_1009244_1009372_1009446_1010350_1010560_1010642_1010778_1012304_1012485_1012598
777111	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	508	3	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
777116	contig_5586_pilon	-	1189	3	Intergenic	novelGene_143570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGTAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393477	390631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_391238_392797_392875_392971
777119	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777120	contig_6241_pilon	+	1521	1	Intergenic	novelGene_156430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGCAGCCACCACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285886	287407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_285900_287400
777123	contig_17108_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_109507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCACTGTACAGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27570	27117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_27100_27600
777124	contig_6361_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_23889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTATGTTTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113922	115480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_113900_115500
777125	contig_19016_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_173338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32528	30528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_30500_32500
777126	contig_15021_pilon	-	1655	13	Intergenic	novelGene_26917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_12	48.6224113849662	90	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	22	1203	36448	15710	FALSE	15	TGCAGGTAGGCATGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGRRGKMDAATLTYDTLRFAEFEDFPETSEPVWILGRKYSVFTEKDEILSDVASRLWFTYRKNFPAIGGTGPTSDTGWGCMLRCGQMIFAQALLCRHLGRDWRWARRRRQPDSYFSVLHAFIDRKDSHYSIHQIAQMGVGEGKSIGQWYGPNTVAQVLKKLAVFDTWSSLAVHIAMDNTVVMAEIRRLCRSSSVCAGAAACPADPSQHCNGLPTGAEAAGRPSLWRPLVLLIPLRLGLTDINEAYVETLKHCFRMPQSLGVIGGKPNSAHYFIGYVGEELIYLDPHTTQPAVELTGGCSIPDDSFHCQHPPCRMNIAELDPSIAVGFFCKTEEDFNDWCQQVRKLSLVSGALPMFELVEQQPSHLACPDVLNLSLDSSDVERLERFFDSEDEDFEILSL	36469	15257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_15784_16492_16587_16850_16908_17689_17836_18116_18196_18864_19059_22068_22149_23134_23208_23737_23840_24173_24273_24812_24885_25385_25488_36438
777127	contig_2310_pilon	+	785	7	Intergenic	novelGene_71623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	62.9534660593751	2983	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCCCGTCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195307	208930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_195410_199428_199499_204122_204254_204739_204944_205022_205048_208234_208307_208749
777129	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	6	413	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777136	SIRV4	-	216	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1307	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3851	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
777137	contig_10627_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_60054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTATTGCCATCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187654	1189130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1187700_1189100
777138	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777142	contig_10627_pilon	+	1349	6	Intergenic	novelGene_59901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	48.1331486607722	395	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	193	1014	29280	32519	TRUE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYGWPDLQGPLQFCCPVTLGRQGVHRLWETWHKVHSAPPKEGLAWTTPPFRPWCPATTC	24149	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515_31837_32346_32538_32744
777144	contig_6102_pilon	+	1744	10	Intergenic	novelGene_32278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.8878583393269	1	80	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	362	1393	1446602	1449029	FALSE	15	CCTGAGTATCTGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVIWSGWRHGPSTARQPRPRLGKQPGDGQARRACWTVTLRCGNCCRGRRTGSVVAWSSSPQRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1445527	1449380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1445717_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
777145	contig_4923_pilon	+	3129	1	Intergenic	novelGene_109326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346592	349721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_+_346600_349700
777147	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777149	SIRV6	+	359	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	14	410	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777150	contig_8674_pilon	+	1667	2	Intergenic	novelGene_102912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTTCAAAAATAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189641	191425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_190925_191041
777152	contig_7426_pilon	+	1040	8	Intergenic	novelGene_27501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	458.518733064886	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	124	882	952246	987945	FALSE	50	TATTAACAAAAAAGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVGVSLRRRFPATTLGAACLQACRGAQTAAAVAPQIKKFAIYRWDPDKAGDKPRMQTYEIDLNKCGPMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIEDREKLDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	952122	988103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_952318_962052_962181_970075_970162_979923_980061_980784_980902_983658_983733_985137_985205_987867
777153	SIRV6	+	277	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	612	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAATCACCGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_2780_2829_3106
777154	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	57	526	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777155	contig_6846_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_107309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	40	573	325558	325025	NA	60	CCAATTAGCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLCPPPSPAVAKTEIVLSGESPLLAATFAYWDNILGPRVRHIWAPKTEQVLLSDGEITFLANHTLNGEILRNAESGAIDVKFFVLSEKGVIIVSLIFDGNWNGDRSTYGLSIILPQTELSFYLPLHRVCVDRLTHIIRKGRIWMHKVSAFELTNHANLAIQSLSSDTFVSDFSKFY	325597	325024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_325000_325600
777156	contig_6846_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_107308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCCTGGCATGTCACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323972	323171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_323200_324000
777161	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	612	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
777163	contig_11316_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_122688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139641	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139600_140500
777169	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777172	contig_12638_pilon	+	1782	8	Intergenic	novelGene_33368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	121.35409480743	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	614	1045	1530456	1538931	FALSE	20	TGGTGCCTGAAAGGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515710	1539668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529438_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
777173	contig_13952_pilon	+	1940	2	Intergenic	novelGene_133262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180162	184188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_180970_183055
777178	contig_9921_pilon	-	1752	2	Intergenic	novelGene_23741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCACGTTTTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199991	197822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_198496_198912
777179	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777180	contig_4659_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_118187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132468	130025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_130000_132500
777181	contig_6635_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_127029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545194	547174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_545200_547200
777183	contig_2798_pilon	-	1846	2	Intergenic	novelGene_119995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	107	junction_1	0	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	225	1112	69370	68483	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELINTTTLSNTSSVDLDHCDLRCRRILIALYSVVLLGGTAGTVMMSRMMFKRKSQSMIATIIVNIIVLHSILLVTLPFRLSYYVSVVWKFGSFTCRVVSSIIYGHMYFTFVFYVVIVILRLLIYFKKLQMQRLQRYHAVVLSITVWMVGSLIFLPVFFLKYGIDPSHSEQHRCFEFYKDLNCRELIIINYSIIVFMMTIVVVLFLIKMAVIFQLAKTHWPDTWAHQEYRAQIKSLFFLLVIVVCFIPHHVFRIHFIQNFSEIEDSQLVLYNEICIALTTVCCLDMLCFIRGVIH	71616	67748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_69387_71408
777188	SIRV6	+	336	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724
777190	contig_960_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_108311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACAATTTTCGGCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047435	1046792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1046800_1047400
777194	contig_11855_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_67075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCCAAGCCCTGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2061815	2062365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2061800_2062400
777198	contig_15021_pilon	-	1544	12	Intergenic	novelGene_26966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_11	303.225933821876	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	43	1128	269638	243699	FALSE	25	TTTTATTAGTCATGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQPAQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIAYIDEQFERYLHDESGLNRRHIVDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQRQAGDGDGSAHGHHA	279802	243282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276_263364_267742_267864_269629_269660_279781
777200	contig_6445_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_76983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	182	322	405505	405645	NA	40	GAGAGGGGAGAAGAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTWFLCESRDSCGCCHRDCKSIPQTKENASIGITQYHFLSAGSHLRTDLIKKRSHFFPGGMGYTQSCLYGDLVQTGTEGGGTSVCLREPQPFQLQHRQPLRFSVSA	405323	405941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_405300_405900
777202	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
777205	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_98122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CCATCTCGTCCCCCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
777207	contig_9937_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_129194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGTCAGTCCATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26977	26086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_26100_27000
777208	contig_9937_pilon	-	153	1	Intergenic	novelGene_129193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22797	22644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_22600_22800
777209	contig_14666_pilon	-	1162	5	Intergenic	novelGene_39537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1552	junction_2	396.009706320439	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	132	743	458202	449808	FALSE	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSDLPQSWDWRNVKGVNYASITRNQHIPQYCGSCWAHGSTSAMADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	458333	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195
777210	contig_15744_pilon	-	699	5	Intergenic	novelGene_83603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	332	697	153261	149575	FALSE	10	GGGTTGACCATGGCTGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAIQPVSPSSADEKLGTVCIGSSICHGQDARTCMLQEEVLIIKFFPIDGLATSAIMACEVTTLAHKPRNNSVKAGTFVTKSFLPSTQGAEVFLLSLELYLRTARRRRGPAVRRRRRCRRTP	153592	149572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_149629_152143_152177_152262_152351_152530_152705_153244
777212	SIRV6	+	561	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	10	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	207	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777216	contig_3095_pilon	-	893	4	Intergenic	novelGene_75218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	674.580363386503	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255531	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246712_248547_248759_253535_253733_255384
777217	SIRV6	+	581	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	202	0	202	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10439	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777218	contig_9730_pilon	-	2129	20	Intergenic	novelGene_150635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	8	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCCGCGTATCCCGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549204	479531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_479660_482201_482343_486785_486926_491169_491212_492881_492984_493138_493201_495320_495381_496588_496652_515088_515226_517168_517234_519712_519855_521098_521141_522399_522479_536460_536518_536880_536978_537717_537841_543181_543351_544137_544264_547300_547364_548913
777219	contig_19851_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_29878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_2	3366.68939761303	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTGTACAATGTACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53976	56455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_54146_54606_54717_55650_55753_55840_55882_56006
777224	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_96482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
777231	contig_8814_pilon	-	2787	2	Intergenic	novelGene_167753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTAGCTGTGTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232830	229301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_229335_230076
777235	contig_7744_pilon	-	1913	15	Intergenic	novelGene_62529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	661	987	830129	829507	TRUE	25	GGCCTGAAATAGGAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCKQMLIMIAWGLVMVTHCSRSLLMRYSKASSRRTSPRPRPGLLVPPLGSGTEEVTRQHRMRVTRKEPSRSCWPGRRSWRLSSLLPALTTTGQSFSGKSATQASKRR	831124	825375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_825549_826010_826085_827074_827192_827677_827742_828145_828258_828367_828459_828602_828695_828934_829005_829269_829366_829469_829676_829810_829931_830091_830174_830324_830396_830490_830536_830624
777236	contig_9609_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_22931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	424	813	54601	54990	NA	50	GGAAAAAATGTGTACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPQTLTSNHNSKRESSSSLIFYKRTKMSEVFPLRIYCSNSATVEEKWKSVFQIKCKSTDLLPQTYIMPDWSLVPSQKQNALCSLYPFCPPTLPITAVYILRTALTEGQAANTTNVFTAFQDPTKMRV	54177	56189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_54200_56200
777237	contig_9609_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_22932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTCTACATCTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56191	56720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_56200_56700
777240	contig_18800_pilon	+	1852	5	Intergenic	novelGene_110672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.5645419492502	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	9	677	56599	63976	TRUE	30	GAAGAGGTGTGTGCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIVRINLAAATHSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPMGPAQSSLEEQHRSHESCLDAASDDLLDLQRSLPERRGRSRDLEEYRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPTEDLDPWEEQLGREAGGTREPKPSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL	56590	65561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_56721_61003_61149_61398_61543_63718_64217_64626
777245	contig_14441_pilon	+	1062	5	Intergenic	novelGene_100610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	513.182715998892	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111207	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111379_122145_122188_125526_125902_126036_126283_126514
777249	contig_2757_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_164612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAAACTCACCAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567246	565732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_565700_567200
777250	contig_2757_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_164611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	122	424	564612	564310	NA	65	TCTTTAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHLFPEQPRAPIPQRSVLLLPAHSPMDTWKSFYSSRSHSEKVEDVPKGWESEGKCSWFQENLFFIRERNVRLLNLPLIYAWKAEGRWKHSPDLPLSFST	564733	564286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_564300_564700
777253	SIRV6	+	358	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	406	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2874_10727_10819_11031_11109_11205
777254	contig_14618_pilon	-	1069	2	Intergenic	novelGene_136800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCTGCACATTCTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383930	382696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_383347_383511
777255	contig_6436_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_134910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACAAACTCATCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517746	516297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_516300_517700
777256	contig_7057_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_123239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCAGAATTACCGACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539417	539846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_539400_539800
777257	contig_7057_pilon	+	788	4	Intergenic	novelGene_123241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_3	136.274233318947	2935	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	337	642	540255	541317	FALSE	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLERVSNEEKLNLCRKYYLGGFAFLPFLWLVNIFWFFREAFLAPAYTEQSQIKGYVWRSAVGFLFWVIVLATWITIFQIYRPRWGALGDYLSFTIPLGTP	539795	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540890_540996_541177
777258	contig_11816_pilon	-	1138	3	Intergenic	novelGene_98565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	669	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	421	735	1236333	1236019	TRUE	15	CAGGGCCGCGCCCACATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNCSSLAQSARQKANLSNIAMRYQAFFLILCDPCRGSKPDLHRPAIFTISITRRIVSNIQTGINMRNQFQGAFSSSFNTNMIKKSNVKSQVSSTLWAKDILI	1236753	1232465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1232652_1235566_1235735_1235969
777261	contig_8801_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_66309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACGAAGAAAAATGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575092	576561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_575100_576600
777263	contig_17522_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_160819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATAAAGAGTTTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96517	94111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_94100_96500
777264	contig_11396_pilon	+	1502	7	Intergenic	novelGene_71298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	53.0031445608026	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	99	779	372895	378694	FALSE	10	GCCGGTGTGAGCAGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAGLAGRAAPAGVARGQVRVGRRLEAGGQGRMYTLLSGLYKYVFQKDEYCILILGLDNAGKTTFLEQSKTRFNKHYKGMSLSKITTTVGLNIGTVDVGKARLMFWDLGGQEELQSLWDKYYAECHGVIYVIDSTDEERLSESKQAFDLPLDPRHQDSLQRLYLQDRAAGLPDPGLFSTHGQGRERGHRVDGEVRRAQCPSTTTAEGYHIGVSTAGGQFVSSCCGRSLPGPGPVCFVFWLLYLLCVSSKTKFFVSTEM	371965	379417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_372058_372888_372988_373206_373295_373480_373564_377454_377537_378290_378392_378460
777265	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	51	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777267	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146660	1	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
777268	contig_5758_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_119061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTTTTGAATACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61156	60748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_60700_61200
777270	contig_11964_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_164729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTAAATCATCTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256786	254640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_254600_256800
777272	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_95988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
777274	contig_5590_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_162997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATAACAATAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218898	218496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_218500_218900
777275	contig_5590_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_162996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGAGATGGCATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216978	216592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_216600_217000
777277	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
777278	contig_10003_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_88201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAAAAAGAATTAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499159	496873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_496900_499200
777280	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
777281	contig_14882_pilon	-	1615	2	Intergenic	novelGene_114985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	622	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	684	1085	66629	57876	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGNDDDLTIPRAAINKMIKETLPNVRVANDARELVVNCCTEFIHLISSEANEICNKSEKKTISPEHVIQALESLGFGSYISEVKEVLQECKTVALKRRKANSRLENLGIPEEELLRQQQELFAKVSNAF	67312	57345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_58058_66409
777282	contig_6230_pilon	+	2057	7	Intergenic	novelGene_102083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_6	51.0862560338449	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	718	1956	106543	115548	FALSE	25	CACAGTGGAATTTCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYWGEIPISSNQTNRSSFDLLPREFRLVEVHDPPLHQPSANKPRPPTMLDIPSEPCSLTIHTIQLIQHNRHLRNLIATAQAQNQQQTEGVKTEESEPLPSCPGSPPLPDDLLPLDCKNPNAPFQIRHSDPDSDFYRGKGEPVTELSWHSCRQLLYQAVATILAHAGFESANESVLETLTDVAHEYCLKFTKLLRFAADREARLGQTPFPDIMEQVFHEVGIGSVLSLQKFWQHRIKDYHSYMLQISKQLSEEYERIVNPEKATEDTKPVKIKEEPVSDITFPVSEELEADLASGDQSLPMGVLGAQSERFPSNLEVEASPQASSAEVNASPLWNLAHVKMEPQESEEGNVSGHGVLGSDVFEEPMSGMSEAGIPQSPDDSDSSYGSHSTDSLMGSSPVFNQHCKKKMRKI	102865	115649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_103152_103908_104035_105598_105698_106336_106956_112590_112916_113815_114054_115285
777283	contig_10296_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_168867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	192	518	30004	29678	NA	50	TATGAATAAAGGGAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPWKRREASGETTSVLCTHIQGCDPQAIPSPSGEGGAPGSRPSAASPANPSLPGTGSLQDGQTGTARGRRTGGRAEGWATGAGWPSGLLVGPPSKQDVCYSLINATH	30195	27889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_27900_30200
777286	contig_5157_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_173673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAAAACACATTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506225	505633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5157_pilon_-_505600_506200
777287	contig_987_pilon	-	1292	8	Intergenic	novelGene_72282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	205.631332481116	27	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	233	622	929235	916735	FALSE	5	TGGTCTTTTTGACTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEVIDKYTAVVKMIDSGDKLKLDQTHLETVIPAPGKRILVLNGGYRGNEGTLESINEKSFSATIVIETGPLKGRRVEGIQYEDISKLA	933245	916064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_916798_920068_920170_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198
777288	contig_20493_pilon	-	1273	7	Intergenic	novelGene_86405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	35.0269737329517	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	11	454	47073	43349	TRUE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGEGPSPGLH	47083	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43445_45931_46203_46996
777296	contig_4812_pilon	-	1097	5	Intergenic	novelGene_103618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5215.0911485323	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	115	672	82626	17374	FALSE	25	CAAGCTGGTTTGCAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQGWSAGGLPGKRRSGRSLATLPAPASPRTPSMTQRHQHLPRENRTLPNQPRLP	82740	16948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_17533_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
777297	contig_16098_pilon	+	1330	4	Intergenic	novelGene_46189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	11.4309521329882	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	668017	687808	FALSE	45	TCAAACTCAGCAGAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTIPPEHEAQRLEQEAQGRLERQKILDQSEAERARRELLELEALSTAVESTGTAKAEAESRAEAAQIEGEDFILQAKLKVEALAIETTFLKLPPESNGTSSTQPFTQLPTWVRNGK	668014	688785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_668034_680553_680671_680841_680969_687718
777298	contig_19342_pilon	+	900	5	Intergenic	novelGene_41089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	156	323	5431	6183	FALSE	35	GACCTGAGAACCTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWRPRPSSCCSRGPPARVAGHGSPRPHGRVAPSLRVRTSPPRPRDSTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3255	6760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3301_3899_3995_5415_5522_5960_5994_6139
777299	contig_1532_pilon	-	1870	9	Intergenic	novelGene_37430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1487.88544900977	1	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	59	847	32217	13483	TRUE	55	ATTATGGCAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKVSAKDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDIREVK	34919	12396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12523_12585_13497_15746_15889_17971_18115_27260_27369_28815_28964_29438_29505_32049_32227_34870
777300	contig_15897_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_49592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	115	444	887247	886918	NA	55	ATAAACAAGACTTTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLQFWPNVFDITKMKLMTAKTTTCFLQIVAFILISVIEDHAISHSFIPTTHKALWTRARMSQRHQKKTGYQHASAQFSSDLLPGLEMPRCRKGKAYGCQSSPPREFYE	887361	886366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_886400_887400
777303	contig_3184_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_169792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTCTATTATCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47436	49328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_47400_49300
777304	contig_6710_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_94117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653356	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
777305	contig_12277_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_139676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1154	1495	104992	105333	NA	15	GTTTTCAGCCACCTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPELDHSPVPERGRFRSGNSYSLFYLKHILMKIKLRPREIMICQRWWSPGGAVVKTSAANPKVGSSTLSCRVIMSQNRLMATGLVSVKHGTAGRQEQEFNQSRMIPASSRG	103838	106017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_103800_106000
777308	SIRV6	+	198	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	406	-2	-236	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGCTTCCACACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
777309	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777317	contig_14322_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_116117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
777318	contig_15498_pilon	+	1395	5	Intergenic	novelGene_42648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	119.035708928036	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	81	518	679496	686124	TRUE	25	GAGTATCTGGCTTTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	679415	687396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_679550_681329_681431_682090_682116_685866_686619_687013
777319	contig_5389_pilon	-	2235	11	Intergenic	novelGene_143003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	234.559608628596	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	122	931	254084	240038	FALSE	15	TATTCAGCCTGCCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPARKGRSRSTKTNSLRSRKLASFLKDFDREDRQNLLKEMDNLYNIEILRLPKALREMNWLDYFALGGNKQALEEAATADLDITEINKLTAEAIQTPLKAAKTRKAIQMDEVIAEEEEENKNKNLQITRVKRCPPSKKRTQSIQGKGRSKRSSRCNTVTPAMNRLELSMIKPTPGLTPRFDSRVFKTPGLRTPAARERIYNVSVNGSPLADSKEIFLTVPVGGGESMRLLASDLRRIDITQLDPEALGSIKKLSSRLAQICSSIQSHK	254361	238733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_240083_241195_241283_242075_242203_243548_243645_244513_244579_246253_246334_248993_249067_251240_251282_253715_253815_253987_254101_254256
777320	contig_3960_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_138009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAATTTTACCTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354783	355922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_354800_355900
777322	contig_15168_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_173674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGTATGGTCCCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103941	103534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15168_pilon_-_103500_103900
777324	contig_10367_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_169465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGAGCTCTCTGCTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141115	139287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_139300_141100
777325	contig_1925_pilon	+	1176	8	Intergenic	novelGene_162216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	423.293018595673	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	142	774	254564	284492	FALSE	35	TATTTCTTTACTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGKAINVFISANRLIHQTNLILQTFKTVA	225109	284894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225172_254484_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713_279797_284410
777327	contig_6589_pilon	+	1225	8	Intergenic	novelGene_26027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	990.222485822541	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	110	553	1725483	1729051	TRUE	35	AATAGCTTTATATTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYCAAAAGILRRTGSRSSA	1725373	1731819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728246_1728996_1729234_1730074_1730152_1731406
777328	contig_3172_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_173676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTTTTTATCTCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9515	7223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_7200_9500
777329	contig_5059_pilon	-	1922	12	Intergenic	novelGene_140736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	308.463963096057	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	287	1558	283612	263572	FALSE	15	CCTCTTTCCAGTATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKLFGMIITIGQAIVYVMTGMYGDPAEMGAGICLLIIIQLFVAGLIVLLLDELLQKGYGLGSGISLFIATNICETIVWKAFSPTTINTGRGTEFEGAVIALFHLLATRTDKVRALREAFYRQNLPNLMNLIATVFVFAVVIYFQGFRVDLPIKSARYRGQYSSYPIKLFYTSNIPIILQSALVSNLYVISQMLSVRFSGNFLVNLLGQWADVSGGGPARSYPVGGLCYYLSPPESMGAIFEDPVHVVVYIIFMLGSCAFFSKTWIEVSGSSAKDVAKQLKEQQMVMRGHRDTSMVHELNRYIPTAAAFGGLCIGALSVLADFLGAIGSGTGILLAVTIIYQYFEIFVKEQAEVGGMGALFF	292680	263207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_263759_266445_266523_267451_267644_269915_270114_270419_270581_271560_271715_275956_276067_276480_276613_283551_283631_288493_288598_290235_290304_292584
777330	contig_5210_pilon	-	1928	8	Intergenic	novelGene_65458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.6343151752	605	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	428	1102	652471	648401	FALSE	15	TACTGCCAATGCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPATQQSPFMVDLHDQVHQGPVPLSYTVTTVTTQGFPLPAGQHIPGCSAQQLPACSVMFSGQHYPLCCLPPPLIQACTMQQLPVPYQAYPHLISSDHYILHPPPPAPPPQPTHMAPLGQFVSLQTQHPRMPLQRLDSDVDLRGDQHPLGSFTYSTSAPGPTLSPSVPLHYLPHEPLPQELPFGMPYSHVMPRRLNTPTPTQPATGHHQPGPTPKENPKSYCI	658031	647574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_648481_650987_651025_651120_651283_651377_651552_651850_652019_652417_652544_652784_652936_657827
777331	contig_6391_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_173682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACATTGGTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30324	29760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6391_pilon_-_29800_30300
777332	contig_7467_pilon	-	1504	13	Intergenic	novelGene_69459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	209.522605516021	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	140	1465	92058	67563	TRUE	30	ACAAGTTACCTTTCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133010	59931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_59939_67530_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132905
777333	contig_10197_pilon	-	1067	7	Intergenic	novelGene_115221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1291.08680532677	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	96	863	952331	910531	TRUE	55	ATTAAAAATGCCAAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952426	909627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_909797_910495_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
777339	contig_10437_pilon	+	1972	4	Intergenic	novelGene_38385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	52	441	653751	655381	TRUE	55	AAAGTTAACAAACACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGAPGDGLDAGLTPVVFMTDVRLLRMELILAKSTFARFGKASAGEEDRRDVLTGFGRGGVTATVTGAAVLEGPLETLSVGFVGAAVDTAGFSTGFSFLSSTMILEPSSSTSESSMSSTSRLSVAGSGVADFSLSTVGDGESSPPIP	652164	666875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_652208_653742_654001_655241_655524_665486
777340	contig_8420_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_69362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCCTTGATTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140258	141811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_140300_141800
777344	contig_8161_pilon	-	3055	2	Intergenic	novelGene_156773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTACAAAATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402847	399751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_402184_402224
777353	contig_744_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_145079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAAGAATGGAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208021	206041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_-_206000_208000
777357	contig_57_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_44911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145146	143712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_143700_145100
777359	contig_7866_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_171188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1608	1916	158985	158677	NA	40	AAATGATTTGGAGCAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQIKVLRRLLPVRIPRLVLSACRVPSIYYVAHTRTHPWGMLSHSSGSVKVVCMYSHTDEGRRIEMMILCKRKDPLTYFCQSLYEEFVSFTLRDFFCLAIYN	160592	158398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_158400_160600
777366	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	2	414	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777368	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	51	521	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777372	SIRV1	+	182	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTCCCACAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
777374	SIRV6	+	305	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8135	-2	604	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTTGTCGAAATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777376	contig_15570_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_137864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCTGGCAAGTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726121	728176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_726100_728200
777377	contig_6975_pilon	-	1827	1	Intergenic	novelGene_74298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTGCCACATCCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482876	481049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_481000_482900
777378	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
777379	contig_2933_pilon	+	1358	11	Intergenic	novelGene_111372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	33.2541726705086	109	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	90	1310	1039396	1058901	FALSE	25	ATATTTCCAAATGGCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLARRRRVPWLQTCPHPGGTEQTDPEPTRMQMPQGNPLLLSYTLQELLARDTVQVELIPEKKGLFLKHVEYEVSSQRFQSSVYRRYNDFVVFHEMLLHKFPYRMVPALPPKRMLGADREFIEARRRALKRFINLVARHPPFSEDVVLKLFLSFSGSDVQNRLKESAQCVGDEFLHCKLATRAKDFLPADIQVQFAASRELIRNIYNSFYKLRDRAERIASRAIDNAADLLIFGKELSALGSDTTPLPSWAALSSSTWGSLKQALKGLSVEFALLADKAAQQGKQEESDVVEKLNLFLDLLQSYKDLCERHEKGVLHKHQRALHKYSLMKRQMMSAAHSREPESVEQLESRIVEQENAIQTMELRNHFSLYCLHQETQLVHAYLPLTSHILGAFVNSQIQGHKEMSKVWNDLKPKLHCLFAGPSGALTLPRSPPGG	1001009	1058949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1001048_1039344_1039537_1040826_1040945_1043665_1043788_1045720_1045802_1047909_1048071_1049470_1049604_1053909_1053979_1055385_1055533_1055886_1056037_1058802
777380	contig_401_pilon	+	936	10	Intergenic	novelGene_42836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1453.61017580708	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	157	702	1712599	1715475	TRUE	10	TCTTATGTTTTTGGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAHGLDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711899	1718331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712619_1712864_1713004_1713129_1713193_1713666_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1717899_1717970_1718177
777381	contig_1146_pilon	+	1638	6	Intergenic	novelGene_84808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	19.2208220427743	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	14	1159	281596	297282	FALSE	45	GAGCATTAAGGGAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFLRMCLPPPLCGAGPSEGAGWGERVGFSPSPVALLSGEPGGSGTPVIAGAGAGMWLWEEQGGLLGPFSFLLLLLLLATRSPFSACLLTGSLYVLLRLFSFEPVPSLRALQVLKPRGRVAAIAHRGGGHDAPENTLAAIRQAAKNGATGVELDLEFTSDGIPVLMHDSTVDRTTDGTGRLCDLTFEQIRKLNPAANHRLRNNFPDEKIPTLREAVAECLNHNLTIYFDVKGHANMATVALKKAYLEFPQLYNNSIVCSFLPDVIYKMRQADQNVVTALTHRPWSLSYTGDGKPRYNSVWKQSVFVMMDILLDWSMHNILWYLCGISAFLMQKDFVSPAYLNKWSAKGIQVVGWTVNTFDEKSYYESHLASSYITDSMLEDCAPQF	281582	297761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_282007_289938_290115_291925_292032_295404_295498_296230_296443_297134
777383	contig_16098_pilon	-	2137	13	Intergenic	novelGene_46206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	5.16128752240067	8	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	35	1948	723116	711393	TRUE	30	TTGTGTAAATACAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATSGAGRCLLSKVRAGRRPPPARVRVAVRLRPFVDEIAGANDAPCVRGLDSCSLEISNWRNHQETLKYQFDAFYGERSSQQDIYAGSVQPILRHLLEGQNASVLAYGPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLTREEGAEGRPWALSVTMSYLEIYQEKVLDLLDPTSGDLVIREDCRGNILIPGLTQKPITSFTDFEQHFLPASRNRTVGATRLNQRSSRSHAVLLVKVDQRERLAPFRQREGKLYLIDLAGSEDNRRTGNKGLRLKESGAINTSLFVLGKVVDALNQGLPRVPYRDSKLTRLLQDSLGGSAHSILIANIAPERRFYLDTVTALNFAARSKEVINRPFTNESLQPHALAPVRLSQKELLGPTEAKRARGPEEEEIGSPEALAAPASDAQKLSPLQKLSNIDPAMLERLLSLDRLLGSQGSQGTPLLSTPRRERMVLMKTVEEKDLEIERLKVKQKELEAKVLAQEAADPKEKENCSPTMLRPLAHRTVSVAKPLKKAVVMPLQLLQEQAASQNTEVHILKKKGRKRKLESLDASEPEEKAEDCWEPQISRELLAHGRQKILDLLNKGSARDLRSLQRIGQKKAQLIVGWRELHGPFSQVRAQAGQHWDPVGVGEGVLHP	723150	711112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_711211_711301_711672_712439_712508_712899_713069_713568_713738_715464_715601_715708_715863_715994_716226_716306_716517_716743_716899_716987_717116_719746_719943_723097
777385	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777386	contig_1406_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_25489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACTCATAGTGACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341225	1340876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1340900_1341200
777387	contig_9429_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_155109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTCTGAACTTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106907	105323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_105300_106900
777390	contig_12750_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_172628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119961	115506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_115742_118971
777391	contig_11855_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_66990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGATTTCTTTTCATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281412	1283900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1281400_1283900
777394	contig_7057_pilon	+	251	4	Intergenic	novelGene_123198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	561.826189018158	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGCAGAAGGCACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418005	425650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_418086_419809_419860_421272_421374_425630
777395	SIRV6	+	481	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	19	518	12	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
777396	contig_5260_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_144356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAGTGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100035	98355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_98400_1e+05
777397	contig_2062_pilon	-	839	3	Intergenic	novelGene_139052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.5	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAATTGCCTTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324605	1313308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1313896_1319148_1319216_1324420
777399	contig_10801_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_74042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGGAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271015	272605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_271000_272600
777405	contig_6710_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_98198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777406	contig_12485_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_147291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTTTTGTGACATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297912	298947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_297900_298900
777407	contig_3602_pilon	+	1496	13	Intergenic	novelGene_60693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_8	239.084364468556	713	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	10	1443	1360465	1371923	FALSE	10	CCTCAGGCTTTGTGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGSSGGGGRPCSKSAADSGFLGLRPTSVDPALRRRRRGPRNRKRGWRRLAQEPLALEVDHFLEDVRLQERTRGGLVSEAPDEKLFFVDTGPKEKDLKKRTKGQKKSLLLRKPLRIDLTLENTSKVPAPKDILAHQVPNAKKLKRKQQLWERLAKQGEVPREVRRAQARLCHPPTAKAKPGPQDTVERPFYNLWASDNPLDQPLVDQDTFFLEQTKKKGVKRPQRLLTKPSQVPAVEVTPAGASYNPSFEDHQALLRAAHEVELQRQQAAQKLERQLALPTAEQAATQESSFREMCEGLLEESDGEGEPGESQGPETGGDQALPASPRLATAEKKTEQQRRREKAARTLRVQRAAQRAAQLRHQQLFQLRGIKAQVAQRLAELARRREQRRLQRLAEADKPHRLGRLKYQAPDIDVQLSSELSDSLRTMKPEGNILRDRFKSFQKRNMIEPRERAKFKRKYKVKLVEKRAFREIQL	1360455	1371976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1360689_1361999_1362065_1365074_1365181_1365890_1366091_1366460_1366532_1368395_1368492_1368619_1368725_1368798_1368982_1369366_1369543_1369919_1369987_1371411_1371489_1371591_1371649_1371916
777411	contig_4496_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_66712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACCATTTTCAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286918	1286029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_1286000_1286900
777413	contig_2834_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_28020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCCAGCAAATTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314655	315650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_314700_315600
777416	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
777417	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777418	contig_9706_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_20866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGGTGTATTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2500_2700
777422	contig_854_pilon	-	1330	2	Intergenic	novelGene_36095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTGGCTCCTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77456	75693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_76805_77237
777423	contig_3095_pilon	-	701	4	Intergenic	novelGene_75253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	433.811787145839	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	132	368	248564	246716	FALSE	25	TATGAATTATCTGTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	248695	246382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476
777426	contig_12250_pilon	+	960	4	Intergenic	novelGene_80590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	757.791674685215	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322736	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_323216_323438_328400_328687_332096
777427	contig_13496_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_107632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTTAATTAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269231	268917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_268900_269200
777428	contig_13496_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_107634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAATATATAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274474	275455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_274500_275500
777430	SIRV6	+	345	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	10	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11033_11109_11205
777431	contig_7428_pilon	-	2207	14	Intergenic	novelGene_77690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.4739505753481	50	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	92	1384	243098	235179	TRUE	15	TGAGCTGTATGCATTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETTAKPEPRSLSRLRHLGLGPRRAGSSKAMSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGERERISCCSWRMRR	250481	225866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226025_226528_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235221_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_243113_250404
777434	contig_5201_pilon	+	2534	5	Intergenic	novelGene_82173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	99	junction_1	26.8828476914184	2	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	46	408	250608	268923	FALSE	25	ATGGTTCCCCACCAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHNRSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPILDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKGTLI	250562	271049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_250657_250797_250857_251002_251033_251196_251257_268758
777437	contig_5302_pilon	+	920	5	Intergenic	novelGene_81376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_2	293.743510566617	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	224	919	92713	115166	FALSE	15	GCCTCACGTTGGTGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHAN	92489	115167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92815_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046
777439	contig_9706_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_20959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	545	859	306284	305970	NA	30	CCCGCCAAAACATGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSITCVWQVLGSLPASSLPHFLSSVFSTPKYSLLLETLSSLGLLEGSSSKSALSLLLYLPRGELIQPEDFPVVIEWTPTHGDTMYVRVEQHIRFSWLQSLWK	306828	305617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_305600_306800
777440	contig_1406_pilon	+	2349	4	Intergenic	novelGene_25470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGCCTGGAGGGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830593	841105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_831025_831149_832828_835025_835220_841059
777441	contig_19769_pilon	+	558	4	Intergenic	novelGene_102327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_1	94.0224559465568	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	69	524	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87578	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87609_87820_88040_88841_88958_89163
777442	contig_2438_pilon	+	1151	6	Intergenic	novelGene_112027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2309.15937951455	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	79	678	310588	312871	TRUE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305087	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729_313124_313299
777444	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777448	contig_6191_pilon	+	2146	4	Intergenic	novelGene_107814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	13.8884444373331	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	137	991	17002	21029	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSKGAGAAASDEKPGIDTLNENYSWQISVTDNDFKIFKNHESQLCEILQDKFDCISTVVSPALEGHIKSLQVFRKMLTSQVALSVWKDDLTRHVVDAVVNAANEHLQHMGGLALALVKAGGPEIEEDSRRFIGRYGKVPTSRIAITRAGRLPCKEIIHAVGPQWIARDGQRCVEELKMAIINILEYVNCTNLDIKAVAIPALSSGIFQFPLDLCTRIIVSTIKLYFIKKQVVGNLKEIHLVSNEDPTVAAFKTASENILGRNQLESLVSQEAAPPLDTVLVI	13003	22184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_13052_16913_17017_17825_17860_20223
777449	contig_12884_pilon	-	1088	9	Intergenic	novelGene_104990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_6	559.709285589403	3184	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	68	1030	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGVSTAPGLAESLPQPCCKFRCKGRLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915295	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905692_905834_906224_906349_915235
777453	contig_9797_pilon	+	1266	5	Intergenic	novelGene_65583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	336.717518849257	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	242	868	183892	191368	FALSE	15	CTATGTTGTCCTGTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172537	191766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188734_189277_189422_191138
777454	contig_10196_pilon	+	2062	9	Intergenic	novelGene_132298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	205.303091489144	2	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	224	898	2348084	2369190	FALSE	20	TGTTTCACATACTTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKVKKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKKVAELVPGTGPYL	2346773	2370354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348003_2348088_2348736_2348832_2352497_2352597_2364367_2364483_2365377_2365518_2368749_2368927_2369145
777457	contig_4211_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_80234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTAGATGGAAGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515071	515771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_515100_515800
777460	SIRV6	+	280	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	8131	20	608	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777464	contig_13014_pilon	-	1612	3	Intergenic	novelGene_169369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	74	junction_1	27	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	608878	539692	FALSE	25	GATCAGCTTCTACTAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAGEALKAKERNEEEAERRKEEDQATLVEQVKRVKEIEAIESNSFVQQTFRSSKEVRKSVEPSEVKLAAAASGPASGAADPPSVEKEADPSCIPTAIKYQDDNSLAHPNVRSLKLQRVTGTLVD	608878	538457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_539893_546952_547060_608808
777468	contig_11449_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_170549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCTGCCGCCATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40628	38299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_38300_40600
777469	contig_18869_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_56231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73551	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
777470	contig_17768_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_140407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAACCGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110368	108702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_108700_110400
777471	contig_3787_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_102443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAAAAATATTCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730334	729540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_729500_730300
777472	contig_9505_pilon	+	1276	9	Intergenic	novelGene_121852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	245.821804108179	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	52	861	530721	621024	FALSE	15	AGGGTCAGCGTTCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRVMHGLEERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFANKHLNKLNLEVTELESQFADGVYLVLLMGLLENYFVPLHNFYLTPDSFDQKVRGLSQSSVVA	530669	621439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593503_614971_615049_617657_617727_620886
777474	contig_6424_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_109254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1187	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	17	604	7848	5841	FALSE	10	TTGCTGAGCTGTGTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSSFMSVSSDPRQSAVPTRLLTHQMRPTTPLQAQRARVRWPTGTEARPAPADPTGAVSPSSCLRGHSRDAHDLPFSDLRWNMSSHSPSQRLPAATAWRGQKPPCTPTPCTYLPQIFQAFPPLHHLTSPQAGNHNLCPHCLPLSCSVQASDQTMPEPGRIRYLWASDAPCPLLTPYLSGLSAEALIALGQAQPRGIAAWE	7864	5698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842
777475	contig_8772_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_21062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGCTTTCTCAGTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12482	11981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_12000_12500
777482	contig_5421_pilon	+	2618	1	Intergenic	novelGene_173686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	106	501	27460	27855	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSSDLALISHIGIATKSQVAESCLQAVVVSYNGNNMFSIIDTERNLKSRLGIVNKLAAGNIDIWSKKDICNPQDCGFHWKCNINKLSPPFLKFSSLFCFLDTSHGTIATMIKPKHFVVCIPHIHHSAIIPVHKPIWDVFKINIQIMKEGTDRIYWGIFLFFNVINN	27354	29972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5421_pilon_+_27400_30000
777483	contig_19701_pilon	+	1580	6	Intergenic	novelGene_147877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.217037925115	34	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	29	739	12870	93000	FALSE	35	GGTACAAATAGTGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEISSGTSPLACLNAMLHTNSRGEEGIFYKVPGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDGGSNKEGKKSRWKRKVSSRLSQPSSPQSGCPSPSIPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQQCRPSMSISSNQHLLKTVKATSDSVPTKPAIWEGKQSDGQSSSPQNSNSSFCSSVKVENPLLGLGKKSFQRSDRLHTSK	12841	93841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_12926_65685_65798_70260_70412_87853_87970_91634_91759_92848
777486	SIRV6	+	215	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	515	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
777487	SIRV6	+	336	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	536	-1	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
777490	SIRV6	+	502	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	348	6	169	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	166	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777492	SIRV4	-	346	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1172	3	1172	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3986	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777493	contig_13778_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_70855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACACAATAAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286807	286275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_286300_286800
777496	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
777503	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	0	1171	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777504	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777506	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777509	contig_9014_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_106820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCCTTCCCCTTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248221	248633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_248200_248600
777512	contig_987_pilon	+	1020	11	Intergenic	novelGene_72292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCAATAGTTGTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920002	941114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_920169_921709_921813_922618_922690_927661_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933247_936244_936427_937202_937323_937404_937454_941073
777513	contig_5586_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_143519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262150	262668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_262200_262700
777516	contig_9705_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_41717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGAAGAGAGGGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156075	236802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_157065_162930_163096_166745_166827_170662_170801_236662
777517	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_92813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	228	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
777521	scaffold_12124_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_22137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAAAATCAGCCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945048	944632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_944600_945000
777525	contig_12993_pilon	+	2553	2	Intergenic	novelGene_136734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	70	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCTTGATTGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111377	119973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_111541_117583
777527	contig_12250_pilon	-	1274	5	Intergenic	novelGene_80637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	205.19990253409	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	329	1012	379842	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGACRVSGSPWQNPAPVARILADVPSHSVRSADASSSSCSPGWHQAGHAAPESFGTGWWSRWRAGSFLGSAGMIKLKPCSGFPGSMQASRTSGRTRMLPSSRPGRYSRESPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380170	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377386_379170_379194_379537
777529	contig_998_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_153796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAAATGATCTCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335778	333660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_333700_335800
777530	contig_5253_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_61585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTGAATAAACAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317542	318186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_317500_318200
777532	contig_6451_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_173696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAACTGAAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50368	52594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_50400_52600
777535	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	57	511	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777536	contig_9242_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_155084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGAGCTTGGACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848105	849020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_848100_849000
777537	contig_4426_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_15366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	746	1105	114188	114547	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKREGEGRARLPSTVSSHIPFRGLTDGNMRVYIYFHFIRLQECHRPSYPSPWFCKRGSCATSWRSQSWLVESEPNVLCSQVLLRVSQVKSPSLPNANFFQNKGQFSKTHKKYFIIAF	113442	115500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_113400_115500
777538	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_96029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653780	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
777541	contig_3081_pilon	-	2118	4	Intergenic	novelGene_133907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAATGTTCTTTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52467	45155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_46884_48244_48410_51718_51789_52312
777545	SIRV6	+	314	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10434	2	1284	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
777553	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1203	10	1203	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3955	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777560	scaffold_19766_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_34349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTATTTTTAACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604514	602443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_602400_604500
777563	contig_15410_pilon	-	1061	2	Intergenic	novelGene_130563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	644	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	103	360	54749	50948	FALSE	20	CTTCAGCCTCCTGAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHPALSPLLLPTHIPHVGLASAACRLARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIVILVHASLRLRNLKNKLENNMESIGLKRTPMGLLLEALGQEQEAGS	54851	50246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_51088_54631
777564	SIRV6	+	322	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3110_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777568	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	51	508	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777569	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
777575	SIRV6	+	397	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	565	0	386	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	381	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777577	SIRV6	+	373	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	0	410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777578	SIRV6	+	322	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8119	3	620	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGTTATTGTATGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	3160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777582	contig_5684_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_81084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAAAAGACTAGAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479311	480576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_479300_480600
777584	contig_14133_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_119978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTTTACATTCCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255985	255599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_255600_256000
777585	SIRV2	-	509	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4363	35	3188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
777586	contig_1154_pilon	-	2499	4	Intergenic	novelGene_87088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCAGGCCCTGCCTCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392005	330764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_330872_331886_331963_389032_389097_389753
777587	contig_5003_pilon	+	2976	2	Intergenic	novelGene_120197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_1	0	74	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82064	87865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_82693_85517
777588	contig_6102_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_31782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352450	351405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_351400_352400
777594	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	26	-244	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777595	contig_6871_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_21645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCCACCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708680	706908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_706900_708700
777599	contig_3095_pilon	+	1191	5	Intergenic	novelGene_75104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	50	805	147241	151865	FALSE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLRPQRIWCASWACWWVWWASLLAPFSSSRACAKAMLLNVVGLCEAPEGYGLS	147191	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150686_151023_151163_151848
777601	contig_5331_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_112832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGGAGAGGCTACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778559	780249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_778600_780200
777604	contig_10627_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_60062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGAAATAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277817	1277060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1277100_1277800
777605	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
777607	contig_8375_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_141276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAGGAAAAAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39238	40087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_39200_40100
777608	contig_10937_pilon	+	2095	10	Intergenic	novelGene_67305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	41.3515491521654	1	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	29	994	35798	40818	TRUE	10	TTCCCGGGTGTTGTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKLVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYDPGIPAAGSRSAVPHAQPDTQ	35769	45573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_36212_38929_39254_40263_40427_40753_40892_41611_41720_42775_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44253_45270
777609	contig_6326_pilon	+	2269	13	Intergenic	novelGene_168530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	30	junction_1	65.4974024082041	163	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	198	2078	238623	291496	FALSE	10	TGCAATGTTTTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKGRNKGEKPEMEPDAVQTANEELRARLTSLQIEFQQEKSKVGKLRERLQEVRLEREQEQRRHTAFLSELRAKLHEDKTRELQALREALIRQHEQEAARAAKIKEGELQRLQATLTLLRDGAADKVKTALLAEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARRQAEEALSTCMQADKAKAADLRAAYQAHQDEVQRTKRESERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQTGQTQKLLLQKEALDEQLVQVKEAERHHGSPKKELPPGIGDMAELMGGQDPHMDERDVRRFQLKIAELNSVIRKLEDRNTLLADERNELLKRNRETEVQLKPLVEKNKRVSKKNEDLLHSIQRMEEKIKNLTRENLEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLCLERERLLRSKRQRGKNLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDVDEATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEVEESQLKDEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLPNGADILFEPKLKFA	200549	291687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_200626_238501_238752_240769_241265_261623_261834_262807_262928_264303_264451_266044_266186_268621_268682_281452_281582_285013_285143_286930_287015_289403_289467_291322
777611	contig_5769_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_138769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCTCCTGACAGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258060	256131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_256100_258100
777620	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_97996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	CTTCTTTAACTTTAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
777621	contig_13041_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_127734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAATGGCTGATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280952	278993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_279000_281000
777623	contig_3095_pilon	-	1123	5	Intergenic	novelGene_75208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1498.20198488054	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	32	643	255439	247957	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWL	255470	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247832_247962_248476_248759_253535_253806_255384
777624	SIRV6	+	306	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8133	-1	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
777625	SIRV6	+	238	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	54	491	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777626	contig_6031_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_56783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACACATACATGGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527571	529256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_527600_529300
777627	contig_1406_pilon	+	2180	1	Intergenic	novelGene_25563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGTTTGAGAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2145852	2148032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2145900_2148000
777631	contig_9515_pilon	+	1393	9	Intergenic	novelGene_73820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	289.625512515731	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	570	1301	66468	72530	FALSE	35	TGTGGATGTTCAATAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57561	72622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57628_65866_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
777632	contig_3449_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_73739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTACTACACGTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506452	508453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_506500_508500
777633	contig_7457_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_31722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4050	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTTAGTCTTGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175654	1174750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539
777637	contig_12140_pilon	-	665	3	Intergenic	novelGene_86527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_1	6	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	72	554	84789	45762	FALSE	25	TGGTCAGCTCAATTAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATGTDDVDKLKTKFISAWNNMKYSWVLKTKTYFSRNSPVLLLGKCYHFKYEDENEMLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRGKSISVFWFLFELQFSNYIKFAEANFLTP	84860	45650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_46085_64263_64348_84713
777638	contig_12864_pilon	-	1301	7	Intergenic	novelGene_76388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	413.068766134109	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	45	527	220644	217842	TRUE	25	GGCCATAATGTATTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223277	214850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215607_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
777640	contig_4232_pilon	-	1359	9	Intergenic	novelGene_63176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	8.20060973342836	193	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	15	1112	124997	121798	FALSE	25	CCCCCAGCTTCTAAGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTAHLSCLWALLVACLAHSIRGSLRAQAPGPQPLELKEVFTLFQIQYNRSYSSPSEHARRLHIFARNLDQAQQLQEEDLGTAKFGVTPFSDLTEEEFAQVYGHQEAPGRVPNVSSKVVPEEWGKSVPSTCDWRKWAEVTKTVRNQNNCKCCWAMAAAGNIEALWGIKHRQSVEVSVQELLDCNRCGNGCNGGFVWDAFITVLNNSGLASEKDYPFRGDDKAQKCQAKKHKNVAWIQDFIMLMDNEQAIASHLATHGPITVTINMKLLQHYQEGVIRATPTTCNPNLVDHSVLLMGFGKTKSVARMPAEASQGGALTRPRRSTPYWILKNSWGPKWGEKVGVHSSAGGAGQAPPHLPALMPTNS	125011	121550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_122086_122166_122232_122395_122522_122657_122739_122824_122922_123029_123185_123578_123693_124560_124646_124910
777642	contig_3382_pilon	+	660	5	Intergenic	novelGene_124223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	46.100433837438	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	13	660	1918457	1943550	FALSE	25	CCCATCCCCACCAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSESMEVGPSPTSPAPLIQAEHSYSLCEEPRAQSPFGHAAPGDSFNDDEVESEKWFLSTDFPSTTIKTEPITDEPPPGLVPSVTLTITAISTPLEKEEPPLEMNTGVDSSCQTVIPEIKLEPHEVDQFLNFSSKEASVDHLHLPPTPPSSHSSDSEGSLSPNPRLHPFSLPQTPSPARAGARAPSSLSSSPLLTAPHKLQGSGPLVLTEEEKRTLIAEGY	1918444	1943550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1918587_1933740_1933917_1936568_1936657_1940745_1940931_1943481
777644	SIRV2	-	303	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	645	0	645	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4087	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
777645	contig_6361_pilon	-	2557	5	Intergenic	novelGene_23868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	541	junction_1	50.3009691755537	49	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1388	2146	64495	55091	FALSE	20	ATCCTACTTTACGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTISFSSFQDSKGKCLLLSVVGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	65882	54679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372
777647	contig_8687_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_169670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTCAGTATTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303935	305684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_303900_305700
777648	contig_8538_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842802	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
777649	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8463	-1	276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGCCCTGGTACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
777653	contig_2646_pilon	-	1194	7	Intergenic	novelGene_69654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	307.004162114385	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	232	717	2174230	2172056	FALSE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC	2175104	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174339_2174888_2174977_2175069
777657	SIRV5	+	374	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-44	875	-44	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8271	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
777658	contig_5832_pilon	+	2029	2	Intergenic	novelGene_134127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169807	173652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_169853_171668
777661	SIRV6	+	415	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777662	contig_7806_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_157546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAACAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279259	277867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_277900_279300
777663	contig_1443_pilon	-	1379	5	Intergenic	novelGene_28390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	23.6259920426635	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	828	1262	1038476	1036946	FALSE	25	TGGGATTTCAGGGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGRECLNLWGYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVGVKGNPQGFNQGLDCDVIVAEVRSTSHKPDEIYGMIERLSPGTRKIELFGRPHNVQPNWITLGNQLDGIHLLDPDVVARFKQRYPDGIISKPKNL	1039303	1036828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1038263_1038441
777666	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
777667	contig_6031_pilon	+	1190	5	Intergenic	novelGene_56770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTCGGCAGCGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254947	257802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_255009_255391_255866_256161_256375_256704_256812_257467
777668	contig_14683_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_166033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.1516926350343	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	272	706	40640	52585	FALSE	45	TAGAAAGAAATGTAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGLDDPEILEGRTEKYVDTPFGKPSQAWEAAHHHAFKGQLPGEHLGTEGGGLYTCHIIIIDQFIDRTTVRPQTFYDGSCSSARGVGHIPMAEPFCPKTREVLIETAKKLGLRCHSKGTVITIEGPRFSSRAESLMFRTWGADVINMTTVPEVVLAKEAGVCYASIAMATDYDCWKEHEEAVSVDKVLKTLKENANKAKSLLLTTIPQIGSMEWSETLHNLKNMAQFSVLLPRH	16546	53361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_20175_20276_20324_20353_40569_40673_44821_45062_49228_49352_52546
777669	contig_2078_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_100193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	71.2958767448464	20	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	322	1869	535379	521659	FALSE	75	CATTAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGCLPLSL	535700	521355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_521793_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
777672	contig_15410_pilon	+	947	5	Intergenic	novelGene_130627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1281	junction_1	302.224254486631	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	53	520	145617	148093	FALSE	55	ATATGAAAATAAATTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145564	148520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
777673	contig_9297_pilon	+	1356	8	Intergenic	novelGene_69824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_7	64.3104714233528	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	317	1354	514680	696550	FALSE	40	CAAGTCATTCAAAGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLDNPTIILAHIRQSHVTSDDTGMCEMVLIDHDVDLQKIHPPSMPGDSGSEIQGSNGETQGYVYAQSVDITSSWDFGIRRRSNTAQRLERLRKERQNQIKCKNVQWKERNSKQSAQELKSLFEKKSLKEKPPSSGKQSILSVRLEQCPLQLNNPFNEYSKFDGKGHVGTTATKKIDVYLPLHSSQDRLLPMTVVTMASARVQDLIGLICWQYTSEGREPKLNDNVSAYCLHIAEDDGEVDTDFPPLDSNEPIHKFGFSTLALVEKYSSPGLTSKESLFVRINAAHGFSLIQVDNTKVTMKEILLKAVKRRKGSQKISGSRADGTFEEDSQIDIATVQDMLSSHH	473689	696552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_473937_514610_514939_517390_517481_539889_540039_605307_605481_617402_617580_633504_633615_696470
777680	contig_10323_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_123561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	388	1167	2	1168	353243	352077	NA	60	GAGTAAAACAAGAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTRVLDRGSENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHTHLVLDRETENQGWDVHAHLVLDS	353244	351496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_351500_353200
777681	contig_9696_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_68845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACAGGGCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611504	611130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_611100_611500
777682	contig_9919_pilon	-	108	1	Intergenic	novelGene_137950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGAGAGGGCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533994	533886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_533900_534000
777683	contig_14814_pilon	+	821	3	Intergenic	novelGene_137708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.5	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279383	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279538_282721_282992_283413
777684	contig_5643_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_38887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	103.791181585913	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	226	1038	247334	240272	FALSE	50	ATAATAATGAAACTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLSWVHPDGVGVQIDTITPEIRALYNVLAKVKRERDEYKRRWEEEYTVRIQLQERVNELQEEAQEADACQEELAMKVEQLKAELVVFKGLMSNNLSELDTKIQEKAMKVDMDICRRIDITAKLCDVAQQRNCEDMIKMFQKVPSMGGRKRERKAASEEDPSLSESDGPRQPDGDEEESTALSINEEMQRMLNQLREYDFEDDCDSLTWEETEETLLLWEDFSGYAMAAAEAQGEQQEDSLEKVIKDTESLFKTREKEYQETIDQIELELATAKNDMNRHLHEYMEMCSMKRGLDVQMETCRRLITQSGDRKSPAFTAVPLSDPPPPPSEAEDSDRDVSSDSSMR	251721	239329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_240378_241031_241163_244098_244195_244461_244583_244701_244863_245900_246042_247277_247374_247516_247578_251596
777686	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777691	contig_11512_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_43398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616186	617371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_616200_617400
777694	contig_3975_pilon	-	2217	7	Intergenic	novelGene_54724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	372.664020563057	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	351	1616	1603436	1560510	FALSE	40	GCACAATAGTGTTTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSLVPSEQSSGTSLLPKDNARFSWSSLDEDGLDDSLLELSDGEEDDGHFSFTEEEIQELLKDDDLSNEHFSWRGGLLKDDSRHVEKGERESQIPLDALQEKNSLYSLGPVAETPGLFRLPQLSTSIGHGPTATKPLNRHFALEKNVIKITVVAPFDPTVYDAVLDKDKTDSSKDIKKPSSVGEELRENGLNPNESKLCTESEGISPTNSAWDGNTFPSPSNNNFQETVSDKNMPDCKKPTPVFSQVLDHSKSSSNIGSSWRNGGSHKSSCEVRFPVSSKQDVLDKDSGKMKVHERRLGKVIPVLQTKTRTSFLTFSQSDLEQQKQIYLRSVIAHIEDPVDSNQGALGELYALMDQVHHMQNQKWQHPSDLTMRNYARFRQKPLQRYSLTQWVDRNMGSHHRFQHLPDFPNSPFVSSHQQ	1609668	1559908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1560652_1562840_1562929_1599911_1600016_1601762_1601852_1602593_1603439_1606061_1606296_1609554
777695	contig_12270_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_113720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13852	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
777696	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
777697	contig_9177_pilon	-	998	2	Intergenic	novelGene_32830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAAAATTGGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784751	1781500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1782028_1784280
777700	contig_5569_pilon	-	2009	5	Intergenic	novelGene_86745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	149	junction_4	104.075393345401	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	452	811	474098	467456	FALSE	20	ATTAATGTTGTTCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIAVSVFSPVKSKGWNRFCNLRIFFFCSVRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	474549	466257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929
777704	contig_7513_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_89037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTTCTCCAAGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775261	776158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_775300_776200
777705	contig_7513_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_89038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTAAAGTACAATAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776821	777565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_776800_777600
777706	contig_5009_pilon	-	859	5	Intergenic	novelGene_119251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_3	117.169481948159	7793	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTATCTGCTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50565	43061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43540_43812_43900_44537_44622_47700_47792_50446
777707	contig_20844_pilon	-	1012	11	Intergenic	novelGene_78601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	363.070571652399	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	38	649	209140	205507	TRUE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTAGACAGHPEQDRKIRATKPTGRGQPPRGVHAAQPQSR	209177	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206690_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120
777709	contig_12078_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_74098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCTCACATAGAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212035	210417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_210400_212000
777714	contig_9272_pilon	-	1754	8	Intergenic	novelGene_125948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	32.4515337205551	182	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	444	1109	459290	453257	FALSE	5	GTTTGTGTGGCATTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGSNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDILGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP	463562	452611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_453365_453470_453531_454256_454356_455795_455889_458697_458892_459178_459350_462224_462443_463396
777717	contig_4213_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_124818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATAGTCAAATTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50867	52925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_50900_52900
777718	contig_14822_pilon	-	1246	9	Intergenic	novelGene_145392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	116.387217403803	494	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	160	1155	58551	53461	FALSE	15	CACTGCTTACTTGTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSESGQVRDGGTRVKEAIKYALSVGYRHIDCAAVYGNEAEIGEALKENVGPGKVLREHLFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPHAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69756	53369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_55429_56070_56220_56390_56511_58446_58558_69603
777719	contig_4962_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_107382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178951	179639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_179000_179600
777720	contig_3449_pilon	-	1417	12	Intergenic	novelGene_73709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_7	223.508832816753	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	710	1240	315306	299208	FALSE	10	ATTGTTTCTTTTTGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAMLLQPNKKTIKKLREVLYELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK	347012	299030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_299304_305148_305276_306287_306386_307835_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_322018_322114_324625_324712_327360_327429_328710_328880_346866
777721	contig_14441_pilon	+	630	4	Intergenic	novelGene_100586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	26	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111198	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111362_116849_116963_126159_126283_126514
777722	contig_10904_pilon	+	1371	10	Intergenic	novelGene_22588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	231.380932236148	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	637	1053	449467	453964	FALSE	20	GTCCTCGGAGAGTGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTASSVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKSEKSGIMST	441516	454282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445390_448374_448434_449228_449357_449456_449530_451494_451624_451716_451816_453838
777727	SIRV6	+	180	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	552	51	552	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10789	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777729	contig_11579_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_171939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTGGATTCAAACTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54824	55578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_54800_55600
777733	contig_10627_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_60074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353992	1355524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1354000_1355500
777736	contig_2867_pilon	-	1868	3	Intergenic	novelGene_135272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	161	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	373	864	1551225	1545468	FALSE	25	AGTACACTTGGGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSKANGSHYALTAIGLGMLVLGVVMAMWNLVPGFSATEKPTGQGNNKTEIGSSILKSKTFSVAYVLVGAGVMLLLLSICLSIRDKKKQRQGEEIAGIQTQAGAVPHAQEEDSQEEEEVSSRYYVPSYDEVMNTNYSGVRELDQNPRMSISLPLLRVLDRAQ	1621114	1544463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1545619_1550884_1551434_1620950
777738	contig_13740_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_34778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784131	783536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_783500_784100
777739	contig_12102_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_151050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCCTCCCCACCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35024	33872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_33900_35000
777742	contig_8581_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_22837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGACTCGAGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307411	306344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306300_307400
777743	contig_5671_pilon	+	1317	6	Intergenic	novelGene_79430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_5	2293.19405197205	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	205	525	370430	493592	FALSE	70	ACTAAAAAAAAAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKKMKN	368840	494384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_369626_369747_370404_370551_376738_376781_392775_392919_493577
777744	contig_1694_pilon	-	1923	4	Intergenic	novelGene_144932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	82.5604155889626	52	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	26	358	502378	501504	TRUE	20	TGTTCGCTGATACAGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPRHETKMLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGATGCAACGRAHEGPALELQPQDPASSLCPRPHYLLPDTNVLLHQIVIAWRPGTWASVASSLRPPGSLSMFLRTLPSGM	502403	497315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_498760_501382_501541_501810_501879_502150
777745	scaffold_19766_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_34252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCATCGACGGAGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159387	159144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_159100_159400
777746	contig_567_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_34017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAATACAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647407	649936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_647400_649900
777747	contig_7202_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_18199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27950	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_28000
777748	contig_9646_pilon	+	1640	6	Intergenic	novelGene_117415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	51.9438158013059	267	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	333	1178	27953	50711	FALSE	15	CTCTTCAGTTCTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLAHIIANNSKKHSIRFVTLSATNAKTNDVRDVIKQAQNEKSFFKRKTILFIDEIHRFNKSQQDTFLPHVECGTITLIGATTENPSFQVNAALLSRCRVIVLEKLPVEAMVTILMRAINSLGIHVLDSSRPTDPLSHSSNSTSEPSVLIEDKAVDTLAYLSDGDARAGLNGLQLAVLARLSSRKMFCKKSGQTYSPSRVLITENDVKEGLQQSHILYDRAGEEHYNCISALHKSMRGSDQNASLYWLARMLEGGEDPLYVARRLVRFASEDIGLADPSALTQAVAAYQGCHFIGMPECEVLLAQCVVYFARAPKSIEVYSAYNNVKACLRNHQGPLPPVPLHLRNAPTRLMKDLGYGKGYKYNPMYSEPVDQEYLPEELRGVDFFKQRRC	26331	51173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_26526_27814_28057_42075_42306_48928_49085_49771_49852_50435
777749	contig_2798_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_120028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_1	44.2141254452566	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	288	725	116665	115557	FALSE	30	TGCACTCAGAGTTGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASADL	193425	115524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115565_116235_116680_120452_120595_193294
777750	contig_2798_pilon	-	981	3	Intergenic	novelGene_120024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATATAGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116373	114653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115447_115514_115565_116235
777751	SIRV6	+	152	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	793	51	793	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11030	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
777752	contig_8795_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_146882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATTCTGAGCTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106483	106826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_+_106500_106800
777753	contig_16525_pilon	+	1204	2	Intergenic	novelGene_133834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1834	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1	492	158073	158630	FALSE	25	TGGACTGGAATCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKTELCHKFYLQGRCPYGSRCHFIHNPSEDLATPGHPHVLRQSISFSGLPSPSSSPPPPPGDLPLSPSAFSAAPGTPVPRRDPTPTCCPSCRRATPSLWGPLGGLARSPSAHSLGSDPDEYASSGSSLGGSDSPVFEAGVFGPPQPLAASRRLPIFNRISVSE	158072	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_158222_158287
777756	contig_11855_pilon	+	1078	9	Intergenic	novelGene_67042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	251.404274774714	194	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGAGGTTCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1980782	2008515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1980838_1981093_1981141_1981514_1981613_1986608_1986779_1995528_1995625_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253_2002336_2008231
777757	contig_10235_pilon	-	2153	14	Intergenic	novelGene_46575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	54.5662834536202	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	379	1164	541922	539238	TRUE	35	TTTAGAGGGAGTTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSESSRLSTEPSSQTPGVGEVLDVKTESLAPPFCLLGDGPTSPFGTVQINVGPTSDDPSDVQTKIEPVSPSSSINSEASLLSADSPNQALLGEEVLEVKTESPVPPGCLLQDVPTSPFGAVQISMGPSPDGSSGKALSTRKPPLQPKPVMITTVPLPPRAVPPSTTVLLQHLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPEGPTPPAPRPERKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLPLPSQACG	545859	537170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539272_539723_539904_540344_540437_540524_540711_541376_541511_541671_541804_541894_542031_542169_542256_545150_545287_545811
777758	SIRV6	-	478	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9433	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11253	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1515_1631_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
777760	contig_2770_pilon	-	933	4	Intergenic	novelGene_107506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTTCAAAGAGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855048	831497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_831709_834920_835070_845071_845521_854924
777763	contig_10629_pilon	+	1346	2	Intergenic	novelGene_52960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	335	790	451917	452372	FALSE	10	CATTTTTGTGTGGCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSVTIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGRDKVTFTFEAGRRCFSGEGNFEFETQQGNEIFLALEEAISAQKNAASPGPQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	450562	452928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_450732_451751
777764	contig_8735_pilon	-	1576	2	Intergenic	novelGene_173714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45614	40165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_-_41471_45343
777767	contig_6710_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_96895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
777768	SIRV4	-	243	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	371	3	-371	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTACGGGTGCAAGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
777771	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
777773	SIRV6	+	163	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	566	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10803	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10812_11027_11109_11205
777779	contig_14687_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_107958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	414	713	613760	613461	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVSRFLRGVSPLSVSTLSRFWLFCSVALSLQIAMSLVNYRISEKEEDPQRDSLTSSGYHSGPKYSSSCEDGTERGSVSFCSSSGCCESESTQWHLTSE	614173	613264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_613300_614200
777780	contig_7753_pilon	+	1037	7	Intergenic	novelGene_41523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	144.311776681215	225	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	359	1036	1313409	1345627	FALSE	40	TATTTTCAAAATAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPSSNSTGEIQRSKSASSDVKQMLKCESDLDITADLRKKLHRAKKEKLEITTKHNAELASYESQIAKLRSEVEKGEALRQSLEYDLAVARKEAGLGRRAAEAKLAEADRIQEKLCAQNSELQGKANEMDKAFQTSQQKWKEECRRFERDLEERDNIIQNCNREYDLLMKEKSRLEKTLQEASEKHQQEKNEMESRIRETALEEFRLQAEQWEAERRELQFIVQ	1310390	1345628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1310587_1311881_1311932_1313296_1313453_1318683_1318820_1328372_1328548_1342864_1343056_1345495
777782	contig_9415_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_109839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTAGCCCTTTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1935011	1936841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1935000_1936800
777783	contig_16098_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_45883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1380	1679	244858	244559	NA	10	TACTTTCTTGTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFHLSLSPLSLTSILPEPGATGWDTQPPSLPPSDPRFNLPLCLCPQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALEVSAS	246237	244092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244100_246200
777785	contig_11292_pilon	+	1814	5	Intergenic	novelGene_109483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	350	685	475628	476972	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRLFVCSNSNSILCSHPRLLANLPSQFRPLPVNTECHTATLTFGLSLFHLKQWKKGQMLRIPWALDEVELEAEQKLLQELQAEELLWHQSPKFRMKIVTHALITPKPEN	474281	480878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_474451_475350_475473_475569_475718_476726_477281_480057
777787	contig_14536_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_69326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAGAAAAACAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319850	317170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_317200_319800
777789	SIRV4	-	453	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1066	2	1066	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4092	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
777795	contig_1093_pilon	-	2994	7	Intergenic	novelGene_139985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	8.27479439153761	46	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	46	1671	715265	611292	FALSE	25	AGTGATTTCTACATTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLLVLLCCAISVLYMLACTPKGDEEQLGLPRANGPTGKEGYQAVLQEWEEQHRNYISSLKKQIAQLKDELQERSEQLKNVQYHASDSTGLGVDRGAPEKTQADLLAFLHSQVDKAEVHTGVKLATEYAAVPFDSFTLQKVYQLETGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIESALETLNNPAEGSPIQRTYTASDFIEGIYRTERDKGTLYELTFKGDQKHEFKRLVLFRPFGPIMKVKKENLSTASTLINVIVPLAKRVDKFRQFMQNFREMCIQQDGRIHLTVVYFGKEQMNEVKGILENTSRAANFRNFTFIQLNGEFSRGKGLDVGARFWKGSNVLLFFCDVDIYFTTEFLNTCRLNTQPGKKVFYPVLFSQYNPGIIYGHHDSIPPLEQQLVIRKETGFWRDFGFGMTCQYRSDFINIGGFDLDIKGWGGEDVHLYRKYLHSNLIVVRTPVRGLFHLWHEKRCVDELTPEQYKMCMQSKAMNEASHGQLGMLVFRHEIEAHLRKQKQKTRSKKDMNSQGWVLGEILFFFFILLRLLKDWLQQGKDFHKGRQKS	715310	609968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_611699_616011_616094_627326_627422_628330_628510_645152_645255_660322_660540_714721
777797	contig_12127_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_130104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTCTTTAAACTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89740	89181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_89200_89700
777799	contig_19957_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_57695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGGGCAGATTTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117611	119506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_117600_119500
777800	contig_19957_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_57696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTTGATGCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119654	121446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_119700_121400
777801	contig_16322_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_87562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGGCGTCAGGGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159926	159191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_159200_159900
777804	contig_9653_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_48263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCCTAGGGAAACTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998884	999526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_998900_999500
777805	SIRV5	+	324	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	1	880	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8316	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
777810	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_94294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
777813	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657188	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657188	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777814	contig_3975_pilon	+	1888	8	Intergenic	novelGene_54717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_6	310.662425885627	173	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	58	1518	1475276	1486189	FALSE	15	GCTCATCTCATTTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTEFCYHCKQIWHPNQTCDMARQQRAQTLRVRTKHTSGLSYGQESGPDDIKPCPRCSAYIIKMNDGSCNHMTCAVCGCEFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKILWQLGTLIGAPVGISLIAGIAIPAMVIGIPVYVGRKIHSRYEGRKSSKHKRNLAITGGVTLSVIASPVIAAVSVGIGVPIMLAYVYGVVPISLCRGGGCGVSTANGKGVKIEFDEDDGPITVADAWRALKNPSIGESSIEGLTSVLSTSGSPTDGLSVMQGPYSETASFVALSGGTLSGGILSSGKGKYSRLEVQADVQKEIFPKDTASLGAISDNASTRAMAGSIISSYNPQDRECNNMEIQVDIEAKPSHYQLVSGSSTEDSLHVHAQMAENEEEGGGGGGGSGDGGGSEEDPSCKHQSCEQKDCLASKPWDISLAQPESIRSDLESSDTQSDDVPDITSDECGSPRSHTAACPSTPRAQGVPSPSAHMNLSAPAEVQTVLKPEGAEARV	1475218	1486559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1475361_1476782_1476925_1478318_1478482_1478931_1479047_1480111_1480253_1481181_1481390_1484800_1484933_1485714
777816	contig_7171_pilon	+	1234	6	Intergenic	novelGene_101230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	184.596858044767	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCAGCTGTGTGCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733678	764976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733830_755585_755757_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
777818	contig_9807_pilon	+	1498	6	Intergenic	novelGene_32921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	542	junction_2	296.921538457553	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	575	1282	147193	158783	FALSE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	146618	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
777819	SIRV5	+	482	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	875	-38	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
777820	contig_6980_pilon	-	2253	2	Intergenic	novelGene_36086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_1	0	13	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394997	392651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_393169_393261
777821	SIRV6	+	326	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	534	11	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
777822	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	53	508	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777824	contig_13021_pilon	-	1482	8	Intergenic	novelGene_8253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	766	junction_2	363.18028356086	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	55	1101	236115	210494	FALSE	55	CTAAATTCTAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236169	210112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
777825	contig_10235_pilon	+	1823	9	Intergenic	novelGene_46588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	49.5477988915754	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	214	774	567174	569271	TRUE	30	CTCCTGTATTTATGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHASGLL	566773	582302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566979_567165_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569254_569385_569503_569589_581262_581318_581506
777827	contig_10182_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_134637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTAAAAAAAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425900	427620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_425900_427600
777828	contig_9177_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_32715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATCTAGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591445	590602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_590600_591400
777829	contig_12654_pilon	-	1134	9	Intergenic	novelGene_129329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	123.858538260388	2240	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	294	1070	827177	808478	FALSE	15	CTTTTACAGAGTCCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827470	808413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
777831	contig_1331_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_37856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGAGAAGGACATCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232276	230917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_230900_232300
777837	contig_5280_pilon	+	2093	10	Intergenic	novelGene_52645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	60.5324114793568	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	196	990	222581	227623	TRUE	35	TTAGTAAAAACACTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQIRCKANNTWDPEIPVCEKDCQPPSEIHHGQHTGGDRVRFASGTTVDYTCDSGYLLVGNKTIHCMPSGMWSPSPRCEEGSCKPVKDMQEIPSGTRVVTFNMSCQVGYQVSRFSYQKCQDADGVWFRKIPLCKVIHCPPPPIIENGRLTGMTTKHFLYGNEVSYECGQGFDLLGEKTIRCLSDAEGHGVWNGPPPTCFQSRPVTHCPSPEVKHGYKLNKTLSSYSHNDTVYVACNTGFIMNGSHLIRCHTNNTWVPGVPTCIKKAFLGCEPPSEIPNGWHTGEDTARFSPGMSVLYSCDPGYLLVGEELLLCTHEGTWSQSVPYCKGKL	221807	244088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_221869_222446_222621_222695_222781_223093_223174_223652_224046_226241_226428_227612_227797_229137_229228_234372_234482_243357
777838	contig_15752_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_148765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	33	377	201663	202978	FALSE	25	CATCTTCGCATCAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTRCMFAHKLGLSDLPQSVAFFSAVDIDRCLRKEVTMDCKTPSNPTGMEGRYGIPQGEHTAFILHYA	201630	203965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_201812_202782
777839	contig_15118_pilon	-	1820	7	Intergenic	novelGene_74565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	31.614430600949	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	687	1397	216747	214422	FALSE	65	AAACACAATATGAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIPLPILEGQSLRLVCVADSNPPAELSWFQGSQALNASPVFNMSDLELPPVRTGNEGEFTCQAQNSLGSQQVSLCLSLLSPTDSPQLPHPSCSWEVEGLHCSCSARAWPAPSLRWRVGDQLVEGNSSNASVTVTSSSTGSWANSSLSLHKGLSPGLGLYCEAGNDHGNQSVTVLLLAENSFCCTCFTKVKEGSWPLVLTLIRGAVMGAGFLLTYGLTWIYYTWCAGTQRSRAD	218806	213998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_214456_214591_214728_216123_216418_216500_216759_217488_217537_217967_218247_218458
777841	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_98217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGGCCCCTTCCCCACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
777842	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777843	contig_7066_pilon	-	1256	8	Intergenic	novelGene_42115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	409	777	584770	581173	TRUE	10	AAGCCGTGGGGCCGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHCPSTDSFHRVTLLSPPETARILAVMDQLTCHTTSLNLCSSLGDHVLPEASSQVQMNTRPSWEQLAMVLVGRPMEGAQATSRTQSLCASSFCSSFHWPSSSSFHSLMRLSQPPEANFLM	585178	566978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_567061_569658_569708_572365_572480_575161_575314_581090_581227_582053_582171_583098_583251_584724
777844	contig_7801_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_169687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508305	510505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_+_508300_510500
777851	contig_6589_pilon	+	1814	8	Intergenic	novelGene_25823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	40.6005931393287	49	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	917	1630	819381	825205	FALSE	10	GGTTTGCGCATCCCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFAQRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFAVIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLAGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVDDPRKPNCFELYIPNNKGQLIKACKTEADGRVVEGNHMVYRISAPTQEEKDEWIKSIQAAVSVDPFYEMLAARKKRISVKKKQEQP	817730	825389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_818592_819325_819439_819686_819836_820308_820421_824102_824183_824426_824499_824588_824744_825117
777852	contig_5643_pilon	+	842	7	Intergenic	novelGene_38849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2636.90011608749	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	97	630	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITTFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233876	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236290_237393_237456_237550_237635_237720_237819_237913
777854	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777855	contig_13021_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_8096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGCTGAGGAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51958	51410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_51400_52000
777857	contig_12605_pilon	+	614	3	Intergenic	novelGene_64169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	131	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	29	397	3897	4829	FALSE	25	GGGAAGGAGATGCTGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3868	5046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
777858	contig_5894_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_83007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATATTGTTTTTGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244169	245801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_244200_245800
777859	contig_253_pilon	-	1177	6	Intergenic	novelGene_129705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_4	40.5215991787096	848	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	78	1070	513615	507405	FALSE	10	TCTGGTCTGTTAGGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPGIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPDWIQLDQQITPLLLNYSQCKLVAEEYYEVLDHCSAILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALEPVVSRELRTLEARIRQKDEEDKARFRGIFTP	513692	507297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507611_507918_508061_508150_508328_508835_509025_510269_510450_513516
777860	contig_8729_pilon	-	1574	16	Intergenic	novelGene_40093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_15	45.6594154827044	189	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	143	1537	267912	257249	FALSE	0	GGCCGCTGCCTGTGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESGKLWGGRFVGSVDPIMEKFNSSIAYDQNLWEVDVRGSKAYSRGLQKAGLLTMAEMDQILHGLDKVAEEWAQGTFKVHPNDEDIHTANERRLKELIGETAGKLHTGRSRNDQVVTDLRLWMRQTCSSLSVLLRELIRSMVDRAEAERDVLFPGYTHLQRAQPIRWSHWILSHAVALTRDSERLLEVQKRINVLPLGSGAIAGNPLGVDRELLRAELNFAAITLNSMDATSERDFVAEFLFWASLCMTHLSRMAEDLILYGTKEFSFVQLSDAYSTGSSLMPQKKNPDSLELIRSKAGRVFGRCAGLLMTLKGLPSTYNKDLQEDKEAVFEVADTMSAVLQVTTGVISTLQIHRENMARALSPDMLATDLAYYLVRKGMPFRQAHEASGKAVFAAETKGIALNQLSLQELQTISPLFSGDVSRVWDYGHSVEQYGALGGTARCSIDWQIAQVRALLHAQQA	268054	257211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_257394_257497_257605_257721_257803_258981_259066_259327_259388_259474_259560_259742_259858_259995_260059_260411_260465_261060_261139_261239_261318_263415_263514_263616_263674_263921_264006_264378_264574_267900
777861	contig_9633_pilon	-	2025	10	Intergenic	novelGene_139608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	3.05505046330389	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	215	1387	511680	503142	FALSE	85	CAAAAAAAAGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRLNQAVANKLISSVDYLRESFVGTLERCLQSLEKSQDVSVHITSNYLKQILNAAYHVEVTFHSGSSVTRMLWEQIKQIIQRITWVSPPAITLEWKRKVAQEAIESLSASKLAKSICSQFRTRLNSSHEAFAASLRQLEAGHSGRLEKTEDLWLKVRKDHAPRLARLSLESRSLQDVLLHCKPKLGQELGRGQYGVVYLCDNWGGHFPCALKSVVPPDEKHWNDLALEFHYMRSLPKHERLVDLHGSVIDYSYGGGSSIAVLLIMERLHRDLYTGLKAGLTLETRLQIALDVVEGIRFLHSQGLVHRDIKLKNVLLDKQNRAKITDLGFCKPEAMMSGSIVGTPIHMAPELFTGKYDNSVDVYAFGILFWYICSGSVKLPEAFERCASKDHLWNNVRRGARPERLPVFDEECWQLMEACWDGDPSQRPLLGIVQPMLQGIMDRLCKSNSERPNRGLDDST	512300	502503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_503330_503785_503921_506464_506580_507447_507562_509095_509229_509680_509838_510141_510272_510848_511026_511656_511741_512146
777862	contig_7342_pilon	+	2145	4	Intergenic	novelGene_71150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	3.09120616516523	129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	88	393	333289	335685	FALSE	15	ACAAGCCTTCCGGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVLKQHAGSPSFPKAARQFLLKWSFYSSMVIRDLTLRSAASFGSFHLIRLLYDEYMFYLVEHRVAEATGETPIAVMGEFNDLASLSLTLLDKDDISDDRGSEADADVHSLGEPLVKRERSDPNHALQGI	329877	337437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_329961_333284_333439_334699_334743_335572
777863	contig_7333_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_142799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349583	350720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_349600_350700
777866	contig_16578_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_148665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTTTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223824	222343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_222300_223800
777867	SIRV7	-	261	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91665	0	-91659	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACAAAACCGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
777872	contig_12120_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_21424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGAAGCAACTCTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80819	83021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_80800_83000
777875	contig_15787_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_143984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACCTAAAGCACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76775	78883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_76800_78900
777876	contig_6102_pilon	-	969	3	Intergenic	novelGene_32366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_2	13.5	548	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	165	353	1715667	1715479	FALSE	10	CCCGTATTCTTTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLSLRLGADNVEDERVAATEPKSEPESEKKVFQKEVYLHTSPHLKTEPDPTAEMEAESLSFSFGTLSSWELEAWYEDLQEVLSSDESGGTHVSPPANEKVRMLGLKLGRDVVLLN	1719037	1714862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1715688_1716395_1716444_1718941
777877	contig_9901_pilon	+	346	4	Intergenic	novelGene_126921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	81.6591833306103	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	3	344	107525	143738	FALSE	30	TCAAATTGGTAAGTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAEPAAASEQLWRRRASRGLTTASAGLRPSLRGARCPCQPLYSSALVECEDHDPFNPDRNFDVESVKKEIHRGKKLNYHFFCAKSDHAFLHVDEAQGIYKVFCQQHTPEFPIV	107522	143740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_107648_126701_126810_130732_130804_143698
777881	SIRV6	+	522	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1527_1636_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777884	contig_4751_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_173727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTTGTGTAACGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293537	292046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_292000_293500
777887	contig_7080_pilon	+	1483	10	Intergenic	novelGene_100092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	106.947662289252	106	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	104	916	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRALLPCVAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	460778	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540780_541825
777888	contig_11017_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_128060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTCAAACTACTGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69174	70620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_69200_70600
777889	contig_6829_pilon	-	1911	10	Intergenic	novelGene_123766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	102	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCCCCACTCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59627	18549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_18880_33104_33219_33323_33355_34304_34519_52898_52964_54344_54443_56462_56581_57946_58043_58565_58733_58949
777893	contig_8681_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_157190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCCAGCTGTTATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22263	23631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_22300_23600
777894	contig_3601_pilon	-	1556	10	Intergenic	novelGene_132871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	1221.67029962574	265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	21	1040	355137	144563	FALSE	50	GTGAAAAGAAAACTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATASGALGALQASRARLVAAWCARLGLGLGLPGSVTSTRAGPAMWAQGWAPAAGGAVLRRGYSSEVNAENELRVRYLEEENRGIVVLGINRAHAKNAISKNLIKMLSKAVDALKSDKKVRTIIVRSEVPGVFCAGADLKERVKMHSSEVGPFVSKIRAVVNDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLELALACDVRVAASCAKMGLVETKLAIIPGAGGTQRLPRAIGMSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	355157	144046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169200_252871_252929_254568_254662_274999_275087_312798_312887_312992_313061_354875
777898	SIRV6	+	408	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	122	1	-65	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2407	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
777902	contig_1037_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_84616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACTCACCACTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541940	544090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_541900_544100
777903	SIRV7	-	171	2	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	76969	0	43750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883
777908	contig_6165_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_167408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGATAGTATTCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480919	480161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_480200_480900
777909	contig_6165_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_167407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTGCTTTACGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480161	479814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_479800_480200
777916	contig_3004_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_127505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGCCTTGAACATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289119	288082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_288100_289100
777920	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
777924	SIRV2	-	193	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	698	57	698	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACGACGACGTCGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4034	3700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
777925	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
777930	contig_7457_pilon	-	1881	5	Intergenic	novelGene_31360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	146	junction_2	44.1219899823206	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	35	370	321514	320974	TRUE	25	AATTTCAACTCCCACTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRILPQALPQPTHIHFHTFPQAETSTPAPSPRQTRTRTGPWERGSMCS	321548	316934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317653_319025_319102_319888_319978_320345_321263_321467
777935	contig_6710_pilon	+	520	2	Intergenic	novelGene_97931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGCACAGTGACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653411	657521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
777937	contig_11071_pilon	-	2378	1	Intergenic	novelGene_131035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1332	1712	172682	172302	NA	40	TGCATGGTACAATAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSASCTRVVPAPELAPVLSRFVSRVLLAISLTWRAAVPAAPCRTVVLAPLASCIPGEKATGIGGRETIERRSWQCQRNSFIPSQLGTHTALLLPALDGNVRRCLKSRRQWHALTLRALFWMVSLG	174013	171635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_171600_174000
777938	SIRV6	+	300	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	607	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	4	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCGAAATCACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1527_1635_1736_2780_2829_3106
777942	contig_8045_pilon	+	1611	7	Intergenic	novelGene_35334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1175	1609	102623	115899	FALSE	10	GCCACAGGCCTGCGCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCGEAGEVSAYAQDMILKMEVQNFIFELFQVILSCHTLDNAFHFLNLSLTTNHLPARVTAGSTSAAAPPAANSDSCPRRRPDSPSTDLYPAGRTPRQRSPATAHRKKSLCAPTAASRRGLSAHEAGTADVSGALACQTLRRQL	82894	115901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_83606_86593_86665_98060_98117_100168_100249_100941_101063_102487_102762_115603
777946	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
777948	contig_16970_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_157607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGTTTTGACTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141956	143923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_142000_143900
777949	contig_16103_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_118736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	592	1062	298075	297605	NA	35	TTTTTAAAATACATCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFKREGSENQKRNGRSLITQKQAECWQTPPESKTIKSLIGTCRNWNSLTSLSSREVSAFALSHLVIILHVLTASGDCLTEITSSSWSSKTHCLTCFSFSAAWTEGLLSICWASLLFLALASCCCCCIEARIVTGIGCLFFSILVKLQGRTEWMFK	298666	296351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_296400_298700
777950	contig_401_pilon	+	1276	10	Intergenic	novelGene_42840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1497.54614100683	1	58	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	15	980	1711949	1715755	FALSE	25	TGCTGTGTAAAGTTAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRADSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRRGEPEK	1711934	1716051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1712992_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715469_1715733
777951	contig_12080_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_128359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTTTTTAAAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89805	87418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_87400_89800
777953	contig_14441_pilon	+	974	4	Intergenic	novelGene_100604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	359	787	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111202	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_116558_116963_117220_117344_117539
777957	contig_19709_pilon	-	2474	13	Intergenic	novelGene_108660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	315.013348482604	20	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	77	784	85471	71938	TRUE	25	GTAAACGGTTGTTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNYNDELQFLDKINKNCWRIKKGFVPNMQVEGVFYVNDALEKLMFEELRNACRGGGIGGFLPAMKQIGNVAALPGIVHRSIGLPDVHSGYGFAIGNMAAFDMNDPDAVVSPGGVGFDINCGVRLLRTNLDESDVQPVKEQLAQAMFDHIPVGVGSKGVIPMNAKDLEEALEMGVDWSLREGYAWAEDKEHCEEYGRMLQADPNKVSPRAKKKRPSSVGDPGSRQPLRRNSGCG	85547	62778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19709_pilon_-_62993_63997_64771_67456_67577_68946_69058_69748_69938_70456_70633_71830_71991_73968_74127_78145_78303_80586_80687_81791_81860_83476_83556_85378
777959	contig_18869_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_56387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
777964	SIRV6	+	303	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	171	406	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
777967	contig_6424_pilon	-	1076	5	Intergenic	novelGene_109249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	423.58293166746	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	35	466	21039	6307	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTQVPWAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21073	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842_8011_9193_9280_12062_12098_21012
777968	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
777971	SIRV6	+	347	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106_3165_10724
777972	contig_9653_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_48180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGCTACAGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169917	169077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_169100_169900
777975	contig_21203_pilon	+	1142	2	Intergenic	novelGene_84465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	261	437	4320	4496	FALSE	50	AAAATGGGGAAGTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQIWDTAGQERFRSITQSYYRSANALILTYDITCEESFRCLPEWLREIEQYASNKVITVLVGNKIDLAERREVSQQRAEEFSEAQDMYYLETSAKESDNVEKLFLDLACRLISEARQNTLVNNVSSPLPGEGKSISYLTCCNFN	979	5201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_1166_4245
777978	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
777979	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
777980	contig_13565_pilon	-	2449	1	Intergenic	novelGene_162390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCAGGAAATAGAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181225	178776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_178800_181200
777981	contig_5671_pilon	+	1134	5	Intergenic	novelGene_79458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	2312.02566756946	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	264	617	370430	394855	FALSE	65	TGAATTAAAAAAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKECAAQAAGLIASMNY	369959	395372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370198_370404_370551_376738_376781_392775_392919_394807
777982	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	54	519	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
777985	contig_12327_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_140658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGGAACGCTTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023471	1021860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1021900_1023500
777987	contig_8020_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_114429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTTATACACATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279935	279129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_279100_279900
777988	contig_4868_pilon	+	223	3	Intergenic	novelGene_136764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCTTCGGGACCGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217097	245064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_217191_239860_239958_245031
777992	contig_7057_pilon	+	807	8	Intergenic	novelGene_123328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	934.914925737816	5	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	12	431	937155	939255	TRUE	10	GCATCTGCCTCCCGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDVSLGAVWERAWVKSGFSESGIGMAWVQLSYSQTRTRAHQNIHLCA	937143	943721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939280_941208_941288_941405_941485_943527
777993	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_97368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
777996	contig_1836_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_71044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTTGGCTGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730184	729306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_729300_730200
777998	contig_7080_pilon	+	1257	8	Intergenic	novelGene_100115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	110.40814817609	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	134	733	527296	540726	TRUE	40	ACTAACAGAATGGTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	525759	542210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540928_541887
778003	contig_20889_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_127652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGACCGGCTGAGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55558	52938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_52900_55600
778010	contig_15066_pilon	+	1779	7	Intergenic	novelGene_149554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	58.3478553352411	159	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	4	1008	114962	116372	TRUE	30	CCTAGCAACACGTTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMAALRAGQGAGWSLRGLRALGGIRWGKGPLLTPDLRALLTSGTSDPRARVTYGTPNLRARLSAGVPEPRPCLTSGTPDPQARLTAEIPDPRTREASGTPGTRPRVWLAVALGAGGAVLLLWGGGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGRHPFSSREVPISNGSGFVVAADGLIVTNAHVVADRRHVRVRLPSGDTYEAMVTAVDPVADIATLRIQTKEPLPTLPLGRSADVRQGEFVVAMGSPFALQNTITSGIVSSAQRPARDLGLPQTNVEYIQTDAAIDFGNSGGPLVNLVSGTSFQESLPRSVWEGWIFPN	114958	118062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_115465_115566_115772_115860_116056_116270_116631_116789_116860_117518_117615_117715
778011	contig_12761_pilon	+	2534	13	Intergenic	novelGene_164069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	69.9421884288891	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	460	2181	393979	416698	FALSE	30	TGTGAAGTTCTTTCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKKSKPEDPKSLGEGPAAGAEDTGGGAKEEAAQEADPEEEEESLQGREAEGAEEDGRGKLRPAKAKSDRKKKSYGPLHPHLPLLPPPPALPPAPPAHFTPEGVPLPPPLLEPSVLAPAPTAEEESLPPAALNVVPPEAPGGAEDEAKPRPIIPMLYVVPRSERLAGDREHRTCQQAFEHFVQKGTAWPEPAAPMELTLQEEQGGPGRPEIPARAGDVQAPSTFPKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQGASSDEETLPFSGEEEMSDSEALKSLLSLQWKNKAANFQAERKFNAVAALTKPYCAVCTLFYPYSQSLQPEKETPQAMLGEGPTAAAPLSKSGQKTRPLVPEMCFTASGENTEPLPASSYIGDDGTSLLIACAKCCLQVHASCYGIRPELVNEGWTCSRCTAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVMERHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKRVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVSITCFKHKTGAHTAQFQRAVTAGQMVITKNRNGLYYRCRVIGVATQTLYEVNFDDGSYSDNLYPESITSRDCVRLGPPPEGEVVELRWADGNIYKAKFISSVTSHVYQVEFEDGSQLTVKRGDIYTLEEELPKRVRSRLSVSTGAPQDSVFSGEEVKAAKRPRVGAPRTNPTTTTTEDTARSLDYLAFMESLLQAQGRPGAPF	379240	417051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_379401_393679_394174_394331_394453_395875_396055_400669_400896_403005_403083_403260_403317_403745_403855_408878_409065_409134_409300_409685_409806_415132_415226_416503
778017	contig_5988_pilon	-	1054	12	Intergenic	novelGene_15893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_10	50.3209533604784	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	30	1025	555058	529953	FALSE	20	GGATATGCCCCACTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVTSSDSSLALEGEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	555087	529923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532541_549379_549429_555049
778019	contig_6375_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_72985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	984	589	1572	290307	291290	NA	30	TACGCCATACGCACCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLQEEFQCLNHRCVLWAQRCDGVDACGDGSDEAGCSSDSFLGPTPAPFPATPCNRTLEDFYGVFSSPGYSHLASGSHPQSCLWLLDPHDGRRLAVRFTALDLGYGDAVHVYDGAGPPETPRLLRSLTYFSNGKAVTVETLSGQAVVTYHTVAWSSGRGFNATYHVRGYCLPWDRPCSSGSGLGPGEGLVERCYSEAQRCDGSWDCADGTDEEDCPSCPPGHFPCGPASTPGTTACYLPGDRCNYQTFCADGADEKRCRHCQPGNFRCRDEKCVYETWVCDGQPDCADGSDEWDCSYALPRKVITAAVIGSLVCGLLLVIALGCTCKL	289718	291290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_289700_291300
778020	contig_7943_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_173143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTCATCTAAAGTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177820	177187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_177200_177800
778021	scaffold_16539_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_68323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163988	161787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_161800_164000
778022	contig_20779_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_112366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAAAACATTTGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27436	25251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_-_25300_27400
778024	contig_16846_pilon	-	1076	4	Intergenic	novelGene_82946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1375.12528722133	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	75	446	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558724	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551561_552704_552824_555055_555278_558688
778025	contig_21007_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_161510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564
778026	contig_10734_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_51085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTACTTGAACAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534349	536626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_534300_536600
778027	contig_8161_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_156768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCACTGCGTCACTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334979	332942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_332900_335000
778028	contig_6958_pilon	-	1728	4	Intergenic	novelGene_69922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.608489510639	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	126	695	161022	149618	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNALHIILQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	183231	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149960_154455_154590_160928_161102_183185
778030	contig_16643_pilon	-	980	6	Intergenic	novelGene_158124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1492	junction_5	1119.17523203473	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	75	608	243304	231365	FALSE	10	CATTTTGGGTCTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLPKLPKLKKLELSDNRIFGGLDMLAEKLPNLTHLNLSGNKLKDISTLEPLKKLECLKSLDLFNCEVTNLNDYRESVFKLLPQLTYLDGYDREDREAPDSDAEVDGVDEEEEDEEGEDEEDEEDEDGEEDFDEEDEEDEDEDVEGEEDEDEVSGEEEEFGPDGEVDDDEEDEDEDEDEEEEESGKGEKRKRETDDEGEDD	247286	230992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_231433_232651_232722_234526_234649_237584_237775_243220_243344_247251
778034	contig_9482_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_44251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACCACATGATAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443684	442122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_442100_443700
778035	contig_11427_pilon	+	1427	2	Intergenic	novelGene_78967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	149	junction_1	0	241	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	342	1379	93223	94260	FALSE	20	TCACATTGTTTCGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92233	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_93163
778038	contig_8045_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_35321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGCTTAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51488	49004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_49000_51500
778044	contig_6412_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_149973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515110	516138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_515100_516100
778047	contig_21203_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_84488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAGACAATAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66590	67071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_66600_67100
778048	contig_3472_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_166931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	493	822	252548	252877	NA	55	GTATAAAATAAACACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPKLDAGESCWLLGAAVPMHCKSLKPEKLCALQEPDAREIHACYRSLLSKHTRIRRKALFLLQCLASTLREQSLTSCQLSKGNICLKTQIHFHSGGKNSEFGSEEQ	252055	253155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_252100_253200
778049	contig_6881_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_164831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGTAAAGATCTGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65065	65319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_+_65100_65300
778050	contig_16310_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_70070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4043.5	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	183	347	285976	290178	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNAGRKKEPKLPRPCFFS	285793	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_290130
778051	contig_15036_pilon	+	1938	4	Intergenic	novelGene_107142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_3	46.8354092066628	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	231	662	10373	59976	FALSE	75	CTCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSVQSGGSSGGPAVPTVQRGIVKMVLSGCAIIVRGQPRGGPPPERQINLSNIRAGNLARRAAAAQPDAKDTPDEPWAFPAREFLRKKLIGKEVCFTIENKTPQGREYGMIYLGKDTNGENIAESLVAEGLATRREGMRANK	10142	61252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_10451_45988_46139_52672_52794_59893
778052	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	10	-244	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778054	contig_6346_pilon	-	2678	5	Intergenic	novelGene_172085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	12.3566783562574	39	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	540	983	90470	90027	FALSE	15	ATCAACTGTCTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVKSLRDPAAKMSKSDPDKLATVRITDSPEEIVLKFRKAVTDFTSEVTYDPASREGVSNIVAIHAAVTGLTVDDVVRQSAGMDTARYKLVVADAVIEKFAPIKNEIEKLKMDKDHLEKVLQLGAAKAKELAYPVCQEVKKLVGFL	245938	88331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_-_90476_92349_92469_120906_120988_183345_183604_245862
778056	SIRV5	+	331	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-4	878	-4	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8311	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
778057	contig_10324_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_7869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCACACTACGGACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499509	499158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_499200_499500
778058	contig_10263_pilon	-	2418	11	Intergenic	novelGene_135825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_7	61.9248738391932	1	120	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2292	126	2417	749756	583112	FALSE	40	TGAAGGAGGTGGAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSARSVGKVEPSNQSPGRSPRLPRSPRLGHRRTNSTGGSSGSSVGGGSGKTLSMENIQSLNAAYATSGPMYLSDHENVGSETPKSTMTLGRSGGRLPYGVRMTAMGSSPNIASSGVASDTIAFGEHHLPPVSMASTVPHSLRQARDNTIMDLQTQLKEVLKENDLLRKDVEVKESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQDELRIQRDLNQLFQQDSSSRTGEPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELFLLRKTLEEMELRIETQKQTLNARDESIKKLLEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEAEMHVHHLESLLEQKEKENNMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKDSKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGALSTEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKVEQLKEELSSKEAQGEELKKRAAGLQAEIGQVKQELSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQEMAEEKGTQAGEIHDLKDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALAEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDLKDLKEKVSLLQGDLSEKEASLLDLKEHASSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKMESQLKKAHEATLEARASPEMSDRIQQLEREITRYKDESSKAQAEVDRLLEI	749881	583110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_583247_591313_591455_592453_592595_593946_594085_624400_624569_642889_643058_646220_646305_647597_647754_659920_659996_692554_692972_749087
778060	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8468	-1	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
778062	contig_8260_pilon	+	2436	1	Intergenic	novelGene_163248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158527	160963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_158500_161000
778065	contig_8160_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_136408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193983	195008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_194000_195000
778066	SIRV6	+	571	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778069	contig_5485_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_37782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAACAAAGCAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653704	655868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_653700_655900
778071	SIRV2	-	300	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	34	3398	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
778072	contig_17198_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_62440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	186	479	1299232	1298939	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFELPAFWLAAVVLTIVPPGLQKWRITYCILSSLSSLVSWLLVGIHSSWASFCWHNKGGKMSQRRSEHQSIPQALPFAGSKMAFTSVSRGLSAKWEAAALCSTFQKAVFLWNKLAVSVSTPFWKRICSIQISKSVLFLLQNEELRPGIIPSLLTGHF	1299417	1298408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1298400_1299400
778073	contig_12150_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_6970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTATGGTTGCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159930	158603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_158600_159900
778074	contig_12150_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_6969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTATTTCTATTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157894	157334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_157300_157900
778075	contig_6710_pilon	+	555	2	Intergenic	novelGene_96327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACAGTGGTTCCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	657830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
778077	contig_6764_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_173737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATGAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18056	16159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6764_pilon_-_16200_18100
778079	SIRV2	-	278	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	22	648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
778080	contig_6589_pilon	-	1806	7	Intergenic	novelGene_26245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	46.4234734685901	7	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1429	1746	2228346	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGHVTSPEPSWPPNRYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2231125	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228489_2228740_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523
778081	contig_6710_pilon	+	544	2	Intergenic	novelGene_97037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATACACAGTGGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
778082	contig_2114_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_104330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGAACTGTGCATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181764	1179861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1179900_1181800
778085	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
778086	SIRV5	+	537	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	1	14	1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTGCAAGCGGCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
778089	contig_7679_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_173741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTAGCACCTCCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85027	83982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7679_pilon_-_84000_85000
778092	contig_6439_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_154229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGGTGTTTGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197725	196199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_196200_197700
778094	contig_1301_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_47366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	419	718	573119	573418	NA	50	TGTGGCCATATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSFLPSHPTAILSCRNSGHTGAGNPEQVPTGSVLPEHPTEAVVTEEASPTRQLDEAGGSRGHQAARPSFQETLLEGEDAPAAIAAMPTASLMHKIVG	572700	574992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_572700_575000
778098	contig_5389_pilon	-	739	8	Intergenic	novelGene_142990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	49.0276889697473	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	88	738	15088	4716	FALSE	40	AGAAGAAGTGGGAGAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTLRDQINSDHRTRAMEDRYMEVSGNLRDLYDDKDGLRKEELNAISGPNEFAEFYNRLKQIKEFHRKHPNEICVPMSVEFEELLKARENPSEEAQNLVEFTDEEGYGRYLDLHDCYLKYINLKASEKLDYITYLSIFDQLFDIPKERKNAEYKRYLEMLLEYLQDYTDRVKPLQDQNELFGKIQTEF	15175	4714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_4816_5512_5596_6493_6586_6996_7070_8644_8751_8855_8909_14657_14706_14992
778099	contig_2093_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_153019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481448	1483623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1481400_1483600
778100	contig_18869_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_56443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	866	1204	120066	119728	NA	60	AAAAAAAAAAACCCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFSPEKFYRKQTNHSPHSLTSKTKSLKRLTFLRILFPCMSTSLLPRIQIQPKLFKTKRIPLHSCVSTIPPTAGAAKSSVKLLSTLISASPSGNRTCRTICLLMNNNDVLL	120931	119440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_119400_120900
778103	contig_17989_pilon	-	2315	2	Intergenic	novelGene_150840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	1906	2313	268845	268259	FALSE	20	CAGGTATGACCCAGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNFLTRYCCLYEVLTLRSALLKREISIGEKRHECRPLAPGGTQKDGETQERAHLPVGSCWVNACLCPTWSGHHWCPRCLVEIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLS	270750	268256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_268424_268602
778105	contig_9267_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_162018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGAGACACGCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384151	386102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_384200_386100
778106	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	508	3	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
778112	contig_6375_pilon	+	1323	2	Intergenic	novelGene_73013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATGACAAAAGCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358307	360484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_359353_360206
778113	contig_16635_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_153148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	995	1306	89422	89111	NA	60	CTGGGGAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNWEPVLQCPLLSLGSKGPCAPAHWDSRSQTRGDPHGHTPQATPRRATDAVGAAGRSSGGKKHAGVTGQSINRKETLIKVIGYMLLKKKMLQECATETSLS	90416	88870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_88900_90400
778115	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778118	contig_9852_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_138465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40316	42243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_40300_42200
778120	contig_2100_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_50630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAATAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899446	899753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_899400_899800
778122	SIRV6	+	405	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	379	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10723_10819_11031_11109_11205
778123	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	875	-40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
778125	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
778126	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778127	contig_2365_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_103758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAACATTTATTAGCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250940	252300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_250900_252300
778128	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
778130	contig_16525_pilon	-	681	4	Intergenic	novelGene_133851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_2	697.486917440033	7686	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	55	399	181436	178378	FALSE	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKCKPEWVLPVGGVEEQL	181490	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178476_178588_178686_181150_181253_181388
778132	contig_20823_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_159909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	249	548	34433	34134	NA	30	TTTAAATTTTCATGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALCSRLARLPQRRLFRLVRFPLPQPPPLLLLLLLLLTAGSPARAWESGDLELFDLVEEVQLNFYQFLGVQQVSGAGQTAPGVAPPGQNLWVLAETRR	34681	33024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_-_33000_34700
778135	contig_6233_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_74772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGGACAAGTTTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121731	123649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_121700_123600
778137	contig_19954_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_173752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	262	420	105396	105238	FALSE	25	ACCTGCCTAGCTGGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQHSHLEQEVISNIGRAQQILRNACEGLDFLWLYKVEKPLYLRLKGGLQKRLRFANASIGLAGVTCRGWRGGVNTAEPHELRSGKRMVPQGKSEIPFYCLYFRLFYVRLCSAYRLFSELCCLISGTRQNKPEEEYTQN	107766	104536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_-_105542_107650
778138	contig_8357_pilon	+	915	8	Intergenic	novelGene_39678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	347.57316070263	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	215	766	136371	153108	FALSE	40	AGAATTTTAAAATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI	120396	153257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_120533_136292_136420_142263_142332_143242_143351_143490_143550_144117_144221_145401_145489_153030
778139	contig_13894_pilon	-	1242	4	Intergenic	novelGene_62082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_3	17.2046505340853	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	27	611	489339	469121	FALSE	20	TTCATTCATTTATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGAYGAGKAGGAFDPYTLVRQPHTILRVVSWVFSIVVFGSIVNEGYLNSPDEAEEGKEFCIYNRNPNACSYGVTVGVLAFLTCLLYLALDVYFPQISSVKDRKKAVLSDIGVSAFWAFLWFVGFCFLANQWQVSKPKDNPLNEGTDAARAAITFSFFSIFTWSLTAALAVRRFKDLTFQEEYNTLFPTSAQP	489365	468489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_469214_470572_470719_472408_472656_489240
778142	contig_5196_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_38708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATTCACTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351930	351539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_351500_351900
778148	contig_6888_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_147061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTATCAAAAAAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20091	17982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_-_18000_20100
778149	contig_4315_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_46766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258935	257210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_257200_258900
778150	contig_13481_pilon	+	1881	9	Intergenic	novelGene_119404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	318.75803911431	170	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTACCTCACACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619774	644030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_619846_620292_620443_624607_624725_628959_629065_630645_630745_632842_633099_634191_634479_634851_635631_644013
778151	contig_14357_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_121701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGAGCCCTGCTGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721879	723362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_721900_723400
778153	SIRV4	-	405	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1108	8	1108	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4050	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778154	contig_3627_pilon	+	1054	3	Intergenic	novelGene_78506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	6	479	621315	634316	FALSE	20	GCACAGTTGTGCTCTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621309	634891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
778156	contig_9852_pilon	+	1371	12	Intergenic	novelGene_138470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	33	junction_3	96.4005075258407	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	288	1301	330078	354501	FALSE	20	GAACTTTTCCCACTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPEAGGPEIVKVTPLQQMLASCTGAILTSLMVTPLDVVKIRLQAQGNLLPKGQCFVYSNGLMDHLCVCEEGSNKVWYKKPGCFQGTLDAFLKIIRNEGIKSLWSGLPPTLVMAVPATVIYFTCYDQLTAILRSKLGGNETYIPIVAGIVARFGAVTVISPLELIRTKMQSKKFSYQELHRFVSKKVSEDGWISLWRGWAPTVLRDVPFSAMYWYNYEVLRKWLCEKSDLYEPTFMINFTSGALSGSFAAVATLPFDVVKTQKQTQLWMYESHKMPVPSNMSTWAIMKNIVGENGLSGLFTGLIPRLIKIAPACAIMISTYEFGKAFFQKQNVRSQQ	322144	354571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_322339_327725_327795_330053_330175_331882_331943_333307_333415_335289_335358_337777_337903_342138_342313_346567_346678_349920_350003_353927_354009_354391
778159	contig_8710_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_73531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	722	1042	443813	443493	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRKNSLTPQLSQHHAADWIRYRAALPGLSLQGTILPHSTVISSLSCCCCCLWLNYSNTRRLKFGKIKAKLVFNASKSGCGESVSTDVIRIGRRQVCDARLRCRF	444534	442550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_442600_444500
778160	contig_12270_pilon	+	391	2	Intergenic	novelGene_113109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	13827	14364	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAAISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13825	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
778161	contig_17790_pilon	+	1531	3	Intergenic	novelGene_128488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATATCTATACCTCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95464	290588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_96814_258458_258547_290494
778162	contig_10479_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_147115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGTCAAAATCAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146081	145634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_145600_146100
778163	contig_6628_pilon	+	1130	9	Intergenic	novelGene_170609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	32.5823475980476	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	269	991	252329	257143	FALSE	20	GGTACTGTGTACAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNAKQPEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGVGRAAGRGVPAGVPIPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAVAATASIAGAPTQYPPGRGTPPPPVGRATPPPGIMAPPPGMRPPMGPPIGLPPARGTPIGMPPPGMRPPPPGIRGPPPPGMRPPRP	213234	257282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_+_213344_221655_221752_252265_252332_253161_253314_255219_255332_255785_255939_256388_256528_256864_256991_257105
778165	contig_14530_pilon	+	2595	7	Intergenic	novelGene_108444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.4406682011537	30	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	364	966	23820	34219	FALSE	15	GGTTGCATGTGAATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNVTTILMDPNPIWLVGRAAEAPFVINAVIRYPVEVIAYQPGFWEMIKFAWVQYVSILLIFLWVFERIKIFVFQNQVVTTIPVTAAPQGELYKEHLS	9645	35848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10052_23776_23910_24255_24400_26701_26784_33247_33353_34037
778167	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	65	510	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778169	contig_4845_pilon	-	2226	5	Intergenic	novelGene_53612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	5.78791845139511	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	9	2183	201549	196750	FALSE	10	TTCTAGCTGCTGAGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGMEAAEELHLEGKRSQLAPEPCPGPDSGWSPSGEGCAQALKDFSPEPARAVLALKNLPPGLGPWPLTRQRAALGDLVCRGAPAAWTAVGAIGRKACLRGEGEQVDTRQEEDLSLGPWRDICACEQSSGWTSLVQQGRRENEGNVAPVRIGKRLHLQVCRVVLPGFELLLWPWPPDDPSLTQPRLEKEAAVAVVTEVESAAQQEGASPGEDAAEPCTDIGHQWHTSLQAESTVSPGLKPQAQDHLSTGSQPLGPLLHDGSMDEEDPPQTQMPRKPQSSAAIQQGPESSETSSSSSSRDPQLHAYMAKKLCSPSDQPPPRAKTSEPKDQQAEEPQHSSFPAPLRSPPALAGSSSKQGRRYQCGECGKAFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDRAYGTRRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQGSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYHCPHCTDAFPQLPELRRHLISHTGEAHLCPVCGKALRDPHTLRAHERLHSGERPFVCPQCGRAYTLATKLRRHLKCHLADKPYRCATCGMGYTLPQSLKRHQLSHQPEVPSIPPSVPPAASESAMVLLQAEPELLDTSSERAASPAQDVIEVTISESQDKCFVVPEEPGPTHSLLLIHKDMGFSAWAEVVEMETGT	201557	196706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_198279_199068_199326_199547_199610_200903_201182_201500
778172	contig_7004_pilon	-	1255	7	Intergenic	novelGene_126507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	98.0442077160434	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	167	769	434925	432654	FALSE	45	CAATCAATAAAGCATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGAHCSEPSCQRLDFLPLKCDACSGIFCADHVAYAQHQCGSAYQKDIQVPVCPLCNVPVPVARGEPPDRAVGEHIDRDCRSDPAQQKRKIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRVRMRLCNEPWNCRWQRPSPRSLV	435091	432167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432659_433184_433253_433473_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434599_434870
778178	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778183	contig_1428_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_158396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCTCACAAAGTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108310	109537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_108300_109500
778188	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
778195	contig_5799_pilon	+	1819	2	Intergenic	novelGene_50277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	393	722	293743	298253	FALSE	20	CATACCATCTTTTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLRIKDTYEQKTLTTGPISNIMINGQKIHIVKDFILLGSTINAPGSSSQEIQRCTALGKFAAKDLFEVLKSKDVFYSRFSQCDAFLTAPLSFMCTQLWTESKPAGIS	293350	299350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_293968_298148
778196	contig_13780_pilon	-	1871	7	Intergenic	novelGene_149130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	22.1560124771785	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	193	942	852779	845966	FALSE	40	AAAGGTAAAATTGGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSFPGPKPSSGNDSANSVDVINGEEEKDFSAEDPSFSDQPVFFREFRFTSEVPIRLDYHGKHVSMDQGTLAGILIGLAQLNCSELKLKRLFYRHGLLGVDKLFSYAVAEWLSDIKKNQLPGILGGVGPMHSLVQLVQGLKDLVWLPIEQYRKDGRIVRGFQKGAASFGTSTAMAALELTNRMVQTIQAAAETAYDMVSPGTLSVEPKKVRRFPHHRLAQQPVDLREGVAKACSVVKEGFTDTAQTIYETAAREHESRGVTGAVGEVLRQIPPAVVRPLIVATEATSNVLGGMRNQIRPDVRQDESQKWRRGED	856253	845036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_846197_849664_849815_850610_850766_850984_851107_852155_852239_852770_852841_856122
778199	SIRV6	+	397	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	482	-1	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAATAGTGCAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
778201	contig_2100_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_50652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGGTATAAGCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104941	1102471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1102500_1104900
778202	contig_6710_pilon	+	433	2	Intergenic	novelGene_98208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653481	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
778208	contig_10541_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_144644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGCCCCCAAAAAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233143	234950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_233100_235000
778213	SIRV6	+	509	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	32	20	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778221	contig_6726_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_86209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTGTCAGCAGTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24542	23651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_23700_24500
778224	contig_10082_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_63853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGCTCAGTACAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168451	170189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_168500_170200
778226	scaffold_19766_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_34370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTAAGTTTGGGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685772	685310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_685300_685800
778228	contig_9527_pilon	-	2561	7	Intergenic	novelGene_134041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.99205898780101	106	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	213	656	302596	299961	TRUE	35	CAAAACAGTCATTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPGAGLAQVLRPFELTHIEVVERRRLLLEKGTQERLRSPSSSRHGDSKTDRDKNPVIGASSAALSEKTDKMPPMKTPKSLGKKKEKSGEMVKKEEKSGSGQSPTQGAPKKEDASKAGKGKASIPEQKPAKGKGTKSGSKEKRSILLESELVAETTEMVNPLLEPVAHRDGKVYMPGNKGTASQRWGWMASSPQCGTRCSSPSPRLRPRAPWGCSGCR	303379	296728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_298632_299958_300081_300442_300530_301745_301835_302238_302333_302542_302693_303263
778232	contig_9124_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_173754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACCCTTTTATCACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60199	59813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9124_pilon_-_59800_60200
778235	SIRV6	+	460	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	3	555	3	35	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
778236	contig_14618_pilon	-	2250	6	Intergenic	novelGene_136806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	14.2126704035519	87	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	158	1006	570184	559577	FALSE	15	CTGGTTTCCAGTTGCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAPIDPGKKGDLEQKILQVLQEAGSPVKIAQLVKKCQVSKKELNHVLYRMKAVTCTGPATWCLGGDGTRDVVPTEPAEPGPSCGYRPSEEAAQKSLQNAATIPQSTGSPLGEQRQKAIYTLLAANGPRDALSIARALGMKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPEDSGRKNQFTKNIYQQSTVNMFIQTGPSGTISITNSKGIQIGSANMMQKHTASGKSDAGFARCDSDFPGDVGQAAPGIITTLSSQMDTLSFGREDPTPAENRAPTEGN	570341	558332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_559735_563700_563869_565414_565589_566228_566298_567306_567553_570150
778239	contig_10800_pilon	-	2181	1	Intergenic	novelGene_152621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCACCCTCCCTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433414	431233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_431200_433400
778240	SIRV6	+	358	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-33	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGTTGTTCAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
778241	SIRV1	-	248	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3578	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6472_6557
778244	contig_17171_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_147372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.6761895045715	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCATATTGGGTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269401	264896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_265360_265668_266527_268720_268752_269338
778246	contig_14441_pilon	+	445	4	Intergenic	novelGene_100759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	121220	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121219	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125606_126175_126283_126514
778248	contig_6418_pilon	-	903	8	Intergenic	novelGene_81117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	469.437353191487	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	365	667	72409	68463	FALSE	30	CTTTTATGTTAGAAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	106578	68226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73086_85886_85990_103028_103129_106515
778249	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	384	-2	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
778255	contig_16951_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_98654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCCTCATCTCCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90587	91041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_90600_91000
778260	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	502	-1	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
778262	SIRV7	-	224	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69052	4	35833	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78905	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
778264	contig_6710_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_97330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
778267	contig_13453_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_146703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAATTCAAGTTAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58225	56961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_57000_58200
778269	contig_9505_pilon	+	1582	3	Intergenic	novelGene_121874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	60	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTAGTGTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650762	678071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652596_676556
778272	contig_17493_pilon	+	1848	5	Intergenic	novelGene_122187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	536	junction_4	366.123613005225	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	136	549	92066	104545	FALSE	45	AATATGAAGAATTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFGKFIVCVMVYLVCVTYVRTDDVSV	49990	105844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360
778276	contig_14483_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_133778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCAGGGAGACTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200220	199765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_199800_200200
778277	contig_14483_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_133777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTATTTCACCCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198489	198002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_198000_198500
778278	contig_960_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_108261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTCCAACCCATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616330	615935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_615900_616300
778281	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	2	1166	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778282	contig_9646_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_117472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAACCAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384026	382093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_382100_384000
778287	contig_7412_pilon	-	1769	3	Intergenic	novelGene_76280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_2	33	264	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTGAGTAATAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270943	268954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_270292_270432_270579_270657
778290	contig_4103_pilon	-	927	4	Intergenic	novelGene_52023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	117.576452668986	1061	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGTCTGCATTATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619589	528800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_529278_543255_543381_577146_577338_619455
778291	contig_17108_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_109497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGACCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12757	14870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_12800_14900
778292	contig_5947_pilon	-	1039	4	Intergenic	novelGene_101491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	332	junction_1	134.806033495043	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAAATGTTCTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393990	391384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_392116_392437_392503_393389_393497_393854
778296	contig_602_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_134960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTCCCATTGTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516535	514747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_514700_516500
778298	contig_7457_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_31491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615112	616998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_615100_617000
778300	contig_13854_pilon	-	2526	14	Intergenic	novelGene_154119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	150.789402104333	35	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	11	1213	230774	189032	FALSE	30	TAACATGCTGTTGTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNGMSSFQLNGERDGSLHQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCATSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLFPRRCTWLYVMNNCLLSISGKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKFAVSAKIPDTKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALHTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVQFETVNPNSTSSWFTESDTPQTSVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY	230784	187718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_-_189120_189765_189822_192284_192356_195210_195304_195383_195453_197378_197551_211291_211396_213750_213810_218391_218510_218592_218654_222759_222840_224713_224799_227323_227366_230669
778306	contig_6616_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_141753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1434	1769	276095	275760	NA	30	TCTTATCTCAGTGATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEVICDLLMCCKFYHCDEVILMRFPRLDSVLMQSFLRYKREKQAETHGNFIPPRKQCREQSASFGPEVPVLRCSQTKERLMTRTFLQSQQRDALNLDLKPNGL	277528	275320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_275300_277500
778307	contig_6028_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_156556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_4	211.670144328387	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	162	824	247497	203608	FALSE	80	AAAAAGAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLWVLLSLIFTLIAGSDNAQVNAVNHKGLELTKNITKKDAGCRKGLYLASPNHEQHLCCQPCPAGTRKTADCSVNEGNPNCTHCKEGQEYTEMENYLDYCRRCRFCDEGHGLEVEKHCTRTQNTKCRCKEDFFCSSSSCDHCAPCITCEHGIIEKCTQTSNTKCKEKGYFFYSYIPLSPIPKVKYKEKPIPFDTISESILLKDCLFSYEMSNVLIHRL	247658	203074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_203825_205382_205492_206259_206398_227058_227228_247467
778308	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778309	contig_6589_pilon	+	1352	14	Intergenic	novelGene_25981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.5514712209984	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	144	1274	1327642	1336231	FALSE	15	CTGTTCATGCATGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLAVSEHYGNRDGHNQGPGDSRCDKDRAHWRAVLIAGQPGTGKTAIAMGMAQALGPDTPFTAIAGSEIFSLEMSKTEALTQAFRRSIGVRIKEETEIIEGEVVEIQIDRPATGTGSKVGKLTLKTTEMETIYDLGTKMIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDMAPVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIISTSPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLRYAIQLITAASLVCRKRKGTEVQVDDIKRVYSLFLDESRSTQYMKEYQDAFLFNELKGETMDTS	1321849	1336309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1321886_1324123_1324179_1327589_1327646_1330373_1330504_1330641_1330709_1331802_1331910_1331996_1332091_1332495_1332620_1333015_1333111_1333194_1333314_1334933_1335054_1335429_1335560_1335988_1336104_1336205
778313	contig_8452_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_48038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGCTGTGAGACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423960	424601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424000_424600
778317	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	54	512	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778318	contig_13878_pilon	-	2292	11	Intergenic	novelGene_165737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATAGTGAATTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424810	215202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_215342_229097_229255_232939_233086_240929_241012_242341_242496_243650_243765_277920_278051_290348_290418_315603_315729_383519_383638_423752
778319	contig_5744_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_149353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	13	354	747602	747943	NA	70	TGAAAGGAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRREMWNILRTVVSLGGLGVWTAPGDTVRGFLIFICYKNIPVVSYNNKNIFCKPSLHINIPARLKLHANLLFEPSNAVWSELSLLPNYSDTWNHVVPSARVTSKCCCFCCCQCFHSR	747589	748675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_747600_748700
778323	contig_10050_pilon	+	1351	8	Intergenic	novelGene_119612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	84.8679646779126	207	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	63	1283	100426	131179	FALSE	15	GAATATTTCCTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRASAFLPLRPFSRLPLSSGSAEVSAAAILLLAAPHGTVRTKNNIQRYFGTHSVIYNKKDEQSIPTHEISEETSKSQDSVKENTKKDLLNIIKGMKIELSTVNVQTTKPPNRRALKNLEATIGRLQKATENTTKKRNENLSPELVAAASAVAESLPFDKQTTKSELLRQLRQHEEDSRAQKDGKRRWKVSVSNIISDMKVAKSATARVSTRPEHQIQFDEGSDNYFEHQRSADLRKSLRKNIFKGKRLNIFDIKAAEEVPETGVAVRLQRLITWHRRKTKEISPSIWDVEFAKQLATVSQQPFQNGFEEMIQWTKEGKLWEFPVNNEAGFDDDGSEFHEHVFLDNYLEDFPKQGPVRHFMELVTCGLSKNPYLSVKQKIEHIEWFRNYFNEKKDILKESDIQFS	100363	131247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_100551_106951_107240_113259_113422_114461_114603_117560_117638_120637_120692_120902_121047_130949
778325	SIRV6	-	480	7	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9259	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11079	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3162_10711_10825_11035
778326	SIRV4	-	204	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	410	3	-410	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTATCGGCGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
778327	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
778331	contig_2703_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_101685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTCCTTTGGGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259456	258147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_258100_259500
778337	contig_15118_pilon	-	1996	6	Intergenic	novelGene_74537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.8878654660676	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	488	1996	44453	34270	FALSE	35	CCCCAGGAAATAAACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFKDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPDSVFMLEQGVPPWIVEGVIHSGTSPEEIWATDQMQWQPENQNELKSLERCQQNYAFGNNLDLSKNLVPVKQKQNTFGSHCKSLKSPLDFVIQNRRDAEKDSDEFSGYAKSSVHMKHDRTFPGVKYHGCIKPSSTKSQPNDHPKTYTGEKAHECSKCGKAFSRKAQLIRHQKTERGEKPHKCNDCGKTFMRKIQLTEHQRVHTGEKPHECNECRKAFSRKSQLMVHQRTHTGEKPYVCSECGKAFIRKCRLNRHQQSHTGEKLYGCNECGKAFSQKAYLIAHQRLHTGEKPYECSECRRTFFFKSDLTKHQRIHTGEKPYECSECEKAFRSKSKLIQHQRTHTRERPYGCSECGKAFAHMSVLIKHKKTHSREKAINSLKVRKPSSGSHSSLYMSELLQEQNPVNTAPMELSSAGTQPLLNISELLGGRNVVTVEQPFSRSPALVNNREF	48510	34269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_35541_42540_42637_42930_43058_44438_44627_46843_46936_48288
778338	contig_15897_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_49590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	19	549	879548	879018	NA	85	AGAAAAACAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THGGIFMHEVLLKKTGLITEQKNKKLKKGPGFCFVLPFGFQRRPILLALIAGRGLTTTWPNGLLPKPSRLQLSALSVNQGSLARKASLGQLLLLTQTGPRQAAVHLGVRLSHVAFSPLPPLTEVTALRGCFPFFIGVIRGVLVREFRGPATHSTALAPRTEFGPAWPLTCQQVGLLLRPPQA	879566	877289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_877300_879600
778341	SIRV1	-	243	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	0	3587	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
778342	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
778344	contig_6589_pilon	-	1787	14	Intergenic	novelGene_25734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1023	1418	472700	463784	TRUE	50	GTAAATGAACAGAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRHSSNSELKPLSKFTFQPKIRQASLSENLCFWGLDSQVKAEAGAESGSARMPWSSLVWRDPSFQCCPLLSISTVPMGRASSEMVTWLRFRVWGLRRAVCGLPLGVGGLFRLPAVWVVASFFLSGVRPD	509670	457290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_457354_460731_460872_463617_463831_466994_467188_470062_470142_472623_472732_474988_475052_477995_478092_479606_479704_481814_481909_483841_483975_505396_505466_506882_507058_509406
778346	contig_13481_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_119322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATAAAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301950	303658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_302000_303700
778350	contig_5341_pilon	-	1416	3	Intergenic	novelGene_168028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	705	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	225	749	339444	338480	FALSE	30	CTACAAAATCTCAGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340890	337812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339484_340705
778353	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
778358	contig_9133_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_109297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAGGGTATCATGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229653	231657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_229700_231700
778359	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	443	0	270	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
778363	contig_12464_pilon	-	2574	6	Intergenic	novelGene_68697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	103.543227687763	1	118	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	419	1897	357072	337140	FALSE	20	ACCTTCAAGTCTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	357729	336462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347
778364	contig_6831_pilon	+	1151	6	Intergenic	novelGene_165141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_1	6.78232998312527	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	327	1151	13805	29861	FALSE	35	GTGAGGAAAATGGTTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELLKAASLGKLSASGSSGTSSLLEEAAATVDPSMRSGEVTAVPPLWEKLPLESNGCMPSPPLGRLTKSTLQVPLQNVPLSTPDNKQPKTVGAEPCQEPSSNEKLRTTSQKAEPICMGHFHNRHIFQQQLIEKQKKKLQEQQKIILELKENQRLAEARWAAEYAAAGTDAQSRLLSNPSSPAASLGTEASRSDSRNSLSGPRRNPRQLMAPHPILKAMEERAVERAERRRILAERKKKQEEEKLAQLKAQEEERQKREAEEKEAQLERKREEKR	3753	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_+_3947_13671_13925_25127_25547_26528_26642_28946_29030_29771
778365	contig_13542_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_131578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTGTTGACTGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752650	753895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_752600_753900
778371	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	54	503	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778373	contig_7775_pilon	+	2668	1	Intergenic	novelGene_37498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1426	1731	257219	257524	NA	30	TTTTGGAAGTAGATAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRKVGDGNGKADWDHIVKVLIYPAKEWRLCPLGVWRINQNWEDSYVWETIQAASHSLLKLCKSLHEDPDKEVGKKLELRYISGVKFRSDRKSTNSSSKQ	255793	258461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_255800_258500
778375	contig_5782_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_162132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGCTTGATGATTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347261	346203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_346200_347300
778381	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	8	1160	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778382	SIRV5	-	220	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGTAACCTACCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
778383	contig_12450_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_162323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	1125	1787	374671	374009	NA	80	AAAAAAATAAAAAGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTIPHPLFCFALRDKAERLPGLQRRDWTPEKAMDCPTLPSSARQTRAKPSPVLLPTATATQLVESPDFLTRRETFAMITEGSSSHTCDLSLPDFLHLVANGGPHHQVDIICWVQKNVLQDQQPDFCRADILGRTKRVEKATQGRVTGKQCGQDEENFKTPQYVYMGTGKLRGKKQGNIQNLTPSDPRNPKGTLYGRHEFRGHYQNLLSTSIYCMYISI	375795	373442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_373400_375800
778386	contig_16639_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_173755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAATTTTAATGCTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30453	19392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16639_pilon_-_20028_30323
778392	contig_12920_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_166328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGTAAAGATTACGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77861	77203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_77200_77900
778393	contig_7202_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_18200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28115	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042
778395	contig_13176_pilon	+	2014	1	Intergenic	novelGene_159712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	121	711	113764	114354	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVPTRHLNPSPRAQWGSVARQQESLPVTPFSLPVRGRGGNTACTYGQRDSLLPPTQQEVEVPRVRAHPPAIPFSPSPPGVEVAQLPMYLPDALPSLTLPSKGGDIMTACAYTLRPFPPSFCRTLGGSDTGACTSTCCTFLSLPTNRWIQHAEHMSTCHSFLPPTVQEEAEVARLQAHPPTGPLNHTRLPPQLVRG	113643	115657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13176_pilon_+_113600_115700
778398	contig_2069_pilon	-	923	3	Intergenic	novelGene_23507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	3	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTGTGTCTGTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509891	1508365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509212_1509684
778399	contig_12802_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_114243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGGCAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52541	54009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_52500_54000
778405	contig_10345_pilon	+	1268	12	Intergenic	novelGene_158377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1140.4963396813	1	59	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	355	1017	14227	24141	FALSE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	11655	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_11736_11831_11941_13195_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
778407	contig_5485_pilon	-	1813	3	Intergenic	novelGene_37758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_2	11	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCACTGAGGTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473319	471156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_471327_471547_471623_471751
778408	contig_4131_pilon	+	927	3	Intergenic	novelGene_127880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	72	464	240672	241064	TRUE	5	TTTCTTTGTGTGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240600	248865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248183_248362_248714
778415	SIRV7	-	270	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91639	-15	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
778416	contig_3866_pilon	-	508	3	Intergenic	novelGene_112445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	48	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	72	308	306133	302811	FALSE	55	GGAAATACTGAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPQREQRPVHSGVCVRITFLRPSMPLYEGLGSGGEKTAIVIDLGEAFTKCGFAGETGPRCIIPSVIKRAGMPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFR	306204	302610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_302898_303817_303891_306056
778417	contig_11328_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_88371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60384	62602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_60400_62600
778420	contig_11003_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_105458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	689	1063	449515	449889	NA	30	AAATGGTAGAGGCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVHEVSTIPSRSLGPVLFLLQICSSLLSDRAGILTHWDPNKDTELFIAFSMGLLRNQNFSHKRKKFYQGTPLRSSISQSSNQIQKDLLIYPGRTYTVIPYVYIALYSFRALLHVFVSFKLSK	448826	449971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_448800_450000
778423	SIRV4	-	467	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
778426	SIRV6	+	367	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	313	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2480
778427	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
778429	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_91977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	20	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
778430	contig_1225_pilon	+	1256	5	Intergenic	novelGene_44172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTCCAAGAGCCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250763	276208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250820_253416_253520_274232_274440_274487_275051_275881
778432	contig_5832_pilon	+	1746	3	Intergenic	novelGene_134173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	62	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	45	728	565712	569799	FALSE	15	CAGGGGTCTCTGCTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYIPGQPVTAVVQRVEIHKLRQGENLILGFSIGGGIDQDPSQNPFSEDKTDKVRGAGGRVLGPPCGAQRPEVVGISAPWARVEGADLISPNSPLCEGPRNDLVGISRGRGGEQSSPALLGPPTPSDGVLWQSPGGGHQQGVQYLWGNQAFPPGCPGTTFTGHVPPGRLHAGTEGALTVCHAGVCSMGKGPVQGPGPSLSRAFTSHGCLKEALLKLLGCRSVTRSCR	565667	570817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_565751_568817_569459_569795
778440	contig_6710_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_89090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653555	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
778445	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
778446	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778448	SIRV6	+	275	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	8136	20	603	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
778450	contig_15744_pilon	-	618	4	Intergenic	novelGene_83610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGTAAGAGGAAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153592	152146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_152175_152261_152351_152530_152660_153220
778451	contig_14727_pilon	-	1931	7	Intergenic	novelGene_56671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_6	85.3198231492672	58	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCACTGTGTTTTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365713	362352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364971_365053_365112_365488
778460	SIRV4	-	259	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1264	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3894	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
778462	contig_9840_pilon	-	2108	5	Intergenic	novelGene_173761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_4	25.5587558382641	153	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	429	1034	230135	99227	FALSE	30	AATCATGTGGCCTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAWVLLTLGLVACVSAESRAELTSDKDMYLDNSSIEEASGVYPIDDDDYASASGSGADENIESPEMTTSRTLPKIPFTSLAPRVETTTLKIQDKIPAQTKSPEEVNKENVHMSDSERKMDPAEEDTNVYTEKHSDNLFKRKEVLAAVIAGGVIGFLFAIFLILLLVYRMRKKDEGSYDLGERKPSSAAYQKAPTKEFYA	230563	98152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9840_pilon_-_99391_101039_101176_106894_107029_115169_115282_230075
778464	contig_5423_pilon	-	1306	11	Intergenic	novelGene_85243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	221.127203211183	2	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1215	92	1306	520734	502237	FALSE	35	AAAAACGATCCTCTGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMER	534182	502236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_502336_502610_502782_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_534094
778466	contig_7919_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_28102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGACAAGTATGTGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328813	1329848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1328800_1329800
778472	contig_17311_pilon	+	168	2	Intergenic	novelGene_57850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCTCGAGGTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118801	121604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_118889_121523
778478	contig_14755_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_129391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATGTTACTTGATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310525	308805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_308800_310500
778480	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
778482	contig_4125_pilon	-	1066	6	Intergenic	novelGene_25093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	193.966388840954	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	79	606	660980	631015	FALSE	20	GACCCTGGAATCCTCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSCRRVGVPERGSRGRRRRSSNQNRSMEAHNILSKRGFSVRSFGTGTHVKLPGPAPDKPNVYDFKTTYDQMYNDLLRKDKELYTQNGILHMLDRNKRIKPRPERFQNCKDLFDLILTCEERVYDQVVEDLNSREQETCQPVHVINVDIQDNHEEATLGAFLICELCQCIQHTEDMENEIDELLQEFEEKSGRAFLHTVCFY	661107	630554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_631117_631681_631801_632363_632504_648777_648922_660957_661003_661051
778485	contig_5059_pilon	-	1106	11	Intergenic	novelGene_140704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_8	129.043248564193	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	48	890	231713	166409	FALSE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAERKGKGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231760	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_214153_214187_214730_214789_231639
778486	contig_15376_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_154691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTTCCCAGTTAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229986	230229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_+_230000_230200
778489	contig_12570_pilon	-	1895	6	Intergenic	novelGene_79371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.9460164511584	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	351	902	284104	280987	FALSE	15	GGGATTCTATTTTAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGAALVPIFSFGENELFDQISNPPGSWLRWVQNHLQSVMGISLPLFHGRGVFQYSFGLLPYRRPITTVGEPRSRLGGEAYRGAEDTATLSGGGGPSAPALHQGAVQPL	300324	279993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281083_282648_282875_283523_283699_284049_284255_286406_286481_300198
778492	contig_12151_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_54980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTGGAAAGCCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979209	981188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_979200_981200
778496	SIRV6	+	319	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	424	130	258	40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
778497	contig_6270_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_99897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1565	1930	1189869	1190234	NA	25	TCATCTACCTAGAATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNPFSNSVGPPSESTFSTTLSHYLLSPGLLRSFLTGLPASTLAFITVFCSQSSRKSLLILKSDHDIPLLQILQCLPKSQSPNLTDMALPDLVSAHFSSLISSHSLPQLLCSGCTNCLALP	1188304	1190279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1188300_1190300
778498	contig_753_pilon	+	2005	10	Intergenic	novelGene_112929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	20.4836580452218	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	133	1170	487767	534734	FALSE	10	TCTCCCAGTTTCCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STASAQGLPDRRIADAATLSSFWRWISAQTVRIVRALRGHFEGIMDEPSPLAKPLELNQHSRFIIGSVSEDNSEDEISSLVKLDLLEEKEGSLSPASVSSDTLSDLGISSLQDGLALQMRSSMSGMHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNSIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIPTLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLKAAEKVGYPVMIKASEGGGGKGIRKVNTADDFPNLFRQVGYKLFLFI	457786	535569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_457846_484604_484652_487740_487994_521427_521561_522567_522707_527749_527860_529193_529276_530244_530344_531718_531826_534593
778499	contig_5222_pilon	+	2396	10	Intergenic	novelGene_58975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_5	47.6198941723693	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	429	1154	37965	42050	TRUE	15	GCCCAGCCTCTCAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTVNYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTASYLRPREVQVREFEVLRKLNHQNIIKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVVAGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLMGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFTPFGGPRRNKEIMYGGPWAE	35324	44462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_35552_36304_36392_37536_37620_37933_38052_38958_39100_40249_40380_40976_41159_41864_43020_43573_43754_44369
778500	contig_5643_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_39162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTGTCCTGTAGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700607	701813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_700600_701800
778503	contig_5569_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_86755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCATATGCAGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489141	488590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_488600_489100
778504	contig_20550_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_142633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATTAATATCAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37747	37381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_37400_37700
778506	SIRV6	+	345	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	26	412	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778508	contig_8720_pilon	+	2127	10	Intergenic	novelGene_173762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCCGAGCTACTTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4395	35939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8720_pilon_+_5135_6445_6545_7044_7219_8522_8655_12383_12592_16675_16845_19343_19406_20921_21070_24767_24950_35725
778509	scaffold_19766_pilon	-	1330	9	Intergenic	novelGene_34326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	562.269383280826	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	302	1099	622205	596633	FALSE	35	ACCTAGAGAATTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGYRPQAGPQVQPPQEHLPANLPMGSPRQRPYTLS	623633	596401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596710_596919_596947_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_622561_622731_623580
778512	contig_11227_pilon	+	2067	5	Intergenic	novelGene_163217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.7325439668328	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	220	1146	525893	541716	TRUE	25	ACAAAGCAGTGTTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGASSKLALFLFGCYVAALGAHTGKHRVAEHRMAEHHVAEYYVAAVYEHQSILSPDPLALTSRKQALELMNQNLDIYEQQVMAAAQKGVQIIVFPEDGIHGFNFTRTSIYPFLDFMPSPRLVRWNPCLEPHRFNDTEVLQRLSCMALRGEMFLVANLGTKQPCHSSDPGCPNDGRYQFNTNVVFSSNGTLVDRYRKHNLYFEAAFDTPPKVDYITFDTPFAGKFGIFTCFDILFFEPGISLLRDFKVKHIVHPTAWMNQLPLLAAIQIQHGFAIALGINMLAANIHHPSLGMTGEWHTHPSAVLLAP	480984	542709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_481188_525876_526157_539918_540069_541203_541773_541844
778513	SIRV6	+	414	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	6	363	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778514	contig_3602_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_60547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTACTGGCCAATATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304320	306177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_304300_306200
778521	contig_20010_pilon	+	494	2	Intergenic	novelGene_173765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCTTGGAGTATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2661	6771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20010_pilon_+_2801_6416
778524	SIRV6	+	382	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	403	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
778525	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105913	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
778528	contig_20614_pilon	-	2276	5	Intergenic	novelGene_107516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.69258240356725	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	205	1299	55547	53305	FALSE	25	GCGCTGAATACTGAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LADARAGPASTESNQRRWSQEAPAPPFKGPPATALRAPEWDPDRLHRWKQSKRSLQQFPNPLKRFHGWMRETDTSPVTTSSSAMEEDLLPLVMTSDPRPFNQQLPEPPDPRCVLEPQDSPELAPILVCALCCCFGIIYCCFGYRCFKAVMFLSGLLSGALVIFLLCHKERVLETQLSLEVSAGIALGIGLLCGLVTMLVRSVGLFLTGLLLGLTLGAGALLGTEPIYQPPSAWVPAGGLVGLALLGALLTLRWPRPFTVLGTALLGAAVLVACADFFLEGLALGSRLSQRLQALPALPPLCWYSWVLLGAWPALGALGALAQWKLMAEEHGGHANAVVLSRQQRQLQLLRIRQQEAKWHQTRPGVGLSEGSYHRQLPPNARSPADSLAPSYLQSLRERHLGPGTQATAAHTILDLDSDCGSTVPLTTPSVST	58016	52327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_53437_53554_53716_54160_54743_55327_55582_57846
778537	contig_3601_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_132841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	334	774	119990	120430	NA	55	AATCCCACTTCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPSTGIKTPSTADVSCFVYTHWKHEALVRAADYSASPWPQGPRFSNTSSGCMEVRPPPPFLWGGWEEANLGAIRGHAGRHERKRREKRIPEASGPQVIPFLSSLFQVGCLSFATRGVLIQVLVPPQCLCPDPTPSLCWPTSLMVD	119656	122040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_119700_122000
778542	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1213	1	1213	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3945	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
778543	contig_165_pilon	-	1686	4	Intergenic	novelGene_117087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	14.1656862405839	150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	93	590	547869	511720	FALSE	25	TCTCTTGTGTAATTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVLLPRGGRSTDSVPANSLPRVSATAATKMASGVQVADEVCRIFYDMKVRKCSTPEEIKKRKKAVIFCLSADKKCIIVEEGKEILVGDIGVTITDPFKHFVGMLPEKDCRYALYDASFETKESRKEELMFFLWAPELAPLKSKMIYASSKDAIKKKFQGIKHECQANGPEDLNRACIAEKLGGSLIVAFEGCPV	547961	510623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_511830_512737_512815_516496_516805_547866
778548	contig_9345_pilon	-	1843	15	Intergenic	novelGene_24560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	267.657153913017	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	18	1811	922013	880683	FALSE	5	GCATCCCCCTTCTCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAADEMAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSIAPSRNFTTSPKSSASSYSSVSASPIANGDSTNTSGMHGSGVSRGGSGFSASYNCQESPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEVEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDTHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRIMEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRDFWFCAVHWSPQ	922030	880650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_880720_893860_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023_900183_902070_902245_905275_905394_906192_906334_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
778549	contig_11378_pilon	-	1240	6	Intergenic	novelGene_112245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	68.1545302969656	359	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	281	1030	350093	341973	FALSE	20	GCATGTATTTTATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGNGALNSRDAARHTAGAKRYKYLRRLFRFRQMDFEFAAWQMLYLFTSPQRVYRNFHYRKQTKDQWARDDPAFLVLLSIWLCVSTIGFGFVLDMGFFETIKLLLWVVFIDCIGVGLLISTLMWFISNKYLVKRQSRDYDVEWGYAFDVHLNAFYPLLVILHFIQLFFINYVILTDTFIGYFVGNTLWLIAVGYYIYVTFLGYSALPFLKNTVILLYPFAPVILLYGLSLALGWNFTHMLCSFYKYRVK	351244	341762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_342110_343679_343782_343867_344008_348976_349098_349843_350128_350998
778551	contig_6102_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_32316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATAAGATAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582911	1582130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1582100_1582900
778557	contig_18967_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_165342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1233	1544	448477	448166	NA	25	TAACCATTTGTGCCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSLKIIHPTWYYRFQISKGSGPCMTVAEPGLRIFGALLPKRSLGSTNNPRSTANLKVGSSNHPVAPQKKGLAICFHKDYPKKPNQLPSSQFQLLATPCVSE	449709	448045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_448000_449700
778558	contig_5033_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_28969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGCTACTTAACAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468300	467499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_467500_468300
778561	contig_9995_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_47778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738740	740560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_738700_740600
778565	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
778569	contig_3386_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_34547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGCGACTTTCCGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471017	470028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470000_471000
778570	contig_13051_pilon	+	1706	3	Intergenic	novelGene_140126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	82	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTTTACTTTATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389060	420915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_389624_410940_411075_419906
778579	contig_3155_pilon	+	1556	3	Intergenic	novelGene_26334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATTTCTGTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89855	96406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_90055_93761_93849_95136
778583	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
778586	scaffold_13505_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_111641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACAATGCTATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773155	774079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_773200_774100
778593	contig_19737_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_158967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAAGAAAAACTTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33541	35832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_33500_35800
778594	contig_21373_pilon	+	1381	10	Intergenic	novelGene_164222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	44.9273762399104	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	120	1034	70851	83850	FALSE	5	TGTGATCTCCTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGLGTWKSAPGKVGEAVKVAIDVGYRHIDCAYVYQNENEVGEAIQEKLKEKVVKREDLFIVSKLWCTYHDKSLVRGACKKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKAGEDNFPLDETGSVIPSDTDFLDTWTAMEELVEEGLVKAIGVSNFNHLQIERILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLVQYCESKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLDDPRIKAIANKHGKTVAQVLIRFPMQRNLIVIPKSVTPERIAENFQVFDFELSSSDMSTLLSYNRNWRVCALVSCANHKDYPFKAEF	70731	84197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21373_pilon_+_70881_76624_76793_77377_77495_78399_78478_78790_78914_79390_79498_79791_79874_80497_80582_81710_81794_83807
778595	contig_1225_pilon	+	1372	2	Intergenic	novelGene_44120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1325	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	126	311	148749	148934	FALSE	40	CTTAATAGTTTCATCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	147086	149995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_147173_148709
778597	contig_8330_pilon	-	1604	7	Intergenic	novelGene_71982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_6	261.742504933549	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	229	951	2056301	2038853	FALSE	35	TACTAGCAATCATTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056529	2038199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056297
778599	contig_5686_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_45205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTTTCTGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79846	80101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_79800_80100
778600	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	51	516	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778601	contig_10253_pilon	+	1182	8	Intergenic	novelGene_76865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.159022848798	1	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	28	555	16207	81384	TRUE	35	AGACCGCACTAAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPGSKKVKLSNNTQNWDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVSGYAVGTGFGGRMGNASEWVHEREGVLAVPSF	16179	100309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_16261_47123_47263_52948_53068_78973_79092_81286_81399_84015_84222_84985_85122_100038
778602	contig_817_pilon	-	2003	2	Intergenic	novelGene_132444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGAAGCCACCGCCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550068	545220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_547169_550013
778603	contig_9400_pilon	-	705	7	Intergenic	novelGene_146588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_4	554.897488030197	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	115	471	135537	121571	FALSE	30	CAATTGAGATCCAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTGAGLCTCCGWIKPLYPGMYPGAGPSSDFRFGYHSSSRITGTSFYEGCGFQSGDYTTSEE	158630	121336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131218_132506_132600_135452_135561_158539
778604	contig_2078_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_100151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328079	327600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_327600_328100
778607	contig_2087_pilon	+	2109	4	Intergenic	novelGene_65559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	441.504498529995	1	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	256	624	69092	70191	TRUE	30	ATTTCAAAGTGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVWALGGLCGLGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39418	71914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994_70306_70543
778609	SIRV6	+	350	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	2	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778612	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
778613	SIRV6	+	515	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	26	20	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778618	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
778619	contig_14522_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_147304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAACTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62634	60710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_60700_62600
778621	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	61	510	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778622	contig_8377_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_34949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68096	69352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
778623	contig_9440_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_59053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTAAGTGCGCCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483224	481176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_481200_483200
778626	contig_12427_pilon	+	1687	9	Intergenic	novelGene_40597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	468.49172884908	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	144	1463	635220	657001	FALSE	25	GACTGTGAATGTTTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KISVIVETVYTHVLHPYPTHITQSEKQFVVFEGNHYFYSPYPTKTQTMRVKLASRNVESYTKLGNPTRSEDLLDYGPFRDIPAYSQDTFKVHYENNSPFLTITSMTRVIEVSHWGNIAVEENVDLKHTGAVLKGPFSRYDYQRQPDSGISSIRSFKTILPAAAQDVYYRDEIGNVSTSHLLVLDDSVEMEIRPRFPLFGGWKTHYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALKMRFVDHVFDEQVIDSLTVKIILPEGAKNIQVDSPYEISRAPDELHYTYLDTFGRPVIVAYKKNLVEQQIQDIVVHYTFNKVLMLQEPLLVVAAFYILFFTVIIYVRLDFSITKDPAAEARMKVACITEQVLTLVNKRIGLYRHFDETVNRYKQSRDVSTLNSGKKSLETEHKALTSEIALLQSRLKTEGSDLCDKVSEMQKLDGQVKELVLKSAVEAERLVAGKLKKDTYIENEKPSPTSGSTRSLVLVSKSFFSFFFF	635076	657225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_635337_643626_643837_644727_644921_649146_649247_650460_650600_650876_650997_655080_655327_656635_656750_656920
778629	contig_151_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_132558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATCCCAGCATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152199	154474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_152200_154500
778632	contig_854_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_36322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGGCCGTTGCTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567183	569275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_567200_569300
778633	contig_7391_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_112169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAACCAAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452735	454442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_452700_454400
778634	contig_12327_pilon	+	1801	5	Intergenic	novelGene_140623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	650.702312889696	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	312	629	169448	171003	FALSE	25	AGCTGTTAAACTTTATCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVARIRSGPCLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148612	172175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169479_170312_170438_170841
778636	contig_12638_pilon	-	1376	7	Intergenic	novelGene_33352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_6	301.520590783891	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	208	855	1412426	1394910	FALSE	35	TAATAAACTCTCATGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPG	1463549	1394388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1463494
778637	contig_12638_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_33351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTACGTTGGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394288	1393771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1393800_1394300
778638	contig_2537_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_33429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACCTCCACTTCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239819	238391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_-_238400_239800
778640	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778641	contig_4103_pilon	-	1858	12	Intergenic	novelGene_51942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	25.9720129090037	86	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	83	1558	100374	94975	FALSE	30	TATTAAACTGCTTTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGSRHLSGPWPGLRLLVCLWISSSSIMWRRQQGRFRPVGCGVEELRRCRREREAALRKARREQQLVSKRLLRDSALEEAEGVAAILGEAEIQQFLRLAQQGTEGKQREKALVHLRRGLQHLETQQTFIRLEGSMRTLIGLLTSNQALLQLEAARCLHELSHSEQPAVAEACLPATSYLLTYLSGHSSDFIELCLYTLGNLIVESEAVRRQLLPQGIVPALAACIQSPHMAVLEALGYALSQLLQANEAPEKIIPSILGSAIPRHVLRLLQPGPKLSPGVAVEFAWCLHYIICSQVNNALLITHGALSTLGLLLLDLAAAVQRTEDAGLELLACPVLRCLSNLLTEAAVEAVGGQIRFGDERVVAALFILLQFFLQKQPSLLPEGLWLLNNLTANSPSFCTSLLSLDLIEPLLQLLPVSNVVSVLVLTVLCNVAEKGPAYCQRLWPGPLLLSLLDTLAFSDTEVVGQSLELLQLLFLYQPEAAQAFLQQSGLQALERHEEEAQLQHRVRALRETALHG	100456	94674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360_95529_96288_96384_96524_96712_96825_96938_97145_97263_97481_97568_97740_97846_98093_98278_98393_98510_100047_100155_100289
778642	contig_12179_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_127997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGGTTAAGAGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497769	496579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_496600_497800
778643	contig_1982_pilon	+	1992	1	Intergenic	novelGene_151328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAACGAAGAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271058	273050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_271100_273000
778644	contig_19743_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_173161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274555	272651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_272700_274600
778645	contig_10962_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_103913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATAGTGTAATAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390595	389896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_389900_390600
778646	contig_12157_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_135882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCTCCAGTCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40243	41290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_40200_41300
778648	contig_5415_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_146149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTGGATTACTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320441	321054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_320400_321100
778649	contig_9797_pilon	-	1476	5	Intergenic	novelGene_65577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	547	933	191434	189331	TRUE	15	ACGTCGGCGAGAGGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSLLQLRVADGARVVPVILLEEVFPLLDEFP	191980	172528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_172571_183694_183980_188570_188734_189277_189420_191136
778655	contig_4151_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_65247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCAGTTAGTCATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551516	553026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_551500_553000
778656	contig_6496_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_103508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTAATGTGATATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713660	714542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_713700_714500
778659	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
778660	contig_5894_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_83047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATATAGTTATCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482846	482596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_482600_482800
778661	contig_10159_pilon	-	2369	6	Intergenic	novelGene_30789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	91.5051911095759	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	535	1794	353226	317967	FALSE	80	AGTGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	419327	317391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_419006
778662	contig_9272_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_125917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCCGAAAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317110	318960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_317100_319000
778663	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	0	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778664	contig_3942_pilon	+	2447	11	Intergenic	novelGene_128879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	10.5872564907062	13	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1203	1625	1536880	1549972	TRUE	20	CTGCTTCCTAAGAATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVRGVRHLGSRGFLSSATSKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMAEDRPGLQ	1531834	1551313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1535916_1536004_1537094_1549644_1549706_1549824_1549974_1550064_1550179_1550283_1550459_1550671_1550769_1550878
778665	contig_6327_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_147484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGATGTTTAAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42342	44140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_42300_44100
778666	contig_8453_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_125106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTGTATTAACCAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60363	62343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_60400_62300
778671	contig_11253_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_126835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179340	179906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_179300_179900
778672	contig_1091_pilon	+	546	3	Intergenic	novelGene_168773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	9	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	170	544	595861	708550	FALSE	35	AATAGCTGAACAGCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYPYFCRLYKEFISCCFEPGMLNLGTWPKNIHTTAERYHECEAKEQTCKTGAQELCLRHDGDSEAAAKLHKPVMVDEVVQCLAPQKGQIFLDMTFGSGGHTRAILHKESDITLYAVDRDPTAY	582415	708552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_+_582568_595843_596131_708445
778673	contig_1091_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_168776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAACACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709100	710159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_+_709100_710200
778674	contig_4659_pilon	-	2657	10	Intergenic	novelGene_118193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1905	2273	198237	195029	TRUE	0	CCCTCCCGGCCTTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFGLHHLACRLSLLFQVQEQQNRLLYLITISMATYDDRLYPSTHKPGDIFADDSFPEDSATQNISDGAIWRFPHLFQLELLNPLFIRGDSSTLDANVIFLYSFCSILGDLVVGGITILYA	209209	186940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_187103_188121_188197_191708_191847_195019_195316_198155_198257_199557_199742_201064_201208_204158_204301_205904_206069_207957
778675	contig_7635_pilon	-	2012	2	Intergenic	novelGene_171367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	148	324	94332	94156	TRUE	75	AATTTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLFIPPSTLGQGPGVCSRSPLHTQCHRHKPEWPNQCQEKNKLKKINSQMFMHFTYTVPHGLLLGQRETTSVRFMGFMKCVSGTIVQEMLHNNSVAFLKPCFVFIHI	94479	92131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_93454_93789
778678	contig_10493_pilon	-	2180	17	Intergenic	novelGene_173766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	7.61474720525902	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	148	1839	263970	189114	FALSE	25	ACTGAAATGAGTGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAALRLTLRPCARAAAPGLRVYHGDSLATLGTQPDSGSVIYQENYEQMKALVSQLHERAQRITLGGGERARALHISRGKLLPRERIDNLIDPGSPFLELSQFAGYQLYGSEEVPAGGIITGIGRVSGVECMIVANDATVKGGSYYPVTVKKHVRAQEIALQNRLTCIYLVDSGGANLARQADVFPDRDHFGRIFYNQAIMSSKNITQIAVVMGSCTAGGAYLPAMADENIIVRKQGTIFLAGPPLVKAAVGEDVSAEDLGGADLHCRKSGVTDHYALDDIHALHLARKTVRSLNYQKKLDVTIEPSEDPLFPADELYGIVGANLKRTFDVREVIARIVDGSRFNEFKALYGDTLVTGFARIFGYPVGIIGNNGVLFSESAKKGAHFIQLCCQRNIPLLFLQNITGFMVGKDYEAEGIAKDGAKMVAAVACANVPKITVIIGGSYGAGNYGMCGRAYSPRFLYLWPSARVSVMGGEQAANVLATIAKDQKAREGKQFSSADEAALKEPIIKRFEEEGNPYYSSARLWDDGIIDPVDTRLVLGLSISAALNAPIQKTDFGTFRM	264117	188772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10493_pilon_-_189232_192526_192613_195883_195999_202232_202390_205371_205439_207436_207514_211050_211124_214453_214550_214656_214757_219404_219470_235928_236043_244951_245065_246410_246539_251136_251239_256485_256571_261586_261654_263841
778679	contig_1146_pilon	-	1733	7	Intergenic	novelGene_84786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	101.149504310314	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	327	1073	149724	106807	FALSE	20	GAGGAACATTTCTCTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNHSRKTAAFVRACVAYCFITIPSLVGIFTRLNLYLHSGQVALANHCLSQADAFFTAAISLIPEVPKTINIDGKMRPSELFLLEFLCNFFSTLLIVPDHPEHGVLFLVRELLNVIQDYTWEESSDDKIRIYTCVLHLLSAMSQETYLYHVDKVDSNDSLYGGDSKFLAENNKLCETVMVQILEHLKALAKDEHPGPWGPAQQQAEPALRQPVAPGAEARLCGHQNHGENSGIHQEAKQTTRHESLD	150050	106146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_106869_107357_107461_114326_114446_126288_126455_134238_134379_148530_148646_149682
778680	contig_641_pilon	-	1396	13	Intergenic	novelGene_170139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_12	178.266400990827	378	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	126	1295	106083	46058	FALSE	40	AAAAGGAGATGTATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRCAAWQARRAAPGSFGCGFRLRGCTDAKYSKNTSGRTHAMKDKADQKHKPPDVFDFPDDSAISSIDRLGENEQDEEPYEAFAPPLHSTAIYADEEEFSKQCGSSIPSTPQGKEARRSLNTSENEASESVKNHAKELGGKLKPVIDVSESTEKSDVTKDKPAEKRSTQQHEATPAMASSELSGKPAKLVTPKKTGPLNAQSSVENETQATESQQQKIQKKRKMSHGKGKKSRSKDVDSDSDIFDSAFIWCLEGKKTNDIMELGIVLSAFEKTLLEYKQRIESRVCKEAINEFYSIIKEELIKMIKEVQILKNLKRKNAKMISGIKRKRQRLIEVQDELLWLEPQLKQLQTKYDELKERKSSCKNAAYFLSNLKQLHQDYSDVREKDPEAKETYNSSSLPALLLKARGLLGVENHLQNINHQLEKLLGQE	109283	45956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_46172_52807_52965_55159_55222_56600_56649_56889_56969_70624_70740_72947_73018_87159_87397_87882_87938_95922_96029_103545_103664_106074_106124_109198
778681	contig_11316_pilon	+	412	2	Intergenic	novelGene_122698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139878	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139915_140150
778683	contig_14446_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_160713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTTTTTTTTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284815	287138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_+_284800_287100
778684	contig_16503_pilon	+	1624	10	Intergenic	novelGene_162065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	123.137181355181	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	100	897	123420	146861	TRUE	30	ACAACTCAGCCTGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARSDADWGGSRCRWACSAEQKPEPTGSSRTSRMGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPVYEEGCMEKVQAWLQENMGVILGVCVGVAVIELLGILLSICLCRHIHSEDYSKVPKY	92066	147723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145653_146335_146420_146783_146916_147050
778685	contig_12429_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_136216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	84.5	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTTAAAATAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305372	334216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_305453_327891_328041_334090
778686	contig_7079_pilon	-	2130	2	Intergenic	novelGene_129228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379216	307245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_-_309209_379049
778691	SIRV7	-	280	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91646	0	-91640	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTAGCACGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
778695	contig_8259_pilon	-	1387	8	Intergenic	novelGene_148883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	91.2985682879451	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	169	1053	392235	230388	FALSE	30	GTGTTAAAGAATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAHAESPPSVNNLKTEGKNKDEGEVCNREKKAADTSLEPYPEEKKKKRSGFRDRKVMEYENRIRAYSTPDKIFRYFATLKVINEPGESEVFMTPEDFVRSITPNEKQPEHLGLDQYIIKRFDGKKISQEREKFADEGSIFYTLGECGLISFSDYIFLTTVLSTPQRNFEIAFKMFDLNGDGEVDMEEFEQVQSIIRSQTSMGMRHRDRSTTGNTLKSGLCSALTTYFFGPDLKGKLTIKNFLEFQRKLQHDVLKLEFERNDPVDGRITERQFGGMLLAYSGVQSKKLTVMQKQLKKHFKEGKGLTFQEVENFFTFLKNINDVDTALSFYHMAGASLDKGNKTQKFFFLQV	406656	230053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_230535_245398_245537_292588_292787_301983_302067_341829_341945_363021_363066_392075_392239_406491
778697	contig_14744_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_65905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATTAGTAGTACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28961	29688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_29000_29700
778699	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
778700	contig_14618_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_136827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACCTAAACCTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086210	1085271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1085300_1086200
778701	contig_14501_pilon	+	1477	3	Intergenic	novelGene_172028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	89	189	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	39	842	163192	167085	FALSE	15	TCATTAATGTCGGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGSGKADGLGRTLCVLTGASRGFGRALATLLAPLLSPGSVMVLNARNDEALRQLEAELGAGRLGLRVMRAPADLGTEAGLQHLLGTLRELPKPEGLQRLLLINNAATLGDVSKGFVDLADPAEVNSYWALNLTSMLCLTSGILKAFPQSPGLSRTVVNISSICALQPFKGWALYCAGKAARNMMFQVLAAEEPTVRVLSYAPGPLDTDMQQLARETSVDPELRQRLQALKTKGELVDCGMSAQKLLSLLQKDTFKSGAHIDFYDK	163153	167720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_163514_164112_164404_166894
778704	contig_2093_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_152977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACGTACCTCTGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345169	1344446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1344400_1345200
778710	contig_15937_pilon	-	1729	3	Intergenic	novelGene_143142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	21	138	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	165	380	36253	36038	TRUE	25	CTCTTTTGGAAACATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSLSRETQGPKAPTGLNATEAAHRGVGQDSKGSVAPYGGILGASLELFKFTIGMGELDFQEQLRFRGVVVLLLLAYVLLTYILLLNMLIALMSETVNSIATDSWSIWKLQVPPGSHPSPPQEPS	36417	32755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_32967_34679_34760_34979
778711	contig_4908_pilon	+	2097	5	Intergenic	novelGene_117374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	65.1402333431498	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	126	518	53580	60051	FALSE	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGEFRRYQGPRTKKDFINFISEKEWKNIEPVSSWFGPGSILMSSMSALFQLSMWIRTCHNYFIEDLGLPVWGSYTVFALATLLSGLLLGLCMIFVADCLCPSKRRRPQPYPSKKLLPESSQPLKKVEEEQETDEGDVSEEEAESEAGTKSGFSENALRQRSVGPSPRMEES	51357	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_51482_53578_53625_53724_53827_53950_54018_59872
778717	contig_17449_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_173769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGCCCAGCTACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23866	24248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17449_pilon_+_23900_24200
778719	SIRV6	+	332	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	20	-244	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778722	contig_15867_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_170899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACTTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165512	167077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_165500_167100
778723	contig_11294_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_50069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAAGCCCTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330714	328818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_328800_330700
778726	contig_5791_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_35834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGTCAGAAATGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024648	1023197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1023200_1024600
778727	contig_5791_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_35833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGACATACAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023038	1022667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1022700_1023000
778728	contig_12429_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_136223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	94	324	373310	373540	NA	15	TTCTTGTTCTATTAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQDDSLLEKCQVAVEGCIVLKTSLQEETIKGMLYPSCLVKELQFKLFKVAGTMNIVAIVLIFEAVWVLTTSSIKKYVQDCFDTCIYNKKKVGGVDEFLLQAVSACYM	373216	375371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_373200_375400
778730	contig_13718_pilon	+	1624	11	Intergenic	novelGene_142895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_10	125.4658917794	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	259	1176	236419	264799	FALSE	10	CCACGCCCATTTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDYRDLINCCYVSRRLSQLSSHDPLWRRHCKKYWLISEEEKTQKNQCWKSLFIDTYSDVGRYIDHYAAIKKAWDDLKKYLEPRCPRMVLSLKEGAREEDLDAVEAQIGCKLPDDYRCSYRIHNGQKLVVPGLLGSMALSNHYRSEDLLDVDTAAGGFQQRQGLKYCLPLTFCIHTGLSQYIAVEAAEGRNKNEVFYQCPDQMARNPAAIDMFIIGATFTDWFTSYVNNVVSGGFPIIRDQIFRYVHDPECVATTGDITVSVSTSFLPELSSVHPPHYFFTYRIRIEMSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLNVIEK	226388	265247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_226412_230712_230803_236273_236438_252116_252232_253824_254030_255157_255204_256435_256521_257368_257492_262552_262669_263921_264113_264781
778732	contig_11285_pilon	-	951	13	Intergenic	novelGene_5687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	421.801954581636	1	36	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	134	508	796496	795444	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKEDGQSFVSTAWPLVPGVGTAALRTRCGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGMAPGPGFSR	798541	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784135_793893_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795570_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796637_798457
778733	contig_8624_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_112571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCCAATGTGATACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857019	855742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_855700_857000
778736	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	24	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
778739	contig_9656_pilon	-	1458	7	Intergenic	novelGene_121893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	161.43798258843	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	391	1221	97308	81749	FALSE	10	CTGCATTCTTGGTCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPSMFNVLWCSFIVCVFSFQLL	100912	81511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_100608
778740	SIRV2	-	434	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	44	3254	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
778743	contig_12964_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_131668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAAAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185943	183596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_183600_185900
778744	SIRV6	+	255	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	11	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATATGTCTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1844
778746	contig_753_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_112965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1182502	1182784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1182500_1182800
778759	contig_12019_pilon	-	322	3	Intergenic	novelGene_87686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGCCTCCTCTTCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8367	5257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
778760	contig_17796_pilon	+	1956	8	Intergenic	novelGene_33806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	481.78380281311	1	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	116	769	53527	96331	TRUE	30	AGATTTTTGAAATGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPIWVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSW	53411	111191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74658_75549_75729_96325_96509_96831_96882_110231
778763	contig_17106_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_127672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGGTGACTGCCAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86042	86963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_86000_87000
778764	contig_16322_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_87545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	388	912	86481	85957	NA	20	GCTGTGTTTAAAGGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLVSKLLRL	86868	85682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_85700_86900
778768	contig_3233_pilon	+	2436	1	Intergenic	novelGene_56508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCTTGGAAACCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92006	94442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_92000_94400
778776	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778777	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
778784	SIRV4	-	254	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1269	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3889	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
778785	contig_16722_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_118286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	353	679	115995	115669	NA	70	CAAGAAAAAGAAATAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQVRRYFLSFCVQCLTSNFILFFSLEFLVKLKFSD	116347	114891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_114900_116300
778786	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_96246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
778789	contig_6629_pilon	+	1808	3	Intergenic	novelGene_173770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	0.5	120	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATGTACAGGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146501	158512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6629_pilon_+_146791_154554_154669_157107
778794	contig_4924_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_84753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACTGGGGGAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192225	195244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_192200_195200
778797	contig_5552_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_173772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGTGTGGTATAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8704	7545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5552_pilon_-_7500_8700
778803	contig_678_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_167801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAACAGGACAGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56695	57948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_56700_57900
778810	contig_8075_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_42511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAATTAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779660	777460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_777500_779700
778811	contig_9375_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_136070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACGCACACACAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431135	429130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_429100_431100
778815	contig_2537_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_33404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTCTACAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100751	100337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_-_100300_100800
778817	contig_8864_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_136005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727866	728790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_727900_728800
778822	contig_14415_pilon	-	1792	1	Intergenic	novelGene_77603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	582	923	31714	31373	NA	65	AAAAAAAGCCAAATAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSIWGDVHRLHAKTMPFYIRDVSICRFWYPRWLLEPIPCRYRGMTVFRILGPYQIFDLANIFSYSVGCVFTFLIVSFEAQKVLIFMKSIYQDSLLSFGVWCGNKPLPNLRP	32295	30503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_30500_32300
778823	contig_19990_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_30761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGAATCCACCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58818	57419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_57400_58800
778824	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
778826	SIRV6	+	177	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	552	54	552	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10789	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
778829	contig_6677_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_114173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGTGTGTGTTCTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434082	434522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_434100_434500
778830	contig_12123_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_144599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTTAAGTGAAAGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101755	102671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_101800_102700
778833	contig_18184_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_123861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGATATCACTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67846	69898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_67800_69900
778834	SIRV6	+	376	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3110_3165_10724
778836	contig_9434_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_150467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31994	32744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_32000_32700
778842	contig_740_pilon	-	2355	2	Intergenic	novelGene_158940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	262	789	165114	147192	FALSE	45	ACTTTCAAAAAGAAACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILHQKRKGARKKRDQLTCSQISPDQIEVSRQRQSPTSREGAGEKLTCFAVSQEKLDWVHFKKEKILEQSTYLLSLQLYFFAKLFNFHLQFFLLWQIFNVKGRHFALRNGPSESWGTRGAASTANHSPSRNNRAAFHPSRPAAQDVTTAQHSDPGVPEGSSFLPHVCLRQPLPES	165375	145625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_147657_165051
778843	contig_10982_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_87886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATTAATCAGTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171625	172004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_171600_172000
778844	contig_10982_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_87887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCTCCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172008	173923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_172000_173900
778845	contig_1516_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_49942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGGTGTGGTCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217766	218755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_217800_218800
778847	contig_10446_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_162519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGTATAGAAGAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212057	1212923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1212100_1212900
778850	contig_4803_pilon	+	1459	2	Intergenic	novelGene_150737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCAACTGAATGCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109750	170147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_111162_170099
778851	contig_17427_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_30264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCTCTCTCTTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4139	4836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_4100_4800
778853	SIRV6	-	387	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8967	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10787	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1542_1647_1735_2779_2828_3105_3164_10723
778854	contig_8691_pilon	+	1873	8	Intergenic	novelGene_72690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.097212193853	44	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	601	963	119037	144073	FALSE	40	TATGACAAGGATTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNITIDSFSGCLKASTHQGSIDVHVSQLGEVDLKSHKGSIIVKVPSSLQTHLQLSGKEVDVNSEVHVQEIAEAHKDDGVTITGIMNEAGKHEKWIKADAPKGTVSFRSQSWFQSLQLQD	91920	144983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_92156_97002_97113_103833_103927_104849_104989_119013_119056_128309_128406_131745_131881_143960
778859	contig_19973_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_173773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATAAAATTTTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5858	4739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19973_pilon_-_4700_5900
778862	contig_4783_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_108409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379242	376932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_376900_379200
778864	contig_9186_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_85367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	103	528	638883	638458	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	638985	637794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_637800_639000
778868	contig_149_pilon	-	2868	1	Intergenic	novelGene_173783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55718	52850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_52800_55700
778876	contig_12079_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_67379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGCTTAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377010	375229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_375200_377000
778877	contig_7035_pilon	-	1137	12	Intergenic	novelGene_83536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_6	16.1608648815281	213	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	67	945	753102	749349	FALSE	15	GTCTGGCTGATATGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPAMTKLPDYKPYPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP	753168	749156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_749436_749539_749621_749707_749769_750271_750342_750522_750620_750782_750858_750971_751068_751779_751837_751938_752000_752138_752207_752296_752386_753065
778878	contig_17066_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_130946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATGAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102668	104726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_102700_104700
778879	contig_17074_pilon	-	1790	9	Intergenic	novelGene_145144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	116.765791223286	6	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	58	1077	260251	246351	TRUE	15	AGGCTGCCGTGAGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFETYLRRMMKRFTKEVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNRICSQPDLRAIALSIIPTRFTKVPQRDVDVCYLSNLVKWFIGTFTVNADLSYNEQDGLQTTLERRFAIYSARDDEELVHIFLLILRALDLLTRLVMSLQPIPLKLSAAKGKKPSKQRSIEGPGSSSETPSHVPENHTKPKASKGTKQEETFSKDTGNPGAKGKRGKAATGRKKQRAPSSSEETGKGEEQQENQRKRRGRERHMTSRVSYKEESGSDKANSDSDFELSSGEAHSPSDEDSDPDFLRQKRAPAPKRTKAGSKSDSQTSRQSCPNPAASSSSSSNKRVSDKTPGPAFAHCHWHI	261854	239116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_239212_239419_239930_246242_246404_247971_248498_249342_249433_257668_257790_258271_258430_260179_260265_261810
778880	contig_6871_pilon	+	1088	2	Intergenic	novelGene_21678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961280	962716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_962094_962441
778881	contig_10042_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_79184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCTCTCCATAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833292	832826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_832800_833300
778882	contig_6593_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_49858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGTCATTTCTTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267335	1268659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1267300_1268700
778885	contig_5845_pilon	-	1754	17	Intergenic	novelGene_98885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_16	13.9293698260187	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1689	64	1752	125542	20809	FALSE	15	GTAACCAGCTTCCGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYILVTGGVISGIGKGIIASSIGTILKSCGLRVTAIKIDPYINIDAGTFSPYEHGEVFVLNDGGEVDLDLGNYERFLDINLYRDNNITTGKIYHHVINKERRGDYLGKTVQVVPHITDAVQEWVMNQAVVPVDGTKEEPQICVIELGGTIGDIEGMPYVEAFRQFQFKAKRENFCNIHVSLVPQPSATGEQKTKPTQNSVRALRGLGLSPDLIICRSSTPIEMAVKEKISMFCHVKPEQVICIHDVPSTYRVPVLLGEQGIVKYFKERLDLPVTDSASNLLFKWRNMADRYERLQKTCSIALVGKYTKLRDCYASVFKALEHSALAINHKLNLMYIDSVDLEQATESEDPVKFHEAWQKICKADGILVPGGFGIRGTLGKLQAISWARTKKVPFLGVCLGMQLAVIEFARNCLNWKDADSTEFDPNTPIPLVIDMPEHNTGNLGGTMRLGIRRTVFKTENSILRKLYGDVSFIEERHRHRYEVNPNLINQFEHSDLHFVAQDVDGERMEMIELANHPYFVGVQFHPEFSSRPMKPSPPYLGLLLAATGNLNGYVQQGCKLSS	128703	20806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_-_20952_34540_34638_35147_35204_46593_46691_76424_76469_76562_76626_79554_79650_80988_81078_92390_92524_96475_96628_105649_105731_106869_106954_107101_107219_116002_116104_118173_118345_125376_125582_128679
778886	contig_7749_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_170871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAAGCCAGATCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32112	30014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_30000_32100
778887	contig_3975_pilon	-	1763	4	Intergenic	novelGene_54722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.8978113919839	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	678	914	1602734	1600010	TRUE	35	GTGTTTACAAATCTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSGTSLLPKDNARFSWSSLDEDGLDDSLLELSDGEEDDGHFSFTEEEIQELLKDDDLSNEHFSWRGGLLKDDSRHVEKGERESQIPLDALQEKNSLYSLGPVAETPGLFRLPQLSTSIGHGPTATKPLNRHFALEKNVIKITVVAPFDPTVYDAVLDKDKTDSSKDIKKPSSVGEELRENGLNPNESKLCTESEGISPTNSAWDGNTFPSPSNNNFQETVSDKNMPDCKKPTPVFSQVLDHSKSSSNIGSSWRNGGSHKSSCEVRFPVSSKQDVLDKDSGKMKVHERRLGKVIPVLQTKTRD	1603411	1559900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1560652_1599911_1600017_1601762_1601852_1602593
778888	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
778890	contig_3942_pilon	-	972	7	Intergenic	novelGene_128623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	119.859640135174	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	72	644	157401	154974	TRUE	20	AGAGCACCGTCTGGTCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFPPATARLRNQPGSALARQAAFMAPPSEETPLISQRSCSLSSSEAGALHVLLPPRGPGPPQRLSFSFGDHSAEELCVRAAKASGILPVYHSLFALATEDLSCWFPPSHVFSVEDAGTQVLVYRLRFYFPNWFGLEKCHRFGLRKDLASAILDLPVLEHLFAQHRSDLVSGHLSLGLSLKEQGECLSLAVLDLTRIAQEQAQRPEKLLKKVRA	160712	153637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_153715_154722_154981_155375_155522_155967_156080_156420_156545_157217_157415_160654
778893	contig_8453_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_125132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	176	334	222407	222565	NA	65	AGAGCAAAGAAAAAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THTHTHRHTDRQTHTDTHTDTHRHRHRHRHRHTDTQTHRHTDTQTHRHTDTHTHTHTHMGARLLTKRPAVQIHQPLLRNPLGQFYSVQQGRSKLELTSQQQSFCFVIMYI	222231	222953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_222200_223000
778894	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
778895	contig_10857_pilon	+	721	6	Intergenic	novelGene_160897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1435.50520723542	968	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	276	395	61421	66572	FALSE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSCKDIVAGDMSKRSL	58780	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61916_66565
778896	contig_6048_pilon	-	2581	19	Intergenic	novelGene_73097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_17	26.4449112937316	167	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	68	2299	199675	192311	FALSE	40	CCACAATAAAGGAGGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSSRAAQTGVGLCVLSCPLPAMASWSPGPRLLLLLLLLLLLPPPPPAASASDRPRGSDRVNPERLLVITVATAETEGYRRFLRSAEFFNYTVRTLGLGREWRGGDVARTVGGGQKVRWLRKEMEKYADQEDMVIMFVDSYDVILAGNPSELLKKFVQSGSRLLFSAESFCWPDWGLAEQYPEVGTGKRFLNSGGFIGFAPTIHQIVRQWKYKDDDDDQLFYTHLYLDPGLREKLRLNLDHKSRIFQNLNGALDEVVLKFDRNRVRIRNVAYDTLPVVIHGNGPTKLQLNYLGNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPGGQPPPRVLLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPPDRVTLFLHNSEVYHEPHMADAWPQLQDHFSAVKLVGPEEALTPGEARDMAMESCRQDPDCEFYFSLDADAVITNQQTLRILIEENRKVIAPMLSRHGKLWSNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIRGETLRTELPQREVFSSSETDPDMAFCKSLRDKGIFLHLSNQHEFGRLLATSRYDTDHLHPDLWQIFDNPLDWKEQYIHENYSRALEGKGIVEQPCPDVYWFPLLSDQMCDELVEEMEHYGQWSGGRHEDSRLAGGYENVPTVDIHMKQVGYEDQWLQLLRTYVGPMTERLFPGYHTKTRAVMNFVVRYRPDEQPSLRPHHDSSTFTLNVALNHKGLDYEGGGCRFLRYDCVVSSPRKGWGLLHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIMVSFVDP	199742	192028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_192467_192798_192925_193221_193369_194138_194244_194770_194840_195034_195149_195255_195398_195672_195799_195921_196027_196348_196471_196662_196789_196945_197048_197258_197357_198020_198085_198255_198369_198510_198675_198768_198906_199060_199153_199551
778904	contig_4232_pilon	+	1071	10	Intergenic	novelGene_63171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36.4176730939835	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	395	1018	119086	121286	FALSE	20	GACTGATTCTTACTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSLVDNIQQHFLLSDRLARDYAAIVFFANNRFETGKKKLQYLSFGDFAFCAELMIQNWTLGAVDSQVDDMDVDLDKEFLQDLKELKVLVADKDLLDLHKSLVCTALRGKLGVFSEMEANFKNLSRGLVNVAAKLTHNKDVRDLFVDLVEKFVEPCRSDHWPLSDVRLFLNQYSASVHSLDGFRYQALWDRYMGTLRGCLLRLYHD	117104	121339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_117268_117470_117536_117881_118009_119046_119148_119630_119765_120102_120212_120280_120345_120603_120691_120778_120877_121216
778908	contig_12566_pilon	-	1454	5	Intergenic	novelGene_85995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	9.28372231381357	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	44	604	41431	34250	FALSE	45	CCAAATGAAAACCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGPAAGDTGISALMASPSKAVIVPGNGGGDVATHGWYGWVKRRLEQIPGFQCLAKNMPDPITAQESIWLPFMEAELHCDEKTIIIGHSSGAIAAMRYAETHQVYAIVLVSAYTSDLGDENERASGYFNRPWQWEKIKANCPHIVQFGSTDDPFLPWKEQQEVADKLQAKLYKFTDRGHFQNTEFHELISVVKSMLKVPA	41474	33399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_34477_35904_35991_39245_39352_40105_40149_41332
778911	contig_6557_pilon	+	713	5	Intergenic	novelGene_32981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5994.33321458692	31144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434245	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435306_436096_436290_436630_436772_439911
778912	contig_11594_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_80889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82703	84230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_82700_84200
778917	contig_5020_pilon	+	716	5	Intergenic	novelGene_27901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1025.22217104392	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	217	657	122915	126023	FALSE	0	CCTTGGTGTCTCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQLTTSGNGVSPARPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	119481	126082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123288_125790_125827_125879
778918	contig_6795_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_27780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTATTTAAGCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537011	534869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_534900_537000
778919	contig_10135_pilon	-	2146	9	Intergenic	novelGene_106619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	42.3106074170532	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	453	1643	88066	84292	FALSE	5	ATCTCTGTTCTTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRADKGNEENPHRFDLLVRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGLRTPSGPRYPPGSSQAFRQEMLQRRPPARPGPPPTANHTAPHGSH	89568	83788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85945_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_88681_88862_89057_89502
778922	contig_19098_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_65815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	6	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	151	504	345322	358186	FALSE	25	CCAGTGTGATGGTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHTGGVVPRGKRDLETPLLAQSCLEKLIFPGILAPASWRENGRRPCPWVAMNSAVTSCESPKLLESDDGVLDSHPDGQVRKKNGQPGTSSHLVYGIMDIPPWYLCIFLGIQHFLTALGGLVAVPLILAKNLCLQHDPLSQSYLISTILFVSGICTLLQVFFGVRWVK	345171	358485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_345364_355805_355947_358015
778925	contig_6192_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_170332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGCCGATAATAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135678	133802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_133800_135700
778930	contig_12626_pilon	+	2111	2	Intergenic	novelGene_80447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	840	junction_1	0	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTATGGAGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156731	159191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_157111_157459
778931	contig_13593_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_156121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAATGTATGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56588	56202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_56200_56600
778932	contig_12520_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_161056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTTTAACAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330502	328632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_328600_330500
778935	contig_4604_pilon	+	1234	3	Intergenic	novelGene_19178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1149	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCAGGGGGTGTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374903	380913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_374928_377355_377523_379870
778936	contig_12050_pilon	-	1807	7	Intergenic	novelGene_62684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_6	137.256046213718	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	207	725	486455	471181	TRUE	55	GGAACATAGTGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDELNFDLDRGRVSGGRPGRGGRRGR	511544	467333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_467670_470434_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
778944	SIRV5	+	350	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	169	149	55	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8370	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
778949	contig_2069_pilon	-	1756	3	Intergenic	novelGene_23209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_2	49	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	79	1596	111889	102624	FALSE	25	AGGTTGGTATGAGTATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEDLIAQFSLPCEVKVVAKDTSHPDDPLTSFLGLRLEEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	111967	102463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_103694_109097_109509_111852
778954	contig_17427_pilon	+	2167	8	Intergenic	novelGene_30407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	158.686316167386	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	925	1905	356572	367940	FALSE	25	AAGATCCTCTTTGGTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPSVPPVYGLEVSDVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGRKPAATPIKMPCNETENKRSYHVCDLCDRIIIGDREWAAHTKSKSHLYQLKKRRRLDSDAVTTLGSQSISPERDKELKEKGSSGRNDQELKSSI	355647	368202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365288_367770
778957	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
778961	contig_12139_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_146468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTATACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97288	95101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_95100_97300
778963	contig_7963_pilon	+	1064	5	Intergenic	novelGene_58502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	192.811274307287	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	72	773	145917	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVWGSGSAGLVAPSPLSGVKIWIMSRTRELRCYSCYNFYGYCPTPGPPLKPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWVPQNALPSDLLENVLCGIAFGLGVLGIIVGTVLIIYYQKPCSD	145845	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_148059_148271_148907_149187_149419_149546_149948
778964	contig_12970_pilon	+	2219	1	Intergenic	novelGene_50543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTGTGAGGAAGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475182	477401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_475200_477400
778965	contig_10940_pilon	+	1715	6	Intergenic	novelGene_49187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.7346277707115	108	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	18	1043	253697	278102	FALSE	10	CAGTGTGGTGGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGFRPGLTARQAQTLKLVEGPHVREMDGVLKSMLSEWFSSGFLNLERVTWHSPCEVLQKISESEAVHPVKNWMDIKRRVGPYRRCYFFSHCSTPEEPLVVLHVALTNDITSNIQAIVKECPPSETEDKNKIVAAIFYSISLTQQGLQGVELGTFLIKRVIKELQKEFPDLGTFSSLSPVPGFTKWLLGLLSSQKDHGRSQLFTDSESKEISEIIGGPINETLKVFLSSHEWVKSEKLVRMLRVPLMRLCAWYLYGEKHRGYALNPVANFHLQNGAVMWRINWMADVSLRGITGSCGLMVNYRYYLEERATHSTAYLGSKYIKASEQVLSLVSQFQKNSKL	253679	278774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_253731_254198_254240_265323_265437_266666_266824_268797_268948_277571
778969	SIRV6	+	199	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	506	3	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAGTCGAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
778979	contig_9161_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_160652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTATTTTAGTAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111156	112593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_111200_112600
778980	SIRV6	+	277	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10720_10819_11031_11109_11205
778981	contig_12761_pilon	-	1900	8	Intergenic	novelGene_164048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	6.93703459553085	163	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	73	1389	105116	85909	FALSE	10	GAACTTGTGTGTGCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANGTEATASGHMTAEEPVQQPSVVDRVANMPLISSTCDMVSAAYASTKENYPHIKSVCDVAEKGVKTLTAAAVSGAQPILSKLEPQLASASEYAHKGLDKLEENLPILQKPPEKVLADTKELISSTMSGAREMVSNTVSNAKDTVATRVTEAVDVTRGTVQSSVDMTKSVVTSGVHSVMESRMGQMVLSGVDTVLGRSEEWVDNHLPMTDEELAHIATSLEGFDMASVQQQRQEQSYFVRLGSLSSRLRQHAYQHSLSKLQHTRQRAQDALLQLSQALSLMETVKQGVDQKLVEGQEKLHQMWLSWNQKKLKETEKDPAKPEQVESQALTMFRDITQQLQATCASLASSLQGLPTNVKDKAQQARRQVEDLQATFSGIHSFQDLSSTILTQSRERVTKARDALDEMVEYVAQNTPIMWLVGPFTPGITEKAPEEKK	109897	85397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_86254_90615_90742_91377_91578_96130_96429_103898_103982_104152_104352_105050_105134_109842
778984	contig_1107_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_126525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	759	1142	25086	24703	NA	55	TTAAAAACAAATAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIQAGGQSDRQVGGQADLFLRNWPTQLLELAGPKSASQSTGWKFWQSCVPKSKVHSIAWRFYQSCVSKSIGIRMWGSDWNSGKTSICSLEAEYSLRKSPFFLLKPSTDWMRPIHIMEGNPLYFKAK	25844	24445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_24400_25800
778989	SIRV4	-	245	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1278	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3880	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
778990	contig_5145_pilon	+	1083	5	Intergenic	novelGene_131376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	74.2878691308346	100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAGTTGCTAGAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544007	554653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_544058_544138_544181_544683_544740_550233_550325_553809
778993	contig_4301_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_65100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGCCACATTTATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493415	494296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_493400_494300
778997	contig_11816_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_98608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGACTAATCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488166	1487754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1487800_1488200
778998	contig_11816_pilon	-	1434	2	Intergenic	novelGene_98604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGAGCTTAGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487215	1470159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1471325_1486946
779000	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	54	523	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779001	contig_10431_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_117410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTTCACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262487	260451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_260500_262500
779006	contig_11989_pilon	+	1878	9	Intergenic	novelGene_68449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGTAAAAAATAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58243	91076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_59412_65758_65881_65998_66112_71209_71369_74968_75075_76359_76451_80408_80447_90225_90278_91047
779013	contig_12078_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_74115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406461	404064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_404100_406500
779014	SIRV6	+	345	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
779015	contig_11115_pilon	+	1029	5	Intergenic	novelGene_102845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	521.983416882184	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3	515	165653	172730	TRUE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPARSQD	165650	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171223_172714_172964_173047
779016	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4582	35	3407	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
779019	SIRV6	+	238	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8472	-1	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
779023	contig_5794_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_69742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAGCTTTTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469121	467544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_467500_469100
779024	contig_6710_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_98303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAGAGCTTCATCAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
779029	contig_776_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_139924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCAATGTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823521	823322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_823300_823500
779030	contig_12638_pilon	-	1672	10	Intergenic	novelGene_33350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_9	250.519460321948	114	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	173	1138	1434492	1393562	FALSE	20	GCCATTGAGTTGATTCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPG	1463568	1393027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1458588_1458666_1463494
779031	contig_11908_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_133240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTTGGTTTATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747063	745208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_745200_747100
779032	contig_15039_pilon	+	1488	2	Intergenic	novelGene_110186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCCAAACCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360902	415830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_361143_414582
779037	contig_6270_pilon	+	1362	7	Intergenic	novelGene_99815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	169.65913539277	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	607	951	39429	45668	TRUE	25	ATTACAATTGCTGGGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	36492	47669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45591_45713_47302
779042	contig_20657_pilon	-	1240	4	Intergenic	novelGene_173786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.23609564462324	75	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAATTGTCTACCCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4748	465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20657_pilon_-_1552_1761_1789_2370_2476_4726
779047	contig_5812_pilon	-	1063	5	Intergenic	novelGene_167498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.41869858279434	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	26	676	224479	203013	FALSE	35	CAGATTTTGGAGTCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRCRARRMHAGFLGFSALLLAAEQSARLCTMVYYFMTGQLLWASLAFSVLLPGFLVQGLSYLWFRADGHQGHCSLVIVHLLQLGVWKRHWDTASAALSKKWEAPCLGQLLLQEADLSALRLLEALLQTGPYLLLQTYVFLASDFTDIVPGVSALLSWSSLSWALVSYARFMGFLKPGHLSMPWAALFCQQLWRMGMLGTRVLSLVLFYKAYNVWVLVVGEHLQ	224504	202625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_203027_203802_204013_206091_206277_221588_221773_224421
779049	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	102	0	-85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
779050	contig_8452_pilon	-	914	5	Intergenic	novelGene_48090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	1159.54374108957	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	166	609	981839	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGNIQHSGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	982004	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_981811
779052	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_95432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779053	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	0	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779055	contig_15384_pilon	-	2540	21	Intergenic	novelGene_85144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_20	56.3385081449624	2	123	16	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	828	2381	125860	118939	FALSE	10	AGCCTGGTTCTCGTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRRSALYYVDLIEGKCELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMYDWYTKVTSVVVDIVPRQLGEDFSGIYCSLLPLGCWSADSQRVVFDSAHRSRQDLFAVDTQTGSVTSLTSGEPAGSWKLLTIDLDLMVAQFSTPSQPPSLKVGFLPSAGKEKSVFWVPLEEADPIPDIQWDIRVLQPPPEQENVQYAGLDFEAILLQPSNPPDKTQVPMVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLVNYRGSTGFGQDSILSLPGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	127964	118779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124095_124157_124747_124870_125455_125497_125573_125666_125761_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
779058	contig_5549_pilon	-	1596	4	Intergenic	novelGene_81656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	373	junction_1	211.884140248601	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACATCAGTGGGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444433	442026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442315_442504_442535_442879_443683_443958
779059	contig_13740_pilon	-	1939	13	Intergenic	novelGene_34760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_2	224.401843798129	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	144	1226	873748	687607	TRUE	35	TTACTGATAGGCAAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873891	686513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
779061	contig_5549_pilon	+	731	5	Intergenic	novelGene_81564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	92	730	82155	96713	FALSE	30	GCAAGAAGTACCTCCGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGDRRFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPS	82063	96714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
779065	SIRV4	-	378	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	16	223	16	-223	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTACGGCGGACAACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5142	3860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
779069	contig_12638_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_33138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAATCAAAAAAAATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184144	183625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_183600_184100
779070	contig_6710_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_98315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCCTGCGAGGTCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657827	653634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
779074	contig_8674_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_102915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGTCTTTGGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199320	197277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_197300_199300
779083	contig_16666_pilon	-	1205	4	Intergenic	novelGene_61751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	409.650528567407	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	23	331	59591	55974	FALSE	10	TCATACCTTGTCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWGCVWPDGRVVTTPKLQTTILEAKALITGFFRSIAATGVMMAKPQEQLMPFSVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59613	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56671_58116_58264_59582
779085	contig_13457_pilon	+	1236	8	Intergenic	novelGene_118354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	68.9977816857254	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	400	1068	68182	71127	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDYCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVIPLPSPLILPFLTSHTLLPGG	67347	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68886_70314_70416_70761
779086	contig_19778_pilon	+	1316	6	Intergenic	novelGene_143750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	404.016633320956	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	352	369	12576	12593	TRUE	25	TTCACATACATCATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEGDAVSVAGICCPPRAQVLRQHFPGVHVSRLPGRNMWNYT	5642	18627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920_16025_18154
779087	contig_9752_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_122045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	948	1283	224394	224059	NA	40	TAATCAAGAAAGTAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVTKQSFQHTDWKTDLKCNEFFVRRILLLTPVTRICKTKSECNAGSQVQKYQFYLCPECCYQAIAVLHSLGVPHSFSNSHRQDSPVNKRTPAHSLLQLLIDHLSIQRSQS	225341	222852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_222900_225300
779088	contig_10575_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_141824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCTTAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746399	747231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_746400_747200
779091	contig_14405_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_85650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTAAGTAACCCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488249	489387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_488200_489400
779092	contig_4924_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_84711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTATGCTGAGTGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85336	84444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_84400_85300
779094	contig_9415_pilon	+	2851	14	Intergenic	novelGene_109868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1140	1466	2031430	2032239	TRUE	5	GCCTGTCACTGTTTCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPILNGPLHVLLSIGECEWDTIPTRDYGNHFAIRALANKRIKRNHLMETLLGNATVFNVKNAVEGLHVEQVHLLQVLQAERDAAQLLPHERGQVEVQRLLCADGNPH	2026548	2049454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2027368_2029895_2030198_2031411_2031568_2032050_2032302_2033086_2033168_2033973_2034138_2034385_2034558_2035746_2035913_2037806_2037948_2044478_2044649_2046276_2046382_2047129_2047247_2048592_2048753_2049407
779100	contig_15221_pilon	+	1540	2	Intergenic	novelGene_133077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	64	396	181110	181442	TRUE	45	AAGGATACATTTAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKARNDGPIPGTDNSSTSTILLPPVPRELYSRHRVSAEWVWAAFPMQKLRSQRVSEYKLKLSDPSYSTAHSTPCVLRSLSCRYRHPCTNGDMTDRAKQFLNSHVKSFS	181046	190693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_+_182418_190524
779103	contig_8651_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_168172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150412	152032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_150400_152000
779104	contig_11269_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_145813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAAAAAGCCCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278727	278500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_278500_278700
779106	scaffold_12124_pilon	+	552	6	Intergenic	novelGene_22313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3813.88141399284	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACGCCATTGGTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473616	1508441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490337_1490409_1491906_1491914_1508097
779116	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779118	contig_5019_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_109220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGCCCAGCCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322256	321061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_321100_322300
779120	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	65	508	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779121	contig_5350_pilon	+	1185	8	Intergenic	novelGene_99335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	58.838415883447	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	371	802	222805	225433	FALSE	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILVNSVSNSQPLWLRSRNGKASIPLSSLMFLIWDPIRMLPASDSWSSEIFGLPQKSVMYLKLLKYWKATVFRPMLPKRT	142173	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_208153_208204_220460_220530_222758_222931_223349_223423_224707_224826_225318
779122	contig_14744_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_66098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATTCTTAATGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449818	1451544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1449800_1451500
779123	contig_5083_pilon	-	2532	1	Intergenic	novelGene_151684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658757	656225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_656200_658800
779125	contig_10120_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_171757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTACAATTGGACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250545	251508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10120_pilon_+_250500_251500
779126	contig_10120_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_171758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATTACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251508	252414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10120_pilon_+_251500_252400
779128	contig_6102_pilon	+	2674	9	Intergenic	novelGene_32398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	19.9244667431778	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	200	1033	1785570	1792252	FALSE	35	TCCTTAACAGAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAPPATVSPATAGPGQGFGFASKTKKKHFVQQKVKVFRAADPLVGVFLWGVAHSINELSQVPPPVMLLPDDFKASSKIKVNNHLFHRENLPSHFKFKEYCPQVFRNLRDRFGIDDQDYLVSLTRSPPSESEGSDGRFLISYDRTLVIKEVSSEDIADMHSNLSNYHQYIVKCHGNTLLPQFLGMYRVSVDNEDCYMLVMRNMFSHRLPVHRKYDLKGSLVSREASDKEKVKELPTLKDMDFLNKNQKVYIGEEEKKVFLEKLKRDVEFLVQLKIMDYSLLLGIHWILLPTSLPKRLPDSMVTAALCSRWWGSERLGGIGDILANTSSLPPLLNLGCTLLPSK	1782779	1793893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1782946_1785536_1785635_1786298_1786396_1786744_1786889_1789812_1789960_1790138_1790178_1790750_1790865_1791251_1791302_1792074
779129	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
779133	contig_934_pilon	-	981	3	Intergenic	novelGene_129017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	592	junction_2	89.5	46	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAAAGCAGTGTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151454	147854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153
779134	contig_4364_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_2695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532953	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
779142	SIRV1	-	223	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3873	8	3599	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6767	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
779143	contig_6710_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_90014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653802	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
779144	contig_5041_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_27009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167259	169548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_167300_169500
779146	contig_10756_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_170659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAATAAGTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21660	23881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_21700_23900
779148	SIRV6	+	278	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	171	-244	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
779150	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779152	contig_14822_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_145434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGCTTTCTAAAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283027	282061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_282100_283000
779153	contig_14682_pilon	-	1178	4	Intergenic	novelGene_139115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_3	104.540263375728	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1161	16	1176	137270	95702	FALSE	45	TCAAAGAATACATTGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGVSCEDVAFLPVLKFQVWLFRNKDLI	137285	95699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_96558_119740_119809_122397_122532_137167
779154	contig_5039_pilon	-	1579	4	Intergenic	novelGene_64910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	22.4251842554055	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTGTCTCTGGTCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834609	821218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_822533_829290_829391_833802_833898_834539
779155	contig_16122_pilon	-	1771	9	Intergenic	novelGene_134552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_7	38.9382524004352	63	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	995	1558	282755	280796	FALSE	5	GTGCTTGGCATGTGCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVQGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGRYTSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTRDFVEKGGRLPCPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSIICQELQSIRKRHQ	285908	280582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_281504_282123_282282_282524_282649_282739_283302_284184_284239_284662_284786_285120_285331_285847
779156	contig_7904_pilon	-	724	4	Intergenic	novelGene_160015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_1	47.6724938163158	1064	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	27	500	79390	77550	FALSE	15	TGCTTGTGAGTGAGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAQGSDQLMATCSCTMHLCVVLAWALWVSRSHSAPMKITTASLHENHTAICAEIQKELLADNSTYNGSFDRPQNTSEEVCYGKFTKNFISTLKNMSELNKKDCHINKVYKDMKELTTICTKLKPTELPKNCTIERSSFSQFKKALQSVVISIEGWKSCNTIKGSL	79416	77325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_77679_78494_78633_79107_79141_79216
779159	contig_11396_pilon	-	2165	3	Intergenic	novelGene_71374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	0.5	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1108	1740	1043364	1042235	FALSE	40	GCACAGAATATATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLYLGFLLVFLAVKIFSFSEGFKEAAEKFRMESGVEPSVDLETLDERIKIREMVLKGRIQEAIARINSLHPELLDTNRYLYFHLQQQHLIELIRQRETEAALEFAQTQLAEQGEESRECLTEMERTLALLAFDSPEESPFGDLLNTMQRQKVWSEVNQAVLDYENRESTPKLAKLLKLLLWAQNELDQKKVKYPKMTDLSKGVIEEPK	1044471	1041809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1042409_1042609_1042808_1043103
779160	contig_8375_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_141279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATCTGTGCAATGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64652	65679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_64700_65700
779161	contig_12353_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_165768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73491	71862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_71900_73500
779164	contig_10477_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_112493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATTGGGAAGGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281669	283992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_281700_284000
779167	contig_5815_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_141197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCACATTTTCCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236620	234364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_234400_236600
779169	contig_10689_pilon	+	898	4	Intergenic	novelGene_118631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	62	580	57608	61101	FALSE	30	CTTAATGATAATTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51300	61419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
779171	contig_6710_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_89275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653733	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
779172	contig_2364_pilon	-	736	7	Intergenic	novelGene_170821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	6	junction_5	88.5625955656977	639	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	11	373	36980	33731	TRUE	25	GTAAGTTAGTAGTTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSMAATWPAGTAAPEALVAQLLGVLWFVSVTTGPLGAAATTAVGGEETLKCEDLKVGQYICKDPKINDATQEPVNCTNYTAHVQSFISCFWKTGNRINTNKEESAFKCSQVSTIHMRDNGNL	36990	7133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_-_7208_17104_17197_20726_20836_24370_24442_33713_33853_35076_35147_36809
779176	SIRV6	+	224	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	54	505	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779181	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_89578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653772	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
779183	contig_15039_pilon	-	1674	1	Intergenic	novelGene_110160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGGTAAAGAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246111	244437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_244400_246100
779186	contig_12019_pilon	+	2443	5	Intergenic	novelGene_87777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	43.6606229914325	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	321	962	723054	726110	TRUE	25	CCACTAGGGGGAACCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDGASGGSLNMECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRRTIRMKLEYEKCERSCKIQKKNRNKCQYCRFQKCLALGMSHNAIRFGRMPEAEKRKLVAGLTASEGSRHNSQVADLKAFSKHIYNAYLKNFNMTKKKARGILTGKASHMAVSVTARLCSTPGSGPRCLLPASWENQASSLPSLPGTGRGCGKRMGVGGRRGLASNRAWVFSPL	722733	728403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_723162_723984_724124_725715_726552_727323_727499_727538
779195	contig_6710_pilon	-	444	2	Intergenic	novelGene_98188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
779196	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
779198	contig_6710_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_94792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653715	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
779200	contig_12032_pilon	-	1891	10	Intergenic	novelGene_139272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	130.874928514136	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	524	1360	117404	96979	FALSE	25	GATAACTTGGCAGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPSQNVEAESVQYAVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKEVEEAQAEKRCSERAPHGVPATVTPPHPILSYSLSFQPSLSSRNYWW	122509	96447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97116_98342_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110414_110485_110531_117401_117697_122278
779201	contig_11285_pilon	+	2062	11	Intergenic	novelGene_5547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	820	1266	742690	744172	TRUE	10	GTCCCCGGCCCAGCACCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLQLCSHQLQGADHSHVTAGQSTSHHGCVEVRGQGSATQEGLELVVGGKVDGSGWHGHHPQGGWEATPQGLGTLVPHDLHKGIHGASEAGGILKPGGTADTIWAQVQGLQNTIAVQEALPCGLETGWQFGVGNTPESGGRRQFTGH	741220	745237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_741655_741736_741814_741889_741973_742185_742299_742577_742745_742929_743061_743217_743286_743608_743744_743995_744041_744159_744218_744486
779202	contig_3147_pilon	+	2488	2	Intergenic	novelGene_142280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	80	370	178529	182446	FALSE	10	TGTCCAAGTGTCCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQLGRAVQLLHQRGVRVRVVTDCDYMALNGSQIGLLRKAGIQVRHDQDLGYMHHKFAIVDKKVLITGSLNWTTQAIQNNRENVLIMEDEEYVKLFLEEFERIWEEFNPAKYTFFPQEKKTQ	178449	184564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_178572_182198
779204	contig_11378_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_112287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAGCCAAAAGCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516197	516857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_516200_516900
779205	contig_11378_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_112288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTAAGCTTGTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517964	518333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_518000_518300
779206	contig_15720_pilon	-	1786	4	Intergenic	novelGene_41863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52.1301789327023	80	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1244	1546	260343	260041	FALSE	25	TCAAATTCTCTTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	262865	259800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_260733_261064_261341_261661_261826_262451
779207	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
779212	contig_14341_pilon	+	591	6	Intergenic	novelGene_111843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2344.85985935194	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	157	540	548837	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548839_550065_550151_550355_550485_551481_551581_551668
779214	contig_3942_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_128884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.3367343397905	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTGTCTTTGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531866	1537808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534808_1534913_1535409_1535495_1535938
779215	contig_6958_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_69917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTACGAGCTCCCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123805	124769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_123800_124800
779217	contig_6589_pilon	-	761	8	Intergenic	novelGene_25899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	186.139622820273	32	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	176	742	1178015	1158505	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDETPCSQLGHPCLGPSHPALRPPDPHLLSSPVSQVQPQTIPRSP	1178515	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158633_1160537_1160581_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177966_1178100_1178424
779223	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_92573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779224	contig_5880_pilon	+	2423	11	Intergenic	novelGene_151122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	991	1425	167864	181802	TRUE	35	GGAGGGGGAGGAAAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTLCLRVARIESQARTAQSPSFSRMWSEPVPKLSSPQRDSLLASIKFPKNFQPVGVSYKEIFVALATRSRAPLVGMLRAKPRTPVCWKYGMLKMLAAMTATESEGFTKNPCLPRIMFRSPSPSKAAPKSCSPVFMVSTRSAA	157268	224648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_+_157893_161109_161246_164536_164719_167815_167958_177262_177375_180300_180456_181728_181925_184513_184640_186268_186413_187132_187297_224206
779230	contig_7695_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_41677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGATATCCCTGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024577	1024108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1024100_1024600
779231	contig_6589_pilon	-	1749	13	Intergenic	novelGene_26251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	57.1942960442735	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	96	1118	2233261	2228934	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPVRPAFRWEGSHVGMDWGLIFPVWPPRGLSPPRGLSASLSLAPF	2233752	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233270_2233665
779234	contig_8693_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_150884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1857	2189	1189484	1189816	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQCRTAPQSFLGCNLSRSRLPGLSSAEMLGGFKLPTFQLTTKCLTVMPSGYLRIPTYYVLNLHNGSPSGFCTAFNLSVCLFLRYHIFKTTLLWYSLHTIKCTHFNCTIH	1187627	1189861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1187600_1189900
779240	contig_3700_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_138066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGTGCCAGACCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145548	144086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_144100_145500
779244	contig_7182_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_117165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042409	1043432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_1042400_1043400
779250	contig_16122_pilon	-	2025	5	Intergenic	novelGene_134557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	44.2295150323853	46	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	277	579	282583	282038	FALSE	15	GCCCACTGAGTGCTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGIWSLSSHGCRAGGWAWVLLPNGDVSVP	284700	280591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_282282_282524_282649_283182_283302_284184_284239_284662
779254	contig_9161_pilon	+	971	2	Intergenic	novelGene_160651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	55	363	108280	111738	FALSE	30	TTTATAGTTATCTCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRVKLKSQEIIPFPGTKMMRNLLCVHVTKCGGLPNNILDVWEFLGKPEHCRYTWDTQMNSNLGIPNTCKLRFDRIFFRAAAEEGHIIPRSLDLLGLEKLDCGRFPSDHWGLLCNLDIIL	108225	112346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_108307_111456
779255	contig_10000_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_139294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147183	149425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_147200_149400
779259	contig_10003_pilon	+	2328	9	Intergenic	novelGene_88164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGTTTCTGTGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401563	548609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_402905_416836_416924_430740_430845_460909_461114_466537_466695_472051_472140_473195_473341_531532_531656_548530
779260	contig_5039_pilon	+	1882	2	Intergenic	novelGene_64915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAACAAAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926015	938888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_926239_937229
779262	SIRV6	+	533	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	37	-2	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779273	contig_10058_pilon	+	2893	8	Intergenic	novelGene_67661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.03015750727543	83	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	448	1338	24288	28983	FALSE	15	CATGTTACGCCTGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVRVDVAKDAGQLAILNSKYGLHVSSPYEGRVEQPPPPRDPLDGAVLLRNAVQADEGEYECRVSTFPAGSFQARLRLRVLVPPLPSLNPGPALEEGQGLTLAASCTAEGSPAPSVTWDTEVKGTATSRSFKHSRSAAITSEFHLVPSRSMNGQPLTCVVSHPGLLQDQRITHILKVAFLTEASVRGLEDQKQWHVGREGAMLKCMSEGQPPPSYNWTRLDGPMPSGVRVEGATLSFPRLTTEHSGTYVCRVSNELSSRDSQVDVDVLADLRDASVREVDLVSASVVAVGVIAALLFCLLVVVVVLMSRYHRRKARQMTQKYEEELTLTRENSVRRLHSHNADPRSQPEESVGLRAEGHPDSLKDNSSCSVMSEEPEGRSYSTLTTVREIETQTELLSPGSGRAEDEEDQDEGIKQAMNHFVQENGTLRAKPTGNGIYINGRGHLV	22131	30538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_22373_24081_24373_25559_25681_26674_26824_27065_27226_27869_27946_28360_28436_28758
779274	contig_8195_pilon	+	2209	10	Intergenic	novelGene_170055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_9	61.0209435813275	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	93	1235	429165	460351	FALSE	30	AGACATCCACTTGTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWEVVSRNSLSDDRLETQSLPSRSPPGTPSHRNSAFTQEGTRLRPSSVGHLVDHVVHTSPSEAFVNHRSPSSTQANSIVLESSPSQETPGDGQPPALPPKQSKKNSWNQIHYSHSQQDLEDHSNETFDVPSSPEKSTPNGGIPHDNLVLIRMKPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPADLCVPRLNEGDQVVLINGRDIAEHTHDQVVMFIKASCERHSGELVLLVRPNAVYDVVEEKLESEPDFQYIPEKAPLDSVHQDDHSLRESMIQLAEGLITGTVLTQFDQLYRKKPGMTMSCAKLPQNISKNRYRDISPYDATRVILKGNEDYINANYINVSLFYYNFPFGMKEATLNFEINSFFIKRLTSKTKII	428001	461325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_428063_429133_429260_431235_431395_442950_443111_446236_446321_446411_446469_454526_454684_458376_458544_459658_459750_460178
779278	contig_14322_pilon	+	1290	4	Intergenic	novelGene_115632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.0116263352131	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	285	743	251171	251629	TRUE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWHQPPSERPGQPHPGGPAVRTADAAAESGVDRAAPESDPESDPQCQQRRPAGVTTDCPSENHIRPSADWALPHVLPFSPVRLPKREKEKNWTCMFRRIFMFLLAPPFCTPPRPPGPQILFRRKEPASCDHKPATIFPQAPESPVDKVFSRILGLGVGPPAAGHQVAGFMFETPRTPSSGESFVAPALPLSLFVSPFLPCLEAPSSQHLSPCWEELTASRRPGTGVLPASLDRAFLRERGRSVVGD	247960	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_248011_249115_249238_251058_251852_251946
779280	contig_614_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_132647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGAGAAACAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968359	970284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_968400_970300
779281	SIRV6	+	636	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	98	49	98	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCCTAATTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10335	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779282	contig_9653_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_48200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAATTTTTAAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180680	179405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_179400_180700
779287	contig_11978_pilon	+	1763	8	Intergenic	novelGene_63028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1285.57843726758	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	127	918	1608423	1646860	TRUE	45	TGGTGACTCAAATAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNCARCDKIVYPTEKVNCLDKFWHKACFHCETCKMTLNMKNYKGYEKKPYCNAHYPKQSFTMVADTPENLRLKQQSELQSQVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1608296	1649685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1608492_1616197_1616293_1625946_1626032_1633574_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1646982_1648961
779288	contig_10904_pilon	-	1312	1	Intergenic	novelGene_22695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGTACATGAATAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608164	606852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_606900_608200
779291	contig_776_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_139946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	22.1616535684702	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	3	974	932295	1041048	FALSE	75	CGTAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVETCGTGAGGTGFMAAATSKNNVTGFQRKGPRAGGTDSSGSRLVSIAGTRPSVRNGQLLVSTGLPALDQLLGGGLAVGTVLLIEEDKYNIYSPLLFKYFLAEGIISRHTLLVASAKEDPADILQELPAPFLDDNCKKEFDEDTCNHKTPEPNIEMKIAWRYQLLPKMEAGPVSSSRFGHYYDVSKRIPQELLEASKWHGFFLPEKLSLSLKVEHCSLTHGYLKLLNFIQSIIYEEGFDGSNPQKKQKNILRIGIQNLGSPLWGDDICCTENCNNSHSLTKFLYVLRGLLRTSLSACVITVPSHLIQVRIFQNYFPLVSGM	932292	1041776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_932518_953027_953064_974918_975041_1016455_1016588_1022960_1023101_1036269_1036355_1040814
779295	contig_11855_pilon	-	1799	10	Intergenic	novelGene_66895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTCCAGGGCCACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718839	691663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_691729_694124_694242_711188_711327_711601_711688_711903_712141_712737_712793_713125_713228_716698_716856_717599_717676_718073
779297	contig_7753_pilon	-	1837	2	Intergenic	novelGene_41496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	24	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATAGCTAGGAATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200383	1198445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1199321_1199421
779298	contig_10980_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_162565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAATAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264479	262468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_262500_264500
779299	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
779300	contig_10861_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_39180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	29	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	20	316	263064	271952	FALSE	15	CCTTAGTGTGCAGGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIPILQMRKLRLEKQRSDLPQDTPTAGRGGAGPGLMGLPLALRSRFRLIQVPESTSNMQESLSNHGKERYLAPWSSESQQLVQESSCDLNQARKCQHENFCWDY	263044	273855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_263174_271765
779303	contig_715_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_167552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTACTTACTGATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123530	122257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_122300_123500
779307	contig_10399_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_114479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	90	407	172152	171835	NA	75	TGTGAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSLVFLLEFEFCTPPFSCSIRDSSIAFLMFCVRRGTSHLIIFLRVLLSVSAAFEAHPTAAGAQLPPSQSRLLSTCLREAWCQPGAAACAGTDFKFTTWGSSCSPPEILVGSGGERAAGCLEGRLGLALKQRDN	172241	171380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_171400_172200
779309	contig_10324_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_7698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	183	539	23268	22912	NA	20	TGACCACAGCGCGAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWDLKELPLGTVFPGVFLFPRDSFETGLLPVPGRPFSLLGPPFLGPLPWENPSPSAPTQVMMFGSPTIALELLKQGASPNVQDISGTTPAHDAARTGFLDTLKVLVEHGADVNIPDGTGALPIHLAVREGHTAVVSFLAAESDLQHRDARGLTPLELAQQRGNRDLMDILQGHTVASL	23450	22343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_22300_23400
779311	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
779313	SIRV4	-	216	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1307	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3851	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
779314	contig_3382_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_124125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCACGTTTCACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742158	743864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_742200_743900
779317	contig_11978_pilon	+	2097	5	Intergenic	novelGene_62870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_4	33.8415425180354	417	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	216	773	636922	640825	FALSE	55	ATAAAACTATAGATTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSQRGKAVGWGLLYAASVRSSTAATRLVAFVGVTPPAGPTRRASSAAPIPLGLLGAALSSVTLYTRKLAGTMGKKQNKKKVEEVLEEEEEEYVVEKVLDRRVVKGKVEYLLKWKGFSDEDNTWEPEENLDCPDLIAEFLQSQKTAHETDKSEGGKRKADSDSEDKGEESKPKKKKEESEKPRGFARGLEPERIIGATDSSGELMFLMKWKNSDEADLVPAKEANVKCPQVVISFYEERLTWHSYPSEDDDKKDDKN	612978	642149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_613157_636884_637062_637527_637706_638324_638420_640680
779318	contig_6102_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_32068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	514	972	672763	673221	NA	30	AATACTTTCTCTGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLEPTKVALNVERFRDWAVVLADTAVTSGRHYWEVTVKRSQQFRIGVADVDISRDSCIGVDDHSWVFTYAQRKWHTMLVKEKTPIEGIGQPEKVGLLLDYEAQRLSLVDVNRVAVVHVLQTDFRGPVVPAFALWDGELLTHSGLEVPEGL	672249	674294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_672200_674300
779319	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_94468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
779321	scaffold_12124_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_22200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCACCAGTCGCTCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349196	1349741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1349200_1349700
779330	SIRV7	-	588	2	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-58650	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACTGGTAGCTCTTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	114687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_114982_147663
779332	contig_3397_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_154593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191523	190174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_190200_191500
779334	SIRV6	+	363	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	6	414	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779335	contig_11601_pilon	+	855	5	Intergenic	novelGene_141033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	286.769397774588	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTTCTTAAGCTGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92936	99200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_93056_93789_93897_97723_97902_98165_98220_98803
779336	contig_15104_pilon	+	1179	2	Intergenic	novelGene_163362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGTGCTTGATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661422	663800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_661541_662739
779341	contig_6375_pilon	-	1775	5	Intergenic	novelGene_72995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	16.6489489157724	43	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTTTTCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320202	315508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_316434_318798_318865_319257_319396_319480_319656_319731
779342	contig_15049_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_160726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATACAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254235	252048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_252000_254200
779347	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	0	3590	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
779348	contig_5039_pilon	-	982	3	Intergenic	novelGene_64891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	22.5	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585121	579178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_579973_584833_584888_584987
779352	contig_6418_pilon	-	1572	4	Intergenic	novelGene_81138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	14.1970262926979	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	171	623	191759	182721	FALSE	25	AAGTTGATCGTTATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKMVMGEPGLNWDISPKNGLKTFFCRENYKDHSMAPSLKELCILSNRRIGEILNASASSVENEPAVGSAAQAKEKVKTTVGMVLLPKPRVPYPRFSRFSQREQRTYVDLLVRYAKVPANSKDVGINKNDYLQYLVCSLYFIFSKNVTN	192807	181771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_183028_189611_189717_191718_191853_192730
779353	contig_7078_pilon	+	946	5	Intergenic	novelGene_130203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	211.221447774605	205	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951290	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325_965520_975279_975387_982119
779357	contig_5698_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_55031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTTTTTTGCTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4091	20702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7830_8020_11129_11173_17099_17156_19739
779358	contig_5947_pilon	+	1860	2	Intergenic	novelGene_101583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTTTCTCAATCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852336	858168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_853917_857888
779359	contig_10331_pilon	-	1408	5	Intergenic	novelGene_54103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	261.600363149595	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGATTTTCTGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312066	304599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131
779361	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	238	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779364	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	9	1153	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779368	contig_16666_pilon	-	1183	5	Intergenic	novelGene_61759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	669.189995442251	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	55	399	59586	55974	TRUE	45	AATGCAAACATGGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59640	55131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_55248_55305_56041_56584_56664_58098_58264_59552
779377	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_96473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653737	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
779379	contig_9363_pilon	-	1196	3	Intergenic	novelGene_6524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	4.5	26	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTATTGTTTGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571089	566898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_567830_570639_570685_570869
779384	contig_4364_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_3397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAAAGTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
779386	contig_20809_pilon	+	1058	2	Intergenic	novelGene_173787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATCTATAGCAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1968	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20809_pilon_+_2072_10372
779389	SIRV6	+	344	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	535	-1	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779393	contig_5964_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_80378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACATTCTCTTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617084	618111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_617100_618100
779394	contig_8020_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_114405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167178	169497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167200_169500
779395	SIRV6	+	380	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	0	403	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	213	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779401	contig_2114_pilon	-	1859	13	Intergenic	novelGene_104322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	83.6076734250843	1	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	384	1334	1157893	1139050	FALSE	30	TCTGTAACATTTTTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVDSVLSWGPYLYSMSLLDDQGLAEVAKVAEQVLNAVNKGDYMEATRLWGEAEMVIEQNTDGVNFYNILTKNTTVPAKESSLEFTQSHLVHLCQRHMRHLQQDALSQLMNGPIKKKLKIIPEDYSWGAQATNVFMNMEGDFMKPVTSIVDELLEAGVSVTVYNGQLDLIVDTIGQEAWVRKLKWPELSTFNQLKWKALYIDPRSSETSAFVKSYKNLAFYWILRAGHMVPADQGAMALKMMRLVTQQE	1169438	1138524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1139113_1142349_1142514_1143537_1143676_1145462_1145577_1146890_1146985_1147881_1148011_1149453_1149492_1152951_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161021_1167447_1167587_1169367
779403	SIRV4	-	302	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1219	0	1219	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
779404	contig_9113_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_68616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGTGAAAAAAGATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622222	620651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_620700_622200
779412	contig_5864_pilon	+	1677	8	Intergenic	novelGene_162771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_6	43.1173055839106	210	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	117	1031	79500	105629	FALSE	25	AACATTTGTGTGTAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRGGAGVFTVWKLLLSAWLVSRGSRLSAREREAPDGVMDFENLFSKPPNPALGKKPATDSDERIDDEIDDTEVEETHEEKIKLECEQSPPKCRHFGNSMISQKSLQHRKSRSKDYDAYSDDNDVCSQGSEDNFAEELKRYIQAKEMANTAQPSLFPVESVMKERAKGTQQTVKQKNKNFKAGHKNGKQKKMKRKWAGTGNKESSALLRKNGSQEEDGKPKEKQQCVKMSQGFINQHTVERKGKQICKYFLERKCIKGDQCKFDHDAELEKKKEMCKFYVQGYCNRGENCLYLHSEYPCKFYHTGTKCYQGEHCKFSHAPLTAETQELLAKVLDTEKKSSCK	79383	106275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_79577_96694_96780_100000_100239_101154_101289_102939_103063_103454_103567_104614_104725_105593
779414	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779417	contig_7057_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_123303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTTCCCGTGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907680	909440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_907700_909400
779420	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
779421	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	492	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779423	contig_12630_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_173061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTCCCTAAGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30974	30479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_30500_31000
779432	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	57	523	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779437	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_94582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	34	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779438	SIRV6	+	482	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	518	11	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
779443	contig_14353_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_82133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGAGTAGTTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292555	290716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_290700_292600
779444	contig_5423_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_85168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95642	94959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_95000_95600
779445	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
779449	contig_10861_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_39251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805583	804926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_804900_805600
779450	contig_7171_pilon	+	813	9	Intergenic	novelGene_101313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	175.13905189877	1212	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	79	777	1077108	1088749	FALSE	5	AGCTCCGCTGTGTCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDTIVRDRCCWQPRLTGVSSIMASSQ	1077029	1088785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088427_1088470_1088717
779457	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	54	518	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779460	contig_8712_pilon	-	1854	10	Intergenic	novelGene_58883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	22.1899766049538	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	24	557	1020797	1008922	TRUE	25	CCAAAACTTCTCCAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGKGGGMQEVPQDCPGTGSAQAGRGASCQGCPNQRLCASGAGAAPDPAIEEIKEKMKTVKHKILVLSGKGGVGKSTFSAHLAHGLAEDENTQIALLDIDICGPSIPKIMGLEGEQVHQSGSGWSPVYVEDNLGVMSVGFLLSSPDDAVIWRGLTTSLWTRHLGLLTSTSQLFSISREHTSMEL	1020820	1003251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1004318_1007841_1007945_1008229_1008341_1008904_1009019_1009919_1009997_1010655_1010689_1013095_1013165_1018936_1019071_1020595_1020701_1020778
779461	contig_10196_pilon	-	2577	12	Intergenic	novelGene_132288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	11.4516590879998	73	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	79	1737	2295411	2286413	FALSE	0	TCTCTGTCTGCCTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDNKELEAEIHPLKNEDRKSQESLGNLTTKEDPCKSLPPQSRLSRCRTVVFFLSLFICLFVVFVVSFIIPCPDRPASQQMWRIDYNTAVAYDFLATEDINKDRIQDVLFLYKNANSSNHFNRSCADEGFSSPCAFAAALSGANGSLLWERPVAQDVTFVQCTGPQQKSSEALSACILVGGPGSVIAVDPFTGETLWSHPSSPGRNMSILSLLLGVPDVNNDGLPDLLVLTREEKEVNGYIYSGSTGSQVGRKSSLGADGEGSSLLHVTRTGAHYLLFPCAHSLCGWSMKSLFEEMTGRQSLLRKDPLWEHAINATTHRVSSPSPGAIRYQMHVPGRAGEDLLLVGSEACVLLDGQDLAPKWTLGNAQVFRKPVLGHYKPDTLSVVIENGTSIDRQILLLDLGTGVILWRQPLSGLPGSPLSANLPTADHRSAFFFWGLPEGISTNQTETRDAPNSLYMFHPTLPSVLLELANVSANIVAFEAVLFEPSRHAAYILLTGPESPAEPGLVSVTKHKVRDRIPDSRVVRLGQDRAESDQAVRDRFSRLRYRSEV	2341195	2285572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2286625_2286698_2286802_2287245_2287402_2287549_2287626_2287838_2287980_2288292_2288423_2288680_2288814_2289245_2289377_2290529_2290722_2291297_2291415_2295143_2295445_2341150
779462	SIRV6	+	773	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	8	2	8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10245	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779463	contig_5023_pilon	-	1425	2	Intergenic	novelGene_7309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAGAGATGACCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601416	595271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_595655_600374
779465	contig_16907_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_87442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTGAGGCTCACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403502	404512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_403500_404500
779469	contig_13481_pilon	-	1481	4	Intergenic	novelGene_119386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	21	314	536852	527468	TRUE	35	AAAATCATCCAGAGTGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536872	526083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
779470	contig_14441_pilon	+	728	4	Intergenic	novelGene_100758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	185	688	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121203	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126204_126283_126514
779471	contig_500_pilon	+	969	3	Intergenic	novelGene_31122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	9	602	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	114	503	1735075	1737122	FALSE	20	TTTTTTACAAATTTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVRSSVHAKWIVGRVIGTAMQKTAKVRVTRLVLDPYLLKYYNKRKTYFAHDALQQCTVGDIVLLKALPVPRSKHVKHELAEIVFKVGKVIDPVTGKPCAGTAYLESPISSEPTHLTERLKELTISAQ	1734372	1737588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1734469_1735057_1735198_1736855
779474	contig_10196_pilon	+	1271	3	Intergenic	novelGene_132255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	4.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	10	414	1950014	1951810	FALSE	20	CAGTCTACTTCTGTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLFSGALQLTDLDDFIGPSQDCIKPMKVDKKPGSGVAKIHIEDDGSYFQVSQDGGMRKLEKAKISLNDCLACSGCITSAESVLITQQSHEELRKILNANKVGGEWAVIPSQPDINRHSVIHLSRRWVCGHPS	1950004	1952667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1950080_1951188_1951285_1951567
779475	contig_7119_pilon	+	1617	4	Intergenic	novelGene_40920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	181	1272	137044	139798	TRUE	30	GAACACTGATGGCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKGTKRCPVLRHLHDRCNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127483	140944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127597_136976_137097_138759_139923_140723
779477	SIRV6	+	217	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	513	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
779478	SIRV6	+	418	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	438	0	265	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
779481	scaffold_6394_pilon	+	497	5	Intergenic	novelGene_111049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5911.93187545323	212	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTTACGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442103	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443260_443388_444267_444367_444474
779487	SIRV6	+	414	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	461	3	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779488	contig_240_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_173808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAACAGCTATAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752368	751808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_751800_752400
779491	contig_5988_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_15860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	427	795	271065	271433	NA	35	AAACAAGTGCTTTTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFISSGFEEAILSPPATGILILRAVLSAFSKKGRSGFSEPSMGIFRMTEEWLSRWDRRFWAAYAYCDFTLASIFSNCLFWAANSSACFARYSFSDTLADGTLLLLCFWETNAFEPSCCKE	270638	272911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_270600_272900
779492	contig_13021_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_8257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAGGGTTATAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222116	222725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_222100_222700
779493	contig_11677_pilon	-	471	4	Intergenic	novelGene_85945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	222	434	595842	594927	FALSE	20	TCACCACATATGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597384	594889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
779496	contig_13245_pilon	-	315	3	Intergenic	novelGene_148823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	551	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAATTTTGTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26382	25421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356
779498	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
779499	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779501	contig_4114_pilon	+	2078	8	Intergenic	novelGene_15582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGGAGAGAAGCGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180447	205403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_181660_184672_184781_185361_185432_186429_186535_187195_187353_187765_187886_190048_190235_205283
779506	contig_11964_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_164717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTCTCTAATGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203642	204740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_203600_204700
779509	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
779511	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	3	1205	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779512	contig_19848_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_173815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAAGAGTTCCATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31734	30825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_30800_31700
779513	contig_19848_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_173816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAAGGTTGGCAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32916	32205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_32200_32900
779515	contig_6710_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_98148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	CCTTGCAGCTACCCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
779518	contig_753_pilon	-	1062	4	Intergenic	novelGene_112994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	17.5941909605289	618	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	468	596	1254409	1254281	FALSE	15	TAAGGTTTCATTCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGHGVVQLQNHRLRGLLGKAQIPLSGLPCALVSVGPGQEAGAPGRAEGRPEGGERVRAVCGADTACGFCYSCSVTCFRKHKEQCNPETHPVKKKSSSLPIKTTKPVEDKDDESSIADFLNSDEEEDRVSLQNLKNLGDSAPLRSLLLNPHLRQLMVSLDQGDDKAKLMRAYMQEPLFVEFADCCLRIVEPSQNEDS	1259092	1253814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1254463_1255944_1256026_1257046_1257131_1258843
779519	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779521	contig_8330_pilon	+	2140	4	Intergenic	novelGene_71758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	14.522013940528	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	158	460	614635	619164	TRUE	5	GCAGGTCTCTCTTGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLAGQQPGTRTATLEQLRERLESGEPPEKKASRLSEEEQRLVQQAFQRNFFSMARQLPMKIRINGREDRSEASAAALNLTTSSIGSINMSVDIDGTTYAGVLFAQKPVVHLIAGSAPQSVGSSASSSSSHCSPSPTSSRGTPGAEPSTSWSL	614477	621507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_614678_616152_616252_619003_619535_620197
779522	contig_14158_pilon	+	1457	3	Intergenic	novelGene_136118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	142	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	68	346	18010	25363	FALSE	10	CTGTTCCTGTCTTTTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPLPPQPHCSRSRGVPVHLRTMSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKVIKGQNPKECLEFQS	17942	26474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21267_25310
779527	contig_20614_pilon	+	1357	3	Intergenic	novelGene_107612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	122	361	514297	514989	FALSE	10	TAATTGTCCTGTTCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATDSDDHPDIQHRPPDEDHPGASPTRTHRLLEHSLRRRTMQNTKHGEVDAWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDQRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAAS	480528	515985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_480594_514240_514316_514768
779529	contig_3233_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_56506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80988	78875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_78900_81000
779530	SIRV6	+	536	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	23	2	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779532	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	494	2	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779535	contig_13440_pilon	+	1710	13	Intergenic	novelGene_170513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_12	7.65760333844009	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	6	1634	40093	157565	FALSE	10	CATCTTTGTCACTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTLEERIQLGIHGLIPPCFLSQDVQLLRIMRSYERQQSDLDKYIILMTLQDRNEKLFYRVLTSDVEKFMPIVYTPTVGLACQQYGLAFRRPRGLFITIHDKGHIATMLNSWPEDNIKAVVVTDGERILGLGDLGCYGMGIPVGKLALYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNKELLRDPLYIGLKHQRVRGKDYDELLDEFMKAVTDKFGINCLIQFEDFANANAFRLLNKYRNKYCMFNDDIQGTASVAVAGILAALRITKNKLSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEKEGVPKAEATRKIWMVDSKGLIVKERSHLNHEKEIFAQDHPEVKSLEEVVRLVKPTAIIGVAAIAGAFTEQILRDMASYHERPIIFALSNPTSKAECTAEKCYQVTEGRGIFASGSPFKSVTLEDGRTFIPGQGNNAYVFPGVALGVIAGRIRHIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGRLYPPLSTIRDVSLRIAIKVLDYAYKHNLASYYPEPKDKEAFVRSLVYTPDYDSFTVDSYTWPKEAMNVQTV	40087	157641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_+_40224_43723_43874_77965_78042_91720_91883_99948_100053_129235_129346_148694_148793_149070_149185_150746_150853_151448_151592_152173_152348_155913_156013_157403
779540	contig_9335_pilon	+	1557	10	Intergenic	novelGene_147423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_4	129.25121486164	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1275	282	1556	34890	112234	FALSE	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTCLCAQFEAVLQHGLKRSRGLALTAAAIKQAAGFASKTETEPVFWYYVKEVLSKHELQRFYALRHIASDVGRGRAWLRCALNEHSLERYLHMLLADRSRLSTFYEDWSFVMDEERSSMLPTMAAGLNSILFAINIDNKDLNGQSKFAPTVSDLLKESTQNVTSLLKESTQGVSSLLREITASSAVSILIKSDQETDPLPVLSKNVSADAKCKKERKKKKKVTNIISFDDEEDEQNSGDMFRKIPVAGESSEDNSDRSSVHIMTAFESPFGPNSNGSQSSNSWKIDSLSLNGELGYQKLDVKSIDDEDVDENEDDVYGNVPGRKCTGHSESPEKPLDGNTCLSPMHSWAPLQVLHGDADVLFPVRGVGSYSPAGVPVGSLENGTGPEEHSLAEPERRYKLEASPPGQGNPLSSLLPSASVPESMTINELRQAIMAMMNRKDELEEENRSLRNLLDGEMEHSAALRQEIDTLKRKVAEQEERHVVKIQALARYGGQRDREVGEGGYARTPSTPFSSTL	19463	112235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_19593_34737_34919_38706_38778_41195_41445_44523_44900_50902_51022_59564_59641_61931_62015_109879_109944_112026
779541	contig_8978_pilon	-	1150	6	Intergenic	novelGene_49342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	900.560492138091	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	28	837	194082	190787	FALSE	40	AGAATAAGAATGTCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKASIAPIAPHHVTP	194109	190473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190828_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
779547	SIRV4	-	256	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1257	8	1257	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
779548	contig_1146_pilon	+	1351	6	Intergenic	novelGene_84811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	4.87442304278158	118	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	69	689	470159	478458	FALSE	40	AGACCAAAATTTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLRTGARRSLSAYGRKVGVRFCSSRMTLDNINWAAVDRIIRVDHAGEYGANRIYAGQMAVLGRTSVGPVIQKMWDQEKDHLKKFNELMVAFRVRPTILMPFWNVVGFALGAGTALLGKEGAMACTVAVEESIAHHYNNQIRTLMEEDPEKYEELLQIIKKFRDEELEHHDIGLDHDAELAPAYALLKSAIQAGCSAAIYLSERF	470090	479120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_470199_474311_474491_475284_475400_476586_476727_477849_477919_478380
779551	contig_6227_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_49699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047862	1046483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1046500_1047900
779553	contig_12970_pilon	+	2139	7	Intergenic	novelGene_50538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	11.4370256428652	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2097	43	2139	396786	421446	FALSE	70	GACAAAATAGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNKKRETFSILTVRMPRRRKNLGGSPFRKTANSKEVVSSDASHEEPTTTLPSTCEIQVDQDELFTSISEMFSDLDPDVVYLMLSECDFKVENAMDCLLELSATDAKKEESFSVNLLASENQESVAGSDIMEKCPENNNKDSKMYSVLDMQLTEDLECFVENAFETLDSSPEGQVSSSLPLQDVHSLSDPSECINSDSSSVTPIPSAQNKDLNNEILESSASTFSLNSLTSHSVLNESKSFLKDNTLTLEDNCPADSLVNSSLNVANDCILGCSNLNQRQEKLLESECAETQFSQASVDLDANESQAPLNLSVQNPELDLLGAGGDQKSISTPDVLVPSEGFIFKQHKPTELPPKGKDVNCCPLFTPLPLLLPPCSPSQFWSPIVPAFDPFQGNQGFVTPVVNTATHWRPVSYMFPSPVISHTSRTKVWRNKEGTSAYQVQDTPVSHGVRKKKTSYVGLVLVLLRGLPGSGKSFLARTLQDDNPGGVILSTDDYFYINGQYQFDVKYLGEAHEWNQHRAKEAFEKKVSPIIIDNRNLQAWEMRPYVALSQKHKYKVLFREPDTWWKFKPRELARRNIHGISKEKITRMLEHYQRFVSVPIIMSSLVPEKIECVELCVYSCEDRSTSPKDNEDTTSAEEENVLSSSLKHLELTEEKTLEVTNETVLPEDVSFLLNADLDKGRKEISGMNHDIQSAFIQESPDMCFSDSESKVQVI	396743	421446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_397012_401748_402908_406499_406625_410642_410732_414907_414985_419446_419603_421181
779554	contig_5590_pilon	+	1554	11	Intergenic	novelGene_162989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	87.413042505109	3	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	16	1227	174610	184848	TRUE	20	TAAAATCTGTGGTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSQDNVEREETWLTVWVHEAKGLPRGAAGVRAELCSFPTAGRAAARGGRCSRGAERAVQPRGGAGRPGPGHGRAAGVSAGPASGPERQAWCWDLAAGTRAGPSKQ	174594	185295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177920_178717_178810_184093_184269_184806_184871_184990
779555	contig_4469_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_21906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGCACAGAAGAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437315	435296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_435300_437300
779556	contig_14196_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_169971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108001	109708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_+_108000_109700
779559	contig_1146_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_84863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCTGCTTCCCCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955747	957172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_955700_957200
779561	contig_16870_pilon	+	2131	13	Intergenic	novelGene_155504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1061	1780	123181	124629	TRUE	20	GGTTACCTGTGGGTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTWASTGPSEASSRPPQLLPYQAVCPAPCHDLEPVLAPLASTPVAGSEAAPGSAPVATALEAAQVAAPVAVPGAGPLAVLVSAAGSVPVGTSVSVPASAAVPALRAVKVPVAAPVAAPASAEALSALDRSVFVPASAALAAPGRPFGASVAESVAAPGPGSAEPVVGIVVAHRLLETQAAGQASVSASVLSSQPVAEPSPAASLEAPSLQAPLSFSTSWLVAAMPHKAPALRLGCISP	108999	127616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_109350_109678_109748_109964_110023_110422_110576_110774_110891_111399_111488_121821_121947_122649_122738_123167_123229_123483_124080_124553_124661_124872_124968_127391
779562	contig_13697_pilon	+	2364	10	Intergenic	novelGene_165943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	132.973217390608	10	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	113	1261	619809	628041	FALSE	20	GCACTTTCCTTACGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSQGGRRPGCLSVTGTSSVSEEPVRTEASPIEQGAAAMEGEEEEPPQEAATGPVATSGAAESGAAESVPRVVSGEPQNISDVDAFNLLLEVKLKRRHERPDLPRTVTELVAEDGSRVYVVGTAHFSDDSKRDVVKTIRAVQPDVVVVELCQYRVSMLKMDERTLLREAKEVSLEKLHQAVRQNGVMSGLMQMLLLKVSAHITEQLGMAPGGEFREAFKEASKVPFCKFHLGDRPIPVTFKRAIAALSFWQKVKLAWGLCFLSDPISKDDVEKCKQKDLLEQMMAEMIGEFPDLHRTIVSERDIYLTYMLRQAARRLELPRASDAEPRKCVPSVVVGVVGMGHVPGIEKNWSTELNIQEIMTVPPPSVSGRLSRLAMKAAFFSLVGYSLYWLGRRTVGLVLALPVAQDCLQRVSTVLPKK	614131	629144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_614214_619778_619842_622818_622913_623540_623708_624185_624327_626795_626907_626996_627137_627337_627511_627587_627700_627863
779563	contig_12622_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_5827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGACAGAGTAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424401	422965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_423000_424400
779564	contig_12622_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_5829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGTCTTAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428072	427535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_427500_428100
779569	contig_12638_pilon	+	1767	9	Intergenic	novelGene_33058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1332	1685	39856	52021	FALSE	25	GTGCTTTAGATGTCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTPGLCEVPHLVIANVLGGEGSWEVSLTSSLQGHSGLAFFFFFFFFFGFTFTNSLNFFSLFFSLSFAVGELAETRFLARLSWLALSEDEEPLVWTCLFPGLSSGSGDFSIPWKYFM	13093	52103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_13305_17613_17795_19586_19992_23907_24102_26721_26826_38675_38856_39799_39965_40657_40754_51872
779571	contig_5566_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_153675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATTAATTGGCAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205352	206859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_205400_206900
779572	contig_5770_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_74142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1098	1403	9543	9238	NA	35	TGTATGGTATGTAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHPTRPWVRQRLTRCLPNHFRLPGHTAKQCFPTPLSLDKGHMTSSSQWYVGGSNVSTVPSSTLLFPHHLLAGCKDPVGNYEISEADNTWSLEPISWKSY	10640	8711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_8700_10600
779577	contig_8269_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_106260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATGGAAAAAAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382133	382429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_382100_382400
779578	SIRV4	-	193	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	421	3	-421	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTCACCAATAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
779579	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	8	1163	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779580	contig_3277_pilon	+	2411	3	Intergenic	novelGene_74719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	977	junction_2	702	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	185	496	240775	241086	FALSE	80	TTAAAAAAAAAACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKVSVENDHLEGRKKYVFLGIIISVLISSLVYFSSILGGKKR	188792	243001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767
779581	contig_1406_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_25596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAAAGATGAACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2178848	2181108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2178800_2181100
779582	contig_13645_pilon	-	1676	2	Intergenic	novelGene_146160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAATGAATAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15572	13776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_15159_15278
779586	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
779588	contig_7151_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_40710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTACAAGAGTTATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65221	63048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_63000_65200
779589	contig_15859_pilon	-	1657	4	Intergenic	novelGene_50198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	142.347774443048	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	2	1126	346786	341031	FALSE	25	GCTCAGATCTGCAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	346787	340499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153_346352_346510
779590	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	1	1158	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779592	contig_11307_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_105255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170749	168673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_168700_170700
779597	contig_20883_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_173832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGCTGTCTTAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27507	27944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_+_27500_27900
779598	contig_20883_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_173833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAGTTGAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28192	29548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_+_28200_29500
779599	contig_9957_pilon	-	2456	1	Intergenic	novelGene_173843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGAAAAAGACCCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621816	619360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_619400_621800
779601	contig_8377_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_35030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72807	71833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_71800_72800
779604	contig_10235_pilon	+	1614	6	Intergenic	novelGene_46373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	216	junction_1	154.652384398043	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	980	1474	155614	158044	FALSE	10	CATGAGCTGGTCTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILDLEPDEELEDNPNQSDLIEQAAEMLYGLIHARYILTNRGIAQMLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153818	158184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_154761_155636_156206_156323_156763_156840_156980_157171_157953
779606	SIRV6	+	362	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
779611	contig_9363_pilon	+	1150	6	Intergenic	novelGene_6802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	229.889886684908	120	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	888	263	1150	1622283	1625965	FALSE	10	TGGGGCCACGCGAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGSGGHPGGWAFGDDAGEDAGPDATEPGPGRAVGHPLRPPSRPYLTSAPPSVCLLPNPRGPASPAPNHGAPAGRPALALALKILPSDRSSPNPELGAPPLVPPGLYHCPPSSSLSAHFLSRRLRHHQDPVLHLRASPLFTHAVSSINAELP	1622020	1625965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623575_1625555
779614	contig_10331_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_54086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105705	105008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_105000_105700
779617	contig_3410_pilon	-	1357	7	Intergenic	novelGene_58913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.720812290853	3	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	136	345	30437	19638	TRUE	15	TACACGTTGAGCCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELQHRTWCALPVPRGHSLTRLRPKTRAGLIGSDCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKTLLPARRSQGASPAG	30965	13691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14408_15589_15695_19446_19655_29162_29196_29752_29831_30355_30472_30864
779618	contig_10962_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_103881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAGATGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264228	266463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_264200_266500
779620	contig_13481_pilon	+	1470	2	Intergenic	novelGene_119452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATAGTAGTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066924	1085235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1083899
779621	SIRV5	+	351	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	877	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
779622	contig_12786_pilon	-	1019	6	Intergenic	novelGene_103430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	740.176627569393	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	670	981	593240	590909	FALSE	40	CGCTAATAAAATAATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629623	590870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_614020_614079_615624_615731_629303
779623	contig_7695_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_41592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAATACAGTAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479781	479227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_479200_479800
779625	contig_6710_pilon	-	476	2	Intergenic	novelGene_98079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	0	GTCCCCCCTTCTCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
779626	contig_14357_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_121643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTACTGTATGAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43162	42578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_42600_43200
779627	contig_6230_pilon	-	1847	14	Intergenic	novelGene_102091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	81.7500882144902	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	9	1067	157542	118618	FALSE	20	AGTTTCCTGTGTGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVATFEPQASAGPRPPVCLLVLGMAGSGKTTFVQRLTGHLHSQGSPPYVISLDPAVHEVPFPANIDIRDTVKYKEVMKQYGLGPNGGIVTSLNLFATRFDQVIKFIEKAQNMSKYVLIDTPGQIEVFTWSASGTIITEALASSFPTVVIYVMDTSRSTNPVTFMSNMLYAILYKTKLPFIVVMNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVVGVSAVLGTGLDELFVQVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATDSLSPVLDPSDLILTRGTLDEEDEEVDSDTDDIDHRVTEESHEEPAFQNFMQESMAQYWKRSNK	157550	117837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128222_132861_132953_133621_133662_134932_135016_135774_135862_136512_136559_137150_137240_137622_137702_147637_147676_148371_148439_149453_149494_156635_156730_157431
779628	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	3	413	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779629	contig_8594_pilon	-	1213	2	Intergenic	novelGene_140011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105253	103984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_104849_104904
779630	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	131	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779631	contig_10494_pilon	-	805	7	Intergenic	novelGene_102159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_6	1152.84697114964	1350	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	181	744	910844	903512	FALSE	0	TGGCGGGGCGTGGGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSQLTTLQVLITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERCGQKYMTSVVKMFGPLTRNYYIRAFLHLVLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLAAIRGEQWTPIEQKPQERPQVGGTIKQPPSNPPPRPPAEARKKPSEEKEEDTAAGGSPGGAQTNPLPVTDEVV	912941	903450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_903734_906373_906456_907136_907221_907637_907713_908356_908427_910813_910949_912865
779642	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
779643	SIRV6	+	556	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	225	2	225	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10462	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779644	contig_4654_pilon	+	171	1	Intergenic	novelGene_103073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAATGTGGTCCCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474061	474232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_474100_474200
779649	contig_5059_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_140768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGAACTGTCCTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	559854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_559900_560400
779650	SIRV4	-	180	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	434	3	-434	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGGCGAAGCCATGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
779652	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
779657	contig_16103_pilon	+	1249	7	Intergenic	novelGene_118936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	32.9882133833013	409	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	317	1075	808998	810767	FALSE	5	TTCCTCAGTCTTGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDEDEDDEEEEEGGGATWGYGSPRFGDPQPPEEFGFSFSPEGGMRFHRNFGFDDLIRDFNSIFSEMEAWTLPSRPPELPGPESETAGERRRREETLRDSMLKYPDSHQPRIFGGVLESDAGTESQKPGPDWGSQRPFHRFDDMWPVTPHPRAREDNDLDSQVSQEGLGPVLQPQPRSYFKSVSVTKITKPDGTVEEHRTVVDSEGRTETTVTRQEADGSPRDDQESPRPSALDDTSSILDLFLGRWFRFR	808287	810941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_808579_808972_809233_809406_809595_810016_810069_810214_810322_810437_810529_810681
779658	contig_15304_pilon	-	699	3	Intergenic	novelGene_30425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	189	635	54100	52925	FALSE	5	GCTGCTTGTCTGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLNLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53161_53710_53813_53991
779660	contig_8376_pilon	+	1923	3	Intergenic	novelGene_153768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	588	968	106447	106827	FALSE	50	AGAAAAAAATCCCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEPLVIHLLGKMATTDLGPSSQDHDFLGELFGKQEPLQDHPTCYIEWVSHQRPYSYCLTLEMLSSLVLPKIASIIPAVPLGFTARGLGAQWQAEGEHRTILMEKDGPGSDAAINDQASAGKYCL	100013	107782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_+_100096_104880_105013_106073
779663	contig_3095_pilon	+	1183	5	Intergenic	novelGene_75074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	61	801	147241	151865	FALSE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPRIWCASWACWWVWWASLLAPFSSSRACAKAMLLNVVGLCEAPEGYGLS	147180	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150680_151032_151163_151848
779668	contig_15354_pilon	-	2116	12	Intergenic	novelGene_65764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	5.32575218759157	49	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	631	1749	653230	649844	FALSE	45	CCATTGAAACAGCAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDTWWNSASETCNYLSALKRGHLQGLWTHDALRKAGLSPLASGPLLPMSLVFYSSVFFPVLWGAEGCPSFPPSWTSCFGTAEGRGVKIARALVGTFMSALEMPGVSLTLLLVDEPLLKLIDAETTASAWPSTAKVSVTGRKRTRAAPAEPREVADSTAAGGVASKRMVLVLERVCSTLLGLEEHLNALDRAAGDGDCGTTHSRAARAIQEWLKAGPPPASAAQLLSRLSVLLLEKMGGSSGALYGLFLTAAAQPLKAKTDLPAWSAAMDAGLEAMQKYGKAAPGDRTMLDALWAAGQELQAWKSPGADLLQILTKGVKSAEAAAEATKNMEAGAGRASYISSARLDQPDPGAVAAAAILHAILEVLQSQGV	654972	649476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_650006_650407_650498_650605_650640_650752_650857_650944_651052_652010_652149_652364_652485_652866_653589_653683_653769_653844_653880_654508_654599_654910
779671	SIRV4	-	204	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	410	3	-410	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTATCGGCGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
779676	SIRV6	+	268	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	118	-9	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779680	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
779681	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
779686	contig_11126_pilon	-	2066	11	Intergenic	novelGene_138137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	7.98060148109151	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	410	1210	701643	689243	FALSE	15	TCCTTTAGCAGCAGCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDVAVSPDDRYVLTADRDEKIRVSWSAAPHSIESFCLGHTEFVSRIFVVPDHPELLLSTSGDGTLRLWEYRSGRELHRCPVPSLQEPDAPQREKRFAASRITYCRQDGWVALLCDSIPVVCIFQLDVPRHLLVYRQQLSFQHRVWDVAFEETQRLWVLQDCQEAPLVLYQPVQGQWQSVSEDDVLKKVSSHLRGNWAMLEGSAGVGDSFSSLYKASFDNMATYLHKKEERLQQQLEKRQRRKSSQPGPNGHAKKLKSGDASSGC	714881	688386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_689437_689941_690012_690862_691047_692648_692714_695613_695713_696288_696350_698964_699078_701628_701786_711561_711654_713054_713121_714772
779687	SIRV6	+	187	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	406	2	-236	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACGCTTCCACACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
779689	contig_500_pilon	-	1298	6	Intergenic	novelGene_31094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_1	244.265920668439	1076	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	86	634	1510494	1500737	FALSE	20	CGTAATGCTTGCCTCACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAERVVPEEFPVPVSVRGAASAAAGAAMPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRREREEIEKQKAKERYMKMHLAGKTEQAKADLARLAIIRKQREEAARKKEEERKAKDDATLSGKRMQSLSLNK	1510579	1500072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500796_1501999_1502152_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
779690	contig_11417_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_103261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAAAAAAAATAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271152	270657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_270700_271200
779697	contig_4336_pilon	-	2230	9	Intergenic	novelGene_152375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	20.4263157470945	113	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	118	1665	466622	440288	FALSE	45	AAGAGGCCCCAGGAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEPRLQFRAVCARGRGAARGGPGPQVGNALGSLEPLRWMLRSPFDRNVPVNLELQELLFDYSFQHLGVSSQGCVDHPIVLTEAVCNPLYSRQMMSELLFECYGIPKVAYGIDSLFSFYHNQPKNLISSGLIISSGYQCTHILPILEGRLDAKNCKRINLGGSQAAGYLQRLLQLKYPGHLAAITLSRMEEILHEHSYIAEDYVEELQKWRCPDYYENNVHKMQLPFSSKLLGSTLTSEEKQERRQQQLRRLQELNARRREEKLQLDQERLDRLLYVQELLEDGQMDQFHKALIELNMDSPEELQSYIQKLSSAVEQAKQKILQAEVTLEVDVVDSKPETADLEQLEPSLEDVESMHDFEPLFSEETPEVEKPVTTVQPVFNLAAYHQLYVGTERIRAPEIIFQPSLIGEEQAGIAETLQYILDRYPKDVQETLVQNVFLTGGNTMYPGMKARIEKELLGMRPFRSSFQVQLASNPVLDAWYGARDWALDHLDSDEVWVTRKEYEEKGGEYLKEHCASNIYVPIHLPKQASRSSDAQASGKGTGASGSGAGEHA	466739	439722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_440546_443470_443604_444727_444868_445583_445701_452367_452551_453275_453494_462483_462654_464673_464904_466523
779698	contig_7293_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_54234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAATTACCAACAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222836	221173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_221200_222800
779699	contig_14621_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_105848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGCCTCTGTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313344	312267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_313090_313233
779701	contig_12756_pilon	-	1457	4	Intergenic	novelGene_153212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	177.546238109025	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTATCCATGGAGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153162	150131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_150654_151334_151371_151864_151958_152356
779704	contig_7171_pilon	+	2810	4	Intergenic	novelGene_101214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	4.02768199119819	65	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	336	2135	271362	277114	FALSE	15	ACCTTTAGTCTTTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLHPQTPMAAATLMHLAQGCVTFEDVAIYFSQEEWGLLDETQRLLYCNVMLENFALIASLGITSFRPNVVAQLEMEKEPWMPDRVDMTPAMARGAYRGPGSGFWHGMEGQESPSEHSVFIEGVSQDRNPKAGLSVQKDYSCDMSGLLLKDILHLVEHQATHPSQKPYMCGAFGKGFGFSAKLHQQQMQQNVEKPNRRDEGKTSFVKTCRAHMSEKPFTCREDGKDFMARSGFLQHQVIHSLGEPHRSTESVVGVHTVQRNYKCSECGKTFSDKSTLVQHQRIHAGERPYECGVCGKFFRQTSTLNIHQRVHTGERSYECSECGKAFSHKTRFIQHQKIHTKERPYECSECGKLFSQCSSLFQHQRVHTGEKPYECHECGKFFRHISSLIKHRRVHTGEMPYECGECGKFFSQSSNLIQHRRVHTGERPYECSECGKLFSQSSNLIKHRRVHTGESPHECSECGKAFSYNSNLIKHQRVHTGERPYKCNECGKFFSHISSLIKHRRIHTGEQPYECSECGRFFSQSSSLSNHRRLHTGERPYGCNECGKAFSQSSDLMKHQRVHSGERPYECSECGKAFSQRSNLIQHQKLHKPDRPY	271026	277789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_271422_273603_273731_274443_274567_275624
779705	contig_10437_pilon	-	1620	3	Intergenic	novelGene_38412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	45.5	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	306	1049	783828	781690	FALSE	50	AATACAGGTTATAATAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFSQHVVLFSVTCLPYCSIRGLFVYGLFFRKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLSPPGNVDYSVMSVAASPNRTFYGNGNGPYLCCPV	784133	781118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_781865_782612_782780_783426
779707	contig_8618_pilon	+	3690	6	Intergenic	novelGene_173847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.55438784326958	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	641	2014	64835	110939	FALSE	25	TACCCTTGACTCCAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKKPFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLRNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIVLLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLAKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNQKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPAVFGKDNKKKELVNNLAKIYGQIEREHQISPGDFPNLKRMQDQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVHQEETQQPVQMVKGGAFEGTLHGPFGRGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKIKGANAKKEMVRSKLPNSVLGRIWKLADIDRDGMLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE	52658	112615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8618_pilon_+_53292_64827_65005_94365_94464_106078_106492_107170_107336_110411
779708	contig_12123_pilon	+	2278	2	Intergenic	novelGene_144605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCCTAGCGACCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131907	134697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_131967_132478
779716	SIRV6	-	421	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-122	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTCGACTGTCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3165_10725_10825_11035_11109_11205
779718	contig_3780_pilon	-	2265	4	Intergenic	novelGene_169782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	293.837823750903	77	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	457	891	16242	15808	TRUE	70	AAGATACAAAACAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKREAVDGHTVSIFSQPFYTSRCGYRLCARAYLNGDGSGKGTHLSLYFVVMRGEFDSLLQWPFRQRVTLMLLDQSGKKNHIMETFKADPNSSSFRRPDGEMNIASGCPRFVAHSTLENAKNTYIKDDTLFLKVAVDVTDLEDL	19016	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3780_pilon_-_3647_15554_16386_16992_17166_18876
779721	contig_16578_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_148684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTCCCAGCCAGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303820	304390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_303800_304400
779724	contig_998_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_153783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAACCTGTGTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310423	309540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_309500_310400
779725	contig_998_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_153782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAGACTAATTGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309138	308404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_308400_309100
779726	contig_15326_pilon	+	1383	9	Intergenic	novelGene_157701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGACTCCAGATGGACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19280	93163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_19928_20501_20631_41213_41290_65158_65217_66494_66584_81942_82031_83621_83740_89512_89602_93074
779727	SIRV6	+	412	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	444	0	271	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
779729	contig_12292_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_167024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443126	441099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_441100_443100
779730	contig_17432_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_159006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62804	61202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_61200_62800
779731	contig_8167_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_155651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	3	518	131898	132413	NA	15	CAATTGCAGGTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	131895	132787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_131900_132800
779734	contig_11855_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_66978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGGTAAGGTTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085507	1084034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1084000_1085500
779735	contig_17274_pilon	+	1120	8	Intergenic	novelGene_26464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	260.150427441431	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	56	313	7027	26383	TRUE	45	CTACTTTGAGAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLELVLHFLTGHDPRPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEVSEEMSS	6971	42679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26474_27831_28001_30127_30212_31277_31349_36255_36337_41218_41507_42655
779736	contig_19181_pilon	-	1516	2	Intergenic	novelGene_173849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	15	668	19640	16963	FALSE	50	TGACAAAGAAGGACATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICKEMNIKLSKETLVINLVKNSKTQESFQDECEDYINMQKARELQPNTCFRKMEESFLETCEYREVIDFGPKQRMFEQRFPYETFQTYPGPHSISQAVENQLPHYLPAHSQTRYDSFQDELEDYIKEQKARGLEPKTCFRKMEDNFMETHGYREKWLILDLDIEYVNRDFHLRLPRPTKDHTVFHQRKTSYCIGYQLLQRGHITLSKMHLKMTSKSRKLED	19654	16114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19181_pilon_-_17597_19620
779737	contig_9195_pilon	-	2225	1	Intergenic	novelGene_155701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	798	1160	936313	935951	NA	50	TAGAAAATAACCACAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNNLKGPTRGIGADCITSDLAEEKFWNKDNLINSPKGRVEGGKNQKSENTVKPVKARTCVRRKPAGEGKLKYFPLIESDRKVVRLRPVKVGKLLRPRETRRSCRSRLSQISLYIKQNIM	937110	934885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_934900_937100
779740	contig_6065_pilon	+	847	3	Intergenic	novelGene_132707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	44.5	401	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	18	584	507715	519359	FALSE	30	TAGCAAGAATTGTATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSGKMACGMLVLVVPLWPSTGGLLRNCLERLQRNFLQSRPGFPSPPWGPTLAVQGPAVFGEPANDSSGSKEISSLLDSIFWMAAPKNRRSIEVNRCRRRNPQKLIKVKHNIDICPECGHLKQKHVLCGYCYEKVRKETAEIRKQIGKAEGGPFKAPTTETMVLYTGETPAEQDQGKRIIERDRKRPSWFTQN	507697	519622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_507845_509598_509781_519104
779742	contig_9434_pilon	-	2322	2	Intergenic	novelGene_150518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469843	466484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_467348_468384
779743	contig_7593_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_127277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAAAAAAAAAACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41069	42699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_41100_42700
779744	contig_7410_pilon	-	1671	2	Intergenic	novelGene_106073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	634	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	661	1164	365811	361340	FALSE	30	CTTGCAAAGCTTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEWMKKSPLEWQDYIYKEVKVTASEKKEYKGWVLTTDPVSANIVLVNFLEDGSMSVTGVMGHAVQTVETVNDGDHRVREKLIHLFMSGDCQAYSPEDLEKRKNSLKTWLEKNHIPITEQGESQRTICVARVLTIEPPYGPENCISSNEIILSRVQDLIQGHLTASQ	366471	360832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_361716_365683
779748	SIRV2	-	265	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	660	23	660	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4072	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
779749	contig_10163_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_82664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACAAGTTCATCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328454	328876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_328500_328900
779750	contig_19559_pilon	-	2427	5	Intergenic	novelGene_163438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	32.6305071980195	3	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	207	704	94417	88362	FALSE	50	AGATGAGATACAATGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGGK	96002	86638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_88437_88896_88967_90108_90180_94135_94418_95796
779752	contig_10496_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_59419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTCCCTTAGAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37989	38737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_38000_38700
779753	contig_7657_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_30051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTACCTTAAATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360415	361592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_360400_361600
779754	contig_6163_pilon	+	907	5	Intergenic	novelGene_103773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	46.3808958516327	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	176	907	9706	13786	FALSE	10	CTGCGGATCGCCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLEQELADLHGKDAALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHLKELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGGGIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEEL	9530	13786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_9716_10262_10443_10772_10938_12771_13041_13678
779756	contig_6446_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_149180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGATGCAGTTGCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161576	162787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_161600_162800
779763	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
779764	contig_9290_pilon	-	852	4	Intergenic	novelGene_77547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.5407887880287	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	370	690	479978	478765	FALSE	30	TAGAGTTATCTTTGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPWRLSHASCVTMLALMPQTSSISCGLGMPRGGMWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDTPPPGGRGRGRGRPH	497120	478602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480000_491386_491545_496930
779765	contig_6069_pilon	+	1549	9	Intergenic	novelGene_8072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	93.5052638892592	11	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	81	974	560908	564608	TRUE	25	TTTCCTAGAGCAGTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRRPPLLPDSLLSAVPRHPRPARPLMAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLARVMLPRCSSRMCMGHRAQQPRGPGPSTAIPASACPAVATLPSAEAS	560827	566828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563979_564468_564695_564775_564896_565907_566033_566584
779772	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
779774	contig_11702_pilon	-	895	6	Intergenic	novelGene_141954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	187.121992293797	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	129	479	319845	295562	TRUE	10	TCGTGCTTCAGGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRRLRTRSSPCGSSQRA	321152	289167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295611_313743_313853_318184_318286_319753_319887_321065
779775	contig_5018_pilon	+	756	6	Intergenic	novelGene_47136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	453.010551753488	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	73	654	1498209	1500271	FALSE	15	TCCTCAATCTGGGACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497675	1500373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499581_1500193
779778	contig_5918_pilon	-	2364	19	Intergenic	novelGene_99491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_17	91.4374406660398	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	257	2329	242136	192800	FALSE	35	GGAACGTTTGAAACACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEKKYRKCEKAGCTATCPVCFASASERCAKNGYTSRWYHLSCGEHFCNECFDHYYRSHKDGYDKYTTWKKIWTRNGKTEPSPKAFMADQQLPYWVQCTKPGCRKWRQLTKETQLTPQIAKTYRCGMKPSTAVKTETSDHCALPEDLRVSEVSDHWWYSMLILPPLLKDSVAAPLLSAYYPDCVGMSPSCASTHRAASDATSGKLEHSKAVPSVLVPGMNRYFQPFYQPNECGKALCVRPDVMELDELYEFPEYSRDPTMYLALRNLILALWYTNCKEALTPEKCVPHIIVRGLVRIRCVQEVERILYFMTRKGLINTGVLSVGTDQHLLPKDYHNKSVIVVGAGPSGLAAARQLHNFGIKVTVLEAKDRIGGRVWDDKSFKGVTVGRGAQIVNGCINNPIALMCEQLGIRMHKFGERCDLIQEGGRITDPAVDKRMDFHFNALLDVVSEWRKDKTQLQDVPLGEKIEEIYKAFIKESGIQFSELEEQVLHFHLSNLEYACGSDLHQVSARSWDHNEFFAQFAGDHTLLTPGYSVIIEKLAEGLDIQLKSPVQSIDYSGEEVQVTTTEGTVCAAQKVLVTIPLALLQKGAIQFNPPLSEKKMKAINSLGAGIIEKIALQFPYRFWDNKVQGADFFGHVPPSASKRGLFAVFYDMDPQKKHSVLMSVIAGEAVASVKNLDDKQILQLCMAALRELFKEQDVPDPTKCFVTRWSADPWIQMAYSFVKTGGSGEAYDIIAEEIQGTIFFAGEATNRHFPQTVTGAYLSGVREASKIAAF	244247	192764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_192884_197847_198001_199308_199432_200844_200971_201656_201774_205155_205231_205866_205999_207620_207749_210137_210310_211259_211398_215311_215387_215942_216120_219748_219934_222305_222511_225685_225725_239578_239696_242109_242222_242980_243071_244166
779780	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779781	contig_3077_pilon	+	1850	9	Intergenic	novelGene_26787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.3435104328479	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	682	1209	459530	463345	FALSE	20	AAAGGGTTGTTGCATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLDSLKIGDMVEFRGPSGLLTYTGKGNFNIQPNKKSPPELRVANKLGMIAGGTGITPMLQLIQAILKDPEDPTQCFLLFANQTEKDIILRDDLEELQARYPNRFKLWFTLDQPPEDWAFSKGFVTANMIQDHLPAPGDDVLMLLCGPPPMVQLACHPNLDKLGYSQKMRFTY	457870	463986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_457938_458247_458398_458533_458607_458890_459237_459484_459615_460310_460395_461300_461387_462233_462334_463172
779782	contig_7151_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_40714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGATGAACGTTGGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231149	229036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_229000_231100
779791	contig_817_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_132460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGGGAGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571920	574023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_571900_574000
779795	contig_15067_pilon	+	2575	6	Intergenic	novelGene_154321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_5	56.5628853578033	390	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	142	885	52581	69537	FALSE	20	GATGAATTCGTGTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGYEEVSQKFTSIRCVRGDNYCALRATLFQAMSQPAELPLWLQDPELTLLPEKLISRYSWIKQWKLGLKFDGKSEDLVDRIKASLTLLRKKWAGLAEMRTAEARQIACDELFTNEEEEYSLYEAVKFLMLNRAIELYDDQEKGKDVPFFSVLLFARDTSSDPGQLLRNHLNQVGRTGGLEQVEMFLLAYAVRHTIQVYRLSKYNTEEFITVYPTDPPEDWPVVTLIAEDDRHYNVPVRVCEETYL	46126	71227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_46181_52493_52590_55904_56049_62938_63065_65759_66030_69342
779798	contig_20378_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_159561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCACTGAAAACCGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6308	7577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_6300_7600
779799	contig_15486_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_157311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50841	50414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_-_50400_50800
779801	contig_6062_pilon	+	1771	2	Intergenic	novelGene_5278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	590	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1132	1557	715074	726134	FALSE	80	CTACAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFLNFTYFLPFEIYLGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKGRIGYFP	713942	726348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_715284_725918
779803	contig_6458_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_163740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTGTTAAAATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62886	62035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_-_62000_62900
779806	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657499	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657500	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
779807	contig_6576_pilon	-	2330	1	Intergenic	novelGene_42250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307515	305185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_305200_307500
779808	contig_6885_pilon	-	3347	1	Intergenic	novelGene_83664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGTGAACTGGGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197842	194495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_194500_197800
779811	contig_6589_pilon	-	1822	15	Intergenic	novelGene_26268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	63.7391047112191	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	123	704	2233261	2230875	TRUE	15	CTTCAAGCTTGGCCAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAELRNRLAGLWAECLGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWK	2233774	2227810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228375_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229502_2230523_2230632_2230735_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
779812	contig_4908_pilon	+	1534	1	Intergenic	novelGene_117377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60096	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_60100_61600
779815	contig_2646_pilon	+	1381	10	Intergenic	novelGene_69695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	87.1394511723438	368	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	36	1175	2412283	2449537	FALSE	20	TTGTAATCAGAGGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRGWARRGWGCGQAWAPLLGGRSCEELSAALASPRLLGRRFNLFVQQKCGFRKAPRKVEPRRSDTGTSGEAYKRSSLIPPVEETVFYPSPYPIRTLIKPLFFTVGFTGCAFGSAAIWQYESLKSRVQSYFDGLKADWLDSIRPQKEGDFRKEINKWWNNLSDGQRTVTGIIAANVIVFCLWRVPSLQRTMIRYFTSNPASKVLCAPMLLSTFSHFSLFHMAANMYVLWSFSSSIVNILGQEQFMAVYLSAGVISNFVSYVCKVATGRYGPSLGASGAIMTVLAAVCTKIPEGRLAIIFLPMVTFTAGNALKAIIAVDTAGLVLGWRFFDHAAHLGGALFGIWYITYGHELIWKNREPLVKIWHEMRTSGPKKGGGSN	2412247	2449743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2412408_2423862_2424059_2424581_2424723_2428026_2428076_2436009_2436106_2436677_2436828_2438764_2438836_2446645_2446748_2446882_2446981_2449425
779816	contig_1996_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_131865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	92	310	84063	83845	NA	30	AAGGAGCAGCTGGTAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVLPTPKAVAVESTLTHGNLACVRAELCSMGFSMADFSEIDRQCFLPRHKSAGEDPVICPGGVNLSLRQWDRGRGHCNFHDSGMFLTNLYPSIRNANKEPP	84154	83282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_83300_84200
779817	contig_14322_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_115669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGTGGGGTGGGCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622995	623539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_623000_623500
779819	contig_4816_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_115599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTGAAAAAAAAATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28778	26678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_26700_28800
779823	contig_10148_pilon	-	2765	2	Intergenic	novelGene_172861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251140	245758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_248056_250672
779825	contig_6837_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_149805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGCGTTGCCTACGGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9122	10822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_9100_10800
779826	contig_8312_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_152872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCATGCATTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219856	220288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_219900_220300
779828	contig_20622_pilon	-	1819	2	Intergenic	novelGene_173851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	247	1491	11652	10408	FALSE	25	GATGACTGTTATCCATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQFISDFLSGKKLQQLSSEFLPYYSTLISKAGGILSQETINDIQEDLVKGKLKDMVGKIQKSLVEAENAPLDVAVIGECGTGKSSFINALRGLSHEEEGSASTGVVETTMKKTPYQHPKYPKVTFWDMPGSGAPNFSLETYLETVEFAKYDFFIIISSTRFNENDALLAQKIKNVGRKFYFVRTKVDNDLHNEEISKPKSFKKERVLQQIRDYCLANLSDIGVPEPHIFLVSNFDLTDFDFPKLEETLLKELPAHKRHTFVLLMPCLSDSAIEMKRDFFKEKIWLDALKTSALAFVPFMPFIYGFDLPEQEKCLAHYRSHFGLDDKSIKEIAQNFGISEQEIRSSIKSLDFQLLVKDDCTIAKAKTCVEAYCSVTGGLKSSILQFVKTYILHLKFLNTVADDAKIILHKTLGS	20110	10079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20622_pilon_-_11673_19884
779831	contig_12969_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_61669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	925	1233	323261	322953	NA	15	CAGATTTATCTTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPKLIPMRWRSDIPAVSNLFSNSDTSPPPHDTLASMLGLIIHCNGHTELTDHTQIMWFISEITGYNSGYLDTTLDTVLQSGWSSDKTAHSFFSVIPAGRP	324185	321871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_321900_324200
779833	SIRV2	-	243	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	683	22	683	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4049	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
779835	SIRV2	-	548	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4325	34	3150	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
779840	contig_6189_pilon	+	2316	2	Intergenic	novelGene_164932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCAATTGAGAAGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33278	39467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_33313_37185
779842	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	51	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779845	contig_10861_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_39412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1959520	1957612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1957600_1959500
779848	contig_7004_pilon	-	1750	10	Intergenic	novelGene_126494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	29.8370057743777	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	646	1569	410049	408487	FALSE	45	ATCACAATAAAGTTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRGARLPGIFGVQVRERAQKENYSSVLRIFQRSYIVQPVIAPSQGLRDARGRAPHSAGANLRRYNEATLYKEVRDLLARPGWAEALREAGTILLRAPRSGRSLFFGGCGAPLQRGDPRLWDIPLATRRPTFRELQCVLHKLTTLHVHGEDPRETVRSDSPQTHWKTVKEERKEAIEEERRKVPSNENEALGKNAESPKQGLEGEDTFQVELELVEMTLGTLDLREFEVLPKQSRKKRNKKERSRNLEAGAHRTLPQQPQEDEALTESALADTTPLGPLLDEAKAPGHPELWDVLLAACRAGNTGMLKLQLAASLTDPGVTSLLSAPLGSGGFTLLHAAAAAGRGSVVRLLLEAGADPTVQDSRAQPPYTVAADKSTRNEFRRFMEKNPDAYDYNKAQVPGPLTPEMEARQATRKRQQKAAHRLREEQQRKQREQEKQEQEQQQRFAALSDREKRALAAERRLAAQLGAPTSQIPDPVIINVRRCWSCGTSLQGLIPFHYLDFSFCSTRCLQDHRSRAGRPSS	414494	408305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_408611_408831_408918_409054_409223_409356_409469_409615_410097_410782_410939_411126_411356_411636_411723_413208_413303_414461
779849	contig_7398_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_166172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAATATCTGTTAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225889	225127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_225100_225900
779850	contig_16647_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_170315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352039	354770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_352000_354800
779851	contig_8616_pilon	+	964	11	Intergenic	novelGene_72504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	209.628146965049	77	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	404	871	337915	339244	FALSE	5	CGCGCTTGACTCCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336783	339337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337383_337467_337538_337778_337814_337896_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
779852	contig_15327_pilon	+	1877	4	Intergenic	novelGene_70835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	40.4227658628155	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAACACCAATAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640941	1645225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1640969_1641609_1641709_1643312_1643361_1643522
779858	contig_19579_pilon	-	812	3	Intergenic	novelGene_59405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.5	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	106	657	13090	7943	FALSE	35	AGAGATTCTGGAACCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8056_12012_12262_12900
779861	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
779864	contig_13542_pilon	+	1028	10	Intergenic	novelGene_131499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1003.03747329774	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	57	875	346638	505589	TRUE	10	ACACCCTGCCCCCCCGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346581	505848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501_505679_505784
779874	SIRV4	-	265	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1258	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3900	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
779876	SIRV6	+	246	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8472	-2	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
779878	contig_13744_pilon	+	1793	12	Intergenic	novelGene_77187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	69.896144917872	2	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	625	1791	741333	753491	FALSE	75	TAAAAAGAACAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPHQALFGTSGEHFNLFSAGLERASNLLGDVGLSKGRKLGISGQAFGVGALEEEDDDIYATETLSKYDTVLKDEEPGDGLYGWTAPKQYKSQKESEKDLRYIGKILDGFSLASKSLSSKKIYPPPELPREYRPVHYFRPVVAATSENSQLLQVLSESSGKALCDPGTHSRHQLNASKRGDLLGETPIQGSATSVLEFLSQKDKERIKEMKQAAELKAAQLKAKSLAQHALSGRPQPSSPDLGHCSRHMASSGRTATVRASNFKPFAKDPEKQKRYEAFLVNMKQGHKDALERCLDPNMTEWERGRERDEFARASQLYVSSHSTLSSRFTHAKNDISDKQSAVKMKMFGKLTRDTFEWHPDKLLCKRFNVPDPYPDSTLVGLPRVKRDKYSVFNFLTLPETASLPAAQASSEKVQQHRGPDKSRKPSRWDTSKEEKKEDSISEFLSLARSKVGTPKQEPSPLVNKEEEHATESLSNKMVNKGADSQSEGEVSRPSMDLFKAIFASSSDEKSSSSEDEQGDSEDDQAGVGEADFKHSEETDLVETSSVAPTSEPAPQAPAPSFSIQKMHIDEREEFGPRLPPVFCPNARRTLEIPQKEK	731920	753493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_732053_733057_733206_735926_736007_739294_739500_741273_741571_742564_742699_743023_743152_743963_744101_744461_744629_749301_749519_751190_751299_753453
779880	contig_6489_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_128942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGGCAATAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266947	264871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_264900_266900
779881	contig_4232_pilon	-	1848	2	Intergenic	novelGene_63482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	600	junction_1	0	161	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGATCTCTGCTGGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610840	607750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283
779882	contig_16846_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_82997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTAGGTTGGAAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580448	579958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_580000_580400
779883	contig_14807_pilon	-	612	6	Intergenic	novelGene_124709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	6	611	39773	37286	FALSE	15	GTGGCCCCTTGGACAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPN	39778	37284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
779884	contig_10104_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_160142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGACAACTATAACCTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541215	542374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_541200_542400
779885	contig_10235_pilon	+	1287	7	Intergenic	novelGene_46561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	35.0305422294444	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	609	938	438713	440204	FALSE	5	GGTTTTCTGGTTGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTFGFKDPEITQLVNAGVLTVRDAGSWWLAVPGAGKFIKYFVKGRQAVLGMVRKAKYRELLLSELLGRRAPAAVRLGLSYHVHDLIGAQLVDCISTTSGTLLRLPET	432291	440553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_432482_432629_432850_438244_438341_438610_438751_439591_439690_439801_439950_440158
779887	contig_405_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_135281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCTTCATTACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51071	48785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_48800_51100
779888	contig_9909_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_42471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATCAGCTACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640462	640063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_640100_640500
779889	contig_9909_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_42470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTCTAAGATAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638883	637976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_638000_638900
779891	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779892	contig_7091_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_131789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTAAACAGATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421270	421675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_421300_421700
779894	contig_6710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_96469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
779899	SIRV7	-	382	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56093_70877_70988_78841_78964_114680
779900	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8120	11	619	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTTATTGTATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
779903	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	2	410	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779912	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779913	contig_18613_pilon	+	767	6	Intergenic	novelGene_80213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_3	1150.88880435948	60	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	113	601	24385	31105	FALSE	30	TGCTTATACATAATTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23702	31271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
779916	contig_5018_pilon	+	791	6	Intergenic	novelGene_47141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	236.389509073478	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	70	666	1498209	1500271	FALSE	15	GCCGGGCTAAGGCCCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497678	1500396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
779919	contig_19518_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_170718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGGAGACGCTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37612	36356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_36400_37600
779922	contig_12884_pilon	+	1167	4	Intergenic	novelGene_104972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	116.973881225207	702	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	112	504	512166	513121	FALSE	5	CTGCGCAGCCCGCCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFLPVLLAALLGVERAHSLVCFSCKNQKSNFNCLAPTMCSSSDNYCVTVSASAGIGNMVDLGRTLNKFCSPICPGPSINLEVVSVSTHCCQSFLCNISAAGGGPRVSATVLGGGLLLSLLAALLRPGL	510532	513784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_510598_512119_512218_512679_512800_512900
779925	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
779927	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
779928	contig_4364_pilon	+	1321	4	Intergenic	novelGene_84	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	36.4630711207319	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	480	863	849523	851164	FALSE	10	CTTTCTGAGTCCCCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRINFSGSQHNLTITMQRLQPADTGVYTCQAIVDDKISGAGTLVVVTDKSSPRADLCRNDWARAFGLPVALAVCCFLAGLVLGVVCAPRTTQIKKLCSRTDRSADVVVYEDMSCSRHNTLSIPNQYQ	848226	851622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_848336_849152_849665_849901_850036_851056
779929	SIRV6	+	415	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779931	contig_15185_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_99378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42466	44810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_42500_44800
779932	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	53	486	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
779935	contig_13112_pilon	+	864	8	Intergenic	novelGene_98853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	12.6813377263841	328	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	111	770	983764	987285	FALSE	5	CTGGTGTCCAGCTGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGYWDIRGLAHAIRMLLEFTDSAYEEKRYTCGEAPDYDRSQWLDVKFKLGLDFPNLPYLLDGKNKITQSNAILRYIARKHNMCGETEEEKIRVDIIENQVMDFRMQLVQINYSPDHEKLKPQYVEQLPGKLKQFSLFLGKFSWFAGEKLTFVDFLAYDVLDQNRMFEPKCLDEFSNLKAFMCRFEALEKIAAYMQSDRFFRMPINNKMAKWGNKRIC	983653	987379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_983794_984174_984251_984630_984696_985992_986075_986164_986266_986598_986695_986781_986893_987186
779945	contig_15405_pilon	+	2274	1	Intergenic	novelGene_112095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTCAGGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37205	39479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_37200_39500
779948	contig_7753_pilon	+	2336	1	Intergenic	novelGene_41519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCAGGTGCTACTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261541	1263877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1261500_1263900
779949	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
779951	SIRV6	+	329	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	23	-244	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
779953	contig_6557_pilon	+	681	4	Intergenic	novelGene_32987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5673.82428349698	39	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434248	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435470_436630_436772_439911
779964	contig_3155_pilon	+	1493	2	Intergenic	novelGene_26424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	291	380	261316	261405	FALSE	45	AAGATTTGAATAAAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPIYPPGSTVLVEGGYDAASTPWLPSQCCSARSHAGSQRPRNSAEGKLLHGWLRWWLHHLVRSQGHLCAGKDITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	259879	262518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259937_261082
779972	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
779973	contig_10734_pilon	+	1802	2	Intergenic	novelGene_51209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	161	499	1147081	1147419	TRUE	50	AAATCCTCAATTATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVDFGDLELFEAFDHPEESIPKPVHTRFKDDDDDDDEEEEEENGVGDAELRERLRQCEDTIERLRAENILPARGPCHTGVWSGLSSGSGAAEIPTGPEFQVVPLAPQAD	1146920	1161155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1148638_1161070
779974	contig_10_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_173852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTTCTTCCAAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11221	9535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10_pilon_-_9500_11200
779975	contig_7179_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_78185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATTATAAATTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194270	1194610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1194300_1194600
779976	contig_8964_pilon	-	2046	5	Intergenic	novelGene_168686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	23.4454153300811	13	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	74	1489	430584	416334	FALSE	10	CCATTAGTGTTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVSLDTVPSYPQPQRPLPTSRGLMTPERSGFSGLCVFTKINQKRTGQFLNSKTMAHGLVTFADVAIDFSQEEWACLDTAQRDLYWDVMLENYSNLVSLDLVSTYETESLPTEKNIYEISFSQWNAHRKSKSTGLDWKCTGEFEASPGHQERYIHQMIINCEKTPTCRESTSGRPPQKPHNRENSFECKDCGKAFSRGYQLAQHQKIHTGEKPYECKDCKKAFRWGNQLTQHQKIHTGEKPYECKDCGKAFRWGSSLVIHRRIHTGEKPYECKDCGKAFRRGDELTQHQRFHTGEKDYECKDCGKTFSRVYKLVQHKRIHSGEKPYECKDCGKAFICGSSLVQHKRIHTGEKPFECQECGKAFTRVNYLTQHQKIHTGEKPHECKECGKAFRWGSSLVKHERIHTGEKPYKCTECGKGFNCGYHLTQHERIHTGETPYKCKECGKAFIYGSSLVKHERIHTGEKPDECKECGKAFSNVIQLREHQKIHTGEKHCA	430657	415776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_416438_416521_417608_421155_421283_425200_425286_430570
779977	contig_17274_pilon	+	2468	11	Intergenic	novelGene_26557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	271.82869605691	1	136	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	427	1026	203712	213531	TRUE	35	GCTGTCTATGTAAGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAEDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	186545	216871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_186632_195741_195817_202343_202583_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211605_213058_213180_213468_213542_215439
779983	contig_19721_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_99152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGAGTGTATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145755	143565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_143600_145800
779986	contig_6795_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_27719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTACTCAGCTGCCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256150	255563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_255600_256200
779987	contig_6795_pilon	-	1705	8	Intergenic	novelGene_27718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1123	1431	250524	238100	TRUE	20	CCACGCGCGCCCTAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKNMDVAEIFFFSVMNPWVRWPPSGRSRPMMRPWGSTRAVYTAKLAGEPETVGLDIDPPALGVQVVDLQCPLLAENLQLINELCPAIIPLAWVPLRVFVI	255316	226158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_226209_235133_235247_237988_238136_249901_250015_250364_250533_252196_252278_252757_252972_254497
779988	contig_20822_pilon	+	1758	6	Intergenic	novelGene_170640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	26.2221280600946	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	243	1700	72690	78052	FALSE	35	TTGGAGATGTTAAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEYPKKRKRKTLHPSRYSDSSGVSRIADGFSGIFSDHCYSVCSMRQPDLKYFDNKDDDSDTETSNELPKFTDGIKARNRNQNYLVPSPVLRILDHTAFPTEKSADIEIDDEECDSPESVNQQTQEENPIEVHTAEDVPIAAEVHAVSEDYDIEAENNSSESLQDQTDDEPPAKLCKLLDKSQALNVTAQQKWPLLRANSSGLYKCELCEFNSKYFSDLKQHMILKHKRTDSNVCRVCKESFSTNMLLIEHAKLHEEDPYICKYCDYKTVIFENLSQHIADTHFSDHLYWCEQCDVQFSSSSELYLHFQEHSCDEQYLCQFCEHETNDPEDLHSHVVNEHACKLIELSDKYNNGEHGQYSLLSKITFDKCKNFFVCQVCGFRSRLHTNVNRHVAIEHTKIFPHVCDDCGKGFSSMLEYCKHLNSHLSERIYLCQYCEYSTGQIDDLKIHLDFKHSADLPHKCSDCLMRFGNERELISHLPVHETT	68386	78110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_68546_72005_72078_72678_72748_73811_73923_76606_76742_76898
779989	contig_3397_pilon	+	1985	3	Intergenic	novelGene_154594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_1	246	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	830	1474	203312	206594	FALSE	15	ATGCTCTATTTTACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLCSCLYCVLASHHFLFFYPLSLFLVSETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	202482	207105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_203769_204799_204894_206500
779990	contig_12938_pilon	+	1386	7	Intergenic	novelGene_99741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1001.37682994743	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78098	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_78176_79040_79230_80721_80797_81385_81437_83391_83470_84550_84635_85486
779991	contig_6870_pilon	-	2400	3	Intergenic	novelGene_103984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	17.5	194	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	609	1685	1474735	1471932	FALSE	20	CACCTTTGACTTTTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEHGAHITTASVVDDQPSIFEVVAQDSLMTAVRPALQHVVKVLAESNPAHYGFLWRWFDEIFTLLDLLLQQHYLSKTSASFSENFYGLKRIVMGDTRKFQRLASAGLPKQQLWKSIIFLVLFPYLKVKLEKLVSSLREEDEYSIHPPSSHWKRFYRAFLAAYPFVNMAWEGWFLVQQLRYILGKAQHHSPLLKLAGVRLGRLTVQDIQALEHKPVEASMKQPPASVSKKIKSTLKKAVGGVALSLSTGLSVGVFFLQFLEWWYSSENQETIKSLTALPTPPPPVHLDYNSDSPLLPKMKTVCPLCRKTRVNDTVLATSGYVFCYRCVFNYVRSNQACPITGYPTEVQHLIKLYSPEN	1475343	1471216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1472332_1473736_1474288_1474609
779994	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	0	3569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
779995	contig_7057_pilon	-	1705	4	Intergenic	novelGene_123363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	18.1903515328563	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	43	1545	984766	971819	FALSE	30	ACACTCAGTGTTTACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRDSGSGQAIPKAMAQGLVTFRDVTVEFSQEEWKYLEPAQKDLYRDVTLENFSNLVSLGISISKSDVISLLEQRKEPWMIAKDMTEQWYPDLVSRCEKLPQKDVFEIESFSWEIMERLKYCDLEGSSFRDAWKCIDQFERQQKTQEYYFKQVRITYENLPTFENHTSFTLHHGNESGEKLTECNECGKAFSRGAHLTQHQITHTDEKPFECKECGKAFRRASHLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKAFGRTTELTLHQRVHTGIKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYQCKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHRRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPYECKECGKAFSRSSYLTQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTYEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRVHTG	984808	971658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_973090_974890_974987_975856_975984_984757
779998	contig_8676_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_142231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAACATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707817	705823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_705800_707800
779999	contig_15105_pilon	-	411	3	Intergenic	novelGene_151034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	977.5	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	30	410	839916	831498	FALSE	65	TAAGGAACAAAGAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSNN	839945	831496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_831504_836239_836548_839849
780001	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	875	-40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
780002	contig_6710_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_98265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	TCAGTCCCAGCCTCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
780005	contig_4857_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_48651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATTACTATTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441037	442807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_441000_442800
780006	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780008	contig_10446_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_162444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCAGTACCGTACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213597	213103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_213100_213600
780009	contig_16647_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_170318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAACTGAAGATTAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364396	365451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_364400_365500
780012	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
780013	contig_8317_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_19929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTCATATCTCGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16784	16409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
780016	contig_14397_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_134649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCTTACTACCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92737	91100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_91100_92700
780021	contig_20641_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_52879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAGAGAAATAAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58596	60386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_58600_60400
780025	contig_11285_pilon	+	1482	8	Intergenic	novelGene_5571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	263.036584713912	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	40	1191	766060	769878	FALSE	30	TGCTCCAATAAAGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLVSWVALVAGLVAGTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763518	770169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766426_768478_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
780027	SIRV6	+	332	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1675	0	-224	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2799	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780036	SIRV6	+	410	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	10	363	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780038	contig_2093_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_152973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	607	972	1318017	1318382	NA	20	TTGTTTTTGTAATTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDQRKTDAFELWCWRIILNIPWTARRMNKFVLEEVQPECSLEARMARLCLTCFGHVARRDQSLEKDIMLSKVEGPGKRGRPSKRWIDTVAATVGSNIAMIVRMVQDGAVFHLIYIGLL	1317410	1319843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1317400_1319800
780039	contig_14704_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_82685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACTGCTCTCACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46435	48675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_46400_48700
780040	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	533	-1	-42	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGAAGTCGAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
780042	contig_4402_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_140871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625849	623817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_625199_625630
780043	contig_610_pilon	-	1707	5	Intergenic	novelGene_76826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	788	1243	363972	361078	TRUE	20	AGTTCTCAGGCTGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	366947	349996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_350135_360751_361082_363028_363298_363789_364137_366324
780044	contig_12724_pilon	-	1470	6	Intergenic	novelGene_146866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	26	junction_5	50.257735722971	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	87	1031	541481	440995	FALSE	25	CTTTGATTACAGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPGLSRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDGVSKDSDSAVFMETTEELFEQLESHSLSPSDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDHVRVISTFFNYWITHILPQRNSE	541567	440555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445957_448443_448537_448584_449011_497701_497837_541459
780047	contig_13740_pilon	-	1429	2	Intergenic	novelGene_34720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165308	163327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_164516_165067
780049	contig_504_pilon	-	1832	2	Intergenic	novelGene_54407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAATTTTTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47683	44497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_46253_47606
780052	contig_16846_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_82965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9069	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552714	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661
780053	contig_11630_pilon	+	2300	4	Intergenic	novelGene_147164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_1	143.495257374203	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTCTTTCTTGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77614	133838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_97081_97254_131895
780054	contig_11338_pilon	-	1249	10	Intergenic	novelGene_6230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	115.594117497388	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	456	1124	13877	12549	FALSE	30	TATTATGGAAACCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21335	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_15119_15189_16641_16765_17075_17288_21286
780068	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_97618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	653885	653562	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653887	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780069	contig_16846_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_82891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1428	1739	369838	369527	NA	15	TTATTGTCTTTTCATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFPKEACLPSCTDTFWRHSVLSSIKACSCFTDPCSSSICRQQIVVSCKGSLASLMFLKHARQAPASRAFCLLFFQIGMLMPNIFCLLLQIHTLLFSISRSI	371265	368722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_368700_371300
780070	contig_11574_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_64055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGTCTGTGTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446406	447555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_446400_447600
780073	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
780074	contig_7202_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_17903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
780076	contig_14219_pilon	-	1351	6	Intergenic	novelGene_54390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	62.7171427920628	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	327	746	1116288	1107875	FALSE	35	ATGATGAACAATTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RILIDTGEPAIPEYISCLKQALTEYNTAIQEIIVTHWHHDHSGGIRDICKNISDDIAYCIKKLPRNPHKEEIIGNGEQQYVYLKDGDLIETEGATLRVIYTPGHTDDHMALLLEEENALFSGDCILGEGTTVFEDLYDYMNSLKELLKIKANVIYPGHGPVIYNAEAKILQYISHRNIREQQLLAIFRENFEKSFTVTELVKIVYKGIPENLHNMAKNNVSLHLKKLEKEGKIFSNKDPDKKWKAHL	1133846	1107269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1107919_1108569_1108652_1114015_1114165_1116143_1116323_1122717_1122845_1133681
780085	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	51	510	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
780087	contig_6048_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_73170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGATGGCTTCCCGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204596	1206517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1204600_1206500
780088	contig_15264_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_158869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAATTAGATGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89017	88521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_88500_89000
780089	SIRV4	-	352	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	262	3	-262	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCGGACGTTCAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
780090	SIRV4	-	262	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1259	0	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
780092	contig_3787_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_102395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGAGAAAATGAGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458656	459832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_458700_459800
780097	contig_9895_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_144707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAAGACTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417534	416466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_416500_417500
780098	contig_4151_pilon	+	2446	1	Intergenic	novelGene_65295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTACCAAAAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745685	748131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_745700_748100
780102	contig_18604_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_173853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5653	4771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_-_4800_5700
780104	contig_10482_pilon	+	1438	13	Intergenic	novelGene_152847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	279.133032799775	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	7	1251	160197	196230	FALSE	75	AAAAAAAAACAAAGGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMLSPVIREAEVTRTARKQSAQKRVLIRASQDENFANTTPRNQVIPRTPSSFRQPFTPPNRSLLKQPDVSCVLGTGGRSPRLTQSSGLLGNLSMVTNLDDSNWATAFSSQRSGLFTEPHNMTEDITLSAVMLREDDPGEAASMSMFSDFLQSFLKHSSTTVFDLVEEYENICGSQVNILSKIVSRATPGLQKFSKTASMLWLLQQEMVTWRLLASLYRDRIQSALEDENMFTVTALNASEKAVVEALFQRDSLVRQSQLVVDWLESIAKDEIGDFSDNIEFYAKSVYWENTLHTLKQRQLTSYIGTVRPLVTELDPDAPIRQKMPLDDLDREDEARLLKYIFTLIRAGMTEEAQRLCKRCGQAWRAATLEGWKLYHDPNVNGGMELEPIEGNPYRCIWKISCWRMAEDVRYNNIF	160190	196417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_160273_160903_160991_162002_162119_165592_165732_173062_173167_176056_176185_177914_177964_182397_182470_182804_182894_193384_193464_195065_195180_195885_195977_196129
780105	contig_3948_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_53226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATGAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846683	845589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_845600_846700
780107	SIRV4	-	336	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1185	0	1185	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3973	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
780111	contig_14513_pilon	-	878	4	Intergenic	novelGene_70264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1293.11518778835	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	184	552	18880	11982	TRUE	10	ACTCTGCTTTTGTCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11586_11955_12158_13087_13136_18735
780113	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
780114	SIRV6	+	250	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	455	3	-285	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCCCAATGAACAAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
780115	contig_2204_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_71687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGACTGCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50248	50824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_50200_50800
780116	contig_9706_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_21036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGGGCCATGTCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624383	623441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_623400_624400
780117	SIRV6	+	316	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	536	19	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
780119	contig_16930_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_139149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTCTCTCTTACCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78062	78907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_78100_78900
780120	contig_16930_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_139150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79114	80800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_79100_80800
780121	contig_10050_pilon	+	1578	7	Intergenic	novelGene_119611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	83.2361099523518	238	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	71	931	100426	120702	TRUE	10	TTTCCTGTTTTTGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRASAFLPLRPFSRLPLSSGSAEVSAAAILLLAAPHGTVRTKNNIQRYFGTHSVIYNKKDEQSIPTHEISEETSKSQDSVKENTKKDLLNIIKGMKIELSTVNVQTTKPPNRRALKNLEATIGRLQKATENTTKKRNENLSPELVAAASAVAESLPFDKQTTKSELLRQLRQHEEDSRAQKDGKRRWKVSVSNIISDMKVAKSATARVSTRPEHQIQFDEGSDNYFEHQRSADLRKSLRKNIFKGKRLNIFDIKAAEEVPETVGVAVRLQRLITWHRRKTKVKA	100355	131252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_100551_106951_107240_113259_113422_114461_114603_117560_117638_120634_121047_130949
780124	contig_17099_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_173859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	180	545	71736	72101	NA	45	AATAAAGTTAAATTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGINSILYQSGIYPPETFTRVQKYGLTLLVTTDPELINYLNNVVEQLKDWLYKCSVQKPMVVISRIESGEVLERRQFDTECDKTAKDDSATREKSQKAIQEEIRSVTRQITAIVTFLPLLDVSCSFDLLIYTDKDLVVPEKWEESGPQFITNSEEVCLHSFTTTIHKVNSMVTYKIPVND	71556	72807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17099_pilon_+_71600_72800
780127	contig_14450_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_49068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATGATGTGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488270	1486529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1486500_1488300
780128	contig_15304_pilon	-	1024	3	Intergenic	novelGene_30568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	176	1000	54100	52925	FALSE	25	ACTCCGTGCTCCACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54275	52900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
780129	contig_10196_pilon	-	971	5	Intergenic	novelGene_132238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	224.725805149297	74	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	163	435	1442405	1433608	FALSE	5	GGTTTTGGTTGCGTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPGSSELLGLRAERAREGSPETKGSAAAAVVAAAARLSARRDSPGRGRPRTWTMSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGLLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448676	1433071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436166_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
780130	contig_5936_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_53571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGTCAGAGACAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202239	201307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_201300_202200
780131	contig_5936_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_53570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199423	198806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_198800_199400
780132	contig_12969_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_61664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGTCTCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283927	283593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_283600_283900
780134	contig_2219_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_67192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGACTTCTGCTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183802	182951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_183000_183800
780136	contig_5317_pilon	+	1467	2	Intergenic	novelGene_76611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTAGGGGCTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754788	756295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_755751_755790
780137	contig_4884_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_63802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	10	435	260007	260432	NA	65	CTAAAAAAAAAAAAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTLMMTSEVRAEAQAPCSYHPPTDMLSLSVFILFLWFYGHQGFYLLPHHGPAVLRDHSGLHAASSLLLSWENSCKKDEARRVGQFLKSARQFTCFQLLLGCKRSKTLSFLALTVQPQLACLENPVKLLCSLMSLTLNSVTKGVL	259997	261077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_260000_261100
780139	contig_4857_pilon	-	1291	5	Intergenic	novelGene_48842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCCTAAGAACAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411074	1331394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1405451_1405553_1407010_1407073_1409985_1410244_1410359
780140	contig_6630_pilon	+	1869	9	Intergenic	novelGene_30728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	72.0516307934803	22	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	190	1143	777141	791577	TRUE	20	CTAAGTGACATGCGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLEILLASALGFAIYWFVSRDKDKEETLPTEYGWWGPGTRPTPGEDESIRPFKVETSDEEINDLHWRIDKTRLRPPLEESYFHYGFNSNYLKKILSYWRNEFDWKKQVDIINKYPHFKTKIEGLDIHFIHVKPPQLPAGRTPKPLLMVHGWPGSFYEFYKIIPLLTDPKSHGLSDEHVFEVICPSIPGYAFSEASSKKGFNSVATARIFYKLMLRLNFEEFYIQGGDWGSLICTNMAQMVPSHVKGLHLNMALILRNFSTLTLLLGRRFGGLFGYTERDLELLYPPQGEGLLQLDEGERLYAHPGHQAGHCGLCSE	761639	796280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_761824_777135_777330_779683_779865_787775_788004_788619_788750_789224_789435_791561_791672_794987_795114_795774
780141	contig_14184_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_66600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	29	319	113842	113552	NA	35	ACTGTAAATACAGTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPFGSELSIMLIRQDWSGYILSLTTLLEDVTQVTTLTVVTTVTTLIPVTPSYRLAQVRGISLRIWSVSSICMNALAKFSLFLWILHLARQHMTYSSWILSQQPVI	113870	111682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_111700_113900
780142	contig_2444_pilon	-	1474	4	Intergenic	novelGene_83783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	98.7432135502092	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	109	543	279787	245752	FALSE	35	TGAATAGTTACTTGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPIGWKASEPDGQDRLKEGGSAGLVREVSTGFSETIMAARTGQGALRKVVSGCRLKSAAAAGAPAPAQSSARNVRYLASCGILMSRTLPLHTSVVPKEIHARTFFKITAPLINKRREYSERRILGHPVQMGDFSIIWRLFGVLAQVFLATQELVPWIFQFRLNFAHSYTLSLPHSFLMKL	279895	244820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_245819_247146_247249_261967_262118_279671
780147	contig_91_pilon	-	2577	1	Intergenic	novelGene_127077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33240	30663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_30700_33200
780157	contig_6227_pilon	-	1016	8	Intergenic	novelGene_49771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	492.0258413655	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	114	779	1223803	1202870	FALSE	40	ATGCCACAAAAGAGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTEVMLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNVSGEMGLPCDEVGADQLHQATASVRPEANKLMLSGSPCCD	1224099	1202632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202953_1213109_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222115_1223372_1223446_1223746_1223838_1224020
780165	contig_7004_pilon	+	2328	5	Intergenic	novelGene_126451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	8.8423695919137	29	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1625	2227	278091	281026	FALSE	5	CTCATGCTGCTGGGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGPGLPATAQAPYPRPPESGLCCHQVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYVDKHEENHRPLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSEALIREVANKVGVPLQDLMVRNDSPCGTTIGPILASRLGLRVLDLGSPQLAMHSIRETACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSLSHNLIVD	276466	281127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_278333_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
780171	contig_10636_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_172279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAATGTTTCATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126127	127284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_126100_127300
780172	contig_10636_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_172280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127534	127871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_127500_127900
780173	contig_4782_pilon	-	1423	6	Intergenic	novelGene_73637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_5	21.9581419979014	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACACAACTTTACTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418030	391680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_392536_393199_393285_397143_397231_412788_412884_414170_414400_417958
780174	SIRV6	+	473	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	907	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
780178	contig_10331_pilon	+	1246	13	Intergenic	novelGene_54158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	395.573519996248	1	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	630	965	534757	543813	TRUE	65	GAAATATAATACTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRDLYLGIEI	501860	545889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514577_520528_520621_528501_528641_534686_534762_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543787_543864_544927_544989_545719
780179	contig_5434_pilon	-	1202	2	Intergenic	novelGene_74654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTATAATCTCAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282077	256512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_257654_282016
780180	contig_6710_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_97792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	40	CATACTAATATTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780191	contig_15067_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_154320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAGCCCAGCTTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33812	35893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_33800_35900
780192	contig_10235_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_46458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTGTGTCCCCTTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215861	216135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_215900_216100
780193	contig_6958_pilon	+	1596	2	Intergenic	novelGene_69989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	63	308	723196	723441	FALSE	35	TGAAGAATTTGAAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSPLPLVVGSLLAAGAAAIMVNLIQMVRDHWVHILVPVGFVVGCYLDRRNDEKLTAFRNKSMLFKRLVPAFFKEAVDQILGVFFLISYVPEINRRDNFPA	718498	724729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_723190
780194	contig_14513_pilon	-	1190	3	Intergenic	novelGene_70227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1467.5	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	157	300	18880	13100	TRUE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSLV	19036	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13109_18745
780195	contig_14326_pilon	-	2274	7	Intergenic	novelGene_120730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	58.4570117455744	1	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	119	1141	445848	442066	FALSE	30	AAACCTTATGTCAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCVSQRLAEDQSSVRPRNACRLQFPQLALRRRLGQLSCMSRPALKLRSWPLTVLYYLLPFGALRPLSRVGWRPVSRVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	447474	440932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_445734_445908_447415
780196	contig_12977_pilon	-	2760	4	Intergenic	novelGene_122821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	5.24933858267454	59	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	884	2652	107	2758	208710	156543	FALSE	40	AGCTAAAGAATCCCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TINLVPVEEQAKPYRVVNLEQPLCKPYTVVDVSAAMASEHLEGPAKSPKMKSSSSTPNSPVISPALTSGQVSAHFQKSSAIRYQEVWTSSTSPRQKIPKVELISGGTGPNVPPRKNCHKSAPTSPTATNISSRTIPVKSPNLSEIKFNSYNNAGMPPFPIIIHDEPTYARSSKNAIKVPIVINPNAYDNLAIYRSFLGTSGELSVKEKTTSIISHTYEEIETESKVSDSTANKPTECPQVKGFSNSTERKRGSVARKVQEFNNCLNRAQSSPQRSYSSSHSSPTKIQRTTQEPVAKTEDAQESQTVGSCSSTREKASTVLSQIVASIQPPQSPPEMPESGPKACSVEELYAIPPDADTAKSTPKSTPVRPKSLFTSQPSGEAEAPQTTESPTTRVQKDPLSKTVTTPPSKLVMNAQSEPTPPFPPPRSTSSPYHASNLLQKHFTNWTKPTSPARSTEAESVLHSEGSRRAADAKPKRWISFKSFFRRRKTDEEDEKEKEREKGKLVGLDGTVIHMLPPPPVQRHHWFTETKAESSEKPAIVFMYRCDPPAEGQLSVDQSQAGADQTAVMEKGGKEDTFLQDSEKKKRSHSSPSQIPKKILSHVTHEVTTEDFSPRDPRTVVVKQDGRGSTSATPALPLPEAEREEEREDISDPMDLSSCSATYSNLGQSRAAMIPPKHPRQPKGALDDAITFGGKTDQEAPNSSQPTPPPLPKKMIIRANTEPISKDLQKSLESSLCVMANPTYDIDPNWDASSAGSSISSELKGLDIESYDSLERPLHKERPVPSAANSISSLTTLSIKDKFSNSTESLSSRRGPSCRQGRSIQKPQRQALYRGLENREEVVGKIRSLYTDALKKLALKCEDLFMAGQKDQLRFGVDSWSDFRLTSDKPCCEAGDAVYYTASYAKDPLNNYAVKICKS	208816	156540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_156555_171617_172364_186689_186887_207013
780197	contig_7887_pilon	+	1555	7	Intergenic	novelGene_124887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_6	177.590352590824	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	69	1211	289574	293116	FALSE	15	GACCCCCATCCCTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGELEDWGPELGSRIDSLTIQGPHCLEPGTEQLFSEEFLNRLKCSCYLSSCVCQEGHSLAVLNFAGNTSWHVFTPACGITSYVVLLTEGVVGSSDIPPISLLSLCVQMFDWFDYHGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFFTRLRAEPPNAKLWDSSRDISR	289505	293460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_290052_290799_290895_291549_291680_291780_291864_292048_292129_292310_292402_292930
780198	contig_9414_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_131071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	390	689	259474	259773	NA	30	ATCTGAGCCATCTGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNVDYELPRTARKTSKSVLEEIQPECSLEVRMASLHLTYFGRVIRTDQSLEKHMLGKVEGQLKRGRPSTQWIDTVAAIMGSNMTTGLSSVSFCCA	259084	260851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_259100_260900
780202	contig_14953_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_137273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACCTATTCATATGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77069	78033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_77100_78000
780209	contig_15039_pilon	-	1792	8	Intergenic	novelGene_110142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	536.776584847752	3	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	339	1025	202841	185257	FALSE	25	ACCAGAATGCTCCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260868	184489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202966_208401_208526_260778
780210	contig_3978_pilon	+	3196	1	Intergenic	novelGene_173860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4613	7809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3978_pilon_+_4600_7800
780211	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780212	contig_5794_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_69749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGCTGAAGTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498166	499131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_498200_499100
780216	SIRV4	-	306	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1217	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
780217	contig_9389_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_83949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCACCTAACAGAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196383	197417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_196400_197400
780218	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
780222	contig_11631_pilon	-	2339	1	Intergenic	novelGene_104174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAAGTATCGTTTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51933	49594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_49600_51900
780225	contig_9389_pilon	+	1336	2	Intergenic	novelGene_83896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	135	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	348	866	157715	158233	FALSE	30	TGTATTATTAATCTATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLLGGPKPQAHQPLCLFHGDLHVPTQEHLMTSASIIPPPHNLPGANSITESKGRGDLRGLRPLERKPRIPQAPAAEAEIPNISTSVDSTTPYLSLPCARLHPQHFTNIYPFHVYSSLHAVEAFSPQFYRRGDGGPERSGNCIRSHSQVGSRDLNWREGCRIIEHYILPEV	151128	158703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_151249_157487
780227	contig_5389_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_143033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454478	453401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_453400_454500
780234	contig_6710_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_98014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
780236	SIRV6	+	304	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
780239	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	8467	1	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
780243	contig_4364_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATATAATGGGATACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028702	1029403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1028700_1029400
780245	contig_1154_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_87191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTTAGTTTTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060190	1058326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1058300_1060200
780249	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	492	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
780250	SIRV4	-	403	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	214	0	-214	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	120	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAACTCGCCCCCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
780252	contig_14341_pilon	+	1805	10	Intergenic	novelGene_111879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	178.15605588055	556	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	499	1653	724373	725884	FALSE	10	TCCTTGGACTTCGCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKVPRVSLERLDLDLTADSQPPVFKVFPGNTTEDYNLIVIERGGAAAAAGQPGTAPPGAPGAPPLPGMAIVKEEETEAAIGAPPAAAEGPETKPVLMALAEGSGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGASAPSGGPGALDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLNLDESDTTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPLHQLATDSTFSLVSLPGTGEDGQEGVCWPGTQPCGTPSPCLQDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKADVQSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPPPLSLPGAGLGAPELPGGPSDGL	723315	726036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_723335_723435_723583_723681_723797_723874_724009_724202_724252_724338_724592_724679_725000_725083_725208_725290_725606_725707
780253	contig_14326_pilon	+	1260	4	Intergenic	novelGene_120650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.3285709425636	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGAGCTGTAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17925	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_45858_45977_48304_48791_50151
780254	contig_16385_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_86195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGCAACTTAACTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5601	6810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_5600_6800
780263	contig_6270_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_99905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGTAAATCTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228242	1230343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1228200_1230300
780265	contig_14635_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_84376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATACTTCTTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609857	608730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_608700_609900
780266	contig_1262_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_133551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATTTGAAAAAAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239616	237974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_238000_239600
780274	SIRV6	+	521	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	20	20	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780278	contig_10197_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_115268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCAAAGAGATACAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119806	1120402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1119800_1120400
780279	contig_7182_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_117116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTAGCGCTTTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226014	227450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_226000_227400
780280	contig_16076_pilon	+	929	3	Intergenic	novelGene_173863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	53	junction_2	32.5	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	26	928	148079	222517	FALSE	40	GTAGAGAATCCAGAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCSGLRRVARAGAYLMRTVSSTSRGCQHQTLGAGPDASECTAQGAAGGVVEVLGRAYPQDDHTNLTRKVLSKVGRNLHNQQHHPLWLVKERVKEHFYKQYVGRFGTPLFSVYDDLPPVVTTWQNFDSLLIAADHPSRKKGDNYYLNRTHMLRAHTSAHQWDLVHAGLDAFLVVGDVYRRDQIDTQHYPVFHQLEAVRLFSKHELFAGIKDGESLQLFEQSSRSAHKQETHTMEAMKLVEFDLKQTLTRLVTHLFGDGLEIRWVDCYFPFTHPSFEMEINFRGEWLEVLGCGVMEQQLVNS	148053	222518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16076_pilon_+_148691_192404_192565_222386
780281	contig_2768_pilon	-	2057	16	Intergenic	novelGene_57473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_3	207.275940609506	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	110	2002	585667	541766	FALSE	10	ATGCTTTTTAGGTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLELPVRQAGVIYLKNMITQYWPDRETAPGDISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIKHDYPGRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLPLLKDRFIQLLPDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDVPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGVQQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEQNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVLHYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIRPVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEGSDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEVRK	585776	541710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_541907_543104_543266_543458_543625_544016_544107_546707_546825_546967_547045_547804_547905_548490_548626_550212_550298_550410_550506_552439_552530_558103_558261_561917_562077_562445_562600_567694_567777_585583
780285	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_97572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	653864	653562	NA	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653865	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780286	contig_1986_pilon	+	2076	1	Intergenic	novelGene_64153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCAAGACAAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389466	391542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_389500_391500
780287	contig_6496_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_103528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGCATATTCCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946691	947574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_946700_947600
780288	contig_4151_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_65215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGCCTGACTTAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397787	399068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_397800_399100
780289	contig_5434_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_74686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGAAGCCCTGGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360687	362362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_360700_362400
780298	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	203	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780300	contig_16647_pilon	-	955	4	Intergenic	novelGene_170311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	80.9979423606962	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	593	955	318806	313381	FALSE	30	AACATGATTGGTCCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGTFNTTVDIKLKQWTDKQLPNKAVEVAWETLQEEFSRFMTEPKGKEHDDIFDKLKEAVKEESIKRHKWNDFAEDSLRVIQHNALEDRSISDKQQWDAAIYFMEEALQARLKDTESTIE	319398	313380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_313398_316090_316200_317703_317857_318722
780301	contig_16647_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_170310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	329	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAGAAAAAAATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316123	313011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_313398_316090
780303	SIRV2	-	287	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	638	23	638	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4094	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
780306	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	1	1160	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
780307	contig_11285_pilon	+	1435	6	Intergenic	novelGene_5504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	46.617593245469	369	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	87	1127	542637	546547	FALSE	5	GATTCCTTTCTTGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAQGAGIAVAEALQNQMPGLEKLWLWVTFLGDPKCLFLFYFPAAYYTSRRVGVAVLWISLITEWLNLVFKWFLFGDRPFWWVHESGYYSQAPAQVHQFPSSCETGPGSPSGHCMITGAALWPVMTTISSQLATRTHSRWVRMLPSLAYCTFLLAVGLSRVFILAHFPHQVLAGLIAGAVLGWLMTPRVPMERELSFYGLTALALMLGASLIYWTLFTLGLDLSWSINLASKWCERPEWLHMDSRPFASLSRDSGAALGLGIALHSPCYAQVRRAHLGNGQKIACFVLAMVLLGPLDWLGHAPQISLFYIFNFLKFTLWPCLVLALVPWVVHLFSAQEAPPIRSS	542550	546855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_542855_544727_544835_545243_545335_545508_545628_545818_545961_546183
780315	contig_3155_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_26438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCCAACCTGAAGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308459	307264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_307300_308500
780318	contig_17711_pilon	+	1482	3	Intergenic	novelGene_173868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATGAAACAAAATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402	11295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17711_pilon_+_1735_5283_5338_11199
780320	contig_8620_pilon	+	2075	7	Intergenic	novelGene_173889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_2	2.6718699236469	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	453	1457	386828	439707	FALSE	30	GAGCATTTGCTGTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKESWSGRKTNRATVHKSKQEGRQQDILIAALGMKLGSQKSSVTIWQPLKLFAYSQLTSLVRRATLKENEQIPKYEKVHNFKVHTFRGPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVYSCDLTTLVKAHITKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMYEDINIITGALKLYFRDLPIPLISYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIKNEDILF	386375	440325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_387080_405074_405160_427042_427217_427926_428005_432417_432556_437755_437862_439535
780321	contig_14244_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_169448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGTCTATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11870	12596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_+_11900_12600
780322	SIRV6	+	417	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	3	363	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780326	contig_4429_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_50796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGGGCCCTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162770	160866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_160900_162800
780327	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
780328	contig_15744_pilon	+	617	5	Intergenic	novelGene_83592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	53	547	149562	153378	FALSE	10	CTTCTACCCCAGTGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149509	153448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
780329	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4435	34	3260	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
780336	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	581	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780337	contig_6497_pilon	-	1412	5	Intergenic	novelGene_35573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	44	junction_2	47.8820164571209	196	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	30	1124	202240	194894	FALSE	20	AAGATCTGTTTCTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVKAKANSMASSGAELGSFFDHHVQKSVCDTRAKYREGRRPRAVKVYTINLESRYLLIQGVPAVGAMKELVERFALYGAIEQYNALDEYPAEDFTEVYLIKFLNLQSARTAKRKMDEQSFFGGLLHVCYAPEFETVEETRKKLQERKAYIARTTKNKDHRMTKKKLVTEHKDAEDHRQDFHSETSGFCASALNTSTGSSNPYSCESPLCYFSSKCMCSSGEHVARASNSSQDGRNHGEAVEHCNYNKSLQKIQMKTFKNSVACPGAQKVITPSEAIDRFMPRTTQLQERKRRRENDCRLGTFLETSTSSNEVMIGPKLPDIPKVDMHDDSLNTTANLIRDKLKEVISPVPKPSEDKLEDVRTSHPLKQRRRI	202269	194605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_194981_196708_197269_199566_199713_201386_201578_202129
780339	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_98272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	10	TGTCTGGTCCTCAGTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
780340	contig_15029_pilon	-	2127	14	Intergenic	novelGene_128209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	249.044137149463	491	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	128	1312	243863	235437	TRUE	25	CAAGGCTCATGCTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEAAHPGSGVSRLPAFSPSFSPAATPLCPAAPLPGSPPGASMALLASTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQGLCEALGVEAGGGLTQYHKIKAQLNYWSAKSLWAKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRAAVELALLGARVVLVEKRTKFSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWGVTFNGLQPPPKKGGGWRAQLQPSPPTQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFTVREMRGKLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLRLGVLRQDYSETDRLLGSANVVPEALQRFARAAADFATHGKLGKLEFAQDAHGRPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGAP	245498	233447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_233778_234224_234299_234399_234500_234712_234807_234933_235048_235333_235447_240133_240376_241286_241388_242008_242165_242490_242596_242939_243045_243322_243531_243605_243952_245459
780343	contig_2933_pilon	-	1936	3	Intergenic	novelGene_111356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.5	1	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	138	1397	850204	848945	TRUE	5	TCTTTCCGCGTACTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874214	848358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_848597_848643_850290_874162
780344	contig_15114_pilon	-	663	5	Intergenic	novelGene_121235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_4	345.389182662109	8428	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	95	568	1699026	1691054	FALSE	15	TAACTGTGTGACTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTKAVCVLKGDGPVAGTIYFEQKGDGSVMVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1699120	1690958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990_1695085_1698954
780345	contig_13854_pilon	-	2062	2	Intergenic	novelGene_154114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAGATTGCAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18018	11555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_-_12399_16799
780350	contig_6048_pilon	-	2450	1	Intergenic	novelGene_73197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTCACTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476136	1473686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1473700_1476100
780352	contig_987_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_72259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408793	407916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_407900_408800
780353	contig_3942_pilon	-	1242	9	Intergenic	novelGene_128862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_8	9.19238815542512	434	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	291	1073	1491123	1486376	FALSE	15	CTCCAAGGACTTGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1492200	1486206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918
780354	contig_13453_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_146702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTAGAAATTATTACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44825	42864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_42900_44800
780355	contig_11126_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_138113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGTTAATCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145007	142724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_142700_145000
780357	SIRV4	+	198	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGTCCGCCGTAACGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	3843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3800
780359	SIRV5	+	371	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	135	48	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
780360	contig_5671_pilon	+	1100	6	Intergenic	novelGene_79416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2596.97950704275	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	124	528	370430	531225	FALSE	30	ATATATATTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTAVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSESRL	368801	531797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392772_392919_521218_521303_531213
780361	contig_10235_pilon	-	1419	11	Intergenic	novelGene_46350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	7	junction_10	178.427604366589	88	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	12	1193	134106	131467	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDFLQATQTAPPPPPPPPPPPLAPEQQATPPPGSPSGGAGSPGGLGPESLPPEFFTSVVQGVLSSLLGSLGARAGSSESIAAFIQRLSGSSNIFEPGADGALGFFGALLSLLCQNFSMVDVVMLLHGHFQPLQRLQPQLRSFFHQHYLGGQEPTPGNIRTATHTLITGLEEYVRESFSLVQVQPGVDIIRTNLEFLQEQFNSIAAHVLHCTDSGFGARLLELCNQGLFECLALNLHCLGGQQMELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTTMMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQALPEEPMEVQGAERTSPEPQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	134117	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_131425_131535_131619_131765_131864_131925_132030_132178_132339_132465_132552_132656_132784_132839_133015_133186_133351_133644_134088
780362	contig_6710_pilon	-	430	2	Intergenic	novelGene_98244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780363	contig_10732_pilon	-	1200	4	Intergenic	novelGene_114761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_3	26.1916017074176	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	3	662	576340	573306	FALSE	20	CTCACTCAGGATCTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKAGGSFNLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576342	572767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574129_574368_576262
780365	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
780367	contig_6129_pilon	-	746	5	Intergenic	novelGene_159965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	25.0049995001	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	175	744	71114	60590	FALSE	20	AAGTTCTTCTTCATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGVVPEQPQNVSCIQKGEHGTVACTWDRGRDTHLYTAYTLQLNGPKNLTWQKQCTDHYCDHLDLGINLKPESPESSYTAMVTAINRL	74069	60587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_60729_61675_61791_68775_69064_71086_71199_73979
780368	contig_8260_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_163223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	451	762	4696	5007	NA	65	ACATCCATTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFFSTIPLILFSHSFSSNNTAKCFHVMEMMMMTVIRQFVHVLGAVDPYVQQNEMLPGPVPSSQSLLCLSLSSGTTPDNVPLLFIRFSLANIFRSRLPGPSS	4245	6216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_4200_6200
780375	SIRV6	+	323	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727
780376	contig_3602_pilon	-	1720	3	Intergenic	novelGene_60542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	40	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCTCAACATGGACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269176	267022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_267113_267454_267503_267594
780377	contig_10868_pilon	+	2302	4	Intergenic	novelGene_173904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_3	58.5965490072202	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	700	1455	519310	521986	FALSE	45	AAAGGCAATAAACCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPLLPVVVRGNEHRVYTRSIPNVPLSRPLHDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSGRTIMKMTHSELMERFLTDYLNDLQGRSDDDSNGSWDFYGSSVCEPNDESGYDVLAHPPGPEDLDDDDDAYSDVFEFEFSESPLLPCYNIQVSVSQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCNFPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSKDLEAFNPESKELLDLVEFTSELQTLLGSSVEWLHPSDMTSDDYW	518610	522833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_519539_520048_520127_520317_520475_521694
780379	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_96249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRNDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653878_657467
780383	contig_10331_pilon	-	2796	18	Intergenic	novelGene_54218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACCATCAGGTATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439015	1393804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1393923_1396320_1396509_1396927_1397190_1397293_1397486_1398630_1398812_1399000_1399082_1400459_1400579_1400942_1401052_1409616_1409771_1413550_1413638_1424005_1424197_1428415_1428499_1428730_1428830_1430696_1430865_1437280_1437473_1437650_1437778_1438233_1438372_1438708
780389	contig_9014_pilon	-	958	5	Intergenic	novelGene_106783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	50.1765632541728	1555	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	34	693	149986	147517	FALSE	20	GTATTTGCTGTGTTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRNPGGVAEAMAIFSVYVVNKAGGLIYQLDSYAPRAEAEKTFSYPLDLLLKLHDERVLVAFGQRDGIRVGHAVLAINGMDVNGKYTADGKEVLEYLGNPANFPVSIRFGRPRLTSNEKLMLASMFHSLFAIGSQLSPEQGSSGIEMLETDTFKLHCFQTLTGIKFVVLADPRQAGIDSLLRKIYEIYSDYALKNPFYSLEMPIRCELFDQNLKLALEVAEKAGTFGPGS	150019	147251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_147596_147868_147996_148877_148982_149517_149693_149811
780390	contig_4103_pilon	+	1030	5	Intergenic	novelGene_51965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	99.0429199892653	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	6	815	171333	175646	FALSE	15	GTGGGCCCTGGGTAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAELYVKPGNKERGWNDPPQFSYGLQTQAVGSKRTPLTKRVAAAQDGSPRAPASETTPGPPPKGPPPPSDKAPRPSPVGSCPASSVKPPSFPVIKSETLLEDVLRPLEQALEDCRGHMRVKNQSCKELSVKFLGHRKLFFYVVLPFSSPCWAGSTNLERPCVSQKQVCDDISRRLALLQEQWAGGKLSMPVKKRMALLVQELSSQRWDTADDIHRSLMVDHVTEVSQWMVGIKRLIAEKKSLSSEEEAAEKSAATTEENQTVPGFFGAP	171327	175861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_171358_171515_171642_174223_174430_175061_175306_175437
780391	contig_3942_pilon	+	1801	3	Intergenic	novelGene_128892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	45	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1707	94	1800	1629990	1634563	FALSE	30	TGAGTGATGGTAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRWRQRRRVRILRRLQRAWLRTRWARGQRSMAARRIVQESFDTVLQEKAKRYHMDPSAEAVGETLQFKAQDLLRAVPRPRAEMYDDIHSEARYSLSRSVAHPRDTGREGLRGDVFPGPSFRSSTPSVGDDTYFRKDLDFSHSDSRDQVFGHRKLGHLHSQDWKFALRGSWEQDFGHPVSQESSWSQEFTVGPSAILGDFGSSRLIDKECLEKESQDYDLDHPGEAEPVHLGSGQVQGRGRVLNIADQESALLGKGETQAMLKAKGDVGKLVTLRNVSTKKAPTINRVTTKTQAANQVQKTPLSPDVTLGTNPGTEDIQFPVQKIPLGLDLKNVRLPRRKMSFDFIDKSDVFSRFGIEIIKWAGFHTIKDDVKFSQLFQTLFELETETCAKMLASFKCSLKPEHRDFCFFTIKFLKHSALKTPRVDNELLNLLLDKGAVKTKNCFFEIIKPFDKYIMRLQDRLLKSVTPLLMACNAYELSVKMKTLSSPLDLAIALETTNSLCRKSLALLGQTFSLASSFRQEKILEAVGLQDIAPSPAAFPNFEDSTLFGREYIDHLKAWLIASGYPLQIRKVIPEPVQEEEKTAPSTKPDIQTKAPSD	1628307	1634564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1628390_1629978_1630111_1632977
780397	contig_1210_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_171526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGCTTATTAAGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339999	340398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_340000_340400
780404	contig_10953_pilon	+	578	5	Intergenic	novelGene_42551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3089.49230254746	27619	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	39	578	422508	426300	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIGKCLPLANTYFALRMSPPSPPTAPAERGVAVVAVCEQDSSSYFLLINCLRV	419995	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425329_426186
780408	contig_18283_pilon	-	1037	2	Intergenic	novelGene_170699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGGAACAACCTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74830	53922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_-_54076_73946
780410	contig_19812_pilon	-	2016	15	Intergenic	novelGene_100981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	118.212041411583	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	112	591	38519	28294	TRUE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISARWRN	38630	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19491_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_28170_28307_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513
780412	contig_10793_pilon	+	801	2	Intergenic	novelGene_83406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4323	junction_1	0	408	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTAGAAGTCATTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130902	147676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954
780413	contig_9424_pilon	-	700	4	Intergenic	novelGene_143784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2181.79289168844	234	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTGAGTGTAGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280208	277469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279403_279629_280079
780414	contig_14133_pilon	+	2313	2	Intergenic	novelGene_119926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_1	0	2	135	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	356	871	146942	147457	FALSE	30	ACCAACTTCACAATCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQARALCPATYLACMVAQLPPQWAGGAKETQPHAQTAPGRCGYSQVPPNTLSGGLCRRSPLSYHHSRERVLGQTRLQAAQFMGQSSLDCSPGVCTGPRPWCTVPPQAGPSARVVGPIHVLWAACARRHDCPMSVHVYVCMRPFGHRHDLCFPHAWAVPVIPQGLPLLSL	146150	148899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_146231_146666
780429	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
780432	SIRV4	-	368	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1155	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
780434	contig_4469_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_21932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCACGTGACAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622326	622872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_622300_622900
780435	contig_4469_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_21933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAAAGTTAACTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622916	624236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_622900_624200
780437	contig_10103_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_86176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTCTGGCGATGCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682249	682758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_682200_682800
780438	contig_10938_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_171768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGGCAAAAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238136	238357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_238100_238400
780439	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	59	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
780443	contig_11258_pilon	-	1410	5	Intergenic	novelGene_67820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	9.39081998549647	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	200	688	332433	327605	FALSE	80	AAAAAGAAAAAAGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDCGEQRVKKQEDEGRMSIRDHPALLSFIVTMRNLTVEDEGTYWCGIALKWLKDGAYPFDPAFQAVVSVSPAATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRVELLHRVFLAAIFMEADCQDFLHGAAWSLLSSIHFLLRSS	360368	326882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328685_328767_330514_330660_332213_332564_360299
780444	contig_6862_pilon	+	199	2	Intergenic	novelGene_63756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	636	junction_1	0	78	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTCTTTGATCCTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109124	110597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_109218_110491
780450	SIRV6	+	636	4	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGTAACAATGTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10385_10494_10819_11031_11109_11205
780457	contig_9345_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_24584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	96	533	945468	944755	FALSE	10	ACTGTGTGTGTTTCCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945563	944541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
780459	contig_17470_pilon	+	1647	6	Intergenic	novelGene_110475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_3	98.5851915857549	14	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	613	1332	87608	89971	FALSE	10	GGCTTTACTTTTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAFDYIEFTRSLFVN	86995	90286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_87656_88113_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88983_89845
780460	contig_7179_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_78067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408019	409771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_408000_409800
780462	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	61	508	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
780464	contig_13854_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_154115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCCGGCAGTTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15774	16719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_15800_16700
780465	contig_12793_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_164118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCAATCTACTCCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205790	206790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_205800_206800
780468	SIRV6	-	314	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9288	-158	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACGTTTTGCAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1732_2778_2832_3107_3164_10721_10825_11035
780469	SIRV6	-	237	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-979	417	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAAGGCGGCGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2799	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1732_2778
780470	contig_7457_pilon	-	1003	7	Intergenic	novelGene_31356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.962726895732	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	31	555	321514	317540	TRUE	10	CTGCCTGCCTTGGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKNKSSFLIMWRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLLRALQALQQEHKAEIITVGDGRGVKFF	321544	316920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_317218_317388_317653_319025_319102_319888_319978_320345_320400_321116_321263_321467
780474	contig_6710_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_98093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780478	contig_5794_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_69768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAAAATTCATAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708422	706258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_706300_708400
780479	contig_4418_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_98370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	426	755	769502	769831	NA	30	ATTTTTATGAACATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGKRLKKNTKFHLIHSFAKDDGVVLSCLGGNSDSWRPRVCQSKTVQVKLCSTGFSIADFFRSISPGLSSEVPLYGFGLPAFWLAVEHLTVCVTQVWASLFQFSPRKHV	769076	770608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_769100_770600
780480	contig_12427_pilon	+	447	2	Intergenic	novelGene_40599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTGAATGTTTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656717	657236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_656818_656889
780481	contig_8898_pilon	-	880	5	Intergenic	novelGene_137237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_2	39.7775062063976	2131	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	243	596	286566	284943	TRUE	5	GCTTTGCTTTCTGCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAALEVTARYCGQELERYGQCVAAKPESWQRDCHHLKMSIARCTSSHPIIRQIRQVCAEPFLAFEECLRQNEAAVGNCTEYVRRFLQCAEQVQPPRSPTTVEAFTVYQNTIISCHA	286808	281873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_284850_284988_285082_285249_285321_285463_286564
780487	contig_14530_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_108461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGATTTATTCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104611	104172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_104200_104600
780491	contig_6710_pilon	-	443	2	Intergenic	novelGene_98195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657175	653562	FALSE	35	CAAAACACCTATCCCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALGPSWNSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657138
780494	contig_1301_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_47399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	821	1186	780419	780054	NA	20	ACTCAACTGCCATGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYIPFWYTSRPKTVLQTQGGVQEPLPLKSLPHLFPEALSPFPFGNNFSPEAKEGLGYVKPFGGPCVESLQSSLTLLSLHLTPEDLTVHSFLYTFLPNICWLLEVIKIQNQTRCHRVDSSS	781239	779698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_779700_781200
780497	contig_5023_pilon	-	1290	10	Intergenic	novelGene_7190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGTGACTAGAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647197	580799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580903_607252_607341_607933_608098_622525_622620_625668_625849_629214_629289_630203_630326_631446_631539_639069_639227_646981
780500	contig_12786_pilon	-	1269	10	Intergenic	novelGene_103431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	720.62412935071	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	315	1250	614067	590909	FALSE	30	CTCCAAAGACAAGCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629454	590889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614077_615631_615731_628731_628907_629423
780501	scaffold_880_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_121500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	265	600	547303	547638	NA	40	AAAAATTATCGTCTGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVSLKLFLTVFRIAKSYQTSPDLRLTWLQNMAEKHTKRKCYTEAAMCLVHAAALVAEYLSMLEDHSYLPVGSVSFQVRRELSFSFGAMVPKGRQFCHPRGTIGRVWRHF	547038	547776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_547000_547800
780506	contig_6589_pilon	-	1452	2	Intergenic	novelGene_25688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	330	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATGAATAAATAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103450	100571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_101948_103374
780508	contig_7513_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_88980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	217	330	285728	285841	NA	65	AAAAAAAAACCAACATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSFRSFTVYVHTCLPYHPERDTQHYWQPSRPRVPTQTRQRNPCCAVVDHTNSCVWHLLCNLTPSDSSWRLRMAVVSPFLSLFSTPLYEYLPILLLMGKWVVFSSWLPQ	285511	287541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_285500_287500
780510	SIRV1	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
780512	scaffold_6394_pilon	+	1184	8	Intergenic	novelGene_111000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1013.7769548997	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	16	1026	398216	406119	FALSE	10	TACTGTGTTTTGATTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKTYEPLEDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRSTDEVKALAGCDFLTVSPKLLGELLKDTSKLVPTLSAKAAQASDLEKVHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRRFAADAVKLERMLTHMFSAENGK	398200	406277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_405024_405201_405302_405501_405717_405864_406089
780513	contig_2069_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_23394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAAGAGAGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115874	1118180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1115900_1118200
780518	contig_8597_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_158701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29242	28460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_28500_29200
780520	contig_11326_pilon	+	1271	4	Intergenic	novelGene_173908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	4.64279609239471	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	81	455	9002	32032	FALSE	70	CTAGAAAGAAAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLVRLMTHVDLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSEDEDTDTEEYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVSMLDKLSRRADVKDLRQDGG	8921	32848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_9072_17440_17586_28619_28740_31992
780523	contig_6159_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_128240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGGGCTGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43784	42983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_43000_43800
780525	contig_612_pilon	-	1101	3	Intergenic	novelGene_155633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	39.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	101	670	267314	265558	FALSE	10	GTTGTTGTTGTTAGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRSRGINTGLILLLAQIFNVGINNIPPVTLATLALNTWLFLNPVKPLYDSCISVEKCYQQKDWQRLLLSPFHHVDDWHLYFNMASMLWKGINLERRLGSRWFAYVITTFSLLTGVVYLLLELSLAAFLDEPDFQRNCAVGFSGVLFALKVLNNHYCPGSFVNVLGFPVPNRYACWAELVAIHFFAPG	293193	265126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_-_265695_266881_267396_293174
780528	contig_5167_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_164099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAAAAGCATACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309894	309684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_309700_309900
780529	contig_2027_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_39941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACTGCAGAAGCCTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609205	610944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_609200_610900
780534	contig_15787_pilon	-	1660	7	Intergenic	novelGene_143959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACACAGCATCAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99015	56119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_56261_79239_79309_84146_84309_88336_88424_90619_90766_95811_96019_98167
780535	contig_13074_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_153408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99391	97726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_97700_99400
780536	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
780538	contig_6164_pilon	+	442	2	Intergenic	novelGene_121306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAAGGAGCTGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735801	736358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_736023_736137
780540	contig_14048_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_146340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588274	587381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_587400_588300
780543	contig_6434_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_61837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCACCTATTATGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709853	709337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_709300_709900
780544	contig_8156_pilon	-	1606	6	Intergenic	novelGene_98940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	98.1317481756032	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	307	1212	441382	395622	FALSE	65	GAATGAAAAATAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWTTKAFLPRMLELQNGHIVCLNSVLALSAIPGAIDYCTSKASAFAFMESLTLGLLDCPGVSATTVLPFHTSTEMFQGMRVRFPNLFPPLKPETVARRTVEAVQLNQALLLLPWTMHALIILKSILPQAALEEIHRFSGTYTCMNTFKGRT	441688	395227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403531_403883_403997_404661_404810_441187
780546	SIRV6	+	284	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8133	14	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
780548	contig_14720_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_164980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAGAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125814	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_125800_127700
780550	contig_10141_pilon	-	2317	3	Intergenic	novelGene_84631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	12	1411	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	92	1351	418688	408825	FALSE	20	GATGGTGCCCGACTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKETKSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGEV	421180	407858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_409370_417973_418694_421094
780552	SIRV6	+	175	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	51	557	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
780553	contig_14522_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_147318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGTGAACGAGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67006	67708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_67000_67700
780554	contig_14666_pilon	+	1378	12	Intergenic	novelGene_39490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	1134.50119377535	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	156	1043	307541	323175	FALSE	30	GGCAAAAGATGTGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGEGGEEDPHAARSNSDGEKATKVQDIKNNLKEAIEEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	303821	323510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_303939_307502_307576_310680_310726_315323_315379_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322434_322677_322746_323028
780555	contig_12790_pilon	-	1211	5	Intergenic	novelGene_35266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGAGAAAGGAAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313235	310030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312000_312433
780556	contig_5643_pilon	+	787	3	Intergenic	novelGene_38993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	275.5	3324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	324	704	623433	624854	FALSE	5	CTTGGTGTCAGTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASAPPAALSAEQAKVVLAEVIQAFAAPENAVRMDEARDNACNDMGKMLQFVLPVATQIQQEVIKAYGFSCDGEGVLKFARLVKSYEAQDPEIASLSGKLKALFLPPMTLPPHGPAPGGSVAAS	623109	624937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_623485_623780_623958_624702
780557	contig_6270_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_99866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	2	520	1036450	1035932	NA	25	AGTTTAGCATGTAGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAPRQHSLCALHLTRAETPKESQVTRQQGCRWVSGLVSISSGPHPLVEADWPPGAYAVFGSGGVVAGLVRVRGTAFRSEPIIKPNPSFLLQLDSSQAWSLWGIKEEREGRRDWEGGELGSRHSTWETGKGNSCKTHPPGLVVLQITWKLGPAWERRSSSIHRLQPAPREAY	1036451	1035051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1035100_1036500
780559	contig_18869_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_56220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	64	309	73707	73462	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	73770	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73800
780560	contig_3233_pilon	-	1069	2	Intergenic	novelGene_56512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	418	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTTGGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140703	103402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_104373_140604
780565	SIRV1	-	203	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	8	3619	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
780566	contig_1339_pilon	-	1149	3	Intergenic	novelGene_163110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25	172	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	468	848	255467	255087	FALSE	20	TGGCAATGTGTCATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFATAHLLYLAAFSFSPLQPATLLPVALACGPYYGLLLPRLPPDMALPLVAYALLLATVLWRGLVRGGSAGLGALLFTISDSVLAWDAFAQPLPHARLVVMTTYYAAQALIALSAVSGLRHKTN	257333	254785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_255470_256675_256923_257115
780567	SIRV2	-	546	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4327	34	3152	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
780568	contig_7861_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_77414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGAAAAACTCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131119	133433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_131100_133400
780574	contig_20176_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_172709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTGGTAGTATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58482	59325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_+_58500_59300
780576	contig_12050_pilon	+	1177	7	Intergenic	novelGene_62600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGCAGAGTGTCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298599	303013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_299171_300090_300221_300316_300365_302032_302180_302362_302491_302686_302819_302992
780579	contig_50_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_122222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAATTACTCAGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73526	74880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_73500_74900
780580	contig_5894_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_83017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTACAGGAGTCCAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278101	278561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_278100_278600
780581	contig_3774_pilon	-	1783	12	Intergenic	novelGene_142029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	168.715908708218	1	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	63	959	210407	146454	TRUE	20	TCCTGATTGCCAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRCLSVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRVT	210469	106260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_106748_115855_116110_146370_146464_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200979_210283
780585	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780586	contig_500_pilon	+	1878	8	Intergenic	novelGene_31106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	6.40790328343023	5	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	83	931	1541573	1557370	FALSE	15	GCCGTGTCTTGTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEIIANVDHIKFDLEIAVEQQLGAQPLPFPGMDKSGAAVCEFFLKAACGKGGMCPFRHISGEKTVVCKHWLRGLCKKGDQCEFLHEYDMTKMPECYFYSKFGECSNKECPFLHIDPESKIKDCPWYDRGFCKHGPLCRHRHTRRVICVNYLVGFCPEGPSCKFMHPRFELPMGATEQPPLPQQTQPPTKQSNNPPLQRSSSLIQLTSQNSSPNQQRAPQVIGVMQSQNSSAGNRGPRPLEQVTCYKVLAAVSAPLNLSSPSSCWRDCALLRMSEPPHQPVA	1541490	1558317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1541676_1545635_1545687_1547942_1548096_1550879_1550976_1551356_1551451_1552685_1552759_1554299_1554471_1557262
780590	SIRV6	+	332	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	20	-244	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780593	contig_9683_pilon	+	1026	3	Intergenic	novelGene_151286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15.5	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	21	557	487041	487717	FALSE	20	CGTCTGAGGTCTTACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARGTASRFLTSVLHNGLGRYVQQLQRLSFSLSRDSPSSRGAREFVEREVVDFARRNPGVVIYVNPRPCCVPRVVAEYREWAGLGMEGGLNRGSSGSPSAQSPLPSTRPKSVNGAVREESIHCKSAEDIATLVQKLADQSGLDVIRIRKPFHTDSPSIQGQWHPFINKPSDKWSHSL	487020	488186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487172_487259_487636_487687
780594	contig_2646_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_69540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGGATAGTGCAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602808	600871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_600900_602800
780595	contig_10159_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_30892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996295	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_996300_997800
780597	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
780600	contig_13608_pilon	-	2452	16	Intergenic	novelGene_52376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.59801371268	1	134	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	142	852	453349	400700	TRUE	40	GCATAACAGCAAAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRRDKSSAVEPGEECDYEDLKESSKSFSNHQLSGVDQACLYSCLDYMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALAEVLEQDKIQNLKVKSEGAVSSGKIAKGKSVDSQSSRSDSETVPKVTKMTVSGKKQTMGFEVPGLTAEENGHSFHTPQKGPPSEDTSITSSDVLETVSKSALPSHTIQASEEQSSTPTPVKKSSKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNVNKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERER	456404	368776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_369365_370845_370972_373606_373712_382428_382538_382986_383078_385449_385555_391792_391851_392468_392574_393180_393240_395252_395400_400592_400701_410880_411050_411536_411800_416269_416379_453180_453376_456289
780608	contig_8242_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_80193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCAGAAAACCAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37709	38507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_37700_38500
780610	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780611	contig_16907_pilon	+	901	7	Intergenic	novelGene_87484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	48.7362516226086	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	95	697	530225	540528	FALSE	20	TGAAGTTATTTATTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKGKKRHSSSSSQSSEISTKSKSVDSSLGGLSRSSTVASLDTDSTKSSGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	525261	540732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525324_530192_530297_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
780612	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
780614	contig_11386_pilon	+	1555	5	Intergenic	novelGene_82818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	185.989751061718	452	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	29	697	137770	142106	FALSE	55	AGAAACAGAAATAAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELTSPCLAMGPNLLLLLLLTLAGQGSVGSLPEVLQVPVGGSILVQCHYRLQDVKARKVWCRFLLEGCQPLVSSAVDRRAPEGTRMFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKGPLLGGSPHQ	137741	142964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_137813_137981_138315_140637_140759_141029_141170_142074
780617	contig_6854_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_169497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCTTTATTAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490238	487939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_-_487900_490200
780624	contig_11171_pilon	+	1292	6	Intergenic	novelGene_48603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	770	1075	251430	251735	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	212093	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235071_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
780625	contig_2257_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_122492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	329.72024505632	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	98	889	288451	313937	FALSE	35	GGAAGAAAGCAGCCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRCGAGYHSAVGGGWRGLWAGAPATASVCPVMAAAAAVVTPSGLEDGVSRSRGEGAGEVVVERGPGAAYHMFVVMEDLVEKLKLLRYEEELLRKNNLKPPSRHYFALPTNPGEQFYMFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLTLPLYWIMFVSGLTTRMQTPLQQELCSLLFHLCLVYRRCPVIQKE	288353	314239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_288663_291408_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_313799
780626	contig_12701_pilon	-	1400	8	Intergenic	novelGene_169549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	77.7835825498268	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	590	1240	39961	26442	FALSE	40	CAGATATGAGAGAGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKSFLPVRTALMIARYLDIFHLMDGVMKKKDEKTSSTSDAIRYPNPT	52022	26281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26578_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_39949_40102_40228_40576_51920
780627	SIRV6	+	411	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	9	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780628	contig_10324_pilon	-	1873	8	Intergenic	novelGene_7915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	16.6684352803098	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	503	1462	881764	876129	FALSE	45	GTAAGATTTAGAGGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQYGVERDLAVYNMLLDIFPKEVFRPRSIIQHIFVHYPRQQECGVAVLEQMENHGVMPNKETEFLLIQIFGRKSYPMLKFLRMKLWFSRFKNINPFPVPRDLPQDPVDLAKLGLRHMEPDLSARVTVYQMPLSKDSTGAADPTQPHIVGIQSPDQQAALACHNPARPIFVEGPFSLWLQDKCVYYHILRADLLAPEEREVEEIPEEWNLYYPMQLDLDYGRSSWDDYEFDIEEVEEGPVFAMCMAGAHDQATLAKWIQGLQETNPALARIPVVFRLAGSTGELLAASPGLEEPPPPPPAQGQEEEDDNLQRRQQQGQS	885049	875717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_876386_877008_877115_877263_877413_877524_877583_881124_881349_881598_882023_884049_884245_885000
780630	contig_1154_pilon	-	1434	7	Intergenic	novelGene_87166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	85.4998375567008	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	20	532	914362	909624	TRUE	10	TTTCTGTTGTCTTGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTAALMAPPVRYCIPGERLCNLEEGSPGSGTYTRHGYIFSSLAGCLTKSSENGALPVVSVMRETESQLLPDVGAIVTCKVSSINSRFAKVHILYVGSTPLKNSFRGTIRKEDVRATEKDKVGWFIPRNPMALGISLVLSYYPNELQRSTGMQSTRKFNSLAIKYEIHLIVPFLSL	914381	908284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_908720_909040_909126_909241_909826_910583_910673_911663_911739_914112_914229_914331
780634	contig_14744_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_65940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACATTAATGTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200051	200919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_200100_200900
780641	SIRV4	-	287	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	9	321	9	-321	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTTTCAAACGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5149	3958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
780645	contig_1948_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_31185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACACTGTCCTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548526	546374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_546400_548500
780648	contig_5643_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_38907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCAGGACAGAAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270531	270837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_270500_270800
780650	contig_2114_pilon	-	1605	6	Intergenic	novelGene_104325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_4	38.6657471155026	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	20	718	1169443	1152872	FALSE	30	CTAAATGTATACTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCTAFIMELGRCSYPVPRLLLLLLLLLSLNGGAVLSWPTEEGKEVWDYVTVRKDAHMFWWLYYATNPCKNFSELPLVMWLQGGPGGSSTGFGNFEEIGPLDSNLQPRNTTWLQSASLLFVDNPVGTGFSYVNTSDAYTRNLDMVASDMMVLLRTFFDCHKEFQMIPFYVFSESYGGKMAAGIGLELHKALQEGSIKCNFAGVALGDSWISPVGKYGVFRHLFTPVSLILPWDFWAALF	1169462	1151984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1153025_1157410_1157486_1157830_1157987_1160940_1161031_1167437_1167587_1169367
780651	contig_19973_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_173777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62236	62534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19973_pilon_+_62200_62500
780652	contig_13021_pilon	+	2082	2	Intergenic	novelGene_8120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGAAATAGTGAGAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151296	153493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_151844_151958
780653	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
780655	contig_12312_pilon	-	1974	6	Intergenic	novelGene_64026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	109.022933367251	637	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	195	929	575323	573769	FALSE	20	AGTAGTCTCATCTTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFAYRAVLNSPVKTVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECMKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLTKSPIANTTEPPAVRASEERLCNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQNLFSVFSFSHITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLIVVKQEDKLEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS	575517	572723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_573910_574028_574119_574351_574544_574774_574955_575051_575171_575310
780656	contig_10923_pilon	+	880	5	Intergenic	novelGene_66173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	496.420184924022	21	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	54	569	21667	42519	FALSE	25	GCAACACTTGTAGGTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYCQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVGKLLLVPWHLEGLRGSIFLSICTVTQGLGSLF	13825	42830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21812_37429_37540_38578_38746_42425
780659	contig_3529_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_105365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGAAATTGTGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585295	584835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_584800_585300
780661	contig_6710_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_96159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654277	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_654300
780663	contig_6710_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_95240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGGAAGCACAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
780664	contig_15022_pilon	+	1525	10	Intergenic	novelGene_171821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_5	172.395181966991	49	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	41	940	111719	121247	FALSE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEHCSQGLQLSPVSPQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSYLVVKKHQSMETMMLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEIRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFAADPLSLLRNV	111678	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_114652_114686_118370_118454_119220_119272_119455_119520_120780_120931_121229
780665	contig_7106_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_148323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCCCAATACATTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647791	647225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_647200_647800
780666	contig_10902_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_65673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1550	1903	153819	153466	NA	55	AAACAACCCAAGAAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLIGFRHWLQPFPVCSPELISANYPGCLTYLECYSSHPLLILFLANSSNFINYCSGLIGPLKFPIVLCAFHSQSCHTTLNCLFICLSSPLDCELLNGGIICNLFRVPRTWNVKGA	155368	153232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_153200_155400
780667	contig_6445_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_77042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGGAAAAGACAGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611914	610900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_610900_611900
780668	contig_9871_pilon	+	1870	3	Intergenic	novelGene_75730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	49.5	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	711	1226	613795	616625	FALSE	55	TGGAGTAATAAACTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLSREQKYEDGIALLRSALANQSDCVLHRILGDFLVAVNEYQEAMDQYSIALSLDPNDQKSLEGMQKMEKEESPTDATQEEDVDDMEGSGEEGDLEGSDSEAAQWADQEQWFGMQ	613084	617269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_613970_614614_614766_616435
780671	contig_6199_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_126358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTACTTAACTGAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117405	118983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_117400_119000
780673	contig_12624_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_61129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGATTTTACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948399	947487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947500_948400
780674	contig_6189_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_164951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133661	135399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_133700_135400
780682	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_18300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
780687	contig_3111_pilon	+	2619	1	Intergenic	novelGene_129971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56954	59573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_57000_59600
780689	contig_12312_pilon	+	1777	20	Intergenic	novelGene_64004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	84.3938465152519	2	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	688	1329	506925	531856	TRUE	30	AGGAATCCGTACCATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKAAPLRTGNGSSMPEGRSSRDRTAPSAGMQPQPSLCSSAMRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTFAILASLPLSPRPLAT	478479	534387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_529242_529357_531362_531439_531804_531896_533464_533639_534152
780690	contig_6710_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_97798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAGCCCCTGAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	653872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
780691	contig_7728_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_64710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTTCTAACTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713802	713432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713400_713800
780693	contig_3588_pilon	+	1450	4	Intergenic	novelGene_72865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	767.4465598478	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	117	482	84577	90411	TRUE	75	CAGAGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLVSSGQSKTLKPRMFCAFPNACKANWSTLFLGLPRVNVFLQDPHAALYPLQRFDRSLLLTTSQNPSTEHPSQLLH	84460	98064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90720_94316_94532_97619
780696	SIRV1	-	197	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3611	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6755	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
780702	contig_6589_pilon	+	1049	7	Intergenic	novelGene_25947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	34.1857670188438	178	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	11	1015	1271168	1278984	FALSE	10	TAGAGGTCTTGGCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVMALRWGIVSVGLISSDFTTVLRTLPRSEHEVVAVAARDLSRAKEFAQKHDIPKAYGSYEELAKDPNVEVAYIGTQHPQHKAAVMLCLAAGKAVLCEKPMGVNASEVREMVAEARSRGLFLMEAIWTRFFPASEALRAVLAQGTLGDLRVARAEFGYKLTHLARSVDLVQAGGSLLDLGIYCIQFISMVFGGQRPEKISAIGTFHETGVDDTVSVLLQYPGGVHGSFTCSITTPLSNTASVNGTKGMAQILKPCWCPTELVVNEEHKEFPLPPVPYKFNFPNGAGMTYEANHVRKCLRKGLKESPVMPLAESELLADILEEVRKVIGITFPQDKH	1271157	1279018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1271258_1271885_1271998_1273141_1273306_1275568_1275822_1277040_1277166_1278468_1278620_1278874
780703	contig_10446_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_162477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	949	1287	740308	739970	NA	50	AGGTGTTAAAAAGCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQITTVTWSHYESKSTRQHLTATTEFVAETEMIPVMVNTGRHPWKACTSNSDTEPAKVLTHILETFHFLYKLLKTNKQKLPPNPTQCFTILLNFYLGYNLIQTKNSWCTYM	741256	739317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_739300_741300
780704	scaffold_12510_pilon	-	2040	6	Intergenic	novelGene_151379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_5	44.4675162337633	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	23	913	300576	252200	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVVGWEMAAAGLAAVATAAEYPGQEASGGNLSGVNCGPSSGAGPGPGPGSWSRSLDRALEEAAVTGVLSLNGRKLREFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLTELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVRLPEELAELPLMRLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQMITLDNNPLQSPPAQICIKGKIHIFKYLNIQACKIAPDLPDYDRRPLGFGSW	300598	251072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_252314_253485_253623_256441_256548_262905_263033_264951_265097_300314
780705	contig_5423_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_85214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCAATGCACCTCATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340890	342474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_340900_342500
780706	contig_10753_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_105131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAACTGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58415	56213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_56200_58400
780707	contig_6361_pilon	-	595	4	Intergenic	novelGene_23993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	134	310	419537	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	420950	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
780709	contig_6175_pilon	+	2122	2	Intergenic	novelGene_16327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	652	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1449	1979	1493756	1495538	FALSE	25	CCCTCAGCAAGCACTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLSAILKVGSVSIFKLFLLATLIFVSPTGAVASDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWVLAFCFFFKLW	1492307	1495681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1494058_1495309
780711	contig_5423_pilon	-	1778	2	Intergenic	novelGene_85193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	848	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1088	1471	206665	205810	FALSE	45	TTTAAAAAGCCTCATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLDRQYLAINQISTQLSVDLILRCVSDESLPFDLRASFCRLMLHMHVDRDPQESVVPVRYARLWTEIPTKITIHEYDSITDSSRNDMKRKFALTMEFVEEYLKEVVNQPFPFGDKEKNKLTFEVFF	207752	205502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_205967_206438
780713	contig_8045_pilon	+	981	3	Intergenic	novelGene_35391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1784.5	6	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	287	343	118719	118775	FALSE	25	TTGAACACTTGAGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQERREAGEDEADPVSKENIYRLHRKGGSKRDKHRLSNQNSNCPKYTRGYKWLLYNCPEKSIQLDGEQCLSPLLGVRILPGLVQKATDHYRTPCYMRWEKELTKGEHCVFPPP	116139	119413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116187_118194_118243_118527
780719	contig_1836_pilon	+	1188	2	Intergenic	novelGene_71034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	427	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCTTTTGTTATCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583571	587446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_583959_586645
780720	SIRV2	-	523	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	300	4	-300	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
780723	SIRV2	-	518	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4355	34	3180	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
780725	contig_16525_pilon	-	651	7	Intergenic	novelGene_133797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	1930.47987701389	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	68	541	97608	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRYPGGRKEKVGPWGEGFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97675	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95629_95725_96924_96975_97069_97167_97605
780732	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
780735	SIRV4	-	412	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1106	3	1106	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4052	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
780737	contig_6608_pilon	+	1483	8	Intergenic	novelGene_162530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	55.25525185123	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	125	877	55544	59703	FALSE	5	TGCTGTTTCTTCTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQHSASARPHSSKRKKEDDRDDMWAQREQEEAIAQFPYVEFTGRDSITCLTCQGTGYFPTEQVNELVALIPHSDQRLRPQRTKQYVLLSVLLCLLASGLVVFFLFPHSVLVDDDGIKVMKVLFNKEDSLVILAITATLKISNSNFYSVAVTSLSSQVQYMNTVVGTYGTTNVSLIPPRSEQLVNFTVNTEMGGPFSYVYFFCTLPEILVHNIVIFMRTSVKISYIGHVTQSSLETHHYVDCGANATAT	54917	60309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_55014_55515_55731_56590_56655_57140_57301_57392_57534_57957_58008_58648_58703_59606
780738	contig_6710_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_96512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
780742	contig_17470_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_110462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAAAAGATACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21522	23656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_21500_23700
780743	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
780748	contig_11548_pilon	-	1661	2	Intergenic	novelGene_66792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1482	179	1660	139186	134611	FALSE	45	AGAAAAAAGGTGATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRSSRKVVEHSNPAKYVSINSTIDSFEFSEIEESFNVDRCSADPLVESKETSRGQATEMSSPDTNKLLPFIKPPPARSLELCVQSEQKEMFARESHHDNSGSHNFIYSCSNEVIGEKAEHEESDKLETSNVVLSSNGSTQTNGPSIPDEDNTFQPLDSARMTSHNDTVTQTTFTKTYNGISSQSVTCQKSAYSTLESKVDVFHTTVQAKTGVVQGLIQHNSPINKECQPSLERKDDDMGYVMINLEPVTLTFEKNAYVPIQTEAVNRADKSTTFNMELIKQVSPGTSLSHPVSTFETAQTQGLTDIPSLAGSEQKGSRYLCASSVSRETLAKEMCLLQKESPLRVSSSSSDNSAVKEAVSLVKNFNYPLPSEEMRLSRDTFLQTESLFSISSEDITEATQFEEVASSSASTILERNYPLNCISSRSNISDDSLELRKNDNGCLNSENTNFESFNSAFTKQTSLSMSREEVSLELSEEDSDIDLTLTISPPTSPREQIPADEIEQLQEAPLSSLELRDIAEEIIDPEEVTLIENREVNSADCTSLSQEPLEDK	139364	134609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_135931_139024
780753	SIRV4	-	194	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1319	8	1319	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3839	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
780754	contig_6842_pilon	+	2836	1	Intergenic	novelGene_130780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2231	2584	1371883	1372236	NA	65	AAAAAAAAAAGATCTACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQSQLLTWAGKLLAAFSADVVWLLEDGQGQGSFAGISARGLSPPVPSTLLLPPCGPLQPWFWASGALSIISSLGCPGNVGFPSREHAGIAPCVHGWEEQGERSPLGWGRPGPSKS	1369652	1372488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1369700_1372500
780755	contig_11832_pilon	+	2363	11	Intergenic	novelGene_106951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	29.7348280640733	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1510	2100	183796	185618	FALSE	40	TCCAAAACCAAACCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVFNQVVSTGGGGHVELLKRAGAFLTYSSFCPLDDLADRGLLGVKSCYYAQDALWLWEIISRYVEGIVNLHYKTGVAVKDDLELQSWCQEITEIGLQGAQDRGFSVSLQSRDQLCHIVTTCIFTCTGQHSSIHLGQVALGQHKEEYFSGPGPKAVLKKFREELVVSDKEIEIRNAKLDMPYEYLQPSMVENSVAI	178007	185881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_178483_178690_178773_178872_178996_179156_179618_180297_180394_181608_181820_183734_183814_183897_184068_184222_184345_184937_185039_185438
780756	contig_6589_pilon	+	1048	7	Intergenic	novelGene_26088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	76.2636144494141	968	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	5	760	1865997	1874896	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDVSHRWEGPGMEVGARDSRSPPFRGPGDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRGL	1865992	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867459_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1874884
780758	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
780759	contig_3866_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_112402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAAATAATTTAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173918	171824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_171800_173900
780766	contig_14868_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_150431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86695	88823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_86700_88800
780771	contig_6842_pilon	+	910	9	Intergenic	novelGene_130762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	371.035859958306	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	330	701	1366898	1377191	FALSE	25	AATGAGCATGGAGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1308179	1377400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1308221_1308737_1308811_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
780772	SIRV6	+	316	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8116	-1	623	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
780775	contig_11978_pilon	+	1597	12	Intergenic	novelGene_62796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	73.625700687008	1	66	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	378	1217	379985	587379	TRUE	10	GCCATGTCTGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPDEEHNLDEDESGTRRKGVEYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299626	589574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335722_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587387_589201
780776	contig_6635_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_127030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATATTAAGAACCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549168	547284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_547300_549200
780778	contig_8461_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_163933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGGTAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441469	442950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_441500_443000
780779	contig_7457_pilon	+	2176	10	Intergenic	novelGene_31330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	323.875299886458	1	132	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	742	1053	285416	285888	TRUE	25	AAGATTTGCTGCAGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQ	280836	291236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285300_285391_285529_285689_285889_288210_288355_289036_289098_289582_289726_290461
780782	contig_15449_pilon	+	1231	3	Intergenic	novelGene_33629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1972	junction_1	70	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	103	447	84815	86207	FALSE	45	ATAATTTTCTGAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSYFSSF	62251	86991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000
780784	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	384	-1	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
780785	SIRV6	+	300	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11027
780786	contig_6710_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_97739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780787	contig_3956_pilon	+	599	4	Intergenic	novelGene_14919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2031	junction_2	764.728419476846	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	81	599	1281682	1284173	FALSE	20	CTCTACCAGACCTTCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEE	1281601	1284173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054
780792	contig_7861_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_77403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTCCACAGCCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57001	59005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_57000_59000
780793	contig_3822_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_133286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGAGGGAAACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171478	171787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_171500_171800
780796	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
780800	contig_4305_pilon	+	2889	13	Intergenic	novelGene_136706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.3660679216693	445	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	768	2717	789934	803214	FALSE	20	GTAACTGGGAGTTCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSSGSSGRGAGQPKGKTSGTEPADFALPSSRGGPGKLSPRKGVSQTGAPVCEEDGDAGLGIRQGGKAPVTPRGRGRRGRPPSRTTGTRETAIPGPLGIEDISPSMSPDDKSFTRIVPRVPDSTRRADVGAGALRRSDSPEIPFQAAAGPSDGLDTSSPGNSFVGLRVVAKWSSNGYFYSGKITRDVGAGKYKLLFDDGYECDVLGKDILLCDPIPLDTEVTALSEDEYFSAGVVKGHRKESGELYYSIEKEGQRKWYKRMAVILSLEQGNRLREQYGLGPYEAVTPLTKAADISLDNLVEGKRKRRSNISSPATPTASSSSSTTPTRKITESPRASVGVLSGKRKLITSEEERSPAKRGRKSAAVKPGAVGAGEFVSPCESGDNLGEPSALEEQRGPLPLNKTLFLGYAFLLTMATTSDKLASRSKLPDGPSGSSEEEEEFLEIPPFNKQYTESQLRAGAGYILEDFNEAQCNTAYQCLLIADQHCRTRKYFLCLASGIPCVSHVWVHDSCHANQLQNYRNYLLPAGYSLEEQRILDWQPRENPFQNLKVLLVSDQQQNFLELWSEILMTGGAASVKQHHSSAHNKDIALGVFDVVVTDPSCPASVLKCAEALQLPVVSQEWVIQCLIVGDRIGFKQHPKYKHDYVSR	780753	803386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_781183_783516_783550_785434_785584_789777_790050_790753_790904_791204_791636_794786_794979_795395_795612_797275_797492_801101_801197_801728_801929_802484_802631_803026
780801	contig_1867_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_54592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGTGCTTTCGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504523	503668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_503700_504500
780802	contig_3948_pilon	+	1032	7	Intergenic	novelGene_53331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2	469	1467951	1468418	TRUE	5	CCCATGGCTTCTGGGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFISLFLKFPIQTIAVTEIQPSQAIAISTWGLLGIADCGFPESKRDCPVQSTHLTDEELWLQRDWVSGSGKAEREVVDCAGATPQVLLCSWSCSGPAPSWLLLVLALGGRVEVIQHTLDIFKGGPLLWAVLPAACHDVVELLRTVLGSRHPVSTL	1467949	1485180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468444_1471785_1471891_1473201_1473354_1482576_1482656_1483426_1483508_1483567_1483605_1485096
780806	contig_3111_pilon	-	2274	9	Intergenic	novelGene_129965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_5	165.429743395799	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	114	1346	100376	39237	FALSE	55	GAGAAAAGAGGTAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQAGRAESWCCRSWGAGASFPAEPESELGSCERLRTKMFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYTAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYYAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGSAYQSPLPLSRGSLSTIARAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGKESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIREKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVRATGQGL	113282	38308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_39444_39964_40056_40855_41003_41524_41680_48564_48681_63172_63276_65402_65595_100154_100403_113195
780807	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8129	2	610	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGAAATCACCGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
780812	contig_18162_pilon	-	771	2	Intergenic	novelGene_122294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCCGGTATCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9149	7816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8343_8904
780816	SIRV6	+	522	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	32	7	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780819	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780821	SIRV4	-	171	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1352	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3806	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
780822	contig_11742_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_166549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149392	151092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_149400_151100
780824	contig_211_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_129874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGACATCCAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250700	250298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_250300_250700
780825	contig_19185_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_163648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAGTAGTGACAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124524	124071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_124100_124500
780833	contig_15084_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_116678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCATCTGCTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144279	142959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_143000_144300
780834	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
780839	contig_8587_pilon	-	1948	2	Intergenic	novelGene_159143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1640	1948	493201	492893	FALSE	40	TCAGTCTGCAAAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTRAIDTHLSHLLAQACEDNVTKGICGHLLDVLLGVPLLALEHVGLDGLLQVLLTCVAALTHHLPVKTLHRSPTYPSAGPRQGIKPKRHPKLEGPCTFHKP	496586	492892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_493444_495189
780841	contig_8907_pilon	-	1746	8	Intergenic	novelGene_85837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_7	81.211741384947	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	187	1026	519287	489040	FALSE	35	AGAATTTAGTGTGTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPIFTTRAHVFQIDPSTKKNWVPASKQAVTVSYFYDVTRNSYRIISVDGAKVIINSTITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVFGLGFSSEQQLTKFAEKFQEVKEAARLARDRSQEKIETSSNHSQASSVNGTDDEKASHTGPADTHLKSENDKLKIALTQSAANVKKWEIELQTLRESNARLTTALQESAASVEQWKKQFSICRDENDRLRNKIDELEEQCSEINKEKEKNTQLKHRIEELESELREKETELKDLRKQSEIIPQLMSECEYVSEKLEAAERDNQNLEDKVRCLKTDIEESKYRQRHLKVELKNFLEVLDGKIDDLHDFRRGLSKLSSDN	536989	488319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_489229_490838_490920_492252_492364_495100_495258_497739_497847_501751_501845_519185_519318_536833
780843	contig_3132_pilon	-	1707	9	Intergenic	novelGene_127428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	107.815815166422	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	309	1337	229252	219865	FALSE	20	TGGGTGTGAATGTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKVC	229560	219494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
780847	contig_7707_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_72211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTAAAAAAAAAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744512	743529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_743500_744500
780848	contig_2636_pilon	-	824	4	Intergenic	novelGene_52057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_3	132.380763960126	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	123	536	85555	59826	FALSE	25	CGAATTTGGTAGATCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMRKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85677	59537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_85551
780849	contig_15255_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_173917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAAAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403279	404085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15255_pilon_+_403300_404100
780854	contig_5894_pilon	-	2279	1	Intergenic	novelGene_83019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACAGATACCTTCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282965	280686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_280700_283000
780855	contig_13004_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_112655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTCCCGCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521237	522176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_521200_522200
780857	contig_3956_pilon	+	1441	6	Intergenic	novelGene_14780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	10.9654001294982	25	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATGTGTTTGACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988764	991754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_988887_988991_989095_989218_989294_990441_990613_990708_990802_990877
780859	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_90141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653806	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
780862	contig_7202_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_18492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
780864	contig_15821_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_25024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCCAGTAATAACTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147743	146458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_146500_147700
780866	contig_10734_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_51352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTGGGAGAAATAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754914	1755474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1754900_1755500
780867	contig_11026_pilon	+	2063	13	Intergenic	novelGene_167641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	171.908082674692	11	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	72	1802	43170	126045	FALSE	20	CAGAGACTCCTTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKEDDYNEESPTEPSSDGIISEKEITQDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKTMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEATLNDRRRVALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTVRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRGGLLSFEKRIFQVAHEIGSVNTVESIKGFVSFTRVFVTLV	43098	126306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104535_105665_105834_108820_108952_110007_110083_111253_111413_112211_112341_115713_115748_125920
780869	contig_12250_pilon	+	2005	17	Intergenic	novelGene_80542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	76.5330810826273	8	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1096	1947	275593	278399	FALSE	15	TCCCTCGGTTCACCAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKHTDKERALDCGHQATGIGGLRLGEMISDQTLGTANPPRLPTLRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRILPSDAFQTAWRVVCYYCTATSLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	260315	278457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_260388_260737_260819_261003_261219_272799_272856_273020_273132_273484_273566_274376_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277658_278250
780870	contig_10494_pilon	+	1305	4	Intergenic	novelGene_102166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	981	1304	917686	918009	FALSE	15	CACTGTGCTGCCCATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKVSRQVAWNWLLSFMVSCPKPGKSRSRMHRIISAMRAGTTDVTRNCRVTGTFQQGVGFLTEGLSPLCPSGSNYAGSPLPSMHHVGPPTTTASPGAAHWSSRWSAC	914714	918010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_915393_916135_916244_917052_917169_917607
780871	contig_11130_pilon	-	1053	7	Intergenic	novelGene_53099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	924.101500557884	54	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGACCCATCTAAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	55083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55184_55636_56165_58684_58810_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
780874	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780875	contig_9195_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_155685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTGTGTGACGTGGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319640	321249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_319600_321200
780876	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
780878	contig_14275_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_162866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAATAATAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322069	324383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_322100_324400
780881	contig_6710_pilon	+	522	2	Intergenic	novelGene_97785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTGGTTCCTCTTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653399	657833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
780882	contig_14807_pilon	-	772	7	Intergenic	novelGene_124700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	39773	37247	FALSE	5	TCCCATCTGTGTCTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
780890	contig_3270_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_104519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	329	990	251	1240	435229	434240	NA	45	AATGTTTGAACAGGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVYTERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVCTERQEGILHVFSITLLTEVCIERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVCTERQEGILHVFSITPLTEVCIERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLKVFSMMLRSETSRGKSVRCSKPVSAKQSPGLLFLNKRERNLRTQKRPHWELFDEVTWLKYRYERWKTKDQVKGCCEYILSRKTSTLNRLKAKNAEGN	435479	433098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_433100_435500
780894	SIRV6	+	290	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-2	608	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1527_1642_1741_3074
780897	contig_2377_pilon	-	2687	4	Intergenic	novelGene_67891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTCACGTGGTTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212942	197504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_197597_200080_200195_200790_200893_210563
780898	contig_6837_pilon	+	1242	11	Intergenic	novelGene_149823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_5	22.2836262758107	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	80	1087	11753	17185	FALSE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQVIAYSEHRYRIFGETIDIAVGNCLDRFARVLKISNDPSPGYNIEQMAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11673	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15176_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
780900	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780901	SIRV2	-	521	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4352	34	3177	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
780905	contig_15570_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_137838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481644	482964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_481600_483000
780908	contig_12638_pilon	+	830	5	Intergenic	novelGene_33063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTTTAGAGTTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40688	79528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_40754_51872_52155_77424_77628_78341_78533_79439
780910	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_94597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	21	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
780917	contig_7870_pilon	+	1562	1	Intergenic	novelGene_108894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147747	149309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_147700_149300
780921	contig_13292_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_142931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATATTTTAGCACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108262	106900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_106900_108300
780922	contig_5434_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_74641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGGGTAACTATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32430	33446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_32400_33400
780929	SIRV6	+	468	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
780933	contig_6446_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_149176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129076	131168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_129100_131200
780935	contig_4838_pilon	+	1678	13	Intergenic	novelGene_144785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.128196150006	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	905	1522	268265	279206	FALSE	5	TTCTTTTTTCTGGGCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAYERNFWDPSLQLDAQQEIKLCQKPNDISIHHFTCDEENVFAAVGRGLYVYNLQMKRVIACQKTAHDSNVLHIAKLPNRQLISCSEDGSVRIWELREKQHLPAEPVPTGFFNMWGFGRVNKQASQPVKKQQENATSCSLELIGDLIGHSSSVEMFLYFEDHGLVTCSADHLIILWKNGERESGLRSLKLFQKLEKNGDLYLAV	217613	279362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_217805_222261_222380_239648_239698_241062_241195_244326_244390_248316_248429_251007_251071_255283_255395_268199_268385_273286_273409_274222_274312_275548_275683_279053
780936	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
780937	contig_3132_pilon	+	2036	17	Intergenic	novelGene_127404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	72.5747190401038	7	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	531	1652	13928	23874	FALSE	20	TATCATATGTAGTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMPHESTVEHTHVDINEMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	3538	24258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_3601_7470_7589_8405_8502_12587_12680_12806_12865_13071_13142_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953_23131_23628
780940	contig_15882_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_144813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1053	1367	324960	325274	NA	20	GCCCTCTGAGTTGGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWVRHTLVIKVTSLLFKILKRSFAADLPNAIHDLISLLLLPWVLMLMQVKLNPWQLHGVSMGWNPLNNNKAEFYQTLKEELMQILHKHFQKIEEEGNTSQLFL	323907	326063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_323900_326100
780941	contig_14687_pilon	+	1957	2	Intergenic	novelGene_107922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCACAATAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458226	461630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_458512_459958
780942	contig_14563_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_135061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAATGAAATGGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160541	161618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_160500_161600
780944	contig_7843_pilon	-	2311	3	Intergenic	novelGene_152030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	57	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	98	418	271466	264425	FALSE	30	TAAAGTGTCCGTCCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVTYCRAARQLVERQKYSEIRQLLKCVSESGMAAKSDGDTILLNCLEAFKRIPPQELEGLIQAIHNDDNKVQAYLTCCKLRSAYLIAVKQEHSRATALVQQVQQAAKSSGDAVVQEICAQWLLTSHIRGAHGSGPRK	271563	262531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_264629_267969_268015_271394
780950	contig_5951_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_153242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176362	176689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_176400_176700
780954	contig_5415_pilon	+	1721	2	Intergenic	novelGene_146144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTAATCTCCAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223935	225731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_224059_224133
780956	contig_13014_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_169359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTAAATTTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429581	428371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_428400_429600
780957	contig_7157_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_131266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	230	junction_1	0	10	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGACTCTTATGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88932	93093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_88964_90914
780962	contig_14333_pilon	+	1343	2	Intergenic	novelGene_49121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	738	junction_1	0	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGAAGAAAAAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396416	399236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_397100_398576
780966	contig_5479_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_133610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1862	2179	347997	347680	NA	55	TAGCAAAGAGAAACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFSSMIDLMPHPQSGAELSIIITVSMKTYDLFSLLPSLIPCDPFPHYSTCPNPNPFHKTLWNFYSSIKNLSNIYRYMIKKVHTHVYIQTHVYSMSTFGLEGQE	349858	347655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_347700_349900
780967	contig_10930_pilon	+	638	6	Intergenic	novelGene_37097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8010.20664901974	447	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTGTGTTTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339420	342108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341160_341449_341625_342020
780969	contig_14577_pilon	-	853	8	Intergenic	novelGene_164645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	491.777450910968	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	189	794	86842	72950	FALSE	35	AAACTTATACTGTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPVRVFVCKPLL	127091	72890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_101094_101217_127042
780970	contig_8676_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_142206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326414	324933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_324900_326400
780972	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1656	37	-243	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2780	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780974	scaffold_880_pilon	-	1477	2	Intergenic	novelGene_121444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427536	425698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_425764_426124
780975	contig_6364_pilon	+	1394	4	Intergenic	novelGene_51866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.8423039781937	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	27	299	2485601	2487563	TRUE	10	CAGGCTGGCCGGGTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGASSLVMALPWALAVLSLLPLLDAQDPACAILKPAPVTNAIARAAEASASITPATYRSSGRMGPSPDTSGAQNNLPMCCSPRTLRPSCFPTTRKTS	2485574	2489306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486458_2486530_2487476_2487586_2488233
780977	contig_9875_pilon	+	1236	6	Intergenic	novelGene_154396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	24.3507700083591	637	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	67	636	10870	21434	FALSE	25	CTTTCAGTTATTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDEEQLSARPALETEGLRFLHVTVGSLLATYGWYIVLIGILLFVVIQKLSARLRALRQRHLDRAAAAMEPDIVVKQQEALAAARLKMQEELNAQAEKYKEKLRQLEEEKRRQKIEMWDSMQEGKSYRGNARKLQEEDNPGSSTSSVPPKRQPDRKPLRRGGYNPLSGEGGGTCSWRPGRRGPSSSGG	10803	22034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_10946_11610_11746_14126_14234_19197_19288_19388_19468_21351
780981	contig_6440_pilon	-	1810	2	Intergenic	novelGene_161667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49839	47991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_48889_48926
780982	contig_2646_pilon	-	1002	4	Intergenic	novelGene_69610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_3	8.80656320908194	626	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTTTTTTTCCATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2014066	2007932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2008400_2011714_2011799_2012331_2012592_2013875
780983	contig_11340_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_173919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTAAGTTGAAAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198195	196287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11340_pilon_-_196300_198200
780985	contig_5018_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_46980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGTACCACATAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630413	629722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_629700_630400
780993	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	3	409	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
780994	contig_294_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_166752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGTCATAGTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154062	153614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_153600_154100
780995	contig_13161_pilon	+	1253	11	Intergenic	novelGene_173923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	25.8812673569128	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	98	1252	17259	35425	FALSE	25	GTAAGTGTTCATTAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWQPRWFLLCGGILSYYDSPEDAWKGCKGSIQMAVCEIQVHSVDNTRMDLIIPGEQYFYLKARSVAERQRWLVALGSAKACLTDSRTQKEKEFAENTENLKTKMSELRLYCDLLVQQVDKTKEVTTGMSNSEEGIDVGTLLKSTCSTFLKTLEECMQIANATFTSELLCRTPPGSPQLAMLKPSKMKHPIVPIHNSLERQMEMNSCENGSLNMEINDDEEILMKNKSPLSLKSAERDCSISSEENINNITVQGEVMKEDGEENLGNHDSLAQPESNSANSSESHWEEGNEVIPTFFSTMNTSFSDIELLEDSGIPTEAFLASCYAVVPVLDKLGPTVFAPVKMDLVGNIKKVNQKYITNKEEFTTLQKIVLHEVEADVAQIRNSATEALLWLKRGLKFLKGFLTEVKNGEKDIQTAL	17161	35426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13161_pilon_+_17281_18276_18433_20003_20126_22123_22283_23474_23516_25235_25391_26772_26927_27321_27408_33703_33763_34599_34731_35355
781000	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	53	512	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
781001	contig_14855_pilon	+	2018	7	Intergenic	novelGene_146037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	38.6584042896525	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	247	885	650839	654448	TRUE	5	CCCTGGTTGGTCATTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648593	655653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_654848_654919
781002	contig_5954_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_28805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGGTTAAAGCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449737	1451367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1449700_1451400
781007	contig_7580_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_108597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	363.374032506452	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	196	861	104065	109647	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96447	109868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_104052_104173_106952_107190_108145_108248_109428
781008	contig_14275_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_162876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAAAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436769	437292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_436800_437300
781011	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
781015	contig_5039_pilon	+	2626	1	Intergenic	novelGene_64907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1619	1945	675870	676196	NA	45	AAAACTGTCTTATACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLGLLSQQLWLKGRCGTTDAAARPQVFGSTACFSRGQLFQPRPPELLGLVATSSLFSQRSQKFYCEVKPPNLQILMTNFFFQSWEPPVHSQETSLGILDPPERGQLC	674251	676877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_674300_676900
781018	contig_9580_pilon	-	875	8	Intergenic	novelGene_167730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	47.8104249583067	336	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	53	748	807458	752218	FALSE	15	TTTGACTTAATTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATAAAVRGGEGLGRAAMEGQRWLPLEANPEVSADQFLRQLGLQPNWQFVDVYGMDPELLSMVPRPVCAVLLLFPITEKYEVFRTEEEEKIKSQGQDVTSSVYFMKQTISNACGTIGLIHAIANNKDKMHFESGSTLKKFLEESVSMSPEERARYLENYDAIRVTHETSAHEGQTEAPSIDEKVDLHFIALVHVDGHLYELDGRKPFPINHGKTSDETLLEDAIEVCKKFMERDPDELRFNAIALSAA	807510	752090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_752302_752886_752946_758851_758928_782735_782784_784584_784671_785233_785391_791535_791670_807406
781019	contig_11518_pilon	-	2047	5	Intergenic	novelGene_109137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	13.0838641081295	63	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	311	1030	459009	429693	FALSE	65	AAAGGAAATGGAAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLGHIMRLDLEKIALEYIVPCLHEVGFCYLDNFLGEVVGDCVLERVKQLHCNGVLRDGQLAGPRAGVSKRHLRGDQITWIGGNEEGCEAISFLLSLIDRLVLYCGSRLGKYYVKERSKAMVACYPGNGTGYVRHVDNPNGDGRCITCIYYLNKNWDAKLHGGVLRIFPEGKSFIADVEPIFDRLLFFWSDRRNPHEVQPSYATRYAMTVWYFDAEERAEAKKKFRNLTRKTESAVTED	459319	428675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_429725_434066_434141_436306_436444_437933_438054_458652
781021	contig_6418_pilon	+	2062	2	Intergenic	novelGene_81260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513857	1516041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1514810_1514931
781023	contig_3817_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_78293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTTGTTTGGTGTCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94788	96581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_94800_96600
781026	contig_10734_pilon	+	1708	8	Intergenic	novelGene_51111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_7	60.1352217752557	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	509	1636	711421	719124	FALSE	0	CTTGCGTGTCCCGTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIPGWFRSILPKAALRVVEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKADAGENPAVFSLSPAEKSQLTIDFIDIVKDSIPPSEYKTEEDPKLFHSTKTQRGPLSDNWIEEYKKHVFPIMCAYKLCKVEFRYWGMQSKIERFIHDTGLRRVMVRAHRQAWCWQDEWYGLSMEKIRELEKEAQLMLSRKMAQFSEDEDETMELSREEAAQDQASREPAEPSSNKNGEPLAGRGLKKQWSTSSKSSRSSKRGASPSRHSISEWRMQSIARDSDESSDDEFFDAHEDLSDSEDMFPKDISKWNSNDLMDKIESPAPEDAQEGLYRQNTPGFRVDSSVEQLNIMEIKNKIIAFFPTCVMKMKGWKGRRRKPRPCRQK	710912	719196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_711516_712728_712851_713817_714046_715406_715719_716881_716978_718396_718502_718729_718801_719025
781027	contig_5988_pilon	-	1206	7	Intergenic	novelGene_15892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	73.8888053466529	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	376	801	530935	529953	FALSE	15	TTTTACTTACTCCGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVIVTEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	531971	529547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530359_530599_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805
781028	contig_4364_pilon	+	1231	9	Intergenic	novelGene_75	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	66.0642443005292	124	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	70	1182	726367	757636	FALSE	10	CTTCACGTGCATCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQRRGAPKAPDGSGKAERRRPSSTKKDQAQQEAPRRGLKTTVLGACAALTALLLWSRMGGDDGITEVLARRGEVLPGRFIEVPCSEDYDSHRRFESCTPRKCGRGISDVVITREEAMRVRSIAEKGLSLGGSDGGASILDLHSGALSVGKHFVNLYRYFGEKIQNIFSEEDFQLYRDVRQKVQLTIAEAFGISASSLYLTKPTFFSRINSTEAQTAHDEYWHAHVDKVTYGSFDYTSLLYLSDYLEDFGGGRFVFMEEGANKTVEPRAGRVSFFTSGVREPAPGGEGQLGYTLRHHHRLHLQPRPQHHRPLLHVASGAQGTVSESCPRAPSSRMSPSRGLPDHTESPPPISAHPTAQSALWISQSLIC	726297	757685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_726441_727829_728048_729872_729949_731338_731382_737767_737833_738338_738396_744094_744249_751952_752077_757334
781029	contig_3472_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_166942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATTATATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922823	924257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_922800_924300
781033	contig_8006_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_173927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_5	103.08559550199	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	63	1256	343343	512075	FALSE	15	GAGTACCTAGTTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVSGAGGWRRHSSRSCGERRMGPRRAARPLLPAVLRPPLLLLLLPPLSCSGAGVGRPPHLVFLLADDLGWNDVGFHGSSILTPHLDALAAGGVLLDNYYIQPLCTPSRSQLLTGRYQIHTGLQHQIIWPCQPSCVPLDEKLLPQLLKEAGYTTHMVGKWHLGMYRKECLPTRRGFDTYFGYLLGSEDYYSHERCTLIDALNVTRCALDFRDGEEVAAGYKNMYSTNVFTERATALIANHPPEKPLFLYLALQSVHEPLQVPEEYLKPYDFIQDKNRRHYAAMVSLMDEAVGNVTAALKNHGLWDNTIFIFSTDNGGQTLAGGNNWPLRGRKWSLWEGGVRGVGFVVSPLLKQKGVKNRELIHISDWLPTLVKLAGGHTNGTKPLDGFDVWKTISEGSPSPRVELLHNIDPNFVDISPC	343280	512075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_343634_363267_363455_383425_383617_394066_394275_475705_475950_512002
781035	contig_8375_pilon	+	1892	3	Intergenic	novelGene_141305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	173.5	2	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	11	784	175731	221694	FALSE	35	GATAAGCACCTAAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQRPFHCEVSFHASSDRCLDCLLQSFDSGQRRLQKYHHRLQKLRLTHTVAFLSLPVFVAAKEHIKSKAVQLEGFSLPSRLLQSFSLGSQCTTELFFFFTSTVNMCNCSPSHFQRMSVW	175720	222802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_176056_180330_180429_221343
781037	contig_5988_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_15895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAATAAACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547388	545269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_545300_547400
781038	contig_990_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_76131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGAACGTTCTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603254	1602250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1602200_1603300
781039	contig_9436_pilon	-	1262	6	Intergenic	novelGene_60893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	17.7763888346312	362	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	38	1015	384849	375862	FALSE	20	CAATACTTGGGCCTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLRSLRLCLVPRTGSRPAGPLLLQPPQPWPTFHTGPWLYASASSKELLMKLRRKTGYSFVNCKKALETCGGDLKEAESWLHKQAQKEGWDKAVKLHGRKTKEGLIGLLQEGNTTVLVEVNCETDFVSRNSKFQQLVQQVAVGTLLHCQNLKDQLATYSKGFLNSTELSELRAGPDREGSLKDQLALAIGNLGENMILKRAAWVKVPSGFYVGSYVHGAMHSPSLHNLMLGKYGALVICETSEQKANLEDLGRRLGQHVVGMAPLSVGSLDDEPGGETETKMLSQPYLLDPSITLGQYVQPQGVSVVDFVRFECGESEEAAEAE	384886	375614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_376269_378315_378404_381797_381921_382645_382775_384345_384520_384792
781040	SIRV6	+	399	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	461	11	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
781042	contig_2596_pilon	-	2486	1	Intergenic	novelGene_53493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAACACTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746136	743650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_743600_746100
781043	contig_3326_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_170603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGACAAGGGATAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213906	212280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212992_213852
781046	contig_9807_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_32900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	307	624	115576	115259	NA	65	GATGTGATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNIATTSPGEQNCRSLSSTDLDPGHCGFGPGTPRQVLSKCVLATLRTKGWLCQLMNIKHRINSVLQIALLPFHGFSGLSQGCLTPPPPSESCSPWSHPCPSHT	115882	113148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_113100_115900
781051	contig_7308_pilon	+	1301	5	Intergenic	novelGene_159632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_4	136.800950289097	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614796	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_616248_616536_616604_616998_617125_617325
781052	contig_16999_pilon	+	2154	4	Intergenic	novelGene_85017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_1	32.4276973520408	119	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	338	721	386131	395592	FALSE	20	GATGATGCTTGGTTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEIYKFQRQILRVKDRDEFPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEASAKIRLNVDQAFHELVRVIRKFQEQECPPSPEPTRKEKDKKGCHCVIF	385793	397025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_386199_386379_386489_393448_393568_395504
781054	contig_7207_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_72090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGTCTTTTATTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703967	702270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_702300_704000
781056	contig_10732_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_114704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCTACAATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114756	113969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_114000_114800
781057	contig_16951_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_98633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAAGAAATTAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79455	80977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_79500_81000
781058	contig_5013_pilon	+	1484	9	Intergenic	novelGene_110079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	125.211258978576	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	213	1133	38564	73947	FALSE	30	TGATATCAGCGACTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTEVLLQPNPNARIEEFVYEKLDRKAPSRINNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIKCGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLKKAKTADTRASSEQELRITQSEFDRQAEITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQLTYYAQCYQYMLDLQKQLGSFPSNYLCNNNQSSIPPLPPASSNVVGPSAVASTSALVVTSPSNLSDLKECTGNRKARVLYDYDAANSSELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN	26850	74298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_26952_38452_38601_47358_47488_51196_51331_54379_54473_65168_65259_65641_65743_73234_73464_73839
781061	contig_12250_pilon	+	961	11	Intergenic	novelGene_80678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	303.321215875184	27	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	427	915	393102	394948	FALSE	0	CTTCTGGTGTGCGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQEKVLERVNAVKTKVEAFQTTISKYFSERGDAVAKASKETHVMDYRALVHERDEAAYRELRAMVLDLRTFYAELYHIISSNLEKIVNPKGEEKPSMY	391609	394994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392190_392628_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_393955_394108_394177_394326_394382_394687_394775_394867
781063	SIRV2	+	742	3	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-390	276	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36672	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGGTATGTTTTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3643	4733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4479_4686
781065	contig_16541_pilon	-	2687	1	Intergenic	novelGene_126751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACACTAAAGAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423544	420857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_420900_423500
781066	contig_10848_pilon	-	2608	7	Intergenic	novelGene_133522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	32.142477951908	529	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	58	1548	59334	40251	FALSE	15	TCTGATGTTGACTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEARAGKGSLRERFSAAVPMALWRGSAYAGFLALAVGCVFLLEPELPASALRSLWSSLRLGPAPSLPGPASPEGRLAAAWDALIVRPARRWRRVAVGVNTCVDVVLSGVKLLQALGLSPGDGKDHAILHSRNDLEEAFVHFMGKGAAAERFFSDKAAFQDIAQIASELPGAQHYVGGNAALIGQKFAAHSDLKVLLCGPVGPKLHELLDDNVFVPPESLQEVDEFHLILEYQAGEEWGQLKAPHANRFIFSHDLSNGAMNMLEVFASSLEEFQPDLVVLSGLHMMEGQSKELQKKRLLEVVTSISDIPTGVPVHIELASMTNRELMNNIVHQVFPAVTSLGLNEQELLFLSQSASGPHSSLSSWSGVPDVGMVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	59391	39190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40803_43630_43730_44390_44588_48151_48273_49522_49586_52607_52834_59101
781067	contig_12427_pilon	+	2165	16	Intergenic	novelGene_40499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_14	138.300381617534	1	106	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	36	2021	403342	419950	FALSE	20	TTTTAAGATCCTCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRKNDRLAVSKMISKFTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	403306	420094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_403440_403535_403670_404462_404531_404777_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
781070	contig_12709_pilon	-	1376	9	Intergenic	novelGene_147403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	594.847617041541	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	812	1294	33720	29115	FALSE	40	CAAACACCAACAACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59027	29032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_34489_34751_37396_37524_41999_42166_57378_57450_58929
781073	contig_8812_pilon	+	2743	8	Intergenic	novelGene_57259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	23	junction_2	83.7462152662947	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	42	1481	10737	15602	TRUE	5	GTCTTTGTATTTGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYLNQHIENIQKEMNQQHSGQIQRQYEDEGGFLKEVESRRVVSEDTSHYILIKGIQAKKTAEGDSESLPSSSRMHSMSFDVKSPPCEKLKPEKETDASPPSPRTLLAMQAAMLGNNPEEEVESGRKRPYNEKNASAAVDDGSVSPRTLLALQKALDDEEEVKGHAGNDVQTGGLGVKKLPTNNPDEESDEGHRDDGKGRLFTAVPHSAGVNFVEESATSTNSEKELTDSAGLSSAIFCQGSEPSVQKEQISFIHPVSEGLQTSDDSMEKDGKSPIPLQSTVLMSSDAPGLQNRKARIPASSTSTVVVSQDETYPEGLELQNDLGTSESKRDSSVLSSDDEMEGGENRACEISGTVCLQGTGGTAVVPSETLSNLESVVLFSDKQHENLLKTIQESEVTESASRDVISVPKSLELRETDSEDGESDGRAGDSGEQPFRTAEFTESSKTAARTGCCYCNRPDVPGKPGTSSPVWHSLYRGAYGSRGTMCHPGPD	10695	25779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_10858_11168_12285_15236_15357_15519_15734_17209_17355_22661_22864_23482_23568_25080
781075	contig_15092_pilon	+	1305	3	Intergenic	novelGene_57824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	149.5	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	137	556	342199	351165	FALSE	15	GCTTGAGTTCTGTTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNSKMRFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	342062	351914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_342228_348139_348358_350992
781076	contig_6446_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_149215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377021	378058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_377000_378100
781077	contig_9752_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_122034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAGAAAACATTTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189292	190762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_189300_190800
781084	contig_20766_pilon	+	1803	3	Intergenic	novelGene_173942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAATGTAGAGAGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6297	10415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20766_pilon_+_7765_9251_9409_10236
781086	contig_18342_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_154563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGATTTGGAAGAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35261	36134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_35300_36100
781089	SIRV6	+	431	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	20	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1222_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
781092	contig_1225_pilon	+	1065	4	Intergenic	novelGene_44192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	120	386	253442	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSRRLCRGPRGFALAVPGWKDPGPGRGLRSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251409	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274865_276570
781093	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	3	1153	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781095	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	2	1160	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781099	contig_3787_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_102441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728166	728724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_728200_728700
781104	contig_15325_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_157187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95410	97560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_95400_97600
781105	SIRV6	-	542	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATCAGCACATATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11326	10476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
781112	contig_9242_pilon	-	2174	5	Intergenic	novelGene_155068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTAAAAGAAAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653101	637378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_637502_642854_643077_643911_644137_645723_645831_651604
781113	contig_16907_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_87448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTCCCATTTTCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432788	433904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_432800_433900
781118	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
781121	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1681	0	-218	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2805	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781122	contig_5482_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_144501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATTTAAGAGAGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606262	607594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_606300_607600
781128	contig_18889_pilon	+	1543	7	Intergenic	novelGene_167119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGATAAAAAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200837	229713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_+_201774_202581_202707_203380_203474_209917_209985_222782_222888_224885_225029_229639
781129	contig_19941_pilon	-	1571	9	Intergenic	novelGene_139757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	63.1798029436623	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	169	1194	40496	17219	FALSE	55	GTGAGGTAGAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGRLASFQRKELHFPGATANKRLYPISQSSTRFGSTGLSSGLGDFEAKMAAGTGKHKLLSTGPTEPWSIREKLCLASSVMRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQEKYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAMKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTSATLDEATSGVSENEMAVTPGHLNSTGVLLEVGGVLPVIHGGEMQQTPNTVAASPAASGKLPLFLYLLYFRDVELSIACFGFPKICY	40664	16841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_17453_18602_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_40327
781130	contig_6808_pilon	-	911	8	Intergenic	novelGene_173530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGTAGACATGAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358573	185801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_-_185929_221741_221915_283715_283825_311841_311898_329192_329346_343953_344031_350679_350798_358475
781135	contig_11300_pilon	-	1384	7	Intergenic	novelGene_168647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	80.6487583427186	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	368	1084	87814	80702	FALSE	35	TAACTTTCTATCATGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTSEIFEMYQQYAAFKRWHFEPLEYFPSEIGGLRHASASIGGAEAYKHMKFEGGVHRVQRVPKTERQGRIHTSTTTVAILPQPAEIHLVINPKDLRIDTKRASGAGGQHVNTTDSAVRIVHLPTGVVSECQQERSQLKNREMAMKKLRAKLYSMHLEAAASKRYNARKIQIGTKGRSEKIRTYNFPQNRVTDHRINKSLHDLVTFMQGEYLLDELVQSLKEYADYESLVEVISKKV	93894	80401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_80903_81667_81805_83208_83327_87047_87212_87717_87877_90151_90232_93669
781141	contig_9752_pilon	+	2248	2	Intergenic	novelGene_122021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACCTGCCCCTCTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125508	143079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_126986_142308
781142	contig_5278_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_139767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACATACATACAATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113478	112426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_-_112400_113500
781147	contig_9471_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_21766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATCTTGGCTATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389824	390802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_389800_390800
781153	contig_4803_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_150727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCAACCAAAGGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61574	61895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_61600_61900
781155	contig_15744_pilon	+	619	5	Intergenic	novelGene_83581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	59	307	149562	153280	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEK	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152586_153273
781156	contig_12019_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_87696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAGAACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78920	80701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_78900_80700
781159	contig_13700_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_68270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGAAAAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80320	82017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_80300_82000
781165	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
781166	contig_7119_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_40873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108895	108010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_108000_108900
781168	contig_11253_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_126813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGTCAACACTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19380	19629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_19400_19600
781170	contig_4083_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_152312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCACCGCCCCCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19588	19160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_19200_19600
781171	contig_10990_pilon	+	1816	3	Intergenic	novelGene_7402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	30	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	130	618	119582	121424	TRUE	30	GCTATGTGGTATAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119452	123567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121558_122502
781172	contig_5317_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_76598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGGAGGGTATGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393793	395070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_393800_395100
781180	contig_3382_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_124228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTGATACACGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1949363	1948547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1948500_1949400
781181	contig_14481_pilon	-	1923	5	Intergenic	novelGene_153854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCCGGGTATTCTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205880	184486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_-_184534_187150_187238_197916_198062_203456_203508_204287
781184	contig_312_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_128294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGCCTGGTGAGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10805	9518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_9500_10800
781187	SIRV2	-	440	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4433	34	3258	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
781188	contig_1154_pilon	+	2297	4	Intergenic	novelGene_87229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	25.9272486435067	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	16	2199	1626711	1649911	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQDTEKCRVRARRPDMALYVPKARRGAVHSKAGDEEKSYGPPNSVVKEEQKEHFVSQKEMFRDRPEARRLDINPDRKEQNRREGKKSLTKLKKDKCLQERHKNKVYIKRGTTECKEILSQGHQQRVPNPEIISSVPLQKHFKPKKVECLEVETTDVTGHENLLLSQSCSEVSEAQVLTKPFQNVKLCDFSRHGLNGGMFEDRELESRIETDSKVVEIVSQFPGGFSSALKLEDMLAPPKLNSDSGLVQEDMQTSGEMLKISDGGITAISVLGSSDSIIDQTCVDFEVQTVGDMDNSTCFILSQKSMDSIPEAMGHSTYKMPIVSKLENTNGIFDPTMITECERNDSIADEICVKYGPSDTATLAHETYSDNGSNSVGDITSKVCVMDVTDVISENVTVDSPCVVTVRIVDEACSNTNSFSKHTEMSADTAPLHVAKSGNNTENSNNLTDCSDIYAESIPSSFTESTGKLIESLSDCASSLPIKKIAGINYNTCLDSELSMLNWTKVLSDSALGKDLDCAGHITETLHELRTAEEFKTKEEDDSENITFDVSFPDVESVSVETSMEPKATETSYMEGSTDTEESWESMFNDDGDCLDPRLLQELSGNVKSREGIQEPRFDYYNHEVPDIDLSDCEFPHVIEIYDFPQEFRTEDLLRVFCSYQKKGFDIKWVDDTHALGIFSSPVTARDALGSKHTMVKIRPLSQATRAAKAKARAYAGEAVISAVFS	1626695	1650009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1628520_1642448_1642625_1648792_1648864_1649783
781190	contig_9389_pilon	-	1694	7	Intergenic	novelGene_83879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	326.849311185173	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	4	765	45836	36611	FALSE	0	GCCTCGGGCTGGGCGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVALENPEGGSEEAATVAEVSPGGRRMLPLPGCLPALAGSQVKRFSASKRKQHFINQAVRNSDLVPKAKGRKSLQRLENTQYLLTLLESNGGTPGLEDGDLAPPAAPGIFAEACNNATYVEVWNDFMNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMPPLTALLLHSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	45839	35681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38070_38582_38669_38850_38975_39409_39535_40050_40206_45753
781191	contig_9955_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_21372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTTCTGCCCCGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485510	486376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_485500_486400
781192	contig_5023_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_7108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTTCTAATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65910	67674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_65900_67700
781193	contig_19790_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_109489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	41.4208582721314	414	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	20	538	36392	42308	FALSE	70	AAAAAAAGACAAGCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLFVTVGTTSFDDLIACVSAQDSLQIIKSLGYSRLVLQIGRGTVVPEPFSTESFTLDVYRYKDSLKEDLQKADLVISHAGAGSCLETLEKGKPLVVVINEKLMNNHQLELAKQLHKEGHLFYCTCSEKPLEHFKQRNYFMHASWAVTVNGLINTEMFSSWPARKIFYIFG	36372	42790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_36473_37405_37569_39589_39729_40623_40667_42215
781194	contig_6710_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_91269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653884	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
781197	scaffold_13505_pilon	-	642	6	Intergenic	novelGene_111491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6158.2052255507	101	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	176	610	547393	540231	FALSE	10	TTCGTAATCTTGGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTAYSTFARLHPQYLRFSLWQGSCVPVTEALSLSLPHLWRGCQRRVLTSPCPAPASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548328	540198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542189_547380_547465_547734_547806_548295
781198	contig_9290_pilon	+	1067	6	Intergenic	novelGene_77513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	206.148878240945	569	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	313	840	46400	49973	FALSE	35	GGAAGAATAATTGCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTHQLDLFPECRVTLLLFKDVKNAGDLRRKAMEGAISGSLINPTVIVDPFQILVAANKAVHLYKLGKMKTRTLSTEIIFNLSPNNNISEALKNFGISANDTSILIVYIEEGEEQINQEHLISQVEGHQVSLASLPEITNITEVRKIYKLSSQEESIGTLLDGTICRMSTKDVL	45575	50200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_45610_45920_46168_46368_46541_47448_47572_49008_49186_49886
781199	contig_5620_pilon	-	749	3	Intergenic	novelGene_161349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	20	381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	75	401	382782	348736	FALSE	20	TTAGATGATTGTACTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPRRLPPVLYRGSVRTDVGGVGAMTASGLVGLLGSALATTWRAARPPLLCHSLRKTSSSKGGKSEPTKQSLKKPKLPEGRFDAPEGSHLEKEPLEKFPDDVNPVTKEKGGPRGPEPTRYGDWERKGRCIDF	382856	348387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_348846_365394_365548_382718
781201	contig_14514_pilon	+	1380	4	Intergenic	novelGene_137463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	58.1626073082087	21	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGGTTACTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30114	36321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_30203_31668_31750_34833_35378_35654
781204	contig_13015_pilon	+	1200	4	Intergenic	novelGene_165554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTTCCTTCGGTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367982	370828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_368496_369171_369271_369354_369486_370371
781205	contig_3153_pilon	-	864	5	Intergenic	novelGene_104706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	475	804	474444	474115	FALSE	5	CCACTCCCGCGGGCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGGGGWSSSARGRDTAARPRRRRLRGGGTARPRRRRKRRRRPRRRRRWQPGPQPWQQQSPQTPRAPEDGALGGFTEVQKALARAPAVAAAPKPGLVPPSRPHGPLPS	548646	474054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_474540_520567_520650_536467_536540_546500_546614_548534
781207	contig_6326_pilon	+	2551	6	Intergenic	novelGene_168531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	41.1096095821889	10	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1801	2106	284987	291122	TRUE	10	TGCAATGTTTTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEK	282434	291687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_283934_284685_285143_286930_287015_289403_289467_291119_291203_291322
781208	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781210	contig_18544_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_152751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAGAAAATATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50244	48051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_48100_50200
781211	contig_12964_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_131692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1575	1892	554218	554535	NA	50	ATGGCAAAACCCTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKWLCGFLYSLLYRWPLGPLATTHRGTRAGVVGVGKVCGAEVWGAHSGADWFTGNAACDPGSSALPPLPPRQWQEEEIQALVHLCKAAEEAACLRPGAHIGSEK	552643	554769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_552600_554800
781212	contig_10642_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_78681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCCAAAAAAAGAACCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204506	205514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_204500_205500
781216	contig_14785_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_158416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125785	124545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_-_124500_125800
781218	contig_12638_pilon	-	894	11	Intergenic	novelGene_33198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	143.638295729238	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	158	751	333037	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFSRTCLVPVSCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNINMTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333439	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326227_333003_333096_333202_333274_333411
781219	SIRV2	+	506	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	16	1	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTCCTACTAGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1600
781220	contig_6677_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_114165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404038	405962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_404000_406000
781221	contig_7182_pilon	-	1143	5	Intergenic	novelGene_117152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	94	741	889318	887056	FALSE	25	AAAAGTTGCAGCTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891353	886653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
781222	SIRV6	+	344	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	537	3	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
781224	SIRV2	-	292	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4581	34	3406	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
781229	contig_4857_pilon	+	808	5	Intergenic	novelGene_48824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	92.3390491612297	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	73	411	1331453	1410064	TRUE	40	CTACCACAAAAGTGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDWKQLLPLSCAKISAKGSYPGQKGVF	1331380	1410819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1409988_1410362_1410719
781231	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	54	518	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
781232	contig_6427_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_162581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCGGCTGCTAACTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061448	1060967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1061000_1061400
781235	contig_366_pilon	+	1644	5	Intergenic	novelGene_51557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	212.098296787127	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	541	1338	647849	649345	FALSE	0	CTTCTGCCTTGGCTTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	636370	649651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_636524_641061_641269_643249_643425_647843_647985_648683
781236	contig_6710_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_98101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
781237	contig_6847_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_143846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGTGACCCTATAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66785	67180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_66800_67200
781238	contig_6847_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_143847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67477	69313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_67500_69300
781243	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_96868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
781244	SIRV6	+	385	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	19	379	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781246	contig_14219_pilon	-	2129	2	Intergenic	novelGene_54350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAAGTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883263	843342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_845389_883180
781248	contig_7733_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_147152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGCAAAAGATGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192682	191721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_191700_192700
781251	contig_3394_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_152675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	45	410	411225	410860	NA	25	CCCCATTCCAGGACCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKAKILTTEPISNTMINREKTDVVKDFILLGSAHGSSCQEIKQCIALGISPAKDLFKALKSKHVTMRTKVHLTQAMIFSITSYTCKSWNIPWTARRMNKSVLFIVLRSKDGKTSSHVLWTHYQEGLVPGEGHHAW	411269	410509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_410500_411300
781261	contig_13201_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_130890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470233	469832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_469800_470200
781262	contig_6710_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_97106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGAAACTGGCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
781270	contig_11832_pilon	+	2324	11	Intergenic	novelGene_106950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	29.323028492978	134	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1459	2049	183796	185618	FALSE	25	CCAGTTGCCATCAAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVFNQVVSTGGGGHVELLKRAGAFLTYSSFCPLDDLADRGLLGVKSCYYAQDALWLWEIISRYVEGIVNLHYKTGVAVKDDLELQSWCQEITEIGLQGAQDRGFSVSLQSRDQLCHIVTTCIFTCTGQHSSIHLGQVALGQHKEEYFSGPGPKAVLKKFREELVVSDKEIEIRNAKLDMPYEYLQPSMVENSVAI	177960	185893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_178483_178690_178996_179156_179261_179458_179618_180297_180394_181608_181820_183734_183814_183897_184068_184222_184345_184937_185039_185438
781271	contig_15732_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_88862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82512	84774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_82500_84800
781272	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
781273	contig_5059_pilon	-	1880	13	Intergenic	novelGene_140737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.480139853491	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	284	1555	283612	263572	TRUE	10	TTGCCTCTTTCCAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKLFGMIITIGQAIVYVMTGMYGDPAEMGAGICLLIIIQLFVAGLIVLLLDELLQKGYGLGSGISLFIATNICETIVWKAFSPTTINTGRGTEFEGAVIALFHLLATRTDKVRALREAFYRQNLPNLMNLIATVFVFAVVIYFQGFRVDLPIKSARYRGQYSSYPIKLFYTSNIPIILQSALVSNLYVISQMLSVRFSGNFLVNLLGQWADVSGGGPARSYPVGGLCYYLSPPESMGAIFEDPVHVVVYIIFMLGSCAFFSKTWIEVSGSSAKDVAKQLKEQQMVMRGHRDTSMVHELNRYIPTAAAFGGLCIGALSVLADFLGAIGSGTGILLAVTIIYQYFEIFVKEQAEVGGMGALFF	292677	263210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_263520_263555_263759_266445_266523_267451_267644_269915_270114_270419_270581_271560_271715_275956_276067_276480_276613_283551_283631_288493_288598_290235_290304_292584
781277	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	882	9	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
781280	contig_8122_pilon	-	997	8	Intergenic	novelGene_40177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	140.084668274991	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	175	747	34413	30981	FALSE	40	AATGGTGTATTCACTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEEEEAKAEREKKEKEQKEKDK	38016	30730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_31136_32701_32826_33336_33468_33926_34016_34339_34418_36212_36256_36498_36525_37915
781281	contig_8742_pilon	-	2549	9	Intergenic	novelGene_173945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	6.72681202353685	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	37	1110	77466	29950	FALSE	45	GGAAATGGAGAAGTCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATTPQNLSLVVHGAGDLRLENYPIPEPGPNEVLLKMHSVGICGSDVHYWQHGRIGDFVVKKPMVLGHEASGTVVKVGPLVKHLKPGDRVAIEPGAPRETDEFCKIGRYNLSPTIFFCATPPDDGNLCRFYKHNANFCYKLPDNVTFEEGALIEPLSVGIHACRRAGVTLGNRVFVCGAGPIGLVTLLVAKAMGAAQVVVTDLSASRLSKAKEVGADLILQISKESPQEIASKVESLLGCKPEITIECTGAEAAVQAGIYATHSGGTLVLVGMGPEMTTVPLVHAAIREVDIKGVFRYCNTWPMAISMLASKSVNVKPLVTHRFPLEKALEAFETSRRGLGLKVMLKCDPNDQNP	77502	28510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8742_pilon_-_30116_30996_31119_34338_34515_35381_35448_37262_37382_41167_41328_61962_62128_64312_64347_77400
781288	contig_2332_pilon	-	1659	3	Intergenic	novelGene_58637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACCTTCTGCCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233147	180181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_180239_228799_228949_231694
781289	contig_11047_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_173948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCATAAAAAATAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14297	13454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_-_13500_14300
781290	contig_6434_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_61916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932751	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_932800_933800
781292	contig_9177_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_32758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCAAAGCCTCTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302308	1301773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1301800_1302300
781293	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
781295	contig_10003_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_88292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900084	898008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_898000_900100
781298	contig_7057_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_123419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATTGCAATGAATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512222	1509992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1510000_1512200
781299	contig_14528_pilon	+	2354	4	Intergenic	novelGene_111293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	37.0944739819828	596	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	242	448	285287	290323	FALSE	20	CCTCATACTTTGTAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVGGPDEFELSGSGDLDDSEDPRIFPEVIQPLVPLDNHIPERAGPVNRVPSEPKELEENEVIPKRISPFEGDEDVSNRVSMSSTAQGSGIFERTEVLAALIVGGVVGILFATFLVLLLVYRMKKKDEGSYDLGKKPIYKKAPTNEFYA	282264	292229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_+_282315_284250_284298_285142_285342_290171
781304	contig_17940_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_173959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	21	311	8254	7964	NA	15	CATTCTGTTGTACTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFFETLMYSQSSEVFIINAVLLTVMFFLGRIAVIPAFYYCMYYVYGNVVYTGLELLIPCSLASGLVVLQVMTIIWMIQIIRMWLCLNQHSHKTRQSNWKCSS	8274	7575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17940_pilon_-_7600_8300
781305	contig_12923_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_30121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGACAGTTCAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71469	70576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_70600_71500
781308	contig_5408_pilon	+	1120	2	Intergenic	novelGene_173962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	92	298	34762	44809	FALSE	10	CTAGCTCGTGTATGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLPNGSPIPAVLLANKCDQKKDSGQNPPQMDQFCKEHGFSGWFETSAKDNINIDEAARFLVENILVNHQSFPNEENDVDKIKLDQDPLTGESKSQCC	34670	45631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5408_pilon_+_34819_44659
781309	contig_9482_pilon	-	807	6	Intergenic	novelGene_44238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTCCACTTCCGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290158	263240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_263370_264007_264071_278051_278098_285421_285580_288832_288941_289855
781310	contig_610_pilon	+	2064	10	Intergenic	novelGene_76832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	38	junction_8	165.072898224981	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	7	1854	350011	373785	TRUE	20	CCTAGGACCTCAGGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVAYTCTAKNPVSQSTSSPIHAQQFCADLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKVTPFDQHIFPPPPTSRTIQYPA	350004	375701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_363029_363303_363794_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373806_374082_374155_375583
781315	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
781317	contig_6175_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_16282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAGCCTAAGAGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817071	816404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_816400_817100
781319	contig_21412_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_142855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAAGCTTCCTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41630	41073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_41100_41600
781320	contig_9423_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_99187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTTGTGTTGCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81032	79746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_79700_81000
781321	contig_9423_pilon	-	716	2	Intergenic	novelGene_99186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGTGGCAACGATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79746	78980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_79620_79669
781325	contig_8660_pilon	+	1419	2	Intergenic	novelGene_136480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCAGACCCATGTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50403	59740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_50486_58403
781331	contig_18392_pilon	+	2052	13	Intergenic	novelGene_143092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	74.7422887141023	25	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	126	1664	100248	134747	FALSE	20	AAGGGCCTTCACTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPWWLNVIHRAIEFSIEEELVQRVRNEITCNYKQQTGKLSMSEKFHDCRGLQFLLTTHMEELNKFQKLVREAVKNLEGPPSRSVIESATICHLRPTRFPLNCCVFCKADELFTEYESKLFSHTVKGQTAIFEEMIEDEEGLVDDRVPTTSRGLWAVSETERSMKAMLSFAKSHRFDVEFVDEGSALMDLFEAWKKEYKLLHEYWMALRNRVSAVDELAMATERLRVRHPKEPKSSPPVLHIIEPHEVEQNRIKLLNDKAVATSQLQKKLGQLLYLTNLEKSQDKTSGGINPEPCPICARQLGKQWAVLTCGHCFCNECISIIIEQYSVGSHRSSIKCAICRQTTSHKEISYVFTSEKANQEEDIPVKGSHSTKVEAVVRTLMRIQLRDPGAKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNIEFAQISRVKTFQENLSAFKHDPEINILLLPLHTGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATIEERMQAMLKTAERRALGKPCSHTSSSAKHSEASVLTVADLADLFTKETEDIE	100122	135135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_100259_103859_104034_104350_104414_105991_106218_108120_108265_109397_109500_111024_111097_113850_114040_126697_126791_127836_127924_128716_128896_133473_133555_134629
781332	contig_960_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_108287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGAGTCAGGGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021580	1021827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1021600_1021800
781333	contig_17470_pilon	-	1913	13	Intergenic	novelGene_110507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	64.0331402912239	1	99	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	217	1332	277215	270259	TRUE	0	CTCTTGTTGGCTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKSKMPNLPGAEDEAYDRRFVKWMIKNKVGLVGHPGLHLLQCPTSEAL	302462	269588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270854_270939_271026_271145_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302355
781338	contig_8712_pilon	+	1733	1	Intergenic	novelGene_58832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTACTGAACTGTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322844	324577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_322800_324600
781341	scaffold_4805_pilon	-	2446	2	Intergenic	novelGene_161011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTTTTGTAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383873	381379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_382379_382426
781342	contig_7753_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_41468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCATCAAGTCGATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564271	565245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_564300_565200
781343	contig_6102_pilon	+	1709	2	Intergenic	novelGene_32362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACAAAGCTGAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713105	1714918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1714599_1714702
781344	SIRV2	-	281	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	378	2958	-378	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGACTAAAAGTCAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
781348	contig_9807_pilon	+	1480	6	Intergenic	novelGene_32872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	707.872756927401	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	103	672	109130	158956	FALSE	10	CTCTTCGTTGTGGATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVADQGLELHCSRTCSFSRCFCNTPHPCPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	109027	159764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128578_158804
781349	contig_16103_pilon	-	2301	11	Intergenic	novelGene_118784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.054239670522	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1002	1300	2301	568753	563138	FALSE	50	TATATTATATGTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWGSFPAEKGQLCRLPSALNRTSSDSALHTSVMNPNPQDTYPGPTPPSVPPSRRGDFLDGEADSKVFLFQVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLPTSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPASVPALPLVMNSGGSLPDLTSLHFPPPLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISGGLGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSNSQPQLQGSHSHPSLPASSWARHALPATSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAHPYPPSTHGASPRHRRVPLSPLTLPAGPADARRSQQQPPKQFSPLFPLQWRREPEWILFFIK	573873	563137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_563192_566687_567062_567516_567762_567884_567935_568053_568134_568287_568318_568417_568522_568688_568758_569387_570327_570408_570511_573619
781350	contig_13894_pilon	+	1916	4	Intergenic	novelGene_62163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5691	junction_3	938.008647200132	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	125	436	525098	525409	TRUE	15	CTAGTGACACCTGCGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLWNERWAQRPSQSVEIFLAAFLLRTALWAEMTGSVGSAVHLNPYHLQPPQKNLKVKFSCYRETKLMDFDARVLHLVQNCFPEALLLPGFGAYDVCLGRCLI	524973	528166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_526580_526851_526948_527459_527580_528072
781353	contig_3602_pilon	+	1149	2	Intergenic	novelGene_60522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	24	341	169952	170269	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPATLWARGTGRGLPGGRSRDRGIVVLVGFGPEGGHRARESRKLAFSYHLRGRLIVGGQGGQHSDPIGCTSETTGDWLSAVRLGGGELLSWPLCKASMPTFLK	169928	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170303_170357
781358	contig_5084_pilon	+	1481	9	Intergenic	novelGene_64648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_6	14.6522182620926	195	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	123	842	1363913	1373293	FALSE	40	TATTCTGACTGTAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAADAVGCAAVASARLLNEIQEDCRREQRAPGVHPCRLVTMTSVVKTVYTLQPPSMMSGGLPADKQSRAASKSLLPVKSKEVDVTRLFHSGGSENDGTKIAKPRRENGQMKAADLALRKNVRKSYKPLSKQKSEQELKDKNQLLEAVNKQLHLKLTETQGELKGLTLKVELLEKFQDNCLAILESKGIHPVLGSETLAAQQESTTDHTDSMLLLETLQDELKLFNDTARKQMEELQALKVKLKTKEEERIRFLEQQNICNNQVNDFTTALKEMEQLLEM	1363453	1373932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1363551_1363887_1363983_1368529_1368663_1369305_1369354_1370113_1370220_1370431_1370526_1371535_1371598_1372377_1372453_1373161
781359	contig_12032_pilon	-	1204	3	Intergenic	novelGene_139270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	46.5	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	249	902	101436	96750	FALSE	25	GATAACTTGGCAGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRKLNVLCSIIPVTSLFFLLALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	101684	96447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195
781360	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_95725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
781362	contig_10437_pilon	-	1165	2	Intergenic	novelGene_38115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	553	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	82	636	80783	80229	FALSE	25	CAGGGCTCAATGTTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82827	79699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80788_82750
781364	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781365	contig_14208_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_129101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATTGATTTGTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219083	218572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_218600_219100
781366	contig_14208_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_129100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTTAGTTTTAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218496	217196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_217200_218500
781367	contig_10861_pilon	-	1505	6	Intergenic	novelGene_39348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_3	461.504756205177	605	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	26	661	1507756	1497139	FALSE	20	AGACTTAATGCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAGGGVAMSHGHSHGGGGCQCAAEREEPPEQRGLAYGLYLRIDLERLQCLNESREGSGRGVFKPWEERTDRSKFVESDADEELLFNIPFTGNVKLKGIIIMGDDDESHPSEMRLYKNIPQMSFDDTDREPDQTFSLNRDLTGELEYATKISRFSNVYHLSIHISKNFGADTTKVFYIGLRGEWTELRRHEVTICNYEASANPADHKVHQVTPQTHFIS	1507781	1496294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1497241_1497820_1497930_1498794_1498900_1506405_1506484_1506834_1506879_1507558
781368	contig_11560_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_117910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41255	40125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_40100_41300
781369	contig_6496_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_103526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTGTTACGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931340	932386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_931300_932400
781374	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
781375	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_94738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	40	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
781376	contig_8866_pilon	-	2072	13	Intergenic	novelGene_77857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_9	144.926489987166	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	11	1894	769789	661595	FALSE	50	ATAAGAAACACCAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKMNNPSESSKPSMESGDSNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGHLHQVQLAGTNLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLDEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSALSSPSALNSPGLGIEGLNRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVNPVLPLTSAAVTNLSVTGTTDTPSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPPRDQPGDGDIRVANSYPPRSCTVASKCQSCCHGCCCRTKPRPDGTLSVCSWVRSFLISLPSEKQLGGHP	769799	661416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_661987_676950_677057_684092_684273_685274_685421_686661_686804_690845_691020_695554_695650_708097_708225_710870_711060_713011_713132_715095_715150_726515_726617_769731
781378	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
781385	contig_14133_pilon	-	1316	3	Intergenic	novelGene_119967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	56	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	47	463	215526	214312	FALSE	30	AAATGGTTTAATTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVVRVLWGTLPQSEHRGGMLP	215572	213458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_214450_214570_214738_215414
781386	contig_3601_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_132863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGTAAAGTTGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140495	141189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_140500_141200
781388	contig_4232_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_63263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCACTGGTGTGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462150	460883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_460900_462200
781390	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
781391	contig_9706_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_20830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTAGGAGCACTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2195	2504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2500
781393	contig_13700_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_68260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATAAAACATCAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13722	14188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_13742_13852
781394	contig_5854_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_68857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACAGATGGGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47878	49758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_47900_49800
781395	contig_7333_pilon	+	1711	5	Intergenic	novelGene_142779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	51.4514334105475	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	546	1184	203617	217535	FALSE	20	ACCAATATGGCCCTTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVLFVLIVLIQLTILIIFRYRGHPKLKGPPGFVNLTSFSLHVLSKINIFYYSVLLLTLYTVLGPWFVGEITLGKLGCCFSFGIFVDGHFLQGSLTFIVGILQLVFFNVPLMTYLSWSLLQRCFGHNFRSHLHQGKYLKIIPVHLLMLLLYVWQVYSCYFLQVTYGTLAFFFSPLRTWLTLLTPVLIRCVWTLNPSELGTFTVQLKSHLSS	203071	218062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_203620_206388_206474_212390_212496_214311_214431_217208
781397	contig_610_pilon	-	1146	4	Intergenic	novelGene_76728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1334.73950850177	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	417	452	214218	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252613	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235087_252596
781398	contig_6427_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_162575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCATCCCTCATGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887611	887239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_887200_887600
781401	contig_15304_pilon	-	1059	3	Intergenic	novelGene_30435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	189	1013	54100	52925	FALSE	10	GCCCTGCTTTTCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
781402	contig_6654_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_85715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238357	239654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_238400_239700
781404	SIRV6	+	232	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8470	7	269	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTGCAATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
781409	contig_19850_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_170858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_4	44.0482689784741	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	111	869	39513	30325	FALSE	25	TCTATGTCGTTAGAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRQHTVFLKKMTQFILQEMPKARYSSLLNDFVESNYFVIDGDSLLVTCLGDKSFKRGQDLHFFYLVECYLVDLMRNGAQFGIIFFEDAECAYFPFPELLPLRTALILHLQHNTNIDVQTEISGCLSLEWELFLEERHPYFLIVSDEGLNDLQTHLFNFLIIHSWGMGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKENQMMSQSAYKSLIQHLEEDKILALTSHFGHLRWEDMVEEVQKHLFLQVKV	39623	29514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_30478_32120_32463_38256_38447_39010_39081_39509
781410	SIRV6	+	380	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	492	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
781412	contig_5967_pilon	+	1456	6	Intergenic	novelGene_44406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCACCGAACCCCACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423108	517602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_424057_430709_430794_465403_465532_482467_482550_488455_488581_517513
781413	contig_5375_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_169222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAACTAATCACTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99166	98481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_98500_99200
781414	contig_5375_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_169221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTTAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98231	97535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_97500_98200
781415	contig_8615_pilon	+	2099	15	Intergenic	novelGene_165206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	133.094354286187	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1863	237	2099	14070	107474	FALSE	80	AAAAATCAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNVQLPPKESNLFKRILKCYEQKQYKNGLKFCKMILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLGRKEEAYEFVRKGLRNDVKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKLDKDNLQILRDLSLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQVPPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLFQESLEHIETYEKQICDKLLVEEIKGEMLLKLGRLKEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQLSTLEERLQIYEEISKQHPRAISPRRLPLNLVPGEKFRELMDKFLRVNFSKGCPPLFTTLKSLYYNTEKVSIIEELVTNYEASLKTCDFFSPYENGEKEPPTTLLWVRYFLAQHFDKLGQYSLALDYINAAIASTPTLIELFYMKARIYKHIGNLKEAAKWMDEAQSLDTADRFINSKCAKYMLRANMVKEAEEMCSKFTREGTSAMENLNEMQCMWFQTECISAYQRLGKYGDALKKCHEVERHFFEITDDQFDFHTYCMRKMTLRAYVDLLRLEDILRRHAFYFKAARSAIEIYLKLYDNPLTSENKQQEINSENLSAKELKKMLSKQRRAQKKAKLEEERKHAERERQQ	13833	107474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_14124_23318_23404_25714_25820_27074_27233_29227_29363_43082_43237_52424_52545_55001_55098_60417_60525_89003_89077_94892_95063_95392_95546_100245_100375_106274_106489_107364
781416	contig_18113_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_137531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGATTTTTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143900	142347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_142300_143900
781421	contig_1154_pilon	+	1786	11	Intergenic	novelGene_87167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	32.0232727871465	101	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	190	1323	918664	924251	FALSE	20	TTAAAGATCTGTGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGQRSLLLGPARLCLRLLLLLGYRRRCPPLLRGLVQRWRYGKVCLRSLLYNSFGGVDTAVDAAFEPVYWLVDNVIRWFGVVFVVLVIVLTGSIVAIAYLCVLPLILQTYSVPRLCWHFFYSHWNLILIVFHYYQAITTPPGYPPQGRNDIATVSICKKCIYPKPARTHHCSICNRCVLKMDHHCPWLNNCVGHYNHRYFFSFCFFMTLGCIYCSYGSWDLFREAYAAIEKMKQLDKNKQQAVVNQTYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGRHWLTRVLLPSSHLPHGNGMSWDPPPWVAAHSASVMAV	914566	924714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_914751_918658_918907_919076_919272_919418_919508_919901_919931_920589_920724_920860_920909_921741_921828_922770_922895_923093_923165_924136
781422	contig_9706_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_20967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCCAGAATGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320444	321532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_320400_321500
781423	contig_11115_pilon	-	1058	2	Intergenic	novelGene_102867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	460	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	15	833	211368	210444	FALSE	30	ATCAATAAAGGCTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLFAMGSLLLLSPLFLLGATYSGGRSVRERRAEWAQSPGVSPVSPSGTSAPFWVRLSPELVSVPPGSSVLLNCSSSCPLPENYQLRTQLQQGKTLSGSGWVSYQLLDVRAWSSDVHCFVTCAGEMRSATTRVTAYQLPHSMLLEPLVLEGSQYTLRCHMTRVFPVGFLVVSFQHGGRVIYSESLKHFTNVNPANVTLTYMLPSRSPDLWQPVTCHAHFNLDGLVVHSSSAPLMLTALGEAPLILGTWREGGEGPDPKREHGSCVSSVQDLLHMLGS	211382	210218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_210869_210974
781424	contig_6440_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_161671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCACATTTGTCAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54074	52468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_52500_54100
781426	contig_12624_pilon	-	1725	3	Intergenic	novelGene_61087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1226.5	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	143	550	903621	884659	FALSE	40	TGTATTTTACCACACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWVSTLVI	903763	883483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_884815_888695_888774_903447
781428	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781431	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
781433	contig_5210_pilon	+	2581	15	Intergenic	novelGene_65480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	395	724	1101259	1104674	TRUE	5	TCTTTCTCCGTGGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKDLMGESFMSRCARELCISLLQPASSIPSEETLKAPVSEDVVFISASADCCSDCSKTLRSRPSFWPFSLVLLSRCCCFPSATGHTLSLPEGPSPWSPLASWRQEST	1100864	1204090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_1101363_1101906_1101953_1103096_1103161_1104558_1104728_1107303_1107390_1141824_1141977_1147995_1148104_1152587_1152662_1154692_1154758_1160900_1161625_1161932_1162033_1162756_1162895_1173408_1173547_1173672_1173761_1203959
781438	contig_1734_pilon	+	1691	10	Intergenic	novelGene_164378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.314269680527355	21	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	912	1268	582209	597083	TRUE	30	GTTCCAACAGTGTACTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKFRCLHVIQIRGSVPGGCHCLLPSNQPIGCYDHSLVAFKRCQRNSNGRAITGNISISIRFIFIRKLYFIFSRYLLTSIRNWLGYRQLYHISPNMSSLISRSCESQLLRGMKFYRIY	564316	612479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_564387_579940_580769_582195_582440_588211_588292_590495_590540_597081_597159_598598_598732_602350_602418_602748_602843_612425
781439	contig_6576_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_42384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAGGAAGAACCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287164	1286350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1286400_1287200
781440	contig_5226_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_140500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATCCTCTGGTCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_+_16400_17300
781441	contig_15410_pilon	+	763	4	Intergenic	novelGene_130606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	873.24337959128	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	166	588	145617	148348	FALSE	45	TGAAAATAAATTAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPALPASALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVAGGTESPASSVWPHLWVCLHPPFLL	145451	148523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147166_148267
781446	contig_1948_pilon	-	1076	6	Intergenic	novelGene_31153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	115.839544197998	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	29	466	414237	406595	FALSE	0	TTCGCCGTTTCTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPTAVREKMSVPGSTRRRHAQVSRLVFFSASHRLHSKSLSDEENLKLFGKCNNPNGHGHNYKVVVTVHGEIDPVTGMVMNLTDLKEYMEEAIMKPLDHKNLDLDVPYFADVVSTTENVAVYIWENLQKFLPVGVLYKVKVYETDNNIVVYKGE	414265	405984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_406719_406906_406978_409655_409713_410087_410111_411643_411724_414154
781447	contig_5628_pilon	-	2166	10	Intergenic	novelGene_157583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_8	55.3353413290277	1	127	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1591	2166	427966	418412	FALSE	15	TTCCTGGTGTCTGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSEYVKNFERAAELLATWTDKSPPFQEVITRIQSSEASGSLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNA	434830	418411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427629_427864_428023_429228_430176_431498_431731_434266_434492_434700
781451	contig_8594_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_140046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAGGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449147	450878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_449100_450900
781452	scaffold_16539_pilon	+	1123	9	Intergenic	novelGene_68408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	93.4983288620711	409	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	333	1043	913956	918774	FALSE	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPHRHEGVFICRGKEDALVTKNLVPGESVYGEKRVSISEGDDKIEYRAWNPFRSKLAAAILGGVDQIHIKPGAKVLYLGAASGTTVSHVSDIVGQDGLVYAVEFSHRSGRDLINLAKKRTNIIPVIEDARHPHKYRMLIAMVDVIFADVAQPDQTRIVALNAHTFLRNGGHFVISIKANCIDSTASAEAVFASEVKKMQQENMKPQEQLTLEPYERDHAVVVGVYSRPPPKVKN	908240	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913770_913875_913981_914073_914169_915193_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918746
781453	contig_6589_pilon	-	1015	2	Intergenic	novelGene_25695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	315	623	179852	179178	FALSE	75	AAAAAGAAACAGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLGLDDAEYALLIAINIFSADRPNVQEPSRVEALQQPYVEALLSYTRIKRPQDQLRFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE	180166	178785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_179325_179690
781457	SIRV4	-	278	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1240	3	1240	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3918	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
781458	contig_13547_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_104863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTTAGAATAAAGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67253	65866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_65900_67300
781459	contig_13901_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_146673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAACAGAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283894	281900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_281900_283900
781461	contig_4604_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_19140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAGGAAAAATGAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343159	344089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_343200_344100
781465	contig_1264_pilon	-	1545	4	Intergenic	novelGene_161294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_3	43.0838974817997	229	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	452	904	17238	16786	FALSE	10	TGTGGGCAGCCCTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFVLCIPRCPNLQAAKCFSDARLHMPDAKALPDHPSQPPRGLQLGRVLVLEMQLIILCHQEGPEEQAQGRVLARGRQQALCHWVFLSPGTAGHTQPTPSKTIVASFLCWAFSSVLLSIWVPPLLLHEDLAERVERWGLRVLVRMCVCL	19526	16144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_17410_18406_18473_19200_19341_19452
781466	contig_11572_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_100067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATGGCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286291	284642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_284600_286300
781469	contig_8576_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_88811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	392	505	930381	930494	NA	30	CACTATGAGTCGGAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NERIQGQSAGKTVPSQHFILHSVPGEFTVATWEYIEKLVCETPLPSSLEETECQWVLPSWNAGASGTDGGGESLWRAYCPHGWFDYFLCIAIYYLVIEQYIFENALILIHPVLLRRSPGGAVLKCLAANRMVSSLNPPAAPLEKDVAVCFHKDDSLGNPTGQLCSVL	929989	931380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_930000_931400
781472	contig_5643_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_39176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1656	2003	776863	776516	NA	10	TCCGTCTGATCTTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSPHTCLTLTPHLPFQITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGECPSWGYREGNHFPQPWPLGNLRELERQLRLGA	778518	776251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_776300_778500
781474	contig_817_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_132446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAATTCCTAGCCCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547316	545232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_545200_547300
781475	contig_10892_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_116739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTATGGCATAAAATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88694	87076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_87100_88700
781483	contig_4857_pilon	-	2033	9	Intergenic	novelGene_48676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGTTAGAGAATCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104786	1078713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1078748_1079278_1079937_1080626_1080718_1083741_1084303_1086301_1086349_1095239_1095328_1100291_1100386_1102743_1102881_1104463
781485	contig_16187_pilon	+	945	7	Intergenic	novelGene_101072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	137.592393200593	879	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	75	824	53333	64791	FALSE	20	CTTTATGGATTCATGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVTASRKSGTLPLSCWGGGGGLGTMAGSRLGQDPESTAAVTVLKRAVELDSESRYPQALVCYQEGIDLLLQVLKGTKDDTKKCSLRKKISDYMDRAENIKKYLDQEKEDGKYHKQIKIEENATGFSYESLFQEYLNETVTEVWIEDPYIRHTHQLYNFLRFCEMLVKNPCKVKIIHLLTSLDEGSGKEQQSNGLQEIKESLRSHGVLLELEYSSSIHDREIRFNNGWMIKIGRGLDYFKKPQSRFSLGYCDFDLRPCHETTVDIFHNKHTKKI	53258	64912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_53484_59847_59950_62054_62192_62316_62404_63110_63227_64556_64618_64695
781487	contig_10005_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_148902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68814	67195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_67200_68800
781491	contig_16775_pilon	+	1553	2	Intergenic	novelGene_107809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACCATGACCCCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289554	292342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_291005_292239
781492	SIRV6	+	260	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	124	-7	42	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3147	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781493	contig_10345_pilon	+	1317	13	Intergenic	novelGene_158368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	641.766588540309	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	66	1106	11670	24141	FALSE	50	AACCATAAAACCCCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4373	24352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
781495	contig_9945_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_104816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTCCTTGGAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97485	96702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_96700_97500
781497	contig_8620_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_173881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGACAGTGTTTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95305	95672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_95300_95700
781498	contig_9527_pilon	+	1156	5	Intergenic	novelGene_134071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.1386752131695	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	220	687	486523	487885	FALSE	55	TAAAATGAAATCTTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPNGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484902	488354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_485081_486481_486706_486786_486883_487092_487145_487748
781499	contig_7207_pilon	-	1814	4	Intergenic	novelGene_72026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.1093312829525	1	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	436	657	291957	291736	TRUE	15	TGTGTGTGTGTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFEVQPRREGLGAAGLFFPFPFSSTESELIGFHSLGRNKTVWAAPFREILYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPGQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST	294906	290531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_291179_291225_292044_293060_293259_294755
781500	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
781502	contig_9706_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_20942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAACAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250015	250408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_250000_250400
781506	contig_6048_pilon	-	1108	9	Intergenic	novelGene_73242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	220.80729013101	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	87	1103	1916833	1896861	FALSE	35	CAATGAAAGAGTACTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1916919	1896855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
781507	contig_8330_pilon	-	1432	9	Intergenic	novelGene_71741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	45.0499722530436	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	698	1321	519774	515388	FALSE	10	GCTCTCTGCTTTGTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	526197	515276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520118_520465_524730_524851_526013
781508	contig_4769_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_118000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGTTGCCTGAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905250	904120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_904100_905200
781509	contig_7887_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_124873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAAGAAAAAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213098	211549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_211500_213100
781514	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	0	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781515	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	126	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
781517	contig_3627_pilon	+	1929	9	Intergenic	novelGene_78539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	197.585701342481	7	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	28	1011	642322	676255	FALSE	30	CAGGGGAAATTTTTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAAVAVLTMSFLGGFFGPICEIDVVLNDGETRKMAEMKTEDGKVEKHYLFYDGESVSGKVTLAFKQPGKRLEHQGIRIEFVGQIELFNDKSNTHEFVNLVKELALPGELTQSRSYDFEFMQVEKPYESYIGANVRLRYFLKVTIVRRLTDLVKEYDLIVHQLATYPDVNNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIQHMELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	642294	677173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_642325_652898_653049_660439_660516_661658_661816_667857_668023_670412_670520_672027_672097_673913_674057_676141
781518	contig_7138_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_120982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTACTAGATGCAGCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139616	140521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_139600_140500
781519	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_90606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
781520	contig_15304_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_30646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102705	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_101800_102700
781521	contig_6375_pilon	-	1596	10	Intergenic	novelGene_73011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_9	21.2916258968951	109	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	219	1310	364700	357917	FALSE	30	TAGTATGTTTTAGAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGDFCLPGEGMEILQQVCSKQLPPCNLNEEDLLHNPYFGKLLLSLSQHVDESGLSLTLAKEQAQAQKEVRLHRTAWLRSEILQRVIQELLVDYYVKTQDTNLIPEDKKFHETLEQRLLVTELTRLLGPSQEGEMPSLLGLEKADLLELMPPSEDFVWMRARLQLEVEEQLKKKCFTLLCYHDPSSDTDSETLKAAKMWKLAEVLVSEKQQCQDTKSQQKERMVLLEKQIATFSQVLLRCLALLHRLLQEHRLKTQSELDRINAQYLEIKCSAMVLKLRMEELKILSDTYTAEKVEVHRLIRDRLEGAIRLQEQDMEKSQQVLNTYEVLGEEFDRLVKEYTQLKQATENKCWALQEFNKAYH	366677	357630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_358101_358241_358311_358671_358803_359206_359353_360206_360304_361156_361292_361625_361758_361846_361990_364645_364731_366489
781522	contig_10109_pilon	+	1710	17	Intergenic	novelGene_131334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	91.0701781251689	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	200	1708	210095	353782	FALSE	70	AGGAAAAACAGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPVPKANTPINLSVNQEIFIASEQVLKDQPSLAPHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIIITSRKLSTLTACLHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFNDLSNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPISFCEESFVKHRSSLMKQFLEMAVNLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDAFEEEITSGGFCGGSPRSYQQWVHTVKKGGALFNTAMTKATPAVRTAYKFAKNHAKQGIKEVKSKLKHKENEEDYGACSGSVQYTPVYMLQNEKGGHLEKRKLAQTHLKRPLKSLDSALYDDNDDDIERASKLSSEDGEEASAYFYESDDSIETRVKPPYSGEMDLLGEILDTLSTHSSDQGKLAAARSLDFFRSMDDIDYKSTNKSNAPSENNLALLCGGSGDQAEWNLGQDDSALRGKHLPPSPKKQASSSGFTDSLFMLKKENSEKALGADNVNGPTAVGKPASASGLDFQLAPPEISQTN	200848	353784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_200892_204051_204112_207386_207441_210052_210164_233816_233918_243396_243443_248935_249038_262336_262463_279459_279562_306174_306266_315274_315316_316044_316114_323428_323486_324312_324421_351491_351572_352511_352729_353482
781523	contig_4754_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_35914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCAAAGGAGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195128	196218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_195100_196200
781525	contig_6684_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_168594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGATTGTCCAGCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115409	115060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_115100_115400
781528	contig_4213_pilon	-	1703	2	Intergenic	novelGene_124809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	948	1565	39809	39192	FALSE	45	AAAGGAAAGAGGTGCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALYMRLTGTAIDCYKYLEPLYEDYRKIKSQNRNGEFELMHVDEFIDELLHSERVCDIILPRLQKRCVLAEAEQLEPRVSALEEDMDDVESSEEEEEEDEKLEKVPSPDHRRRSYRDLDKPRGSPTLRYRRSRSRSPKRRSPPPRRERRRSKSPRRHRSRCRDRPHRSRSKSPGHHRSYRHRSHSKSPERSKKSHKKSQRGNE	42845	39053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_40644_42732
781530	contig_7025_pilon	-	651	3	Intergenic	novelGene_104401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	953	junction_2	1160.5	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	139	570	95047	90760	FALSE	40	TATGCATTTAGCAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLQPVTEGAPPCGSDKEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGW	95185	90678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_90883_90969_91018_94786
781531	contig_7025_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_104400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTTGGTTATTATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90678	89721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_89700_90700
781534	SIRV6	+	407	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3152_10724_10819_11031_11109_11205
781535	contig_6102_pilon	-	1598	8	Intergenic	novelGene_32169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	646.235661823336	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	867507	847043	TRUE	10	TTTTGGTTGTCCTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867509	839082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841258_844934_844983_846088_846188_846753_846809_846969_847094_867237
781538	contig_12352_pilon	+	2271	3	Intergenic	novelGene_57458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	16.5	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGAAAATGCTATCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230036	240335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230108_237953_238083_238264
781539	contig_6807_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_84577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	520	822	170022	170324	NA	25	TCTGTAAACCTTCATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGLSVISHPNKDPTNAQKHQEPTEEGGTEHTFFYWAVDLQGVDVKVAATIMATEGRMCQKARASTHGELPHHCPSSDSRAQQYIDVNKNLFYFIFCCC	169502	171785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_169500_171800
781541	SIRV4	-	299	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1207	15	1207	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3951	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
781546	contig_19974_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_130472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	37	768	195734	195003	NA	40	TTTTTCTTTTTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSLELIPLTARMVMAHLVNHLGHYPLSGGPAMLHSLVSENHDNAHVDSSELSSEVFRSPNLQLFVFNDSTLISYLQIPTERPAGGPPVGALSDVRVIVRDISGKYSWDGKILYGPLEGCFTPSGRNSSSLISGWHHQTLGPQKVFSQIEEGEDVLDKLLENIGHTSPECLRPSQLNLNEPSPPPRGMSYDQEKEITEVILRQDTQEDEYVQRSNSASVVKVARQGQPMPAEPRGPFYFCRLLLNDLGMNSWDRR	195770	193460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_193500_195800
781548	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781552	contig_9578_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_67963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	61	378	1050188	1049871	NA	75	TTAAAAAATAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRLPRDSHRLPALPLLPLSFLPLSPSVAGVRVPSQTENMVAIPGPRCQYVAASGFLASIAGSVLVASGPVMWLCLLMGALSQNGVSLRIWLQPRSPPENNEPH	1050248	1047970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1048000_1050200
781557	contig_1813_pilon	-	1276	3	Intergenic	novelGene_105513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_2	605	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	734	1102	417919	415881	FALSE	20	GATATGCAGACCTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPILPFLPAVWLCQLAFCTVIQRQHLGLVVVLIKGYGLVSLLLKRRFCSFSVFILQDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSQTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHRLFNGLK	423077	415706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415914_417583_418533_422957
781558	SIRV6	+	192	3	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	346	8466	167	273	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780
781562	contig_3382_pilon	-	2131	2	Intergenic	novelGene_124182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968340	964145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_965416_967479
781565	contig_20332_pilon	+	924	4	Intergenic	novelGene_156183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	154.151440689559	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	641971	643374	TRUE	15	TCCCTTTGTGAGCAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIGHFVGEAAAPPLLSRLPICRRRLFLRLLLSLFLPPPGFRRRKRCSRIPTPGRSFSLFISVFSPLQPPDTVIRAGPVGILSPHRPHISIACPLSRTSNLSGLKITFI	641969	644876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643350_643470_643932_644035_644477
781570	contig_7057_pilon	+	900	10	Intergenic	novelGene_123319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	852.553477559482	210	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	135	899	936984	943721	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLFV	936027	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941495_943646
781572	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781573	contig_6980_pilon	+	1868	3	Intergenic	novelGene_35991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGCGTCAGGAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224066	227936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_224358_226254_226461_226565
781578	contig_5947_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_101570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792200	791577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_791600_792200
781582	SIRV5	+	551	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
781587	contig_14687_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_107974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATTCACATATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759458	757510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_757500_759500
781589	contig_1230_pilon	+	1163	5	Intergenic	novelGene_28884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1060.53594941426	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	239	502	407256	407995	TRUE	25	GGCACCATATAGTTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKNIY	406800	408988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_406932_407148_407352_407588_407746_407984_408237_408568
781590	contig_5649_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_82432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTTTCATGAGAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461095	1460284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1460300_1461100
781591	contig_3409_pilon	-	2496	12	Intergenic	novelGene_172308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGTACCAACTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295408	110922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_111053_134452_134662_151434_151623_167741_167916_168487_168603_170286_170355_174533_174943_179885_179999_222176_222381_237652_237780_243749_243894_294793
781593	contig_17_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_173979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGACCTATTTATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082825	1081994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1082000_1082800
781594	contig_6313_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_149320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCGGGGCGGGCGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7781	32142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6313_pilon_+_7891_30748_30840_31909
781599	contig_8801_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_66272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATAAATGGAGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416405	415038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_415000_416400
781600	contig_8660_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_136488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254978	254633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_254600_255000
781603	contig_5316_pilon	+	2187	2	Intergenic	novelGene_61251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492707	495051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_493787_493943
781605	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1210	3	1210	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3948	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
781607	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
781608	contig_7020_pilon	+	2062	2	Intergenic	novelGene_57055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9569	junction_1	0	351	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGTCGCATTTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79461	81800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_81448_81724
781611	contig_57_pilon	+	2103	9	Intergenic	novelGene_44915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	670	1011	280579	280920	TRUE	25	AAATTTCGGTTAGTCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPYRLSSCLKKKKLVNAASMSSGCFLLSFTSSSLSLRLSRPLQTAVEFLLSQGGPVLACTDIISRLTLEDRKCNRFASQTFTSQRLLEKNSPRKENQCSGSTVTCLSPAHGF	272911	286510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_273139_274871_274982_276383_276471_278805_279017_280544_281075_282200_282279_282452_282660_284638_284848_286066
781614	contig_12869_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_75343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACGCCTGGTGGATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74183	75223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_74200_75200
781615	contig_10042_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_79150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAGAGAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118788	121125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_118800_121100
781616	contig_6217_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_109672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATACCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790347	792517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_790300_792500
781619	contig_6842_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_130790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405399	1403704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1403700_1405400
781620	contig_2078_pilon	-	2045	7	Intergenic	novelGene_100187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_6	46.2481230850387	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1598	1984	505579	505193	FALSE	20	CTAAACATTTTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLQNTMRMSHAHHRPWTTSPSPREHGRDPREASCAILPVLSNQELLSLSDSAPRRLECRRPKVMQKACLSPLSLSQCVLLERVGGICTSASFFPQWRHMARQAGLQLLVRWNRGERICLARMTRVK	523352	505131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157
781621	contig_13409_pilon	+	1579	8	Intergenic	novelGene_128447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGATTTCTGCTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57337	67198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_57908_58766_58930_60929_61117_62731_62929_64192_64281_64956_65173_66196_66331_67174
781622	scaffold_4805_pilon	-	1869	10	Intergenic	novelGene_161025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	79.4201205964556	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	61	903	529482	495408	TRUE	15	TGTCATTGTTCTTGTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDGYHCGYCDSKEGKASCGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRVVRSSPPSSQFKATFQESYQIYKRYQMIVHKDPPDKPTVRL	534084	469005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_469755_474528_474711_495372_495415_512479_512605_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_534026
781623	SIRV6	+	191	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-230	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACACCACATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642
781625	contig_6589_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_26136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCATTACAGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879790	1880244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879800_1880200
781626	contig_14890_pilon	-	1495	8	Intergenic	novelGene_122513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1228.26647378012	3	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	279	950	369736	366814	FALSE	15	TTTTGTCTGTTTGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMMLYMNLMEKNSAAKGVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371095	366268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369683_369756_370073_370219_370981
781627	contig_11378_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_112285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGGGTCTGCGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509631	511742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_509600_511700
781628	contig_10937_pilon	+	2107	6	Intergenic	novelGene_67297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	32.9702896559918	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	78	878	35798	40225	TRUE	30	GGAAGGGGTAGGGAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKGLHWMGPLPPAPPWHLRPSS	33205	42501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40162_40427_40753_40892_41611
781630	contig_14871_pilon	+	1968	6	Intergenic	novelGene_63696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_1	596.853750930661	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	131	871	201945	219832	FALSE	25	GCCATGTGGTCATAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMG	194859	220929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645
781631	contig_8606_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_159408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTCTGGACAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133556	133842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_133600_133800
781634	contig_6410_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_108622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	146.316437900873	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTGTTGTTTCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299800	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_310261_310369_312966_313651_314166
781637	scaffold_19766_pilon	-	1466	11	Intergenic	novelGene_34270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.604209155426	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	182	1378	325368	322711	FALSE	10	TACCTGGTCTCCACCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLAHAHTTGRELWGWVHQASLPGEPWSLGSLLPHPGLVPPGAPTVEIKMGIEWGKRKGRKPSSFCCPGVRAPPLWRARGRRW	327827	322622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_322953_323061_323101_323179_323397_323489_323692_324034_324102_324196_324360_324442_324507_324827_324935_325050_325090_325311_325458_327735
781639	contig_6576_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_42364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	998	1411	1097722	1097309	NA	30	TTGCCTGACTTAAAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQGHFCRISVLLSRVDTAACWNPSALLHRPCLCMVWGLCPCAFSPATTVQDLPCYSVPPFLHLLVSPDLAEPCKCVHTASHFVPMHHRREPSDPETCSPGRPPSTFIHECQAPLPFTHSAVQTYCLKLGGGLGPT	1098719	1096486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1096500_1098700
781640	contig_10813_pilon	-	2382	7	Intergenic	novelGene_87012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	6.29814787589706	92	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	201	1151	55397	43584	FALSE	35	CCTAATTGTTTTTACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGQGQSASGSSAWSTIFRHVRYENLVAGVSGGVLSNLALHPLDLVKIRFAVSDGLELRPKYKGILHCLTSIWKLDGLRGLYQGVTPNVWGAGLSWGLYFFFYNAIKSYKTEGRAERLDAMEYLVSAAEAGAMTLCITNPLWVAKTRLMLQYESEVNPPQRQYKGMFDTLVKIYKYEGVRGLYKGFVPGLFGTSHGALQFMAYELLKLKYNQHINRLPEAQLSTVEYICVAALSKIFAVAATYPYQVVRARLQDQHVFYNGVWDVIARTWRKEGIAGFYKGIAPNLIRVTPACCITFVVYENVLLFLLDAKENKVG	55597	42352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_-_43723_44557_44704_45171_45286_46863_47025_47760_47847_48337_48489_55243
781641	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
781654	contig_10800_pilon	-	1563	5	Intergenic	novelGene_152616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	116.113091423836	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	53	673	457582	429975	TRUE	10	CTTTTTATGCCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSGSSVCVLQPQKTSRMAANKNKSQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVQIEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRAKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL	457634	428974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_429736_429845_430095_432709_432888_436425_436635_457468
781655	scaffold_16539_pilon	-	2313	18	Intergenic	novelGene_68327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_5	63.4874044124592	119	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	22	2124	312030	298542	FALSE	15	CCTTGCTTGCATTCTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVATAAEGVPGRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSLLSGRISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRSRHSLVGPQQSGGRPAPVRRSNTMPPNLGNAGLLGRMLEEKAPPSPSGLPEEPGMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPIERLALTARVLGGALGEHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGNQLIATSHTGRIGVWNAVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRMKDNDLLVSELYRDPAEDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILALESADGHGGCSAGNDIGPYGERDEQQVFVQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVDGSPTTAFTVLECEASRRLGSRPRRYLLTGQANGSLALWDLTTAMDGLGQAPAGGLTEEELMEQLEQCELAPLGSSRGSLPSPSPRISLTSLHSASSNCSLSGRRGSPSPLQAEARRRGAGSFVERCQELVQSGPEPRRPPTPAPPTLHGSWGSPHSTQGEGQ	312051	298352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_298762_298874_298990_299236_299416_300930_301028_301283_301440_302916_303088_305864_305982_306095_306184_306964_307081_308417_308609_308700_308792_308869_309032_310612_310694_310942_311002_311329_311404_311511_311558_311667_311722_311944
781656	contig_12201_pilon	-	996	6	Intergenic	novelGene_159977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	316.12592427702	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	177	803	138975	110501	FALSE	20	GCCAAGTTTAATTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLTVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	139151	110307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_124329_124453_130805_130980_132873_132971_138877
781657	contig_11304_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_156704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTCCCCTTTAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374745	375233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_374700_375200
781660	contig_13044_pilon	-	1803	4	Intergenic	novelGene_99992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	118	junction_3	84.99803919307	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	234	926	127700	114768	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVERELQLKTQQQLKKQYLEVKAQRIQLQQQQQQSCQHLGLLTPVGVGEQLSEGDYARLQQVDPILLKDEPQPNAAQMGFAPIQPLAMSQALPLAAGPLPPGSIANLTELQGVIVGQPVLGQAQLAGLGQGILTETQQGLMVASPAQTLNDTLDDIMAAVSGRASAMSNTPTHSIAASISQPQTPTPSPIISPSAMLPIYPAIDIDAQTESNHDTALTLACAGGHEELVQTLLERGASIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDNGADIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVTFSPSIIVSVFV	127933	113890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_114956_115087_115200_123012_123162_127456
781664	contig_9515_pilon	+	1153	8	Intergenic	novelGene_73824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	255.345943810369	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	16	1032	65880	72530	FALSE	0	TTTCCTTGGCTCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGMCRGGNPGSWTSPSLSPQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	65864	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69483_72414
781665	contig_5018_pilon	+	1189	8	Intergenic	novelGene_47207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_4	570.918164906677	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	48	476	1605501	1606815	TRUE	20	TTTTTAAGGCGTGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGVGSHLHSTPTPPMCPQTSLVQEVHQNFSAWCSQVVRLYPGQRHLELEWTVGPIPVGDGWGKEVISRFDTTLETDGRFYTDSNGREILERRRDYRPTWNFSQTEPVAGNYYPVNSRIYITDGNMQLTVLTDRSQGGQQPERWLPGAHGAQKAAER	1605453	1608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1605632_1605720_1605823_1606004_1606093_1606293_1606376_1606789_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
781666	contig_9200_pilon	-	2001	9	Intergenic	novelGene_173991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_1	20.968726713847	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	192	977	254386	246541	FALSE	45	ACGAATTTGATGAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDDDWIVDDDGIGYVEDGREIFDDDLEDDVLDSSQKGKDNKAPKKDKRIVKKAAVAKPNNIKSMFIASAGKKSTDKAVDLSKDDLLGDLLQDLSTEKSQVTLPPVTILKKKRSIGALLNPFSVYTPKAVPSGKTAPPVSRKEPPSTPVHRKCVEFTGETVQATHTEDEEKSGAMDFEDGDFDEPMETEEVTMEPVAAKTWNQKSEPAEEVKHEADPEKETTACLGHFLPDVSCWDIDQEDESCFSSQEVQVDSNHLPLVKGADEEQVFQFYWLDAYEDQYNQPGVVFLFGKVWIESAKTHVSCCVMVKNIERTLYFLPREMVSD	265223	245516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9200_pilon_-_246666_251637_251817_251902_252105_252376_252465_252893_252987_253827_253891_254350_254467_264144_264226_265193
781667	contig_5894_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_83020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCACACAGTGGGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294824	293729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_293700_294800
781669	contig_5260_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_144366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTCACTCCTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247550	249749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_247600_249700
781670	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
781671	SIRV7	-	910	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114687_114961_147608
781672	contig_14923_pilon	+	1492	7	Intergenic	novelGene_157754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355088	369485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_355651_357872_357985_358241_358319_360541_360627_361007_361107_364574_364743_369096
781673	contig_20429_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_169251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTATGGCTTAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139497	140614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_139500_140600
781675	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	5	3564	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
781676	contig_12951_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_68141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGAATTGGAGCGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134555	136754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_134600_136800
781677	contig_6326_pilon	+	1575	6	Intergenic	novelGene_168536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	43.093386963663	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	924	1310	284987	291199	TRUE	30	ACCTGTTCTGGAGAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKVLTCKKNWHSGAYENTSCGEGAVGKHT	283191	291584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_283754_284625_285143_286930_287015_289403_289471_291119_291203_291322
781681	contig_10609_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_123932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGTTAAAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369413	371303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_369400_371300
781682	SIRV4	-	331	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1187	3	1187	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3971	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781686	contig_366_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_51631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394014	1391658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1391700_1394000
781688	contig_10718_pilon	-	1780	5	Intergenic	novelGene_164616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	28.6476438821764	20	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	111	695	114129	110301	FALSE	60	AAACAAAAAAACCTGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIITFHPQELSQEELCVQKETVKEFFTKGPGAVCDLTSLYFQESTMTHCSHQQSPYQLLFGEPHIFEDLLDLKIRISPDAFFQVNTAGAEMLYRTVGELSGVNSNTILLDICCGTGVIGLSLARHTSKVLGIELLEQAVEDARWTAAFNGITNCEFYAGRAEKILPQLLKSKNDGQLIVAVVNPARAGLRKDK	114239	109215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_-_110435_111574_111677_111842_112058_112392_112488_114090
781690	contig_8628_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_164421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGAATACCTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413113	414162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_413100_414200
781691	contig_9297_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_69830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAATACCATCTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563098	564085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_563100_564100
781693	SIRV2	-	219	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	678	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969
781694	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
781695	SIRV6	+	562	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781700	contig_14666_pilon	-	395	3	Intergenic	novelGene_39660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	495	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492452	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
781708	contig_7361_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_163384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303081	300927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_300900_303100
781709	contig_14243_pilon	-	961	9	Intergenic	novelGene_57446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	103.676103201268	603	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	235	810	705976	702878	FALSE	40	CAAAGTTGGAAAGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	708119	702726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_706122_706192_707740_707817_708092
781710	contig_10404_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_138698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAGGAGTGAGTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157388	1157052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1157100_1157400
781712	contig_9931_pilon	+	1109	4	Intergenic	novelGene_134817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.35702260395516	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	324	974	364058	364756	FALSE	75	GAGAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	297138	364891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_360287_360432_364048_364178_364225
781713	contig_14219_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_54386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAATGTAATTAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104718	1106216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1104700_1106200
781716	scaffold_13505_pilon	-	1103	5	Intergenic	novelGene_111438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	273.662543107383	5	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	420	695	532469	531050	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTGRRCPGLQGSSKLCLRQSSSSSCSLPLAWVHHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535614	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535512
781719	SIRV4	+	331	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	651	966	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATAACTTTAACCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
781720	contig_16775_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_107801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTTCACTTGGGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202072	204288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_202100_204300
781721	contig_11551_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_168475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCAAACTAGATGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473086	475199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_473100_475200
781723	contig_6710_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_98289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	20	CTACTGAGGCATCCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
781730	contig_11026_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_167693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGACTGGACACGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303467	304830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_303500_304800
781735	contig_5210_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_65419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACTTAGTCATTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433597	435181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_433600_435200
781739	contig_9633_pilon	-	2949	1	Intergenic	novelGene_139610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538780	535831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_535800_538800
781740	contig_20398_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_155199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAATCCAACAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55360	57858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_55400_57900
781743	SIRV6	+	486	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10726_10819_11034
781744	contig_4678_pilon	-	1479	7	Intergenic	novelGene_126027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	22.1484887871736	217	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	404	958	340016	338979	TRUE	15	ATGACGTTCAGCCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQRVDVKVVMLGKEYVGKTSLVERYVHDRFLVGPYQNTIGAAFVAKVMSVGDRTVTLGIWDTAGSERYEAMSRIYYRGAKAAIVCYDLTDSSSFERAKFWVKELRSLEEGCQIYLCGTKSDLLEEDRRRRRVDFHDVQDYADSIAPQSPGFGGGKSLLGCLGKVPEIFLGSVDLRGPDFLNC	340419	338207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_338552_338662_338726_338864_339201_339285_339354_339459_339539_339747_339817_339899
781746	contig_8027_pilon	+	1950	3	Intergenic	novelGene_158857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	747	1052	491595	491900	TRUE	20	CAGAGGGGCCGTTCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKHLFSKHFSDLLCRGNYSLLFYGPLVCVSGVPWWHKRLSAQPLTERLAVQTQPEMPQETDLAICFRKVTALRTLWSSLLCTYQVETDLMATNNNSVCL	490848	500726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_492569_493827_493886_500554
781747	contig_6871_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_21646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTACTGTACCCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709519	710835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_709500_710800
781748	contig_11986_pilon	+	1158	11	Intergenic	novelGene_69082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	132.249801512138	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	45	839	12992	18605	TRUE	10	CTGGGTCTGTCTATGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRCGCAAWSGQGPGSPGCPGSITTCWRTPSSSSWCRPCCSLSSTSTSRW	12947	22185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17186_17506_17620_18573_18653_21266_21335_21981
781749	contig_9843_pilon	+	1537	7	Intergenic	novelGene_114328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_6	49.4820393902901	647	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	134	700	107444	121020	FALSE	45	TATTTTGCCACAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYWKSQPKKFCDYCKCWIADNRPSIEFHERGKTHIENVAKRISEIKQKSLDKAKEEEKASKEFAAMEAAALKAYQEDLKRLGLESDISEPSISPVASTIPPTSASNQQKEKKKKKKDPSKGRWVEGITSEGYHYYYDLITGASQWEKPEGFQGNLKKTVKPVWVEGVSEDGYMYYYNTETGGKYYL	107310	121857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_107446_108429_108503_111440_111504_111587_111712_117714_117883_120061_120109_120930
781751	contig_3560_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_149493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATGAGAAACTGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173357	172959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_173000_173400
781752	contig_15084_pilon	+	2593	1	Intergenic	novelGene_116680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTATATAAGAGTGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152684	155277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_152700_155300
781753	contig_6842_pilon	+	1053	9	Intergenic	novelGene_130761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	254.576087594652	1009	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	359	475	1366898	1368268	TRUE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVWPAGDLTLRTDLGAPASATGPEGGVDQRLREARCVDKLALATDGAVSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRCRDGQPPCRVCRE	1306800	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306944_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368227_1368337_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
781754	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781755	contig_6630_pilon	+	1002	3	Intergenic	novelGene_30739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACACAGCTGGACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813084	814460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_813927_814028_814153_814424
781757	contig_1154_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_87129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACTTTTACTTTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454879	457074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_454900_457100
781761	contig_6710_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_98031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	TCTCCTCTTCTTTAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
781764	contig_6230_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_102100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	522	1436	1957	159136	159657	NA	65	GGAAAAAAGAAAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFKEKAMVEVMELNNQIKQAQIQQEQLQKDSRQLCTEKLLVQAEHKFVLEYLTNKIEEYRKQPVKMWNNYVQKSGEIELQRQESASRYAKQTSVLKAELLQKEKTQSLLEHQLKAMKDILILKEKQETEVEALQKEKRKVQDETATKTQEVQVQILQEKALLEKQLSEPDVSQ	157700	159659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_157700_159700
781766	contig_7512_pilon	-	2063	11	Intergenic	novelGene_153190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	131.167107157244	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	677	1342	128508	108364	TRUE	15	CTTCGAGAGTGCCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEAKIAKAEEELIKAQKVFEEMNVDLQEELPSLWNSRVGFYVNTFQSIAGLEENFHKEMSKLNQNLNDVLISLEKQHGSNTFTIKAQPSDGAPAKGNKSPSPPPDGSPAATPEIRVNHEPEPAGMAAPGATLPKSPSQSSLPAVVVETISATVNGAVEGGSGAGRLDLPPGIHVQGTGPA	134558	105712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_116678_116827_120235_120319_121698_121775_122012_122099_126699_126808_128472_129047_129306_129362_134475
781767	contig_11978_pilon	+	2009	9	Intergenic	novelGene_62927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_5	12.607041683123	251	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	11	1054	877592	883595	FALSE	10	CTTTGGCCTGTGCCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVSMPVQLNEPLNTLQRLCEELEYSSLLDQASRITDPCERMVYIAAFAVSAYSSTYHRAGCKPFNPVLGETYECERPDRGFRFISEQVSHHPPISACHAESENFIFWQDMKWKNKFWGKSLEIVPVGTVNVSLPRFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEVLIRNTQDSSCHCKITFCKAKYWSSNIHEVQGAVLSRSGRILHRLFGKWHEGLYRGPPPGGRCIWKPNSMPPDHERNFGFTQFALELNELTTELKRSLPSTDTRLRPDQRYLEEGNIQAAEAQKRRIEQLQRDRRRVMEENNIVHQARFFRRQTDSSGKEWWVTNNTYWRLRAEPGYGNLDGAVLW	877581	884550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_877706_877872_878011_880746_880811_880915_880995_882394_882540_882647_882793_882878_883006_883202_883326_883486
781768	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_95685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
781769	contig_12250_pilon	-	920	8	Intergenic	novelGene_80719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	419.75211343684	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACCCATCAACCCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401297	398587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399161_399187_399297_399521_399747_399846_400106_400218_400314_400378_401187
781772	contig_9527_pilon	-	1880	8	Intergenic	novelGene_134078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	26.5622103825748	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	749	1666	490725	488550	FALSE	10	TCTTTATTTCCCTTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGLGLLVKSIEGDQRLVERAQRLDQELLLALEKEKKRTPQVVHAGPRHPPHHVVRWVDPTALCEELLLPLEPAPQGGARLLLTGLHACGDLSVALLRHFSCCPDVAALASVGCCYMKLSDPGGYPLSQWVAGLPGCELPYRLREGACHALEEYAKRLHKAGPGLRTHCYRAALETVIRCAQPELRRPGVQGIPRVHELKIEEYVQRGLQRVGLDPQLPLNLAALQAHQAQEHRVVAFFSLALLLAPLVETLILLDRLLYLQEQGFHAELLPLFSPELSPRNLVLVATKTPLGQAFSVLETEDS	494305	488335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_488672_489070_489256_489661_490147_490599_490744_490976_491040_491533_491687_491886_492012_493916
781775	contig_12270_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_113838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	3	338	14422	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14424	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
781778	SIRV4	-	275	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1248	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3910	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
781784	SIRV6	+	419	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	461	-2	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
781785	SIRV6	+	325	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	48	410	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781786	contig_5316_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_61256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAATCAAAAACATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518339	520065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_518300_520100
781787	contig_12638_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_33068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTATAATGTCCTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95271	94385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_94400_95300
781792	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
781793	contig_5479_pilon	+	2394	12	Intergenic	novelGene_133603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	277.990784079361	1	143	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	23	1249	319705	446821	TRUE	45	AGAAATGCTATTTCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSRNDFMGSLSFGISELQKAGVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEGNEELRQKFERAKISQGTKTPEEKTTNTISKCDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS	319682	448011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_319761_334184_334282_344547_344695_375219_375373_395880_395973_398958_399022_403751_403891_409404_409486_409809_409909_415695_415837_446662_447106_447150
781796	contig_9940_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_125337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGCCTAGTTGATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48472	47788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_47800_48500
781797	contig_12622_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_5813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACCCAACGTTTAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355834	354386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_354400_355800
781798	contig_6048_pilon	-	446	2	Intergenic	novelGene_73354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	41	445	2975508	2973687	FALSE	40	GCAGAATGGAGAGGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTAMNFGTKSFQPRPPDKGSFPLDHFGERRTPAVRARRSRPNSEVQALVCRRRKLRPRRACGPRAGPQPGPHPPQVLARTPSPSPGPRAQARSQGRAPRPPSECKSFKEKFMKCLRDNNFENALCRNESKEYLE	2975548	2973685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2973785_2975201
781803	contig_7416_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_134336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAGTAGGAGAACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878528	876222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_876200_878500
781805	contig_11328_pilon	+	790	6	Intergenic	novelGene_88393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1838.7062190573	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	186	749	644854	647995	FALSE	35	AATCATCTTTACACAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643643	648036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644845_645017_645228_645376_647064_647223_647899
781807	contig_12021_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_172193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAATCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52547	52293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_52300_52500
781813	contig_6654_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_85710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGGTAGTTCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192527	191449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_191400_192500
781819	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
781822	contig_11292_pilon	-	1397	6	Intergenic	novelGene_109399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	571.186274344894	99	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	179	943	124274	107816	FALSE	20	CCCAGTGTTCTCTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALQCQGRGLTQGSCSSGGRPEPCARPASIQPPTGRPIPRGSIVAPTETGDPTGSELGWMLQACKMEGFPLVPPQPTEDLVPYDADLYQRPTHDYYQYLSSDGDSHSDHYWDFHPHHVHSEFESFTENHFTELQSVQPPQLQQLYRHMELEQMHVLDTPMAPPHASLGHQVSYLPRMCVPYPSLSPAQPSSDEEEGERHSPPLEVSDGEADGLEPGPGLLHGETGSKKKIRLYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSSKKMTYQKMARALRNYGKTGEVKKVKKKLTYQFSGEVLGRGGLAERRHPPH	124452	107361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_107966_108016_108136_109382_109546_110339_110528_120962_121063_124229
781823	SIRV1	-	234	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3870	0	3596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
781825	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1662	3	-237	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2786	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781826	contig_16098_pilon	-	2048	2	Intergenic	novelGene_45863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_1	0	25	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1380	1784	244858	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFHLSLSPLSLTSILPEPGATGWDTQPPSLPPSDPRFNLPLCLCPQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	246237	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573
781827	contig_12411_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_145686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCCAAAATAACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430224	431667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_430200_431700
781829	contig_6842_pilon	+	899	8	Intergenic	novelGene_130757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	354.408734401973	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	314	685	1366898	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1306473	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306572_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
781832	contig_5033_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_28960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGTCGATTCTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456864	455981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_456000_456900
781833	contig_14225_pilon	-	1900	2	Intergenic	novelGene_52739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169102	166411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_168225_169015
781834	contig_18869_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_56297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGTTGAACTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73355	73542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73500
781838	contig_177_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_41855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAATAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438556	439974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_438600_440000
781847	contig_5988_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_16151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAAAAAGTGGTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1931712	1929910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1929900_1931700
781848	SIRV6	+	427	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	536	164	54	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
781850	contig_15327_pilon	+	1652	4	Intergenic	novelGene_70780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135694	1150540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1135852_1137313_1137381_1138468_1138566_1149209
781855	SIRV6	+	471	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10805_11022
781859	contig_12694_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_171983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAAAACCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318281	315865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_315900_318300
781865	contig_2204_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_71641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10188	12014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_10200_12000
781866	SIRV2	-	656	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	26	4	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCGACACAAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
781868	contig_10324_pilon	+	1282	8	Intergenic	novelGene_7838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	68.0668938678439	946	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	84	833	283476	296100	FALSE	20	CAAGGCCTCTCTGGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPGSNYTQTTRLEHIGESWLPKVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTKMVSEEDSTTLDAQSSSTAASSISQTWKRPTSTSSSLESPEFSTFRAPL	283392	296549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287031_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
781869	contig_16122_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_134498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	132	344	108682	108470	NA	20	ACCTAGCTGTTGTGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQARVPFQQILSLPELKVPAPYPLHTHIPSARLPLTYTAFEVMKLLVPVLARSLFSLNFLGSGALPNHPVELSRIVFLTRGSRTYSQRFKEVLSFKRNQVTLLKFESPCSRG	108813	108380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_108400_108800
781873	contig_10437_pilon	-	591	2	Intergenic	novelGene_38105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTCCTTGAGTCTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69535	68788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_68944_69099
781875	contig_34_pilon	+	1095	6	Intergenic	novelGene_40020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	89	457	212125	212493	TRUE	25	AGTAAGAATTTCTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	212036	230305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212560_212973_213048_214057_214151_215287_215458_224659_224818_230228
781878	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
781879	contig_16156_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_137079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACCAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225178	227664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_225200_227700
781880	contig_14618_pilon	-	458	3	Intergenic	novelGene_136798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGAAGGTGACGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373413	372100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_372279_372572_372709_373269
781881	contig_11678_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_160854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTAGATGATAACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296239	295086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_295100_296200
781883	contig_10711_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_118453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATGAAATCTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851457	849592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_849600_851500
781884	contig_13905_pilon	+	1434	4	Intergenic	novelGene_130424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	207	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	62	382	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218452	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_228578_228652
781885	contig_6195_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_71028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCTAGTGGCATCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115550	114767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_-_114800_115600
781887	contig_4659_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_118220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGACAGTGTTCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721443	720868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_720900_721400
781889	contig_10940_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_49213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAAGAAAAGGCTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865733	866331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_865700_866300
781891	contig_13460_pilon	+	1105	5	Intergenic	novelGene_162173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	61.0102450413043	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	456	860	7936	19547	FALSE	35	GTCAGTATAAGCAAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENSPSPLPERAIYGFVLFLSSQFGFILYLVWAFIPESWLNSLGLTYWPQKYWAVALPVYLLITIVIGYVLLFGVNMMSTSPLDSIHTITDNYAKNQQQKKYQEEAIPALRDIPISEVNQMFFLAAKELYTKN	7305	19792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_7737_7911_8018_13302_13376_17726_17846_19416
781893	contig_10609_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_123951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAGCATCTAGAACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480335	482552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_480300_482600
781894	contig_1274_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_137790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110876	109683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_109700_110900
781895	contig_12951_pilon	+	1926	11	Intergenic	novelGene_68128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_7	63.0746383263511	7	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	16	1134	61341	120246	FALSE	15	ATGTCTGTCTTGACCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKMAEEEFPNTTHEGLNVTLHTTLVITTKLVLPTPAKPILPVQTGEQAQQEEQSSGMTIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNMSDVSGWRTFLQALGYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCGECCLCVVSRGPAWP	61325	121038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_61367_63778_63958_74877_74959_86814_86874_91427_91512_95327_95430_96507_96543_102050_102195_107974_108114_109617_109724_120082
781896	contig_15610_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_154283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	91	765	682241	681567	NA	20	TTCTGCCCTGAGTCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRKRKASPEPPDSAESALKLGEEQQRQQWMANQSEALKLTMSAGGFAAPGHAAGGPPPPLGPHSNRTTPPESAPQNGPSPMAALMSVADTLGTAHSPKDGTSVHSTTASARRNSSSPVSPASVPGQRRLASRNGDLNLQVAPPPPSAHPGMDQVHPQNIPDSPMANSGPLCCTICHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRESIKAQGATGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDP	682331	680721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_680700_682300
781897	contig_2733_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_128583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCTCTTTTTCATAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785326	784000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_784000_785300
781898	contig_18869_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_56178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGACACCCCGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
781900	contig_6102_pilon	+	1128	6	Intergenic	novelGene_31903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	748.113467329656	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	180	737	374896	394867	FALSE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYFLLCLYLVLLSCQLPRAFCTCAWPLAALAVASAYAKYSF	374591	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_374768_374892_374935_378881_379032_379330_379487_379617_379711_394747
781901	contig_7428_pilon	-	2369	7	Intergenic	novelGene_77706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	16.139151843335	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	771	1790	320089	317760	FALSE	35	CTTTCATAAAAGCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFSSWGARYEFLLVSRGIRLCLKRSAASGSRFHVLRGKYGWGHRSVWLYLREAGVRELGPLGSGRHPSHSATPTGPGDEVARGIAGEKFDIVKKWGINTYKCTKQLLSERFGRGSRTVDLELELQIELLRETKRKYESVLQLGRALTAHLYSLLQTQHALGDAFADLSQKSPELQEEFGYNAETQKLLCKNGETLLGAVNFFVSSINTLVTKTMEDTLMTVKQYEAARLEYDAYRTDLEELSLGPRDAGTRGRLESAQATFQAHRDKYEKLRGDVAIKLKFLEENKIKVMHKQLLLFHNAVSAYFAGNQKQLEQTLQQFNIKLRPPGAEKPSWLEEQ	321911	317180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_317916_318369_318545_318693_318852_319383_319606_319780_320627_320876_321018_321819
781904	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	2	409	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	589	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
781905	contig_11378_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_112270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCGTAGGTTTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412398	413361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_412400_413400
781907	contig_10753_pilon	-	2689	1	Intergenic	novelGene_105139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303465	300776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_300800_303500
781908	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
781909	contig_6477_pilon	-	1875	4	Intergenic	novelGene_154159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAACGACTCAGAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767385	748134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_748470_754496_754595_758320_758405_766027
781911	contig_6724_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_167970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTTTTTCCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298690	296576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_296600_298700
781912	contig_10331_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_54113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTGACTCCAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327760	328371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_327800_328400
781919	contig_14326_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_120668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1041	1376	67502	67167	NA	25	ACAGTCCTGTACAACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLQLSSQRPESLQANSPYSSRVEARVYRSNQIACYQHRGCFGTKAMCGSWNPRHMAPVYSSVSVSGQKHSPITSVRWGQTCPPILQSEQLLSFHQHQMTMGQALFYVP	68542	66384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_66400_68500
781920	contig_14029_pilon	+	1007	8	Intergenic	novelGene_151944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_4	271.021198056385	1094	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	7	594	131703	135305	FALSE	40	TTAAAGCGGAACACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQNNKNSLEILLGSIGRSLPHITDVSWRLEYQIKTSQLHKMYRPAYLVTLNVENTDSGSHPGISFSCNMEQLQDLVGKLKDASKSLERATQL	131696	135718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_133472_133564_133600_133959_134021_134104_134162_134258_134319_135245
781923	contig_7078_pilon	-	1531	4	Intergenic	novelGene_130164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	244	junction_3	443.129276346706	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	266	1213	645721	593925	FALSE	75	TAGAAAAAGAAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRSGKIVPGQVYIEVEYDYEYDAKDRRIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVPRKALMPPVKQAVGQPNNSVKMIQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKSSSSVQGTGLIRDANQNFGPSCSPGQTVSLSLDLTHNNGKFNSDSHSPKVPSQNRTRLFGHFPGPEFSDIEKTGFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRASTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSAVPPLPGSPAVQINGEWETHKDISGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISKGDFQSSGDQEV	671126	593606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_594195_645043_645800_647333_647376_670981
781924	contig_10436_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_108506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACTTGAGGGAGGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101611	103557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_102103_102539
781927	contig_12427_pilon	-	1006	4	Intergenic	novelGene_40564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1490.98982782133	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	578037	506035	FALSE	20	ATTCTTGGATTATGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSLLVLLRWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578038	505377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510496_578012
781928	contig_3233_pilon	-	245	3	Intergenic	novelGene_56509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCAGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94828	94338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_94462_94665_94764_94804
781930	SIRV4	-	329	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1192	0	1192	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3966	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
781931	contig_610_pilon	-	1205	3	Intergenic	novelGene_76747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTGTCAAAGTGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252662	213499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214266_220521_220730_252431
781935	contig_10460_pilon	+	2272	4	Intergenic	novelGene_157463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_3	49.3783578323765	34	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1581	2189	65919	70175	FALSE	40	GGAGGAAAAAACTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHIRDCLPELKTRINVLAAQYQSLLNSYGEPVDDKSATLLQLITKFATEYCNTIEGTAKYIETSELCGGARICYIFHETFGRTLESVDPLGGLNTIDILTAIRNATGPRPALFVPEVSFELLVKRQIKRLEEPSLRCVELVHEEMQRIIQHCSNYSTQELLRFPKLHDAIVEVVTCLLRKRLPVTNEMVSYYFTNHHCNHY	64338	70258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_66119_69295_69417_69641_69798_70043
781940	contig_6557_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_32931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCAGAGTAAAACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199174	198031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_198000_199200
781941	contig_3130_pilon	-	1676	13	Intergenic	novelGene_103585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_1	260.058593824973	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	94	1620	202529	178989	FALSE	20	TAGCTCTTTCAGATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGRGLGELPRWWWRRLRRRQQERILGLSLTMPTVEELYRNYGILADATEQVGQHKDSYQVILDGVKGGTKEKRLAAQFIPKFFKHFPELADSAINAQLDLCEDEDVSIRRQAIKELPQFATGENLPRVADILTQLLQTDDSAEFNLVNNALLSIFKMDAKGTLGGLFSQILQGEDIVRERAIKFLSTKLKTLPDEVLTKEVEELILTESKKVLEDVTGEEFVLFMKILSGLKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFSKNVHSTRFVTYFCEQVLPNLSSLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDMEKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSFHQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIRLQYFARGLQVYIRQLRLALQGKTGEALKTEENKIKVVALKITNNINVLIKDLFHIPPSYKSTVTLSWKPVQKVELGQKRANEDTTSGSPPKKSTAGPKRDARQIYNPPSGKYSSNLGTFNYGERFRLGASNM	202622	178932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_179161_179661_179739_181844_181902_182722_182817_185026_185209_186380_186471_187649_187755_188282_188490_189699_189852_190418_190485_191011_191106_192189_192352_202460
781942	contig_12622_pilon	-	892	6	Intergenic	novelGene_5956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2460.1989675634	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	33	890	1590968	1583552	FALSE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLQSDTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTAPLLPPSFFVGIFLINLDSLT	1591000	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583612_1588878_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
781945	contig_10093_pilon	+	1483	4	Intergenic	novelGene_147503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	160.208891416453	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	41	391	73194	101883	TRUE	70	GAAAAAAGAAAAGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APALASGGPLLAAMDRFLWTSGLLEINETLVIQQRGVRIYDGEEKECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKSAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEVSFCINKIGLEMCVCAFFCCLL	73153	103715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_93068_93140_101699_102925_103664
781946	contig_1786_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_142598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACCAAAAACCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65929	66301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_65900_66300
781947	contig_1786_pilon	+	2118	2	Intergenic	novelGene_142599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTTCCGGTAGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66301	80031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_68321_79932
781949	contig_4964_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_157258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTCTAAGAAGATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144385	145893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_144400_145900
781954	SIRV6	+	331	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	404	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10682_10819_11031_11109_11205
781956	contig_7815_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_134386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAATAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508448	507678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_507700_508400
781957	contig_2438_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_111999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAATCCACCAGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188844	187180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_187200_188800
781959	SIRV4	+	362	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
781962	contig_6102_pilon	-	1386	13	Intergenic	novelGene_32327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	332.021198704072	10	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	52	1071	1690301	1682624	FALSE	35	CATGTAAAGGGCTTAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRSSWTTEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGCGFCGGNKG	1690578	1682308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1682658_1687250_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690554
781964	contig_7457_pilon	-	2801	8	Intergenic	novelGene_31371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	122	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378573	371921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_372187_372655_372782_373809_373991_374729_374829_375247_375330_375810_375892_376325_376411_376691
781966	contig_5217_pilon	-	1956	14	Intergenic	novelGene_135746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.683556088057	1	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	375	584	532753	531630	TRUE	10	TTTATTTATTGGCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKSHQREKILNEIELHRDLQHRHIVRFSHHFEDDDNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPDQRKKTICGTPNYVAPEVLLRQGHGPEADVWSLGCVMYTLLCGSPPPLRQLT	533447	528997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_529462_529568_529683_529851_529984_530119_530270_530411_530460_530597_530692_530930_531015_531226_531361_531477_531679_531766_531863_532688_532777_532869_533000_533128_533246_533343
781967	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
781969	contig_14744_pilon	-	838	5	Intergenic	novelGene_66082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAATATTGAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386693	1382973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1383209_1383301_1383390_1384446_1384585_1385819_1386006_1386502
781970	contig_960_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_108291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGAGCTTTTTCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032629	1033271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1032600_1033300
781974	contig_15105_pilon	-	889	6	Intergenic	novelGene_151016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	817.89842890178	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	40	834	839916	828407	FALSE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPVSVKHQNREDIREGSGRARTHMEFVSISLRKHDKGCSLKATSV	839955	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828518_830985_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
781978	contig_6102_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_31799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7954	junction_1	2053.07785207153	6645	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864
781985	contig_9180_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_109104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	429	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTCTTCCAGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243956	239406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_240376_243753
781986	contig_5917_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_122142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209233	211301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_209200_211300
781987	contig_8161_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_156759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271809	272638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_271800_272600
781988	contig_8161_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_156760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAACTTAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272678	273071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_272700_273100
781990	contig_6633_pilon	+	1649	8	Intergenic	novelGene_143164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	226.838430318559	131	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	373	1509	23500	36061	FALSE	20	CATTCCTGGTTCAGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLSEANGTFALNLLKKLGENNSQNVVFSPMSISSALAMVFLGAEGNTATQISQALSLNKSRGGGGDVHQGFQSLLTEVNKPGTQYMLRTANRLFGEKTYDFLSSFKDSCRKFYQAEMEELDFANATEESRKHINTWVAKKTEGKITELLSSGAVNSITKLVLANAIYFKGNWDTQFNKEQTKERPFKISKNEEKPVQMMFKKSTFKITYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDGNTDLSTVEKELTYEKFMEWTRPDMLDEEEVEVFLPRFKLEENYDMEDVLRSLGMADAFDQGRANFSGMSSKRDLYLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCVRITPRFCADHPFLFFIQHTKTNEILFCGRVSSP	21772	36201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_22007_22393_22522_23489_23665_25832_25983_28985_29104_30715_30859_32189_32346_35656
781991	contig_14034_pilon	+	1986	5	Intergenic	novelGene_72675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	124.630453742254	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCCTGAAATAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404247	409084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_404321_406464_406532_407086_408187_408267_408814_408884
781993	contig_12638_pilon	-	1009	7	Intergenic	novelGene_33222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	577	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGTAGCGGATCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617125	610264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_610285_610530_610651_610822_610870_613328_613504_614062_614241_614436_614617_616836
781996	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_94684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATACACAGTGGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
781999	contig_16098_pilon	-	1841	5	Intergenic	novelGene_46174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	19.2921616207205	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	898	1707	545635	534853	TRUE	5	TTCCTGGGGTGTTGATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDECNRLFSSSPSVSPSRLSVEAQDLLLPMGSFQAGHNLHFCLAHHPPLVCATLILLLLGLSGLGLGRFLLTHKTGLRSPDIPQDWVSFLRSFGQLTLCPINGTLTGKWHGPHVVGLLTTLNFGDGPDRNKTQTFQAKVLGSQMGLKGSNARELVLITARVTTGRTPGTCLYFNAAPDILPSSQPPIACPEEEAGNATVSPRMADECIRIWSHEGLVLTKLLTSEELALCGSRLLVLGSFLLLFCGLLCCVTAVCFHPRRESHWSRTRL	546532	533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_533391_534820_534991_536677_536908_545105_545296_545383
782000	contig_19179_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_142381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCATTCTAGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41619	43382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_41600_43400
782001	contig_6424_pilon	-	957	6	Intergenic	novelGene_109247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.293543869014	111	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	24	503	21039	6307	TRUE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPWAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21062	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6103_6258_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_21012
782003	SIRV6	+	303	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	83	-9	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3106	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782005	contig_4732_pilon	+	334	4	Intergenic	novelGene_75408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2591.52477639452	46	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524071	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524259_524510_524671_525073
782007	contig_1532_pilon	-	948	2	Intergenic	novelGene_37373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13359	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13048_13095
782008	contig_7279_pilon	+	1281	4	Intergenic	novelGene_145979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	159.587663126641	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64638	74178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68856_73284
782012	contig_3068_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_137645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	161	418	276667	276924	NA	75	AAAAAAAAAAGCCAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPLELSTDTSGTRGHVGLRKRVLLKGIWYSRFSLSNPPWHHQPAAGAGGGTVMRRPLYRECHSWEFQQHSQSQGQWQPKAETPQGGELLKDLFCETEGRLWHVRQGWAASGTLEYSQSPDRSWREQRSEVFKRIKIR	276506	279052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_276500_279100
782014	SIRV4	+	620	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12744	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCTAAAGACATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	5159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
782015	SIRV6	+	292	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8128	11	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
782017	contig_5210_pilon	-	2492	8	Intergenic	novelGene_65412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	193.59583399127	1	143	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	214	1107	443109	431502	FALSE	25	AAATGTGGACAGCTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSWEALLTCSSWTMFHIISLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	444372	430116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777_439924_443048_443119_444168
782018	contig_5479_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_133595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGTTCTTAGGTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275970	276615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_276000_276600
782019	contig_8064_pilon	+	1002	4	Intergenic	novelGene_164562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	76.630426217151	1108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	174	335	117228	118008	TRUE	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAFSQASEPVSCTWWQLHLDPHLNVYSPSLPGNSNPRRNQLINLNHYATKKSVAESMLDVALFMSNATRLKVVLEQGPSSHYYITLITLISISLLLQVVIGILLVVIDL	101618	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_117149_117382_118000_118295_118823
782020	contig_5988_pilon	-	1398	2	Intergenic	novelGene_15994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	764	1183	689940	689521	FALSE	10	TGAGTTCAGTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	691358	689305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690480_691134
782021	contig_4736_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_168634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGATCATGATTCGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278582	279270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_278600_279300
782023	SIRV4	-	323	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1061	-8	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4097	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_3956_4084
782025	contig_4759_pilon	+	2375	9	Intergenic	novelGene_106344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_8	19.7484176581315	45	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2244	132	2375	857452	874067	FALSE	10	GTTTGCAGGTATCTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKKRKDMEPACTWSLLSSEKTTSSSLASFSWRELTDYREIFRKHLKEKYLKIGIDKCYHHGKHVESQLLLVKEHGISEETPCGIPQQEHFIEMEHVFDPDEEGSSSSRTVVLQGCAGIGKTAVVHKFMFDWAAGMVTPGRFDYLIYINCREISHIANVSAADLIANTFQDINGPILDIILTYPEKLLFILDGFPELQYSVADQEEDLNANPQEKKPVETLLCSFVRKKLFPESSLLITARPTAMKKLHSLLKQPIQVEILWFTEAEKRAYFLSQFSGANVAMRVFYSLRENEALNIMSSLPIVSWMICSVLQSQGDGDRALMRSLQTMTDVYLFYFSKCLKTLTGISVWKGQSCLWGLCSLAAEGLQNKQVQFEVSDLRRHGIGVYDTNCIFLNHFLRKAERGVHVYTFLHFSFQEFLTAVFYALKNDNSWMFFDQVGKTWQEIFQQYGKGFSSLTIQFLFGLLRKGNGKTVEATFGRKISPGLREELLKWTEREIKDKSSRLQLEQIDLFHCLYEIQEEEYAKRITDELQSIILLQPTYTKMDILAMSYCVKSSHSNLSVSLKCQHLLGFDDEERISAFRPPALILNQSFQVRHLPVSRLHFLCQALCNPYCKIKDLKLIFCHLTASCGRDLSLVFEANQYLTDLEFVKNTLEDSGMKLLCEGLKQPNCVLHTLSFYRCLISPASCGALAAVLSTNQWLTELEFSETKLEASAVKFLCEGLKDPNCKLQKLKLGASFLPESSEA	836040	874067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_836086_837975_838044_857433_857522_858641_858687_861857_863518_865901_865992_871841_872013_872127_872299_874030
782028	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782029	contig_19957_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_57693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATTTCATAGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111564	112319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_111600_112300
782030	contig_19957_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_57694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	558	863	113432	113737	NA	40	CAAGCTACCCTAAAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVQFSRYQLVTLLLCSGNSRCCLTRDWNLVAPGACLICLFVFYIEFGCFLVEQAFSPQLPTVLYTVIFSLVYITLLIYTTLLNYIICQASGGVRFVSPRI	112874	114294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_112900_114300
782034	contig_2069_pilon	-	1241	13	Intergenic	novelGene_23407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	294.90365658409	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	48	1241	1257919	1234088	FALSE	10	GCACTTTCTGGCGACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCLLLPWCHGPAGRMEQDPKPPRLRLWALLPWLPRKQRPRISQTSLPAPGPGSGPRRDLDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKAPGTSIRIGLANGSAVVSLGCPRGRIRK	1257966	1234087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234171_1249409_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1257784
782043	contig_20819_pilon	-	1174	5	Intergenic	novelGene_55674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_4	1559.52989711644	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70237	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_69462
782045	contig_1339_pilon	+	834	2	Intergenic	novelGene_163096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	59291	65304	FALSE	75	AAAAAAAAAAGGATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHTKLHFKAILGGPVGAPHHSRVIDQNVHSLLLFNDLPCKVSDGLEGRQVQVPGIDVVIEGLPTNVLCCCLTLLHVSTGQNDVASWKPAQGKLKGKKKKKSSR	59288	65824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_59389_65090
782048	contig_5566_pilon	-	1938	6	Intergenic	novelGene_153652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_3	72.8631594154412	5	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	153	1610	176330	164772	FALSE	30	TTAGCAAGACATGTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGGSRIIRRVSLRKRNRPSLGSVCAAPAAAELKPGNVEDEEMVAGSRRRKTVGVQPVEYDSEEDMFGDYDSFTENSFLAQVDDLEQKYMQLPEHRKHDTDLAIEDLCSESIKDSKLNITTVDNFTALKTDEPTKNQCGQEDVAIEPGTDLLYDVPSSQVLYFENLQNSSNDWGNQFTKEKDWNSSSHQTVNEELSHSCIEQPQQNDQSSSEVRTSSDTTRRKSLKDHLKSTMTGNAKAQTPVFSKTKQLKESLLSEEINVAKKTLESSSDDRGPFYSLPSKVRDLYVQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCRRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSTFGMELGFFVEEYAGSKGRFPPVKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETERISNLGLVVVDELHMIGAGSRGAVLEMTLAKILYTNKTTQIIGMSATLNNVEDLQEFLQAEYYTNQFRPVCT	176482	164443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_164882_167749_167823_168362_168564_169131_169311_173166_173882_176150
782052	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
782053	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
782054	contig_11428_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_138496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131125	128529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_128500_131100
782058	contig_15410_pilon	-	1208	3	Intergenic	novelGene_130562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.5	126	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	189	419	53472	51036	FALSE	20	CTTCAGCCTCCTGAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAARPPSVPHGAAGSTGYCSWTARVAGPAISSCRMSEVRLPPLRALDDFVLGSARLAAPDPGDPQRWCHRVINNLLYYQTNYLICLGFGLAMAGDPGARFAAPAQPQEQA	54721	50246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_51088_53293_53571_54631
782064	SIRV4	-	465	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
782066	contig_935_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_45564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375862	374776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_374800_375900
782067	contig_14711_pilon	-	1652	10	Intergenic	novelGene_68870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.27926193518187	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1641	10	1650	16416	9595	FALSE	30	CAAGAGCTTAGGGAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKMQEGIERDRRAQAPSNLEEFEVNDLNYEDKLQEDRFLYSNIVFNLAADAAQSKCLDQALALWKEVLTRRQAPVVRCLQQTAASLQILAALYQLVAKPLQALEVFLLLRIISKRLEDPAKVAGSTCRIAQLLLTLGCPSYAQLYLKEAKSSVKLLDQTTDTYLLLSLTCDLLQSQLYCTTQKVTEGVSLLLSVLRDPALQKSSKAWYLLRVQALQLVAVYLSFSSNSLPVSLWEQLCAQGWQTPEVALIDSHKLLRSIILLLMGSDVLSVQKTAVETPFLDYGENLVQKWQVLTEVLSCSKKLVSRLGYLGSVSEAKAFCLEALKLTMKLQIPRQCALFLVLKGELELARSDLDLCQSDLQQVLFLLESCTEFGGPAQQPDSVKKVHPQKGKQQARVLCPPELPEEELFLRGPALELVATVAKEPSPTAPSTVSSPILKTKPQASPDFLFHQPTCDCSLCASPVLSAVCLRWVLVTAGVRLAMGHQAQGLDLLQTVLKGCSAATKRLAQALQASMNHRAPPSPVPSLLDEILAQTYTQLAWEGLSQPA	16425	9592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_10125_10967_11078_11596_11754_11874_12004_12642_12815_13322_13443_14675_14811_15825_15966_16160_16300_16407
782072	contig_15672_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_171830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCCTGAGTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151836	152612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15672_pilon_+_151800_152600
782073	contig_8712_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_58849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1301	1657	683002	683358	NA	60	AAAAAAAAAAGTCCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMVRVAYLAPCPRMRTQSAALWGHCCPGGTGRRSGKAGAGWERWSRVQTPGLRLPAGLGGPGGLHLNNTVVHSQHRGSGGVDEALCVVGGVTRAAVALPGVSLGRCQVGSLELGRQ	681701	683925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_681700_683900
782074	contig_8284_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_125676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGTAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265589	266873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_265600_266900
782075	contig_16883_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_161756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTCACCTAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536179	535476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_535500_536200
782076	contig_16883_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_161755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAGAGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535377	534201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_534200_535400
782077	contig_16204_pilon	+	2363	4	Intergenic	novelGene_154470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6.12825877028341	65	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAGTCACTTAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70599	79021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_70886_71621_71733_73378_73501_77177
782081	contig_5945_pilon	-	1474	7	Intergenic	novelGene_104557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	313.563612188801	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	33	674	249708	219576	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGMGWR	249740	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224400_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
782083	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_98170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
782089	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	65	AAGAATAAAAATGAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
782091	contig_6497_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_35552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129829	132320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_129800_132300
782092	contig_20646_pilon	+	1297	9	Intergenic	novelGene_145021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	231.871967635159	226	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	179	1081	33838	40819	FALSE	5	GACCCTTCTGTCCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL	31290	41035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_31307_31903_32001_33772_33898_34130_34317_34507_34637_35584_35682_37587_37778_38317_38424_40684
782097	contig_2892_pilon	+	1774	2	Intergenic	novelGene_119004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGGGTTGCTATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159521	162005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_160327_161036
782098	contig_7695_pilon	+	2078	14	Intergenic	novelGene_41597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	553	921	506218	512118	TRUE	20	CAAACTCATTTCCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRDSLRSSTVSLRVRKHSGGASVTAAYPSYKSRPPATSPVDFSTSQEPLQGRFAYGTDLASVKADPGIRAPVGACGGSDGNKPLASLQQDLQDHKPGLHVGLQRPPGCRTPEPAARPEPC	503905	525570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_504431_506190_506357_510473_510653_512067_512175_512300_512421_512505_512582_513908_513985_514281_514396_514584_514659_521098_521207_522004_522092_524168_524439_525012_525168_525549
782099	contig_11396_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_71385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	603	1031	1101164	1101592	NA	10	CTGGTCATGTTTCTTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSPRALAVLRKQVRAPKPRLSQHPNLQQLPCQPLGRAPSSAPQLLSVTVTLRSGSHTQLLGAAGPRLPSWPVHRKCQATCPVPRPRAVLGQRLWRMAGGLCSRTGPSLYRYVRLWSLVRGRRSLVEWKPGLSGSVCECNRS	1100561	1102046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1100600_1102000
782100	contig_4071_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_151866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGCAGGAGATGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37626	36781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_36800_37600
782101	contig_4125_pilon	-	1248	8	Intergenic	novelGene_25213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACCCAGGGAACTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711809	1684740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1684882_1703185_1703297_1703838_1703967_1708048_1708179_1708683_1708777_1709646_1709808_1711091_1711208_1711441
782104	SIRV4	-	460	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1063	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4095	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
782105	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	503	3	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAGTGCCGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
782106	contig_8616_pilon	+	1283	10	Intergenic	novelGene_72401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	21.1893287841071	247	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	489	1241	209271	213351	FALSE	10	CTTGACCTTGAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQDPAHPHVVATGGKENALKVWDLQGSEEPVFKAKNVRNDWLDLRVPIWEQDIQFLPESQKLVTCTGYHQVRVYDPASPQRRPVLEATYGEYPLTAMTLTPGGNSVIVGNTHGQLAEIDFRQGRLLGCLKGLAGSVRALQCHPSKPLLASCGLDRVLRVHRIRNPRGLEHKVYLKSRLNCLLLSGRDNWEDEPQQPQEPNKVSPEDTEMDELWASLEAAAKRKLPDFKQSQGALQARHKKKKRPGSTSP	207073	213393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_207328_207415_207538_209039_209116_209234_209382_209537_209640_211720_211822_211911_211968_212282_212429_212563_212621_213171
782107	contig_9807_pilon	+	1167	8	Intergenic	novelGene_32839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	717.693897572109	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	154	714	109130	151649	TRUE	25	GAGCGCTTAAACCACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKWCRNSA	108976	158996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128699_151627_151820_154095_154274_158891
782111	contig_12021_pilon	+	1388	8	Intergenic	novelGene_172197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_6	15.5445377242691	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	289	963	273810	314683	TRUE	15	TCGTGTTCTCTCTCCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSSGNKDFVVLSNGNIATSATNPSPLTSCDGDLAAQQLTPKEAPRTKVSPNGCLQINGTVKSSFLPLDNQRTAQMLPQCCHPCPYHHPLTSHNSHQECHPEAGPTAPSALASCCMQPHSEYSASLCPHHSPVYQTACCLQPSPSFCLHHPWPDHFQHQPVQQHIGNRRPSRPFKLPKSYAALIADWPVVVLGTCTVFTVVCALVGVLVPELPDFSDPLLSSG	129808	318468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_129835_164443_164543_175172_175319_273792_274319_304849_304880_313264_313389_314671_314770_318129
782112	contig_16411_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_77387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACGGTTTCCTTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379362	379689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_379400_379700
782113	contig_12622_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_5861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	305	915	1552	2466	1101733	1100819	NA	85	AGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWPKGGLHVRGLWLRLAPLLTEAEKFTLGQPAMVLTPHHVLSVLEQKGGFWLTAGQLGRYKAALLDDPDVTLKAVSTFNPDTLLLVPEGEGPVHDCLEIIEEVYSSRPDLTNQPLDNQDLELFTDRSSFIDNGTHKPGNAVVTLFETKEAEALLPGTLVQKAEITALIRALELSSGHWVNIFTDSRYAFSVLHAHGAIWKERGLLTSGRKENKHTEEILKLLGAVNLPTEVAMIYCPGHLKGDSVIPKGNHLADAAAKQAAKTKLLVTLVATLIPDLDLTDSDPGYSDDDLTEADEWGFNRNKT	1103284	1100816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1100800_1103300
782114	contig_14326_pilon	+	1000	7	Intergenic	novelGene_120698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	45.1986356726248	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	95	799	221889	248940	FALSE	15	CCAGCTGGCTACGTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDGGKSAGVCVSGDSKCGRSYRFFPPGLATMSSTLAKIAEIEAEMARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQLLDLPGIIEGAKDGKGRGRQVIAVARTCNLILIVLDVLKPLGHKKIIYTKPKGQLPDYTSPVVLPDSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKK	221794	249141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_231908_231979_236605_236676_242864_242988_248840
782118	contig_6710_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_98243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782120	contig_665_pilon	+	3139	1	Intergenic	novelGene_158183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61848	64987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_61800_65000
782123	contig_9653_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_48253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAATAGCATAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853672	854484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_853700_854500
782125	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGGTACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
782128	contig_6837_pilon	+	1309	11	Intergenic	novelGene_149815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_5	22.2836262758107	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	147	1154	11753	17185	FALSE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQVIAYSEHRYRIFGETIDIAVGNCLDRFARVLKISNDPSPGYNIEQMAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEDAAQRMLATGECTPEDLCFSLQETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11606	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15176_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
782131	contig_3077_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_26836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAAAAAAAAACGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547341	548913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_547300_548900
782132	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	3	1165	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782133	contig_6102_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_32098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCAACTCAGTTGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806401	805450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_805400_806400
782135	contig_6217_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_109585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGATCTACTACTGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197985	197462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_197500_198000
782136	contig_6217_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_109584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAACAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197462	195523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_195500_197500
782137	SIRV1	-	209	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	2	3619	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
782142	contig_8674_pilon	-	1697	13	Intergenic	novelGene_102953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	53.3861717426276	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	418	1332	723870	707008	FALSE	10	TTCAGGTTATCCTGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSDEYEEEDNKEKKKTTSQLTPQRGFSENDDDDDDDDSSETDSDEDDDDEEHGAPLEGAYDPADYEHLPVSAEIKELFQYISRYTPQLIDLDHKLKPFIPDFIPAVGDIDAFLKVPRPDGKPDNLGLLVLDEPSTKQSDPTVLSLWLTENSKQHNITQHMKVKSLEDAEKNPKAIDTWIESISELHRSKPPATVHYTRPMPDIDTLMQEWSPEFEELLGKVSLPTAEIDCSLAEYIDMICAIVDIPIYKSRIQSLHLLFTLYSEFKNSQHFKALAEGKKAFTPPSNSTSQAGDAETLTFS	727570	706642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_707104_707575_707662_708033_708095_713359_713427_713788_713911_715028_715158_715592_715687_715853_715929_718143_718284_723825_723906_726636_726734_726854_727004_727434
782143	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	101	1	-86	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	72	311	2458	3109	TRUE	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2386	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
782147	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_92033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782149	contig_11281_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_125513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGCTGAGCTTGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964522	964921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_964500_964900
782154	contig_7887_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_124882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1110	1412	233738	234040	NA	25	TGTTAAAGCCATCCACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRVGFCNTLTKVTSLIQSKGSFPKVWPAPPFNLQEIKGKGIRQNWGPQTTKKTVSGAECVLWAGGSCAEKLLVRGKTDDNKDLPPEPTETESLPLELTL	232628	234086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_232600_234100
782158	contig_12450_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_162318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCTCCGAGATGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344484	345772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_344500_345800
782161	contig_7378_pilon	-	2324	2	Intergenic	novelGene_120276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTACTTCAAACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537368	534916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_535248_535375
782164	contig_5317_pilon	+	1035	4	Intergenic	novelGene_76515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	6	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	108	518	35282	43326	FALSE	10	ACCTGTTTTTGGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33681	43843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
782166	SIRV4	-	452	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1059	10	1059	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4099	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
782168	contig_2043_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_169929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCTGAGAAACAGCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814164	812646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_812600_814200
782169	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	57	522	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782172	contig_6102_pilon	+	2197	3	Intergenic	novelGene_31755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	51	1688	267419	269511	FALSE	25	GTTTAAGATTATGACTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPILILASSSYRSVTMLLLLHRAMVPGLQQASRLRSTLRLCIRACSTDDSFQPQHPSRTFSDDNSARRGWGVMGTLLGLGAVLAYHECRCRADQESPRVYTREEVSSHCSPKTGIWVTFGHEVFDVTEFVDLHPGGPSKLMLAAGGPLEPFWALYAVHNQPNVREILAQYKIGELNPEDKAPPTLENSDPYAGDPPRHPALKVNSQRPFNAEPHPELLTENYITPNSLFFTRNHLPVPNLDPDTYRLHVVGPPGGQSLSLSLDDLRQFSKHEVTVTVQCAGNRRSEMTKVKEVKGLEWTTGAISTAHWAGARLCDVLAQAGHHLSETEAHVCFEGLDSDPTGSAYGASIPLARALDPEAEVLLAYEMNGQPLPRDHGFPVRVVVPGVVGARHVKWLGKVSVEPEESYSHWQRRDYKGFSPSVDWDSVDFDLAPAIQELPIQSAITQPRDGETVESGEVTVKGYAWSGGGRAVVRVDVSLDGGLTWQVAELDGEVQRPRKAWAWRLWQLQAPVPAGQKELNIVCKAVDDSYNVQPDTVAPIWNLRGVLSNAWHRVHVHVAP	267368	270020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_267472_267749_267925_268101
782175	contig_14680_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_132735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5097	4259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_5100
782178	contig_8145_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_118666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTCTATTCCGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872707	873984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_872700_874000
782179	contig_8145_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_118665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAACACCTGTTGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868093	868359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_868100_868400
782181	SIRV6	+	356	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	19	408	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782187	contig_7568_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_174016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGTCAACAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147385	148136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_147400_148100
782188	contig_17074_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_145136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGGGAATTTCAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226466	228388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_226500_228400
782189	contig_10569_pilon	-	2719	1	Intergenic	novelGene_44097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAGAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447953	445234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_445200_448000
782190	contig_11292_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_109443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCGTGGAATGGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324713	326133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_324700_326100
782194	contig_17158_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_141165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCGCTTGGTGTTTGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254891	256147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_254900_256100
782195	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782197	contig_3846_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_137151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAAACTCGTTGCTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216230	216822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_+_216200_216800
782198	contig_1349_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_171642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAATTCAGGAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227224	229403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_+_227200_229400
782200	contig_9098_pilon	-	1148	7	Intergenic	novelGene_75785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	458.109793972289	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	205	732	288027	265453	TRUE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFCLISGVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKVRKHRIKFMQSQFSSRWTKRTFHKQISNLFRN	289256	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265398_265552_266729_266813_267336_267515_282568_282709_287999_288160_289184
782203	contig_13004_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_112626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATGTTTCTCTCCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209882	209635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_209600_209900
782206	contig_8682_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_165281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATCTGTAAAAAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135259	134639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_134600_135300
782210	contig_11829_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_128147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200752	198967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_-_199000_200800
782211	contig_10196_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_132125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGTGTCTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925858	926563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_925990_926138
782212	contig_6870_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_103974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTTTAAAGCCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1437318	1435412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1435400_1437300
782213	contig_8587_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_159157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1061	1537	585421	585897	NA	65	CAATGACATAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHAVEASPSLRPHLCHRTIALELGSKRTGRTFSCSRHLDSSRDALAVGDGPLTGTGLKPIDEAVLQGRTADQCMQPSVLTALSEGLLSSGLGSPVYETLHHAVSQADGPLRAEQTLPGDSQLTISLASTGSPRPLPFAWDLGEARTLSWARCCADLN	584360	586222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_584400_586200
782215	contig_10748_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_150744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAAGACTGAGTCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150100	147848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_-_147800_150100
782217	SIRV4	-	261	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1257	3	1257	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
782220	contig_5961_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_144170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCCATCTCTGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262898	263687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_262900_263700
782221	contig_16109_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_80329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAACAGGAGAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266491	265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_265100_266500
782222	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	527	53	527	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782229	contig_19185_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_163656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAGTTGAAAAAACCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148254	148552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_148300_148600
782231	contig_3900_pilon	-	2745	16	Intergenic	novelGene_84171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	78.4051018748142	128	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	366	2054	232131	156472	FALSE	30	ACATATTACCAGATCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDSDSRHLLISEVDHEINPGPMNIQFDSSDLRSKRPFYIEPTNIVNVNDAIQRVSDHASAMNKRIHYYSRLTAPADKALIAPDHVVPALEECYVYSPLGSAYKLESYTEGYGKNSSLVTIFMIWNTMMGTSILSIPWGIKQAGFTTGMCVIVLMGLLTLYCCYRVVKSRTMISSLDTTTWEYPDVCRYYFGSFGQWSSLLFSLVSLIGAMIVYWVLMSNFLFNTGEFIFNFIHHINDTDSVLSTNDSNPVICPSASSGGHPDNSSMIIFYTNETGVQQFEKWWNKSKTVPFYLIGLLLPLLNFKSPSFFSKFNILGTVSVLFLIFLVTLKAVRLGFHLEFHWFTPTEFFVPEIRFQFPQLTGVLTLAFFIHNCIITLLKNNKNQENNVRDLSIAYMLVTLTYLYIGILVFASFPSPPLSKDCIEQNFLDNFPSSDILSFIARIFLLFQMMTVYPLLGYLARVQLLGHVFGDIYPSIFHVLVLNLIIVGAGVSMACFYPNIGGIIRYSGAACGLAFVFIYPSLIYIISLYQEERLTWPKLIFHVFIMILGLANLIVQFFM	248919	155780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_156638_157879_157970_161878_162028_163617_163732_186031_186139_194873_194982_198880_199079_202002_202063_206194_206366_210091_210186_210627_210692_210822_210945_214508_214642_232018_232166_242269_242484_248802
782232	contig_5120_pilon	-	1195	11	Intergenic	novelGene_169619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_9	49.0621035015826	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	993	201	1193	347128	284007	FALSE	40	CACTGAAAATTGGACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWKVLLGLLGAAALVAIITVPVVMLNKDDDAAADSRRTYTLTDYLKNTFRMKGYSLRWIADHEYLYKQDNNILLFNAEYGNSSIFLRNSTFDELGYSVNDYSVSPDGQFILLEYNYVKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITDERIPNSTQWITWSPEGHKLAYVWNNDVYVKNEPNLPSQRITWNGKEDVIYNGITDWIYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYSFYSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFIVNTDSLSLTTNATSVQITAPTSVLAGDHYLCDVTWVTQERISLQWLRRVQNYSVMDICDYDE	347328	284004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_284116_292579_292693_294299_294461_299547_299669_300659_300733_300849_300903_308123_308205_309530_309623_310256_310353_346301_346390_347122
782234	contig_12292_pilon	-	1792	1	Intergenic	novelGene_166988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGTTTTGACAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163416	161624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_161600_163400
782235	contig_7391_pilon	-	2491	2	Intergenic	novelGene_112156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTAGTGCCCTGTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413161	410573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_411750_411846
782246	contig_14483_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_133768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1234	1554	145543	145863	NA	55	AAAAAAAACCTGACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLTNPFGGRQLPYLHSSAQSLGWELQDHYEKGHMKAIQDVAPTYSLHEMKEPDWIPDLELLLPFNATFIHLQASVFQVCEVAKTILTLPSQLILAYQTSPRSIN	144309	146083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_144300_146100
782247	contig_5698_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_55045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18987	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_19000_20900
782253	contig_6710_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_98215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	35	CTTCCCCACAAAACACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782254	contig_9481_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_149641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTCAGACAAAGATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128619	130337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_130158_130250
782257	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	8	1165	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782259	contig_6286_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_165655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGGTCAAGTGCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157531	158894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_157500_158900
782260	contig_11512_pilon	+	1118	3	Intergenic	novelGene_43254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	35.5	133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	33	518	43509	44218	TRUE	15	TTCAATGAGTTTTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGETATINCKSSQSVRKYLAWYQQKPGQAPKLLIYSASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISNLQAEDVAVYYCQQYYSSTPTVLQPRTQTSSPGLQASESSLHQLLPFCSALNVHPSSDYPKGHIS	43476	51855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_43558_43781_44292_51328
782261	contig_401_pilon	+	1495	2	Intergenic	novelGene_42739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	805	1203	157478	157876	FALSE	25	AACCGTATGGGGCAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDGVVFHCVVGGVAMIWNRLDGTQQQQQNLRPAYLLLKWLSFFHFSSPCSPNRIQCPPSLCFVYTPLLQYLTLFLSNNDFCRYLSPLQQIVSSLIHKRNQILVISPSGVFVCTLITIEEQLSQRSPPIFS	156441	158168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_156958_157189
782263	contig_253_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_129672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_2	128.5	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAGAAAACCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395617	392338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_393209_394069_394396_395464
782265	contig_8122_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_40188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCCTGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77740	76079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_76100_77700
782269	contig_11846_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_105997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCTTATAATAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405291	404697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_404700_405300
782271	contig_7992_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_115542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGCTTTTAAGACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606789	605955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_606000_606800
782275	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
782276	contig_5210_pilon	-	1393	3	Intergenic	novelGene_65452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGAAGTCTCAGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617964	614329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_614847_616478_616651_617260
782279	contig_13542_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_131507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357748	356276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_356300_357700
782280	contig_13542_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_131506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGCTTCAGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355965	355713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_355700_356000
782285	contig_12873_pilon	+	1671	6	Intergenic	novelGene_27212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1213.7654798189	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	132	1097	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16225	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_17999_18984_19264_19611_19703_19851
782289	contig_7733_pilon	-	1727	6	Intergenic	novelGene_147156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATATCTGATAGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241662	236081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_236338_237018_237210_238074_238286_239107_239152_239247_239441_240830
782291	contig_2480_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_63522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	602	1102	232378	232878	NA	50	ATATTAAAACAGAAGTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAGGVPAVPGALAGSWFGVVVAAAAAAAAHVNGSGSQGHHRQPQLLAPAHPIPMAISLCPLRPRPVPGRAQSPYSVPSAALARPVATHQQGQPPVSSGYSSRGFVWWVVGEGCGLPGWGCPASQAGRTAGKAGHLTQELPVYNMVLAQCPNRVTSCFTECIVDVE	231776	233038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_231800_233000
782292	contig_8954_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_130303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	667	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTCTTTTTTGTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187660	188704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_187700_188700
782294	contig_3942_pilon	-	1352	3	Intergenic	novelGene_128728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	35	junction_1	21.5	308	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	109	1044	637793	634505	FALSE	20	TGCTGGCTCAGGAAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGALVWVLLLPLLLQDARTQEYSCALFSGNVDWTKEFQDMCLNFSKKGLSLPRNQSLLASKVISLDLSANGLRELPPVFFANLGTLQILDVTGNVLDHVDGALAARCNLDLKANCRCSLEVWHKVRSDNCSGQLPLQCLDVAMGAWRNLSAFLEASCAPRLAPSTIGGLVAGGCLLLGLAISGPMVAWRLRRCRVASSHGLGKAQATKDDSRPHWGWQPQYSSQGLNPKSPVVTLSSSHTSDYENMFLGQQAAGPGFQEHDLAKHGGHSPEDDLYMNYEGISQTSQPIYCNLASLGQAPLDEEEYVVSGR	638402	634196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_634641_636993_637803_638303
782295	contig_3584_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_108129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTGACTATTATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269111	267653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_267700_269100
782297	contig_6710_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_97970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657173	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKHAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653876_657142
782304	contig_7391_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_112160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTATACCAACCAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438702	440177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_438700_440200
782306	contig_5020_pilon	+	754	4	Intergenic	novelGene_27822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.8624569548	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	160	690	122915	126023	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDHLRQWRQPSQALLPFFSFPSLFISLPSPPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	118461	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118547_122840_123041_123152_123326_125791
782308	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
782309	contig_5461_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_156837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAACCCTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816004	815266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_815300_816000
782311	contig_4600_pilon	-	1669	7	Intergenic	novelGene_174020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	32.5904723636969	45	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	107	1084	216149	205685	FALSE	30	ATATACTCTCCTAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAWNVSVRGVAADCWGLSPGWEAYCVAAVPLGPTMRRLGSVQRKMPCVFVTEVKEEPSAKREYQPFKVLATETINRKALDADIYSAIPTEKVDGTCCYVTTYKGQPYLWARLDRKPNKQAEKRFKKFLYSKENSKEFFWNVEEDFKPVPECWIPAKEIEQLNGKPVPDENGHIPGWVPVEKNNKQYCWHSSVVNYEFEIALVLKHHPDDPGLLEISAVPLSDLLEQTLELIGTNINGNPYGLGSKKHPLHLLIPHGAFHIRNLPTLKHNDLLSWFEGCREGKIEGIVWHCNDGCLIKVHRHHLGLHWPIPDTFMNSKPVIINMDLNKYDYAFDSKCLFNYFSKIDNQKFGRLKDIMFDV	216255	205099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4600_pilon_-_205874_207318_207489_208551_208750_210692_210810_211483_211580_213355_213474_216059
782312	contig_4600_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_174019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTAAAAGGTGCACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204997	204674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4600_pilon_-_204700_205000
782317	contig_9297_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_69831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGAAAAAAGAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564650	565217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_564600_565200
782318	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782322	contig_14341_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_111789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGACTGCCCAGTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347630	346424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_346400_347600
782323	contig_7963_pilon	+	1512	4	Intergenic	novelGene_58399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	997.020561473032	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3	416	51405	57937	FALSE	40	AAGTCATATTCTATTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVVIIPHNVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51402	59033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51432_57298_57374_57406_57564_57782
782324	contig_6375_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_72923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAACCAAAAGGTGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16548	17460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16500_17500
782330	contig_18113_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_137522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87638	85248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_85200_87600
782336	contig_10013_pilon	+	1970	13	Intergenic	novelGene_125072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1644	1967	461201	462973	FALSE	20	CTCATGCTGATGACGTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDVFIGRVGHTAMLHLCPACLQVAIPELVAARQQLERPLIQLIEPGLRGTLFELDVAEPAFDGERVPHDLLLVGEVLLLEDKIRPLGPRDPRHHHHFPVSPDTG	454216	462976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_454538_455386_455502_455585_455724_455817_455943_456424_456548_456623_456769_457206_457357_458529_458696_458782_458918_460673_460872_461173_461298_461568_461717_462894
782337	contig_18096_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_58061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTATTGTTACTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121455	119705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_119700_121500
782338	contig_854_pilon	-	1190	2	Intergenic	novelGene_36090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGGTGTCCTGGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5442	2942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_3425_4734
782340	contig_10549_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_110619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGAATGTGTGGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217469	216964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_217000_217500
782342	contig_19076_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_74217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACAGGAGAATAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116497	119052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_116500_119100
782346	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782349	contig_4857_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_48790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATCTTCGTTTAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237069	1238551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1237100_1238600
782350	contig_4845_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_53687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAGGGATAAAATAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839851	841736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_839900_841700
782353	contig_7396_pilon	+	1793	12	Intergenic	novelGene_79616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGATAATGGCGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245934	257436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246400_247178_247357_247718_247803_248184_248284_248742_249062_249736_249861_250230_250355_251447_251550_253919_253979_254604_254699_255103_255193_257380
782355	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	159	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782361	contig_12837_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_57389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	49	390	393815	394156	NA	15	CGGAACCCTGGTGGCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCCLWWLAYCLDARSYATSISSISSHPWWTGFSGASRLRQNGKKSLVIYSQKLTNENLMNHHRILSDIVLEDESLRLEGTTLTAATMYSNIPKIMKMAQDQQHFVLLYIMSP	393766	395206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_393800_395200
782362	contig_5229_pilon	+	1896	2	Intergenic	novelGene_117705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTTTTGTCTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648017	651267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_648376_649729
782363	contig_6325_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_143354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCTTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371302	370906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_370900_371300
782368	contig_9366_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_166229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710849	712966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_710800_713000
782369	contig_1399_pilon	+	2044	7	Intergenic	novelGene_166665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGCAGCTTCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74332	96347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_74594_81882_82220_83952_84142_87122_87248_88845_89022_92507_92706_95589
782371	contig_7022_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_142146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154091	155707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_154100_155700
782374	contig_18039_pilon	+	2074	6	Intergenic	novelGene_171249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	8	junction_1	88.0636133712443	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	306	641	198438	204795	FALSE	15	ATGACTCCCTTCCTCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSQRLLTFRDVAIEFSQEEWDYLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLGISPSEINIISILKKGTEPWTVEKETKLAKKPRFGGPGGHVHREKPTDDGFGTCQPPQLREPFP	196172	206228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_196217_197219_197413_198369_198453_201831_201959_202444_202542_204698
782377	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782381	contig_935_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_45541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339294	341755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_339300_341800
782383	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782386	contig_2480_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_63539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCACAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257407	255867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_255900_257400
782388	SIRV2	-	475	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	25	327	25	-327	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCATTGTGATCTACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5870	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
782389	SIRV2	-	192	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	688	68	688	-46	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCTACTGCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
782390	contig_10855_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_124310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	3	344	315142	314801	NA	15	GGGTCATATGGCCGCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSISKHFRVCGVRAGPRDPWARQGGRPSRHQQDLFQVIPKQSSQAVPRSDLLVWLRGSSPSSRVAPRLCSDNGTGRRRQDPGDEGSRRRRKLGTPPPSCCPPHSPRIHSSLLTG	315144	314799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_314800_315100
782394	contig_1274_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_137815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	227	304	496922	496999	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLFRVYRPSAGPALHDSTAAFSSTLSTCDNPRSVFQKCVEIFHLLVTANSHYCSLSFGFTPLHEFIPFLYFYISVMSGKECFESIKKLNFHSFCLGNSAL	496695	498463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_496700_498500
782401	contig_6710_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_97326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
782402	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
782403	contig_19851_pilon	+	966	6	Intergenic	novelGene_29859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2638.66299477595	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53477	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53599_54054_54146_54606_54717_55650_55741_55852_55882_56006
782405	scaffold_6394_pilon	-	1213	8	Intergenic	novelGene_110951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	78.2111219190515	502	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	108	683	136081	132366	TRUE	5	GGAGTCCTGTCCTTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDIQCECLSDTQWKELLPQMQQVEVIRLDDCGLTEVRCEDISSALQANPSLTELSLHNSGLGDAGLRRLLQALQGPARKIRKLSLQNCSLTAAGCTALPGALRSLPSLLELHLSDNTLDEAGLRLLSQPGGQRAGGPGCTAAVQGPEGAGLSAGVTVGEDLRPHACLLPRLQCDAGPEQVPPGVAAEQQ	145790	127883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128171_128360_128532_132293_132465_132715_132808_134575_134704_134926_135098_135995_136102_145703
782407	contig_14426_pilon	+	1826	4	Intergenic	novelGene_170623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	3.29983164553722	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	176	1210	128596	135751	FALSE	20	GGCTGATGTCCAGATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVLDSDQAKKQKRLVEEMAPLKTVQEQQVQLKYEVPKPEQEKDEERRNENGKLVIETDSCRGVESSGKISEPVEACYEYSNLERQQAKPMEKPDYKCSRCGEGFVQHSDLIKHEGVHMGEELCDSEVCHSSILTGHQKIRSREKGHQCHQCGKAFQRSSHLVRHQKIHLGEKPYQCKECGKVFSQNAGLLEHLRIHTGEKPYLCSHCGKNFRRSSHLNRHQRIHSQEEPCECKECGKTFNQALLLTHHQRIHSHSKSHQCNECGKAFSLTSDLIRHHRIHTGEKPFKCNVCQKAFRLNSHLAQHVRIHNEEKPYECNECGEAFRQRSGLFQHQRYHHRDKLA	123712	136367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_123826_128533_128611_129326_129445_134849
782408	contig_2596_pilon	+	1566	5	Intergenic	novelGene_53487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	92.4374788708563	564	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	691	1155	729054	739160	FALSE	35	CTAGATTTGGTAAGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFTVASAVRAASGILRPLNILASSAYQTYAKKACLISALSTRCFSHIQMPVVSSAPRLTTPVGNLTCRHTTIILNRVAPLLPNILKLPVRTVTYFSSRKGKRKTVKAVIYRFLRLHSGLWLRRKPSVRITSFQRTCQPPWKSVLSSHWTNKP	722722	739571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_723380_729020_729097_735202_735393_736062_736208_739073
782413	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_93727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
782415	contig_12622_pilon	-	376	3	Intergenic	novelGene_5792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAACCTCAAAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307985	279260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_279447_282160_282330_307964
782423	contig_18869_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_56395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGCACTACCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73381	73592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
782430	contig_6451_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_173706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGATTCCCAGCAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174801	175420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_174800_175400
782432	contig_6494_pilon	-	616	6	Intergenic	novelGene_108582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1673	junction_5	473.442287929585	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	30	614	8286	2782	FALSE	35	TAAGATTGGCCCTAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPS	8315	2779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
782433	contig_17753_pilon	+	1688	5	Intergenic	novelGene_105048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	373.670309229941	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGGGAAAAAAGAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45441	138185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96231_130836_131596_137748
782438	contig_9656_pilon	-	1534	3	Intergenic	novelGene_121898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGACATGTTTAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101207	96139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_97333_100608_100766_101023
782444	contig_16098_pilon	-	622	10	Intergenic	novelGene_45795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	309.97124518172	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	219	347	35038	34731	TRUE	20	CCCTAACTTATTGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYL	35940	31223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_34722_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907
782452	contig_817_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_132464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCCAAATCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621564	619129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_619100_621600
782453	contig_3789_pilon	-	1449	6	Intergenic	novelGene_79817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_5	16.280049139975	325	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	58	681	179382	155029	FALSE	25	CTGGCATACAGCACTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDGPAAAASWYQPASPPREACVYSSCYCEENVWKLCDYIKNHDQYPLEECYAVFISNERKMIPIWKQQARPGDGPVIWDYHVVLLHVSSGGQSFIYDLDTVLPFPCLFDTYVEDAFKSDDDIHPQFRRKFRVIRADSYLKHFASDRSHMKDSSGNWREQPPPYPCIETGDSKMNLNDFISMNPEVGWGAVYTLSEFVHRFGSKNY	179439	154260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_155139_159879_160005_164514_164664_169288_169340_172991_173092_179293
782455	contig_12638_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_33288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086838	1087997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1086800_1088000
782456	contig_938_pilon	+	637	4	Intergenic	novelGene_143910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_3	269.792924707492	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	399	416	68947	68964	FALSE	20	TTTGTTCATGTATTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIESVLPAEPEASESTADENEDDIQFVSEGPLRPVLEYIDLVSSDDEEPSTSHSDENVKHKDYIENQQDKVALTLARLARHVEVEKQQKEEKNRAFREKIDFQHAHGLQELEFIRGHSDTEAARLCVDQWLKMPGIL	24835	69185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_24922_32069_32151_64172_64299_68841
782457	contig_938_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_143912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCAACTCTAAATATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69148	71038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_69100_71000
782459	contig_6710_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_97657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653810	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
782473	contig_821_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_149381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTAGCTCCTCTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42263	41914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_41900_42300
782474	contig_12964_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_131664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGGAGTCCCTGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147970	146072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_146100_148000
782475	contig_12964_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_131663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAATAACAAAATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145674	144982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_145000_145700
782477	contig_15410_pilon	-	1082	3	Intergenic	novelGene_130565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	27	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	334	414	51028	50948	FALSE	50	TAAAAATAAAAGCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLHLRLRSQYFQECQLCHWYVRPLHTLLSALVVAVALGVLVWAAETRAAVRRCRRSHPAACLVAVLAVGLLVLWAVGGACTFLLSIAGPVFLILVHASLRLRNLKNKLENNMESIGLKRTPMGLLLEALGQEQEAGS	54687	50279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_51088_51485_51704_54631
782480	contig_2311_pilon	-	2115	2	Intergenic	novelGene_169820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	51	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTTGGAGCTCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476938	456529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_458526_476819
782485	contig_15407_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_123051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTATTATACATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350340	352200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_350300_352200
782486	contig_13460_pilon	-	1747	4	Intergenic	novelGene_162175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	0.816496580927726	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	91	552	106002	94274	FALSE	35	ATAAAATTATTTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPEAAAGAEEARGGGCHCPGDGPRRPPPPLGPESSTPWRPWSCSGAAERVRTGRQLEPGGDQQTFGSKGAFGFQHPVRLYLPISKRQEYLQSSGEKVLASFPVQATIHFYNDESDSDDDEERGEELQPSALRCQETEGSAGSGPGGGSAGTT	106092	93078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_94500_98967_99036_104964_105029_105898
782487	contig_9053_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_87949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCCATAATTCATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289587	291652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_289600_291700
782488	SIRV6	+	175	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	555	53	555	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10792	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782493	contig_6159_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_128245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAAAATGGTGAAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161633	162375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_161600_162400
782494	contig_6159_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_128246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGAAAGAAGCATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162499	162768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_162500_162800
782495	contig_7622_pilon	-	2072	16	Intergenic	novelGene_132419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	189.081522688554	3	121	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	215	1825	297961	269125	FALSE	30	TGGCTATAGGAAATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLQGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	306651	268877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
782500	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	51	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782503	contig_12270_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_113331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	13845	14364	FALSE	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13842	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
782508	contig_15732_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_88917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365057	363088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_363100_365100
782513	contig_11448_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_66394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430051	431127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_430100_431100
782518	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
782520	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	46	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
782523	contig_14499_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_174023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCGTAAATTCTGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98737	100835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_98700_100800
782526	contig_8677_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_174036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCTTGTGGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150618	152674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_+_150600_152700
782528	contig_1146_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_84829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGAAAAGGTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849911	848927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_848900_849900
782529	contig_7272_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_25419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCTGTATGAATCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911666	909187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_909200_911700
782530	contig_10436_pilon	+	1457	8	Intergenic	novelGene_108515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	12.9772170847723	274	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	301	1203	111967	118324	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAACTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSLLALRGFVLLRDSVECEGRSLLKALIKKSALCGEQVHILGCEVSEEEFREGFDFDINNRVVYHNLFRDPLNWSKTEEALPGGPLGALRALCRRTHPGPVTIALDSLSWLLLHLPCTTLCQTLHALSHRDFCPDGSSSVEQVCVLGLLHEELHGPGLVGALSSLAQAEVTLSGMLSQTSASIVYRRPRQRPTRQTQCFSILPDFSLNLQGVLPLESQPHPGPPTTQVDPTTHLTFNLRLSKKEKEAKDSLTLPFHFSSEKQQALLCPGPGQATSRIFYEPDAYDDLDQEDPDDDLDI	111666	118578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_112013_112254_112316_112401_112483_114548_114770_116488_116671_117196_117293_117434_117536_118209
782531	contig_9332_pilon	-	2191	6	Intergenic	novelGene_60741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACAGCAAGCATTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618088	598176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_598330_610125_610283_612192_612287_616017_616236_616337_616415_616596
782536	contig_383_pilon	+	1737	10	Intergenic	novelGene_126131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	400.325083949915	20	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	103	798	148663	155382	TRUE	30	TATTCATGTGGTTAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMVCLMLLSESQNQPRVTIPMVMTVFF	145199	169455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155412_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
782539	contig_1274_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_137785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATATGTTCACTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85547	85297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_85300_85500
782540	contig_1274_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_137784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGAAGACATTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83038	81313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_81300_83000
782542	SIRV6	+	382	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	618	11	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCGATCAGCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
782545	contig_5039_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_64899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACTTGGAGGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606947	606524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_606500_606900
782548	contig_10104_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_160129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCTAAAAACTGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397259	399978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_397300_4e+05
782549	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGGCTAAGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
782551	SIRV2	-	240	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	688	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
782558	contig_18869_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_56047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTCCTTCACATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
782559	contig_8145_pilon	-	1921	8	Intergenic	novelGene_118654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	39.7492138287036	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	83	1156	843611	812258	FALSE	10	TGTCACTTCTGTTTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVWSLVSRLVFGPGPAVAVDGGGICWAMSAFEKPQIIAHIQKSLNYTVFDCKWVPCSAKFVTMGNFARGTGVIQLYEIQHGELKLLREIEKAKPIKCGTFSATSLQQRYLATGDFGGNLHIWNLEAPEIPVYSVKGHKEIINTIDGVGGLGIGEGAPEIVTGSRDGTVKVWDPRQKDDPVANMEPVQGENKRDCWTVAFGNAYNQEERVVCAGYDNGDIKLFDLRNMSLRWETNIKNGVCSVEFDRKDISMNKLVATSLEGKFHVFDMRTQHPTKGFASVSEKAHKSTVWQVRHLPQNRELFLTAGGAGGLHLWKYEYPIQRSKKDSEGVEMGVAGSVSLLQNVTLSTQPISSLDWSPDKRGLCICSSFDQMVRVLIVTKLHKI	843693	811492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_812466_814455_814554_817273_817409_818326_818443_828182_828285_830586_830718_835079_835181_843428
782560	contig_9955_pilon	+	2135	9	Intergenic	novelGene_21393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGGAGGGTGGAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716711	742460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_717826_724807_724967_726798_726960_728598_728698_735073_735216_735592_735662_740267_740365_741189_741344_742320
782561	contig_12157_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_135925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	82	303	228744	228523	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSILKISFRGKRLFISLSPLSWRNTARMLLKSEDGKTFTYFGHVTRRDQSLKKDIMLGKVEGSVKKRKTVNEVGSNIPTIVRMVQDQAAFHSIIRWVTMS	228825	226874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_226900_228800
782563	contig_8616_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_72498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327602	328641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_327600_328600
782564	contig_8328_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_174043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCTCAATTTGGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74675	76623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_+_74700_76600
782565	contig_12886_pilon	-	755	2	Intergenic	novelGene_135541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGGTGGAAATGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886019	884934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_885066_885395
782566	contig_19769_pilon	-	488	3	Intergenic	novelGene_102329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	89175	88018	FALSE	20	ATGGTGCCCACCGGGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHTNHGSVG	89356	87860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_88039_88840_88958_89163
782567	SIRV6	+	244	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10581	1	1344	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11581	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
782569	contig_3627_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_78428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCTGACTTCTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220425	221261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_220400_221300
782571	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	298	-74	-298	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATGCTAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
782572	contig_11507_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_103346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	33.4149667065523	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	147	725	1165	21461	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRVVCICLGNPPETFTWEYRDKDKNYQKIGPITPLEFYREHVKPVFDMENKVCLVNDPRPQHKYNKLYTVDYLSNMVGGRKTLYNNQPIDFLKKMVAASIKDGEAVWFGCDIGKHFNDKLGLSDMNVYDHELVFGVSLKNMNKAERLTFGESLMTHAMTFTAVSEKEDQDGVFLKWRVENSWGEDHGDKGYLCMTDEWFSEYVYEVVVDKKHVPEEVLAVFEQEPIVLPAWDPMGALAE	1018	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_1177_2068_2228_2345_2414_3695_3814_7753_7824_21309
782573	contig_7695_pilon	-	2759	3	Intergenic	novelGene_41580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	111	16	143	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	463	2118	391241	388811	FALSE	15	TGGGGCAATTTGCAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	395857	388169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793_391259_395412
782579	contig_14441_pilon	+	1070	5	Intergenic	novelGene_100632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	4	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	457	885	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111289	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113003_113209_116578_116963_117220_117344_117539
782586	SIRV4	-	267	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1256	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3902	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
782587	contig_16103_pilon	+	1527	10	Intergenic	novelGene_118791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	28.4986462749755	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	82	1269	584607	588701	FALSE	25	TTGTATCCAGGGAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFGNSDLLDVWLEPPEDVFSTGSFLELGLHCPPPEVPLTRQQEQGLQGWTSSGGHGCGLQESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSESGISEDPGHPDSPPAPRAPSSPALYEVVYEAGALESMQGEVGPAVGLISIQLDQWSPPFMMPDACMVSELPLDAHAHILPRAGTIAPAPPATLRPCQTLFLTDEEKHLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQTKVQELERRNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLVLIILPSLSPFQGLPEAGPEDYQHHGVVSRNILTHKDMPENLETLLVESRLRGPSGAKGTNGSMRTRPEKMAGKTGPSRLLRTVLHADEM	584334	588959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_584412_584602_584781_585218_585466_585619_585742_587393_587487_587617_587725_587848_587918_588040_588126_588276_588374_588507
782590	contig_9696_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_68756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGTCAACAGTTACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119967	121737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_120000_121700
782596	contig_6164_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_121309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782357	784213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_782400_784200
782598	contig_18533_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_174054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTGAAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176219	178820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_+_176200_178800
782599	contig_4364_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_90	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878072	876229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_876200_878100
782600	contig_14925_pilon	-	983	5	Intergenic	novelGene_55204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	1551.90318641338	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	199	456	29675	27020	TRUE	30	GGAAGAGCAAAGGCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLTFGAGTPVIVRANIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	53831	25800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_53785
782603	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782606	contig_3817_pilon	+	1864	6	Intergenic	novelGene_78360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	122.26757542374	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	35	982	600174	632895	FALSE	30	TATCACACCCCAGACATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDGAVPLPESRREIEELLAEAKYYLVQGLVEECQAALQNKDTYEPFCKVPVITSSKEEQKLIATSNKPAVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDNMLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVSTLKDSSEWLFWIMYLYNLSFHFSRIKLLVAVESAATHGSPMYNRTKHCAIFTIVDRFESIVAATVYFECFLI	600139	633777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547_612762_627206_627377_630762_630850_631177_631231_632474
782609	SIRV2	-	535	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1100	2	-63	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGACGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4795	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
782611	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
782613	SIRV4	-	314	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1192	15	1192	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3966	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
782614	contig_15063_pilon	-	935	3	Intergenic	novelGene_13904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	227	550	35891	35108	TRUE	40	AGGACCCAAGAGTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36117	34610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839
782615	contig_3095_pilon	-	1151	5	Intergenic	novelGene_75211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1495.41975712507	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	23	964	255481	246561	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGKELWREPGAPALTPEDILTGIASCSSVMSASSLLRVLAACVCLVPLGDLSPSVVLAQLPGHLL	255503	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247833_247970_248476_248747_253535_253806_255384
782616	contig_2863_pilon	+	2589	1	Intergenic	novelGene_174066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2186	2542	244455	244811	NA	15	TTCATCTTGTTTTGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQTECSLEARMVRLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQGKRGRPSTRHTDTVAATMGSSITTIVRTAQDRAVFHSVVHGVAVRMAQDRALFCSVVHGVPVSRNRLEG	242269	244858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_242300_244900
782618	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
782620	contig_1331_pilon	-	1232	4	Intergenic	novelGene_37841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1229.42299022301	3	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	6	476	169924	160009	FALSE	35	AGCATATACCTGTGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIMYLNNRENISDPTSPLRTEFVYLFFSCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169929	159252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160229_160885_160942_166402_166534_169860
782621	contig_10734_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_51143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887915	892718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_888124_890623
782624	contig_9807_pilon	+	1508	5	Intergenic	novelGene_32920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	542	junction_2	290.004633583672	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	575	1309	147193	156903	FALSE	40	AGCAGCCACATTTTAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQGDSVPRLSLPRQGSWAPSIPLSFCTVVLVEAGLPLLSGQHQVLC	146618	157102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624
782625	contig_1294_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_174067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	611	1833	89	1921	112289	110457	NA	55	TTATTAGAGAGAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTTIGRIIGQKLGCCVIDVDNDILEKTWNMSVSEKLQEVGNEQFLEEEGKAVLNFSASGSVISLTGSNPMHDASMWHLKKNGIIVYLDVPLIDIINRLKSMKINRIVGQNFGTPMKDLLAFRRQYYKKWYDARVFCESGASPEEVADKVLNAVKRYQNVDSETFISTRHIWPKNCKQKNSTKFFSEAVIEGLASDGGLFVPEKEFPKLSSGEWKGLVGATYIERAQILLEKCIHPADIPAARLGEMIETAYGKNFACSRIAPVRHLSGNQFILELFHGPTGSFKDLSLQLMPHLFAHCILPNCNYMILVATSGDTGSAVLNGFSHLNSNDKKRIAVVTFFPENGVSDFQKAQIIGSQKENGWAVGVKSDFDFCQTAVKRIFNDSDFTGFLTVEYGTVLSSANSINWGRLLPQVIYHASAYLDLVSQGFISFGSPVDVCIPTGNFGNILAAVYAKLMGIPIRKFICASNQNHVLTDFIKTGHYDLRERKLVQTFSPAIDILKSSNLERHLHLMANKDGQLMTKLFNQLEDQCHFQIEKILVEKLQQDFVADWCSEEDCLAAINSTYNASGYILDPHTAVAKVVADRMQDKTCPVIVSSTAHYSKFSPAIMQALKIKEINQTSSSQLYLLSSYNALPPPHGA	112377	110456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1294_pilon_-_110500_112400
782626	contig_1516_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_49917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAAGTACACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78244	77688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_77700_78200
782629	contig_5018_pilon	-	1610	11	Intergenic	novelGene_46990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_9	52.4171727585531	116	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	298	1473	653432	643667	FALSE	15	GTCCCTGCCTCCAGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERKGVNKYYPPDFNPEKHGSLNRYHNSHPLRERARKLSQGILIIRFEMPYNIWCDGCKNHIGMGVRYNAEKKKVGNYYTTPIYRFRMKCHLCVNHIEMQTDPANCDYVIVSGAQRKEERWDMEDNEQVLTTEHEKKQKLETDAMFRLEHGEADRSTLKKALPTLSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRAKKKAIKEEEERDQALQTKASLAIPLVPETEEDRKLAALLKFHTLDSYEDKQKLKRTEIISRSWFSSASGSGAGSGNSKAGSVLKKLAQNRRSTAASSPITVGDLGIVRRQSREVLESPQDASGTPKSREPQVPKGTVQDRPTFPQDCSQETAETPESCCQDRPLPPQGSPQEAADTSDAPHPCSLSTSLVADYSDSESE	656289	643529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_644131_644237_644377_646983_647157_647239_647383_648077_648139_649914_649971_650897_650981_652225_652280_653429_653656_655111_655157_656260
782631	SIRV2	-	278	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4595	34	3420	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
782633	contig_2757_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_164589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAAGCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246374	244683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_244700_246400
782635	contig_6608_pilon	+	2559	20	Intergenic	novelGene_162538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	10.4338040008416	69	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	953	2161	237866	244895	FALSE	15	CTTTTGGTTCTCTTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNWEVYKLLAHIRPPMSKAFSHTIAVMNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEKISANITKFNIHGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQYDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFTVGADTALNTICMTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEDPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWISGKIKESYRNGRVFANSPDSGCVLGMRKRALVFQPVTELQDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHISQKRSGETPV	218806	245293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_218893_222004_222102_230156_230231_231091_231170_232619_232810_233291_233458_234171_234217_234626_234736_234808_234909_237858_237923_238859_239010_239456_239528_239882_239971_240056_240210_240703_240869_242279_242342_242582_242695_244222_244323_244402_244509_244750
782636	contig_5479_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_133607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331885	329877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_329900_331900
782638	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
782639	SIRV1	+	177	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTCCCACAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6454	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
782641	SIRV6	+	323	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1692	584	-244	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
782642	contig_11994_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_129355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACCACAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95869	97041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_95900_97000
782653	contig_2204_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_71690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTCTCTTTTTTTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53996	54504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_54000_54500
782655	contig_4125_pilon	-	1041	7	Intergenic	novelGene_25055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.4081797891017	145	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	19	822	352343	349515	FALSE	15	TGGGTCTCCTGTGGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRRLRMCAGTQLAVPCMALLLLALALSCAATLNCKGPTYPSGSRCCHECQPGYGMESRCDHSRDTVCQLCKPGYYNEAFNYEACRPCTQCNERSGSEPVQSCTSTRDTVCHCRPGTQPQGGYKPGVDCAPCPPGHFSPGHNQLCKPWTDCTSTGKRTLQPASNSSDAVCEDRSPLATTLPWSTQYPPPLSTSAQPTTAQPGASQKPPEAPTGPPRGPALAAILGLSLGLGLLSALAAVLVLVLHRQAWRPPPTAVKPPWEQQLPDPHPRGAR	352361	349295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_349558_349640_349771_349866_350067_350919_350987_351161_351264_351806_351930_352204
782658	contig_12299_pilon	-	2202	8	Intergenic	novelGene_29745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.1192734371145	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	325	1248	354891	275506	TRUE	15	TACCTTATGTGAGTGGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDFISISMLSLAMLVGCYVAGIIPLAVNFSEERLKLVTVLGAGLLCGTALAVIVPEGVHALYEDILEGKHHQTSETQNVIASDKAAEIPVVHEHEHSHDHTQLHAYIGVSLVLGFVFMLLVDQIGSSHVHSTDDPETARSSNSKITTTLGLVVHAAADGVALGAAASTSQTSVQLIVFVAIMLHKAPAAFGLVSFLMHAGLERNRIRKHLLVFALAAPVMSMVTYLGLSKSSKEALSEVNATGVAMLFSAGTFLYVATVHVLPEVGGIGHSHKPDTTGGRGLSRLEVAALVLGCLIPLILSVGHQH	355215	271823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_271969_274696_275737_277431_277567_278093_278180_281081_281151_289529_289728_324112_324222_354795
782660	contig_6842_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_130784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	917	1285	1383490	1383122	NA	30	AAAAGCTGAGCTCTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAGLGQSAGSLTALRRPPAWPGQMVTWLLQRSLQRFGRCLPLMWDGRSALAGLQWVPCGLRVRSASDVECGLPAAGPRLLCTEAFLLQEGRENAPPPELSLLCQIFPCTVLGQKCCLVLL	1384406	1382376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1382400_1384400
782662	contig_9516_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_106165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	17	382	836524	836159	NA	30	CGCCCAGCAGCACTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASNGMDDIHQVWPQSPKHSQLAWIMARQTDRQPASDPASLTADQSANIDQAPTMLRALGLLANQTVCQLVTHVARQWALGSHVVSQLSECNYVAHVATKPAKQLLSRSAELLASQQCGPSAQGVD	836540	833972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_834000_836500
782663	scaffold_19766_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_34445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGCCTTGGCCCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854741	855779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_854700_855800
782667	contig_14666_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_39671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTATCCTTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495340	493590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_493600_495300
782669	contig_6102_pilon	-	2548	13	Intergenic	novelGene_32051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	53.5534520103254	6	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	239	1915	571141	558013	FALSE	40	CAAAAATATTATTGGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFEGLDPGLAEYAPAMHSGLDSVLDAHLNPSLLQNVELDPEGVALEALPVQESVHIMEGVYSELHSVVAEVGVPVSVSHFDLHEEMLWVGSHGGHATSFFGPALERYSSFQVNGSDDIRQIQSLENGILFLTKNNLKYMARGGLIIFDYLLDESEDMHSLLLTDSSTLLIGGLQNHILEIDLNTVQETQKWGAARAEEEHGVCVYDLMATVVHILDSRTGGSLVAHIKVGETYHQRKEGVTHQQWYLFNDFLIEPIDKHEAVQFDMNWKVPAILYYVKRNLNSKYNLNIKNPIEASVLLAEASLARKQRKTHTTFIPLMLNEMPQVGDLVGLDAEFVTLNEEEAELRSDGTKSTIKPSQMSVARITCVRGQGPNEGIPFIDDYISTQEQVVDYLTQYSGIKPGDLDAKISSKHLTTLKSTYLKLRFLIDIGVKFVGHGLQKDFRVINLMVPKDQVLDTVYLFHMPRKRMISLRFLAWYFLDLKIQGETHDSIEDARTALQLYRKYLELSKNGTEPESFHKVLKGLYEKGRKMDWKVPEPEGQTSPKNAAVFSSVLAL	572024	557379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_558048_558363_558562_558801_558896_559566_559747_559874_560019_560117_560276_560923_561015_561244_561305_561438_561583_567061_567183_567290_567461_570859_571264_571908
782671	contig_5350_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_99355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181004	178729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_178700_181000
782673	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	65	508	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782674	contig_6109_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_160374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAAAGGTCTACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566663	567742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_566700_567700
782675	contig_2547_pilon	-	2335	7	Intergenic	novelGene_165463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	13.3666251038423	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3	455	443047	420206	FALSE	70	TTCATAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKRLAKKYYDKLFKEYCIADLSKYKENKFGFRWRVEKEVISGKGLCQECSCKLNFHHRKKEVKLKNRKDKTKKDCEESSHKKSRLSSEKETSKKKDKGRSSSKKSEDSINRNSDEEEGASESELWKGPLPETDEKSQEEEFDEYFQDLFL	443049	418325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_420249_423244_423324_429422_429462_433504_433624_435592_435636_438887_438934_442963
782680	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
782682	contig_4364_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACATCTGTGGTCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992191	991487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_991500_992200
782685	contig_11285_pilon	-	1290	13	Intergenic	novelGene_5690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.225475100838	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	25	1167	798530	784185	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHAVPTLPFTLH	798554	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784218_793851_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
782690	contig_1154_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_87069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATGGTTAAAAGCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195042	196806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_195000_196800
782692	contig_18869_pilon	-	181	1	Intergenic	novelGene_56014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73529	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73500
782693	contig_2067_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_158918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTCCCAGCTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467531	466131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_466100_467500
782694	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
782695	contig_13292_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_142978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTGTGGCTTGACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556820	557978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_556800_558000
782696	contig_8676_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_142228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATTGTGTACCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694874	695358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_694900_695400
782697	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
782698	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782699	contig_7887_pilon	-	836	2	Intergenic	novelGene_124949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	379	684	851157	850852	TRUE	30	TAACTATAGCGAGCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSILEEVQPECSLEARMTRICLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLDKVEGERKRGRPSTRWTDTVAAAVGSSITKIMRMVQDPAVFCSVVHKVTMSRNRLDST	851535	850459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_850532_850771
782701	contig_9609_pilon	+	1023	6	Intergenic	novelGene_22935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	564	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGTTATTTATTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72839	76350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_73063_73494_73592_73671_73766_75368_75561_75654_75750_76028
782704	contig_21232_pilon	+	1831	4	Intergenic	novelGene_165984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_2	364.590180888076	120	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1004	1678	18807	22578	FALSE	25	TAAGTAGTGAGTTCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGKSSSIADYTRPSSVSNIEINTTTTAAAFSWQNFDNASSMYTYRLLISGNSSNPVENITGVGTTYATVCGLIPGSSYTVEIFAQVGNVTEGASSSASFCTDAAPVNFSCEPVPREPTLVLTWALPPGNNAGFKLEVSSGACDNMTCLENCSLENGTSCMAEVTHLNFCTSYNISITTLSCGKNASSVQKTCTTDSTGGYSSRRVVRWHGGHPGMSTSVA	17526	22731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_18350_18626_18853_19552_19823_22219
782705	contig_5039_pilon	+	2103	2	Intergenic	novelGene_64840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	157	297	311469	311609	FALSE	60	CCCTGGAACAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGMYPSELNS	305516	313415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_305628_311423
782707	contig_14341_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_111872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTTGTCTCTAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638988	641193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_639000_641200
782708	contig_13700_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_68272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTCCTCATCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93122	91009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_91000_93100
782711	contig_9014_pilon	+	1047	5	Intergenic	novelGene_106789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_4	2277.09689078001	680	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	548	925	150693	152329	TRUE	35	CTTACTAGTAGATATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150145	156229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_156111
782712	contig_6102_pilon	+	2621	1	Intergenic	novelGene_32306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2099	2422	1541298	1541621	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTRTSQKACFSKKVEQTPPLEFIRGHSYSKNLPKHSKRDIFLPITFKDKGTITQRHRTETHIHQAGVDSCVMTQRRILIGDSLLPAMCVNSITKENRNHHYSHKLI	1539199	1541820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1539200_1541800
782713	contig_7635_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_171357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15810	17382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_15800_17400
782718	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	602	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
782720	contig_8464_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_125384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATGATGTGTGTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840270	841833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_840300_841800
782726	SIRV4	-	407	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1116	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4042	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
782727	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782729	contig_12638_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_33286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062562	1060885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1060900_1062600
782732	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782733	contig_6710_pilon	-	439	2	Intergenic	novelGene_98211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	35	CCCACAAAACACCTATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
782734	contig_2093_pilon	+	3607	1	Intergenic	novelGene_152989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAGACATAGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365019	1368626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1365000_1368600
782735	contig_11307_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_105251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAAGTGAATGCTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95704	96028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_95700_96000
782738	contig_1331_pilon	+	2131	7	Intergenic	novelGene_37891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	25.30316185776	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	295	1077	493706	524704	FALSE	15	GATCACTGTGGTCACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPKRSCPSPATSSEGTRVKKISIEGNIAAGKSTFVNILKQVCEDWEVVPEPVARWCNVQSTQNEFEELTTSQKSGGNVLQMMYEKPERWSFTFQSYACLSRIRAQLASLNGRLKDAEKPVLFFERSVYSDRYIFASNLYESDCMNETEWTIYQDWHDWMNNQFGQSLELDGIIYLRATPEKCLNRIYLRGRNEEQGIPLEYLEKLHYKHENWLLHRTLKTNFDYLQEVPILTLDVNEDFKDKHESLVEKVKEFLSTL	493411	525758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_493797_499154_499271_517655_517850_518837_518986_521791_521908_522643_522735_524677
782739	contig_5669_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_86090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATACTTTTCTACTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207102	206480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_206500_207100
782740	contig_513_pilon	-	1874	9	Intergenic	novelGene_80165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	547.20671368323	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	450	1334	451757	449542	FALSE	35	CCATGAAGCTGCAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSHFFFFSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRVTHVVLHLHEGPRHLMVEAVAMMITAAHVTDMVEVETVTQAAEVISTQVAVIGLADKKEGFPLLWKGGTLLHVIPTAVQAAEHQEVVAVEEADLIEGEAEADTKNKQNFGPKSLFKETKQKVETCSVITTQGLLKGKIVLLLKIFLLSSPP	454638	449001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450642_450723_450821_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452358_453009_453117_453312_453428_454593
782745	SIRV5	+	239	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	278	151	164	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8479	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
782746	SIRV6	-	190	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACTCTCTTGTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
782748	contig_1516_pilon	+	1157	5	Intergenic	novelGene_50018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	681.837361472661	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	26	523	356373	363092	FALSE	15	TGAAGCACCTGTTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	356148	363726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_356174_356372_356526_359957_360027_362129_362299_362985
782749	contig_10129_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_128174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTGAGGTTTGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649198	650535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_649200_650500
782750	contig_10399_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_114507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTAGGGGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468967	468045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_468000_469000
782755	SIRV6	+	468	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3177_10976
782756	SIRV5	+	342	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	893	-30	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
782760	contig_1210_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_171525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336421	334520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_334500_336400
782761	contig_8651_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_168180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAACAAGATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179988	179704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_179700_180000
782766	contig_7279_pilon	+	1298	4	Intergenic	novelGene_145978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	159.587663126641	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTTTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64638	74171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68880_73284
782767	contig_3956_pilon	+	1054	3	Intergenic	novelGene_14778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGAACTTATTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975831	977488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_975874_976202_976594_976867
782768	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	2	411	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782770	contig_10437_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_38096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAAGGAGCTGTAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43543	45913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_43500_45900
782771	contig_10629_pilon	+	1168	2	Intergenic	novelGene_52952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	87	614	447968	452372	FALSE	20	AACATTTTTGTGTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTQPTTIPMVLPQPESPYSRPHDSLPPPSPGTRVPAVRPRGPEGEYAVPFDAVARSLGKNLRGILAVPPQPPVDPLYDSIEEHLASRPDHIYDEPEGVAALSLYDRPQERQGEARRWQAKADRDPSGLQHVFPVGQDFSASGWPQGTEYDNVVLRKGPK	447881	452926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448019_451895
782772	contig_18342_pilon	-	1617	5	Intergenic	novelGene_154559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAACCCCAAAGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64409	26155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_-_26307_54737_54795_56448_56611_60654_60756_63263
782774	contig_5997_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_168619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTCAATAAATACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331829	332911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_331800_332900
782775	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
782776	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	231	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
782777	contig_13744_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_77203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACTTTTAGACCTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041831	1043039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1041800_1043000
782789	contig_11173_pilon	+	1490	10	Intergenic	novelGene_156902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	251.739479287812	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	490	1329	434044	450103	FALSE	15	TCATTGCTTTCATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPKPSWSRVPPRAVHLRSWGPEPHPAAPQIVDVIVGKDEKGRKIPEYLIHFNGWNRSWDRWAAEDHVLRDTDENRRLQRKLARKAVARLRKGRKKKRCRLPGVDSVLRSPSVEEKDENAENSISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVTSSGLTFIPDGSLTVLQ	430899	450264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430993_431765_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936
782790	contig_1443_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_28154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	204	116	319	292799	292596	NA	55	AATGATGCATACAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCIFAVPGTTLLDLDSPVSLRGFHAEPTRRLSTGTLRPMHPKASHSLLARVLLASLTVRARDATPSWVKEPGLRPGALLTLTSCARLVIQAHLHRQASFLPFTRP	292914	290747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_290700_292900
782792	contig_6589_pilon	-	821	4	Intergenic	novelGene_26151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGAGCCACAGCTACGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887838	1885102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1885136_1885926_1886060_1886256_1886798_1887724
782793	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
782794	contig_14684_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_99669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332974	333798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_333000_333800
782795	contig_19469_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_134990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95084	96094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_95100_96100
782796	contig_9189_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_165127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACCACAAACAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458635	456563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_456600_458600
782797	contig_14562_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_174070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAGAAAATTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25112	25621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14562_pilon_+_25100_25600
782798	contig_11338_pilon	-	1676	6	Intergenic	novelGene_6301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	160.510934206988	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	172	939	228022	209898	FALSE	35	ATAAATATAAGGGGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGAGSGGGQNGSWLRIAALRHANVKSVSSDHLDAKVTQFTPPLFTLTFNSNRPPPPPMSFTDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQERLSLEKDIVLGNVEGQ	228193	209160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_209952_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965
782804	contig_20157_pilon	+	1103	9	Intergenic	novelGene_145863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.716801427435	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	333	959	48801	53749	FALSE	20	CGCCATCTTATGTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTRWPHRLRQRVLLPPLQPQHRLRRRLQPQPQLRLRPRPRLQLLLLPLRHPLRLHPVILASIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDMEFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHLTVDTSLQNGRMSIKAYVSTLMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVDLIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSADNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIALNEKLVNL	40951	53893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_41111_41244_41335_48495_48567_48788_48869_49551_49690_51049_51142_52576_52714_52849_52964_53671
782808	contig_10235_pilon	-	1010	4	Intergenic	novelGene_46293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	50.5239217269074	4152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	99	833	85430	83647	FALSE	40	TAGATGCTGAAATGCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALGLEGRGGRPQGRGCLLLAVAGAIVLGSVVLSVPITVLTVLALVPQERGGLVTETADLGGQTQQQLEFQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGSWKTGQGLGWETKKEEAFLRSGTQFLGAEGLALPQDGLYYLYCYVGYRGRAPPAGRGPLGRSVTLRSSLYRAGGAYGPGIPQLLLEGAETVTSVLDPARRHEYGPLWFTSVGFGGLVQLRRGERVYVNISHPDMVDYRRGKTFFGAVMVG	85528	83469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84102_84567_84640_84830_84877_85268
782809	contig_10163_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_82651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGCCCAAAAAGGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182490	183344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_182500_183300
782812	contig_5965_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_154666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACATTAAATAGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217331	218338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_217300_218300
782813	contig_5965_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_154669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCTGGAGATTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218595	219132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_218600_219100
782814	contig_10057_pilon	-	695	5	Intergenic	novelGene_162340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	161.187003198149	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	275	694	63521	35444	FALSE	75	AGAAGAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAK	64958	35442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63670_64832
782815	contig_7775_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_37468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96810	97956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_96800_98000
782816	contig_383_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_126156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACTATATTAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420038	421174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_420000_421200
782818	contig_8823_pilon	+	2136	6	Intergenic	novelGene_53057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	43.1972221329104	453	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	522	830	84378	84686	FALSE	10	TACCTGTGCGTCTGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	51772	85992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_76219_76301_76878_76985_77800_77899_84353
782819	contig_15888_pilon	-	1064	7	Intergenic	novelGene_84409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1782.07909944162	13	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	199	558	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGVGGRTRRYGGGAARGSLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259757	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251817_252020_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_259702
782821	contig_11498_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_65537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATAGCCTTCTGTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296107	297014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_296100_297000
782823	contig_8291_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_99948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAGTTGGTGGAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314692	313931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_313900_314700
782825	contig_5261_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_102464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCTAAAAATTTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510869	508818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_508800_510900
782826	contig_4496_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_66689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939471	938051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_938100_939500
782827	contig_13718_pilon	+	2241	6	Intergenic	novelGene_142902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_2	179.076966693095	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	738	1463	255164	273278	FALSE	25	AATTTTACTGTCTAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNPAAIDMFIIGATFTDWFTSYVNNVVSGGFPIIRDQIFRYVHDPECVATTGDITVSVSTSFLPELSSVHPPHYFFTYRIRIEMSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLEMGPDEYEEMEEEEEEEEEEDDDSADMDESDEEDEEERRRRVFDVPIRRRRCSRLF	254426	274056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_255204_256435_256521_257368_257492_262552_262669_263921_264113_273107
782829	contig_13558_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_123030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCATGGAAAATTCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519404	518703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_518700_519400
782830	contig_10494_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_102196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	260	466	1057678	1057884	NA	25	GCGACATATCCCTGGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLQLETAAICLCSPCLLSIPHAQGLLGPRGRGCAAKAQVRPTWLPVGCETLGKSPGLPANLRVLSSLHWAAYDVGDAQQSRHRGACMRTAPCPSDAASAQGLLIKKETWPTIPTALQEGRKEGRFLPARECSQGQEAFVGHGQVREEWPGHALR	1057418	1058815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1057400_1058800
782832	contig_5690_pilon	-	2536	1	Intergenic	novelGene_119669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150558	148022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_148000_150600
782833	SIRV6	+	522	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	19	20	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782834	contig_12793_pilon	+	1779	2	Intergenic	novelGene_164124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTACTGACCAAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248121	251231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_248370_249700
782836	SIRV1	-	207	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5595	3564	-146	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATGAATATCTGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
782837	contig_12270_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_114088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	21	308	14409	13899	FALSE	30	AGCAGCTTCCAGGCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTI	14429	13898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
782838	contig_5317_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_76565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTTAATTCAAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46227	48506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_46200_48500
782839	contig_6418_pilon	+	1765	2	Intergenic	novelGene_81159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAACCAGTGGCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299175	301058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_300020_300137
782840	contig_10093_pilon	+	1406	14	Intergenic	novelGene_147502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	118.696221083101	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	128	1174	73276	125260	FALSE	40	AACCCATGTTTAACTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRSTHRLIWRDQKNHECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKSAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEFYRRLSEEMTQRRWETMPVSQSLQTNRRPQSGRIRAVGIVGIERKLEEKRKETDKNISEAFEDLSKLMIKAKEMVELSKSIANKIKEKQGDITEDETIRFKSYLLSMGIANPVTRETYGSGTQYHMQLAKQLVGILQVPLEERGGIMSLTEVYCLVNRARGMELLSPEDLVNACKMLDALKLPLRLRVFDSGVMVIELQSHKEEEMLASALETVSEKGSLTSEEFAKLVGMSVLLAKERLLLAEKMGHLCRDDSVEGLRFYPNLFMTQS	73148	125492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90968_91006_93068_93140_101699_101815_102834_102925_103664_103752_108824_108858_108972_109051_109680_109816_118733_118800_122855_122921_123505_123591_124997_125075_125166
782842	contig_10930_pilon	+	1112	5	Intergenic	novelGene_37087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8285.16256252706	9	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTTTTGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339417	342105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339467_339770_340055_340505_341098_341522_341625_342020
782844	contig_10324_pilon	-	1548	6	Intergenic	novelGene_7922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	17.2557236880984	273	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	231	1214	929627	927701	FALSE	10	GGCCTAGCGTGTGCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWTALLTLVLQASLVLPLAESAAPALRFVAVGDWGGVPNAPFYTAREVASAKEIARTVQTLGADFILSLGDNFYFSGVQDVNDKRFQETFEDVFSARSLHNVPWYVLAGNHDHLGNVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKVPRTNVSLAIFMLDTVTLCGNSDDFLSQQPERPRDLMLARTQLSWLKKQLAAAKEDYVLIAGHYPVWSIAEHGPTRCLVKQLQPLLATYGVIAYLCGHDHNLQYLQDEKGVGYVLSGAGNFMDPSKRHQRKVPNGYLRFHYGVEDSLGGFAYIEISPKEMSVTFIEASGKSLFKTSLPRRPRP	931344	927366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_927944_928538_928885_929014_929143_929360_929628_929916_930004_931201
782845	contig_7171_pilon	+	1033	6	Intergenic	novelGene_101241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	415.864208606608	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	21	545	734335	764486	FALSE	10	GATTTCAGCTGTGTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSVKPVMAPLCGPRWCRALLALLGSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSWSSEDDKEHLVKNTYTL	734314	764974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760620_764431
782846	contig_8420_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_69369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCTAATTTATAGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232364	234414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_232400_234400
782849	SIRV6	+	325	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	532	14	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
782851	SIRV6	+	264	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2051	562	33	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
782852	contig_9706_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_20915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTTTTTTACTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127113	128013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_127100_128000
782853	contig_6020_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_155573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306294	308031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_+_306300_308000
782857	contig_11321_pilon	+	460	2	Intergenic	novelGene_86646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTTTTCCAGGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49804	95884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_49959_95578
782859	contig_15629_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_122463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAAAACTGGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126528	127100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_126500_127100
782863	contig_11720_pilon	+	977	4	Intergenic	novelGene_44015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	531.68746040842	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	434	736	271308	272210	FALSE	50	AATCATTCAAAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	270408	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_270803_271268_271343_271806_271961_272096
782870	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782879	SIRV6	+	360	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	488	8	315	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1618	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
782881	contig_8880_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_165756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62333	60706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_60700_62300
782883	SIRV4	-	354	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1169	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3989	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
782887	scaffold_16539_pilon	+	1798	2	Intergenic	novelGene_68336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	568	1161	438928	439521	FALSE	10	TTTGGAAGTGGTGGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGLKRKHSDLEEEEEEKWGWGPAGLRSYQQALLRISLDKVQHSLGPHAHCLRRHVLIHNTLQQLQAALRLAPAPALPPEPLFLGEEDFSLSATIGSILRELETSMDEAEHPPNPVTPPGPQDEALPQPDPVFLESLSSQYLGDSGLDDFFLDIDTSAIEKEPVLAPPEPSHSLFCAPGSWEWNELDHIMEIILGS	436990	440158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_437065_438434
782888	contig_14744_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_66020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCCAGGGCCGCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967164	966506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_966500_967200
782889	contig_1301_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_47403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCCAGTTAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791590	793207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_791600_793200
782890	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	51	516	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782892	contig_7513_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_88971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243079	241134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_241100_243100
782895	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	0	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
782897	contig_6710_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_98305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653591	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653600_653900
782900	contig_20614_pilon	-	1374	3	Intergenic	novelGene_107594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	679	junction_2	23.5	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTAAACAACCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302003	292146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_293369_295570_295693_301973
782901	contig_2704_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_75298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATAATAAGCTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68720	70341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_68700_70300
782903	contig_18869_pilon	-	1830	4	Intergenic	novelGene_56453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGCTTTTCAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168196	164225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_165666_165884_165993_167552_167713_168074
782908	contig_2799_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_85527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCTCTCCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651217	653147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_651200_653100
782910	contig_5954_pilon	-	2080	14	Intergenic	novelGene_28704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	201.333689276956	1	101	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	53	1675	975610	962496	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTRSGRVRFNGVPGRAMEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975662	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970062_970223_970883_971026_971182_971325_972040_972251_975601
782911	contig_5324_pilon	-	1861	4	Intergenic	novelGene_102048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	15.06283137026	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	315	1436	91092	61671	FALSE	10	TTCACCTGTCTCTTCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKECEHCACLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQNKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQEATVNDGEETFEDEEEIDE	93322	61245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_62732_91031_91143_92612_92766_93211
782912	contig_9216_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_163515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641876	641165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_641200_641900
782915	contig_5424_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_172810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCGATCCTGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114189	112519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_112500_114200
782916	contig_10857_pilon	+	917	7	Intergenic	novelGene_160882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1548.45672274759	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGCGCTGCCTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21844	66895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21908_59603_59662_59830_59913_61366_61447_61878_61962_62094_62198_66447
782918	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
782919	contig_10861_pilon	-	1201	10	Intergenic	novelGene_39340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	322.912096741857	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	147	1187	1492163	1489353	FALSE	5	CTTCCTCAGTTTGGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLCLELSGKRPRFLPSYRHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQALGQDRPRPGPACPPGLSHLALSAAGDNLVSCLFSSRLSIMNVSTALPLAAVGHLSLGRSAGEGVEPSEGPSLRCSLPLGGWAHLPFLLLPCRPGACRAGLRLKVSTSCPTHTSSPLLGQGGGGGGVVSRLLSPCGFWVFFLLCPGFQ	1493833	1489338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489721_1489941_1490021_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491723_1492122_1492227_1493750
782921	contig_6710_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_96789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
782924	contig_6100_pilon	+	941	8	Intergenic	novelGene_168123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	66.0086574408453	442	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	25	939	529838	656737	FALSE	20	AAGTACTGCATCTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAMRMAAAGTKLCVLVTSLGSQAARGTAVRTLCSQTVSVNERIENKRRAALLGGGQRRIDAQHKRGKLTARERISLLLDPGSFVESDMFVEHRCADFGMAADKNKNFTVFGGSLSGAHAQKICKIMDQALTVGAPVIGLNDSGGARIQEGVESLAGYADIFLRNVTASGVIPQISLIMGPCAGGAVYSPALTDFTFMVKDTSYLFITGPDVVKSVTNENVTQEELGGAKTHTTMSGVAHKAFENDVDALCNLREFFNYLPLSNQDPAPICECHDPSDRVVPELDTIVPLESTKAYDMEDIIHS	529813	656739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_530039_544839_544960_549632_549690_551680_551795_634297_634409_649660_649770_654387_654509_656655
782929	contig_8330_pilon	-	1540	8	Intergenic	novelGene_71964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	338.927239196539	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	220	942	2056301	2038853	TRUE	5	CCTCCAGTTGTTTGTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056520	2032111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2032704_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056297
782931	contig_7411_pilon	+	1606	4	Intergenic	novelGene_137053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.0988215187606	199	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	612	920	992034	1000329	FALSE	30	AATCACTGTTTTGGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSGACPFPAGPRAVAHAVGSGDTSVFPAPLRGVCSSPRGPGPRPEQRRGGFSARVWSARHHLLWPESAGLGSTACAGAGAGSSRPPLHRHRHLLSSPHQR	990044	1001015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_990430_990902_990973_991877_992044_1000030
782933	contig_4780_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_65402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAATAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412430	410869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_410900_412400
782934	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
782941	contig_14501_pilon	-	2377	2	Intergenic	novelGene_172035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	327	377	380340	380290	FALSE	5	CAGGTGGCTCTGTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAVPVEGSPDRKPPRSSLSTALSSGLEKLKTVTSGSVQPVAPAPQIGQAVEAKRLKDSGALDQSAKYYHLTHDELIGLLLQRERELSQRDEHVQELESYIDRLLVRIMETSPTLLQIPTVPPK	380926	378289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_-_380494_380753
782942	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4094	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
782947	contig_16999_pilon	+	1970	13	Intergenic	novelGene_85006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	187.305213636875	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	379	1689	219737	236848	FALSE	25	TTTTTTGTTATTTTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYATQSALSSSRPTKKEEDRPPLRGFLLDGDFFVAASLATTLTKVALRYVALVQEKKKQNSFVAEAMLLMATILHLGKSSLPKKPITDDDVDRISLCLKVLSECSPLMNDIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIVYDVSGAASDRNCVVLSDIHIDIMDYIQPATCTDAEFRQMWAEFEWENKVTVNTNIIDLNEYLQHILKSTNMKCLTPEKALSGYCGFMAANLYARSIFGEDALANVSIEKPIHQGPEAPVTGHIRIRAKSQGMALSLGDKINLSQKKTSI	211580	237129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_211676_212127_212274_213398_213440_219640_219802_220701_220823_224062_224291_224437_224618_229831_229977_230975_231096_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
782948	contig_6914_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_151723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGACACCCTTTTAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100045	99382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_99400_1e+05
782950	SIRV4	-	602	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	3	12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
782951	contig_7870_pilon	+	639	3	Intergenic	novelGene_108990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACGACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441392	497931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_441796_496464_496590_497820
782953	contig_6434_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_61855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTTTACTGTATGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802996	803290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_803000_803300
782955	SIRV6	+	175	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	51	557	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
782957	contig_5779_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_106471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAGTAAAAAAGTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132086	130638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_130600_132100
782958	contig_5779_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_106469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAGAAAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129891	129729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_129700_129900
782959	contig_9435_pilon	-	2272	1	Intergenic	novelGene_156966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGAAATGAAGAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478874	476602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_476600_478900
782960	contig_5075_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_174079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGACATCATCCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566126	566506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_566100_566500
782966	contig_10523_pilon	-	1377	8	Intergenic	novelGene_120926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	186	1049	39240	13060	FALSE	5	TGCCAGGTTGTGTCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEEELEWRG	39425	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13084_15144_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
782967	contig_4364_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_3684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533055	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
782968	contig_15063_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_14470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36451	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36500_36800
782969	contig_4812_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_103620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	160	585	18575	17168	FALSE	45	TTCCTAGCAGAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTGIKSTTSVERDDGETPGLERRRAARKAAFRTLPRHAPRPCITSDPQHDSKTPASSPREQDASEPASPPLGPRAAASQPAGAPGTQGGAWAQRGRDRDRDAPQVRRRLTDPGAPATWSKQKANAALATPPSFSLLLYCL	18734	17167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_17533_18514
782971	SIRV4	-	318	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1205	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
782973	contig_8322_pilon	+	1581	8	Intergenic	novelGene_143263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_5	79.6397500995474	148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	85	963	409542	484065	FALSE	20	CACAGATCTGGTTCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKERVKVSQNWRLGRCREGILLKWRCSQMPWMQLEGDSLYISQANFILAYQFRPDGASLSRRPLGVFAGHDEDVCHFVLANSHIISAGGDGKIGVHKIHSTFTVKYSAHEQEVNCVDCKGGIIVSGSRDRTAKVWPLASGRLGQCLHTIQTEDRVWSIAISPLLSSFVTGTACCGHFSPLRIWDLNSGQLMTHLGSDFPPGAGVLDVMYETPSTLLSCGYDTYVRYWDLRTSVRKCVMEWEEPHDSTLYCLQTDGNHLLATGSSYYGVVRLWDRRQRACLHAFPLTSTPLSSPVYCLRFTTKHLYAALSYNLHVLDFQNP	407142	484683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_407223_409537_409724_410199_410333_415561_415657_466372_466439_482911_483053_483599_483742_483945
782976	contig_12886_pilon	-	1291	9	Intergenic	novelGene_135506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.758966531383	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	82	1131	607263	592963	FALSE	25	CTTTCATGTAAATTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMELESKLNEAKEEFTSGGPLGQKRDPKEWIPRPPEKYALSGHRSPVTRVIFHPVFSVMVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHSGKLLASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSTISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHVSFSSRFP	607344	592802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_592989_594094_594231_596156_596259_597389_597619_598329_598433_600459_600629_605606_605814_607030_607106_607260
782977	contig_12050_pilon	+	1402	6	Intergenic	novelGene_62751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	834	1250	695071	698091	FALSE	35	TCCCCCTCTAATCACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSEWMSAPSLLNTGLFCTLKVTKISLLPTGILTVWPSSTPGRHGDHHSLLLLGLSCSSADHAWGRDDGASATTPPTGGAHHKRARVYGFLTKGEENGTLEYPGRCCGPRAMMCTRNATLKTQLLYAQVLKQLRAQI	692220	698243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_692769_693020_693122_694061_694174_694998_695128_696707_696777_697800
782984	contig_6117_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_167313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169778	167358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_167400_169800
782988	contig_11702_pilon	-	1213	9	Intergenic	novelGene_141963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	172.153955443957	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	456	905	313781	289501	FALSE	40	AATAAAAGTTGTTGTTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321141	289192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319355_319430_319753_319887_321065
782989	contig_7426_pilon	-	2213	16	Intergenic	novelGene_27465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	108.703184048225	2	111	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	848	1534	649816	641165	TRUE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQVQAPVKLYSDWLFVGHVDEFLSFVPARDRDSVCSWPARGPATNCSRRKRKKAMGRLCCSKGSTHEKNSKK	668284	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642377_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772_649877_650083_650227_652746_652851_654838_654955_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
782990	contig_12729_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_149930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGTGAAGGCTTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10059	11430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12729_pilon_+_10100_11400
782993	contig_16541_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_126736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTACAGCCTTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315978	314563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_314600_316000
782997	contig_9771_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_156924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCAGTGTTGCTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441540	442009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_441500_442000
782999	contig_10238_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_170094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCGTTGTCACTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87281	89085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_87300_89100
783003	contig_4931_pilon	+	1218	4	Intergenic	novelGene_138345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	65.3758365147246	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	82	1215	212295	231692	FALSE	30	TGCTGACCAAAAGTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS	123222	231695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123286_212276_212521_228217_228931_231497
783005	contig_13780_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_149057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607235	607699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_607200_607700
783006	contig_11338_pilon	+	881	4	Intergenic	novelGene_6255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	4.18993502999218	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTAACTGTAAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112009	115435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_112493_112638_112735_114211_114264_115185
783007	contig_4271_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_171870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGCTATAACTGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508635	506291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_-_506300_508600
783011	contig_7677_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_78274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTGCTTAGCCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481634	483785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_+_481600_483800
783012	contig_4782_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_73665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTAGGGTCCCTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547552	548086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_547600_548100
783013	contig_4924_pilon	+	1258	7	Intergenic	novelGene_84734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCCGCACGGTGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127260	252625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_127785_132966_133128_137219_137300_145996_146130_155810_155860_197778_197864_252399
783019	contig_15410_pilon	-	2303	10	Intergenic	novelGene_130590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	228.442552953691	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	449	859	89172	87704	TRUE	35	CTGGTAAAATTAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGMGWKPGEGIGRTFNQVVKPRVNSLRPKGLGLGANLTEAQALASTGPHRLPKPDEEQEKEKEDQPQGLVPGGAVVVLSGPHRGVYGKVEGLDPDNVRAMVRLAAGSRVVTVSEYCLRPVSQQEFDKNSSDLSK	92395	85344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_85697_85793_85880_86394_86465_86562_86687_86891_87845_88121_88336_89116_89227_91215_91341_91434_91599_92290
783022	contig_15114_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_121139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCCGGAAGTGGCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113588	125325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_115439_123580_123707_125214
783024	contig_10557_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_171921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGCAAAACAGACACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34682	36392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_+_34700_36400
783025	contig_15034_pilon	+	1843	2	Intergenic	novelGene_143629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	181	423	26345	26587	FALSE	70	GAAAAAGGAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLQAYVAWVNAQLKKRPAVKPVQDLRQDLRDGVILTYLIEIVAGEKLSGVQLSPSNQQEMKNNVEKVLQFVASKKIRMHQTSAKGQCFITFLVVHSALASDCQPQNKPWLCSEGSWVDWSRMSPIASYHFPIKEVILSG	22580	28007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_22711_26294
783027	contig_3900_pilon	-	1966	2	Intergenic	novelGene_84194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGTGTGTAATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534146	531984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_532739_532934
783029	contig_3601_pilon	-	2106	10	Intergenic	novelGene_132964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	179.206274691733	2	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	153	845	1157683	1127313	FALSE	35	ACACACAGTATTTTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSYGFATIASAIPAYSKRGDIVFVDKAACFAIQKGLQASRSDIKLFKHNDMADLERLLKEQEIEDQKNPRKARVTRRFIVAEGLYMNTGAICPLPELVKLKYKYKARIFLEESLSFGVLGEHGRGVTEHYGINIDDIDLISANMENSLASVGGFCCGRSFSFQRLSGQGYCFSASLPPLLAAAAIEALNIMEENPGIFAVLKEKCEQIHKALQGISGLKVVGKSFSPAFHLQLEKSTGSRERDVKLLQEIVSQVMHEQKHRVNAGALLGERREVPPSSEH	1171242	1126051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1127319_1129305_1129380_1132663_1132786_1139478_1139534_1141955_1142062_1142368_1142450_1147057_1147166_1152465_1152556_1157632_1157763_1171169
783030	contig_6710_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_98312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAGGTCACGCATAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
783035	contig_1154_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_87077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224378	225718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_224400_225700
783039	contig_9727_pilon	-	847	4	Intergenic	novelGene_86322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	272	343	314385	314314	TRUE	35	CCACATCTAATGCAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIFIRKPHLVSASLTQNRDWVASKSPTAFIFHPLLRTEDEGWGGVRQSLKCPLLDPREFTLPAICPTVPQWGTRGPSGLKAVTKGVPVCMASGWNQGGSQTPRPLGLFLHSG	314656	310005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_310088_310904_311013_312911_312991_314078
783040	SIRV2	-	443	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4429	35	3254	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
783043	contig_6870_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_103929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGTCTTCTGTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338708	347442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_338784_339180_339245_345443
783044	SIRV6	+	287	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8137	7	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
783046	contig_14666_pilon	+	1276	8	Intergenic	novelGene_39517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.509612461455	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	454	846	443672	448893	FALSE	25	GAAAGGTATCGAGTCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	429337	449323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429430_440704_440824_441064_441175_441955_442067_443650_443759_448153_448295_448638_448769_448858
783047	contig_19606_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_148281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTTCCAAGGCTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83788	84797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_83800_84800
783050	contig_18391_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_174087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGTAAGGAAGTGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13594	11787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_11800_13600
783052	SIRV5	+	232	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2129_3494
783055	contig_15697_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_173304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGTTATTTAATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46838	47136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_46800_47100
783056	contig_11292_pilon	+	2803	10	Intergenic	novelGene_109388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_7	4.8099690715363	95	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	184	1533	28065	34499	FALSE	25	CAACAGGTATTCCTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWLEAPVPDVSPGSDSVVELWEPDVQDASNQALGGSNCILREEARVPQPPQGTSEVGLEATEPTALLPRAKAPSESTELRPPKRKKGPAPKMLGNELCSVCGDKASGFHYNVLSCEGCKGFFRRSVIKGARYVCHSGGHCPMDTYMRRKCQECRLRKCRQAGMREECVLSEEQIRLKKLKRQEEEQAQATSVLPRASSPPEVLPQLSPEQLGMIEKLVAAQQQCNRRSFSDRLRVTPWPMAPDPQSREARQQRFAHFTELAIVSVQEIVDFAKQLPGFLQLSREDQIALLKTSAIEVMLLETSRRYNPESESITFLKDFSYNREDFAKAGLQVEFINPIFEFSRAMNELQLNDAEFALLIAISIFSADRPNVQDQLQVERLQHTYVEALHAYVSIHHPHDRLMFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE	26904	35769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_27051_28027_28108_28556_28752_29562_29830_30089_30299_30396_30577_30768_30869_33742_33857_34052_34148_34352
783058	SIRV4	-	344	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	20	1157	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
783059	contig_4783_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_108410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380828	381536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_380800_381500
783062	contig_6191_pilon	+	1507	5	Intergenic	novelGene_107820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	580	junction_1	210.239149541659	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	184	648	93605	123590	FALSE	40	AGAGACTCTGCGACTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSNSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQVRNILISCLIP	55655	124449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_55834_93599_93734_112654_112760_121430_121531_123459
783065	contig_5253_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_61580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCGCCAACCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281624	280712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_280700_281600
783066	contig_11047_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_173957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACCATCAGGAGCACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116719	116315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_-_116300_116700
783071	contig_6710_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_97921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	45	TAACTTTAATCATACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
783072	contig_7391_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_112150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGAGTTTCACAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364515	366520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_364500_366500
783076	contig_12864_pilon	-	1246	6	Intergenic	novelGene_76446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	437.310690470745	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAGAAATAAAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252157	242262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244763_245704_245915_251844_251999_252111
783078	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
783081	contig_9633_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_139652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	381	704	1182299	1182622	NA	40	TTAAATGTGAATACAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLVKLMIYAICHEKEIEVVNNFILLGSTINVHGISCQEIKRCIALDKSAAKDLFKVLESKDATLMTKVCLNQAMVFSIALCVCESWIIKKEDRRTDANCGTGEEY	1181918	1183199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1181900_1183200
783082	contig_1154_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_87137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGACAATAAAAAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817213	816297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_816300_817200
783084	contig_91_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_127118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCGGTAGTGGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676645	674704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_674700_676600
783085	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
783087	contig_11601_pilon	+	1028	4	Intergenic	novelGene_141032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	305.636312560461	135	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	571	930	98187	99107	FALSE	20	CTTAAGCTGTGACACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCQSLVACLKSCFFCCHRNRAGAEESRSGLQIQRHSYKDLARCRIASIFASRLLPLPVFLVELNKQNFKSSQPSNSETQQTVKRAAQRILGPFYLLWTTGRGVGVCVDGLTETELRRE	92933	99205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_93056_93789_93897_97845_98220_98780
783088	contig_10904_pilon	+	1491	5	Intergenic	novelGene_22471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	795.162365495249	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	202	1170	149100	150068	TRUE	30	TAAAGAAGGACTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	144903	151574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_145027_146149_146226_149097_150259_150454_150524_151512
783089	contig_10050_pilon	+	1998	2	Intergenic	novelGene_119615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1484	1927	120833	131179	FALSE	10	TATTTCCTGTTTTTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIFLKRKIFTLTCAYLKCFYCTEISPSIWDVEFAKQLATVSQQPFQNGFEEMIQWTKEGKLWEFPVNNEAGFDDDGSEFHEHVFLDNYLEDFPKQGPVRHFMELVTCGLSKNPYLSVKQKIEHIEWFRNYFNEKKDILKESDIQFS	119349	131250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_121047_130949
783091	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
783092	contig_10372_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_112512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGTGGCACTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29970	31275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_30000_31300
783093	contig_10372_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_112513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGGAAAAGAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31523	32757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_31500_32800
783094	contig_19815_pilon	-	1502	2	Intergenic	novelGene_154697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	446	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70122	46007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_46830_69442
783099	contig_14651_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_157222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGGAGCCACAGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106706	106210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_106200_106700
783100	contig_11364_pilon	-	2090	2	Intergenic	novelGene_65170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	105	425	123723	123403	TRUE	70	GAAAGGAAAAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHIKPGKQLVSGQIPGKPTVRWRFVCRKCAGEKSHEITWGTKGSRIGQREMLDFDAAATKARANSTESSGAGMAQQRELSQIEMKGQGSYATVLTSQGALVVLNC	123827	120170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_121810_123376
783101	contig_1337_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_84269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGCTGGAACAACATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659126	660076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_659100_660100
783102	contig_1337_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_84270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACATGAAAAAAAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661480	662067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_661500_662100
783105	SIRV2	+	326	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	271	-74	-271	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGTTCTATCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
783106	contig_8122_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_40224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTATTGTGTGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512460	514859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_512500_514900
783114	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
783116	contig_7562_pilon	-	1393	11	Intergenic	novelGene_140882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	114.738659570347	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	284	1354	142122	125717	FALSE	25	ATTCAGTGCTAACAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVVSNPVLWTPGTAQIGEGIENSWGDLEDSEKEDEDEGGSDEAIILDNVKMDTGVDISNIGSQDAPIVLSDSEEEEMIILEPDKSPKKIRTQTIGVKQEKAASKKPMKKRKKKRAVN	143699	125677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_125802_126240_126320_128841_129027_129846_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_141978_142093_142305_143598
783119	contig_7356_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_60429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	142	732	515889	515299	FALSE	30	GGCCATATAGAATATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPQYRGPGSSCAGEEWAVGLESALSLCVRAYRGSRRCRVRKLQSKTMGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSGNVFQFVKLQPRSQHVFSSFSFK	516950	514499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515921_516840
783121	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783122	contig_16103_pilon	+	1804	8	Intergenic	novelGene_118792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	30.1269423118448	110	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	82	609	584607	585572	TRUE	25	TTGTATCCAGGGAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFGNSDLLDVWLEPPEDVFSTGSFLELGLHCPPPEVPLTRQQEQGLQGWTSSGGHGCGLQESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSESGISEDPGHPDSPPAPRAPSSPALYEVVYEAGALESMQGEVGPAVGLISIQLGQFSVGRGQCPSGPALALGLRGLPQSVPLPSPCYH	584334	588959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_584412_584602_584781_585218_585742_587393_587487_587617_587725_587848_588126_588276_588374_588507
783124	contig_10003_pilon	-	2682	2	Intergenic	novelGene_88260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	0	159	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756548	747822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_750355_756398
783125	contig_9919_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_137978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609448	610762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_609400_610800
783126	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
783128	contig_6470_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_145602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCCAGAATCCTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994280	996058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_994300_996100
783130	contig_11574_pilon	+	907	3	Intergenic	novelGene_64112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_2	53.5	220	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	557	700	627635	629850	FALSE	20	TGTTTGTTTTTTTAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVDRSPFAKSLGQLLEDDLFDSGDIFSKSTGSQSTGRTKAKEKAAEAQASQPGGSREQSSIFSALDEAGSDDDLFQSVKPKPAKKVSLFPLLEDEDNLFTDQKGKKNGLKSSSQQDVIFKTQDVFEDDIFAAEAIKPAQKTKEKERTSESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGTQAKKTKPKSRSAQAVPEPRSEHKGSNIFDDPLNAFGGQ	626304	630057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_626687_627460_627639_629710
783131	contig_5429_pilon	+	1499	2	Intergenic	novelGene_127787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147418	149579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_147507_148168
783132	contig_7189_pilon	-	1968	13	Intergenic	novelGene_117642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	63.64332032682	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	336	1511	526930	277726	FALSE	20	ATTAATTTCTTTTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDEFHSRLRFNRRGLVAMANAGPHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKEKPEEEVKKLKPKGTKNFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDDGEDQSAEHDEYIDGDEKNLMRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRSEELRKEARQLKRELLAAKQKKVENAAKQAEKRSEEEEAAPDGAVAEYRREKQKYEALRKQQAKKGTSREEQTLALLNQFKSKLTQAIAETPENDISETEVEDDEGWMSHVLQFEDKSRKVKDASMQDSDTFEIYDPRNPVNKRRREESKKLMREKKERR	537351	277268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_277889_305602_305707_311080_311191_396531_396636_501927_502086_505132_505164_506157_506238_520885_520956_523229_523334_524020_524120_526777_526939_532652_532782_537153
783134	contig_4604_pilon	+	1243	8	Intergenic	novelGene_19187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	145.921561260892	781	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	338	820	535559	548080	FALSE	35	AGACTTCAGAAATGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNEFERLAARQPIELLSMKRYELPAPSSGQKNDITAWQECVNNSMAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNENLVHMIEHAQKELQKLRKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	526564	548503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_527027_527097_535549_535621_540751_540914_545202_545254_545868_545950_547953
783139	contig_6270_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_99860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTAGTGGGGGTCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926549	928028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_926500_928000
783141	contig_14744_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_66116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGAGTTGTGTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582174	1583031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1582200_1583000
783144	contig_15293_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_146535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCCCCACCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128263	127311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_127300_128300
783148	contig_15327_pilon	-	766	6	Intergenic	novelGene_70452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_5	1037.41883537942	6969	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	207	692	293006	289810	FALSE	0	CTGTGTGTCTGCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVKSCAEFLAVSKTRIGEYEKQLEKLRNIIPFDQMTIDDLNEAFPETRLDKTKYPYWPHQPIENF	294958	289735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_290158_291454_291527_292481_292579_292884_293016_294761
783151	contig_13366_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_99766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	237	560	30093	30416	NA	20	AGTCCTCCCCTACCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQFKDILLGSHLIQSTALSTMYDLDTSSINCPGEGLDRYTGRSLPYTILCTDHMSMHLHGEDTEDFDHPKALSGGSVLLFFQCTNSILLRYKLHRAKYTNFKSTTQ	29856	31600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_29900_31600
783152	contig_8268_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_147009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309470	307074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_307100_309500
783153	contig_7171_pilon	-	1560	15	Intergenic	novelGene_101401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	87.1668877873394	1	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	625	1056	1412687	1409817	FALSE	10	CACTCAGCTGTCTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1437476	1409312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413042_1414806_1414848_1421632_1421690_1421813_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
783154	contig_1986_pilon	-	1169	6	Intergenic	novelGene_64148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.965024936521	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	32	505	410391	384418	TRUE	45	GGTTACAATAAGCACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPRPRPAAAMQFMLLFSRQGKLRLQKWYVPLSDKEKKKITRELVQTVLARKPKMCSFLEWRDLKIVYKRYASLYFCCAIEDQDNELITLEIIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLLGGEVQETSKKNVLKAIEQADLLQEEAETPRSVLEEIGLT	412697	383047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_383364_384069_384466_402862_403001_403608_403718_410212_410392_412666
783157	contig_15029_pilon	+	2520	7	Intergenic	novelGene_128206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_6	32.0832251080426	415	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1893	2504	232392	233287	FALSE	0	GTGGCTCTGCCTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQNCYVNQQELEPYPFGIRIDYVLYKAVSGVCVSCKTLKTTTGHDPHSGTPLSDHEALMATLYVRHSPLQHSPSPTHGAAEMSPLITVLKEAWTELGLGMAQAHRWAAFASCVIGLGLLLLVLLCALVARGKTSEVTLLLLSPSVGLMLGAGAVYLFHVKEVKGLCRARAELLHMLRRARDAEDLGSVSQPAQQEDRAEEQ	229897	233303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_230463_230685_230783_230907_231447_231609_232280_232370_232476_232660_232815_232913
783161	contig_8415_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_141698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCATGTTATATAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262861	263511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_262900_263500
783162	contig_8415_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_141699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCCCAGTTTCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264575	265874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_264600_265900
783166	SIRV4	-	517	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	97	3	97	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5061	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
783167	contig_2693_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_167599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGACTCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296179	295322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_-_295300_296200
783173	contig_6557_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_32959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369958	372072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_370000_372100
783175	contig_14792_pilon	-	824	4	Intergenic	novelGene_170496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_3	20.8326666559997	929	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	70	384	112454	107722	FALSE	15	CTTGGTCTCGGGCTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGRGARFLAGHLLLARVPPRSDMAGKAHRLSAEERDQLLPNLRAVGWNELEGRDAIFKQFHFKDFNRAFGFMTRVALQAEKLDHHPEWFNVYNKVHITLSTHECAGLSERDINLASFIEQVAVSMT	112523	107281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_107821_108652_108734_109285_109418_112451
783176	contig_19377_pilon	+	1743	3	Intergenic	novelGene_174104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	5	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	178	450	4708	4980	TRUE	35	TACTGGATGTATTTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVCSNPEFFSYGVEAYEACKKRTLARDIIDEQKKVQEADLVIFQFPLYWFSVPAILKGWMDRVLCQGFAFDIPGFYDSGFLKVCALAPGLLWAKVCMHVCARAYVCMYVCVCVRVCVCACVCMYVVHMCTRVCACVCECMVCVRVCVSL	2409	8302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19377_pilon_+_2542_4662_5997_8025
783177	contig_6871_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_21673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATCAGGTTTATCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938472	937439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_937400_938500
783180	contig_846_pilon	-	1434	4	Intergenic	novelGene_136104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.203830762666	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	198	578	214365	212487	TRUE	40	CAAAACGTGTTAAATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSGVGEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	214562	211435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212268_212462_212690_213134_213244_214296
783181	SIRV4	-	462	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	3	1056	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
783183	contig_6155_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_174106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGAATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239724	238731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6155_pilon_-_238700_239700
783184	contig_12661_pilon	+	2089	2	Intergenic	novelGene_166718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	42	junction_1	0	140	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	75372	81437	FALSE	30	TAGCTGAGTAATTCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQKHFQSDRKFARETGLPAEESSPGPRDENEGGELRVPDAAPELQEHRFHGGGRGAEGRGGRGGAAKRLCVSERRGPAPEGGLRAQGHHRSGGQRARGTTECKTERGSSLPVPRFI	75371	83175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_75713_81427
783186	SIRV5	+	355	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	151	48	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
783188	contig_5959_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_150182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTAAATAGGAAAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180264	179750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_179800_180300
783193	contig_9345_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_24453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCAGAGAGATGCAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439485	437727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_437700_439500
783196	contig_7202_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_16625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27849	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
783199	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	145	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783200	contig_8866_pilon	-	1519	9	Intergenic	novelGene_77883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	25.5388796739403	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	122	1048	1023553	1009538	FALSE	20	AACTCTTTATGTTTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSHAVLMRLVASAYSIAQKAGMIVRRVLAEGDLGIVEKTCATDLQTKADRLAQMSICSSLARKFPKLTIIGEEDLPSEDVDQELIEDGQWEEILKQPCPSQYSAIKEEDLVVWVDPLDGTKEYTEGLLDNVTVLIGIAYEGKAIAGVINQPYYNYQAGPDAVLGRTIWGILGLGAFGFQLKEAPAGKHIVTTTRSHSNKLVTDCIAAMNPDAVLPVGGAGNKIIHLIEGKASAYVFASPGCKKWDTCAPEVILHAVGGKLTDIHGNGLCYNKEVKHMNSAGVLATLRNYDYYASRVPESVKNALVP	1031212	1009066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1009687_1010841_1010948_1013227_1013426_1017318_1017411_1018918_1018968_1020870_1020979_1021671_1021777_1023433_1023562_1031099
783202	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	10	409	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
783203	contig_401_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_42941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAGCCTACATCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2218747	2216982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2217000_2218700
783204	contig_19098_pilon	-	1106	3	Intergenic	novelGene_65863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	70.5	284	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1	633	502991	486105	FALSE	20	GGTGGGACAATCGTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCWPAVLTACLLKSRRRGRSRSLILLVLCESPGSSPSFSEAGEGALQLRHGRHSKPLGRLLAPYFHPLKKAAPKAKAPGVLHWVDLPAQGSRKQRAESHQHCPLAALSRKSCNSVPQLKNISLTYFKASSSSFWLWLWVESDPPNSWEAPRVGGRVSSPLSLSSLLPPGEHGDLERVGESSSLSAPARAFCSKGFSCLWSCSIEETADTA	502991	485631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_486565_488873_488932_502876
783205	contig_10857_pilon	-	1663	2	Intergenic	novelGene_160861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3	524	22143	21622	TRUE	80	AAAAAAAGAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRQKERHPPEWRARFQEDHLPRHAQLATCLPAPESPALARRPGVSIALWLNGPWPLTPWPRPPAAPPAPQDRGHSPPPPWASLSSGGVLRLNPGVRVCVRVRWPPGASRAGRLGASTPSLVSLPPSGLQVEVWSKWGSGWVLLLIYCCKRTKPPSGNVKQVAGAWGCPAGAG	22145	20173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21293_21601
783206	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	8	1159	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
783208	contig_11173_pilon	+	1532	10	Intergenic	novelGene_156896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_9	295.53308185233	384	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	39	1376	430220	450103	FALSE	30	AAATATCATTGCTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSEGMKFKFHSGEKVLCFEPDPTKARVLYDAKIVDVIVGKDEKGRKIPEYLIHFNGWNRSWDRWAAEDHVLRDTDENRRLQRKLARKAVARLRKGRKKKRCRLPGVDSVLRSPSVEEKDENAENSISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVTSSGLTFIPDGSLTVLQ	430181	450259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430322_431765_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936
783209	SIRV7	+	376	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
783214	contig_20356_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_159544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCCATTTCTGTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111473	112471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_111500_112500
783217	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	9	344	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14417	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
783219	contig_7229_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_39843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATGTTAAAACAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120204	1119960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1120000_1120200
783224	contig_6102_pilon	+	1202	5	Intergenic	novelGene_32300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTATGGACTCCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501426	1510585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1502188_1503077_1503204_1503731_1503820_1505750_1505795_1510402
783225	contig_9982_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_55721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	885	1247	256569	256931	NA	75	AAAAAAAAAAGGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCKEQTRNIRAFRDIKASTTLISRPFFLPQDEIKSIWAYMKSKHQNELCIHSSQTYLHRKGLSHLPPFTVVWHNTSNTNPQKVSIFTLEQLIQEIINSRQEDLETGNNEKNLLLWLCCD	255684	257509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_255700_257500
783226	SIRV6	+	506	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	50	11	-50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
783227	contig_7378_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_120302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACACTATCATTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650968	649054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_649100_651000
783228	contig_1154_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_87216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCGATTCTGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573199	1572548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1572500_1573200
783230	contig_5816_pilon	+	1499	5	Intergenic	novelGene_158242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	18.4661853126194	169	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	417	839	198408	204615	FALSE	15	TCTGATCAGTCCTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFLNVLRSWLVMVAIIAMGNTLQSFRDHTFLYEKLYTGKPDLVNGLQARTFGIWTLLSSVIRCLCAIDIHNKTLYHITLWTFLLALGHFLSELFVYGTAAPTVGVLAPLMVASFSVLGMLVGLQYLEAEPVSRQKKRN	194617	205275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_195003_198376_198541_201346_201438_204283_204403_204535
783235	contig_4496_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_66678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACCCCCCACAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884347	882438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_882400_884300
783238	SIRV4	+	286	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCACCCGTAACAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3707	3993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
783240	contig_2209_pilon	-	1270	8	Intergenic	novelGene_141006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	82.0825865845379	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	225	917	207436	120917	FALSE	70	GCAAAAAAAAAAAGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAARESASEGPRLLLRPAPCVRTTRARSSAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVVINRTLVLTGQWEALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAGSDFIKTSTGKEAVNATFPVAIVMLRAIRDFFWETGNKVGFKPAGGIRTAKDSLAWLSLIKEELGNEWLKPELFRIGASSLLSDIERQIYHQVTGRYAAYHDLPMS	248839	120563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_120974_122030_122181_125972_126086_184487_184617_202235_202371_205518_205615_207423_207572_248750
783241	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
783242	SIRV4	-	201	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	3	-410	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTATCGGCGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
783246	contig_7057_pilon	+	971	10	Intergenic	novelGene_123324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	852.553477559482	177	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	79	969	936984	943710	FALSE	5	CTCTTCGTGGCATCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFQGLLSSGGISPVPAPCHACSSYPPGSRTPRSTSHVPSAFVPALLSARQAQEEIKAPHC	936083	943712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_943537
783251	contig_6412_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_149950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAACTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220471	219189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_219200_220500
783261	contig_614_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_132596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTCCTCCTCACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23805	24150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_23800_24200
783262	contig_5671_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_79478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531243	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_531200_531800
783263	contig_14288_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_153815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246932	248091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_246900_248100
783265	SIRV4	-	305	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1216	0	1216	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3942	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
783270	contig_1339_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_163124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACATAGACAATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348135	347743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_347700_348100
783278	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
783279	contig_6661_pilon	-	2750	1	Intergenic	novelGene_174111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGTAATTTGTTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403625	400875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_-_400900_403600
783281	contig_5092_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_62288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCATTTTCTTCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421617	423728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_421600_423700
783282	contig_10446_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_162463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAGATACTGAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555802	555495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_555500_555800
783284	SIRV6	+	256	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	124	-3	42	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3147	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
783286	contig_6595_pilon	-	2341	6	Intergenic	novelGene_122531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_4	114.297856497836	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	601	1698	617546	483041	TRUE	35	AACATCTTTGTTATCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLIVKLRRSFRTLIVLLATFCLVSIVISAYFLYSGYKQEMTLIETTAEAGCADLKILPYRSMELKTIKPIDTSKTDPTVLLFVESQYSQLGQDIIAILESSQFQYHMVIAPGKGDIPPLTDNGKGKYTLVIYENILKYVSMDSWNRELLEKYCVEYSVSIIGFHKANENSLPSTQLKGFPLNLFNNLALKDCFVNPQSPLLHITKAPKVEKGPLPGEDWTVFQYNHSTYQPVLLTELQTEKSLPSLSSKTFYATVIQDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWLHKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNVKDVKGLKRKMKEMTFCFSLWMSFGGFLTCGATCSPISSTMSRP	649967	371246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_371540_437508_437638_440561_440748_483005_483161_616568_617793_649613
783288	contig_5125_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_43500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCACTTTATGCACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009222	1008161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_1008200_1009200
783291	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	24	356	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14432	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
783292	contig_2917_pilon	-	1237	6	Intergenic	novelGene_147591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	235.933549966935	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	59	598	124032	96271	TRUE	50	ATTAAAAAAATTGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLNFIFNRFKFSAKFKT	124090	92793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93965_96189_96317_109377_109739_113029_113116_123985
783293	contig_15474_pilon	-	794	4	Intergenic	novelGene_136227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	37.6061460697879	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTGAGAAGGCCCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43456	35844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_35924_36059_36123_42294_42901_43410
783294	contig_7318_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_152213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	983	1309	183964	183638	NA	35	ATAAGAGTGATGACTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTAHPAGLGTEASTGLDTLGPFLLTPQLVLRGRYSVVRGWTRSVCLCPPVPALLCSWARFFSANLCHLLQKACLILLVESSLAYSCFSIAPGRYQHLRLAVLFKHA	184946	182432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_182400_184900
783298	contig_7919_pilon	+	1788	11	Intergenic	novelGene_28075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	142.55065766246	10	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	435	1340	1068397	1120476	FALSE	75	TACAAAAAAAAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLILLTSVTLLSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKLVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNELPSAIKCLMGKEEDFSAWYVDGRFLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFLIVVIYKKFQIPCIVPELNSTISANSTNADVCTPKYVTFNSKTVYALPTIAFAFVCHPSILPIYSELKE	1066949	1120924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1067292_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847_1079964_1113436_1113511_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449_1116533_1118753_1118813_1118934_1119052_1120392
783302	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
783303	contig_10581_pilon	+	888	3	Intergenic	novelGene_41349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	463.5	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGCCTTTGGGCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74525	87906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82835_87253
783304	SIRV6	+	569	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	266	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
783305	contig_8020_pilon	-	922	8	Intergenic	novelGene_114370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	126.231565637384	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	562	864	106036	104794	FALSE	20	TAAACAGGGCTGTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107284	104735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105872_106031_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
783306	contig_6364_pilon	-	1910	9	Intergenic	novelGene_51798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_5	20.288158492086	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	151	1077	1426712	1406241	FALSE	30	GGTAATTAATGCTAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLHLLQNFGSSRRASLRYCRKTVRHAAFYDDGSEGAFENLRLPSRGKASPMFSAGDEDDSDFLSPSGGARLASLFGLDQTAAGHGNEFFQYTAPRQPKKGQATTTTGNQATQKIAPTTAGTSTVLFATAVHAYRYINGQYVKQGKLGAAVLGNHTAREYRILLYMSQQQPVTVARIHLNFELMVRPNNYSTFYDDQRQNWSIMFESEKAAVEFSKQVCIAKCNSTSSLDAVLSQDLIVVEGPSVEVGDSLEVSYTGWLFQNHVLGQVFDSTANKDKLLRLKLGSGKVIKGWEDGMLGMRKGGKRLLIIPPSCATGSEGVIGWTQATNAILVFEVEVRRVSETVLCCLLSPLSTSLLIM	1426862	1405407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1406451_1407788_1407858_1408768_1408919_1413050_1413150_1413482_1413558_1417008_1417079_1417539_1417625_1421731_1421848_1426659
783308	contig_6365_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_134002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12378	14599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_12400_14600
783309	contig_4392_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_117320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	511	813	415641	415339	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSYTPAGFRHQMPLTPLCSPSLMAPTSSHSYPTSPKHCGRTLFLVPVLCMARELYCGGYNPSELISPLNCGFFSVLTHLCPPCRAQPRDLVRLLLKIYF	416151	413469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_413500_416200
783314	contig_9505_pilon	+	1173	11	Intergenic	novelGene_121851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	174.877928853243	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	55	639	530721	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530666	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_617651_617727_620886_620989_631447_631521_632605
783317	contig_9202_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_168938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGCCACCCGGGGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13177	14265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_13200_14300
783320	contig_6635_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_127007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_3	48.760184121428	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	249	947	377299	344041	FALSE	25	TAGGTATTTGACCTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANYIHVPPGSPEVPKLNVTVQDQEEQRCREGALSLLQHLRPHWDPQEVTLQLFTDGITNKLIGCYVGNTMEDVVLVRIYGNKTELLVDRDEEVKSFRVLQAHGCAPQLYCTFNNGLCYEFIQGEALDPKHVCNPAIFRLIARQLAKIHAIHAHNGWIPKSNLWLKMGKYFSLVPTGFADEDINKRFLSDIPSPQILQEEMTWMKEILSNLGSPVVLCHNDLLCKNIIYNEKQ	377547	344038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_344183_347562_347704_361649_361910_377143
783324	contig_14289_pilon	-	798	6	Intergenic	novelGene_110557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	382.452402267263	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	63	695	66533	51519	FALSE	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQGPEPGAGCLYLRCRAGRVHWGRAADLHRHPGGHPRGDCGPAEGLSR	66595	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51660_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
783325	contig_8696_pilon	+	1605	9	Intergenic	novelGene_153336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	80.7650914690252	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	47	1030	984957	1016099	FALSE	25	CATTTTTTGAAAGCGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAVEPQAPTLGSEPMMLGSPTSPKPGVNAQFLPGFLMGDLPAPVTPQPRSISGPSVGVMEMRSPLLAGGSPPQPVVPAHKDKSGAPPVRSIYDDISSPGLGSTPLTSRRQANISVLQSPLVGVTTTTPGTGQSMFSPANIGQPRKTTLSPAQLDPFYTQGDSLTSEDHLDDTWVTVFGFPQASASYILLQFAQYGNILKHVMSNTGNWMHIRYQSKLQARKALSKDGRIFGESIMIGVKPCIDKSVMENSDRCALSSPSLAFTPPIKTLGTPTQPGSTPRISTMRPLATAYKASTSDYQVISDRQTPKKDESLVSKAMEYMFGW	984910	1016674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_984997_988039_988211_992399_992528_995696_995758_1009925_1010068_1012248_1012319_1013309_1013439_1014875_1015041_1016021
783329	contig_15067_pilon	-	2052	3	Intergenic	novelGene_154333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	38	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	175	480	93847	92165	FALSE	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	94021	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92279_92840_92941_93755
783330	contig_2114_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_104214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCCCTGAACTAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56529	55742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_55700_56500
783331	contig_5628_pilon	-	1560	7	Intergenic	novelGene_157557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	23	junction_4	69.3269227805635	108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	117	1559	41297	11690	FALSE	25	GTGAGTGGTTATGAGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPDSLVTEDRAGGRSWCLRRVGMTAEWLLLEDGSEVTIGRGFGVTYQLVSKSCPLMISRNHCVLKQNAEGQWTIMDNKSLNGVWLNRERLEPLRVCSIHKGDHIQLGVPLENKENAEYEYEVTEEDWERMYPCLAPKSDQMMEKNKGLRTKRKFSLDELNSLGAEGPSNSKPKISEVFCEPGQPVQSHGNDEVASQPSECSNPKMTSYEPSKKTTGTHIYLAPPGVVELHHKKQKASNPSASQSSLELFKVTMSRILKLKTQMQEKQVAVLNVKKNQKGNSKNIVTMEQELQDLQSQLCEEQAQQQARVEQLEKTFQEEEQHLQGLEEEQGEDDLKQQLAQALQEHRSLMEELNRSKRNFEAIIQAKNKELEQTKEEKEKVQAQKEEVLNHMNDVLENELQCIICSEYFIEAVTLSCAHSFCSYCISEWMKRKIECPICRKDITSKTHSLVLDNCISKMVDNLSSEVRDRRIILIRERK	41413	11688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_11894_13866_13975_15822_15913_18418_18482_20689_21428_31034_31164_41186
783333	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
783334	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	97	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
783336	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	51	512	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783339	contig_5727_pilon	+	1383	13	Intergenic	novelGene_7944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1069.99388303028	4	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	886	1293	173359	179994	FALSE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRRSLLL	168146	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173341_173443_173717_173796_174030_174115_174203_174303_174721_174768_179977
783345	contig_16870_pilon	+	604	3	Intergenic	novelGene_155486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	667	junction_1	650	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	283	603	96164	97740	FALSE	30	AGATTTGCACAGCTACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYATTYELKEDGSYNVTSTLLKNEDCYHWIRTFVPSFLPGQFNLGNIKSESQLRHGPWAQGLGSFQILPEGAQTTLPLYTDDIIRGRGQPLPPPGQGLPLVTHPQVS	95610	97741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95823_96093_96229_97484
783348	contig_10082_pilon	+	1525	1	Intergenic	novelGene_63882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAACTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306219	307744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_306200_307700
783350	contig_14176_pilon	-	2113	14	Intergenic	novelGene_74851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	12.3048073541876	81	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	459	1916	431829	413308	FALSE	30	CGCTCCATTGACTGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	451694	413110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431945_451351
783351	contig_13937_pilon	-	1564	9	Intergenic	novelGene_167348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	92.0759706709628	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAACAAATGTTAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49236	30907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36183_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274_45449_47019_47101_48570
783354	contig_6276_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_174130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	515	865	245550	245900	NA	35	ATAAAGTTTTATTGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVARAFLHDAVCQSFSALAPMTCVGMIFCGGGYPVHCRVFSSIPGLHPLDASSISVPTVMTKSVSRHCPMSPGRPGLPPALIVQREHCDLQSMEKRTILWCYFVEFFIKLGENP	245035	246334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_245000_246300
783359	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	3	1171	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
783363	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	11	370	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14419	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
783365	contig_19640_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_134873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGAACTGTGTCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102940	104888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_102900_104900
783367	contig_5718_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_110390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGTAAACTTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231102	1230858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1230900_1231100
783368	contig_7356_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_60437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554674	553969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_554000_554700
783369	contig_16869_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_137582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGGAAAAAAAAAAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32199	31330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_31300_32200
783374	contig_753_pilon	+	1700	2	Intergenic	novelGene_112900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	394	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	68	355	267340	268361	FALSE	70	CAATTAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSYKNKIRYSSSGVSSWVYKGRMSIAQLIIPEAGSSPDCLSYRKRFEQQQRLLEEERKRRQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKTRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPGS	267272	269706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_267508_268241
783377	contig_14661_pilon	-	2023	3	Intergenic	novelGene_47448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	55	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAAAAAAGTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70868	66799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_67448_68173_69466_70785
783378	contig_15248_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_149162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1351	1755	249118	249522	NA	30	AGTTGTAGCAACAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEENVFNKTEHPFMIKTLHKLGIEKNFLKLIKSIYEKPTANIILKGERLKTFRLRSGIRLGCPISLLLFNTERIPGGAVLKCSAANQNVGGSNPPVAPWEKDVAICFHKDYSLGNPMGQFYSVLQGCYESELT	247767	249582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_247800_249600
783382	contig_14508_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_79056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGGAATCTGTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76837	77617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_76800_77600
783383	contig_5968_pilon	-	1134	8	Intergenic	novelGene_112186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	394.112177131417	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	429	968	636624	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732373	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636694_638293_638353_700585_700743_732230
783387	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	202	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
783392	contig_12886_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_135511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618383	617072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_617100_618400
783393	contig_5515_pilon	-	2382	24	Intergenic	novelGene_52351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_8	64.9715074966667	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2379	4	2382	137157	116639	FALSE	40	AACTCAGCAAAGTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAQALSEEEFQRMQAQLLELRTNNYQLSDELRKNGVELTSLRQKVAYLDKEFAKAQKALSKSKKAQEVEGLLSENEMLQAKLHSQEEDFRLQNSTLMAEFSKLCSQMEQLERENQQLKDGAAREGAAQAGSLVDGELLRLQAENTALQKNVAALQERYGKDAVRSPAISEGQGDPPGGPALTVLAPMPLAEVELKWEMEKEEKRLLWEQLQDLESLKQAETSRLQEELAKLSEKLKKKQESFCRLQTEKETLFNDSRNKIEELQQQKEADLKAQLSRTQKLQQELEAANQSLAELRDQRQGERLEHAAALRALEDQVSIQSADAQEQVEGLLAENNALRTSLAALEQIQTAKTQELNMLREQTTGLAAELQQRQAEYKELMGQKDDLNSQLQESLRANSRLLEQLQELGQEKEQLSQDLLEARKSAEKRKAMLDELAMETLQEKSQHKEELGAVRLRHEKEVLGVRARYERELRELHEDKKRQEEELRGQIREEKARTRELENLQQTVEELQAQVHSMDGAKGWFERRLKEAEESLQQQQQEQEDALKQCREQHTAELKGKEEELQGVRDQLQQAQEERDTHLKTISSLKQEVKDTVDGQRILEKKGSAALKDLKRQLHLERKRADKLQERLQDILTNSKSRSGLEELVLSEMNSPSRTQTGDSSSVSSFSYREILREKESSAVPARSLSSSPQAQPPRPAELSDEEVAELFQRLAETQQEKWMLEEKVKHLEVSSASMAEDLCRKSAIIETYVMDSRIGQFPLPSSHPWPSLLTCPCSLLFCAVTSLLLASW	137160	116638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_116834_116962_117086_118265_118397_120043_120144_120246_120304_120410_120507_120607_120686_121644_121759_122547_122761_123096_123193_124055_124191_124946_125040_125253_125332_126682_126783_126927_126976_127083_127116_127778_127827_128013_128199_129126_129278_132538_132647_133614_133642_134705_134768_134908_134976_137115
783394	scaffold_16539_pilon	-	1204	7	Intergenic	novelGene_68309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	75.2036125018827	588	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	116	505	126401	122501	TRUE	10	TGTCTTAGCCTCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARGVGRSRVAAGVEWLPAEDQAQPRRHTEALSGRYRVMAETYDFLFKFLVIGSAGTGKSCLLHQFIENKFKQDSNHTIGVEFGSRVVNVGGKTVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITRWVHRAGGRGRGSPSPAPASLLSPSCAAGRRTTRWPPG	126516	107463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_107815_120764_120897_120985_121082_122380_122679_124586_124702_124967_125049_126385
783399	contig_3424_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_55534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	461	799	262325	261987	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYFSCTSQLIKLTQECHTLPTPAAVKSISTHSKPIGQRRTAPEGFQGVAGGFELLTFWLAAELLTRAPPGLLPHLNHHKFRMRPLTTHHSIPNTSIRQFTTDHIPNQKMGF	262785	261336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_261300_262800
783403	contig_11601_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_141039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCAACAACAGAATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115581	113831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_-_113800_115600
783404	contig_5136_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_126631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGCAACACAGCTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276077	275500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_275500_276100
783405	contig_2969_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_157075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGATCACTCCCTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905220	904439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_904400_905200
783407	SIRV6	+	358	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
783408	contig_6710_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_98259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	CCTCACCCCCTCCCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
783410	contig_9527_pilon	-	943	6	Intergenic	novelGene_134091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	44.7598033954574	575	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	48	887	628863	626376	FALSE	10	CCGTGTAGTCCCAGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVGPVGLGVCSEGCMSGLRALLGLGLLVAGSRLPRVRSPAGVCRSGPVWWRPQRLISGVHEDPAAMASAAVKYLSQEEAQAVDQELFNEYQFSVDQLMELAGLSCATAIAKAYPPTSLSRSPPTVLVICGPGNNGGDGLGYQPTVYYPKRPNKPLFTALVTQCQKMDIPFLGEMPLEPMMIDELYELVVDAIFGFSFKGDVREPFRSILKVLSGITVPIASVDIPSGWDVEKGNSEGLQPDLLISLTAPKKSASQFTGRYHYLGGRFVPPALEKKYQLNLPSYPDTECVYRLQ	628910	626319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_626579_626891_627040_627959_628074_628178_628263_628423_628533_628681
783412	contig_9927_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_137100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAAAAAACACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8301	6514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9927_pilon_-_6500_8300
783413	contig_15120_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_108036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTGGCCATAGATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665920	667924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_665900_667900
783414	contig_5033_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_29085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAACTCCTATAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668261	669418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_668300_669400
783416	contig_8661_pilon	-	1201	11	Intergenic	novelGene_137932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	520.788143106196	3	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	79	888	315977	301399	FALSE	20	AAGTAGCACTGTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316055	301085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313862_315970
783417	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_97003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783418	contig_12125_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_76210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178409	179687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_178400_179700
783419	SIRV6	+	348	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	4	1248	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
783420	contig_5549_pilon	+	835	4	Intergenic	novelGene_81586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1211.758043322	64	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	58	555	82155	96749	FALSE	0	TTTGGCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIACALQVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82097	97029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86776_93251_93412_96620
783422	contig_1694_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_144992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCCACATCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684871	1685320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1684900_1685300
783424	SIRV4	-	259	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1262	0	1262	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3896	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
783425	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
783427	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_97573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	GTGGAAAAAGAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
783432	scaffold_19766_pilon	+	1951	4	Intergenic	novelGene_34374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.35702260395516	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	708	1505	726532	727329	FALSE	25	CTTGATTTATGTAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722154	727775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722248_723435_723738_723925_724236_726529
783434	contig_6270_pilon	-	2137	1	Intergenic	novelGene_99834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAAACCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173920	171783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_171800_173900
783435	contig_5954_pilon	-	1948	3	Intergenic	novelGene_28720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	10	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCATTTTCTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972875	970054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_971026_971182_971325_972040
783436	contig_2069_pilon	-	1403	11	Intergenic	novelGene_23415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_10	223.606104567832	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	28	945	1259894	1250353	FALSE	15	GCTGTCCATGGGCAAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLATGLIPTMQTPADFPRVEGDSVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLVGDADPKLARGAVLIK	1259921	1249894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1250403_1250859_1250949_1251243_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1259834
783440	contig_9177_pilon	-	2325	1	Intergenic	novelGene_32711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTTTTTTATTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572637	570312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_570300_572600
783441	contig_6445_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_77059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGCAACAAGTTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667185	666419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_666400_667200
783445	contig_8673_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_129921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCATGTGCCAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314108	315861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_314100_315900
783448	contig_6069_pilon	+	1883	9	Intergenic	novelGene_8079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98.3869116041356	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	375	1106	563354	564879	TRUE	15	TTTTTTTTCCTAGAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVCLLCFLLHCGLPEDCDEAARGNPAGAGGSHDDRL	560886	566823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562653_563232_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564666_564775_564896_565907_566043_566197
783449	contig_17144_pilon	-	2449	1	Intergenic	novelGene_29145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1134	1433	81228	80929	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLTKAATAAQVASVTYSWMKRRVLKAGTDQAGVRPQSGRGRGPLLPTCGLNVEGPSTRVPVPCQCSAVSEAGTDCCDVGRQVPPDTCLLLAAWQGAV	82361	79912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_79900_82400
783450	contig_9580_pilon	-	1084	9	Intergenic	novelGene_167731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	62.3538290724796	346	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	71	958	807458	752218	FALSE	15	CTTTGACTTAATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAAVAVATAAAVRGGEGLGRAAMEGQRWLPLEANPEVSADQFLRQLGLQPNWQFVDVYGMDPELLSMVPRPVCAVLLLFPITEKYEVFRTEEEEKIKSQGQDVTSSVYFMKQTISNACGTIGLIHAIANNKDKMHFESGSTLKKFLEESVSMSPEERARYLENYDAIRVTHETSAHEGQTESSSPSSSQPHSSHCRTKASSLCHHASLAWVKRNHVGPAKAASPSLRLRRWRPFLRLPSLGLHSVAPSIDEKVDLHFIALVHVDGHLYELDGRKPFPINHGKTSDETLLEDAIEVCKKFMERDPDELRFNAIALSAA	807528	752091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_752302_752886_752946_758851_758928_763446_763639_782735_782784_784584_784671_785233_785391_791535_791670_807406
783453	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
783455	contig_8452_pilon	+	1826	3	Intergenic	novelGene_48046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.5	1	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	41	1126	432928	434013	TRUE	0	TGCTTGGTTTTCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423989	434986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909_434360_434632
783456	SIRV6	+	514	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	218	51	218	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10455	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783457	contig_10196_pilon	-	2135	5	Intergenic	novelGene_132192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	81.293834329548	39	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	21	473	1160033	1141618	FALSE	10	CTTGTATGTGCCCATCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAAGDMFQGSESEGFRAGSRAMKPPGGDSSNLFGSPEEVVPSSRPNRMASNIFGPTEEPQNIPRRTNPPGGKGSGIFDESTPVQTRQRQNPPGGKTSDIFGSPVASTSPLAHPNKPKDHVLLREGEDPKPDLAAVSNTPHLPLLPVFPLEAVGWV	1160053	1139955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1141686_1145035_1145085_1149127_1149271_1152791_1152941_1159989
783459	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783461	contig_2933_pilon	+	1648	3	Intergenic	novelGene_111377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_2	2.5	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	70	846	1077245	1082982	FALSE	25	AGCAAGCAGTGATGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLLHTCARVQRGVNGYFKLACMSLQRFHTAVSCPKGRTGAEHLWLMRHLKDPFVKAAKVESYRCRSAFKLLEMNERHQILRPGLRVLDCGAAPGAWSQVAVHSVNAAGTDPSSPIGFVLGVDLLHIFPLEGATFLCPADVTDLRTFQRIRELLPGHRADVILSDMAPNATGISALDHDRLISLCWSLLDLAPHILHPGGTFLCKIWAGSQSHRLQKRLTQEFQSTRTIKPSASRKESSEVYLLATQYWRGKGSAEE	1077175	1083784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1077295_1079270_1079555_1082539
783462	contig_5515_pilon	-	1557	8	Intergenic	novelGene_52342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	491.200237652007	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	139	807	75892	68907	TRUE	50	TTATAAAATCAACCGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPAPHVVQPQQQPPVAWRSGPAGPHGSGVQPRLLSTPSCMPSWASSPLLQALS	89130	67640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68772_68895_69066_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75992_76045_89044
783465	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8115	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
783466	contig_9683_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_151276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.55248303539968	94	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	86	955	485966	482321	FALSE	0	CCTTTGTTTCTGTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSEGRAPKLSPRTSSQTVQEGGSSSLRRPTGSGKTTFISEYALDLCTQGVNTLWGSFEISNVRLARVMLTQFAVGRLEEQLDKYDEWADRFEDLPLYFMTFHGQQSIRTVIDTMQHAVYVYDICHVVIDNLQFMMGHEQLSTDRIAAQDYIVGAFRKFATDNSCHVTLVIHPRKEDDDKELQTASIFGSAKASQEADNVLILQDRRLVTGPGKRYLQVSKNRFDGDVGVFPLEFNKSSLTFSIPPKSKARLKKIKDDNGLVAKKPSSGKKGAVSQNSETCLDQAPNA	486912	481362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_482612_483536_483679_483996_484105_484348_484590_485878_486028_486888
783467	scaffold_21177_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_145494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAATTAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221687	220431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_220400_221700
783470	contig_10023_pilon	-	2211	6	Intergenic	novelGene_123461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1714	2076	48194	46553	TRUE	30	TTTAACAGATGAGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRGFGLAHLNRKTTDEQHPLITDILCVHINPRTCLLPQLFNVGSLPANDQLHSLLRNPHLHLDVILPNKRQPLFSAFPIPAVQDVDNCHTGWDPQAQRYFLHSGQVCPRSPFSGHFLLH	50726	40014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_40140_46542_46690_47357_47464_48074_48266_49012_49118_49189
783471	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_95667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
783474	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_95907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
783475	contig_6831_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_165145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	518	817	56784	56485	NA	30	TAAAGTGCTTTCTTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWDYLRDFVTGLGSFQKAGELIVHPLKDKASVKGQLWVRGSPCEPTNQQSLGPRNESLNVVLDKQVPSPHPTSSALFTYHSHSCHATASYFWGRNGSI	57301	54840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_-_54800_57300
783477	contig_13453_pilon	+	1426	6	Intergenic	novelGene_146727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_5	63.3068716649307	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	393	1193	167437	185512	FALSE	15	CATGTTTTGTCTGTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNACLGWKKARQEGGYRSEMAYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSNSWEGNRASQTLSFKEIALLKAVLAAGLYDNLGKIIYTKSVDVTEKLACMVETAQGKAQVHPSSVNRELQTYGWLLYQEKVRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSVDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENNN	167044	185745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_167556_167968_168063_173658_173962_175345_175478_182908_183006_185456
783480	contig_1154_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_87034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34281	36452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_34300_36500
783481	contig_3132_pilon	+	1949	16	Intergenic	novelGene_127403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	53.8204422129733	2	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	461	1582	13928	23874	FALSE	35	AAATACATTGTTTCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQCNSFKTGVTHSAPASASLYKSPEYESLGFELTVERLVSIGYPQELLGFAYDSTFPTRGLVFDTLYGNLLKVDAYGNLLVCAHGFNFIRGPETREQYPNKFIQRDDTERFYILNTLFNLPETYLLACLVDFFTNCPRYASCDTGFKDGDLFMSYRSMFQDVRDAVDWVHYKGSLKEKTVESLEKYVVKDGKLPLLLSRMKEVGKVFLATNSDYKYTDKIMTYLFDFPHGPKPGSSHRPWQSYFDLILVDARKPLFFGEGTVLRQVDTKTGKLKIGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAKGKDILYIGDHIFGDILKSKKRQGWRTFLVIPELAQELHVWTDKSSLFEELQSLDIFLAELYKHLDSSSNERPDISSIQRRIKKVTHDMDMCYGMMGSLFRSGSRQTLFASQVMRYADLYAASFINLLYYPFSYLFRAAHILMPHESTVEHTHVDINEMESPLATRNRTSVDFKDTDYKRHQLTRSISEIKPPNLFPLAPQEITHCHDEDDDEEEEEEEEEEE	3538	24241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_3601_7470_7589_8405_8502_12587_12680_12806_12865_13893_13988_14685_14740_16622_16707_17745_17788_19617_19726_20015_20083_20755_20927_22579_22632_22741_22803_22953_23131_23628
783485	contig_8681_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_157197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCATATTGTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108187	109131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_108200_109100
783500	contig_14441_pilon	-	1071	5	Intergenic	novelGene_100430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	3	566	117794	116671	TRUE	35	GGCGGGTCAGACGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGLKKALTCTAPDHGTDVLGDGLGPGLSPLVVGREPIELDLAAEVVAGIVPEGGRHSQAAAQAVAGVIGAGLQPRLGVRADPAEGHLAIHPPAQLHVVGVEAGG	117796	81886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_81944_82062_82369_113662_113707_116572_116971_117530
783502	contig_4674_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_174144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTTTGGCCCCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306978	307527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_307000_307500
783503	contig_9683_pilon	+	906	4	Intergenic	novelGene_151299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	68.3243896586147	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	355	810	932610	936708	FALSE	10	TTTGTGCCTCATTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPDRSQQERDPWYDWDHSDLRLNWGEPLHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMCKHLFGFVAFMLFMFWVGEKYPSYQPVGPKQYPYNDLYLERGGDPSKEPEPVVHYEI	932255	936804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_932717_934040_934141_934565_934722_936615
783512	contig_9375_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_136068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGCCCCCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415908	415439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_415400_415900
783513	contig_13424_pilon	-	2092	5	Intergenic	novelGene_151595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	8.90224690738243	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	684	1370	39524	20704	FALSE	50	GTAGCAACCTCAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITALTLQNREACQEQSLILTVVGPILDILASLLRQGEEIIHNPHHVSLAFSILLAVPVDRLKPLEYGSIFPRIHNVLFSILQCHPKVMLKAIPSFLNSFNRLVFSVMQEGRQKDKGSTEDLTMVLECARLVERMYSHIAAKAEEFTVFSPFMVSQYVTEVQKVTLYPAVKDLLQEGIYLILDLCLERDIQFLRVSLQPGVREVFKELYNDYLKYHKAKHEGEKRYTV	40207	19981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_-_20902_31364_31505_34102_34191_37499_37743_39506
783514	contig_11321_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_86650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTAGTGTCTTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95578	96004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_95600_96000
783515	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	53	514	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783518	contig_8044_pilon	+	2171	16	Intergenic	novelGene_132368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_1	165.979061597808	701	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	174	1643	353086	386963	FALSE	20	CCACCAGAGTGTTTCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKDLGMDDLGVYSCDVTDTDGIASSYLIDEEELKRLLALSQEHKFPTVPIKSELAVEILEKGQVRFWMQAEKLSGNAKVSYIFNDKEIFEGPKYKMHIDRNTGIIEMFMEKLQDEDEGTYTFQLQDGKATGHSTLVLIDDAYKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFAEYLSWEVTSDCNVLLKCKVANIKKETNIVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAFKELMTEVCKTIALSATDLKIQSTAEGIRLYSFVPYYLDDLKVSWSQNGTAVKYTDRVKSGVTGEQIWLQINEPTPNDKGKYVMELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	351414	387491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_351581_353078_353186_353303_353349_362064_362202_364428_364574_365301_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
783519	contig_19851_pilon	+	942	7	Intergenic	novelGene_29831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3181.21203317226	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	175	690	53637	56177	TRUE	25	TTTTTTTAATAAACTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53462	56502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006_56413_56485
783520	contig_15354_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_65727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTGCCCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570141	569696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_569700_570100
783522	contig_15744_pilon	+	581	4	Intergenic	novelGene_83582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1695.39631551642	212	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	59	367	149562	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152340_153245
783523	contig_4876_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_137891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAATACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325664	326357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_325700_326400
783524	contig_9727_pilon	+	1864	6	Intergenic	novelGene_86255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	44.1225565895722	218	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	37	1257	28167	30780	FALSE	25	GACTGTGGTAGTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDFPVRVRKLCCMCGCGEPRWAWGRCAPSPMLLLSLLLSAAPFGLLGEETRQVSLEVIPGWLGSPQNLLHIRAVGTNSTLHYVWSSLGPPAVLLVATNTPHSSLVVNWSCLLSPEPDEGLMVLPKDSIQFSSALVFTRLFEFDSTNVSDVAAKFPGKPYPPYPLAEFSWNNITDSLDPATLSATFRGHPMHDPTNAFANGSLAFRVQAFSGSGRPIQPPRLLHTADTCQLEVALCGASPRGNRSLFGLEVATLSQGPDCPSVQEQLSIDDEYTPAVFQLDQLLWDALPSGFMQWRPVAFSQKQRGRESALPCQVSPLHPTLEYPLPQSPIVRAFFGSQTNFCAFNLTFGASTGPGYWDHYYFSWSMLLGVGSPPVDTLSALVLGIMAVALGAPGLMLLGGGLILLLRHKRYSEYQPIN	28130	31387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_28287_28804_29063_29229_29431_29542_29762_30245_30503_30614
783527	contig_12257_pilon	-	2675	3	Intergenic	novelGene_152097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	143	1	126	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTTGTACTTCTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148475	116471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_118821_138594_138695_148249
783528	SIRV6	+	494	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031
783534	contig_6208_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_53003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422023	423662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_422000_423700
783535	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	31	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783541	contig_13924_pilon	+	1564	3	Intergenic	novelGene_147780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	6.5	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	55	579	38863	48768	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKATSTPATGGACSVSVEETEKWMEAAMYMAKDALENLEVPVGCLMVYNNEIVGKGRNEVNQTKNATRHAEMVAIDQVLDWCHHSGKSPSEVFEHTVLYVTVEPCIMCAAALRLMSILGLHGVMSCPLPMNTKTIIHITRSGIYETNHRRFMLQKIVPLGQKKKIVKKPFHF	38808	49753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_38959_45541_45647_48444
783542	contig_2596_pilon	+	1065	4	Intergenic	novelGene_53490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	90.2748888426652	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	487	903	735310	739418	FALSE	35	GTAAGGGAAATAGCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVSSAPRLTTPVGNLTCRHTTIILNRVAPLLPNILKLPVRTVTYFSSRKGKRKTVKAVIYRFLRLHSGLWLRRKAGYKKKLWKKTPARKRRLREFVFCNKTQSKLLDKMTTSFWKRRNWYANDPYQIYHDRTNLKV	722782	739580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_723162_735202_735393_736062_736208_739229
783544	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
783546	contig_9267_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_162004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTTTGTAAACATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161383	160976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_161000_161400
783547	contig_9267_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_162003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160326	159756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_159800_160300
783550	contig_3817_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_78369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	519	1037	639717	640235	NA	15	CTTCTGTTTAAACCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTLPSQPASRQGRRSFQPWGACLAWAAPTVNSAITRDHTSCLHLLFLNSIEWLSVNGLKRMCRYLWVRLVAMVMFKECERAVCAGHKGPVLEPAVCTMLALDRRTRLPTSLSPLCLGRNRVSCDSWTVESRLGTVVTKRCECVQGSGCVLSAYQGKCYRFIPKVLIGTTF	639198	641350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_639200_641400
783551	contig_5947_pilon	-	1267	9	Intergenic	novelGene_101514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	72.5908913018707	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	24	1058	442078	431265	FALSE	25	CTTATTTTGCTGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGCCCNMFEELGLIGTIGEDEDVPLEPESDSGDEEEEGPIVLGRRQKALQKNRSADFNPDFIFTEKEGLYDGSWAMADVLSQLKKKRAATTLDEKIEKVRKQRKTQHKEARSAKSEKEKEAIESSEPEEQEDLEGKDKDGSEDEDSETDYSSADENILTKADTLKVKERKKKKGQEAGGFFEDASQYDESLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAAVTRVLVLVPTRELGIQVHSVTKQLAQFCSITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSSIEVLILDEADRYT	442101	431055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_431426_432222_432397_434531_434638_435430_435518_435643_435685_435956_436123_436374_436435_438527_438675_441985
783552	contig_6361_pilon	+	666	5	Intergenic	novelGene_24015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	245	574	415471	424138	FALSE	50	CTATGCAAAAAACAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQTVITDGSRDAIFGPVVGPHCDTCSTQTAFIHVTSNLTCKALNAKCSTKTDFAIGEAITQASVPVGGLDWRTTPRLRHNDHLGRLHFQCRLLKGLENCKPKTIPHY	411048	424230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411212_415389_415503_419464_419589_420868_421003_424098
783559	contig_10861_pilon	-	1543	10	Intergenic	novelGene_39342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.671877644283	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	108	710	1492200	1490178	FALSE	20	AAACTGCTTCCTCAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTEVPAGAAEGEECVSVPGKEENSPRGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAVKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRPGDGSREGIS	1493831	1489344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1490212_1490364_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490963_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493750
783562	contig_3942_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_128714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCCCTAATAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444356	445149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_444400_445100
783569	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
783571	contig_3095_pilon	+	1055	5	Intergenic	novelGene_75185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2237.16912358007	4	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	23	949	220513	227138	FALSE	25	TTAGCTACCTAATCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWDSNSNDRAHRECGLRLGVGRGPRGHRGGYHPHHPWPALRRCLETPRVLVSCTLQERKVAGTMSIYKNRRVDLLCDLALLSGQVHHIPSLLLRLFLSLLLWDLRC	220490	227244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226653_226824_226994
783572	contig_11292_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_109383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	14.6562462982701	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	74	940	6987	12447	FALSE	30	CCAACTGAAAGCCTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAGGSITGLKFNPLNTNQFFTSSMEGTTRLQDFKGNTLRVFTSSGTCNFWFCSLDVSAGSRVVVTGDNAGQVVLLNMDGKELWNLRLHKKKVTHVALNPCCDWLLATASVDQTVKIWDLRQVRGKSSFLSSLPHRHPVNAACFSPDGARLLTTDQNSEIRVYSASQWDCPLGVIPHPHRHFQHLTPIKATWHPRYNLIFVGRYPDPNFKSCTPHELRTIDVFDGSSGNMMCQLYDPEYSGIISLNEFNPMGDTLASVMGYHILIWSQEEAGIQKRETVTKVCAKQGLGATNGNKSCEKRQLSVKGLKVYKS	6913	12698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_7061_8364_8465_8555_8734_9051_9195_10733_10899_11038_11085_12286
783577	contig_7171_pilon	-	935	9	Intergenic	novelGene_101184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	365.047599635993	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	220	684	49603	37659	FALSE	5	CCTGTGTCTCTGGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50453	37407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_49818_50308
783578	contig_8330_pilon	-	1653	9	Intergenic	novelGene_71746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_8	37.0048561002472	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	91	636	526197	520306	TRUE	10	GTCAGTCTTCCCTACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSDWHLAVKLADQPLAPKSILRLPETELGEYSLGGYSISFLKQLIAGKLQESVPDPELIDLIYCGRKLKDDQTLDFYGIQPGSTVHVLRKSWPEPDQKPEPVDKVAAMREFRVLHTALHSSSSYREAVFKMLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGKCRSELEEVGVVGRGETRKKQLP	527605	517905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_527544
783579	contig_7815_pilon	-	2257	7	Intergenic	novelGene_134368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	49.6199444668058	60	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	4	861	343805	318884	FALSE	80	AAAAAAAAAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDTPFEEGMLSPSAADMRPEPPNSLDLNGAHPQRIKLTAPNINLSLDQSEGSVLSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGHEDLTANKDSGQESESIPEYTAEEEREDNRLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYRRVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYLNGATPRRKMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSKIKYVSSLSELSGLIPMDCIHIPESIIK	343808	317487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_318987_323833_323921_325074_325207_325835_325939_332591_332766_341550_341752_343747
783580	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
783581	SIRV6	+	256	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2049	572	31	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
783582	contig_19957_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_57732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTTAAAGAAAGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281317	283147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_281300_283100
783586	contig_6876_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_147028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTAGAGTAGCATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166321	164668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_164700_166300
783587	contig_6129_pilon	+	2325	1	Intergenic	novelGene_159962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCCAGTGGTGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20685	23010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_+_20700_23000
783588	contig_15236_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_141606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTATGATAGAGCTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567206	569190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_567200_569200
783589	contig_13633_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_15328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTTTTTCTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21450	23287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_21400_23300
783590	contig_16103_pilon	+	1452	5	Intergenic	novelGene_118734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	153.968137937692	625	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	290	670	296045	303559	FALSE	15	GATCCAGCCTGGACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSAPKVVLKSTTKMSLNERFTNMLKNKQPMPVTIRASMQQQQQLASARNRRLAQQMESRPSVQAALKLKQKSLKQRLGKSNIQARLGRPIGALARGAIGGRGLPIIQRGLPRGGLRGGRATSV	294841	304341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_296110_297637_297792_300401_300557_303552
783591	contig_4812_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_103686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	158	385	188081	188308	NA	30	TGGCTAATTTTTCAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVGVAVSESLARPGVLRGCSGLSSSCAARAQWDARFRDWSPLPAPSVRPVLMIVGDVIGSCYNDIKTQAHAGIWAFAPLLPRVCFLGPLHPSHSMVHLGCSWSTCELRALRKGTRYFELLVEHARL	187923	188594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_187900_188600
783592	contig_11492_pilon	+	1281	11	Intergenic	novelGene_152255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.9019042240149	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	86	838	394652	486678	FALSE	10	CTCTGAGCACCTCGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGEQSICQARASVMVYDDTSKKWIPIKPGQQGFSRINIYHNTASNTFRVVGVKLQDQQVVINYSIVKGLKYNQATPTFHQWRDARQVYGLNFASGGGGLMEEMNKLLAKRRKAASQTDKPADKREDESQTEDPSTSPSPGTRAASQPPNSSEAGRKPWERSNSVEKPVSSLLSRTPSVAKSPEAKSPLQSQPHSRMKPAGSVNDVALDALDFDRMKQEILEEVVRELHRVKEEIIEAIRQELSGISTT	394566	487121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_394663_420235_420405_431936_432043_474813_474863_477958_478020_479357_479422_480854_480922_481010_481074_483808_483876_484297_484356_486640
783593	contig_16635_pilon	+	732	4	Intergenic	novelGene_153135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_3	391.402889900193	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	174	578	86080	88670	FALSE	20	ACTTTTAGGACTTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLEWIEMPVMPDISAH	53052	88824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_87773_88626
783600	contig_13525_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_145090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTAGAGAGAAAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80725	81632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_80700_81600
783601	contig_1399_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_166667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACATTGTTTACAGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98077	97495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_97500_98100
783607	SIRV6	+	239	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8459	11	280	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
783611	contig_5300_pilon	+	2178	2	Intergenic	novelGene_144235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	8601	8906	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIRTLKNSNIFLGIQKAICMSKIQEEVTLVDSVYRNQSYPNTKARQRDHNKRKLQSNIPYECRSKNPQKILVNIIQQHIKRITQHDQVEFIPGTQVWFNI	8599	11463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_+_10199_10884
783613	contig_14142_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_120465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAGGAAAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147218	145395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_145400_147200
783614	contig_678_pilon	-	1822	3	Intergenic	novelGene_167798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	748.5	94	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1140	1487	125444	48497	FALSE	25	AGTTTATGGTAATTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPPETTSKMASVRFMVTPTKIDDIPGLSDTSPDLSSRSSSRVRFSSRESVPETSRSEPMSDMSGATTSLGTVALDPASDRTSNPQDVTEDPSQNSITGEHSQLLGYGTSDGMSH	126583	48161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_48529_58505_58551_125173
783616	contig_10148_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_172868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTAGGGTTCAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297395	298605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_297400_298600
783619	contig_9239_pilon	+	1391	5	Intergenic	novelGene_137168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	142.299639844941	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	8	493	100978	109517	TRUE	10	ATCATGTCTTGTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STMSRQSNRGTESKKMSSELFTLTYGALVTQLCKDYENDEDVNKQLDKMGYNIGVRLIEDFLARSNVGRCHDFRETADVIAKVAFKMYLGITPSITNWSPAGDEFSLILENNPLVDFVELPDNHSSLIYSNLLCGVLRGALEMVSAALGLLGHLKCSSGMVNV	100970	110679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_107248_107347_107581_107682_109271_110297_110560
783622	contig_7058_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_136025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGAAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176456	176960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_176500_177000
783625	contig_20610_pilon	+	1482	4	Intergenic	novelGene_67643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	154.34377214517	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	272	412	49863	50003	TRUE	30	CAATGAGACATGCTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSTSPQSKATSGTPRITKQPSSTSGRIPLLTHPFRKQHACDRSFRAFDWWIRRAGLRRLVQRKSSHRRPRAHSFIRSYFPAGCSSCVGVMVDVMELPKSRVNASMLAQFINQPVCFVGKLEKVRGLAASGYPVRR	49591	53413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_50507_51483_51559_52403_52513_53030
783627	contig_15219_pilon	+	981	3	Intergenic	novelGene_40838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_2	121	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	24170	25321	FALSE	80	CATCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGRDSFPWEVPKKLKY	24168	25920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_24314_24453_24588_25218
783630	contig_12624_pilon	+	394	2	Intergenic	novelGene_61024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	92	394	851408	851710	FALSE	5	GTGTGTGTTCTTTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHSGFQQYQQADASKQLWNPPQVQGPLGKIMPVKQPYYLQTQDPIKLFEPSLPPPVMQQQPLEKKMKPFPMEPYNHNPSEVKVPEFYWDSSYNMADNRAVMAQQANIDRRGKRSPGVFRPEQDPVPRMPFE	850686	851710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_850709_851338
783631	contig_12379_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_148930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96974	95697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_95700_97000
783632	contig_5988_pilon	-	1074	4	Intergenic	novelGene_15877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	79.6673640136843	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	44	571	390673	387838	FALSE	25	ACAACCCCTGTGCCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	390716	387334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390433_390653
783635	contig_7887_pilon	-	1496	8	Intergenic	novelGene_124878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	17.5487658732308	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	195	980	231498	229179	FALSE	10	GACTGCGGTTATGTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARLKEVLEYNAIGGKYNRGLTVLAAFQELVEPKKQDADSLQRVLTVGWCVELLQAFFLVLDDIMDSSLTRRGQLCWYKKPGIGLDAINDALLMEACIYRLLKLYCREKPYYLNLIELFLQTTYQTETGQTLDLITAPQGDVDLDRFTEKRYKSIVKYKTAFYSFYLPVAAAMYMAGIDGEEEHANAKKILLEMGEFFQIQDDYLDLFGDPSVTGKVGTDIQDNKCSWLVVQCLQRASPEQRQILQVPRRGSWVPGLMRKGIEQWFSTGGGSVPRGTLGHVCRHVLVSQLNGREESACSWHLSSAQMPVMPLNILQCTDSPHNKE	238686	228662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_229554_229655_229734_230434_230508_230600_230690_231172_231296_231450_231532_236391_236533_238666
783636	contig_1948_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_31186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTAGAAGTCATGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549790	550378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_549800_550400
783638	contig_14687_pilon	+	1897	2	Intergenic	novelGene_107881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	360	632	22392	22664	FALSE	15	GCCCAGCTGTCGTCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLLRLAAAAPRARRAGSYGASRLAPGCGQPWRPPGTAKGGGKLGALGAGPSRRTGTTCTRSTQWTGQLPSWTSWPRPTTPTTAETATITGCWSPSGPRRPPARPVTCPERYGSWRRRRLMTSGARENPIQVPRSSREAAGARERRPEDVPHPDLAWLPATHHKGSLPNPCFGVGCTGTARSRFLGSLGKCGRLDSSHPARLCGRGRRGD	21456	23929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_21607_22182
783640	contig_12841_pilon	-	1506	9	Intergenic	novelGene_55885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_8	8.03021637317451	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	221	1072	866576	855189	FALSE	20	TATGACTTGCTAGAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVEFSTSGHAYTDTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISLENKLAEGLKLTLDTIFVPNTGKKSGKLKASYKRDCFSLGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNNFALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYKLDCRTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA	869283	854754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_855281_856125_856184_857007_857159_858441_858670_859798_859852_860847_861001_865222_865273_866509_866579_869065
783641	contig_19957_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_57701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTTGCCTAATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146194	145349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_145300_146200
783642	contig_6001_pilon	-	1511	5	Intergenic	novelGene_128039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	37.9835490706174	163	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	66	908	623579	615898	FALSE	20	CAGCAGTTTGAAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQDLSEALKEATKELHTQAENAEFMKNFQKGQVTRESFKLVMASLYHIYVALEEEIERNKENAVYAPLYFPEELHRRAALEEDMAFWYGPDWQEAIPYTAATRSYVRRLHEVGCMEPELLVAHAYTRYLGDLSGGQVLKKIAQKALDLPSSGEGLAFFTFPNIASATKFKQLYRARMNTLEMSPKVRQRAIEEAKTAFLLNIQLFEELQGLLTQDTAGQSSSTTPRLRRQEGGGVQESTPTKTPRGKPQLNIASQSLLLRWVLTFSFLVATVAVGLYAI	625901	615294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_616029_618194_618295_621029_621522_623459_623581_625837
783644	contig_240_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_173789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCACTGAATTGTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253859	254361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_253900_254400
783645	contig_6504_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_158780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221440	222178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_221400_222200
783648	contig_5643_pilon	-	2008	9	Intergenic	novelGene_38888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	103.791181585913	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	470	1072	244850	240272	FALSE	45	TCTTTAATAATAATGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRKRERKAASEEDPSLSESDGPRQPDGDEEESTALSINEEMQRMLNQLREYDFEDDCDSLTWEETEETLLLWEDFSGYAMAAAEAQGEQQEDSLEKVIKDTESLFKTREKEYQETIDQIELELATAKNDMNRHLHEYMEMCSMKRGLDVQMETCRRLITQSGDRKSPAFTAVPLSDPPPPPSEAEDSDRDVSSDSSMR	251721	239335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_240378_241031_241163_244098_244195_244461_244583_244701_244884_245887_246042_247277_247374_247516_247578_251596
783652	contig_5643_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_39160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAAGGTCGGCAGTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700594	701754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_700600_701800
783653	contig_821_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_149397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGGTTAAGAGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168728	168986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_168700_169000
783656	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
783659	contig_5019_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_109199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCATAATTTATAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155483	157913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_155500_157900
783665	contig_13558_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_123004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	160	1119	40701	41660	FALSE	80	AACCAATAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36703	41881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655
783666	contig_9505_pilon	+	1751	3	Intergenic	novelGene_121871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	60	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTAGTGTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650721	678071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652596_676428
783669	contig_2940_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_81995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTCAATTCCAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142585	1143289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1142600_1143300
783670	contig_10011_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_68055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210587	211492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_210600_211500
783671	contig_12128_pilon	-	1716	4	Intergenic	novelGene_131973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	99.1878128714522	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTTTGCATTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280897	193723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_195106_195873_196027_280623_280724_280816
783676	contig_10437_pilon	+	2062	6	Intergenic	novelGene_38429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	26.0537905111713	591	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	201	944	833635	835896	FALSE	20	TAATTGTGGGGGAACGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAVFFGCTFVAFGPAFALFLITVAGDPLRVIILVAGAFFWLVSLLLASVVWFILVHVTDRSDARLQYGLLIFGAAVSVLLQEVFRFAYYKLLKKADEGLASLSEDGRSPISIRQMAYVSGLSFGIISGVFSVINILADALGPGVVGIHGDSPYYFLTSAFLTAAIILLHTFWGVVFFDACERRRFWALGLVVGSHLLTSGLTFLNPWYEASLLPIYAVTVFMGLWAFVTAGGSLRSIQHCLSCKD	833434	837014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_833748_834291_834463_834628_834703_834936_835060_835210_835339_835761
783678	contig_15067_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_154349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATATCTTTGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263238	263627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_263200_263600
783684	contig_709_pilon	-	1310	5	Intergenic	novelGene_57596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	94.9038987607991	40	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	226	867	2332133	2326707	FALSE	20	TGAGCCAGATTCATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQITQRKNEKEQERRMQQAMLSRPVPSENLESGFSPRMPYSAFAAEGRSTLGDAEASDPPPPYSDFHPNNQESTLSHSRMESSVFMPRPQAVGSSNYASTSTGLKYPAGGADLPPSQRAAGDSGDESDDSDYENLIDPTEPSNSECPHSRDSRPVTHPDGDSRDTQTSQI	2334277	2326263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2327177_2329518_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200
783686	contig_7410_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_106053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	463	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95344	93813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_93800_95300
783687	contig_7378_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_120282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582112	584262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_582100_584300
783689	contig_7563_pilon	+	1408	2	Intergenic	novelGene_145552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTTTTAGCTTTAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89910	91604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_+_90587_90872
783691	contig_17501_pilon	+	1848	6	Intergenic	novelGene_174155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.09065454189081	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAAGGTTGACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32776	70230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17501_pilon_+_32961_63272_63400_67154_67300_67652_67754_67843_67974_69069
783694	contig_8310_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_75584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGAAAGGAAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295482	296709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_295500_296700
783697	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_92416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783700	contig_6839_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_161876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCAAGGAGATACAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295815	294445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_-_294400_295800
783702	contig_20890_pilon	+	1217	5	Intergenic	novelGene_147045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTTTAAAAATTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21157	45633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_21902_29613_29791_42126_42207_42590_42704_45530
783706	contig_9218_pilon	+	2214	10	Intergenic	novelGene_157677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	124.463391414782	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	171	1166	264852	303097	FALSE	35	ATTGTTTATCAAAGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSVEQKKGPTRQRKCGFCKSNRDKECGQLLISENQKVAAHHKCMMCSLCHCPGATIGCDVKTCHRTYHYHCALHDKAQIREKPSQGIYMVYCRKHKKTAYNSEADLEESFNEHELEPSSPKNKKKSRKGRPRKTNFKGLSEDTRSTSSHGTDEMESSSYRDRSPHRSSPSDTRPKCGFCHVGEEENEARGKLHIFNAKKAAAHYKCMLFSSGTVQLTTTSRAEFGDFDIKTVLQEIKRGKRMKCTLCSQPGATIGCEIKACVKTYHYHCGVQDKAKYIENMSRGIYKLYCKNHSGNDERDEEDEERESKSRGKVEIDQQQLTQQQLNGN	260758	304463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_260883_264805_264990_279861_279996_280262_280307_290833_291001_291154_291299_292787_292893_295644_295779_302967_303098_303415
783707	contig_5684_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_81016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4.54606056566195	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGTGAACTCGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369132	351253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_366669_366740_366896_367046_369036
783708	contig_18414_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_170012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGGTTTGGTATTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89702	88837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_88800_89700
783709	contig_18414_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_170011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAAAAAAAAAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88493	87395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_87400_88500
783711	contig_8330_pilon	+	1314	9	Intergenic	novelGene_71761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	252.597722426391	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	767	1084	657181	658351	FALSE	5	CCCCTGGTACCGGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	644820	658581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_644880_648212_648365_649087_649305_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
783713	SIRV6	+	348	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-41	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3162_10721
783717	SIRV6	+	294	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	603	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTTTGTCGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106
783721	contig_14984_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_174161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109905	110700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_+_109900_110700
783722	contig_14029_pilon	+	1131	6	Intergenic	novelGene_151939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_2	248.830544748831	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	28	363	131703	133382	TRUE	45	CACACAAGAAAGTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSEYVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLRYRIYLNIHLFSNSTFMIPISVFKMHTN	131675	135618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133600_133959_134021_134104_134162_134258_134319_135245
783723	SIRV5	+	354	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	152	48	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
783724	contig_9668_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_58079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGCAACTTAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62332	61084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_61100_62300
783725	contig_9839_pilon	+	1041	4	Intergenic	novelGene_88581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	116.848429837784	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	383	826	335855	336298	FALSE	35	AAATAACTTCTCACTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTINRSMDPKNMFAIWRVPAPFKPITRKGVGQRMGGGKGAIDHYVTPVKAGRLIVEMGGRCEFKEVQGFLNQVARRLPFAAKAVSRETLEKMQKDQEERERNNQNPWTFERIATANMLGIRKVLSPYDLAQKGRYWGKFYMPERV	331238	336513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331364_331783_331850_334831_334981_335812
783727	SIRV4	-	300	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1223	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3935	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
783730	contig_4580_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_173387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGCAGTGAATCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160663	162668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_+_160700_162700
783733	contig_7979_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_125525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTTTAGGTCTTTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378248	377597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_377600_378200
783734	contig_15029_pilon	+	1523	4	Intergenic	novelGene_128227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	2.05480466765633	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	108	491	523694	568266	FALSE	20	TTGCTCTGAATAAGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPSEEAVSSSSEDDSGTDREDEGSVSQRSTPVKMTDTGDSAKVMENVVQPMKEVYGINLSDGLSEDDLSIYSRFVQLGQSQHKQDKSSQQHCSKCSEGVIKLTPISAFSQDNIYEVQPPRVDRKSTEIFQAHIQASKGIMQPLGKEDTSTYREYIRNRYL	523586	569298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_523730_524731_524815_528850_528938_568088
783736	contig_5451_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_167170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCTTACCTAATAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430963	431320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_431000_431300
783737	SIRV6	+	498	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	514	-1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
783740	SIRV4	-	308	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1215	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
783742	SIRV4	+	334	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCACAAACTGCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
783743	contig_9915_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_174168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCAAACTGTTGAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459612	458773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_458800_459600
783744	contig_5009_pilon	-	858	5	Intergenic	novelGene_119253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	199.5426019676	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTAGTATGCATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50266	43076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43540_43812_43900_44537_44622_47700_47792_50133
783748	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	51	521	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783749	contig_9505_pilon	+	1234	11	Intergenic	novelGene_121823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	38.817650624426	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	443	1069	423416	447348	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLNAGNLCSLNYGEGPKAHIRRLAECIRWSYGAGIVLRLGNIARLELNYCIPMGVQRGDRICDGVQFGAGIRFL	404052	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417406_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438046_438750_438893_447302
783754	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
783756	contig_5935_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_102768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACTGATGGCATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402930	1402499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1402500_1402900
783760	contig_2444_pilon	-	556	4	Intergenic	novelGene_83761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	138	446	229702	227685	FALSE	20	ATGATATCTAGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGPGERACALVGLFPTLTCLESGIAGLFLRWDRESRVPAAATRGMAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229839	227574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
783762	contig_18506_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_67955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCAGGAAGGTACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23420	23856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_23400_23900
783765	contig_5084_pilon	+	1572	8	Intergenic	novelGene_64504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347991	353700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_348126_348371_348483_349383_350027_350978_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383
783767	contig_6589_pilon	-	977	9	Intergenic	novelGene_26191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	103.661031130314	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	42	950	1950197	1936442	FALSE	20	AGGCGCTTGGACTCGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHGKNCTAGAVYTYHEKKKDTAASGYGTQNIRLSRDAVKDFDCCCLSLQPCHDPVVTPDGYLYEREAILEYILHQKKEIARQMKAYEKQRGARREEQKELQRAAAQDQVRGFLEKEAAIVSRPLNPFTPKAASSGNGPDDAQPGPSAGPASKDKDKALPSFWIPSLTPEAKATKLEKPSRTVTCPMSGKPLRMSDLTPVRFTPLDSSVDRVGLITRSERYVCAVTRDSLSNATPCAVLRPSGAVVTVECVEKLIRKDMVDPVNGEKLTDHDIIVLQRGGTGFAGSGVKLQAEKSRPVMQA	1953415	1936414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1936514_1936951_1937061_1937166_1937355_1937504_1937624_1937714_1937878_1941840_1941923_1949540_1949647_1950127_1950199_1953375
783771	SIRV4	-	249	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1264	8	1264	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3894	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
783779	contig_4496_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_66653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742677	744633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_742700_744600
783780	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	532	2	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
783782	contig_12837_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_57327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGTCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147118	147317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_147100_147300
783784	contig_16122_pilon	-	1347	6	Intergenic	novelGene_134489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	109.590875532592	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	52	420	110548	104895	TRUE	65	GAAAAAAAAAAATCATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFDPGRVRH	110599	103696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_105255_105407_108757_108867_110332_110368_110497
783785	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
783786	contig_6871_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_21655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGCATCCCACATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762108	760919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_760900_762100
783787	contig_8616_pilon	-	859	9	Intergenic	novelGene_72452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	64.6408346171366	1102	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	450	659	272117	271262	FALSE	15	TGGAAGTGTTATCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATTGSGVDAAVKPPREYVLPHLPGARDLAAPALFRPQPAQHGEAEALHRGGGDLHGEPYRIKTLWGQTWEFNKFLSDDSEASQSLRYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS	274348	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271276_271486_271521_271722_271795_271904_271971_272093_272145_272904_273065_273281_273368_274039_274150_274282
783788	contig_15777_pilon	+	1818	2	Intergenic	novelGene_75763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277172	279801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_277911_278721
783789	contig_13680_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_149598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAGAAAAAGTTTCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396895	397637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_396900_397600
783791	contig_6504_pilon	+	2586	8	Intergenic	novelGene_158778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTCAGGCTCCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175632	195357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_176994_178134_178294_180435_180601_184000_184193_185780_185973_186071_186316_189887_189997_195193
783792	contig_3307_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_86881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAAAGTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118046	120027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_118000_120000
783795	contig_9177_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_32656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	213	515	83121	83423	NA	65	CAAAATGATCTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAVSWWEKLASCYRCTFLSQRPSRCLGTRTDSSAHMESLQSYILPLLFLDPCSHPTKYFICFVLFLNYQPLTSGKSLRQSYSSSCLVLGQDLLCGKSK	82908	83933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_82900_83900
783796	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_95775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
783800	contig_10711_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_118430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1849	2172	755051	754728	NA	85	CAAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIVPLSRVVEAGVAAGQRCGWRNKYRQCCRLSRPGRSEAWGLGERTKQTKNNGERARDMKSDSSKSRVRDRQRRQSYTKYSSKPKHFSPCLSILNSCFLRWVLRTS	756899	754453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_754500_756900
783804	contig_7457_pilon	-	2218	1	Intergenic	novelGene_31553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGATTTACTAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830230	828012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_828000_830200
783806	contig_5718_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_110385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAGAATTGGGGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213602	1214645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1213600_1214600
783807	contig_5718_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_110386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	219	332	1215218	1215331	NA	35	AAGCATATGGGTGGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLEWEWGHYKSLIIILETLGGTVVKSYSCYPKGWQFKSTRHSLETLWGSSALSYRLPASESVWSWFIFILLLMPRTKSSFGVCIFKQGVNTNTNLWYLRWKLPPSVRSH	1214999	1215446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1215000_1215400
783809	contig_10013_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_125034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTCTTGGTTAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6269	7093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_6300_7100
783812	SIRV6	+	287	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10538	1	1301	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11538	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
783821	contig_3153_pilon	-	2385	1	Intergenic	novelGene_104692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATAAAAAAAGTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350663	348278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_348300_350700
783822	contig_8330_pilon	-	775	6	Intergenic	novelGene_71873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	529.433810782802	121	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTATTGTTCCATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962657	947119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_947288_950736_950861_953221_953344_955449_955567_961260_961374_962526
783824	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-6	510	1	-340	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGGTAGTCGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	1610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
783825	contig_1154_pilon	-	1698	11	Intergenic	novelGene_87134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	9.52680429105164	42	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	184	1431	757383	730544	FALSE	30	AGAATCAGGTGGGCTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDAVCNFVICNDSSLRGQPVIFNPDFFVEKLRHEKPEVFTELVVSNITRLIDLPGTELAQLMGEVDLKLPGGAGPASGFFRSLMSLKRKEKGVVFGSPLTEEGIAQIYQLIEYLHKNLRVEGLFRVPGNSVRQQILRDALNNGTDIDLESGEFHSNDVATLLKMFLGELPEPLLTHKHFHAHLKIADLMQFDDKGNKTNIPDKERQIEALQLLFLILPPPNRNLMKLLLDLLYQTAKKQDKNKMSAYNLALMFAPHVLWPKNATANDLQENITKLNNGMAFMIKHSQKLFKAPAYIRECARLHYLGSRTHASKDDLDLITSCHTKSFQLAKSQKRNRVDSCSHQEETQQRTEEALKDLFQHVHNMPESAKKKQLIRQFNKQSATQTPGQEPSIPWVQKRTRSRSFSGLIKRKVLGNQMMSEKKNKYPTPESVAIGELNRVSKENVNSLFSGSPAVKMTPTRLKWSEGKKEGKKGFL	757566	730276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_730555_733657_733737_734237_734349_736906_737006_738470_738663_740531_740598_746435_746523_747983_748211_753932_754143_755658_755740_757298
783833	contig_839_pilon	-	1114	9	Intergenic	novelGene_171537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	35.3639558731769	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	171	1112	482034	451785	FALSE	45	TGAGGACAGAAGGTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAVYTFGLGQFGQLGLGTFIFEASEPTVLEYVKDQKIRHVSCGENHTALITDVGHMYTFGDGRHGKLGLGLENFTNQFIPTLCSNFLKFIIHLVACGGCHMLVFAIPRRDAVEDICIEEIDDSCLSPVASLPVGDSASGSILQGTLSARVRRRERGKSPESIQMTRALPPTEGTLASADSFSASSVPFRLSTSNLPERTVSGKDSPMEPMEPDYFQDKMTKEKETDSSSVANSENLGETTDILNMTHVMSLNSNDKSLKLSPVQKQKEEKANGEERAIHEYNENPKGNMHSRTKKSSLEVHEDNESILSKDSKSKRGFLFKRMSLTSHKNISQPLPEIKPIGDQIIFKGNKKDANQNHMGQNHKDTSPA	485137	451782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_-_451944_458529_458619_459623_459682_472514_472581_472931_473030_478221_478394_480012_480199_481920_482046_484978
783835	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	0	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
783836	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
783838	contig_5690_pilon	+	1326	9	Intergenic	novelGene_119726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	542.379004364107	4	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	48	725	1044729	1088271	TRUE	45	CAAAAGAGAAATTTCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEISFKW	1044681	1105961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087803_1088262_1088346_1094155_1094243_1105521
783848	SIRV6	+	293	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
783854	contig_9609_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_23033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGCCTTGGAACTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329403	330276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_329400_330300
783855	contig_8801_pilon	-	1711	3	Intergenic	novelGene_66298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	80.5	586	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	290	1027	548049	545797	FALSE	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRWANRSHSQILLGQTLSAGAPRWGFTLISPRSLTSLHTCLGAMVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549260	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738_548273_549194
783859	contig_6434_pilon	+	2030	4	Intergenic	novelGene_61910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1509.37389521469	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	193	390	924065	925567	FALSE	20	CTGAGCTCTGGGGCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGGPLWKS	921559	927207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_921686_923998_924150_924283_924377_925547
783863	contig_11370_pilon	+	690	3	Intergenic	novelGene_98731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2677	21	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	137	445	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145694	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145897_147470_147616_148205
783864	contig_4783_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_108429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAAATTAATGAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450479	451621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_450500_451600
783865	contig_5337_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_136565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATTGGGGAAGATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348051	349560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_+_348100_349600
783867	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_94050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	657818	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657819	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
783868	contig_9799_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_145564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTGTGAAACAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988011	988963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_988000_989000
783869	contig_9799_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_145565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAGAAATCAGTAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992070	992501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_992100_992500
783872	contig_1154_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_87145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	720	1166	859207	858761	NA	20	ATCCGGCCCTACCTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALGQEPWRSIDHCGTSFSVPWPQPLLSQGNLKLGLPGPATRSPKKMLQAAAWWPLAGDGNCPFHATLVLLPEADQAEVSRFAKNFLPILFNLYGQPVAAGDTPAPRRTVLETIKTYLTITEPQVSWWRGGGMLSGRQVLGWACGKG	859926	857866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_857900_859900
783873	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783874	contig_253_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_129765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGTGGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754626	756004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_754600_756000
783875	contig_6876_pilon	+	1263	4	Intergenic	novelGene_147018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	85.3398435016663	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	154	1125	133885	141512	FALSE	40	CTGAACGTTATAAGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTQTVAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSFTRREGSLKLSSGLLETTSGALSL	126360	141650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_126490_133860_133906_140423_141165_141302
783876	contig_7009_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_23583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCAGCCAACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206905	206307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_206300_206900
783877	contig_11338_pilon	-	1432	10	Intergenic	novelGene_6302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	161.750150266116	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	29	1138	250534	209898	FALSE	5	TCTTGTACCTCGTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVWVTYTKGMRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQERLSLEKDIVLGNVEGQ	250562	209603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_209952_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_250509
783878	contig_2069_pilon	+	1432	5	Intergenic	novelGene_23355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	78	junction_4	11.5542200082913	160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	185	1117	947018	955281	FALSE	15	CTTTCTGTGGCTTCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAPTTAFGQVVIGPPGSGKTTYCLGMSEFLRALGRRVAVVNLDPANEGLPYECAVDVGELVGLADVMDALRLGPNGGLLYCMEYLEANMDWLHAKLNPLRDHYFLFDCPGQVELCTHHGALRSIFSQMVQWDLRLTAVHLVDSHYCTDPAKFISVLCTSLATMLHVELPHVNLLSKMDLIEHYGKLAFNLDYYTEVLDLSYLLDHLTSDPFFRHYRQLNEKLVQLIEDYSLVSFIPLNIQDKESIQRVLQAVDKANGYCFGVHEQRSLEAMMSAAVGADFHFSSTLGIQEKYLTPSDQSVEQEAMQL	946833	955596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_947429_947996_948154_949924_950086_951355_951487_955208
783882	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	51	529	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783884	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_92005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	657493	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657495	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
783887	contig_12410_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_167276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATCAAGTGACAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115036	113050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_113000_115000
783889	contig_5210_pilon	-	2550	15	Intergenic	novelGene_65481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	218.00478603621	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	10	2262	1204106	1101153	FALSE	0	CTTTTTTTGCCTCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRKKKVKEASESQSLAKKDAETSTSVSLKRKRKFEDAFIVISDSDGEQEPEEENGLQKTKMKQPSRAKCLAKRKIARTNFHPLGGDITSLKMHDPGCQIYWHKIVHEMTEEEQFALALKMSEQEAREVNSQEEEEEELLRKAIAESLNSCQPSDASATSSRPLAIGPSSQFHQEKTTDSGTTEGIWQLVPPSLFKGSHISQGNEAEEREEPWDHTENTEEEPVSGSSGSWDQSSQPVFENENVTCFDRCTGHLAEHTQCGKLQESTGRGCAQGRGDTSRHCLPTPADDRGFQSIGGTVHYFWGIPFCPAGVDPNQYTKVILCQLEVYQKSLKMAQRQLLKKKGFGEPVLPRPLSLIQNECGQGDQASEKNEGISEDMGDEDKEERQESRASVWLSEPKDFQESPIKSLKEKLLLEEEPTTSHGQSSQGLFVEETSEEGNSVPASQSIAALTSKRSLVLMPESSAEEITVCPETQLSSSETPDFEREVSPSSRETPDEVRIIMADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAMYCNGLMEQDTVLTRRQKEAKSKSKSDTGTAAQTSLDIDKSEKCYLCKSFVPFREYQCHVDSCLQLAKGDQGDGPSGSDSVCPVAEGKQQQRLRSTKEKGQNEGRLLSVLEQSEQQSADAEIKTTSSETGAFRVSSLGMEEAGCSREMQSSLAHLDINDSPIKSFVSISEATDCLVDFKKQFTVRPGSRARTKAGRGRRRKS	1204115	1100864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141824_1141979_1147997_1148102_1152584_1152662_1154692_1154758_1160900_1161623_1161930_1162037_1162767_1162893_1164212_1164303_1173672_1173761_1203959
783890	contig_3747_pilon	-	700	6	Intergenic	novelGene_24984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	420.113603683575	4488	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	25	549	271655	270395	FALSE	30	AAATTGCTTTTTTGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVLDLHEAGGEDFAMDEDGDESIHKLKEKAKKRKGRGFGSEEGSRARMREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEYGEIKNIHLNLDRRTGYLKGYTLVEYETYKEAQAAMEGLNGQDLMGQPISVDWCFVRGPPKSKRRGGRRRSRSPDRRRR	271679	270243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546_270684_270796_270934_271070_271149_271284_271345_271588
783891	contig_593_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_102003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGGGGGTAGGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348855	348351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_348400_348900
783893	contig_10074_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_57183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGGTAGGTAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564068	564541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_564100_564500
783894	contig_5050_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_110265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATGAGAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495240	493944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_493900_495200
783895	contig_2703_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_101849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATCATAATCTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369362	1371513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1369400_1371500
783896	SIRV6	+	333	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	527	11	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAGTTGTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
783898	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_96661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	653870	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653871	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
783899	contig_2636_pilon	-	739	4	Intergenic	novelGene_52092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_1	132.97702391349	156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	123	500	85555	61641	FALSE	40	TGATAATCTTATAATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVV	85677	61401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_61761_62471_62624_81113_81216_85551
783901	contig_14481_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_153859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAATTGCATTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212872	213621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_212900_213600
783908	contig_11378_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_112232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTATAGGAAGTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317499	315762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_315800_317500
783909	contig_8138_pilon	+	1216	6	Intergenic	novelGene_52463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	168	650	280295	306552	TRUE	15	ATCCTTCTTAGTAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280127	307932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306833_307646
783913	contig_14142_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_120582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAATTTCTTCCCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532043	530134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_530100_532000
783914	contig_5236_pilon	+	2047	7	Intergenic	novelGene_100933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	32.1022671404304	22	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	167	1192	965121	986227	FALSE	75	ACAGAAAAAAAAACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTGSQASDINELFGFFNDGAPPTKKPRKLLPSLKTKKPQELVLVIGTGISAAVAPQVPALKSWKGLIQALLDAAIDFDLLEDEESKKFQKCLHEDKNLVHVAHDLIQKLSPRTSNVRSTFFKDCLYEVFDDLESKMEDSGKQLLQSVLHLMENGALVLTTNFDNLLELYAADQGKQLESLDLTDEKKVLEWAQEKRKLSVLHIHGVYTNPSGIVLHPAGYQNVLRNTEVMREIQKLYENKSFLFLGCGWTVDDTTFQALFLEAVKHKSDLEHFMLVRRGDVDEFKKLREDMLDKGIKVISYGNEYADLPEYFKRLTCEISTRGRSGKMHSELEGSEQQL	928562	987082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_928586_964696_964833_965113_965207_969356_969610_979903_980132_983078_983208_985897
783915	contig_6424_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_109260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCTCTAATCAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17842	19580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_17800_19600
783916	contig_2867_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_135239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACATGCTAATTTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277532	1276840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1276800_1277500
783917	contig_2867_pilon	-	1492	7	Intergenic	novelGene_135237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	15.1703292280981	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	554	1441	1276186	1268923	FALSE	15	CTTCAAGCCGCCTCGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPCLLDPKLVLFLPAHPTCPHTSGDASPTHLISSPPAHPASSCGVPSFPPNIAARVVGGENAVAHSWPWQISLQYFANGTWWHTCGGTLIANNFVLTAAHCISDSLIYRVGLGKNNLSVKDEEGSLFVGVDTIFVHERWNSFLIRNDIALIKLAKSVELSDTIQVACLPEKDSVLPQDFPCYVTGWGRLWTDGPIAEELQQGLLLVVKHATCRRLDWWGLLVTNKMVCAGGDGVVSACNGDSGGPLNCQAENGSWEVHGIVSFGSGRGCNIPKKPTVFTRVSAYIDWIKKKLQL	1276739	1268871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1268938_1270891_1271045_1271895_1272042_1272998_1273136_1273933_1274060_1275777_1275876_1275973
783918	contig_3004_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_127479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGTATGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275358	273344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_273300_275400
783921	contig_15114_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_121191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGGTTAAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734230	733076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_733100_734200
783922	contig_4295_pilon	+	257	2	Intergenic	novelGene_169973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTCTAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34512	46565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_34535_46330
783925	contig_4847_pilon	-	746	3	Intergenic	novelGene_156173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAACCCAAACGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110060	102377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_102569_108592_108656_109568
783926	contig_18364_pilon	-	1886	7	Intergenic	novelGene_102547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGACGGAACTGGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32552	16486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_16530_27317_27487_29080_29183_29560_29678_29872_31204_31511_31588_32504
783931	contig_5059_pilon	+	1205	10	Intergenic	novelGene_140724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	185.687910214963	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGAGAATGCATGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232252	259563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232541_243414_243504_244759_244828_250083_250134_250448_250558_251589_251698_253218_253315_253949_254056_255904_255964_259331
783934	contig_6164_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_121292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTACTTCTGCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595130	593332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_593300_595100
783936	contig_15664_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_171508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCAGCTATCCAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73837	74231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_73800_74200
783938	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
783939	contig_10583_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_167913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTCAGAATGAAAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130986	129276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_129300_131000
783942	contig_6735_pilon	-	1263	6	Intergenic	novelGene_15828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_2	14.8781719307178	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	205	924	675494	657030	FALSE	25	GACTTGTCAGGCATACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNLHKAACVIQAYWKGFQTRKRIKKLPSAVTTLQRSFRTKRTKILLKLNRQKEEEDHRLQLQLQRQRAMRLSRESRLSLLEIVHPGQVEKHNREMEEKSALIIQKHWKGYRERKKFHQQRPSLMEYKAAVTLQRAALKFLAKCRKKKKVFVPWQGLRGLTDARRVELKQQVDDYVRRHPSSPMSDVASRELHAQAQERLQHYFMGRALEERAQQHREALMAQISTNIEQLMRAPSLKEAEGKEPELFISRSRPLAAKAKQGHLATLKHIQAPWWKKLGEEPGDEIDVPKDELSIELGTLFIGGTKPP	680433	656690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_657260_658167_658325_660619_660752_667078_667228_675442_675586_680320
783946	contig_12464_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_68638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTACTGAAAGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81047	81560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_81000_81600
783947	contig_15047_pilon	-	1199	6	Intergenic	novelGene_52180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGAGACTGAGTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21626	2174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2282_3261_3495_4155_4431_4551_4683_20999_21070_21243
783948	contig_12836_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_170412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGGGTGAATGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37996	35777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_35800_38000
783950	contig_13460_pilon	+	938	6	Intergenic	novelGene_162171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	69.2283179053196	389	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	279	683	7936	19547	FALSE	15	GCAAGGTATCCCTCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENSPSPLPERAIYGFVLFLSSQFGFILYLVWAFIPESWLNSLGLTYWPQKYWAVALPVYLLITIVIGYVLLFGVNMMSTSPLDSIHTITDNYAKNQQQKKYQEEAIPALRDIPISEVNQMFFLAAKELYTKN	7270	19802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_7465_7676_7737_7911_8018_13302_13376_17726_17846_19416
783951	contig_678_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_167805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1300	1689	83212	83601	NA	75	TTTAAAAAAAAAACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFKIIMLCKSNQTEESICCMVPFTQNSRKCKPMYSNSKQMSGCLRTSGWGLEQLSTAIKSAPTHGDLIRRWIIKGHKETFRGDGNAHYLDYNNGSIGVHISQTHQIIHFKYVQFIICQLYLNKTVKQN	81912	83666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_81900_83700
783952	contig_4232_pilon	-	1046	4	Intergenic	novelGene_63193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGCGGCCTCTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149696	146282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146364_148229_148515_148801_148891_149105
783953	contig_11986_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_69094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	1448	2059	34092	34703	NA	50	TATAATTAATAACAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMFPDLGKLRPGCCLLSFQVPPSQLSEERRSWGREPGWSGVGRKADGNRAPLVGAGRKDGIWLYPSLPQKNQGLPKDAAPCCRARLASFTQKTRHTHLLNGAVLNLHSCAQLSCHSSCFRRRPPEMMKIKLYSQSAALRFDEKERAGSADSLSLPPPFLAWTKPAEPGDPTGQRRAAPWAFQAVILTEADCHVFLLGSGWRV	32644	34998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_32600_35000
783955	contig_8357_pilon	-	2188	6	Intergenic	novelGene_39753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	441	junction_1	77.6726464078571	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1697	2104	779547	763734	FALSE	60	AAAAAAACACCAAACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGKTFVFLFSIF	785771	763649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_763918_773765_773852_778744_778838_779502_780039_783786_783868_784647
783957	SIRV2	-	484	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4389	34	3214	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
783958	contig_4059_pilon	-	446	4	Intergenic	novelGene_140601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	792.796316843109	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	89	445	422646	398149	FALSE	30	TCAATTACATTGAGTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDRFTDEEVDELYREAPIDKKGN	436379	398147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398214_411100_411209_422462_422662_436306
783959	SIRV6	-	149	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATTTCAACGACGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	11031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11109_11205
783962	contig_11256_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_150888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAAGAAAATGTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9964	10202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_10000_10200
783963	contig_11256_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_150889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAGAAAACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10856	11925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_10900_11900
783964	contig_9505_pilon	+	1366	13	Intergenic	novelGene_121821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	46.2249181238383	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	96	1190	404142	447337	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVTGQFPWSSLRETDRGLSAEYSFPVWKTSHTVKWEGVWRELGCLARTASFAVRKESGHSLKSSLSHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGVLELG	404046	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419604_422552_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433988_447321
783965	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
783968	SIRV4	-	445	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	160	12	-160	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGTAGCAGTTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
783970	contig_3787_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_102439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATGCATTCCATTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714793	716392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_714800_716400
783972	scaffold_13505_pilon	+	767	5	Intergenic	novelGene_111419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	193.393866241926	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	98	766	455671	458415	FALSE	20	TTCTGCAGACATTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKNQQKDAEAEGLSATTLLPKLIPSGAGREWLERRRATIRPWGGFVDQRRFSRPRNLGELCQRLVRNVEHYQSNYVFVFLGLILYCVVTSPHAVGGSGGLLWCLLHPLSAHTAVQACALWPRGEPSPSVRSGRRCLLPLLLAGGCRLGRLLGPGSRLRTGRSCRWSLCEVSSRTCGPPGPAALPLFTPMLHGSAAEAKVPFPITSPGRHLSFGNKAVTVV	455573	458416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_455727_456025_456239_456548_456648_457989_458092_458216
783973	contig_8865_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_164459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACATTGGATGCCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401434	400935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_400900_401400
783975	contig_9482_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_44250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCCAATTGTGCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441947	441333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_441300_441900
783976	contig_4845_pilon	-	3007	2	Intergenic	novelGene_53720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	285	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	485	1579	1064773	1059594	FALSE	25	TATATTGTGTGTGGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRAPLKRSRILHMALMAASDPSGEAQASEEKPFLLRALQIALVVSLYWVTSISMVFLNKYLLDSPSLQLDTPIFVTFYQCLVTTLLCKGLSTLAACCPGYVDFPTLHLDLRVARSILPLSVVFVGMITFNNLCLKYVGVAFYNVGRSLTTVFNVLLSYLLLKQTTSFYALLTCGIIIGGFWLGVDQEGAEGTLSWVGTLFGVLASLCVSLNAIYTKKVLPVVDGSIWRLTFYNNANACVLFLPLLLLLGELQALRSFTHLGSAHFWGMMTLGGLFGFAIGYVTGVQIKFTSPLTHNVSGTAKACAQTVLAVLYYEETKSLLWWTSNMMVLGGSSAYTWVRGWEMKKVQEEPSPKEDEKSLLGV	1065257	1058165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1060154_1064238
783978	contig_10159_pilon	+	1935	10	Intergenic	novelGene_30873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	110.707823672143	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1156	1809	978504	992845	FALSE	30	ATAAGTCTGGAGCCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNAEAEDDGSVCTKLQMAGATSCGWSWTKGKGRFSPFTPYVLKERKKNNNRIMDGFYFYFGLFCIFHNEYILITFHKQKRNLRLSEVHH	958529	992971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_958899_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_992585
783980	contig_12638_pilon	-	1177	12	Intergenic	novelGene_33202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	263.535058906263	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	606	1034	321507	319953	FALSE	5	CTTGCTGGTTTCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHYIRHLSFGEDYPGIVNPLDRTNVTAPQASMMFQYFVKVVPTVYMKVDGEVLRTNQFSVTRHEKVANGLMGDQGLPGVFVLYELSPMMVKLTEKHRSFTHFLTGVCAIIGGMFTVAGLIDSLIYHSARAIQKKIDLGKTT	333563	319809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320235_320292_320391_320529_321266_321332_321416_321514_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_333069_333096_333202_333274_333411
783984	contig_10626_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_138214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTTAAAGCACAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307847	308914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_307800_308900
783988	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
783989	contig_10437_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_38338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTCAGCTGATGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453524	453778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_453500_453800
783991	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	163	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
783992	contig_11378_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_112210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	180446	180784	NA	35	CAGTGAAGAGGCCATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSDRVSCSILAHCWVINEPRICCCAGCLLGLLTSHLGLQGCHWGFVFASWTGNSFLKLRQLCFEAGQDSRFHIPLAATAVNPYACSVAWQGEPEPAGGRVSLCFKTPDCTNA	180443	181564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_180400_181600
783993	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
783994	contig_16578_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_148680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293498	291776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_291800_293500
783996	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
783997	contig_12919_pilon	-	932	6	Intergenic	novelGene_75898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	482.322464747393	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	77	793	743659	725465	FALSE	30	ACTTTTCCAAGCTAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFICLFVLLWEEAHGWGFKNGIFHNSIWLEQAAGVYHREARSGKYKLTYAEAKAVCEYEGGHLATYKQLEAARKIGFHVCAAGWMAKGRVGYPIVKPGPNCGFGKTGIIDYGVRLNKSERWDAYCYNPHAKECGGVFTDPKRIFKSPGFPNEYEDNQVCYWHIRLKYGERIHLIFLDFDLEDDPACLADYVEIYDSYDDVHGFVGRYCGDELPEDIISTECMLASSLLRLAQVPPV	743735	725325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_725518_728831_728873_730980_731210_734916_735079_737596_737735_743565
784000	contig_14684_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_99659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAGAAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287596	289381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_287600_289400
784002	contig_20596_pilon	-	676	5	Intergenic	novelGene_157233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	32.9876870968548	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAAAGCAGGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110087	83631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_83879_101490_101730_104478_104527_106384_106462_110022
784003	contig_12250_pilon	+	872	11	Intergenic	novelGene_80673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_8	255.422865068889	4003	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	116	835	391631	394948	FALSE	10	TGTGGATTACTTCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVWRTKGAGLRGAALDLGSESESPGGEPGDRKSCNWRNMAKPCGVRLSGEAREQVDVFRQNLFREAEEFLCTFLPQKIIYLNQLLKEDSFNVADLTSLRAPLDIPIPDPPPKDDEMETDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQEKVLERVNAVKTKVEAFQTTISKYFSERGDAVAKASKETHVMDYRALVHERDEAAYRELRAMVLDLRTFYAELYHIISSNLEKIVNPKGEEKPSMY	391515	394985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392016_392628_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_393955_394108_394177_394326_394382_394687_394775_394867
784004	contig_15084_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_116709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	781	1167	245904	245518	NA	45	CACCAGGGAAAAAGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERAAPPDKAHPRPIKGSNQKGRARKSKRHHVLGHPSTCYPEADPQSEIESSVWEPMDYKELLSTKSTFDSHMRTSSAHIHHSKSHKQATQSDMTDLNRDQGLSVANIFLGLSKFHVLDLRKSAKSS	246684	244796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_244800_246700
784005	contig_11096_pilon	-	939	2	Intergenic	novelGene_143491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGCCCTAAATCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357057	355650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_356183_356650
784006	contig_15042_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_115419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCATCTACAATATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8916	7374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_7400_8900
784008	contig_10857_pilon	+	917	9	Intergenic	novelGene_160925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	376.32264664115	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	201	698	530230	532828	TRUE	15	GCACGGCTCAGACTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTKCIKYLLFVFNFVFWLAGGVILGVALWLRHDPQTTNLLYLELGDRPAPNTFYVGIYILIAVGAVMMFVGFLGCYGAIQESQCLLGTFFTCLVILFACEVAAGIWGFVNKDQIAKDVKQFYDQALQQAVLDDDASNAKAVVKTFHETLNCCGSSALSTLATSLAKNSLCPSGSTVLSNLFKEDCHQKIDELFSGKLYLIGIAAIVVAVIMIFEMILSMVLCCGIRNSSVY	512739	533269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_512793_527516_527632_530197_530296_531019_531095_531428_531534_531931_532034_532604_532692_532765_532845_533066
784011	contig_10953_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_42544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTAGGAATTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365355	366105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_365400_366100
784012	contig_5643_pilon	+	1587	7	Intergenic	novelGene_38762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	164.764899848913	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	302	1270	159302	163341	TRUE	25	AGGCAAAGCTTCTCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQASPKIRLNLVNEAQPPTLICNIAGYYPLDVAVTWTREELGGTPVQVSGASFSSLRQSTAGTYSISSSLTADPGSAGATYTCQITHISLEEPLGASTWVAPPEKRMSFGIIFASGLFLLALLFLGLQRRQATSPRFVKILRTSG	158845	163736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_159073_159227_159501_160519_160859_161443_161747_163000_163085_163297_163471_163548
784013	SIRV4	-	200	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1323	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3835	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
784014	contig_2476_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_157628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136523	137716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_136500_137700
784018	contig_2716_pilon	+	2480	4	Intergenic	novelGene_173551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_3	32.273139846559	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	143	568	502816	515609	FALSE	20	GTAAATTTCCTTGTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAEQPASSGGSLASDMVEQPETAVITPAMLEEEEQLEAAGLERERKMLEKARMSWDRESMDIRYRRLQHLLEKSNIYSKFLLTKMEQQQLEEQKKKEKLERKKESLKVTKVIQQARLFHILPEILKKLFCILFNFLIIIF	502673	517521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_502847_503265_503388_509945_510069_515459
784019	contig_8284_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_125682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTAAAAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346053	345505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_345500_346100
784020	SIRV6	+	430	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	309	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1504_1618_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
784021	contig_19564_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_29666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAGTGGGAACTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65211	66016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_65200_66000
784022	contig_14744_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_66083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	10	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	3	866	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
784023	contig_13044_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_100008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAATAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253093	251083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_251100_253100
784026	contig_6327_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_147482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCAAATTACTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31952	32987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_32000_33000
784028	contig_8880_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_165758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70603	72717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_+_70600_72700
784029	SIRV6	+	551	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	23	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
784031	contig_14679_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_174194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCTCATTTTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312596	313804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_312600_313800
784035	contig_6958_pilon	-	2370	2	Intergenic	novelGene_70000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736730	730475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_731487_735371
784036	contig_91_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_127079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGGTTAAGAGCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58615	58281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_58300_58600
784038	contig_5797_pilon	-	1869	1	Intergenic	novelGene_56933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACGGGTTTGGTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267685	265816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_265800_267700
784040	contig_6233_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_74773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCCCTGCTATAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127431	125097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_125100_127400
784042	contig_7580_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_108607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103818	104985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_103800_105000
784044	contig_15327_pilon	+	2180	8	Intergenic	novelGene_70416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	187.957767727167	1	124	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	288	368	31740	32287	TRUE	35	TTGCAGTATTTTGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKVTGHQQRAGNTHSWGKRWAS	28791	34361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_28869_29900_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31762_32228_32409_32488_32566_32747
784045	contig_6576_pilon	-	1645	3	Intergenic	novelGene_42457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	15.5	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	61	399	1408643	1396123	FALSE	40	CCTGACAGAGACTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFKEKPTDLETRSYKYLLLSMVKLIHADPKLLLCNPRKQGPETQGSTAELITGLVQLVPQSHMPEIAQEAMEALLVLHQLDSIDLWNPDAPVETFWEIRYVYFYFFNSVVKNYFVFYFLFLHINYTSVLSSL	1408703	1394876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1396306_1404700_1404815_1408601
784050	contig_19848_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_173822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACAGTAGATTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79147	81213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_79100_81200
784058	contig_10734_pilon	-	2064	4	Intergenic	novelGene_50991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	1	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	362	667	318911	311551	FALSE	5	GCCTTAGTGTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320700	310153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319025_320452
784061	SIRV6	+	183	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	549	51	549	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10786	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784067	contig_3964_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_174209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTTTCAGAAGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85185	86275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_85200_86300
784069	contig_15120_pilon	+	1847	5	Intergenic	novelGene_108029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	49.6002772169672	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	29	622	269587	308082	FALSE	45	CCAGTAATTCAAATATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFKTQDIAMISAKLTGMQNSLMMLVDTPDYSEKCVHLEALKNRLEALVSPQIVAVFGSQSIDQAKAFVKVFTEIDRMPQLLAYYYKCHKVQLLAVWQELCQSDLPLDRQLTGLYDAMLGAWHAQIQWAAQVFKNPHEVVTVLLIQTLGALVPSLPICLSSAVERAGPEMELTKLLEFYDTTAHFAKGLEMALLSHLRKHSFLAAL	265384	309307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_265404_269577_269747_289890_289974_290722_290846_307854
784072	contig_15687_pilon	-	1358	13	Intergenic	novelGene_129146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_12	42.2242689562399	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	132	1136	195341	187610	FALSE	15	CACTGGGGCTTCTTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGRWKKINTEGDVPPSMSGSCAVCIDRVLYLFGGHHSRGNTNKFYMLDSRSTDRVLQWERIDCQGIPPSSKDKLGVWVYKNKLIFFGGYGYLPEDKVLGTFEFDETSFWNSSHPRGWNDHVHILDTETFTWSQPITTGKVPSPRAAHACATVGNKGFVFGGRYRDARMNDLHYLNLDTWEWNELIPQGICPVGRSWHSLTPVSSDHLFLFGGFTTDKQPLSDAWTYCISKNEWIQFNHPYTEKPRLWHTACASDEGEVIVFGGCANNLLVHHRAAHSNEILIFSVQPKSLVRLSLEAVICFKEMLASSWNCLPKHLLHSVNQRFGSNNTSGS	198876	187387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_187734_187947_188001_188102_188191_189274_189348_189734_189845_190273_190333_190404_190486_191289_191374_191539_191622_191882_191999_193940_194059_195324_195405_198808
784078	contig_2161_pilon	-	1555	3	Intergenic	novelGene_114972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4734	junction_1	1184	20123	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAAACAAATGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066407	1059537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1060815_1063660_1063751_1066219
784079	contig_6503_pilon	-	2864	1	Intergenic	novelGene_145790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCTTTTTAAAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868194	865330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_865300_868200
784080	contig_11656_pilon	+	2159	13	Intergenic	novelGene_54020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	189.696907372436	1	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1067	1438	521815	536636	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTFGPQMGIR	468797	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_468997_484730_484826_485804_485923_489324_489395_507865_507931_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521707_521902_522657_522853_523727_523790_536608
784081	contig_10196_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_132207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	193.5	479	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	157	546	1260788	1256120	FALSE	15	CTTTTGAACATGTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPAGCRTGRAGGPGPGAKPALADEHECEALSWGSEAAGFQEARGTVKLQFDMMRACNLVATAALAAGQLTFVLGLAGLPLLSPESPCWEEAMAAAFQLASFVLVIGLVTFYRIGSYTSLSWSCYLNIGACLLATLAAAVLIWNILHRREDCMAPRVIVIRRSLAARFRRGMDNDYVESPC	1264249	1255608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1256365_1260643_1260800_1264104
784082	contig_6589_pilon	+	2003	15	Intergenic	novelGene_26256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	903	1259	2230194	2230830	TRUE	25	GGAAATGACTCGCTCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSGFRYKPACVATKTWNGTPSFSTTASTLALNSSAGSFPRPMPIWLVKITSWGGDGCHLLPSSPGPPPQRDLAAARVRAWACTHTHLIALGFQLTELPRNLGVQNPRTGGEAARVT	2227804	2233770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2227988_2228062_2228125_2228212_2228299_2228380_2228492_2228746_2228805_2228892_2228989_2229064_2229165_2229235_2229304_2229388_2229500_2230166_2230246_2230525_2230962_2231916_2232217_2232516_2232561_2233110_2233274_2233664
784085	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
784091	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	0	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784097	contig_16205_pilon	-	869	10	Intergenic	novelGene_156851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	123.151216892982	10	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	55	693	70684	16357	FALSE	40	GTAAGAACATAAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAGPATPQRFFRSLSDALIDEDPQAALEELTKALEQKPDDAQYYCQRAYCHILLGNYCDAVADAKKSLKLNPNNSTAVLRKGICEYHEKNYVAALETFTEGQKLDDADDNFIVWIKRCQEAQNGQNQSLSQRTHQSKIKYDWYQTESQVIITLMIKNVQKNDVSVEFSEKELSALVKLSSGEDYNLKLRLLHPIIPEQSTFKVLSTKM	70738	16180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_16363_29159_29268_30233_30331_32170_32217_37674_37729_42368_42440_47378_47449_48102_48194_70506_70565_70646
784102	contig_9099_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_149914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356178	357890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_356200_357900
784104	contig_12756_pilon	+	1353	10	Intergenic	novelGene_153198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.6012550080785	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	221	922	47160	66492	FALSE	35	ATAACAAAGTTGTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGATGFLRTADVLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFYRFWK	46747	66923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_46874_47065_47202_49220_49336_50950_51055_58624_58727_60056_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_66436
784113	contig_6710_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_97351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653796	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
784114	contig_5981_pilon	+	1151	2	Intergenic	novelGene_35515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	83	493	146360	165596	FALSE	15	GTATTGCGTCTTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPPPLPLRGQEHVCNSSQESEDGHQVMPRVRPTDVNSTISLKDLRILFLYEFKLGHSAAEASRNINSVFGGGSVSERTIRWWFEKFRSGHMSLKNEPRGRPKSVLNEDQLRAMVEANPKTAIRGLAADLGVSATTISRHLAAIGKVKKLDRWVGTTPVDGGS	146277	166254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_146382_165207
784115	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784117	contig_5947_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_101502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407619	406405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_406400_407600
784118	contig_2311_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_169818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGTAGTTGGAACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285508	284058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_284100_285500
784120	contig_6710_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_98325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAACCGAGTACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653881	653662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653700_653900
784124	contig_6654_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_85686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTAAAAGAAATATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36181	35438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_35400_36200
784128	contig_7704_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_154615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACCCACCAGGCGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306509	308317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_306500_308300
784129	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784131	contig_8729_pilon	+	1580	9	Intergenic	novelGene_40067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_5	28.6593680146649	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	22	924	45249	56380	FALSE	5	TGTCTCGGACTTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQPAGPGSGIREKLELPVLHVSWNDARTYCAWRGKRLPTEEEWEFAARGGLKGQVYPWGNQFQPNRTNLWQGKFPKGDRAEDGFHGVSPVNAFPPQNNYGLYDLMGNVWEWTASPYHPANQDMRVLRGASWIDTADGSANHRARVTTRMGNTPDSASDNLGFRCASSAGHLHGEL	45227	57036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_51117_51269_52546_52603_54672_54758_54932_55078_56295
784133	contig_5815_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_141180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAATAAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160474	158671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_158700_160500
784140	contig_11883_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_163776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	131	655	107519	106995	NA	65	TAAAAAAAAGAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNLNCPLPAFPEESGVASFHFQDKLLVLAFRVSCVLAHQPASPSSLPPLPASLPFQPASPSSQPPFQPASPSSQPPLPASLPFQPASPSSLPPLPACLPFQPASPSSLPPLPACLPFQPASPSSQPPRSSLWLGWACVSSEQIVCLHVFKSLLVLVFFVPQSAVLLLSVSGC	107649	106190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_106200_107600
784141	contig_2487_pilon	-	2421	2	Intergenic	novelGene_148448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	0	15	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1893	527	2419	101488	98663	FALSE	15	ATTTCCCCCTGCCACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQGAGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCIGLISVNGRMRNNIKTGSSPNSVSSSPTNSAITQLRNKLENGKPLSMSEQTGLLKIKTEPLDFNDYKVLMATHGFSGTSPFMNGGLGATSPLGVHPSAQSPMQHLGVGMEAPLLGFPTMNSNLSEVQKVLQIVDNTVSRQKMDCKAEEISKLKGYHMKDPCSQPEEQVVTSPNIPPVGLPVVSHNGATKSIIDYTLEKVNEAKACLQSLTTDSRRQISNIKKEKLRTLIDLVTDDKMIENHNIATPFSCQFCKESFPGPIPLHQHERYLCKMNEEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVDNKALLLSSVLSEKGMTSPINPYKDHMSVLKAYYAMNMEPNSDELLKISIAVGLPQEFVKEWFEQRKVYQYSNSRSPSLERNSKLLAPNNNPPTKDSLLPRSPVKPMDSITSPSIAELHNSVTNCDPPLRLTKPSHFTNIKPAEKLDHSRSNTPSPLNLSSTSSKNSHSSSYTPNSFSSEELQAEPLDLSLPKQMKEPKSIIAAKNKTKASSISLDHNSISSSSENSDEPLNLTFIKKEFSNSNNLDNKSTNPVFGMNPFSAKPLYTALPPQS	102014	98660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_100453_101385
784143	contig_4413_pilon	+	840	6	Intergenic	novelGene_116983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	118.67164783553	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	13	561	126062	152361	FALSE	10	TTGCTTCGTCATGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGSMAAVDIRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	126049	152640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131813_131906_142574_142691_151580_151609_152230
784144	contig_8328_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_174046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTATGCTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156084	153825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_-_153800_156100
784145	contig_6589_pilon	+	1073	6	Intergenic	novelGene_26230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	177.700196961061	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	24	731	2055179	2058250	TRUE	10	CTTGGCTCAGCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSEEDGLGGAQRWSGARAWEQLLQMRNQLHGNWFGFWFFNLAVTWGPAILGRGHGKGQGPKARVAWGTGRCGPVEDNSADQPPGVQAPSPHTRTGSRRCSTWRIT	2055155	2060059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057573_2058010_2058313_2059779
784150	contig_14093_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_174212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATTTTAATATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52041	53729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14093_pilon_+_52000_53700
784152	contig_12270_pilon	+	354	2	Intergenic	novelGene_113964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	299	346	14384	14431	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTAEAQSNRDMRNRVCGTILLPLPA	13858	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14134_14360
784154	contig_15897_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_49570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAACTCAGCCTGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814483	814978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_814500_815000
784155	contig_5649_pilon	-	1658	9	Intergenic	novelGene_82464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	143.78450672795	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	622	1062	1566684	1564135	FALSE	15	CCTGGTGGAGACTCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYLHHVGWFPFRQRPVQNFPDDGLPYEAVNQDPNNNLQEDGSDPETEDPSHLAPDRGVLEEQTSPSFRSTAWLVFKTFFASLLPEGPPAIAN	1573729	1563538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1565229_1566514_1566702_1566747_1566866_1567380_1567504_1569700_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
784156	contig_1813_pilon	-	1195	4	Intergenic	novelGene_105511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	583.795055363324	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGACCTGCCTCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423101	415700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415914_417583_417746_417856_418533_422957
784157	contig_854_pilon	-	2127	4	Intergenic	novelGene_36330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	5.09901951359278	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCACTTCCTGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718376	705239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_706938_710960_711134_715048_715180_718251
784158	contig_6896_pilon	+	1467	5	Intergenic	novelGene_174227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	51.3876201044571	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	29	604	645658	650557	FALSE	20	CAGAGTATCCATTGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGEDSLALFGAGVRAALEAWPALQIAVENGFGGVHSQEKAEWLGGAVEEYFIRNADLELDEVEDFLGELMTNEFDTVVEDGSLPQVSQQLQTMFHHFRRGDGAALREMASHITQRKCRVTATALMTARETDDEEEDADSTEEMEVTATNDGAATDGVCPEPEPSGPDSQTIEEEDIVEDGWTIVRRKK	645629	651420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_645739_645880_645972_649374_649467_650009_650187_650422
784159	contig_1275_pilon	+	848	2	Intergenic	novelGene_108842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	4	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	84	773	747279	747968	FALSE	35	AGAAGTTACCAGTTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746553	748043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
784161	contig_16541_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_126757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441277	443053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441300_443100
784163	SIRV4	-	303	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	3	1215	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
784165	contig_6191_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_107842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTAGCATATAGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153151	151859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_151900_153200
784166	contig_7286_pilon	-	810	6	Intergenic	novelGene_108694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5598.54816894523	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	436	744	289312	286948	FALSE	10	AATTGCCTTGTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPFRLIWRLEKLLISSSSTLVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292085	286881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288493_289249_289422_290758_290830_291304_291497_292022
784168	contig_11378_pilon	+	1832	10	Intergenic	novelGene_112328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	70.2853092143587	194	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	112	963	1232390	1236992	FALSE	0	GCCCGCTGTGTGGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDLFIGPKAEEHRGLLTIRYPMEHGVVRDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPSKNREKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSITRVDIAGRDVSRYLRLLLRKEGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSINPQKDEALETEKVQYTLPDGSTLDVGPARFRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVLAFAVHKSDVDLRRTLFANIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIKA	1229023	1237861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1229042_1231108_1231174_1232361_1232438_1233475_1233602_1233946_1234072_1234310_1234528_1234659_1234753_1234879_1235055_1236260_1236323_1236986
784169	contig_6710_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_94848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
784170	SIRV6	+	408	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	545	9	366	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1669	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784174	contig_13481_pilon	-	1713	9	Intergenic	novelGene_119421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_8	33.5111921602321	144	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	102	1286	785433	765792	FALSE	20	CTCAAGGAGATTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQLRRCWGPGPVRCATGVRSTPQWRALAGLGVSSGGEEGLGARAREKPPWRVLFFGTDRFAREALRALHAARDNKEEELIEKLEVVTVPSPSPRGLPVKRYAVRSQLPVYEWPDVGPGDYDVGVVASFGRLLSEALILKFPYGILNVHPSCLPRWRGPAPIIHTVLHGDKVTGVTIMQIRPKRFDVGPILKQETVPVPPKSTAKELEALLSRLGASMLISVLKNLPESLNSGRQQPAEGVTYAPKISAGKSCIKWEEQTSEQIFRLYRAIGNIIPLQTLWMDNTVKLLDLVEVNSSILADPKLTGQAVIPGSLMYHKQSQILLVSCKDGWIGVRSVMLKKTLTATDFYNGYLHPWYQTNSQAQPSQCRFQTLRLPAKKQQKKKIVAMQQCIK	785534	765364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_765990_768792_768876_769889_769969_772727_772820_778106_778183_779741_779845_781113_781237_783134_783345_785212
784177	contig_16119_pilon	-	1392	3	Intergenic	novelGene_164272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	8	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTTATCTTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74544	67788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_68347_72574_72598_73733
784179	SIRV4	-	315	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1203	3	1203	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3955	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784183	SIRV4	+	247	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTCCGGGCAGTTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
784185	contig_7694_pilon	+	569	6	Intergenic	novelGene_159935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	79.6959221039571	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	59	568	221111	234193	FALSE	30	ACGTTGATCAAGGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPPGLRSGAGGPWVMQERLGTGGFGNVCLYQHRELHHKIAIKSCRLELSTKNRERWCHEIQIMKKLNHTNVVKACDVPEELNVLINDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKILHKIIDLGYAK	221052	234194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_221216_228015_228111_230769_230885_231567_231638_232867_232957_234157
784187	contig_9839_pilon	+	838	6	Intergenic	novelGene_88571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	483	junction_5	231.379342206689	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	92	820	261595	269866	FALSE	30	AGACGGATCTAATCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	260205	269884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_260286_261583_261772_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
784190	contig_366_pilon	+	3031	20	Intergenic	novelGene_51646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	180	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	767	1078	1409407	1413114	TRUE	30	TAGGAGGATGGGATTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLASPKSPILATCPLVNSTFRAATSRWMHSRKAIPWATWLEKWSRSLSSSGRLSSLSRPARRSHLKMKWRQASSPHRCPHPGWRSGTTCGHISSPDGCSCSQ	1406591	1436664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1407003_1407099_1407212_1408086_1408185_1409177_1409282_1409365_1409498_1410523_1410616_1410721_1410797_1413060_1413233_1413964_1414071_1414568_1414680_1414852_1414936_1420693_1420806_1423382_1423580_1423725_1423836_1424021_1424133_1427896_1428086_1432837_1432983_1433657_1433796_1435700_1435988_1436418
784191	contig_3837_pilon	-	2133	10	Intergenic	novelGene_104012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTGTCACGTGACTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134612	66975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_-_67668_70832_70935_75761_75846_77748_77814_88995_89220_121917_122013_124343_124466_128624_128720_133148_133267_134076
784192	contig_5020_pilon	-	806	6	Intergenic	novelGene_27957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	35.0177098051829	450	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	226	567	223081	210147	FALSE	15	CCCAGCCTGTGCAGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRTSRENPICSAGGFLLNTSRHYKTKPTHGIGRYKHLIIAQEPKKKRGKVEVRPINLGTDHEYGVVNIHLTAYDMALAESYAQYVHNLCNDLSIKVEESYALPTKTVEVLRLQDQGNKTFLDSVLTTHERVVQISGLSATFAEIFLEIIGNNLPEGVKLSVKEHTEEDFKGRFKARPELEELLAKLN	260446	209907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_210222_211256_211347_212688_212792_223007_223178_239656_239746_260406
784194	contig_9727_pilon	-	1733	2	Intergenic	novelGene_86269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	111	467	103874	103518	TRUE	5	GCTTTGGCTTACGTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFPQSQFPIPEVPGALGQYKLLASPGPEDYSGGHSSKLMRVFGTHWTWTVPWKVRLREQSIWKATRGVCAQHVSPRPAGPSLGGQWRFSAPGSPRHTQVYSNHWNSWKQMLSHNGYL	103984	102202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_102545_102593
784196	contig_18231_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_105907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAATAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537659	539370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_537700_539400
784198	contig_4364_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_4383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533086	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
784200	contig_8278_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_165293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTCAAGCTGGAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193762	192912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_192900_193800
784203	contig_7057_pilon	+	805	6	Intergenic	novelGene_123262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	61.5512794343058	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	388	762	569042	570531	FALSE	5	GGCCTCTGCTTGCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEGSEVTNSKSRDVYKLPPPTAPGPPGDPCRSRIPSPLQPETQGTPDDEPSEPEPSRSTLIYHNMQRWKRIRQRWKEASHRNQLRYSESMKILREMYERQ	566904	570574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_567152_568676_568707_568931_569120_570061_570203_570293_570368_570449
784208	contig_10437_pilon	+	1263	6	Intergenic	novelGene_38183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_4	107.08874824182	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	47	922	204544	208508	FALSE	5	GCCTGCCTCCGTTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWCGEGRLAHRDLFHPQNVDDAMSVLPKLATGLDVNVRFTGVSDFEYTPECSVFDLLGIPLYHGWLVDPQSPEAVNAVGKLSYNQLVEKIITCKHSSDTNFVTEGLIAEQFLETTAAQLTYHGLCELTAAAREGELSVFFRNNHFSTMTKHQSHLYLLVTDQGFLQEEQVVWESLHNVDGDSCFCDSNFHLSHSLVRGPEAEGGSGSPEKQRQVDQDYLIALSLQQPQGTLGLSDLELAQQLQQEEYQQQQAAQPVRTLVPSPQGRGSASGRPAGERRQRPKQESDCALL	204497	208849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_204757_205264_205368_205962_206106_206907_207100_207432_207577_208427
784211	SIRV6	+	400	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	386	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
784212	contig_6101_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_114278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCATTAGATTTCAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198248	196944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_196900_198200
784214	SIRV6	+	381	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	476	14	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAAATAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
784217	contig_8656_pilon	-	659	2	Intergenic	novelGene_162355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAATCCCAGCTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601945	599195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_-_599609_601699
784220	SIRV6	+	280	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8137	14	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
784222	contig_7135_pilon	+	750	3	Intergenic	novelGene_136956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	20.5	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	227	634	319771	324119	FALSE	40	CTATAAAAATCGAGGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALLKQIEVERSLYSDHELRALDEAQKLARKKADLYEEEEDGKEILLVQDLEDMWEQTFLQFKPGARITEADKKNDRTSLHRKLDRSLILLVKEKLGDQDVWMLPQAEWQPGETLRATAERTLATLSGELSVSC	319544	324235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_319792_322789_322980_323922
784223	contig_7135_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_136958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAAATATATTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325086	325448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_325100_325400
784224	contig_14289_pilon	-	892	5	Intergenic	novelGene_110551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	139.78443225195	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	251	673	58752	51527	FALSE	15	GCTCTTCCTTATGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66631	51307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58758_64671_64754_66468
784226	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	410	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
784228	contig_5744_pilon	+	1074	3	Intergenic	novelGene_149351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	4	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1041	34	1074	709344	714013	FALSE	35	AAAATGGCAGTTCATAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPLEQYQRQCELILEKLELQSLLSEELRRLERLQNQSVHQFQPQLGEAETPPASLRNDPGEESKFKTSTPQEINCNMHTSSPGGSPGGSPLLNPPSHLGPNRSTSRKHSAEPPNNRDNSLDWFDSMATPEVEPKNTVYVSPSSKTTDKEMALKICNSKSKGKEKSRPGQGSKSEAGQLPAPGETDAPLRPHKTFHVEGKTKKSATVSEVAVPADEPASMLTHHVPRKLHKLRKEKAQELCQNPARETSQPLSPSHPQSIPIYSPERTLETPKRKRQKSVAQVEEPELEGVESPPVAKLAKFTFKRKSKLIHSPHDHSHVSHGTT	709310	714013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_709362_710459_710606_713136
784229	contig_3817_pilon	+	2247	11	Intergenic	novelGene_78399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	107	junction_1	95.7883604620102	65	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	999	2015	1270810	1274996	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSRSASTVIAYAMKEFGWPLEKAYNYVKQKRSITRPNAGFMRQLSEYEGILDASKQRHNKLWRQQTESSLQQAVEDPAGPGDVLREALDDSLEAQLPGLDDTAQLGLPGGRALGGPTDSCCFQRLSDHLLHSPDNETDSSVQLDDLERDALLEEAAHPAEARMPARQSLEGSGLCEKEGKKKLEFGFPKARTGSLLQMVEMEREEGPAAGRWGQPPTQLQKNLLNRENLNNNNSKRSCPEDFEVGVGPRLGGSTPPRSCPASQNSPAQPCLLLRFALQPPWVHLRERLLQADGSIECVYVGGQGQIGIALTPGCLHPGARISHSASNSVSFSSFIM	1244457	1275228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1244535_1249685_1249751_1250510_1250633_1256553_1256623_1257900_1257967_1260624_1260820_1263442_1263537_1264559_1264689_1269099_1269247_1270775_1270977_1274146
784235	contig_8195_pilon	-	1088	2	Intergenic	novelGene_170051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCGAAGTGGTGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114791	113532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_114547_114717
784236	contig_14755_pilon	-	846	8	Intergenic	novelGene_129384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_1	40.5628763622048	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	113	718	364298	198203	TRUE	15	AGGCTTGCCATCCTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELCKTISVARLEKHKNLFLNYRNLHHFPLELLKDEGLQYLERLYMKRNSLTTLPENLAQKLPNLVELYLHSNNIVVVPEAIGSLVKLQCLDLSDNALEIVCPEIGRLRALRHLRLANNQLQFLPPEVGDLKELQTLDISTNRLLTLPERLHLCLSLQYLTVDRNRLWCVPRHLCQLPSLNELSMAGNRLAFLPLEKIC	368711	186909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_186968_198132_198217_225825_226033_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
784237	contig_12464_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_68637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGTGCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68354	70398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_68400_70400
784238	contig_3571_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_88712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATGATGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38500	37624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_37600_38500
784241	contig_2758_pilon	+	1592	4	Intergenic	novelGene_166433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	140.98305650759	102	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	85	1590	35671	58323	FALSE	25	TAAGATATTTGTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLEEKNATVVYNPKLQTPKTLQDAINDMGFDATLHNPNPLPVLTDSVFLSVSSSFAPPWDHIQSTLLKTKGVTDIKISPQQRTAVVTIIPSIVNANQIIELVPGVSLDTGTLEKKSGTCEDYSMAQGGEIMLKMKVEGMTCHSCTSTIEGKIGKLQGVQRIKVSLDNQEATVVYQPHLITVEEIKKQIEAVGFSVFIKKQPKYLTLGAIDIERLKNTPVRSSEGSEQRSPSYTNDSTATFIINGMHCKSCVSNIESALSTLQYVSSIAISLENRSANVKYNASLVTPETLRKTIEAISPGQYSVSITSDAESTPSSPSSSYHQKIPLNIVSQPLTQETVINIGGMTCNSCVQSIEGVISKKAGVKSIQVSLVNSSGIIEYDPLLNSPETLREAIENMGFDAALSDVNEPSVLITQPSSEMPLLASANEFYAKIMTPVHDKEETRTSSKCYIQVTGMTCASCVANIERNLRREEGIYSVLVALMAGKAEVRYNPAVIQPPMIAEFIRELGFGATVIENADEGDGILELVV	35586	58325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_+_36077_36813_37540_54893_55101_58156
784242	contig_6227_pilon	+	1481	5	Intergenic	novelGene_49664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	133.625175397453	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	95	793	493479	497963	FALSE	35	AGGAAAGTCGTCAACGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPEHPGSPGWTGHPVAQCAARTKQEASATGPDLLNPGPAGHLDTTSSLSPNSNMTTRELQEYWRNEKCHWKHVKLLFEIASARIEERQASKFVMYQIVVIQTGSFDSNKAILERRYSDFERLQKNLLKIFREEIEDVTFPKKHLMGNFTEEMICERKLAFKEYLSLLYAIRCVRRSREFIDFLTRPELREAFGCLRAGQYTNALDILVRVVPLQARTSCPCKRNWRSASS	488688	498651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_488774_493469_493612_495120_495273_497353_497716_497911
784243	contig_14563_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_135047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	2	475	124044	123571	NA	65	TGTCCAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHLSFVFFFCLSLSSQDWNVTPFLPSRFYPLFFDSLTICLRLDIAGLREADKSGHEFPSPFLSVTSFTFSSLIDYLGISYCELLDCDSQSWLCIGIPKGAISSVCLSRSVAQFLSSLQVHFSACIREAYEQLFLVLYPLYTDGNIVCVLFCIFLSPS	124045	122135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_122100_124000
784244	contig_5253_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_61605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTGTTTCATGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383892	383570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_383600_383900
784245	contig_5482_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_144463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332404	331019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_331000_332400
784246	contig_6870_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_103946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1262	1696	1216968	1217402	NA	90	ATAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEFNGGHTPAEMPVVHSSMQHLKTGQAPQQAPPSRDVVMLLCFFLCQSALSTSLPQPHPYPLVLLRPRFSPYQPLLLTLSCRHSFLQPTGREKGSLRSDDENRVLADHFLVKGICATSQSIRFLTCKVGKVSLPQRTIGSIT	1215706	1217851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1215700_1217900
784247	contig_7171_pilon	+	1558	7	Intergenic	novelGene_101359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	94.5628832517753	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	89	745	1322494	1325806	TRUE	30	TAAAGAACCTGGTGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKVTLGLGGRPHCPPLLAGPEPTAPFSSSAPSPSSQPSMGAALVQVSLQPHPGRSLWLGPFWLLSFRLSQWPTASDVWLLRLDPHMQAHVPRWRG	1321970	1328778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211
784248	contig_5018_pilon	-	1035	6	Intergenic	novelGene_47078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.838914280781	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	67	897	1402792	1399224	FALSE	0	CCTCCTGTGTCTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKLDRHLFFLLSSLRIPWFLSTPGAGGVKPRPEIPSALLPGAQGGRRRGVASRSPSTEKEWGC	1402858	1399085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399409_1401108_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
784251	contig_14618_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_136832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113073	1113658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1113100_1113700
784253	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784256	contig_12479_pilon	-	1881	6	Intergenic	novelGene_56828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCATCTAGGTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111545	78394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_78934_92940_93066_95742_95834_95955_96082_96398_96578_110724
784262	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
784263	contig_18889_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_167113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTAGTTCTATTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151405	148939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_148900_151400
784264	contig_6595_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_122565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTGTCCACATATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754949	752941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_752900_754900
784265	contig_9177_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_32753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCAGCAGTGTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1238605	1236634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1236600_1238600
784267	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784268	contig_13300_pilon	-	1769	3	Intergenic	novelGene_125802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33.5	121	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	176	373	248830	248633	TRUE	40	TCTGAAGCAATATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSGISQNHWGAPSLKTKTQEACSQNVRRGARARAWRSPLSRSWFCSPLLIPHLGEPMERQQWNFLLFSLTPLADTLPLLLSCPEGEIPLVSHVRSRDSTSSLRQPGAAQQAKGLLLVSAAA	249005	244131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_248072
784269	contig_14030_pilon	-	1986	5	Intergenic	novelGene_62226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	774	junction_1	440.71327130006	2	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	16	348	344359	337410	FALSE	20	GGTTTTAAACTTGTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	344374	335771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350
784270	contig_10482_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_152827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116254	115913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_115900_116300
784272	contig_4884_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_63808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286514	287675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_286500_287700
784273	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
784276	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784277	contig_14029_pilon	+	1846	3	Intergenic	novelGene_151953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	109	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCCCTAGAACACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132196	134247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_133298_133407_133470_133564
784279	contig_5954_pilon	+	1776	3	Intergenic	novelGene_28539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.5	20	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	188	787	540542	541886	FALSE	70	AAAAAAAAGAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQVGGARPRVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGAGAGSHSSAQRADYFAMELLDGYLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGQGASGPFPCPLTTPLHLP	521944	542875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_522072_540481_540644_541388
784280	contig_12622_pilon	+	2688	2	Intergenic	novelGene_5893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1830	2249	1533411	1534730	FALSE	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPRDSRDMRDHRDSRDMREHRDSRSMRDARDMRDFRDFRDLRDSRDFRDHRDPVYDRYRDMRDSRDPMYRREGSYDRYLRVDDYCRRKSDSYFDRYRDSYDGRGPPGPESQSRTKGKVAETSLFLLLVEQFTKGKGN	1531581	1535169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1533626_1534525
784281	contig_5816_pilon	-	843	4	Intergenic	novelGene_158253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	164.197712800419	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	255	665	333346	308844	FALSE	10	CTTGGCAGGACTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSSDSSDSSFSRSPPPGKQDSSDDVRKVQRREKNRIAAQKSRQRQTQKADTLHLESEDLEKQNAALRKEIKKLTEEMKYFTSVLNSHEPLCSVLATSVPSPPEEGHTDCGQAALALSIGTPEGGGLDKDCTQGL	333600	308665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_308940_309051_309199_330700_330806_333283
784284	contig_9843_pilon	-	1959	11	Intergenic	novelGene_114337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	24.6067064029301	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	208	1548	302693	250148	FALSE	30	CCCAGCAATCAGCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHHLCVWLFRHLSLDGYHQHHIRLRSQQFRQIHLDTRMWIFRQNRNYILHSLLSKNSSRRYCHRDTRMPWKHKALQKYMGDLNKEYLKLDQCLHHIAVNEGDRRSLNQRHAELAPLAAIYQEIQEAEQAVKELESMCESLNKQDEKQLQELVLEEKQTIDQKINMLYNELFQSLVPKDKYDKNDVILEVTSGRTTGGDICQQFTREIFDMYQSYSCYKHWNLELLNYTPADYGGLHHAAARISGDNVYKHLKYEGGIHRVQRIPEVGLSSRMQRIHTGTMSVIVLPQPDEVDVKVDPRDLRVDTFRARGAGGQHVNTTDSAVRLVHIPTGLVVECQQERSQIKNKEIALRVLRAKLYQQIVEKDKCQQQSSRKLQVGTRAQSERIRTYNFTQDRVTDHRIAYEVRDIKEFLCGEKALDQLIQRLLQSADEEAMAELLDKNLKSAK	305461	249736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_250262_254201_254301_259666_259804_264923_265042_269038_269212_287663_287772_288386_288469_291039_291132_302275_302702_304403_304509_305367
784285	contig_5057_pilon	+	2621	1	Intergenic	novelGene_151523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAACCATCCTCTCCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511528	514149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_511500_514100
784286	contig_5799_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_50313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGGTAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608563	610396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_608600_610400
784288	contig_1836_pilon	+	1123	2	Intergenic	novelGene_71035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAAGCTTTTGTTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583634	587444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_583959_586645
784289	contig_14666_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_39496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCAAGAAGGGATGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307909	310170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_307900_310200
784292	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
784297	contig_12756_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_153225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTATCCTGACCTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244886	243880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_243900_244900
784298	contig_12756_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_153226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTGCATATAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245238	244852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_244900_245200
784301	contig_13481_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_119459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCTATAGGACAGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087440	1088889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1087400_1088900
784302	contig_15034_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_143641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAAAATAAATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53726	53125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_53100_53700
784303	contig_16098_pilon	-	1903	17	Intergenic	novelGene_45869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	59.3090423122815	1	76	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	488	1639	251605	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSAAHDILRHQRAPGNQSHVDPGPIPIPHNGSSRFDCNSVSTAAVLLADILPTLLIKLLAPFGLHLLPYSPRVLVSGVCAAGSFILVAFSHSVGTSLGVVLASISSGLGEITFLSLTSFYPRAVISWWSSGTGGAGLLGALSYLGLTQAGLSPQHTLLSMLGIPALLLVSYFLLLTSPAPQDPGGEEDTETAARQPLMSSEAPESKPDSGSSLSLQERWTVFKSLLPHIIPLVLVYFAEYFINQGLFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	253588	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247323_247416_247486_247564_247612_248284_248398_249225_249370_249447_249521_249990_250074_250211_250292_250692_250765_251545_251643_251721_251945_253023_253103_253255_253379_253563
784304	contig_5935_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_102675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637108	636689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_636700_637100
784305	contig_5916_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_158059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485836	486500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_485800_486500
784309	contig_8050_pilon	-	2295	2	Intergenic	novelGene_114852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAGTACCAACAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376295	371709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_372428_374718
784310	contig_18804_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_163801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAGCTTTTTAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59844	58503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_58500_59800
784311	contig_2027_pilon	-	686	3	Intergenic	novelGene_39877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	120.5	109	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	271	585	55814	53400	FALSE	20	CTAGCTAGTGTTGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLPAVHVRWESTASRTVVAPPAITGKRPREPIIRWQEDPDPEDENLYEKNPDSHGYDKNPVVDLWNMRVVFFFGFSIVLVLGSTFVAYLPDYSKIQLPEEED	56084	53298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_53431_53703_53835_55661
784313	contig_6496_pilon	-	1795	6	Intergenic	novelGene_103478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.8059663747158	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	96	500	285171	247708	TRUE	20	TGCCTCTTATAATGGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSDKAVKYYTLDEIKKHNHAKSTWVILHHKVYDVTKFLDEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDAREMSKAYIIGELHPDDRSKLAKPSESLITTIDSNSSWWTNWVIPAISALIVALMYHLYTAED	285266	246334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247108_247185_247790_249540_249576_263148_263179_264936_265066_285042
784319	contig_6710_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_93436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653710	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
784320	contig_5389_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_142995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTCTACTGAAGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52809	53627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_52800_53600
784321	contig_5916_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_158046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATTCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367133	369167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_367100_369200
784326	contig_11448_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_66405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501926	500815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_500800_501900
784328	contig_13004_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_112637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCACAAGCAACTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259916	258558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_258600_259900
784329	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	51	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784332	contig_4093_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_27603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAACAAGATCCCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36625	37435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_36600_37400
784334	contig_3789_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_79819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	24.6513184231594	151	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATGTTTCGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179394	154280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_155139_159879_160005_169288_169340_172991_173092_179293
784335	contig_12638_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_33246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752949	750280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_750300_752900
784338	SIRV6	+	331	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	542	0	376	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1679	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
784339	contig_20819_pilon	-	321	4	Intergenic	novelGene_55680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_2	355.588088789387	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATCTTCCTTCTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66065	65406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048
784341	contig_5758_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_119132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTATACGTGGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627880	628978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_627900_629000
784342	contig_5758_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_119133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATTGCTCTTGGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629130	630030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_629100_630000
784343	contig_10104_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_160147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAGACACAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573443	574814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_573400_574800
784344	contig_10323_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_123572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTTGAACTCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454286	453893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_453900_454300
784345	contig_19311_pilon	-	999	3	Intergenic	novelGene_144087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	5.5	223	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	392	976	164618	164034	FALSE	65	ATGAAGAAAGAAAAGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPKKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEEFRRKLLKAGGDPNRSVHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKADSSLLTITSGQQDKKAPSKRPPVSDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKVESETSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENMSSKSDVSSLVDFPPFLYCFFRF	202994	164010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_164781_193126_193271_202909
784347	SIRV5	-	414	5	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-1129	1160	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTATGCTTCGGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3535	1017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2050_2253_2316_3298_3403_3481
784349	contig_9027_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_156356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGGGGGAGTGTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96476	95611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_95600_96500
784351	contig_2093_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_152997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408945	1408447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1408400_1408900
784353	contig_2033_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_71531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCAGCTGACTGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121575	119170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_119200_121600
784355	contig_9375_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_136050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTGAATTTTCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172538	173773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_172500_173800
784356	SIRV5	+	471	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-150	884	-36	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATAGGTTTACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8165	10982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
784357	contig_8729_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_40123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCAGTTGTGCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509332	508223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_508200_509300
784359	contig_15063_pilon	-	650	2	Intergenic	novelGene_14459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCACTGAAGGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	36044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36156_36264
784360	contig_9883_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_87597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTTTCTACAGTTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103544	103850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_103500_103800
784361	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8125	11	614	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCACCGGTTATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
784365	contig_854_pilon	-	1777	15	Intergenic	novelGene_36449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGGAAAATGTGCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465470	1451234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1451295_1453635_1453775_1454088_1454143_1454913_1455006_1455681_1455786_1456398_1456463_1457307_1457417_1458336_1458468_1459019_1459136_1460064_1460208_1460539_1460620_1460744_1460875_1464204_1464355_1464548_1464818_1465334
784372	contig_10159_pilon	+	965	3	Intergenic	novelGene_30884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	8.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	479	964	982630	992704	FALSE	70	AGAGAAAGAAAAATAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHVAPSTDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNAEAEDDGSVCTKLQMAGATSCGWSWTKGKGRFSPFTPYVLK	982151	992705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_982861_992071_992208_992585
784375	scaffold_16539_pilon	-	1422	5	Intergenic	novelGene_68299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	200.75155665648	718	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	454	831	98796	97499	FALSE	15	GCTGCACTTAACTTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVACYPGNGLGYVRHVDNPHGDGRCITCIYYLNQNWDVKVHGGLLQIFPEGRPVVANIEPLFDRLLIFWSDRRNPHEVKPAYATRYAITVWYFDAKERAAAKDKYQLALGQKGVQVPVSQPTTPT	99623	96907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97555_97821_97890_98114_98252_98679_98800_99173
784377	contig_5791_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_35829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014397	1012799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1012800_1014400
784379	contig_6217_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_109563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAACTATTTGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34003	31506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_31500_34000
784382	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784384	contig_6710_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_95225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
784385	contig_401_pilon	+	1198	6	Intergenic	novelGene_42791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCACCAACAAAAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113993	1131675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1114527_1125504_1125661_1127487_1127681_1128470_1128574_1128905_1129086_1131642
784386	contig_10600_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_169872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGTGCTAGAGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272763	274818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_272800_274800
784387	SIRV6	+	251	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	8468	3	271	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTGCAATGCCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
784390	contig_5826_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_71526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATGATGAATTTAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215181	213576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_-_213600_215200
784392	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784393	contig_7919_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_28127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTAAATTTCATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486492	1485936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1485900_1486500
784394	contig_7919_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_28126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGCTGTATTATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485089	1484582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1484600_1485100
784395	contig_7919_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_28125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAAAGACAAATGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484483	1484284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1484300_1484500
784396	contig_5954_pilon	-	1461	10	Intergenic	novelGene_28718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	266.829718669852	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	102	1049	970200	962561	FALSE	20	GTCTTCACATTGTTAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKFLSVVKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEVQQIMSDPAMHT	970992	962148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963054_963182_963385_963503_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968643_970053_970223_970913
784397	contig_500_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_31091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	304.2440997328	601	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	11	559	1510494	1500737	TRUE	20	TAATGCTTGCCTCACGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRREREEIEKQKAKERYMKMHLAGKTEQAKADLARLAIIRKQREEAARKKEEERKAKDDATLSGKRMQSLSLNK	1510504	1500070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500566_1500626_1500796_1501999_1502152_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
784399	contig_9119_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_169741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96407	95736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_95700_96400
784400	SIRV1	-	237	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	5	3588	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGGCCTGGAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
784402	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784404	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784406	contig_20183_pilon	+	2861	1	Intergenic	novelGene_174234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1131	1490	36972	37331	NA	55	AGTAAAAAGTTGAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNAGQGFALRRKLKVQQSYKKLLWKEKKAQISQDSQFTDRYPDHLKHLYLAEEERLRKQLRKVPRPLPEEQVNQPLREEQVDQPLPEEQCSIDQPLPEEQCSKTVKYAFPFLKSFTF	35841	38702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20183_pilon_+_35800_38700
784407	contig_1406_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_25644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTACAAAATTTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2714542	2713522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2713500_2714500
784411	contig_14332_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_173048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTTAGAAAAAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31931	33376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14332_pilon_+_31900_33400
784412	contig_18592_pilon	-	868	2	Intergenic	novelGene_114765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2399	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATCTGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13093	1132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1645_12737
784413	SIRV6	+	492	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031
784416	contig_5039_pilon	-	1538	5	Intergenic	novelGene_64883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	19.7673974007708	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTATATAATCAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585110	550260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_550917_551519_551692_579525_579973_584747_584888_584987
784417	contig_5039_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_64882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGTGTGCCTGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550053	549762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_549800_550100
784419	contig_11386_pilon	+	1172	4	Intergenic	novelGene_82784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	364.011294086079	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	107	862	17940	24897	FALSE	5	TTTCACTGTTGCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHYSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	17833	25207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19974_20816_21022_24791
784422	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784423	contig_2480_pilon	-	2058	3	Intergenic	novelGene_63541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1646	1960	263153	261703	FALSE	25	GGGTGACCACATAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQLTTTVAMMPFTTVLSHSTPCIQAAPRDAQTTSGRKSARRMYSSLDIDFRGPGLQMVPEIQRTFRLGTCLLRGEKFPFYKSSDIRAHVCTISTLTPDFFYL	264848	261604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_262003_263138_264572_264621
784424	contig_1715_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_127195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266968	269316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_267000_269300
784426	contig_7091_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_131779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355413	357627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_355400_357600
784427	SIRV6	-	227	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATCAATTATACGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
784429	contig_7293_pilon	+	511	3	Intergenic	novelGene_54251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	39491	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	55	381	335695	336451	FALSE	35	GTATGTTTAAAAATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335640	336581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
784430	contig_20561_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_166368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGCCTAAAGGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58442	59814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_58400_59800
784431	contig_12864_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_76357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTGGTGAGTTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118907	118608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_118600_118900
784433	contig_5586_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_143525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278373	280700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_278400_280700
784434	contig_8027_pilon	-	1871	4	Intergenic	novelGene_158855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.4995974211616	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500742	489878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_490670_491734_492571_493829_493887_500555
784435	contig_13780_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_149094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATAAGGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699171	697091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_697100_699200
784437	SIRV6	+	158	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	560	65	560	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10797	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784441	contig_14260_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_28885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGTCTTCATAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10809	12148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14260_pilon_+_10800_12100
784445	contig_5585_pilon	-	1633	4	Intergenic	novelGene_143071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	20.3360653902262	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	629	1150	402839	390145	FALSE	55	CCCAAAAATTAGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKHGFSDIKVEDTAKGHIVLLQEAETLIQIEEDSTHIICDSDEMLRVRLRDLVLKFLQKF	403467	389661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_390322_392713_392852_394330_394430_402731
784446	contig_18634_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_174236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16198	13816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_13800_16200
784450	contig_12620_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_98814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGACCAATTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436830	437522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_436800_437500
784452	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
784456	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	54	517	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784459	contig_14472_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_111191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAACAAAAGAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489661	490902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_489700_490900
784463	contig_7963_pilon	+	832	6	Intergenic	novelGene_58579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.00056603698	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	41	715	254848	257509	FALSE	15	GGCCAGTGGGAGCTGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSKRSPELALPRGMQRSLGGDRERNVQIEMAHGTTTLAFKFQHGVIVAVDSRASAGSYIANLRVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254807	257626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255619_255753_255911_256024_256447_256578_256972_257178_257420
784467	SIRV6	-	216	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCGACTCGTTCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
784470	contig_5020_pilon	+	814	5	Intergenic	novelGene_27833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1194.63352121058	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTGGTATTGACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118462	125956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122896_124918_125091_125657
784471	contig_13295_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_31245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	482	817	107867	108202	NA	20	TCCCTAGTCCAGAATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVFLFFFESHGLKYTAATATSYYPQWSPHCLPGTGLCEHLNMGKSFKVGVIHLYFTYKENMVLRDEVTFSGSAAGESKDSNSSLNPKTKPIAFESIQAHSDPIGRSRVP	107385	109138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_107400_109100
784473	contig_13607_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_170223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAAACCACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452569	451931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_451900_452600
784474	contig_13876_pilon	+	1048	3	Intergenic	novelGene_174242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	22	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25590	30476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_25705_27482_27579_29638
784477	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784478	contig_11572_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_100081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCGGAAATATGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400364	399463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_399500_400400
784479	contig_11572_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_100079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAATCTGGAATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399258	398506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_398500_399300
784484	contig_14219_pilon	-	1060	9	Intergenic	novelGene_54378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	937.482258165455	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	101	370	1084399	1077228	TRUE	15	ATTCTTTCGGTACTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPGGGGGGSLSVSSREERTQGGAPAGTGGGPTMAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEINSLVIRNSHCACQGATELGFPWFLALGIELCNDFPLVYCMGEGHILI	1084499	1056709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077375_1084276
784485	contig_17936_pilon	-	1646	7	Intergenic	novelGene_29980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.5628065724317	49	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	137	595	167355	161377	TRUE	30	TTTTGTAGTCAAGGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRGSADPVGASSSPASASSASSASLASAGSRDPGVCPTLDPTRDMSTPARRRLMRDFKRLQEDPPAGVSGAPSENNIMVWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLTIEFTEEYPNKPPTVRFVSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWRDC	167491	160227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161156_161253_161506_161839_161929_162755_162846_166658_166685_167090_167172_167311
784489	contig_9900_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_159517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACTGCCATTAAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338679	341081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_338700_341100
784493	contig_253_pilon	-	737	7	Intergenic	novelGene_129685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_6	436.090204735977	9546	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	33	665	421711	418769	FALSE	15	GAAGCTGTGCTGTGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVVAAASTAIMPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421743	418696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
784495	contig_2100_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_50613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753710	754158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_753700_754200
784497	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
784498	contig_13528_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_66878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCCGTGTGACAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42571	42016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_42000_42600
784501	contig_14441_pilon	+	735	3	Intergenic	novelGene_100697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	228	734	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWKPYGTARLCPVGSLGVRLCFTATDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADLLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	114653	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114732_116578_116963_117523
784504	contig_935_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_45530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120581	118375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_118400_120600
784505	SIRV4	+	237	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACCGCCGTTTGAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
784509	SIRV5	+	228	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	286	154	172	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8487	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
784510	SIRV6	-	422	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-122	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTCGACTGTCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
784511	contig_9345_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_24573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGCTTCTCTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907732	906353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_906400_907700
784512	contig_7635_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_171365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAAACTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78290	76132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_76100_78300
784515	contig_10196_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_132126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	18	392	925908	926282	NA	20	CAGGCCCAGTGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCTGMGRRGQAGGSSWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	925890	926561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_925900_926600
784517	SIRV6	+	295	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8134	2	605	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGTCGAAATCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
784519	contig_9415_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_109816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1791471	1792863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1791500_1792900
784525	contig_13244_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_86935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAGTAATATGCTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245652	247370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_245700_247400
784528	contig_6164_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_121311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAGAAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788788	789276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_788800_789300
784529	contig_7171_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_101210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGCGGCTGTGCCTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179160	176866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_176900_179200
784532	contig_7919_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_28131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514340	1513587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1513600_1514300
784533	contig_7919_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_28130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGTCTGGTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513437	1511788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1511800_1513400
784534	contig_16098_pilon	-	1541	5	Intergenic	novelGene_45864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	33.9042770163294	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	816	1277	247373	244355	FALSE	5	CTTTCTTGTGTCATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTYTALFLFLIWSLLQFELLFFRNMSLSHAEQYRWYQMLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	248861	244090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247145_247266_247612_248284
784538	scaffold_13505_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_111499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTATTACAAAGACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540820	540307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540300_540800
784539	contig_19564_pilon	+	2788	8	Intergenic	novelGene_29650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	86.4827457133644	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2715	74	2788	19890	24284	FALSE	50	ATGGAGACAAGAGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDTQVIDWEADEEEETEQSTESVGCHLEPLGRLHIFSSAHGPEKDFPLYLGENVVGRMPDCSVALPFPSISKQHAVIEILALNKAPILRDCGSLNGTQILRPPKVLSPGVSHRLRDQELILFADLPCRYHRLDVPLPFASRGPLAIEETPRVQGGTRPQGLLLAEDSDGEVDSLSESCVVKDSRTTSSPLATVVPESDEEGASSARDGPGVPFAFSLNSDTDEEEGQQPASRQASSAARRGAPAEPEQSDVDGVTAELQLEKDQPLAKERDSDTKVERDAGNVVVPVGVILERNHPVGEDSDTDVDEDSRPPGRPPEGHLERGQLSGFIDSDTDVEEEGIPATPAVVPMKKKQIFYGVGMHGLRVPTLAHLQKSQAGGDADVEQGEAPVVVRLERSQGSMVINSDTDDEEEVLAALTLARLKESRAVTHHRDTDVEEDRSPPVVLLERSQTSTERDNGTDVEKEERCPVEKRQTILKGPTDKDGALVIAHSGKSQPPLRDDDIDMGEEKGSPGAHLERRQAFTTMDISTEVEEDVSLEPAVTHLEKHQVPVEGTNQTDMEAEGSPAKLPVVYLEEAWPPPDEDCETDEEEDMSFMASALVHVRKSQLPAEGDAGTEWAAAVKRERVLEAGTQGGSPVAQVEQDLLPVSRENLTDLVVDTGTPGNATQPHREGAQTPTEREREPYADRTKDSKDSHDDSEDLDLQATQCFVERENPSLEAIKSMEEEPTRAFLFTLPQEETGPSRCSFQTPGTLDEPWEVLATQPFCPRESETSETQHIAVHLEAHGNCPSPPRATPQDQHPESTVHTESLGIQGRGIHTEEKVLDTPRETAGRVTPEREPLEREAKELPPEGEREDETGEEELTRGLQDREQKQVLAIDLQRQESDTKLKSANTERDVKSSKVE	17989	24284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_18060_19886_20026_20647_21029_21114_21191_21469_22969_23106_23173_23335_23432_23823
784541	contig_10531_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_114513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTAATGTTTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372506	370756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_370800_372500
784542	contig_5918_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_99625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTTGAGTTTCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2225698	2227085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2225700_2227100
784549	scaffold_14325_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_162654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGACACAGTGGCTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8463	6427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_6400_8500
784550	contig_5059_pilon	+	1273	9	Intergenic	novelGene_140722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	182.978653126533	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	481	1140	243441	259441	FALSE	20	CATGTGGTGGTATGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQEPMDSSQTTKQSIISEELISEGKWVKLEKTTYMDPTGKTRTWETVKRTTRKGQSADGVAIIPVLQRTLHYECIVLVKQFRPPVGGYCIEFPTGLIDDNESPEAAALRELEEETGYKGDIAECSPVVCVDPGLSNCTVHVVTVTINGDDAENVRPKPKPGNLEFVEVISLPKNDLLKRLDALVAEEHLTVDAKVYSYALALKHANTKPFEVPFLKF	232100	259574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232537_243396_243504_244759_244828_250083_250134_251589_251698_253218_253315_253949_254056_255904_255964_259331
784552	contig_12540_pilon	+	1575	12	Intergenic	novelGene_148141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	674	1228	1350412	1352682	TRUE	30	AAAGCAGAGGTGTTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLLPHRVQVPVDGFCPFLGLPDLDSDIGVTGTCLVLCLQALGTDHGDADLGRPFGRPVQHALLDRLHLLRVRRLGHGEDLLNELEDLGLVALPDLHAVLEHHDDVLRAVLRPVLRALLRRPLQAVGVEQVLALLMALDAALRAAHALPRDAPQQPLTLVAVGGRGGRPHLEVVRCRARDGVD	1346932	1358936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1347002_1347291_1347442_1347847_1348013_1349311_1349433_1350102_1350269_1350409_1350552_1351350_1351578_1352494_1352715_1352953_1353031_1353782_1353863_1357953_1358003_1358827
784554	contig_5643_pilon	-	1298	9	Intergenic	novelGene_39131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	234.473745865075	2	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	336	956	650541	647313	TRUE	45	ATTACTTAAACTGAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGPDLGKSPPPQAPKMVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	651393	646207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344_649522_650490_650580_650899_650956_651152
784555	contig_7457_pilon	-	2681	11	Intergenic	novelGene_31320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_10	73.0671608864064	365	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	194	958	268463	263970	FALSE	20	ACAGACCCTCGTGCGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGSRQQADGREDCTEGGSEPAVSEPARAAVSRGQPRFPPPFWPPPRSPQRLRSPAERTRPGPAMASLLKVDQEVKLKVDSFRERITSEAEDLVANFFPKKLLELDSFLKEPILNIHDLTQIHSDMNLPVPDPILLTNSHDGLDGPTYKKRRLDECEEAFQGTKVFVMPNGMLKSNQQLVDIIEKVKPEIRLLIEKCNTVKMWVQLLIPRIEDGNNFGVSIQEETVAELRTVESEAASYLDQISRYYITRAKLVSKIAKYPHVEDYRRTVTEIDEKEYISLRLIISELRNQYVTLHDMILKNIEKIKRPRSSNAETLY	268656	262246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_264051_264699_264787_264908_264964_265061_265130_265265_265335_265570_265684_266212_266262_267146_267252_267508_267572_267690_267724_268421
784559	scaffold_19766_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_34389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACATTTAAACTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809210	808404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_808400_809200
784560	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	0	1214	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
784561	contig_2463_pilon	+	2807	1	Intergenic	novelGene_43012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTCTTTCTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415257	418064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_415300_418100
784562	contig_10324_pilon	-	2764	1	Intergenic	novelGene_7787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124420	121656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_121700_124400
784564	contig_12970_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_50557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTTACCCAGCTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607721	608600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_607700_608600
784567	contig_10404_pilon	+	669	2	Intergenic	novelGene_138686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1724	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098834	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098859_1099839
784570	contig_14415_pilon	+	1484	2	Intergenic	novelGene_77610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGGTGTTTATATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33331	39505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_38135
784578	contig_6102_pilon	+	1636	13	Intergenic	novelGene_32388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCCGAGTCCCGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728488	1743504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1728945_1729883_1729979_1730098_1730200_1730453_1730534_1730626_1730712_1731990_1732063_1732387_1732545_1732742_1732903_1733189_1733284_1733600_1733663_1733866_1733963_1742374_1742448_1743399
784579	contig_10904_pilon	+	1745	5	Intergenic	novelGene_22679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28.4813535492961	73	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	515	895	562663	609239	FALSE	10	TGAGAGTTGGGGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHPVSDQKFQDPPRILRPSQDSPPICSPSPAAWWWHLVPSEEMGPGKIGEGLTCLHLNPLAQTQPWKRDPGRTPEERPVHQTPVLTHPQPSPAPSPTLQGPDNPTWGLSGHGACVYGGRVEVEVG	541570	610089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_541868_556193_556373_562624_562696_602191_602373_609072
784587	contig_15105_pilon	+	2413	3	Intergenic	novelGene_150990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1572	1874	700989	701291	TRUE	40	GTAAGAGAAGACAGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCFTALALLMQVSSWPFTMSPPAKLLRTVSLLLRLRGFRGASGTVRNISSSRLWLSSLKGTIRESGTSFSTPFTKGCSDCSIRRISATSASSSSARAW	699417	703555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_701507_702797_702973_703406
784588	contig_4392_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_117319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390377	392607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_390400_392600
784589	contig_6360_pilon	-	1058	4	Intergenic	novelGene_165878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	39.4658783705058	6	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	135	497	48545	17795	FALSE	30	GCTCATTTTCAAGCACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAREKDPADDIENDLEKKKLDWSCSLLLASFVGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTQYIKAFYNESWERSRGHPVDSDTVTLLWSVTVSIFALGGVVGTLMVKLIGKFLGRSVGTISVWSSPI	88977	17233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_17996_38188_38288_48482_48586_88883
784591	contig_10064_pilon	+	1886	8	Intergenic	novelGene_122709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	62.9635463047096	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1120	1680	268353	273630	FALSE	15	TTGACAGTTCTGCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCPDQKCLYTCQIKDGGLQPQFEIVPEDNPQNAIVSSSADVCHEELLKTIRASAGRLTPSLLPSGADFFGFSHPTIHNLIQSCPGARKCVNYQWVKFDVCKPGDGQLPQGLPENDAALSFEAFQRQTFEDQNDPILPGSLDLPELQPAAFVSSYPPMFLTHEPLVETHLQHLKSPVQCSPTRSSD	264430	273836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_264725_266181_266253_267020_267254_267831_268419_271806_271905_272159_272271_272657_272798_273484
784595	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784597	contig_5286_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_157387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGACATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645896	646746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_645900_646700
784598	contig_3942_pilon	-	448	5	Intergenic	novelGene_128805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	158.104988852345	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	32	409	1054846	1050150	FALSE	5	CTTGATGCTGTGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVVRPSYRKPGPSAPFSYQ	1054877	1050110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050186_1053126_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811
784608	contig_13547_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_104884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTATTAACTCATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99958	99318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_99300_1e+05
784609	contig_1443_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_28212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	15	320	344287	344592	NA	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344272	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344300_344900
784618	contig_6807_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_84559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACTGAATCATCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87312	85164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_85200_87300
784619	contig_7815_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_134361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAATAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153398	155523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_153400_155500
784620	contig_14704_pilon	-	1906	2	Intergenic	novelGene_82677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_1	0	62	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTGTCAGTTTCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71044	8761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_10424_70800
784621	contig_7057_pilon	+	680	3	Intergenic	novelGene_123357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_2	81	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	250	678	943281	943709	FALSE	5	GCTCTTCGTGGCATCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPL	941406	943711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_941523_942970_943030_943206
784625	contig_16122_pilon	+	1678	3	Intergenic	novelGene_134510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.5	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	505	1200	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133480	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_133552_133656_134161_136976
784628	contig_7157_pilon	+	1953	8	Intergenic	novelGene_131278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	252.293318118707	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	16	1884	806224	864891	FALSE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAEFKDHSTTMDSEANPGTSSVSTTTSSTTTTTITTSSSRMQQPQISVYSGSDRHAVQVIQQALHRPPSSAAQYLQQMYAAQQQHLMLHTAALQQQHLSSSQLQSLAAVQASLSSGRPSTSPTGSVTQQSSMSQTSINLSTSPTPAQLISRSQASSSTSGSITQQTMLLGSTSPTLTASQAQMYLRAQMLIFTPATTVAAVQSDIPVVSSSSSPCQSAATQVQNLTLRSQKLGVLSSSQNGPPKSIGQTQSLTICHNKTTVTSSKISQRDPSPESNKKGESSSLESRSTAVTRTSSIHQLIAPASYSPIQPHSLIKHQQIPLHSPPPKVSHHQLILQQQQQQIQPITLQNPTQDPPPSQHCIPLQNHGLPQAPSNAQSQHCSPIQSHPPPLTVSPSQSQSAQQSVVVSPPPPHSPSQSPTIIIHPQALIQPHPLVSSALQPGPNLQQSTANQVQATAQLNLPSHLPLPASPVVHIGPVQQSALVSPGQQIVSPASHQQYSTLQSSPIPIATSPQMSTSPPAQIPPLPLQSMQSLQVQPEILSQGQVLVQNALVSEEELPAAEALVQLPFQTLPPPQTVAVNLQVQPPAPVDPPVVSPWKLFEFLAELKVKTIVSHTVLYR	806208	864960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_806238_809724_809891_814471_814628_820239_820318_850805_850965_853021_853118_858596_858844_863938
784629	contig_6494_pilon	-	792	6	Intergenic	novelGene_108571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1089.51611277668	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	366	719	3457	2635	TRUE	30	AGACACATGGCCTGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5664_6700_6883_8256
784630	contig_4402_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_140802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCAGCCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239448	237263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_237300_239400
784633	contig_7933_pilon	-	793	3	Intergenic	novelGene_164708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2405	214	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	80	451	238534	234215	TRUE	30	CATACTGGAGCGTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKISAGSRPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKVLVTALAPPNDPSTKPGPGRRASNEGPAAAPHTPGRMAPVCPGAHLTPLCPLQAGWSIEQPRLSHLPRGEL	238613	233159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234185_234584_238531
784635	contig_2100_pilon	-	684	6	Intergenic	novelGene_50737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	963.502693301892	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	116	493	1182812	1170114	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKCDSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185526	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170178_1176761_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
784638	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	0	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784639	contig_7593_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_127264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAATTTGAATTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2865	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_2900
784640	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784642	contig_9919_pilon	-	1395	2	Intergenic	novelGene_137947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGGGTGAGATGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529044	527376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_528151_528423
784643	contig_16870_pilon	+	468	5	Intergenic	novelGene_155512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCCCGGGGGGCTAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193788	194617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_193826_193914_194071_194161_194270_194369_194473_194553
784644	contig_6710_pilon	+	554	2	Intergenic	novelGene_97059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACTCCAAGAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653371	657513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657469
784647	SIRV4	-	604	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	15	-2	15	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1175	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5143	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
784650	scaffold_13505_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_111413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTTTGAGGAACCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322248	322759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_322200_322800
784652	contig_15185_pilon	+	763	7	Intergenic	novelGene_99463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGCCTGGCTGAGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430214	472325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_430256_430362_430541_430670_430751_434093_434172_435509_435689_444528_444701_472290
784653	contig_7157_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_131274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	18	401	640797	640414	NA	15	CAAGTTCTTCCTGGCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLQTNFSMVQGSSKKLKGMGDDGSPPVKKMMTDIRANGKMLINKVPAVKKEHLEDYGEVPMETDGEHVKRTCTSMPEPLNLNPSLKHTLAQFHLSSQSSLGGPAAFSARYSQESMSPTVFLPLPSP	640814	640413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_640400_640800
784654	contig_11338_pilon	+	1170	11	Intergenic	novelGene_6276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.3467843907466	3	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	600	1082	179446	189573	FALSE	40	TTCATGAACAGACACGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172053	189661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176351_176432_176475_176652_176695_177543_177685_177808_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
784655	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	38	-244	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784659	contig_14516_pilon	+	1532	10	Intergenic	novelGene_153945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.875612016018	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	109	1188	378714	422609	TRUE	70	CGAAAAAAAAAAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	365891	423132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_365952_378665_378790_388358_388419_391029_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472_422614_422792
784665	contig_5649_pilon	-	2739	1	Intergenic	novelGene_82442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	660	1136	1495694	1495218	NA	40	TGAAAAGTCTCAGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIGKFKQILYEVVASSLVECVIGVDIMSSWGTLPLPDIVKLKLCKSAFRPVLIRHAKWEPLELPEPTQVVNLKQCRIPGEQKEITALIKDMLKTGVLVPTNSLYNSPVWPMKKADDSWTLTVDYPGLNKVVPLWLQLFQTWYQRCRRYIRLKETDTK	1496353	1493614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1493600_1496400
784666	contig_10523_pilon	-	1249	8	Intergenic	novelGene_120932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	133	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	289	1182	39240	12805	FALSE	5	TTGTTTTGCCAGGTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEDRGK	39528	12737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12820_15105_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
784667	contig_15039_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_110107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130243	128502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_128500_130200
784669	contig_8880_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_165757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATCCATCCTATACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70134	69856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_69900_70100
784670	contig_3817_pilon	-	2136	16	Intergenic	novelGene_78379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	29.2881470147149	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1041	1095	2135	912870	897317	FALSE	20	TGATGGCCCAGTACGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMALKELSIRGDFRTTVEYLINLLETESFQNNDIDNEWLDHLIAQKVQAEKPDVMLGVVCGALNVADAMFRTCMTDFLHSLERGQVLPADSLLNIVDVELIYGGIKYILKVARQSLTMFVLIMNGCHIEIDAHRLNDGGLLLSYNGNSYTTYMKEEMDSYRVTIGNKTCVFEKENDPTVLRSPSAGKLIQYTVEDGGHVEAGSSYAEMEVMKMIMTLTVQESGQVKYIKRPGAMLEAGCVVARLELDDPSKVHPAEPFTGELPAQPTLPILGEKLHQVFHNVLENLTNVMSGYCLPEPIFSIKLKEWVQKLLMTLRHPSLPLLELQEIMTSVSGRIPAPVEKAVRR	930419	897315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_897446_899095_899243_903330_903466_904810_904962_907037_907184_910616_910699_912510_912615_912723_912875_915587_915752_919977_920141_922330_922502_923280_923491_927109_927221_927326_927437_928939_929039_930357
784671	contig_3817_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_78377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891436	890528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_890500_891400
784675	contig_11052_pilon	+	730	4	Intergenic	novelGene_115453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2271.10961622043	175	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	107	538	102902	107529	TRUE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102795	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445_107617_107693
784677	contig_152_pilon	+	867	5	Intergenic	novelGene_162651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_2	85.3679535891543	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724597	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
784678	contig_2703_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_101692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1718	junction_1	456.443041353464	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAATAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526138	582848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578915_582631
784679	contig_9578_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_67980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126272	1126524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1126300_1126500
784681	SIRV4	-	349	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	15	1157	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
784682	contig_17074_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_145141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAGGTGGGAGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226627	227623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_226600_227600
784685	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784688	contig_7619_pilon	-	1026	7	Intergenic	novelGene_162143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.8342036494195	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	239	724	30763	23773	TRUE	25	CTCTCTATATATGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVLVASRCCASLWAQPGFGLCTSPVPVVLFALFPRAGIDEGSPLFRLRLPLAFPAARVSDDSQVTLKSASCFLNTSLKMEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	32336	8389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_8664_23744_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_32143
784690	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
784691	contig_11816_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_98502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588411	590475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_588400_590500
784696	contig_15022_pilon	+	1903	2	Intergenic	novelGene_171800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTAAAAAAGAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15615	18051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_16786_17318
784697	contig_5643_pilon	+	850	6	Intergenic	novelGene_38734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	298.782462671423	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152346	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152456_152907_153040_155745_155892_156463_156584_156823_156945_157085
784699	SIRV6	+	493	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	20	164	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	236	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784700	SIRV2	-	470	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4403	34	3228	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
784701	contig_5799_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_50232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTCACTTGGATTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136000	135261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_135300_136000
784704	contig_8552_pilon	+	1341	11	Intergenic	novelGene_80094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_3	220.425406884052	218	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	348	1220	538771	545273	FALSE	30	AATGTACAGAGACTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPTKISRCPHLLDFFKVRPDDLKLPTDSQAKKPETYLMPKDGKPNAADITGPIILQTYRAIADYEKSSGSEMALASGDVVDVVEKNESGWWFCQMKVKRGWVPASYLEPLDSPDEAEDPEPNYAGEPYVTIKAYTAVEEDEVSLGEGETIEVIHKLLDGWWVIRKEDVTGYFPSMYLQKSGQDLAQAKRQIKSRGAPPRRSSIRNAQSIHQRSRKRLSQDTYRRNSVRFLQQRRRQARPGPQGAVAPLQEQPQAERPKPQPAVPPRPSADLILHRCSESTKRKLASAV	528379	545394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_528495_535667_535749_538479_538556_538695_538863_540320_540377_541022_541146_541764_541873_542826_542945_544151_544260_544823_544970_545151
784705	contig_5222_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_58992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATCACCATCATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178489	179084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_178500_179100
784707	contig_11171_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_48623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376724	374977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_375000_376700
784709	contig_4531_pilon	+	2014	12	Intergenic	novelGene_47880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	191.793621865874	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	124	1344	225395	330172	FALSE	15	AATTGTGTCCGTTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGKSCDQRHVAMNKEQHNGSFTDPSSMNEKKRRDREERQNIVLWRQPLITLQYFFLEILVILKEWTSKLWHRQSIVVSFLLLLAVLIATYYVEGAHQQYVRRIEKQFLLYAYWIGLGILSSVGLGTGLHTFLLYLGPHIASVTLAAYECNSVNFPEPPYPDQIICPDEENIEGAISLWSIISKVRIEACMWGIGTAIGELPPYFMARAARLSGAEPDDEEYQEFEEMLEHAETAQDFASRAKLAVQNLVQKVGFFGILACASIPNPLFDLAGITCGHFLVPFWTFFGATLIGKAIIKMHIQKIFVIVTFSKHIVEQMVAFIGAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	216850	330842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_216948_225368_225471_228604_228741_229766_229858_230729_230841_257190_257359_264246_264379_301983_302065_303610_303728_310531_310594_328808_328912_330028
784710	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784712	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
784714	contig_1154_pilon	-	2263	3	Intergenic	novelGene_87123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCCAAGAGCTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446348	438655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_439503_442408_442504_445027
784717	contig_2770_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_107422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCTTCCCAAGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259272	259804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_259300_259800
784718	contig_5815_pilon	+	1168	7	Intergenic	novelGene_141206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	387.352445024769	1115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	376	945	566561	571884	FALSE	25	TATTGGTGTAAGAGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	561880	572107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566190_566314_566543_566635_566892_567037_567804_568014_571741
784721	contig_11360_pilon	-	1539	8	Intergenic	novelGene_174253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	60.4223232163175	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCATCTAATTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269464	15782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11360_pilon_-_16184_16400_16512_96842_97066_128979_129163_251669_251823_253906_254080_261706_261904_269366
784725	contig_13744_pilon	+	1698	10	Intergenic	novelGene_77191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_9	78.4060340333543	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	460	1461	743057	760922	FALSE	10	TTTTCTATTTTCTTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMFGKLTRDTFEWHPDKLLCKRFNVPDPYPDSTLVGLPRVKRDKYSVFNFLTLPETASLPAAQASSEKVQQHRGPDKSRKPSRWDTSKEEKKEDSISEFLSLARSKVGTPKQEPSPLVNKEEEHATESLSNKMVNKGADSQSEGEVSRPSMDLFKAIFASSSDEKSSSSEDEQGDSEDDQAGVGEADFKHSEETDLVETSSVAPTSEPAPQAPAPSFSIQKMHIDEREEFGPRLPPVFCPNARRTLEIPQKEKHKKNKEKPKTKKEHRRRKEKKKKHRKHKHKGKQKNKKSEKSSSSEGTESSDSGSDEEGTADVSPQELLRRLKRLPLKRQ	741349	761159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_741571_742564_742770_743023_743152_743963_744101_744461_744629_749301_749519_751190_751299_753453_753552_757762_757912_760891
784726	contig_13937_pilon	+	2376	10	Intergenic	novelGene_167354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGCAGAGAGATGACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49276	64452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_50674_54169_54290_54960_55091_55513_55616_57597_57686_57973_58080_58242_58338_59680_59822_61949_62119_64424
784727	contig_7091_pilon	+	2043	16	Intergenic	novelGene_131776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333.977843576486	3	110	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	531	1514	384719	431690	FALSE	40	TACTAAGTGATCCAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPKSQVTDILAKEGPSSPSYDWFQTESLVTIVIYTKQKDINVDSVIVDHQDDSFRAETIIKDYSYLIHLGLSHEIQEDFSVRVVENVGKIEIVLKKKENTSWKCLGHPLENHNSFIPKKDTGLYCRKCQLISKEDVTHDTKLFCLMLPPSTHLQVPIGQHVYLKLTITGTEIVKPYTPVSDSLLSEFQEPVISNNKYIYFLIKIYPAGLFTPELDHLQIAGTGFTPMVKILTFALTNIPSLRKVKLMFFNKTEDDIIWRSQLEKLTFKDERFDIEFVLSAPTSEWNGKQGHISPALLSEFLKRSSHKSKVLICICGPTPFTEEGIR	349764	435621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349865_354241_354396_361875_361940_368186_368288_372017_372127_384716_384778_386117_386176_399993_400088_404533_404567_406335_406459_415515_415657_417076_417230_420877_420945_421228_421316_431521_431691_435092
784730	contig_6137_pilon	+	1817	6	Intergenic	novelGene_59313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_2	67.6934265641798	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	145	930	1677350	1682139	FALSE	25	AGTGGGACAGCCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEARLVQGSILKKVLEALKDLINEACWDISSSGVNLQSMDSSHVSLVQLTLRSEGFDTYRCDRNLAMGVNLTSMSKILKCAGNEDIITLRAEDNADTLALVFEAPNQEKVSDYEMKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVISCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTSNVDKEEEAVTIEMNEPVQLTFALRYLNFFTKATPLSPTVTLSMSSDVPLVVEYKIADMGHLKYYLAPKIEDEEGS	1677205	1683026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1677571_1678870_1678969_1679085_1679154_1679889_1680085_1681848_1681973_1682059
784732	contig_12964_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_131721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597618	599881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_597600_599900
784733	contig_533_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_174261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCACCAGACTGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142545	141184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_-_141200_142500
784738	contig_2205_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_174263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31986	31277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2205_pilon_-_31300_32000
784739	contig_9633_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_139589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGATAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24208	25998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_24200_26000
784742	contig_2689_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_100840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCAGCAATGGTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244175	241735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_241700_244200
784743	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_89421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653748	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
784752	contig_3754_pilon	-	1404	2	Intergenic	novelGene_146823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCGTAGAGGTATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110063	107990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_108367_109035
784754	SIRV6	+	171	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	222	487	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
784758	contig_5947_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_101602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAAAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937595	939248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_937600_939200
784759	contig_3233_pilon	+	1319	10	Intergenic	novelGene_56547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	360.207896075394	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	712	1185	743801	747909	FALSE	20	CCAATGGGATTGTGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738566	748043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740582_740664_740817_740912_741759_741894_742724_742823_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
784760	SIRV6	+	194	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	508	-1	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGGTAGTCGAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
784764	contig_4364_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	868.551299578787	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	35	766	1268714	1270512	FALSE	25	TCCTCCAAAGGAGCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKSDLRCGHRGQRLVAASACAVGQAAQATLPFLYPGSCQLSGRRVVWGVTGAQCPSEPLRVPRLSPASPPAPGTWSPPRCCQSPCNHDALTCGVRAGPSLTSYPVSA	1267062	1271064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268701_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269717_1270199
784768	contig_7753_pilon	-	2341	19	Intergenic	novelGene_41476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_18	37.2696215617764	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	110	1909	1083243	950076	FALSE	55	AGAAGGGAAATATAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSWKRTRSSPSDMEGSSHHFTAFDSKQASGHHEASNLSRSASAKISLNTGLEECAVALNLFLSNKFSDALELLRPWAKDSMYHALGYSTIVVLQAVMTFEQQDIQNGISAMKDALQTCQRYRKKSTVVESFSSLLSRGSLEQLTEEEMHAEICYAECLLQKAALTFVQDENMISFIKGGLKIRTSYQIYKECLSILHVIEKNKLEQQLFYEFEGGVKLGVGAFNLMLSLLPARIIRLLEFIGFSGNRELGLMQLREGASGRSMRAPLCCLTILGFHTYICLILGTGEVNIVEAESLLAPFLQQFPNGSLMLFYHARIELLKGNVEEAQETFRKCISVQEEWKQFHHLCYWELMWIYVFEQNWMQAYYYSDLLCKESKWSKAIYVFLKAAILSMLPEEDVVSTKENVVALFRQVESLKQRIAGKSIPTEKFAVRKARRYSPMLPAPVKLVLPALEMMYVWNGFPVVSKRKDLSENLLVTVEKAEAALQKENSNDYFTDDECLVKLLKGCCLKNLQRPLQAELCFNHVIQSEKLLKYDHYLVPFTLFELAFLHKSQGEMDKAIKVLETARTNYKDYSMESRLHFRIQAALHLWKKPPSN	1083352	949643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_950167_953305_953423_957916_958035_960575_960685_962909_963037_964941_965034_965670_965833_967327_967388_967477_967546_968155_968265_970734_970801_971808_971915_980367_980433_983333_983402_988461_988539_990206_990339_992120_992232_1004789_1004886_1083217
784769	contig_14822_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_145422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_3	307.506458830091	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	133	435	186140	190065	FALSE	10	CTTTGATGTTTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	185642	190346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_185738_186102_186226_186462_186594_189979
784770	contig_8177_pilon	+	1212	3	Intergenic	novelGene_86507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	21.5	363	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGTCCCAGAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100228	104234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_100396_101334_101545_103399
784771	contig_14341_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_111860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAATACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550384	549450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_549400_550400
784772	contig_8453_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_125114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100322	102302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_100300_102300
784773	contig_15760_pilon	+	1579	3	Intergenic	novelGene_131053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4514	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGCTACCATAGAGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29535	51897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_30839_38233_38326_51713
784775	contig_10765_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_122954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	917	1219	343588	343286	NA	60	GAAAATAAAATATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVLCCGPVFDNVGLSPDGYLYKWLDNILACQDLRVSVSQKYIVFKCLWSSASVELLRYLSIVYNRSLFTHQLQKCRLMCCLPYTMLCKDQKHSNIYQN	344504	343017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_343000_344500
784776	contig_13366_pilon	-	1864	2	Intergenic	novelGene_99793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169538	164232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_164405_167846
784778	contig_753_pilon	+	2868	1	Intergenic	novelGene_112943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745386	748254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_745400_748300
784779	contig_14811_pilon	-	1038	2	Intergenic	novelGene_74475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCAAAGTGTCTCGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375718	356576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357541_375644
784783	contig_12424_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_174269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48881	49959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_48900_50000
784788	contig_6412_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_149974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543835	542141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_542100_543800
784791	contig_7457_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_31393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460640	458348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_458300_460600
784796	contig_6276_pilon	-	1725	12	Intergenic	novelGene_174121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	909	1286	146488	144263	TRUE	30	ACGCAGAGACACGACGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGSGYSGLVWVQLLHPLSTESACQLLKSGAASAWPSRRSAWRISSSVHSSFTLSSASSLSTACSWAVVLASSTVTASVFPKTECAGFCARRSSARSFSLALCGSELVKTWTEYQRSCISLELS	157291	138748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_138805_139627_139705_140557_140645_142914_143105_144233_144404_144985_145136_146401_146572_149252_149420_152060_152150_154993_155223_155735_155865_157080
784804	contig_9195_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_155672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55031	56867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_55000_56900
784808	contig_10196_pilon	+	1937	5	Intergenic	novelGene_132201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.40832691319598	18	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	448	930	1246593	1255805	FALSE	30	AGAGGTTTTCTTTCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSFFVSEEHGLLLQDSFSRPAAFQALLGVEVPYFYFTRKPGEADQEDQADTGHHGIPQMVGRRPLRDFMGLEDGDRATRDAMLNFSFFVTVGDMDEAFKSIKLIKRKITRSEMYTAERLCQKPQLSGWESGCFWSISLGVPCHQRSLPPAMPLSAGAE	1242411	1256812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1242681_1244844_1245014_1246583_1246716_1252825_1253026_1255645
784812	SIRV4	-	202	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	412	3	-412	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAACTATCGGCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
784814	contig_15631_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_151547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	358	849	396107	396598	NA	10	TGAGCCTCTGCATCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHYRKAGSVELPAPSPMPQLPPNTLDMRVEDGSKIRNLLELALGQLEGGSARHVVFSGSGRATGKAVSCAEIVKRRVPGLHQLTKLRFLETEDSWVPASPDTGLDPLTVRRHVPAVWVLLSRDPLDPNECGYQPPGASPGLGSTPSSSCGPRPQRRARDTRS	395749	396964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_395700_397000
784815	contig_11281_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_125451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	123	371	810757	811005	NA	30	AGACCACAGCTGTGCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLRKRCISPFLKQFRKKKKNNTRLGRHSLRVCCLLSGCGMCFSSTCPLIPTSLYSAQTRQLSLAALDDREGRGGKHCPVSLWAGHSEHWPEVMLHRAGSAGEGAESLLHLPSAGGAARGRV	810634	811428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_810600_811400
784816	contig_3948_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_53426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	51	359	1975758	1975450	NA	10	CCCGGGCTGACTTTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKVGSAAKPGASRSSSQADMDPPSAHCRRDRHHPSPDTGPSQH	1975808	1975418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1975400_1975800
784819	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-6	31	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784821	contig_3817_pilon	+	1713	5	Intergenic	novelGene_78320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1083	junction_4	206.766172281638	5	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	65	694	178717	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGEDARGAGWGITAGLDPEMALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178652	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
784824	contig_1275_pilon	+	895	2	Intergenic	novelGene_108861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	64	753	747279	747968	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAERPLRAGETNGSLTDGSVRMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746798	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746856_747272
784825	contig_7119_pilon	-	919	8	Intergenic	novelGene_41011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	169.201847821241	12	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	261	605	195610	190765	TRUE	45	CAAGTGAAATACAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSRFSEGQSPMISQ	196800	188507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_190679_190803_191009_191089_193612_193724_194906_195021_195607_195676_196293_196379_196690
784827	contig_10323_pilon	+	1854	5	Intergenic	novelGene_123568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAACAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447072	453942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_447164_448195_448299_450802_450921_452275_452328_452452
784829	SIRV4	-	244	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	370	3	-370	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACGGGTGCAAGCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
784832	contig_7411_pilon	+	1784	4	Intergenic	novelGene_136983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	19.0262975904404	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	464	769	165590	169858	FALSE	10	CTTTACTCCCAGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKSQVSFEDVAVDFTLEEWQLLNLTQKNLYRDVMLENYSNLVFLGYQIIKPNAIFKLEQGEEPWIIDEEMISQNFSGEKEPGCMGCKNKKKHCCQVDSNS	162646	170873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_162835_165314_165605_169336_169458_169688
784835	contig_8907_pilon	+	467	5	Intergenic	novelGene_85815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1404	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAATAGGAAGCATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173355	179864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_173477_177971_178043_178593_178695_179391_179550_179848
784841	contig_4305_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_136660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	742	1107	503643	504107	FALSE	10	CTTTTTGGTCCATTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMKKYTREISAHLLWRIISIKPFFPKSCRSRTLDALAVPNTPTLWIKTPPPSTQLGVKRVPRTQSFLNKRQPGYEMYLSDHLPRSGKLPRVQLVSLPAAGHTGKSQRLILDWLLLTWYST	502901	504440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_503732_503830
784843	contig_16385_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_86199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	853	1164	30002	29691	NA	40	TATCAAAACTGAGACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKYTVSSQSDERQSPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPVAASCHLTSCSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSPTCRSWACHVLQLCDLGEASTLIHGLGTF	30854	29457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_-_29500_30900
784844	contig_8161_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_156739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	585	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	105	311	196357	196151	NA	15	AACTTCACTGGCTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTAGCPAPGSTPQKKPRRNLEEQPGGGEEEEEMETGNVANLISIFGSSFSGLLRKKSPGGGREEEEGEESRPEAAEPGQICCDKPVLRDMNPWSTAIVAF	196461	195178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_195200_196500
784848	contig_10235_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_46461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	540.224201142452	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	38	406	220733	219405	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	220770	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219345_219485_220089_220197_220354_220481_220677
784849	contig_5423_pilon	-	2423	1	Intergenic	novelGene_85169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTAAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102217	99794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_99800_102200
784850	contig_15105_pilon	+	2075	10	Intergenic	novelGene_150984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	37.2213930255899	167	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	48	1331	665621	683537	FALSE	20	CTGGCAACATGGTGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLRTLPLADQIKILMKNVKVMPFANLMSLLGPSIDSVAVLRGIQKVAMLVQGNWVVKSDILYPRDSSSPHSGVPAEVLCRGRDFVMWKFTQSRWVVRKEVAAVTKLCAEDVKDFLEHMAVVRINKGWEFILPYDMEFIKKHPDVVQRQHMLWTGIQAKLEKVYSLVKETMPKKPDGQSVPAGLVSGDQRVQVAKTKAQKNHALLERELQRRKQQMQAPAVLPGMRIKEEPMSEEGEEEEEGQEAEEEEEPMDTSPSGGLNSRLANGLPAGRAAGGDSFNGHPPPGSANTPVARELRAFVEATFQRQFVLTLSELKRLFNLHLASLPPGHTLFSGISDRMLQDTVLAAGCKQILVPFPPQTAASPDEQKVFALWESGDMSDQHRQVLLEIFSKNYRVRRNMIQSRLTQECGEDLSKQEVDKVLKDCCVSYGGMWYLKGTVQS	665573	684281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_665631_666452_666574_673037_673120_673936_673997_674118_674277_674797_674860_675400_675931_678303_678382_682062_682189_683480
784853	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	492	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
784856	contig_10948_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_124960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGGCTAATAAGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28706	27231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_27200_28700
784857	contig_1996_pilon	+	1434	9	Intergenic	novelGene_131904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	328	junction_8	93.1839578468311	102	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	627	1292	251625	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	250998	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
784859	contig_5779_pilon	-	754	2	Intergenic	novelGene_106428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94511	93291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93840_94305
784860	contig_5903_pilon	+	1945	14	Intergenic	novelGene_173225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.67830229695	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	336	1511	500787	534211	FALSE	15	ATATGTGGGGGCTGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNSCVKLQTVHNIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKITKEDGENTDRIMGKGQVQLEPQALQDKDWQRTVIAMNGIEAKLSVKFTSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKETVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPATPGQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV	461952	534645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_+_462037_463447_463553_464264_464379_500754_500854_501783_501859_504808_504907_506643_506776_527963_528024_529093_529204_530784_530925_531973_532109_533014_533121_533546_533710_534121
784862	SIRV2	-	314	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	38	3380	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
784863	contig_7629_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_153566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262443	263610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_262400_263600
784867	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	9	1159	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784869	contig_8330_pilon	+	2354	9	Intergenic	novelGene_71717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_7	160.138806976947	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	52	2100	111957	158103	FALSE	10	CCTCGCTGGCCCAGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQEPAPARSSGPQKDPALPDLPTMPPPESPFEDHQPSPSPSPSPSPSPTEQTVEEEFQFLCCQCCKAEAKCPKLLPCLHTLCSGCLEAAGVHCPICQAPRSPGADAQALDNVFFESLQRRLSMYREIVSLHAACTRCKEPADFWCFECEQLICTKCFEAHQWFVKHEARPLASLRSQSVHEFLDGSRKSNNIFCSNSKHHTPELTSIYCRGCSKPLCCSCALLDTGHSELKCDIRAEIQQRQEELDTMTQALQEQDGVFGAAHAQMRSAIGQLDRARADTEELIRARVRQVVAHVQMQEHKLIQSLKARYQSESEEMTRRLSRLDAVLQRIRTGGALVQRMKRYASDQEVLDMHSFLREALHRLRQEEPQSLQAPVPTNSFDEFKVRLRDLVSCITQGTDAALPRRASPEAASTPRNSFDVDLPEEAQRAQAQVMGLSEAQPMAVVQQEPGAHPVPMYAFSIKDPSYREEAPSPLTPQKRKSCQTEGPRKIIKLESEEEKEERLARSSPEQPRPSTSKAVSPPHLDEPPSLGSPDTGNKVLLLNNNHVTSEPGEEAEERVVVISSSEDSDAENSSSRELDDSSSESSDLQLEGPSTLRVLDESLADPQAEDRPLVFFDLRIDNETQKISQLAAVNRGKQVPCAHPAQGLLQHLLKGCVPGGGPAALPPLPGLHAPPHSGLL	111905	158357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_112110_113297_113765_135042_135624_137089_137161_144962_145101_146068_146331_147352_147406_156521_156673_157930
784872	contig_2455_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_119212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352139	1353743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1352100_1353700
784873	SIRV6	+	395	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	9	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
784876	contig_10864_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_107091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929368	927559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_927600_929400
784877	SIRV4	-	561	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	35	21	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACAGTTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
784878	contig_2773_pilon	-	1037	3	Intergenic	novelGene_174277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	2.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGCCTCTACACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133227	126277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_127041_128456_128529_133025
784879	contig_2773_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_174276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTGAGAAGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126063	125572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_125600_126100
784880	contig_5253_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_61582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303543	301173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_301200_303500
784881	contig_10163_pilon	-	1828	3	Intergenic	novelGene_82660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	301	1209	248689	240878	FALSE	35	TTTAAGTGATTAAATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVRVELCSVGFSMADFLEVDLQVFLLRHLWVDSNLQPTFQLAAECINHLYHPGTSHCGNKHKISSLSCPGLAQVVNDKIMASNLVTGLPKQTPGSSGDIIVRTSKLLIPVTCEFPRLYTISEGYVPNLRNPPLEIMSRNHGIFPFTLEIFKDNEFEEPYREALPTLKLRDSLYFGIEPLVHVNGLESLVESCFATPTSKIDEILKYYLIQDGCVSDDSVKQYTSRDHLAKHFQVPVFKFVGKDHKEVFLHCRVLVCAMLDERSRCAQGCHRRMRRDTAEEDTAGAENQVLTGGPIIIDWGD	248989	240258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_241049_242651_242752_248051
784882	contig_5794_pilon	-	1506	11	Intergenic	novelGene_69803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	4785.08387491797	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	15	1130	749501	743712	TRUE	25	TTAACTTTTCAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLKMEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749515	743243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747333_747439_749429
784884	contig_5236_pilon	+	2053	2	Intergenic	novelGene_100976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	10	465	1067459	1070519	FALSE	75	AATTTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSMADTPAQPTKRKREPDAEGAEGPGPGEKEAAVGNGTSAPVSLPFSGFTVQKVLRESARDKIIFLHGKVVNEASGDGDGEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLAGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRHLSGEHVRAEGRVGCWDVRCGDQDVPHD	1067449	1072107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1067663_1070267
784885	contig_6479_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_160597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAATTAAAATCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31839	29693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_29700_31800
784886	contig_6479_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_160596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACATCATGTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29446	28949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_28900_29400
784887	SIRV4	-	356	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	3	1162	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784891	contig_6710_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_98306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	2	337	657517	653592	FALSE	25	GTCGAGAGCTTCATCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPI	657518	653591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
784893	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784897	contig_7164_pilon	-	2307	7	Intergenic	novelGene_172134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	13	junction_6	30.3845721085919	110	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	211	1080	140107	119408	FALSE	40	AAATCAATGAGTGAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLGSMSQQRPARKLPSLLVNPAEETVRRRCRDPINVEGLLPSKIRINLEDNVQYVSMRKALKVKRPRFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSDFGAIPQQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREDSITVHIRSTKGPIDVYLCEVEQENTSNKVSEDIGTSSSESKPPENPDKEENPPQQSEELLEVSN	140317	118180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_119458_119933_120082_122675_122790_124141_124299_126040_126258_129569_129625_139978
784898	SIRV4	-	270	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1253	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
784901	contig_9375_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_136037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAGTACCTCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102341	104129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_102300_104100
784907	contig_3861_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_57880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1021	1374	57962	57609	NA	45	TAACCAGAACAGAGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCHICNVGGNFGQIALHMENLKMPQLSERFKSYHLIVFRVQIANQVQLSKVFEQIYPGRNFSHISELHVKASQVIAEKTKSSLFNFCRAVAEVKLLEIGHLRNLSRYFSFWNQFKF	58982	57287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_57300_59000
784913	contig_6137_pilon	-	1471	2	Intergenic	novelGene_59279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGTGCCACTAGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345602	1343996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1344075_1344209
784916	contig_9146_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_79510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATTAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295107	296063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_295100_296100
784918	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
784919	contig_5686_pilon	-	2474	5	Intergenic	novelGene_45501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	43.7492857084547	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1681	2232	283437	277750	FALSE	35	CTCAAGAAGCATGGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPSAAGSLVGRECELAKGLSKRKHGSGQLMSKTSSPGVVIVPESSENKSLGGVTQEAFDLMIKENPSSQYWKEVAEKRRKALYEALKENEKLHKEIEGKDNEIARLKKENKELAEVAEHVQYMAEVIERLNNEPLDNSESSDGQEFESEEETGENSEVEDSEIGTCAEEIVPSSTDAKPCI	285117	277507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_277912_279149_279261_279538_279622_282623_282772_283389
784922	contig_4469_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_21974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAGTCATCTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927004	926647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_926600_927000
784925	contig_10857_pilon	+	578	3	Intergenic	novelGene_160886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21897	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54485_66447
784931	contig_15020_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_87395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15586	13787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_-_13800_15600
784932	contig_14333_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_49115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGCCTTAAATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381606	381426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_381400_381600
784934	contig_9706_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_21012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAGTTGTACGTAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533937	535161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_533900_535200
784938	contig_19606_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_148282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGGCTAAGACTAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86485	84918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_84900_86500
784940	scaffold_880_pilon	-	1419	9	Intergenic	novelGene_121449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTGGGATAAATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455204	433160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_433596_437560_437774_439123_439212_441361_441427_443430_443581_447598_447680_450969_451131_453829_453965_455113
784941	contig_10618_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_170046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAACAAAATGAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173721	171751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_-_171800_173700
784942	contig_10618_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_170045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTAGATTAAAAAACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171147	170287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_-_170300_171100
784943	contig_1813_pilon	+	2142	13	Intergenic	novelGene_105482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	380.251552338127	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGCACAGAGAAGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102767	155681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_106495_106653_113656_113838_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
784944	contig_14483_pilon	-	737	4	Intergenic	novelGene_133752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1927	junction_3	81.773399641258	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAAATCTGGTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96398	53119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53621_62296_62425_87781_87830_96338
784945	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	71	509	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
784946	contig_10515_pilon	-	2151	16	Intergenic	novelGene_174286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTTAAAAGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81915	15859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10515_pilon_-_15929_17014_17181_20346_20503_37439_37559_41378_41458_42746_42872_46136_46253_50640_50764_51189_51291_52691_52785_53576_53630_76081_76127_76844_76926_78529_79148_80702_80738_81743
784949	contig_10765_pilon	+	1357	2	Intergenic	novelGene_122896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAATTTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92827	94921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_93447_94183
784953	contig_6375_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_72991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCACTCTTCCCCTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299901	301104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_299900_301100
784954	contig_6375_pilon	+	774	3	Intergenic	novelGene_72993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	2	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	60	347	302471	302758	TRUE	5	CTTCGGCTCCGGGCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDQNTPTPAPGAPRRRGSMPVPYKHQLRRAQAVDELDWPPQASSSDSSDSLGSGEAAPNQNDGIFKVMLVGESGVGKSTLAGTFSGLQGDNAHEPENPGIWGPLQGLRGPLEP	302411	303866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_303006_303148_303218_303755
784955	contig_7870_pilon	-	2304	1	Intergenic	novelGene_109097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGCAATTCAAAAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842792	840488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_840500_842800
784957	contig_6593_pilon	+	1932	12	Intergenic	novelGene_49835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_11	847.435197064142	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1398	1754	1258147	1258503	FALSE	35	CCTTGAGAAATGATTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSDMTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQCVYKQCDTNYSGYLGSSQLRDALQAVGFQLDEQLYQMIVRRYADEDGNMDFNNFISCLVRLDAMFRSFKSLDQDADGLIQVSIQEWLQLTMYS	1180645	1258681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1180926_1191011_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1198315_1198377_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1258073
784960	contig_6710_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_95802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
784961	contig_5018_pilon	-	909	8	Intergenic	novelGene_47131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	69.4785240640764	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	83	847	1494545	1489525	FALSE	40	AGAAAGCCAAGAGTAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYAICYCPLSRLADLEALKVADSKTLSESERDRLFVKMEEDKDFVGWALDVLSPNLISTSMLGRVKYNLNSLSHDTAAGLVQYALDQGVKVTQVFVDTVGLPEKYQERLQQCFPGIEVTVKAKADALYPVVSAASICAKVARDQAVKNWQFVEKLQDVDADYGSGYPNDPKTKAWLRKHVEPVFGFPQFVRFSWRTAQSILEKEAEGVTWEDSSAEDQEGLGKITSYFLSEGPRPRLPHRYFQERGLESATTL	1494862	1489462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1489658_1489765_1489890_1490836_1490925_1491029_1491168_1494000_1494089_1494220_1494348_1494478_1494551_1494785
784962	contig_12357_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_6064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	711	1010	16474	16175	NA	70	ACAACAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEKQIEGKIIYCTALLQVDSTQGGPKGMLVTLKVQQSHSGPLCRTDGGVQRVQHLEPGSLPLAHFSTHLFIHQHGPILPVLPHHTAWQEAPVCTAYT	17184	15834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_15800_17200
784966	contig_4364_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_3672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
784968	contig_8322_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_143265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTGGTAAGTAATGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414751	415295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_414800_415300
784969	contig_13625_pilon	-	1866	11	Intergenic	novelGene_150151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_10	107.185819957679	139	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	551	1600	39925	27060	TRUE	20	GTCATGCCTTATTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43675	23707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_42099_42261_43361
784970	contig_10765_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_122981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAGGAGCCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453884	455175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_453900_455200
784974	contig_4876_pilon	+	1180	7	Intergenic	novelGene_137894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTGGCATTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346218	361983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_346266_352426_352551_358566_358708_359459_359594_360104_360325_361142_361489_361815
784979	contig_1618_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_141778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTAAGGTAGAGGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116712	115774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_115800_116700
784983	contig_19061_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_173508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAGTCTCTAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40067	37936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_37900_40100
784987	SIRV2	-	522	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	137	2958	-137	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCTATAGTCTGACACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
784993	contig_16948_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_166416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCACTGAGACTGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379427	377512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_377500_379400
784995	contig_18850_pilon	+	1003	5	Intergenic	novelGene_142455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.0258007461196	642	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	362	865	253252	254888	FALSE	10	GAGGCCAGGTGTGCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLTLVVLGTPTCWAGTMYGYGGGKYFSASAGSEDEITGIRFCVGPAGLFKSVQLRVGSSWSERHGAPGGNCQEFILWPDEHIVSVYGTYGLFLRSLVLYTDQGRVATFGSDSGQSFFAYPEEDGQVLTGVSGQHKLLGISGLIFKWNFPPGEATAASRSTTTIT	252516	255026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_252660_252941_253134_253225_253307_253488_253595_254545
784996	contig_14441_pilon	+	762	4	Intergenic	novelGene_100745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	193	552	125667	126535	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKDS	121195	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125883_126159_126283_126514
785000	contig_4232_pilon	-	1316	2	Intergenic	novelGene_63462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	103	441	557269	556795	FALSE	20	GCAAACCCTGGATGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGTLGSLHLLRWGHSAGTGWRGQGPTQVRASGFTGVRHYSQRESAFLLAFCDVTVLGGGCPVEEQAHQPHTPCSVESLSRKWPLFISEALACLQRWRRGFPASLSVWPEA	557371	555919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_556897_557032
785001	contig_10456_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_163472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAATAAAGGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70766	72867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_70800_72900
785004	contig_14322_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_115645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCTGTAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398644	399508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_398600_399500
785010	contig_2793_pilon	+	2355	18	Intergenic	novelGene_142875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	26.5797748121715	3	53	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1023	1907	373200	414846	TRUE	25	AGACTGATGGTTCATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDAVMGLRVAQCSQKPCEDSCTLGSTYVLHEGECCGRCLPSACEVAIGSPRGDSQTSWKSVGSHWASPENPCLLNECVRVKEEVFVQQRNVSCPQLDIPTCPMGFQLSCKTSGCCPTCRCEPVEACVLNGTIIGPGKSLMIDECTTCHCTVQVGVVSGFKLECRKITCKACPLGYKEEKIQGECCGRCLAMACTIQLRGGQIITLQRDETIQDGCDSHFCKVNERGEYIWEKRVTGCLPFDEHKCLAEGGKIMKIPGTCCDTSPVTAVTKSQTEETHSESISFCYPHLNGLRM	285954	416947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_285993_286658_286875_291609_291851_299208_299313_365118_365153_366370_366476_367707_367914_373121_373272_377963_378075_380511_380693_381757_381799_382281_382399_412461_412561_413436_413566_414101_414142_414751_414884_415825_415924_416634
785013	contig_5018_pilon	-	907	6	Intergenic	novelGene_47083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	788.418416832078	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	140	721	1401120	1399645	TRUE	0	TCCTCCTGTGTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSLKTGMSGPRLMTPQDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1401259	1399086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399161_1399532_1399843_1399929_1400023_1400619_1400743_1400851_1400966_1401066
785019	contig_1618_pilon	+	1311	8	Intergenic	novelGene_141803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	39.1798573822034	402	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	110	1114	727106	745924	FALSE	10	CTTCTGTTTCTGAGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESILKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEAFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL	724113	746121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724217_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742218_742337_744092_744217_745756
785024	contig_5988_pilon	+	2377	3	Intergenic	novelGene_16145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	61.5	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	66	416	1851404	1878415	FALSE	40	AAAAAAAGTCTCATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPVSRLESRRRERLGRAEEVMLLFVEQVTSKGTGLNPNAKVWQEIPSENTDATPVTHGRESSWHETAATSGPHPEGSSELSDGMCKEYEVMYSTSCETSRSTAGIEESTDGMILGPEDLNYQIYDVSGKLDGLLVK	1851338	1880376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1851422_1877459_1877608_1878230
785026	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785028	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
785031	contig_10755_pilon	-	1908	13	Intergenic	novelGene_174288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	11.3834675443528	29	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	454	1575	65161	25882	FALSE	30	TCCAACTCTACTTATCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNVAVISALAILSTFLIGLLVVTLVILRKKHLQMARECGAGTFVNFASLETDGKLPYSWSKNGLKKRKLTNPVQLDDFDSYIKDMAKDSDYKFSLQFEDLKLIGLDIPHFAADLPLNRCKNRYTNILPYDFSRVRLVSMNEEEGADYINANYIPGYNSPQEYIATQGPLPETRNDFWKMVLQQRSQIIVMLTQCNEKRRVKCDHYWPFTEEPIAYGDVTVEMISEEEQDDWACRHFRISYADEMQDVMHFNYTAWPDHGVPTANAAESILQFVHMVRQQATKSKGPMIIHCSAGVGRTGTFIALDRLLQHIRDHEFVDILGLVSEMRSYRMSMVQTEEQYIFIHQCVQLMWLKKKQQFCISDIIYENVSKS	71545	25548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10755_pilon_-_25987_30807_30944_32607_32763_38207_38331_38714_38850_41107_41185_42462_42554_49093_49176_52196_52233_60883_60953_65048_65170_68715_68849_71233
785032	contig_6710_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_94849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785033	contig_7091_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_131784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACACTGACACCTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380078	381364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_380100_381400
785034	contig_14744_pilon	+	1009	2	Intergenic	novelGene_65907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	0	133	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	51	371	69238	137099	FALSE	75	AAAGAAAAGAAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESDQGVSRGFQTMPSLPPLYDSGSHFQSIWRLVEPFCFLPLPKLLSLWQNHPRLVDSHPLVTSNITHLQKITFL	69187	137737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_136799
785035	contig_4852_pilon	+	2786	9	Intergenic	novelGene_153973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	150	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCAGGATCGGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83239	100012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_84721_86246_86283_86874_86945_87165_87275_90255_90374_90697_90971_91135_91426_93962_94253_99893
785039	SIRV6	+	228	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8467	14	272	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
785040	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	4	414	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	183	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785041	contig_11823_pilon	-	1545	9	Intergenic	novelGene_171024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_8	37.5391462342979	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	416	1282	53948	41304	FALSE	5	GTCTGCGCCTGCTGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHQCNVFVYSSSKGTVRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVNFSHSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECSWNGSDSAIMTGSYNNLFRMFDRNTRRDITLEASRENSKPRAILKPRKVCTGGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPVENIIAVAATNNLYIFQDKIN	78934	41040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_41584_46515_46608_46680_46851_49217_49383_53788_53967_57079_57193_57585_57752_63147_63246_78914
785050	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	-9	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785051	contig_10016_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_117856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325891	327388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_325900_327400
785057	contig_6576_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_42249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCGCTACGAGTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303667	305117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_303700_305100
785058	contig_8174_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_160067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACCGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322103	324265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_322100_324300
785061	contig_9515_pilon	+	1110	8	Intergenic	novelGene_73827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	262.780423586705	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	254	985	66468	72530	FALSE	5	CTTGGCTCTCTGCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	66116	72655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
785062	contig_17274_pilon	+	1517	15	Intergenic	novelGene_26537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	333.984731717497	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1467	51	1517	163818	195908	FALSE	15	ATTGCTTTCTGTAGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAPTPSSARADNDRMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGKEEKMNTLSITKHLNAHTFFCAFSNKPVSL	131672	195908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131722_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741
785072	contig_7342_pilon	+	2233	4	Intergenic	novelGene_71135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTATTTCTAGTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164322	184359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_164486_177694_177819_182159_182528_182781
785075	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785076	contig_6488_pilon	-	1237	4	Intergenic	novelGene_44723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	836.981481276617	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	267	686	54113	36838	FALSE	70	TCTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFR	91395	36286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_37030_53885_54122_90850_90985_91271
785077	SIRV2	-	542	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	98	46	98	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCTACTGCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5797	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
785080	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
785081	contig_9218_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_157689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAGCCAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359532	357585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_357600_359500
785083	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785086	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
785088	contig_15390_pilon	-	546	5	Intergenic	novelGene_174291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	2.34520787991171	145	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	37	546	81093	25173	FALSE	30	TCAGTCCCAGGGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSMSLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLHAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERQKQLRDQYCFECDCFRCQTRDKDADMLTGNEQVWKEVQESLKKIEELKAQWKWEQVLAMCQTIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFYGIRTMEPYR	81129	25172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15390_pilon_-_25349_32011_32100_66761_66873_79163_79267_81061
785091	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
785093	contig_8476_pilon	-	1898	2	Intergenic	novelGene_121332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	713	junction_1	0	4	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGGAAATCCAATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107759	103794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_104864_106930
785094	contig_17311_pilon	-	476	6	Intergenic	novelGene_57838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	7214.24656079899	169	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126899	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344_123535_123675_123709_126862
785104	contig_4131_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_127902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393861	392951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_393000_393900
785105	contig_3335_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_165012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870073	868946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_868900_870100
785106	contig_8149_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_169948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTGGCAGCTGATCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505611	506035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_505600_506000
785107	contig_8149_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_169950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAGAAGAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509287	510437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_509300_510400
785108	contig_7457_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_31534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCAAGAAGCTCCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749912	748275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_748300_749900
785112	contig_4769_pilon	+	3085	1	Intergenic	novelGene_117954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATCAATGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380116	383201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_380100_383200
785115	contig_5921_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_142240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATTTAAAATCTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140589	138865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_138900_140600
785117	contig_9297_pilon	+	1791	10	Intergenic	novelGene_69878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	360.595940213926	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	134	1660	909195	913003	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGT	908978	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227_912348_912998
785118	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	508	3	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGGTAGTCGAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
785121	contig_14341_pilon	-	1792	1	Intergenic	novelGene_111804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGGCCATGTAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459258	457466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_457500_459300
785123	contig_13697_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_165908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61705	60927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_60900_61700
785127	contig_8304_pilon	+	1512	2	Intergenic	novelGene_153178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCCTCCCTGCAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151493	153067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_152747_152808
785128	contig_15498_pilon	+	1368	8	Intergenic	novelGene_42638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	178.672657022128	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	217	1341	679496	686124	FALSE	30	AAGAACTTAGCGGCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWCDRRWAGACSWAERCCCASQPSLARPTGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKNYPCTLRQYLRTATPSPRLATMMILQLLEGVDHLVQQGIAHRDLKSDNILVELDADGCPWLVITDFGCCLADEHIGLQLPFTSWYVDRGGNGCLMAPEVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	675068	686151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675156_679366_679550_681329_681431_682090_682274_682834_682999_683984_684113_684485_684723_685866
785129	contig_2332_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_58704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAATATAAACATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743506	741847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_741800_743500
785130	contig_11269_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_145809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTATGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262206	262690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_262200_262700
785131	contig_11269_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_145810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263763	264813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_263800_264800
785134	contig_6631_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_174302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	390	446	835	1076448	1076059	NA	20	TTTTCACATTTCTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSILSPLLSLDGEPRLPLFHRSWKKSVQDLTAFSAALAAQAGHSVTQGPERRLLWQQPPLNQICGGKPCRLRGSLILQSSHSPLINLFCTTSPVCFYCLQLRSNLELTNAPSIIQNNHGSGKIWPPLCT	1076893	1076057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_1076100_1076900
785135	contig_15613_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_147208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGTTACATTTGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142056	141476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_141500_142100
785136	contig_9609_pilon	-	1419	11	Intergenic	novelGene_23121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	104.192178209307	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTATTGAGTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523926	520724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521723_521824_521862_521982_522081_522171_522309_522696_522731_522774_522806_522950_523297_523741
785137	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785139	contig_2940_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_81877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTCCCCCTCCCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350486	349512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_349500_350500
785140	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
785144	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785145	contig_2537_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_33412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTTAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205812	206973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205800_207000
785148	SIRV2	-	597	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	89	0	89	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	96	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5806	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
785149	contig_13041_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_127714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	8	370	14119	14481	NA	25	TTCCTTCCTACATGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGMCFPYWNASLLILFKFLVGNMDFEKYDLVIQATNEASGTVVPPICDMTIYQWELEIQFIMGAFPLGYMGNLWFSKYDTEKPKQTHQGSLTITKESHNYACKPYLTDMKEKKAKVYRSLQN	14111	16545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_14100_16500
785150	contig_2646_pilon	-	2017	12	Intergenic	novelGene_69650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_7	38.9740324653681	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	409	1140	2167706	2165980	FALSE	25	GACGATCTTGTCTCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDAPIQLSKITGNYDCDTKLPGLLKREQSSTVNAKKLEKAEARLKAKQEKRSEKDTLKTSSPPVLEEASASQAGSRKESRLESSGKNKSYDVRIENFDVSFGDRVLLTGADVNLAWGRRYGLVGRNGLGKTTLLKMLATRSLRVPAHISLLHVEQEVAGDDTPALQSVLESDTMREDLLRQERELNAQIASGRAESSEAAQLVEIYARLEEIEADKAPARASVILAGLGFTPAMQQQPTREFSGGWRMRLALARALFARPDLLLLDEPTNMLDVRAILWLENYLQTWPSTILVVSHDRNFLNAVATDIIHLHSQRLDGYRGDFETFIRSKQERLLNQQREYEAQQQYRQHIQVFIDRFRYNANRASQVQSKLKMLEKL	2169073	2165102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2166061_2166241_2166443_2166556_2166613_2166722_2166746_2166857_2166915_2167008_2167069_2167161_2167243_2167533_2167801_2167953_2168077_2168175_2168274_2168483_2168531_2169027
785152	contig_12540_pilon	+	1400	10	Intergenic	novelGene_148102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	48.224014303618	319	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	181	1170	1027807	1035226	FALSE	20	ACCCCAGTCCACTTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAEPSSPTEEEEEEEEQSAEPRPRTRSNPEGAEDRALGIQASVGSRSEGEGEAASADDGTPNPPGAGPKPWQVPPPAPEVQVRTPRVNCPEKVIICLDLSEEMSLPKLESFNGSKTNALNVSQKMIEMFVRTKHKIDKSHEFALVVVNDDTAWLSGLTSDPRELCSCLYDLETASCSTFNLEGLFSLIQQKTELPVTENVQTIPPPYVVRTILVYSRPPCQPQFSLTEPMKKMFQCPYFFFDVVYIHNGADEKEEEMSWKDMFAFMGSLDTKGTSYKYEVALAGPALELHNCMAKLLAHPLQRPCQSHASYSLLEEEDEATEVEATV	1026767	1035456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1026832_1027230_1027295_1027754_1028092_1028909_1028969_1030643_1030765_1030840_1030920_1032403_1032429_1033885_1034016_1034207_1034295_1035022
785153	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
785157	SIRV4	-	318	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1205	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
785158	contig_16686_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_162103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAACTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182386	183985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_182400_184000
785159	contig_5018_pilon	-	2087	11	Intergenic	novelGene_46944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	95.7016718767232	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	456	1439	308519	301750	FALSE	15	GCTACTGTAGCTTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	312823	301101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302764_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308600_310009_310170_312504_312644_312747
785162	contig_14275_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_162858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTTTCATGTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292179	289813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_289800_292200
785164	contig_7031_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_132789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATTTGGCATGCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214892	212830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_212800_214900
785166	contig_16970_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_157601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGCTTATTTGCAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88895	89646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_88900_89600
785167	contig_4232_pilon	+	830	4	Intergenic	novelGene_63200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2217.62791188142	92	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	79	597	146362	149463	FALSE	20	GATTCATTAATGGGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGKGQHWCTPLDLPQIAFDLLIPLGLKQTNSPQAPPFGRGLYFF	146283	149696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148903_149351
785169	SIRV2	-	494	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	329	4	-329	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTCATTGTGATCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
785173	contig_7963_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_58503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	68	301	145917	146150	NA	75	TCTAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWGSGSAGLVAPSPLSGVKIWIMSRTRELRCYSCYNFYGYCPTPGPPLKVWQYLPLYFNLDGVRAQGASPEHLKRALCFVSGVKYGVVETIAELGKSYS	145849	147081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145800_147100
785174	contig_3975_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_54714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCAAGTCTTCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469873	1470103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1469900_1470100
785176	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785177	contig_14142_pilon	-	1302	12	Intergenic	novelGene_120595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	157.436436078052	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	170	937	598441	585568	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKVRGRQAC	598610	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585445_585573_590659_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
785178	SIRV5	-	416	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8377_8448_8590_10863
785181	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
785189	SIRV6	+	321	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	31	-244	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785191	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
785194	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785198	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	23	373	14409	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14431	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
785201	contig_10235_pilon	+	609	4	Intergenic	novelGene_46345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	30.7354301526214	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	120	608	121540	122589	FALSE	15	CAATCCCGCGCTTCCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRQQQEQLLKQQQQQQWQQHQQGSAPPAPVPPSPPQPVTMGAVPTPQAPPLPPKALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPSVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFERHAPPLLRERATPPVDPKLAWVGDVFATTPTDPRPLASPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPGFPENGAPGP	121293	122590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_121311_121437_121736_122092_122304_122507
785203	contig_12532_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_111150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTACCCCAGATATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88750	89263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_+_88800_89300
785204	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
785205	contig_9668_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_58152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAGATAAAACAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366818	365510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_365500_366800
785208	contig_11171_pilon	+	1318	10	Intergenic	novelGene_48528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	11	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	41	922	31058	65562	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPPSQGPGRP	31017	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64901_65528
785209	contig_16907_pilon	-	851	5	Intergenic	novelGene_87451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	68.5747767039748	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	244	618	467716	449131	FALSE	10	GCTTTGTACTTGGGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGEVRKLSALSSRAAVWRLHHPGYNTRWAKIILPRLIRKGNSLDSPVAVTIFFGSNDSALKDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGCKLNRLNLVVGEYASACLKVAQDCGTDVLDLWTLMQKDNQDFSSYLSDGLHLSPKGNEFLFSHLWPLLEKKTSSLPLLLPYWRDVAEA	474481	448897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_459295_459418_467610_467773_471189_471307_474411
785211	contig_5684_pilon	+	1900	5	Intergenic	novelGene_81044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	181.926324373357	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	700	1263	443906	447039	FALSE	30	TAAGTTTATATTTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403580	447676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441843_442574_442785_443891_443949_446518
785212	contig_1867_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_54586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	124	447	488255	488578	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKILHNLAPSTYLSSLFSSTLPTATPPLCFSSLAFFFSYKNASFLAHALSFLGKPLTPTCPKGQPLSDASSLHITFLDKSPLSTPSSWVSSLFFMRGLFSFIALL	488131	488792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_488100_488800
785213	contig_6805_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_163890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419974	418122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_418100_420000
785214	contig_2924_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_140270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTACACCATGCAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154230	152599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_152600_154200
785216	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
785217	contig_4469_pilon	-	2058	17	Intergenic	novelGene_21878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCACTTTGAAGCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396585	193065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_193315_194145_194224_224119_224229_228129_228200_355198_355311_365415_365507_367844_368006_369951_370049_371162_371247_371354_371501_375926_376023_377596_377644_383049_383203_390520_390623_391598_391757_392269_392413_396423
785221	contig_2054_pilon	+	654	3	Intergenic	novelGene_51656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	603	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTTATTTTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	19448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890_17059_19133
785222	contig_10196_pilon	-	1546	4	Intergenic	novelGene_132342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	110.792097592242	72	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	141	335	2475895	2475701	TRUE	25	GCTAACATATCCTGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGPAADAALEGAEAEARPEASEDNEDDDEALPHSEVVDVFQEGLAMVVQDPLLCDLPIQVRGRGGRAGVSPSRAGACADPEVLWALQPLGWRKHRAGPRRARSPACFCC	2476035	2473785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474169_2474605_2475197_2475338_2475430_2475554
785225	contig_19640_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_134866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACTGTGTATGTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80200	78185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_78200_80200
785227	contig_11720_pilon	-	1450	2	Intergenic	novelGene_43762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	200	601	16194	15793	FALSE	20	TTGGCCCTTCTGGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTIKTLLLSELRALAVGHTWPVPQAYRLPYSSLIVCYEDIGNNTEKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMVFCYGFTLRTLLEAHMKQKYRAMQVIFVVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRTGVIKETCERRNDVGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRNGFLKILAARGLVSKDFLARHRITSYTSSSINVPANL	18350	14943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_16321_18277
785228	contig_10196_pilon	+	2323	9	Intergenic	novelGene_132285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	38.3566731482281	169	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	185	1420	2226583	2232043	FALSE	30	AGTCAAACGAGGTCTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLNAVATLTACRPWTVSTQHLLQGSPNQSRNASDGPQDPVCSSGAGSPSCLVSYPVLREDMDVVSVRFRPLDRVSVLVQPHMPSVLRLYLNTGMDSGGSLTVSLRANKTTVKNSTLVVACVNAASAFLGFNASHNCTTAFFQGHLLTLSTTSWQANLIVPFPETENWYLSLQLVCPENPEECEQTVVHVETTLYLVPCVNDCGPYGQCLVLRRHGYLYAGCSCKAGWRGWSCTDNSTAQTVAQQTVAALLLTLSNLVFLAPIAVSVQRAFLVEAFVYAYTMFFSTFYHACDQPGEAVLCILNYDTLQYCDFLGSEVSIWVTILCMARLKAVLKYVLFILGTLLIAMSLQLDRRGAWNMMGPCLFALVIMVSMWVYRCGRRRHCYPTSWRRWAFYLLPGISMATVAMAIYAFMMTSDNYYYTHSLWHMLVAGSAAFLLPPCEGHTEPWACVQRLPCHYQICRNDREELYAVT	2226322	2232946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2226355_2226430_2226727_2227044_2227136_2227211_2227336_2227646_2227784_2227941_2228121_2228200_2228348_2231300_2231418_2231746
785229	contig_5019_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_109174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACCATCTTCACGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66704	64861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_64900_66700
785230	contig_7066_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_42128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTGTGTTTACCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670592	672248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_670600_672200
785232	contig_6589_pilon	+	675	5	Intergenic	novelGene_26112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2241.4335117286	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	21	299	1876599	1880720	FALSE	30	GTAAACAAGATTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRQLPKMAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHLFTTVNVQVPQEAWGCAERA	1876578	1881096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879264_1880656
785235	contig_7058_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_136019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGCATATGTACTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127984	129947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_128000_129900
785239	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	152	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
785240	contig_11417_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_103318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTAGCTATATAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563047	562302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_562300_563000
785241	contig_11417_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_103317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561944	561498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_561500_561900
785243	contig_19769_pilon	+	788	5	Intergenic	novelGene_102307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	5	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	299	754	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87268	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
785245	SIRV5	+	342	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8580_10858
785247	contig_10749_pilon	-	714	3	Intergenic	novelGene_133441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1144.5	35	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	15	323	145217	136250	FALSE	15	CAGTGATTTCATGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFPMTHGNTGFSGMDTSVCVSVRCSARQRPAPRSQPKLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	145231	135858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142371_145121
785249	contig_13697_pilon	-	1707	5	Intergenic	novelGene_165906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_2	39.7680776502963	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	281	712	22705	16950	FALSE	30	ATGGTAGGGGGAAAGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTNGFGGTRGEQELGSALGRKAAPRRRCASESSISSSNSLLCDASFSTPKCGRGKPALVRRHTLEDRSELISCIENGNYAKAARIAAEVGQNSMWISTDAAASALEPLKVVWAKCSGYPSYPALIIDPKMPRVPGHHNGVTIPAPPLDVLKIGEHMQTKSDEKLFLVLFFDNKRSWQWLPKSKMVPLGIDETIDKLKMMEGRNSSIRKAVRIAFDRAMNHLSRVHGEPVSDLSDID	24109	15954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_17134_21810_21966_22612_22723_23364_23493_23974
785253	SIRV6	+	337	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	532	2	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
785256	contig_15327_pilon	-	1698	7	Intergenic	novelGene_70525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	17.4491324203303	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	254	1210	488304	478231	FALSE	10	CCTTATCTTTGTTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492652	477742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172_488343_492437
785259	contig_12050_pilon	-	2285	10	Intergenic	novelGene_62674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	184.617388798871	56	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	215	772	486455	453288	TRUE	20	GCAATATCCTGTCCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDEPIVPHPRRGRREALRGLGRPSPAEWPGPGSAEKQLP	511552	446062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_447397_448651_448697_451585_451676_452504_452548_453286_453399_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
785260	contig_5967_pilon	-	1439	10	Intergenic	novelGene_44391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	505.165759374529	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	719	1180	412501	388566	FALSE	80	AAACATTAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517545	388306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412600_423959_424055_430708_430797_455202_455276_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
785261	contig_19378_pilon	-	1526	4	Intergenic	novelGene_73776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	62.6329696636595	28	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	19109	18070	TRUE	5	TATGTCTTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFFQTSPRGKRLPSQRRGSPRRRRRSRSRSRSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	19109	15988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_17040_17682_17788_18062_18376_19052
785262	contig_16098_pilon	+	2204	4	Intergenic	novelGene_46060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	499.730816429094	47	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACAGTTCCAGGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435996	439223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436858_436943_437045_437090_437263
785266	contig_7004_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_126457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACGTAAAGCCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353435	351883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_351900_353400
785269	contig_9858_pilon	+	2243	9	Intergenic	novelGene_140530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	37.7820641971822	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	53	1210	215497	233654	FALSE	70	TCTTAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFLVKKNDIENILNWNVMQHKNIEVPFKPARVILQDFTGVPAVVDFAAMRDAVKKLGGDPEKINPVCPADLVIDHSIQVDFSRRADSLQKNQDLEFERNRERFEFLKWGSQAFRNMRIIPPGSGIIHQVNLEYLARVVFDQDGYYYPDSVVGTDSHTTMIDGLGVLGWGVGGIEAEAVMLGQPISMVLPQVIGYRLTGSPHPLVTSTDIVLTITKHLRQVGVVGKFVEFFGPGVAQLSIADRATIANMCPEYGATAAFFPVDEVSIKYLVQTGRDESKIKHIKKYLQAVGMFRDFSDSSQDPDFAQVVELDLKTVIPCCSGPKRPQDKVAVSDMKKDFESCLGAKQGFKGFQIAPDHHNDHKTFIYNNGEFTLAHGSVVIAAITSCTNTSNPSVMLGAGKCI	215444	234687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_+_215559_216738_216877_223898_223969_224093_224278_224818_224959_227122_227295_230611_230713_232243_232361_233480
785271	contig_1996_pilon	-	1613	8	Intergenic	novelGene_131946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	352.808672205876	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	488	1126	509679	508483	FALSE	15	CTGTGACAGTGCGGACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTCSSSFARRVSPTAELADTSLCRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEDGSLWSFNYFFYNKRLKRIVFFSCRSISGSTYTRSEAGNELDMELGEEEEEIEEGRGSEGGAEETSTIEEDRVQVICM	511060	507995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509543_509632_509712_509829_509957_510732
785275	contig_17993_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_61944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGCATTCGCAGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107184	108377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_107200_108400
785278	SIRV6	+	358	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	594	10	415	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785282	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785284	contig_12078_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_74118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428716	428079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_428100_428700
785292	contig_2069_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_23408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1042	1407	1236326	1236691	NA	20	CAGGTCACTGCCAGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLGLNSEGGGERGVSPPPNGYSQGQHLPPQGGAPKGRAMSPSLDPSEGRAESLPSDKHHHPLNTRAGKGVWGGEGSPAGTLTPPAWCITECPGSRCRSPHHSPGASAPGREVSLRGSGR	1235284	1237072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1235300_1237100
785297	contig_10074_pilon	+	1296	2	Intergenic	novelGene_57211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	45	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTGTGTGGTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616728	618970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_616973_617918
785298	contig_10437_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_38206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGGGTCGGGTGTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227178	228781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_227200_228800
785301	contig_5954_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_28518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	738	1163	440823	441248	NA	0	CCGCCGCCCCCTCCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPVSLSCPLFWSSFPIVFFRDWELWPSALGGSRWMDMAGNIVLLGCQTSLGDLSLWGRAVLSVLVPWHSQKNSVATRGIRQGHWREMPSRSLSCPPPRVAHPG	440085	441987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_440100_442000
785305	contig_6199_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_126364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGGTGGATTCGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158284	159037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_158300_159000
785306	contig_17198_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_62436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATATTAAATATTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286534	1284311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1284300_1286500
785315	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_98085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653826	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785319	SIRV1	-	208	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	4010	5568	3590	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAGATGTCGTAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
785321	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	6	413	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785324	contig_11816_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_98530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAATTCTGGTAGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021727	1023194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1021700_1023200
785326	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8138	-1	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
785328	contig_3627_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_78483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATTTGGATCCAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446536	445754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_445800_446500
785330	contig_11396_pilon	-	1284	7	Intergenic	novelGene_71287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_6	690.121346012585	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	121	741	249053	232299	FALSE	20	TTTCTTTATTTTTTAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMRNSATFKSLEDHVGTIKSKVVGGRENGSDNLPSPTGSDDKPLPDHAPF	249173	231755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
785331	contig_14915_pilon	-	1975	7	Intergenic	novelGene_174305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	15.3161135192102	171	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	105	899	87031	67055	FALSE	5	TGCGTTTTTTTTCCCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEQKPSSNLLEQFILLAKGTSGSALTALISQVLEAPGVYVFGELLELANVQELAEGANAAYLQLLNLFAYGTYRDYIANKESLPELSTAQQNKLKHLTIVSLASRMKCIPYSVLLKDLEMRNLRELEDLIIEAVYTDIIQGKLDQRNQLLEVDFCIGRDIRKKDINNIVKTLHEWCDGCEAVLLGIEQQVLRANQYKENHNRTQQQVETEVTNIKKTLKATASSSAQEMEQQLAERECPPHAEQRQPTKKMSKVKGLVSSRH	89482	65978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14915_pilon_-_67214_77231_77338_79146_79350_81429_81519_83811_83888_86869_87048_89394
785332	contig_13366_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_99783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGCTCTGCTTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100499	99504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_99500_100500
785335	contig_7457_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_31675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1903.55667107654	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1	333	1176889	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFRRPFPPRKRNRIVCPLSRTSTLSVSPRPGWRRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176889	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176052_1176787
785338	contig_6048_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_73126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCCCCACCCCGCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943696	944397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_943700_944400
785345	contig_10324_pilon	+	1252	7	Intergenic	novelGene_7835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_2	53.6886600896523	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	116	805	283476	296100	FALSE	15	TCCAAGGCCTCTCTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTKMVSEEDSTTLDAQSSSTAASSISQTWKRPTSTSSSLESPEFSTFRAPL	283360	296547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
785347	contig_6241_pilon	+	2532	1	Intergenic	novelGene_156436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAATGCAATGGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333296	335828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_333300_335800
785348	SIRV6	+	345	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
785353	contig_6710_pilon	-	418	2	Intergenic	novelGene_98229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
785354	contig_6710_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_89565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
785356	contig_5753_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_174313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTACCTCGTTAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81147	82164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_81100_82200
785357	contig_2933_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_111373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGTTGAAAGTAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005543	1005193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_1005200_1005500
785358	contig_9995_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_47691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAATTACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287007	289055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_287000_289100
785361	contig_9753_pilon	-	1448	5	Intergenic	novelGene_41322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	397.955399511051	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGTACATACCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93348	69165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73308_85975_86095_93302
785366	contig_5590_pilon	+	2533	8	Intergenic	novelGene_163048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.3512781198564	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	470	1552	384207	387285	FALSE	40	CACTGTCCAATAGAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELVVTALLAPSRLTLKLLRALMWSLVFSAALVAAAVYSCIALTHVLCRPRRGCCGRPRCVFPACLSDPSLGEHDFLTLQSSGLRLHYVSAGRGNGPLMLFLHGFPENWFSWRYQLREFQSRFHVVAVDMRGYRPSDAPGDVDCYTTDLLMVDIQDVILGLGYSKCVLVGHDWGGFLAWNFSIYYPALVERLVVASAAPMSVYQDYSLRHISQLFRSHYMFLFQLPWLPEKLLSMSDFQILKTIFTHSKTGIPRVTLHEIEAFLYSFTQAGGLVGPLNYYRNIFRNFPLEPQELSTRTLLLWGEKDIYLEPGLVGAVGSRFVPGRLEAHILPDVGHWVPQSNPEEMHQYMWAFLRDLLD	383260	388266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_383337_383813_384450_384559_384646_385099_385258_385395_385525_386645_386750_386836_386974_387059
785367	contig_12074_pilon	-	1090	8	Intergenic	novelGene_53737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	339.582817286032	3	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	119	835	43217	30226	FALSE	10	TTTAATGCCTGCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45853	29970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33188_41193_41228_43071_43252_45769
785368	contig_294_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_166740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCTAGACTTATGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124049	123698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_123700_124000
785372	contig_7943_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_173147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190717	192648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_190700_192600
785374	contig_9921_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_23714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTTGACTCAATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47042	48776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_47000_48800
785375	SIRV6	+	354	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	560	48	381	-39	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785376	contig_15327_pilon	-	2487	1	Intergenic	novelGene_70800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAGAAAAATGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259904	1257417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1257400_1259900
785378	contig_10549_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_110598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGTCACAAAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133820	132886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_132900_133800
785380	contig_5317_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_76629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCCTCCACCACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888578	889912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_888600_889900
785381	contig_16703_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_72776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTATACTGCCCATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29121	29961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_29100_30000
785384	contig_20234_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_174327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTATTTCAAGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216575	214547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_-_214500_216600
785386	SIRV4	-	260	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1259	2	1259	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
785390	contig_9727_pilon	+	2670	6	Intergenic	novelGene_86338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	199.309207012621	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	136	795	425838	430935	FALSE	45	TGTATGACAATACAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGHRSAPAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425226	432810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704
785391	contig_16310_pilon	+	847	5	Intergenic	novelGene_70079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	36	junction_4	3784.91884820534	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	181	540	285976	291671	FALSE	15	CGAGCTTCTACCATCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEEGDFPQPGVPPTAWHGRLWAEKRE	285795	291978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_291596
785392	contig_2100_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_50601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTGAGCTAGATGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699387	698233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_698200_699400
785394	contig_5062_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_157861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATCACAGGGCTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737499	738290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_737500_738300
785395	contig_11850_pilon	+	1215	8	Intergenic	novelGene_125226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	671	1039	284312	286326	FALSE	5	ATCTGGGCGCCGCCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSIFSISPKAPKYSLICSSEVSGLNPPTKTFLGGSFPFKALALLGSINLPSSLCSFSSKTLSTLAASLKSTNPNPLDRPVTGSVLIVQSTTSPNRDKYSVRSFLLVSQLKPPINILPSSC	281454	286502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_281680_282367_282483_282863_282955_283269_283466_284268_284335_285098_285259_285359_285531_286311
785402	contig_15838_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_174332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136022	138002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_136000_138000
785408	contig_13901_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_146667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTGAGTTGCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274406	273099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_273100_274400
785409	contig_9609_pilon	-	1408	4	Intergenic	novelGene_23103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9.7410927974683	173	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAGAGTGACATCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504671	501834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_503021_503190_503312_504408_504446_504607
785410	contig_7810_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_144218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAATAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309799	308560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_308600_309800
785411	contig_2219_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_67164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACACATGGTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72052	72772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_72100_72800
785412	contig_2219_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_67165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	394	732	73864	74202	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPSPVLDSCAGLLAYFPSLDISVEAGMTLLWWKPEAGRWTRQGVHLGSTANSWQLILDKSCFQLLVDFITHSLCLTLDRWIVITSFVYTQCQEYQLNRKIFRQTNYLGVKLN	73470	74204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_73500_74200
785418	SIRV4	-	217	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1306	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
785419	contig_11986_pilon	-	1423	7	Intergenic	novelGene_69193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	1622.18632475503	38	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	248	892	743119	734510	FALSE	5	GGTGTTTGTCTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	744250	733978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737080_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135
785420	contig_6316_pilon	-	1112	8	Intergenic	novelGene_134720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGCTTCCTTTTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157498	145483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_145491_148859_149008_149206_149304_149540_149671_153044_153127_155949_156030_156847_156939_157021
785423	contig_3472_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_166949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCACTTAGCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975185	972844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_972800_975200
785427	contig_9777_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_154431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAATTTCCTTGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66130	66858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_+_66100_66900
785428	SIRV6	+	472	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-40	8827	3	-36	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCAACTAAGGTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090	2504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
785432	contig_11413_pilon	+	499	3	Intergenic	novelGene_103224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.5	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	852342	853453	FALSE	5	CATCTGCTGTGGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQGGAVPPHPLSIAAATHSGLDDLISIWDRSTGIKLYSIQQDLGCGASLGVISDNLLVTGGQGCVSFWDLNYGDLLQTVYLGKNSEAQPARQILVLDNAAIVCNFGSELSLVYVPSVLEKLD	852339	853578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_852398_853052_853123_853207
785433	contig_6079_pilon	-	1742	7	Intergenic	novelGene_160123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	96.9873989524183	68	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	109	720	548810	517358	FALSE	25	TGCAAATTCAGTTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKALTAKNGGREKKVIHPYSRKAAQITREAHKQEKKEKLKNEKALRLNIIGEKLQWFQNHLDPQKVAYSKKDACALTESYLDRFCSELEQIELHNSIKDRQGRRHFSRETAIKQTMERERQRYEGYGLEIPDIVDAGNLKTFREWDFDLKKLPNIKMRKICAKDAIPKKCKRKNVTAVDKVLEELELKDESSDSDEEMTPVT	548918	516335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_517539_519069_519113_529871_530021_531161_531247_532395_532434_542333_542447_548807
785435	contig_500_pilon	+	1443	10	Intergenic	novelGene_30995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1119.31861989315	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	64	1038	1492663	1498065	TRUE	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQAGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493714_1494240_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
785437	contig_15165_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_145322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1144	1476	234898	234566	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRGAKVTLSIKETRHERQYLLDLQFKVFCGQKCHMSVKTSWLTLAQPLPLYPPLWEVTLRKALPALPQITQYLPQLCPNPHFKILFYLKCSKDFCTTMKFNQDAVICD	236041	233470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_233500_236000
785438	contig_10428_pilon	+	2474	3	Intergenic	novelGene_162592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.5	23	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTATGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55798	60259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_+_55875_57231_57531_58160
785439	contig_6069_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_8003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAGGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24219	23672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_23700_24200
785441	contig_12915_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_148332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGTAGAAGACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40481	39897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_39900_40500
785446	contig_12090_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_80483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGAATTTTCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60917	61420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_60900_61400
785447	SIRV2	-	475	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	44	3213	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
785449	contig_1301_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_47387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708361	709715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_708400_709700
785450	contig_10003_pilon	-	1745	2	Intergenic	novelGene_88155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1132	junction_1	0	226	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGGGAGAAGGAGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387202	380303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_380846_385999
785453	contig_6494_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_108584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAGGAAAATGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6883	5746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_5700_6900
785454	contig_6361_pilon	+	2076	6	Intergenic	novelGene_23898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGAATCCAGGAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121274	129084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_122882_123926_124008_126514_126586_128203_128260_128664_128796_128954
785455	contig_11106_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_167457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATGACCAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290642	288552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_288600_290600
785457	contig_7057_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_123211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.5399362039845	293	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	135	1187	536193	534278	FALSE	10	TGCCTACTGACTCTGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRHLLTAALLLAQAKPLKASLLCGRLEYWNPDNGCCGSCLQRFGPPSCPDYEFTENCGLDDSGDHLVPPFKECAPGWCNPDGAELCRPCGGGAAAPAPARSSGGTQRRCGKRPVPTKKPCPLSKPGVLSSQEPSPPAISSVSWTSQRGHTPAGDVFPRALQSFAPSVVLVSLVTLSLILLLAVGRYCCCRQATPLPYSGLVCSGLDTLFPVHTPSPGSLKASEVGDAQKAVSALPLQGAEPPTLATQPLSRLLDELEVLEELIVLLDPEPGPGPGGMACGTTRHLAARYGLPAAWSTFAYSLRPSRSPLRALLEVVVAREPTACLGQLAAHLAQLGRADALQVLSKLS	536892	534229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534688_535074_535348_535534_536039_536305_536869
785458	contig_10627_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_60072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAGGAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353753	1351244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1351200_1353800
785459	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
785460	contig_8357_pilon	+	1107	9	Intergenic	novelGene_39677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	341.408754281433	1212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	393	944	136371	153108	FALSE	5	TTTCTTTTTTTTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI	120394	153271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_120533_126020_126088_136183_136420_142263_142332_143242_143351_143490_143550_144117_144221_145401_145489_153030
785461	contig_5145_pilon	-	1675	2	Intergenic	novelGene_131362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_1	0	214	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	43	1524	329159	326887	FALSE	60	ACGAAACGAAACAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLLLGALILGLNPAGDTRTPSVYDETSEDWSTGVADDHPEVTAPHPPCPRSFPGRLCSNDSNTLLLPDSSQTLLLGWVPTRLVPVLYALALTLGVPANGLALWVLATRVPRLPSTLLLANLAAADLLLGLALPPRIIYHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSLLLLAAVALDRYLAVVHPLRVRALRGLGLATGLCAAAWLAATALSLPLALQRQTFWLAGAGSDHHLLCHDALPQEAQLSHWRPAFACLALLGCFTPLLAMVLCYGATLRALAAGGRRYGHARRLAALVLASALAFFVPSNVLLLLHYSDPGPRAWGNLYAAYLPSLALSTLNSCVDPFVYYYVSAEFREKVRHALRRLAPGNAGGSSKASGEGGGAGTGTPLYFVGVTALQMGCGAPGQPNLQTRRNPPPTLARPLALLDPRTRWTLGRTTVKPPSETEAPGPLQDPVQEEARLPPSPPTPHCPGGSGSHPQQPWFQMWARPRV	329201	326735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_328251_329041
785462	SIRV7	-	276	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91650	0	-91644	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAATTAGCACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
785463	contig_5200_pilon	+	1735	16	Intergenic	novelGene_140158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	69.7307838922109	14	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1233	502	1734	262919	480953	FALSE	40	CCAAGTAAGGAAATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASFKAFRSLQPCECHQIKSLQYSNTGDMILVVSGSSQAKVIDRDGFEVMECIKGDQYIVDMANTKGHTAMLHTGSWHPKIKGEFVTCSNDATVRTWDVDNPKKQKSVFKPRTMQGKKVIPTTCTYSRDGNLVAAACQNGSIQIWDRSLTVHPKFHYKQAHEPGTDTSCVAFSYDGNVLASRGGDDTLKLWDVRLFNKPLFSASGLPTMFPMTDCCFSPDDKLIVTGTSVQRGCGSGKLVFFERRTFQRVYEIDITDASVVRCLWHPKLNQIMVGTGNGLAKVYYDPNKSQRGAKLCVVKTQRKAKQAETLTQDYIITPHALPMFREPRQRSTRKQLEKDRLDPLKSHKPEPPVAGPGRGGRVGTHGGTLSSYIVKNIALDKTDDSNPREAILRHAKAAEDNPYWVSPAY	187472	480954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_187556_187662_187729_189054_189139_194501_194623_248426_248487_262831_262966_294935_295090_314553_314631_388264_388440_444645_444746_447912_447998_449683_449823_474225_474327_476123_476204_478133_478251_480795
785465	contig_10857_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_160901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	26.8493740874697	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	979	1293	113585	118376	FALSE	20	AGCCAGAGCTCCATCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRVDLRNYLERIYQVPVAAVRTRVQHGSGRRRDHRQVRVKKPDYKVAYVQLAHGQTFRFPNLFPEKEQSPERSAHLDLQDQLVEQQRQSSDPRRGSVPAWFSL	110347	118439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_110380_112638_113667_114298_114373_118217
785468	contig_11292_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_109428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACCAATTCAATAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239118	239926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_239100_239900
785474	contig_11056_pilon	+	1278	9	Intergenic	novelGene_130367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	115.67951417602	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	78	977	340996	369990	FALSE	35	GAGTGTGGTTGAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEGGFGGTSSSDAQQSLQSFWPRVMEEIRNLTVKDFRVQELPLARIKKIMKLDEDVKMISAEAPVLFAKAAQIFITELTLRAWIHTEDNKRRTLQRNDIAMAITKFDQFDFLIDIVPRDELKPPKRQEEVRQSVTPAEPVQYYFTLAQQPTAVQVQGQQQGQQTTSSTTTIQPGQIIIAQPQQGQTTPVTMQVGEGQQVQIVQAQPQGQTQQAQSGTGQTMQVMQQIITNTGEIQQIPITQTEVQQGQQQFSQFTDGQQLYQIQQVTMPAGQDLAQPMFIQSANQPSDGQAPQVTGD	294623	370291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_294693_340987_341101_347924_347997_350305_350420_353822_353919_358817_358992_362304_362464_368561_368622_369870
785478	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
785479	contig_5643_pilon	+	1199	9	Intergenic	novelGene_39094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	858.871061335751	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	478	1185	634983	641584	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRWMTHSLNLGAPLFHCNLNGRVPTSLSPPLYIAQQGPGRVMPFYSCK	631458	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_641443
785480	contig_10708_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_174356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGATAAATGATACAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470843	471777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_470800_471800
785481	contig_10708_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_174357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGGAAATAGAAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472938	473358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_472900_473400
785482	contig_15063_pilon	+	728	2	Intergenic	novelGene_14453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	98	586	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35966	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
785483	contig_5551_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_134216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88678	87154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_87200_88700
785485	contig_12605_pilon	+	785	4	Intergenic	novelGene_64213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2019.54719897528	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	374	784	4816	5960	FALSE	20	GTGCAGCACGAGGGGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAVPSRYHPDLAAGRGGPDPGRGACGDQACGGRDLPEVGSHRGALWRGAKIHMP	3878	5961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5805
785486	contig_16259_pilon	+	1087	2	Intergenic	novelGene_174363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	759	1085	8195	8521	FALSE	30	AGTGGTTAAGAGCTATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKEHVKFPTVKEEFVPLFFKWIEWIPTQSDPIGQSKTVPQGFQGCKSLRKQTAKSFSRGVAGGFKQLTFRLAAERFNHCTTRAQTDNGGYPITMVFRFHWTFGNPSG	6493	8523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_+_6777_7719
785487	contig_383_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_126093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCTTGGGGGTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86171	85799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_85800_86200
785490	contig_7963_pilon	-	1010	6	Intergenic	novelGene_58305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	10	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48831	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40227_43546_43819_48741
785492	contig_1348_pilon	-	1673	16	Intergenic	novelGene_174370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_13	20.3812550044288	176	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	88	1608	577739	521037	FALSE	25	AATTGTGTTACCTTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPLTNCSHNKVYKNLKEFTQNGENFCKQVTAVLQQRSNLEISYAKGLQKLAIKLSKVLQSTKKNCLTIAWNWASEGMKSSADLHQKLGKAIQLEAIKPTYQVLSAQEKKRKALDNEVQKTADLVISNWNQQIKAKKKLMVSTKKHEALFHLVENSKQSVTKKEKQKLLNKLKKSTEKLAKEEENYYQKNLAGYSTRLKWEKTLENCYQSILELEKERIQLLCNNLNQYNQHISVFGQTLTTCHTQIHCAISKIDAEKDIQSLLEETAISSTEKKSEFLLTDYFEEDPNNAMDKERQKSSIKSKLLRLQRDIEKASKDKEGLERMLNAYSSNSSFSDGKSQKDTAALMDETNLKLDLLQANSYKLSSVLAELEQRPKPPHPCSTCIFKWKEKEQTHSYVKISRPFMMKRLENVMSKASSGGQSNPSSSSLASDVAQLSNGLCKALYSFQAREEDELSLEKGDIVAIHEKKGEGWWFGSLNGKKGHFPAAYVEELPSNTGNTATQP	577826	520971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_521174_523891_523982_526009_526125_526890_527017_529507_529597_531074_531184_533140_533267_533363_533463_540712_540839_548219_548319_551354_551418_552218_552301_552495_552559_556279_556364_568648_568735_577712
785493	contig_6397_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_146251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTAGAAAAAAGGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449614	448505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_448500_449600
785495	contig_11512_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_43326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	85	432	428291	428638	NA	10	TGGGCCTGTGCTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLYSVLESAYELELTRKQWVWFWFFISFKEHIRSVTVGYNTRIKNEKCRRIKGLAEWRWAELELKAWSAWTQIHGPFTLHMRDGAGPSHSHGDRKGTHDHRPETDDVQGSIAQ	428206	430215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_428200_430200
785497	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8139	-1	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
785501	contig_401_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_42763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	1009586	1009885	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRVRTLDIAGSGAKVAAARAPTLLPRQRKGTRADGWDSVAESLWPALRRAVSAAAARLPLTHRLEKAVAIHFQRLKHRVGSNKKLAWRRFRRALLQNI	1009584	1010938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1009600_1010900
785505	SIRV4	-	353	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1170	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3988	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
785507	contig_9915_pilon	+	2943	1	Intergenic	novelGene_174166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343472	346415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_+_343500_346400
785509	contig_14546_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_157450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532742	531695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_531700_532700
785515	contig_6375_pilon	+	2397	2	Intergenic	novelGene_72932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGAATAAAAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16558	19999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_17311_18354
785517	contig_6710_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_97669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
785519	contig_10437_pilon	+	1693	8	Intergenic	novelGene_38258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	181.607897877346	34	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	126	1115	397110	407700	FALSE	30	TTAACATATATTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLSRSSPGRTWRSSLTNSDLRPEENGALKKWSGRRIERERMWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396480	408278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397106_397230_398632_398756_398840_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
785520	SIRV5	-	352	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
785528	contig_348_pilon	-	1430	8	Intergenic	novelGene_67587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	17.3110793825156	46	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	77	613	254084	252775	TRUE	15	TTTCTGGGGTCAGGCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVAEFWCSRVEWSPGEEKYHLRGVMPPDEFHPGVNNSVYTNVLVQNSLHFAAALAEDLGLPVPNRWLVVADKIKVPFDPERNFHPEFDGYQLGEEVKQADVVLLGYPVPYPLSPSIRRRNLEVYEAVTSPHGPAMTWSMFAVGWMELKDPGRVQGLLDRSFAKDRERRWVRCCELPDGHGGLPAGGPLRVHGVQDHQGRHNL	254256	251829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_252461_252588_252802_252876_252971_253164_253242_253334_253469_253718_253856_254016_254090_254185
785529	contig_13481_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_119354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	144	668	422432	421908	NA	40	TCTATACACGTTAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIEAEKAFDKIQHPFIIKTLSKIGIEGNFINLIKTIYRKLIVNIKINDKRLKAFFLRSGTRQDCAVSLLLFNIVMEILANIIKHEKEMKHIQMRKEELKLCLFTNDMIVYIEKPKEATKNTPRISEFGKIIGSRSTCKNQLHFYVSAMTKWKSKFKKIQYARKKTTTYLSI	422575	421800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_421800_422600
785530	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_96200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	76	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
785533	contig_7179_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_78189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACCAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230713	1228695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1228700_1230700
785534	contig_3822_pilon	-	1318	13	Intergenic	novelGene_133317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1160.53135280066	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	75	650	306185	290876	TRUE	40	AGGGGTATGACAGCGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGVIPDETKALSLLAPANAVAGLLPGGGLLPTPNPLTQIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMS	320796	277235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277264_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284703_285140_285216_290752_290881_292770_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985_306208_320744
785536	SIRV6	+	366	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	6	411	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785537	SIRV5	+	442	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7440	1	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
785538	contig_14362_pilon	-	1253	3	Intergenic	novelGene_142527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	162	junction_1	21.5	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	158	577	40212	39684	FALSE	25	CCCCAGGCATTAGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPAASLAACSAAARPDPQVGTAERLGPGFSTRTSAAPRCCLLLRGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGTSPGAHCMQGLVCMASTWGLSMCRDQDA	45447	39007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_39948_40056_40233_45310
785540	contig_10063_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_127739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375923	378173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_375900_378200
785541	contig_9434_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_150486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGGCACCACCCTAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87525	88182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_87500_88200
785542	contig_9434_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_150487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88898	89835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_88900_89800
785545	contig_1154_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_87104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTGAAAAGAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375075	373864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_373900_375100
785547	contig_6743_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_33534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9922	8575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_8600_9900
785550	contig_3721_pilon	+	2186	2	Intergenic	novelGene_123784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAAGCTTGGGATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33639	38009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_35775_37958
785551	contig_4136_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_161245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTAAGGCCCGCTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133137	135006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_133100_135000
785554	contig_15304_pilon	-	912	4	Intergenic	novelGene_30591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	65.0538238691624	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	226	774	65241	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	65578	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65129_65170_65310_65421
785555	contig_7356_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_60424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTGAAAAAGAGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498574	496358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_496400_498600
785558	contig_6710_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_98168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657508	653562	FALSE	20	TATTTCAGCCTTGCAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657510	653462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
785561	contig_9982_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_55777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGAAATCTAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622675	620991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_621000_622700
785562	contig_610_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_76784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTCTCTCTATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267929	267137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_267100_267900
785566	contig_709_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_57564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTGCACTATTCCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2079292	2080938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2079300_2080900
785567	contig_709_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_57565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGGTTTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2081042	2081487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2081000_2081500
785569	contig_10890_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_166792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTTTCTCAGAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151139	153167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_151100_153200
785570	scaffold_12510_pilon	+	2258	3	Intergenic	novelGene_151369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCAAATTAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198720	208234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_199444_206082_206221_206837
785571	contig_14441_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_100803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTAAAGTATTCATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149824	151299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_149800_151300
785572	contig_14441_pilon	+	747	3	Intergenic	novelGene_100807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCCTGGTGCCTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157374	162674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_157604_159105_159263_162313
785573	contig_10037_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_148959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCATGGGCATTGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292749	294797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_292700_294800
785574	contig_10037_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_148960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295104	295545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_295100_295500
785575	contig_8122_pilon	-	1775	11	Intergenic	novelGene_40192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_10	85.2830581065196	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	130	1620	116849	86033	FALSE	50	AGTTAAAATTTAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSAGCAFEYLIETLNDSSHKYFNIPKLGGTKYDALPYSIRVLLEAAVRNCDGFLMKKEDVMNILDWKTKQSNVEVPFFPARVLLQDFTGIPAMVDFAAMREAVKILGGDPKKVHPACPADLTVDHSLQIDFSKCAIQNAPNPGGGDLQKAGKLSPLKVQPKKLPCRGQTTCRGSCDSGELGQNSGKFSAQIENTPILCPFHLQPVPEPETVLKNQEVEFGRNRERLQFFKWSSRVFKNVAVIPPGTGMAHQMNLEYLSRVVFEEKDFLFPDSVVGTDSHITMVNGLGILGWGVGGIETEAVMLGLPISLTLPEVVGCELTGSSNPFVTSIDVVLGITKHLRQAGVAGKFVEFFGSGVSQLSIVDRTTIANMCPEYGAILSFFPVDNVTLKHLEHTGFDKAKLESIEIYLKAVKLFQNDQTSSGEPEYSQVIQINLNSIVPSVSGPKRPQDRVAVTDMKSDFQACLNEKVDYFIAVFICRTSYLCCLRSKEPTT	116978	85877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_86228_88379_88481_90452_90625_94324_94465_94776_94961_95625_95696_97966_98186_99091_99230_101133_101300_114499_114587_116830
785576	contig_8122_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_40191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACAGGATTCTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85877	85353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_85400_85900
785577	contig_9706_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_20817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTCCGCTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	2033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
785583	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
785584	SIRV2	-	316	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	34	3382	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
785590	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
785592	scaffold_880_pilon	-	2031	1	Intergenic	novelGene_121408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTACCAAGGAAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311086	309055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_309100_311100
785594	contig_744_pilon	+	2536	13	Intergenic	novelGene_145073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	32.0073776217644	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	219	1943	84340	130028	FALSE	40	TGAATACAAAAGCAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSLWRWSRSVSYERVSGGLKAQKCNPEKSASFFSKVTYSWFSRVIILGYNKPLETEDLCGLNESDSSYIVCPIFEKQWRKEVLRNQERQKASSWKEAHTRKPSLLSALWNNFKFVLIQVALFKVFADILSFTSPLIMKQMIIFCEHHSDFDWSGYGYAVALLLVVFLQTLILQQYQRFNLLTSAKIKTAVIGLIYKKALLLSSVSRKKFSTGEIINLMSADAQQLMDLTASLNLLWSAPFQILMVVSLLWQELGPAVLAGVAVLVFVIPMNALVANRVKKLKKSQTKSKDKQIKLLNEIVHGIKILKLYAWEPSYKKKINEIREQELEVHKSAGYLAVFSMLTLTCIPFLVSLATFGVYFLLDEGNILTAAKVFTSMSLFNILRLPLFDLPVVISAVIQTRISLSRLENFLNTEELLQSIETNYRGDHAIGFTNASFSWDKTGIPVLKDLNIKIPEGALVAIVGQVGSGKSSMLSAILGEMEKLTGVVQRKGSVAYVSQQAWIQNCILQENILFGSIMQKPFYERVLEACALLPDLEQLPNGDQTEIGERVRKRYSVTYRNEIPLTVLIKCL	84121	130621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_+_84412_91425_91488_99401_99544_100115_100259_102790_102969_114427_114683_117153_117220_121517_121656_122959_123107_124969_125052_125139_125207_125397_125525_129782
785604	SIRV4	-	463	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1058	0	1058	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
785605	contig_15047_pilon	+	966	5	Intergenic	novelGene_52170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.006005641583	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	509	544	3482	4178	TRUE	35	ATACAAATTTTTTTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRQAPTPCGISTPPCPGPAAGSPASSPSATWTTRSSCGSTATPRIRERSRGRRGSSGRGRSIGTSRHGESRAPQRLSDGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2170	21549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2551_2780_3282_3498_4158_4301_21249
785607	contig_6069_pilon	+	1663	8	Intergenic	novelGene_8077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	86.8609021742844	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	43	993	560908	566005	TRUE	25	TCCTAGAGCAGTGTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPVRVAADELWLRL	560865	566830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564586_565965_566043_566197
785608	contig_13457_pilon	+	1262	9	Intergenic	novelGene_118320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	145.696388081517	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	97	993	52406	57730	FALSE	40	AAACGAGGACAATTCCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRICNRRDAVEWFVQVLWWLAEVASGYVGTGYMEGDGSDPEPPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52309	57999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53324_55664_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
785609	contig_835_pilon	+	1110	3	Intergenic	novelGene_152130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	137	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	133	522	70975	137430	FALSE	10	TGATGCTTTTGGACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKSTEILEYSSDSGKEDDSENVLFIDSESPHKCSVDFGTDARQYMERLVEPWTKSTETILYTPQKQKNKFPRTPEDSTKKKKLIRGGLAERLNELQNRERSAISFWRHQCVSYPKTLEGEKNSNECSWLSYSSQETNRCNKLRYLYTLYTVKSVISYTVIMANDHFKCKLAEE	70842	138018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_88205_88307_137263
785610	contig_5539_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_104762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGTTTCTTAACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150250	149287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_149300_150200
785611	contig_16098_pilon	-	1206	8	Intergenic	novelGene_46036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1251.3574017597	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	534	1097	350530	348413	FALSE	15	GCTTTATTTTCTGGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPTSYLQGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354093	348303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349509_350507_350639_350765_350889_352152_352352_353990
785612	contig_7057_pilon	+	825	4	Intergenic	novelGene_123245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	219.776148741294	3387	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539943	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540705_540996_541177
785616	contig_11948_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_174387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCCTATAGGACAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145218	144933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_144900_145200
785618	SIRV6	+	175	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	51	557	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
785619	contig_11227_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_163207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTTTTAAGGAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319925	318768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_318800_319900
785620	contig_9283_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_164401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTATTTGCTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122610	120532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_-_120500_122600
785622	SIRV4	-	444	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1077	0	1077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4081	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
785623	contig_9955_pilon	+	2574	13	Intergenic	novelGene_21370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	7.22793577417201	15	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	475	921	424413	502892	TRUE	15	CCTGATTGAGCTCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFLLFLSGLVTLCFGALFLLPHSSRLKRLFLASRIQQPGLEVVADVVGHPPVREQKPPPNPAPAAPAPGEDDPSNRANHPRRNGWPRRTRPTGPREEVTAVRGNGIAALGPRQRSVPFSFDFNAFRSRLRHPVLGTRPDESKEPKSQVRAQREKVKEMMQFAWQSYKHYAMGKNELRPLTKDGYEGNMFGGLSGATIIDSLDTLYLMELKEEFQEAKAWVEESFHLNVSGEASLFEVNIRYIGGLLSAFYLTGEEVFRIKAIKLGQKLLPAFNTPTGNPKGRCELQKRLQWKLGLGDGREQQHPG	359499	528212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_359974_424412_424510_480675_480792_483980_484062_494730_494827_502835_502967_506686_506781_516216_516333_521868_522089_524704_524878_525243_525318_526255_526372_527426
785626	contig_6005_pilon	-	1756	3	Intergenic	novelGene_158895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	158	junction_2	58.5	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	25	459	327313	320202	FALSE	15	CTCCTTGACTGAGGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAFAATNMEALYRVPFLVLECPNLKLKKPPWVHMPSAMTVYALVVVSYFLITGGIIYDVIVEPPSVGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSNAPNIPKLNRFLLLFIGFVCVLLSFFMARVFMRMKLP	327337	318904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_320404_321980_322075_327174
785629	SIRV4	-	231	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1292	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3866	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
785630	contig_5836_pilon	-	2465	2	Intergenic	novelGene_106284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGAATAAAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115199	110556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_112646_114823
785632	SIRV4	-	361	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1162	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
785633	contig_7562_pilon	-	1464	11	Intergenic	novelGene_140883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	98.041623813562	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	453	1463	142006	125777	FALSE	65	AAAAAGCAGCAAGTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVHSYFHRQSDLLVKLNRLLERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELIQKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPVDTSDVGEKAEEIIAEAEPPSEVVSNPVLWTPGTAQIGEGIENSWGDLEDSEKEDEDEGGSDEAIILDNVKMDTGVDISNIGSQDAPIVLSDSEEEEMIILEPDKSPKKIRTQTIGVKQ	143716	125775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_125802_126240_126320_128841_129027_129846_129994_130132_130222_131864_131998_133263_133347_140847_140986_141874_142214_143084_143180_143566
785635	contig_14223_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_156976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	20	388	183219	182851	NA	40	AGCAAGACTTAATTAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVHKVPFLCILPHFCKNVAPRVTWGHIPQAMGEAAPVQHGPCTAILCPVRIPWPHLECPCIHQKHTLHVPSFSAHSEESPSTQGPTAHHQGQLARSRLDVTADSAGCSAPRSTAGTFFS	183238	182296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_-_182300_183200
785636	contig_8898_pilon	-	1453	5	Intergenic	novelGene_137253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	36.4785896108937	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	22	789	339805	331370	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVQADGHMEPVGRWRNLPSGPSLKHLTDPSYGIPREQQKPALQELTRAHVESFNYAVREGLSLAVQAIPPFEFAFKDERISLTIVDAVISSPTVPKGSICKELKVYPAECRGRKSTYRGKLTADISWAVNGISKGIIKQFLGYVPIMVKSKVCNLHSLPPKALIEHHEEAEEMGGYFIINGIEKVIRMLIMPRRNFPIAMIRPKWKSRGPGYTQYGVSMHCVREEHSAVNMNLHYLENGTVMLNFIYRKELFFLPLGFALRV	339826	330705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_331513_333084_333218_334681_334829_335585_335754_339628
785638	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
785641	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8115	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
785643	contig_7568_pilon	-	2223	10	Intergenic	novelGene_173994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	177.302002244758	58	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	21	1283	104038	15487	FALSE	20	TTTATGTTTATTGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPVPVPMYAGSVSGSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDADDFVLVPDISSDHSCDDMPVGTAGRCASHEFLVYGGQCQPTVSSHSETAAIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNLHGSPRSAVVRRSNTSPLGFRRLGSCTPVPADPVQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHPHVHESRSRNSSGSPVPQAQSPQSLLLGARLQSTPTLTDIYQNKQKLRKQHSDPVCPSHARAGYSYSPQPSRPGSLGASPTKHMGSSPRSSDWFFKTTLPTIIGSPTKTIAPFKIPKTQASSNLLALVTRQGPSEGQSRDGNDPRECSHCLPVQGGERQRAEQQNKTVFGRSVSTGKLSDQQIKTPLGGQLHQGSTDSLNTERPMDIVFY	104058	14546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_15498_16679_16790_18066_18255_18619_18907_20827_20909_28445_28592_50582_50721_64619_64681_93724_93897_103969
785646	SIRV4	-	239	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1284	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
785647	contig_2380_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_117897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTTAATGTTTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472140	471642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_471600_472100
785648	contig_2380_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_117896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTCCAGAACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470040	468856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_468900_470000
785649	contig_10861_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_39410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCCCCCCAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1940839	1938712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1938700_1940800
785652	contig_3068_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_137602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTTCAAAGAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26428	27318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_26400_27300
785654	contig_9995_pilon	+	1869	2	Intergenic	novelGene_47783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	900	1232	748379	748711	FALSE	40	AACATTTTTTACATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPVLRTLPGKSRGSINTEWMAEGKSQDTATGARKEPALLQLAGLRILSSAALAWRLAGPGRGHQLARGARGLLRCWGLRKAMSLLESTNNLTRSIYGKDRNSSFKTCS	747057	749348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_747189_747610
785656	contig_5769_pilon	-	2124	7	Intergenic	novelGene_138761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_2	152.69650363457	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	1072	2124	170337	150301	FALSE	20	GTAAGATTGCTTTTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKTLETQSALGSALQAAFKLMSPTGGRMSVFQTQLPTLGMGALKPREEPNQRSSAKEIHLTPSTDFYKKLALDCSGQQVAVDLFLLSGQYSDLASLGCISRYSAGSVYYYPSYHHQHNPVQVQKLQKELQRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSIHTFHGNFFVRSTDLLSLPNVNPDAGYAVQMSVEESLTDTQLVSFQSALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSTLNEVFLGADIQAISGLLANMAVDRSVTASLSDARDALVNAVIDSLSAYRSSVLSNQQPGLMVPFSLRLFPLFVLALLKQKSFQTGTNARLDERIFAMCQVKNQPLVYLMLSTHPSLYRVDNLSDE	171408	150300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_150439_152527_152704_154068_154180_163332_163507_168639_168799_169117_169239_170163
785657	contig_16103_pilon	-	1636	2	Intergenic	novelGene_118926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786302	783569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_784418_785514
785659	contig_10235_pilon	-	1227	8	Intergenic	novelGene_46399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.1825057193689	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	486	938	178699	177938	FALSE	20	AAGGTATTTTTTCTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLVSSGIGSRKKVLEWQLPWSGWWAQRAGAGQDVHAAAPHSTLHLTHSTRPLSSGSEASAQL	181339	177648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178911_179492_179561_180341_180466_180843_180894_181307
785661	contig_6870_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_104006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCCACAAGCACTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565598	1567779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1565600_1567800
785664	contig_987_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_72262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGTCTTTTGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418118	418619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_418100_418600
785667	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	53	486	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
785668	contig_7286_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_108721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGAAGATCTAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449654	449219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_449200_449700
785670	contig_1301_pilon	-	1732	2	Intergenic	novelGene_47298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2406	junction_1	0	110	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAGAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267888	263941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_264323_266537
785671	contig_4315_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_46741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTACATTCTTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171109	171590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_171100_171600
785674	contig_12050_pilon	+	1008	7	Intergenic	novelGene_62719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	81.4058761187831	168	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	93	896	666343	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSLPMGDIPMDGMAVADLGPVVLSLLKAPEEYVGQNLGLSTCRHTVGEYTTLLTKHTGHAVHDAKTTPEEYEKLGFPGAQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	666034	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668370_679709_679750_679854_679960_681576_681768_682979
785677	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
785679	contig_5918_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_99609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	603	908	2095928	2095623	NA	30	ACAACAACACCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLLLLASSLNTRTHTHTHNIGSQKRFSSLLIFHTFINLTGCTLVLKFEQNIKDSLFRGTSTASGVWVLSPKSLMQPSDRIQRFSSYNFYKIMLQINHALK	2096530	2095030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2095000_2096500
785681	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	510	51	510	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10747	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
785682	contig_3095_pilon	-	1198	5	Intergenic	novelGene_75122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCAGTAGAGCTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152245	147217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147320_149646_149895_150412_150691_150990_151165_151849
785686	contig_11448_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_66385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	130	321	397113	396922	NA	75	ACAAAAAATGAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPILQLRKSRLKGIKWFTQGIQLVSGLVNTLVFLAPRPVLLILMHCCCLLTEQRDACGSILQTRKWYTNGSLCGRWKVLRGTISKSPCRENKWLFTLNTVKALAAH	397242	395094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_395100_397200
785688	contig_10300_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_152927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81400	79612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_-_79600_81400
785690	contig_9363_pilon	-	1960	12	Intergenic	novelGene_6722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	64.6223613525292	213	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	71	871	1388216	1384992	TRUE	5	TCTGCTTTTTGTATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAGGSGRSLGSLRDPPGAAASPMDLPGDSSPSGRPRLCRQPLARALWAAGSPKRPRLQPLGAPSPLEKASRRVLAVVLEDVMAAHMAPLVPQEDASTPRHRSNHWDSVHSQPPASPSRQSVWSPQARPPNPLHLCRQPLSRVHRPPSTQRRRPRTSPGPEEASSPKVDRVPQPTLVVMLEDIAGPRSPAKVPEHRGFVDETCNFTVPARRAEPMPVVHQPVPLPKDLEPPFRQSALPARHSESPPPAPDPDLESPSTPPTSSLLRPHLSPWGLAPPFPFRPLQVGEFC	1389098	1383324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1383720_1383809_1383882_1384165_1384258_1384338_1384409_1384531_1385120_1386087_1386198_1386381_1386426_1386707_1386913_1386984_1387107_1387901_1388071_1388193_1388267_1389078
785691	contig_854_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_36323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1759	2088	592152	592481	NA	0	TGCTGTGTGGCCGGGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVMLGTLPSSLQWGGDGADLIIKWRCTPRLGLHPPLLHQAGLSASGPWAEDAAGHEQRGVGGRGRGTGRQGCRESPAPQGEKKFQKPELAWKVEAGGPALGLGLGLP	590393	592681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_590400_592700
785692	contig_10642_pilon	+	2173	2	Intergenic	novelGene_78643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTTGAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31729	90341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_31975_88413
785693	contig_11003_pilon	+	961	4	Intergenic	novelGene_105424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	128.085908670704	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	189	662	56015	72741	FALSE	10	CGCAGCGTCCTGGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKPRPPGAESQAPSSKSL	55826	73040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61041_72690
785694	contig_10734_pilon	+	1860	6	Intergenic	novelGene_51105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	37.2161255371915	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	689	1486	704822	714200	FALSE	35	GCTTTATATTTACAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIKEYRIPLPMTVEEYRIAQLYMIQKKSRNETYGEGSGVEILENRPYSDGPGGSGQYTHKVYHVGMHIPGWFRSILPKAALRVVEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKADAGENPAVFSLSPAEKSQLTIDFIDIVKDSIPPSEYKTEEDPKLFHSTKTQRGPLSDNWIEEYKKHVFPIMCAYKLCKVEFRYWGMQSKIERFIHDTGEPPACQPVCLARGSACLSLPLRCCLFILFPKGNPEYTPSFRLWRVQTVSV	634177	714574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_634662_638214_638324_704726_704900_711300_711516_712728_712851_713817
785695	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785697	SIRV4	-	504	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	115	-2	115	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5043	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
785698	contig_7171_pilon	-	1359	2	Intergenic	novelGene_101333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	29	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCATCCTGGGGTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274316	1272535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1273835_1274256
785699	contig_11292_pilon	-	1197	8	Intergenic	novelGene_109484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	342.611757425998	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	74	457	481968	480089	TRUE	55	AGAAGAAAAGTAATTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKSRAVPGRRPILQLSPPGPRSSTPGRDPEPEPDTETDSTAAAASQPVPMAVVPATTTALTAVAASEDSPSEEIKLYQESLPLPQIPFPSLPPSLPLRNIPKLIQMNRKWWWRLPELFSILQNQS	482041	474334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_474452_475351_475473_475569_475718_476726_476914_477144_477282_480058_480158_480785_480878_481745
785702	contig_6102_pilon	+	1598	16	Intergenic	novelGene_31737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_15	143.831135556789	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	232	1581	216236	229231	FALSE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLPCSSSPTTIHAAPRALTTPEQIPGRKKLKGSLFTPYFWPAPSATPAKAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQGSVPSASQYLLSCTTSTTCHAHMCTHVHAHAHTTNTYAESASSE	210264	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_220990_229096
785705	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	2	1154	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
785710	contig_9335_pilon	-	1272	4	Intergenic	novelGene_147462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.7515902921777	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	234	1040	737423	642197	FALSE	40	AATATCTCTGTTTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYRLCRHVGRGGGGYFPQSPGQDPGRVFCRYYRPSGWGGDKSWAEEPSAEGTFRPEKEREWKGPFYFIQGADPQFGLMKAWSVGDCDGGGDEWGQEIRLTEQAVQAINKLNPKPKFFVLCGDLVHAMPGMPWRKEQTEDLQRVLKDVDREIPLVFVSGNHDIGNVPTAESIAEFCQTWGDDYFSFWVGGVLFLVLNSQFFYDASRCPALKQAQDQWLDEQLSIAGERKCQHAIVFQHIPLFLQSLDEEDDYFNLSKSVRQEMADKLTEAGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758623	641964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_671128_671552_737269_737489_758455
785711	contig_5241_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_174392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATTTAATCTGCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42240	43739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5241_pilon_+_42200_43700
785714	contig_17936_pilon	+	1318	9	Intergenic	novelGene_29920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	935.059882774895	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	55	849	50646	111001	TRUE	70	AGAGACAAAGAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQGD	50591	118806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106476_110997_111167_114800_114934_118635
785715	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
785716	contig_1813_pilon	-	1563	10	Intergenic	novelGene_105523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	4.08248290463863	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	290	1006	506095	502204	FALSE	15	GACTCTTTTCATGTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCFSFLKTMMFLFNLLIFLCGAALLAVGIWVSVDGPSFLKILGPLSSAAMQFVNVGYFLIAAGAVLLALGFLGCYGAHSENKCALIMFFSILLIIFIAEVAAAVVALVYTTMAENFLTLAVVPAIKTDYGKQKDFSELWNITMTGLKCCGFNNYTDFEGSPFYLEKSVFPPYCCNNSTESGSCTKEEAEKDAVQGCFDQLLYEIRTNGGTVGGVAAGIGGLELAAMIVSLYLYCHLE	513280	501646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_502252_502458_502543_502650_502798_502877_502977_503091_503167_503375_503583_506038_506104_506527_506636_511961_512103_513248
785718	contig_9091_pilon	+	2055	9	Intergenic	novelGene_32443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	102.947726419771	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	129	821	72118	81448	TRUE	35	TTTTATTGGAACAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSTSPDREDDLEACVLRFSDLDLKDTGLIDPSSHLKAQLDHSTKKKYSFGKKKAFALFVKTKEVPASAFECKEKWWKCCQQLFKDKIGIHRHVATQHADEICHQTASILKQLAVTLSSSKSLKSSDKRDLLKEYLTHDHDVSAWLPDTSCFSPDKLIGFELLQKESMGQLVEANWPPNSMWKSCFPVHCLRIIFVRTILRPAKEELTVFQNCVLVYLKKSCLWGLAPI	67284	90154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_67363_72067_72283_73534_73849_80355_80482_81360_81467_85773_85893_86396_86556_87131_87212_89296
785722	contig_10003_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_88267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCATAGGGTTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785411	787386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_785400_787400
785723	contig_10734_pilon	-	1884	12	Intergenic	novelGene_51453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_11	73.6173937405898	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	11	1177	2234466	2216993	FALSE	30	CAAACCATTTTCTTAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRAVVAGFLFEYDTPRIVLIRSRKVGLMNRAVQLLILAYVIGWVFVWEKGYQEVDSVVSSVTTKAKGVAVTNTSELGFRIWDVADYVIPAQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2234476	2216285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275_2226348_2229766_2229915_2234332
785726	contig_13657_pilon	+	952	4	Intergenic	novelGene_174396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCAACACGTCCAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87362	100561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13657_pilon_+_87444_87600_87902_98777_98824_100037
785729	contig_8866_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_77786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	337	1014	176	1189	349626	348613	NA	40	CAGAAGTAGATCACATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERTGGSPPGLFYRLWIIFLNTFFQVRTRGSIKRRPPSRQFRRSQSDCGDLGNFRAAESSQENGAKEENGDEVFTSKSKAPGPPPSSDSAVGKEVRRSLELDQKPPLRRTSSWTEKREEKGGSAEDTKQWEKAAVHSVEEERQSTAQEEATEPPRASSPKAENGCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEVSGPTCSPWDGSVGSSLETSLLCLLCHMPCSLQSCHKSAQCVVTKVPGFHLVPHWVGTGCF	349801	348255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_348300_349800
785731	contig_10940_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_49296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTATGGTTAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034390	1035196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_1034400_1035200
785732	contig_10940_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_49297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035145	1036449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_1035100_1036400
785734	contig_8420_pilon	-	873	5	Intergenic	novelGene_69351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAGAGATAATTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58869	37073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_37167_39045_39176_41726_41916_51044_51180_58543
785737	contig_14357_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_121708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATATTTGCCAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806162	807982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_806200_808000
785738	contig_7045_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_77464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAGCATAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378324	379011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_378300_379000
785740	contig_2854_pilon	-	2181	11	Intergenic	novelGene_120846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	143.310327611097	2	117	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	234	1559	340469	293609	FALSE	65	AAAATACATCAAAGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEAY	347997	292986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_293617_300455_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773
785743	contig_7965_pilon	+	1454	5	Intergenic	novelGene_174401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	20.7409618870485	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1434	21	1454	193981	216330	FALSE	30	GGGAAAGTCTATAAGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPGPGAAAASVEERQRKLQEYLAAKGKLKCQNAKPYLKAKNICANPAPSKSTIRPKKDVTNHVALPVKTTRPINLKLQPRPTNITETQKPKLDPPKLVGKRLISGCISSNLNCKPSSSSQKQPKTRSSATREPSRKPMGSCPRQELKTTKQQVTDQEKAKCMDSVDNTQVENESLNRFLKEINKENLPQTLSDSERKPDPEFCTVSKPETNSHNPTKSRSAPEQALGKSLMNSAVLKDRGNKPFVGKTQIRIQPVESQQLSRGADLTRRREKPPRTVPCHFVKTLSRTPASKKPVAKEQDINISRAKHEKADEAKLQSYVNEQKAKRLVPQTYTGLLQGRINNRHPNIKQDQKPNQPCFRPQASFVLQNSKDLSRRPDLTADNSNPVIPSTPSIRANGTNGNKCNNDFQPKVQTLDSKLKRTLYQNYFLNKTAPKTQAGDTTMNRRIPDGTPTNPNIKKKATEDRRKQLEEWQKSK	193960	216330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7965_pilon_+_194021_195831_195899_197525_197578_211701_212946_216299
785744	contig_20819_pilon	+	2416	19	Intergenic	novelGene_55688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	24.9827100705495	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	2	1111	70678	75243	TRUE	20	CCCCAGTATATCTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAARELVLRAGASDMEEEEGPLGSGPGLQEPLQLGELDITSDEFILDEVDVHIQANLEDELVKEALKTGVDLRHYSKQVELELQQIEQKSIRDYIQESENIASLHNQITACDAVLERMEQMLGAFQSDLSSISSEIRTLQEQSGAMNIRLRNRQAVRGKLGELVDGLVVPSALVTAILEAPVTEPRFLEQLQELDAKAAAVREQEARGTAACADVRGVLDRLRVKAVTKIREFILQKIYSFRKPMTNYQIPQTALLKYRFFYQFLLGNERATAKEIRDEYVETLSKIYLSYYRSYLGRLLKVQSDALHDFSRSHHFAAGTPSLPWGPVALSSPPLNLRPPSWCPTQPKEESRGIHMRPSSAASTTLS	70676	88354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_70750_71584_71670_71830_71884_72064_72141_72326_72395_72687_72864_73243_73395_73684_73786_73895_74029_74585_74735_75197_75354_75835_75957_76236_76361_76632_76729_76847_76956_77169_77236_87245_87358_87576_87696_87905
785750	contig_17274_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_26478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCGGATTCATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13115	13640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_13100_13600
785751	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
785752	contig_11378_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_112224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTTAGATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286668	287016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_286700_287000
785753	contig_6344_pilon	-	1267	5	Intergenic	novelGene_157106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.7788778173041	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	261	959	993996	991066	FALSE	40	AAAAGTTTTATTTTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSNSAVILPSTPQACEIPPSPHTNSSRKQPMSATLRERLRKTRSSFNSCYSVAKRLKVENEESDQIFSEKPVSSTEENRLEFQESFKHIDSDFEESTYLKNTFKNISVCESKSLDIGSCNALQNDFVNENLPIQGLKEEKAKLVKQVQEKEDFLRRLKLVKMYRSKNDLSQLQLLIKKWRNCSQLLLYELQSAMSEENKKLSLTELIDHYGLDDKLLHYNRSEEEFIGV	994798	990757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991258_992459_992871_993900_994023_994403_994521_994681
785755	contig_6589_pilon	-	2487	5	Intergenic	novelGene_26310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTCTTTCTGGGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2318295	2308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2309434_2312851_2313133_2313346_2313454_2314166_2314240_2316775
785756	contig_7338_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_156794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGATTAGAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251083	252165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_251100_252200
785758	contig_1397_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_174404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGCTTACATAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37203	37955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1397_pilon_+_37200_38000
785759	contig_401_pilon	+	788	5	Intergenic	novelGene_42796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCACCACCAACAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125378	1131672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1125661_1127487_1127681_1128470_1128574_1128905_1129086_1131642
785760	contig_19892_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_158953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTACATCTGAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40123	39763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_-_39800_40100
785762	contig_8660_pilon	-	914	3	Intergenic	novelGene_136505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.5	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAACACAATAAACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315366	308124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308756_310288_310437_315231
785763	contig_10235_pilon	-	972	6	Intergenic	novelGene_46475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	925.890576688196	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	10	972	222843	217920	FALSE	25	ATTTAGTGGTGTTATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDSESCGPESPEGFGQLLDIPPSQKKWMRPVLRMRASLRGSFWMAMSLRWLTATCCRSSILCRLYVRSTGDSPSRSSYGECIGTCAMHMLGKNSPPLVQMMRRLSWPTSKWPKPSNKPLLGLPCLPPFSPQRPSVVSTWLSNGQTHSEMASEQGILEHLCRLARGMREKDGRPGRNFYCTEGWVGQRISVIKYRMK	222852	217919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219470_220076_220197_220354_220481_220677_220788_222804
785764	contig_5514_pilon	+	2677	16	Intergenic	novelGene_75288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_10	108.893097424339	168	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	8	2305	89136	95955	FALSE	35	CTGGAAAAAGCCTTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATPAGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNCRSLAEGVSASLHTLLGDPCPMLESPGAPCLSARTSISCTLVALEPFWEVLMQSAETLEEDYVENDKEEGPWEPPVPQILAWPVLRARTGLVYDQRMMSHYNLWDNHHPEMPQRISRIMYHLEELGLAERCLTLPARPATDAELLTCHSAEYMARLRATENMKTRELHREGASFDSIYICPSTFTCAQLATGAVCRLVEAVLAGEVLNGTAVVRPPGHHAEWDAACGFCFFNSVAVAARHAQAISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHIFEDDPSVLYMSLHRYDHGTFFPMGNEGASSQIGQAPGMGFTVNVAWNGPHMGDPEYLAAWHRLVLPVAYEFNPELVLVSAGFDAAQGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMGLANGRIILILEGGYNLTSISESMAACTRTLLGDPPPLLAPLRPPLSGALASISETIHIHHRYWRSLRIKKVEDKEEETSNSELVTKEPQPANPGSAEGMATPEENILEAGTRKATSASPVEGSTLGQAKSETAVMELTQDKSLEAATGGAVLDQTTSEGPVGDTKLASRTDNQTTPSSPVQETTPHISPSNLIESLRTLELSNKAQKAPDSQTPEEEKLLGEAAGGRRDLDDSMLMGFGDTDKATFYAVTPLPWCPHLMAVCPIPATGLDVTQPCRDCGSLQENWVCLSCYQVCCGRYINAHMIQHHEDSGHPLVLSFVDLSTWCYHCQAYVHHQALLDVKNFAHQNKFGEDMPQPH	89128	96327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_89220_89562_89670_89757_89826_90068_90223_90321_90451_90612_90782_91066_91201_91725_91795_91917_92111_93839_93990_94231_94407_94528_94939_95017_95129_95259_95407_95509_95639_95886
785778	contig_6017_pilon	-	1872	3	Intergenic	novelGene_152563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	56	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	533	1549	480245	472973	FALSE	55	TAAAGTTTCAAAACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPRIESGEPLCPPLQCNQDEESLTLLIQVPRILPQSLQGDLKPLRYKLCFSTQDFIYYSFFLQFAPENKLSTKEPVISISSNNVVIELAKSPESHGHWKQWYYGLNNDSLEERLFVSEENVNEFLDEVLSSPFKQTIPLTPPLIEVLQITDNNIQIHAKLQESSNSHELHVKEGVNEGSHLTEKENIEHLITTTTEQEQTLGDARPSDSCVADNALVTDSCGSVAYLKQESRDVFQVLSGKSQQPESKMEPEFIKEKCAVYSNEEKQNLKEPVLTGEKELDGDYLSSLQNKTTVHNISAFESIKETNMQDGSVQIMKDHVTHCAFSFRNSLLYDLD	480777	472649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_473507_474670_474815_479906
785782	SIRV5	+	334	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-21	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8294	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
785788	contig_10898_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_172770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	271	606	219017	218682	NA	40	CTGATGACCCAAGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKPVVSTISNGGYLQGNANGRLPALGSKESPGQEKVMLKKKITLLRGTSIIIGTIIGAGIFISPKGVLQNTGSVGMSLVIWTTCGVLSLFGECNFFSRGCDCGAEQLAL	219287	218487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_218500_219300
785790	contig_6975_pilon	-	1278	9	Intergenic	novelGene_74272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	500.730325998935	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	439	1035	163040	159482	FALSE	30	TTCAAACCACTGATGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGGDGYDGGYGGFDDYGGYNNYGYGNDGFDERMRDGRGMGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYAAAVEGTMGKAV	169956	159238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159520_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162461_162549_163009_163195_164402_164538_169807
785793	contig_10045_pilon	+	1419	5	Intergenic	novelGene_163753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.59522876548166	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGTTACTGAGTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7589	25494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_7652_9136_9237_15996_16117_22672_22923_24607
785794	contig_9505_pilon	+	1296	9	Intergenic	novelGene_121845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	120.699976698424	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	82	666	530721	597995	TRUE	15	AGGGTCAGCGTTCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSASSAKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	530639	621439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614971_615049_620886
785799	contig_11978_pilon	+	1961	2	Intergenic	novelGene_62917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	23	304	860845	863104	FALSE	45	CATTACTTTGGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVPVVAMAVAGAGMLRGGLLPQAGRLPTIQTVRYGSKAVTRHRRVMHFERQKLMALTEYIPPKLAINPRCLPPPPSPPQEVRGRMSVHHLAMGWWIKVI	860822	864761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860897_862874
785805	contig_10549_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_110579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGATTAAATGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18059	17186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_17200_18100
785807	contig_5586_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_143527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	206	559	292526	292879	NA	30	TTCCTCAGAAATGTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGDGSEALQEQTSGTPATSLILEERATPVTSILCTGIFLSFEKGSILRKTETHWYMQKRSIHLFSQQIFIKCPLHTRPYTRFYLKTIEGFLTDQWHGNKTIGVSNLSYNPVSATH	292320	293647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_292300_293600
785808	contig_7157_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_131293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTGGGAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888135	885846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_885800_888100
785809	contig_9482_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_44279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149637	1151371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1149600_1151400
785811	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	3	1205	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
785817	contig_7622_pilon	+	724	3	Intergenic	novelGene_132435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGAAACAAAACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297443	306643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_298021_305045_305138_306588
785818	contig_18613_pilon	+	859	6	Intergenic	novelGene_80218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1179.41860253262	17	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	111	539	24385	30177	TRUE	15	AGTATATGGTCTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQCDRGWKSTTCYWRG	23704	31361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28643_30137_30195_31058
785822	contig_12450_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_162314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTGGTTGCCAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253696	255916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_253700_255900
785825	contig_16098_pilon	-	784	12	Intergenic	novelGene_45794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	303.217239310162	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	42	578	36010	31519	TRUE	25	AGAATGGACTACCCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPEERRRGVEARMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36336	31153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32129_34760_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
785826	contig_817_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_132473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1247	1627	688536	688916	NA	80	CACTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEFLRKVTVTIQAQEHPRIQFFHQDSLFPAVLAGTPLPGPQCLPTGTQFSPSVGREAHCAVPCCLVSPAGLFFLGGGGFLPLLWNWLSFKAKLTHRLDRPRLPYHNHLGGSYKLMARKATHKSN	687289	689157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_687300_689200
785830	contig_10319_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_147259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	552	959	369005	369412	NA	20	AGTGGCAGTTTGGCATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLHLMGISFGLILIIPREVRLVLTLLLLPFYIRSLLKCHFCRKVCPGHSILGWVGRLQLASLEKARVTKDLRGGIGALLLVSDGHDIGKVPVVLGPGNHHHIFFFLLLLLSHLGSLTSPFSSTGLGLDFQACG	368453	370950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_368500_371000
785831	contig_12414_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_59677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTACTGAGAATTATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912413	911492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_911500_912400
785832	contig_8544_pilon	+	1195	3	Intergenic	novelGene_55920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	791	junction_1	105.5	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	226	420	90532	90726	FALSE	70	TAGAAAAAAGAGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLVSIGNKSNDLLSLILYEISGISFSTYKFFNISI	83414	91501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458
785840	SIRV6	+	211	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	514	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11102_11205
785845	contig_4732_pilon	+	2399	2	Intergenic	novelGene_75478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1537	1959	706196	706799	FALSE	75	CTTAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLEATVVLGDGVSKVHTLPLAQELTQLWPLLQPQVVPNEVPVDAVPPPLLLVEQDVGGFLPHLLILPDRDVAPPGLLDGTGKAIKLAFTHLLQEEKLSKGEGLWAGVSQEAKVSGVPWAIPPTHSCSHTPPYTLIRCI	704659	707239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_706377_706557
785846	contig_5316_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_61257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528725	531054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_528700_531100
785847	contig_7229_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_39828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAACTCCCAAAATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906903	908389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_906900_908400
785853	contig_4125_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_25096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGAATAAATATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644967	644343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_644300_645000
785857	contig_10861_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_39369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1719	2051	1641252	1640920	NA	20	GAGAACTGGCCGTGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLLPCTKHVRSSLVPRVMLCKTFVAWTLPAPQPRHSVPSPLLSASTHHLPFGPFLLVLPPHLHPPAPNTCSLFPFIGRVVKGRLPGFESQLCHFLQSSTVTSGKFLPS	1642970	1640323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1640300_1643000
785858	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785862	contig_10235_pilon	+	2082	8	Intergenic	novelGene_46587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	43.8885415755941	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	612	1409	567531	581650	FALSE	20	AGTTCCATTTCCTCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPLARGQCGRVFIVGGCIAPFPQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	566732	582323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566979_567165_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
785863	contig_12080_pilon	+	1961	12	Intergenic	novelGene_128409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	17.8144708566049	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	91	1683	484514	497042	FALSE	15	GAGACCCTGAGCCTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLPGLLGRAFHRLPGPGLRELNHRSTSPGGPQATSSNLLVPVPSLDSSGPHVPRPGTSKGTRTHGWKDAFQWMSARVSPNTLWDALSWGTLTVLALQLARQTHFQASLPGAPWRAEPCSWRSPLDHFLSSPLWHPHCSLRRHILPSPEGPAPRHTGLREHRLGQEGPSAQPRSLSSHSSTQPRSLPSHSSWRAAGVQDSSEEDASDIGFLHASSSSESKARLAQPQTTGEKQEQDKSKTLSLEEAATSVQQLFQLSVSIAFNFLGTENMRNGDYPTAFSYFQKAADCGYSKAQYNIGLCHEHGRGTPQDLSKAVLYYQLAASQGHSLAQYRYARCLLQDPASSGEPERQRAMSMLKQAADSGLKEAQAFLGVLFTKEPYLDEQRAVKYFCLAANNGDSQSRYHLGICYEKGLGVQRNLGEAVRCYQQSAALGNEPAQERLQTLFFMEAAALGPSNLAVTGLKSFSSPALCSLNTLLAGALRLPHAWSTGNLGLLCRSGHLRPNPRANSSAIPPHPHSLERSLVRLGFG	484423	497320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_484545_485620_485736_485829_485954_487377_487526_488472_488668_488922_489012_489110_489208_492136_492280_493300_493460_493553_493647_496096_496257_496803
785864	contig_5229_pilon	+	986	6	Intergenic	novelGene_117719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183.777474136522	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	311	688	662862	667261	FALSE	20	TCAGAGGTCAGGACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDKTLKICANHYITPLMELKPNAGSDRAWVWNTHADFADECPKPELLAIRFLNAENAQKFKTKFEECRKEIEEREKKGLGKNDNAEKVAEKLEALSVKEENEEATGTKVSEGEEAKEKTEEKQ	657927	667559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_658039_660570_660655_662746_662905_664881_665011_666201_666268_667121
785865	contig_5423_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_85225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGAGCAGAACTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481290	481850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_481300_481800
785866	contig_8461_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_163915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTTTGTGTGCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109864	110537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_109900_110500
785869	SIRV4	-	340	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	8	1173	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
785871	contig_10176_pilon	-	1213	7	Intergenic	novelGene_72699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	228.227530231468	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	337	1101	223226	214602	FALSE	25	CAGCTTTTTTACAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNELYPYIVEFEEETESPGLETHRKRKRSGDSDSIERDVAQEGEPGTGLDPRSSPTQCSVPAKKGEDASTKKESLGHWSQGLKISMQDPKMQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	224368	214489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223007_223311_223840_223874_224149
785875	contig_8611_pilon	+	1256	4	Intergenic	novelGene_166567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	4.89897948556636	238	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	341	823	140571	153318	FALSE	30	AATGTTTGTTAGTGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSPFALLLGFTQARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIESGFKMDQPFYATEEIYFIMQSCWAFDSRKRPSFLNLTSFLGCQLADAEEAMYQNMDGRILERPSIYQNRRPCSQEMNSGAPSPQAQAEDS	140230	153751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_140725_141980_142081_142798_142905_153195
785876	contig_9752_pilon	+	1896	16	Intergenic	novelGene_122038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_12	108.71176978087	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1128	768	1895	218730	241428	FALSE	40	ATCAGGGACCTCAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKIVGGHYLKVTLKPILDEICESSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKVFSTIIESSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTVRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEERYIRAVKKFLDEISSTETKESSGTSEPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHRQPGKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLRRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQEASENTLGCKPSTAGVPADIRIDIDEDRETERIYSLFTLSMLKLQKMEEACGTIAV	198751	241429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_199056_200022_200125_217236_217394_217658_217808_218674_218790_219180_219256_219969_220094_222352_222460_228053_228138_228558_228637_231174_231249_231733_231841_238813_238897_239543_239753_240550_240655_241405
785877	contig_12178_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_156550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTTGTGTTTTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552257	554731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_552300_554700
785882	contig_678_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_167814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTCATTTCACTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119460	118633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_118600_119500
785883	contig_8386_pilon	+	1257	3	Intergenic	novelGene_82220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAACGCTGTGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30980	35900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_31423_34573_34662_35173
785885	contig_13760_pilon	-	1860	7	Intergenic	novelGene_61330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	7.24952105697718	517	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	89	673	293766	287136	FALSE	35	TAAGTTATACAAGGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKLKTTKIVFVVGGPGSGKGTQCEKIVQKYGYTHLSTGDLLRAEVNSGSARGKMLSEIMEKGQLVPLETVLDMLRDAMVAKVDTSKGFLIDGYPREVQQGEEFERRIGQPTLLLYVDAGPETMTKRLLRRGETSGRVDDNEETIKKRLETYYKATEPVIAFYEKRGIVRKVNAEGSVDNVFSQVCTHLDAMK	297000	285948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_287205_287498_287691_290963_291081_291799_291964_292137_292174_293759_293799_296944
785888	contig_8004_pilon	-	2700	5	Intergenic	novelGene_174408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.82915619758885	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	133	558	149240	146217	FALSE	10	ATTCCATTTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSYFKTQPGAPLPGSLPGFPCLDPALWSSVFSAQLLAPAHLFPRMKPPPVLICLCLLVALASGNLVQFGVMIERMTGKPALQYNYGCHCGIGGSRGPVDQTDWCCHAHDCCYGRLEKLGCEPKLEKYLFSTSRHSIFCAGRTACQRLTCTCDKRAALCFRHNLDTYNHKYAHYSKKLCTGPTPPC	152229	144074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8004_pilon_-_146360_148101_148209_148393_148530_149200_149276_152132
785889	contig_17432_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_159012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGGTATGTTAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104862	106931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_104900_106900
785890	contig_7285_pilon	-	1317	6	Intergenic	novelGene_143419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.393716160293	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	271	594	370123	356156	FALSE	50	TTCAAATCATAATAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADEFVEKTLSSISTSTDAASVVHSTDLVVEAIIENLKVKTELFARLDKFAAEHTVFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPIMKLVEVIKTPMTSQKTFESLMDFSKTLGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERGDASKEDIDRWHEMDVQNPLFQPSPIMNKLVAENKLGKKTGEGFYKYK	377548	355432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_356275_357368_357396_362968_363042_366660_366751_370108_370236_377390
785893	SIRV4	-	318	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1205	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
785895	contig_6842_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_130823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAGGAAGGAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770128	1768545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1768500_1770100
785896	contig_6299_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_172945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGCTCTTTTTTCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959385	960577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_959400_960600
785898	contig_4686_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_118599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAATCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876313	874290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_874300_876300
785899	SIRV2	+	673	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-390	-1	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGAACACACTTCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3643	4456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
785901	contig_14322_pilon	-	585	5	Intergenic	novelGene_116510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_4	3504.9379452424	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	674728	671886	TRUE	10	AGTAGCGGCCGCCCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAPCRSSACTAAAATAARGSLSIAVVTWVQGLGGAPDVPHPPLKIPGGRGNSQRDHNLSANLFYSDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674729	671535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672416_672787_672928_674670
785906	contig_6842_pilon	+	1604	3	Intergenic	novelGene_130779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	208	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	991	1296	1375381	1377092	FALSE	25	AATGAGCATGGAGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPLLQGWARRGKRSCLYQKVTLAVVGPAVWESDASGERELGDRRLGEAEEEGISSLSQRWDGMLFCLKNQLSSPEGWPPAATPLGRPGPGQVWVAAGGL	1368952	1377400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1368988_1374425_1375643_1377048
785909	contig_12479_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_56841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTCTGGTCTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153667	154024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_153700_154000
785916	SIRV4	-	438	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1060	23	1060	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4098	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
785919	contig_5485_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_37734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGCCTCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340970	340210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_340200_341000
785920	contig_5690_pilon	-	1381	4	Intergenic	novelGene_119693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	7.11805216802087	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTTTTGGCATCTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766141	756364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_757580_758556_758618_765085_765147_766097
785921	contig_6418_pilon	-	892	8	Intergenic	novelGene_81104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	426.834193301601	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	43	456	106563	71817	TRUE	20	CAACTACTTTGTTCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSQLSAPGPASFEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKSSVSRTSPCILRIDSTTP	117990	68211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
785922	contig_12299_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_29728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTAATGTGATCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70067	72339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_70100_72300
785926	contig_14525_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_149768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGACTTCCGTCCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157735	157484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_157500_157700
785927	contig_6027_pilon	+	2863	17	Intergenic	novelGene_74433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_15	30.4833458629462	104	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	230	1525	246152	253329	FALSE	20	CCAGATACAGTCTTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKKKTLLVAVDRACPESGHPRILADAFPGSSHYEGYNYGSFENGSGSTDGLVDSTGTGDLSYSYQDPVGTRPRLDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLYALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTVFWIVFSVIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDSGIFRRILHVVYTDCIRQCSGPLYADRMVLLVMGNIINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIICTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF	243916	254667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_243970_244699_244772_244935_245008_246119_246227_246546_246621_246716_246784_247852_247927_248071_248196_248411_248530_249062_249200_249477_249587_249806_249884_250080_250128_250395_250502_251165_251277_253049_253164_253266
785929	contig_7775_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_37494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAGAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240172	238854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_238900_240200
785930	contig_10205_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_143101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGTGAACTATCTGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15241	13747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_13700_15200
785933	SIRV6	+	465	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	391	0	212	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
785935	contig_1982_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_151336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAAGTCTCAGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397293	396207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_396200_397300
785938	contig_19228_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_174415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCCCCTCAAACCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246172	245362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_245400_246200
785940	contig_8248_pilon	+	1430	3	Intergenic	novelGene_125011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_1	31.5	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	83	445	36029	42005	FALSE	25	TCCAGTTTTGAAAGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECDLMETDILESLEDLGYKGPLLDDGALSQAVSGGASSPEFTKLCSWLVSELRVLCKLEENVQATNSPNEAEEFQLEVSGLLGEMNCPYLSLTSGDVTKRLLVQKNCLLLLSKFMAIRI	35946	42990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_36082_39422_39572_41844
785942	contig_7730_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_156276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAACAATTGATAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219337	218486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_218500_219300
785943	contig_2716_pilon	+	2239	14	Intergenic	novelGene_173554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	21.9493769371478	35	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	44	1270	525885	540102	TRUE	35	TAAGATGATCTCATCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGKTVQCIATIALMIQRGVPGPFLVCGPLSTLPNWMAEFKRFTPEIPTMLYHGTQQERRKLVKNIYKLKGTLQIHPVVITSFEIAMRDRNALQHCYWKYLIVDEGHRIKNMKCRLIRELKRFNADNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNFLLPDVFDDLKSFESWFDITSLSETAEDIIAKEREQNVLHMLHQILTPFLLRRLKSDVALEVPPKREVVVYAPLSKKQEIFYTAIVNRTIANMFGSSEKETVELSPTGRPKRRTRKLINYSEIDDFPNELEKLISQMQPEVNQERAVVEVNIPLESEVNLKLQNIMMLLRKCCNHPYLIEYPIDPVTQEFKIDEELVTNSGKFLILDRMLPELKSRGHKVVLLFSQMTSMLDILMDYCHFRNFNFSRLDGSMSYSEREKNVCIASTQIQKCLSS	525841	545642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_525981_526591_526736_528980_529178_530897_530995_535752_535915_537171_537312_537394_537534_538822_538910_538984_539107_540059_540177_540533_540694_541767_541865_541946_542024_545081
785945	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
785946	contig_4422_pilon	+	2117	3	Intergenic	novelGene_155960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	811	1311	164012	164512	FALSE	35	AGTCCGGGTAATTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPLARSPTGGLSSTSLGYRSVNPWEQGRRGFIFAKPKLISQLEQGEEPWVPEGPRPSNLGLIPTFSAGDTPETPPPPKEGCEAGDLQGLFSPALPSGDEASGEPTDKVLYWRTSEGKELIPCAAADCPWPLPSPPDPPKPYQCPQCGKGFSHSSNFNRHRRTHSVEKRFQCPQCNQRLSWSSDLTRHLRTHSGERPFRCTLCGKGFGLSSDYARHQRTHTGERPFPCPQCTRSFSRSSDLATHQRVHTGERPFRCADCGRGFLRSSSLLMHQRVHTGERPYRCGDCGKCFRLGQDLVKHRRTHTGERPYKCTDCTKCFSHSANLITHRRVHTGEKPYKCPECGKSFSQSSHLIIHQRAHTGERPYSCSDCDKSFSSRSYLLKHRRVHTGEKPYGCDICGKSYSQKTNLITHQKLHGADRQLGVIPCELAEPRPGS	156429	165318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_156521_159817_159932_163406
785947	contig_14158_pilon	+	1652	4	Intergenic	novelGene_136119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	135.072819866421	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	53	376	18010	24159	TRUE	40	AATAAGGATATGCTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFLKILFKARCRKCHEVHKWDASG	17957	26290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21296_24090_24236_25090
785953	contig_6842_pilon	-	2567	6	Intergenic	novelGene_130730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_2	14.8647233408496	14	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	609	1160	532693	529297	TRUE	25	TTAAGGCTTCTACCCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDAQNALRRVIEKFTENTRFCLICNYLSKIIPALQSRCTRFRFGPLTPELMVPRLEHVVEEEKVDISEDGMKALVTLSSGDMRRALNILQSTNMAFGKVTEETVYTCTGHPLKSDIANILDWMLNQDFTTAYRNIMELKTLKGLALHDILTEIHLFVHRGNLHHPLVWKLWADGMLGVKGG	533301	526785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_527152_528255_529443_529978_530109_530509_530592_531310_531471_532659
785954	contig_10523_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_120961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATCACTCGCCGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76828	74539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_74500_76800
785959	SIRV7	-	329	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-2	-11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114740	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
785960	contig_10962_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_103874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCGTTATTAAATATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39063	40049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_39100_40000
785962	contig_7157_pilon	-	1272	8	Intergenic	novelGene_131309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	381.402192774322	256	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	5	742	1019968	985783	FALSE	65	GTTTAAAAAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAERRRHKKRIQEVGEPSKEEKAVAKYLRFNCPTKSTNMMGHRVDYFIASKAVDCLLDSKWAKAKKGEEALFTTRESVVDYCNRLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVDD	1019972	985252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_985791_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589_1004795_1010536_1010643_1011511_1011621_1019932
785968	contig_10948_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_124971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGAATTGACTCGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135184	134543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_134500_135200
785969	contig_6829_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_123768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGTATGACTAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30187	30751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_30200_30800
785970	contig_8182_pilon	-	616	5	Intergenic	novelGene_173258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9.86154146165801	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	107	562	280015	254720	FALSE	30	ATATTTATAGATGGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKKQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNQGQYLVPDGIVQSQVFEFAEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK	280121	254665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_254902_260075_260145_272886_272951_272992_273131_280012
785971	contig_8330_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_71714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32958	35431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_33000_35400
785972	contig_11898_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_144300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295050	296237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_295000_296200
785974	contig_12733_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_129607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGGCAATAATAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388386	389815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_388400_389800
785977	contig_2924_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_140277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTAAACCAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253918	253340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_253300_253900
785980	scaffold_13505_pilon	+	1225	4	Intergenic	novelGene_111555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	217.740416296307	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCCACTTCTCCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608562	613607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_610099_613391
785982	contig_9297_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_69848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTGAGGGATGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722423	720499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_720500_722400
785985	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
785995	contig_9239_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_137201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241264	242950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_241300_243000
785996	contig_11720_pilon	-	1385	10	Intergenic	novelGene_43907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	206.249100259916	5	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	89	829	124674	117437	FALSE	45	ATGTTTAGAAATTAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPSAPPPYEDRNPLYPGPPPSGGYGQPSVLPGGYPAYPAYPQPGYGHPSGYPQPMPPIHPMPTNYGDGYGGEERAVSDNFGPGDWDDRKVRHTFIRKVYTIISIQLLITVGIIAIFTFGTSWQVREEKCGCLLCILCCLPGYLPDSCVLPGTQTPFPMEHHLADPLSSDLSQLLPSMHSTKAVIIAMIITAVVSISVTIFCFQTKVDFTSCTGLFCVLGIVLMVTGIVTAIVLSFKYHLSRAPS	134606	116880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_117461_119758_119855_120209_120326_120779_120820_121337_121389_121875_121930_122147_122211_123024_123120_124472_124711_134554
785998	contig_4797_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_6947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAAATAGGTTTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656688	657327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656700_657300
786000	contig_15360_pilon	-	995	7	Intergenic	novelGene_171260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	10.816653826392	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	14	865	516512	163688	FALSE	30	TTGACTAGGATTTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQVMLAASYWSLLAPAVEMAMSSGGFGAFAFFPVAVGFTLGAAFVYLADLLMPHLGAAEDPQTALALNLDPQLVKKKSDPEGPALLFPASELSIRIDKSENGEAYQRRRVTGLPGDPVPPVPSRGNPVQPEGGSWRRIALLILAITIHNVPEGLAVGVGFGAIEKTASATFESARNLAIGIGIQNFPEGLAVSLPLRGAGLSTWRAFWYGQLSGMVEPLAGIFGAFAVVLAEPILPYALAFAAGAMVYVVMDDIIPEAQTSGNGKLASWASILGFVVMMSLDVGLG	516525	163557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_163767_165146_165306_168912_169012_237670_237741_317316_317482_437178_437303_516356
786003	contig_14219_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_54342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAAAATGCTCGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813587	813156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_813200_813600
786004	contig_8045_pilon	+	2521	1	Intergenic	novelGene_35433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	27	347	397773	398093	NA	65	TAACAGACATAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDLNFIPCTKTNPKWITNLNVKCYTINLLEKNIKENLQDLGLGKEILDLTTKTRLIEGKTDKLNHVRIKNFCSINVILQIMLGGKGHRLQTEGEYLQSISPMKD	397746	400267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_397700_400300
786005	contig_10734_pilon	+	1036	3	Intergenic	novelGene_51043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	235	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	54	461	397040	409518	TRUE	20	CTTTCTGGAACTGCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPPLREEEEEGDGDEVGPEGALDKSPSQLTAEDVYDISYVMGRELMALGSDPRVTQLQFKIVRVLEMLEALVNEGSLEAEELRMERDSLRKELQALRREGPSAGGEWPDSTKRRPRKKKRKRCLGCQDQQCQL	396986	413713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_397364_409434_409546_413165
786006	contig_2799_pilon	+	1892	3	Intergenic	novelGene_85572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1854	junction_2	24.5	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1286	1666	761515	762419	FALSE	70	TTTTAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKGKAYFV	760116	762645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_761396_761508_761627_762150
786007	contig_3817_pilon	+	1191	2	Intergenic	novelGene_78332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1083	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201773	205462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_201852_204349
786008	contig_6164_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_121265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCAGTCAACAAAGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308068	306784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_306800_308100
786014	contig_8587_pilon	+	1891	11	Intergenic	novelGene_159134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_10	54.980087304405	116	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	276	1511	427907	436771	FALSE	35	GAACACAGTTCTTAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFVSRSFENNWKIYKLLSHQKISKEKTNFCLAILNVGAPAAGMNAAVRSAVRSGISQGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHHVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKSYMEKIVENIRTYNIQALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGHYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFSLGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDPFNIHDLKVNVEHMTEKMKTEIQRGLVLRNEKCHEHYTTDFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVLGHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKALLWMSEKLRAVYRNGRVFANTTDSACVIGLKKKAVAFSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLNLRLMLKMLAHYRISMADYVSGELEHVTRRTLSIDKGF	427631	437151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_427991_429753_429901_430803_430875_431831_431920_432896_433050_433855_434021_434554_434617_434891_435004_435678_435779_435861_435968_436623
786018	contig_8386_pilon	+	2193	2	Intergenic	novelGene_82242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAGAACGTCATACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88470	93162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_90194_92692
786020	contig_2414_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_158469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	446	850	203236	202832	NA	30	TTGTACATGATCATGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRSGVCFQGGWWQASRDGRRQTGAQKQRRSCIKKELLGELWTCGAACRTVRIFSLHLVILPEIVPIRPLSGLCVPFRQVKYLKVKDCNWELVVQWLRARLLTKGWQFQSTSGSLETLWGSCTLSYRVAMSPN	203681	201108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_201100_203700
786022	contig_12638_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_33331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCAAAAACTACTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328177	1327310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1327300_1328200
786023	contig_4891_pilon	+	1154	7	Intergenic	novelGene_124558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	606.595325475633	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	124	732	701017	754769	TRUE	40	AGAACAGAACGCATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFG	700893	756918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754803_755965_756027_756590
786026	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	20	1154	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
786027	contig_3270_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_104521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTTAATATGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457219	458352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_457200_458400
786028	contig_3270_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_104522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAACTAAAGGCTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460323	461063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_460300_461100
786033	contig_11378_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_112283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1868	2173	498359	498054	NA	50	AATCCCCACATAACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWLTAASSSTLTGNNLGACVKLNGIPKVKRVLTHCESLRAFEKRGCLLLMPPPRSIKVISGGGAAIGVCYLIHQGILMCGQGGEPLGPQRFRTWASELD	500226	498044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_498000_500200
786034	contig_10937_pilon	-	2161	8	Intergenic	novelGene_67310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	115.564453259395	123	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1260	1766	74961	72144	FALSE	30	AAATCTGTTGTTGCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSPHLKTASESELSTTATELLQDYMLTLRTKLSSQEIQQFATLLHEYRNGASIHEFCINLRQLYGDSRKFLLLGLRPFIPEKDSQHFENFLETIGVKDGRGIITDSFGRYRRAASTASSSTTNGNRAAGSSDDQSLPSEGDEWDRMISDISNDIEALGCSMDQDSA	125182	71748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_72425_73617_73757_74874_75600_78367_78504_79639_79777_81960_82145_82616_82701_125102
786035	contig_14341_pilon	-	602	5	Intergenic	novelGene_111858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAAGAGCTTGATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551788	548820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_548860_549934_550151_550356_550483_551479_551579_551666
786037	contig_730_pilon	+	1133	5	Intergenic	novelGene_155611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	7.17635004720366	260	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	174	866	172977	175048	FALSE	35	TTAACACTGAGAGATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTNVSPLHPYWPRHLRLDNFVPNDRPTWHLLAGLFSVSGVLVMTTWLLSGRAAVVPLGNWRRLSLCWFAVCSFIHLVIEGWFSLYHEDLLGDQAFLSQLWKEYAKGDSRYILGDNFTVCMETITAWMWGPLSLWVVIAFLRQQPFRFVLQLVVSVGQIYGDVLYFLTEHRDGFQHGELGHPLYFWFYFVFMNALWLVLPGVLVLDSVKHLTYAQSTLDAKTSKVKSKQN	170900	175315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_+_171012_172914_173278_173927_173965_174092_174224_174824
786038	contig_12158_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_104847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68750	66708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_66700_68800
786040	contig_12694_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_171979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGAGGTGAAAGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214081	213231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_213200_214100
786041	contig_12694_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_171978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATATTGCTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213036	212637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_212600_213000
786043	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1205	8	1205	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3953	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786046	contig_14472_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_111164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTAGTTTTGGTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169045	170769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_169000_170800
786048	contig_6477_pilon	+	2063	6	Intergenic	novelGene_154162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	31.6	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	453	1883	754555	767211	FALSE	15	CATGTGGGAGGTGTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDWKTVSKESPPEQDISEESFQDPSVEIPPGESDHRNSEFGKSFNLRLVLSPQPRVPTEVRPRKCEIHPKSFKKNSDIIKPHRAKPYTCNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYKCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCNECGKAFSYCAAFFQHQRIHTGEKPYKCKTCGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGMKPYKCIECGKAFRCSSAFIRHQRLHIGE	748199	767391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_749798_749923_754498_754588_757413_757541_758317_758414_766036
786049	contig_14744_pilon	+	784	6	Intergenic	novelGene_66052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5164.71070244985	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	20	367	1382976	1385116	TRUE	50	AATTAAATAAGTGATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMTLGI	1382037	1386670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1382057_1382975_1383210_1383302_1383402_1385101_1385233_1385820_1385951_1386499
786050	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
786052	contig_6710_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_95070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786053	contig_15219_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_40855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAAGCCTGTACGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70823	72237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_70800_72200
786055	SIRV6	+	143	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	802	51	802	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11039	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
786056	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786061	contig_11493_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_143649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84375	82182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_82200_84400
786062	contig_15423_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_171591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTTTGGAGACAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317870	319755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_317900_319800
786063	contig_7945_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_161611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCCCATACTCAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488590	488918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_488600_488900
786064	contig_7894_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_170781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCTGCTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191998	191336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_191300_192000
786065	contig_7912_pilon	-	2300	4	Intergenic	novelGene_129566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.8962065205765	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	175	489	79123	74525	TRUE	25	GTTATTTAATCCTAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALRDLAEGCVNFEDVAIDFSQEEWGLLDETQKLFYCDVKLENFAVISSLACWHGVEEEKASSEQSVSLEGVLQVRTPQEVHPPRRLTPGDMCPCLERYCD	79297	72668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_73013_73057_74680_76009_76137_79090
786066	contig_6163_pilon	+	1725	4	Intergenic	novelGene_103828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	63.2789239970326	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1314	410	1723	324226	327975	FALSE	25	AGCACCTGCTCCAGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASSLSSTDSLTPDDRPIARGCSDSLESIPAGQAASDDLRDVPGAVGGASPEHAEPEVQVVPGSGQIIFLPFTCIGYTATNQDFIQRLSTLIRQAIERQLPAWIEAANQREEGQGERGEEEDEEEQDTIENRYFEMGPPDVEEEEEGSRGEEDEEEEEEEEGEEERLALEWALGADEDFLLEHIRILKVLWCFLIHVQGSIRQFAACLVLTDFGIAVFEIPHQESRGSSQHILSALRFVFCFPHGDLTEFGFLMPELCLVLKVRHSENTLFIISDAANLHEFHADLRSCFAPQHMAMLCSPVLYGSHTSLQEFLRQLLTFYKVAGGCQERSQGCFPVYLVYSDKRMVQTAAGDYSGNIEWASCTLCSAVRRSCCAPSEAVKSAAIPYWLLLTPQHLNVIKADFNPMPNRGTHNCRNRNSFKLSRVPLSTVLLDPTRSCTQPRGAFADGHVLELLVGYRFVTAIFVLPHEKFHFLRIYNQLRASLQDLKTVVIAKTPTTVGGSQGPVGDGQPAEGRASNDQRPQEAPIEPPLLAPAPVEVPALASAEAEAPGPVKTPAEAPVPAPAEAPGPVKT	321242	327977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_321346_323091_323142_323969_325371_327806
786067	contig_6163_pilon	+	1879	6	Intergenic	novelGene_103830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.8411971345886	65	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	258	1289	328534	330957	FALSE	10	GTCTGGGTCTTTGAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSSVVFYQTPGLEVTACVLLSTKAVYFVLHDGLRRYFSEPLQDFWHQKNTDYNNSPFHISQCFVLKLGDLQSVNIGLFDQYFRLTGSSPVQVVTCLTRDSYLTHCFLQHLMAVLSSLERTPSPEPVDKDFYSEFGDKSTGKMENYELIHSSRVKFTYPSEEEIGDLTFIVAQKIAAAEQAPALSILLYVQAFQVGTPPSGRSRGMLRPKTLLLTSAEIFLLDEDYVHYPLPEFAKEPPQRDRYRLDDGRRIRDLDRVLMGYQPYPQALTLVFDDVQGHDLMGNVTLDHFGEVPGGLAKAGQGHEVQWQVFVPSAESREKLVSLLARQWEALCGRELPVELTG	327977	331547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_328131_328180_328258_328506_328664_329129_329259_329800_329963_330346
786068	contig_5880_pilon	-	1650	10	Intergenic	novelGene_151123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_9	46.7546789102438	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1512	138	1649	224452	161199	FALSE	15	GCGGGACTGGGAGTGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVTVKTHAYPDQKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIISTVEPALRQEATLVVGGDGRFYMKEAIQLIGRIAAANGIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISSGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYVICPDLKIDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVETYGTMLRNIFDFNALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMKTGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVANATKISLYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDMEALMFDRSFVGKQFSAGDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRNQGLRLIFTDGSRIIFRL	224589	161197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_161247_164537_164722_167818_167955_177259_177376_180301_180457_181729_181921_184511_184638_186266_186414_187133_187297_224206
786073	contig_11328_pilon	+	516	4	Intergenic	novelGene_88399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1989.06968762339	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	38	514	643683	645356	FALSE	40	GCCCCTGAACAAAGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVR	643645	645358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228
786074	contig_10003_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_88239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667382	669549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_667400_669500
786075	contig_19579_pilon	-	1118	5	Intergenic	novelGene_59404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	585.614847830893	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	106	750	13090	8566	TRUE	35	CTGGAACCCATTAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKR	13195	7780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8080_8496_8613_8704_8825_12012_12301_12900
786077	SIRV6	+	351	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	260	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
786082	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_97494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	GGAAAAAGAATAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786083	contig_16185_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_144767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGCAAAAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176710	178848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_176700_178800
786084	SIRV6	+	350	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	522	-1	-31	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTGTTCAACAAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
786085	SIRV4	+	338	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	644	966	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTAACCGTCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
786086	contig_6710_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_95984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653644	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
786089	contig_12629_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_150649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGAAGAATAGAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81880	84355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_+_81900_84400
786091	contig_4857_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_48902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCCTTCTTTTAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481141	1482445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1481100_1482400
786092	contig_8357_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_39782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCTCAAATTGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919604	917160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_917200_919600
786096	contig_8447_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_69413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAATTACTCTTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61175	60827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_60800_61200
786098	contig_13697_pilon	-	2341	17	Intergenic	novelGene_165936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_5	36.4378216109306	154	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	51	1517	356364	319196	TRUE	20	CCCACGCTCGGGGAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGSQAASILQPCHTQMQVHTRPPTVGVHCHAGQMLAGQVVVFLSLTWTTHQSLAIPRITECGLSCSQGFACKSRTNWNIFNSFCRAPPMSMSRSVLESLELSTGMKCDPREGCALHLRVHASLMLLEGLRGLEICTMNLDTQAAQCQAVRVPRASRPLHVGQQLQVVFDCFEVSVAQHLYVTLRTIPNFCGVQLDQQYHVEDCKDEDVAKNMPDCSAEKLTYQVNRSRKAILVQVPEALGSPDYYVRLCLRWLVCEDAGPTVTVSPNGLSRTVSLPYSQELPCLCLEGWSSTPDAVRIQTCPFEDDTEALWDAIHYHPGSQALTWVPICPVSGRVSLCWLQEPGTPCSELEHSGRPAHSRVQYPLVDTQPQLCLKFSTHGGFWVRCPFAQRRFPAWRMTVQPAPSQGFLRATFFSPSPARFQVRLCPQWKPLRPTCHRALETTSLPAALGDPSAEPAAAFVDIPREEACAPGICIQGWRTDMHFSVPQQLCHVQCAVTHETAA	356414	318082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_318885_319173_319222_319719_319778_319979_320061_320278_320443_321193_321252_321615_321661_321724_321889_322150_322206_322279_322352_322437_322578_322777_322823_323347_323463_323772_323883_324116_324267_343485_343514_356208
786099	contig_1861_pilon	-	1557	14	Intergenic	novelGene_77668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	129.657628359137	1	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1413	144	1556	112534	94315	FALSE	10	AGGTACCTGTCTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLRHKSKKPGKGSKGCTKPAKQNGKKAACRVSSVPQLVHSNDHANREAELKQKRVEEMREKQQAAREQERHRRRTIESYCQDVLRRQGEFEEVLQELNMFPQLDDEATRKAYYKEFRKVVDYSDVILEVLDARDPLGCRCFQMEEAVLRAEGNKKLVLVLNKIDLVPKEVVEKWLDYLRNELPTVAFKASTQHQIKNLNRCSVPVKQASESLLKSKACFGAENLMKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVY	115224	94313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99937_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104770_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115128
786101	contig_8065_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_107320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCACATACATGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112072	111063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_111100_112100
786102	contig_6870_pilon	+	2296	6	Intergenic	novelGene_103939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_4	72.1454087243256	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	101	1189	1178538	1186770	TRUE	30	CTATCCCAGCACCTGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKRQELQPSWAGSGLWAPGPEAYGVRRSREGSCMTLAFKTLFPQSLRVLSRKELCVFRERHHQPDIRQFSQCSETDLIHGCGLLLRKKPVLSFQRGSLRPRATCLVFSPGSHVGLCSGSSEMAEQRFCVDYAKRGTAGCKKCKEKIVKGVCRIGKVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQYIADLSSKAASTPKKKAFVQAKLTATGQVTSPAKGASVTNTNRRKFSGFSAKPNNFGEAPSSPNLKTSLSSSKCDPKHKDCLLREFRKLCAMVAENPSYNTKTQIIQDFLQKGSAGDGFHGDVYLTVKLLLPGVIKSVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQVRGRQGWAAFQVGFC	1175960	1188003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1176057_1178533_1179088_1182795_1182937_1185741_1185940_1186570_1187577_1187702
786104	contig_15538_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_152640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGCGTCTCACTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71244	71917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_+_71200_71900
786106	contig_6742_pilon	+	1735	6	Intergenic	novelGene_144556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.9513440212762	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	63	938	26826	47227	FALSE	15	GTCACTCCATCTCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWRLWQWISIQVLGQEISEKMESPGCQVREAESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEQWRHLDSTQKEYYWDLMLEAYGKMVSGEHGQELARLHLDAGENIPMPTCTGDRQENDKEKVNLEHYRDQEPPNVSCDISGEAPSQAPVSGFFTGDEPRHFGEVAQGNLQVEGRGEQHSPQERSSGKQPGQHVLNPHPGDLSVLWLKEKPEAPPERSAETSHDPEAPYLHRVWENLLQEFSACVSPENSHWREVFSVPHLQKKPFCGVQTL	26090	48024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_26114_26786_26974_27402_27495_41061_41147_41839_41909_46745
786107	contig_4845_pilon	+	2300	3	Intergenic	novelGene_53613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1387	1701	198160	201037	FALSE	50	TCAAGAAAGAATCCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQWAKWLATRGKVVLGLGLKSRAHCTLRLEASVPLVTDIWSSLNSAHRHKCLAMGLVTVPPPAGCPLARLLLGDRLFFQWPPLQSRLQGLPDTPDPQVLLFGE	196773	201636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_198279_199547_199607_200900
786113	contig_4783_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_108411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGTTAATAAGGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384261	384539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_384300_384500
786117	contig_854_pilon	-	642	4	Intergenic	novelGene_36103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1871.80144958451	9020	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	68	391	94569	91808	TRUE	15	GAACGAGCCTCGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVGWGLGPRGWALGGLRWTWA	94636	91378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91753_92043_93127_93208_94560
786118	contig_4232_pilon	+	2021	8	Intergenic	novelGene_63481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGCCCACAGAGCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607749	620522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_607968_611644_611787_611936_612075_613618_613697_613872_614983_615283_615391_615782_615945_620456
786121	contig_4531_pilon	-	2388	11	Intergenic	novelGene_47926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1790	2200	610877	608218	FALSE	15	CGAATTCACGGGTTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNKVSKVRVFTPPKYPQLSSSRSLISPPNTKYICLKASTKTAQNGVFLSHRKQNRGRSWALPYISFPFNSRQVSLAEKVTVTVFQAGPVRHEGGTHRPSQQPPPAPQPTIRHYRRLRPEKPGEKPRPPARQRRCP	660740	608029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_608268_608650_608784_610649_610886_620964_621134_635637_635784_636985_637185_638568_638762_639314_639481_639684_639800_648123_648804_660627
786122	contig_7963_pilon	-	979	6	Intergenic	novelGene_58321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1540.8	5	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48903	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39276_39399_39945_40074_40172_40232_43546_43819_48741
786123	contig_9463_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_83846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219272	219506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_219300_219500
786124	contig_6589_pilon	+	1982	16	Intergenic	novelGene_25737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	62.6067089056756	1	96	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1006	1623	479648	507033	TRUE	30	AGGAGTCTACCATCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTRSTSYQRGPCSRWPAGWYLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457290	509764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_472623_472734_474991_475059_478001_478081_479600_479711_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509416
786126	contig_6735_pilon	-	1254	7	Intergenic	novelGene_15790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	821.199935054389	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	322	792	551194	542464	FALSE	20	GACTATGGTTCACCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRKTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	564232	542001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543260_551180_551231_552840_552952_554274_554374_564157
786127	contig_14341_pilon	+	1170	5	Intergenic	novelGene_111880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_1	153.74085338647	536	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	55	786	724577	725653	FALSE	10	CCTTGGACTTCGCTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQPGTAPPGAPGAPPLPGMAIVKEEETEAAIGAPPAAAEGPETKPVLMALAEGSGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGASAPSGGPGALDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLNLDESDTTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEVSPVDGGGIGLVEGA	724522	726037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_724592_724679_725000_725083_725208_725290_725378_725467
786129	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786130	contig_10002_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_157661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTCCTCAGCTAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428030	427163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_427200_428000
786134	contig_11525_pilon	+	2099	8	Intergenic	novelGene_171091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	4.65547735337152	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	74	1408	134922	152146	FALSE	10	TCCTATGTTTATGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLRLRVVSPRPAGGNTSPAADPAMPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRRSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGQQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFNQKELAGKIREGKFRRIPYRYSEELNNIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVAEEQRKNPQRRGRRLAESGKLQDSSPVTSELKLKELQLQERERALRAREERLEQKEREICIRERLAEDKLARAESLLKNYSLLKEQKLLSLASNPDLDLPSSMIKKKVHFSGESKENVMRSENSENLLTSKSKCRDLKKRLHAAQLRAQALSDIEKNYHLKSRQILGMR	134848	152837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_135018_135864_136083_136383_136625_138524_138608_139337_139465_144431_144652_149077_149204_151922
786137	SIRV4	+	448	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGCCGATTGGAACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	4085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4100
786141	contig_8420_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_69347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGTGAAAAGACAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12148	12615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_12100_12600
786142	contig_9995_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_47760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674244	676158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_674200_676200
786143	contig_8200_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_169830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445919	446946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8200_pilon_+_445900_446900
786150	contig_10765_pilon	+	1514	6	Intergenic	novelGene_122900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	71.6893297499705	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	38	754	99687	117362	TRUE	15	CAGGTTTGTCTTTGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGAPAAGPLPPMEDSFLESFGRLSLQQRQQPRPPPPRGTPPRRHSFRKHLYLLRGLPGSGKTTLARQLQLDFPRAVIFSTDDFFSQEDGTYEFNPDFLEEAHKWNQKRARKAMRNGVSPVIIDNTNLQAWEMKPYALMALENNYEVLFREPATRWKFNVPELARRNIHGVPREKIHRMKEQYEHGVTFHSVLHAEKPSWATGSQDRNTAAPSEGAGDWRACAEFPSRRAPGGFASDSFFSRRGGCHRGY	99649	118760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_99851_112536_112665_112950_113040_115931_116009_117103_117964_118601
786151	contig_8673_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_129937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGATTGATACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401622	399561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_399600_401600
786152	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
786158	contig_776_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_139926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAACTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828275	826852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_826900_828300
786160	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	127	0	-60	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	46	366	2458	10736	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2412	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
786161	contig_6138_pilon	+	1470	3	Intergenic	novelGene_159685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTATTTATGAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568748	576023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_569598_575309_575528_575620
786162	contig_1719_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_87291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACCAAAAGGTCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375793	378244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_375800_378200
786166	contig_11227_pilon	-	2287	4	Intergenic	novelGene_163209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	2.49443825784929	36	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	471	932	448340	438653	FALSE	40	TGACTAAGTTATACTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGLGFAIAAALVAKDRHPGQRVICVEGDSAFGFSGMEVETICRYNLPIILLVVNNNGIYQGVDASSWKEMLNFREAAAMAPPFCLLPNSHYEQVMTAFGGNGYFVQTPEELRKSLRQSLADTAKPSLINIMIEPQAMRKAQDFHWLTRSNM	448810	437297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_438686_442909_443097_446712_446821_448206
786167	contig_16322_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_87571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208738	207890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_207900_208700
786169	contig_2550_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_135689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGGCCATAAAATAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612125	1613349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1612100_1613300
786170	contig_2550_pilon	+	890	2	Intergenic	novelGene_135690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	108	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614425	1619174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1614655_1618513
786171	contig_6477_pilon	+	2094	6	Intergenic	novelGene_154154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	22.6927301134086	214	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	540	1931	757420	767211	FALSE	25	CATTTTGTTACATGGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDWKTVSKESPPEQDISEESFQDPSVEIPPGESDHRNSEFGKSFNLRLVLSPQPRVPTEVRPRKCEIHPKSFKKNSDIIKPHRAKPYTCNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYKCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCNECGKAFSYCAAFFQHQRIHTGEKPYKCKTCGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGMKPYKCIECGKAFRCSSAFIRHQRLHIGE	748084	767374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_754498_754588_754693_754751_757413_757541_758317_758414_766036
786172	contig_2596_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_53502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATTTGAGCAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015690	1017021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1015700_1017000
786174	contig_6533_pilon	+	1453	10	Intergenic	novelGene_114653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	124.841924740207	101	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	148	735	215442	231149	TRUE	10	TTCCTGTGTCTGTATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDDLQFEEFGDAASSLVANSDDTTISIEDPGETPKHQPGPPRGSGREEDDELLGNDDSDKTELLAGQKKSSPFWTFEYYQTFFDVDTYQIFDRIKGSLLPIPGKNFVRLYIRSNPDLYGPFWICATLVFAIAISGNLSNFLIHLGEKTYHYVPEFRKDTVDYPPESCSLDSSHDCSGHLRICLGNDFLASCS	214574	246787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_214602_214928_215001_215393_215473_220467_220632_224459_224541_224786_224875_227139_227257_231042_231226_236038_236134_246240
786180	contig_5758_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_119119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACCAATGGAAAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414898	414546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_414500_414900
786183	contig_9177_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_32782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACTATAGGAGACTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411161	1411613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1411200_1411600
786186	contig_15304_pilon	-	464	2	Intergenic	novelGene_30503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	395	424	52954	52925	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53520	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
786188	contig_15498_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_42710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATTTCTTTTAATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969625	969902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_969600_969900
786189	contig_19311_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_144082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142452	144878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_142500_144900
786192	contig_1339_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_163116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	6	305	282377	282676	NA	75	TAAAAAAAAAAAACAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMTMHRATQPLMGSNRVDKPKLHPNNKLELLHLGSINILGCVILCPPPPFYQFVVLRWPACCYDAGSYATGISNTNSVTHVFSGTSRLRQTRKKSLVIYL	282371	283409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_282400_283400
786193	contig_4180_pilon	+	2213	11	Intergenic	novelGene_8300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	175.743250226004	1	117	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	188	1495	733322	821915	FALSE	10	GAATCTGGTTTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733037	822633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733157_733253_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821671
786200	contig_4364_pilon	+	1276	8	Intergenic	novelGene_176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	932.253775557287	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	103	717	1268714	1270037	TRUE	25	CCAAAGGAGCCAGTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1267003	1271068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1270045_1270150_1270582_1270947
786201	contig_11130_pilon	-	812	6	Intergenic	novelGene_53100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	879.764741280304	2177	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTGTTGTTTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	55709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_60430_60488_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
786202	SIRV6	+	223	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	272	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCAATGCCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780
786206	contig_9297_pilon	+	1379	6	Intergenic	novelGene_69899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	572	junction_5	101.574800024415	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	158	841	964967	970821	FALSE	0	GGGCTGCCCTCCTTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRTTTPYFL	955847	971359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_955942_964903_964970_966037_966180_968984_969065_969260_969471_970572
786210	contig_7004_pilon	-	1305	7	Intergenic	novelGene_126505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	50.5351912587214	202	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3	332	434652	433953	TRUE	35	CAATAAAGCATTCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKDPRSRWTCNRTHSLQIFCHSSVTRARASSAQTMWPTPSISVDLLTKRIYRCQCAHSVMCLCLWPEGNPLTVLWGSTLTETVALIPHSKKGRSSPISVNALAADSGK	434654	432163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432659_432779_432853_433184_433253_433335_433570_433849_434002_434135_434268_434503
786216	contig_13244_pilon	-	2302	5	Intergenic	novelGene_86902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	69.7495519698872	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	72	497	187238	36535	FALSE	20	CTAATGGTGTTGATGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRKPGRRRASSEIVTEGKRRKSSSSDLREFRITKMLNAKPEDIHVQSSLSKLRSSERWNLPLQELKRSLRNKVISLDHKSKKGVCGHPVTSKASSERGSQSSKTTVNNKSAKQAAHTKEKQRDDDGISLVMSDTQPKGL	187309	34729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_36665_134656_134755_152886_152992_175957_176011_187198
786218	contig_11338_pilon	-	2090	7	Intergenic	novelGene_6304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_6	122.587043904865	132	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	127	879	250534	223100	FALSE	25	GAGGGGACCTCACCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGTCSDCTSFVQSSIIM	250660	221888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_250509
786221	contig_9435_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_156968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGAAACTATTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486015	486413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_486000_486400
786225	contig_5018_pilon	-	877	2	Intergenic	novelGene_47000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1023	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	140	304	1215079	1214021	FALSE	0	TCTGCTGCCTGTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVLAVSQRKLACGERRERARWPEYSSCQTCPTREPPLLLPPRPRAVMEVQKEAQRIMTLSVWKMYHSRMQRGGLRLHRSLQLSLVMRSARELYLSAKVFQ	1215218	1213447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1214033_1214926
786227	contig_9696_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_68834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2	436	577941	578375	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSLGGRFGGSRRSSSWWKLGVAVLCTGTLVYIGREVDCGVAPVCLLLGFPGFSSSAWGLAKESRALWATVLVPDFAVSACFFPAPGYGGSARGRPISAYGARDSRGSRLPWPRAVVTETEILWPFFISCLLSELLLKDAQCPF	577939	579253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_577900_579300
786229	SIRV6	+	354	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	26	403	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
786232	contig_20314_pilon	+	823	6	Intergenic	novelGene_125647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	591	junction_4	151.399603698292	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	18	755	9165	24277	FALSE	5	GCCCCAGTGCCCTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	9147	24345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
786233	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
786236	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	10	1161	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786237	contig_10159_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_30829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAAAATGTCTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531254	533531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_531300_533500
786238	contig_13014_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_169362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAACAAAAAGTTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441323	443397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_441300_443400
786239	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1147	8	1147	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4011	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786240	contig_6589_pilon	-	849	6	Intergenic	novelGene_25767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3060	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	201	311	672646	671363	TRUE	25	TGCTCCTCTCAATATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRWFYFLEDSRGRGLRGAAEGPGAGNAGCSLPLPQVDVDDAAGQGKGEGHPGQGKAVAEAAPRRVMLQDLLGVDGIDQGSSEYCHACQVPCDSGAHASTTN	672846	668287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_668404_669649_669746_669995_670103_671045_671187_671284_671412_672584
786245	contig_14326_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_120664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAAGGTTGGTGGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56583	58180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_56600_58200
786246	contig_21190_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_174418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAATGAAAAACATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17687	19830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21190_pilon_+_17700_19800
786247	SIRV6	+	531	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	23	7	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
786248	contig_14501_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_172031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTTATACAATAATCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261848	263081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_261800_263100
786249	contig_13760_pilon	+	1921	19	Intergenic	novelGene_61270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	34.8042143042094	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	126	1910	25333	111755	FALSE	25	GCCCCAGCAAACAGTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVEDINKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDAPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQGTVDKLCRVEQDVAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVTTYDKIRIILLYIFLKNGITEENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS	25207	111766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_25370_69312_69363_75791_75874_78978_79056_80725_80805_82071_82176_83954_84104_86045_86131_86959_87091_89218_89327_90403_90465_91831_91898_92636_92718_94694_94834_95707_95818_98579_98682_100475_100562_103896_104052_111672
786250	contig_10058_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_67673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAGAAAAGGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32446	34722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_32400_34700
786254	contig_17470_pilon	+	1513	11	Intergenic	novelGene_110537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	727	1104	271345	273587	TRUE	35	TGAGTGACAAGCAGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRVLVHSPQVLHELIWAQDPAHLPASGAKGLAGAANGQGAFPHSREAGNADVLVPVEDQPLVNLITDAHHVMLLAQAGHQLQFCLGEDLSQRVAGCVEDQGFGARCELVGQLCGVQLPVAAVI	269782	275957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_270152_270243_270314_270856_270939_271026_271219_271331_271414_271528_271609_272834_272958_273481_273609_273860_273952_274030_274178_275807
786256	contig_13004_pilon	+	2255	1	Intergenic	novelGene_112724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATTCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912666	914921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_912700_914900
786258	SIRV5	+	322	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	8	875	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
786261	contig_8992_pilon	-	1347	4	Intergenic	novelGene_174423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGGCGGCGGCGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97596	73883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_73999_74485_74544_90496_90642_96567
786263	contig_4486_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_38646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	281.066824794389	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATGCAACAGCTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014874	1037798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014951_1016053_1016124_1016547_1016629_1026830_1026879_1027876_1028010_1037297
786265	contig_6441_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_172889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATATTGTTTGATAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304527	306130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_304500_306100
786268	contig_9415_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_109855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTCTGAATTTAGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989844	1987954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1988000_1989800
786269	contig_9415_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_109854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGGACTTAAATACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1988003	1987293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1987300_1988000
786273	contig_12786_pilon	-	1153	7	Intergenic	novelGene_103417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	686.962638479464	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	451	1095	602829	590909	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIYISRRDADRPALSPFSPARSASRPRAAISSAPGSLSPASLREYGEAGLRGPRARCCRSGLTCQPRTAHSVPGCGSDQVEAVRKEDRAGAVQLQGRAVLCHWKECGEPCGTCLAPTEEQERIGNVSDSLGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629494	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602893_628714_628911_629303
786274	contig_6227_pilon	-	1151	7	Intergenic	novelGene_49709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_6	3.3870669054836	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	9	1103	1199215	1170696	FALSE	10	TTTGGTATTTTTACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFRKPVLLGLRDTAVHGCPTGPDAWTTSKLGGVPDALPAVATPRPVCGRCGQLLALAVQVYCPLEGSPFHRLLHVFACARPNCDSGGSWKVFRSQCLQIREKEAPDAQKQEDSLAAQDWCEGADDWGSDSEEVPPPRVTLDFGNDANSAKHIDWSAQLQDLSLQDAVLDAAHPTPPGEELSLPEVPQFLPYYISVVDEDDYRDFVNLDHAHGLLREYQQREGIDMERLLSQSLSSDGGDEKYEKTIIKSGDKMFYKFMKRIAACQEQILRYSWDGEPLFLSCLAPEVIELPACSHCGGRRIFEFQLMPALVSMLRSADLGLSVEFGTILIYTCEKSCWPQNHHTPVEEFCIVQEDPDELFFK	1199223	1170647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1170827_1175946_1176096_1194730_1194845_1197132_1197504_1198645_1198707_1198855_1199017_1199107
786276	contig_9594_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_73954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTGGAACAGAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314679	313664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_313700_314700
786277	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
786278	contig_13201_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_130887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1085	1417	221814	221482	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRVVQRSTELPAWHEPRDRAIISLVPEDRASSQSLWMGPILRFQGAGVHTQDRGVGSPPRTEEQGQLPEQRGQGCHHGGRGERDILVDLGTVAIHVGWECGGTPPRLP	222898	220738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_220700_222900
786279	contig_10324_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_7827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	301.535238405066	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	92	772	261538	266158	FALSE	60	TAAACTAAAATAAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDSQEDVDSWKASFLRAGVYPEKDQENTFSMDPQLERQVETIRNLVDSYVAIINKSIRDLMPKTIMHLMINNTKAFIHHELLAYLYSSADQSSLMEESADQAQRRDDMLRMYHALKEALNIIGDISTSTVSTPMPPPVDDTWLQTTSSHSPTPQRRPVSSVHPPGRPPAVRGPTPGPPLIPIPVGAVGSFAAPPIPSRPGPQSVFANNDPFSAPPQIPSRPARIPPGIPPGVPSRRPPAAPSRPTIIRPAEPSLLD	260980	266905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_261057_261522_261664_263847_264081_265197_265450_266088
786280	contig_6048_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_73233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCTCCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788151	1786000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1786000_1788200
786281	contig_7426_pilon	+	989	8	Intergenic	novelGene_27504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	460.044540878203	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	18	830	952246	987945	FALSE	50	ATTAACAAAAAAGGAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGAKMAAVVGVSLRRRFPATTLGAACLQACRGAQTAAAVAPQIKKFAIYRWDPDKAGDKPRMQTYEIDLNKCGPMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDFTEERLAKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	952228	988104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_952318_962052_962181_970075_970162_979923_980061_980784_980884_983670_983761_985081_985205_987867
786285	contig_16103_pilon	-	1803	7	Intergenic	novelGene_118901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	110.900480912693	82	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	625	1005	761606	759680	FALSE	50	AAGTAAAAAACTGTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNFRSYLLDLRNTSTPFKGVRKALIDTLLDGYETARYGTGVFGQSEYLRYQEALTELATAVKARSGSSQRHHQSAAKDLTQSPEASPTTIQVTYLPPSQKSRRAKHFLELKSFKDNYNTLESTL	766595	758881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761334_761394_761480_761747_762206_762261_762483_762602_765904_766007_766385
786289	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786291	contig_8210_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_30206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTAAGCCACTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6816	5806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_5800_6800
786292	contig_9014_pilon	-	2058	5	Intergenic	novelGene_106706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	80.8254291668161	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1098	1496	42265	41867	FALSE	10	CTCATTTCTTCTTCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLQLVRYESVELTQQLLRQPQDGSGLGASLHESSLQGILLETVPGDPGPEEEAEEEEEGGGGEGTALSAPQDTPSPVIHVVNQTNAEGQREIVYYVLSEAPGEPPPPTELPSGGIMEKLEGTAEEPKVQMM	44232	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42961_43054_43194_43275_43315_43480_43559_44086
786294	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	573	1	394	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
786297	contig_15021_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_26935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTAGGATTATTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197044	198822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_197000_198800
786299	contig_8885_pilon	-	1906	5	Intergenic	novelGene_115553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	72.6378000768195	3	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	29	412	75477	49174	TRUE	20	CTCATTTTCTTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75505	45832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75405
786300	contig_7119_pilon	-	1960	2	Intergenic	novelGene_40983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	119	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	1249	1959	139626	138916	FALSE	10	GCTTTTCTGGAGAGTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCS	140944	138914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_140673_140742
786301	contig_15991_pilon	-	1029	7	Intergenic	novelGene_70897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	6	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	592	960	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106358	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102300_103616_103703_104975_105142_106315
786303	contig_6710_pilon	-	533	2	Intergenic	novelGene_96692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	657161	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657161	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
786304	contig_10003_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_88204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTGGGCTGCAAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505226	507005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_505200_507000
786305	contig_10003_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_88205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	50	301	507358	507609	NA	40	TATCATGCAAAAGTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNAVTFTVKGNLPFNMQQTEIRRGPGTECQQGALRVLWISLGESRPSRIVQLNYMRSQGREVAAEFFVGWAREELVWHHIVSRSGGTLSKVRNPLLLN	507308	508110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_507300_508100
786306	contig_383_pilon	-	694	2	Intergenic	novelGene_126154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	59	634	416711	416085	FALSE	30	ATTGAAATATTGTTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNFAELKIKHLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANKFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVDGGDAGNREDQINRLIRRMN	416769	416024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_416460_416510
786308	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
786310	contig_18869_pilon	+	2132	4	Intergenic	novelGene_56430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.8423039781937	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGATGTGTTGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111258	114073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_111329_111620_112185_112241_113480_113813
786311	contig_4364_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_59	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGTGTGCACAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679441	678868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_678900_679400
786315	contig_9450_pilon	-	763	4	Intergenic	novelGene_174437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	512	junction_2	124.729930472022	4500	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	396	698	83101	71055	FALSE	30	CTTTATTTTTAAAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNKLRGQKSRNIFHIASQKHFKSKNKAKPVTTNLKKINIVNEEKVNRVNKAFVDIQKELAHFSKGLSLEPLQKQLIPQQHHENEPVNVDEATRLMAQL	86610	70989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_-_71127_71483_71601_82987_83105_86218
786316	contig_11702_pilon	-	2092	10	Intergenic	novelGene_141998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	52	junction_4	178.867907672287	472	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	538	1284	509434	508213	TRUE	5	GCCAGCTCTCTGTTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRSKPEQKATGVGVWGAEQAHPAKRPLYPQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGGCPAGQHGGGE	509971	505998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506403_507258_507359_507568_507653_507909_508098_508180_508249_508330_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277
786319	contig_4125_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_25263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3055774	3053794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3053800_3055800
786320	contig_4951_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_122124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAAATTTCTGTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182473	180659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_180700_182500
786321	contig_14160_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_171543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAATAACATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5513	4948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_4900_5500
786331	contig_4847_pilon	+	1016	6	Intergenic	novelGene_156165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	306.228019619368	5	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	155	454	101466	108753	TRUE	10	ATTTTCTGTGGTGTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYACLAAGADVGGAVRVPACVISQLDRVGREQCRSWALATQHWLLLVGSLAMQKQVASHPWLLDSSLEGWQAWVLTSSLRIPGTFGFSISYVWDLGWHHGNEILPLWKIYACRLNRRCQVRHVLLLLFTTMGFSLLPQILSTFKNLLISV	99610	110074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101077_101415_101478_102278_102371_108557_108812_109570
786332	contig_5253_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_61592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGGTAACTGTCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345859	343686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_343700_345900
786333	contig_10500_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_41196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCACAGCTCTGGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388400	1390762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1388400_1390800
786337	contig_5690_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_119750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATCGACTCAACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092163	1091834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1091800_1092200
786341	contig_6489_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_128921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTGCTCTTGAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111642	112506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_111600_112500
786344	contig_6496_pilon	-	1294	6	Intergenic	novelGene_103463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	17.5658760100372	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	821	1195	99570	93103	FALSE	10	AGTAGTTGTTTGGTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVVINFNNNTQHVPLIGKVGLSWRTNIFEGRIESCSIMDVTLLDDSGKPFWCFSSPVCMRLSTSPCDTCDFLGQRYCIDYVDSEGRVHVDLVWIEETEEYFVVNLALYLSVVKINHWFGTEY	140960	93003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_93373_99465_99591_131093_131337_135709_135815_140400_140506_140613
786345	contig_5954_pilon	+	820	5	Intergenic	novelGene_28814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	133.871206762321	394	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	165	653	1530879	1556854	FALSE	35	CAAGAATGACCTGGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALIPEPRPGDLIEIFRPFYRHWAIYVGDGYVVHLAPPSEIAGAGAASVMSALADKAIVKKELLYDVAGKDKYQVNNKHDDKYLPLPPSKIIQRAEELVGQEVLYKLTSENCEHFVNELRYGVSRSDQVRDVVMTAGIAGVGLAAIGLIGIMFSRNKRQKQ	1530301	1557021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1530405_1530817_1530894_1542641_1542745_1547935_1548205_1556752
786346	contig_12050_pilon	-	2343	4	Intergenic	novelGene_62661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.94392028877595	77	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	196	552	439303	438705	TRUE	25	CTACTGATATGAGTCGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAARARAWVSCSWACAALRALSCSRRQLSTTARNSCSCDTWPRTASTSSQRCGRGCSCGGLVLLPLGPDAARPLVLTRAHLVQLDGQLLHLGLEPVGVGQLQGVPRGGGHCCASGQ	439498	434904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_436508_438175_438239_438579_438851_439092
786348	contig_2377_pilon	+	2170	3	Intergenic	novelGene_67892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1732	junction_1	108.5	35	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCAGCTCAGTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197513	212548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565
786350	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	530	51	530	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10767	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
786358	contig_5999_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_45638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205426	203783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_203800_205400
786361	contig_1639_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_74900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTTCTTAAAGAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291290	292045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_291300_292000
786364	contig_17470_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_110538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273513	275132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_273500_275100
786365	contig_9468_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_59528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAGAAAAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534921	536986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_534900_537000
786366	contig_753_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_112951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGAGGGGAAAACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831309	833189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_831300_833200
786367	contig_10734_pilon	-	2009	13	Intergenic	novelGene_50978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	45.8599922469345	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	50	973	281208	266491	TRUE	40	GTTATAAAGTTTTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWRPKEECSQGHFRCTDTHNSPHKDELNLLVIIVDTNPIWWGKQALKGSQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNRLAVIASHIHESRFLYPGKNGRLGDFFGEAGNPPSEFNPSGSKDGKYELLTAANEVIAEEIKDLMTTSDIKGQHMETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPIHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSSTVRDLFRSDSL	281257	264965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_265956_266444_266503_266707_266870_267699_267769_270919_270974_271980_272056_273753_273783_273933_273964_275096_275160_276523_276691_278456_278564_279918_279999_281132
786369	contig_11986_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_69095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGACAGAGGAGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38549	37854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_37900_38500
786370	contig_934_pilon	-	1973	2	Intergenic	novelGene_129024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGTCATTTTTGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152021	148505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148659_150201
786375	SIRV6	+	578	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10244	4	1007	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11244	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11200_11800
786376	contig_6589_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_26166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8966	junction_1	3715.87576039171	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	159	398	1886667	1887829	FALSE	35	CCGAGAAGCCGTTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885993	1887861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
786379	contig_6097_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_174445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTTTTGTTATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172045	172910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_+_172000_172900
786381	contig_9177_pilon	+	2832	20	Intergenic	novelGene_32646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	47.7352463030431	281	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1314	2744	105101	109340	FALSE	20	AGTCATGGTGTCATAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57866	109428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_99898_100009_100303_100440_100685_101142_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
786385	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786387	SIRV7	-	595	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	32974	0	-67	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114983	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
786388	contig_6673_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_164009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCCTAGGCAAGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37283	36814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_36800_37300
786389	contig_6673_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_164008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATAAAAAAATAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35960	34913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_34900_36000
786390	contig_5954_pilon	-	625	2	Intergenic	novelGene_28662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	222	503	945129	944848	FALSE	10	TGGACCATCCGTCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTWPRVTWSRPGASATCVSGTSTGTSGRWPSSLTSTSTWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSCSSQEAMRLSRAVSLPYPTHTCHSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	945472	944725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384
786391	contig_2940_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_81878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATTTTCCCAGCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359580	360349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_359600_360300
786392	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
786396	contig_17281_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_105197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGATGAGTGAATTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	2592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2100_2600
786401	contig_2342_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_132775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAACGATTGAGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587776	586088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_586100_587800
786403	contig_4350_pilon	+	2190	2	Intergenic	novelGene_136362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	325	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	9	1715	15185	20906	FALSE	15	AGGGACTGTCTTTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSQVYIFWGAPVLPLKMTVSQEPTSVIPTADPWKKIQLLYSQHSLHLKDEKYKHKNPENYQVLDNIDPLGLNSHCSLSSRKRSVHLKDDLICCISETQNIKSQKCSPSGMNGLTDSSVQVCGFKSRVQHVTGEEKNQKLVTENKKITVEQHQEQSSICAPNLTKTPLQLGHKCAAILDLVCSTKQINIGPEAVETTYVPRVHHEMQNLCVEFLFSKTVDKPRSKRGVKKVSNLKISTDTEFLSIMTSSQVAFLAQRKCKGQNSLNKETINMEIGPKASHEEVRGTEDNLIQHSDDFAEGYKSGQNEAYSLELFSPVGPETKNNHILINSDTNLEENIGSQELFSPEETLPPNEICIESFSSGILCSQLNTFHKISIERSLISEDKLGHSKAPSKGFQVSKKTKLLSNARDLAVTLDRRNVSEFKYIKKTSLIKNCNCKSQKYNCLVMVLSPCHVKEVNIKSGPPSGSAVPVAATTVIDQSEIKKKVFMWRTAAFWALTVFPGDIILLTDVTVHEDQWVGETVLQSTFTSQLLNLGSYSSVEPEECKTHFKCNNFLAFKIYKHIRKK	15176	21381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_16716_20730
786405	contig_15236_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_141533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66743	69147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_66700_69100
786406	contig_2161_pilon	-	1874	2	Intergenic	novelGene_114915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAATAAAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792869	789802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_791379_792571
786407	contig_12993_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_136731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGATAATGCTATACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89928	90997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_89900_91000
786408	contig_1154_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_87112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGGAAAAAGGACACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399431	398318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_398300_399400
786409	contig_8538_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_4951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTAGATTCTTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
786411	contig_15410_pilon	-	728	5	Intergenic	novelGene_130624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCCCCAGGGCGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148249	145514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_145713_146817_146980_147079_147182_147754_147839_148067
786414	contig_2646_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_69578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTGTGATTTAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330519	1329877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1329900_1330500
786415	contig_4678_pilon	+	2286	15	Intergenic	novelGene_126033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	55	junction_9	41.4778032598799	152	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	91	1791	411126	424775	FALSE	10	CATGAGGTGTTTTCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPALQALTGAAHCPHGGHPLRRGPVTSSGMPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSVAEPQDQGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARSIYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAPQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPAEGPGGRPLRKSFRREPAGGVANLRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSENQSHRKSLGSAEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLSDIKVYLVGKEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELELAALDRVVRISAKPTKRLQEALEPILAKHDLSLQQVTLHRPGEKQALDLEKLVSSVTAQRLVLDTLPGTKIPAASDLSPRRSQGGRPRTQDKASHSHPLPTNSLAEPPCSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPTQGPSAQEAPPQTELSTQPRGGCLDSTGHPAL	411035	425270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_411171_418307_418330_418490_418664_419032_419126_419221_419366_419860_420005_420152_420265_420599_420707_421189_421400_423387_423465_423702_423830_423911_423994_424104_424152_424239_424355_424572
786417	contig_11293_pilon	+	1379	6	Intergenic	novelGene_134684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	18.1151869987588	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAATAAATGTGTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156169	193468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_156494_160525_160632_173513_173640_185180_185325_185972_186126_192942
786419	contig_9527_pilon	-	2036	3	Intergenic	novelGene_134093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	149	589	635882	634376	FALSE	25	TCTTGATCATGTCAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPGGGVGDRPGSASLSRCAPAPAPADLPVGGKTKRLRITVRRKRRRGRRMFPQCLGRGDWRVQDPGSISHLEAQIPPEWGNLASWYPMALKPTGHPDGPGKPPAGIPRGDPTSLAFARSRDSTLLATALASAIPPGTHTLGTSGDQASSHLFNPVWTWNIKKHAGQGFAISALRGCLLFIGIFALARQRRKENGW	636030	632928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_634684_635103_635201_635846
786420	contig_13863_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_42049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGCTTTAATGTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301440	302858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_301400_302900
786421	contig_13863_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_42048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAACTGGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299291	300166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_299300_300200
786422	contig_12624_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_61089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGTGGTGCTCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887949	886368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_886400_887900
786423	contig_2596_pilon	-	2188	8	Intergenic	novelGene_53516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTTGGCTACTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049338	1035594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1036288_1038936_1039023_1039934_1040067_1045983_1046103_1046178_1046319_1047740_1047917_1047991_1048128_1048632
786424	SIRV2	+	233	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-368	-419	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGACGTCTTCAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3665	4038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
786427	contig_9614_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_104428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAAAACAATTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150081	151234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_+_150100_151200
786431	contig_7025_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_104408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	146.752247758671	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	311	655	353982	394891	FALSE	80	AGAAAAAAAAAAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTRIIRLVCCLIFLHQVQLFLGTSQYILRYSLNTISHLSHL	344059	396316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_344312_353923_354090_362626_362745_394772
786434	SIRV4	-	261	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1253	7	1253	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
786438	contig_13558_pilon	+	568	2	Intergenic	novelGene_123001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	95	568	23647	25668	FALSE	10	TGGATGCTGATCCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFQKALAVGNQKMINSTTTPPAEGVCSWNSLVTQYIIPVLYCMVFIVGILLNGVSGWIFLYTPSSKSFIVYLKNIVVADFLMSLTFPFKILSDAGVGPGQLNVFVCRVSAVFFYTNMYVSIMFFGLISFDRYYKIVKPRLTSSIQSVKYSKALSVMV	23552	25668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_23662_25209
786439	contig_13558_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_123002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTACGTACTAATAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26163	27394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_26200_27400
786447	contig_9901_pilon	-	1736	11	Intergenic	novelGene_126932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	157.71886380519	15	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	58	690	207348	185991	TRUE	20	TATTTGGTGGTTTTATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVFAWGYNNCGQVGSGSTANQPTPRKVTNCLHIKKVVGIACGQTSSMAVLDNGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	207405	171083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_172049_172212_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_204141_204301_207324
786448	contig_9594_pilon	+	940	4	Intergenic	novelGene_73956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	754.856424906235	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	49	468	319775	322414	FALSE	10	TTTTTTTTCCTGTCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGVMLSLCVYSLKNR	319726	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_319904_321480_321659_321936_322009_322373
786449	contig_13905_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_130411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCACCACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66182	64697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_64700_66200
786453	contig_12485_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_147270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCTTTTTCAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29466	30161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_29500_30200
786456	contig_14566_pilon	+	1328	7	Intergenic	novelGene_148842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	356.753143722036	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	103	948	88884	118595	TRUE	10	CCCTTTTTCCCCACTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFGKPLS	88781	125387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_108219_108328_118470_118638_125049
786457	contig_15706_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_172040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90956	88776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_-_88800_91000
786461	contig_12250_pilon	-	1367	8	Intergenic	novelGene_80585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	28.9573930498741	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	190	978	321794	315207	FALSE	35	ATTTAAAGTTCAGAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHIDNDLKLDFKDVLLRPKRSTLKSRSEVDLTRSFSFRNSKQMYTGIPIIAANMDTVGTFEMAKVLCKAGNVVTGEMVEELILSGADVIKVGIGPGSVCTTRKKTGVGYPQLSAVMECADAAHGLKGHIISDGGCSCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMLAGHTESGGEFIERDGNKYKLFYGMSSEMAMKKYAGGVAEYRASEGKTVEVPFKGDVEHTIRDILGGIRSTCTYVGAAKLRELSRRTTFIRVTQQVNPIFSAES	322362	314817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_315397_315597_315758_316414_316458_316648_316756_316839_316922_321446_321567_321707_321829_322207
786463	contig_13424_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_151606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179133	181133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_179100_181100
786469	contig_2062_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_139062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAATCAGACTGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434542	1434169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1434200_1434500
786470	contig_3584_pilon	+	1100	6	Intergenic	novelGene_108165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_5	14.4360659460949	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	12	731	482440	498534	FALSE	20	ATTTGAACTGTAGTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRHLKKRAQDAVVILGGGGLLFASYLTAVGDEHFYAEHLMPALQGLLDPESAHKLAIRFTSLGLLPRATFQDSDMLEVRIMGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLFKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAIINRYGFNSHGFSVVEHRLRARQQKQTKLSEDGLLLGINLGKNKMSVDAAADYTEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAKLHHLLTKRTRF	482428	498903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_482461_484970_485184_487766_487967_490200_490284_495888_496077_498519
786474	contig_11855_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_67035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAAGCTGTGCAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1933365	1934327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1933400_1934300
786479	contig_9415_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_109851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTACTCCTGTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1980601	1981682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1980600_1981700
786480	contig_1009_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_121740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191100	193407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_191100_193400
786482	contig_19790_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_109492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTTTCATTTGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49774	51074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_49800_51100
786484	contig_1244_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_38074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATCCTGCTCATCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286269	1285996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1286000_1286300
786488	contig_16103_pilon	-	2597	3	Intergenic	novelGene_118903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1873	2253	759613	759233	FALSE	50	TGTTAGAAAGTAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEDSQWGLSPPEYSVQAGPSSGHLAPQAQTPPAKAPVCTELTPGGPFLWAISQQQLKLFSPSSTFSGVQFSCYSKCFCQAFFKNPHLVLIWFVHLPCSGHLLPEVRVEMRGLVASVMCPVVVHG	763000	758888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759876_761305_761396_761480
786491	contig_5918_pilon	+	1734	5	Intergenic	novelGene_99477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_1	495.962385166456	50	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	116	517	158624	161275	FALSE	55	AAAAAAATACTATACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REESEDDDEEEEEEEEEEKEKSLIVEGKREKKKVERLTMQVSSLQREPFTIAQGKGQKLCEIERIHFFLSKKKTDELRNLHKLLYNRPGTVSSLKKNVGQFSGFPFEKGSVQYKKKEEMLKKFRNAMLKSICEVLDLERSGVNSELVKRILNFLMHPKPSGKVRINFVLFS	154087	162492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_154147_158567_158670_158903_159014_160171_160267_161124
786494	contig_7629_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_153574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAAAAAAGGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311761	312138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_311800_312100
786495	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	653885	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653885	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786497	contig_16883_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_161763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGCTTTGCATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579841	580451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_579800_580500
786498	contig_5375_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_169197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAGCTAGAGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9975	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_10000_11800
786499	contig_9127_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_103019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGGAAAAAGAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209807	212447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_209800_212400
786504	contig_9363_pilon	+	947	3	Intergenic	novelGene_6648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	6	482	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	203	694	963791	965720	FALSE	15	TTGGCCGAGTCTGAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTWASPGWARLALCLAGFGLSLYALHVKAAHARDKDYRALCDVGTAISCSRVFSSRWGRGFGLVEHVLGPDSVLNQSNSIFGCIFYTLQLFLGCLRGRWTSILLVLSSLLSLAGSVYLAWILFFVLYDFCIVCITTYAINVGLTVLSFRGAQGPKGKAKGH	963588	965973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_963964_964729_964840_965511
786505	contig_9668_pilon	+	1629	10	Intergenic	novelGene_58118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	425.461057102893	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	315	1403	282781	359314	FALSE	30	TACTTACACATTGTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214109	359540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_281470_281518_282649_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
786506	contig_4315_pilon	+	772	2	Intergenic	novelGene_46849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCATTGTTTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575551	580871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575559_580106
786509	contig_12019_pilon	+	3126	1	Intergenic	novelGene_87749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTATGTGTCAGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625408	628534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_625400_628500
786510	contig_6299_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_172934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTTATGAAAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944536	943736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_943700_944500
786514	contig_16578_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_148627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGGCTTGGCATGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112198	113244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_112200_113200
786516	contig_9696_pilon	+	1855	14	Intergenic	novelGene_68781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCAGGCGCGCACTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197846	255831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_198513_206410_206500_206591_206749_210594_210683_214715_214754_216374_216451_224241_224349_226517_226615_238468_238593_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599_255647_255803
786520	SIRV4	+	275	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1496	632	1041	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2496	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
786521	SIRV6	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
786522	contig_5780_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_29767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28586	29715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_28600_29700
786524	contig_6418_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_81171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAATTAACTGTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545354	544943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_544900_545400
786528	contig_16635_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_153154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTCTCTGATGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98731	100756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_98700_100800
786529	contig_4519_pilon	+	1892	2	Intergenic	novelGene_123659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGACTCATAGTGACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58541	60753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_59113_59432
786530	contig_7057_pilon	-	1354	5	Intergenic	novelGene_123231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	33.4402452144119	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTATTTGCTAGCCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539712	536983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537616_537717_538252_538336_538404_539420_539484_539654
786533	contig_16578_pilon	+	1907	2	Intergenic	novelGene_148635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAATGCCTGGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133974	135931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_135090_135139
786535	contig_14807_pilon	+	1145	5	Intergenic	novelGene_124728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	378.175554471729	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	190	750	75475	77275	FALSE	10	AACGTGTTGGCTCTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPRGGDSRPRTRPPPRSPIGSRSYLHTRTSGEPESVGASRNFREPVASLSNTETFGHQTREDDLFTSSEEESKDRERPLYARDSTYQSIAHYRPISSISRATVGLPCYPSTTSTSSTSSSSYSSPSWLARRAIRPEKQVPGAGQSQDRQVPLWGQLLLFLIFAAFLVFVYYLLQADDGNPFWVDP	75191	77670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_75342_75435_75544_76234_76343_76791_76842_76941
786536	contig_4962_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_107379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGGGTTCCAGAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136596	135189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_135200_136600
786540	contig_6361_pilon	-	922	6	Intergenic	novelGene_23944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1274.74144829452	84	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTTTGTGCTTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368226	351715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351991_354928_355044_359308_359434_360681_360814_364883_365095_368162
786541	contig_3410_pilon	-	1893	5	Intergenic	novelGene_58898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	734.560412763988	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	40	744	57649	14837	FALSE	5	CGTTGAGCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCACRGRGTQDSHPASKDRASACMLRLRDSPSEQTGWGWPSSRWFCVGRGRQPLQRIQVPHLTQDP	57688	13687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15032_31514_31619_32120_32250_34217_34318_57472
786544	SIRV4	-	506	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	8	103	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
786545	contig_8452_pilon	-	1490	6	Intergenic	novelGene_48112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	889.637993792981	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	53	511	991128	967786	TRUE	20	ACACCCTTTGGGGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQRRWQRESSRAVVRLPRHLDWGVWILVKEILILTEETLELQHATVP	991180	966166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_966437_967076_967922_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
786546	contig_11933_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_107262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGAAAAAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136063	135769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_135800_136100
786547	contig_6228_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_164495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGAGCCCTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202519	200439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_200400_202500
786548	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_96816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
786549	contig_1856_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_84878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCACTGAACCACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252563	251831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_251800_252600
786557	contig_10734_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_51524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	637	1020	2281023	2280640	NA	45	ACAATCCCAGCAGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELMICLLGNFFSMVLSLWWSYHPLIPQESRLESVYSTKGTRRPVKSLPGALSRQWKKPPGELHGGDRCGGPQQKFLPGAAQGFPFSVQSCKVLGRPGLVTPTPGTLLGTKLVVTGRAVLVVKLLK	2281659	2279050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2279000_2281700
786562	contig_7179_pilon	-	1905	4	Intergenic	novelGene_78160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCACACCAAACTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049257	1043000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1043332_1044700_1045525_1047700_1047870_1048676
786563	contig_854_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_36185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGGGTCTGCCTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482279	481979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_482000_482300
786570	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	880	25	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
786571	contig_8106_pilon	-	1383	5	Intergenic	novelGene_139724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.791859025648	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	56	676	85457	64191	TRUE	30	AATCATCATGAGTCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGQTVPGTAERGAVAAAMTDQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDKIILQLNRYYPQILTNKEAEKFRNPRAALRVRLCNLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSCLPSRHALHSKVLPGARRVLGFSPVIIERHISRYLLTFLAEDLGGSLIRPWTLDFACRSAQRLPPASRLAYCHHPACSLPTLRGDQSVSFSKGFFLTIYHFCETHLDLAYEGA	85512	62456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_62901_63927_64508_66863_67018_69922_70066_85450
786572	SIRV6	+	529	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10827_11054_11109_11205
786575	contig_17171_pilon	+	1376	4	Intergenic	novelGene_147381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	3.29983164553722	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	243	644	320702	326562	FALSE	25	CCTTTTCAAAGGGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHPATWRQPQPTTSILSHRDFPVAGHAVADFTSEVKVPFEWTWTQRSETPRAAGDGRPSDIWCQGPKDEKNRTSRRGSRKPESRVWPASNQLVACFKLPWQEIKSRKERIASGTLITLRSWPSTGPQNSRCS	318566	327294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_318671_320563_320761_323711_323849_326356
786576	contig_5039_pilon	+	2011	11	Intergenic	novelGene_65004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	65.2325838825966	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	192	1079	1703196	1712098	TRUE	35	TAAGCAGTTTAAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALIPRV	1703004	1718208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1703245_1703623_1703734_1704337_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710734_1712083_1712222_1713013_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
786578	contig_14519_pilon	+	1976	10	Intergenic	novelGene_66821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAACCTAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269645	283831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_270647_272654_272793_275371_275479_277941_278044_278561_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282308_282712_282806_283635
786581	contig_14426_pilon	-	2269	5	Intergenic	novelGene_170619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	6.86931583201704	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	181	1824	100825	94813	FALSE	25	AGTGTACCAGTGAGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESRQRAALDAQSTEDQTGLLTVKVEKEEASAFAEEARLSCSPAPGPERSRQRFRSFRYPEAAGPREALSRLQELCRQWLRPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGALQSWVQEQHPESGEEAVVLLEYLERQLDEPRPQVPAFDPGQELLCCKTALLTRAWRSQMSQFQPMKALLKHESRGSQPLQDRVLQVPGLAEGGSCREDTVVAARLIPESQGLLKVEDVALTVSPGWAQLDSSQVNLYRDKRQENCGSLISLGGEIQTKIRDLPPEDEHLVREPGEIPCHLGEDVAQITSCAEAGEQEGRLHRKQKNATGSRRHYCHECGKSFAQSSGLTKHRRIHTGEKPYECEDCGKTFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHKIHTGEKPYQCNMCGKAFRRNSHLLRHQRIHGGDKNVQDSEHGETWESQGRMENQWENVEASVSYKCNECDRSFTRNRSLIEHQKIHTGEKPYQCDACGKGFTRTSYLVQHQRSHVGKRILSQ	101005	94367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_95679_96514_96639_97647_97731_98882_99031_100402
786582	contig_15937_pilon	-	1798	5	Intergenic	novelGene_143143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	40.3941518044382	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	183	1211	47182	42162	FALSE	55	TTTTGAAATTAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPSSSPAFRLETSDGSQEDGTKGDKGNLGHGDGPAPMESPFQGEDRDFSPQIKVNLKYRKGSGACQPDLDRFDRDRLFSVVSRGALEELAGLPEYLRRTSKYLTDSEYTEGSTGKTCLMKAMLNLREGTNACILPLLQIDRDSGNPQPLVNAQCTDEYYRGHSALHIAIEKRSLPCVKLLVENGADVHARACGHFFQKRSQEACFYFGELPLSLATCTKQWDVVTYLLENPHRPASLQATDSLGNTVLHALVMIADNSAENSALVTGMYDALLQAGARLCPSVQLEDIPNLQGLTPLKLAAKEGKIEVSGHPPPLSRKAAGSLQKGGWWWSRAVVSTLFD	50224	41574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_42563_43203_43498_44887_45022_46982_47292_50151
786583	contig_17493_pilon	-	3033	1	Intergenic	novelGene_122194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTGATCAACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71727	68694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_68700_71700
786589	contig_14450_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_49026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222795	1221375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1221400_1222800
786592	SIRV6	+	225	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	503	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
786593	contig_6117_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_167304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAGGAATAATCACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112144	113226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_+_112100_113200
786594	contig_14322_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_116601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCCGCGGCGGCCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
786598	contig_5549_pilon	-	947	11	Intergenic	novelGene_81632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	263.08859724435	160	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTCTGTGAGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	438890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_439392_442018_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442938_443620_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
786608	contig_16098_pilon	+	1921	2	Intergenic	novelGene_46230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1066	junction_1	0	1	115	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	104	778	766291	766965	FALSE	40	ATTTATTTTAAAAGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHLSGNCPVPSWHEQGRATLNGERGALELTNSEMPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPSAPSAPYAPPSALVSQAAPQAPVRSTFWVPQPWEERPHNPGMVSWAEPELRPGASVFLGNPQSRRQRPGSPEPDWGLQPRVTLEQISAFWRREGRTSVGF	765534	768108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290
786618	contig_17753_pilon	+	2163	5	Intergenic	novelGene_105054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	370.245189030188	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1028	1474	131420	133179	FALSE	50	GAAAGTGAGTCATTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLIPEAKWMEPRGAFWRERRLRPPALVPALLQRALPTPSIHAQPTKAQ	45479	133868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96221_130836_131726_133038
786626	contig_2414_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_158492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1575	2144	308864	309433	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLKDSPWPTNWKRSVFVPVQRKVIQQNSEIIQQYHKYHTQVKFAEDNSKTIVAVHRQELPEIKARFRRGHGTSSIIAYVDESWPKAEEYQKMFTCVLLIMQRHLTIWKTLQRMGTPEHLMVLTRNLHIDEEAVIRIERGDSAWFKIRKGVHQHCILSPYLLNLYAQQKIPEAGLYEEEHQDWWKTH	307289	309549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_307300_309500
786627	contig_12425_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_46707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGAGCCCTGGTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227516	228363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_227500_228400
786628	contig_5684_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_81080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTTTTGATGGCCGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463677	464290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_463700_464300
786630	contig_5954_pilon	-	780	7	Intergenic	novelGene_28561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	223.362498095709	1704	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	146	634	861192	858737	FALSE	15	CCTCCTTGTTTCTGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAWHGAGRVARSLSPSGLGSQWGGSRRVGSSGSGTLGGTRSFSRAAAAMAPIKVGDTLPSVVVFEGEPGNKVNLAELYKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAGALKAKGAQVVACLSVNDVFVTGEWGKAYHAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVPLFGNRRLKRFSMVIEDGVVKALNVEPDGTGLTCSLASNILSQL	861374	858590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_858843_858963_859026_859148_859188_859263_859396_859910_860046_861177_861237_861273
786631	contig_8656_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_162356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	601105	601428	NA	25	TGCCTCATAGGAACTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSQRERAQGGALLTGACTADRACMPKRGSARPRGGLSSEGVHDRGWASKLINHITVSTVYEFCETLQQITDPNRERRELRAGRVVDVRDDGVVQQLGEVGNLGHV	600308	601432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_600300_601400
786632	contig_15405_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_112107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCCTCATTGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140883	138472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_138500_140900
786636	contig_8663_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_57999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55968	57989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_56000_58000
786640	contig_16126_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_141883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	306	608	70571	70269	NA	40	CAGATCACCTATCTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLESRFSATLISRGLELLELPPPEAFSFTIFRLFLGVLAAILERSPSKSGCTVALLMQGLWWGVRVVEVLSPGHLKLGPQGGHLMEVAVGQVMLFLNSC	70876	69099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_69100_70900
786643	contig_5770_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_74154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146613	147598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_146600_147600
786645	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	54	504	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
786646	scaffold_12124_pilon	+	2093	12	Intergenic	novelGene_22042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	495.456413674543	1	127	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	137	766	836073	846800	TRUE	25	ACTGGCGTCTTCTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGQLRGHELHLHHLQHQLHELQLGAWPSSTCRCPVPPRCLDLFVRRDRMSPVHQGLGRHTRGLSFRYQL	829599	858980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836052_836149_837230_837452_844270_844398_846520_846650_846723_846899_847602_847768_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793_857930_858358
786648	contig_18420_pilon	-	1796	7	Intergenic	novelGene_109374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	306.029773424453	14	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	85	726	129249	117815	FALSE	10	AGGTGCTGCCGCGTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDLYLEHLLQKRSRPEAVSRQLNAVTEDMYTNGSAAPGSPAKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQECLCLGIFSFLHIVCFHNCLSLIKSIFNKKESFTHSL	142759	116744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_117924_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822_128902_129147_129286_142711
786649	contig_4364_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	433	966	1020859	1020326	NA	35	CTTTAAAACTTTTTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPCVSECFTEFSMADYLEGRLPGLSFEAPLGGLEPSALWLASEHLNCVHHLGRGSVLPTGRRSKPVGGGGCCWALGRCCVEPSGERTARRRHPWTHGPLALSRGLTNPTLRPVPPATSWLCHFRPRPALWGLRLRGAHDAPHGVCSPTLHRPMSQLHRHTSRLSLLSQLMAVPDT	1021291	1019635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1019600_1021300
786650	contig_6058_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_172401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCAGCACTCGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386021	384257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_384300_386000
786651	contig_12050_pilon	+	2970	17	Intergenic	novelGene_62678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	184	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	305	1591	446455	454905	TRUE	25	AGCAGGCCGCACGGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPTPGAAWTSAGSRPLWASSHPTSTRSHASPYHPSAAQRFTLKNIVVGLRSPAGPLQEPQTTSQRETHRDADVAQESWGRRAGPSGWAGLAGGPHVEASEMQMDWGLQEAAGRLPPETTSEHPVSAQQPCLQTPACPKGPSWPAGERRAERMAQHGTSWPAKALPPVIRVPGTGPPARGWATPIPGQSALPPTSSARANGRKLLSFICTIYKHVDRRKRGIRGQSCPCVPGSRAAGPQNRWLWARAGGRPESHWAQAAPWQHWGAESSMLLAGPALKGGSARWPRGRDEGHPAEARVGQWCRGRGASPWRRSILQLTPLNQQSRSRHPGLAGRCRRAGRGHGARGCCPAGCSQRTGPGSPCFTDISSTSSVMKLWELLFRRARSRPLSGGGASESSESFSSSSSRMGDDGDRRETCSVACPPDGCCL	446150	511520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_447403_448654_448699_451587_451670_452497_452550_453291_453408_454860_455085_456701_456769_458811_458922_461655_461812_465467_465535_467619_467674_471131_471253_480730_480852_482308_482448_483759_483845_486357_486481_511363
786652	contig_7165_pilon	+	2184	12	Intergenic	novelGene_116879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_11	61.7577244474375	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	161	1333	693848	737771	FALSE	35	TAAAACTTTCTCTGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDAGYSEFLTGEGHLKVSGEANETQIAEALKRYSERAFFVREALFHLFSLTHVMEKTKPEILKLVVTGMRNHPMNLPVQLAASACVFNLTKQDLAIGMPVRLLADVTHLLLKAMEHFPNHQQLQKNCLLSLCSDRILQDVPFNRFEAAKLVMQWLCNHEDQNMQRMAVAIISILAAKLSTEQTAQLGAELFIVRQLLQIVKQKTNQNSVDTTLKFTLSALWNLTDESPTTCRHFIENQGLELFMRVLESFPTESSIQQKVLGLLNNIAEVQELHSELMWKDFIDHISSLLHSVEVEVSYFAAGIIAHLISRGEQAWTLSHSQRNSLLDDLHSAILKWPTPECEMVAYRSFNPFFPLLGCFTTPGVQLWAVWAMQHVCSKNPSRYCSMLIEEGGLQHLYNIKEHEQTDPHVQQIAVAILDSLEKHIVRHGRPPPCKKQPQARLN	682845	738622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_682895_693736_693878_699093_699271_703815_703881_708009_708110_708341_708393_711873_712036_712146_712195_721751_721950_722083_722137_723301_723400_737580
786654	contig_12638_pilon	-	681	4	Intergenic	novelGene_33327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	1067.35633953968	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAAAATGCTTGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325576	1298317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534_1303703_1310601_1310678_1325493
786658	contig_7904_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_160028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATTTAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472259	474183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_472300_474200
786661	contig_4857_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_48698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTAATTGCTAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151117	1151767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1151100_1151800
786663	SIRV6	+	314	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8121	3	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCGGTTATTGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	3158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
786669	contig_6881_pilon	-	1738	2	Intergenic	novelGene_164843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAATAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92665	90106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_91617_92437
786672	contig_18420_pilon	+	1224	2	Intergenic	novelGene_109336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	313	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74668	76853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_75138_76098
786678	contig_10404_pilon	+	1050	6	Intergenic	novelGene_138665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2900.39200109227	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	66	509	1085448	1099935	FALSE	15	TTGCCCAACTGTTGCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEDLPFLCL	1085382	1100476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099912
786679	contig_11386_pilon	-	630	2	Intergenic	novelGene_82845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1005	junction_1	0	611	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGCCAAGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250801	247183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_247600_250587
786683	contig_14499_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_174027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAACATTGTTGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123373	124113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_123400_124100
786685	contig_13004_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_112594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTTTTTTATAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60622	61339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_60600_61300
786688	contig_5047_pilon	-	1271	5	Intergenic	novelGene_158010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	31.4483703870328	105	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	307	924	1671909	1666216	FALSE	15	TTAAGCTTCTCTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSPVRREGDGAACQEPEAHAKVPHGAGSSSGPCPSRGPLLGEGHFPGPPGLKLFWVVHSTPVRHWSGPTSQSLLPSARTPVSTKRLLAVPTPASHRLSGLPLMTLRTMPRALASPWCASARRLSSEPKKRSGARNQPTTESSTKGTSRPSDPSSDSFSPPSAVPQALNFSPEKRDFTFSKNITEATLTEAKTTGNTPLNEALLVDTQLNQLTIAPKAESGPLADPLLIDFCNTPEANGGQLLLKPSVALESESKPLIDLMINTPDMNKDVALKPLQVVGQLIDLASPLIQLSPAADKENVDSPLLKF	1672315	1665868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1666300_1666837_1667078_1668204_1668404_1671814_1672052_1672151
786689	contig_12113_pilon	-	972	7	Intergenic	novelGene_134742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_6	125.355051309825	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	139	822	259537	217850	FALSE	5	TCTGCATGGTCCCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGSSSGYSGDASGAVTVWEVVSLLGKLLGTVAVLKVVLYLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRWK	259675	217699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_233167_233273_259482
786690	contig_12566_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_85994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCACTCTGTGGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19641	21531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_19600_21500
786691	contig_9678_pilon	+	1815	14	Intergenic	novelGene_146352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_8	285.627472863585	330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	50	1678	190975	213164	FALSE	30	TAAAACCTTTATCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWQAPVPADAAEQRAAMQRSPLSPRRPRGLCPLMLPGLLALLPALVAARTLGDQAALWPLPLSVEMFPRQLLLAPRNFSIGHGPNSTAGPSCAILQEAFRRYYEYIFGFYEQHHGPTRFSTGTELQQLLVTVVLDSECDAFPGISSDESYSLLVKEPVAMLKANRVWGALRGLETFSQLIYQDSYGTFTISESIITDSPRFPHRGILIDTSRHYLPIKAILKTLDAMSFNKFNVLHWHVVDDQSFPYQSITFPELSNKGSYSLSHIYTPNDVRKVIEYARLRGIRVIPEFDSPGHTLSWGKGQNDLLTPCYDAQKPSGYFGPINPTVNTTYNFLYKFFKEISKVFPDQFIHLGGDEVEFYCWASNPKIQNFMKQKGFGKDYKKLESFYVQKLVDIIAAVNKSSIVWQEVFDGNEKLQPGTVVEIWKAENYPKEQTKVTEAGYPIILAAPWYLDLISYGQDWKTYYEVEPLNFPGSQEQKTLMIGGEACLWGEFVDATNLTPRLWPRASAVGERLWSHKGVRNLEDAYHRLIRHRCRMVRRGIAAQPLFTGYCNYEEST	190925	213301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_191229_195484_195631_199415_199482_200865_200913_201169_201281_204661_204764_206753_206884_208321_208503_209057_209145_210397_210471_211276_211452_212327_212419_212586_212692_213103
786700	contig_6710_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_90299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTGCTGTGCCCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
786701	contig_8617_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_73419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62586	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
786702	contig_1948_pilon	-	1222	4	Intergenic	novelGene_31171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	332.349213930167	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	22	417	552044	544410	FALSE	15	GTGTATTCTAGTCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLWRLSVFCGSQGARALFLRTPVIRPAHVSAFLQDRSTPGVQHILLSPSHHSAYLNPCSAMDYSLAAALTLHSHWGIGQVVTDYVHGETSQKTAKAGLLALSALTFAGLCYFNYHDVGICKAVAMLWKL	552065	543604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_544576_546754_546825_548485_548594_551992
786703	contig_16098_pilon	-	1020	6	Intergenic	novelGene_46175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	33.8313464112796	554	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	164	886	545548	534853	TRUE	5	TTCCTGGGGTGTTGATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFQAGHNLHFCLAHHPPLVCATLILLLLGLSGLGLGRFLLTHKTGLRSPDIPQDWVSFLRSFGQLTLCPINGTLTGKWHGPHVVGLLTTLNFGDGPDRNKTQTFQAKVLGSQMGLKGSNARELVLITARVTTGRTPGTCLYFNAAPDILPSSQPPIACPEEEAGNATVSPRMADECIRIWSHEGLVLTKLLTSEELALCGSRLLVLGSFLLLFCGLLCCVTAVCFHPRRESHWSRTRL	546714	533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_533391_534820_534991_536677_536908_545105_545296_545383_545583_546585
786704	contig_15039_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_110156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1440	1835	211715	212110	NA	10	TATATGTCCTTTTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLKNSHSLFVCCCDNSQSLRWPLCLLVFRALDSHLPHCISAGLCDQQNPSDGMSFPTLGHKRHCGFCLALSLSYITHSREASCHVARTSPHGKELRPLATTGSSSSIPDQAFGQLQPWFTCGLQSHDRS	210275	212398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_210300_212400
786705	contig_7412_pilon	-	1096	6	Intergenic	novelGene_76315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1229.79022601418	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	455	850	365920	364445	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	373495	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370251_370320_370349_370542_370747_373393
786709	contig_8317_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_19316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTTTGAGCTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16687	16152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
786710	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
786711	contig_18352_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_174447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAAAATGATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4686	2611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18352_pilon_-_2600_4700
786712	SIRV6	+	324	6	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1715_2765_2829_3106_3165_10724
786714	contig_5485_pilon	-	2228	4	Intergenic	novelGene_37774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_3	131.585206868655	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1734	2054	645959	638722	FALSE	20	TGCTCAGATGGTTGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSLAGIPCITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVTQHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF	647692	638547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870
786716	SIRV4	-	411	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1107	3	1107	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4051	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
786717	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_97698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATATTTGTGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
786719	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
786720	contig_5968_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_112178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCTACTTCCTACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614837	613357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_613400_614800
786724	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_97181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	50	ATAAAAATGAAAATGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
786726	contig_9683_pilon	+	854	2	Intergenic	novelGene_151287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTGAGGTCTTACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487020	488186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487154_487465
786728	SIRV6	-	383	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-157	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGACGTTTTGCAATGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3166_10726_10825_11035_11109_11205
786730	contig_3774_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_142048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGACCTGATTACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147621	148654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_+_147600_148700
786733	contig_9982_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_55716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGACTGAGATTCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232009	234106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_232000_234100
786734	contig_13992_pilon	+	2769	1	Intergenic	novelGene_147628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCCAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391099	393868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_391100_393900
786735	contig_1734_pilon	-	1075	5	Intergenic	novelGene_164389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGGAGACTGCGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664812	654329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_654429_658209_658380_658995_659083_659847_659986_664231
786736	contig_11378_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_112324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	249	389	1223622	1223762	NA	25	TGCAGTTTATTACATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVTYWGERETYKEVGQWFKGKKVKEGTEDFPFWSRCWFTPPDSSREVGKGTRHETTPSPISSTWRWHSSGQPLQGTLTQSARMERGQHAEQDNLEAVGLGAWAGRGKARRSRVPYIQPRGLPLVDPSL	1223373	1224625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1223400_1224600
786738	contig_9696_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_68811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTTAATTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385916	386543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_385900_386500
786742	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
786746	contig_7356_pilon	-	1426	4	Intergenic	novelGene_60368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	739.441380743298	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	385	831	342753	342307	FALSE	20	TATTTGAGCTCTTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSEAQKMLSQSLYGMSLISGTVIRRGDPQPVLMCTLVKKENWERPKSMTDLLHHSLLSGSLSAVHKLRRSQARLAQSGIPPPAHTFPYEILIDHANSLKTATVRKKVQNTLVLCKLGISKISVPEKFIVEDKLPKYFLINPGNLNR	457915	341711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_342830_435516_435623_437474_437529_457767
786749	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_89122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653654	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
786751	SIRV4	-	291	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1227	3	1227	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
786752	contig_9363_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_6679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGCCCCCATAATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185235	1185590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1185200_1185600
786753	contig_9363_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_6680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCCTTGTGTTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185660	1187584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1185700_1187600
786756	SIRV6	+	274	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	8138	19	601	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
786757	SIRV6	+	265	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2054	558	36	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3141	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
786758	contig_7272_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_25321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTTGAAAAATAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498479	499254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_498500_499300
786760	contig_2987_pilon	-	360	3	Intergenic	novelGene_125847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	24	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGGTTTGATTTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499361	496908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_497107_498767_498909_499340
786763	contig_9571_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_136305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCTCATTTAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581009	580265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_580300_581000
786765	contig_9609_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_23035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAATGTAGCGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330198	333091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_330200_333100
786766	contig_9901_pilon	-	2306	15	Intergenic	novelGene_126930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	143.843168565133	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	244	1296	216214	185991	TRUE	25	TTTGGTGGTTTTATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFTLLSPQEIASIRKACVFGTSGNEALYVTDNDEVFVFGMNYSNCLGTGDNQSTLVPKKLEALCGKKIKSLSYGSAPHVLLSTEDGVVYAWGHNGYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVFAWGYNNCGQVGSGSTANQPTPRKVTNCLHIKKVVGIACGQTSSMAVLDNGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249493	171081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_172049_172174_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_204141_204301_207324_207492_215524_215676_216088_216261_245846_245927_249376
786770	SIRV7	-	330	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	15	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114723	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114685
786775	contig_2773_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_174275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAGAGAAGTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119342	116920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_116900_119300
786776	contig_17171_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_147348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGCTACCAATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42448	41769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_41800_42400
786777	contig_6710_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_89409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653747	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
786778	contig_7097_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_174450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1166	1465	295114	295413	FALSE	25	TCTACTTTTGGTTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLQQVSAKRRASSSCLLAGLLSTAVSAKLTLESPRACYSKTLIQTQSLMLFVSLKNTHQEESPKVSCENVTEMFLDDFSPKYVFSLTFHEVLAEMLS	289960	295457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7097_pilon_+_290021_294008
786779	contig_3111_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_129979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACAGGTCGAAGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104882	105252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_104900_105300
786784	contig_15118_pilon	+	956	4	Intergenic	novelGene_74624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	117.680358032539	2175	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	278	769	430861	432703	FALSE	15	TTTGCTGGGATTTGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPCRSLALLTGSLGLVSMVVALSTNFWIVAMGPSMSAHTGLWPSEGSVAVYIRVTQSFSILATLCILVSVVILALSFFPLLSAPGRSPLFAAITALTAALFMIVAMAVYTSERWVQVPGSQIQVFFGWSFYVGWVSVLLLLCTGALTMDAYCGARRPGYEAV	430583	432890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_431012_432159_432307_432391_432527_432644
786786	contig_6710_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_98285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	TACTGAGGCATCCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
786789	contig_16897_pilon	-	1500	17	Intergenic	novelGene_174453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	27.6447892920167	117	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	44	1381	69436	38758	FALSE	20	CTCATTTGTAATGTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRSSIGKNRAQAAMEFLQELNNDVSGSFVEESPENLLDNDPSFFCRFTIVVATQVPESTLLRLADVLWNSQIPLLVCRTYGLVGYMRIIIKEHPVIESHPDNALEDLRLDKPFPELKEHFQSYDLDHMEKKDHSHTPWIVIIAKYLAQWYHETSGRIPKTYKEKEDFRDLIRQGILKNENGAPEDEENFEEAIKNVNTALNTTQIPSSIEDIFNDDCCINITKQTSSFWILARALKEFVAKEGQGNLPVRGTIPDMIADSGKYIKLQNVYREKAKKDAAAVGNHVAKLLQSIGQAPESISEKELKLLCSNSAFLRVVRCRSLAEEYGLDTVNKDEIISSMDNPDNEMVLYLMLRAVDRFQKQHGRYPGVSNYQVEEDIGKLKSCLTGFLQEYGLSVMVKDDYVHEFCRYGAAEPHTIAAFLGGAAAQEVIKVITKQFVIFNNTYIYSGMSQTSATFQL	70206	38638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_38868_41625_41676_41758_41874_47895_47989_48469_48557_50069_50110_50383_50460_51289_51424_51520_51581_58719_58812_59123_59188_59755_59819_60658_60769_63417_63528_69080_69161_69382_69455_70181
786790	contig_7202_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_17688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27858	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
786792	contig_9345_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_24699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTTCACTTCAGACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952648	953601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_952600_953600
786794	contig_17790_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_128491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	120	542	120973	121395	NA	30	ATTCTTTTTAAATTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSISPRDRKGHINQRLYQPETRRTRCAWLPLMTTLRRNTTEFLTDHKKSRVQNSNSSKKTRLNGLIETGGTLEDMALRLSVSPKLKTFPRSILQTLDWTMGHKMILMKGVFLSSSRYMRLNGQLLSRGKMRRQRGSGAG	120853	121764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_120900_121800
786795	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1217	0	1217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
786799	SIRV6	-	317	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGACCATTTCTGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
786802	contig_8616_pilon	-	1188	4	Intergenic	novelGene_72445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	472.850457920425	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTACCAAAATATTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255496	253334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253639_253827_254223_254302_254668_255372
786803	contig_14243_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_57420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGACTCCTTTTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526857	526098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_526100_526900
786806	contig_7229_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_39867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGGTACAATAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498944	1496784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1496800_1498900
786811	contig_1759_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_171337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCCAAAATAAAGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72805	72613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_72600_72800
786812	contig_5769_pilon	-	2103	2	Intergenic	novelGene_138771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	705	1016	271640	271268	FALSE	45	TAGAGAAAAAATGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVKQTRHLWRISRGAELVKPEGAASLHSSQSLCSSWLAAGFWPVLVGYCFGPNHPWGPACITRSVSCVWLAGGTFIPRPGPRAVLTSQLSVSRLSTRLQEG	272344	270180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_271551_271611
786825	contig_9972_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_162797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGAATCGGAATCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317755	320058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_317800_320100
786827	contig_13265_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_145997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGGGGTTGTTAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12963	14060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_13000_14100
786828	contig_12920_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_166338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGATCTTTTTATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184767	185210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_184800_185200
786829	contig_14142_pilon	+	1314	3	Intergenic	novelGene_120424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	17.5	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCAGCCTGAGTTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22402	24118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22422_22530_23425_23717
786830	contig_12644_pilon	-	2327	19	Intergenic	novelGene_44594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_18	7.2970482786019	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	64	1833	2674981	2641998	TRUE	15	CCTAAGTTTGGTTCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLGAHFRLSLSHPGSDWAEMWSKMNQAAEELYARLLQGFDEEKKGICKDPFIYEADVQVQLISKGQRNPLRNILNENDIIFIMEKVPLEKEETGYVEEIQSEETAISDFSTGENVGPLPLPVGRARQLIGLYTMAHNPNMTHLKINRPVTALPPLWIRCDSSDPEGTCWLGAELITANDSIAGIVLYVVGCKADKHYSVHLEDLKNSHKKRHHLSTVTTRGFAQYELFKSTALDDTASASQTTITLDISWSPVDEILEIPPLSSTATLNIKVESGESRSPLNNLHRQLKFLLVLADGLRTGVTEWPEPLEVQSAVELVQEFLNDLNKLDGFGDSTKKETETVKHDTAAVEHSIESVFTARGDLDFAEQLWCKMSSSVISYQDLVKCFTLIIQSLQRGDIQPWLHSGSSSLLSKLIHQSYHGTMDTVPLSGTIPVQMLLEIGLDKLKKDYISFFIGQELASLNHLEYFISPSIDLQEQVYRVQKLHHILEILVSCMLFIKPQHELLFSLTQSCIKYYKQNPLNEQHVFQLPVRPIAMKNLYQSEKPQKWRVEINSGQKKVKTIWQLSDSQPVDHLNFHKHDFSELTLNGSLEEKMYFTNLVTCSQVHFK	2675044	2636575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2637044_2641971_2642087_2645306_2645420_2648084_2648181_2649278_2649416_2653648_2653678_2654156_2654314_2657188_2657269_2657745_2657852_2658473_2658524_2659052_2659147_2663347_2663420_2664737_2664894_2665141_2665213_2665745_2665946_2666385_2666505_2669244_2669341_2670324_2670377_2674928
786833	contig_2204_pilon	+	791	2	Intergenic	novelGene_71642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAAAGACAGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13174	15429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740
786834	contig_504_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_54448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTACCTGCTGGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251126	250537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_250500_251100
786839	contig_8330_pilon	+	1947	9	Intergenic	novelGene_71864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.3819433167334	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	286	1110	923753	929265	TRUE	20	GCTGTGGGGTGAAGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGSWGPTAKWPYSWLAVTHWPRSQRTSHMQSCGWGPTPGGDAKILDNHISQKTLGQWIAENRDSLGSKVKDSFNGQLPFLFKVLSVKTALSIQAHPNKPEMAIALTSFQGLCGFRPVEEIVTFLNKVPEFQFLIGDNAATQLKQSMSHNSRAVASALRNCFSHLMKSEKKVVAEQLNLLVKRISQQVAAGNNMEDICGELLMELHQQYPGDIGCFAIYFLNLLILKPGGGHVSGGQHAPCLPERRLCGVHGMLRQHGACWPDTQVHRRANSV	916335	930422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_916436_922879_923035_923722_923851_924644_924847_925669_925752_926085_926269_928093_928269_929180_929390_929709
786840	SIRV2	-	336	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	96	395	96	-395	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCATTGAAGACGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5799	4060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
786846	contig_2888_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_151491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTCAGTCATTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94408	94652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_94400_94700
786848	SIRV4	-	331	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1182	8	1182	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3976	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
786849	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
786850	contig_3503_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_174463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGAAAAAACTGAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21484	22453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3503_pilon_+_21500_22500
786851	contig_2703_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_101684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTCTACTTAGTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254875	254032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_254000_254900
786853	contig_5696_pilon	-	910	5	Intergenic	novelGene_117518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	37.49249924985	761	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	59	577	438708	423167	FALSE	40	TAAGATAAAGTGTCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQPNILLTGTPGVGKTTLGKELASRSGLKYINVGDLAKEGHLYDGYDEEYDCPILDEDRVVDELENQMKEGGVIVDYHGCDFFPERWFHIVFVLRTDNNVLYKRLETRGYNEKKLQDNIQCEIFQVLYEEAMASYKEEIVHQLASNKPEDLENNINQILKWIEQWIKDHSS	438766	422833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_423360_427848_427995_428433_428493_436686_436780_438680
786855	SIRV2	-	238	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	689	21	689	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTGACGTGGACGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4043	3664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
786857	contig_6710_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_97063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653684	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
786862	contig_9995_pilon	+	1724	2	Intergenic	novelGene_47746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGCTAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602564	604471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_602749_602931
786863	contig_16722_pilon	+	1260	3	Intergenic	novelGene_118272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	9.5	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	207	497	85111	86066	FALSE	15	GATCTTGGATGCACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAPAPPRLSSPARDAELCAHACRTDLDERESYCGSEFAVNGIVHDVDVLGEGIRLVTLLVDRDGLYKMSRLYITPDGFFFRVHILALDSSSCNKPCPEFKPGSRYIVMGHIYRKRRQLPTTLLRVLRGRVRPGDGLLRSSSYVKRFNRKRDGQVQGAVHTQCT	84642	86829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_84760_85021_85214_85878
786864	contig_4531_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_47855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATATTTGTCTTTTTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150265	151258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_150300_151300
786872	SIRV2	+	494	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	13	16	13	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTCCTACTAGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1600
786875	SIRV4	-	257	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1266	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3892	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
786876	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
786877	contig_10882_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_172752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	293	595	28673	28371	NA	65	ATTTAGAAAAAAAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKKQWSGQSSPSKAKREHKVLSLDKKIKVLDLLRSDMSPAEVGRKVGKNESSICTVKQKETKIRRSVGAASTTAKVVSLVPYKVLAKTEKALSVKCKR	28965	26684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_26700_29000
786878	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	57	521	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
786879	contig_10962_pilon	+	2934	1	Intergenic	novelGene_103907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356991	359925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_357000_359900
786880	contig_5918_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_99499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245760	243141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_243100_245800
786884	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
786887	contig_10235_pilon	-	939	6	Intergenic	novelGene_46462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	546.917324647885	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	4	651	222843	218207	FALSE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAVVINSSLARSGEGAPESPEGFGQLLDIPPSQKKWMRPVLRMRASLRGSFWMAMSLRWLTATCCRSSILCRWVLNGTITGSASVLAQCICSGRIRLHLSR	222846	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218278_219281_219512_220124_220197_220354_220481_220677_220788_222804
786888	contig_6589_pilon	-	1107	10	Intergenic	novelGene_25900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	217.584267768253	3	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	247	639	1177924	1160562	TRUE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKLALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKP	1178516	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160568_1160878_1160984_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177923_1178079_1178424
786889	contig_9955_pilon	+	1011	7	Intergenic	novelGene_21333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.34803054451	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	130	648	68148	84621	FALSE	30	CTTCAGTGTTAATGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVCVRSTAGEGERAAAPRRRPASQNGGEDGDGTASLRREITVSMKIISPSCFRDGPEKMSGFLEGLRCSECVDWGEKRNTIASITAGVLFFTGWWIIIDAAVIYPTMEEFNHSYHACGVIATIAFLMINAVSNGQVRGDSYSEGCLGQTGARIWLFIGFMLAFGSLIASMWILFGGYVVKEKPTVYPGIAVFFQNAFIFFGGLVFKFGRTEDLWQ	68018	84984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_68183_69954_70058_71904_72018_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575
786890	contig_4783_pilon	+	2514	1	Intergenic	novelGene_108432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	456096	456440	NA	30	ATGAGTCGGAAGTGACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFILLTFLPNLILPKSSLCEQIAFSFTSLCRPKTSEPFFTSLFSFISHIQLSNKYCGFYFQIYLEPDPSSYAVTLVQGAIFFYLNYYSSLLTGLPAYTLGELHLFYPHNLFKHQ	456095	458609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_456100_458600
786891	contig_7356_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_60425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATCCTTGAGCATAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498574	496694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_496700_498600
786895	contig_4486_pilon	+	1181	7	Intergenic	novelGene_38641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	452.379265661016	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	386	721	1027888	1037335	FALSE	35	AGGAACATGCAACAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQVKVNKYGDTWDE	1014109	1037795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029856_1037297
786901	SIRV4	-	269	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1242	10	1242	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3916	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
786902	contig_12965_pilon	-	449	3	Intergenic	novelGene_65202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	226	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATTTATGAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315874	314135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_314219_314850_314934_315591
786908	contig_4769_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_117980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	342	1029	279	1307	438163	439191	NA	25	GTATTATCAGTGTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAAALLAEEESEPERLVPVSPLPPKAALSRDEILRYSRQLVLPELGVHGQLRLATASVLVVGCGGLGCPLAQYLAAAGVGRIGLVDYDVIEMSNLARQVLHDEALAGRAKALSAAASLRRLNSAVECVPYAQALTPATALDLVRRYDVVADCSDNVPTRYLVNDACVLAGRPLVSASALRFEGQITVYHYDGGPCYRCVFPQPPPAETVTNCADGGVLGVVTGVLGCLQALEVLKIAAGLGPSYSGSLLLFDALRGHFRCIQLRKRRPDCAVCGERPTVTDLQDYEAFCGSSATDKCRSLHLLSPKERVSVTDYKRLLDSGASHLLLDVRPQVEVDICRLPHALHIPLKHLEQRDAESLKLLGEAVRERKQGTQEGAALPVYVICKLGNDSQKAVKILQSLTAAQELDSVTVQDVMGGLMAWAAKIDETFPLY	437884	440107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_437900_440100
786909	contig_4364_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
786910	contig_4769_pilon	-	2291	8	Intergenic	novelGene_118032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.2262710556426	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	251	1012	1583092	1383500	FALSE	30	GCACACCAGTCATTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATQTQTTTRTITSETQTITVAAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQTATVISLPAKSRTRKPTAPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCDVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTAAELDNDVPKPPCLSAESSDTQKAPATSLPSEAKEQTATLGERTFNCCYPGCHFKTVHGMKDLDRHLRIHTGDKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSVKPHKCHLCDYAAVDSSSLKKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTEN	1600811	1382220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1383508_1532319_1532572_1544192_1544256_1544520_1544671_1578266_1578519_1583055_1583119_1585030_1585193_1600749
786913	contig_14450_pilon	+	2249	2	Intergenic	novelGene_48961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1620	1928	1038017	1038325	FALSE	35	ACTCCTGAAAGTATACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKCLQKPKTKSQHLGSCDPPERNQSQSEESLKGKRNHIELNPTPYRKPSHFGHLDVTLIPSQRALRCEARGPQTQCIVIETSGFLHASRHYSVLSCPGVL	1036270	1038646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1037284_1037410
786914	contig_12654_pilon	-	992	9	Intergenic	novelGene_129318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	164.544067045883	408	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	181	918	827177	808478	FALSE	10	GTCCTTGGTCTGTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLEFLKSRWKRGGLLQQKRPLPPLRALSESSFCLRWCNFLPARAQSGGFRAVLESFASTMAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827357	808403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817798_823815_823887_827115
786915	SIRV6	+	185	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	547	51	547	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10784	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
786917	contig_1594_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_138837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCTACTTCTGAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635292	634465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_634500_635300
786918	contig_1594_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_138836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTACAAAATACTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633698	633128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_633100_633700
786922	contig_16461_pilon	-	323	2	Intergenic	novelGene_139212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	25	321	919	404	FALSE	25	TGAAGATGTTGCAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDIVLTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSVSNYLAWYQQKPGQAPKLLIYYASNRASGVPDRFSGSGSGTDYTLTISNLQ	943	401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16461_pilon_-_652_870
786924	contig_11115_pilon	-	1979	4	Intergenic	novelGene_102869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	45.146674542232	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	78	860	214017	212895	FALSE	15	CCAGCCTACGCCTTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STCHWGGRRLSPTIKDSDDLLLATAMVMADLDQEGTQQLTCAVNLGNQNQETRKKVTIYSFPAPSLTLSELEVSEWTMVTVACEAHAAAVVTLTGAPAPTSAQMPASKAQFSFNASAKDNGRSFSCSAALEVAGQVLYKNQTQQLQVLYGPRLNEEDCPGNWTWQEGSEKTLKCQAWGNPPPKLDCHRKGDKVSLPIGDLRPVKREFAGTYLCQAVSVRGEVTRQVVVNVLYHQNNLAIIITVAAVAILGLAGIAGYLYNRQRKIRKYKLQKAQEEASMKMNTPP	214094	211775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_213059_213138_213388_213570_213838_213914
786925	contig_5331_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_112788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282834	284043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_282800_284000
786928	contig_4232_pilon	+	892	3	Intergenic	novelGene_63224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_2	835	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	32	481	148279	149200	FALSE	10	CCCTCTCCCCTGGTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	148247	149611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_148539_148806_148884_149087
786930	SIRV6	+	298	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10527	1	1290	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11527	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
786933	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786934	contig_10196_pilon	+	835	4	Intergenic	novelGene_132112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	200.905173872872	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	29	553	922274	926282	FALSE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRFWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	922245	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924509_926037
786935	contig_9843_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_114317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATTTATGTCCTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48361	45650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_45600_48400
786936	contig_6870_pilon	+	2554	4	Intergenic	novelGene_103976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	236.412539618542	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTAAGATCTCAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443606	1449180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1443718_1444620_1444758_1444878_1445027_1447022
786940	contig_4364_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACACCTCGGCGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533298	1532853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
786941	contig_6361_pilon	-	2528	12	Intergenic	novelGene_23905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	143.718043519448	47	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	599	1039	170222	166600	TRUE	20	TTACTGAAGTGGGCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATPLPQIQPNLTNLPPGTVLAPAPGTGNVGYAVLPAQYVTQLQQSSYVSIASNSNFTGTSSIQTQARLPFNGIIPSESASRPRKPCNCTKSLCLKLYCDCFANGEFCNNCNCTNCYNNLEHENERQKAIKRHALTEIQKPLSLK	247797	155311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_156503_158628_158832_166504_166645_166803_166907_167814_167887_168646_168739_170093_170292_170443_170518_219753_219897_226023_226148_231313_231367_247662
786944	contig_2114_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_104269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGTCTCTGACCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555123	556002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_555100_556000
786946	contig_15031_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_138416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGAGCAGAGATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134404	135171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_134400_135200
786949	contig_18967_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_165329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	203	370	121027	121194	NA	15	TGGGGTTGTTAACCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPDRIRGSPDSEGRWAGASCPTQGYPRWLLAGGLSLQDCLPPLLSGEWLPAARPLPLGKQFPCTSYLMRSRKSAGWGRQPHSSNGETEAGPEKGTCFQSLAGPTLSHFSLQKPSQNCTTGRV	120824	121301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_120800_121300
786950	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786951	contig_16045_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_130858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18901	16594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_16600_18900
786952	contig_7357_pilon	+	1004	5	Intergenic	novelGene_36768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	16.2941707368003	190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	95	637	81684	122850	FALSE	30	CAATTAAGATATTCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKTADPCLQKTLHNVLLAYGRHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITKNEEESFWLLDALVGRILPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRMKIPAVAELMEGHGVLWTLVVSRWFICLFIDILPVETVLRIWDCLFNEGSKIIFRVVLTLIKQHQAFILEATSFADICDKFKQITKGNFVTECHTFMQKIFSEPGSLSMTTITKLRESCRAKLLTQG	76425	123217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_76517_81680_81778_107180_107354_107458_107645_122760
786953	contig_10801_pilon	+	1475	3	Intergenic	novelGene_74029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_1	80	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	14	355	235415	323536	FALSE	75	CTGAAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAYSMEVCYQLPVLPLDRPVPQHVLSRRGAISFSSSSALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHCKCCKQNISLRLTLNFKSS	235401	324656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_235553_319908_319970_323393
786954	contig_6217_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_109566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAACAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42750	40602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_40600_42800
786956	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
786957	contig_3817_pilon	+	1462	6	Intergenic	novelGene_78317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	626.364941547657	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	316	708	199102	204532	TRUE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178642	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198013_199026_199161_201700_201852_204349_205158_205422
786959	contig_8801_pilon	-	1632	2	Intergenic	novelGene_66282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_1	0	85	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTGTCAGTATGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450463	445434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_445892_449288
786961	contig_16999_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_84947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTTTGGTGCCATCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15608	14779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_14800_15600
786963	contig_8978_pilon	+	2198	10	Intergenic	novelGene_49353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_6	58.8358251492036	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	132	1655	200543	204398	FALSE	55	TAAAGAAGTAGTAGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAITETKVKKRHVIDPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGSCASTIGPLPHDVEVAIRQWDYNEKLAMFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVSSHSSHVMSAQSTSTLPTTPAPQPPTTSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEVNKKGNIRSKK	200411	204941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_200642_201168_201274_201485_201678_201811_201972_202459_202642_202832_202944_203050_203306_203687_203835_203996_204097_204225
786964	contig_15500_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_128995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAATTACAGCAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248973	251064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_249000_251100
786965	contig_7202_pilon	-	440	3	Intergenic	novelGene_18557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_2	8735	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	77	328	28129	27786	FALSE	15	TCAGTTCTTTCATTTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHLCDFIETHYLHEQVKSIKELGDYVTNLRKMGAPASGLAEYLFDKHTLGDSDGDN	28523	27673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28169_28486
786966	contig_15093_pilon	-	2494	6	Intergenic	novelGene_143307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGACTTTCTAAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164450	146437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_147585_149036_149273_153797_154046_156651_156755_162966_163069_163792
786968	contig_9839_pilon	+	1096	8	Intergenic	novelGene_88567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	396.828806969474	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	95	448	258981	264526	TRUE	35	GATCTAATCCATTTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQI	258886	269889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_258985_260129_260286_261583_261772_264520_264600_266322_266513_267523_267705_269528_269648_269804
786969	contig_3754_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_146849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAACACAGTCTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474898	476021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_474900_476000
786972	contig_10159_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_30887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCCACCAGCACATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987251	986337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_986300_987300
786973	contig_10159_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_30886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACATAAACAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986126	985082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_985100_986100
786974	contig_19179_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_142361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	434	763	11041	10712	NA	20	GGAACTTCTCCATAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALADEEGLILGCSHSRPTNGLLFILWREKKSTEKRISLPQLGFSTYLLNIIQNNKNNNIDTDLTFNAMPRLLQLTKHHSLQALKKVQMYGLRRQRPKKSWENGFLFAF	11474	9703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_9700_11500
786978	contig_7234_pilon	-	1672	9	Intergenic	novelGene_145941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_8	80.024898469164	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	141	623	510034	435135	FALSE	25	AACCCATTGCTGTCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPAGIVIKLVMWAFDY	587404	434085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
786979	contig_9440_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_59121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTCAGTGAACAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947545	1946195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1946200_1947500
786982	SIRV1	-	261	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3841	2	3567	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6799	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
786983	contig_3424_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_55570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCTGTGGCCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058934	1059877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1058998_1059087
786985	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
786986	contig_2867_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_135190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814321	812582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_812600_814300
786988	contig_3103_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_146219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	495	530	1024	530352	529858	NA	15	CCCGTCCCTCCCAAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSISSSAPYPGSATTASQESPLQELLAPQPFPGSSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRSSIETSIHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQLVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQGQLLPSHASIIPPEDLPGIPKVFV	530881	529856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_529900_530900
786989	contig_3103_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_146218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	295	885	314	1198	529593	528709	NA	20	CTATCAGTACCCCTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIIPPEDLPGIPKVFVPRPSQVSLKPTEEAHKKEKKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHRIKAGLASGMSSEMYTPGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETGAPSSHPTEVSPRPKHLLLSSGLYSSGSHGSSHERCFLSQSSTSQSLEDPTPFSEPSSEHPLSHKPEDTHTIKQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFGKCGRIGQRTAMLTSTSTQPLLPLSTEDKPSVVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSEIDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKVKPEQSLLSLQHPPNTTPPVPLLRSHSMPSAAC	529906	528707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_528700_529900
786990	contig_12884_pilon	+	1121	5	Intergenic	novelGene_104986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	75.6153919516391	389	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	31	702	876918	877979	FALSE	10	CCTTTGCCTATTCTGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPPPGLTLLMKSVRQSCSFLSDGPAEEWAAVTKDFVGLRAEVEAQAQELAHLSGELRQELLEALGRLLLDVPVLQALEETLEQGLLCGQVEPQDGPAGAVLECLVLPSRELVKDLAIPVFYLLGALTALSEIQHLLMAKALKTGALRGQLELVGSILEQSSPWQEPRDVSLPPGLLGSVWGEDAPAWVLLEECGLELQVGTPQACWEPEAQGRVCALYAALALLLQLGQEPS	876887	878398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_876955_877045_877222_877300_877443_877541_877616_877736
786991	contig_20819_pilon	-	647	7	Intergenic	novelGene_55677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_5	1654.39187383831	3594	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	225	605	66706	65441	FALSE	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWCHATSGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	70277	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_66682_66787_69625_69725_70232
786996	contig_15236_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_141557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTGTCCAGTCCAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336333	335164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_335200_336300
786999	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	427	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787001	contig_16643_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_158107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGACTTTGATTTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132437	132153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_132200_132400
787005	SIRV1	-	283	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3060	109	2786	-109	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7580	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6814_7552
787006	contig_16846_pilon	-	1201	4	Intergenic	novelGene_82981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1375.12528722133	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	86	577	555239	551492	FALSE	10	GCACTACTTCGGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGLLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558735	550867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551636_552659_552824_555055_555278_558688
787008	contig_19402_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_80834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135682	133530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_133500_135700
787011	contig_6710_pilon	+	513	2	Intergenic	novelGene_97830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATACACAGTGGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	657826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
787013	contig_12864_pilon	-	2247	7	Intergenic	novelGene_76342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	9.79795897113271	89	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	28	984	56380	53596	FALSE	20	TGAATTCACATGTCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPPGSATLLHILLLLPALLSSGWGELAPRIDGQTWAERALRENEHHTFTCRVTGGHGAPRLAWYLDGQLQEAGTSRLGREAFSGGTSTFTVTAQRAQHELNCSLQDLGSGRSANASVILNVQFKPEIAQVGAKYQETQAGLLVVLFALVSANPPANVTWIDQDGPVTVNASDFLVLDTQNYPWLTNHTVQLQLHNLAHNLSVVATNDVGVTSASLPAPGPSRRPSLISSDSNNRKLSNVHLPRENMSLPSNLQLNDLTLDSRAGKPADRQMARPNSRPELLDPEPGGLLTSRGFIRLPMLGYIYRVSSVSSDEIWL	56407	52332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_53670_53816_53907_54039_54141_54289_54321_54971_55260_55738_56042_56310
787015	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8115	14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
787018	contig_8045_pilon	-	1653	2	Intergenic	novelGene_35439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	85	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTATACTAGGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434681	432671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_434213_434569
787019	contig_17440_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_7603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATGAATTCCGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
787023	contig_776_pilon	-	1020	8	Intergenic	novelGene_139933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	118.107007862034	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	376	873	888118	833183	FALSE	20	GTTTTAGCTATTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMKLKAISTLLTVINFINNNKKSGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRFGL	932105	833035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834739_834799_857382_857510_861796_861886_863749_863884_888042_888299_911670_911784_932023
787024	contig_9706_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_21008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512300	510575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_510600_512300
787026	SIRV4	-	259	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1254	8	1254	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3904	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
787027	contig_8538_pilon	+	286	2	Intergenic	novelGene_4625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_1	0	143	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGTCTTTCTGTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795025	796300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_795199_796187
787032	contig_14925_pilon	-	1618	4	Intergenic	novelGene_55323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	23	436	116065	114666	TRUE	10	ACTTGCCTTTGGCTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116087	112095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
787034	contig_16766_pilon	+	2398	1	Intergenic	novelGene_153353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACACGACGTTTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114438	116836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_114400_116800
787038	contig_10299_pilon	-	1532	12	Intergenic	novelGene_79677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_11	46.6793174509434	271	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	28	1185	194338	188031	FALSE	10	GTTTTGTGAATTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSSVRWLTRALVATPNPGVWRGLGTSAATRAASRSQGEDVRVEGAFPVTMLPGDGVGPELMHAVKEVFKAAAVPVEFKEHHLSEVQNMASEEKLEQVLSSMKENKVAIIGKIHTPMEYKGELASYDMRLRRKLDLFANVVHVKSLPGYKTRHNNLDLVIIREQTEGEYSSLEHESAKGVIECLKIVTRTKSQRIAKFAFDYATKKGRNKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAELYPKIKFETMIIDNCCMQLVQNPYQFDVLVMPNLYGNIIDNLAAGLVGGAGVVPGESYSAEYAVFETGARHPFAQAVGRNIANPTAMLLSASNMLRHLNLEYHSTIIADAVKKVIKVGRVRTRDMGGYSTTSDFIKSVIGHLHPYAG	194365	187683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_188118_188847_188909_188990_189086_189360_189508_189811_189915_190007_190142_190247_190381_190455_190517_193639_193761_193858_193958_194122_194204_194302
787039	SIRV2	-	556	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	126	4	-126	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCGCTGCAAGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
787046	contig_3584_pilon	-	2411	4	Intergenic	novelGene_108121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_1	169.357609808358	12	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	318	824	254310	218214	FALSE	25	TTCCTGAACTTATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKVTFNEIRCLCLD	277337	216626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_218395_223202_223328_254109_254314_277023
787047	contig_1867_pilon	+	1787	13	Intergenic	novelGene_54589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAACCGGCCCGGCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493191	566866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_493344_531513_531646_532496_532637_537552_537677_538245_538437_546225_546368_547618_547727_547862_548021_548574_548748_550593_550747_550974_551129_553311_553377_566771
787049	SIRV6	+	148	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	61	787	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
787051	contig_7730_pilon	-	1216	5	Intergenic	novelGene_156253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	611.200202470516	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	188	628	43591	2302	FALSE	30	AATGCATTTCTGATATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERGKKKNFP	43778	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2328_2412_2445_4051_4177_7798_7895_43429
787055	contig_5264_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_165054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTAGAACTACCCCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93653	92293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_-_92300_93700
787057	contig_7593_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_127336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557349	557845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_557300_557800
787058	SIRV6	+	394	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	554	14	375	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787062	contig_17014_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_163163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCAGTGGAAGTTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17248	18041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_+_17200_18000
787065	contig_14829_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_163829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGATATTTCCAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249426	250518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_249400_250500
787066	contig_7870_pilon	-	1128	8	Intergenic	novelGene_108893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	50	TAAAATAATTGACAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
787067	contig_15087_pilon	-	1111	12	Intergenic	novelGene_37194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1135.53224131875	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	28	1110	158925	110644	FALSE	15	ATGAGTGACGTGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSTITTLFMPERLKSRSHRFRPPPLHICFLSLFPASVPRHSLCPGLDFLKSKNILSLSL	158952	110642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_110819_139537_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907
787068	contig_14807_pilon	+	1189	7	Intergenic	novelGene_124726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	323.779631848577	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	77	859	75260	77275	TRUE	0	CGTGTTGGCTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCSALPGRPAPRPSPPRGPGAGRAMEDYTVLSDAELVAMLRQYNIPHGPVVGSTRKLYEKKIFEYETQRRRLSPSNSSASSFSYRFSDFDSTSSDSDKYDLPKKEDALFYQSKGSNDDYEESYLHTRTSGEPESVGASRNFREPVASLSNTETFGHQTREDDLFTSSEEESKDRERPLYARDSTYQSIAHYRPISSISRATVGLPCYPSTTSTSSTSSSSYSSPSWLARRAIRPEKQVPGAGQSQDRQVPLWGQLLLFLIFAAFLVFVYYLLQADDGNPFWVDP	75183	77672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_75342_75435_75544_75934_76013_76211_76343_76791_76842_76941_77373_77439
787069	contig_3975_pilon	+	1074	5	Intergenic	novelGene_54890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	68.69634269741	362	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	32	433	2099675	2103258	FALSE	20	CTGAGGTTAGTATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPEVERSGVTMAASLGQVLALVLVAALWGGTQPMLKRASAGLQRVHERTWAQQLLQEMKTLFLNTEYLMPFLLNQCGSLLYYLTLASTDLTLAVPICNSLAIVFTLIVGKLLGEEIGGKRAVAGMVLTVTGIALCITSSVSKT	2099643	2103899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2099691_2099973_2100126_2100912_2100980_2102748_2102842_2103184
787070	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1146	10	1146	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
787074	contig_854_pilon	+	1570	3	Intergenic	novelGene_36494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2473	junction_1	4034.5	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	175	765	1649514	1656294	FALSE	10	TTTAGTTGCTCTCTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQGECPGGTRPSQWLSLHHVLFTCFLWPHWPLSRD	1612771	1657099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036
787075	contig_1939_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_144862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGAGAAAAAAATTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225267	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_225300_227900
787077	contig_2379_pilon	+	1098	2	Intergenic	novelGene_159434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3	413	24508	91375	FALSE	45	GATTAAAAGTGCTATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTDLSQFENDYSAVSDSVFQLLDGLIAFYSSPKIPFSSFWTEAVCILGRLFCDCNLSNHILKKCSKKLEEFEKTLLQVILRNNHINRFQVQHYISQSLITLGSCSFLRRSIVSLLLSEVNSFTDDLETIIQVLII	24505	92060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2379_pilon_+_24772_91228
787078	contig_8676_pilon	+	1545	9	Intergenic	novelGene_142223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	300.746752891864	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	124	1002	666237	672718	FALSE	25	TCAAAAGTGGCTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSPKLAGELQGIRLGSLLPPKQIRLLEATFLSNEVANVKELMARALELESQRWAQDVPPQRLDGHCHSELAIDVIQIVSQSQAKAESITSDLGVQIRQVLLLELAGFLRSYQRAFDDFLERYKQLKNYRANVIANINNCLSFRASVEQRWQTLQDTHSHLLVPLNEIKTHGFDSLLQNLFLDLKPLFKRFTQTRWSAPVEILEEILATVSERLPEFSELQDSVRKELMEAVHLHLVKEYIIRLSKRRLILKTAEQQQQLARHILSNADLIHCFCTQNGSSANWLSLALPRLAEIICLQDLNAIKIEVATYVTWYPDFRSPGFFLPWSHWWVNR	665697	673261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_665803_666218_666342_666550_666652_667206_667306_667814_667939_668983_669107_669414_669571_669677_669800_672669
787080	contig_7333_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_142760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCAGTACTGAGTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145620	146811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_145600_146800
787084	contig_14441_pilon	+	783	4	Intergenic	novelGene_100629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.064333633354	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	284	781	116728	117783	FALSE	10	CTTGGCGCTGCCTACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGESLFFRPRRRSPESSPGGEPGASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTA	111248	117785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111300_113125_113209_116578_116971_117528
787085	contig_9706_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_21039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCTTAGAACCTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639294	639950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_639300_640000
787086	contig_854_pilon	-	624	5	Intergenic	novelGene_36098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1795.77398007099	11226	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2	571	94633	91429	FALSE	5	CGAGCCTCGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQWSLQTAGVAIPGSPPALSHGLWSGRQQRESQTRGVPPNAGRGGPRRQESFLHSFVQVGCFLDSCVTLDQSVNLIRSPFVHHFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVCISFEEADLSIKLPDGYTFKFPNRLNLETINYLEAEGDFKVKCVAFE	94634	91375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91870_92043_92598_92697_93127_93208_94560
787089	contig_14744_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_65918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAGAATAGTAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107711	109952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_107700_110000
787090	contig_5260_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_144404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTCACCTCCCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470849	469581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_469600_470800
787091	contig_9354_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_108053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTAGAGTTGCTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206295	206709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_206300_206700
787093	contig_9345_pilon	-	2219	7	Intergenic	novelGene_24565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	65.925252285364	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1187	2092	890264	881092	FALSE	60	GAAAAAAAAAAAGACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQEEGKEQLSETEGSGEEELGSDPSETIQKKVKGQPCPKRLFTFSVVNSYGTADINSLATDGKLLKLNSRSTLAIDWDSETRNLYYDEQESETCEKHVSMLQPQKKKKTSVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPVRALNMSEFVCDLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFSKTPSPITLPGSSDGGMRPSSSQQGLGDDEACSMDTN	891450	880964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053
787096	contig_5671_pilon	+	972	5	Intergenic	novelGene_79464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1916.44089068774	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATATATATTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370402	531795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370505_376727_376781_392775_392919_521218_521303_531205
787099	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	236	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
787101	contig_11816_pilon	+	748	2	Intergenic	novelGene_98598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTGTTTCTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1427200	1429098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1427682_1428831
787103	contig_3975_pilon	+	1152	10	Intergenic	novelGene_54870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGGTGACGCGAGGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2091884	2099558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2092043_2092163_2092256_2092977_2093052_2093358_2093446_2093566_2093684_2096132_2096263_2096346_2096484_2097467_2097545_2097852_2097939_2099364
787105	contig_11428_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_138489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCCCAAGTTATTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57451	60066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_57500_60100
787107	contig_5217_pilon	+	1656	12	Intergenic	novelGene_135725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	64.7152695714271	174	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	195	1550	344794	487428	FALSE	25	TGTTGGAGACTCATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFQAVVMAVGGGSRMTDLTSSIPKPLLPVGNKPLIWYPLNLLERVGFEEVIVVTTRDVQKVLCSEFKMKMKADIVCIPDETDKGTADSLRHIYPKLKTDVLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAHDASLAVLMRKGQNSIEPVPGQKGKKKAVEQRDFIGVDSTGKRLLFMANEADLDEELVIKGSILQKHPRIRFHTGLVDAHLYCLKKYVVDFLMENKSITSIRSELIPYLVRKQFSSSSQQGQEEKEEDLKKKEPKSLDIYSFIKEANTPNFAPYDACWNACRGDRWEDLSRSQVRCYVHIMKEGLCSRVSTLGLYMEANRQVPKLLPVLCPEEPLVHSSAHIVSKHLVGVDSLIGSDTQVGEKSSIKRSVIGSSCVIRDRVTITNCLLMNSVTVEEGSSIQGSVICNNAVIEKGADIKDCLIGSGQRIEAKAKRVNEVIVGSDQLMEI	335152	487534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_335338_344784_344942_348213_348360_389730_389891_399974_400087_439261_439352_456531_456657_457777_457969_463080_463159_463760_463910_474758_474863_487375
787109	SIRV6	+	217	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	514	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
787110	SIRV2	-	441	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	25	361	25	-361	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTTAGTTGAGACAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5870	4026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
787114	contig_11285_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_5489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2015	2476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_2000_2500
787115	contig_9440_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_59098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACTGTGGACATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699705	1698666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1698700_1699700
787117	contig_5423_pilon	+	1212	2	Intergenic	novelGene_85313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAGAATTCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778185	779644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_778539_778785
787123	contig_1301_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_47375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCTGGTAGTTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663613	662123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_662100_663600
787130	contig_2100_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_50651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTGACCCTACAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096256	1095805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1095800_1096300
787131	contig_2100_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_50650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTCAGTGCTCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092372	1091796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1091800_1092400
787132	contig_5153_pilon	-	2460	1	Intergenic	novelGene_74347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTAAGGCTCTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762016	759556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_759600_762000
787133	contig_10437_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_38502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTAACGGTGGCACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304166	1304530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1304200_1304500
787134	contig_6102_pilon	+	1747	2	Intergenic	novelGene_32067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	3	junction_1	0	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	51	674	672232	673221	FALSE	30	AATACTTTCTCTGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHFACSLRLCSWGAKRLRIAAAEARRGISFKLEEKTAHSSLALFKGDTGVKYGMVGLEPTKVALNVERFRDWAVVLADTAVTSGRHYWEVTVKRSQQFRIGVADVDISRDSCIGVDDHSWVFTYAQRKWHTMLVKEKTPIEGIGQPEKVGLLLDYEAQRLSLVDVNRVAVVHVLQTDFRGPVVPAFALWDGELLTHSGLEVPEGL	672181	674294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_672317_672682
787135	contig_8452_pilon	-	696	4	Intergenic	novelGene_48084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1552	junction_3	670.11557875406	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	167	388	968728	962919	FALSE	15	CAGGCTAGTGGTTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	981709	962610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637
787137	SIRV4	-	200	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1318	3	1318	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3840	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
787138	SIRV5	+	345	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	886	-26	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
787140	contig_9423_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_99164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	915	1280	5103	5468	NA	25	GCCTGAAAAGGCTGGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEHCHSGWRERTCGSHVLACVGAHLPRMWGGKQHQKAAQGVKTTPRQGAFKQDRCGKETHSSFNQRISRPWYFHSTWMPTGLKAPEMTCSQTFFSPTSQMQPISKAQLPCSAANSFKKF	4188	6471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_4200_6500
787141	contig_7057_pilon	-	1541	3	Intergenic	novelGene_123232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	32	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	732	1076	537793	537449	FALSE	10	CGTATTTGCTAGCCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPCTPSYLLSLTSGSLAVDSMRWGTVARGWGGHLGSETPECARGRGLPNALLSGLCPGNVLEVASATSCICGPSPGTSGGNSMGGALGAGTSGPASQDSSYPEASLDTLKAA	539712	536983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_538404_539420_539484_539654
787142	contig_15092_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_57783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGCTCATTTGATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311326	310964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_311000_311300
787149	contig_5321_pilon	-	1091	2	Intergenic	novelGene_153863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82525	17247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_18316_82502
787152	contig_14300_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_133099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162037	161015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_161000_162000
787159	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
787160	contig_14326_pilon	-	2379	8	Intergenic	novelGene_120722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_7	42.1179102917861	1	123	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	9	1238	493216	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSVGPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493224	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
787162	SIRV2	-	513	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-66	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCGACACAAGACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4798	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4340_4480_4687
787167	SIRV2	+	444	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-55	134	-55	-134	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAATGACTCTAATACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
787171	contig_753_pilon	-	1950	2	Intergenic	novelGene_112905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTTTATAGAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277855	275256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_276471_277119
787172	contig_8276_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_174471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107851	106308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_106300_107900
787173	contig_7347_pilon	-	2223	2	Intergenic	novelGene_172499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGAATAAAGGAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259756	254629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_254672_257575
787177	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	15	347	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14423	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
787178	contig_7171_pilon	+	2329	14	Intergenic	novelGene_101428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3.15103063819447	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	690	2000	1627780	1644254	FALSE	10	GCCTGTGACTTTGTCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLCPCWPCCCLLLLFSRGVQGAPGDAIPEQVHLSYPDEPGAMTVTWTTWVPAPSEVQFGLQLSEPLPFQTLGTSSPFVDGGILHRTLYMHRVTLRRLLPGVQYVYRCGSAQGWSRHFRFKTLKNGTQWSPHLAVFGDLGADNPKALPRLHRDIQKGMYDAVLHVGDFAYNMDEDNARIGDRFMRLIEPVAASLPYMTCPGNHEERYNFSNYKARFSMPGNTEGLWYSWDLGPAHIISFSTEVYFFLHYGYHLVERQFRWLESDLQKANQNRAVRPWIITMGHRPMYCSNADLDDCTRHESKVRKGLFGRLYGLEDLFYRYGVDLQLWAHEHSYERLWPIYNYQVFNGSSVTPYTNPRGPVHIITGSAGCEELLTPFTIFPRPWSAVRVKEYGYTRLHILNGTHIHIQQVSDDQDGKIVDDFWIVRPLLNRMLYL	1573456	1644583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1573837_1576514_1576666_1627621_1627895_1634881_1635083_1635382_1635566_1637011_1637136_1637426_1637490_1637585_1637701_1637791_1637900_1637990_1638049_1638135_1638204_1638310_1638383_1642040_1642179_1644188
787180	contig_12635_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_60862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAAAACCAGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611189	609708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_609700_611200
787182	SIRV4	-	211	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1312	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3846	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
787186	contig_11590_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_125604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791686	790898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_790900_791700
787195	contig_15123_pilon	-	1356	7	Intergenic	novelGene_110936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	71.4399514744143	60	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	717	1082	320397	318930	FALSE	10	GATTATTTTTCCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI	321929	318655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319292_319627_319688_320277_320408_320544_320630_321186_321683_321804
787197	contig_4531_pilon	+	1989	11	Intergenic	novelGene_47877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	191.332407082543	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	184	1317	228616	330172	FALSE	5	TTGTGTCCGTTTTCTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEKKRRDREERQNIVLWRQPLITLQYFFLEILVILKEWTSKLWHRQSIVVSFLLLLAVLIATYYVEGAHQQYVRRIEKQFLLYAYWIGLGILSSVGLGTGLHTFLLYLGPHIASVTLAAYECNSVNFPEPPYPDQIICPDEENIEGAISLWSIISKVRIEACMWGIGTAIGELPPYFMARAARLSGAEPDDEEYQEFEEMLEHAETAQDFASRAKLAVQNLVQKVGFFGILACASIPNPLFDLAGITCGHFLVPFWTFFGATLIGKAIIKMHIQKIFVIVTFSKHIVEQMVAFIGAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	211544	330844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_211717_228604_228741_229766_229858_230729_230841_257190_257359_264246_264379_301983_302065_303610_303728_310531_310594_328808_328912_330028
787199	contig_8571_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_169157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.591717135396	101	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	447	839	306796	305540	FALSE	50	CAAGGGCTGAAATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNERSLAFYATCDAPVDNAGFLYKKGGRHATYHRRWFVLRGNMLFYFEDPASREPVGVIILEGCTVELVEAAEEFAFAVRFAGARERTYVLAPRAAGAEGAPRSRPRFQCVNSTLRWLGSGPPGLEQG	310348	304157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_305651_306514_306832_307164_307366_308759_308905_310283
787202	contig_1154_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_87064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAACAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161219	159609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_159600_161200
787203	contig_7165_pilon	-	1649	3	Intergenic	novelGene_116870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	4.5	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	143	838	587789	569717	FALSE	20	ATTAGTAGTCTGTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVVDFQDEEQVKSFLQNMEVECNYQCYREKDPDGCYRLVDYLEGIQKNFDEAAKVMKFNCEENQHSDSCYKLGTYYVTGKGGLTQDLKAASNCFLMACKKPGKKSVEACHNVGLLAHDGQVNEDGHPDLGKARDYYTKACDGSYAASCFNLSAMFLQGAPGFPKDMNLACKYSMRACDLGHVWACANASRMYRLGDGVDKDEAKAEVLKNRAKQLHKEQQKSVHPLTFG	587931	568905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_570166_584658_584800_587683
787208	contig_15327_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_70431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	274	609	39965	39630	NA	80	AAGTCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIQGVQSHRRRKDKEQEELGRQRADSFHEIKQKLCGRRVDWESVPHEKRAGSVPRQWNCQREGLETDSMACLRETRTLGVVWLERGAHTGAVVREGCQIVKGLVITYNY	40238	38084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_38100_40200
787210	contig_990_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_76077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTCAAACTGCTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096248	1097130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1096200_1097100
787212	contig_8865_pilon	+	2111	2	Intergenic	novelGene_164467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1434	1811	446631	447008	TRUE	30	TCCTGAATCTAATGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNKGMRMLVQNKALVSEGALVFLWSVTSMSTLGFLEKLISVLKRNLGQAEEAIRLTFKYPKTPGGKTHIRVQSTSCKTTKLLPNLLKDFWVWEDGKRLKANRGHCALRIDLMDKTNSKVIVTI	445197	448275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_447165_448131
787213	contig_8865_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_164468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATGTTACTCTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448325	448629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_448300_448600
787214	contig_383_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_126141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGATCTCTAGTCTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244259	244977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_244300_245000
787216	contig_15905_pilon	+	927	7	Intergenic	novelGene_154704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	242.911334990088	1285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	92	700	117212	134917	TRUE	10	GATTGTTTTCTTTTGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGGWGLCRALQLPGDKQSPRVASAPRDPAMVRAGPVGTHLSASGLDIFGDLRKMNKRQLYYQVLNFAMIVSSALMIWKGLIVLTGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNFQEDPIRAGEIVVFKVEGRDIPIVHRVIKVHEKGNGDIKFLTKGDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFHVSIQPAPIHFCLLISPPDRSCPFYLLELRSTLFTSFYHMLVWLP	117120	135967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_117299_128768_128879_130304_130455_133188_133309_134139_134250_134885_134944_135766
787219	contig_5153_pilon	+	1737	16	Intergenic	novelGene_74369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	264.483362215639	2	77	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	380	967	1010261	1016092	TRUE	25	ATTTGGAGACATATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKVSGLDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEDPGGGHSERHVRALPAAPHLTLSGKPG	956675	1022502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010039_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012142_1012831_1012935_1014969_1015061_1015434_1015507_1016078_1016140_1017374_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
787221	scaffold_13505_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_111664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGCCCCCCTCTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859593	858897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_858900_859600
787222	scaffold_13505_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_111663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	369	809	858173	857733	NA	20	TGTTTATTACATATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRVGKTLKPHRTSVPQPQHQLCPLGQPELESDTESESWARRVFRWGHRQAITATVTEQFRPPPGLSEGLPPRWMLQRACELETISSLTDGSRRPRKEELRKVAQPSEAKLRWVPGSRTTQVLETSLLARLQIRGAAQGQAEREG	858541	857400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_857400_858500
787225	SIRV4	-	291	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1227	3	1227	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
787227	SIRV1	-	232	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3864	8	3590	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6776	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
787228	contig_5815_pilon	+	817	4	Intergenic	novelGene_141227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4142	junction_1	15211.6517694679	310	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	23	400	1041346	1045638	FALSE	10	GCCTTCGTGCGATTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHPGPGRMAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKSKFARSHKAI	1040934	1046055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1044248_1045493
787230	contig_12292_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_166992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202928	203811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_202900_203800
787232	contig_14882_pilon	-	2705	2	Intergenic	novelGene_115030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	42	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAGAAAAAAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363666	319283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_321739_363416
787233	contig_15120_pilon	+	1380	2	Intergenic	novelGene_108002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACATTCTGCTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143605	147249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_144488_146751
787237	contig_9706_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_21021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATAAAACAGAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567452	565757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_565800_567500
787239	contig_12588_pilon	-	2429	2	Intergenic	novelGene_173090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	824	1126	73212	72910	FALSE	65	GTATACAAGAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVTFLNLGSNPISRIRLLKRLTTPLLSISVQGFDLYLKNIWICFGFASLAMTELVRTGLKPSAEGGRALGGAGNEEQTCCQALMGLFPQTLSLLQANVL	74672	71606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12588_pilon_-_73883_74519
787240	contig_9931_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_134820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGACCCCTACTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297942	298232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297900_298200
787241	contig_7057_pilon	+	990	10	Intergenic	novelGene_123310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	852.553477559482	238	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	161	964	936984	943696	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHRLGCCHTPRAFSVLEESLLSLHPVTPVPVTPPAAVLPGPRPTCPVPLFLLCFQPARPRKK	936001	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941426_943513
787245	contig_14220_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_159865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTGGATTTGGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327373	328182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_327400_328200
787252	contig_5718_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_110354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAGCCAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680234	681971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_680200_682000
787254	contig_12492_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_77501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTGCTGTGTACATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273492	273006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_-_273000_273500
787256	contig_3004_pilon	+	1827	2	Intergenic	novelGene_127546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	55	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	138	317	802247	814117	FALSE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGAPAPGGSCRALVPHGPLRLGVASQAKAGERVPRRQRPGDPGEMEAASPTAAESAGREELDMDVMTPLINEPNFDGTSDEEREQELLPVQKHYQLDDQEGIS	802109	815627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989
787258	contig_10689_pilon	+	709	3	Intergenic	novelGene_118639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_2	116	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	60	506	57680	61101	FALSE	35	AAAGATCATTGCCTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	57620	61304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_57792_58211_58374_60928
787259	contig_16103_pilon	+	1066	2	Intergenic	novelGene_118737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCAGATCCAGCCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297682	304335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_297792_303378
787261	contig_6710_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_93410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653638	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
787263	contig_15354_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_65704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTCCTATACATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132231	131164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_131200_132200
787264	contig_7720_pilon	+	1419	9	Intergenic	novelGene_155756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_3	17.519631845447	171	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	583	1125	567290	635457	FALSE	0	TCTCGTGTGGTCCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKWRNGDIVQPVLNPEPNTVSYSQSSLIHLVGPSDCTLHGFVHGGVTMKLMDEVAGIVAARHCKTNIVTASVDAINFHDKIRKGCVITICGRMTFTSNKSMEIEVLVDADPVVDNSQQQRYRAASAFFTFVSLSQEGKPLPVPQLVPETEDEKKRFEEGKGRYLQMKAKRQGQVEPQA	497417	635751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_497569_546498_546617_557212_557370_561411_561505_567226_567342_574306_574394_599033_599151_612956_613145_635358
787267	contig_12765_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_106566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGTTAACAACCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156778	156280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_156300_156800
787270	contig_5145_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_131382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCAGGCTGAGCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603958	602918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_602900_604000
787271	contig_5145_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_131381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGGGGGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602769	601997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_602000_602800
787274	contig_3409_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_172310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	342	650	137053	136745	NA	25	GCTGTCCACCATATAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSITSYVCESWTMNKEDQRIDAFELQCWQRISNIPWTARRMNKYVLEEVPPQCFLEARMVRLRLMYFGHVIRRDQSLEKDFMLGKVEGQQKRGRPFSEMD	137394	135812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_135800_137400
787275	contig_9673_pilon	+	986	7	Intergenic	novelGene_119167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	177.790763414626	579	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143212	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_143356_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
787277	contig_17602_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_174500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88987	87281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_-_87300_89000
787278	contig_2113_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_161147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATGTTACACAACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243675	245849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_243700_245800
787281	contig_11978_pilon	+	1121	10	Intergenic	novelGene_62799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	80.0468998327824	26	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	115	1014	299759	589465	FALSE	10	TTGCCATGTCTGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPDSSSSSLSMSTRPRLPYP	299644	589572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547777_589409
787284	contig_8156_pilon	+	1648	5	Intergenic	novelGene_98946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	323	700	398306	403429	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTADMTNQSHEYFLSTCCLFPTSGNGRHNSTFSPVPYLFKIMRACIVQGSRRRAWLSCTASTVLRATVSGFSGGKRLGNLTLMPWNISVLVWKGSTVVALTPGQSSSPRVRLSMKAKAEALDVQ	397983	441768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_398544_403289_403537_403887_404006_404667_404810_441187
787287	contig_9014_pilon	-	1174	11	Intergenic	novelGene_106814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	30.696742498187	139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	20	1012	160706	152605	FALSE	20	CATACAGTTGGTTGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAHHCPLCRQTFFCGRGHVYSRKHQRQLKVALERLLPQVEAARKAVRAAQVERYVPEHDRRCWCLCCSCEVRKHLSHGNLTVLHGGLLEHLASPEHKKATNKFWWENKAEVRMKDKFLISPQDYARFKKSMVRGLDSYEEKEDEVIKEMAAQIREVEYSRQEMVRSVLEPQAVQDPEEGSSTPGSWKQRNRVSSSSQQPSDLDLPTAPELDWMETGQPLTFIDHQDIPGVGNIHSGATPPWMVQDEENSPGSQQIGPSYEEFLKEKEKEKLKKLPPDRVGANFDHSSNTNACWLPSFGRVWNNGRRWQSRHQFKTEARNKQQSRKGKT	160725	152442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_152663_152746_152880_152957_153048_154044_154076_155240_155344_155528_155594_155938_156002_156077_156145_158771_158871_160304_160469_160586
787288	contig_2969_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_157065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATATAGAAATAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845569	843803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_843800_845600
787290	SIRV6	-	411	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8998	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10818	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723
787293	contig_7753_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_41520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAAAGAGAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1265969	1263852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1263900_1266000
787294	contig_6445_pilon	-	2204	13	Intergenic	novelGene_76991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_3	110.762853530515	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	28	1191	465313	433537	FALSE	20	CCCAGCTTCTCAATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGFFKHGYMVVNVTSLSVNKPEGATDKDPTIGFSLDRTKNDGFSSYLDEDVNYCILRKQSVSVTLLILNISRREVRVKSPPEAGTQLPKIVFSKDEKVLDQSQEPSGNPVSAGNQTQKNEDSGKSKRSTVNSKPMGEKSFSVHNNDGAVSFQFFFNISTDDQEGLYSLYFHKCRGNETQSSDKVSFSLDIEITEKNPDSYLSAGEIPLPKLYISMAFFFFLSGTIWIHILRKRRNDVFKIHWLMAALPFTKSLSLVFHAIDYHYISSQGFPIEGWAVVYYITHLLKGALLFITIALIGTGWAFIKHILSDKDKKIFMIVIPLQVLANVAYIIIESTEEGTTEYGLWKDSLFLVDLLCCGAILFPVVWSIRHLQEASATDGKGKFLCALFVLLTFP	465340	432523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_433625_440892_441024_445873_445992_446430_446505_447823_447900_454080_454215_454572_454684_458144_458202_460227_460266_462440_462581_464510_464591_464844_464896_465247
787299	contig_9871_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_75686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTCACAACAACCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536002	533380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_533400_536000
787300	SIRV6	+	478	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	701	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845
787307	contig_10196_pilon	+	1256	3	Intergenic	novelGene_132348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	3.5	1806	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	71	397	2476343	2480661	FALSE	50	TAAATACTGTTAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRGGCRESGAGLGGRNRPDSAAMLLFCPGCGNGLIVEEGQRCHRFACNTCPYVHNITRKVTNRKYPKLKEVDDVLGGAAAWENVDSTAEPCPKCEHPRAYFMQLQTRSADEPMTTFYKCCNVQCGHRWRD	2476272	2481520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2476454_2479177_2479266_2480533
787308	contig_7380_pilon	-	2249	1	Intergenic	novelGene_157528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGTGTGAGTGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301621	299372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_299400_301600
787309	contig_8729_pilon	+	1021	4	Intergenic	novelGene_40078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACGCGGCATCGTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69492	73318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_69781_70466_70630_71386_71638_72999
787316	contig_6726_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_86240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTACTGCAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304647	303893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_303900_304600
787320	contig_11846_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_106011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATAAAAACGCTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455696	453906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_453900_455700
787321	contig_10163_pilon	+	2598	7	Intergenic	novelGene_82609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	42.6708982276628	21	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	225	1250	11226	24845	FALSE	20	TGAAGTGATTCCCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENMKLATVEDTVEYCLFLIPNEPRNPEKHKEILLKYIERIMTHFAPILVPYIWQNQPFNLKYKPEKGDVPAHMFGMTKFGDNIEDEWFIVYVMKQITEEFPELVARIEDNDGEFLLIEAADFLPKWLDPDNSTNRVFFHHGELCIIPAPRKPRAISWLPTTTPTIPQALNIISTHPEKILASESIRAAVNRRIREYPEKIQASLHRAHCFLPAGIAVVLKQRPRLVAAAVQAFYLRDPFDLRACRVFKTFLPDTRIMTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLVMLNQKFYFLLCVKVLLSNQWHSVESLGICPVYMRLS	6467	26193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6679_11212_11431_13892_14011_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602
787325	contig_4962_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_107398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAATTGCTTACAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550316	548819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_548800_550300
787330	contig_9482_pilon	-	2196	10	Intergenic	novelGene_44265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	61.8183320127574	33	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	14	1240	773701	748914	FALSE	60	GAAAAAGTAGATAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKGTRERRAAPQHGVSLRVLLRVFPTACVCC	773714	747957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_749099_751176_751253_754752_754886_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
787331	contig_13409_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_128445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAACCAGAAGAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39172	38511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_38500_39200
787334	contig_19606_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_148284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCCAGCCGTACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166649	167251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_166600_167300
787337	contig_7171_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_101246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	221	340	745953	745834	NA	15	TCACGGATCGTCCTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGQRLWSSHDLTIWSQHLFYTLENRHTPFSGFGSVSNISVVFSTSRNSSKTSLFRLLSLPSTNSSGCTSRVSQMVVMSILLWSALSSKIPFTLDWRFQFQCYRFSLLHFHLC	746173	745670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_745700_746200
787339	contig_10609_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_123977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	137	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATACATAGAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644701	646970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_644700_647000
787340	contig_1719_pilon	-	1215	5	Intergenic	novelGene_87369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	559.149968702494	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	86	568	803613	755903	FALSE	10	AGTGTGTTTGCTCGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQSCASAAVITQVFAFCSRLLFSFTGGCS	803698	755255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755987_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
787341	contig_10734_pilon	-	1464	3	Intergenic	novelGene_51083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	9.5	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	92	592	530044	527027	FALSE	60	AAGCTACAAATAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASALFRFPVSLTRTRTVRPGLGLWETLTLLSREIAVTRVQMAGKKDCPALLALDESQLEEQFVKGHGPGGQATNKTSNCVVLKHIPSGIVVKCHQTRSVDQNRKLARKILQEKVDVFYNGENSLVYREKREAEKKKQERKKRAKETLEKKKLLKELWGLSKNAR	540311	526154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_527246_529762_530070_540245
787342	contig_3307_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_86887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTTCTAGGGTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130415	129809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_129800_130400
787343	contig_14575_pilon	-	1593	16	Intergenic	novelGene_101892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAATTTTATTTTTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63922	26341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_26426_27682_27778_28956_29020_30471_30761_33860_33951_41531_41650_42755_42849_44947_45001_47299_47374_51062_51144_54375_54489_59250_59374_59880_59984_61541_61637_62293_62355_63864
787345	contig_7513_pilon	-	2043	5	Intergenic	novelGene_88955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	85.1098554810194	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	509	1357	154535	146657	FALSE	90	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGYHGVDHRVETCPSSNTPWTWHSRDHDEPCLSPQVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	155043	145970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147151_147983_148086_152144_152280_154232
787346	contig_6137_pilon	-	1337	2	Intergenic	novelGene_59251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGAACTGGCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324458	1319307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1320097_1323910
787347	contig_14814_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_137754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTAAGACGTCTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405107	406912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_405100_406900
787349	contig_17274_pilon	-	1879	2	Intergenic	novelGene_26560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTAGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201403	197629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_199002_200896
787350	contig_11780_pilon	+	711	5	Intergenic	novelGene_134305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	34.5181111881864	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	528	183	710	66429	93600	FALSE	25	CTCTAGTGCAATTGCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWETVHTILQELPDLEELFLCLNDYETVSCPSICCHSLKLLHITDNNLQDWTEIRKLGVMFPSLDTLVLANNHLNAIEEPGDSLARLFPNLRSISLHKSGLHSWEDIDKLNSFPKLEEVRLLGIPLLEPYTTEERRKLVIARLPSVSKLNGSVVTDGEREDSERFFIRYYVDVPQEEVPFRYHELITKYGKLEPLAEVDLRPQSSAKVEVHFNDQVEEISIRLDQTVAELKKQLK	64955	93601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_65002_66292_66550_68038_68166_70308_70426_93437
787351	contig_2100_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_50618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAATTACTCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816122	816776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_816100_816800
787355	contig_9653_pilon	+	1199	3	Intergenic	novelGene_48317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAACAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015967	1018425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1016781_1017927_1018023_1018134
787356	contig_7751_pilon	-	2061	2	Intergenic	novelGene_174503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	56	538	277825	276923	FALSE	25	CCATAACTCAGGCTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYVCRECGRSFTRKSDLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCKECGRGFSQKSGLLLHQRTHSGEKPYVCKECGRGFNFKSTLIRHQRTHSGEKPHTCKECGRGFNCKSNLVRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSHLLLHQGTHSVEKSHVEGIWARL	277880	275399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7751_pilon_-_277229_277648
787358	contig_10436_pilon	-	1752	6	Intergenic	novelGene_108509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	61.3142724004778	120	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	334	423	106604	106515	TRUE	20	CTGATCTAATTCTTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFIYLLRRQIRTVIQYQTVRYDILPLSPVSRNRLGQVKRKILVLDLDETLIHSHHDGVLRPTVRPGTPPDFILKVVIDKHPVRFFVHKRPHVDFFLEVVSQWYELVVFTASMEIYGSAVADKLDNSRSILKRRYYRQVRG	110674	104880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_105346_105650_106644_107071_107144_107339_107459_107555_107623_110638
787362	contig_383_pilon	-	2275	6	Intergenic	novelGene_126147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	54.9923631061623	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	397	978	361400	350004	FALSE	15	TTCTACCTCCTTTATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQCDVWRSKFLASRVMADELTNSRAVLQRQSRDAQSAIQDLLSEREQFRQEMLATQKLLEKLLVCLQWGREQSYYPNAQPHSTAELALTNHKLAKAVNSHLLGNVGANDQKKIPSTGEFCSTPAEKMAETILRILDPVACTENSPESPFSESSPTTLLATKKNIGRFHPYTRYENITFNCCNHCQGELIAL	363353	348706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_350190_353503_353724_359666_359796_361353_361554_362749_362894_363254
787364	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
787366	contig_13904_pilon	-	1706	2	Intergenic	novelGene_165483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	447	junction_1	0	57	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	332	631	62211	61912	TRUE	40	TAACATTTTCTAGATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGVCSVVSPVTDGPGSVQCGLTCHRWTGECAVWSHLSQVDRGVCSVVSPVTGGPGSVQCGLTCRRWTGQCAVWSHLSQVDRGVCSVVSPVAGGPGSV	62542	58998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_59524_61361
787367	contig_2716_pilon	-	1991	9	Intergenic	novelGene_173557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	67.3938980917412	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	238	1323	709234	667062	FALSE	35	CCAATGTGTATAATGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRNFGMGKRSTEDRIQEEARCLVEALRETNASPCDPTFILACAPCNVICSIIFQKRFEYTDQDFLNLLEKLDENTQIVSSPWMQFCNAFPMLIDYFPGSHNKLLNNVAYLRSYFLEKVKEHQESLDINNPRDFIDCFLIKMEQEKHNQESEFITENLIITVSDLFVAGTGTSTTLRYGLLLLMKHPKVSAKIQEEINHVVGRHRSPCMQDRSSMPYTDAVVHEIQRYIDIIPNNLPHAVTRDIKFRNYFIPKGTTILTSLSSVLHDNKEFSNPEVFDPGHFLDDSGNFKKSDYFMPFSAGKRICLGEGLARMELFLFLTTILQKFTLKPLVDPKDIDTTSVASGFVSVPPSYQACFIPA	723530	666393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_667244_678339_678482_691890_692079_694763_694903_702787_702965_704082_704244_709137_709288_711234_711337_723448
787368	contig_1150_pilon	-	554	3	Intergenic	novelGene_61446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGATTTTAATTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
787369	contig_12644_pilon	+	690	5	Intergenic	novelGene_44602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4525.62500517884	108	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	54	602	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675472	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677341_2679888_2679963_2680107_2680229_2680311
787370	contig_19469_pilon	-	1736	8	Intergenic	novelGene_135000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	53.6534610025394	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	252	761	153553	134615	FALSE	20	GTTTTTCAAAAGTTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPDVTNENVFCIYQSAINAPHYELIYQSHVYSLPKGRNNMFHTLLMFLYIIKTKESGMLGRVNLGLSGVNILWIFGE	157434	133639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_139384_139459_141415_141514_141610_141726_142377_142476_153483_153689_157184_157244_157377
787371	contig_8587_pilon	-	1711	3	Intergenic	novelGene_159128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	4	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGCTTGGAGATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311482	306869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_307678_308817_308854_310615
787379	contig_10437_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_38389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCATAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674742	673812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_673800_674700
787380	contig_14483_pilon	+	2507	1	Intergenic	novelGene_133747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47817	50324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_47800_50300
787383	contig_6048_pilon	-	1002	3	Intergenic	novelGene_73350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.5	931	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTGTGTCAGACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2975527	2967993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2968739_2973628_2973785_2975426
787385	SIRV4	-	404	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	210	3	-210	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCGCCCCCAGTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787387	contig_1309_pilon	-	1711	8	Intergenic	novelGene_73968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTGGCCAGGGACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185857	170892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_170996_171819_171930_173393_173574_174175_174314_175084_175192_176245_176338_184629_184735_184981
787388	contig_13292_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_142918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTATAAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21298	21739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_21300_21700
787394	contig_7229_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_39874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAATTTCAAATATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548197	1547597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1547600_1548200
787395	contig_8122_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_40185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCTGATCTTCAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61843	62807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_61800_62800
787396	contig_8122_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_40186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTAGTTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62954	64291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_63000_64300
787397	contig_14682_pilon	+	1753	7	Intergenic	novelGene_139114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAAGCCTCTGTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94284	141926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_94413_95763_96502_119740_119813_122399_122532_124154_124254_137167_137313_141487
787401	contig_16303_pilon	-	895	5	Intergenic	novelGene_34068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.113078666587	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	324	425	37218	35759	TRUE	15	CCAGCCTCTACGATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	37664	33023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33155_35419_35764_35980_36029_37169_37302_37424
787403	contig_12871_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_140376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAGCAAGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29655	32026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_29700_32000
787408	contig_4131_pilon	-	1341	3	Intergenic	novelGene_127840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTAGTCCCCTCTGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88141	85390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_85489_85604_85842_87135
787411	contig_8615_pilon	+	2286	16	Intergenic	novelGene_165205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	131.943152742215	82	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	257	1114	14070	55032	TRUE	70	CAAAAGAAAAAAAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNVQLPPKESNLFKRILKCYEQKQYKNGLKFCKMILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLGRKEEAYEFVRKGLRNDVKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKLDKDNLQILRDLSLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPTQRASWIGYAIAYHLLKDYDMALKLLEEFRQTQQVPPNKIDYEYSELILYQNQVMREADLFQESLEHIETYEKQICDKLLVEEIKGEMLLKLGRLKEASEVFKNLIDRNAENWCYYEGLEKALQLSITDNRHFRREASNL	13813	107480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_14124_23318_23404_25714_25820_27074_27233_29227_29363_43082_43237_52424_52549_54989_55098_60417_60525_89003_89077_94892_95063_95392_95546_100245_100375_100982_101128_106274_106489_107364
787412	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787415	contig_5338_pilon	-	1389	9	Intergenic	novelGene_114581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_8	16.8522995463527	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	7	1014	391497	387912	FALSE	15	AGGGCTTTCTCAGTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMESPDSGARCPLQEQRARWERKRACTARELLETERRYQEQLGLVATYFLGILRAKGTLRLPERQALFGPWELIYGASQDLLPYLEGGHWGQGLEGFCPHLELYTQYAANAESSWTTLQEQLKKNKRFRRFVQLQEGRPEFGGLQLQDLLPLPLQRLQQYENLVVALAENTGPNSPDHQQLTRAARLISETAQRVHTIGQRQKNDQHLRRVQALLSGRQAKGLTTGRWFLRQGWLLVVPPRGEPRPRMFFLFTDVLLMAKPRPPLHLLQSGSFACRALYPMAQCQLHRVFGHSGGPCGGLLSLSFPREKLLLMSTDQEELSRWYHSLTLAISSQKN	391503	387536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387928_388106_388196_388459_388690_389280_389410_389658_389730_390314_390434_390691_390813_391079_391175_391359
787416	contig_16382_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_160221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAGAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66136	66408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_66100_66400
787423	contig_3942_pilon	+	1262	11	Intergenic	novelGene_128609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	53.6921782012986	198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	348	1061	95207	117646	FALSE	15	TTTTCCTGCTCCAGGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPVSTKELAEFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASNGTPVGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKSKEEVVGTLDAVQVFAGVNQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTRNLEEKRLLWRLPDVSEAGGSGHLSASWEPCSGPSTPSPVAAQFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC	89356	117847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_89408_94440_94548_94690_94779_95105_95234_100708_100801_102070_102146_103074_103217_105002_105137_116696_116753_117096_117262_117623
787424	contig_12977_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_122794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAGGGGGTTGGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20647	21177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_20600_21200
787425	contig_12709_pilon	-	1225	9	Intergenic	novelGene_147399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_8	531.244397029277	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	69	1133	59003	29115	FALSE	15	CAACTGTGTGTCTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLVALTLLGVGLALIGERLWALRRRMNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59071	29022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
787429	contig_4797_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_6901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAAGCAATTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334755	334496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_334500_334800
787430	contig_12923_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_30189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAACCCTAATCCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507082	507644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_507100_507600
787431	SIRV5	+	258	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	259	151	145	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8460	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
787432	contig_16714_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_161576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGATGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919129	918445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_918400_919100
787433	contig_12270_pilon	-	337	2	Intergenic	novelGene_113160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14385	13836	FALSE	15	TGCTGGTACCACAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYS	14395	13835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
787437	contig_6316_pilon	+	1496	8	Intergenic	novelGene_134703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	166.326455490155	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	146	616	140538	149021	TRUE	35	AGGAGACGCTGCAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGVFVAVVGGGRRRFDDSSRPKGLLLLQRCGIPNALTALIGIAEKAGGMKATVEVTNGRGGLTVAHKRTGIVKNHILSLKNLIDEIVDTLGEGAFGKVVECIDHDMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINCKYN	136294	156916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_147102_147170_148632_148750_148840_149672_153045_153129_155951_156032_156849
787439	contig_3529_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_105367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCCTTGTCAATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597452	596998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_597000_597500
787440	contig_500_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_30937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212934	1214971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1212900_1215000
787441	contig_5479_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_133619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCTCCTCCCCAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419136	420724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_419100_420700
787443	contig_6217_pilon	+	2124	6	Intergenic	novelGene_109685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	70.7067182097995	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	716	1447	1016733	1017965	FALSE	80	GAAAAAAAAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPQKSHQCAHCEKTFNRKDHLKNHLQTHDPNKMAFGCEECGKKYNTMLGYKRHLALHAASSGDLTCGVCALELGSTEVLLDHLKAHAEEKPSTGTKEKKHQCDHCERCFYTRKDVRRHLVVHTGCKDFLCQFCAQRFGRKDHLTRHTKKTHSQELMKESLQNGDLLGTFHSISPPFQLKAAPLSPFPLGASMQNGLTSSLPAEVHSTMSLGQLPLPPIPHVFPAATGSAILPHFHHAFR	877415	1018642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_877532_964389_964428_981681_981756_1008903_1009387_1016728_1017362_1017862
787446	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
787448	contig_13112_pilon	+	536	4	Intergenic	novelGene_98827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_2	242.612173368664	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAAAGTTTGGATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222004	227916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_222039_223786_223849_226376_226495_227594
787449	contig_15491_pilon	+	994	7	Intergenic	novelGene_75991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	7.39369100427294	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	237	854	173542	178825	FALSE	20	GTATTGCAATGTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHKSSSSELPFAKKELKHHRGCKKQKKNTAEDVSGKDFLTLPWRLISGVLGVLCLLLLVTAIVVSLLTANSSSEQTPLMIQQKGCHSCPENWIWFRYSCYYFSKEQLTWRESQRACLAQNSSLMKINREELHFFSLNSFFWIGVYHNGIDKQWLWENGSVMSSDIFDCHRHQKKQVCLSYKSRDVYSGDNCETKLNYICKNHRI	172610	178965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_172758_173452_173654_175291_175394_175622_175662_176889_177033_177909_178011_178704
787453	contig_13744_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_77219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTGTCACTTTCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154144	1151844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1151800_1154100
787454	contig_5482_pilon	-	653	4	Intergenic	novelGene_144480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	512.490867127297	7033	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	6	344	497972	494118	TRUE	20	TCTACTCCTGTTGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPSTLLRRFSGLLAPARLPSGRECPSLHKQTPIPRVSLPGRAWLATVGGGCGLASPCLLARSKFYVREPPNSKPDWLKVGLTLGTTAFLWFYLIKQHNEDVLEYKRRNGLE	497977	492687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_492977_494097_494178_497265_497370_497797
787455	contig_15327_pilon	+	2251	2	Intergenic	novelGene_70582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	0	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	459	869	812900	813310	FALSE	35	TTAAATGAAGTTTACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWILLRLLEVKKGSWDRNGRNCYVVSKKNHSAWLTREWKGTTRGEEGSCSASPVLGERPHCPCLVPPWLPLLPKYGSDCSASVYLYPPPPSLCPRTFLEHLSFILMVFNNILDTLEHISGISILLYEVSKTRTDH	809928	814692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_809980_812492
787456	contig_20939_pilon	-	2065	9	Intergenic	novelGene_172445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_6	32.7261363439071	262	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	21	896	99885	82224	FALSE	40	ATCAAAATATGGAGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPYHHDQLDRIFNVMGFPADKDWEDIKKMPEHSTLMKDFRRNTYTNCSLIKYMEKHKVKPDSKAFHLLQKLLTMDPIKRITSEQAMQDPYFLEDPLPTSDVFAGCQIPYPKREFLTEEEPDDKGDKKNQQQQQGNNHTNGTGHPGNQDSSHAQGPPLKKVRVVPPTTTSGGLIMTSDYQRSNPHAAYPNPGPSTSQPQSSMGYSTTSQQPPQYSHQTHRY	102261	81054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_82350_85431_85591_85710_85790_86517_86616_89137_89211_89905_89976_92361_92506_99758_99891_102246
787458	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787465	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	51	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
787467	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
787468	contig_17436_pilon	-	1567	2	Intergenic	novelGene_164170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26873	25268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_26324_26361
787469	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
787476	contig_6919_pilon	-	1405	4	Intergenic	novelGene_163987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_3	6.84754619472471	139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	764	1285	67864	65000	FALSE	10	TTCTCTATCCCCTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREWETDETEELSSGQRQALVCFLENSHYGSLINADGHAEVWTDWNDMSKFFQYGWRCTTNENSYSNRTLMGNWNQERYDLKNIVQPKPLPSQFGHYFETTYDTSYNDKMPLSTHRFKQEPHWFPGHQPELDPPRYKYTEKSTYMDSYSKPQITRHLECVWDPNNGQFQSPGF	68627	64879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_65176_65425_65493_66017_66249_67816
787479	contig_10323_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_123571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTGCAAAATCTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450326	449869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_449900_450300
787483	contig_17127_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_168302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	544	843	67189	67488	NA	20	GGTGTCACTGAACTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARRCLAATTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQTYWPERDWRNPESMAPRHPFSLVVKSLLRFAVQLGIGQPHKTKWD	66645	67708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_66600_67700
787486	SIRV1	+	264	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6451	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
787491	contig_10734_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_51146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCGGCACTGCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892719	890418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_890400_892700
787494	contig_12485_pilon	+	2703	5	Intergenic	novelGene_147275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2195	2521	76824	91800	TRUE	5	GTCGCGGGCGCCGCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQAEELLVLARLLFKGRRPRAGGNGTGYVVFPQVMDQFFNTWQQRGLGEHLSQLHLALLHQLLLGHWELQDLYYNLRGIQRLFTHDQGLHIPGVFLPIAIAYFLKHH	58854	129248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_60946_76720_76946_91595_91818_122151_122268_129199
787495	contig_11413_pilon	+	621	4	Intergenic	novelGene_103139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1	501	87465	90735	FALSE	20	AACCTACTCAGTGTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87464	90855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
787497	contig_6048_pilon	-	1336	10	Intergenic	novelGene_73259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	747	1331	1977111	1972063	FALSE	15	GGAGCCGCAACCCCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENPPAFDPGAIVDEDALSDGQGAVVPDQQEVEGSICHPGVEEEAAGEGDEDKDDGEVELELLVLVLVGKPEGLLAKECHVDVTSPILLGQIGFHVEEEPLALFDLVLELLHSLLGLPQDKAQLLELLLLPTDGAGTVVLQLGQLLQLQAVQPMGLLDALEVLLQILPVPQAVIQRAWGRRMHGCRAAGRRNGG	1978143	1972057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1972176_1973880_1974004_1974233_1974333_1976338_1976371_1976597_1976697_1976774_1976868_1977085_1977151_1977243_1977306_1977407_1977882_1977972
787498	contig_17680_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_150129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGGTCCCGACACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12938	11388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17680_pilon_-_11400_12900
787499	contig_401_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_42806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGGTCTAAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704981	1703767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1703800_1705000
787500	SIRV2	+	542	4	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-368	344	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCCACGCACCCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3665	4801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340_4479_4686
787503	contig_50_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_122209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTGTGGAGAGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28131	27632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_27600_28100
787505	SIRV2	-	467	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4374	66	3199	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCCAGTTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533	1066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
787508	SIRV1	+	238	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGTTACCCTAGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6451	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6470_6556
787509	contig_13015_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_165567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	363	1307	1669	407951	408313	NA	20	AGTGGAGTTGTCTGTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFWRTALLSWDSCPLLWSICLSVTPAFVLLNSHLGADLSRTYRGPFTSQGALVAQWLDACLLTERLAIQTHPVAPQEKALVIYSCKDYSLGHPMGHLSSVMWGHYESESTRAPNPNNICF	406644	408315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_406600_408300
787510	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
787513	SIRV2	-	470	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1106	61	-57	-61	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCATTCGCTGGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4789	3726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
787518	contig_11702_pilon	+	923	5	Intergenic	novelGene_142012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGACTCCAACCGTCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531172	534345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_531529_532311_532396_533589_533636_533818_533938_534027
787524	SIRV4	-	248	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1273	0	1273	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3885	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
787525	contig_1380_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_138882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCTGTGGTGATCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130260	129071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_129100_130300
787529	contig_9440_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_59054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATATTCCCCAACTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484503	485001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_484500_485000
787530	contig_9440_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_59055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAGGGTTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486063	487252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_486100_487300
787532	contig_10986_pilon	-	1061	9	Intergenic	novelGene_71479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	183.459080928146	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	11	847	80340	67011	FALSE	20	ACTTTCCCCGTAAGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80350	66796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74286_80295
787534	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	53	519	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
787536	contig_5247_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_81800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAACCAACTGCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143948	145829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_143900_145800
787539	contig_12348_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_174506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300125	302298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12348_pilon_+_300100_302300
787543	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
787546	contig_2773_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_174279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACTGCAAAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201365	203281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_+_201400_203300
787550	contig_16920_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_138451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAAATTCATGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12921	11006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_11000_12900
787553	contig_11986_pilon	+	2743	6	Intergenic	novelGene_69101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGGGAGGAGGGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48566	93423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_48978_50771_50915_51980_52044_53491_53596_74373_76355_93382
787554	contig_9363_pilon	-	1433	6	Intergenic	novelGene_6700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	66.1011346347398	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	158	979	1291497	1288546	FALSE	10	GAGCGGGTGCCCTGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVSLRVSGPGPVPLPHGPSVMDTPLEFTLSPFPGGSVDSAGCWTSGLKHPPHTAPDQECTVEGSLCTAASAAPH	1292829	1288091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288894_1288965_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291596_1292770
787555	contig_10437_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_38444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCTCTCTTGGCTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942683	940061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_940100_942700
787556	contig_835_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_152136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGGGAAATCTTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89718	91349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_89700_91300
787557	contig_9366_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_166230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAGAGCGGATCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719289	717025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_717000_719300
787558	contig_16103_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_118740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTGGTAATAACATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305693	307418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_305700_307400
787559	contig_9682_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_125322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.13783344124853	450	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGCAAGTCTTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604213	579432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_580019_582184_582326_595229_595276_603710_603857_604095
787560	contig_12624_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_61077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATAATCACCAGAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874091	872920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_872900_874100
787562	contig_9752_pilon	-	1604	2	Intergenic	novelGene_122037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201322	198751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_199054_200020
787563	contig_1244_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_38075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	490	837	1287161	1287508	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSSPNLSHTSSWQQPSSLPVFPPNCYKAPFTLRRGLDDVLHGHLTSDSATFSRGARCFSNISLTYTSQLPTMLPFPRKGMQMSKLSYFLYEYCFSFLINLSKIEHKILIKAKF	1286671	1288970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1286700_1289000
787565	contig_3787_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_102370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCTAGGCTGTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376155	377459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_376200_377500
787566	contig_3787_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_102369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTTCTACTGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374744	375191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_374700_375200
787568	SIRV4	-	310	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1213	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3945	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
787569	contig_15063_pilon	+	970	3	Intergenic	novelGene_14403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	366	854	36064	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35233	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35844_36158_36266
787576	contig_7347_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_172493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAGCTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16744	19201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_16700_19200
787578	contig_10404_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_138699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCAGGTCCTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174869	1173132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1173100_1174900
787580	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
787583	contig_3612_pilon	-	1518	9	Intergenic	novelGene_87815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	154.200711331044	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	386	1168	878868	871142	FALSE	30	TTAAGTGCTCCAATACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHLNAYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSINRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDELLDLAKFHFGDTLPTHKGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDTISLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSRLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCEPATVADMLHSVQKEW	881803	870791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_871307_872192_872337_872981_873095_873945_874026_874616_874816_878786_878917_879315_879404_880323_880465_881695
787584	contig_5033_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_29089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAGCAGAGAACAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684296	685452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_684300_685500
787587	contig_753_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_113045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAACAACTTTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509237	1510366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1509200_1510400
787588	contig_3754_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_146828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACCTTTTATCCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183383	184505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_183400_184500
787589	contig_3754_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_146827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182771	183172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_182800_183200
787591	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
787593	contig_6031_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_56776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTGCATTTAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444463	443063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_443100_444500
787599	contig_205_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_144311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGTACCTGTATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273762	276183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_273800_276200
787603	contig_6589_pilon	+	1166	9	Intergenic	novelGene_26227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_5	72.1152506409012	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	5	982	2051722	2059863	FALSE	10	CCTCAGCTGGGACTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2051717	2060047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
787604	contig_5018_pilon	+	815	6	Intergenic	novelGene_47159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	461.865781369436	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	13	561	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLSVMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1498196	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499503_1499550_1499588_1500185
787605	contig_16103_pilon	-	2527	5	Intergenic	novelGene_118763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_4	223.251399771648	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	822	1241	447247	444653	TRUE	60	ACCAAAAATAAATCGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARLVLLKKLRQSQLQKENVVQKTPVVQNAASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPP	448068	442859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_444088_444594_444767_445744_445877_446221_446354_447205
787610	contig_2444_pilon	-	979	3	Intergenic	novelGene_83750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	497	junction_1	10	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGTAAAATTGCTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185032	182860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_183257_183385_183498_184561
787611	contig_19647_pilon	-	1324	10	Intergenic	novelGene_144010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	285.848228744806	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	192	590	137920	112533	TRUE	90	AAAAGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTIASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKFSIPEETRV	146563	73932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_94938_95039_102559_102668_112495_112562_112602_112694_113103_113211_137748_137954_146405
787612	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787613	contig_4392_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_117323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436666	434907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_434900_436700
787614	contig_19564_pilon	+	1420	4	Intergenic	novelGene_29657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	6.12825877028341	290	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	8	793	33630	35995	FALSE	20	ACATCGGGGCATGCAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPALLLVPAALASFILAFGTGVEFVRFTSLRPLLGGVSESGPDARQGWLAALQDRSILVSLAWDLGLLLLFVGQHSLMATETVKAWSSRYFGVLQRSLYVACTALALQLVMKYWEPIPRGPVLWEARAEPWATWVPLLCFVLHVISWLLIFSILLVFDYAELMGLKQVYYHVLGLGEPLALKSPRALRLFSHLRHPVCVELLTVLWVVPTLGTDRLLLALLLTLYLGLAHGLDQHDLRYLRAQLQRKLHLLSRPQDGEAE	33622	36622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_33760_34345_34543_35178_35356_35713
787615	contig_3068_pilon	+	2014	3	Intergenic	novelGene_137646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1357	1785	323890	342885	FALSE	35	ATAAATTCCTGTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESFSHYSGLDHITTHPSLLSILPLASLPTSILPAAAEKPNSTFINQRHHCYRQCERQEREMFNCQKERPTAYLQRICLVHLKPSRDATEELSKAISDISKVAEDKIYLHEIHSFRTDRQRSWKIWFKNNIPWFLLLFNVF	305894	343114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_305978_322616_324305_342871
787618	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_94713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
787622	contig_14219_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_54275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGGAGACTGGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187429	188003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_187400_188000
787623	contig_3817_pilon	-	1223	11	Intergenic	novelGene_78392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	24.91666109253	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	150	1196	1172191	1153400	FALSE	15	AAGGATTCCTGGCTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLCTSPSSAGRGLRTGHPRIRSLLSENRSRRPQQLPVFSRSLSHQAGTMRVVVIGAGVMGLSTALCIHEHYHSVHQPLDMKIYADRFTPLTTTDVAAGLWQPYLSDHGNPQEADWNQQTFNYLLSHVHSPNAEKMGLALISGYNLFHEAFPEPFWKDTVLGFRKLTPRELDMFPDYSYGWFNTSLILEGKSYLHWLTERLTERRVKFFQRKVESFEEVVARGGADVIINCTGVWAGALQPDPLLQPGRGQIIKVTAPWVKHFIITHDPDNGIYKSPYIIPGTQAVTLGGIFQLGNWSEINNIQDHKTIWEGCCRLEPTLKNAKIVDECTGFRPVRPQIRLEREQLHFGPSVTEVIHNYGHGGYGLTIHWGCALEAAKLFGKILEERKLSRRPPSHL	1178018	1153372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1153532_1154901_1155001_1155674_1155793_1156773_1156857_1158136_1158242_1158869_1158928_1160475_1160542_1161475_1161553_1171226_1171342_1171997_1172201_1177878
787624	contig_14882_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_114987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAAAGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61113	63381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_61100_63400
787625	contig_15384_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_85109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTAAAAACTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35261	37588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_35300_37600
787626	contig_610_pilon	+	2074	9	Intergenic	novelGene_76839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	223.294613403459	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	863	1639	366398	375649	FALSE	30	AAATGTCCATTAGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350008	376084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_363794_364130_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
787629	contig_14215_pilon	-	2016	2	Intergenic	novelGene_59358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGAAGTTTACAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179591	177110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_177245_177709
787630	contig_1948_pilon	-	1153	4	Intergenic	novelGene_31156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.9977776790036	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTTTGTACAACATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465545	459860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_460752_462608_462661_462769_462882_465447
787631	SIRV4	-	181	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	436	0	-436	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGTGGCGAAGCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787633	contig_10477_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_112501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCGATTCAGACTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444199	444726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_444200_444700
787636	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787637	contig_12998_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_168962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTATTCATGGCACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11989	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_10900_12000
787638	contig_2704_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_75299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCCACATTTTTGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72900	75302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_72900_75300
787649	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787652	contig_14441_pilon	+	770	3	Intergenic	novelGene_100705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	157	585	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116571	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
787653	contig_5590_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_163013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAACCTGTTGCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292016	292895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_292000_292900
787658	contig_7272_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_25385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGCAAGGAGAGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732979	732235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_732200_733000
787659	contig_8330_pilon	+	1074	6	Intergenic	novelGene_71836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	196.895302127806	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	67	366	855707	856687	TRUE	5	CCGCTGCCCAGCCTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	855640	857810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968_857205_857405
787661	contig_8636_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_141907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	431	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	206	319	305591	305704	NA	10	TCCTTTTAGCCTTTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGVQTATGWGRDSGAGPVSIPVEGQYLLRVGVEQVAAEVTSLLRIPALAACSRRGGKGQGTHKLRFCMGAAGWREGRQPCIPRATPGLDPTLLGVQQGPLSLLP	305385	307169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_305400_307200
787663	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
787668	SIRV6	+	238	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	54	491	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
787669	contig_5480_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_107224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77270	75173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_-_75200_77300
787670	SIRV5	-	416	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10862
787671	contig_10940_pilon	+	1818	5	Intergenic	novelGene_49188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	3.83242742918897	105	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	69	1148	254111	278102	FALSE	10	TACAGTGTGGTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQQQREAAVLLLAEDRLRYALMPRYRGLFHHISKLDGGVRFLVQLRADLLQAQTLKLVEGPHVREMDGVLKSMLSEWFSSGFLNLERVTWHSPCEVLQKISESEAVHPVKNWMDIKRRVGPYRRCYFFSHCSTPEEPLVVLHVALTNDITSNIQAIVKECPPSETEDKNKIVAAIFYSISLTQQGLQGVELGTFLIKRVIKELQKEFPDLGTFSSLSPVPGFTKWLLGLLSSQKDHGRSQLFTDSESKEISEIIGGPINETLKVFLSSHEWVKSEKLVRMLRVPLMRLCAWYLYGEKHRGYALNPVANFHLQNGAVMWRINWMADVSLRGITGSCGLMVNYRYYLEERATHSTAYLGSKYIKASEQVLSLVSQFQKNSKL	254042	278772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_254240_265323_265437_266666_266824_268797_268948_277571
787676	contig_19061_pilon	+	2245	8	Intergenic	novelGene_173500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	6.56521445318632	106	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	1	1215	27492	35072	FALSE	55	AAGAATATTGTGAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYIRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFIKALEQKFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQRMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQTSIEDWEGEDVLVRSSELIYSGELTRIMAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRVDMDHLEVVDVEDGKDRDLHVSVKNAFRLRCSATGESHLLCARKPEQKQRWLKALVSEREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKHQAAGKPKTTSRPYYLTRQKHPALPAGLPQQQVLVLAEPKRKPSTFWHSISRLAPFRK	27491	36102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_27567_27644_27825_29291_29525_29827_29958_31940_32064_33132_33377_34338_34417_34920
787677	contig_17859_pilon	+	2067	2	Intergenic	novelGene_155718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	933	1232	204361	204660	FALSE	30	CTCCACAGAAATCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGRPPQVWATQWGGAHPSCQAGQAHTLDGKHTGPVPWGLTPPCWGHTEPTQPALAQEGEEPRTEIQIHFQKVQRSPCPLNGVGVPGSQAEARKHKTS	201972	205495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_+_202164_203619
787679	contig_13894_pilon	-	1392	3	Intergenic	novelGene_62062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	271	1329	287445	286290	FALSE	25	CTTTTGTAGTGAAAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288310	286226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
787682	contig_19098_pilon	-	1019	2	Intergenic	novelGene_65787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	325	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCTTCTCTCTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64006	50146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_63908
787685	contig_15022_pilon	+	755	4	Intergenic	novelGene_171817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	539.601293137401	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2	406	105826	121483	FALSE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDPVKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAVKPLQDRRAREEFSRRWCVLSDGILSYYENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPNTHSFEHTFEVYTEGERLYLTAPWGSLSVRAAGSAWGGTVPALSRGLALLA	105824	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_105950_107887_108024_108312_108361_121386
787686	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	583	2	404	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787687	contig_16525_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_133820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1352	1654	152884	152582	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQAVQQSPNNLVRVKFSPRPSMICCDFLSSSRPLTVVQVSSLLSKLYTSTPLPQGLCTRCPLCGMLLPHMFTTYSLFQVFASVSPQVFRNFCQRSKKIF	154235	152566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_152600_154200
787688	contig_10235_pilon	-	1288	9	Intergenic	novelGene_46355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	93.2536024773306	25	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	168	797	140447	137516	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDSTSTTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTQLPSSGASSGTGSPSATHGGGPPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNLPSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGGPKPSTVSRRRRCRLLSRNQ	141071	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_137356_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_140917
787691	SIRV6	+	372	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	484	0	311	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
787702	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_93685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	653858	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653858	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
787704	contig_12050_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_62663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCGCACAGCTTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440842	440593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_440600_440800
787705	SIRV5	-	353	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10858
787707	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
787708	contig_10196_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_132205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	757	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCAGCCCGATGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255600	1256337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1255600_1256300
787714	contig_233_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_14678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92725	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_92700_93000
787715	contig_11265_pilon	-	2971	1	Intergenic	novelGene_174509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGTCATTGTAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34894	31923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11265_pilon_-_31900_34900
787716	contig_9981_pilon	-	849	3	Intergenic	novelGene_121034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	2	262	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	67	438	147235	144698	TRUE	15	CTTGAGCCTCTCCTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSPVGYKSKFRASAPREGFKSKFRASAPAEGFLCQLWRKLHIINLPLVWELLCAGTAGPKDALLSWHCFLGALIGITGSGAIPVRIFAVQRHRVCDVAETPPTVLVTHSTLLS	147301	141724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_142068_144629_144826_146991
787719	contig_6364_pilon	-	2291	4	Intergenic	novelGene_51784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	5.90668171555645	1	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	63	1490	1102801	1091442	FALSE	50	TAATAAAACCAGTATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPETSCPWMGHLPRLQVRTWIEPVVASTQVAASLYDAGLLLVVKEYYDAGGSSNHSASPSTRGAVEDQQQRAISNFYIIYNLVMGLTPLLSAYWLGWLSDRYHRKISICVPLLGFLLCRLGLLLKVLLDWPLEVMYAAATLKGLCGGFSAFWSGVMALGSLGSSEGRRSVRLVLIDLILGLAGFCGSMASGHLFKQIAGRARQGLVLTACSVSCATFGLFYSLLVLKVPESVAKSNKALTTVDTVSGMVGTYRTLDPDQSEKQSVVGHPPPLGKGKPPKAIIALLFVGAIIYDLAVVGTVDVMPLFVLRAPLSWNQVQVGYGMAAGYIIFITSFLGVLIFSRCFRDTTMIMIGMVSFGSGALLLAFVKKTYMFYIARAIMLFALIPITTIRSAMSKLIKGSSYGKVFVILQLSLALTGVVTSTVYNEIYQLTMEKFVGTCFTLSSFLSFLAIIPIGIVAYKQVPRSQFEDITEK	1102863	1090640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1091500_1099429_1099587_1100102_1100187_1101672
787721	contig_15304_pilon	-	1055	3	Intergenic	novelGene_30451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	188	1012	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54287	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
787722	contig_12869_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_75351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGAAGAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91140	89190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_89200_91100
787724	contig_9752_pilon	-	1607	2	Intergenic	novelGene_122040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201332	198758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_199054_200020
787727	contig_14923_pilon	-	1676	14	Intergenic	novelGene_157743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	87.9165823026975	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	785	1669	194677	183547	FALSE	35	GATAATATATATATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVTAVEFLGHIGGIGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGKAELITCDVLLVCIGRRPFTQNLGLEELGIELDSRGRIPVNTRFQTKLPNIYAIGDVVAGPMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF	216077	183539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_183613_183702_183793_185802_185941_186469_186660_186990_187162_188340_188532_194638_194741_195171_195313_195626_195798_205380_205455_206019_206089_206585_206666_213503_213583_215970
787729	contig_6710_pilon	-	475	2	Intergenic	novelGene_98120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	CATCTCGTCCCCCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
787732	contig_5350_pilon	+	1001	6	Intergenic	novelGene_99340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	56.9680612273228	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142195	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
787736	contig_15327_pilon	+	1919	7	Intergenic	novelGene_70830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	46.8045581825816	33	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGCTAGTGTAGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639509	1645262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1639593_1640097_1640265_1640871_1640969_1641609_1641709_1642716_1642816_1643312_1643431_1644006
787739	contig_5910_pilon	+	2950	1	Intergenic	novelGene_168426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAACCTTTTGTTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165771	168721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_165800_168700
787743	contig_2646_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_69524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTTGATTAGAGTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554101	555057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554100_555100
787745	contig_1146_pilon	-	2610	1	Intergenic	novelGene_84818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCTTCCACCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519930	517320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_517300_519900
787746	contig_10331_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_54161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGCAAAGTGTTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504676	505076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_504700_505100
787749	contig_7707_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_72123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCTGGGGACACTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44342	43939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_43900_44300
787750	contig_16882_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_148250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATGTCACTGAACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532942	532401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_532400_532900
787751	contig_10246_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_46922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1108	1665	195140	194583	NA	30	ATAGTAGCCATCTCACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREELGVEEQQTDQDVARQLQQLRSLGEQAVRTTSPVQQSHREHEQHVLVQSLPQARQQLSRRRREVRVDLVAPQRGHPGVQHVQHHEGQAEDHVGGYPKDDQKEGRLREGVRVPHAVPEWLQEPLARVAEDLELRAVPAAHGEAKSGAAPARLRPTILKACGSAPSYVSDVFALFPTALSLNK	196247	193261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_193300_196200
787757	contig_19362_pilon	-	1462	2	Intergenic	novelGene_157809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACATATGTACACCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145705	142059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_142480_144663
787758	contig_19362_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_157808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCTCAATACCTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141904	140794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_140800_141900
787759	contig_20610_pilon	+	791	4	Intergenic	novelGene_67647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	197.293351805545	1344	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGACATGCTGTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49825	53416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_50029_51483_51577_52403_52513_53030
787760	contig_7593_pilon	-	1505	4	Intergenic	novelGene_127356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	375	junction_3	74.7454941042528	451	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	61	513	717631	695591	FALSE	20	GAAATTTAGCCTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQESLPPVQFDWSSSGLTNPLDGVDPELYELTTSKLEISTSSLKVTDTFARLMSTVEKTSTSTRKPKREEHLSEEAIKVIASLPDLTFMHAKVLMFPATLTPSTGSQEKTDW	717691	694598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_711220_711282_717511
787761	contig_8795_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_146887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAATTCAAATTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168775	170581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_+_168800_170600
787763	contig_11416_pilon	+	1091	2	Intergenic	novelGene_145384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	364	822	909436	909894	FALSE	15	TAGGAGTTCTATTTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDRKRMNVFELWCWQRISNIPWTARRTNKSVLEEVQPECSLEARMVRLHLTYFGHVTRRDQSLEKDFMLGKVEGQRKRGRPSMRWIDAVAATIGSNIAIVRMEQDRAVFSSVVYRATVSWKDLTAPNNNNNLQVQSPWVARMVNALNAK	906689	910163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_906799_909181
787766	contig_4105_pilon	+	2557	11	Intergenic	novelGene_21456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	129.905504117416	1	158	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	91	1341	60529	73266	FALSE	25	AACTGCCGTGACAGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLNLHYRFLNWRRRIREIREVRAFRYQERFKHILVDGDTLSYHGNSGEVGCYVASRPLTKDSNYFEVSIVDSGVRGTIAVGLVPQYYSLDHQPGWLPDSVAYHADDGKLYNGRAKGRQFGSKCNSGDRIGCGIEPVSFDVQTAQIFFTKNGKRVGSTIMPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGIIPRTGILDGVEGLWPIMLMMARSSMAVVWGTRLGPAVTKGTLWAVESCSPGTTFWTVRVTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58726	74482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62413_62727_62864_63712_63899_71022_71160_71624_71683_72381_72506_72619_72766_73131
787775	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
787776	contig_9706_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_20940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGAACCATTGAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244411	243534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_243500_244400
787778	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
787779	contig_3679_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_112136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGTCAAGTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092719	1094551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1092700_1094600
787781	contig_3774_pilon	-	1024	8	Intergenic	novelGene_142045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	79.4963739386128	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	145	834	210407	144743	FALSE	5	GTTGCCTGTGTGTTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLRRASCAGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210551	144552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
787782	contig_9468_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_59534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAATATATTCACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613751	613999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_613800_614000
787784	contig_11512_pilon	+	357	2	Intergenic	novelGene_43236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	15	356	4011	4575	FALSE	15	GTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAY	3996	4576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
787786	contig_5643_pilon	+	1107	7	Intergenic	novelGene_38740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	310.256569453233	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	170	946	152580	157138	FALSE	20	CTACCACACGCTGCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAESGCLPLHALPTGHPKGPCVAQTVSASLWSSLECYLFSPWAESCFSTNKENMDQTKEKAQWSLQSPVLTAAPERRKAAPFPSRRITANQSPLSTRLKKWLYETGNDEGKWE	152410	157299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156167_156206_156463_156584_156823_156945_157085
787787	contig_11572_pilon	+	1237	6	Intergenic	novelGene_100055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_4	96.5380753899724	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	79	987	255328	266311	FALSE	45	CCAGCAAAAATAAGCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETPSEELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPNSNFYVSRTAYRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHICQYYIYDLQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKVKNKAVKDAEK	255249	266561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_255430_255959_256152_257659_257837_265156_265322_265592_265721_266166
787791	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787793	SIRV1	+	239	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTCCCCCACTATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
787794	contig_6589_pilon	-	1494	8	Intergenic	novelGene_26201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	109.69754336542	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	193	636	2032630	2030536	TRUE	15	TCATTGCATGTATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033638	2027927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032637_2033452
787795	contig_16907_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_87425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCAATAAGGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336701	335773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_335800_336700
787796	contig_14680_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_132733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	5	298	4262	4555	NA	40	TTTTGAAAGGACAGGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMFFKFIVPIHKKQSTEFKQQGRWLREYKMEGFKVVIWLRNTLSGHGRSPWVVQMVKCSSANQRVGDSSPLRGASVERPCDLLLKNQPWKILWSTALH	4257	5130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_+_4300_5100
787798	contig_1719_pilon	-	2374	1	Intergenic	novelGene_87379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGATAAGTGGCTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846906	844532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_844500_846900
787800	contig_17964_pilon	-	1650	10	Intergenic	novelGene_33933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_7	61.8518740297144	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	36	1103	693144	652815	FALSE	35	CTCTTAAACTTCTAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPVLRIVAAAMIEQQKRKGPELPLVPVKRQRHDLLLGAAGSGTGAGQQQGALLQAGPPRCSSLQAPIMLLSGHEGEVYCCKFHPNGSTLASAGFDRLILLWNVYGDCDNYATLKGHSGAVMELHYNTDGSMLFSASTDKTVAVWDSETGERVKRLKGHTSFVNSCYPARRGPQLVCTGSDDGTVKLWDIRKKAAIQTFQNTYQVLAVTFNDTSDQIISGGIDNDIKVWDLRQNKLTYTMRGHADSVTGLSLSSEGSYLLSNAMDNTVRVWDVRPFAPKERCVKIFQGNVHNFEKNLLRCSWSPDGSKIAAGSADRFVYVWDTTSRRILYKLPGHAGSINEVAFHPDEPIILSASSDKRLYMGEIQ	693179	652267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_652865_653826_653931_658528_658591_659491_659575_661445_661567_669526_669650_685918_686085_687203_687298_688016_688147_693009
787806	contig_5935_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_102722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1289	1621	1104039	1103707	NA	35	AAAGAATTACTGGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTQFILVGCSQSREEHWGGLNTGMDSPENHTEVHFELVSRQSLISSIWRSPGGAVVTSSVANQKVRSLETLWGSSTMSYRVAMNWNQLDSTGFLVLYVVEESLSGANG	1105327	1103477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1103500_1105300
787807	SIRV6	-	334	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTCTGGTTGGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11835	11501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
787809	SIRV2	-	396	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	2	673	2	-673	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACATCTATCACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5893	4338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4480_4687_4801_5751
787811	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
787813	contig_6710_pilon	-	605	2	Intergenic	novelGene_93901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	657221	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFVEGASVRAITVAPFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657221	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
787814	contig_2969_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_157060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCCCTGTAGGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772874	774153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_772900_774200
787815	SIRV5	+	244	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	6	-2538	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACTTAAATTGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8207	8451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_8200_8500
787816	SIRV5	+	319	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	200	149	86	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8401	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
787817	contig_3975_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_54693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGTGCGCTCCTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094775	1094551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1094600_1094800
787818	contig_3975_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_54692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCGGTGGTGTGTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094394	1093379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1093400_1094400
787820	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787822	contig_3241_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_146408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGTGGAAAGGAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868955	869997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_869000_870000
787825	contig_11370_pilon	+	675	3	Intergenic	novelGene_98746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	2663	268	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147083	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_147223_147422_147616_148205
787826	contig_7361_pilon	+	1755	3	Intergenic	novelGene_163380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	4.5	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	259	1116	265238	267168	FALSE	25	TCATTTTTGATGGGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSTGVDTNPCPNSPVFRTGSEPTLSPALVRRVSSDIRVGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKAPFLKFPPSPSTWLNSEAHYCELNPAFAISCDRAARLPSCAQDSYVELLRARQNGALGPRNSGTSYLILDDDDRVRPWEPPAAQMDKGQEDEGEFVKPLLETDSSFRPNNFESKLLPPENKPLETAMLKHVKELLTNHDPKVIAQHMLQMDCKVNAGAGMVSLWLWKAWKRDLSGPPFALPFEYFAQRKSLKITWVWRFI	264118	267807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_264334_265194_265299_266371
787827	contig_11924_pilon	-	2641	1	Intergenic	novelGene_128023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTCCAACGTTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50582	47941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_47900_50600
787829	contig_1090_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_131118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAAAAAAAGCCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358899	360599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_358900_360600
787832	contig_7379_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_150012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAGTTTGGGAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409684	411713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_409700_411700
787834	contig_6710_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_97891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	35	CTTTAATCATACTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
787835	contig_4742_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_130973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCCTTACAGTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139123	140611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_139100_140600
787836	contig_614_pilon	-	874	2	Intergenic	novelGene_132634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGCTCTTGAGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860068	857991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_858467_859669
787841	contig_16187_pilon	+	1182	9	Intergenic	novelGene_101081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	27.2141392478248	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	575	1180	120003	125903	FALSE	45	GTAAACTAAATTACCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVKAPGRWRTSPPQVTTKEHDFGLGVPVSEAEKYQNTLQLEQEVKNQDRFINTLKLQIEDLKQTNHGLEEYVRKLLDSKEVVSSQVDDLTSHNEHLCKELIKIDQLAEQLEKEKKFVVDTADKELEEAKIELICQQNNIIVLEDTIKRLRSIILETEKAQNKSPSRLDSFVKTLEADRDYYKSEAQNLRKMIRSRSKSPRRPSPSSRGANCDVELLKTTRDREELKCMLEKYERHLAEIQGNVKVLTSERDKTFLLYEQAQEEIARLRREMMKSCKSPKSTTAHAILRRVETERDVAFTDLRRMTTERDSLRERLKIAQETAFNEKAHLEQRIEELECTVHNLDDERMEQMSNMTLMKETISTVEKEMKSLARKAMDTEGELGRQKAENNSL	93664	125905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_93711_102787_102917_111183_111400_118598_118665_119885_120054_120448_120605_123471_123643_123731_123810_125753
787843	contig_10593_pilon	+	1072	5	Intergenic	novelGene_172827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	9.98436277385793	82	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	294	395	74929	75030	FALSE	15	TGGCCACACTGCCTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKVYTRTPTLYLDFKLEQGAKHSQPIPKGWTSFIYTISGDVYIGPDDAQQKIEPHHTAVLGEGDRVQVENKDPQRSHFVLIAGEPLREPVVQHGPFVMNTSEEISQAILDFRNAKNGFERARTWKSKIGN	25952	75707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10593_pilon_+_26040_52474_52520_62211_62295_71135_71203_74917
787844	contig_10904_pilon	-	1038	3	Intergenic	novelGene_22613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	352.5	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	117	425	507325	499746	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTPAQPPCFHLEIL	507441	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499785_505068_505184_507170
787845	SIRV6	+	343	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	529	-1	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
787849	contig_3960_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_138043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCATTCAACTAATTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687094	687701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_687100_687700
787850	contig_3960_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_138044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTTACTAAATTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687947	689811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_687900_689800
787853	contig_18303_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_146809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGATGAACTGTAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68289	67386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_67400_68300
787854	contig_18303_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_146808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAGAAAAATCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66866	66062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_66100_66900
787856	contig_8330_pilon	-	1409	3	Intergenic	novelGene_71751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	1.5	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCGTGCCTATTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566423	555097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_556288_566111_566265_566357
787859	contig_5041_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_27008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAATGGAATGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162425	164574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_162400_164600
787860	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
787861	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
787863	contig_2770_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_107427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTATTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478925	480214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_478900_480200
787864	contig_6062_pilon	+	1394	3	Intergenic	novelGene_5270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	419.5	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	739	1131	662655	688068	FALSE	15	TTTCATTGGAGTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKAVTSSIMEWRHSCTACVFLRIKLPERAYRTTIKG	660889	688331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_660973_661999_662943_687963
787865	contig_6929_pilon	+	855	3	Intergenic	novelGene_139410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4374.5	4	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	118	456	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEKGFITAVLHNVGSRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127058	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_130666_130971_131948
787870	contig_7619_pilon	-	935	6	Intergenic	novelGene_162146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_2	41.5046985292027	423	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	175	708	31424	23773	FALSE	45	AGCTGAAAGAACGAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLKSASCFLNTSLKMEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	31598	23545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_31421
787873	contig_3975_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_54688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCACTTGTTTCTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065129	1065820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1065100_1065800
787877	contig_8017_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_65385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAGAAAATTCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1622796	1621707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1621700_1622800
787878	contig_5093_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_135102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGTCCACCCAGAGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644400	642440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_642400_644400
787881	contig_5916_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_158032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCACTATGGGGTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288912	289320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_288900_289300
787882	contig_17500_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_157931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAGTCGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287317	288809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_287300_288800
787883	contig_6031_pilon	-	1411	3	Intergenic	novelGene_56744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	2.5	121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	134	418	207906	207622	TRUE	50	GTAAAATTATGCCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDKPPAAWFPASSQNTRAAAQRLLLSLLSPVQGEAEPLQGGARSMSPMDAEQVRSQEQFWGAPEVIHDRGGPSAGSRAGQPRASRLRNPGVTNKLFFLLGRSSHSTPLVRTDSPSYQAQDPTGEFATLRERCSARQFF	208039	205673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_206410_206951_207080_207492
787885	contig_4857_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_48673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACTATGATCTGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075399	1075928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1075400_1075900
787887	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_97481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	21	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	75	AAAAGAATAAAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
787892	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
787893	SIRV6	+	303	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	171	406	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
787901	contig_5649_pilon	-	1492	8	Intergenic	novelGene_82379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	74.1358378180188	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	488	823	1071447	1069132	FALSE	10	GCTTCCTGTTGCGTAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1081992	1068462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949_1073035_1076875_1077012_1078583_1078753_1081910
787907	contig_14142_pilon	+	1261	10	Intergenic	novelGene_120624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_8	218.401996553982	942	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	93	917	617485	619267	TRUE	0	GCCCCTGGCTGCTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAKSRRAPSEVWQSVIEPGAHGPSVPSGTMPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGDNTPRRAPVPRVFPLSVLFSVHPIFCSFHKLL	617197	619881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619348_619435_619532_619713
787909	contig_10861_pilon	-	1396	3	Intergenic	novelGene_39372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	10	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648985	1646310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1647387_1647494_1647631_1648801
787914	contig_8992_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_174431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAAGCCACCACAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308284	307911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_307900_308300
787917	SIRV4	-	342	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1181	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3977	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
787918	contig_6397_pilon	-	1726	15	Intergenic	novelGene_146256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	104.559742711611	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	188	1504	554772	458437	FALSE	15	TGTTCTTGTTTCCTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESRLLLKTVFNGVIFTSQNNIFLV	601750	458214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_458507_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
787923	contig_15304_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_30575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	64	351	53036	53495	TRUE	25	GTCTCAGGCTCTGGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGFTGQAVDGLLGEVQGQGLMAHQAGEIITLLPGLGLHAQHTGHGKGDSFLAWLLPWGPGQVVVLGQLLGPVPPAHQHVLGAESTHHACQCHQFVQRQLLRRWWQQVDLGWEAVP	52972	54284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_53322_53493_53813_53991
787925	contig_10749_pilon	-	1150	4	Intergenic	novelGene_133501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.2534149181967	339	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	95	793	243911	241347	FALSE	20	CCATGCCAGGCCTCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNSGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSGGGGGQESQPSPLALLAATCSRIESPNENSNNSQGPTPSGGTGELDLAATQLSQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAATPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLS	244005	240989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_241357_241870_242398_242714_242870_243904
787928	contig_10734_pilon	-	2679	17	Intergenic	novelGene_50970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_16	12.0932251178087	87	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	10	2007	261748	227647	FALSE	15	GGACCGTTTTTCCTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRMSGPAVSAALVGRTEDVTVSLALLQNETGILPVPTCTVPSNETEDWILTVTPGVNMSEVTVRLKRDVERCSSNEKDPFLASPCLLQTLLVSASHNASCSAHLLIQVEIYANSSLAHNASENMTVIPNQVYQPLGPCPCDLTAGACDVRCCCDQECSSGSTELFRQSCFTGVFGGDVNPPFDQLCSAQTTRRVPDWFPLLCVQSPLVNSPFLGYFYHGAVSPKQDSAFETCLHTDLKDIADFGYKQGDPIMTVDKTYFTIPQVSLAGQCLRNAPVAFLQNFDVKCITDLEVHQEQDGILNAKIKNGLLGGIVTPKVIYEEAADLDKFITLTETLSNKGSAPRNVNLEEHYVFRWNNNTISEINVRIMRANIDAHQKGILTQRFTVKFLSYNSVSDKELSGNPGYQLGKPVRALNANRMNNATTLHLWQPAGRGLCTSATFMPILFGEDALSGCLLEVGINENCTQLRETAVERLDSLIQATHVAMRGNSDYSDPNDGWLEIIRVAAPDTGAGPSVSSTPGVCLGIPAQLSVRILISEAGAVEGIIQQEILAVETRSSPVDWQYQCGLTCEDKADLFPLSASVQFIKIPAQLPRPLTRFQASCTEHDCNRNEVCWPQLLYPLTRYYQGEPYSHCIAKGFLLVSFLVLAVFLSNPGTRICRAWNSSAI	261757	226974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_227769_228204_228294_228441_228568_232384_232542_235871_235979_238523_238636_239690_239772_244001_244080_244320_244456_245372_245439_246445_246588_247836_247964_249221_249419_253170_253272_259038_259235_261231_261309_261663
787929	contig_14441_pilon	+	1691	2	Intergenic	novelGene_100779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122735	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_124351_126669
787933	contig_8019_pilon	+	2098	10	Intergenic	novelGene_126979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	19.8295203306386	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	545	991	231796	259089	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKIEAELAKQRAQHLVEFEEQALLFKEEAKLILDTEKEKYQEMIQKYQKEQEELQMKIYLTDI	91602	278911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_195244_195431_231345_231424_231758_231963_240500_240595_251912_252078_259068_259382_278096
787934	SIRV6	+	539	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
787935	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
787936	contig_5936_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_53564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183364	184551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_183400_184600
787940	contig_16578_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_148641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCAGCATGGGGGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145280	143270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_143300_145300
787944	contig_6048_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_73369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	582	926	3108673	3108329	NA	60	AAATTTGGAAAATAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPLQEWPVQLFGPLAARGCSRFWPFTGDPVLHSPALHNLRSCAYSFGYRVQMEMASLEPLELFVSSPVTPSSQNLSFTGFPGTISISTSYSNFFRASLGGCHFGHRSLSFPV	3109254	3108152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3108200_3109300
787947	contig_17427_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_30394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215185	216509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_215200_216500
787950	contig_7004_pilon	-	1546	13	Intergenic	novelGene_126441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	50.0867996581934	207	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	193	1203	162331	154158	TRUE	15	GAGCTGACTCCCGATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHHVEACAQVPGMQEILLIGFYQPDESLTRFLEAAQQEFNLPIRYLQEFAPLGTGGGLYHFRDQILAGSPEAFFVLNADVCSDFPLSTMLDAHRCQPHPFLLLGTTANRTQSLNYGCIVENPQTHEVLHYVEKPSTFVSDIINCGIYLFSPEALKPLRDVFQRNQQDRQLEDSLGLWPGAGTIRLEQDVFSALAGQGQIYVHLTDGIWSQIKSAGSALYASRLYLGRYQFTHPERLAKHTPGGPRIRGNVYIHPTAKVAPSAVLGPNVSIGEGVTVGEGVRLRESIVLHGATLQEHTCVLHSIVGWGSTVGRWARVEGTPNDPNPNDPPSPHGQ	163472	153519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_153816_154110_154281_154523_154617_154830_154878_155041_155140_155259_155395_158683_158815_160570_160631_160963_161151_161409_161514_162298_162398_162508_162570_163407
787951	contig_8544_pilon	+	1426	5	Intergenic	novelGene_55914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	323.014705547596	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAGTAGAAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54106	91496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_54161_83417_83520_83788_83836_87136_87322_90458
787954	contig_20075_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_168248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTGGCTATGATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30995	31539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20075_pilon_+_31000_31500
787955	contig_3469_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_34196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAACAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528154	526985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_527000_528200
787956	contig_11473_pilon	+	2734	9	Intergenic	novelGene_159252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	101.244058467645	131	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	149	1051	117661	137192	FALSE	25	TTGGCTAGACTTGCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILEGSGVMNLNPSNNLLHQQPAWTDSYSTCNVSSGFFGGQWHEIHPQYWTKYQVWEWLQHLLDTNQLDASCIPFQEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGTAGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEETDPSIMNTWKEENFLYDSNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQNHPAKSHTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGIFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN	94572	138875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_+_94718_117657_117758_122003_122250_124870_124934_127740_127810_127925_127995_135095_135159_136794_136991_137092
787957	contig_15114_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_121247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGGCTGTGGGGACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1757215	1756214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1756200_1757200
787961	contig_16022_pilon	+	1603	5	Intergenic	novelGene_160267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	26.1282892666168	84	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	289	312	31268	33220	TRUE	10	TTATTGTGGCTGATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWSPEVVELCKKYRHNVVAIDLAGDETIEGSSLFEGHLKAYEEAVRSGVHRTVHAGEVGSAEDVRQAVDRLKTERVGHGYHTLEDEALYKRLLQENMHFEVQK	30097	34854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_30224_31023_31096_31177_31280_33208_34260_34602
787963	contig_3077_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_26844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGTTCTGGAAGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674361	675019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_674400_675000
787965	SIRV6	+	417	6	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
787969	contig_8289_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_171167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGACATCATTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149993	151758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_150000_151800
787970	contig_366_pilon	+	1805	6	Intergenic	novelGene_51560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	191.90143303269	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	15	1499	636436	649345	FALSE	0	CTTCTGCCTTGGCTTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARAAPLLAALAALLAAAAAGGDAPPGKIAVVGAGIGGSAVAHFLQQHFGPRVQIDVYEKGTVGGRLATISVNKQHYESGAASFHSLSLHMQDFVKLLGLRHRREVVGRSAIFGGEHFVLEETDWYLLNLFRLWWHYGISFLRLQMWVEEVMEKFMRIYKYQAHGYAFSGVEELLYSLGESAFVNMTQRSVAESLLQVGVTQRFIDDVISAVLRASYGQSAAMPAFAGAMSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	636421	649651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_636524_641061_641269_643249_643425_645173_645386_647843_647985_648683
787972	contig_13593_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_156132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	248	598	82116	81766	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFANFRRILRLSTFEKRKSREYEHVRRDLDPNEVWEIVGELGDGAFGKVYKVRALEAGGRVSRARGAAPEGRGAGLRQPRPRLGRAQRGCPGPELGVPGPRPGDPCSLGDLTQPS	82363	81611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_81600_82400
787974	contig_13780_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_149097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTTCGACTCATAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724996	724339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_724300_725000
787975	contig_9609_pilon	-	1311	8	Intergenic	novelGene_22942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	9.49758293633981	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	144	851	81393	79969	TRUE	20	GGGGGTAGAGCTCAGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLEISKLLDEELYSRQLYVLDSVAMQRIQGAKVLLSGLRGLGAEVAKNLVLMGVGSLTLHDPHPTCWSDLTAQFFLSERDLGKSRAEASQEPMSQLNGAVQVRVHTGAITEGLLLDFQVVVLTASELEEQLRVSNFCHQHGVCFVMADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLMAAIQHISQGSPGVVTLREADVHYFQDGDLVTFSGIEGMVELNGCTQPIRVQGKPAPL	81536	79153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_79182_79453_79601_79683_80119_80220_80312_80614_80722_80855_80991_81087_81257_81337
787976	SIRV4	-	611	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
787977	contig_13481_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_119517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAATGGGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416757	1418895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1416800_1418900
787981	contig_12635_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_60868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653585	651769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_651800_653600
787982	contig_4974_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_161412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87686	89988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_87700_90000
787983	contig_11429_pilon	+	1389	8	Intergenic	novelGene_60476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	58.9236794506249	176	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	211	1302	61844	67460	FALSE	10	GATGGCTGGCTCCCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGKLTFRAFVLQAPAGGHVREGVRRPGNGRGVAAGLSSGREDFEDDPRALGARGHRRSVSRGSYQLQAQMNRAVYEDRPPGSVVPTSAAEASRAMAGDTSLSENYAFAGMYHVFDQHVDKAVPRVRFANDDRHRLACCSLDGSISLCQLVPAPPTVLRVLRGHTRGVSDFAWSLSNDILVSTSLDATMRIWASEDGRCIREIPDPDGAELLCCTFQPVNNNLTVVGNAKHNVHVMNISTGKKVKGGSSKLTGRVLALSFDAPGRLLWAGDDRGSVFSFLFDMATGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	60031	67547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_60158_61759_61870_61989_62121_62735_63044_63853_64035_64134_64277_66731_66851_67275
787985	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	8	1155	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
787987	contig_9272_pilon	-	1953	5	Intergenic	novelGene_125932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	24	junction_3	18.0623918681884	172	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	47	1420	421635	379667	FALSE	15	CTTCTTGGTATATTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAVGGGKRFGAVEPMSALRRSGYGPSDCPPYGRYYGAGGGDVPVHPPPPLYPPGSEPPQPPISWRVRGGGPTETTWQVEVGGGDGYYPSGGAWPEPGRTGGSHQEQPPYSSYNSNYWNSPARTRAPYPSTYPVRPELQGQSLNSYTNGAYGPPYHPGPGANTASYSGAYYTPGYTQTNYSTEVPSSYRSPGSSPTPASRWMYPQQDCQTEVPPLRGQVPGYPASQNPGMTLPHYSYGDGNRTVPQSGPSVRPQEDAWASPGAYGMGTRYPWPSPAPSAPPGNLYMTESTSSWPSSGSPQPPPSPPPQQSKDSSYTYIQSDQGVNRHGFPCSVHQYESSGTMNSDNSDLSDSQVQYSAEPQLYDNATNENPSNQDQSSNHPEERLSSDEGTPPSIKKIINVLEKVQYLEQEVEEFVGKKTDKAYWLLEEMLTKELLELDSVETGGQDSVRQARKEAVCKIQAILEKLEKKGL	421681	379133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_380153_380852_381108_383472_383728_400769_400878_421365
787989	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
787996	contig_1443_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_28266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGGTCAAGTTCGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738408	739271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_738400_739300
787997	contig_10003_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_88298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923022	921621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_921600_923000
788001	contig_1786_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_142585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31740	30367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_30400_31700
788002	contig_15706_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_172043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAGGGAAATGACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112241	110054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_-_110100_112200
788003	contig_1008_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_121598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.467024705065	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	48	311	750514	750777	TRUE	35	GAACATTGTTGCATATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVELKSFGALAPAGQMRAGRPKGTRKQKLKRQGTQEAEQPQSQKVGPPPLEFLRVESPLRWTRRMGPPKFEGRVAVPVGLKGRAEAQDQGASTQNPESVANT	750466	775561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_768733_768862_771065_771135_775322
788005	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
788007	SIRV2	-	259	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	666	23	666	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4066	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
788008	contig_5623_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_154854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGAATATGACCTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226152	225651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_225700_226200
788010	contig_6710_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_98298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	3	311	653879	653571	NA	25	GAGTGTTAGAGGGAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRD	653881	653570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
788013	contig_4151_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_65272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624498	624103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_624100_624500
788014	contig_13558_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_123037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586984	584094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_584100_587000
788015	contig_7912_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_129573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTACGCCGCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215409	216008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_215400_216000
788016	contig_18420_pilon	-	1999	5	Intergenic	novelGene_109375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_4	378.902691993604	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	42	605	128838	118145	FALSE	5	GTTGTCAGGTGCTGCCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSSTLSGCLESPGSRQHALVYLPISLIAAKG	128879	116750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_118341_119704_119902_124360_124430_127611_127698_128822
788017	contig_9098_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_75772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCTGGCAAGTGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48294	46087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_46100_48300
788020	contig_11720_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_43910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	250	828	124417	124995	NA	20	AGGAGCCTGGGAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLLPPPPPPPSAPQGLTVVCGHRVDGGHRLWVARGVTVARLRVGRVGGVPTREDRWLPIAPRGWGARVEGVAVLIRRRGTGDGHGRSRAEEPSCLDLKWKIRKAVMSGQAQLTQPTRLPSSPSSGHLCGKEPLILSLDYSVSLSPHRQSPPDQLLALLSAFWPGPLFTVQPPGLGKQQEGGFSSGAQRVS	124167	125026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_124200_125000
788022	SIRV4	-	178	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1345	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3813	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
788025	contig_9290_pilon	+	1835	12	Intergenic	novelGene_77550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58.645876606759	1	106	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	553	867	480056	482218	TRUE	20	AAGGCGTTGTGCCGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTTLMALLTIMMASCRDRSVSSINCSAPPRRMMVQVLALGQPVKKFRLQSGSPQRPGSSRAHLLSEHSRWSGLSLRRPSLSSSDPLRALGQHRTCPCQQSTG	478609	497043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_478986_479879_480062_480820_480958_481342_481437_482140_482300_483136_483304_486107_486276_486625_486681_487544_487667_489934_490033_491384_491538_496919
788026	contig_5419_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_15520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACAGACTCCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251000	252122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_251000_252100
788027	SIRV6	-	241	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTCTTCTTTTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
788029	contig_9014_pilon	+	2284	8	Intergenic	novelGene_106777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	10.7892614791424	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	626	1753	141410	145866	FALSE	25	CACTGTCAGTAATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGYGYYRTVIFSAMFGGYSLYYFNRKTFSFVMPSLVEEIPLDKDDLGLITSSQSAAYAISKFVSGVLSDQMSARWLFSSGLLLVGLVNVVFSWSSTVPVFAALWFLNGLAQGLGWPPCGKILRKWFEPSQFGTWWAILSTSMNLAGGLGPILATILAQSYSWRSTLALSGALCVVVSFLCLLLIHNEPADVGLRNVDPTPSKGKKGSSYMSALEVGGLVGSIAAGYLSDRAMAKAGPSIYGNPRHGLLLFMMAGMTVSMYLFRVTVTTDSPKLWILVLGAVFGFSSYGPIALFGVIANESAPPNLCGTSHAIVGLMANVGGFLAGWPFSTIAKRYSWSTAFWVAEVICAASTAVFFLLRNIRTKMGRVSKAE	140066	146397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_140496_141213_141558_142401_142635_142956_143201_144071_144158_144683_144798_145428_145568_145702
788031	SIRV4	-	198	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1308	15	1308	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3800
788032	contig_10734_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_51095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562538	564108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_562500_564100
788036	contig_6489_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_128941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAATTGCAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254370	253859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_253900_254400
788037	contig_3612_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_87842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTTCATGCCTGTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984499	984057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_984100_984500
788042	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	51	500	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788045	contig_14720_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_164990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGATACATTAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213468	214241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_213500_214200
788047	contig_13721_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_169482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACGAGTGGTCTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20760	19093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_-_19100_20800
788048	contig_1812_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_174512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCATGCTTAATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	4768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_-_4800_5200
788049	contig_5707_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_174517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACACAAGGTTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4270	5232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5707_pilon_+_4300_5200
788051	contig_5484_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_151091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATCAAGTCGATTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203609	204251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_203600_204300
788052	contig_12701_pilon	-	1244	7	Intergenic	novelGene_169550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	63.3160064017517	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	113	1084	40561	26442	FALSE	40	CAGATATGAGAGAGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTAGGPNSAGHPPTRRGQLAALPPHPGAECRGVNQNMAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKSFLPVRTALMIARYLDIFHLMDGVMKKKDEKTSSTSDAIRYPNPT	52022	26281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26578_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_51924
788055	contig_19709_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_108664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82827	84793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19709_pilon_+_82800_84800
788056	contig_15888_pilon	-	925	7	Intergenic	novelGene_84428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1937.42272247322	93	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259789	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251822_252066_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253579_254619_254685_259659
788058	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
788062	contig_8259_pilon	+	1073	3	Intergenic	novelGene_148860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	100.5	139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAATGGTAGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53175	64668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53266_62754_62830_63760
788063	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	496	54	496	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10733	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788065	contig_18081_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_23827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGGCTAGGCCATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202978	202674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_202700_203000
788066	contig_3575_pilon	-	2199	6	Intergenic	novelGene_141116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	4.45421149026402	37	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2148	50	2197	492470	479502	FALSE	45	AAACCGAATGTTAACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFLAVIKAIDPSLVDMKQALEDSTRENLDKAFSIAHDALHIPRLLEPEDIMVDMPDEQSIVTYVAQFLEHFPELEAEDFVDSDKEFPIESTFVRIKDTPPEEESRVFLVTENGERAYTINHETSHPPPSKVFVCDKPESVTGFQLQPCLGGASSGALPDSSHDLMHQIIDQVLQGVPYKASDVGEPSPETSILSSRKDSRRANSLPAKKTVHFETDIYKDASCSKDPFGGQGVCVEGSPRGAKESLKQDGHVVAVEADEGKKPKQEAPKDPEAASDKALDDVSLADAKASDSQSSPGPPTWNGALENTADHMGESRPIVSPGEDATVADSLEITVKLMNVEAMDKEDYFESIPLKASKFNSDLVSFASTSHAFDETPSLHEDKPTESDASEGHAEKLGKRIAKSAHKEKESSASQVTADQPAPHKDPGQDVQGSLVPEEAPIDKKQGVYEKAKQKSVRHHGEEEEEEEGFQGDDGELPSNPPSSSVSLETLRSHSEEGLDFKPSPPLSKVSVIPHNLFYYPHYEMPLAAVLEAFTEGPEDLKNEDAGLEDPDDYLQDLDSREEEADDAQIGCSFLVTGKELPRASDQVPYLDRGAVGTLRAPDPTPSAHHEDHQQGEATESDPSERDQSQKSPNSENLVNPIEEKIKEESTSSKKKEKRKHVDHVESSIFIAPGTVRSSDDLEEDIAVHKIPSRTSHSDSSIYIRRHTNRSLESDHFSYVQLRNAADVDDR	492519	479499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_479553_480140_480202_483752_483950_487398_489055_491221_491305_492370
788067	contig_12340_pilon	+	1323	8	Intergenic	novelGene_122108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_2	11.1593284853927	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTGTGCAGTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53563	69392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_53597_55686_55761_59536_59600_61820_61931_62566_62623_64091_64205_65708_65787_68596
788073	contig_2100_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_50640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982305	980741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_980700_982300
788079	contig_3862_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_137442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTTCCTGGGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646488	645730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_645700_646500
788080	contig_1331_pilon	-	921	4	Intergenic	novelGene_37844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2559.73488210531	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAGAGCCACTGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169926	159647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160275_160847_160949_166406_166534_169860
788083	contig_8452_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_47986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGTAAAATCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104360	105783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_104400_105800
788085	contig_5896_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_159249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAAAACCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362838	361983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_362000_362800
788087	contig_5602_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_132998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAGCTCAATCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91424	89159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_89200_91400
788090	contig_3942_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_128740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784091	784745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_784100_784700
788091	contig_10734_pilon	-	2539	11	Intergenic	novelGene_51314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	3.01496268633627	21	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	61	1653	1411787	1396695	FALSE	15	TGGAATATTGTTGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSDSSAEDRFLRELAIQNPLMLSDVFFCSYFRSLRVVNKGVSLVDKGLLKFPKLEELVLSANRIKEVKASNLPPTLKVLELYGNEITSVECLCACPPPGLQHLGLGHNKLLGPLESLYVTADHWPNLVSLDLGFNDLTDLQSMVDSLHTLRQLRLLVLQGNPLALVPYYRGLTVDTLSRLCVLDDITVSPNEKHQFRGLSVNGDLLAHEAQLVVTIGNIRGVLDSSVLDPEPGPEGPFIAYSYYVTYDFVEDEEGEGSEYAGVLAEIVKPSSSPEIVPEESPEEDVEEAEESVESGGMTESGELEGSVSVRGSAVLQTSIDSAEELAKLRPRIDPRLCPSPGTVLFSTARKPWSDVIPCNYEMQHTLRDLVPLKAFLLAGTTVTIVQEKILSWPLVAPPSESPLTTKKGKLEKDKKRRDDKKRKGEKEASKEQKGPKKKKELPKELRQDPPILTVLGRGMVALESLLAGESLMSTVCNFGVVRTVESDRLTFARESKKNKSKKAAKRGQSGAASYGFQGAAGGFKLLTFWFAAELLTTAPPGLHAHQVAN	1411847	1395808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1396826_1397313_1397354_1397825_1398015_1398101_1398228_1398426_1398569_1402795_1403023_1403601_1403790_1404941_1405181_1408536_1408677_1409559_1409671_1411727
788093	contig_5725_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_167148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251051	249293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_249300_251100
788094	contig_2550_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_135632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGACTCATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428529	426891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_426900_428500
788095	scaffold_9100_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_83319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	649	972	849274	849597	NA	25	TGAGGCAGCACACGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVCQSSTSTPESGVSVHSTGTPPEVGFLATVSKPHRTPFGGFPANSTSTSESGSLNAKPGLQSSLDFSTIQLAIAKTSPTKFGFQTWRGQGSSKLVPSLGVLLPS	848625	849936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_848600_849900
788096	contig_6191_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_107849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCTGGAGCTACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166884	167627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_166900_167600
788097	contig_6191_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_107850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAACTTCCTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168240	169365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_168200_169400
788098	contig_16091_pilon	-	1279	6	Intergenic	novelGene_112337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAGAAGAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16814	1462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_-_1547_1932_1979_3654_3727_12748_12834_14268_14449_16002
788099	contig_7963_pilon	+	1240	6	Intergenic	novelGene_58520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.252834300513	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	358	969	195152	200117	FALSE	40	AATAAATTCTGGTGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	193886	200388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195060_195309_197688_197974_199411_199529_199689_199726_200100
788100	contig_1037_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_84589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCAGGTGAAGGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146637	147128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_146600_147100
788102	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788104	SIRV1	+	182	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTCCCACAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
788109	contig_18869_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_56048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73561	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
788111	contig_8161_pilon	+	1120	2	Intergenic	novelGene_156766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGACACTACAAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321410	322806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_321691_321966
788113	SIRV6	+	266	4	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	32	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10721_10819_11034_11109_11205
788114	contig_20842_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_160973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTTTGAATCCTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129475	130228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_129500_130200
788115	contig_20842_pilon	+	656	2	Intergenic	novelGene_160974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130489	132299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_131081_132234
788118	contig_3122_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_64393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACATTAATTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268874	268262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_268300_268900
788120	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	53	500	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788123	contig_8122_pilon	+	1174	6	Intergenic	novelGene_40261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1143.3909217761	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	106	336	742073	744774	TRUE	40	TCTTTAAAATTTCAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYTNLRDHSMLKSLQITLMHPCPRFMERHIY	737500	748827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_737594_742060_742163_744037_744088_744683_744784_745062_745148_748083
788126	contig_4531_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_47896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGGAGTTAATGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331403	330113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_330100_331400
788127	contig_11338_pilon	+	1073	13	Intergenic	novelGene_6261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	101.480156790489	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	70	573	119137	149685	TRUE	10	GACCCAGGCTCTGTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHYEVEILDAKTREKLCFLDKVEPHATIAEIKNLFTKTHPQWYPARQSLRLDPKGKSLKDEDVLQKLPVGTTATLYFRDLGTLHLWPQIRLHVQSAHSRAPCLHLPLIPLHQAPAGDALRASLLPRHHAPAQHLQELHVLLGLRCLDGLLHQPPSLYTPPPTELSR	119067	150707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_119152_147568_147620_148324_148377_148784_148830_148916_148996_149155_149217_149301_149408_149503_149578_149664_149709_149804_149863_149940_150030_150264_150311_150423
788128	contig_11115_pilon	+	1024	5	Intergenic	novelGene_102817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	681.09044002981	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	86	934	171830	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPQLRSALSETCQRPAPAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165342	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165398_171799_171981_172339_172595_172714_172964_173047
788129	contig_13778_pilon	-	1502	2	Intergenic	novelGene_70851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	0	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320460	257420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_258738_320275
788130	contig_11088_pilon	+	864	5	Intergenic	novelGene_85025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.331791652406	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10800	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_10942_13625_13696_14663_14937_16250_16348_17119
788133	contig_16098_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_45854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202154	202517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_202200_202500
788136	contig_16790_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_171677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAGTGAGATAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31200	31579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_+_31200_31600
788140	contig_12490_pilon	+	2648	1	Intergenic	novelGene_169047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAAAAAAAAAAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8952	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_+_9000_11600
788141	contig_9132_pilon	-	1619	9	Intergenic	novelGene_121374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	70.8421440598744	500	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	205	1335	137052	97662	FALSE	15	ATTTCCTTTCTCCAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMALSKTFGQKPVKFQLEDDGEFYMIGSEVGNYLRMFRGSLYKRYPSLWRRLATVEERKKIVASSHDHGYTTLATSVTLLKASEVEEILDGNDEKYKAVSISTEPPTYLREQKAKRNSQWVPTLPNSSHHLDAVPCSTTINRNRMGRDKKRTFPLCFDDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW	137256	97377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786_105954_125469_125598_127955_128094_131337_131468_133181_133294_136959
788146	contig_3975_pilon	+	3494	5	Intergenic	novelGene_54702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.1650635094611	37	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	276	1703	1252900	1277467	FALSE	25	TATAGGATGTCAGTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSAFPLDAILNARRAARPCQAHDKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFEELQRELKEQLQALQDSEREHTEALQLLKRQVAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKAQRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETDRHAFLAGVASVSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSSGIHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQPLRINTIRI	1252624	1279258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1253308_1263771_1263868_1269632_1269890_1270760_1270877_1276916
788153	contig_6217_pilon	-	1582	8	Intergenic	novelGene_109627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_1	343.010084935337	16	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	88	1002	468498	452281	FALSE	15	AGTTCCTCTTGTGTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEVNICCL	494682	451700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619
788154	contig_6546_pilon	+	406	4	Intergenic	novelGene_140990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	24	368	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQHSRAMASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597679	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
788155	contig_4769_pilon	-	1673	8	Intergenic	novelGene_117967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	107.187419304426	169	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	5	397	437505	418729	TRUE	20	GAAGCCTGGTTGATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMASTEASRSLPKSRRDPEGRALRQDKFSVLLPTYNERENLPLIVWLLVKSFTESVINYEIIIIDDGSPDGTREVAEQLEKIYGSDKILLRPREKKLGLGTAYIHGMKHATGNYIIIMDADLSHHVNFITH	437509	407532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408337_408495_412412_412482_417835_418746_421191_421273_423624_423659_433960_434061_437344
788156	contig_14513_pilon	-	1173	2	Intergenic	novelGene_70334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	155	319	18880	12143	FALSE	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19034	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
788157	contig_9705_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_41744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGATGGAATACTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413633	416654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_413825_415872
788159	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
788160	contig_9995_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_47742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCTAAAAATTAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567507	568297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_567500_568300
788163	contig_8269_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_106222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTCACAGAGCTGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266280	268443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_266300_268400
788164	contig_9875_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_154421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTTTTGCCAATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396943	395883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_395900_396900
788169	contig_10434_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_82017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCTGCTGAGACTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97307	98007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_97300_98000
788170	contig_14441_pilon	+	964	5	Intergenic	novelGene_100564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	467.18431855104	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	380	928	125667	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111196	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111385_121829_121872_125517_125902_126159_126283_126514
788172	contig_6602_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_166438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCAAAAAAAAAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338743	339977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_338700_340000
788173	contig_6602_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_166439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGCAATTAAACCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339984	341041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_340000_341000
788179	contig_6164_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_121256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	361	765	32887	33291	NA	20	GGCATAGTTTCACTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLQDGVKLSYTVSKAIIFMEADCHTSFSCRAAGGFELPTFQLAAECLTITPPGVLDKGLISRINKDLQQLNNKKKKKIKKLAKDLKRHFSKEDIQMANDHMKRFSISHCVPSSLFQFIATLQDRVELPHRVS	32526	34189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_32500_34200
788181	SIRV6	+	183	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	546	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10783	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10812_11027_11109_11205
788184	contig_2074_pilon	-	1502	4	Intergenic	novelGene_155331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	86.5422183420067	191	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	351	1091	138653	133493	TRUE	20	TTGGGCTTTGTGAACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAWLWLLGAAVLASVHCQPFPAHGDKSLEVPQAPSDQLSEPAPAYHKITPTITNFALRLYKQLAADIPRNIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSTQILEGLGFNLTETPEADLHHSFQSLLHTLDLPSPKLELKVGNSLFLDKQLKPQQWFLDSIKELYGALAFSANFTDSAGTARNINEYVRKRTYGQVSDCLQEFSQDTLMVLLNYIFFKVCWTCICQGFPFLEHITWKRYCPESVSPTYST	145209	131200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2074_pilon_-_131562_133442_133591_138010_138657_144862
788189	contig_3602_pilon	-	1558	6	Intergenic	novelGene_60551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	121.508189024444	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	71	589	401350	389696	FALSE	85	CACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPEAEPPSHQGTGDAGVRTGVAMIRFILIQNRAGKTRLAKWYMQFDDDEKQKLIEEVHAVVTVRDAKHTNFVEFRNFKIIYRRYAGLYFCICVDVNDNNLAYLEAIHNFVEVLNEYFHNVCELDLVFNFYKVYTVVDEMFLAGEIRETSQTKEPHLEVLPLVSQQTPLLTEQCGGCRHTSDLLLSTEDLKSERG	401420	388726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_389825_390171_390235_390436_390497_391239_391354_397430_397581_401347
788190	contig_6027_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_74419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTGTTAACCAATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111760	113621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_111800_113600
788191	contig_1925_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_162224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACCCAGCACTAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569125	568134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_568100_569100
788193	contig_8354_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_24068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	322	333	43270	43281	NA	25	GTAATAATGGCTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTSQSLVKQKEKFYSAYVQRGKSRKRTSTLPQLTSARVQGNTTDQARVGKRTSTLPQPCLPESKEILQSRQEWENGQARCHSHVCPSPRKYYRAGKNGKTDKHAATAMSA	42948	43918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_42900_43900
788196	contig_10050_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_119634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATCATAGTGTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267243	267690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_267200_267700
788197	contig_10050_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_119635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGCCCGGCAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269327	270287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_269300_270300
788198	contig_11003_pilon	+	1901	1	Intergenic	novelGene_105455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGAGTTTAGAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446426	448327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_446400_448300
788199	contig_9011_pilon	+	1933	1	Intergenic	novelGene_159321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543409	545342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_543400_545300
788200	contig_2219_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_67182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTGGCCTTTTTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128528	129171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_128500_129200
788202	contig_2219_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_67183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGGTGGAAGAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129820	130201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_129800_130200
788203	contig_12270_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_113188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14119	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
788205	contig_10549_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_110620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATAGGTACGCTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225821	224543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_224500_225800
788211	contig_8589_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_107361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169633	167443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_167400_169600
788212	SIRV2	+	410	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	112	1	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
788213	contig_11629_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_161197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTCTGTCCTATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317427	315750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_315800_317400
788216	contig_7945_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_161609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGGGAGGAAGCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472089	471397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_471400_472100
788217	contig_500_pilon	+	946	6	Intergenic	novelGene_31100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	264.393192045484	1332	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	322	756	1512837	1524409	FALSE	5	GGTCCTGTGTTCATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVKRSRKAPPDGWELIEPTLDELDQKMREAETEPHEGKRKVESLWPIFRIHHQKTRYIFDLFYKRKAISRELYEYCIKEGYADKNLIAKWKKQGYENLCCLRCIQTRDTNFGTNCICRVPKSKLEVGRIIECTHCGCRGCSG	1510912	1524599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1511065_1512133_1512275_1512808_1512931_1522521_1522645_1522858_1523026_1524358
788218	contig_12250_pilon	+	1005	4	Intergenic	novelGene_80593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	757.025025272539	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTTTGTATCGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322739	332467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_323177_323438_328400_328687_332096
788221	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
788223	contig_8866_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_77868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804642	802711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_802700_804600
788224	SIRV7	-	278	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91642	6	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
788226	SIRV2	-	241	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	684	23	684	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4048	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
788231	contig_5020_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_27905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATATAATGTCTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120564	122222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_120600_122200
788234	contig_10437_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_38234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTCCCCTGACCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320213	319496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_319500_320200
788235	contig_8487_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_111915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCATTCATTGTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193004	192139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_192100_193000
788237	contig_14445_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_137374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTGCTGTTACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336251	334004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_334000_336300
788239	contig_3679_pilon	+	640	5	Intergenic	novelGene_112112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	10.4731800328267	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	24	638	625182	641708	FALSE	25	TTTGGCCACGGACCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFPVFDLMEKIGRKCGCILSQVSYRLFEDMGLFEAFKIPIREFMNYFHALEIGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTQPIPGLSTVINDQGSASDSDSDSGFTHGHMGYVFSKMYNVPDGKYGCLSGNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATSAPQAVLYNDRSVLENHHAAAAWNLFMSRPEYNFLVNLDHVEFKHFRFLVIEA	625158	641710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_625224_629771_629884_639320_639435_639594_639795_641561
788240	contig_3679_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_112114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655366	656934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_655400_656900
788241	contig_13224_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_104105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCCAGAGCACCGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266694	269063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_266700_269100
788242	contig_8598_pilon	-	1144	2	Intergenic	novelGene_22883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	281	655	57802	57188	FALSE	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLSVSHPLPNLGPLTFLSSQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	58082	56698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_57297_57536
788244	contig_2757_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_164587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223919	226164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_223900_226200
788246	contig_10904_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_22594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCACATAGGAAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459827	459536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_459500_459800
788247	contig_9011_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_159315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTTAGCATTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503618	504513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_503600_504500
788250	contig_4519_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_123703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGAAATTCTTCAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568641	570411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_568600_570400
788251	contig_19941_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_139759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAAATGTTCTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40353	39645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_39600_40400
788252	contig_13145_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_116635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGTAAAAACATTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67077	67825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_67100_67800
788253	contig_13145_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_116636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCCTGGCATATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69043	70508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_69000_70500
788255	contig_4654_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_103068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGGCAAGGCCTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462658	464411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_462700_464400
788256	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
788257	contig_9389_pilon	+	1203	8	Intergenic	novelGene_83988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1157.54338747088	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	76	597	383398	384766	TRUE	30	GGCTTCACGAAGCCGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	382006	385482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749_384798_384907
788258	scaffold_21177_pilon	-	1390	7	Intergenic	novelGene_145475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	131.087439011778	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	97	1362	221483	145712	FALSE	5	TGGTTTTTGTTTGGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGGTVDIVESEPENDHGVELLDQNSSIRVPREKMVYMTVNDSQQEDEDLNVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYDIWVVSGALVAQQLSAWLLTERSTVGTHQPLHRRKIWQSASIKITALKTLWAVLLCSIASL	254674	145683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_145897_182184_182341_182719_182864_183067_183218_217716_218287_221422_221512_254606
788259	contig_9423_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_99173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGCACTTCTTCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37587	36936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_36900_37600
788260	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788261	contig_16382_pilon	-	2931	5	Intergenic	novelGene_160223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_4	89.5443325956478	54	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	611	1126	301025	91686	FALSE	55	CTAAAATAAAAAATTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIEMDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVNQMGCWAL	303444	89880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_91779_164620_164784_195380_195574_300958_301567_303375
788265	contig_6059_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_44806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCCAGAGTGTGACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431261	429904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_429900_431300
788268	contig_6375_pilon	+	1438	9	Intergenic	novelGene_72949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	58.791873375493	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	12	1214	196329	201553	FALSE	15	CACTGCTTCTGGTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLMCGRREILLLLRSQRQFHRVAGPSHWPQKPLTSRLPFPAGQNYGRPHYVLAAAGPRCLSTSAVSFAEAQVQASPPAVPVTPSPTAVTEVAPGETADVVQAAAEQSFAELGLGSYTPVGLIQNLLEFMHVDLGLPWWGAIAASTVLARCLVFPLIIKGQKEAAKIHNHLPEIQKFSTRIREAKLAGDQAEFYRACSEMTLYQKKHDVKLFRPLILPLTQAPIFLSFFIALREMANLPVPSLQTGGLWWFQDLTVSDPTYVLPLVVTATMWAVLEAVFMYWLSSNMFSLGQVACLRIPAVRTVLKIPQRVVHDPDKLAPREGFVKSFKRGWRNAEIAHQMQERERRMQNHLQLAARGPLRQTFAHNPLLQPGKNHPSTTPDSSSKPKSKQPWQDTLG	196317	201777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_196392_196745_196905_197540_197758_199548_199693_200148_200235_200431_200597_201018_201182_201262_201344_201428
788270	contig_11590_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_125589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCAAACTCGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680310	679478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_679500_680300
788271	contig_11590_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_125588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTTATCAGAAGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679164	677377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_677400_679200
788273	contig_6132_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_163621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACTTCTTGTTTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196347	198610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_+_196300_198600
788275	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788276	contig_3825_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_78046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	523	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGTTCCTGGACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476239	2474910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2474900_2476200
788279	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788280	contig_4125_pilon	-	2340	20	Intergenic	novelGene_25211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5812028540948	2	67	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	336	2222	1650440	1625813	FALSE	50	AAATATATACATATATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAIDIGGSLTKLAYYSTVQHKVAKVRSFDHPGKDTEQDHEPPYEISVQEEITARLHFIKFENTYIEACLDFIKDHLVNTETKVIQATGGGAYKFKDLIEEKLQLKVDKEDVMTCLIKGCNFVLKNIPHEAFMYQKDADPEFRFQTNHPNIFPYLLVNIGSGVSIVKVETEDEFEWIGGSSIGGGTFWGLGALLTKTKKFDELLHLASKGQHTNVDMLVQDIYGGACQTLGLSGTLIASSFGKSATADREFSKEDMAKSLLHMISNDIGQLACLYAKLHHLDRIYFGGFFIRGHPVTMRTITYSINFFSKGEVQALFLRHEGYLGAIGAFLKGAEQDNPNQYSWGENYAGSSGLMSSSPELCPAQRARSGTFDLLEMDRLARPLVDLPLLLDPSSYVPDTVDLTEDPMARKYWLSCFEEALDGVVKRAVASQPDSIDAAERAEKFRQKYWNKLQTLRHQPFAYGTLTVRSLLDTREHCLNEFNFPDPYSKVKQKENGVALKCFQQVVRSLDALGWEERQLALVEGLLAGNVFDWGAKAVSDVLESDPQFGFEEAKRKLQERPWLVDSYNDWLQRLKGPPHKCALIFADNSGVDIILGVFPFVRELLFRGTEVILACNSGPALNDVTYSESLIVAERIAAMDPIIHSALGEERLLLVQTGSSSPCLDLSRLDKGLAALVRERGADLVVIEGMGRAVHTNYHATLRCESLKLAVIKNSWLADRLGGQLFSVIFKHRITVALA	1657028	1625694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1625841_1626018_1626211_1627086_1627156_1627414_1627516_1628021_1628127_1628557_1628608_1629837_1629894_1631137_1631290_1632326_1632415_1632927_1633041_1634251_1634408_1636643_1636745_1637576_1637659_1638916_1639099_1649290_1649445_1649825_1649919_1650275_1650460_1651217_1651433_1651884_1651968_1657010
788281	contig_11855_pilon	-	1190	3	Intergenic	novelGene_66997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2.5	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	458	733	1310207	1309932	FALSE	20	TGGAGGGTTTGTTGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWPYCEKRCGYCNFNKYIPRGVEEAAVRSCLVTEAQTLLLLSGVRRVESVFFGGGTPSLASPHTVAAVLEAVAQAAYLPADAEVTLEANPTSSAGSRLAAFGTVGVNRLSIGLQSLDDAELQLLGRTHSASDALRTLAEARHLFPGRVSVDLMLGLPAQQVGPWLGQLQELLCHCDDHVSLYQLSLERGTALFAQVQQGALPAPDPELAAEMYQKGRVVLREAGFRQYEVSNFARNVRPGAEG	1313225	1309474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1310322_1312759_1312965_1313087
788282	contig_4125_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_25098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1597	1974	653190	652813	NA	15	GGCTCTGAGAGGCAGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHLDTQWQNFKPHKRFEQQINTWKSTLPGSKIHVERRDSHVKWPLWCGMVPSWLILDITCLWRMSPCGLLPVPPAAGLPYAWTSSTSGWTAFLLLGNILILQSFLGSGLCPPAPLLLGTVLCLS	654786	652752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_652800_654800
788284	contig_7416_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_134341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAACAAAGCCAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915433	916897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_915400_916900
788287	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	8	1158	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
788290	contig_11294_pilon	+	2207	11	Intergenic	novelGene_50049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_10	115.820075979944	79	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	28	1251	251378	325920	FALSE	20	TTTTTATGTGGGAGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGAASALKMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGGSNHLAVVLGDIILAVIDSIFVWFISFAMSFGKVSCVIKDRLFLICNNRKKYSYVIIVTLI	251350	326876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693_323788_325734
788291	contig_20241_pilon	+	2026	7	Intergenic	novelGene_159734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	12.8668393770792	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	79	720	213603	221924	FALSE	15	TGTTCCTGTCCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQEYFALNTEAGSHMAVLSCRHINWCYYSVHRHRHQSDHECGKLEISKPRMAATQRLGKDVIGSKTGETVSKRRKGAKNTETAAKVALMKLKMHADGDKSLPQTERIYFQVFLPKGSKEKSKPMFFCHRWSIGKVIDFAASLASLKNDNNKSTAKKLRLCHITSGQALPLDNILGTWMAKEDCPLHNGGNIILEYLNDEELFLKNVDSYLE	210067	223230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_210125_213581_213625_216096_216137_216616_216748_217495_217618_221499_221656_221753
788292	contig_20199_pilon	-	767	3	Intergenic	novelGene_82591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1345	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	44104	41055	FALSE	25	TCAAAGAGTGGCTGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44105	40651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43996
788297	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	61	511	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788301	contig_19680_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_132003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGGTTAAGCACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49335	46910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_46900_49300
788302	contig_10765_pilon	+	1916	5	Intergenic	novelGene_122901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.9099959410092	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	141	530	112611	117362	FALSE	30	ATGTAACATTTACAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTPTSWRKLTNGTRKEALENNYEVLFREPATRWKFNVPELARRNIHGVPREKIHRMKEQYEHGVTFHSVLHAEKPSWATGSQDRNTAAPSEGAGDWRACAEFPSRRAPGGFASDSFFSRRGGCHRGY	99686	118748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_99713_99810_99851_112536_112665_115931_116009_117103
788303	contig_7707_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_72186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTCTCACAAACACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582500	581734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_581700_582500
788304	contig_6710_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_96394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788308	contig_14445_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_137353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAAGCAGCAGACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259243	259049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_259000_259200
788309	contig_5484_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_151109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTTAAAAATGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335715	334964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_335000_335700
788311	contig_709_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_57614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCAGGACCTTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2410454	2410716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2410500_2410700
788313	contig_9189_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_165116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAGCTGAAACGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303031	301773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_301800_303000
788314	contig_405_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_135308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCTGAAGTACAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349986	349654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_349700_350000
788316	contig_12123_pilon	+	2432	4	Intergenic	novelGene_144609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1103	junction_3	904.088982837911	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	142	720	141418	168339	FALSE	30	GTGAGGCACTTTTTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSGGARWREALPGPHYYTWGDHGGIIMAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFLFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIFGSNKEDVHSWLIFQVNATDALGKLLPPWLFSYTHLLTSCYVQSTSLSTMCSEEFDSLGEMHTYGKLVRNPGRSMKAYLNDSFY	141276	170051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_141467_143157_143232_154195_154285_167972
788319	contig_3822_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_133332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307262	308419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_307300_308400
788320	contig_12414_pilon	+	1462	7	Intergenic	novelGene_59608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_6	28.1424945589406	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	179	898	527780	582642	FALSE	70	GAAAAAAGAAAAAGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRVCLIYLLSGVIMLKSGWTRVPYLTQAYKTNWYLPICTCDYIRTKQFTFPTGPFPEKYCRQQRQSSNSS	527601	583206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375
788321	contig_5686_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_45435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	40	309	205869	206138	NA	15	TTTACCTTTTTTTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAQFYSDTRGAAMSRNQLHCNQFSQLEREERRAGTQPSLQFLRRVHGTPSSAGGWYPPDFMGCSLTITRRAKHFFKGEETAPVEVTCVSQRHAFLLILYLK	205829	207133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_205800_207100
788326	contig_9668_pilon	-	660	2	Intergenic	novelGene_58252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	520	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAAGGTAACACATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669976	609963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_610514_669866
788329	contig_9132_pilon	-	1633	9	Intergenic	novelGene_121371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	71.5572323388768	516	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	191	1348	137052	97662	FALSE	10	TTTCCTTTCTCCAACTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMALSKTFGQKPVKFQLEDDGEFYMIGSEVGNYLRMFRGSLYKRYPSLWRRLATVEERKKIVASSHGKKTKPNTKDHGYTTLATSVTLLKASEVEEILDGNDEKYKAVSISTEPPTYLREQKAKRNSQWVPTLPNSSHHLDAVPCSTTINRNRMGRDKKRTFPLCFDDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEKLMTPEMFSEILCDDLDLNPLTFVPAIASAIRQQIESYPTDSILEDQSDQRVIIKLNIHVGNISLVDQFEWDMSEKENSPEKFALKLCSELGLGGEFVTTIAYSIRGQLSWHQKTYAFSENPLPTVEIAIRNTGDADQWCPLLETLTDAEMEKKIRDQDRNTRRMRRLANTAPAW	137242	97376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786_105954_125469_125598_127955_128094_131337_131468_133154_133294_136959
788330	contig_4686_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_118536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATGAAAGCAAAGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488283	487910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_487900_488300
788331	scaffold_13505_pilon	+	1317	3	Intergenic	novelGene_111561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_1	186	179	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTTCTCCAGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608568	613611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610099_613391
788332	contig_12635_pilon	-	1955	12	Intergenic	novelGene_60870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	11.8558839177463	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	9	1763	675811	657474	FALSE	35	TACATACTGTGTATTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQYIYQSMPRMLSLWLDYGAKAYEWEKAGRSDRVQMRNDLAKINKVITEHTNYLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFVVLMEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRLTDKLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHANHEPFPGHWAYIAGFDDTVEVLASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVYMTGKELRQCMLPKAAALTEKLKVFQEFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKSFLHDPLVEWSKPVKGNSKAPLNETGEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKNRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGWTPYM	675819	657281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_657648_658547_658654_660618_660771_661933_662088_662384_662542_664755_664907_666945_667090_668503_668705_670228_670364_671291_671525_672238_672337_675761
788333	SIRV6	+	353	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	17	337	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
788334	contig_7157_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_131283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGGTGTGTTCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834320	835417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_834300_835400
788335	contig_15092_pilon	+	1333	3	Intergenic	novelGene_57812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	2	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	18	584	325159	351165	FALSE	15	GCTTGAGTTCTGTTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325141	351914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
788336	contig_2646_pilon	-	2391	14	Intergenic	novelGene_69550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	78.5193602930411	3	135	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	426	1445	863799	847260	FALSE	40	ATCTATTTTGCATAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPVFRKKMVWEILHQQLLY	867411	846313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847267_847377_847437_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858974_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863809_863997_864102_865297_865467_867268
788338	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788341	contig_1331_pilon	-	860	5	Intergenic	novelGene_37834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1129.29712653491	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169932	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159640_159995_160195_160867_160949_166414_166534_169860
788342	contig_19899_pilon	-	1132	6	Intergenic	novelGene_102534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	53.2653733676955	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	247	882	419823	407770	TRUE	55	AAAAGAAATACATATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMQSHHHAYRKAMESYFNSLWSFPSAVLPYSYYANQGGYPQSFYDRHSASQDSHCTYPHFRGSGQHPHDSHWLQASTREEQALSSEEEVESESDGEVECDLSNMEITEELRQYFAETERHREERRRQQQLDAERLGDYVNADHDLYYNTHRSAEPPSESPSERRQAEMKRLYGDSAAKIQAMEAAVQLSFNKHCDLKRPKYWPVIPLKF	430017	397781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_397926_407352_407445_407755_408027_419444_419902_420536_420582_429894
788346	contig_13004_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_112725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCATTAAAGATTGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917913	920192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_917900_920200
788347	contig_14694_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_152473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAATTATTTCTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116806	117102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_116800_117100
788348	contig_14694_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_152474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117508	118271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_117500_118300
788349	contig_10000_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_139340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1585	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311351	305721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_306801_310657
788350	contig_11052_pilon	+	656	4	Intergenic	novelGene_115459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2271.10961622043	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102809	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_102929_103065_103136_106346_106461_107445
788351	contig_16387_pilon	-	822	6	Intergenic	novelGene_174523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	22.9137513297147	285	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	23	577	95195	68277	TRUE	30	CCCCAAGAACTTGATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTFSASMTTLQGPQNTTPGADSSVSQMGQPAALHLDPWKGMSEKRVLRIFGVVQILIALINLSLGITILCVSLLFDEPAPISVYMGYPVLGSVMFIVSGALSIAAGKRDTECLDECTPGLNCLSSITAAIGIIIIAFSLSSFSFHHFPCDSNPMSENCAINRSILVGMNGVVLILSALEFCIAAYLCTIG	95217	65678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_-_65897_68249_68352_79968_80128_81803_81861_93844_93974_95060
788353	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
788356	SIRV4	-	464	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
788365	contig_9363_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_6658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGCTTGGAGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009739	1009122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009100_1009700
788369	contig_12596_pilon	-	1146	2	Intergenic	novelGene_172736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATGTGTTTTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78626	75399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_-_76392_78472
788371	contig_12046_pilon	+	1756	2	Intergenic	novelGene_83495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCATTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856636	862772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_856784_861163
788372	contig_6595_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_122535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGATTCTGACTCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434755	436281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_434800_436300
788373	contig_8145_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_118650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTGAGAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735907	734972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_735000_735900
788375	contig_7057_pilon	-	1179	7	Intergenic	novelGene_123225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	40.6793013159709	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	349	789	538082	537363	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSGRKARASYAERTEGFLRACEAPRGGGELHFPTLLRNGSDIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRYLGTGLPRLLIPRGQPGYPESGLILSLSDSTPSPLCPEASPSYILRSAPES	539857	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539734
788377	SIRV4	-	452	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1071	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4087	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
788378	contig_1472_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_86118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCAACAGGTGAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171126	169171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_169200_171100
788379	contig_11978_pilon	-	794	6	Intergenic	novelGene_62990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAAGGCCGGCTCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527344	1517250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1517352_1517682_1517869_1520333_1520440_1523597_1523777_1526093_1526190_1527218
788381	contig_5120_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_169620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAACTGTTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333433	334792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_+_333400_334800
788383	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_17838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27883	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
788384	contig_7179_pilon	-	1854	2	Intergenic	novelGene_78173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	273	junction_1	0	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	533	973	1060393	1058685	FALSE	5	TTTTTTTCTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMVSDQWGERTAQSPENWGLDPRIKINFSPFLSWAAMALQNRDFL	1060925	1057803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058958_1060225
788388	contig_14679_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_174183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	183	542	94992	94633	NA	70	TTAAAGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIITPLSYLSNAAITEIPQVDGFNKQLYFLTVLGGKKSKYRAPALGEGFLSLLALGEGLRLLGDLHVSWHQSSPGSKRFSAQEPQVQRMCSTPSSSFLVVVGPPLSACCLSLLLSLVR	95174	93957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_94000_95200
788389	contig_13365_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_168088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTATTTCTAAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64498	66044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_64500_66000
788390	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_98169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTTCAGCCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653800
788392	contig_8044_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_132390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTATTTGGCTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542637	540943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_540900_542600
788393	contig_10235_pilon	-	1452	9	Intergenic	novelGene_46568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50.8570299958619	11	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	180	770	540388	538346	TRUE	20	GTTGAAGGAATGGTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENATLRRQLEALLAKNSELKLGSGNRKVVCIMIFLLFIAFNFGPVSISEPPSVPASPRVSGEEPRPRRHLLEFSEQEPALGVAPVQGSSQGPEEPQPSPAGRPSFRNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSDCRHFNRTESLRLADELSGWVQRHQRGRRKIPQRAQERQKSQLWKKLPPVKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRITCCSQPSATIRPLGLRCPW	540655	537160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538618_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539572_539723_539904_540344_540437_540524
788395	contig_13292_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_142938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTCTTATAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206038	204265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_204300_206000
788398	contig_5799_pilon	+	1522	8	Intergenic	novelGene_50325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	79.9890298600951	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	252	1286	671828	717769	FALSE	25	TATGGATATATTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGFSDVDHTYAQRTQLFDTLVNFFPDSMTPPKGNLVDLITL	671576	718005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547_704603_717647
788399	contig_20610_pilon	+	1262	2	Intergenic	novelGene_67632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGTCTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5935	7368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_6455_6625
788400	contig_11292_pilon	-	1066	9	Intergenic	novelGene_109410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	273.520451703342	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	449	994	164507	161842	FALSE	5	CCTGCCACCTGTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167566	161769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164759_166399_166476_167109_167194_167413
788402	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
788403	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_96426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
788404	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
788410	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788412	contig_537_pilon	+	1158	3	Intergenic	novelGene_167592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.5	472	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	110	973	547218	549477	FALSE	30	ATCACTTATGATTCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFTYWCILHDFPLILPDVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	544540	549662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_544580_547147_547288_548683
788413	contig_18869_pilon	-	161	1	Intergenic	novelGene_56403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATTTTGTAATCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73571	73410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
788415	contig_14855_pilon	+	2128	6	Intergenic	novelGene_146032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	24.273442277518	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	283	921	650839	654448	FALSE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648557	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340
788418	contig_15273_pilon	-	2214	5	Intergenic	novelGene_140417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	235.219445412151	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	1838	2212	53110	27941	FALSE	30	TCATGGACAGTAAGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSCYQYGKSPNSKEKKHVTEHYYGVLYCVCHKSTYSSLPDDYNCKVELALTSDGRTIVCYHPSVDIPYEHTKPIPHPDPVHNNEDTHDQVLKTRLEVKDEPLEQGPMIEQLSKMFFTTKHRWY	55085	27938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_28094_35310_35396_48755_48820_53037_53179_53316
788419	contig_1964_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_130916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTCTTATAAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183740	181636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_181600_183700
788420	SIRV6	+	376	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	0	407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788422	contig_18081_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_23814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAATATTGACTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162875	164319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_162900_164300
788425	scaffold_4438_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_174540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACTTTTTTTAATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399267	398490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_398500_399300
788427	contig_7022_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_142147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAACTCCGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157425	159293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_157400_159300
788428	contig_11702_pilon	+	2415	10	Intergenic	novelGene_142022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	708	1274	556150	557662	TRUE	5	CTGCGTGCTACCGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFTRVMVLVTPPTTVVTTWACWATVTVPDLCTVMMGRVDVLAAEDTDVPTCAAAVFSMRVAGLLTMTGEEATFTVAGRVVVPGVTATVLTMVVPAGTLSTVGAEDGGIFCVAAAAAASAAIPLICGLLPITCPLGALCGHDHSHARRQGGHSDGGFPSLAGRSHSDQRGSCGGLRPGYFENSRDSP	554267	558889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_554345_554666_554802_554956_555101_555504_555725_555852_555959_556124_556348_556613_556816_557173_557331_557652_558020_558105
788436	contig_753_pilon	+	1643	14	Intergenic	novelGene_112886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	57.280892029681	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1632	10	1641	218165	238510	FALSE	50	GATTAAGAAACCATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVKMDGHDLFRRLGAGAKFDVKRFSSDAARFQLGKRKRDFNSSEVLQGLDFFGNKKSVPGKYGASRTHQELQDEEKQEEKLIERKRKQNKKKRKMMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSIANVIQQAGCPVPEYIKGFKKLLSKQKKK	218155	238512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_218252_219571_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236217_236308_236440_236592_236763_236840_237845_237918_238494
788437	contig_11056_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_130351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATTGAATTGAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33693	34204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_33700_34200
788441	contig_10792_pilon	+	2061	12	Intergenic	novelGene_161004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	816	1286	99489	114792	TRUE	25	TCACTATGCTTATATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGTLLSLPCIGLVFPIVLMGWCIQEHQSKDIQVPHPIDACEKGTVHLNCDAAPFPMAFSHLTNDEEDDSHSSTGQGDEHKELKPENQPLIVQPPDPIHGRQAGLLPADVPKHLKYHEAQKQEVEAEADPSHNDEGHLMPTLFQHLWSRYCRKDS	91541	151638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_+_92319_99450_99521_102219_102372_111251_111345_112640_112784_114741_114806_115152_115250_116732_116903_120172_120309_121595_121759_128375_128500_151566
788442	contig_5779_pilon	-	1246	8	Intergenic	novelGene_106463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	105.929510640283	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	195	608	129312	113173	TRUE	35	TTAATGAAATCTAGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEDPYRKKKLQEKKEGNLQNLNWNKNRTCRKNKKRGVTQVSRPSEQSELKLVCSEFGRPELSSDMDVRNWCIQENTGEVCKTDAEIGSLPAAQGEAEDYYRKPEKKCVEKFCSDSSSDCGSSSGSVRASRGSWGSWSSTSSLDGDKKPAVGPQHFLPTSDSVSQNDFPSESPISFSLSHNQLKLQSREQRALCAAGASPRS	132225	107413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113239_126886_126952_127357_127544_129215_129380_132098
788443	contig_11088_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_85040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGGGACATGAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17384	14663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
788444	contig_1406_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_25640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTCCTTTACACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2677611	2677058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2677100_2677600
788445	contig_7457_pilon	-	2194	13	Intergenic	novelGene_31633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	35.2676275861527	67	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	109	2025	989357	964463	FALSE	30	AACTTTCACTCCTGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGERLYLCGEFTKAAQSFSNALHLQNGDKNCLVARSKCFLKMGDLENSLKDAEASLQGDPTFCKGILQKAETLYTMGDFEFALVFYHRGYKLRPDREFKVGIQKAQEAINNSVGSPSSIKLENRGDLSFLSKQAENMKAQQKPHPVRQLLHDTKRESKRKGSLKSEKTVRQLLGELYVDKEYLEKLLLDEDLIKGTIKRGLTVEDLIMTGINYLDTRSDFWRQQKPIYARERDRKLMQEKWLRDRKRRPSQTAHYILKSLEDIDMLLTSGSAEGSLQKAEKVLKKVLEWNKEEVPNKDELVGNLYSCIGNAQMELGQMAAALQSHRKDLEIAREYDLPDAKSRALDNIGRVFARVGKFQQAIDMWEEKIPLAKTTLEKTWLFHEIGRCYLELEQPWQAQSYGEKSQQCAEEEGDIEWQLNASVLVAQAQVKLRDFESAVSNFEKALERAKIVHNNEAQQAIISALDDANKGIIEELKETNYRENLKEKKEKEETMELDDATMMARRLTEEKIKRVKEEPEKVMKQWEREPAEADDDDELFKADLKSSALGLEDSRQRLEAESTSSSGRTELGAMERRDSGEVGKRLSGELGRRELGETGRKLSDAGRGESKELGGLGDTGNTENSEEMGEDRKEDE	1001946	964293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_964900_967378_967464_972009_972111_975222_975420_976697_976785_984053_984262_984450_984676_986032_986199_986438_986501_987348_987500_987755_987888_989291_989426_1001906
788447	contig_14938_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_174557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCTTGATTGACTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14870	15180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14938_pilon_+_14900_15200
788449	SIRV4	-	270	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1251	0	1251	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3907	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
788453	contig_7378_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_120248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTAACTTTATGCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369234	368300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_368300_369200
788457	contig_3602_pilon	-	1485	3	Intergenic	novelGene_60675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_2	50	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	112	618	1139393	1118948	FALSE	55	AAGAGAAAGGAAGATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQGEALGHTIAGSMLRAPGMERCPRVSMWPCFLVADMIGWPGGTQGASQALALHLAPSCLAFAPASSGAVCS	1139504	1118080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1119277_1123651_1123732_1139295
788458	contig_14289_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_110556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	385.276731713712	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	358	780	58752	51527	FALSE	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66430	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66263
788459	contig_20895_pilon	-	1123	3	Intergenic	novelGene_171408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	20	125	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAAAATAGTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2944	996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20895_pilon_-_1943_2584_2687_2869
788460	SIRV4	-	396	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	218	3	-218	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCGGACAACTCGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788461	contig_7457_pilon	-	1390	5	Intergenic	novelGene_31595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.88964618645	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	251	772	958306	956489	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	960567	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955911_956367_956939_958234_958375_960225_960333_960492
788465	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	218	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788466	contig_8866_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_77903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGGACAGAGTAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126016	1127429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1126000_1127400
788467	contig_4301_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_65102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATAGGGTCTCTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501811	500246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_500200_501800
788469	contig_6069_pilon	+	800	4	Intergenic	novelGene_8030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_1	49.254441424099	4906	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	259	591	191950	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	191691	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_191992_192360_192446_193297_193402_193545
788473	contig_9647_pilon	+	1946	6	Intergenic	novelGene_127390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	22.5973449767888	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1134	1760	115903	138145	FALSE	15	TACTGCACTCACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGYCGYLANMGGLAAGADAAYIFEEPFDIRDLQSNVEHLTQKMKTSIQRGLVLRNENCSENYTTDFICQLYSEEGKGVFDCRKNVLGHMQQGGAPSPFDRNFGTKMSAKAMQWITVKLKDSQRTGRKFVTDDSVCVLGISKRNLVFQSVADLKKDTDFVHRIPKEQWWLKLRPVMKILAKYKASYDVSDSGQLEHVHLHPQEESAGI	114769	138331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_116005_118298_118361_118846_118959_121139_121240_137548_137652_137997
788475	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788476	contig_9017_pilon	+	1611	5	Intergenic	novelGene_130337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	6.68954408012983	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1306	1611	235084	237166	FALSE	10	GCTCTGGAGTCATGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMSNTECSSPDIHMMMDFMLCNGNLMVIQDTCRGDKGGPLICDGMLQGTMAVGNFPCGIYNFPSVFTKLMPYVGSIRDTMAAQLLNTSVCLLLSVKSNMHE	224621	237166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_224795_232790_233359_233979_234182_234721_235186_236962
788478	contig_15182_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_136469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611925	614023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_611900_614000
788479	contig_10074_pilon	+	2152	6	Intergenic	novelGene_57112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	618	junction_1	106.07431357308	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	613	1197	260301	264426	FALSE	50	AAATATCAATATATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLVSWSHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLIPETAVRHESCNGLCKLSLSGLDGGDSINRSFLLLAASTLLKFLPDAQALKPIRIDDYEEEPMLKPGCKEYFWLLCKLVDNIHIKDAGQTTLLDLDALARHLADCIRSREILDHQDGSIEDDGLTGLLRLATSVIKHKPPFKFSREGQVGVKLSKCLYET	259559	265381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_260158_260286_260412_261466_261620_262593_262699_264116_264173_264266
788480	contig_7376_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_108089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATAGTAACTAAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113110	112332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_112300_113100
788481	contig_7870_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_108921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACTAATGACCGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247611	245797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_245800_247600
788485	contig_12157_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_135888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77545	77191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_77200_77500
788486	contig_5686_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_45199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	338	364	40627	40601	NA	40	TCTCTTCCAAAATTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSLPCLGKCYSFLAPPTSARGTILHQRVSCLRAISSLAPWTGKSTAATLLHGPGSPSQPSHTGLLVPITHDVVLSCTSYAVSCCLSLSSVLQLSLSPVSRRFSVQRLQVKSMCSAPCSS	40964	39132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_39100_41000
788487	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1720	729	-216	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2807	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034
788488	contig_4364_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_4597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGGTTATGGAGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2179835	2178571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2178600_2179800
788489	contig_4876_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_137885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	687	1169	220547	220065	NA	10	GTTTTGATTCTGATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHVPLYRALLELLRAIASCTSMVPLLLPLSTEDGEEEEEQSESQTSVGTLLAKMKTCVDTYTNRLRYYITYSFLLALPLTVFLNTSMGFFVCLFCFLMQHANYTHTQYINVQRKNFHPNPASRNINIYSDVSAISLCILIAVGMQFFKNAVMLYLLYR	221233	219278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_219300_221200
788490	SIRV5	+	381	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	138	149	24	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8339	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
788493	contig_10733_pilon	-	2422	18	Intergenic	novelGene_109971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	26.5556802256906	1	73	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	440	1300	318017	315944	TRUE	5	CCCTCCTTGCCCGTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTSRLPQYRKGLVRASLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQDCEALIQAAFAALQDSELFDSSVEAIVNAISQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQEQLRQAVQNGDMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHYPVNETTSSLTLTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYGFWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLGAELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEALLYGFQSIAETIDVNYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINSVLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQVCGLGRGRASACG	323162	306921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_307041_307136_307319_307608_307699_307841_307901_307991_308059_310206_310260_313133_313231_313411_313550_314099_314181_315543_315667_315830_315966_316246_316449_316874_317023_317108_317230_317434_317602_317705_317848_317958_318100_322805
788498	contig_3382_pilon	+	1620	2	Intergenic	novelGene_124194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGCTTTGCTGCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991746	993455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_992594_992682
788499	contig_4847_pilon	+	788	4	Intergenic	novelGene_156161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	440.956536028968	265	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	224	343	108596	109628	FALSE	10	CATTTTCTGTGGTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPCPAPGTQYARRSVSGGAESPRPKAYACLAAGADVGGAVRVPACVISQLDRVGREQCRRSPAHSTSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLLMVAKLGFTVFTRPHQS	99532	110073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_108569_108658_109570
788500	contig_7202_pilon	+	184	1	Intergenic	novelGene_18392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGAGATACTCTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27639	27823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27800
788501	contig_10864_pilon	+	2671	2	Intergenic	novelGene_107049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACTTATATAAAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721301	727547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_721630_725204
788503	contig_3018_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_78797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAACAGATTATGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478714	478378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_478400_478700
788504	contig_3018_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_78796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGTCTTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477976	476766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_476800_478000
788507	SIRV4	-	327	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	35	1159	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACAGTTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
788509	contig_5569_pilon	-	2070	1	Intergenic	novelGene_86752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGAGAAGTGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474544	472474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_472500_474500
788513	contig_610_pilon	+	1550	6	Intergenic	novelGene_76785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	178.705791736026	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	32	1012	267172	340593	FALSE	30	TATATTATTCCCATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASHLKTEAEMGVMLLQVKERLEPPETGKDKGRSSPRAFRESMALMTLRIQTSILQNWSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTNDSGSTWRIVRTRRSHPKVESQPKPC	267140	341131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_267314_304532_304863_306145_306407_309314_309419_313377_313441_340512
788517	contig_6710_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_98295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	1	342	657173	653571	FALSE	20	GTGTTAGAGGGAGGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRD	657173	653568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
788519	contig_10014_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_174564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAAAAAAATGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40772	42680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_40800_42700
788520	contig_18189_pilon	+	2201	8	Intergenic	novelGene_170762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.27775312999988	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	17	1492	65291	75126	FALSE	5	TATCTGCCTGTCTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASGLCGAGPRVLLFPLLLLLLLLPPPPLLARAPRSPDTHRHHPVKRGSKPWHAALPGSLAPASATQESSQPTSGPRPPRCGVPDPPDELSARNRQKRFVLSGGHWEKTDLTYRILRFPWQLVREQVRQTVAEALQVWSKVTPLTFTEVHEGRADIMIDFTRYWHGDNLPFDGPGGILAHAFFPKTHREGDVHFDYDETWTVGDNQGTDLLQVAAHEFGHVLGLQHTTAAKALMSPFYTFRYPLSLSPDDRRGIQHLYGRPWSSPAPSAPALGPQADVDTNEIAPLEPEAPPDACEASFDAVSTIRGELFFFKRGFVWRLRGGRLQPGYPALASRHWRGLPSPVDAAFEDAQGHIWFFQGTQYWVYNGEKPVLGPAPLSELGLVGSPVHAALVWGPEKNKIYFFHGGDYWRFHPSTSRVDSPVPRRATDWRGVPAEIDAAFQDADGYAYFLQGRLYWKFDPVKVKTLEGFPRLVGPDFFGCAEAANIFH	65274	75835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_+_65408_70756_70987_71784_71929_72009_72144_72271_72514_72633_72851_73817_74076_74992
788522	contig_1694_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_144998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCCAATTAAAGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707404	1705679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1705700_1707400
788523	contig_11321_pilon	+	574	2	Intergenic	novelGene_86648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAAACTAGTGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49804	95998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_49959_95578
788526	contig_3584_pilon	+	1371	8	Intergenic	novelGene_108163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22.0380005759995	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	14	1006	482440	498534	FALSE	25	CTGAATTTGAACTGTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRHLKRAQDAVVILGGGGLLFASYLTAVGDEHFYAEHLMPALQGLLDPESAHKLAIRFTSLGLLPRATFQDSDMLEVRIMGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLFKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAIINRYGFNSHGFSVVEHRLRARQQKQTKLSEDGLLLGINLGKNKMSVDAAADYTEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAKLHHLLTKLGIDGLIVTNTTLSRPASLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGACLVQLYTALTYWGPPVRTRF	482426	498899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_482461_484973_485184_487766_487967_490200_490284_495888_496077_497541_497696_497806_497929_498519
788527	contig_6710_pilon	+	502	2	Intergenic	novelGene_98107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTGACTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653432	657524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
788531	contig_14322_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_115614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACCATTGCCGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11454	9532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_9500_11500
788536	contig_6710_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_94959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653803	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
788539	contig_3560_pilon	-	1720	7	Intergenic	novelGene_149501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	30.9659310999829	12	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	233	676	210973	198131	FALSE	10	TAGTTGTCATTGCGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAVMAESAFSFKKLLDQCENQELEAPGGIATAPVYGQLLALYLLHNDMNNARYLWKRIPPAIKSANSELGGIWSVGQRIWQRGILEQGWQADSTTRMVMPKKPVAGAADVSSNRFIPLSEPAPVPPIPNEQQLARLTDYVAFLEN	211205	197086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_198211_199031_199080_199798_199862_206647_206703_207915_207965_209277_209349_210895
788542	contig_10629_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_52944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGGGCCATACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396464	398092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_396500_398100
788543	contig_11292_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_109398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	439	834	108211	107816	NA	20	CCCAGTGTTCTCTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVRGWITVSGPDPVPPPWPLALTGSKKKIRLYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSSKHKEALAHRWGIQKGNRKKMTYQKMARALRNYGKTGEVKKVKKKLTYQFSGEVLGRGGLAERRHPPH	108649	107361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_107400_108600
788544	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	107	-3	25	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3130	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788545	contig_13571_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_128127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTTTCATCTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289303	287949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_287900_289300
788546	contig_5021_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_167099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACCTGCAGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307366	309809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_307400_309800
788547	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788548	contig_5041_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_27007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTACATGACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160724	159548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_159500_160700
788549	contig_11815_pilon	+	1198	9	Intergenic	novelGene_50894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.0219176551031	224	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	62	925	126103	152169	FALSE	30	ATACCCTTGGCCATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGETVVSVKIIRNRLTGIPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAKRFKLNYATYGKQPDNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALMDCHWQPLDTVSSEIPAMM	126041	152442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_126130_126649_126748_134759_134860_135466_135520_136974_137107_139155_139276_142441_142605_142770_142805_152032
788554	contig_11427_pilon	+	1516	2	Intergenic	novelGene_79015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAAAAAAAAAAGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765188	772262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_766003_771560
788558	contig_6975_pilon	-	1444	9	Intergenic	novelGene_74259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	378.924938972087	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	700	1221	162115	159453	FALSE	20	CTGATGTTGATACTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHGYGGAGDASSGFHGGHFVHMRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169955	159229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162118_162919_163195_163709_163849_164402_164538_169807
788559	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	94	3	94	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5064	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788560	contig_11978_pilon	+	692	5	Intergenic	novelGene_63095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4326.32655956529	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829110	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829205_1829891_1830123_1830663_1830730_1831179_1831273_1831759
788561	contig_15182_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_136450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTCAATTCTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446235	448155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_446200_448200
788562	contig_15182_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_136451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448605	449125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_448600_449100
788564	contig_366_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_51632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTGTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394157	1395227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1394200_1395200
788565	contig_14514_pilon	+	1798	3	Intergenic	novelGene_137479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	3.5	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTCGTATGAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94052	96351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_94409_94623_95176_95461
788567	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
788571	SIRV1	-	288	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3055	109	2781	-109	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	244	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7585	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6814_7552
788579	contig_18272_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_7071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCCCACAGCGCTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516659	515970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_516000_516700
788584	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
788588	contig_17470_pilon	-	1913	13	Intergenic	novelGene_110529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	58.2198896903417	1	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	164	1234	277215	270908	TRUE	25	ACTATTCAAACTCTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAGGRPVFVPLKPSPSQDGELDYSSNWQLDPTELANKFTSRTKALVLNTPSNPLGKVFSKAELELVASLCQQHDVVCISDEVYQWLVFDGNQHISIASLPGMWERTLTIGSAGKTFSATGWKVGWVLGPDQLMKHLRTVHQNSIFHCPTQAQAAVAWSFEREQQHFGQPSSYFVQLLQATQHKRDHVTRSLQSVGLRPVIPQGSYFLITDISDFKQDAQLAWC	302600	269598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_270142_270230_270318_270858_270937_271026_271214_271326_271417_271531_271609_272834_272956_273479_273609_273860_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277325_302546
788594	contig_5350_pilon	+	1254	9	Intergenic	novelGene_99338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	47.3596611052064	680	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	132	872	142324	225433	FALSE	20	ACTTTATGTATGCTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGMNKILPGLYIGNFKDARDAEQLSKNKVTHILSVHDSARPMLEGVKYLCIPAADSPSQNLTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILVNSVSNSQPLWLRSRNGKASIPLSSLMFLIWDPIRMLPASDSWSSEIFGLPQKSVMYLKLLKYWKATVFRPMLPKRT	142192	225815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349_223423_224707_224826_225318
788595	contig_10003_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_88301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCTTCACTTATCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928109	927370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_927400_928100
788596	contig_12250_pilon	+	1188	4	Intergenic	novelGene_80595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_1	757.535917740318	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322742	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_323438_328400_328449_328603_328687_332096
788597	contig_6418_pilon	-	1391	13	Intergenic	novelGene_81107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	395.417105725081	3	72	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	473	1141	81719	68463	FALSE	20	GCAACTACTTTGTTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	117998	68212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103178_106493_106575_117959
788598	contig_15905_pilon	+	862	6	Intergenic	novelGene_154703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	174.416283643472	1029	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	139	717	117212	135820	FALSE	15	AAGATTGTTTTCTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAWPPPLGGLALALRARAGGWGLCRALQLPGDKQSPRVASAPRDPAMVRAGPVGTHLSASGLDIFGDLRKMNKRQLYYQVLNFAMIVSSALMIWKGLIVLTGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNFQEDPIRAGEIVVFKVEGRDIPIVHRVIKVHEKGNGDIKFLTKGDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFLPYVGMVTIIMNDYPKFKYALLAIMGAYVLLKRES	117073	135965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_117299_128768_128879_130304_130455_133188_133309_134885_134944_135766
788600	contig_776_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_139906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTAATTAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445162	444847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_444800_445200
788601	contig_12923_pilon	-	1265	3	Intergenic	novelGene_30105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	295.5	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCAGATTGTCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51221	45402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46387_48954_49071_51056
788603	contig_7095_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_166463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	526	825	479989	479690	NA	35	CACAACCCTGTAGGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVRPYSLSPPFTLQFIAIWFSSSSLDIVDFSSHLTAWHHPSVSLLYCDGLHVAVMLKVMPWVFQISAGSPWWTGFSVASKLRRTRKKSLAIYFCKLAN	480514	478591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_478600_480500
788604	contig_3409_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_172317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCAGTAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282119	284026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_282100_284000
788605	contig_2940_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_81975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091717	1089734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1089700_1091700
788609	contig_14357_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_121670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519927	517252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_517300_519900
788612	contig_16122_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_134547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGATTTTACTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280236	279561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_279600_280200
788615	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
788616	contig_1759_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_171346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTCCACAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95828	96738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_95800_96700
788620	contig_9848_pilon	-	1116	8	Intergenic	novelGene_79961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	598.660579791185	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	239	400	104554	104073	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPGYLVEWALRNHRGRPSATPMLAPIQMTTPRTTRIRHPSNSGGSPGGLWSLSWVKHLLPWQEAPTRTTVSQTM	106543	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99097_99302_99381_104028_104148_104467_104611_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511
788621	contig_5918_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_99559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704774	1705855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1704800_1705900
788622	contig_16411_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_77383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGAGCCCTGATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351325	353864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_351300_353900
788623	contig_1516_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_49930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTCACCCAAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126670	125160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_125200_126700
788624	contig_16594_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_53857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGTTACTTTCTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130655	130150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_130200_130700
788625	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	54	516	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788628	SIRV2	-	528	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1099	10	-64	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4796	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
788631	contig_8284_pilon	+	1115	10	Intergenic	novelGene_125703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	522.374280462667	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	94	570	426599	458481	TRUE	15	TTAAGCTATCGGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSID	425061	461610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431897_431956_436430_436487_438444_438503_441540_441606_449073_449188_457896_457936_458480_458556_461139
788635	contig_1706_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_155028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACAGTTGATCCATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9375	11056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_9400_11100
788636	contig_10734_pilon	+	1156	5	Intergenic	novelGene_51307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	345.368281693615	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	154	564	1377357	1388902	FALSE	25	AAAAAGTGTGGGTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGAGGAPALPEGREQVGRGTDRGAPAESTRGRGREG	1369484	1389494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388795
788637	SIRV6	+	771	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	4	8	4	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47921	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACTATGGGGAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10241	11322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788640	contig_5201_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_82159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	268	717	147171	147620	NA	35	ATCAAACCAAACCTGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWHFKNRNRCSILLVVRNANKHHTAHLVDKNLRGSGVGNNVAQEELYTLLVEVYISSATVENILALSRKIKQAHDYSPAIKILRVQGIYPGDALAWRSAPGHLRKDACCSKFCNSNTLETTQMFIHSQINTLYVYVTAFYTVVKMRKS	146903	148022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_146900_148000
788641	contig_19848_pilon	-	1356	2	Intergenic	novelGene_173828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203351	187548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_188336_202782
788644	contig_5502_pilon	-	1507	2	Intergenic	novelGene_154977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCAGTTCTACTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363280	359876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_360822_362718
788645	contig_1008_pilon	+	1705	2	Intergenic	novelGene_121639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTCAAGTCTCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386706	1397057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1387343_1395988
788646	contig_1008_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_121641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAATTAGAAGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397209	1398414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1397200_1398400
788648	contig_10427_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_142186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCAATCAATAGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60071	59145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_59100_60100
788649	contig_4659_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_118162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCATAGGGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66497	67801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_66500_67800
788651	contig_1594_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_138830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGACGGAAAGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606404	607424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_606400_607400
788654	contig_19892_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_158952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	939	1241	27703	28005	NA	65	ACAAAAATGAAATAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSKRMGLYNTKREALCKLWTLGDNSVSLLVHRLLQTNHKNCKMLVTGERIPGGTVVKRLAANQKVGGLNPPSGASEESPGNLLPKNKSSKTQWSPGLL	26764	28874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_26800_28900
788658	contig_11429_pilon	+	1170	7	Intergenic	novelGene_60454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1028.31778756483	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	88	555	46162	48504	TRUE	40	GAAAATCGATACTGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRWGGYDRYSGGNYRDNYDN	45404	49489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47556_48450_48530_48899
788659	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
788660	contig_7644_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_64267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCAGATTAAGACCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219601	217889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_217900_219600
788661	contig_1339_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_163097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACACCCGTTAGCAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65824	64718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_64700_65800
788663	contig_6847_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_143885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTTTTCTTCTAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114726	113504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_113500_114700
788665	contig_2693_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_167597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGTCAAAAAGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291355	292902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_+_291400_292900
788666	contig_6175_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_16307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTTCCAACTCATACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451051	1449622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1449600_1451100
788668	contig_641_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_170143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTTATAGACATATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93071	94112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_93100_94100
788669	contig_12503_pilon	+	1880	3	Intergenic	novelGene_143820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	7	761	junction_1	221.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATAGTAGTATGTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112208	145088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_112318_138022_138133_143427
788670	contig_4891_pilon	+	1773	2	Intergenic	novelGene_124530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	101	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	338	958	393666	394286	FALSE	20	CTTGTTTCTCAAGAGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDTLDPGSPASPALPFHLRTKVPGYLLRRPADGGARKPSAVERLEADKAKYVKSLHVATTRQEPVQPLLSKQPLFSPGTRRTVLTPSRRALPGPGRRPQLDLDILSSLINLCDSPVSPAEASRTPGRAEGTRQDLPATPPRPPPSTAAVRRVDVRPLPASSAQPCPSPGSAAASSPARPPGLQRSKSDLSERFSRAAADLERFF	374118	395101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_374362_393571
788673	contig_6807_pilon	-	1851	5	Intergenic	novelGene_84566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	365.511542225413	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	120486	112241	TRUE	50	AATGTAAAGCACTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQKEAEKLGADIREERASWKDQIQSERQNVQAQFSQLRDILDSEEQSELQKLQQDEENVMYNLIEDESELAQKSQLVEELISDLERRLQASSVEMLQVRVGKE	120487	110173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_117926_118173_120423
788675	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	0	411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788676	contig_16322_pilon	-	1145	7	Intergenic	novelGene_87514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.886833496906	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAATCCTGTTGTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57644	31806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32033_32098_32416_32926_33081_34551_34626_36310_36442_37009_37070_57461
788677	contig_9363_pilon	+	1513	10	Intergenic	novelGene_6804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	315.697464178743	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	329	733	1622549	1624442	TRUE	10	CTGGGGCCACGCGAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISTSSLTVILMRMKTLRGRMQR	1622023	1625964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622271_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623520_1624376_1624445_1624573_1624674_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
788682	contig_6795_pilon	-	1573	14	Intergenic	novelGene_27765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.4496200937615	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	49	1143	504815	483470	TRUE	35	AAAAAGCTGGTACTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILEKISEIEKEIARTQKNKATEYHLGLLKAKLAKYRAQLLEPSKSASSKGEGFDVMKSGDARVALIGFPSVGKSTFLSLMTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVCHRIHRSLASQFKYALVWGTSTKYSPQRVGLTHTMEHEDVIQIVKK	504863	482767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_482933_483204_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_499670_499832_504751
788685	SIRV4	-	322	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	0	1199	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
788689	contig_8914_pilon	-	813	6	Intergenic	novelGene_112863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2320.78472935341	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	22	588	268944	265586	TRUE	15	TGCTGTGCTTCTGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLSSRMAVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKL	268965	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264900_265585_265799_267319_267508_268075_268180_268882
788694	contig_17753_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_105083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	438	758	75255	74935	NA	55	TATCCAAGAAAGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVLTPEKATHPTLLPTRVGTGQLPFTSAACVIIHLGPQMQISWPGSLKHLLITALGDASHFLLALSFQKGRVPRWHPLEGKRRKVHVSFDSQFVHGLLKTIQGN	75692	74272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_74300_75700
788695	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
788696	contig_3584_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_108172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	917.231806851463	3	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	31	1074	527096	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527065	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602
788701	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	75	GAAAAAGAATAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788702	contig_13904_pilon	-	1039	6	Intergenic	novelGene_165495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	219.280094855872	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTAAGTAAGTGTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124891	107550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_108074_108597_108731_111535_111633_112699_112765_120210_120348_124807
788703	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	71	509	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788705	contig_11293_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_134690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAACAGTATGCCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326276	325619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_325600_326300
788707	contig_11492_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_152257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCAGCTCCCAGCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397554	398718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_397600_398700
788708	contig_10058_pilon	-	1704	6	Intergenic	novelGene_67736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAGGCACGGCTGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101647	98220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_98259_98434_98538_98695_98813_99355_99405_99530_99742_100461
788709	contig_3068_pilon	-	584	2	Intergenic	novelGene_137632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	872	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	3	584	240963	239329	FALSE	70	TAAAAAAAAAAATTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISYLFLQEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVFDKSLSSSDSTPESPISFLKYLLKKPSYGFGSQGASYVLFGGHSHEKWISVNTWPPSVHWSVCRTQSSLPLAQFGMRGDSFNSSFASVITYQVYILYNYH	240965	239328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_239786_240838
788711	contig_6823_pilon	-	2192	1	Intergenic	novelGene_131234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321722	319530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_319500_321700
788712	contig_10134_pilon	-	795	2	Intergenic	novelGene_16270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGAGGCCATCTGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39706	38143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_38817_39584
788713	contig_9705_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_41720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAACTTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171720	169433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_169400_171700
788717	contig_20984_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_42217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCCAGAAAATATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2488	2037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20984_pilon_-_2104_2187
788722	contig_5480_pilon	+	1330	8	Intergenic	novelGene_107215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	175.581831610895	70	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	83	985	79527	101521	TRUE	25	TACTTGTGAAGAATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKTGKRPKANIIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISLRSQEYLIEQYL	53821	103844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_53887_79509_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89918_92258_92469_101482_101551_103528
788723	contig_9682_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_125324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591118	589403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_589400_591100
788724	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788725	contig_9038_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_143318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATGGTCAGGAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345292	345645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_345300_345600
788726	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	523	57	523	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788728	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	171	412	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
788729	contig_13966_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_158156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAGTGACTTAAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437327	437677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_437300_437700
788730	contig_5059_pilon	+	980	9	Intergenic	novelGene_140720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	173.648171599934	414	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	186	845	243441	259441	FALSE	15	TGTGGTGGTATGGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQEPMDSSQTTKQSIISEELISEGKWVKLEKTTYMDPTGKTRTWETVKRTTRKGQSADGVAIIPVLQRTLHYECIVLVKQFRPPVGGYCIEFPTGLIDDNESPEAAALRELEEETGYKGDIAECSPVVCVDPGLSNCTVHVVTVTINGDDAENVRPKPKPGNLEFVEVISLPKNDLLKRLDALVAEEHLTVDAKVYSYALALKHANTKPFEVPFLKF	232064	259576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232206_243396_243504_244759_244828_250083_250134_251589_251698_253218_253315_253949_254056_255904_255964_259331
788733	contig_5121_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_170749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450336	449688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_449700_450300
788734	contig_5799_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_50289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCTAACCAAAAGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348050	349362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_348000_349400
788735	contig_408_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_84940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACAAAAACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229535	231544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_229500_231500
788736	SIRV6	+	407	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3155_10718_10819_11031_11109_11205
788738	contig_4364_pilon	-	960	3	Intergenic	novelGene_159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	8	248	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	1244250	1238195	FALSE	5	CGGAGGCCTCCGCGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFAGPGSGCGSLGSGDWSACTWGAGLEGGWSWVPDVGGGAPASLVSCNAELPWEVTEALPPFPTYSLPSTLSDESSLGTLSFGCVTSLKAPGYEGEDQVLERRGHLALGGQRRELWHLPDGFQRLLSRL	1244251	1237625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1238199_1243254_1243381_1243990
788743	contig_6278_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_119815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTTTTTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469065	467522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_467500_469100
788744	contig_252_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_99932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAGTAAGTCTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380516	383762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_380637_382183_382381_382430
788748	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
788752	contig_10220_pilon	-	1733	7	Intergenic	novelGene_174565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	50.2858495669176	90	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	98	865	363506	342453	FALSE	15	TTTACTTTGTTTTAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSDLEKLCSHINEKIGNIKNTMSLRNCGQEPALKTMLNKIGDEIIVVNELLNKLELEIEYQEQTSNSLKELCESLEEDFKDMQHLKENIPPHLPQVTVTKSLAKESDLSSEEPVKVVESVPINKPPKGQRNIKEMPFITSDEFNGIPAYMKSRLTYCQINDIIKEINKAVASKYKILHQPKKPMSSVARNLYHRFIEEETKDTKGLFFIVEADIKEFTALKVDKRFHVILNILRHCKRLSEVRGGGLTRYVIT	364230	341584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10220_pilon_-_342602_343423_343594_353461_353600_358375_358474_360429_360555_363418_363515_364141
788754	contig_7056_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_43596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAATGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665086	666015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_665100_666000
788756	contig_4519_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_123685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94473	91915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_91900_94500
788757	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_97531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	527	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788760	SIRV4	-	207	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1316	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3842	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
788761	contig_9415_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_109878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2048006	2046727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2046700_2048000
788762	contig_9828_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_172261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAATTGTACACGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383492	383847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_383500_383800
788764	contig_4769_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_117994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTACTGCTGAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882805	883131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_882800_883100
788769	contig_6710_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_97640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	TTTGTGGAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
788770	contig_152_pilon	+	797	7	Intergenic	novelGene_162649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.381772359649	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	378	626	728104	731492	FALSE	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLIDRGGKVRHELRGTTQTVLWPWRRCRRSSKLVDECEVQDCKASPARCPHVVRRRSIASKRIPTVYVDGSCKNNGRDGAKAGCGVFWGPNNPLNVSERVSGRQTNQTAELRAAHKAIEQAKSLNMDKLIIETDSKFVIQGVTKWMDNWKQNGWKTASGRDVVNRSDFEKIDQASRGMDIQWKYVPGHQGIKGNEEADRLATEGSRK	722970	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_723718_723823_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
788772	contig_9423_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_99183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTGAAACAACAGTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75074	75785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_75100_75800
788773	SIRV4	-	614	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4982	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788775	contig_12619_pilon	-	1080	7	Intergenic	novelGene_73557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_6	24.6266567406585	270	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	128	865	987941	721383	FALSE	0	TGCCCTGTGTCCTGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRSTSGSTGFISFSGVESALSSLKNFQSCISSGMDAASSVALDLVETQTEVSSEYSMDKAMIEFAIMDRELNHYIKAVQSAINHVKEERPEKIPDLKLLVEKNFVALQNKNSDTDFEKNEKFVQFKQQLKELKKQYGLQGEREADGPEGVDEDMIVTQSQTNFICPITQLEMKKPVKNKVCGHTYEEEAIVRMIESKHRRRKKACCPKIGCSHTDVKMSDLVQDEALRRAIESHNKKRNRHSE	1005005	721167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_721501_729611_729719_730134_730236_906437_906592_936811_936919_987790_987956_1004892
788777	contig_8907_pilon	+	443	4	Intergenic	novelGene_85817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAGGTGAAGACACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173357	179543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_173477_177971_178043_178593_178695_179391
788778	contig_5200_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_140169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415416	416996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_415400_417000
788779	contig_4868_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_136759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1784	2149	113841	113476	NA	55	AAAAAAACCCACTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHVPFNIHLMIETWIEWRLSSVTLGKSLHLSKPPFPLLKNGGNEPELLPAWNRWEVTKMKVLNKLITRAGMLNVKLTNEAIVTRLTKSSAQYTLPYVPIGASNIIGRKYKKLGTRKVTRF	115624	112986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_113000_115600
788780	contig_4385_pilon	+	1092	7	Intergenic	novelGene_141513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	642	1040	441688	444474	FALSE	25	GAACGAGGACTCCCCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQPPPSCIAIDGGNHRLLDVGHTVPVAQEPAGVAVLERLVLHLFDVSSRCKGFLPAGEDNGPHGRVSLEGLQRLVQLCHEATAQRIECLRAVQPDQPHVATLPLLLCDDVLKVGTRGEGAQRRVPGPGP	437883	444526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_438280_439117_439184_440791_440896_441612_441716_442389_442517_442918_443115_444426
788783	contig_3409_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_172316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGGAAGATATTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275741	274356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_274400_275700
788786	contig_10236_pilon	+	2313	12	Intergenic	novelGene_169119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	29.7993288515027	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	6	2015	103344	127848	FALSE	15	ATTTAGTGTGTATGTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAADRSRTPMDSPVPASMFAPEPSSPGVASAAAAAARLHSGFDSDCSEDGEALNGEPELDLTSKLVLVSPTSEQYDSLLRQMWERMDEGCGETIYVIGQGSDGTEYGLSEADMEASYATVKSMAEQIEADVILLRERQEAGGRVRDYLVRKRVGDNDFLEVRVAVVGNVDAGKSTLLGVLTHGELDNGRGFARQKLFRHKHEIESGRTSSVGNDILGFDSEGNVVNKPDSHGGSLEWTKICEKSTKVITFIDLAGHEKYLKTTVFGMTGHLPDFCMLMVGSNAGIVGMTKEHLGLALALNVPVFVVVTKIDMCPANILQETLKLLQRLLKSPGCRKIPVLVQSKDDVIVMASNFSSERMCPIFQISNVTGENLDLLKMFLNLLSPRTSYREEEPAEFQIDDTYSVPGVGTVVSGTTLRGLIKLNDTLLLGPDPLGNFLSIAVKSIHRKRMPVKEVRGGQTASFALKKIKRSSIRKGMVMVSPRLNPQASWEFEAEILVLHHPTTISPRYQAMVHCGSIRQTATILSMDKDCLRTGDKATVHFRFIKTPEYLHIDQRLVFREGRTKAVGTITKLLQTTNNSPMNSKPQQIKMQSTKKGPLTKREEGGPSGGPAVGAPQPGDAAASIGAVQPSAASSLQPQPKPSSGGRRRGGQRHKVKSQGACGTPASGC	103338	128146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_103536_106910_107023_114434_114616_115253_115603_117968_118093_121298_121414_123171_123317_123444_123628_124374_124511_125160_125340_126692_126894_127755
788789	contig_6735_pilon	-	1405	6	Intergenic	novelGene_15809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	996.177614685253	185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTGCACTGTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568277	552056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_552952_554243_554374_554548_554692_564157_564232_564784_564869_568198
788797	contig_3862_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_137419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	279	638	589480	589839	NA	40	TGCAGTGAAAAGCTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPPCSILKLHHCPLLTPSKKALHSSSSGTFRTHHNECHHDSDNHQRTPLHYWPSSCRLKILRAHFECGDFRAAPSLVLLIPHEQSCHIPPEAPVLFGRDGNVFLVDECAHFLEHFHLC	589201	590138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_589200_590100
788799	contig_14530_pilon	-	630	5	Intergenic	novelGene_108459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	354	488	89643	87659	TRUE	15	CTTCGGAGTCGAATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPAGSEGRAEGAFACGFSFSLCLKKDLASLDVASTSLATLTSSPAKSNTLVILTFSVSLGFSSSSALTNNLLEVVSSVSSPLLTCVLGGTFDFGPTSLRKLAQSSSSFFFLASSDPMPFSCSATASSSSLLLPPDSAVASSSSSPSNERPLCFLFLAGML	102195	80415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_80454_87554_87674_89523_89745_90057_90186_102071
788802	contig_11751_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_150297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132099	133143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_132100_133100
788803	contig_18108_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_33533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	630	1007	329622	329245	NA	50	AAAAAAAGACTGCAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNPLSGNGFRLFINNAVMNILVHKYFVFFHYFLEESSRNEVVRSKMTHFAAFATFCQIAAQKVSSSSYSHPAINDSDSILEGVSEAGYQKLNCPIRGLRDGFSETSYFIHSANTFAQFSSSKG	330251	328961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_329000_330300
788805	contig_6589_pilon	+	1051	3	Intergenic	novelGene_25926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	295	972	1208834	1211526	FALSE	35	AAGAATAAAGCCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQVPPLATPWRDVHPFFLLSPLVGLVRQAWSHLRGPGPPESWLVEAVTEEAALDGEAKASLAFHHAAWGEHPQGEAEDSRTAEEDGEADRRACPDLKDSSSFLDASNDDDEEYGEEEATSVAREQGGEFTDGRPAPLPSSFLIRTLRDPPGEKESEKEKEAPEEGVANNTEMTKVFFYPLSPLECYPGVEEKEDEDREAVKKEAPRISIPPFPLRASPCLLV	1207797	1211605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1208083_1208824_1209478_1211492
788806	contig_19918_pilon	+	1233	3	Intergenic	novelGene_172972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.5	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	76	300	48594	49252	TRUE	35	TGTTTAGAAAAGAACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGISPASVVPSVAKALSQPPWRTRMVRFTAKVVMLKTSGPRALASVKELGPWSTLSDAATACCPLPTQCFALPSLPQQLWRLLGFLLPSQPCHTSPMT	48518	50288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_48615_49048_50057_50159
788807	contig_13786_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_174570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	75118	74810	NA	75	AAAAAAAAATTAAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLHLLVPGLNRKGKKQIRTERPAELCIFFTRGRVLKNSSNISYEKHLEVRIIVLIRYFNFKQRLLPPCHNNKINTLILFPVQLGYFQLYYYSSFHFAWFHSA	75118	72947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_-_72900_75100
788808	contig_7009_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_23651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCCACCACCGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470916	469743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_469700_470900
788811	contig_6710_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_90163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653807	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
788814	contig_5121_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_170743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATATATCTACTCACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433399	431190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_431200_433400
788815	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
788816	contig_16846_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_82855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCCCAGCGTTGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94587	96308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_94600_96300
788819	contig_5891_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_151585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAGGCCTTCATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148186	147554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_147600_148200
788820	contig_5891_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_151584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCCAAAACTTTAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147396	146074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_146100_147400
788822	contig_10958_pilon	-	1219	3	Intergenic	novelGene_5354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	41.5	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATTAACTCTTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802642	795896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_796282_797033_797266_802040
788823	contig_19722_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_171896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACTACTTCAGCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74237	76588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_74200_76600
788827	contig_14034_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_72641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157014	157884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_157000_157900
788830	contig_6513_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_117737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTTAACATTTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44345	42615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_42600_44300
788831	contig_10475_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_148749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAAAGTTACGTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268816	269066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_268800_269100
788832	contig_13021_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_8099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	393	692	72258	71959	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRHSANSEVKTLPKSTFQPEIRQAYKTNKTHMRNVRLSSIKYMRPKGHHLPKSKEEKAGRERKTGRMDTGNPGGKGESTDTLQGLEAMSQNNLSINV	72650	71801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_71800_72600
788833	contig_5317_pilon	-	2210	12	Intergenic	novelGene_76631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTCCTAGTCTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924976	893298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_893375_896811_896975_902550_902766_904314_904460_912333_912403_913223_913445_915043_915144_918155_918239_918627_918738_920003_920185_921983_922105_924250
788834	contig_9706_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_20990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCACCTGCCCCCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435528	433865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_433900_435500
788836	contig_15304_pilon	-	410	2	Intergenic	novelGene_30465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54288	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53126_54122
788837	contig_10765_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_122973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATAAAGTATCTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409876	411636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_409900_411600
788839	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788840	contig_5965_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_154663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTGGCTGCACATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215738	217233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_215700_217200
788847	contig_15188_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_163071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	134	430	22640	22936	NA	5	TGGCACTCTCCTTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVPSDHCYCWSRGSGPSVTTWKSVAQQTRPGCPAGAGPTVSTRDMAASGQDGPWSQGAGMLASGCTQKPLHQCCSDQAKGGSGGQQLPHWKMRARTAPEEQGLQGSRDGIHHRKRLARSLALCEHSLSLISSILDSNKREGP	22506	23119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_22500_23100
788851	contig_7839_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_45708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372553	370853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_370900_372600
788852	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
788853	contig_15236_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_141663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATTAAAACTCAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721859	721359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_721400_721900
788857	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2166	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788861	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	412	6	-412	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAACTATCGGCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788863	SIRV6	-	464	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATTTATGGTGAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11400_11800
788866	contig_5718_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_110327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541922	539551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_539600_541900
788867	contig_11117_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_148567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGATCACAACAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6723	6456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_6500_6700
788868	contig_12425_pilon	+	1471	8	Intergenic	novelGene_46637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.245250624264	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	241	1290	174103	198400	FALSE	20	TTGCCCTCAGCAACTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCDLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167067	198581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167223_174017_174116_175576_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
788872	contig_3817_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_78381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAAGAGTGTTTTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913058	913512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_913100_913500
788874	contig_18145_pilon	+	1543	8	Intergenic	novelGene_37302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	38.4484813001205	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	485	1030	58238	59279	TRUE	30	TTTATTTGAACTTGAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHVRYPWVGVGDRIDSERGSFIQS	57099	60211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_57553_57963_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59562_59980
788876	contig_9833_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_68571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACAACAACAACAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313293	312148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_312100_313300
788878	contig_6583_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_174584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGTTCTTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12867	14570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_+_12900_14600
788881	contig_20493_pilon	-	1431	11	Intergenic	novelGene_86408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	90.2202305472559	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	771	1370	43387	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	54628	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_47025_47119_48982_49107_49197_49252_54457
788883	contig_18604_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_173855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	499	861	63721	64083	NA	70	AAAAGGTAAAAAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSRDRSLRITCPKYMRRSLAILPFKEHPGCTSSKTDLFVLLAVHGIFNILRQYHNSKGSILQSSIFTVQLSHAYEVIENTLAWVRHTLVLKVIPLLFNTLKRSFAADLPNAICRLIS	63222	65058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_+_63200_65100
788884	contig_8729_pilon	+	1721	6	Intergenic	novelGene_40105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	58.4622955416566	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	96	539	276603	322350	FALSE	30	ACTGCTAATTGAATTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKDANSALLSNYEVFQLLTDLKEQRKESGKNKHSSGQQNLNTITYETLKYISKTPCRHQSPEIVREFLTAMKSHKLTKAEKLQLLNHRPMTAVEIQLIVEESEERLTEEQIEALLHTVTSILPAEPETEQQKRANDAAVDEEYPE	276507	323532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_292842_292938_306155_306214_322203
788885	contig_4759_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_106324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	352	693	505755	505414	NA	25	TATCCATGTGAAGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLNRLADRNRARYPTGGGMDVVKRFTKQGWSVDCLLSPGPSVLRRESRLKKREAVGTCPAPSPLQCDANPYPTSLFFQDKFNFLSFRKKSITSSYYPTSLIPHFVSLQKKH	506106	504666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_504700_506100
788886	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788889	contig_9527_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_134023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	979	1299	47532	47852	NA	25	GAGAAACTCGGCAGTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKQSRDSEQCNVKTGTLVCMYLAPDYLDRALFTLKDISFLTGPTKQSRPQAPGRSSCGTSSLSCCRKRSSAMSLPGSRESTGNLSSRTQTRWPASGAAGSASHR	46553	48813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_46600_48800
788890	contig_12951_pilon	-	782	4	Intergenic	novelGene_68170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_3	159.112119798168	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	40	483	326206	296988	FALSE	40	CATCTAACTCAACTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKGPAFQRQRRKMAATTGSGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	326245	296688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_307070_307220_326184
788891	contig_7057_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_123302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCCGAGTGGGATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903720	905087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_903700_905100
788895	contig_8317_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_19947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
788901	contig_15474_pilon	-	1497	4	Intergenic	novelGene_136238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.35702260395516	125	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	307	783	128130	125612	FALSE	20	GGCTGTCACTAAGTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDLLNKDASYYEGFTETLGFVISFHQEPRFDEITGGFDQLPRALHYALLPGTVQLHSSAEEAETSGDLVHITNQTSDPLQPKEHLTADYVIVASTAKAARLLHFRPPLSPGKQDALRSIHYSSAIKVILACTQCFWELDGIFGCKSITNWPARFIY	132522	124897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_125997_128038_128141_130619_130711_132317
788902	contig_4874_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_78639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGGGGTATATATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398268	398783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_398300_398800
788905	contig_13421_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_166812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTAAAATAAGGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229756	231596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_229800_231600
788907	contig_2069_pilon	-	735	3	Intergenic	novelGene_23487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	70	351	1509802	1508747	FALSE	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509871	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
788913	contig_3270_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_104443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9116	junction_1	1142.5	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	44600	46099	FALSE	25	TAACAGTTGTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVSHFRGLTHH	44597	46755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44652_45124_45211_45934
788915	SIRV4	-	204	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1319	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3839	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
788916	SIRV4	-	596	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	15	6	15	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5143	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788919	contig_10296_pilon	+	756	3	Intergenic	novelGene_168894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	13	3422	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAAGTCTGATTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978010	988416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_978380_984694_984797_988131
788923	SIRV6	+	172	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	54	557	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788927	contig_12079_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_67477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTTCACCTGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604483	603145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_603100_604500
788929	contig_12327_pilon	-	1106	3	Intergenic	novelGene_140647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	15	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCACCTCAGTCTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189033	183839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_184808_187670_187752_188976
788930	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	31	372	14409	13845	FALSE	20	CTTATAGCTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14439	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
788931	contig_10196_pilon	+	957	8	Intergenic	novelGene_132168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_3	222.374477319825	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	29	772	1038403	1050606	FALSE	10	CGTAACCCCTGCCTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1038374	1050791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
788932	contig_19179_pilon	+	1244	3	Intergenic	novelGene_142357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	911	junction_2	837.5	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8128	11473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_8486_8569_8948_10964
788933	contig_5832_pilon	+	2322	8	Intergenic	novelGene_134150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	33.8049628043588	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	253	1107	355217	365690	FALSE	35	ACAACACATTTGTCTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRLQDEMATFFFEYDTPRMVLVRNKKVGVIFRLIQLVVLVYVVGWVFLYEKGYQTSSGLISSVSVKLKGLAETQLPGLGPQVWDVADYVFPAQGDSSFVVMTNFIATPQQSQGYCAEHPEGGICTGDSSCIPGKAERKAQGIRTGKCVAFNDTVHTCEIFGWCPVEVDDNTPRPALLREAENFTLFIKNSISFPRFKVNRRNLVEEVDAAYLKTCLYHKTTHPLCPVFKLSYIVQESGQNFNSLAEKGLAWTWHRRGTTMSGRGQTLSPGHQLRSHCLLNIR	354964	366905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_355354_362937_363086_363385_363458_364137_364208_364543_364641_364912_364994_365257_365400_365582
788934	contig_8538_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_4633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCGTTTTTTGTTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829564	830277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_829600_830300
788935	contig_6608_pilon	-	1577	5	Intergenic	novelGene_162543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	33.8701564802999	72	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	75	941	254585	249448	TRUE	15	TTTGGCAATTTCTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSMWYIMQSIQSKYSLSERLIRTIAAIRSFPHDNVEDLIRGGADVNCTHGTLKPLHCACMVSDADCVELLLEKGAEVNALDGYNRTALHYAAEKDEACVEVLLEYGANPNALDGNRDTPLHWAAFKNNAECVRALLESGASVNALDYNNDTPLSWAAMKGNLESVSILLDYGAEVRVTNLKGQTPISRLVALLVRGLGTEKEDSCFELLHRAVGHFELRKNGTMPREVARDQQLCEKLTVLCSAPGTLKTLSRYAVRRSLGLQYLPDAVKGLPLPASLKEYLLLVE	257833	248149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_248288_248949_250081_252879_252985_254456_254621_257794
788937	contig_11173_pilon	-	1515	10	Intergenic	novelGene_156898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCCAGCCTCGCGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450258	430608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_-_430727_431762_431847_432245_432342_432690_432789_433336_433427_434009_434132_434778_434942_441129_441287_442830_443096_449936
788941	contig_6412_pilon	+	1181	8	Intergenic	novelGene_149965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	83.4889703090492	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1137	44	1180	429960	640910	FALSE	20	CGACTTCCCCAGGAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSSSGTGLKAIRTMSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKASQANVRIGDVVLSIDGISAHGMTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASATPKPEPVPVEKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTSTTNMAYNKTPRPFGFVSSPKVTSIPSPSSAFTTAHVTTSSHASPPPVAAVTPPPFAASGLHANANLSADQRSPALSAVKTAVNVPRQPTVTSVCSETAQEVAEGQRRGFQGDSKQQNGPPRKHIVERNTEFYHIPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESENDNTKKANNIQEPSQQLPSFVTSTRSMPKSLESSASARPDVASPATAASFKSLASTNVIKSPGWQQPNQAAPSTGRISNS	429916	640911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_430056_497577_497730_555722_555766_557408_557828_570697_570871_571426_571464_610200_610389_640881
788945	contig_7694_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_159919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACAGAGAAACAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67647	69756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_67600_69800
788946	contig_7694_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_159920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70108	70601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_70100_70600
788949	contig_10148_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_172864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261435	263483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_261400_263500
788950	contig_3942_pilon	-	1465	8	Intergenic	novelGene_128865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_7	12.328828005938	7	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	209	724	1491123	1488922	TRUE	30	AGAACTCCAAGGACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWVRLGPAGGSQQASRWGSWLHLLGTGL	1492122	1486210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1489104_1489377_1489444_1489587_1489669_1490936_1491132_1491922
788952	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
788955	contig_854_pilon	-	536	4	Intergenic	novelGene_36097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	1332.52450467357	436	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	133	483	93159	91429	FALSE	5	CGAGCCTCGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQITAPVGRTNLPRATQISRFPRLPVGLGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVCISFEEADLSIKLPDGYTFKFPNRLNLETINYLEAEGDFKVKCVAFE	93401	91375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91870_92043_93127_93208_93317
788956	contig_20842_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_160970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCCTAGGGTCCCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88974	87669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_87700_89000
788957	contig_11318_pilon	-	1236	3	Intergenic	novelGene_48154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1410	junction_2	84.5	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAACATCAAGGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34707	30837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_31211_32293_32348_33898
788958	contig_6364_pilon	-	2338	2	Intergenic	novelGene_51801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAGAATAAATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426787	1419637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1421848_1426659
788963	SIRV2	-	435	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4093	268	2914	-268	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGCAAACCTAGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1818	1303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
788964	SIRV2	-	291	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4552	64	3377	-29	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCCAGTTATCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	1064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
788967	contig_11428_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_138502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAAACATCAACTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200866	199698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_199700_200900
788970	contig_18843_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_165619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACGTAAAAAGAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35320	37166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_35300_37200
788972	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	508	55	508	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10745	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
788973	SIRV2	-	271	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	388	2958	-388	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTGTGCTCGCGACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
788974	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
788980	contig_5041_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_27011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATAAAAGTGGATGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185237	186142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_185200_186100
788981	contig_13937_pilon	-	2628	7	Intergenic	novelGene_167343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_2	96.4929473531039	42	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	2029	2619	36898	30851	FALSE	20	TAAGTCAGAGTGGTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGSIKLLSPVLYLILLLIALELVNIHAVQGKHTCEYQRYLKFLKSVLQYTENLATYTSQEKNKWDETVSLTHGVLLKIWTYSEKKQMLMHLAEKPTDKAVS	47089	30841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36079_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274
788984	contig_2646_pilon	+	1747	2	Intergenic	novelGene_69567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGGTGCTTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939706	946986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_939779_945311
788986	SIRV6	+	374	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	586	2	407	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
788987	SIRV1	-	238	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	4	3588	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
788989	contig_5903_pilon	-	927	4	Intergenic	novelGene_173221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.24721912892465	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	31	543	306971	296593	FALSE	10	TATGTGTCACTGGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRVALFQPGKMAHARISMYLPPDVNPTQAAIAYGCRALPKLNEELQSEDLQTRQKALMALCDLMHDPEHVYEAIKIGCLESLKALLKDGDHMVRIKTTEVFYIMATHNVGRDGFLEHGVILALSFLLNDPQPLCRENLHLAYKHLAQLPSAGFCSSDLWFLGSELAAYLPILGFISLHSL	307001	296208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_-_296685_301582_301702_305275_305379_306772
788990	contig_14023_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_165368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	286	633	164614	164961	NA	5	TTCTGGGTGGCTGAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTRLKITGQLFCRLSLNLHFSDVFIIRPSVYLSGNKTTGMMCPSPILGHMMSICLMAGDVNLDRLVKVVSVKFIHCKSTTFPRITNVMGELFSNYTNILFLIIPSVTNSGILR	164328	165100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_164300_165100
788993	contig_3942_pilon	-	1887	4	Intergenic	novelGene_128704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	99	407	430075	429465	TRUE	30	CCGGCAGGGGAACAGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCAEVIQGPRAGSRKNGGSWVFTAVTGNRLPSGTWSQFGRHLASHPGGDSCEALTPLTTTQGTYLWGGCRASVSWALTCMSCVPRSPIAHSVMVSEDTSGA	430173	426942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_428320_428491_428578_429447_429616_429917
788994	contig_6654_pilon	-	2641	17	Intergenic	novelGene_85697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_9	82.5565857079252	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	13	2169	130794	99286	FALSE	25	GTCTAATTTCTTATCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALEEEFTLSGVPLSAGPDGLLGVEPSDRTDQFLVTHSGRTVILYKVSDQKPLGSWSVKQGQIITCPAVCNFQTGEYIVVHDDRVLRIWNNEDVNLDKVFKATLSAEVCRIHSVQGTEPLVLFKKGAIRGLEALLAEPQQKIETVISDEEIIKWTKIFMVFKHPVLIFITEKHGNYFAYVQMFNSRILSKYTLLPGQEEKSAIQSFAASANRKFISLMSLSSDGCIYETLIPTHPSDREKNQVVVRSLLLKAVVSGDVRNGVALSVLDQDHIAVLGTPLSASKECLSIWNIKFQTLQASKDLLQGTSGQLWYYGENLFMLHGKFLTVIPYKCEVSSLAGALGKLKHSYEPGSHAVPHFVNWETSQEYGLGSQNSEQSRILRTRKVEVSLQPAVSASAQLLLTIKNDTEKHIEVELRKFLAIKQTPEFHTTIGDIVTGLLGRCKAEPSFYPRNCLMQLIQTHVLSYSLCPGLMEVALEKTDVQILQLCLQQFPDIPESVTCACLKIFLSIDDDSLQETDISTESVFDYSDTVRDEKMEEQTEIMENGFNPEEDNSNKEKPQGTTEETTLSPVTPKRAALLNAVLHSAYSEAFLLPHLKNIPAQHVTLFLQYLYFLYLKCSENATMTLPGIQPPTLNQIMDWICLLLDANFTVVVMIPEAKRLLINLYKFVKAQVCDCWIYTEFCLYSQAPPNYHLFLNFVLEIVISNHGGFVYRSKLW	130806	98813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_99532_101466_101560_102065_102145_102576_102790_102940_103067_103179_103365_103822_103898_104401_104488_104966_105091_107018_107096_109212_109402_111222_111368_111644_111703_126505_126655_128623_128681_129399_129514_130653
788999	contig_14691_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_146797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTTTTTTTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40545	41192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_+_40500_41200
789000	contig_3751_pilon	-	2232	9	Intergenic	novelGene_158632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	200.210982465998	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	46	1032	171742	103062	FALSE	45	AAATTCATACTCAGTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSRQPPLVTGISPNEGIPWTKVTIRGENLGTGPPDLIGLTICGHNCLLTAEWMSASKIVCRVGQAKNDKGDIIVTTKSGGRGTSTVSFKLLKPEKIGILDQSAVWVDEMNYYDMRKDRNKGIPPLSLRPANPLGIEIEKSKFPQKDLEMLFHGMSADFTSENFSAAWYLIENHSNTSFEQLKTAVNNLKKQANKKNEGSLAYVKGGLSTFFEAQDALSAIHQKLEADGTEKVEGSMTQKLENVLNRASNTADTLFQEVLGRKDKADSTRNALNVLQRFKFLFNLPLNIERNIQKRVIMMWLLTIMKRPSHSLGKRRCRFSRNIMLK	171787	101861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_103077_103866_103951_104086_104233_112860_112942_125272_125398_127350_127465_150782_150910_153409_153587_171624
789001	contig_11088_pilon	+	636	3	Intergenic	novelGene_85041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	25	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAGTGGAATGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_16250_16348_17119
789004	contig_4125_pilon	-	2170	11	Intergenic	novelGene_25091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1357	1878	609264	600525	FALSE	40	AAACCCAATTACGCTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRYLGAHTSECSGKDSHSSSCSLSLSRCLSPAPPAWAAEDNAFQCVLGLAEKPPADLHGVLQRLQHSDAGCLPYQGRLPQPGLDVSASHSRGVLGRVDPNSQQCQPSHRGCHFVPVSHKGTKSLAKQCARCPDGLQDGLAVLRGLQADLLTDDVCVLPISLGPGTRLSLHP	623070	600232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_600645_600820_600892_607709_607862_608795_608858_609147_609274_609543_609669_616851_616906_617388_617458_617706_617877_619571_619674_622243
789005	contig_8801_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_66332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTGGAGATATTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939248	939783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_939200_939800
789006	contig_9272_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_125958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTCCAACGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483606	481403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_481400_483600
789012	contig_3832_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_161482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTATTCATCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447757	447264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_447300_447800
789015	contig_4364_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_2799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
789016	contig_6175_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_16355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTGAAATTCAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706854	1709220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1706900_1709200
789019	contig_8210_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_30262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACAAAAAAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330928	333119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_330900_333100
789020	contig_13158_pilon	+	2135	6	Intergenic	novelGene_107286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATAGGCTGCAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96798	139558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_98511_100236_100354_101048_101111_105959_106068_118708_118771_139484
789022	contig_9901_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_126927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATATAGAATAGACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166392	165385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_165400_166400
789023	contig_5947_pilon	-	2779	1	Intergenic	novelGene_101623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCACATCACCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685912	1683133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_1683100_1685900
789024	SIRV1	-	258	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	8	3564	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
789028	contig_5083_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_151707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACTCAGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651477	1653126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1651500_1653100
789030	SIRV6	+	332	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	532	7	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAGTCGAAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
789033	contig_11832_pilon	-	1663	14	Intergenic	novelGene_106931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	989.776712611689	1	79	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	640	1074	86997	84681	TRUE	10	ATGAGTGTGTGTGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGRS	92471	83798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84967_85052_85901_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
789035	contig_10436_pilon	-	1591	5	Intergenic	novelGene_108475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	52.2081171849742	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	424	1245	97741	96819	FALSE	20	TATTAGCACACCCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGAASGLELVGPSRTRSSVEYPPPTLKPETQPPEKRRRTIEDFNKFCSFVLAYAGYIPPSKEESDWPASGSSSPLRGESAADSDGWDSAPSDLRTIQTFVKKAKSSKRRAAQSGPTQPGPPRSTFSRLQAPDSATLLEKMKLKDSLFDLDGPKVASPLSPTSLTHASRPPVPLTPVPLSQGDLTQPPRKKDRKNRKLGPGAGAGFGVLRRPRPAPGDGEKRSRIKKSKKRKLKKAERGDRLPPPGPPRAPPSDTDSEEEEEEEEEEEEEEIVAVVGGEAPAPVFPTPPEAPRPPATGPPEGAPPTDSESKEVGSTETSQDGDASSSEGEMRVMDEDIMVESGDDSWDLITCYCRKPFAGRPMIECSLCGTWIHLSCAKIKKTNVPDFFYCQKCKELRPEARRLGGPPKSGEP	99488	96472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_97034_97134_97973_98574_98668_98822_98855_99421
789038	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657502	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657504	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
789041	contig_7815_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_134372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACACCAGGTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330467	332113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_330500_332100
789044	contig_11378_pilon	-	1656	3	Intergenic	novelGene_112314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	785	1156	1136460	1134977	TRUE	80	AGACCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVRIRPRVGASSPDCGAPYPPRVVGLPQVVGWAGGGGGGRSGGAFWAHEADPGQRVCWSGEGEGTAEAAGPNRAAERSGVPQATGAAENGLRRWWSGSLSWLARKGWSPSLETPKGTKGHC	1137244	1133646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1134080_1134909_1135071_1136182
789045	contig_18637_pilon	-	1663	3	Intergenic	novelGene_81850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154496	148083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_148389_149542_149604_153199
789051	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
789054	contig_20890_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_147048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTGTAGCAGTAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35428	33576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_33600_35400
789059	contig_3397_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_154588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAGAGGCCCACACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168484	166337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_166300_168500
789060	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
789063	contig_14133_pilon	-	653	7	Intergenic	novelGene_119954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1507.56466601676	34	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	45	614	209116	206601	FALSE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRDVEKKK	209451	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206622_206687_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208728_209012_209131_209421
789064	contig_7963_pilon	+	989	4	Intergenic	novelGene_58508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	199.285947544951	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	42	698	145910	149953	FALSE	10	TGTGGCTTCTTTCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVGSSEPAVWCEDMDHEQNQGAALLQLLQLLWLLPHSWAAPEAPTPVWRDGLQNHTFLHTVYCQNGTPSLGLSEAYDKDQLFSFDFSQNSRVPRLPEFADWAKDQGDASAISFDKEFCQMMIQEIGPQLDGKIPVARGFPVAEVFTMKPLEYGKANTLVCFVSNLFPPTLSVNWQHHSVPVEGVSPTFVSATNGLIFRAFSYLNFTPEPSDVYSCIVTHEIDRYTAVAFWD	145868	150244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_145998_147985_148271_148907_149187_149948
789065	contig_6871_pilon	+	588	2	Intergenic	novelGene_21628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTCCCCCGTCTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626392	627031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_626666_626716
789066	contig_12837_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_57330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGGAGAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151480	153029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_151500_153000
789069	contig_12239_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_170474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53717	54763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_53700_54800
789070	contig_6589_pilon	+	1397	5	Intergenic	novelGene_26065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.5188925819407	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	188	655	1757003	1758336	FALSE	30	AGTGCTTTGCAAATGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRPLVLLLLLPSILVPPSTAAPIRDGDFQESSSGLLGLQSLLQGFSRLFLKDDLLRGMDSFFSAPMDFRGLPRNYHQEENQERRLGNNTLSSHRQIDKMTDNNTGEVLISEKVVASIEPAEGSFEGDWKVRTCPTKCLLLLLGLSSRFQLIVTV	1756318	1759078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1756373_1756617_1756732_1756983_1757159_1757897_1758039_1758165
789073	contig_10980_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_162562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGCAGAACTGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235807	236870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_235800_236900
789076	SIRV6	+	401	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	3	379	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	158	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789078	contig_15236_pilon	+	2293	18	Intergenic	novelGene_141593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	25.7612138380222	3	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	27	2096	456726	511415	FALSE	45	ATTTCATATTAATAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEQLDSRNMAAASAVSMLLVAAERNQWQRLPSLRLPPRRWTGKQRSMKYTTTTGRSITKVLIANRGEIACRVMRTARKMGIQSVAVYSEADRNSIHVDMADEAYCIGPAPSQQSYLAMEKIIQVAKVSAAQAVHPGYGFLSENPEFAELCKQEGIIFIGPPSSAIRDMGVKSTSKSIMAAAGIPVIEGYHGEDQSDQCMKEHAGRIGYPVMVKAVCGGGGKGMRIVRSEKEFQEQLESARREAKKCFNDDAVLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNTVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPGPGIEAEVRRKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHNFYFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQEEITLQGHAFEARIYAEDPNNNFMPVAGQIVHLSTPQTDLCTRIETGVREGDEVLVHYDPMVAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLHTNIDFLLSLSGHPDFEAGNVHTDFIPQHHTELFPAQRATAKELLCQAALGLILKERAATDAFRLKAQDRFSPFASSSGRRLNICYTRNMTLRDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIDDKTFRVLGDLHSEGDCTYLKCSVDGVASKAKLIILENTTYLFPQVFVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKAPKDGTIKNVFHQEGSQANRHAPLVEFEEEESDKRESE	456699	511612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_456815_460858_460906_462590_462728_465310_465407_472155_472278_472737_472886_472958_473081_482969_483082_488131_488214_489403_489532_492971_493156_495822_495933_497260_497478_499243_499331_503696_503747_505706_505845_509859_509932_511286
789079	contig_2476_pilon	-	2325	2	Intergenic	novelGene_157624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	0	27	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	931	1236	119332	117476	FALSE	35	CATTTCAGTTGATTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKDQPSNASPQWPRDLSRSSSSLQASNFTYSPSHISVKEPTPSIASDVSLPVATQELRQRLQQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHSCR	120262	116386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_117579_119129
789081	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
789082	contig_6847_pilon	+	1169	6	Intergenic	novelGene_143877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	518.02108065213	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	89	727	98613	104254	FALSE	50	GGAATAAATCTAACCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTGKYFVFPLPIFFLPSSLLCFLGPYHTVQLMA	96774	104696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102632_102750_104095
789083	contig_5696_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_117581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTCCTAGCCTGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722575	722222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_722200_722600
789084	contig_13607_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_170226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGGTACAATAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474534	474934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_474500_474900
789085	SIRV2	-	478	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	24	325	24	-325	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTGATCTACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5871	3990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
789086	contig_5816_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_158249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCCCCACTAGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234143	232843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_232800_234100
789090	contig_11855_pilon	-	2345	1	Intergenic	novelGene_66890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGAGTCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651249	648904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_648900_651200
789091	contig_4350_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_136374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACACCCATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79842	80035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_79800_80000
789092	contig_1639_pilon	-	1685	4	Intergenic	novelGene_74909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324247	313585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_315036_315550_315687_321335_321392_324204
789096	contig_2364_pilon	-	665	6	Intergenic	novelGene_170822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_3	96.2941327392277	654	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	11	373	36980	33731	TRUE	25	GTAAGTTAGTAGTTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSMAATWPAGTAAPEALVAQLLGVLWFVSVTTGPLGAAATTAVGGEETLKCEDLKVGQYICKDPKINDATQEPVNCTNYTAHVQSFISCFWKTGNRINTNKEESAFKCSQVSTIHMRDNGNL	36990	7133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_-_7208_17104_17197_20726_20836_33713_33853_35076_35147_36809
789098	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_94864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
789099	contig_13051_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_140109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTTAATTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159058	158469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_158500_159100
789103	contig_7202_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_18758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTCGGAGGCCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30102	29868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
789104	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	435	8	262	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
789108	contig_14133_pilon	-	620	5	Intergenic	novelGene_119942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1651.89427249446	26	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	43	618	209116	206563	FALSE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPNHHAGREGLQGICQSPHGPRQRPTLRDPRKEGQRGRRAGCGEEKVNLCQGPLIKAVKP	209449	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206735_208230_208389_208585_208728_209012_209131_209421
789111	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_96324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	53	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
789114	contig_15820_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_174595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACCCTTAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119978	118603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_-_118600_120000
789115	contig_4232_pilon	-	1983	14	Intergenic	novelGene_63236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_10	59.4291383515452	86	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	29	1570	273386	267079	FALSE	15	AGAGCCCCGGGAGGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVAVEGGKMAEVGEIIEGCRLPVLRRNQDNEDEWPLAEILSVKDISGRKLFYVHYIDFNKRLDEWVTHERLDLKKIQFPKKEAKTPTKNGLPGSRPGSPEREVPASTQASGKTLPIPVQITLRFNLPKEREAIPGGEPDQPLSSSSCLQPNHRSTKRKVEVVSPATPVPSETAPASVFPQNGSARRAVAAQPGRKRKSNCLGTDEDSQDSSDGIPSAPRMTGSLVSDRSHDDIVTRMKNIECIELGRHRLKPWYFSPYPQELTTLPVLYLCEFCLKYGRSLKCLQRHLTKCDLRHPPGNEIYRKGTISFFEIDGRKNKSYSQNLCLLAKCFLDHKTLYYDTDPFLFYVMTEYDSKGFHIVGYFSKEKESTEDYNVACILTLPPYQRRGYGKLLIEFSYELSKVEGKTGTPEKPLSDLGLLSYRSYWSQTILEILMGLKSESGERPQITINEISEITSIKKEDVISTLQYLNLINYYKGQYILTLSEDIVDGHERAMLKRLLRIDSKCLHFTPKDWSKRGKW	273414	266665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_267214_267306_267389_267518_267679_269582_269677_269749_269891_271074_271165_271245_271495_271788_271864_271971_272047_272135_272292_272582_272720_272811_272881_273208_273276_273374
789116	contig_14536_pilon	-	1885	12	Intergenic	novelGene_69307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	98.2425737945883	316	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	15	1319	370282	171562	FALSE	40	ACAAAAATTACTGATGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATAGRGVLLATWGGRLRRVLAASRRALPGPAPLAAAVAGVALTGAGVSWYKGRVNLAASEGNLTVLAQRNVDSDEMVGKLSLRKQRFMQFSSLEHEGEYYMTPRDFLFSVMFEQMERKTSVKKLTKKDIEDALAGIQKAGWGPTFFRDLGDKGLISYTEYLFLLTILTKPHTGFHVAFKMLDSDGNEKVEKKEFFKLQKIISKQDDLKTTVTNETECQERKLKEPEVNTTLQIRFFGKRGEKKLHYKEFRRFMENLQTEVQEMEFLQFSRGLSFMRKEDFAEWLLFFTNTGNKDIYWKNVREKLSAGESISLDEFKSFCHFTTHLEDFAIAMQMFSLAHRPVRLAEFRRAVKVATGQELSDNILDSVFKIFDVDGDECLSHGEFLGVLKNRMHRGLWVPQQLSVQEYWKCVKKESIKGVKEVWKQAGKSHF	370296	170995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_171667_173456_173615_174077_174187_178024_178197_185030_185129_203390_203457_235530_235614_236607_236656_256980_257057_257152_257185_292478_292624_370069
789117	contig_12654_pilon	+	2465	1	Intergenic	novelGene_129258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAGGAAATGTCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60245	62710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_60200_62700
789118	contig_6059_pilon	-	1372	5	Intergenic	novelGene_44790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	236.650058102676	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	210	767	411475	377554	FALSE	55	AAAAAAATGTACTGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYVFVNDSSQTNVPLLQACIDGDFNYSKRLLESGFDPNIRDSRGRTGLHLAAARGNVDICQLLHKFGADLLATEYQGNTALHLCGHVDTIQFLVSNGLKIDICNHQGATPLVLAKRRGVNKDVIRLLESLEEQEVKGFNRGTHSKLETMQTAESESCFADPLEHTGWSGSNRLRVVRHAQNRQR	437288	376948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_377642_409565_409725_411164_411508_415816_415920_437214
789119	contig_567_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_34002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTATGACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590812	592957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_590800_593000
789124	contig_15500_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_128994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAGTAACTAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248929	251075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_248900_251100
789125	contig_11281_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_125465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGTGTTCTTTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845012	842855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_842900_845000
789129	contig_6710_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_90267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
789135	SIRV6	+	197	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-4	508	3	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGGTAGTCGAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	1612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
789139	contig_5988_pilon	+	2046	2	Intergenic	novelGene_15856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	884	1252	271065	271433	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFISSGFEEAILSPPATGILILRAVLSAFSKKGRSGFSEPSMGIFRMTEEWLSRWDRRFWAAYAYCDFTLASIFSNCLFWAANSSACFARYSFSDTLADGTLLLLCFWETNAFEPSCCKE	270181	273202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_271741_272715
789140	contig_13295_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_31247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGAAGGAGCTGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115819	118058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_115800_118100
789141	contig_11386_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_82840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGCCCATACGACAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232924	232114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_232100_232900
789144	contig_2903_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_148971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGAGGATGCCTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120770	121846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_120800_121800
789147	SIRV4	-	246	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1272	3	1272	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3886	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
789148	contig_14441_pilon	+	1179	5	Intergenic	novelGene_100626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.651485960052	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	623	1051	116728	117610	FALSE	25	CCTAGCAAGCCTGAACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111233	117738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_112352_112680_116578_116963_117220_117344_117539
789149	contig_13460_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_162176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTGTTAATTTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101402	103856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_101400_103900
789153	contig_8812_pilon	-	1427	3	Intergenic	novelGene_57260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	971	1366	12183	11788	FALSE	35	CTTGACAAAAGATAGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSKFSCCLSLNNTTLSKLLNVSEGTTAVPPVPCRQTVPLISQARFSPPSISSSLERTEESRLLSDVPRSFWSSRPSGYVSSCDTTTVLVEDAGIRAFLFWSPGASLLISTVLCRGMGLFPSFSIESSLV	16268	11726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_-_12284_15235_15354_15516
789157	SIRV5	+	365	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	168	135	54	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8369	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
789158	contig_18438_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_171384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGGTAATGGGGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91301	89269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_89300_91300
789159	contig_3822_pilon	+	2838	1	Intergenic	novelGene_133335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	29	337	320969	321277	NA	65	AAATAATTCCAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLKGAAGWDPRAGFRAERRECTTSVPQGLLKAARKSGQLNLSGRNLSEGKIRRYDPLLLGSPCPVRLPFLWPSLSQDPSRYLCALIQALIIFHLAWSVPF	320940	323778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_320900_323800
789161	contig_14288_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_153804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	36	374	144859	144521	NA	10	CACTGTGTCTTTCGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCLNLKYSTITCFSCGVGWGDLHLFLKMLTNPESLMQPNLENCFGTFVEICRNIISSLKALILKKKTTRKSITLSDPVMVVECVLVRCFEMRLKIIFLGNIEFLFLLRMS	144894	144299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_144300_144900
789163	contig_14322_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_115619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTCTTGAAGCCCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157699	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_157700_158900
789164	contig_8710_pilon	-	1334	4	Intergenic	novelGene_73542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	65.8634952003004	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	116	460	518747	501978	FALSE	80	AAAAAGAAATAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKSELKAELERKKQRLAQIREEKKRKEEERKKKETDQKKEAVAPVQEESDLEKKRREAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSKSVSTPSEAGSQDSGDGAVGSRYSNFLLIF	520846	501103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_502097_516296_516415_518639_518757_520740
789165	contig_5918_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_99505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266699	265009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_265000_266700
789170	contig_17427_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_30380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCTTAAGGACTGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180386	182392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_180400_182400
789172	contig_12605_pilon	+	558	3	Intergenic	novelGene_64215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	11	379	3897	4829	FALSE	10	GCACGTGTGTGGAGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3886	5008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
789177	contig_15498_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_42708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAATCAAACACAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922144	920894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_920900_922100
789178	contig_10446_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_162513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGAAATTACGTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085120	1086581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1085100_1086600
789179	contig_12948_pilon	-	1192	6	Intergenic	novelGene_126187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	35.2102257874044	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTAAATTGGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209716	203048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_203590_204892_204999_205869_205986_206247_206372_207620_207693_209483
789187	SIRV4	+	199	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCTAAAGACATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4055	5158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
789189	contig_7933_pilon	-	528	3	Intergenic	novelGene_164705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4810	junction_2	276	1209	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	58	360	238534	233326	FALSE	25	TACTGGAGCGTCAGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	238591	233157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430_234584_238531
789190	SIRV2	-	510	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4363	34	3188	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
789191	contig_12301_pilon	+	2499	13	Intergenic	novelGene_110007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_5	105.156596189788	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	182	1981	39135	63602	FALSE	65	AAACTAGGTTAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEVRVYNYRKLILCYGTTKGSSISIQWNSIHQKFHISLGTVGPNSGCSNCHNTILHQLQEMFNKTPNVVQLLQVLFDTQAPLNAINKLPTVPMLGLTQRTNTAYQCFSILPQSSTHIRLAFRNMYCIDIYCRSRGVVAIRDGAYSLFDNSKLVEGFYPAPGLKTFLNMFVDSNQDARRRSVNEDDNPPSPIGGDMMDSLISQLQPQPPPQQQPFPKQPGSSGAYPLTSPPTSYHSTVNQSPSMMHTQSPGNLHAASSPSGALRAPSPASFVPTPPPSSHGISIGPGASFASPHGTLDPSSPYTMVSPSGRAGNWPGSPQVSGPSPATRMPGMSPANPSLHSPVPDASHSPRAGTSSQTMPTNMPPPRKLPQRSWAASIPTILTHSALNILLLPSPTPGLVPGLAGSYLCSPLERFLGSVIMRRHLQRIIQQETLQLINSNEPGVIMFKTDALKCRVALSPKTNQTLQLKVTPENAGQWKPDELQVLEKFFETRVAGPPFKANTLIAFTKLLGAPTHILRDCVHIMKLELFPDQATQLKWNVQFCLTIPPSAPPIAPPGTPAVVLKSKMLFFLQLTQKTSVPPQEPVSIIVPIIYDMASGTTQQADIPRQQNSSVAAPMMVSNILKRFAEMNPPRQGECTIFAAVRDLMANLTLPPGGRP	37964	64120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_38032_39020_39174_39491_39762_42625_42773_46777_46890_50931_51064_53025_53209_54147_54384_56686_56867_56954_57063_60150_60277_60664_60858_63528
789196	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	575	23	396	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789197	contig_9091_pilon	+	2085	9	Intergenic	novelGene_32441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_8	63.7435045710541	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	176	1456	72118	87302	FALSE	35	CAAAAATATTTTGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSTSPDREDDLEACVLRFSDLDLKDTGLIDPSSHLKAQLDHSTKKKYSFGKKKAFALFVKTKEVPASAFECKEKWWKCCQQLFKDKIGIHRHVATQHADEICHQTASILKQLAVTLSSSKSLKSSDKRDLLKEYLTHDHDVSAWLPDTSCFSPDKLIGGQGIDEGEVLLYYCYCDLEDPHWICAWQTALCRHLHLTGKVRIATEGINGTVGGSKLATKLYVEVMLSCPLFKDYLCKDDFKTSKGGAHCFPELRVGVFEEIVPMGISPNMISYKKPGIHLSPGEFHKEVEKFLTLASQEQSDTILLDCRNFYESKIGRFQGCLAPDIRKFSYFPSYVDKNLELFRDKRVLMYCTGGIRCERGSAYLKAKGVCKEVFQLKGGIHKYLEEFPDGFYKGKLFVFDERYALSYNSDVVSGGSAQNQNPN	67237	87931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_67363_72067_72283_73534_73849_75326_75448_80355_80482_81360_81467_85773_85893_86396_86556_87131
789198	contig_17833_pilon	+	2065	10	Intergenic	novelGene_174601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	213.678886806036	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	132	1139	56955	79074	FALSE	25	TCATAATGTCTTGTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVLRARLAVSPRLPAPELSSPKIIKAGKLKTKKTNKASDFGDMANWPTPSELVNTGCQSVISQGNKKPQNRKERDEKIEKRSNNESKENRETKLDGPGENVSEDEAQSSNQRKRANKHKWVPLHLDDVRPDGQERPGSRNSSRSQLEANKTAHNNRRNDTRSWRRDREKRDDQDEASSVRSEGGNIRGPLRGRGRGRGRGRGRGRGNPRLNSDYSCGYREHGERTDQPFQTELNTSMMYYYDDGTGVQVYPVEEALLKEYIKRQIEYYFSIENLERDFFLRRKMDEQGFLPISLIAGFHRVQALTTNLNLILEALKDSTEVEIVDEKMRKKIEPEKWPIPGPPPRSMPQTDFSQLIDCPEFVPGQAFGSHTVRVMIC	44143	80000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_44198_55928_55988_56936_56997_59322_59498_62495_62637_68731_68876_69042_69209_72894_73040_78276_78452_79054
789199	contig_10196_pilon	+	874	8	Intergenic	novelGene_132151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	410.673463809815	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	4	390	1034566	1046442	TRUE	40	AAAAGTATTTATTCCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKTRCTRP	1034562	1050776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043871_1046421_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
789202	contig_9731_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_154392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTCAGTTAGGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74117	72748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_-_72700_74100
789203	contig_4350_pilon	+	2473	2	Intergenic	novelGene_136395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAAGTATATCCAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371941	379256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_372575_377416
789205	contig_7031_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_132785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGATGCTATTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206415	205311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_205300_206400
789210	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789212	contig_5899_pilon	-	750	5	Intergenic	novelGene_146955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	513.012365835367	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	213	593	53130	12851	FALSE	20	TGAGTCTGATGTCTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEPLHQLVAFPRTLFPQDRPLEQ	84485	12693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_22380_22427_43099_43192_52908_53140_84282
789219	contig_11898_pilon	-	2063	5	Intergenic	novelGene_144273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	43.2608367926465	260	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	602	910	74004	73696	FALSE	15	GTTTAAAGCTGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTSVKIYLRLMWKKQLRPLSHITIIVIITSMGIIILGTISFQRISNQVIQMLLSIRLLQAFITTISTRTIKDRVTQRAEICQEVKVYNFPFHKRSSDERDV	83456	72542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_74015_76946_77060_78666_78884_79632_79849_83411
789226	contig_9571_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_136250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	299	640	284261	283920	NA	75	TATGAAAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLGSWFRMNSFLKLRRSRKRSSPLYDSSESTSSLELSTLCMNHLCQVLPPGFASLPSQAYLWDIFLNNCSTVRKCNLIFNPPGWRELGKPDIHIMSSNPSLMLIGLFAVMN	284559	282464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_282500_284600
789229	contig_8636_pilon	+	1784	14	Intergenic	novelGene_141927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	139.443696088056	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	35	1702	392437	456882	FALSE	35	TTTTATGACAAGACACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPYSLLVTRLQKALGVRQYHVASVLCQRAKVAMSHFEPNEYIRYDLLEKNINIVRKRLNRPLTLSEKIVYGHLDDPANQEIERGKTYLRLRPDRVAMQDATAQMAMLQFISSGLPKVAVPSTIHCDHLIEAQVGGEKDLRRAKDINQEVYNFLATAGAKYGVGFWRPGSGIIHQIILENYAYPGVLLIGTDSHTPNGGGLGGICIGVGGADAVDVMAGIPWELKCPKVIGVKLTGSLSGWTSPKDVILKVAGILTVKGGTGAIVEYHGSGVDSISCTGMATICNMGAEIGATTSVFPYNHRMKKYLSKTGRADIANIAEEFKDHLVPDPGCHYDQLIEINLSELKPHINGPFTPDLAHPVAEVGNVAEKEGWPLDIRVGLIGSCTNSSYEDMGRSAAVAKQALAHGLKCKSQFTITPGSEQIRATIERDGYAQILRDVGGIVLANACGPCIGQWDRKDIKKGEKNTIVTSYNRNFTGRNDANPETHAFVTSPEIVTALAIAGTLKFNPETDFLTGKDGTKFKLEAPEADELPPRVSCPRQCGQTLLPSPPQPTE	392402	456964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_392473_429634_429772_436550_436810_440076_440170_445103_445263_445487_445639_446894_447000_448263_448356_449634_449741_450879_451038_451238_451313_451844_451957_452835_452960_456820
789231	contig_2069_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_23319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTTTTTAGCCGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524099	525734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_524100_525700
789232	contig_10299_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_79772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGCAGGGAGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603962	604652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_604000_604700
789234	contig_5690_pilon	+	1353	11	Intergenic	novelGene_119703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	44.4595321612812	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	195	1190	930555	939107	FALSE	5	TAGGTGGCTTCTCGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQASDSHQHFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLSAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVEHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRMVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAGPLGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQRQMKETH	930035	939270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_930146_930470_930565_930991_931079_931573_931698_937441_937577_937689_937808_937894_937997_938193_938291_938381_938545_938702_938803_939047
789235	contig_6767_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_174617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGGAAAACAATCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19976	22029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_20000_22000
789236	contig_14441_pilon	+	864	5	Intergenic	novelGene_100624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416.76214739345	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	258	686	116728	117610	FALSE	10	GGCGCTGCCTACGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111216	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111261_114096_114161_116578_116963_117220_117344_117539
789238	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	106	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
789239	contig_5696_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_117527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGTAGAAGAATTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460042	462263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_460000_462300
789240	contig_7694_pilon	+	1055	4	Intergenic	novelGene_159926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_3	34.7562943939655	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	139	624	175141	180869	FALSE	55	AAAACAAAACAAACTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELICSSKGRWRGVEVAPLAQLGLGVGHDTYSFSLDADDAAVETAEEAKEPAEADINELCRDMFSKMATYLTGELTATGEDYKLLENMNKLTSLKYLEMKDIAINISRNLKDLNQKYAGLQPYLDQINLIEEQVAALEQAAYKLDAYSKKLEAKYKKLEKR	175002	181300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_175370_178578_178699_179449_179555_180837
789242	contig_18189_pilon	+	2289	7	Intergenic	novelGene_170761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.15470053837925	39	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	808	1578	72352	75126	FALSE	0	TCTGCCTGTCTGGTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFYTFRYPLSLSPDDRRGIQHLYGRPWSSPAPSAPALGPQADVDTNEIAPLEPEAPPDACEASFDAVSTIRGELFFFKRGFVWRLRGGRLQPGYPALASRHWRGLPSPVDAAFEDAQGHIWFFQGTQYWVYNGEKPVLGPAPLSELGLVGSPVHAALVWGPEKNKIYFFHGGDYWRFHPSTSRVDSPVPRRATDWRGVPAEIDAAFQDADGYAYFLQGRLYWKFDPVKVKTLEGFPRLVGPDFFGCAEAANIFH	65269	75837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_+_65408_70756_70987_71784_72144_72271_72514_72633_72851_73817_74076_74992
789245	contig_13547_pilon	-	1700	14	Intergenic	novelGene_104869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	342.987190748797	9	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1665	36	1700	223705	75798	FALSE	60	GAGAAAGGAAATAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNAIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTIMEVNGQNFENITFVKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKAGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDIEQTSQ	223740	75797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_75929_84852_84962_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
789246	SIRV6	+	309	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3115	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10827_11024_11109_11205
789250	contig_3942_pilon	+	2016	10	Intergenic	novelGene_128880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	12.0369800568452	7	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1182	1604	1536880	1549972	TRUE	20	CTGCTTCCTAAGAATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVRGVRHLGSRGFLSSATSKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMAEDRPGLQ	1531855	1551313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1535916_1536004_1537094_1549644_1549706_1549824_1549974_1550064_1550179_1550283_1550327_1551059
789253	contig_19185_pilon	+	2953	1	Intergenic	novelGene_163651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACAGCTAAGGACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136283	139236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_136300_139200
789254	contig_9931_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_134838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	181	531	348793	348443	NA	15	CTGCAATGTCTTATGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEELVRNPLASNLLSRDSNSGTKLKPNPAITYCRVCPHFKQNYVLNLGKVHSPSPFMFIKYHQVNVLFGTWNSLVFWEAINRFSTRTKWYSIYQQENTKLGLSSCTGNVTLQTI	348973	347782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_347800_349000
789255	contig_4659_pilon	+	2487	1	Intergenic	novelGene_118189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGAATTCTGGATGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130034	132521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_130000_132500
789256	contig_17769_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_124245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCCATGGTCACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24447	23941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_23900_24400
789257	contig_12570_pilon	-	1976	6	Intergenic	novelGene_79353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	210.631811462561	2	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	262	933	198025	190389	FALSE	35	AATGGAAATGAGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGADLVPTYSFGENEVYKQVIFEEGSWGRWVQKKFQKYIGFAPCIFHGRGLFSSDTWGLVPYSKPITTVVGEPITIPKLEQPTQKDIDLYHAMYMEALVKLFNNHKTKFGLPEAEVLEVN	228493	189345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_194619_194823_196195_196371_197886_198092_211349_211479_228427
789258	contig_6163_pilon	+	2083	1	Intergenic	novelGene_103820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	1750	2082	93607	93939	NA	10	GCTGCTGGAGGCGGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIIIGKTGLPADCRVKAALAGASAKQAGGWRAGRGASAGPQEGLRPGPRPPPHSLALLAVIQHDGVVVAARNDGLAVGAEIEAVNLVGVLAEHLGDAEAPQHAVGQLHGG	91857	93940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_91900_93900
789261	contig_8898_pilon	-	767	4	Intergenic	novelGene_137238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	37.5322083904833	2346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	267	599	286566	282042	FALSE	5	GCTTTGCTTTCTGCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAALEVTARYCGQELERYGQCVAAKPESWQRDCHHLKMSIARCTSSHPIIRQIRQVCAEPFLAFEECLRQNEAAVGNCTEYVRRFLQCAEQVQPPRSPTTVEAQPLPAS	286832	281873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_285082_285249_285321_285463_286564
789263	contig_15172_pilon	+	1946	8	Intergenic	novelGene_158739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	593.653681768715	1	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	163	345	224971	227578	TRUE	25	CTTGTGTCAATTTTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERERREKAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEELESWSSWRVSWSERRNVRRCLN	215635	238481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220390_220525_224966_225085_226241_226309_227576_227653_231630_231682_231767_231838_237075
789264	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	53	511	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789267	contig_7426_pilon	+	744	4	Intergenic	novelGene_27546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	71	382	1086841	1087992	TRUE	40	ACCTGGGGAGAGAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGQKGWGSYSFSSPVFWSHTGIPGTNQCDKVPTDCLMRPVCQRSQAWRRESCSKHRGQQGALHPPSYVPDEVAPFQKLYEEKSVLRSELDPACARLSLVGC	1086770	1093479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1087152_1087991_1088069_1090920_1091100_1093372
789268	contig_6445_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_77006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCATAGGTATTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511940	510993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_511000_511900
789269	contig_16148_pilon	+	2219	6	Intergenic	novelGene_50375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAAACCTAGAAGACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83820	151688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_84621_85722_85774_88827_89048_89182_89311_111367_111490_150790
789270	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
789272	contig_15153_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_166454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACCCAGCACTACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115523	115084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_-_115100_115500
789273	contig_8926_pilon	+	185	1	Intergenic	novelGene_174622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCAAAAAAAAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99394	99579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8926_pilon_+_99400_99600
789276	SIRV6	+	286	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	610	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGAAATCACCGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106
789277	contig_5988_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_16146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTACAAGTACATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1867291	1865638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1865600_1867300
789280	contig_6630_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_30717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAATAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421835	424072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_421800_424100
789282	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
789284	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	119	-7	37	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3142	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789286	SIRV4	-	311	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1212	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3946	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
789289	contig_8907_pilon	+	387	4	Intergenic	novelGene_85813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACTTCTCAATGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173355	179485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_173477_177971_178043_178593_178695_179391
789292	contig_5928_pilon	-	1566	10	Intergenic	novelGene_40364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	44.3721634461166	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	30	932	251809	199880	FALSE	45	ATGCCTGAAGAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRATPWQDMACGFRRSIAYQLSRVLDLPPENLIKSISAVPISKKEEVADFQLSVDSLLENNSDHLRPDIQDQAKRLAEKLKCDTVVSEISTGQGTVNFKINRELLTKTVLQQVIEDGSKYGLKSELFSDLPQKKIVVEFSSPNVAKKFHVGHLRSTIIGNFIANLKEALGHQVTRINYLGDWGMQFGLLGTGFQLFGYEEKLQSSPLQHLFEVYVQVNKEAADDKNVAKSAHEFFQRLELGDLQALSLWRKFRDLSIEEYIRIYKRLGVHFDEYSGESFYREKSQEVLKLLDRKGLLQKTMYDQVTIL	251838	199245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_200012_201202_201362_214487_214565_217593_217678_220326_220383_221490_221589_229383_229468_230831_230935_249346_249421_251773
789297	contig_6710_pilon	+	555	2	Intergenic	novelGene_95311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
789298	contig_6291_pilon	+	1338	5	Intergenic	novelGene_164776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_4	285.351099524778	2225	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	295	1164	355015	381395	FALSE	45	CGGAATAATTAAAAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEDVSSLTGDALTDLLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQFRQDQRDGGKSEDELDQASTPTDVRDIDL	354720	381569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961_360122_370429_370579_381245
789299	contig_3410_pilon	-	1547	11	Intergenic	novelGene_58927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.00849199195	2	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	819	1247	29768	14003	FALSE	15	TTAGTTTGTTTTACACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMAPSQVLDSLSDKFHRT	57660	13702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14053_15574_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29854_30398_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34317_57472
789302	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
789305	contig_10986_pilon	+	222	2	Intergenic	novelGene_71506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAGAGAAACAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167206	167488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_167415_167474
789313	SIRV4	-	255	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1263	3	1263	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3895	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
789316	contig_21357_pilon	+	293	2	Intergenic	novelGene_171858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACACTTGGAGTGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87574	136203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21357_pilon_+_87819_136154
789317	contig_4924_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_84771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCTTAGTTTCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242363	243229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_242400_243200
789321	contig_14133_pilon	-	3128	16	Intergenic	novelGene_119969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_15	47.0526891426575	3	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	1214	2959	225586	213631	FALSE	30	GATAAATGGTTTAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEVKDRIPVSYKRTGFFGNALYALGMTAVGLAILWYIFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTVVDGKMGKGISFKDVAGMHEAKLEVKEFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARHRAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSSFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDSALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTRASSFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTSNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQRVVAFHESGHALVGWLLEHTEAVMKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	231366	213461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220461_220587_221852_222027_222355_222519_222935_223062_224401_224505_225467_226434_227173_227264_228605_228709_231193
789323	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
789325	contig_17144_pilon	-	867	3	Intergenic	novelGene_29121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAACGAGACCTAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11722	9225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_9712_9802_10113_11651
789328	contig_10196_pilon	+	2961	9	Intergenic	novelGene_132259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	174.420782520318	37	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	482	2809	1996172	2000239	FALSE	15	AAGCTGGAGTCGCTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVSTALGGNVLTGRTMHCHLDAPANAISVCRDAAQVVVAGRSIFKIYSIEDEQFVEKLNLRVGRKPSLNLSCADVVWHQMDENLLATAATNGVVVTWNLGRPSRNKQDQLFTEHKRTVNKVCFHPAEAHMLLSGSQDGFMKCFDLRRKDSVSTFSGQSESVRDVQFSIRDYFTFASTFENGNVQLWDIRRPDRCERMFTAHNGPVFCCDWHPEDRGWLATGGRDKMVKVWDVTTPRAREVHCVQTIASVARVKWRPECRHHLATCSMMVDHNIYVWDVRRPFVPAAMFEEHRDVTTGIAWRHPHDPSFLLSGSKDSTLCQHLFRDASQPVERANPEGLCYGLFGDLAFAAKESLVASESGRKPYAGDRRHPIFFKRKLDPAEPFAGLASSALSVFETEAGGSCMSWFVDTARRYALAGRPLAELCDHNAKVARELGRNQVAQTWTMLRIIYCSPGLVPSTNLNHSVGKGSSCGLPLINSFNLKEMAPGLGSETRLDRSKGDTRSDTVLLDSSATLITNEDNEETEGSDVPADYLLGDVEGDDEELYLLDPDHTHPEEPEYVLPQEAFPLRHEIVDTPPGPEHLQDKADSPHVSGSEADAVSLAPVDSSFSLISVSHTLYDNRLPPDFFSALVRDMLRFYAEQGDVQMAVSVLIVLGERVRKDIDEQAQRFRLWNVSNEVVKLSTSRAISCLNQASTSLHVNCSHCKRPMSGRGWVCGRCHRCASMCAVCHHVVKGLFVWCQGCSHGGHLQHIMKWLEGSSHCPAGCGHLCEYS	1995690	2000391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1996644_1997190_1997369_1997787_1998461_1998705_1998825_1998914_1999037_1999121_1999227_1999326_1999668_1999830_1999980_2000070
789329	contig_8330_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_71779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAACTCAGAAAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831593	831076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_831100_831600
789331	contig_11631_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_104170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	661	1011	35689	36039	NA	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTYLLVSLVTFKWCQYILLILLFCRRFILNTVCFLIKYTLVNSDIFCVVFILVILDMGDGTTVNANADGNVGTLEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQV	35028	37277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_35000_37300
789335	contig_4091_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_173046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTTTATATATGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58607	57531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_57500_58600
789339	contig_10437_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_38394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGAAATGTATGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698620	696419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_696400_698600
789343	contig_8394_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_27331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGTAGAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164893	163597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_163600_164900
789346	contig_6967_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_174624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTTGACTCCAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102775	103397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6967_pilon_+_102800_103400
789347	contig_5083_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_151667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	805	1206	489872	490273	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSSNGFDFGLHGSVTVSFLRENGFLSFGLTSSSVHGLWFPFAIAAHELGCLGTRGTLGFWPGKVWGPGVPGWHSTGRLMLKILCGAWAPWRPAAGPLFLPWILCCHVPPTWGFFSVFLCYLCNTSEDYFGNI	489067	491335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_489100_491300
789348	contig_753_pilon	-	1325	10	Intergenic	novelGene_112969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	269.357993003849	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	150	1325	1199491	1183306	FALSE	45	AATTCTGAAGAGAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGRRSWEEAAAARAVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWA	1210760	1183305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755_1192870_1196905_1197005_1199447_1199592_1210711
789349	contig_11590_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_125590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCCAAACCCGTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692695	691432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_691400_692700
789355	contig_16315_pilon	-	1618	12	Intergenic	novelGene_166322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	102	1088	14334	11871	TRUE	15	CACATTTATCCCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENKHFIKQQDSQEWALPEASLGHTVEAGCISGDMGPKEMIQDLLARAGLFPTRRDRHLGPFGTLAGPWLLALIHPECLFHGSRDSCSVELLSGQPASARWCGGHRDLPFQGQTIYLICQLDVREGVDNLPRCLRRVAGRGPAQLCSSCSRASCWYCPEDSMVTDGNSHSPASKPELGLCTSRSREPPRAPGCSRTQVAEHSSLGGLRLAFRGKLATPRVWSQGFVGGGHSWHCPVLGAHSSTSGLCGRLWEAESCSRFTLWCALHRLCTGHWLQSGRCGVHTVAPSSMAAWLKSPGRAGSTSSWAKLQSCWETRVLLGSAPIARTRHSTRTTFPSTIPVAWYTGAQESASAGRKEGGQGTQ	14435	10282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16315_pilon_-_10316_10869_11054_11251_11360_11581_11655_11738_12035_12115_12261_12340_12405_12592_12781_12885_13024_13119_13279_13480_13518_14242
789359	contig_11378_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_112279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470392	469560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_469600_470400
789360	contig_12951_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_68139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACCAATTCAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122419	121254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_121300_122400
789367	contig_10235_pilon	-	1366	11	Intergenic	novelGene_46359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	107.153394719906	53	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	226	855	140447	137516	TRUE	15	GCTCTTTGGTTTCTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDSTSTTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTQLPSSGASSGTGSPSATHGGGPPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNLPSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGGPKPSTVSRRRRCRLLSRNQ	141304	130275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131535_131619_131682_137505_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_141092
789368	contig_16360_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_170085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTAGAAAAATTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153047	152397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_152400_153000
789371	contig_4857_pilon	+	1589	8	Intergenic	novelGene_48682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	552	junction_1	397.78581048148	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	185	973	1127714	1137790	FALSE	30	AGAGGAAGTGGTATTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLSFSCPESAERPTYTRVPRRLDPGPRRGYPERSERQHLRVSAAAPASTPVHPFRAWLAEMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEVRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPILMSMIICKCLKEERKILENAQRFNQAQSGSIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKTLEDLQDEYDFKCKTLQNREHETSGVAKNEQKQEQMLLQKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNW	1123476	1138406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1123660_1127712_1127842_1128631_1128777_1130171_1130271_1133432_1133523_1136158_1136238_1137333_1137426_1137634
789372	contig_11846_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_105976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGAAGTACCATCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332296	333376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_332300_333400
789377	contig_15118_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_74575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGGTGCTGGGACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363460	363188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_363200_363500
789380	contig_9852_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_138459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAAATTAATATGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30304	30799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_30300_30800
789382	contig_6837_pilon	+	1696	9	Intergenic	novelGene_149821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	24.1916178665256	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	122	652	11753	15241	TRUE	10	TGTTGGTAATTGGCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11631	17340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15471_15617_15697_16233_16824_16921_17021_17145
789383	contig_3424_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_55602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTGTAATTCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340147	1342516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1340100_1342500
789384	contig_9272_pilon	+	1792	7	Intergenic	novelGene_125921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	93.3727595298662	38	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	117	791	322791	327365	FALSE	25	AAATGTGAATGTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAAAVALGAEVGVRLALFATFLVTELLAPFHRLIQPEEMWLYRNPYVEADYFPTKPMFVIAFLSPLSLILLAKCLKKADTADSRQACLAASLALALNGVFTNTIKLIVGRPRPDFFYRCFPDGQAHPDLMCTGDKDVVNEGRKSFPSGHSSFAFAGLAFASFYLAGKLHCFTPQGRGKSWRFCAFLSPLLFAAVIALSRTCDYKHHWQDVLAGSMIGLTFAYVCYRQYYPPLTDAECHKPFQDKLVLPTVQKKPGDPYHFDV	322410	328366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322478_322741_322851_323324_323416_323879_323944_324411_324537_325357_325529_327201
789388	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10443	2	1293	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
789390	contig_11328_pilon	-	1723	7	Intergenic	novelGene_88375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	33.3299998333167	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	101	658	605565	590049	TRUE	5	TGTGGTATTTGTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCFNSGIYLIWTLLVVVGIGSVYFHATLSFLGQMLDELAILWVLMCALAMWFPRRYLPKIFRNDRGRFKAVVCVLSAVTTCLAFVKPAINNISLMTLGFPCTALLIAELKRCDNVRVFKLGLFSGLWWTLALFCWISDRAFCELLSSFHFPYLHCVWHILICLAAYLGCVCFAYFDAASEIPEQGPVIKFWPSEKWAFIGVPYVSLLCASKKSPVKIT	606369	581850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_582701_589647_589856_590041_590236_593081_593220_598060_598199_605470_605613_606316
789393	contig_2917_pilon	+	935	5	Intergenic	novelGene_147585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAAGCCGGCTGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92769	124066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_93169_93781_93970_96189_96300_98760_98920_123987
789394	contig_1516_pilon	+	822	3	Intergenic	novelGene_49996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1413	61	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	394	789	363302	363697	FALSE	5	GCACCTGTTTCCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLHPSKGRVRGAGLEAPSIFNARGHHLPLLCVLHSVPVENGCPENAQPGPGAWRQQEQGLRAGGSGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	335229	363730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347307_363026
789397	contig_1867_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_54579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAATATAACTATGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466679	467282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_466700_467300
789398	contig_8671_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_126274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556296	554058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_554100_556300
789399	contig_14530_pilon	+	672	5	Intergenic	novelGene_108457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	198.734747842445	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	127	672	80394	102195	FALSE	15	GAGTATTTGTGCCTCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFDSEDFSTSEEDEDYVPSGGEYSEDDVNELVKEDEVDGEEQTQKTKGKKRKAQSIPARKRKQSGLSLEGEEEEDATAESGGSSSEEEDAVAEQEKGIGSEDARKKKEDELWASFLNDVGPKSKVPPSTQVKRGEETEETTSSKLLVKAEELEKPKETVRKRNHRQMPLQLCLHSLQGQG	80267	102195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_80458_87558_87677_89526_89747_90059_90139_102130
789400	contig_12931_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_166768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCCCAGTTCAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102262	103958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_102300_104000
789402	contig_10126_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_105771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTTGGGTGTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186136	186778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_186100_186800
789403	contig_6710_pilon	-	417	2	Intergenic	novelGene_98245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TTAGGCCTCTGGCCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
789408	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789409	contig_5400_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_162834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAATGCCCTTTGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294038	293316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_293300_294000
789410	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
789415	contig_1918_pilon	+	2175	3	Intergenic	novelGene_168330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15.5	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATTGACTGTAATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49504	53705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_51870_52142_52192
789419	contig_14341_pilon	+	519	4	Intergenic	novelGene_111849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1667.67709371116	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	72	518	548758	550484	FALSE	25	TAGGCCTGGGCCGTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQ	547744	550485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355
789420	contig_7593_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_127363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACTATGGAGCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703877	704748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_703900_704700
789422	contig_3602_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_60563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	605	1012	506594	507001	NA	20	TGTTTTCAGTGAAGCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWNQLDCKQQLLWEESCTKPGDRASASRGSTCLGTVLKWKPGLIFQSPLLVSLELSPTALGLSACTQQAVWSGGAPFSAPEGALFLVGQHHQVTLDLLSLGEGEIHESRTRYLLNIPIKCLLYAGQYVELKLPS	505989	507518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_506000_507500
789423	SIRV2	-	438	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	45	3249	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
789428	contig_15673_pilon	-	1137	5	Intergenic	novelGene_169834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	93.9893611000735	729	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	143	634	161215	159835	FALSE	10	TGTTTGCTGTCTCACGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTSQRKRMSSKPELTDEQRREIREAFDLFDADGTGTIDVKELKVAMRALGFEPKKEEIKKMTNEIDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEEEFLRIMKKTSLY	162342	159331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_159925_160343_160482_160693_160823_161080_161243_162227
789430	contig_10177_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_174626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTATTTTTGCTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89551	90196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10177_pilon_+_89600_90200
789432	contig_11898_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_144308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCTATTGCAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376047	377237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_376000_377200
789434	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789438	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
789442	contig_16869_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_137597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACTGAGTCTATTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84006	85973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_+_84000_86000
789443	contig_7630_pilon	+	255	2	Intergenic	novelGene_133655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTCAGAGGCGCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525520	535641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_525694_535559
789444	contig_7630_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_133661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCGAGTTCAATTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536312	536823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_536300_536800
789445	contig_19918_pilon	+	1338	13	Intergenic	novelGene_172974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	17.2739366934376	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	494	1141	184847	191016	FALSE	35	ACCAAATAGTATTTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLVPPKIPDGERVDFDDIHRKRMEKDLNELQTLIEAHFENRKKEEEELISLKDRIEKRRAERAEQQRIRNEREKERQTRLAEEKARREEEENRRKAEDEARKKKALSNLMHFGGYIQKTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSIYNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTCGKAKVTGRWK	170713	191213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_170967_175515_175589_182157_182242_182714_182757_183672_183707_184839_184901_185187_185305_186165_186244_186742_186854_188085_188196_188710_188802_190588_190630_190970
789446	SIRV5	+	475	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-145	875	-31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8170	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
789448	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	119417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
789452	contig_11978_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_63138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1993783	2000877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1993903_1994164_1994288_1994810_1994928_1999304_1999390_1999769
789454	contig_11285_pilon	-	1689	15	Intergenic	novelGene_5509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	63.6173590095262	173	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	564	1610	552970	548818	FALSE	20	AACAACGTGTGCCGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAMLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLVELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGAGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQRFAVGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL	555912	548738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_548858_548940_549107_549237_549323_549593_549728_550212_550332_550494_550593_550836_550957_551944_552033_552198_552255_552662_552771_552937_552988_553463_553585_553908_554043_554912_555080_555788
789455	contig_6710_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_96796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
789456	contig_11825_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_155407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATCCCATTCTTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51691	49717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_49700_51700
789457	contig_11825_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_155406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATCTTTATTTTATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49615	49274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_49300_49600
789458	contig_3832_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_161462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355345	353695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_353700_355300
789459	contig_5196_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_38677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACATGCAGAAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102869	104995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_102900_105000
789460	contig_17_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_173987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCTGTGAAAGCAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112385	1110042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1110000_1112400
789465	contig_7843_pilon	-	1776	4	Intergenic	novelGene_152002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	33.8657480190367	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	45	425	115284	112946	FALSE	35	GCAGCACACATTGTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCGWRPTDSSPSVSMILSAAIFITLLGLLGYLHFVKIDQEALLIIDSLGIQMTSSYASGKESTTFIEMDKVKDIVINEAIYMQKVIYYLCILLKDPVEPHGISQVVPVFQSAKPRLDCLIEVYRSCQEILAHQKATSTSP	122629	111594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_113039_114507_114592_115080_115286_122586
789467	contig_9919_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_137963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATAGCCACCCTACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554845	555389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_554800_555400
789469	contig_7963_pilon	-	888	6	Intergenic	novelGene_58342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	26	664	48841	38897	TRUE	50	AATAATCAAAATCCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWICHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	48866	38342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40169_43629_43819_48741
789470	contig_6270_pilon	+	1677	3	Intergenic	novelGene_99827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	139.5	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGATACTCACGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44206	47595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_45457_45578_45713_47302
789472	contig_2093_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_153005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGTGGTAGCTGCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421089	1421611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1421100_1421600
789475	contig_15063_pilon	+	817	3	Intergenic	novelGene_14415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2992	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	319	807	36064	36661	FALSE	15	CCAAGGCCCTACTCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35271	36671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35371_35844_36158_36266
789477	SIRV6	+	372	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	552	38	373	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	558	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789480	contig_15456_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_139500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCATAACATGGCATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125197	124061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_124100_125200
789482	contig_10148_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_172865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289232	287783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_287800_289200
789483	contig_15034_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_143632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGATGGAAATACCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27966	28979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_28000_29000
789484	contig_3975_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_54696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111741	1109750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1109800_1111700
789485	contig_5479_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_133606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAGGAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324284	325986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_324300_326000
789487	contig_8673_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_129908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATATATTTTGTTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145278	144909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_144900_145300
789490	contig_12148_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_140331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTCAAAGATATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78608	80070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_78600_80100
789491	contig_7165_pilon	-	674	5	Intergenic	novelGene_116919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	36.2655139216308	1613	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	94	534	1241993	1235077	FALSE	30	TTTTATTATTTTGTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDVMIRKEAYVHKSVMEELKRIIDDSEITKEDDALWPPPDRVGRQELEIVIGDEHISFTTSKIGSLIDVNQSKDPEGLRVFYYLVQDLKCLVFSLIGLHFKIKPI	1242086	1234936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1235177_1236917_1237001_1238422_1238534_1240210_1240270_1241905
789492	contig_9481_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_149659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTCACCATCTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170846	169981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_170000_170800
789494	contig_13645_pilon	-	2353	2	Intergenic	novelGene_146165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	0	43	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCCAGAATATTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23768	20325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_22603_23692
789495	contig_8801_pilon	-	1287	6	Intergenic	novelGene_66241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	42.7663419057557	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	197	652	199038	193594	TRUE	5	TCAGCTTCTCTCTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	218802	180718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_183962_184124_193584_193615_194487_194715_198830_199065_218632
789501	contig_5727_pilon	-	1070	3	Intergenic	novelGene_7967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAAGCTGGACAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180001	177929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_178132_178219_178342_179255
789502	contig_8651_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_168173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACCTCACCATTTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163833	162884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_162900_163800
789503	contig_6364_pilon	+	889	5	Intergenic	novelGene_51865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.6984250992003	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGACACAGAGTTGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485574	2489191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486060_2486530_2487476_2487586_2487738_2487843_2489125
789504	contig_2100_pilon	+	1980	4	Intergenic	novelGene_50588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	12.4721912892465	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	9	740	631446	633621	FALSE	30	ACTAATAAACTTTGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPASSTPPGEAFFPTLAPQDFWRSQVSSYSGSVTRHISHRANNFKRHPKRRKRIRPSPPPPPNTPCPIELVDFGDLHPQRSFRELLFNGCILFGIEFSYAMETAYVTPVLLQMGLPDQLYSLVWFISPILGFLLQPLLGAWSDRCTSRFGRRRPFILVLAIGALLGLSLLLNGRDIGIALADTASNHKWGILLTVCGVVLMDFSADSADNPSHAYMMDVCSPMDQDRGLNIHALLAVWKLH	631437	634861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_631843_632416_632510_632953_633179_633604
789506	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	0	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789507	SIRV6	+	462	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	550	-1	40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
789508	contig_6710_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_97945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
789509	contig_709_pilon	-	1143	7	Intergenic	novelGene_57532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_2	275.96844626394	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	11	958	1498098	1481990	FALSE	35	GTTGATTAAAAACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRSKRRAVGNGAPRPPGSQLQRDEEEEDEVEDEKEDSDEEDSDEEDDEVVDEEVNVEFEAYSISDTDYDGINKLLQQLFLKAPVNTAELTDLLIQQSHIGSVIKQTDVSEGSDDDVDVDEDEIFGFISLLNLTERKGTQCAEQIKEWILSCCDQSGEESLVEQLDKLLRDTARPVGFLLSERFINVPPQIALPMHQQLQKELAEAHKTNKPCGKCYFYLLISKTFVEAGRHSSRKKRSNQKTDGLMFANAEEEFFYEKAVLKFSYSVQDESDTCLGGRWSFDDVPMKPLRTVMLIPADKMSEIMDKLKEHLSL	1498108	1481804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1482161_1483364_1483540_1484964_1485153_1487576_1487673_1489760_1489842_1490541_1490617_1497936
789514	contig_14682_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_139130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAATATTAGAGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148961	149527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_149000_149500
789517	contig_3241_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_146385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	554	1009	739509	739964	NA	30	TCCTCAGCAACTAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTWTISWSSSNGHLVQIKTACPQMPPWFQWSQIGLEAEDTGFGKFVLWPRVGVEPRGMPLKWEASSLYLTRAQMALDFLPSRLRCHDFNNHIFFLEIIFSVLCSEALQMQPKDWKFAVRRPELGAGPHQSRKPASPLGASMFLSVKWDP	738955	741206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_739000_741200
789518	contig_9389_pilon	-	810	5	Intergenic	novelGene_83940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1	573	167411	164402	TRUE	15	CTCGATCCAGCTGCGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVLGVIDLPAQAKDLAALVGALRVTHLQGHGGVVTLVGAQLGVIDVPPGPWGCHAHLAGTLVGAHLEADGGVVHGWQDVVLGVVEVASHPVGRHARLAGTFVGAHLQPDDALARLHGGIVEVPLLPLRVFNTDVHAALQPLCLGLPRQGEKRHLHLGHVPTLKQVVGLEQVHGVHAVADHGLDEVGEVL	167411	163673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_163742_164232_164538_165813_165927_166068_166228_167246
789519	contig_6182_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_171658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTAGAAGATGAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287831	287532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_287500_287800
789522	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	35	-244	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789523	contig_19851_pilon	-	969	6	Intergenic	novelGene_29865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGGCACCATGACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56529	53532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53694_53922_53978_54059_54144_55648_55751_55838_55884_56007
789524	contig_12019_pilon	+	878	6	Intergenic	novelGene_87692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	109.702506808186	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAATTGTGTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66924	80395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_66972_72165_72275_73343_73455_74438_74529_76915_77021_79979
789526	contig_7171_pilon	-	1059	8	Intergenic	novelGene_101188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	359.293922087446	117	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	345	809	49603	37659	FALSE	5	CCCTGTGTCTCTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50438	37408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49818_50308
789527	contig_2069_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_23564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	28	336	2271757	2271449	NA	20	GACTTCAGTTTGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGWRPRPCMPAPSVPSAIPSRSSPRGSSSARSVGAGRLVGGDFSAVARGGWVPAALQPHSSGASGILGSGALASPSGDPFIQRLGHQLRKVRKKDTESCLLLSGPGRGRP	2271784	2270615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2270600_2271800
789528	contig_2069_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_23563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATCGGAAGGAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270464	2268695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2268700_2270500
789532	contig_4071_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_151899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGTTGAGCCAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360068	360582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_360100_360600
789535	contig_13722_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_174629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTGTATTCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3231	4496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_+_3200_4500
789536	contig_14322_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_116489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACGCTCACTCCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
789538	contig_6710_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_94806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653731	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
789540	contig_7234_pilon	-	1130	10	Intergenic	novelGene_145934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	118.915261872364	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	4	567	463571	411977	FALSE	30	TTAAATTGTGTCTGATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	463574	411413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523
789542	contig_17212_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_88616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110725	112738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_110700_112700
789544	contig_8671_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_126294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCTACCTTTTACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972727	973258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_972700_973300
789545	contig_12701_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_169558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGAAATTCAAGATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37711	40111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_37700_40100
789546	contig_9839_pilon	+	1204	9	Intergenic	novelGene_88564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	249.913203682799	21	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	11	1024	255906	267661	TRUE	35	TCCATAATGGAGAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVDTGAMAVLALTCVNGSIINRQPEDEKISMSINNHTELLIKKILSEKKENGLIGNIYSTGEAMQALFVSSNHYNESEWNCQQTLDTVLKEISQGAFNIPTAAAQILPALMGKTYLNVNKDSPCVYTSVSQSITLCKSMKHIPPTSPCQMGLSS	255895	269822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129_260286_261583_261772_266322_266513_267581_267705_269528_269648_269804
789552	contig_13215_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_145892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATAGTTGAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118651	117714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_117700_118700
789553	contig_935_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_45512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGATTGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19088	20893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_19100_20900
789555	contig_8453_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_125116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTTTAATTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112244	111023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_111000_112200
789557	contig_8712_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_58746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAATGTTCAATGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96222	96831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_96200_96800
789567	contig_18869_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_56278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73688	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73700
789568	contig_6710_pilon	-	255	2	Intergenic	novelGene_98324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAACCGAGTACAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657506	653661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
789569	contig_2035_pilon	+	1567	3	Intergenic	novelGene_174636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	75	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1124	1462	128771	129109	FALSE	20	ATCTCTGGTCTCTTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLLRTGDLSCLALPALPPSWKEGGEPGRSLATPVPVGRLPGWDCSLPCLKRLYRSPQVSGHGSAIGTRFQQRLKELEGALGLLQRQNGGTARRRERSHAGVFPEVTQPEG	112700	129214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2035_pilon_+_112756_124388_124533_127846
789570	contig_6412_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_149959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCTGTCGGGGTTCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234698	236455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_234700_236500
789578	contig_6589_pilon	-	503	6	Intergenic	novelGene_25867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1461.61518875523	181	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	34	501	959104	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956088_957251_957360_957758_957846_959101
789580	contig_15491_pilon	-	1422	5	Intergenic	novelGene_75957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	439.808196831301	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	15	491	46982	37437	TRUE	50	TGATGGATATAAAGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNL	46996	31484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32416_37436_37560_38887_39040_45107_45207_46879
789584	SIRV6	+	342	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	403	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
789587	contig_11370_pilon	-	1272	10	Intergenic	novelGene_98708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	5.97732340280567	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	171	1196	141239	137244	FALSE	20	CCAAGACAGTGCTCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASTGIYEALELRDGDKSRYLGKGVLKAVEHINKTLGPALLEKKLSVVDQDKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGNQDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKEAMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENHEALELLKTAIQEAGYPDKVVIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKNFIKNYPVVSIEDPFDQDDWATWTSFLKEINIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGNKAVFAGHKFRNPKAK	141676	137167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_137314_137393_137453_137600_137710_138143_138346_138541_138740_138842_139066_140673_140808_141208_141279_141439_141499_141604
789588	contig_9535_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_124461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197042	195132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_195100_197000
789595	contig_2867_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_135265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTTGGCCTCTACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293087	1292847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1292800_1293100
789596	contig_2867_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_135264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGCAAAGGGACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292741	1291113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1291100_1292700
789599	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
789600	contig_366_pilon	-	2505	2	Intergenic	novelGene_51623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	188	1762	1343260	1341686	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKGNKKRRQFSLEEKMKVVEAVDSGRRKGDVAKEFGITPSTLSTFLKDRTKFEEKVREASVGPQRKRMRNALYDDIDKAVFAWFQEIHAKNILVTGSVIRKKALNLANMLGYDSFQASVGWLNRFRDRHGITLKAVCRDNSDRLMNGLGIDKVNEWHAGEIIKLIADYRPDDIFNADETGVFFQLLPQHTLAAKGDCCKGGKKAKQRLTALFCCNASGTEKMRPLIVGRSASPRCLRNIHSLPCDYRANQWAWMTQDLFNEWLMQVDARMKQAERRILLLIDNCSAHNMLPRLERIQVGYLPSNCTAVLQPLNLGIIHTIKVLYRSHLLKHILLQLSSSQDQEKVDIKQAMDMIAAAWWSVKQSTVVKCWQRAGIISMECTDSDVEEAANEPDIVIEKLWHSVAIATCVPNEVHFQDFVTADDDLIISQELMDTEVIQGMVSGENTDEAGSEDEGEVSLPEQPKITITEAITSVQKLRQFISTCVGVPDAVFGQLNGIDEYLMRRVTQTLADSKITDFLQTK	1346837	1340942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1343344_1346733
789601	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	158	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789602	contig_12270_pilon	-	347	2	Intergenic	novelGene_114027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	27	347	14409	13866	FALSE	20	TACTGTCAGTATGGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14435	13865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
789603	contig_6069_pilon	+	1547	9	Intergenic	novelGene_8080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	90.8246077613331	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	20	1441	560908	566722	FALSE	25	TTTCCTAGAGCAGTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGQWFRPKKGTMGAMDLGGASTQITFETASPAEDPASEVQLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQVLRRLLASVIQTRRFHPCWPKGYAAQVLLQDVYGSPCTAAQRPRTFNSNTSISVSGSGDPALCRSLVMGLFDASSCSFTHCSFNDVFQPRLAEHFIAFSAFFYTVDFLRTVMKLRVETLQELEAATMTVCNQTWNELQTRAPEEMSRLPHYCAGAMFVWQLMSYGYGFDEPAFRGVTFRKKVRAGGRPRLLLKASTTSPLPGVRGLQTPQPVCGGPQPVTVLQGVGFLF	560888	566828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563677_563761_563990_564439_564695_564775_564896_565907_566061_566593
789604	contig_2817_pilon	+	1579	15	Intergenic	novelGene_104334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.7231694011537	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1248	331	1578	265498	282376	FALSE	55	AAGTGGGAAAATTAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCTSSVQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMCRPTLCQLLIDKGADINSRDKQNRTALMLGCEYGCKDAVEVLIKNGADVSFLDALGNDSFYYARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRHLTHMQEEVNRKSNQREHQSFQDLEIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEKEKLKSLLAAKEKQHEESLRTVEALRNRLKFSESDHLASGSHFSNRKEEMLLKQGQMYMTDSQCTSTGMPVHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRSFCDSTKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAATGNSRLTEELKEQLKDMKAKYEGTSA	191550	282377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_191667_253093_253183_261105_261171_261967_262026_265495_265567_265666_265774_266805_266988_268559_268598_271269_271339_272893_273002_274655_274689_275372_275472_278941_278979_280049_280103_281923
789605	contig_504_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_54413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAACCAGATACAAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137231	138042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_137200_138000
789606	contig_12586_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_121792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20317	18480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_18500_20300
789608	contig_6589_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_26323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2419666	2419951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2419700_2420000
789611	contig_5954_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_28568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAAGGCTCTGGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862132	862934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862100_862900
789616	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	82	486	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789617	contig_10324_pilon	-	1507	6	Intergenic	novelGene_7923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	19.0157829184075	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	190	1173	929627	927701	FALSE	10	GGCCTAGCGTGTGCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWTALLTLVLQASLVLPLAESAAPALRFVAVGDWGGVPNAPFYTAREVASAKEIARTVQTLGADFILSLGDNFYFSGVQDVNDKRFQETFEDVFSARSLHNVPWYVLAGNHDHLGNVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKVPRTNVSLAIFMLDTVTLCGNSDDFLSQQPERPRDLMLARTQLSWLKKQLAAAKEDYVLIAGHYPVWSIAEHGPTRCLVKQLQPLLATYGVIAYLCGHDHNLQYLQDEKGVGYVLSGAGNFMDPSKRHQRKVPNGYLRFHYGVEDSLGGFAYIEISPKEMSVTFIEASGKSLFKTSLPRRPRP	931609	927366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_927944_928538_928885_929014_929143_929360_929628_929916_930004_931507
789620	contig_348_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_67601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCGGTGTACAACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314469	314972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314500_315000
789621	contig_11816_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_98580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAGACTACATATTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334935	1334193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1334200_1334900
789622	contig_9901_pilon	-	2260	6	Intergenic	novelGene_126937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	127.069115051613	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAAGTCCTTGGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198663	176354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_177916_178113_178343_184551_184678_185862_185998_197326_197519_198646
789623	contig_2703_pilon	-	1328	7	Intergenic	novelGene_101777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAATGTTGATCCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610213	596371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_596399_602058_602152_603415_603515_605150_605220_606090_606159_607652_607730_609318
789625	contig_5918_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_99575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAGAAAGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1818469	1820488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1818500_1820500
789627	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	893	-23	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
789630	contig_18419_pilon	-	1379	2	Intergenic	novelGene_141467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATCAATAAAGAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30426	28663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29684_30067
789631	contig_5954_pilon	-	1884	13	Intergenic	novelGene_28717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224.140007708476	1	98	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	66	1052	975610	967095	TRUE	45	CCCTTCAATAAAACAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVNELKEKGNKALSAGNIDDALQCYSEAIKLDPQNHVLYSNRSAAYAKKGDYQKAYEDGCKTVDLKPDWGKKGYSRKAAALEFLNRFEEAKRTYEEGLKHEANNAQLKEGLQNMEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDVFQGTTPRL	975675	962124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963152_963385_963490_963688_963726_966990_967124_968042_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971328_972040_972251_975601
789632	SIRV5	+	403	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	893	23	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTCCTCGTAGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
789635	contig_11364_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_65186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGCTGCCAGACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226805	227484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_226800_227500
789640	contig_12969_pilon	+	1773	6	Intergenic	novelGene_61693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	13.499629624549	35	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	304	1650	586087	594778	FALSE	35	ATACCTTTAGAATCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPDSIFKLEQRETPWIVEGAIHSQSSPEKIWAIDHMQQHPENQNELKSLERCLQSFALGDNFGLSKNLVPSTQRHNMVDSHCGNLKPHLDFVTQNRRDARNDSDKFSDYGKSSVRLKHDKASSGIKYHGCVKPSNTKSQLNNHQKTSTEEKPHECSECGKVFSRKSLLLIHQRIHTGEKPCVCSECGKAFTWKSRLKRHQQSHTGEKLYRCNECGKSFSQKAYLIVHQRLHTGEKPYECSECGRSFVFKSDLTKHQRIHTGERPYKCSECEKAFRSKSELIQHQRTHTRERLYGCSECGKDFTHMSFLIKHKETHAKEKAINSVKVRKPSGRHSSLYMCQLIQEQNPMNTVPLEMLSSGTQPLNICELQGGKNVVIVEQPFQEVRPQYIIGNFHRE	580141	594901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_580323_584902_584955_586016_586102_590444_590572_590858_590955_593669
789641	SIRV6	+	559	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789643	contig_3789_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_79836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCAGTGGCTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377798	376234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_376200_377800
789645	contig_11285_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_5744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTGATTCGAAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195553	1194671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1194700_1195600
789646	scaffold_12510_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_151385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTTATTCTTGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291290	290579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_290600_291300
789650	contig_10159_pilon	-	1345	3	Intergenic	novelGene_30908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	2	176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056822	1046685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1047711_1050916_1051092_1056677
789651	contig_6738_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_166134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATCCACAATCAATGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50732	51773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_50700_51800
789657	contig_16322_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_87566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180772	182887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_180800_182900
789660	contig_5649_pilon	-	1575	6	Intergenic	novelGene_82337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	19.8957281847134	92	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTTGGATTTTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570585	561373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_562447_563694_563779_564659_564766_568260_568315_569543_569641_570424
789661	contig_10354_pilon	+	1028	4	Intergenic	novelGene_50842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	381.479866950916	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	335	817	432976	475314	FALSE	45	CAGAATCAGAGAAACTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMKRLIPVPLGTWPNIQDGLEAFTRFLKTEFSEENIEFWIACEEFKKSKEPQQITLKAKAIYEKFIQTDAPQEVNLDFHTKEITTKNITQPTLHSFDAAQSRVYQLMEQDSYTRFLKSDIYLDLIEGRPQRPTNLRRRSRSLTYNEFQDVKSDVSIWL	432198	475525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432489_432931_433034_471873_472041_475056
789663	contig_4364_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_2694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532953	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
789664	contig_8920_pilon	-	2439	6	Intergenic	novelGene_146051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	25.2792404949199	62	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	177	1811	23830	13629	FALSE	40	TTAGCACAAAGTATTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEPQLQMSVPVVKLEKELPWGKGREDTSPETFRLRFRQFRYQEAAGPQEALRELQELCHQWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHCPESSKALVAMMEDMTERALEAKAVPCHFQGEQDETALCRGPWEPGVHLGPVEVKPEWGLPHGEGVQGLGQSTEEQLNQNPGDGTQAFQEQALPVLHAGPGLPSVNTRDQEMAAGFLTAGSQGLGPFKDMALAFPEEEWRHVTPAQIDCFGEYVEPEDCGVSSPGIGSKEKEAKTQQEDLKGPLAGLTSERFGEAVLQSPELGRTCDQEPSSSVGHMPGLPAPQHGVIPKPDDLKTHSSFWKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHEEEKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEVHQRSHTGEKPFKCTDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEKPYTCECGKSFSRNANLAVHRRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQDTPGAVKAPC	26060	13000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_14477_19942_20070_21373_21466_22065_22268_23464_23881_25934
789669	SIRV6	+	276	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
789672	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	27	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
789674	contig_8106_pilon	+	2973	1	Intergenic	novelGene_139740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1037	1336	125554	125853	NA	20	TATTCTTTTTTGGGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDYNGMKLEISNRERSGKLKNLCKLNTLLNNQWVNTYEKLRDAADAVLRGRLIAVNTYIKKERSQVNNLTFHLWTLEKEEQTKPKTSKWKEIIKIRE	124517	127490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_124500_127500
789675	contig_7704_pilon	-	1379	10	Intergenic	novelGene_154604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	182.573644873703	682	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	424	1323	230301	216744	FALSE	0	GGCTCCTGCTGGGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGKDEEGVPQPPGPPQRKKFIIPLDEDEVPPAGAKLLFKSTRSLPTVETPAQVAPQTYAEYAISGPPGGAAVTCPSPTGPDPPAGETPNQAPKPGAKSNSIIVSPRQRGNPVLKFVRNVPWEFGDVLPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHQRLQSLGKNFALRVLLVQVDVKDPQQALKELAKMCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	231224	216687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_228371_228594_230196_230309_230808
789676	contig_12142_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_147788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	436	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGTGGTGTACGGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15606	16328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_15600_16300
789677	contig_5005_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_84308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTCGCCCTGTTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510112	510591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_510100_510600
789678	contig_8628_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_164446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCTTACTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672159	670069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_670100_672200
789680	SIRV4	+	333	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGCACAAACTGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
789683	contig_16411_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_77378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATTAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337832	338432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_337800_338400
789684	contig_15036_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_107150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95034	93809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_93800_95000
789685	SIRV2	-	169	1	NIC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	920	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3812	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV2_-_3600_3800
789686	contig_7426_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_27562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAACAAAAAAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184914	1182744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1182700_1184900
789687	contig_14441_pilon	+	998	4	Intergenic	novelGene_100439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.107647738325	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	90	386	82151	116621	TRUE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEDAVVTQFPRHRVLGKGKELTLECSQKMNHLVMYWYRQVPGHGLQLIYYSTGTGSIEDGDVTEGYSVSRDKTQNFPLTLASTSPSQTAVYLCASSEGTGSHLRPGVQADGCRQPDQGEPAQGGRV	82061	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82365_112113_112154_116578_116963_117525
789688	contig_12866_pilon	+	1460	2	Intergenic	novelGene_174653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTTGGGAATACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685527	687744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_685806_686562
789689	contig_13349_pilon	-	2589	2	Intergenic	novelGene_161122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTTCGATCGAGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28484	25104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_25392_26182
789690	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789691	contig_5463_pilon	-	2181	1	Intergenic	novelGene_144772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18631	16450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_16400_18600
789696	contig_7202_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_16391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTCTTGGCGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
789699	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	0	406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	541	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789702	contig_9133_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_109304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCCAGCTACTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273205	274359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_273200_274400
789706	contig_1008_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_121587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACCAGAGGGTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697728	699227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_697700_699200
789710	contig_5039_pilon	-	1499	4	Intergenic	novelGene_65003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAGGCCCACGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706661	1703004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1703243_1703621_1703728_1704331_1704535_1705709
789712	contig_5092_pilon	-	731	8	Intergenic	novelGene_62262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	633.407500132805	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	173	628	252711	210983	TRUE	10	GCTAGCTGCAGGCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRALVILAKGAEEMETVIPVDVMRRAGIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGSFAQKGLYYSTLGSL	254065	209521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_209604_210961_211030_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252621_252780_253961
789713	contig_2069_pilon	-	1202	5	Intergenic	novelGene_23439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	962.154223604511	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTTGGCTTGGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331430	1327111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327966_1328529_1328637_1329861_1329892_1330155_1330201_1331264
789714	contig_6027_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_74450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCAAATGAGCAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274786	274109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_274100_274800
789716	contig_960_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_108216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	470	802	295873	295541	NA	75	TTAAAAAAAGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGRGLLRDWSSGNSLLLNMQMSYWPRRRFPKTRHFYSHYWFLFGCLSKVLKNGFSIIQTKLVTLSSYCNTSPTTVISIFYDTLAFRIGLKILPGSNKYASICSQLDAS	296342	294248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_294200_296300
789725	contig_9828_pilon	-	2514	12	Intergenic	novelGene_172257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_11	94.3440161771257	146	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	189	1763	242525	220693	FALSE	35	AAGACAGAATTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSFLVLAIGACLTNSLVPEKEKDPNYWRVQAQETLKTALELQNLNTNVAKNIIMFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHKPGEETILEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVGVSAATERSQCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSDNEMPPEAVSQGCKDIAYQLMHNIKDIEVIMGGGRKYMFPKNRTDVEYEMDEKARGTRLDGLNLINIWKSFKPRHKHSHYVWNRTELLALDPHAVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNTTDPSLSEMVRVAIKILKKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEVVEMDQAIGQAGTMTSVEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMVSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAIFSKGPMAHLLHGVHEQNYIPHVMAYAACIGANHNHCALDNSVGSPSPGPLLLLLALLPVSILF	290778	219941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_220959_221886_222007_222538_222731_225008_225144_227756_227827_230196_230341_233853_234030_235028_235204_236911_237028_237305_237426_242464_242620_290684
789726	contig_6710_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_97073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
789727	contig_4989_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_160786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	52	537	98434	97949	NA	20	GAGTAGCAGGGGTAGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTGYNSGSGTLRIQFFYQDSLFSAVLAGIPLSGPSASALLGQVLQSSFSSSSKCPEAPHSASDPPAQKHSAFSLHKPGSPMRCLLLVSPAGVSPTASHRLQYYSSFLVPWFQELLSTGISGPKDTLHSWLFFSVAVRSSLCSGIGSLLSLAGWQN	98485	97531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_97500_98500
789732	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789734	contig_15777_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_75760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGTTAATGCACTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273494	273966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_273500_274000
789735	contig_15021_pilon	-	2199	2	Intergenic	novelGene_26982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACGTTCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338770	336301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_336506_336775
789736	contig_19076_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_74200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGATAAAAAAAGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81242	80081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_80100_81200
789737	contig_15476_pilon	-	159	2	Intergenic	novelGene_174654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTATTCCTCCAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86772	34478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15476_pilon_-_34553_86687
789744	contig_2933_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_111333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGTGTATATTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668398	667210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_667200_668400
789745	contig_11017_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_128069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTAGAACGGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233391	232313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_232300_233400
789748	contig_5696_pilon	+	1563	15	Intergenic	novelGene_117531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	52.8085201072551	176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	67	1203	635115	652960	FALSE	30	TATTTATGATTTATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGQSGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLNMAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLVKTVKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTILARETGGMYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSNSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDSSTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLQEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCSVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGI	632370	653320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638908_638964_641895_642002_643311_643403_643580_643669_644176_644285_645344_645409_647462_647567_648142_648246_651345_651386_652840
789752	contig_15500_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_128990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATATCTCCTGCATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230964	233549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_231000_233500
789754	contig_5549_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_81710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGCTACCAGTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915658	914170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_914200_915700
789757	contig_12229_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_169385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	153	542	694	77013	76861	NA	50	GTATAAATATGAACGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSTCSSTTLPASVTPSLPAAPTCQGVPGDKHLPRLIISNFLKAKQKPGGTANLQQKKSQARLAPEIVSASQYRKFDEFQTGILIYELLHQPNPFEVRAQLREQDYRQEDLPPLPALSLYSPGLQQLAHLLLEADPIKRIRIGEAKRVLQCLLWGPRRELVEQPGSPEEVLRGTLQNWIDMKRALMMMKFAEKAVDRRRGVELEDWLCCQYLASAEPGALLQTLKLLQLL	77554	76717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_-_76700_77600
789758	contig_2703_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_101797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGCCCCCCACTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615906	615142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_615100_615900
789759	contig_13305_pilon	+	1344	7	Intergenic	novelGene_146766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	52.7680985276353	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	37	1035	50285	66734	FALSE	15	CAAGGCCAGTTCTGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAAACRSRLPVMARPLLLLLLLAHTCLPVSWGLRCMLCETNGHCRVGECPLGENLCRTTVLRIWEVGEEELEKVERGCAHPEKTNRTMSYRTGSQIITLTEAICASDLCNKPKPGRIFTFPQRHYLECASCASSDMSCERGRGHSLQCRNPGEQCLEVVTHRSLESSLKDERHSRGCGYLPGCPDPTGFHNNYTFHFLRCCNTTECNGGPILTLKNLTLNGFQCYSCEGNSTDRCSAEETSLISCRGPMTQCLEATGSNGLGKPRYTVRGCATPSWCQGLHVAETFSLTNVSVSCCSGNGCNHPARDAQARAGGAPGPGPTHLSLTITLLMTARLWGGTLLFT	50248	67043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_50337_52161_52273_53577_53725_62014_62168_63408_63544_65432_65580_66480
789761	contig_11106_pilon	-	2060	6	Intergenic	novelGene_167452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	158.388888499162	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	185	940	161983	134374	FALSE	35	ATTTTATCTAAAGCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVPCVEPAPELTGFTLLMPAVSVGNVGQLAIDLIISTLNMFKVGYFYTDCLVPMVGNNPYATTEENSTELSINTEVYSLPSRKLVALQLRSIFIKYKSKSFCEKLLSWVKNSNCARVIVLSSSHSYHRSDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNWEEMEKSQCIPGIEDSEFCVRIPGGGITKALHEESCCREIPMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQIIKPCVSFFIVTIVLLLFNPLI	162167	133253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_134549_151410_151585_152477_152597_155942_156002_159246_159419_161926
789762	contig_11572_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_100078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAAAGTTGAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381694	383323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_381700_383300
789763	contig_12837_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_57403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCTATGGCTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453933	456271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_453900_456300
789767	contig_11832_pilon	-	790	3	Intergenic	novelGene_106909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.5	673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	39	422	74306	72712	FALSE	20	GATTAGACTTTTCATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGKILWRPPRVIMATCSLANERLRALEDIEREIGAILQNAGSGCYDRTARSNVILELSKEKTNERLLDRQAAAFTASVQHVEAELSAQIRYLTQVATGQPHEGSSYSSRKDCQMALKRVDYARLKLTDVARTCEQMLEN	74344	72343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_72850_73874_74006_74191
789768	contig_14577_pilon	-	971	7	Intergenic	novelGene_164646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	306.118032791275	1956	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	234	920	127106	72950	FALSE	30	CACCCTCTAAACTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFTPTPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPVRVFVCKPLL	127339	72898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
789769	contig_3095_pilon	+	1101	4	Intergenic	novelGene_75143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_2	1046.09570414098	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	62	685	149709	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149647	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150696_150996_151163_151848
789771	contig_9706_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_21038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638573	635977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_636000_638600
789774	contig_9345_pilon	-	1084	9	Intergenic	novelGene_24513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	224.170937846546	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	20	670	670245	667708	TRUE	65	AATAAAAATTTGAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITDTGRMGSRLMGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNGDCLPICSFIPQQCWPVDGPRQQLCTKYQNTHGALVSQSSLMEEYKMWAILPKPWPLGPPQS	670264	667035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667977_669110_669206_669289_669490_669566_669655_670161
789777	contig_6017_pilon	-	1754	2	Intergenic	novelGene_152547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4630	junction_1	0	19	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTTTAATATACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442548	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_442225_442457
789782	contig_9297_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_69862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873404	873798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_873400_873800
789786	contig_6102_pilon	-	274	2	Intergenic	novelGene_31809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACCACTACAGACACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361138	360143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_360203_360923
789789	contig_16098_pilon	-	1386	7	Intergenic	novelGene_45848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	498	junction_1	125.348070942033	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	204	1304	212862	201500	FALSE	25	GTTGCTACAGTTCCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	213065	201417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685
789790	contig_1372_pilon	+	3490	1	Intergenic	novelGene_140509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGAATATTCCTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420078	423568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_420100_423600
789791	contig_2069_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_23229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATAAGTGGCAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250695	249756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_249800_250700
789793	contig_15732_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_88901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGCCCCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251161	250790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_250800_251200
789794	contig_5482_pilon	-	1665	3	Intergenic	novelGene_144481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_2	18	62	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTACTCCTGTTGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497978	492689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_494178_497265_497370_497905
789796	contig_8160_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_136397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGCTCGAACATGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9773	7993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_-_8000_9800
789800	contig_2646_pilon	+	1638	9	Intergenic	novelGene_69523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	355.967848793961	2	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	233	790	566553	573396	FALSE	30	GAACACCACACCTGGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGSESSAFSEAVTEPPEDSRRSRSKSRSRSESRSRSRRSSRRHYTRSRSRSRSHRRSRSRSYSRDYRRRHSHSHSPMSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPMAAHAVEITMTEDMTEAMMIGTTTADHTEEAAEVEEDGELLKTGIRFTEGAHLLPTTVVEDTDHVPDLGRTLLY	554033	574244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554086_565339_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569722_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573390
789803	contig_9389_pilon	+	1622	4	Intergenic	novelGene_84104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	104.550891382565	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATATTTGGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390447	1425349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1398390_1398531_1408698_1408798_1424004
789805	contig_6533_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_114644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGACCAATCACTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112076	110679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_110700_112100
789806	contig_13941_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_174662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	6.59545297913646	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	16	843	96510	124593	FALSE	30	TGCATAAGGCAAATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSKERKSQGEPKEAVVKQDTTSLTDAVEQVAKQQQSQTSEIEKNKKVLFHLQNELHELEKQIASVSAETKEIGRQIYQQDAAIENTKLQCRSLETQVISLHTENVKLKFDIEAAQEDFEEHMIRYNAYYAKIKAHKDSLEEIESKWSFMIELNEKRDLVKKLMTMKEELTRDLRNPEGNRIKQVQEDITKLSNTIITIKESIVEKTCVLEKEKKIHEKLRKEIEVQHKRYDAILKRLHCQVKKRQSNRRQWQWNIQQLEKTAAELRQRIGMQK	96494	125242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13941_pilon_+_96556_97052_97169_101012_101412_102184_102302_124443
789807	contig_8907_pilon	+	2570	5	Intergenic	novelGene_85791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_4	80.5710090541257	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	492	1361	88680	106640	FALSE	35	TTAAGAAACTATGTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPEIFYCKVTGQKENCPEGFLASKAIPHFEKISCFQQTLDPVDEVAALLAATIHDVDHPGRTNSFLCNAGSELAILYNDTAVLESHHAALGFQLTIRDDKCNIFKNMERNDYRMLRQGIIDMVLATEMTKHFEHVNKFVNSINKPLALLEENRETDKDQEAINTMLRTPENRILIKRMLIKCADVSNPCRPLEFCIEWAARISEEYFSQTDEEKRKGLPVVMPVFDRNTCSIPKSQISFIDYFITDMFDSWDAFVDLPDLMQNLDNNFKYWRGLDEMKLRSLRPPPQ	88188	107849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_89012_90860_90994_95958_96127_103602_103733_106533
789809	contig_2209_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_140997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAATCCCCAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110332	107994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_108000_110300
789810	contig_1301_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_47384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGGTTAGTCAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700810	698852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_698900_700800
789813	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
789814	contig_4654_pilon	+	1902	7	Intergenic	novelGene_103059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_1	144.120320103262	389	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	78	1022	444670	458173	FALSE	10	TGTCCGTTGTACTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKSPDSVEGLRAAGNQSFRNGQYTEASALYGRALRVLQARVSTRAGSSDPEEESVLYSNRAACHLKNGNCSDCIKDCTSALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPKETTTTKNKVPSAGDVERAKVLKEEGNEFVKKGNHKKAIEKYSESLSFSHLESATYTNRALCYLALKQYKEAVKDCTDALKLDGKNVKAFYRRAQAYKALKDYKSSLADISSLLQIEPKNGPAQKLQQEVNQSLK	444592	459053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_444797_449177_449293_450644_450798_453119_453290_456226_456375_457717_457845_458068
789815	contig_6496_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_103472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATTACATATGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242745	242249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_242200_242700
789816	contig_11855_pilon	-	1992	5	Intergenic	novelGene_67002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	16.5283846760656	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1402	1893	1318284	1316223	FALSE	0	CTGTTGTCTTTGGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELNKPGELWIRGYCVMLGYWGEPQKTEEVVGQDKWYRTGDIAVMDKEGFCKIVGRSKDMIIRGGENIYPAELEDFFHKHPQVQEVQVVGVKDERMGEEICACIRLKSGENATAEEIKAYCKGKISHFKIPRYIVFVNKYPLTISGKIQKFKLREEMEQHLKL	1319685	1316123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1316274_1316566_1316636_1316837_1316949_1317037_1317180_1318165
789820	contig_16126_pilon	-	1685	6	Intergenic	novelGene_141887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	65.9466451004143	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	32	853	106789	81799	FALSE	65	AAAAAGAAATAAGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAGRAGSETMNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKTKIAKCPLKTKQTGHILKSTQNTCVRSEKHLQKKRIGSETSLAKGEKNKTTFSPTKDLCKQYEDNDCLHIQKGISPATPNMPKTRNTITTSAAKQKPCRNHIAAENMKSNLVCLTQDQLQQILMTVNQGNRPISLTENGTEETSQYSLHFNNIPNQPEDENVMGLLQKTEAVSSVSDENKSVLNKKQETSKQLEQKIATETVWKPADIFSTLGERERDRSLLEAKKAQWRKELGR	106820	80966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_81911_82095_82262_95666_96109_103829_103856_104569_104635_106778
789821	contig_10734_pilon	+	963	6	Intergenic	novelGene_51189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	430.168339141783	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	361	759	1129441	1132787	FALSE	40	AAATAACTCTGAAGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSR	1123705	1132991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609
789825	contig_10734_pilon	+	2531	5	Intergenic	novelGene_51226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	265.427367654505	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	210	1310	1243300	1262670	FALSE	70	ATAAAAAAAAATTAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLVSLPLLTMCLLLPGREECTLPIHLLCFKKY	1198710	1263891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354
789827	contig_3942_pilon	+	608	5	Intergenic	novelGene_128652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	31	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGGGGCCCAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176961	180118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
789828	contig_5918_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_99488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAGGAAGAACAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188366	188615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_188400_188600
789829	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8128	2	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
789831	contig_7733_pilon	-	2226	4	Intergenic	novelGene_147124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	29.4089933334837	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	63	1130	59410	42472	FALSE	30	ACAAGTTTGTTGGTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQLAPRRVAGAAGRRWLALLPLMLLARPAGALLEGLYCGTRDCYEVLGVSRTASKAEIARAYRQLARRYHPDRYRPEPGDEGAGRTPQSAEEAFLLVATAYETLKDEDTRKDYDYLLDHPEEYYSHYYHYYSRRLAPKVDVRVVILVSVCAISVFQFFSWWNSYNKAISYLATVPKYRIQATEIAKQQGLLKKAKEKGRNKKSKEEIRDEEENIIKNIIKSKIDIKGGYQKPQIRDLLLFQIILAPFHLCSYIVWYCRWIYNFNIKGKEYGEEERLYIIRKSMKMSKSQFDSLEDHQKETFLKRELWIKENYEVYRQEQEEELKKKLANDPRWKRYRRWMKNEGPGRLTFVDD	59472	41375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_42595_44273_44745_47194_47348_59089
789833	contig_6871_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_21632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	43.0945343273238	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	470	1288	663492	656751	FALSE	35	ATATTAATTTGTTTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKRAKKETVDPTYVWIGPNENKLTGNNRINITNTGKLMVKDFLESLSGPYTCTFSYKSVKAETQEEKTVKKTYEFIMFAYREPDYSYQMAVRFTTKSCVGRYNDLLFRVLKKILDNLISDLTCHVIEPSYKCHLVKIPKHGLIHELFIAFQVNPFAPGWKAACNQSVDCEDNTNRNILQARDRIEEFFRSQAYIFYHDLNKTLPAMHFIDHSFQVVRMDSCRPGFGKNEAMHSNCASCCVVCSPGTFSPDIDVTCQTCVSIHIYGAKSCP	665133	656364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_656846_657398_657580_660195_660279_660817_661037_662595_662758_663413_663540_664711
789835	contig_15304_pilon	-	957	3	Intergenic	novelGene_30576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1400	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	189	335	54100	53777	TRUE	25	ACCCACCCACGTCAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGFQAAPLYATQA	54288	52982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53989
789836	contig_9999_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_174669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTCTGTGACACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247746	246903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_-_246900_247700
789839	contig_12689_pilon	+	1725	4	Intergenic	novelGene_145059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	71.6534871602368	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	86	1279	291739	329486	FALSE	85	AAAAAGAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSCRLHASPGASDAEVVTLVATQSRKQMSRDICVHTWPCSYYLEPEKQWVPGELSLTSLSLKFIADKTGKILVSFPLSSIIEIKKEASHFIFRSITILEKDHVKHWFSSLQPSRNAVFNIIEHFWRELLLCQPGATVQASSSPMTKGKELTGLMACSQKRLEDTAKVLHHQGEQFDNIMEGLDKIESDLDVADRLLTQLESPSWWPFSSKLWKTPSETKPAEGASASGSEALGKEGIVIKIPAVISQRTESHAKPGKLIVLVSGLEVRDSDSLLMHRFEREDVDDIKVRTPYEVSIRQRFIGKPDITYHLISAKMPEVIPILEVQFSKKIEFLEDALMLRSTRASSPAEKGCSTWHAAPGLMDRVRPREPSGSPGGQSQLQMSEPFISEEEAHELTQVTSVHRATPVPMRLSVFPCSRSFLSTA	272685	329932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_272727_291694_292239_318845_319337_329283
789841	contig_91_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_127125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722064	720221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_720200_722100
789842	contig_10990_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_7482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716455	714799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_714800_716500
789843	contig_990_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_76160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAACACTCAAGATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879252	1880728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1879300_1880700
789845	contig_1964_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_130921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAATGGCGTCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342213	343443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_342200_343400
789846	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
789848	contig_8660_pilon	-	960	5	Intergenic	novelGene_136490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	485.657479608829	24	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	TRUE	20	TTTTCTCCTGGGACCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	292191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_292580_292941_292978_308477_308731_310288_310437_315231
789851	contig_2463_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_43037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTGTGCCCAGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559119	561388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_559100_561400
789853	contig_8161_pilon	+	1597	8	Intergenic	novelGene_156757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	24	junction_2	59.5109319403432	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	175	942	267245	316833	FALSE	20	GTGCTAACAACTTGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTCGGPVHPVLRARSLLWILQAEAPAAAGGRWVGQREARRARAPCAWSKREAARGRDAMSMEDPFFVVKGEVQKAVNTAQGLFQRWTELLQDPSTATREEIDWTTNELRNNLRSIEWDLEDLDETISIVEANPRKFNLDATELSIRKAFITSTRQVVRDMKDQMSTSSVQALAERKNRQALLGESGGQNWNTGTTDKYGRLDRELQLANSHFIEEQQAQQQLIVEQQDEQLELVSGSIGVLKNMSQRIGGELEEQAVMLDDFSHELESTQSRLDNVMKKLAKVSHMTSDRRQWCAIAILFAVLLVVLVLFFVL	267070	317488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_267280_286414_286585_288559_288655_297515_297579_306897_307024_308259_308367_312463_312559_316756
789854	contig_15720_pilon	-	1021	2	Intergenic	novelGene_41878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3875	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	202	600	279917	278921	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGINMWKRSHCPDSPSLSAQDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQVSGSSQVDSASTISALGVIYQSQNHCL	280118	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_279116_279713
789855	contig_13093_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_105229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTTCTAGAGCTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70631	70268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_70300_70600
789856	contig_7333_pilon	-	1453	9	Intergenic	novelGene_142784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGGAAGCCACAGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237566	218380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_218552_218730_218790_219132_219218_221831_221915_222678_222771_223592_223675_224011_224319_230327_230429_237093
789859	SIRV1	-	240	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	2	3588	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
789862	contig_4364_pilon	-	2953	1	Intergenic	novelGene_223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1885	2280	1398557	1398162	NA	10	CGGTGTGGAGGAGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLQPSVSAQPSPLTCWRLFWAWPATSSDLLGLPCTQFLVTCSVRAQACAWWLPHSPRLRLWQSLHPAWQELQVRPPEARASPATAPKAQVTHLEVERVSHGQLLTRDRQGKGKSPGRCSSPHLPPWVDF	1400441	1397488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1397500_1400400
789864	SIRV6	+	243	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8459	7	280	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
789870	contig_1867_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_54593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGCAGGAAAAAATGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505966	504725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_504700_506000
789885	contig_3233_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_56594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1050	1400	792718	792368	NA	80	AGATATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVFQLIYKFDLKADSGTDLVCNLGTACISRESIFLGWFVTLRNEWPSLCRILSQVISYMIDLPSSSTCRLSSAGELSPGSVTCGHSSRLVSCIVCGTDCSIYKKNLLEIVSSEDN	793767	791918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_791900_793800
789886	SIRV2	-	435	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4434	38	3259	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
789889	contig_4180_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_8431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAAACAAAAAGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159494	1159176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_1159200_1159500
789891	contig_3584_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_108140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340322	338629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_338600_340300
789892	contig_16525_pilon	-	697	3	Intergenic	novelGene_133845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_2	798	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	191	415	181180	178378	FALSE	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRARGGRGLGEAGGQGLGSTWELGPETHAAPLSASRFPQKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKCKPEWVLPVGGVEEQL	181370	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178476_178588_178686_181150
789895	contig_753_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_113043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCCTTCCCACCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496877	1498236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1496900_1498200
789898	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	57	518	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
789899	SIRV6	+	400	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	20	363	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
789900	contig_13571_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_128131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTCAAATGCATCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332274	332807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_332300_332800
789901	contig_2550_pilon	+	2243	1	Intergenic	novelGene_135700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1669196	1671439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1669200_1671400
789902	contig_9578_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_67990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGATTTAGGGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1198827	1197006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1197000_1198800
789903	contig_12340_pilon	-	1795	6	Intergenic	novelGene_122098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	72.4690278670826	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	4	564	42866	5458	TRUE	25	GTCTTTTACTGACTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAGAPEGLVFVSPPDEEMATGADDPASVPAAPREDFRVLCTSKRAVTEVLELCGRFVQQLGDALPEKIREPALRDAQWTFESAVQENVSINGGAWQEASENCSMDSDIKVLEDQFDEIIVDIAMKRKQYPRKILECVIKTIKAKQEILKQYQPVVHPLDLKYDPNPGDLSYGKFEMQRGNSNSGDQ	42869	2919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447_5516_23808_23868_26700_26832_32416_32496_42632
789905	contig_4780_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_65400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAGAAATACAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356818	356006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_356000_356800
789907	contig_8671_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_126240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCACTAATTAAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191155	189814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_189800_191200
789912	contig_7333_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_142751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAATGTACATTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73295	70992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_71000_73300
789913	contig_15120_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_108005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161579	160180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_160200_161600
789914	contig_987_pilon	+	2078	5	Intergenic	novelGene_72343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440.215501203672	5	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	270	1148	1286769	1295595	TRUE	85	AAGAAAAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKRQGVCKLRGNLNPTVAERWDGALPLQCLRALPQNEWTEPTPH	1286499	1305130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1287010_1289450_1289959_1295465_1295612_1300073_1300200_1304342
789915	contig_14703_pilon	-	1973	6	Intergenic	novelGene_174672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	7.4027022093287	36	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	29	913	109406	29594	FALSE	70	CTTAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDLICIQSMDGMLMVFEQESYAFGRFLPGSLLPGPLAYSSRTDSFITVSSCRQVESYKYQVLAFATDADKRQETEQQKLGSGKRLVVDWTLNIGEQALDIRIVSFNQSASSVFVLGERNFYCLKDNGQIRFMKKLDCSPSCFLPYCSVSEGTINTLIGNHNNMLHIYQDVTLKWATQLPHIPVAVKVGCLHDLKGVIVTLSDDGHLQCSYLGTDPSLFQAPKVESRELNYDELDIELKELQKIIRDVNKTQGVWPMTEREDDLTVSAMVSPNFDSESVGVFADVKGVYDSSRLLLTGITVLF	109434	28533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14703_pilon_-_29749_34947_35130_94845_94976_95615_95800_99653_99739_109257
789916	contig_8263_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_83081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCACCTGTTTCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129316	128502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_128500_129300
789919	contig_15104_pilon	+	1749	11	Intergenic	novelGene_163364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.7749887488726	87	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	1204	1749	946672	961101	FALSE	25	AGGGGCTCCCTTCCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLWSSTPPAVAKLGDSLAEENSRDENRALVHQLSNESRLSVTDSLSEFFDAQEVLLSPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQTLGPVLESGREVKSKRRTCLPAPCPNTSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIPNPLERMV	791867	961101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_792177_894656_894897_921582_921700_921851_921906_923006_923121_927555_927724_928346_928471_946594_946735_953526_953662_954761_954856_960847
789920	contig_9484_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_105672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAACAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147270	148283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_147300_148300
789922	contig_15732_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_88863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAGTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85816	86344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_85800_86300
789923	contig_8161_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_156783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTAGACGCTCAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524488	523144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_523100_524500
789925	SIRV6	-	392	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-148	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGGCGTCTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2826_3104_3164_10723_10818_11031_11109_11205
789926	contig_7909_pilon	+	2139	11	Intergenic	novelGene_155904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_4	150.556833122911	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	123	1712	444983	517918	FALSE	30	GTTTAGCTAAATACGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVWPTLLDLSRDECKRILRKLELEAYAGVISALRAQGDLTKEKKDLLGELSKVLSISTERHRAEVRRAVNDERLTTIAHKMNLSLYLGERPSYSMSGPNSSSEWSIEGRRLVPLMPRLVPQTAFTVTANAVANAAIQHNASLPVPAETGSKEGVSCSDEDEKPRKRRRTNSSSSSPVVLKEVPKAVVPVSKTITVPVSGSPKMSNIMQSIANSLPPHMSPVKITFTKPSTQTTNTTTQKVIIVTTSPSSTFVPNILSKSHNYAAVTKLVPTSVIASTTQKPPVVITASQSSLVSSSSSGSSSSTPSPIPNTVAVTAVVSSTPSVVMSTVAQGVSTSAIKMASTRLPSPKSLVSAPTQILAQFPKQHQQSPKQQLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGRYI	442990	518345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_443074_444943_445053_451521_451622_453110_453186_454741_454784_458393_458570_462225_462486_496264_496542_511061_511317_516141_516292_517733
789931	contig_10346_pilon	-	1938	9	Intergenic	novelGene_161217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	198.290151986931	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	70	1341	277815	261973	FALSE	25	CTCACCTCGTTTCAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVRCLRGGSRGAEAVHYIGSRLGRNLTGWVQRTFQSTQAATASPQNSCAADDKATNPLPKDCPVSSYNEWDPLEEVIVGRAENACVPPFTVEVKANTYEKYWPFYQKHGGHYFPKEHLQKAVAEIEEMCNILKLEGVTVRRPDPIDWSLKYKTPDFESTGLYGAMPRDILLVVGNEIIEAPMAWRARFFEYRAYRSIIKDYFQRGAKWTTAPKPTMADKLYDQDYPIDSVADRHKLAAQGKFVTTEFEPCFDAADFIRAGRDIFVQRSQVTNYLGIEWMRRHLAPDYRVHVISFTDPNPMHIDATFNIIGPGLVLSNPDRPCHQIDLFKKAGWNIVIPPLPVIPDDHPLWMSSKWLSMNVLMLDEKRVMVDANEVPIQKMFEKLGISTVKVNIRHANSLGGGFHCWTCDVRRRGTLQSYFD	277884	261375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10346_pilon_-_262086_265066_265184_265633_265698_266924_267090_267229_267368_268345_268537_269329_269526_275714_275934_277746
789934	contig_13854_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_154112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGATAAAAATAAAATCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6292	7903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_6300_7900
789938	SIRV6	+	152	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-341	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1944	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
789939	contig_3077_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_26812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470337	472807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_470300_472800
789946	contig_299_pilon	+	2984	2	Intergenic	novelGene_129519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	685	junction_1	0	1	137	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGTTACACTGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725117	1729173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1725155_1726226
789947	contig_6958_pilon	-	2013	2	Intergenic	novelGene_69999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734092	730475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_731589_733192
789948	contig_10627_pilon	+	1965	11	Intergenic	novelGene_59943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	346.645005733531	2	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	70	1104	163279	166905	FALSE	20	TAAATCCTTTTGTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPILKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	163088	167766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_163125_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165906_166186_166259_166411_166535_166672_166775_166851
789950	contig_2100_pilon	-	1692	8	Intergenic	novelGene_50622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	50	junction_7	243.93818219929	163	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	658	1641	960877	822177	FALSE	40	TACCACATACTATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTADKDKDKDKEKDRDRDRDRERDKRDKAREGENSRPRRSCTLEGGAKNYAESDHSEDEDNDNNSATTEESTKKNKKKPPKKKSRYERTDTGEITSYITEDDVVYKPGDCVYIESRRPNTPYFICSIQDFKLVHNSQACCRSPTPALCDPPACSLPVASQPPQHLSEAGRGPVGSKRDHLLMNVKWYYRQSEVPDSVYQHLVQDRHNENDSGRELVITDPVIKNRELFISDYVDTYHAAALRGKCNISHFSDIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNSTQGEIRVGPSHQVKQILVASLIGFHFLLFWLTSIMLNSILELLLLL	1132394	822125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_822331_847790_847896_868566_868664_870263_870370_918244_918371_927444_927516_960552_961022_1131881
789951	contig_11538_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_152283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAACCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124854	125940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_124900_125900
789952	contig_4213_pilon	-	1404	2	Intergenic	novelGene_124826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_1	0	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166026	161430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_162697_165888
789957	contig_1406_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_25667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2817957	2819549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2818000_2819500
789958	contig_3832_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_161461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCATAAAACAAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348614	348961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_348600_349000
789960	contig_9995_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_47800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGGAATTTTTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810843	810579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_810600_810800
789962	contig_11929_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_171232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGCAAAATACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48980	50001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_49000_50000
789963	contig_8921_pilon	+	2359	3	Intergenic	novelGene_161631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	9	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	230	1612	211227	217517	FALSE	35	ATTGTTTAAATTACCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATLRDLAQGSVTFEDVAMYFSQEEWGLLDEAQRHLYHDVMLDNFGLISSLGWCGAENAEAPSEQSVSVGIVSQAGTPKSGPSTQNVHLCETCVPVMKEILYLADPPGIYRGQKLYTCGACGKHFWLSTDLHHHQKEHIGEKPFSKNMDTASFVNSYRLHVSEKPFICGVVGKDFPTDVSLFQPHSTPRGAKLHSGTDCGEAFHNGKTHYKCGECGKTFSRKRTLVQHQRVHTGEGLYECSECGKPFSYKHTLVQHQRIHTGERPYECSECGKAFWLKYKLVQHQRIHTGEKPYECSECRKAFGCKSKLVQHQRIHTGARPYECGDCGKCFRQSSSLVQHRRIHTGARPYECGECGKCFSQSSILIQHRRIHTGARPYECNECGKCFRQSSSLIQHQRVHTGARPYGCSECGKSFRQRFSLILHQRIHTGERPYECSECGKCFSQNFVLIKHQKLHTK	210997	218264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_211260_214869_214997_216294
789965	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_93469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653735	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
789966	contig_7961_pilon	+	596	2	Intergenic	novelGene_173122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTCTTCTCTCCGCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166792	168133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7961_pilon_+_166893_167637
789968	contig_10753_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_105164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGAGACACCCCGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437448	436800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_436800_437400
789969	contig_10753_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_105163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAATACAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436194	435554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_435600_436200
789970	contig_14575_pilon	+	2009	2	Intergenic	novelGene_101899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAACTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43374	47680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_45006_47302
789976	contig_20374_pilon	-	1238	10	Intergenic	novelGene_166016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_9	73.4626805398412	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	64	1167	23124	5081	FALSE	60	AAAATTTGGAATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPARAATSDLPPGWLGWICVSMAGHLPRGAMLVVARLTRSWRPRYARSPMQISNFPVLQMHKSQTAMRASQKDFESAVNQMKLLTKDPGNEMKLKLYALYKQATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLRDFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDIVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYMFPKIMGSAKAAEMLIFGKKLTAREACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAYSKLPPNVSIQCLLIGTMEIIS	23187	5009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_5273_6728_6819_8068_8190_8942_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_20713_20877_22691_22739_23091
789978	SIRV6	+	341	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	531	-1	-40	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
789981	contig_12622_pilon	+	2128	5	Intergenic	novelGene_5866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	159.494514012238	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1281	1601	1188156	1188476	FALSE	20	CCAGGGCTTTCACTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDFHRTTSFPEREAAAQKCCLRRKIDIWSWKFLSEMQTSALPIVLCSDLSSCSTFSHLRDTGGLLYHREQCALQSLCCNGGREEKGRGGRDGQALTPWPGTGTGL	1169928	1189003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1169960_1184171_1184307_1184595_1185179_1185536_1185611_1187698
789983	contig_3601_pilon	-	1835	2	Intergenic	novelGene_132865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	0	116	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAAACTTTTCTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147244	144029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_145838_147217
789985	SIRV4	-	322	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1201	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3957	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
789988	SIRV4	-	413	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1110	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4048	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
789994	contig_11216_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_173598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACAGAACGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144485	143009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_-_143000_144500
789995	contig_5640_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_27266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCCCTTGTGGTGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871021	870530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_870500_871000
789998	contig_6654_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_85746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAGTTTCTGCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504517	503291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_503300_504500
790002	SIRV6	+	332	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	20	-244	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790003	contig_9471_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_21719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTCAGAAAGAGCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132949	135690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_132900_135700
790004	contig_9415_pilon	+	1611	6	Intergenic	novelGene_109764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_5	64.6993044784872	269	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	185	1366	1571528	1589104	FALSE	45	AAAAATATGTATTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSKRFAKAIKNSRDLLHRIKDEVGAPGIVVGVSVDGKEVWSEGLGYADVENRVPCKPETVMRIASISKSLTMVALAKLWEAGKLDLDIPVQYYVPEFPEKEYEGEKVSVTTRLLISHLSGIRHYEKDMKKVKEEKAYKALKMMKETMEFDQEKQLREKGGKSNEKNDFAKAQIEQDNEAKGRNSKPGKKKNDFEQGELYLKEKFENSIESLRLFKNDPLFFKPGSQFLYSTFGYTLLAAIVERASGCKYLDYMQKIFHDLDMLTTVQEENEPVIYNRARFYVYNKNRRLVNTPYVDNSYKWAGGGFLSTVGDLLKFGNAMLYGYQVGLFKNSNENLLPGYLKPETMVMIWTPVPNTEMSWDKEGKYAMAWGVVEKKQTYGSCRKQRHYASHTGGAVGASSVLLVLPEELDGDATNNKVPPRGIVVSIICNMQSVGLNSTALKIALEFDKDRSD	1567062	1589349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1567127_1567537_1567605_1571474_1571666_1571983_1572336_1573508_1573675_1588578
790007	contig_9940_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_125355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATGGCACAGGACGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248720	248005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_248000_248700
790008	contig_5690_pilon	+	2701	16	Intergenic	novelGene_119687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_13	31.7121778221273	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	403	2076	363313	436979	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQSVESIAEVFRCFICMEKLRDARLCPHCSKLCCFSCIRRWLTEQRAQCPHCRAPLQLRELVNCRWAEEVTQQLDTLQLCSLTKHEENEKDKCENHHEKLSVFCWTCKKCICHQCALWGGMHGGHTFKPLAEIYEQHVTKVNEEVAKLRRRLMELISLVQEVERNVEAVRNAKDERVREIRNAVEMMIARLDTQLKNKLITLMGQKTSLTQETELLESLLQEVEHQLRSCSKSELISKSSEILMMFQQVHRKPMASFVTTPVPPDFTSELVPSYDSATFVLENFSTLRQRADPVYSPPLQVSGLCWRLKVYPDGNGVVRGYYLSVFLELSAGLPETSKYEYRVEMVHQSCNDPTKNIIREFASDFEVGECWGYNRFFRLDLLANEGYLNRQNDTVILRFQVRSPTFFQKCRDQHWYITQLEAAQTSYIQQINNLKERLTIELSRTQKSRDLSPPDNHLSPQNDDGPETRAKKSGSSSDMLLEGGPTPASVREAKDDEEDEEKIQNEDYHHELSDGDLDLDLVGEDEVNHLDGSSSSASSTATSNTEENDIDEETM	362910	437604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_363334_365061_365164_376459_376501_377967_378085_380327_380416_382610_382734_385008_385133_386192_386261_391585_391711_412515_412567_413678_413761_424259_424337_433029_433210_434443_434559_435687_435907_436838
790009	contig_2069_pilon	+	501	3	Intergenic	novelGene_23546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCCGCCGCGCTCGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508594	1509871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508806_1508937_1509111_1509754
790018	contig_15426_pilon	+	2456	2	Intergenic	novelGene_174674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTTAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74569	94528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15426_pilon_+_75061_92563
790019	contig_10481_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_170527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	817	1119	61810	61508	NA	35	CTTAATAATGTAACATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCVCVCVSIAFYYYPLPWSQFQLTVTLQDRVELPHRVSKLKATSFSCEMASEFDLLTFQLAVKHLTTMLPVPFYFFLDEANLVICFNLMFNLVFYLLK	62626	61498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_-_61500_62600
790021	contig_9940_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_125354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAGTTGTAGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246131	244056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_244100_246100
790022	contig_2596_pilon	-	1238	7	Intergenic	novelGene_53519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.26058530567	110	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	35	637	1120571	1054771	FALSE	15	GGTCTTATTGTAGGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPGRASQIQIAMGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAAF	1120605	1054169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1054778_1054968_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
790023	contig_1406_pilon	-	1465	2	Intergenic	novelGene_25564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	114	320	2159494	2159288	TRUE	25	TGACCGCTGTGTGGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPLSRQEFPFIAARDLQQLGSGLRASGSRAPFPPSAMAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDAGECRWCAQAPPSPFLAAVTRRGEAPMGAHFRSSP	2159607	2156893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2157142_2158390
790027	contig_11326_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_173911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACATGTTTGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30531	30961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_30500_31000
790032	contig_14441_pilon	+	1103	5	Intergenic	novelGene_100544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	625.542714368891	2	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	531	878	116876	117560	FALSE	10	CTTGGCGCTGCCTACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQTVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMKKES	111196	117785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_112103_112154_116578_116963_117097_117344_117545
790036	contig_5649_pilon	-	1657	8	Intergenic	novelGene_82365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	66.2413644737708	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	389	727	1057385	1056259	FALSE	15	CTTCATGCGTCATCGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFFYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN	1064334	1055328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
790040	contig_998_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_153785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAGTGCCAGTGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317743	319007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_317700_319000
790044	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
790045	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1184	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
790047	contig_3529_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_105361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATTTAGGTTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550696	551887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_550700_551900
790048	contig_9840_pilon	-	1993	5	Intergenic	novelGene_173760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.104322138927	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	506	910	106999	99227	FALSE	40	GCCTAATATTGAAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSRTLPKIPFTSLAPRVETTTLKIQDKIPAQTKSPEEVNKENVHMSDSERKMDPAEEDTNVYTEKHSDNLFKRKEVLAAVIAGGVIGFLFAIFLILLLVYRMRKKDEGSYDLGERKPSSAAYQKAPTKEFYA	230473	98143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9840_pilon_-_99391_101039_101176_106894_107029_115203_115282_230075
790052	contig_7707_pilon	+	1569	4	Intergenic	novelGene_72175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	497	junction_2	115.316954521007	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	75	605	531589	575897	FALSE	30	ATTCATCCTTTGAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKGGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQEPIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFNIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLFSNTVYFKHTIHEAFWIHRLF	531514	576861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531644_542837_542969_553915_554043_575679
790054	contig_12427_pilon	+	1517	10	Intergenic	novelGene_40500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	260.18402793996	1	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	42	869	404919	417596	TRUE	20	TCTGAAATTTGTCTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGESEPVRSTLCSGCRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVL	404877	420254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_404967_407156_407253_410177_410437_412452_412585_413035_413053_414538_414711_415809_415908_417590_417711_417961_418061_419819
790060	contig_6919_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_163969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10200	11011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_10200_11000
790061	contig_5302_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_81459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATGAAAAAGAAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207923	205692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_205700_207900
790064	contig_5047_pilon	-	2033	13	Intergenic	novelGene_157977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	60.1461183748008	77	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	127	1683	1132145	703648	FALSE	10	GCCACGTGCCGCGCTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDGARKQFWKRSNSKVPGSIQHVYGAQHSPFDPLLHGTLLKSTPKLPSTPLKAKRGSTFQEFESNTSDAWDAGEDDDELLAMAAESLNSEVVMETAHRVLRNHSQRQEQHRLQEAMLPEERPQPWAQAPPVPGGDPWLVKSVSESHTPRPTESGSEAGPLQRSQSLPHSSTVALSGGVSDHSALGSSALSEREASRLDKFKQLLAGPNTDLEELRKLSWSGIPKPVRPITWKLLSGYLPANVDRRPATLQRKQKEYFAFVEQYYDSRNDEVHQDTYRQIHIDIPRMSPEALTLQPKVTEIFERILFIWAIRHPASGYVQGINDLVTPFFVVFICEHIDGEDVDTVDVSRVPADVLCDIEADTYWCMSRLLDGIQDNYTFAQPGIQMKVRMLEELVSRIDEPVHRHLEQHEVKYLQFAFRWMNNLLMRELPLRCAVRLWDTYQSEPEGFSHFHLYVCAAFLVRWRKEILEERDFQELLLFLQSLPTATWGDEDISLLLAEAYRLKFAFADAPNHYKK	1132271	703297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_703777_751773_751870_811762_811891_862509_862586_895330_895441_959374_959490_989613_989677_994731_994861_1006798_1006870_1091793_1091974_1095665_1096007_1097090_1097148_1132083
790067	contig_7051_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_64321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGCGCACTAAACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229832	231143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_229800_231100
790068	contig_12540_pilon	+	1154	2	Intergenic	novelGene_148084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	243	560	941479	942014	FALSE	20	TTGTTAGCTGCCATCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDMEESVSCLSIGVLDIFGFEDFERNSFEQFCINYANEQLQYYFNQHIFKLEQVRKHDLGTYLAPGEMECSATGKSLRAHW	941236	942608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_941575_941792
790072	contig_8330_pilon	+	1643	7	Intergenic	novelGene_71767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	283.741323900642	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1118	1435	657181	658351	FALSE	15	AAGTGTTTCTTACTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	650810	658559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_651599_653909_654005_656357_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
790078	contig_10451_pilon	+	870	5	Intergenic	novelGene_138291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	74.1396486368799	422	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	302	616	64467	83904	FALSE	30	TAATTGTTTGTTTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRALFGYHSCFKVKNFAVIYLVDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEMIDIIETVYRGARKGRGLVVSPKDYSTKYRY	60700	84158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_60798_61219_61393_64435_64506_80280_80385_83732
790080	contig_13055_pilon	+	1400	4	Intergenic	novelGene_104956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	668	976	98742	103257	FALSE	40	GTCATCAGTACACAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRDCDGCAILRYHCDGIANGLHVSLRYVDMLSSILGYKCNLLTQPRLGYCGYLCRHNILSFYTCNIRDLGPFKNIFTLTCLKQMNHLFDQPTKLFRNQMVF	87924	103681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_+_88371_89894_90040_98665_98830_103036
790081	contig_9727_pilon	+	778	7	Intergenic	novelGene_86309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	277.148826846195	117	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	46	777	309192	314662	FALSE	10	GACTGACTTGTCCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTNVNSRGSRRGHFRDCLTPPHPSSSVLRRGWKMKAVGLLEATQSLFWVREALTKWGFLIKIETNT	308420	314663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078_314177_314469
790082	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_96241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	501	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
790090	contig_6434_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_61874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTCGTGACAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857719	858620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_857700_858600
790093	contig_10753_pilon	+	1232	2	Intergenic	novelGene_105142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	744	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	15	326	307751	308148	FALSE	20	TAATGGGTTTTGGGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTCDGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWLVT	307736	309054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_307835_307920
790095	contig_10064_pilon	+	1467	8	Intergenic	novelGene_122708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	63.5269507326438	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	701	1261	268353	273630	FALSE	15	TTGACAGTTCTGCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCPDQKCLYTCQIKDGGLQPQFEIVPEDNPQNAIVSSSADVCHEELLKTIRASAGRLTPSLLPSGADFFGFSHPTIHNLIQSCPGARKCVNYQWVKFDVCKPGDGQLPQGLPENDAALSFEAFQRQTFEDQNDPILPGSLDLPELQPAAFVSSYPPMFLTHEPLVETHLQHLKSPVQCSPTRSSD	264409	273836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_264725_266181_266253_267020_267254_268271_268419_271806_271905_272159_272271_272657_272798_273484
790097	contig_15118_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_74602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	775	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGACAAACTTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388880	388312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_388300_388900
790099	contig_19851_pilon	+	869	6	Intergenic	novelGene_29872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3332.68572775772	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	30	299	53637	55737	TRUE	15	CTTTGATTTAATTGTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAELLQDTALLVLPCTILHMTHGLASFCILRTSL	53607	56520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54118_55641_55753_55840_55882_56006
790101	contig_4336_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_152358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTATGATTTCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338858	338465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_338500_338900
790102	contig_9945_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_104795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGAGCAACCGTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5132	5986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_5100_6000
790103	contig_9945_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_104796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTATTTTGTAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5986	7058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_6000_7100
790105	SIRV4	-	319	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	3	1199	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
790107	contig_5758_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_119134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAGGAAATTGCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631387	631831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_631400_631800
790109	SIRV6	+	466	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	-1	76	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1690_1831
790112	contig_5549_pilon	-	1160	10	Intergenic	novelGene_81650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	755.770557644626	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCTGGAAAAGTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445634	441971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442936_443118_443145_443324_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
790115	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790117	SIRV2	-	270	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	50	3412	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
790119	contig_20612_pilon	+	2627	9	Intergenic	novelGene_174677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	73	junction_1	47.710061831861	50	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	128	1465	35730	60998	FALSE	25	TTTCTTGTGTAAATGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEESGIETTPPGTPPPNPAGLAATAMSSTPLPLAATSSFSSPNVSSLQSLPPHAYSTPQPSLPPVKPSAPLSFVPPSPVPSVPPLVTSVPPPVSLSTATVFSSPPISHFPPSTSAPNTLLSAPPSSPPTSGFSVGSTYDITRGHAGRAPQTPLLPSFSAPAVTGILPGPITQQASLTSLPQGTGTTSAITFPEEQEDPRIGGGQDEASTGGIWGFIKGVAGNPMVKSVLDKTKHSVESMITTLDPGMAPYIKSGGELDIVVTSNKEVKVAAVRDAFQEVFGLAVVVGEAGQSNIAPQPVGYAAGLKGAQERIDSLRRSGVIHEKQTAVSVENFIAELLPDRWFDIGCLIVEDPVHGIHLETFTQATPVPLEFVRQAQSLTPQDYNLRWSGLLVTVGEVLEKSLLNISRTDWHLAFTGMSRRQMIYSAAKALAGMYKQRLPPRTV	31134	62160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20612_pilon_+_31240_35707_35833_36461_36852_38834_38996_43142_43246_45553_45718_50395_50500_56442_56546_60788
790120	contig_14333_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_49120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTCCTCAGCCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394768	394455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_394500_394800
790121	SIRV6	-	215	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTCGACTCGTTCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
790125	contig_10734_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_51310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAGGGGAAAAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376663	1375782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1375800_1376700
790128	SIRV4	-	251	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	363	3	-363	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAAGCGGCCCCAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790130	contig_6740_pilon	+	1073	5	Intergenic	novelGene_142641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	53.6772763839597	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAAATAGTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10143	46955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_10227_11303_11447_19527_19605_44182_44288_46290
790131	contig_11304_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_156686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAACTGCAGACCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276828	275311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_275300_276800
790132	contig_6102_pilon	+	588	7	Intergenic	novelGene_31972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1364.20400071087	173	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	33	386	413086	415290	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEAFVRHILSG	413053	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414262_414613_414788_414877_414956_415261_415307_416018
790138	contig_9807_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_32901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCCTAGAAGATAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117403	118000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_117400_118000
790140	contig_5479_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_133564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAATTAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82852	81270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_81300_82900
790143	SIRV4	-	453	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1060	8	1060	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4098	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
790144	contig_9505_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_121812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	72	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	85	348	361358	364410	FALSE	35	CATTAACAAGTACCTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSWAPGGAAEQPDAGTHHRLRPRLAAAMYDPERGWSLSFVGCGFLGFYHVGVTRCLSERAPYLLRDARMFFSCSAGSLHCAFFLAGIPLDRTLQLLMDLVRTVRSYKLGILHPSF	361273	364412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_361545_364333
790145	contig_8341_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_160243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCTGCAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22511	21386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8341_pilon_-_21400_22500
790146	contig_4103_pilon	-	1389	7	Intergenic	novelGene_51874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	278.981928924916	1752	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	8	496	45573	40734	FALSE	5	GCCTGTTTCACGTTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKMASGSGTKNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKNY	45580	39840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40741_40851_40878_41783_41930_42374_42449_43898_44023_45129_45224_45555
790147	contig_5881_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_129032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	709	1035	255297	255623	NA	35	AACATTTTCCGATATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCEQSPASYVFGISRLLPLVLWVFSACRLLGCGEEADAGRLLNERLVGLFSHYQSCCKVPFLALHWRCPSPQMQDEYSPDQSLSSCKSSQDPRGPRPLVTMCLPAGT	254588	255822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_254600_255800
790148	contig_4156_pilon	-	1736	6	Intergenic	novelGene_88103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_4	52.1743231867937	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	72	908	433791	313887	FALSE	70	CTGTAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVSFLLIQFS	433862	313058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550
790149	contig_10753_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_105165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGTGAACCTCAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437603	438519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_437600_438500
790150	contig_10341_pilon	+	715	4	Intergenic	novelGene_47218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	537.341811347509	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	55	363	63271	64998	FALSE	40	TCAATAAAGGTCATATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVGRIHRHLKSRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGVIPHIHKSLIGKKGQQKTV	63216	65350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_64039_64154_64484_64615_64936
790157	contig_13481_pilon	+	2382	8	Intergenic	novelGene_119402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	304.049539465166	10	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	89	1417	613420	634531	TRUE	20	TTTACTACGGAACTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGVKEGRERPRGARTADKAGWIKKSGGGLLSLWKDRYLLLCHAQLLVYENEDEQKCVETVELGSYEKCQDLRALLKRKHRFILLRSPGNKVSDIKFQAPSGEEKESWIKALNEGINRGKNKILDEVKVDKSCALEHVTRDRVRGGQRRRPPTRVHLKEVASAASDGLSRLDLDVLDSGPPVFTPSDDGSVAQPQEKFQPLMPPTKTSSAPETPSVGDRVETSAGERASTPTSASTETHAESQEDSETPSGEGRGPEQPRNGIMPDKLKMSWENPSPEEPLAPESTGAPQLHCSETSEAAPKESRKPPTPPPKIISEKLRASMSGMEPSGLAQSPGVPDISAPGPAQVSVNGIDDNSEPTKLSKATAAPGIHQKDAAMSTALPVWDLPPQFHPRCSSLGDLLGEGPQRPRQPRERLYRAELEVRVASEQTEQLLNKALALW	613331	635625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_613429_620292_620443_624607_624725_628959_629065_630645_630745_632842_633674_634513_634649_634777
790164	contig_9366_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_166263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGGCCAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025619	1023599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1023600_1025600
790166	contig_7758_pilon	-	2179	1	Intergenic	novelGene_163539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161840	159661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_159700_161800
790167	contig_13216_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_47498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTTTCTATGTTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241047	240619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_240600_241000
790169	contig_2550_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_135669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGTAGCCATCGAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222065	1223968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1222100_1224000
790174	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
790175	SIRV6	-	458	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-279	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2099	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1522_1631_1735_1844
790177	contig_5816_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_158248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATGAATTAGAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222496	220995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_221000_222500
790178	contig_7045_pilon	+	2008	6	Intergenic	novelGene_77445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	334.0045508672	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTCCAAAGCTTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323180	365717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364699_364922
790179	contig_10013_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_125051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	393	872	238026	237547	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEDSDIGSGPQGTACTETGPSGRKGERHKGRKRRAEFSLWAQPARDAPRTPCFRSPGVVKNMSGVRIPIESENIYLGTIHMQKQLEHTVNVRWESTNVTWWLVCCCDAGSYATGISANENPMDRHRTLLDIALEDEPHRLEGTQNTQWPQPRTRARQ	238418	236225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_236200_238400
790182	contig_8907_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_85792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACACTATAAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99677	100632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_99700_100600
790184	contig_2069_pilon	+	1262	9	Intergenic	novelGene_23284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	375.921347325474	2	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	352	1044	341106	347326	FALSE	30	ATACACATTTACTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTGTWNGSTKVAVKMLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPAEKEKKTLRSYNTCPG	335656	347544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341204_341292_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_347276
790185	contig_16882_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_148247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCTTATATGAGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491896	494915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_491900_494900
790187	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	53	498	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
790190	contig_5018_pilon	+	1082	4	Intergenic	novelGene_47158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_2	281.53073643131	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	63	491	1498209	1499336	TRUE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRQKALLGALTRSGSQLSVMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRYCGALSRALGDSSPG	1498146	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1498555_1499164_1499588_1500185
790193	contig_3018_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_78789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441255	440057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_440100_441300
790194	contig_16103_pilon	-	2172	1	Intergenic	novelGene_118767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAACTCCAAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463476	461304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_461300_463500
790196	contig_14219_pilon	-	1258	9	Intergenic	novelGene_54377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1026.05134343999	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	456	1178	1072280	1047262	FALSE	30	CTTGAAAATACAGTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLLNLNHLGLILLVLHYFVEFLFHISRLFYFSDEKYQKGFSLWAVLFVLGRLLTLILSVLTVGFGLARAENQKFDLSAGNFNVLAVRIAVLASICITQAFMMWKFINFQLRRWREHSAAQAPAVKKKPTVTKGRSSRKGTENGVNGTVTSNGADSPRNRKDKSS	1084431	1047181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057774_1057846_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077375_1084276
790197	contig_6958_pilon	+	1756	15	Intergenic	novelGene_69915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	80.0469568823353	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	109	690	99742	129826	TRUE	25	CCCAAGTATTAATTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRAALLLGLALGTGAFLLDDPEDGGKHWVVITAGSNGWYNYRHQGIPDEQIIVMMYDDIANCSDNPTPGVVINRPNGTDVYKGVLKDYTGEDVTPQNFLAVLRGDAEAVKGKGTGRVLKSGPRDHVFVYFTDHGAPGILAFPSDDLSVKDLNETIRYMYKHKKYQKMVFYIEACESGSMMKHLPNDINVLL	89779	138860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_89859_99712_99880_121614_121674_122965_123048_124493_124580_126347_126424_127155_127219_127879_127947_129815_129891_129976_130067_132013_132215_135036_135190_138007_138076_138286_138623_138706
790198	contig_18272_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_7098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGCGTTTTTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540649	541703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_540600_541700
790199	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_95379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
790204	contig_5210_pilon	+	2197	8	Intergenic	novelGene_65473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	124.119428991038	2	135	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	72	698	807530	812511	TRUE	20	CTTAGAGTGTATGTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISALTDLGGLDPVWLFVVVGGVMSVLGFAGCIGALRENTFLLKFFSVFLGLIFFLELATGILAFVFKDWIRDQLNLFINSNVKAYRDDIDLQNLIDFAQEYWSCCGARGPNDWNLNIYFNCTDLNPSRERCGVPFSCCVRDPAEDVLNTQCGYDVRLKLELEQQGFIHTKGCVGQFEKWLQDNLIIVAGVFVGIALLQIFGICLAQNLVSDITAVKANWIKRDDGYKLLK	807458	814067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_807596_808816_808988_810095_810222_811047_811096_811638_811756_811831_811894_812474_812736_812792
790207	SIRV4	-	522	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	97	-2	97	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	907	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5061	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790211	contig_8978_pilon	-	2562	9	Intergenic	novelGene_49364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	16.4088390814219	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	105	1277	306531	302321	FALSE	10	GTCTTTTACCTTCTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KASSDLCDLVSNQSAEGLLEDCDLFGPARDDVLAMAVKMANVLDEPGQDLEADFPKNPLDINPSVDFLFDCGLVGPEDVSTEQDLPRTMRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYANGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCLGIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQLGVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAPVRQRKGRDTGPGKRKREDEAPVLEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYLQPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD	306818	301035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_302514_302624_302743_303567_303823_304345_304461_305048_305201_305515_305685_305997_306102_306464_306612_306794
790213	contig_6127_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_157053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCGTGTATGATGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243476	245400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_+_243500_245400
790214	contig_1725_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_24297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCACCATTTTTCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212549	211638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_211600_212500
790220	contig_6710_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_96611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790224	contig_5247_pilon	+	544	2	Intergenic	novelGene_81812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	802	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160554	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_160731_161186
790225	contig_7992_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_115549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAGGGAAAGAGTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625460	624206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_624200_625500
790226	contig_7992_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_115548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624204	622802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_622800_624200
790228	contig_9673_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_119174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAACAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149357	150231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_149400_150200
790233	SIRV4	-	306	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1217	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
790236	contig_12786_pilon	-	1109	7	Intergenic	novelGene_103421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	569.839158593604	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	408	1052	602829	590909	FALSE	25	CAGAATCTCCTTTTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLHLPEGRRPSRAQPFFARPVREPSESCHFLSPWVFVAGVAARIWRSGSKRSPRSVLQIRTDLLVSLLRPLQPAAHSPLRPRVRIRSGGGSEEGGQGRRSSAPRESSPVPLEGELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629494	590851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602896_628787_628938_629303
790241	contig_10863_pilon	-	2271	2	Intergenic	novelGene_59331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTGCTTAAACATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76488	73611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_73784_74389
790247	SIRV6	+	327	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	530	14	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
790249	contig_15631_pilon	-	1399	8	Intergenic	novelGene_151535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	8.8132553229641	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	364	1095	363465	361631	FALSE	45	TTATATATTTTAACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPWSDVTLPLLSVPEIRAVVDAWASVTEELGAQYPWVQIFENKGAMMGCSNPHPHCQVWASSFLPDIAQREERSQRAYQNQNGGPLLMEYGRQELHRKERLVLTSEHWLVLVPFWAVWPFQTLLLPRRHVRRLPELTPAERDGAPTGSEAEADWDHWQLHAHYYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAQAQRDLTPEQVRTWSIQSPLFSPTSSRDPNNHDPENLHNILGIPRDSGTAQPLYPW	364632	361326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_361927_362432_362566_362856_362980_363136_363194_363342_363473_363595_363645_364034_364205_364495
790250	contig_12125_pilon	+	1774	7	Intergenic	novelGene_76198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_2	98.0606388358188	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	747	1028	1774	67320	79777	FALSE	30	TTATTGGTAATTGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSSSAENESLEVSDTRFHSFSFFELKSVTNNFDERPLSAGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNRTVAVKKLAAMVDISTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQ	66292	79777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_67375_67884_68046_69243_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720
790252	contig_17440_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_7637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCATTCTATTTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3473	3764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_3800
790253	contig_17144_pilon	-	1796	7	Intergenic	novelGene_29158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	238.806348789604	3	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1365	1781	160376	157620	FALSE	20	TTTCTTTCTGCCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLPKHQRVVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	163884	157604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_160348_160598_161422_161508_162014_162064_162875
790254	SIRV4	-	507	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	99	11	99	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTACTTAAGAACATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5059	3648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790255	contig_8554_pilon	+	646	5	Intergenic	novelGene_160273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_1	37.3363094051889	4264	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	69	320	40200	43470	FALSE	15	TCTTTTTGTTAGATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRRHRPRASPPPGLTFYTAVIMSFFQLLMKKKELIPLVLITSVAAGGASSFALYSLRKTDVIVDRKRNPEPWEAVDPSVPQKLITINQQWRPIEELQSARKASR	39993	43796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40036_40173_40236_40399_40486_41396_41458_43401
790258	contig_12402_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_133343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCACATTAATTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209405	210252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_209400_210300
790260	contig_15518_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_127625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAAGGCACAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33238	34101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_33200_34100
790261	contig_13888_pilon	+	1002	7	Intergenic	novelGene_151784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	604.445751632573	2443	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	109	750	337589	359495	TRUE	25	TCATATATGGCTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVVWANSYKVGCAVQFCPKVSGFETLSAGAHFICNYGPAGNYPTWPYKKGATCSACHKNDMCLDKLCGDMFLCP	337480	361986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_355083_355197_358600_358687_359472_359544_361679_361707_361809
790262	contig_3832_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_161502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	353	1062	136	1197	573894	574955	NA	70	ACTTAAAAAAGAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWSVTARGAHQPDNTAFTQQRLPAWQPLLSAGITLPLFFCAGLAFIGLGLGLYYTSNGIKELEYDYTGTSGTGNCSACAAAAEGRAPPPSCQCAWYFSLSEFFQGPVFLYYELSNFYQNYRRYVVSRDNAQLSGLPSALRQPINECAPYQFSAAGLPIAPCGAIANSLFNDSFSLWHQRQAGGLYVEVPLDRTGIAWWSDYHVKFRNPPLVNGSLALAFQGTAPPPNWHRPVYELSPDPNNTGFINQDFVVWMRTAALPTFRKLYARIRQGNYSAGLPPGAYRVSITYNYPVGAFGGQKRIIFSSISWMGGRNPFLGIAYLVVGSLCILMGFVMLVVYIRYQDQNDDEADEE	573758	576080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_573800_576100
790263	contig_6509_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_145657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAAATCTACCTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202545	204992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_202500_205000
790264	contig_6724_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_167978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	640	981	369957	370298	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPQSRRPPSLHSFLLVAQGLSDCSTGNTAGSTNPRSLSELPCIHQYQGTYHSGLQTFRAMSRCLTLCTMERNSAWSCAISMICCELDHCDLKAFHGLILEVDCQAFLPSPS	369317	371160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_369300_371200
790268	contig_11052_pilon	+	816	3	Intergenic	novelGene_115446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	116	547	102902	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102786	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
790272	contig_15304_pilon	-	662	2	Intergenic	novelGene_30494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	245	619	54053	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHVPSPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53284_54037
790273	contig_6710_pilon	+	493	2	Intergenic	novelGene_98004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGAGCCACAGTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653417	657171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
790276	SIRV6	+	285	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8147	-1	592	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTCTTGTGGTCGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
790278	contig_7300_pilon	-	1388	13	Intergenic	novelGene_170455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.069710073486	4	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	79	1239	504153	440577	FALSE	25	GCATTTGTAAACTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVKAAQAGKPGPAKRRLAEQFAAGEIITDMTKKEWEPSDNGPLFTELKFYQRAAKPEQIQKWIRTHKLKYLGVPKYWGSGLHDKNGKSYRFMIMDRFGSDLQKIHEANAKKFSRKTVLQLSLRILDILEYIHEHEYVHGDIKASNLLLSCKNPDQVYLVDYGLAYRYCPEGVHKEYKEDPKRCHDGTIEFTSIDAHHGVAPSRRGDLEILGYCMVQWLSGHLPWENNLKDPNYVRDSKIRYRENIPSLMDRCFPEKNKPDEIAKYLETVKLLDYTEKPLYQNLRDILLQGLKAIGSKDDGRLDLSVVENGGLKAKTVTKKRKKEVEESTESSVEDMECSSPKTEAFPPSRSEESQGAVQRSVSQPEASSSSSYDSLRTRKRVQK	551225	440427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_-_440609_443954_444030_445428_445520_464275_464455_468159_468219_468514_468636_469429_469563_474926_475020_475152_475262_481496_481585_483014_483085_504042_504159_551152
790280	contig_10674_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_6421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTGTTAGGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110038	109141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_109100_110000
790281	contig_7594_pilon	+	1155	6	Intergenic	novelGene_55433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	809.207414696628	35	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	82	465	539088	556488	TRUE	20	AAGTATACTTGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARPGWLAVLSPPWPAQTLGTPPSPSRMTSTMAAAWPLPACTSEWTLLEALTVAIVVTFYDVYIILQAFILTTAVFLGLTAYTLQSKRDFSKFGAGLFAVLWILCLSGFLKAPDLALTHLMQFWRLAGVSTNHRTFWSNWELLACFFHLCRALS	539006	557751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_539142_549197_549232_551173_551292_552953_553000_556356_556518_557090
790282	contig_4125_pilon	-	2594	2	Intergenic	novelGene_25259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	532	834	3026092	3024949	FALSE	25	GCTGCCAGTAGCACAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQVGAALSSLSWR	3026623	3023188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3025159_3025999
790283	contig_11326_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_173914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTGAAACCCACCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155269	156589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_155300_156600
790284	contig_8357_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_39757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTTCAGTAAGAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806959	804973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_805000_807000
790285	contig_6589_pilon	+	734	5	Intergenic	novelGene_25777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	1864.08617021853	323	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	151	642	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668303	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669620_669748_670000_670104_671046_671188_672584
790288	contig_10196_pilon	+	1499	11	Intergenic	novelGene_132292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	239.730035665121	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	421	1278	2364371	2374406	FALSE	0	CTGGGGTCTCGGCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2346686	2374627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2348736_2348832_2352497_2352597_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
790295	SIRV6	+	292	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8137	2	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
790302	contig_11117_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_148580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGGCGGTGGGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57535	55651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_55700_57500
790308	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
790310	contig_10331_pilon	+	1787	2	Intergenic	novelGene_54058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1183	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	904	1269	46226	52386	FALSE	65	AACAAAAGAAATATGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLGRLLVHILSPSHPSQERKQIFEIVREPNHQEILRDCLSSSLQTGAKLVLYLSELMHNHQDELSEEELDTAELLMNALKLCGHKCIPPSAATKSDLIKMIKEVSQGNHTCFLGDSVGYN	45322	52904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_46361_52155
790313	contig_8354_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_24133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCGCCAGGCCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502824	503168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_502800_503200
790320	contig_5461_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_156828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGTAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774944	776885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_774900_776900
790323	contig_9871_pilon	-	1144	3	Intergenic	novelGene_75681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	3	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	76	564	515669	510912	FALSE	25	CTTTAGAGTCTTTCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSIDDILLEANFILATLVNVPSRTSSPQSLCLSQKLKRSDLILSNSEAGKNVTNKAPECILRKVAPKRLHPTESPTKTSALENRSSPRRKRADREGSDVPESSVGKAEEAPRSPYLRKFSRMFFGAVSSGQQEHFNHPSESLVNDSQEDMNNGSFSTFNI	515744	510331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_511041_514200_514442_515550
790325	contig_3077_pilon	+	1783	3	Intergenic	novelGene_26884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42.5	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTCTCTCCATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343566	1348274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1343629_1345320_1345449_1346681
790328	contig_567_pilon	+	758	5	Intergenic	novelGene_33985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	183.152088440181	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATGCTGTCTCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442601	458816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442818_444625_444705_452579_452767_455775_455862_458626
790329	contig_3161_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_84517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATTCTATATTGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386905	387258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_386900_387300
790330	contig_8673_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_129907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTTTCTAACCAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143028	142457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_142500_143000
790336	contig_7286_pilon	-	854	7	Intergenic	novelGene_108711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4984.33013442016	4	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	55	798	293122	286948	FALSE	25	ATGATTGATTAATTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFLGTPEEAGPLSVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGKQPLERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293176	286891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288446_289236_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
790340	contig_6230_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_102112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGAAAGAATAAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166254	165316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_165300_166300
790343	contig_15208_pilon	+	1972	9	Intergenic	novelGene_174679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	43.808532273976	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	169	1263	168726	193974	FALSE	15	TCTCTATGTTGTGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELREALVAVWLQCTAISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKGNETIVNLIHNTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIVYVNEKEGGPNNHLLTNLKRLVGQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYPYDETRSGSAHEYSSCPDDVIFQSLARAYSSFNPAMSDLNRPPCRKNDDDSSFVDGTTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKSYWEDNKNALISYLEQIHRGVKGFIRDLRGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLVPGNYKLTASAPGYLAITKKVAVPYSPAVGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF	59391	194683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15208_pilon_+_59531_168696_168894_170943_171112_177917_178036_179252_179436_181499_181640_187698_187799_191808_191928_193875
790345	SIRV4	-	396	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1122	3	1122	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4036	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
790347	contig_7165_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_116834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAATTGCAGAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257148	259318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_257100_259300
790349	contig_2455_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_119189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCCAAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153490	153957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_153500_154000
790354	contig_6589_pilon	-	1181	7	Intergenic	novelGene_26199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	116.992046263363	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	207	701	2032681	2030536	TRUE	10	TTGCATGTATGTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033650	2027924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
790355	contig_6710_pilon	+	527	2	Intergenic	novelGene_97645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTGTACTCCAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653391	657508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
790357	contig_15691_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_60790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGTGGTCAAGGGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192061	192667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_192100_192700
790358	contig_5718_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_110363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTGTGGGTAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712356	712946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_712400_712900
790359	contig_6710_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_94861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653765	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790360	contig_15596_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_139520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAACAGCGGCCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90774	90974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_90800_91000
790361	contig_16503_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_162070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGCCTGGTAAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97875	98504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_97900_98500
790362	contig_10904_pilon	+	1577	6	Intergenic	novelGene_22787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	426	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTCTACAGCAATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757106	773351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_757980_759068_759158_759446_759495_759592_759723_769599_769889_773203
790371	contig_266_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_166306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCATAAAAACCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712698	710851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_710900_712700
790372	contig_5916_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_158064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGATATTAATTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693813	695046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_693800_695000
790374	contig_9919_pilon	-	1892	14	Intergenic	novelGene_137985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	30.2735066865501	29	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	335	1588	817991	766672	FALSE	15	GGACATTGGACCCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYMQLLTVTVIVRLLYLRCTRKSGPDQSALCAACCLLTSLCDTVGAILARQLTIQVFTGAYLAAIDLVNFMFILFPVCGSKFKSHSGRGSRERKRRQRLKATIFALALPLSLGPGWALWASVPKASGPVQGPQRRLLGSLLQENIEIFGYLLGGIAAFGSWASQIPTLSRICQGKAFPSLHLWMRFLLALGCLLYASAIVAHSQQPEYLLRATPWFLTSLGRAALDLAVIFLSCVMKSKMRRVLGLATEARESPDTQALLTCAEKDEEGSQEVQSKKKFSRSFIFMNPDWVPLTTLPNYKSLRTMGVISHYMEMTIEPVQQAGCSATRLPDDQQMSTGDVSLQEPPSYPPVQVIRARVSSSSSSEVSSINSDLEQKYWEALNSEQWDPEDVHLERSKDNMEMLRSQAHRGSMSQWT	826070	766367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_766768_771523_771557_785412_785572_791906_792012_793650_793675_794571_794722_797090_797262_803342_803430_803628_803796_807290_807385_809633_809761_817950_818050_823980_824186_825999
790375	contig_990_pilon	-	1090	10	Intergenic	novelGene_76039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	105.708193732663	335	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	124	813	865835	849870	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWNLLVTWMLGS	865958	849592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_849901_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
790376	contig_4364_pilon	-	2953	27	Intergenic	novelGene_29	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_18	70.3156450644407	202	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	627	2525	358338	283469	FALSE	15	CATTTGTGTGTTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDHLVTAKINHWDRVIRELSAKALRNLAWRAPEYCAAQVFPKLLSLTQSPDLHTRHGAILACGEVTCALHRLAAQGGRSVTDYLDEKALEGLKQIHQQLYDHQLYRGLGGELMRQAVCVLIENLSLSKMPFKGDAIIDGWQWLINDTLRNLHLVSSHSRQQVKEAAVLALAALCGEYYLKEPGEADPAVVDALIRQYLAELQSPEEMTRCGFALALGALPSFFLKGRLQQVLAGLRAVTHISPKDVSFAEARRDSLRAIARICQTVGVSAGGVPDKVLCEANVPQIYSTLLDCMNDYTTDSRGDIGACVREAAMTSLMELTLLLGRSQPQLIGASVCERVLCYVAQQASEKIDRVRAHAGNVLLTLLHFDSPPLPHVPHREELEQIFPRSDVATMNWNSPSQVFPRITQFLGLPAFRYHVLLGLAVSAGGLTESTVKYSMQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	423030	283040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_314033_314111_314271_314370_314455_315013_315155_315840_315933_317038_317158_320223_320306_321422_321500_322870_322934_341505_341538_342347_342371_344982_345044_349101_349220_355492_355567_358294_358376_360982_361069_368137_368168_373003_373062_386159_386317_422772
790377	contig_14443_pilon	-	975	4	Intergenic	novelGene_126668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1757	junction_2	153.33260869394	8	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	97	450	39405	29618	FALSE	10	CTGCAGTGTGGCCATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSSLTMGQLYEKEKDEDGFLYVAYSGENTFGF	39501	29092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_37689_37863_38988_39045_39371
790381	contig_1442_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_172169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTCTAGGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623387	622129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_622100_623400
790382	contig_4742_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_131002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAGGCACAGTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246214	244638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_244600_246200
790385	SIRV7	-	287	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91639	0	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
790389	contig_15500_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_129001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTTAAGCGGTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269162	269903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_269200_269900
790390	contig_8866_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_77813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAAACCCACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521977	522365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_522000_522400
790391	SIRV1	-	241	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3567	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6799	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
790393	contig_10427_pilon	-	1393	4	Intergenic	novelGene_142185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	12.2292908852294	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACATTAACAAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82587	57547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_58593_61080_61348_82270_82330_82565
790394	contig_8020_pilon	+	2014	1	Intergenic	novelGene_114411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAGAAAGATAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185824	187838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_185800_187800
790396	contig_4845_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_53718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTCCTGTCTTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034967	1034040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1034000_1035000
790398	contig_9609_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_22966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	740	1168	256981	256553	NA	25	TCACTCAGCATAATGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHLMVDSEQKNGRTSSSCSTVNCKPSPDMLKTQISKTDPGLDNPRHLVKINKTKTITKTPHSPWMCLWSFHDLSSYKLCWFPLYCVLSHPSPKIPSVYCLFNISPQHLPSLVTNKDCYILCVNFFMGFYNTGLTKYLSFCD	257720	256546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_256500_257700
790400	contig_14333_pilon	-	2598	1	Intergenic	novelGene_49124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCCACAACATACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401897	399299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_399300_401900
790408	contig_1406_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_25503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACACTTTGTGTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431549	1432108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1431500_1432100
790411	contig_665_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_158210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256602	255315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_255300_256600
790413	contig_15118_pilon	+	2586	5	Intergenic	novelGene_74574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	5.1720402163943	25	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	211	2220	293491	300822	FALSE	30	ATTTTAAGTGCCAGCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQLQDPGRSGVVSKRDQKLKPSGAMPIDMNLPWRPQVLGPEEQDKSYKVCGVKGPVSFEDVTVDFSREEWQQLDPAQRHLYQEVMLENYSHFLSMGYDLPKPEVIFRLEKGKEPWVVELKLPYWSCRAEEFGLETPQWEISEKAAFYSEVVDEVTRDSSWCSILEELWQDADQRKRDQENKNKPAHRGATLNKQRLNIERDCDYKGTGKIIHVRPHLVTSQKQPLRSCSFAKSLKHNVEVNSQNESNTTKHLEKSIGSSHLLTHSSSNSTCKNIQTEENFCGDNQSRKVLSHKQALMHHQIHTGEKPNECTECGKFLPQKSSLLTQQRIHSVENLHECSKCGKAITPKPQHGVYLSVHTGEIPYICTECGKVFIQRSEFITHQKTHTRKKPYKCHECGKAFCQMLSLFRHQRIHTREKLYECSECGKGFSQKSDLNIHRNIHTGERQYACSECGKAFSQKSTLSMHQRIHSGEKSYVCIECGQAFIQRAHLIIHQRTHTGEKPYQCSSCGKSFISKSRLHAHDRIHTGEKPYECSDCGKAFSQKTHLNIHQKIHTGERQHECRECGKAFNQKSILIMHQRIHTGEKPHQCSDCGKAFISRAQLREHQRIHTGEKPYVCTECGKAFTGRSNFNRHKTTHTGDKSYKCSDSEKRFAQKSILSMHQSIHK	289915	301188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_290013_293377_293641_295061_295204_295461_295558_299200
790418	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
790422	contig_10324_pilon	-	1313	6	Intergenic	novelGene_7792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAATCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131619	128228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_128481_128859_129524_130121_130232_130661_130760_131327_131442_131544
790424	contig_10437_pilon	+	1343	2	Intergenic	novelGene_38092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAATTTAGGTACTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26090	33164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_27367_33097
790425	contig_17768_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_140397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTACTCAACCTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60611	61453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_60600_61500
790426	contig_17768_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_140403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGATGAAAAAAAAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81925	82179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_81900_82200
790427	contig_15114_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_121104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGGGAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48819	50403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_48800_50400
790429	contig_9955_pilon	-	1055	8	Intergenic	novelGene_21345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	48.3963230176906	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	172	900	110010	86976	FALSE	35	TAAAAACTTGTTTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	127965	86820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_127812
790430	contig_11709_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_168234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCATCAAGTCAATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611269	611931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_611300_611900
790431	contig_11709_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_168235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTCTAGCTACAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612076	613391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_612100_613400
790432	contig_8167_pilon	+	1056	2	Intergenic	novelGene_155649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	463	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	104	682	117391	132413	FALSE	15	CAATTGCAGGTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCRGAAGGLQFPSARRGRGSAAAPGACGHSVAKMAAWGRRRLGPGSSGGSTRERASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	117287	132787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_117453_131896
790434	contig_11978_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_62907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCTAGCATACAGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788168	786991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_787000_788200
790435	contig_14326_pilon	+	1475	5	Intergenic	novelGene_120684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	618	962	123573	124018	TRUE	5	GACCTGCCCTTGTTCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNHQVKTRSKSLYYKLVLIFQHLASFLCKNASEESGLTLCMFPSPLKRTQKGSYLPLISIAQDDANSNGDDDHHHGDAQHIAQGPQVLLLGVHPHPLADTNHRLHCCCLPPGG	122955	126445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_123820_123920_124115_125076_125209_125293_125410_126276
790443	SIRV4	-	304	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1219	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
790444	contig_6365_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_134010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGATAGAACCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48806	48455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_48500_48800
790446	contig_13740_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_34602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATACTTTAGTATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149103	148658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_148700_149100
790447	contig_18511_pilon	+	1908	2	Intergenic	novelGene_126896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1214	junction_1	0	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTGATGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58442	60849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_59255_59753
790449	SIRV6	+	769	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10251	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
790451	contig_9373_pilon	+	2390	1	Intergenic	novelGene_162711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1759	2088	160349	160678	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQNMLSLTVVAWPGATSSKKSKGTIHEKELCKQVGKNENIHKTKRPTQCWTNSIELATSWIFQMGRNGACRRYFVELAEMDLLMIICIFVLQTLKQLLCLRIPKCLS	158590	160980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_158600_161000
790452	contig_17935_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_170597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCTTAGTTCAGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63168	62170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_-_62200_63200
790455	contig_4989_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_160781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCTAAGGAAAGAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78392	77273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_77300_78400
790458	contig_13490_pilon	-	3040	1	Intergenic	novelGene_129126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1504	1881	70972	70595	NA	25	CAGCTTCCTTTTAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCWNGKHADSHRLLPHRQSSKCHRSLFLSPPSHNITINIISFMIKIIRSTHVPKWIHHEHMAQRMDANLHKPVVLELIPTHGDTMCIRIELCSMGFTMADFLEVDWQVFLPRHLWVDLNLQSFG	72475	69435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_69400_72500
790460	SIRV4	-	338	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	20	1163	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
790464	contig_18184_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_123856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAAATACAGAGATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39297	41142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_39300_41100
790466	contig_14740_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_174688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAATTTCTCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328822	330221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_328800_330200
790467	contig_10000_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_139315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTTTTTAAAAATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176257	177598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_176300_177600
790468	contig_11292_pilon	+	1173	8	Intergenic	novelGene_109439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	247.696077762195	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	105	395	313199	329543	TRUE	20	AACCGTGTCTTGTGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPSSSSSFQLSSRLSTATSGAERSPLCQAPKRGMAAAALLEAGLARVLYYPTLLYTLFRGNMPGRGHRDWYHRIDPTVLLGALPLRSMTRRLVQDENVRGVITMNEEYETRFLCNSSKESCDLRHYCCL	313094	334167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_313373_313499_313581_329507_329574_330709_330808_331218_331369_332049_332176_332265_332386_333913
790470	contig_6578_pilon	+	1207	2	Intergenic	novelGene_162240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCACCCCACTATTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164021	165302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_164971_165044
790472	contig_7378_pilon	-	1388	3	Intergenic	novelGene_120241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	28	2603	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	149	511	286964	279175	FALSE	15	CTTTCATTTGTATGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTGRPGRVPLQFLPNEARSLPPPKLTDPRLVFCGFLGYCAGLVDNAIRRRPVVAAGLHRQLLYVTSFFFVGYYLLKRQDYIYAVRDHDMFGYIKSHQEDFPEKDKKTYAEILEEFHPVR	287112	278297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_279225_281198_281343_286795
790473	contig_5947_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_101576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACCAACCTTTCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815126	814787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_814800_815100
790475	contig_6710_pilon	-	520	2	Intergenic	novelGene_97651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	41	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
790476	SIRV4	-	352	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	262	3	-262	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCGGACGTTCAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790478	contig_11429_pilon	+	1606	9	Intergenic	novelGene_60474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	56.3731984191069	211	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	337	1518	61142	67460	FALSE	10	ATGGCTGGCTCCCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLETGKLTFRAFVLQAPAGGHVREGVRRPGNGRGVAAGLSSGREFRTQYIRRRSQLLRENAKAGHPPALRRQYLRLRGQLLGQRYGPLSEPGSARAYSNSIVRSSRTTLDRMEDFEDDPRALGARGHRRSVSRGSYQLQAQMNRAVYEDRPPGSVVPTSAAEASRAMAGDTSLSENYAFAGMYHVFDQHVDKAVPRVRFANDDRHRLACCSLDGSISLCQLVPAPPTVLRVLRGHTRGVSDFAWSLSNDILVSTSLDATMRIWASEDGRCIREIPDPDGAELLCCTFQPVNNNLTVVGNAKHNVHVMNISTGKKVKGGSSKLTGRVLALSFDAPGRLLWAGDDRGSVFSFLFDMATGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	60022	67548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_60158_60940_61148_61759_61870_61989_62121_62735_63044_63853_64035_64134_64277_66731_66851_67275
790479	contig_2646_pilon	-	2062	9	Intergenic	novelGene_69620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	482.838482310596	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	756	1685	2072023	2069828	TRUE	0	GGTCCCTCTCTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAVGSCNGDVTSTILQTIMEKSETELKDTYARWLPLGLGLNHLGKGEAIEAILAALEVVSEPFRSFANTLVDVCAYAGSGNVLKVQQLLHICSEHFDSKEKEEDKDKKEKKDKDKKEAPADMGAHQGVAVLGIALIAMGEEIGAEMALRTFGHLLRYGEPTLRRAVPLALALISVSNPRLNILDTLSKFSHDADPEVSYNSIFAMGMVGSGTNNARLAAMLRQLAQYHAKDPNNLFMVRLAQGLTHLGKGTLTLCPYHSDRQLMSQVAVAGLLTVLVSFLDVRHPRQIALCTVWAGGRHAAPDAGHVR	2072778	2069344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2069682_2069787_2069907_2070144_2070267_2070459_2070555_2070646_2070816_2071046_2071131_2071330_2071477_2071662_2071765_2071890
790484	contig_4891_pilon	+	1218	7	Intergenic	novelGene_124569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	533.909402427041	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	309	653	707907	754769	TRUE	10	CTCCCACTTTTCTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFG	702885	756985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_703063_707775_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754770_755867_756027_756579
790488	contig_7357_pilon	+	1852	1	Intergenic	novelGene_36947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTGATGGACAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129181	1131033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_1129200_1131000
790489	contig_10756_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_170664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAACATAACACCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72943	73351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_72900_73400
790493	contig_10377_pilon	-	1259	4	Intergenic	novelGene_115373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGCACCACCAAAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221465	208783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_209211_219443_219613_220701_221292_221392
790495	contig_15897_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_49522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGATTTCCTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273781	271874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_271900_273800
790496	contig_15897_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_49521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271079	270663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_270700_271100
790500	contig_16724_pilon	-	1046	6	Intergenic	novelGene_105313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	910.80434781571	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	139	456	560992	541872	TRUE	35	AAATACGTTTTTACTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	567697	541231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541329_541378_542004_543916_544002_547919_547968_560939_561029_567595
790501	contig_14546_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_157415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	715	1050	67570	67235	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKRINKRGSSAVYQTSCFFSLGLSVFIIKTKEVKLDGIKEPRLSSVHISVDFSKWLFWPQYPLSNDLDLPSRLISKILSWKEPWIPQSSCLRAYLPLTILKLMCFSFFF	68284	67063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_67100_68300
790502	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
790503	contig_9999_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_174668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGCCAAGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244021	243536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_-_243500_244000
790504	contig_9999_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_174667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCGTACTGTACTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243079	242670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_-_242700_243100
790505	contig_5690_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_119662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTCCAACCAGCTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102723	104673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_102700_104700
790509	contig_4125_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_25150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	608	916	864672	864980	NA	80	TTAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVSQEHKEVLTSHLLCPKMTNYSRTVPDPSEETEMSAGHTIGLLPHPRDFTTKELTVIPPRYSGSYVTAWMNPESENPPRLGFSGKGLCSPLPCWWCSYPK	864064	865157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_864100_865200
790510	contig_7165_pilon	+	1232	8	Intergenic	novelGene_116825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	91.35644476445	21	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	170	841	231921	256219	FALSE	15	CCCATTTTTCTGTAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRTVKDAHSIHGTNPQYLVEKIIRTRIYESKYWKEECFGLTAELVVDKAMELRFVGGVYGGNIKPTPFLCLTLKMLQIQPEKDIIVEFIKNEDFKYVRMLGALYMRLTGTAIDCYKYLEPLYNDYRKIKSQNRRSPTLRYRRSRSRSPRRRSRSPKRRSPSPRRERHRSKSPRRHRSRSRDRRHRSRSKSPGHHRSHRHRSHSKSPERSKKSHKKSRRGNE	231751	256610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_232051_233711_233872_238291_238403_254222_254277_254902_254930_255046_255145_255605_255655_256176
790511	SIRV2	-	444	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4428	35	3253	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
790514	contig_6871_pilon	-	2249	2	Intergenic	novelGene_21636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	507	830	664469	664146	FALSE	40	AAAGCTGATGGTGAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHCQVSLLLCNLRDQVQTSDSQGWKFPPFGTPLSLPLLTGRTPPYSLRPPSNVIYHSNETFPHSPPLPRKITQLCCSITLSHFVAVVMIEIPPCLIAPLDCRIVP	665120	662726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_664778_664922
790518	contig_1225_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_44212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	654	977	320176	319853	NA	30	CCAGACAACAGGCTTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKHLPPDPPTSWESCFFQKPFHTRLLILYFGTLQHSVIILEAALSQDLPHSLLFLWCNPSCAVRSSRVSIKPNSPLNIPEHLAQCLTEQLLDSTQVIRHRLCVQYH	320829	318327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_318300_320800
790520	contig_1938_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_114891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311552	309697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_-_309700_311600
790524	contig_3386_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_34541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCCATATACTCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412207	410383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_410400_412200
790528	contig_9239_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_137160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATATGTATTTTTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88219	86860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_86900_88200
790529	contig_9239_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_137159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATATTATTTTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86708	85823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_85800_86700
790530	SIRV2	-	194	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	7	1078	7	-1078	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATACCAAATGGTAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	4743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
790534	contig_610_pilon	+	1727	8	Intergenic	novelGene_76830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	196.000520615718	3	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	11	1318	350011	375649	FALSE	50	TTGAAATAAAAGGCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVAYTCTAKNPVSQSTSSPIHAQQFCADLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGNITTVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350000	376058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_363029_363303_363794_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369670_374092_374155_375583
790537	contig_7416_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_134345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGAGAATAACATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930876	932308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_930900_932300
790538	contig_2480_pilon	+	1216	7	Intergenic	novelGene_63513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGACTTCCGGCGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123228	138415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_123556_127197_127442_128834_128965_130076_130253_135239_135314_137755_137895_138289
790539	contig_9609_pilon	-	723	6	Intergenic	novelGene_23109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	13.2725280184296	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	7	705	517328	515840	FALSE	20	GCTGACTACTCTCGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRMLSTHNLPCLLVELLEHSPWSRWEGGKLQRFESGRWQTVAPSEQQKLSKLDGQVWIALYNLLLSPEARARYCLTSFAKGQLLKLRAFLTDTLLDQLPNLADLQNFLAHLALAETQTPKKDLVLEQIPEIWERLERENRGKWQAIAKHQLRHVFSPSEQDLRLQARRWAETYRLDVLEAMAPERPRCAYCSAEASKRCSRCQNEWYCCRECQVKHWEKHGKACVLAAQGDRAK	517334	515821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_515916_515995_516122_516240_516363_516462_516589_516730_516904_517252
790542	contig_11855_pilon	-	760	5	Intergenic	novelGene_66906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	20.8851023459307	1491	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	117	575	747567	742958	FALSE	30	CAATTCATTGATTCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVALKFMQASEDLLKEHYIDLKDRPFYAGLVKYMHSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIIHGSDSVESAEKEIGLWFQPEELVDYKSCAQGWIYE	749078	742772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_743076_743753_743867_744906_745009_747441_747572_748966
790543	contig_9177_pilon	+	2628	18	Intergenic	novelGene_32661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	56.1352173751718	1	129	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1254	1889	105101	106963	TRUE	70	GTCAAATATAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPQW	99893	109408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_100009_100303_100440_100685_101146_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103073_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
790544	contig_15087_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_37252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGAACCAGTCTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228868	226916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_226900_228900
790550	contig_11175_pilon	+	2248	8	Intergenic	novelGene_61177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGCAGAACTACAACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249866	296972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_250659_252418_252648_260353_260573_264733_264905_268986_269275_292779_292938_294805_294935_296710
790551	contig_16846_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_82921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_3	136.947678573485	1267	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	244	633	487254	478240	FALSE	20	TCTGTTGATCATACCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGRRKEEPPQPQLANGALKVSVWSKVLRSDAAWEDKDEFLDVIYWFRQIIAVVLGVIWGVLPLRGFLGIAGFCLINAGVLYLYFSNYLQIDEEEYGGTWELTKEGFMTSFALFMVIWIIFYTAIHYD	487497	477735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_478282_479461_479592_484888_484993_487140
790554	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
790555	contig_1443_pilon	+	1530	14	Intergenic	novelGene_28222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.5523212951229	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	486	1397	538016	541708	FALSE	35	GAATGGAAATGAATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535984	541841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536335_536468_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
790556	contig_7051_pilon	-	1813	6	Intergenic	novelGene_64374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATCCAACTGAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385564	368196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_368290_371431_371585_374003_374105_376001_376247_378973_379134_384503
790558	SIRV6	+	779	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10241	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
790560	contig_7457_pilon	-	1704	9	Intergenic	novelGene_31400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.834486042117	1	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	480	746	470910	469327	TRUE	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASPEDPWVKAVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKSKESPFALLSPQRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473183	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468354_468487_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471326_471575_471667_471948_472039_472730_472768_473148
790561	contig_10003_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_88220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAATTAAAACCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565447	564121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_564100_565400
790562	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_18416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAATTTGGTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
790567	contig_10042_pilon	+	732	5	Intergenic	novelGene_79165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCATTTTCTTACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714564	729540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_714724_716940_717120_721700_721760_725761_725880_729323
790569	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
790570	contig_990_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_76141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTACAGCTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706356	1704081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1704100_1706400
790573	contig_12837_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_57407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTTAAATCAAGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475579	475779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_475600_475800
790574	contig_10176_pilon	-	1104	8	Intergenic	novelGene_72696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_5	206.421799196871	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	486	977	222322	214602	FALSE	5	GCTTGTTCTATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	232719	214474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223007_223196_223831_223879_225238_225376_232660
790582	contig_6589_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_25991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	784	1107	1379816	1379493	NA	50	AAAAAAGGGTTGAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSNHRKSFKPFLTLNQNQTCCHESILTHSDPTGRSRNAPQGYQGAIGRFKLPTFCLAARLLTTAPPRLLLGLTCCCWIDSDSQRPWNYPKRFWGAAGGFECRSFG	1380599	1378830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1378800_1380600
790583	contig_5423_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_85187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTAAGAAAAGAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194016	192529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_192500_194000
790586	contig_13904_pilon	+	1037	7	Intergenic	novelGene_165482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1241	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCGCAGACCGGAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58995	82010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_59527_63501_63578_65030_65067_67280_67367_68751_68830_70842_70929_81866
790587	contig_10581_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_41369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429878	428923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_428900_429900
790588	contig_9656_pilon	-	1421	2	Intergenic	novelGene_121900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGCCTCCCAAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100847	96150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_97333_100608
790589	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
790590	contig_4782_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_73661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCACAGGGTTTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542607	543459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_542600_543500
790591	contig_3588_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_72899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGGGCATTACATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140463	139590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_139600_140500
790592	contig_11256_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_150891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTATTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17063	18553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_17100_18600
790596	contig_3095_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_75152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	558	872	153804	153490	NA	5	CTTGGTTTGTGCTTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANQKVGSSNQPSSTVEERHDNLFLKVIAIENPVVCSSTLIHIGSPRVGINLMIMDLVFLVCIFCTILFFEPKTVLKIKSIKKVSFSHDRVWFRFCFFYLLFV	154361	153320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_153300_154400
790604	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790605	contig_6795_pilon	+	2293	2	Intergenic	novelGene_27709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGTTACTAGCTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128626	131144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_129069_129293
790606	contig_5602_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_133019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAAACCTGTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512783	512257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_512300_512800
790610	contig_8976_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_174690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAGGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464227	466503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8976_pilon_+_464200_466500
790611	contig_12964_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_131720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCCCTCTCACTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594021	593322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_593300_594000
790612	contig_14357_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_121673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529649	527980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_528000_529600
790615	contig_10594_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_142320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAAGAGATATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289763	289184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_289200_289800
790621	contig_14351_pilon	-	2240	5	Intergenic	novelGene_174691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	14.2653426176871	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	67	2070	48763	22215	FALSE	15	ATCTGTAACCCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTGPWKARGETHMAFRDVAVDFTQDEWRLLSSAQRTLYREVMLENYGNLVSLGIPFSKPKLIIQLEQGKETWREEKKCPPAICPAEPKPEIQLCPFCPPDFSSQKFHLQHVLCSHPPWMFTCLCAENHVQPGDSCPGEQKKQQQTCDESSWSDKSKGQEKEGAKPVFGRTKKKTLGTFSRPPQRQPVNSRNGIRGVEIETSPAQRGIPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLGFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHSEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLTRHQNIHSGDKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCEDCGRGFSQKSNLIAHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYTCRQCGLGFSNKSTLITHKRLHSEDKPCVCRQCGQDFIQKSHLLLHQMTHKEEKPYVCRTYAQGYNQKSHLNRHRRIKSVHHKSPLKADLETFSGQSSVPLHSL	61167	22044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14351_pilon_-_23963_46096_46193_46661_46789_48730_48810_61147
790622	contig_9981_pilon	+	2110	4	Intergenic	novelGene_121037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGGATGGCCGGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170474	198537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_171980_172692_172973_182279_182417_198349
790624	SIRV6	+	329	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10496	1	1259	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11496	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
790625	contig_9708_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_67245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTGGCTAAATCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20174	18881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_18900_20200
790626	contig_5286_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_157385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAATACAAGACTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640736	638572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_638600_640700
790627	contig_17436_pilon	+	2089	5	Intergenic	novelGene_164177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	19.4983973700404	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	32	682	77842	82834	TRUE	25	CTATCAGTAATGTTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGSGSFRSVMSQERDYGRWTISSSDESEDENAKLDRPSTSSLPPCQVGCSKRATVHLFRGSASRPQKENVTREIQQRGSRLQQFHLLKGRKVVPRKTSAGVCLVVTMSCSQKRSRSRLGKWRSKRRKARFLPKATQQKGLETMALLSGTASKRRRKMSTRHQGKARTSGTCWIRGTLSSFTSLGSRELSRSTTLEPSTSGIFCLLYLGPLFLQLSLTTASTWTGW	68788	85006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_68813_77834_78415_81547_81592_82800_83649_84413
790629	contig_1443_pilon	-	988	5	Intergenic	novelGene_28306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	363.730669589464	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	143	457	748987	748558	FALSE	45	TCTCAAAATAAATAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQVKTTGKERKRMTETAPMARMTLKHIVGFRNLIPLFLYLGACLRSNFSPYPLP	776235	748026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748688_748802_748988_749234_749258_767485_767556_776186
790633	contig_2100_pilon	-	573	3	Intergenic	novelGene_50657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	549	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173237	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170317_1172341_1172451_1173171
790634	contig_14546_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_157448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCCGTTAACAACATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526461	525128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_525100_526500
790635	contig_2463_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_43018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGGTAACCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443953	441930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_441900_444000
790636	contig_6445_pilon	-	635	7	Intergenic	novelGene_76909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	671.851670137588	3	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	49	531	88578	77863	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPATNAWAPLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVCTLRMSAKSLWRNSSGLLSSLAHCMRTATSWAPLLLGPALPANKWKLPSGREPSMCLMVPQERGTIRSGLNSLATHWPPRLRLLPPGGCRSSTTGSRAAMI	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_42965_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88144_88216_88473_88594_96306
790637	contig_7593_pilon	-	1962	6	Intergenic	novelGene_127312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.585105071756	186	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	45	806	291713	262609	FALSE	15	GATCCGTGTGTTCATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRTQVSYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGAASLDASSLGRLGGIAVAYFGLTTLGASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLDESGLPPVPKETVDSFLDLARNLLPSNLVVAAFRTYATDYKMVTSNTSSGNVSIEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEELIRFFNAFNDATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIVVLVTSLGKYIFASILGHFIHGLLFFSTQVATLLHGGLMCVGSQLS	291757	261452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_262684_268559_268687_272811_272979_278019_278083_280182_280226_291426
790638	contig_11978_pilon	+	539	4	Intergenic	novelGene_63093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2800.99676702578	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	150	455	1830714	1831883	FALSE	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829101	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829242_1830704_1830785_1831161_1831273_1831759
790639	contig_8795_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_146885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152437	153472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_+_152400_153500
790643	contig_3161_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_84506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCCTGTTGCACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351037	353289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_351000_353300
790644	contig_3161_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_84507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTTAAGAGAATAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353235	353524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_353200_353500
790647	contig_12157_pilon	+	3150	3	Intergenic	novelGene_135921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGAACCATATCTGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213562	246985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_214670_231132_232260_246069
790650	SIRV6	+	363	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	510	0	344	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
790651	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1213	0	1213	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3945	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
790652	contig_1150_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_61454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGGAAGTCGGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311171	311714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_311200_311700
790656	contig_9739_pilon	-	2297	2	Intergenic	novelGene_165101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1132	1440	224098	223790	FALSE	30	GATTTTTCATAAGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLKLWAERLRAARWQHRQTVGWREGAPGGRPVRRLAWLAKVTQICSASSGARHSLEKITHYIGLLDQEEKTVIQSEWVKSCQRDLLSLTPNWLVAIVFSI	234644	222932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_225013_234427
790658	contig_7138_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_120995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATTCATACTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255130	253076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_253100_255100
790660	contig_11978_pilon	+	552	5	Intergenic	novelGene_63062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2699.07771284934	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	154	459	1830714	1831883	FALSE	15	GCTTTTTAAAGTTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827917	1831976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829191_1830704_1830785_1831161_1831273_1831759
790661	contig_11427_pilon	+	1584	3	Intergenic	novelGene_78972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	17	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	553	1584	93223	94254	FALSE	25	GTATGAACCAGCTTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTG	92304	94254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92634_92733_92898_93163
790663	contig_13608_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_52386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTATACAATCCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422323	422949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_422300_422900
790664	contig_13608_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_52387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423743	424024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_423700_424000
790665	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	111	-7	29	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3134	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790668	contig_14844_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_174693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCATTTATGTGTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93755	92135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14844_pilon_-_92100_93800
790671	contig_15430_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_174694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTGTTATGTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37587	36189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15430_pilon_-_36200_37600
790672	contig_7457_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_31451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	31.873774486245	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	13	966	477748	475857	TRUE	20	CAGGTGAATGTATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGSMAVFRSGLLVLTTPLASLTTRLAPILTSAAQLVNHTLYVHLQPGLSLEGPAQPESSPVQATFEVLDLITHLYAGASVHGHLDVRVLLTNIRAKSAFLPPQFSSVQNLAHPPEVVLTDFQTLDGSQYNPVKQQLERYATSCYSCCPQLASVLLYPEYGSRAVSLEPQDAPSSSTIKPASPVARSPKQPVRGYHRGAVGGTFDRLHNAHKVLLSVSCILAQERLVVGVADKDLLKSKLLPELLQSYEVRVERLSEFLVDIKPSLTFDLIPLLDPYGPAGSDPSLEFLVVSEETYRGGDGRQPLPPRECPATEGPKPHGK	477760	474159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_475895_476193_476410_477048
790673	contig_13481_pilon	-	1313	4	Intergenic	novelGene_119289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	17.0163320241336	142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	189	719	190444	184858	FALSE	20	GTTTATTCTAGCTTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKTALGKSWAPWKASRYRPSWVAANHKPLGVDGQTGAARSPELSSPHPRDWFGEHGVEPMGAAALESRWRAREGDPYKLWREIRFRILVPFNILGWGPVRNFYILSLPVSIWCGLRQTGPQAPTEKWWLLEPPGRCLAPPPLPLTPRRRRHGKLKISMQEGIQFVFAQFPNGKKE	190632	184263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_184927_187277_187359_187641_187998_190419
790674	contig_5566_pilon	+	1301	5	Intergenic	novelGene_153662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_4	145.461979568546	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	808	1263	177541	181788	FALSE	25	AAATGGTTTTGTGGTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKAFFYIVSLDSSCLHKTKSISLATQKELVWCYFCLIVVLWRRACSQYKQATSNEDLPIPMENPYKEPLKKCLLCGKRVDYKNVQLLSQFISPFTGCIYGRHITGLCGKKQKEITKAIKRAQIMGFMPVTYKDPAYLKDPKVCNIKYRE	176733	181826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_177718_179689_179774_180773_180832_181571_181632_181711
790679	contig_10446_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_162468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGAGCTTCCAGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640192	639494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_639500_640200
790682	contig_7229_pilon	+	504	4	Intergenic	novelGene_39820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	207	440	876778	877495	TRUE	30	AGGAAGAACCCTTTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWLSDPLGVRVSSDSFVEWINEDHFKEFVRGIFTNPVRIQDPQGPTVASSSLLSHRLKASGKLQLVNTMIDGLAIGCTFRHWAFAATPAHADPIDDITLLGLVSQSARLIRPGGAGSPVQRRELAVLPAADSQKKAHHIGLLLPP	875801	878213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_875959_876728_876865_877348_877532_878185
790685	contig_7457_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_31352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAGCCAAGTGAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300001	301156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_3e+05_301200
790688	contig_2890_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_60300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATACTTTAAAATGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410446	409299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_409300_410400
790691	contig_5894_pilon	-	1361	3	Intergenic	novelGene_83065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	4.5	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACACCTTGGAGTCGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754131	751825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_753013_753681_753821_754096
790698	contig_4103_pilon	-	970	3	Intergenic	novelGene_52022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_1	43.5	1572	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTGCATTATTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619755	528798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_529278_577146_577338_619455
790699	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
790700	contig_12005_pilon	-	1631	8	Intergenic	novelGene_160477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	60.4020542967315	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	42	1502	216421	192601	FALSE	35	ATAAGGTTTTAAGATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGLLWKNLLGSAAMGKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPCSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKRYDYLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGHQFALKLHRLGRTSFRNLKNKRDYHKHRHNMSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYERKFPVPKPIDYNRHAVVMELVNGYPLCQIHHVEDPASVYNEAMELIVKLGSHGLIHGDFNEFNLILDKDDHITMIDFPQMVSTSHPNAEWYFDRDVKCIRDFFIKRFSYESELYPTFRDIRREDSLDVEVSASGYTKEMQADDELLHPVGPDDKNIEAVEGSEFSFSDEEVSEKAKVCRSENESDGDPGDESDGCCYTSPGNLEQVMEDGLSEESADAHSFEMTEFSQALDEIKGQVGENNSVTEFSKEKNKTENGTRQDSQTGQEGIPAGSEEYEDECPHLIALSSLNKEFRPFRYRFLLIDFFFTFILKPVLFSILVKSIFSNGVTALYSATIV	216462	192471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_193250_194007_194101_198002_198195_202798_202888_205826_206003_208295_208383_209617_209727_216355
790702	contig_6048_pilon	+	2625	1	Intergenic	novelGene_73367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3089244	3091869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3089200_3091900
790707	SIRV6	+	238	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	8464	7	275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAATGCCCTGGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
790708	SIRV6	+	343	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	9	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790709	contig_4531_pilon	-	1685	9	Intergenic	novelGene_47921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.2668995284509	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	622	1101	418451	413360	TRUE	25	ATTCATATACGCATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKSKGFWYMLLEELCQYYRTFVPIPVWFRYLISYGEFGNVTRWSLGILLALLYLILKLLDFFRHLRTFRQVLRIFFTRPSYGVAASKRQCSDVDDICSICQAEFQKPILLICQHIFCEECITLWFNREKTCPLCRTVISDHINKWKDGATSSHLQIY	422060	412741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_413052_413085_413495_414172_414275_416925_416992_417689_417849_418433_418588_419856_419958_421465_421547_421757
790710	contig_6710_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_97661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
790711	contig_20951_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_43038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAAGCTTGATTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24330	25638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_24300_25600
790712	contig_5880_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_151117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGCTCAATAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154144	153619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_153600_154100
790713	contig_10023_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_123486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAGTTTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204742	202451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_202500_204700
790714	contig_3948_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_53401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCAGCCAGCTCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1815239	1816434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1815200_1816400
790715	contig_6208_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_52995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCCTAAGACAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409843	410369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_409800_410400
790716	contig_14744_pilon	+	885	5	Intergenic	novelGene_66072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3123.47069579658	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	3	545	1382976	1385854	TRUE	10	TTTAACTTGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKVSGHSGRIPLLTSVPQSSSSA	1382973	1386688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384606_1385820_1386006_1386499
790717	contig_9366_pilon	-	2345	1	Intergenic	novelGene_166231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCTTTTTGGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735847	733502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_733500_735800
790718	contig_7201_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_152525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACGGCTTCTGACCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334868	333597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_333600_334900
790721	contig_11823_pilon	-	3095	1	Intergenic	novelGene_171029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1917	2225	68797	68489	NA	75	GAAGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAASIWGRRHESQLLCAPPANRMGLGLGRTWECSPWGAAVGVSLCTHFDWNWSGSTHRPLDIIQNVCGRFYTCCHFSYIVDRCLCTSFRHFKWGLGRERR	70713	67618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_67600_70700
790724	contig_15543_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_164356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184701	183923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_183900_184700
790725	contig_14546_pilon	+	1337	3	Intergenic	novelGene_157410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACAGGTAAACATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24908	43455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_25786_25888_26324_43430
790728	contig_16907_pilon	-	2138	18	Intergenic	novelGene_87469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	103.33186366481	1	73	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	244	1245	519112	502170	TRUE	40	ATCTCTGTATACATTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEDSMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKSCLNPKKSLPCLDRSYH	524844	480602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_480714_482744_482842_485631_485702_489764_489853_491533_491629_493508_493608_495044_495150_499457_499597_502080_502224_503134_503294_505626_505803_512215_512367_514184_514275_516847_517026_518254_518384_519047_519150_520230_520295_524702
790735	contig_7182_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_117115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTCAAATTGTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170715	171352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_170700_171400
790740	contig_10953_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_42532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAGGCAGAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157717	158464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_157700_158500
790741	contig_19957_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_57681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGTTGGTGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41375	41591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_41400_41600
790743	contig_20614_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_107613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTGAAAGACAGGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491119	492154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_491100_492200
790744	SIRV5	+	419	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	877	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTACCGCCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
790745	contig_10907_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_144908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16168	18260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_+_16200_18300
790749	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_18060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
790752	contig_8693_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_150872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACAAGGGTTTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125603	1126442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1125600_1126400
790753	contig_7416_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_134314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACTGAATTAGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36962	39329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_37000_39300
790754	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
790755	contig_11978_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_62846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549726	552022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_549700_552000
790756	contig_4565_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_174703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAGAATAACCAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223283	225409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_+_223300_225400
790757	contig_10414_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_146943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTGATTTCTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163579	162526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_162500_163600
790758	contig_12540_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_148136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGTAATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303750	1303173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1303200_1303800
790759	contig_14790_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_127909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGCCCCATAGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162587	164164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_162600_164200
790760	contig_11564_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_158571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCCCCCAAGAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61733	63187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_61700_63200
790761	contig_11071_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_131039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTTGAAGGAGGGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188321	186900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_186900_188300
790767	contig_10734_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_51382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	295	726	1887162	1887593	NA	35	CTACTAGGTTACAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAQAVESWVHLPTFWSPGGARGTGPQLSRVCPSSNPGNQEAGCPKPCLASSPPQRDRGPFPPFVTATGASAGKRSCGAVLAWGGQNLPTLPEACGWGSLGSSACSAGTSSQRKGPVAVLQKEPCHLAGPSRSWNSDHTGWL	1886867	1888819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1886900_1888800
790770	contig_12689_pilon	-	1838	6	Intergenic	novelGene_145056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_4	47.7677715620061	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	440	1714	272233	266204	FALSE	25	GTACCGCCTTCAGCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRETRVLAEKHFQGLRGRLPGGVRRAPDCVDFIERPDAFSYADFFKGYLLPNVPCVFSSAFTEGWGSRKHWVTPDGKPNLDYLLQNYGDIVVPVANCGVQEYNSNPKEHMPLRDYISYWKAYIQENDSSPKGCLYLKDWHLCRDTSAEDVYSLPVYFSSDWLNEYWDAINVDDYRFIYMGPAGTWSPFHADIFRSFSWSVNVCGRKKWILFPPGQEEALRDCHGSLPYDVTSPALLDVRLHPARAHCSPPLEVTQEAGEMLFVPSGWHHQVHNLEDTISINHNWVNGCNLAPMWHFLQQELRAVQREISEWRDAMPDWYHHCQVIMKSCTGINYEEFYHFLKVIAEKRLLTLANGTGTGTAGSVDDTRLGAQQAAFDVSRITEVLASLIANPDFQRVDTSTFSLQPEELLQQLEEAVTATASL	272672	266079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_266507_267060_267208_268078_268347_268822_268949_271472_271639_271968
790773	contig_6496_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_103501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAAAGTCAGTAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596853	595863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_595900_596900
790775	contig_8631_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_121961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	29	364	749732	749397	NA	10	GGGCAGTTCTACTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNHFFSHLMDLLFLSSLCILALQLSSLHTLLSICVSNCYWTSPHELMCFLPSKTKQFKSLLYDIPYNGEGHHHSITVQTRKVGVSFNSSISLLHHSIGGQVLCCFINKFCFGFPPTQLY	749760	749250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_749200_749800
790777	contig_7467_pilon	-	1473	12	Intergenic	novelGene_69469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.752462967709	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	196	915	92058	73652	TRUE	35	AAAGAGTAAACGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYYINFLSQQGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQGKEQKSVPRHSI	133005	67518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67620_68378_68502_70794_70966_72389_72482_73580_73691_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86190_86621_86735_91949_92093_132844
790778	contig_3986_pilon	-	1755	3	Intergenic	novelGene_52694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_2	1	7	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	328	804	41485	35282	FALSE	20	ATAAAGGCTTTCCCGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	41812	34330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346
790784	contig_11003_pilon	+	1938	9	Intergenic	novelGene_105430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	218.888634640997	1	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	144	1298	56015	70048	TRUE	5	GCCGCAGCGTCCTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTCMKHRPPCQAPT	55871	73038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64636_64778_64966_66252_66427_70010_70127_72476
790789	SIRV6	+	302	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	401	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11037
790790	contig_6048_pilon	-	1289	3	Intergenic	novelGene_73310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.5	232	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	30	767	2122086	2102483	FALSE	5	CTGTGGTGTTTGGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAASGPGCRSWRLCPEVPSATFFTALLSLLVSGPRLFLLQPPLPPSGLSLRSEALRNWQERVALKLDQKFPFSLMRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2122115	2101960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104871_2121899
790793	contig_6129_pilon	-	2091	15	Intergenic	novelGene_159961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	35.2808701128298	27	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1890	202	2091	71114	2687	FALSE	15	TGAGTTGGTTACCTCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGVVPEQPQNVSCIQKGEHGTVACTWDRGRDTHLYTAYTLQLNGPKNLTWQKQCTDHYCDHLDLGINLKPESPESSYTAMVTAINRLGSSSSFPSIFTFLDIVKPLPPWDIRIKFLNASVRRCTLHWRDEGMVPLNRLKYRSIDGGSWNMVNVTNAKGKHDLLDLKPYTEYEFQIASKLHLHKGIWSDWSESLRTQTPEEEPTGMLDVWYMKQHINYNKQQISLFWKNLSVSEARGRILHYQVALQEVAGGKVTLQNITEHTSWTWVIPRTGSWTATVSAANSKGSSLPARINITDLCGAGLLAPHHVSAHSEGVDNMVVTWKPPGKAVQEYVVEWRELHPEGSTQPPLNWLRSASSSVSALISENIKPYVCYEIHVYALSGDQAGCSSIWGSSKHKAPLNGPHIHAITEEKGGILISWNRIPAQEQMGCILRYRIYWKERDSDSQPQLCEIPYRISQNSHSINSLQPRVTYILWMTALTAAGESPRGNEREFYLQGKANWSAFVAPSICIAVITVSIFSVRYFRQK	74053	2686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_2779_5038_5177_11727_11887_11976_12076_17221_17414_30500_30721_43587_43668_57707_57859_59140_59284_60543_60729_61675_61791_68775_69064_71086_71195_73238_73293_73986
790795	contig_14876_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_170246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	701	1000	177076	176777	NA	55	CAAGAACGGGAATAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPSKFTEPPTSMQALHCSRRNSTMSRCPYLAAIKSGVAPFVFSEIKEETSSLDLLANNFVRSRSLPSRAALNTAVFRSIYVQLRGCALFILQSKVPA	177776	176719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_176700_177800
790798	SIRV6	+	168	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	561	54	561	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10798	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
790802	contig_18604_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_173856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82306	80366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_-_80400_82300
790803	contig_15327_pilon	+	1576	3	Intergenic	novelGene_70527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTCAGCACTAAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477749	482099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_478411_480126_480260_481317
790804	contig_9177_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_32768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAGCATTCCTTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342977	1343975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1343000_1344000
790805	SIRV4	-	404	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	210	3	-210	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCGCCCCCAGTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790807	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_89460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653753	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790810	SIRV4	-	463	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	121	33	121	-33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACAGTTTAGAAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5037	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
790812	contig_6576_pilon	-	1499	2	Intergenic	novelGene_42330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1095	405	1499	657601	653132	FALSE	55	CAGAAAAGAAAATCTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAPTPVKDYEIEPCKKQRKDDDGSSYRTITKYLSPIGKTGDRVFSPPKSNNILDYFRKTSSTNERTQSMKECKIKSSAPLPVDSGKDYKTSLEMFSNVEFKKRGKRVNLSHQLNNIKTGHESPIEISSDESKGDSSLNHDFEESSTSVLLHQKHVEVLAESIQDIKNQSSTMICKQNSKKLNPKQGTTKNDCKKIRKRKYREVIDLSESLSLAKELNLKKDGKDNKQIISSLTNEDSTANNANTRDNVAKIALLNDNTITVSYEEFLKSHKENKVEQIPDSTMVMSVCAPETVGEIVKSGCISDTETCENSQQVHFKTVTVLAQVHPVPPRKTGKIPSIFLKQKQIEMENSLSDTESEQTI	658005	653131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_654179_657553
790813	contig_1435_pilon	+	1487	3	Intergenic	novelGene_115501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	18	125	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTCATAATTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519959	526443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_519985_524875_524918_525023
790814	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_97338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790816	contig_6795_pilon	+	1574	12	Intergenic	novelGene_27738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	370.360088348248	43	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	212	943	324073	332823	TRUE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTRSARTPASSTQSSASSSRFPLRVRTTRASCTHGWAGPQTPMRPSWLRISSTPCLTPPTASRSSTKARSPKTSSGWALGHRNLMTTTRST	322665	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325448_332382_332438_332541_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
790817	contig_5690_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_119710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	946187	946561	TRUE	65	AACAGAAGAGAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVRRSWGPKSGGAPCPVKKYPLVPTKKSQRGSSARSAGFLLSGLWRDENLSVRIPLAPGKERQLSYTAVAWCCYCGEDSPFLCWPSFSRGDPLEQGLGRG	946185	949046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_946717_947523
790818	contig_9706_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_20917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAATAAAAAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134891	135963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_134900_136000
790820	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	1	1159	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
790822	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
790826	contig_2027_pilon	+	1832	12	Intergenic	novelGene_39952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	86.8942551049719	245	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	629	1387	643723	648974	FALSE	5	GCTTTTGCTTGTTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYSHIGSRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRTQADELPACLLSAARLVP	638059	649419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639646_639810_639915_640833_640941_643414_643448_643533_643737_646146_646324_646427_646475_647010_647130_647372_647505_648505_648641_648839
790829	contig_9909_pilon	-	1723	16	Intergenic	novelGene_42468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_10	9.0145561300722	51	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	388	1557	614180	580096	FALSE	5	TTTTGTCTCTGTGTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHSLSGKKTAIPYGTKSQYILSISRENLNKDLLTAVEKYPNAKVHFGHRLLKCTPEEGVITVLGSNKVPTDVTCDLIVGCDGAYSTVRSHLMKKPRFDYSQQYIPHGYMELTIPPKNGDHAMEPNYLHIWPRNTFMMIALPNTNKSFTCTLFMPFEEFEKLLTGSDVLDFFQKYFMDSIPLIGEQALMQEFFLLPAQPMISVKCSSFHLKSRCMLMGDAAHAIVPFFGQGMNAGFEDCLVFDELMDKFNNDLSVCLPEFSRFRIPDDHAISDLSMYNYIEMRAHVNSRWFIFQKNIERCLHAIMPSTFIPLYTMVTFSRIRYHEAVLRWRWQKKVINNGLFFFGTLIAIGSTYLLTHYMLPRPLDYLRRPWNWITYFQNTGHVSLKLP	640459	579929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_580261_581712_581773_581862_581965_583148_583232_585519_585578_587424_587573_597565_597688_599382_599455_603437_603604_605370_605459_609350_609400_614123_614214_615734_615833_616136_616207_639702_639799_640369
790830	contig_6710_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_89212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCTGTTCTGGAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
790832	contig_15752_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_148773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCAATTTGCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330328	330820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_330300_330800
790833	contig_15752_pilon	+	1942	3	Intergenic	novelGene_148774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGTACAGTTCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331180	334549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_332535_333156_333268_334072
790836	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
790837	contig_7357_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_36917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGGTTTTCAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528470	530177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_528500_530200
790839	contig_1594_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_138823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGCAATGATTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511348	511736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_511300_511700
790841	contig_1594_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_138824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514536	514798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_514500_514800
790842	SIRV6	+	281	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	102	-6	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790844	contig_2438_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_111998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCAAGGAGCACCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185715	184706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_184700_185700
790846	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
790849	SIRV7	+	441	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACGCATCTATAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56048	114847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114680
790850	SIRV4	-	255	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1263	3	1263	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3895	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
790852	contig_11986_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_69246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGTCCTGCGCCATCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802957	802000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_802000_803000
790858	contig_4301_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_65147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAGTATTTAAACATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710344	711891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_710300_711900
790862	contig_16103_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_118954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAACGAAAATCCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016083	1016850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1016100_1016800
790869	contig_233_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_14683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAACTCAGGTGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96263	97862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_96300_97900
790872	contig_5696_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_117526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTGTTTTGTGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445234	444029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_444000_445200
790875	contig_8330_pilon	+	1754	13	Intergenic	novelGene_71763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	227.011869488996	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	52	1524	648213	658351	FALSE	5	CCCCTGGTACCGGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREHEGRLRYLSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDCYGSSRSHHRRRSREREPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVFMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHNSRNPSR	644828	658581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_644880_648212_648365_649087_649305_651159_651257_651531_651599_653909_654027_654809_654977_656163_656259_656348_656479_656695_656779_657150_657231_657420_657512_658174
790876	contig_7839_pilon	+	2066	7	Intergenic	novelGene_45667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	55.6639220880295	11	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1803	264	2066	12482	20217	FALSE	30	TAATCAGCCTCCAGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRNPGYILSCSPGWRLRLTTSFLLSIFPLLDLLPAALPPGAGPGPIELEVLAAGVAAVAWISHSLALWALAHSPHCRSRGPLALALAAFLPAPALVLTLLWHCQRGTLRPPLLPGPLARLCLLVLQLAALLAYGLGWAAPGGQQEPWPQEPLLSEGQEPEVAEDGESWLSRFSYAWLAPLLARGARGELRQPQDICHLPYRLRPTYLACVFQEHWQEGVQLWRALYRAFGQCYLTLGLLKLVGTMLGFSGPLLLSLLVGFLEERQEPLSQGLLYALGLSSGAVLGAVLQNQYGYEVQKVMLQARGAVLGILYRKTLQLGPSRLPAGEALNLLGTDSERLLNFAGSFHEAWSLPLQLAITLYLLHQQVGIAFVGGLVLALLLVPVNKVIATRIMASNQAMLQHKDVRVKLMTELLSGIRVIKFCGWEQALGTRVEACRARELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVISIVIFITYVLMGHQLTATKVFTALALVRMLILPLNNFPWVINRLLEARVSLDRIQRFLDLPNHNPQAYYNPEPPTEPSTVLELHGALFSWDPVGTTQETIISHLKVKKGFLVGIVGKVGSGKSSLLAAIAGELHR	11971	20217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_12030_12276_12490_14604_15824_16801_17030_17871_18029_18298_18409_20136
790880	SIRV2	-	235	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	690	23	690	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4042	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
790882	contig_16510_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_139073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	18	392	235677	235303	NA	25	GAGTACTACCCGTCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTYAVVQKRGAPEVARPEASGRRVEAAPLYTQVTPRALRPRADTAGVATRAEDARRALTGHGEFGSLRGSCKRPAPRLLSQAVHPPRTRGTQKPLTEKRTPFPESGLATPRRLTSGFPGHAPW	235694	235302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_235300_235700
790883	contig_16510_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_139071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	547	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTGGGGACTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235351	234465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_234500_235400
790885	contig_10354_pilon	+	1663	6	Intergenic	novelGene_50857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	267.2	1	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCTTCCACTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432243	476234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_432469_432931_433034_434103_434158_471884_472041_475056_475536_475587
790887	contig_755_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_119783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553073	550916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_550900_553100
790889	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
790891	contig_16113_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_140540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAACAAAAAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3525	2124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_2100_3500
790892	contig_19680_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_132019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGCTGGTTTCGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216845	217722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_216800_217700
790893	contig_5649_pilon	+	1291	6	Intergenic	novelGene_82333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	59.5718054116207	249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	271	852	480530	494677	FALSE	10	TTTTGTGTCTTTTTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNTFQSGFLSILYSIGSKPLQIWDKKVRNGHIKRITDNDIQSLVLEIEGTNVSTTYITCPADPKKTLGIKLPFLVMIIKNLKKYFTFEVQVLDDKNVRRRFRASNYQSTTRVKPFICTMPMRLDDGWNQIQFNLSDFTRRAYGTNYIETLRVQIHANCRIRRVYFSDRLYSEDELPAEFKLYLPVQNKAKQ	480259	495116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_480614_492102_492183_492851_492964_493558_493748_494097_494209_494671
790894	contig_5968_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_112202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAGACAGCAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665590	666850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_665600_666800
790896	contig_16578_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_148639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAAATGATGAGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138520	138821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_138500_138800
790898	SIRV6	+	390	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	14	379	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	265	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790905	contig_7035_pilon	-	1136	5	Intergenic	novelGene_83511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_4	117.526592735432	370	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	186	866	305338	225899	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKKSPTRPKRQAKPAADEGFWDCSVCTFRNSAEAFKCSICDVRKGTSTRKPRINSQLVAQQVAQQYATPPPPKKEKKEKVEKQDKEKPEKDKEISPSVTKKNTNKKTKPKSDILKDPPSEANSIQSANATTKTSEANNTSRPRLKNVDRSTAQQLAVTVGNVTVIITDFKEKTRSSSTSSSTVTSSAGSEQQNQSSSGSESTDKGSSRSSTPKGDMSAVNDESF	305523	225628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_226152_226573_226673_226760_226938_304456_304583_305312
790911	contig_6446_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_149210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGAAAATGCAAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330910	331904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_330900_331900
790912	contig_1594_pilon	-	1278	8	Intergenic	novelGene_138818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	85.2851160543747	188	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	247	1056	730900	503479	FALSE	15	TTGCTCTGGGAATTGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPMPGHPVNFSSVTLEQARKDVEQLEQLIESHDVIFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETV	737356	503256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719919_726773_726890_729033_729238_730723_730919_737128
790914	contig_14786_pilon	+	1305	4	Intergenic	novelGene_174706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_1	54.9019327731021	812	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	58	447	35571	66036	TRUE	0	TTGCTTGGGTTTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRALRRPQFLPLLLLLSGVCPQVDGCNETRMLEKLPRCGKAFAEMMQQVDVWKWCNLSEFIVYYEIFTTCTEVETNLVGCYWPNPPGRELHHPHPQAVLFQLHRGQGALGRPPRMRFSFHSSLCPSC	35513	67086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_35629_60316_60450_65837_66092_66283
790915	contig_8702_pilon	+	2311	7	Intergenic	novelGene_157734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	181.689677441755	278	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	152	1609	66903	84628	FALSE	15	CCATCTGTGTCATTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLEKVKLLHGGVAICSRGTPLELVNGDGVDSKIRCLDDPSTQIREEEDEMGTTVASGTAKGSRRRRQNNSAKQSWLLRLFESKLFDISMAISYLYNSKEPGVQAYIGNRLFCFRNEDVDFYLPQLLNMYIHMDEDVGDAIKPYIVHRCRQSINFSLQCALLLGAYSSDMHISTQRHSRGTKLRKLILSDELKPAHRKRELPSLSPAPDTGLSPSKRTHQRSKSDATASISLSSNLKRTASNPKVENEDEELSSSTESIDNSFSSPIRLAPEREFIKSLMAIGKRLATLPTKEQKTQRLISELSLLNHKLPARVWLPTAGFDHHVVRVPHTQAVVLNSKDKAPYLIYVEVLECENFDTTSVPARIPENRIRSTRSVENLPECGITHEQRAGSFSTVPNYDNDDEAWSVDDIGELQVELPEVHTNSCDNISQFSVDVMGGLDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGSQLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQMLVEQMVDGSMRSITTKLYDGFQYLTNGIM	66751	85330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_67503_71857_71903_74326_74555_76058_76287_77868_77923_82864_82986_84446
790923	contig_12128_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_131964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCATTCTTTTACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126426	128308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_126400_128300
790928	contig_6299_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_172936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGTACTGGCAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948656	950984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_948700_951000
790930	contig_3241_pilon	-	2345	1	Intergenic	novelGene_146426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATGCAGTCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993905	991560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_991600_993900
790933	contig_11370_pilon	+	770	3	Intergenic	novelGene_98741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2676	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	158	526	146436	148303	FALSE	10	AGTGCTGTGTGGTTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALHGVPALPGSVREGEAATRPPNSAPEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	146278	148547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_146518_147426_147616_148205
790935	contig_12127_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_130105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93867	95821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_+_93900_95800
790937	contig_3004_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_127527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	447802	447485	NA	60	GATTTTTAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWVRHTLVFKVPPLFFNTLKRSFAADLPNAMHLLISWPLLPWVLIVDPSKMKSLTTSIFSLFVMIVHIKFLGEHLKHKKSSVNVCWEYFYSQVLWSVTYTLFIL	447802	445764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_445800_447800
790939	contig_15021_pilon	+	1682	5	Intergenic	novelGene_27000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	11.3880419739304	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	16	1089	483495	487607	TRUE	25	CAGCCATGCCCAGTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVDVMAALSRQVFDWHRLIPLTGASVARQTSRLGEQRRTIASLLPPLTTVSRGGSLEELSRVKSRKYVQESECRTDLTRCLLEQPRTPVDGGALGLETITTSLRDMGFSDAHVGELLSIQPGPSPQQLLDITSELILLGLNPEPVCVALKKSPQLLKLPMKQMKKRSSYLRKLGLGEGKLKRVLYCCPEIFTMRQRDIDDIVGVLREKCLFTVRQVTEILHRCPYVLREEPGELEYKFQYAYFRMGIKHRDVVKTDFLQYSITKIKQRHIYLERLGRYQTPDKKGQTQVLNPSLKDIFRVSEAEFLVKTACSSPEEFEVFKKLLAREEEEGPGGCTSDDSASSDGDVEDRDAEEEFTDGRD	483479	490775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_483516_484302_484802_486390_486576_487238_487625_490199
790940	contig_11984_pilon	-	1568	12	Intergenic	novelGene_174711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.49627822140836	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	2	1288	216920	190340	FALSE	0	TTTCTGTGTCCCGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQGKIYPFRGTFPPVWNPIAYLDYNNLWRTMDNMGKEIPAEAPWDAPHAEEWDKLTMKDLIDKICWTKTARQFAYLFVNINVTSEPYEVSALWFLWYVKQCGGTTRIFSVTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGERVKLSCPVSYVDQSGENIIVETLNHEVYECKYVISAIPPVLTSKIHFRPELPPERNQLIQRIPMGAVIKCMMYYKEAFWKKKDYCGCMIIEDEEAPISITLDDTKPDGSLPAIMGFILARKSHRFAKLHKEIRKRKICELYAKVLGSQEALQPVYYEEKNWCEEQYSGGCYTAYFPPGIMTQYGRVIRQPVGRIYFAGTETATQWSGYMEGAVEAGERAAREILNALGKVAKKDIWVQEPESKDVPSVEITHSFWERNLPSVGGLLKIIGFSTSITALWLVVYKCKLLNRP	216921	190059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11984_pilon_-_190487_190681_190745_190942_191055_192791_192890_194034_194093_198262_198317_202855_202953_203854_204015_204302_204453_214414_214557_215955_216048_216806
790943	contig_9321_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_174722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACCATGCCTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47848	48474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_47800_48500
790944	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_98147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	CTTGCAGCTACCCACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
790946	contig_9481_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_149684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463466	462625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_462600_463500
790947	contig_13211_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_123147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTTTATGACTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286347	285362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_285400_286300
790948	contig_12520_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_161074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500023	499042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_499000_5e+05
790950	contig_521_pilon	-	1785	11	Intergenic	novelGene_174731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	58.2224183626891	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	200	1264	27162	14411	FALSE	10	GGAATCTGGGTTTTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVRAQPSLLAEMLRLRIGLIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQMTRRFSADEQFFSVGQAVSSSAHSSKSVRSSTPSSPTGTSSSDSGGHHIGWGERQGQWLRRRRLDGAINRVPVGFYQKVWKILQKRRERYDGKNLNAGSAAASHRRLISRALDRRSARLVLMTPHEIKFAVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTLLSDTEMSSLGGIIHVDQIVRTANQLFLQDQMAIGTLDTLEKDQATGVCHFFYDSAPSGAYGTMTYLTKAVASHLQELLPNSGCQMQ	27652	13889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_14582_15140_15342_16067_16176_18320_18492_20380_20435_22208_22239_23050_23170_26338_26441_27053_27184_27277_27357_27553
790951	contig_2100_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_50647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067421	1069155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1067400_1069200
790952	contig_5231_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_65880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112158	113562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_112200_113600
790955	contig_3233_pilon	+	1073	9	Intergenic	novelGene_56550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	291.438645987453	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	203	973	740857	747909	FALSE	60	AACACATAGAAAATAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738698	748009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
790961	contig_18869_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_56266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
790969	SIRV6	+	547	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790970	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
790972	contig_12312_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_63978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	862	1185	279737	280060	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTYVVVVELILTHGDPMCAEKNCSVGFSRLCPFRSTLPCLSSKMPLSGFEPPAFPVVVKHLTAYATPGILHSRLFRCNYFLPNNFSNYLSVYPNLPKVVAKSKKIL	278875	280754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_278900_280800
790973	contig_10765_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_122880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTCCCCAGCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42580	42917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_42600_42900
790975	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	35	AATGAAAATGCCTTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
790976	contig_9656_pilon	-	1373	2	Intergenic	novelGene_121899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	127	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAAAGGACATGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101207	96143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_97333_101023
790978	contig_1143_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_86629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAGAGCTGCTTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278007	1276050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1276000_1278000
790979	contig_14450_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_48942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523261	521407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_521400_523300
790981	contig_6361_pilon	-	1536	7	Intergenic	novelGene_23888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_6	69.5575301459159	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	75	923	109608	103005	FALSE	65	TTTTTAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARYYAAFSRNLICYFFKCIYLLL	119059	102391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529_109610_118986
790983	contig_14727_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_56654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312505	310264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_310300_312500
790986	contig_12454_pilon	+	1095	3	Intergenic	novelGene_171735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	49.5	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	182	1093	110006	111565	FALSE	25	ATGAAGTGGATGGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLYPVQPSPSVSNNWTKLNLENYSWEEWDMPYEPLDYNDPSIEAAAPCHSCNLLDDSSLPFFIVASVLGTLASGTVLLALLKPLFHWELCRGRPILIQLPVGSAAFSVVVPILAPGLSSSHSTTLCCLGHWVWYSAAFAQALLIGCRACLGPKLDVFQVSRLTLGLTVGVWGMAALLALPITLASDTSQGLCTLTSSRGLGTLQYMHAAVCFAVFFLLPLGLVGAKGLKKTLDRGPGPWVDILWVWFTFWWLHGVVLGLDSLTLPFPPCPSMQDSLLMWTPLEANPSSHSSRQPELKCMLL	109824	111567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12454_pilon_+_110027_110532_111307_111448
790988	contig_10238_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_170102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTCAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415409	414834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_414800_415400
790989	contig_15118_pilon	-	2027	7	Intergenic	novelGene_74564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	31.614430600949	4	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	865	1575	216747	214422	FALSE	15	CTTATTTTTTCAGATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIPLPILEGQSLRLVCVADSNPPAELSWFQGSQALNASPVFNMSDLELPPVRTGNEGEFTCQAQNSLGSQQVSLCLSLLSPTDSPQLPHPSCSWEVEGLHCSCSARAWPAPSLRWRVGDQLVEGNSSNASVTVTSSSTGSWANSSLSLHKGLSPGLGLYCEAGNDHGNQSVTVLLLAENSFCCTCFTKVKEGSWPLVLTLIRGAVMGAGFLLTYGLTWIYYTWCAGTQRSRAD	218984	213969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_214456_214591_214728_216123_216418_216500_216759_217488_217537_217967_218247_218458
790990	contig_610_pilon	-	907	2	Intergenic	novelGene_76725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	0	67	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252608	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_252475
790991	contig_18869_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_56140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
790992	contig_8268_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_146997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACAGCAAAGTAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32967	32401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_32400_33000
790993	contig_6361_pilon	-	951	6	Intergenic	novelGene_24028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	280.899270201971	2301	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTTTTATTATTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594674	551041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_551475_552728_552804_556742_556858_572329_572455_577570_577700_594600
790994	contig_13510_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_164199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTACATTCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71316	73588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_+_71300_73600
790995	contig_10159_pilon	+	1445	10	Intergenic	novelGene_30861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	130.326749857407	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	114	1046	902231	982706	TRUE	45	CGTTTTGAAAGAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIKKQKTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDGGSFHRWSDQHEHSHHTACLHG	902117	992694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_902258_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982638_982861_992071_992208_992585
790998	contig_7887_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_124944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814300	816504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_814300_816500
790999	contig_10661_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_174743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAAGAGTGTTTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133393	135622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10661_pilon_+_133400_135600
791000	contig_5210_pilon	-	1977	8	Intergenic	novelGene_65483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	290.926458201437	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	640	1719	1152831	1101153	FALSE	40	AAATCTTATTTCAATAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFPVSGLEFSLPIPCYPVVLFWSLTADFLNDSPLLLALCSDLFYWNSLGVWFFFSIAALTSKRSLVLMPESSAEEITVCPETQLSSSETPDFEREVSPSSRETPDEVRIIMADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAMYCNGLMEQDTVLTRRQKEAKSKSKSDTGTAAQTSLDIDKSEKCYLCKSFVPFREYQCHVDSCLQLAKGDQGDGPSGSDSVCPVAEGKQQQRLRSTKEKGQNEGRLLSVLEQSEQQSADAEIKTTSSETGAFRVSSLGMEEAGCSREMQSSLAHLDINDSPIKSFVSISEATDCLVDFKKQFTVRPGSRARTKAGRGRRRKS	1153470	1100894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141824_1141979_1147997_1148102_1152584
791001	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	171	413	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
791002	contig_3212_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_174747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	109	450	110795	111136	NA	40	CTAAAATATTCTTTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGRIDRIIYLPLAEAATRREILNLQFHSMPVSNGIDLILQTYSGTEIIAVCREAALLALEEDVQANCIMKRHFTQALNTVTPRIPKLLRLFMKTIKRRVGYIHSEKMYIFIM	110686	111136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3212_pilon_+_110700_111100
791003	contig_8978_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_49496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGATCAGGCTTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1791091	1791825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1791100_1791800
791004	contig_9424_pilon	+	1271	4	Intergenic	novelGene_143765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	86.5113993773203	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	235	861	8600	22598	FALSE	15	GTTTGATGGTTTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISGEKEKRTKTDALYSTYLKFCVKEGMMDNGSYSNLPDKLPVFSDSANLPLTRSFYLDPMVTLHLYPEAPVPSPYSEELPLLPFSSGSMIMENYGDPCTFSFPMPYPNYRRCEYSYGPAFIRKRNERERQRVKCVNEGYARLRHHLPEEYLEKRLSKVETLRAAIKYINYLQSLLYPEEAKTKNNPGKGLSITATTSCHTDPIFRIV	6530	23008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_6641_8475_8611_20484_20543_22040
791005	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_95113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
791006	contig_2716_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_173560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTCTCAGCAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872456	872045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_872000_872500
791008	contig_19934_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_166639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329600	331390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_+_329600_331400
791010	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_97732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
791011	contig_4678_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_126010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAGTAGCTAAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221888	222499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_221900_222500
791013	contig_15631_pilon	-	1279	11	Intergenic	novelGene_151534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_10	4.90815647672321	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	44	1183	364577	361423	FALSE	45	TTATATATTTTAACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARQTFQRDLPVGFMSRSGAGTEQHQPASEADATETTFRASEHQHIRYNPLQDEWVLVSAHRMKRPWQGQVEPPPLETVPRHDPHNPLCPGATRANGEVNPYYDGTFLFDNDFPALQPDAPNPGLSDHPLFQTEAARGVCKVMCFHPWSDVTLPLLSVPEIRAVVDAWASVTEELGAQYPWVQIFENKGAMMGCSNPHPHCQVWASSFLPDIAQREERSQRAYQNQNGGPLLMEYGRQELHRKERLVLTSEHWLVLVPFWAVWPFQTLLLPRRHVRRLPELTPAERDDLASVMKKLLTKYDNLFETSFPYSMGWHGAPTGSEAEADWDHWQLHAHYYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAQAQRDLTPEQAAERLRALPEVHYRLGQKDRVTATIA	364620	361326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_361504_361771_361927_362246_362331_362432_362566_362856_362980_363136_363194_363342_363473_363595_363645_363731_363808_364034_364205_364495
791015	contig_7457_pilon	-	1022	3	Intergenic	novelGene_31369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACTCAGCCACATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363879	360163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_360886_362201_362322_363699
791016	contig_3409_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_172307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96134	94740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_94700_96100
791017	contig_10749_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_133443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCCACAGTGATTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142320	135865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142190
791020	contig_10106_pilon	-	1887	2	Intergenic	novelGene_73896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGAACAAAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164393	162441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_163900_163964
791022	contig_3575_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_141126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCATATGAAAGTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787510	786860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_786900_787500
791023	contig_7657_pilon	-	2383	5	Intergenic	novelGene_30020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_4	548.659901487251	127	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	219	647	174162	154452	FALSE	15	TTGTATGTATTTGCGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEADNLDSIKEEWVCETGSDNPPVSDNRQRNCEYFVDSLFEEAQKIGAKRLSPTEKKKQVDVSIKLWKNGFTVNDDFRSYSDGASQQFLNSIKKGELPLELQGIFDKEEVDVKVEDKKNEVFMSTKPVFQPFSGQGHRLGR	204362	152715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_154594_159603_159711_167271_167411_174121_174177_204158
791024	contig_762_pilon	-	1203	8	Intergenic	novelGene_135936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	32.9712305020047	1105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	449	907	259754	255535	FALSE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGLL	266759	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_256436_256765_256905_257514_257668_259724_259837_263480_263602_263903_264056_266666
791027	contig_14441_pilon	-	1093	5	Intergenic	novelGene_100382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	169	360	126577	126154	TRUE	40	TGGAGGAAGGAGACAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSL	126745	30839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_31148_121187_121237_125515_125888_126149_126282_126513
791028	contig_6227_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_49706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	26	301	1149936	1149661	NA	25	CACCCAGCAGCTCTACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGTVKKEIMLYLKFVIYIARYFLAVCPVENCGSVCFNCSVLLLEAYFVSFSKDLEQSLLNLVASVEACQDLLTLQGSTCFFPLQYEEWLLAICYSKAVR	1149961	1147803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1147800_1150000
791030	contig_10104_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_160140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTGGCTGCTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536595	535438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_535400_536600
791031	contig_20939_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_172447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTGAAATTCACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112102	112937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_+_112100_112900
791032	contig_19851_pilon	-	1020	5	Intergenic	novelGene_29866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGCTGGCACCATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56530	53534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53706_53928_53971_54044_54142_55625_55807_56001
791034	contig_3161_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_84520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAAATAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403308	402152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_402200_403300
791035	contig_1856_pilon	-	2836	19	Intergenic	novelGene_84886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	26.797883185242	35	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	127	2523	395052	306639	FALSE	45	GAACTGAAAATTGACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGSALTTLEAGCVALANSCQNISGGLWGTVVNILLDQSECSMVRREAAFILQNLLVIPMPTEIIKDYTWQGPCVHDEDSGVSLVGKPALQALLYHCHFYEHLNQMVQHCFLGRYTFDLNCSAFDGTSEGSDLNSLDDSFKFWRAPSVLSSRDQDPGSLSTLETMVTPSVGSAEFQPLVPAATLISEASHDQFVVPGQHETTSPQPPHDSSISALLPKQCVLVTPSLLSAICSLLDNLLVIAPRDTANALRQAHLIKLLCGIAAPALIEKCVQELRTSLPSSSPVEHTLAQVSFLLEYLSSVSRLLQSCLLVDPDLVVQEELLKPLLANIVRVLTICTKDVLDAELVSAFHRTWTHLFNLLAALLRKAGGMSLPSITVAIARHWAAVTDMFCKCVGLSATCPTLCITSLQFLSLLLMEEAKRCLQDKDKTIICHSPTVASLLDKTKENQESLERLNEVILQCYEGKSSKDPLKRVAAQALMSLLAVSRRAQRHALKADLIDNCMEQMKHIHAQLNLDSLRPGKAALKKKEDGFIKELSTAMQLLRNCLYQNEECKEAALEAYLVPVLHSLWPWLLMDDSLMQIALQLLCVYTANYPNGCSSLCWSSYGQYPVQPACRGAPSSSLMLCIMKLASQMPLENSAVQQTVFMFLSNLALSHDCKGVIQKSNFLQNFLSLTLPKGGNKHLSNLTILWLKLLLNVSFGEDGQQMILRLDGCLDLLTEMSKYKHKSSPCIPLLIFHNICFGPANKPKILANEKVITVLAACLESENQNAQRIGAAALWALSHNYQKAKTTLKNPSIKRRVDEAYSLAKKTFSDSEESSLNAYYLRCLENLVQLLSSS	395178	306325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_306725_308184_308255_309587_309692_316860_317129_320670_320874_323889_324017_327375_327454_330037_330136_331078_331185_339059_339278_343468_343607_346127_346282_349725_349817_355799_355993_357649_357744_374062_374155_379749_379940_393723_393796_395037
791036	contig_12123_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_144597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACACTATCTTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85140	84469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_84500_85100
791042	contig_11656_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_54045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCTCAACAGTGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538825	540147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_538800_540100
791043	contig_5041_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_27124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATGAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711361	713239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_711400_713200
791044	contig_8729_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_40167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGCTTGTGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793856	794820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_793900_794800
791045	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
791047	contig_2069_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_23548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAATATTTATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512842	1511233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1511200_1512800
791051	contig_9706_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_20803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAATTCCGCTACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
791054	contig_7078_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_130128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTATCTTCTCTATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86901	84866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_84900_86900
791055	contig_13894_pilon	+	1129	9	Intergenic	novelGene_62134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1979.775204253	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	155	382	521729	523542	TRUE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWQEVAR	521574	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522847_523523_523588_524826_525025_525647_525799_526477_526550_526851_526912_527459_527580_528072
791057	contig_7415_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_168679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCGGTGCCGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275556	275003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_275000_275600
791058	contig_7415_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_168678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAACAGATGAAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274741	273445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_273400_274700
791063	contig_18916_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_136867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCATGTACAGTTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10365	8374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_8400_10400
791064	contig_2069_pilon	+	1543	5	Intergenic	novelGene_23357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	38.2516339520288	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	147	1229	947018	955281	FALSE	20	ACTTTCTGTGGCTTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAPTTAFGQVVIGPPGSGKTTYCLGMSEFLRALGRRVAVVNLDPANEGLPYECAVDVGELVGLADVMDALRLGPNGGLLYCMEYLEANMDWLHAKLNPLRDHYFLFDCPGQVELCTHHGALRSIFSQMVQWDLRVRLRLGRPVMQIRLREEGRCHAPMSHSELTAVHLVDSHYCTDPAKFISVLCTSLATMLHVELPHVNLLSKMDLIEHYGKLAFNLDYYTEVLDLSYLLDHLTSDPFFRHYRQLNEKLVQLIEDYSLVSFIPLNIQVLGTRRPLPPGFPRAWDLITSRDKESIQRVLQAVDKANGYCFGVHEQRSLEAMMSAAVGADFHFSSTLGIQEKYLTPSDQSVEQEAMQL	946871	955595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_947513_947996_948154_949924_950152_951355_951487_955208
791066	SIRV4	+	419	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCTAAAGACATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3836	5159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
791069	contig_10861_pilon	-	687	7	Intergenic	novelGene_39358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	1627.9387188166	1717	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	225	638	1583920	1581171	FALSE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEVPSTYQVKSRYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1585435	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1583886_1583971_1584525_1584677_1585412
791073	contig_6551_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_155542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTAGGCAGGATGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149263	150164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_+_149300_150200
791076	contig_16846_pilon	-	978	3	Intergenic	novelGene_82990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	4508.5	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	91	393	552791	551492	FALSE	25	ATTTGGGCCAGGGGAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558746	550906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_558688
791077	contig_3424_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_55493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTGCTGTGAAGTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155121	155606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_155100_155600
791078	contig_5229_pilon	-	1890	17	Intergenic	novelGene_117683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	36.5066346709745	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	190	1470	423297	371213	TRUE	0	TGTGTGCTCTGCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSGRSKDSTQSQVFERKEGEVVRAAQLGRKVAVADYVDPSPRGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIRDAQHYGWEVTHPIPHNWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVDYFNIKASFVNEHTVCGVTKGGKETLLSADHIVIATGGRPKYPMHVEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLSGMGLDTTVMIRSIPLRGFDQQMASLVTEHMASHGTQFLRGCTPLQVRRLPDGHLQVTWEDRASGRQDTGTFDTVLWAVGRAPETRSLNLEKAGVNTNPDNQKIVVDAREATSVPHIYAIGDVAEGRPELTPTAIMAGKLLAQRLFGQSLDLMEYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHVEVYHAYYKPLEFTVAERDSSQCYIKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCAEEVAKLRISKRSGLDPTVTGC	438316	369825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_370147_371113_371337_374365_374464_374779_374852_376983_377077_377707_377804_381475_381613_396235_396411_399927_400020_400687_400708_409295_409367_419509_419573_420299_420379_422209_422285_423211_423357_423736_423794_438243
791079	contig_12120_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_21443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTTCCAGCAGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248243	247293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_247300_248200
791083	contig_6710_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_97748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
791084	contig_7605_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_172956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340545	341187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_+_340500_341200
791085	contig_1244_pilon	-	636	2	Intergenic	novelGene_38021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCATATTTATGCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923535	922794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923435
791088	contig_9415_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_109793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1146	1454	1680895	1681203	NA	85	CATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNFRPWWHSQLSARLLTKRLVIRIHEQCCGRKDLTVCSHKDYSLGNPMGQFYSVTWGHYELESTHGTQQQHLLFKNYEKFQICKSIVNIENSHLDGPTTQL	1679749	1681770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1679700_1681800
791089	contig_9972_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_162789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAAACCCATTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198041	195465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_195500_198000
791090	contig_3894_pilon	+	795	6	Intergenic	novelGene_174750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	21.5870331449229	88	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	173	793	305820	325149	FALSE	25	GGGTAAGAATCTTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRLHFSHYSPLPGFLICLREEVEKIQPLFSAWKGKQNNFNSVLKKFFPRTFFRDFTQMMYTMKKEYVFWASVCLLLSRAPAPLKAGSEEGAKLTNLTDIKLPPLKLINSFCALKADDGPCRAMMKRFFFNIHTQQCEEFVYGGCEGNQNRFESLEECKEKCTRDYQKIMKTALQKGKPEFCFLEEDAGICRGYITRYFYNNQSKQCERFKYGGCLGNLNNFESLEECKNTCEDSVSNFQVDDFRIELDAVNNSLTPRPTKVPRI	278373	325151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3894_pilon_+_278544_305817_305941_315265_315464_320622_320659_324205_324383_325060
791091	contig_3894_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_174751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTCCTGGCAGGAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329134	329931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3894_pilon_+_329100_329900
791096	contig_12079_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_67415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTGTAAACAAAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554586	553131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_553100_554600
791099	SIRV4	+	401	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATAGTTTTTATTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
791101	contig_7963_pilon	-	885	7	Intergenic	novelGene_58310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1556.50417603038	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	48	299	48841	43558	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREERAASGTRCADTTTSWTRASP	48888	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39276_39405_39949_40047_40117_40232_43546_43622_43730_43819_48741
791102	SIRV6	+	385	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	9	389	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
791109	contig_17976_pilon	+	1300	3	Intergenic	novelGene_32495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	2	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	205	1221	41843	47385	FALSE	25	GGTGCTGCCCATAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41638	47464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
791111	contig_12292_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_167008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGCAAAACATGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301937	304347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_301900_304300
791113	SIRV6	+	225	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	505	53	505	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10742	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791115	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
791116	contig_9471_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_21845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAATTTATATGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416192	417514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_416200_417500
791119	contig_20596_pilon	+	1799	10	Intergenic	novelGene_157228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.82768510921654	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	388	1146	56185	69001	FALSE	15	TCCATCGGTTAGTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGPGEDVDLFDIEQFKSSFTKILQRALKNVTVSFRDAEENAVWIRIAWGTHHTKPNQYKATYVVYYPQTPYVFMSLSRLKRNIPLLDQALMIASKHHQIVKIDLRSRYLDSLKAIVFKQYNQFFETHNSTAPLQETSLWLDTNMDLRVIHENKIEKERVQRVTRETFGDCPQPRLEFAQYKLETKFKSNLNGGILADREEPLRCMIKFSSPHLLEALKSLAPAGIADAPLSPLLTCIPNKGMNYFKIKDK	41709	69654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_41872_45829_46011_56140_56201_56494_56572_59511_59689_61250_61353_64988_65053_66344_66458_68539_68667_68918
791122	contig_13460_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_162192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAGAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292801	294759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_292800_294800
791124	contig_12032_pilon	-	1683	9	Intergenic	novelGene_139266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_8	113.890023707083	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	58	1377	122315	96750	FALSE	15	ACTTGGCAGTCTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVSGELGLLLPKSRLRGHMAQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	122372	96443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
791128	contig_1759_pilon	-	1888	4	Intergenic	novelGene_171331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	12.8322510366134	80	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	692	1282	56906	50228	FALSE	45	AATGGTGAGAGAATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPSKYCTSYSISDINTVSFHMYF	93008	49621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_50681_56768_56915_64867_64939_92396
791131	SIRV5	-	417	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
791132	SIRV6	+	478	5	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	120	359	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQWSWRWSDCSLKSSKKQLDHLFSELPNVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2288	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2377_2426_2621_2740_2815_3106_3165_10724
791133	contig_6048_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_73147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCCAATCACCAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034783	1032688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1032700_1034800
791134	contig_9995_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_47793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCATTGAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781581	780823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_780800_781600
791135	contig_2278_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_118152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8659	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAGAATAAAGTGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471649	1470453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1470500_1471600
791137	contig_14300_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_133102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182678	183861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_182700_183900
791138	contig_10451_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_138310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGAGGGGGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146651	145975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_146000_146700
791139	contig_5286_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_157357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGCTGGGAAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542278	540879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_540900_542300
791141	contig_1154_pilon	-	1598	6	Intergenic	novelGene_87245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	24.429490375364	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	1231	1596	1856553	1850989	FALSE	20	CACAGACGTGGTGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPSLSIHDKTTSELGKGPLAAFVKTKVWSLIRLARRYLQKGYTTLLFREGDFYCSYFLWFENEMGYKLQIIEVPVLSDDSVPIGMLGGDYYRKLLRYYNKSHPAEAVKCYELLALHLSVI	1860253	1850986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856607_1857686_1858451_1859840
791142	contig_3130_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_103559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTACCATGAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55511	57472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_55500_57500
791146	contig_10196_pilon	-	1712	2	Intergenic	novelGene_132304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2353545	2348167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495
791148	SIRV6	+	306	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10519	1	1282	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11519	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
791153	contig_6446_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_149230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAACAATTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461684	460201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_460200_461700
791155	contig_12250_pilon	+	1547	9	Intergenic	novelGene_80573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	73.217036098165	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	239	1519	311980	314315	FALSE	30	TGGTAATTAAACTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQLQDMLSWMQPGVSITSSFALSQYGVDMGWTLPECSITDSVTMTQPMEPNPPQQPRLALGSSLPNTKHSPHFPQEPASRTHPEPLTGHHFNLAPIGRRRIQSRWASTRGGHKERPTVMLFPFRNLGSSAQVISKPENRRQHWTHTADPACAVGTRTASAGKPKCPSQHLGGRALKENPVGSSASEQKENCLDCALDPLKLSLSPPRTRKPASSPSLCSPIITIGDLVLDSDDEENGQREGKPYKQFSGNEVEVQDWVA	311741	314343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_312793_312871_312969_313132_313596_313684_313753_313856_313949_314261
791156	contig_17274_pilon	+	2005	14	Intergenic	novelGene_26529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	345.480969941495	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	74	1387	163818	186645	FALSE	35	AGCTCCAAATCAACCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHTGRRLRAGPAPTPSSARADNDRMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGKEN	131649	187263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131722_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547
791157	contig_14029_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_151935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAATTTTTAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117002	115811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_115800_117000
791158	contig_9400_pilon	-	564	5	Intergenic	novelGene_146587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	115	junction_2	636.015870478088	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	115	333	135537	121567	FALSE	30	AATTGAGATCCAATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTASSQGTIQPPRNN	158630	121335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_132506_132600_135452_135561_158539
791159	contig_4125_pilon	+	2343	18	Intergenic	novelGene_25175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_11	62.3144165116734	100	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	172	1950	1126708	1261661	FALSE	5	GCTTCCTTCTGATGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTGAKMDGSGCRVRLKAHYSGDILITSLDAATTFEELCEDVREMCRLHQGQPLTLKWVDDEGDPCTVSSQMELEEAFRLSCQRRDEGLIIHVFPSIPKEPGMPCPGEDKSIYRRGARRWRKLYRANGHLFQAKRFNRRAYCGQCSERIWGLGKQGYKCINCKLLVHKRCHVLVPLTCEKHMDSVMPSQEPPVDDKNDDVDLPSEETDGIAYISSTRKHDNIKDDSEDLKPVIDGMDGIKISQGLGLQDFDLIRVIGRGSYAKVLLVRLKKNDQIYAMKVVKKELVHDDEDIDWVQTEKHVFEQASSNPFLVGLHSCFQTTSRLFLVIEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYAAEICIALNFLHERGIIYRDLKLDNVLLDADGHIKLTDYGMCKEGLGPGDTTSTFCGTPNYIAPEILRGEEYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRSPFDIITDNPDMNTEDYLFQVILEKPIRIPRFLSVKASHVLKGFLNKDPKERLGCRPQTGFSDIKSHAFFRSIDWDLLEKKQALPPFQPQITDDYGLDNFDTQFTSEPVQLTPDDEDVIKRIDQSEFEGFEYINPLLLSTEESV	1126536	1262054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1126779_1133584_1133707_1135701_1135792_1137465_1137517_1217039_1217126_1221223_1221356_1223397_1223480_1224623_1224677_1226875_1227065_1230426_1230525_1247308_1247396_1248276_1248413_1248570_1248659_1249987_1250108_1250937_1251018_1251780_1251871_1260863_1260980_1261573
791165	scaffold_17542_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_139225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAACATTTTATGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321206	320167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_320200_321200
791167	contig_5502_pilon	+	1034	8	Intergenic	novelGene_154965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	568.964723988102	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	246	809	362878	439183	TRUE	25	GTAAGCAGAGTTGCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HASSLAALPLSRCSAAQSRQPAAARQRHDRSGLCDADHKRCLCQRRPGPGLIPEAAQDHQEAGTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVPKVEEIEEDCY	357628	442755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360796_362824_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_439147_439210_442556
791168	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
791172	contig_6102_pilon	+	1810	5	Intergenic	novelGene_32401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	6.89202437604511	158	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	163	1185	1797356	1799595	FALSE	25	TGCAACTCTATGCCACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACGGTCKNKVTVSKPVWDFLSKETPARLARLREEHRVAILIDGETSDIYVLQLSPQGPPPAPPNGLYLARKALKGLLKEAEKELKKAQRQGELMGCLAFGGGGEHPELHRPGPPPLRAAPLLPPGARGILPPPPPLPPPLPPRLREEAEEQESTCPICLGEIQNAKTLEKCRHSFCEGCITRALQVKKACPMCGRFYGQLVGNQPQNGRMLVSKDATLLLPSYEKYGTIVIQYVFPPGVQGAEHPNPGVRYPGTTRVAYLPDCPEGNKVLTLFRKAFDQRLTFTIGTSMTTGRPNVITWNDIHHKTSCTGGPQLFGYPDPTYLTRVQEELRAKGITDD	1796659	1800220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1796725_1796915_1796993_1797335_1798085_1798934_1799153_1799519
791175	SIRV4	-	298	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	8	1215	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
791176	contig_5988_pilon	-	1760	12	Intergenic	novelGene_15886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_10	64.0409218345699	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	162	1061	532502	529953	FALSE	50	CTCATCATTAATAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	555080	529253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531067_531195_531641_531697_531805_531852_531991_532051_532148_532231_532430_532584_549379_549429_555049
791183	contig_12265_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_149439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25255	26779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_25300_26800
791186	contig_835_pilon	-	2699	2	Intergenic	novelGene_152151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATAGACATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206356	203344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_204536_204848
791188	contig_7728_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_64730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAAACCATGGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769237	767526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_767500_769200
791190	SIRV1	-	223	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3881	0	3607	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6759	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
791192	contig_4783_pilon	-	1423	13	Intergenic	novelGene_108377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	258	junction_4	350.63478150349	82	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	207	1271	335593	178051	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERILMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFSDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVTLKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQNEGMAQLDSIGFSVIRKCIHAVETRGKVIQQMTLFSEKVMHLMRSQPCYLQFPNFK	473260	177898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_178212_203798_203836_272584_272664_292845_292941_300778_300880_302093_302224_303697_303803_313098_313210_322707_322810_330045_330118_333871_333934_335583_335680_473140
791193	contig_6445_pilon	+	1428	14	Intergenic	novelGene_76960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	659	1228	64195	88161	TRUE	10	GCGGAGCGGGGCCGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPVHEELQGCAVGGAILDVGHLHRVLELDLKDVRAVGGFGWVLGLCVEIWRRLVLGVLQDSSLIAVLVHAPRVLGGDRDGDSVLLCILHQIIAALEPVVELRHPPGGNNLGTGQEVRTDLLPYLSCGTMRHILGSLPLGNFHLFAGNAGPSKRGAQEVAVLIQCARLDSRPDEFLHKLFADILNVHL	42888	96332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_43153_44517_44575_49740_49893_55482_55611_64137_64207_64869_64937_68007_68097_73277_73311_73993_74051_77848_77952_85273_85481_88159_88220_88480_88598_96307
791195	contig_13014_pilon	+	893	2	Intergenic	novelGene_169348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396462	398247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_397204_398095
791196	contig_11416_pilon	-	475	5	Intergenic	novelGene_145337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	434.326202295003	5921	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	284	340	123185	123038	TRUE	0	CGCCCGTGGCTGTGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLSAPDPAPPCPSAPSATRRCISVRRPLGRRSGPTRYRGRAPGWGSAAERVTSLGKDWHRPCLKCEKCGKTLTSGGHAEHEGKPYCNHPCYAAMFGPKGFGRGGAESHTFK	124643	122797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_124497
791197	SIRV2	-	418	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4455	34	3280	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
791202	contig_11293_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_134687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCATTTATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165826	164301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_164300_165800
791204	contig_12951_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_68235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804745	806764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_804700_806800
791205	contig_13593_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_156137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTAAATGAGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187853	187149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_187100_187900
791207	contig_5361_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_167223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAGAAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633117	632880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_632900_633100
791211	contig_6102_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_31997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCCTTTTTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447059	448599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_447100_448600
791212	contig_14142_pilon	+	1899	2	Intergenic	novelGene_120429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_1	0	244	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	380	400	35422	35442	FALSE	10	TGTCTGTCCTCCTTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGNGTGTAARVVRLRRVVKCPFCRVPSALPRGGVTEISVDQDLWSRLEEKARAKCEQDEAGSPVRERGDADVETDEEESEKGAGPRSAGWRALRRLWEQVLAPAHHWRRPLPSNVLYCPEIEDIAHMTRCRL	34942	36941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_35287_35386
791213	contig_6710_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_93542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653782	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
791214	contig_11253_pilon	-	894	6	Intergenic	novelGene_126811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_5	170.892246752157	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	100	894	126321	14889	FALSE	30	GTGAGTTGGATAATTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGERRREEEVLLAASVASAAGRLGSSPAFAAAMDEQAGPGVFFSNNHPGAGGAKGLGPLAEAAAAGDGAAAAGVARAQYSLPGILHFLQHEWARFEVERAQWEVERAELQAQIAFLQGERKGQENLKKDLVRRIKMLEYALKQERAKYHKLKYGTELNQGDMKPPSYDSDEGNETEVQPQQNSQLMWKQGRQLLRQYLQEVGYTDTILDVKSKRVRALLGFSSDVTDREDDKNQDSIINGTEAEIKETAMIGKSELTDSASVLDNFKFLESAAVDFSDEDEDDDIDGREKSIVDTST	126420	14888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_15025_17294_17463_23135_23215_38384_38459_47544_47649_126087
791215	contig_6210_pilon	-	410	3	Intergenic	novelGene_171887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_2	90.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	10	408	93739	84640	FALSE	45	GAATTTACAGAAAACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQDMLANLRDVDELPSLQPSVGSPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTYDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDGIRALAFHPIEPVLITASEDHTLKM	93748	84637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_84784_89630_89768_93621
791216	contig_299_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_129461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTCATGAGTCTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990589	992653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_990600_992700
791218	contig_10159_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_30805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAAAAATTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387379	385310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_385300_387400
791219	contig_11825_pilon	+	1895	5	Intergenic	novelGene_155409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	580	junction_2	805.455306022625	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	126	686	66097	81925	FALSE	30	CCCAGGTACAGCCCACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKIQEEEQKAVEKQCKDKGGTASALVNYRALYPFEARSHDEMSFNSGDIIQVDEKTIGEPGWLYGSSKGNFGWFPCNYVEKMSSSEKALSPKKALLPPAVSLPATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPASVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREE	65143	83134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_65201_66028_66127_77431_77608_77912_78058_81715
791222	contig_13490_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_129123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAGTTCTTTACTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55043	54333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_54300_55000
791223	contig_13490_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_129121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATTGATTTCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45666	44900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_44900_45700
791227	contig_16951_pilon	+	1049	5	Intergenic	novelGene_98651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_3	120.418800442456	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	748	1047	111216	111515	FALSE	20	CAATTTGCTTTGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCPEMLFPVPAWRCQPQQQLPLHVHTTCASSLTPGCIAKGSGLGTSASRVPSPAKVVLVKDNSFTDNWKLDFWKSSMYLRENRSYLLPPVKYYGNMSA	85868	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91172_91463_103952_104099_110476_110582_111169
791228	contig_3627_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_78430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACTTTTCACATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233966	234968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_234000_235000
791230	contig_12837_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_57404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGTGCGCCACAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457046	458408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_457000_458400
791233	contig_6215_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_21241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	410	790	580048	580428	NA	20	GGTGGAGCTTGGATTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLSVWQFSVIEGALDCKSGETGSSSAFITELSCDLKEILKTYLCLNVVICKLKRYLLRACCRTDILYMLGIYKPRYCLHQRGMPLMHSKFWFTKIQYPYGLISLIHHSISYGGGGSCCQVDSDSW	579638	580802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_579600_580800
791239	contig_7963_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_58353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTAGATCTTCCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46412	46922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_46400_46900
791240	contig_7963_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_58354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGGCACAGGCTATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47287	47689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_47300_47700
791243	contig_2069_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_23385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAGCTTCATTGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091213	1090585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1090600_1091200
791246	contig_4971_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_174754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTCTTAATAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361399	359556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4971_pilon_-_359600_361400
791247	contig_6137_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_59132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTTTACCTGAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895001	898800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_895277_898706
791249	contig_12694_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_171990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGAATAAAATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371611	369864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_369900_371600
791250	contig_4891_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_124522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68105	70199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_68100_70200
791252	contig_6633_pilon	+	1474	8	Intergenic	novelGene_143163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	226.301586744913	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	198	1334	23500	36061	FALSE	20	CATTCCTGGTTCAGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLSEANGTFALNLLKKLGENNSQNVVFSPMSISSALAMVFLGAEGNTATQISQALSLNKSRGGGGDVHQGFQSLLTEVNKPGTQYMLRTANRLFGEKTYDFLSSFKDSCRKFYQAEMEELDFANATEESRKHINTWVAKKTEGKITELLSSGAVNSITKLVLANAIYFKGNWDTQFNKEQTKERPFKISKNEEKPVQMMFKKSTFKITYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDGNTDLSTVEKELTYEKFMEWTRPDMLDEEEVEVFLPRFKLEENYDMEDVLRSLGMADAFDQGRANFSGMSSKRDLYLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCVRITPRFCADHPFLFFIQHTKTNEILFCGRVSSP	19031	36201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_19087_22389_22522_23489_23665_25832_25983_28985_29104_30715_30859_32189_32346_35656
791253	contig_6227_pilon	+	2427	6	Intergenic	novelGene_49795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1265	1681	1290901	1291317	FALSE	60	TCAGGGGAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHIFKLHGCLGVVRVPEHSAEEVREESTGTAEDVEGVQVFRDALLDVSDGSGVGHGMVAAACSSQTAQGCGGGRRCQGSTQCSAQLRQWVLLVLLHLLLGPAKQEAPLVVHFTVLGTAAIHAGGGAVPGSRRGSGF	1249850	1292063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1250462_1252822_1252990_1254206_1254373_1254489_1254581_1254971_1255115_1290814
791256	contig_9771_pilon	-	1531	6	Intergenic	novelGene_156914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	100.176643984514	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	66	707	350071	332829	FALSE	25	CCTCAAATGTTTTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVGSADRGASLFLREAFERPMAVDIQPACLGLYCGKTLLFKNGSTEIYGECGVCPRGQRTNAQKYCQPCTESPELYDWLYLGFMAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLL	350136	332004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_339573_339756_341990_342198_346911_347067_347659_347752_350067
791261	contig_11563_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_142304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTGTTTTGAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137687	137444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_137400_137700
791263	contig_6164_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_121277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACTTTCAAATGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480598	481550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_480600_481600
791264	contig_17074_pilon	+	1859	2	Intergenic	novelGene_145190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	127	678	625218	635612	FALSE	70	AAAGAAAAAGAAAGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQPALTVPSSVCSKAQRAESVLWNQPPRCSEVGPCSLPPPCLADLFLLHLEGRQVHGESRVHHSHFPIHHAPGAAGPWTHTAWGRCRHQVLSVPRHLPPRGSPGTAGRAPCLSFFPPRARLARTLRTAGSVPSCSWMHRPSQAVILVFFHWACGGRGCFQCPQAFAGVCVSFHVNSPVAGQL	625091	636793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_625396_635238
791266	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	54	524	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791267	contig_5279_pilon	+	1883	9	Intergenic	novelGene_105554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAAATAAAATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292789	353745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_292908_322519_322658_330144_330247_332944_333071_335227_335374_336366_336465_339168_339286_339887_340242_353061
791268	SIRV6	+	305	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	611	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1732_2780_2829_3106
791272	contig_6710_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_96795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
791275	contig_678_pilon	+	2269	15	Intergenic	novelGene_167846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	32.1841797871474	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	201	1622	495955	512455	TRUE	25	ATTTAGGATTTGATGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKYTKFLKKISQLILEEIPKAEYSSLFNDFVESEFFLIDGDSLLITCLREKSLNWGQNLHFFYLVERYLVDLKSKGGQFAIVFFKDAEYAYISFPELLPLRSALILHLQRNTTIDVQTEFSGCLSQEWKCFLEERYPYFLIVSEEGLNDVQTHLFNFLIIQSWAMKVHVVLSSGQVSDILRLYAYLMPSKYKNQTFFKKSEKMVEGAYKTLMEQLEDSRVLTLAPLFRDVTWTNMMEEACKSLSLLKELWPEGSDIRRVLCVTSCFLSLSMYHHFLLNRKETASDQVTNNCPALQNVEDLCRMHCLSVACLLHLPLSQRARARFITSHWIKEVNSFFKMKKWCEHFILNNIDIFENLNLTHLSDLSDEPLLKNIAFYYENEHVQGLHLNLESAIAKEYEYLWNTVSNLVEGYEVGKPLPLRTTKLHFLKKNPSPIKESFKVKMPNLGFIPVSCKLVDEFVGDILKDLPFLKR	489878	518459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_489973_495848_495959_496144_496209_496962_497153_498909_499252_501165_501283_503702_503847_505519_505679_507810_507947_508737_508894_511211_511318_512451_512566_514057_514219_516809_517063_518336
791276	contig_2703_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_101800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGAATCAAACCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615151	616008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_615200_616000
791278	contig_6710_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_94301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
791279	contig_8801_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_66290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATGTGGTCATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475627	476669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_475600_476700
791286	contig_3789_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_79875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532007	532286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_532000_532300
791287	contig_7457_pilon	-	2076	10	Intergenic	novelGene_31452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	32.1159165954427	190	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1052	1774	475867	474462	FALSE	20	CAGGTGAATGTATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEEDKVSSSNFRQQMLGNLLRPPHKRPELPQNLYVIGLTGISGSGKSSVAQRLKGLGAYIIDSDHLGHRAYAPGGPAYQPVVEAFGPDILHKDGIINRKILGSRVFGNKKQLKILTDIMWPIIAKLAQEEMDLAVAEGKRVCVIDAAMLLEAGWQNMVHEVWTVVIPETEAVRRIVERDGLSEVAAQSRLQSQMSGQQLVDQSHVVLSTLWEPEVTQRQVEKAWNLLQKRIPKMPSGP	478151	474159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_474522_474627_474775_474879_474978_475066_475152_475329_475395_475478_475669_475789_475922_476193_476410_477048_477761_478082
791291	contig_6710_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_95825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653774	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
791298	contig_3529_pilon	-	904	7	Intergenic	novelGene_105387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_5	687.703101313027	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	68	838	790139	777431	FALSE	15	ATCATTCTTTGTATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTDSPVGVRGTLRPPPGSFLIMLSRVVLSAAATAAASLKNAAVLGPGVLQATRIFHTGQPSLAPVPPLPEYGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYMLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYKEVKNRLDYHISVQNMMRRKEQEHMINWVEKNVMKSISTQQEKETIAKCIEELKLLAKKAQAQPVM	790206	777364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713_778894_784507_784634_785190_785355_786999_787146_789784_789822_790099
791301	contig_6494_pilon	-	534	5	Intergenic	novelGene_108551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1012.9778810517	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	67	456	6872	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKLNSMSFSLGSWLKMVTLELKFALHQPGQKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3390_6768_6883_8256
791304	contig_19442_pilon	+	1320	6	Intergenic	novelGene_169605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_3	77.9317650255658	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	63	650	3856	31680	FALSE	45	TCATTTTGTAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IETDIKSAKRELKKARTVLQMDELKCRKRVLRRLGFATSSDVIEMKGRVACEISSADELLLTEMMFNGLFNDLSAEQATALLSCFVFQENSSEMPKLTEQLAGPLRQMQECAKRIAKVSAEAKLEIDEETYLSSFKPHLMDVVYTWATGATFAHICKMTDVFEGSIIRCMRRLEELLRQMCQAAKAIGNTELENKFAEGITKIKRDIVFAASLYL	3793	32350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19442_pilon_+_3960_8718_8825_12588_12646_14205_14369_29969_30075_31627
791305	contig_13778_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_70854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTAAGCACTCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276080	275047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_275000_276100
791308	contig_10451_pilon	+	1732	1	Intergenic	novelGene_138325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAATACTGTGAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321965	323697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_322000_323700
791310	contig_13481_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_119286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTTTATTTTCTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176453	177431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_176500_177400
791311	contig_14415_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_77601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTACTTACGTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26823	27783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_26800_27800
791312	contig_10958_pilon	+	1906	7	Intergenic	novelGene_5347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1419	1757	769326	769664	TRUE	15	GTCAGGACGTTCATTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQAERRQRGQSRGPEEGKHGPTTVRTAGPDGEGPVRCTVASRATGRFEAEKMAQSNSHLARLLQWQLGHEAGQAMRLGHQSGPCNHWMRSNSLNQGNNTGVLRKGTSFRGT	764728	770564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_764968_766458_766872_767187_767288_767837_767881_768066_768121_768756_769753_770503
791314	contig_11708_pilon	+	2176	4	Intergenic	novelGene_138964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTCCCTGAGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247771	252031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_248356_249277_249413_250376_250540_250737
791317	SIRV1	-	208	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3896	0	3622	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6744	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
791320	contig_8362_pilon	-	717	2	Intergenic	novelGene_150679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	340	690	81723	81373	FALSE	30	GCATTCTGAGTTACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPPANHYQTDHRAPTFQKCVPWNMRGLPRGEKRVCPPPEGPRERARLGTQSSWTVQAAITCQALLGGWAWTRGETKGVVHTLTGGNGLKGPSLTFGKQQVPELKGTFVSHCSSTQ	119667	81345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_81972_119576
791322	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
791325	contig_10196_pilon	+	962	9	Intergenic	novelGene_132133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	372.585036434637	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	19	717	1034566	1050210	TRUE	45	AGCCTATTTATAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMRNWPGPRRSTGSGSPQCRPPLQRSSPTTPSCE	1034547	1050750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046429_1047061_1047083_1050131_1050212_1050506
791330	SIRV6	+	210	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-6	497	1	-327	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAGTACTGTTGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	1623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
791332	contig_14516_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_153943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACCCCACAACATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354771	353330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_353300_354800
791334	contig_6217_pilon	+	1993	1	Intergenic	novelGene_109665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772814	774807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_772800_774800
791335	contig_2550_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_135683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACGTTCATTCTTACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382044	1382779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1382000_1382800
791336	contig_8330_pilon	-	1697	8	Intergenic	novelGene_71847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.50967439108	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	559	873	901522	895686	FALSE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCACARTAASLREVEGLHRECRWVWVLGSSSARGACPSAPDCHVGLRHEPLRGPNGREPLPASAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGSPDCSGMVSGLPEPLA	916238	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895736_899582_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904875_916051
791338	contig_8631_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_121959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATATTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735167	734480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_734500_735200
791341	contig_10296_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_168881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873337	872001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_872000_873300
791342	contig_15093_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_143308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTACTCAAGTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153520	154746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_153500_154700
791343	contig_16846_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_82876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAGGAGGAAAGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223650	222224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_222200_223600
791345	contig_12969_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_61696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACTTTACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584619	585486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_584600_585500
791346	contig_9921_pilon	+	308	2	Intergenic	novelGene_23735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	855	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	64	306	162460	166559	FALSE	30	TACATGTCATGAGTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAVEAIEKHLIKKSRGGLIFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRMDKAGHYLELGAEIA	162396	166561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_162514_166370
791350	contig_6854_pilon	-	1230	3	Intergenic	novelGene_169490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTAAAAATACACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239184	226814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_-_226962_230416_230759_238443
791351	contig_20614_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_107561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTTGTACCTTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216845	214958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_215000_216800
791353	contig_10629_pilon	+	1757	8	Intergenic	novelGene_52889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	29.8465463082517	107	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	536	1309	182537	185702	FALSE	5	CGGTTTCTCTTGGTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWMICRLVVLVFGMLYPSYASYKAVKTKNIREYVRWMMYWIVFALFMSLETFTDTFISWFPFYYEIKMAFVLWLLSPYTKGASLLYRKFVHPSLSRHEKAIDTYIVQAKEHSYKTMLSFGKRGLNIAASAAVQAATKSQGALAGRLRSFSMQDLRSIPNTPAPTYQDPLYMEDQVPHQRPPIGYRAGGLQDSDTEDECWSDTEAVPQLPARSREKPLSRSHSLRVIKRKPLVREGTSRSLKVRTRKKPVPSDMDS	182001	186150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_182569_183407_183481_183924_184002_184092_184214_184644_184759_185156_185293_185392_185548_185636
791355	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
791358	contig_10855_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_124311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCCCCCCCATCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316132	315152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_315200_316100
791359	contig_9389_pilon	+	1156	8	Intergenic	novelGene_84007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	34.9588679590686	984	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	436	1089	528462	541916	FALSE	5	CGCCCGCCCGCCAGTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLPAPGLFGLRILGLRSGVGAAVQARGIHQSAATGRPSSAQPAVPKAGAVVPKPTALPSSRGEYVLAKLDDLINWARRSSLWPVTFGLACCAVEMMHMAAPRYDMDRFGVVFRASPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRYVVSMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGILQLQRKIKREKRLSIWYRR	528026	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_528478_531579_531617_535010_535080_535512_535631_539153_539334_539899_539947_540720_540810_541818
791362	contig_11551_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_168466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369085	371311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_369100_371300
791366	contig_13496_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_107662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCCAGAAGCACCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478804	479608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_478800_479600
791367	SIRV5	+	357	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	878	-30	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
791368	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	0	1215	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
791370	contig_2043_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_169896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	45	410	638792	639157	NA	35	AAAAAGTTTTTAATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRQENAAGRSSACVMHRQNFRPPTPPYPGSGVGGWGSGSSFRGTPGGSGPRPPSPRDGYGSPHHTPPYGPRSRPYGSSHSPRHGSSFPGGRFGSPSPGGYPGSYSKSPAGSQQQFGYSPGQQQSHPQVIIIASVD	638747	640021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_638700_640000
791371	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
791372	contig_5878_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_145738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACTACTTTACGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380304	379503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_379500_380300
791377	contig_6710_pilon	-	418	2	Intergenic	novelGene_98241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	TAGGCCTCTGGCCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
791379	contig_1301_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_47434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAACAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000494	1002060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_1000500_1002100
791380	contig_3822_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_133330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGCTAACCTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303772	303364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_303400_303800
791384	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
791386	contig_8167_pilon	+	1088	3	Intergenic	novelGene_155636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	64	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	149	706	41287	132413	FALSE	5	GGTGTTTTCTCTCTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVGEALPSTLPRASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	31958	132795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_32029_41208_41328_131896
791387	contig_7446_pilon	+	1494	2	Intergenic	novelGene_101958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229901	231601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_+_231282_231487
791392	contig_10311_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_50496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGATTATACAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252600	253984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_252600_254000
791393	scaffold_21177_pilon	-	1485	3	Intergenic	novelGene_145493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_2	41	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	97	747	221483	217697	FALSE	30	ACTCAGAGATGATTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISCKFWVK	254674	216958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_218287_221422_221512_254606
791394	contig_10436_pilon	-	863	4	Intergenic	novelGene_108507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2483.15690648461	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	129	443	103480	102032	FALSE	50	AGAAAACCACCAAGCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103608	101611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102853_103414
791395	contig_5954_pilon	-	1262	6	Intergenic	novelGene_28728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	80.6845710157772	880	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	737	1126	1171123	1170586	FALSE	0	GCTGCGTGTGTGCGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIEQVEKQTSVADLLASFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRESKFFEHFIEGGRTVKEFCQQEVEPMCKESDHIHIIALAQALSVSIQVEYMDRGEGGTTNPHVFPEGSEPKVYLLYRPGHYDILYK	1178023	1170449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170784_1170931_1171127_1171244_1171736_1176032_1176132_1176381_1176444_1177942
791397	contig_990_pilon	+	2719	11	Intergenic	novelGene_76000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.5116339027692	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2715	3	2717	205127	235717	FALSE	35	AACAATAGCAGCTGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLEYERQLVLELLDADGLVVCARGLGADRLLCHFLRLHCHPACLVLVLNTQPAEEEYFISQLKLEGVDHLPRRVTNEIASNGRYEVYTQGGVIFATSRILVVDFLTDRIPSDLITGILVYRAHRIIESCQEAFILRLFRQKNKRGFIKAFTDNAVAFDTGFCHVERVMRNLFVRKLYLWPRFHVAVNSFLEQHKPEVVEIHVSMTPAMLTIQTAILDILNACLKELKCHNPSLEVEDLSLENAIGKPFDKTIRHYLDPLWHQLGAKTKSLVQDLKILRTLLQYLSQYDCVTFLNLLESLRATEKAFGQNSGWLFLESSTSMFVNARARVYHVPDAKMSTKSKMSEKMEIKEEQETKKELVLESNPKWEALTEVLKEIEAENKESEALGGPGQVLICASDDRTCSQLREYITTGAEAFLLRLYRKTFEKDSKAEEVWMKFRKEDNSKRIMKSNKRPKDPQNKEKASTKERTLKRKKRRLTLTQMMGNSEEHKGEEQVEEGYPREISSSQEIDFEGIKHEEFDLNLSSDAAYGILKEPLTIIHPLLGCSDPYALTRVLHEVEPRYVVLYDAELTFVRQLEIYRAGRPGKPLRVYFLIYGGSTEEQRYLTALRKEKEAFEKLIREKASMVIPEEREGRDETNLDLARGSTSTNVSTDTRKAGGQEQSGTQQSIVVDMREFRSELPSLIHRRGIDIEPVTLEVGDYILTPEMCVERKSISDLIGSLNNGRLYSQCISMSRYYKRPVLLIEFDPSKPFSLTSRGALYQEISSNDISSKLTLLTLHFPRLRILWCPSPHATAELFEELKQNKPQPDAATAMAITADSETLPESEKYNPGPQDFLLKMPGVNAKNCRSLMNHVKNIAELATLAQDKLTSILGNAANAKQLYDFIHTSYAEVVSKGKMKK	205124	235719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_205301_206724_206906_213464_213661_214559_214768_216943_217125_219102_219232_220185_220297_221868_222467_224596_224690_232493_232607_234986
791398	contig_15668_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_169631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116224	114061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_114100_116200
791401	contig_12142_pilon	+	1691	16	Intergenic	novelGene_147806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_15	60.399411328993	7	28	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	49	1485	94411	135686	FALSE	50	GCAGAAGTAAAGCAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIRDKVWSQACLGACAPQLAEKLGPPMRSSSVAGTISSYYVQRYGFHPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIVVSLGTSDTLFLWLQEPMPSLEGHIFCNPVDPQHYMALLCFKNGSLMRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLRGPPPTVCQARAENRVPNPGGPQSEFCQPGALQTCLPRLTEPSWRRGPGQQRPPLLWGSACPS	94362	135892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100329_100403_102360_102480_104919_105002_106950_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_135489
791402	contig_10437_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_38133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145341	144169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_144200_145300
791405	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
791406	contig_7135_pilon	-	2731	1	Intergenic	novelGene_136952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAAAAAAAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319226	316495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_316500_319200
791408	contig_6885_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_83662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCCTTTAGCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191994	194363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_193084_193133
791409	contig_16883_pilon	-	2661	1	Intergenic	novelGene_161733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCCTAAGCCCCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283340	280679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_280700_283300
791414	contig_10058_pilon	+	1715	11	Intergenic	novelGene_67692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	112.856590414561	1	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	318	1037	51319	53215	FALSE	50	TTTAAAAACATAAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVIQVSEGQLDGQTEGTGAISGYPATQSMTQAVIQGAFTSDDAVDTEGTAAETHYTYFPSTAVGDGAGGTTSGSTAAVVTTQGSEALLGQATPPGTGQFFVMMSPQEVLQGGSQRSIAPRTHPYSPKSEAPRTTRDEKRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCSMESTKSGQSKGGILSKACDYIQELRQSNHRLSEELQGLDQLQLDNDVLRQQTLKTRICCYELSYGTME	48247	53893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_48333_50196_50291_50687_50738_50884_50970_51315_51418_51653_51850_52099_52188_52314_52374_52522_52618_52837_52967_53161
791416	contig_12312_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_64024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAACTGCTTTTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568500	567099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_567100_568500
791417	contig_15434_pilon	+	1318	8	Intergenic	novelGene_56692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	391.563532520586	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	58	1143	26904	33302	FALSE	15	GATGATTTGTTTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSVAHLARANPFNAPHLQLVHDGLSDPRSSPAGPPGLPRRSRNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26607	33477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
791419	contig_7357_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_36938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAATTTCATAGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836105	834662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_834700_836100
791421	contig_16119_pilon	-	874	2	Intergenic	novelGene_164274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87352	84831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_85370_87016
791423	contig_7428_pilon	+	931	2	Intergenic	novelGene_77711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTATGTGCTTGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322087	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_322157_322655
791425	contig_5916_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_158042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	89	346	346470	346727	NA	65	AACTAAATGCAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISILKTPLPSGDFSHINVGEALPLSIAAAMILHRKFQRLFTRAKDGRRPRACSKLRDVTGQVEERDFSSLKVKNIWNLIPEALTPLLLHKYSKETHSIQLGNYRKLNKRWIIRS	346381	348724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_346400_348700
791426	contig_10000_pilon	-	1755	8	Intergenic	novelGene_139309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	272.047114767022	3	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	117	881	192773	159846	FALSE	20	ATTTCCAAGAGTGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAARCFAGLLILSPLTVISDSSRPADSGKAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPGNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	194711	158971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_182891_182946_192582_192801_194622
791434	contig_6710_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_98224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	10	CCTCTGGCCCCTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
791435	contig_5765_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_141431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958772	960024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_958800_960000
791436	contig_9515_pilon	+	1481	5	Intergenic	novelGene_73831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_1	269.694734839225	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	692	1360	68062	72530	FALSE	0	TTTCCTTGGCTCTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPQWTALLRGEREVKTLPPSCLPPYCMGSRAQAAALTALPTSLQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	67370	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
791438	contig_709_pilon	-	1840	2	Intergenic	novelGene_57555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATAGCAGAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548280	1546388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1548122_1548173
791439	contig_5696_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_117571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATTCATTCCACTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708593	707636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_707600_708600
791440	contig_5696_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_117570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTGTCCCCCTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707585	705762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_705800_707600
791441	scaffold_19766_pilon	+	332	3	Intergenic	novelGene_34266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	29	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	192	140	331	319424	319710	FALSE	20	AGCAGCAGGTGAGGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSLSDSYSHLSGRPVRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFTQWCEQMLHTLSTTGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRAKQKASQQRQ	319179	319711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_319195_319299_319461_319555
791443	contig_14773_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_174762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTGAACGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59358	57322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_-_57300_59400
791447	contig_15182_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_136443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	210	536	349164	348838	NA	20	AGAAAGTTTTGTCGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTGRINNKHDRRESNWLNKYPEAVMLLSGALELVLTHSDPTYNRAKHCRSCAFLTVIAMFEPTVTATVSIRLIEGLPLFRIPSTLSSMMSFFREWSLLITCPKYVR	349373	347765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_347800_349400
791451	contig_9011_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_159335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	41	397	644517	644873	NA	20	CTAGTTTTAATGGCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQIEIIILLDAQITSSLANGSLFKLTPESLIVSWLSYMVVLQFLSGWNVAYCEHFPSLLTKIPYSLYFCWPFWRRWGVSLPFVGSPKDKSKQALETHLLNSFHEFLLSFYFCLILY	644476	646542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_644500_646500
791452	SIRV6	+	206	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	51	526	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791455	contig_10003_pilon	-	893	2	Intergenic	novelGene_88168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTGTTTCTCGTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408269	405993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_406059_407441
791456	contig_10003_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_88166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTAATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405993	404516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_404500_406000
791459	contig_233_pilon	-	1696	4	Intergenic	novelGene_14483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	49.6655480858378	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	88	402	22361	13017	FALSE	5	GTATTCTGTCTCTTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEKPKEGVKTENDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGTRAARRLSGCGV	22448	11722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_13110_14678_14751_18722_18852_22340
791460	contig_12817_pilon	+	1371	3	Intergenic	novelGene_174769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	5.5	123	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTGTCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112455	137061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12817_pilon_+_113028_125035_125212_136438
791461	contig_2940_pilon	+	2322	10	Intergenic	novelGene_82008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	26.9732377655252	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	1723	2322	1349613	1365688	FALSE	65	AAAAAGAAAAGGAAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKKCMEFISLPLANKLTSASKDSLSTHTSPSHSPTSVHGSRRGSISSMSSVSSVLDEKDDDRIRCCMHCKDTLLKREQQIDEKEHTPDVVKLYEKLRLYMEKVDQKAPEYVRMATSLNAGETTYSLEHANDLRVQVQKAYELIDALSKKILTLGLNQDPPPHPNTLRLQRMVRYSATLFVQEKLLGLMSLPTKEQFEEL	1338491	1365688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1338600_1341081_1341402_1345715_1345857_1348347_1349382_1349493_1349656_1352031_1352274_1353882_1353954_1362242_1362330_1363275_1363379_1365634
791463	contig_7898_pilon	+	627	3	Intergenic	novelGene_47568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	481	8643	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGAATTCTTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483947	487531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484076_484218_484454_487267
791464	contig_15029_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_128175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCCCAGCAGTCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147323	146448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_146400_147300
791465	contig_9705_pilon	+	1094	2	Intergenic	novelGene_41742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTCCTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299979	302025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_300286_301237
791466	contig_14191_pilon	+	2028	4	Intergenic	novelGene_153762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1602	junction_2	1758.62717923827	2329	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	131	490	25902	44263	FALSE	20	AATTCCTGGATTTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLLVDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR	25771	45801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_25916_34342_34420_42206_42399_44186
791470	contig_9682_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_125294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAGAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19712	20050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_19700_20000
791472	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
791473	contig_5551_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_134252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACTTATTAGAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525821	526987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_525800_527000
791475	contig_15410_pilon	+	2016	9	Intergenic	novelGene_130630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1231	1563	151344	153891	TRUE	5	CGTCAGGCCGCCGCGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVATTVDLASMVEVDEVHKQLPARGTHKALWVPAGTQACTAGKHCDVPTSNLLPTLLTDGPSDGHGKDAHSATSQILPLPLLAEGPELFLFLLFQCCAVVYLTVMWWQLV	148627	158765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_149335_149932_150229_151036_151225_151304_151509_153192_153329_153859_153974_156057_156244_157198_157287_158668
791477	SIRV4	-	463	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1058	0	1058	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
791480	contig_16761_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_146900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACCAGCTGCTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58183	56554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_-_56600_58200
791481	contig_18168_pilon	-	1316	7	Intergenic	novelGene_122087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	198.34033601083	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	210	641	26622	25294	TRUE	25	CCTGTTGCAGATGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRMPQRHR	27126	23527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24893_25034_25315_25968_26241_26483_26754_27048
791483	contig_5515_pilon	+	1199	2	Intergenic	novelGene_52346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATCAGGTCCGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99827	101154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_99916_100043
791484	contig_12250_pilon	+	999	6	Intergenic	novelGene_80604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	114.67937914028	668	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	198	707	337326	338940	FALSE	20	AAACTTTTCTGTAGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKRGTKNKRAALQALQRKKRLEQQLAQTDGTLSTLEFQREAIENSTTNKEVLRAMEFAAQGMKKAYQDIDIDKVNELMTDITGQQEVAQQISDAISRAVGFGDDVDEDELLEELEELEQEELSQELLNVGNKEGEPPVKLPSVPSTHLPAGPDEDKEALKQLTEWVS	335425	339232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_335510_337212_337360_337445_337624_338035_338151_338322_338459_338893
791488	contig_6589_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_26062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	573.846863041197	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	265	576	1731416	1731813	FALSE	35	GTAAAATAGCTTTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDPFRCPGHSPMSCKYLFIPQYTLPGTEHTASSLPWEPRCLPALAPKGPGASEHQLSVPKDKLRSLSHLVAYHLPARLFSAQTSNKFPAF	1729062	1731815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1729234_1730067_1730152_1731406_1731460_1731545
791489	contig_21377_pilon	+	2198	4	Intergenic	novelGene_174771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	11.0855260988773	170	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATGGATTGCTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18968	23857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21377_pilon_+_19294_20248_20394_21372_21456_22212
791490	contig_3009_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_132509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTGGAAGATCAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47360	49451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_47400_49500
791494	contig_2114_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_104265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGCTATGGCTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506106	503425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_503400_506100
791496	SIRV6	+	325	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8115	-2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
791497	contig_12970_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_50559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTTTTCTAATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613009	614788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_613000_614800
791504	contig_7459_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_174778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACAGGGGATATTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123196	122393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7459_pilon_-_122400_123200
791507	contig_11447_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_168103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCTTCCAGGAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528296	527054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_527100_528300
791508	contig_16411_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_77280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGGAGATTCTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27653	25219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_25200_27700
791511	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_97266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
791512	SIRV6	+	367	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	379	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_10697_10819_11031_11109_11205
791513	contig_7652_pilon	+	1152	6	Intergenic	novelGene_170952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	16.5601932355876	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	387	986	48665	49870	FALSE	25	ATAGGTGTGGACGTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCGAVWERWSCLKQEGKPAEELLGRDPTISIADHDKELLQLLQESQRSWHFVAWQQSCFQEEQRLKEAQALFAQERAHFKAERYHFTEAAIRRGLEIEMERSLFLKEQLLGFSLYSSSQAKTISPGPDSPGLRNRDPASWCRVSCSISGFSKSPGKCPVSQNVTALQGSTYFLISQVEEYTGIAANRKEMIPVFHLIC	48278	50036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7652_pilon_+_48714_48897_49032_49146_49255_49346_49459_49589_49725_49808
791514	SIRV6	+	212	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	57	514	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791516	contig_6583_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_174590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCCTGACATACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35985	36311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_+_36000_36300
791517	contig_6583_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_174591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAGAAAACAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36379	36189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_36200_36400
791518	contig_1037_pilon	+	2018	3	Intergenic	novelGene_84585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	11.5	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	247	1506	54640	59706	FALSE	20	TCCAAGTCGTGTGGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDSRNTMNQDMEIGGNPRDPKKVPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTITWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQNWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSRAQLDQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAETGPDAEAEQDREDKPEGLRGPRETRDSV	33110	60218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_33346_54628_55577_59383
791519	contig_11448_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_66386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATCACTACTAACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395094	397293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_395100_397300
791520	SIRV6	-	331	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-297	-132	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTGGGGCTGGTTTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117	1676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
791521	contig_5981_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_35529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAAGAAGGTACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281818	281125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_281100_281800
791523	contig_2757_pilon	+	1785	10	Intergenic	novelGene_164582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	78.5513907429672	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	227	1375	223240	243321	FALSE	35	CACTTGCAGTAATAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQTNIGELLSMLDSSKLGVRDEITAVFKENLNSDRGPMLVNTLVDYYLETNSQPVLHILTTLQEPHDKHLLDKINEHVGKATTRLSILSLLGHVIRLQPSWKHKLSQAPLLPSLLKCLKTDTDVVVLTTGVLVLITMLPMIPQSGKQHLHDFFDIFGRLSSWCLKKPGHVTEIYLVHLHASVYAFFHRLYGMYPCNFVSFLRSHYSMKENLETFEEVVKPMMEHVRIHPELVTGSKDHELDPRRWKRLETHDVVIECAKISLDPTEASCEDGYSVSHQISARFPHRSADVTTSPYVDTQNSYGSATSTPYSTSRLTLNTPGQLPQTLSSPSTRLLTEPPQVCCKIVCLLSSLLMVKLTTGSGFSMWLEKPHTACLKGQLY	203140	243731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_203223_213895_213959_223158_223346_224568_224673_225724_225878_228067_228213_230084_230240_230810_230885_242248_242425_243085
791524	contig_11978_pilon	+	1311	12	Intergenic	novelGene_62800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.3350227966366	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	481	1071	542997	587379	TRUE	15	GTCCACGTCTGCCTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPDEEHNLDEDESGTRRKGVEYPSYYQGLWDYHGDQPDELSFQRGDIIRILSKEYNMYGWWVGELNSLVGIVPKEYLTTAFELEER	299645	589442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362769_539062_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547777_556592_556644_564821_564923_587277_587390_589212
791525	contig_15307_pilon	+	1054	6	Intergenic	novelGene_174781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGATGATAAGCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133933	141338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15307_pilon_+_134092_134340_134476_135883_136148_136989_137269_139865_139953_141207
791529	contig_6710_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_98270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	10	TCTGGTCCTCAGTCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
791530	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
791533	SIRV4	-	310	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1211	0	1211	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3947	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
791534	contig_7285_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_143388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGCGTACTCACCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221183	220238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_220200_221200
791538	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
791544	contig_7571_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_106398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAACACTAAGAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88684	89895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_88700_89900
791545	contig_10235_pilon	-	1372	6	Intergenic	novelGene_46555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.4210453469305	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	246	1094	431644	429937	TRUE	20	CACTATGTCTTCTGAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRMTVTAGTPLCA	432085	429575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430355_430576_430660_430897_431288_431651_431846
791547	contig_12923_pilon	+	169	1	Intergenic	novelGene_30116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAACAGCCGAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65467	65636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_65500_65600
791549	contig_1759_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_171324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCTTAAATATCCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12579	13757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_12600_13800
791552	SIRV6	+	305	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	4	1280	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
791555	contig_2069_pilon	-	1420	5	Intergenic	novelGene_23452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	257	682	1439189	1436583	TRUE	20	GAGTGGGTGTGAGAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLQVNMLGEATWAAAALKGPGPRVQAQVSLEVAGAAEALVAQRALVGPFPGVHQVVLLQVGKLGEALLARGTLERALPAVHAQVDLEVGELPKSLAAHVALIQDFAILFLQRVGQGCSAHSGAQWSPLCRSHHTSLLQP	1439445	1431979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1432057_1432932_1433061_1436049_1436746_1437868_1437999_1439056
791557	contig_14980_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_78220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	329	664	278155	277820	NA	80	AACCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSVNSLQVHPCPAVSPQAPSDMKGKKCGSPTTTSDTPMGSLSPIAGPLASPHCMVGMGLSVSSPQTTAGQPKHSGQGRLSSHSPGACPTFSKHTCTVTIPALAGAGSSA	278483	276746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_276700_278500
791558	contig_6217_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_109579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157980	159600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_158000_159600
791560	contig_16205_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_156857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCTTTATCCAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21105	20736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_20700_21100
791562	contig_312_pilon	+	988	2	Intergenic	novelGene_128304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	0	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAGGAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402595	410307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415
791564	contig_12119_pilon	+	2096	7	Intergenic	novelGene_88663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	395.069192252024	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1302	793	2094	329789	356244	FALSE	15	AGAATTGTTTCCTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKPKQNVSEATTIELTILAETASPSLSKEPQIVPDRTTPIMPLITALSVITTKFSSVENIVNFEQKGPVQSQTVTDKLATESATPSGSTKKPWDMDYLPSAAGPLEKPDMSEIKEDVPKSTTVISHHTTDSWDDVTEDTKTQESVTQIEQIEVGPFVTSVEISKHTPSKEFSATEIPFLSTRMTMESKTEKKTVSPISESVTTNLYGFTLGNDDGEDRTLTVRPGHSTFIFSQIPDVITVSKTSEDITHTQLEESESISASTLVTSVTMPDNDGSSMDDRQEKQTTGRTTEDSWDQHVSTTPFSPQHQTE	306616	356246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329658_329745_329874_348682_348977_355321
791565	contig_19185_pilon	+	2242	2	Intergenic	novelGene_163647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAGGCTTACAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118156	139561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_118445_137607
791568	contig_3942_pilon	-	1202	10	Intergenic	novelGene_128864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_9	12.8062484748657	433	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	251	1033	1491123	1486376	FALSE	15	CTCCAAGGACTTGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPVEIGRRSCSSSGTSRRAFLTLPSPWAGEELGTRALRVQVPVGPLYIKWRRKVCALSPQVLEDPVLRRGGTEEAREEVASCMEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1492809	1486206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918_1492062_1492710
791569	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
791574	contig_11259_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_144547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGGCTGGCTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194592	195628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_194600_195600
791575	contig_14563_pilon	+	576	2	Intergenic	novelGene_135050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAATGTCACAATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125291	132183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_125367_131682
791576	contig_14563_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_135052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCTGTAAAATTAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132724	133523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_132700_133500
791577	contig_12437_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_169074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCGCACCCTCTAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46682	46086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_46100_46700
791578	contig_6412_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_149984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAATAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635924	633189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_633200_635900
791580	contig_20819_pilon	+	2098	13	Intergenic	novelGene_55660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	48.1325571267054	243	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	616	1563	48590	51734	FALSE	15	TGAATTCATCCCCCCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLKLVPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSAGEGLEEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGETARDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLLQEVKLQPPLEPNSKKSPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRQLQNKCRGYDLRPDPDIQQWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGISDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGGPTPFVSWDRPSMGGDEVPGTPAPLLARLAQHMKWPSVSSLDSVLENTPSLHSPADPSHLSPPSSSPRPSRGHRRSASCGTPLSGGAEGTSRGTGYGGGGPGPGASDCQIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLEKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPPSANVFYAMDGASHDFLLRQRRRPSAATVVLTSGPSASGTPPE	47220	52269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_47284_47553_47806_47901_48006_48113_48199_48295_48365_48547_48623_49478_49512_50012_50135_50232_50329_50409_50522_50629_50921_51346_51462_51588
791581	contig_13894_pilon	+	975	8	Intergenic	novelGene_62124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1737.02006144936	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	21	974	520713	528172	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFDAKMSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGWYRLNAGPWRRLTSSSLIPPPSLATAASRLWRRRKHSWDRLRKTELQRKKELNVRNRLYSWWDLNKKYFLV	520692	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525689_527464_527580_528072
791583	contig_1406_pilon	-	1099	4	Intergenic	novelGene_25435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	134.683167305924	426	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	34	516	242375	240028	FALSE	25	CATCATTTCTTAATATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSLWGTCSCNMTLEEFSAGEQKSERMDKVGDALEEVLSKALSQRTITVGVYEAAKLLNVDPDNVVLCLLAADEDDDRDVALQIHFTLIQAFCCENDINILRVSNPGRLAELLLLEPDASRATSEGAEQPPRPALRAGDESTFIAMEGSCLKSTYLFLPGKSIHGSVGSSD	242408	239444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_240126_241210_241450_241704_241807_242331
791587	SIRV6	+	201	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	57	525	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791588	contig_6738_pilon	-	1568	5	Intergenic	novelGene_166136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_3	119.067995280008	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	385	924	63262	54735	FALSE	65	AAAAAAAAAAAACACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEDYEWGSSSILDALTGINVQQRRLALAAMRWRKKIQQRQETGIVEGAFSGWKVILHVDQSREAGFKRLLQSGGAKVLPGHSVPLFKEATHLFSDFNKQKPDDSGVNIAEAAAQNVYCLKTEYIADYLMQESPPHVESYCLPEAVSFLQNNKELGPGLSQKRKVPTEKNKIKRPRVH	63646	54090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_54879_60311_60474_60653_60744_62317_62456_63256
791589	contig_7733_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_147141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCCCCCAGCAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96699	97240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_96700_97200
791591	contig_9481_pilon	-	1853	1	Intergenic	novelGene_149629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGAGGACAAGGCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97700	95847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_95800_97700
791592	contig_16303_pilon	-	992	2	Intergenic	novelGene_34126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCCATGTTAAGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55259	50680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_50791_54377
791594	SIRV4	-	461	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1057	3	1057	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4101	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
791595	contig_12625_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_140490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACGGGGTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49362	51046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_49400_51000
791599	contig_16204_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_154475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTGTCTCCTGGTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109250	107166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_107200_109200
791600	contig_935_pilon	-	2055	3	Intergenic	novelGene_45507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	66	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	230	559	21342	19993	FALSE	25	AGCATCCCTTTAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	32118	18496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_32034
791601	contig_4071_pilon	-	1333	9	Intergenic	novelGene_151897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	79.5140514311779	513	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAACATCTGGTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363786	343570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_343827_344069_344130_345262_345532_346373_346455_347957_348032_354570_354660_355444_355542_360908_361010_363480
791604	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_96419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	48	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
791606	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
791611	contig_3960_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_138026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTTTGGGTTTTTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516591	517656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_516600_517700
791614	contig_10140_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_148410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAATATATTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227123	226286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_226300_227100
791618	contig_5019_pilon	-	1508	1	Intergenic	novelGene_109234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377005	375497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_375500_377000
791621	contig_9177_pilon	+	1516	12	Intergenic	novelGene_32822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	19.1363096522668	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	74	1333	1696824	1712630	FALSE	15	CTCTAGTTTTGCTGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVLPSARWLYCGEPDGSQRAVLVQFSNGKLQNPGNMHFTLYKSKDFTNPRKRSQRILAAETDRLSYVGNNFGTGALKCNTLCRHFVGILNKTSGQMEVYDAELFNMQPLFSGESLESELPSQSQTKTFREKMDSCIEAFGTTKQKRALNSRRMNRVGNESLNLAVAKAAENIIDTKGVTALVSDAIQDDLQDDSLYLPPCYTDADKPEDVYKFEDLLSPVEYEALKSPSEAFRNVTSEEILKMIEENSHCSFVIEALKSLPSNEESRDRQARCIWFLDTLIKFRAQKVIKRKSALGPGVPHIINTKLLKHFTCLTYNNGSLRNLISDSMKAKITAYVIILALHINDFQIDLTVLQRDLKLSEKRIIEIAKAMRLKISKRRVPVAADREEEHRLGTLSIPLPPAQTLDHQLKRRRVT	1696750	1712813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1696900_1697463_1697568_1699090_1699168_1700268_1700355_1702291_1702351_1703096_1703242_1704951_1705060_1708307_1708405_1708906_1709041_1709953_1710036_1710797_1710930_1712470
791626	contig_3747_pilon	+	833	7	Intergenic	novelGene_24868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5408.28610405675	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	107	625	201481	204963	FALSE	80	GTAAAAAAAAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVAPFLSIRRPRCSQPLSLYP	201043	205171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201060_201390_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202924_204903
791630	contig_6710_pilon	+	540	2	Intergenic	novelGene_97665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653393	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
791631	contig_8677_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_174033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	354	1065	301	1365	119439	120503	NA	35	TCCAAGACATGGACGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSDTPSSTASKITISVILTVLILITIAGNVVVCLAVGLNRRLRSLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSYSWSFGQIFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVTISLVFIWVISITLSFLSIHLGWNSRNKTVGSNHTISKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKIARNQAKRINHISSWNAATIKEHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTVFVYRGLRGDEAINEVTEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTAYQQLFCCRSTGHNSHGTSLRFTNSQMSRSQSRKHKGQEENPLKLQVWSRTEFTAPQGATDR	119138	121402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_+_119100_121400
791633	contig_12626_pilon	+	927	6	Intergenic	novelGene_80425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_1	229.022269659525	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	22	855	107206	155805	FALSE	60	ACTGAAAAAGAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQVRNNRK	107184	155877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637
791634	contig_7004_pilon	+	1401	8	Intergenic	novelGene_126520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.62776596885385	120	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	57	953	477623	591884	FALSE	20	CTGCTTTTGAGATGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLHRRLLRGGWELSQTLTMEELEQGLLMQPWAWLQLAENSLLAKAYITKHGYALLVSDLQQMWHEQVDTSVVSQRAKELNKRLTAPPEAFLCHLDDLLRPLLKDTARPSEATFSCDRVAEALILRVRSELSGLPFYWNFHCILASPSLVSQHLIRPLMGMSLALQCQVRELATLLYMKDAEIQDYHESGATLSRDRLKTEPFEENSFLEQFMVEKLPEACSIGNGRPFVMNLQSLYVAVTKQEVQVGQKHQGTDSQTSSSASLQGTDSHLLNQPEEPVSSAPSLSVPEIEPTSTSGSMPRPQLSKVKRKKPRGLFS	474950	592332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_475007_477622_477800_478464_478678_484476_484616_485547_485607_590520_590639_591212_591329_591809
791639	contig_3942_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_128671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGGGCTCATTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301649	302085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_301600_302100
791640	contig_6215_pilon	-	2245	2	Intergenic	novelGene_21243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585117	581809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_582962_584024
791641	contig_11227_pilon	+	2293	8	Intergenic	novelGene_163172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_6	17.2354641506922	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	210	950	103603	111341	FALSE	20	CATCTCTTAAGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNKIKSANNKPKPPPTRAHFPLGPNPFLERPQQFITPQSCDAQGQRYTAEEIEVLRTTSKINGIEYVPFMSVDLRERFAYPMPFCDRWGKLPLSPKQKTTFSKWVRPEDLTNNPTMIYTVSSFSIKQTIVSDCSFVASLAISAAYERRFNKKLITSIIYPQNKDGEPEYNPCGKYMVKLHLNGVPRKVIIDDQLPVDHKGELLCSYSNNKSELWVSLIEKAYMKVMGGYDFPGSNSNIDLHALTGWIPERIAMHSDSQTFSKDNSFRMLYQRFHKGDVLITASTGVMTEAEGEKWGLVPTHAYAVLDIREFKVLP	101057	112684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_101227_103562_103650_105407_105535_106914_107001_108267_108362_109080_109228_110359_110467_111208
791642	contig_15134_pilon	-	1894	11	Intergenic	novelGene_140227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_10	17.607100840286	53	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	695	1492	270230	264711	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLEEHGKVVLVLERTSQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMRPDSSAHDPTETFLSDFLLTYSVFMPSAQLCAALLHHFHAEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVNQWVALYGPMLHSDPVATSFLQKLSDLLSRDARLSNLLKEQWPERRRHHRLENGCGSASPQMKARNVPVWLPSQDEPLPSSNCAIRVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDSWTKGQVLVKVNSAGGELCLWAGWL	271750	264308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_264890_265218_265301_267982_268023_268837_268921_269004_269156_269358_269438_269754_269844_270135_270249_270797_270945_271108_271186_271298
791647	contig_3004_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_127475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAAAAGGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250226	249290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_249300_250200
791654	contig_14976_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_139964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTTTGCTCAACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4839	3830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_4587_4741
791655	contig_14976_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_139961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTAAAATGAAGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3621	2367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_2400_3600
791656	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_90555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653848	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
791657	contig_14133_pilon	-	1647	13	Intergenic	novelGene_119908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	19.0153446808974	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	216	941	126818	123944	TRUE	20	TGCAGTGTCACTCGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCITLQVLRGLQYLHRNFVIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTPTQTTSIDMWAVGCVLAELLAHKPLLPGSSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLASQYSLRKQPYNNLKHKFPWLSEAGLRLLNFLFMYDPKKRC	129624	122742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_123380_123620_123674_123927_124091_124246_124371_124641_124702_125128_125199_125328_125382_125889_125958_126305_126388_126575_126679_126799_126872_127642_127716_129535
791658	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	53	509	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791659	contig_9653_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_48281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGGATTTGATGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005660	1005011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1005000_1005700
791662	contig_5217_pilon	-	1358	9	Intergenic	novelGene_135720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_8	29.2037561796424	43	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	475	1293	296982	295104	FALSE	30	AGAGTTGGAATCTAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298468	295038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297449_297571_297685_298335
791664	contig_5253_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_61588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGGGAAATGAGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334358	333940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_333900_334400
791666	SIRV6	-	195	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGTTGAACAACTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11037_11109_11205
791668	contig_12938_pilon	-	1022	4	Intergenic	novelGene_99723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCGGGGCTATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86244	51961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52044_83389_83468_84548_84632_85465
791670	SIRV4	-	412	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1111	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4047	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
791671	contig_15866_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_63618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGCCTTCCGGGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416381	415195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_415200_416400
791672	contig_14666_pilon	-	326	3	Intergenic	novelGene_39664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	2522.5	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCCTGCTGTTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491216	488764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_491165
791676	contig_4531_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_47857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGTTACCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155633	157580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_155600_157600
791681	contig_16316_pilon	+	406	2	Intergenic	novelGene_174785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTAAGTCATCATGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18691	25908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16316_pilon_+_18760_25570
791683	contig_16541_pilon	+	1534	4	Intergenic	novelGene_126747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1132	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCCGGGGCAGCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399377	423577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_400612_402579_402722_406168_406221_423471
791685	contig_10734_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_51332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGGATAAATGGTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614543	1614873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1614500_1614900
791689	contig_6870_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_103957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273334	1274514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1273300_1274500
791690	contig_19545_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_170834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCACTCATGTTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25227	23726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_-_23700_25200
791694	contig_16907_pilon	+	1357	11	Intergenic	novelGene_87471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGATGGTAACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480676	517033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_480687_491556_491621_493499_493615_495049_495155_499445_499597_502080_502230_503136_503303_505632_505803_512215_512366_514183_514277_516849
791696	contig_1308_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_172684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCTTTTATCCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61524	59108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1308_pilon_-_59100_61500
791698	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
791700	contig_8617_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_73450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62590	62046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
791702	contig_2969_pilon	-	1770	2	Intergenic	novelGene_157072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	70	402	875996	875481	FALSE	70	CAAAAAAAAAAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKQHQGPLQFCFYILPQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANPLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIASKNFKFFFLAYSVLCE	876065	874112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_875663_875845
791705	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	3	411	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
791708	contig_2487_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_148438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTCTGTGGTATACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7502	9686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_7500_9700
791709	contig_3529_pilon	+	2298	10	Intergenic	novelGene_105394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	85.793176510737	1	155	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	167	1195	790486	809557	FALSE	45	AAATTAAATGTGGTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790319	810660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
791710	contig_3601_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_132957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTTTGTTAAGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479518	479154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_479200_479500
791711	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
791717	contig_6266_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_170988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAAGCAGTGAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424744	424115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_424100_424700
791718	contig_14426_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_170630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCACTTGACCGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198504	199084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_198500_199100
791719	contig_14426_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_170632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	88	579	199273	199764	NA	30	TAACCAGGAGTGCAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESRQRAALDAQSTEDQTGLLTVKVEKEEASAFAEEARLSCSPAAGSERSRQRFRSFRYPEAAGPREALSRLQELCRQWLRPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGALQSWVQEQHPESREEAVVLLECLERQLDEPRPQVETTGLVFQSCGFFLPKISRLE	199185	200394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_199200_200400
791721	contig_14740_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_174687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312163	310771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_-_310800_312200
791722	contig_7009_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_23585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGGGGGTTGCTGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283684	285950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_283700_286000
791724	contig_10074_pilon	-	1965	17	Intergenic	novelGene_57146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCCCCATCCGGGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545670	463854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_464086_467219_467361_478320_478576_479299_479387_514038_514075_518438_518550_520695_520760_521057_521102_524516_524584_527323_527450_533079_533136_533989_534066_534159_534216_535280_535399_540422_540573_543315_543410_545417
791726	contig_6710_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_96856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653654	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
791727	contig_2100_pilon	+	1241	2	Intergenic	novelGene_50585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	124	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490453	493767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_490684_492756
791729	contig_1836_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_71052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856292	854254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_854300_856300
791730	contig_2834_pilon	+	1369	3	Intergenic	novelGene_28023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	55	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	194	1222	763154	764624	FALSE	80	AACAATGAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPNYSRQLLQQLYTLCKEQQFCDCTISIGSIYFRAHKLVLAAASLLFKTLLDNTDTISIDASVVSPEEFALLLEMMYTGKLPVGKHNFSKIISLADSLQMFDVAVSCKNLLTSLVNCSVQGQVVRDVSVPSPESFRKEPEKPQVEILSSEGAGEPRVLPEGSAPPGGPVKAETEEAAQMAAQELHVEPPTAQEVPRSTEAPAETPSAAEVCSPSPVVQTFSEATEASPEPEYERKHYRLDFLLENESIFSDALSSTQDVLKRLEECSEIKGPQKVVGTCFFVCLLVECSQDNISTFHIGQKSENTNTLGFQFFQTLILFFLAFIPLKASLKKVLGKILSK	723209	764771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_723344_763094_763851_764292
791732	contig_20748_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_138178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157334	159478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_157300_159500
791734	contig_3878_pilon	+	2802	1	Intergenic	novelGene_174805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCGAAACCTAAATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615558	618360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_615600_618400
791736	contig_5586_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_143579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398889	400221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_398900_400200
791737	contig_9027_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_156364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159373	157158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_157200_159400
791738	contig_8377_pilon	+	598	2	Intergenic	novelGene_35158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAATATTTGTAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198418	199108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_198529_198620
791741	contig_15741_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_159667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGGTATTTAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50271	49604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_49600_50300
791745	contig_14441_pilon	+	809	4	Intergenic	novelGene_100644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	197	625	116728	117610	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHCGDRGATVIQPYGNNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111363	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111411_116578_116963_117220_117344_117539
791749	contig_854_pilon	+	1859	3	Intergenic	novelGene_36324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGTGTGGCCGGGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590393	592681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_591721_591981_592107_592274
791752	contig_9415_pilon	+	1828	8	Intergenic	novelGene_109872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1136	1462	2031430	2032239	TRUE	25	AGCTAAAGACCTCCCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPILNGPLHVLLSIGECEWDTIPTRDYGNHFAIRALANKRIKRNHLMETLLGNATVFNVKNAVEGLHVEQVHLLQVLQAERDAAQLLPHERGQVEVQRLLCADGNPH	2026552	2049502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2027368_2029895_2030198_2031411_2031568_2032050_2032302_2033086_2033168_2033973_2034007_2048657_2048750_2049404
791753	contig_14727_pilon	+	2472	18	Intergenic	novelGene_56668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.8235294117647	54	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1599	1901	372989	376244	TRUE	40	TCCGATAATAGGAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPMVKRLAPSFRSFLRFFCIRATRKLQTTWESSGSSSSSSSFRRYCGLVQKVSGKLRQPPAEQPLTQRPSFTDTVQVWSLSDSRASAVRLQISSFVKW	362350	414671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_363158_363557_363619_363865_363979_364211_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365111_365487_365569_370715_370752_371626_371837_372971_373152_376104_376273_377290_377369_378998_379081_380221_380279_388021_388139_390305_390370_414526
791754	contig_6842_pilon	-	1270	5	Intergenic	novelGene_130689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.246658965599	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	47	649	433953	369417	FALSE	65	AGAAGAAAGTGAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGKNKNLSPGDAAATL	433999	368795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_369460_429484_429699_431763_431865_432547_432658_433818
791755	contig_14353_pilon	+	2253	10	Intergenic	novelGene_82078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	144	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCTTTTCACATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79071	104394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80619_82377_82549_82705_82785_83259_83303_83903_83953_84505_84545_87367_87453_88662_88748_90957_91052_104333
791756	contig_3147_pilon	+	1544	8	Intergenic	novelGene_142265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	58.913288061388	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	93	1178	54862	68557	FALSE	70	TACAGAAAAGTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGGLVLPLLPERPLFPAELPPLLGPPGGNMASALEQFVNSVRQLSAQGQMTQLCELINKSGELLAKNLSHLDTVLGALDVQEHSLGVLAVLFVKFSMPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKVRLCCPQMASSGSPTPGFSPLLFSAEEAGARRKCDRIPVLRRNSIPTDF	54769	68923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_54917_58006_58137_60341_60455_60549_60600_62108_62202_63668_63849_66431_66573_68233
791758	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
791761	contig_2358_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_156097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGGGGAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46953	49032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_47000_49000
791766	contig_16122_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_134523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_3	8.9566858950296	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	356	676	142082	147718	FALSE	55	AAAAAAAACCTAGGGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIASEYAMVLHCS	141726	149035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636
791767	contig_753_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_112897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGGAGGGGGTTCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256238	254474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_254500_256200
791770	contig_11709_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_168221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCGGCTGCTGTGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62621	61312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_61300_62600
791771	contig_13952_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_133253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGACACTGAGCCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84410	81912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_82744_83548
791772	contig_9720_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_116772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCCCACAGAGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231051	232587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_231100_232600
791774	contig_1910_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_168276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAATTGTCCGTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42394	40733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_-_40700_42400
791775	contig_8681_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_157201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	68	313	133389	133634	NA	35	GGGCTCTCCAAGAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSHTAWLINHQHTASPGLPHPHMPNPNVPTFYLPFSSFFCFFASVSLSFSLTHLAPNMKSSPFPPAYLQCTPSATPLNGTSTDHQTLTCTAPWPHPIGPSTCH	133321	134001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_133300_134000
791778	SIRV4	+	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTCCGAAAAACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3663	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
791780	contig_9575_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_169731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAAGATGGCTAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746749	744622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_744600_746700
791782	contig_11318_pilon	-	993	9	Intergenic	novelGene_48156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	369.755916112237	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	147	695	49795	40241	TRUE	55	CCTAGGAAGAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGVGMKVVREAGQG	58241	33931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_34085_36394_36474_40174_40280_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58143
791783	contig_16525_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_133826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52	301	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCATGACTTTTCTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156816	159349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_157685_157787_158573
791784	contig_987_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_72268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440432	442484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_440400_442500
791785	contig_5906_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_174815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAAAATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341333	340077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_340100_341300
791789	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
791791	contig_16882_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_148213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_1	77.207909079898	272	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	67	930	202217	213521	FALSE	45	AACCACACGAGACAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLFSLAHRVALATVRYSRCGCGGFGMFYAVRRGRKTGVFLTWNECRTQVDRFPAARFKKFATEDEAWAFVRNSVSPDVSEGQKNQRVQEPQLKANKRPRESPNDEEDENTEPCVKHLKQNTESVPSVSKDTFSYMGEFVVVYTDGCCSSNGRKRARAGIGVYWGPGHPLNVGVRLPGRQTNQRAEIHAACKAIEQAKAQNIDKLVLYTDSMFTINAITNWVQGWKKNGWRTSTGKEVINKEDFVELDTLTQGMDIQWMHVPGHSGFIGNEEADRLAREGAKQPGD	202150	214186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_202348_203443_203560_206620_206786_208805_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
791792	contig_8712_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_58796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCTTCAGGAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302567	303774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_302600_303800
791797	contig_987_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_72253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCACCAACAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374848	373379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_373400_374800
791798	contig_12250_pilon	-	662	7	Intergenic	novelGene_80720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	291.321939136451	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	269	541	399347	398710	FALSE	30	TGTTACCCATCAACCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHWTSQCLIQSRRKRRRSERNSRRKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVSPPTSTARLQEKVFELMTTLQTKLEGFHTQISKYFSERGDAVTKAAKQPHVGDYRQLVHELDEAEYRDIRLMIMEIRNAYAVLYDIILKNFEKLKKPRGETKGMIY	400178	398588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399714_399846_399972_400019_400105
791799	contig_6710_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_91241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
791800	contig_1008_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_121635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATACATCTTACAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358710	1359058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1358700_1359100
791801	contig_6902_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_135598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483856	485923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_483900_485900
791814	contig_9708_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_67280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783045	782049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_782000_783000
791821	contig_10437_pilon	-	1030	2	Intergenic	novelGene_38225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	279	743	278778	277592	FALSE	45	TTAAAGCATAACTTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAEVILLCSEDSSMASIPECVGLEAAAAAVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRQFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELETWVKQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLHYRESSSEDEASRPTEIIEIPDEDDDVLSIDSGKR	279056	277304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_277755_278476
791822	contig_11978_pilon	-	494	4	Intergenic	novelGene_63105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCGAGAATGGACGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1831966	1830070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1830121_1830661_1830785_1831161_1831272_1831755
791824	contig_10751_pilon	+	2163	5	Intergenic	novelGene_174819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	9.39414711402797	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	511	1539	264590	275050	FALSE	25	TTATAAAAGCCTTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSFPMRNSQALISGGAMGGTISAVALLADLAASSDVTDSALAFFLTADVFLALCIVLYLLLPRLEYARYYMRPARPAHVFSGEEEQPQDSPDASSLAPGSSNHPLPALRSILKTTAGLGFCTVYIFFISGLVFPAISSNVESLNKGSGSLWTDKFFVPLTTFLLYNFADLCGRQITAWIQVPGPKSKLLLGLVLLRTGFIPPLCVLQLPAPCTPEDGGLHVRHLPGPLHLPAGAQQRLPQHPGSHLRAKDCVQGAGGGHRGSDVLLPVFGFAAWLSLLCPAGTPHLGGWWPGHQGHVTLWSLCKVVRKCWQGLAGMEEGAGASLGAEGRAYPGLISAPRE	228769	275674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_+_228800_232892_233192_264408_264636_269238_269402_274230
791828	contig_11832_pilon	+	1453	5	Intergenic	novelGene_106907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	12.7744862910412	323	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	373	987	68920	71806	FALSE	25	TGTGCTGCTGACATCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKQHLGKHLKAYQSCPPFVRFNLHRRTVCGDRSAPWVLELMRCFDNGECGSPLHKSQAGQKHSPPLSTQVPEPTKGASSDMGTPAQTYLPSTLQSTQRPTLPAAPPSLDRGHTHFNEIITSTVDHSLGAGPEARENQKQLQANVGPSAGRSAAAPVVSLLAITFVLSGVLVYMLCKKRREQAGPYCPDLQIHYATVSEDSIA	68218	72272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_68526_68854_68985_69274_69358_70698_71119_71759
791829	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_95066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653857	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
791831	contig_5918_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_99574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796686	1797808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1796700_1797800
791832	contig_11855_pilon	-	1927	14	Intergenic	novelGene_67031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_9	134.719739771214	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	154	1899	1937414	1911014	FALSE	30	CCCAGCAGTAGGAATCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTLDAVRQEALGIVRRFGTATEAATEPAGATVPTAAAAAARIGTIGPQPPAMPRRKRNAGSSSDGTEDSDFSTDLEHTDSSESDGTSRRSARVTRSSARLSQSSQDSSPVRNLQSFGTEEPTYSTRRVTRSQQQPTPVTPKKYPLRQTRSSGSETEQVVDFSDRETKNAADHDESPPRTPTGNAPSSESDIDISSPNVSHDESIAKDMSLKDSGSDLSHRPKRRRFHESYNFNMKCPTPGCNSLGHLTGKHERHFSISGCPLYHNLSADECKAPTERQLRYKEKVAELRKKRNSGLSKEQKEKYMEHRQTYGNTREPLLENLTSEYDLDLFRRAQARASEDLEKLRLQGQITEGSNMIKTIAFGRYELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSISVFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKNSFLNYNVSCILTMPQYMRQGYGKMLIDFSYLLSKVEEKVGSPERPLSDLGLISYRSYWKEVLLRYLHNFQGKEISIKEISQETAVNPVDIVSTLQALQMLKYWKGKHLVLKRQDLIDEWIAKEAKRSNSNKTMDPSCLKWTPPKGT	1937567	1910985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1911116_1911748_1911856_1912484_1912632_1914058_1914153_1915280_1915422_1915657_1915748_1917914_1918107_1919633_1919745_1922355_1922455_1927210_1927294_1931559_1931800_1933180_1933358_1934848_1934997_1937399
791834	contig_13300_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_125779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACACTATGCATGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61744	63223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_61700_63200
791835	contig_13300_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_125780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	155	541	63331	63717	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQERADGLLCQTQSLGVRWPFQGDPDSMGSLLSPKGNSRGRKGYGMWRGVPCRTFSNRPCLQGLFHPKEKTYDGQKSGSTLFPSSHGGPGRRQRELSGNTFPAPKAMVLTVSSRRTTKSLEERGHPK	63176	64011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_63200_64000
791836	contig_5485_pilon	-	2201	4	Intergenic	novelGene_37728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	317	1924	289326	280471	FALSE	25	CATATTAAAGCTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLQLAPHLPVGVMLPYNKTEAPGLHSAKQDPYEQGDSPQRSSMGHQRNNIQRKLLSNKELMLDNLYTQPKWNTFTKARSYSYPHCAGISQQDSGTNPQGRGKGLFYLSDPQSSQCWHPKANNQDAIPFTKKRVGVDRAYPLKPVFHRKSHSTGEAGADEDQNVSPRLPEPGDFSYSSFGSKNRVNSSVVGPVLAAMQGQRARAKPDRTEQLQIQRLEAAGESLEEEIRRKETLLREKLKKTEEELRRIQREKEQAEGNEKREIQRMTLSKRRVKGNSSNTIYKPTFSPEFGLEEVFSRDRRESETWGQLQENSSPFQFSDYGIQRLKREGPVASSNKIRDKASGPLTEKFSQPSEAPGNAVQGSTSNSSLSRAPDSSGSSCSTEEPILGRCSHCGRKFLLLRLERHSNVCSRMLGSKRKVFDSSRARAKGTELEQYLNWKGPASVKAEPPRKSNWRQKHESFIRTLRQAREVQQVIAKGGNPSDLPPILPAENPDYIQCPHCSRHFAPKVAERHIPKCKTVKNRPPPPRKHYS	290321	280193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_280735_287982_289346_289567_289742_290198
791839	contig_19865_pilon	+	1968	6	Intergenic	novelGene_170147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	110.224498184387	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	161	1261	43592	80344	FALSE	30	CAGCTTCACTTTCAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHCMYTPFGSPCACVRVCACVRACARALWERWSLRAPNEGACLGKLGLRRISGLQQKAMPSACSPLAGTAFSLAVSGCELRDTRTSHAASPKHSLVSGT	43431	81051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191_79369_79927
791840	contig_6163_pilon	+	1946	5	Intergenic	novelGene_103829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	59.5372782380921	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	325	1356	328534	330957	FALSE	10	GTCTGGGTCTTTGAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVKTPAPAPAEAEAPSLVSPETPAEALAPVQDPVEAPAPAETLAQAEAPAQYPGDHLIQSTSEENQIPSHLPACPSLRHIASLRGSAIIEFFHSSIAEVENEELRHLMWSSVVFYQTPGLEVTACVLLSTKAVYFVLHDGLRRYFSEPLQDFWHQKNTDYNNSPFHISQCFVLKLGDLQSVNIGLFDQYFRLTGSSPVQVVTCLTRDSYLTHCFLQHLMAVLSSLERTPSPEPVDKDFYSEFGDKSTGKMENYELIHSSRVKFTYPSEEEIGDLTFIVAQKIAAAEQAPALSILLYVQAFQVGTPPSGRSRGMLRPKTLLLTSAEIFLLDEDYVHYPLPEFAKEPPQRDRYRLDDGRRIRDLDRVLMGYQPYPQALTLVFDDVQGHDLMGNVTLDHFGEVPGGLAKAGQGHEVQWQVFVPSAESREKLVSLLARQWEALCGRELPVELTG	327960	331547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_328258_328506_328664_329129_329259_329800_329963_330346
791845	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
791847	SIRV4	-	196	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1318	7	1318	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3840	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
791850	contig_10732_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_114703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTGTAGCCTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111845	113954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_111800_114000
791853	contig_11720_pilon	+	997	3	Intergenic	novelGene_43928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	564	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	218	544	266571	268041	FALSE	55	AATACACAAGAGAAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTGVGREM	262258	268494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_266453_266610_267753
791856	contig_5484_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_151089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93072	90968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_91000_93100
791857	contig_14362_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_142510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTACTGCGGAATTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15023	15732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_15000_15700
791858	contig_12239_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_170476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAATGCTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73334	73983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_73300_74000
791860	SIRV4	-	261	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1262	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3896	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
791866	SIRV6	+	533	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-436	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1849	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724
791867	SIRV6	-	279	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1302	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3122	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105
791868	contig_9017_pilon	+	1157	3	Intergenic	novelGene_130341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_2	159	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	20	949	609348	610563	FALSE	55	AGAGATATAAAAGAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTPKMLLLLLLLLLWAGSLAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNLTCRATFPGADVTTESTVLLNVSCECWAGTPVSLRAVGVGGSGAEPGILAAASWKKGLVRKRTLNSTCFLFLKFLGETGCMD	609328	610771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609403_609470_609855_610072
791869	contig_14816_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_172455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAAGTTGTACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126347	124913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_-_124900_126300
791874	contig_6364_pilon	-	1910	2	Intergenic	novelGene_51818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	975	1730	1576381	1575626	FALSE	15	TCCTGGTGTCTGAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRLQIRLITWDVKNTLLRLRHPVGEEYATKARAHGLAVEATALGQAFRQAYQAQSHSFPNYGLSRGLTSRRWWLDVVLQTFYLAGVRDAQAVAPIADQLYEDFSNPCTWQVLEGAKATLMGCHRRGLKLAVISNFDRRLEDILVGLGLREHFDFVLTSEAAGWPKPDPRIFHKALQLAHMEPAVAAHVGDSYCCDYQGAQAIGMRSFLLTGPEPLDPVVKNSVPEEHILPSLSHLLPALDRLEGLPPGL	1578196	1575445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1576562_1577402
791875	contig_11719_pilon	+	1689	5	Intergenic	novelGene_154756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	96.055647933893	114	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	24	542	33169	133661	FALSE	20	TGTGAAAGGTCCATCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTRARRMMKLKSNQTRTYDGDGYKKRAACLCFRSESEEEVLLVSSSRHPDRWIVPGGGMEPEEEPGVAAVREVCEEAGVKGTLGRLVGIFENQERKHRTYVYVLIVTEVLEDWEDSVNIGRKREWFKIEDAIKVLQYHKPVQASYFETLRQGYSANNGTPVVATTYSVSAQSSMSGIR	33145	134808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_33268_106844_106956_130464_130510_131325_131411_133482
791877	contig_1339_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_163115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	628	960	279270	278938	NA	5	CTTCCTGTGCTTCATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNTPPPKGKSKEMHGNISCEKCPPSEKRSELRIWNHEEYWLHGAPPPRAPASAAVKWDNMPHLAVLMWRQDKVLEGASYRHVGSLQVSIWSCLLSPPPTEGGGLVQGG	279897	278898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_278900_279900
791878	contig_8624_pilon	-	1980	2	Intergenic	novelGene_112574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTTTGTGATGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062006	1059927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1061794_1061892
791881	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	512	54	512	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
791882	contig_10437_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_38397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725466	723815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_723800_725500
791883	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	6	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
791884	contig_9345_pilon	-	1742	6	Intergenic	novelGene_24436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_5	47.6889924406042	168	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	186	1463	361096	353865	FALSE	15	CACAGTGCTGCTGTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAFRAMDVESRTKGILLEPFVHQVGGHSCVLRFNETTLCKPLVPREHQFYETLPAEMRKFTPQYKGVVSVRFEEDEDRNLCLIAYPLKGDHGTVDSVDNSDCEPKSKLLRWTNKKHHVLETEKTPKDWVRQHWKEEKVKSHKLEEEFEWLKKSEVLYYSVEKKGNVSSQLKHYNPWSMKCHQQQLQRMKENVKHRNQYKFILLENLTSRYEVPCVLDLKMGTRQHGDDASEEKAANQIRKCQQSTSAVIGVRVCGMQVYQAGSGQLMFMNKYHGRKLSVQGFKEALFQFFHNGRYLRRELLGPVLKKLAELKAVLERQESYRFYSSSLLVIYDGKEWPEVALDSDAEDLEDLSEESADESAGAYAYKPIGTSSVDVRMIDFAHTTCRLYGEDSVVHEGQDAGYIFGLQSLIDIVTEISEESGE	382153	353585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_354366_354816_354993_357479_357656_358722_358946_360894_361223_382094
791888	scaffold_19766_pilon	-	1339	9	Intergenic	novelGene_34444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	273.684124493914	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	470	913	853617	852863	FALSE	30	GCTACATTAATTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFAELTYTLATEEAERIGVDHVARMTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIKMLHSRVKLILEYVKASEAGEVPFNHEILREAYALCHCLPVLSTDKFKTDFYDQCNDVGLMAYLGTITKTCNTMNQFVNKFNVLYDRQGIGRRMRGLFF	855765	852436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_853004_853126_853228_853326_853420_853508_853624_853707_853756_854229_854320_854681_854814_855356_855483_855698
791889	contig_16714_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_161583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964906	964543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_964500_964900
791896	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
791898	contig_4402_pilon	-	1660	2	Intergenic	novelGene_140872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625844	623818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_625200_625565
791902	contig_10057_pilon	-	521	5	Intergenic	novelGene_162346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	121	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	23	520	64936	35480	FALSE	50	CAAGACGTACATCAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKR	64958	35478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
791904	contig_8045_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_35322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGCAAACTTAACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61154	61819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_61200_61800
791905	contig_8259_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_148884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAATACTGTGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245975	247740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_246000_247700
791906	contig_18919_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_156012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCTGGTAAGGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58950	60053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_59000_60100
791907	contig_4868_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_136756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTAACATTTTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52055	52659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_52100_52700
791911	contig_9940_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_125342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGAGGAAAATTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137027	134973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_135000_137000
791916	contig_12864_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_76354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTATCCTTGTTATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105873	103966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_104000_105900
791917	contig_6862_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_63752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGAGGAGTTGCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86505	87452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_86500_87500
791921	contig_8616_pilon	+	1259	9	Intergenic	novelGene_72591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	940.600207314457	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	306	1184	428707	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426908	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427047_427756_427821_427982_428058_428678_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
791925	contig_16098_pilon	-	943	11	Intergenic	novelGene_45766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	355.377559786771	4	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	323	673	35038	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSNGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36329	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35685_35749_35907_36011_36295
791932	contig_7171_pilon	+	2545	21	Intergenic	novelGene_101278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_7	35.6135858907805	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	4	2379	1005445	1037913	FALSE	25	TACACCCCTTGCATATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEIFIYWSKSHNFKREEQNFVVQNEINNMSFLTADNKSKMAKSGGSDQERTKKKRRGDRYSVQTSLIVATLKKMLPIGLNMCAPTDQELIVLAKIRYALKDTDEEVREYLQNNLHLQGKVEGSPSLRWQMALYRGLPGREEDADEPEKIVRRVQEVSAVLYHLEQIEHPYKSKKAVWHKLLSKQRRRAVVACFRMTPLYNLPTHRACNMFLESYKAAWILTEDHSFEDRMIDDLSKAGKPKEEEEEEVEKKPDPLHQLVLHFSRTALTEKSKLDEDYLYMAYTDIMAKSCHLEEAEEDVGAEEVEVSFEEKETEKQRLLYQQARLHTRGAAEMVLQMISACKGETGSMVSSTLKLGISILNGGNADVQQKMLDYLKDKKEVGFFQSIQALMQTCSVLDLNAFERQNKAEGLGMVNEDGTGEKVMADDEFTQDLFRFLQLLCEGHNNDFQNYLRTQTGNTTTINIIICTVDYLLRLQESISDFYWYYSGKDVIEEQGKRNFSKAMSVAKQVFNSLTEYIQGPCTGNQQSLAHSRLWDAVVGFLHVFAHMMMKLAQDSSQIELLKELLDLQKDMVVMLLSLLEGNVVNGMIARQMVDMLVESSSNVEMILKFFDMFLKLKDIVVSEAFQDYVTDPRGLISKKDFQKAMDSQKQFTGPEIQFLLSCSEADENEMINCDEFANRFEEPARDIGFNVAVLLTNLSEHVPHDPRLRSFLEQAESILEYFRPYLGRIEIMGASRRIERIYFEISETNRAQWEMPQVSRAAHAHARLAGLPCAWGCLRPRLARLESP	1005441	1038079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1005484_1005590_1005684_1008604_1008776_1010387_1010448_1010661_1010800_1011560_1011674_1011859_1011957_1012206_1012314_1014046_1014099_1014677_1014741_1016062_1016163_1016456_1016537_1016628_1016706_1017857_1017932_1019629_1019711_1024147_1024237_1024352_1024482_1024563_1024669_1027470_1027553_1030216_1030405_1037475
791934	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
791935	contig_8773_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_74521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCATGGCCCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37039	38997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_37000_39000
791936	contig_14357_pilon	-	1863	1	Intergenic	novelGene_121678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTAGAGAAATAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546473	544610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_544600_546500
791938	contig_5718_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_110337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGATTTAGTTTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573480	571868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_571900_573500
791942	contig_13594_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_174825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1130	1543	436	23	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELKFRSNLKDANLFSTVFVISYSLKCYLYTMDCQKNEQICLERRTARMLLRSKDGETSSHFGRVFRRDQSLERDIMLGRAEGQRKRGRPSTRWIDTVAVTMGSNLAMIVGMVQVRAAFRSVVHGVTMNQNQLEGT	1565	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13594_pilon_-_0_1600
791943	contig_19179_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_142380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2825	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGCTGTTAGCACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35017	36292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_35000_36300
791944	contig_16934_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_132542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTATTGAAACCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266303	264993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_265000_266300
791946	contig_16122_pilon	+	1622	3	Intergenic	novelGene_134507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.5	90	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	449	1144	134090	137601	FALSE	0	GTCTTGCTTGGTGCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133458	138079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_133532_133714_134161_136976
791950	contig_18869_pilon	+	1917	1	Intergenic	novelGene_56483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAACAATATTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299069	300986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_299100_301000
791951	contig_12837_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_57269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGCCCTGCCCACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33376	33772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_33400_33800
791952	contig_9415_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_109927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAACAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2225695	2223869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2223900_2225700
791956	contig_1154_pilon	+	2162	8	Intergenic	novelGene_87090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	246.015927806908	1	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	7	1806	330777	445998	FALSE	70	TTGGAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVCRRQQCSVERRGFRQELDSWRHKLIHCRSRFPLFGGRRDHKGLTHIFNPPPKRFESIFEGLFGPGLLKDLSLFKDCEPESVSDWTFDENCLFCCLRRDKVKGHLVDLDEPASGAGQEALLKQEQAKIIRFERQAEEFLNAVFYRKGCPWVSDPNIPLVAREIMQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	330770	446354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330870_331886_331963_389032_389099_389755_389836_434841_434979_439220_439505_442410_442505_445028
791958	scaffold_7386_pilon	+	1185	8	Intergenic	novelGene_136592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGATGCTGTTCAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296979	308231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_297388_298836_298979_304002_304132_305069_305166_305566_305696_306774_306858_307254_307381_308159
791959	contig_3817_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_78292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTGGGTCAATCCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93483	92426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_92400_93500
791966	contig_8864_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_136009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAAAAATAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745253	743063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_743100_745300
791968	contig_4429_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_50827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240122	241233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_240100_241200
791974	contig_5485_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_37759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAAGCTCTTTCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476290	477143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_476300_477100
791975	contig_5485_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_37760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477245	477734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_477200_477700
791979	SIRV6	+	383	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	492	3	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
791980	contig_11417_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_103313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTTATCTAAGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558544	557747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_557700_558500
791981	contig_11417_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_103310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557452	556412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_556400_557500
791982	contig_19769_pilon	+	784	5	Intergenic	novelGene_102300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1653.76606190235	7	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	295	750	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87572_87820_88040_88841_88958_89163
791983	contig_14338_pilon	-	1873	5	Intergenic	novelGene_174830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6.9462219947249	62	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	631	1005	16428	16054	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGAIFISAGSQTTVPKVRFLGPCLEFSFLHPVKSRACSLWLWMSMEGEVRSELHPVHPQFCPRCGAIPYMPSAAAAVEVPPEICLDKESCSLGHPPSFQVMGCQQQHVITEWNDASPPKTLVS	23476	15185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_16461_18261_18351_19978_20170_21699_21859_23317
791985	contig_2414_pilon	-	2740	1	Intergenic	novelGene_158450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTCAGTGAAATGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86193	83453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_83500_86200
791988	SIRV2	-	198	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	1077	4	-1077	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAAATGGTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
791990	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
791991	SIRV4	-	450	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	15	1056	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
791992	contig_20878_pilon	-	2903	1	Intergenic	novelGene_173437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGCATGATGACCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11884	8981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_9000_11900
791993	contig_14341_pilon	+	655	7	Intergenic	novelGene_111834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2189.33617539401	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	78	611	548758	551737	FALSE	5	CCCCGCCTACCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYANSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_549973_550053_550151_550355_550485_551481_551581_551668
791995	contig_6557_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_32996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAATACAAAGAATATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491784	491029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_491000_491800
791996	SIRV6	+	538	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	9	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792000	contig_8797_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_174845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATGACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60565	58920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8797_pilon_-_58900_60600
792001	contig_10159_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_30819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGCATTCGTTGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482501	483683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_482500_483700
792002	contig_10159_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_30820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGAGTCGAGTTAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483775	484306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_483800_484300
792003	contig_5033_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_28959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	137	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1732	2067	451758	451423	NA	45	AGAACAGTATCTCCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	453489	451121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451100_453500
792006	contig_18822_pilon	-	2029	2	Intergenic	novelGene_111743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277738	275666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_276609_276651
792007	contig_7839_pilon	-	1114	9	Intergenic	novelGene_45675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.616617802677	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	152	1096	100162	95786	FALSE	25	GAACTGTAGCTACTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAPAGGARNGAGPEWGGFEENIQGGGSAVIDMENMDDTSGSSFEDMGELHQRLREEEVDADAAAAEEEDGEFLGMKGFKGQLSRQVADQMWQAGKRQASRAFSLYANIDILRPYFDVEPAQVRSRLLESMIPIKMVNFPQKIAGELYGPLMLVFTLVAILLHGMKTSDTIIREGTLMGTAIGTCFGYWLGVSSFIYFLAYLCNAQITMLQMLALLGYGLFGHCIVLFITYNIHLHALFYLFWLLVGGLSTLRMVAVLVSRTVGPTQRLLLCGTLAALHMLFLLYLHFASPPTPSSSFSLPHCLAKYRLGN	100313	95767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_95854_96393_96500_96695_96810_97013_97146_97303_97397_97532_97579_98949_99057_99252_99451_100081
792011	contig_504_pilon	+	2569	8	Intergenic	novelGene_54437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1383.35910311215	1	147	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGCTTGAAGCTCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227589	238582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_227640_228461_228554_230991_231054_231902_231950_232826_233002_234985_235108_236050_236135_236645
792012	contig_15135_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_119874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAAAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80084	79503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_79500_80100
792016	contig_2867_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_135229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	311	679	1204481	1204113	NA	45	CCACAGTTCAAACACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRAEASLQLLTVDIGASAGAEPRIEAEVHIVDNEAVATRVSLQDVCLPKHRDQCEPGVSLHSSKEKVAPRFTHVVDSLQRWERTWRLPPTVGAAGSTPSILGQKRTECKADGCKHYLGVRD	1204791	1202746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1202700_1204800
792026	contig_10134_pilon	+	1293	2	Intergenic	novelGene_16183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTGTCTTACAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29374	35319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_30273_34924
792029	contig_8268_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_147006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	699	1064	282110	281745	NA	20	GGTCACGATTCCCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKISHANSNQKRAGVTVLIPNKTDFKSKSVIRDKKGHCIMIKKVNSSRRYTKRVAPTWCYRRKHHDIPPQQRPKKLSKTETNVNPGTLSIKQRDKEFNQALTGIRNREQRATTYELSSLS	282808	281127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_281100_282800
792032	contig_17382_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_165190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCAGCATCCTTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31874	33535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_+_31900_33500
792034	contig_6102_pilon	-	605	5	Intergenic	novelGene_32189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2000	junction_2	913.295543622107	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	85	495	896355	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	896708	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627
792035	contig_14665_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_171046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTTTTAAAACAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51499	52753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_51500_52800
792036	contig_14665_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_171047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAATTTCTGGCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52857	53744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_52900_53700
792038	SIRV6	+	421	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	591	-1	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGGTGTTTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
792039	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
792040	contig_8394_pilon	+	1192	3	Intergenic	novelGene_27320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	1.5	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTCTCTTGGTCTCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75595	114802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_75716_113598_113655_113786
792046	contig_12566_pilon	+	1557	9	Intergenic	novelGene_85998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	86.3940825519896	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	564	1535	47610	86464	FALSE	25	CTCTTTAGATTGTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMEIEANSIRLCPQLFIKAYNIPFTFLEDFNK	43997	86486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57113_86371
792047	contig_1618_pilon	+	1230	8	Intergenic	novelGene_141807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	39.1798573822034	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	52	1056	727106	745924	FALSE	45	ATAAAATTAACTATCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKEKLIASVAEADTLVPNSKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLKGEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKFIIPQIVKYSPDCVIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLGIHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAYEVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESILKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEAFLSLPCILNARGLTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL	724171	746098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_724217_727099_727235_734117_734236_736267_736442_738262_738437_742218_742337_744092_744217_745756
792050	contig_8964_pilon	-	1149	6	Intergenic	novelGene_168708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	67.0235779409008	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCTGTAGCACATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549698	542944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543276_543392_543520_547370_547457_547844_548009_548900_549078_549434
792051	contig_18869_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_56265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73583	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
792052	SIRV7	-	267	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	17	91642	-15	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
792054	contig_6477_pilon	-	2251	23	Intergenic	novelGene_154192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	226	309	816016	815147	TRUE	45	AACCTAAACTCAGAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVPGTRHILRSAPPALRDEPTALPPQEAPGGAVGNTGGPRTSPLGGFSSSGWILAASSSCWTLRRISCCRPASEMPTLARSPGLIRLSVSSEMRWWAKMGR	819533	773732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_773891_776696_776803_777232_777293_777829_777875_778916_779000_780212_780278_782027_782110_783188_783306_784952_785049_786300_786445_790317_790449_790803_790944_791891_791937_794157_794229_795887_795988_805711_805801_806785_806861_808595_808676_810343_810440_814076_814178_815088_815221_816006_816089_819380
792057	SIRV1	-	252	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3852	0	3578	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
792058	contig_8942_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_143212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATGCCCAACATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699475	700176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_699500_700200
792059	contig_7695_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_41536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTATACACTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369786	368456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_368500_369800
792060	contig_2069_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_23310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCAGATATAAGGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516376	514894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_514900_516400
792061	contig_8689_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_170028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	432	11	442	135103	134672	NA	20	GCAGATGCGGCCATGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNEMHQLRLLGHLCDVTVSVEYQGVREEFMAHKAVLAATSKFFKEMFLNEKAVDGTRTNVYLNEVQVVDFASFLEFVYTAKVQVEEDRVQRMLEMAEKLKCLDLSETCFQLKKQMLESVLLELQNFSESQEVEASSGSQVTVTPESR	135113	134671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_134700_135100
792062	contig_3161_pilon	+	1074	2	Intergenic	novelGene_84543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTTCCCTTCTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703717	712563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_704113_711884
792065	contig_12964_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_131652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGGGGTAAAAAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99208	100109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_99200_100100
792066	contig_9582_pilon	-	1944	13	Intergenic	novelGene_106855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.5044796394103	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	54	1568	828141	771024	TRUE	25	CAAAAGGCTCCTTCGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPVVGQELQAGVAVGMSTGRPEPGPEGLSRHHGALASDHQPPPTAPVSWSLPRWRAYVAAAVLCYINLLNYMNWFIIAGVLLDVQKCFQISDSNVGLLQTVFIGCLLLSAPVFGYLGDRHSRKAMLSFGILLWSGAGFSSSFISPQYSWLFFLSRGIVGAGTASYSTIAPTILGDLFVKDQRTRVLAIFYIFIPVGSGLGYVLGSAVTELTRNWRWALRIMPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDSLIFGALTVVTGIIGVILGAEAARRFKKVNPRAEPLICASSLLATALCLYLALVLVPTTLLPFYVFLALGELLLSCNWAVVADILLSVVVPRCRGTAEALQITVGHVLGDASSPYLTGLLSSALRAGRPDSYLQHFLSLQQSFLCCAFVITLGGGCFLLTALYLERDQAQAGQPGTGTSDSKDVESQGLLSGAEGPLEGP	828194	769379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_769559_770826_771098_772219_772392_772508_772608_782168_782235_808680_808871_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817393_817921_818059_824373_824440_827951
792067	contig_13760_pilon	-	1894	12	Intergenic	novelGene_61354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	214.540254174262	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	187	1140	371224	361134	TRUE	10	GTTTTGGTATGGCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKFKFQTTFTLEELTAVPFVNGVLFCKVRLLDGGDFVSLSSREEVQENCVRWRKRFTFVCKMSANPATGLLDPCVFRVSVRKELKGGKAYSKLGFADLNLAEFAGSGSTVRCCLLEGYDTKNTRQDNSILKVTIGMSLLSGDPCFKTPPSTAKSISIPGQDSSLQLTCKGGGTSSSGSSSTNSLTGSRPPKARPTILSSGVPEEPDQNLSSPEEVFHSGHSRNSSYASQQSKISGYSMEHSRSSSLSDLTHRRNTSTSSSASGGLSMTVEGPEGSEREHRPPEKPPRPPRPPHLSDRSFRRKKDLMESHPTWVDDTRIDADDIVEKIMQSQDFTDGSNSEDSNLRLFVSRDGSTTLSGIQLANRVSSGVYEPVVIESH	402675	358387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_358569_360560_361180_362646_362717_362826_362949_363547_363744_363832_363938_366253_366412_366572_366620_368580_368698_370942_370973_371161_371283_402547
792068	contig_9011_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_159353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757966	760155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_758000_760200
792069	contig_9216_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_163511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTTTTTCATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607913	607475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_607500_607900
792070	contig_9706_pilon	+	1932	2	Intergenic	novelGene_20906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98424	105923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_99461_105027
792072	contig_5649_pilon	+	1588	6	Intergenic	novelGene_82332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	74.5036911837259	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	271	852	480530	494368	FALSE	20	AAATTTGTCCTATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNTFQSGFLSILYSIGSKPLQIWDKKVRNGHIKRITDNDIQSLVLEIEGTNVSTTYITCPADPKKTLGIKLPFLVMIIKNLKKYFTFEVQVLDDKNVRRRFRASNYQSTTRVKPFICTMPMRLDDGWNQIQFNLSDFTRRAYGTNYIETLRVQIHANCRIRRVYFSDRLYSEDELPAEFKLYLPVQNKAKE	480259	495104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_480614_492102_492183_492851_492964_493558_493748_494097_494209_494362
792073	contig_17586_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_174846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTGCATGTGGCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27155	27744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17586_pilon_+_27200_27700
792074	contig_3584_pilon	-	1193	6	Intergenic	novelGene_108153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTTTAAATCCAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355253	350990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_351654_352275_352364_352717_352800_353355_353468_354410_354631_355225
792077	contig_10982_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_87885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAAAGGCCATACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164528	162267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_162300_164500
792078	contig_9981_pilon	+	1143	3	Intergenic	novelGene_121031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	108	junction_1	6.5	279	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAATCTTTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99141	102006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_99249_100185_100237_101021
792079	contig_10042_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_79146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTAGACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109829	112258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_109800_112300
792081	contig_8174_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_160049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTGTTGTTTCCCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231134	232267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_231100_232300
792084	contig_7744_pilon	+	1794	15	Intergenic	novelGene_62520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_14	70.8574308749907	1	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	176	1588	825487	830740	FALSE	35	GCCAAATTAGCATTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRGSCAPERTFHLPSHLLFQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825311	830946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
792085	contig_6710_pilon	+	534	2	Intergenic	novelGene_97476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACACAGTGGTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653381	657828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657794
792088	contig_4782_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_73604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGAGGTTGTTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133253	130815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_130800_133300
792093	SIRV4	-	179	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1344	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3814	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
792097	contig_13592_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_33752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAATATTATCACCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377008	376485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_376500_377000
792098	contig_15304_pilon	-	478	2	Intergenic	novelGene_30516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	54286	53061	FALSE	20	GAAGCAGCCCTGCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54288	52884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53191_54116
792102	contig_13780_pilon	-	1929	13	Intergenic	novelGene_149034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	301.627103759298	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	156	1388	513204	485342	TRUE	35	ACTTCTAATAAACTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGMRNVKLGLVK	513359	484173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_484702_485328_485375_490695_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162
792103	contig_15120_pilon	+	2242	10	Intergenic	novelGene_108000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.4667752440117	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	189	1952	127481	146962	FALSE	15	ACATTCTGCTTGGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLKFLSSFFKITDFQLPDDDFGLLKLQKLKSCSEKMIESFALKTCAERHLKEGNCTVWEELIPKQIDTEKEVLEKELIVLPGKAHPKMPNLESQSKKGLSSSILLFTPSNTVAPDDNDRPTADMCSPAFPILGTTPAFDSQAHYENVSAEVVGHTCYIPQLSQSKDTVSLANDNKQCNSSISPSKLDTTLHVSDRKGQPNCDSGSQPAPLPMESLTAKGNQLRGSTRLELCNESVKQAEIADLPTCDSLNPGSLQLISKLKNPSGSCSVDVSTTWWEIAGCKEPCIITACEYVVSLWKPLDTWQWKKVYTWHFTEVPVLQIVSVPDVCNLVCVALGNLEIREIRALLCSSNDGSEKQLLLKSGNIKAVLGLTKRRLVSSSGTLCDQQVEIMTFAEDGGSKEKQFLMPPEETILTFAEVQGMPEALLGTTIMNSIVIWNLKTGQLLKKMHMGDSCQASVCHKAYSEMGLLFVVLSHSCAKESEWLGSPVFQLIVINPKTTLSVDMMLYCLPQGKAGRFLEGDVKNNFAAAVLTSGTIAIWDLLLGHCTALLPPVSDQNWSFVKWSDTDSYLLAGQKDGSIFVYRCL	126624	147252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_126706_127373_128198_128558_128631_130410_130573_132850_132937_133188_133351_135260_135378_141542_141631_144338_144488_146751
792104	SIRV2	-	565	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	99	22	99	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACACAAGACATTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5796	3687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
792105	SIRV6	+	182	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	540	61	540	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10777	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792111	contig_15828_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_173244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGAGTAAAAAGAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34820	33129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15828_pilon_-_33100_34800
792112	contig_6296_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_168791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACTGGCCTAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255694	256499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_+_255700_256500
792113	SIRV7	-	198	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91728	0	-91722	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTGAAGGTTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147800_148000
792120	contig_6017_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_152546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6688	junction_1	0	26	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTTTAATATACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442547	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124
792121	contig_7904_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_160038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATACTGGAGAGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551191	549922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_549900_551200
792125	contig_9481_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_149621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTCAGGACCCTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53001	54063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_53000_54100
792126	SIRV6	+	401	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	3	379	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	395	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792128	contig_6710_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_97717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
792131	contig_12644_pilon	+	684	6	Intergenic	novelGene_44648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4581.51771359666	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	49	600	2675526	2680545	FALSE	25	GAAATATGTGTTGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678783_2680476
792136	SIRV7	-	240	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69046	0	35827	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78911	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
792138	contig_7870_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_109029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCAAGACCAGGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580902	581276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_580900_581300
792139	contig_9345_pilon	-	1444	6	Intergenic	novelGene_24427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	72.3159733392284	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	954	1310	267581	266016	FALSE	5	GAGCTGCGTTGTCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDDMMFFLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLSEWESRISEVDARVVRDVCSKYFYDQCPAVAGFGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF	268661	265881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_266081_266519_266596_266946_267036_267348_267435_267540_267702_267828
792140	contig_17195_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_168970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16823	15470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_-_15500_16800
792141	contig_7123_pilon	-	957	3	Intergenic	novelGene_170578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	32	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	284	661	434051	433674	FALSE	40	ATGCATTAATATGTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNPCQSPTTSNFDDVGVLQKKLVPFVTDLTIHLAQELEKQKEDPGKVEQLQAWLQAWLLPHTNEVSQQINDNLCELQQRLVPCTNHPSVKTVCCCFTSTLQLSHTMSVWPILTGNMGKGVLEM	437381	433377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_434148_437108_437171_437256
792142	contig_10074_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_57156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAGATGTTTAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498468	499896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_498500_499900
792143	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	91	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
792144	contig_4640_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_147975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAGGAGTATAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480210	477647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_477600_480200
792145	contig_2799_pilon	-	2266	1	Intergenic	novelGene_85573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTAACTTTCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762637	760371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_760400_762600
792150	contig_15456_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_139480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACGTAATTTGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52952	53577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_53000_53600
792155	SIRV5	+	403	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_3234_3405_3483
792158	SIRV4	-	247	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1259	15	1259	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3899	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3900
792159	contig_2903_pilon	+	1383	7	Intergenic	novelGene_148984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	486	junction_1	155.439609566617	121	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	173	607	221148	238492	FALSE	35	CACATGCATAGGAAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKGKGGKNRRRGKNENESEKRELVFKEDGQEYAQVIKMLGNGRLEAMCFDGVKRLCHIRGKLRKKVWINTSDIILVGLRDYQDNKADVILKYNADEARSLKAYGELPEHAKINETDTFGPGDDDEIQFDDIGDDDEDIDDI	220975	239268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_221164_228693_228778_231689_231794_233695_233747_235105_235188_236334_236427_238486
792160	contig_15327_pilon	+	1788	6	Intergenic	novelGene_70832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	44.133434038153	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGCTAGTGTAGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639541	1645262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1639593_1640097_1640265_1640871_1640969_1641609_1641709_1643312_1643431_1644006
792170	contig_5331_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_112793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGCTAACTGAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408120	407451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_407500_408100
792181	contig_4232_pilon	-	1687	15	Intergenic	novelGene_63182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_8	41.8747525122141	157	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	154	1587	143519	138528	FALSE	15	CGTTCATAGCTTTATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDERLQQHRASGGDHTPVSPSGEKSSAPEGPAAEAQDPSLPVSAQPRSRGSGGYWPARHSGARAVLLLLYQEHLNPSGCSFLTKEELLQRCAQKAPRVVPANVRSWPALRSLLNRNLVLRAHQPARYSLTLEGLELAQKLAESEGLSSLNAGTGPEEPAREEPEVPGAASAKLGASEGGGQQPPLELGPGEYRVLLCVDVSETTGAGHRPELLRELQRLHVSHTVRKLHVGDFVWVAQETRPRDPARPSELVLDHVVERKRLDDLCSSIIDGRFHEQKFRLKRCGLGRRVYLVEEHGSVHNLSLPESTLLQAVTNTQVIDGFFVKRTADIKESAAYLALLTRGLQRLYQGHTLRSRPWGTPWDPEPGARPSPNPLCSLLTFSDFNAGAIKNKVQSVREVFARQLMQVRGVSGEKAAALVDRYGTPASLLAAYDACATPKEQEMLLSTIKCGRLQRNLGPALSRTLSQLYCSCGPLT	143672	138427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_138595_138681_138766_139300_139405_139484_139614_139779_139876_139965_140083_140633_140732_140817_140940_141029_141126_141292_141434_141960_142047_142229_142299_142484_142584_143153_143240_143479
792183	contig_18637_pilon	+	907	8	Intergenic	novelGene_81840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	13	junction_1	10.0529211918624	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	133	906	63585	92593	FALSE	40	AGATGAAAGGGGAAGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSDASDMLAAALEQMDGIIAGSKALEYSNGIFDCQSPTSPFMGSLRVLHLVEDLRGLLTMMEADEKEGLRCQIPDSTAETLIEWLQSQMTNGHLPGNGDVYQERLARLENDKESLVLQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEFCLEEHREKLNATEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDRFRDTEGLMQEISDLRLRVSEMDSERLQYEKKLKSTKDELASLKEQLSEKESEVKRLQEKLVC	10912	92594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_11010_63549_63649_66528_66735_80712_80800_81952_82067_83366_83499_90591_90685_92515
792186	contig_12790_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_35197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	30	320	299272	299562	NA	55	TACACATTTTAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGIIFSSFWMFSDDFMPDLCCWGKVTENKIYSQPRKLLYKNRREIGSFLDIAKQLEGLVNCVKRLGTIISGDNLVNWHNIVHKDNVLYPSLVSSVWCLKSLRAAI	299242	300431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_299200_300400
792188	contig_7078_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_130228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981378	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_981400_982400
792189	contig_4686_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_118568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCTGTCCTATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687007	687509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_687000_687500
792190	contig_5145_pilon	+	1450	11	Intergenic	novelGene_131354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	26.6037591328744	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	10	1011	36550	65385	TRUE	15	GTAATTGCAGCCTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEVHVQRTQPALQPGLPGVGGTRPPLLRLRNRAWGRIRLRGAGLRAEGGKMADSSGRGGGKPSAAGSNTPSGAKPKGKRVQGGRMVEPRYLQYEKKTTKKVPAADALKASGKMPEVGKKPNLLQKSRGTSDLSGVGKSDLQSTMLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLDTICWVNSEPTTRRRV	36540	66921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514_52606_57458_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509_60652_65335_65450_66546
792193	contig_6870_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_103965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCGCGCCCTGTGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411621	1409424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1409447_1410087
792195	contig_1865_pilon	-	1295	6	Intergenic	novelGene_103237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.913171985358	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	50	517	68599	41954	FALSE	20	GATTTGGATTAATGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVEGIKKEQAVRLAQKMGFPHNIVDSAAENMVKLYRLFLKYDATMVEINPMVEDSDGAVLCMDAKINFDSNSAYRQKKIFDLQDWTQEDERDKAATEANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDKVQAILVNIFGGIMRCDVIAQGIVMAVKDLEIKIPIVVRLQGECRRL	72110	41175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_41961_52949_53086_56406_56443_56538_56701_68472_68612_72073
792196	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
792197	contig_10296_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_168866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGAACATCTTAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028	1783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_1000_1800
792199	SIRV4	-	306	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1217	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
792203	SIRV4	-	457	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	8	1056	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
792205	contig_5832_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_134131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183999	182442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_182400_184000
792206	contig_7898_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_47579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTATTAGAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484413	485663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484400_485700
792207	contig_8017_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_65355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTCATGAGCTGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922928	923970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_922900_924000
792208	contig_835_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_152172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTGCCTATTCTAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368301	369821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_368300_369800
792209	contig_20029_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_138894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTTAGATGGTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4995	6855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_+_5000_6900
792212	contig_14807_pilon	-	697	8	Intergenic	novelGene_124674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6927.56527009516	10	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	40	600	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQVRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37524_37607_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
792217	contig_11017_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_128096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCGGGGGGTCGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303435	301708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_301700_303400
792219	contig_1996_pilon	+	782	8	Intergenic	novelGene_131894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	195.621250045561	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	121	558	251625	255356	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSAADPERHVGLR	249871	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_255320
792222	contig_1146_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_84841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAGACACAGCAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934638	933064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_933100_934600
792223	contig_4783_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_108367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	707	1099	150127	150519	NA	40	GGAAATATGAACATATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEENEWTQDIGVKINRISSLVWESVTKKPNRTKNVVSVALCGYQATLSVVGQPRCHFCAGSSRMSKGYRRDQRLRSQGIWLREGCQRSSQEHSILEKTSPQKHGVLLNVLCKVPQLFHLDESRWREKN	149420	150803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_149400_150800
792224	contig_8254_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_48375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGTCTTCCTCTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54940	55907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_54900_55900
792226	contig_10753_pilon	-	821	6	Intergenic	novelGene_105121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAATTTTTTAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71938	5778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_5867_10042_10120_12295_12448_19661_19727_33692_33746_71552
792228	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	3	1155	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792230	contig_4364_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_4599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGGTACTTATCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2209936	2211519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2209900_2211500
792232	contig_13110_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_138741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTATTTTACTTAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450855	452757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_450900_452800
792234	SIRV6	-	267	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1341	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3161	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_2779_2826_3101
792235	contig_13722_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_174630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCACAAGAATGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5135	4402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_-_4400_5100
792236	contig_10609_pilon	+	994	4	Intergenic	novelGene_123962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	64.3549186586041	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	75	752	574055	589892	FALSE	45	AGAATCGACTCAACACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGAGDQWFSGAGSPGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKQDLINLLITQATPHVAPVMPLDRFITGEYCYISAI	573980	590134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888_585065_589691
792237	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
792238	contig_6100_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_168118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	212	529	484779	488503	FALSE	40	AAAAAGCTTCAATTGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYGVGKQYRIDHELPEEQMCLGRSTARMLIRRMVRLHLVYSERVIRRDQSLKKDIMTGKVEGQRKRGRPSTRWSDTVAATLGSNITIERMTQDWTTVIHRAFTG	484567	489830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_485057_488463
792239	contig_14754_pilon	+	1261	4	Intergenic	novelGene_174848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	18.3726850393609	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	104	985	151457	155245	FALSE	50	CAAAGGATACATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKANLKKEIISQFHCSAAEGDIAKLTAILSHSPSLLNETSENGWTALMYAARNGHPEVVQLLLEKGCDRSIVNKSKQTALDIAKFWGYKHIANLLANAKGGKKPWFLTNEVEECENYFSRTLLDRKSEKRNNSDWLLAKESHPATVYILFSDLNPLVTLGGNKESFQQPEVRLCQLNYTDVKGYLAQPEKITLIFLGVELEMKKELLSYAEEVPKEEEDGLVAWFALGIGQIAAEEFKQRHENCYFLHPPMPALLQLKEKEAEIFRPNRSPWVVQMVNAPTQLLTENLEV	148594	155521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14754_pilon_+_148692_151450_151663_152506_153097_155159
792241	contig_16098_pilon	-	1694	6	Intergenic	novelGene_45805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	9.47839648885823	121	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	34	735	133249	131586	FALSE	10	CCTGACGGCTGTGGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASQTAPRHPSPPVLPPLPPPILTQWNCSPQSCPPASPSKRDPHQGQFIPSQPLTLPWTLRKRPQGHSCSRGESEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQLVLAGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDMLEHFQVHPIPLESGGSSDVVLVSYVVSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDRCHPDASSTLMPFGASDCVIEHLP	134895	130626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_131605_131784_131885_132311_132484_132622_132836_133051_133256_134868
792244	contig_3161_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_84535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATCCTATGACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508400	508951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_508400_509000
792249	contig_12886_pilon	-	1610	11	Intergenic	novelGene_135504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	205.691638138258	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	270	1502	626364	592899	FALSE	25	TTATTCTGGATGTAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMELESKLNEAKEEFTSGGPLGQKRDPKEWIPRPPEKYALSGHRSPVTRVIFHPVFSVMVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHSGKLLASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSTISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHEHFVTSLDFHKTAPYVVTGSVDQTVKVWECR	659578	592790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_592973_594073_594231_596156_596259_597389_597619_598329_598433_600459_600629_605606_605814_607030_607106_607260_607346_626332_626554_659498
792253	contig_6189_pilon	+	1895	2	Intergenic	novelGene_164933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACGCAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33315	36100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_34198_35087
792256	contig_6266_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_171007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCAAGGCCCTACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830981	833193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_831000_833200
792258	contig_2100_pilon	+	1200	9	Intergenic	novelGene_50617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCGGTGGTTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813218	960634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_813657_814881_815010_822283_822333_847792_847896_868566_868664_870263_870370_918244_918369_927442_927516_960552
792259	contig_10609_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_123954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAACCTTTTGGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486083	487411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_486100_487400
792260	contig_8864_pilon	-	2506	15	Intergenic	novelGene_135985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	28.3837586500104	18	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	681	2114	228070	137431	TRUE	25	GTATGTCAAGTTGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACEIMPLQSAHVSQVSSVSTTGELLERTIRSAVEQHLFDVNSSGGQSSEDSESGTSSTSSTASTKQRRRQPKEQDEIRRAKDMGLVNKENIPSKFSDLDDCILNAQEVEKVHENCSGYGGERSKPKRQKSSTKLSELSENQDGLVNMESLNSARSHERTGPDGIELMTNESKENEEDCGHAQHAESSTMKIQEHPSIPDAKLQRSQDADDQQESFVPEVPQLDLAALCDGKSWEEPVPTFSTWQRESINSDEARLSPQAGRLIRQLLDEDSDPLLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEERKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRKQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQELVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKVMTGTGWSNRSCPEPTPYPSLEG	228750	129947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_130145_136023_136108_137319_137441_137851_137912_146303_146527_147385_147468_148398_148538_149075_149290_156779_156928_167857_167901_168264_168342_182504_182692_190815_190996_193805_193848_228041
792263	contig_4847_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_156162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	387.933705676627	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	347	466	108596	109628	FALSE	15	AACATTTTCTGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQYARRSVSGGAESPRPKAYACLAAGADVGGAVRVPACVISQLDRVGREQCRRSFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLLMVAKLGFTVFTRPHQS	99556	110071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101080_101420_101478_102278_102381_108569_108658_109570
792264	contig_4674_pilon	-	1705	12	Intergenic	novelGene_174139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	105.640275314839	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	78	1142	354677	244687	FALSE	10	CAGCCTTTTGGTTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHYFCIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMIRKKIIHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRVLMFGDTSYIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEYYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHTRTRLESGYHQHSPEAYIPYFKNHSVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMSAAETIAWIRICRPGSVIGPQQQFLVMKEASLWLEGDYFRQKLRGQENGKHRAAISKLLLSVDDISINGVKNQDKQEPEPYSDDDEINGVTQGDRLRALKSRRQSKANTIPLTS	355335	244123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_244694_271190_271289_271977_272138_272342_272482_274350_274582_274889_274978_278391_278455_281209_281277_313985_314063_351305_351399_354635_354712_355292
792268	SIRV4	-	452	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1062	7	1062	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4096	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
792269	contig_9833_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_68564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTACGTATTTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295801	293912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_293900_295800
792272	contig_6445_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_77044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCTATAGGAAGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616658	616154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_616200_616700
792273	contig_12852_pilon	+	1168	4	Intergenic	novelGene_141443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	61.9731124494056	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	207	605	469165	474263	FALSE	25	GGATTTTCTTAAAGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAARAMRSNIRHYFMEPPQLKLFYDVITWIVTQIAISYTVVPFVLLSIKPSFMFYSSWYYCLHIAGILVLLLLPVKKTQRGRNTHEKIQLSRSKKFDEQENSLGQNSFSTTNNVCNQNQEIASRHSSLKQ	465266	474826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_465361_469052_469186_472149_472302_474037
792274	contig_6233_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_74824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434517	434162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_434200_434500
792276	contig_6551_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_155553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350701	349335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_349300_350700
792284	contig_5590_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_163018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	854	1252	304545	304147	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKNESGTKSRLPEPWWNWLQAEVKSGACECSHKTPKEVALFLQTSCPGEKRASQPEWCTPPQGPPPQLADLPTLRPRSAVSLRPCPKHTAAGLPSCSACPVLVTHQPNHRQVPREQTLHKQIHSPHPLFY	305398	303537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_303500_305400
792289	contig_9058_pilon	+	1135	6	Intergenic	novelGene_149358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	312.493199926014	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	47	1012	41923	57128	FALSE	10	CCCCAGTGTCTGCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNDEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPSCQGTNKKIVLLGRLGERAQKSQSSLVSLSDHVQICEVH	41876	57251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47502_51837_51961_56353_56462_57003
792290	contig_10399_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_114485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCTCAGAGGCTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265263	265957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_265300_266000
792291	contig_7933_pilon	-	534	3	Intergenic	novelGene_164707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4810	junction_2	276	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	66	368	238534	233326	FALSE	30	CATACTGGAGCGTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	238599	233159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430_234584_238531
792296	contig_9375_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_136077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAGAATTAGTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608702	609160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_608700_609200
792297	contig_7697_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_128283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	394	714	221174	220854	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFQTYTLRRLLMPLGFSKTASCPSGLSEHWRGVNVTTNHLTPQIWGWRIKLLLTAVESIPTHGDPMCAENCAPQGFQSCDLLEADCQACLPKRLWVGSNRQPFG	221567	219464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_219500_221600
792298	contig_12802_pilon	-	1493	1	Intergenic	novelGene_114263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	758	1057	287556	287257	NA	30	TTGAGGCTATGTCAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACKRWTMNKEDQRRIDAFELWCWQRILNIPWTARRMNKSVLERRTARMLLRSEDDETLSHILWTCFRRDQSLEKDIMRGKGEGQQKRGDPQ	288313	286820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_286800_288300
792299	SIRV6	-	377	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9416	-122	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTCGACTGTCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11236	1666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2826_3102_3164_10723_10818_11031_11109_11205
792300	contig_11720_pilon	+	1658	2	Intergenic	novelGene_43885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCAGGCCTGGGTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113720	116155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_113801_114577
792303	contig_593_pilon	+	2056	11	Intergenic	novelGene_102010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	150.043360399586	5	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	285	1256	383582	481427	TRUE	75	AAAAAAAGACCAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSARDLEESINKIREILSDDKHDWEQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLG	383297	482319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016_479091_480193_480287_481277_482111_482202
792305	contig_6365_pilon	-	1065	6	Intergenic	novelGene_133998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	92.6053994106175	217	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	170	763	12349	10077	FALSE	25	CTCTTGACTATGAGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKVAKKIKEKTKTPRKSSNQGRSCPVTSTTATQEGQKRKNTVKEKPVTKKQKVSQEQSQPPCPSGASTSATMDHPSPPQISSSSSSFISLTEEESERDAASTPVQENTAV	17696	9774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_10535_11092_11194_12081_12368_17459_17529_17614
792306	contig_18859_pilon	-	1508	7	Intergenic	novelGene_150544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	39.4672860311761	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	139	1413	168580	97303	FALSE	25	CATGCTTGTAAATGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPRATTDTTPAAGAAGEEVPQFETTCSYVEATLEEFLNWNCDQSRGSGPFRNYDHSQFWAYADYKYFVSLFENKTDVFRDVIWSDFGFPGRNGRESTLWIGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQVQGRKRWHLFPPEDTPFLYPTRIPYEESSVFSKISVVNPDLKCFPQFRKAQRHTVTLNPGQVLFVPRHWWHYVESIDPITVSINSWIELEEDHQARVEEAITRMLVCALKTAEDPDNTKAWLNPTEIEETSHEINCRYLNEAVSALFDHYRTSKKVDIEALGTNGEHTKTEGLNVHNHMEVEQPHSQNLTTGTVKQEAASPFGPDLVPVMPSSEEPSTERGRIFESDGNSLDGEHFGKSHCTKRQRMMYKSKNAIVEQIASNSTVAPSQTFISTDDLLDCLVNPQVTRIVAQLLIQGRTL	168718	97207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_97828_97942_98054_111646_111731_114358_114531_118430_118568_131869_132052_168516
792307	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
792309	contig_8693_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_150871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGAATATACCGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104874	1103959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1104000_1104900
792310	contig_563_pilon	+	935	3	Intergenic	novelGene_169774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	18	junction_1	57.5	3604	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	489	845	716908	720513	FALSE	10	GTACCTGTCTGGGCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKSGKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK	716419	720603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_716910_719107_719288_720338
792311	contig_5727_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_7972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	608	964	198913	199269	TRUE	25	TCATCTTTCAGGACAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLIYEIKPSRYHLNHVLSPDPRLHCWIPLVLIHFPSLGRNPHYQILSRNLDLIRHLEKLGESRSQKLLSGFFLTAETHCQTVQNPKPFSFWMAGHCLNPHLTAVCGASWDCRPRCQT	198305	205202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_199365_200281_200395_200607_200705_201753_201912_202861_203011_203332_203417_205119
792313	contig_11417_pilon	+	1452	2	Intergenic	novelGene_103256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTCATCGTATTGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256669	275877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_256772_274527
792314	contig_11136_pilon	-	1020	5	Intergenic	novelGene_169022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	17.3853386507137	177	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	16	846	146932	137339	FALSE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSTMVAALFGCWFRVGGARSAMAGRVIPVGPTVVQTSMSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLPLHRAHRVEVVLLHGKAFNSHTWEQLGTLQLLSQRGYRAVALDLPGFGNSAPSAEASTEAGRAELLQRVLQDLEVHNAVLVSPSLSGHYALPFLMRAHHQLRGFVPIAPASTQNYTQEQFWAVKTPTLILYGELDRILARESLQQLRHLPNHSVVKLRDAGHACYLHKPQDFHLVLLAFLDHLP	146947	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137522_137734_137971_143996_144113_144265_144478_146848
792319	contig_5797_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_56962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACTTATAAATATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406939	407193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_406900_407200
792321	contig_2438_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_111991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTATTTATTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175884	175684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_175700_175900
792322	contig_12427_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_40423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	362	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	122	655	209839	210372	FALSE	30	GTCAACCCAGCCACCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	209626	210424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_209737_209827
792323	contig_1639_pilon	+	1267	10	Intergenic	novelGene_74920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_9	102.215458713445	389	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	22	996	341627	399668	FALSE	30	GTAGTTATTCTTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAALAWRMAPLVLQLVVLGVALAAAALIVISFVAFVTAVKMPHLYQHEDEKFFLNARGQKETLPSIWDSPTKQLSVVVPSYNEEKRLPMMMDEALDYLEKRQKQDPMFTYEVIVVDDGSKDQTSKVAFKYCQKYGSDKVRVITLVKNRGKGGAIRMGVFSSRGKNILMADADGATKFPDIEKLEKGLNDLQPWPDHMAIACGSRAHLEKESIAQRSYFRTLLMYGFHFLVWFLCVKGIRDTQCGFKLFTREAASQTFSSLHIERWAFDVELLYIARFFKIPVAEVAVNWTEIEGSKLVPFWSWLQMGKDLLFIRLRYLTGAWRLEHARKKN	341605	399939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_341693_343053_343226_343614_343662_344780_344850_354138_354232_357538_357653_374183_374244_390252_390405_396934_397021_399552
792325	contig_14441_pilon	+	695	3	Intergenic	novelGene_100662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	191	508	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAVSSSGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112112	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112154_116578_116963_117527
792327	SIRV5	+	433	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	24	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8225	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8607_10866
792328	contig_4640_pilon	+	2912	1	Intergenic	novelGene_147965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAGTGCCCATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149187	152099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_149200_152100
792329	SIRV3	+	497	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4777	1721	2718	500	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAGAAGAAAGAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6721	7218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6700_7200
792332	contig_10299_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_79753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTCTTCCTGGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581286	579636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_579600_581300
792333	contig_9482_pilon	+	1144	6	Intergenic	novelGene_44282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	18.3150211575089	252	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	202	939	1216671	1229484	FALSE	30	TCAGAAGCTGAAGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEANPCPCDIGHKMEYGGLGHEVQIEHMRAYVSKPAVNTGRAVIVIQDIFGWQLPNTRYMADMIAANGYTTILPDFFVGREPWCPSSDWATFSEWLKTRNAQKVDREVDAALKYLKLQCGAQKFGIVGFCWGGVAVHHLMATRSEFRAGVSIYGIVKDSEDVYNLKNPTLFIFAENDAVISLDEVSLLTQRLKDHCKVEYQIKTFSGQTHGFVHRKREDFTPADKPYIEEARRNLVEWLSKYV	1207457	1229689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1207640_1216651_1216886_1221365_1221474_1225685_1225829_1228449_1228542_1229304
792335	contig_11498_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_65492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCCAAAAAGAGAAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25524	24127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_24100_25500
792337	contig_9609_pilon	-	1890	12	Intergenic	novelGene_23093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	40.6342281318074	1	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	149	928	481425	478159	TRUE	5	CTCAGTCTTCTGTGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARKGNAPRKGSARSSAQADSGSSEDEAASEARSTTSECPSLLSVTAEDCLGGDAVDEQAQQEDLEDKLKEYVDCLTDKRPGKVPWRTCAWPWHPTYFLTSCWSAASHWLMPWKSASGKGKVRSRPWLLLCWVSFVCSWALGPRVRSCSTAYSPCWSPCSTTAQLALLRGSTVLLLSAWAVMWLLPMSRTWSLALLAWKVFLAGLAVWVAPQPLWPLPAFTACCVLPCRPGHCCSPSAPAPTSATSLTGSCPGCPSS	481573	476611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_477134_477276_477373_477447_477577_477649_477788_478081_478188_478265_478445_478528_478580_478748_478907_478988_479107_479222_479308_479392_479513_481385
792342	contig_9345_pilon	-	1957	7	Intergenic	novelGene_24724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.1852375713238	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	27	590	1015290	1012925	TRUE	10	GCATGACTCTGCTGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVSVPCHVKGTVALQVGDVRTSQGRPGVLVIDVTFPSAAPFELTRLLECSLLSCALQCLSSMSRAALAWRCQMLQEIVFKNYYTAFLSIRVRQHTSIHTPAKWVTCLRNYCLMPDPHSEEGAQEYVSLFKHQMLCDMARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKPLHGLSQVAFPPSAL	1015316	1011137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012973_1013434_1013549_1013799_1013977_1014913_1015007_1015158
792345	contig_17753_pilon	+	2064	5	Intergenic	novelGene_105069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	270.849589255734	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	933	1379	131420	133179	FALSE	35	TTTTGAAAGTGAGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLIPEAKWMEPRGAFWRERRLRPPALVPALLQRALPTPSIHAQPTKAQ	48906	133864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_49006_75018_75173_96134_96231_130836_131726_133038
792350	contig_16594_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_53929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAGAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316861	314951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_315000_316900
792354	contig_6710_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_97188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
792355	contig_9373_pilon	+	2287	18	Intergenic	novelGene_162720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAGACTAAAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196096	234213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_196175_197720_197825_198894_199013_202169_202291_202558_202614_203330_203410_205288_205383_206758_206876_208020_208169_210657_210822_213362_213531_216487_216548_224540_224769_226242_226320_229821_229981_230791_230974_232303_232415_233989
792356	contig_7707_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_72212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAACCGAAAAGTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754822	756282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_754800_756300
792357	contig_15899_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_128899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGAGTGTTGACATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792	139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_-_100_800
792358	contig_13148_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_162930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTGAGAAGAAAAGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106854	105316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_105300_106900
792359	contig_672_pilon	+	1009	2	Intergenic	novelGene_174852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGCTAAAGAAAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263820	265086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_672_pilon_+_264581_264837
792365	contig_9053_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_87917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGTCTTAAACAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50216	48055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_48100_50200
792368	contig_6710_pilon	-	416	2	Intergenic	novelGene_98234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCCTCTGGCCCCTTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
792369	contig_8587_pilon	+	1730	13	Intergenic	novelGene_159133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	67.6586099472935	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	94	1353	427077	436771	FALSE	35	GTGGAACACAGTTCTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIHSLHAGRLGALCSPGPYEHVSKTKLVQKAMDEKRFDEAIQLRGRSFENNWKIYKLLSHQKISKEKTNFCLAILNVGAPAAGMNAAVRSAVRSGISQGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHHVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKSYMEKIVENIRTYNIQALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGHYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFSLGSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDPFNIHDLKVNVEHMTEKMKTEIQRGLVLRNEKCHEHYTTDFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVLGHLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKALLWMSEKLRAVYRNGRVFANTTDSACVIGLKKKAVAFSPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLNLRLMLKMLAHYRISMADYVSGELEHVTRRTLSIDKGF	425894	437148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_425967_427055_427121_427926_427991_429753_429901_430803_430875_431831_431920_432896_433050_433855_434021_434554_434617_434891_435004_435678_435779_435861_435968_436623
792370	contig_14727_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_56676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTGTTGACACTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369997	370330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_370000_370300
792371	contig_14665_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_171042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCTGGAGAAGAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39832	37659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_37700_39800
792372	contig_11702_pilon	-	1682	2	Intergenic	novelGene_141968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	512	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGCCCAGCTTAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319389	313375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_313853_318184
792376	contig_15744_pilon	+	695	6	Intergenic	novelGene_83583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1491.37179804367	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	59	646	149562	153543	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKNHSFCSSGDQPSTPVCLQHPIIFVLSLQCFGFHLFLILLQV	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245_153347_153418
792377	contig_10749_pilon	-	1061	4	Intergenic	novelGene_133485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	763	junction_3	475.975489565027	18	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	61	507	168321	164528	FALSE	10	TGCTCTTATCCTCCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNESSPGGGVKVWGGNTGTMWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169048	163973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168302_168346_169012
792381	contig_8626_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_174855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAAGCGAGAAGAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15784	14766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8626_pilon_-_14800_15800
792382	contig_14133_pilon	-	608	6	Intergenic	novelGene_119945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1641.93990145803	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	395	568	207422	206601	FALSE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGCSALRRAIGSHGAQPEWHDPEAPLPQGLRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209451	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208668_209064_209131_209421
792384	contig_5338_pilon	+	1926	6	Intergenic	novelGene_114570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	35.0542436803306	243	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	428	1642	358573	360655	FALSE	20	CTGCCCCTATCAGCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCSMEPGARAPFTEITQHLEWILEQMPEPALLTKAPLTHNQGSLPRWGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPGSPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVAPLPLVPPSPLSSTHLPLVTTPETLVQPGTPVRRCRSLPSSPELPRRMETALPGSGPPPVGPSAEERMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSAQPWSSQSGPPLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSVPRETDEGLPCPGCCLGPFSFSFLSMCPRPTPAVARYRNLNCEAGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS	357962	360939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_358341_358523_358615_358848_358933_359087_359178_359324_359440_359771
792388	contig_15036_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_107149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75009	72889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_72900_75000
792389	contig_16565_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_174858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGCTCAGTGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8833	7586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16565_pilon_-_7600_8800
792390	contig_8964_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_168713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAAGTGCGGCCCTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550950	550432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_550400_551000
792392	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
792396	contig_2550_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_135668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220844	1218765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1218800_1220800
792397	contig_3601_pilon	+	2227	1	Intergenic	novelGene_132838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103381	105608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_103400_105600
792398	contig_9345_pilon	-	718	2	Intergenic	novelGene_24602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	96	533	945468	944755	FALSE	35	CACTAATAAAGTGCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945563	944569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
792399	contig_6163_pilon	+	1208	2	Intergenic	novelGene_103835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	155	307	375051	378560	FALSE	10	CTGTGTGGTCTTATTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAESVEQRWACKTGRGLAGRSRPCLCAPSQGQEQLQSRLVPPYPSPRPWSSMFSRAPVRRVLQWVPGKERLGIYRFLPFFFVLGAAMEWIMIKVRVGQETF	374896	379461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_375202_378558
792400	contig_9668_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_58139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAGAAGACTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308690	309106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_308700_309100
792401	contig_2455_pilon	+	2734	7	Intergenic	novelGene_119242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	15.195028426722	11	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	2066	2734	1496490	1505440	FALSE	40	TCCCAAAGAAGCAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLAREPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKKLQEIENAINEYRMRCGKKPSQKATVILPEDIIPSESSSLSDTTAYDDPNDSFTLAGQRSSSVPRSPRILPPKSLGIERIHFRKSSINEQFVDTRQSREMLSTHSSPYKTLERRPQGGRSMPTTPVLTRNAYSSSHLEPEASSQHCRQRSGSLESQSHLLSEMDSDKPFFSLSK	1493355	1505440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1494010_1494984_1495119_1495212_1496725_1500063_1500121_1501407_1501556_1504103_1504224_1505331
792402	contig_11978_pilon	+	661	6	Intergenic	novelGene_63066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4712.40112893629	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	28	363	1827946	1831181	TRUE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRRKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRITACT	1827918	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830111_1830663_1830757_1831161_1831273_1831759
792403	contig_18869_pilon	+	1658	2	Intergenic	novelGene_56444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	186	593	119633	120040	TRUE	25	CACCCAGCAGCCTCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFTNCKTVTEFETTSFCFIGISLSSLRILSFHNNTSLLFINKHIVLHVLFPEGDAEIRVLNSFTLDLAAPAVGGIVDTQLCRGILFVLNSLGWICILGSKDVDMQGKRIRRKVSLFRLLVLEVREWGEWLVCFR	119447	122514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_120219_121627
792408	SIRV6	+	331	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	539	3	373	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
792409	contig_5918_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_99597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	669	1070	2064730	2064329	NA	45	TGGGTAACAGCAGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVLLCVKIPAIREMTLNWILLNSRSLFSSCLGVWMLQQISNLRDKEAVKLTVSETEANTITFYGKRQSDTWSGQVKRPRWLKNRLQARRTHIGRWLGRRHLLSLYCVQNVLEGVTQKQEDVPLDSTQSNSH	2065398	2063382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2063400_2065400
792411	contig_10074_pilon	+	1976	6	Intergenic	novelGene_57217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTTCAGTATTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699956	708978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_700285_700700_700819_705607_705663_706064_706148_706743_706869_707711
792414	contig_12402_pilon	+	1943	3	Intergenic	novelGene_133373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAGGAACACTTCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596933	620193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_598323_616967_617208_619879
792415	contig_8673_pilon	-	1375	5	Intergenic	novelGene_129934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_2	98.874920986062	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	124	633	338208	330855	FALSE	50	AGGAAAAAAAATTGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKR	352753	330112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_352650
792416	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	57	506	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792420	SIRV4	-	346	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	15	1160	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
792422	SIRV2	-	276	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	649	23	649	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
792423	contig_10627_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_60064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289122	1290809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1289100_1290800
792428	contig_12841_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_55879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAACAAAATCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717513	715244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_715200_717500
792429	SIRV6	+	384	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	10	389	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	248	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792433	contig_3424_pilon	-	1152	3	Intergenic	novelGene_55457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	8.5	143	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	48	1118	76972	69042	FALSE	50	TTTTTTAAGTTAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTWTGGHSSPILCLNASKEGPVASGAEGGDLVAWGEDGTPLGHMQFQGADDVTSVVFSNTCPTKLYASHGETISILDVRSLKGSLDHFHVNEEEVNCLSLNETENLLASADDSGAIKILDLENKKVSRSLKRHSNICSSVAFRPQRPQSLVSCGLDMQVMLWNLQKARPLWITNLQEDESEDMEDPQSPGQLLNPALAHSVSVASCGNIFSCGAEDGKVRIFRVMGVKCEQKLGFKAHTLGVSQVNFLPESYLLLTGGNDGKIMLWDVSSELEKKQKSPTKHTHKRKTKKATYAKQGGTTSASVTDEEERGDILPKLTIKHGEKVNWLLGAKIKGCQNVLVADQTSCISVYPLS	83804	69007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_69633_76492_76989_83773
792441	contig_11328_pilon	+	1511	2	Intergenic	novelGene_88434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1	411	761254	779515	FALSE	25	GAACCTGTGTGTGGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGDPCGRRVPVPRALPRLRRCRPQRGLRRRIPGRCCAPAPARLARYVLWLYCLGLGQVKAAPRRFFIYGESETEWPKVKEESAEGGRSPHVEFQSRGGSWDSHARPGSCVAGRSLRAGAHKVASPWQRPGLGKLP	761253	780615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_761645_779495
792443	contig_3588_pilon	+	2102	2	Intergenic	novelGene_72858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1628	junction_1	0	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	176	541	84577	90411	FALSE	20	TGCGCCTGATGTTACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLVSSGQSKTLKPRMFCAFPNACKANWSTLFLGLPRVNVFLQDPHAALYPLQRFDRSLLLTTSQNPSTEHPSQLLH	84401	91972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123
792447	contig_7963_pilon	-	997	6	Intergenic	novelGene_58309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1608.70228445166	5	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	47	343	48841	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48887	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39331_39949_40232_43546_43819_48741
792448	contig_10437_pilon	-	1737	5	Intergenic	novelGene_38129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_4	163.868849999016	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	203	931	143663	139108	FALSE	45	AGCAGGGCTTCAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKRLLEAARKGQDDEVRTLMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTAEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAAADGHAHIVELLVRNGADVNAKDMLKMTALHWATEHHHRDVVELLIKYGADVHAFSKFDKSALDIALEKNNAEILVILQEAMQSQVNANPERANPTTNPVTVAAPFIFTSGEVVNLASLVSSASTKTTSGNVLIMWHLDLNMNRTSGVPGRWMENLSDNPSPLY	148900	138301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_139366_141300_141496_142008_142177_143555_143696_148730
792449	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	506	70	506	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792452	contig_10352_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_49607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_3	3.96074487943871	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	332	484	25674	25826	FALSE	20	GTTAATGGCTGTAGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIGTVK	21392	26548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654
792453	contig_10352_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_49609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAATTTTACTAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26498	26806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_26500_26800
792454	contig_5684_pilon	-	749	3	Intergenic	novelGene_81026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	1151	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCATCTGTGAACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359520	351257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_358810_359357
792455	contig_15628_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_147690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGGCCAAGCAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61123	60745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_60700_61100
792457	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
792458	contig_13894_pilon	+	1223	9	Intergenic	novelGene_62135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2527.15603186171	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	412	1167	523580	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521574	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_522813_523497_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
792459	SIRV6	+	231	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	498	54	498	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792462	contig_8538_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_4824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGACAGGGTGCGCCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843129	842771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
792463	contig_12884_pilon	-	926	8	Intergenic	novelGene_104999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	552.721541140579	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	80	868	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVQSVDIAAFNKI	915307	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899845_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_905761_905834_906224_906349_915235
792464	contig_19179_pilon	-	1022	3	Intergenic	novelGene_142358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	434	772	11041	8686	TRUE	55	AGAACAAATAAAATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALADEEGLILGCSHSRPTNGLLFILMEVSRLNVLPCLGTSGLGSNCEGNENGSECRLVNSLPAQGSPGLKEPTGTLGIGRGSHDSPRRLEGTGGSLSLEGQSPGVQGRGRL	11474	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_8484_8567_8947_10963
792465	contig_6842_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_130703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTTTTTTCCCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402865	405539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_402900_405500
792466	contig_9363_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_6684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	129	461	1271286	1270954	NA	15	GTTTGCCACGAGCCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLGHLRGVTSFIAACAGPWPCPRKPGASVQRAVWASDGSFTEAILELALTGVGVGAGVGAMATVATAGLSADGLSREPAALSVVAPSRRLAALSAFGPRLVAGASAGP	1271414	1270394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1270400_1271400
792472	contig_14077_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_174866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAATACTAGTCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50660	50880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_+_50700_50900
792480	contig_7744_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_62502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCGAAGATGGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814167	816514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_814200_816500
792481	contig_6397_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_146278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAATGTTGGGCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552234	552036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_552000_552200
792482	contig_6397_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_146277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAATCAAACCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552086	551023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_551000_552100
792483	contig_10864_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_107074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	492	531	1022	891461	890970	NA	30	ACCACAGCCCAGCGTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASWPAYTTAQCTWLPGQRTPQPSVHGFLAGIHHSRPAYATAQRTLLSGWRTPQPSVHGFLAGVQHSPEYMASWPAYTTAQCTWLPGRRTPQPPSVHHSPEYTTAQGTPQPRVHHSPGYTTAQRTPQPRRTPQPSVHHSPGYTTAQRTPQPRVHHSPAYTTAQS	891991	890967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_891000_892000
792484	contig_20615_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_146905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTGCAGGTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9975	11877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_+_10000_11900
792486	SIRV4	-	465	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1058	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
792490	contig_13004_pilon	-	2054	2	Intergenic	novelGene_112628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	230	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	991	1347	219141	217450	FALSE	55	AAAACTACCAACAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPITRQVGQHIEMEPEWEAAFTLQMKLTHVISMIQDWCALDEKVLIEAYKKCLAVLMQCHSGFTDGEQPITLSICGHSVETIRYCVSQEKVSIHLPVSRLLAGKVFPKMKKNRGITF	220131	216742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_217681_219015
792491	contig_2646_pilon	+	1212	7	Intergenic	novelGene_69680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	173.942199850666	231	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	230	856	2313200	2333563	TRUE	15	CCTCCTGGTATTTAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDIDIGKEYIIPSPGYRNVSQRTSTSGQQREREESKYKRSRPVECQDALETAARAEGLSLDVSVHSQLRILDEEHPRGKYHHGLSVLKPIRTTSKHQHPVDNAGLFSCMTFSWLTSLARVAYKKGELLMEDVWPLSKYESSDVNCRRLERLWQEELNEVGPDAASLRRVVWIFCRTRLILSIVCLMITQLAGFSGPNFQDGCVLRSE	2309474	2335208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2309649_2313144_2313329_2329777_2329936_2330114_2330271_2330951_2331100_2333527_2333603_2334891
792492	contig_10013_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_125056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAATCTGGAGAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245794	247104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_245800_247100
792494	contig_9272_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_125886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTTTCAAGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224213	224921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_224200_224900
792495	contig_9272_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_125887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATTAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225022	225421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_225000_225400
792498	contig_8452_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_48056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGGAACCAGCGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438632	436967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_437000_438600
792499	contig_1406_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_25668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2819502	2821206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2819500_2821200
792500	contig_6710_pilon	-	516	2	Intergenic	novelGene_97879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	35	TTAATCATACTAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
792502	contig_3081_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_133964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144261	1143852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1143900_1144300
792506	contig_10159_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_30848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTTAGGGACTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637239	639542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_637200_639500
792507	contig_10159_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_30849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCCTTCCGTAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639492	640012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_639500_640000
792508	contig_1331_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_37876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTGCCAGTGTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343289	341972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_342000_343300
792511	SIRV6	+	304	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8128	-1	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
792512	SIRV2	-	543	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1094	0	-69	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4801	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
792513	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	388	-1	-218	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTATAGTGGACGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
792519	contig_709_pilon	+	2120	11	Intergenic	novelGene_57521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	34.8053156859696	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	147	1955	1454004	1481555	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKCGKSSQVPQWCAEYCLSIHYQHGGVICTQVHKQTAIQLALRVADEMDVNIGHEVGYVIPFENCCTSETILRYCTDDMLQREMMSNPFLGSYGVIILDDIHERSIATDVLIGLLKDVLLARPELKLVINSSPLLSSKLSSYYGNVPLIEVKNKPPVEVVYLSGAQKDAFESILRLIFEIHHSGEKGDVVVFLACEQDIEKAYEIVCQEGSNLNPDLGELVVVPLYPKEKCALLKPNEEAETRCGVCQRRVVLTMSSGESLICSNTVRFVIDVGVERRKVYNPRIRADSLVTQPISQSQAEIRRQLLSPASSGKLFCLYSEEFASKDMKPLQPAEMQEANLTSMVLFMKRVDIAGLGHCDFMNQPAPESLMQALEDLDYLAALDNDGNLSEFGIIMSEFPLDPQLSKCILASCEFDCVDEMLTIAAMVTAEEAALTRWKTFLHPDGDHFTLINIYKAYQDITLHATSEHCVESWCHSHFLHVSALRMADVVRAELLEIIKRIELPYAEPAFGSQENILNIKKALLSGYFMQIARDVDGSGNYLMLTHKQVAQLHPLSGYSLTKKMPEWVLFHKFSISENNCIRITSATSPELFMQLAPQYYFSNLPPSESKDILQQVMGHLSPIPATAKEQDLCEKCPEATAEQRCVLQ	1444900	1481720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1444930_1453886_1454081_1456992_1457366_1463803_1464050_1465350_1465451_1465539_1465699_1476153_1476346_1477190_1477308_1479128_1479317_1480217_1480400_1481380
792520	contig_4364_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_1974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAATACCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
792521	contig_10003_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_88247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTACTGACCCTATGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699395	698314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_698300_699400
792522	contig_14829_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_163815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73437	71576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_71600_73400
792525	contig_5084_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_64644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAGAAAATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335819	1334697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1334700_1335800
792526	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792528	SIRV5	+	366	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	167	135	53	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8368	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
792529	SIRV6	+	503	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	1	514	1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
792530	scaffold_21177_pilon	-	1497	8	Intergenic	novelGene_145477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	151.70715614133	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	55	552	221483	217723	TRUE	25	CCTCATATAAGTCCTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEATVRTTL	254632	167882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_168442_182184_182341_182719_182864_183137_183218_217716_217746_217872_218287_221422_221512_254606
792536	contig_13894_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_62079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	21	319	339	426812	426792	NA	45	TCTGAAAATCAGCCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSSHLLLIESLNCCRDCISGSFHRYLRKYPYVTGSINYKTQHYFIYNKKKRGHCWFSSRILTFDAGDVGSILSQCISCTATTPSAGLLVAVILDFSRASRLRWTRMKGLMIY	427130	426790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_426800_427100
792539	contig_10404_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_138728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	968	1276	1553670	1553362	NA	70	GCACAGAATACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRGAICSEPTLVKYYFSSFLGTKYVLSSEGKPWETGSIAGTKLKLVEFCHLQVSWVCLMFDYCQVGLQGRFKGRPFTRTRKQKRYGKMCLRRFAIRRHNC	1554637	1552790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1552800_1554600
792540	contig_7707_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_72121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCATTCCTAATATTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34930	35877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_34900_35900
792541	contig_12836_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_170416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACAGGTCTGTATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161025	160660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_160700_161000
792544	contig_3975_pilon	-	2260	7	Intergenic	novelGene_54922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	172.101149198823	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	117	791	2262603	2243449	TRUE	45	CAAAGTAAATGTGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRDDPAARMSRSSGRSGSMDPSGAHPSVRQTPSRQPPLPHRSRGGGGGSRGGARASPATQPPPLLPPSATGPDATVGPAPTPLLPPSATASVKMEPENKYLPELMAEKDSLDPSFTHAMQLLTAEIEKIQKGDSKKDDEENYLDLFSHKNMKLKERVLIPVKQYPKFNFVGKILGPQGNTIKRLQEETGATPTYCEGCSNTKSTDSRHPENTSASTPCTRNI	2262719	2237769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2239105_2241779_2241839_2242857_2242926_2243441_2243553_2250457_2250525_2251915_2252041_2262224
792548	contig_7171_pilon	+	944	8	Intergenic	novelGene_101354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	115.095523769766	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	39	851	1321960	1328646	FALSE	20	ACAAGGCCTTATCTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPDAYSRSSVRMAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1321921	1328739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
792549	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
792550	contig_8616_pilon	-	1928	2	Intergenic	novelGene_72459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274363	272302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_274150_274282
792552	contig_7345_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_159177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAACAAATATTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122432	122827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_122400_122800
792554	contig_14341_pilon	-	2264	3	Intergenic	novelGene_111866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1607	1951	574833	573728	FALSE	15	GAGCCCTCTTTATTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKFSSITSRYKCLWVTLRSLHSSPEKYTATSSKATALCIDGFSTDFLTPPEAHSEPGLTGWGSRRLPLLCATSAIGTFGRSGAERGTNPDLSAVSADTPPSPAAAVGAVTSG	588274	573414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_573938_574698_574844_586678
792556	contig_1337_pilon	+	3088	1	Intergenic	novelGene_84265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623518	626606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_623500_626600
792564	contig_9848_pilon	-	1334	3	Intergenic	novelGene_79994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_2	814	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATGAAAAAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149241	133479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_134664_134747_134813_149156
792568	contig_9239_pilon	-	1706	9	Intergenic	novelGene_137185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	93.1114084041263	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	110	1234	279021	205036	FALSE	30	GATCACCTCTTAGGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQR	279130	204563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_205200_212054_212240_218398_218533_218860_218984_234936_235057_235500_235649_235788_235877_240383_240519_278993
792571	contig_9888_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_162265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAATAATACCAAGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61125	60606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_60600_61100
792576	contig_9415_pilon	-	2500	1	Intergenic	novelGene_109884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTTGTCCATTTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2054192	2051692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2051700_2054200
792579	contig_7457_pilon	-	1312	5	Intergenic	novelGene_31626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.3020384815662	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	89	898	960838	956817	TRUE	30	AATCATGTTAATCCTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLGTGCSPKNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDDDWGPGGAERAGAAVVAK	962458	955429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955554_956526_956874_958234_958375_960225_960896_962427
792582	contig_12140_pilon	-	1280	9	Intergenic	novelGene_86524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_6	53.1105862799499	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	72	1280	84789	21492	FALSE	35	GTATCTTTATTTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATGTDDVDKLKTKFISAWNNMKYSWVLKTKTYFSRNSPVLLLGKCYHFKYEDENEMLPARSGGAIEDCVISGNVEEFRKDFISRIWLTYREEFPQIEGSTFTTDCGWGCTLRTGQMLLAQGLILHFLGRAWTWPDALNIENSDSESWTSHTVKKFTASFEGSLSGESELKTPSISLKKMVGRYSDDHEMRDEIYHRKIISWFGDSPLTLFGLHRLIDYGKKSGKKAGDWYGPAVVAHILRKAVEEARHPDLQGITVYVAQDCTVYNSDVIDKQCASMASDNPDNKAVIILVPVRLGGERTNVDYLEFVKGILSLEYCVGIIGGKPKQSYYFAGFQDDSLIYMDPHYCQSFVDVSVKDFPLETFHCPSPKKMSFRKMDPSCTIGFYCRNVQDFERASEEITK	84860	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_-_21612_28580_28658_29315_29395_34649_34787_41209_41281_43272_43604_45850_46085_64263_64348_84713
792589	contig_18869_pilon	-	1873	9	Intergenic	novelGene_56433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	1520	1873	118717	116125	FALSE	10	CTTCCGGTCACCTGCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSYFLLRISNLGLSVGVLRLGEFSHTNCRKGPSSEQLPPPPGAKESTWRLPAAVKLPKTSCSLCSCARGPSRPVASAGIGTNNTDRTRSMASVLQLPPAVATLPGTSAAAILVQPF	136634	116124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_116392_118630_118816_119693_119919_121690_121891_127623_127762_128531_128983_130279_130426_132148_132283_136507
792590	contig_10042_pilon	+	951	5	Intergenic	novelGene_79206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	11.8532695911297	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	87	419	1054190	1066691	FALSE	40	CTTCAGAGGAAGAGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKVCVPVLTP	1029004	1067223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550
792594	contig_11171_pilon	-	1534	2	Intergenic	novelGene_48584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1074	1490	106730	106314	FALSE	25	CCTTCAAACAGCCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNGKHLKSPASEELTQLASEPNPGCDECHARLGQVTMQPLPAVTPRRLRQLGQGIWYNPRKKGNMNFDNVLWVARNGKSLPSQELGCTLIAVQQFTCPCHVALSGTPRLELITVREQGPVTRSPPRLTVELFRIPL	107864	106269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_107564_107624
792597	contig_9011_pilon	-	248	2	Intergenic	novelGene_159340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAATAAAGAGATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680852	675960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_676139_680782
792598	contig_10949_pilon	-	175	1	Intergenic	novelGene_146689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCCTTTCGATTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48222	48047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_48000_48200
792601	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_95989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
792603	SIRV4	-	204	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1309	8	1309	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
792608	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792611	contig_9177_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_32748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCCTTACAACAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174043	1171666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1171700_1174000
792612	contig_546_pilon	+	1836	2	Intergenic	novelGene_117178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61163	70026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_62919_69945
792614	contig_13015_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_165534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAAAATCTGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43258	43756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_43300_43800
792620	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
792621	contig_776_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_139917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGATTTAATTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788186	789482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_788200_789500
792623	contig_10904_pilon	+	848	6	Intergenic	novelGene_22678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.429490375364	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	523	846	562663	609117	FALSE	15	CATCCTCAGCCCAGCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHPVSDQKFQDPPRILRPSQDSPPICSPSPAAWWWHLVPSEEMGPGKIGEGLTCLHLNPLAQTQPWKRDPEEEEEEEEKTYMGHPVSDQKFQVEHQKRDLFTKLQSS	541556	609119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_541868_556193_556373_562630_562696_602191_602373_608698_608764_609072
792631	contig_6975_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_74295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437491	436862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_436900_437500
792634	contig_11337_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_107206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTTAAACAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364990	363803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_363800_365000
792635	SIRV6	+	151	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	794	51	794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11031	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
792636	contig_9091_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_32429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATGTATTACTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24875	25227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_24900_25200
792637	contig_10045_pilon	+	1345	4	Intergenic	novelGene_163755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.6074420214316	29	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATAGACTTTTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7589	53824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_7652_9136_9237_15996_16117_52761
792641	contig_6418_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_81164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	486654	486956	NA	10	GGTGTTCATCCATCCGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFFSKKKKLKVDLHFLLYEHWPKTKKSRGKYYRFLFSERYETNSSDNCSRWPHQRPEVYKKGQPVETERKGPTCKAESQFSVLTLTLDSHLNSLSLGFLT	486652	486996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_486700_487000
792643	contig_8377_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_34982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATAAATTTTTTGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68109	69543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69500
792644	SIRV4	-	193	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1330	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3828	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
792645	contig_6710_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_97686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
792646	contig_12619_pilon	-	2174	3	Intergenic	novelGene_73583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	40.5	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	128	463	987941	936734	FALSE	20	ATTCCCAGCATTTCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRSTSGSTGFISFSGVESALSSLKNFQSCISSGMDAASSVALDLVETQTEVSSEYSMDKAMIEFAIMDRELNHYIKAVQSAINHVSLIFMFMYTHSLGYVWLQVTDLEI	1005005	935022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_936919_987790_987956_1004892
792647	contig_5153_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_74334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGGGAGGCAGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603090	600410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_600400_603100
792648	contig_9706_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_21027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTACCAGCATTCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590048	590913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_590000_590900
792649	contig_5794_pilon	+	2639	1	Intergenic	novelGene_69728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	665	1998	3	2000	360460	362457	NA	35	AGAAACATATTTCCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLSGGQIPDGEFTATVYRLIRDSRYAEAVQLLGGELQRCPRSRAGLSLLGYCYYRLQEFALAAECYEQLGQLHPELEQYRLYQAQALYKACLYQEATRVAFLLLDNPVYHNRVLRLQAAIKYSEGDLPGARSLVEQLLSGEGGDDSGGESEPDGQVNLGCLLYKEGQYEAACSKFSAALQASGYRPDLSYNLALAYYSSRHYAPALKHIADIIERGIRQHPELGVGMTTEGIDVRSVGNTLVLHQTALVEAFNLKAAIEYQLRNHEAAQEALTDMPPRAEEELDPVTLHNQALMNMDARPTEGFEKLQFLLQQNPFPPETFGNLLLLYCKYEYFDLAADVLAENAHLTYKFLTPYLYDFLDAMITCQTAPEEAFIKLDELAGMLTEQLRKLTIQVQEARHNRDDEAVKRAVNEYDETLEKYIPVLMAQAKIYWNLENYPMVEKIFRKSVEFCNDHDVWKLNVAHVLFMQENKYKEAIGFYEPIVKKHYDNILNVSAIVLANLCVSYIMTSQNEEAEELMRKIEKEEEQLSYDDPEKKIYHLCIVNLVIGTLYCAKGNYDFGISRVIKSLEPYNKKLGTDTWYYAKRCFLSLLENMSKHTIMLRDNVIQECLQFLDHCELYGRNIPAVIEQPLEEERMHIGKNTVTYESRQLRALIYEIIGWNM	360457	363096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_360500_363100
792650	contig_14513_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_70326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	397	846	12282	11833	NA	20	AGAACTCTGCTTTTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVVDVYFWVFCGCVVSLQFRSSKIIFVTPHPINISCPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	12678	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11300_12700
792651	contig_6710_pilon	-	377	2	Intergenic	novelGene_98266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657170	653562	FALSE	15	GTCCTCAGTCCCAGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657170	653532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
792652	contig_4339_pilon	+	1888	4	Intergenic	novelGene_146093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_3	19.3448241713959	464	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATAAGGGTATGGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103280	1121913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1103781_1119146_1119192_1119902_1119977_1120644
792653	contig_6848_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_174871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1021	1404	45940	46323	NA	5	TCGTGATGTCTTTGGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRQYRSPRRKSAGSIPLSPLAHTPSPPPPATSPQRSPSPLSGHGAQAFPTKLHSSPPLGRQLSRPKSVEPPRSPLLKRVQSAEKLAAALTASHKHSLDLPHPELKKELTPREASPLDVAGTRSVLSGKGALPGKGVLQPAPSRALGTLRQDRAERRESLQKQEAIREVDSSEDDTDEGPENSKGIQEPSLAPSPEVGQNLPLRGAEGGEEDAFLPSDPKSQGPVAPDLLTGVTLGPPRIEGPSAPQSWVGSLKASEEAAITSSPAPSLGRAGRTDPIPTEGCWKAQRLHTQALTALCPSSSGLIPTGCSDTSSTPGEPSPWSWKFLIESPDKASPSRKAMMEVGPARLQDLETTVPAHPENLSPRQEGKSQLPSGPGLAHSPCKVPNHSWLWKPGCLQVEKEELEAALGITKVPDASGDSRQDAPRRGCPHTQEPGPSRLQRGREPGGSQKHQDLAMAPDELLKQT	44919	46379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6848_pilon_+_44900_46400
792656	contig_16685_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_115060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	805	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCATTTTCAAGATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597995	599615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_598000_599600
792657	contig_14954_pilon	-	1984	21	Intergenic	novelGene_165175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	35.2767274559305	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	34	936	71262	68275	TRUE	25	GCAACGCCAACTTCTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGPPRPPWPGPMAQIPDGISCELRGEITRFLWPKEVELLLKAWLPEREGADRSHVLALLRWRAYLLHTCLPLRVDCTFSYLEVQAMALQETPPQVTFELESLPELVLEFPGVTALEQLAQHITVAIKKVFPRSALGKLFRRPTPPSMLAQLERSSPSEATTPGSPCGGFLETYEALCDYNGFPFREEIQWDVDTIYHGQGCRHFSLGDFSHLGSRDLALSVAALSYNLWFRCLSCVDMKLSLEVSEQILHMMSQSSHLEELVLETCGLRGDFVRRLAQALAGNSSSGLQELSLAGNLLDDRGRREVQSFCW	71295	64937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_65044_66267_66370_66450_66614_66858_67032_67167_67226_67305_67403_67504_67587_67724_67795_67994_68100_68182_68307_68932_69028_69151_69241_69318_69395_69530_69605_69719_69791_69985_70078_70218_70344_70449_70513_70708_70760_70870_70966_71222
792658	contig_9471_pilon	-	1644	13	Intergenic	novelGene_21797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTACGGAGACAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417520	407024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_407043_410632_410795_411005_411224_412234_412327_412751_412818_413708_413846_413924_414084_414633_414727_414811_414934_415628_415714_416192_416265_416952_417022_417169
792661	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
792663	contig_366_pilon	+	2491	2	Intergenic	novelGene_51616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGCCCTGCCCGGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172116	1175746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1173534_1174672
792669	contig_12050_pilon	-	1060	8	Intergenic	novelGene_62703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.602787510354	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	601	936	616954	615621	FALSE	30	AGCCAGATGCTAAAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659663	615496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617075_617217_617366_617771_617873_619164_619256_619530_619612_659604
792671	contig_16098_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_45822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTACCCAGCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157365	156667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_156700_157400
792673	contig_10196_pilon	+	1232	9	Intergenic	novelGene_132143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	524.408655058248	2	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	737	1066	1046427	1050606	FALSE	35	TTTAAAAAGTATTTATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034554	1050772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1034995_1035140_1038292_1038488_1043788_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
792675	contig_2463_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_43003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAATGAGAAAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239397	241464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_239400_241500
792676	contig_7513_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_89040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	22.2752665528384	281	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	576	1097	902463	912620	FALSE	15	GCTGCGTGTGTGCAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARMNRPAPVEVSYKNMRFLITHNPTNATLNTFIEDLKKYGATTVVRVCEVTYDKAPLEKDGITVVDWPFDDGAPPPGKVVEDWLSLLKAKFCDDPGSCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIESGMKYEDAIQFIRQKRRGAINSKQLTYLEKYRPKQRLRFRDPRTHKTKCCVM	901887	913076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_902568_905070_905164_907385_907517_908214_908290_912502
792677	contig_11370_pilon	+	1372	5	Intergenic	novelGene_98757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	64.3947785150318	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	468	827	154616	155238	TRUE	10	TACCCCTGCTCCACTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGEIQSWALSSQPGRAGCKLTVCHPLPYFPRVLL	153576	155861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153678_154249_154693_154868_154960_155046_155326_155403
792680	contig_3602_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_60581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAATTTAGAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656168	657297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_656200_657300
792687	contig_9332_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_60745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAGGTGACTGAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619708	619180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_619200_619700
792690	contig_9274_pilon	-	2580	4	Intergenic	novelGene_151161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	48.3482735529983	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	62	751	641970	534467	FALSE	75	GCAAAAAAAGAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPSLLRCRLPAPLPPPAAAMADSASESDTDGAGGNSSSSAAMQSSCSSTSGGGGGGGSGGGKSGGIVISPFRLEELTNRLASLQQENKVLKIELETYKLKCKALQEENRDLRKASVTIQARAEQEEEFISNTLFKKIQALQKEKETLAVNYEKEEEFLTNELSRKLMQLQHEKAELEQHLEQEQEFQVNKLMKKIKKLENDTISKQLTLEQLRREKIDLENTLEQEQEALVNRLWKRMDKLEAEKRFV	642031	532637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_-_534581_558920_559050_583760_583911_641673
792691	contig_6710_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_97136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
792693	contig_6424_pilon	-	1860	6	Intergenic	novelGene_109272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	15.4841854806767	135	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	114	881	97897	94515	FALSE	10	GACAGTGCCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGNINELPENILLELFIHVPARQLLLHCRLVCSLWRDLIDLVTLWKRKCLREGFITEDWDQPVADWKIFYFLRSLHRNLLHNPCAEEGFEFWSLDVNGGDEWKVEDLSGDQKKEFPNSQVKKYFVTSYYTCLKSQVVDLKAEGYWEELMDTTRPDIEVKDWFAARPDCGSKYQLCVQLLSSAHTPLGTFQPDPAMIQQKSDARWREVSHTFSNYPPGVRYIWFQHGSVDTHYWAGWYGPRVTNSSITIGPPLP	98991	93535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_94659_95619_95756_95862_95959_96104_96232_97632_97931_98911
792694	contig_8689_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_170034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGCCCAAAGCTACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166493	165863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_165900_166500
792696	SIRV6	+	424	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	432	0	259	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
792697	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657178	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSALGPSWNSNDAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653877_657142
792698	contig_14513_pilon	-	1133	5	Intergenic	novelGene_70388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1207.97524291684	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	148	471	18880	11982	FALSE	55	ATATATAGGAACAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19027	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735_18775_18867
792702	SIRV6	+	382	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	580	0	401	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792703	contig_854_pilon	-	1393	11	Intergenic	novelGene_36412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	157.523458570462	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	483	1220	1074187	1064774	FALSE	35	CAAGGTTGAGGAAAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKKEIAEMRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081692	1064600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074308_1075239_1075395_1075806_1075892_1076657_1076745_1081657
792704	contig_8027_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_158833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTTATATTACATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236646	235259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_235300_236600
792705	contig_8027_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_158832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTAAAAAAAAAAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235011	234498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_234500_235000
792706	contig_8289_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_171171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAATGGCAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167732	165690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_165700_167700
792707	SIRV6	-	192	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTTGTTGAACAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
792712	contig_11396_pilon	-	1306	10	Intergenic	novelGene_71405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	85.5012814863173	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	66	1178	1648829	1644244	FALSE	5	TCACTCTGGTGGTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGSVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGTLGASGSGSHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649982	1644115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1644896_1645249_1645372_1645524_1645607_1646269_1646357_1646708_1646833_1647806_1647924_1648616_1648831_1649918
792713	contig_3862_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_137421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595152	592954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_593000_595200
792714	contig_17440_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_7670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3628	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
792715	contig_3964_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_174198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18509	19481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_18500_19500
792717	contig_6710_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_96832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	657487	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657489	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
792719	contig_16525_pilon	+	417	4	Intergenic	novelGene_133869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCACCGCTGTAGCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178111	181230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_178303_178427_178478_178589_178686_181150
792720	contig_18303_pilon	-	1427	4	Intergenic	novelGene_146798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	57.4108003776293	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	261	980	26035	9736	FALSE	35	TAAAAGCTGCACAGGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKAVSRKRKAPASPGAGSDAQGLQFGWDHSLHKRKKLPPVKRSLVYYLKSREVKLQSETSYFRVLHGYAAQQLPSLLKEREFHLGTLNKVFASQWLNHRQVVCGTKCNTLFVVDVQTSQITKIPILKDREPGGVTQQGCGIHAIELNPSRTLLATGGDNPNSLAIYRLPTLDPVCVGDDGHKDWIFSIAWISDTLAVSGKFSPFIGSFGVVKRERGRRLKRDSKMIGTRCHQVDSDS	26295	9288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_9916_10805_11013_24633_24889_25957
792721	contig_9177_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_32697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	38	427	460187	459798	NA	15	GACTTCTCTTTCCTAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGHSGHTLAGKLMLVSFWQDAAPTFFHINVSPPQLGTDWWELQPRKDSGKRREDILYSSTPTSITGKAKAMEMTGLWGGKGGTITGMAMANTAEAQSHYNTATSWHTQLGAVRKVYLTVLGCSKDGLCLCLKVKRRNKEKL	460224	458944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_458900_460200
792725	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
792734	contig_6837_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_149836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAGAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89199	91395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_89200_91400
792736	contig_10140_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_148419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGGGTTCTCTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271035	271463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_271000_271500
792737	contig_6544_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_142069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGTCTGGACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23997	25378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_24000_25400
792740	contig_817_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_132489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATGTTCTTGTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757475	757102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_757100_757500
792741	scaffold_17542_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_139227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTATAACGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334129	332372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_332400_334100
792742	contig_7342_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_71145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGACTTTATGCCGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312340	309777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_309800_312300
792743	contig_7744_pilon	+	2097	11	Intergenic	novelGene_62458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	151.080905477827	1	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	51	398	400981	404672	TRUE	20	GCAGCCTGTTGAGACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIQTTSTLYELGFEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALKALDVAALQKELDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHGYTYLFPLLPVQSHP	400930	408527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_401131_401634_401790_404629_404698_405079_405176_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407455_407652
792744	SIRV6	+	360	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	381	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
792746	SIRV4	-	543	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	71	3	-71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1085	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGTGTAATCGATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
792749	contig_21196_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_174876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAATGAGAGAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18985	19935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21196_pilon_+_19000_19900
792751	contig_19692_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_174880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42681	44986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_42700_45000
792752	contig_998_pilon	-	1195	13	Intergenic	novelGene_153793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	427.99315285281	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	85	1047	365529	330571	FALSE	70	AAAAAGAAACAAACCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDYNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTDLEPTNLSILSPLRMTTQTTTYLF	373651	330422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330814_332165_332329_335041_335140_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
792757	contig_5423_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_85182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGTCCTGGTGGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178174	178708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_178200_178700
792758	contig_5018_pilon	+	836	6	Intergenic	novelGene_47147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	456.32023842911	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	68	427	1498209	1499510	TRUE	10	GGTGCGAATCTGTGTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADHRWQRCPSSDHGQ	1497680	1500517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499226_1499468_1499588_1500185
792762	contig_7171_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_101220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	21	416	492793	493188	NA	40	ATCAACCCCAGCAACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNQLNSNGFRQRLCSIWKNITGVTCPPQCSGKLPVARRLISGDTDRDHWVSWCLPGFSVTLLFSPFVTGGHLGRITLRQCRCLFSPQTFTYDFQHRLMDQSCLQQLLLCYVPSFVFSSFLLHFLIGILQ	492772	494051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_492800_494100
792763	contig_5711_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_80255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1236	1622	41948	42334	NA	50	AAAACTTGGCAAAGACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDISSTSNYSLKLKSIIQGGALVAQWFSAQLSSKMSEVRTQEPLGRRKIIQGLVSHCWASCLLGSFMGTQPRPFTYLLFMDAFVLQSQISCSRDPVAHKAENIYYLSLYRKNLLTPGLFNQLQCNMT	40712	42720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_40700_42700
792764	contig_10733_pilon	-	1296	6	Intergenic	novelGene_109964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	55.7329346078241	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTGCAGCTTGTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299745	296341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_296642_297291_297483_297867_298391_298518_298603_298831_298881_299596
792765	contig_14895_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_106693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAGAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79421	80220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_79400_80200
792766	SIRV6	+	379	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3110_3165_10724
792767	SIRV4	-	360	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1163	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
792768	contig_19899_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_102524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147542	149117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_147500_149100
792771	contig_4783_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_108389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACTTTTCATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240456	239084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_239100_240500
792773	contig_10803_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_170119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAATACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66494	65780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_65800_66500
792775	contig_7333_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_142804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATACACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379159	378423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_378400_379200
792781	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_97720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
792783	contig_10003_pilon	+	2465	1	Intergenic	novelGene_88276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823097	825562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_823100_825600
792784	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	65	509	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
792785	contig_7839_pilon	+	1427	8	Intergenic	novelGene_45678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	4.76380914300945	90	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	13	960	100465	103881	FALSE	45	GTCAAACAAAAATACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAKAVEEMRGRVVLGEFGVRNVHTTDFPGNYAGYDDAWDQERFEKDFHVDVVHMDENSLEFDMVGIDAAIANAFRRILLAEVPTMAVEKVLVYNNTSIVQDEILAHRLGLIPIHADPRLFEYRNQEDEEGTEIDTLQFRLQVRCTRNPHASKDSSDPNELYVNHKVYTRHMTWVPLGNQADVFPEGTIRPVHDDILIAQLRPGQEIDLLMHCVKGTGKDHAKFSPVATASYRLLPDITLLEPVEGEAAEELRQCFSPGVIEVQEVQGKKVARVANPRLDTFSREVFRNEKLKKIVQLARVRDHYICEYFGWIK	100452	104348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_100534_100655_100728_102183_102292_102512_102646_102934_103055_103151_103305_103491_103642_103738
792790	contig_8453_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_125147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGGAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303644	304296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_303600_304300
792795	contig_14219_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_54388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	67.003523953761	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	334	660	1116195	1107875	FALSE	55	AAATTTAAACAAGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RILIDTGEPAIPEYISCLKQALTEYNTAIQEIIVTHWHHDHSGGIRDICKNISDDIAYCIKKLPRNPHKEEIIGNGEQQYVYLKDGDLIETEGATLRVIYTPGHTDDLYDYMNSLKELLKIKANVIYPGHGPVIYNAEAKILQYISHRNIREQQLLAIFRENFEKSFTVTELVKIVYKGIPENLHNMAKNNVSLHLKKLEKEGKIFSNKDPDKKWKAHL	1133844	1106817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1107919_1108569_1108652_1114015_1114165_1116143_1116210_1116293_1116323_1122717_1122845_1133681
792796	contig_8452_pilon	-	809	5	Intergenic	novelGene_48101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1167.80079101703	24	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991180	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991092
792797	contig_10312_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_159038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGTTTAAATTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633913	631838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_631800_633900
792801	contig_9656_pilon	-	941	5	Intergenic	novelGene_121929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_1	113.095921677132	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	573	878	432186	430496	FALSE	35	CTGAAATTTAACTATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	437399	430432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929
792806	contig_20429_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_169252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGGAAAGAAAATTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140992	143078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_141000_143100
792807	contig_11512_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_43395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACTCGCTGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605644	603416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_603400_605600
792808	contig_10196_pilon	-	679	4	Intergenic	novelGene_132100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	487	junction_1	167.803456460229	3469	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	95	625	912624	908940	FALSE	10	TTCCCGTGTTGCCTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSWDKDVYPEPPRRTPAPSPQTSLPNPITYLTKAFDFLVDRPVTLVRDFIERQHAKNRYYYYHRQFRRVPDITECEEKDVLCMFEAEMQWRRDYKVDQEIVNIIQERMQACQQREGESYKQNCANELEQFAQVSKAYQDRYHDLGAHFSARKCLAKQKQRMLAERKAAKEPAAA	912718	908885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_909044_909341_909482_910115_910255_912476
792810	contig_18438_pilon	-	1996	12	Intergenic	novelGene_171390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	26.828811452745	53	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	88	1647	288154	232042	FALSE	20	TTTACTTCTTGGGTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTVSNILIPPPNQLSSRKWKDYVAKKPKTMSVPDIEVKGECSSYYFLLQGNGNKRCKATLIHSANQINGSFALSLIHGKMKAKTEETKLSFPFDFLSLPHFSGEQVVQREKQLASVQTLALKECLKRRKLAKQPEAVSVDELKTLLILTREQFLDQFNAIIPKTILIKTDKIKISNVLNDAIPLKPDSSSRMETNTLECPERHVLQNLETFEKAKQKMRTGSLPHSSEQLLGHKEGPRDSITLLDAKELLKHFTSDGLPVGDLQPLQIQKGEKTFVLTPELSPKKLRVLPFEKASVCHYHGIEYCLDDRKALERDGGFSELQSRLIRYETQTTCTREGFPIPTVLSPLPSPAVLSEPGSVPDGEALQSELRTEASRLKRQSKDRNCLYPKKSRLVKSESSDSLPSQTNGSSHHHHRVVTSRRPQAKQSLSMTGPCVPVPSTETAKVTIKARSSQKSVPESKTSRRIKESRSQKHTRILKEVVTETLRKHSITETHECFTACSQRLFEISKFYLKDLKTSRGLFEEMKKTANNNVVQVIEWVLEKTSKK	288241	231692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_232081_233989_234056_235899_236014_236593_236847_238782_239050_251241_251338_261673_261830_266623_266742_269359_269522_273113_273222_274423_274598_288147
792811	contig_13592_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_33735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTTGCTCTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276645	275467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_275500_276600
792812	contig_4531_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_47947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTAATATCTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772389	773608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_772400_773600
792813	contig_11307_pilon	+	1466	6	Intergenic	novelGene_105241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	87.7268487978452	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	73	693	74141	87762	FALSE	15	TTCTTTTTATTTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMNNFAHRTEVRKALAKNKEWQEQFLIPNLPLIDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEGVYELVSFQMKPGGPALWGDAFQRAVNSHVNLNYAKLVGVFHTEYGVLNRVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	74068	88535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748_76837_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
792815	contig_9437_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_141733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288859	289777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_288900_289800
792816	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792817	contig_13224_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_104081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGCCATGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186834	185641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_185600_186800
792819	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	384	582	211	8	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTATAGTTTACGCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	1958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
792820	contig_1406_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_25603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	312	939	1062	2000	2204340	2203402	NA	25	GAATGTTGTTATGGATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTQRVTSLSLDIHEGKVEAALSGIGIRSSLSGRLREALPYFSYLLFFPALLGGPLCSFKRFQARVQGSSSLCPRHSFWALSWRGLQILGLECLRAALRWVVSAGAGLRDCQQLECVYVMWSTACLFKLTYYSCWVLDDSLLQAAGFGSEFGGGPAEDAYIPDADIWTLETTHRISLFARKWNQSTARWLRRLIFQRGQAWPLLQTFAFSAWWHGLHPGQVFGFLCWAVMVEADYLIHTFANLFIRSWPMRLLYRTLTWAHTQLIIAYIMLAVEVRSLSCLWLLCNSYNSVFPMVYCILLFLLARRKHKFN	2205401	2203282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2203300_2205400
792823	contig_6302_pilon	-	1424	9	Intergenic	novelGene_171687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_5	225.825395770715	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	569	1129	104349	46812	FALSE	85	AAAGTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEIEDGGADHITTEVQGQKCALVCECTAPESVSGKDNLPFLNAVLKNPVCKLYRFPTSDNKWMRIREQMSESILSFHIPKELISLHIKEDLCRNQEIKELGELSPHWDNLRKNVLSHCDQMVNMYQDILTELSKETGSSFKSSSSKGEKTLEFVPVNLHLQRMHVHSPHLKGIIYYSFPNGNVMV	257863	46516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_46961_47367_47499_75594_75743_90572_90646_104289_104402_147045_147126_158490_158542_255425_255543_257595
792824	contig_8122_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_40182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGACCACTTAGCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50748	50094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_50100_50700
792825	contig_11816_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_98535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTCCACGGGTGGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053096	1051436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1051400_1053100
792831	contig_10446_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_162491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCCAGAAGCTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820288	822217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_820300_822200
792832	contig_10734_pilon	-	2282	9	Intergenic	novelGene_51440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	72.7787743782485	4	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	126	323	2226326	2226022	TRUE	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSVTTKAKGVAVTNTSELGFRIWDVADYVIPAQEKDSIFIMTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGRGACHDLEQKLSLGKEASDKIGP	2229870	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222874_2223204_2225534_2226169_2226275_2226348_2229766
792834	contig_11855_pilon	+	1119	8	Intergenic	novelGene_67062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.0029353617276	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	186	968	2011316	2016987	FALSE	75	AGGAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYCKKRLIQFFDTARVDRTRSWLYAACSVSYLGAMVSSNSALQFVNYPTQVLGKSCKPIPVMLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2011130	2017138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011338_2012699_2012831_2013138_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
792837	contig_10324_pilon	-	1823	6	Intergenic	novelGene_7897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	165.446547259228	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	222	881	761911	755303	TRUE	15	CAAGCGCGTCTGTTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGEPPTGQRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFKVKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDVANQESFAAVQDWATQIKTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPTEDGRRLADDLGFEFFEASAKENVNVKQVFERLVDVICEKMNESLEPSSSQGSNGKGPALGDAPPPQSSGCSC	763802	752071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_752588_754876_755491_760887_761013_761092_761212_761683_761971_763640
792839	SIRV1	-	260	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3843	1	3569	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTGGAAGTCAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
792841	contig_8934_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_167248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTATTACTTTTGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710626	711406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_710600_711400
792842	contig_4989_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_160779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGGTAGTCATCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77269	78392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_77300_78400
792843	contig_6189_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_164948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGACCTGGCTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109049	111370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_109000_111400
792845	contig_11248_pilon	+	1323	2	Intergenic	novelGene_142537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACTCGCTACTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151177	154303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_152176_153978
792849	contig_17108_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_109534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCACCAGCTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84001	84348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_84000_84300
792850	SIRV6	+	233	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	568	486	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
792851	contig_11493_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_143667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCAGTTGTCTATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139557	138253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_138300_139600
792852	contig_11493_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_143666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	228	314	137968	137882	NA	25	TCCACTTTCACCTAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQLTATIQDTVKLPHRVSKAVIVTEADCHIFLPWSSWWIQTANLSVSSQVLNSYVTRAPFLHSLAILYFLYLVFDMDHNEIEELLEINGHKSITNARRSIQSI	138195	137667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_137700_138200
792855	SIRV4	+	387	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCCATTGCCGCCGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
792861	SIRV4	+	273	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTCAGAATGGGCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
792863	contig_16846_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_82896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATTTGAAAAGCAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383332	381550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_381600_383300
792864	contig_7229_pilon	-	690	4	Intergenic	novelGene_39817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2656	junction_3	638.233499590863	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	34	648	877522	875654	FALSE	30	GGACAGTTACGTCTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878211	875611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877535_878190
792865	contig_11285_pilon	+	806	4	Intergenic	novelGene_5530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTGGGGCAAATACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741216	742408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_741639_741736_741819_741892_741972_742185
792866	SIRV3	+	191	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4626	2178	2567	43	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGGTTTGGTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6570	6761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6600_6800
792868	contig_10404_pilon	-	1051	2	Intergenic	novelGene_138649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTATCTACCTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767673	765835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_765912_766698
792869	contig_5451_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_167183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638926	639619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_638900_639600
792875	contig_12250_pilon	+	1124	7	Intergenic	novelGene_80663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	133	744	376002	378324	TRUE	35	GCCCAGGCCTAGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFKGERRKRGEEAGGSSRLGDGVAACFSKCRAKACSICNKTLWGVARVRTLLPEIQGNLELGQGAQALDIPDEVSAEVGCFEELHALITGQQMWAWTRWGLGCIPGDGDGAEALHEEALGVAGHQDAPLELAQQALCGLQWVRLGENHLLHADLGARGLSHKAAVEAVHLGLPNHTPAVDEGEQQRAAVPESGGSRSSRDT	375869	379185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_376120_376273_376383_377316_377654_378276_378340_378478_378533_378621_378760_379012
792876	contig_13760_pilon	+	2284	15	Intergenic	novelGene_61324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	3.80721656321041	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	143	1780	225953	234190	FALSE	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYQDAVRTLNTLQTNAGYLEQAKRQRGDPQTQLEAMVLYLARSGLQVEDLDKLNIIHVTGTKGKGSTCAFTERILRSYGLKTGFFSSPHLVQVRERIRINGQPISPELFTKYFWRVYHRLEETKDGSCVSMPAYFRFLTLMAFHVFLQEKVDLAVVEVGIGGAYDCTNIIRKPVVCGVSSLGIDHTSLLGDTVEKIAWQKGGIFKRSIPAYTVLQPDGPLAVLRERAQQISCPLYLCPPLEALEEGGPPLTLGLEGEHQRSNAALALQLAHCWLQRQDHPGIGELKTSRLSLLQQLPLAPVFQPTSHMRHGLQDTEWLGRTQVLRRGPLTWYLDGAHTTSSVQACVRWFRQALQRRERLSSGPEVCVLLFNATGDRDRVALLKLLQPCQFDYAVFCPNLTEVSPTDNADQQNFTVTLDQMLLRCLEHQQHWNNLAEEQASPDLWRPPSSEPSGPTSLLLAPRPPHGHSTNSRIFSCISHALQWISQGRDPVFQPPSPPRGHLTQPVAGSGSSVLQEAAAIHVLVTGSLHLVGGVLKLLEPSLSQ	225810	234694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_225965_227207_227337_227434_227489_227572_227638_229335_229451_229597_229676_229808_229871_229975_230079_230395_230474_230724_230873_230956_231047_231627_231779_231947_232024_232809_232877_233780
792879	contig_9185_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_166875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGGGTTTGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31946	30950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_31000_31900
792880	contig_11292_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_109459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAAAGCCATGACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411935	411491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_411500_411900
792881	contig_11292_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_109458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1137	1586	409890	409441	NA	40	ACCCATCCCGCTCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRESPRCPASIVLGGNPALGPPLPQLLRMIALPPPHSTLGLPQALLTHPLSSIATSPPPPCRYARTTIRTQRLPSTGALSLLHLPVVHVFLTLTTRMALKNFARYFLHQFHKEKEHAEKLTKVQNQGVARSSFRISRNQTTMTGRAG	411026	408934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_408900_411000
792885	contig_6557_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_32993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGAAGCGCCTTTTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438478	440078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_438500_440100
792886	contig_4659_pilon	+	1834	3	Intergenic	novelGene_118225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	3.5	60	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	152	478	791331	793317	FALSE	35	TCCCAGCATCTCAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVPYEETAVMGLQKFHKPLATFFFANHTIQIRQDWRQLGVAAVVWDAAIVLSAYLEMGAVELRGCSAVELGAGTGLVGIVAALLGECDPLVLSLVRGIQEVHLWFS	790266	794673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_790385_791297_791478_793137
792892	contig_14219_pilon	-	897	7	Intergenic	novelGene_54373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	848.213351043762	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	147	728	1084399	1047324	FALSE	5	TTCTTGCTGTTTTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKKMV	1084545	1047154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
792893	contig_8017_pilon	-	2521	1	Intergenic	novelGene_65343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTTTATGAAGAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637522	635001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_635000_637500
792894	contig_299_pilon	-	2427	3	Intergenic	novelGene_129428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCAAATTTAATAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870457	863096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_864195_867485_867619_869261
792895	contig_15172_pilon	+	1246	6	Intergenic	novelGene_158775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3595774569303	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	525	992	287225	287692	FALSE	15	GCCTCTGAGTTTGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHPRRTPPPPAPRKPLSRSPAGNSGRASRHSPQTGKRVQQQLKSHLAAVSLPLLWDTRWSAATHGSGARASSHEDAGGANWEDNAYPDAFERAQAPHRPPQRQKCLFQRGLYVSQLERSFRRGQGSAPSSSEVPIRAGTQAGDEGLGGAPRLAP	276008	287946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_276068_279694_279839_283514_283553_284225_284361_285285_285373_287163
792896	contig_10005_pilon	+	2997	1	Intergenic	novelGene_148913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126724	129721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_126700_129700
792897	contig_5779_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_106423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAATATGTGGTAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64395	65827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_64400_65800
792898	contig_14925_pilon	-	741	4	Intergenic	novelGene_55119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77402	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_77351
792899	contig_17753_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_105081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGTTTGGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67153	65873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_65900_67200
792903	SIRV4	-	345	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	3	1173	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792904	contig_11855_pilon	-	806	5	Intergenic	novelGene_66904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	460	junction_1	103.388526926347	7591	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	208	666	738197	733972	FALSE	15	TACCATCTCTTGTGCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738817	733831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071_738202_738614
792907	SIRV6	+	343	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	529	-1	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
792909	contig_6488_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_44743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82717	84721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_82700_84700
792910	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	384	-1	-214	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGGACGCCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
792913	contig_20844_pilon	+	1420	2	Intergenic	novelGene_78593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	45	1154	202070	204457	FALSE	20	GATGATCCGAGCCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWGQRGEQTERVHTMAASTGAPLCPDNFSAAAEQVLSSVQENFLWPVLVVEFLVAVTGNGLALYRFSIQEQRPWHPAVVFSAQLAISDLLHALTLPPLAAYLYPPKHWHYGEVACRLERFLFICNMQGSIIFITCISLNRYLGVVHPFFTRSHLRPKHAWAISATGWALAALLAAPTLSFSRLKGNYTKDGLENYVKCLGTAEDNRLEAYRAYSLVLAGLGCGLPLMLTLAAYGALGRALLHSHGMKVAEKLQVAVLVASGVVLYASSYVPYHVMRVLNVYARQRWNAQCPNFANEDEAKAALDQGAYMGYQLMRGLMPLAICIHPLLYMAVVPSLGCCCQHRPGCRGYKDPGVPQSSSQALPLDVTATTPKTSEPWSSEPTP	202025	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_202086_203363
792914	contig_16870_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_155507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1483	1878	112256	112651	NA	60	TAAGAGGTCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYRQVFLLWSHWVFELPTFGLAANHLTIAYPGILGKGLVSRLYKELSQFNNKKTNNPVKKWAKDLNRYFFKEDIQMADKHRKRCSISLVIREMQIKTTIRYHFTPIKMAIKKTPENNKCWWELKMIQLL	110773	112750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_110800_112800
792915	contig_7342_pilon	-	1040	2	Intergenic	novelGene_71167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTTGTGGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470593	469246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_469986_470292
792918	contig_11948_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_174389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCTGCTTTCATAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165622	165253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_165300_165600
792921	contig_10523_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_120956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGAAAAAGATACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52054	51280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_51300_52100
792923	contig_12566_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_86029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACGGTCTAAAGCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252222	253354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_252200_253400
792926	contig_2480_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_63550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAATTAAATATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296645	297252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_296600_297300
792927	contig_11171_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_48629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGAGTAATCTGAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410262	408341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_408300_410300
792930	SIRV6	+	304	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792931	contig_9206_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_137500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACACTGAATGGATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361299	362626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_361300_362600
792933	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_97942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653713	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
792934	contig_7004_pilon	-	1326	8	Intergenic	novelGene_126473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	91.9773707750655	213	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	115	975	400192	397565	FALSE	5	GTTCTTCGTTTCATTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETLWAMRCVSALGELVEGLHDGHFYALKRILCHEQQDREEAQREADMHRLFHHPNILRLVAYCMRERGSKHEAWLLLPFFKRGTLWNEIERLKDKGNFLTEDQILLLLLGICRGLEAIHAKGYAHRDLKPTNILLGDEGQPVLMDLGSMNQARIHVEGSRQALALQDWAAQRCTISYRAPELFSVQSHCVIDEQTDVWSLGCVLYAMMFGEGPYDMVFQKGDSVALAVQNQLSIPQSSRHSSALRQLLASMMTVDPQQRPHVPVLLSQVEALQPIPPGQDTTQI	400677	397213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_397704_397832_397955_398375_398472_398595_398717_398884_399019_399327_399527_400142_400283_400653
792937	SIRV6	+	351	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	518	2	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCAACAAGAGAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
792939	contig_6862_pilon	+	2201	18	Intergenic	novelGene_63762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	20.421848670338	66	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	132	1637	228787	255346	FALSE	20	TCCTTCAGGGTCGGGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRASLAPGIWFLRAFSRDSWFRGFILLLTFLVYTCYHMSRKPISVVKSRLHQNCSDLIKPINDTHTINDTTWCSWAPFDKDNYKELLGAVDNAFLVAYAIGMFISGIFGERLPIRYYLSAGMLLSGLFTALFGMGYFWNVHMLWYFVLIQICNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGRRGLIMGIWNSHTSVGNIVGSLLAGIWVNEQWGLSFVVPGVITAAMGAFTFLFLVEYPEDVDCAPPQHHSSPGEDEDNPEDPANDPCSDREGHLDAATKCSKDPSAKPAAISFLGALRIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIFNVAHFDAKEAGDLSTLFDVGGIIGGILAGLISDYTSGRATTCCIMLILAAPMMFLYNYSGQSGMTSSIVMLIICGALVNGPYALITTAVSADLGTHQSLKGNAKALSTVSAIIDGTGSVGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADILACLFLCRLVYKEILAWKTSLSSGRGYREI	228655	255910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_228846_243261_243344_243790_243885_244009_244089_246434_246571_246983_247061_247938_248106_248730_248769_249067_249221_249526_249618_251372_251436_251796_251883_252340_252390_252610_252685_252955_253035_253140_253239_253481_253547_255330
792940	contig_7398_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_166184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326580	327856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_326600_327900
792943	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792946	contig_3612_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_87822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	84.2507418364966	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	286	1353	955615	969861	FALSE	80	TGGAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEVSL	932467	970026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_953607_953719_955598_955909_965350_965998_969734
792947	contig_6102_pilon	+	516	5	Intergenic	novelGene_31977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2756	junction_2	290.583464773892	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	104	454	414294	416047	FALSE	15	CTGAAGGCTTCCTCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413337	416109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
792953	contig_19957_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_57739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAGTACCAAGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338185	340008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_338200_340000
792956	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	3	1154	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792957	SIRV4	-	417	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	200	0	-200	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTCAACAACTTGGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
792960	contig_14970_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_45117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTCAACAGAAACTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265969	267076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_266000_267100
792964	contig_10331_pilon	-	1435	11	Intergenic	novelGene_54185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	771	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	284	340	619939	619883	TRUE	5	CGCTTCCGCGCCCGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPHFYYQYSVYKKHKTKQKAFSYFCFFCFLGRPLLFCPFFFFLVRTAFSPINKLLDCPSACFEAKLSPCLGLLTFFKPGFEFCCFNFSLLTERMTLSFLPISSELFNFRAR	620222	604694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_604811_604927_605105_605366_605503_608971_609211_610657_610719_613926_613972_615773_615856_616000_616067_617716_617757_618144_618262_619866
792965	contig_6589_pilon	+	1005	9	Intergenic	novelGene_25911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCTATTTACTAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158487	1178514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1158808_1158899_1159000_1160515_1160580_1160877_1160984_1171911_1172004_1176083_1176150_1176854_1176889_1177966_1178099_1178423
792971	contig_14060_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_156051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATTTCATTATCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53019	51593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_51600_53000
792972	contig_20246_pilon	+	455	3	Intergenic	novelGene_174889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	9	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGAAGGGGCTCTCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4713	5883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20246_pilon_+_4789_5349_5610_5763
792977	contig_18976_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_174897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATTGTGCAGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21726	22159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_+_21700_22200
792978	contig_18976_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_174898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATACACCTGGACCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22208	22915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_+_22200_22900
792979	contig_11677_pilon	+	1268	3	Intergenic	novelGene_85968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	43	1266	700016	708453	FALSE	35	GAGCACTAAGGACAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRAKTLNLSASASPQPGKPAMRTPLRELNLQPGALTSSGEGPPVHSSLTPSLCKLTLQKSSNKSSPLDFVSTKKTDSPSELFSTPSKWLEACQHESDEQLLDQIPKTNSTPKTSEEAADPLDNYLVKTMVFVPSPVGQQQDITLEESPLDAMAETNNISLDEILRPGDLVKEGVAPCTEDSFSEAVATLPEKPTFRDSPCNLLEFPPNPSSEQQLHCPKESLRDSSTEAVPENLVPSESNAFLPSFMLWLSPSTDLEADFPVNHVDPGEEIGENRAIEEREMSFPTLPEEVELEDQALVSAMEDILSTCLTPNPVEMESQAALGPAVEDAGMILVSDTGTWMSPLAWLEKGINTSVMLENLRQSLCLPSVLRDAAIGTSPFSTCSVGTWFTPPAVQEKSTNTSQKGL	699973	708455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_700067_700315_700442_707406
792980	contig_11413_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_103202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650717	649444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_649400_650700
792981	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
792983	SIRV2	-	486	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	25	316	25	-316	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACATACACAGTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5870	3981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
792987	contig_9363_pilon	-	1627	5	Intergenic	novelGene_6516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.847169643377	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	244	1170	558677	543191	FALSE	5	GTTTCTGTGGGGACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVLLTARWKELLSFEDVAMFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDVPSTGNRKASRSACPGSEARYKMKKLTSMQTISEELVSYKVSVVKQEKAKKTSEKLFKSNDFVNNFRFALPTSGDEYKKGFFQNFNFIEDQNAQTKKQGKYDEYGKPFSQRSLLVRHKQILTGPKTYECSECGMVLRCETDFVQHQRLHTSENPFECNICGQAFKQMSALTVHKCHPPKKPHKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSREFNPYSTSVYP	571067	542733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_543844_544981_545096_547316_547444_558644_558723_570869
792988	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
792989	contig_3584_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_108118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTTTGACCCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210196	208424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_208400_210200
792990	contig_7593_pilon	+	2194	3	Intergenic	novelGene_127304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_1	38	1	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTATTGGAAGTAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195223	199205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_196495_198038_198171_198414
792991	contig_8241_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_157481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTAACCCAGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120820	122695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_120800_122700
792992	contig_15970_pilon	-	649	2	Intergenic	novelGene_144064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_1	0	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAATTTGTCTTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221134	220394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_220920_221010
792993	contig_10126_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_105772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATGGCAATGCTAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189639	187359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_187400_189600
792994	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	0	1164	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
792997	contig_709_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_57556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTATGCCAATGGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552553	1552049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1552000_1552600
793000	contig_5062_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_157869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCATAAAGATCATTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979654	979357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_979400_979700
793001	contig_5062_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_157868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAAAAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978695	978136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_978100_978700
793005	contig_12427_pilon	+	688	3	Intergenic	novelGene_40420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	131	55	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	145	585	209932	210372	FALSE	25	TCTAAGCTCAGAGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	208719	210475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_208743_209618_209737_209928
793008	contig_4232_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_63229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCACAATGGCTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149694	149203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_149200_149700
793010	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
793018	contig_6589_pilon	-	570	4	Intergenic	novelGene_25852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1434.79623020909	7	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957789	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_956127_957302_957360_957758
793019	contig_294_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_166747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGCAAGAAAGATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137368	137887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_137400_137900
793020	contig_3948_pilon	-	1981	17	Intergenic	novelGene_53280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	99.0609029839724	7	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	375	1718	1430826	1414309	TRUE	10	CTCCTGGCACAGTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTCDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEVRESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGILMAGILPFGAMFIELFFIFSAIWENQFYYLFGFLFLVFIILVVSCSQISIVMVYFQLCAEDYRWWWRNFLVSGGICVLRPGLCHLLFC	1439749	1410922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427084_1427210_1429092_1429217_1430585_1430666_1430816_1430986_1434911_1435012_1439634
793023	contig_5084_pilon	+	632	5	Intergenic	novelGene_64669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1728.040129019	25	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTGTCTCTTATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751432	1756002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751509_1751646_1751681_1752193_1752279_1754409_1754443_1755598
793025	contig_5084_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_64521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	12.5499003980111	186	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	150	1139	414204	422254	FALSE	15	CCCATGGCTGGTATGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSGDPGGSYCQPPSVEASLPTSVPGGVRLFTDTSFPGGPGEFYILAFFVMALVHKLLNGVYILRKCQMPSAASCLFVGPHFADYCSSSLQKPMVAPGKAGSPQRKTERDLQGHPQREVDLDIISPEEKPEVSFDKAIQDEIKDRFRRLKEDFVNHWIGPEGRPLHEVLLEQAKVVWQFRGKEDLDKWIVTSDKTIGGRSEVFLKMGKNNQSALLYGNLSSEAPQDGESGRSGYCAMISRVPRGTFERKKSYDWSQFNTLYLRVRGDGRPWMVNIREDTDIIQRKNQMYSYFMFTRGGPYWQEVKIPFSKFFFSNQGRVRDAQYQLLLDKISSIGFTLADKVDGPFFLEIDFIGVFADPAHTEEFAYENSPDLNPKLFK	413477	422342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_413553_414129_414783_418442_418629_419727_419803_422104
793028	contig_12008_pilon	+	1917	1	Intergenic	novelGene_25004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGTAGAAATTTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44076	45993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_44100_46000
793029	contig_414_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_115096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCTGAAATCCCTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285537	283652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_283700_285500
793032	SIRV5	+	426	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7456	1	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
793037	contig_5039_pilon	-	1361	5	Intergenic	novelGene_64884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	19.2532464794902	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATTTCAGAGTTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585126	550367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_550917_551519_551692_579525_579973_584833_584888_584987
793039	contig_4364_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_1034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAAGCAGACGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1532888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532900_1533300
793041	contig_5247_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_81796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACTTAGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138146	136194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_136200_138100
793045	contig_15673_pilon	-	1111	5	Intergenic	novelGene_169837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_4	45.5706868502111	880	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	88	609	162366	159835	FALSE	15	ATGTTTGCTGTCTCACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSFRKASMASTSQRKRMSSKPELTDEQRREIREAFDLFDADGTGTIDVKELKVAMRALGFEPKKEEIKKMTNEIDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEEEFLRIMKKTSLY	162453	159332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_159925_160343_160482_160693_160823_161080_161243_162363
793047	contig_13172_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_146322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCACCTAATCTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23722	24323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_23700_24300
793048	contig_11284_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_174900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGAACCCACCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12458	11085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11284_pilon_-_11100_12500
793049	contig_3942_pilon	+	1983	3	Intergenic	novelGene_128832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	26	105	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	1193	1906	1242045	1245243	FALSE	10	CTTTGATTTTGATGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAQPGSRVVGNNGCFEGSPRCVHLCYFLIESTLPVTAVCACRSPTGLATKESGIKSMGNSQEEASVYMSKTSVDATKVGILGHKASCPLMPNSGSSGSFSLTSPGNTFVSLLALASIGDPKAGPGSQSQLSQSQPRGSWQGPPTVHHVTCWRSRECPLRRIQLSFGDRAEKHPGTVPTPGAADYLRTQTSKEWPPAPSRPTAPALSCPHPRLSFFIPAHVKRAKVLLFSQFGSFF	1240852	1245320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1242331_1242642_1242765_1244937
793051	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
793054	contig_9471_pilon	+	1303	6	Intergenic	novelGene_21827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	520.028076165124	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	577	882	413930	414785	TRUE	40	AGAAAATGTTGGAGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMVSNVLSLWFHVFFSYLLS	412463	417204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_414084_414633_414955_416163_416273_416936_417028_417152
793057	contig_11171_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_48622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGGCAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373364	372102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_372100_373400
793059	contig_3948_pilon	+	1122	7	Intergenic	novelGene_53234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	99.3457766255483	15	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	304	360	965279	966121	TRUE	15	GCTCTAGTTGCCTTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFSALTEVIFHFLAEPKEVERFLAQLSEFATTNQISLGPLRSTVKSLLLVPNGALKKSLTAEQVRADFITLGLSEDKATYFSEKWKQNSQTLAQWAIGQTLMINQLIDMEWKFGVKVGG	940742	967416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_940797_940893_940997_964583_964641_964723_964762_965227_965319_966104_966154_966686
793061	SIRV4	-	517	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	100	0	100	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	420	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5058	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
793062	scaffold_13505_pilon	-	1085	5	Intergenic	novelGene_111457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	319.278385582238	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	23	574	535595	531157	FALSE	25	TGCAGACCTTAGCAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRDPSWTWGRAPRTASSQLRGSSCCSVPWCLGRCCCSGNDGRMKSSGWSPMMTMRMKICMRA	535617	530645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532483_532707_532999_535516
793064	contig_6946_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_59766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAAGTGAGACAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386313	384985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_385000_386300
793066	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793067	contig_20017_pilon	+	2646	3	Intergenic	novelGene_174904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	4.5	21	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGGCCTAACGAGATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9109	29235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20017_pilon_+_9169_22693_22790_26744
793068	SIRV4	-	363	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1160	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
793069	contig_3081_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_133982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTATTGCTGCTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230614	1229960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1230000_1230600
793070	contig_10016_pilon	+	2744	2	Intergenic	novelGene_117869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410153	413187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_411373_411662
793076	SIRV6	+	220	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	501	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
793078	contig_2444_pilon	-	612	4	Intergenic	novelGene_83756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	3786	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	114	422	229702	227685	FALSE	20	TTTTTGTTTAGTGACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229815	227494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
793079	contig_7078_pilon	-	2087	11	Intergenic	novelGene_130184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	333.326641599498	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	172	651	795828	777331	TRUE	65	AAGAAGTATGAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAAGLSARSALSREGRTGPLSRARESSQPRSRPWPARKKFRSRGSLYRPPAPAARKMADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDGKLTSFSLIIFK	796230	773201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795854_796084
793080	contig_1996_pilon	+	1042	9	Intergenic	novelGene_131895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	128.251644726296	1661	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	117	701	251625	255065	TRUE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEVTFLLGLGLGLLQGRACGPFCFLRGGRLGVGPSGLVVSADPA	249875	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_255147_255320
793081	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
793082	SIRV5	+	413	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-85	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTGGTAGAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
793084	contig_6375_pilon	+	1801	3	Intergenic	novelGene_72924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	28.5	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	15	503	16563	22704	FALSE	30	AAATTAAGAGTTGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLEQQPQGWLSSWLPTWRPTSMSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPER	16548	24002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327
793088	SIRV1	-	226	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3984	5576	3564	-127	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTACTATCAAAGATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
793089	SIRV2	-	660	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	22	4	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	296	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACACAAGACATTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
793090	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_97047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
793091	contig_11656_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_53978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196482	195222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_195200_196500
793092	contig_1264_pilon	-	2127	7	Intergenic	novelGene_161319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1031	junction_6	1188.59096085332	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	986	1426	143557	141933	FALSE	60	GAAAAAAAAATCTAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNGEFRTKHFQWIFF	146821	141231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_142036_142291_142403_143248_143422_143503_143665_144044_144187_145468_145535_146151
793093	contig_8576_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_88824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTGAGAATTCCAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014455	1014900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_1014500_1014900
793094	contig_8330_pilon	+	1827	1	Intergenic	novelGene_71996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACGACTAAACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2090178	2092005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2090200_2092000
793095	contig_4125_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_25043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAGAAATTTCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201741	203045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_201700_203000
793096	contig_2062_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_139031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173391	1172019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1172000_1173400
793102	scaffold_19766_pilon	-	1089	7	Intergenic	novelGene_34331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_6	473.388289063241	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	227	868	621659	596625	FALSE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVHSQSQLRQCVSPSSSHRAVSPDNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623651	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_623580
793105	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
793106	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
793109	contig_10801_pilon	+	2214	2	Intergenic	novelGene_74058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	656	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCTGTCATGGCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356315	358728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_357119_357317
793110	contig_14727_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_56664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGGTACTAATACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340956	341618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_341000_341600
793115	contig_15029_pilon	+	1253	2	Intergenic	novelGene_128226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTTGACTTGACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519360	528172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_520597_528155
793117	contig_12127_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_130098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCACAGCAAAATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29220	26867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_26900_29200
793118	contig_4678_pilon	-	1634	13	Intergenic	novelGene_126041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	73.8818031272473	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	91	993	551815	542940	TRUE	15	TCCCCAGGCATCAGTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGDGRPIPTRLFGAGGQAAPQRGQAGAGTMDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGALTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPAQSKLQKVQTPDKQPIRPLVPNASKQRLMEDTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASATTQEPWPGPTNPSPTSRPPWAMDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQNRTSIVQAAAGGGIGDGSGSSGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPLL	552855	535644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_536000_536164_536281_536373_536495_542890_543073_544078_544317_544453_544516_545466_545504_545644_545782_546017_546035_547042_547074_547151_547304_551719_551827_552776
793119	contig_12756_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_153223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGCCTGAAAAATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214675	256796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_214900_256723
793120	contig_7870_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_108934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAACTGGAAGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287809	289122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_287800_289100
793125	contig_10988_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_104738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGGAAATGTAAGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303429	301891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_301900_303400
793127	contig_12638_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_33258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTGGAGAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815952	814053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_814100_816000
793131	contig_15114_pilon	-	1059	6	Intergenic	novelGene_121136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	241.409693260233	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	548	952	106923	100551	FALSE	70	GATTAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125273	100443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106958_109514_109642_112541_112709_115280_115439_125212
793132	contig_10297_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_112564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACTGCTGGAATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735690	736475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_735700_736500
793135	contig_10456_pilon	+	1723	4	Intergenic	novelGene_163453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	68.3439016217898	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12072	38373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_12155_33549_33721_36295_36499_37106
793138	SIRV4	-	185	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	429	3	-429	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAAGCCATGTCACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
793140	contig_3004_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_127532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAGGCTGAATGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482669	480916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_480900_482700
793142	contig_4350_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_136368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48912	50938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_48900_50900
793146	contig_8045_pilon	-	1796	3	Intergenic	novelGene_35419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	39.5	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTATCAGTAAATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300228	230996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_232502_286664_286746_300018
793147	contig_6208_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_53013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACAAAGTGTGCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461300	461615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_461300_461600
793148	contig_11126_pilon	-	2125	11	Intergenic	novelGene_138138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	7.89683480895985	67	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	28	1269	714861	689243	FALSE	15	TCCTTTAGCAGCAGCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSAGLSLCGQALVVRGGSRFLATTIANSDDDSLFTYDCSTAEEKPQENKGEDGQPVEKGSDTILASAFSESGSYFALTDDSKRLILFRTKPWQCLSVRTVVRRCTALTFTASEEKVLVADKSGDVYSFSVLEPQGRGKLELGHLSMLLDVAVSPDDRYVLTADRDEKIRVSWSAAPHSIESFCLGHTEFVSRIFVVPDHPELLLSTSGDGTLRLWEYRSGRELHRCPVPSLQEPDAPQREKRFAASRITYCRQDGWVALLCDSIPVVCIFQLDVPRHLLVYRQQLSFQHRVWDVAFEETQRLWVLQDCQEAPLVLYQPVQGQWQSVSEDDVLKKVSSHLRGNWAMLEGSAGVGDSFSSLYKASFDNMATYLHKKEERLQQQLEKRQRRKSSQPGPNGHAKKLKSGDASSGC	714888	688386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_689437_689941_690012_690862_691047_692648_692714_695613_695713_696288_696350_698964_699078_701628_701786_711509_711654_713054_713121_714772
793149	contig_5423_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_85178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171393	169680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_169700_171400
793150	contig_6589_pilon	+	940	7	Intergenic	novelGene_26083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	70.2867144076476	644	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	41	907	1865997	1875151	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRRTLRPREGSPLPEDTQPGCGESQRQAGPLLGALPLSISPQDGGNTRTQAQPQDRREALCTKPSSL	1865956	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1874950
793157	contig_12793_pilon	-	1586	1	Intergenic	novelGene_164117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAGCTTTCCTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200182	198596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_198600_200200
793159	contig_9053_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_87956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTATAGAATATTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307662	308389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_307700_308400
793163	SIRV6	+	151	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	794	51	794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11031	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
793164	contig_8588_pilon	-	1924	1	Intergenic	novelGene_146514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGGAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476268	474344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_474300_476300
793167	contig_5961_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_144188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATACTCCTCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340198	342128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_340200_342100
793168	contig_567_pilon	+	1292	3	Intergenic	novelGene_33972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	53	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	31	336	338793	359131	FALSE	25	TATACGTTTGCATATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLFSTPKLVSAVASARSLSGCMSRSQRKYSLQPILERKIPNRYLGQPSPLTHPHLLRPDPSVAARRCHPHCSNEDLKVKKKKTVKGYIKGNEYHPKELV	338762	360087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338857_358266_358384_359006
793169	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793172	SIRV6	+	470	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	30	518	23	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
793173	contig_2646_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_69555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGTTAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853403	854339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_853400_854300
793175	contig_2078_pilon	-	1333	8	Intergenic	novelGene_100157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	22.8035085019828	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	937	1119	356205	352385	FALSE	30	TGACACATTGCTGTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVSHPVLTIRAPRTQTAVGDVVELHCEAQRGSPPILYCFYHEDVTLGNISVLSKGGASFSLSLTEEHSGSYHCTADNGLGTQHSYSVSLSVRVPVSRPVLTLWTPRTQTVVGDLVKLHCEAQKGSPPILYWFYHEDVTLGNISVLSGRGAFFNLSLTTEHSGNYSCEANNSLGAQLSHVVTLNVKVPVSSPVLTVRAPGAQAVVGDVVELHCEAWRGSPPILYQFYHEDVILGNSSVCFRGGVSFNLSLTIEHSGNYSCEADNGLGAQRSEAVTLSIRGRKSTSDPTRSPSNSDPQEPTYHNVPAWIELQPMYSNVNLKGGEVIYSEVRSSRKEKTCAVTSAPRLLKDQDSSVIYSQVKVSSTPASSAAHR	367702	352170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_352454_352530_352563_355919_355989_356192_356276_357272_357301_361704_361984_365599_365879_367422
793176	contig_5454_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_145506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTGGACCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572326	570937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_570900_572300
793177	contig_11378_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_112302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCATAGTGACTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053436	1054236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1053400_1054200
793178	contig_2703_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_101828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAGAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205025	1203051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1203100_1205000
793185	contig_1154_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_87075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTGCTGTTAGGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215435	213768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_213800_215400
793186	contig_9839_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_88600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGAATGATAGTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551206	550752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_550800_551200
793187	contig_15354_pilon	-	1584	13	Intergenic	novelGene_65763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	5.45371942398539	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	27	1202	654914	649844	FALSE	15	CCAACCGCTTCCTCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLGVSLSSCSVPGSKPTFELSADEVELGLGIHGEAGVRRIKMATADDIVKLMLDHMTNPSNASHVPVHLGSSVVLMVNNLGGLSFLELGIVADAAVRSLEGRGVKIARALVGTFMSALEMPGVSLTLLLVDEPLLKLIDAETTASAWPSTAKVSVTGRKRTRAAPAEPREVADSTAAGGVASKRMVLVLERVCSTLLGLEEHLNALDRAAGDGDCGTTHSRAARAIQEWLKAGPPPASAAQLLSRLSVLLLEKMGGSSGALYGLFLTAAAQPLKAKTDLPAWSAAMDAGLEAMQKYGKAAPGDRTMLDALWAAGQELQAWKSPGADLLQILTKGVKSAEAAAEATKNMEAGAGRASYISSARLDQPDPGAVAAAAILHAILEVLQSQGV	654940	649461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_650006_650407_650498_650605_650640_650752_650857_650944_651052_652010_652149_652364_652485_652866_652984_653498_653589_653683_653769_653844_653880_654508_654599_654910
793193	contig_5423_pilon	-	250	3	Intergenic	novelGene_85246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	594	junction_1	89	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCTACTTCATCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518949	515796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_515835_517366_517496_518866
793198	contig_3147_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_142271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGCTGAGTTCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68852	67045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_67000_68900
793199	contig_12746_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_152197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATTCGTTTTTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639026	637758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_637800_639000
793200	SIRV5	+	372	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	878	-45	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
793203	contig_2537_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_33434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATATTCTTTGTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292769	294266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_292800_294300
793206	SIRV4	-	247	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1271	3	1271	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3887	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
793207	contig_7810_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_144222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCAGGTATTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374742	372757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_372800_374700
793208	contig_4847_pilon	+	658	3	Intergenic	novelGene_156163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	497.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACATTTTCTGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99589	110070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_108569_108658_109570
793209	contig_3426_pilon	+	1006	3	Intergenic	novelGene_57925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGTATCTAACGGTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200902	204113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_201394_202902_203076_203771
793210	contig_5643_pilon	-	1046	6	Intergenic	novelGene_39117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	226.475252511174	10	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651362	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646541_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649343_649530_651162
793211	contig_6488_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_44773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTGTCACACATAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245011	244260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_244300_245000
793212	contig_15092_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_57784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCCTATCCTGAGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323397	325704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_323400_325700
793213	contig_299_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_129470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCCAGTCTGGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295667	1294872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1294900_1295700
793214	contig_299_pilon	-	179	1	Intergenic	novelGene_129471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATACATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297716	1297537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1297500_1297700
793216	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	174	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793220	contig_10904_pilon	+	1029	6	Intergenic	novelGene_22723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATTATAATGATCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650756	662732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_651011_651380_651439_652442_652496_660333_660636_661464_661755_662660
793222	scaffold_16539_pilon	-	1963	12	Intergenic	novelGene_68353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	273.103528336934	1	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	176	1651	502141	490096	FALSE	5	GCCTGGGCCTGAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502821	489783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502243_502747
793224	SIRV4	-	468	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1055	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
793225	SIRV2	-	618	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	51	17	51	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATTCTTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5844	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
793228	contig_9460_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_155311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAGAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338258	337781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_337800_338300
793231	scaffold_13505_pilon	-	1092	5	Intergenic	novelGene_111440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	351.253469733752	2	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	23	577	535595	531157	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVQRLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLA	535617	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531306_531369_532376_532496_532710_532999_535516
793233	contig_7945_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_161613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499876	497589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_497600_499900
793236	contig_6710_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_97253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
793237	contig_5018_pilon	-	1153	7	Intergenic	novelGene_46965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	32.5678778348646	178	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	186	701	374671	373312	FALSE	10	CCTCGTCGAGGTCCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGIAPPAAEAPAPEPGYVNYTKLHYVLESGEGTEPEDEFEDDKISLPFVVTDLRGRNLRPMRERTAFQGQYLTVEQLTLDFEYVINEVIRHDATWGHQFCSFSDYDIVILEVCPETNQVLINIGLLLLAFPSPTEEGQLRPKTYHTSLKVAWDLNTGIFVTVSVGDLTEVKGQTSGSVWSSYRKSCVDMVMKWLVPESSGRYVNRMTNEALHKGCSLKVLADSERYTWIVL	374941	372859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_373368_373756_373873_373946_374052_374241_374328_374416_374546_374647_374740_374824
793241	contig_12622_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_5828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTAAAATGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426707	427550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_426700_427600
793242	contig_10864_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_107098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTACAGCTTTTTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981172	980429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_980400_981200
793246	contig_3721_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_123834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGACTATTTCACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302403	303152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_302400_303200
793247	contig_10549_pilon	-	1003	6	Intergenic	novelGene_110638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	111	383	481799	474670	TRUE	35	CTTTGAGAACTTTCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTQICTSPVVGSFLPGLGSGTYWRANFISPLFSASMATGAVFRFRGYHFNCLFCLLSQSHVSKSSSTSPRKLLRLNVSRCQTDMFSFCVFKICFSILYPQNLVIYRIQGFLHYDCFLLAHFASVW	485368	470630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_471062_472637_472808_474650_474758_476854_477021_481780_481861_485319
793248	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_97182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	50	ATAAAAATGAAAATGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
793250	contig_546_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_117239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTACCCCCACAGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159205	160955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_159200_161000
793251	contig_8017_pilon	-	908	5	Intergenic	novelGene_65354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_3	67.4129067760766	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	149	880	919675	911261	FALSE	30	GTAACTGTAGATTAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLTYCLLILTAKIGFSAADAVTGLKLVEEGVPKEHLALLAVPMVPLQIILPLIISRYTAGPQPLNVFYKAMPYRLLLGLEFALLVWWTPKVEHQGGFPIYYYIIVLLSYALHQVTLYSMYVSIMAFNAKVSDPLIGGTYMTLLNTVSNLGGNWPSTVALWLVDPLTVKECVGASNQNCRTPDAVELCKKFGGSCVTALDGYYVESIICVFIGFGWWFFLGPRFKRLQDEGTSSWKCKRSN	919823	911232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_911429_912527_912744_914906_915025_915281_915467_919630
793255	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	653876	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653878	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
793256	contig_5649_pilon	-	1690	9	Intergenic	novelGene_82370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	47.3022198210613	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	3	503	1064253	1057321	TRUE	35	GAGCACAATATAATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064255	1055345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
793257	contig_5350_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_99353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1677	2006	176602	176273	NA	40	TCAGATAGGAAACTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSILLEQQRKMESQQQEEDIECVANCLMNNCLLCHETRTGWCPAIIYGRILIKKGKNVEQNFKFSWTPDFLEPWRLDEPLKTTTLRQYLSLKPKTSPEAFLKPKNSLA	178278	176204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_176200_178300
793258	contig_15185_pilon	-	2898	1	Intergenic	novelGene_99413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATATGTATTGAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227082	224184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_224200_227100
793262	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	55	ATTTGTGGAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
793263	contig_10331_pilon	-	2098	18	Intergenic	novelGene_54106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_17	226.926797946601	82	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	976	1944	320137	304759	FALSE	25	CCTACTAATGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLVLNRTGITWAKVLQCVPGWPALEELYLESNNIFISERPTDVLQMLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQWSFINELDKLQSLHSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	371643	304604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312168_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_318866_320092_320196_321424_321525_325324_325414_332861_333045_355498_355627_364604_364909_365333_365391_371587
793265	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793267	contig_1009_pilon	+	1547	12	Intergenic	novelGene_121734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	116.277951407268	123	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	632	1198	188509	213490	FALSE	15	TTAACCTTTACTCCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDEESLEGGTTVRKEIIKNKIRAIGKMARVFSILREESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIQTATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPRKDSVHTDGPVKLVTPVHPNAAHRSAPGKKTQ	169862	213839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_169891_179433_179580_181526_181667_183899_183978_184062_184158_185053_185169_188479_188606_189335_189411_204164_204247_204874_204973_212107_212138_213305
793271	contig_5526_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_111699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATTAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308631	306891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_306900_308600
793273	contig_2703_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_101744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGATTCTCTAAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533036	533675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_533000_533700
793275	contig_12765_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_106557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90154	88630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_88600_90200
793277	SIRV6	+	203	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	529	51	529	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793278	contig_13800_pilon	+	2381	2	Intergenic	novelGene_153755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	754	1092	220489	220827	TRUE	30	CACCGACAGAACTGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGWMTMHEKEQILHKLHFAAACISFQKGNEMEDDDPLMINLTFLKHFSPRRYHLGHSVRFTGSEGRGNDPQRSSEISTLFCNYPVCQGISFCGSDGAKGFLQMVSLYVKFQ	219735	223069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_222060_223012
793279	contig_9843_pilon	-	2537	1	Intergenic	novelGene_114322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTTTCAAGCATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62951	60414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_60400_63000
793280	contig_4103_pilon	-	1146	2	Intergenic	novelGene_51944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	535	849	95561	94975	FALSE	20	TTTTATTAAACTGCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDYICPCLQVLTVLCNVAEKGPAYCQRLWPGPLLLSLLDTLAFSDTEVVGQSLELLQLLFLYQPEAAQAFLQQSGLQALERHEEEAQLQHRVRALRETALHG	96095	94677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360
793282	contig_19032_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_172522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1888	2199	141264	140953	NA	15	CCCCAGTATTGAGTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFFPLDYIYIYIIGLYIFDSQSIKSHSEPLNEPGLGLVSRRGKCESQTLARCRALCNRPGNSGFILKARDCYYWILSRGVKSSLQVAKNTLTAVDGGPRRAH	143151	140833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_140800_143200
793283	contig_211_pilon	-	2222	2	Intergenic	novelGene_129895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAGAAAAAAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446472	442991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_444332_445590
793284	contig_753_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_112913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306713	305831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_305800_306700
793285	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
793287	contig_9434_pilon	-	1783	3	Intergenic	novelGene_150489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTTAAATGTCTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117102	112534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_113548_113683_113846_116494
793288	contig_8063_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_152428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTAAAGAGACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132716	131853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_131900_132700
793290	contig_16846_pilon	-	1243	4	Intergenic	novelGene_82952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	95	613	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558744	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
793293	contig_4305_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_136711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGGCTAGAGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805766	803869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_803900_805800
793295	contig_3153_pilon	+	1501	4	Intergenic	novelGene_104700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	50.6162029393751	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTATTACTTTAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448260	455365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448445_448543_448616_448707_448756_454168
793297	contig_16578_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_148672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAATGAGTGTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250487	251340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_250500_251300
793298	contig_5467_pilon	-	1888	3	Intergenic	novelGene_111957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	2.5	271	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	253	1662	91730	90321	FALSE	10	GCTTGGGTTCCTTCCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASGWLGRRWRRAPRARQAPSSVFLHPSFLAGRKAGPRPPGESSAIQEGSPGPGLAHGFLSGAANGTGWGALLSCRGPGRTEEAMVLGRPGLGRGGGCPGPLSMLGAAVLLASLPWGVRGTASANHSIALGHTGPLTGPRYLSIGDGSVMAFEFPEESEGIIVVSSQYPGQSNGTRLGPTLRVTSLDTAVLTIKNVSAISWGGGGGFVVSIRSGLEGLAPLHLQLVDLHQAQPLLIEERSDFCIKVLPAEDAPAPLGADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLLQSPQPMLLGLLGQFLVMPFYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLAISMTFISTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPVSKILGTLLFIAIPIAAGVVIKSKLPRFSQLLLQVIKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGVRFPIVLVGVTVPLVGLLVGYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSFRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALVMGHFIYSSLFPVP	93799	90094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_91861_93140_93209_93745
793300	contig_987_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_72254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACTGAGACCCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376398	375694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_375700_376400
793301	contig_11629_pilon	+	2514	1	Intergenic	novelGene_161198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCCTACTTCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324504	327018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_324500_327000
793302	contig_14322_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_116169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	57	249	305	671606	671662	NA	15	GTGGGGAGATGCGGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCG	671357	671663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671700
793304	contig_6270_pilon	+	1793	5	Intergenic	novelGene_99902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.00382649326	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	979	1365	1215643	1222846	FALSE	55	AAAAAATAATTGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRLKDANDVPIQCEISPLISYAGEGLENYVADKEFHAPLIIDENGIHELVKNGL	1214591	1223274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1214786_1214858_1215681_1216884_1217074_1221864_1221932_1222753
793306	contig_10324_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_7804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCCTCGATACTTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134241	135894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_134200_135900
793308	contig_6283_pilon	-	2240	2	Intergenic	novelGene_100224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	125	313	628045	626349	FALSE	20	TGCCGTTGAGTCATAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQVRALEPWGLIAP	628169	624421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_626508_628015
793309	contig_13412_pilon	+	1632	5	Intergenic	novelGene_80019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1023	1379	432694	491683	TRUE	60	GTCAAAAGAGAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPPQVLPGGEQSQDGSQDFIPLFHGEPLFSNFTKHSICHTFHLLPQSFQLSHGLTPPISALFISIALKPILSQPLKLYLIVDFFSLFQNCRFQGFQRDITIIHLITQILQSQLAPL	431671	522258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_432814_474766_474889_491568_491711_498796_498877_522112
793310	contig_8676_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_142219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGTTTCTGTCCAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650203	652167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_650200_652200
793311	contig_8676_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_142220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGACAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652562	653007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_652600_653000
793314	SIRV6	+	229	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	54	500	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793316	SIRV6	+	352	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3048	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793320	contig_9919_pilon	-	1975	12	Intergenic	novelGene_137996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	82.6920004725291	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	2	1141	864718	845488	TRUE	25	TTGCTACCAATATGTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILLNGIPKKQVNRGAGETNTAESENSDFDEAGIPYDETERLPGRGSPSLSEGASSDEDDSEYEDCQEEEEEDWQTCSEEDSNFEESRGQDWKKSCTVDSDTQDRRTPQKRQTHNFSHLLCLHQGRDDLQWNPTDRPDERPRPICVTSLPEYSETCSRSYLWNYHHKA	864719	834868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026_843107_845428_845553_850459_850545_853180_853511_855898_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591
793321	contig_12079_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_67373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	680	1090	354603	355013	NA	50	AAAAAAATCTTAGGGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLIRLNLSISPRDRKGHINQRLHQPKTRRTRWCPATTTDRPDREHNREFLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTSEDMAPGLSVSADTFPRPALQRLDWTMGHKMVLMKSVLLSSSRYMRLMGSSCPEAR	353923	355187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_353900_355200
793324	contig_9440_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_59077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTATATTTTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213045	1211448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1211400_1213000
793325	contig_12644_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_44527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTGGTAGAGCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376603	1374861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1374900_1376600
793326	contig_3018_pilon	+	225	2	Intergenic	novelGene_78768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTCCTCAGTAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361148	361493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_361332_361451
793329	SIRV6	-	191	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTCTCTTGTTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
793330	contig_5791_pilon	+	1255	8	Intergenic	novelGene_35812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_4	110.779612063681	172	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	291	1004	325962	349481	FALSE	35	TTTGTGACAAAGGCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKKKRKSPGVAAAVAEDGGLKKCKISSYCRSQPPARLISGEEHFSSKKCLAWFYEYAGPDEVVGPEGMEKFCEDIGVEPENIIMLVLAWKLEAESMGFFTKEEWLKGMSSLQCDCTEKLQNKFDFLRSQLNDISSFKNIYRYAFDFARDKDQRSLDIDTAKSMLALLLGRTWPLFSVFYQYLEQSKYRVMNKDQWYNVLEFSRTVHADLSNYDEDGAWPVLLDEFVEWQKVRQAS	325671	349732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_326048_328474_328567_334698_334770_335182_335275_345642_345752_345836_345942_347551_347655_349425
793331	contig_1244_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_38066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAAATGGCAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229143	1227147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1227100_1229100
793332	contig_8972_pilon	+	189	3	Intergenic	novelGene_167629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAAAGGTCGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378418	381676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_378476_380605_380649_381587
793334	contig_15134_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_140235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATCTCTACCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378869	377991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_378000_378900
793337	contig_16896_pilon	-	968	2	Intergenic	novelGene_174907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	79	junction_1	0	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	116	355	83851	77316	FALSE	5	TTGATGCTTTTGGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTILDKKELLEFAQFGCYLEYDLFGTGLLHYQFDPDTDMPDDNKRIRRVRLLVDEGYEDRILMAHDIHTKHRLMKYGGHGYSHILTNIVPKMLLRGITENTLDKILIENPKQWLTFK	83966	76702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_-_77527_83822
793341	contig_7158_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_163731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTGTAAACTTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123056	1122035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_-_1122000_1123100
793342	contig_13481_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_119440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	49	312	963522	963259	NA	45	AACACTATCCATAAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPEGSKGRSPGLGPAEMSGCGACTCGAVAARLITSSLASAQRGNEVVPCVSSRCWGNRPADGWRPRGGHGGVRRCSAFCLATPILPVGWGFANLRSSRFPNLK	963570	961271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_961300_963600
793344	contig_744_pilon	+	3175	15	Intergenic	novelGene_145075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	20.0876904128486	47	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	181	2175	137138	184924	FALSE	15	CCTTTAAGGGTTGTTAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISGGQKHRVSLARAVYSGADIYLLDDPLSAVDVHVGKQLFEKVIGSSGILKNKVDLIVVMESGRVAQMGTYQELLAKTKNFTNLLQGSSEQETAHVLEGFNVLNSRSIPKDQFQEQKDRPSLDRGKQFSMRKEKIPVDGLKFSIIVKYLQAFGWPWVWLTLATYIGQNLVGIGQTLWLSAWTKEAKHMDEFKEWKQLRSYKLNIYGLLGLIQGLFVCSGAYVLTRGSLAASRTLYSQLLNNVLHLPLQFFETNPVGQMINRFTKDMSVVDVRFHYYLRSWLNCTLDVIGTVLVIVAALPLFILGVVPLIFLYFTIQRYYVASSRQIRRLAAASRSPIISHFSETLSGVSTIRAFGHEQRFIQQNKDVVNENLVCFYNSVISNRWLSVRLEFLGNLMVFFAALLAVLAGSSVDSATVGLSISYALNITQSLNFWVRKACEIETNAVSIERVCEYENMDKEAPWIMSRRPPSQWPNKGIVEFINFQARYRNDIGLALQDITFQTHEEEKIGIVGRTGAGKSTLSNCLFRIVERSGGKIIIDGIDISTIGLHDLRGKLNIIPQDPILFSGTLQMNLDPLDKYSDAELWEVLELCHLKEFVQSLPKKLLHEVSEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILILDEATASIDFETDNLVQTTIRKEFSDCTILTIAHRLHSIIDSNRVLVLDSGRIVEFEAPQNLIHQKGRFFEMITEAGITQDLEAKK	135094	185924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_+_135257_137119_137241_143399_143476_150376_150438_151186_151407_165521_165677_167842_167999_171448_171649_172381_172509_173859_173962_176478_176623_178141_178301_182063_182231_184255_184451_184794
793346	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	26	-244	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793347	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793348	contig_13547_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_104853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAACATCAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17603	15347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_15300_17600
793349	contig_9706_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_20979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	537	875	364832	364494	NA	20	TGAACCTCCGACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNSWSPSRELQQMVNQQKCKPRNQFNLGPHPCHHHWKMEMTSAACRSNTTPSYQAALVVWELNSKAITIQGIGTKGQGLWPCDIKLSYQKRKNMHVFGAKSKSHFILFFCC	365368	363928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_363900_365400
793351	contig_13412_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_80015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412072	410425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_410400_412100
793352	contig_6233_pilon	+	1849	2	Intergenic	novelGene_74752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_1	0	79	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112900	119691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977
793356	contig_12179_pilon	+	2043	1	Intergenic	novelGene_127986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGGTTCAACACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326845	328888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_326800_328900
793361	contig_11026_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_167686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	363	38	400	282107	281745	NA	35	GTTCATGAAATCAAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKTFTHSSSSHSQEMLGKLNMLRNDGHFCDITIRVQDKIFRAHKVVLAACSDFFRTKLVGQAEDENKNVLDLHHVTVTGFIPLLEYAYTATLSINTENIIDVLAAASYMQMFSVASTCS	282144	281742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_281700_282100
793368	contig_20951_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_43122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241153	238907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_238900_241200
793369	contig_2487_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_148477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAACTGGTACCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181131	179286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_179300_181100
793370	contig_7594_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_55454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTCCAAATCATGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580119	580747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_580100_580700
793372	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	516	51	516	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793375	contig_5988_pilon	+	1576	5	Intergenic	novelGene_16044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	42.3024821966749	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	160	612	1005700	1015741	FALSE	15	TTCTGTTTCAATGTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREVALLAEMDKVKAEAMEILLSRQKKAELLKKMTDVAVRMSEEQLVELRADIKHFVSERKYDEDLGRVARFTCDVETLKKSIDSFGQVSHPKNSYSTRSRCSSVTSVSLSSPSDASAAAASTCASAPSLTRLQATRPKVQRPHKPRAT	1005540	1016705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1005755_1009777_1009888_1012736_1012840_1014387_1014517_1015685
793378	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
793379	contig_4103_pilon	-	866	4	Intergenic	novelGene_52021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	109.137018874848	2536	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTGCATTATTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619574	528798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_529278_577146_577338_585000_585078_619455
793383	contig_6738_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_166123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAAGGACAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32617	30732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_30700_32600
793384	contig_835_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_152132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGGAAAAGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72263	72961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_72300_73000
793385	contig_10013_pilon	+	2236	19	Intergenic	novelGene_125080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	204.702463994531	658	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	13	1794	470350	479307	FALSE	35	GTAAAGGAACTATTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIVDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVEDINKRREPIPSLEAIYLLSPMEKSVQALIADFRGTPTFTYKAAHVFFTDTCPEPLFSELGRSRLAKALKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAGERTRQLEVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEHDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWMELRHMHIADVSKKVTELLRTFCDSKRLTTDKANIKDLSHILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDAMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHCSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGPSSRLERKERLEPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRKLWPFVSDPAPTPSSQAAVSARFGHWHKNKAGVEVRAGPRLIVYVVGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKTLDQKLEDIPLP	470337	479749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_470387_471683_471734_471973_472056_472615_472693_473247_473327_473411_473516_473893_474043_474229_474315_474393_474525_474618_474727_475078_475137_475264_475331_475428_475510_475838_475978_476437_476548_477338_477435_478243_478330_478470_478629_479221
793388	contig_15270_pilon	+	2099	5	Intergenic	novelGene_174913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	16.6883192682786	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	246	602	56233	59054	FALSE	40	AAACCAGCAGATGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEVFSTTLAYTKSPKVTKRTTFQDELIKAITARSARQRSSEYSDDFDSDEIVSLGDFSDTSVDKNSVKKKMNDFHMSDDDEKNSSRLSFLKTKKSNSDIIKGKPTKTQFSEGKFLV	55597	60551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15270_pilon_+_55766_56155_56308_57056_57142_58172_58323_59007
793391	contig_9571_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_136279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAACTGGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437889	436911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_436900_437900
793392	contig_8320_pilon	-	1855	2	Intergenic	novelGene_152275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560994	557123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_558078_560093
793393	contig_5539_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_104767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAGTAATGCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163888	165055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_163900_165100
793394	contig_5549_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_81672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCATTTTGAGACCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531520	529757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_529800_531500
793395	contig_7171_pilon	-	874	7	Intergenic	novelGene_101259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2	469	876882	872518	TRUE	25	TTACGGCAGCGACGCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSTFIGEQPCTIIALNNARPTPAPCPVGSDDHLQLPGILDDLFGQLCGGNGGVFWLLLLAGKAVVVVGAQDPPSLLGVVCHLFRRAEEEDPGGLSEEDFLIGLLNAPGNFIPDSVQQDVDEEGVALGGDVALGQEHLVVAALHQVSPVPETQGA	876883	869785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_869977_871005_871066_871289_871302_872375_872551_873462_873560_875804_875916_876655
793399	contig_8729_pilon	+	1538	9	Intergenic	novelGene_40071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	26.7555484899861	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	421	885	51078	56380	FALSE	5	GTGTGTCTCGGACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPEACLTSPWLSACRSRLRHPRETGAPGVTRQVYPWGNQFQPNRTNLWQGKFPKGDRAEDGFHGVSPVNAFPPQNNYGLYDLMGNVWEWTASPYHPANQDMRVLRGASWIDTADGSANHRARVTTRMGNTPDSASDNLGFRCASSAGHLHGEL	45259	57033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_51027_51172_52546_52603_54672_54758_54932_55078_56295
793402	contig_6418_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_81160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTTTGAAGTAAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302729	300999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_301000_302700
793405	contig_2078_pilon	-	2157	9	Intergenic	novelGene_100161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	7.9912061042123	53	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	268	894	436735	419636	FALSE	45	GCAGAAAAATTCTACAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGYYCTADNGFGPIQSEVVNITVRRTPRNRSELIAAGVTGGLLSILLLPTALLFYCWRQRKSGTSTSESLNPGSSAPTTRLPTGDGSLGETNRKLLTTGPGEFPNSARNVSVDLQLLYENVYPKEGSLIYSEIQIFHLGEAEKASSSRTPSEYKDASVVYSVVKTQLPGDAAGQVISKDEDSMNNYENVTLTRLAPNPGSQAQCRS	438482	418372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_419795_419879_419912_423192_423262_423480_423564_429666_429695_430275_430339_430767_430882_436656_436947_438426
793410	contig_14556_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_138518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTACTCATAACAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101738	103260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_101700_103300
793411	contig_14556_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_138519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCCTTTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103508	104471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_103500_104500
793414	contig_8801_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_66273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATATTAGTGTTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417567	416737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_416700_417600
793416	contig_2636_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_52054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACACATAAACAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58312	58651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_58300_58700
793419	contig_10196_pilon	+	849	4	Intergenic	novelGene_132094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	12042	junction_1	953.887834076942	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	162	818	907588	908556	FALSE	20	GTCTGTTAAAACTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRETKDLLGTSDRPPCGLSFLEGRNKLWALGTDAGHLGVWPQPVSLCLQAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	907426	908587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_907912_907991_908152_908260_908353_908475
793420	contig_16113_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_140547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGACCACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26837	26276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_26300_26800
793422	contig_299_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_129497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607939	1610018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1607900_1610000
793424	contig_3942_pilon	+	2279	16	Intergenic	novelGene_128821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_12	51.6113682567449	107	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1296	2075	1180777	1182720	FALSE	5	AGCCTTGCCTCCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVKLGDASIAAPFTSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQGLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTVLTVMLQFLVHFLSLVYLYSEAQARSPAKQEQFVDLYKEFEPSLVNSTVYIMAMAMQTATFAINYRGPPFMESLPENKPLVWSLAVSILAISSLLLGSSPDINSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLVDRVLQFFLGAPKLKVPS	1177061	1182924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1177128_1177201_1177323_1177632_1177791_1178051_1178158_1178230_1178342_1179251_1179378_1179603_1179713_1180038_1180239_1180317_1180415_1180503_1180663_1180734_1180850_1181185_1181383_1181877_1182021_1182190_1182303_1182389_1182534_1182609
793425	contig_3111_pilon	+	2279	2	Intergenic	novelGene_129947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGGGAGAAGCGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8005	10994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_9467_10176
793426	contig_12265_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_149432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTATCCCTGATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16691	18728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_16700_18700
793428	contig_8697_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_83220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAATGCAACGTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59384	58849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_58800_59400
793431	contig_16686_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_162094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAAGTCTTGTTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151926	151017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_151000_151900
793432	contig_17195_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_168969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTTATGTATGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3094	3739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_+_3100_3700
793434	SIRV4	-	393	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1120	8	1120	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4038	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
793436	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
793437	contig_8538_pilon	+	1799	7	Intergenic	novelGene_4613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	496	1020	692738	696988	TRUE	30	GACTTCTGAGAGTAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRQAEADGIADPLHQVSPEGVAGSHLQEEDHSLLPVLVVLGDAQAVHYLLKGLHNVVDFRAAKPHSIGVERAITPAQHDDAPSLGIDSAVITVRPDTWEFGEIGFPVLAPVLVIPEVRGLAGDGLGAHQLSALTPDCLSCPHPRPPLPCPGSGLGSPLCTQGSRHSGPRSRR	692242	698572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_692905_693724_693784_694501_694570_696233_696365_696888_696999_697664_697790_697928
793438	contig_1008_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_121557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCGAGGGGACTGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542372	544373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_542400_544400
793440	contig_8362_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_150694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGATTTGACTGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330804	328642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_328600_330800
793441	contig_12492_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_77497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	251	328	258977	259054	NA	85	ATAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSARFPGLVVCDTGVRPWRTRSLSPVASPTRLPSVAALTRTPAPRWAQNLILPPRNPALSGFGAGGEEILGLNWAWPGLHSNSMWLPLQFPTPPPSADGSELRRLMGV	258726	259721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_+_258700_259700
793442	contig_10627_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_60041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAGAAGCAAAGTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792794	792079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_792100_792800
793446	contig_11574_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_64051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTAAAACAATAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431142	432042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_431100_432000
793448	contig_9468_pilon	+	1609	3	Intergenic	novelGene_59508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	466	junction_2	110.5	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGCTATATAAAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355136	357226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_356242_356378_356511_356854
793449	contig_19941_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_139763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCCAAGCTCTTAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55465	56664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_+_55500_56700
793450	contig_19098_pilon	-	1900	3	Intergenic	novelGene_65864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.5	611	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGGACAATCGTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503008	485631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_487189_488282_488494_502876
793454	contig_10708_pilon	+	2890	1	Intergenic	novelGene_174354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440477	443367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_440500_443400
793459	contig_10197_pilon	-	234	2	Intergenic	novelGene_115231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGTTGTGTCAAGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952426	935340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_935416_952267
793464	contig_14687_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_107972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749346	751320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_749300_751300
793465	contig_11171_pilon	+	1014	10	Intergenic	novelGene_48525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	491	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	45	977	31058	65921	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLLLLPSPWLRGDFEQCLLSERRTNTRWPPRCLQTTAVLASCISAFQSHL	31013	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64835_65770
793468	contig_8978_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_49368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGATGCTGATTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316050	328175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_316226_327092_327244_328149
793471	contig_13547_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_104866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGATTACATATTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71864	70391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_70400_71900
793472	contig_854_pilon	+	1063	6	Intergenic	novelGene_36298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_5	2338.45612317187	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	80	526	556108	562402	TRUE	30	AAATTCTGTAAATCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	545934	563564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
793474	contig_5916_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_158052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTATTTTCACTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452036	450300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_450300_452000
793475	contig_5916_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_158051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTCCTTTTCTCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449847	449623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_449600_449800
793476	contig_14871_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_63717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGTCAAGCTTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227255	224710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_224700_227300
793484	contig_7135_pilon	-	2733	3	Intergenic	novelGene_136953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	15.5	14	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAGCAATACTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319481	316522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_319020_319128_319277_319393
793485	contig_12964_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_131723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	17	54	265	318	610120	610173	NA	10	AAGCTTCCCCGGCGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLQAANVLGFLKRHTRCRCCLQGAWLLGGAIISISTGFDIIRCIFEPHRVTNCRLSCHQKSPQSQPTLKRWTASKKRCRRPEQPKQTMWALFCVPADSPEEQLV	609855	612327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_609900_612300
793492	contig_7963_pilon	-	617	3	Intergenic	novelGene_58298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1279.5	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	161	400	40037	38544	FALSE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKGKEPSGYRVPDLN	40197	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38568_39276_39405_39949
793494	contig_5009_pilon	-	854	4	Intergenic	novelGene_119257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	65.8904815246903	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACTGGCTCCTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50474	43248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43900_44537_44622_47700_47792_50446
793497	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
793498	SIRV1	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
793500	SIRV6	+	219	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	506	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
793501	contig_9375_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_136030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTTAAAATGCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46992	46328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_46300_47000
793503	contig_3380_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_60134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCATGAAATTTAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598594	596538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_596500_598600
793507	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
793509	contig_15787_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_143997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106613	108119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_106600_108100
793513	SIRV2	-	414	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3019	-1	-389	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGACGTCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
793515	contig_7457_pilon	-	1184	9	Intergenic	novelGene_31412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.665054302988	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	494	760	470910	469327	TRUE	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRWVQDDGASSLARRPLGQGKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473213	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468298_468962_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473146
793517	contig_2114_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_104310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACAGTAATTTTTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069920	1071672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1069900_1071700
793518	contig_10437_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_38172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCGTTGCAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162723	164087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_162700_164100
793519	contig_2892_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_119034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACCTCCAATATTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326200	324179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_324200_326200
793520	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
793521	contig_7898_pilon	+	1218	10	Intergenic	novelGene_47616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	455.854617283587	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	117	1217	571727	599864	FALSE	70	GAAAAAAACAGAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGSRRFNRKREPSYTKNENFSNQSRRSNAQKSKTFNKMPPERGGSSSKLFSSSFNGGRRDEVAEVQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTFEPRGQAGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALDPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKK	571610	599865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_571799_583823_584024_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587615_596048_596137_598693_598752_598838_598998_599844
793522	contig_8513_pilon	-	1168	9	Intergenic	novelGene_174915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_8	26.4099294773765	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	86	1003	129752	125753	FALSE	25	GAAGTGAGTGTGTCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARSVGREAEAVGLVELQRLLTWPSALWMLEVGANTRVRDVCQSIAAKLQLASWEGCSLFVKIADKVFSQKEGDFFFDSLRQVSDWVKKNKPQKEGAAVTLPYQVLFMRKLWLNVVPGKDVNADTILHYHQELPKYLRGFHKCSREDAVHLAGLIYKAQFDNDRSQLASVPKILRQLVPENLMRLMSSEEWKKNIPLAYDKHVDKTVEEAKVAFLKWICRWPTFGSAFFEVKQTSEPSYPDIVLIAINRHGVLLIHPKTKELLTTYPFTKIASWSSGSTYFHMVLGSLGRGSRLLCETSLGYKMDDLLTSYVQQLLSTVNKQRSSRAPALANL	130278	125587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8513_pilon_-_125855_126290_126411_126688_126773_127452_127570_127806_127993_128517_128625_129256_129345_129638_129753_130193
793523	contig_11285_pilon	-	1197	6	Intergenic	novelGene_5652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	485	1102	769622	768492	TRUE	15	GTGGCATTCTCCTTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSAARLVITAEVALPTCHISHAHVKAVGQLGGGLGRDHLLLTGAGLHIAGIPCWAAVLAILTAHSVGQLAAGPAPAQALAAGLPHWAASVLVTAGVSRVRQGGLAGGHLLQCSHRLVPLLTLPLVRARVAMGAAVLVVRAADSLWRRTAAPLPRQESAAGIEGGTAGDVVTGDITLYGLGVWQAEPTQHSQVPGQTGSSPRPL	770194	768116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_768147_768426_768549_768730_768855_769083_769320_769421_769649_769736
793524	contig_11832_pilon	+	1427	5	Intergenic	novelGene_106974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	21.6448608219134	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	705	1166	464768	466366	FALSE	0	TCTCGGCTTGGTGTCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLHIPPSSFAVPPLPSDSAKWTETEIEMLRAAVKRFGDDLNHISCVIKERTVAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPEAGGPPIKKQKADVTLSALNDSDANSDLVDIEGLGETPPAKKLNFDQA	463858	466627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464929_465610_465802_466007_466113_466361
793527	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	57	503	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793529	contig_5059_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_140728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATGAAAAAAAAAACTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251583	252949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_251600_252900
793537	contig_10413_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_71030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAAGTATGATTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40829	38834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10413_pilon_-_38800_40800
793539	contig_10627_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_59923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_5	113.513699613747	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	67	747	105394	109221	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	105327	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106116_107835_108139_108453_108573_108962_109005_109122
793540	contig_12644_pilon	+	879	7	Intergenic	novelGene_44653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4081.48736845882	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	369	791	2679895	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675477	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677220_2677396_2677585_2677693_2678054_2678085_2679889_2679963_2680107_2680229_2680311
793541	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
793542	contig_16187_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_101075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53298	54466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_53300_54500
793547	SIRV4	-	225	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATTATTTCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	2542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
793549	contig_18794_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_54667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGCTCTTCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345929	345680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_345700_345900
793550	contig_6217_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_109575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAATCAATAAACCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95317	97596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_95300_97600
793553	contig_16098_pilon	+	621	3	Intergenic	novelGene_46075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAAGGTGCCTTCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456062	456937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456663_456827
793554	contig_10904_pilon	-	975	7	Intergenic	novelGene_22622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	362.909998025222	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	93	446	515110	510240	TRUE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEAGESGQ	515977	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499426_507435_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515888
793555	contig_6375_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_73033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	103	441	472395	472057	NA	35	TTGGCATATATATATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHGGFLTQRLTSCSLFPLVLSCPALPTSPHTVSEEKEEVNMDTTENRPENEIPEPPMPIADQVSNDDRPEGSAEDEEKKEVNIQTTHWGRRAGVDLEERVDHSGDPSYIVG	472497	471602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_471600_472500
793556	contig_15628_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_147702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTAAGCAAAAGAGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141362	142300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_141400_142300
793558	SIRV4	-	213	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1308	0	1308	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
793561	contig_1406_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_25666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2816698	2815163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2815200_2816700
793562	contig_9915_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_174175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGGAAGACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738900	738235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_738200_738900
793563	contig_6302_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_171700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACAACTCCCCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141768	141433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_141400_141800
793564	contig_6302_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_171699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141481	139550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_139600_141500
793565	contig_5935_pilon	-	1179	6	Intergenic	novelGene_102666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	10.8332820511607	1055	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	159	584	423849	422875	TRUE	65	ACTCAAAAAGAAAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METENGSQDKVMEEENIEKKKDVEKKKRSRVKQVLADIAKQVDFWFGDANLHKDRFLREQIEKSRDGYVDISLLVSFNKMKKLTTDGKLIARALKSSAVVEVRFILIYYLLIIFIQFINLMCFFLKAGFRRHQDQEEKAPR	431673	421962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_422262_422333_422428_422509_422675_422837_423099_423647_423851_431516
793567	contig_4686_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_118566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685233	683329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_683300_685200
793570	contig_12046_pilon	-	1810	1	Intergenic	novelGene_83505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAAAGTGGGAATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961400	959590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_959600_961400
793571	contig_10988_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_104741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313990	313401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_313400_314000
793573	contig_3155_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_26433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	632.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCTGACTATATATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295656	294812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295065_295303_295338_295600
793574	contig_5791_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_35825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACTTATCTCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970200	970511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_970200_970500
793576	contig_6914_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_151726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	432	1583	2014	115315	114884	NA	20	CCGCCTATAAGGTTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFFYFSKFSTSCDWEIQQIFKATPVLPPRYRCQSPTKLTFRSLNIGMCRHVHPQVLLDSPGWEKRAAEPQDSPYPQPETGVRPEEPACIQLETHTTGKGDLLSLSLLSLPPLQPPLQTQTHLVVTRCLQADFQLIATSCDKVK	116897	114883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_114900_116900
793578	contig_5551_pilon	-	1278	4	Intergenic	novelGene_134274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	170.364967708218	576	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGCATTATTCATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834366	746564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_746828_796483_797237_817301_817377_834179
793579	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
793581	SIRV4	-	464	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1059	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4099	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
793582	contig_11978_pilon	+	1196	4	Intergenic	novelGene_63036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	446.420081189107	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTTGGTTTCCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645300	1649719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1645382_1646686_1647075_1648801_1649034_1649224
793585	SIRV6	-	383	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9456	-158	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	424	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACGTTTTGCAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	1702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
793587	contig_3787_pilon	-	807	5	Intergenic	novelGene_102417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	383.014604812924	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	306	716	562283	559769	FALSE	10	GGTCTGGTATGGCTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARFEEHKNEKDMVKATQLLREAEEEFWHCQHPQPYIFPDSPGGTSYERYECYKVPEWCLDDWHPSEKAMYPDYFAKREQWKKLRMESWEREVKQLQEETPPGGPKTEALPPARKAGDLPPLWWHIVTRPREQPM	565107	559677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559901_561481_561596_562118_562312_562655_562825_564999
793589	contig_11933_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_107273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCTAACATCATAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216030	214289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_214300_216000
793590	contig_4857_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_48634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438025	436395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_436400_438000
793592	SIRV5	-	417	1	FSM	SIRV5B	SIRV512	229	1	8	-196	8	196	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6383	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGCACCCGGCGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2398	1981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_-_2000_2400
793594	contig_2739_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_165838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236262	235222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_235200_236300
793595	contig_5643_pilon	+	570	7	Intergenic	novelGene_38778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2140.70507595564	257	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	71	511	233973	238136	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGMTMNLATATGWWTLWSTWPLRKRGPLSCWGVLAPTPSNTLRIFHPLHSFHPYPLKKG	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236454_237913_237980_238026
793596	contig_11566_pilon	-	1851	13	Intergenic	novelGene_166702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_12	230.481862385935	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	220	1542	246031	188958	FALSE	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHRIKSFDSLGSQSSHSRTSKSFQGQYRSLDMTDNTNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFTKGDIIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREIKSSEKPVSPKSGALKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSAYLRPLQTSEKLSSANTSYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEEKNERYLLLFPNILLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHKNSFEISGSMIERILVSCNNQQDLHEWVDHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTVRTALRLPNGIQYHPFAGAVRK	259298	188648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_189167_189368_189448_191619_191707_194821_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203342_223964_224061_224290_224386_234704_234794_245832_246035_255113_255245_259213
793601	contig_6028_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_156599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCTCCCAGCGCAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347341	345900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_345900_347300
793602	contig_4079_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_167474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCAGGCTCAGCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122979	121985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_122000_123000
793603	contig_4079_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_167473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAATATAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121829	120538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_120500_121800
793605	contig_6842_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_130803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668812	1670929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1668800_1670900
793607	contig_9609_pilon	-	1332	9	Intergenic	novelGene_23129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	78.0607735998049	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	124	513	523819	522305	TRUE	25	CCTACCTCTATTGAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAGARAPVAQASELPLTGVPKGGGVFAREGLEATDLGPAGAMGSSCRIECIFFSEFHPTLGPKITYQVPEDFISRELFDTVQVYIITKPELQNKLITVTAMEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLEVCLGKWAGRARAGAPI	523942	520727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521543_521628_521759_521978_522081_522171_522309_522903_523120_523204_523297_523741
793610	contig_8248_pilon	-	2137	1	Intergenic	novelGene_125032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCGTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196732	194595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_194600_196700
793611	contig_7253_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_140194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159214	160960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_159200_161000
793615	contig_13558_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_123024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAAACAAAGACATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185295	186410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_185300_186400
793616	contig_8594_pilon	+	1673	5	Intergenic	novelGene_140047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGGAGAGGAGAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460904	496216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_461711_463839_463888_475734_476003_487002_487311_495973
793618	contig_10404_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_138736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCAAACCCCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603224	1604019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1603200_1604000
793619	contig_18967_pilon	-	1507	8	Intergenic	novelGene_165335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_6	65.182005780361	486	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	8	1084	343580	334485	FALSE	5	CCATGTCCCTTGCTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPFPLLSLPAPLYPIMCSMEHPLSADIAMATRADEDGDTPLHIAVVQGNLPAVHRLVNLFQHGGRELDIYNNLRQTPLHLAVITTLPSVVRLLVTAGASPMALDRHGQTAAHLACEHRSPTCLRALLDSAAPGTVDLEARNYDGLTALHVAVNTECHEAVQLLLERGADIDAVDIKSGRSPLIHAVENNSLSMVQLLLQHGANVNAQMYSGSSALHSASGRGLLPLVRTLVRSGADSGLKNCHNDTPLMVARSRRVIDILRGKATRPAPAPQPEPSPERSATTSPESSSRLSSNGLLSTSPSSSPSQSPPKDSPAFSMVPPNFFLPPSSPPAFLPFAGVLRAPSRPVPTSPAPGGS	343587	334061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_334673_335296_335415_336068_336237_336965_337044_337246_337336_337435_337641_338116_338226_343458
793621	contig_10882_pilon	+	2437	1	Intergenic	novelGene_172748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16833	19270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_16800_19300
793622	contig_3147_pilon	-	952	2	Intergenic	novelGene_142269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCCTCCTTCAAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63847	61428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_62200_63666
793623	contig_3147_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_142268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATTAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61479	60887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_60900_61500
793626	contig_4574_pilon	+	142	2	Intergenic	novelGene_174920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTTAATATAAGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69420	70315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4574_pilon_+_69475_70227
793627	contig_7357_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_36767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACGCTGAGTGATAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74443	73845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_73800_74400
793628	contig_9839_pilon	-	2255	5	Intergenic	novelGene_88590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	18.060661671157	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	36	404	348247	344325	TRUE	25	GAAACAGTTCTGGCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSGIIDSQISRQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVVVVVLLGILALIIGLSVGLK	348282	339645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_341467_344294_344409_345886_345998_347942_348078_348208
793631	contig_11338_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_6408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAAAAAACCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314071	316434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_314284_314343
793632	contig_8611_pilon	+	2089	14	Intergenic	novelGene_166566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_10	20.8874130439516	281	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	356	1660	120815	153318	FALSE	35	TAGAAATGTTTGTTAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTETSTSQASCSSDGYPLPSWTWKKCSEKSPNCTEEITEGIWTKKARRQVFGQWISSSTLNISEAVKGFRVKCCAYNSIGSSCETILLNSPGPFPFIQENISFYATIGLCLPFIAVLTMLLYHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSLDNEYFYIDFRESEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEKEALMSELKMMTHLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHPNPSVPGSREVQIQKDLDQISGFNGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCFAYQVSKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIESGFKMDQPFYATEEIYFIMQSCWAFDSRKRPSFLNLTSFLGCQLADAEEAMYQNMDGRILERPSIYQNRRPCSQEMNSGAPSPQAQAEDS	118670	153747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_118767_119039_119219_120734_120842_120925_121059_121147_121253_126318_126430_127911_128066_132018_132102_133159_133288_138205_138329_140612_140725_141980_142081_142798_142905_153195
793635	contig_2596_pilon	-	1384	6	Intergenic	novelGene_53522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_1	248.38679514016	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	34	699	1120571	1054899	FALSE	40	AACGCTATATAAATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPGRASQIQIAMGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAASEDEEEEEALEAMQSRLATLRS	1120604	1054213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
793636	contig_4952_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_145527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAACCCTCTACCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390725	391486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_390700_391500
793639	contig_1154_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_87207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGAGTTGGGGCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164335	1165576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1164300_1165600
793640	SIRV1	+	220	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTACCCTAGTATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
793641	SIRV6	+	264	4	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2049	564	31	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11034_11109_11205
793642	contig_13702_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_102623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAGGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207699	209394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_207700_209400
793651	SIRV5	+	340	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	166	48	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTAGTATAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
793655	contig_13542_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_131555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATATCAAGAAATGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620252	619330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_619300_620300
793656	contig_15135_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_119843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCAAACCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9666	11138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_9700_11100
793658	contig_14838_pilon	+	1231	7	Intergenic	novelGene_151904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	6.93821943216622	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	15	896	73071	107995	FALSE	20	CCATTTGTAGTGTTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVRGFRAFVRLRLRLHLSALKPRIPGAQALAAVAYGTSVTSAKVAVNGVHLHYQRTGEGDHAVLLLPGMLGSGETDFGPQLKNLNKKHFTVVAWDPRGYGHSRPPNRDFPIDFFERDAKDAVDLMKTLKFPKVSLLGWSDGGITALIAAAKYQSYISKMVIWGANAYVTSEDEVIYQGIRDVSKWSERTRKPLEALYGYDYLAQTCEKWVDGILQFKHLPDGNICQHLLPLVQCPTLIVHGEKDPLVPRFHADFIHKHVKGSWLHLIPEGKHNLHLRFANEFNNLVEDFLQ	73056	108330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_73184_80954_81059_83584_83752_85029_85184_95171_95304_98270_98395_107907
793659	SIRV4	+	275	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTCAGAATGGGCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
793660	contig_1154_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_87035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTCAAACATAGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37226	39389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_37200_39400
793663	contig_9011_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_159352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGACCTCCCACGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756880	757532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_756900_757500
793664	contig_1146_pilon	-	362	5	Intergenic	novelGene_84853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAGAATAGTGAGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957072	949779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_949802_950972_951112_951650_951730_956015_956103_957037
793665	contig_6445_pilon	-	773	9	Intergenic	novelGene_76956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	672.968598357308	105	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	88	708	89674	42950	FALSE	50	TTAAAAAAGATACATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAGPAPPPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISFVPCPP	96354	42884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_42972_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
793667	contig_602_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_134927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGTGTACGTATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63223	63426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_63200_63400
793668	contig_1244_pilon	-	1773	5	Intergenic	novelGene_38049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	13.6633634219397	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGTAAAGCCAATCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981772	978799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_980028_980529_980649_980853_981047_981419_981570_981689
793677	contig_6589_pilon	+	1251	8	Intergenic	novelGene_26010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	985.674657588519	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	125	811	1725483	1730119	TRUE	35	GGTAAAATAGCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLQLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPAGTTSSP	1725358	1731814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728195_1728304_1728996_1729213_1730098_1730152_1731406
793679	contig_15888_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_84460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAGTATGGTGAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541612	541852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_541600_541900
793681	contig_16103_pilon	-	714	3	Intergenic	novelGene_118719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_2	83	7693	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	179	592	209773	207292	FALSE	10	TGAGGCTGCTGGTCTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWVVPTHGGSCLRPLLTHCPSVPAGGRKTVSRLGWLRGPWLLLHRPRAGGCLCSPPPPAMGRTWPGYKEVRRLSLPPLFSPARCFLSLGLVLTAAMAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	209951	207169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627_208784_209680
793691	contig_9429_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_155088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	110	382	17721	17449	NA	55	TAGTCTTACCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERERSNKKSQKSNIKKQTKEQSKQTKKITAHQEGQGMAYGATWAGKRKGRKEERKKQQKNPKIQFQKTNKNFKNNFLSASSITKAQNHLNVGQIWKCKVIVEKECWKEIKSVFQQSVFYTMWDEGL	17830	16328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_16300_17800
793692	contig_6361_pilon	-	515	3	Intergenic	novelGene_23992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	2048.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419590	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465
793696	contig_9437_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_141740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGGTTTTTAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477059	478194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_477100_478200
793697	SIRV4	-	179	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	3	-432	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCGAAGCCATGTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
793699	contig_6496_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_103518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATAGTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864613	866713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_864600_866700
793701	contig_5571_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_75523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTACCCAGCAACAACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180500	180956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_180500_181000
793702	contig_6076_pilon	+	962	2	Intergenic	novelGene_81722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTTACCACTTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18976	158902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_19898_158861
793704	contig_14744_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_66030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTGGTCGATCTGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294065	1294806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1294100_1294800
793705	contig_14846_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_85378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTCAAGCTTGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194267	196250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_194300_196200
793708	contig_14923_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_157758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360708	362685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_360700_362700
793711	contig_9706_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_20918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGATATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140403	138832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_138800_140400
793715	SIRV7	-	208	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69072	0	35853	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78885	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
793723	SIRV6	+	180	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	22	499	22	-329	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGAAGTACTGTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	1621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
793729	scaffold_19766_pilon	-	1445	8	Intergenic	novelGene_34341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	437.262541972492	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	372	1238	622205	596625	FALSE	65	AAACAAAAACAAAAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGTWSRTPPCPGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	623728	596417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_605070_605300_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
793732	contig_6710_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_98249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TCCTTAGGCCTCTGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
793734	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
793738	contig_7444_pilon	-	1912	1	Intergenic	novelGene_174927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGACAGTAGAATTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75791	73879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_-_73900_75800
793740	contig_854_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_36186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGACTCAGGTGGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484865	485762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_484900_485800
793746	contig_10324_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_7880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTGGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545772	548415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_545800_548400
793748	contig_7272_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_25383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGGAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717522	718786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_717500_718800
793750	contig_10629_pilon	+	1195	6	Intergenic	novelGene_52954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	199.049139661542	368	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	83	880	447968	452607	FALSE	25	CTAAAACATTTTTGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATVVAQKKFSVTIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGRDKVTFTFEAGRRCFSGEGNFEFETLLVTVFGHCIHRTSLRLLPALPPYTHAGLGLP	447885	452922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_450546_450732_451751_451818_452508
793753	contig_9955_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_21324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCAGCTGGCATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61079	59365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_59400_61100
793754	contig_15918_pilon	-	1505	5	Intergenic	novelGene_132722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	20	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACCAGGTGTGCAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257709	211353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_-_211419_248784_248873_250552_250644_253440_253529_256536
793755	contig_10523_pilon	-	1563	9	Intergenic	novelGene_120921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.127071818687	59	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	206	1189	39240	15001	TRUE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	95343	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13048_14947_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
793761	contig_12479_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_56843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACATTTTCATCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161677	163615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_161700_163600
793765	contig_10575_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_141812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCAGCAGTGCCTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302512	303170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_302500_303200
793766	contig_9199_pilon	-	1922	14	Intergenic	novelGene_65650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_9	91.5643143841478	77	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1758	165	1922	182028	170862	FALSE	70	ATTGAAATTAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSEIEPNVFLRPFLEVIRSEDTTGPITGLALTSVNKFLSYALIDPIHEGTAEGMENMADAVTHARFVGTDPASDEVVLMKILQVLRTLLLTPVGAHLTNESVCEIMQSCFRICFEMRLSELLRKSAEHTLVDMVQLLFTRLPQFKEEPKNYVGTNMKKLKMRAGGMSDSSKWKKQKRSPRPPHHVTKVTPGSELPTPNGTTLSSNLTGGMPFIDMPTPISSASSEAASAVVSPSTDSGLEFSSQTTSKEDLTDLEQAGFPGYSTAADPVSNELGVPEQPDPQQEVVQVEKAQSASVESIPEVLEECTSPADHSDSASVHDMDYVNPRGVRFTQSSQKEGTTLVPYGLPCIRELFRFLISLTNPHDRHNSEVMIHMGLHLLTVALESAPVAQCQTLLGLIKDEMCRHLFQLLSIERLNLYAASLRVCFLLFESMREHLKFQLETYIKKLMEIITVENPKMPYEMKEMALEAIVQLWHIPSFVTELYINYDCDYYCSNLFEDLTKLLSKNAFPVSGQLYTTHLLSLDALLTVIDSTEAHCQAKVLSNLTQQEKKEAARPSYETVDSTREASNTERAASDRKAVGMAPDIPGLHLLAGGWLLAEHGKPGCSDLEEAGDSGADKKFTRKPPRFSSLLPDPREL	186138	170861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_170927_171241_171383_171979_172170_172404_172600_173227_173327_173663_173876_174317_174487_175002_175227_175570_175719_179452_179508_180733_180795_181306_181416_181938_182058_186003
793768	SIRV6	+	357	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	565	40	386	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
793770	contig_16869_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_137593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCACTCATATTTAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58431	57502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_57500_58400
793772	contig_12622_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_5882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	217	774	1224776	1224219	NA	35	ACACAGTGACAAGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQHTFKYSKEREEPQEHERLQVEHGVNGVLESCRVGRWADCQGWPGRSCFSSAHCSLHPARAPLSGTAVVLTELSLLQEDLGEGPTNATDEGGPQHQGEALDVELCGLVGEHEEAPSDEEDYQDQCRSLTEEREAATNLGVSRAKRSSYPELGSQQPSWLSLEHETLPLPLALGVRARLLSIKG	1224992	1223919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1223900_1225000
793773	contig_11825_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_155395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACATCTGCTTTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11173	12374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_11200_12400
793774	contig_5799_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_50281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	308	607	311676	311377	NA	5	TCCTCTTTGCACGTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYWEKCERKRVLTVSRKRGTGNGEKEEIMNKTLLRCECCADVGCCRFHFSVSTLSCLYLRILIYLFCFLPFFATVSINLLYQIQNLMFSSSVVVLNN	311983	311265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_311300_312000
793776	contig_8322_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_143221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136210	134773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_134800_136200
793777	contig_10063_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_127742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCAAAAAATGTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387735	390365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_387700_390400
793778	contig_5718_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_110358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTTTGCAGCATCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702012	703368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_702000_703400
793779	contig_20058_pilon	-	2001	11	Intergenic	novelGene_109280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	413.290563647417	1	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	28	990	59150	39325	TRUE	30	AATGGGGCTGATGTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGRGRRKMADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGHHLQVPRRQLHM	59177	23454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_23874_30510_30706_32764_32919_33550_33667_39197_39363_39471_39703_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
793780	contig_7027_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_164329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGGAGATTCAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14505	15847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_14500_15800
793783	contig_6589_pilon	+	512	4	Intergenic	novelGene_26141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7978.98808677447	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	238	390	1886754	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFSKRPGRWRTFRPSVPTKSSRPSSKTKRGSCWEKLARRSSRVITRTSVWVSRHPRRYREDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885097	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886071_1886698_1886783_1887705
793786	contig_4103_pilon	+	931	5	Intergenic	novelGene_51967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	101.701769896104	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	129	701	171627	175646	FALSE	30	GAGCAATAAGCCCTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPEVRDGPLRGDSWAPASETTPGPPPKGPPPPSDKAPRPSPVGSCPASSVKPPSFPVIKSETLLEDVLRPLEQALEDCRGHMRKQVCDDISRRLALLQEQWAGGKLSMPVKKRMALLVQELSSQRWDTADDIHRSLMVDHVTEVSQWMVGIKRLIAEKKSLSSEEEAAEKSAATTEENQTVPGFFGAP	171340	175876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_171358_171515_171676_174223_174430_175196_175306_175437
793787	contig_7426_pilon	-	1495	9	Intergenic	novelGene_27522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	1109	1495	1013949	1012642	FALSE	20	AGCCCCAGGAGGCTCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWTRTWAHSLGKCFTRIVKVDPLRARWLERGSSSMVQLTAWPGSLVPFTAAEDSTGRNSREAGWPCSGGMAWTMTRCSWGPTMLQPRATVIAVCRLSPVTMTARMWVLRRAWITGVVCGFSRFLMTS	1017331	1012641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1012728_1013435_1013598_1013719_1013830_1013920_1014010_1014671_1014822_1014902_1015004_1016202_1016425_1016509_1016654_1016900
793788	contig_13300_pilon	+	2073	3	Intergenic	novelGene_125772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	923	1258	46526	46861	TRUE	5	GGGTGGTGCTCAGGGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKRVHTAGPRRRTQPRQSQVLQLNLATQFREEESGVTSEAQERTLGTSQASLQDPARGVESQRFPLRGVCAWRWGRGRNDLAKLTRGSVGAPCFHTSPRPWLRLPLEFCN	45552	49682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_46427_46477_47630_49635
793792	contig_5832_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_134115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGTAGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33407	31826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_31800_33400
793793	contig_9633_pilon	+	2180	2	Intergenic	novelGene_139653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	313	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCAAAGAGAATAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186615	1189224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1188673_1189101
793794	contig_7275_pilon	+	1325	2	Intergenic	novelGene_111233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187941	191491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_188189_190413
793795	contig_13894_pilon	-	948	5	Intergenic	novelGene_62204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	240.930877016625	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	123	731	766610	750013	FALSE	50	AAAAGATAAATTTTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSPQTPGTRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766732	749795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_766578
793799	contig_5201_pilon	+	982	7	Intergenic	novelGene_82193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	160.751360802949	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	11	844	388812	405561	FALSE	35	AAACTCATTTGTAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAMAATFFGEVVKGPCRAGTEDEEEEEDKRETPEDKDVRRQLMRKREVRLLRRQTKTSLEVSLLEKYPCSKFIIAIGNNAVGVWEEVGCAKLWNEWCRTTDAISLSPTEAFCVFYHLKSNPSVFLCQCSCYVAEDQQYQWLEKVFGSCPKKNMQITILTSRHITDYKTSESTCSLPSPFLRALKTQSFKDPVCCSLLEQPNIVHDLPAAVLSYCQVWRIPAILYLCYTDVMKLDPITVEAFKPILSSRSLKGLVKNIPQSTEMLKKLMTTNEIQSNIYT	388801	405699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_388943_392320_392428_393630_393753_396005_396069_402083_402283_403180_403318_405486
793801	contig_7919_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_28082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTATGTTTTGATGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093674	1094292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1093700_1094300
793805	contig_11574_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_64110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGGATATGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602576	601692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_601700_602600
793809	contig_2894_pilon	-	1594	5	Intergenic	novelGene_86558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	13.1600721882519	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	437	1315	323383	321303	FALSE	45	GTCAAAGTATAATTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVQAGHVPLVSLLLNYYAGLDLERRDQRGLTALMKAAMRDRTECVAALLMAGADLTAVDPARGKTALELAVLTDSFSTVQRIRQLLGRPRVEQLSQHYQPEWPALAGLVAQAQTAPSLLERLQATLSLPFPQSPQEGGVLDHLVTITTSLASPFLTTACHTLCPDCPPALGTRSVSVPELLGTAPPPPLAPQSSPVVPSPQVLVPYQSPQGILSLCPQWLWPRDSSSPRPQAPRILLSKAPWSFSQRKQEPKPGGHCRLALPVWRYQELRMERRRQQEEARCAQSLGKMG	336514	321023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_322022_323054_323196_323364_323495_323723_323973_336438
793810	contig_253_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_129777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTTAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825981	824631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_824600_826000
793813	contig_7202_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_17516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCTGCTCATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
793814	contig_5389_pilon	+	1745	1	Intergenic	novelGene_143024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCTACCATCTCACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429193	430938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_429200_430900
793816	SIRV6	+	338	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	531	4	365	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGTCACAAGTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668	2116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
793817	contig_9484_pilon	-	1648	8	Intergenic	novelGene_105609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	6.39195923462774	66	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	906	1514	85865	79795	FALSE	5	TGGTTTCTGCTTGTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVNFSPASLSSTGSRYLNALVDIAVVLETKDTSLTSFIPAVNDLTSDLFRIKYKNEEIELELAKLGKNLTTTLILEKRLQEDLKKAEQHLSTERARVDHRLQNMDFLKAKSEEFRFGIKAAEEQLSARGMDASLSHQSLVALSEKLAELKQQTKPLKKKLESYLDLMPNPSLAQVKIEEAKRELDTIEAELTQKVEMMEL	88480	79660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_79846_80846_80895_81139_81212_82034_82101_82473_82598_84270_84406_85752_85889_87598
793818	contig_17144_pilon	-	2260	15	Intergenic	novelGene_29155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	256.623085795618	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	1059	2063	141718	123440	FALSE	40	TATTTTCCACAAAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNRKFMEELFKPQELYSKKALRTVYDRLAHASIMRLNQASMDKLYDLMTMAFKYQVLLCPRPKDVLLVTFNHLDAIKEFIRDSPAILHQVDETFWQLTEVYGSLSAGEFQMIRQTLLIFFQDLHIRVSIFLKDRVQNSNGRFVLPVSGPLPWGTEVPGLIRMFNNKGEEVKKVQFRHGGNYVTAPKEGSFELYGDRVLKLGTNMYSVNRPVDTHMSGASKNLASRTEENITPNPLAKEELNFLARLMGGMEIKKPSGPEPGFRLNLFTTDEEEEQAALTRPEELSYEVVNIQATQDQQRNKELARIMGEFEITDQPRWTASKGEDLLAMMDEL	164789	123242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_123557_123795_123860_124982_125123_126645_126716_127248_127378_127848_127953_136802_136884_137422_137591_141586_141742_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875_162952_164215
793821	contig_5649_pilon	-	1875	9	Intergenic	novelGene_82367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	78.6764537520598	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	609	947	1057385	1056259	FALSE	10	TCCTTCATGCGTCATCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFFYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN	1064326	1055330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057467_1058323_1058457_1060289_1060407_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
793824	contig_6137_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_59134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912408	911230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_911200_912400
793825	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
793826	SIRV5	+	327	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-24	902	-24	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8291	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
793829	contig_1143_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_86618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGCTTTAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839496	838557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_838600_839500
793830	contig_665_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_158208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCTCAGACCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246768	245466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_245500_246800
793834	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-89	878	25	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8226	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
793836	contig_15047_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_52168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	276.926321428643	12	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	25	648	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2169	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4183_21445
793839	contig_6871_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_21675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	736	1074	942000	942338	NA	55	GCAGACAATATCAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTENGEQGELWRRCPLLANTAWIHHLRPQSPRTADREYRKTNSKSSQQETEHTAIKDTHFPNPYSSSLYMASAAFQWAMVTQLDRQQLTALSPTSCLLQHCLLLLFFGFF	941264	942937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_941300_942900
793840	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
793841	SIRV6	+	280	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8137	14	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
793843	contig_9415_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_109744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAGCCCTGCTGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586262	586668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_586300_586700
793847	contig_4742_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_131016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	318	884	285113	285679	NA	10	CTCACGTATTTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIETVHLLRRGSAVTTSHFEAGNTCQPDFPSKSINFTSRSTSPRTNANFSPVRPQQPNLQHLKSSPPAFPFPGPPNFPPQNIFGFPPHLPPPLLPPPGFGFPQNPMVPWPPVVHLAGQPQRMLGPLSQASRFIGPQNFYQVKDIRRPERRHSDPWGRQDQQQLDRAFNRGKGDRQRFYSDSHHLKRERHEKEWEQESERHRRRDRTQDKDRDRKSKEEGHKDKERARLSHGDRGADAKASRDGRNVDKKPDKPKSEDHEKDKEREKSKHREGEKDRDRYHKDRDHTDRAKSKR	284795	286418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_284800_286400
793848	contig_7356_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_60360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149664	147445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_147400_149700
793854	contig_11932_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_85408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTCGATTTTTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256353	257352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_256400_257400
793855	SIRV4	-	444	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1077	0	1077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4081	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
793858	contig_10642_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_78676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTTCTTAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190450	188222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_188200_190400
793859	contig_10500_pilon	-	1698	6	Intergenic	novelGene_41144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	232.849822847259	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	220	1134	1206167	1143770	FALSE	40	AAAATAATCTTTATTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWISDHHLSKLKNEEFGMEAEKPLIKHASQRNDIQEKCVKLLPVIAEQLQWMPFVNAKHHEPFVKFIYWSLRQLDAGTQHSTLTSTLRRLGEDIFKGIVTKGIQDNSLEHSGENKPKTAAFFKSPNLPLRFLSTLIVLKTVTQADYLAQAFDSLCLDLKTDEGKTLFLDFQAVPVILGHLRISSKGLLSNVIDSLLQMTVESKSLQPFLEACSNTLFFRTCSVLLRTPKLDLQILEKLSIILQKLSKIKSNKKLFELFTIHLMLQEIQRTTHPEHAFLCINLNSTLFNLGLTKCNSLVSNASH	1206386	1143205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1143936_1146045_1146185_1177662_1177840_1191620_1191814_1197867_1197985_1206044
793860	contig_17427_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_30387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189014	190659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_189000_190700
793863	contig_7862_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_174933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAATTACATTTACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10465	8892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7862_pilon_-_8900_10500
793864	SIRV6	+	242	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11026_11109_11205
793867	contig_16049_pilon	+	1232	2	Intergenic	novelGene_174935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90730	93418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16049_pilon_+_91911_93366
793868	SIRV2	-	406	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4432	69	3257	-34	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATTTGCCAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
793871	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	61	502	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
793873	contig_1275_pilon	+	890	2	Intergenic	novelGene_108819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	4	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	90	779	747279	747968	FALSE	40	AAATTGTTAATAAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
793875	contig_12080_pilon	+	1809	11	Intergenic	novelGene_128412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.095642759636	3	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	48	1382	485841	497042	FALSE	30	GTTACATGTTTAATTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCWSLCPALTAPAPMSHAQAQARAQGPMDGRMPSSGCLLVSPQTPCGMPYRHSDCTGSAAGKADPLPGIPARSAVASRALLLAQSPGPFPLISLEGPSAQPRSLSSHSSTQPRSLPSHSSWRAAGVQDSSEEDASDIGFLHASSSSESKARLAQPQTTGEKQEQDKSKTLSLEEAATSVQQLFQLSVSIAFNFLGTENMRNGDYPTAFSYFQKAADCGYSKAQYNIGLCHEHGRGTPQDLSKAVLYYQLAASQGHSLAQYRYARCLLQDPASSGEPERQRAMSMLKQAADSGLKEAQAFLGVLFTKEPYLDEQRAVKYFCLAANNGDSQSRYHLGICYEKGLGVQRNLGEAVRCYQQSAALGNEPAQERLQTLFFMEAAALGPSNLAVTGLKSFSSPALCSLNTLLAGALRLPHAWSTGNLGLLCRSGHLRPNPRANSSAIPPHPHSLERSLVRLGFG	485699	497469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_485736_485829_485950_487377_487509_488552_488668_488922_489012_489110_489208_492136_492280_493300_493460_493553_493647_496096_496257_496803
793878	contig_14300_pilon	+	493	4	Intergenic	novelGene_133118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	21.6384431561566	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	169	492	326890	332093	FALSE	5	GTGGCAGCTTTGTCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDCGFPPQTPAHPFGPSSPTPRGAQPLLAIPGSPRLPPASGVDFRGEAGPQGVGVSMLSGWATPFLLLMLQGAWGCSDLACYTDYLQTITCTLETWSPRLRTLALTWQDLYRELEDEVISCSLHLSGHNATHAWYTCHMDVSCFMADDVFSVNMTDQSGKHSQE	314107	332094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_314261_326874_326939_329792_329896_331921
793879	contig_7207_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_72042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGGGCTCCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415407	415185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_415200_415400
793881	SIRV6	+	292	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8140	-1	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCGCTTTTGTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
793883	contig_7179_pilon	-	1639	4	Intergenic	novelGene_78156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	36.8872154908264	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATTGCGTATACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041418	1038899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1040059_1040747_1040887_1040984_1041097_1041189
793885	contig_5526_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_111701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320640	319530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_319500_320600
793887	contig_19342_pilon	+	647	2	Intergenic	novelGene_41136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAATTAAAGGAGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5915	6708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5994_6139
793888	contig_3866_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_112429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTCAATCTAAAACTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243282	241767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_241800_243300
793891	contig_6630_pilon	-	2384	23	Intergenic	novelGene_30732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	5	junction_1	171.404269356743	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2304	80	2383	836018	789990	FALSE	20	TATTTGTATGAGTCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRRDAAPPGQCQPSQVAAAAGRTGVMTDSPFLELWHPKAVSIRERLGIGDQPNDSYCYNSAKNSTVLQGVNFGGIPVVLLIDVSCFLILILVFSFIRRRFWDYGRIAMVSSETESESRFRRLSSSSSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLNNDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIISLLVVVNFLSLCIILPVNLTGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNNLLWLHTIFAVIYLILTVCFMRHHTQSIRYKAESLVRRTLFITGLSRDANKELVESHFRDAYPTCQVVEVQLCYNVAKLMYLCEERKKTKKSLRYYTNLQVKTGQPVLINPKICGQFCCCEVSGCEREDAISYYTRMKDRLTEKIAEEECRFQYQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQGLQCKGEPQPSSHSRELCTSKWTVTFATYPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFVGLFFLTTPSIILSTIDKFNVTRPIHALNNPIISQFFPTFLLWFFSTLLPTIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILPSLGLTSLDLFFRWLFDKTFSEASVRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMEMLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFEYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLIYILLKHMVDRHNLYFAYLPTKLEKKIHFTAVNQALAAPILCLFWLFFFSFLRLGLKAPTTLFTLLVLLLTILVCLAYTCFGCFKHLSPLNYKTEESASDKGSEAEAPAPPPFTVPLLTNELNKIFERAHF	841937	789988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_790041_799295_799359_799668_799785_800695_800864_802841_802948_803730_803894_807531_807595_808267_808355_808463_808571_811335_811490_812935_813074_813793_813928_814029_814154_814425_814507_818072_818144_819255_819365_820022_820075_822710_822854_827394_827433_828351_828419_833067_833151_835832_836033_841872
793892	contig_13504_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_157957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1689	2003	98625	98939	NA	70	GAAAAAAAAAAAAGCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGADHQVSLPQRHWVNSNSQSSRQQLSNSPLRHQGPFHQLLLLHNSAALFIGRSYVTSTVTAPSSVTKPAVQLQTTDVGSSLVHSLKHLLPTYCVQGPEHGRGV	96936	99199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_+_96900_99200
793893	contig_2703_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_101801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCTAGTCAATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617991	616780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_616800_618000
793894	contig_11293_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_134669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTCACAAAGATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42874	42449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_42400_42900
793895	contig_6710_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_97980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
793896	contig_5718_pilon	+	3055	1	Intergenic	novelGene_110393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1488	1817	1272706	1273035	NA	40	AAGTTATAGATTTCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCTSQNSLPCLFLVRVGHTRNLREIWKSSSNHAYSLKVMKVRSCCITHVFEHLLNFWHGQQLGPQLLWISSFSFSTSQASYEDWLLLQVICSSKDEGLEMRRGQCGFW	1271218	1274273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1271200_1274300
793897	contig_6361_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_24031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGTATATGTTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641944	641202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_641200_641900
793900	contig_1399_pilon	-	1815	8	Intergenic	novelGene_166666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	29.7115383345272	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1713	103	1815	96384	74452	FALSE	45	GACTATAAGATAGTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEPPNGEAAEIKIIREAYQKAFLFVNKGLNTDELGQKEEAKTYYRQGIGHLLRGISLASTEPEHTGPEWESARQMQQKMKETLQNVRTRLEILEKGLATSLQNDLQEVPKLYPEFPPKEMPEKPPSFGSLLWHAEVNGDTPATSGASASAPGPLPSAPQGRPTEAPPAYTPQAAEGHYTVSYGTDSGEYSSVGENFYRNHSQPPPLETLGLDADELILIPNGVQIFFVNPAGEVSAPSYPGYLRIVRFLDNSLDTVLNRPPGFLQVCDWLYPLVPDRSPVLKCTVGAYMFPDTMLQASGCFVGVVLSSELPEDDRELFEDLLRQMSDLRLQVKDTSSEEMNLSHIVPYEPVSEEKAKELPEWSEKVAQNILSGASWVSWGLVKGAEFTGKAIQKGASKLRERIQPEEKPVEVSPAVTKGLHIAKQATGGAAKVSQFLVDGVCTVANCVGKELAPHVKKHGSKLVPESLKKDRDGRSTLDGAMVIAASSVQGFSTVWQGLECAAKCIVNNVSAETVQTVRYKYGHKAGEATHYAVDSAVNVGVTAYNIDHIGLKAMVKKTAKQTGHTILE	111322	74451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055_82215_83948_84144_87124_87249_92501_92700_95583_96387_111222
793904	contig_9177_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_32763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAACGGCCACAATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318512	1316858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1316900_1318500
793905	contig_13292_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_142970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465101	465857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_465100_465900
793908	contig_7635_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_171373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATAATGATATTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138532	137937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_137900_138500
793912	contig_13201_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_130874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCGAGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79862	80324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_79900_80300
793913	contig_2550_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_135682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	184	543	1374384	1374743	NA	80	AATAAAAAACAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAFYKCLNVIILNTLCNGCTHPTTDCSEIMVQNSSFASFKQESDLVRFVIPNRPLVAVWRVDRQRMRSWPSCSGLFSVQAQQKWQELGYPGHDSEPDLLPALSAESKGQCFFWPRKG	1374200	1377097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1374200_1377100
793914	contig_5947_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_101468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCCATGACTTCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53113	52441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_52400_53100
793917	contig_5880_pilon	-	1978	9	Intergenic	novelGene_151124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_8	46.8959952981062	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	99	1682	224452	164418	FALSE	20	TTTCTTTGATATCCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVTVKTHAYPDQKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIISTVEPALRQEATLVVGGDGRFYMKEAIQLIGRIAAANGIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISSGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYVICPDLKIDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVETYGTMLRNIFDFNALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMKTGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVANATKISLYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDMEALMFDRSFVGKQFSAGDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRNQVGTDLCVCGKETPEGASSLKSQGRKERPLAHISFAALFF	224550	164121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_164722_167818_167955_177259_177376_180301_180457_181729_181921_184511_184638_186266_186414_187133_187297_224206
793921	contig_19769_pilon	+	620	4	Intergenic	novelGene_102322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_1	94.0224559465568	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	142	597	87859	89322	FALSE	10	TTCTCCTGCCACTTAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87505	89345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87609_87820_88040_88841_88958_89163
793922	contig_8616_pilon	+	1677	12	Intergenic	novelGene_72483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	671.415637796504	2	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	291	1322	320431	330491	TRUE	15	CACTTCCTTGACTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEVAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHVQGPKAQRS	318280	331070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318429_320288_320477_322277_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330285_330461_330546_330638_330720_330850
793923	contig_15039_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_110174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTTATTCCTGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331919	332825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_331900_332800
793925	contig_15697_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_173303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAAAAAGAAACTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46551	44762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_44800_46600
793926	contig_5918_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_99612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACTTCAAAATCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2110083	2108239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2108200_2110100
793930	contig_16525_pilon	+	1418	9	Intergenic	novelGene_133883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.4894991178518	681	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	220	1128	214743	217911	FALSE	5	GTCTCGTTCCTGTGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSQTPLQDGSRTPHYGSQTPLHDGSRTPAQSGAWDPNNPNTPSRAEEEYEYAFDDEPTPSPQAYGGTPNPQTPGYPDPSSPQVNPQYNPQTPGTPAMYNTDQFSPYAAPSPQGSYQPSPSPQSYHQVAPSPAGYQNTHSPASYHPTPSPMAYQASPSPSPVGYSPMTPGAPSPGGYNPHTPGSGIEQNSSDWVTTDIQVKVRDTYLDTQVVGQTGVIRSVTGGMCSVYLKDSEKVVSISSEHLEPITPTKNNKVKVILGEDREATGVLLSIDGEDGIVRMDLDEQLKILNLRFLGKLLEV	211595	218201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_211682_212637_212738_214709_214774_214865_214972_215450_215610_215699_215869_215975_216180_217584_217681_217767
793932	SIRV4	-	184	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	430	3	-430	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGAAGCCATGTCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
793938	contig_13780_pilon	-	2093	15	Intergenic	novelGene_149084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	1608.14844096037	1	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	175	1971	699220	657588	FALSE	25	GAATGAGCGCACGCCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727462	657465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438
793940	contig_11285_pilon	-	1529	4	Intergenic	novelGene_5497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	9.67241208569794	402	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	65	808	508480	505872	FALSE	0	TTTGGCTTTGCTTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLIMQLGSVLLTRCPFWGCFSQLMLYAERAEARRKPDIPVPYLYFDMGAAVLCASFMSFGVKRRWFALGAALQLAISTYAAYTGGYVHYGDWLKVRMYSRTVAIIGGFLVLASGAGELYRRKPRSRSLQSTGQVFLGIYLICVAYSLQHSKEDRQAYLNHLPGGELMIQLFFVLYGILALAFLSGYYVTLAAQILAVLLPPVMLLIDGNVAYWHNTRRVEFWNQMKLLGESVGIFGAAVILATDG	508544	505150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_506181_506861_507009_507875_508057_508373
793942	contig_2596_pilon	+	1208	5	Intergenic	novelGene_53488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	82.6630963610728	583	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	470	1036	729054	739418	FALSE	30	TAGCAGTTTCAAACTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFTVASAVRAASGILRPLNILASSAYQTYAKKACLISALSTRCFSHIQMPVVSSAPRLTTPVGNLTCRHTTIILNRVAPLLPNILKLPVRTVTYFSSRKGKRKTVKAVIYRFLRLHSGLWLRRKAGYKKKLWKKTPARKRRLREFVFCNKTQSKLLDKMTTSFWKRRNWYANDPYQIYHDRTNLKV	722725	739590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_723162_729020_729097_735202_735393_736062_736208_739229
793944	contig_6418_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_81168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGCTAAGTGTTTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541924	540780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_540800_541900
793945	contig_6418_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_81167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539071	538474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_538500_539100
793946	contig_14029_pilon	+	981	7	Intergenic	novelGene_151948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_3	266.582069914689	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	24	311	131739	133480	TRUE	45	CACACAAGAAAGTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVQKGFQMLGDPGCFDPSAFMLLLRAAFQSLLDAQADEAVLDHPDLKHIDPVVLKHCHAAAATCILEAGKQRADKSTLSTCLEDCKFDRERIELFCTEYQVT	131715	135618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133298_133407_133600_133959_134021_134104_134162_134258_134319_135245
793952	SIRV6	-	267	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1008	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2828	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779
793955	contig_610_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_76651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	6	21	343	363	21140	21120	NA	30	GGGCACCTAACTCAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIIHVPKKHIVLWIRETCEQTYSKCPLGPHPHQRQDRTSVPPQASSGPLVIYVGTQRNAPHGPPKQPGSHNHHGPILLILSLLFWFQSYTPAASRVTWQKPPPPALPTLITSISMSRVLA	21482	20369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_20400_21500
793957	contig_5918_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_99511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATATGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450152	451482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_450200_451500
793959	contig_6710_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_98062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGAAGGAAGCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653428	653882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
793960	contig_8476_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_121354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTATATTTGCTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206315	207920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_206300_207900
793961	contig_7286_pilon	-	871	7	Intergenic	novelGene_108690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4992.98722932697	22	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	54	803	293122	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGTPEEAGPLSVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293175	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289380_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
793962	contig_6829_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_123770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAATGTAATCTGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57288	58434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_57300_58400
793965	contig_6163_pilon	+	1333	3	Intergenic	novelGene_103834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	20.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	165	386	375051	378191	TRUE	20	GAAGCTTTCCTCTCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGGAESVEQRWACKTGRGLAGRSRPCLCAPSQGQEQLQSRLVPPYPSPRPWSSMFSRAPVRRVLQWVPGKERLGIYRFLPFFFVLGAAMEWIMIKVRVGQETFYDVYRRKASERQYQRRLEDAPGD	374886	379445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_375202_378120_378252_378558
793968	contig_10581_pilon	-	1748	10	Intergenic	novelGene_41386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	65.1937283963897	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1091	1648	580514	577593	FALSE	20	TAGAATCTCCCAGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEQFVDAVNSAFWSDANHTDFVDSVGTMLQHAIALLKPSKVSARQLPPSVARVDAKSRVLFPLGLGHAAEYVRPRVALIGDAAHRVHPLAGQGVNMGFGDISSLVHHLSTAAFNGKDLGSMSHLTGYETDRQRHNTALLAATDLLKRLYSTSATPVVLLRTWGLQATNAVSPLKEQIMAFASK	584609	577492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_577623_578126_578294_578476_578593_578669_578873_580472_580581_580767_580831_580918_581027_581916_582016_583483_583520_583891
793973	contig_12250_pilon	+	1272	6	Intergenic	novelGene_80517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	8.58836422143356	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	58	942	61723	64563	FALSE	10	GCTTCGACTCATCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLVGGGTGFIGTALAQLLKARGHEVTLVSRKPGPDRITWDELARSRLPRCDAAVNLAGANILNPLRRWNEAFQKEVLSSRLETTQMLASTISKAPQPPKTWILVTGVAYYQPSLTAEYDEDSPGGDFDFFSSLVTKWEAAARLPGDSTRQVVVRSGVVLGRAGGAIGHMLLPFRLGLGGPIGSGHQFFPWIHISDLVGILAHALEARHVQGVLNGVAPGPTTTNAEFAQALGAALGRPAFIPLPSTVVKAIFGRERAIMLLEGQKVVPRRTLATGYQYSFPKLGAALKEVVA	61665	64893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_61739_62039_62147_62225_62309_62687_62810_63712_63857_64150
793978	contig_5485_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_37718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAGTACAGAAGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185455	187172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_185500_187200
793979	contig_13760_pilon	-	899	4	Intergenic	novelGene_61347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	182.93411078552	1851	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTCTCTGTGCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355726	352846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354458_355293_355384_355695
793982	contig_2689_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_100841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249239	251711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_249200_251700
793983	contig_16261_pilon	-	379	2	Intergenic	novelGene_155299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	27	377	46215	45642	FALSE	20	TACCACAGTGCTTCAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQSGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAEDAAVYYCLYGYGYSY	46241	45639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
793984	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
793986	contig_11978_pilon	+	706	5	Intergenic	novelGene_63086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4482.20963225729	8	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	295	621	1830693	1831883	FALSE	20	GCCTCTCAGCTTTTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829077	1831968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830127_1830634_1830785_1831161_1831273_1831759
793990	contig_4442_pilon	+	1124	9	Intergenic	novelGene_127950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_8	214.353060101786	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	110	934	303978	397305	FALSE	20	TCTATTATATTTTGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKFSPEAASRRGLSTAEMNAVEAIHRAVEFNPHVPKYLLEMKSLILPPEHILKRGDSEAIAYAFFHLAHWKRVEGALNLLHCTWEGTFRMIPYPLEKGHLFYPYPICTETADRELLPSFHEVSVYPKKELPFFILFTAGLCSFTAMLALLTHQFPELMGVFAKAFLSTLFAPLNFVMEKVESILPSSLWHQLTRI	301629	397495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_397209
793992	contig_13863_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_42053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAGAACCAAGATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336983	339092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_337000_339100
793994	contig_11720_pilon	-	2306	3	Intergenic	novelGene_44036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	55	68	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	45	1889	478329	474918	FALSE	35	CTTAGAGACACGTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKREAPQAQPVASPMNSGDSAPLSNGSTESSPGDGGAALVLRQKGARFSCPTCPFSCQQERALRTHQARGCPLKSGELVCDLCPFTAPAAAALRLHQKRRHPTAGPARGPRPPLQCSDCSFTCKQSRCLQQHQRLKHEGVKPHQCPFCDFSTTRRYRLEAHQSRHTGVGRIPCSSCPQTFGTNSKLRLHRLRVHDKTPTHFCPLCDYSGYLRHDITRHVNSCHQGTPAFACPQCEAQFSSETALKQHTLRRHPEPTPPAPGSPTEATEGPLHCSCCGLLCPSPASLRGHTRKQHPRLECVACQEAFPSRPALDEHRRQQHFSHRCQLCDFAARERVGLVKHYLEQHEETSAAASDVDGDTSQPPLRCPFCDFACRHQLVLDHHVKGHGGTRLYKCTDCAYSTKNRQKITWHSRIHTGEKPYRCHLCPYACADPSRLKYHMRIHKEERKYLCPDCGYKCKWVNQLKYHMTKHTGLKPYQCPECEYCTNRADALRVHRETRHREARAFMCEQCGKAFKTRFLLRTHLRKHSEAKPYVCNVCHRAFRWAAGLRHHALTHTDRHPFFCRLCSYKAKQKFQVVKHVRRHHPDQADPNQGVGKDPTTPTVHLHDVQLEDPGPPAPAAPPTGPEG	478373	474500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_475388_476295_476402_477060
793997	contig_401_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_42877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAACTGAAGTAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764225	1763299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1763300_1764200
793999	contig_6929_pilon	+	689	3	Intergenic	novelGene_139372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4374.5	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	121	348	130770	131975	FALSE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIGSGSGERTPESPEQPHRALLAKDSLERTATKRIRKIKMRPKVSSHLNVGTAATSITDADAQKTLNHKMAKRQKQPIHQLRIRPLPRLSRAGLSKCRLTISTIIRFSHPTRRI	101616	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101675_130707_130971_131948
794001	contig_7695_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_41528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGTGCTCAAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350932	351792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_350900_351800
794004	contig_12623_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_138171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTTCTACTCTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147132	148079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_+_147100_148100
794005	contig_3469_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_34223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAGAAATTGAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575241	573413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_573400_575200
794006	contig_12624_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_60966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10697	11418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_10700_11400
794008	SIRV4	-	409	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1114	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794014	contig_3277_pilon	+	1252	10	Intergenic	novelGene_74727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	549.89267190724	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	398	1105	258281	265230	FALSE	75	CAGAAAAGAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPR	190997	265377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_191077_240767_240801_240912_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618_263687_265054
794016	contig_6726_pilon	+	1437	13	Intergenic	novelGene_86232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	613.618926940817	2	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	536	1192	308170	331590	TRUE	25	AAAATTGGCCGTGCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLMQSHPISK	287830	333154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300349_301440_301535_308103_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331563_331677_332995
794018	contig_11719_pilon	+	1319	3	Intergenic	novelGene_154776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	27.5	349	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	380	727	159659	160006	FALSE	5	GGGGTGTGGTTGATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSPPDTSLKFPTRSGLCFPARASPHPLGRGHCRNGHVFLEPLLTLRARKYPCLGEWRLGSQVSNRKVGSCAEPPISPGWTGFATTCSPCTATTLLRSCTRLSKSSCLMWETPR	157989	160598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_158045_159129_159328_159532
794021	SIRV6	-	685	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAATGCCGTTTCGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11111_11198
794022	contig_8161_pilon	-	1127	2	Intergenic	novelGene_156740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTTCACTGGCTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197307	195178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_196092_197093
794023	contig_6276_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_174119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGATATTTCATGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110271	109006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_109000_110300
794025	contig_10176_pilon	-	1692	10	Intergenic	novelGene_72734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	5	ATCCTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
794028	contig_3233_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_56500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTACCTTTGCGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56454	57345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_56500_57300
794034	contig_16259_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_174364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGATTGTTAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9336	7270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_-_7300_9300
794035	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794039	contig_20890_pilon	-	1269	5	Intergenic	novelGene_147042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1129	junction_1	472.36446468802	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	155	670	42692	21744	FALSE	10	TGCTCGATAGCTTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFTDVVTTNLKLRNPSDRKVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDPGLTVTVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQTIFAPPNTSDMEAVWKEAKPDELMDSKLRCVFEMPNENDKLNDMEPSKAAPLNASKQDGPMPKPHSVSLNDTETRKLMEECKRLQGEMMKLSEENRHLRDEGLRLRKVAHSDKPGSTSAASFRDNVTSPLPSLLVVIAAIFIGFFLGKFIL	45626	21144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_21903_29614_29789_42125_42207_42590_42695_45474
794041	contig_11816_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_98588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAACATATCTGGCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367416	1366974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1367000_1367400
794042	contig_5832_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_134166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTCACCTCCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553876	555260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_553900_555300
794044	contig_14744_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_66099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGGACAGACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477324	1478809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1477300_1478800
794047	contig_3414_pilon	+	2746	1	Intergenic	novelGene_80980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGAGACAAGGGACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77826	80572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_77800_80600
794050	contig_12756_pilon	-	1967	6	Intergenic	novelGene_153211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	233.296035114187	21	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	999	1625	153039	150438	FALSE	40	AAATAAAGACAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFTTSQTDVYADHLDWHYRQNRTEKDVSRKVTHRRWYYSLTDWIEFEEIADLEERAKSQFFEKVHEEVVLKTQEAAKEKEFQSVPAGPAGAVESCEICQEQFEQYWDEEEEEWHLKNAIRVDGKIYHPSCYEDYQNTSSFDCTPSPSKTPVENPLNIMLNIVKNELQEPCESPKVKEEQIDTPPACTEESIATPTEIKTENDTVESV	258377	150095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_150654_151334_151371_151864_151958_152356_152513_152913_154020_258359
794051	contig_5628_pilon	-	2571	9	Intergenic	novelGene_157582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_8	66.2833642402074	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	191	784	434334	427956	TRUE	15	TGTGTGTGTGTGTGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEGVNKKELASVSNLETGFENSTPGAVPRAHMLEDKSHQPGYRPPQTPEPWENYSLGESLGSEPRTVSRRYLSSLKNKLSSGAWRKSYQPETGPGSGTQEPKERIVQELLETEQAYVARLHLLDQVFFQELLKEARSSKAFPEDVVRLIFSNISSIYQFHSQFFLPELQRRLDDWTATPPHWRCDPEAGPLPEDVQ	434809	418143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_418448_425662_426621_426878_426938_427489_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266_434416_434700
794055	contig_20892_pilon	-	1886	2	Intergenic	novelGene_174936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATTGTTATTGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21876	14456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20892_pilon_-_14954_20487
794056	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
794057	contig_10986_pilon	-	959	9	Intergenic	novelGene_71471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	165.307100573448	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	72	557	80340	67474	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVHYEGVQIRRQPSAHFHGRLGPGVGCPAGLPHH	80411	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70674_74322_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
794058	contig_12622_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_5780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCCGACCTCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145349	145993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_145300_146000
794071	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
794073	contig_4315_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_46870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1586	1918	864634	864302	NA	25	ATTCTCCCAGCAACACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIQVVKGLPGTILVAGEECGRAAASLLLPLERLKTSRDLAPIRWIDLYLDCPAPRVCLFFVFPAKGSAPAQGVNHFSDRYRPICTPFTLNTHHSKPTVKLTAFLLHQS	866219	863785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_863800_866200
794077	contig_5231_pilon	-	2226	3	Intergenic	novelGene_65885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	5	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	244	588	158754	129321	FALSE	60	TGCAATGAAAAAATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKELPDHYKPWMEIVNKLPHLIESHQLRAHVNKMPLLNCHFLKSYREQRLAHLVLSFITMGYVWQEGETQPEQVLPRNLALPFVDVSRNLGLPPILVHSDLVLTNWTKRNPEG	158997	127682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_129444_132042_132163_158652
794080	contig_6557_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_33042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTAATACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676883	677359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_676900_677400
794082	contig_16535_pilon	-	1567	13	Intergenic	novelGene_167711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCCACGCCCTGGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364427	359906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_359950_360403_360455_361032_361125_361204_361382_361810_361954_362079_362217_362301_362406_362480_362577_362664_362850_362936_363105_363321_363437_363504_363600_364266
794083	contig_10434_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_82019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAATAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99500	100859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_99500_100900
794084	contig_18108_pilon	-	1222	9	Intergenic	novelGene_33515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	361.080583111305	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	151	1014	297156	266909	FALSE	20	GTTAGCCAAGTGTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	335413	266700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270009_289360_289454_296016_296172_296960_297166_316667_316759_335363
794086	contig_6192_pilon	-	2159	6	Intergenic	novelGene_170326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_5	238.644002648296	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	80	1705	123448	117771	FALSE	65	TTAGAACAGAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVPAIKPSREEFLSSRMLMPQDIMAYRGREVVDNTLPLRNAPGCESRTFPPSLYSGLSTPPASYPMYSHLPVSSFLFSDEELRDARMPMANPFPKERALPCDSARPVPSEYSRPTMEVSLSVCHNNIYSPKEAAPEDARSDMHYSVAEGPKPAAPSARNPPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQTSGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQGELGRLSPRTYTAPPACQPPMEPDNLDLQSPTKLSIGGEDSTIPQASRLNNIVNRSLTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHTEMCLHAAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCGESLACPSLAREKEAPCLCSTGLGFPFY	135717	117316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_118042_118177_119150_121262_121485_123287_123460_124896_124936_135688
794087	contig_3463_pilon	+	1021	4	Intergenic	novelGene_61984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	4.92160768674447	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	111	689	71260	129381	FALSE	65	ACACCATATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNVLQGQHEADKIWSKEGFYAVVIFLSIFVIIVTCLMILYRLKEKFQLSLRQDKEKNQEIHLSPIVLQTTQSEAKTVNSMVQPEQAPKVLNVVVDPQGRCTPEIKAATSACPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLGNVEPFVAIPTPREKVTMEYLQSASRILTRSQLRDVVTSSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPSKFLKLNSLYCKT	71149	129713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_71263_83061_83325_126620_126808_129255
794088	contig_2798_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_120006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105117	107491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_105100_107500
794091	contig_1442_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_172164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGGCCTAAAGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476069	475606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_475600_476100
794093	contig_9833_pilon	+	2541	8	Intergenic	novelGene_68492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	6.68534797531291	37	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	30	1223	205190	218991	TRUE	15	CAGCCCCTCTGTCTTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQTGKLTEFMSNLAWDFAVKEGFRVFKKMPATKPLLRSFHTRASPQTLLSITGMRSYSSFPEPSPTCASKGALVISPEGLSQPVRELYHRLKQFIEQHVYPVEQELRSHQASADRWTPSPLIEDLKEKAKAEGLWNLFLPLETDPEKKYGAGLTNVEYAHLCELMGSSLYAPEIFNCSAPDTGNMELLVRYGTKEQKARWLVPLLEGRARSCFAMTEPQVASSDATNIESSIREENGCYVINGRKWWISGILDPRCQLCVFMGKTDPQAPRHQQQSVLLVPMDTPGIKVIRSLTVFGLEDAPGGHGEVLFEDVRVPKEHIVLGPGRGFEIAQGRLGPGRIHHCMRLIGLSERALALMKARVKSRSGLRETPGGAGHAPGRHCSVTSGDRADPAAGAQSCPPHGHGW	205160	221181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_205541_207642_207784_208932_209071_209190_209282_210404_210564_211205_211379_218850_218996_219867
794094	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_97467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
794098	contig_10404_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_138635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCAACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422111	419491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_419500_422100
794100	contig_20739_pilon	+	2717	1	Intergenic	novelGene_83180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGGAATGCAGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133584	136301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_133600_136300
794101	contig_5620_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_161336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTAGTAGGGTGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173615	172605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_172600_173600
794104	contig_9752_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_122005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGCCTCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43035	42364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_42400_43000
794106	contig_2463_pilon	-	2015	2	Intergenic	novelGene_42999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	14	517	136539	135381	FALSE	50	ACTAGCCACATTAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLVRLGRVPYTEVLALQEQWLRQLQTEPDTEARPRIEVGALLLSEPAGPVYTAGLRGGLTPEEAARLRALGAEVRATGRGGLATFHGPGQLLCHPVLDLRRLGLRLRTYVAALEACAVRLCELQGLPAARARPPTLYRRLAGSPLWKAHHISRLGSELLYGPDVV	136552	133882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_135454_136108
794107	contig_6102_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_32004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCCAAACACAGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448644	452181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_449694_449732_449894_450748_450854_451253_451388_452090
794109	contig_18859_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_150546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTGTAGGCGTGGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103882	101901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_101900_103900
794110	contig_7119_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_41045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTCTAAGTCTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520912	522720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_520900_522700
794111	contig_2933_pilon	-	1132	3	Intergenic	novelGene_111358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.5	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	140	1120	850204	848373	FALSE	10	GATCTTTCCGCGTACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPRFFKNLHFAVWTHCLLHCWHPLSSVLILFFKINIFQIFNMTYGERGME	874216	848360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_848520_849370_850290_874162
794112	contig_10609_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_123971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCTGTCCTACCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608419	608852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_608400_608900
794115	scaffold_880_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_121458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACTGTGACATCACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456039	454952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_455000_456000
794117	SIRV2	-	213	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	708	27	708	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4024	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
794118	contig_11017_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_128058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACTGCCAAAACTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59486	61029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_59500_61000
794120	contig_11855_pilon	-	1021	2	Intergenic	novelGene_67130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2675444	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674293_2674641
794122	contig_10299_pilon	+	999	8	Intergenic	novelGene_79702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	68.8019933266056	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	44	826	320559	336895	FALSE	20	CCCCCTTACCTATAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPFGAAQPSPAPVMDCYTANWNPLGDSAFYRKYELYSMDWDLKEELRDCLVAAAPYGGPIALLRNPWQKEKAASVRPVLEIYSASGMPLASLLWKSGPVVSLGWSAEEELLCVQEDGAVLVYGLHGDFRRHFSMGNEVLQNRVLDARIFHTEFGSGVAILTGAHRFTLSANVGDLKLRRMPEVPGLQSAPSCWTTLCQERAAQILVAVGPDLYLLDHAACSAVTPPGLAPGVSSFLQMAVSFTYQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320515	337068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_334250_334349_334435_334565_334643_334789_334912_335029_335130_335194_336805
794123	contig_7378_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_120237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAATGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157894	157440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_157400_157900
794124	contig_18869_pilon	+	2006	8	Intergenic	novelGene_56434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	69.8087767126917	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	16	1752	116141	132291	FALSE	25	ATGTATTGCCATCCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEVPGSVATAGGSCNTEAMDRVLSVLLVPIPAEATGRLGPRAQLHREQEVLGSLTAAGSLQVLSLAPGGGGNCSLEGPFRQFVWENSPNRSTPTDKPKLLILSKKYELFIYEFNLKDGRCDSTILFSCNGETLQKLIEDQSMSISLSSLRILSFHNNTSLLFINKHIVLHVLFPEGDAEIRVLNSFTLDLAAPAVGGIVDTQLCRGILFVLNSLGWIYIFDVVDGTHVARVDLALHQEDVWDEQQPEPAEVSSFTSLKVSQDLDVVVVVSSSSSALALNLNLYFRQHPGHLLRERRLEDLPIQGPKGIDEDDPVNSDYNMKLTKFSFQVDRSWKAQLSSLNETIKIPKPEVSHCTPWFQDYLHLESFESGNHGTNVLSWAFMPQDTCGQYSFPRKDGHAKTSDPERSWKIVHVSDEEEAAELECVSVTGFTALFTQATERKGCTIILWDLETQGMQCFSLGKIRIPIESDGDQQLCLVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDSLCHLNAWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVDFFLKSKENLLNPSSNSSALDQFDHFPSDLYLRSK	116125	132545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116392_118630_118816_119693_119919_121690_121893_127625_127764_128533_128983_130281_130428_132150
794125	contig_6658_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_168408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1781	2086	209947	209642	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNHCAIRQEIFPLVTDSNEGTRECSISIRNHFLTKKRTKRHRRQGYLDVMDGNSCCCSAVEGQNDAEKQSMKDSYGPGTHSCPCHPPSNNQSRENQLIKK	211727	209486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_-_209500_211700
794127	contig_16970_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_157598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67233	69288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_67200_69300
794128	contig_7733_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_147145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCATGTATGTCTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125999	127015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_126000_127000
794129	contig_2987_pilon	-	1355	6	Intergenic	novelGene_125863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	199.11966251478	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	26	820	545497	535740	TRUE	10	TTCCTCCTCAGTTCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQQPPSPTGR	545522	533361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_535550_535683_535767_538273_538325_539478_539678_544979
794131	contig_6929_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_139371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGATCAAGAGACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94527	96393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_94500_96400
794132	contig_9931_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_134824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCGCTCCTCGGAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309340	307906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_307900_309300
794134	contig_6164_pilon	-	985	6	Intergenic	novelGene_121274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	107.382307667511	508	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	56	832	486686	475276	FALSE	15	GTTATCTGTCTTTATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGFSLNDALTGSRNPNPQGWPGAWGNQPAGPGGYPVASYPGAYPGQAPPGAYPGAPPSGTYPGPAPPGAAYPGPAPPGAAYPGPAPPGAAYPGPTAPGAYQSGAGAYPAASPYGGLAEPLTLPYDLHLPGGIMPRMMITILGTVKPNANRIALDFMRGNDIAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKQDNVWGREERQNAFPFESGKPFRIQVLAEADHFKVAVNDAHLLQYNHRMRNLGEIRKLAISGDIILTSASHAMI	493177	475122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_475432_481538_481705_483551_483641_485555_485904_486668_486691_493126
794135	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_94587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
794137	contig_8576_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_88826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTAATCGTTCCTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021344	1020551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_1020600_1021300
794138	contig_16620_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_156006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGCCAACAAGGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36787	37982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_36800_38000
794144	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794146	contig_18081_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_23766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTCACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48812	47404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_47400_48800
794147	contig_10689_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_118633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTCAGAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55963	54380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_54400_56000
794149	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_2958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
794152	contig_13760_pilon	-	2276	5	Intergenic	novelGene_61333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	17.5	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	71	772	310593	304082	TRUE	0	CTCTGGCTTGCTTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSLPPGPTAGRWPPPLSRRRREMSSSKEQRSVVFVVLFALITILILYSSNSANEVFHYGSLRGHSHRPINLKKWSITNGYVPLLGNKTLPSRCHQCVIVTSSSHLLGTKLGPEIERAECTIRMNDAPTTGYSADVGNKTTFRVVAHSSVFRVLRRPQEFVNRTPETVFIFWGPPSKMEKPQGSLVRVIQRAGLVFPNMEAYAVSPSRMHQFDDLFRGETGKDREKSHSWLSTGWFTMVIAVELCDHVHVYGMVPP	310663	301681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_303177_304072_304182_306725_307133_309563_309744_310578
794157	contig_7157_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_131292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATTACTGGGGATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876693	875225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_875200_876700
794158	contig_3426_pilon	-	1488	9	Intergenic	novelGene_57910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_2	110.512442738363	494	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	169	1224	179690	145330	FALSE	25	GTAAGTTAAATCTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKAPQGKNQRPFVFILEPKKQGDPPVEFATDSVEDLFEWFQSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVETKADSIVRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKYMQLNHALFSLNGRTGYVLQPESMRIENYDPLPPEPQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSIACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPVWASTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKGIKSGFRSVPLKNGYSEDMELASLLVFCETRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNTNRDRDALVREFNVNENQLQLYQEKCNRRLREKRVSNSKFYS	184437	145065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278
794159	contig_17106_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_127666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGCCCTGGTGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54002	51926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_51900_54000
794160	contig_18231_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_105893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270352	272448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_270400_272400
794162	contig_9297_pilon	-	1664	9	Intergenic	novelGene_69886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	9.55820982192795	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	745	1656	927198	914923	FALSE	25	ATGTTTTATTACTTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGTHQWNLATWEGLLPRYEHASFIPSCTPDSIWVFGGAHQSGNRNCLQVLNPETRTWTTPEVTSPSPSPRTFHTSSAAIGNQLYVFGGGERGAQPVQDVKLHVFDANTLTWSQPETLGKPPSPRHGHVMVAAGTKLFIHGGLAGDKFYDDLHCIDISDMKWQKLSPTGAAPTGCAAHSAVAVGKHVYIFGGLAPTGALDTMYQYHTEKQHWTLLKFDTFLPPGRLDHSMCIIPWPVTSSEEEDSNSVPLNCEVQKEDFADKGVIQVDDSQESQADILLCFVFGGMNTEGEIYDDCIVTVVD	935204	914914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_915210_915483_915634_917329_917480_920216_920379_924278_924432_927188_927348_930417_930483_933831_934296_935138
794166	contig_8291_pilon	+	2662	1	Intergenic	novelGene_99940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29133	31795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_29100_31800
794167	SIRV2	-	194	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	1081	4	-1081	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACATACCAAATGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	4746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
794171	contig_10235_pilon	-	1253	8	Intergenic	novelGene_46574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	59.6865964511159	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGAGTTGAAGGAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546950	537166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537822_538324_538410_538548_538661_538883_538955_539167_539250_539463_539531_546402_546465_546831
794183	contig_14322_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_116553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGCAGCGAGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674887	674685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_674700_674900
794186	contig_8019_pilon	+	2280	10	Intergenic	novelGene_126983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	19.946842938417	5	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	768	1526	231796	259414	FALSE	40	ATATTGATTCTAAGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKIEAELAKQRAQHLVEFEEQALLFKEEAKLILDTEKEKYQEMIQKYQKEQEELQMKISDLIEGATRDLRLEVVTLQEKLCESQVRYTQESESKEKEIENLRSLVAEFESRLKKEIDSNDSMSEDLRKGVKQKSDELERVLLAQTQLMEQFNQSQEEVGFRWPYHCS	97769	260168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_97863_152433_152554_195244_195431_215116_215199_220522_220694_231345_231424_231758_231963_240500_240595_251912_252078_259081
794189	contig_20013_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_174939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACTGTGTAAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48524	47943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20013_pilon_-_47900_48500
794191	contig_5649_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_82469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCACTAGACCCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1567446	1568111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1567400_1568100
794195	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	53	514	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794196	contig_6654_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_85780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1826	2131	759092	759397	NA	20	TTTGGAGATGTGTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCCGILKAQYSLLEKLWWDCLNVEQRFLYPVPASRDLQFLYILLCMMPCVRPLHLSIGQRVLCPGYRPNVSVTPENVLSPSHREDFPISRPCLLSINPCI	757266	760135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_757300_760100
794197	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794200	contig_15293_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_146541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCAGGTTGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138539	137674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_137700_138500
794207	contig_21203_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_84468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAATTGCAGAATGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13673	15506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_13700_15500
794208	contig_9313_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_86488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATATTCTGAAAATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462780	464812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_462800_464800
794209	contig_6375_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_72994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	307	648	306081	305740	NA	70	AAAAAAAAAAAACCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFHQVLGDCVELGGGLALRCSGSCIVCLGVRGAAASAPFVLAAADVGVLREALTASAFTWALQVTAGVAGPCQGRCRQTPWFQLMGLPGRWWLHPEPAQVRAECSSGSYV	306387	304910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_304900_306400
794212	contig_17829_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_157046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGCAATATGTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112555	110965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_111000_112600
794214	contig_10109_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_131331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182693	183803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_182700_183800
794215	contig_6102_pilon	-	656	6	Intergenic	novelGene_32191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1519.62921793443	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	136	546	896355	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTESDSDESVPELEEQDSTPAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	896972	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896699_896911
794217	SIRV6	+	154	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	788	54	788	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11025	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
794222	contig_7056_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_43751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGTTAAAAAATTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181420	1182316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1181400_1182300
794226	contig_20742_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_150670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAGGGGACAGGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205534	206368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_205500_206400
794227	contig_9571_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_136308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTTCCTGTTTCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585391	584368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_584400_585400
794229	contig_730_pilon	+	1782	16	Intergenic	novelGene_155623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_15	7.48153281977252	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	77	1495	223583	231431	FALSE	20	TAATTCTATCTCTGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAGCGVPEPKSELLPILELRGTERMELQDPKMNGALPAGAVGYRQEHEGFLPSHSPAPGRKPTQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMAHTGVLFFLALLLCIALLSSYSIHLLLTCAGVVGIRAYEQLGQRAFGPAGKVVVAAVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLGMEPEGDWFLKGNLLIIIVSVFIILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLISVIYKKFQLGCAVGRNETAMESEAPLDHPTQGLNRSCEAQMFTVDSQMSYTVPIMAFAFVCHPEVLPIYTELCRPSQRRMQAVANVSIGAMFCMYGLTATFGYLTFYSSVKPEMLHTYSQKDLLILCVRLAVLLAVTLTVPVVLFPIRRALQQLLFPSKAFSWPRHVAIALVLLVLVNVLVICVSTIRDIFGVIGSTSAPSLIFILPSIFYLRIVPSEVKPLCFWPKVWALCFGALGVLFMVISLGFMFANWATGQSRVSGH	222269	231718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_+_222345_223581_223636_223714_223791_224403_224520_224611_224686_225435_225529_225655_225735_227761_227845_228133_228193_228287_228426_228632_228713_229241_229343_229581_229698_230455_230601_230699_230804_231329
794232	contig_10323_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_123541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCTCTTTCCCCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252062	250916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_250900_252100
794236	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
794238	contig_8156_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_98906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGATGTTTATGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91588	90980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_91000_91600
794240	contig_9363_pilon	+	1906	6	Intergenic	novelGene_6501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	23.8293936137704	144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	364	945	452827	486456	FALSE	5	TGGTGTTTCTGTGGGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDVDWRSSLAYAKRFGRQLPGQLTEGDPYLCPFQRQLSVNTRILPLVKDQAVDAVLLTARWKELLSFEDVAVFFTKEEQENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDLPRARNRKATRSACPGSEARHKMKKLTSLQKISEELVSYEVSVVKQEKAKKTSEKLYKCNEL	446597	487417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_446841_452706_452947_455011_455090_482124_482252_485034_485149_486313
794242	contig_14722_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_110219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATAATAATAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76308	73990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_74000_76300
794243	contig_5566_pilon	+	2587	4	Intergenic	novelGene_153674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCGCGCAAGGGGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203546	212951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_203579_207287_209614_209854_209949_212816
794244	contig_5671_pilon	+	1553	4	Intergenic	novelGene_79454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_3	2222.40605350747	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	544	864	370430	493592	FALSE	30	GCAGCACATAATTTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKKMKN	369886	494281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_493577
794246	contig_7730_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_156274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAATGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182339	182957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_182300_183000
794247	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
794248	contig_12090_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_80513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGCAAGCTTTGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335227	336326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_335200_336300
794249	contig_10197_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_115325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGATCCTTTCTGTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614481	1612972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1613000_1614500
794250	contig_10197_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_115324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAACTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612778	1611388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1611400_1612800
794252	contig_2703_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_101794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGACTTGAATCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613528	612275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_612300_613500
794253	contig_4364_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_1038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTGGCTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
794256	contig_7457_pilon	+	1381	9	Intergenic	novelGene_31728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.9146122768992	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	96	1121	1326270	1330119	FALSE	5	TTTTTGATTCTGGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFTMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIREWHLKQSPTSPEHDYSNYYKTIEELRGKILVATTDNNRVILEIDNARLAADDFRLKHENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLVKTDLEMQIESLNEELVYMKKNHEEEMKEFSNQVAGQVTVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDAEEWFNNKSAELSKEVTSSVTMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLESTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEQQLSDLRSEMECQNQEYNVLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMTGFTSGGGKVSTTTTTTTSRLTSETRRT	1326174	1330379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1326276_1326538_1326719_1327741_1327825_1328016_1328174_1328339_1328502_1328612_1328739_1328829_1329051_1329704_1329731_1330054
794266	contig_6241_pilon	+	861	6	Intergenic	novelGene_156446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	85.6084108017431	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	5	859	553729	604567	FALSE	50	AGTAACAACGAAAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMVNTGSWYTVAHMSVLTNNNTSKIFVCGVESQAKDPDLKNLFTKMGCKNIEILHETFINIESKDHRLQKVKVILLLPRCSGLGVSNPVEFILNEHEDTDLLKDFSQGRISEDKLHVLAQQQYEQLTHAMKFTKAQAVVYCTCSVYPEENEAIVKKALEFQDPGIKVQPYRLSPPVLPLCSLKEIHLSTDKFFRMEPSEITNGCFLSILTRERDPSETVSVKDVLARAAAKGLLDGIELGKSSKREKKKKKSKTSLPKASTNDNCIQMRIAEFLNREAKANANQSE	553724	604569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_553874_562986_563131_567817_567920_579532_579651_603752_603877_604345
794267	contig_5954_pilon	+	1234	5	Intergenic	novelGene_28571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	40.9023226724351	437	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	63	365	889079	894044	TRUE	5	CGCCGAGTGTCCTCTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGDCRPGSRGPRARAWAQSMFQIPEFEQSDREDSSPADRCLGPSPKRGRPSGPRNRHHASPGPLGDASHQQGQPTSSSHHGETYGTRRKEEHAVGEAARHPTLGQTARVQPQLSCLLGG	888743	900182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_888798_889070_889266_893928_894055_897858_898050_899514
794268	contig_5484_pilon	+	2006	12	Intergenic	novelGene_151079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_8	211.53027644108	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	622	1923	48767	342119	FALSE	80	ATTAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHPWTKDSSGTGHFTSGVRVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANAGDRGQTNNAASASASNST	48145	342202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_48855_137525_137720_201596_201681_238751_238863_246565_246697_250578_250686_263868_263967_302319_302416_316023_316063_318738_318926_333538_333638_342051
794269	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1167	0	1167	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794270	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	8	1158	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794274	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_95386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	50	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657179	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657180	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
794276	contig_2799_pilon	-	872	2	Intergenic	novelGene_85576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCTTTTTCTTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767355	766357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_767147_767272
794279	contig_10727_pilon	+	2575	1	Intergenic	novelGene_159651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76827	79402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_+_76800_79400
794284	contig_11028_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_163966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGCCCAGTCCTGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940512	939054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_-_939100_940500
794285	contig_14838_pilon	-	1611	4	Intergenic	novelGene_151908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_3	65.2192882171797	3	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	76	1419	112817	109062	FALSE	10	CATTGTGGTCTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRSPPVCSVPTASQGLPPPLRSRTMREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112892	108869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_110129_110895_111007_111351_111461_112760
794287	contig_6710_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_97969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	657170	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657172	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
794295	contig_7202_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_17521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27911	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
794296	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
794303	contig_1213_pilon	+	2270	11	Intergenic	novelGene_76482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	1.85741756210067	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	145	1677	153344	286589	FALSE	20	TTACAGGATTTGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAASGFYLYSNKYLDPNDFGAVRVGRAVATTAVISYDYFTSLRSVPYGSEEYLQLRSKVHLRSARRLCELCCANRGTFIKVGQHLGALDYLLPEEYTSTLKVLHSQAPQSSMQEVRQVIREDLGKEIHDLFVSFDDTPLGAASLAQVHKAVLRDGRTVAVKVQHPKVQAQSSKDILLMEVLVLAVKQLFPEFEFMWLVDEAKKNLPLELDFLSEGRNAEKVAQMLKQFDFLKIPRIYWELSTKRVLLMEFVDGGQVNDRGYMERNKIDVSEVSRHLGKIYSEMIFVNGFVHCDPHPGNVLVRKHPGTGKAEVILLDHGLYQVLTEEFRLDYCHLWQSLIWRDMKKVKKYSQRLGAGELYPLFACMLTARSWNSVNRGISQAPVTAAEESEIRDNAANYLPQISQLLSHVPRQMLLIFKTNDLLRGIEAALGTRASASSFLNMSRCCIRALASHKKKNTCSFFRRTQISFSEAFNLWQINLHEFILSVKGLRLANWVLALLCWLFPASH	145962	287182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_146057_153293_153440_155618_155703_201383_201588_235073_235233_247613_247773_256377_256495_275215_275366_276593_276792_284878_285073_286417
794304	contig_10082_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_63855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTGTGGAGGAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176548	174526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_174500_176500
794305	contig_11574_pilon	+	2380	13	Intergenic	novelGene_64037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGAGAAACATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300424	410753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_300856_302273_302352_314089_314238_318465_318545_333975_334053_342354_342515_347375_347465_391730_391809_396222_396308_396544_396666_408534_408639_408791_408851_409882
794306	contig_14467_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_138267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCCTGGCTCCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318998	319733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_319000_319700
794307	contig_6915_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_162424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAGTTGCAACCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272521	274079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_272500_274100
794308	contig_21025_pilon	-	1266	8	Intergenic	novelGene_76483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	33.0861583982036	176	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	16	609	28511	12922	TRUE	25	GCTTTGAATCAATGTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLLGFCAPAWRSVRMASSGMARQHPLANKVALVTASTDGIGFAIARRRVQDGAHVIVSSRKQHNVDQAVGELQGTGLSVLGTVCHVGRAEDRERLVAMALKLHGGVDILVANAAVNPFFGNIMDATEEVWDKILDINVKCTALMTKAVVPEMEKRRGGSVVIVSLHSSLPPSFLAWALTVLVKQPCSASPGAWP	28526	9363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_9894_12328_12385_12850_12986_13277_13332_13431_13503_15517_15620_26654_26833_28386
794309	contig_9578_pilon	-	1944	8	Intergenic	novelGene_68000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTGCGCGGCGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327141	1309242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1309461_1311493_1311819_1317334_1317598_1318292_1318358_1319387_1319809_1321484_1321545_1324878_1325041_1326711
794313	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794315	SIRV4	-	411	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1102	8	1102	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4056	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
794316	contig_9440_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_59073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076760	1074949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1074900_1076800
794317	contig_14450_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_48925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGACAGCACCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24376	25430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_24400_25400
794320	contig_18869_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_56218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73746	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
794323	contig_7457_pilon	+	1623	6	Intergenic	novelGene_31549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	364.74177166867	664	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	176	826	840844	844700	FALSE	0	CTTGCTCTTGTCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPGTPLGGEERSLSEPRRRVTPPPRSRLGDPLATKCLFAKLRPPAPTLTGTTTEGRAMAGRGGAARPNGPASGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFARAKNWVKELQRQASPNIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNEIFMAIAKKLPKNEPQNAAGAPGRNRGVDLQENNPASRSQCCSN	820278	845497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_820365_840754_841010_842546_842699_842968_843092_843987_844082_844584
794324	contig_6510_pilon	+	2699	1	Intergenic	novelGene_173522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGATCTTTTAAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209948	212647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_209900_212600
794325	contig_20602_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_133728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGATTCCGACTCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10935	10544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10500_10900
794326	contig_9915_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_174163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	241	591	328574	328224	NA	15	ATCTCCCTGTGACTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCASHPGQREGWLCVIFTVFLKVTVCVFTFVQITGSKAANSTYYTFTLPSLCFYISGVTPLKTDMSQYTYTFYNFAVILKLYDHNIIYYHKTAKSSQKSRLNMLKENSDLVYKKF	328814	327143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_327100_328800
794327	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	2	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
794329	contig_18290_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_174942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGAGCAATGTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95355	97643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18290_pilon_+_95400_97600
794330	contig_16666_pilon	+	1830	3	Intergenic	novelGene_61806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.5	164	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	798	1328	213183	213713	FALSE	15	CAACAGTGTGGTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGHSWFLCNSRDLFIFFNCAEEWAGGGASPFQPPCSWPPAHTVLFPSPKRVPGREDLAPPVHLSMMSLCPKTARQGWDRLLAASPTALSPEAGQILWTVKSVIYFCNLFGDRGGVGLFSGWWVVRGQCGAQTLEVTFALQTCSPAWALVQTRCAFEPMINSVSRLAPGWLGTQG	202448	214215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_202553_208919_208980_212549
794331	SIRV1	-	189	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3619	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
794333	contig_2799_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_85528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCTGTTTGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654018	656102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_654000_656100
794334	contig_4071_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_151864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACACAATGTTATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35346	35068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_35100_35300
794335	contig_10477_pilon	+	2389	1	Intergenic	novelGene_112499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360659	363048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_360700_363000
794336	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	1	1214	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
794337	contig_12437_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_169083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119291	121162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_119300_121200
794338	contig_11317_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_164081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACTACCTAAATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112137	111425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_111400_112100
794339	contig_19865_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_170157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGGGAAAAAAAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54215	53392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_53400_54200
794342	contig_8866_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_77898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATGAGAAGACTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098654	1099011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1098700_1099000
794346	contig_5201_pilon	-	2356	12	Intergenic	novelGene_82170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	264	671	293496	293089	TRUE	20	GGGGAAGTAGGTGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDASELRCWQGILNIPRAARRTNKSVLKEVQPERSLEARKGRLQLTYFEHIIRRDQALEKHIILGKADGQRKRGRSSTRWTDTVAATMGSNIATTVRMAQDWAVFRSVVHRFTMRQNLTTFMRHAVGSHSLRP	293759	250306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_250655_250795_250875_251188_251256_268757_268914_270973_271067_271517_271683_272651_272872_287288_287390_288465_288538_289352_289455_291973_292013_292845
794347	contig_6497_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_35588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCTGTCAGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330297	333109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_330727_331230_331368_332350
794349	contig_9363_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_6743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505861	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505300_1505900
794350	contig_9535_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_124501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGAAGTCCTGTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628654	630282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_628700_630300
794351	SIRV6	+	304	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8128	-1	611	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAAATCACCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
794354	contig_2798_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_120043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTGAGGAAAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152930	153257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_152900_153300
794355	contig_18168_pilon	-	1056	6	Intergenic	novelGene_122070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	161.652219285725	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	20	613	27110	24845	TRUE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRWLEL	27129	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24861_26002_26241_26483_26754_27040
794357	contig_5050_pilon	-	2118	2	Intergenic	novelGene_110239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	0	90	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	844	1155	14501	14190	TRUE	50	AATAAAAAGCCTGACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGPPGLIRAPCLAHRGPSDSAECIFIHHLHLTRREDGVEEPKDLPLCRPSAPLSSSEANKVSTSLSFSFLLGKFRRDNRCLSEQVLGKFSSPSFSKMAVAY	15344	13078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_13454_13601
794360	contig_4654_pilon	+	1885	8	Intergenic	novelGene_103058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	180.408945884349	327	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	105	1049	444670	458173	TRUE	10	TGTCCGTTGTACTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKSPDSVEGLRAAGNQSFRNGQYTEASALYGRALRVLQARVSTRAGSSDPEEESVLYSNRAACHLKNGNCSDCIKDCTSALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPKETTTTKNKVPSAGDVERAKVLKEEGNEFVKKGNHKKAIEKYSESLSFSHLESATYTNRALCYLALKQYKEAVKDCTDALKLDGKNVKAFYRRAQAYKALKDYKSSLADISSLLQIEPKNGPAQKLQQEVNQSLK	444565	459053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_444797_449177_449293_450644_450798_453119_453290_456226_456375_457717_457845_458068_458218_458261
794365	contig_5041_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_27038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAACAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407515	406726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_406700_407500
794370	contig_9972_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_162807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGACCAGAGTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375429	375790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_375400_375800
794371	contig_6710_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_97843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
794380	contig_4686_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_118494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCCCAGCAAATTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362431	361004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_361000_362400
794381	contig_10436_pilon	+	1390	9	Intergenic	novelGene_108513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.7333259193342	277	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	221	1123	111967	118324	FALSE	35	CTGACAGCTATTTAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSLLALRGFVLLRDSVECEGRSLLKALIKKSALCGEQVHILGCEVSEEEFREGFDFDINNRVVYHNLFRDPLNWSKTEEALPGGPLGALRALCRRTHPGPVTIALDSLSWLLLHLPCTTLCQTLHALSHRDFCPDGSSSVEQVCVLGLLHEELHGPGLVGALSSLAQAEVTLSGMLSQTSASIVYRRPRQRPTRQTQCFSILPDFSLNLQGVLPLESQPHPGPPTTQVDPTTHLTFNLRLSKKEKEAKDSLTLPFHFSSEKQQALLCPGPGQATSRIFYEPDAYDDLDQEDPDDDLDI	111658	118591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_111755_111842_112013_112254_112316_112401_112483_114548_114770_116488_116671_117196_117293_117434_117536_118209
794382	contig_19564_pilon	-	2044	4	Intergenic	novelGene_29695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.58653778449403	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	433	864	140167	137551	FALSE	35	AACAAGCATTTTCTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANGKPGDPKSALHRGPPGSRGPLIPPLLSLPPPPRGRGPMRGGLGPRFGPYGRGWWGVNAEPPFPGPGHGGPPRGGFHKEQRNPRRLKSWSLIKNTCPPKDGPQVMEDKSDRPVCRHFAKKGHCRYEDFCAFYHPGINGPPL	141271	136370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_137658_137909_138201_140133_140198_140869
794384	contig_3397_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_154584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150617	152548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_150600_152500
794385	contig_6270_pilon	+	1727	9	Intergenic	novelGene_99906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	5.95687627872193	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	34	1038	1490509	1519133	FALSE	20	TGATGGCTGGTAGGAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDCFESECATMRKVVLVTGASSGIGLTLCKRLLAEDDELHLCLACRNVGKAEAVRADLLASHPTAEVTIVQVDVSNLQSVFRASKELRQRFQRLDYVYLNAGIMPNPHLSIRGLFSGLFSRRVMHMFSTAEGMLTQEDKTTADGLQEVFETNVFGHFLLFRELEPLLCHNDHPSRLIWTSSRNAKKSNFSLEDFQHRKGHEPYSSSKYATDLLSVALNRNFNQQGLYSSVVCPGTVLTKMTYGILPRYVWTLLMPFIWLLRFFTHAFTLTPYKGTEVLIWLFHQKPESLNPLIKYMSATTGFGSTYIKLHRMDLDEDTAEKFYQSLLELEKHIRTTFQKSDNQS	1490475	1519822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1490544_1493375_1493580_1499332_1499426_1501167_1501283_1509577_1509773_1512116_1512222_1513023_1513081_1516199_1516299_1519031
794388	contig_19990_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_30750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGGGTTAACCCGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39462	38528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_38500_39500
794389	contig_6375_pilon	+	1244	3	Intergenic	novelGene_73046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	63.5	25	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	189	614	500167	500592	FALSE	20	CCATAAGTCTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRESSSSIPLSFPSPLSSVPDNIINSSLPSMSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498205	501222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498294_498571_498671_500165
794391	contig_7870_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_108985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAATATGGATAGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426608	427211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_426600_427200
794395	SIRV2	-	371	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4501	35	3326	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
794401	SIRV4	-	349	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	15	1157	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
794402	contig_6710_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_95510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	632	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
794403	contig_9646_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_117482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480125	478199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_478200_480100
794406	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
794408	SIRV4	-	466	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
794409	contig_2799_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_85533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGTAATGTTACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684662	683969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_684000_684700
794410	contig_2799_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_85532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCAGCTTTCTTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682289	681381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_681400_682300
794412	contig_1225_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_44116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138501	140375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_138500_140400
794413	contig_10023_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_123525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	26	454	497627	497199	NA	20	TCTTCCAACCCCCTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRDRTGKPMKISRTVRDRTGKPMKISRTVRDRTGKPMKISRTVRDRTGKPMKISRTVRDRTGKPMKISRTVRDRTGKPMKISRTVRDRIGKPMKMSRTIRDQTGKPMKRIKTFDDNRIHKPMTGKRGMKGPRINNPMGPSKVVLTEKLST	497652	497073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_497100_497700
794414	contig_3817_pilon	+	1507	3	Intergenic	novelGene_78358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	71	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	39	302	600174	614628	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFGDSGVLRLFMEEMSGESVVSSAVPAAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEVFGRAQEKQLNSFES	600135	615833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_600177_612547_612762_614581
794415	contig_6946_pilon	-	1559	12	Intergenic	novelGene_59752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	44.8893957548959	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	518	1426	98541	85447	FALSE	25	TGGTAAATGTTGGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLMNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARFELLCSPLFNKCIEAIRELLEQSAFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPDVELLNSVPPDEVIPIGAAIEAGILTGKEKLLVEDSLMIECSAKDILIKGVDESGADRFTVLFPSGTPLPAQRQHTLQAPGSISSVCLELYESEGKNSAKEENKFAQVVLQDLDRKENGLRDILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAITIEVAS	113091	85313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_85526_86274_86346_88713_88888_89349_89563_94179_94283_96975_97132_98428_98591_100115_100221_101142_101223_111802_111886_111959_112041_112972
794416	contig_6215_pilon	-	1204	2	Intergenic	novelGene_21224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1050	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTAAAAGCTCTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243071	237627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_238751_242990
794418	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9694	558	544	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
794421	contig_990_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_76137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGAGTAAAACTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648345	1646808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1646800_1648300
794424	contig_9582_pilon	-	1617	8	Intergenic	novelGene_106857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.9111779924262	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	34	954	828141	813917	FALSE	15	TTTTGTTGATCCATTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQELQAGVAVGMSTGRPEPGPEGLSRHHGALASDHQPPPTAPVSWSLPRWRAYVAAAVLCYINLLNYMNWFIIAGVLLDVQKCFQISDSNVGLLQTVFIGCLLLSAPVFGYLGDRHSRKAMLSFGILLWSGAGFSSSFISPQYSWLFFLSRGIVGAGTASYSTIAPTILGDLFVKDQRTRVLAIFYIFIPVGSGLGYVLGSAVTELTRNWRWALRIMPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDRR	828174	813253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_813924_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817393_817921_818059_824373_824440_827951
794425	contig_5585_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_143075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405609	403441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_403400_405600
794427	contig_10923_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_66183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	507.632938253616	69	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	383	778	37471	42718	FALSE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21848_22992_23056_37382_37540_38578_38742_42554
794432	contig_14951_pilon	-	2358	4	Intergenic	novelGene_174943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.05480466765633	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	352	1464	35012	26750	FALSE	50	TAAATAAATCTGTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSLLLIHPSEGVSALWRARNQGYDRVIFTGQFSRCICHVNTNCALVLNSSAKLCQYLDAQDQETFYCVKPQQMPCAALTHMHSKNKEVSYLSKQERSLFQRSNVGVEIMESFKAIHVSKCNIQAVPRKEKCKPGMTSTVPSGHVWKDTWNPVSCSLTPTEMKECLRGKLIYLIGDSTIHQWMEYFKQNINTLKSVDLHESGKLQHQLAVDLDRNINIQWQRHGYALIGSLNYSVKETEYFSQVIDRIEGGKNTVIVISLGQHFRPFPTDVFIRRALIVHKAVQRLLLRSPDTMVIIKAENTREMYSDPGRFSDFHGYIQYLAMKDIFQAINMGVIDAWDMTIAYGTLEVHPPQSVVRNQINILLNYIC	35363	25855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14951_pilon_-_27286_32401_32609_34140_34203_34704
794434	contig_14643_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_99113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGGTTTCCCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24585	23097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_23100_24600
794437	contig_14219_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_54381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065120	1064818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1064800_1065100
794438	contig_12050_pilon	-	1060	5	Intergenic	novelGene_62697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	119.543924981573	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	226	924	617317	615621	FALSE	15	AAGCCTCTGCCTGCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659663	615484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617366_617771_617890_659604
794439	contig_10904_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_22438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65736	65453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_65500_65700
794440	contig_14744_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_66095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAATAAAATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425936	1425253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1425300_1425900
794441	contig_9366_pilon	-	2921	2	Intergenic	novelGene_166282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2329	2646	1058434	1058117	FALSE	10	GCTTTACTGGGCCTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLGICSLPCQPHFQERMREQNCQECPDHHSDPVSCEKNKHKHINACISTSGGFSHPSNSTYKCCYNITLGNGSDIQYHVSLFRVKWRVFQEKNRRNMFSYNVI	1060913	1057841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1058507_1058657
794443	contig_1786_pilon	+	1113	7	Intergenic	novelGene_142583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_6	245.918008016222	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	29	940	26683	40018	FALSE	15	GTTTTTGAGTTCTGGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPRWPQRIMATLRSRVLLWRPLICSRGVEQFSLCARTQPITLLQRLPQPCGAGSPYRRVASEAAASGNSEIKKPTFMDEEVQSILIKMTGLNLQKIFKPAVQELKPPTCKLMTQTQLEEATTQAVEAAKVQLKMPPVLEERAPINDVLAEDKILEGSETAKYVFTDISYNIAHRERFIVVREPSGTLRKASWEERDRMIQVYFPKEGRRILTPIIFKEENLKTMYSQDRHADVLNLCIAQFEPDSTEYIKVHHQIYEDIDKHGKYDILRSTRHFGGMAWYFVHEKKIDGLLIDQIQRYLSLQKLKHRWEHM	26654	40191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_26849_27764_27932_29190_29356_31212_31357_31691_31776_35614_35761_39978
794444	contig_383_pilon	-	1932	4	Intergenic	novelGene_126107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCACTCCAGGATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131310	125797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_126388_127895_127991_128774_128989_130277
794446	contig_9673_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_119160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	869	1201	63223	62891	NA	35	AGTGACAACTAACTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYVLHSKILSLAHLSHSGSPQLNRTDERTKLGLEKHAKNTSQTFIFRKAKRDRNFHHIPKMLMAPYNNCNCKQVSISRAFWRKCLTPSQTTRNAYFAEMGSSYVSTCL	64091	62203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_62200_64100
794447	contig_6842_pilon	+	871	7	Intergenic	novelGene_130760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	389.893895822953	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	286	657	1366898	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGLVWPAGDLTLRTDLGAPASATGPEGGVDQRLREARCVDKLALATDGAVSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1306792	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306944_1330129_1330200_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
794450	contig_1301_pilon	+	557	5	Intergenic	novelGene_47423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	308	junction_1	1078.07777432799	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	46	429	983738	992105	FALSE	30	AAAACTTTTTTTTAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSKELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL	981495	992233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981540_983736_983810_986236_986360_990207_990317_992025
794452	contig_5084_pilon	-	1944	11	Intergenic	novelGene_64524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	265.21229232447	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	296	1324	443121	423423	FALSE	40	CAAATAAAAGTTTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKYCDLQKLAKSLGLRANLKADKLLKALKAHLKQEARRENENQDGSQTCASSCDESEIQVREQDHAERKTGSYITKSRRRRRTVQGIPDSQQDHSERKMSDLTEFQNQEQPENQDLKTAGEAPTPPDESQGDENADSMEESRINGNEDSKIPSERKKYLCTDAFLKAGKNNKTGSTTPNFKKLHEAHFKKMESIDQYIERKRKHFEEHSNSLNELKKQPFHKGAVTAPTVTPVPVRGRSSGARAPGHGRSQRGSQGTAGRSILGPRRSVKPFALSATKMNVRFSAATEDNEQKRSLTKTPARKSPHVLVSGSTPKGPAVLGTHKLKTTKADPATVITPLKLTAEAVQTPSSNKKPVFDLKASLSRPLTYEPHKGKLKPWGQSKENNPLNEYVSRVSFRKKTYKQPHLQTREEQRKKREQERKEKKAKVLGARRGLVRAAS	467681	422802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_423517_424820_424930_426950_427068_430465_430624_432182_432380_439640_439754_440829_440932_442982_443143_444435_444580_448313_448383_467620
794454	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	502	54	502	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794455	contig_9468_pilon	+	1383	4	Intergenic	novelGene_59482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	44.3195467285285	41	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	258090	261440	TRUE	35	AATCTGTTGAATGAGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFCEWSGLLGRRPAREQGRKHEPTRAGEDNRTAASARPGSVRSLRDPARLLLPSSPGTASHGGRHHVRAPRPPSGRTRQELRSLHSFPPNQKTLFPAYKA	258087	276306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_258330_261374_261553_269873_269978_275447
794456	contig_6589_pilon	+	618	5	Intergenic	novelGene_26158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	20	496	1885124	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAAGKMADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885104	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
794457	contig_6929_pilon	+	2116	2	Intergenic	novelGene_139432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	194279	194635	TRUE	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRSSSWLLLQPRRALRESLKIRRFSRRQVRKGCGSGVRRGKEVLTERLIPWASREAKGGSSLPVFLGVYRRKLGGAHPDPRRLGPGEPLPHPPGRGPLRPRGARRAGAEGETARLGK	194278	198557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_195689_197851
794465	contig_13952_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_133272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCAAGCATTGCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211591	212452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_211600_212500
794466	SIRV4	-	313	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	0	1208	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794467	SIRV6	+	267	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8451	-2	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
794471	contig_2377_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_67916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACTTACCAAGGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256069	256782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_256100_256800
794478	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	10	1164	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794481	contig_12427_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_40400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCAAGATGCATTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565	715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_700_1600
794483	contig_10986_pilon	+	1364	7	Intergenic	novelGene_71448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	9.2135166407235	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	41	1363	50437	55909	FALSE	5	TGAGTGTGCTCCCTCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCIHGFSAAQLTMGMGQLPCSRHLAWPLLGTCAFTLLATAALMAHILQRDFTVVPREWSGLSQGLEEANQAHSRGPEHAPESRSRPGPVPTQCDVPPNSRFDCAPEAAITQEQCEARGCCYIPAQHGAQGPRMGQPWCFFPPSYPSYRLENLTATQMGYTATLTRAAPTFFPKDILTLRLEVLMETESRLHFTIKDPANKRYEVPLETPHVHSRTLAPLYSVEFSQEPFGVVVRRKLDGRVLLNTTVAPLFFTDQFLQLSTTLPTPYVVGLAEHLSPLMLSTNWTKITLWNRDMAPEPGVNLYGSHPFYLVLENGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRTTGGILDVYVFLGPEPKSVVQQYLAVVGYPSMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAIVRQVVENMTRAGFPLDVQWNDLDYMDARRDFTFNKDGFEDFPAMVQELHQGGRHYVMLV	50396	55910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_50980_52391_52538_52898_53065_54518_54616_55074_55195_55548_55668_55777
794484	contig_7179_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_78134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894817	896723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_894800_896700
794488	contig_7697_pilon	+	1826	12	Intergenic	novelGene_128279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	99.1427720824789	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	424	1188	219239	252672	FALSE	20	TTAAGTTCTTTCAGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTRKIKLWDINAHITCRLCSGYLIDATTVTECLHTFCRSCLVKYLEENNTCPTCRIVIHQSHPLQYIGHDRTMQDIVYKLVPGLQEAEMRKQREFYHKLGMEVPGDIKGETCSAKQHLDSHRNGETKTEDSSNKETAEEKQEEDNDYHRSDEQVSICLECNSSKLRGVKTEMDPLLGPGNSLTPKEVHRQKKLNLSSFNELDILCNEEILGKDHTLKFVVVTRWRFKEIIGAPPHHVCPYHDKPVCFSALGFK	179016	253310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_+_179158_184336_184414_208012_208055_209748_209903_219229_219348_221272_221370_225665_225722_239712_239824_241094_241184_243904_244046_247670_247752_252591
794489	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794490	contig_12257_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_152116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCCTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196312	194731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_194700_196300
794491	contig_4531_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_47898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCCATAAGAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336049	336752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_336000_336800
794494	SIRV4	-	208	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1315	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3843	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
794495	contig_10235_pilon	-	2227	17	Intergenic	novelGene_46550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	681	1244	426844	423188	TRUE	20	CTGTGGATGCTTCCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAVFAGRKLREASFHHVLHPESIHAQQVEDHGVREAELGLQLGWLSHHHAVQVCHLRHAALAEQDDGSRGVQAPPPSPACHLHILSREQVPEGGAIMLAHGVEHHCSGRHVYTHGKGLRGKQDLDQAAAKEHLHDLLEDGQDAAVVHTQATLQELRHVQDLGQLAVRATEAGEAALQEEVNLALL	429480	420713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_420828_421031_421179_421548_421696_421834_421919_422111_422220_422550_422706_422781_422870_423047_423263_423343_423456_425689_425922_426543_426681_426836_426974_427076_427182_427438_427588_427678_427808_428049_428113_429375
794497	contig_9682_pilon	+	1085	11	Intergenic	novelGene_125285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	162.264752796163	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	10767	27135	TRUE	35	GCAGGACAAATGGATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEEQYKLLSDHIEQMAIE	2375	28469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_27085_27228_28354
794504	SIRV6	+	303	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	570	0	404	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
794506	contig_10793_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_83434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156536	154907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_154900_156500
794507	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	527	51	527	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794509	contig_13289_pilon	-	1623	2	Intergenic	novelGene_174944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	78	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	129	1283	165987	164833	FALSE	25	GAGGTGTAAATTCTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIPGLLFLLLLLLLCAVVQVHPYGVHWKPAWPAYRLPVVLPQSTHSLSKPDFVAKAKLEVSSSCGPQCHKGTPLPTYEEVKQYLSYETLYANGSRTETQVGIYILSNGGGGAQRQDSESSGRPRRKRQIYGYDSRFSIFGKDFLLNYPFSTSVKLSTGCTGTLVAEKHVLTAAHCIHDGKTYVKGTQKLRVGFLKPKFKDGGRGANHSTSAIPEKMKFQWIRVKRTHVPKGWIKGNANDIGMDYDYALLELKKPHKRKFMKIGVSPPAKQLPGGRIHFSGYDNDRPGNLVYRFCDIKDETYDLLYQQCDAQPGASGSGVYVRMWKRQQQKWERKIIGIFSGHQWVDMNGSPQDFNVAVRITPLKYAQICYWIKGNYLDCREG	175030	164492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13289_pilon_-_166001_174915
794510	contig_1625_pilon	-	2076	17	Intergenic	novelGene_174947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	47	junction_9	39.6909447323946	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	81	1904	102235	81050	FALSE	30	TTTTGCTTTCTTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQEVTDIVFKVELYFQAALLGIIVTAMPPYFAMENAENHKIKAYTQLKLSGLFPSAYWIGQAIIDIPLFFIVLVLMLGSLFAFHYGLYFYAVKFLSVIFCLVAYVPSVILFTYVASFTFKKVLNTKEFWSFIYSVTALACVAITEITFFMGYTITATLHYTFCIVIPIYPLLGCLICFIKISWKSKQKNEDTYDPWDRLLVAVVAPYLQCVLWIFLLQYYEKKYGGRSIRKDPFFRTFSTKSKNRKFPESPNNEDEDEDVKAERLKVKELMNCQCCEEKPAIMVSNLHKEYDDKKDFLTRKVKKVATKYVSFCVKKGEVLGLLGPNGAGKSTIINILVGDIEPTSGQIFLGGYSSDLAEDDDSTKCVGYCPQMNPLWPDITLQEHFQIYGAVKGMSESDMKEVIKRIANALDLKEHLQKTIKKIPAGIKQKLCFALSMLGNPQITLLDEPSTGMDPKAKQHMWQAIRTAFKNKKRAAILTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIEHLEVERLQREIQCIFPNASRQESFSSILAYKIPKEDVQSLSQSFSKLEEAKHTFAIEEYSFSQATLEQIFVELTKEQEEEDNSCGTLNSTLWWERTQEDRVIF	102315	80877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1625_pilon_-_81158_84537_84594_85477_85558_86543_86694_87802_87923_88814_88910_89038_89115_89526_89703_90772_90865_90963_91079_91388_91516_94883_94976_95477_95553_96260_96396_97062_97177_98155_98327_102193
794513	contig_4232_pilon	-	1290	10	Intergenic	novelGene_63175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	7.92246376443373	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	19	1149	124997	121686	FALSE	25	GCTTCTAAGAGGACTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTAHLSCLWALLVACLAHSIRGSLRAQAPGPQPLELKEVFTLFQIQYNRSYSSPSEHARRLHIFARNLDQAQQLQEEDLGTAKFGVTPFSDLTEEEFAQVYGHQEAPGRVPNVSSKVVPEEWGKSVPSTCDWRKWAEVTKTVRNQNNCKCCWAMAAAGNIEALWGIKHRQSVEVSVQELLDCNRCGNGCNGGFVWDAFITVLNNSGLASEKDYPFRGDDKAQKCQAKKHKNVAWIQDFIMLMDNEQAIASHLATHGPITVTINMKLLQHYQEGVIRATPTTCNPNLVDHSVLLMGFGKTKSVARMPAEASQGGALTRPRRSTPYWILKNSWGPKWGEKGYFRMHRGSNACGITKYPLTARVDKPAKQLSVSCPP	125015	121544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_121797_121875_122086_122166_122232_122395_122522_122657_122739_122824_122922_123029_123185_123578_123693_124560_124646_124910
794515	SIRV4	-	270	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1253	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3905	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
794516	contig_7733_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_147143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGCCCTCTTATGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109499	108949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_108900_109500
794519	contig_240_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_173810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786599	784459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_784500_786600
794525	contig_12520_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_161088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603343	601165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_601200_603300
794526	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	51	491	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794527	contig_5253_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_61611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCGTGCTTAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414515	414045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_414000_414500
794528	contig_7171_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_101216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCGAATGGGATTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376020	375460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_375500_376000
794529	contig_9389_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_84114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCATGCCCGAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404520	1406256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1404500_1406300
794530	contig_6494_pilon	-	800	7	Intergenic	novelGene_108570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	913.705763483093	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	29	445	8286	3385	TRUE	25	GACACATGGCCTGACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRVEPRAARSWCLGNSEDRGLNP	8314	2106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3452_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
794535	contig_7188_pilon	+	1437	2	Intergenic	novelGene_108527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95553	97825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_95883_96717
794538	contig_5600_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_174962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	590	982	406246	405854	NA	80	AGGAAAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKILFYSFSPFDQDSSIESLIKMFSSGSRAPSSSSGLMAKEAVVHVGNQLCIPLRGKLLIKNLCGWFITGGHGGFTNFHTLRAVTFNYSLQLHSGAFSTTGKEVLSVSYSLFSQSSSTFSLVYRRISP	406835	405844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_405800_406800
794543	contig_9482_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_44243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAATAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283670	284746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_283700_284700
794544	contig_5485_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_37765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTTAGTTGCTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551538	551239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_551200_551500
794545	contig_16714_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_161581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCAGTGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943698	945670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_943700_945700
794550	contig_13780_pilon	-	2916	1	Intergenic	novelGene_149035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCCCTTCAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488659	485743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_485700_488700
794551	contig_6710_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_98171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653464	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
794552	contig_15114_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_121112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAATCAAGGGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86792	87759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_86800_87800
794553	contig_15066_pilon	-	1494	8	Intergenic	novelGene_149548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_7	123.249373885896	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	727	1353	113086	111830	FALSE	15	CATTCAAGGTCTCTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGWQPLPWVPPTWPWIVFCRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114210	111688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113512_113709_113895_114094
794556	SIRV5	+	289	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	880	36	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
794557	contig_16098_pilon	-	1171	8	Intergenic	novelGene_46079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1994.26054016039	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	359	961	457605	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460197	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458547_460148
794558	contig_15044_pilon	-	2046	2	Intergenic	novelGene_174966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	263	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	119	796	104245	103568	FALSE	5	CCACCTTCTGTTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGKSKGAISRSSSQGKAYENQRKTARPRQKWGVAARFDSSLSRLRRSLDEKPYKCIECEKSFSQSSTLFQHQKIHTGKKSHKCADCGKSFFQSSNLIQHRRIHTGEKPYKCDECGERFKQSSNLIQHQRIHTGEKPYQCDECGRCFSQSSHLIQHQRTHTGEKPYQCSECGKCFSQSSHLRQHMKVHKEEKPRKTRSKNIRAKTHLVSSWKAGTGRKSVARLR	106861	102317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_-_104325_106822
794561	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
794562	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794563	contig_14966_pilon	+	1105	2	Intergenic	novelGene_174971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	36	470	20401	20940	FALSE	50	AAACAGAAGCCCACGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPLSGSPEQEMPTSFLPDPTRGSRILCWVALCLLGAGPVDTGVVQSPRHLIAEKGGQATLQCHPASGHRSVYWYQQTRGQGPKFLFELYKGEQQEKGDIQGRFSAQQFSNDSSELNVRALEQGDSAVFLCASSPAQPCRATSHLHPNLLSLLGT	20365	21575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14966_pilon_+_20480_20584
794564	contig_14966_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_174972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTATGTAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22230	22558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14966_pilon_+_22200_22600
794568	SIRV6	+	526	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	27	-13	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2026_2470
794572	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
794573	contig_8285_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_174974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGGTACAGGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229221	228718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_-_228700_229200
794575	SIRV4	-	196	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	418	3	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
794578	contig_9389_pilon	+	1200	7	Intergenic	novelGene_83993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1148.39685358909	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	161	493	383663	384766	TRUE	20	CGAACCTTGCTCTGACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	383426	385516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749_385280_385322
794581	contig_14536_pilon	-	2088	2	Intergenic	novelGene_69297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	111	359	137680	95316	FALSE	25	CTCCAGCATGTTTTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDLGEDSPRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKALLVSIYVDYGILIETHLLFIYLMVTTCIFVF	137790	93586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_95447_137562
794582	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8463	-1	276	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGCCCTGGTACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
794584	contig_9871_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_75638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTCAAATGACACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353930	353182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_353200_353900
794585	contig_9119_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_169744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98132	97180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_97200_98100
794586	contig_6576_pilon	-	2329	2	Intergenic	novelGene_42381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	3	569	1288435	1283359	FALSE	15	AGGTTTTATATTGGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISQARCRFKTGQINGDLLIYHVLLTLKPYYAKPYEIVVDLTHTGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVSAVYVYNCNSWVREYTKYHERLLTGLKGSKRLIFIDCPGKLAEHIEHEQQKLPAATLALEEDLKVFHNALKLAHKDTKVSIKVSFAPCYINDSCLSSLTRIHPDSSRCPCHSSESHVK	1288437	1281598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1283903_1288412
794587	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_94728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
794588	SIRV6	+	252	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8458	-1	281	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCTGGTACGTTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
794592	contig_8260_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_163239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119102	120108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_119100_120100
794593	contig_5894_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_83029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACACCAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354081	353842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_353800_354100
794594	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
794598	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
794599	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	8	1160	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794601	contig_10377_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_115411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCTCTGCAGGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252408	251697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_251700_252400
794602	contig_10627_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_60007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAAAGAATTTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355044	352923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_352900_355000
794605	contig_7391_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_112172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCTGGAGTTCTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474513	474236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_474200_474500
794606	contig_2450_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_160314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754271	756364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_754300_756400
794609	contig_8248_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_125019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96115	97189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_96100_97200
794613	contig_9919_pilon	-	1681	12	Intergenic	novelGene_137990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	82.802463332224	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	1	837	866326	845488	TRUE	25	TATGTCTTACTGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALADAILCLHQGRDDLQWNPTDRPDERPRPICVTSLPEYSETCSRSYLWNYHHKA	866326	834858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208_839383_843026_843107_845428_845553_850459_850552_855926_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
794614	contig_6589_pilon	+	1377	9	Intergenic	novelGene_26047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	989.917010410469	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	43	696	1725483	1729051	TRUE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGRPQEALLWSPLPPLSEPQCLPVANGVAHTDHNNYSNNNSSHFSSTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNCAAAAGILRRTGSRSSA	1725440	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725850_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728243_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
794615	contig_1847_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_171723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACAGACAGTGTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41989	41608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_41600_42000
794616	contig_17936_pilon	-	997	4	Intergenic	novelGene_29964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	478	891	126099	118792	TRUE	15	ACCTGCTGATCTTGGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVKGLLEKGRPSSVAQGKGVYRKPKLRPWVSCSMQQTAELIFLLFVSFQSL	126576	90058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_90077_118703_118827_121017_121060_125762
794618	contig_6102_pilon	+	1587	5	Intergenic	novelGene_32373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	26.4326975543549	240	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	115	705	1726366	1727421	FALSE	5	TCTGGCTCTGGCTCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLLPAGGAPPPLSEASSPLACLLQSLQLPPEQSEAPCMPPESPTSALEPEPARPPLSALAPPHGSPDPPVPELLTGRGSGKRGRRGGGGLRGINGEARSGRGRKPGSRREPGRLALKWGARGGFNGQMERSPRRTHHWQHNGELTEGGAEPKDPPPPGPYSEELKSIFSQVPPGVVRKSRRGRRRKYNPTRNSNSSRQDVPLEPSPTTRAAVPLPPRARPGRPAKNKRRKLAP	1726117	1728303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1726202_1726335_1726750_1726837_1726906_1727120_1727185_1727346
794621	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	171	14	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
794622	contig_9098_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_75818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310513	309484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_309500_310500
794623	contig_13558_pilon	+	1232	3	Intergenic	novelGene_123014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.5	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	134	997	40701	41660	FALSE	65	AAAACAAAAAACCTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36729	41895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655_40870_40965
794624	contig_6217_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_109569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGGAAATGAAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61674	60041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_60000_61700
794631	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794632	contig_4087_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_156077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATAAACTTACCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118877	117020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_-_117000_118900
794633	contig_6356_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_126426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTAGAATTTATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33222	34491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_+_33200_34500
794637	contig_6946_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_59741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAATAAAATTGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3948	1705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_1700_3900
794638	contig_15066_pilon	+	1656	8	Intergenic	novelGene_149557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	61.8648955880671	175	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	638	991	115715	116499	TRUE	40	AAATGAGGGGAGAAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGQGAGWSLRGLRALGGIRWGKGPLLTPDLRALLTSGTSDPRARVTYGTPNLRARLSAGVPEPRPCLTSGTPDPQARLTAEIPDPRTREASGTPGTRPRVWLAVALGAGGAVLLLWGGGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGRHPFSSREVPISNGSGFVVAADGLIVTNAHVVADRRHVRVRLPSGDTYEAMVTAVDPVADIATLRIQTKEPLPTLPLGRSADVRQGEFVVAMGSPFALQNTITSGIVSSAQRPARDLGLPQTNVEYIQTDAAIDFGNSGGPLVNLVSGTSFQESLPRYPPSPTVCLG	114975	118083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_115465_115566_115772_115860_116056_116270_116339_116465_116631_116789_116860_117518_117615_117715
794639	contig_3077_pilon	+	1400	4	Intergenic	novelGene_26907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGCCCGCCAGCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680096	1710488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1681174_1681898_1681989_1682202_1682263_1710315
794640	contig_13145_pilon	+	2011	2	Intergenic	novelGene_116640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAAACAAGGGACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143790	150710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_145743_150651
794641	contig_12697_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_122832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTTCCTTTCAGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244957	243706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_-_243700_245000
794648	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	6	-244	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
794651	contig_4071_pilon	+	1364	4	Intergenic	novelGene_151886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	17.9876500843094	345	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	66	905	338050	343578	FALSE	35	AATTACAGCTTGCCTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRPTLTKELTFSSNIGQHDLDTKSKQIQQWIEKNYQVQITIKKGKNVEDPENKMEAIFNQILQTMPGIATFSSKPQAVKGGRAVMCVLRHLSTKEENMYREAQKTQKGDILNKENRNDRPPDVLHQ	331770	344037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_331835_338048_338513_342301_342460_343359
794654	SIRV6	+	361	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	9	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
794656	contig_7009_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_23686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	44	547	755088	754585	NA	25	CATTTTCTATTACTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIQRLNNGPQTFAEGAPPLCRLPQCGFSSQITNHPHPFPVYLKNFVLVQGVDCGRHLASFMDPVKQPQSLSHFSMHRCPILLSLTCLVLHSSGDYFFEKKSLLHSTTGLNHLASSWMKASLPETRPVATATSGAAESAPGATFSLTFFTASTCSRMIAALPPLRG	755131	752676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_752700_755100
794660	contig_6710_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_96395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	657167	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657169	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
794661	contig_20667_pilon	-	1766	2	Intergenic	novelGene_174982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	32	343	39484	29560	FALSE	15	GCGATCATTTTTACCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVSPTWKINMNIYIDPAVVDYSHFPGSQLKAVHRVAFVVRKTVSLKFMVMLKMFCTTHDSWHKYMQIKGHICEKLWRTWKRGLVYSMRLPHVQTGTVSLHRSWSKSCESGRY	39515	28136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20667_pilon_-_29636_39248
794663	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	0	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794664	contig_6175_pilon	+	2135	2	Intergenic	novelGene_16352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1066	1368	1694013	1700392	FALSE	30	GTGGCAGCAATGAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGQISMWPSNVGRRVSSKVSSIWIALTMADSFFSLWKIFDRSCSIISCLGKQINSQVPIATSFNTNNFREGHGTSQISVIHKFILTRAYLFYLTRFSF	1692947	1701159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1694049_1700125
794668	contig_10753_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_105155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAATTCATTCCACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374868	374089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_374100_374900
794669	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
794670	contig_6546_pilon	+	434	3	Intergenic	novelGene_140976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	277	junction_1	4936	2127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597576	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_599246_599365_599577
794672	contig_10000_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_139339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303240	304515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_303200_304500
794674	contig_14855_pilon	+	1879	5	Intergenic	novelGene_146016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	54.1156169695958	269	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	67	492	444182	449205	TRUE	5	TGGATGTGTTTCTCGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDASELVTAVDKVVCLESARPRMGVGCRLSRALLTAVTHVLIFFWCLAFLWGLLILLKYRWRKLEEEEQAMYEMVKKIIDVVQDHYVDWEQDMERYPYVGILHVRDTLIPPQSRRRMKRVWDRAVEFLASNESRIQTESHRVAGEDMLVWRWTKPSSFSDSER	444115	450740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_444252_445286_445389_445464_445568_449054_449534_449681
794675	contig_6710_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_94110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTACTCGGTTGAGGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653356	653647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653600
794676	SIRV6	+	220	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	77	486	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794677	contig_2310_pilon	-	2214	10	Intergenic	novelGene_71634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	142.077443670697	105	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	93	1316	495462	468648	TRUE	40	TGAGATAATATAGATTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPRIACTRRRRRHGLLRLSHPREPPAAGTMTVRGAALAPDPALPTTAAASPSISAIPEGSPTAMEQPVFLMTTAAQAISGFFVWTALLITCHQIYMHLRCYSCPNEQRYIVRILFIVPIYAFDSWLSLLFFTNDQYYVYFGTVRDCYEALVIYNFLSLCYEYLGGESSIMSEIRGKPIESSCMYGTCCLWGKTYSIGFLRFCKQATLQFCVVKPLMAVSTVVLQAFGKYRDGDFDVTSGYLYVTIIYNISVSLALYALFLFYFATRELLSPYSPVLKFFMVKSVIFLSFWQGMLLAILEKCGAIPKIHSARVSVGEGTVAAGYQDFIICVEMFFAALALRHAFTYKVYADKRLDAQGRCAPMKSISSSLKETMNPHDIVQDAIHNFSPAYQQYTQQSTLEPGPTWRGGAHGLSRSHSLTGARDNEKTLLLSSDDEF	523252	466622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_467236_468362_468890_472011_472207_472686_472857_474008_474101_477143_477220_477728_477820_493510_493677_495270_495500_523197
794679	contig_9833_pilon	+	1405	4	Intergenic	novelGene_68493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.68178700572909	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	915	1280	208966	211218	FALSE	10	TGTCGGAGAGGGCCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLVRYGTKEQKARWLVPLLEGRARSCFAMTEPQVLLRCHQHRVFHQRGEWLLRHKRSQVVDLRHPGSSLPTLRVYGENRPAGPAPPAAVSAPGPHGYPGDQSHPVPDGIRAGGCARWPR	208051	211343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_209081_209202_209282_210404_210564_211205
794681	SIRV6	+	511	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	345	0	172	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
794682	contig_5794_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_69734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	207	506	393950	394249	NA	45	AGTGAGAATAGCAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYSPKGDWRNLESMAPSHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPHKNKWD	393743	394434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_393700_394400
794691	contig_7022_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_142135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89689	91938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_89700_91900
794692	contig_2215_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_163867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTAGGCTCTTCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271555	272695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_271600_272700
794694	contig_3654_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_174994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCAGCATATGAGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550638	552505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_+_550600_552500
794697	contig_4364_pilon	+	1180	7	Intergenic	novelGene_70	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	41.8436242322398	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	24	602	703017	707465	TRUE	30	CAGACTCATATTAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPESPRDVSQSSDSDPDAGGHS	702993	709027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707953_708936
794700	contig_14516_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_153939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTGCCCAGCACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322678	324503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_322700_324500
794702	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_94865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653767	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
794704	contig_1076_pilon	-	1424	12	Intergenic	novelGene_101103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	191.570111024702	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	90	1049	66339	54305	TRUE	15	CTGTATGTTTTTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKLFWLSVMMLLVRIPVLRWELRTEPN	72667	51355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54383_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66369_72607
794705	contig_14513_pilon	+	870	5	Intergenic	novelGene_70386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATATCAATTAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11303	19077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_11561_11983_12158_13086_13136_14952_15001_18735
794707	contig_6946_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_59795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTTGGACCATGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452392	454063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_452400_454100
794708	contig_1150_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_61459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338074	339054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_338100_339100
794710	contig_3397_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_154595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTGTTTGCTATATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204987	205974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_205000_206000
794711	contig_3397_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_154596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206074	206934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_206100_206900
794712	contig_13453_pilon	+	822	6	Intergenic	novelGene_146717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	154.112166943431	85	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCACTGTCTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126439	136854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_129696_129771_131069_131184_132536_132667_136355_136502_136758
794713	contig_20890_pilon	-	890	4	Intergenic	novelGene_147047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	315	junction_1	927.07317222896	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	162	518	42692	33916	FALSE	20	TTTGCTGTTCAGGCAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPFTDVVTTNLKLRNPSDRKVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDPGLTVTVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQTIFAPPNTSDMEAVWKEAKPDELMDSKLRCVFEMPNENDKLGITPPGTTAAVTSLSSINNTVATPASYNMKNDPRGLSVFKQEKQKVCQRELTDLEVY	45633	33543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_34090_42125_42207_42590_42695_45474
794715	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
794716	contig_7894_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_170770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGTCAAATGTACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76108	76623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_76100_76600
794717	contig_7894_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_170771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGATCCTGAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77928	78479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_77900_78500
794718	contig_6710_pilon	-	445	2	Intergenic	novelGene_98190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
794720	contig_10446_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_162439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGACTTAATTTGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175157	174463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_174500_175200
794721	contig_10446_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_162440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACATTTTCATTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181161	180250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_180200_181200
794722	contig_15867_pilon	-	2566	4	Intergenic	novelGene_170879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1710	2009	39049	34321	TRUE	80	AGTGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMRAQMEMQFKIIVCGITFCPFCLQFNVGCVHFTQQMTWNLVSWISSSFRGSLQQRFPIKQHIGTFFTLKLLFNILFLDWLDFGIIYIKPVGAGCAII	40758	30821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_31230_34171_34473_37178_37259_38981
794725	contig_15185_pilon	-	1985	10	Intergenic	novelGene_99405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	893	1237	209120	206293	TRUE	5	GCCGGCGCCGCCGCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSGVGSKISDSSLGSSRTPVESALMGSKEVEGLGPDELLLLLLSSRAEDCSGRVSSAVRPRGSELSSPLSLLSVPGPPLTVLSAAGPVTPWPSMLLGTGAGVASWGLLGHEAS	210110	203648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_203821_204295_204409_204551_204714_205023_205065_205815_205880_206096_206394_206852_207041_208881_208928_209110_209157_209254
794729	contig_8075_pilon	-	1114	5	Intergenic	novelGene_42480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	294.186484223868	639	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	54	944	620458	606190	FALSE	25	CTGAATCAGCCTAGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSAFPSVDLGGPRPGVMAGPLQGGRVRALDLLRALPRVSLANLKPNPGSRKPERRPRGRRRGRKCGRGHKGERQRGTRPRLGFEGGQTPFYIRIPKYGFNEGHSFRHQYQPLSLNRLQYLIDLGRVDPTQPIDLTQLVNGRGVTIQPLKRDYGVQLVEEGADVFTAKVNIEVQLASELAIAAIEKNGGVVTTAFYDPRSLEILCKPVSFFLRGKPIPKRMLPPEALVPYYTDARNRGYLADPAKFPEARLELARKYGYILPDITKDELFKMLSARKDPRQIFFGLAPGWVVNMADKKILKPTDEDLIKYYSS	620511	606019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_606528_612911_613036_616670_616837_619302_619458_620350
794731	contig_15371_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_151470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAATGAATAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210663	212139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_210700_212100
794732	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	1	1214	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
794735	contig_6710_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_98271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	GTCTGGTCCTCAGTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
794737	scaffold_12124_pilon	+	1244	5	Intergenic	novelGene_22022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	246.891676651928	5	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	259	720	836073	858450	FALSE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGEEALSVTNTFS	829486	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844425_858439
794739	contig_504_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_54436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220599	222654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_220600_222700
794740	contig_628_pilon	-	1370	5	Intergenic	novelGene_130242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	39.7932155021431	19	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	6	731	197081	175382	FALSE	30	AAGGTCCTACTTGGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMFKTPQEMGLIAIAVRQTQGQGRGRNAWLSPMGCALSTVLVSIPLRSQLGQRIPFVQHLMSLAVVEAVRSLPGYQDINLRVKWPNDIYYSDLMKLGGVLVNSTLMGETFYILIGCGVNVTNSNPTICINDLVTEYNKQQRVDLKPLRADFLIARTVTQLEKLIDTFQDKGPNGVLPLYYKYWVHSGQQVHLGSMEGPEVSIVGLDDSGFLQVHQEGSEVVTVHPDGNSFDMLKNLILPKQH	197086	174742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_-_175554_177062_177277_180614_180730_193680_193842_197017
794742	contig_10617_pilon	+	1156	4	Intergenic	novelGene_172356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	11.7284080571728	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	167	544	98437	106279	FALSE	15	TATTGTAGGTCTGTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPGSVRAPARWRLQGVSCRPFAASAVCCFSSHSSTSCWAVNEESRSQKNFIINMTCRFCWQLPETDYECSNSTSCMTVSCPRQRYAANCTVRDHVHCLGNRTFPKMLYCNWTGGYKWSTALALSITLGGFGADRFYLGQWREGLGKLFSFGGLGIWTLIDVLLIGVGYVGPADGSLYI	87296	106891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10617_pilon_+_87424_98397_98573_100550_100627_106113
794743	SIRV4	-	414	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1109	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4049	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
794749	contig_5019_pilon	-	2856	1	Intergenic	novelGene_109235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAAAGAGAGGGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382674	379818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_379800_382700
794752	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
794753	contig_3956_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_14771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	172	501	923490	923819	NA	65	TGTGAGAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAHTIPSRHPARGTSLACQASHYNFLSQGSKMTCIQICEKCFETWKAQYRDQYITFTLCGPVLRNRCDGRVRLRELSPRLWISLCRVVLSGAPPPPFSSVLFCTSFL	923318	924217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_923300_924200
794754	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	51	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
794759	contig_1301_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_47343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292390	294919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_292400_294900
794763	contig_854_pilon	-	1265	4	Intergenic	novelGene_36470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	505	1029	1526937	1514776	TRUE	15	CACAGCTCAGCCCTCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPGQQQHFPCRPPRGLAALWALMYGGLVSQAQAPRGRQREMAEGASQKGWEFCRGPSPGPRGPRWVRVVRTLPCWSANQLLQEGLQLVLILDAHKLVHHVSILHGQHSGHGGHLAYSMARSVWSSISTLAITTFPCCLATIFSNLGPRILQGPHHCAWKSTTTGVSLLTTRS	1527441	1513666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1513692_1514564_1514830_1517440_1517563_1526588
794764	contig_9653_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_48222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516333	518287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_516300_518300
794768	contig_1264_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_161322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGCTTATTATCCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144156	145553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_144200_145600
794769	contig_20641_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_52781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGATCTATGGGGGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6729	8500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_6700_8500
794772	contig_13015_pilon	+	2376	5	Intergenic	novelGene_165568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_4	33.1539967424744	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	792	1229	417922	418359	TRUE	45	TAATTGTGTAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVLWLTLVSSVMVFAMVRHFSYARWPQKAAGLFTPLCFPFSLLLCPLPVSVRPAGPPVFQTPPGSWLDGARESRAVGCEEQCKELLGRQSAGAGGPRLTSLGQHRATLWLPGSRYSGRWAWDLVFLYFTLFFSKLADRTLLQV	417130	427358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
794773	contig_4486_pilon	+	913	4	Intergenic	novelGene_38648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_2	380.160492423924	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	208	444	1029810	1037335	FALSE	25	CAACAGCTCTCCATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQGPDPNIEESPKRKNITYEELRNKNRESYEVTLTQKTDPSVRPMQERVPKKEVKVNKYGDTWDE	1027932	1037804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1028010_1029679_1029856_1033761_1033915_1037297
794774	contig_1406_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_25602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAGCCAAATCCAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2185396	2186601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2185400_2186600
794776	SIRV2	-	485	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	34	3213	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
794777	contig_6510_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_173525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGGGTAGGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240296	241742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_240300_241700
794780	contig_12250_pilon	-	2173	10	Intergenic	novelGene_80740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_9	7.02552664868322	54	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	134	2011	435416	429384	FALSE	20	TAACATTTGTGTTGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPWGWSSHRSLQTPRVLSGDLGQLPAEVRDFVERSARLCQPEGIHICDGTEAENTATLTLLEQQGLIRKLPKYNNCWLARTDPKDVARVESKTVIVTPSQRDTVPLPAGGARGQLGNWMSPAEFQRAVDERFPGCMQGRTMYVLPFSMGPVGSPLSRIGVQLTDSAYVVASMRIMTRLGTPVLRALGDGDFVKCLHSVGQPLTGQGEPVSQWPCNPEKTLIGHVPDQREIVSFGSGYGGNSLLGKKCFALRIASRLARAEGWLAEHMLILGITNPAGKKRYVAAAFPSACGKTNLAMMRPALPGWKMECVGDDIAWMRFDSEGQLRAINPENGFFGVAPGTSATTNPNAMATIQSNTLFTNVAETSDGGVYWEGIDRPLASGVTVTSWLGKPWKPGDKEPCAHPNSRFCAPARQCPIMDPAWEAPEGVPIDAIIFGGRRPKGVPLIYEAFNWCHGVFVGSAMRSESTAAAEHKGKVIMHDPFAMRPFFGYNFGHYLEHWLSMEGRKGARLPRIFHVNWFRRDEAGRFLWPGFGENARVLDWICRRLEGEDSARETPIGLVPKEGALDLSGLGAIDTTQLFSLPKDFWEQEVRDIRSYLTEQVNQDLPKEVLAELEALEGRVRRM	436429	429221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_429839_430106_430203_430505_430644_432738_432958_433229_433393_433695_433884_434257_434462_434548_434734_435186_435433_436312
794783	contig_5419_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_15527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAACTTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272446	274200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_272400_274200
794784	contig_13496_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_107646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTAGTGGTGGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372954	373954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_373000_374000
794785	contig_5039_pilon	-	1926	2	Intergenic	novelGene_64761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGATCTGAAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140448	119474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_119894_138941
794786	contig_9516_pilon	-	1470	9	Intergenic	novelGene_106206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	60.8254418397433	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1083	387	1469	1371562	1321958	FALSE	70	ATGAAATAGAAGAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPMSDPTAWATAMNNLGMTPMGIAGQPILPDFDPALGMMTGIPPITPMMPGLGIVPPPIPPDMPVVKEIIHCKSCTLFPPNPNLPPPATRERPPGCKTVFVGGLPENGTEQIIVEVFEQCGEIIAIRKSKKNFCHIRFAEEYMVDKALYLSGYRIRLGSSTDKKDTGRLHVDFAQARDDLYEWECKQRMLAREERHRRRLEEERLRPPSPPPVVHYSDHECSVVAEKLKDDSKFSEAVQTLLTWIERGEVNRRSANNFYSMIQSANSHIRRLVNEKATHEKDMEEAKEKFKQALSGILIQFEQIVAVYHSASKQKAWDHFTKAQRKNISVWCKQAEEIRNIHNDELMGIRREEEMEMSD	1473988	1321956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1322027_1332467_1332575_1334277_1334491_1337286_1337521_1342665_1342873_1355880_1356037_1371465_1371601_1371898_1372100_1473841
794788	scaffold_19766_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_34284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCAGGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410408	411006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_410400_411000
794789	contig_7019_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_149480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTCCGTGCCCTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386920	1388848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1386900_1388800
794791	SIRV6	+	346	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	518	7	-27	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCAACAAGAGAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
794793	contig_10436_pilon	-	1456	11	Intergenic	novelGene_108463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	7.84856674813943	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1239	218	1456	66858	60145	FALSE	15	CGGCGGGTCCACTCTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEHSPAHLPNQVKAPELAHVLERNLSHLEAVHGVVGHAHLSPLKANSPPVIVNTDTLEAPGYELQVNGTEGEMEYEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPSIFITKIIPGGAAAQDGRLRVNDSILFVNEVDVREVTHSAAVEALKEAGSIVRLYVMRRKPPAEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGRLQIGDKILAVNSVGLEDVMHEDAVAALKNTYDVVYLKVAKPSNAYLSDSYAPPDITTSYSQHLDNEISHSSYLGTEYPTAMTPTSPRRYSPVAKDLLGEEDIPREPRRIVIHRGSTGLGFNIVGGEDGEGIFISFILAGGPADLSGELRKGDQILSVNSVDLRNASHEQAAIALKNAGQTVTIIAQYKPEEYSRFEAKIHDLREQLMNSSLGSGTASLRSNPKRGFYIRALFDYDKTKDCGFLSQALSFRFGDVLHVIDASDEEWWQA	70597	60144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_60263_61424_61540_61668_61772_61910_62207_65717_65863_65992_66130_66228_66399_66495_66621_66828_66889_67027_67082_70464
794798	contig_1939_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_144895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAAGCAAAGACAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013128	1014080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_1013100_1014100
794799	contig_10235_pilon	+	1266	5	Intergenic	novelGene_46404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	15.204851199535	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	14	1084	194955	198156	FALSE	35	CTGTGATGTCATCTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLPMAVLFLLLLFLCWPLKAAAENIQAIYVALGEAMELPCPSPPTLHGDEHLSWFRSSAAGSSTVLVAQAQVARPAPDQGKLGRESRPKLLGNYSLWLERTKEGDAGRYWCAVLGQHYTYQNWRVYDISVLRGSQLSARTADGSPCSVLLCSVIPPRRLDSVTWLEGKGPVRGRVQSFWGEGAALLLVCPGEGLPEPRGRRPRIIRCLLPQNKGISFSLAASVDASPAVCAASTGWDMPWILMLLLAAGQGVIILTLSIVLWRHRTQRASCRSGSLPPRGKKRESAYGCEVSHLTSVASFLGEGVARNTDLGFLVTSLLFLTLYGSFSPDASIPQFKPEIQVYENVHLACLSPPAPKTR	194941	198338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_195013_195500_195831_195950_196215_197088_197483_198131
794801	contig_5649_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_82411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290753	1289381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1289400_1290800
794804	contig_12010_pilon	-	1050	9	Intergenic	novelGene_160936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_8	39.0302366761976	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	14	1003	68491	49038	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVTLGGRGLRLWRVARGGGAGWKFIATSPASQLSATELTEMRNELFNKEKSRQLSLTPRTEKIEVKHVGKTDPGTVFVMNKNISTPYSCAMHLSEWYCKKSILALVDGQPWDMYKPLTKSCEIKFLTFKDRDPREVNKAYWRSCAMLLGCVIERAFKDEYVVSLVRAPEVPVIAGAFCYDVVLDKRLDEWMPTKENLRSFTKDAHALIYKDLPFETLEVEAKVALEIFQHNKYKIDFIEEKASQNPERIVKLHRFGDFIDVSEGPLIPRTSVCFQYEVSAAHSLQATQPGLVRRFQGLSLPTHLRAHFTIWNKLLERSRKLVSVCDN	68504	48990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_49107_53133_53288_54214_54281_56126_56240_59413_59482_61445_61546_63993_64134_67290_67498_68418
794806	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
794807	contig_567_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_33998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCCCTTGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580918	578989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_579000_580900
794808	contig_7340_pilon	-	2323	2	Intergenic	novelGene_159890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTAAGAAAGGCTGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87160	84552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_85270_85554
794811	contig_16122_pilon	-	834	8	Intergenic	novelGene_134494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	186.125040261231	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	62	637	110548	104536	TRUE	15	TTCGATCCTGTGTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSQLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFVSSFKIVL	110609	104300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104371_104408_104558_104828_104918_104996_105116_105255_105407_108757_108867_110332_110368_110497
794814	contig_14563_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_135016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATCTAGTTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32281	33673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_32300_33700
794815	contig_14563_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_135017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAGATGGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33979	34920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_34000_34900
794816	contig_10197_pilon	+	1285	2	Intergenic	novelGene_115292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	716	1159	1261939	1263353	FALSE	15	AACTTTTGTTACCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1261223	1263479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1262123_1263093
794817	contig_4736_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_168640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384075	386253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_384100_386300
794819	contig_16504_pilon	+	2094	3	Intergenic	novelGene_167950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	8	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTTGTTTTTCATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694537	699945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_+_694791_694913_695362_698552
794820	contig_4392_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_117333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAAAAAAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545628	547154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_545600_547200
794821	SIRV4	-	461	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
794822	contig_8683_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_150260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAAGTCGATTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616260	616850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_616300_616800
794823	contig_3787_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_102390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444098	444925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_444100_444900
794824	contig_3948_pilon	+	1561	3	Intergenic	novelGene_53365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	500	970	1860968	1861438	FALSE	35	GACTCATTGAACAAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1812316	1862029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812478_1813844_1814073_1860857
794826	contig_12122_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_174996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGTTTGCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91925	93773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12122_pilon_+_91900_93800
794828	contig_14341_pilon	+	374	4	Intergenic	novelGene_111864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3063	junction_3	1348.60158023866	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	550127	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	550124	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_550151_550355_550485_551481_551581_551668
794829	contig_10286_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_98413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCAGTAAAGGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397751	398509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_397800_398500
794832	SIRV4	-	523	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	96	-2	96	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5062	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
794833	contig_6954_pilon	+	1446	7	Intergenic	novelGene_64436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	49	junction_1	74.6874970943747	185	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	61	1254	447943	486868	FALSE	40	GCAAAAGCTTGTATATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFLPTWDPRRPRDGRPVGAMSQVLGKPQPEDEDDDEEEDELVGLADYGDGPDSSDADPDSGAEEGVLDFSDPFSTEVKPRILLMGLRRSGKSSIQKVVFHKMSPNETLFLESTNKICREDVSNSSFVNFQIWDFPGQIDFFDPTFDYEMIFRGTGALIFVIDSQDDYMEALARLHLTVTRAYKVNTDINFEVFIHKVDGLSDDHKIETQRDIHQRANDDLADAGLEKIHLSFYLTSIYDHSIFEAFSKVVQKLIPQLPTLENLLNIFISNSGIEKAFLFDVVSKIYIATDSTPVDMQTYELCCDMIDVVIDISCIYGLKEDGAGTPYDKESTAIIKLNNTTVLYLKEVTKFLALVCFVREESFERKGLIDYNFHCFRKAIHEVFEVRMKVVKSRKVQNRLQKKKGATPNGTPRVLL	447882	487060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_448082_466830_467127_474666_474867_476113_476229_477440_477584_482257_482407_486716
794834	contig_7408_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_168751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAACAAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38095	36221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_36200_38100
794837	contig_7593_pilon	+	1569	4	Intergenic	novelGene_127278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.1169043222683	101	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTTAATAAACAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43577	57818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_43689_50348_50494_51977_52124_56651
794841	contig_11851_pilon	+	1695	2	Intergenic	novelGene_146549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	219	401	21555	21737	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLFPYIKENIKEYLQTHWEEEECQQDVSLLRKQAEEDSHLDGAVPIPAASGNGEDDLQQAIQAVVDNVCWQMSLDRKTTALKQLQGHMWKAAFTAGCMKAEYVAVQVTLNIFPAPNPNTLFTSPLSHVYIA	20252	23031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_20357_21440
794843	contig_14341_pilon	+	559	4	Intergenic	novelGene_111861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3063	junction_3	1348.60158023866	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	119	508	550058	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	549939	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_550151_550355_550485_551481_551581_551668
794844	contig_1986_pilon	+	1693	4	Intergenic	novelGene_64150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGACGACTAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383162	410361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_384468_402864_402993_403604_403720_410216
794845	contig_3601_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_132882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGTAAGAATATAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173007	173594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_173000_173600
794847	contig_3948_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_53262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATCAACATTTTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360211	1358372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1358400_1360200
794848	contig_3394_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_152701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATCATTGAGGAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504005	506148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_504000_506100
794849	contig_4783_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_108400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAATCCACAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269303	270933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_269300_270900
794850	contig_14405_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_85624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351543	350121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_350100_351500
794852	contig_12270_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_113585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGATGCTGATCAGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13850	14426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
794853	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794854	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
794859	contig_4364_pilon	+	1856	4	Intergenic	novelGene_102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	23.1564725772779	33	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	126	455	981403	1004956	TRUE	30	CATGATCCGTTTGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSPQRPLLASRPVAGGAISDVCIPGPCRWRAHGDGGPGAAGHTALLGAPTPAEAEGRRQEHPPPAAGEGAARGSQQPAPRGAGPSPGHRRDATWPFPNSCPGSPEPR	981277	1013691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_981669_1004892_1005024_1011113_1011331_1012574
794860	contig_4315_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_46859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGGTTAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633385	632559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_632600_633400
794861	contig_4315_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_46858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACTCGTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630482	630151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_630200_630500
794862	contig_5324_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_102062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGGTAGAGTATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441419	443114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_441400_443100
794863	contig_6210_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_171877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTAATGTGCTATAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63316	61620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_61600_63300
794864	contig_4845_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_53655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTGCCAATAACATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467911	466624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_466600_467900
794865	contig_6451_pilon	+	657	5	Intergenic	novelGene_173692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	86.7939370002306	996	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	13	453	12389	243826	TRUE	5	CTCTCCATGTGCGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCALPSLLFPLASPEEPIYLLASARCRTYHGNSRRNSLRLFGSVE	12376	277974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231_153334_243695_243857_277800
794867	contig_2310_pilon	-	1472	7	Intergenic	novelGene_71601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCGAAACGAGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119294	106065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118168_118358
794868	contig_4339_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_146108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231563	1233136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1231600_1233100
794869	contig_20561_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_166361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTAGATGGAATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36233	38795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_36200_38800
794875	contig_8106_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_139736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACAGGCAGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114987	114204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_114200_115000
794881	contig_12496_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_170713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGATTCCCCTGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316370	316861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_316400_316900
794882	contig_8920_pilon	-	2148	4	Intergenic	novelGene_146056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.0388511535855	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	537	1403	64349	63483	FALSE	15	CCAAAGTCTCTTGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNNVNKTNMRESFNREEPYDYEKNFSNISNFIQQPQIVIEEKSQMCNICGKLFRRNSYLIQHERIHKQEKPHKCHECGKAFDHSSNLIHHQRIHTEEKPYECSECGKTFRRSSHLIQYQIIHTGEMPYMCNECGKAFGRSSSLTQHQRIHTREKPYECNECGKAFSQSSNLIEHQRVHTKERPYECNDCGKTYSHNSHLIEHQRVHTGETPYNCNECGKSFSRTSLLIKHHRIHTGERPYECIQCGKTLSWNSHLIQHKKTHGGIKPYEVKNVRKQSSIVHTLLII	94914	62737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_64428_74320_74440_93782_93946_94738
794883	contig_14322_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
794884	contig_5782_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_162138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCTTTTAAATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132091	1133179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_1132100_1133200
794885	contig_2829_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_175001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATCTTTGAGTTCTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296230	294727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2829_pilon_-_294700_296200
794889	SIRV6	+	484	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	172	2	139	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
794890	contig_10163_pilon	+	1808	9	Intergenic	novelGene_82638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	157.723997460754	1	96	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	115	744	149701	181300	TRUE	25	GCCAAAATGTTTGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLSRATVHDPETGKLTTAQYRVSKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANYGVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYVSYG	146760	186519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_146825_149650_149848_152146_152324_155412_155484_165096_165197_175174_175229_181219_181302_183906_183969_185518
794894	contig_11601_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_141038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	906	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTTTGTCTGAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112366	113800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_112400_113800
794895	contig_7894_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_170787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAGTTAAGCGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227270	225842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_225800_227300
794897	contig_10082_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_63840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAACAACAATGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53043	54198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_53000_54200
794898	contig_1301_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_47388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTGCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723062	720962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_721000_723100
794899	contig_5485_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_37771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATACAGTTCTGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640147	638456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638500_640100
794901	contig_8106_pilon	-	1860	6	Intergenic	novelGene_139728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.7320512717439	887	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	65	517	85457	65556	TRUE	30	AAGAATACTTGTCGATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDAWAGQTVPGTAERGAVAAAMTDQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDKIILQLNRYYPQILTNKEAEKFRNPRAALRVRLCNLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSCLPSRHALQNSDGTELDSGVERWELSDRGNTSLLPSLCLCLSLCLSPSTLPWHQLLL	85521	62478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_62901_63885_64508_65256_65705_66863_67018_69922_70066_85450
794903	contig_10581_pilon	-	1216	8	Intergenic	novelGene_41382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGGCCATGCAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572697	560752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_560820_561138_561219_561863_561926_563095_563198_563927_564070_568276_568333_569038_569155_572106
794905	contig_4838_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_144796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	939	1298	284414	284773	NA	40	CAAATGTATATAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLGQRGKIKQLLGMKNGCRNLVTSTSQKHFHHIYIMQHYNTKLAAVVTKQVFLANKNKLDTFLCMELSYVFPFLVQNIEKNIGTLCSDKSFFFFPFTSFRCSAFQFSFERKINSWFN	283475	285252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_283500_285300
794906	contig_6497_pilon	-	1420	4	Intergenic	novelGene_35574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	50.9378706530482	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	352	1272	201514	194894	FALSE	35	AAATTATAGTTTGTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELVERFALYGAIEQYNALDEYPAEDFTEVYLIKFLNLQSARTAKRKMDEQSFFGGLLHVCYAPEFETVEETRKKLQERKAYIARTTKNKDHRMTKKKLVTEHKDAEDHRQDFHSETSGFCASALNTSTGSSNPYSCESPLCYFSSKCMCSSGEHVARASNSSQDGRNHGEAVEHCNYNKSLQKIQMKTFKNSVACPGAQKVITPSEAIDRFMPRTTQLQERKRRRENDCRLGTFLETSTSSNEVMIGPKLPDIPKVDMHDDSLNTTANLIRDKLKEVISPVPKPSEDKLEDVRTSHPLKQRRRI	201865	194745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_194981_196708_197269_199566_199713_201386
794908	contig_3721_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_123802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAAGAAAAATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77154	78117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_77200_78100
794909	contig_3602_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_60686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATCCATAGGGTTTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271248	1269603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1269600_1271200
794910	contig_15720_pilon	-	534	3	Intergenic	novelGene_41877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2672.5	7	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279856	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279229_279654
794912	SIRV4	-	310	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1208	3	1208	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
794914	contig_10734_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_51086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534627	536649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_534600_536600
794916	contig_3004_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_127525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCAGAGGCATCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394913	393925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_393900_394900
794918	contig_9363_pilon	+	1383	4	Intergenic	novelGene_6645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGGTTAAGTGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939830	941596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_940481_940675_940830_940919_941005_941102
794922	SIRV5	+	316	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	9	880	9	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8324	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
794924	contig_7882_pilon	+	1942	8	Intergenic	novelGene_175004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	63	junction_5	71.4057106274007	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	160	1083	80736	295031	FALSE	5	TCCTCCTGCTCTTTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARELEKARQQLQDEVRQVGSQLLEERKRRETSEAQARRLQKRVLLLTKERDGMRAILGSYDSELTPAEYSPQLTRRIREAEDMVQKVHAHSSEVEAQLSQALEDLGDQKQRADMLEMELKLLKSQADPTDQSFLFSKEEVDTLRLKIEELEGERSRLEKEKKTLEMQLEKLTLQGDYNQSRTKVLHLRMNPASAARQRLREDQVQLQGECERLRELVHALEQGSAVPADLEGTAGLPSAKEVTELKKQVESAELKNQRLKEVFQTKIQEFRKVCYTLTGYQIDITTENQYRLTSMYAEHKADCLLFKATGPSGAKMQLLETEFSRTVGELIELHLLRQDSIPAFLSSLTLDLFSRQTMA	6334	295890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_+_6482_80723_80865_97482_97540_117721_117811_141355_141447_176035_176244_219866_220058_294872
794926	contig_6937_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_175015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	231	317	220884	220970	NA	25	GAATTACTGTTAATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCPLCTYPAGEAQPEARHPRNFLNIAHRSQSTLPHKWSSKLQSFLPALPDLSCKVHSITCWKGNKNSITRKIKLKKMTILPKEYTLFFLFNVLVVTLLRKSDSG	220653	222114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6937_pilon_+_220700_222100
794928	contig_4838_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_144789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCCATTATTCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232129	230890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_230900_232100
794929	contig_3948_pilon	-	1591	6	Intergenic	novelGene_53235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTAAGTAGGAGAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967991	964582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_964639_964721_964760_965225_965317_965631_965684_966104_966152_966684
794930	contig_10296_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_168877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTGTCTCAGTGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485072	484039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_484000_485100
794932	SIRV4	-	460	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1058	3	1058	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
794933	SIRV6	+	504	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
794934	contig_15066_pilon	-	890	9	Intergenic	novelGene_149531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	8.52844505170784	204	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	20	799	95894	93326	FALSE	30	AAAAATGTATCTTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSAFKMASPQGGQIAIAMRLRNQLQSVYKMDPLRNEEEVRVKIKDLNEHIVCCLCAGYFVDATTITECLHTFCKSCIVKYLQTSKYCPMCNIKIHETQPLLNLKLDRVMQDIVYKLVPGLQDSEEKRIREFYQSRGLDRVTQPSGEEPALSNLGLPFSSFDHSKAHYYRYDEQLSLCLERLSSGKDKNKSVLQNKYVRCSVRAEVRHLRRVLCHRLMLNPQHVQLLFDNEVLPDHMTMKQIWLSRWFGKPSPLLLQYSVKEKRR	95913	93234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_93374_93463_93545_93709_93797_93901_93936_94117_94224_94350_94423_94934_95088_95265_95372_95801
794935	contig_17769_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_124268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGATGTTTCTATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107449	108050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_107400_108000
794939	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_98250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	CTCCTTAGGCCTCTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
794940	contig_4151_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_65254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTTCTGTAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567192	569312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_567200_569300
794941	contig_13760_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_61273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATATAGCAAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53210	53668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_53200_53700
794944	contig_5423_pilon	-	1678	3	Intergenic	novelGene_85277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	448	junction_1	92	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	49	492	561528	558772	FALSE	40	TGTAAAAAAGCCTCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	561576	557585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510
794946	contig_9437_pilon	-	1486	2	Intergenic	novelGene_141716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	16	junction_1	0	63	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119832	118164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_118767_118948
794947	contig_1699_pilon	-	1840	2	Intergenic	novelGene_72804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTTTAAGATTTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30733	28792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_30393_30493
794948	contig_348_pilon	+	1493	7	Intergenic	novelGene_67591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	790	1101	252769	253419	TRUE	30	ACACGGCTGCACCAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSKVMPALVILNPVNPKRAACRKPPMPVRKFTAPDPSAFSVHTLKGSVMLAKLLSKRPCTRPGSFSSIQPTANMLQVMAGPWGDVTASYTSRFLLRMLGLRG	251851	254223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_252460_252587_252801_252875_252977_253147_253242_253334_253470_253720_253856_254016
794949	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	6	337	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
794952	contig_9706_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_20808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACCCCATATCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
794953	contig_8978_pilon	-	1259	7	Intergenic	novelGene_49348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	516.479643570027	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	28	885	194082	190856	FALSE	45	TGTTGATAAGAATAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLAWMDRNSTRSVFRAAITHSVAVLNIGVNGATRSTGGAIHGGAIHQRRILCCLHWKLCLFPLALWVWLLASSLCIAGWKGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRLGVACLRDWRRVCSQTTVNDSATSVKFSQKGEP	194109	190481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_191693_192265_192403_193215_193398_193613_193768_193967
794954	contig_9363_pilon	-	1507	11	Intergenic	novelGene_6641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_10	55.3632549621136	263	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	19	1395	949591	939928	FALSE	10	GCTCTGGACTTTGGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSTTAMAAQGAAAAVVAATTGVAGEGEPGPGENVAVEGTAPSPGRVSPPTPARGEPEVTVEIGETYLCRRPDSTWHSAEVIQSRVNDQEGREEFYVHYVGFNRRLDEWVDKNRLALTKTVKDAVQKNSEKYLSELAEQPERKITRNQKRKHDEINHVQKTYAEMDPTTAALEKEHEAITKVKYVDKIHIGNYEIDAWYFSPFPEDYGKQPKLWLCEYCLKYMKYEKSYRFHLGQCQWRQPPGKEIYRKSNISVYEVDGKDHKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYFDVEPFVFYILTEVDRQGAHIVGYFSKEKESPDGNNVACILTLPPYQRRGYGKFLIAFSYELSKLESTVGSPEKPLSDLGKLSYRSYWSWVLLEILRDFRGTLSIKDLSQMTSITQNDIISTLQSLNMVKYWKGQHVICVTPKLVEEHLKSAQYKKPPITVDSVCLKWAPPKHKQVKLSKK	949609	939815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_939993_940322_940478_940670_940822_940913_941008_941105_941247_942987_943078_943833_943999_944092_944147_947708_947885_947963_948039_949380
794955	contig_11948_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_174391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188936	187923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_187900_188900
794959	contig_3426_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_57924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATACCAGGTACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196855	198295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_196900_198300
794961	contig_6914_pilon	-	1044	7	Intergenic	novelGene_151744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	5.02217305777312	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	63	782	156681	153543	TRUE	10	GTTACTGTTACTGGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAGLKARVVCRAQWNLACPMALRVLTRTLGSLSLAPPAASTPAQNLLPAAQVIRNAFLQPLFASKLLPCRPVLTFVALNAKFVSWKSHTKYTVTPVKMKKSGGRDHTGRIQVHGIGGGHKQRYRMIDFLRFRPEQEAMRGPFEEKVIVVRYDPCRSAHIALVAGGSRKRWIIATENMKAGDVILNSDHIGQMAVAAQEGDAHPLGALPVGTLINNVESEPGRGAQYIRAAGGQSCFSPRDMWCAAAEDEWDGHHPAAL	156743	152911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_153161_153529_153629_153901_154013_154088_154205_154316_154459_155067_155237_156585
794963	contig_5569_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_86730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214502	212392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_212400_214500
794964	contig_7446_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_101947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAATGAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169329	167507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_167500_169300
794967	contig_17198_pilon	-	1363	7	Intergenic	novelGene_62360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	94.2928358301355	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	87	809	792266	760020	FALSE	30	GTCTAAATTTACCTACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLEILLKDDCLDIEKLCTFSQRFPLPSMYRALVWKVLLGILPPHHESHTQVMTYRKEQYSDILHALQVVRFVSDATPQVEVYLRMHQLESGRLPRSPSFPLEPEDEVFLAVAKATEEMVEGCIDCYWIVRCFVNQLETKYRDSLPQLPKAFEQYLNLEDSRLLNHLKMCSVMSRLPYDLWFKRCFAGCLPESSLQRVWDKVVSGSCKILVFVAVEILLTFKIKVMALNSAEKITKFLENIPQDSSDAIVSKAIDLWHKHCGTPVHSA	793719	759465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_760107_761722_761853_763119_763266_773121_773260_790726_790915_792232_792314_793680
794968	contig_4125_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_25156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890461	888752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_888800_890500
794969	contig_8616_pilon	-	2150	2	Intergenic	novelGene_72403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	66	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	415	750	213657	212070	FALSE	20	GTAAGTATGGTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCQSHSSESLVPPSSESAFLVASSESLSWQQPMASRGPHSVPAPPVSPPAGPSPSFCDVINPAAAALQAHTPSHPFPFSHHKRLKVKVRKLRHRVEVICPRSTTFGETRI	214071	210669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_212142_213393
794970	contig_6302_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_171697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATGGCAACTCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134234	136185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_134200_136200
794971	contig_5372_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_149713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGGGACTAGGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162902	164815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_162900_164800
794972	contig_10609_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_123973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATCAACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634933	633659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_633700_634900
794973	contig_11677_pilon	-	1876	5	Intergenic	novelGene_85901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	8	412	469521	469117	TRUE	20	GACGCAGGGCCCTTGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQMGQVVGQCSIQAPDQTCSIHMQEQLHRLGQNQEWGIRTKGHPQHPCQDTWAWALLSPPEQGERGLGSFRIAGTLPLGQKERWHRGYGAWPACSTQFCTQPCLLAGPDSQGSTALAGKVYILSCPHWPGPDPRKA	469528	452104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_452166_466818_467032_467449_467625_467990_468146_468256
794974	contig_11422_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_99078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1300
794975	contig_504_pilon	-	1192	11	Intergenic	novelGene_54461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2.37697286480094	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	384	1190	712738	706346	FALSE	10	GTCTGGGAGGCTCAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKDPVFRISPQSRHARPNAEEPSDEDEDVQAERIRTATALTTSNIDEKPVIIASCLHKEYAGKKKCCFSKRKKKIAARNISFCVKKGEILGLLGPNGAGKSSSIRMISGITKPTAGEVELKGSSSVWGHQEDNVVRFLGYCPQENPLWPTLTVREHLEVYAAVKGLRKEDAVAAITRLVDAFKLQELLNVPVQKLTAGSSRTLCFVLSILGNSPVLLLDEPSTGLDPTVQQQMWQTIQAAIKNTEKGALLVTHYLAEAEAVCDRVAIM	717244	706343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_706449_707890_707986_708059_708136_709357_709537_709977_710070_711193_711312_711894_712016_712715_712808_714054_714135_716129_716250_717130
794976	contig_6497_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_35615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633229	630381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_630400_633200
794983	contig_14176_pilon	-	2070	13	Intergenic	novelGene_74856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	15.0351440151252	1	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	658	1431	427766	419916	TRUE	60	AAAAAACTTACCCTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHGEALLSPLGAGEAQLGSTPLSLGPCSYCASSPAPSLATSWTGGSRTVWTTPPRALLSEMPAFRAKARRQREGPGCSL	451684	413144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415444_415539_419211_419286_419757_419969_421553_421693_422006_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431341_431423_431555_431612_431719_431898_451351
794984	contig_14621_pilon	+	2014	2	Intergenic	novelGene_105840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	1	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTTGTGGTTTTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116099	126770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_124824
794985	contig_9848_pilon	-	1964	5	Intergenic	novelGene_79992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	699	junction_1	524.982618759898	4	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	18	557	149215	134114	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDTYDDRAYSSFGGGRGSRGSAGGHGSRSQKELPTEPPYTAYVGNLPFNTVQGDIDAIFKDLSIRSVRLVRDKDTDKFKGFCYVEFDEVDSLKEALTYDGALLGDRSLRVDIAEGRKQDKGGFGFRKGGPDDRGMGGSRESRGGWDSRDDFNSGISIYSITTYLFSSGLAAVAQFL	149232	132706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_134245_134566_134664_134747_134813_136653_136842_149156
794987	contig_18420_pilon	+	1289	8	Intergenic	novelGene_109348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	58.3487054575457	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	75	920	92356	96909	FALSE	40	AAGAGGTTGAAGACTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKVHCSGIGRFRAGSYCLPALGRTLPA	92281	97278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700
794989	contig_5093_pilon	-	1679	4	Intergenic	novelGene_135075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	37.5972812255827	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	129	1370	535931	466912	FALSE	65	ATTAAAATAAATCTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGGGTQLEYTPPDGGWGWVVVGASFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQEIFNTSYSEIAWISSIMLAVMYAGGPISSVLVNKYGSRPVVIVGGLLCCLGMISASFSTNVIQLYLTVGFIGGIGLAFNLQPALTIIGKYFYKKRPMANGLAMAGSPVFLSTLAPFNQFLFNNYGWKGSFLILGAIFLHACVAGSLMRPIGPKQTKSKSKNKTDMRVDESGVKESRERKSIWERINKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDKGIDEYSAALLLSVMAFTDMFARPSVGLIANSKLIRPRIQYFFSFAIMFNGICHLLCPLAEDYTSLVVYAIFFGLGFGSVSAVLFETLMDLVGAVRFSSAVGLVTVVECCPVLLGPPLAGKNISHRGKQKSMQLIFIS	540825	466602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_467790_471231_471376_535711_535961_540726
794993	contig_50_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_122228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTCCTGTTGTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111073	110147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_110100_111100
794996	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
794997	contig_7963_pilon	-	709	6	Intergenic	novelGene_58313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	566	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	57	374	48841	39369	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDPSRAMSIPAMWSTPAWIVLSPWSGRQSLILPKTKC	48897	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40021_43707_43819_48741
794998	contig_3233_pilon	+	836	7	Intergenic	novelGene_56556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	354.915365498124	12	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	384	698	746379	747909	FALSE	10	TGGGATTGTGTTGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738712	748047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738780_742741_742836_743705_743819_745289_745346_746325_746424_746936_747016_747718
795000	contig_533_pilon	+	1486	5	Intergenic	novelGene_174258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	2.44948974278318	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	28	921	131021	155937	FALSE	30	ATATACTGCATGTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVPCWNWGWAAVSFGPHRGLSALLARKPGRAPRWLPACRQKTSLSFLNRPDLPNLAYKKLKGKSPGVIFIPGYLSNMNGTKALAIEEFCKSLGHACIRFDYSGVGNSDGILEECTVGKWRKDVLSVIDELADGPQILVGSSLGGWLMLHAAIARPEKVVALIGVGTSADGLVTQFNQLPVEAKKEVEMKGQWVMPSKYSEEGVYHIQYSFIKEAERHCLLHSPIPVTCPVRLLHGMKDDIVPWHTSMQVADLVVSTDVDVILRKGSDHRMKEKADIQLIVYTIDDLIDKLATSA	130993	156502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_+_131139_134343_134528_143946_144059_144428_144567_155595
795001	SIRV1	-	174	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	8	3648	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
795002	contig_5551_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_134232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTAACTTAAAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339759	341336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_339800_341300
795003	contig_10734_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_51213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	8	346	1147081	1147419	NA	35	TCAGCAGTTCAAATCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMAAEVDFGDLELFEAFDHPEESIPKPVHTRFKDDDDDDDEEEEEENGVGDAELRERLRQCEDTIERLRAENILPARGPCHTGVWSGLSSGSGAAEIPTGPEFQVVPLAPQAD	1147073	1148665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1147100_1148700
795007	contig_6048_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_73230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTCATTAACACAGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767102	1765997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1766000_1767100
795009	contig_11258_pilon	-	386	5	Intergenic	novelGene_67740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27021	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGAGACTTCCGCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53625	49139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_49231_49378_49417_50089_50154_52748_52870_53553
795017	contig_3754_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_146826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTTGGATATGATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172307	171613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_171600_172300
795019	contig_8322_pilon	+	1128	2	Intergenic	novelGene_143231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGGACAGTCTTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252236	253888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_252676_253199
795020	contig_3523_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_171487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAATAAATGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122780	121408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_121400_122800
795021	contig_1719_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_87336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTATGTATATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526041	525399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_525400_526000
795026	contig_7241_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_171546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAATGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160752	161759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7241_pilon_+_160800_161800
795027	contig_12031_pilon	-	2356	3	Intergenic	novelGene_137577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1195	1569	400033	399659	TRUE	80	AGCAAAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRCVATVMSPGATHSTESSFHQPPAVMELTPTGDPMCVRVELCSIGFSMAHFSEVDHQDFFLRHLWVDLNLQHFGSQPNVLTSCPNQGLLRHQEDLYSVACTSEPCWVDASRTLHRKGQMSQ	404215	398722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_399341_399489_400998_403985
795033	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	51	521	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795034	contig_6589_pilon	-	555	6	Intergenic	novelGene_25853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1375	junction_3	872.762418989269	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	104	553	957293	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	957795	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758
795037	contig_6958_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_70002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAAAAAGACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736734	734487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_734500_736700
795039	contig_8075_pilon	+	1388	8	Intergenic	novelGene_42510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	219.160550598814	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	267	704	780728	794885	FALSE	20	CTTCATAGTTTTAGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGADEEELGSQIEEIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYADEPMTTFVVCNECGNRWKLSGPLRKWIL	772236	795569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_772297_776800_776889_780609_780756_781927_781963_782969_783114_785918_786059_793327_793386_794852
795040	contig_5640_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_27256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGCCATGCAAAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138250	136767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_136800_138200
795041	contig_3960_pilon	-	2005	2	Intergenic	novelGene_138024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTTCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505608	503146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_503446_503902
795042	contig_13015_pilon	-	1169	5	Intergenic	novelGene_165543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	20.8146582964986	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCTGATAAGCTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369275	338352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_338811_351800_351864_351964_352130_368116_368494_369169
795044	contig_5084_pilon	-	1501	3	Intergenic	novelGene_64553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.5	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCACGTGTTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580116	531590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_532855_570209_570287_579956
795047	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
795048	contig_11978_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_62910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATCATTGCTTCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842932	843934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_842900_843900
795051	contig_3382_pilon	-	1896	13	Intergenic	novelGene_124035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	369.951676649202	1	97	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1086	1712	224882	176852	FALSE	25	ATAAATGTTTGCTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEIVGQAFIFLIAGYEIVTNTLSFATYLLAIHPDCQEKLLREVDRFYEKHAVLEYHTLQEGLPYLDMVIAETLRLYPPAFRFTRESAKDCELLGQRIPAGAVLEMAVGALHRDPEYWPQPEAFDPERFTAEARRQRRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLRVLRKFRFQACAETQLESKSALAPKNGVYIKIVPRQAGRPP	344838	176667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176933_181453_181617_183905_184044_189061_189154_224729_225045_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
795052	SIRV6	-	256	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTAGGCTACATGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_1900_2100
795055	contig_7898_pilon	-	2125	2	Intergenic	novelGene_47603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	49	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	9	416	560200	554697	FALSE	35	TGGAGAGGATAAGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGTCLLWSYCGRGWSRAMLACRLPGFRSSSSGGPLGARLLSHEKQSTETHFGFETVSEKEKGGKVYHVFESVAKKYDVMNDMMSLGIHRIWKDLLLWKMHPFPGTQLLDVAGGTGSNLVSYPWVPLSIFYRS	560208	552987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_554903_559998
795057	contig_6595_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_122556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCTCTATTGCCTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705595	707924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_705600_707900
795058	contig_4232_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_63250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAGCCATGTTTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354509	355307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_354500_355300
795061	contig_17796_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_33844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAAAGGCCCTCATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149340	147298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_147300_149300
795062	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
795064	contig_5317_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_76503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	114	524	35282	43326	FALSE	25	TTTTTCCATGGGGTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33675	43414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
795065	contig_6189_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_164935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGTGGTAGTCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33388	34984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_33400_35000
795066	contig_10003_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_88146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAAAACACCTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371673	371270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_371300_371700
795069	contig_8063_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_152430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTGTAAAGATTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151252	152415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_151300_152400
795070	contig_10074_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_57196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTACTTTTCAAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586278	585454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_585500_586300
795074	contig_3382_pilon	-	1405	11	Intergenic	novelGene_124105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	659.913297335339	6	7	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	15	1166	725130	673341	TRUE	30	TAACTTGTCTAGTAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDIASRDRDRNSRDRSPRDRDRKDKNRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI	725144	672480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_672548_673168_673519_677153_677346_685166_685197_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303_694415_696445_696545_712955_713051_725096
795078	contig_14516_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_153929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTCCCAGGGCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299318	299022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_299000_299300
795079	contig_9752_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_121998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGATGCAATTGTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6921	5152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_5200_6900
795082	contig_5324_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_102043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACGTTCTGGATACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18010	18828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_18000_18800
795083	contig_5324_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_102044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGATCCCAGCAGTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20108	20914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_20100_20900
795086	contig_17814_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_168521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	121	414	76792	77085	NA	50	GTTTTCAAAGTATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLRRAQGAAGGSAAAAASGPGSSSSSISSSFSLPPSAVVMARRWSTKESLRWRSALVLLFLGGVYGKCPRLCAPLTKQSWGDPQPRGLQDGVSPGDPGRDPSRLRDKDRARGRCDREVGGRGCFRPLAYLGVLERD	76671	78741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_+_76700_78700
795087	contig_7744_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_62465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTATTCAAGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433387	432888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_432900_433400
795088	contig_6876_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_147016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	226	576	76842	77192	NA	20	TGTTTAAGCCTCACTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFNYGTGKGYGLYHGLPEERTNLSWKKYSQNAPQKRGWQDFVSHTLDMLSGGISTWRRTSCLVKQRVSKKRGRSSTRWIDTVAATMGSNTAITVRMVKDWATFHSIAHRVATSRN	76616	78130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_76600_78100
795091	contig_15596_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_139522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	528	950	104797	104375	NA	55	CAAAAAAAAAACACCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRRAYSGLTRASPHAPQDMTEGRRQQGRAPGCPSSPLCFPKPTPHSRSSASPSTSRPPIVPAQCPQASLQRQLLPARDPGTSGYGGDFHTSSDEGRSSGKPEYCSALTGFPDVSRMPSPGSPSQSAGQELKNTLGRVHS	105324	104156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_104200_105300
795092	scaffold_14128_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_169534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	551689	551366	NA	20	GTGGGAAGACGGTTACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTCGSPRGRCVWRGLLRAPRPGLGLSPLIVGEGEVARDPTTPAPSSVPQHPCLPEQHLERAPPALLPGPGHPSSSHGFSARQRLLPAEPGQENLRPAQRGAAEAQVG	551690	551034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_551000_551700
795093	scaffold_14128_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_169533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAGAAAAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550527	549968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_550000_550500
795094	contig_10479_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_147110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128734	126255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_126300_128700
795095	contig_11978_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_62816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCCCAGCAATTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404435	405190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_404400_405200
795096	contig_7904_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_160032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGAGGGTTATGTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530694	529745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_529700_530700
795098	contig_6279_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_164765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	341	646	90134	90439	NA	35	CTCATGACTTACATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPRDVKWGKIENFRNLSLVGNTYRHRMNAGKHGPSPLKDYRNEKEKLTTRQIGSNPSVCHMTFLSGIRRPIPYFKVCFWVSLCGKETMLLSFLINIRPC	89793	90747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_89800_90700
795101	contig_8848_pilon	-	1754	2	Intergenic	novelGene_140470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339093	328566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_329957_338729
795103	contig_14970_pilon	+	2538	1	Intergenic	novelGene_45013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	538	840	142260	142562	NA	10	CCCCAGCAGCGGCCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVFFRINWGKLVLSTLYLNPTLYSLDSLKFFLKCAHTPPKSWPTKFGKPARFARVMEGVTCKVCGLGVWLGMNTVIVYSGFSRRASKYSTNGHITYILT	141722	144260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_141700_144300
795107	contig_10011_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_68057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTGTAATAGAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224729	222459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_222500_224700
795108	contig_14895_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_106698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCGAAGATCCCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136019	133897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_133900_136000
795109	contig_11378_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_112263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACAGTCAACAGAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388985	389659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_389000_389700
795110	contig_1948_pilon	-	1222	5	Intergenic	novelGene_31155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.9554907485873	356	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	105	356	463942	460727	FALSE	30	GATCTTTGTACAACATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPRFFFSHPRVWLPRSRAFSDEEGLDAGLYFHNMMSGHLVKPDTRNCKRPRELEPQMPDSPQLSSLGKSDSSFSESSGLFYKDEALEKDLNDMSKDINLMLSAYAKILRYFADTNN	465535	459860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_460752_462608_462661_462769_462882_463879_463959_465447
795113	SIRV6	+	433	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	530	164	60	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGCCTGGATGCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
795114	contig_15354_pilon	+	2099	10	Intergenic	novelGene_65769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_9	61.867241376641	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	109	1368	663143	673659	FALSE	50	AAAAGGTACAGTGGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLEELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYHNGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGIKGILLVEVGWRF	663034	674390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_663204_664557_664707_665958_666076_666467_666690_669379_669495_670617_670716_671430_671590_672205_672290_672860_672978_673521
795115	contig_2069_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_23570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACAACACCTGCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2277665	2276080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2276100_2277700
795119	SIRV6	+	229	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	501	53	501	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10738	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795122	contig_16633_pilon	+	2282	2	Intergenic	novelGene_165078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAAAAGGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101379	103796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_102371_102505
795124	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8115	14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
795128	contig_5698_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_54992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCCAGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	2220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_2200_3900
795129	contig_13700_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_68262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTCATATCTGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19099	20358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_19100_20400
795130	contig_10531_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_114519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTGTCTTAAAGACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386899	388721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_386900_388700
795131	contig_2069_pilon	-	909	2	Intergenic	novelGene_23169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	120	617	25904	22755	FALSE	40	AATAAATCTGCATTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APARGCPRAVPVSSHSATPDPEGRPEPQRRRGRGRGRRAMPWSPRAAPLWDLVLGVLGTAAFLLDLGTDLWAFVQYVLSGRYLWAALVLALLLLASVALQFFSWVWLRADPADLHGSQPSGRCLALLHLLQLGYLYRCVTGLQQGLLVWRQEVPSEFDMAYADFLSLDISMLRLFETFLETTPQLTLVLAIVLQSGQAEYYQCE	26023	22462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_22960_25611
795132	contig_7870_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_108962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGATTCCAACACATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358629	359293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_358600_359300
795133	contig_5917_pilon	-	1744	8	Intergenic	novelGene_122172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	163.164246783943	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	46	954	794139	741675	FALSE	5	CCCATTCGTGTTTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAQPDSSSPSQARTGSLCSVSIERALPEDRGLYKCVAKNSAGQAECSCQVVVDDAPTSENAKAPGTKSRRPKSSLSTVLGTESDATVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEELWWCSG	794184	740884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_741698_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_793276_793394_794093
795134	contig_5286_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_157371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGCAGTGGGTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573394	574863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_573400_574900
795135	contig_5286_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_157372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACACTGCACATTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575277	575583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_575300_575600
795136	contig_7171_pilon	-	1994	11	Intergenic	novelGene_101263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	61.756376189022	235	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	545	1003	909974	906293	TRUE	15	GACACGGCCCTTGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTAWLLQPRGADGLPAPGQCRLLPAGPGLPAHLP	910518	899210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_899382_901155_901269_901388_901524_901626_901665_902352_902498_905383_905503_905646_905748_905828_905910_906204_906392_908204_908481_909890
795137	contig_17936_pilon	-	1916	5	Intergenic	novelGene_29985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_3	83.1636188486288	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	413	772	167116	161377	FALSE	35	TAAAATTTTGTAGTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLTIEFTEEYPNKPPTVRFVSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWRDC	167528	160232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_161506_161839_161929_162755_162846_166658_166685_167090
795142	contig_16917_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_161939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181574	179808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_179800_181600
795143	contig_366_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_51601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCCAGCAATTCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780094	777846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_777800_780100
795144	SIRV6	+	377	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1748_3065_3165_10724
795147	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795152	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
795154	contig_11034_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_175023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154469	155981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_+_154500_156000
795155	contig_1301_pilon	-	1564	11	Intergenic	novelGene_47378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_10	97.4117036089607	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	54	1181	746763	682660	FALSE	40	CATAATTAATGTCAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNDKEATEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLKYVQEDSCQRGICGKLVCTDFKIAFLGDDESALNNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGVFDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFHFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKRLFLFSYATASQNSTATDTKNHTVMFNTLKDWCWELERTKGSMKYKAVSVNEDYKVCERLPAYFVVPISLPEEDIPHFQGHGIPIWCWSCHNGCALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGIYKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESSGWLEMIRYFRLFFCS	746816	682276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_682767_684244_684370_685185_685293_695781_695858_703498_703629_710363_710458_712730_712862_713946_714020_715057_715201_717955_718017_746682
795156	contig_15066_pilon	-	1015	8	Intergenic	novelGene_149530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_6	5.14682386704338	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	394	924	95037	93326	FALSE	30	AAAAATGTATCTTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNIKIHETQPLLNLKLDRVMQDIVYKLVPGLQDSEEKRIREFYQSRGLDRVTQPSGEEPALSNLGLPFSSFDHSKAHYYRYDEQLSLCLERLSSGKDKNKSVLQNKYVRCSVRAEVRHLRRVLCHRLMLNPQHVQLLFDNEVLPDHMTMKQIWLSRWFGKPSPLLLQYSVKEKRR	95608	93234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_93374_93463_93545_93709_93797_93901_93936_94117_94224_94350_94423_94934_95088_95265
795157	contig_15105_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_150948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTTTGTCAGATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366714	368458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_366700_368500
795158	contig_10549_pilon	-	1060	6	Intergenic	novelGene_110646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	32.7071857548154	158	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	371	1006	529487	524895	FALSE	45	TGAATAAACAGACTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSEIAGSSGSKMENHELDDTIKENLKTLNIVTRKINQLPEAEKYLLEHGSTYVGLNAALCGLIANSLFRRVLNVTQGRLAASLPMAVIPFLTAQISYKGFVSLPLSTGNLSCETCTVTRSGLVGLIFSGLYPVILAIPVNGGLAARYNTALLPEKGNILTYWIRISKPVFRKMLFPILLQTVFAAYLGSRQYKLLIKALQLPEPGLETP	531202	524840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_525088_525720_525836_527209_527404_528335_528439_529456_529751_531095
795160	contig_15120_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_108007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCAAGGACTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170826	172505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_170800_172500
795163	contig_7993_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_170976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATAATTGCCCAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416919	415725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_415700_416900
795165	SIRV6	-	527	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAGATGAAGTTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11329	10491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031_11109_11205
795166	contig_817_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_132477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAATGAACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721391	720122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_720100_721400
795174	contig_12150_pilon	-	2448	2	Intergenic	novelGene_6955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28772	19559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_21146_27910
795177	contig_8045_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_35413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142915	141352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_141400_142900
795181	contig_11449_pilon	-	1597	11	Intergenic	novelGene_170550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTCTTTGCTTTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248036	38344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_38368_59400_59592_74820_75015_98468_98655_105616_105729_127558_127802_145446_145622_182910_183034_236345_236490_241670_241761_247920
795184	contig_9999_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_174664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTCAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196149	194128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_-_194100_196100
795188	SIRV4	-	330	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1188	3	1188	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
795191	contig_8304_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_153168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCATTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84000	81841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_81800_84000
795192	scaffold_12124_pilon	-	841	8	Intergenic	novelGene_22215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCCGGAGGGCGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508444	1473570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473679_1489006_1489095_1491900_1491974_1494274_1494330_1497005_1497095_1506649_1506684_1508007_1508130_1508172
795193	contig_11171_pilon	+	990	7	Intergenic	novelGene_48549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1974.87532658534	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	154	537	51117	64812	TRUE	5	GCTGTGTGTGGTCTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEEHGTIARAS	49126	65964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64783_64842_65540
795195	contig_20844_pilon	-	446	6	Intergenic	novelGene_78615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	479.311756584376	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	24	422	445	206899	206876	FALSE	35	TAAGCGGGCAACAGAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGSDCVDKILQCRRETLSDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKE	209176	206874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209116
795197	contig_8616_pilon	+	1709	13	Intergenic	novelGene_72479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	630.73309969872	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	319	1638	320431	330999	FALSE	15	CACTTCCTTGACTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQREEGEAGEEEEPPAASPHGQGWRPGGRAARNARAEPGARPPALPAMVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVNIRKRDNPGRRLSTHQPGPEELTQSDVPEDADLCSPFLAAEGQLSEEEKPEQQPPRGEEEPEPETSDGSGSWEDAALLMEANLPASAPAPASAPALETLGSSEPLVGTLRQRSTCSSS	318080	331070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318102_318283_318439_320288_320473_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330087_330236_330292_330476_330516_330608_330720_330844
795199	contig_10126_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_105708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	0	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGGCCTTTACCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107239	104498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_104778_107060
795200	contig_17603_pilon	+	2184	4	Intergenic	novelGene_152799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	42.6249796350554	67	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	1626	2183	185853	187577	FALSE	20	AACCTTTAGTTTTTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYLENKTWLSVLEICELHSNVDHHENQGRYLRSHTVENLCESNEGSQCWKTFSWIPDLTGLKRNLPEVNPFEHSECGKVFMGHSYNHHIRSSTRCSACQCKECGESCSSSSHLTTPLRILHREKPHKCKVCGKDLICTSTLKNPVTTLTGEKRYECNECGKDFCSFLSFWTHVRGHKHAVKNVV	172337	187578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_172562_173451_173699_184698_185954_187120
795202	contig_15899_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_128906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14356	15749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_14400_15700
795203	contig_4782_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_73681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGCTAGCCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660259	659545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_659500_660300
795206	contig_7728_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_64735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	286	627	862479	862138	NA	30	TCAAACCTGAGTATCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASGILSLYICLCLFSFKDIIYIGLGLTLLWYNLMLTSNIFKDPISKQGHRHRYLGLRLHHIFPGGHNSIHNSLINLDLSDGVCQTGVMGLGGIPQVRCPHSHQIRGYMISA	862764	860712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_860700_862800
795211	contig_18850_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_142426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGCTGCCTTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174353	173551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_173600_174400
795217	contig_19957_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_57712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGCTGAATTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200543	201300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_200500_201300
795218	contig_6710_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_93554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653789	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
795219	contig_5018_pilon	-	874	2	Intergenic	novelGene_46961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCAGCCTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318608	316395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_317017_318355
795223	contig_6445_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_76977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAATAAAAAGGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392727	390798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_390800_392700
795229	contig_935_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_45528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGACATTTTCTCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93761	92178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_92200_93800
795230	contig_14666_pilon	-	587	2	Intergenic	novelGene_39535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2524	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450822	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765
795231	contig_6870_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_103956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTATTGTACTTCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270835	1269837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1269800_1270800
795235	contig_6056_pilon	+	857	8	Intergenic	novelGene_157879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	90.0376338549836	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	9	524	267066	296286	TRUE	20	TATGATTTTGGAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIMASGSSGLAASRLLTRYFLVQRNGIRHCSYASSRNHLYIDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQKALDYGTKLVGGTTPGKGGKMHLLFMSLLLLLLLQLMKLLRQKCPWLCALPKVFPSRTWYGSSTRCCARERQGWSGQTALESSILENVKLVSCLGIFTRKEELVLCPDLAP	267057	312359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112_287194_291398_291587_291720_291779_296259_296294_310598_310692_312126
795236	contig_5019_pilon	+	2219	1	Intergenic	novelGene_109197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGTTATTTGAGTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142703	144922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_142700_144900
795237	contig_6506_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_153489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTTGTGGTTCTGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180079	178477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_178500_180100
795239	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
795240	SIRV4	+	307	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTGAAAGCTGGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
795244	contig_10023_pilon	+	1970	9	Intergenic	novelGene_123453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	7.51664818918645	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	216	1484	1276	10056	FALSE	5	GATGTTCTGCCTTCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRRSQQCNVTYSCTRQQNCPIDRTSRNRCQHCRLQKCLALGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLHAEVQKQLQRQQQQQREHVAKTPSAGGQGADTLTYTLGLPDGQLPLGSSPDLPEASACPPGLLRAPGSGPSYSSHLAKAGLNGASYHLDYSPERGKAEGRESIYSTGSQLTPDRCGLHLEEPRHSGLGEPGRGPDYSSPGFRSTPETPYASMTEIEHLVQNVCKSYRETCQLRLEDLLRQRPNIFSREEVTSYQRKSMWEMWERCAHRLTEAIQYVVEFAKRLTGFMELCQNDQIVLLKTGAMEVVLVRMCRAYNADNHTVFFEGKYGGVELFRALGCGELISAIFDFSHSLSALCFSEDEIALYTALVLINANRPGLQEKRKVEQLQYNLELAFHHHLCKTRRQGILAELPPKGKLRSLCSQHVEKLQTFQHLHPIVVQAAFPPLYKELFSTEIEPPEGLSQ	704	10542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_791_1146_1289_2715_3226_3447_3570_4440_4574_4721_4830_4986_5098_6522_6633_9894
795245	contig_7440_pilon	-	1037	9	Intergenic	novelGene_61170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_4	260.705503154421	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	50	760	71121	54265	FALSE	30	TTTGTACAACTCCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSELTGKFEKLIVALMKPSKLYDAYELKHALKGAGTDEKVLTEIIASRTPEELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDARIDEAQVELDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRRVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAEALYCAMKGAGTDDHTLIRIVVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKNDTSGDYKKALLLLCGGED	71170	53987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_54325_56284_56408_56649_56709_58967_59064_59972_60067_65872_65930_66361_66442_69429_69521_71070
795253	contig_9434_pilon	+	1780	6	Intergenic	novelGene_150469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGACCGGTGGCCGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34466	49707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_35205_37712_37970_38155_38523_42141_42261_47000_47221_49628
795254	contig_6434_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_61883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTTCTAAATGTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886551	884898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_884900_886600
795258	contig_11026_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_167674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGTTAAAACAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187907	188339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_187900_188300
795260	contig_11026_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_167673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAAGTATTATGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186672	187679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_186700_187700
795261	contig_6365_pilon	-	1712	4	Intergenic	novelGene_133999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	73.4892282356174	20	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	259	726	12349	10994	TRUE	25	CTCTTGACTATGAGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKVAKKIKEKTKTPRKSSNQGRSCPVTSTTATQEGQVSLRKKDRLEVSQKKLPRWLLHSFSPFRHLLH	17699	9774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_11194_12081_12368_17459
795262	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9667	558	517	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
795264	contig_3627_pilon	+	1065	2	Intergenic	novelGene_78523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	9	398	630860	634316	FALSE	50	AGTATAACCAAAGATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	630851	634983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_631000_634066
795265	contig_15327_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_70447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	9	596	275426	276013	NA	30	TAGGTAAATAATTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDMAAAWCLRWGVSRAGAWLLPPPACCPRRTLHKQVDGAEFQSIYSLDKLYPESNGPDTAWKVPVSREPGNTEGAFPCRFWVTSGIWVRIGLACSCVEALPCAPRDVRRAGELVTPATGASVWSGCLGAGCSSGSFRLGRANWICSFQGHQLFRVSFPAHGPKFLSRRQMGSFWSSRVDKKGQSLHTCLLNGRLHCP	275417	276977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_275400_277000
795266	contig_9668_pilon	+	1905	4	Intergenic	novelGene_58143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	653	junction_1	128.998708003866	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	752	1360	331960	342854	FALSE	65	TTAAAAAAATAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKFKIQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPGTLFINPFLICIYELYDERLN	331208	343399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_332161_337930_338032_339303_339445_342688
795267	contig_19769_pilon	+	827	6	Intergenic	novelGene_102262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1453.37309731535	6	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	338	793	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87371_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
795269	contig_12139_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_146451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1459	1800	56864	57205	NA	40	CTCTCAGCAAAATAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIHPSAQTRKFLVITDASFLHIYTQSINKSCWCVSIPKRHTESDLFLPPSLLSTEPKPPCSILCKPLLYLLPLLVFPPHDRQGGPAQIYPKITIIVLPMHFLPAFFLIHMCM	55405	57583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_55400_57600
795270	SIRV4	-	194	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	420	3	-420	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCACCAATAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795272	SIRV4	-	493	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	114	10	114	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5044	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795274	contig_8050_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_114862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTGAAATTAATTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393771	394221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_393800_394200
795275	contig_6557_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_33035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGGGTGTGTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651265	651499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_651300_651500
795276	contig_8063_pilon	+	1198	2	Intergenic	novelGene_152429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGCAATTCAAGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136124	140239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_136376_139292
795282	contig_2332_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_58638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAAGTAACTTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185219	186042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_185200_186000
795285	contig_5096_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_111984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTATAGGACAGAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95703	96901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_+_95700_96900
795286	contig_8020_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_114427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	328	633	273225	273530	NA	35	TCGAAAATATTGTCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVGSYWPLMRLQLLTCNTHSKSSFNDPLHFFGSLIWHSGHDLLLSFPASFLTTPCLILYTPSAHLLMAPYVMWFLVFAHAVSPLPKLPFPHITLSLSSV	272897	274751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_272900_274800
795287	contig_13453_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_146723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAATATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127097	128260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_127100_128300
795288	contig_4782_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_73688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGAAGTATGGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707011	704900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_704900_707000
795289	contig_6807_pilon	-	1797	4	Intergenic	novelGene_84562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	421.070329306426	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	281	895	112164	111018	FALSE	40	CTAAAAAATATATGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQVFRELTDARCYWVHLRLDPMMPNAVTISNDQRQMKLVPDWICISHLPTTVYSNYGVLGFPCITAGKHYWEVDVSDKTDWILGIYFRDYGMHATYANHKNFYSRYSPQCGYWVIWLQNGSTYNTFENSSSKHALILTLSLTVPPRRVGIFLDCDADSLSFFNVTYHGSLIYKFSKCGLPKPAYPYFSSVKCTLPMSLCLPNS	118124	110115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_111587_111854_111882_112145_112247_117926
795290	contig_8019_pilon	+	2048	9	Intergenic	novelGene_126980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	15.9172665681014	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	536	1294	231796	259414	FALSE	40	ATATTGATTCTAAGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKIEAELAKQRAQHLVEFEEQALLFKEEAKLILDTEKEKYQEMIQKYQKEQEELQMKISDLIEGATRDLRLEVVTLQEKLCESQVRYTQESESKEKEIENLRSLVAEFESRLKKEIDSNDSMSEDLRKGVKQKSDELERVLLAQTQLMEQFNQSQEEVGFRWPYHCS	91611	260168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_195244_195431_231345_231424_231758_231963_240500_240595_251912_252078_259081
795295	contig_11126_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_138128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	16	51	417	467	311767	311817	NA	35	GAAAAGAAGGGTTCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQAPPSPVLCSHLEQIPEVLSLPTIFAVQPPFSLHLLRIGCCPPHPLAWPWSAAASSGSSLIPLGLSAVLDTGVLSLHDLLSSFGVWDARCPGFLVTHRPFLPRVLCQTPHTGTPRPDLQPLLSWVHTSPLVTSPRPMRIDSPHLCPSRDPLP	311350	313327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_311400_313300
795296	contig_2036_pilon	-	1620	6	Intergenic	novelGene_131817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	335.362251900836	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	109	573	661441	641984	TRUE	40	TTAAAGTAGTACCTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDNQLLDLDYPSKREAAGQG	661549	585024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_585641_631747_631872_636558_636731_641848_642039_647832_647936_661134
795299	contig_5794_pilon	-	975	8	Intergenic	novelGene_69787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2224.24455416546	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	129	611	747241	745169	TRUE	45	TTACATATTTTAAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGEWRRIRWRWWI	747455	740773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740913_743694_743765_743856_743980_745136_745203_746400_746495_746807_747019_747097_747245_747330
795303	contig_3281_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_128530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACTCGCTTATCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141551	140939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_140900_141600
795305	contig_8259_pilon	+	1618	3	Intergenic	novelGene_148863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	7.5	343	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	99	797	97732	98672	FALSE	40	TTTAAAAACAGTTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLWDRFSSSSSSSSPSSLSRTPSSDRPPRSARGSAAREEGLGRCASLESSDCESLDSSKSGFGPEEDSAYLDGVSLPDFELLSDPEDEHLCANLMQLLQESLAQARLGSRRPARLLMPSQLVSQVGKELLRLAYSEPCGLRGALLDVCVEQGKSCHSVSQLALDPTLVPTFQLTLVLRLDSRLWPKIQGLFSSANSSFVPGFSQSLTLSTGFRIIKKKLYSSEQLLIEEC	97536	99493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_97575_97671_97937_98178
795308	contig_13992_pilon	-	751	6	Intergenic	novelGene_147653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_4	198.587612906747	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	74	577	660029	655415	FALSE	30	CCTTAGATTTAAGCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRALQLENLELKGRCEELYAKNQEMGKIMDEFEGIAHQVTEEAKKEKELAEAKIQKILKERDQLTADLNSMEKSFSDLFKRLEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYILRIEKESQRYQALKAHAEEKLSLANEEITQVRSKAQAEALAFQASLRKEQMRVHSLEKTIEQKTKENDELTRICDDLISKMEKI	660102	655240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656275_658801_658963_659896_659941_660024
795309	contig_10861_pilon	-	572	4	Intergenic	novelGene_39434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1058	junction_1	454.773203549491	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	33	572	2432774	2423660	FALSE	20	CAGGTGACAACTGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALSGILWVRAQLGLPPLLLLTMALAGGSGTASAEAFDSVLGDTASCHRACQLTYPLHTYPKEEELYACQRGCRLFSICQFVDDGIDLNQTKLECESACTEAYSQSDEQYACHLGCQNQLPFAELRQEQLMSLMPKMHLLFPLTLVRSFWSDMMDSAQSFITSSWTFYLQADDGKIVIF	2432806	2423659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2423810_2425542_2425638_2427135_2427242_2432585
795310	contig_4125_pilon	-	1323	4	Intergenic	novelGene_25267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	32.8937684067971	500	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	108	842	3086875	3077767	FALSE	25	TTTTTAAGTCTTAATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRKLTDGVRSSARLRSRGCPAAELASAQEVDVPKSSKALCLTSSSHKSTDKRTSKKFKYDKDNLVKSELQKLIPKSAGASLPKIAPKTPCANEPLELGGHHAEPPGNEAGASAQQEGEGPLLGHCGILKDGCPTQTDDGLSLPKHSAASEAEVSNSSSTARDESALEAEGAQKPPLQMDSSVFLDDDSNQPMPVSRFFGNVELMQDLPPASSACPSMSRREFRKMHFRAKDDDDDEDDDAEM	3086982	3077285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3077881_3079097_3079590_3080429_3080544_3086860
795311	contig_4857_pilon	+	2187	8	Intergenic	novelGene_48649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACAGCGACTGCCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440386	448618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_441768_442782_442850_443245_443323_444432_444539_444998_445059_447605_447762_448064_448328_448541
795317	SIRV2	-	414	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4459	34	3284	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
795318	SIRV6	-	679	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCCCCAATAACGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10341_10387_10719_10769_10825_11035_11109_11205
795319	contig_2332_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_58633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAAGAACTTGTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68038	67108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_67100_68000
795320	contig_5711_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_80286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAGAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204376	206529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_204400_206500
795322	contig_5965_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_154676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAATAAAAGCAGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240520	238373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_238400_240500
795325	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	404	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
795326	contig_17803_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_175028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTGTGCCCATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109977	108918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_-_108900_110000
795327	contig_17803_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_175027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGGTTCATCCAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108662	107232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_-_107200_108700
795329	contig_7730_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_156262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGCTTGACATAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46344	47093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_46300_47100
795330	contig_6069_pilon	+	1304	9	Intergenic	novelGene_8026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	139.937876841833	43	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	397	1095	187774	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGTSIGAFMGALYSEERNYSRMRIRGDALSGWWLLWKRWNPLATKVKVLNMAEIQTRLAYVCCVRQLETVRSSDYCEYLRPPIDSYGTLDFGKFDEICEVGYQHGRTVFDIWVRSGVLDKMLKDRQETKTKACDVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	171943	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_172170_172421_172534_187715_187855_190561_190628_191492_191646_191883_191992_192360_192446_193297_193402_193545
795331	contig_12939_pilon	-	886	4	Intergenic	novelGene_166199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1000	junction_3	108.324615033806	266	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46790	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45889_46031_46116_46311_46379_46727
795335	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
795337	contig_12427_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_40566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAAGAAGGTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508856	506520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506500_508900
795339	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	3	1171	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
795342	contig_8978_pilon	-	1192	8	Intergenic	novelGene_49495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	23.7177278052704	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	18	1076	1811402	1784387	FALSE	15	TTTATAAGGCTCCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGCRMVGGGGKRRPGGKRRPGGEGQQCEKAVDVKKSKSCEADVSSDLRKEVENHYKLSLPEDFYHFWNFCGELDPEKPADSLSASLGLRLVGPYDILAGKHKMKKKSAGLNCNLHWRFYYDPPEFQTIIIGDGRTQYHMGYFRDSPDELPVYVGTNEAKKNCLIVQSGDNVFAAVKLFLMKKLKEVTDKKKTSLLKSIDEKLTAAARELGYSLEQRTARMKQRDKKVVTKTFHNAGLVVPVDKNDVGYRELPEADADLKRICKTIVEAPSDEERLKAFAPIQEMMTFVQFANDECDYGMGLELGMDLFCYGSHYFHKVAGQLLSLAYNLLKRNLFAEIIEDHLANRRKENIDQLAA	1811419	1784270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1784519_1789948_1790122_1793453_1793542_1801229_1801381_1803208_1803308_1804536_1804727_1806946_1807107_1811336
795346	contig_3241_pilon	-	1294	2	Intergenic	novelGene_146411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTTGTCTGACTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879565	877167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_878039_879142
795347	contig_10324_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_7812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAAAAAAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174281	176493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_174300_176500
795350	contig_815_pilon	-	2681	4	Intergenic	novelGene_175034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.62466929133727	17	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	38	334	124569	118564	TRUE	35	CAAAGCACAGTTTCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWDLPVFTLPFNMAITMYLAATGHYNPFFPSKLITPVTSVPNVTWTDLSALEGSAFRLHLRTSTLDSGVSTALWPALQLEECSQRSLGKPTSWLLPVPCSPPTLESACHK	124606	114539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_815_pilon_-_116879_118555_118606_123422_123558_124449
795351	contig_14353_pilon	-	2246	9	Intergenic	novelGene_82149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.755380334094	1	131	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	647	1141	407973	402994	FALSE	30	TGTTGACTTTTTAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLADA	420047	401888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403499_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415455_419981
795352	contig_16121_pilon	+	1874	5	Intergenic	novelGene_6851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	466.833482089706	2	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	115	1380	57746	62826	FALSE	40	ATATTGCCATAATAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	63320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59324_60762_60856_62565
795354	contig_5999_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_45607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCACTTCGTTCTCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93968	92152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_92200_94000
795356	contig_15323_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_148502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTCAACTTGGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21812	23878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_21800_23900
795357	contig_5954_pilon	+	729	2	Intergenic	novelGene_28567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	0	634	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	228	554	862259	862710	FALSE	15	AGCGGTTTCTTTTTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPKVEWAALLEAADTLHLVEVPKGPTEGYERDEQFLRKMHHVLLEVRPGASPASQATPPAATGAQLCLPSPQVDVLEGTLQCPESGRLFPISRGIPNMLLNDEETET	862031	862885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862307_862431
795358	contig_10986_pilon	-	795	8	Intergenic	novelGene_71488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	182.057178728362	47	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	79	723	80340	66918	FALSE	35	ACATGTAAATAATGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLITFI	80418	66845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_66929_72254_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
795359	contig_2087_pilon	+	1698	3	Intergenic	novelGene_65563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	516	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	40	333	69092	70252	FALSE	10	CTGTTTACTTTTCTATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSKRQHQALCVVTPAGK	69052	71617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_69264_69994_70069_70204
795360	contig_14516_pilon	+	2495	4	Intergenic	novelGene_153935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	129.543643439404	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	124	564	317115	378824	FALSE	40	GGAAAAAGTATGAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNSLMYYYNGKAVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMGKSQKSQF	316991	380755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_317157_361653_361760_365817_365952_378665
795361	contig_6102_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_31979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2756	junction_1	306.293976434405	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5	355	414294	416047	FALSE	0	TTTGGTCCTGCTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	414289	416206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414364_414613_414788_414877_414956_416018
795364	contig_9825_pilon	+	1060	4	Intergenic	novelGene_172560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	25.4602086052377	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACGTGGATTTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28975	34103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9825_pilon_+_29012_29775_29856_30630_30666_33194
795366	contig_7426_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_27566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATCATGAAGATGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211694	1213745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1211700_1213700
795369	SIRV1	-	262	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	4	3564	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGGCCTGGAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
795372	contig_9668_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_58128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263654	262157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_262200_263700
795373	contig_15371_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_151438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	589	912	116026	115703	NA	40	GTTATTTGAAAGAGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEPPRDSCMHIKIPKNKPLAVESILTHSNPPGQRTAPQGVQGCKSLREQTVITFLPQSGWWVQTAHLSAKHLTTVPQKALESPKHLINVYSFLHSHSTPIIFYYLY	116614	115067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_115100_116600
795374	SIRV7	-	316	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	30	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114708	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
795375	contig_11896_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_88042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTACTGTCCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175397	175033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_175000_175400
795378	contig_18514_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_175035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.94392028877595	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	33	455	1155	3425	FALSE	45	AAGAAAGTGTCCTAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSLQASEGKMKSLNLWIESFQKKAEIFTEVQKVLDQSKENLERLQNQNVYLTEALQELKTNQGDTCESPLHHWIQYTDHCYHQTMEMVSWFNCSDLCVSLNATFVKTESSGLISFLKLFVANHTWLGLSYEEEDNQWRWENGSSLSLDL	1122	4963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18514_pilon_+_1243_2107_2180_2323_2476_3314
795383	contig_14868_pilon	+	1621	12	Intergenic	novelGene_150455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	85.6422503284583	88	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	129	1619	186170	252478	FALSE	45	TGACAAAAGATGACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPSDSSCRKLASAPQVLGLLFSEGSPLDKSARNSYLWAPGPCMAKSPGNSTLEEILGQYQRSLRERANRSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVR	186041	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
795384	contig_13718_pilon	+	692	2	Intergenic	novelGene_142884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGGACAATCCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108165	117437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_108421_117000
795386	contig_6710_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_93541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653781	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
795388	contig_14501_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_172032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGCAACTTTCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310987	308429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_-_308400_311000
795389	contig_2867_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_135221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTTTTCAGCACTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179644	1180624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1179600_1180600
795392	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_94736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	67	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
795395	contig_7619_pilon	-	925	6	Intergenic	novelGene_162148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	69.8466892558266	42	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	336	821	30763	23773	FALSE	25	TGTTCTGTCAAAAGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	32343	23668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30883_32127
795398	scaffold_13609_pilon	+	1838	6	Intergenic	novelGene_124402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	295.97256629627	35	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	354	872	564647	575063	FALSE	70	GAGAAAAGAAAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDRTKLKKTPTEAPADCRALIDKLKVCNDEQLLLELQQIKTWNIGKCELYHWVDLLDRFDGILADAGQTVENMSWMLVCDRPEREQLKMLLLAVLNFTALLIEYSFSRHLYSSIEHLTTLLASSDMQVVLAVLNLLYVFSKRSNYITRLGSDKRTPLLTRLQHLAEVSHG	516020	576029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_516220_519634_519765_564622_564692_572408_572508_573273_573481_574895
795404	contig_10196_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_132311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2354251	2353530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2353500_2354300
795405	contig_10674_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_6453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305280	305776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_305300_305800
795407	contig_3602_pilon	-	1516	3	Intergenic	novelGene_60541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	2	161	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	66	305	264552	263454	FALSE	25	TGGAGTAAGATGGGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAHDDRGIRFLDNRTGKSVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGVFLMSGSHDCSLRLWSLDNKTCVQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV	264825	262242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_263624_264482_264570_264777
795408	contig_6710_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_98263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CCCAGCCTCACCCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
795410	contig_12239_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_170473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	49	393	35496	35840	NA	80	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLLLKRKMWQSASVKIAALKTPWGSSTLSYRVTVSWSQVLNGSWFVFLVCITNAMRREKNTGRELAGKVFLENYLLTRDQNNRKEQAKRRFQGKSISDSYSNVFHKDKTKKG	35447	36966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_35400_37000
795411	contig_7179_pilon	-	1717	11	Intergenic	novelGene_78168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	147.122432008175	3	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	629	1351	1061981	1058069	FALSE	35	ATCACCTGGAAGCATCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKWLGESEKLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTEFLVQMQGVGNNNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEEFGQES	1071686	1057702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058171_1058816_1058958_1060225_1060446_1060733_1060816_1061212_1061362_1061952_1062038_1062585_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
795420	contig_8006_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_173928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_5	103.08559550199	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	28	1221	343343	512075	FALSE	15	GAGTACCTAGTTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRSCGERRMGPRRAARPLLPAVLRPPLLLLLLPPLSCSGAGVGRPPHLVFLLADDLGWNDVGFHGSSILTPHLDALAAGGVLLDNYYIQPLCTPSRSQLLTGRYQIHTGLQHQIIWPCQPSCVPLDEKLLPQLLKEAGYTTHMVGKWHLGMYRKECLPTRRGFDTYFGYLLGSEDYYSHERCTLIDALNVTRCALDFRDGEEVAAGYKNMYSTNVFTERATALIANHPPEKPLFLYLALQSVHEPLQVPEEYLKPYDFIQDKNRRHYAAMVSLMDEAVGNVTAALKNHGLWDNTIFIFSTDNGGQTLAGGNNWPLRGRKWSLWEGGVRGVGFVVSPLLKQKGVKNRELIHISDWLPTLVKLAGGHTNGTKPLDGFDVWKTISEGSPSPRVELLHNIDPNFVDISPC	343315	512075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_343634_363267_363455_383425_383617_394066_394275_475705_475950_512002
795423	contig_8954_pilon	+	715	7	Intergenic	novelGene_130306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	224.346210625948	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	59	436	618527	632779	TRUE	25	GGTATCGGCGATTATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRGLGSQLKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQMEFKAVQQVQRLPFLPSSNLSLDILRGTDETIGFEDILNDKQIKF	618468	638726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_618530_621521_621620_623284_623346_627018_627121_632111_632206_632759_632879_638546
795424	SIRV6	+	338	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	534	-1	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
795428	contig_12414_pilon	+	774	2	Intergenic	novelGene_59575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370855	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373869
795429	contig_2414_pilon	-	2489	3	Intergenic	novelGene_158498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	244	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCAGGATACAGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490654	369352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_371481_410024_410161_490429
795430	SIRV4	-	226	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1280	15	1280	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3878	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3900
795437	contig_7165_pilon	+	2014	4	Intergenic	novelGene_116892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_3	376.527112790921	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	62	400	1016847	1060338	FALSE	25	CCTTTCTATTAATGTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVALQHNIGLGGAVVVTVYKMGFPEAARTHQIEAVPTSSAFDGFKANLVFKEIEKKLEEEGEEFVKKIGGIFAFKVKDGPGGKEATWVVDVKNGKGSVHPNSDKKADCTITMADSDLLALMTGKMNPQSVSR	1016785	1061952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582_1043677_1053994_1054125_1060246
795440	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
795441	contig_821_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_149377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAATTTTTTTCTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35314	36168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_35300_36200
795442	contig_3241_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_146379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGCATGGATGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711097	708887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_708900_711100
795444	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
795447	contig_7870_pilon	+	1845	7	Intergenic	novelGene_109067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTGCTTAATTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700677	854140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_701917_705742_705835_738947_739040_748850_748908_762132_762204_823988_824167_854024
795448	contig_8879_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_158998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGATGGGCTGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417246	417064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_-_417100_417200
795449	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
795452	contig_6710_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_98260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCCTCACCCCCTCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
795453	contig_10126_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_105763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCCAATGAAGTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166673	168704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_166700_168700
795454	contig_14426_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_170618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATCCTGGCAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93150	91568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_91600_93200
795455	contig_10377_pilon	-	2783	7	Intergenic	novelGene_115347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	28.2572507902347	1	138	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	359	2461	131197	113448	FALSE	20	ATATTTGGTTTATGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFPSTSRRWSKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDIAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSQNFIDGEKLSSEHIMMRLTKDNTWSSVLGNIFKSHGSKNEPKIQGKLLRSVTVENLCESNDGNQYLTSFSQIPNLTGLKKNLAAVNAFECCECGKTFMDLSSHNHHTGSHTGCNTCQCKECGEACSCPSQLTTPMRTLNGKNPQNCKVCGKVFICISNLKNPVTTLTGEKYYKCNECGKDFFSFSSFWTHERGHKCECKERCKTDSLSCLILHKFLNTDKPYVCKECGKAFSCSSHLTSHIKTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHIRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSVLTTHKRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDLTTHKRTHSGERPYECKECGKTFSQSSHLTTHIKTHNGQRPYECQECGKAFSWPSDLTTHVRTHSGVRPYECKECGKAFSQASSLTTHLRTHSGVRPYNCKECGKAFSQASSLTTHMRTHSGVRPYSCKECGKSFRCSSHLSNHTRTHSGERPYECKECGKAFSDFSAFTKHIRIHSGEKPYECKECGKTFSQASNLTSHTRTHSGARPYKCKECGKAFSDSSSLTSHMRTHSGERPYECKECGKTFSRSSHLISHRRIHSGERPYECKRCGKAFSQASALTTHIRTHSGERPYECKQCGKAFSQASALTTHKRTHSGETTL	133732	113125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_114682_114849_115399_118831_118983_119952_120080_131155_131395_131539_131576_133607
795461	contig_10674_pilon	-	2595	2	Intergenic	novelGene_6467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCCAGTAACGAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394503	389062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_390125_392970
795463	contig_10011_pilon	-	1243	3	Intergenic	novelGene_68066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	9	680	241342	236529	FALSE	65	ATAAAAAGAAAAATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCMQGQKVLLEKTGAQLGEQELPDFLEESSQAEPQDQLSHHHGEKYHLLQEPTLKLAGTEATRMRSDNKENPQQEGTKGAKPCAVSADRSKGNGLQSPEHTAVNMSEPWLSPRQVSPPNAQNHLLRDVEKSNHLERLGHPKKSYKCDHCGKSFSFNSELERHKRVHTGERPYTCEVCGNCFGRQSTLQLHQRIHTGEKPYHCNLCGKSFRQNSNLRKHQSLHHGE	241350	235965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_236842_236904_237092_241170
795465	SIRV4	-	362	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1161	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
795466	contig_7035_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_83513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226218	225631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_225600_226200
795468	contig_10732_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_114732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGGGGTTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433733	432364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_432400_433700
795470	contig_15244_pilon	+	1980	11	Intergenic	novelGene_118061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	609	926	616451	620891	TRUE	25	GATTTTTCCACAGATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIGSCFLQRVEYFYYTMAGILLSNKALKHIWDVFKQLLLCPLFCFQTLLFASDCGWWCQFPSWPESIPENTDVVNQHLLTENPVHCVPDLFVDGSSKSDLNKSN	615269	645140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_615866_616438_616543_617144_617327_620847_620915_624851_624969_627189_627358_632747_632862_636160_636298_639035_639170_644302_644467_644943
795471	SIRV6	+	219	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	51	513	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795473	contig_8059_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_111110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATTTTTACTCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248514	250625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_248500_250600
795479	contig_11171_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_48617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCAGCCCCAGGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246345	245999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_246000_246300
795483	contig_14846_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_85384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGCGGATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224911	222887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_222900_224900
795484	contig_10299_pilon	-	2618	1	Intergenic	novelGene_79790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGGACCGTCGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707033	704415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_704400_707000
795486	SIRV6	+	544	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
795488	contig_10732_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_114727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGCGGCACCCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396866	395995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_396000_396900
795489	contig_4496_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_66623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605579	604974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_605000_605600
795491	contig_11849_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_171753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCTTTAAATCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132896	133817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_132900_133800
795492	contig_2062_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_139047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	1221435	1221740	NA	55	CCACTAATAGAAAACCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPPLQILWGKIHTARIPRCTFAEKLKSLPEKQNTDFGCLAFTANSLVGSQGLPGFFQQVRVYIHHQLGSCHTTTSEIQNQIPNSEWKEAPQLQNTKNSEL	1221433	1223314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1221400_1223300
795493	contig_9833_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_68555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGAAAGCTGTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245021	245767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_245000_245800
795494	contig_9833_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_68553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTAGGGGTCTAGGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239079	239733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_239100_239700
795495	contig_9833_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_68554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	301	402	241324	241425	NA	50	GAGTAAAGGACTTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DILLVSGVVRGPAWSNLSHPRPAKLPAPAGAACCPCSSQHSPSSCASPSPVKPEGVGGSEAVKHEPAQQVTKGTDALHTAAALRVPGPPQALTKNPPGSPMSYSSTFVGGPRRLGNGSQKLNFCKSITERQTT	241023	241434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_241000_241400
795497	SIRV7	-	288	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	91636	2	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
795498	contig_10354_pilon	-	1541	3	Intergenic	novelGene_50870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476494	471871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_472040_475066_476146_476200
795500	contig_7457_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_31470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAACTATATCTTGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505129	506649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_505100_506600
795501	contig_9561_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_100853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTACAATATCACAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121661	120146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_-_120100_121700
795502	contig_11416_pilon	-	596	3	Intergenic	novelGene_145333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_1	116.5	153	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	28	333	124610	123057	FALSE	0	CGTGGCTGTGTGTGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVCTRPSAAMPKCPKCNKEVYFAERVTSLGKDWHRPCLKCEKCGKTLTSGGHAEHEGKPYCNHPCYAAMFGPKGMLPTTSDPAPTAPSPHSPWIPLTSQRLLCRLWERWS	124637	122793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_123228_123308_123404_124570
795505	contig_4803_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_150738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	509	979	115663	115193	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVLETTSCHPPPKDNYGCTFSKTDLFVFLAVHGKFSVPHQHHNSKPLICLQSSLFIVQVSHAYEVIENIMAWVRHTLVLKVTSLLFHGLKRSFAADLPNAIHPFISGLLLPWLLIVDPSKMKSLTTSIFSVIMMLLIGLVVRIFVFFILRCNSY	116171	114701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_114700_116200
795512	contig_12092_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_163440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACTTCTGGATTTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123047	121137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_-_121100_123000
795513	contig_1380_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_138885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCCACTAAAGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140547	141580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_140500_141600
795514	contig_7744_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_62474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	62.6775256549126	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	564	1091	488892	487677	FALSE	30	CTGAAACCCTAAATGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRYQACRFGRVPDQPARLRLFTVQIPHKRQRQPPPCYLTAWDGSTFLPLRTKSCGHEVISCLSVSESGTFLGLGMVTGSVAIYIAFSLQRLYYVREAHGIVVTDVAFLPEKGRGPELLGSHETALFSVAVDSRCQLHLLPSRRSVPVWLLLLLCVGLIIVTILLLQSAFPGFL	489637	487043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487772_487929_488090_488282_488356_488503_488678_488866_488992_489090_489268_489350
795515	contig_10732_pilon	-	1534	4	Intergenic	novelGene_114755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	276.010064228744	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	576319	573779	TRUE	10	TCACGGTCTCCTTCCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSGSPSPQEFPQGPRKAPASSQG	576320	572497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573844_574129_574368_576262
795516	contig_10734_pilon	-	2071	15	Intergenic	novelGene_50971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	13.3693603406583	2	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	510	1736	247872	227647	FALSE	20	TGAGTGTTGAATTCATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVDKTYFTIPQRNAPVAFLQNFDVKCITDLEVHQEQDGILNAKIKNGLLGGIVTPKVIYEEAADLDKFITLTETLSNKGSAPRNVNLEEHYVFRWNNNTISEINVRIMRANIDAHQKGILTQRFTVKFLSYNSVSDKELSGNPGYQLGKPVRALNANRMNNATTLHLWQPAGRGLCTSATFMPILFGEDALSGCLLEVGINENCTQLRETAVERLDSLIQATHVAMRGNSDYSDPNDGWLEIIRVAAPDTGAGPSVSSTPGVCLGIPAQLSVRILISEAGAVEGIIQQEILAVETRSSPVDWQYQCGLTCEDKADLFPLSASVQFIKIPAQLPRPLTRFQASCTEHDCNRNEVCWPQLLYPLTRYYQGEPYSHCIAKGFLLVSFLVLAVFLSNPGTRICRAWNSSAI	259160	227311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_227769_228204_228294_228441_228568_232384_232542_235871_235979_238523_238636_239690_239772_244001_244080_244320_244456_245372_245439_246445_246564_247836_247964_249223_249419_253170_253272_259038
795518	contig_10765_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_122979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTGTAGGTAGGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447968	446967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_447000_448000
795519	contig_8149_pilon	+	1357	2	Intergenic	novelGene_169946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCAAAGAGCTTACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491831	499068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_492812_498691
795524	contig_6654_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_85709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189631	191278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_189600_191300
795526	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
795527	scaffold_9100_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_83322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGAGGGAGAGTTAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857802	857124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_857100_857800
795528	scaffold_19766_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_34286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAATAGTGGAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419347	419661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_419300_419700
795531	contig_5400_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_162815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1342	1719	130776	130399	NA	80	AAAAAAAAAGATAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARDKQVLRSLRLELGAEVLVEGLVLQYLYQEGILTENHVQEIKAQATGLRKTMLLLDILPSRGPKAFDTFLDSLQEFPWVREKLEKAREEAITELPAGRPQEDHLKPVPELLELCPLDLKLGF	132117	129687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_129700_132100
795533	contig_5999_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_45612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGGAAGATTTGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101053	99714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_99700_101100
795536	contig_7321_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_53112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	771	1073	106844	106542	NA	15	TCTGTCACCCCAAGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPCVQSRTCPVGFSKLGPFISRSPCLSFQAPLGGFEPPIFWLVVEYLTVFITQGILSKIYSPENLMEQFYSVTHGVAMSWNLLSNGFGFLVCYAHVLI	107614	106001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_106000_107600
795537	contig_12746_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_152190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCTACCCAGTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565433	564539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_564500_565400
795538	contig_18859_pilon	-	1235	2	Intergenic	novelGene_150551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	121	453	168580	148281	FALSE	25	CTTCTTCCCTAAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPRATTDTTPAAGAAGEEGEHVKPFTPEKAKEIIMSLQQPAIFCNMVFDWPARHWNAKHLSEVLHGKQIRFRMGMKNTNTGRTVRNNNNNNVSSVAFLRSPQWFPHL	168700	147498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_148550_168516
795540	contig_8063_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_152436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCATTCTTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664066	663521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_663500_664100
795541	contig_3081_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_133980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTTACATAATGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220378	1221063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1220400_1221100
795542	contig_5945_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_104580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATAAAATGGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262796	265117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_262800_265100
795543	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
795546	contig_11285_pilon	-	1664	12	Intergenic	novelGene_5549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	331.82767109719	4	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	154	1281	745067	741608	FALSE	35	ATGATAAACTTTTGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAGRRGEPGVPACSPEKADGPFTAISLVYKFRLLPGPTSHPDQNYMMADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRGPLMLTPLGCCCGGSGPSRAPGDSLQAFSRGSSRPPPPVPS	745220	741224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741815_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744938
795547	contig_960_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_108271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686937	685919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_685900_686900
795552	scaffold_21177_pilon	-	1112	6	Intergenic	novelGene_145484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	152.655953044747	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	84	1112	221483	181550	FALSE	65	CAAAAACCAAAGAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLDVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGNNSDGIENRNGTASALLHIDESAGLGRLAK	254661	181549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_181642_182184_182341_183067_183218_217716_218287_221422_221512_254606
795554	contig_7333_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_142800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1522	1851	367133	367462	NA	30	TCTGTACGGAATAACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLKFIKGFKIFYPLAFFCREKAAIEFIHVHGTASCPASLKEAAPLSLHVGKAVQAVQGRIQLPKMLLHELAKGVTWLHLLIDHEKGIRKTPGCPGDEGCGALGLQVG	365611	368111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_365600_368100
795555	contig_9895_pilon	+	1524	3	Intergenic	novelGene_144679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	29.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62175	111169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_62319_96885_96996_109898
795556	contig_10235_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_46604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCAGAGGGGTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597229	598070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_597200_598100
795557	contig_6710_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_96535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
795561	contig_9839_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_88595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481409	483162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_481400_483200
795564	contig_7887_pilon	-	1022	6	Intergenic	novelGene_124906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	563.548613697168	191	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	65	733	395831	393753	FALSE	15	TCACGGCTCATTCTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQRGSGAGLLSRVSGLCPGGMEPGAVVDSLLSGACVLFTLGMFSTGLSDLRHMRVTRSVDNVQFLPFLTTDVNNLSWLSYGVLKGDGTLIVVNAVGAVLQTLYILVYLHYCPRKQTLLLQTATLLGVLLMGCGYFWLMVPDPASRLQQLGLFCSVFTISMYFSPLTDLANVIKTQSTQRLSYSLTIATLLTSASWTLYGFRLRDPYITVPNLPGIFTSVIRLWLFWKYPQEKDKQHYRLLQT	395895	393463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_393858_393937_394058_394356_394519_395112_395237_395352_395431_395751
795565	contig_4769_pilon	+	189	2	Intergenic	novelGene_118035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATTGACTTATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405285	1406285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1405403_1406213
795566	contig_12603_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_105792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGAAGTGCATTAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576215	591075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_577194_578475_578593_579305_579382_582716_582809_590820
795567	contig_10494_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_102130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1090	1446	301756	301400	NA	30	TCATTGTAGTCAACATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEELVYKPPGRWEGVCQVEKRRKLAFLREPTTCAKQDSMSENTVLVPGECMHGVIPNSTMPVYGSCYESIPTHGDPMYVRVELCFIRFPMADFSDVHLQAFLPRRLLVDSNFQPFS	302845	300342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_300300_302800
795569	contig_2100_pilon	-	856	6	Intergenic	novelGene_50717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1230.35783412794	2	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185517	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170295_1176330_1176418_1176765_1176875_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
795570	contig_299_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_129475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312805	1314716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1312800_1314700
795572	contig_20615_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_146909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTATCGTCATTTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24054	24468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_+_24100_24500
795573	contig_12841_pilon	-	1999	4	Intergenic	novelGene_55877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	404.939776043577	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTTTTAAATATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724290	706884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_708539_717403_717529_719539_719678_724208
795574	contig_10074_pilon	+	1942	5	Intergenic	novelGene_57218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCTCAATCTACTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704599	709019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_705663_706064_706155_706748_706869_707710_707782_708421
795577	contig_6084_pilon	-	1781	5	Intergenic	novelGene_127065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_4	24.8696602308918	46	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	71	442	438083	436530	TRUE	15	GTGAGTGCACTGTTTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECLLEDIGEDDVSESFQLLQIDMECESQERRSLPTGSASWCSKNVQRKQKHWEKMVAAKKSKRKQEKERRKANRAENPGIRPQHSKRFLRTLTKERLLEAKHSGPRLCIDLSMTDHMSKKVEHPLSPKFQLSGGRPRKEQLSRRA	438153	433030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_433099_433811_433891_435337_436733_437315_437425_438023
795582	contig_8616_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_72621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	330	770	480009	479569	NA	35	AAATTGAGGTCAAGGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAENSLSSLKEFERCWGFLVLKKENLPLGEDVSPSASPSREPKLAFELFRSPLDPEMDASGEPVTPPFPLGLEKLNLGILILDFLSFTSDSSHSPSAAAAWTLASALGKLTSTPTSLPTSSRPEKVNLGIFILGNVTFPDPLPK	480338	478536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_478500_480300
795586	contig_7357_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_36929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTAAATTGTCTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772296	769608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_769600_772300
795587	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_98016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	653858	653562	NA	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653860	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
795590	contig_4640_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_147978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAGAAAAGAACTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495644	495002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_495000_495600
795592	SIRV6	+	341	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3161_10721_10819_11031_11109_11205
795593	contig_10734_pilon	+	1142	6	Intergenic	novelGene_51298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	350.636563980427	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	5	364	1368595	1378537	TRUE	30	GCCCTTAAAAAAGTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKMFNLFMLSEVLCLIYR	1368590	1389487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378486_1378631_1388739_1389241_1389303
795600	SIRV5	+	423	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7466	2	-73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
795602	contig_7457_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_31546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATATTGAGTCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773171	774517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_773200_774500
795603	contig_11989_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_68465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGAATATACAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169431	167785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_167800_169400
795604	contig_10377_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_115362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCTCTGGGTGGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194923	194486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_194500_194900
795606	contig_11505_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_140939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	544	897	310644	310997	NA	75	AAAAATCTACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPHFGYQQTNFSKKHKPPHSPKLKDNLNSPVTIKEIEFVIKNLPKKKSPGPDGFNREFYQTFKKELTILHNLIQKIEQRTLPNSFYEASITQIPKPDKDNIKKKAADQYPSHNDL	310100	311709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_310100_311700
795607	contig_1596_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_131581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTGCTTTTGCTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68239	69998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_68200_70000
795609	contig_19132_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_170008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAAAAAAGAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473940	476383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_473900_476400
795610	contig_3825_pilon	-	1794	10	Intergenic	novelGene_78043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_9	82.8941017127602	347	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	59	1156	2443425	2425470	TRUE	5	TTGCCCTTTTTCCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVQEEKIFAGKVLRLHICAADGAEWLEEATEDTSVEKLKERCLKHCAHGSLEDPKNVTHHKLIHAASERVLNDTKTILEENVQDKDVLLLIKKRAPAPLPKMADVSEEEQKKQEEKAPDKDAIFQATANLPSYNMDREVVQTNMRDFQTELRKILVSLIEVAQKLLALNPDAVELFKKANAMLDEDEEERVDETALRQLTEMGFPESRAVKALRLNHMSVTQAMEWLIEHAEDPTIDTPLPGQASPGTSAAASAEAPAETSEGDEEARDELTEVFKKIRRKREFRADGRAVVSLMEMGFDEKEVMDALRVNNNQQNAACEWLLGDRKPSPRGAGQGHRPQQPPSSKPSWTTLWCSWASRTLRHC	2443483	2421118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2421757_2425469_2425611_2426349_2426437_2429607_2429825_2430513_2430623_2430924_2431028_2432244_2432353_2435075_2435150_2436262_2436384_2443287
795611	contig_2450_pilon	-	664	2	Intergenic	novelGene_160315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCAACAGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764266	763469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_764091_764223
795612	contig_16261_pilon	-	330	2	Intergenic	novelGene_155302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	21	329	46215	45684	FALSE	15	CCGCAGTTTATTATTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAED	46235	45682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
795614	contig_14666_pilon	-	2265	6	Intergenic	novelGene_39478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAGAAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37241	31661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_32554_32676_32787_33380_33519_34637_34807_35719_35811_36376
795616	SIRV6	+	310	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	578	171	399	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
795618	contig_7201_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_152521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTTGATGACAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325374	326818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_325400_326800
795620	SIRV4	-	215	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1308	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
795622	contig_6760_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_150791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162575	163447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_162600_163400
795626	contig_7457_pilon	-	544	5	Intergenic	novelGene_31282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_3	3665.98646342291	12512	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161041	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160625_160767_161010
795627	contig_7035_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_83514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226646	229072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_226600_229100
795628	contig_2917_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_147598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAGATATTACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108286	106527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_106500_108300
795629	contig_8476_pilon	-	1486	2	Intergenic	novelGene_121355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_1	0	135	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210306	208088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_208740_209471
795630	contig_12128_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_131989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTACACCTTGAAGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402215	401770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_401800_402200
795633	contig_2940_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_81998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	486	809	1161267	1160944	NA	25	AAACCCCAGCATCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTIIIKLKSPLFHFSGTSYNMHYFFSDPSHLELGQIAQIKRTLSFRLPNSGMPAASLGVPPDSDVLVTDSGVSLYPFRLPATSLGVPPGTSVLLDPSVPLYLIIY	1161752	1160714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1160700_1161800
795634	contig_10197_pilon	+	1797	1	Intergenic	novelGene_115244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGAGGAAGGCTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985531	987328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_985500_987300
795637	contig_7078_pilon	+	486	5	Intergenic	novelGene_130159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTAATCTGAACTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567317	594072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_567382_572841_572915_576651_576778_585712_585794_593930
795638	contig_2125_pilon	-	1523	8	Intergenic	novelGene_147708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCCGAGCCATGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295303	168462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_168798_172106_172283_235706_235887_243043_243273_249786_249942_251716_251883_291584_291744_295180
795640	contig_13265_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_146011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126152	128171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_126200_128200
795644	contig_8420_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_69356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89692	87673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_87700_89700
795645	contig_678_pilon	-	475	2	Intergenic	novelGene_167818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCTTTTACTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130498	129747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_130118_130393
795647	contig_3612_pilon	+	974	5	Intergenic	novelGene_87825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	67.7606080256073	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	226	576	955615	969791	TRUE	40	AATGAATTAGCTAATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEVVYEIPACRPRRSCKDPH	932527	978346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_953607_953719_955598_955909_969734_969850_978006
795648	contig_15882_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_144815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370900	369342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_369300_370900
795649	contig_14744_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_66090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3071	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383059	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383067_1385854_1386006_1386499
795650	SIRV6	+	474	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
795651	contig_18869_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_56379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73573	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
795652	contig_15974_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_164815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGCAGTCCATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162316	161437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_161400_162300
795653	contig_3525_pilon	-	1577	3	Intergenic	novelGene_135125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2	9	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	178	402	52721	51210	FALSE	75	ACTAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSDIISAFLSNKDTQNLSSPVTFTFSHHPVTPGPGQGVVCAFWEHEKDGCGHWATTGCRMLGTRDESTTCHCTHLSSFAVLMAHYELQEEDPVLAVTTYMGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAVQNTSTSLHLQL	53109	50034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_51348_52634_52815_53025
795656	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	98	1055	-98	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAACCAGCCAAACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
795659	contig_5928_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_40397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGTTACAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371025	372840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_371000_372800
795661	contig_20844_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_78609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	741	junction_1	0	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	207	542	206162	205827	TRUE	15	CATCCTCCACGTGCTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLTRDCSTCPSACPWHDLPIVTLCLDSTSSGLGCEAHSPAVRGTCEVCVWAPRTMPALWVFALSVLLTGCLNGAFFLDMTLMSPRPLQLWASEELAQMLVAWQAVPGLG	206368	204727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_205292_205376
795662	contig_5467_pilon	+	2140	2	Intergenic	novelGene_111972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAACAAAAGAAACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157876	160234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_159491_159708
795664	contig_15405_pilon	+	2575	1	Intergenic	novelGene_112104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGATGAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101658	104233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_101700_104200
795666	scaffold_880_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_121395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTAGATAATGTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273178	271350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271400_273200
795673	contig_5586_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_143558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	383	706	376796	376473	NA	80	AAAAACAAAAAAACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAVLKNKKPAPGLPSASGEGNRTGRTHTQGVWQLPQGQQSPIPPSLSGDESQRLEEGQEMHAIWFCIIALFFLHDFLFPVITLDFKILYLLQTPFFFPITLKKGI	377178	375090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_375100_377200
795674	contig_17427_pilon	+	1840	8	Intergenic	novelGene_30296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224.744753179318	1	116	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAACCTTAATTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147962	176579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151418_152121_152250_152599_152639_155691_155795_171334_171426_172221_172352_175445
795675	contig_11300_pilon	-	2556	5	Intergenic	novelGene_168643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	11.0989864402116	27	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	479	1891	75653	65910	FALSE	40	TAATAAATAATGTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRAAGAIALLAAPSPEAEAISAGMSRSPCSCCSRPLTCSCRCSPLTATGRPRPSDSYKEENTTLSAKMKCDFNCDCVHSGLKLVKPVDGGRLGSCTPAYLEGSCKACIKDYERLSYIGSPIVSPTSVELETESKPLHNKENQHVQQILDRSNEIEELQTSRFYEDSGYSSFSQQSGLNEHEEGSLLLEENTSDSPQSCLLQTQSPGQYPNKNLLPVLHFEKVVCSTLKKNVKRNPKVDREILKKIISSGNFRLQNIIGRKMGLECVDILSELFRRGLKLLLADILAQLNDMDLINVAKVSTTWKKILEDDKEAFQLYNKAMQRVSENITKFSPHASTREHIMFRTALASVQKAAAQTLPKTDTRSKLPNQRDQEGSAYSRHNEFSEVAKTLKNNESLKACVRCHSPAKYDGYLQRAVCKREGCGFDYCTRCLCDYHTAKNCSNGKPLRASCKMGPLPGSKKSKKNLRRL	76131	65244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_66162_67218_67402_68450_68542_69449_70168_75484
795680	contig_2776_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_175037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTGTATATATATACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3543	4870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2776_pilon_+_3500_4900
795682	contig_7078_pilon	+	1124	5	Intergenic	novelGene_130115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	111.02111285697	98	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	118	858	182358	232357	FALSE	25	GTGAACCAGTGATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNSILWKKKVSQMQQTVKVVCQKDDLPADQTVLPGSSDREGNAQSCWEDDGKERQEILGPEAQADEARCTVKDDECDSDAENEQNRDPNVEEFLQQQDTAVIYPEAPEEDQRQGTPEAGGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQVSEMAESSLTSQILRANLHGRQGFEYTEKWKGCTRQYLVYRLTKTKVIIQII	29762	232623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_182312_182515_219236_219297_227970_228133_231995
795683	scaffold_19766_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_34253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCCCAGCAGGACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162718	161139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_161100_162700
795684	contig_17108_pilon	+	1810	2	Intergenic	novelGene_109520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGGAAAGCTAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48474	54629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_48888_53232
795687	contig_2480_pilon	+	2697	5	Intergenic	novelGene_63532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	43.0834945193632	1	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	81	815	251468	263460	TRUE	30	AAACTTACATTTCCCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLVLFGRRWAIASDDLVFPGFFELFLRVLWWVGILALYLRHREKLDCAGGALLSSYLIVLIVLLAVVICAVSAIVYVSMKGTICNPGPRKSMSKLLYIRLALFLPEVVWASLGAAWIQGVECDRTVVNGIIATVVVSWIIIASTVITIIIVFDPLGGKMAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSVSRRGLVWSFFCLSKCLLC	251387	266136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_263141_265138_265931
795689	contig_9516_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_106197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	521	952	1123728	1124159	NA	35	AATTAAGACCAGTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGIHLNLSHCPGGLRDGNWQNYTDASAGCCVISNKLSCSNAVCCGTAAGLPLAVLPELGVFPDSIPDPKSPVWGVLCLPGMTHFSTSVTLSHWLGAAWGTVTWVKTQWSVSAELDVSLQQLGPSANYNGPCSLKQPASHWFS	1123207	1125525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1123200_1125500
795694	contig_5019_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_109189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCATCAAATCTATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107715	108703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_107700_108700
795695	contig_9982_pilon	-	1399	12	Intergenic	novelGene_55762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	262.984083357099	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	682	1263	344177	339852	FALSE	25	TCAGAGCCTCAACTGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGEFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	350205	339715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343223_343336_343409_343910_344027_344110_344199_345119_345312_346182_346321_347234_347271_347429_347551_348004_348136_350163
795696	contig_6277_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_80388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54571	52719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_52700_54600
795697	contig_7057_pilon	+	774	3	Intergenic	novelGene_123249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	458	junction_2	68	2189	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539991	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540890
795698	contig_2890_pilon	-	1945	3	Intergenic	novelGene_60274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	11	65	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	675	1166	298684	296365	FALSE	30	GAACCTCTATACCGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPYDIAVVSLEKSLDGIPMPVPAEHFHEGEAVSVVGFGVFGQACGPSVTSGILSAVVHVDDRPVMLQTTCAVHGGSSGGPLFSTRSGDLLGIVASNTRDNNTGATYPHLNFSIPITVLQPALQQYSETGDLRSLRQLDRATEPVQVVWRLQRPLAEVPRSKL	299358	295585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_296583_297210_297397_298596
795699	contig_593_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_102006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGTAGTCAATTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374774	375591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_374800_375600
795700	contig_10569_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_44091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1549	1872	407255	407578	NA	35	TACATATTGATCACAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQKFPVDYEQFNVGAGLRRDYPHLTGGLLLHSESSMRLLFPHSSLAASVFLAAGNQDPGLLPLSAAPEETKVITVKAKVIGRIPFSSPLPQCPGVSPLRAGGGRD	405706	407672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_405700_407700
795702	contig_1172_pilon	-	1737	13	Intergenic	novelGene_162019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_10	12.4286854583348	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	96	1607	43511	5023	FALSE	35	ATGATGAATGATTATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIPSFSTETWILLVTSLVLLYLYGTYSHNVLKKLQIPGPKPLPFMGNLLAYRKGWWKFDMKCYKKYGKIWGFYDGRQPVIAITDPDMIKTVLVKECYSTFTNRRVLGPMGFMKSAISVSSDEEWKRIRTLLSPTFTSGKLKEMFPIIRQYGDVVVKHLREEVQKGKPVTLKSIFGAYSMDVTTSTSFGVNIDSLSNPQDPFVENVRKLLKLDIFDPFIFLIVLFPFLTPICEALSISVFPRAVTDFFIKSVKTIKESRLKDNKKHRVDFLQLMIDSQNSKETASHKALSDMELIAQSIVFIFAGYETTSTALSFLMYLLATHPDIQQKLQKEIDAALPNKAPPTYDVMLQMEYLDMVVNETLRIFPIIGRLERVCKKDVEINGVIIPKGALVIIPVFVLHRDPELWPEPEKFLPERFSKENKDNIDPYVYLPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLAVIRVLQEFSIKPCKETQIPLKFGKGGFLAPEEPVVMMFESRDGNASEA	43606	4892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_5119_6644_6808_8712_8940_11554_11716_16415_16483_17575_17704_21006_21156_22085_22175_22430_22545_37369_37470_39188_39242_40667_40762_43440
795705	contig_9127_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_102995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAGAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27413	26048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_26000_27400
795710	contig_1719_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_87342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTAATTGCTCACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627943	626331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_626300_627900
795713	contig_9074_pilon	-	1870	17	Intergenic	novelGene_156618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	19	junction_1	227.901765775849	269	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	202	1725	80082	61565	TRUE	5	TTTCTTGCACTTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVKDVHEDSITVAFENNWQPERQIPFHDVRFPPPVGYNKDINESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKPATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKESAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKRAHMLIDMHFRSLRTKLSLILRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKNGKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIIPPNSLPSSNSRVGPNPSEEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRVLVVSSIVAGESQKPELKAWQGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSGTNSEASNASETESDHRDELSDWSLAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	88372	60520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_60648_61546_61607_62803_62887_63085_63269_64807_65004_67449_67537_70247_70311_70814_70950_71841_71952_76158_76238_76326_76498_78722_78840_78924_79019_79641_79791_80067_80140_82886_82981_88322
795714	contig_7202_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_17644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27837	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
795717	contig_16322_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_87568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAGCTATTGGCAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191645	192821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_191600_192800
795719	contig_2312_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_160731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTGGCCATTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193875	192294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_192300_193900
795726	contig_4125_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_25233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTTCTTTAAAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2228955	2226438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2226400_2229000
795727	contig_17198_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_62333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATACCTTTGTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493862	493400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_493400_493900
795729	contig_19228_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_174412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCCACATCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23493	23150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_23200_23500
795731	SIRV6	+	203	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	393	-1	-223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGGTATAGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
795735	SIRV2	+	591	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-368	1342	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	5	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTACCTTCTACAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3665	5799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340_4479_4686_4804_5752
795738	SIRV4	-	598	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	-2	21	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795739	contig_6710_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_98191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	20	CACCTATCCCTATTTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
795740	contig_17144_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_29149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTTCCCAGTACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100950	103257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_101000_103300
795741	contig_12125_pilon	-	2009	3	Intergenic	novelGene_76220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	32	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCACACGCGTGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340547	335844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_336646_338332_339396_340402
795743	contig_8972_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_167626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAAACCCTGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258210	259311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_258200_259300
795744	contig_18620_pilon	-	1668	2	Intergenic	novelGene_168581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	184	junction_1	0	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTAGAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54375	51737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_53256_54225
795746	contig_8177_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_86501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47061	46080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_46100_47100
795747	contig_4496_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_66655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGGAAGAGCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751005	749970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_750000_751000
795748	contig_15114_pilon	-	1473	5	Intergenic	novelGene_121146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_1	149.611789308196	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	347	1471	150745	129803	FALSE	5	GCCCTTCCCCAGCCCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPETYIPRVVGFKGNTVLVSCIDSVFLPMNMTLEPPDFEIVGSADHINVIVKFPSRAPKTIDVERLQHHFYLIIEQRSEEMVKKHKPRINGNITGDFIYVMDKLIPNTNYCVSIYFEPKNLGTITKSPLKCALLPGQEPESSESAKIGGIITAFLIATVFISSVVTLKRTGYLCLRLDLPSALNFSNRPTRIFLELPPLEAVDTVEVIYVSRKKKVWDYNYDESDSEEEATPTTSAGGYTRHGLILQPLTQASTSSPDSEESQFTDPDVDEPDLPEDEAEPLLVPGPRAEQSEPASGPCERRASPLQDPFSKKDSSATEGSEDRIIFNVNLNSVFVQALDDDGDVSPMLPEETVDLEDPSEMESSFLIAREDGMP	151091	129800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_130379_137049_137181_141879_142046_147669_147831_150654
795750	contig_4686_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_118497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATGGAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373444	373945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_373400_373900
795751	contig_10855_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_124324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGACTACACATCACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331428	330402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_330400_331400
795753	contig_13424_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_151600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTCAGACTCTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78386	76540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_-_76500_78400
795754	contig_9437_pilon	+	1904	3	Intergenic	novelGene_141749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_2	26	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTACCTTTGTTAGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553479	558314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_554871_557035_557171_557936
795757	contig_5643_pilon	-	2534	15	Intergenic	novelGene_38893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	50.3650449726995	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	428	2410	259736	253080	FALSE	5	TCTGGCCACTGTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCCPLKGLLGSRRPRKLMGQWSEEETDEEEEKEKVSSESGPTKNDEVDGSLQINVDEEDLFVLPPAGDMEQGAQAPDLQRVHKRIQDIVAVLRDFSTQRQEGRSRSEYVNRLQKDLATYYSYGDFLLGKLMDLFPLSELVEFLEANEVPRPITLRANTLKTRRRDLAQALINRGVNLDPLGKWSKTGLVVYDSSVPIGATPEYLAGHYMLQGASSMLPVMALAPQEHERILDMCCAPGGKTSYIAQLMKNTGVILANDANAERLKSVVGNLHRLGVTNTIISHYDGRQFPKVVGGFDRVLLDAPCSGTGVISKDPAVKTNKDEKDIQRCAHLQKELLLSAIDSVNATSKTGGYLVYCTCSIMVEENEWVVDYALKKRNVRLVPTGLDFGQEGFTRFRERRFHPTLRSTRRFYPHTHNMDGFFIAKFKKFSNSIPQSQTGDSATVTPTNPDLPDLKGQVAPKPENSSQPTKKAKGAGKAKQKLQKQKHLKKASFQKQNGISKRTDSELSTVPSVTKAQASFKVQDSNQLAEKAEVVREPKVTGTLKQRLPKLQSPKKVVFLKQNAPPKGTDSGTPAALSFSKIQPTTPKPEDQGQPLWKAKGAEKVKQHLPELPFKKAAFQKQNGTPKRSTSYSHSPSRPPPAKRRKSQSRGNSQPPLS	261953	252955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_253742_254843_255073_255186_255310_255450_255541_255664_255805_256547_256689_256762_256851_257651_257742_257880_258081_258178_258340_258461_258513_259728_259893_260143_260237_261496_261624_261902
795758	contig_5331_pilon	+	1764	14	Intergenic	novelGene_112809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	367.075020950646	288	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	41	1309	711291	741184	TRUE	30	TAAACAGTCATCCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGAGERGGFNKPGGPMDEGPDLDLGPPVDPDEDSDNSAIYVQGLNDSVTLDDLTDFFKQCGVVKMNKRTGQPMIHIYLDKETGKPKGDATVSYEGPLDL	711250	741800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_733574_733610_734135_734169_734490_734610_737891_737979_741163_741240_741400
795762	contig_11846_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_105924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCATAAGAGCTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166827	166380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_166400_166800
795764	SIRV4	-	163	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1358	0	1358	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3800	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
795766	contig_13905_pilon	+	1075	4	Intergenic	novelGene_130423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.606279126351	197	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	68	388	218514	226369	TRUE	30	TTCAATGACTTTTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEFVNSRIHPGKVVVFIKPTCPYCKKTEEILFQLPFKQGLVEFVDITATNNISAIQDYLQQLTGARTVPRVFLGKDCIGGCSDLIALHQSGKLLKRLEDMGVLQ	218446	229559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_218721_226255_226376_228438_228570_229009
795770	contig_4845_pilon	+	1287	9	Intergenic	novelGene_53605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_8	84.4318327113654	159	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	95	1105	96050	110836	FALSE	15	TTGCAATTGGTTATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDDSEWMKLPVDQKCEHKLWKARLSGYEEALKIFQKIKDEKSPEWSKYLGLIKKFVTDSNAVVQLKGLEAALVYVENAHVAGKTTGEVVSGVVSKVFNQPKAKAKELGIEICLMYIEIEKGEAVQEELLKGLDNKNPKIIVACIETLRKALSEFGSKIILLKPIIKVLPKLFESREKAVRDEAKLIAVEIYRWIRDALRPPLQNINSVQLKELEEEWVKQPTGAPKPTRFLRSQQELETKLEQQQSAGGDAEGGGDDGDEVPQIDAYELLEAVEILSKLPKDFYDKIEAKKWQERKEALEAVEVLVKNPKLEAGDYADLVKALKKHMKVHIHTLT	71930	111018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_71988_96012_96107_100721_100916_102411_102619_105993_106166_106782_106916_107302_107404_109208_109323_110803
795771	contig_7898_pilon	-	2320	20	Intergenic	novelGene_47513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_1	42.4094276875638	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1857	463	2319	263301	250809	FALSE	10	GGTGAGGCCCATTCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETLKRFAGKVTTASVKERREILSELGKCVAGKDLPEGAVKGLCKLFCLTLHRYRDAASRRALQAAIQQLAEAQPEATAKNLLQSLQSSGIGSKAGLPSKSSGSAALLALSWTCLLVRIVFPSRAKRQGDIWNRLVEVQCLLLLEVLGGSHKHAMDGAVKKLTKLWKENPELVEQYLLAILSLEPNQNYAGMLGLLVQFCTNHREMDVVTRHKGALLDFYMKNVLMSKVKPQKYLLDSCAPLLRYMSHSEFKDLILPTIQKSLLRSPENVIETISSLLASVTLDLSQYALDIVKGLAGQLKSNSPRLMDEAVLALRNLARQCSDSSAMEALSKHLFAVLGGSEGKLTIVAQKISVLSGIGSISHHVVAGPSSQVLNGTVAELFIPFLQQEVHEGTLVHAVSVLALWCNRFTMEVPKKLTEWFKKAFSLKTSTSAVRHAYLQCMLASFRGDTLLQALDLLPLLVQIVEKAASQSSQVPTVTEGVAAALLLSKLSVADAQAEAKLSSFWQLVVDEKKQIFTSEKFLLMASEDALCTVLYLTERLFLDHPHRLTGSKVQQYHRALVAVLLSRTWHVRRQAQQTVRKLLCSLGGFKLACGLLEELKAVLSSHKVLPSEALVTDGGEMTEAGKAYVHPRVLQEALCIISGVPGLEGDTSNLEQLAQEMLIISHHPSLVAVQSGLWPALLARMKIDPEAFITRHLDEIIPRVTTQSPLSQSSMNAMGSLSLLSPDQVLPQIISTITTSVRNPALCQVTREEFAIMHTPAGELYDKSIIQ	273001	250807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_250986_251757_251883_251975_252166_252956_253117_253451_253528_254930_255024_256235_256389_258532_258707_258950_259050_259447_259499_260514_260644_260913_260989_261597_261707_261835_261905_263029_263165_263259_263359_267857_267967_268641_268774_269190_269255_272901
795773	SIRV6	+	342	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	175	363	136	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
795774	contig_13937_pilon	+	1456	2	Intergenic	novelGene_167357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	88	438	64731	65081	TRUE	80	AGGCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPVSPGWVEAFGADQRARADRLAGERREMEKRGRLGKPPSSHTPPATQAVPRKERRPSMFEKEAVSAETARARNSLFGPAPVTAPNQRIYPRDPSLRPDTIGSPFSRVLRFVLVKDIEPDIAECLPAPCRFSKSHVALYRNRRV	64643	66400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_66031_66331
795776	contig_990_pilon	+	1169	10	Intergenic	novelGene_76066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_3	109.538876350357	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	397	1014	1082680	1091532	FALSE	15	GGCATTTGTTTAGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIAVNIKTAEIYRASFPDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067234	1091687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082171_1082245_1082312_1082512_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087593_1087692_1090825_1090940_1091352
795777	contig_16595_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_150140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATATGAAAAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144179	144835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_144200_144800
795779	contig_14651_pilon	-	1889	9	Intergenic	novelGene_157220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	49.7512562655457	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1284	1799	106188	87171	FALSE	25	CCACCACCTTCCTTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDVATNVLQAKVIAAAGNEQKCKLAMQRGAQSSVNYSQGSLKEAVRKLVGSGGVNVVIDTVGGDVFLEALRSLAWEGRIVVVGFAGGTIASVPANVLLLKSISATGMSWGQYKNKNFSLFSSILSSVLRYCQQGRIQPYIGAEFKLEEVNDAFLHVTRRKSTGKVLLSLK	112682	87080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_87240_97825_98055_100098_100281_106152_106235_107093_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
795781	contig_14060_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_156060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144707	144102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_144100_144700
795783	contig_20819_pilon	+	2502	8	Intergenic	novelGene_55609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	40.8341593696818	1	147	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	108	1610	22116	24224	TRUE	5	CTTTTCTTATTGTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEGPSGIASQECPTTSRAETDEEEDDESDEEEEEEEEEEEEEEATDSEEEEDLEQMQEGQGDNEAEEEEAGWKQEPHVRTTVLP	21114	25485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22066_22323_22476_23309_23427_23643_23798_24004_24180_24654_24809_25033_25245
795787	contig_10324_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_7848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGCTTTTTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289620	289172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_289200_289600
795788	contig_6710_pilon	-	494	2	Intergenic	novelGene_98007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	CTCTTCTTTAACTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
795789	SIRV4	-	205	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	409	3	-409	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTATCGGCGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795791	contig_8453_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_125119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCAACTCATAGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155321	153510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_153500_155300
795793	contig_5260_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_144370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273902	272207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_272200_273900
795794	contig_1910_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_168277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAATGCTCATCGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43590	44962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_43600_45000
795796	contig_9696_pilon	+	1337	12	Intergenic	novelGene_68836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	655.122472935752	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	237	1217	593219	609124	TRUE	40	AATAAACTTCAAAGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGT	577967	626549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_593186_593297_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609134_626438
795798	contig_3832_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_161439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGAAAAAGTAAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116808	116453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_116500_116800
795799	contig_3832_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_161424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61433	60816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_60800_61400
795802	contig_14445_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_137363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCATGACTATAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306312	306976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_306300_307000
795803	contig_12864_pilon	+	596	6	Intergenic	novelGene_76398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	763.74629295336	72	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	49	513	225015	229231	FALSE	10	TTCAGCAGTTTCTGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSRFLVGLILAALILQESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	224966	229314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225070_227822_227917_227955_228030_228490_228623_228901_228946_229165
795805	contig_14687_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_107932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490439	488423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_488400_490400
795807	SIRV6	+	252	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	231	2	-61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGGTGGCATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
795808	contig_15354_pilon	+	1634	5	Intergenic	novelGene_65773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	110.709925029331	299	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	68	487	687193	688272	TRUE	15	GAGCTATTTGTGCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEILDDDNFLGAENAFNLFVCQKPFSAATTDEERQHLQEVGLFHLGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGSVLFGTVNGMIGKANPRRGAL	687125	691082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_687298_687694_687799_688061_688550_689596_689721_690336
795809	contig_12216_pilon	-	1019	2	Intergenic	novelGene_175041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTTGTTTTGGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166343	165169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12216_pilon_-_165992_166146
795813	scaffold_19766_pilon	+	2020	2	Intergenic	novelGene_34406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAACACGGCCAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826355	830516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_828310_830450
795814	contig_835_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_152153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGAATGAACTCTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215676	217043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_215700_217000
795815	SIRV2	-	682	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11887	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
795816	contig_16594_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_53928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGCTGGCACCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313712	314911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_313700_314900
795823	contig_17836_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_165581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	243	605	4908	4546	NA	50	GAAGAAAAGAAATATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDMSLSDIGTYYCVKYRESSPQDVEISRGEGIRVTVVGCQVPAHLPDRWDCSSNGLVTMSHARATVGNLSNCWVCHHLPWSGAPLSPLAAPVFNYIKEIPDCILSHGASKSPIWARLI	5150	4122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17836_pilon_-_4100_5200
795827	contig_1719_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_87330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502744	504194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_502700_504200
795828	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795829	contig_5758_pilon	+	1196	2	Intergenic	novelGene_119100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	978	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAATTAATAGCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231519	233650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_231822_232756
795834	contig_8443_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_150614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGGCAATATTGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781083	783554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_781100_783600
795835	SIRV4	-	364	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	0	1157	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
795838	contig_4891_pilon	-	1465	2	Intergenic	novelGene_124587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1014	1349	928857	928522	FALSE	20	CACTGTATTTTCTGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METNPENFQFIQSAPNTQLQHLSFMTIWNGSHSSRHSSCLHRLCTSYMHLHLHRKCERNNGSSVPVERKKRSLRDCHPVIPCTAHTLNLTGDTLLKVFLNVLFFPFCKKRH	931100	928405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_928875_930104
795840	contig_6509_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_145664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCTCCCTGTATGGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234397	234855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_234400_234900
795843	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
795847	contig_11968_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_172505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACAGAGACACCACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30768	32099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_+_30800_32100
795848	contig_11968_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_172506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTACCTAGTTCTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32466	33222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_+_32500_33200
795851	SIRV6	+	239	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	51	493	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795853	contig_4223_pilon	-	973	2	Intergenic	novelGene_117271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTCTGAACTAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180765	178431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_179305_180665
795854	SIRV6	+	228	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	504	51	504	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10741	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
795855	contig_9027_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_156353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAGGTGAATTAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64063	64966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_64100_65000
795856	contig_20199_pilon	-	883	4	Intergenic	novelGene_82581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.07816092788	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	179	499	43922	41171	TRUE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44100	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40808_40944_41250_42110_42347_43916
795858	SIRV6	+	415	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
795860	contig_1918_pilon	+	1093	2	Intergenic	novelGene_168329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGTTTTACTGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49494	52706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_52014
795861	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
795862	contig_14640_pilon	+	605	3	Intergenic	novelGene_168053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	1	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	205	366	459315	459476	TRUE	35	CCTGACGAAGCATATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPLLRRSTSESGGRIGLITPPACWPTDNSPESAALSHTESCKGQDTSLLRSAAHKLPVNPVPTISTRAMARVLADRREGLESGNAAEPEQVLSRLHSPSPGPCLEQSLKPTCRWQRRGDWC	459110	472795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_459577_472168_472281_472768
795864	SIRV6	+	471	7	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	136	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11029
795865	contig_9668_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_58135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	304	621	292409	292092	NA	75	GGACATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVSEVGISYYHFTLFSIGKQIEIRDFFEVVLQCPFSNSLGVKRHLQWRQRLDSKLQCPVTSFVGVNRKLRQQQRQKLSILDLKSLNQVLKLSNSSVIIRGYTL	292712	290823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_290800_292700
795866	contig_9363_pilon	-	1488	4	Intergenic	novelGene_6487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_3	92.8331837222014	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	175	1398	377097	372391	FALSE	35	AGGAACTGAAATGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDLPSAGNRKASSSACPGSEARYKMKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	405648	372300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_374687_376997_377125_405501
795867	contig_8138_pilon	-	653	3	Intergenic	novelGene_52476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGCAGCGGCGGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306824	280272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280347_288496_288614_306362
795869	contig_9471_pilon	+	1801	13	Intergenic	novelGene_21780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	838.014303113152	2	88	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1069	1599	414726	417296	FALSE	30	ATAAACTTTTGTGCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	406929	417498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_407044_410633_410795_411003_411233_412237_412329_412753_412813_413710_413828_413916_414084_414595_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
795870	contig_15689_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_164158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCGATGTCTTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163477	161286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_161300_163500
795871	contig_10982_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_87890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAAGGTTATTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191350	192666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_191400_192700
795872	contig_10982_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_87892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCGGAAAACGAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195277	196065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_195300_196100
795873	contig_6975_pilon	-	1727	13	Intergenic	novelGene_74287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTGGGGCGGCCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466384	401453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_401491_403253_403586_427500_427661_437077_437155_440403_440627_441780_441872_448646_448778_457459_457624_464103_464181_464464_464592_465445_465504_465617_465730_466246
795874	contig_19606_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_148268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41222	39309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_39300_41200
795875	contig_12622_pilon	-	831	4	Intergenic	novelGene_5926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2699.02455630836	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	16	408	1590968	1585470	TRUE	40	GAAGCGAATTTATATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWSPVCSL	1590983	1583547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585490_1589998_1590234_1590830
795879	contig_7593_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_127332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543269	541803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_541800_543300
795880	scaffold_6394_pilon	+	523	5	Intergenic	novelGene_111044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5071.80061713786	243	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGAGCATTCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442095	444586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442234_442368_442494_443338_443388_444267_444367_444474
795881	contig_20697_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_134604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGAGAGTACTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3346	6018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_3300_6000
795882	contig_5954_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_28547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	500	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	311	505	547430	547624	FALSE	5	TCCTTTCCCCCTTTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVVPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFVCDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGNHPPQ	546902	549422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_547184_547400
795883	contig_253_pilon	-	746	7	Intergenic	novelGene_129646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_6	97.6723547831672	897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	62	694	269509	267057	FALSE	15	CCACCGCCTCCTGTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRLSADRAGLHAKERQRFRMRCLATPTVLRALAQASHAGHFSGRSVHSTSLAATYKYVNLQEPKMDMKSVTDQAAQTLLWTELVRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR	271319	267004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267397_268417_268591_268687_268778_269311_269363_269451_269510_271258
795884	contig_10674_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_6454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCACCAGTAAATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306723	305919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_305900_306700
795886	contig_6710_pilon	-	442	2	Intergenic	novelGene_98214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	35	CTTCCCCACAAAACACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
795890	SIRV6	+	383	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1241_1622_1736_2780_2829_3106_3165_10724
795893	contig_8660_pilon	-	916	3	Intergenic	novelGene_136501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	15	GCTTAGTTTCCTGTCGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	308097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
795895	contig_12520_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_161073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498898	497580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_497600_498900
795898	contig_15244_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_118056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGCCAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587451	589162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_587500_589200
795899	contig_10734_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_51312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAAGCCTTCCAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387212	1387670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1387200_1387700
795902	contig_8285_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_174975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGGGAATTTCCATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230808	231404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_+_230800_231400
795903	contig_16387_pilon	-	779	6	Intergenic	novelGene_174524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	22.9137513297147	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	48	542	95135	68277	TRUE	25	TTTATTTCCCCCAAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQNTTPGADSSVSQMGQPAALHLDPWKGMSEKRVLRIFGVVQILIALINLSLGITILCVSLLFDEPAPISVYMGYPVLGSVMFIVSGALSIAAGKRDTECLDECTPGLNCLSSITAAIGIIIIAFSLSSFSFHHFPCDSNPMSENCAINRSILVGMNGVVLILSALEFCIAAYLCTIG	95182	65686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_-_65897_68249_68352_79968_80128_81803_81861_93844_93974_95060
795906	contig_17066_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_130939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGTAAAATACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6639	7786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_6600_7800
795908	contig_16387_pilon	-	425	3	Intergenic	novelGene_174522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	6.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAATCTTTGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29860	4738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_-_4962_28011_28162_29808
795915	SIRV6	+	521	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1244	204	6	-24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACAAGAGAGTTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	10764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10200_10800
795916	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9679	561	529	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
795917	contig_17618_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_173358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1	420	41486	41905	NA	50	ACCCCCTACACTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVNCRAEGDLLPPRKKSEEWNTSIGTRIPALRPRAGRQRERAVTPETAKTARSGSRKTVAAEAAKQGDWQETARWASWPTEQGGYSGCANLWSKRAKNLPADFLVDRGASRHLAAKLGSPTTERSERAKHLWAKGLLEE	41485	43161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_+_41500_43200
795918	SIRV4	-	612	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACATTTAAAAATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795919	contig_9931_pilon	+	1499	2	Intergenic	novelGene_134808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	974	1348	243172	264417	FALSE	60	GATTTTACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKGHGLIILKSCSSDVLPVKPQGYSPLNDNVSSGSLETQSGAAISVSAQLHFSSERLLHSILARSSAGLAQWAGRRGVQTSVRSGELWGLFIQISGLVQICSAKTRISSCWHVLTRSGLKFR	242198	264568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_243465_264335
795924	contig_17840_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_154295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39763	38192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_38200_39800
795926	contig_15732_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_88876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTAATGTTTCCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167815	166250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_166200_167800
795930	contig_5445_pilon	+	593	4	Intergenic	novelGene_135416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1317.60717464147	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	168	497	52614	53758	FALSE	35	AAAAAATTTATTGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPMFYTVSVQLWHIFKRSRQKKKTRSLYGSFPSAGLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51685	53854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52677_53084_53240_53646
795932	SIRV6	+	262	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11033_11109_11205
795934	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
795936	contig_15021_pilon	-	1326	9	Intergenic	novelGene_26987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	131.856930041617	2	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	141	890	420902	389550	FALSE	25	GGTGCAAGATGATCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSHAPSARPQTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRAIENIDTLTNLDSLFLGKNKITKLQNLDALTSLTVLSMQSNRLTKIEGLQSLNKLTMLDLASNRIKKIENISHLTELQEFWMNDNLIESWSDLDELKGARSLETVYLERNPLQKDPQYRRKIMLALPSVRQIDATFVRF	426145	389113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_389727_411764_411852_416069_416109_417090_417208_419336_419500_420184_420351_420901_420962_421592_421649_426120
795939	SIRV6	+	193	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	509	-1	-339	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAGGTAGTCGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
795940	SIRV4	-	404	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	210	3	-210	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCGCCCCCAGTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795942	contig_9091_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_32449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	459	1323	1781	204876	204418	NA	55	GTGATTAAAAAGAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTDFSLYLEKPQPLSNGLVSLELCCAWHKWKISSLLSTCQILGEYEKQEKDPSQTCHSPPEVAVCWLEPDLYPRNVSWVLLGWYYETYGHLMAPENEEWSWARRQDCESAYAYPRAFVREAVLSPQRVKDTGRCVGNPCASVLGAWQMRDV	206198	204417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_204400_206200
795946	contig_4364_pilon	-	1605	7	Intergenic	novelGene_27	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	91.5532631859728	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	599	1177	311143	283469	FALSE	15	CATTTGTGTGTTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	311741	283040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033
795947	contig_10437_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_38388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672107	670455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_670500_672100
795949	contig_9363_pilon	+	785	6	Intergenic	novelGene_6812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	229.889886684908	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	69	785	1622283	1625968	FALSE	10	GGCCACGCGAGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSCPYQRKWRATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFPRGPASPAPNHGAPAGRPALALALKILPSDRSSPNPELGAPPLVPPGLYHCPPSSSLSAHFLSRRLRHHQDPVLHLRASPLFTHAVSSINAELPW	1622214	1625968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623529_1625683
795950	contig_15120_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_108010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATACAGAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179163	178089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_178100_179200
795953	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	438	5	265	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
795954	contig_5482_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_144517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760626	761261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_760600_761300
795955	contig_20293_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_153537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127151	128426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_127200_128400
795956	contig_6446_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_149167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGGTGGTTATGTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102364	101779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_101800_102400
795963	contig_11292_pilon	-	1157	5	Intergenic	novelGene_109487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	36.62222685747	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATATCTGATGGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498080	491832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_492252_493450_493556_494515_494642_496232_496375_497715
795964	contig_9098_pilon	-	2169	6	Intergenic	novelGene_75860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_5	128.294037273756	36	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	38	307	350012	349743	TRUE	75	GAATAGAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSRQSCCSTLGHMATHVASPVHVLDFQVSGFFPTLGAAWFQVCSADVETAQLALILFCDLKCCLCTGQPDSRCLGAGKAASGGRRCLASHRLCSRHGQMRC	350049	342513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535
795966	contig_7182_pilon	+	1718	2	Intergenic	novelGene_117088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	750	1088	35244	35582	TRUE	20	AGTGTGTGATTAATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGEIDSTIIIVGDFNTPLSILDRTSRKKTNKETEYLNDTINQLDLTDIYRTLSPTTAQYTFYSKSCGSFSGIDYTLGHKASPDKLKKIEFIQSILSDHNGVKLEINNRKKT	34494	36453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_35777_36017
795968	contig_12622_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_5785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGTTTAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169520	171024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_169500_171000
795969	contig_5978_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_152404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTACCCTCTAAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444576	443849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_-_443800_444600
795970	contig_1472_pilon	-	1836	2	Intergenic	novelGene_86124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGGTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389172	386645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_386790_387480
795972	contig_14322_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_115844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671547	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671500
795977	contig_4754_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_35972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTTGTGGGGATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436903	438415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_436900_438400
795978	contig_8174_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_160071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGCACCCAAAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396808	395849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_395800_396800
795980	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
795982	contig_8760_pilon	+	1623	6	Intergenic	novelGene_175046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	14.4554487996741	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	226	807	150454	157267	FALSE	40	AATTCTTTAAATTAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYLDIDSYWKTAYCNESFHSLCKRSNDTPATEPPQLPGRCPESEHTAWIPFHGHCYYIESSYTKNWGHASLECLRMGSSLVSIESAAESSFLSYRVEPLKSKTNFWIGLFRNVEGMWLWINNNPVSFVNWNAGDPSGERNDCVTLLASSGFWNNIHCSSYKGYICKRPKIIDAEPEPTHTLMTTKADSRKMGPSKPSSSVAGVVVIVILLILTGAGLAAYFFYKKRHVQLPREDTFENTLYFNSRSSPGSSDTKDLMGNIEQNEHAVI	148984	158083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8760_pilon_+_149064_150307_150458_153929_154044_154744_154910_155924_155973_157016
795983	contig_5947_pilon	+	985	6	Intergenic	novelGene_101607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	495	junction_1	96.603519604619	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	114	983	983563	988984	FALSE	20	GCTGGGAGCTAGACCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSYPKTTPSVGRSFSIRFGRKPSLIGLDPEQGHLNPMSYTQHCITTMAAPSWKCLPAIDGDPQGQCLNDSSFGLANGALGQEDRGLSFLLKQEDREIQDAYLQLFTKLDVALKEMKQYVTQINKLLSTITEPTFSGSCDPPLAEEASSSLLVSEESEMDRVEHGGIKKVCFKVSEEDQEDSGHDTMSYRDSYSECNSNRDSVLSYTSVRSNSSYLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKQDKLHGCLEHLFNQVDSINALLKGPVLSRAFEETKHFPMDHSLQGEQTEVLGQGQEGFQHPAKRKPVLGRGCQTHAGYLVTRLAEFTPAV	982787	988986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_982887_983548_983826_985586_985794_987124_987214_988514_988598_988756
795984	contig_5947_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_101611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCCCTAGCTGGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989094	989535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_989100_989500
795985	contig_3095_pilon	-	664	5	Intergenic	novelGene_75265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	409.110315196281	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	317	553	248564	246716	FALSE	10	GTCCTTCAGTGGTTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	253657	246604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535
795986	contig_15118_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_74551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGACAGTTTTTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133959	132653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_132700_134000
795987	contig_15118_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_74550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132694	131959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_132000_132700
795988	contig_3004_pilon	-	1380	3	Intergenic	novelGene_127539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_2	26.5	188	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	139	357	573863	566693	FALSE	20	AATCCCTGTGTAGTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNEQFDKIGSITWSVRVKAGKRLSQDCETNRSTTPPLPPLTFQTKEMASPLVSDDEVFPLSPPDMSIPASLAAQHFLLEEEKRAKELEKLLNTHIDELQRHTEFTLNKYTKLKQNRHI	576303	565669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_566870_573821_573937_576238
795989	contig_3837_pilon	+	2110	9	Intergenic	novelGene_104016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.23618210128	131	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	530	1150	67539	123213	TRUE	50	AATAGAAGACAGGAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKNR	67009	129362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67630_68418_68454_70834_70935_77748_77816_88997_89221_121918_122015_123204_123318_124345_124469_128629
795990	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_94190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGTGATGGCTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653356	657178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
795991	contig_5766_pilon	+	2730	1	Intergenic	novelGene_175052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1569	1880	855135	855446	NA	45	TGGTAGCATTAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCCRRGCPLNKSTNKNANVNIFSHNFSHFERGMKISLYIDSQKREQLAAYILWKRKMTLPVWFYHMHRERYGTLLDVGALQRTKENLPPSSMWSTPTLFFES	853566	856296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_853600_856300
795993	contig_7635_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_171361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45521	47874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_45500_47900
795997	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
795998	contig_4931_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_138352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCTCACTCTTAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170279	171292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_170300_171300
796000	contig_3975_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_54699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAACCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135713	1133563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1133600_1135700
796003	SIRV4	+	328	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	654	966	-22	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAATAACTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
796008	contig_9415_pilon	-	1217	2	Intergenic	novelGene_109824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACCACATTACTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1919053	1912850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1913934_1918919
796009	contig_4392_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_117317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACTCAATGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329861	328766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_328800_329900
796010	contig_262_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_140611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATTACTTGACATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14636	14965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_+_14600_15000
796011	contig_15952_pilon	+	1149	6	Intergenic	novelGene_154028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	56.6448585486803	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	70	990	62239	64518	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWARAWRLPHGGRGASRPSFPRVPVANSSSSGGGGGVELRPLPLSFTLLDGEAGRPALVFLHGVCGCKNNFNSVAKALARRTGRKVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVHPSHYPEIRRLFPRAQMQTVLNAGHWIHADRPQDFMAAIQGFLA	62169	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344_63519_63695_63867_63969_64152_64385
796012	contig_3386_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_34540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAATCTTGGGTTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410383	412096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_410400_412100
796016	contig_11978_pilon	+	800	8	Intergenic	novelGene_62976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_5	173.262570589689	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	182	673	1474618	1479429	TRUE	30	CTGAGCAGTGGAAAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHTGGGGGGGGTGGSGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPQHPHPACGPHC	1473715	1482340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1473780_1474267_1474323_1474555_1474666_1475775_1475880_1476136_1476231_1478510_1478661_1479333_1479434_1482217
796020	contig_6048_pilon	-	1892	1	Intergenic	novelGene_73196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	293	646	1468093	1467740	NA	65	AAAAAAAAAAACCTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVLRLGNSALEVPSNKSPYSHLDFSGRQVYVMISNTGVRLYHFGSSRLHNNLNWHNAIHWCHQTSIPHCRVSSLSCWTSMENKWVYFLANNRTELLASSPTPLFRGRAKRLEYFE	1468385	1466493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1466500_1468400
796024	contig_11071_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_131020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70945	72043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_70900_72000
796025	SIRV6	+	284	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8133	14	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
796027	contig_17198_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_62351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAGATGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684141	685591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_684100_685600
796033	contig_1301_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_47424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1380.15530527063	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGTGGCCTTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981495	992357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981544_986236_986360_990207_990317_992025
796034	contig_5302_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_81548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651698	1650287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1650300_1651700
796037	contig_9373_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_162738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGAAGAAAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394692	394025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_394000_394700
796038	contig_9651_pilon	+	1089	10	Intergenic	novelGene_162846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	40.2685430026411	475	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	55	792	16280	49359	FALSE	25	GGACTTTTGTTTTTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLDGKVIILTAAAQGIGRAAALAFAREGARVIATDINESKLQELEKYPGIQTRVLDVTKKKQIDEFANEVERLDVLFNVAGFVHHGTILDCDEKDWDFTMNLNVRSMYLMIKAFLPKMLAQKSGNIINMSSVASSIKGVVNRCVYSTSKAAVIGLTKSLAADFIQQGIRCNCVCPGTVDTPSLQERIQARPNPEEALSDFLKRQKTGRFATAEEVAQLCVYLASDESAYVTGNPVIIDGGWSL	11373	49656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_11420_16271_16352_17400_17480_22401_22499_24138_24248_29317_29379_30576_30691_46583_46643_46960_47054_49305
796041	contig_848_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_83330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTTCAGAAAACAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499102	499874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_499100_499900
796042	contig_6873_pilon	-	2222	23	Intergenic	novelGene_129805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGACTGCCACGCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182200	44076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_44158_56252_56349_60380_60446_78981_79038_80189_80245_80866_80931_81658_81727_82278_82373_87151_87257_88728_88831_89954_90067_98683_98917_100247_100317_110336_110425_122089_122186_145151_145252_157444_157532_165726_165913_168548_168659_170365_170518_172082_172201_180266_180318_182166
796043	contig_7057_pilon	+	950	9	Intergenic	novelGene_123258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_4	17.3637553541853	616	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	164	904	542770	570531	FALSE	5	CTCTGCTTGCCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVKVKVEKSDMEMAKARNQLDAVLQCLLEKSHMDRERLDEEAGKTPSDTHNKDCSIAATGKRPSARFPHQRRKKRREMDDGLAEGGPQRSNAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEGSEVTNSKSRDVYKLPPPTAPGPPGDPCRSRIPSPLQPETQGTPDDEPSEPEPSRSTLIYHNMQRWKRIRQRWKEASHRNQLRYSESMKILREMYERQ	542606	570577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568676_568707_568785_568872_568952_569120_570061_570203_570293_570368_570449
796046	contig_10949_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_146685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCTAGCATATAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29979	28590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_28600_30000
796050	contig_9381_pilon	-	847	6	Intergenic	novelGene_129364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_2	78.5722597358635	466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	26	760	74659	19597	FALSE	25	TAATTTTATATGTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKISGLEIMDEDRLIEEVLDKFVNCHEQTYEEFLSTFTHLSKEDNGTKKGAFGTDSLENVFTSVKFAHKMEPNDHHLRNKTIFLRTLSQCSEEEQIMMDEGQKVGSSFQGDLNRAGKVKVDNFLDLEDLDMDEDIKPQMSKDLLLLPGEVEQYISTSAPSYIPSVDQILTPEVKPSTTTNRAGKPMEELLGDEVHPFSLDEEFDYDKVMLTPKFTSAEMDTIKQLSKQKKENPNGDLEEPHD	74684	19509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9381_pilon_-_19762_34777_34918_48899_48967_50275_50348_52639_52798_74526
796052	contig_9414_pilon	+	1232	5	Intergenic	novelGene_131090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	96.1106133577348	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	44	793	548238	564078	FALSE	20	CATGACAATGTGTGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPLCGPGAAAAGKMKNEIAAVVFFFTRLVRKHDKLKKEAVERFAEKLTLILQEKYKNHWYPEKPSKGQAYRCIRVNKFQRVDPDVLKACENSCILYSDLGLPKELTLWVDPCEVCCRYGEKNNAFIVASFEHEDENKDEISKKVTRALDKVTSDYHSGSSSSDEETSKDVKPTLVTATPSPVYQISELIFPPLPMWHPLPRKKPGMYRGNGHQSHYPPPVPFGYPNQGRKNKPYRPIPVTWVPPGMHCDRNHWINPHMLTPH	544621	564517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_544659_548231_548411_552888_553027_558005_558208_563841
796058	contig_19974_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_130474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCTCATCCAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223479	223928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_223500_223900
796059	contig_9029_pilon	-	1537	6	Intergenic	novelGene_155136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	39.0968029383478	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	15	674	914666	870508	FALSE	15	CTGGTTTCCATGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGDMGKVRELRTRVHSSAVRPSEEAALGPAPSPQGPSPPHLSSGGARGKDGASVGTNIFAGTKIDLSALEQKLDLVTRTLASFKRGAETKSLLPKKEKLKLRHERWLQKIEAIKLAERKRLEAQRRRATEVVGDLRPLMEALPELAELENGGKSRQLRSRVTSKPRPTELSRMNAAQRLQLLEEERARFQALLANPTYQASPLQAIGQQLAHQMRLEGCGRL	914680	869644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_870632_873401_873471_878020_878172_886129_886199_900321_900431_914528
796060	contig_3386_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_34498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTTCGGGGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401173	400470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_400500_401200
796061	contig_8447_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_69457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATATAGAAGTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266973	268398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_267000_268400
796063	SIRV4	-	421	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-46	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATGACAAAAAACTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
796064	contig_6710_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_97965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
796066	contig_10068_pilon	-	2973	8	Intergenic	novelGene_148707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	144.277934726623	1	171	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	545	1462	57243	44668	FALSE	35	AAAAGACAGCATCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	59839	43156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_54327_54436_56355_56498_57186_57273_58180_58368_59511
796068	contig_12884_pilon	-	775	6	Intergenic	novelGene_104993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	648.14288548128	65	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	76	717	906341	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915303	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_905761_905834_906224_906349_915235
796069	contig_8120_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_159716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACTCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49432	48513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_48500_49400
796072	contig_10431_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_117392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38183	35756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_35800_38200
796073	contig_6424_pilon	+	1192	6	Intergenic	novelGene_109269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	737	1192	85115	89649	FALSE	5	GCTAGGGCCGCCCCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSREALHLPVVTSIGVDSPESHILFSAGVAQEVSAEAGEEVEDLPVGHRLVPVLCDEAIAQAFAFPEGHNINEVPPEATDRAAVPQQLPGRHVGEQLQQDVLWQLVDADRGHGCGRAGTCAGLGAGRAPEPEPSCDQPGVPLLGARPLSTR	82837	89649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_83287_83392_83534_84313_84407_85061_85189_87478_87776_89564
796075	contig_16666_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_61769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGAATAAGGAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57681	59664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_57700_59700
796076	contig_2069_pilon	-	2414	21	Intergenic	novelGene_23398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	275.107301793318	8	76	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	174	2018	1256627	1234847	TRUE	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVASGLMEDDGKPRATQTPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGILLYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWITQKDKLPPEPAVPPGPAACKGSHGSHVLRTQ	1256978	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234022_1234561_1234882_1235178_1235318_1236191_1236310_1236576_1236654_1236857_1237020_1245605_1245765_1246182_1246273_1246482_1246609_1247815_1247947_1249409_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256856
796085	contig_8544_pilon	+	1532	3	Intergenic	novelGene_55904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	95.5	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTATAAAGAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18367	28907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_27777
796086	contig_7707_pilon	-	1869	1	Intergenic	novelGene_72156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234843	232974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_233000_234800
796089	contig_13481_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_119319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCTCCACAGGGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290233	289436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_289400_290200
796092	contig_10323_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_123624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGAAGTGCCCAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483449	484726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_483400_484700
796093	contig_8453_pilon	+	2530	1	Intergenic	novelGene_125123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACACTGGGAAGGCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190469	192999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_190500_193000
796097	contig_15066_pilon	+	1165	4	Intergenic	novelGene_149524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_2	6.16441400296898	263	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	145	723	57293	59088	FALSE	10	TGCTTGTGGATTTGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKLRTRSDGGAREDGPGRDHGGGGRGGRGGAAGGRGDSGVQGAVGGGMARASSANDSEEAWGALRAPQQQLRELCPGVNNQPYLCESGHCCGETGCCTYYYELWWFWLLWTVLILFSCCCAFRHRRAKLRLQQQQRQREINLLAYHGACHGAGPVPAGSLLDLRLLSAFKPPAYEDVVHRPGTPPPPYTVAPGRSLTASSECTCCSSASSCPAHCEGTNVEGVSSHQRAPPLIRRVNLG	57148	59530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_57362_58281_58385_58509_58687_58858
796099	contig_6503_pilon	-	1608	2	Intergenic	novelGene_145761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAAAGAAGAAACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137106	133459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_134982_137020
796100	contig_2380_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_117889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTAGAAAGATGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133878	132169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_132200_133900
796102	contig_10986_pilon	-	1472	12	Intergenic	novelGene_71482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.266221627834	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	63	920	80340	70757	TRUE	35	ATGTAAAACTTTCCCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVC	80402	66803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67229_67339_67434_67543_70645_70762_71485_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
796103	contig_10506_pilon	-	1442	3	Intergenic	novelGene_125171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTGGCCAATGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59239	9494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_9899_57803_57922_58319
796104	contig_7411_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_137019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341183	342777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_341200_342800
796109	contig_7400_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_175057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222655	222887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7400_pilon_+_222700_222900
796112	contig_10058_pilon	+	902	7	Intergenic	novelGene_67674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	237.067266590917	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	86	841	40880	47188	FALSE	30	AAATAGTGTGGAGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDREDKSGKGTLRPAKSMDSLSAAAGASDEPEGLMGPSRPRPSPLLPESLENNSAEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAARAGGTSRSERCAGVHISDPYNISLPLHITSILNMPPNVTQATGLLFQTG	40182	47249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_41898_41977_42737_43019_47149
796121	contig_6374_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_158428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGTTGACGAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9307	10295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_9300_10300
796122	SIRV6	+	270	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-6	31	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796124	SIRV5	+	363	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-36	878	-36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
796125	SIRV4	+	295	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTGAAAGCTGGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3649	3944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
796128	contig_1594_pilon	-	2223	18	Intergenic	novelGene_138822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	67.4030381375573	2	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1336	1716	730780	726770	TRUE	10	ACCTCCGTGTTGGCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQRGAGVLCPSHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAMIAGALAVELMVSVLQHPEG	810143	503277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_503512_653304_653428_695195_695277_719842_719912_726769_726890_729033_729238_730723_730911_737128_737288_741268_741414_742429_742521_747563_747686_749270_749360_761084_761235_762622_762740_768615_768694_777250_777306_777805_777976_810114
796129	SIRV6	+	503	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	353	0	180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
796130	contig_12257_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_152117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201893	201361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_201400_201900
796133	contig_4812_pilon	-	973	6	Intergenic	novelGene_103651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8963.78925678198	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAATACAGTTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82705	78721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81261_81543_81645_82268_82346_82624
796135	contig_6557_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_32942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339487	338621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_338600_339500
796137	contig_11115_pilon	+	1179	5	Intergenic	novelGene_102855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	681.09044002981	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	197	1096	171704	173241	FALSE	15	CTCCGGAGTCTGTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMS	171507	173324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171981_172339_172595_172714_172964_173047_173160_173234
796138	contig_13894_pilon	-	1204	3	Intergenic	novelGene_62065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	271	1203	287445	286416	FALSE	55	AGGAGCTAGAAAAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDEC	288310	286414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
796143	contig_20055_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_175059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTGTCCAGGACTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39632	37821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_37800_39600
796147	contig_12746_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_152182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTATACAAATATATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484446	484105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_484100_484400
796148	contig_12746_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_152181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTGTATTAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482757	481942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_481900_482800
796149	contig_5424_pilon	-	758	6	Intergenic	novelGene_172815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	455.865155501054	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	373	705	155931	144242	FALSE	40	ATAATGATGAGAACATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVEEDSDTVTVETVNSVTLTQDTEGNLILHCPQNEADEIDSEDSTEPPHKRLCLSSEDDQSIDDSTPCISVVALPLSENDQSFEVTMTATTEVADDEITEGTVTQIQV	168311	144188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_144343_152897_153021_155822_155940_156654_156778_166294_166435_168210
796151	contig_9177_pilon	+	959	5	Intergenic	novelGene_32692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	315.790278507746	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	117	677	437240	460987	FALSE	20	CATGAAGCTTCTTTATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMDPFGAPAGAPGGPALGNGVAGIGEEDPAAAFLAQQENAVDAIMNGEYYQESNGPTDNYAAISQVDRLQSEPESIRKWREEQTERLEALDANSRKQEAEWKEKAIKELEEWYARQDEQLQKTKANNRAAEEAFVNDVDESSPGTEWERVARLCDFNPKSSKQAKDVSRMRSVLISLKQAPLVH	437123	461269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_437361_442070_442109_444198_444317_452974_453087_460815
796153	contig_13244_pilon	-	1731	1	Intergenic	novelGene_86979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTTACATTATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355996	354265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_354300_356000
796154	contig_15304_pilon	-	602	4	Intergenic	novelGene_30577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1311.2986777322	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCTTGGCCGGTAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57675	52998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53577_54269_54295_57504
796159	contig_6069_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_8009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	70	351	80811	81092	NA	35	CCCAATAATATTGGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLLPLRALAPRPAPRQARRKRVMEDWWCPREAARALERGALGTRSHRPSPDLRGPFPGRPCDPTPATLQTLSLLLRGPLPGRPKNSCPAFPSCQSLCGRSSRRCACRACCVRRAA	80741	81580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_80700_81600
796160	contig_15673_pilon	-	991	5	Intergenic	novelGene_169835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	79.1308252200114	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	18	488	162366	159835	FALSE	10	TGTTTGCTGTCTCACGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSFRKASMASTSQRKRMSSKPELTDEQRREIREAFDLFDADGTGTIDVKELKASSLLDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEEEFLRIMKKTSLY	162383	159331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_159925_160343_160482_160693_160759_161067_161243_162363
796161	contig_5236_pilon	-	1846	5	Intergenic	novelGene_100914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	10.9630059746403	124	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	96	1535	447928	445307	FALSE	0	TTTGTTGGGCTGTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDIDRNQTEKLLKRVQELEEEVQRLKKEQVNKDSSRKEDSSGSKKAKRAFDFSAHGRRHVALRIAYLGWGYQGFASQENTNNTIEEKLFEALTKTRLVESRQTSNYHRCGRTDKGVSAFGQVISLDLRSHFPKDKDSEDLSLKDEVNDSAKEIRYTHILNRVLPPDIRILAWAPVEPTFSARFSCLERTYRYFFPRADLDIVIMNYAAQKYVGTHDFRNLCKMDVANGVINFQRTILSAQVQLVGQSLGDERWEEPFQLCQFEVTGQAFLYHQVRCMMAILFLIGQGMEKPEIIDELLNIEKNSQKPQYSMAVEFPLVLYDCKFENIKWIYDREVQEFNVTHLQQLWANHAVKTHILYSMLQGLDSAAVPCGKGPEMDGVIKWRNVKPPVIKQTSAFVEGVKMRTYKPLMDRPKCQGLESRIQHFVRRGRIENPHLFHEEETKAKRDCADILEEENTILEKPTKRICVDTEIKRIT	454866	444995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_445618_445761_445953_446893_447460_447556_447971_454813
796162	contig_7119_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_40993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTTGGACCTACGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150684	148465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_148500_150700
796163	contig_5671_pilon	+	1096	6	Intergenic	novelGene_79467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2280.05092925575	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	25	438	370430	525570	TRUE	35	TAAAACGTTATCTCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEDLCLLHL	370405	531778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_525546_525660_531209
796164	SIRV5	+	570	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-240	875	-126	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8075	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
796165	contig_6163_pilon	-	1524	13	Intergenic	novelGene_103827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	972	1301	309545	300235	TRUE	25	CCACAGCAGCAGCCGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPRSVLASPLAHVGFPCCSCSVTAWSCSGPMAKTSPAPRSCSPFLKELLSQCCSDAVYLVEVKMQEVGQHSGGHTGEGGQERLEVDLQILLPLLHQASRVFPNYLFGW	316966	296682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_296788_299375_299459_300199_300385_308445_308494_309413_309578_309942_310039_311438_311535_313246_313401_314044_314109_314640_314828_314999_315131_316422_316537_316869
796167	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
796169	contig_5643_pilon	-	1020	8	Intergenic	novelGene_39130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	233.931439458973	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	150	719	649521	647313	TRUE	35	TAAACTGAAGTCAAGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNRIGGVQQDTILAEGLHFRIPWFQYPIIYDIRARPRKISSPTGSKDLQMVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	650931	646201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646487_647296_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344_649530_650490_650571_650870
796171	contig_12765_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_106559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGAAAGAAACAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116575	117437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_116600_117400
796172	contig_6710_pilon	+	576	2	Intergenic	novelGene_94615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	980	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCACAGTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
796173	contig_8712_pilon	-	1225	11	Intergenic	novelGene_58881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_10	19.5655309153624	228	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	32	994	1020797	1003480	FALSE	20	AAACTTCTCCAGGGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVPQDCPGTGSAQAGRGASCQGCPNQRLCASGAGAAPDPAIEEIKEKMKTVKHKILVLSGKGGVGKSTFSAHLAHGLAEDENTQIALLDIDICGPSIPKIMGLEGEQVHQSGSGWSPVYVEDNLGVMSVGFLLSSPDDAVIWRGPKKNGMIKQFLRDVDWGEIDYLIVDTPPGTSDEHLSVVQYLSGAHIDGAVIITTPQEVSLQDVRKEINFCHKVKLPVIGVVENMSGFVCPTCKKESQIFPPTTGGAEAMCQDLKIPLLGKVPLDPQIGKSCDKGQSFLTEAPDSPATLAYRSIIQRIQEFCSLHPSHEEQLTGS	1020828	1003248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1003539_1004233_1004318_1007841_1007945_1008229_1008341_1008904_1009060_1009905_1009997_1010655_1010689_1013095_1013165_1018936_1019071_1020595_1020701_1020778
796174	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	507	60	507	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10744	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
796177	contig_4803_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_150725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1852	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTGCTGGTGTAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58483	55842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_55882_57974
796183	contig_15063_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_14441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	225	713	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35839	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
796184	SIRV6	+	566	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	9	-1	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3206	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAGTCAAGTCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
796185	contig_7704_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_154627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	208	327	358300	358419	NA	20	GAAGATCTCTGGTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPGTEEAGFPLTTGTRRIALLLSAHPACHPAFPCLDLTWNWLKTTQECIFPTAHPAWKIPRRCGFLGAMPTPIPAADWLRRPPPSAPFGPSPLPSPLGWFLYWGCTN	358092	358950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_358100_359000
796186	contig_16578_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_148633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTAAAAAAAAACAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129429	128357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_128400_129400
796187	contig_8196_pilon	-	421	2	Intergenic	novelGene_168765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATGTCCAATCCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408025	217998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_-_218070_407675
796188	contig_8153_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_34814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	431	736	156287	155982	NA	20	ATCATACTTGGGTTTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLYMILNSIGPSALCRALHPCGFVTSCIDWPLGKYWFTNLTIFKKITFINIRLSISSEEISSIGKLSCSKWWMQVFQNSNFHLKAQILSLATNTVSCCP	156717	155825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_155800_156700
796193	contig_9875_pilon	+	2094	2	Intergenic	novelGene_154399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGAAAAATGGATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10860	13619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_10946_11610
796195	contig_10019_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_86690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTAACTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345087	342878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_342900_345100
796196	contig_11285_pilon	-	1470	6	Intergenic	novelGene_5499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.5917543975161	64	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	14	601	539296	519894	TRUE	5	CTCATGTCTCTGGTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPPGEYFSVGSQVSCRTCQEQRLQGEVVAFDYQSKMLALKCPSSSGKPNHADILLINLQYVSEVEIINDRTETPPPLASLNVSKLASKARTEKEEKLSQAYAISAGVSLEGQQLFQTIHKTIKDCKWQEKNIVVMEEVVITPPYQVENCKGKEGSALSHVRKIVEKHFRDVESQKILQRSQAQQPQKEAALSS	539309	518322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_518980_519681_519987_520827_520955_522390_522501_537224_537359_539172
796197	contig_13904_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_165486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCACTGGTTAAGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59007	60491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_59000_60500
796198	contig_12588_pilon	+	2356	2	Intergenic	novelGene_173091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTGTACTCTTGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71660	74680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12588_pilon_+_73858_74521
796199	contig_6544_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_142085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGTGAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75370	77033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_75400_77000
796201	contig_14474_pilon	-	1710	5	Intergenic	novelGene_144204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTTTCTAAACACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44945	21375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_-_22549_24383_24516_29599_29723_36664_36827_44825
796202	SIRV4	-	178	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	418	21	-418	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCAATAAAAACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	4055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796203	SIRV4	-	216	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1307	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3851	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
796204	contig_7359_pilon	+	1183	8	Intergenic	novelGene_139861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	33.013911724407	352	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	118	867	325382	335167	FALSE	25	TATTTCTTCAATTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRGSGCTMLPYVVPSGNVVVLTPSDFSMSRAERSELPNQDDRGKGLKNEVKVLGTLQVLAGMMIMSLGITLGCTVTSHHFSPIVSTLMKSMYPFIGAKCFIVSGLLSLILEKRFNKHLAWSTLAINITSLLAAAVGFIILTFNLAAMPAARERCLQNASPPLEGFYYSRSEATNCLVVSSILLGVLSVMLIFTGLEFTVAVPSSILWWKQTHPHDEPQMVHFLPQSGTTVSTKPPAELPGPGPEEQ	325264	335483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_325402_326900_327052_328428_328564_329401_329459_331463_331659_333430_333536_334399_334484_335164
796206	contig_10581_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_41358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTGCAACCATTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82722	82262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_82300_82700
796209	contig_15691_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_60772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCAAACTGGAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68557	114446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_69581_114283
796210	SIRV4	-	309	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1209	3	1209	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
796211	contig_20028_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_170650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	73	729	46935	47591	NA	65	AAAAAAAAAACATATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDKPSVWGSFKQRTRPLLINLSKKVKKNANKPLDLQATHHLDRRLSLSVPDILEAGALAVEGGPYSGPQSSYTSVPTSLSAAGIFPKSSGSSLRQSEDEPDWSQEEAGHLDVMEMDSEEIYAPPAADWRASSNSIFDLLQKTPLGGGCIRRVRGESRAVNFPVLFLFFLFFFFFFQCIQCPWKIWLGVIFVVSLDGENVIYKNLKECDIDHTQCSH	46862	48710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_46900_48700
796212	contig_11702_pilon	-	1128	11	Intergenic	novelGene_141972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	83.1867777955127	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	174	1034	376758	372981	FALSE	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380760	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_374165_374269_374525_374660_374903_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
796219	contig_6975_pilon	-	1538	2	Intergenic	novelGene_74296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCTAGAAAATAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438950	437082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_437155_437484
796220	contig_13481_pilon	+	896	6	Intergenic	novelGene_119556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_5	578.468529826818	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	786	110	895	1568681	1586293	FALSE	5	CTCGTGGTCACCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPVRHLKLGARVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTAELDACERNNPIISIWDQYFYRYTALFLRSKCQTDVKMTCLQATMWFLFTFHQPLKTSQRCSAVRTYKALLFSPRRLCIVHFPGLRFKYICN	1568571	1586294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1581545_1581608_1586080
796221	contig_2403_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_71001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTGAAATATCTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97600	98497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_97600_98500
796223	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
796225	contig_12437_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_169078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	812	1228	79262	79678	NA	20	TCCCAGGAACCCCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWFPSLGVGRTETTGPAQLCRVPWADSVSLLSSQQTPEPALRQVRQLHPIAVSLRWAPWGGPGAFKPNQVLGLGLTDSTYTVASCFLPFLFLLCTGRARPCLQGRKSSKTGGTGACQGLKTGPSLQPCPFSRERAGS	78450	80501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_78400_80500
796228	contig_10947_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_167139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTATGACTTTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79209	78587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10947_pilon_-_78600_79200
796229	contig_2161_pilon	+	3020	1	Intergenic	novelGene_114901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	541	1626	136	1761	740541	742166	NA	25	TTTCCTTTTAGTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGCPSSREVEIALQGEGDVAHFVQEPSDCDEDDAVTDGAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDVQDAQVQGPQGHRLEKRLSHRSSLRQSHSLDSKTMERGQWTLKAPSSSSCANLETERNSDPLQPLASRRGVTGWEENDPRSFREFSGLKEAEALASQKGPGDVQPKAAETGPVSPTEGKELAAHLGHDNLQIEQGSVSGPESSKESSPSVQDSTSPGEHPPKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDSATPFADLVRFENVASFGSPGMQFSEPGDSTVTWMTSSHCNAECWRVHSQDPQDLDIVAHALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMVKMCQARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQSSGEGGAQPLEKSPEEPSLTGGPAQQPARDDSPRSSESPKGEKPKQDTGVTESSPMNAAASCVSEGPTLSPEPGSSNLFFTQDAVVQCRKRSSETEPSGDNLLSSKIERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHPPPSSAGIDSRVMLSPIRSPIQTVSPGLLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRNGRQIE	740405	743425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_740400_743400
796230	contig_4295_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_169978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAAAATACTGTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74914	74429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_-_74400_74900
796231	contig_6710_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_98025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653420	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
796233	contig_9335_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_147443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353573	354012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_353600_354000
796234	contig_5686_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_45495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACTGTTAGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263810	262808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_262800_263800
796237	contig_15248_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_149149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCTAGAGAACCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82159	81195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_81200_82200
796238	contig_5864_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_162769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34663	36641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_34700_36600
796240	contig_8127_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_175067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACAAAAAACCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252521	253650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8127_pilon_+_252500_253600
796243	contig_10629_pilon	-	2702	14	Intergenic	novelGene_52887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	9.9757101451179	105	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	194	2119	144366	110750	FALSE	15	TATCCTGTGCCAGATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTTMDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGGKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDNGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQQDCVNTFGSYECQCRSGFVLHDNKHDCKEAGCDHKVTSTSGTITSPNWPDKYPSKKECTWAISSSPGHRVKLTFMEMDIESQPECAYDHLEVYDGRDAKAPVLGRFCGSKKPEPVLATGNRMFLRFFSDNSVQRKGFQASHSTECGGQVHAEVKTKDLYSHAQFGDNNYPSGVDCEWVIVAEEGYGVELVFQTFEVEEETDCGYDYMELFDGYDGTAPRLGRYCGSGPPEEVYSAGDSVLVKFHSDDTITKKGFHLRYTSTKFQDTLHSRK	145167	110166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_110885_112825_113077_115020_115235_115636_115765_118881_119008_124158_124340_124666_124828_125625_125752_126649_126846_126963_127110_127378_127496_129022_129126_144324_144441_145048
796244	contig_5057_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_151529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAAAAATTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555102	555721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_555100_555700
796248	contig_4305_pilon	-	279	3	Intergenic	novelGene_136684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	814.5	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAATTCCTTGAGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514032	512967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513051_513199_513298_513934
796249	contig_6710_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_98054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATGAAGACTGTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653427	653849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
796252	contig_817_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_132448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGGCTCCCACTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548573	549187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_548600_549200
796253	contig_8376_pilon	-	1614	4	Intergenic	novelGene_153773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_3	115.550854605234	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	46	702	215432	149661	FALSE	65	TAGACCCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEGQAGRRSSKAVAMGGLKDELLKAIWHAFTALDLDHSGKVSKSQLKVLSHNLCTVLKVPHDPVALEEHFRDDDEGPVSNQGYMPYLNKFILEKVQDNFDKIEFNRMCWTLCAKKNLTKNPLLITEEDAFKVWVIFNFLSEDKYPLIIVPEEIEYLLKKLIEAMGGGWQQEQFEDYKINFDDSKDGLSAWELIELIGNGHFSKGMDRQTVSMAISEVFSELILDVLKQVRVL	215477	148748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_149904_171807_171982_193128_193270_215333
796256	contig_7285_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_143394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTTTTTCATCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233857	236052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_233900_236100
796258	contig_4364_pilon	+	1191	4	Intergenic	novelGene_170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	900.364864312734	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	113	475	1268714	1270358	FALSE	15	GAGCCAGTGTCCCTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELGGPGHTSLSVPRFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1266993	1271074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269076_1270260
796260	contig_11872_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_143148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTCACTCAAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54758	53596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_53600_54800
796261	SIRV6	+	357	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	23	403	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796262	contig_12250_pilon	-	998	5	Intergenic	novelGene_80632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.035979944862	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	357	596	377548	376087	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECFLYRWSRPLHDIY	378724	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376129_377350_377659_378286_378359_378463_378540_378626
796264	contig_6870_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_104009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGACCAAGTGGAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606193	1605447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1605400_1606200
796265	SIRV6	-	240	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACTTCTTCTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
796272	contig_9239_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_137153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCATATGTTTTTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6296	5119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_5100_6300
796273	contig_5434_pilon	-	2149	8	Intergenic	novelGene_74695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	20	junction_7	172.029067311312	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	357	1268	432788	404280	FALSE	35	TTAAATACTCATTTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYSRTLKEEGPRYLSSTAVVVAELLKIMACILLVYKDSKCSLRALNRVLHDEILNKPMETLKLAIPSGIYTLQNNLLYVALSNLDAATYQVTYQLKILTTALFSVSMLSKKLGVYQWLSLVILMTGVAFVQWPSDSQELDSKELSAGSQFVGLMAVLIACFSSGFAGVYFEKILKETKQSVWIRNIQLGFFGSIFGLMGVYIYDGELVSKNGFFQGYNRLTWIVVVLQALGGLVIAAVIKYADNILKGFATSLSIILSTLISYFWLQDFVPTSVFFLGAILVITATFLYGYDPKLAGNPTKA	467761	403398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_404371_408258_408393_410565_410685_420366_420539_426593_426717_426796_426952_432670_432876_467492
796280	scaffold_16539_pilon	-	1559	4	Intergenic	novelGene_68307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_3	153.176006244088	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	565	987	98413	97499	FALSE	45	AATAAAAGTTTACCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMQTIGPSFILRETAWVVGGRDFAPPGGLLLAVQGRGPRRDQRPLASASGLPQVHGGLLQIFPEGRPVVANIEPLFDRLLIFWSDRRNPHEVKPAYATRYAITVWYFDAKERAAAKDKYQLALGQKGVQVPVSQPTTPT	103852	96926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97555_97821_97890_98114_98800_103674
796282	contig_2798_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_119992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	16	366	60229	59879	NA	30	CATTCCAACTCATAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRLIMSPHASFISGRASPSQGSSFPLSWVYYRRGRKHMEVTHQHLDTSSQKLNMSFLFTGHWLEQATRSCLTARAWHHRLPSVPKKEMGAVLGRALVVSTKMKNESKKSKKTTHVLGENF	60244	59672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_59700_60200
796283	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	404	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
796284	contig_16228_pilon	+	1813	7	Intergenic	novelGene_147944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262.910261411675	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	37	966	47816	71852	TRUE	25	TGCTTACACACCTCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47779	79236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60179_69494_69790_71434_71573_71760_71853_72142_72611_78857
796287	contig_2069_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_23309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514978	513303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_513300_515000
796288	contig_4071_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_151893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTTTGTACATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340085	340328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_340100_340300
796289	contig_4071_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_151894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAACACAAAACCAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342143	343607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_342460_343359
796290	contig_5758_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_119137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCCTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643988	643692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_643700_644000
796291	contig_12721_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_175073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAGTACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740040	741673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12721_pilon_+_740000_741700
796302	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	39	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
796305	contig_10937_pilon	+	2167	8	Intergenic	novelGene_67306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	60.7876867230762	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1262	1966	42786	45357	FALSE	20	GCTCAGCACCAAGGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFFLARRHVLAAGFLVVDVPYYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK	39168	45558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_39254_40254_40427_40733_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
796309	contig_14472_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_111182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTGTTTCAAAGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385472	387607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_385500_387600
796311	SIRV4	-	327	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1196	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3962	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
796314	contig_8676_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_142216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAGCAGTCAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528556	528934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_528600_528900
796320	contig_13863_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_42001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTCATCTAGTCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67593	68057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_67600_68100
796324	SIRV6	+	221	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	51	511	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
796325	SIRV7	+	271	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGTTTAATTTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	78942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78840
796326	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
796328	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_2975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
796329	contig_2730_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_135382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCCAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326606	324104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_324100_326600
796330	contig_16882_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_148259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622099	624095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_622100_624100
796331	contig_15866_pilon	-	2265	2	Intergenic	novelGene_63674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	668	1012	616051	615707	TRUE	40	CTGAATGTTAAATAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLTNLLVNSSKHLICIDLTPPPRVPCTLFALLASCPIPFVGHKHLICIVPPNHLVAVIRSWQERPYKSDPLHYTSTYLIYQLTLHSLVHSTNIESFTICKQLSLVSKETGNI	616718	613057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_613127_614522
796332	scaffold_15568_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_122569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGAATTGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18278	17880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_17900_18300
796334	contig_1812_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_174511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAAATGTCACTAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4727	4218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_-_4200_4700
796335	contig_15893_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_128503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34839	36847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_34800_36800
796336	contig_8978_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_49438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTCTTTCTTACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064969	1065376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1065000_1065400
796339	contig_15120_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_108018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226660	226288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_226300_226700
796340	SIRV2	+	410	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	97	16	97	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTCCTACTAGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1200_1600
796343	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_98213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	CTTCCCCACAAAACACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
796344	scaffold_9100_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_83307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	130	570	796487	796047	NA	60	CAGGTTAAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSESQLKKMVSKVRPARARIPARALRSPPRLGRFILAQRSSRAGRKPRAVLGSFWTPSPQTLRRLSLCAGSPNSGGGEGGGRCQSTKARSGGRLPPAARSPFFRRLWSDLWGSIVIVLVFINTKRGSYLVLDLGQSSSTPTVRK	796616	795256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_795300_796600
796345	contig_12583_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_175074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGCAATTTGTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_+_800_2300
796347	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_96688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
796348	contig_6634_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_171143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCATTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250754	252728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_250800_252700
796349	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_97923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
796351	contig_8631_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_121937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTGGAATCACTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640075	640424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_640100_640400
796352	contig_10581_pilon	-	1530	12	Intergenic	novelGene_41385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_11	43.0485023400235	240	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	19	1428	592288	577593	FALSE	15	GAATCTCCCAGTCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVAVSRWGAWPVAVRRGPLVPCRRWSGAPADTVYDVVVSGGGLVGAAMACALGYDTHFCDKKILLLEAGPKKVLEKLPETYSNRVSSISPGSATLLSSFGAWDHICNMRHRAFRRMQVWDACSEALIMFDKDNLDDMGYIVENDVIMHALTKQLEAVSDRVTVLYRSSAVGYTWPYPFSMADSSPWVQITLGDGSTLQTKLLIGADGHKSGVRQAAGIQNISWNYDQCAVVATLHLSEATENNVAWQRFLPSGPIALLPLSDTLSSLVWSTSHKHAAELVSMDEEQFVDAVNSAFWSDANHTDFVDSVGTMLQHAIALLKPSKVSARQLPPSVARVDAKSRVLFPLGLGHAAEYVRPRVALIGDAAHRVHPLAGQGVNMGFGDISSLVHHLSTAAFNGKDLGSMSHLTGYETDRQRHNTALLAATDLLKRLYSTSATPVVLLRTWGLQATNAVSPLKEQIMAFASK	592306	577490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_577623_578126_578294_578476_578593_578669_578873_580472_580581_580767_580831_580918_581027_581884_582016_583891_584016_584318_584378_585447_585583_592122
796355	contig_2054_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_51695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTAAGTAAGAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149668	152408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_149700_152400
796357	contig_5878_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_145727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGCATATGTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268350	268946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_268400_268900
796358	contig_6885_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_83684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGGAAGGAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248205	246538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_246500_248200
796360	contig_14341_pilon	-	1660	8	Intergenic	novelGene_111748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.8335719357273	102	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	571	960	115467	113541	FALSE	25	ACCCTCCAGTGTCTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAPLPPGRRARGYLSSRNSCPCDFSPFPSALYPRDSSWPVEGTPEEERRTAWLPTDQVQNYTTITMIFFQNIFIIPKRNPMSIKQSSPFPFLQPLVTTNLFLYGFTSSDTSYERNLTICGPLRLASFT	118513	112840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_113751_114863_115043_115466_115528_116275_116352_117568_117660_117822_117907_118087_118195_118361
796361	contig_18869_pilon	-	1046	3	Intergenic	novelGene_56445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	428	766	120066	119728	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFSPEKFYRKQTNHSPHSLTSKTKSLKRLTFLRILFPCMSTSLLPRIQIQPKLFKTKRIPLHSCVSTIPPTAGAAKSSVKLLSTLISASPSGNRTCRTICLLMNNNDVLL	127719	119447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_120151_121643_121891_127623
796362	contig_7549_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_164535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710336	711461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_710300_711500
796363	contig_12629_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_150644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGCTTCTAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13887	12758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_-_12800_13900
796364	contig_6364_pilon	-	1039	5	Intergenic	novelGene_51830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	2.34520787991171	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	576	989	1588512	1586979	FALSE	40	GCCTTGGAGAAATGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1589087	1586928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465
796365	contig_2043_pilon	+	2783	7	Intergenic	novelGene_169917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGACTTGCGGCTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717204	835518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_718470_719493_719679_773228_773401_775085_775227_776673_776845_782163_782827_835332
796366	contig_15063_pilon	+	448	2	Intergenic	novelGene_13946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	198	383	34808	36740	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPGETGSAPCGDQPLCVCPCVHSN	34610	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34936_36682
796367	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	57	526	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
796370	contig_2069_pilon	-	1087	5	Intergenic	novelGene_23443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1008.35881510502	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTTGGTAGTCCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331422	1327234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328618_1329451_1329503_1329861_1329900_1331254
796371	contig_205_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_144324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATAGTGTTCTTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306168	303885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_303900_306200
796372	contig_9646_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_117459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTCAATACTTCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328410	330002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_328400_330000
796374	contig_8687_pilon	-	2424	1	Intergenic	novelGene_169675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322306	319882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_319900_322300
796376	SIRV2	-	497	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	326	4	-326	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTGTGATCTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
796380	contig_14133_pilon	-	2167	2	Intergenic	novelGene_119909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	539	1201	135898	131931	FALSE	25	GGTTAATGCTTGGCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPIVVGSVNYSLITCIFQVRSKRRGLPILFPSLRRRRRRDRPWRPGRQIRSLETASVGLQRPPTWGRGHPDASGLLLHLKLKRNLSLQSQARKKLPSHKSSSHAPPTRLSSAAAPWKSKSRRPSRSMLVGAPLPGTGTPAQWTHTVQKTGNKRVLWSPVVTHAAVQENWTQLHLGNNGRSATCLSRSCSCPTVNQLLPRGLPRPHLFQSCVQPDGGQQE	136436	130964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_132345_135649
796382	contig_3861_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_57899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAACCCCAACCGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155113	154394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_154400_155100
796385	contig_5092_pilon	-	1195	2	Intergenic	novelGene_62264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTGTGTCTGACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229680	227183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_227495_228796
796390	contig_5041_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_27120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	895	1266	631323	631694	NA	75	TGGGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTSLKKCYWLQDTNDTIAKSVEPTSISTVLESQPECSLEARMARLPLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSTRRTDTMAATMGSSITTIVRDGTGLGSISFCSTEGPDQLEPS	630428	632661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_630400_632700
796391	contig_9091_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_32432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46385	43658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_43700_46400
796393	contig_5590_pilon	+	2253	16	Intergenic	novelGene_163057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	27.8243698141675	557	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	777	2024	523540	530513	FALSE	15	GGGCGAGCCTGTGCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKEMLPIKPPKGLLGWAVTWYLENHLANLFAGAWEPQPEGPLPLDIPQAAPQQVQRCVEILSRAKRPLIVLGSQALLPPTPADKLRAAVETLGVPCFLGGMARGLLGRNNPLHIRQNRSAALKKADVVILAGTVCDFRLSYGRVLSRSSKIIVANRNREEMLLNSDLFWKPQEAVQGDVASFMLKLGEGLRGHTWGPDWVEELREADRQKEQTFREKAARPVAQHLNPVWVLQLVDETLPEDSVLVVDGGDFVGTAAHLVRPRGPLCWLDPGAFGTLGVGAGFALGAKLCRPDTEVWCLFGDGAFGYSLIEFDTFVRHKIPVIALVGNDAGWTQISREQVPSLGSNVACGLAYTDYHKAAMGLGARGLLLSRENEDQVVQVLREAQQQCQDGHPVVVNILIGKTDFRDGSIAV	520302	530742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_520509_521400_521546_522770_522973_523064_523193_523275_523338_523506_523605_525724_525825_525957_526056_526175_526313_527811_527947_529036_529152_529239_529410_529483_529555_529635_529708_529851_529958_530334
796394	contig_8415_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_141686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTATATCTTAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148240	146109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_-_146100_148200
796399	contig_7308_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_159612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGTAGGGCTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535354	536445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_535400_536400
796402	contig_1406_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_25491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348727	1347564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1347600_1348700
796406	SIRV6	+	436	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	14	35	14	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTGAAGCCGAAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
796411	contig_2487_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_148450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGATCTGTCCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102531	104100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_102500_104100
796412	contig_14326_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_120666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCATAGTGACCCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62619	60725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_60700_62600
796416	contig_14666_pilon	-	1104	6	Intergenic	novelGene_39546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1206.76983721006	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	337	645	458202	450773	TRUE	25	CCTTGGAATCATTGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCRGLHKPHRLGGWLGCQQRDRVLDCPQLMG	459079	449466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450862_452068_452102_453686_453867_458195_458392_458932
796417	contig_6785_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_132592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGAAGCAGACCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812181	809998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_810000_812200
796419	contig_3293_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_175081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435034	432957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3293_pilon_-_433000_435000
796420	contig_2854_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_120858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGGGAAAAAAACACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328012	330363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_328000_330400
796421	contig_5145_pilon	-	1394	9	Intergenic	novelGene_131449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	151.386921495881	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	84	593	946991	936187	TRUE	30	AGCCCCAGCATCAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGASALLNARPFPPLLPRLLPKLSAAAMSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	947074	923078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925735_936185_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
796424	contig_12740_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_159215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	776	1201	93888	94313	NA	20	CCCATTTGGTCTTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLPICLSIHLCIFGAQHIIAAQQMLVKRTYEAEKGGKNHREERGREQNQKQKSEVAEGENTRLSGRAERPQLRQNCSETGGVSRKEQKATGASLSVAAVEDPGTSTLYVYLSIKPKTNQTRCCRFNSNSWPNRYLNLQAP	93112	95579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_93100_95600
796426	contig_5375_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_169202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39889	37728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_37700_39900
796430	contig_9011_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_159344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCTTTTAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710669	712703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_710700_712700
796433	contig_9189_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_165113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCCCAAAATGTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276949	275760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_275800_276900
796434	contig_5423_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_85211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTTTATGGAAGCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329253	330586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_329300_330600
796440	contig_11417_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_103337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCATATGTCCCAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616353	613973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_614000_616400
796442	contig_16503_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_162080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTAGTGGTGGTGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468728	466708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_466700_468700
796443	contig_8978_pilon	-	1109	6	Intergenic	novelGene_49340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1017.02869182733	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	17	316	194082	192981	TRUE	35	GAATAAGAATGTCTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYENPGLRKI	194098	190472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191324_192286_192444_192867_193003_193604_193768_193967
796445	contig_7229_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_39833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACCAATGACCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932026	932493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_932000_932500
796452	SIRV6	+	249	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	488	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
796453	contig_7050_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_153636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATGTGGACTTCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824565	822438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_822400_824600
796454	contig_14333_pilon	-	2061	2	Intergenic	novelGene_49119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTCTCAGACATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392804	390683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_391898_391957
796455	contig_6576_pilon	+	1965	8	Intergenic	novelGene_42283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1308	1697	330304	337942	TRUE	10	TGGCCGACGGCCTCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGCIFSDDAISGGMPGITGGIPGISGGTPGINGGMAFLVLLGPVADLAVPLEGYNLAEVEQAVVEMKLMLQSHHHHIHQNHLVASFFDSLAFSVQEVVVFHPCLFLEYLPYHIFPILYLFSQLHAMNS	325462	339560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_326682_329120_329193_330287_330338_330838_330913_331034_331197_332093_332193_337921_338052_339401
796456	contig_14516_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_153955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	1653	1952	425229	425528	NA	50	GCAAAAAATTAAATTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTIVWLFPQSVKDFVLVVHSALILYSRPRRVSLETILYRKQVYSDQFRISVQKKVRCLLFRELETLPALMYILRKALLIHVIMKVLYRAELKFFKSVNK	423576	425528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_423600_425500
796459	contig_500_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_31116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCCTAGTTTAAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666089	1665620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1665600_1666100
796460	contig_15888_pilon	-	1051	5	Intergenic	novelGene_84429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1731.8379507044	118	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	261	341	252824	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLIAAAAAAGGGGVGGRTRRYGGGAYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259789	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253579_259713
796461	contig_16110_pilon	+	1374	4	Intergenic	novelGene_126786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	416	junction_3	152.539248137069	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	600	1112	53111	56273	FALSE	20	CTGATGGGTCAGTTAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQENSLYYAIYNLTMHSIFREPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITG	52511	56535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_53331_54084_54158_55828_55977_56201
796465	SIRV6	+	154	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	788	54	788	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11025	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
796466	contig_10926_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_137506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	966	1322	133005	133361	NA	15	CATACGTGTGTGCTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKRKLEKHNVPEFSMVCLQTNLTDCLTVVSLNLLLLNTVSALDFSSLLAASTNGCMWWLKIDEASSDQCGCWSLVKCVLKHPSPRRQPLNHISKIGSAPFFPCSQHGVAGKASIATV	132039	133636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_132000_133600
796467	contig_12292_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_167001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCATGCCAACCCGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253746	253534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_253500_253700
796468	contig_5093_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_135090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGATTATCAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584306	582780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_582800_584300
796469	contig_4418_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_98361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGAGAAATTTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704571	705796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_704600_705800
796470	contig_8412_pilon	+	2649	18	Intergenic	novelGene_118392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.7128122376975	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	643	2226	692562	715040	FALSE	20	CCTTTGAGAGATGCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRRAAVIFADTLTLLFEGIARIVETHQPIVETYYGPGRLYTLIKYLQVECDRQVEKVVDKFIKQRDYHQQFRHVQNNLMRNSVTEKIEPRELDPILTEVTLMNARSELYLRFLRKRISSDFEVGDSMASEEVKQEHQKCLDKLLNNCLLSCTMQELIGLYITMEEYFMRETVNKAVALDTYEKGQLTSSMVDDVFYIVKKCIGRALSSSSIDCLCAMINLATTELESDFRDVLCNKLRMGFPATTLQDIQRGVTSAVNIMHSSLQQGKFDTKGIESTDEAKLSFLVTLNNVEVCSENISTLKKTLESDCTKLFSQGIGGEQAQAKFDSCLSDLAAVSDKFRDLLQEGLTELNSTAVKPQVQPWINTFFSVSHNIEEEEFNDYEANDPWVQQFILNLEQQMAEFKASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	684927	715463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685028_687497_687613_689265_689441_690471_690669_692506_692620_694544_694703_695820_695880_697721_697856_701200_701320_702442_702610_703455_703622_706634_706698_708972_709090_709879_709973_710539_710624_710851_710954_714546_714676_714905
796473	contig_12638_pilon	-	1161	2	Intergenic	novelGene_33152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	492	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACAGTGGTCTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204139	202789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_203912_204100
796475	contig_5551_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_134225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATAGAACACTATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218608	219274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_218600_219300
796479	contig_7171_pilon	-	1682	16	Intergenic	novelGene_101399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	108.627477596089	550	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	61	1176	1437436	1409817	FALSE	5	CTCAGCTGTCTGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPDPSDPLETQAGKVQEAQDSDSDSDTEEGATGRETEMDFLRNFFSQTLGLGSQKERLLDELTLEGVTRYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYANLEKYHLPLAKELYPGQFKPTICHYFIRLLKEKGLLLRCYTQNIDTLERVAGLEPEDLVEAHGTFYTSHCLSPLCRQEYALNWMKEKIFSEVIPKCEKCQSVVKPDIVFFGENLPAHFFSCMQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTEGEKPQ	1437496	1409310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983_1413044_1414806_1414937_1421053_1421123_1421632_1421666_1421849_1421921_1422050_1422093_1432502_1432617_1432853_1432909_1436580_1436628_1437420
796481	contig_8606_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_159397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAACCAAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71478	70090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_70100_71500
796482	contig_6020_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_155575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACCTCCTGCCAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323746	322678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_322700_323700
796483	contig_7887_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_124946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGTTAAAGTACTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829929	829064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_829100_829900
796488	contig_10990_pilon	+	1930	3	Intergenic	novelGene_7408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	239.5	4	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	96	584	119582	121424	TRUE	25	ATAATAGTGTTTTTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119486	123480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_122087_122796
796489	contig_16204_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_154523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGCAATAAAAAAGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384557	386608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_384600_386600
796493	contig_6576_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_42353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACCTTTATAATAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740242	740853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_740200_740900
796503	contig_5896_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_159248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAGAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361795	360546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_360500_361800
796506	contig_8594_pilon	-	1517	6	Intergenic	novelGene_140056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	247.876904934687	8	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	31	600	495995	466731	TRUE	10	TTCTGTGTTTCTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVK	496025	460967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466735_475766_476005_487004_487311_495973
796508	contig_9548_pilon	-	2213	6	Intergenic	novelGene_141054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTAGCCCGCCCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141961	127727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_127858_130888_132314_137202_137341_137799_137868_139965_140062_141605
796510	contig_6710_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_93453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653726	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
796514	contig_11720_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_44037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	805	942	477045	476908	NA	35	CAAGTGCAAATGGGTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCPQTFGTNSKLRLHRLRVHDKTPTHFCPLCDYSGYLRHDITRHVNSCHQGTPAFACPQCEAQFSSETALKQHTLRRHPEPTPPAPGSPTEATEGPLHCSCCGLLCPSPASLRGHTRKQHPRLECVACQEAFPSRPALDEHRRQQHFSHRCQLCDFAARERVGLVKHYLEQHEETSAAASDVDGDTSQPPLRCPFCDFACRHQLVLDHHVKGHGGTRLYKCTDCAYSTKNRQKITWHSRIHTGEKPYRCHLCPYACADPSRLKVRSGAMGAGGEEMLALELNFLGSLILAFLNISSVTLGKFLRFSEPQIPHL	477849	476345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_476300_477800
796515	SIRV6	+	247	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8451	11	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
796519	contig_3472_pilon	-	1945	2	Intergenic	novelGene_166929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAACAAAAGATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229871	226769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_228054_229210
796520	contig_3789_pilon	+	950	6	Intergenic	novelGene_79847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	536	junction_5	74.1835561293741	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	176	685	445610	467113	FALSE	25	TGGACTCACTGTCTAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVITGLAMDMQLLMIPLIMSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGS	445434	467378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465169_465197_465816_465913_467056
796522	contig_10581_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_41413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	498	812	612664	612350	NA	60	AAAAAATAGTGCTAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQVGISVDSVFVETLFCCFVEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQEVNYLLPLVYVETNVESIYESSFEDRKRKNVLQFPFPGNFD	613161	612125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_612100_613200
796523	contig_11855_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_67090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCTCCTTACCTCGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2348419	2349009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2348400_2349000
796524	contig_165_pilon	-	1775	6	Intergenic	novelGene_117066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCAGGTTTTGTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64240	58903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_58988_60299_61197_61948_62056_62143_62225_63550_63586_63669
796525	contig_8167_pilon	+	1118	3	Intergenic	novelGene_155638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.5	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	187	744	41287	132413	FALSE	15	CAATTGCAGGTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVGEALPSTLPRASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	32455	132787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_32564_41208_41328_131896
796526	SIRV4	-	464	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
796527	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796528	contig_1008_pilon	+	3193	1	Intergenic	novelGene_121562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACTCACGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580466	583659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_580500_583700
796529	contig_13055_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_104962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGCACTGCAGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125104	125869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_+_125100_125900
796531	SIRV6	+	369	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	0	414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796532	contig_10235_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_46428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	230.946287045278	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	16	504	210483	211288	TRUE	20	TTAGCATTCATCTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRR	210467	212581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211297_211834_211924_212047
796535	contig_10765_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_122969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACTCATAGCGCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402930	403778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_402900_403800
796537	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1146	15	1146	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
796539	contig_987_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_72359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGATCTTACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305516	1306462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1305500_1306500
796540	contig_9784_pilon	+	1995	17	Intergenic	novelGene_165697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.898125738428	14	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	1426	1995	293036	318267	FALSE	40	CTTAATAACCAATCGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCKEVELFHFDIGPFENMWPGIFVHMIHQSCGIACFDLEKLCRFIMSVKKNYRRVPYHNWKHAVTVAHCMYAILQNNTGLFTDLERKGLLIACLCHDLDHRGFSNSYLQKFDHPLAALYSTSTMEQHHFSQTVSILQLEGHNIFSTLSSSEYEQVLEIIRKAIIATDLALYFGNRKQLEEMYQSGSLN	24054	318267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_24159_147611_147762_244071_244200_245510_245554_257546_257688_261835_261992_263697_263749_265155_265215_267553_267606_279177_279321_281870_281964_283594_283782_292917_293062_294100_294185_295938_296090_299968_300125_318114
796541	contig_13952_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_133259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTGGTTATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174905	175442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_174900_175400
796544	contig_4802_pilon	-	2244	15	Intergenic	novelGene_172216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAATTGGAAGCCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572841	157834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_-_157882_201739_201982_226325_226534_298331_298427_345207_345375_348411_348480_437336_437459_447169_447249_483349_483501_490607_490792_495024_495213_527054_527164_556963_557197_559791_560010_572708
796545	SIRV6	+	375	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	45	363	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAACGTAAATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796546	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796548	contig_10324_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_7828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	163	396	261538	261771	NA	65	CAAAAAAAAAAAGAGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSPEGHLLLEQGEQFPEEWGYTTLTSGQNNPHHLPFPHLQAENEDGAQENTFSMDPQLERQVETIRNLVDSYVAIINKSIRDLMPKTIMHLMINNVSASHRVVASGWPIARFGLDTVCIKLKMRISHHSF	261375	262811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_261400_262800
796549	SIRV5	+	426	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	11	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1121_1928_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
796550	contig_7045_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_77443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	268.995301487261	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	156	989	323324	365689	FALSE	10	GCTTGTATTGTCTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFSEAALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEVLDMGVSSNDVIIH	323168	365727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364288_365644
796551	contig_7904_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_160020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATGTTAATTTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383658	385609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_383700_385600
796553	contig_5954_pilon	+	1007	5	Intergenic	novelGene_28525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	312.892153944454	924	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	147	569	465084	467077	FALSE	15	TGGGCTCGAGGGCAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVCVVGGAESSASHPICA	463174	467515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463252_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893
796554	contig_18889_pilon	-	1181	5	Intergenic	novelGene_167112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	45.3452037154979	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	351	536	136693	135837	FALSE	25	TTTACCAAGGACTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHLERLLSQLGQTLRCRQLLCPPAEQQLAKCSVELASLLVADQIPILGPPTPHRLDRGQARRLLHVLLALWKDDFQVPVPLQLLLRPRNVGLLADTRPREWDLLLFLLQELVERGLMGRTEIETCLGSLHEAQWPGDFSKELAALFNLFLAEPHVPEPQLRACELVQPNRGTVLAQS	137575	135191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_135963_136633_136742_136973_137156_137323_137388_137519
796556	contig_11292_pilon	+	2565	13	Intergenic	novelGene_109389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	60.7796566843435	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2226	338	2563	39733	52123	FALSE	30	TCCCAGCATTGGCAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKKKFCPRLLDYLVIVGARHPSSDSVAQTPELLRRYPLEDHAEFPLPPDVVFFCQPEGCLSVRQRRMSLRDDTSFVFTLTDKDTGVTRYGICVNFYRSFQKRMPKEKGEVGTGSRGKEVTRATCVSEEVGTESSESGTSLQPPSADSTPDVNQSPWSKRRAKGGGRSRNSTLTSLCVLSHYPFFSTFRECLYTLKRLVDCCSERLLGKKLGIPRGIQRDTMWRIFTGSLLVEEKSSALLHDLREIEAWIYRLLRSPVPISGQKRVDIEVLPQELHPALTFALPDPSRFNLVDFPLHLPLELLGVDACLQVLTCILLEHKVVLQSRDYNALSMSVMAFVAMIYPLEYMFPVIPLLPTCMASAEQLLLAPTPYIIGVPASFFLYKLDFKMPDDVWLVDLDSSRVIAPTNAEVLPILPEPESLELKKHLKQALASMSLNTQPILNLEKFHEGQEVPLLLGRPSNDLQSTPSTEFNPLIYGNDVDSVDVATRVAMVRFFNSPNVLQGFQMHTRTLRLFPRPVVAFQAGSFLASRPRQTPFAEKLSRTQAVEYFGEWILNPTNYAFQRIHNNMFDPALIGDKPKWYAHQLQPINYRVYDGNSQLAEALSVPSERDSDSDPTDDSGSDSMDYDDSSSSYSSLGDFVSEMMKCDINGDTPNVDPLTHAALGDASEVEIDELQNQKEAEEPGPDSELSQENHPQRSSSSTTASSSPSTVIRGAHSELADSTEMDDKAAVGVSKPLPTV	35859	52125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_36116_39651_39795_40407_41005_41794_42099_46190_46323_46775_46890_48128_48210_49730_49910_50238_50475_50674_50832_51289_51394_51484_51676_52054
796563	contig_16595_pilon	+	1584	2	Intergenic	novelGene_150138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGTAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108679	156047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_108797_154580
796564	contig_12654_pilon	+	1131	9	Intergenic	novelGene_129330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGTGAGGGAACCGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808416	827469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_808517_809770_809880_810588_810681_812617_812722_815566_815683_816770_816830_817710_817836_823814_823887_827115
796567	contig_4686_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_118601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTTTCTGAGCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892277	891828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_891800_892300
796568	contig_4769_pilon	-	1468	4	Intergenic	novelGene_117965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	100.141011689628	64	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTGATGATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418917	407529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408337_408495_412412_412482_417835
796569	contig_8955_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_175088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	50	514	283652	284116	NA	40	AAATATATTGTTTCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGRKQPQGPGPGFSHMQGMMGDQGPRIGLALPGMGGPGPVGTPDIPLGTAPSLPGHSPLRPPPFLQQGMMGPHHRMMSPAQSAMPGQPTLMSNPAAAVGMIPGKDRGPAGLYTHPGPVGSPGMMMSMQGMMGPQQNIMIPPQMRPRGMAADVGMGGFSQGPGNPGNMMF	283602	285348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_283600_285300
796570	contig_6546_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_140960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTCTATACAAAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426847	427945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_426800_427900
796572	contig_2215_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_163864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCATGCAGTGACACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241294	239037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_239000_241300
796573	contig_7694_pilon	+	1167	6	Intergenic	novelGene_159928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	9.00222194794152	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	84	710	185836	199350	FALSE	70	AATTTCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKPLRLLACGDVEGKFDVLFNRVRAIQKKSGNFDLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYR	185752	199807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_191858_191944_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227
796574	contig_14133_pilon	+	2447	22	Intergenic	novelGene_119896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	16.1995772739561	16	23	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	1158	2327	87156	94424	FALSE	35	TTAGTGGGAGGAGTAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAELELGRSGAARGHFLFQIFCRRLQALGNMSTVAAHLQRQRELLLHKRILLGLPPSMLFTSLQGQPAAVDCDEFLHFVNSELRNFSHGGALTHDITAHFFRLWWPCLEPVLTCQWKQHSQSPLPRALQQLAEARDLAKSFLSLDTTLPIPRPTWVFAASLHFAIQQALREQGRRELKRLDFEREEVVLFLFFFSMMGLLSTYLAPSEAIDPLKTLDVCAEILECLERRKVPWLALFQLTETGAGLGRVLLRVASDQHIRLLPLAFFSLLPRLDPNALIREAAFLHVAVDMYLKLIRLFVAGETSTLPTLATQSQQYQNQDDPLGLITKARLFLLQSIPQCPERCFLNMTELLATGKDLDPEVSAALQKRQQAPPNLDPDLYGEPQLF	68818	94544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_68839_69946_70024_72688_72797_73184_73313_73649_73721_74028_74126_74450_74639_80914_81092_82049_82124_83818_83948_84902_84988_87152_87305_87856_87960_88629_88687_89941_90055_90980_91120_92258_92322_92745_92852_93374_93451_93554_93712_94009_94103_94310
796582	contig_5331_pilon	+	1550	4	Intergenic	novelGene_112774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	616	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACAGAAGAAGCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247934	251800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_249119_249437_249577_250435_250570_251707
796583	contig_15498_pilon	-	1629	2	Intergenic	novelGene_42625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	125	427	535094	534746	FALSE	20	CCAAGTGTTAGCCTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRAAWFLCTIANCPEATQSDLEVILPSRDSYLDAFKRAVVGVTVNLQV	535218	533543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_534884_534929
796584	contig_9424_pilon	-	668	5	Intergenic	novelGene_143775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1699.04487874806	159	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	24	365	280461	277512	FALSE	5	CCTGTTCGTGTTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSWAAEMPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280484	277208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277584_278634_278762_279552_279629_280079_280144_280458
796586	contig_10324_pilon	+	961	6	Intergenic	novelGene_7733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1048.02454169738	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACAGACTCCAGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57250	80759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_57429_57928_58047_66121_66171_67844_67919_68040_68126_80302
796587	contig_3018_pilon	+	2287	12	Intergenic	novelGene_78943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_8	33.7462578274299	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	108	1349	1350624	1399470	FALSE	60	TTGAAAAAAAAAAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLENTVLCRESQVSTLQSLFGERHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKLSHLCSSEDGCCTQITCDTLNDFVRLFKQVTKAEGLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANVLPGFLRLQELTDRNVTVIFLSEIIWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILCHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQQDDTDPGQLKGLSAYTHVELPYYSKFILIAAYLASYNPARTDKRFFLKHHGKIKKTNFLKKHEKTSNHLLGPKSFPLDRLLAILYSIVDSRVAPTANIFSQVSLIIGYYLSSLWNSSVRIVSRVSGVLIFF	1350516	1400408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1350696_1354411_1354505_1356662_1356864_1362065_1362141_1365533_1365646_1368023_1368155_1384570_1384620_1384708_1384800_1388934_1388988_1389909_1390023_1395834_1395883_1399266
796588	SIRV1	-	245	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3588	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6474_6557
796590	contig_10904_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_22689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCAGAAGTTAGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587244	585827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_585800_587200
796594	contig_13481_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_119329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325847	323815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_323800_325800
796596	contig_11292_pilon	+	936	12	Intergenic	novelGene_109453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACCTTTAAAAACAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370073	383280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_370274_372197_372275_373463_373532_374255_374302_375251_375347_376420_376486_376913_376963_377213_377272_378608_378671_378864_378893_382730_382838_383199
796597	contig_10235_pilon	-	945	6	Intergenic	novelGene_46489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	925.820587371009	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	20	472	222843	219405	TRUE	45	CGTATTTCAGTAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVAVSTMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRTVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	222862	217949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220472_220677_220788_222804
796599	contig_21412_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_142861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64986	66681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_65000_66700
796600	contig_3529_pilon	+	986	5	Intergenic	novelGene_105407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_4	7.58287544405155	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	537	986	791940	806815	FALSE	30	CCCCAGCAAAGTGAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYVSSRSELLSWYNPSLCFPHLPPHPQPGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWH	791403	806815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771
796602	SIRV6	+	352	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3048	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796604	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
796605	contig_5649_pilon	-	2579	16	Intergenic	novelGene_82344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	6.83585319392458	24	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	94	2355	846245	818352	FALSE	30	TATTTCACAAGCTCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLREKVEEEEEAEREEGVERPSRPEKMTKLLRKEATTLTPEMLRDMEQKLSEIKVPVPGEPLSLPLQKFLSTTIRPTLMPYPELYNWDSCAQFVSDFLTMVPLPDPLKPVVHEEERAPPKKYAIKPPRDLISRFEKEQETKRQEEIKIAEEKRLREEEERIMEAEKAPPDPLHGLRVHCWVLVLSGKREVPESFFIDPLTARSYSTQDGHFLGIESLWNHKNYWVNMQDCWNGCKDLVFDLGDPVRWEYLLLGTDKPHLLTTDDDDDGVNDDDDDVENLGKEDEEKSFDMPYSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWAPYLNSNGLVCRLTTYEDLECTNVLEIKEWYQNREDMLELKHMNKTTGLNIDYFKPGHPQALRVHSYKSMLPENDRAMEFYESARVDGLIKREETPKTMTEFFRGRPDFLSYRHIDFGPRVKKLTLNSAESNPRPMVKITERFRRNPAKPADEDVAERVFLIVEERIQLRYHCRDDHITASKREFLRRTEVDSKGNKIIMTPDMCISFEVEPMEHTKKLLYQYEAMMKLKNEEKLSRHQAWESELEVLEILKLREEEEEGHMLTISIYDTKRNEKSKEYREAMERVMHEEHLRQMETQLDYLAPFLAQLPPGEKLTRWQAVRLKDECLSDFKQRLIDKANLIQARFEKETQELQKKQQWYQENQVTLTPEDEDLYLSYCSQAMFRIRILEQRLNRHKEMAPLKYLALEEKLYKDPRLVELLKVFA	850835	818127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_818446_818538_818679_819577_819773_820969_821081_821163_821275_821841_822058_823016_823238_824259_824389_824610_824740_825742_825816_828025_828158_836707_836927_837887_838047_843519_843662_846054_846258_850754
796607	contig_7045_pilon	-	1555	11	Intergenic	novelGene_77485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	150.21904007149	67	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1308	246	1553	585475	546211	FALSE	50	TAAAGAAAGCAAGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLQNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKNYMDYLSRLYEREIRDFFEVAKIKMTGT	591022	546208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_546295_552563_552714_568441_568552_569434_569571_569768_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585486_587386_587526_590926
796608	contig_11702_pilon	-	1108	8	Intergenic	novelGene_141964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	101.926343954037	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	112	825	319845	289501	FALSE	25	CAGCAGACGCAGCAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQWIAVATFLYAEVFAVLLLCIPFISPKRWQKIFKSRLVELVVTYGNTFFVVLIVILVLLVIDAVREIWKYDDVTEKVNLQNNPGAMEHFHMKLFRAQRNLYIAGFSLLLSFLLRRLVTLISQQATLLASNEAFKKQAESASEAAKKYMEENDQMKKEAGADGGKLQEENKSLKADLKKLKEELANSKQKLEKAENEVLAMRKQSEGLTKEYDRLLEEHAKLQAAVDGPTDKKEE	321135	289217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_289540_295517_295619_296521_296619_297502_297639_313704_313853_318184_318286_319753_319887_321065
796609	SIRV4	-	305	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1216	0	1216	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3942	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
796610	contig_7467_pilon	-	1365	3	Intergenic	novelGene_69481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	293	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAGGAAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133014	85621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_86735_91949_92093_132905
796611	SIRV4	-	596	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	876	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796612	contig_6654_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_85694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98280	100392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_98300_100400
796616	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	280	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796617	contig_2550_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_135691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACTTGGTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632023	1630120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1630100_1632000
796620	contig_4213_pilon	-	1547	4	Intergenic	novelGene_124829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	99.7374330708163	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	51	527	185273	177526	FALSE	30	AATGGTTTCCAAGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEDCSITENSSLHLEKGKQVGQYNCPGQYIASVPLDSHVSPCSDDWIGYQKKCYLISTLTNSWTSAQSSCSKQGATLALIDSEKEMVFLKRYVGRTEHWIGLTNETGQTWKWSNGNEFNNWFNMSGSKNCAFLNSTHVITAECQKPLHWICSKPSN	185323	176505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_177635_178895_179000_179367_179568_185209
796621	contig_13901_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_146629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATAGAAAAATCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97764	98369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_97800_98400
796623	contig_11986_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_69260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTTCCTCATTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841488	839884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_839900_841500
796626	contig_11720_pilon	+	2339	5	Intergenic	novelGene_43915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.27760839478607	34	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	96	494	208784	211348	FALSE	25	TGATTGAGGTTTGATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAPTSTGTTVEGTVTSAGGTGTAGCTGALKMAFPTSPRRTFEGTAETMLSSLDTVLGLGDDTLLWPGHEYAEENLGFAGMVEPENLARERKMQWVQRQRMERKSTCPSTLGEERSYNPFLRTHCLALQEALGPGPGPTEDDCSSRAQLLEELRRLKDMHKSK	207209	213193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_207234_208712_208806_209953_210041_210846_210963_211174
796628	contig_1450_pilon	+	1702	4	Intergenic	novelGene_27419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	835.328810841708	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	40	CAAGTTTTTTCAAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423275_423390_423770_424926
796630	contig_1694_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_144951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGGCCTAAAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773058	773443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_773100_773400
796631	SIRV4	-	236	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1284	1	1284	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
796633	contig_14566_pilon	+	2032	7	Intergenic	novelGene_148832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_4	340.594292703536	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	420	1157	88884	118595	FALSE	70	TTCAAATTAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFGKPLS	66730	119470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_70344_70518_88762_88951_90606_90937_99199_99308_108219_108328_118470
796636	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	103	0	-84	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	70	309	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2388	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
796637	contig_12638_pilon	+	1407	13	Intergenic	novelGene_33183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	176.208426933056	78	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	144	1211	269238	274265	FALSE	15	ACCACTGCTTGCCACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFKPLPPPAKGPAQFPQA	244416	274461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271404_274209
796638	contig_4769_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_118039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTACGAGTTATTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509699	1508831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1508800_1509700
796639	contig_6740_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_142704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTAAAAACCATTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654750	655213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_654800_655200
796642	contig_3745_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_85103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGTTTAAAAAAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470157	471763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_470200_471800
796643	contig_12503_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_143819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACATGAGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82425	84365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_82400_84400
796645	contig_11948_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_174384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTTAAGAGCTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142027	143389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_+_142000_143400
796646	contig_17522_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_160821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGCCTTAATTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99918	100398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_99900_100400
796648	contig_10050_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_119638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTCTCTAAAGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298772	298117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_298100_298800
796651	contig_6217_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_109607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398629	400749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_398600_400700
796656	contig_3789_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_79857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGCAAACAAGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452638	451520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_451500_452600
796657	SIRV4	+	610	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	707	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTAGTGCTAAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3641	5155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
796658	contig_8552_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_80080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATACATGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482364	484346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_482400_484300
796660	contig_11429_pilon	+	1150	7	Intergenic	novelGene_60460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	909.227266541332	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	73	411	46162	47494	TRUE	20	CGATACTGACAGTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGLWEQQV	45419	49495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46620_47263_47370_47471_47552_48443_48539_48908
796662	contig_1239_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_150401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180209	178059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_178100_180200
796663	SIRV4	-	191	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	16	410	16	-410	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTATCGGCGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5142	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796667	contig_11088_pilon	+	517	2	Intergenic	novelGene_85039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGCCTGACGAGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14933_17119
796670	contig_504_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_54403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAACTCATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27470	26191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_26200_27500
796671	SIRV4	-	511	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	106	0	106	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	315	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5052	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796675	SIRV6	+	308	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8131	-1	608	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCGAAATCACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
796678	contig_11416_pilon	-	776	4	Intergenic	novelGene_145341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_3	98.9084874461686	287	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACACTCTGAACGCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123863	122810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308
796680	contig_3948_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_53264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368886	1367710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1367700_1368900
796684	contig_10042_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_79246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCTCATAATTCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201319	1200652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1200700_1201300
796685	contig_7898_pilon	+	2073	6	Intergenic	novelGene_47507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	46	381	187741	188076	TRUE	20	CGGCGGATCCACTTCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKCPEGRGGEQYQVQMTLVFPPGDQGQSKLAAPSYHSSPPAKKCSCHLRTKSLSVTQGCLEPPFRGVVPTVQQPPPTTHIQRCLVLHQPQELQSVAVGGPGLTTDQVGGPVSFPTRKQPERQSYSA	187695	209205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_189212_191213_191337_191422_191546_199601_199727_203511_203561_209068
796690	contig_11816_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_98446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACATTCACTGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398435	400043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_398400_4e+05
796691	contig_11816_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_98447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAGTCAGAGCACCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400043	400358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_4e+05_400400
796692	contig_11978_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_62957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075831	1077953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1075800_1078000
796693	contig_7188_pilon	+	2426	21	Intergenic	novelGene_108529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGGAAACTCTCACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95650	150957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_95883_96717_96838_97866_97947_98776_98882_103530_103644_107536_107630_108795_108925_110235_110419_116645_116737_118458_118511_118866_118949_119795_119982_121157_121294_121560_121706_126169_126237_132551_132631_143594_143737_144252_144360_145968_146056_147049_147090_150800
796694	SIRV2	-	451	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4376	80	3201	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
796697	contig_7157_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_131273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTCCTCTGAAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631974	633121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_632000_633100
796698	contig_12464_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_68676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCCTGCATTTTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178774	177259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_177300_178800
796700	contig_14322_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_115940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
796704	contig_11498_pilon	-	1930	15	Intergenic	novelGene_65514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	580.503405745076	39	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	163	1479	200916	173588	TRUE	20	GCAATACATGCGCGTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWDAAPRPLSAAKPRPRPREPLPPSPSGREPCPLPPGKLDFRGWRRLADWVGTTMGNAAGSAEQPAGPTASPPKQPTTPKQPMPAAGELEERFNRVLNCMNLPPDKVQLLSQYDNEKKWELICDQERFQVKNPPAAYIQKLKSYLDTGGVSRKVAADWMPNLGFKRRVQESTQVLRELEISLRTNHIGWVQEFLNEENRGLDVLLEYLAFAQCSVTYDMESTDNGAPSSEKSKPLDQSVEDLIKGPPSSCPPQPKSRHLTIKLNPAHSRKTLRNSRIVSRKDDVHVCIMCLRAIMNYQSGFSLVMNHPACVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHDIILAAFDNFKEVCGEQHRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVENMNFRVFLQYEFTHLGLDLYLERLRLTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGSLLEDTETKNAVLEHMEELQEQVAMLTDRLRDAENESMAKIAELEKQLTQ	201078	172647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173555_173591_178442_178518_179021_179172_180756_180868_181153_181229_182553_182648_182905_182983_183596_183706_185276_185415_185823_185908_186258_186333_187914_188029_189602_189687_200787
796707	contig_1964_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_130915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGAACTGGGGGCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180019	178767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_178800_180000
796708	contig_4536_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_175092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGGAAGGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846693	848235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4536_pilon_+_846700_848200
796710	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	99	-2	99	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5059	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796712	contig_12915_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_148340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCTCCTGATAACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64796	67372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_64800_67400
796715	contig_3975_pilon	-	969	11	Intergenic	novelGene_54878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	154.782944796899	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	21	470	2099555	2093665	TRUE	20	TACATGGTTTCTGGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRVTAGMKPILLQGHERSITQIKYNREGDLLFTVAKDPIVNVWYSVNGERLGTYMGHTGAVWCVDADWDTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFWESVSLQATRVESSTSTAPSLERYW	2099575	2091888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092039_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096191_2096374_2096498_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364_2099458_2099552
796716	contig_14223_pilon	-	1957	2	Intergenic	novelGene_156971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_1	0	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAACGGTGGCCCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29289	26887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_-_27674_28118
796717	contig_8020_pilon	-	912	8	Intergenic	novelGene_114364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	123.527242306451	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	127	855	107186	104789	FALSE	5	CAGGGCTGTGTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTDRCQAAADTELTHRAHKETGQVPLCSWDYACPDSDGEATDPGASGGNRAGHGGGVK	107312	104731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105084_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
796718	contig_12671_pilon	+	1362	4	Intergenic	novelGene_19231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_1	236.913955313363	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	516	845	207076	212313	FALSE	5	GCATGGGTTTTTGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	206560	212830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_207206_210609_210724_211053_211113_212286
796719	contig_11978_pilon	+	584	6	Intergenic	novelGene_63065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4015.20198246614	312	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	197	502	1830714	1831883	FALSE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827918	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830040_1830696_1830785_1831161_1831273_1831759
796720	contig_10141_pilon	-	1254	5	Intergenic	novelGene_84629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	139.27042040577	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1227	26	1252	418688	395613	FALSE	15	TGCTTTGAGCTGCATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKETKSRPKPPTCHKFQMKGIKVVGKWKQVKIDPNMFADGQMDDLVCFEELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEEPKKRKAQAVSEGEEEGEASSPKKKVMLKKSKDVETEGASAQKEFEVKDAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAEYRNFQACLHNSWIEQAAAALEIELEEGMYKGGKADEQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPLFKDDLKTKYPTQSGKPIVVSAPGNGK	421114	395610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397330_409123_409370_417973_418694_421094
796721	contig_3335_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_165002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	906	189	1094	328707	327802	NA	25	TGGAACCCTGTTCAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCKVNVHIEENHQKKEKHRGQLVFINDKTLNKEGQKVLEKPFNLNIAPLFSGKIPSKGESCRMSLPLVSELIISNRNYCRKKTDYTNVCENWRLDIKHERTNSREKSYEYKENMVALSYKINQHQEFQTLERSFQCNQFGKALHGMTVCMPESSHTGEKSCRHDEFRKHDKPPLFNHMRTGTREKFSDLNERRKSYEEITIVKYNKVHMAVTPSECNESRNHFSRKSHLTQTQRTVTGQSAFQRNKCEENFRQSSALIVHQKSQIEDKFCKYSECTNAVYQKLDLTVHQGTHTEENSYKCGEYGKSFCQNTALDVYQQSDTGQKSFKCNESRKSFCQEVHLIQQQRTHSGERPYECEKSLCSTS	328895	327801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_327800_328900
796723	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-7	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796729	contig_16761_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_146903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAAACTTGACATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348967	350159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_349000_350200
796731	SIRV6	+	159	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	786	51	786	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11023	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
796733	contig_14361_pilon	+	1364	10	Intergenic	novelGene_139252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	55.5577777333351	20	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	799	1257	26315	32905	TRUE	35	TTGATACAGGCTTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCLEKISPHWFLYSRSLSGAEAVNALRPFYFAVHPDFFGQHPREREVNENSLKRLSVYLENLQKPGFKSLKPTQLTFYVRETDQNSSDGQEPFSTSGFRAVEFTLHTRDLLSTVLDILNSCSLSTEHLQSLNTHVHSQPLRQARRPPDRPIKWDKSYYSFTGFRDPDEDLEQVSRVETTLISWLDHNEKSAVKKLKNSLPLRRELDRLKDELSHQLQLSDIRWQRSWGIAHRCSQLHSLGRLAQQNLEALKTAKGCTLIFTDRSGMSAMGHVMLGTMDVHHHWTKLFERLPSYFDLQRKLMLLEDQISYLLGGIQVVYIEELQPVLTVEEYYSLLDVFYNRLLKNRIPFHPRSLRGLQMILNSDRYAPSLHELGHFNIPALCDPASLQWFILTKAQQARENMKRKEDVHKFLKTRGI	3975	34062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_+_4114_7563_7718_13454_13708_21706_21830_25747_25846_26282_26375_30828_31062_31717_31850_32871_32991_34040
796734	contig_2414_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_158451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAATCCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92074	93315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_92100_93300
796736	contig_5896_pilon	+	1270	4	Intergenic	novelGene_159234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	10.2089285540757	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	35	1072	87117	100477	FALSE	5	CATTTGCCTTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMTLKTQHKEAVTFEDVAVYFTRTEWAGLSPTQRALYRHVMLENYGNLTFLGYPVPEPSLISLLEGGDLPWGLETQDDPPAERTKDICKDAETNIPSDSTSTQRISGERDMISCGLQKSVPQGTDFPETCEVEKHQEIPIVKSIRGKFERIHCVGKPFRCDECGKCFSSFSYYVRHQRVHTGEKPYPCEECGKSFNESSSLIRHQRIHTGEKPYQCEECGRAFNNSASLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNGFPSSSELVRHQRIHTGEKPYKCNECGKAFTVKSTLSRHQRIHSGEKPYECSKCGETFRTSSQLYHHEHVYPGEKPVLDLGSFDLPAFFTPFSW	87082	100675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_87150_91697_91825_92364_92479_99713
796739	contig_16187_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_101082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTAGGCCTATCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95755	97697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_95800_97700
796741	contig_9955_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_21359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	908	1315	184729	184322	NA	65	TGAGAAAGAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMGLIREVTGYISCLGMLRIQFFHQDSLFSAMPTGIPLSMAPRPLPCSCKCYKALLALLISTLRHPTLPVSLSRRCSALAPWVGKPSPTKYPEVPYSASKPPAQRHSAFLLQGWKAEHTVSCQSLLLPFLSYHF	185636	183402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_183400_185600
796742	SIRV5	+	426	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7456	1	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
796743	contig_7293_pilon	+	426	4	Intergenic	novelGene_54263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5251.44636161209	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGCAGTATGTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335736	336575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335816_336037_336241_336363_336391_336458
796744	contig_10861_pilon	+	1945	10	Intergenic	novelGene_39403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	408.367965273635	1	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	50	1879	1907103	1934804	FALSE	40	AAAAAATTGGCTTAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQVNGNAVQLKEEEEPMDTSSVTHTEHYKTLIEAGLPQKVAERLDEIFQTGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLVPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1907053	1934870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1907206_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924713_1926387_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
796747	contig_10990_pilon	+	1007	4	Intergenic	novelGene_7522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_3	64.3652770435185	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	543	845	784365	789971	FALSE	20	AAATTTTTTTTTATTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEMTSFREQKLCYSCIFFSLTTVVQNLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLKGDNITLLQSVSN	783822	790133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_784470_785394_785458_786477_786557_789915
796748	contig_11978_pilon	-	1271	3	Intergenic	novelGene_63000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATTCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527311	1522694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1523777_1526093_1526190_1527218
796754	contig_13952_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_133261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTGACCTCCAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180126	179884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_179900_180100
796757	contig_15459_pilon	-	1431	6	Intergenic	novelGene_106379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.8777990068453	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	75	761	20238	16392	FALSE	40	GTCTCTTAAGAGATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSALRAHVETAQKTGVFQLKDRGLTEFPSELQKLTSNLRTIDLSNNKIESLPPMLIGKFTLPVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQISQISVKISCCPRLKVLRLEENCLELSMLPQSILSDSQICLLAVEGNLFEIKKLRELEGYDKYMERFTATKKKFA	20572	15721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_16434_16838_17025_19068_19338_19942_20049_20154_20240_20499
796759	contig_15182_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_136463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATAAAGAGGTTTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564209	566556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_564200_566600
796761	contig_14219_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_54345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821821	823298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_821800_823300
796762	contig_7467_pilon	-	1721	13	Intergenic	novelGene_69471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	210.682801992843	1	97	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	357	1682	92058	67563	FALSE	40	GTCTAAAAGAGTAAACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRDGSASATYYFKDESAAVKGNKSWLYFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133018	67523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_74702_75332_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_93771_93914_132838
796763	SIRV4	-	516	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	98	3	98	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	223	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796765	SIRV6	+	428	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	396	32	223	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTAAGGTTCGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1526	2508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
796772	contig_5732_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_119578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	185	400	139575	139360	NA	20	CACGGTCCCCTGTAACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQSTGEPRLPQQLDSDLGGVAVGTGRSGGLGWGTHTWSLSGPSGQAPGRWAGATLTKIRNMGHEEQRGCTVTWLRLKCLISSVQETYRKMVGEKPGLNTQTWVSQAQIQTSLCRKGVEVHRVHKQRLQGRH	139759	138279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_138300_139800
796777	contig_593_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_101989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	259515	259826	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSRRRAAVAPSPARQKLSERRRGEQRAGRDVGGSPSSLGPAESCFPKLGARTSAELSLAQLLQVAFVVLWYWQRRSDEGACVILLVSLVGYNGANRICLSIF	259512	261669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_259500_261700
796780	contig_5084_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_64647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAGGTAACCTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340018	1340609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1340000_1340600
796781	contig_13216_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_47449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62021	61180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_61200_62000
796783	contig_6199_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_126410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGAGCTGACAGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687942	688536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_687900_688500
796784	contig_15034_pilon	+	1559	11	Intergenic	novelGene_143644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	27.127292529849	50	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1521	37	1557	75755	92919	FALSE	35	GTAAGTGTAACACTACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRVCAQRAQSAAPRAGSGARCAALRERLGALCVTLRSGPAPARCGSTTTGYGGVRALCSWSPNCWPTPRNRFLLQLLGSPGRRCYSLPPHQKVPLPSLSPTMQAGTIARWEKKEGEKINEGELIAEVETDKATVGFESLEECYMAKILVAEGTRDVPVGAIICITVEKPEDIEAFKNYTLDSSATATPQAAPAPAPAPAPAPAVSPPTPAQAPGSSYPTHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEKKVGEKLNEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILIPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADIPAFADYRPTEVTDLKPQAPPPTPPSVATVPPTPQPVAPMPSVARPATPAGPKGRVFVSPLAKKLAAEKGIDLAQVKGTGPDGRIIKKDIDSFVPTKAAPAPAAAVSPPAPGVAPVPTGVFTDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLSVRKELNKTLEGSGKISVNDFIIKASALACLKVPEANSSWLDTVIR	75718	92921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_76034_76469_76572_76891_77017_77175_77339_79066_79194_81283_81472_82817_82972_89112_89181_90808_90902_91228_91337_92805
796787	contig_19769_pilon	+	415	4	Intergenic	novelGene_102330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	217	381	88952	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGTIVCCLEEKPGDRGKLARGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87861	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87926_87997_88040_88841_88958_89163
796788	contig_18919_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_156041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGATGCGGGAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163168	161319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_161300_163200
796791	SIRV7	-	915	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	54	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56086_70877_70995_78841_78964_114686_114961_147608
796794	contig_19769_pilon	-	723	5	Intergenic	novelGene_102312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	182	334	89175	88018	TRUE	25	AACACAGAGCCGGCGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSQPLTNHGSVG	89356	87295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87381_87462_87622_87872_88049_88847_88958_89163
796795	contig_14525_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_149778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTAAAAAGTAGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193322	195508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_193300_195500
796797	SIRV7	-	267	3	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	35794	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78944	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70981_78834
796799	contig_8452_pilon	-	650	4	Intergenic	novelGene_48088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1302.46979064989	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	70	345	972918	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGASRRRGHWPLSGSTLPTKTARMHTPLSSLCCVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	981692	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972887_972933_981637
796801	contig_6839_pilon	+	644	4	Intergenic	novelGene_161872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_1	17.2111075245674	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	14	322	226655	297740	FALSE	30	TGAGGTGTTGGAGAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCTMAEAEEQETSSLEESTDESEEEESEEEPKLKYERLSNGVTEILQKDAASCMTVHDKFLALGTHYGKVYLLDVQGNITQKFDVVSIQFKIIYKLEFMLKIGVF	226641	298062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_+_226676_244379_244419_294220_294329_297599
796803	contig_15327_pilon	-	1014	4	Intergenic	novelGene_70539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.488722994014	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	25	462	517568	513059	TRUE	30	TCAGTGTTTAAATGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	517592	511238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_511776_513043_513245_513894_514064_517485
796805	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	6	412	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796806	SIRV6	+	203	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGGTACGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1541_1645_1736_2780
796807	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796808	contig_5935_pilon	+	1078	4	Intergenic	novelGene_102723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	44.8998886412873	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	23	421	1105392	1116002	FALSE	5	CTTTCCCGTGGGTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALRAREQLRRRYLFPQDAEAQLNSESGPGAETSTAVEKKEKPLPRLNIHSGFWILTSIAVTYYVDFFKTIKENIHTSSWFLFGGALLLVSLSVAFYCIIYLEWYCGVEDYDAKHPSLIPITTATFIAAGI	1105369	1116659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1105489_1107351_1107494_1111358_1111518_1116001
796809	contig_14142_pilon	+	1066	10	Intergenic	novelGene_120620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	227.142365755461	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	110	1024	617485	619835	FALSE	5	CACTGCCCCTGGCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQEAAEKAKSRRAPSEVWQSVIEPGAHGPSVPSGTMPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGSAPSPWTPCLPPASCADAASRKVGLRSHQPAWPSASFHPAQPEPTFLPQVTRSYLHSCPHHV	617180	619877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619167_619462_619532_619713
796814	contig_8611_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_166561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGAGCAATAAAATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57768	58265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_57800_58300
796815	contig_13421_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_166815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAGTTTAGAGAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233434	232856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_232900_233400
796817	SIRV6	+	394	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	0	389	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796818	contig_8801_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_66269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAACTAAGAACCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407751	409704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_407800_409700
796820	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
796822	SIRV4	-	314	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1209	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
796824	contig_4429_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_50823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTACTTTTCTAACTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227027	227385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_227000_227400
796825	contig_8538_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_4683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	30	CTTTCAATAAAGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
796828	contig_11978_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_62971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAACTGACTCTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458950	1459574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1459000_1459600
796830	contig_6079_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_160083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCAGTTCCGTGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399673	399222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_399200_399700
796831	contig_9414_pilon	-	683	4	Intergenic	novelGene_131085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	6.94422221866655	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCCAACATCCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538404	532334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_532515_536009_536242_536363_536452_538221
796832	contig_11396_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_71381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGAATCATTCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085027	1087619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1085000_1087600
796833	SIRV6	+	398	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	6	379	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
796834	contig_6503_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_145783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCATGAACTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525287	523871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_523900_525300
796838	contig_6710_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_97664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657505	653562	FALSE	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657505	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
796840	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
796841	contig_6434_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_61845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCACAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763987	765663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_764000_765700
796842	contig_4125_pilon	+	1177	8	Intergenic	novelGene_25200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	221.487089041878	122	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	112	702	1510873	1518074	TRUE	30	TGAGATTATTTTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505607	1518705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984_1518337_1518492
796845	contig_2596_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_53528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094765	1094191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1094200_1094800
796847	contig_9415_pilon	-	1254	2	Intergenic	novelGene_109767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	540	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	76	300	1598250	1597383	FALSE	0	TCCTCTTTTTTTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPSLEDEKKKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGTRQLLSLPAKQQITNGACQRFYFYEQVLND	1598325	1596428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1597589_1598231
796849	contig_9871_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_75667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTTTTTCAAATAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430000	430742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_430000_430700
796850	contig_2757_pilon	-	1678	4	Intergenic	novelGene_164596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.79869268479038	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	166	846	272528	266779	FALSE	10	TCTCTGCCTAGCTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEVKESLRNIEQTYKLFQQQQFTFIAALEHCRENAHDKIRPISSIGQVQSYMEHYCNNSTDRRILLMFLDICTELNKLCQHFEALHSGTPVTDSLLEKCKTLVSQSSDLSSLRAKYPHDVVNHLSCDEARNHYGGVVSLIPIVLDLMKEWIAHSEKLPRKVLQHVSVPPASTKCSMGATCPHQTTDTQTPLKTNKHRKLPKTSLKSSVKDKACLKPSWRPPGGKL	277918	265946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_267113_268545_268749_272384_272568_277792
796853	contig_20614_pilon	-	1434	3	Intergenic	novelGene_107585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	679	junction_2	23.5	18	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCAGTGTGGCAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302054	292137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_293369_295570_295693_301973
796856	contig_6356_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_126432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTACTGTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95880	95085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_95100_95900
796857	contig_6356_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_126431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94986	94637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_94600_95000
796858	contig_13021_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_8287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	473	904	266261	265830	NA	30	AGGACCACAGACCAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQATRALCRALLQEWCLYHLDPHTCSRKTTELSLRDVNEACFVVCFPECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLGK	266733	265471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_265500_266700
796860	contig_10437_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_38091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACTATCTTCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22123	23661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_22100_23700
796861	contig_15897_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_49546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	299	610	654526	654215	NA	55	AACAGACTGGGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHTFNRAWLDKMSLSLQRIRNPGASCLLIWRARCSAHSQELEKWKNFLSKTRAQGSSSFGWHKLVGVPVSPHPRGLTRILLRWQPRYPLRTLCLPSSPEGL	654824	652617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_652600_654800
796862	contig_14530_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_108460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAAAACCCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82940	80985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_81000_82900
796863	contig_2917_pilon	-	1172	5	Intergenic	novelGene_147587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	299.813692148974	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	531	866	96248	93080	FALSE	30	TCAACTGGAATATTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124089	92773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93970_96189_96302_109365_109739_123985
796864	contig_12410_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_167280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTGGTGAAAAATTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139159	140493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_139200_140500
796865	contig_10140_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_148413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCACCCTTGGTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242018	243361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_242000_243400
796866	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
796867	contig_10904_pilon	-	1036	9	Intergenic	novelGene_22491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	372.281626426822	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	207	806	336807	292255	FALSE	15	GTCACTTCACATTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEFLSLLCLGLCLGFEDEKMNERLPKPVFMAWPSPVVESKSNVTLKCRSPFQNTTFRLGKLNDTGPKQQLSSAGNNAELLLIDLKPKDSGTYFCTYKTTAFQGWSESECLHLVVTDPYAGYGAPPLKIDSRSLIFITTFSCLSIFLSFLSVFIIYRCVPNDSAREESTRRTSHSDCPKQEATDFSKPERTSLLMCFT	337013	292024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_292270_315357_315390_315486_315525_315742_315771_316599_316696_328268_328308_330781_331064_334066_334103_336773
796869	contig_6710_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_95007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653811	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
796870	contig_1275_pilon	-	278	2	Intergenic	novelGene_108878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTCAGACGAAGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748106	747730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_747777_747874
796873	contig_14288_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_153816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	421	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGTTCTATAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260015	258688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_258700_260000
796874	contig_8801_pilon	-	1404	3	Intergenic	novelGene_66302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	81	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	124	726	547914	545797	FALSE	15	ATTTCACCCTCTGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGHLLSRAVDAPFVRLEGHRRWGFTLISPRSLTSLHTCLGAMVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549256	545118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738_547976_549194
796876	contig_11316_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_122695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139839	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139800_140500
796881	contig_8683_pilon	-	870	1	Intergenic	novelGene_150246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516779	515909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_515900_516800
796882	contig_4659_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_118209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAATGAAGTCACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445301	446466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_445300_446500
796883	contig_8357_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_39707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAATGAATCTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472280	470712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_470700_472300
796884	contig_10135_pilon	+	1979	2	Intergenic	novelGene_106574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAGAGTCACTGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5371	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_5667_6613
796887	contig_11832_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_106955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATACGGCAAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185325	185857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_185300_185900
796891	contig_9727_pilon	+	729	7	Intergenic	novelGene_86312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	277.148826846195	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	44	595	309192	314189	TRUE	20	CACCAGACTGACTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308422	314658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078_314196_314530
796892	contig_7549_pilon	-	1385	3	Intergenic	novelGene_164528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGTGGTGCAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716473	696976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_698036_715499_715706_716353
796895	contig_12644_pilon	+	1326	7	Intergenic	novelGene_44449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	309.944484276351	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTATTTTTCTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338358	375375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_338778_367593_367744_367994_368118_370700_370900_372113_372212_374741_374806_375102
796896	contig_11832_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_106971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	36.1317035302793	50	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	99	515	463912	466366	FALSE	10	TTGGTGTCTTCGGCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGAVRSPGPLWSRLAWQWQQQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPEAGGPPIKKQKADVTLSALNDSDANSDLVDIEGLGETPPAKKLNFDQA	463813	466634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_465610_465802_466007_466113_466361
796900	contig_4689_pilon	-	2001	12	Intergenic	novelGene_165392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	25.342937138578	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	318	1385	311908	294073	FALSE	15	ATTTTTGTTTGCCATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSYFIKVCMILVFLSSIFGYCKEVAQIFQQKRSYLWDHSNAVEWVIYTMSIIFVLPLFVGIPAHVQWQCGAIAIFLYWMNFLLYLQRFETCGIFIVMLEVIMKTLLRSTVVFIFLLLAFGLSFYVLLNVQDAFSNPLLSIIQIFSMMLGDVNYRDSFLEPFLRNELSYPILSFIQLITFTMFVPIVLMNLLIGLAVGDIAEVQKHASLKRIAMQVKLHTSLEKKLPLYFLRKVDQQNIIVYPNRPKYQGGLICIFHYMFSIQEARQETPNDDTSLETEILKQKYRLKDLTSLLEKQHELIKLIIQKMEIISETEDEDNHSSFQDKFKKEQLEQRNSKWNSVLRAVKEKTQCSPH	317641	293456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_294284_295631_295730_297228_297343_302505_302575_304726_304910_305355_305486_308236_308407_310334_310425_311905_311977_316341_316441_317150_317211_317551
796901	contig_5039_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_64887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGGAATTTGAAGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571339	572144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_571300_572100
796906	contig_15952_pilon	+	1235	4	Intergenic	novelGene_154032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	36.9173250505625	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	234	713	63396	64155	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVQ	62181	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_63344_63519_63695_63867_63969
796907	contig_13409_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_128451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTACTATAGTAAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86557	85425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_85400_86600
796910	contig_7816_pilon	-	397	2	Intergenic	novelGene_66533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTAGCTGTCGGGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250054	245669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246012_249999
796912	contig_13760_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_61362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1250	1564	383572	383886	NA	35	CAGGGACTAAATGGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVEGCSRQWEQPREDPERRRWLPGGGERRPGWWDQADAGQGLPPWPRGSPITVSLDSFICKRTWCLSHGVVGMTPQSCVQAPLSTALLSWRGQRMQRFLPIQ	382322	384733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_382300_384700
796914	contig_10765_pilon	+	1052	2	Intergenic	novelGene_122971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAGAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405411	406553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_405838_405927
796915	contig_5316_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_61254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	502086	501682	NA	15	TCATCACTTCATCGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLESNLSLIHSLLIFPFLSCSSLKSRNHSSFHPLDSTIFTVYLVSHPQSVCSLTPYFPVNHPSTTDRVSLKCKSNCITIVLINHGGYQKPHSLACTASPLPASPASSPPEPCVLAKGELLTISQKRLCPLITLL	502086	500962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_501000_502100
796916	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_93959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	24	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
796917	contig_11816_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_98549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCTGTCCAGAGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085220	1083294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1083300_1085200
796925	contig_15897_pilon	+	2168	12	Intergenic	novelGene_49563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_9	162.477665343693	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	194	1777	842355	867085	FALSE	20	CCTCCCAGCACTTCGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRLGQITKGKDGKSKYSTLSLFDKYKGKSVDALRSSVIPRHGLQSLGKVATARRMPPPANLPSLKSENKGNDPNIVIVPKDGTGWANKQDQQDPKSSSATASQPPESLPQPGLQKSVSNLQKPTQSISPENTNSAPGGPKSWAQLNGKPVGHEGGLRGSSRLLSFSPEEFPTLKAAGGQDKAGKEKGVLDLSYGPGPSLRPQNVTSWREGGGRNIISTTSLSASPTELGSRNSSTGDGAPSSTCTSDSKDPSLRPAQPVRKGASQFMGNVYHPPTYHDMLPAFMCSPQSSENQGTVERGSFPLPQLRLEPRVPFRQFQMNDQDGKENRLGMARPIRPLRQLVERAPRPTIINAENLKGLDDLDTDADDGWAGLHEEVDYSEKLKFSDDEEEEEVVKDGRPKWNSWDPRRQRQLSMSSADSADAKRTQEEGKDWGETVGMSRVVRKMPESQPPSRKLHSWASGPDYQKSSMGSMFRQQSIEEKEDKPPARQKFIQSEMSEAVERARKAPGRRGAPSPGREVGCLCR	806612	867476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_806751_842299_842470_843312_843491_846505_846609_849570_849644_853911_854056_855943_856186_856652_856775_857229_857373_860536_860628_862642_862836_866905
796926	contig_8210_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_30207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGGGGATGTCACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8384	7836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_7800_8400
796929	contig_13366_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_99782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTTTTTTCATACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98042	98764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_98000_98800
796931	contig_9436_pilon	+	1248	6	Intergenic	novelGene_60896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	15.866946776239	111	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	52	885	393187	396198	FALSE	10	TCACCTGTCCACTCGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVETGNAAGAEAPQPQKRYYRQRAHSNPMADHTLRYPVKPEEMDWSELYPEFFAPLTQNQSHDDLKDKKEERPQAQVEFADIGCGYGGLLVELSPLFPNTLILGLEIRVKVSDYVQDRIRALRAAPGGGFQNIACLRSNAMKHLPNFFRKGQLTKMFFLFPDPHFKRTKHKWRIISPTLLAEYAYVLRVGGLVYTITDVLELHDWMCTHFEGHPLFERVPLEELSEDPIVGHLGTSTEEGKKVLRNGGKNFPAIFRRIQDPTLQAVTPNPTLPGH	393135	396561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_393300_394038_394203_395226_395412_395505_395620_395777_395880_396042
796932	contig_6630_pilon	+	1880	9	Intergenic	novelGene_30727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	72.0516307934803	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	193	1146	777141	791577	TRUE	20	CATGCGTGTCCCTGACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLEILLASALGFAIYWFVSRDKDKEETLPTEYGWWGPGTRPTPGEDESIRPFKVETSDEEINDLHWRIDKTRLRPPLEESYFHYGFNSNYLKKILSYWRNEFDWKKQVDIINKYPHFKTKIEGLDIHFIHVKPPQLPAGRTPKPLLMVHGWPGSFYEFYKIIPLLTDPKSHGLSDEHVFEVICPSIPGYAFSEASSKKGFNSVATARIFYKLMLRLNFEEFYIQGGDWGSLICTNMAQMVPSHVKGLHLNMALILRNFSTLTLLLGRRFGGLFGYTERDLELLYPPQGEGLLQLDEGERLYAHPGHQAGHCGLCSE	761636	796288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_761824_777135_777330_779683_779865_787775_788004_788619_788750_789224_789435_791561_791672_794987_795114_795774
796934	SIRV4	-	297	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1226	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3932	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
796935	contig_14575_pilon	+	1993	23	Intergenic	novelGene_101887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.022974729049	1	89	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	436	1368	26368	50408	TRUE	55	AAATTGAAGAGAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYNLLEEFKTADCTDCTEQGEIMKIKGNEEFSKERFALAIIYYTRAIEYRPENHLLYGNRALCFLRTGQFRSALGDGKRATVLKSTWPKGHYRYCDALSLLGEHDWALKANIKAQELCKNDPEGLKELIQQHIRFQKQIDELQGRTRGRGHFKRGYYDSRDYIPLSVPSFCASLNFVDIEKGSTNSALEMASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQDFVTLMKMLKGLIQDGYTALLDKRCCCVYRPLHTC	20047	63898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20883_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59976_61543_61637_62293_62359_63867
796937	contig_16411_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_77390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCTGTGAATGTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395302	393254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_393300_395300
796939	contig_18392_pilon	+	2139	3	Intergenic	novelGene_143090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_1	6	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63568	75406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_63641_68758_69304_73884
796940	contig_5018_pilon	-	821	6	Intergenic	novelGene_47103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.838914280781	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	70	753	1402792	1399217	FALSE	30	CGGCTCATACTGAGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEALRKNGAVRA	1402861	1399148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399249_1401102_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
796941	contig_8674_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_102927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACCCAGTATTGCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434989	437287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_435000_437300
796948	scaffold_16539_pilon	-	1206	9	Intergenic	novelGene_68397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	79.5399860133254	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	46	1071	800534	794915	FALSE	10	TCCTGCTTCATTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRIWQGHTAAGLVTMEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK	800579	794779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795469_795639_795760_795838_795923_796065_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
796949	contig_7733_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_147154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGTTCCCTATCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211938	212870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_211900_212900
796951	contig_11294_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_50063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACTGATTCAGCAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290687	289128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_289100_290700
796952	SIRV4	-	395	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	219	3	-219	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCGGACAACTCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
796954	contig_12468_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_164881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTACATTTAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71351	69338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_69300_71400
796957	contig_1785_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_175097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACAGTCCAGTAGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366630	365187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_-_365200_366600
796959	contig_10095_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_57223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117996	120550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_118000_120600
796961	contig_14618_pilon	-	1736	2	Intergenic	novelGene_136856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328820	1279748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227
796965	SIRV7	-	269	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91632	-7	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
796968	contig_15114_pilon	+	1370	3	Intergenic	novelGene_121241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTTCTACTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699329	1742064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1699395_1732552_1733802_1742008
796972	contig_628_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_130247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254213	256331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_254200_256300
796973	contig_5605_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_143951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCCAAACTAGGAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467416	465435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_465400_467400
796976	contig_13625_pilon	-	1438	10	Intergenic	novelGene_150155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	112.313494236687	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	13	1176	43415	27060	TRUE	25	CTAAGTCATGCCTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43427	23711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_39986_43361
796977	contig_7025_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_104393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTAGTTTTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68649	70100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_68600_70100
796979	contig_5732_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_119575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTAGGAAGATCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100900	100273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_100300_100900
796980	contig_6065_pilon	-	676	6	Intergenic	novelGene_132701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_5	216.110712367527	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	21	515	507473	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALPVKMAERGYSFSLTTFRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	507493	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497_499621_507432
796981	contig_2940_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_81979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGAAAAAATTAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103638	1102637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1102600_1103600
796982	contig_6842_pilon	+	971	8	Intergenic	novelGene_130758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	354.209381177695	1079	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	386	757	1366898	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARREVIEEGLVWPAGDLTLRTDLGAPASATGPEGGVDQRLREARCVDKLALATDGAVSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1306773	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306944_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
796983	contig_3394_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_152697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTGTATACTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490843	492829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_490800_492800
796986	scaffold_12510_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_151425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTCGGAGTCACGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735645	733413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_733400_735600
796987	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
796988	contig_6496_pilon	-	1566	7	Intergenic	novelGene_103462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	16.152055252781	71	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	513	1079	135813	99581	TRUE	10	AGTTGTTTGGTGCCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLIQDTSTYFTVSSFLSLSSFHSFSPFHPPSLPSSPPSFFPLFLLFVPSLLLHPSFLSSVVPSFSRFSFPSSPPSFLHTSPPSFLPSPPSFLSSSCPLSSPPPFFSFLPSSSLPSSCPFFLPPFLLSRNKVSQKGPGVRPTADLLKHYARHRECHRRAASDCAVSLDGMPSEILLKIFSYLDAVNLLCIGCVNRRFYHLASDNFIWVRIYSTAFSPKRSNWKVNSVEKTAVSVNLLSLEDKEAGYWKKEYIAKQIASVKATVAQLLQPVNPYTGLPVKIKEALRVSGLGWVIILRDKSGKEYLTERVHLSVNDTSVSVVWYGKNWPCLATLSTLDLCGVTPVFMDRYKSPTKNGIH	141019	93000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_93373_99465_99591_130326_130537_131093_131337_135709_135815_140400_140506_140613
796989	contig_12277_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_139700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATCAGATCACAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294722	296408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_294700_296400
796990	contig_10311_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_50495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAATTAATTTTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240064	240859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_240100_240900
796992	contig_5594_pilon	+	1360	10	Intergenic	novelGene_150124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_9	46.1254328495197	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	214	1074	225751	260201	FALSE	10	TGGGTTTGTCCATGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKRQRARVQGAWAGPSKSKASVHPATTAKSHLRQKPSQTWKNQERHLSDREFVFKEPQQVVRRAPEPRVIDREGVYEISLSPTGVSRVCLYPGFVDLKEADWILEQLCQDVPWKQRTGIREDITYQQPRLTAWYGELPYTYSRVTMEPNPHWHPVLSTLKNHIEENTGHTFNSLLCNLYRNEKDSVDWHSDDEPSLGRCPIIASLSFGATRTFEMRKKPPPEENGDYTYVERVKIPLDHGTLLIMEGATQADWQHRVPKEYHSREPRVNLTFRMVYPDPGGARW	223400	260487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_+_223541_225677_225830_226177_226282_229982_230018_234488_234537_235933_236038_237808_237898_243025_243236_259250_259350_260108
796993	contig_5605_pilon	+	2456	6	Intergenic	novelGene_143935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGGCCGCCTCCCCAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253418	313695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_255265_258710_258814_275967_276066_276879_276983_289896_290040_313532
796994	contig_14202_pilon	+	1418	2	Intergenic	novelGene_157149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACCAAAGAACATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152386	154746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_152815_153756
796995	contig_13607_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_170227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCAGCACTTTACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475114	476305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_475100_476300
796996	contig_15236_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_141586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	211	531	446720	447040	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCVTHSEFCLLPGVTGAQAGSLIGSPGWEGGGIGAEADGLCLRRPPGFLPVLPPSLSPLAAGLMRRPSGPDACRCPVGLSASVNESQRSCKGFSVLWASLAPCR	446509	447713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_446500_447700
796997	contig_14528_pilon	-	1346	5	Intergenic	novelGene_111280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	59.0185352241141	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	401	883	212001	210110	FALSE	20	CCATTCCACTTCATTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNPRATLERQQLRLRERQKFFEDILQPETEFVFPLSHLHLESQRPPIGSISSMEVNVDTLEQVELIDLGDQDGADVFLPCEEAPPTPQTSGVDDHPEELSLLVAVSDRTTSRTSSSSSDSSTNLHSPNLSDGGADTPLAQSDEDDDGGDGGAEPGACS	250359	209646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_210316_211529_211668_211862_212040_248485_248554_250065
796998	contig_5247_pilon	-	1461	6	Intergenic	novelGene_81819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	282	junction_5	73.9443033640861	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	30	788	416518	342767	FALSE	5	AGTGGTTTGGCTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSEAARRDMAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNHHSRHRWLLILAFVTSLVIVILMLFGKGVLRSCRKTHRPNSS	416547	342093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_367107_367372_376192_376490_416448
796999	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
797003	contig_935_pilon	-	1423	7	Intergenic	novelGene_45513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	42.6331248366025	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	464	1054	22566	19993	FALSE	45	AGAAAATATGACTCATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGYGACLINKPELIQDMVKQVRNEVENPRFSISIKIRIHDDLTRTVDLCRKAEATGVSWITVHGRTVEERHQPVHYDAIKIIKENMSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	31913	19623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_22450_22574_23585_23764_26040_26163_27055_27193_31894
797004	contig_9707_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_175103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184662	184252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9707_pilon_-_184300_184700
797007	SIRV4	-	245	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	369	3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
797010	contig_1263_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_170398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	146	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTCACCGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54164	51844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_51800_54200
797011	contig_8589_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_107366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTATATTTGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270452	269935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_269900_270500
797012	contig_4364_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_26	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCAGTCCCAGCACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282390	282886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_282400_282900
797013	contig_6028_pilon	-	1636	4	Intergenic	novelGene_156591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_3	133.447451164203	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1114	1566	332055	323625	FALSE	75	GGAAAAAAAAGAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKVLWDSFSPVGSNAAQVPIIDSLSLPFLLSLTLLRVKHKNSFH	336928	323554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_323830_326490_326709_332025_332108_335867
797014	contig_10235_pilon	-	1726	7	Intergenic	novelGene_46525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.8958825016466	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	153	1247	331785	328168	FALSE	15	CATTTGTAGAGGCTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVVSDAETGVVFLFYSLCAHKFGCQVASTMLVWSKDDGLSWSKPQNLSLDIGTEMFAPGPGSGIQKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQP	331937	327688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328174_328375_328441_328537_328761_328943_329127_329763_330027_331063_331257_331623
797022	SIRV6	+	298	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	590	171	411	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
797023	contig_8133_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_98672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_4	85.8557503988126	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	29	1024	391787	342097	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPAADSLMHLTKSPSAKPSLTVAVDSAPEVAVKEDLETGVHLDPAVKEVQYNPTYETMFAPEFGPENPFRTQQMAAPRNMLSGYAEPAHINDFMFEQQRRTFATYGYALDPSLDSHQVSTKYIGSVEEAEKNQGLTVFETGQKKTEKRKKFKENDASNIDGFLGPWAKYVDEKDVAKPSEEEQKELDEITAKRQKKGKQEDEKPGEEKTILHVKEMYDYQGRSYLHIPQDVGVNLRSTIPPEKCYLPKKQIHVWSGHTKGVSAVRLFPLSGHLLLSCSMDCKIKLWEVYEDRRCLRTFIGHSKAVRDICFNTAGTQFLSAAYDRYLKLWDTETGKSLY	391815	341483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_342216_344308_344355_348353_348429_349241_349382_350680_350778_351893_352034_357702_357787_360618_360749_366687_366775_391709
797024	contig_15905_pilon	+	813	6	Intergenic	novelGene_154705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	174.416283643472	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	88	666	117212	135820	FALSE	10	GATTGTTTTCTTTTGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGWGLCRALQLPGDKQSPRVASAPRDPAMVRAGPVGTHLSASGLDIFGDLRKMNKRQLYYQVLNFAMIVSSALMIWKGLIVLTGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNFQEDPIRAGEIVVFKVEGRDIPIVHRVIKVHEKGNGDIKFLTKGDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFLPYVGMVTIIMNDYPKFKYALLAIMGAYVLLKRES	117124	135967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_117299_128768_128879_130304_130455_133188_133309_134885_134944_135766
797025	contig_10627_pilon	+	1150	5	Intergenic	novelGene_59906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_4	48.91829923454	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	94	747	29280	32658	FALSE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYG	24248	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515_31837_32653
797026	contig_10765_pilon	-	1283	2	Intergenic	novelGene_122983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484218	481856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_483015_484093
797027	contig_5324_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_102045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAATTCAGAGGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44045	45931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_44000_45900
797035	contig_938_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_143922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGACTTAAACTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137760	135515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_135500_137800
797036	contig_11096_pilon	-	587	2	Intergenic	novelGene_143475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	244	576	242420	242088	FALSE	20	GATCTGGTGGTTGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIQFFDGFHLLIQVMNFCQWPVYALLVVTDSHFLPSVMHSHCIPPALPITIRILESLKEDLATPLVLQLRQFLSMYTPPHDTDEENIWQRSSKSHLHGQSSKTQIDTGA	244055	242076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_242591_243982
797037	contig_12120_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_21432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAAGTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125167	126209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_125200_126200
797040	contig_4364_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_3027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
797044	contig_1348_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_174369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGCCCTTACCGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511587	510654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_510700_511600
797045	contig_14513_pilon	+	1219	2	Intergenic	novelGene_70242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGGAAAGTAAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11282	19066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12116_18680
797051	contig_11505_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_140921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	625	966	72414	72755	NA	20	GCCGAATGCTTAGCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEKRGMATFICEWISCGWNEERTRSYGKKQEQKGHTDRDLSSGQWSTYYVHGTVFLSLVEDTKTHKAQLFSEECTGQPQFTGKVPLDSCMKFHSTLQLPLEHVNPTPSSIYY	71789	73600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_71800_73600
797052	contig_9972_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_162799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322186	322784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_322200_322800
797055	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
797057	contig_7457_pilon	-	1676	4	Intergenic	novelGene_31632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	82.3528991596531	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	485	1006	958306	956489	FALSE	20	GCCAGCTGACCTCACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962632	955818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960508_960896_962603
797058	contig_19402_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_80811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72345	74957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_72300_75000
797061	contig_3529_pilon	+	1145	8	Intergenic	novelGene_105400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	40.7220543966745	40	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	69	842	790486	810191	FALSE	10	GATGTGTGTTCTCTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLQPGHCRHSCAHLLAVKQNWKSTFWLNKKYGWCLCNQWSCVDEK	790417	810494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806796_810060
797064	contig_14002_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_175104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTTTTGAGGCACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37240	36046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14002_pilon_-_36000_37200
797066	contig_4083_pilon	+	2768	1	Intergenic	novelGene_152328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67808	70576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_67800_70600
797067	contig_10855_pilon	+	1748	1	Intergenic	novelGene_124298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	318	758	283093	283533	NA	25	TTGACTCGACGGCAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPWSSASVSYCGGLRVAVMLEAMPLVFQVPPVGSRMVDRFQLSFQTNTDWEEGPGSLLVNKLASENLTNSSETLSDTVPEDEPLRLEGTQNATREELPSQSRVHLNDGDGVKLSGPSFADAARLRMRKNSCKHPLKLEHGMYQV	282775	284523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_282800_284500
797068	contig_6740_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_142715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGCCCTGGCTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719863	721013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_719900_721000
797069	contig_5350_pilon	+	1180	6	Intergenic	novelGene_99343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	51.9792266198719	13	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	235	558	184722	225194	FALSE	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPGLCWRTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQVISPQGTWEINVNMLI	142201	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_220454_220530_222758_222960_225172
797070	contig_4674_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_174132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACAGAAGATAAGATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14339	15768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_14300_15800
797073	SIRV2	+	739	2	Genic_Genomic	SIRV2B	novel	523	1	NA	NA	-70	223	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTGCTGGGAACGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1657_1733
797074	contig_6069_pilon	-	1077	4	Intergenic	novelGene_8049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.2662676809642	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	496	936	360462	360022	FALSE	10	TGGACCTCCGCCTCTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362295	359880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360604_361550_361671_361753_361863_362170
797077	contig_4114_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_15617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAAAAAAACCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377189	375886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_375900_377200
797079	contig_8710_pilon	-	2454	2	Intergenic	novelGene_73546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	1	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAGAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520802	516364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_518757_520740
797080	contig_4812_pilon	-	624	4	Intergenic	novelGene_103664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2559.96488691197	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	145	495	82339	79141	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCSPTFTRSGRSRTGCAWRWRGSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSNRFGNYLDLSSVILTGCCSSSTQHQDLDKWD	82739	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81547_81731_82268_82343_82598
797082	contig_14068_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_165964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACACACACACCCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75883	76779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_75900_76800
797083	contig_14068_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_165965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCACAGGGAATGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76829	77538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_76800_77500
797087	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797088	SIRV6	+	773	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	6	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	43	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
797089	contig_15327_pilon	-	681	4	Intergenic	novelGene_70477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	186.235215669743	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	94	405	390867	381607	TRUE	15	CTGCTGTCTTTTTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKVSVT	390960	372567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_381602_381720_382830_382974_390811
797090	contig_4125_pilon	+	935	2	Intergenic	novelGene_25177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCGCCGCCCTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189933	1245414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1189974_1244519
797091	contig_6102_pilon	+	1638	3	Intergenic	novelGene_31824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCCAGTCACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361737	366765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_361765_365112_365479_365520
797095	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	225515	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
797096	SIRV6	+	420	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	0	363	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797097	contig_7342_pilon	+	1103	3	Intergenic	novelGene_71205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	3	81	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGACTGGCGTGGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673057	674910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_673870_674045_674098_674671
797099	contig_6885_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_83686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCAGCTAGTGGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251775	251273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_251300_251800
797100	contig_10904_pilon	-	1034	5	Intergenic	novelGene_22626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	355.760013913874	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	5	346	515110	510253	TRUE	15	ACTACTCTGTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEGW	515114	499133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499741_510171_510260_514052_514181_514793_514925_515034
797104	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
797105	SIRV4	-	257	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1261	3	1261	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
797106	contig_2204_pilon	+	409	3	Intergenic	novelGene_71643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	99.5	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	30	365	13204	15508	FALSE	20	ATCTCTGTGAAATGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKVIFGYSERRPKL	13174	15552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422
797107	contig_3787_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_102373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATCGACTTGATGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383400	383744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_383400_383700
797109	contig_7020_pilon	+	548	4	Intergenic	novelGene_57053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5615	junction_1	2737.84456989232	303	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGTCGCATTTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79453	81800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_79486_79910_80228_81324_81448_81724
797111	SIRV4	-	341	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1180	0	1180	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3978	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797113	contig_7171_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_101382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGAGCGCTTGCTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363897	1363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363400_1363900
797114	contig_253_pilon	-	1348	7	Intergenic	novelGene_129644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	114.747064837794	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	31	564	269509	268256	TRUE	15	CCACCGCCTCCTGTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHAKERQRFRMRCLATPTVLRALAQASHAGHFSGRSVHSTSLAATYKYVNLQEPKMDMKSVTDQAAQTLLWTELVRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQVSSRPHTDHHPAPLPRRHSQGANCDLSCVPRKVPLSDTSPSVAGAMSPYGQGA	271288	267004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267298_267685_268591_268687_268778_269311_269363_269451_269510_271258
797115	contig_9481_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_149651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTACAAAAGGCAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151915	151365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_151400_151900
797118	contig_19797_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_175106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	8	415	7991	8398	NA	45	TACATAAATTTGTAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSDLPQSLDTSLFFGTTATGFQQSTLDMDDVPSVSAGPLGSLPIKNSSQEPQALTPSNKLTVDTDALTPSSALCDNSVSALLTPTKVEWNVHPDSDFFEREEETPFGFSSPAGNHSSQKETDLTTVTGSAFLV	7983	10264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19797_pilon_+_8000_10300
797119	contig_3747_pilon	-	1223	8	Intergenic	novelGene_24971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	107.582147066077	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	130	783	220555	217418	FALSE	15	AGGACAGCCTTCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLERQGPVDNQQISSWLQCGFRLGEGRQVYLARSLNTQDPPTMASRGGGRGRGRGQLTFNVEAVGIGKGDALPPPTLQPSPLFPLLEFHPVPLPSGEEGEYVLALKQELRGAMRQLPYFIRPAVPKRDVERYSDKYQMSGPIDNAIDWNPDWRRLPQELKIRVRKLQKERTTILLPKRPPKTPEDKEETIQKLETLEKKEEEVTSEEDEEKGEEEEKEEEEEEYDEEEHEEETDYIMSYFDNGEDFGGDSDDNMDEAIY	226371	216977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_217505_217816_217928_218058_218133_218368_218426_218771_218841_220022_220153_220429_220598_226284
797120	contig_8576_pilon	+	1974	8	Intergenic	novelGene_88818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	44.8967068470983	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	484	807	981756	991159	FALSE	30	CTAGTAAATATATGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVSPEEIGLPGVEAEEALEEDSHRPLISGAENEDEYEPGYSVQEGDTVTQVKAISFYQACCLPGVILYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNSFEWKEAEADQLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDLLQKRAPVLALSLLLATGALGGYSRSPNDKSINALLMAVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIRGSSEALATVTGIVDGTGSVGAAVGQYLVSLIQDRLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVRELGHLVQRRQAHTLRE	976046	992326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_976072_976910_977090_979602_979745_981028_981131_981720_981769_984198_984351_989578_989645_991066
797122	SIRV2	-	536	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1101	0	-62	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4794	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
797123	contig_18607_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_175110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAATCAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85058	85471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_85100_85500
797124	contig_13366_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_99759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTCTTCAGCCAATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25384	27219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_25400_27200
797126	contig_10494_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_102211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	34.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTTGGAGTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085126	1087194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1086314_1086606_1086687_1087001
797127	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
797128	contig_16622_pilon	-	1333	7	Intergenic	novelGene_48508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	31	junction_3	18.5060050314005	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	101	979	206888	163313	FALSE	35	ATAACTGGTAGCTATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFMKKYLLPIWVLFLAYYFYSANEEFRPEMLQGKKVIVTGASKGIGEEMAYQLAKMGAHVMVTARSKETLKKVVSRCLELGAASAHYIAGTMENMTFAEQFIAKAGKLMGGLDMLILNHITNTSMNLFNNEIHHVRKSMEVNFLSYVVLTVAALPMLKQSNGSIVVVSSTAGKVANPLIAPYSASKFALDGFFSSIRTEYSVTKVNVSITLCVLGLINTETAMRAISGIVDIDPAPKDKCALEIIKGGALRQEEVYYNNSPWIAFLLGNPGRKLVEFLSLRSYNMDKFINN	223540	162958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_163531_164963_165108_204662_204849_204967_205080_205852_205984_206800_206915_223466
797129	contig_6938_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_69073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATCTTTTGAGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163063	164544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_163100_164500
797133	contig_18869_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_56319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
797134	SIRV7	-	256	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91670	0	-91664	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTGAGACAAAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
797135	contig_10953_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_42569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTACTCTGTTTCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425212	426296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_425200_426300
797139	SIRV6	+	280	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8137	14	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
797140	contig_2100_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_50648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCCTAAAAGTGGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090441	1088927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1088900_1090400
797142	contig_6842_pilon	-	1114	5	Intergenic	novelGene_130720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.246658965599	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	96	659	433953	429481	TRUE	70	GAATAAAAATAAAAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGK	434048	428950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429312_429386_429699_431763_431865_432547_432658_433818
797143	contig_7440_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_61152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAAAAATCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50571	48932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_48900_50600
797144	contig_16103_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_118776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAGGCAGTGTACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511902	509809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_509800_511900
797145	contig_9720_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_116776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	248	550	304996	305298	NA	60	AAAAAAATTGGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQQRYTWSKQNTAQTLWRSSLGFFLWLRENLENSALFSQIRRGRWQLLTCIMKSKGEVIVSYLFYDTVSQRRITMLKLKSSVATLKYFPIGGTSIFKV	304748	307014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_304700_307000
797146	contig_3789_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_79877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTTTCCCCAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542008	542308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_542000_542300
797147	SIRV2	-	518	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4355	34	3180	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
797149	contig_4576_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_175118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAATATTTGGATGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18287	17306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4576_pilon_-_17300_18300
797150	contig_294_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_166753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACCACTGTAAAACTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156244	156893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_156200_156900
797151	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_95090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	653867	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653867	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797152	contig_1349_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_171639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGATTTGATAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159715	158756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_158800_159700
797156	contig_6842_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_130739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247478	1245846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1245800_1247500
797158	contig_18613_pilon	+	779	6	Intergenic	novelGene_80214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_3	1150.88880435948	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	113	601	24385	31105	FALSE	30	ATTCATTCTTTGCAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23702	31283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
797159	contig_20667_pilon	-	848	4	Intergenic	novelGene_174983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	388	846	39484	29511	FALSE	30	GTAAGTAATGGATTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIYIDPAVVDYSHFPGSQLKAVHRVAFVVRKTVSLKFMVMLKMFCTTHDSWHKYMQIKGHICEKLWRTWKRGLVYSMRRISKQQQQRQKNMSVKGMVIALAILFCATIVQGFPMFKRGRCLCIGPGVKAVRVADIEKASIIYPSYNCDKLEV	97300	29508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20667_pilon_-_29636_30452_30551_39248_39516_96944
797160	contig_1406_pilon	+	2091	12	Intergenic	novelGene_25676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_4	16.4839014879507	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	499	1482	3133304	3161745	FALSE	35	ATTGAATGTCTATATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRCFSVEDSDDTSQDFGPQAFQLLSAVDALGEQFGIGVPILFLRGSNSQRLPNEYRSHCFFGTGKDQTESWWKAFSRHLIIEGFLVEVSTRNKFVKICTLTRKGRNWLDKANEEFPQRLILQADEELCPRKFLLPSSKAVASVTEPCVFNQVPIELTAEKQCNLEKMYSYKAPDKVSSGSNVPKKSVMVSSPGKYLPVSYKSTEPVISAQEQETQTTLYGELVEARQKHSNKIDVPPAILATNKILLDMAKIRPTTVENMKRIDGVSEGKATMLTPLLEVIKQFCQRNSLQTDIFSSTKPQEEQKKSLVMKNEEFSLSQSVVITYSLFQEKKMSLKSVAESRTLPLTTVGVHLSQAVKAGYPLDMERAGLTPEVQKIIADVIRNPPINSDMNKIKLIRTLVPSNIDTYLIHMAIKVLERDDDSRLLCQLSCDSNKKRCFPNSEESRLNSKRSKKETSAETSKRKLPQWFAKGTETLGTTYKKSTAKTKKGLFS	3124338	3162354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3124477_3131543_3131715_3131791_3131890_3132423_3132500_3133288_3133363_3139285_3139374_3139607_3139721_3141872_3141988_3145062_3145195_3147603_3147767_3155079_3155277_3161628
797165	contig_19957_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_57755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACTGGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422103	420138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_420100_422100
797167	contig_14341_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_111791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAATTTGCTATGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376662	377264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_376700_377300
797169	contig_5217_pilon	+	1657	13	Intergenic	novelGene_135726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	65.3720123600307	132	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	187	1542	344794	487428	FALSE	30	CTCATGGAGCAGTCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFQAVVMAVGGGSRMTDLTSSIPKPLLPVGNKPLIWYPLNLLERVGFEEVIVVTTRDVQKVLCSEFKMKMKADIVCIPDETDKGTADSLRHIYPKLKTDVLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAHDASLAVLMRKGQNSIEPVPGQKGKKKAVEQRDFIGVDSTGKRLLFMANEADLDEELVIKGSILQKHPRIRFHTGLVDAHLYCLKKYVVDFLMENKSITSIRSELIPYLVRKQFSSSSQQGQEEKEEDLKKKEPKSLDIYSFIKEANTPNFAPYDACWNACRGDRWEDLSRSQVRCYVHIMKEGLCSRVSTLGLYMEANRQVPKLLPVLCPEEPLVHSSAHIVSKHLVGVDSLIGSDTQVGEKSSIKRSVIGSSCVIRDRVTITNCLLMNSVTVEEGSSIQGSVICNNAVIEKGADIKDCLIGSGQRIEAKAKRVNEVIVGSDQLMEI	335304	487543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_335338_335917_336062_344784_344942_348213_348360_389730_389891_399974_400087_439261_439352_456531_456657_457777_457969_463080_463159_463760_463910_474758_474863_487375
797170	contig_7202_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_17678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27845	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
797174	contig_10958_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_5322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31553	29681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_29700_31600
797175	contig_14450_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_49025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTATGCCAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208632	1206751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1206800_1208600
797176	contig_15047_pilon	-	1179	5	Intergenic	novelGene_52286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	17.3403431338598	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	245	736	84499	79792	FALSE	20	TTTGTCTGTGTATTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQRWRLKSLRSSAFRAPILDSTVFVITSRWSPRRSVQPRFIAEGYIDGKLFLHYDSEKDRAEPQGPWGEANLGAETWDLETMDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPA	96185	79348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82700_82842_82958_83229_84423_84686_96127
797177	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_94163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797178	contig_3975_pilon	-	1604	7	Intergenic	novelGene_54674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	36.4070353396459	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1548	57	1604	861258	852862	FALSE	50	GAGGAAGATAGTGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAAQQQELELCAETRSLMAMQESRNFQLQPEDHWPEEQSQKQWVKNQNPDLPKHLNTKMVPQSLKERAVLTSHLLTLPKMGSIGHWEVPTESQEALGPRKHTEKEFCKDPSRDDCRDSVSLEVLVSKPNSTSQRKQAPDFWGPNIISSWKRNTAGDYNLGNEQAKSAQTLAWKDSRTWEEQYQWDVEDMKVSGVHWGYEETKTFLAILSESPFSEKLRTCHQNRQVYQAIAERLRARGFLRTLEQCRYRVKNLLRNYRKAKSSHPPGTCPFYEELEALVRARTAIRATDSPGEAVALRRLGDSDAEVEEQEEGGWEPEETAEDCNGDDLAIDESVQGPRIPGGPALFQSRIAGVHWGYEETKAFLAILSESPFSEKLRTCHQNSQVYRAIAERLCAQGFLRTLEQCRYRFKNLLRSYRKAKSSHPPGTCPFYEELDSLMRARTAVRTMGTLREAAGLLMSGQNSTEADDQEAWDEMADEDVIKPPTPCPKTPDTGFELRHEDEDQISEQEIFEDFPGALSKCTAEDVLHAHDW	868518	852861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_852978_853748_854178_858222_858913_860145_860231_860545_860623_861107_861292_868495
797179	contig_11130_pilon	-	480	6	Intergenic	novelGene_53104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	959.19437029207	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	253	366	62581	61286	TRUE	30	TGAAACAGATTTGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYVFSHNPLGAVPTTKKKENEVFVSGTQTSQIICSHRAHQEQLLILKQQVYNFLLLWPKPPQDQENRLTHIFSEPGIIGIIFGVMVGIVGTVLSIAYCVRFLIKRTSVKAKPQSSIDADAA	76243	58719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_58810_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884_66978_76150
797180	contig_3529_pilon	+	952	7	Intergenic	novelGene_105385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGTAGCAAGATGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777266	790203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_777508_778724_778873_784521_784633_785189_785354_786998_787145_789783_789822_790099
797181	contig_57_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_44896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTGAGTGTAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98095	96615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_96600_98100
797183	contig_11986_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_69247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCACCCTTAAAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803515	803266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_803300_803500
797187	contig_21412_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_142848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCTAGCCTTGGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19162	19865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_19200_19900
797188	contig_21412_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_142849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCATTACTTAGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20119	21676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_20100_21700
797189	contig_6576_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_42301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCAGATAACATACACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457344	457947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_457300_457900
797190	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8115	14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
797193	contig_8992_pilon	+	1853	3	Intergenic	novelGene_174425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	59	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTAGAAGTGCCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73885	92241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_73937_74486_74544_90496
797198	contig_13966_pilon	-	1340	9	Intergenic	novelGene_158148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	71.6519364706914	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	824	1282	415811	412840	FALSE	50	AATATAATGATATGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNFLIQVTGKKRVVLFSPRDAQYLYLSGTKSAVLNIDNPDLAKYPLFSNARRYECSLEAGDVLFIPALWFHNVISEEFGVGVNVFWKHLPSECYDKTDTYGNKDPTAASRAAQILDRALKTLAELPEEYRDFYARRMVLHIQDKAYSKNFE	430014	412781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_413097_415225_415343_415726_415815_417992_418131_419096_419142_419916_419987_427336_427473_429308_429644_429918
797199	contig_6946_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_59797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCAACTGTGTTTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453573	454074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_453600_454100
797200	contig_9027_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_156352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTCTGTGACTTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58486	59502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_58500_59500
797202	contig_6710_pilon	-	434	2	Intergenic	novelGene_98197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
797203	contig_8050_pilon	+	1197	5	Intergenic	novelGene_114849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	624.106711628709	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	106	852	368104	375010	FALSE	60	CTAAAAAAAAAAAAGTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLPSSITSLKLSQNKFTCIPEAILNLPHLRSLDMSSNNIQYLPGPAHWKSLNLRELLFSSNQISILDLSEKAHAWSRVEKLHLSRNKLKEIPPEIGCLENLTSLDVSYNLELRSFPNEMGKLSKIWDLPLDELRLNFDFKHIGCKAKDIIRFLQQRLKKAVPYNRMKLMIVGNTGSGKTTLLQQLMKTKKSDLGMQSATVGIDVKDWPIQIRGKRKKDLVLNVWDFAGIYFSRLFNLVLLFFRMGI	365445	375355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_365542_368094_368193_370881_371069_372248_372431_374721
797205	contig_17859_pilon	-	1428	2	Intergenic	novelGene_155724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	9	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCCCTAGGAACAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210697	208977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_209995_210286
797206	contig_10734_pilon	+	1750	6	Intergenic	novelGene_51092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	159.431991770786	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	57	1055	545373	566125	FALSE	25	GCAGCATAATTCCAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTRPSVIQGTVEVLTSLMQELQNSGKTDPELWKTCETRWLQLFSLVEKQCQEQIVAQQEQFHNQIQRIQEEIKNLVKLQTSNASWAPYDSSSSKQISSESPMGFFYENSERNESVLSLPKSKEPEMQQESSPSQPDCNVDSSSVSSGYGTFCISELNACKSKDPKEFMEDTEVSKEQYVAPVVQTDSLLGGVKNKSFYIQTAEEFSASLKDDISVFPGEFEHNFLGENKISEVYSGKTNSKSITSWAQKLKQNQPKRAHIEEGRSKSMQGSEQAKKSLSEKPDFTAATQSHAFYLSKPDESPDSWISDSGTGLTYWKLEEKDMYHSLPEALEKTLVPSSSTDMSPSQVI	545316	566820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_545430_555001_555092_557793_558315_559408_559533_563827_563919_566009
797208	scaffold_6394_pilon	+	835	6	Intergenic	novelGene_111010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1203.04503656347	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTACTGTGTTTTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398218	406275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402247_402704_402973_403239_403321_405788_405864_406086
797209	SIRV6	+	184	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	404	7	-234	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCTTCCACACCACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
797211	contig_18544_pilon	-	2187	7	Intergenic	novelGene_152752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	303.926389114206	28	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	377	1126	63312	49124	FALSE	65	ATATGAATAGAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNELYHLELILKCYLIFCIAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARY	64912	48062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025_58270_63285_63461_64684
797212	contig_6608_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_162532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACACGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139224	141414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_139200_141400
797213	contig_5887_pilon	-	2097	2	Intergenic	novelGene_175119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	3	26	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	666	1142	8658	8182	FALSE	25	ATGAGTTTTCCCAGCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATASGTLPALSGQASEEQGEIIKVRVKEEDHIWDQGSCLQKNLSHIREFSRQRFRQFCYQETPGPREALSHLRKLCYQWLSPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHNPESGEEVVTVLEDLERELDEPRQQVRNWRCHLWRIWVHGCPG	9409	7226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5887_pilon_-_9022_9107
797214	contig_14341_pilon	+	2227	5	Intergenic	novelGene_111758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5.54526825320471	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	421	1755	218687	220099	TRUE	35	AATCTTTATATGCAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGTHGKRQKPDSNADEKTYAKEKPYECRECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECGKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCNQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKGFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNECGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLHLTQHRRIHTGEKPYECRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG	205541	220813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_205566_207547_207623_218365_219902_219979_220212_220453
797217	contig_3469_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_34230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGAAGTCTTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625464	624642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_624600_625500
797221	contig_14196_pilon	-	1161	4	Intergenic	novelGene_169968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	104.91372116596	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	413	865	114010	58066	FALSE	60	AAAAAATGGAAAATTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFLPTVSTMGDVGGELSSGDDSGDVDESPQSPETEASRSLTELFEKAAAHLQGLIQVASREQLLYLYARYKQVKVGNCNTPKPSFFDFEGKQKWEAWKALGDSSPSQAMQEYIAVVKKLDPGWNPQNSQEDISFHFKKLPKRGTSQI	114422	57769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_58132_103247_103345_106756_106822_113785
797222	contig_6503_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_145743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTGGAGAGATCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25426	25782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_25400_25800
797223	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_94312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	653873	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653875	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797224	contig_5899_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_146967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGAAAGTTTAGCGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66969	66329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_66300_67000
797233	contig_7182_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_117101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTGTTAGCCATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98989	98448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_98400_99000
797234	contig_7410_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_106034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5955	5094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_5100_6000
797235	SIRV6	+	343	4	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	-244	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2838_10682_10819_11031_11109_11205
797237	contig_11978_pilon	-	468	4	Intergenic	novelGene_63008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5914.29310136798	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	21	329	1596982	1591984	FALSE	5	CTTGCCTTCCGGTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPARKMSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1597002	1591844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1595890_1596020_1596304_1596389_1596969
797238	SIRV4	-	233	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTATTTCCATTGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
797243	contig_8907_pilon	-	598	5	Intergenic	novelGene_85808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	1078	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179866	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178789_179365_179544_179839
797244	contig_11105_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_159826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1046	1378	407751	408083	NA	75	TGCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKAWGPPDSPLGDVDPCAGPAGPQTEAPGQCVVLSSYGPAEAVCELTQESSFCGSLVRGYCTERPLGGHGWRYHLSRSVLNGWPRRLAACLLSQRGFLSWLFSAGRYY	406705	408894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_406700_408900
797246	contig_21083_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_58021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATTCTAAACTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47319	45295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_-_45300_47300
797249	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	0	1161	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797251	contig_10861_pilon	+	1918	2	Intergenic	novelGene_39435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTTCTTAAAATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432383	2451420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2434067_2451185
797255	contig_13823_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_145280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAAAATTTTTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338007	338926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_338000_338900
797256	contig_2783_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_119660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGACAAGAAACCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772914	773195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_772900_773200
797257	contig_5136_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_126654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAATTTTAAATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349362	348181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_348200_349400
797263	contig_13349_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_161136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTTGTTTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359402	360098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_359400_360100
797264	contig_19076_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_74218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAATCAATGTATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126499	128176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_126500_128200
797265	contig_5316_pilon	+	1817	2	Intergenic	novelGene_61234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	60	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAAAAAAAAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450438	454152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_451882_453778
797266	contig_18364_pilon	+	2236	2	Intergenic	novelGene_102553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2772	junction_1	0	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37524	39855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_39209_39303
797267	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
797269	contig_4211_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_80240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGAACATTGTTCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125697	1125107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1125100_1125700
797273	contig_4857_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_48666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTGGGGGAGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027596	1025844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1025800_1027600
797283	contig_5549_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_81617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCATTTCTGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332223	330791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_330800_332200
797284	contig_11964_pilon	-	1311	5	Intergenic	novelGene_164727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	34.9597983403795	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	82	327	253966	252300	FALSE	60	GAAATGAGAAAGGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKEKLNNLNSRLTERKEPRTNDNDEFMMLWSKVEKSSEEIMEIMQNLSSIQALKGRKELENLIGISCASSFLQREMQKTKELMRKVTKQRLFEKRSTGLPNKVRKGV	275195	251315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_252317_252920_252981_253366_253461_253891_253971_275118
797286	contig_4223_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_117280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAAGATATAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285713	286967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_285700_287000
797287	contig_12123_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_144589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	115	393	66960	66682	NA	30	TATCAATTATTTTCATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNGFSFHPFNSPSPHSSHCLLSFHSFCLSKPPSSIPQDMRAPNELNSGQRLSMELHTTRRDAKWNQEEFFKVTSLLKPTQHSKQLFTNKEPETANALPSHLLLEAHRSHILTSESTSQFFPKQVYRASIY	67074	65755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_65800_67100
797289	contig_6552_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_163589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGGGATCTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99091	100223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_99100_100200
797290	contig_11335_pilon	-	1850	3	Intergenic	novelGene_104943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_2	102.5	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	122	385	459255	451411	FALSE	35	ACAAGGCAGAGGTTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLNPPVRLRSLREGDVYEIGEDGELAAILLAVSLPLEFEMLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFG	459611	449945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_451540_459120_459279_459513
797292	contig_10609_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_123967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTTTTTTAAAAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581933	579682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_579700_581900
797295	contig_4857_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_48916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCCCTATATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1779896	1778757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1778800_1779900
797300	contig_1275_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_108747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGATGATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391660	390759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_390800_391700
797302	SIRV4	-	305	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	106	206	106	-206	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCCCAGTCAACAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5052	3843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
797306	contig_12479_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_56873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500012	502344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_5e+05_502300
797307	contig_20819_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_55692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCCACGTAACAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115974	113888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_113900_116000
797308	contig_10159_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_30817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATAAAATTCAAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469974	468789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_468800_470000
797309	contig_6589_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_26170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10963	junction_1	3346	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	80	319	1886667	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1886269	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886335_1886652_1886783_1887705
797310	contig_12427_pilon	+	1441	3	Intergenic	novelGene_40415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTGTGAGTATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207048	224378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_207139_222263_222943_223706
797313	contig_6446_pilon	+	1901	1	Intergenic	novelGene_149229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCTGGGGAAGACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438129	440030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_438100_440000
797314	contig_13844_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_79404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATCAAGTCCAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92704	92993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_92700_93000
797315	contig_13844_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_79405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGATTAAATGAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94153	95239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_94200_95200
797316	contig_17194_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_155374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATAACCTTTGGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249838	250911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_249800_250900
797322	contig_960_pilon	-	1798	2	Intergenic	novelGene_108231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGCTAGTGAGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435391	432624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_433325_434293
797325	contig_10930_pilon	+	395	5	Intergenic	novelGene_37104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7433.51765653382	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTTTTGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339424	342105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_341520_341625_342020
797328	contig_9363_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_6732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGGGGCCAAGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474452	1474892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1474500_1474900
797332	contig_11850_pilon	+	883	7	Intergenic	novelGene_125196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	331	801	181235	185962	FALSE	15	TAGTCCTTCAGATCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSPGYFPITTLLLTTTSSTSSSCKSSSRSPLLLLLILFLRHGYFYFTFTKTNIVIFLFHYLLHWLLFLKSNKAESTPLIGLVVHGELYGFHLTKTTKVLPYFLFRCIWRKATNKNFFNRLFCFHGFGPFRINHFPIQFMFLLIHDLIYTLRLFK	179833	186044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_180001_180767_180877_181180_181277_182659_182765_183240_183371_184499_184662_185930
797334	SIRV4	-	253	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1270	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3888	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
797335	SIRV4	-	238	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1275	8	1275	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3883	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
797336	contig_9177_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_32786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTACTTCAGGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424837	1422252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1422300_1424800
797337	contig_8920_pilon	+	2369	3	Intergenic	novelGene_146067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGCAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90866	94912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_91014_91999_93948_94638
797340	contig_10749_pilon	-	868	4	Intergenic	novelGene_133519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	91.6551507917949	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAATGTTGGTCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314654	311719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_311926_312685_313143_314250_314354_314552
797341	contig_5918_pilon	-	2741	1	Intergenic	novelGene_99588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCAGTTGGTTCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989246	1986505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1986500_1989200
797347	contig_7224_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_172969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAACAATGACGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64588	63632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7224_pilon_-_63600_64600
797351	contig_2100_pilon	+	1498	2	Intergenic	novelGene_50584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490446	493766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_490684_492505
797355	contig_5499_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_56981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	523	906	317665	317282	NA	15	ACGACTGTCTGTTCCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHLQKEQGAELETTEKSMLVLAPRMWLSLCWCRLMWMLTRPCSMLGVPGGAWGKLLQAEGSLWAQCIPDTLTPTWPEKQAILLSVLINDYIMWEIHILTLSILLLLWPRGRSGTTYSEQQDSRSPA	318187	317049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_317000_318200
797356	contig_4364_pilon	+	1771	4	Intergenic	novelGene_85	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	40.0194397206602	94	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	929	1312	849523	851164	FALSE	10	TTTCTGAGTCCCCATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRINFSGSQHNLTITMQRLQPADTGVYTCQAIVDDKISGAGTLVVVTDKSSPRADLCRNDWARAFGLPVALAVCCFLAGLVLGVVCAPRTTQIKKLCSRTDRSADVVVYEDMSCSRHNTLSIPNQYQ	848238	851623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_848336_848691_849665_849901_850036_851056
797357	contig_12622_pilon	-	829	5	Intergenic	novelGene_6046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_2	414.986370258109	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	154	468	1686921	1685486	FALSE	30	GGACAGCTTAAAACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1687878	1685124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765
797358	contig_9363_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_6508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACATGTATTTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494051	495081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_494100_495100
797359	contig_9195_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_155693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATATCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743949	743353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_743400_743900
797360	contig_6710_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_93676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
797362	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	15	1156	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
797365	contig_6279_pilon	-	1869	2	Intergenic	novelGene_164771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAAAATAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113422	111197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_112743_113098
797366	contig_2987_pilon	-	2631	13	Intergenic	novelGene_125853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	63.1682057859982	25	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	130	1983	522271	510815	TRUE	30	TGATTCTTCCAAAGGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSHLYRDGEGRMDEDEDEHENFEITDWDLQNEFNPNRQRHWQTKEEATYGIWAERDSDEERPSFGGKRTRDYSAPVSFISAGLKKGAAEEAELEDSDDEEKPVKQDDFPKDFGPKKLKTGGNFKPSQKGFAGGTKSFMDFGSWERHTKGIGQKLLQKMGYVPGRGLGKNAQGIINPIEAKQRKGKGAVGAYGSERTTQSLQDFPVVDSEEEAEEEFQKELSQWRKDPSGSKKKPKYSYKTVEELKAKGRISKKLTAPQKELSQVKVIDMTGREQKVYYSYSQISHKHNVPDDGLPLQSQQLPLPGKEAKAPGFALPELEHNLQLLIDLTEQEIIQSDRQLQYERDMVVNLSHELEKMSEVLDHEERVISNLSKVLEMVEECERRMQPNCSNPLTLDECARVFETLQDKYYEEYRMSDRVDLAVAIVYPLMKEYFKEWDPLKDCTYGTEIISKWKSLLENDHLLSHGGQDLSADAFHRLIWEVWMPFVRNIVTQWQPRNCDPMVDFLDSWVRIIPMWISDNILDQLIFPKLQKEVENWNPLTDTVPIHSWIHPWLPLMQARLEPLYSPIRSKLSSALQKWHPSDSSAKLILQPWKDVFTPGSWEAFMVKNIVPKLA	524098	507907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_508349_510118_510285_510773_510820_511458_511703_512416_512586_513337_513445_513566_514095_515391_515545_517516_517645_519400_519558_519837_519992_522062_522321_524018
797367	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
797370	SIRV2	-	272	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	653	23	653	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4079	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
797372	contig_628_pilon	+	839	2	Intergenic	novelGene_130240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTCCTTGAGATGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171763	172656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_172113_172166
797373	contig_7704_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_154623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354709	353169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_353200_354700
797374	contig_10609_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_123952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483235	485094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_483200_485100
797376	contig_3153_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_104637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_6	420.625724367876	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	183	488	69592	99804	TRUE	55	CATCAGAAAATCAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLECNLNINDLCMIQETGK	69409	145440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_69752_95022_95116_99751_99862_99967_100139_101885_101979_111196_111365_145104
797378	SIRV6	+	264	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	122	-9	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3145	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797380	contig_6241_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_156453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGTATATTTCCGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607973	608757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_608000_608800
797382	contig_846_pilon	-	1420	3	Intergenic	novelGene_136105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	53	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	145	369	213156	212487	FALSE	40	CAAAACGTGTTAAATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSYSSRHTRKRRAGSGVGEENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	214596	211435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212690_213134_213244_214539
797383	contig_14796_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_159371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCTGATTCGATGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149649	150893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_149600_150900
797384	contig_6589_pilon	-	999	8	Intergenic	novelGene_25906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	207.154088365474	42	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	212	706	1178015	1158779	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYHPPPQWPQETSALGFRQLLEVNLLGTYTLTKYLPRKHLDPTVEGICSLNSRPEGHNPRGHVGPAPGPHGSAS	1178551	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1171911_1172004_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
797385	contig_2414_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_158464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAGTATGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179984	178050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_178000_180000
797389	contig_13295_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_31246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCCAGTTGCCATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114524	115559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_114500_115600
797390	contig_14683_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_166035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16983	18985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_17000_19000
797391	contig_19974_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_130458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCTGTGTCACTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114315	115942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_114300_115900
797392	contig_19974_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_130459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTAGACTTACTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116055	116577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_116100_116600
797394	contig_5643_pilon	-	1247	9	Intergenic	novelGene_39119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	277.259101518778	1	46	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	343	921	649521	646519	FALSE	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNISLRVLSRPNALELPSMYQRLGLDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLSLCLYSDSLIKAKK	651402	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646564_647348_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344_649530_650490_650555_650870_650956_651217
797397	contig_6833_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_175132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAACAGGGATCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225919	227516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_225900_227500
797398	contig_20719_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_140564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAATACCAAAGGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14970	12899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_12900_15000
797400	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14950	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
797416	SIRV2	-	544	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4305	58	3130	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1600
797418	contig_1867_pilon	-	1937	6	Intergenic	novelGene_54606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.014822883183	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	499	858	532582	517583	FALSE	45	AGATTATACAACAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566892	516503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_547864_548024_548580_548748_566772
797419	contig_9177_pilon	+	1097	6	Intergenic	novelGene_32586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	765	1097	2759	3432	FALSE	15	GCCGCAGCTCCCAGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMA	1715	3432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2274_2378_2487_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373
797420	contig_12864_pilon	-	823	4	Intergenic	novelGene_76368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_3	184.858504447771	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	193	516	184995	181861	FALSE	35	TAAAACTTACTGCCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKINKPGNMIVAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE	185607	181553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_181988_183586_183745_184956_185105_185524
797422	contig_7744_pilon	+	1914	6	Intergenic	novelGene_62441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	11.7405280971513	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	82	1197	21624	36559	FALSE	20	GGAATTTTCCTGAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWTKYQLFLAGLMLVTGSINTLSAKWADIFVAEGCGGSKEHSFQHPFLQAVGMFLGEFSCLAAFYLLRCRAEGHSDSSVNPQQPFNPLLFLPPALCDMTGTSIMYVALNMTSASSFQMLRGAVIIFTGLFSVAFLGRRLVPSQWLGILATIAGLVVVGLADLLSKHDDQHKLSEVITGDLLIIMAQIIVAIQMVLEEKFVYKHNVHPLRAVGTEGLFGFVILSLLLVPMYYIPAGSFSGNPRGTLEDALDAFCQVGRQPLIALALLGNISSIAFFNFAGISVTKELSATTRMVLDSLRTVVIWALSLVLGWEAFHPLQILGFLILLMGTALYNGLHRPLLSRLSWSHPPAEESERERLLGDTRTPINHTS	21542	37276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_21701_32044_32118_33101_33274_33661_33875_34664_34776_36089
797423	contig_7744_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_62444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTTCGGGGCATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37476	38078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_37500_38100
797427	contig_13744_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_77140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	208	297	59661	59572	NA	15	GTTACTCTCCTGAGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHGSSPPDCGTNREGPFGLCQDLNWPARPCQCSNQLQCLFAYIKSWQQFWLFLSDFLLPLAYQLSISRSMSGKNANTLLSASILLLPSFLGLWLVQMV	59868	57788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_57800_59900
797430	contig_7568_pilon	+	1480	6	Intergenic	novelGene_174002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTACCTACTATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58444	113071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_58581_64619_64681_93727_93897_103969_104059_104596_104647_112096
797431	contig_9267_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_162008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGGGATAACTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255687	254201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_254200_255700
797433	contig_12746_pilon	+	2051	6	Intergenic	novelGene_152203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	19.0094713235271	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	150	614	770909	772593	TRUE	20	ACTTGGTAGAGTCACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGSAPGAVPRAECPCESSAKTCFSPESLERHSIPEALRLKWKNLPSPIMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSNPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPRRLWQWISIQVLGQEISEKMDDGCLPASCPT	751783	786457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_751825_770800_771296_771969_772014_772559_772652_779295_779381_785163
797435	contig_16525_pilon	+	843	2	Intergenic	novelGene_133831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCATGACTTTTCTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156833	159349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156901_158573
797440	contig_3004_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_127520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTCGCCACTTCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334540	333491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_333500_334500
797441	contig_4422_pilon	+	2520	5	Intergenic	novelGene_155959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	33	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	294	1682	157190	164512	FALSE	55	AAAAACAAAACACACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASMHSATGAQGLLTFEEVAVSFSQEEWGHLNSAQRALYRDVMWENYRNLISVDPTGFIFAKPKLISQLEQGEEPWVPEGPRPSNLGLIPTFSAGDTPETPPPPKEGCEAGDLQGLFSPALPSGDEASGEPTDKVLYWRTSEGKELIPCAAADCPWPLPSPPDPPKPYQCPQCGKGFSHSSNFNRHRRTHSVEKRFQCPQCNQRLSWSSDLTRHLRTHSGERPFRCTLCGKGFGLSSDYARHQRTHTGERPFPCPQCTRSFSRSSDLATHQRVHTGERPFRCADCGRGFLRSSSLLMHQRVHTGERPYRCGDCGKCFRLGQDLVKHRRTHTGERPYKCTDCTKCFSHSANLITHRRVHTGEKPYKCPECGKSFSQSSHLIIHQRAHTGERPYSCSDCDKSFSSRSYLLKHRRVHTGEKPYGCDICGKSYSQKTNLITHQKLHGADRQLGVIPCELAEPRPGS	156387	165350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_156674_157182_157223_157882_158010_159808_159932_163406
797442	contig_1331_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_37867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACAGTACTAATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320190	321285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_320200_321300
797445	contig_20615_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_146906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCCAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14861	12696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_12700_14900
797446	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
797447	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797449	contig_3602_pilon	-	857	7	Intergenic	novelGene_60648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	339.221003018517	218	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	91	588	1139393	1106301	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNSFRPAEW	1139483	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106323_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
797451	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	54	487	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
797452	contig_593_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_102024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGACCCTCTTCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483824	484889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_483800_484900
797453	contig_9202_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_168939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTAGCAGTGCTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153682	152430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_152400_153700
797454	contig_7171_pilon	-	1674	13	Intergenic	novelGene_101265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	60.3045511457377	19	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	885	1310	911210	901469	TRUE	15	GACACGGCCCTTGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSRPGPAQRAQVLDKFIHVAQSVFKNYDPEGRGTISQEDFERLSGSFPFACHGLHPPPCQGPGSFSREELTGYLLRASAVCSKLGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFFWGGNQARLPLPGLWALLPQTLQRPGEGGV	919876	899210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_899382_901155_901269_901388_901524_901626_901665_902352_902498_905383_905503_911141_911316_914111_914266_914383_914516_915033_915096_915220_915329_916332_916520_919740
797455	contig_7056_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_43602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCATTGAGAGGGGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718932	717215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_717200_718900
797459	contig_16882_pilon	+	1791	9	Intergenic	novelGene_148214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41.545156155682	277	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	67	1116	202217	213521	FALSE	30	GACAACTGTATAGCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLFSLAHRVALATVRYSRCGCGGFGMFYAVRRGRKTGVFLTWNECRTQVDRFPAARFKKFATEDEAWAFVRNSVSPDVSEVLDKAEFRERQIAVGVHPRRTSPQCVSTLPSIFPAAFTGGSRVTVLFLPRWGKQFGTESKFERQKNQRVQEPQLKANKRPRESPNDEEDENTEPCVKHLKQNTESVPSVSKDTFSYMGEFVVVYTDGCCSSNGRKRARAGIGVYWGPGHPLNVGVRLPGRQTNQRAEIHAACKAIEQAKAQNIDKLVLYTDSMFTINAITNWVQGWKKNGWRTSTGKEVINKEDFVELDTLTQGMDIQWMHVPGHSGFIGNEEADRLAREGAKQPGD	202150	214196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_202348_203443_203560_204478_204665_206620_206786_208805_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
797460	SIRV4	+	354	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCACCCGTAACAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
797466	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797467	contig_10861_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_39189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCACAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317227	316072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_316100_317200
797468	contig_14953_pilon	+	2077	7	Intergenic	novelGene_137277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_5	194.58302997835	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	70	537	98786	192426	FALSE	65	GAAAAAAATTGAAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTVSLELENSVYRREAGFVNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEVHGTGNEPPLLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGTQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSG	97336	193966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_97389_98768_98857_101504_101560_110603_110680_117909_118017_152898_152981_192349
797469	contig_10523_pilon	-	1132	9	Intergenic	novelGene_120919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.127071818687	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	161	1054	39240	12805	FALSE	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEDRGK	95298	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12820_15105_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
797470	contig_16882_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_148234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTCCTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391609	392636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_391600_392600
797473	contig_9995_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_47745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTCTGTTACAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582965	584010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_583000_584000
797474	contig_8063_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_152451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923992	926232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_924000_926200
797475	contig_3956_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_14808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTGCAGCCAGCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229538	1230288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1229500_1230300
797476	contig_3956_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_14809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATACAAATATTAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230593	1231600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1230600_1231600
797477	SIRV5	-	412	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8362_8439_8590_10863
797478	contig_7898_pilon	+	658	2	Intergenic	novelGene_47570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1709	junction_1	0	47	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	259	480	484224	487351	FALSE	25	GAGAATTGAATTCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQNGGGGWVTGLWAAASVPATARAAYGEQRSRRGGLRYCGWGRRGGSQPSLGEAGRNRDLGLRPWGETAGASHKSGLSGCVLPAARMWKTLTYFVALPGVGLSMLNVFLKSHHGEEERPEFIAYPHLRIRSKPFPWGDGNHTLFHNPHVNPLPTGYEDD	483965	487529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484362_487267
797480	scaffold_19766_pilon	-	1569	8	Intergenic	novelGene_34343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.297777909277	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	812	1402	621659	596588	FALSE	75	ATAAAACAAAAACAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKVRRPNEWDGPLHLNQD	623658	596420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596631_596911_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622157_622736_623580
797483	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797485	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	8	1161	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797486	contig_7078_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_130163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGGAAAGAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584630	582734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_582700_584600
797488	contig_854_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_36106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_1	0	109	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCATGGAGACTGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94322	95814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_94681_95455
797489	contig_6954_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_64458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTCCATTTGTTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769373	770833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_769400_770800
797490	contig_7898_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_47630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	697669	698001	NA	15	TTTGCAGTGACACTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRILAKLQKTTLVSFLAYNTPFPRNRLTSGSPGKESAGSLPSPGNGERPTRAAQCLLLSCSEPGWAFPLDSGLGRGPSVLSWGCFPIPPPSSPLLACPDIIQVSSCLKEP	697666	699484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_697700_699500
797491	contig_8020_pilon	-	995	8	Intergenic	novelGene_114372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_2	88.89112808971	684	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	117	938	107186	104794	FALSE	20	CTAAACAGGGCTGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPALEPRGGFSFENCQRNASLERVLPELRTPHARKTGTTIAGLVFRDGVILGADTRATNDSVVADKNCEKIHLIAPKIYCCGAGVAADTEMTTRMAASNMELHALSTGRAPRVATVTRTLRQTLFRYRGHVGASLIVGGVDAKGPQLYSVHPHGSYSRLPFTALGSGQDAAMAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107302	104736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106117_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
797492	contig_8671_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_126232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10285	11395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_10300_11400
797493	contig_14133_pilon	-	672	6	Intergenic	novelGene_119931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1944.79062112095	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	45	344	209116	208321	TRUE	25	GTAGTATCATTGTGGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSCGWYPQEGGPDHWDLRGSAEAE	209451	206554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206724_207399_207465_208226_208389_208599_208728_209012_209131_209421
797494	contig_18145_pilon	+	1234	10	Intergenic	novelGene_37304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	35.0273261932297	545	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	26	1096	57127	60118	FALSE	20	GGAACTATCCTCTTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLRQWEMLARAARGTGGILLRGFLRAPGRAPRRASSGLPRNTVVLFVPQQEAWVVERMGRFHRILEPGLNILIPVLDRIRYVQSLKEIVINVPEQSAVTLDNVTLQIDGVLYLRIMDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHNGDAAASLTVAEQYVSAFSKLAKDSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTKAPVPAAQDLVSSGSSRDVPGTDTSLDEELDRVKLS	57101	60256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_57553_57963_58064_58193_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59211_59432_59562_59980
797498	contig_6710_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_89136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653665	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
797500	contig_8898_pilon	+	840	2	Intergenic	novelGene_137255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGCCTCTGGGTGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335530	338218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_336301_338148
797501	contig_2069_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_23496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509069	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942
797502	contig_6062_pilon	-	1234	7	Intergenic	novelGene_5246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	172.244738671461	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	22	1071	597983	541389	FALSE	30	GTGTCATAAATTGCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598004	541225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548747_560804_561084_569595_569743_597863
797506	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4567	34	3392	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
797507	contig_16385_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_86180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACAGCCTGAATATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2489	3882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_2500_3900
797510	contig_12427_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_40571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523810	521588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_521600_523800
797511	contig_15123_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_110929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTAAACTGGAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301337	300664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_300700_301300
797513	contig_4782_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_73678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623997	625182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_624000_625200
797516	contig_12119_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_88686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATTGATTCTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386730	384975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_385000_386700
797517	contig_12543_pilon	+	566	3	Intergenic	novelGene_168394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	30.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGCAGACATTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548766	562610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_548899_558949_559028_562254
797518	SIRV5	+	325	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	181	48	-28	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTCAGTGGTGACGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
797519	contig_6079_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_160118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502322	501316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_501300_502300
797521	contig_5947_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_101597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCCCACTCCCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918090	919159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_918100_919200
797523	contig_10196_pilon	-	865	8	Intergenic	novelGene_132243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.910345097551	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	107	583	1442405	1433608	TRUE	25	ATAGAAAGGTTTTGGTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448620	1433078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433278_1433524_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
797532	contig_6873_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_129815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTCAGCGTAATTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218158	217669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_217700_218200
797533	SIRV4	-	513	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	103	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	16	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
797536	contig_13952_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_133260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCTTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177202	175472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_175500_177200
797540	contig_9389_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_84061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCATGAGGAATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778868	781415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_778900_781400
797541	contig_2854_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_120845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACCCACCCAGCGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292953	294105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_293000_294100
797542	contig_6710_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_96370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	653873	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653874	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797545	SIRV6	+	232	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8475	2	264	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTACAAATGTTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
797549	contig_2043_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_169911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCAGCATTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689395	686716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_686700_689400
797552	SIRV5	+	407	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2095_2157_2267_2316_3298_3405_3483
797553	contig_6434_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_61854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGATTAAAGAATGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799867	799096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_799100_799900
797554	contig_6217_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_109668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAATAGACATTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781337	782086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_781300_782100
797555	contig_6217_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_109669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTACAGTGGAAGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782035	783711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_782000_783700
797558	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
797559	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
797562	contig_18634_pilon	-	1840	1	Intergenic	novelGene_174239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCCCTCAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28884	27044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_27000_28900
797565	contig_11370_pilon	+	1286	7	Intergenic	novelGene_98754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	54.0524436697053	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	134	871	153583	155238	TRUE	10	TACCCCTGCTCCACTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAASPGASVMDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGEIQSWALSSQPGRAGCKLTVCHPLPYFPRVLL	153449	155861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153678_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155326_155403_155456_155585
797566	contig_5916_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_158062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTACTCCTCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509710	510529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_509700_510500
797567	contig_14441_pilon	+	1006	5	Intergenic	novelGene_100347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282.324281633727	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	453	989	125667	126728	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTVQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQTPEPESTHPNWPPEKLIPCTLTWVSSPSPLCSPRVLSPLASLHGHLLHLCFPEIQLPALNPNQMNQ	6649	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6916_121201_121239_125517_125902_126159_126260_126526
797568	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
797570	contig_19564_pilon	-	1814	12	Intergenic	novelGene_29677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	67.8708058077384	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	13	813	83587	74791	TRUE	35	TCACGAGAGCTATTCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPFDVDALLPERITVLDQHLRPPARRPGTTTPARVDLQQQIMTIVDELGKASAKAQQLPAPITSASRMQSNRHVMYVLKDTSARPAGKGAIIGFLKVGYKKLFVLDDREAHNEVEPLCILDFYIHESFQRHGHGRELFQHMLQKERVEPYQLAIDRPSQKLLKFLNKHYKLETTVPQVNNFVIFEGFFAHQHRPPSSSLRATRHARAAAVDPTPTERPRVLAGPAGTIPQPQNPRGAWQHPLTVRAHLPLAALLLHLPGLQSPL	83599	70451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_70783_71288_71369_74005_74248_74442_74940_76159_76229_76341_76388_82060_82163_82336_82451_82561_82623_82748_82841_82952_83014_83480
797571	SIRV6	+	289	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	601	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGCTTTTGTCGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_2780_2829_3106
797573	contig_15500_pilon	-	2363	1	Intergenic	novelGene_128982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAATTTATACTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211213	208850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_208800_211200
797575	contig_11525_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_171064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTTGGCTATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387	1046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_1000_2400
797578	contig_13664_pilon	+	1806	2	Intergenic	novelGene_144191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	146	568	16659	35042	FALSE	50	GCAAATATAATTACCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRVGDNLAEDERYTILEEEFFSFQKSWLFGDLSLVATFQSSLFTSSEMFLTISRKNMSQKLSFLLLVFGLIWGLMLLHYTFQQPRHQSSVKLREQILDLSKRYVKALAEENKNTVDVENGASMAGYADLKRTIAVLLDDILQRLVKLENKVNYIVVNGSAANTTNGTSGNLVPVTTNKRINASGTIR	16513	36280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_16897_34857
797579	contig_6138_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_159694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAGTGATAAGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626324	626913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_626300_626900
797581	contig_1339_pilon	-	662	5	Intergenic	novelGene_163141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45050	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTCTCCCTACGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434175	430953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_431155_431331_431421_431611_431733_433674_433795_434044
797582	contig_7179_pilon	+	2304	2	Intergenic	novelGene_78145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	252	junction_1	0	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	918	1487	997634	1001122	FALSE	30	CCACATACACCAAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKALKSESAASSTVKEDKEPAPEPVEKPLREPARELQNTPTTIGIMTLKAAFKALSNAKDSEAAFSRLDQKDLVLPNQASLPSSALKNKRPRKDEESSAPAEGESGSELQPKAKRMTISRLVLEEDSQSTEPSAGLDSSQEVVPASLSKPATLHQPLPKEKNLKYEDSLCSSFGAGCWSWLGLILLP	996716	1001939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_997741_1000659
797583	contig_1107_pilon	-	2170	4	Intergenic	novelGene_126597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_1	57.9789233735463	14	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	105	518	885345	865119	FALSE	45	AGTTATGATTAACATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSRMNLPKGPDTLCFDKDEFMKEDFDVDHFVSDCRKRVQLEELRDDLELYYKLLKTAMVELINKDYADFVNLSTNLVGMDKALNQLSVPLGQLREEVLSLRSSVSEGIRAVDERMSKQEDIRKKKVYSSAVRLKH	885449	863466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_865233_867475_867542_868869_869032_885273
797584	contig_2310_pilon	+	2079	13	Intergenic	novelGene_71626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	31.5660682801433	56	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	257	1510	299755	318733	FALSE	10	GCAGCTGTTTGCCTCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFADLDYDIEEDKLGIPTVPGKVTLQKDAQNLIGISIGGGAQYCPCLYIVQVFDNTPAALDGTVAAGDEITGVNGRSIKGKTKVEVAKMIQEVKGEVTIHYNKLQADPKQGMSLDIVLKKVKHRLVENMSSGTADALGLSRAILCNDGLVKRLEELERTAELYKGMTEHTKNLLRAFFELSQTHRAFGDVFSVIGVREPQPAASEAFVKFADAHRSIEKFGIRLLKTIKPMLTDLNTYLNKAIPDTRLTIKKYLDVKFEYLSYCLKVKEMDDEEYSCVALGEPLYRVSTGNYEYRLILRCRQEARSRFSQMRKDVLEKMELLDQKHVQDIVFQLQRFVSTMSKYYNDCYAVLRDADVFPIEVDLAHTTLAYGLTQEDFIDGEDEEDDEEEDTAAREPSQDARGAARPLDKDGSWCGS	299203	319302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_299403_299697_299796_301525_301638_307480_307610_310321_310389_311610_311701_313903_313958_314446_314510_315866_316001_316332_316426_317238_317290_317888_318034_318458
797585	contig_5039_pilon	+	1558	9	Intergenic	novelGene_65009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	52.2827349609792	7	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	604	1557	1704607	1713442	FALSE	35	AATTTGACAATGCAGTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRDHASQDEGGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPADSPRVKVRNLMESMQINRSVLENSSLENHVSVQPPRARVAVLISGTGSNLQALIDSTREPHSSARVVVVISNKAAVAGLDKAETAGIPTRVINHKLYKSRV	1703020	1713443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1703245_1703623_1703734_1704337_1704647_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710831_1712083_1712222_1713013_1713145_1713409
797587	contig_14288_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_153814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTCCAGCAGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241800	240068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_240100_241800
797588	contig_9389_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_84163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAATAAAACTGCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2003203	2004058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_2003200_2004100
797589	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_97997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	CTTCTTTAACTTTAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
797594	SIRV6	+	474	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
797604	SIRV5	+	238	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	167	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8596_10866
797605	SIRV6	+	232	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	282	17	51	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2567	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
797606	contig_10063_pilon	-	1110	5	Intergenic	novelGene_127764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.8147076726462	481	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	161	859	752750	746874	FALSE	40	AGATTGACACATCCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSYHSFYSLSYTEDRDPTGDSPRAWSCCQPGERPTQTQQSVLRAAKEVQGQKDMAWKSTPLLLLVAWVAATSSTRDRTDLLNVCMDAKYHKTKPGPEDKLHGQCSPWRKNACCSVNTSQELHKDISRLYNFNWDHCGKMEPDCKRHFIQDNCLYECSPNVGPWIKQVNQRWRKERFLDVPLCKEDCQSWWEACRTSYTCKTNWHRGWDWTSGVNKCPVGTTCHTFEFYFPTPADLCEGLWSHSYKASNYSRGSGRCIQMWFDPAQGNPNEEVARFYAKAMSGVEE	753897	746622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_747098_747246_747383_747499_747689_752600_752763_753749
797609	contig_4803_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_150719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAAAAAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40715	41947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_40700_41900
797612	contig_9243_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_60306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTATAGATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20104	18771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_18800_20100
797613	contig_2036_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_131853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCCAAACCAGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648507	649029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_648500_649000
797614	contig_10569_pilon	+	2113	2	Intergenic	novelGene_44059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	646	1119	82798	86026	FALSE	20	AAAATCTGTGGTGTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSGNIHFVGPFPISGPNNVGCRMPFLQPLTSIWGGDVLTCTHVPVRLTLKMPPSQGNNRCSANMVEFFSSMKQTASRGACLYEVLIDPRGGPVIWQIEHEPNSGLGSHWQLPRRLWVRNNPAASEPAQSPPLLACFRVVGRAQLKLQWIADPPSL	82152	87020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_82944_85698
797615	SIRV4	-	461	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1062	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4096	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
797617	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1169	45	1169	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGACAAAAAACTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3989	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
797623	contig_9242_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_155083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAGTACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833475	832987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_833000_833500
797624	contig_6102_pilon	+	1820	3	Intergenic	novelGene_31822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5.5	191	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	60	371	362547	365336	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRTGRRQQQLRRRRQNPAVMWRWKPTAAPPTNAAPPAAPPPPPPHLNPEITPLSAALAQTIAQGMAPPPVSMAPVAVSVAPVAPVAVSMAQPLAGITMSHTTTPMVTYPIASQSMRITAMPH	361717	366785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_361765_362534_362569_365046
797627	SIRV5	-	352	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
797628	contig_6302_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_171705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193393	191458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_191500_193400
797630	contig_7342_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_71093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAAGCTCCTTCCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46675	45885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_45900_46700
797633	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	51	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
797634	contig_10855_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_124299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290789	290372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_290400_290800
797637	contig_5623_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_154870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273577	275105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_273600_275100
797638	contig_5419_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_15485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACTTTTAGATTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222931	224609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_222900_224600
797641	contig_8304_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_153169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACCTAAAGTACTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84113	81875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_81900_84100
797642	contig_6654_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_85742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485617	487053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_485600_487100
797643	contig_10496_pilon	-	2544	11	Intergenic	novelGene_59416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	120.859463841273	1	140	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1151	1783	47882	38747	FALSE	20	AGTTGCATGCTATGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64709	37985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50495_50736_52476_52557_52660_52821_55292_55444_55640_55777_56170_56288_64494_64566_64672
797645	contig_2114_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_104287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCTAAAAATATGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717492	719690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_717500_719700
797646	contig_7004_pilon	-	1421	9	Intergenic	novelGene_126502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_8	55.4581768091956	419	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	188	937	434925	432641	FALSE	10	GCATTCAGGTCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGAHCSEPSCQRLDFLPLKCDACSGIFCADHVAYAQHQCGSAYQKDIQVPVCPLCNVPVPVARGEPPDRAVGEHIDRDCRSDPAQQKRKIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGLSEDEALQRALELSLAETKSQVPSSQEEEDLALAQALSASEAEYQQQQYDSRP	435112	432156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432659_432779_432853_433184_433253_433335_433397_433473_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434599_434870
797648	contig_10494_pilon	+	2651	9	Intergenic	novelGene_102201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGCTCGCGGGCTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072677	1083018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1074378_1074978_1075117_1075308_1075438_1075513_1075582_1076538_1076682_1078184_1078292_1079045_1079120_1080318_1080443_1082850
797649	contig_6217_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_109703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGAACTGGTGTAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071576	1069700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1070021_1070145
797651	SIRV6	+	250	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	14	31	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797653	SIRV6	+	281	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8139	11	600	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTTTTGTCGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	3140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
797655	contig_5445_pilon	+	165	3	Intergenic	novelGene_135415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1483	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCCAGGTGTCATGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51684	53224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51699_52580_52635_53127
797657	contig_7751_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_174501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCTTGATTGCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260847	259023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7751_pilon_-_259000_260800
797662	contig_5954_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_28541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	207	686	524109	523630	NA	25	AGGTAACCAAGGGTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSPMAPSTGCTIRVLAKQHMDRDSGLVMSCQRQSQVRTLFLGKEREQEAPKANSLPNKTDVASESITNVYDTLKFAPTLVTPPASLLSGKGNNVTGTGGTALTGVPSPSIPLLRSREALGIGASAGAQGAVGWERSSRLVTAFTARGRHQTRRNPH	524315	522692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_522700_524300
797663	contig_9177_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_32802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTACTCACCGTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538293	1535969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1536000_1538300
797664	contig_16703_pilon	+	1255	2	Intergenic	novelGene_72761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4571	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACCACAAGTGGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14804	17501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_15480_16921
797665	contig_5039_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_64825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAATTAGAAAATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257150	257611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_257200_257600
797670	contig_10629_pilon	-	2175	12	Intergenic	novelGene_52916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.700932384393	1	142	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	9	305	256132	253855	TRUE	20	CCCAAATCTATTTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPAQIPTSTRSHQFTSRESLWEAALRARLQRT	256140	245859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247319_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254218_254588_254689_255094_255140_256072
797677	contig_1349_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_171641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	82	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCCTAAACTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229432	222006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_223149_228582
797679	contig_13645_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_146159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTATACACTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13543	13318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_13300_13500
797683	SIRV6	+	443	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	20	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	14	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_1845
797686	contig_12622_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_5869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAAGCCTTTTCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190339	1191669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1190300_1191700
797687	contig_12312_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_63982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATGTACAGATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292690	293825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_292700_293800
797688	contig_14483_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_133770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAGAAGTAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153433	152729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_152700_153400
797690	contig_12635_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_60853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTTGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583841	585318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_583800_585300
797691	contig_15787_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_143994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACTTGGATGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96584	95702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_95700_96600
797698	contig_16703_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_72787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAGAGCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44757	42416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_42400_44800
797700	SIRV6	+	385	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	577	0	398	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797702	contig_14362_pilon	-	1172	6	Intergenic	novelGene_142512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	23.2413424741343	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	117	305	33047	32859	TRUE	10	TGTGCCTTGTTTTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSCFWPRRWSELRYSGKEKTETILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTVSRDWAGATRKSGPPARCLTAERSLASDPLLLLLPHPPGGSVSELQPW	33163	26325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_26634_27675_27732_30007_30119_30223_30389_32119_32159_32670
797708	contig_5569_pilon	+	1428	8	Intergenic	novelGene_86718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	46.3702930940991	86	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	18	968	39917	63783	FALSE	5	GGCTGTGACTCTCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAVMAEAALDAVRRALREFPAAARELSVPLAVPYLDEPPTPLHFYRDWVCPNRPCIIRNALQHWPALQKWSLPYLRATVGSTEVSVAVTPDGYADAVRGDRFVMPAERRLPLSSVLDVLEGRTQHPGVLYVQKQCSNLQTELPQLLPDLEPHVPWASEALGKMPDAVNFWLGEAAAVTSLHKDHYENLYCVVSGEKHFLLHPPSDRPFIPYELYTPAIFQLTEEGTFKVVDEEAVEKVPWIPLDPLAPDLARYPGYRRAQALRCTVQAGEMLYLPALWFHHVQQSHGCIAVNFWYDMEYDLRYSYFQLLDSLTKASGLN	39899	64243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_39981_61025_61180_61254_61509_61913_61971_62797_62894_63097_63175_63416_63577_63694
797710	contig_12756_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_153206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTTTTTGGTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62037	60538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_60500_62000
797712	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797713	SIRV4	-	447	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1071	3	1071	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4087	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
797716	SIRV6	+	377	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	431	48	258	-48	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGTTGCTAAAGTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	2492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
797717	contig_11258_pilon	+	416	4	Intergenic	novelGene_67750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	4172.813679042	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTGTCTTGTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49846	53625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_50009_50092_50154_52748_52872_53555
797719	contig_16351_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_175139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTGTGGGATAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68257	66350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16351_pilon_-_66400_68300
797722	contig_15236_pilon	-	2007	2	Intergenic	novelGene_141661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCAACCCTATGTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718904	716128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_717068_717836
797728	contig_6902_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_135595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAAAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463029	465174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_463000_465200
797729	contig_10402_pilon	+	1457	5	Intergenic	novelGene_175141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_4	12.3970762682174	148	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	75	1232	240760	248155	FALSE	65	TAAAACAAGTAAAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPARRPEPDPHPRRCRDRALGHPAMIATAALLRVLLLLLVFGRSTHGAVNCYPACHPVHGSCEDENVCRCQPGWQGPLCDHCVPFPGCVNGICFEPWQCVCDEGWEGHLCDIDVRPCTSNPCANNSTCVNLDTGGYKCSCAPGYMGPHCQEKKPGPCVINGSPCQHGGTCVDDEGRASHASCLCPPGFSGIFCEIVANSCTPNPCDNNGVCTDIGGDFRCRCPAGFIDKTCSRPVTSCASNPCQNGATCLQHAQVSYECLCKPEFTGPTCTKKRAPSSQQVTRLPNGYGLTYRLTPGVHELPVPQPEHRILKVSMKELNKSSPLLTEGQAICFTILGVLTSLVVLATVGIVFINKCEAWVSTLRYNHMLRKKKNLLLQYNSGEDLAVNIIFPEKIDMTTFNKEAGDEEI	240685	248380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10402_pilon_+_240827_242060_242128_242543_242675_245580_245726_247407
797730	contig_13760_pilon	-	1028	4	Intergenic	novelGene_61352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	185.733381191666	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTTTGTCTCTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355366	352849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354491_354763_354911_355293
797731	contig_13055_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_104966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGATTGTTTTCCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164583	164896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_+_164600_164900
797732	SIRV4	-	346	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1177	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3981	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797734	contig_18438_pilon	+	571	6	Intergenic	novelGene_171396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_3	257.424474360928	505	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	57	569	312040	332755	FALSE	10	GTAAGTTTTTCGTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSKAPQQWATFARVWYLLDGKMQPPGKLAAMASIKLQGLHKPVYHQLSDCGDHVVIMNTRHIAFSGNKWEQKVYSSHTGYPGGFRQVTAAQLHQKDPVAIVKLAIYGMLPKNLHRRTMMQRLHLFPDEDIPEDILKNLVEELPQPRKVPRRLDEYTQEEIEAFPRVWS	311983	332757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_312067_315925_316050_323945_324040_325723_325785_331057_331145_332635
797738	contig_15236_pilon	+	656	3	Intergenic	novelGene_141671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	11.5	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	728348	728647	TRUE	35	TTGGAAACCCCACAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAVGLSTESAPSGPLLSSSCCRSVGALCPVWATLSPPQANAQSEVGVTEDYRQGSPVWGSVKSSKRITQPSSKSHLELWECWPLSDFERGAATPLCLV	728346	913332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_728791_732963_733049_913205
797739	contig_15236_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_141679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGTAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917672	918978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_917700_919000
797740	contig_16122_pilon	+	2744	4	Intergenic	novelGene_134500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	2.44948974278318	62	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	619	1776	116739	117896	FALSE	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPYDSNEVSYLLPSNKEDWEEQGIPDFVYGQEELLMREIQWPRNASGVPGALPLSRFDSAVCSAWRQRMELGLFRYHLGELQTQTLPGAVGFVAQLNVERGVQRRRPQSIRSVRQPFDPEQFNFNKVRPGEILFRLHREPDLPGAVQQEDILVMINVSPLEWGHVLLVPEPARGLPQRLLPGALRAGVEAVLLSLHPGFRVGFNSLGGLASVNHLHLHGYYLAHRLPVEGAPSEPLDPGGHLHFLQALPAPGFLFYTGGPGPDLEALVSRVCRATDYLTDHEIAHNLFVTRGALPGKTSPSSALTGVRVILWARKSSFGIKEGEAFNVALCELAGHLPIKTSQDFTSLTEAAALTLIQDCLLPPAQAEEVQAALVALVAQEEQ	110914	118864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_111247_115108_115329_115852_115910_116729
797741	contig_6443_pilon	-	1378	4	Intergenic	novelGene_175149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1.63299316185545	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	255	566	474006	437204	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKYKRDFEESKGRGFSIVTDTPELQRLKRTQEQISNVKYHEDFEKTKGRGFTPVVDDPVTERVRKNTQVVSDAAYKGVHPHIVEMDRRPGIIVAPVLPGAYQQSHSQGYGYMHQTSMSSMRSMQHSPNLRTYRAMYDYSAQDEDEVSFRDGDYIVNVQPIDDGWMYGTVQRTGKTGMLPANYIEFVN	666667	436391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_437381_439686_439794_473978_474151_666557
797742	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797745	contig_10640_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_175157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTAAGAATGACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36943	36188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_-_36200_36900
797746	contig_8330_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_72001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTGCCACTTATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2113460	2114033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2113500_2114000
797748	contig_7962_pilon	+	2220	2	Intergenic	novelGene_149302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTACCTTGGGCTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236571	238847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_237916_237971
797751	contig_5725_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_167152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCCAAACAGCAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254474	252895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_252900_254500
797752	contig_8954_pilon	-	1446	6	Intergenic	novelGene_130320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.3324043662795	80	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	365	670	662592	655638	TRUE	35	CTGAGTAACCAGCTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPLSVLRSMLSKVVCSSEQGTLFACISVLETLGGVLAVSAFNGIYSATVAWYSGFTFLLSAALLLIPAISLCIVKCTNWNEGSYVPLVQEESGEDASDR	682493	654503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_655079_655436_655723_658639_658797_662528_662613_671322_671547_682373
797753	contig_5253_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_61556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATCATGAAGGTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182335	181908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_181900_182300
797754	contig_1339_pilon	-	1035	3	Intergenic	novelGene_163111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	24.5	243	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	54	734	257300	255087	FALSE	20	TGGCAATGTGTCATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTRGRGTPQEPGLAAHTTHIARWLSPFFLTCTVYFLLWIPKDPPSPLGALVKCLPVLSLAVSLWAVSPSSGYTALLQGALLCSAVGDICLIWPDAFLYGMAAFATAHLLYLAAFSFSPLQPATLLPVALACGPYYGLLLPRLPPDMALPLVAYALLLATVLWRGLVRGGSAGLGALLFTISDSVLAWDAFAQPLPHARLVVMTTYYAAQALIALSAVSGLRHKTN	257353	254785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_255470_256675_256923_257249
797755	contig_12915_pilon	-	2453	3	Intergenic	novelGene_148345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	377	junction_2	52.5	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	31	453	159330	87397	FALSE	60	GAAAAAAAAATACAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEAEQERLSRSGGGCVAELQRLGERLQELERQLRESRVPAVEAATEYCQQLCQTLLEYAEKWKTSDDPLPLLEVYTVAIQSYVKARPYLTSECENVALVLERLALSCVELLLCLRVELSDKQWEQFQTLVQVRLFTY	159360	85396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_87497_87695_87851_159162
797757	contig_9843_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_114306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_2	635.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCATGTGCCTCCAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35785	6586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_6768_34898_35189_35502
797760	contig_9027_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_156345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCATTCTTTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11380	9312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_9300_11400
797763	SIRV4	-	410	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1113	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4045	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797766	contig_7446_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_101959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229901	231601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_+_229900_231600
797767	contig_10235_pilon	+	669	6	Intergenic	novelGene_46337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	345.858121200009	7308	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	164	574	109496	111229	FALSE	10	TCCAGTCAGCTTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNTAVMRICPPNWKPSRPLPTACDPLASYHPPCSLTHPEKYMEFDLNGNGDIDIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKMILMYEEKAREQEKPMGPPAKKAISELP	109053	111324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_109553_109868_109975_110144_110308_111144
797770	contig_7398_pilon	-	1355	1	Intergenic	novelGene_166156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115939	114584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_114600_115900
797771	contig_3077_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_26895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504548	1506564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1504500_1506600
797772	contig_7457_pilon	-	1850	4	Intergenic	novelGene_31629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	77.7817459305202	1	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	131	808	962606	956658	TRUE	5	TTCCTGGGTGCCCCCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRGG	962736	955563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_955770_955821_956669_960231_960896_962603
797776	contig_2358_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_156104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAGAAAGGAGAACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69825	68548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_68500_69800
797777	contig_8322_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_143264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	443	757	412800	412486	NA	55	TAAAAAATCAAAGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELSVLAQAHQERKLPSGHNSGWGRPHRSPATQSKPGHNKSETRVGGGRRQAPWIVPISEVLQSEFFGSLHPSKTNSSFLVHIWEIPPKKGYRCLQVNITVSS	413242	411872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_411900_413200
797779	contig_9732_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_98356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAAAACGTAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225414	226363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_+_225400_226400
797786	contig_5302_pilon	+	1403	2	Intergenic	novelGene_81414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGCAAGCAGTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175552	177139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_176868_177051
797787	contig_4678_pilon	+	1166	6	Intergenic	novelGene_126028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.617006256212	448	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	103	762	340677	343851	FALSE	15	GTCGGCCACAGCTCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYFLGQSVLRSSWDQVFAAFWQRYPNPYSKHVLTEDIVHREVTPDQKLLSRRLLTKTNRMPRWAERLFPANVAHSVYILEDSIVDPQNQTMTTFTWNINHARLMVVEERCVYCVNSDNSGWTEIRREAWVSSSLFGVSRAVQEFGLARFKSNVTKTMKGFEYILAKLQGEAPSKTLVETAKEAKEKAKETALAATEKAKDLANKAATKKQQQQQQFV	340517	344255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_340596_340652_340769_341343_341570_343168_343283_343385_343465_343702
797802	contig_9955_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_21375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	45	335	379	567087	567043	NA	20	CCACATTTTCATTTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWGASLIGCISRLVSASLVLYRFSHDTTSESLEAEAHVAAQTRKCLVPHPYCKLQNLHPGVHGPLSLVLAAPHLALVLLTVHASRLSPLLSAFLSFPVYLPLYISYPPFWSMSVPPSQKLSLQLK	567421	565370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_565400_567400
797803	contig_12414_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_59619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTTAGCAACCGCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530290	533185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_530300_533200
797805	contig_7695_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_41654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGCCATCACCACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846348	846910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_846300_846900
797806	contig_8452_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_47993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGTTCTTTCCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141942	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_141600_141900
797807	contig_15744_pilon	+	662	5	Intergenic	novelGene_83599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	45	434	149562	153362	FALSE	5	CAGTTGTGTCTGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKVGWQACGLWESERRHENCGSHGALWVQERQDQQEDHHC	149517	153590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152617_153245
797808	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_3011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
797809	contig_7157_pilon	+	2034	2	Intergenic	novelGene_131268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	0	62	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTATGCTTCTCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89516	93099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_91295_92843
797810	contig_6589_pilon	+	1565	7	Intergenic	novelGene_26244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	998	1372	2229214	2230830	FALSE	15	ACTCATGGCCGTCTGCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAGASPGGLHKRSLSSSAQGPSWQGDRAAERRQLTCSCRWSHMPVSGFRYKPACVATKTLEWDPQLLHHSLHFGLELLCWQLPTPDAHLVGEDHQPLGFQLTELPRNLGVQNPRTGGEAARVT	2227804	2231023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2227988_2228062_2228125_2228212_2228484_2228732_2229298_2230148_2230246_2230524_2230633_2230744
797812	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
797814	contig_6710_pilon	-	183	2	Intergenic	novelGene_98335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCAGAACAGCTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657825	653730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
797815	contig_13904_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_165487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTCACTGCCCCGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72714	72424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_72400_72700
797816	contig_13904_pilon	-	1380	6	Intergenic	novelGene_165480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	173.821747776278	76	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTCTAGATCAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71441	58995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_59524_61361_61392_63518_63578_67280_67363_68747_68831_70843
797819	contig_6946_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_59754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCACCAGTCACTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95595	93788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_93800_95600
797821	contig_15970_pilon	-	635	2	Intergenic	novelGene_144065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTCTATTTTAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221134	220408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_220920_221010
797822	contig_13806_pilon	+	2083	8	Intergenic	novelGene_173654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	66.0831263775915	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	364	1185	105222	117985	FALSE	20	AGCTTTTGTATTGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGGPFAEEKVEDVKALVKIVPVFLALIPYWTVYFQMQTTYVLQSLHLKIPAISSITTTPHTFPAAWLTMFDAVLILLLIPLKDKLVDPVLKRNGLLPSSLKRIAVGMFFVMCSAFAAGILESKRLDLVKEKTINQTIGNVVYYAADLPIWWQLPQYVLIGISEIFASIAGLEFAYSAAPKSMQSAIMGLFFFFSGIGSFVGSGLLALVSVKAIGWMSSHADIGNINSCYLNYYFFLLAAVQGATLVLFLIVSVKYDRQRSRANGVPTGGRA	93254	118883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_93322_99845_100142_105221_105333_105797_105876_106344_106514_113910_114067_115124_115284_117836
797824	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
797826	contig_7840_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_68952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1011	1319	85777	86085	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTELITVPVDPISINSPSFWARTLKSFWTTSSSSHNQLITKFHCFDIHFLRSLTWKQEGFLHWQKYSCMGEGGMSLGSAGASCWDLSKTLPDVSLHLYPF	84766	86112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_84800_86100
797832	contig_7521_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_160563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGAATTTCACAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363103	362542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_362500_363100
797833	contig_8354_pilon	-	1978	7	Intergenic	novelGene_24120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_3	56.9727030154695	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	114	1025	327570	312395	FALSE	70	AATGAAAAAAAAATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATDWAAHPGASSGGGASGPGADRYTALPGRRASAGAAMITSAAGIISLLDEEEPQLKEFALHKLNAVVNDFWAEISESVDKIEVLYEDEGFRSRQFAALVASKVFYHLGAFEESLNYALGAGDLFNVNDNSEYVETIIAKCIDHYTKQCVENADLPEGEKKPIDQRLEGIVNKMFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQCLIFLDDPQAVSDILEKLVKEDNLLMAYQICFDLYESASQQFLSSVIQNLRTVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEKERYDYFFLHQN	327683	311441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_312653_315101_315246_317291_317498_320772_320943_321129_321204_322339_322384_327554
797835	scaffold_12510_pilon	-	540	6	Intergenic	novelGene_151353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	971.788989441638	1861	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	63	386	148136	145892	TRUE	25	CATTTTTCTTAAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPSWSLWRPAGNRTSKPTNMSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVCESY	149120	145628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_145810_145907_146287_146433_147758_147912_148125_148171_149092
797837	contig_16635_pilon	+	1630	5	Intergenic	novelGene_153144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_3	146.408674606391	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	171	623	86080	94700	FALSE	75	GTTATAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGAVAAKVRRHDMRVHPYQRVVTADRAATGN	53055	95707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_87773_90607_90683_94683
797838	contig_11677_pilon	+	1268	4	Intergenic	novelGene_85964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	72.6100697026399	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	289	522	651345	654304	TRUE	15	CTGTGTTGTCATTTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHFLLSSPTRLSAFVREGESWQKRFRKTAVTEFREPSEGIGSNQSQPFPQATLAKGTIKPRTRPSSLPPLRCSAAASGSGEGAGFSSKIRTAYPVRMAVVPLLLFGGLWGAVGASDLAVVTCGSVVKLLNTRHNVRLHSHDVRYGSGSGQQSVTGVTSCVRGELPSNVANPSG	651056	660886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_651496_654172_654208_654256_654370_660205
797842	contig_500_pilon	-	938	6	Intergenic	novelGene_31088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	302.89047525467	992	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	118	513	1510494	1500493	FALSE	10	TGCTTGCCTCACGATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGCGGSWWALGRAERVVPEEFPVPVSVRGAASAAAGAAMPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRREREEIEKQKAKERCRRAFHM	1510611	1500067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500518_1502118_1502152_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
797843	contig_6159_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_128262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCATCTCTGCTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286306	287028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_286300_287000
797846	SIRV4	-	365	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	0	1156	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797847	contig_7045_pilon	+	445	5	Intergenic	novelGene_77418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.03112887414927	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCATCTAGAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146445	183905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_146529_155826_155959_177494_177529_183569_183719_183858
797848	contig_7045_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_77426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTCCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195362	196414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_195400_196400
797849	contig_9527_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_134062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	49.5378643060033	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTAATAAATTAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484524	488343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486513_486625_487515_487647_487748
797850	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
797851	contig_7457_pilon	-	837	6	Intergenic	novelGene_31285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3947.37733691625	28478	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATGCCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173039	157841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160585_160767_161010_161186_172930
797852	contig_7744_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_62466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	369	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGAGGTAGACGACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436447	437618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_436696_437310
797854	contig_9482_pilon	+	1221	8	Intergenic	novelGene_44231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	87.0793679727329	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	122	985	226224	235868	FALSE	10	CGTGCTTTCTCTTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPGISETAMIFAGVDVTKEPIPVLPTVHYNMGGIPTNYRGQVLKHVNGQDQVVPGLYACGEAACASVHGANRLGANSLLDLVVFGRACALSIGESCKPGDKVPPIKPNAGEESVMNLDKLRFADGSIRTSELRLNMQKSMQSHAAVFRVGSVLQEGCEKITQLYRDLQHLKTFDRGMVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKVRIDEYDYSKPIQGQQKKPFTEHWRKHTLSYVDVKTGKVTLEYRPVIDRTLNEADCATVPPAIRSY	223735	236104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_223789_226155_226353_226946_227119_230423_230543_232975_233088_233345_233477_234032_234147_235781
797857	contig_2770_pilon	-	492	3	Intergenic	novelGene_107501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	117	356	834956	831505	TRUE	40	GCCCGTGCAAAAGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYVPSVERLVLPVCRVWFLICSEGFSCHSLNVLQPNTPMASISSSIIFMTWLLRLLFTDASRRSVPFSITIWLRCAATRLPMLSLGFLVVLMFPFFLFLFLLLSACLFEFSVTVTFI	835072	830371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_830488_831484_831709_834920
797859	SIRV6	+	315	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	379	127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAATTTAAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3180_10741_10819_11031
797862	contig_5916_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_158055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467521	467761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_467500_467800
797864	contig_5815_pilon	+	2367	7	Intergenic	novelGene_141220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	8.11719710792395	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	125	1237	1016842	1033401	FALSE	15	TTTCCTCTGGAGATAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSALQSGIPQFSTQFSMFQTIKDQLEQRTRILQANIRWQQEELHKIQEQLCLVQDSNIQMFLQQPAVSLSFGSAPRPEAQQQLQQRSAGVSQPQLVSSPQLTGQIASAQITNQHLLREPSVTANQGPKPIRSSQTLQGSGHSVTSLSPQFSNAAAVLSPALNLTTPASATQDTSQCQPSPDFSHDRQLRLLLSQPIQPMMPGSCDARQSSEVGRPSRQVKYPPGQAVFQNPDMHTSRSSASTPVLLMGQAVLHPSFSASQPSPLQPVQAQQQLPPQHYIQVQTPTSLQSEQPDTLLLPTYSHQQGAIGYPPTAPTAAPSPSAKGQQSVGVVRRPAATTVAPWPVGRVPISCNQWTRRVATGAGERSLN	1016717	1034531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1016878_1017421_1017569_1023697_1023896_1026163_1026355_1026949_1027043_1030200_1030382_1033134
797865	contig_7594_pilon	-	2365	10	Intergenic	novelGene_55398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	121.313897507231	76	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	10	2205	397200	374973	TRUE	60	GCTAAAAATAAAAATAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLNQPLRALQGPLFPPKDLVEEDIDCLKEDVEEDEDPVFVDAEELCSGGVKAGCLPGRLPVLIYDEDTKEKCEVFGRFPLTDPWWRVKVQVKPVGRRYHTQGFPSYFLQSDMSPPNQEHICSLFLKECRVSDEFITQFSEWVNRVSSYKYLNFGNITEALRTFQKESEKRNKKKPTQNEQEESVPDREISLPLENTILLPRHFKQLINSDSTMLLEAIEEILGTCPWILGFSKITYRELKLLQCEASWTAFCQCKSLLQLMSDLEKNALIIYSKLKQICREHGHTCIEEAELTSKLSDRMSFDDAWQSLKFLKDSGVVTYEKGCVFPYDLYQAERDIASSICHLMMRPPWDLHVDVKKVLASLQARKPENSECADVLNESKLDETRLENSVHILDTQDNSDHDGENELNAEISEVQLDRDQVTALEMICANAVTVISGKGGCGKTTIVSHLFKHIEQLEEREVKKACEDFEQDQDVSEEWVTFTEQSQLEAGKAIEVLLTAPTGKAAGLLRQKTGLHAYTLCQVNYSFYLWEKNKMMKDKPWKFSSIRVLVVDEGSLVSVRIFKSVLNLLCEHSKLSKLIVLGDIRQLPSIEPGNLLKDLFETLKSRNCAVELKTNHRAESQLIVDNATRIARRQFPKFDAELNISDNLTLPISIQDKTFIFVRLPEDDTGSQLSKSNHHPHLYSVVGTLLKEEDLKDEKTSQFIAFRRQDCDLINHCCSKHYTGRLNK	397209	372658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_372819_374972_375037_375398_375481_378389_378545_381779_381922_383014_383193_386858_387729_388187_388298_391785_392194_397013
797866	contig_17108_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_109551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCCCATCCACTCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415223	416990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_415200_417000
797868	contig_2214_pilon	-	1711	4	Intergenic	novelGene_144272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.35412613473634	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	147	665	471164	462206	FALSE	45	CAGTCTAAATAAAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNGKTCQDVDECLEQNVRCGPNRMCFNMRGSYQCIDTPCPRNYQRDPVSGFCFKNCPPNDLECALSPYALEYKLVSLPFGIAANQDLIRLVVYTQDGVMHPRTTFLMVDEEQTVPFALRDENLKGVVYTTRPLREPQTYRMRVRALSYSANGTIEYQTTFIVYIAVSAYPY	471639	461159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_462573_464102_464230_471139_471260_471588
797869	contig_12583_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_175077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACACTTTATGTAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4840	4188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_-_4200_4800
797872	contig_9921_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_23730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACCATCCTCACAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147847	147128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_147100_147800
797877	contig_10734_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_51340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCATCCCAAGTTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673473	1672373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1672400_1673500
797878	contig_10734_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_51335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAAAAAAAAGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620076	1619785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1619800_1620100
797880	contig_6506_pilon	-	2111	2	Intergenic	novelGene_153476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	112	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTATAACTACCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38471	20013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_22055_38401
797882	contig_13699_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_158328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATCTTTCTCCCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79601	78640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_78600_79600
797883	contig_9297_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_69821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCCAGCTTCAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438422	436050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_436000_438400
797884	contig_1275_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_108801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGCTATTTATCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541819	542547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_541800_542500
797885	SIRV6	+	395	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	9	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797888	contig_7933_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_164702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCACCTCTTTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195370	197138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_195400_197100
797889	contig_8866_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_77795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAGAAGCCCTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396051	396508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_396100_396500
797891	contig_7009_pilon	+	1138	6	Intergenic	novelGene_23608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_1	448.270721774242	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	237	836	444955	523012	FALSE	90	AAGAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCPRLGAAPRAAATVATTPQSRRSGPKPGRDARPRRGGRGERTRQDRGIPSSKVTLHTRGSVLAPRVRRRNPHTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGKS	430715	523314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430938_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991_518118_522866
797896	contig_709_pilon	+	1340	9	Intergenic	novelGene_57533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_4	55.6366560821191	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	719	1033	1523149	1526933	FALSE	15	TGTGCACGACTGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1498409	1527240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1498617_1506113_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511859_1512018_1515791_1515867_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795
797898	contig_4469_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_21886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260991	259952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_260000_261000
797906	contig_4678_pilon	-	1571	4	Intergenic	novelGene_126065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	10.0332779621949	149	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	776	1198	584959	583473	TRUE	20	ACAGAGTTAGTGTGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCVEAGEGSRESRPGPGWAGNPKAEKEKGSSWRNWSGEAKSRPPEQESVQPPGPARPQSLPQGKGRSRRSRNKQEKSASSLDDVFLPKDMDGVEMDETDREVEYFKRFCLDSAKQTRQKVAVNWTNFSLKKTTPSTAQ	585734	581167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_581540_583471_583570_584482_584559_584709
797908	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
797910	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	3	1163	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
797911	contig_12299_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_29744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATATGCTGTATATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272470	270857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_270900_272500
797912	contig_17440_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_7630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAGAATTTGATGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3400_4000
797914	contig_3975_pilon	-	1998	7	Intergenic	novelGene_54771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	236	580	1975875	1973618	TRUE	65	TAAAAAAAAAACCCACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPCLSLSFRCWRVWTSRCLSSAQTPVSLWAPPPSESLLWLEACVLGYWRGQEGLGVWGELGAEVQSRPYPQAGPVPPKMPLAAFGTGPWAAQVPQVRWQGWQSVSRGRCFHCSLMESPLLESQLGSLDSLHRGSGVQLFLQATWKFWSRGPLLLLEMWVKRPQAPLSSSSQPGSSEMLCSARCFRASLRACS	1983172	1967001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1968182_1970742_1970799_1972853_1972970_1973384_1973451_1973617_1973700_1975612_1976093_1983154
797915	contig_15752_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_148799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437898	438867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_437900_438900
797918	SIRV6	+	326	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	26	-244	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
797919	contig_6825_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_155117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTAATATATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23474	22479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_22500_23500
797920	contig_15063_pilon	+	1243	4	Intergenic	novelGene_14325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	2	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	283	1104	35271	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34876	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
797921	scaffold_13505_pilon	-	1054	5	Intergenic	novelGene_111452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	321.267411979491	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	23	409	535595	532432	TRUE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYHTPSHRATPQTLPGHGGGHQEPHHHS	535617	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532511_532769_532999_535516
797922	contig_16666_pilon	+	1553	9	Intergenic	novelGene_61813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	27.3995323865208	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	32	1327	266837	277669	FALSE	35	GCTGCCTAGGAGAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGSSVERLAGGAEGFHLHGVQENSPAQQAGLEPYFDFIITIGHSRLNKENDTLKALLKANVEKPVKLEVFNMKTMKVREVVVVPSNMWGGQGLLGASVRFCSFHRASEQVWHVLDVEPSSPAALAGLRPYTDYVVGSDQILQESEDFFTLIESHEGKPLKLMVYNSELDFCREVTVTPNAAWGGEGSLGCGIGYGYLHRIPTQSPSRHKKPPGSLPPGPKPQDPPGPPAPPGPERGSSQGDYMEALLQAPGSSLEAQLPTPASPSQGAPDLEGPPRSMETPLQPPPPLQRVMDPGFLDASGISLLDSSSASLWPGRPSPTGLTSTTTSVSGPEDVCSSSGSQERGGEATWSGSEFEDSFLDGPGGQAQLDHLPRLSLPDSLTSAASPEDGLSAELLEAQAEEELASTENPDFGMETEGAASQAQISAPE	266805	277895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_266900_270495_270577_271032_271237_274750_274838_274971_275103_275329_275502_276313_276465_276896_277050_277415
797923	contig_4845_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_53658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCGCCCGGCTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491368	492460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_491400_492500
797925	contig_7870_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_108895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACCAAAACAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150193	150941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_150200_150900
797927	contig_14563_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_135044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118946	120550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_118900_120600
797929	contig_18869_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_56480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCCAGCTAGAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271550	270685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_270700_271600
797931	SIRV2	-	248	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4625	34	3450	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
797932	contig_5145_pilon	-	1992	3	Intergenic	novelGene_131360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	7.5	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	28	1566	243237	239924	FALSE	25	AATTTGGTTTAAGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQRKLYREVMMETFRNLALVVSQNLNNGEKLSTEHIIVRFMKNDSWSSMLGEISESHGSKDRHKNQRRHLRSHTVKNLCETNKGNQCGKTFSHIPNLTVLKRNPPEVHRFECCECGKDFMDHSSHSQPTISHNRSSTCQCKKCGEACNCPTHPTSSMRTLTGRKLKKCKVCGKDVICILALKNSVTTLTSDKCYECNECGKNFFSFSCFWTHMRGHRSECKECCKTCDLPSSLILHKIFYNRDMLYKCKECGKTFSDASSFSRHRRTHSAEKPYECKECGKTFSLALYLNRHRRTHSGEKPYECKKCGKAFSQTSCLTRHKRTHSGKKPYECKECGKTFSQTSGLAGHKRTHSGEKPYECKQCGKAFSQTSCLTRHERTHSGVKPYECKECGKTFSCSSVLTHHIRSHSGERPYECKECGKAFSCSSHLTAHTRTHSGERPYECRECGKAFSSSSNLTQHIRTHSGERPYECKECGKTFSESSSRNRHIRTHSGERPYKCKECGKAFCRSSHLTRHTGTHI	243264	239497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_241278_241842_241994_243203
797934	contig_18544_pilon	-	1492	10	Intergenic	novelGene_152749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	528.209133666665	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	40	1284	64864	44790	FALSE	25	TAAAGCCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNDACLSIVHSLMCHRQGGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSLITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAGRKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVKYCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGIDLSGLTLQSNAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKK	64903	44581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_44796_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025_58239_62799_62830_63285_63461_64684
797935	contig_3155_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_26328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTTTCCTGGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53834	52348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_52300_53800
797936	contig_6929_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_139398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAATCACTGCCACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119147	119485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_119100_119500
797940	contig_7391_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_112146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCACCTGGTGGCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330030	328782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_328800_330000
797943	contig_19469_pilon	-	1430	4	Intergenic	novelGene_135007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	23.6971634495683	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTCATAGCATGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378509	349399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_350541_350667_350776_361256_361321_378392
797944	contig_7286_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_108666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	526	1086	228816	229376	NA	25	TGCAAATTTCTTCTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTVVKMLKVPLPTSPYLLEHPAEHYGMLTGHTVVKMLKVPLPTWPHLLEHPAEHYGMLTGHTVVKMLKVPLPTWPHLLEHPAEHYGMLTGHTVVKMLKVPLPTWPHLLEHPAEHYGMLTGHTVVKMLKVPLPTWPHLLEHPAEHYGMLTGHTVVKMLKVPLPTWPHLLEHPAEHYGMLTNHQLFQ	228290	229607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_228300_229600
797946	contig_10706_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_175159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAACAGTGGTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8158	6459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10706_pilon_-_6500_8200
797948	contig_8570_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_120165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382787	381141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_381100_382800
797950	contig_17522_pilon	-	1451	2	Intergenic	novelGene_160817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCAGTTGTCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96541	93685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_94332_95736
797957	contig_11081_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_167074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACTCACTGGAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27986	26197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_26200_28000
797961	contig_12250_pilon	+	841	5	Intergenic	novelGene_80591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	826.253895603524	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322739	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_323177_323438_328400_328449_328603_328687_332096
797964	contig_7963_pilon	-	1033	5	Intergenic	novelGene_58327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	3	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	31	327	48841	43622	TRUE	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48871	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39283_39405_39949_40227_43546_43819_48741
797967	contig_5935_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_102746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308603	1306727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1306700_1308600
797973	SIRV4	-	207	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1313	1	1313	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3845	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
797974	contig_17768_pilon	-	954	7	Intergenic	novelGene_140387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAACAAAACAAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78802	21798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_21901_39949_40050_40786_40884_58290_58336_60533_60610_66601_66627_78293
797975	contig_14855_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_146014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCGCAAACTTACTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433228	431549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_431500_433200
797977	SIRV2	-	485	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	34	3213	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
797978	contig_11629_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_161195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTGTGCAGGGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236163	234375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_234400_236200
797979	contig_753_pilon	-	2171	7	Intergenic	novelGene_112973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	173.650671048388	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	49	858	1199692	1188184	TRUE	55	TCAAGCAAGAAAAGAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGEGSSSSVSSEKLSTDKRSSEDHRKDSKCRIIFHYGPFQGTARGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGYEYVIC	1202755	1185768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1185851_1186952_1188410_1192755_1192870_1192996_1193123_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716
797987	contig_5317_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_76605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702800	703191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_702800_703200
797988	contig_12837_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_57352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1290	1727	242706	243143	NA	15	CATGGCTCCCTGCAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKICRKSQNAISQVNAVYTVYSPLFHFCFNTSCACSISFSDLPHLELGLTLQVNEHICPDCQICPKTSNASHNTLTSDLLATNWGFSYYFFRVPDLSLKVTRTPFTSDLLATNLGVPSTSSGYQHKHRGSPAPCWLPLLLWVE	241416	243668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_241400_243700
797989	contig_5649_pilon	+	1629	4	Intergenic	novelGene_82480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGATGAAAAGTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660251	1669104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1661510_1662921_1663058_1667371_1667511_1669008
797990	contig_13112_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_98828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGCTGGCAAGGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236570	239309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_236600_239300
797992	contig_19352_pilon	-	780	5	Intergenic	novelGene_122377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	534.215955864293	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	210	548	122805	107513	FALSE	15	TTATATGTGGTCCTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLY	123014	107280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_107522_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
797993	contig_5988_pilon	-	1538	2	Intergenic	novelGene_16122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	19	900	1305590	1301464	FALSE	10	TTCCCTGTGAGTCTGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVELKLMAAPRKQTTGGVEEAAAEEEPRILEPGAAPFGNFPQYSRFHPPEQRLRLLPAELLRQLFPPESPDTRPILGLDVGCNSGELSVALYKHFLSLHDGETCSDVSRELRLLCCDIDPVLVERAEKECPFPDALTFITLDFMNQRTRKVLLSSFLSQFGRSIFDIGFCMSVTMWIHLNHGDRGLWEFLAHLCSLCRYLLVEPQPWKCYRAAARRLRKLGLHNFDHFHSLAIRGDMANQIVQILTQDHGMELVCCFGNTSWDRSLLLFRAKQTIETHLIPESLMEEGKERNRLRFWRQ	1305608	1300825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1302109_1305353
797994	contig_6589_pilon	+	1248	8	Intergenic	novelGene_26012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	855.401779330411	3	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	123	653	1725483	1729133	TRUE	40	AAAATAGCTTTATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRAALLRLEFSAGLAPGPQPERQRVGGVPRALLLLQLVVDQRLRNLR	1725360	1731817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728251_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
797995	SIRV6	+	356	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	517	0	351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
797996	contig_7870_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_108954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTAAACCAGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320931	319516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_319500_320900
797997	SIRV4	-	345	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1178	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3980	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
798000	SIRV6	+	655	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	114	14	114	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10351	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798002	contig_5479_pilon	-	2220	1	Intergenic	novelGene_133594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCAAACTCCACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275430	273210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_273200_275400
798003	SIRV6	+	414	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	270	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
798004	contig_8942_pilon	+	2068	5	Intergenic	novelGene_143211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	9.36416040016402	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	15	557	647532	681466	FALSE	20	AATGAAGTCTGTCTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEVMAAQQGMRNSALRVLEEALGMGLTAAADTAEAVAAEGAYYLEQVTVTEASEDDYDYEEIPDDNFCIPEGEEDLAKAIQIVQEQATDTYILEQKTVLPPKHAVPEVIEDFLCNFLIKMGMTRTLDCFQSEWYELIQKGIIELRDAENVPDVYTQNMFLENENKNLKKELKQHKQAAEYVIF	647517	682977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_647659_667950_667998_669236_669333_674753_674873_681312
798007	contig_12919_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_75920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATATGTCTCTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844435	844634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_844400_844600
798008	contig_6975_pilon	-	1350	10	Intergenic	novelGene_74266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	471.155422444405	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	684	1130	162046	159453	FALSE	20	CCACTGATGTTGATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLPFRATENDIANFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169966	159232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159685_159773_159846_159943_160732_160869_162001_162101_162461_162549_163060_163195_163709_163849_164407_164538_169827
798009	contig_10140_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_148412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235759	238080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_235800_238100
798011	contig_14676_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_175162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATATGAAGACGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42698	41756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14676_pilon_-_41800_42700
798012	contig_12119_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_88671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCCAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335073	333304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_333300_335100
798015	contig_1406_pilon	-	1295	3	Intergenic	novelGene_25511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	5	53	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	115	525	1522222	1511136	FALSE	5	CTTTGGGGTTGTTTGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLHSNSLSPSGLADRTGKKDAPCMVESWHCHQKSRMLGPLEESPGCSSLSVEVKAWCLGSSAICLASINPQDHPLSEKPTNISQKAWKGTSPGRFLADLHHWPILDDGNHNGRFCHCPLSPVIIPVELKSPLHGP	1522336	1510365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1511313_1520897_1521073_1522163
798020	contig_7452_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_109160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	40	321	185962	186243	NA	75	GAAAAAAAAAAAGAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGDGRGQSCSDFMLGSGEWCRTPEGDQAAPGHWAWPGKRAGLLSRHTLVHGGIQGILRPTATLAIPQVLWSPPSGTTPRTAEVLEHSRQNARRWKNCQVRIHWKK	185922	188086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_185900_188100
798021	contig_12102_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_151058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72866	70689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_70700_72900
798022	SIRV1	-	408	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	2935	109	2661	-109	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7705	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6814_7552
798026	contig_14357_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_121690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGCCATCCTCACAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593846	594387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_593800_594400
798029	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	3	1152	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
798032	contig_1337_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_84230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTTCTAATATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127594	129224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_127600_129200
798033	contig_15456_pilon	-	2211	2	Intergenic	novelGene_139492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101295	96825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_97389_99647
798034	contig_1379_pilon	+	1716	5	Intergenic	novelGene_134575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.2016724367238	138	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	8	790	362564	396207	TRUE	25	TATCAAATGTCTCACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQQAPSSRVFVELVPWADRGQENSLVSGRETLPGIRRPLSSAQSQTTTREVHVSGTAEVSADPDRAQVAVRVSSTKAAAAEAKKSVYRRLDYITQSLQQQGLQAENVTVTKDFRRVENAYHMEAEVCITFTEFVKMQNICNFLVEKLDRSVVISPPQFYHTPGSVENLRRKACLVAVENAWRKAQEVCNLVGQTIGKPLLIKEEETKEWEGQIDDHQSSRLSSSLTVHQKIKSATLHAVSKVFITFEVKGKEKKKKHL	362556	402969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_362879_384109_384176_395706_395838_395936_396715_402550
798035	contig_3601_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_132955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGTCTTTTAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464142	462756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_462800_464100
798036	contig_8248_pilon	-	2486	17	Intergenic	novelGene_125018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	33.1171570903965	1	68	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	483	2327	153334	89305	FALSE	30	GGGACAGAGGATTGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWILKFPAEFNLDLGLIRITEEFREVASQLGYEKHISLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWMEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTMPNKPVVPLEWISGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARVPSLGSGQGSLPGSPSLPPVQDEVFEFPGVAAGHQDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVQAGVDVVDRGTEFEFDQDGADMSEAREDGEDG	201970	89145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_89314_94922_95288_95606_95733_98038_98076_103765_103914_117512_117629_129590_129705_136163_136242_146568_146845_148727_148845_149217_149392_151124_151273_152671_152804_153329_153398_157653_157739_158735_158934_201834
798040	contig_9771_pilon	-	2200	2	Intergenic	novelGene_156919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTTCTATAGAACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336208	332110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728
798042	contig_2438_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_112005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCCAAAAGCAGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304683	303675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_303700_304700
798043	contig_378_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_175168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAAACATTTGCTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238837	239158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_378_pilon_+_238800_239200
798044	contig_5389_pilon	+	1851	5	Intergenic	novelGene_143008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	18.3507493035026	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	176	784	255025	261970	FALSE	35	GGGGCTTAATAAAGAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDRPLLAVQEALQKCFPVVEEQQGLWRSTLSDCQPLLASLSNLAEQLQAAQNVRFEDVRSLRAFPDLKERLRRKQLSAGDIVLDKLGERLASLLKVRDTVSSHVEQVFQVYEQHANTVDIDAVLQPSVVSPSLADMLEWLQDIERHYRNSYLKRKYLLSSIHWGDLANIQALPKAWDQISEDEQDLVQDILLNVSFFLEA	254665	263037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_254838_255021_255300_259067_259248_261640_261757_261932
798045	contig_16525_pilon	+	1025	2	Intergenic	novelGene_133822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACGTCTGGACTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156816	159334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156994_158486
798047	contig_14341_pilon	-	996	5	Intergenic	novelGene_111882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_1	270.808396287855	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	71	511	729247	727747	TRUE	20	TGTGATGACTGCCCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRIPVPAPASHLTQARQRAPTTMDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQVCLSPSPFLPQLTPKPRMSHPGCSGLEGRV	730591	727005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_728020_729079_729290_730563
798050	scaffold_4438_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_174542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCTGAGCTTTGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406992	405297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_405300_407000
798051	contig_2940_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_81972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077023	1078098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1077000_1078100
798058	SIRV5	+	547	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
798060	contig_12689_pilon	-	1920	4	Intergenic	novelGene_145054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	55.1603722491669	73	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1386	1781	267153	266204	FALSE	30	ATATAAGCTTGAGCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHFLQQELRAVQREISEWRDAMPDWYHHCQVIMKSCTGINYEEFYHFLKVIAEKRLLTLANGTGTGTAGSVDDTRLGAQQAAFDVSRITEVLASLIANPDFQRVDTSTFSLQPEELLQQLEEAVTATASL	271538	266064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_266507_267060_268347_268822_268949_271472
798062	SIRV2	-	229	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	697	22	697	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4035	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
798063	contig_6272_pilon	-	2026	3	Intergenic	novelGene_160449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161193	153690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_153925_154949_155930_160381
798068	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	116	-6	34	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798069	SIRV2	-	267	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	659	22	659	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4073	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
798070	contig_6445_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_77084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTTTGGACTGTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761866	760408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_760400_761900
798073	contig_1008_pilon	+	1407	5	Intergenic	novelGene_121595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	177.793946747351	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	58	321	750514	750777	TRUE	25	GCAACTGTGCTGGAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRHLSVELKSFGALAPAGQMRAGRPKGTRKQKLKRQGTQEAEQPQSQKVGPPPLEFLRVESPLRWTRRMGPPKFEGRVAVPVGLKGRAEAQDQGASTQNPESVANT	750456	775549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_768733_768862_771065_771135_775119
798074	contig_15689_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_164154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTTTTTTCTTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139907	139279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_139300_139900
798075	contig_10600_pilon	+	437	2	Intergenic	novelGene_169869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTCAGAATTGACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163687	169960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_163817_169652
798076	contig_10600_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_169870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGTATTCTGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170160	171205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_170200_171200
798077	SIRV6	+	239	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	51	493	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798079	contig_7157_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_131270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTGGATTAAATTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617978	615865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_615900_618000
798080	contig_7272_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_25429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971831	972281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_971800_972300
798081	contig_7138_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_120991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTGAAAAAATAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207085	205774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_205800_207100
798082	contig_10451_pilon	+	1531	2	Intergenic	novelGene_138307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	78	junction_1	0	13	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTGCCCTAAATGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140414	145921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_140520_144495
798089	contig_9177_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_32831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAATTGAGAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782751	1781507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1781500_1782800
798091	contig_11259_pilon	+	2082	8	Intergenic	novelGene_144543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTGGCTTTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175892	234074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_176467_179970_180071_206383_206528_207456_207606_213355_213478_221297_221503_223923_224027_233389
798092	contig_2892_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_119039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAAAAAAATCCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333370	331395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_331400_333400
798094	contig_753_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_112949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAATAAAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824298	822140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_822100_824300
798097	contig_4402_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_140824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAATCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447731	447316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_447300_447700
798103	contig_5019_pilon	+	1719	1	Intergenic	novelGene_109205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCCCAGTGCAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181562	183281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_181600_183300
798107	contig_11594_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_80942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAACCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572069	571187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_571200_572100
798108	contig_21343_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_170232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCAGTACAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39306	37526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21343_pilon_-_37500_39300
798109	contig_15182_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_136430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGTAAGCTGTCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8135	9136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_8100_9100
798115	contig_9982_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_55768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342779	344347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_342800_344300
798116	contig_10082_pilon	+	983	4	Intergenic	novelGene_63917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	332.367601041711	222	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	262	771	580253	584895	FALSE	5	TTCTGTGCGATGGCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	575285	585107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_575518_580223_580435_583586_583726_584706
798117	contig_6710_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_97934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
798120	contig_10296_pilon	+	2567	20	Intergenic	novelGene_168879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.98660129137168	34	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	21	1712	795268	824431	FALSE	35	TTTTTCCATGAAAATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NITHGFMNFSDIPELIGPPGPRGPKGDTGIPGFPGLKGEQGEKGEPGTILTGDIPVERLRGRKGEPGVHGTPGPMGPKGPPGRKGEFGFPGRPGRPGLNGLKGAKGDRGVMMPGPPGLPGPPGPPGPPGAVINIKGAIFPIPARPHCKMPVGTTHPGNSELITFHGVKGEKGSWGLPGSKGEKGDQGAQGPPGPPVDPTYLRHFLNSLKGENGDRGFKGEKGDSNGNFFVPGPPGLPGSPGLVGQKGEMIIGPQGPPGAPGLPGPPGFGRPGTPGPPGPPGPPGPPAILGAAVPLPGPPGPPGQPGLPGSRNLVTAFSNMDDMLQKAHLVIEGTFIYLRDSTEFFIRVREGWKKLQLGELIPIPADSPPPPALSSNPRQHQPQPPLTPILSANYEKPALHLVALNTPFSGYIRADLQCFQQARAAGLLSTYRAFLSSHLQDLSTIVRKAERYSLPIVNLRGQVLFNNWDSIFSGHGGQFNTRVPIYSFDGRDVMTDPSWPQKIIWHGSNVHGVRLVDNYCEAWRTEDMAVTGFASPLSTGKILDQKAYSCASRLIVLCIENSFMTDARK	795247	825286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_795307_799389_799453_802021_802091_802199_802236_803089_803144_803231_803292_804714_804784_804915_804958_807461_807508_809777_809859_810536_810587_810698_810801_812699_812845_816398_816464_818064_818194_818313_818374_819079_819146_821194_821381_822886_823003_824217
798121	contig_7894_pilon	+	2183	1	Intergenic	novelGene_170795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGAATCCTAGCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299741	301924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_299700_301900
798122	contig_3382_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_124110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGCTGTCCTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701330	698892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_698900_701300
798125	contig_9940_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_125352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	189	515	226493	226819	NA	50	TAAAGGACAAATCATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWEGLQSEQLPIHKLGDMKNDQTKNGRFLIHSHNLKGVLVLQWLKCLAANQKVSCLKLPTALREKDVAVCFHKNLRPWKSYEAVPPCPIGSLSVGINSMVVGNGDP	226304	227359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_226300_227400
798135	contig_10050_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_119614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCAAAGAAGGTAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117580	118890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_117600_118900
798139	contig_13744_pilon	+	1409	9	Intergenic	novelGene_77184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	40.6624827082656	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	29	1150	718929	736069	FALSE	70	AGGAAAAGTATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRRRTVTAMRIWSATVPAWSRWKKVKDQRNQFLFRTRPSEMKKEGISDFMEPLVGVSLLDISIQLAQKKGWTPSTFISSRQNRADKSVLGPEDFMDEEDLSEFGIAPKTIVTTDDFASKTKDRIREKARQLAAAAAPIPGATLLDDLIAPAKLSVGFELLRKMGWKEGQGVGPRVKRRPRRQKPDPGVKIYGCALPPGDSEGSEDDDDDYLPENVTFAPKDVTPVDFTPKDNVHGLAYKGLDPHQALFGTSGEHFNLFSAGLERASNLLGDVGLSKGRKLGISGQAFGVGALEEEDDDIYATETLSKYDTVLKDEEPGDGLYGWTAPKQYKSQKESEKDLRYIGKILDGFSLASKSLSSKKVRKTFFFSFNGLVFKMFAVM	718900	736328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_718977_726876_727012_728357_728445_729891_730053_730689_730788_731378_731438_731809_732053_733057_733206_735926
798140	contig_7426_pilon	-	1239	9	Intergenic	novelGene_27507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	880	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTGCCATTTTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988116	952254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_952316_952564_952794_962049_962181_970075_970160_979921_980059_980779_980899_983654_983758_985078_985201_987863
798141	SIRV2	-	611	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	41	34	41	-34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACGACGACGTCGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	3699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
798142	contig_5954_pilon	-	977	7	Intergenic	novelGene_28731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	98.874920986062	814	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	472	861	1171123	1170586	FALSE	25	AAAGGGGATGCTGGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIEQVEKQTSVADLLASFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRESKFFEHFIEGGRTVKEFCQQEVEPMCKESDHIHIIALAQALSVSIQVEYMDRGEGGTTNPHVFPEGSEPKVYLLYRPGHYDILYK	1178012	1170469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170784_1170931_1171127_1171244_1171330_1171583_1171736_1176032_1176132_1176381_1176444_1177942
798143	contig_3747_pilon	-	685	6	Intergenic	novelGene_24987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	478.899822509886	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	165	542	271128	270395	FALSE	25	TGTATTTAAAATTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEYGEIKNIHLNLDRRTGYLKGYTLVEYETYKEAQAAMEGLNGQDLMGQPISVDWCFVRGPPKSKRRGGRRRSRSPDRRRR	271622	270251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_270441_270546_270684_270796_270934_271070_271149_271284_271345_271538
798145	contig_9852_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_138481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATTGAGAGGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360997	359763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_359800_361000
798146	contig_9852_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_138480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359713	358563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_358600_359700
798147	contig_10863_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_59342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119325	121323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_119300_121300
798149	contig_9609_pilon	+	1739	11	Intergenic	novelGene_23150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	13.082813153141	219	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	281	1354	749304	757537	FALSE	20	GACCTAATGTTTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLWGQMLWALLSGPGRKGGTRGWAFSSCPPHSPLAGLVSATELVSHWTAVFEERGIPEARESSEYIVAHVLGAKTFQSLRPALRTQPLTSQQLQCVQELSSRRLQRMPVQYILGEWDFQGLNLKMAPPVFIPRPETEELVDWVLEEEAQRPCAAGTQDGPLILEVGCGSGAIALSLLSQLPQSQVIAVDKEEAAICLTRENAQRLQLQDRIRIVPLDVTLERWWTHLLPWGPMDLVVSNPPYVFHQDMEQLAPEICSYEDPVALDGGKEGMDVIIHILALAPQLLKGSGSVFLEVEPRHPGLVGSWLRSQPDLHLDLVAVRRDFCGSNGPSSLSLVRPRFLHIRRSGPQCGCPVGT	747930	757922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_748041_749133_749532_749925_750018_750274_750369_754607_754743_755056_755122_755388_755439_756056_756166_756924_757021_757194_757309_757446
798151	contig_11304_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_156706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACGAATTCCTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381584	380724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_380700_381600
798152	contig_1637_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_142389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACCCACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598983	600512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_599000_600500
798153	contig_11883_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_163781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	889	1191	123419	123117	NA	75	AAAAAAAAAGTAAATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILMCILASIGETRQARNYPDKYTVLSATESNAQCQGAVREAVVSDSVGRVSPTPRILCSFSVRIEYFSKAPFSCLRPKYIFLISPHCGSWKRRTEAFKG	124307	122125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_122100_124300
798154	contig_3975_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_54908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAGTAGAGGGCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2137727	2139764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2137700_2139800
798155	contig_10437_pilon	-	2601	9	Intergenic	novelGene_38126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	272	junction_1	130.782202057467	246	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	316	1668	143663	125797	FALSE	20	AGCTTAGATGTTAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKRLLEAARKGQDDEVRTLMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTAEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAAADGHAHIVELLVRNGADVNAKDMLKMTALHWATEHHHRDVVELLIKYGADVHAFSKFDKSALDIALEKNNAEILVILQEAMQSQVNANPERANPTTNPVTVAAPFIFTSGEVVNLASLVSSASTKTTSGDPQASRVQFSNATPSVLATLAALAETSAPLSNPHRATDSSEEMVEGNSVDSSLQQVVGSGGQRVITIVTDGVPLGSLQTAIPTGGIGQPFIVTMQDGQQVLTVPAGQVAEETVIEEEEEEVEKLPTTKKPRMGEMADSVEERKEGSERALLQQQLQEAHRRAQEYRHQLLQKEQEAERYRLRLEAMARQQPNGVDIAVVEEVAEVDAVVVTEGEVEGRGTEMTGAPETLEPHSGVSMETVSS	149013	124863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_126097_126207_126339_129326_129513_131551_131666_139214_139366_141300_141496_142008_142177_143555_143696_148730
798156	contig_9871_pilon	+	2015	10	Intergenic	novelGene_75726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_7	88.4659382034816	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	19	1446	598126	614769	FALSE	40	TACTACTTAATACAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCHSFYSKRYSRALYLGAKAIQLNSNSVQALLLKGAALRNMGRVQEAIIHFREAIRLAPCRLDCYEGLIECYLASNSIREAMVMANNVYKTLGANAQTLTLLATVCLEDPVTQEKAKTLLDKALTQRPDYIKAVVKKAELLSREQKYEDGIALLRSALANQSDCVLHRILGDFLVAVNEYQEAMDQYSIALR	598107	615338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796_610915_611455_611653_613744_613970_614614
798158	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_97346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653791	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
798160	contig_12292_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_166993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAACCCTGTAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204292	205959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_204300_206000
798164	contig_14516_pilon	-	2640	4	Intergenic	novelGene_153883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACAAGATAGTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171025	32276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_32543_36326_36417_165669_165730_168801
798165	contig_6102_pilon	-	872	8	Intergenic	novelGene_32201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1882.7988826885	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	115	762	905250	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906010
798167	contig_6031_pilon	-	2002	10	Intergenic	novelGene_56780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	94	junction_4	26.867760293889	23	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	98	1585	583421	522929	FALSE	55	AAAAAAAGAAAGTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVLQVFIINSSNIFLLEPANEIKSLLDEHTDMCKRILNIYRFMVVQVSMDKKTWEQMLLVLLRVTESVLKMPSQAFLQFQGKKNMTLASRLAGPLFQTLIVAWIKANLNVYISRELWDDLLSVLSSLTYWEELATEWSLTMETLTKVLARNLYSLDLSDLPLDKLSEQKQKKHKGKGVGHEFQKVSVDKSFSRGWSRDQPGQAPMRQRSATTTGSPGTEKARSIVRQKTVDIDDAQILPRPTRVRHFSQSEDTGNEVFGALNEEQPLPRSSSTSDILEPFTVERAKANKEDMSPKLPPLNSDIGSSSANVPDLMDEFIAERLRSGNASTMTRRGSSPGSLEIPKDLPDSLNKQSQMRPIDDPGVPSEWTSPASAGSSDLISSDSHSDSFSAFQYDGRKFENFGFGADTGIATSADVDSGSGHHQSAEEQEVASLTTLHMDSETSSLNQQAFSAEVATVTGSESASPVHSALGSRSQTPSPSTLNIDHMEQKDLQLDEKLHHSVLQTPDDLGNIWKLEICRFFHSVK	590113	522511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_523132_526428_526606_527784_528002_529587_529713_532908_533077_573917_574080_575103_575342_577095_577226_583353_583503_590097
798168	contig_9646_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_117433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTCTCAGATGTTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174035	173145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_173100_174000
798169	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
798172	contig_5586_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_143492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGTCTTCTACTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21439	20257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_20300_21400
798177	contig_15327_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_70564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCCATAAGAGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586995	588747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_587000_588700
798178	SIRV2	-	281	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4591	35	3416	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
798179	contig_15036_pilon	-	2469	1	Intergenic	novelGene_107154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140421	137952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_138000_140400
798180	SIRV6	+	242	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8465	2	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
798183	contig_10074_pilon	+	1100	9	Intergenic	novelGene_57181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGCCTGGGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559585	586281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_559726_560820_560890_560995_561091_561861_562073_562179_562283_563748_563892_577107_577200_583722_583871_586182
798184	contig_8045_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_35471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	987	1286	578170	577871	NA	35	CTCCTGACAAGTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLNSVAIGALRVGINSTAMGLGFCFFCFWHLYANRLPGLFSHTAPGGFQPPIFQLATKGLTTAPPGLLWCNSIMLCKEDHALCVLCHLNKPGMQRDA	579156	577499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_577500_579200
798185	contig_11964_pilon	-	163	1	Intergenic	novelGene_164728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254667	254504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_254500_254700
798186	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
798187	contig_13349_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_161133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCCCAGAGGAGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295134	297171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_295100_297200
798190	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
798194	contig_17796_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_33804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGTTACCTCTGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53400	55491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53400_55500
798195	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
798196	contig_3469_pilon	-	2001	1	Intergenic	novelGene_34228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTATCAAAATTCCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618762	616761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_616800_618800
798203	contig_12543_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_168378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTAATCCAGAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315985	315136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_315100_316000
798205	contig_8138_pilon	+	1463	5	Intergenic	novelGene_52465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	551.725475213897	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280142	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304983_305098_306364_307118_307638
798209	contig_11720_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_43874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAATAGGGTATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105700	106201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_105700_106200
798217	contig_17158_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_141146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTTGGTAATGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123351	121117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_121100_123400
798221	contig_2455_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_119210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345436	1343763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1343800_1345400
798222	contig_3335_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_165004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATATAATTCTCATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341221	340399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_340400_341200
798225	contig_6842_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_130722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1139	1570	498543	498112	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVMGMDHLKKKKKRSPNSLKSLKTYSSSGLVTNLAILMCTPGREVSDISHSLSGQGMRGLRCSGTKTLEFPFASGKTPPQIFPNIRCVRRRRGSGKHPNDLAVCSLHPSLGFFFFLTFCFVLNMVASAEWTLKFKNLFMED	499681	497642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_497600_499700
798226	contig_15629_pilon	-	1175	2	Intergenic	novelGene_122460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAACTGCCGAACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162627	121993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_122089_161547
798227	contig_18081_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_23811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACGATACACATAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150288	149334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_149300_150300
798229	contig_12969_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_61708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGATCTCCATTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635917	636558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_635900_636600
798234	SIRV4	+	238	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCGCCGTTTGAACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
798236	contig_6873_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_129809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113877	111930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_111900_113900
798237	contig_19145_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_164151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCACAACCCACAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229760	228380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_228400_229800
798238	contig_6740_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_142714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714625	712986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_713000_714600
798239	contig_11720_pilon	-	995	7	Intergenic	novelGene_43935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	123	476	272327	271841	TRUE	5	GCGGGAGCGCTTGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDYQVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272449	262258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_262363_262922_263061_263893_264012_264319_264368_271265_271340_271803_271964_272096
798240	contig_9332_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_60734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGTGAGAATGTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559437	558543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_558500_559400
798243	contig_18919_pilon	+	744	2	Intergenic	novelGene_156029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGGCCACCGTCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122597	125491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_122786_124935
798244	contig_11396_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_71377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCCCTGTGAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055221	1056963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1055200_1057000
798245	contig_1996_pilon	-	931	8	Intergenic	novelGene_131898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	318	740	255089	251586	TRUE	5	GACGGCCCGGCGCTCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISSRRSGWISSIARISRRSLSITVMKRRNLRQNSSMELISEPWTCRKAALYWTRSREQAAVYSLGVTQSLMYAFSRACIVFTTAKSSAMLSYLSRSRAFLYSFTSCTAPATLTSQARSRWDPMEHAGGSGGAAEISA	255580	249896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_249949_251446_251682_252336_252377_252584_252677_253943_254050_254882_254935_255052_255146_255319
798246	contig_6270_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_99855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTTGTGGCTGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650807	652013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_650800_652000
798247	contig_6270_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_99854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650584	650914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_650600_650900
798248	contig_953_pilon	-	1994	11	Intergenic	novelGene_129993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATGGGAGTCCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209852	201425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_201820_202188_202380_204813_205024_205191_205303_205519_205709_206648_206766_206880_206953_208037_208078_208163_208262_208385_208486_209380
798254	contig_6062_pilon	-	2068	9	Intergenic	novelGene_5297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	23.0702053523587	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	290	1489	791135	770133	FALSE	25	CTGTGATATGTACATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRHLMYKIKSTGPITVAEYMREVLTNPAKGYYVHHDMLGEKGDFITSPEISQIFGELLGIWLISEWMATGKSSTFQLVELGPGRGTLTGDILRVFSQLGSVLKNSDISVHLVEVSQKLSEIQAVTLIEENVPLEQNAGSLVYMKGVTKSGLPISWYRDIQDVPKGYSFYLAHEFFDVLPVHKFQKTPQGWREVFIDIDPQASDKLRFVLAPCATPAEAFIWSGETRDHVEVCPDAGVIIQELSQRIARAGGAALIADYGHDGTKTDTFRGFCGHKLHDVLIAPGTADLTADVDFSYLRRMTQGKVASLGPITQQMFLKNMGIDVRLKVLLDNSDEPSTRQQLLQGYDMLMNSKKMGERFNFFALVPHQRLPNGSHQMNARKSNPSPAPVAGFDELAWR	791424	769553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_770349_770837_771012_772256_772401_774626_774738_775433_775493_776297_776512_783038_783150_784740_784822_791045
798256	SIRV6	+	548	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	14	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798263	contig_15410_pilon	-	1606	11	Intergenic	novelGene_130591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	217.894837020063	1	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	449	1393	89172	85562	FALSE	45	ATTACTGGTAAAATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGMGWKPGEGIGRTFNQVVKPRVNSLRPKGLGLGANLTEAQALASTGPHRLPKPDEEQEKEKEDQPQGLVPGGAVVVLSGPHRGVYGKVEGLDPDNVRAMVRLAAGSRVVTVSEYCLRPVSQQEFDKNSSDLSQVSKTSSEQQNGTASSWKALWDQDLHVQQEDSERKRKNPPDREDRPAAKSEKAAPRSQHWLRRDLRVRFVDKTHEGGQYYNTKMTVEDVLSPDTCVCRTDEGQILEGLREDMLETLIPKVEGNRIMVVLGPQAGRVGRLLSRDTQQSRALVQLQRENQLVELHYDAVCQYMGPSDSDED	92395	85348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_85697_85793_85880_86394_86465_86562_86687_86891_87019_87711_87845_88121_88336_89116_89227_91215_91341_91434_91599_92290
798265	contig_6098_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_145458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAACGAGAAAAATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9180	7199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_7200_9200
798271	contig_11121_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_167058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	123	443	88916	88596	NA	25	GCGAAGGAGGCCAAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPNPSGPAAARGREVEARDLRKRGRRAAPGPGEAESCGPEPAGREENRQRRRMVAPVSGREQVESETSGEASGAGKATRRRVEGPGGLSRDHVGRSSADGVDVEA	89038	88595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_88600_89000
798272	contig_11121_pilon	-	1705	1	Intergenic	novelGene_167057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	546	1638	68	1705	87975	86338	NA	30	TTTAAAATTCCCTTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRKESLTSSESFQTVECSEFQSMAFLQSLSKEGLVEGIKRRIQTKKLKSLESVPLNITEEKATQNINVEFQDELYKNTPKYSCNSLSPGIENNSVLKLYDCNCFPYFKGCNDENNLEYKTDGGCMHVAENSSKKENLKSLAEKSDVNSIPQLLQTEENLMGVNKLLLEESDLYQSTNNGLLSCLQSEKNKYSMEESNIGKKPKKKMKLSEKRDETVTELSFCNVYNKSELVLQENEMCDEGKEAGTSETKKDPCKVLRNVNDNTRSPVDHSLSLPETVGKKTSPEHEINAKFQKTLDPLLKEETKTASEPLVCKNMEPEEHLKSVKSSIVRSPSDTSDLSDYCHIGSPSQEEFGNEAEESKLSCRRTIPMTGKRTWPCYSCARISVQCWKKTSLPGSNYLLSGSGESLSQDDFLKHPANQTHLTDSKVLLQSSITETNTESSSKEKLDSSVNCLSSVSAIEPTLMVPEESIISDDKKARSEDLSRSGPEIVSNPTEDTQLTNVTQSLTGSKKKDRGNLAKPNLTVTSQDGQEANNSTGKSIHRKACIAKQTLVVPDLVKILNTGRLTN	88042	86337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_86300_88000
798273	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	51	509	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798276	contig_4364_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	0	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTTGCAGTTGGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335778	1339038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1336051_1337503
798278	SIRV6	+	273	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	176	-244	135	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGTCTTGTAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
798279	contig_5718_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_110411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTACAAACCCAGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431483	1432381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1431500_1432400
798283	contig_17964_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_33910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGGTAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386909	384364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_384400_386900
798287	contig_11986_pilon	+	1587	13	Intergenic	novelGene_69078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	129.495468603689	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	23	1303	10419	18605	TRUE	30	AACTCTATTTATTCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYFTHTVMYYGYYSNTTLNQQCAPPLDGNQCTRGEGGLPYNMPLAYLFTMGVAFFITCITLVYSMSHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCYAVWQPWTPCMRRARCGCAAWSGQGPGSPGCPGSITTCWRTPSSSSWCRPCCSLSSTSTSRW	10396	22150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_10589_11809_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17285_17476_17620_18573_18653_21266_21335_21981
798289	contig_8980_pilon	+	1810	9	Intergenic	novelGene_74000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	6.67083203206317	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1731	79	1809	332778	349731	FALSE	15	AGGAGCGTGTGTCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCLCFPGFPVPEVSWFRDGQVISTSTLPGVQISFSDGRARLMIPAVTKANSGRYSLRATNGSGQATSTAELLVTAETAPPNFVQRLQSMTVRQGSQVCLQVKVTGIPTPVVKFYRDGAEIQSSLDFQISQEGDLYSLVIAEAYPEDSGTYSVNATNSVGRATSTAELLVQGEEVVPAKKTKTIVSTAQISETRETRIEKKIEAHFDARSIAAVEMVIDGATGQQLPHKTPPRIPTKPKSRSPTPPTIAAKAQLARQQSPSPIRHSPSPVRHVRAPTPSPVRSVSPAGRISTSPIRSVKSPLLVRKSQTPTMPTGPEVAPPWKQEGYVALSEAQMREAMMTSATQIRTEERWEGRYGIQEQVTISGAAGAAASVSAAAAFAAEAVATDAKEVKQETDKSAAVATVVAAVDMARVREPVISAVEQTAQRTAATAVHIQPAQEQIRKEAEKIAVTKVVAAADKAKEQELKLRTREEIMTKQEQIHITHEQIRKETEKAFVPKVVISTTKAKEKEMRVTGEITTKQDQKQVTQETVDVGKKAEAVATVVAAVDQARVREPREPVRLEESYAQQTTLEYGY	332699	349732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_333004_335252_335541_336019_336106_336194_336440_339188_339517_340564_340718_341834_341973_343357_343490_349596
798290	contig_8980_pilon	+	1215	7	Intergenic	novelGene_74001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1.97202659436654	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	397	1215	351818	354097	FALSE	25	AGGTATTTTGATGGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTKSVKPPTVKPAETTVRREPTPSPQFPFADAPDTYKSQAGIEVKKEVGVSITGATVREEHYEVLHAREAKVTETARVPAPVEIPVTPPTLVSGLKNVTVIEGESVTLECHISGYPSPTVTWYREDYQIESSIDFQITFQSGIARLMIREAFAEDSGRFTCSAVNEAGTVSTSCYLAVQVSEEFEKETTAVAEKFTTEEKRFVESRDVVMTDTSITEEPAGPGEPAAPFFFTKPAVQKLVEGGSVVFECQVGGNPKPHVYWKKSGVPLTTGY	349683	354097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_349891_349997_350121_351751_352034_352300_352367_353101_353361_353710_353775_353883
798291	contig_8452_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_48115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	924	1286	967461	967099	NA	70	ACAAACAAACAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSQEFYSPSHLFFHSSPVAAYLSSQTTIPLSLLSLSALSQMIFFILFYPGKTLLCLSPGDDLLLSMAWVGRVEQSPSVLVPRQPCLPSPKSQEFGPVTVLLFICHPWPEIQSCFNSKTI	968384	966219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_966200_968400
798293	contig_11292_pilon	+	1394	11	Intergenic	novelGene_109405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	412	738	163360	165366	TRUE	10	GCCACAGGCCCCGCCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYSPLLECWAGTHPAGSEATLVCAAQARASRVFPVPGGPYISTPFGGWIPKFSNFSLWFIGRTMASTSSWICLSRPPMSLYCSVGLSSTSMAFTLESYSVGRVSRIR	161762	167675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_161951_162125_162213_163018_163147_163351_163420_164660_164807_165245_165383_165645_165712_165803_165911_166354_166476_167109_167196_167415
798294	contig_19006_pilon	+	371	2	Intergenic	novelGene_145591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGTCATGTGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93710	94321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_93815_94054
798295	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
798296	contig_9727_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_86274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	138.677131996503	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	155	1030	156166	131975	FALSE	15	GTATTGTGTGATTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTTAGSLHKVVMSKNTSARLVEEIQLSPTPEPVRNLQLAPTQGAVFAGFSGGVQRVPRANCSVYESCVDCILAQDPHCAWDPESQTCRLLPSPVPSSWKQDIERGNPRWACATGPMSRSHQPTSRPQIIYYAGNDTSKEES	156435	131477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_132016_138719_138821_139099_139258_139381_139501_141241_141423_154841_154993_156041_156215_156329
798297	SIRV6	+	541	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	33	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798298	contig_5918_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_99531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTAAAAGGAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698876	696957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_697000_698900
798300	contig_5797_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_56905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	599	973	43819	44193	NA	70	ATTTGAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAILNNMVKEDHTEKVTIQERPEGSEGGKHMDTLSENMLGRGNSKYRDPEEEACLKVQPTARRPICLRGSGQEKGWREERSMRWGGVAWVMAGFCRVLHVIVRTEECYAEEHCKLVCLLKALL	43220	45367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_43200_45400
798302	contig_12119_pilon	+	1600	7	Intergenic	novelGene_88659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	385.186715185708	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	275	1333	319865	352533	FALSE	10	TGTTTTGCAGCTATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKRKSAICLITEAQRR	306502	352800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_352489
798304	contig_6958_pilon	-	1538	10	Intergenic	novelGene_69913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	566	1075	138028	129865	TRUE	5	GCTGTGATTGCGGCGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSILVHGGVPVEAVCAEVHGGLLVAGILRELHSLGEELLCLSVGHHQQGDDLLHGLLHDVSGLQVPADLLEKNPGLLQVIGGHQLPFQDRKGYLRARGEVKVSDRRQRDGRADFVSDTLKLHQLHGRDGFVSVLHDVAGVGAGLDQLVLLVKGLLCQVLPRPSLPAS	138865	89774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_89858_99712_99877_127152_127217_127877_127947_129781_129891_129975_130067_132013_132213_135016_135189_138006_138055_138326
798305	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
798308	contig_15857_pilon	+	2274	16	Intergenic	novelGene_152073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	129.708390887663	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	129	863	71533	89301	TRUE	25	GTCTGTCAGAAGTACGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEKIDISPVLLQKGSTKIALYGLGSIPDERLYRTFVNKKVTMLRPKEDENSWFNLFVIHQNRSKHGNTNFIPEQFLDDFIDLVIWGHEHECKIAPTKNEQQLFYVSQPGSSVVTSLSPGEAVKKHVGLLRIKGRKMNMQKIPLHTVRQFFTEDVVLARHPDLFNPDNPKVTQAIQSFCLEKIEEMLENAERERLGNSRQPEKPLIRLRVDYSGGFEPFSVLRFSQKFVDRVANPKDIIHFFRHREQKEKTGEEINVGKLITRPSSEGTTLRVEDLVKQYFQTAHF	70145	127029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_70221_71479_71595_77857_78044_79043_79216_80718_80800_84879_85007_87922_88019_89290_89454_94923_94987_98580_98667_98728_98792_100761_100846_106561_106621_108632_108701_115721_115798_126269
798310	contig_20739_pilon	-	1571	2	Intergenic	novelGene_83188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCCCCTTGTGATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189748	170058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_170773_188891
798311	contig_5649_pilon	-	1943	6	Intergenic	novelGene_82400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	12.6649121591901	344	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	206	697	1244898	1240327	FALSE	15	CTGTACTGACTTCTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALEEESFALSISSASDAEFDAVVGYLEDIIMDDEFQVLQRNFMDKYYQEFEDTEENKLTYTPIFNEYISLVEKYIEEQLMERIPGFNMAAFTTALQHHKDEVAGDIFDMLLTFTDFLAFKEMFLDYRAEKEGRGLDLSSGLVVTSLCKSSSMPASQNNLRH	1245103	1239080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1240429_1240920_1241018_1241219_1241306_1242536_1242644_1244107_1244170_1244860
798313	contig_6544_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_142112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAACAGATTCACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363364	364005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_363400_364000
798314	contig_6544_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_142113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGAAAAAAATCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364558	364831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_364600_364800
798315	contig_11052_pilon	+	651	3	Intergenic	novelGene_115445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	119	550	102902	107529	FALSE	5	CCTGCCCTCCTTCGAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102783	107630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
798321	contig_7004_pilon	-	1076	2	Intergenic	novelGene_126476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	60	362	398364	398062	TRUE	15	GTATAGTTCTTCGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNLGGRGLPLCTHCAVEGGSVVSTAWGPRKYGMSPSPLASFLGTVTDTVLNCSRSGIIPALEQGGYSYMLGLKAVAKQGVQRAPDNWQFLWPLVVPFG	398423	397218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_397704_397832
798323	contig_10848_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_133527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	732	1166	40685	40251	NA	40	CGATTACACAGAAACATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	41416	40099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40100_41400
798326	contig_9363_pilon	+	1388	8	Intergenic	novelGene_6833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	370.553034018625	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	83	508	1622549	1623633	TRUE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGSGGHPGGWAFGDGLQALGLGSDQFLDAGSGP	1622466	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622716_1622985_1623110_1623401_1623728_1624341_1624445_1624905_1625066_1625343_1625435_1625537
798330	SIRV6	-	158	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACGACGACAAACCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	11024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11109_11205
798332	contig_19469_pilon	+	1618	9	Intergenic	novelGene_134985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.1355906855905	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	80	1237	33262	100360	FALSE	65	TCAACAAAAACTAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAQGWDRNRRRGGGAAGGGGGGGGGGHRPPPARSGHRCVADNTNLYVFGGYNPDYDESGGPDNEDYPLFRELWRYHFATGVWHQMGTDGYMPRELASMSLVLHGNNLLVFGGTGIPFGESNGNDVHVCNVKYKRWALLSCRGKKPSRIYGQAMAIINGSLYVFGGTTGYIYSTDLHKLDLNTREWTQLKPNNLSCDLPEERYRHEIAHDGQRIYILGGGTSWTAYSLNKIHAYNLETNAWEEIATKPHEKIGFPAARRCHSCVQIKNDVFICGGYNGEVILGDIWKLNLQTFQWVKLPATMPEPVYFHCAAVTPAGCMYIHGGVVNIHENKRTGSLFKIWLVVPSLLELAWEKLLAAFPNLANLSRTQLLHLGLTQGLIERLK	33182	100741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_33344_86223_86446_87893_88049_89142_89292_96011_96097_97046_97114_97616_97665_99390_99531_100150
798341	contig_5018_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_47206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACAAGAGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599464	1597760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1597800_1599500
798345	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_95497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
798347	contig_10196_pilon	+	1072	8	Intergenic	novelGene_132156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	387.996212899675	3	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	139	786	1038364	1050210	TRUE	10	CGTAACCCCTGCCTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTVRPLALVTGQLGVSALVRGCCRERSTGSGSPQCRPPLQRSSPTTPSCE	1034571	1050791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046543_1050131_1050212_1050506
798348	contig_8464_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_125410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGTTTGCTGATGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932777	931739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_931700_932800
798349	contig_2332_pilon	+	1820	7	Intergenic	novelGene_58684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	185.716630021834	185	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	134	955	426955	511437	FALSE	30	ATTTCCCAGATTGGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRKFFGVIPSGKKLVNETVKKNEKTKSTEETLKAKKGIKEIKVNSSCRDDDFKQKQPNKKKRIIYDSDSESEETVQVKNAKKQPEKMPLSSKPGKILRKDPVTYISETDEEDDLMYKKTAFKSKDNGGSANSYLGESNMKKNEENTKTKNKPLSPVKLTPTSVLDYFGTGSIQRSDKKMVASKRKKPSKNTDDFRLNDEAIAKQLQLDEDAELERQLHEDEEFARTLAMLDEEPKTKKVALCWAICTLNIRYRSVFVFVPVYSRHWMYNHE	426821	512302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_426958_462517_462647_469677_469754_471303_471427_504089_504323_505189_505268_511257
798350	contig_1154_pilon	+	1912	1	Intergenic	novelGene_87041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAATAAAAAAAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48699	50611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_48700_50600
798352	contig_10727_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_159653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCGAGTCAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85120	84905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_-_84900_85100
798353	SIRV6	+	339	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	2	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
798355	contig_11720_pilon	+	1442	10	Intergenic	novelGene_43818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2376.23151696593	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	499	858	86302	95013	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVPETTPST	67877	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68124_76930_76961_78408_78511_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94987_95036_95383_95486_98306
798357	contig_9561_pilon	-	1306	3	Intergenic	novelGene_100849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	0.5	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	301	1305	45087	36894	FALSE	25	CCGATGACTTTCTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKYKEDDREKASKRPRAQKTEKIQKISSGRETGQLSGVKKPIISVVLTAHEAIPGATKIVPVEAGPPETEAANPETTVADLAHRRGYQEYAIQQTPYEQPMKSSRLGPTQLKIFTCEYCNKVFKFKHSLQAHLRIHTNEKPYKCSQCSYASAIKANLNVHLRKHTGEKFACDYCSFTCLSKGHLKVHIERVHKKIKQHCRFCKKKYSDVKNLIKHIRDAHDPQDQKVKEALDKLCLMTREGKRQLLYDCHICERKFKNELDRDRHMLVHGDQWPFACELCGHGATKYQALELHIRKHPFVYVCAVCLKKFVSSVRLRAHIKEAHGAAEEAAVFHSSVNQSFCLLEPGGDIHQEALGDQLQLAEEELVFQGVNAPKEAACPADPRPEEGQKEPEAPVEIPAPAEHSATPPAEGAALPPCELGATVVSSALPSPAVV	47540	36892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_-_37885_45073_45225_47377
798358	contig_7909_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_155926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGACACTGAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551556	551802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_551600_551800
798359	contig_8548_pilon	+	2483	1	Intergenic	novelGene_170566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1503	1838	481192	481527	NA	85	AAAAAAAAAACAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKVLLLKQTTIFYCPSEATWISQKQLKFNKFKMPLLCWTSGCYACARHTPRSLLLSSPAVIAPDSLFSQILSHWPKPGINTQLLGSHSWQPQVCQSRTVLHRVFSDFQK	479689	482172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_+_479700_482200
798360	contig_3948_pilon	-	2715	1	Intergenic	novelGene_53347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGAAGAAGGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507988	1505273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1505300_1508000
798361	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798364	scaffold_12124_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_22208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACAAAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366966	1367722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1367000_1367700
798365	contig_14970_pilon	-	1443	6	Intergenic	novelGene_45106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.144950402616	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	332	958	291083	255387	FALSE	25	GTTGATTCAAATTTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLTEKKWPCAVGNIEWSSLFMREVKPKIPLKREAHSFAVTSPDEWNKGIW	315729	254901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_255535_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
798366	contig_17074_pilon	-	1416	3	Intergenic	novelGene_145095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	13	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	69	494	207498	194230	FALSE	35	AATTGAATTTCCTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVTAWSGRRRPAAKSECRAAAMAYCRQEGKDRIIFVTKEDHETPSSAELVADDPNDPYEEHGLILPNGDINWNCPCLGGMASGPCGEQFKSAFSCFHYSTEDVKGSDCIDQFRAMQECMQKYPDLYPQDDDDDDEEEKKKPEGSEETAPTEATATKKEEGSS	207566	193307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_194535_197234_197334_207476
798367	contig_14333_pilon	-	987	4	Intergenic	novelGene_49154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.2913478836908	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	343	378	443225	443190	TRUE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPQRTSLGGAGVGLWLRSVLCYWAWEDGAGRLPSELLTSVRPGGFTAGESTSTALCLSEPLAKYYLRARVHILWHRPPGGLRWHSELEICRPPVSSHPLLLPLLFHSSVVRPTVMWSTPQSSAGP	446987	440791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441205_441682_441821_443131_443262_446681
798368	contig_6873_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_129826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAGCTTTTTCCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460009	460888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_460000_460900
798369	contig_19132_pilon	-	1882	1	Intergenic	novelGene_169997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACAACTAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348590	346708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_346700_348600
798370	SIRV6	+	445	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	518	164	72	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
798372	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	57	2	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACGCAATAGAGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
798373	contig_8616_pilon	+	1944	2	Intergenic	novelGene_72602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3567	junction_1	0	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCTTTTCATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434550	436588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_435900_435993
798374	contig_10058_pilon	+	1925	2	Intergenic	novelGene_67664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	98	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACGCCTGATTGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27804	30542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_27946_28758
798375	contig_4496_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_66677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAACTTTTCATTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882537	881038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_881000_882500
798378	contig_10404_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_138723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAGTGCTCCTACTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316764	1316051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1316100_1316800
798379	contig_17769_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_124250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGTTACAGACAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47801	48314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_47800_48300
798380	contig_12786_pilon	-	1177	8	Intergenic	novelGene_103428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	665.007810296317	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	350	1126	614067	590909	FALSE	20	ATTGTCCAGAATCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629462	590857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_604600_604719_614020_614079_628731_628911_629303
798383	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
798386	SIRV6	+	169	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	57	557	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798387	contig_6503_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_145744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTTAATAACAATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26424	28644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_26400_28600
798388	contig_14300_pilon	-	1031	8	Intergenic	novelGene_133092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	66.1118409228187	1198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	95	865	180320	148003	FALSE	5	CCTCTGTCTGTGGTCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPEIFNPEKEREAGISTSNKKSLRSRQH	186546	147836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_186493
798389	contig_18108_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_33492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGACAAAGAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260207	259651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_259700_260200
798390	contig_4103_pilon	-	1274	5	Intergenic	novelGene_51966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1409	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTCCACTTCCGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176214	171336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_171357_171514_171640_174221_174429_175160_175304_175435
798392	contig_2414_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_158510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481272	483224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_481300_483200
798395	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_96344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
798398	contig_18420_pilon	+	1386	3	Intergenic	novelGene_109377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117778	120928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_117860_118252_118326_119696
798399	contig_6807_pilon	-	2210	8	Intergenic	novelGene_84575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	48	junction_5	86.100795227312	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	143	1639	169453	161781	FALSE	30	GGCTTATGTTTCCTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSQGSSAMASKILVSLEEEVTCPICQELLTEPLSLDCGHSFCQACITAHNNEAVIGPEGESSCPVCGIRYLLGKLWTNQHLSNIVERLKKVKLTPEEEQKRELCVHHREKCLFFCKEDGRIICWLCRWSQEHRGHHTFLMENVVKECQEKLHAALERLRKEQQEAEKWQAVIREERASWKNQIQTERQRIQAEFNHLRGILDSEELRELQKLEEEERKVLDNLAETEDELVQQSQLVRELISDLELRCQWSTVELLQDMSGIMKWCEIWTLKKPKTVPKKPKHIFRAPDLSGMLQVFKELTDAQHYWVDITLNPVNLNLSLVLSEDQRQVMSVPIWPVEYYNYGILGSQYFSSGKHYWEVDVSEKTAWILGVYCRTFSRNIKFGIRRDTNHQNVYSRYRPQYGYWVIGLRNQFEYNAFEDSSPSGPQVLTLSMPVPPRRVGIFLDFEAGTVSFFNVTNHGFLIYKFFKCCFSQKIFPYFNPWNCPGPVSLCPPSS	172357	161209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_162347_162609_162637_162945_163047_164273_164297_167441_167673_168289_168386_169000_169487_172248
798401	contig_3942_pilon	-	2197	8	Intergenic	novelGene_128889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.92272291935599	49	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	384	1796	1601666	1590626	FALSE	20	CAGAGTGGACAGTGCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAPEAKNFPAGGAVATPTGLEKAAETRTLRTGQSSWLCLLSRSPLINPGVVRGAEEGIPRRASALAPVRRPVGTIRCCDSRERNSFPTWTHRLGEERRPPGPLRAERNVDSAGRARLLAGTAPHVSMRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQALDALREAVACSQPREVSVPLARFRDQCQQHRPCRFLAAQKGAYPVLLAIWQLAAAGDPALLLQVLDALTVLTDGQPDLLDAQGLQLLVATLSQGAGVANLTCAALRLVRHVCLKHEQNRQALVKAGVLPLLTGAIAQHSRCADVVREACGALRIMTFDDDIRVPFGHAHSHAKMIVQENRGLKVLVKAAQAFPDDPGVLGELCSTLSRLAVRNEFCQEIVDIGGLGILVGLLADYTNHQDLMKQVLSALRAIAGNDDVKDAIVHAGGADSVVATMTRHLASPQVCEQSCAALCVLALRKPENSRVIVEGGGALAALEAMKAHPQEVGVQKQACMLIRNLVARSQAFSQPILDLGAEALISKARAAHRDCEDVAKAALRDLGCRVELCELWTGQKGNLAL	1628090	1590224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1590839_1591718_1591857_1592275_1592408_1593160_1593307_1595408_1595983_1600394_1600478_1601539_1601707_1627747
798403	contig_10569_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_44072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACTATTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267923	268851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_267900_268900
798407	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	3	410	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798408	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_96097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653840	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
798409	contig_5041_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_27046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477268	478859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_477300_478900
798410	contig_2069_pilon	-	1035	11	Intergenic	novelGene_23397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.332468695985	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	17	823	1256627	1234123	FALSE	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTDSQLRAPASASALPMGLL	1256643	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234178_1249432_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251282_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596
798413	contig_9535_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_124462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209878	208241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_208200_209900
798414	contig_14243_pilon	-	861	7	Intergenic	novelGene_57431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_6	119.165734262087	54	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	291	860	630281	612543	FALSE	45	TTAATAGTAGAAACCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGKRVVSPRPWLCRAFGTVCSPGVLCISAWNLWTFFTENNISHSVLVALFYHFVQIVHKKNISVQYREYGLHAAGLYFLLLEVPGSVANQVFHPVMFDKCIQILKKSWPQESNLNRKRKKEQPKSSQGNPRGNRKRGKPLRREDIEMDVILQEQEDEENICFSARDLSYIRNAIFHLLKNFLRLLPKFSLKEKPQCVQNCIEIFVALTNFEPVLDEFHVSQARNLNEAKYIPELAYHGLYLVCSPIHGEGDKVISCVFHQMLNVILMLEVGEGSHRTSLTITSQV	671505	612541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_612642_628844_628933_629119_629182_629296_629465_630128_630314_645348_645512_671410
798416	contig_10962_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_103919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATACCAGTGACTATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406007	407316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_406000_407300
798418	contig_3382_pilon	+	722	5	Intergenic	novelGene_124002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	282.714520320411	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	415	720	116280	118132	FALSE	75	AAAAAAGACAAAAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLRDHTVRTPSNLDILELHTREVLKRLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPDWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFTDPSLYTADSESEEDKRR	106924	118134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_107147_108767_108858_116177_116388_117742_117868_118059
798419	contig_9054_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_160680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTTCTCTAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501891	503805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_501900_503800
798421	contig_7619_pilon	-	1353	9	Intergenic	novelGene_162156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	33.26691299174	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	69	1052	343262	338356	FALSE	0	CCTGTGTGCTGCCTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FITLLADTSDSRSSENRVADANMACRKLAVAHPILLLRHLPMLAALLHGRTHLNFQEFRQQNHLTFFLHVLGVLELLQPHVFRSEHQGALWDCLLSFIRLLLNYRKSSRHLAPFISKLVQLIHKYITCNAPAAVAFLQKHADVLHDLSFDNSDLVMLKSLLAGLSLPSRSSVTDRGLDEEGEDESPAGSLPLVSVSLFTPLTAAEMAPYMKRLSRGQTVEDLLEVLSDIDEMSRRRPEILGFFSTNLQRLMSSAEESCRNLAFSLALRAMQNNPSIAADFLPTFMYCLGSRDFEVVQTALKNLPEYTLLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQMDTSAQISEALRILHMEAVM	343330	338054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_338472_338594_338705_338964_339057_339265_339337_340019_340134_341030_341144_341544_341673_342618_342812_343215
798422	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
798423	contig_11428_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_138505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTTATAGAACTAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204242	205926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_204200_205900
798424	contig_6710_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_96513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653366	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
798425	contig_6710_pilon	+	505	2	Intergenic	novelGene_97827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGAAACTATATACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	657819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657794
798430	contig_2646_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_69719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATGAAACAGAAGTACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2605806	2606480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2605800_2606500
798435	contig_15384_pilon	-	1142	10	Intergenic	novelGene_85135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_5	76.4578476621975	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	341	982	120480	118939	FALSE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVMPHGGPHTSFVTAWMLFPALLCKMGFAVLLGNVGQQDVKDVQFAVEQVLQEEHFSASRVALMGGSHGGFLSCHLIGQYPETYSACVARNPVINIATMIGSTDIPDWCVVEAGFPYSSDLLPDLSVWAEMLDKSPIKYVPQVKTPLLLMLGQEDRRVPFKQGMEYYRALKAQKVPVRLLLYPKSSHALSEVEVESDSFMNAVLWLHIHLGS	123267	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119548_119740_119849_119885_120301_120383_120461_120546_121025_121165_122514_122567_123183
798436	contig_12802_pilon	-	2801	1	Intergenic	novelGene_114252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145159	142358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_142400_145200
798439	SIRV4	-	243	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1278	0	1278	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3880	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
798441	contig_13760_pilon	-	1447	4	Intergenic	novelGene_61339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.0055547841649	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	132	770	330619	324325	FALSE	5	TGCCTCTGTGTGGTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLIILCSLVFLAVYILICGWACLPLCLATCLEPHLPTSSRPTMLGPLHFSGYSSVPDGKPLVREPCRSCAVVSSSGQMLGSGLGTKIDGAECVLRMNQAPTMGFEADVGRRSTLRVISHTSVPLLLRNYSHYFQQARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRWLTVSPLLQEAVRLLSQHRLVHHDPRPGAVRGDRCLWNGQRQLLQRGEPPLGALPLL	330750	323647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325754_327791_328205_330568
798442	contig_5018_pilon	-	727	6	Intergenic	novelGene_47151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGCGTCACGAGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500365	1497687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1497764_1498206_1498310_1498396_1498555_1499168_1499291_1499457_1499578_1500217
798443	contig_4745_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_175172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGGAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141017	138861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_-_138900_141000
798445	SIRV6	+	404	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798449	contig_7420_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_85864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313602	315155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_+_313600_315200
798450	contig_7361_pilon	+	1871	9	Intergenic	novelGene_163379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	14.789671226907	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	314	1756	261083	283017	TRUE	35	GGGGCAGCAAAGGTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCQWKNLAQHFKIIRTVLRLSEAYSRVQYQFERESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEERYGISPGRASEGSLSEEWPEVTKRLSLTMGGMPGREQSLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDKRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSTGVDTNPCPNSPVFRTGSEPTLSPALVRRVSSDIRVGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKAPFLKFPPSPSTWLNSEAHYCELNPAFAISCDRAARLPSCAQDSYVELLRARQNGALGPRNSGTSYLILDDDDRVRPWEPPAAQMDKGQEDEGEFVKPLLETDSSFRPNNFESKLLPPENKPLETAMLKHVKELLTNHDPKVIAQHMLQMDCKVARILEVSEEMQRNMGVSSGLELITLPFGHQLRLDIIERHNTMVIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSRIIQVAVELKDSMGDLYSFSAIMKALEMPQITRLEKTWTTLRHQYTQTAIRYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARLMAEAADTYRMNAEKILEDGTEQS	260769	285226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_261136_265194_265299_266371_267025_272871_272988_277290_277463_280595_280708_280936_281150_282997_283070_285163
798451	contig_610_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_76690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTACTGAAGAGAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91046	90051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_90100_91000
798452	SIRV7	-	739	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	2	22848	2	-22842	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	46	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGACGATAAGTCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	78879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_78964_114680_114989_147608
798457	contig_20332_pilon	+	1662	4	Intergenic	novelGene_156189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_3	280.015475762799	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	193	534	642243	644522	FALSE	25	GGCATCCGTAAAATGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLLEVGIVKEEQLKVHGF	642050	645650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932_644035_644477
798460	contig_18919_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_156019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAAATGCAGTTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64733	65172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_64700_65200
798463	contig_8394_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_27329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATCTAAAATTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160240	161186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_160200_161200
798465	contig_14816_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_172452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATAAGGCTTTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46350	47004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_+_46400_47000
798466	contig_10339_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_125272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTACAAGGAAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309497	308894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_308900_309500
798467	contig_8210_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_30252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATAGATTATGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77257	75285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_75300_77300
798471	contig_5400_pilon	+	1256	2	Intergenic	novelGene_162830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGAGAAAGTAGCGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268513	271485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_269407_271122
798472	contig_4364_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_2726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532966	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
798473	contig_9199_pilon	+	853	9	Intergenic	novelGene_65631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	70.5149585194517	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	83	775	120933	122752	FALSE	30	CGAGGAAAGTGTGAGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKAAGAEEELLPGVDVLLEVFPTCSVGQAQWALAKARGDLEEAVQMLVEGKDGPNQDLPRRLRGPQKDELKSFILQKYMMVDSAEDQKIHRPMTP	115812	122830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_121799_121872_122035_122230_122293_122367_122418_122744
798474	contig_11594_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_80918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCGTGTATACTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373037	375210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_373000_375200
798476	contig_7569_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_114591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCACTTTCCATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92490	93417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_92500_93400
798477	contig_8581_pilon	-	1607	8	Intergenic	novelGene_22825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	570.30593293675	3	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	60	1013	386058	306934	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLAQVAEDEGWPRAPTVKMIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDRFEQRPLVPPSEPCREVPAQEPATTAAGRKTKPNLWRIT	386117	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307052_339303_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
798478	contig_10372_pilon	+	2033	5	Intergenic	novelGene_112506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	18.2345825288105	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	185	1414	11639	14384	FALSE	10	GTCTTCCATGTACTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLGLHKTTLQRVSKDVAELVGRVGEDVSLVLGIVAKLLPLRVLPVLFSLLKVVPRVFGRVMGKSREAVAQAMVLEMFREEDYYNDDVLDQMGASILGVEGPRRHPDEPPEDEVFELFPMFMGGLLSAHNRAVLAQLGCPIKNLDVLENTQAIKKKLGKQGRQVLPPSELLDYLFFHYEFQNQRFSAEVLSSLRQLNLAGVRMTPLKCTVVAAVLSRGKHTLDEVNLASCQLDPAGLHTLKPVLLRARKLGLQLNSLGPEACRNLRDLLLHDQCQITTLRLSNNPLTAAGAALLVEGLAGNTSLTHLSLLHTGLGDKGLELLAAQLDRNQQLQELNVAYNGAGDTAALALAKAARGHPSLELLHLYFNELSSEGRQVLRDLGGTAEGGAQVVTSLTEGTAVSEYWSVILSEVQRNLNSWDQARVQRHLELLLRDLEDSRGATLNPWRKAQMLRVKGEVKALLEQLRGSGS	8416	15003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_8574_11611_12208_12486_12574_13338_13591_14062
798481	contig_13044_pilon	-	1830	2	Intergenic	novelGene_99979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1147	1518	35393	31690	FALSE	40	ACTAAACGGTCCAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETNERSVCVSDRICILIIRVYVYILPFQIFALQKIGMSRFQKYVTYFVRGVSMLMIPIAATVPSSVVLYWLCSSFMGLSQNLLLRSPGFRRLCRIPLTKSDSDTPYRDLFAAFCAKFFSRK	36539	31377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_31864_35195
798483	contig_13760_pilon	-	1415	4	Intergenic	novelGene_61281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	41	457	159222	158170	TRUE	20	CGAATGTTGGCTGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGDIPRESSGFTWMAAATRDCWPWGSFLGLLGLVSAAAAAWDLASLRCNFGDFCECDFRPDFQGLECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVHDPAPKKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLFRGGLRSPHVHHFSPRHPLPPPQPHRAL	159262	154563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_155345_157249_157426_158168_158436_159071
798484	contig_7730_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_156279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATTGCTTTTGAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307910	309034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_307900_309000
798485	contig_8060_pilon	+	1651	7	Intergenic	novelGene_104828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	84.3315217196723	104	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	43	630	158272	215146	TRUE	50	AAAGTAATTCAGGCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRGLPGSAVLAAAVFVGGTASSALEAPDNGGSHALHSRTEMTPSPASNAENGHPEYIAYVLVPVFFIMGLFGVLICHLLKKKGYRCTTEAEQEVEEEKIEKIELNDSINENSDTVGQIVHYIMKNEANADVLKAMVADNSMGDPESPVTPSTPGSPPVSPGPLSPGGTPGEARLWTPSAHSGWCCGEGRVSSV	158229	242456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_158360_201356_201582_203636_203709_212184_212243_215001_215240_219456_219596_241667
798487	SIRV7	+	232	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCGTTCAAATCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	78909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
798493	contig_9121_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_134463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTTGACAATTTAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202175	203605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_202200_203600
798494	contig_1996_pilon	-	1322	9	Intergenic	novelGene_131947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	377.309202611068	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	213	824	509912	508494	FALSE	15	CTGTGACAGTGCGGACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLENSSFEAINSQLTVETGDAHIIGRIESYSCKMAGDDKHMFKQFCQEGQPHVLEALSPPQTSGLSPSRLSKSQGGEDDGPLSDKCSRKTLFYLIATLNESFGPDYDFSTARSHEFSREPSLSWVVNAVNCSLFSAVREDFKALKPQLWNAVDEEICLAECDIYSYNPDLDSDPFGEESKRAEAVRVEPRRPAPLRRTGSR	511082	507995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508691_508999_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509712_509829_509957_510732_510802_510983
798496	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
798498	contig_12644_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_44506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTTTAGCTAGACTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096202	1096973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1096200_1097000
798499	SIRV6	+	303	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	585	171	406	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
798501	contig_7202_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_18115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27864	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
798507	contig_7070_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_104044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCCCCCACTGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117684	116936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_116900_117700
798508	contig_11429_pilon	+	1138	7	Intergenic	novelGene_60461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1122.04213626564	2	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGACAGTGCTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45419	49498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46265_46512_46612_47281_47370_47457_47552_48446_48530_48899
798509	contig_6287_pilon	-	1716	2	Intergenic	novelGene_160430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTCAAATTTAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151999	150231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_-_151416_151467
798510	contig_13625_pilon	-	1705	10	Intergenic	novelGene_150152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	118.210525737185	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	15	1439	43661	27060	TRUE	20	GTCATGCCTTATTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43675	23707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
798512	contig_5732_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_119591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGAAAGGGGCCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279931	280934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_279900_280900
798513	contig_10882_pilon	+	1402	2	Intergenic	novelGene_172755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	0	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTGTAGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45078	47038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_46242_46799
798514	contig_19769_pilon	-	759	5	Intergenic	novelGene_102294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	408	758	87875	87237	FALSE	20	GAGAGCGTCCACGGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSGMVPTGRTLPMFSWAALLAAVHELACVDALGCNKELCPLFKPIRVPEDHLGKGRAAARIVDDVLHNALDVAMPLSEVHGAQSRGALTVLHVRAEHRAGALPLSTNYAAHGGGS	89290	87235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87385_87464_87608_87815_88039_88840_88958_89163
798515	contig_10082_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_63883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAATTCAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312885	311556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_311600_312900
798518	contig_6059_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_44811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGCTGGAAATACATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565011	566628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_565000_566600
798519	contig_7887_pilon	+	2067	14	Intergenic	novelGene_124883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	176.932207122275	189	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	215	1717	286508	293116	FALSE	15	CATCCCTGGAGTTTGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPRRYHSSERGSRGSYHEHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRHRREDSYHVRSRSSYEDRSSDRRAYDRRYCSSYRRNGYSRDRGEACCDADYRHSCEYHRENSSYRSQRSSRRKHRRRRRRSRTFSRSSSQHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGRVVQCVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFFTRLRAEPPNAKLWDSSRDISR	280978	293466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_281012_284273_284455_286507_286678_287429_287659_288350_288439_288772_288840_289008_289126_289884_290052_290799_290895_291549_291680_291780_291864_292048_292129_292310_292402_292930
798522	contig_16362_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_161165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAATAATAATCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219664	221263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_219700_221300
798524	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798527	contig_18613_pilon	+	562	3	Intergenic	novelGene_80229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3591	junction_2	801.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	9	308	28443	31105	FALSE	15	CTAGTATATGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	28434	31359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_28639_30137_30195_31058
798528	contig_5210_pilon	-	1595	11	Intergenic	novelGene_65478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	44.5088755193838	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	478	1221	1148012	1101153	FALSE	30	CTGAATGAATGCCATTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAMYCNGLMEQDTVLTRRQKEAKSKSKSDTGTAAQTSLDIDKSEKCYLCKSFVPFREYQCHVDSCLQLAKGDQGDGPSGSDSVCPVAEGKQQQRLRSTKEKGQNEGRLLSVLEQSEQQSADAEIKTTSSETGAFRVSSLGMEEAGCSREMQSSLAHLDINDSPIKSFVSISEATDCLVDFKKQFTVRPGSRARTKAGRGRRRKS	1204115	1100778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141824_1141979_1147997_1148104_1152584_1152662_1154692_1154758_1173672_1173761_1203959
798529	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
798533	contig_5600_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_174959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282707	281194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_281200_282700
798534	contig_10299_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_79796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATACCCTCCATAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748889	747531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_747500_748900
798537	contig_7612_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_170370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGCCAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219757	219347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_219300_219800
798538	contig_18919_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_156028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92501	94325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_92500_94300
798540	contig_14243_pilon	+	2144	14	Intergenic	novelGene_57418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACCTTGAGATGACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525372	558540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_525837_525925_525988_526074_526154_532901_532977_533832_533976_534169_534341_535078_535240_537244_537358_540588_540788_541052_541185_541495_541636_555937_556018_557100_557340_558454
798546	contig_19577_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_119834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33033	31591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_31600_33000
798548	contig_13894_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_62127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTAAGAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520785	522092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520800_522100
798549	contig_5947_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_101585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAGGTGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860895	859939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_859900_860900
798551	contig_13224_pilon	-	1638	10	Intergenic	novelGene_104122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	240.068560166147	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	234	950	376207	371151	TRUE	15	CTCGATGATGCCTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGVVLDKTCFYAEQGGQIYDEGYLVKVDDSSEDKAEFTVKNAQVRGGYVLHIGTIYGNLKVGDRVRLFIDEPRRRPVMSNHTATHILNFALRSVLGEADQRGSLVAPDRLRFDFTAKGAMSTEQIKEAEEIANQMIEAAKPVYTQDCLLAAAKAIQGLRAVFDETYPDPVRVVSIGVPVSELLEDPSGPAGSLTSVEFCGGTHLQNSSHAGTFVIVSEEAIAKGIRRIVAITGAEAQKALRKAESLKKSLSVIEAKVKAQTTPNKDVQREIADLGEALATAVVPQCWRRPSSSSIATPTSPSLSWRWRAAPQPRR	377937	370015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_370597_371043_371158_371535_371623_371846_371873_373081_373196_373800_373910_375324_375510_376018_376226_377135_377250_377836
798552	contig_5649_pilon	-	1771	2	Intergenic	novelGene_82375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGTTTCTGGTGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057738	1055819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1057119_1057266
798553	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
798554	contig_6163_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_103847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGCATTCAGCATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466195	463751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_463800_466200
798555	contig_11548_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_66785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAGGGAGAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117916	116709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_116700_117900
798556	contig_13760_pilon	-	2280	5	Intergenic	novelGene_61312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_2	209.998809520435	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	99	677	194443	179583	TRUE	10	GCTTACTGGCTCTCTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKEPWWRSG	194541	177521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_179044_179501_179607_180114_180155_191857_192336_194406
798557	contig_14225_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_52760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTAGTTAATGTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452719	453740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_452700_453700
798558	SIRV2	-	631	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	51	4	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	175	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATTTAGACCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
798559	contig_15787_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_143992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGAGAGAAGATGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89010	91098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_89000_91100
798562	contig_13529_pilon	+	2804	6	Intergenic	novelGene_170866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	190	618	53805	54233	TRUE	20	AGTGCTCCCTTCAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVATSSEGSFLRSNGVLKRDISSVVVFSCKVNSFCKKDFSLVSVFSGKATGCRKSESSLLVELFCNDNGLWKRNSSTMVDFSSIANGSLIRNSSSEVISSCKANSFFKDSSLIAVFSCKNKTFWKRDSFLLLSFSCNKNGS	53615	106610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13529_pilon_+_55877_69750_69879_76788_76877_79889_80026_89283_89400_106535
798563	contig_10158_pilon	-	1874	2	Intergenic	novelGene_150772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	59	649	162504	77746	FALSE	80	AAAAAAGGAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GESGGGGCAGVCVCRRLRKMRLKIGFILRSLLVVASFLGLVVLWSSLSPRPDEPSPLSRMREDRDVNNPMPNRGGNGLAPGDDRFRPVVPWPHVEGVEVDLESIRRKNKAKNEQEHRAGGDSQKDIMQRQYLTFKPQTFTYHDPVLRPGILGNFEPKEPEPHGVVGGPGEKAKPLVLGPEFKPAVQASIKEFGFNMVASDMISLDRSVSDLRQEE	162562	76520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_78211_162378
798566	SIRV6	+	361	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	9	413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798567	contig_3018_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_78909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATATGGGTACATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619495	620668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_619500_620700
798568	contig_6691_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_60160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363329	363147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_363100_363300
798570	contig_401_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_42880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTTTGTGCGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767430	1768491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1767400_1768500
798571	SIRV4	-	488	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	126	3	126	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5032	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
798576	SIRV6	+	185	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	544	54	544	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798578	contig_9516_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_106168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTGCACAACTCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849223	850265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_849200_850300
798579	contig_753_pilon	+	2543	2	Intergenic	novelGene_113003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAATGCATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279539	1282656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1279807_1280380
798582	contig_7357_pilon	+	2605	4	Intergenic	novelGene_36932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781900	792055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_782316_784986_785088_785934_786003_790034
798584	contig_11448_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_66443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTTATTTTTCAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670500	669898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_669900_670500
798585	contig_5643_pilon	+	1405	4	Intergenic	novelGene_38756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	17.9133717900592	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	135	1205	157978	161022	FALSE	10	TTTCGTTGGCTTTACTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLTGWCWPARGVRRASLLFSNRGPCKHWGPGEGSGCGGPRAASMGTEEAWCLLLCLALSRAAEAKPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVTTQTPSLNFLLGASASLHCVFSMAPGLDLISVEWRLQHKGSGQQVYSWTTGQAQAKREGATLEPQQLHVAGDASLTLPSLTPKDEGAYICQITTSLYRAQQIIQFNVQGEARTQLSWRRGKDKSIGSVFQIGVQTQGQFSEWQTDFPQPKCLLHPGSIDGIR	157843	161222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_159501_160519
798587	contig_12127_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_130102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCCTTTAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45287	43334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_43300_45300
798589	contig_12970_pilon	+	905	6	Intergenic	novelGene_50499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	974.961209484767	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1	606	15593	74093	TRUE	45	AAAGGGGAAATACTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSGAILVAGRGGDSTLRRARRPRWQWQHSCARVLIAEGGGSGGRGGGGGVGRSGGGGGGYESAAGGDMANIAVQRIKREFKEVLKSEETSKNQIKVDLVDENFTELRGEIAGPPDTPYEGGRYQLEIKIPETYPFNPPKVRFITKIWHPNISSVTGAICLDILKDQCTNKILKCSNRQLDFGHMCMLEHQFLVQNTPKK	15592	74704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_15863_45022_45117_49409_49469_61722_61806_73993_74123_74434
798590	contig_19692_pilon	-	1370	5	Intergenic	novelGene_174878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGTAAATAAAATCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50020	13484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_-_13611_33981_34067_35896_35985_37205_37267_49010
798592	contig_6228_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_164518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547694	549868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_547700_549900
798593	contig_11572_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_100048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATTTTTAAAAAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239228	237438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_237400_239200
798600	contig_9516_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_106150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATAGCTTATTCCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621660	620927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_620900_621700
798601	contig_8729_pilon	+	2036	5	Intergenic	novelGene_40102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	71.6881266319605	2	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCTGAACTATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276496	323931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_306155_306214_322203
798602	contig_6433_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_162752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTGGGTCAGGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49648	48962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_49000_49600
798607	contig_1575_pilon	+	1234	9	Intergenic	novelGene_45161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_1	302.590792159973	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	149	868	130657	167899	FALSE	80	AAGGAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLLPQSRFACLKKYPLHAIRKYLSTLRNQRAEEQVARFQKLPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVTSILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWRKYISQFKNPLIMLLLASAVISVIMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEVSS	40258	168265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167818
798608	scaffold_19766_pilon	-	1630	5	Intergenic	novelGene_34255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.82623792124926	145	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	103	558	180569	179450	TRUE	15	TGCAGGCTGGCTGAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESSPLLAYRLLGEEGVAFPANGAGGPGGTSARRLSTFLGVVVPTVLSMFSVVVFMRIGFVVGHAGLLQALAMLLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVRGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANICGCAICVLGLVEAVLDVFGAGL	181439	171408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_171887_178855_179590_180016_180152_180388_180611_181378
798612	contig_5988_pilon	-	1162	6	Intergenic	novelGene_15844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	160.118705965293	40	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	27	818	259970	241969	FALSE	25	TCATCTGAATTGAATGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGSGGSGMNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGKEREVIPLEAAGIELSIWGWARGTSL	260587	241624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242048_255231_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260569
798614	SIRV4	-	315	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1208	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
798615	SIRV6	+	349	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
798618	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	120	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
798620	contig_5918_pilon	-	2587	1	Intergenic	novelGene_99564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAACTGAAAGGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1721144	1718557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1718600_1721100
798625	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	1	1161	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
798626	contig_14744_pilon	-	1563	5	Intergenic	novelGene_65970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	52.5856444288743	303	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	494	832	782207	781496	FALSE	15	TGATGCTTACTGATGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAAASQASGAKGSCESTPPRGSTPTLTPRKKNKYRLISHTPSYCDESLFGPRYSQGQPLTPTQGDPASSRPPSRCLQDRAQGGGRLPEAALRWVRCSRPSMAGTISVPYQP	783511	780764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_781677_781760_781812_782100_782454_782895_783030_783398
798627	contig_11448_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_66344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTATCAGCTTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157540	155800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_156164_156210
798631	contig_3960_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_138006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGACGCTTTAGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341023	342045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_341000_342000
798632	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798638	contig_6325_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_143362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGCATACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412003	409894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_409900_412000
798640	contig_6325_pilon	-	906	9	Intergenic	novelGene_143343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	155.33170152934	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	198	905	132679	115254	FALSE	30	TAAGTATAAGGTGTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKP	182255	115252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_115280_116468_116635_118233_118341_125704_125793_127615_127704_128782_128892_130009_130129_132674_132823_182201
798645	contig_14405_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_85629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTCCTGAAGGCACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377174	378867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_377200_378900
798646	SIRV6	+	244	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	51	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798647	contig_10734_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_51378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCTTTGATCTTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1872831	1874915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1873228_1874378
798648	contig_10734_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_51380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCAGTATATTCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1876657	1877172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1876700_1877200
798649	contig_10734_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_51206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	376	junction_3	354.224348244003	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	602	907	1134427	1140856	FALSE	45	AAAAGGAAAATGCTTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEK	1132276	1140856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659
798652	contig_4519_pilon	-	909	2	Intergenic	novelGene_123744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGTTAACTGGAATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810714	809174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_809747_810377
798653	contig_14501_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_172033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTGAATTATATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314170	312427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_-_312400_314200
798654	contig_12644_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_44576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2048484	2050580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2048500_2050600
798656	contig_5999_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_45665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGGAGAAAATATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310527	310285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_310300_310500
798657	contig_2310_pilon	-	2060	8	Intergenic	novelGene_71592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	39.092772963288	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	88	987	97652	80233	FALSE	20	ACTAAGTTTGCAGTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGGADEEPRSGRSSSDGECAVAPEPLKGPEGLFSFASLGAALGSGTDLPGRASDGAQSPLRYLHLLWQQDAEPRDELRCKIPAGRLRRAARPHRKLGPTGKEVHALKRLRDSANANDVETVQQLLEDGVDPCAADDKGRTALHFASCNGNDQIVQLLLDHGADPNQRDGLGNTPLHLAACTNHVPVITTLLRGGARVDALDRAGRTPLHLAKSKLNILQEGHSQCLEAVRLEVKQIIQMLREYLERLGRHEQRERLDDLCTRLQMTSTKEQVDEVTDLLASFTSLSLQMQNIEKR	97739	79159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_80308_80679_80788_80970_81096_81174_81223_81689_81762_84753_84853_95969_96018_97327
798658	contig_12919_pilon	+	1518	3	Intergenic	novelGene_75914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	109.5	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1086	1385	823773	824072	FALSE	70	TTGTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFRIVSFFCLGGRSKLEGNMRGLLRVGHVLFLDLDVHMGMFALQTFILLYMHDYTHFSICILQLNLQQRKPILSYFCFKFLVFSLSPFIILLIRGNK	807110	824205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_807149_821931_822013_822806
798659	contig_4686_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_118505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGGGGTTTTAGTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396322	397205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_396300_397200
798661	contig_14744_pilon	+	1902	13	Intergenic	novelGene_65972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	39.7962693673107	282	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	64	1584	783918	803092	FALSE	25	AGCACCCCTGGTGGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQWRKKKGLRKRRGAASQARGSDSEDGEFEIQAEDDARARKLGPGRPLPTFPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTIPMILDGKDVVAMARTGSGKTACFLIPVFERLKAHSAQTGARALILSPTRELALQTMKFTKELGKFTGLKTALILGGDKMEDQFAALHENPDIIIATPGRLVHVAVEMNLKLQSVEYVVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIGRLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPSLIRLDVDAKLNEQLKTAFFHVREDAKPAVLLHLLRAVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQRVTCAHIYSALDQTARKINLAKFTHGKCSALIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKGKLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEVPYLLDLHLFLGRALTLAHPHEEPSEDALPAAWGPQAALGPQPPPGPGAAAGCLWPGHPLQEGQDEEEDVRTGTWP	783854	803410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_784044_787156_787287_789643_789715_790304_790494_790613_790664_792404_792447_792563_792660_793950_794073_794174_794237_794315_794448_795675_795887_796835_796971_802937
798662	contig_17769_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_124266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	339	398	103564	103623	NA	50	ACTTGGAAAATAAGTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDVPRFLRLFKYLTLEITLRGAEADRHDLNHRPQFSRSIWQKLGCWRSLWRLSQHSHLQVESVDKQRLFRESGLHLSGGTLRPPLKSRTSPEIPADQQPHSFLSFSANYCHGMMTVSQKRLLLKLSLKAAR	103225	105420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_103200_105400
798663	contig_253_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_129764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750651	751493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_750700_751500
798664	contig_1996_pilon	+	812	9	Intergenic	novelGene_131901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	182.195250692766	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	95	670	251625	255438	FALSE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249928	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251552_251662_252200_252230_252340_252379_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
798665	contig_19737_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_158965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAGACAATGGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24395	26101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_24400_26100
798667	scaffold_12124_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_22190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCTACAGGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255818	1258405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1255800_1258400
798668	contig_14322_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_116298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAATGCGGCTGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671363	671650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671400_671600
798669	SIRV2	+	477	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	119	-73	-119	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCTTGCAACTTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
798671	contig_14553_pilon	+	2089	5	Intergenic	novelGene_124996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	80.4704914860099	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	43	474	5787	6218	TRUE	45	TACAAATTAAACAGCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVGEQGRVRVGKERPPFHQLFSLLNEWALSRKRGFRLRKVTAEARSEEILPFLHHLTGDKMGVYKSGFEIGFLCGRTCVCQQVELHPLECFSKGLCYVWHYLGHQEEAGGISEGIAETVRVLRHSGHQ	5744	23516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_6387_12152_12270_13796_13937_14294_14424_22455
798673	SIRV2	-	244	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	682	22	682	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4050	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
798675	SIRV6	+	197	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	77	509	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798676	contig_19098_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_65836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTTGGGCAAGTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401154	399573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_399600_401200
798681	contig_15744_pilon	+	579	3	Intergenic	novelGene_83597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	49	324	149562	152709	TRUE	40	AAACTAAATGACAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFERRVNIFFSLQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDW	149513	153579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152502_152712_153326
798682	contig_8554_pilon	+	940	5	Intergenic	novelGene_160274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	175.414330942486	134	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTTAGATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39994	43796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40236_40399_40486_40575_40733_41396_41458_43401
798684	contig_11709_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_168216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	217	399	50817	50635	NA	75	TTAGGAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGFLKVGVEAGAWYVPRLQQPEVNLRAPLFTTRSPFSFIFHGGFPSWIPDRFCDITCQLIIEIQSATCQQRWMGFWLQMHSLNAPPQPRRQGDLRVQACLAPEDSSTDLTGPLQMQTTPRARRGLPLGAAAG	51033	50546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_50500_51000
798685	contig_13780_pilon	-	982	5	Intergenic	novelGene_149019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	58.3373808119631	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	135	434	436757	433545	FALSE	30	ACTCATCAACACTGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCRLSNNQRFLVLDGDGHYEIEITRISTMRILTEGLPPGGGSMRASGMLLQYTVPGAEGVTQLKLTAGEDANTSKRPAVAWLAAMHKAAKLLYESRDQ	439832	432996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_433581_433682_433826_436534_436627_436728_436805_439745
798686	contig_6137_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_59242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316283	1318083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1316300_1318100
798688	contig_2550_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_135635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450790	452883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_450800_452900
798691	contig_10609_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_123941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCTAGTGATAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424861	426233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_424900_426200
798695	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	15	1152	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
798696	contig_7644_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_64229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80821	79211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_79200_80800
798697	contig_6217_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_109695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGATCAAATTAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989206	990839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_989200_990800
798698	contig_9440_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_59066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	394	741	536042	535695	NA	30	GCTGTAAGAGTGCCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFSVLIALGLLEHLLAWMEMEVTMDGSYRSVIWERGHCMMLILCSPPVLLSLGSFEGNVSLLDDVSLSIKLCFCCCPSRSGTPQILWHSFVQAELWEFWFTDLGKSANRWHTVP	536435	534987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_535000_536400
798700	contig_11885_pilon	-	1236	5	Intergenic	novelGene_159705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	13.9463256809814	73	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	42	305	66978	51772	TRUE	45	AATAAAATTTTTACTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRWARASSCGRVMARLLRALCGLRFRETPLRVVRSRAGTGGLGARHKPREAGSLTKCEPSLAKSDWQRKLTTEQFYVTREKGTEPPFSGIYLNTKEAGM	67019	32185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_-_32937_35061_35210_51739_51817_57078_57180_66860
798702	contig_12724_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_146877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	122	469	522741	522394	NA	65	ACCTTACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLFFVSSSSLSFFFFGLDDGAVEWGIGAASPRLCYDEKMCCFFWHCLAHLHWYSDDLLGLLSFIYLVSTEGRPLLSFPCLTLTSQLVFGRWPSPVKSLPRSLEQHSGLQWKLH	522862	521353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_521400_522900
798703	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798705	contig_7151_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_40697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACCATTATCTATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24752	24500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_24500_24800
798706	contig_9921_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_23743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCAGGGCTCCTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213417	212162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_212200_213400
798708	contig_20889_pilon	+	1740	6	Intergenic	novelGene_127636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	44.859781542045	5	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	280	903	39523	63266	FALSE	30	GTCCACGCTAAATATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVAIEDVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRNNDGGKLSTENTIVGFMKNDTCFSMVGDICKSHGVEDKDNNQKTHVRKHMIENLCERNEDNQCGQTFSQILSHSVLKRTPMEGHPSEFLECGKSLMDHSSLKHHIRSHSGCVASQCKECGQACSCLSYLSTPVRTLTVERDLLNVRNVAKPFVVPHTSLTI	20035	64103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_39283_39526_59533_59661_60671_60820_61830_62103_63192
798709	contig_9919_pilon	-	2030	11	Intergenic	novelGene_137999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	127	junction_3	55.679080452177	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	40	1593	866377	845418	FALSE	20	GGCATTCTGATGGTACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRKATGGGSLGRTLIRRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILLNGIPKKQVNRGAGETNTAESENSDFDEAGIPYDETERLPGRGSPSLSEGASSDEDDSEYEDCQEEEEEDWQTCSEEDSNFEESRGQDWKKSCTVDSDTQDRRTPQKRQTHNFSHLVSKQELLEIFKQLHTGKTVKDGQLTVGLVGYPNVGKSSTINTILGNKKVSVSATPGHTKHFQTLYVEPGLCLCDCPGLVMPSFVSTKAEMICNGILPIDQMRDHVPSVSLVCQNIPRRVLEATYGITIIKPREDEDPHRPPTSEELLTAYGCEL	866416	844980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_845553_850459_850604_850743_850846_853096_853511_855898_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
798712	contig_9731_pilon	-	940	7	Intergenic	novelGene_154391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	103.062144143985	507	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	287	592	86753	49449	FALSE	80	TGAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSVTETLIKPLEKFRKEQLGAVKEEKKKFDKETEKNYSLIDKHLNLSAKKKDSHLQEADIQVEQNRQHFYELSLEYVCKLQEIQERKKFEFVEPMLSFFQGMFTFYHQGHELAKDFNHYKMELQINIQNTRNRFEGTRSEVEELMNKIRQNPKDHKRASQFTAEGYLYVQEKRPAPFGSSWVKHYCMYRKTAKKC	103808	49100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_-_49458_73202_73265_76729_76860_86648_86754_88505_88617_94367_94470_103735
798713	contig_13831_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_160985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATCAGAATAGCAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61061	61760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_61100_61800
798715	contig_13831_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_160986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCCCGCAATAAATAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62555	63182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_62600_63200
798716	contig_13258_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_146927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGGGCCAACTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58788	58153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_58200_58800
798717	contig_19693_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_175178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60145	59116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19693_pilon_-_59100_60100
798718	contig_2867_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_135240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGTCCTGCGTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279700	1280765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1279700_1280800
798721	contig_11338_pilon	+	1163	4	Intergenic	novelGene_6243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	283.705246103534	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	2	736	57601	62044	FALSE	35	CCGTAAGTAGGAATCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPEHPLDQELKSEPRTWSLLEQLGLSGADLAAPGVQQQLELERERLRREIRKELKLKEGAENLRRATTDLGRNLGPVELLLRGSSRRLDLLHQQLQELHAHVVLPDPVTAAHDDPHSPGAGSPACLATNLSRVAGLEKQLAIELKVKQGAENMIQTYSHGSTKEESVTKRRRIWNVWLVASMNNCLLCHETRRTGWCPATITEHFDQRFHRRILIKREKMQNRISNSCGIQTFWYHGGWVNP	57599	62471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_57640_58271_58576_59421_59574_61804
798723	contig_5696_pilon	-	1454	3	Intergenic	novelGene_117599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	2	534	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGATAATGAAGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787188	782659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_783912_786128_786238_787095
798725	contig_12622_pilon	-	1866	15	Intergenic	novelGene_6042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_14	339.651922667057	1	99	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	69	1499	1691275	1685486	FALSE	20	CTTAAAACCCTGTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691550	1685118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
798726	contig_6873_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_129844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1500	1931	791122	791553	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKWPHCQNCEQYATMHNAYLLSGGAFRVLWAAALAHSYTYPDTITHNPQPTHTHLSGKEGRNIWIQVEGGDWTSETKDRKEWPERQVTNEVCDCMCSLEHVHDHMCMTTYARVAVLGGSTPLCSGLLRWPGSQSQLSMVSLS	789622	791707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_789600_791700
798727	contig_5279_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_105547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	147	716	142106	142675	NA	35	TACAGATGTTCATAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVKGNSGEGSEGSKESYREYHLREYLWHQQQNAARNVDVKCAPGEALKESDEHVIGQWRKGDAFYAVAKNLSELFSNVEWKAEPGSDELGYLAEEITKQDLKQAAWFLLAVYSKMQEERDGLCKMKTKLKDLENSVVQTKDIYELECSPRKSKKRTIPGASGRSVQQNCWKQHRKQRCLSFKGCGHGL	141959	143243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_142000_143200
798728	contig_16411_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_77365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGGTCAAATTACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302695	303665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_302700_303700
798730	contig_2969_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_157070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGAGGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862433	863297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_862400_863300
798731	contig_6710_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_97183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	AATAAAAATGAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
798732	contig_8898_pilon	-	1361	6	Intergenic	novelGene_137232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_5	69.3483957997588	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	482	1216	216890	210776	FALSE	30	ATATTGCCCTCAACTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTVPPLSTVAATTAASGPLVDYLWMLILGFIIAFILAFSVGANDVANSFGTAVGSGVVTLKQACILASIFETVGSVLLGAKVSETIRKGLIDVEMYNSTQQLLMAGSVSAMFGSAVWQLVASFLKLPISGTHCIVGATIGFSLVAKGQEGVKWSELIKIVMSWFVSPLLSGVMSGILFFLVRAFILRKADPVPNGLRALPVFYACTVGINLFSIMYTGAPWLKSPRRWLACAHFRRLQASVC	217760	210630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_210844_210933_211031_215999_216086_216263_216405_216547_217160_217548
798733	contig_6677_pilon	+	1220	1	Intergenic	novelGene_114188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGCAACCCTACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550933	552153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_550900_552200
798735	contig_4091_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_173039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGGTTGTGATGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31124	30828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_30800_31100
798737	contig_15689_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_164163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	218	514	213348	213052	NA	15	CTTCCTGGACAATGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSHSPSLGARVLCPKGCASPPGRGGRRRPRPGRAQLPVSLPTEAAPATPEPGLQPGVDQAGLGPKGGPCGTMQPSFSHLHCPGSRTLVDWDLGRVGLSLVRCCQVDFGTVKMAWRRHLTSSNFTRGKENQDQKPKADSCEAEVNMPPLSTIFPNSDTNRPSHRTLCSVQ	213565	211812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_211800_213600
798739	contig_14519_pilon	-	1851	9	Intergenic	novelGene_66820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	177.560861044882	1	100	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	339	665	281013	275404	TRUE	25	TGCTTTATACAGTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDFLSDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDLLVLYGESFQSFTAKKTPLCLMT	283770	269629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275476_277945_278045_278562_278601_280895_281014_282189_282296_282707_282802_283632
798740	contig_4305_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_136648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTAACTCATATATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41270	42124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_41300_42100
798743	scaffold_14325_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_162658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71040	69267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_69300_71000
798746	contig_12019_pilon	+	1558	5	Intergenic	novelGene_87735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	181.477960094332	64	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	11	661	623205	642316	FALSE	45	GCATAAAAATATGTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHQKISLC	623194	643213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635927_642292
798747	contig_1372_pilon	+	1712	11	Intergenic	novelGene_140520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.3983516110277	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	580	1536	457535	484809	FALSE	20	CTATACCGCTTTACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451718	484985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452216_454521_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
798749	contig_19730_pilon	-	2307	3	Intergenic	novelGene_142489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	3.5	38	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGGAAAAATATAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125625	122701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_124676_125123_125201_125369
798751	contig_10019_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_86663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCCTTAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187642	189396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_187600_189400
798752	contig_3787_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_102425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCCTGTATGTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596774	595225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_595200_596800
798754	contig_1143_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_86576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTATCTACAGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101694	102981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_101700_103000
798755	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	54	519	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
798756	SIRV5	+	357	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	162	149	48	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
798764	contig_12869_pilon	+	1363	8	Intergenic	novelGene_75334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	228.514903725096	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	29	1108	67397	97384	FALSE	75	ATAATAAAAAAAATTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67368	97639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
798765	contig_8616_pilon	-	861	9	Intergenic	novelGene_72506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGAAAGCCGAAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339331	336784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_336814_336908_336998_337137_337189_337272_337386_337470_337538_337776_337838_338228_338352_338838_339029_339193
798767	contig_12080_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_128371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTTGTCAATAACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136480	135946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_135900_136500
798768	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-7	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
798769	contig_1996_pilon	-	492	3	Intergenic	novelGene_131888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	252	341	170419	170330	FALSE	20	CTGGGAGACAGCCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGDLRRSRRCWPNWRPRPSSQSKSSARLPASAVTRCRAPCTPSPACTCPRAPCSARRSGGSRTGICVVPGSGFGQREGTYHFRMTILPPMEKLRPLLEKLSQFHAKFTLEYS	170870	170178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_170421_170489_170552_170682
798770	contig_9345_pilon	+	1071	2	Intergenic	novelGene_24339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	222	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	89	1033	139909	140853	FALSE	10	CTGAGTGGTCATTCGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEAPSGGHMQTLIFLDLEATGLPFSQPKVTELCMLAIHRCALENSPSPQGPPPTVPRLPRVVDKLSLCVAPGKACSPSASDITGLSTAALAAHGRQRFNADLANLLRAFLQRQPQPWCLMAHNGDRYDFPLLQAELAALGLASALDRAFCVDSITALKALECASSPSERGLRKSYSLGSIYTRLYGQAPPDSHTAEGDVLALVSICQWRPQALLQWVDVHARPFSTVTPMYRVEASTRTNPGPSAPTATAALVTARDTSPNLVGGRRPKSPLCMEGPGAPSREGLLAPLGLLAFLTLAVATLYGLSLATPQP	139553	140891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_139615_139881
798771	contig_5643_pilon	-	702	5	Intergenic	novelGene_38913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_3	106.62404747523	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	4	702	345886	336672	FALSE	20	CAGGCCTCCCAGGCATCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMNDPYVLSPEDDDDHQKDGKTYRCRMCSLTFYSKSEMQIHSKSHTETKPHKCPHCSKTFANSSYLAQHIRIHSGAKPYSCNFCEKSFRQLSHLQQHTRIHTGDRPYKCAHPGCEKAFTQLSNLQSHRRQHNKDKPYKCHNCHRAYTDAASLEVHLSTHTVKHAKVYTCTICSRAYTSETYLMKHMRKHNPPDLQQQVQAAAAAAAVAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQA	345889	336671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_336840_337444_337604_338283_338363_340741_340967_345818
798772	contig_10549_pilon	-	1957	7	Intergenic	novelGene_110613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATACTACTACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218173	197523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_199011_200635_200769_200862_200897_201057_201159_205110_205167_206938_207041_218129
798773	contig_6403_pilon	-	2197	3	Intergenic	novelGene_139903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	16	106	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	665	982	1135307	1134990	TRUE	30	TTAAACTCAGAAGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPSEEVPRPLTPSSCPTSMKENLGMLLEMIQLTSGSALCWEALLTALDWTTGLLWPKRGFGLAGQGALYCQGWVRLSLAFLPAKLSHTHEIVDTPSRGHLHTQT	1136965	1133156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1133860_1134477_1135760_1136753
798775	contig_14326_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_120762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGGCCTGTATCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605786	603324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_603300_605800
798777	contig_4103_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_52033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGCATGAATCTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675053	677144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_675100_677100
798779	SIRV4	-	305	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	87	225	87	-225	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGTTACGGCGGACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5071	3862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
798783	contig_4519_pilon	-	2631	7	Intergenic	novelGene_123733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	25.0111086430721	16	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	528	1244	802412	763354	TRUE	15	TTCTTAGTAGTTTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAVMIPGLLRGSVGTTCTRAALLRLTPRSLRHLTLTSVMKSKRKTDHMERTADVVRREVVSTAKVCGAANESPSVKRLHLLVAEKDFSFKAGQWVDFFIPGVSVVGGFSICSSPRLLEEERIIELAVKYTNHPPALWIHNQCTLDSEVALRVGGQFFFDPQPTDASRNLVLIAGGVGINPLLSILRHSADLLRERANKGSGFEIGTIKLFYSAKNTSELLFKVRGRGKRMFHSLP	810896	761283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_763639_768630_768773_788185_788293_801943_802008_802293_802421_810377
798785	contig_11422_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_99034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1400
798786	contig_14017_pilon	+	1545	2	Intergenic	novelGene_165678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	925	1413	29686	34756	FALSE	20	TCCTTTGCCTCAACCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKVSKPEHLLPSLKWQ	28761	34888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524
798788	contig_5797_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_56902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAACTGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20778	18808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_18800_20800
798789	contig_9011_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_159328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAACACCATCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588666	588056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_588100_588700
798792	contig_3789_pilon	+	2171	7	Intergenic	novelGene_79853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.065224972188	2	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	149	592	445610	465911	TRUE	10	CAGTGTTTTCCATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVILTSFAVADDSSDNVSTLCLGAAEQRHDCVILVWNTI	445461	473622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465797_465913_467056_467110_468585_468691_472202
798793	contig_2069_pilon	+	2133	15	Intergenic	novelGene_23326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	2.9666513796136	90	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	206	1927	569452	574392	FALSE	5	CCCTTGTCTTGGTGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGKGTYGVVYAGRERHTKVRIAIKEIPERDSRFSQPLHKEIALHKRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKIFMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLSYLHDNRIVHRDIKGDNVLINTFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTGTLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVIEMATGRPPFYELGSPQAAMFQVGMYKVHPPMPSSLSAEAQDFLLRTFEPDPLLRASAQALLGDPFLQPGKKSRSPSSPRYAPRPSDIPSACPTPSADSTTQSQTFPCPQAPSQHLPSPPKRCFSYGGTSQLRVPEESGAEEPPSPEESSGLSLLHQESKRRAMLASVLEQELSVLADSLRLEQEQGPQLGRSQVEQLLRCLGAHIHTPNRRQLAQDLRALQRQLRAQGLGPVLLQGPLFAFSDAVKQILRRRQICPHWMFVLDSLLSRAVRAALAVLGPEMEKDVVSPLSEEPSKEKGSQTKQQETPVHCNPLPKDPEQGPPPLMVQLGLLRAETNRLRAVLAEKERECQALMQRALQQVDGEARTRPLASERLAAFPADQGLVQWLEELSVDSGTIQTLLNHTFTLRALLTSVTRDDLIYTRIRGGMVCRIWRAILEQRAGAAPGTPGLRETE	568940	574598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_569037_569342_569471_569702_569840_570289_570396_570911_571070_571160_571354_571464_571604_571909_572070_572199_572377_572830_572937_573216_573389_573468_573582_573670_573745_574021_574099_574301
798796	contig_9242_pilon	-	1170	13	Intergenic	novelGene_155060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	78.1030302442443	2	28	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	65	598	404330	383729	TRUE	45	TTTAGCAAAACAAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGIITAFNFPVAVYGWNNAIAMICGNVCLWKGAPTTSLISVAVTKIIARVLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAKDEQVNLLSFTGSTQVGKQVALMVQERFGRSLLELGGNNAIIAFEDADLNLVIPSAFFAAVGTAGQRCTTTRRLFLHESIYDEVVNKLKKAYEQIRVGNPWDSDVLYGPLHTKQAVNMFLGAL	404394	371062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_371313_372640_372717_381994_382069_382271_382370_383654_383735_385173_385233_386411_386497_389018_389114_391417_391460_396071_396170_397611_397690_400726_400772_404304
798797	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
798798	contig_9415_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_109920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAACCAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2184170	2183498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2183500_2184200
798799	contig_5690_pilon	+	1295	9	Intergenic	novelGene_119743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	484.774883322146	3	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	73	384	1078679	1088260	TRUE	30	AGAGAAATTTCACGTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGD	1077691	1105965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1077740_1078654_1078720_1086391_1086568_1087638_1087729_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
798800	contig_2043_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_169925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCGTGACAATGTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791441	790671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_790700_791400
798806	contig_20420_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_172480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGAGCCTTCAAGCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37940	40097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_+_37900_40100
798808	contig_13481_pilon	-	2192	3	Intergenic	novelGene_119266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_2	23	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	439	888	35868	33268	FALSE	85	CAAAAAAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDLFSLLEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGSLPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRNTPIEALCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYEYLRTLFTDLFERKGYTFDYAYDWVGRPIVSIFFLPCHFLPQTSIAPSHYLPVFLLKSMETFL	36306	31963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_33522_33796_33882_35757
798811	contig_11978_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_62961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGAAAAAAGATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115862	1115196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1115200_1115900
798813	contig_12920_pilon	-	831	2	Intergenic	novelGene_166340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTTTCTACTTCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193158	187113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_187313_192526
798816	contig_5791_pilon	+	1494	3	Intergenic	novelGene_35810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	360	junction_1	15.5	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	295	606	325962	334832	FALSE	55	ATTGAAAAAAGAAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKKKRKSPGVAAAVAEDGGLKKCKISSYCRSQPPARLISGEEHFSSKKCLAWFYEYAGPDEVVGPEGMEKFCEDIGVEPENVCFISKQNGIQVGDSIFVHF	325667	335720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_326048_328474_328567_334698
798819	contig_16716_pilon	+	1574	5	Intergenic	novelGene_169280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	24.1505693514666	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	38	757	155552	170709	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCTAGRGLERFLMREVRARLAATQIEYISGKVFFTTCSDLNTLKKLKSAERLFLLIKKQFPLTVFSASKGKIFKELQKLINDDPGSWLNAISLWKSLLELDAKNEKLSQESSPPLKRKVEENEIIVAKKLKTEQMQELQENRECQLEKQTGEETLEQEDFITKREDFQEEEFQNDVEKAIVGHNQKDLTFRVSCRCSGAVGKTFTAQEVGRIIGIALMKQFGWKADLRNPNLEIFIHLNDIYSVVGIPVFR	155514	171526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_155588_164327_164464_166650_167064_168148_168227_170652
798822	contig_8637_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_175179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTACCTCCTGTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258500	258003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8637_pilon_-_258000_258500
798823	contig_10500_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_41140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59760	61621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_59800_61600
798825	contig_7695_pilon	-	1028	5	Intergenic	novelGene_41560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.785041295675	532	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	62	595	380076	375835	TRUE	20	TTCAACTTAGGGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTARNSLYDMARYEREQYADRARYSAF	381066	373565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_375915_376478_376521_379664_380089_381017
798826	contig_15063_pilon	+	773	4	Intergenic	novelGene_14142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.1359091687616	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	170	532	34808	39515	FALSE	25	ATATATTCTCCTTATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34638	39756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34880_36433_36600_38975_39092_39506
798828	contig_10386_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_173541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCAGCCTGGAGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104289	106266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_104300_106300
798830	contig_6767_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_174615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAATTACGCTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16744	18766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_16700_18800
798831	contig_6589_pilon	+	1265	7	Intergenic	novelGene_26179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	51.2510162500868	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	15	695	1901836	1911490	TRUE	15	TTGATTGTGTTCTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLRMRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901821	1913577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901909_1903195_1903448_1903648_1903762_1903824_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
798833	contig_4232_pilon	+	2454	6	Intergenic	novelGene_63153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	36.7314579073578	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	554	1219	18294	21268	FALSE	10	CTCACTCGTCTCATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQATKRKHVVKEVLGEHMVPSDQQQIVRVLRTPGNNLHEVETAQGQRFLVSMPSKYRKNIWIKRGDFLIVDPIEEGEKVKAEISFVLCKDHVRSLQKEGLWPEAFSEVAEKHNSRIFPQVVCVLSFCTVGHLVPGLMLCFLHVFADGEQPCLMACLRLILLEAVRITALEPRATCLQETLRTNPVMPQEPRSPLFRGPPFVTAGVLISAAVREAQPLAHP	16909	22503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_17347_18177_18381_18506_18616_18713_18823_18993_19035_20948
798834	scaffold_12124_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_22191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGACTGTGGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271948	1269873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1269900_1271900
798836	contig_13245_pilon	-	706	3	Intergenic	novelGene_148821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6357	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26872	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_26093_26457_26749
798838	SIRV4	-	224	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1299	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3859	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
798839	scaffold_880_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_121404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAAGGTGCTCTATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295309	295963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_295300_296000
798840	contig_934_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_129006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	31.5841028929991	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	559	1146	38975	28541	FALSE	55	GAATGAAGACGAATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVFQYIQEKHHQEDMLRNLSQNHHIMQNDSCLKEQKKELDSSFIKKSGCPRKDEISSESLQNMGKLYEEKWTCCGVTCYYFTTEHKTWKDCQQICQNYGSFLLKIDDKDELVFIQSQAYHNTYWIGLAYDNMENKWKWVNSSTSSGFNFTIMSLPSRRGNCAFLTSTRITDIRCSNTYNCICEKRVDCIFPNSL	39533	28539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_28683_35551_35659_37441_37585_38779
798841	contig_14405_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_85636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATAAATCTTACCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411241	412266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_411200_412300
798843	SIRV2	-	650	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	32	4	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGACGACGTCGACACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
798847	contig_10990_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_7499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATCACCTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733060	731572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_731600_733100
798849	contig_19469_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_134991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAGTTGTGTTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96031	97637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_96000_97600
798850	contig_5039_pilon	-	2245	13	Intergenic	novelGene_64938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	19.4055762318177	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	267	839	1480078	1469121	TRUE	85	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELARQQLRDQLDEVEKETRAKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSIEAERLKQKEQERKILELEKQKEEAQRRAQERGKQRLEPMQREDEHQRPRKLHDEERLKRDECVKKKDMEDKGRPEVQDKLTRLFLQHPEPAKAAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKISENEVPAPAKPATGPASAPAPKLALRETPAPFAGPASEPSTTPNNWADFSSTYV	1496870	1443801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1444168_1444512_1444705_1446781_1446900_1450881_1451004_1456631_1456799_1460819_1460900_1461725_1461932_1464674_1464823_1469113_1469379_1477867_1477990_1479885_1480116_1481900_1482029_1496769
798851	SIRV4	-	243	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	368	6	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
798853	contig_6277_pilon	-	1292	8	Intergenic	novelGene_80402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	10.6617760897402	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	173	1264	343301	322281	FALSE	15	TGTTCTTTTTTTAATGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRRLREVPRHLLVCEKSNFGHDKSRHQRLVETHYYNYRVSFLIPECGILSKELKSLVMGTGPYYFVKNLPLHELISHEFINTFVKKGACYALTYNTNIDEDNTVALLPNGKLILSLDKDTYEETGLQGRPSQYSGRKIMKFIISIDLMDLSFNPDSKNCKRTSWSFKEKKPLKFDFLLAWHPTGAEESTMMSYFSSYQIQEHQPEIALSTLMDLPCPVLQSHALQGVPEAACSAQELFDWLGAVFSHVNLNNEPNNFISTYCCPQPSTVVSKAYLCTVTGFLLPEKISLLLEQLRRYFNEPKLAPWVSLSVQGFADSPVSWRENEHGFRKGGEHLYNFVIFNNQDYWLQMAVGANDDCPT	343473	322252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_322480_324191_324327_324440_324640_326628_326755_327517_327614_328160_328230_341040_341186_343178
798855	contig_6048_pilon	+	1203	5	Intergenic	novelGene_73089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	225.257075360576	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	41	487	130291	135654	FALSE	5	TCTGGACTTTGCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRRGTRRAGGCRMMRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEMGLA	130250	136370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_132370_132550_133132_133242_134181_134320_135636
798856	contig_10331_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_54175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAGTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556727	554615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_554600_556700
798860	contig_5815_pilon	+	352	4	Intergenic	novelGene_141238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	11895.13684943	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	102	320	1044174	1046025	FALSE	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1041403	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
798862	contig_5125_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_43486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGTACTCAGGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165845	163773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_163800_165800
798864	contig_7864_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_164861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTAAAAGAAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108240	106454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_-_106500_108200
798865	contig_6710_pilon	-	147	3	Intergenic	novelGene_95608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2457.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657825	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653447_653853_653882_657793
798866	contig_2323_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_151853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAATTTGTTTAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130732	132009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_130700_132000
798868	contig_1625_pilon	+	2093	17	Intergenic	novelGene_174946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATCACAGAATAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80867	102315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1625_pilon_+_81157_84534_84594_85477_85558_86543_86699_87806_87922_88813_88910_89038_89115_89526_89703_90772_90864_90962_91082_91388_91513_94880_94976_95477_95553_96260_96396_97062_97179_98156_98327_102193
798869	contig_7744_pilon	-	3034	18	Intergenic	novelGene_62494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	321	716	686637	682905	TRUE	10	CAGAGCGTCTGCGGCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYDALHSVQEPAVDACEFIQALHRVTSPQSSCHHKDPLICWGLQLHITDWLYSVIKAHTVLIHHAQGLLESFLKRTPNAHDFTDTLHAAPNLCADTQELAEVPARDLHHTIIQTWLKGCCSPCHRVPELR	687189	675467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_675725_675969_676109_678045_678176_679011_679161_679340_679478_679668_679840_680042_680229_680418_680532_680892_681034_681295_681432_681572_681807_681938_682162_682336_682525_682790_682916_683098_683232_685924_686038_686498_686743_686974
798870	contig_1910_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_168279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTAGGTTCACAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52437	50028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_-_50000_52400
798873	contig_16917_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_161935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATAAGGTAAAAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143275	145274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_143300_145300
798876	contig_13257_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_175183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	473	805	473	805	NA	35	ATGCATTCCTTGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEHCLLSASPLTHELLRPDGLRLFPGQVCQLLAASEPSLPPPATLSGSSTLPWMFRSPRLPYIIELLVFSGICFKRVHQKRLTTPPCCHPCPYSFLPHPSIRSSKLFF	0	1559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13257_pilon_+_0_1600
798878	contig_7426_pilon	+	1257	8	Intergenic	novelGene_27524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	6.49018096662888	8	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCAGAGTCACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026075	1032539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1026121_1028595_1028671_1029855_1030179_1030265_1030353_1030536_1030582_1031433_1031522_1031736_1031811_1032019
798881	contig_818_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_167990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGCAGCTTTGGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515943	515494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_-_515500_515900
798884	contig_6576_pilon	+	163	1	Intergenic	novelGene_42234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGCCACACACACTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228771	228934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_228800_228900
798886	contig_3975_pilon	-	2184	8	Intergenic	novelGene_54862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_7	196.742761711109	1	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	110	553	2066301	2065412	TRUE	20	GTGACCCAGGCTAAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQLSAFSIPSTTVLAGSVREGGSWAETPNPRVTPYLQSPCDSDWLGVGARGTNGKL	2079250	2062974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
798887	SIRV1	-	230	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3578	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
798891	contig_13657_pilon	+	1047	3	Intergenic	novelGene_174397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCAACACGTCCAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87424	100561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13657_pilon_+_87902_98777_98824_100037
798894	contig_8558_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_123173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCAGAGGACCAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141902	1142757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_1141900_1142800
798895	contig_8558_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_123174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTTTTGCAAGTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142808	1143303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_1142800_1143300
798896	contig_10749_pilon	-	471	3	Intergenic	novelGene_133487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	763	junction_2	11.5	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	108	440	167375	167043	FALSE	10	GTCAGTGTTCCTCTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWKEERIKPRWWCKGLGRKHRHNVEIQCRAAGAKSMSSLHWVPWRCQPCPSTAYQSCLSSRPLSPSPRSSPRESSVPPMWTPSTCATTRVSRMPTPRTLPTSWPPPSSMPTTCPWNASFESLGSWHGGTRNGDGQEDAEENEESS	169057	167011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_167395_168302_168346_169012
798898	contig_10863_pilon	+	432	4	Intergenic	novelGene_59343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	10.6562449087639	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	106	432	120858	182136	FALSE	25	GTATGTCTTTTAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPNKTPPGADPKQLERTGTVREIGSQAVWSLSSCKPGFGVDQLRDDNLETYWQSDGSQPHLVNIQFRRKTTVKTLCIYADYKSDESYTPSKISVRVGNNFHNLQEIR	119333	182136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_119427_120845_120973_161840_161932_182015
798900	SIRV4	-	332	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1191	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3967	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
798903	contig_7839_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_45682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	5.24404424085076	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	617	1048	103166	103881	FALSE	40	CAAAAATACTTCTGTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVPLGNQADVFPEGTIRPVHDDILIAQLRPGQEIDLLMHCVKGTGKDHAKFSPVATASYRLLPDITLLEPVEGEAAEELRQCFSPGVIEVQEVQGKKVARVANPRLDTFSREVFRNEKLKKIVQLARVRDHYICEYFGWIK	102231	104354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_102292_102512_103055_103151_103305_103491_103642_103738
798904	contig_15731_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_171971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCAGGCTTCTCCCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15334	15881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_15300_15900
798905	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	120	-1	-67	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	53	373	2458	10736	FALSE	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2405	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
798910	contig_14684_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_99682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAAAAAAAATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410224	410905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_410200_410900
798911	contig_14711_pilon	+	1652	5	Intergenic	novelGene_68881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	41.0205741061726	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	78	641	65704	67289	TRUE	30	AAACTCATAGGATGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKVDKLQEPLLEALRLYTRRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGPMPPLIQEMLENPEMFEDDSSQPGPHPKASSEDEVPGGQGKGGQSPQPDQGP	65076	68384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_65154_65703_65909_66294_66454_67089_67732_67815
798916	contig_8885_pilon	+	2581	3	Intergenic	novelGene_115580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	4.5	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	380	1150	222558	259949	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMVWKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTSYSEQEYGKAGGSPASYHGSTSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQVSAWSVSPVGAERGGLQGGSQHSPVFKTS	159964	261380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_160154_222367_223126_259746
798917	contig_10904_pilon	+	1077	8	Intergenic	novelGene_22579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	256.461478191011	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	71	652	439135	453854	FALSE	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEAWRL	438405	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444426_453838
798921	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
798924	contig_8269_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_106263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAATTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389372	390500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_389400_390500
798927	contig_6740_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_142675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAGCGATATTAACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607893	609220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_607900_609200
798930	contig_11363_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_160487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	224	589	148328	148693	NA	15	ATCCCTCTAATTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVCSTQGLQKPVAVRSVLTHSDPIGQSRTASYSFQGALGGFELPTFWLAAVTLNHFTTSVSTRNILLGKLVFEKVELHFFDVCPWSHLLRPSQAKHCAESSLPFCQKLTTENTGNDAQR	148104	149494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_148100_149500
798931	SIRV5	+	421	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2250_2316_3298_3405_3483
798937	contig_10042_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_79148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGTTCCCATAACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113682	114605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_113700_114600
798941	contig_9027_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_156360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTTCTTATGATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117407	115308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_115300_117400
798945	contig_16109_pilon	+	1941	2	Intergenic	novelGene_80335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	454	1203	285957	286706	FALSE	45	TAAAAGCATGAAAGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEVILHYRPYESDPTQLPKIAEKAIQDFPTRPLSRFIPWFPHDGSKLALKPKKSSPVISEEAAEDVKRHLTILDVKSQSYDCTVDLLEFQPNLKMKKHLIQSHTLGEQTNSENLDKQSGKEKRHLKRSWSVSVPNSNCPEKILPLSKKLQDILKSLNLHSFYRARWTIEQNICDTQTLEDIWAKLNRIIRHKELPYCNATVQRHLGQIWVFCDIMYCEYVGNLLKERLSLTGKMNLFVRKCGVIFSM	282487	287444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_282822_285837
798952	contig_8330_pilon	+	1457	5	Intergenic	novelGene_71914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	15.0228991875736	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	922	1293	1267378	1268601	FALSE	60	TTAAAAATAAACTGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLRDRHGRTIWFQGDPGPLVPKGSKSRKKKSKETQPGREDRKEDPPPPSKAPSRARKARRDLPKQPAAQELERTSLQQDHRAPRIPKKGKRRGRAATSGRRRPQKTKTDTPSLEPERTSAS	1266456	1268765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1267423_1267755_1267784_1267960_1268023_1268193_1268360_1268530
798953	contig_5684_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_81018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6312	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTGTGAACTCGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361516	351254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361315
798954	contig_7119_pilon	-	1829	10	Intergenic	novelGene_41020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1483	1821	209472	209134	FALSE	40	ACTTCCAACCAAATCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTSQLSSSLFCMPPKCSMGQPLCNLLKQIQINHEVKRNNTWAQVKLPRRSARIQCRIMPCRKNKIAVPNSLRTPKTPPSTTHAHSSRATKAWLAKIYSPKKENPHQTPKI	223410	209125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_210028_214743_214900_215608_215749_216230_216338_217061_217142_217268_217326_218344_218455_221061_221174_222160_222239_223323
798955	contig_6589_pilon	+	719	6	Intergenic	novelGene_25785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2189.08547115	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	284	412	671073	671366	TRUE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WENRDRRKRGEAKGETRRKTASKGSKIEGEKRVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTIFSD	668307	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669690_669748_670000_670104_671046_671188_671352_671412_672584
798959	contig_20844_pilon	-	865	8	Intergenic	novelGene_78612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	409.085889888813	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	186	761	206899	204834	FALSE	20	ATCATCCTCCACGTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	208130	204729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205734_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086
798960	contig_13854_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_154117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30575	32875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_30600_32900
798961	contig_8576_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_88757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAAGAGGAACTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715217	713806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_713800_715200
798962	contig_10749_pilon	-	1491	9	Intergenic	novelGene_133427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	10.9708420369633	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	107	1207	116862	112517	FALSE	10	CCCAGGTCTGTTTCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEEQGSGITTGCGLPSIEQMLAANPGKTPISLLQEYGTRIGKTPVYDLLKAEGQAHQPNFTFRVTVGNTSCTGQGPSKKAAKHKAAEVALKHLKGGSMLEPALEDSSSFSPLDSSLPEDVPVFTAAVAATPVLSAVPTRSSPMEVQPPVSPQQSECNPVGALQELVVQKGWRLPEYTVTQESGPAHRKEFTMTCRVERFIEIGSGTSKKLAKRNAAAKMLLRVHTVPLDARDGNEVEPDDDHFSTGVGSRLDGLRNRGPGCTWDSLRNSVGEKILSLRSCSLGSLGALGPACCSVLSELSEEQAFHVSYLDIEELSLSGLCQCLVELSTQPATVCHGSATTREAARGEAARRALQYLKIMAGSK	116968	112232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_112675_112829_113032_113426_113555_113872_113991_114207_114281_114870_114967_115528_115632_116091_116262_116809
798969	SIRV7	-	190	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69090	0	35871	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78867	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
798970	contig_3942_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_128719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCGGCTCTCCGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526712	525198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_525523_526551
798972	contig_5196_pilon	-	1423	4	Intergenic	novelGene_38680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	15.5848929700813	27	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	257	784	170180	132419	FALSE	75	ATTTAAAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLESDRPGLKFPVLPLTKRSIRDVTLKTKVHLTQAMVFSTASDACESWTRNKEDRRRTDAFKFMVVAKNIEYAMHCQKNKQVLEEVQPECSLEARMMRLHLTYFGYVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSMRWIDTVAATMGSSRTMIVRMAHDWEVFCSVVHRQSRYEL	205644	131779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_132876_170109_170203_204391_204525_205543
798973	contig_10196_pilon	-	1651	6	Intergenic	novelGene_132305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	560	880	2368777	2364376	TRUE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAWNFYILLSAVLVPFLRVCSPPTSASFFFVRTFSTSMRIFWDSSTFPSAPSCSALARSFPISSFNSWTFSALAETSALISSWVSASRFLASSVLRSHSAMKDSR	2369555	2348167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495_2352597_2364367_2364477_2365371_2365564_2368749_2368926_2369144
798975	contig_7426_pilon	-	2070	1	Intergenic	novelGene_27460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	151	510	598372	598013	NA	30	GAAAGCTTCGGACCATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKFPGIPLTRSQGNAFCLFCDSTKPSHSDTRARFYQHLPTNATANRWQFFNLKTTEMPYRCCGLTSFLRNVTLKNYPRQHDDQKKTATAALHVYKAAKNSRHPQPATPLGSSNTLSKS	598522	596452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_596500_598500
798977	contig_20165_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_54490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAATGAAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267978	268304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_268000_268300
798978	contig_7202_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_17204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27896	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
798979	contig_9363_pilon	-	1242	9	Intergenic	novelGene_6764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.972887157356	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	152	1003	1548961	1505564	FALSE	10	CCCAGTTGTTGTGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIILPSH	1549112	1505324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505578_1539053_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
798981	contig_6058_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_172379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1	6	298	303	375333	375338	NA	35	TTCCAGCCAAAGAACACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGPQGPGQLHEHQPKLKCLSPPCWLCPCPVLTTRHPPAHLWRALCTWRGPESQEGIREHKREQPASRTCPNARVLWPHPNRQQRNPRLEHSELCQGTPM	375035	375535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_375000_375500
798982	contig_6058_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_172381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	375590	375889	NA	10	GCATTTTCTCCTGCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLTGGATGSGPEGGREGLAARQEESGSSAPGRFQLGPLRRGWGGDGALFHLPWSPELTCSDRCWASAQTSSLRLTGTGPGLRGGLLALGLLHLGGVSV	375587	376236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_375600_376200
798985	contig_6361_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_24030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTCATTTGGGTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628751	629608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_628800_629600
798987	contig_14142_pilon	-	1457	14	Intergenic	novelGene_120594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.932974406687	16	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	166	1365	598441	584636	FALSE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFNQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598606	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584739_588748_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
798992	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
798993	contig_16126_pilon	-	1151	3	Intergenic	novelGene_141877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	7	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGTAAAATGCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49774	47082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_47271_48546_48675_48939
799000	contig_1813_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_105496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144499	143378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_143400_144500
799001	contig_2114_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_104218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAAAAAGCCTTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137009	135060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_135100_137000
799002	contig_5988_pilon	-	3076	1	Intergenic	novelGene_16123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTCCTCCTTCCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305592	1302516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1302500_1305600
799005	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
799006	SIRV6	+	506	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	19	49	12	-49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
799008	contig_8978_pilon	-	1417	8	Intergenic	novelGene_49331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	928.460608771754	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	21	1091	194082	190773	FALSE	65	AAAAATAAAGTATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLVIPWAPENLTLRHLSESQLELSWDNRYLDHCLEHLVQYRSDRDRSWTEQSVDHRRSFSLPSVDGQKLYTFRVQSRYNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTWGSNTSKENPLLFALEAVLIPLGSVGRCPEFPPSRTWRTWLLNTMGTFRGVSKGLAESLQPDYSERLCHVSEILPKGGALGEGPGGSPSSQHSPYCPPPCYTLKPES	194102	190446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190951_191286_191357_191638_191693_192265_192444_192867_193008_193215_193398_193613_193768_193967
799010	contig_11978_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_62838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATGAGCAATGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478299	477165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_477200_478300
799011	contig_5981_pilon	-	1041	2	Intergenic	novelGene_35502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATTTCTTTGAACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38416	25413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_25635_37596
799012	contig_9297_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_69816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACATACAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333841	333296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_333300_333800
799013	contig_10732_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_114690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGAGCTGGTTGAACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86840	86390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_86400_86800
799014	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
799015	contig_9875_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_154422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGTCTTTCTTCCGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417235	419033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_417200_419000
799016	contig_5916_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_158057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480178	478106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_478100_480200
799017	contig_7411_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_136959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17496	15087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_15100_17500
799021	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	3	1163	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799022	contig_18869_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_56264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
799023	contig_6842_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_130707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTGGCACAGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415841	413742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_413700_415800
799026	contig_9293_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_175189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGTAGAATCCTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17786	18792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_+_17800_18800
799030	SIRV6	+	361	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	495	0	322	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
799031	contig_10434_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_82062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATGTAATTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177417	176585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_176600_177400
799033	contig_6710_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_95025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTGTGCCCAACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
799037	contig_12046_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_83452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTAATCTGCTGTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125418	126064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_125400_126100
799039	contig_8461_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_163920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTTGGCTATACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363175	361480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_361500_363200
799048	contig_12239_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_170477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCTGGGGAGTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80668	78312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_-_78300_80700
799050	contig_14618_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_136831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109839	1110438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1109800_1110400
799051	contig_12157_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_135889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAACACATGCAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78513	79233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_78500_79200
799058	contig_6589_pilon	+	1417	4	Intergenic	novelGene_26067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	61.1882341631134	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	216	683	1757003	1758336	FALSE	30	GATTGTAAAGTGCTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRPLVLLLLLPSILVPPSTAAPIRDGDFQESSSGLLGLQSLLQGFSRLFLKDDLLRGMDSFFSAPMDFRGLPRNYHQEENQERRLGNNTLSSHRQIDKMTDNNTGEVLISEKVVASIEPAEGSFEGDWKVRTCPTKCLLLLLGLSSRFQLIVTV	1756535	1759070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1756732_1756983_1757159_1757897_1758039_1758165
799066	contig_740_pilon	+	806	2	Intergenic	novelGene_158942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	0	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTTGTGTCATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199868	201992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_+_200403_201720
799070	contig_5125_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_43485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCTAACTTTCAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151914	152461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_151900_152500
799072	contig_7760_pilon	+	2212	3	Intergenic	novelGene_138438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	98	874	243131	246549	FALSE	30	ACTTAAGCAAAGGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLYKVPEQYTLVGHLPSKSRESSPGPRLGKDMSEEPFNIWGTWHSTLKSGSKDPGMTGSHGDIFESSSLRPGLYSLSQGNLSPNWSRWQGSPTELDSGTQVIRRTQTTATIAECRAHPPVSRVCSTPHAQGSSRRSEQSTSRSEQSLTLSSAEDLSDSELDVVWLQTRAKPLYQRPRESGRPDKRPPPPYPGPGKQALASSQQPAEPLLWRRQQPEEGSGTALEEGSQASEQEHQATQQKLSSGYSARASDQNSKKLGDPSWLDWQRERWQIWELLSTDNPDALPETLV	242178	247887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_242274_243128_243210_245851
799075	contig_10126_pilon	+	153	1	Intergenic	novelGene_105743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156737	156890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_156700_156900
799076	contig_5484_pilon	-	2238	10	Intergenic	novelGene_151082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334518	48607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_48855_137525_137718_201594_201679_238749_238861_246563_246695_250576_250683_263865_263965_302317_302414_318733_318924_333536
799077	scaffold_12510_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_151375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTTCTCTTTCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226857	224749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_224700_226900
799079	contig_6833_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_175129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAACTTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169367	170315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_169400_170300
799080	contig_6102_pilon	+	1724	2	Intergenic	novelGene_32228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900821	904358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_901785_903597
799081	contig_19564_pilon	-	2982	11	Intergenic	novelGene_29675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	68.0385185023895	10	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	87	800	82991	75969	TRUE	30	CGAGAGCTATTCTAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLDQHLRPPARRPGTTTPARVDLQQQIMTIVDELGKASAKAQQLPAPITSASRMQSNRHVMYVLKDTSARPAGKGAIIGFLKVGYKKLFVLDDREAHNEVEPLCILDFYIHESFQRHGHGRELFQHMLQKERVEPYQLAIDRPSQKLLKFLNKHYKLETTVPQVNNFVIFEGFFAHQHRPPSSSLRATRHARAAAVDPTPTGKLAVNGWSHSAAMASHSRGSGEYSAICGQFWRILKHPRSPAVITWLSLPSWELSTFYTWQDF	83544	70448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_70783_71288_71369_74005_74248_74442_76229_76341_76388_82060_82163_82336_82451_82561_82623_82748_82841_82952_83014_83480
799082	contig_12750_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_172621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATTCATGCCTATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24684	25189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_24700_25200
799083	contig_10016_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_117841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	126	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	926	1258	211450	211118	NA	35	GTTATTTACTAACTAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIRGINATRTISNNTQEPEERLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQHTDWEKIFGYDKSDKHLIFNIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDI	212375	210486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_210500_212400
799084	contig_3241_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_146388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCATGGGTCGAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756434	754084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_754100_756400
799085	contig_10890_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_166793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153152	154160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_153200_154200
799087	contig_3077_pilon	+	1183	8	Intergenic	novelGene_26638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4085.95398897247	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	531	926	13867	17828	FALSE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAHTC	9602	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9720_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16284_17814
799089	SIRV4	-	400	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1108	13	1108	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTACTTAAGAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4050	3650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799090	contig_11590_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_125563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTATACAGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48268	47939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_47900_48300
799092	contig_11590_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_125562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTCTCTAGGTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46838	46190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_46200_46800
799093	contig_715_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_167556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATTTTAAACAAGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142784	144725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_142800_144700
799098	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_97173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
799099	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	16	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657178	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
799100	contig_6434_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_61893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATCAGTGCTTTCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903181	905080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_903200_905100
799101	contig_1719_pilon	-	875	5	Intergenic	novelGene_87362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_3	399.987812314325	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	62	607	803613	754873	FALSE	35	ATTTTGTAGCTTAATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803674	754604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
799103	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
799105	contig_5350_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_99367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGAGAAACCAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227495	229277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_227500_229300
799106	contig_6206_pilon	-	431	2	Intergenic	novelGene_168149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	77	430	98576	95739	FALSE	25	GTATGGTAAGTGTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSGLPLESSKNSCSFQNPSSFDPNMLLQRFSVAPRETQTQRGGEFQCSLEASAVYSEHANANNLTFLMDLPSAGRSTLEASDQEEHLSPLDFLCSASFSLGAINQRLSKRERSKLKNLRRKQRRHERWLQKQGEYPGVGLLD	98652	95737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_95769_98252
799107	contig_7189_pilon	-	1108	2	Intergenic	novelGene_117668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTTTAGTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031870	969966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_970986_1031781
799112	contig_9519_pilon	+	2309	10	Intergenic	novelGene_172079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	11.9443152447793	83	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	439	1842	473122	485957	FALSE	35	CAATTTAAAATGAGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNEVEASTTNGQPDQQATPKAPSKKEKKKGPGKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDVPDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNKISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKKKTEEANKAVENGSEVLMNLDVQPTKLKLGIDQMDLFGDMSTPPDLNSPTESKDILLVDLNSEIDTNQNSLRENPFLTNGITSCSLPRPKPQASFLPENTFSTNLNFFPTPNPDPFRDDPFTQPDQSTPSSFDSLKSPDQKKENLSSLSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRTGKQEAQAGQWPFPSTQTQPAMRTQNGVSEREQNSFHVKSSPNPFVGSPSKGLSVSNGVKQDLESPVQSAPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKVNCLLHISIGRMHVRYQRVV	437892	486424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9519_pilon_+_438232_473022_473213_475450_475591_476384_476484_478398_478531_479133_479215_479623_479651_479881_479936_480346_480410_485240
799114	contig_9571_pilon	-	1711	2	Intergenic	novelGene_136292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504026	502012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_502383_502685
799116	contig_14786_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_174709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCAGAGCCGAGGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61938	62342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_61900_62300
799118	contig_8156_pilon	+	2128	13	Intergenic	novelGene_98910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	67	junction_6	104.197295496999	18	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	7	2109	137749	166292	FALSE	25	AGCAATATCCCCTTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRLDSPSAPDKPVVLPAIMPGDSFAVPLHLTSWRLQARPKGLGVFFCKAPIHWTNVVKTTEVSSSKRECHSMDTEKSRFFRFCVAIKKENYPDYMPSNIFSDSAKQIFRQPGHTIYLLPTVVICNLLPCELDFYVKGMPINGTLKPGKEAALHTADTSQNIELGVSLENFPLCKELLIPPGTQNYMVRMRLYDINRRQLNLTIRIVCRAEGSLKIFISAPYWLINKTGLPLIFRQDNAKTDAAGQFEEHELARSLSPLLFCYADKEQPNLCTMRIGRGIHPEGMPGWCQGFSLDGGSGVRALKVIQQGNRPGLIYNIGIDVKKGRGRYIDTSMVIFAPRYLLDNKSSHKLAFAQREFARGQGTANPEGYISTLPGSSVVFHWPRNDYDQLLCVRLMDVPNCIWSGGFEVNKNNSFHINMRDTLGKCFFLRVEITLRGATYRISFSDTDQLPPPFRIDNFSKVPVVFTQHGVAEPRLRTEVKPMTSLDYAWDEPTLPPFITLTVKGAGSSEINCNMNDFQDNRQLYYENFIYIAATYTFSGLQEGTGRPVASNKTITCAELVLDVSPKTQRVILKKKEPGKRSQLWRMTGAGMLAHEGSSVPHNPNKPSAARSSEGSAILDIAGLAAVTDNRYEPLMLRKPDRRRSTTQTWSFREGKLTCGLHGLVVQVSSFWHHQLQQAVVETSLTPQSPTRMYMICC	137742	166311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_137786_137978_138190_143081_143330_145529_145722_146025_146153_147749_147893_152479_152611_152836_153013_156877_157002_157838_158075_160153_160263_164877_165042_166087
799119	contig_2715_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_173169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCACTAAGATAGAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88278	89377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_88300_89400
799124	contig_14822_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_145402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGTGCATATGTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115918	117400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_115900_117400
799128	contig_6842_pilon	+	863	7	Intergenic	novelGene_130766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	299	junction_6	314.521152795095	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	28	654	1330090	1377191	FALSE	25	AATGAGCATGGAGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSRSDRSKLMITDVFLSFPYFSVSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1330062	1377400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
799129	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
799131	contig_9363_pilon	-	1128	9	Intergenic	novelGene_6659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	87.5099101530792	291	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	121	783	1013530	1009478	FALSE	60	TTAAAAAGAAAAAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEFFQKVRTIRQTIVKLESKVRELEKQQVTILATPLPEESMKQDLQNLREEIKQLGREIHTQLKAIEPQKEEADENCNSVNTRMRKTQHGILSQQFVELINKCNSMQSEYREKNVERIRRQLKITNAGMVSDEELEQMLDSGQSEVFVSNILKDTQVTRQALNEISARHSEIQQLERSIRELHEIFTFLATEVEMQGEMINRIEKNILSSVDYVERGQEHVKTALEYQKKARKKKILIAICVSVTVLILCVIIGITIAVG	1013905	1009132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1009562_1009641_1009753_1010764_1010903_1011144_1011222_1011305_1011415_1012877_1012949_1013457_1013533_1013669_1013770_1013887
799133	contig_11429_pilon	+	1069	7	Intergenic	novelGene_60456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1123.75151711676	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	53	430	46162	48451	TRUE	40	TCATGGAGCTGATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISEVVVVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYG	45414	49460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45445_46139_46265_46512_46620_47263_47370_47457_47519_48450_48530_48899
799137	contig_4364_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_4472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGACTTAAATCCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
799138	contig_17274_pilon	+	2219	3	Intergenic	novelGene_26592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAATACAACAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251814	259035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_252226_252354_254032_258904
799146	contig_1516_pilon	+	1775	1	Intergenic	novelGene_49933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140990	142765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_141000_142800
799148	contig_8059_pilon	+	1632	14	Intergenic	novelGene_111098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	74.5298478789006	1	82	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	370	705	266127	279478	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKVRNFTFL	173927	342013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266137_275614_275710_278417_278541_279370_279491_283677_283736_292994_293044_327563_327644_336437_336520_338661_338891_341596
799149	contig_2703_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_101756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570958	573484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_571000_573500
799155	contig_7356_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_60357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1012	1326	105896	106210	NA	50	GCTCTTAAAAATTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRIELLHRVFKAVTFQKQITRPVFRGTSGWVQTANLSTNRCSTVGTTQGLLTETGPEQLLLLTAQKDTGQLLRASKERTNHHLGSCQGLEPEPKSDQASGSSC	104884	107005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_104900_107000
799157	contig_4407_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_122268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17573	18464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_+_17600_18500
799158	contig_10369_pilon	-	555	4	Intergenic	novelGene_171060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	231.149783089282	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCTTTTTTCCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318071	305392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10369_pilon_-_305571_310246_310350_311515_311618_317899
799159	contig_11106_pilon	-	1147	7	Intergenic	novelGene_167450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	72.2534120686044	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	289	921	159313	133474	FALSE	25	TCTAAAGCATATCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNNPYATTEENSTELSINTEVYSLPSRKLVALQLRSIFIKYKSKSFCEKLLSWVKNSNCARVIVLSSSHSYHRSDLQLRSTPFRYLLTPSMQKSVQNKIKSLNWEEMEKSQCIPGIEDSEFCVRIPGGGITKALHEESCCREIPMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQIIKPCMDDSTVSALPWKIPSSWRLLFGSGLPPALF	162172	133247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_133567_134427_134549_151410_151585_152477_152597_155942_156002_159246_159415_161985
799162	contig_5758_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_119105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246831	244911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_244900_246800
799164	contig_1143_pilon	-	1684	11	Intergenic	novelGene_86607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_10	118.194796839793	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	184	1269	249983	228758	FALSE	30	TCAGTGTCAGATCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKDASWELEENAYQELLQHYERCDVRRCRCKEGREYNAPNSKWEIKRCQCCGSSGTHLACSSLRSWEQNWECLECRSIIYNSGDFQKAKKHALPNSNSMGINDCLLEESSPKLLKQSPGAQSKDLLRYVYELEKNINISLEKITTRNYLQY	295039	228342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_228967_229069_229195_231297_231415_232073_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_254862_254932_294929
799165	contig_13456_pilon	+	1234	2	Intergenic	novelGene_153317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	3	467	599836	600300	TRUE	40	AGATTAGTCCGAAGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVRVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELSVHVLELCSRVRAVCSRVRTVC	599833	601400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_600386_600718
799167	contig_15114_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_121097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTATTGTTGTAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30480	31504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_30500_31500
799170	contig_7151_pilon	-	1686	9	Intergenic	novelGene_40653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	131.568423263335	1	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	34	1581	65162	1924	FALSE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWSTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	65195	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_18271_18479_18570_18880_40400_40716_65077
799172	contig_6710_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_95819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
799173	contig_1719_pilon	-	2304	4	Intergenic	novelGene_87255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	13.9124245031395	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCAGCAGCAGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104882	92366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_94451_95117_95162_100649_100789_104845
799174	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_1122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
799175	contig_5698_pilon	+	1157	3	Intergenic	novelGene_55013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	365	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTAAACCTGTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7894_19863
799177	contig_10042_pilon	+	989	6	Intergenic	novelGene_79205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	39.4512357220911	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	92	496	1054190	1067625	FALSE	10	GGTTTTTGTCTCAGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQRM	1028999	1068118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526
799183	contig_3469_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_34141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGCAAAAGAAAAACAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245536	246264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_245500_246300
799184	contig_253_pilon	-	765	4	Intergenic	novelGene_129784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	37.5440482041502	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATCCCTGATGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097447	1091169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_1091242_1092900_1093454_1093822_1093879_1097363
799185	contig_15185_pilon	+	1029	5	Intergenic	novelGene_99427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	33.203915431768	167	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	293	760	363687	369975	FALSE	30	TTCTCCAGAGTCATGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLHGLPGNHSPPISARTSHVATVLRQLLELVDKHWNGSGSLLLNKKFLGPARDLLLSLVVPAPSQPWCRAHTEDTSKAFRRREIDLKEAGQLVPNDMESLKQKLVRVLEENLILSEKIQQLEEGAATSIVSGHQSHAYDDLLHKNQQLNMQVACLSQELAQLRKLEETVALLHESQRSLVVTNEYLLQQLNKEQKGYSGKALLPPEKSHHLGRSSPLGKTTLSSSSPAANDTGQYLIQSVSNAVPEPSLWS	362424	370244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_362574_363543_363690_364672_364797_367481_367597_369749
799187	SIRV2	-	515	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1098	24	-65	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACACAAGACATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4797	3689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
799193	SIRV2	-	414	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3	3019	-1	-389	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGACGTCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5788
799194	contig_1076_pilon	+	982	5	Intergenic	novelGene_101129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	142.948417270007	336	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	454	867	973982	989508	FALSE	20	TCTTGATGCTTCCTAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAELFKILSLKLEDWVAVA	945658	989623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980865_988168_988246_989457
799200	contig_6710_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_96462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653630	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
799204	contig_10937_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_67327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCCACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145303	144075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_144100_145300
799208	SIRV4	-	320	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1193	8	1193	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3965	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799209	contig_14450_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_49024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTTGAGTGCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201327	1199706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1199700_1201300
799212	contig_1090_pilon	-	1310	2	Intergenic	novelGene_131137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	655	1164	482910	481596	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFRTHGACLSIDLNEYLSSSLSSKRLADTSSSCLDWLMALRSHNKYAGLMVSSFPSIVMFFLVCLFSSWKPLGLFNFRSATLASEYNCNYEITRGLHVRKLSLKEIKKTTKKPEPIAVKSIPIHGDSTCDRVELLHMVFLAIIFAKADCQVFPLWCQWVASNHQFLG	483564	481449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_481993_482797
799214	contig_6497_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_35549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAAAATTTACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92027	92857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_92000_92900
799216	contig_10750_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_172613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACATTTGACTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171073	172328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_171100_172300
799220	contig_5836_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_106280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTAATAATGATGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103868	103042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_103000_103900
799222	contig_5640_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_27257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144602	146759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_144600_146800
799225	contig_9099_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_149895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268258	266526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_266500_268300
799226	contig_15134_pilon	+	1879	7	Intergenic	novelGene_140217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAGTGACACTCTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184303	195833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_184539_187359_187457_187929_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194800_194916
799227	contig_10446_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_162470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAGAAGGTGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658099	657025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_657000_658100
799228	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799229	contig_12520_pilon	-	2841	1	Intergenic	novelGene_161057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTATGCAACTTTGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339205	336364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_336400_339200
799231	contig_7810_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_144226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGAAGAAAACTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402235	401559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_401600_402200
799233	contig_8059_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_111082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAATAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90280	91204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90300_91200
799237	contig_5649_pilon	-	1671	11	Intergenic	novelGene_82402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47.525256443285	62	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	156	1424	1286943	1249073	FALSE	35	TTTGATTAAGATTTCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFGWAVFLASRSLGQGLLLTLEEHIARFLGTRGTTTMGNSCICRDDSGAEDSVDTQQQQSENSAVPTADTRSQPRDPVRPPRRGRGPHEPRRKKQNVDGLVLDTLAVIRTLVDNDQEPPYSMITLHEMAETDEGWLDVVQSLIRVIPLEDPLGPAVITLLLDECPLPTKDALQKLTEILNLNGEVACQDSGHPAKHRNTSAVLGCLAEKLAGPASIGLLSPGILEYLLQCLKLQSHPTVMLFALIALEKFAQTSENKLTISESSISDRLVTLESWADDPDYLKRQVGFCAQWSLDNLFLKEARQLTYEKVDLNNIRAMLNSNDVSEYLKISPHGLEARCDASSFESVRCTFCVDAGVWYYEVTVITSGVMQIGWATRDSKFLNHEGYGIGDDEYSCAYDGCLSIYAKSLLSLYLNSKYVF	1287098	1248825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1249137_1261321_1261369_1270967_1271112_1272067_1272184_1273155_1273288_1274126_1274194_1276017_1276077_1276851_1276979_1279129_1279243_1280476_1280530_1286596
799240	contig_17108_pilon	+	1762	9	Intergenic	novelGene_109552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGGAAGGAGGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415253	442464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_416114_419051_419184_421902_421989_424207_424277_425248_425498_425626_425737_436850_436906_437040_437166_442388
799241	contig_5967_pilon	+	1719	3	Intergenic	novelGene_44336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	0.5	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	45	467	378963	383538	FALSE	35	CCAAATAATCTAGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRRPRCSAKGSKMAGWQSYVDNLMCDGCCQEAAIVGYCDAKYVWAATAGGVFQSITPVEIDMIVGKDREGFFTNGLTLGAKKCSVIRDSLYVDGDCTMDIRTKSQGGEPTYNVAVGRAGRALVIVMGKEGVHGGTLNKKAYELALYLRRSDV	378918	384790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_379095_381203_381397_383440
799244	contig_13224_pilon	-	1490	6	Intergenic	novelGene_104101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	37.5307873618447	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	395	790	263277	262566	TRUE	5	CACTGTTGTGTTGTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGQGNPQIWRVVQGSSARAHVLSWYQQLKGSGPTFLLSQREGPPPTYGLGVNPRFLAELGLAQNGACRTVGNASPADEGICYCAMWFSGQCIFGEGTRLLYQERMLEAPREDTCGRDKLRVHALLNKLG	283307	260545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_260922_262070_262365_262535_262649_262964_263325_281780_282020_283199
799245	contig_4496_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_66710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTGAGGTTCTTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227354	1228821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_1227400_1228800
799247	contig_9633_pilon	-	2576	11	Intergenic	novelGene_139658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	21.0342577715497	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	942	2360	1232299	1215655	FALSE	35	AATAAAGCATTCCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPEPKDVHQLNGTGPTASPRPADGPGREPLAGTSEFLGPDSTGVEVVVIESRANAKGVREEDALLENGSQSNESDDVSTDRGPAPPSPLKETSFSIGLQVLFPFLLAGFGTVAAGMVLDIVQHWEVFQKVTEVFILVPALLGLKGNLEMTLASRLSTAANIGHMDTPKELWRMITGNMALIQVQATVVGFLASIAAVVFGWIPDGHFSIPHAFLLCASSVATAFIASLVLGMIMIGVIIGSRKIGINPDNVATPIAASLGDLITLALLSGISWGLYLELEYWRYIYPPVCAFFVALLPVWVVLARRSPATREVLYSGWEPVIIAMAISSVGGLILDKTVSDPNFAGMAVFTPVINGVGGNLVAVQASRISTFLHMNGMPGENSEQAPRRCPSPCTTFFSPDVNSRSARVLFLLVVPGHLVFLYTISCMQGGHTTLTLIFIIFYMTAALLQLLINCTGAQENELSFQHNH	1234929	1215438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1215715_1215819_1215969_1216279_1216415_1218630_1218711_1219613_1219762_1220351_1220499_1221469_1221615_1222243_1222316_1223366_1223475_1231924_1232930_1234618
799248	contig_6980_pilon	-	2664	1	Intergenic	novelGene_36056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	128	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTATTACCATATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354504	351840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_351800_354500
799254	SIRV6	+	227	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	502	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10739	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11123_11219
799256	contig_4782_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_73695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGTTCTGTCTTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797275	798116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_797300_798100
799257	contig_14048_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_146344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613208	611764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_611800_613200
799259	SIRV6	+	157	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	788	51	788	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11025	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
799260	contig_13954_pilon	-	1429	8	Intergenic	novelGene_130046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGACCAAAAACAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89689	35391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_-_35519_60809_60928_64421_64573_67371_67532_68451_68693_70040_70302_82874_82991_89434
799261	contig_383_pilon	+	1959	10	Intergenic	novelGene_126080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_7	45.4519146264475	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	62	1900	21066	50438	FALSE	35	CTCTAGGAAGAATCTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETIRSLGQAEGRKPAESTEEMASCLKADWNRRFQTLVFRAAHLLCFSTLICELMDQREVAAWTYHHSTTAYPWNVSRAFCQKYYTDLVAIQNKNEIAYLNDVIPYYNSYYWIGIRKINKVWTWVGTKKTLTEDAENWADNEPNNKRNNQDCVEIYIKSSSAPGKWNDEPCWKKKRALCYTASCQDMSCSKQGECIETIGNYTCSCYPGFYGPECEHVRECGEVDLPQHLLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCPKGYTLKGPSKLECLASGNWTSKPPQCVATQCPPLEIPEQGSMACLPPEKELQHQSSCSFRCEEGFALVGPEEVRCTASGVWTAPAPVCKAVQCRLLEAPSKGTMDCAHPLAAFAYGSSCKFECQPGYRVRGSDTLRCIGPGQWTAPMPACEAIACDPMESPVHGSMDCSPSSQGFQYNTSCSFRCAEGFLLRGAKMAQCSDLGQWTAPAPVCQALQCQDLLTPNKAQVNCSHPFGAFRYQSACSFTCDEGLVLVGANVLQCLVTGNWSAVPPECKAITCTPLLSPQNGTMTCIQPLGDSSYKSTCQFSCDEGFSLSGPERLDCTSSGHWTGSSPTCEGRITGLSFLTAFHITLWEWTISRDSCKSVLQLKQTTRSPQNMVI	21004	50497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_21069_34860_34952_37371_37759_39957_40066_40538_40725_41553_41740_42327_42514_44073_44260_46204_46391_50118
799264	contig_10557_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_171923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGCAACTATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55942	55262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_55300_55900
799266	contig_13272_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_163947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCCCCCCAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75378	76765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_+_75400_76800
799268	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	60	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799269	contig_11816_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_98575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAACACCTTTTGTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300111	1298287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1298300_1300100
799271	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
799273	contig_3004_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_127521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAATGACAAGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339279	337180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_337200_339300
799275	contig_5018_pilon	-	2272	19	Intergenic	novelGene_47174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	17	844	1565188	1562727	TRUE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQTEMNSGFRLVPRMGRVIPMQGLTWMKQALVRSPRRAKELCRTSGMESCMHWKSSVMMLLRATSCSTWPPRPSARPLSRSSATIMKSLSGASYCSGCWFGAHHGLGQRLLHQGDTALVDRLTVGQEATLEGSGHRRQALQQWEEVLVFILELVPLLDQWGHQLLDVFRLVEVVAHRVSQGADGIIEDEQVLVLVLAEGKDEGVQDVAEVGHQLRAGLFLQGGKGTAGCLLYPLVAIQDAFEQLGHQGLEMHVRRLADHPVGIAAQRPTGDGADQGLLV	1565204	1553459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1553540_1554934_1555048_1555888_1555963_1556044_1556196_1558370_1558477_1558562_1558698_1558776_1558857_1558932_1559055_1559153_1559276_1560364_1560426_1560521_1560686_1560858_1561016_1562663_1562888_1563094_1563269_1563744_1563830_1563914_1564036_1564134_1564285_1564864_1564965_1565151
799277	contig_2069_pilon	+	1490	5	Intergenic	novelGene_23356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	38.0032893313197	151	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	177	1175	947018	955281	FALSE	15	CTTTCTGTGGCTTCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAPTTAFGQVVIGPPGSGKTTYCLGMSEFLRALGRRVAVVNLDPANEGLPYECAVDVGELVGLADVMDALRLGPNGGLLYCMEYLEANMDWLHAKLNPLRDHYFLFDCPGQVELCTHHGALRSIFSQMVQWDLRLTAVHLVDSHYCTDPAKFISVLCTSLATMLHVELPHVNLLSKMDLIEHYGKLAFNLDYYTEVLDLSYLLDHLTSDPFFRHYRQLNEKLVQLIEDYSLVSFIPLNIQVLGTRRPLPPGFPRAWDLITSRDKESIQRVLQAVDKANGYCFGVHEQRSLEAMMSAAVGADFHFSSTLGIQEKYLTPSDQSVEQEAMQL	946841	955596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_947429_947996_948154_949924_950152_951355_951487_955208
799278	SIRV4	-	488	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	126	3	-126	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAAGCTAGCGTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
799279	contig_12042_pilon	-	1592	9	Intergenic	novelGene_170436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_8	29.2871025367823	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	70	1392	190427	154328	FALSE	35	CTTTCAAGAAAGATTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCRRGVGSRGGWARGVGEEWEAGMGGLRLLAVALTCCWWPHGSQGKTLRGHFSSAAARDAQGQSIGHFEFHGDHALLRVRISNIATAVGKEAKLYLFPAQEWLKLQESSHGYSCSEKLSKALLTMTVNQTEHNLTVSQIPHPQTWHVFYADKYTCKDDFENSQVEDIQFEMMLLNPDAEGNPFDHFSAGESGLHEFFFLLVLVYFVIACIYAQSLWQAIKKGGPMHMILKVLTTALLSQAGSALANYMHFSSYSKDGIGVPFMGSLAEFFDIASQIQMLYLLLSLCMGWTIVRMKKSQSRPLQWDSTPASTGIAVFIVITQSILLLWEQFEDTGHRSYHSHHNLAGIFLILLRICLALSLGCGLYQIITVERSTLKREFYITFAKGCILWFLCHPVLACISVIFSDYQRDKVITIGVILCQSVSMVILYRLFLSHSLYWEVSSLSSVTLPLTISSGHKSRPHF	190496	154127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_154487_155465_155544_157074_157267_159636_159795_163363_163414_163553_163735_178308_178510_186908_187068_190282
799280	contig_7004_pilon	+	2123	16	Intergenic	novelGene_126479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.1927895082258	114	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	617	1969	405049	408168	FALSE	25	TACCAGCTCCACACACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLAGLFRTILGDKILLFTTDGPEGLRCGTLQGLYTTVDFGPADNMTKIFTQLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKFQEIPLGPLPAPSPKMMLGPLTLHLDGSLLAFLDFLCPQGPIRSILPMTFEAVKQDHGFMLYRTHLVNTFTEPTSFWVPNNGLHDRAYVMVNGVFQGVLERNIKHRLFLTGKMGDKLDVLVENMGRLSFGSNSSDFKGLLEPPLMGHVVLTQWLMFPLKIDNLVKWWFPIQLPKRSQPSTPSGPTFYSATFPILGLVGDTFLYLPGWSKGQVWINGFNLGRYWTKRGPQQTLYVPKPLLFPRGTFNKITLLELENVPPRPQIQFLDRPILNSTLYRTYLYSLSAGEQMELSGH	402259	408322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_402356_402537_402705_402952_403104_403286_403349_404817_404913_405003_405179_405266_405326_405432_405555_405663_405705_405918_406038_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
799286	contig_5586_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_143604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGTTGTTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666044	665121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_665100_666000
799290	contig_19744_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_120353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATAAATTTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22006	22553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_22000_22600
799291	contig_11396_pilon	+	2732	2	Intergenic	novelGene_71296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2294	2596	370819	371121	TRUE	10	CCCATCGCCCCGCCCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGPTSSLETVSNSASVAAGTSTTSEMAFWKARYSVSSWAGCSWSSVARSLLFLTDTKLASVSSISSFRSPCSWCRSACSDASRPAPRASSTCCSCTW	368525	371792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_371221_371755
799294	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	3	1166	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799296	SIRV6	+	451	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	217	-14	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCAATCGGTAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520	2526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
799299	contig_5200_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_140173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCAGTACATAGCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470508	472964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_470500_473000
799301	contig_20719_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_140571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTATTTTCAAAGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56802	56254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_56300_56800
799304	contig_20719_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_140563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGTCTGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12852	14966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_12900_15000
799305	SIRV7	-	372	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	10	-32	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
799306	contig_15498_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_42724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTTTTCCCAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072094	1071464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_1071500_1072100
799307	contig_4857_pilon	+	1079	2	Intergenic	novelGene_48852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAACTGTTAATTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331491	1339924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1338905
799314	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
799316	contig_10904_pilon	-	1967	3	Intergenic	novelGene_22767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	0.5	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	65	649	688227	684515	FALSE	90	AAAAAACAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLQGSVHHQLQDRAGFGGCAMSPTPTTLLGLLLCLGPTIQARQGYLPRPSISAEPGSVIPWGTSVTFVCQGPPEVEVFLLEKDGKPDSLPDVKNSSGIETEARFPISSVKTDTAGRYNCIYFIGNANSEPREFLELVVTGEAPSRAASHLILSPHVCSQVLGPVPSSTISQQTPSLPPASPPIYFGSLSPSAHLSPLLSDTSEVPGDLGLVWTQ	688291	683196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_685030_687522_687559_688193
799317	contig_19606_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_148275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAAATGTATATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52112	52994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_52100_53000
799318	contig_16098_pilon	+	1054	9	Intergenic	novelGene_45908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	61.9374684661877	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	304	966	321962	336931	FALSE	10	TTACCTGCATCCGTCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294706	337019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306428_306572_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335906_336034_336814
799319	contig_10299_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_79802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGATAGTTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806838	806082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_806100_806800
799320	contig_10299_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_79803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGCCTGCAGACCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807505	807020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_807000_807500
799321	contig_17059_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_166090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAGGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439894	438656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_438700_439900
799322	contig_12623_pilon	-	2297	8	Intergenic	novelGene_138164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	177.046978661205	37	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	12	1133	177710	51811	FALSE	35	GAGATAATGTAGGATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGSPTPPLPSVMSPSRVAASRLAQQGSDLIVPAGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177721	50646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_141648_141745_147430_147540_177617
799326	SIRV7	-	269	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69007	4	35788	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
799327	contig_15104_pilon	+	1123	8	Intergenic	novelGene_163370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	24.9227377537633	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	578	1123	946672	961101	FALSE	25	AGGGGCTCCCTTCCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLWSSTPPAVAKLGDSLAEENSRDENRALVHQLSNESRLSVTDSLSEFFDAQEVLLSPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQTLGPVLESGREVKSKRRTCLPAPCPNTSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIPNPLERMV	928331	961101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_928471_930502_930607_932193_932351_943499_943631_946625_946735_953526_953662_954761_954856_960847
799328	contig_2114_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_104293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAACCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770939	773065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_770900_773100
799329	contig_10446_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_162505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAGGTGTTATATACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977715	979045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_977700_979000
799331	contig_4364_pilon	+	1123	4	Intergenic	novelGene_184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	900.364864312734	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	70	408	1268714	1270358	FALSE	15	GGAGCCAGTGTCCCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGHTSLSVPRFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1267036	1271073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269061_1270269
799334	SIRV2	-	195	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	7	1077	7	-1077	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAAATGGTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	4742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
799337	contig_12689_pilon	+	2496	1	Intergenic	novelGene_145048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	1	603	174557	175159	NA	30	ATTATAACTTTTTGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSEDRRTVLQAQPWNGQPGAGELFGGFPSVLGSERLSAGRHYWEVEVRDRGSWLLGVCKEDADRKDSPTWTPEHGFWSKGDLFPAGVFSPQKTLHPRVGVFLDYEAGELSFYNVNEEAHIFTFPRAVFSGPLRPIFITPSWCQTRLTICPTPGNGTKDAPSADGGKPLEASLRGSSKPPLFVFGNVPASDPSLPPQRNI	174556	177052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_174600_177100
799338	contig_10302_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_175199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTTACCCCAGCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2354	739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_-_700_2400
799339	contig_17108_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_109516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAAAAAAAAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46406	47986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_46400_48000
799343	contig_5779_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_106415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACCACTGCACCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51702	53190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_51700_53200
799344	contig_12485_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_147280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGAAAGATAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111255	110402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_110400_111300
799345	contig_6304_pilon	+	1291	7	Intergenic	novelGene_122241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	357	junction_6	108.061196653666	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	38	931	70293	162408	FALSE	40	GCATTGTATTAAATACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGPPQQYSGQEDYYGDQYSHGGQGPPEGMNQQYYPDGNLS	70255	162768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695_128850_132145_132368_161430_161599_162289
799347	SIRV6	+	479	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	25	514	18	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
799348	contig_11396_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_71268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTGCAGTTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218679	220119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_218700_220100
799350	contig_14326_pilon	-	1609	3	Intergenic	novelGene_120693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	45.5	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	20	925	177243	173747	FALSE	10	CATTTGAGGCTTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVDRLPMVAGPLSPQLLTSPFPNVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSMFGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPISEDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMSYHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQVWVGSSSGLPPLEPLPSDLPSWDFAQPALWRSSHSVPDTAFSLSLKKSFPALENLGPAHSSNPLFCPAPPGYLRQGWTAPEGGRAFAQWPVG	177262	173062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_174026_175279_175344_176680
799352	contig_9386_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_175208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTCTATTCATGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87779	90438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9386_pilon_+_87800_90400
799353	contig_7151_pilon	-	1059	6	Intergenic	novelGene_40797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1370	junction_2	498.724533184402	3	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	162	800	551180	529189	FALSE	25	TACTTCTCAATTGGCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551341	528929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
799355	contig_12050_pilon	+	2069	3	Intergenic	novelGene_62626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_2	13.5	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1224	1559	342792	343127	FALSE	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLVRGPHFENPRPSGHVMTTLKLAMVGQLGDREVKGFGVKPISLPPLALPAVASCPPPPIHLRVTLHLPRQVGEQSLLLWSLGLRALAYAYCSGAQLPSRLLGWQSPVD	340694	343637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_341422_342204_342256_342346
799358	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	276	-74	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
799359	contig_5967_pilon	+	1760	2	Intergenic	novelGene_44394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTTGTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395342	399630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_396268_398795
799360	contig_9777_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_154430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCTCGCTGCCACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61097	60523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_60500_61100
799361	contig_5423_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_85180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCTCTTCTGTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174543	173458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_173500_174500
799362	contig_5423_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_85179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172315	171599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_171600_172300
799363	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
799366	contig_10163_pilon	+	1803	11	Intergenic	novelGene_82637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	204.518849986988	1	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	170	574	149701	165117	TRUE	40	AGACTGGAAATTTTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIVRFHDIISDAEIEVVKDLAKPRLSRATVHDPETGKLTTAQYRCLAVWL	146705	186445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_146825_149650_149848_152146_152324_155412_155473_165096_165197_175174_175229_181219_181286_183288_183341_183871_183969_185518_186186_186231
799371	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
799373	contig_3281_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_128529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	28	408	139814	140194	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAATFFSSTMPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIASEASRLAHYNKRSTISSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	139786	140593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_139800_140600
799374	contig_9098_pilon	-	1991	12	Intergenic	novelGene_75855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	163.402661398357	1	114	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	187	1308	350397	336537	TRUE	35	TGAAAAAGGTCTGTGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQSNFRTNQ	350583	335383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337026_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330
799375	contig_10307_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_170285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAAAAATTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510122	512108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_510100_512100
799376	contig_11631_pilon	+	1121	8	Intergenic	novelGene_104206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	462.716513027762	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	200	970	257487	283438	FALSE	20	GAAAATTTCCTTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTNTTRNSSKKSWRRSPGLRKGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	257287	283589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257554_260494_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390_281540_283353
799383	contig_6980_pilon	+	1598	2	Intergenic	novelGene_36030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	150	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346094	354575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_353050
799385	contig_12046_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_83488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCCAGAGTCCTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459035	440200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_440614_458999
799387	contig_17470_pilon	-	1661	9	Intergenic	novelGene_110476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_6	6.67083203206317	90	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	174	1496	103770	90458	FALSE	30	AAAGCCTTTAGGGGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTASQQDSPRLAAFLRRVEGMVIRELNKNRQSHAFDGFEVNWTEQHQTVSCLHTLGYPPAQGQGLHVTSVSWNTTGSVVACAYGRLDDGDWSTLKSFVCTWNLDRRGLNPRQPAAVVEVPSAVMCLAFHPSQPAHIAGGLYSGEVLVWDMSRPEDSLLWRTGLTDDTHTDPVYQVVWLPVSGHSHRFQLLSVATDGRVLLWQGVGTGLLQLTEGFALVAQQLPRNTKLKKPTRGETEVGVTAVAFNSFDPSLFVLGTEGGFPLKCSLAAEEAALTRVPSSVPLRAPTQFTFSPHGGPIYSVSCSPFHRNLFLSAGTDGHVHLYSMLQAQPLTSLQLSHKYLFAVRWSPVRPLVFAAASGEGDVQLFDLQKSSQKPTVSIKQTQDESPVYCLEFNSQQTQLLAAGDAKGVVKIWQLSTEFTEQRPRETEDLDHLAVEVAT	114482	90292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_90697_90942_91101_91429_91663_91946_92115_92639_92750_93356_93515_94036_94147_103623_103874_114412
799388	contig_11825_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_155419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATTAAAATTTTTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113043	112720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_112700_113000
799389	contig_6707_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_167041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGTCATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176315	178124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_+_176300_178100
799391	contig_5997_pilon	+	1948	2	Intergenic	novelGene_168615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACGCATTGAGATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328857	331573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_329039_329806
799392	contig_6361_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_23877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTATGGATAGTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72876	72115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_72100_72900
799393	contig_9177_pilon	+	1670	15	Intergenic	novelGene_32663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_13	46.5335626078596	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	890	1525	105101	106963	TRUE	20	TATGGCCCTAGCATTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPQW	100318	108348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106956_107026_108265
799395	contig_5827_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_129798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAGGAGACGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455653	457332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_455700_457300
799396	contig_5467_pilon	-	1483	10	Intergenic	novelGene_111959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_9	21.548108679286	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	166	858	113214	107896	FALSE	25	TGAAGCGCATTCAGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIARRARLRSASCEFSNRRDPAGLSLTEPTSPLGESARSPNGETAGGPSSAGEVDMRLAGPLRIVALIITAGLTWIVISILLGRPGSGFPRIQQLFTSPENSVTAEPRARKYKCGLPQPCPEEHLAFRMVSGAANVIGPKICLEDKMLMSSVKDNVGRGLNIALVNGVSGELIEARAFDMWAGDVNDLLKFIRPLHEGTLVFVASYDDPATKMNEETRKLFSELGSRNAKELAFRDSWVFVGAKGVQDKSPFEQHVKNSKHTNKYEGWPEALEMEGCVPRRSTAS	113648	107270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_107992_108751_108879_108955_109041_109325_109377_109734_109794_109913_110038_110546_110571_110948_111063_113201_113275_113543
799398	contig_11896_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_88014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGTTCTTCTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144899	144499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_144500_144900
799400	contig_11896_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_88013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTTTTATGCTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143777	143024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_143000_143800
799401	SIRV2	+	429	4	Antisense	novelGene_SIRV2A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGCTTCTTTGAGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743	2981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV2_+_1843_1965_2062_2671_2802_2877
799404	contig_11448_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_66407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACCTATAGGGCAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505287	506420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_505300_506400
799406	contig_9682_pilon	+	655	7	Intergenic	novelGene_125282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	219.438677842657	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGGGAGAAGATCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2375	14675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_5575_5702_10756_10828_12614_12827_14041_14083_14645
799407	contig_10658_pilon	+	1995	1	Intergenic	novelGene_130079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229035	231030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_229000_231000
799408	contig_13300_pilon	-	1466	2	Intergenic	novelGene_125761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAATGTTGGCTCTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46270	44712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_46086_46177
799409	contig_11253_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_126824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTTTACTTCAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122492	122144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_122100_122500
799410	contig_5643_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_39153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCGGCTGCTAACCGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669056	667664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_667700_669100
799411	contig_12836_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_170411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCATCACATGTGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8339	10414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_+_8300_10400
799413	contig_6589_pilon	+	1147	7	Intergenic	novelGene_25832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	34.4899341193276	450	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	108	1121	897401	939875	FALSE	5	CCCAGCGCCCCGGCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRPAEPRIPVLREAYENNISEISEKLPGEYFRYKGIPFPVGLYSPDSISIVENASDVRDDDIFIVTYPKSGTNWMVEIVSLILKDGDPSWIRSVPIWERAPWCETIMGAFSLPDQSSPRLMSSHLPIQLFTKAFFNSKAKMIYLGRNPRDVVVSLYHYSKIARQLKDPGKPEQFLQDFLNGEVQFGSWFDHIKGWIRLQGKENFLFITYEELHQDLCGSVQRICEFLGRPLSEEALGSVVAHSSFGAMKANTMSNYTLLPPSLLDHRRGAFLRKGVSGDWKNYFTVAQSEAFDRIYREQMRGQPTFPWDEAPKDASPDLEPSPDPSPGQAPETPYH	897293	939901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_897472_918663_918807_929431_929641_934092_934220_935022_935118_939258_939440_939687
799414	contig_2933_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_111364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGCCTGAGGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863077	862408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_862400_863100
799415	contig_2933_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_111363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTGTAAAAGGCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862306	861546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_861500_862300
799422	contig_10196_pilon	+	944	8	Intergenic	novelGene_132138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	404.824829842665	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	425	754	1046427	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034551	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038387_1043858_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
799424	contig_4315_pilon	-	1383	4	Intergenic	novelGene_46783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.663996924429	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	156	305	353316	328146	FALSE	5	CATCCTGTGTCTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTPPPQDGFRRTRLSPVTSPQGSGPSQWLLRPAGSWPVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRLLSGPPKPPPSQLRRTGTPSS	357127	327067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328212_350824_350888_353295_353356_357011
799425	contig_6589_pilon	+	1354	6	Intergenic	novelGene_25699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGGCAGGTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178798	185684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_179322_179683_179902_183729_183828_184901_185082_185263_185529_185614
799426	contig_10011_pilon	-	2557	2	Intergenic	novelGene_68078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	451	1671	304222	299612	FALSE	45	GAAACATGAAAGTGTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQGPDLQRGSEPPEAQVQKFENQEETSQSVAPKNTHPQDLPGQARGEVPWSPEQGRPRDRSEGHWDPPPPEDQKEQSLVGATSCRELERPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLYMGVECGDIFGGNSHFLSLHRAQLGEEAHKCLQCGKSFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKSFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSACGEAGSDCTPFLTNHGAPKVEKKLFECLTCGKSFGQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG	304672	298725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_300773_304162
799427	contig_12923_pilon	-	3002	12	Intergenic	novelGene_30186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1573	2205	464818	455738	TRUE	40	ATCAATACATGGAGAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPVALWLCTGRNNHHKSREPIAKGTEVQHLDVVSAEAVHHLQVPDHQEEHHSFQQHPEEAGEEKVVQGACDDGTAGLVVGLVYTGEEEHLGQEEAPAEVQVEVGVVVTDGTTQQERGNGQGEAHQGDDHAHVANHVQRKLHLELSRSHDDGQVRHPITAADGTHLGSLKDHTARGCPPPALHVRAPGNTYRLIKLLLWLDILQSVHDWI	492551	451004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_451338_452801_452980_454262_454379_455567_455771_459693_459866_462174_462369_464584_464822_479291_479360_483641_483731_488089_488259_488370_488478_491415
799429	SIRV6	+	262	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-427	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1858	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
799430	contig_2380_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_117890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACCCTTTTAGCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142899	142192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_142200_142900
799432	contig_16532_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_110047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	226	681	892	1572	194747	194067	NA	40	ATAAGAGCAATTCATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLYALAALYMHAGCATNFQAAIRLLGMRQVHPPTGINHSMGAMFICDGARHTRHLHSVDKVKAIIIYRNQTVNNNNRFPKGKRLPFPDYPCPFLCRWAGALWFKSDAMFTSPLPLATATLPEASALPLDLAGPRLEGQEDPCTGFPMPLLPATATLPAPAGLSCHHTARGHAVWRCGVGVCNPCLERSQVSLALHKQVFSSFSSTGKPPTLRHPAAPCCKKASA	195638	193611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_193600_195600
799434	contig_13947_pilon	+	2802	9	Intergenic	novelGene_173105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	4.6837484987988	27	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	143	2683	42070	60243	FALSE	25	AACTTTGGTTTTGATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNEQERLLCYNGEVLVFQLCKRKFADTGAAKTPILHVRRMVFDKGTRVFAQKSTGFFCMEEENSHFKIICCSCVSDLRTGLSLPHVMIQSEKDNVFNYFLLLLHSTNKFEKRLSFKLGYELKDSLRVLNGPLILWRHVKAVFCISSKTGTVVSVPVNFSSVVWAGEIGNLGIVLLGCTQRPSKSDCAIWNTKFCVYSLDHQEILPDTYVIPHAYSSVVTCVHVCATELVNNQLRMSLIALTQKNQLISFHNGTPESVCQLPFGDPCTVQLMDSSGEDSLFIVSFRSSDACAVWKKNFQIATKWEKIFSVLIDDFIGAGTEQVLLLWKSFLDSDCLTSFKITDLVSINYSSDALDCSEDILIEDIEKNSPHSLVIPALERRLKIGLASVQDLQQHLLLKEKVISKSCKALINLVQGKTDITSSTEEEYLVPLCGEKENPVHTFDEKISDDLKDSEHLIEKMWYRVMDDSLVVGVKTTSSLQLSLNDVTLSLLLDQACDSSFLLKCQNRVIKLSTGSLPASPSMPYEVGSEAKRIKLTLHSKEEKSFVCQQPSKKDCVQIITAVTSLPPLLALNNFCCIVLLQIRERKNGNHSENRSVPCGRLFLSLEDISRGKYLVTFPKNESVENMEDFFVLLAALHKFCFQITSSGHTLTSMRTWLLEYMQCEVIKEFPEMWFCKRPGSFYGTLFNWKQRTLCEGILIVYCRNQTVLFQCLHYLIRVLPVNCFFKKLKLGSEDFLIDHLALTLEKELVTLTSSLFSALAEVESNFVQQYEASKNKSSVIVASLSDREEKIHPYRKELQREKQQITLGMNLKVSGALYREITLKVAEVQLKSDLAVQKLASLKL	31557	60362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_+_31613_41982_42970_47827_47981_48738_48838_51353_51483_54290_54458_58481_58910_59029_59268_59816
799436	contig_9363_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_6738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACTTTGAGTGCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491875	1494092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1491900_1494100
799437	contig_1594_pilon	+	1639	2	Intergenic	novelGene_138846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	957	1280	691161	691484	FALSE	30	CCTAAAAGGGATCCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTRKVINPRDRKGYINQRLHHPETRTRWCPATTNDRPDREHNRESMMVQEKNRVQNSNSSKKTRLNRLRLEVPQKAWPPDSVNPELKQFLRPTLQTGLWDIK	690132	691843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_690883_690954
799438	contig_6048_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_73194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTTTATTTGCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455600	1454350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1454400_1455600
799439	contig_6048_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_73193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	212	325	1453985	1453872	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQASWPDCGKGLFGYVLRLRTRSKPLHTVSEEKSDVYLENQKESGKGPGQSGRKCRTKFKLIKKTRLTGLMETGGTPETMALRYPSDLNRTRSQRPPFSQMTDKSIK	1454196	1453443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1453400_1454200
799443	contig_8991_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_170934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGTGGGAACTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13752	11767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_-_11800_13800
799448	contig_10749_pilon	-	627	6	Intergenic	novelGene_133518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	48.4503869953585	1995	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	30	494	314624	311849	FALSE	0	TGTTGGTCTTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSVNITELNLPQLEMLKNQLDQEVEFLSTSIAQLKVVQTKYVEAKDCLNVLNKSNEGKELLVPLTSSMYVPGKLHDVEHVLIDVGTGYYVEKTAEDAKDFFKRKIDFLTKQMEKIQPALQEKHAMKQAVMEMMSQKIQQLTALGATQATAKA	314653	311715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_311926_312685_312792_312891_312967_313916_313949_314250_314354_314552
799449	contig_14341_pilon	-	962	5	Intergenic	novelGene_111884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_1	660.019128510682	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	217	885	729247	727088	FALSE	15	GACTCTGTGATGACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	729463	727010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_729079
799450	contig_9423_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_99192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTGGAGAGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123087	120794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_120800_123100
799452	contig_5961_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_144134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTGCAATTTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171531	170010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_170000_171500
799453	contig_2444_pilon	-	2134	2	Intergenic	novelGene_83789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	0	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	55	417	279787	261871	FALSE	45	CTTGAAAAGAACCCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSAGLVREVSTGFSETIMAARTGQGALRKVVSGCRLKSAAAAGAPAPAQSSARNVRYLASCGILMSRTLPLHTSVVPKEIHARTFFKITAPLINKRREYSERRILGFVYNNSSTKRAPLQFSMEYYASFSLDSVVVD	279841	260153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_262118_279671
799454	contig_14846_pilon	+	1817	4	Intergenic	novelGene_85370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	114.05554202522	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	79	468	66644	71427	FALSE	60	GTGCAAACTGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASGSSSPTAPLCQHRNSRLTAPNPTMEDSQELDLTYITERIIAVSFPASSSEESYLHNLQEVTRMLKSKHGDNYLVLNLSEKRYDLTKLNPKTMDVGWPDLHAPPLDKMCTICKAQESWLNSDPQHVVVIHCRVSEQRVPPEVVKVVGWRPSVV	62813	72776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_62870_66621_66794_69387_69439_71238
799457	contig_1435_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_115511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTGCTTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564925	565944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_564900_565900
799459	contig_7839_pilon	+	1290	9	Intergenic	novelGene_45677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	5.33268225192539	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	18	1058	100465	104122	FALSE	40	CAAAAATACTTCTGTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAKAVEEMRGRVVLGEFGVRNVHTTDFPGNYAGYDDAWDQERFEKDFHVDVVHMDENSLEFDMVGIDAAIANAFRRILLAEVPTMAVEKVLVYNNTSIVQDEILAHRLGLIPIHADPRLFEYRNQEDEEGTEIDTLQFRLQVRCTRNPHASKDSSDPNELYVNHKVYTRHMTWVPLGNQADVFPEGTIRPVHDDILIAQLRPGQEIDLLMHCVKGTGKDHAKFSPVATASYRLLPDITLLEPVEGEAAEELRQCFSPGVIEVQEVQGKKVARVANPRLDTFSREVFRNEKLKKIVQLARVRDHYIFSVESTGVLPPDVLVSEAIKVLMGKCRRFLDELDAVQMD	100447	104354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_100534_100655_100728_102183_102292_102512_102646_102934_103055_103151_103305_103491_103642_103738_103856_104003
799461	contig_7428_pilon	-	1638	4	Intergenic	novelGene_77719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	22.4251842554055	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	409	741	425802	424970	FALSE	45	TGCTCAATAAACCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVPLEDESVDVAVFCLSLMGTNIRDFLEEANRVLKPGGLLKVAEVSSRFEDVRAFLGAVTKLGFKVVSKDLTNSHFFLFDFQKTGPPRVGPKAELSGLKLQPCLYKRR	426210	424072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_425090_425312_425410_425492_425600_425793
799463	SIRV6	+	364	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	508	-1	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
799464	contig_6028_pilon	+	1517	7	Intergenic	novelGene_156604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	130.309460729279	17	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	222	797	384610	413558	TRUE	40	TTGAGAATACAAGCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILYSEPICQAAYQNDFGQVLRWAREDNDYINIQDGFNGDTPLICACRRGHLKIVSFLLRRNANVNLKNQKERTCLHYAVKKRFTFFDYLLIILLMPVLLIGYFLMISKTKKNETLVQMILDAGIEVNATDCYGCTALHYACEMKNQTVIPLLLEAHADPTIKNKDGESPLDIAQRLKFSQIELMLRKVS	384388	414319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_384631_402437_402630_407315_407424_409888_409967_412683_412783_413480_414127_414167
799465	contig_17518_pilon	+	1966	7	Intergenic	novelGene_117360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	906	1388	111436	119517	TRUE	55	CTACAGAGACAAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVLWAVGLELDFIVLRQDGLHLQAPIESTGHVEGCAAVLHGALYGGPKLLIAEAAHERPPAAGDVRDLGDGLHLLGAADAYLGDPQSTADVDPFGSTAGRFHRSTFLGTQQTLGLHPQGTCPAQPTALWHLEDSITGLVHADVAFVTEHHLVAILTVR	110530	128947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_111568_115128_115243_116526_116700_119453_119663_123195_123384_125571_125729_128859
799466	contig_12145_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_172320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTAGACTCCCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116167	114358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_114400_116200
799469	contig_15732_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_88909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTCCATTATGTGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296406	295170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_295200_296400
799470	contig_9609_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_22956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGCCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212679	214669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_212700_214700
799471	contig_3707_pilon	+	2529	5	Intergenic	novelGene_173433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1741	2115	884950	886480	TRUE	15	ACTTCGGGAAGCCCTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMSRKMTQPAPTAANNATLELKKLSGSPLLLPPLAPGPLFSSWFTVSCFPSESPRGPRPRGACVAIKTVLSASLLGQLVVSCSGVTALGSCPTFMMIFMVRVRHTPPSRFSSPSRLPLDVEVI	883209	895547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3707_pilon_+_885092_885224_885354_885552_885646_886469_886746_895398
799472	scaffold_12124_pilon	-	1520	8	Intergenic	novelGene_22176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	47.4371764999321	25	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	301	1026	1333065	1238432	TRUE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTHGHILSSQSDFGKWMNAQRCPQLGSVFRSVVHMVAVIRN	1368215	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1238392_1238555_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368007
799473	contig_4083_pilon	+	901	6	Intergenic	novelGene_152338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	164.230326066777	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAAGGATTGTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320418	329788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_320666_322191_322331_323222_323337_325623_325738_328878_328998_329620
799475	contig_6980_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_36084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	347	649	392189	392491	NA	55	AAGTACTGTACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKNKTDLKIKAVEIAVAAASYAPRLLTHLILNIRMSNHLRKPGPRGLKQLLWGYRGSENGIRTWTQGGQFQSPLAPTGTLPHRERTSGMSLNTEKSE	391842	394109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_391800_394100
799479	scaffold_13505_pilon	+	1771	5	Intergenic	novelGene_111630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	40.0085928270415	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	41	733	735345	739702	FALSE	25	AACTTTCCCGGTTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNRGTRGVRGLNRMVAPQGNQRKRRTLVQFLADHFYDVQALREYFLHKQALKVHQENRSVNSIKNRYGPYIAGAFSVLNQGGAVKFQGQEWIRPNGRGHFSLDFLKFQAVPVEAVDASGCTLNYSGLDNLLPLKELQSLWLQRCPHVDDWCLSHLHPLADSLQELSLAGCPRISERGLACLHHFQKLRKLDISDLPSVSNPGLTRILVEEMLPNCEVLGADWAQGLKSAPEEQRRDAAGPVPA	735304	740740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_735479_737020_737102_737892_738030_738222_738386_739524
799482	contig_9633_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_139646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGGTAGTCAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145419	1144778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1144800_1145400
799485	contig_5918_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_99579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTAACCTAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1855734	1854804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1854800_1855700
799486	scaffold_17542_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_139246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTAAGTCTTTACACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491677	492202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_491700_492200
799488	contig_5758_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_119096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCTCTTGTAGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213546	212895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_212900_213500
799489	contig_9579_pilon	-	1645	5	Intergenic	novelGene_150591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAATGAGACAGGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811988	808831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_809019_809115_809226_810377_810435_810524_810615_810787
799493	contig_16907_pilon	-	2431	1	Intergenic	novelGene_87488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTTTTACTTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544051	541620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_541600_544100
799494	SIRV4	-	378	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	19	220	19	-220	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGCGGACAACTCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5139	3857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
799498	SIRV6	+	332	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	541	0	375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
799499	SIRV6	+	548	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	21	5	14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
799500	contig_11115_pilon	+	790	5	Intergenic	novelGene_102805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	617.73108024447	127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	165311	166330	TRUE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVNTSCGFTWGPAPQLRSALSETCQRPAPTHSWASWAPHLPSPFTASTSSGQLFPEDWPPWCPWGHCSGPASLCSASCCWSAVCCPQVPRGRHLHCGWSPRTRWCLLEGRSW	165310	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165436_165553_165690_166252_166358_172823_172964_173047
799503	contig_12570_pilon	-	1162	7	Intergenic	novelGene_79357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	281.47730320973	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	25	870	220118	190537	FALSE	20	CAATGTTAGGTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLGSFQLCWRNTIPVLPLTSVGPSGSTSLFLSSAPPCENVAHICWGPAGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGG	220142	190244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211482_219970
799505	SIRV6	-	427	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-260	389	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCACAATTGTCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2080	1155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
799506	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_97563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
799508	SIRV4	+	332	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGCACAAACTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
799512	contig_12278_pilon	-	1561	7	Intergenic	novelGene_152577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_3	3.28718048721934	38	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAACTTGTCTAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105626	100799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_101017_101594_101691_102478_102577_103238_103331_103415_103525_104361_104471_104786
799520	contig_7426_pilon	-	1010	8	Intergenic	novelGene_27505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAAGCCCCACCCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988116	952233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_952315_962049_962181_970075_970160_979921_980059_980779_980899_983654_983758_985078_985183_987865
799523	contig_4742_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_130984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	191484	191831	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGGECAPLPPRGRAGPEARRVLLGKPGPQPSRPGPSSLFPLGGLRYRALGPGSANRGLALVVARLIPAPAFGGGELALHPSSCYRALLCSGPNCRLLLHSLKREAWNLAFSEYV	191481	193568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191500_193600
799526	contig_10341_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_47237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGAGCAGGCAGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133494	133787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_133500_133800
799527	contig_13547_pilon	-	645	4	Intergenic	novelGene_104857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	88.8644410824087	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	78	644	40983	26500	FALSE	20	TTCAGGTGCCAGCTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWEKLPNKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLAVETDEEKFQIMSLQWEPAYGTLTKNISEKKSAKSSEMSPAPMRSAGQTAKAHLHQPHRVSQV	41060	26498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_26622_32128_32350_38327_38452_40883
799533	contig_15471_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_175218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATACTGATAATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270269	272733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_270300_272700
799536	contig_10324_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_7814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197367	195472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_195500_197400
799538	contig_7730_pilon	-	931	3	Intergenic	novelGene_156243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	538	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	103	324	43591	2302	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCARARCPRGGRQQRRPWNAEGAEGVRGGGCNSEMAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESRGKKKNFP	43693	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2328_7860_7895_43429
799540	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
799547	SIRV4	+	329	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCACAAACTGCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
799549	contig_9515_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_73839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTTTTACTCAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92723	94961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_92700_95000
799550	contig_14182_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_76177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAGAGAAGAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29419	30685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_+_29400_30700
799553	contig_17059_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_166079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCTCTTCGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398375	397252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_397300_398400
799554	contig_16411_pilon	+	875	4	Intergenic	novelGene_77323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1965	junction_3	479.8001898939	17	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	209	679	146713	152673	FALSE	80	TAAAAAAAATAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGR	146504	152869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_146849_147896_148054_148956_149054_152592
799555	contig_4783_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_108418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTTGATTGCTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404396	404913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_404400_404900
799557	contig_8365_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_150908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23646	24466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_23600_24500
799558	contig_3469_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_34149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	114	416	301073	300771	NA	85	ATCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYEYVSPEQLAGFDKYKVARAPRTLLSLVAPASPRRLRGRRGSCHLVPRGSGRAGGRFSGGPAESEGLWSGCVRAPEARHPVFAAFGRFPFPYEIARR	301186	298680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_298700_301200
799560	contig_3155_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_26429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTTTGTAAATTAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271554	272212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_271600_272200
799561	contig_13067_pilon	-	2304	1	Intergenic	novelGene_141352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75396	73092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_73100_75400
799569	contig_11396_pilon	-	827	4	Intergenic	novelGene_71354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	266.678749726249	1594	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	226	498	545081	544424	FALSE	15	GCCTGTGATGTGTATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACARRGRGAAFRGLPCGWSQWLSPVSPRRATRDRAPRRRGGRSGGSARGERPWLSGYPGHKPPTRAGFHQAESKSMAAIPSSGSLVATHDYYRRRLGSTSSNSSCGSVEYPGEAIPHHPGLPKADPGHWWASFFFREICCPVHGHCVGVPRELGTSPDLQRHDHL	545598	544094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_544564_544687_544766_545026_545187_545478
799570	contig_12050_pilon	+	939	6	Intergenic	novelGene_62715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.0690192639358	23	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	489	827	681609	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVADLGPVVLSLLKAPEEYVGQNLGLSTCRHTVGEYTTLLTKHTGHAVHDAKTTPEEYEKLGFPGAQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	665946	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668261_679901_679999_681576_681768_682979
799571	contig_12078_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_74082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTTTTAATTGAATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133882	132908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_132900_133900
799572	contig_6710_pilon	-	2121	2	Intergenic	novelGene_98350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTATAAGAGTTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662805	660606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_661570_661647
799573	contig_1331_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_37854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGTGAAGGTTTACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218640	220107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_218600_220100
799574	contig_12689_pilon	-	2228	3	Intergenic	novelGene_145053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	58.5	47	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1595	2089	268123	266204	FALSE	30	ATATAAGCTTGAGCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFVPSGWHHQVHNLEDTISINHNWVNGCNLAPMWHFLQQELRAVQREISEWRDAMPDWYHHCQVIMKSCTGINYEEFYHFLKVIAEKRLLTLANGTGTGTAGSVDDTRLGAQQAAFDVSRITEVLASLIANPDFQRVDTSTFSLQPEELLQQLEEAVTATASL	269717	266064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_266507_267060_267208_268078
799575	contig_6888_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_147065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCCGTGAGAACAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840153	842442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_840200_842400
799576	contig_7527_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_139576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108575	109449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_108600_109400
799577	SIRV6	+	215	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	51	517	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799578	contig_5669_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_86108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGTGGCACAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471275	469061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_469100_471300
799579	contig_16831_pilon	-	1964	4	Intergenic	novelGene_134789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	11.7851130197758	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	319	534	334706	334491	FALSE	30	TCTTACAATCCCAGCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LADLEDDTDEANEDQPEKPHFDSRSVIFELDSCNGNGKVCLVYKSGKPGLAQDTEIWFLDRALYWHFLTDTFTAYYRLLVTHLGLPQWQYAFTSYGISPQVKQWFNMYKPITYNTNLLTEETDSFVNKLDPSKVFKSKNKALIPKKKGPVQPAGAQKGPPGPSTSKSSSGSGNPVRK	340093	333060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_334719_336058_336220_337568_337683_340062
799580	contig_5684_pilon	+	1974	2	Intergenic	novelGene_80992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1555	1896	97936	98277	FALSE	5	AGTGTTTGTCCTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNRSRRCWHSAISAVCFPGPCLHLPLPPAVPSSHLMNWGGWCGGTDRRGSECSSKVEKRREDDCLSAAAEVQVFLPGALYPVPLRWCSAEGKNLLQARSMNHCSTDFSPTLP	96137	98355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_96660_96903
799586	contig_7870_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_108969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGATGAAATTCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368695	369145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_368700_369100
799587	contig_7870_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_108955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCTCACCCTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324416	323875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_323900_324400
799588	contig_3602_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_60540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGCACCTTGATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260203	260839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_260200_260800
799591	contig_5718_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_110381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTGGATGGCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186763	1184456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1184500_1186800
799592	contig_11590_pilon	-	1442	11	Intergenic	novelGene_125575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	97.4451640667714	6	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	283	1017	413797	409013	FALSE	15	AGTTTTTCCCAGCTTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGCLPENSTFLQAELRSEALNGNLDFVLSFLESNTLPFSINSVRGSLILGFRRCVDINLWSKITELLYNDGRYCQEPLGPTEAVGYFLYNLIDSMSDSEVQAKEEHLRQYFHQLKKMNITISQNIYRGLRNLLDIYHVPELIKDVNMLVEREKIDSRKTLQLTSSDLESTLEKLKAENQPIRDVLKQLILLLCSEENMQKALEMKTKYESDMVVGGYAALISLCCRHDNAEDALSLKQEFDHLDSSAVLDTRKYVDLVRVLGKHGKLQDAVNILKEMKEKDVVIKDATVLSFFHILNGAALRGEVETVKQLHEAIVTLGLAKPSTTISSPLVTLYLEK	437434	408587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_409225_410638_410725_411409_411541_412584_412699_413051_413097_413441_413520_413728_413836_414908_414967_416838_416867_434356_434424_437343
799594	contig_15775_pilon	+	1028	2	Intergenic	novelGene_148380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGAGTCATTTCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39384	41956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_40280_41823
799598	SIRV2	+	388	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	134	1	-134	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAATGACTCTAATACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
799603	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	65	513	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799604	contig_16633_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_165067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52298	54438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_52300_54400
799605	contig_5765_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_141359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGGAAATAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368832	366912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_366900_368800
799613	contig_6084_pilon	-	1786	9	Intergenic	novelGene_127061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	64.9739130343863	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	912	1316	435364	430603	FALSE	30	TTTCCCAGCCTATCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQVFDILSTYFETRNWPEALKKGVSSGKGYVLQNSVE	438180	430132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430710_431272_431397_433030_433099_433811_433891_435337_435491_436079_436474_436607_436733_437315_437425_438023
799614	contig_8138_pilon	+	1439	5	Intergenic	novelGene_52411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	223	678	280295	306552	TRUE	50	GAAATAAAAAAGTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280072	307837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_307126_307649
799616	scaffold_12124_pilon	+	1900	11	Intergenic	novelGene_22084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	192.113638245701	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	918	1553	879089	898465	FALSE	15	CTTTCAGACACCGTCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRRRSPGLSSKAPRGQGFKAPTFRLAAKHLNHFHHPKPNQTQYHRVDSNSQRSFKDRTELPHRISKAVKFLQKQTATSFCGAAAGFKPLSCWLAAERAHHCATRHS	859941	898812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_898149
799618	contig_4857_pilon	-	1765	3	Intergenic	novelGene_48688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130664	1126715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1127839_1128627_1128775_1130169
799619	contig_7426_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_27482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGTCCTGCAGCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664424	666755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_664400_666800
799621	contig_9777_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_154426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACATCATCAACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12179	13777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_+_12200_13800
799624	SIRV4	-	274	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1249	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3909	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
799625	contig_11281_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_125496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928352	929489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_928400_929500
799626	scaffold_17541_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_175234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAAACATTTCAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120849	119678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_119700_120800
799627	contig_17880_pilon	-	2092	2	Intergenic	novelGene_167332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	21	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCTTTGCAGGGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37231	34000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_35909_37047
799630	contig_11413_pilon	+	1702	10	Intergenic	novelGene_103145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	8.20267947790745	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	64	1041	120944	137753	FALSE	75	AATGAGAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGCSPALKRSHSDSLDRDVFQMIDQDENKENLSSNESESSEPGNFIPLFLPRSPVTVTLSDEDDGFMDVLDGENLKNDEETPSCMASLWTAPLVMKRTTNLGNRCKLFDSPSMCSSTRSTLKRPERSQEESPFGNSKRRKSMTGASPEEAATPEKPQEILHQCLSLASSPKGTIENILDSDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLRYISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTDGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFLKCQSHCEPPPATGPCTTRTLKKT	120880	138414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_120974_125769_125905_126410_126486_127860_128032_132929_133029_134974_135038_135123_135223_136093_136225_137370_137483_137690
799632	contig_15952_pilon	+	879	5	Intergenic	novelGene_154037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	70.8431365765238	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	39	605	62239	64403	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWARAWRLPHGGRGASRPSFPRVPVANSSSSGGGGGVELRPLPLSFTLLDGEAGRPALVFLHGVCGCKNNFNSVAKALARRTGRKVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEPQPLP	62200	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344_63519_63695_63810_64385
799633	contig_7151_pilon	-	825	6	Intergenic	novelGene_40800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	868.190670302325	195	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	181	690	551180	529905	FALSE	35	CAATTATAATCTTGTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVYRMKS	551360	529769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529924_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
799635	contig_6673_pilon	-	1585	4	Intergenic	novelGene_164000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	70.6304938866115	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	250	672	11168	5486	FALSE	70	TTACAAGAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVSYQVDERTCIQFAMKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160313	4572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_11111_11199_56429_56515_160179
799636	contig_9216_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_163502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGACAGACATGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488866	489857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_488900_489900
799637	contig_8571_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_169182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	14.6692706021806	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	131	508	482050	514280	FALSE	10	CATGGCCTCTAGTCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARWEQKTRRLSKAFGSPYLACYALGGAILLLNLVRSHCFTQAMLSQPKMESLDNAGAYRVGLVLLGVGALFVLTSFSALGFTGTFLGDYFGILKEARVTTFPFSVLDNPMYWGSTANYLGWAIMHASPTGLLLTAIVAIVYVVAVLYEEPFTAEIYRQKAAKSHKRS	471124	514512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_471242_482036_482183_510795_510908_513706_513782_514222
799638	contig_16776_pilon	-	1297	7	Intergenic	novelGene_130535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_6	114.631898798817	500	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	28	984	129657	95984	FALSE	5	CTCAGTTGTGTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAAASSTRMAPCGVFLPMLLLLVQETGSHEEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEKDCFQLKEPACPENLNTWGKNPRDGLIGEMKWLSCKLQDCRASNASLDSPTGLGLLCSGSREEMKGREEKRGASSLVSCVCQWLLNASEEDCFQLKEPSCPENLSTWGKNPQDGLIGEMKWLSCKLQDCRTSNASLDSPTGLGLLCSENTTILKSERKYNGLSSLGTAATAVSGSVGVVAFILLLVGLLSVTLKKWRHERLFKRQLRHQRNFLHQSLEPSCHADAIYSNVINLGPWKEEDFAIYANVPPFDRTRRTSPDQVEYASIVFH	129684	95670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96143_96385_96439_96955_97063_97348_97398_99707_99975_100905_101173_129602
799644	contig_9646_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_117471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371804	371513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_371500_371800
799645	contig_5253_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_61593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346012	346850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_346000_346800
799647	contig_2069_pilon	-	1278	7	Intergenic	novelGene_23330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	31.3195891841938	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	30	596	595512	588076	TRUE	5	GATGGTGCCCTGTCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPLLPGMAEVEVKTAAETDMKHFRGPGSGVMDVERSRFPYCVVWTPIPVLTWFFPIIGHMGICTSTGVIRDFAGPYFVSEDNMAFGKPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVALALNLMHYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVSVGAFVKTWLPFILLLGIILTISLVLNLR	595541	587045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_587294_587641_588164_588940_589072_589149_589247_590792_590825_592127_592213_595378
799648	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	51	491	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799649	contig_5549_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_81598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGACCACATGCCACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88375	86845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_86800_88400
799650	contig_13854_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_154121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTCCACAGCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241348	243228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_241300_243200
799651	contig_12010_pilon	-	1917	2	Intergenic	novelGene_160954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAAACTTACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218013	211411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_211951_216635
799652	contig_17768_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_140390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGATGAACAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38165	37592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_37600_38200
799653	contig_17768_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_140389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGATTTGATTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37235	36366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_36400_37200
799654	contig_6871_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_21526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1258	1614	57787	58143	NA	65	TGTAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKFSFLNERKRTVTTHHCLFKFRLLLHAICKSFFISVFSSFELISHSCFCLICFHQQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTVGESTITASGKQLELARNGFRVRSF	56529	58836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_56500_58800
799655	contig_8330_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_71775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	27.3780122645081	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	111	1070	705342	683134	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADWLGSIVSINCGDSLGVYQGRVSAVDQVSQTISLTRPFHNGVKCLVPEVTFRAGDITELKILEIPGPGDNQHFGDLHQTELGPSGVGYQVGINQNGMGKLVKKPASSSSAPQNIPKRMDTKSQDVAVSPQQQQCSKSYVDRHMESLSQSKSFRRRHNSWSSSSRHPNQATPKKSGLKNGQMKNKDDECFGDDIEEIPDTDFDFEGNLALFDKAAVFEEIDTYERRSGTRSRGIPNEKPTRYRHDENILESEPIVYRRITVPHNVSKEFCTGELHQVPRPTGYSSFSIMFETQRARFWQSFVPGIKWLGDWPIIIAF	719522	682257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_683610_701703_702024_705178_705359_719428
799657	contig_6576_pilon	+	785	5	Intergenic	novelGene_42456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGAAATGAAAAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358186	1384289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1358309_1368769_1368875_1369009_1369173_1383774_1383986_1384105
799658	SIRV6	+	777	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	4	2	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	36	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10241	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799659	contig_10196_pilon	+	609	2	Intergenic	novelGene_132124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	276	338	926220	926282	FALSE	25	AGGACACCCAGGCCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGAGRGLGQQKQSRCFPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	925826	926553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_925879_925996
799662	contig_10765_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_122975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAAAAAAAAAATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416185	414827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_414800_416200
799663	contig_7843_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_152025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTCAATCATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204599	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_202300_204600
799664	contig_12050_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_62621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAGGAAGAAGGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326020	325560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_325600_326000
799674	contig_18869_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_56380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCCGGTCATCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73376	73580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
799675	contig_8269_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_106256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1187	1507	377362	377682	NA	30	TAATTTTGATTTCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSPSPLHSPQAAHRHPQIVLGSETPGRLLVTKHLSEKEQKSATDEQKEGVPSPLPLTFVTGRLLLKVPPAPSPPAVLPVSMRADGASTSFTQPCPLWPVSLTKA	376175	377750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_376200_377800
799676	contig_12654_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_129284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGACTAACCGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722129	723131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_722100_723100
799680	contig_8044_pilon	-	2538	1	Intergenic	novelGene_132383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCACCAAGGCTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466740	464202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_464200_466700
799681	contig_12250_pilon	+	1443	8	Intergenic	novelGene_80582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAGGTAGGAAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314812	321829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_315368_315595_315760_316615_316767_316851_316921_317883_318061_318238_318321_321446_321564_321701
799682	contig_11337_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_107199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAATAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250108	248326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_248300_250100
799684	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_89609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653776	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
799685	contig_10239_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_175246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAATCTCTAGCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33228	35299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_33200_35300
799686	contig_11338_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_6296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTGGTCACACAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196689	197395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_196700_197400
799687	contig_12841_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_55838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAAAAAAACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141805	140221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_140200_141800
799688	contig_10196_pilon	-	2510	22	Intergenic	novelGene_132085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_16	17.4454770987157	66	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	80	2497	901296	895099	FALSE	0	CCTCCTGCCTCCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDLPHAAAASLTDSSGSDGVRGGGNMAETAAGVSRFKANYAIERKIEPFYKGGKVQLDQAGQHLFCVCGTRVNVLEVASGAVLRSLEQEDQEDITAFDLSPDDEVLVTASRALLLAQWAWREGSVTRLWKAVHTAPVATMAFDPTSTLLATGGCDGAVRIWDIVRHYGTHHLRGSAGVVRLVAFHPDPARLLLFSSAADAAIRVWSLQDRSCLAVLTAHYSAVTSLVFSADGHTMLSSGRDKICVVWDLQSHRAVKTVPVFESVEAAVLLPEELAPELGVKSPPGLHFLTAGSQGSLRVWEVASGQCVYTQPRLTGPGQELTHCALARAAGLLLSVTADHNLLLYEAHSLQLRKQFAGYSEEVLDVRFLGPEDSHVVVASNSPCLKIFELQTSTCQILHGHTDIVLALDVFRKGWLFASCAKDQSVRIWRMNKAGEVACVALGSGHTHSVGTVCCSRLKESFLVTGSQDCTVKVWPLPEGLLSRTTAPSGGPVLLQAQATQRCHDKDINSVAIAPNDKLLATGSQDRTAKLWALPQCQLLGVFSGHRRGLWSVQFSPMDQVLATASADGTIKLWALQDFSCLKTFEGHDASVLKVAFVSRGTQLLSSGSDGLLKLWTIKNNECVRTLDAHEDKVWGLHCSRLDHHALTGGSDSRVILWKDVTEEEQAEEQAKREEQVVKQQELDNLLHERRYLQALGLAISLDRPHTVLTVIQAIRRDPEACEKLEATVLQLRRDQKEALLRFCVTWNTNSRHCHEAQAVLGVFLQHEAPEELLAYEGMRATLEALLPYTERHFQRLSRTLQAATFLDFLWHNMKLSPVPAGPPGPLSRS	901375	895085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_895221_895298_895458_895535_895608_895747_895852_896068_896128_896195_896353_896441_896513_896579_896811_896897_897046_897404_897509_897608_897668_897747_897890_898017_898200_898292_898390_898460_898537_898622_898794_898878_898964_899054_899197_899304_899353_899434_899531_899619_899672_901255
799689	contig_10629_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_52945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAACACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401442	400422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_400400_401400
799690	contig_20889_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_127655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	986	1342	60395	60039	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTGVLGLVKVRKASSGICELHTPQPKRDFSCFIQISFPPHRPDPSKDSCLLVPPDTVVLDECHLHSPQVFLLLLCENKWVQLTWCSWRKAYHEGRQGTAMNTSLTLSQYFGLQGLWR	61380	59690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_59700_61400
799692	contig_7151_pilon	+	1852	12	Intergenic	novelGene_40635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	121	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	709	1044	5253	6217	TRUE	25	TGATCCCTTCCTTCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETGSEPELVPKEKNVPPLTRAPHSSILLVLTVVLPPGLRSTGPQGRLPASAPHLVQPDAPISWAKCSLLQGFQGRATVQLLTHHLGLCQAPGVVTHCAPGAVVPNLHSP	1813	18279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2092_3100_3248_4314_4398_4633_4730_5148_5300_5928_6259_6347_6384_12485_12813_13365_13464_13578_13675_13784_13876_18160
799694	contig_2480_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_63570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504694	505327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_504700_505300
799695	contig_2009_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_165438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAACCAAAAGTCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15019	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_14400_15000
799699	contig_10013_pilon	-	1042	3	Intergenic	novelGene_125098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	47.5	254	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	294	668	551875	551115	FALSE	25	GAAATGAATTTCGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEGSCYLFSPQRASWKEAQKSCADRSAHLVIVANLEEQTFLSRNTRGRGYWLGLRAVRRQGKIQRYQWVDGVQLTFSHWNLGEPNDSRGREDCIMMLNTGLWNDAPCDSERDNWICEKRRSC	552168	550740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_551254_551526_551643_551755
799701	contig_14023_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_165344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	86	580	23996	23502	NA	85	TAAAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYQGAHLQGPYCRTSGRRAYWSEVLGRCKWLLCSATNQKVGGSSPRGTLEERPGNLLLQISHRKPYGALLYSDTHGVTMNGKQLDSNWVLVGILVGVGRTAEAKLEKQGRAQQGGWGGGSVTEWAEGRAEEGRAEEGRLQKHLGCEGLSVQLEKEEFKCHPSS	24081	22014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_22000_24100
799702	contig_15327_pilon	-	1426	8	Intergenic	novelGene_70597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	15.1818903934381	347	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	129	1307	888378	882963	FALSE	20	TGAGCCTGCCTGCCCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSHPQVAELLAEARRAFREEFGVEPQLAVSAPGRVNLIGEHTDYNQGLVLPMALELVTVLVGSPRMDRLVSLLTTSEDADEPRRLQFPLPTAQRSLEPGTPHWANYIKGVIQHYPAAPLPGFNAVVVSSVPLGGGLSSSASLEVAMYTFLQQLCPDSGKIATRAQVCQQAEHSFAGVPCGIMDQLIALMGQKGHALLIDCRSLETTLVPLLDPRLAVLITNSNVRHSLGSSEYPLRRRQCEEVAHALGKESLREVKLEELDAGKELVSKEGFRRARHVVGEIRRTAQAADALNRGDYRAFGHLMVESHHSLRDDFEVSCPELDQLVEAALSVPGVYGSRMTGGGFGGCTVTLLEAATASRTMQHIQEQYSGTATFYLSQAADGAMVLPL	888506	882843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_883035_883137_883301_883389_883541_885928_886111_886237_886374_886570_886691_887140_887331_888213
799704	contig_19459_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_59861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7874	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7083_7789
799705	contig_9582_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_106863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACACACACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896506	898061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_896500_898100
799707	contig_12638_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_33342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCACTGAGTGGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362441	1362687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1362400_1362700
799708	contig_6795_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_27725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTTCTATGTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277826	277187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_277200_277800
799709	contig_8050_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_114857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386631	388800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_386600_388800
799717	contig_2987_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_125841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTATTACTTTAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464262	463455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_463500_464300
799718	contig_602_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_134940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCGAAAAGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264359	262474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_262500_264400
799722	contig_7078_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_130139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATAACAGCTTTAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188343	190366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_188300_190400
799724	contig_8020_pilon	+	2027	5	Intergenic	novelGene_114460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_2	33.5484723944325	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	135	572	387453	404095	FALSE	30	TCTCTCCACAGCCCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFCGRANPTTGSVEWLEEDEHYDYHQEIARSSYADMLHDKDRNVKYYQGIRAAVSRVKERGQKALVLDIGTGTGLLSMMAVTAGADFCYAIEVFKPMADAAVKIVEKNGFSDKIKIINKHSTEVTVGPGEISRSCVEDLLGLA	382277	405550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396_388434_401951_402102_403939
799725	contig_1275_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_108876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	194	427	747735	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747541	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747500_748100
799726	contig_14855_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_146023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	485	943	519803	520261	NA	35	TAGAAAGTTGGCAGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPCLCHAFAMPLSPSHSLDPHPTHPEVQLWKSVQGLWLPLTLGRHSANCHCNERSSFPITPALLARPGDHLPPLIPCSSQHSKTLAVHYKLPVPCLVVNASISCLLSWIANFSSSRTGSSLFCPPQPQAEDSLYSRCSRNTFSIEEYRLP	519318	521373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_519300_521400
799727	contig_1996_pilon	-	1162	3	Intergenic	novelGene_131913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	13.5	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	484	1161	332154	331381	FALSE	30	TACCCACAGAGGGACCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPPLGHLVLTHLLVALFGMGSWVAVSGIWVELPVVVKDLPESWSLPSYLSVLVALGNLGLLVVTLWGRLAPDKGEQAPIRAVQVLSVLGMALLGPLWHQVSPVAGQPHSVAFLTLTLLLALACCASNVTFLPFLSHLPPPFLRSFFLGQGLSALLPCMLALAQGVGRLKCPPATSNGTLGPPHYFPERFSASSFFWALTALLVTSAAAFQGLLLLLPSLPPPPS	332916	331379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_331929_332024_332324_332602
799728	contig_1996_pilon	-	436	3	Intergenic	novelGene_131912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	249	187	435	331050	330618	FALSE	5	TCCAGGTGGGCTCGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAHGLLSAHSVCLLGLLTVTNALTNGVLPAVQSFSCLPYGRLAYHLAVVLGSAANPLACFLAMGVQCRSLAGLISVTLLGVFFGAYVMVLAILSPCPPLVGTSAGVALVVVSWMLCLGLFSYVKVVVSSLLHGGGRRALLAAGGA	331236	330616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_330726_330819_330944_331033
799730	contig_6871_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_21671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCTGCAGACTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867802	866555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_866600_867800
799732	contig_11816_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_98491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523372	522796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_522800_523400
799735	contig_15859_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_50222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCGGTAAAGTCTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378956	377381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_377400_379000
799736	contig_4783_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_108417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGTTGAACACTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400519	401783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_400500_401800
799737	contig_2455_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_119214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAATATTAAAATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362383	1363068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1362400_1363100
799738	contig_9366_pilon	-	1667	8	Intergenic	novelGene_166221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	7.47785847331566	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	49	918	194572	141576	FALSE	25	TGGTGAGTGTTGGATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPLNTPENREYLAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHIIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAIKEKYCYICPDIVREFAKYDVDPQKWIKQYTGINAVNQKKFIIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFMESISDVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNVVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRVVDARLKLSEELSGGRIKPKPVEVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFFQVCHTKKDYEEYGPSICRHNPVFGVMS	194620	140826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_141672_144077_144162_145301_145428_182906_183000_184563_184738_188820_188965_192439_192548_194527
799740	contig_7914_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_165028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTCTGCTTAGCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137332	138715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_137300_138700
799743	SIRV4	+	196	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1575	632	1120	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2575	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
799746	contig_12019_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_87705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTCTTCCTTAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200634	198120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_198100_200600
799747	contig_11849_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_171746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAGGATATTAGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101236	101832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_101200_101800
799748	contig_11849_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_171747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111801	112271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_111800_112300
799749	contig_19769_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_102342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAGTGACCTTATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192018	191707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_191700_192000
799752	contig_7020_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_57059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGTTATGTTCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79475	81781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_79500_81800
799756	contig_5799_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_50273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAATCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275786	274054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_274100_275800
799759	contig_17075_pilon	+	2318	15	Intergenic	novelGene_131763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	8.2015429110899	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2244	74	2317	149608	175028	FALSE	40	CCGAAGAAACTGTTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNAKERKHAKKMRNQPTNVTLFSGFAANRGVKHHNGGGKPAQTQKEESRSGTLQQLETKVTRHSLLDPDASEQSSSKVMFRKKGGWKAGPEGTSQEIPKYITASTFAQARAAEISAMLRAVTQKSSNSMVFQTLPRHMRRRAMSHNVKRLPRRLREIAQKEAEKAVHQKKKHSKNKCHKARRCHKNQVLEFNRRQKKNMWLETHIWHAKRFHMVKKWGYCLGERPTVKSHRACYRAMTNGCLLQDLSYYCCLELKGKEEEILKALSQMCSIDTGLTFAAVHCLSGKRQGSLMLYRANRYPREMLGPVTFIWKSERNPGDASESRQLWIWLHPTLKQDVLEEIKAVCQCVEPNKSTVCTPDPLLTPPQEKSQMELPDEKIGKKRKWKDDGENAKPVKKIIGDGTRDPHQPCSWVSPATCIVISDLTMEMNRYRLIGPLSHSILTEALKAASVHTEGEDTEKTPHCWWIETCKNPDNISLHHRQEAIFELLGGITSPAEIPAGTILGLTVGDPRINLPQKRSKALPDPEKCQDNEKVRQLLLEGVPVECTHSFIWNQAICKSVTENKISEQDLNRMRSELLVPGSQLVLGPQESKIPILLIHQPGKVTGEDRRGWGSGWDVLLPKGWGMAFWIPFIYRGARVGGLKEGLVHSQYKRSPNIPGDFPDCPAGIQFAKEQAKNLLEKYRRRPPAKRPNYVKLGTLAPFCCPWVQLTQDWESRVQAQEESSVSSSPNGGESDARRDEVPCAAI	145062	175029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_145134_149605_149750_151031_151200_152165_152342_155138_155388_157578_157667_158095_158284_159125_159383_159494_159589_161257_161370_162174_162295_168764_168881_171339_171532_173379_173535_174841
799761	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1166	8	1166	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799766	contig_15114_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_121177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651647	653693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_651600_653700
799767	contig_5419_pilon	-	1673	3	Intergenic	novelGene_15477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTTTTGTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115853	113387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_114414_115081_115261_115385
799768	SIRV6	+	400	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	552	10	373	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
799769	contig_8729_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_40117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATTAGCCAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390757	390008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_390000_390800
799772	contig_11855_pilon	-	2759	1	Intergenic	novelGene_67094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1084	1425	2398913	2398572	NA	85	AAAAAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRYLWPTKGIGHLANNANKVHGTLWGGTMQKGKWNPNKGIGQFCHPTRLKREPIPEQGGPDYHQEEPGVECILWTWNSCTETFLDPGKRGAVTRKTVRDGGARTAGIRRQE	2399996	2397237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2397200_2400000
799774	contig_6270_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_99846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTAATTTTTATAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402153	402652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_402200_402700
799776	contig_16775_pilon	+	1971	18	Intergenic	novelGene_107774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	342.118921431399	1	107	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	484	1113	152231	168120	TRUE	45	ATGACTTTAAAATAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPER	130388	174710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137112_143951_144038_144961_145037_152207_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_165001_165041_165182_165276_168016_168067_168113_168146_172805_172867_173216_173325_173988_174356_174413
799777	contig_14575_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_101930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417652	418696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_417700_418700
799781	contig_11318_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_48158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAAGTCATTCCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55853	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_55100_55900
799782	SIRV6	+	229	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	8469	11	270	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGCAATGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
799784	contig_8888_pilon	+	3186	1	Intergenic	novelGene_167758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGCTTCTTGTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24055	27241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_+_24100_27200
799787	contig_15407_pilon	-	1207	5	Intergenic	novelGene_123085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTAGCAGACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470715	465719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_466096_467694_467845_467974_468047_468156_468305_470254
799791	contig_3817_pilon	+	1883	7	Intergenic	novelGene_78344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1063	1500	475160	482939	TRUE	20	AGAGGAGGTGGAGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVWAQAGDADPAGQRQGLGRCVLAPGGSEPQPRQLSNPGSCAQTLTSRTRYCSGVGSAAISPSTRSHSRAMAFIEVSSGATISGNLISLFLTPATSALVLRGTLVLVSKIFKAGGFFKDEICPCWYRSAPPQVLTALSTPEGFP	474097	515681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_475417_475814_475905_482217_482264_482894_482998_491021_491179_514581_514675_515606
799794	contig_7411_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_136975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTGTTAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122872	122321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_122300_122900
799795	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
799796	contig_4874_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_78634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAGGAAAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337970	339781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_338000_339800
799805	contig_10355_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_175252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79087	79478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10355_pilon_+_79100_79500
799806	contig_8538_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_5045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842824	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
799808	contig_4519_pilon	-	1887	9	Intergenic	novelGene_123731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_8	25.8166612868512	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	526	1464	802412	761707	FALSE	15	TTCTTAGTAGTTTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAAVMIPGLLRGSVGTTCTRAALLRLTPRSLRHLTLTSVMKSKRKTDHMERTADVVRREVVSTAKVCGAANESPSVKRLHLLVAEKDFSFKAGQWVDFFIPGVSVVGGFSICSSPRLLEEERIIELAVKYTNHPPALWIHNQCTLDSEVALRVGGQFFFDPQPTDASRNLVLIAGGVGINPLLSILRHSADLLRERANKGSGFEIGTIKLFYSAKNTSELLFKKNILDLVNEFPEKIACSLHVTKQTTQISADLKPYITEGRIMEKEIRDHISKETLFYICGPPPMTDFFSKQLENSHVPKEHICFEKWW	810742	761283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_762654_763395_763639_768630_768773_788185_788293_801943_802008_802293_802421_804667_804820_810377
799809	contig_6302_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_171715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGAAGCAGCATGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565183	565472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_565200_565500
799810	contig_8312_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_152917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAAGAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1588852	1587538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1587500_1588900
799812	contig_10863_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_59324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAACATGAATGAACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55565	53996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_54000_55600
799815	contig_5419_pilon	+	2388	1	Intergenic	novelGene_15543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436988	439376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_437000_439400
799819	scaffold_19766_pilon	-	799	4	Intergenic	novelGene_34386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.487466969668	3648	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTAGGGGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737661	734271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_734809_735124_735243_737002_737084_737598
799820	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_114018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	29	349	14409	13866	FALSE	15	CTGTCAGTATGGTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	14437	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
799823	contig_6434_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_61852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTTAGCAGTCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797695	797886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_797700_797900
799824	contig_6434_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_61853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGATGTCATTGTACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798053	798952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_798100_799000
799825	contig_14618_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_136804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	459	764	409400	409705	NA	35	TTCTATCCCAGCAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPSTWLGSEALGAERLGLFGGAEMPCLGPQRHHLGVFPIAPTVLGVCSCCPRPCWYIQHKATGSILHTGQGQLDGISQQQSSIPWVNNIVFYGISQHAP	408941	410605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_408900_410600
799827	contig_6217_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_109634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAATCCTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526686	527747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_526700_527700
799829	contig_5935_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_102687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTCTGAATACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796854	797777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_796900_797800
799832	contig_1380_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_138878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101418	102452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_101400_102500
799833	contig_6710_pilon	-	488	2	Intergenic	novelGene_98049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	10	CCTTCTCCTCTTCTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
799834	contig_5302_pilon	+	1631	2	Intergenic	novelGene_81379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	170	322	111129	111281	FALSE	50	TCCAGAATATATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVIFSFCFPCDL	92738	112590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92815_111035
799835	contig_3394_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_152683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGCATTTAAGAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442400	442001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_442000_442400
799837	contig_6710_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_95983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653635	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
799839	contig_13481_pilon	+	2543	17	Intergenic	novelGene_119510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCTTATCCCCAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411856	1501666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1411959_1412475_1412615_1415049_1415179_1426236_1426388_1427715_1427935_1430772_1430872_1437121_1437298_1437583_1437731_1439918_1439976_1441289_1441356_1444325_1444566_1445292_1445464_1447627_1447700_1459726_1459976_1462358_1462693_1473241_1473323_1501555
799840	contig_19564_pilon	+	922	5	Intergenic	novelGene_29571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_4	215.140070651657	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	199	567	7722	9682	FALSE	40	AAGTACTGATACTTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAKTKQQIEEQRVQVQVVERAQQVAVQEQEIARREKELEARVRKPAEAERYRLERLAEAEKSQLIMQAEAEAESVRMRGEAEAFAVEARARAEAEQMVKKAEAFQLYQEAALLDMLLEKLPQVAEEISGPLTSANKITLVSSGSGTIGAAKVTGEVLDILSRLPESIERLTGVSISQVNHNKPLQTA	7323	10037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_7509_7708_7755_7878_8017_8469_8635_9649
799845	SIRV4	-	465	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1058	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
799846	contig_2100_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_50603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGCCCACCGCAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706037	707008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_706000_707000
799847	contig_8020_pilon	+	1847	1	Intergenic	novelGene_114398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGCGACGCACGGTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165254	167101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_165300_167100
799848	contig_6361_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_23915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1123	1440	214085	213768	NA	35	TAGAATTCACCATATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSSSREMATTEPGDRRETGVVLVLKKCFCDEHTCFQKICSAFENLGKLSWTSLNTPYSCPALGSSILFCPLFLQQSFLFSLPVVRNCIIIYSHLECKMYLTAV	215207	213482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_213500_215200
799851	contig_8317_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_20234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGACCCATTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
799852	contig_14426_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_170626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTCAAAGGCACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179437	177308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_177300_179400
799853	contig_8879_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_158991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276376	275117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_-_275100_276400
799857	contig_17470_pilon	-	870	3	Intergenic	novelGene_110484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	5.5	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	33	530	167807	164687	FALSE	5	TGTGGCGCCCTTCTGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTGRTQGGADGHGSSGHPPFGAADTAWCWSGLRFFQPWGLWLRSSGLLFATFLLLSLFSSVAGLLLASHLYLVASNTTTWEFISSHRIAYLRQRSSNPFDRGLIRNLAHFFCGWPSGSWETLWAEEEEDSSQAV	167839	164346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_165006_165582_165662_167707
799858	contig_7357_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_36923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAGAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600331	598934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_598900_600300
799859	scaffold_9100_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_83240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAAAATCCTTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588616	590693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_588600_590700
799861	SIRV6	+	320	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	50	337	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAGGCACCAGCGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
799862	SIRV6	+	335	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	534	2	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
799864	contig_776_pilon	+	1412	7	Intergenic	novelGene_139912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAAGGGCGGAGCGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699816	788066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_700209_714624_714831_732938_733102_733566_733724_734976_735246_748603_748775_788012
799867	contig_15596_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_139556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGTCACAGGAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317035	316201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_316200_317000
799869	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799870	contig_12008_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_25007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57724	55708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_55700_57700
799871	contig_12008_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_25010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61501	60930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_60900_61500
799875	contig_6199_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_126405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	985	1383	643548	643150	NA	45	ACATTATATGCACAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANKCLEPPHQPASLLPKGTQLSHSVVSKPTAAALLHGLVSPLQQSCSSLLVPTVLRHCRLCCCCTVSRCCRCYSSLSPGSRRFSAEGLRSKGLLSMFFLLMIVKTPSTSVELALICLLFPPRPQTDQSPW	644532	643046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_643000_644500
799876	contig_9901_pilon	-	2001	13	Intergenic	novelGene_126929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	156.782492645065	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	232	1125	216214	185991	TRUE	25	TTTGGTGGTTTTATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFTLLSPQEIASIRKACVFGTSGNEALYVTDNDEVFVFGMNYSNCLGTGDNQSTLVPKKLEALCGKKIKSLSYGSAPHVLLSTEDGVVYAWGHNGYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249481	171081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_178113_178333_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_207324_207492_215524_215676_216088_216261_245846_245927_249376
799878	contig_9609_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_23163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834429	833504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_833500_834400
799879	contig_6689_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_175253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCCTGCATACCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13637	12621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6689_pilon_-_12600_13600
799880	contig_6710_pilon	-	375	2	Intergenic	novelGene_98277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	15	ATCCATGTCTGGTCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
799881	contig_6710_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_89093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653594	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
799882	contig_4125_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_25179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATATACTTCTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233084	1232789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1232800_1233100
799883	contig_4125_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_25178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGCCCCAGGGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232739	1231905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1231900_1232700
799884	contig_11677_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_85879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1600	1992	198101	198493	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQISTAFPRNHKHALCLPAGLPPPHCTKLLNSAHCSLGWRAASGGTSDPVGVGAPLLPGQAAWRLHCQFWAAGMDVPQASGSTVGAHYARQALQHGVGVFIPCHPCCAVWGAPVNPRVLRGVWQQLLFC	196501	198901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_196500_198900
799888	contig_6228_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_164512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257388	255995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_256000_257400
799891	contig_7009_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_23685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	167	1126	602141	601182	NA	60	TAGAAAATAGAGATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLWAVQQKKYHQPQRASGSSHGGVKKSLGAGRARGIFGKFVPPIPKQDGGDQNGGMQYKPCGAGPTEPAHPVDERLKNLEPKMIELIMNEIMDHGPPVNWEDIAGVEFAKTTIKEIVVWPMLRPDIFTGLRGPPKGILLFGPPGTGKTLIGKCIASQSGATFFSISASSLTSKWVGEGEKMVRALFAVARCQQPAVIFIDEIDSLLSQRGDGEHESSRRIKTEFLVQLDGATTSSEDRILVVGATNRPQEIDEAARRRLVKRLYIPLPEASARRQIVVNLMSKEQCCLREEEIELVVQQSDGFSGADMTQLCREASLGPIRSLQTADIATITPDQVRPIAYIDFENAFRTVRPSVSPKDLELYEDWNKTFGCGK	602307	600432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_600400_602300
799893	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	51	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
799894	contig_11338_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_6281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGACCCTGGGACCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178890	176869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_176900_178900
799897	contig_12528_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_81304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGGGACGCAAGAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930928	930424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_930400_930900
799898	contig_13565_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_162397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213875	212651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_212700_213900
799900	contig_7758_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_163548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCAAAGCCATACCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194033	193617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_193600_194000
799903	contig_10437_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_38392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTGAGATAATCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695385	694096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_694100_695400
799904	contig_12786_pilon	-	1171	7	Intergenic	novelGene_103403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	686.962638479464	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	465	1109	602829	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629600	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602874_628787_628911_629303
799907	contig_10196_pilon	+	1901	11	Intergenic	novelGene_132307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	234.988425246862	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	841	1698	2364371	2374406	FALSE	20	GTAGCCCACCTGCCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2348252	2374609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2348832_2352497_2352597_2363547_2363643_2363946_2364011_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
799908	contig_9202_pilon	-	1453	11	Intergenic	novelGene_168943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_7	34.4934776443315	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	677	1255	268833	262775	FALSE	15	CTCCTGGTGTGCTCTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQAVQATAQMKEGRRTSSLKASYEAFKNNDFQLGKEFSMPRETTGYSSSSALMTTLTQNASSSAADSRSGRKSKNNNKSSSQQSSSSSSSSSLSSCSSTSTAVQEISQQTTVVPESDSNSQVDWTYDPNEPRYCICNQVSYGEMVGCDNQDCPIEWFHYGCVGLTEAPKGKWYCPQCTAAMKRRGSRHK	286212	262576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_262892_265227_265267_267566_267760_267991_268186_268797_268956_269241_269362_270145_270218_281603_281670_282798_282900_285766_285839_286089
799909	contig_5210_pilon	+	1450	11	Intergenic	novelGene_65460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	148	303	649949	650448	TRUE	20	GACCACCGACGGGGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGGAGLGTPSHPPGVLPPEFPELRAGLSWTAVGPHSASLGTSEASARQMGHVRLAFNHLSTHLVWNSWLQGRTRSSCRASKSLKQMTHLASALTDGCRG	649801	657885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_649968_650181_650287_650416_650539_650612_650707_650901_651027_651121_651283_651377_651552_651850_652017_652415_652544_652784_652935_657826
799911	contig_14647_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_167385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAACAGAAGGAGTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161967	163456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_162000_163500
799912	contig_16714_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_161560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGTAAGTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659914	659170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_659200_659900
799913	contig_8354_pilon	-	1298	10	Intergenic	novelGene_24101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_9	76.3264593379106	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	171	1073	259876	221213	TRUE	30	CAGATGGTCAAGAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKMPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAKAKKKEKEKEKKEEEKMEVDEAEKKEEKEKKKEPEPNFQLLDNPARVMPAQLKVLTMTETCRYQPFKPLSIGGIIILKDTSEDIEELVEPVAAHGPKIEEEEQEPEPPEPFEYIDD	261531	219060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_219277_221203_221360_230251_230399_231375_231463_232863_232957_240651_240822_247565_247669_256652_256770_259837_259953_261437
799915	SIRV6	+	248	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	8465	3	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
799917	contig_7050_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_153633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	260	601	780157	780498	NA	60	AAAAATCTTAAGGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVAKRERRWLILMSCTLREQVFSQQRRGVSKGLESNIRSREDACSTRKALRNVEHEGRKKASLRGLSRKRCLQGTVRFQVMQRGEGDFLFLKTFHFEFIFNLESVYKKRVFW	779897	781709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_779900_781700
799918	contig_10235_pilon	-	869	6	Intergenic	novelGene_46490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	925.890576688196	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	93	869	220733	217977	FALSE	20	TATTGTACGGAAGGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDRQLLDIPPSQKKWMRPVLRMRASLRGSFWMAMSLRWLTATCCRSSILCRLYVRSTGDSPSRSSYGECIGTCAMHMLGKNSPPLVQMMRRLSWPTSKWPKPSNKPLLGLPCLPPFSPQRPSVVSTWLSNGQTHSEMASEQGILEHLCRLARGMREKDGRPGRNF	222842	217976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219447_220089_220197_220354_220481_220677_220788_222804
799920	contig_3942_pilon	+	1715	13	Intergenic	novelGene_128818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	161.252562425807	384	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	260	1411	1069027	1072979	FALSE	10	TCCCTGGTCCAACTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSSTFSIKKIRFLVLDEADRLLEQGCTDFTADLEAILGAVPACRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQPFFWEAQAPVRTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQGFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILCMMLRKFNFPTVALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVINHNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGMAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLDEFSVEEAEVLQILTQVNVVRRECEIKLEATSFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKTELAKIRQKNRRFKEKVEQTLQRQKAGGRPRGVPTQGPARVPQSPAHPGPGLSPPQPPST	1060466	1073283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1060591_1067922_1067976_1068944_1069031_1069113_1069236_1069385_1069574_1069654_1069796_1070818_1070895_1071136_1071214_1071329_1071428_1072218_1072294_1072448_1072538_1072617_1072690_1072769
799922	contig_15741_pilon	-	798	3	Intergenic	novelGene_159670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	226	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	146	298	50351	50105	FALSE	40	AAGAGAGGTATTTAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	50730	49604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651
799923	contig_361_pilon	-	1892	6	Intergenic	novelGene_166611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	75.6343837153447	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	247	669	1011845	983117	FALSE	25	GATTCACTTTAATATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVDFTQEEWALLDLAQRKLYIDVMLETFINLASVVSRNLSDGKTFSSEHTIVRFMKNDSWSSVLGDIYELHGIEDKHNDQGSYLRRHMVEKFHENNEGNHCGKLSQLPKLTVFKRTPTETTCEILHCRLIL	1021195	981893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_983156_985143_985247_985602_985754_986721_986849_1011842_1012073_1021176
799926	contig_10235_pilon	-	1870	20	Intergenic	novelGene_46388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	99.4614306014413	1	100	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	618	1220	182616	178895	TRUE	10	CTGGCTGGCTGATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCVLGPRLYKIYRERDSERTPSGVPEPPTTDTYYQPRALEKHADSILALASVFWSISYYSSPFAFFYLYRKGYLSLSKVVPFSHYAGTLLLLLAGVACLRGIGRWTNPQYLQFITILEATHRNQSAENKRQLSKYNFDFRSWPVDFHWEEPSSRKESRGGPSRRGVALLRPEPLHRGTADTFLNQVKKLPCQITSYLVAHTLGRRMLYPGSVYLLQKALMPVLLQGQARLVEEYNGRRAKLLACDGNEIDTMFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLALCC	192384	177633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178911_179502_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182421_182532_182648_184875_184999_185214_185289_186962_187049_190070_190158_190402_190470_191199_191257_192292
799928	contig_10299_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_79728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCACAAAATCTCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342322	343281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_342300_343300
799931	contig_4151_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_65212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCCCCATAGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201411	202287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_201400_202300
799936	contig_3948_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_53171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTTTAAGAAGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276844	275107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_275100_276800
799943	contig_8552_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_80060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCTTGAAACAGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320800	322836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_320800_322800
799948	contig_14300_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_133117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTCGGGGAAGATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313712	314098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_313700_314100
799949	contig_9995_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_47812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAATGCTTATTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872123	872423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_872100_872400
799950	contig_9995_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_47813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGAGTAGAACTGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872476	873228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_872500_873200
799953	contig_6885_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_83637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGCATTGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120735	121835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_120700_121800
799954	contig_9049_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_83161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCAATCTTATTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112442	113681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_112400_113700
799955	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	8130	-1	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCGAAATCACCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	3149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
799956	contig_7411_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_136974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1097	1471	113009	113383	NA	85	CAAAAAAAAAAAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYFSTCISLAETFLGLCTGDAGSSEDLITPGATSTSRRWQVNIMASLSLRVKSEVRSTVPQKVPSRSELPMLTAAAHPSTHPSLTLFLSQFHFLILSTPVGITHRKNPSTQRCVSGPAFEEN	111912	114321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_111900_114300
799958	contig_3269_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_117038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAATCCAGTTTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212272	210251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_210300_212300
799959	contig_5302_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_81488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGGCTCTCTGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326921	327825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_326900_327800
799961	contig_15045_pilon	-	1420	3	Intergenic	novelGene_130066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	88	junction_1	143	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	529	1266	157938	157201	FALSE	35	AGTCAGTGGAAAATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVWVLAFLVHGPIILVSQSWKKDWKECEPGFFLVWYIIAITSFFEFLVPVISVAYFNMYMYWSLWKRGSLGRRQSHPGLNSPDSSNDCGHSFKCRPFSRTSLPELKETEVPLRSEKQRRKSSFLHSFRTQVNTCTIASKMCSFSHSHSVTHQREHLELLRAKKLAKSLAILVGVFAICWTPYSVSAIVLSDKHPKPYWYEIAFWLQWLNSFVNPFLYPLCHKRFQKAFLKIFCMKKKTILSQS	167016	157046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_157987_164323_164519_166731
799963	contig_6164_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_121287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571751	573709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_571800_573700
799964	contig_7202_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_16571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
799965	contig_4686_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_118595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATAGGGTAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851909	850110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_850100_851900
799970	contig_7630_pilon	+	1339	3	Intergenic	novelGene_133650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	3	590	449454	450041	TRUE	35	ACACTGATTACATTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDNKPVNVEELFSENLLIQKKFSRYQTTTQKVLSKMQHGRVSLRGEDQAAIPANTVGLPENSTHQEPAREGRRQETLWWHAISGGSKRYREQGSWKQEHRGCNTGCGGWERVGVRKESRKHNMHIGRCPWYLPSWPLCIQMRDVPRLCTKTKPVHLRLSWGTRPLPASKNKAATRARAIVKIRRLDSHPGRAPP	449451	452491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_450255_451544_451710_452120
799972	contig_5059_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_140738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	962	1300	274729	274391	NA	35	GGGTCTTGAGTAACATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLMRLLCLLTRAGIFNGLSGSLVVFRALMCSHFKIRYVSLRSPGGTVVKRSATNQKVGSSNPQGALREKDVAVCFCKDDSLGNFMQQFYSVLQGRYESDLTARGLHFFKE	275690	273565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_273600_275700
799973	contig_8866_pilon	-	1674	3	Intergenic	novelGene_77882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	15.5	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	902	1201	1013272	1009538	FALSE	15	CTCTTTATGTTTTTCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPDAVLPVGGAGNKIIHLIEGKASAYVFASPGCKKWDTCAPEVILHAVGGKLTDIHGNGLCYNKEVKHMNSAGVLATLRNYDYYASRVPESVKNALVP	1014173	1009064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1009687_1010841_1010948_1013227
799974	contig_10324_pilon	-	916	4	Intergenic	novelGene_7919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	30.1588387633801	1322	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	69	320	914508	913762	FALSE	5	GCTGTCCGTGTTTCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPGEPDCCNEGRRVLVHPPGDMGRRKSKRKPPPKKKMTGTLETQFTCPFCNHEKSCDVKMDRARNTGVISCTVCLEEFQTPITYLSEPVDVYSDWIDACEAANQ	920777	913165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_913827_914132_914204_914392_914527_920727
799975	contig_14220_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_159871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAACGACCAATAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345171	344840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_344800_345200
799976	contig_2332_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_58649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACCAATGTCACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252664	254472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_252700_254500
799979	contig_3986_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_52730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGGTAAATGTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150053	149462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_149500_150100
799980	contig_11932_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_85433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATAGCCAAACTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491302	491996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_491300_492000
799981	contig_11932_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_85434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATAGTGACCTATAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492042	492596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_492000_492600
799982	contig_11281_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_125472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGTGACATTAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861143	860071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_860100_861100
799983	contig_15185_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_99433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	46	366	391676	391356	NA	25	GGCTCCTTGGAAGAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQAWGLGSGPGLLRLMLSLLFLPLEMNICNKPSNKTAPEKSVWTAPAQASGPSPELQGQRSRRNGWSWPPHPLQIVAWLLYLFFAVIGFGILVPLLPHHWVPAGYAVSLGDCGADTGKRGC	391721	389959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_390000_391700
799990	contig_5642_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_153028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	216	560	77560	77216	NA	25	TGAATTGATTTTGTTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLSLRGSATCPRSFLCKWWSWNLVDQFHVHTHSLIYLLRASCVAFIPLCGAMDLSGLLLDCTAQSLKHDLPAHDKKTFPLFVLLHCQVAISQLLLNNYFLHRSEFVVKFFQS	77775	75950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_76000_77800
799991	contig_1107_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_126536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120593	118921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_118900_120600
799992	scaffold_16539_pilon	-	1025	7	Intergenic	novelGene_68359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	305.577958774662	8	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	118	666	502141	490145	FALSE	10	CAGCCTGGGCCTGAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNQTLRGPCRRGPGPDPIFPCQPQQVPGDRTCCLHRNLQLVRQLLHGDSRHLTAGDPEWTGRPAEPAGGCVREGLGLALQL	516057	489785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_500670_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_516002
799993	SIRV5	-	173	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGGCACCGCGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8580_10856
799994	contig_11498_pilon	+	1995	4	Intergenic	novelGene_65506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	23.1564725772779	219	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	3	530	153362	157836	FALSE	0	GTTGTTCTCTGGGCCGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLALQQVGGLKSPWRGEYKEPRHLPPNQPNYHQTFCAQPRELSLGAPGPQPAEDTADGAPKLQPPLPPEPPERNKSPALNLSKEESGTWEPLPLSSLDPAPVKSPSSPERRATFPEQELQQLEIELFLNSLSQPFSLEEQEQILSCLSVDSLSLSDDSEKHQLCSAETAFLVGG	153359	159301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_153384_154977_155332_155517_155625_157791
799995	contig_6710_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_93516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653755	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
799997	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1154	8	1154	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
799998	contig_11356_pilon	+	2019	12	Intergenic	novelGene_175260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	3.574473318425	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	271	1563	134108	146996	FALSE	10	CTGCTTCCTTCTGAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEASPGAARSSSTPPSCSTRSTVTCSSTRRSRVSSGRTAWLSPPGSHPPRQPRKALVSSESYLQRLSSASSSSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEAKFELIISEASYLRSLNVAVDHFQLSTQLRAALSNQDHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFTFHVCDVVLNHAPHFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLLNSNSHFREVLERLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSLEEAEATKAHHALEELIRDCNSNVQRMRRTEELIYLSQKIEFECRIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDRLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSAVRGEKCEMKLHGAHKNLFRLFLLHNTQGSQAEFLFRTETQSEKLRWISALALPKEEMDLLECYDSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPQQQVEFISNRDVCARNLKEAQRVKTARLQLVEQQA	133647	147452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_133693_133882_134138_137340_137502_138303_138457_138729_138860_139363_139439_139861_139952_141554_141713_142518_142681_144509_144581_146433_146539_146838
799999	contig_5549_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_81697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1404	1709	788544	788239	NA	65	AAAAAAAAAAACCTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISVSLGRHTLDQVSTGMCVSLSSASMSSGQVGSSVAALVSVSTASLGLVWPPRCFSLYLSRCVIKLGRVQHDCALSLTVSLCSFLGEVWPPVLAGPAIN	789947	787518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_787500_789900
800000	contig_12150_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_6966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACATTTATTTGCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114775	115398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_114800_115400
800002	contig_12078_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_74103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACAGGTATGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231872	229734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_229700_231900
800006	contig_19816_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_156466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGTGATCATATCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54093	55650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_54100_55600
800007	contig_14687_pilon	-	928	2	Intergenic	novelGene_107976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGCTCCTTGGAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766473	765102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_765572_766014
800008	contig_10235_pilon	+	1418	6	Intergenic	novelGene_46531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	260	496	355152	355480	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSPRGILGQGWRGGGCSAGWWGHPIPPGDGHLLGLRGVLPTVGTEDHPIQLGHAGLVEAVGHAEVRVTLQEGTCRAEVATSWAAVMFDHAGAVGLTEHHQGHTAGRPHGLPLEDGSVAARQLSVHTLGGHALMPRPLTDAIDFGCLHAAAAEGQLLKATFRLQ	354813	356873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_355036_355114_355262_355353_355501_355720_355823_355985_356102_356189
800009	contig_7182_pilon	-	2852	2	Intergenic	novelGene_117128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	113	352	869526	869287	TRUE	80	AAGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVQEGTVPPSSSGGCVCVRACSEEKNGSPEVSGRKDSMGLLRGSSFCSDCQLSPGGVSGAVLAPLSSLLQKEEMRHDSEMSVQYHNCTQETGANDCDILYFCLPFFLLFYLAFFVI	869638	862965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_864447_868267
800010	contig_10753_pilon	+	1684	2	Intergenic	novelGene_105153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1143	1583	367545	367985	TRUE	30	TATGGACACGGGGACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGEPENDKSKPNPAISILGSIFAQRHASDFCSPGDLRNPRLETSNCARGAEGPQEALMVELRGEEEKLQASLHGLQGHVTCFVYRAPLMSSLGGKKFQRQRRKKRKTTKLVQPFHFTAEQTDGPREKGFTQDHRAWYQQAKPWL	366402	368268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_368020_368201
800014	contig_854_pilon	+	778	2	Intergenic	novelGene_36107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGCATCATAGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96427	97360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_96619_96773
800016	contig_6630_pilon	+	1766	9	Intergenic	novelGene_30723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	73.1979337140059	153	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	83	1036	777141	791577	TRUE	15	GTGACATGCGTGTCCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLEILLASALGFAIYWFVSRDKDKEETLPTEYGWWGPGTRPTPGEDESIRPFKVETSDEEINDLHWRIDKTRLRPPLEESYFHYGFNSNYLKKILSYWRNEFDWKKQVDIINKYPHFKTKIEGLDIHFIHVKPPQLPAGRTPKPLLMVHGWPGSFYEFYKIIPLLTDPKSHGLSDEHVFEVICPSIPGYAFSEASSKKGFNSVATARIFYKLMLRLNFEEFYIQGGDWGSLICTNMAQMVPSHVKGLHLNMALILRNFSTLTLLLGRRFGGLFGYTERDLELLYPPQGEGLLQLDEGERLYAHPGHQAGHCGLCSE	747085	796284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_747163_777135_777330_779683_779865_787775_788004_788619_788750_789224_789435_791561_791672_794987_795114_795774
800020	contig_6608_pilon	+	1449	8	Intergenic	novelGene_162529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	56.2911527466885	46	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	64	843	55544	59703	FALSE	5	TGCTGTTTCTTCTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQHSASARPHSSKRKKEDDRDDMWAQREQEEAIAQFPYVEFTGRDSITCLTCQGTGYFPTEQVNELVALIPHSDQRLRPQRTSVMCCVICSKQYVLLSVLLCLLASGLVVFFLFPHSVLVDDDGIKVMKVLFNKEDSLVILAITATLKISNSNFYSVAVTSLSSQVQYMNTVVGTYGTTNVSLIPPRSEQLVNFTVNTEMGGPFSYVYFFCTLPEILVHNIVIFMRTSVKISYIGHVTQSSLETHHYVDCGANATAT	54906	60309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_54942_55515_55731_56590_56655_57113_57301_57392_57534_57957_58008_58648_58703_59606
800021	contig_6654_pilon	+	2848	1	Intergenic	novelGene_85759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGAGCAGTACGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574556	577404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_574600_577400
800024	contig_854_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_36292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	1	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	116	550	556108	562402	TRUE	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543616	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557053_557591_557752_562271_562405_563029
800028	contig_11338_pilon	+	1288	12	Intergenic	novelGene_6245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	178.400376162373	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	46	1227	75045	84021	FALSE	15	CCCCATCTATGCATCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDFLDNERHEVQLDMEPQGCLVAEVTFRNPVIERIPRLRRQKKIFSKQQGKTFQRARQMNIDVATWVRLLRRFIPNGTATSTFSPGASPGPEARPTSSDISVEKLNLRADSDTSPQRSPLEPPSSLSSLSSRIQEQPLTPAPPSETQETPGPALCSPLRKSPLTLKDFKFLAVLGRGHFGKVSFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTKGYVKIADFGLCKEGMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSDRDAEDVKKQPFFRTLGWDALLTRRLPPPFVPTLSDRTDVSNFDEEFTGEAPTLSPPRDARPLTATEQAAFQDFDFVAGDC	74999	84082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_75075_77126_77203_77282_77425_77510_77608_79806_79887_79962_80044_82107_82171_82275_82353_82552_82696_82974_83083_83183_83265_83817
800029	contig_3095_pilon	-	976	4	Intergenic	novelGene_75239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	675.051273772757	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255561	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246698_248550_248759_253535_253804_255384
800030	contig_6278_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_119828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAGATACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554202	552483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_552500_554200
800031	contig_12923_pilon	+	856	3	Intergenic	novelGene_30187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	19.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	189	854	451205	454617	FALSE	20	GGAGAGCTTATTTCCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCLWERSINILLSGTQASFCALMNTTFSVLDDACKNKTTAISLERVVESFAIVLEQTSTWSNFTKEEKAALATVVLESVESMALAAFLKPSRNSSQTVRTEPLDIESKFVKEECIKENVIFHLKAKGDEMKIGCSTIAESESTGTDLAKNPGEWLECLQSAATYSSPLRRQGVSLLMVKEALGMDGTESNLAHIPRSTSIERASSEEKPPVETKQECPQT	451016	454619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_451340_452803_452982_454264
800032	contig_9011_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_159309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCCACTCCTAGAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477587	478491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_477600_478500
800033	contig_13206_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_161908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTAAAATAATTATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202294	201719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_201700_202300
800034	contig_13206_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_161907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCACAATTGGGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201452	200424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_200400_201500
800037	contig_7549_pilon	+	1083	8	Intergenic	novelGene_164542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_7	285.481762525549	28	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	104	1030	855416	899461	FALSE	45	GTAATAATCAAAGCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKILSERKLKMVFYRIKEILQCHSMFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQCQESSPDRITLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEIKQIAKAINERYLNKLLSSGNRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRIFMLNDVLMCATVSARTSHESNAMISTSQRYLLKWSVPLGHVEVIAYGNNEGPGENSSYPPCTRWKAWWLLLMLSQTKFTRDQGNCTKICKTCCMT	854812	899514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_854892_855391_855572_857661_857779_860748_860842_867189_867361_869475_869622_874252_874434_899398
800040	contig_12550_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_175281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACATTAGAATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92667	90985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_-_91000_92700
800041	contig_5696_pilon	+	915	9	Intergenic	novelGene_117495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	75.1959939092502	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	150	716	273638	295872	FALSE	30	CGAATCTGAAAATTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDANEEKTPEQIMQEEQIKAKIEGLENEVEEAKTAFEMKNLALDRMQLSAALKNNLEKIDTKTSLLMDDMKHVLELNKLIMTSQQESWDLEEKLLDIRKKRLQLKQASESKLLEIQTEKNKQKDDLDNMENSDKIKAIRQNLQREIQITTVIQNVFQNLLLGSKANWAENPALKKTVLQLEKNLTMI	270584	296071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_270691_273594_273651_277202_277252_277624_277700_279528_279586_289658_289723_289969_290022_291302_291467_295779
800044	contig_11572_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_100049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAGAAGAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248036	247642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_247600_248000
800045	contig_19362_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_157793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAACTTGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43565	41612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_41600_43600
800046	contig_7744_pilon	+	1459	14	Intergenic	novelGene_62523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	82.0697495243055	1	77	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	122	1387	825487	830691	FALSE	35	CTCTACCCCTGAGAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLCQ	825365	830763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830682
800048	contig_20241_pilon	+	1774	3	Intergenic	novelGene_159738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	14	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	7	468	218972	221924	FALSE	15	TGTTCCTGTCCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTMLRLWYTTFSCLCEVGLGTSIQFFCVPVSAGVSDSHNYHSFIISRTERIYFQVFLPKGSKEKSKPMFFCHRWSIGKVIDFAASLASLKNDNNKSTAKKLRLCHITSGQALPLDNILGTWMAKEDCPLHNGGNIILEYLNDEELFLKNVDSYLE	218965	223230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_219107_221499_221656_221753
800049	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
800050	SIRV4	-	198	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	416	3	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
800053	contig_16578_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_148679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCTGTCTATACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290154	291576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_290200_291600
800055	contig_6189_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_164947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107058	108474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_107100_108500
800056	contig_6279_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_164768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102465	100552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_100600_102500
800058	contig_5588_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_172831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCATTGTTGTAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378835	376962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_377000_378800
800061	contig_9945_pilon	+	3014	1	Intergenic	novelGene_104802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36019	39033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_36000_39000
800062	contig_11986_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_69105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56800	54822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_54800_56800
800066	contig_16103_pilon	+	506	4	Intergenic	novelGene_118807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10379.0150571023	27	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603902	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604521_605003_605118_605495
800068	contig_1594_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_138803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACATTGCCAAGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359650	359295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_359300_359600
800070	contig_12970_pilon	-	1801	3	Intergenic	novelGene_50528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	462	junction_2	16.5	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	275522	213839	FALSE	70	GAGGTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPVPLRGGRRQRHRGAALCASWRGAAAQPPDRGPGAQCTFRPHEEKRPVEDCERKVVPQDGLHHAAETCHCPLWRRECRWEDRLPSGGKGDHRQDHHRRNDQTTEDGSENFYGYGSGLRRRKAAVSPTSLASCI	275523	212446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_213928_274347_274526_275381
800072	contig_12920_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_166359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATTAAGGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347168	348447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_347200_348400
800074	scaffold_13505_pilon	-	1077	5	Intergenic	novelGene_111460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.352852742625	3	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	23	730	535595	531010	FALSE	35	AATAAATCCTTCCCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEVTSRIAPCMRTSPGASRVPTKMWAASRSETSSWRSRDPGRLPCLLCSQL	535617	530662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531156_531295_531369_532376_532496_532707_532999_535516
800075	contig_13244_pilon	-	488	5	Intergenic	novelGene_86961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	2127.32547756567	555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	35	409	299402	296126	FALSE	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVELCSFSGYKIYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQKPEVRKAQREQAIRLLQRQHLNRRLPSL	299436	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_297254_297392_298566_298678_299204_299281_299397
800076	contig_2463_pilon	+	2144	3	Intergenic	novelGene_43035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	4.5	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	237	1565	544034	557207	FALSE	70	AAAAAAAAAGAAACCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELPAPSSAPRKTEEPGPRAEVMEEVTSCSFNSPLFQQEDKRGITYRIPALLYIPAARTFLAFAEKRSTCRDEDALHLVLRRGLRTGHLVQWGPLESLMTATLPGHRTMNPCPVWERKSGRVYLFFICVRDHVTERQQIVSGRNAARLCFIFSQDAGCSWSEVRDLTEEVIGPEMKHWATFAVGPGHGIQLQSGRLIVPAYTYYIPYRLFCFRLPCKARPHSLMIYSDDLGVTWHHGRLIRPMVTVECEVAEVIGKAGHPVLYCSARTPNRRRAEAVSTDHGECFQRSALSQQLCEPPHGCQGSVVSFRPMEIAHECQDPGGKDAPVGEQSPPLDSSLRLEQETGTLSESWLLYSHPTNKKRRVDLGIYLNQAPLGAPCWSRPWILHCGPCGYSDMAAVDEKGLFGCLFECGIKRECEQIAFRLFTDREILSHVQGELHQP	543797	557786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_544098_548724_548937_556154
800078	SIRV6	+	350	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	413	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1783_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800079	contig_7201_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_152498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTATAATCTTTATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95724	96739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_95700_96700
800082	contig_12964_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_131716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTCCTGAGCGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588602	588034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_588000_588600
800083	contig_5083_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_151626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAGAAAGGCAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66662	68324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_66700_68300
800086	contig_615_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_80051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTCTGTATGCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58502	57573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_57600_58500
800089	contig_6048_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_73160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	878	1183	1175023	1174718	NA	65	GCAAAAAAAAAAGAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRLVKQNQKQSFKIYTQKLDRTERRKRKIHNNRDFKTPLSVIKSTRRHRISMDKKDLNNIINQLDLIDIYRTHHLTTTEYTFSSSVHGPLIKTEHIYTMP	1175900	1174461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1174500_1175900
800093	contig_11493_pilon	-	1701	3	Intergenic	novelGene_143683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	720	junction_2	36.5	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTACTCCTCCTTAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188771	184122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_184964_185815_185919_188014
800099	SIRV4	-	452	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
800102	contig_8120_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_159720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCTTATTGTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68207	67914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_67900_68200
800103	contig_1091_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_168774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGTTATAATACATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636756	634191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_634200_636800
800107	contig_5947_pilon	+	1717	4	Intergenic	novelGene_101613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	542	junction_3	23.1516738055805	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	281	883	995846	998704	FALSE	15	CCACGTTTATTCGTTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKGELRGAEWAPSGWAAERTRMSPLPSCISPHSSRECRGAATSRQPGLRGFAAGDQRSVPGEGSAVLSQTQVSARGMCWGRKPPSGVAVNREGPSVGWADHSLLTPAVCSPFTSMSSSASLSSPAQ	992357	999538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_992402_993750_993972_995830_995931_998186
800109	contig_10437_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_38235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGGTTGCTGTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322508	321044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_321000_322500
800111	contig_8258_pilon	-	981	7	Intergenic	novelGene_130438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATAAATGTATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51489	586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_-_646_1580_1668_4697_4775_25321_25492_32381_32473_38820_38947_51118
800113	contig_12119_pilon	-	1519	7	Intergenic	novelGene_88661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCGCTTGTCCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355707	306572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_306739_319826_319895_325355_325696_329481_329655_329746_329927_348770_348977_355321
800114	contig_18251_pilon	+	1118	5	Intergenic	novelGene_50171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	90.9982829508338	2317	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	476	1054	110201	119066	FALSE	30	TCACGAGCCATCAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEDGYVALNIKTRRPAFTSAVMQQNLLQAENENLSGTVQQLAKRFCQDLIKKSKEEAHKCSPCDTNWRYYGDSCYGFFKHNLTWEESKQYCTGMNATLPKIASQNILEYIKARTGLIRWIGLSRQNSNGVWTWEDGSVFSKNLFELPGDGNPNMKCAYFHHGKIHPSSCKNRHYLVCERKAGMAKVDELL	109725	119130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_110265_112045_112157_112324_112477_116797_116905_118921
800119	contig_12250_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_80521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAAGGTCAACCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64896	63983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_64000_64900
800120	SIRV6	+	377	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	3	403	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	190	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800121	contig_2062_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_139053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCCACCCAGATAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318402	1317312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1317300_1318400
800122	contig_19647_pilon	-	1620	2	Intergenic	novelGene_144020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATGGTGTTAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100613	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_99308_99544
800123	contig_9839_pilon	-	1082	8	Intergenic	novelGene_88545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	56.0910338791562	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGAGTTGGTTCTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124678	111522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_112055_115463_115563_116318_116478_118304_118362_122018_122154_122697_122733_122791_122822_124643
800124	contig_4125_pilon	-	1402	8	Intergenic	novelGene_25135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	352.570097242219	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	412	801	813277	811152	FALSE	15	TGTCTTCCTTTAGCCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYQVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKKPGTLRGFHLMDGRDKRSAMGTVSASPRPATRCPPSASKTP	815549	810550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812121_812627_812786_812921_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466
800125	contig_10904_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_22676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAATTAACAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541558	539849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_539800_541600
800126	contig_19640_pilon	-	994	3	Intergenic	novelGene_134863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1176	junction_1	96.5	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	148	621	61278	59454	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAGACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKHIYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKISHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLKLCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKVSNKFQEY	61982	59080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_59732_61082_61293_61849
800127	contig_563_pilon	+	912	3	Intergenic	novelGene_169775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	18	junction_1	57.5	3358	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	472	828	716908	720513	FALSE	15	CTACTAGTACCTGTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKSGKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK	716436	720597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_716910_719107_719288_720338
800128	SIRV6	+	264	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	7	8451	1	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
800129	contig_12923_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_30167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTTCTCATATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310915	307779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_308253_310825
800130	contig_10341_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_47231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92961	90823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_90800_93000
800132	contig_6954_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_64439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCATGCGTGCCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468151	468561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_468200_468600
800134	contig_12520_pilon	+	233	2	Intergenic	novelGene_161049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGATTTTCTTGAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47144	48469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_47302_48393
800136	contig_10143_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_163336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCTAAATGCTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169786	167841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_167800_169800
800141	SIRV6	+	226	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	71	486	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
800142	contig_10926_pilon	-	898	2	Intergenic	novelGene_137501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATTTAAATATGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12420	463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_1230_12288
800143	SIRV4	+	227	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCTAAAGACATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4027	5158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
800144	contig_9440_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_59071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAACTTAATTTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986767	985351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_985400_986800
800149	contig_10727_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_159652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76851	79402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_+_76900_79400
800150	contig_4305_pilon	+	1339	4	Intergenic	novelGene_136669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCGACGGCAGCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512044	514653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_512381_512649_512709_513072_513297_513933
800152	contig_12080_pilon	-	2285	13	Intergenic	novelGene_128390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	101.632883731377	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	221	1729	202904	194427	FALSE	25	GGCTATCATTCATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQPPHTGHTHRASVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQHDDQQPVVLRRRSSSDLARQKFGTMPLLPIRGDDSGATLLSANQTLPMKSSQGSVEEQEELEEPVYEEPVYEEVGAFPDLTEDTSISSTTREWTAKPETLLTSQSSFDQFLLSKAGTLGQEERPPEPPPGPPSKSSPQAHGSLEEKLLQELSSLILRKAETTTGLASPSQPSSSHPPSPTGLPTQTSSFPMQPPCTSSLPSSQPLT	203399	193870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195651_195790_195898_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200892_200956_201268_201417_202863_202963_203237
800154	contig_20398_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_155196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48358	50654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_48400_50700
800155	contig_16204_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_154522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAATCCACGTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380054	380866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_380100_380900
800156	contig_14322_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_116379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGCAGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671600
800157	contig_19098_pilon	+	2013	13	Intergenic	novelGene_65818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_8	146.723568507434	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	118	1980	345322	410278	FALSE	35	CCAAAAGTGTTTGTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLETPLLAQSCLEKLIFPGILAPASWRENGRRPCPWVAMNSAVTSCESPKLLESDDGVLDSHPDGQVRKKNGQPGTSSHLVYGIMDIPPWYLCIFLGIQHFLTALGGLVAVPLILAKNLCLQHDPLSQSYLISTILFVSGICTLLQVFFGVRLPILQGGTMAFIAPSLAMLSLPAWKCPEWMINASLVNTSSPEFTEEWQKRIRELQGAIMVASCVQMLVGFSGLIGFLMRFIGPLTIAPTITLVALPLFDSAGNDAGIHWGIAAMTIFLIVLFSQYLKNVTLPVPVYGGQKKCHTSKFHVFQVFPVLLALCTSWLTCFGLTVTDVLPSAPTAYGHLARTDTKGSVLSQAPWFRIPYPGQWGLPTISLAGVFGIIAGVISSMVESVGDYYACARLVGAPAPPRHAINRGIGIEGLGCLLAGAWGTGNGTTSYSENVGVLGITQVGSRMVIVAAGCMLLLMGVFGKIGAAFATIPTPVIGGMFLVMFGVITAVGISNLQYVDMNSSRNLFVFGFSIYCGLAIPNWVNKNSEKLQTGILQLDQVVQVLLTTSMFVGGFLGFLLDNTIPGSAEERGLLAWNQIQEESQETSKAFEVYGLPCGIGTKFCTSSCVQCLPFWPRLEGGGKDEEIIPSVDAKKEKVLKSQPKPCFLALSCTSEEE	345204	410311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_345364_355805_355947_358015_358174_382756_382917_393940_394123_395034_395156_395416_395574_397037_397292_402630_402796_403128_403238_403357_403454_404278_404453_410174
800159	contig_6710_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_98280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657827	653562	FALSE	15	GCATCCATGTCTGGTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657828	653545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
800160	contig_9272_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_125942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGCCTGTAAACCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431912	433787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_431900_433800
800163	contig_14483_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_133750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAAATCTGGTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53624	53119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53100_53600
800165	contig_7285_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_143405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGAGCCTTCTCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311630	312280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_311600_312300
800167	contig_2257_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_122502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTAGGTACTGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309906	310833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_309900_310800
800168	contig_10734_pilon	-	1108	9	Intergenic	novelGene_51157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	64.9017285979349	772	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	390	848	957719	949859	FALSE	10	TTGACTTTTCTATCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDVAKCRQWLEKNFPKEFAKLTVENSPKQEAGISEGQGTVGEEEEKKKQKRGGRGQIKQKKKTVPQKVTIAKIPRAKKKYVTRVCGLATFEIDLKEAQRFFAQKFSCGASVTGEDEIIIQGDFTDDIIDVIQEKWPEVDDDSIEDLGEVKK	965497	949598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_949904_950011_950152_952711_952829_955443_955528_957646_957732_959984_960064_960391_960412_964459_964575_965334
800170	contig_15423_pilon	+	1141	7	Intergenic	novelGene_171590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_5	12.347964294661	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	61	1140	308681	322085	FALSE	45	GTAAGTAAATACATTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENDRICQVNNFYNNKIIAIMNESTEFEERSAAISKEWEHDLRSVKEESEKMFKNYQTLKASLTSGDAVNSTTKDNKNHHVTSRTTQLTREKVQELEISLREAKESAKHKESKITEMQKELEMTNGMIAKLQAKVNESNKCLEKTKETIQVLQEKVALGAEPYKEEIEDLKTKLVKIDLEKMKNAKEFEKEITITKATVEYQKEVIRLLKENLRRNQQAQETSMVSENVDSQPLNKAITCGGGSGIVQSTKVLILKSEHMKLENEMSKLKQQNEQLIKQHSELLSNNHRLSKEIKTWKERTLKREAHKGVTCENSPKSTKVTGTPSKNRQNTPSQCKERNLQDPVPKESPKSWFFDSRSKSLPTAHPVRYFDNSGLGLCP	307789	322086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_307844_308674_308894_310778_310965_315731_315845_317565_317664_319808_319993_321799
800171	contig_5018_pilon	+	959	3	Intergenic	novelGene_46939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	65.5	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	256	387	268087	268218	FALSE	10	TGCTAGGAGTCTGTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSRASRSKRGGEERVLEKEEEEDDEDDEDEDEDDVSEGSEVPEGDRPAGAQHHQLNGERGPQSVKERVKDLFSTQEIDGKSLLLMQRTDVLTGLSIRLGPALKIYEHHIKVLQQGHFEDDDPDGFLG	266851	268790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_266879_267277_267463_268043
800176	contig_3414_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_80975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAGGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69934	67424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_67400_69900
800183	contig_15666_pilon	-	1313	2	Intergenic	novelGene_70118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTACAAAGCAAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103838	102438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_103595_103681
800184	SIRV6	-	340	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
800185	contig_11505_pilon	-	1458	3	Intergenic	novelGene_140929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	73.5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	202	567	198190	150270	FALSE	35	TACACTTGAATTGTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPFLPLMFLNPSWYRWINNRLVATWLTLPVALLETVFGVKVIITGDAFIPGERSVIIMNHRTRMDWMFLWNCLMRYSYLRLEKICLKASLKSVPGFGRLFTNYFKYFIHFTLKFYRITW	345839	149378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_150540_198094_198265_345712
800187	contig_9484_pilon	-	645	2	Intergenic	novelGene_105606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	42	305	75875	74841	FALSE	30	TTATTGGTATTCTGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGASREVAGAAAMAAQQEPGPPQEKGDQPEKGAQVAAWLKKIFGDHRIPQYEVNPRTTEILYHLSERNKARDRDVSLVIEDLKQKASEYESEGEINSRV	75916	74500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_75039_75809
800188	contig_9484_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_105604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGGCTCCTTCTGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74449	73481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_73500_74400
800189	contig_14467_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_138281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTACTAATTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358320	357311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_357300_358300
800193	contig_15353_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_151967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGAAATGTATTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277130	276474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_276500_277100
800195	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	6	1153	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
800196	contig_15325_pilon	+	771	7	Intergenic	novelGene_157173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	889.739428147365	8	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	19	537	93248	96074	TRUE	25	AATATTGTTGTATTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPAGIMEGVEEKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIARSDS	93229	96612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_94567_95094_95233_95674_95752_96060_96245_96548
800197	contig_10019_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_86703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1034	1390	437943	438299	NA	35	GAATTACGGCTTCCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSNTEATPETHSSMNPFGFWFHSFSFPWILFFVSGTPGVFRFFIFECVCVCVCVYIYTHISMVVQWLQCQTAKQKVSSSKPSTAPGEKNMAVCFQFTALEILWGRYELKLTQWQWV	436909	438589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_436900_438600
800202	contig_6397_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_146276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGCTAGTGACCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537638	536346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_536300_537600
800203	contig_15720_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_41930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGCCCCCCAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284075	285973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_284100_286000
800204	contig_19938_pilon	+	861	4	Intergenic	novelGene_146570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	76.8779696806713	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	122	502	8931	19091	FALSE	40	CTCTATCACAAGTGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVAIVAGAGTIVHEKYQGRLSNEEESEKKLLGGIPCLPLPPRTAPRLPSSCELPGPPWAPECPCLE	8809	19450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_9006_16532_16644_16947_17005_18953
800205	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
800206	contig_18081_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_23855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGTGTCCATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482956	481831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_481800_483000
800207	contig_5341_pilon	-	1060	2	Intergenic	novelGene_168010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	101	385	340788	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGAGVALRVVRAEGNSSRKLRRCGVSLDGPLLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340888	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338764_340787
800209	contig_9516_pilon	+	1379	10	Intergenic	novelGene_106192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	12.0195314302376	90	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	97	450	1046702	1055489	TRUE	25	GGCAAAATTACTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIAVAFPIVGASASQSSDEPEQHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQTIDVRFKEIKYRGMFHALFRIYKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLEEANCHIFLLRSSWWV	1040885	1079217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1040952_1046671_1046766_1048549_1048698_1050939_1051035_1055442_1055536_1056903_1057000_1063622_1063748_1064513_1064650_1077401_1077483_1078772
800211	contig_5916_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_158063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1104	1565	531069	531530	NA	50	CAATAAACAAGAACTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTWSAVLKQHLPPLPRVTLRSCRPVYFQLIAHQHWPPKSPRVTYYLPPRSSDPAVAQFAPAVTVHTLMKTHPRALLGSLTQWCSCYQCLHAGAASSSSIASLIHKAACRCPCHVCLLLPWFRLTRAHSSDFHFFLPPGSVRTVGTELLVHT	529965	531901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_530000_531900
800214	SIRV4	-	298	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1220	3	1220	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3938	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
800215	contig_5196_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_38709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAATGATTTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351917	353359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_351900_353400
800217	SIRV6	+	437	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-85	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	104	315	71	385	2458	10736	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAIELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2823_3106_3165_10724
800218	contig_20794_pilon	+	2029	4	Intergenic	novelGene_161388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAAATATCTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232	9474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20794_pilon_+_2908_5417_5578_5660_5747_9366
800219	contig_7356_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_60364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGGTTGCAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339044	338529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_338500_339000
800220	contig_7293_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_54223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGAATTCAATTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185914	184631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_184600_185900
800222	contig_14041_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_144040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112999	115247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_+_113000_115200
800223	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
800226	contig_7391_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_112139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTGCTCTAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314088	312255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_312300_314100
800230	contig_12724_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_146857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTATTTTTAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152897	152397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_152400_152900
800231	contig_12724_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_146856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTTATCCATCCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152102	151250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_151200_152100
800232	contig_12724_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_146855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATTCTCCATGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151301	150840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_150800_151300
800235	contig_13265_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_146009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGTGGTTAACTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112506	114392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_112500_114400
800237	contig_18081_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_23821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGTCAGTGCGCCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192259	190511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_190500_192300
800238	SIRV6	+	276	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	33	1280	-31	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTTAGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
800240	contig_7066_pilon	-	1533	7	Intergenic	novelGene_42181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	13.8644228953903	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1419	113	1531	973207	957833	FALSE	40	CACAGCTCAGAAGGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVMIRFQNQNRPRASGLSRVSPALGAEDFWLTAARNVLKLVVKSEWRPCSIQEEEEETPGDKQHKKQEKKPVTVSPEFVDEALCACEEHLSNLAHMDIDKDLEAPLYLSPQGWSVFLQRYYQVVHEGAELKHLDTQVQRCEDILQQLRAVVPQIDMEGDRNIWIVKPGAKSRGRGIVCMDHLEEMLKLVNCNPMMMKDGKWVVQKYIERPLLIFGTKFDLRQWFLVTDWNPLTVWFYRDSYIRFSTQPFSLKNLDNSVHLCNNSIQKHLENSCHRHPQLPPDNMWSSQKFQAHLQEMGAPEAWSTIIVPGMKAAVIHALQTSQDTVQCRKASFELYGADFVFGEDFQPWLIEINASPTMAPSTAVTARLCAGVQADTLRVVIDRRQDHNCDTGAFELIYKQPAVEVPQYVGIRLLVEGSTIKKPTAMCHRRMTIRPALPHLLTQQDSREGKDSGALTHSRGIRKFKEVARG	973319	957830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_957870_958559_958733_961445_961882_964067_964312_968069_968219_971266_971463_973023
800242	SIRV6	+	238	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8472	-1	267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGTTGCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
800243	contig_12543_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_168373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTCACCCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267518	266137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_266100_267500
800244	contig_13944_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_175286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGCTCCACGTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63892	64248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13944_pilon_+_63900_64200
800246	contig_9516_pilon	+	1492	11	Intergenic	novelGene_106194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	18.2537667345674	71	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	56	553	1041253	1055489	TRUE	5	CTTTGGCTTTGTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIFPGIILIFLRVKFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQTIDVRFKEIKYRGMFHALFRIYKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLEGQPGAAGWLGTAGEPFEANCHIFLLRSSWWV	1041197	1079227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1041319_1046671_1046766_1048549_1048698_1050939_1051039_1051515_1051560_1055442_1055536_1056903_1057000_1063622_1063748_1064513_1064650_1077401_1077483_1078772
800250	contig_4654_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_103047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCTGAATAAAAAGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407929	408856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_407900_408900
800251	contig_14807_pilon	-	600	6	Intergenic	novelGene_124711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6519.35231752357	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	24	599	39773	37307	FALSE	40	GAGTTAAATACATCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGC	39796	37305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38836_38887_39750
800252	contig_1008_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_121544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGTCTACCAGTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337277	336110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_336100_337300
800253	contig_11370_pilon	+	1274	2	Intergenic	novelGene_98722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	140	319	145831	147474	FALSE	0	GGGGTGGGGGCTGGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITQRLQFSLAKTGQVFS	145691	148429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147426
800254	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_93715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
800255	SIRV7	-	267	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	27	91632	-5	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147930	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
800256	contig_12638_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_33228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	618263	618589	TRUE	40	CACTGTACAAATCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTWGLSSCRPWAPSLAAARTPQNRLSPSRRSPSRRSPSPRSQRTLSIPGPSPAHGGRWTTCASSSPAPPGTESVVRRSNRPPSRRRQSFLSASAWSLSSLLTSLCLS	618261	619860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_619464_619698
800263	contig_12125_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_76207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGTTTATTTTCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122842	124138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_122800_124100
800265	contig_14679_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_174186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111068	108897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_108900_111100
800269	SIRV4	-	417	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1106	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4052	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
800271	SIRV6	+	317	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	35	-244	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800275	contig_6710_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_94766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATACACAGTGGTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653358	657827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
800276	contig_12127_pilon	-	1975	10	Intergenic	novelGene_130100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_9	287.206382541961	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	125	1039	47806	35925	FALSE	10	TTTTTTGCTTTTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASETHNVKKRNFCNNIEDHAIDLPRKRNSNFTNKNMKEVKKSPKQLAAYINRTVGQAVKTPDKLRKVIYCRKKVQRPFPHPCYRKKQSPRSGGCVMANKENELACAGHLPEKLHHDSRTYLINSSDSGSSQTESPSSKYSSFFSEVSQDHETMAQVLFSRNLRLNVALTFWRKRSISELVAYLVRIEDLGVVVDCLPVLTNSLQEEKQYISLGCCVDLLPLVKSLLKSRFEEYVVVGLNWLQAVIKRWWSELSSKTEMVNDGNIRILKQQLNGLWEQENHLTLVPGYTGNIAKDVDAYLLQLH	99574	34988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_35958_39796_39891_40666_40757_41178_41269_41358_41410_42073_42193_45407_45688_47104_47146_47689_47821_99464
800278	contig_13496_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_107656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	89	400	404010	403699	NA	75	AATTTAAAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLLTPQMTFIFMSMFQSHHSLVGYGRTYRMLLLSLYNSEDWCLNTYTKCNRKYSQLPEHYCLKANILFSKIQWHFGWLVLSSKPHPCSCNPGWSRVSEKLR	404098	403318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_403300_404100
800279	contig_2444_pilon	-	514	4	Intergenic	novelGene_83762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	175.547397841406	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACTAATATCTAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229809	227588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229028_229693
800281	contig_14516_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_153903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTTACCTTCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175411	173977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_174000_175400
800282	contig_14483_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_133776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185880	187339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_185900_187300
800285	SIRV6	+	171	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	561	51	561	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10798	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
800287	contig_15752_pilon	-	1844	18	Intergenic	novelGene_148768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_8	4.72496132424075	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1647	196	1842	256052	227437	FALSE	30	TCCTCTGAAACTAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANLLQNQAVKGKAAGALLRGIFKGSPCSEEAGALRRRNVYTLCIQLVESGDLQKEVASEIIGLLMLEAHNFPGPLLVELANEFIDAVREGSLVNGKSLELLPIILTALAAKKENLTDGKGELSGEEYKKQLINTLCSGRWDQQYVIQLTSMFKDVPLTAEEVEFVVEKVLKMFPKLNLQEIPPLVYQLLILSSKGSRKRVLEGIMAFFNELDKQHNEEQSGDELLDLVTVPSGELRHVEGTIILHIVFAIKLDRDLGRELLKHVKTGQQGDSSKNLCPFTIALLLSVTRIQRFEEQVFDLLKTSVVKSFKDLQLLQGSKFLQNLVSHKSCVSTMILEVVKNSVHSWDHVTQGLVELGFILMDSYGPKKILEGKAVEISSGLSRVPVHQACKLGASILLETFKIHEMIRQEILEQVLNRVVTKASSPISHFLDLLSSIIMYAPLVLQSCSSKITETFDYLSFLPFQTVQGLLKAVQPLLKVSMSMRDSLILVLRKAMFASQLDARKSAVAGFLLLLKNFKVLGSLSSSQCSQSVGVSQVHVDVHSRYNSVANETFCLEIIDSLRRCLGQQADVRIMLYEGFYDVLRRNSQLVNSIMQTLLSQLKQFYEPKPDLL	271625	227434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_227473_229028_229098_229862_229986_231186_231302_232629_232701_233170_233302_237421_237510_239216_239398_245371_245509_246191_246285_250012_250140_252497_252584_253022_253147_253554_253597_255325_255384_255461_255619_256043_256175_271552
800288	contig_8110_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_158616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGCTGGAAGTCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137991	138944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_138000_138900
800292	contig_17897_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_153402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67909	69242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_67900_69200
800293	contig_6710_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_98019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	20	CCTCTTCTTTAACTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
800294	contig_15323_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_148522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCAACTTCCTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91621	91314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_91300_91600
800295	contig_14882_pilon	+	725	3	Intergenic	novelGene_114998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	389	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	72	392	254243	254563	TRUE	35	AAGAGGTGGAGGCAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTCSGLHVRWYALTPGLKGQRPRRVRKGTSGPALSPYPFEHGVSPSAAAFAAAAATAASATWNIFRLQVSLPTTRNPGRKSGAQALITHSSHAFSARDRPGRDGR	254171	258600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_254742_257635_257738_258547
800298	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	26	358	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14434	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
800299	contig_3797_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_120101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCCCTTTATAAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392875	394031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_392900_394000
800300	contig_1406_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_25648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTGTCAGAATTGGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2749328	2747247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2747200_2749300
800302	contig_16948_pilon	-	1381	6	Intergenic	novelGene_166398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_5	40.2810128968972	217	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	145	1083	175892	148322	FALSE	15	TTCACTTGGATCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLLLLGLIGALTLLLLLTLLAFAGYSGLLAEVAVSAGSPPIRNITVAYKFHKGSYGETGHLFTESCSISPKLRSVAVYYDNPHMVYPEKCRCAVGSILSEGEESPSPELIHLYQKFGFKVFSFPAPSHVVTATFPYTTPLSIWLATRRVHPALDAYIKERKLCAHPRLEIYQQDQIHFMCPLARQGDFYVPEVKETERKSRAPVEASDAPMDGTGADTSDTSSVSLEVGPGSREPSATTLSPGASSHGWDDADTRSEHSYSESGASSSSFEELDLEGESPLGEPRLGPEAEPLGANKWPRELSTLEKGEE	179491	148023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_148612_152121_152291_166214_166437_175634_175927_178410_178478_179448
800305	contig_8681_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_157202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACAAAGGCCAGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145898	147362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_145900_147400
800309	contig_10176_pilon	+	2022	3	Intergenic	novelGene_72709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_2	92	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1496	1906	252607	254018	FALSE	30	TAGTAGTGTTTTAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIVITSHPGQIVKHEDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVNFPENGFLSPDKLSLLEKLLPARKEVEETDEMDQVELVDFDPNQERRRHYNGEAYEDDDHHPRGGVQCQTS	251111	254134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_252698_253015_253117_253799
800312	contig_7898_pilon	+	442	3	Intergenic	novelGene_47575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	854.5	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGAATTGAATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483973	487526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484011_484215_484362_487267
800313	contig_8570_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_120147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAACAAAAAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310389	311831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_310400_311800
800316	contig_1964_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_130933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAGGAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692674	694519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_692700_694500
800320	contig_14621_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_105844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTTTGTGGTTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125504	126768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_125500_126800
800327	contig_15952_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_154091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCCTGGTGGTGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701223	700579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_700600_701200
800328	contig_6710_pilon	+	545	2	Intergenic	novelGene_97202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGCTCTAACACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653378	657184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
800330	contig_12605_pilon	+	564	3	Intergenic	novelGene_64168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	29	397	3897	4829	FALSE	15	CCTACTTGGAGGGCACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3868	4996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
800331	contig_3572_pilon	-	1508	6	Intergenic	novelGene_175288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	347	715	244735	191085	FALSE	60	TCTGAAAATAAAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCRCTGSSNLFIVSITLLLISSSAFFIIARSSSWFCSWSCRICWSWSLSSATFRLMSSRLMWTVEEPAGRDWLGGMVDSRVVSIFPPETWGVPALSVWFLLAAVFIIFSLVSLSLGIVAVL	251717	190291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3572_pilon_-_191121_215847_215899_235446_235614_244620_244801_250925_251058_251568
800332	contig_6364_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_51776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051770	1050021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1050000_1051800
800337	contig_5515_pilon	-	2027	6	Intergenic	novelGene_52348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4.70744091837593	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	51	890	109563	104479	FALSE	45	AAGAGGAGAGATAAGGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSLGGRTIRSTSVSSQPVGTSNLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSRGSMQELDTLAGLQRSPAPQSRSSLNAKPHDSLDLNCDSQDFVAAIISIPTPPANTPDESQPSSPDGSSGRASSTLRNSNLGTPCLLPETVKISSL	109613	103341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_104708_105537_105789_106058_106158_106245_106330_106428_106592_109549
800338	contig_5020_pilon	+	817	7	Intergenic	novelGene_27885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1089.12815540178	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	231	815	123294	126067	FALSE	35	AAAGCAAGCTCAACCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCAPRIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPP	118492	126069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_123293_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125048_125987
800339	SIRV6	+	232	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9647	558	497	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
800340	contig_9481_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_149676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGCTATTAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401255	402362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_401300_402400
800342	SIRV5	-	418	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10860
800344	contig_8964_pilon	-	2416	5	Intergenic	novelGene_168693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	97	junction_1	112.713131444388	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	442	2352	547424	526898	FALSE	35	GAGCGGAACCCTTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGGGGKKEASGIAFSQGLLTFKDVAIEFSQEEWQSLDSAQKALYRDVMLENYRNLVSLDISSRCMLQELSPDENIIKGELFRTVMLERRVSHSLENFDFRKTLGSMHEFESHCRYCERNYRGVTKSHNSSLTGREDQQHDIPWNNFLLKQCVSVRKNVYQYCKYENLFVRDLLKLENNISYREDKNMKCFENKIGLAFQSDLNELQRFQTAEKIYGCSQIEKSINGCPVSPLQRIPPGVNFNICNKCGKVFKDPSLLTQHQKTHITGKLYECIEDGKAFNQSSIVSKHQKVHSGLRTHKCNECGKAFNYFSNFIKHKRIHTGEKPYKCNVCGKVFIQNSNLRSHLRIHTGERPYKCHECGKAFIRRSQLLGHERIHTGEKPYKCNECGKAFTVHSCLTRHQRLHNEENLYKCNQCGRAFISRSYLWDHEKIHTGEKPYKCIECGKAFRQRSDLRIHQRIHTGEKPYKCNECDRAFTVRSSLTNHRRIHTGEEPYKCNECGKAFTHFSNLIRHQKIHTKKEHCKSNTSVNAFIQSSNLDDHTIHSKEKTYKCHECGKSFTVLSSLTNHKRSHTAEKPYKCNECNKTFTHFANLTRHQKMHAENEQCKSNMCVSASIENSSLGDHEKIPTGEKPYK	549666	526833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_528628_543392_543520_547370_547457_548900_549078_549434
800345	contig_4418_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_98367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAGCTACCATTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761132	762011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_761100_762000
800349	contig_5031_pilon	-	1230	5	Intergenic	novelGene_133218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.465401638754	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	420	800	116574	98726	FALSE	85	AAAGAAAAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVREPQPVTMIADELVFFVNGKKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRFQNKVIHFSATACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKMRLHPVQVTRGKGTPIGSFS	116993	98295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_98747_105885_106016_107368_107466_110278_110337_116499
800351	contig_6496_pilon	+	1655	9	Intergenic	novelGene_103493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	81.6699722970444	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	371	1081	461115	467595	FALSE	25	TGAAGGAAGGGCGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLITLMGSLVDWKGKILIPGIYEAVAPVTDEELALYNDIDFDTDEYTKDVGAKTLLHSCKKDILMHRWRYPSLSLHGIEGAFSGSGAKTVIPRKVVGKFSIRLVPDMTPEVVSKQVTSYLTKKFADLHSPNKFKVYMSHGGKPWVSDFNHPHYLAGRRALRTVFGVEPDLTREGGSIPVTLTFQEATGKNVMLLPVGAADDGAHSQNEKLNRHNYIEGTKMLGAYLYEVSQLKD	455642	468169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_455736_457424_457514_459854_459983_461054_461140_461416_461578_462836_463002_463278_463421_463637_463786_467525
800352	contig_11047_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_173947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6036	6251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_6000_6300
800353	contig_15118_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_74636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	171	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGTCTCTGTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456798	458980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_457772_458767
800354	contig_3410_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_58932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAACCATGGAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36116	34847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_34800_36100
800356	contig_2114_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_104294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCCCAGAATACAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776907	775714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_775700_776900
800357	contig_9283_pilon	-	3255	2	Intergenic	novelGene_164399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAATCTTGTAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16289	12969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_-_14215_14279
800362	SIRV4	-	270	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1248	3	1248	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3910	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
800363	contig_14522_pilon	-	2137	6	Intergenic	novelGene_147320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_5	216.85257665059	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	51	992	175672	78899	FALSE	30	TGTCCCAGCTGAATACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPTQTLSPNGENNNDIIQDNGTIIPFRKHTVRGERSYSWGMAVNVYSTSITQETMSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHVSVRGLDSCALK	175722	77753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_175553
800364	contig_3015_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_163319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAATAAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243011	241848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_241800_243000
800365	contig_4407_pilon	-	1627	3	Intergenic	novelGene_122266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_1	82.5	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAAGTGTTTCGGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12601	10393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_-_10520_10947_11019_11171
800366	contig_11264_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_154201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	10	366	16299	16655	NA	55	TTCTAGCAATAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKMRDGKCPRAFSFMGWRKEITCTKVGVGETPSKGGVVLSAQCLAQAGNLVYCTLWTSVNNNVSQSREAADMRLISKISHPLWFTPPFGGVKANNQFKKKKKKEQDTYSMRTSSKPLSCF	16289	17207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_16300_17200
800369	contig_19352_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_122395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAATAAAAAAGGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211787	211445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_211400_211800
800370	contig_5968_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_112201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655881	656898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_655900_656900
800371	SIRV2	-	378	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4495	34	3320	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1412	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
800372	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
800374	contig_10404_pilon	-	1586	9	Intergenic	novelGene_138652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	24.2693221990232	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	199	1140	870560	855376	FALSE	20	TTTCCTAATTTTGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPQVLAFGLLLAAATAAVGTAQKECLCETYKLTANCTVNSNGQCQCTSVGTQNTVICSKLASKCLVMKAEMTTSKSGRRKRPEGALQNNDGLYDPDCDEKGLFKAKQCNGTATCWCVNTAGVRRTDKDTEIMCSERVRTYWIIIELKHKTREKPYDVQSLRTALEEIFTTRYQLDRKYITNILYENDVIVIDLVQNSSQKTQNDVDIADVAYYFEKDVKGESLFYSSKMDLKVNGEQLDLDPGHTSIYYVDEKSPEFSMQGLKAGVIAVIVVVTIAIIAGIVVLVTSRKRSVKYEKAEVKEMGEMHRERNA	870758	854929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_855418_857428_857471_859072_859274_859993_860096_860976_861041_862502_862569_867019_867261_867543_867652_870484
800375	SIRV6	+	339	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1662	6	-237	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2786	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800377	contig_990_pilon	-	1172	3	Intergenic	novelGene_76129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	74.5	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	18	332	1605903	1598926	FALSE	80	TGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRWKMATVTELKAVLKDTLEKRGVLGHLKARIRAEVFNALDDEREPRPPLSHENLLINELIREYLEFNKYKYTSSVLVAESGQPVVPLDRQFLIRELNLFEEPKDNTM	1605920	1598085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1599015_1601437_1601636_1605875
800378	contig_2205_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_174262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATAGCCCTAGCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25198	26798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2205_pilon_+_25200_26800
800385	contig_12635_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_60860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602366	603907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_602400_603900
800386	SIRV1	-	233	1	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	3989	5564	3569	-115	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTCGTAGGTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6600_6800
800388	contig_11026_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_167684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACATAGTGGATGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270416	272556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_270400_272600
800390	contig_4686_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_118520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGGAAAAATTGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433774	432677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_432700_433800
800391	contig_854_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_36379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAACCCTGAACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976112	974704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976100
800392	contig_4131_pilon	-	897	2	Intergenic	novelGene_127846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGTATTTCATGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97839	94272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_94538_97207
800393	contig_11978_pilon	+	655	5	Intergenic	novelGene_63061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3707.56675597352	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	207	572	1830113	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827917	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827969_1829957_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
800395	contig_14687_pilon	+	2773	2	Intergenic	novelGene_107884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCAACCACTCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28561	32685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_31047_32397
800396	contig_10437_pilon	-	1586	1	Intergenic	novelGene_38242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATATATAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364658	363072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_363100_364700
800400	contig_11328_pilon	+	439	5	Intergenic	novelGene_88391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2387.43214563263	2	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATCATCTTTACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643643	648033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_644811_647099_647223_647899
800401	contig_665_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_158214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGGAATTCTATATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286471	284428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_284400_286500
800402	SIRV2	-	513	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4359	35	3184	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
800403	contig_2215_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_163868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCAACCTTTTGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323655	322374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_322400_323700
800405	contig_5153_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_74399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGCCTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001183	1000237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_1000200_1001200
800406	contig_5059_pilon	+	1164	9	Intergenic	novelGene_140725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	181.309085197074	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	238	777	243441	255821	TRUE	15	TGTGGTGGTATGGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQEPMDSSQTTKQSIISEELISEGKWVKLEKTTYMDPTGKTRTWETVKRTTRKGQSADGVAIIPVLQRTLHYECIVLVKQFRPPVGGYCIEFPTGLIDDNESPEAAALRELEEETGYKGDIAECSPVVCVDPGLSNCTVHVVTVTINGDDAENVRPKPKPGDGGMLFNSQWLTTYMA	232343	259576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232537_243396_243504_244759_244828_250083_250134_251589_251698_253218_253315_253949_254052_255768_255964_259331
800407	contig_16098_pilon	+	1068	2	Intergenic	novelGene_46056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	83	526	421567	423091	FALSE	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEIVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAPTLEAMRDVYPSPLPDGWPGMALELGWGSIGILSFSPTTLQNKPSKRNFPAREATECKSIGALVEFGPAAARPCSLGLVPSLLCASLGGWVR	421484	423633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_421575_422655
800408	contig_3818_pilon	-	1445	9	Intergenic	novelGene_99280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	48.9993622407476	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	537	1286	701346	695411	FALSE	25	AGGCCAGAGCAGTAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFLEQGEATLSVARRALTASLPTLLRSEVTFLPPVTRPDKVVCVGMNYVDHCKEQNVPVPKEPIIFSKFASSIVGPYDEVVLPPESQEVDWEVELAVIIGKKGKHIKATDAMAHVAGFTVAHDVSARDWQMRRNGKQWLLGKTFDTFCPLGPALVTKDSVPDPHNLKICCRVNGEVVQSSSTSQMVFKTEELIAWVSQFVTLYPGDVFLTGTPPGVGVFRKPPVFLKKGDEVQCEIEELGIIINKVV	703670	695251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_695474_695589_695678_695800_695910_697488_697652_697925_697986_699628_699846_701296_701574_701948_702032_703444
800413	contig_5896_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_159236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	264	1166	92340	100477	FALSE	5	CATTTGCCTTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSFPLSGYPVPEPSLISLLEGGDLPWGLETQDDPPAERTKDICKDAETNIPSDSTSTQRISGERDMISCGLQKSVPQGTDFPETCEVEKHQEIPIVKSIRGKFERIHCVGKPFRCDECGKCFSSFSYYVRHQRVHTGEKPYPCEECGKSFNESSSLIRHQRIHTGEKPYQCEECGRAFNNSASLIRHQRIHSGDRPYHCKECGNGFPSSSELVRHQRIHTGEKPYKCNECGKAFTVKSTLSRHQRIHSGEKPYECSKCGETFRTSSQLYHHEHVYPGEKPVLDLGSFDLPAFFTPFSW	92076	100675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_92479_99713
800414	contig_12948_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_126222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGAACAAAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327595	327282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_327300_327600
800415	scaffold_13505_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_111621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGCCCTCGTGCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671011	671484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_671000_671500
800416	contig_15407_pilon	+	1239	9	Intergenic	novelGene_123099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.4497580098991	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	495	1229	537960	591712	FALSE	35	CTAAGAACTACAGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKNITRPFEDQTSLEFFSKKSDCSLFMFGSHNKKRPNNLVIGRMYDYHVLDMVELGIEKFVSLKDIKNSKCPEGTKPMLIFAGDDFDVTEDYRRLKSLLIDFFRGPTVSNIRLAGLEYVLHFTALNGKIHFRSYKLLLKKSGCRTPRIELEEMGPSLDLVLRRTHLASDDLYKLSMKMPKALKPKKKKNISHDTFGTTYGRIHMQKQDLSKLQTRKMKGLKKRPAERKTVEKEENKSKRIKKN	535141	591722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_535508_537831_537965_547222_547263_555461_555544_556273_556351_566034_566135_584666_584770_590554_590700_591529
800417	contig_8461_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_163914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAACCTAATTAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107652	109401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_107700_109400
800420	contig_4868_pilon	+	1579	10	Intergenic	novelGene_136754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGCGGTTCGCAAGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43692	94499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_44091_45073_45161_49060_49215_60478_60678_62074_62136_63935_64089_64898_64989_80677_80811_89877_89964_94281
800421	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
800422	contig_6557_pilon	+	1276	2	Intergenic	novelGene_32979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGTAGGGTGGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434245	436002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434652_435132
800423	contig_3837_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_104023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTATGTATGTTCGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130709	130294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_-_130300_130700
800424	contig_5457_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_139008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGAAATTCAAATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247573	249140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_247600_249100
800427	contig_1986_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_64120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTAAGCGTAACATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88027	89591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_88000_89600
800430	contig_3817_pilon	+	1968	8	Intergenic	novelGene_78345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	975	1412	475160	482939	TRUE	20	AGAGGAGGTGGAGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVWAQAGDADPAGQRQGLGRCVLAPGGSEPQPRQLSNPGSCAQTLTSRTRYCSGVGSAAISPSTRSHSRAMAFIEVSSGATISGNLISLFLTPATSALVLRGTLVLVSKIFKAGGFFKDEICPCWYRSAPPQVLTALSTPEGFP	474185	515681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_475417_475814_475905_482217_482264_482894_482998_491021_491183_513603_513776_514584_514675_515606
800432	SIRV5	+	450	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	6	96	-5	-96	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAAGGTCGCCGTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
800433	SIRV6	+	404	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	368	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
800434	contig_15691_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_60776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGGAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90500	90925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_90500_90900
800436	SIRV4	-	200	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1318	3	1318	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3840	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
800437	contig_12920_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_166334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAACTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153631	154332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_153600_154300
800439	contig_15327_pilon	-	1189	4	Intergenic	novelGene_70723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	228.421150995748	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTTTGCTGAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967442	959516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960736_965088_965146_967420
800443	contig_7361_pilon	-	699	6	Intergenic	novelGene_163387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_5	27.0140704078449	165	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	203	697	429130	337632	FALSE	50	AGATGTTGAAAAGGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRRRRLAQSRLPHSLGGPAVAVPFKAEQWNREPASLWEGGQTDYRADGRTNRQRDSQTAGVASSFAMSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSKDEEPRFTSCIAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAYRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEGRKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATK	429332	337629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_337722_343984_344048_345083_345232_346326_346381_364629_364746_429106
800445	contig_13625_pilon	-	1749	6	Intergenic	novelGene_150167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	242	junction_4	45.849318424596	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	155	895	43415	29843	FALSE	25	GGAAGTTCTGGATCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43569	28988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
800446	contig_11413_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_103157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353197	354185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_353200_354200
800448	contig_7839_pilon	-	2191	8	Intergenic	novelGene_45666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	517	837	16977	15679	TRUE	15	CCGGGTACCGGTGCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMTTGRAAHRYTQAASRYLMTRSRPNSRARQASTRVPSACSHPQNLMTRMPLSSSVISLTRTSLCCSIAWLLAMMRVAITLLTGTSSSARTRPPTKAMPTCWCNR	21167	11847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_11912_12273_12489_14603_15822_16799_17028_17869_18026_18295_18407_20134_20226_21059
800450	contig_10183_pilon	-	2004	3	Intergenic	novelGene_169513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	12	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	69	542	152596	151581	FALSE	25	GTTTTGAATATATTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMTSVRLPAGVLRKPDAWTGLWGVLRGTPSYKLCASWNRYVYFSSTKLNASNYKTLFHNIFSLRLPGLLVSPEYVFPFSIRLKSNISSKKSTKKTLQKVEAEDDSDEESDHSEINEQEQELEDDPSVVKDYKDLEKVAQSLRYDVILKTGLDVGRK	160072	150118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_151585_152126_152609_160016
800451	contig_8386_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_82218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAACATGTCTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26352	27327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_26400_27300
800458	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
800459	contig_18184_pilon	+	1818	5	Intergenic	novelGene_123872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	55.5382750902474	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	48	524	225511	237545	FALSE	20	AATTTTGCATTCTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGKERRASSFRSGVMPCQDSDLPWKEQEKMTKFQEAVTFEDVAVVFTEEELGLLDSAQRMLYRDMMVENFKNLVSVGHHPFKLDMLFQLEAEEKLWMMETESRRSSSLWWHASGLDVSLWLSNIPFCVCITFCISIHLLMNISVVCPFWLLWKALQGTLVYRFLRACFYKDA	222672	238839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_222718_225508_225571_232921_233049_234007_234092_237339
800460	contig_3975_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_54748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGAACCCAAGGGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1757630	1756165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1756200_1757600
800461	contig_2214_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_144247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAGGTTAAAAATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245161	245782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_245200_245800
800462	contig_5105_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_168913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACTGAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481358	483742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_481400_483700
800463	contig_6710_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_89133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
800464	contig_7171_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_101228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	450.371579920403	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCAGCTGTGTGCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733614	764976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733830_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760679_764319
800465	contig_2487_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_148486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATTTGCATTCTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215827	215218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_215200_215800
800467	contig_7171_pilon	+	879	7	Intergenic	novelGene_101261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.8902901286646	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	238	789	871269	876795	FALSE	0	TCTCTCTTGGGCCCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLKCYYFDYKEQLPESAYMHQLLGLNLLFLLSQNRVAEFHTELERLPAKDIQTNVYIKHPVSLEQYLMEGSYNKVFLAKGNIPAESYTFFIDILLDTIRDEIAGCIEKAYEKILFTEAARILFFSTPKKMTDYAKKRGWVLGPNNHYSFASQQQKPEDTTIPSTELAKQVIEYARQLEMIV	869854	876885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_869951_871007_871081_871200_871304_872377_872544_873459_873561_875805_875918_876657
800468	contig_10050_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_119628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236476	234230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_234200_236500
800469	contig_12841_pilon	+	1285	14	Intergenic	novelGene_55895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	454	756	909445	916606	TRUE	25	ACTGAACAATGGCCGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVSPFDKVSVIKWTFSNCSTTRCNSFGCLVDSEVKLGWVRRTSMSPLDSAPLLKLPQTVAMYSESTFLISFSTISCICNISSRGILFSKSSKYFSPIR	892163	931894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_892414_892627_892763_893296_893363_909442_909531_910220_910291_914690_914764_914861_914918_916588_916643_920816_920864_922933_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931708
800470	contig_7909_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_155915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATGAGGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512749	513023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_512700_513000
800472	contig_13224_pilon	+	1669	7	Intergenic	novelGene_104110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	51.5829967678842	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	489	1310	291619	302288	FALSE	30	TTCATGAGAAACTATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNCRSSPCFFFFSNIVPPTAHLKSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLCHQLEQETGIQTGYVRTGSISLAQTQDRLISLKRINSRLNVMGIPSEIISPKKVAELHPLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALALASAASQNGVQIYDRTTVLHVIVKKDQVTGVETDKGQIDCQYFVNCAGQLLWMLMGGFIFGTGRVASCLGALRRTRNQFSLRARTSWRFRIYRKTGITSVCELDYNNNALYLCKISYFQSILKNRWLQWTFCSG	283444	302647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_283616_291301_291694_293374_293496_299267_299350_299443_299608_300338_300461_302030
800475	contig_3789_pilon	+	2086	7	Intergenic	novelGene_79834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	6.04611904907235	124	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	257	862	300730	307842	TRUE	20	TGACTTCTCTGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLVGCEFEDSVFEDGRQRRAGPPASYCAKRCEPQWFYEETGSSDNVEALTIKKFRGDLAYRRQEYQKALQEYSSISEELSLTSFAMKRDVQEGQARCLTHLGRHAEALEIATNLETKATNTDHLTTVLYLQLAICSSLQNLEKTIFCLQKLISLHPFNPWNWGKLAEAYLNLGPALLASSQKRNSFTSSDKAIKSSSPHSGKDCLLCIPEISPESSKFSMDASSSDSQQNEKALKNTQNSVSEKREAVLIETQIKACAAFVRTRVTVSGNQLNGNGYRCLASTAPR	297440	315462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_297544_299628_299725_300672_300817_303684_304134_307772_307879_308209_309071_315135
800476	contig_5023_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_7162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAATATCATGATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374762	375239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_374800_375200
800478	contig_2054_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_51680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCCTTATTTCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100034	102068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_1e+05_102100
800481	contig_15548_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_173482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAATGAAACACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248905	248268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_248300_248900
800484	contig_9720_pilon	+	1151	4	Intergenic	novelGene_116785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.881158828371	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGCATTCTGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391628	393998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_391904_392015_392089_392400_392465_393259
800485	contig_9415_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_109950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTGGTTGCCAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2498637	2497888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2497900_2498600
800487	contig_15888_pilon	-	1570	12	Intergenic	novelGene_84396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	362.173740326129	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	82	1401	49714	37821	FALSE	10	CTAACCTTGCGGTGCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGSLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYAEPVSAQHAKLSLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGAPGIISASPYAGAVRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	49795	37651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38680_41545_41588_41880_42056_42149_42261_42376_42548_42626_42774_42847_43021_43145_43222_46483_46515_49706
800489	contig_10014_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_174561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGCAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14685	16272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_14700_16300
800491	contig_7728_pilon	+	906	2	Intergenic	novelGene_64741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTGTGTTTTGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871301	874549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_871368_873709
800492	contig_8636_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_141933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431484	430654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_430700_431500
800495	contig_3818_pilon	+	2383	1	Intergenic	novelGene_99256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	939	1394	493582	494037	NA	20	CTTGTTTATTTTTTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKKCIGKRPVKENGEPEEPGELQCRSNPYGRRREEGRLGWRSLRLRFRSKKASAELTDCLSQSPVRAALSSQERACLSFPAAQSLSGTARGKLVSAQMWDGFQTSAAGGLGPIMLPAVRSERCIIMALTVPSDFDSLFQSLVKLNCISCP	492643	495026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_492600_495000
800499	contig_10481_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_170525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTGAGAGTAGAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29420	30300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_29400_30300
800500	contig_10481_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_170524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGAAAACTTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27974	28882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_28000_28900
800501	contig_1428_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_158412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCCTGGCTACTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159927	161515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_159900_161500
800502	contig_4812_pilon	-	799	5	Intergenic	novelGene_103668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	5092.905868706	113	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	175	576	82626	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQ	82800	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
800503	contig_14034_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_72664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACTGACATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343487	341462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_341500_343500
800504	contig_7171_pilon	-	639	9	Intergenic	novelGene_101186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	325.07499134815	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	30	509	49603	37539	FALSE	5	CCCTGTGTCTCTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLGTPSSDMSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCRAYRVVRV	50394	37408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37564_37662_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47596_47690_49542_49604_50365
800506	contig_14353_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_82123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152946	154636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_152900_154600
800507	contig_4531_pilon	+	1101	9	Intergenic	novelGene_47909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_4	78.4422558319175	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	13	918	395224	406716	FALSE	80	AAAAGAAAAAAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESIHDGTVTHTFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQSEEDVSQFDSKFTRQTPVDSPDDSTLSESANQVFLGFTYVAPSVLESVKEKFSFEPKIRSPRRFIGSPRTPVSPVKFSPGDFWGRGASTSTVNPPTPVEYPMETSGVEQMDVTMSGEASAPLPIRQPNSGPYKKQAFPMISKRPEHLRMNL	395211	406899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_395240_397264_397356_397538_397630_398158_398267_398552_398616_398792_398871_402240_402349_405389_405503_406478
800512	contig_9463_pilon	-	1914	7	Intergenic	novelGene_83808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.719401666985	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	44	442	44553	39465	TRUE	30	CCAGATTTCTGATGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPGSGPGRWCPPKMLPRLLLPLVALLSLRLGSDAQGTELPSPLSVWFEAEFFHHMLHWTPILNQSQSTYYEVEFLCYGEESWKAIPTCNQTLAQSCDITAVTLGLYHNNGYRAKVRAVDGSRRSNWTISDTRFTRDEVHKQEGKP	44596	31366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_32549_34114_34158_37753_37876_39339_39491_41370_41556_42167_42289_44486
800515	contig_4469_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_21885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTCAATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259284	256603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_256600_259300
800516	contig_9705_pilon	+	2227	2	Intergenic	novelGene_41769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAAAAGGAGGAGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553789	556432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_553835_554250
800517	contig_10104_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_160136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATAAAAATTGTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442095	442560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_442100_442600
800519	contig_9561_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_100863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAAAGCAAACCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257719	258781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_257700_258800
800520	SIRV6	+	446	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	99	0	-88	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2384	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
800522	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
800523	contig_9455_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_161832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGAATGGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251416	253190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_251400_253200
800524	contig_9354_pilon	+	1716	9	Intergenic	novelGene_108046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.661882832443	1	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	179	724	105086	111145	TRUE	50	TACAGTAAAATAATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERNFTLAFTDFSTTTVLVSFGAVLGKISPIQVLIMTILEIAVFNGNEYLFAEIFQATDIGGSMVIHAFGAYFGLAVAGILYRSNQIWEHHNKQSDIHSDLFAMIGTLFLWIFWPSFNSTLAVPEEKQNRAIINTYFSLAACVLTSYAFSSLVERRGKLSSHSECNPCWRSSCGHLCRHGD	96420	117859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_96446_104932_105117_105998_106136_108697_108846_109396_109559_111077_111216_111996_112123_116135_116202_117129
800525	contig_5999_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_45648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTTTTCCTGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260406	262982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_260400_263000
800526	SIRV5	+	366	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-36	875	-36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
800527	contig_19459_pilon	+	1129	8	Intergenic	novelGene_59826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGGGGGTGGCTTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6665	19046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7786_7945_10267_10328_11325_11424_12582_12707_15506_15650_16230_16265_18988
800530	scaffold_12124_pilon	+	1126	2	Intergenic	novelGene_22118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTGCTTCACTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904639	913068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_905691_912993
800531	contig_11742_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_166547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTATTTTGTCATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135757	134608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_134600_135800
800532	contig_10863_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_59338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91077	93074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_91100_93100
800533	contig_2817_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_104346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1160	1543	291913	292296	NA	25	AAAATTGTAGTCTGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVHVRGPGGAVVKCLDANQKVGGSNPPATLREKDVAVFFHKNLQPWKPMRQFYSVHVQKCSTSPVMGGMQTNMQVLLCTCGTSKLNRMIVCNVSQSVAGNGHKYPAGERVNCCNVLEGRSGQCLF	290753	292655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_290800_292700
800535	contig_4783_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_108380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAATCATACTCCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203361	201524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_201500_203400
800540	contig_6117_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_167306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124767	123096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_123100_124800
800541	contig_19242_pilon	+	2263	3	Intergenic	novelGene_166450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	5.5	156	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	78	917	7521	10029	FALSE	5	CCGTGATGGTGGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHVLLLGILLLQLPPPVPARCYTATRSECRRVRRFVPGTELAGESVDVTTLQRSGSFPVNTQRFARPDGTCTLCHSAQRPGTLWLLPLAFTDWSAQSSSCQHQVINTNAMSTQAVAREVAKSITNNWTVGLDVTPKTDSNVQVSVAGSHSKAAKFVAVKLHQDQYIFSRDLVECHFYSFHLVHTPPLHPDFKRAVKALPGDFNASTEPQYLSFISKYGTHFIQAVKLGGRISAITALRTCKLSLEGLTTNEVSDCLSVEAAVTIGRIAKLFSRSQGL	6145	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19242_pilon_+_6201_7498_8060_9728
800548	contig_9440_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_59047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440436	441107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_440400_441100
800550	contig_12425_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_46708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACACTTTTATTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230081	228357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_228400_230100
800552	contig_16503_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_162073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	556	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112285	111732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_111700_112300
800554	SIRV3	+	588	4	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	5	-384	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTTAATCATCAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1968	6334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4754_6039
800558	contig_7119_pilon	+	1570	13	Intergenic	novelGene_41019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	127.479954851298	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	37	576	198455	209889	TRUE	45	GCTGAGAAGAAAGCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARVSACVWG	198418	223394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207515_209881_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217168_218346_218430_221055_221177_222163_222241_223329
800561	contig_4065_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_133409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGAAAAACAAAGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844386	846524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_844400_846500
800562	contig_11136_pilon	-	1044	5	Intergenic	novelGene_169025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	14.1509716980849	199	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	142	870	144459	137339	FALSE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLPLHRAHRVEVVLLHGKAFNSHTWEQLGTLQLLSQRGYRAVALDLPGFGNSAPSAEASTEAGRAELLQRVLQDLEVHNAVLVSPSLSGHYALPFLMRAHHQLRGFVPIAPASTQNYTQEQFWAVKTPTLILYGELDRILARESLQQLRHLPNHSVVKLRDAGHACYLHKPQDFHLVLLAFLDHLP	148345	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137522_137734_137971_143996_144113_144265_144478_148222
800563	contig_15420_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_175300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACCAAACCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165727	166143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_+_165700_166100
800570	contig_9272_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_125934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTGTTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379695	381137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_379700_381100
800572	scaffold_12124_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_22148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	405	1383	1787	968977	969381	NA	10	TGCCTTTGGGTTCTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEQNVLGKRRVHERVNGQKERGSQKVGPTTFLVATLIQVPQLTHNPDFCYSGAWVSSSRLSPGNCPSLSLCDYLACRSVNHAGVDVCPKPGQSWAPITLPTEFGPRGKSGNPGRTNQNSLRAVTHSCWDREGIP	967594	969382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_967600_969400
800574	contig_1686_pilon	+	2365	7	Intergenic	novelGene_165598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.54666899441312	53	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	97	2079	312601	322393	FALSE	30	GGAACGTACGCATACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVGLRRNLCHLCDFQIHRALAVLRSQPVSHIHQAVREHLCCWFFALRPTPSRVRSHHPCWNNFHSENGSKTQPAGQLVSPRVHDWDRLEQNIKHADEQMFYRRLNDFTSSEEVLSFVSTLETLPDSGAAGALQRIWEVGKKDDAGRLPEEILDNHVFKALCFRLEREAPTLTNTGLVRALQALTLSHVDPQTSLLENLVAECQNRLQKGGLEVHHLCILGESLVKLQGPGCVMLEQIIAQLQGEELEKFSPEDVVAIYRILQACPEKVDQHQAFLSKINSFTLSVVYSLSPKSISQVLSALVALDQTQALPLVIKLGKYMVRYIPRFTSGELASVLEAFIYFGYSDRFFTRALEQHVAALCLALNPEVVSKITKYCSKKLIFSKPILNAVAESFVCHSEKFSPHQISELIEPFGTLNYLPPNTPALFRKLETMLVTHFNHFPPKTLLKLLHSCSLIERHPVNFMAKIFSPYFLQQLQGKEPYLDRLSLAQLTQLFLTSILECPFYKGPRLLPKYQVKSFLTPCCSLETPMDFQLYKSVMIGLIDLLGARLYFASKVLTPYCYTLDVEIKLDEEGFVLPFTVDEDVRKRVALCIDGPKRFCFNSKNLLGKEAIKQRHLRLLGYEVVQIPYHEIEMLKSRLELVEYLQRKLFSQNTGLHW	310421	322679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_310491_312573_314039_314684_314771_319192_319368_320850_320921_321253_321369_322294
800577	contig_8907_pilon	-	564	5	Intergenic	novelGene_85806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3291.03930202907	1377	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTGTGTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179858	173350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178789_179391_179544_179839
800579	contig_10074_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_57158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511720	513622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_511700_513600
800587	contig_5499_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_56977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAATAGTGGAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181745	183158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_181700_183200
800588	contig_10074_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_57091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCCACATGCAAAAGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118373	120103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_118400_120100
800589	contig_3825_pilon	+	956	7	Intergenic	novelGene_77954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1537.68824502527	2	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	12987	13848	TRUE	40	GGCAAAGGCCAAAGAACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVSKQAF	12984	15566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13854_13947_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15307_15498
800592	SIRV6	+	472	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	384	0	211	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
800593	contig_13215_pilon	+	1418	4	Intergenic	novelGene_145880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	64.9632374672185	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	745	1209	27022	32973	FALSE	30	ATTCAGAAGCCCAGCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLETLETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGTNGDF	26277	33182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_27188_27729_27768_29075_29223_32859
800598	contig_6710_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_97274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	65	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
800599	contig_9482_pilon	-	2270	10	Intergenic	novelGene_44264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	61.8183320127574	33	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	14	1240	773701	748914	FALSE	10	TGTACTGTTTTTCATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKGTRERRAAPQHGVSLRVLLRVFPTACVCC	773714	747883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_749099_751176_751253_754752_754886_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
800601	contig_9423_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_99184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	219	302	77168	77251	NA	20	GGCTGTTCTATTTGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENIEKWLEVDSTEPGYEVLTDSEIIRRAQGQTDESSENEEEEIELIPEKHINHAAALQWTENLLDYLEQQGDMILPDRLVIRKLRATIRNKQKMTNANQ	76949	78204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_76900_78200
800602	contig_5018_pilon	-	1430	7	Intergenic	novelGene_47170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	61	junction_6	40.8360543311096	182	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	127	1212	1544079	1538334	FALSE	15	TGTGGATGTTGATCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSACSREPVPRWRQGWLGGGVEAEEFEDAPDVEPLEPTLSNIIEQRSLKWIFVGGKGGVGKTTCSCSLAVQLSKGRESVLIISTDPAHNISDAFDQKFSKVPTKVKGYDNLFAMEIDPSLGVAELPDEFFEEDNMLSMGKKMMQEAMSAFPGIDEAMSYAEVMRLVKGMNFSVVVFDTAPTGHTLRLLNFPTIVERGLGRLMQIKNQISPFISQMCNMLGLGDMNADQLASKLEETLPVIRSVSEQFKDPEQTTFICVCIAEFLSLYETERLIQELAKCKIDTHNIIVNQLVFPDPEKPCKMCEARHKIQAKYLDQMEDLYEDFHIVKLPLLPHEVRGADKVNTFSALLLEPYKPPSTQ	1544205	1538115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1538466_1538867_1539066_1539148_1539257_1539979_1540131_1540214_1540364_1542883_1543032_1543879
800603	contig_9038_pilon	-	2867	1	Intergenic	novelGene_143314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAGGATGTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338366	335499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_335500_338400
800604	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_96328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
800608	contig_846_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_136095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTCCCTGTCTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98550	100599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_98600_100600
800609	contig_7188_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_108534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	901	1227	140111	140437	NA	80	AACAGGAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQNKPNWAEASASAGIYEPGSQHREGREGPRIVNAGLAGVGVQPWRQFCKRSSDPAEEEGEVVNPKGPPSHIPPYPVLSPPSLLCRGIIHNWTCHSNEHISKPCCC	139210	140644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_139200_140600
800611	contig_12485_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_147302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTTCGGTAAAGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791912	791337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_791300_791900
800617	SIRV2	-	516	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	4	-305	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTTGTGATCGTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5751
800619	contig_13901_pilon	-	2065	2	Intergenic	novelGene_146676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGCTTTTGTGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294357	291031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_292708_293968
800622	contig_5649_pilon	+	1208	9	Intergenic	novelGene_82279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_1	93.7442498236558	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	276	1208	126523	149912	FALSE	40	GTAAGTATATAGAATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSGKDFHQTQFLIQECASLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFGLALLNSSSSDLRGFAAQFIKQKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGAFGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYSEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQ	94497	149912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_94599_126348_126625_145420_145529_146103_146203_146616_146686_146773_146829_147492_147697_148627_148797_149785
800623	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
800629	contig_8620_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_173885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126228	127187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_126200_127200
800630	contig_2773_pilon	+	2578	1	Intergenic	novelGene_174284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGGCCAAGGAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261106	263684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_+_261100_263700
800631	contig_15114_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_121163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCAAGTTTGTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177744	178341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_177700_178300
800634	contig_15570_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_137862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTTTATATATAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724748	725564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_724700_725600
800635	contig_15570_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_137863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCCTGATAATTATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725762	726167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_725800_726200
800637	contig_3832_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_161436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104064	102060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_102100_104100
800639	contig_8063_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_152423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGCCCACGGCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81781	82277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_81800_82300
800640	contig_10141_pilon	+	3335	6	Intergenic	novelGene_84620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.6	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	167	871	370867	390421	FALSE	20	CCCGGGTTCAAACCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETSFNLISEKCDILSILRDHPENRIYQRKIQELSKRFTAIRKSKGDGNCFYRALGFSYLESLLGKSREILRFKERVLQTPNDLLAAGFEEHKFRNFFNAFYSVVELVEKDGSVSSLLKVFNDQSASDRIVQFLRLLTSAFIKNRADFFRHFIDEEMDIKDFCAHEVEPMAMECDHIQITALSQALNIALQVEYVDEMDTALNHHVFPEAASPSVYLLYKTSHYNILYAADKH	370700	392885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_+_370870_382369_382466_384449_384569_388053_388139_388891_389087_390214
800642	contig_5954_pilon	-	924	7	Intergenic	novelGene_28730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	97.9194680450329	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	9	794	1178000	1170586	FALSE	5	TGGTGAGCTGCGTGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEEPQQQKQEPLGSDSEGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSERLELSVLYKEYAEDDNKKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSHLEALLDDSKELQRFKAVSAKSKEDLVSQGFTEFTIEDFHNTFMDLIEQVEKQTSVADLLASFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRESKFFEHFIEGGRTVKEFCQQEVEPMCKESDHIHIIALAQALSVSIQVEYMDRGEGGTTNPHVFPEGSEPKVYLLYRPGHYDILYK	1178008	1170455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170784_1170931_1171127_1171244_1171330_1171616_1171726_1176052_1176132_1176381_1176444_1177942
800644	contig_5954_pilon	-	1764	6	Intergenic	novelGene_28481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	66.4337263744854	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	638	1132	291061	289124	FALSE	25	ACAGACTTGAACTGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLGEMEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQVARCVSSPHFQVAERALYFWNNEYILSLIEDNCHTVLPAVFGTLYQVSKEHWNQTIVSLIYNVLKTFMEMNGKLFDELTASYKLEKQQEQEKARERQELWQGLEELRLRRLQGAQGAKEAPLQRLTPQVAASGGQS	291907	288491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_289272_289622_289725_289973_290102_290944_291065_291196_291248_291324
800645	contig_14618_pilon	+	1716	2	Intergenic	novelGene_136844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGCAATAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232389	1235944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1233566_1235404
800646	contig_6513_pilon	+	1827	3	Intergenic	novelGene_117743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	39	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAAAGACAGTGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48516	149855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290_136434_148509
800648	contig_6589_pilon	+	854	5	Intergenic	novelGene_26037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	773.88338914852	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	95	853	1725483	1731798	FALSE	20	AATTCCCTGCGTTTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLVSGPPLALPGASSLAAEQPHLHSGHLSGRRSTRARLHDALDIPVQELGPRLRPDQSIPIGSAPSQSPAPSQSPSPPRPTPDPFRCPGHSPMSCKYLFIPQYTLPGTEHTASSLPWEPRCLPALAPKGPGASEHQLSVPKDKLRSLSHLVAYHLPARLFSAQTSN	1725388	1731799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727080_1730091_1730152_1731406
800649	contig_10569_pilon	-	1102	4	Intergenic	novelGene_44098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	7.34846922834953	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	107	466	466480	457217	TRUE	25	GAAGATAGTCTACTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKRFRPLGRGQQVRLWARYKSAFDCWGRASSWWNMANSGYGNCSDHEENSFLYFAYGSNLLKERIHLQNPSAAFCCVACLQDFKLDFGNPQGKKSPTWHGGIATIFQSPGDEVWGVIWKMNKSNLSSLDKQEGVSSGIYVPIEVKVYTQEKKK	466586	454823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_455398_457154_457290_458218_458365_466339
800652	contig_835_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_152159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	644	1024	236280	236660	NA	45	AATTTGGATTTCAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTYMCFPLNGLLPQICGENNCFRVHLFSPFGCQQQERLLKAWSEPEWKCKGPVSSKRKRKFHPGLQRPWKMWEEGRGALPFLAAGMPGFKCVHIKNYKISLCCMGNILLLLKSRKYLLKSIMLE	235636	237392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_235600_237400
800653	contig_11416_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_145368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATCTCCCAGGGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577415	579070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_577400_579100
800654	contig_11096_pilon	-	1629	14	Intergenic	novelGene_143473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCTGCAAATCCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276214	237520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_237673_239714_239869_243981_244095_247395_247497_252249_252346_252997_253130_254418_254592_254697_254868_256759_256884_257318_257442_272464_272593_275158_275203_275630_275728_276192
800657	contig_401_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_42950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	507	821	2261014	2260700	NA	30	CAAGGTTTATAATTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCIILGVCAHQGVPEGNKCLSCSTANRKVGGLSPPRGTLEERPGDLLLKNQPLKTLWSTVYSDTHEVTISQNQFNSKYFCVCVCACQILFVLVLARLNISPPT	2261520	2259830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2259800_2261500
800660	contig_15182_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_136473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641862	644368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_641900_644400
800661	contig_5643_pilon	+	1259	7	Intergenic	novelGene_38967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_3	538.363389253847	3	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	316	819	551251	552476	FALSE	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	549595	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
800662	contig_11121_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_167068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTTTTACAATCATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336009	336306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_336000_336300
800664	SIRV6	+	188	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	535	60	535	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10772	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
800670	contig_6063_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_27598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCCACTTAGCTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51985	51580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_51600_52000
800675	contig_17989_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_150805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGCACTGACAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199949	197997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_198000_199900
800676	contig_5686_pilon	-	1055	7	Intergenic	novelGene_45500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	45.4376862673853	168	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	188	805	286084	277750	FALSE	25	GCATGGTGTATATCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKQGLQENVKNSPVPRRTLKMIQPSAAGSLVGRECELAKGLSKRKHGSGQLMSKTSSPGVVIVPESSENKSLGGVTQEAFDLMIKENPSSQYWKEVAEKRRKALYEALKENEKLHKEIEGKDNEIARLKKENKELAEVAEHVQYMAEVIERLNNEPLDNSESSDGQEFESEEETGENSEVEDSEIGTCAEEIVPSSTDAKPCI	289419	277499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_277912_279149_279261_279538_279622_282623_282772_283389_283468_286048_286128_289275
800681	contig_5910_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_168431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATGAGATTTTAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185453	184709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_184700_185500
800682	contig_16098_pilon	+	954	5	Intergenic	novelGene_46058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	431.294200633396	1083	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	205	564	436826	438839	FALSE	20	AGTTCCAGGCTCGCGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIKDNGWD	435974	439229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436759_436943_437045_437090_437263_437373_438749
800683	contig_10432_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_171314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCAAAGATGGAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194692	194354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_194400_194700
800686	contig_405_pilon	-	1735	5	Intergenic	novelGene_135290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	72.613273579973	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	259	876	190847	138031	FALSE	75	ACAATAAAAAAAATAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDQALQQMLDRSCWVCFATDEDDRTAEWVRPCRCRGSTKWVHQACLQRWVDEKQRGNSTARVACPQCNAEYLIVFPKLGPVVYVLDLADRLISKACPFAAAGIMVGSIYWTAVTYGAVTVMQVVGHKEGLDVMERADPLFLLIGLPTIPVMLILGKMIRWEDYVLRLWRKYSNKLQILNSIFPGKALKCGCNIHATLILLFRNI	191153	137171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_138280_150337_150469_165723_165927_190812_190946_190993
800688	contig_5241_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_174393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTGCAATCCCCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54177	55009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5241_pilon_+_54200_55000
800691	contig_18511_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_126897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAATTCAAGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60771	58605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_58600_60800
800694	contig_9609_pilon	-	2049	4	Intergenic	novelGene_23099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.63299316185545	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	99	1451	491416	489097	FALSE	20	CTTTGAGAGCTGTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPFSPEVPKDPPRAKAAHLLPFRALFLTLLGMAQGSRAPVVPNKPFTTIWNANSQRCLERHGVDVDVSVFDVVVNPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLDAHLAQTYQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDAKDIYRKRSRALVQEQHPDWPFPWVEAAAQDQFQKAAQAWMVGTLQLGQALRPHGLWAFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPLDICAQNDQLRWLWGQSQALYPSIYLPAALEGTGKARMYVRHRVGEAFRVAMGARDADLPVLPYAQIVYDMTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENMQTKESCQAIKEYVDTTLGPFILNITSGALLCSHALCSGHGRCVRRPSHPEALLILNPASFSIRVMPSGKPLTLQGALSLEDRAQMAVEFKCRCYRGWQGVWCEQQGMW	491514	488498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_489415_489594_489685_490011_490936_491395
800695	contig_8561_pilon	-	503	5	Intergenic	novelGene_161635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	51.2853536596951	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	20	502	182853	34675	FALSE	25	CAGGTATCGTAGCCACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSKEDNYKRTREYIRSLKMVPSIPYLGIYLLDLIYIDSAYPASGSIMENEQRSNQMNNILRIIADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGSSSPRLVSSKEDL	182872	34673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_34739_39560_39655_43262_43401_162275_162403_182793
800696	contig_1076_pilon	-	1324	6	Intergenic	novelGene_101155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.84707681233427	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	316	621	1133090	1090075	TRUE	35	AATATTCAAGTTATTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAERRWRGSFRYQAGPRFLPIDTFIKMEKKSILGGKNLDTLNSICKLIDKSLLKKIKDYEDQGRGQSPYLWISNCSGFSIQVTIWCYFLSASGLPLVLLT	1144194	1088153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1088854_1090071_1090141_1103651_1103696_1104277_1104407_1133023_1133343_1144131
800697	contig_6710_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_98267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	15	GTCCTCAGTCCCAGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
800700	contig_5765_pilon	+	2536	1	Intergenic	novelGene_141406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828985	831521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_829000_831500
800701	contig_5302_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_81529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	3	455	1553368	1553820	NA	20	CAAACCTTTACTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRLRESIRRRQRTGRGSRCQVLADPPPPPPSAVWVPADCHELGRDLRLFRVRCVAATAAFAFRGLPTPAAARSLSPLAARRRPRGRLECASGEGAGAAPPLPQPGNGSGLAEPGLEVRRAVGLTEGHARPRREAGSASGLGKTFPARVA	1553365	1555226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1553400_1555200
800702	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	0	1160	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
800703	contig_8357_pilon	-	2315	19	Intergenic	novelGene_39750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	322.17908236121	1	138	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	98	1036	808159	784686	TRUE	15	GCTGCGTGGTAGATGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQQQLTTQHHHKPDEIKATVFDDCKKEGEWKIMLLDDFTTKLLASCCKMADLLAEGITVVENIYKSREPVRQMKALYFVSPTSKSVDCFLRDFASKSENKYKAAYIYFTDFCPDSLFNKIKASCSKSIRRCKEINISFIPLESQVYTLDVPDAFYYCYSPDPSNANGKDAVMETMAEQIVTVCATLDENPGVRYKSKPLDNANKLAQLVEKKLENYYKIDEKSQIKGKTHSQLLIIDRGFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKFKDFNTYLQGTIVSVKRRHLVLFPN	809725	762693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_780039_783782_783868_784647_784714_786876_786927_787909_787968_788105_788202_790715_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808770_808821_809681
800704	contig_16322_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_87521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAACACCTAGCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54523	52157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_52200_54500
800706	contig_9109_pilon	-	1477	3	Intergenic	novelGene_175312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	93	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	95	1099	20698	17171	FALSE	10	GCAGCCCTGACTGTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVTGADVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYREVMTETFRNLASVVSRNPNDGEKLSTENIIVRFMRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19106_20664
800707	contig_7704_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_154611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATGATCATGGACCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223690	222779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_223073_223587
800708	contig_5916_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_158039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1120	1449	332784	333113	NA	25	ACTTGCCCAGCATCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIGKSWVSCSEEKPWLEKHIGETPEQMWSRIRSAGRTNESTTMEAAFLPVHVEEEPARGREGAVREVTGEPEGCHFRKPREHRDFLKLRKDTVSSGVVSRRWKGRWRW	331664	333471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_331700_333500
800711	scaffold_4805_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_161026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCACTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472445	473520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_472400_473500
800713	contig_15245_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_145220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATAGTTTTATTTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61376	62207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_61400_62200
800715	contig_3469_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_34240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATACTCTTGATGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650681	648495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_648500_650700
800716	contig_6227_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_49712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTGACAGAAAGTAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173355	1174861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1173400_1174900
800719	SIRV6	+	670	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	113	0	113	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10350	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
800723	contig_1244_pilon	+	336	3	Intergenic	novelGene_37906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	73	336	249157	260709	FALSE	10	GGGGTCGAGGGGCCGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSVLPPGGSAQPAVPVAIVARRAMKPQETLCPQNPVPGKHMPTRERKSPSATSAAKTDGEMVLPGFPDADSFVKVSSRGLGGAESLRGWQEAGPDPLSGGLGSACRSRAQG	238459	260709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_238513_249137_249213_260501
800724	contig_16122_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_134527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGAATCTTTGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159105	158683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_158700_159100
800725	contig_5954_pilon	-	1922	2	Intergenic	novelGene_28748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	0	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTGTAATGACTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298582	1296542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1298366_1298483
800726	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	508	3	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
800730	contig_5261_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_102494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814485	813785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_813800_814500
800732	contig_7078_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_130130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAATGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97233	99004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_97200_99000
800733	contig_8597_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_158728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATAAATTGCTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147716	146903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_146900_147700
800734	SIRV4	-	300	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	317	0	-317	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAACGCAAAGTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
800736	contig_11978_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_62964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAGGCAGGCTGCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140422	1139932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1139900_1140400
800738	contig_3832_pilon	+	1812	3	Intergenic	novelGene_161423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTTACGGGCCTCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59479	93147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_59655_73709_73893_91693
800739	contig_9177_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_32702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAGGGAAGGGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484826	487221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_484800_487200
800740	contig_11816_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_98469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAAATTTTTCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438102	438843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_438100_438800
800741	contig_11816_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_98470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTTTAGGGAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438893	439149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_438900_439100
800744	contig_9571_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_136318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	599	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	723	1040	626816	626499	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRLDGKGSGFGFTDTLEGSAQNCEAFSCRKCLEVPLPTCGQTLKSQECLLLPPATITVDQVPKVEAEEQFLFYREGENSSPHTCDSQQLTSRLEVRKNCPVW	627538	625977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_626000_627500
800746	contig_10296_pilon	+	760	3	Intergenic	novelGene_168895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	13	3436	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGATTGCTGGTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978012	988422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_978380_984694_984797_988131
800747	SIRV6	+	276	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	580	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATGAATGGTCGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1182_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
800748	contig_3986_pilon	+	829	2	Intergenic	novelGene_52724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAGTAACATGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105309	106335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_105417_105613
800749	contig_9765_pilon	+	1770	7	Intergenic	novelGene_175313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.38748219369606	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	269	859	99736	107532	FALSE	80	AGAAAATAAAAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVNTYEVNCLVSLFYTLVGDVAERPGAVTGLDRNAFRNILHMTFGMTDDMIMDRVFRGFDKDNDGCVNVAEWISGLSLFLRGSLEEKMKYCFEVFDLNGDGFISKEEMFHMLKNSLLKQPSEEDPDEGIKDLVEITLKKMDHDHDGKLSFADYEQAVREETLLLEAFGPCLPDPKSQMEFEAQVFKDPHEFSYDM	98944	108443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9765_pilon_+_99134_99656_99743_103190_103350_104017_104123_104793_104946_105224_105330_107469
800750	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
800751	contig_11378_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_112322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTAGGTGGTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176239	1174743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1174700_1176200
800752	contig_6677_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_114217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATTCACCAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622321	623766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_622300_623800
800753	contig_8322_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_143228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATAAAACTGTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211611	209418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_209400_211600
800754	SIRV6	+	510	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	3	164	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	380	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800757	SIRV6	+	414	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	516	32	337	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	169	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACACATATGACACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	11247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800758	contig_15039_pilon	-	1617	7	Intergenic	novelGene_110119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_6	480.886218928715	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	220	843	200602	185257	FALSE	10	TGCTCCTTGTATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQASVPDTAQQPPEEQNKSLEKPKQKKNRCFMCRKKVGLTGFECRCGNVYCGVHRYSDVHNCSYNYKADAAEKIRKENPVVVGEKIQKI	260856	184482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_185406_187754_187869_197516_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_260778
800760	SIRV6	+	386	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	468	2	295	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
800761	contig_10494_pilon	-	1658	9	Intergenic	novelGene_102168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	68.1018309225237	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	575	1060	917789	915313	FALSE	5	CCCCCGGTCTCAGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRCIRERDFPGFGQLTMKDSNQFHATCLDTFPPISYLNDTSRHIMHLVHRFNTHYGQTKVAYTFDAGPNAVVFTLDNTVAEFVAAVRHCFPPESNGDKFLKGLPVRPVPLSDELKAALALDPTPDGVRYIIATKAGPGPQILDDTHLHLLGSDGLPKPAA	923252	914714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_915394_916136_916246_917054_917171_917609_917829_917971_918047_919992_920140_920415_920531_921205_921277_923125
800764	contig_7308_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_159625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTACCCACACTGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614187	612879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_612900_614200
800767	SIRV4	-	268	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1252	1	1252	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3906	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
800768	contig_13699_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_158325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCCAGCCAGGGCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67870	66475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_66500_67900
800770	SIRV4	-	451	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	15	1055	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
800775	contig_3975_pilon	+	2215	8	Intergenic	novelGene_54761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	96.1690688107063	1	137	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	11	703	1961329	1984755	FALSE	30	ACAGAAGCTGGAAGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961318	1986267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1975950_1976095_1983156_1983261_1984722
800778	SIRV4	-	199	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	415	3	-415	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATAAAAACTATCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
800779	contig_17470_pilon	-	1000	4	Intergenic	novelGene_110485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	11.4406682011537	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	29	568	167807	164782	FALSE	5	TCATGTGGCGCCCTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTELRQWEEQGELLLPLTFLLLVLGSLLLYLAVSLMDPGYMNVQPQPQEELKEEQMAMVPQATPPSALQILPGAGPASGSSSPGGCGCGPVASYLPHSCCCLSSHQWPACSWPRISTWWPATPPRGSSSPHTALPTSANAPATPSTAA	167835	164349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_165006_165582_165662_166040_166178_167707
800780	contig_10341_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_47234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTGCCCATTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105097	103097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_103100_105100
800781	contig_12179_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_127996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1055	1369	494426	494740	NA	75	TTAGTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMKRKNIERRYHRDKMDMDCCPFISGEVRKREESGTDLGFLQILQTGKSLLKVHLNDCTHISSLSSLENSFRFNLVRNINSCKYKARLTLYMFQLSYMITCVP	493371	495397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_493400_495400
800782	contig_18168_pilon	-	1386	7	Intergenic	novelGene_122084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	195.924943111727	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	552	959	25980	24845	TRUE	35	TGGTTGATGGAAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWTPYFPFLSQSPILSPLSSSWGSLLPWFSLSLWLWWLEL	27131	23468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24961_25038_25315_25964_26171_26483_26754_27040
800784	contig_3476_pilon	-	1362	4	Intergenic	novelGene_134104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	238.931417403033	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	177	347	81810	72084	TRUE	30	TGATAATTTAGGAGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKPRKGKNVQTTLNVESDQKKPRRKDTPALHIPPFIPGVLSEHLIRRYDVQERQPKNKMSPALHNTDLEQKKPRRKDTPALHMPPFAAGVRLLRDERPKVIMEDDEKDGDKIAI	83517	71010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3476_pilon_-_71131_71188_72164_81719_81873_83403
800785	contig_9909_pilon	+	594	2	Intergenic	novelGene_42475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGAATGTTTTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681145	683150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_681566_682976
800790	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
800791	contig_5419_pilon	+	1408	2	Intergenic	novelGene_15526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATATTTTACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272419	285938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_273490_285600
800792	contig_3525_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_135146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	870	1232	624490	624852	NA	25	ATGGAGCCAGGGGCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASSSRVGDPREQVAAFYDIALEVKYHHFCNDLCVTHVTPVHRGRGPPKGTGSGDRWGVLEGCCADRPRGSRSAYSGLLITAVLNDVLLALVQYEQSHLMVTEDTIFLVYVQLYYRYCS	623620	625624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_623600_625600
800793	contig_5463_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_144771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTCCTCTCTCCACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15802	14317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_14300_15800
800795	contig_6710_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_98003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TCTTCTTTAACTTTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
800796	contig_6589_pilon	-	1311	2	Intergenic	novelGene_25806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	436	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGGATGAATAGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675611	673999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_675076_675376
800797	SIRV4	-	135	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	16	1370	16	-1370	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACGGGATATCCACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5142	5007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_5000_5100
800798	SIRV4	-	458	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1065	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4093	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
800804	contig_12402_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_133363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAGGAGGCCATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540641	538866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_538900_540600
800806	contig_13700_pilon	+	1739	2	Intergenic	novelGene_68265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68484	72591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_69939_72306
800809	contig_14694_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_152464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAACTACCTGGACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65359	64360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_64400_65400
800810	contig_6424_pilon	-	1083	5	Intergenic	novelGene_109246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	569	junction_4	231.810671669792	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	42	473	12076	6307	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21032	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_21012
800814	contig_7057_pilon	+	858	4	Intergenic	novelGene_123301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	230	junction_3	55.3714727996285	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGAAGTGTTTGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900519	905867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_900848_901239_901432_905387_905461_905602
800816	contig_14441_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_100722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	116	415	117673	116671	FALSE	25	GCTCAAACACGGCCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDVRTAPLSTGWGDGLGPGLSPLVVGREPIELDLAAEVVAGIVPEGGRHSQAAAQAVAGVIGAGLQPRLGVRADPAEGHLAIHPPAQLHVVGVEAGG	117788	116623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_116927_117629
800817	contig_19155_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_173371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623442	624924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_623400_624900
800820	SIRV2	-	694	4	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4731	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4313_4357_4480_4687
800821	contig_10581_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_41437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGCTCACAGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750077	749770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_749800_750100
800822	contig_16907_pilon	+	1892	15	Intergenic	novelGene_87466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGAGCACAATTTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480565	524852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_480714_482744_482841_485630_485700_489762_489855_499452_499595_502077_502230_503136_503294_505626_505803_512215_512366_514183_514277_516849_517026_518254_518384_519047_519146_520230_520297_524704
800823	contig_9656_pilon	-	1221	10	Intergenic	novelGene_121921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	368.309987528957	3	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	50	859	446594	432174	TRUE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDVSSFISLIMNTYQTNYCVIQAYYMNRTWQK	446643	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432244_436906_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
800824	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	134	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
800826	contig_5020_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_27944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167757	169099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_167800_169100
800828	contig_7391_pilon	-	2074	5	Intergenic	novelGene_112166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_2	28.3581998723473	1	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	262	672	457964	443049	TRUE	35	TATTAGTAAAACTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRAEEAGSCFPGRTRLWGARGLGRGGSKRPVVTAWVRGSGTGEALGCFGLWVGQRAWRAGVPGPGQGSDPWLVSLRTRSAAHPVLAMRPQQAPVSGKVFIQRDYSSGTRCQFQTKFPAELENRIDRQQFEETVRTLNNLYAEAEKLGGQSYLEGCLACLTAYTIFLCMETHYEKVLKKVSKYIQEQNEKIYAPQGLLLTDPIERGLRVIEITIYEDRGMSGR	458225	438728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_440116_443033_443094_444144_444247_451552_451706_457853
800829	contig_19378_pilon	-	909	4	Intergenic	novelGene_73778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_3	124.854582081182	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATATGTCTTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18316	15991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16440_16937_17040_17682_17788_18062
800831	SIRV6	-	183	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTGATCGGTCTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_1900_2100
800837	contig_7652_pilon	-	2162	14	Intergenic	novelGene_170951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	590	934	79629	49386	TRUE	10	TCTTCTCCGATGTCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSDASGGPFHSLLCTGSWTSFSNCRVPWAGSRIHHTLGAILPAFYLGDEEVGRPLQCGNILGYRALAWAFTESRDGTRNTAPRCRVPVSESWRIRTGTYGLCLGRTVQRES	80218	16400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7652_pilon_-_16452_43893_43986_44380_44420_44642_44712_44981_45052_47506_47718_47804_48119_48612_48712_48895_49030_49144_49253_49344_49459_49589_49722_79100_79207_79595
800838	contig_4952_pilon	-	2023	2	Intergenic	novelGene_145533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	164	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGCACATATCTGGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490753	488528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_488922_489123
800839	contig_4783_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_108351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGACTGTAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94165	94405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_94200_94400
800840	contig_7943_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_173134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGGCAGCTGAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117690	119182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_117700_119200
800841	contig_7943_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_173135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGTTAGACACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119430	119919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_119400_119900
800844	contig_383_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_126097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCAAAGGGACCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93954	95648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_94000_95600
800846	contig_5515_pilon	+	1012	8	Intergenic	novelGene_52309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	124.915318254784	370	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	177	758	40298	49417	TRUE	20	CCCATGAGGCCTGAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHRLLRPQTLLTKSQRKRSLLRTMMMILWTMRPPGWRACRQAGTRCLTLPAGSLTTGMWTQTLCPGSPHMTPTLSLPSLPRSSGTVMQMLRRSRTGAMTSRTGATTSRTVAMTSQTGAMTSPTEATTSWTETESVAMTRWTERESGTEIGTGIVGMTRQTEKRPKNGVTIAGRSWLPIPRARKWQAERMKS	37991	49844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_38043_38215_38316_40272_40343_48213_48326_48565_48679_48868_49154_49390_49455_49627
800850	contig_13868_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_172662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCGGATACCAGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116774	117588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_116800_117600
800852	contig_8050_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_114829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAAGATCTAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304995	304699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_304700_305000
800853	contig_8050_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_114828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTCTATATTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304122	302789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_302800_304100
800854	contig_8461_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_163913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	43	345	106902	107204	NA	75	CAAAAAAAAAAAAACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVPWEGQTVSELVEMAEREEVYLTPTSQQSAPCEVKQGGQTPQRQVSAEPPDKDGLERRPGDLLLKISQGKPYGSQWSDPQPVVRMAQDRAAFASIVHGTDSATASNEHSMLLF	106859	107704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_106900_107700
800856	SIRV4	-	265	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1258	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3900	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
800858	contig_10855_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_124308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	426	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGGAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312915	314442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_312900_314400
800860	contig_8885_pilon	-	1998	5	Intergenic	novelGene_115565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	123.384308159506	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	124	513	75477	49174	TRUE	35	ATTAGAAAACTCATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75600	45841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
800861	contig_11386_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_82769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCCCACTAATCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8120	10046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_8100_10000
800863	contig_11498_pilon	-	1704	14	Intergenic	novelGene_65511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	598.094231755475	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	155	1612	200916	172734	FALSE	5	CATGCGCGTTCGCCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPLSAAKPRPRPREPLPPSPSGREPCPLPPGKLDFRGWRRLADWVGTTMGNAAGSAEQPAGPTASPPKQPTTPKQPMPAAGELEERFNRVLNCMNLPPDKVQLLSQYDNEKKWELICDQERFQVKNPPAAYIQKLKSYLDTGGVSRKVAADWMPNLGFKRRVQESTQVLRELEISLRTNHIGWVQEFLNEENRGLDVLLEYLAFAQCSVTYDMESTDNGAPSSEKSKPLDQSVEDLIKGPPSSCPPQPKSRHLTIKLNPAHSRKTLRNSRIVSRKDDVHVCIMCLRAIMNYQSGFSLVMNHPACVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHDIILAAFDNFKEVCGEQHRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVENMNFRVFLQYEFTHLGLDLYLERLRLTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGSLLEDTETKNAVLEHMEELQEQVAMLTDRLRDAENESMAKIAELEKQPPPPLSHHGPALPSFATGGSIADLSRKCCLQHPLSPKAILSPSGSLAYNL	201070	172641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_172887_178451_178518_179021_179172_180756_180868_181153_181229_182553_182648_182905_182983_183596_183706_185276_185415_185823_185908_186258_186333_187914_188029_189602_189687_200787
800864	contig_6589_pilon	+	810	4	Intergenic	novelGene_25829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	31.5383364600397	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGAGGTTTGCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823865	825383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_824183_824426_824499_824588_824744_825117
800866	contig_15172_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_158744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGTGAGAAGCTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226415	227095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_226400_227100
800868	contig_10304_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_166494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	607	1020	94836	95249	NA	80	ACAAGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAWSPGATPGLRCGTCSPASHLPPGAPLAPFSSFLPACLPHLLMAFKVFQPHPPLLHLVPWLPFLLLLRPLPQPRLLSGHHHRRSQGLEPGMMCRVPWLSGAVALQGIPLSGSSDICAVPALGERTRTGSHGWAP	94229	96607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_94200_96600
800869	contig_7057_pilon	-	1050	5	Intergenic	novelGene_123415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.0138835346518	45	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	930	119	1048	1443214	1429431	FALSE	35	GAGAATTCATACTGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGLTFKDVAIYFSQKEWECLESTQKDLYRDVMLKNYDILVSLGLPDSKPSVISLLEQGKEPWMVRREEAEGWCPDWESRSKNFSLKEDSYEIESFQQEITKRLTSSNPECTRFKDDRESEFQLERQQEGQFRQAIMTLDRLHPRIHAGERSCECGESIKAFRYRSCPVQHERIHNKEKDSEYRVCGKTFSSRSDLIQHQRIYDNKKSNGNKKCTFTCDSDITQSQKINTDEKPHKCKECGKVFSSSSQLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKAFPSTSQLNLHQRIHTDEKYYECKECGKAFSRPSHLSRH	1444486	1429428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1430132_1435756_1435853_1436144_1436269_1443205_1443258_1444411
800872	contig_5816_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_158274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAGGCCAGTCAAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426090	426740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_426100_426700
800874	contig_9424_pilon	-	1150	5	Intergenic	novelGene_143767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	11.4537111889553	240	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	233	856	45980	38336	FALSE	35	GAAGAGAATTCTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNCLAAAALNGVDRRSLQRSARLGQEVLERARRRAVNWHSLELPKGSMGVLALEGPDQERRPAANTQRLLPGEKEERYPTLSASFRTMAEFMDYASSQCGKYYSSVPEEGGATHVYRYHRRKLEVSWCSDTGNGPGQDTSLGLKGIYQASQCDLEASQPAENISKDLYIEVYPGTYSVTVGSNDLTKKTHVVAVDSGQSVDLVFPI	46212	38041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_38480_40628_40701_42685_42791_45015_45097_45758
800875	contig_7229_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_39832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCATGTAGCATACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924261	923776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_923800_924300
800876	contig_7229_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_39831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATGAGTTAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921423	920334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_920300_921400
800877	contig_5728_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_126687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTAAAATGTTACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235360	237415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_235400_237400
800880	contig_10930_pilon	+	885	5	Intergenic	novelGene_37111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	16032	junction_1	2121.52934224347	4	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	70	435	339608	341654	FALSE	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKVSWNMPGRN	339430	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522
800881	contig_1624_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_138363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATAGTACTGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17646	16869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_16900_17600
800884	SIRV6	+	289	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	271	19	-236	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
800885	contig_10734_pilon	-	849	2	Intergenic	novelGene_51148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATATTTTTAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909118	907555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_908330_909043
800886	SIRV6	-	228	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
800888	contig_15022_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_171815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	230	595	99354	99719	NA	30	TCTGAATGGCAAGGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKVLLSCQALAQASFLPSSLLCSLGWVRVLWGSLNSRIALRFFLVLALIYADLSTRPRTPPSSDHELHCLFSLTHFMLVLPPNPSEPFPISPHSCVPSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGVCGGGASGRGNGSMTGLVCWESRWFGWMEGLE	99124	100962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_99100_101000
800889	contig_15022_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_171816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	447	419	865	101331	101777	NA	45	GCGTTGTTTAAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLCSSHAKCGAADLDPCLSLDGLWGWVSAMWRGGPRMTPKSGPLSAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIEVGCPHLLPVPRVCPTQLLPGSPKPPAPSHSSQHPGARRDFWDYLVGGDFGKADFFQSQQTMACKLSVILHFN	100912	101777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_100900_101800
800890	contig_9463_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_83817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCCAGTTCAGAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43590	43146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_43100_43600
800891	contig_8156_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_98912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCCATTGCAATAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138332	139515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_138300_139500
800900	contig_16126_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_141889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1267	1599	101692	101360	NA	80	CTAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDTNYSVSSFVKIVDSKILILGLTNYLTYKTFKKFSKIFLHLKISSDMLKNLHSISAQRHILYLNMLLFSYSFWPWDSGPCKLQSANIKQMHSTLSFNIQKNVGRIKNR	102958	100937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_100900_103000
800901	contig_7704_pilon	-	1028	9	Intergenic	novelGene_154606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	178.783344791958	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	641	973	220403	216744	FALSE	5	AGGCTCCTGCTGGGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	266679	216688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_228371_228594_266501
800902	contig_9543_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_175315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364072	364967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9543_pilon_+_364100_365000
800903	contig_10225_pilon	-	1527	4	Intergenic	novelGene_86878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	1.88561808316413	71	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	62	496	107928	101971	FALSE	10	CTCTTACGATGCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGFQNVVTVDELRTAFPVLDMVDLERRPKTTPLLRNDFPAIEGVLLLGEPVRWETSLQLIMDVLLSNGNPGTGLATAPYPHLPVLASNMDLLWMAEAKMPRFGHGTFLLCLETIYRKVTGKELRYEGLMGKPSILTYQYAEDLIRQQAERRGWAATIQKLYAVG	107989	100939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_102164_104441_104617_106244_106279_107895
800905	contig_14546_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_157441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGCCCTATTGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512693	513221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_512700_513200
800908	contig_13958_pilon	+	2165	2	Intergenic	novelGene_129532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACTATAAAGAAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126668	134281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_126822_132269
800910	SIRV2	-	536	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1101	0	-62	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4794	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
800912	contig_7695_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_41649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGGTATCATTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804257	802865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_802900_804300
800913	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
800914	contig_13015_pilon	+	1182	11	Intergenic	novelGene_165563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	51.088256967722	459	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	422	991	411270	427161	FALSE	55	TGAAAATAATTGTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAPKLEERLKALTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTDVEYETFDILEDEEVRQGLKAYSSWPTYPQLYVKGELVGGLDIVKELKENGELLPILRGEN	396066	427352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404118_410292_410370_411107_411310_416546_416720_416945_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
800915	contig_4900_pilon	-	1962	7	Intergenic	novelGene_159047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1446	1781	538955	521448	TRUE	15	CCAGCGTCTTCCACCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTVQRNKLIRYFSIHILPVWWHGNSLIFTDITGTCATCHIPPSKTSPTGYLTCPSHPSRYLSLWRRILLLCETSPEMLSRMKGAYFLFIFGNSLQGMRYDNFLDFSFMF	551814	496251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_496419_521433_521545_523096_523234_538769_538842_538925_539058_549070_549222_550622
800916	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
800917	contig_2596_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_53500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTATCCACTGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008259	1009378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1008300_1009400
800918	contig_2596_pilon	+	1140	4	Intergenic	novelGene_53431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	185.404662532766	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATGTGGTTCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9066	11484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_9953_10378_10454_10666
800919	contig_13901_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_146669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGACTTGGTGATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276050	275454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_275500_276000
800922	scaffold_17306_pilon	+	2642	1	Intergenic	novelGene_175318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	93	299	10840	11046	NA	35	GTTGAACAGTGATGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLEGTRRHLKSLGLIKAHQRELPSGLIILMGDQPCASGRSTLPPGKTREAKPPKKRCLLAPRWDYPEGTLNGGNTPLPSAPPPASPGLKLHPPPPEK	10747	13389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_+_10700_13400
800923	contig_10297_pilon	-	1130	9	Intergenic	novelGene_112563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	162.748271880226	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	416	994	752945	730242	FALSE	50	AATAGAACATTAACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIKGQKLHKMGLKAQDTAELFFEDVRLPANALLGEENKGFYYLMKELPQERLLIAELAVSASEFMFEETRSYVKQRKAFGKTVAQIQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDSCLQLHESKRLDSATASMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIARDIIQDK	769895	730105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_730336_733901_733989_736234_736363_750933_751048_751979_752082_752891_753057_755182_755239_766112_766258_769792
800924	contig_19442_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_169609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70576	69744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19442_pilon_-_69700_70600
800929	contig_8954_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_130283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAGGTGCCTAACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153336	152503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_152500_153300
800931	SIRV6	+	217	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	51	515	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
800932	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
800942	contig_5899_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_146966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTCTTAAGTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55507	57785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_55500_57800
800943	contig_18096_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_58056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78455	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_78500_79100
800944	contig_16594_pilon	+	1422	2	Intergenic	novelGene_53890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGAGCCTCAGAGATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221321	223594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_221812_222662
800945	contig_13424_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_151598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65743	66796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_65700_66800
800947	contig_11115_pilon	+	1073	5	Intergenic	novelGene_102848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	336.617735718129	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	440	946	171704	173204	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYQWHLPLSGRQLAGHDHRGGGDGSSGLERPLRHHHHGGVSGLGPGDYYSSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	166394	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_166520_171029_171336_171695_171981_172890_172964_173047
800948	contig_14326_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_120670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACAGCTCTGTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77983	79675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_78000_79700
800949	contig_7286_pilon	-	862	7	Intergenic	novelGene_108709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4737.12826744455	5	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	24	317	293122	290815	TRUE	20	TGATTGATTAATTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMALTRLERISV	293145	286890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290847_291315_291497_292022_292101_293119
800950	contig_3862_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_137416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTCAAAAGGTCGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550609	551041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_550600_551000
800953	contig_15010_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_175327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47383	46683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15010_pilon_-_46700_47400
800954	contig_3818_pilon	-	1053	4	Intergenic	novelGene_99306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	98.3948959832549	317	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	78	539	1057148	1027212	FALSE	10	ATTTGTGGAGTGTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASASGGSTLPSGFAVLTTFPDLLFIFEFVFGGLVWILIASSLVPIPLVQGWVMFVSVFCFVGTTALLILYMIGAHSGETSWVTLDAAYQSVASLFYLSASVLEALATILMQDGYTSKHYHENISAVVFSYVATLLYVTHAVFSLIRWKSS	1057225	1026697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1027287_1031842_1031969_1033398_1033567_1057055
800955	contig_4364_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_3160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533027	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
800957	contig_10235_pilon	+	997	4	Intergenic	novelGene_46425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	194.444507936498	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	19	558	210483	212152	FALSE	15	TCTGATTGGCCTTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRLSPAVPADASTIYAVVV	210464	212591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_212097
800959	contig_9363_pilon	-	2209	3	Intergenic	novelGene_6796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	39	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	53	1321	1614905	1612082	FALSE	20	TAAACTGGCCTTATCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAVEPWGPDLPAREEREQLRGARTGLGSENVEISKQDDFEHTPQENELEFKDEEELAPDHEVGNSSLKPEGIQTWDDLWVQREGTGKPQLQDRGPRLLGEPRWGQASDRAAVCGECGKSFRQMSDLVKHQRTHTGEKPYKCGVCGKGFGDSSARIKHQRTHSGEKPYRARPPAQGPPKIPRPRIPAGERPTICGECGKSFRQSSDLVKHQRTHTGEKPYKCGICGKGFGDSSARIKHQRTHRGEQPPRPVVPRRRPSRATTAAAQGPKVQDKPYICTDCGKRFVLSCSLLSHQRSHLGPKPFGCDVCGKEFARGSDLVKHLRVHTGEKPYLCPECGKGFADSSARVKHLRTHSGERPHACPECDRTFSLSSTLLRHRLTHMEPQDFGFPGYPLAPLIPSPPPSSSPPPPPLGTSPPTDTS	1615166	1611193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1613272_1614826_1614921_1615129
800962	contig_15304_pilon	-	718	2	Intergenic	novelGene_30533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	199	543	54100	53061	FALSE	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKYPTQPRTCSLAYREQLPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54298	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53357_54051
800963	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
800965	contig_6443_pilon	-	765	6	Intergenic	novelGene_175151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	2.4	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	26	625	496330	475089	FALSE	25	AATCATTTTTCTCACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYKDEAEKMLSTYSTMADTPEIQRIKTTQQNISTVKYKEEIKHATAISDPPELKRVKENQKNISKLQYKEQHYKATPVSMTPEIERVRKNQEQLSTVKYKGEIKQATAISDPPELKRVKENQKNISNVYYKGQLGRATALSITPEMERVKKNQENISSVKYTQDHKQMKGRPSLLLDTPGLRHVREAQNHISMVGYNQIILLMTKTY	496355	474948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_475239_475717_475811_477860_477954_479526_479620_482408_482502_496252
800966	contig_10196_pilon	+	807	4	Intergenic	novelGene_132116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGTGTCTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922250	926563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925833_926080
800974	contig_15596_pilon	+	1658	3	Intergenic	novelGene_139527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_2	12	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTGCTCTTCCCCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104301	106869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_104363_104476_104614_105409
800976	contig_15939_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_160247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCGCGCATCAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20833	18950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_19000_20800
800981	contig_1309_pilon	+	1515	10	Intergenic	novelGene_73990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCAAATAGAATAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356715	392401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_357115_358834_358942_363803_364085_371302_371406_371588_371694_373520_373601_388078_388109_389593_389705_389846_389966_392221
800983	contig_15691_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_60749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGGGACCTTAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20341	22100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_20300_22100
800985	contig_5918_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_99586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGACAAGCATAAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1986234	1985412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1985400_1986200
800987	scaffold_19766_pilon	-	727	3	Intergenic	novelGene_34363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	151	junction_2	155	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	196	435	677202	676963	FALSE	0	TTTGGGCCTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAPGSTLGPADPLSQYWSVPRLLPPHTSPWTQRRAQPAGQTSRASLHIPYTTVNTNYFCPAALEMAHHHQQLSRWPPLPIPTTSQTQALAPWAPLPASAHSSFISVENVLYAQAGGSPPHSGPGSPNLIPFPDPLEPKPRRNA	678328	676670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_677287_677394_677453_678275
800988	contig_7622_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_132434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295360	292858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_292900_295400
800989	contig_8020_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_114418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAATGACGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216617	215735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_215700_216600
800996	contig_602_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_134964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543642	542217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_542200_543600
800998	contig_18869_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_56156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73596	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
801003	contig_5039_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_64855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGAGAGAGTAGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342590	344562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_342600_344600
801004	contig_14643_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_99134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAGTTTAATGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90907	93120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_90900_93100
801006	SIRV6	+	353	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	589	20	410	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
801009	SIRV6	+	296	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	171	413	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
801010	contig_9696_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_68824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGGAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532692	533069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_532700_533100
801011	contig_8177_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_86513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTTTGCCTCGTATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184077	185755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_184100_185800
801017	contig_10324_pilon	-	1548	9	Intergenic	novelGene_7695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	77.5258021564434	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	15	551	20592	19046	TRUE	35	TTGAGAAAGAGGAAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIFGGPTASSSESEEESAAAEKQKKVRPMYLKDYERKVILEKEGKYVDEENSDGEASDQRRQQTLSQSYVEEQKQLKESFRTFMEDSEDEDSTRDSGSGLLQKRAKTREEKAQEEADYVEWLKGQKEIENPETLQELTHLKDYWNNPELDAGERFLRDYILNKRYEEEGDEEEEER	20606	16616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_16669_17911_18083_18171_18268_18367_19166_19516_19595_19669_19767_20049_20100_20180_20236_20455
801020	contig_7131_pilon	+	909	7	Intergenic	novelGene_175331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	16.2446572413483	379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	135	557	126497	128690	FALSE	20	AGAATCCTGGGGGTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGPAWRTAVPRLSDPTVYPLPVPNRIGGARSLRWLRPDPGALLEMDSRIPYDDYPVVFLPAYENPPAWIPPHERVYHPDYNNELTQFLPRVITLKKPPGAQLGFNIRGGKASQLGIFISKVIPDSDAHRAGLQEGDQVLAVNKVDFQDIEHSKAVEILKTAREISMRVRFFPYNYHRQKERTVH	125830	129042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_+_125952_126483_126584_127211_127296_127567_127625_128104_128204_128436_128498_128655
801023	contig_18145_pilon	-	791	3	Intergenic	novelGene_37310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGCCAGGGGCCTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68043	65889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_65910_66656_67200_67815
801026	SIRV6	+	529	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	254	0	254	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10491	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
801028	contig_6414_pilon	-	1484	12	Intergenic	novelGene_157011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	380.194556544996	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	46	1149	85578	46102	TRUE	25	AAAGCTCTGTGTTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRPRRQEPGGRRRNMSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTANAPGRKSWGKGKWKSKKCKYSFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSHPLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNRPFISQKIHFPDFSTRDIHRNYVDCVRWLGDLILSKSCENAIVCWKPGKMEDDIDKIKPNACIGQSGWQTLCLGFRSRRSS	85623	44742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095_46170_47225_47296_57068_57175_59286_59421_63319_63412_67557_67640_69124_69251_70319_70386_72834_72928_74835_74989_85464
801029	SIRV6	+	304	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	37	1248	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGCAGTTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
801030	contig_7179_pilon	-	2087	4	Intergenic	novelGene_78171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	92.1641048468557	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	455	1186	1061369	1058685	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLVKNLFELARQHKPSIIFIDEVDSLCGSRNENESEAARRIKTEFLVQMQGVGNNNDGTLVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMVSDQWGERTAQSPENWGLDPRIKINFSPFLSWAAMALQNRDFL	1061823	1057783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058958_1060225_1060446_1060733_1060816_1061212
801031	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
801034	contig_3942_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_128643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGACTGATGATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176954	180109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_178318_178490_179045_179177_179714_179825_179974
801036	contig_9345_pilon	+	358	4	Intergenic	novelGene_24337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_1	737.148711063258	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATCATACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117960	120186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_117988_118097_118154_118235_118324_119999
801037	contig_13226_pilon	-	826	4	Intergenic	novelGene_175344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	193	junction_3	85.2030255070532	934	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	320	391	183557	183486	TRUE	30	TCGCAGGATAAATGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAGARASGRDSRRARARGVVASLRLRRRRTRAAAGVRGAGCCAPSSPLSPLWRVEEAEVVLGAPPSSSPSGDLSRPSRAARSLRRKTVPARIWLVGSRRFSLSRKMPKSKLDKRRNKDMTKRLLPKLL	187085	180491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_-_180796_181535_181644_183462_183600_186808
801038	contig_5315_pilon	+	2298	2	Intergenic	novelGene_175350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAATGATATAAAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136286	138963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_136335_136713
801041	contig_6735_pilon	-	809	6	Intergenic	novelGene_15705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	847.932214271872	401	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	83	490	564868	542303	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKST	568280	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542312_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
801042	contig_7744_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_62586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCTAGCTTGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021819	1023269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_1021800_1023300
801043	contig_7157_pilon	-	2924	1	Intergenic	novelGene_131264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGGAAGCTATTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91856	88932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_88900_91900
801047	contig_10197_pilon	-	786	3	Intergenic	novelGene_115217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2102.5	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	115	417	952331	909985	FALSE	30	AAATATTATTGCGCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVRLLEFIVMILL	952445	909615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910013_923897_924109_952267
801049	contig_6710_pilon	+	560	2	Intergenic	novelGene_91639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
801050	contig_3382_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_123997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAGAAAAAAAATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97865	99817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_97900_99800
801051	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
801054	contig_19402_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_80831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCATCCCAGCATCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121168	123847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_121200_123800
801055	contig_4730_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_71700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGTTTATAGCCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99792	98513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_98500_99800
801057	contig_16578_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_148696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAACGGAAAGATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358850	358264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_358300_358800
801058	contig_6076_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_81746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCTGTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82718	80802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_80800_82700
801060	SIRV4	-	386	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	27	204	27	-204	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAGTCAACAACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5131	3841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801063	contig_6497_pilon	+	1538	10	Intergenic	novelGene_35581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_9	36.834296954045	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	24	1319	232881	244448	FALSE	35	ATAACGGCCAAATGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQRTGVLLYGPPGTGKTLVAGIIARESGMNFISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFVRAQAAKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDPALLRPGRLDKCVFCPPPDQVSRLEILNVLSDSLPLADDVDLHHVASVTDSFTGADLKALLYNAQLEALRGRLLSCGHQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGLEQSLVSLEMSDVLPDESKFHMYRLYFGSSYESELGNGTSSDLSSQCLSAPSSMTQDFPRVSGKDALFSQPPVFRTASQEGYHELTQEQRDQLRADINIIKDRYRSQSGVDESLNQPGPIKTSLAISQSHLMTALGNTRPSISEDDWKNFAELYENFQNPKKRKNQSGTMFRPGQKVTLA	232857	244667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_232908_234427_234563_236429_236495_237618_237762_237844_237949_238781_238959_240060_240292_241393_241592_241878_242010_244363
801066	contig_19352_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_122394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207845	210646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_207800_210600
801067	contig_1274_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_137818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539617	538688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_538700_539600
801068	contig_10341_pilon	+	1797	2	Intergenic	novelGene_47254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTCCTTCTTCAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169935	172323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_171307_171897
801070	contig_13123_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_136904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTATGTATCAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437066	435428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_435400_437100
801074	SIRV7	-	375	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-32	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
801082	contig_1154_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_87161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	306.81844070322	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	167	616	900067	901946	FALSE	20	CAATATTGTCCTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGWYDADLSPAGHEEAKRGGQALRDAGYEFDICFTSVQKRAIRTLWTVLDAIDQMWLPVVRTWRLNERHYGGLTGLNKAETAAKHGEAQVKIWRRSYDVPPPPMEPDHPFYSNISKNEEIVPQIKEGKRVLIAAHGNSLRGIVKHLEGLSEEAIMELNLPTGIPMVYELDKNLKPIKAMQFLGDEETVRKAMEAVAAQGKAKK	896068	902821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_896146_899977_900253_900895_900990_901776
801083	contig_11978_pilon	+	1531	7	Intergenic	novelGene_62805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	64.6030615029625	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	199	633	379985	543182	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEVGRTEEMVILISVACELWLPCWVPSFLCYLLISYQ	335613	558364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543456_557739
801084	contig_11328_pilon	+	804	6	Intergenic	novelGene_88394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2537.40224639295	6	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	40	405	643683	645033	TRUE	35	AATCATCTTTACACAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGKAYF	643643	648036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645057_645289_645376_647069_647223_647899
801085	contig_9146_pilon	+	577	5	Intergenic	novelGene_79500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	309	392	142828	146334	TRUE	35	GAGAAGGAAGAAGGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLYYFYNSHLCFLARCLRSRCFLGWGFLALLSFWRPSLLSWSFLLLACCLFFLGRSLLACSGHLLCWNLCSSCCCSCSCSLCSSCFFGRSFQESCPLKLLNFMLYYSVPHFLCLHDFITIKIRHLGFLQ	142519	147506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_142849_143321_143378_146327_146398_146893_146994_147484
801086	contig_7292_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_175364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGAAAGGAGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144461	143584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_143600_144500
801087	scaffold_19766_pilon	-	1582	10	Intergenic	novelGene_34271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	304.971036876182	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	191	1213	325368	322994	FALSE	10	TGTACCTGGTCTCCACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	327836	322624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_323101_323179_323397_323489_323692_324034_324102_324196_324360_324442_324507_324827_324935_325050_325090_325311_325458_327735
801088	contig_11719_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_154775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	373	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1435	1794	141122	141481	NA	5	GCCCTGTTAGTGTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFSVFSFVSKTTVLGTAWKTELSFLPCLPGPGPFPSIFTVLVRRTSQCCQELRGNRIRSREGRRNLSFPISFSQGRCLGFPHSSLSHGCRLVFTGSSGTVGLWRRQKRKGNWVHPQV	139687	141838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_139700_141800
801090	contig_12113_pilon	+	804	2	Intergenic	novelGene_134728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	198	428	107068	107298	TRUE	15	CTTCATCCTAGGTGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVQGSVDGKPFLHYESDSNKAKPLGPVGEKVNTTKTWEEQTETLKDLRQELRNLLPDIALEKYTTMGKFGGAHILETVSRRRKGEGKTWEGRAIGCICIKELNIDPTPEGHGQDLEDSVWVPNAWKKTGLMGSVSSGKSVG	106870	108799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_107596_108720
801091	contig_12113_pilon	+	1949	3	Intergenic	novelGene_134729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACCTCCTGTCCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108751	121856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_108850_119387_119500_120117
801097	contig_14326_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_120665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	621	962	59536	59195	NA	80	ACAAAACAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEYFNGTRQWFHVLVAVGYKLIGKSLTLAKYKRRSKVRKKRERNQNLVRKCHSSRLSLACQSEAKGGPPLPPAVPLSPNSPQVALTRSQSPAGNQLSLQKMQKTHPKCTKA	60156	58352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_58400_60200
801098	SIRV5	+	459	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7412	1	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCACCACCTTTACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
801099	contig_4951_pilon	-	1659	8	Intergenic	novelGene_122125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	13.1738764381697	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	20	1363	213620	183603	FALSE	5	GGGCCTTCCTCCCAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQIMRQFLYQALPEDSYKFATGKLHVALTRLTDGESVVVSEFTSKEELIEALYCSCFVPVYCGLIPPTYRGERYIDGGFTSMQPCSFWTDSITISTFSGQQDICPRDCPAIFADFRLFNYSFQFSLENITRMNYALFPPDLQVLHEYYYRGYEDAVLYLRRLNAVYLNSPSKRVIFPWVEVYCQIELDLGNECPEHSKPRLQTERASLEESMQLHTQWAPKGDGKGRHSPPMSPPVQTPESTCEWPVELPVSTPISSIEQSPASPLASSPSHSANGLPPVSPVPPVSPPAVQLPPSLTSDSSLPVTSPELPPVLPQQQVQPSGSPCRSSSSELSTSPRPSLEPSAVEALQTSPQCSPSASPAQSPIEELDPEQPQAPLAASNPKRATPLVNVKETICKPCVTESPAKDANWGNKVLKKNKQKTSGTRKGFPRHPRSKKSSGRIQKL	213639	183306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_183613_188688_188815_190726_190806_193495_194135_206708_206770_207903_208114_210690_210757_213467
801100	contig_6047_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_24235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATGCAATTATCAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230763	231882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_230800_231900
801101	contig_6871_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_21591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310111	310916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_310100_310900
801102	contig_9434_pilon	-	233	2	Intergenic	novelGene_150485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTGTAAGAGGCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92903	86044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_86192_92817
801104	SIRV2	-	262	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	664	22	664	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4068	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
801105	contig_14288_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_153838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTATCATTTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457278	455830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_455800_457300
801108	contig_10437_pilon	+	1124	2	Intergenic	novelGene_38439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGATTAGTTTCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866949	868353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_867299_867578
801112	contig_6915_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_162415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAATTAAATGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223596	223042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_223000_223600
801117	contig_13481_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_119372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCCAACAGTGCCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485383	485856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_485400_485900
801119	contig_5954_pilon	+	1074	2	Intergenic	novelGene_28397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGAGTATTGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6991	8766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_7301_8001
801126	SIRV6	+	412	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	265	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATCTGCAGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470
801127	contig_9895_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_144691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAAGTAGAGATTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151595	153060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_151600_153100
801128	contig_8864_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_135964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	189	518	51829	52158	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLGRCIALTRIIFVDGICIISGNTSYPILIPDGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFSWGMNNAGQLGLSDEKGK	51640	53810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_51600_53800
801129	contig_10324_pilon	+	739	5	Intergenic	novelGene_7709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1013.31942150538	102	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	48	311	51839	80335	FALSE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNARRRLMAS	51791	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_80310
801130	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
801131	contig_610_pilon	-	1461	6	Intergenic	novelGene_76815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	106.38984913985	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	32	538	338775	334270	TRUE	45	TAAACAGTCAGTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVRPRSDVYLYGPEPSQ	338806	331080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334318_334361_334502_338456
801132	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
801133	contig_16492_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_100290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTTTTGTAATATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121207	120352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_120400_121200
801134	contig_14528_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_111290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	897	1394	253479	252982	NA	20	CACGCCCCCTCTCTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLRFDPTQQLCRRNDLAICSCKDLQPRIPYGAVLLCLTGSLGVGIDWTAHNNQRDPARDLPKVPQQASGVHLGLCALNSHSHSAGCLRSNPQVDQGRLAELSQFSPTLGFLTGPKLRHRMVPISGAQQDGNSRAETLKGNGNSRRLACWPVGFSQRHSSGLQG	254375	252510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_252500_254400
801137	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_93993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
801138	contig_12050_pilon	-	1577	5	Intergenic	novelGene_62623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCACAGAGAGCTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343422	338889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_339190_340473_340565_341362_341420_342202_342254_342344
801144	contig_7870_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_108949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGTTGAGTAGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304689	305534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_304700_305500
801147	contig_9014_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_106828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTGAAAAAAAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269432	267152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_267200_269400
801148	contig_6445_pilon	+	1865	3	Intergenic	novelGene_77090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATACCTTTGTCCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923495	933018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_925019_925852_926067_932890
801149	SIRV4	+	248	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCCGGGCAGTTTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
801151	contig_5780_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_29766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTAATAAGGATCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26447	28497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_26813_27676
801154	contig_13780_pilon	-	2435	16	Intergenic	novelGene_149028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	310.341632542089	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	329	2131	515426	468957	FALSE	15	AGTTTCTATGCCCTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDDESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASPAENDSGSSGLEDAGFN	544225	468652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482_469541_483206_483338_490722_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162_513394_515177_515440_543910
801155	contig_10937_pilon	+	1847	10	Intergenic	novelGene_67311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	42	812	71806	74887	TRUE	15	GTTAGACGTTAGCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKTETCAGRDRQPPVLGAGPARPSLDGHWMQEWPPENGVSASAPAPRMAAVHAGMAGTGLLHRGSVPGPGCSLQPPAPGGEANGGGRLGRPWEEGPALPSPATPAALSPRVHHAESWSMLQPSASMSLLMSEIIRSHSSPSEGKDWSSELPAALFPLVVELEAVLAARRYLPKLSVMMPLPSFTPIVSRKFSKCWLSFSGMKGRKPSSRNLRLSPYSCRRLMQNSWMEAPLRYSCSNVANCWISWDDSLVRSVSM	71764	125237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_72423_73615_73757_74874_75014_75541_75602_78368_78503_79638_79777_81960_82145_82616_82701_117512_117687_125102
801158	contig_1406_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_25615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATCTAGTCATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2401009	2399861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2399900_2401000
801160	contig_9843_pilon	+	1322	10	Intergenic	novelGene_114330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_7	57.9254523045902	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	105	698	107444	125697	TRUE	25	GTGAAACATATTTTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYWKSQPKKFCDYCKCWIADNRPSIEFHERGKTHIENVAKRISEIKQKSLDKAKEEEKASKEFAAMEAAALKAYQEDLKRLGLESDISEPSISPVASTIPPTSASNQQKEKKKKKKDPSKGRWVEGITSEGYHYYYDLITGASQWEKPEGFQGNLKKTVKPVWVEGVSEDGYMYYYNTETGVCFPVRSMKRQLAA	107339	136788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_107446_108429_108503_111440_111504_111587_111712_117714_117883_120061_120109_120930_121004_125653_125796_130105_130270_136426
801164	contig_4783_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_108426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	239	394	438216	438371	NA	50	GACATTTAAAATAATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGCPLSPFQRPSPICLISPTPWLLNALLGLPTVCSFLEVLSTSKLSRFSPCKSESRVTLLKQSLIDQILINLNLETNYDMFQRQTPFSSLDDLFNLLRPLWRNFVALAAWQLSSFCIYNTLIFLWEAPPF	437977	440047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_438000_440000
801165	contig_312_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_128302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	344	745	240199	240600	NA	5	TCGGGTTGTGCGCTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALLKEIQNRAWALATSQSTASTQPLPHTAQWLLDTFPSTQAPGQSATQRGLTQPCQRCPRGPSEFCSGKERGDKGQLLSGTRHHAHFTVHPPTGPVLLCLGCPSSLAALEPGPMVLLLSQEGDEGVTVGDLQPAVPSRSLIPCRLGREVVQVTPGAPSLSLPSAVGVELHQLQLVFGCSLQDPLLVVVPDEIVDNGVDGQGNGNDPAQEADGRVELAQCGLGVDVTIANRRHGDDGPPEGLGDALK	239855	241673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_239900_241700
801168	contig_5815_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_141173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92696	94782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_92700_94800
801169	contig_18473_pilon	-	930	6	Intergenic	novelGene_169645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATACTCAATAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88212	59611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_59663_66207_66297_68946_69112_76953_77168_80408_80579_87971
801174	contig_8843_pilon	+	1445	2	Intergenic	novelGene_156635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCCTAAACTTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7272	8941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_7640_7863
801175	contig_7410_pilon	+	2984	1	Intergenic	novelGene_106057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTGGAATGACAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128076	131060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_128100_131100
801179	contig_3424_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_55547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	545	883	307970	308308	NA	50	ACCCAGCAACAACAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLPSSTCPPIGVTQWFWLLTTDLPPYEGHPHNSDTGAPADTDVQQDLSPRNTGCSAPVSEPHLGNDSCAYSPCVLTVVPTSLCCAHLIASFWIHRNSCLSSTHLTALSQV	307425	309354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_307400_309400
801181	contig_13823_pilon	+	900	2	Intergenic	novelGene_145245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	42	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	318	671	88522	88875	FALSE	25	CTTCCACTCCGCAAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEACAARDPEMAEVLPQHKFDCRSLEDYLSQHLPGFVAEPETTLSVTQYRYQLQPSPPADTNLCIVLFFLSSCMVPKFLHPNFLSCNDTLFRRELPLLVPLHSFWGIPSSKAIMEAR	87902	89104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_88168_88469
801183	contig_15188_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_163084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGGTTCACACAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176221	177140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_176200_177100
801184	contig_4364_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_3028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533318	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
801185	SIRV6	+	198	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	504	-1	-334	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAGTCGAAGTACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
801188	contig_3525_pilon	+	2408	1	Intergenic	novelGene_135110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATGATTTAAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18064	20472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_18100_20500
801189	contig_2715_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_173167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	21.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	79	426	66451	73089	FALSE	60	AATTTAAAAAAAAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLHGDSRDLSRGRTARAGPRRSGGLRGGAIVFAAVAAVFTLTLPPSVPGGDSGELVTAAYELGVAHPPGYPLFTLVAKLAIVLFPIGSVAYRVNLLCGLFGAVAASLLFFTVFR	66372	73158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_66611_72172_72205_72933
801190	contig_11145_pilon	-	907	7	Intergenic	novelGene_160521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	77.6782895451919	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	135	905	215710	73379	FALSE	30	CAGGTGAGCAGTATGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAF	220177	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_220053
801193	contig_11258_pilon	-	876	3	Intergenic	novelGene_67842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	90	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	21	584	360471	352136	FALSE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQGECMRGREAKEVSHEEPQIWTLTPFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGPCSAASTSCS	360491	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_354741_355099_360299
801194	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
801196	contig_8864_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_135955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24718	23620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_23600_24700
801199	contig_762_pilon	-	1536	7	Intergenic	novelGene_135937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	34.7738726952035	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	452	844	259754	256695	TRUE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGEEPRRRLVLIDTRYLSWIHDEM	266762	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255546_256309_256905_257514_257668_259724_259837_263480_263602_263903_264056_266666
801200	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
801202	contig_12661_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_166713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACAGATGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37352	35257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_-_35300_37400
801204	contig_14562_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_174071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTTAAAGCTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27538	30033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14562_pilon_+_27500_30000
801205	contig_826_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_154944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTCACTATTAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336743	337252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_336700_337300
801206	contig_1516_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_49920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCATTCCTACTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86866	87858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_86900_87900
801210	contig_3942_pilon	-	2507	10	Intergenic	novelGene_128672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	6.78415000998833	17	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1045	1884	345279	338670	FALSE	40	GGTAATCGCGCAATAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEGCYRITIFASTHPKKPTSWSTVLSTYHFWGNASRAGTPQLVSVKNHSANSVSVHWAESPLSSCPGVLKGHVVRFWDEDSSQVSERAVNATETQVTLRGLRPGTTYTVQVRADTAAGRGAWSKPQQFSTEVQVSRLVIFLVSLGSFVSILILGILGYFSLNRAARHLCPPLPTPFASTAVEFPGSQGKQVWQWTKQEGFPEELPPQEALVVETFWDKGEGTGLDTAGPLKESQLAPEAQAEALGPGGQDGLAEGRPLLLGDLMQSPRLGDPQYIKA	350225	338046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_338934_339735_339818_340224_340322_341264_341400_344126_344283_345173_345312_346011_346149_347823_348065_348891_348978_349677
801212	contig_5586_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_143602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656376	658697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_656400_658700
801213	contig_11986_pilon	-	843	2	Intergenic	novelGene_69214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	55	531	734848	734311	FALSE	50	GTGAACTGTTTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECVCPTGRCQKARGLPPASLTTASWAGALRFEVELMSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	734902	733998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734747_734807
801214	contig_10235_pilon	-	1167	6	Intergenic	novelGene_46558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	26.8283432213024	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	142	747	431644	430207	TRUE	15	TTCTAAGTGGTTCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADTSS	431981	429592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430084_430221_430660_430897_431288_431651_431846
801216	contig_6175_pilon	+	1983	5	Intergenic	novelGene_16277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	22.599778759979	57	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	493	915	555583	556005	FALSE	25	CAGAAGGCTGTCTGGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEQRRNWGVAVALLSPPVCQALWHMPLPRLDLVTSGAHSTNEEAETQGDRLVQSLISHVQTGVITPPPLGQCTGRHGTHSRWHWGESGSCCAWWRSRESSAASYLDIAERTRPAWPEGACSSPSHLSFKTRSSPRLLP	545665	557073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_545792_547354_547461_548998_549070_552971_553090_555511
801218	contig_12721_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_175071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATATGATCTTTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738134	735794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12721_pilon_-_735800_738100
801219	contig_10732_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_114735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	3	437	503914	504348	NA	35	AAGCAATATGTATTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYLLCGSQHRGDQHGGGAGGGAVARGAVPAPAGRECRRGEADGPGGERAAVPLDRALCACRVAPRRLSAGHRAGTEEVGVRAEAAGALRTGWPETPCPGWDGRGSRGTQREAVKQHPIIRLSCIGPLTFHDTGVKPSPHSVSEP	503911	505353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_503900_505400
801220	contig_5556_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_173276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGGTTGTACAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160134	162808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_+_160100_162800
801222	contig_12427_pilon	-	1633	4	Intergenic	novelGene_40432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	321.90302197332	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	120	773	264797	229865	FALSE	40	CTGTGTTTCCCAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPGPGPGDPDEQYDFLFKLVLVGDASVGKTCVVQRFKTGAFSERQGSTIGVDFTMKTLEIQGKRVKLQIWDTAGQERFRTITQSYYRSANGAILAYDITKRSSFLSVPNWIEDVRKYAGSNIVQLLIGNKSDLSEHREVPLAEAQSLAEHYDILCAIETSAKDSSNVEEAFLRVATELIMRHGGPMFSEKSTDHLCLSLACQTKPRADPPGHQWF	264916	229004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_229931_230016_230217_230601_230786_264593
801223	contig_9484_pilon	+	917	7	Intergenic	novelGene_105631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	617.062598121131	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	35	811	95848	104958	FALSE	60	AGAAATCACGTTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTGKDLRTVRRKAKRDCSKLLGWI	95813	105064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101279_104890
801224	contig_5671_pilon	+	829	5	Intergenic	novelGene_79434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_4	2296.42944317913	388	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	81	401	370430	493592	FALSE	60	TAAAGCATATTCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKKMKN	368844	494020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_493577
801225	contig_11396_pilon	-	1334	7	Intergenic	novelGene_71286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	765.208849487075	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	154	570	245798	238728	TRUE	30	GCCTCATAGTTAGAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMR	247892	231694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238712_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245816_247756
801226	contig_4816_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_115601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1445	1759	51989	52303	NA	35	ATCTGCCACTGAGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHITSRYYFKCFGSSLTASADIVLRISKCPSLASSKTGRYGAGWTEGNRSLQLELPVRALNLDVPELKGLCWGSKPIQSQCQHKIINSVVSIKNSKPFTSTVR	50544	52919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_50500_52900
801228	contig_16934_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_132521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTCTCTGCACACAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131642	129983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_130000_131600
801230	contig_14289_pilon	-	884	6	Intergenic	novelGene_110554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	376.090201946288	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	258	680	58752	51527	FALSE	20	ACAGAGGTCGTGTCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66615	51322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61240_64672_64754_66468
801232	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
801234	contig_12340_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_122113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTATGGGTAGAGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126339	127119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_126300_127100
801235	contig_7171_pilon	-	897	9	Intergenic	novelGene_101189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_8	391.840030337637	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	288	767	49603	37539	FALSE	5	CCCTGTGTCTCTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCRAYRVVRV	50438	37408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37564_37662_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47596_47690_49542_49818_50365
801236	contig_6710_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_97193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
801238	contig_8544_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_55911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACTGTTAATTCATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25402	23333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_23300_25400
801242	SIRV4	-	352	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	8	1161	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
801243	contig_2799_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_85600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACTCCGATGGATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785831	784972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_785000_785800
801248	SIRV4	-	297	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1221	3	1221	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3937	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
801249	contig_9673_pilon	+	1687	3	Intergenic	novelGene_119158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	34	45	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATCTTGAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59046	89134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_84698_84875_87676
801250	contig_3130_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_103557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGCTCACCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47924	47327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_47300_47900
801251	contig_6208_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_52992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTATACCAGCCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396598	398458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_396600_398500
801254	SIRV6	+	313	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	575	171	396	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
801255	contig_12638_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_33194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_1	151.601084722006	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	321	608	273852	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSGEEPHFHSHPQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	271649	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_271746_273449_273584_273761_273999_274124
801256	contig_10642_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_78675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATACAGGTAAAGCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185196	184284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_184300_185200
801260	contig_12019_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_87771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGCTACAAAGTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696966	695932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_695900_697000
801261	contig_5999_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_45611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGTCAAATCAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99773	98299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_98300_99800
801264	contig_15897_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_49554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	596	943	675173	675520	NA	15	CCTGTCCTCTAGATGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSLVVPQKVKHRISPPRYILQNLGGTVVKSSAANQKVGSLNPPAAPWKPLWGSSTLLYRVAMSRNPLDGNEFFRYILKRIENRGANRCLYTNVHSSIIHNSQEVETSQMSING	674577	676004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_674600_676000
801266	contig_12479_pilon	+	1399	8	Intergenic	novelGene_56826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	172.114935494884	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	490	1191	92999	119124	FALSE	40	GCACTGGTTACAGCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEASKAYESSESSDRFMTEKQQEEAEWESINVLLMTHGLKALSLVGRTDLKDLIIFDKQSSQRMRENFKTLVEDTARQQNMIRELIETNQQLKNELQLEQRRAADQEQRANDLEQIMESVKSKIGELEDESLNRVCQQQTKIKNLQKEHTALQAKCQRYEKKQMEQQETIASLQKNICRLTQEEEERIVTQNRVFAYLCKRVPHSVLDRQLLCLIDYYESKIRKIHQQRYD	76400	119332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_76674_78775_78935_92941_93068_95744_95836_95957_96082_96398_96580_110726_110897_119057
801267	contig_253_pilon	-	927	7	Intergenic	novelGene_129643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	110.286621531756	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	186	875	271077	267057	FALSE	15	CCACCGCCTCCTGTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYPDLAAPATVGSEVSGKMRCLATPTVLRALAQASHAGHFSGRSVHSTSLAATYKYVNLQEPKMDMKSVTDQAAQTLLWTELVRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR	271262	267004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267397_268417_268591_268687_268778_269311_269363_269451_269510_271020
801273	contig_5229_pilon	+	1638	5	Intergenic	novelGene_117702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.3472930471214	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	10	408	581989	591423	TRUE	40	GTAATAAAACTTTGATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDMEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIAADLRWPCAGQADRTLYRHLRAEQRTVGHALEEAELREAALPGGCGAEPGSVQGRPHCPAP	581979	597211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_582101_582738_582858_591255_591445_593087_593193_596107
801275	contig_4151_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_65296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGTAGAAAATTTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772730	774538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_772700_774500
801276	contig_13481_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_119436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTAGAGGAGCTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948086	949494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_948100_949500
801279	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	385	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
801280	contig_13093_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_105219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_1	66.6370767666169	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	232	1530	80341	56383	FALSE	60	GGAAAAAATGGAAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSEPP	80572	56233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_56394_59701_60773_77589_77717_80070_80127_80307
801281	contig_10380_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_175373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAATAGAAACAACCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10589	11645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10380_pilon_+_10600_11600
801282	contig_8954_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_130322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCTGAAACAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664537	662248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_662200_664500
801285	contig_8138_pilon	+	1021	5	Intergenic	novelGene_52470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	96	551	280295	306552	TRUE	5	TCCTTTCTTTCCGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280199	307521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306859_307357
801288	contig_3942_pilon	-	1981	7	Intergenic	novelGene_128888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.88762609953839	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	312	1445	1601666	1590759	FALSE	15	GAGTGGACAGTGCCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQALDALREAVACSQPREVSVPLARFRDQCQQHRPCRFLAAQKGAYPVLLAIWQLAAAGDPALLLQVLDALTVLTDGQPDLLDAQGLQLLVATLSQGAGVANLTCAALRLVRHVCLKHEQNRQALVKAGVLPLLTGAIAQHSRCADVVREACGALRIMTFDDDIRVPFGHAHSHAKMIVQENRGLKVLVKAAQGPHEAGAERPAGHRRQRRCEGRHCSCWRGRLRCGHHDPALGQPPGVRAELCGPVCPGPAQAGEQSGHRRGRRGPGCTGGHEGAPTGSWRAETGLYADPKPGGPQPGLLTAHSGPGS	1628076	1590222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1590839_1591718_1591857_1592275_1592408_1595408_1595983_1600394_1600478_1601539_1601707_1627805
801289	contig_5935_pilon	+	1458	9	Intergenic	novelGene_102719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	15.5075586408693	422	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	88	966	1064952	1075728	TRUE	25	TTTGAAATTCGTGCTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFTCNACGESVKKVQVEKHVTICRNCECLSCIDCGKDFWGDDYKNHVKCISEDQKYGGKGYEGKTHKGDIKQQAWIQKINELIKKPNVSPKVRELLEQISGFDNIPRKRAKFQNWMKNSLKIHNESILEQVWSIFSEASRNEPVSEGQDKQPLNQGANPCAEISTKAPSAGACKAPDQQAEMKKNKRDRKEERQKNKKKEKKELKLENQQESSRSQKPKKRKKGEGAEPEAGSAGTPEANGTARKRDKKKRSKGECTTEGGRERRPGSGGRLCQGGRDKSRRQKTKTEAF	1057550	1084431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1057577_1064890_1065074_1067042_1067158_1069514_1069623_1069731_1069816_1075278_1075731_1076207_1076295_1083465_1083552_1084114
801290	contig_15952_pilon	-	1179	12	Intergenic	novelGene_154045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	40.2019694431434	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	221	952	102969	93502	FALSE	10	GCACTCTCTGGCTCTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRALELLYLPEGQPCYLLDVGCGSGLSGDYLSDEGHYWVGIDISPAMLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKKFYLCLLSGPSSFLPKGLSDQKDGDEERESAFTKERVPHRAARRGMVRKSRDWVLEKKERRRRQGKEVRPDTQYTGRKRKPYF	105379	93274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93708_93799_97043_97103_97395_97442_97625_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102732_102816_102901_102998_105093_105236_105329
801294	contig_19744_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_120371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCATCAGCAGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132239	133154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_132200_133200
801295	contig_19744_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_120372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATTAAATTATAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133883	134836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_133900_134800
801299	contig_5253_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_61587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTTTGTTTAGCAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326722	327206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_326700_327200
801300	contig_5999_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_45629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAACTCTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164955	163596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_163600_165000
801302	contig_6674_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_148012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197644	195985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_196000_197600
801303	contig_14483_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_133782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229764	230615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_229800_230600
801305	contig_7057_pilon	+	2356	5	Intergenic	novelGene_123408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	12.2167917228706	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	185	1783	1335339	1350645	FALSE	40	AAATTTCCCTAATAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESVVFSDVSIAFSQEEWAHLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFVSKPDVISLLEQGKEPWKIVRKGRRRYPDLETRYETKKLFSENDIYEINLSQWKIMERMKNHGLTSLVLKNDWEYKSKFEGQEGPQEGYFSQVNITPEKVSSNQKHTSLTPRQRNHFVEKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMVFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYKCKECGEAFVCGPDLRVHQKIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTRHQKLNIADKLYECKECGEAFLCGSGLRVHHKIHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHSVKI	1328749	1351218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1328856_1335260_1335348_1336564_1336692_1337746_1337840_1349275
801307	contig_6589_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_26229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGAAGAAGGGAGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2053712	2052956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2053000_2053700
801308	contig_12923_pilon	-	1674	4	Intergenic	novelGene_30143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	336.12034881704	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	49	747	201671	199318	FALSE	35	ATAATAATGAGCTTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSPSIPLPLHCPCTMGPASGPSLLLLLLTSLPLALGDPMYSMITPNVLRLENEETVVLEAHDVQEDIRVTVSVHDFPGKKQVLFSEDTQLTAANSHLSALPIKIPANKDLRSDRKNKFVVVQAAFRDVVVENVVLVSLQSGYLFIQTDKTIYTPGTTVLYRIYSVNHELLPVGRTVVTTIEVSASRGSETWGPETLGEIKRWRQAEEETPVWNGAYGFCVILGRLLHLPEPQFPHLEDGTMTDNSI	201719	198390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_199587_199678_199842_200279_200473_201597
801309	contig_9415_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_109853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCGTAAAAAAAAGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982120	1982587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1982100_1982600
801310	contig_10016_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_117874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGGTATTTTACCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432100	431560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_431600_432100
801312	contig_10129_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_128170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAGAAAAAATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609439	611113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_609400_611100
801314	contig_8291_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_99939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAAAGCCCCAGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26163	26712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_26200_26700
801315	contig_14734_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_175374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCCCCTCCTAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44734	43757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14734_pilon_-_43800_44700
801316	contig_2940_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_81910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAGTATGCTAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501066	499933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_499900_501100
801318	SIRV6	+	339	5	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	136	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCTTGTAATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034
801319	contig_9098_pilon	-	1269	10	Intergenic	novelGene_75788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	436.154152157749	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	215	1015	288130	264388	FALSE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295237	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288145_292817_292905_294101_294178_295200
801322	contig_13952_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_133250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58899	60007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_58900_60000
801324	SIRV6	+	360	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	20	403	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
801326	contig_17075_pilon	-	370	6	Intergenic	novelGene_131758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2562.80973932908	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	72	368	91005	88048	FALSE	35	TAAATCATGTAATATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQTLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYKYAHWLSLIQVILISLEACQNRLVK	91175	88045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89025_89070_89127_90576_90723_90984_91038_91136
801327	contig_3975_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_54729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAACAGGAGCAGCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1611602	1612985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1611600_1613000
801328	contig_15153_pilon	+	496	3	Intergenic	novelGene_166452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGCTATCATCTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79178	107428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_+_79238_82895_83017_107112
801329	contig_5423_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_85158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAGTGCCTAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22652	19979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_20000_22700
801330	contig_7887_pilon	+	1458	9	Intergenic	novelGene_124891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	65.4769759152024	3	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	567	1151	296287	298611	FALSE	10	GTCCCTGTTTTATGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPQEFQKTVSTMYYLWMCSTLALLVNFLACLASFCVDTGNGSGFGLSILWILLFTPCSFVCWYRPMYKAFRSDSSFNFFIFFFIFFAQDVLFVLQAIGIPGWGFSGWIAALVVVKTNPGVAVLMLMVALLFTGIAVLGIVMLKRIHSLYRHTGASFQKAQQEFAAGVFSNPAVRTAAANAAAGAAENAFRAP	294034	298918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_294188_294521_294600_295190_295334_295417_295539_296215_296345_296825_296986_297103_297206_297746_297865_298464
801333	contig_9646_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_117447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGATTTGTTTTATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241820	242433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_241800_242400
801336	contig_10376_pilon	+	290	2	Intergenic	novelGene_175377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCGGCCAGGCCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6135	6531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10376_pilon_+_6324_6429
801337	contig_266_pilon	+	2197	1	Intergenic	novelGene_166302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665655	667852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_665700_667900
801338	contig_10064_pilon	+	1137	5	Intergenic	novelGene_122730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	126.547174998101	512	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	121	315	395972	403488	TRUE	30	AAGTATTCAGAGGGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQASFRGHMARKKIKRPGRRGRRPQRRLGQRN	395851	404721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403095_403150_403197_403479_403501_403911
801340	contig_11551_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_168461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345304	343450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_343400_345300
801341	SIRV6	+	294	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	554	211	375	100	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTAGGTATAGTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	11068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
801343	contig_16532_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_110054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	277	609	227774	228106	NA	25	ATGTCTCTGTAACTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFLNFLLLSFATLNNTWYKNAFVRLAQSVVSAGNLTDSWICHQILKTEHDNSDPLAFPVLNYSFIPSGMVNASIIARRTIPVMLWHPSNFPTYPSVHCSFLFLCLDKS	227497	229911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_227500_229900
801344	contig_20718_pilon	-	1594	1	Intergenic	novelGene_169152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	365	1098	5	1102	116501	115404	NA	35	CAAGGTAGTTGATAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNLGNSHPPTKGSTFQTRIPFNRPRGHNFSLKTSAVVLENAAGATKVIAQAQQAQVEAPQAGAWRNRLNLLEGSQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSVLPAMLQTNMGNPVTVVTTTTGSKQNCTTGEGDYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIRPILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYLQSRYYR	116505	114911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_-_114900_116500
801345	contig_9177_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_32784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGGAATGTACGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418191	1419230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1418200_1419200
801346	contig_4339_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_146091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTTTAACCTTCAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083061	1084673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1083100_1084700
801347	SIRV6	+	365	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	6	412	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
801348	contig_10904_pilon	-	1831	3	Intergenic	novelGene_22766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_2	1.5	61	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	409	507	680430	680332	FALSE	25	AAGGTGGTGCAGGCCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLPRPSISAEPGSVIPWGTSVTFVCQGPPEVEVFLLEKDGKPDSLPDVKNSSGIETEARFPISSVKTDTAGRYNCIYFIGNANSEPREFLELVVTGGPSDISPSPTEAGFQTAPTLQNYKVGNCVHLGLACVVLLMLLVILAEAWHSQCRSQRGPTGWRQDGTSQRD	685030	679007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_680499_680643_680695_684741
801350	contig_17198_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_62422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTCTGTATGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148578	1146037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1146000_1148600
801351	contig_299_pilon	+	133	2	Intergenic	novelGene_129415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAAGTGTTCCAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829975	841712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830004_841607
801352	contig_20600_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_137107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAAATAAATGACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73722	72695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_-_72700_73700
801354	contig_13542_pilon	+	1666	2	Intergenic	novelGene_131510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAATAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384401	386784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_385701_386417
801358	contig_6738_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_166141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGTAAACAAAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88936	90283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_88900_90300
801364	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
801365	contig_9995_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_47822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAATGCCTAACCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903391	902959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_903000_903400
801366	contig_12479_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_56887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATGCTGAACTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567953	569467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_568000_569500
801367	contig_5346_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_161853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGCAGAAACACGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135002	136250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_135000_136200
801369	SIRV2	-	380	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4485	42	3310	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1422	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
801370	contig_10311_pilon	-	1058	4	Intergenic	novelGene_50398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	876.375997439962	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	9	410	68351	65773	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	68359	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_68264
801371	contig_6375_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_73048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510012	507782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_507800_510000
801373	contig_16103_pilon	-	715	3	Intergenic	novelGene_118723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	542	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	289	594	208768	207292	FALSE	15	ATGAGGCTGCTGGTCTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	209244	207170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627_208784_208971
801374	contig_4892_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_162855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACATAGTACTGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43903	45732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4892_pilon_+_43900_45700
801376	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
801379	contig_9708_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_67252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTATCCTGGATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24884	25747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_24900_25700
801381	contig_12119_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_88630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAGGCAATATAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42799	40892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_40900_42800
801382	contig_5649_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_82395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTGGCTATGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167573	1165734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1165700_1167600
801384	contig_11267_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_175383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTTCATAATCGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136011	136243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_+_136000_136200
801385	contig_12148_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_140339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102726	101960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_102000_102700
801386	contig_12229_pilon	+	1863	3	Intergenic	novelGene_169387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	338	640	77867	85472	TRUE	10	TGGAATTTCTTTTTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTQSCSWAGGCEGRAGSGSLGPSGDTSMLEGTEATKWPQSCWMLKCTGTEGLQYEAALGSGVLQILPSQHRCCQRPRSRWHSNKWHPPSRSRACYRSV	77529	98764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_78069_85371_86126_98194
801387	contig_3602_pilon	-	796	7	Intergenic	novelGene_60647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	339.221003018517	154	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	82	561	1139393	1106267	FALSE	10	CATGAGTCTCTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGGSSKIEEACEIYARAANMFKMAKNWSAAGNAFCQAAQLHLQLQSKHDAATCFVDAGNAFKKADPQEAINCLMRAIEIYTDMGRFTIAAKHHISIAEIYETELVDIEKAIAHYEQSADYYKGEESNS	1139474	1106031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106271_1111892_1111949_1112148_1112227_1113549_1113597_1119159_1119277_1123651_1123732_1139295
801388	contig_4418_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_98363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	148	405	726778	726521	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGDYSAFSDGSWSCSHLEYPQCLTGFGWPLVLAVALELSLGSLPRCHFMWFELLTAWRLDSEGECSKSKTSKWRKEKTAHLLGSPVCHLHHICYGLNCVPPKNMYWNLNLYTVDVLPFGNRVFFVTLMRPYQC	726925	724890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_724900_726900
801392	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_16917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27881	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
801394	contig_4055_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_158178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	219	659	950009	950449	NA	25	AGCACAGCTCTTGGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNSKLLCFNKQHQGEKTTRRIGENTCESRINKGFDLDYTKTLPRQGRDGHVKMHLPVKECLGRPGARKDKKGSSPRAFGESVALRTPCIQAASLQNCKVLTSVLVCRNKESYNSIIKRKINQLKDGQMTRIDISPKSCKRPSST	949790	951411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_949800_951400
801395	contig_4055_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_158179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTATGATTAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952163	952483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_952200_952500
801396	contig_3817_pilon	+	558	4	Intergenic	novelGene_78394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGATCCCCGAGCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171246	1198480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1171340_1171996_1172201_1190913_1191082_1198387
801397	contig_4812_pilon	-	681	6	Intergenic	novelGene_103679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	6972.1678522537	2	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	173	589	81738	79235	FALSE	15	GATGTCATCTTGAGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82703	79142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82332_82594
801398	contig_6837_pilon	+	1975	14	Intergenic	novelGene_149833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.4017913318524	13	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	888	1868	88139	92466	FALSE	25	AATCTTAAGTGCAGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSGSQTGELILWQEAKAVATAQAPGRISALIWYSAHTFFVLSADEKVSEWQVELQRGSTSRNFSLHLNRILQEDIGVLIGLGLAPDGQSLILAKAELELLHMMPGNDPSVIWGCYMEDGLTVLSTHKEYGVFVLQSMAPKGLYLLRQKELGEFEEFLEFNLNLENPSGAVIWVTQAKPESESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKIHSGCVTALHVLPKLLVTASRDRDVKLWERPSMQLLGLFRCEGAVNCLEPCLGPNSTLQLAVGDAQGNVYFLSWE	84052	92573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_84240_85227_85484_85761_85876_87476_87532_87635_87713_87817_87951_88073_88211_88372_88498_89574_89719_89856_89957_91500_91607_91698_91905_92028_92134_92343
801399	contig_4486_pilon	+	1693	7	Intergenic	novelGene_38625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	18.006171781426	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	518	1144	721247	738483	FALSE	20	TGCCTGTCTACCATGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKDTPFLESMPGNGHGKPTHPSPYLAHFKVGSNDLTLVNLHLATLTLPGAENPSKNHTDGLRLASFAQTLQESLKGEKDVIILGDFGQGPDSSDYDILRKEKFYHLIPAHTFTNISTKNPQGSKSLDNIWISKSLKKLFTGHWAVVREGLTNPWIPDNWSWGGVASEHCPVLAEFYTERDWNKKEGPRNGSGVTLERNEANIKHER	657710	739032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_658023_672273_672326_714549_714661_721204_721340_725285_725425_736313_736509_738283
801401	SIRV4	-	359	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1164	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
801402	contig_14513_pilon	+	802	4	Intergenic	novelGene_70293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAGGGGAAAGTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11287	19063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_11548_12026_12158_13087_13139_18703
801403	contig_7571_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_106405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAACGGAAACGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297481	296754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_296800_297500
801406	contig_9609_pilon	-	1629	5	Intergenic	novelGene_23105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	39.7366329726111	230	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	267	836	507907	506367	FALSE	5	CTGCTGCTTTTGGACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDASASCSRGSSASRPGLSADCKFTCHYRCRALVSLDCCGPRDLGWEPALERDTNVDEPVEWETPDLSQAEVEQKIKEYNSQINSNLFMSLNKDGSYTGFIKVQLKLVRPVSVPSSKKPPSLQDARRSPVRGTAVRRRTSFYLPKDAVKHLHVLSRTQAREVIEALLRKFLVVDDPRKFALFERAERHGQVYLRKLSDDEQPLRLRLLAGPSEKALSFVLKENDSGEVNWDAFSMPELHNFLRILQREEEEHLRQILQKYSCCRQKIQEALHACPLG	513027	505573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_506514_507150_507267_507390_507689_507898_508004_512857
801408	contig_4065_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_133397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529514	531562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_529500_531600
801409	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801412	contig_5643_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_38890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	122	517	245640	246035	NA	10	TGCCTCTTGGGCTTCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLETASKPSLQRLLLAPQPRPTWVPSCQDKVPQEGGGQGLCPRPAVVMFLHLPNPPLGSGTGTCGLEGARTPPISTQGPEGTQASHLEHFDHILAVALLSHVAQFGCDINAAADVHVHLHGLLLDLCVQL	245518	247358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_245500_247400
801414	contig_10549_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_110584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGTACACCTGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108771	103836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_103941_108623
801420	contig_10629_pilon	+	2365	7	Intergenic	novelGene_52964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	15.9861050777091	51	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	301	1041	607541	670638	FALSE	15	CACTAAGGTTGTGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEEFYEASPYEPVTSRLSDIFRLASIFSGTGADPVVSAKSNHCLDAAKACNLNDNCKKLRSSYISICNREISPTERCNRRKCHKALRQFFDRVPSEYTYRMLFCSCQDQACAERRRQTILPSCSYEDKEKPNCLDLRSVCRTDHLCRSRLADFHANCRASYQTLTSCPADNYQACLGSYAGMIGFDMTPNYVDSNPTGIVVSPWCSCRGSGNMEEECEKFLRDFTENPCLRNAIQAFGNGTDVNLSPKNPSFQATQAPRVEKIPSLPDDLSDSTSLGTSVITTCTSVQEQGLKANNSKELSMCFTELTTNIIPGSNKVIKPNSGPSRARPTTALTALSLLMLKLAL	576108	671962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_576194_607325_607681_657095_657206_657977_658119_660251_660425_669519_669574_670515
801421	contig_3472_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_166950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGGCTCCAAAGCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977302	978428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_977300_978400
801422	contig_5434_pilon	-	2077	2	Intergenic	novelGene_74664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	0	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACCCAGCAAAACACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280144	277979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_279118_279205
801423	contig_7452_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_109155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTCCAATGTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161707	161236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_161200_161700
801424	contig_10674_pilon	+	1322	2	Intergenic	novelGene_6462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346980	348448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_347392_347537
801426	SIRV6	-	459	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-281	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2101	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1736_1847
801427	contig_6361_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_23890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAAAAAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115622	118089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_115600_118100
801430	contig_10196_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_132037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGACTTACCTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463548	462636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_462600_463500
801433	contig_7962_pilon	-	2027	14	Intergenic	novelGene_149316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.7375513756362	42	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	199	1380	450659	447626	TRUE	25	CCCAGACTCTGTATGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPPRLSRSGAPSLWDPASPAPTSGPRPRLWEGQDVLARWTDGLLYLGTIKKVDSAREVCLVQFEDDSQFLVLWKDISPAALPGEELLCCVCRSETVVPGNRLVSCEKCRHAYHQDCHVPRAPAPGEGEGPSPWVCRQCVFAIATKRGGALKKGPYARAMLGMKLSLPYGLKGLDWDAGHLSNRQQSYCYCGGPGEWNLKMLQCRSCLQWFHEACTQCLSKPLLYGDRFYEFECCVCRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGERSSKLLSALNSHKDRFISGREIKKRKCLFGLTSPGEAPEAGARAPEAEAEGESGGAGATLGSAQSPRAPGAEGAGSSAEGAAGLSVSTTPQP	451591	446437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_447040_447580_447658_447742_447902_448114_448159_448332_448401_448509_448634_448774_448844_449035_449132_449318_449468_449592_449697_450116_450213_450327_450410_450500_450676_451409
801434	contig_6710_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_98291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	GAGGCCTACTGAGGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
801436	contig_16716_pilon	+	1337	5	Intergenic	novelGene_169286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	8.57321409974112	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	253	897	177300	204432	FALSE	20	TTTAAACCTATGGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLAEIQAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIELPLPSESVDIIISDIPFGKKFKLEKDIKSILQEMERVLRVDGAIVLLLSEDHHRCLQDCEESGIPLNSKSSHIDEPGMKKCLNPEGENGISETASSSFQASNQEGLDRTSPFGSLVPVECYKVSLGKTDAFISKYRKSHSSGL	177047	204872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_177324_183761_183834_184294_184410_194792_194902_204107
801439	contig_5965_pilon	-	1784	5	Intergenic	novelGene_154659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	8.04285397107271	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1590	194	1783	176988	159628	FALSE	20	TTAGCATCGGTTCACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRGPGWTGETRFLRSAKRIFAIQEQHQEEKVKMTVELVKAMPQDLVTFKDVAIDFSQEEWEWLNPTQRSLYKSMMLENYQSLVSLGLCISKPYIISLLEQGKEPWKVKSEMTRGPFLDWESIYETQELSLKQAMYNEALLKRITNYGLECSTFREDWKCEDLLEGQIVSQETGIRREANTHEEILTKKIDYKYNKSGKCVHLNNIEEHVHNHKSDKKSFTKNSRIMKQHKGIYTAKKLFKCNECEKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYECKECGKAFNQSQHLAQHQRIHTGEKLFECKECRKAFSQNVHLIQHQRIHTGEKPYKCKECRKAFSQPAHLAQHQRIHTGEKPYECRECGKAFSDGSSFARHQKCHTSKRPYECIECGKAFRQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLIQHRRIHTGEKPYRCNVCGKTFSYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCGKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQSIHLASHLRIHTGEKPYECKECGKA	177181	159626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_160860_170262_170359_171754_171882_174885_174959_176926
801440	contig_5965_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_154658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAGATTGCTCATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159108	158750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_158800_159100
801441	contig_8589_pilon	-	2237	6	Intergenic	novelGene_107358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.8353200037226	1	112	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	21	515	16686	2831	TRUE	40	TGTAATAAAAATTGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAAGAMEPLYQQTHKQVHEIQSHMGRLETADKQSLHLENEIQARIDQIFSHLERLEILSSKEPPNKRQSAKLRVDQLKYDVQHLQTALRNFQHQRCAREEQERQREELLSRTFTPNGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKRAFQDKYFMIGGMLLTCVVMFLVVHYLT	16706	787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_1425_1745_2993_8839_8973_9819_9926_11589_11655_16657
801448	contig_13878_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_165740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTTTTCCCTCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301260	300919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_300900_301300
801450	contig_10626_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_138210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCTAAGCTGGTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294196	293759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_293800_294200
801451	contig_6710_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_94708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653853	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
801452	contig_709_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_57608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAAAAGCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383313	2381090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2381100_2383300
801453	contig_14415_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_77581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGACTGCCAGGCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8168	7763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_7800_8200
801454	contig_1264_pilon	+	1686	5	Intergenic	novelGene_161298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	43.0021801772887	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	105	749	120493	131789	FALSE	25	ATTGTCAACAGTGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCAPRGSGGRGQPPPCQKVSWKFAGRRRKATCRTMNVFRILGDVSHLLAMILLLGKIWRSKCCTGISGKSQILFALVFTTRYLDLFTNFISIYNTVMKVVFLLCAYVTVYMIYGKFRKTFDSENDTFRVEFLLVPVIGLSFLENYSFTPLEILWTFSIYLESVAILPQLFMISKTGEAETITTHYLFFLGLYRALYLANWIRRYQTENFYDQIAVVSGVVQTIFYCDFFYLYVTKVLKGKKLSLPVPI	120388	132726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_120584_126608_126710_129863_130023_130637_130891_131748
801456	contig_15304_pilon	-	463	2	Intergenic	novelGene_30553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	198	428	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53100_54044
801457	SIRV7	+	377	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78840_78963_114679
801460	contig_12638_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_33265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	405	722	827427	827744	NA	60	TTGAGGAAAAAAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLCYFSVIGCSCQCVEWAFMAGTPDTESQHRSLGLLLHNFARLPSRALSLLSVLPKMVMGLLDIMGTLVQFARGIDITKKVKTQAMGKDICNPWLQKISIHNV	827022	829473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_827000_829500
801461	contig_9199_pilon	+	1882	4	Intergenic	novelGene_65610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106.540550443899	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	71	394	42527	52102	FALSE	45	AGAAATACAGTCGTGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVSAALAADWAGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYIVWADRSMCVSWQEPSKVISSLAPKLRSTEGCSPSATQWSMALSRTGMTWSASGNMSILRTSCRLSQRR	42456	53590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51090_51172_51972
801463	contig_5316_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_61246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCCAAAGAATGATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470711	472416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_470700_472400
801464	contig_15039_pilon	+	1613	5	Intergenic	novelGene_110154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTGTTTGGTTGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196545	260916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_197618_198506_198615_200451_200611_208389_208526_260778
801465	contig_15105_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_151036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATATGAAAATTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832034	831641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_831600_832000
801466	contig_10324_pilon	+	761	2	Intergenic	novelGene_7779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	146	352	80140	80346	FALSE	25	TATTGTACAGACTCCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPNPLVWPGPNPFPVVEQLAQGPPEAFLYDFFNLDIPQTGPLRSAFLCMPLSGCGWGGDVRVRGEVSLVCEAAAGAVVRREDLVRLLGEGHLDRGLCGQTGAGGEEEKANGFLMET	79953	80755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_80064_80104
801468	contig_8978_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_49432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTTACCTGTCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523870	524221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_523900_524200
801469	contig_8978_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_49433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTGTAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524372	524668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_524400_524700
801470	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	AAATGAAAATGCCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
801471	contig_2125_pilon	+	2804	9	Intergenic	novelGene_147712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	9.7082439194738	24	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	22	1401	304180	342094	FALSE	55	ATAAAACCTTCTAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQADRNWMPENIRLVTSRSGWALPPSSHPYVNQWLQVDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWRMIMSDSKRKAKSFEGNNNYDTPELRTFPPLSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEVPTAGPTTPNGNPVDECDDDQANCHSGTGGTTVLTTEKPTVLDSTIQSEFPTYGFNCEFGWGSHKTFCHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHTGDGNFIYSQADENQKGKVARLVSPVVYSQNSAHCLTFWYHMSGSHVGTLRVKLRYQKPDEYDQLVWTAIGHQGDHWKEGRVLLHKSLKLYQVIFEGEIGKGNLGGIAVDDISINNHISQEDCAKPADLDKKHPENKIDEAGSTPGYTGAEEGDENISRKPGSVLKTLDPILITIIVMSALGVLLGAVCGVVLYCACWHNGMSERNLSALENYNFELVDGVKLKKDKLTTQSTYSEA	304158	343497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_304423_309409_309555_312802_312887_321081_321142_327059_327198_332305_332578_333289_333387_339269_339321_341804
801472	contig_11855_pilon	-	692	6	Intergenic	novelGene_67118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.40476055578028	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	9	692	2457165	2449100	FALSE	10	CAGGCGGCCCCGCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQQLQEFEIPTGREALQGNHSALLRVADYCEDNYVQTTDKRKALEETMAFTTQALASVAYQVGNLAGHTLRMLDLQAAALRQVEARVSTLGQMVNMHMEKVARREIGTLAAVQQLPPGQKIIAPDSLPPLTPYYRKPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRKSIKAPATPASATLGRPPRIPEPVHLPVMPDGHLSAASSASSLTSAGSAEGVGGVSTTKG	2457173	2449099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2449140_2449321_2449418_2449592_2449679_2450943_2451121_2452166_2452335_2457048
801475	contig_15114_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_121198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGATTTGCTCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771190	772688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_771200_772700
801476	contig_7720_pilon	-	1114	2	Intergenic	novelGene_155802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTCTGAGGGCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872309	859730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_860723_872187
801477	contig_2715_pilon	+	1473	2	Intergenic	novelGene_173173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGATACTACAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108444	111376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_109891_111349
801478	contig_7202_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_18498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27880	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
801479	contig_9696_pilon	+	1442	4	Intergenic	novelGene_68782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTGTGATATTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198290	211568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_198513_206410_206500_206591_206749_210594
801480	contig_3942_pilon	-	1268	10	Intergenic	novelGene_128867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17.4737898961082	23	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	263	934	1491123	1488049	TRUE	30	GTGCAGAACTCCAAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWLSGPHPPHSAPLFPSSPSAAREPTHTFWPRSGRVPCRWPARVATRTSWGCCWSGMWTSTSTIGTEEPPCCTPCEGTT	1492742	1486214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488753_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936_1491132_1491918_1492062_1492631
801481	SIRV4	-	215	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	390	12	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801483	contig_6241_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_156414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	62.2228856611456	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	327	815	195215	182199	FALSE	30	AATCCAACTCTGATATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPGSTVPVTSHLLLLRPQPRSPHYRRTRQPPLLSMEDMQAIYLRPSLLLLFRFPFMMSTRHTETGDKSEDKPQRYH	365107	181466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182424_194951_195247_219950_220075_293626_293710_365019
801484	contig_15570_pilon	-	2628	1	Intergenic	novelGene_137857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688538	685910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_685900_688500
801489	contig_9011_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_159269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCCAAAACGATTACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101325	103364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_101300_103400
801493	contig_13607_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_170197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTAGGGACGCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294176	291972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_292000_294200
801496	contig_8674_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_102897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTAATCACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141904	139696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_139700_141900
801497	contig_7234_pilon	-	1610	15	Intergenic	novelGene_145929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.543368931232	5	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	331	1023	481428	411996	FALSE	20	TTGTGTCTGATGCAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESVILP	587404	411408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420175_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_490914_491063_509998_510089_587318
801500	contig_2054_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_51679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTACAGTTGCATACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98300	97557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_97600_98300
801503	contig_8210_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_30205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGTAAACTACAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4287	3235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_3200_4300
801505	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1161	3	1161	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3997	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
801506	contig_723_pilon	+	1936	2	Intergenic	novelGene_169432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATTTTGTGACATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10789	12794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_723_pilon_+_11155_11223
801507	contig_4083_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_152343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAATGACAAAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415238	413255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_413300_415200
801508	contig_10311_pilon	+	1533	9	Intergenic	novelGene_50390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	43.4906599168143	241	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	232	1323	52491	64913	FALSE	40	CTTTTAAGTGAATATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFLKGASISTKPPLTKDRGVAATAGSSGENKKAKPVPWVEKYRPKCVDDVAFQEEVVAVLKKSLEGADLPNLLFYGPPGTGKTSTILAAARELFGPELFRLRVLELNASDERGIQVVREKVKNFAQLTVSGSRSDGKPCPPFKIVILDEADSMTSAAQAALRRTMEKESKTTRFCLICNYVSRIIEPLTSRCSKFRFKPLSDKSQQQRLLDIAEKENVNISNEGIGYLVKVSEGDLRKAITFLQSATRLTGGKEVTERVIMDIAGVIPAETIDGIFTVCQSGSFDKLEAVVKVKSVYCWEGVSKANTLMSAFVTQDLIDEGHAATQLVNQFHDVVIEKDLSDKQKSVITEKLAVSRHFHLL	50861	65123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_51081_52478_52622_56175_56255_59300_59381_61184_61305_62478_62623_62822_62944_63585_63712_64622
801510	contig_7171_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_101435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTTGGCAGTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590877	1591279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1590900_1591300
801511	SIRV4	-	184	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1339	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3819	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
801514	contig_11264_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_154206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAACTAGTTTCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326268	327717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_326300_327700
801519	contig_2027_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_39882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGACCCCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86106	84731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_84700_86100
801521	contig_5093_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_135105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTGGCTATTGAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650856	650036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_650000_650900
801522	contig_5093_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_135104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649800	649096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_649100_649800
801524	contig_6710_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_97610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTGGAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
801525	contig_10958_pilon	-	2022	8	Intergenic	novelGene_5351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.52656557650139	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACTCTCAATGATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770857	764765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_764969_766459_766559_766694_766872_767187_767285_767837_767881_768066_768121_768756_769749_770500
801527	contig_18533_pilon	-	754	4	Intergenic	novelGene_174048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.4406682011537	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAAAGCTCATAGGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156466	122270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_-_122364_147152_147418_154147_154256_156178
801529	contig_16124_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_175389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201296	203529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_+_201300_203500
801530	contig_13945_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_173460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCTAAAAATATGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122933	123419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_122900_123400
801531	SIRV6	+	395	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	368	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2856_10707_10819_11031_11109_11205
801538	contig_10575_pilon	-	2141	2	Intergenic	novelGene_141816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCCCACAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323568	320655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_322556_323327
801539	contig_5538_pilon	+	1628	11	Intergenic	novelGene_23704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	345.872751167246	1	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1614	13	1626	103250	258981	FALSE	35	GAGAAAGATGTTCCGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENRMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSFKKEEVPVRAGEYLGQLLEQASLHFFVTARVNETKDILAKQKSIVLTIPRIIIKVPGAKVVGSDMVVIVEFTNPLTETLQNVWIYLDGPGLMRP	103237	258983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206394_207987_208077_216811_216966_224811_225100_232486_232648_258861
801540	SIRV4	-	434	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1089	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
801541	contig_20719_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_140561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCCTCTATCATATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12886	8467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_8704_12528
801542	contig_20951_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_43107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128007	129633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_128000_129600
801543	contig_1836_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_71046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTGAAAGATTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735593	733257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_733300_735600
801544	contig_1836_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_71045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733257	733009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_733000_733300
801546	contig_6607_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_164215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTAGCTTTCACAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284383	285582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_+_284400_285600
801547	contig_6607_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_164216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGCTGTGTAATGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286235	286829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_+_286200_286800
801548	contig_9653_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_48207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACTAAACAGGCAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190725	192756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_190700_192800
801552	contig_1009_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_121788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGACAATCAGCCGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391229	389075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_389100_391200
801555	contig_5389_pilon	+	1975	5	Intergenic	novelGene_143005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	18.3507493035026	342	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	260	868	255025	261970	FALSE	5	TGGCTTTGCTTTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDRPLLAVQEALQKCFPVVEEQQGLWRSTLSDCQPLLASLSNLAEQLQAAQNVRFEDVRSLRAFPDLKERLRRKQLSAGDIVLDKLGERLASLLKVRDTVSSHVEQVFQVYEQHANTVDIDAVLQPSVVSPSLADMLEWLQDIERHYRNSYLKRKYLLSSIHWGDLANIQALPKAWDQISEDEQDLVQDILLNVSFFLEA	254581	263077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_254838_255021_255300_259067_259248_261640_261757_261932
801556	contig_753_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_112946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTATGAGAAATTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768391	770336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_768400_770300
801558	contig_4083_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_152346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATTAAAATGATGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435509	433758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_433800_435500
801559	contig_1939_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_144866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287509	287776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_287500_287800
801560	contig_4180_pilon	+	882	2	Intergenic	novelGene_8293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	0	293	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	319	348	735156	735185	FALSE	75	AAAAAAAGAAAAATGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKVESPVPAAAAAAAAVLAAAVAVGEKAKAGKPQSEIHHPAGWSARPSFLLPRPPTPSPTGAIRRHPPSLPPYPQVRGVSSGSRDPEEPSRLTICSATWQELEEGMIFSGVFLR	733025	735719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140
801561	contig_1694_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_144930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494995	496747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_495000_496700
801562	contig_5628_pilon	-	1765	5	Intergenic	novelGene_157587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	57.3993684634248	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	288	677	434334	430086	TRUE	20	GGGCCACGCCCATACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEGVNKKELASVSNLETGFENSTPGAVPRAHMLEDKSHQPGYRPPQTPEPWENYSLGESLGSEPRTVSRRYLSSLKNKLSSGAWRKSYQPETGPGSGTQEPKERIVQELLETEQAYVARLHLLDQASG	434830	427791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_428023_429228_430176_431498_431731_434266_434492_434700
801565	contig_11281_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_125471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACAACCCCCAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860100	859597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_859600_860100
801566	contig_12533_pilon	-	1767	17	Intergenic	novelGene_175394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	33.9143567497601	94	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	360	1628	100031	73376	FALSE	5	CTGGTGATGTCTTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVPSCGAKEFWNTCPCRADASHEARRAERPRNQEAEDKETKNIGSRAVFISKDPKPKKRNGVKCFLALVTVYLILLTTGGGLLVVQVLNLQERIRALEIYLFNDTLAADDSSFFSLRQEMHHPHLARGAWDGEKLQNLQAQLMQVHASQQHLRWQVDNFTQSPELFGSKGEPGSPGLPGQKGAPGMPGTPGLPGPPAEKGARGPMGPSGATGPPGPQGPPGIKGEAGLQGPKGEPGKPGATGTPGPQGQKGSKGDGGLIGPKGESGAKGDRGEMGLPGSKGDVGVKGDMGVTGRPGAPGSKGDSGKPGPPGVTGLPGIKGNQGQPGVQGLPGHPGPAGSPGPKGDPGRAGSAGPTGPPGTPGSPGAAGVKGSKGDTGLQGQKGTKGELGVPGLAGVKGERGSPGPAGPKGASGPAGQKGDPGMKGSPGQKGVKGEQGQKGESPIPVRIIGSPSRGRAEVYHNNVWGTICDDGWDNSDATVFCRMLGYSSGRAIFGVLAGTGQIWLDEVACRGSEESLWQCNKNAWGSHNCAHAEDAGVECS	124476	73236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12533_pilon_-_73507_74623_74801_76418_76464_77237_77337_78478_78524_88140_88204_88285_88385_88872_88909_89011_89111_91957_92066_92391_92437_96002_96048_96127_96236_98551_98588_99898_100130_100968_101071_124317
801567	contig_7202_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_18062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
801568	contig_10324_pilon	+	874	5	Intergenic	novelGene_7846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_4	40.106109260311	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	322	780	295985	296443	FALSE	15	TTGAGGTGTTTCCAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLAPLRPPASLRPGRGPPPHHLLLNPLNSALSGPPSEHWGPLCLCILHSALSFKLAGSALPPATSGGSGCCFLRELSRQDEGPLALGASSWRSRNGRGTGISLQPGQKAGSPSLDSQLLRTTKEGDGDTFWPPNWATRGLQSPQAPLSST	287094	296537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
801570	contig_20055_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_175065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAGCAAATCTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125612	123924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_123900_125600
801572	contig_4857_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_48891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430575	1432929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1430600_1432900
801574	contig_10106_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_73845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTTTTTTTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12855	12000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_12000_12900
801576	contig_6098_pilon	+	1437	2	Intergenic	novelGene_145474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	473	1249	247239	248114	FALSE	20	ATTGTTGCACTTACTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLVEPWTKSEETILYTPQKQTNKFPRTPEDSAKKKQLIRGRKSGELVVKILELHEECTMQVAVCEQLEDLQANSPSPGVAPGPGDCLKIFFTKETASNLKGCPQDIVHIYPPWQTLTIPDESCPVVLNTYFCRKSIAKEDSETMAVVHCRDSPLPRRSITLAQMFRLKGLTPEIQVTCGGMTTMGTDLTPEQKEAKQHFLAHTSSSGSLLDVVGSQGATVGSGVWVQVVVQRVYLFPGRDGASCVPCTHTDPPCAR	246766	248302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_247363_247461
801578	contig_9696_pilon	-	1060	7	Intergenic	novelGene_68827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	52.773099207835	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	2	778	577517	534233	FALSE	0	TTGTTTTTCCCTGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAFFRADVCSKMEFCSGRRAVLQLLRAVAPADRPALLQWMRTTRDFDEFIQDNNDVMLKSIAEDLRNCLPLEAMLSSEHLALQKIQQQPEPTVHFDAFLYDEDFIDSLCEEGRMSRNYCMVCGSHQTAPLGFISHSFSLTELKFIYHHVLPDLSGKVLVDVGSRLGAVLYGGYLYSSALQLYGVEMNEDFCQLQEMVIKKYQFTDRVKVLHADICTQGSLLQNADVVIMNNVFEYFLNEAEQTSLIYSYPFGLKRYL	577518	533950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_534276_544243_544351_547757_547869_549992_550115_552616_552756_564332_564455_577384
801580	SIRV4	-	243	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	3	-368	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
801581	contig_7020_pilon	-	953	3	Intergenic	novelGene_57058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2317	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCGTATCGACGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81800	79473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_80226_81322_81446_81722
801586	contig_12638_pilon	+	1388	12	Intergenic	novelGene_33169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	181.136951065547	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	143	1291	269238	274362	FALSE	20	AGACCACTGCTTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWRCPTSRPKVGPHSSHFHPRLRALHNSPRPRFPWRMGCGQSSILYPQRPFEPWPNPVHTPQC	235651	274459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271251_274177
801595	contig_12970_pilon	+	2548	10	Intergenic	novelGene_50541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_8	7.08676387515643	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	142	2166	422602	474056	FALSE	20	TCATGCCCTTTAAAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLWKIERNKITVSDSVRVLTGRLDGFKPEAFNINTKSDVPETIPYRVMHDKSTYVEESELTSADESENLNILCKIFGSFSSEALKDLYERCNKDIIWATSLLLDSETKLCEDTEFNNFHTSNDGSQTGPFSLGLDLKEIISPRETLKGSNSVSEFRHGIDISNANAKHACDGEKGNSEQAEIRALTPTAAVDLKNASEPLSNSQGEFSGTTTKDVSEMEKSPVATEDGDSMHSSLNWSDILNSVSSTSNLKLHEEVYFTDPFEVKKNENLSKDSVEFQIHEEFMDEDMQEMEKILMAGNSWSPGVSEEDKTEMLNPTPVMAKSLTIDCLELALPPELAFQLSELFGPVGIDSGSLRAEDCVVHIDLNLAKVIHEKWKESVMERQRQEEISCGRLLGDPSLFGHIDNPEQKSSQRTGKKLLKTLAASEMLPLLDHWNTQNKKVSLREIMSEEIAIQEKENLKRESPMFEKGFATKLKGKQLFEIFPAINQNFLMDIFQDHNYCLEQTVQFLNSVLEGDPVKTVVAQEFVHQNENVTSQTAQKSKEKKAKRSKETEDIPSEPSTQDFEYPVYDDYRAEAFLHQQKRMECYTKAKEAYQMGRKNVATFYAQQGSLHERKMKEANHLAAVEIFEKVNASLLPQNVLDLHGLRVDEAIAHLMTVLQQKTEEFRQNGGKPYLSVITGRGNHSQGGIARIKPAVIKYLTNHSFRFSEIKPGCLKVMLK	422460	474438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_423518_424198_424285_424802_424849_426708_426900_430189_430309_437364_437504_453996_454186_455096_455266_472206_472331_474010
801596	contig_10734_pilon	+	1515	3	Intergenic	novelGene_51110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_2	4.5	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	509	1108	711421	714200	FALSE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIPGWFRSILPKAALRVVEESWNAYPYTRTRFTCPFVEKFSIDIETFYKADAGENPAVFSLSPAEKSQLTIDFIDIVKDSIPPSEYKTEEDPKLFHSTKTQRGPLSDNWIEEYKKHVFPIMCAYKLCKVEFRYWGMQSKIERFIHDTGEPPACQPVCLARGSACLSLPLRCCLFILFPKGNPEYTPSFRLWRVQTVSV	710912	714607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_711516_712728_712851_713817
801598	contig_7919_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_28092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	141	467	1137356	1137030	NA	30	AACAGTATTTTCTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWTQMRSTIHWTLESGLRTNNQDSSVSGKNYLRQSILASTLKNKTQTCKTFKSLMKQWFFVFFLQICAHGYYSGYCPLSRIPKFEKCSNSILKKTFSSPTSVFMNTV	1137496	1135876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1135900_1137500
801599	contig_11816_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_98460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAATAAAGACATATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407079	405908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_405900_407100
801600	contig_5549_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_81660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTAGGGACTGTGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460113	460884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_460100_460900
801601	contig_15777_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_75759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCCACGTCTCAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272784	272451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_272500_272800
801602	contig_8710_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_73519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1956	2276	377815	377495	NA	15	TTTTTAGAAGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVPSPPVVKSKNVSRHCQMSPKGQNHPQGTLTMRTIKKHCSRSNYQFTKNHGTNMLNTPKSSTSKNADWGKRQDKYLAAVCKEKNFLKTWKGNVDLNRRRRRSN	379770	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_377400_379800
801603	contig_3787_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_102452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTAAAATATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753953	752540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_752867_752916
801605	contig_9839_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_88549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTTTCACTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184184	183260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_183300_184200
801606	contig_9839_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_88548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACCGATCTTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183062	182108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_182100_183100
801609	contig_20868_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_175396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATTTAAAGGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78196	77367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20868_pilon_-_77400_78200
801610	contig_4782_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_73685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGAATTTTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685393	684119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_684100_685400
801613	contig_8587_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_159107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCACACTGTGAACAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120059	119449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_119400_120100
801615	contig_18108_pilon	+	1798	13	Intergenic	novelGene_33513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTGTAAGAAAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266700	287584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_267082_267669_267734_269584_269653_269897_270015_271249_271426_272037_272202_273835_273909_276258_276376_277889_278090_278279_278363_282726_282850_284890_284974_287435
801618	contig_6838_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_171791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTATTAACAAATGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43767	45461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_+_43800_45500
801619	contig_11678_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_160832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAATTGTCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142470	142036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_142000_142500
801620	contig_9186_pilon	+	1825	7	Intergenic	novelGene_85350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	86.0982965375429	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	74	808	440908	453431	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNRERFCNREREFVYKFKVGSQYLELKVPLKFPVQEDASHLHGRLMLLHNLPCFIENDLKEGLSQFIEEESLRDYDRDAEASLEAVKSGEVDLHQLASTWAKAYAETTLEHARPEEPSWDEDFADVYHDLIHSPASETLLNLEHNYFVSISELIGERDVELKKLRERQGIEMEKVMQELGKSLTDQDVNSLAAQHFESQQDLENKWTNELKQSTAIQKQEYQEWVIKLHEDLKNPNNSSLRY	437178	478713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_437227_440882_441086_442499_442646_448627_448810_452725_452826_453302_454057_478321
801623	contig_2312_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_160748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCTGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263060	261325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_261300_263100
801625	contig_348_pilon	+	1357	6	Intergenic	novelGene_67610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	12.8530152104477	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	211	942	320570	345268	FALSE	45	ACTTCAGTATAAAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRPRTEEGAFPRPQALGRGRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEKPEVNLCCPLRPPRQAMGCWSLSGVPCPPRDARFLSGAFQVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314501	345683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342659_342990_345214
801629	contig_8377_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_34948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATTTAAAGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68096	68750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_68800
801630	scaffold_13505_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_111586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCCTCTTCATATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631641	632691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_631600_632700
801633	contig_14546_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_157412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCACTGAAAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49914	48426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_48400_49900
801635	SIRV6	-	419	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-142	396	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTCGCCCCCATCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1962	1148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1735_1844
801639	contig_14814_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_137697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116149	117726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_116100_117700
801642	contig_3382_pilon	-	1152	6	Intergenic	novelGene_124057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	832	junction_3	118.879098246916	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	110	652	344734	234087	FALSE	80	TTAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQR	344843	233586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
801648	contig_1275_pilon	+	871	2	Intergenic	novelGene_108858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	44	733	747279	747968	FALSE	20	GGTAGCATAATTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746593	748106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
801651	contig_17376_pilon	-	181	1	Intergenic	novelGene_175401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAGAATGAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11350	11169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17376_pilon_-_11200_11400
801653	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
801655	contig_16920_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_138446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2855	2189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_2200_2900
801660	SIRV3	+	716	5	FSM	SIRV3A	SIRV307	779	5	9	54	9	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTAAGCATGCAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1972	8885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4775_6057_6334_8755
801664	contig_12625_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_140491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATCCAAGGTTGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59374	60399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_59400_60400
801665	contig_7179_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_78101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCAGTATATCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638025	636508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_636500_638000
801667	contig_7707_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_72110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	200.807553317568	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	262	891	39062	59234	FALSE	50	GAGATCAATTTAAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRAEAVLQHIAELNPYVHVTSSSLPLNETTDLSFLDEYQCVVLTEIRLPLQKKINDFCRSQCPPIKFISADVHGIWSRLFCDFGDEFEVLDTTGEEPKEIFISSITQANPGIVTCLENHPHKLETGQFVTFREINGMTGLNGSTQQITVVSPFSFSIRDTTELEPYLHGGIAVQVKTPKIFYFVSIFFSAIKKYFFTGEEWQKRKIN	7331	59539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_7446_14660_14724_38977_39073_39609_39722_42243_42325_53086_53210_54824_54949_59055
801668	contig_3161_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_84513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCATCTGTCAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372150	371780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_371800_372200
801669	contig_5586_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_143502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGTGGCTGTGCATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201753	201091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_201100_201800
801670	contig_7622_pilon	+	2168	3	Intergenic	novelGene_132418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAAGTAGTTCACAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268877	276130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_269295_270025_270119_274472
801671	SIRV5	+	391	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	950	-1	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGTACGGCCAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006	2397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2000_2400
801672	contig_5136_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_126625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGGATGAAATGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252675	250464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_250500_252700
801673	contig_12864_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_76358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAATAAGAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131311	129873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_129900_131300
801674	contig_6110_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_163284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCACCCTACTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664134	665971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_664100_666000
801675	contig_16310_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_70089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGAGTTGTTCTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285893	290614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_290024
801676	contig_8452_pilon	-	637	4	Intergenic	novelGene_48087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1552	junction_3	670.11557875406	48	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	111	332	968728	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	981653	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637
801677	SIRV6	+	341	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	547	171	368	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
801678	contig_7057_pilon	+	539	4	Intergenic	novelGene_123273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	397	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAGGTGACGCTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705643	707611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_705874_706663_706712_706884_707082_707547
801682	contig_15741_pilon	-	832	2	Intergenic	novelGene_159669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGGTATTTAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50530	49604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288
801683	contig_6215_pilon	+	2341	13	Intergenic	novelGene_21176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_11	17.1129824012843	1	97	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	154	1590	190311	210628	FALSE	20	GTACTAGTGTTCATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAFLSKLWTLVEEAHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIIKQERDGPVEFQHPYFKQGQDDLLENIKRKVSSTKPEENKIRQEDLTKIMSSAQKVQIKQETIESRLSELKSENESLWKEVSELRAKHAQQQQVIRKIVQFIVTLVQNNQLVSLKRKRPLLLNTNGAQKKNLFQHIVKEPADNHHHKVPHSRTEGLKQRERISDDIIIYDVTDDNADEENIPVIPETNEDVISDPSNCSQYPDIVIVEDDNEDEYVPVIQSGDQSEPARESLSSSTDGTSPLMSSAVQLNGSSSLTTEDPVTMMDSILNDNINLLGKVELLDYLDSIDCSLEDFQAMLSGRQFSIDPDLLVDLFTSSVQMNPTDYINNTKSENKGLETTKNNVVQPVSEEGKKSKPKPDKQLIQYTAFPLLAFLDGNPTSAVEQGCTTSSEVMSSVDKPIEVDELLDSSLDPEPTQSKLVRLEPLTEAEASEATLFYLCELAPAPLDSDMPLLDS	161696	211379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_161772_190232_190342_190495_190624_191275_191401_196036_196113_198910_198973_199892_199981_201233_201383_201781_202022_202665_202772_206988_207043_209829_209915_210335
801685	contig_20951_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_43114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCTGGATGCACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178707	178018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_178000_178700
801686	contig_2455_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_119193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170427	172262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_170400_172300
801687	contig_15185_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_99374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAGAAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38562	36437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_36400_38600
801689	contig_13699_pilon	-	1393	2	Intergenic	novelGene_158342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	279	704	158855	158430	FALSE	10	GCTGGTGTTGGCCGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGILEGLFSPLLELPWPPAVLLSEVSEQADCVSKRSKSEASLPRRLLARLPARLPARLPGRLADFLGSEIQVQSSRLNRDRMGWKTRGQGSDPINLIPCVTLDCGFLIHTVVALCLFDSTGALFWLYGSEFLLRSLTPKD	159955	157740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_158893_159714
801691	SIRV6	+	452	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	7	-31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	259	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
801692	contig_1450_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_27451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCGAAAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949108	949948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_949100_949900
801693	SIRV4	-	264	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	350	3	-350	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGCAGTTTGTGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801695	contig_5586_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_143549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGGAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349938	351865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_349900_351900
801696	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
801699	contig_2537_pilon	+	1213	12	Intergenic	novelGene_33407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	255.053583739795	1	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	97	579	205895	233337	TRUE	25	TAAAGTGTTTCTACTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSAGGPGRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSYFI	205798	235589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232348_233323_233397_233558_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480
801702	contig_7359_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_139857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58567	57167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_57200_58600
801705	contig_6557_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_32998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAAATGTTGGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494074	493768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_493800_494100
801706	contig_2799_pilon	-	1678	2	Intergenic	novelGene_85567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	142	558	734489	734073	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGLVFGFARRTNKFVLEEVQPECSLEARMARFRLTYFGHVIRRDRSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSTIRNDTVAATVGSSIRTTVRMPQDQTAFHSVVPRVVTSQNRLESTQQHSTKKKISLGLQKYSPYLSHLNS	735350	732952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_734516_735235
801711	contig_10467_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_175411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123583	122643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_122600_123600
801712	contig_9335_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_147429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGTAATCTTTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90123	89748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_89700_90100
801714	contig_7775_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_37460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCAATGTCTGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66783	67186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_66800_67200
801715	contig_6217_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_109561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTTTGTTTTGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13815	11614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_11600_13800
801716	contig_18420_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_109379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGAAGAATATGAGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135404	135135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_135100_135400
801718	contig_2209_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_141018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACCTATGAAGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184710	185216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_184700_185200
801719	contig_8712_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_58865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAAGATTAGTGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831092	830782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_830800_831100
801720	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
801722	contig_5083_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_151629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTGGTAAACAAATAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107206	108307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_107200_108300
801723	SIRV4	-	411	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	203	3	-203	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGTCAACAACTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801726	contig_3942_pilon	+	464	5	Intergenic	novelGene_128751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4886.18716383235	110	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	42	365	793521	795407	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792273	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795129_795326
801729	contig_9098_pilon	+	1521	8	Intergenic	novelGene_75813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	66.2752454787254	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	882	1376	324266	331644	FALSE	30	AGTTTTATTGGAACACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVSIVLCLTS	302667	331789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_303081_309869_310018_311367_311510_322434_322576_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488
801730	contig_16907_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_87429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATCATCCTGTATACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351180	350318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_350300_351200
801731	contig_6975_pilon	+	1975	13	Intergenic	novelGene_74283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	104.955910055392	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	426	1700	403362	465453	TRUE	45	TCCAACAATTTCACAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKKVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCGCNDLGQLGHEKSRKKPEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLGLLGSEECIRVPRNIKSLADIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGLDCKKQASPKLIKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDENDRYVPNLLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGSIVTQIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWLPYNGQCPPDIDYEDYFCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPDPSKQIWTVNEALVQKWLSYPSGRVPVEIVR	401139	466359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_401486_403282_403588_427502_427663_437079_437157_440405_440628_441781_441874_448648_448780_457464_457626_464105_464183_464466_464588_465445_465506_465619_465732_466248
801734	contig_9354_pilon	-	1803	8	Intergenic	novelGene_108059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.3679602147843	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	287	631	224023	214257	TRUE	25	TTTTTCTGTCTAACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVIISILSNTVKEKEQIQYHLNYLKKRLLQLCETLKVPPKKLRHLTNVSSLLKMEMAQHRANEEGLALLQEEVDKIVETTESMTENIQSLKNKIQILTTEMEKEEEKVTNGS	226108	212323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_213438_214198_214271_214419_214535_219693_219824_223361_223431_224006_224134_225187_225237_225981
801738	contig_7707_pilon	+	1207	9	Intergenic	novelGene_72111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	190.101247694485	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	259	936	39062	60963	FALSE	35	TCCCTCCTCCCAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRAEAVLQHIAELNPYVHVTSSSLPLNETTDLSFLDEYQCVVLTEIRLPLQKKINDFCRSQCPPIKFISADVHGIWSRLFCDFGDEFEVLDTTGEEPKEIFISSITQANPGIVTCLENHPHKLETGQFVTFREINGMTGLNGSTQQITVVSPFSFSIRDTTELEPYLHGGIAVQVKTPKIFYFESLEKQIKHAKCLIADFSKPEVNKHFAGLREAAEWGSGDW	7334	61234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_7446_14660_14724_38977_39073_39609_39722_42243_42325_53086_53210_54824_54949_59055_59160_60840
801739	contig_11512_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_43313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATCGCAAATTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388479	387034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_387000_388500
801741	contig_7131_pilon	+	785	6	Intergenic	novelGene_175334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	7.78203058333749	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	16	438	126497	128690	FALSE	40	AAAAAAGAATCCTGGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALLEMDSRIPYDDYPVVFLPAYENPPAWIPPHERVYHPDYNNELTQFLPRVITLKKPPGAQLGFNIRGGKASQLGIFISKVIPDSDAHRAGLQEGDQVLAVNKVDFQDIEHSKAVEILKTAREISMRVRFFPYNYHRQKERTVH	126481	129037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_+_126584_127211_127296_127567_127625_128104_128204_128436_128498_128655
801742	contig_9578_pilon	+	1824	4	Intergenic	novelGene_68005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_1	89.5817441719511	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	386	997	1319409	1320020	FALSE	25	GGGCAATGTTTATCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDEPSSKRRKHQGTIERHWEYLYNHNKENTKILGDKNVNPKCEDSENKFDFSVISYNILSQDLLEDNSHLYRHCRRPLLHWSFRFPNILREIKHFDADVLCLQEVQEDHYGTEIRPSLESLGYHCEYKMRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKVSTPPSLSGGGPGCLVHRNVVWLFRNFSWSSSLGSPSYNGFPQLVVSNYIHLVAFHLAHLSVATFCLEE	1311782	1320847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1311821_1317336_1317594_1318288_1318359_1319388
801743	contig_6418_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_81262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATACAAGTTGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536185	1535331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1535300_1536200
801744	contig_9099_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_149888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTCACAGCAACCCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233868	231741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_231700_233900
801748	contig_5935_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_102770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAGATAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404608	1403537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1403500_1404600
801749	contig_13015_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_165569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCCACATTTTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423663	421054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_421100_423700
801750	contig_5423_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_85200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATAAAATACATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271975	270546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_270500_272000
801751	SIRV6	+	289	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	235	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCCCAGCGGTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
801754	contig_11326_pilon	-	1160	7	Intergenic	novelGene_173909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCACAAATGCAAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43633	8921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_-_9068_17438_17586_28619_28738_31990_32075_36436_36576_37217_37395_43284
801757	contig_10765_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_122974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTACTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414161	414814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_414200_414800
801758	contig_19564_pilon	-	1098	7	Intergenic	novelGene_29679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	28.3196045170126	923	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	22	798	91577	84392	FALSE	0	CTGTTTTTGTCTTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVVSTLLRRLPSLSLFRSAYGVQVSLQALCTKASPEEDSLPPAPISPYEDEPWKYLDSEEYQNRYGSRPVWADYRRNHKGGVPSQRTRKTCIRGNKVAGNPCPICRDHKLHVDFRNVKLLEQFVCAHTGIIFHAPYTGICMKQHKKLTQAIQKARDHGLLSYHIPQVEPRDLDFSTSHGAVSSTPPAPTLISGDPWYPWYSWKQPPERELSRLRRLYQGHLQEESGPPPEKMPKAPPTAPSEAASTDQAGPQSAV	91598	84091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_84688_85117_85178_87022_87090_89834_89904_90026_90125_90225_90335_91499
801761	contig_366_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_51610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAACCCTGTTGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064177	1063750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1063800_1064200
801767	contig_15866_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_63644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501897	502900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_501900_502900
801768	contig_5602_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_133038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613071	611104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_611100_613100
801769	contig_9527_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_134054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGATTTTGAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433634	431136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_431100_433600
801770	contig_5917_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_122143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	297	1575	1871	209730	209434	NA	15	CAGGCCTTTCTTCTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTQLLTFTTETHLSSSLTHFSPIIYPVPQAKNLQVILDSSLFLIFHINPLGRFVGATPQTKIKPAAVKLIPTHGDPMCCRVELCSTRFSRLWLSETDH	211304	209433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_209400_211300
801771	contig_14450_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_49049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGGGAGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354272	1354774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1354300_1354800
801772	contig_10042_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_79181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGGGCAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801390	803572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_801400_803600
801773	contig_13004_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_112587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGATACAACAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34376	32804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_32800_34400
801774	contig_13707_pilon	+	990	4	Intergenic	novelGene_43576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGCATGAGGATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272483	274197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_272980_273329_273441_273706_274038_274145
801775	contig_1146_pilon	+	582	5	Intergenic	novelGene_84858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2292.89396832911	186	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACTCTGCTGCTTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949780	957168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951182_951595_951732_956017_956104_957038
801776	contig_990_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_76086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTCAGTGATGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126096	1127759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1126100_1127800
801777	SIRV1	+	244	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6800
801778	contig_11525_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_171092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACACCCACTTGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214143	216475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_214100_216500
801779	contig_10904_pilon	-	825	4	Intergenic	novelGene_22634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	297.234288436281	18	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTTGCACAAGACTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515837	499146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499672_514834_514925_515034_515114_515706
801780	contig_8045_pilon	+	1047	8	Intergenic	novelGene_35465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_7	827.564018116806	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	546	1046	543653	614394	FALSE	50	GTAAAAACATAAAACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEKIAAIKAKIMAKKRSTIKTDLDDDITALKQRSFVDAEVDVTRDIVSRERVWRTRTTILQSTGKNFSKNIFAILQSVKAREEGRAPEQRPAPNAAPVDPTLRTKQPIPAAYNRYDQERFKGKEETEGFKIDTMGTYHGMTLKSVTEGASARKTQTPAAQPVPRP	520979	614395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_521367_521448_521502_523819_523909_543636_543854_549183_549283_555484_555564_557308_557374_614337
801781	contig_7593_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_127345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624465	623140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_623100_624500
801784	contig_7066_pilon	-	2450	7	Intergenic	novelGene_42124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_4	100.228766108117	70	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	219	2087	638067	613660	TRUE	20	GTCACCCTCCTACTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKRLKAKKEDDVACTQRLSWGSSCRGYSSYSSRSSGPGVGGAPYEGCLIRSTEGFLSSVGSPLRSGSPSLEEMASLEEEACSLKVDSKDSSRTLKNSEFAAEAEGQNDRTEETNKVQKRRRERLRDQGSTMIYLKAIQGILGKSMPKRKGEAATRAKPSTGEHPTRGRGPSRSVMVSAPQKEKEPAPEVRAEEDMTVVERSSFCDRRVVVDPQEKPSKEPLGDRRTVVDKSSPPLEFLDEYDSHSETQKQKEREVVLEHLSSGSDWSDVDEISTVRFSQEEPVSLHLSGVPEPSTFTTDYVMYPPHLYSSPWCDYASYWTSSPKPSSYPSMGSSSNDTSQAGRSSRSLLSDYSPNSTVSSQNTSRDLEVTEEGRSRNSRSFHFSRSLEDEEMKEKRTFQEETPPRPCGEYTSSSLPRSHWEPSLEEGFIDTHCHLDMLYSKLSFKGTFTKFRKIYSSSFPKEFQGCISDFCDPRTLTDCLWEELLKEDLVWGAFGCHPHFARYYSESQERNLLQALRHPKAVAFGEMGLDYSYKCTTPVPEQHKVFERQLQLAVSLKKPLVIHCREADEDLLDIMKKFVPSDYKIHRHCFTGSYPVIEPLLKYFPNMSVGFTAVLTYSSAWEAREALRQIPLERIIVETDAPYFLPRQVPKSLCQYAHPGLALHTVREIARVKDQPLSHTLATLRENTSRLYNL	638285	613132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_613461_613624_613801_614223_614408_615860_615989_619696_620582_629463_629959_638031
801785	contig_9995_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_47756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	139	531	665327	665719	NA	35	AGCCAGTGAAAACCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDKQINFILNQNGGFLSSLRGLPALVQENSQDGWTQKSPPTQHVSSGSIFGQVRPALTEVRRGQIAQNLGLKRVWGRREGQPSHCGVTENDFLLYPGPQYNTYIYSHLVPGEKGGQNVTDVSRIIAATI	665188	665931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_665200_665900
801786	contig_9995_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_47757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGAACTCATGTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665931	666309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_665900_666300
801787	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
801789	contig_5018_pilon	-	1577	11	Intergenic	novelGene_46989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_10	49.8141546149285	118	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	264	1439	653432	643667	FALSE	15	TCCCTGCCTCCAGTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERKGVNKYYPPDFNPEKHGSLNRYHNSHPLRERARKLSQGILIIRFEMPYNIWCDGCKNHIGMGVRYNAEKKKVGNYYTTPIYRFRMKCHLCVNHIEMQTDPANCDYVIVSGAQRKEERWDMEDNEQVLTTEHEKKQKLETDAMFRLEHGEADRSTLKKALPTLSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRAKKKAIKEEEERDQALQTKASLAIPLVPETEEDRKLAALLKFHTLDSYEDKQKLKRTEIISRSWFSSASGSGAGSGNSKAGSVLKKLAQNRRSTAASSPITVGDLGIVRRQSREVLESPQDASGTPKSREPQVPKGTVQDRPTFPQDCSQETAETPESCCQDRPLPPQGSPQEAADTSDAPHPCSLSTSLVADYSDSESE	656289	643528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_644131_644237_644377_646983_647157_647239_647383_648077_648139_649914_649971_650897_650981_652225_652280_653429_653622_655111_655157_656260
801792	contig_6199_pilon	+	1697	21	Intergenic	novelGene_126399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	184.900757164485	1	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	39	1172	559486	592948	TRUE	10	TTTTGCCTATTGCCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLFRLPLLSVATMGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDIPKTNFRRLPFDHCSLSLQPFVYPVCTPEGIVFDLLSILPWLKKYGTNPSNGEKLDGRSLIKLNFAKNNEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAIKTTGNVYAYEEKQRLPPCRLQAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559447	603907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559518_564006_564057_565838_565885_568957_569021_570040_570093_574879_574932_585652_585745_585928_585962_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754
801793	contig_11615_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_151252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTGTGACATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35308	37394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_35300_37400
801796	contig_15410_pilon	-	872	6	Intergenic	novelGene_130574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	106.65345751545	963	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59311	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_57820_57870_59216
801799	contig_9437_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_141720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGTGACTTGCTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179208	177798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_177800_179200
801800	contig_5020_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_27960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211539	212614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_211500_212600
801803	contig_5019_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_109176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87214	84472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_84500_87200
801805	SIRV4	-	463	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1060	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4098	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
801819	contig_7022_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_142163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGTTAAATGAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308876	309354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_308900_309400
801821	contig_15471_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_175228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAGTTTTGTTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388208	386093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_386100_388200
801823	contig_16228_pilon	+	1499	3	Intergenic	novelGene_147920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	216.5	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	26	799	47776	69797	FALSE	5	TAGCTGGTTCTGCCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLWSLLPLMCGSSSAGWLTARDGVLLRRPPPLLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHGE	47750	70497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47852_59843_60222_69477
801824	contig_7357_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_36928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1489	1821	649852	649520	NA	65	GATGCTAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVILSYLFYISKYNNHLYMRTLDVIVQINHPITFLHQKSISNNYPYLPIPTVIIYINGDSRLLIGKARKRQKSSSSIASFSKHVHQWERTELCHLCYSVKNELYSETAF	651340	649380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_649400_651300
801825	contig_9609_pilon	+	683	2	Intergenic	novelGene_23086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455514	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_455731_455808
801826	contig_20356_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_159548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAAAGAAAACATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125442	126617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_125400_126600
801828	contig_8660_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_136489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTTGAATTAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257780	256041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_256700_256765
801832	SIRV6	-	451	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	79	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTACAACTCCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
801833	contig_9119_pilon	-	2965	24	Intergenic	novelGene_169749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_23	22.6540514952478	11	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	833	2502	263	2764	374286	258067	FALSE	25	AATAATCCTATCTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALILGCLLLLGLCGKTISAGPPSSTQTPEGLHFDLPAVNYETSGSPSTGSITGLFRMVHTFLHVVQPHNFPEDTVRKIIQKKFDLMEDYKEVVFYEIGLIICAVLGLLFVILMPLVGCCFCMCRCCNHCGGEMHQRQKKNGPYLKRYFAISLLVICILISIGIIYGFVANHHLRTKIRRTRKLADSNFKDLRTFLNETPAQINYILSQYNTTKERAILDLNNVKPLLGDGIRDQLRPKVIPVLDDIKAMATAIRETKEALEKVNNTLEELESGFEHLNTSLSNIRTELENSLNDSTCSEQMVTATCNDIRKSLGQLDININLDQLPPVHDQLNSVNNILRTNLTDLVEQGYKSFNDIPEMVQNQTKNIISDVKSVLDSIGSKISDVTNQFPIQDKLSDFKGYINDTEKSVNQGLLTLEEYESYRWLGCLAVCCLLTLIVIFYYLGLLCGTCGYDKNATPTSRGCVSNTGGIFLMAGVGVSFLVCWILMIIVALTFFIGGNVQKLVCEPYENRKLFQILDTPYLLNEKWEYYVSGWMFQKPYINLTFEKVYSDCKENKGIYTSLQLENLFNVSAHLNIQEYTQDITNEFEHLNINLDNIVLLDDAGKQSLEDFSTLGVEKIDYTAYLMEIGKNLTKVNLVSFADNLLVTASRLPPGALKTSLDGHAQSIKRIHQREVIPLERSMSTLNQSLKVLQRISNGLTEKLNKIILSLDSAQKFISNNASSLIVEESKTYVNTIIGYLEHYIQWVKDSITHKIAACKPVATALDSAVDVFLCSYIVDPLNLFWFGIGKATLFLLPAIIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDCSVSGTWHFTL	384605	257865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_258104_258339_258456_264173_264267_265610_265680_265807_265889_269125_269180_272548_272642_273840_273913_274133_274281_277026_277112_281604_281709_284613_284738_297678_297832_300971_301132_304403_304468_306903_306979_309367_309586_316303_316394_317578_317643_319870_319992_331134_331341_342734_342791_374066_374498_384554
801834	contig_5727_pilon	+	741	8	Intergenic	novelGene_7981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_6	8.19407451411428	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	61	741	389648	408131	FALSE	25	GGGAAAGGCAACCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSELSPSIEEEESKSGLDVMPNISDVLLRKLRVHKSLPGSAPPLTEKEVENVFVQLSLAFRNDSYTLESRISQAERERNLTEENTEKELENFKASLMSSASLWHHCEHRETYQKLLEDITVLHRLAARLSSRAEMVGAVRQEKRMSKATEVMMQYVENLKRTYEKDHAELMEFKKLANQNSSRSCGPSEDGVPRTARSMSLTLGKNMPRRRVSVAVVPKFNALNLPGQSPGSSPIPSLPALSESTN	389587	408131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_389710_392509_392541_395526_395668_396137_396270_398328_398471_405086_405137_405668_405777_408116
801836	SIRV4	+	611	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTAGTGCTAAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	5155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
801839	contig_1596_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_131600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGTAAAAAGATAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130482	128882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_128900_130500
801840	contig_8310_pilon	-	1448	7	Intergenic	novelGene_75580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	777	1448	308001	283441	FALSE	10	TACTTCTTGGGCCCCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVPVRPTPALGDHDGPSVCGVERPHFLQELQHSDGCERHPEVGPAGEVQLGDKPGGFAAVREGLDAELPDGVVHQDYAVLHTHADVPICPAALVRPVLMALFLFPFFQVSQHDNGCRFLFPDHSPKVIHRFLFRALSSYEFILFFVTIYVRSINIVGTGNSIHVAQNHPGMIIWGGCRISLVPPPTIPQGPPTLTLNSSRKRLQSSAERIRISSSSCATGMGK	308777	283440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_283584_294698_294784_295440_295476_296626_296725_302455_302578_303836_303989_307964
801843	SIRV6	+	278	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	171	-244	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
801845	contig_10466_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_173617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATATTGGTTGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50103	51926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_50100_51900
801846	contig_4315_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_46865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGTGCTTTTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827514	826397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_826400_827500
801847	SIRV4	-	459	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	51	107	51	-107	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTAAAAACTAACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5107	3744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801848	contig_17493_pilon	+	1333	9	Intergenic	novelGene_122180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_5	426.166615744359	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	162	1160	92066	146724	FALSE	20	TTCTTTGTGTATGAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVQRHASAEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGSHFGRPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFEDFFGNHRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGGGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGLGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADEDAFAEECRRRGQNALPSQPAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGVQRETNVEHTKSDTSLNSQGKRGQKASLCCCVLT	49964	146897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50101_92040_92131_94731_94842_103476_103531_104360_104472_116052_116185_118447_118590_119116_119188_146410
801849	contig_4832_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_163403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCACCATAGCTGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385657	383927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_383900_385700
801850	contig_4832_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_163402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTGTTAGCAGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383747	383337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_383300_383700
801851	contig_10437_pilon	+	694	5	Intergenic	novelGene_38468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	63.3339364006375	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	66	692	1131049	1141525	FALSE	25	CTTGATGCTACGCAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDMDAVLSDFVRSTGAEPGLARDLLEGKNWDVSAALSDFEQLRQVHAGNLSPPFSEGSGGPRTPEKGFSDRESTRPPRPTLQRQDDIVQEKRLSRGISHASSSIVSLARSHVSSNGGGGGSSEHPLEMPICAFQLPDLTVYNEDFRSFIERDLIEQSMLVALEQAGRLNWWVSVDPTCQRLLPLATTGDGNCLLHAASLGMWGFHDR	1130983	1141527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1131134_1135846_1136036_1139109_1139338_1140802_1140905_1141502
801855	contig_6710_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_97758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653813	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
801856	contig_19769_pilon	+	516	3	Intergenic	novelGene_102328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3673	junction_2	89.5	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	31	486	87859	89322	FALSE	15	GCCACTTAGCTGTGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87828	89352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_88040_88841_88958_89163
801862	contig_299_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_129514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATGAAGTTCAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1696881	1695301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1695300_1696900
801865	contig_10732_pilon	-	1760	2	Intergenic	novelGene_114745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTATGGAATCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558234	554438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_556093_558128
801866	SIRV4	+	362	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
801870	SIRV6	+	516	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	340	0	167	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
801871	SIRV6	+	486	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	514	11	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
801874	contig_12540_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_148052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTGAAGGATTCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136377	137655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_136400_137700
801875	contig_9656_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_121904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170570	168316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_168300_170600
801876	contig_14807_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_124738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1359	1658	234693	234394	NA	65	TAGAAAAAAAAAAAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDNCKFPKSSPNLSPTYCCVCLLTHNCSLYEPSNNTVPSGQGEAGDTTADGLCIWPVLSTTTGALVAQWLSAWLLTERWGFEPTSGSAGERYGSLLP	236051	234380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_234400_236100
801885	contig_8636_pilon	-	1434	8	Intergenic	novelGene_141942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	9.85610760609162	234	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	184	972	506485	495810	FALSE	20	TATGGTGTCAGGACTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTSEGARRKERVLCLFDVDGTLTPARQKIDPEVAAFLQKLRSRVQIGVVGGSDYSKIAEQLGEGDEVIEKFDYVFAENGTVQYKHGRLLSKQTIQNHLGEELLQDLINFCLSYMALLRLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCTLEERIEFSELDKKEKIREKFVEALKTEFAGKGLRFSRGGMISFDVFPEGWDKRYCLDCLDQDSFDTIHFFGNETSPGGNDFEIFADPRTVGHSVVSPQDTVQRCRELFFPETAHEA	506668	495347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_495933_496317_496434_497330_497407_499954_500055_500262_500355_500521_500599_501871_501990_506398
801888	contig_10003_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_88199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGCCCCAAAACATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490109	489173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_489200_490100
801892	contig_14553_pilon	+	270	2	Intergenic	novelGene_125003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTACCCCCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13795	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_13937_14294
801893	contig_12624_pilon	-	1796	2	Intergenic	novelGene_61009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789199	786354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_787249_788297
801894	contig_5891_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_151581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATGGAAAACTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119918	118412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_118400_119900
801895	contig_7378_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_120243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTGCAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282699	280692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_280700_282700
801896	contig_14526_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_111213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCGGCTTCCCCTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354274	352551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_352600_354300
801899	SIRV4	-	237	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	368	12	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
801900	contig_15323_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_148541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAATAAGAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192871	194072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_192900_194100
801901	contig_6302_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_171703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCACCAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150812	149238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_149200_150800
801902	contig_16804_pilon	-	964	3	Intergenic	novelGene_167292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_1	31.5	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	198	689	53399	51453	FALSE	80	CAAAAGAAAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKTRRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLLPELKNADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNK	53596	51177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_51617_52338_52539_53271
801910	contig_14924_pilon	+	2053	15	Intergenic	novelGene_104155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.7064295370631	2	99	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	765	1505	49029	53716	FALSE	20	GAGGGGAAGGACCTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPYKDNPFSLGESFGSRWDTDATWGMDRVEEKEPEVMISSIRPISERATNRREVESWSSGLESNEARQKFAGAKAISSDMFFGREMDSEYEARSRLQQLSGSSAISSSDLFGEVDGAHGAGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQDRYGSY	44115	54264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_44181_44368_44488_45052_45126_45629_45751_45838_45920_46743_46860_48219_48262_48758_48896_49018_49151_51163_51287_51371_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695
801912	contig_8702_pilon	-	1248	10	Intergenic	novelGene_157737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	162.167799090104	161	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	36	1142	140251	131677	FALSE	0	TTTTCTTTTTCCTTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPSGREEGGKMVLESTMVCVDNSEYMRNGDFLPTRLQAQQDAVNIVCHSKTRSNPENNVGLITLANDCEVLTTLTPDTGRILSKLHTVQPKGKITFCTGIRVAHLALKHRQGKNHKMRIIAFVGSPVEDNEKDLVKLAKRLKKEKEVNTEKLTAFVNTLNGKDGTGSHLVTVPPGPSLADALISSPVLAGEGGAMLGLGASDFEFGVDPSADPELALALRVSMEEQRQRQEEEARRAAAASAAEAGIAAAGTEDSDDTLLKMTISQQEFGRAGLPDLSSMTEEEQIAYAMQMSLQGAEFGQAESADIDASSAMDTSEPAKEEDDYDVMQDPEFLQSVLENLPGVDPNNEAIRNAMGSLASQATKDGKKEKKEEDKKGD	140286	131570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_-_131854_132417_132486_132562_132695_132845_132955_133557_133774_133973_134010_134244_134332_134713_134829_135907_136049_140225
801916	SIRV4	-	346	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1175	0	1175	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3983	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
801917	SIRV2	-	319	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4554	34	3379	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
801918	contig_13823_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_145270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	812	1120	283735	284043	NA	10	TTAATCTGTCCTCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLAKLALSTLHSSRRLISGSWDVSLQKSPACCLTCRFWVCQLLQPHEPAEVFSLLPDTCLGLVNPNSCVSHFLEVNLSIYIHFTGFAPLENPDQVYFKNW	282923	284182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_282900_284200
801919	contig_11328_pilon	+	1367	3	Intergenic	novelGene_88372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGGCACAATGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90960	136468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_92126_131076_131214_136403
801921	contig_11126_pilon	-	2367	7	Intergenic	novelGene_138136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	4.81028989655394	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	124	831	699064	689243	FALSE	70	TGGAAAAAGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATCSLRTVTRRSVSAGRQRPTASSPSAWDTRSSSAGYSWCLTTRSCCCPPPGTELCGSGSTGAGGSCTAVPCPACRSRMHPRERSIPVVCIFQLDVPRHLLVYRQQLSFQHRVWDVAFEETQRLWVLQDCQEAPLVLYQPVQGQWQSVSEDDVLKKVSSHLRGNWAMLEGSAGVGDSFSSLYKASFDNMATYLHKKEERLQQQLEKRQRRKSSQPGPNGHAKKLKSGDASSGC	701738	687706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_689437_689941_690012_690862_691047_695613_695713_696288_696350_698964_699078_701628
801922	contig_5196_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_38699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCAATGTCTGCACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313873	311898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_311900_313900
801924	contig_6266_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_170986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCCGGTGGGTTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350354	349256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_349300_350400
801927	contig_1143_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_86615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	391	402	813699	813688	NA	40	TTTAAAAAGCATTGACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGKSILCSKEVPAQDLRKLCERLRGIDSKSTKLTSDIQGPGSHDPTFSETADHKAAHLVHTSQAQCSGSSLHKGDSNGCGSCFEEDTTNLEGWDKVPDEAYDLLDKLLDLNPASRITAEGALLHPFFKDMSL	814089	812251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_812300_814100
801929	contig_12201_pilon	-	1071	7	Intergenic	novelGene_159979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	297.195455700266	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	141	653	138975	120895	TRUE	15	TTTCACTAGTGTTTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLTVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQVRVLNM	139115	110369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_124329_124453_130805_130980_132873_132971_138877
801931	contig_6434_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_61888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAAAAATGCTTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896464	897411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_896500_897400
801932	contig_6434_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_61889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCATAAAAAAATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897411	897639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_897400_897600
801933	contig_10011_pilon	-	1620	6	Intergenic	novelGene_68072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	34.1561121909388	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	299	1033	281066	277516	FALSE	25	TTATTTTTACTTTTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSAELQSVGRSQDEEFWNTYRGLQEQPSRNTLKETEALYKKALPTPQTLALSEQTNTKDWTMAPNLILPESQSLLTFEEVAMYFSQEEWELLEPPQKVLYHDVMQENYETVISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWIQGPQEFKDSHVESPTGLKFKNDTGSHQPVSLPALEIEAPGDIVSKKARAKVPQKTTDKENQGDIHRVGKRHQDFPVKKRKKTFNLETRVAETYGSSQERPCRRKAF	284747	276928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_277791_277971_278083_279704_279832_280160_280253_280936_281133_284515
801934	SIRV4	-	306	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1200	15	1200	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
801936	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_96903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
801941	contig_15361_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_167861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTTGTTAGGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424061	423583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_423600_424100
801942	contig_3334_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_137667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGTGTAATAATAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427005	425791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_425800_427000
801944	scaffold_19766_pilon	-	1190	6	Intergenic	novelGene_34359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.429138908476	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	29	1021	678336	676839	FALSE	0	TTGGGCCTTGGCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEPGQRGAMVGPQPLALLLVLLTLCLSTGTPEVWVQIKMEATKVPSFTIRCGFLGSGSISLVTVSWGGPDVAGGTRLAVLHPDFGTQQWAPAHQAHWEARTNISLTLGGSEGKSPSPNSTFCCKFVSFPEGSQEACGNLLLSTDQDLPAPTPASILRAHLAGIFGVSGVLLFGCIFLLHLLQQRHWSVPRLLPPHTSPWTQRRAQPAGQTSRASLHIPYTTVNTNYFCPAALEMAHHHQQLSRWPPLPIPTTSQTQALAPWAPLPASAHSSFISVENVLYAQAGGSPPHSGPGSPNLIPFPDPLEPKPFPCLPGLWNLPSGGSLVPGLLTFLHIMFYS	678364	676669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_676932_676977_677287_677394_677453_677548_677670_677786_678138_678275
801947	contig_13490_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_129115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTTAACATAAATAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	9343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_9300_11000
801948	contig_4812_pilon	+	1802	7	Intergenic	novelGene_103688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.523395608027	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	148	678	198765	213053	FALSE	40	TAACAAAAAATGTTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSLKRLFVERPEDETLLINVVCGILSGVISSAIANPTDVLKIRMQAQSSTIQGGMIGNFVNIYQQEGTRGLWKGVSLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYTHFLPLLRYMQGKLLAFGAPSSIEAG	196948	214177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_197045_198713_198824_202849_202945_203859_203946_205876_205973_206700_206826_212983
801949	contig_20026_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_175417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	241	723	839	1561	163152	163874	NA	35	GGTAAGAAAAGATCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRTGIPAPRELSVVGSRERSVPRGPSNPRKLVSSPTSSSTPTPTKHLRTTSSKAKQENEGAEKAVLESHIRELLAEAKAKDSEINRLRSELKKCKEKRALNTEETDALDLSVDGIPFSSCDTEPLIRALEEKNKNFQKELADLEEENRTLKEKLIYFEHSPNSEGAASHTGDSSSPTSVTQESSFRSPARNQLSGEIDEYKNNIRENALRTSDSSSSDVTKASLSPDASDFEHITADTPSRPVSSNSNPFKSSKCSTTGSSPNNISELSLASLTEKIQKMEENQHSTAEELQATLQELSDQQQMVQELTAENEKLADEKTILETSFHQHQERAEQLSQENEKLINLLQERVKNEEPSVQEGRILELEQKCADILDQGRFEREKLLIIQQQLTCSLRKVEEENQGALEMVKHLKEENEKLNGFLELERHNHSVMAKTLEECRVNLEVLKIENGSLKAQLESEKQKAVETSPTGQTADSCEVQEMLKVARAEKDKLELSCTELKQELLKANGEIKHVSSLLS	162313	163876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_+_162300_163900
801953	contig_16122_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_134569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAGTGGGGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566975	568334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_567000_568300
801957	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
801960	SIRV2	-	510	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4363	34	3188	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
801963	contig_6496_pilon	-	1330	9	Intergenic	novelGene_103465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.7196042563032	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	444	1070	135813	124041	TRUE	10	CAGTAGTTGTTTGGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSFSPFHPPSLPSSPPSFFPLFLLFVPSLLLHPSFLSSVVPSFSRFSFPSSPPSFLHTSPPSFLPSPPSFLSSSCPLSSPPPFFSFLPSSSLPSSCPFFLPPFLLSRNKVSQKGPGVRPTADLLKHYARHRECHRRAASDCAVSLDGMPSEILLKIFSYLDAVNLLCIGCVNRRFYHLASDNFIWVRIYSTAFSPKRSNWKVNSVEKTAVSVNLLSLEDKEAGYWKKEYIAKQIASVKATVAQLLQPVNPYTGLPVKIKEALRVSGLGWVIILRDKSGKEYLTERVHLSVNDTSVSVVWYGKNWPCLATLSTLDLCGVTPVFMDRYKSPTKNGGRKSWLLLWQIFISISLWRGAS	140950	93004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_93077_99558_99591_122908_123052_124027_124111_130326_130537_131093_131337_135709_135815_140400_140506_140613
801964	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
801965	contig_13245_pilon	-	436	4	Intergenic	novelGene_148811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	40	399	26752	25454	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGTSRSGSSAAAMAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26791	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
801968	contig_8020_pilon	-	794	3	Intergenic	novelGene_114445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAACAAAGAATAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364324	339814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_339942_350804_351367_364219
801970	contig_17840_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_154301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCATAGAACTATTGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73754	74130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_73800_74100
801971	contig_13244_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_86905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGCACTATCACCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90845	91923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_90800_91900
801972	contig_8942_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_143201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGAAATAATTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390210	387863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_387900_390200
801974	contig_10765_pilon	-	1525	2	Intergenic	novelGene_122897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	54	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCCCCTAAGTGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96345	92871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_94317_96265
801976	SIRV7	+	269	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
801980	SIRV2	-	493	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	61	132	61	-132	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTGACTGCGCTGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5834	3797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
801985	contig_4686_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_118558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625853	626714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_625900_626700
801986	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
801988	contig_7272_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_25300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395491	393985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_394000_395500
801991	contig_6589_pilon	-	1442	14	Intergenic	novelGene_26253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_13	56.8595279364836	1	38	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	474	1382	2230610	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233759	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2231914_2232215_2233665
801993	scaffold_6394_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_111051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10205	junction_3	1437.16209555112	326	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	325	480	444288	444551	FALSE	10	TTCTGGGGGCACTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPWGGQGPPGRATPAFLPWPLAPRVGGHGRPPVTPPRPVSLASGCATLPPTCWPPSGAIPPPSAKDIKKILDSVGIEADDDRLNKVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442238	444597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442494_443338_443388_444267_444367_444474
801994	contig_9415_pilon	-	1316	3	Intergenic	novelGene_109944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	282	junction_2	138.5	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	136	762	2490739	2472408	FALSE	30	TTTCTGGAAAGTAGACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSGLLSWTLSRVLWLSGLSERGAARRPQIMEEKALEVYDLIRTVRDPEKPSTLEELEVVTEGCVEVQEINEDYCLVIIRFTPTVPHCSLATLIGLCLRVKLQRCLPFKHKVRMTDFSVVFSNSFIEIQFTYHILHPFKLYHSVVFTVFTVVQLSLLSILEHFHHPKRDLVPLSSHSPFFPLLPTLIPSPSQQLISFFFFLLAIIS	2490874	2471853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2472746_2481742_2481908_2490615
801996	contig_5777_pilon	-	1011	10	Intergenic	novelGene_173319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	253.350048181523	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	157	840	64063	40120	FALSE	30	TGGTCCTAATTTTAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQFYSVAFAGLSDVSISQDIPVEGEITIPMRSHIQEFDSSTLNESVQNTIMRDLKAVGKKFMHVLYPRKSNTLLRDWDLWGPLILCVTLALMLQRGSADSEKDGGPQFAEVFVIVWFGAVTITLNTKLLGGNISFFQSLCVLGYCILPLTVAMLICRLVLLAKPGPVNFVVRFFVVIVMFAWSIVASTAFLADSQPPNRKALAVGIPHKFILINQVNNTRTTGSLE	65183	39948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_40165_40888_40914_44383_44439_46524_46683_47289_47416_53621_53665_56491_56571_57809_57939_64039_64150_65113
801997	contig_8312_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_152911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAGGAAGAAGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539972	1538472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1538500_1540000
801998	contig_5968_pilon	-	1079	9	Intergenic	novelGene_112184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	507.643929713535	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	214	762	638341	625829	TRUE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMHYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQVPATPAGEYAAPESRRTPAPRGGPV	732275	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625903_631639_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638272_638328_638353_700585_700743_732230
801999	contig_6446_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_149260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGTCTAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711926	713913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_711900_713900
802001	contig_11115_pilon	+	954	4	Intergenic	novelGene_102811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	674.108464731175	9	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	285	719	165608	173089	FALSE	15	CTCCGGAGTCTGTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYPAPTMNCSQEVSKLNIGTPAPSPSPWRC	165323	173324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_172807_172852_173047
802002	contig_6418_pilon	+	2584	1	Intergenic	novelGene_81136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2158	2472	160639	160953	NA	20	GGGTCTTTGTGAAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTRPYGSRVDPILNPSEWCLTNSAEQTQTQRRHHVTMKADASTSSKRTPRTAAATRKEERPTEGIDTAETLMWTFSPQNCEKINVCSLQPPICGIFVTAALGN	158481	161065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_158500_161100
802004	SIRV6	-	331	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAGCCGAATTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	11489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
802005	contig_12671_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_19237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	377	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACATATTCTTATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215363	213935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_213900_215400
802009	SIRV6	+	384	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	10	389	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
802011	contig_5084_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_64678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAATCTAATGCCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1757522	1758973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1757500_1759000
802020	contig_7165_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_116912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAACAGTTAACCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222409	1224791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1222400_1224800
802021	SIRV4	-	446	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1077	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4081	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
802025	contig_10549_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_110597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCAGCTTAAACCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132497	131567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_131600_132500
802026	contig_13966_pilon	+	1115	5	Intergenic	novelGene_158153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	34.9383385409209	341	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	17	895	430352	440885	FALSE	35	AACAACACATTATTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAARLLPGLLFSQHLSGGAARLRTPGAAKVRPLLTGLCCFCRRRLGSGVAPFPRGAWTEAASARSAGSSSCRLLSPPGFPAALASFLVHPRRSYSTEEQQPQPRQKTKMIILGVSNPVNWIRTRIYSFLIWAYFDQEFSIREFSEGAKQAFAHVSKLLSQCKFDLLEELVAKEVLHVLKEKVTSLPDNHKNALAVDIDEIVYTSTGDISIYYDEKGRKFVNILMCFWYLTSANIPSETLSGASVFQVKLGDQNVETKKLLSASYEFHREFTQGVKPDWTISRIEHSKLLD	430335	441105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_430805_435242_435315_435755_435883_437287_437436_440806
802027	contig_12969_pilon	+	2346	5	Intergenic	novelGene_61710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	33.0794498140462	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	357	1538	647719	654673	FALSE	40	ACTGCTGTAACAAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQESLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPNPVFKLEQGEPPWIVEGAIHSWTSPEEIWAIDHMQWHSENQNELKNLEGCQQSYALGNNSNLSKNLFPLTQRGNTFDLHCKSLKAPLSFVIQNRRYAVKDSDEFSGYRKSPVHMKHDKTFSGIKYHGYVKPSSTKSQLNDHHKTYVGEKLHECSECGKTFSRKSRLMVHQRTHTGGKLYVCSECGKAFTWKSWLKRHQQSHTGEKLCGCNECGKAFSQKAYLIAHQRLHTGEKPYECSECRRTFFFKSDLTKHQRIHTGEKPYECSDCEKAFRSKSKLIQHQRTHNRERPNGCRECGKTFAQMSVLIKHKEKHRREKVIKSLKVGKPSSGNPFYMSELI	638773	655481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_638947_647535_647734_649028_649156_649421_649518_653729
802030	contig_2894_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_86533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1783	2109	138769	139095	NA	60	TAAAAGCAAAATCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISVPLQQWRSALNIGQQFVDYSEIRLALPLPWQSALVYLYYRLPFHRCYSCLSHYADNSLRARTVCYSPLYTHYLVQNNYSIHPVILEFQVLPEVFRSASPTLLDQG	136986	139665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_137000_139700
802031	contig_6589_pilon	+	711	3	Intergenic	novelGene_26061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_2	333	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	306	374	1731416	1731484	FALSE	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYDQISQYR	1729021	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1729234_1730067_1730152_1731406
802037	contig_12701_pilon	-	1827	1	Intergenic	novelGene_169559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	633	944	43905	43594	NA	20	TCCCCAATGCATTTGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPWSMVRVVASPAVLETTKERSRLLSFWMYLQSGGPGLGAGMSWLSQPGVGFLVEGVLTGPRQWQVGSCLGVPRGEGICVPGNAIFSPSSAGSYSENKSEQR	44537	42710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_42700_44500
802039	contig_7816_pilon	+	1223	9	Intergenic	novelGene_66455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	205.14655584484	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	26	1015	94386	148859	FALSE	85	TGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSAPGFKMESLSRAGQEMSLAALKRHDPYITSIADLTGQVALYTFCPKANQWEKTDIEGTLFVYRRSASPYHGFTIVNRLNMHNLVEPVNKDLEFQLHEPFLLYRNASLSIYSIWFYDKNDCHRIAKLMANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSMQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKNDSGFLSTLHEVYLQVLTKNKENLSL	94360	149067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_146636_146703_148224_148444_148778
802042	contig_15277_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_175430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272412	270402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_270400_272400
802043	contig_8357_pilon	+	1233	4	Intergenic	novelGene_39781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.69967317119759	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTTTTGCTTGCCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913483	916524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_913551_914136_914224_914585_914738_915597
802044	contig_10437_pilon	-	2010	6	Intergenic	novelGene_38454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_3	9.65401470891774	21	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	84	548	1030186	1022285	TRUE	70	TATGAAAAAGTAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAKRPGVSSARKRGREGLGAPCQVVAMNVVFAVKQYISKMIEDSGPGMKVLLMDKETTGIVSMVYTQSEILQKEVYLFERLDSQNREVMKHLKAICFLRPTKENVDYLIQELRRPKYSVYFIYFSNVISKSDVKSLAEADEQEVVTEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNILGCCQVWKKRIRN	1030269	1020378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1021608_1022051_1022381_1023404_1023485_1027648_1027710_1029382_1029518_1030093
802048	contig_7898_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_47552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGATTGCATTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299354	296955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_297000_299400
802049	contig_14526_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_111212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTCTAACAAGTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341011	343228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_341000_343200
802050	contig_13224_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_104083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATGTTTAAAAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203439	201903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_201900_203400
802051	contig_7165_pilon	-	1556	3	Intergenic	novelGene_116869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	4.5	30	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	46	741	587789	569717	FALSE	15	GTAGTCTGTGTTCTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVVDFQDEEQVKSFLQNMEVECNYQCYREKDPDGCYRLVDYLEGIQKNFDEAAKVMKFNCEENQHSDSCYKLGTYYVTGKGGLTQDLKAASNCFLMACKKPGKKSVEACHNVGLLAHDGQVNEDGHPDLGKARDYYTKACDGSYAASCFNLSAMFLQGAPGFPKDMNLACKYSMRACDLGHVWACANASRMYRLGDGVDKDEAKAEVLKNRAKQLHKEQQKSVHPLTFG	587834	568901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_570166_584658_584800_587683
802052	contig_3233_pilon	-	1902	5	Intergenic	novelGene_56532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	100.268078170473	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	924	1373	706773	702290	FALSE	10	GTTCATCTACCTTTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWFSTAVLIGLFVFEHFPTYMIGVGLFTNLVYFGLLQTFPFIMLTSPNFILSCGLVVVNHYLAFQFFAEEYYPFSEVLAYFTLCLWIIPFAFFVSLSAGENILPSTMQPGDDVVSNYFTKGKRGKRLGILVVFSFIKEAILPSRQKIY	707696	701760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_702406_702578_702682_703401_703470_705474_705629_706764
802054	SIRV4	-	518	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	101	-2	101	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5057	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
802055	contig_3409_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_172313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178907	177981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_178000_178900
802058	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	2	379	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
802060	contig_1964_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_130920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAGCTGAACTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198597	197186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_197200_198600
802062	contig_6589_pilon	+	1342	9	Intergenic	novelGene_25702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	565	junction_8	312.549971004638	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1	1230	205129	216262	FALSE	15	CACCTACATTGGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPPLLLPLPLLLLPLLLVDPTIATLIRIPLHRVHPDPRTLNLPRGWRKPAEHPSLGASSPGNKSTFVPLSNYMNVQYFGEIGLGTPPQNFSVIFDTGSSNFWVPSKRCHFLSLPCWFHHRFNPNASSSFQPNGTKFAIQYGTGKLSGILSEDKLTIGGIKGTSVVFGEALWEPSLVFTFAHFDGILGLGFPILAVDGVRPPLDILVEKGLVDKPVFSFYLNRDPEAADGGELVLGGSDPAHYFPPLTFMPVTIPAYWQIHMERVKVGTGLNLCARGCAAILDTGTSLITGPTEEIQALNSAIGGVALMTGQYLIDCSKIPTLPPVSLLLAGVWFNLTAQDYVVQIARFGVRLCVSGFQALDVDPPVGPLWILGDVFLGSHVAVFDRGDKKGGARVGLARARPRGAGR	205128	216374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_205215_210348_210491_210575_210700_210868_210988_211399_211600_212765_212889_213033_213179_215758_215858_216070
802070	contig_3818_pilon	+	1300	2	Intergenic	novelGene_99273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_1	0	4181	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	265	543	569573	569851	FALSE	20	CAGCAGCCTCCCAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLCSESPIQAPPPTGAENSLPDPRAPSYDQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLRACGITAVLNVSASCPNHFEGLFRYKSIPVEDNQMVEISVWFQEAIGFIGKRSASAPAPGGHREAWATSLYPVFFPLTPLPCLPCRLGEEQRRPGASALPGRHLTLCHHLPGVPDAEPPCAAGRGL	568925	570608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_569016_569398
802071	contig_10011_pilon	+	2080	10	Intergenic	novelGene_68036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	128.662732620725	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1548	2009	136184	140376	FALSE	55	TGAAAGAAGAAAAATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALYTNQTLLSLNLRENSINPEGAQALARALCTNSTLKNLDLTANLLRDQGAQAIAEAIRENRALTSLHLQWNFLQAESGQGPGTSTTAQQQPGQLGFTGERHRGRRSFRSGQGAEGKHGPHRPLPPGDLHRCLWGPGPGGSPGGEQNLGDS	130436	140447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_131715_133174_133259_134695_134780_135379_135438_136140_136225_136715_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139856_140292
802074	contig_4847_pilon	+	794	6	Intergenic	novelGene_156168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	310.289284378304	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	86	406	101069	109685	FALSE	10	CATTTTCTGTGGTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKEPSPLVPLHWLGFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVRIKNLRADCS	99621	110073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_101400_101478_102278_102381_108569_108658_109654
802075	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_97319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	65	AAGAATAAAAATGAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
802076	contig_12250_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_80547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270946	272219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_270900_272200
802079	SIRV6	+	483	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	21	514	14	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
802080	contig_11328_pilon	+	1712	9	Intergenic	novelGene_88451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_8	233.42825450232	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	86	1456	830591	857309	FALSE	30	AATCAGAGTAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	829366	857565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
802083	SIRV4	-	183	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1335	3	1335	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3823	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
802084	contig_14341_pilon	-	2027	6	Intergenic	novelGene_111751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	61.1705811644781	109	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	909	1331	115501	113541	FALSE	25	CAACACCCTCCAGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISPWASWAESTSCIPIACRGVASPSSDLLQPGVRIREPALYPRDSSWPVEGTPEEERRTAWLPTDQVQNYTTITMIFFQNIFIIPKRNPMSIKQSSPFPFLQPLVTTNLFLYGFTSSDTSYERNLTICGPLRLASFT	118555	112844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_113751_114863_114953_115377_115528_116275_116352_117568_117907_118087
802085	contig_11590_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_125570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359058	361140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_359100_361100
802086	contig_11493_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_143680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACCAAGGAATCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172409	174166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_172400_174200
802087	contig_10013_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_125045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGGAGAGAGAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196354	197645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_196400_197600
802088	contig_15888_pilon	-	892	6	Intergenic	novelGene_84440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088.29690801729	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	53	826	259726	251668	FALSE	10	CCACATTTCGGCTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDGEARGFRHSAALTLTLP	259778	251601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251702_253383_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
802090	contig_6842_pilon	-	1124	5	Intergenic	novelGene_130710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.246658965599	3	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	80	730	433953	429315	FALSE	30	CCAGGACTATCGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKNCQGSRGKLRKETILEALGSLLKFSDACRFLLFPAPIVTGETLKSDSGLGPFPAACPLYL	434032	428920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429496_429574_429699_431763_431865_432547_432658_433818
802097	contig_10235_pilon	+	905	4	Intergenic	novelGene_46517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_2	45.5070202154447	1285	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302537	304396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_302743_302923_302963_303185_303227_303776
802099	contig_9833_pilon	+	755	6	Intergenic	novelGene_68482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	37.1731085598178	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	36	755	170776	182708	FALSE	20	TTAGAAACTCTTTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAAALSLSLSMCLRRLFQSLHLQGAWRAAFLKHSQRRPRGVRRWTHSGGGIYKAVIFDMGGVLIPSPGRVAAEWEVMNHIPSGTILKAFIAGGENGPWMKFMRGEITLEDFSQEFGRLCSEMSQTSVPVDSFFSLLTSEQVARQFPVMTEAISQIQAKGLQTAVLSNNFYLTNGKSFLPLDRKQFDVIVESCREGICKPDPRIYKLCLERLGVQPSESIFLDDLGRNLKVAASLGIHTVKVNDPETAVKE	166151	182708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_166174_170762_170963_176892_177042_178643_178839_181808_181968_182678
802101	contig_4684_pilon	+	1533	11	Intergenic	novelGene_175434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	19.86479297652	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	54	1241	285238	557932	TRUE	10	TTCAGTTGTATGTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATAGRLLTLCGTASEVRWLRLRGAGLSRTFLQLSSAGAGGGNAIQGRQVSHFIFQPDPECQEYGQTQKMNLFQSITSALDNSLAKDPTAVIFGEDVAFGGVFRCTVGLRDKYGKDRVFNTPLCEQGIVGFGIGIAVTGATAIAEIQFADYIFPAFDQIVNEAAKYRYRSGDLFNCGSLTIRAPWGCVGHGALYHSQSPEAFFAHCPGIKVVVPRSPFQAKGLLLSCIEDKNPCIFFEPKILYRAAVQQVPVEPYYIPLSQAEVIQEGSDVTLVAWGTQVHVIREVASMAQEKLGVSCEVIDLRTIIPWDVDTVCKSVIKTGRLLISHEAPLTGGFASEISSTVQEECFLNLEAPISRVCGYDTPFPHIFEPFYIPDKWKCYDALRKMINY	285184	559925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_+_285443_303698_303777_308825_308895_360633_360768_360991_361148_363338_363448_383310_383409_385247_385359_490793_490881_557791_557941_559641
802102	contig_3018_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_78808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTTTCCCAGCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524721	524098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_524100_524700
802104	contig_5799_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_50343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGTTAACAGCTTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725120	723944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_723900_725100
802105	contig_13004_pilon	-	1481	2	Intergenic	novelGene_112607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	0	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTGATGACTATGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160646	156950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_157016_159230
802107	contig_14811_pilon	-	1175	2	Intergenic	novelGene_74468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTGTCTCGATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368237	356572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_368102
802111	contig_4315_pilon	+	1320	7	Intergenic	novelGene_46738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	84.4736974185193	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	90	812	163968	180330	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFHKQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVWNWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPSEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESDVRGITGVDLFGTTDAVVKHVLEVLISAASAGCGLFSRETVHVLIASIHIYGVLTKCLALF	163878	180838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_164008_168532_168647_168852_168927_172542_172624_174181_174259_175154_175265_180103
802112	contig_9424_pilon	-	1038	4	Intergenic	novelGene_143777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2321.44930784389	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	405	740	279584	277512	FALSE	20	AAACACCTGTTCGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280456	277213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552_279608_280075
802113	contig_5696_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_117572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713389	711433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_711400_713400
802114	contig_2114_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_104215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	633	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	130	399	59147	58878	NA	10	GCACTTGTGAGCTGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSVLGVKTGVTPPPPQPPGPDPLFALWPSAPCEGFRSTTWEEMAVLPSVLERVSVEGESDWGWLQSLVGGKHRSDKGPERVFGGTVQEVSLAGMKPGIWSGAGPRVGGDSRENSGEILSVDETGLGWGVSC	59276	58422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_58400_59300
802115	contig_1301_pilon	-	1351	1	Intergenic	novelGene_47280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTACTGAAGACGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243830	242479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_242500_243800
802116	contig_13894_pilon	-	1401	3	Intergenic	novelGene_62052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_2	556.5	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	270	1328	287445	286290	FALSE	25	GAAAGTACTTCTGCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288309	286216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219_287538_288132
802118	contig_11832_pilon	+	1115	3	Intergenic	novelGene_106954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	4.5	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	23	298	183796	184071	TRUE	40	TCCAAAACCAAACCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGLGSDMGVFNQVWGQRGGCWGSFSLLASGKLTLPILAPQVVSTGGGGHVELLKRAGAFLTYSSFCPLDDLADRGLLGVKSCYYAQDALWLWEIISR	183773	185881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_184345_184937_185039_185438
802119	contig_18364_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_102582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1195	1572	169907	169530	NA	30	CGCATGCAAAGCACGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLKASYILSYIRFPKSSRRSQTSKSTFSKPTNHFQAKAFVPNYNHSDYIKLARPPLQAALPIEHSQAVLGMAPFLSVGRKVKNGQQDSLGRAEDLIYQSREARNMFHVYFCFMRNYLFCKPFT	171101	169197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_169200_171100
802120	contig_4486_pilon	-	912	10	Intergenic	novelGene_38584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	171	386	391161	385404	TRUE	25	GGATCTCGCACTGACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASVVLIVYIISDIFQVLHVLINIFLRIVKSQCSPFSTSATPQGYCLPLTLLPLTSMIVLLPTTARGKRSFIFLTSLFSSSSSVSGNSYILILCSWISFIIYFKLLALLWCECVCFGNKWDDIHFFM	399372	311774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_311821_342989_343091_360533_360635_376085_376192_377337_377475_385368_385483_389955_390050_391118_391216_392816_392872_399311
802122	contig_7882_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_175006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAATTCCAGAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144577	144353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_-_144400_144600
802124	contig_2646_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_69709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGTAAACTTTCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2548269	2547589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2547600_2548300
802125	contig_2646_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_69711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCCCAGCAAAGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2550518	2549984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2550000_2550500
802126	contig_8683_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_150264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699322	700800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_699300_700800
802128	contig_299_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_129432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGCCCATTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872260	871012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_871000_872300
802130	contig_10902_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_65668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1699	2040	91151	90810	NA	60	GCTTATCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMENKMVACELQLFPSLVQSDFISISMSSIPCVQASLGCVKMVYNTREMLPTTTWPLGKSSLKKFSVWFSANCPFSNKLTILTRWRESVILVYVLGGLWERKRMGSLPLRIS	92849	90740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_90700_92800
802133	scaffold_7386_pilon	-	1548	10	Intergenic	novelGene_136594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	62.351057095992	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	23	1051	309042	298000	TRUE	40	AAGTAACAAGTCACGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSKEESMESPGDGLARCLLPDQGLLCGLGAWGRRLLLLSIPLIAMLSVSLSFWRRRGRSTRGTRKPPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEERTIFSCKDLQ	309064	297024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_298036_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308864
802134	contig_9345_pilon	-	1506	6	Intergenic	novelGene_24524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.809644501421	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	71	784	681773	673398	FALSE	20	ATGTATTCTTACTCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLRFQEDLISSAVAELNYGLCLMTREARNGEGEPYDPDVLYYIFLCIQKYLFENGRVDDIFSDLYYVRFTEWLHEVLKDVQPRVTPLGYVLPSHVTEEMLWECKQLGAHSPSTLLTTLMFFNTKYFLLKTVDQHMKLAFSKVLRQTKKNPSNPKDKSTSIRYLKALGIHQTGQKVTDDMYAEQTENPENPLRCPIKLYDFYLFKCTFYLTPEPVVAPNSPIWYSVQPISREQMGQMLTRILVIREIQEAIAVANASTMH	681843	672675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_673564_675089_675181_675486_675639_675997_676107_679449_679565_681692
802138	contig_12709_pilon	-	1000	2	Intergenic	novelGene_147416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCTTACCTTCCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59060	56580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_57450_58929
802139	contig_12464_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_68675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGCAAGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172094	172805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_172100_172800
802142	contig_15629_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_122466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTGAAAGGTCGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140160	138787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_138800_140200
802147	contig_10765_pilon	-	1513	2	Intergenic	novelGene_122987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTTTACGTTAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513876	508195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_508289_512456
802148	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
802151	contig_13528_pilon	-	1249	2	Intergenic	novelGene_66862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	426	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41827	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024
802152	contig_8954_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_130282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTCCTGCAGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142542	141029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_141000_142500
802155	contig_11709_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_168212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAATAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40708	38312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_39333_40298
802156	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACAACTTCGACTTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	10767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10818_11031_11111_11205
802158	contig_6001_pilon	+	2230	15	Intergenic	novelGene_128043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1122	1724	673867	684691	TRUE	35	TCCCGAGAAGAAAGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSSSSWPEAFRDCRPALTLLEPRSAGAERPTFIPASWDERWLGAAESGPMSIRSVADSASLGALAVWPVRNRSIPFVAQEHVVEIVVDNKQLLGQLLIGDSGDELQDSLLHGSACPVELLQQLQIRRLGLGGYQLRQHLRHHSHVPAHHLQLAAQLRDLLRGWCYGCVAGRYSWGGQRGSVLVRVHLLTGVGTHSILS	664436	712427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_665339_665419_665459_666179_666238_670981_671060_673822_673967_675050_675144_675510_675542_677375_677517_680181_680297_684568_684716_684905_685041_685405_685554_686459_686541_692449_692535_712394
802159	contig_3832_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_161498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490382	492084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_490400_492100
802161	SIRV4	+	330	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTTGCACCCGTAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3660	3990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
802162	contig_15087_pilon	+	2970	1	Intergenic	novelGene_37165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGAGGGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79291	82261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_79300_82300
802163	SIRV4	-	298	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	8	1215	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
802167	contig_6291_pilon	-	1261	2	Intergenic	novelGene_164802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACCAGAAGAGTATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386326	384417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_384782_385429
802168	contig_15449_pilon	-	836	3	Intergenic	novelGene_33671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	110	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	40	459	193091	191352	FALSE	40	AAACTTAAGAGATGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDRIRIYNLQHNNMLRGTGSQRLHILFPLDCGVPNDLSVADANIRFLQKLPQQSADCAGIKGRVYTNSVYQLLEHGQPAGICVLEYATPLQTLFAMSQDGRAGFSREDRLEQAKLFCRTLEDILADAPEYQNNCRLIVYQGEGLVGWRSLLA	193130	190974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191367_192030_192241_192896
802171	contig_8636_pilon	-	1077	7	Intergenic	novelGene_141938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_5	34.2576025625456	536	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	138	752	468713	458644	FALSE	25	CGGCCAGTGTCATGATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRRGAGRSFLLARSPEPTGFGSSPKARRLLGGCVWEPEPPAQARMFVLVEMVDTVRIPPWQFERKLNDSIAEELNKKLANKVVYNVGLCICLFDITKLEDAYVFPGDGASHTKVHFRYVVFHPFLDEILIGKIKGCSPEGVHVSLGFFDDILIPPESLQQPAKFDEAEQVWVWEYETEEGAHDLYMDTSEEIRFRVVDESFVDTSPTGPSSAEATSSSEELPRKEAPYTLVGSISEPGLGLLSWWTSN	469129	458318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_458698_459739_459942_461427_461492_461996_462084_465963_466061_468602_468734_469012
802175	contig_2215_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_163869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTACAGTACTATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324838	323576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_323600_324800
802177	contig_2043_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_169910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCTTAAGAGTAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683825	685420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_683800_685400
802178	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
802179	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
802180	contig_5815_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_141178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCTGAAATTCAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138499	137592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_137600_138500
802181	contig_2323_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_151844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCCGAAGGTGCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68349	67788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_67800_68300
802186	contig_6102_pilon	+	2590	14	Intergenic	novelGene_32257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	35	junction_7	116.566155632985	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2388	203	2590	1345908	1378804	FALSE	30	GCCCAGCAGCAGCAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPPWLLLLPLLSALVAAAIDVPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGERDCPDGSDEAPEICPQSKVQRCQPNEHNCLGTELCVPMSRLCNGVQDCVDGSDEGPHCRELRGNCSRLGCQHHCVPTLAGPICYCNSSFQLQADGKTCKDFDECSVYGTCSQLCTNTDGSFTCGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEPVDRPPVLLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQTTAMDFSYANETVCWVHVGDSAAQTQLKCARMPGLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWLTGNFYFVDDIDDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYNPKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVERCDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLDYIEVVDYEGKGRQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANTQQKTSVIRVNRFNSTEYQVVTRVDKGGALHIYHQRRQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHKARTCRCRSGFSLGSDGKSCKKPEHELFLVYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDEHMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIGRQKIDGTERETILKDGIHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTHPRAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDVFVTSKTVLWPNGLSLDIPAGRLYWVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRLERGTGGAPPTVTLLRSERPPIFEIRMYD	1345705	1378804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1345975_1354412_1354536_1357024_1357163_1359367_1359488_1360658_1360788_1360911_1361176_1370621_1370785_1370897_1371121_1372142_1372333_1372833_1372978_1374387_1374625_1375840_1376022_1376912_1377136_1378618
802188	scaffold_12124_pilon	-	1079	6	Intergenic	novelGene_22180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_5	102.151651969021	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	125	829	1333065	1229338	FALSE	5	AGCGTGGGCTTGTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVRETSPPAQVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1368039	1229087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1323601_1323671_1333049_1333158_1368007
802189	contig_10235_pilon	+	1675	9	Intergenic	novelGene_46584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	43.9680281568323	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	110	1021	567174	581650	FALSE	40	CCTGTATTTATGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	566729	582304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566831_567165_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
802190	contig_19352_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_122412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTGTTACTTCCCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318063	317439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_317400_318100
802191	contig_19352_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_122411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTTCAGGATCCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317489	316235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_316200_317500
802194	contig_15273_pilon	-	947	7	Intergenic	novelGene_140415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	197.87425861446	619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	465	830	51102	10095	FALSE	25	ACCTTTTCATGTATTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDGVLYCVCHKSTYSSLPDDYNCKVELALTSDGRTIVCYHPSVDIPYEHTKPIPHPDPVHNNEDTHDQVLKTRLEVKDEPLEQGPMIEQLSKMFFTTKHRWYPHGQYHRRRTKLNPPKDR	55067	9977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_10141_27929_28094_35310_35396_48755_48820_51095_51190_53316_53480_54853
802199	contig_9646_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_117454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGATTCTGTTATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292514	291704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_291700_292500
802201	contig_15135_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_119847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAAGGTACACAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17331	16917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_16900_17300
802205	contig_4315_pilon	+	1233	8	Intergenic	novelGene_46734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	176.184736071232	51	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	111	734	163968	180348	FALSE	60	AAAAAAAAAATACTACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFHKQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVWNWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPSEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESDVRGITGVDLFGTTDAVVKHVLETLETE	163857	180847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_164008_168532_168647_168852_168927_172542_172624_174181_174259_175154_175265_180103_180214_180330
802206	contig_7171_pilon	-	1002	8	Intergenic	novelGene_101190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_7	351.247746742718	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	288	752	49603	37659	FALSE	5	CCCTGTGTCTCTGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50438	37408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49818_50365
802207	contig_5020_pilon	+	793	5	Intergenic	novelGene_27880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1180.79324502641	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	185	487	124540	125772	FALSE	10	TCAACCTTGGTGTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118482	126078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119504_124503_124547_124909_125091_125657
802208	SIRV6	+	312	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	558	3	392	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
802209	SIRV6	+	301	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8116	14	623	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
802210	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
802211	contig_12810_pilon	+	1735	1	Intergenic	novelGene_145698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272920	274655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_272900_274700
802214	contig_8702_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_157721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGTGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12967	13686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_13000_13700
802216	SIRV6	+	269	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	25	1295	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
802217	contig_5003_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_120193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTTTTCAGGGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81521	82883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_81500_82900
802218	contig_5958_pilon	-	2739	8	Intergenic	novelGene_140080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	20.6150331514828	1	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	129	1199	114807	108463	TRUE	25	TAAGCCAGTAAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQIYQAQRKVIGCGNSELSERLYDVGYQNIVNIDISEVVIKQMKEHNASRRPQMSFLKMDIMQMQFPDASFQVVLDKGTLDAVLTDEEEKTLQQVDRMLAEVGRVLQVGGRYLCISLAQAHILKKAVGHFSREGWMVRVHQVTNSQDQVLEAEHQFSLPVFAFIMTKFRPVPGSALQIFELCVQEQGKPTRLESAERLAEAVLERQQYAWLCSQLRRKSWLGSVSLDLCNGDTGEPRYTLHVVDSSAVKPSRDNHFAIFIIPQGRETEWLFGMEEGRKQLAASAGFRRLVTVALHRGQQYEGMDSIQAELSARVMELAPVGMPAQQQVPFLSVGGDIGIRTVQHRDCSPLSGDYVIEDVQGDDKHFFRRLIFLNNRNVVQSEARLLKDVSYREETQKG	116605	101615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_102662_103971_104104_106592_106812_108319_108483_110724_110921_112593_112794_114152_114906_116575
802219	contig_17880_pilon	-	1303	9	Intergenic	novelGene_167329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	53.6748020490062	107	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1293	11	1303	46189	31440	FALSE	50	ATAGAAAAAAAGTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEDVNALLVQACRLVPLSQNHLVSKVSQLIHHLLNRLQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKYLPDSVGKTGLLMKLSDPAQSDPEVRRAAVHCMANLCLSVPGQPYLDEPYQSICFQTFLTTLQSPKLSDMDDITFCMLLQNALKGIQSLLNSGKMKLTLAEELGALLAVLKKAMFHGLPGLNIEIPTVLYPTLLPQYDGRPPAKPQQSESCASRPTVNKKKKAKVKPEKVHQGEEAEEESNGEIEAAAATGRVHLHKGNTQCPSSPGVQSLPLDGSGAAGKDRVSSPFSSASWKRVSSSESDYSHAEGGMQSKMRSYQAKVRQRALACFLSTIKS	46199	31439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_31501_33344_33638_35770_35909_37047_37150_39669_39785_40628_40745_41000_41142_43188_43297_45970
802222	contig_12543_pilon	+	2235	4	Intergenic	novelGene_168387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	43.3666538560063	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGTCCTTTTGCGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386611	395834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_386718_387512_387585_391289_391351_393838
802224	contig_4845_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_53652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1261	1656	460836	460441	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCKPTDSKKKVIQVELPWCGNSTLHLLCDLGEGNHSTNVCLTFTFKRTGKCRDFNLLNSSLLTLIPTPQRETKTSPGWMAEVLFISHYGLCLIHSVSQCPWAAPVCTLQLLGIKQRVSQAAGSALEEEYR	462096	460136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_460100_462100
802225	contig_19132_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_169998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAAGTGCAATGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384197	383447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_383400_384200
802226	contig_1759_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_171351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGGCAGAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118344	120372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_118300_120400
802227	contig_1244_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_38078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTTGACAGCAACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300633	1298442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1298400_1300600
802232	contig_6062_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_5312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814069	814852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_814100_814900
802233	contig_9239_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_137202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247314	248358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_247300_248400
802236	contig_5947_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_101460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTACTGAGTTTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30477	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_29900_30500
802237	contig_8317_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_19992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16412	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
802238	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	51	525	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
802242	contig_14176_pilon	+	2335	9	Intergenic	novelGene_74847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	91.1766828745157	1	112	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	182	778	247724	271823	TRUE	35	CATTAGCTTAACTTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRFAKYYKMENGSEYRTLLKAFGIRFDVLVYGNAGKFNIIPTIISAVAAFTSVGVGTVLCDIILLNFLKGADQYKAKKFEEVNETMLKVAASANPVYPSDQTTEEKQSTDSGAYSIGH	246030	273757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247693_247832_248399_248537_270173_270268_270557_270624_271207_271286_271709_272632_273008
802243	contig_1406_pilon	-	723	2	Intergenic	novelGene_25462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCTGTCTTCTGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680342	678968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_679074_679724
802244	contig_3386_pilon	-	1489	7	Intergenic	novelGene_34593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	75.9583219052835	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	746	1267	522114	518621	FALSE	35	AACTTGAAAAATTTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCAKKGERECHIVVLTDEDSVDWDEDHPPPMGEEYSQILYSSKLYRFFKYIENRDVAKTVLKERGLKNIRIGIEGYPTCKEKIKRRPGGRSEVIYNYVQRPFIQMSWEKEEGKSRHVDFQCVRSKSLTNLVAAGEDVLEDQEILMHHPPQVDELDRLNAPLSQMASNDFQD	531521	518398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_518914_520332_520444_521996_522195_523203_523439_523515_523637_523989_524093_531315
802248	contig_11702_pilon	-	931	8	Intergenic	novelGene_142011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_7	62.535540915155	1606	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	104	811	535701	531292	FALSE	10	TGTGAGTGTGCACGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRNARPEDLMNMQHCNLLCLPENYQMKYYFYHGLSWPQLSYIAEDENGKIVGYVLAKMEEDPDDVPHGHITSLAVKRSHRRLGLAQKLMDQASRAMIENFNAKYVSLHVRKSNRAALHLYSNTLNFQISEVEPKYYADGEDAYAMKRDLTQMADELRRQLELKEKGRHVVLGPIENKVEAKGNSLPSSGEACREEKGLAAEDSGGDSKDLSEVSETTESTDVKDSSEASDSAC	535804	531171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_531529_532311_532397_533590_533636_533818_533935_534024_534071_534740_534800_535082_535182_535680
802252	contig_10951_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_61641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	454	1362	18	1379	292629	291268	NA	25	CCCAGCGATCAAGGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQEVQMQKKRNLVQGSQASQLSLQPKNHGTDQSRPKSGQPHPHHQQMQQQMQQHFGNSQPEKSCENPSTSRNHHNHPQNHLNQDIMHQQQDVGSRQQGSGVTSEHVSGHNPMQRLLTSRGLEQQMVSQPSIVTRPSDMTCTPHRPERNRVSSYSAEALIGKTSSNSEQRMGLSIQGSRVSDQLEMRNYLDIPRNKNLAIHNMQSRVDHTVAPEIRLSDCQTFKPSGASQQPQSNFEVQSSRNNEIGNPVSSLRSMPSQTFRISQNTGPPPIDRQKRLPYPPVQSIPTGNAVPPRDSDNACHQSFMQSLLAPHLSDQVIGSQRSLSEHQRNTQCGPSSAIEYNCPPAHESVHIRRESESQNRESCDMPLNTINARNSTLNIPFSSSSSSGDIQGRNTSPNVSVQKSNPMRITDSHGTKGHMNPPVTTNMHGVARSALPHPSVSHGSADQGPPVRQTNSSV	292646	291266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_291300_292600
802258	contig_10765_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_122984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	170	529	483827	483468	NA	15	GTGCCGTGGTTAAGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLYLPQWTNKCRKRERKEDEETEAQFVQVPSPGSPRVPLQCSSRSVLPTALAVWELRKLIGLHSPLLCSLFTRWCQCGFQACGTSSTWSLLEMQILKPHLGPLMEWGSAFQVISGT	483996	483337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_483300_484000
802259	contig_11215_pilon	-	504	4	Intergenic	novelGene_118972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.7575988543909	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGAGAGATGTGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6573	1794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_1976_4789_4994_5547_5569_6475
802260	contig_1428_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_158407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134985	135522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_135000_135500
802262	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_95776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
802263	contig_6048_pilon	+	1820	9	Intergenic	novelGene_73114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	374.17206519862	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	69	857	909094	1224074	FALSE	40	TTAACTAAAATTGGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTANLFVEETESFVLQSSPKSSLYRLHARM	909025	1225037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1223992
802265	contig_13300_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_125785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	352	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	232	570	157718	157380	NA	25	CATGCGTCCCTGCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELLRGHLPAPALHGTHLECLRLREYPELLAGGKVQKSGFHSEYSYNTAYTQAPSDYRYHSYRSFQTPQHPSFLFHNMFLSWSLSYLPTVQSCWNYGFSCSSDEVPALGLTRSGYPDPAIGYENKALMLCSGSFVAAVTDFRGQKTPIPNTLSTNGSSNASLFSCPTGSFSSFYAVIRPFYLTNSSGVY	157949	157051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_157100_157900
802268	contig_20596_pilon	+	1873	11	Intergenic	novelGene_157227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.35609943282828	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	201	1220	45840	69001	FALSE	15	TCCATCGGTTAGTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETVAEFIKRIFLKIPMTNIMTILKAWDFLSESQLQTVNFRQRKEPLVQELVLLCEEKCASLNDAALLDIIYIQVHRHQKLWDVFKMNKGPGEDVDLFDIEQFKSSFTKILQRALKNVTVSFRDAEENAVWIRIAWGTHHTKPNQYKATYVVYYPQTPYVFMSLSRLKRNIPLLDQALMIASKHHQIVKIDLRSRYLDSLKAIVFKQYNQFFETHNSTAPLQETSLWLDTNMDLRVIHENKIEKERVQRVTRETFGDCPQPRLEFAQYKLETKFKSNLNGGILADREEPLRCMIKFSSPHLLEALKSLAPAGIADAPLSPLLTCIPNKGMNYFKIKDK	41681	69654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_41872_45829_46011_54236_54283_56140_56201_56494_56572_59511_59689_61250_61353_64988_65053_66344_66458_68539_68667_68918
802269	contig_4364_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_2948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533275	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
802270	contig_19908_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_167619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACCAGTTGCCGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72250	73267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_+_72200_73300
802271	contig_4659_pilon	-	198	3	Intergenic	novelGene_118165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	668	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCGTCCTGATAACATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91130	87311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87390_90900_90924_91033
802272	contig_15021_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_26924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82685	81746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_81700_82700
802275	contig_7963_pilon	-	681	5	Intergenic	novelGene_58348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1215.48570538695	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	306	524	40037	38897	TRUE	20	TCTCTGATTCCATGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSPGTARRTILEELDGPRVEHAVQTQLRAGRGLHPEAPRLNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	43669	38409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40220_43546
802276	contig_9982_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_55783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCCAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660370	661140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_660400_661100
802277	contig_13015_pilon	+	1178	11	Intergenic	novelGene_165564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	50.2554474659215	478	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	422	991	411270	427161	FALSE	45	CAATTGAAAATAATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAPKLEERLKALTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTDVEYETFDILEDEEVRQGLKAYSSWPTYPQLYVKGELVGGLDIVKELKENGELLPILRGEN	396067	427348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411141_411310_416546_416720_416945_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423169_423257_423351_427110
802278	contig_10003_pilon	+	1875	3	Intergenic	novelGene_88149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTACAAATCACACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373887	387091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_374497_380671_380845_385998
802281	contig_12250_pilon	-	1284	8	Intergenic	novelGene_80695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.326713358727	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401303	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398781_398952_399054_399134_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400105_400562_401200
802287	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
802291	contig_7078_pilon	+	2453	1	Intergenic	novelGene_130134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACCCAAAAGTTTTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128265	130718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_128300_130700
802292	contig_7342_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_71142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGCAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284369	284021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_284000_284400
802296	contig_8059_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_111102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATGTCATCCAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201925	203175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_201900_203200
802297	contig_17814_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_168523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCACAGTCGCCATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100672	101244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_+_100700_101200
802298	contig_10082_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_63879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACGTTCTGTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253987	255446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_254000_255400
802301	contig_17436_pilon	+	2002	5	Intergenic	novelGene_164178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.2731349327133	11	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	32	541	77842	82805	TRUE	60	AAAAAAATAAACCTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGSGSFRSVMSQERDYGRWTISSSDESEDENAKLDRPSTSSLPPCQVGCSKRATVHLFRGSASRPQKENVTREIQQRGSRLQQFHLLKGRKVVPRKTSAGVCLVVTMSCSQKRSRSRLGKWRSKRRKARFLPKATQQKGLETMALLSGTASKRRRKMSTRHQGYFVSFIWDPYFFSSV	68788	85033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_68813_77834_78303_81547_81592_82800_83636_84402
802302	contig_3948_pilon	-	1491	11	Intergenic	novelGene_53414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	215.456352888468	1	96	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	106	819	1975758	1950386	TRUE	10	GCACTGGCTTTGTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCAHGKNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVSIWHKCDGDSGQVL	1975863	1933180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950371_1950430_1951138_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975575
802303	contig_20493_pilon	-	1187	10	Intergenic	novelGene_86411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	64.3186511743591	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	296	1126	50506	37388	FALSE	5	CTTCTGCCTGAGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAAGGWGPCTPLSAHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55241	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46062_50462_50565_54457_54665_55211
802304	SIRV6	+	225	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-390	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1895	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
802307	SIRV6	+	373	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1474_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
802308	contig_1694_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_144925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAACCACAACCACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454967	454432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_454400_455000
802309	contig_3202_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_167392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCAAAAATACTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45429	46374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_45400_46400
802310	contig_50_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_122233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATGTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131124	130712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_130700_131100
802312	contig_3233_pilon	+	1180	10	Intergenic	novelGene_56570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	264.227595497182	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	173	607	740857	745305	TRUE	15	CCCAATGGGATTGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQIG	738728	748042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745296_745378_746325_746424_746936_747016_747718
802313	contig_8571_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_169193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547651	544705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_544872_546430
802315	contig_10143_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_163340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTTAAGATATATGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209979	210377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_210000_210400
802320	contig_12292_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_167027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGAGTCCCTGGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457001	457386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_457000_457400
802323	contig_15304_pilon	+	1423	4	Intergenic	novelGene_30593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCGACAGGGCTGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64415	66403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_64894_64990_65315_65400_65726_66107
802326	contig_960_pilon	+	1464	2	Intergenic	novelGene_108309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGCTTTCTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044167	1045781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1044355_1044504
802327	contig_14855_pilon	+	1381	3	Intergenic	novelGene_146047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	359	667	654004	654448	TRUE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHSACSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	653645	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_654205_654340_654972_655464
802328	contig_14980_pilon	-	1038	8	Intergenic	novelGene_78218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	8.9259996296076	393	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	35	910	240461	203038	FALSE	0	TGGTCTGGTTTGGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVALSEAEKVYIVHGVQEDLRVDGRGCEDYRSIEVETDVVSNTSGSARVKLGHTDILVGVKAEMGTPKLEKPNEGYLEFFVDCSANATPEFEGRGGDDLGTEIANTLYRIFNNKSSVDLKSLCISPREHCWILYVDVLLLECGGNLFDAISIAVKAALFNTRIPKVRVLEDEEGSKDIELFDDPYDCIRLCVENVPCIVTLCKIGYRHVVDATLQEEACSLASLLVSVTSTGVVTCMRKVGKGSLDPESIFEMMETGKRVGKVLHTSLQSVLHKEESLGPKRQKVGFLG	240495	202909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_203143_206114_206271_207925_208050_212379_212451_216619_216786_228506_228602_228877_228980_240404
802329	contig_3252_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_61494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288460	290432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_288500_290400
802332	contig_10011_pilon	+	1722	4	Intergenic	novelGene_68020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.6938866743962	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAAAGATCATGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29911	35566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_30000_31694_32737_34850_35230_35353
802333	contig_4125_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_25264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGGCTTGAACTGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3069587	3058042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3058739_3059284_3059364_3061732_3061902_3063926_3064032_3069428
802336	contig_5059_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_140708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTCTCTAGGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169364	167941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_167900_169400
802340	contig_15991_pilon	-	1940	2	Intergenic	novelGene_70933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7327	junction_1	0	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGGCCTACGTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105763	102550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_103703_104975
802341	contig_11096_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_143482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATAAGTTCCTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274794	272532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_272500_274800
802342	contig_5136_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_126630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGATCCCTGGGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273351	275138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_273400_275100
802343	contig_9363_pilon	+	802	5	Intergenic	novelGene_6720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCCGAAAGTCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370872	1372956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1371214_1371309_1371519_1371639_1371726_1372683_1372767_1372873
802348	scaffold_13609_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_124411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAGAGAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573382	576025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_573400_576000
802349	contig_15047_pilon	-	1668	3	Intergenic	novelGene_52293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.5	34	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	861	1244	131962	129138	FALSE	5	TCTGGCTCTTTAGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGRE	132822	128713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129148_130052_130198_131733
802352	contig_16768_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_168313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGCAGAAGCATCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20579	19372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_19400_20600
802354	contig_7056_pilon	-	1976	14	Intergenic	novelGene_43692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	83	junction_1	96.7625655036091	109	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	311	1522	910814	907116	FALSE	25	TGTATGCCTCAAATGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLALRDRLHAAEQESLRRSKELNLVLDEIKRAVSERQALRDAEGNRTWGRLTEDPQLKPWNVSHKHVLHLPTVFHHLPHLLAKESSLQPAVRVGQGRTGVSVVMGIPSVRREVHSYLTDTLHSLISELSPQEKEDSVIVVLIAETDPQYTAAVTENIKALFPMEIHSGLLEIISPSPHFYPDFSRLRESFGDPKERVRWRTKQNLDYCFLMMYAQSKGIYYVQLEDDIVAKPNYLSTMKNFALQQPSEDWMILEFSQLGFIGKMFKSLDLSLIVEFILMFYRDKPIDWLLDHILWVKVCNPEKDAKHCDRQKANLRIRFKPSLFQHVGTHSSLAGKIQKLKDKDFGKQALRKEHVNPPAEVSTSLKTYQHFTLEKAYLREDFFWAFTPTAGDFIRFRFFQPLRLERFFFRSGNIEHPEDKLFNTSVEVLPFDNPQSDKEALQEGRSATLRYPRSPDGYLQIGFFHKGVAEGEVDPAFGPLEALRLSIQTDSPVWVILSEIFLKKAD	911298	906661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_907140_907222_907336_907435_907524_907605_907685_908086_908281_908408_908517_908664_908796_909185_909301_909496_909573_909816_909931_910224_910272_910691_910826_910912_911054_911140
802355	contig_8617_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_73494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCTAGAGGTGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63555	63777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63600_63800
802356	contig_11370_pilon	+	1125	8	Intergenic	novelGene_98755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	50.2820615556454	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	59	1003	153583	155741	FALSE	5	CCCCTGCTCCACTTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAASPGASVMDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTKEYKTSFHALSSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPPDRRRGYKNVFNALIRIAREEGVLTLWRGCVPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIVKTRIQNMRTIDGKPEYKNGLDVLVKVIRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG	153524	155863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_153678_154249_154403_154485_154693_154868_154960_155046_155138_155225_155326_155403_155456_155585
802358	contig_14176_pilon	-	956	3	Intergenic	novelGene_74865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	49.5	1897	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCCGGCTTCTGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483867	480418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_481183_483229_483346_483791
802359	contig_6794_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_149002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATATTTTCAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14151	13109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_13100_14200
802361	contig_19892_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_158954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTATCCTTGTAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59454	60107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_59500_60100
802362	contig_2799_pilon	-	2256	2	Intergenic	novelGene_85493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555969	552879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_553036_553869
802365	SIRV4	-	465	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1058	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
802366	contig_3942_pilon	+	476	5	Intergenic	novelGene_128747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5574.63857012273	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	48	443	793521	795466	FALSE	35	AACTGAAGCAGTAACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQPAPGAASARRHHRAFSAPACPEVQLRQDDLPQVLRSPAPPCCQLPQEEVRPHQQPAPQKEGQIRAPLSRFPCFLLMASSQAP	792267	795499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793839_795082_795179_795313
802367	contig_6440_pilon	-	2171	4	Intergenic	novelGene_161670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1.88561808316413	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	238	1314	60239	51854	FALSE	15	CTGGTTTCTCCAGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGLHHPGLESSYVGRPRDTRSSSGGSGSSASARRLRTVGRSETGAGAQPQPSGPRSTSGALATLRLAGARTAAGREAKMRATPLAAPAGAPSRKKRLELDDDLDAERPTRKRTQNQSQPLLPPCLLPLSPPRAPDPAPTVATASRLGPYILLEPEEGGHAYRALHCPTGNEYTCKVYPACEALAVQEPYARLPPHEHVARPTEVLVGTQLLYALFKRSHGDMHSLVRHRRRLPEPEAAMLFRQMAAALAHCHQHGLVLRDLKLRRFVFTNRERTKLVLENLEDACVLTGPDDSLCDKHACPAYVGPEILSSRTSYSGKAADVWSLGVALFTMLAGHYPFQDSKPALLFGKIRRGAFALPEGLSAPARCLVRCLLRREPADRLTATGILLHPWLREDPCCLAPSRSHLQEADQVVPDGPGPEEAEEEEGDQEVGLYG	67465	50996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_52347_56207_56501_59948_60240_67228
802370	contig_1037_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_84586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATCATCTTCTGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60192	62489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_60200_62500
802371	contig_15021_pilon	+	2020	3	Intergenic	novelGene_26997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	20	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1452	1805	487254	487607	FALSE	35	TCTGGATAAAAGACTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKHRDVVKTDFLQYSITKIKQRHIYLERLGRYQTPDKKGQTQVLNPSLKDIFRVSEAEFLVKTACSSPEEFEVFKKLLAREEEEGPGGCTSDDSASSDGDVEDRDAEEEFTDGRD	483469	487822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_483516_484302_484845_486390
802374	contig_6048_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_73248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTGTTTGTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1970421	1971047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1970400_1971000
802375	SIRV4	-	515	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	102	0	102	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5056	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
802376	contig_16930_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_139148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAATCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68378	70261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_68400_70300
802377	SIRV2	-	542	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1095	0	-68	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4800	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
802378	contig_6233_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_74823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	125	412	418966	418679	NA	30	ACATTCTGAGGATGCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLLSFCLRLLPGSFLPPILILLSFLVSFLPPHPNEVRKFLMASPYSPDSEFSLKASLMERSLQGRGDPPPGSCSATNLLSELEQVALPLGASVSPFVSLGLASMRPKVPSSSVIHFVLPHNLVLSEFPLAQTFTR	419090	418089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_418100_419100
802381	contig_11227_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_163191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTGCCACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208949	208311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_208300_208900
802383	contig_10749_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_133498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226827	227817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_226800_227800
802385	contig_11978_pilon	-	2806	1	Intergenic	novelGene_62867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	2141	2554	601495	601082	NA	10	TTTTTTCTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQHWQHGRVPGRMGPFTHIGMFVVDAFLAPSHLQCSLKPEASQRMGWRATPQGDTLCCATCVCPRVLQSVVLLSDSQLHLFLQSQLSVPEIEACVQGRSPMTVSDAILHYAMSNCGWVQEERQGSSHLAKGDQPKR	603635	600829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600800_603600
802387	contig_11873_pilon	-	1333	4	Intergenic	novelGene_175439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.86744175568088	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	192	308	278961	264158	TRUE	25	GCTGATTGGAAGACATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERFTVYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASKLLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTIPNVRLQPETGESMRAFGKNNSYGKSLSNSKH	318117	178132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11873_pilon_-_179130_264129_264274_278960_279101_318065
802388	contig_9727_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_86357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	277	594	556500	556183	NA	35	AGGAAAATATTTGGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMIHGQGTSCLLSSPQLCLRTASSPECLLSQTPGFSLCLWSLEKQGSGRKPGAPQSPAMAQFLKHPRQAWKSLTPPLPRGPPCLCEVRGMPWHRRQPPAQPDFS	556776	555199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_555200_556800
802389	contig_5590_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_163067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTTCCGCACTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799182	797956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_798000_799200
802390	contig_2799_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_85525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640787	640382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_640400_640800
802394	contig_3525_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_135116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAAGAAACTCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37766	39019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_37800_39000
802395	contig_3525_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_135117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTACTGCTTCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39121	39625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_39100_39600
802396	contig_11171_pilon	+	2253	1	Intergenic	novelGene_48551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGACCCATGGCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56486	58739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_56500_58700
802397	contig_11003_pilon	+	1047	4	Intergenic	novelGene_105431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	128.085908670704	30	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	142	699	56015	72689	FALSE	5	TGCCGCAGCGTCCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFPWAHSPWQPRAPLGLCPSSRCPCNRHCLTLCHLLCTCPGSPQLPPLPGS	55873	73037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61025_72538
802398	contig_14142_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_120556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGGGAGGTCGGAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432443	433407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_432400_433400
802401	contig_5092_pilon	-	2107	6	Intergenic	novelGene_62289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	38.3426655307114	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	474	1334	435443	422391	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELCEGVDLPRGQARDSGENEPKELEGPLPRGQESLGAKPDAVWSQNYQLPRKYGENSNSKHRDRIRVSEEVMMVVQEMKKYFPSERHSKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVTMYSLEKLTTIASEHTSKNTDTFAAVFSFLSGRLVHISEQATSILNCRKDFLESSHFVELLAPQDVRVFYAHTAHAQLPSWNNWTQRAASRYEFAPVKSFFCRIRGGEGGEQENYCPFRIIPYLIHVHSPTQPGAEPCYLMLVEKIHSGYEGESGISAF	435916	421617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_422557_423914_423967_432141_432344_433559_433676_434499_434646_435264
802402	contig_4686_pilon	-	2206	6	Intergenic	novelGene_118564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_1	219.051044279638	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	964	1941	664076	652253	FALSE	20	TTGTCAAAGCTGTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMVKSKWDHFGSNFEALSVWITEKEKELNALESSSSALDVQISQIKVTIQEIESKISSITGLEEEAQSFAQFITTGESARIKAKLTQVRRYWEELREHAQCLKAAILGHLSQEQQFEENLRKIQQSVSEFEAKLADPVKICSSATETYRVLQEHMDLCQALECLNGTVTAFSASARKVVTRESSVQEAAALRQQYEAMRSRAKERQTALESRLAHWQRLEKELSTFLTWLERCEAIASSPEAGISADRVKVEGELQLIQALQSEVVSQASLYSNLLQLKESLFSVASGEDVKMMKLHLEQLDERWRVLPQIISKRLGFGFSLSF	665039	651987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_652451_657320_657445_658173_658362_660058_660158_660543_660772_663935
802403	contig_21104_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_175441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCACTTTGTCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4180	2914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21104_pilon_-_2900_4200
802405	contig_15897_pilon	-	1797	1	Intergenic	novelGene_49505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGTAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74619	72822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_72800_74600
802406	contig_1694_pilon	+	1583	3	Intergenic	novelGene_144960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAAAAAAGGCATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538527	1677963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1539811_1560248_1560410_1677824
802407	contig_3163_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_168074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAAGCCTAAGAATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877502	876644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_876600_877500
802408	contig_8365_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_150914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTATGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105483	106456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_105500_106500
802409	contig_4754_pilon	+	1190	5	Intergenic	novelGene_35896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	78.1408983823452	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATTTTTGAGTGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114738	167305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114787_119671_119871_121506_121634_121913_122010_166585
802410	contig_6344_pilon	-	926	5	Intergenic	novelGene_157098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	161.025425011083	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTGGATCACCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847334	836287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_836519_837526_837634_839176_839276_846648_846758_846954
802411	contig_14528_pilon	-	1838	11	Intergenic	novelGene_111272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	120.558533501366	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	385	771	197232	195201	TRUE	0	CTTGGTTCTTTGCCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVWFQDTVTDVDKSWKELSNVLSGIFCASLNFIDSTNTVTPTASFKPLGLANGTDHHFLRYAVLPREIVCTENLTPWKKLLPCSSKAGLSVLLKADRLFHTSYHSQAVHIRPVCRDARCTSISWELRQMLTVVFDAFITGQGKKDWSLFRMFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENERPHRCPSCMPSATSAAMGCRTGN	200954	190724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195275_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459_198588_200925
802412	contig_5084_pilon	+	705	5	Intergenic	novelGene_64671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1550.29714893629	39	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	92	394	1751538	1755688	FALSE	15	GCACGGTTGTCTCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVGALFQKCRLSGSVFITLKKYDGRTKPIPRKGTVDSFEPSDNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMAYSNLLRANMDGLKKRDKKSKSKKSKAAQ	1751446	1755999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751552_1751666_1751720_1752165_1752279_1754409_1754443_1755598
802413	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
802414	contig_15172_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_158768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAGCAGCATAGCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262714	263779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_262700_263800
802417	contig_3004_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_127477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTCTCTCTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253802	255297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_253800_255300
802419	contig_8317_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_19555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTTCCTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
802422	contig_4659_pilon	-	261	3	Intergenic	novelGene_118167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1327	junction_1	9	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTAATGCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91069	87467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87670_90900_90924_91033
802424	contig_10800_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_152630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCAGTCAGCTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534084	535783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_534100_535800
802425	contig_9828_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_172248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTGTATATCAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102225	104221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_102200_104200
802426	contig_11386_pilon	+	1346	5	Intergenic	novelGene_82777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	511.686610631937	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	288	1049	17940	24897	FALSE	25	AGAGTCCAATGCCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRVSVFSIVTLVVCGILSKSLVFTVLLVVTQRSAAL	16666	25194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_16859_17844_18037_19625_19980_20816_21022_24791
802427	contig_8865_pilon	-	1089	2	Intergenic	novelGene_164451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	807	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	265	582	426830	376918	FALSE	50	AAAATAGAATGAGTTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKLPRNWEFNLKAEAGKIARSQSVMTGVQMAAFHSSSTLNPLERPIKMGWLKKQRSIVKNWQQRYFVLRTQQLYYYKDEEDMKPQVPSSLCPQDCVSPSPGME	427094	376410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_377175_426769
802429	contig_12250_pilon	-	1045	6	Intergenic	novelGene_80641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.016420343085	399	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	48	455	379717	377358	TRUE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRATECWDSLHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHQPPRPLRAAPLPHPHLLGCTPDPTWSRPTSAAQ	380569	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377460_379067_379194_379537_379719_380523
802430	contig_17171_pilon	-	1260	7	Intergenic	novelGene_147387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	74.7724325314261	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	20	373	350839	343976	TRUE	45	AAGTAAAAGATGCAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGRAKMQLRLWLLLTVQLAALPGSSAFHQTPESKMVQIHETVTLSCDMKTSTTTRVYWLRQRQDPSPKSHPEFLPLAIWDPVKKAVFGEGVEQEKLNVSYNRTCDHREPPADIREGNSAERG	350858	333597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_334272_337314_337352_338784_338875_343889_343980_347342_347397_347452_347706_350796
802435	contig_13206_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_161901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCATCTGATGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169178	167223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_167200_169200
802436	contig_16882_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_148239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	6	341	445593	445258	NA	80	TCTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMRMAILGTWSRFFVHLPLGQEDSNREYDEVGLGCREAAEVVIGRVSETGGILENRLRGGRRCLASMSLRPQPLLPCTIILEIITRSGAVITVIYYYYYYYLLSARSDTFYA	445598	444006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_444000_445600
802437	contig_15628_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_147705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACATATTATATCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165091	167075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_165100_167100
802438	contig_8138_pilon	+	1094	4	Intergenic	novelGene_52432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	500.631601080076	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	204	518	280295	306552	TRUE	0	TCTTCCTTTCTTTCCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280091	307518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306381_307002_307391
802439	SIRV6	+	368	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
802447	contig_5084_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_64490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	764	1369	95343	94738	NA	30	GCAACTTTGAAAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQVSVSCFSGSVLVLG	96106	94454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_94500_96100
802450	contig_151_pilon	-	2179	1	Intergenic	novelGene_132574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATTTCACAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231168	228989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_229000_231200
802453	contig_9014_pilon	-	718	5	Intergenic	novelGene_106785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	50.1765632541728	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	17	676	149986	147517	FALSE	5	CGGGGCCCTGCTGTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIFSVYVVNKAGGLIYQLDSYAPRAEAEKTFSYPLDLLLKLHDERVLVAFGQRDGIRVGHAVLAINGMDVNGKYTADGKEVLEYLGNPANFPVSIRFGRPRLTSNEKLMLASMFHSLFAIGSQLSPEQGSSGIEMLETDTFKLHCFQTLTGIKFVVLADPRQAGIDSLLRKIYEIYSDYALKNPFYSLEMPIRCELFDQNLKLALEVAEKAGTFGPGS	150002	147474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_147596_147868_147996_148877_148982_149517_149693_149811
802455	contig_9481_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_149689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCGAGAAGGGAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478669	480044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_478700_480000
802456	contig_4759_pilon	+	2108	6	Intergenic	novelGene_106347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.0495385427476	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	6	1001	959666	979334	FALSE	35	TAACTTGAATCCTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMAHARDARGRCSWTSQIYYSEGGQAAAIGRFKNRIVGSSQPGNASITISNMQPADTGIYICDVNNPPDFAGKNQGILNVSVLVKPSKPLCSIQGIPETGHPVSLSCLSVIGTPAPVYYWYKLEGKNIIPVKESFNPTTGILVIGNLTNFEKGYYQCTAINNLGNGSCEIDLTTSHPEVGIIVGALVGSLAGAAIIISAVCFARNKAKAKERKRNSKTTTTELEPMTKVNQSTEYTAMPPEEAIQVEATQPPSTLETDPATILEPDHEPDPELEPASESALEPDSGPEPLPVPEHEIELELVPELEPEPEPEPEPGVAVEPLCDEEEGAVKT	959660	980441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_959714_965824_966024_971963_972120_972444_972565_975163_975309_979006
802458	contig_18116_pilon	-	1784	11	Intergenic	novelGene_175450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	9.51630180269625	177	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	309	1727	124986	118076	FALSE	5	CTTCCCGCGCCTCAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMFSEQAAQRVPTLLSPLSANTPTFARVPVVAYTNSSQPFRLGERSFSRQYAHIYATRLIQMRPFLESRAQQHWGSGVRVRKLCELQPGEECCVVGTLFKAMQLQPSILREVSEEHNLLPQPSRSKYIHPDDELVLEDELQRIKLKGNIEVQKLVTGMVLAVFGSVGDDGKFLVQDHCFADLAPQKAVAPLDTDRFVLLVSGLGLGGGGGESLLGTQLLVDVVTGQLGDEGEQCSAAHISRVVLAGNLLSQNTQSRDSINKAKYLTKKTQAASVEAVKMLDEILLQLSASVPVDVMPGEFDPTNYTLPQQPLHPCMFPLATAYSTLQLVTNPYQATIDGVRFLGTSGQNVSDIFRYSSMEDHLEILEWTLRVRHVSPTAPDTLGCYPFYKTDPFIIPECPHVYFCGNTPSFGSKVIRGPEDQTVLLVAVPDFSATQTACLVNLRSLVCQPISFSGFGAEDAEDLGGPDLRP	127961	118018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_-_118240_118624_118727_119215_119344_119582_119741_119931_120013_120218_120418_120624_120740_121011_121136_121401_121524_124760_125040_127706
802459	contig_11449_pilon	+	1577	10	Intergenic	novelGene_170545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	25	junction_7	101.106959621732	109	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	35	1249	38285	182943	TRUE	20	TAAGGTGATTTGAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAAGGKYRSTVSKSKDPSGLLISVIRTLSASDDVEDRENEKGRLEEAYEKCDRDLDELIVQHYTELTTAIRTYQSITERITNSRNKIKQVKENLLSCKMLLHCKRDELRKLWIEGIEHKHVLNLLDEIENIKQVPQKLEQCMASKHYLSATDMLVSAVESLEGPLLQVEGLSDLRLELHSKKMNLHLVLIDELHRHLYIKSTGRVVQRNKEKGRWSSLVKDASPGPLIDVTNLPTPRKFLDTSQYSTPGSSGVREINLQEIKEDLELDPEENSTLFMGILIKGLAKLKKIPETVKAIKERLEQELKQIVKRSTTQVADSGYQRGENLTGENQPRLLLELLELLFDKFNAVAAAHSVVLGYLQQTVGTSLTQQEEIKLYDMADVWVKIQDVLQIQVQPYWQE	38250	241762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_+_38371_59403_59594_74822_75018_98471_98657_105618_105729_127560_127805_145449_145625_182913_183036_236347_236494_241672
802462	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	0	1163	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
802464	contig_7057_pilon	-	721	4	Intergenic	novelGene_123272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_3	1171.3167329501	2267	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTCTGTTATGTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707677	705641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_705875_706664_706709_706884_707201_707549
802465	contig_5954_pilon	+	521	4	Intergenic	novelGene_28418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	217.435558780578	509	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	112	513	97851	99023	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGAPLFFRWLSRRRRRRRPAGPSGGCSTTGVLSMSCPPSARRRAPMPTRKPFVILTRSNKAI	97468	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98841
802468	contig_7078_pilon	-	1300	12	Intergenic	novelGene_130185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	328.098125818008	2	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	278	1300	795828	773202	FALSE	65	AAGAAGTATGAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWK	796280	773201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795853_796027
802469	contig_12964_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_131653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104405	107074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_104400_107100
802471	contig_848_pilon	+	1231	9	Intergenic	novelGene_83341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	635	955	555067	556535	TRUE	5	CTCTTTCACTGGCTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESRTQGIFVAPRTKIPSLSTPTPCIWTRNSVLILRAASLSFSLLEAHKESISSMKIMEGLFSLASWNKFLTSFSLSPSHLETRSEEDSEKNVELFASVATALAK	549174	566231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_549439_551874_552014_552744_552965_555055_555142_555810_555957_556435_556593_559110_559229_563376_563448_566201
802474	contig_9363_pilon	-	1656	9	Intergenic	novelGene_6708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	78.4920378127616	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	85	414	1298867	1292771	TRUE	15	TGCCAGGGAGAGCGGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGEPGVPAASRRPRTLSPPPQAPTSFKMTLDVGPEDELPDWAAAKEFYQKYDPKDVIGRGVSSVVRRCVHRATGSEFAVKIIEVTAERLSPEQLEEVREATRRETHILRQVAGHPHIITLIDSYESSSFMFLVFDL	1299277	1288100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1289120_1289229_1289335_1291198_1291348_1291432_1291499_1292770_1292830_1293102_1293279_1298772_1298886_1299211
802477	contig_14681_pilon	+	1993	1	Intergenic	novelGene_134200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28128	30121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_28100_30100
802478	contig_11719_pilon	+	870	6	Intergenic	novelGene_154778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	59.3214969467224	532	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	232	540	159217	160268	FALSE	5	GGGGTGTGGTTGATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVPNVPQANSDSMVGYVLGPFFLITLVGVVVAVVMYVQKKKRVDRLRHHLLPMYSYDPAEELHEAEQELLSDVGDPKVVHGWQSGYQHKRIPLLDVKT	158002	160598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_158045_158182_158285_159129_159328_159532_159559_159896_160003_160202
802482	contig_11145_pilon	-	981	8	Intergenic	novelGene_160515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	81.9858126104008	66	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	206	979	215710	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284055	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_220053_220176_283982
802485	contig_7097_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_174452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540179	541386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7097_pilon_+_540200_541400
802486	contig_1239_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_150407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACGCTTAAAGAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618340	617346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_617300_618300
802487	contig_2703_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_101840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGGTGCGTATGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279534	1280775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1279500_1280800
802488	contig_6048_pilon	-	2428	11	Intergenic	novelGene_73221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.4759665245722	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	374	2107	1645874	1609163	TRUE	25	AAGTGAGCAGGCCCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661997	1608726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1608987_1609101_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
802490	contig_6361_pilon	-	1095	4	Intergenic	novelGene_23917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_3	130.410463111243	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	927	168	1094	231334	219778	FALSE	40	CACCTTTGAAATCACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVPAEVNSLLPEEIMDTGITLVDDDSIEAVIVSSPIPMETELEEIVNINSTGDSTATPISTEPITVYSNHTNQVAVNTTVTKADSNTTVKPTFPSGLQKLGAQTPVTISANQIILNKVSQTSDLKLGNQTLKPDGQKLILTTLGKSGSPIVLALPHSQLPQAQKVTTQAQSGDAKLPPQQIKVVTIGGRPEVKPVIGVSALTPGSQLINTTTQPSVVQTQQLKTVQIAKKPRTPTSGPVITKLIFAKPINSKAVTGQTTQVSPPVIAGRVLSQSTPGTPSKTITISESGVIGSTLNSTTQTPNKIAI	247797	219776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_219897_226023_226148_230650_231367_247662
802491	contig_8354_pilon	-	1059	5	Intergenic	novelGene_24124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	487.64145383673	46	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	157	411	502371	500999	TRUE	10	CTGTGACTTGGGGGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPQFGGGDPADIIHDFQRGLTAYHDISLDKCYVIELNTTVVLPPRNFWELLMNVKRGTYLPQTYIIQEEMVVTEHVSDKEALGSFIYHLCSGKDTYRLRRRSTRRRITKRAAKNCNAIRHFENTFVVETLICGVV	503691	499976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500465_500838_501091_501670_501822_502359_502471_503634
802492	contig_5954_pilon	-	425	2	Intergenic	novelGene_28587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGAAGACAATAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940341	939614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_939739_940040
802493	contig_3986_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_52711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAGAACTGCCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61577	63010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_61600_63000
802494	contig_10986_pilon	-	871	6	Intergenic	novelGene_71462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	184.749560215985	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	347	652	70698	67011	FALSE	20	CCCCGTAAGCTCTCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	74006	66791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71661_73894
802498	contig_753_pilon	-	1182	6	Intergenic	novelGene_112997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	30.4013157609996	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	751	1062	1254251	1253940	FALSE	30	AATACTAAGGTTTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTPKAYDLLPGDQLVWRGLAGALSTGGVQDADQLLDVSYVGLHLHQHGLMFQAGGSTQNGKSFMERKLDIQMVVLKCFILGTAKIDIINDIIYQVFYTCLS	1270166	1253819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1254463_1255944_1256026_1257046_1257131_1258843_1258876_1269677_1269848_1269994
802499	contig_9727_pilon	-	569	3	Intergenic	novelGene_86297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_2	99	144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	280	438	256119	253928	FALSE	5	TCTTGTGTCTTGGCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGHVPGHTQSRSLLPRSSGGGIWGENPGVLFPALNTLISLARLLNNEGSLLAYSGYGDTDARVTAAIASNIWAAYDRNGNQAFNEDNLKFILMDCMEGRVAITRVANLLLCMYAKETVGFGMLKAKAQALVQYLEEPLTQVAAS	256398	253796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_253985_254217_254308_256107
802502	contig_3424_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_55518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTAAAAAAAAAAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235078	236689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_235100_236700
802504	contig_12638_pilon	-	798	6	Intergenic	novelGene_33317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	368.411509049324	320	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGCCGTGCTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325619	1298307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1302917_1302988_1303534_1303703_1304003_1304087_1310601_1310678_1325582
802506	contig_11285_pilon	-	1318	13	Intergenic	novelGene_5551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333.0311129943	8	47	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	129	1187	744458	741540	TRUE	35	ATGATAAACTTTTGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRAVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGFLPRIIKAAPSCAIMISTYEFGKSFFQKLNQERPRGP	745450	741224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741287_741470_741656_741737_741822_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
802507	contig_3789_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_79871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGGTTTTGGTTTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511746	510925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_510900_511700
802512	SIRV6	+	335	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	534	2	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
802514	contig_6710_pilon	+	536	2	Intergenic	novelGene_97198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACAGTGATGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653378	657175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
802516	contig_12411_pilon	+	2255	1	Intergenic	novelGene_145678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCAACCCCGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333145	335400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_333100_335400
802520	SIRV4	-	465	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	0	1056	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
802521	contig_13645_pilon	+	1568	3	Intergenic	novelGene_146155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATCTTTTTATCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9172	15469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_10497_15105_15159_15278
802522	contig_2646_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_69581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	735	1046	1369906	1369595	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLYFTKHDVLLRGLGSLLITCPKYVRQSLTILDSVEHSGCTSSKTDLFVLLAIHGVFSIFHQHRLIQRHHFFDLPYSLSSFHMHVRQLKTPWLGSGAPESLK	1370640	1369257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1369300_1370600
802524	contig_14744_pilon	+	1005	2	Intergenic	novelGene_65910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	49	369	69238	137099	FALSE	75	TGAAAGAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESDQGVSRGFQTMPSLPPLYDSGSHFQSIWRLVEPFCFLPLPKLLSLWQNHPRLVDSHPLVTSNITHLQKITFL	69189	137735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_136799
802525	contig_5628_pilon	-	1093	6	Intergenic	novelGene_157586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_4	57.946872219301	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	272	898	434334	427956	FALSE	10	TCTCTTGAGCTCAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEGVNKKELASVSNLETGFENRQGNPQVCSVLSTPGAVPRAHMLEDKSHQPGYRPPQTPEPWENYSLGESLGSEPRTVSRRYLSSLKNKLSSGAWRKSYQPETGPGSGTQEPKERIVQELLETEQAYVARLHLLDQVFFQELLKEARSSKAFPEDVVRLIFSNISSIYQFHSQFFLPELQRRLDDWTATPPHWRCDPEAGPLPEDVQ	434814	427760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431764_434266_434492_434700
802527	contig_854_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_36092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCACAGATGAGGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9736	8919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_8900_9700
802530	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
802532	SIRV4	-	516	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	-2	103	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1130	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
802535	contig_3068_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_137635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATCAAGCAACTGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250032	252042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_250000_252000
802536	SIRV4	-	602	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	3	12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7218	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
802538	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
802540	contig_14537_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_158667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTATGAGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122295	120197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_120200_122300
802541	contig_12793_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_164125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248758	248476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_248500_248800
802543	SIRV4	-	311	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1195	15	1195	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3963	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
802546	SIRV4	-	255	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
802547	contig_6589_pilon	+	1989	7	Intergenic	novelGene_25819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	54.5295536587475	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	59	1348	794571	802130	FALSE	15	CTGAGGTGTGTAACTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADFGGDRSKGPSQVYLPGRGPPLREGEELVMDEEAYVLYHRAQTGAPCLSFDIVRDHLGDNRTELPLSLYLCAGTQAESAQSNRLMVLQMHNLHGTKPPASEGSDEEEEEDEEDEEERKPQLELAMVPHYGGINRVRVSWLGEEPVAGVWSEKGQVEVFALRRLLQAVDDPQALATFLREEQARVKPIFTFAGHMGEGFALDWSPRVPGRLLTGDCQKNIHLWTPTDGGSWHVDQRPFMGHTRSVEDLQWSPNEDTVFASCSADASIRIWDIRAVPSKACMLTTTTAHEGDVNVISWSRREPFLLSGGDDGALKVWDLRQFKSGSPVATFKQHMAPVTSVEWHPQDGGVFAASGADNQITQWDLAVERDLEAGEAETDPGLADLPQQLLFVHQGETDLKELHWHPQCPGVLVSTALSGFTIFRTISV	794512	802771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_794710_794873_794992_795210_795371_799231_799446_799573_799717_799956_800155_801812
802548	contig_14661_pilon	-	1922	4	Intergenic	novelGene_47447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	44.9073119510249	74	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	42	377	70794	67371	FALSE	40	AAGAGTCGAGTGCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSSQTGGFHGSIMVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAVKLRNEYGPVLHMPTLKENFKEKGLQNSSDSYGHKQYPDNQGQEVEYLVTGTHPYPPGPGKSAVTY	70835	65825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_67448_68173_68317_69358_69466_70785
802549	contig_3410_pilon	+	2046	3	Intergenic	novelGene_58953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_1	106	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	353	1303	292092	296471	FALSE	10	TATGATTGGTTTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLQRIQLNNPTERVAALQTVGPTAGPVPRAFTSTLEKVGDHQFLLYSGRSPPLSTGLVHLVVVAAKKLVNRLQVAPKTQLDETVLWVVHVSSPINSQALKSRAAKELKTLQDLARKEMLELLEMPANELLQDHQRLWAQLFSPGVEMKRITDAHTPSSLTVNLTLYYMLSCSPAPLLSPALSHRERDQMESTLNYEDHCFSGHATMHAENLWPGRLSTVQQILQLSDLWKLTLQKRGCKGLVKVGAPGIMQGMVLSFGGLQFTENHLQFQADPDVLHNSYSLHGIRYKNDHINLAVLADAEGKPYLHVSVESRGQPVKIYACKAGCLDDPVELTSAPQGHTFSVMVTQPITPLLYISTDLTHLQDLRHTLHLKAILAHDEHMAQQDPGLPFLFWFSVASLITLFHLFLFKLIYNEYCGPGAKPLFRSKEDPSV	291739	297214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_292171_294102_294957_296453
802554	contig_14923_pilon	-	1096	2	Intergenic	novelGene_157753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	587	1096	355598	355089	FALSE	35	ATGCCTCCACAGCAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSIVQGCKRTYLSQRDLQAHINHRHMRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHI	357569	355088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_355651_357035
802555	contig_1090_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_131110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATGCCTTTCTACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316282	315541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_315500_316300
802556	contig_9955_pilon	+	1758	5	Intergenic	novelGene_21382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	72	junction_1	31.2089730686545	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	269	856	574800	580436	FALSE	15	GATTGCATTTGCTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPIWQNKPHGAARSVVRRIGTNLPLKPCPRASFEALLNISDLCLRDAPPVPTLADIAWIAADEEETYARVRSDTRPLRHTWKPSPLIVMQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAASASLTPDFLSPGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDLNRSLLKEEDPAVLISEVLRRKFALKEEDITRKGN	571396	581338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_571503_574376_574487_574747_574960_576188_576511_580330
802562	contig_859_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_132813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAGAATTAGCCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27815	28606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_27800_28600
802563	contig_2799_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_85494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564931	563290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_563300_564900
802565	contig_10626_pilon	-	1577	11	Intergenic	novelGene_138191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.783148190665	2	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	157	957	197901	16095	TRUE	45	CTACACTCAATAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKWLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSRILFHCRPR	199391	10107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_10589_13881_13999_16072_16126_16855_16997_59101_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197899_197996_199329
802566	contig_6842_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_130837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACTAGTCCAGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829930	1830886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1829900_1830900
802568	contig_8683_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_150278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAAATAAGAGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729252	730868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_729300_730900
802569	contig_21394_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_128434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1071	1520	8884	9333	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVSNFSKLLYHSILSNINYSLFLQYSPSCVFGFPNSLQRLTELTNHIKEMAHAVVEAGKSHVCGSGIDFSLALSLCPKALSFLDLWAGKPTALSPVGLSFFGGDGLSSLLWNWLSFKAKLINPLCGSQLSYLHSPTLSPGWESQDRG	7813	9537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21394_pilon_+_7800_9500
802572	contig_18473_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_169649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACACACATTATTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103741	103177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_103200_103700
802573	contig_7963_pilon	+	1005	6	Intergenic	novelGene_58577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	135.080124370686	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	81	770	254848	257509	FALSE	20	TAAATGAGTCTGTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSRHRSDVGHYSFSKRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGDRERNVQIEMAHGTTTLAFKFQHGVIVAVDSRASAGSYIANLRVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254767	257744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_255753_255911_256024_256447_256578_256972_257178_257420
802574	contig_6710_pilon	+	543	2	Intergenic	novelGene_97483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTCCAAGAGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653382	657515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
802575	contig_13481_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_119566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTACAATTAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583049	1580823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1580800_1583000
802576	contig_6608_pilon	+	2201	18	Intergenic	novelGene_162541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	13.6041414414825	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	989	1807	240081	244895	FALSE	10	TGTGCTTTTGGTTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRKQYDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFTVGADTALNTICMTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEDPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWISGKIKESYRNGRVFANSPDSGCVLGMRKRALVFQPVTELQDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHISQKRSGETPV	233375	245289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_233458_234171_234217_234626_234736_234808_234905_235154_235248_236028_236155_237310_237376_237858_237923_238859_239010_239456_239503_239882_239971_240056_240210_240703_240869_242279_242342_242582_242695_244222_244323_244402_244509_244750
802578	contig_177_pilon	+	1445	2	Intergenic	novelGene_41815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	890	junction_1	0	2	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	80	1156	417672	418748	FALSE	35	TTAAGTGACTACTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPHLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415651	419037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647
802579	contig_5261_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_102460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGCCACCACAGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90229	89686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_89700_90200
802580	contig_5261_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_102459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCGGTTGTCGTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89534	89297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_89300_89500
802581	SIRV5	+	426	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7456	1	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
802583	contig_4857_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_48912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1700357	1702625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1700400_1702600
802586	contig_5918_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_99616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACCCATCCAGTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142474	2141378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2141400_2142500
802587	contig_5918_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_99614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	302	622	2138576	2138256	NA	85	CAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHELLSVPSCRDMSLSVGLSNSTVQQFHWQETVFQRHHGSARLTDQGKAMGPMNRTQSCRQGGRRGQFYGLCCGLQACHALRLFTALCSGALHHSTGVFAWPLMA	2138877	2138105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2138100_2138900
802589	contig_10019_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_86704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAACAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441070	440427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_440400_441100
802590	contig_4754_pilon	+	2187	3	Intergenic	novelGene_35910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	7.5	84	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTTAGGTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163163	168014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_163798_164269_164394_166585
802592	contig_21388_pilon	-	815	5	Intergenic	novelGene_136638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	47	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	19	669	28487	21603	FALSE	30	CCCAGTTTTGTAACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPFSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28505	21456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
802593	contig_1443_pilon	+	1771	12	Intergenic	novelGene_28234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	57.9442593367336	1	79	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	752	1663	538016	541708	FALSE	40	TTGATAATAATAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	535994	541816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
802594	contig_14855_pilon	+	1598	7	Intergenic	novelGene_146033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	38.6584042896525	68	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	283	921	650839	654448	TRUE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648557	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_654950_655479
802596	contig_4180_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_8319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCACTGTTCTAGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778901	777915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_777900_778900
802601	contig_6065_pilon	-	880	8	Intergenic	novelGene_132700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_7	182.604065940381	3982	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	15	719	507473	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	507487	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497_499621_501763_501897_503182_503260_507432
802603	contig_8978_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_49447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGAAAGATGTAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578008	1576649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1576600_1578000
802606	contig_14651_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_157223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCACAGAAAGTAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109165	109397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_+_109200_109400
802607	contig_18116_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_175448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTTTCATTCAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73774	73198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_-_73200_73800
802608	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_97721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
802614	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
802615	contig_776_pilon	-	1055	8	Intergenic	novelGene_139935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	114.844882074803	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	361	966	888118	833127	FALSE	15	CAGTTTTAGCTATTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMKLKAISTLLTVINFINNNKKSGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRYYGPIPYGLIRGRIFFKIWPLSDFGFLRDNPNGHRFSDD	932090	833037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834687_834799_857382_857510_861796_861886_863749_863884_888042_888299_911670_911784_932023
802616	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_97341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
802617	contig_10734_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_51322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	978	1313	1518296	1517961	NA	70	ATTGAACAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTRWNGLTKEGYLNQSERERERERESERERECVCVCVCVCVCMCVYITSVSVSVARQFPLTSAYCLFLLPHVVLTVRYQGLHSSAGSPGFFLPVFSALVVQDQISILCRG	1519273	1517732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1517700_1519300
802619	contig_5718_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_110330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCCAACCTTTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552725	552119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_552100_552700
802620	contig_13947_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_173100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6461	8570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_+_6500_8600
802621	contig_15897_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_49552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	49	351	666970	667272	NA	70	TAATGAAAGAGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAKWYSDSAVWLSASQMVGTGGHHPKAFINVAYFLCEAVLPIPHQHSMGRGGSGLFQPHTYHSGPCPGECVAGCKMCAQGVGGPFRACGHRAKLTHEASKKPHILGLSDYPVQFPP	666921	669210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_666900_669200
802623	contig_10437_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_38461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTACCAGATTCACCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097499	1099142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1097500_1099100
802625	contig_6557_pilon	+	1717	4	Intergenic	novelGene_33001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	2.94392028877595	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	546	1295	530347	533579	FALSE	15	GAGTGGAGGCGTCTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLLSGLAACGACVFTNPLEVVKTRMQLQGELQAPGSYQRHYRNVFHAFITIGKVDGLAALQKGLAPALIYQFLMNGIRLGTYGLAESRGYLHTAEGTHSPARSAAAGALAGVLGAYLGSPIYMVKTHLQAQAASEIAVGYQYKHQVFPSQSWKAALAAAMVSGIVVVLAMTPFDVASTRLYNQPTDAGGKGLIYRGILDALLQTARTEGIFGMYKGIGASYFRLGPHTILSLFFWDQLRSIYYKYTK	529801	534001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_530722_532117_532184_533134_533270_533405
802626	contig_610_pilon	-	690	3	Intergenic	novelGene_76740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1631.5	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTCAAAGTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220627	213498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_213767_213950_214263_220517
802630	contig_4388_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_161954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400508	401417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_400500_401400
802633	contig_17144_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_29144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78008	77024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_77000_78000
802635	SIRV6	+	450	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	28	7	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCGAAGACGCTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
802639	contig_6471_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_172091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACACTTTTCAGACTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50470	49878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_-_49900_50500
802644	contig_15939_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_160249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGAGAAACCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25207	23131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_23100_25200
802647	contig_13074_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_153453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAACAAAAAAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583727	586036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_583700_586000
802648	SIRV4	+	363	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTAACAGTTTCCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	4000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
802651	contig_16525_pilon	-	551	7	Intergenic	novelGene_133791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2314.50625884274	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	31	441	97070	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRYPGAMSQIFQMGVNPGSPLGGGEEQKRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97100	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_94940_95016_95668_95725_96924_96975_97069
802652	contig_14935_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_175452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96964	95250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14935_pilon_-_95200_97000
802657	contig_6031_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_56786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGGTACCAGCTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589294	590107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_589300_590100
802659	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
802664	contig_10296_pilon	+	2280	17	Intergenic	novelGene_168868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1673	2053	212073	271330	TRUE	50	GAAAGAGAAGCGCAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAGRVGFRVYLVPPGRLVPAWDDPLVFATVHVLLICTTEHFCCHILVKLAKDDPHVIPLKLFDTGAGIVGEALCVRNLDVLTVQNPSQVVSHLREPLHVLGQGAHALPLEVLQQFQDGWVHRVI	35321	309758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_35359_37157_37288_38438_38622_41063_41289_44426_44540_90787_90909_98361_98474_108897_109027_111839_111995_116794_116877_130050_130111_190522_190761_211985_212186_216642_216712_235747_235846_271229_271403_309603
802665	contig_6609_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_175453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTCCACTTGATACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280884	281932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6609_pilon_+_280900_281900
802667	contig_5551_pilon	+	2752	1	Intergenic	novelGene_134222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATAGTAAGGAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165711	168463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_165700_168500
802673	contig_2278_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_118118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAATAACTACTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939346	941067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_939300_941100
802676	contig_5005_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_84307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCCCTACACCAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509214	508493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_508500_509200
802679	SIRV6	+	192	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	534	57	534	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10771	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
802683	contig_13453_pilon	+	1069	5	Intergenic	novelGene_146715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	294	junction_2	48.4271359879975	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAACAATTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126421	136826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_129696_129771_131069_131184_132536_132667_136355
802684	contig_10689_pilon	+	970	4	Intergenic	novelGene_118627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	78	596	57608	61101	FALSE	15	CCCAGCTCCTCCCACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRQQRQLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51284	61475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
802685	contig_21013_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_38525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81554	79532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_79500_81600
802686	contig_7066_pilon	-	1271	4	Intergenic	novelGene_42137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	282.444488154556	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	60	719	738550	734318	TRUE	50	AAAATATAAGCAAAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPANPEATRSWLCRVLEIMPRKAGNVEEAEAGADESGAEEYGPEESDPEESGAEESGPEESGPEESGTEQMMEAGRPRPVLRSVNSREPSQVIFCNRSPRVVLPVWLNFDGEPQPYPTLPPGKGRRIHSYRGHLWLFRDAGTYDGLLVNQTELFVPSLNVDGQPIFANITLPVYTLKERCLQVVRSLVKPENYRRLDIVRSLYEDLEDHPNVRKDLERLTQEHIENQRMEQETVDFH	738609	726521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_727043_734286_734515_735774_735898_738210
802689	contig_18869_pilon	+	313	2	Intergenic	novelGene_56404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73414	73779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73586_73637
802690	contig_15066_pilon	+	1163	4	Intergenic	novelGene_149522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_2	6.16441400296898	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	145	723	57293	59088	FALSE	5	GCTGCTTGTGGATTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKLRTRSDGGAREDGPGRDHGGGGRGGRGGAAGGRGDSGVQGAVGGGMARASSANDSEEAWGALRAPQQQLRELCPGVNNQPYLCESGHCCGETGCCTYYYELWWFWLLWTVLILFSCCCAFRHRRAKLRLQQQQRQREINLLAYHGACHGAGPVPAGSLLDLRLLSAFKPPAYEDVVHRPGTPPPPYTVAPGRSLTASSECTCCSSASSCPAHCEGTNVEGVSSHQRAPPLIRRVNLG	57148	59528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_57362_58281_58385_58509_58687_58858
802691	contig_15422_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_173112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCTTGATTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110065	111827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_+_110100_111800
802694	contig_8269_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_106223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCAGTTCTACTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268507	266280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_266300_268500
802695	contig_5231_pilon	-	2088	2	Intergenic	novelGene_65898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	403	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAAGGTAAAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219504	217297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_219165_219283
802698	SIRV6	+	451	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	335	514	162	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
802699	contig_15299_pilon	+	1151	2	Intergenic	novelGene_175458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	0	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTTGCTGTAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210116	212287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15299_pilon_+_210519_211538
802702	contig_3787_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_102445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACCCACCCCAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733637	734139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_733600_734100
802703	contig_8554_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_160294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGTTTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160990	162383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_161000_162400
802705	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	183	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
802709	contig_11846_pilon	+	952	3	Intergenic	novelGene_106022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTCCCTCTCCTGGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575965	602569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_576007_578934_578988_601711
802710	contig_11846_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_106026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGGGGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603426	603725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_603400_603700
802711	contig_91_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_127113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAGAAGTGAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427524	426114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_426100_427500
802712	contig_19849_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_175461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATTTTTTTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5588	7736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19849_pilon_+_5600_7700
802716	contig_7870_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_109079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	587	937	764205	763855	NA	50	AGTAACCACAGTCAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAEKCSQDMCPGKRGQNFGEQPTDSATVFLPLCCRSVCICLSTLRMHVSTSPKKTTKSLIQLLHTAQIPESLVINSSLPQAQISACGPVVWTLKYKLSVPISPPHPVDNGRARNW	764791	763418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_763400_764800
802718	contig_10500_pilon	-	1856	2	Intergenic	novelGene_41156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	359	949	1238256	1237545	FALSE	25	TAAGATATTTGGACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDYADGEAKVEQLAVRFKTKEMADCFKKKFEECQQNLLKLQKGQVSLAAELSKETNPVVFFDVCADDEPLGRITMELFSNIVPHTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRIIPDFICQVSINCVLQLKSRRMHRTNLGNLSISPCLHPVIFITYL	1238614	1236637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1237994_1238114
802719	contig_16907_pilon	-	2147	2	Intergenic	novelGene_87458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	32	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	154	405	467716	467465	FALSE	30	AGGGGCTCCCAAGCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIILPRLIRKGNSLDSPVAVTIFFGSNDSALKDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGKQNQTAVSPNLDVNAQRIILMELWFPACGPQVLIVSCQQIGSDSWQP	471286	465722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_467773_471189
802731	contig_7530_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_141839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCATGTCTAACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187522	188086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_187500_188100
802736	contig_15907_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_175462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCATTTTCATCCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46295	47894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15907_pilon_+_46300_47900
802738	contig_990_pilon	-	1792	5	Intergenic	novelGene_76042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_2	72.0451247483131	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	127	537	865835	862139	FALSE	65	TTGGGAAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQVSSVIEFLFYEWLMRQCGNVNLFNSGI	865961	860883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
802743	contig_10855_pilon	+	2123	7	Intergenic	novelGene_124341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	1616	2122	562316	575663	FALSE	15	GAGGTGAGATGGGTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRICLMNVLFPLSPGPSSSSFSSPRSRFFCSRRILLISWSIRTAVFSSSVRHHGQQRQVSARAMVWASEGARRHGPPAPREEGTPPWRLRGELQAAERKGDAFVLGVPPPGLPGFPASRLGSPAQRGRRLGTGRGGGGAVEVVRLRVPRPSPDLPGPSQTGCQVKGTP	547404	575664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_548315_554344_554500_557699_557829_560085_560216_561145_561301_562179_562364_575204
802744	contig_91_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_127078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGGAAAAAAAACAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39027	38324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_38300_39000
802752	contig_19957_pilon	-	3020	2	Intergenic	novelGene_57690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	19	330	97206	96895	TRUE	80	TTAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEIKCMILSVVVTCFELKISEKSLIILPSKGFFVTASYRTGGAASAPAWPSVIRDNGQEKVPPLLTPQHEAPLFTSTLCLEFDLESLIRYQGHRHGRTTKRIPTWSQA	97224	93956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_95127_95374
802758	contig_6578_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_162235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGTCCAGGGACAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129709	131904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_129700_131900
802760	contig_14924_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_104166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	7.5	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	25	552	206743	78805	FALSE	35	ATTCAAATCCATTTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQQHVLTYMEDAVCQLLENKEDISQYGIARFFTEYFNSVCQGTHILFREFSFIQATPHNRASFLRAFWRCFRTVGKNGDLLTMKEYHCLLQLLCPDFPLELTQKAARYVSWALKPTQPSMDHGFYTVKPLGKNKANREEIGIWREVYLGFIQKYIILSVFPKASQMILCGFCGEPEGLKIGGW	206767	78348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_79122_163115_163247_206663
802763	contig_3004_pilon	+	957	4	Intergenic	novelGene_127529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.536310297998	243	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAAACGGGATGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470011	539082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_470059_471163_471244_514582_514662_538331
802764	contig_5770_pilon	-	577	6	Intergenic	novelGene_74189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6355.85111216429	7	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	109	549	264028	261935	FALSE	45	AGTAAAAGAAGAATGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVSGLRIVLRSVPGDLAKWFATHLTQKTPQNAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265791	261906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264041_264892_264969_265771
802765	contig_7457_pilon	-	1848	11	Intergenic	novelGene_31382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_7	47.0833303834807	381	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1182	1658	437993	437249	FALSE	20	ATCAAGTCACGGGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	442445	437058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438030_438414_438566_438678_438766_438987_439115_439569_439651_439898_439968_441329_441498_441683_441797_442096
802766	contig_6589_pilon	-	1334	6	Intergenic	novelGene_25694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	147.183422979628	338	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	218	925	185335	179178	FALSE	35	TAGGAATACAAACCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLPEEVAKLLFRGPEQWRRARGYREGGSGAEKENRASSSASGPGASPGGPEGSSQGSGEGEGIQLTAAQELMIQQLVAAQLQCNKRSFSDQPKVTPWPLGADPQSRDARQQRFAHFTELAIISVQEIVDFAKQVPGFLQLGREDQIALLKASTIEIMLLETARRYNHETECITFLKDFTYSKDDFHRAGLQVEFINPIFEFSRAMRRLGLDDAEYALLIAINIFSADRPNVQEPSRVEALQQPYVEALLSYTRIKRPQDQLRFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE	188199	178768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_179325_179690_179900_183727_183828_184901_185082_185263_185439_188085
802767	contig_1867_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_54587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACTTTCACCTAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490307	489509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_489500_490300
802770	contig_7513_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_89030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGGGCCCTGCCCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694380	693571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_693600_694400
802771	contig_5643_pilon	+	1016	5	Intergenic	novelGene_38973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	652.122112797902	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549628	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
802772	SIRV6	+	206	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	522	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
802774	contig_6048_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_73187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGCCAGCAGGGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367015	1364906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1364900_1367000
802775	contig_17880_pilon	+	573	3	Intergenic	novelGene_167327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGACCAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27879	37231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_+_28134_35770_35912_37053
802777	contig_6059_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_44788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAGGTTCTCAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144426	143318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_143300_144400
802779	contig_11978_pilon	+	479	4	Intergenic	novelGene_63106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_3	2164.46180120807	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	31	396	1830113	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1830082	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
802781	contig_8907_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_85787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTATTAGAGGAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56601	55190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_55200_56600
802784	scaffold_880_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_121437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGTTATTATAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415200	415601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_415200_415600
802786	contig_15084_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_116693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGACCCTTTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192818	192070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_192100_192800
802788	contig_13844_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_79401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTTGAATGAATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71336	71679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_71300_71700
802792	contig_6871_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_21599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAATGTTGGTTTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379376	377112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_377100_379400
802793	contig_4531_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_47852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGACAGAGCAGAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133496	132746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_132700_133500
802794	contig_4531_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_47853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGCAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137173	136026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_136000_137200
802796	contig_14744_pilon	-	2229	1	Intergenic	novelGene_65975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAATCTAAAGGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903261	901032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_901000_903300
802797	contig_18108_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_33530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302476	304514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_302500_304500
802802	contig_10494_pilon	+	1183	9	Intergenic	novelGene_102177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	7.59934207678533	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	178	963	962954	964882	FALSE	20	CTCTACAGTACGCTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPSPHNPQSPARPHTAAETEALSRLFNSVRTLTAKEELLQTLRTHLILHVARTHGYSKVMTGDSCTRLAIKLLTNLALGRGAFLAWDTGFADERHGDVVVVRPMREHMLKEVAFYNHLFAIPTVLTPAIDTKAPEKASIHRLMEAFVLQLQAQFPSTVSTVYRTSEKLVKAPRAGRAASPSRPCCLLCLCMLDVDSAGLHPDSATAFGAQSTTALSLRQAPALQTQAKEPTVPCCSPGLCEDRGCCRGARPSEREDLQACVIEQLCYSCRVNMKDLPSLDPLPPYILTEAQLRNHRAQAMQEIQEFLIEDSEDEVETGQS	962476	965102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_962605_962904_963041_963201_963334_963627_963720_963823_963940_964145_964303_964421_964489_964660_964720_964806
802804	contig_9708_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_67267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768036	769207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768000_769200
802807	contig_2770_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_107413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAGAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180686	181436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_180700_181400
802809	contig_13403_pilon	+	2651	1	Intergenic	novelGene_158090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAGAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55364	58015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_55400_58000
802811	contig_6175_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_16367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATCTCTTTTCCAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771209	1772284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1771200_1772300
802813	scaffold_13609_pilon	+	1743	5	Intergenic	novelGene_124400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	226.922205832748	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	259	777	564647	575063	FALSE	70	GAGAAAAGAAAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDRTKLKKTPTEAPADCRALIDKLKVCNDEQLLLELQQIKTWNIGKCELYHWVDLLDRFDGILADAGQTVENMSWMLVCDRPEREQLKMLLLAVLNFTALLIEYSFSRHLYSSIEHLTTLLASSDMQVVLAVLNLLYVFSKRSNYITRLGSDKRTPLLTRLQHLAEVSHG	515985	576029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_516220_564622_564692_572408_572508_573273_573481_574895
802815	contig_20293_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_153521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCCCACAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72313	70186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_70200_72300
802816	contig_18967_pilon	-	1008	2	Intergenic	novelGene_165313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	914	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	225	620	35397	35002	FALSE	10	TTAGACTCCTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPLTIPVPVLRLPRGPDGSSRGFAPDGRRALLKPEVPEIQESPVVQESLESQEQRARAILRERYLRSLLAMAGRQVSFTLHEGVHVTAHFGATDLDVANFYVSQLQTPIGVQAEALLRCSDIIAYTFKP	42973	34613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_35406_42757
802818	contig_7057_pilon	-	2233	5	Intergenic	novelGene_123380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	72.3550274687254	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	94	1752	1194054	1173144	FALSE	25	TGAAGTGTGAACTGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSVSFKDVTVDFTQEEWQQLEPAQKALYRDVMLENYCHLISVGFHMTKPDMILKLEQGEELWTTGRVYPSHTYLEEDGKAGDVLVKFREYQDKHSRSGVFINHRKLIKERSNVYGKTFTLGKNRITSKTTLCEYKTDGKVLKNISELVIRNINPIREKFGESNGWEKSLLNTKHEKIHPAVNLHKQTERSLSCKQELIQHQKVQTPEKLFEHNECEKSFLMKGTLFTHTRVHRGGIPLEYNKDGIAYIRKSNIDVHPQALMEKKPYAYSKYGKFFCRKSVFIMHERSQTEERPFQCPYCGNGFRRKSYLIEHQRIHTGEKPYVCSQCGKAFRQKTALTLHEKTHIEGKPYICIDCGKSFRQKATLTRHHKIHTGEKAYACTQCGSAFRKKSYLIDHQRTHTGEKPYQCNECGKAFIQKTTLTVHQRTHTGEKPYICTECGKSFCQKTTLTLHQRIHTGEKPYICNECGKSFRQKAILTVHQRIHTGEKSNGCPQCGKAFSRKSNLIRHQKTHTGEKPYECKECGKFFSCKSNLIVHQKTHKEKLLEFSK	1197032	1172662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1174571_1191057_1191154_1191418_1191546_1194045_1194109_1196993
802819	contig_10968_pilon	+	1120	2	Intergenic	novelGene_84272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	107	688	114414	114995	FALSE	50	CATATACAAGAATATAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEARRAPESDGVSDAGSEVGPGSRAPTAGAVEEEMAGPNQLCIRRWTTKHVAVWLKDEGFFEYVDILCNKHRLDGITLLTLTEYDLRSPPLEIKVLGDIKRLMLSVRKLQKVHIDVLEEMDYNSDSPMGSMTPFISALQGSEWLCNGDPSHDCDGPITDLNSDQFQYMNGKNKHSVRRLDPEYWKTILSCIYVFIVFGFTSFIMVIVHERVPDMQTYPPLPDIFLDR	75969	115427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_76061_114398
802820	contig_10904_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_22501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTCCAGGTTCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319494	319289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_319300_319500
802821	contig_15360_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_171272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGCGATGCCACGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456704	455940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_455900_456700
802824	contig_5120_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_169621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAGAGCAGGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338489	337931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_337900_338500
802826	contig_4125_pilon	-	897	4	Intergenic	novelGene_25082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	84.5156132846996	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	245	844	527566	526557	FALSE	25	CAAAGAGCCCACCTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVRLTSQLVRAASRAGRSLPWPVSGVPGAHAWKPCYSTQPVGPSKAASLPGREAQLELEEMLVPRKMSISPLESWLTARCLLPSLGAGIPGTVTPSQLYECPPSHVGEGAEQGDEGVLDVPQVQCKNVLKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLKRKQMKFERDLRRIWLRAGLKEAPEGWQTPKIYLKGK	528497	526503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_526659_526769_527216_527514_527676_528362
802827	contig_6589_pilon	-	1212	7	Intergenic	novelGene_26206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	144.76033833739	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	310	1128	2031410	2028014	FALSE	25	AATCATTGCATGTATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAVPPILRQTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVADLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2032524	2027929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030257_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032429
802828	contig_5718_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_110361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAAGGTCATTAGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708484	709641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_708500_709600
802829	contig_8045_pilon	+	2020	6	Intergenic	novelGene_35448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_2	65.3409519367448	7	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	146	1399	452026	459618	FALSE	25	TCTACCTTGTCAAAGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVRKLKRSTMFFYSKSV	434992	460239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450
802831	contig_15327_pilon	-	1546	7	Intergenic	novelGene_70526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	17.832554500127	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	275	1060	488304	478231	FALSE	5	TTCCTTATCTTTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	492620	477744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_487817_487974_488172_488343_491906_491960_492437
802832	contig_9389_pilon	-	753	4	Intergenic	novelGene_83867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	12.2565175405668	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	168	662	31262	29711	FALSE	35	GTCATGCGAGAAACAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAYVCEWEKWPRSTLCPSVPLACAWSCRNLIAFTTDLRNDDQDLTRMIHILDTEHPWDVHSIDSEHREAITCLEWDQSGSRLLSADADGQIKCWSMADHLANSWESPVGSLVEGDPIVALSWLHNGVKLALHVEKVSGPPERVGGWVRSRHPVSSSPTTSIP	32337	29619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_29965_30244_30353_31129_31300_32207
802833	SIRV6	+	371	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	582	9	403	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	223	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
802836	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
802838	SIRV4	-	511	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	108	-2	108	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5050	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
802839	contig_13481_pilon	+	1820	2	Intergenic	novelGene_119399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_1	0	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATAAAGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613319	622003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_613429_620292
802842	contig_12427_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_40425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAATAACAAATCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215248	216194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_215200_216200
802843	contig_11832_pilon	-	2140	11	Intergenic	novelGene_106939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	877.381268320677	1	132	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1205	1693	86074	84249	FALSE	10	GGCATGAGTGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQESLIPTPSDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDEDYDDQFC	88707	83801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_85052_85901_86723_86952_87089_87233_87289_87725_87786_88081_88281_88490_88536_88646
802844	contig_12622_pilon	+	921	6	Intergenic	novelGene_5810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	243.37082816147	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	440	859	401868	406044	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGEWLCRLLGERVCCVCCLLPCSSSKTRLFILPSGPITEYLCRDWCVNREQCLHAF	349720	406106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_388907_389057_398271_398486_401825_401940_404556_404650_405789
802845	contig_15327_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_70528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAACAAAACCTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479325	480351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_479300_480400
802848	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	3	1157	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
802849	contig_10371_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_175485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGGTCAGGTTCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770168	770830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_770200_770800
802850	contig_10371_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_175486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGTTAAGTAGTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771551	772234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_771600_772200
802851	contig_12624_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_61091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1011	1319	891092	890784	NA	35	TGTAAAAATTGTTGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPVPAHTLVGLIDVVSPILDHKTSDSSPNMPPANQHNANPTKHRAVPGGALGMLCGLNGSFFFVFPFFFPRSVWGGLEGRRKIKKFSKPRGKLHSKEAKRS	892102	890506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_890500_892100
802852	contig_2829_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_175002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACTATAATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297224	298703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2829_pilon_+_297200_298700
802853	contig_15135_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_119880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAATAATAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104733	102645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_102600_104700
802856	SIRV6	+	302	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8115	14	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
802857	SIRV6	+	363	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	510	0	344	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
802858	contig_13224_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_104075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCCATCCTCATAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114702	113704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_113700_114700
802859	contig_18364_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_102584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACTTACTGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185934	184026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_184000_185900
802863	contig_6175_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_16279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTACAGCGCTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562337	562720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_562300_562700
802864	contig_18735_pilon	-	2200	4	Intergenic	novelGene_132675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_3	276.526470503077	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1558	1926	71480	59686	FALSE	30	CTGTAAAGCTGGCACATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRIITKTDV	73037	59411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_59711_65767_65880_67037_67197_71407
802865	contig_9471_pilon	+	953	7	Intergenic	novelGene_21764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	128.262318013601	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	265	684	389490	401578	FALSE	25	AATGCTGAGCCTCTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGNSPHRHNVGMTAPIKPSVWHSERRKDKRVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	384716	401847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_399693_399775_401451
802868	contig_3602_pilon	-	1221	8	Intergenic	novelGene_60669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	250.269813584932	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	204	635	1123707	1106687	TRUE	25	AACACTTTTGCATGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLRQSGKHVQNGQKLECCRKRFLPGGPAASAAPEQANAMDSPLLKYSAKDYFFKAALCHFCIDMLNAKLAVQKYEELFPAFSDSRECKLMKKLLEAHEEQNVDSYTEAVKEYDAISRLDQWLTTMLLRIKKTIQGDEEDLR	1139474	1106041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106317_1106375_1106789_1107775_1107827_1108693_1108763_1110847_1110945_1119219_1119277_1123651_1123732_1139295
802869	SIRV6	-	199	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAACTTCGACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11273	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
802870	contig_11335_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_104947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459636	458564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_458600_459600
802871	contig_9027_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_156355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTTACGTTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93997	95316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_94000_95300
802872	contig_9027_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_156357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTTACTCAGTTAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95621	96476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_95600_96500
802877	contig_9363_pilon	-	1828	5	Intergenic	novelGene_6519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	6.60965203320114	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTAAACTTAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571089	546278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_547444_558644_558723_560024_560063_567732_567830_570639
802880	contig_10437_pilon	-	1823	10	Intergenic	novelGene_38375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.64997911442	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	109	1737	621811	615402	FALSE	15	GGTGTCATTGTCTCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTATRRASSQQPCPSNPHLPERTHLLQPVTSPCPGMGTMSMTLVLACLAVTSAASEGGPKAPGQRELRPQHLAEHLQEVGYAAPPSPPQTRPLPVDNPNTAQQDPQFEGQREVQPPPSQEAVPAQKEELPPRQVPGERKVDHPLPHEAIPIQEQLPPRPLPIEQKEEKPAPFLGQGHPEPESWSSAQQCQQGPPQGGWGRGLDGFPPGRPSPDNLNQICLPGRQHVVYGPWNLPQTGYSHLSRQGEALNLLEAGYSRCCCRHSSLSRLDCAKLVWEDAMTRFCEAEFSVKTRPYSCCTQQGEARFSCFQEEAPRPHYQLRACPSQQPGVSSGPELPFPPGLPTADNVRNICLLRRFQSVPRNLRATGHAERQLQALSQLEQEFQRCCHQGHNHICTRKAWEDVLDGYCAKEQATKTHGHPCCRHAPSPARNECFARQAPHPNYDRDILTVNIGQVTPNLMGHICGNGKFLTKHEQIPGLIQNMTARCCDLPFPEQACCVEKEKSTFVENLCGSQRNSWRDPALCCDLSRGDQQSNCFNIHYLRNVALVAGDIGAESQGEQDPTQETNTSPTLEPKEE	621919	615315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_615630_616005_616094_616258_616480_617167_617543_617769_618093_618974_619056_619155_619237_619383_619486_619563_619627_621744
802883	contig_16804_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_167294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCTTTACGAAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55183	54114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_54100_55200
802887	contig_2414_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_158446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTTAGCGCTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20157	19774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_19800_20200
802888	contig_6589_pilon	-	1537	8	Intergenic	novelGene_26211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	108.661616676615	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	195	1457	2032681	2028014	FALSE	30	TTACAATCATTGCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGWEFEVTAFYRGRQVFQQAVFCPGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVADLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2033638	2027933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030619_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
802890	contig_513_pilon	-	1784	10	Intergenic	novelGene_80160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	383.461717631485	1	93	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	148	1017	453421	447909	TRUE	35	TTTTGGTCATCTAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYG	454719	446334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_447914_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
802892	contig_6914_pilon	+	2006	11	Intergenic	novelGene_151733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	50.244999751219	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	302	1396	126550	128759	TRUE	25	CTGAAGCTCAGCCAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWTVHLEGGPRRVNHAAVAVGHRVYSFGGYCSGEDYETLRQIDVHIFNAVSLRWTKLPPVRPATRGQAPVVPYMRYGHSTVLIDDTVFLWGGRNDTEGACNVLYAFDVNTHKWSTPRVSGTVPGARDGHSACVLGKTMYIFGGYEQLADCFSNDIHKLDTNTMTWTLICTKGNPARWRDFHSATMLGSHMYVFGGRADRFGPFHSNNEIYCNRIRVFDTRTEAWLDCPPTPVLPEGRRSHSAFGYNGELYIFGGYNARLNRHFHDLWKFNPVSFTWKKIEPKGKGPCPRRRQCCCIVGDKIVLFGGTSPSPEEGLGDEFDLIDHSDLHILDFSPSLKTLCKLAVIQYNLDQSCLPHDIRYSM	124093	130457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_124336_126490_126704_126882_127060_127214_127331_127512_127585_127715_127930_128008_128096_128249_128359_128472_128547_128667_128802_129889
802896	contig_753_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_112986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	54	305	1204473	1204724	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKSILEGQPECSLEAKMARLHLRYFGHIIRRDHSLEKDIMLGKVDVQQKRGRSLTRCTDTVAAIMGSNIAKIVRMAQDEAVFCCVVHRVTMSQNRLDGT	1204419	1205510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1204400_1205500
802897	contig_12157_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_135891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAGAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89063	88104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_88100_89100
802899	contig_13153_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_107280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAAATTATTCCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61498	60684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13153_pilon_-_60700_61500
802900	contig_3837_pilon	+	1954	9	Intergenic	novelGene_104018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	76.9796036297927	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	516	1577	67539	132266	FALSE	70	AAAAAATAAAATATAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLGATIDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAEIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDAHRFEKISNIIKQFKLSCSSAVALKTKNLTIMVTVKISILAPTGGCRMGFELPKSPIPEKCHYLTYLAILWKLHLEGLSLFDCSFTVNSSPTPGIC	67023	132643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70935_77748_77816_88997_89221_121918_122015_124345_124469_128629_128722_132031
802903	contig_7775_pilon	+	877	3	Intergenic	novelGene_37471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102941	108613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_103052_105393_105481_107933
802904	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
802905	contig_5878_pilon	-	1783	3	Intergenic	novelGene_145717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	259	junction_2	15.5	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTTTGTGCTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210658	202734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203104_208192_208278_209329
802909	contig_10341_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_47250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1491	1808	168247	168564	NA	20	GAGCAGGGCATCCCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRDILKIVPSFVFIFLHNCLWILSSQGLIIRSEGPTRFLSLLKRENKYCKHFPVLGNCFCFFKKNKKAKNNSSPPKKSLMFTVSMCFLKKLSKPQVCNRFSPC	166756	168909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_166800_168900
802910	contig_10523_pilon	-	1298	8	Intergenic	novelGene_120925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	272	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	293	1222	39240	12805	FALSE	5	CAGGTTGTGTCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPREDRGK	39532	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12830_15079_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
802912	contig_13048_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_138918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGGAACAGAAATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399893	399049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_399000_399900
802914	contig_16535_pilon	+	1374	11	Intergenic	novelGene_167705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	54.876315473982	341	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	11	1198	255787	258873	FALSE	5	CAGCTTCTTCCTTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAMAAEGTAVAGGGAVGGCPASDSLELSKCADAAPIRRRTSSLSQDAERRAYQWCREYLGGAWRRVRPEELRVNPVSGGLSNLLFRCSLPEHLPSHGEEPREVLLRLYGAILQGVDSLVLESVMFAILAERSLGPQLYGVFPEGRLEQYIPSRPLKTQELREPVLSAAIATKMAQFHGMEMPFTKEPHWLFGTMERYLKQIQDLPPTGLPQLNLLEVYSLKDEMDNLRKLLDSTPSPVVFCHNDIQEGNILLLSEPENADNLMLVDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWVYDYTHEEWPFYTARPADYPTRGQQLHFIRHYLAEIRKDKTPSPEEQRKLEEDLLVEVNRYALASHFFWGLWSILQSSMSTIEFGYLEYAQSRFQFYFQQKRQLTTLHPKS	255776	259049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_256011_256382_256492_256808_256923_257112_257247_257442_257539_257684_257744_257830_257913_257992_258102_258215_258320_258562_258645_258798
802916	contig_5551_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_134267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAATAAAGGCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627687	626116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_626100_627700
802918	contig_5954_pilon	-	1395	4	Intergenic	novelGene_28451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	14.3836326735943	171	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	814	1323	109263	107815	FALSE	5	CCTTACGGCTCTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWSPCSAPFYHQVGLLYEEGVRKAQSSDSSKRTFSVYSSSRQQGRYAPSYTPSAPMDTNLLSNIQKLFSERIDVFSPVEFNKVSVLTGIIKISLKTLLECVRLRTFGRFGLQQVQVDCHFLQLYLWRFVADEELVHLLLDEVVASAALRCPDPVPMEPSVVEVICERG	110263	107742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_108076_108922_109011_109102_109888_110074
802921	contig_21007_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_161511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256	900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
802922	contig_11160_pilon	+	1221	10	Intergenic	novelGene_168850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.5382403072661	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	47	907	796774	820083	FALSE	20	GGAACACATGCTTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPVRVKTWVEENRASFLPPVCNKLLHQEQLKIMFVGGPNTRKDYHIEEGEEVFYQLEGDMVLKVLEQGKHRDVVIRQGEIFLLPAGVPHSPQRFANTMGLVIERRRLQTELDGLRYYVGDTMDILFEKWFYCKDLGTQLAPIIQQFFSSEQYRTGKPIPDQLLKEPPFPLSTRPVMEPMSLEAWMDGHRGELQTGMPLSLFGDTYETQVVAHGQGSSKGPRQDVDVWLWQLEGSSVVTMRGQRLSLTPDDSLLVPAGTSYTWERAQGSVALSVTQDPARKKPLG	796727	820397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_796854_800250_800330_805203_805288_805585_805693_816943_817034_817361_817406_817680_817827_819563_819633_819808_819892_820004
802924	contig_5092_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_62314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGTAACTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446405	446912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_446400_446900
802925	contig_8866_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_77878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969259	970367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_969300_970400
802926	contig_12970_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_50525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGTAGCAAAAAAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200008	202028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_2e+05_202000
802927	contig_9363_pilon	-	1859	5	Intergenic	novelGene_6517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	14.9749791318719	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	496	1422	558677	543191	FALSE	50	TAAAAAGGAACTGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVLLTARWKELLSFEDVAMFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDVPSTGNRKASRSACPGSEARYKMKKLTSMQTISEELVSYKVSVVKQEKAKKTSEKLFKSNDFVNNFRFALPTSGDEYKKGFFQNFNFIEDQNAQTKKQGKYDEYGKPFSQRSLLVRHKQILTGPKTYECSECGMVLRCETDFVQHQRLHTSENPFECNICGQAFKQMSALTVHKCHPPKKPHKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSREFNPYSTSVYP	571089	542753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_543844_544981_545096_547316_547444_558644_558723_570639
802928	contig_5302_pilon	-	1070	2	Intergenic	novelGene_81554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	41	349	1667074	1666766	FALSE	5	TGTTGTGGTGTTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREFGNLTRMRHVITYSLSPFEQRAFPHYFSKGIPNVVRRTRASILRAAPRECLCLGRGGGADAGGRIPSTVLSERLPPGRHLVTCRKLIFSLNIRDGFSS	1667364	1666044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1667089_1667338
802929	contig_3956_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_14774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951052	949960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_950000_951100
802931	contig_12654_pilon	-	2700	14	Intergenic	novelGene_129264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_7	7.93762667047042	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	14	1993	204499	90830	FALSE	25	AAAGCAACCTTCGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHIRTPKVENVRLVDRVSSKKAVLGTLYLTATHIIFVENASDTRKETWILHSQISTIEKQATTATGCPLLVRCKNFQIVQLVIPQERDCHDVYVSLIRLARPVKYEELYCFSFNPKLDKEEREQGWRLIDLGEEYKRMGLPNSCWQLSDVNRDYRVCDSYPSELYVPKSATAHIIVGSSKFRSRRRFPALSYYYKANHASICRSSQPLSGFSARCLEDEQMLQAIRKANPGSDFIYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIKFQFIGIENIHVMRNSLQKMLEVCELKSPSMSEFLWGLENSGWLRHIKAIMDAGIFLAKAVSEEGVSVLVHCSDGWDRTAQVCSVASLLLDPYYRTLKGFMILIEKDWISFGHKFNHRYGNLDADPKEISPVVDQFIECVWQLMEQFPCAFEFNERFLIHIQHHIYSCQFGNFLGNSQKERQELKVQERTYSLWAHLWKNRADYLNPLFRADHSQTQGTLPLPTTPCNFLYKFWSGMYNRFEKGMQPRQSVTDHLMAVKEETQQLEEELEILEERLEKIQKVQLNRTKVKSKPSEPSRHSGFSTSDNSTANTPQDYSGNARSFPSRSPSQGDEDSALILTQDNLKISDPDLSGNSDQESGVEDLSCRSPSGGERASEDSSKDRDSDEAVFLTA	204512	90122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_91190_94531_94659_95934_96076_97322_97524_101569_101620_104088_104215_106027_106138_117517_117651_129334_129470_134850_134980_143968_144127_156297_156461_158398_158522_204475
802932	contig_15067_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_154316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGACAGACTTTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12301	12761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_12300_12800
802934	SIRV6	+	155	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	54	787	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
802939	contig_13366_pilon	-	1563	5	Intergenic	novelGene_99784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_4	295.268521857647	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	120	740	177621	101316	FALSE	50	ATATTACTTCTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRRISIQELAAGGRRELSVPPGGAGRTAPRSAHASTRAMGGSASSQLDESKCAYIRGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHGMAFFP	177740	100492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_101504_109702_109818_113593_113726_116845_116977_177566
802940	contig_7815_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_134391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	28	312	569156	569440	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLGANGANMDYYGSFYKNENYKHLYRLAKTGGYSEGFYYLALHSNNRHHAMPTKVLDNQKGSPLENCPLAMAAASPEREAPASSTVSASSDAFQALPSSRRP	569128	569547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_569100_569500
802942	contig_15114_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_121244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCTGAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734962	1736124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1735000_1736100
802944	contig_6914_pilon	+	321	2	Intergenic	novelGene_151753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	222	99	320	267555	269400	FALSE	35	TCCAAACAGCACCCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YELSTLTGTQVLLLVASETGHVYTFATRKLQPMITSETGKALIQTCLNSPDSPPRSDPTTDQRMSATGFEETDLTYQVSESDSSGETKDTLKPAFTVTNLPGTTST	267456	269401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_267723_269346
802945	contig_10307_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_170284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCCAAAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461393	463118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_461400_463100
802949	SIRV6	+	240	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	561	486	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
802950	contig_5023_pilon	-	2007	12	Intergenic	novelGene_7152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	77	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAGGAAAGAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405985	359328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_359545_368511_368585_369249_369375_370400_370527_373060_373177_375328_375398_385232_385446_387158_387393_388219_388290_402042_402192_403086_403178_405460
802954	contig_17_pilon	-	1571	2	Intergenic	novelGene_173986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGAAAGCAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112260	1110037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1111412_1112063
802956	contig_3975_pilon	+	2603	2	Intergenic	novelGene_54893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCGTCATTAGCCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2109037	2111759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2110164_2110282
802957	SIRV6	-	379	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8959	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10779	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1184_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723
802958	contig_16369_pilon	-	1324	3	Intergenic	novelGene_98689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.5	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTTTGAGTCCAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	1580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_1938_7038_7908_8357
802960	contig_20429_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_169255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAAGCTCCGTGAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165472	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_165500_166100
802961	contig_6710_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_97691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
802962	contig_8064_pilon	+	799	4	Intergenic	novelGene_164559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	76.2685314457338	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	56	400	101662	118276	TRUE	10	CTGTGAGTCAGTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVATSPGSTPECLQPQPAREFQPQEEPAHQPEPLCHQEERGREHAGRGPLHVQRHAAESARLNLNEVEKQWRLNQLNNAATTLVFITVVVNIFITAFGAHKTGFLAARTSRNPL	101606	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_101714_117149_117276_118109_118295_118823
802963	contig_8631_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_121941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGATTGGTGAACACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656803	654798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_654800_656800
802966	contig_9955_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_21361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACTGGCAGCCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207460	206919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_206900_207500
802968	contig_4531_pilon	+	1838	10	Intergenic	novelGene_47864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_5	248.268224126873	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	111	1673	177632	182042	FALSE	45	TTTTTTTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFSKVKQLSLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVMTPLSIFWTNYLEDILNSCANLFFPNVFL	177521	182207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_177717_178063_178222_178428_178594_178903_179012_179091_179260_179392_179543_179789_179922_180347_180459_181219_181391_181727
802970	contig_4156_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_88102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGACAGCTTTCAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310641	310142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_310100_310600
802971	contig_8650_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_162631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTAGCATTTATTTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301820	302842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_301800_302800
802973	contig_10235_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_46313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	1292.67689526639	22961	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	142	654	90027	91802	FALSE	10	ACCTGTGTCTCAGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRTVHICGTGTGRAPPPGHDHSVHLSVLAPSESKEAGEELVPTLVSAPLFLFLCAHFCVSPPVPTPLCQPPVPSPAYLLLCASPSVPVTQCPPPCAHPSVPTPLYLPLCASPRPCRQSRSSTMHLCRGYQGQAVLRGSTSARETGRMPRKTPVLTMPALPRKNPPKHP	89885	91873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91416
802976	SIRV6	+	334	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	593	35	414	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
802978	contig_5280_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_52635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTGTCTCATTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74559	73989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_74000_74600
802979	contig_5018_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_46969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATAAAAGTTGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490094	490877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_490100_490900
802980	contig_5018_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_46970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACATTTGAGGGTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490928	491536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_490900_491500
802984	contig_9578_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_67962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043991	1045182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1044000_1045200
802985	contig_9363_pilon	-	1653	6	Intergenic	novelGene_6515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	21.7255609824004	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	219	1196	554357	543191	FALSE	5	GTTTCTGTGGGGACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWKSEEEGVPGEGQCLPLKYEGGMGKNELLSFEDVAMFFTREEWENLDSAQKYLYRDVMLENYRNLIFLGFQFPKPEVISQLEDWEEPWILDVPSTGNRKASRSACPGSEARYKMKKLTSMQTISEELVSYKVSVVKQEKAKKTSEKLFKSNDFVNNFRFALPTSGDEYKKGFFQNFNFIEDQNAQTKKQGKYDEYGKPFSQRSLLVRHKQILTGPKTYECSECGMVLRCETDFVQHQRLHTSENPFECNICGQAFKQMSALTVHKCHPPKKPHKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSREFNPYSTSVYP	558697	542733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_543844_544981_545096_547316_547444_554273_554463_555229_555290_558644
802988	contig_8616_pilon	-	1046	4	Intergenic	novelGene_72441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	455.444349570346	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	26	625	255468	253726	FALSE	15	TCATCTTGGTACTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPWPQRVELALFVACFLCGAVAAAALTRTQGSFSGRCPLYGVAALNGSSLALSRPSAPSLCYFVAGVSGLLALYCLLLLLFWVYSSCIEDSHRGPIGLRIALAISAIAIFLVLVTACILRFGTRSLCNSIISLNITSSCPEAQKISWTPPGTAVQFYSNLHNAEVRPWDMKGLGRSRDTLDISVCSQGCCEQLRRSC	255493	253304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254491_255372
802989	contig_9481_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_149672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397974	397078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_397100_398000
802990	contig_5021_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_167105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGGAAAATGGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454198	454478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_454200_454500
802991	contig_6960_pilon	+	2047	5	Intergenic	novelGene_60229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	61	363	89904	90206	TRUE	30	TAAAATGCCCTGTACTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKQNTALFFFTTGPLHLLSAMDLACTSGSSGRLPSFSVHYQTSLILQVLKIQSNLNKNFFFLLNQSKTYYLLLFFLPFFFLPHLTVQALLSSGNLGLNVRVIISFIPTCFSHYLFLFLDF	89843	271632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_91059_92522_92693_151666_151749_266692_266802_271161
802993	contig_9058_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_149370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84798	86976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_84800_87000
802994	contig_7342_pilon	-	1354	13	Intergenic	novelGene_71104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.380374402175	31	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	76	1158	86720	76292	FALSE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVTLPTRQWKNLESRRAPAPGFPSRPPSPTLQKAPHLCPSQSPALILLARPSLQVFPRVPVPQRRPEPSLPRSC	86795	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76510_81071_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
802995	contig_5605_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_143945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTTAGTCTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391030	393051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391000_393100
802996	contig_9119_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_169739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCCAACCGTGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53059	52698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_52700_53100
802998	contig_4725_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_175496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAATTAAATACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35811	34396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4725_pilon_-_34400_35800
803000	contig_18328_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_132544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAAAAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6375	5207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_-_5200_6400
803001	contig_19640_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_134871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96816	97186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_96800_97200
803002	contig_9937_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_129223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	240	299	280037	279978	NA	30	TTCCATAAGCATTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSHGGDAAGTAGSGRPSAGIRAEAGAQRRHEVVRIAGSQEANGALDRIPGTHPVALLASARAPPAWHHQQGQTGLLSVMDFSCGAVRERTGSKNWPK	280276	278363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_278400_280300
803003	contig_11307_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_105249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGAGTTAATGAATGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92338	93573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_92300_93600
803004	contig_13760_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_61268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTAATACTGTGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20797	21784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_20800_21800
803006	contig_15326_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_157712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115358	114307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_114300_115400
803007	contig_6374_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_158426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	208	junction_3	219.182525744724	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	140	1117	4881	44784	FALSE	75	TTTAAAAAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCSSLEPLLQLLPLLAFGRAGVSVLYPRSPAARSRDALLLLWVHIMETKRVEIPGSVLDDLCSRFILHIPSEERDNAIRVCFQIELAHWFYLDFYMQNTPGLPQCGIRDFAKAVFSHCPFLLPQGEDVEKVLDEWKEYKMGVPTYGAIILDETLENVLLVQGYLAKSGWGFPKGKVNKEEAPHDCAAREVFEETGFDIKDYICKDDYIELRINDQLARLYIIPGVPKDTKFNPKTRREIRNIEWFSIEKLPCHRNDMTPKSKLGLAPNKFFMAIPFIRPLRDWLSRRFGDSSDSDNGFSSAGSTPAKPTVEKLSRTKFRHGQQLFPEGSPGDQWVKHRQPLQQKPYNNHSEMSDLLKAKVSNIHLKNFRP	4741	45121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4934_17854_18007_25247_25376_25800_25900_41257_41411_41531_41645_41737_41846_44612
803008	contig_6270_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_99890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	70	321	1145876	1145625	NA	65	AAAAAAAACCCAACCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFRLYLITFIKHTSESVSTVHLMVSQFTAKLNKAIVFTGKVFSKKLHNTVNCNAVFILFRYLGKWTIKVLCYSARKKTSLKDLNGNQKFRALGKDLLGIDTHVHL	1145945	1144278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1144300_1145900
803010	contig_7816_pilon	+	1898	6	Intergenic	novelGene_66568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.5166582576501	10	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	410	727	507997	514716	TRUE	75	ATTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQSQFLSMNLRRT	507587	518524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_508060_509102_509254_511377_511448_514682_514810_515865_515980_517560
803011	contig_13612_pilon	-	2390	3	Intergenic	novelGene_157283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	85	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	243	1004	41103	40342	FALSE	60	ACGATTAAAACACTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNERSVAHYALSDSPADHTGFLRTWGGPGTPPTPSGAGRRCWFVLKGNLLFSFDSREGRAPLSLVVLEGCTVELAEAPVPEEFAFAIRFNAPGVRPHLLAADGPAAQEAWVKALSRASFGYMRLVVCELEGQLRDARQSLALHRCSSWKSGASCCKPQAPDHCSPGLENGHFPSKDCSSVGLAEEGGSRSAGWASAEWELQGPASLLLGRGQSPVSPETSCFSTLHNWYGQEIVELRRGWLQRAPGGPARM	46581	38955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_41132_41906_41989_46449
803012	contig_6710_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_97656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
803013	contig_8375_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_141309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATAACAACAATAACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186804	189092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_186800_189100
803015	contig_8475_pilon	-	2482	5	Intergenic	novelGene_171099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	8.38152730712011	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	55	1776	35694	30381	FALSE	20	CAGTCCCAGTACCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEARKPSSQSPSDQAPEEDLVIVKVEEDHGWDQESNLHDNNPPGQELFRVRFRQLCYQETLGPREALIQLRALCYQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPKELQTLVKEHQLESGEEVVTLLEDLERQIDILGRPVPARAHGHRVLWEESAAEPPSTQLQPVASQHKSPDPQGPQERATSASQSPVPSQKRNSGDQEMAAALLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDPTQRDLCRDNRTENYRNMFSLGGETRNENRELASKQVISAGIQPHGETAAKCNGDVIGGLEHGEAQDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCNVCGKAFSYRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQCNQCGKAFSQSAGLILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHLIGHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGLIQHLRIHTGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESIGV	35748	29674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_31343_32031_32156_32462_32555_34532_34660_35277
803018	SIRV2	-	233	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4623	51	3448	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
803025	contig_4469_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_21909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAAAAAGAAAGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451248	450297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_450300_451200
803026	contig_11227_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_163187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATGTATGACAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195873	194304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_194300_195900
803027	contig_5954_pilon	+	1331	2	Intergenic	novelGene_28410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	377	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	155	346	92266	92457	FALSE	25	ACTTGCATTAACGACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLLLQLSLLPPPLAFPAPRPPPHPLEPPHLPLSLKSLQLQSQWALRSCRKMGSLTQQSSAAAAYKSWSPLLPTDTAPGPVPAPALSSSPRWNTSCHQVPAPSLSAPGRSSPQL	92037	93442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_92156_92229
803028	SIRV6	-	396	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-148	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGGCGTCTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
803029	SIRV1	+	234	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGTTACCCTAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6454	6775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
803030	SIRV6	+	157	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	788	51	788	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11025	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
803031	contig_405_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_135279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAGTGACCGTATAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47311	48044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_47300_48000
803033	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
803036	contig_12619_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_73554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2096	2422	668176	668502	NA	20	CTCTAAGAAGCTGGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIFPSSIRPPAPKSKPQSPHLLGPFLVCRQGCKTADRRHPLGSPGGEISPWNCMSSCRPKVLAKRAQRGGTAASTGKQGPESMQICHQSGGRDELEKSKPVTRSSAA	666080	668631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_666100_668600
803038	contig_3789_pilon	+	1288	6	Intergenic	novelGene_79833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	5.21536192416212	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	23	1159	297427	315333	FALSE	20	TGACTTCTCTGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGCWLVGCEFEDSVFEDGRQRRAGPPASYCAKRCEPQWFYEETGSSDNVEALTIKKFRGDLAYRRQEYQKALQEYSSISEELSLTSFAMKRDVQEGQARCLTHLGRHAEALEIATNLETKATNTDHLTTVLYLQLAICSSLQNLEKTIFCLQKLISLHPFNPWNWGKLAEAYLNLGPALLASSQKRNSFTSSDKAIKSSSPHSGKDCLLCIPEISPESSKFSMDASSSDSQQNEKALKNTQNSVSEKREAVLIETQIKACAAFVRTRLLLQLTQSQQTSFALERNLKTQQEIEDKMKAFRFKEETLLLISEVMGEDIVPEKIKDEVHTEVKCVGSAALTALVTASSKEFEDKWFKKIKDHFCPVENQFHTEIQILA	297404	315462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_297544_299628_299725_300672_300817_303684_304134_308937_309071_315135
803039	contig_17753_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_105088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGCACCCAACAACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83713	85358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_83700_85400
803040	contig_8447_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_69408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	995	1543	54952	54404	NA	20	ATCATCCCCACTCTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTQESKVQCMEKWLLMTQLNTWLQLCLDLAFQLHELPKIPHRGDKVLLGLLLLASERVLILLEPPCLGPACTHLLLHQFELFLEPGTVPLLFQADPLGLLPAAHGMFLLHLLYLLLLLTLQVLQLCVKVLLLGLKGTEREIQQSHFIPGREVGRDESLCLNLSLSPSSTTSLLCDLGQVI	55946	54174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_54200_55900
803043	contig_8145_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_118652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	117	479	741791	741429	NA	25	GCACAATGTTGTAGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHVWSAQKSAWHVVSAVHVSTVAAATRGVTALSWDQSSKRTEECFPAFPVEGTNIQKLPIYNTSRNHYIGGISGNRRTFVCLLVCLAFIFELGKSQVVQFRFNESNYSYLQPCFQCSP	741907	740960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_741000_741900
803044	contig_12079_pilon	-	1195	4	Intergenic	novelGene_67392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_3	2.94392028877595	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	28	360	471245	462920	FALSE	15	TGAAGTTTGTGGTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGDGAGGKMEDYQAAEETAFVVDEVSNIVKEAIESAIGGNAYQHSKVNQWTTNVVEQTLSQLTKLGKPFKYIVTCVIMQKNGAGLHTASSCFWDSSTDGETSVSAFLDHAETYLIKAV	471272	462084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_463060_463673_463798_467104_467147_471218
803046	contig_5732_pilon	-	880	5	Intergenic	novelGene_119596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	125.114697378046	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	25	879	312264	303296	FALSE	20	AATTGACATCTTCCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLAASSHMLQEVLDSPFVDPLKSLRLPRELNPNKKYSWMQKKEERMYAMKSSLESMDAMELDFRMRLAEVQRQYKEKQRELVKLQRRRDCELSSKSLLTSDDFELGAGIRKRHKGAEEEHDALIGNGKARGRSQTWDEHETSSDFMSQLKIKKKKMASDQEQLASKLDKALSLTKQDKLKSSSFKFSDNAGGKSKTSGGCSRYLTPYDSLLSKDRKALAKGLSLSLKASREGKHKRAAKTRKMEVGFKARGPSKSAHSPFASEVSSYSYNTDSEEDEEFLKDEWSGQGPSSS	312288	303294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_303364_306923_307288_308919_309092_311177_311315_312150
803047	contig_4952_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_145530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440540	442650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_440500_442600
803048	SIRV4	-	401	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1122	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4036	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
803049	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
803051	contig_5600_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_174958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTAGCATGTATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262544	264842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_262500_264800
803053	contig_3975_pilon	+	1278	4	Intergenic	novelGene_54942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3569	junction_2	806.585808619682	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	411	809	2344841	2353062	FALSE	35	ATAACGGGCCGTACATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQ	2344430	2353531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983
803054	contig_20374_pilon	+	1385	11	Intergenic	novelGene_166010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCCCAGCGGCGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3677	23186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_+_3941_5127_5272_6727_6818_8067_8189_8941_9045_15985_16061_18246_18430_18625_18728_20715_20877_22691_22743_23094
803055	contig_1719_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_87388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCCTAAATGGCGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854079	856441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_854100_856400
803056	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	492	51	492	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803057	contig_3270_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_104477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGACCAGAAGAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181277	182332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_181300_182300
803058	contig_3270_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_104478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182382	182888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_182400_182900
803059	SIRV5	+	477	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	880	-38	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
803062	contig_7119_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_40864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGGGTACTGACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45788	44632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_44600_45800
803064	contig_8866_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_77832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCTGGCACAGGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590662	589285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_589300_590700
803065	contig_9144_pilon	-	1354	5	Intergenic	novelGene_151131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.33853912601566	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	328	660	578537	564406	FALSE	30	ATGTTATGCAATTTCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYGDHCYYFSVDKNDWNSSLEFCLAKDSYLLMLRDNQEMSFLKNILHDDFHWVGLRNNFGWRWEDGSALNFSRISSNSVVQTCGVINKNGLQASSCEVLLQWVCKKVRL	586329	563711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_-_564518_564851_564953_578417_578588_580650_580756_586157
803067	contig_5286_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_157391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATCAAGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670296	671196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_670300_671200
803068	contig_8453_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_125131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTGGAAAAGTAAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220634	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_220600_221600
803076	contig_8330_pilon	+	1826	9	Intergenic	novelGene_71913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	14.7303895060518	105	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	42	515	1263824	1266225	TRUE	15	CTCCTAGGAACTTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGPELHLASLFVNEACRELVFGGRVEKSSVSRNPEVPFESSAYSISATARGKELRLTLSPLPGAQPPQEPLALVFRFGMSGSFQLAPSDALPPHAHLRFYTVSPGPGLALCFVDIRRFRSLGPRGRVAAGPRALCLAGVRAVQGERAAKPSRQSL	1262653	1268790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1262672_1263800_1264259_1266186_1266307_1266405_1266471_1266773_1267423_1267755_1267784_1267960_1268023_1268193_1268360_1268530
803077	contig_18251_pilon	+	1061	3	Intergenic	novelGene_50174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	115.5	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	26	460	110201	112584	FALSE	35	AAAATTATTTTTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTCIPSEVMQDEDGYVALNIKTRRPAFTSAVMQQNLLQAENENLSGTVQQLAKRFCQDLIKKSKEEAHKCSPCDTNWRYYGDSCYGFFKHNLTWEESKQYCTGMNATLPKIASQNILVRRFLHRVFWSRDEKLSNVTHGVFNVFAYVFNGLC	110175	113185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_110265_112045_112157_112324
803078	contig_15353_pilon	-	959	4	Intergenic	novelGene_151971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_3	35.5621521658443	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	301	957	464479	321715	FALSE	40	AACAAACTTTAGGGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEREVESAPRKRFEQKTGAVFDEIVENCGGIMDTEMSEDTDHNLTPTLDSMSYGMPNQTGSENSLLDEDDYFLNSGDLAGIPVVDSDNEDEQDFSSKDNLVSSVHTDDSLEVERRVLQHESDNESEIQIQNKVKKDFPKQFDQVSVFKSIRKDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYHEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETLHTHLPQTP	464779	321712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_321762_323431_323957_354803_354850_464440
803080	contig_10451_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_138342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622544	622093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_622100_622500
803082	contig_15304_pilon	-	599	2	Intergenic	novelGene_30690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10721	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	5	598	106308	105634	FALSE	20	GAGTGCTAGCCAGCACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	106312	105632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040
803083	contig_13702_pilon	+	2561	17	Intergenic	novelGene_102603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_15	37.3019247995328	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2514	47	2560	101307	125911	FALSE	35	GTTGGTGTCTAATAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGACGCWSQLPRPPVMGQEPRTLPPSPNWYCARCSDAVPGGLFGFAARTSVFLVRVGPGAGASHGTPPFRVIGELVGHTERVSGFTFSHHPGQYNLCATSSDDGTVKIWNVETKTVVTEHAFHQHTISALHWSPRVKDLIVSGDEKGVIFCYWLNRNDSQHLFIEPRTIFCLTCSPHHEDLVAIGYKDGIVIIIDISKKGEVIHRLRGHDDEIHSIAWCPLPGEDCLSINQEEHSEEPEIPNGKVISQTPGTKGCYLATGSKDQTIRIWSCFRGRGVMVLKLPYLKRRGGGIDPAVKERLWLTLHWPQDQPTQLVSSCLGGELLLWDLTQSWRRKYTLFSASSEWQTHSRIVFNLCPLQTEDNKKLLLSTSMDRDIKCWDMSTLECCWTLPSLGGFAYSLAFSPVDTGCLAIGVGDGMIRVWNTLSLKNNYDVKNFWQGVKSKVTALCWHPTKEGCLAFGTDDGKVGLYDTYSNRPPQISSTYHKKTVYTLAWGPPVPPMSLGGEGDRPSLTLYSCGGEGIVLQHNPWKLSGEAFDINKLIRDTNSIKYKLPVHTEISWKADGKIMALGNEDGSIEIFHVPNLKLICTIQQHHKLVNAISWHHEHGSQPELSYLMASGSNNAVIYVHNLKTVIESNPESPVTITEPYRTLSGHTAKITSLAWSPHHDGRLVSASYDGTAQVWDTLREEPLCNFRGHRGRLLCVEWSPLDPDCIYSGADDFCVYKWLTSMQDHSRPPQGKKSIELEKKRFSQPKPKLKKKKKPTSRVPVKQESFDGNEEESLKENSGPLENGVSDQEGEEEAQEPEVPCSLASVVTVSREPIISSPGSLGFEKSKVIINNKVTLPKKEAPKEKP	101260	125912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_101473_102275_102437_103571_103754_107691_107844_108473_108594_110054_110188_111063_111230_112115_112329_113094_113181_116347_116431_117629_117767_119612_119687_120582_120765_121358_121499_122467_122640_124073_124302_125792
803084	contig_12528_pilon	-	1769	4	Intergenic	novelGene_81356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGCATTTTAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020878	1009736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1010737_1011281_1011409_1016758_1016845_1020322
803085	contig_3018_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_78775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTAAACATATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372746	373125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_372700_373100
803086	scaffold_12510_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_151426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	278	834	770	1603	734813	735646	NA	30	AAGTAAAATGGGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGNCSRYYPREQGAAVPNSFPEVVELNVGGQVYFTRHSTLISIPHSLLWKMFSPKRDMANDLAKDSKGRFFIDRDGFLFRYILDYLRDRQVVLPDHFPERGRLKREAEYFQLPDLVKLLTPDEIKQSPEEFCHSDFEDASQGSDTRICPPSSLLPADRKWGFITVGYRGSCTTGRESQADAKFRRVPRILVCGRISLAKEVFGETLNESRDPDRAPERYTSRFYLKFKHLERAFDMLSECGFHMVACNSSVTASFINQYTDDKIWSSYTEYVFYR	734043	735646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_734000_735600
803088	contig_8538_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_4704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
803092	contig_10196_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_132275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	205	768	2075383	2074820	NA	5	CATCTGGCTGTGTCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCWAVNAPQVSGGRCPCALRCGGPVLLPDSQGLEVTGRARLPGQALSLALFALGPASWSCLLIMLSADAPRPQSLPWEHPPATHSHSTSSTGPLSHRDLGPLRGCAGLSLGWPVTGMEGVPLGRTPYNHSSAFALPPSASSWGDQPTGASEQHLAPRPNQRRGRPIRLMAWAFSLTLPGEGVCRKS	2075587	2074457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2074500_2075600
803093	contig_10988_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_104744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACACCACAGACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441817	441153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_441200_441800
803094	contig_7056_pilon	-	1301	9	Intergenic	novelGene_43735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	743.69028121591	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	265	1131	1176512	1079637	FALSE	25	AATACTGTGCTTTTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPIHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGARMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRHLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLASDSSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTSKWGPFAPGPGSFCFLMFGLFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF	1211378	1079466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1079653_1086616_1086689_1089892_1090156_1094903_1095001_1099856_1099940_1109072_1109145_1146709_1146961_1176499_1176695_1211296
803099	SIRV4	+	350	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	632	966	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
803100	contig_1666_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_160590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTGCATTGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742102	741502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_741500_742100
803101	contig_2636_pilon	-	685	3	Intergenic	novelGene_52067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	47.5	53	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	113	412	62513	59826	FALSE	40	CAAGAAGTCATGGATCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	62625	59552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471
803102	contig_10732_pilon	-	1462	4	Intergenic	novelGene_114751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	276.010064228744	1872	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	270	653	574201	573306	FALSE	10	CACGGTCTCCTTCCATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSPRSATPLTATLWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576365	572496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574161_574368_576262
803105	SIRV4	-	195	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1328	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3830	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
803106	contig_11631_pilon	+	1259	8	Intergenic	novelGene_104204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	472.871083091882	558	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	132	1103	257411	283438	FALSE	0	TTTCCTTTTGTTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	257279	283594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_257554_260336_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273589_281390_281540_283353
803107	contig_1594_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_138844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	128	418	687600	687890	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLSIRAPHCTCSRTNIEPRKGSTHPRRRNVITGVYDFFLSLMSTAVPGVGKGLGTWSQGTGYTSAIAIFLGNRKYFPHSMDEEIEAKGEMSKVFQGGEEPRVLRLRLASEYSTLALAGYSISFWEPSSSGDYGNTSC	687472	689091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_687500_689100
803108	contig_7119_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_41038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCCTCCCCCTCACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418690	417131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_417100_418700
803112	contig_17753_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_105089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1695	1997	88616	88918	NA	25	CGGCCAGCTGTTGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFVQCPGQRRHLQPLHPQHCLQVLCATKALLRGRLCSRTLFILPQMDWSPSFLLCPSEPHSPSPCAFPKAPSTVCLAFVCRIPSLTSLGFFKLLMRTE	86921	89183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_86900_89200
803113	SIRV3	+	338	4	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	1	2862	1	-641	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTACAATCGTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1964	6077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4775_6057
803115	contig_3601_pilon	-	1783	2	Intergenic	novelGene_132928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360748	357402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_357626_359188
803118	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
803119	contig_2703_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_101682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248126	249170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_248100_249200
803120	contig_16776_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_130514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	402.643142248816	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTCTTTTGCCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57754	34700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_43076_43228_57706
803121	contig_4686_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_118500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386403	384890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_384900_386400
803122	contig_9696_pilon	-	875	7	Intergenic	novelGene_68851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_6	67.4052833405678	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	301	789	691283	685465	FALSE	40	GAACACAGCAAATGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLENYILELIPTLPQLDGLEKSFYSFYVCTAVRKFFFFLDPLRTGKIKIQDILACSFLDDLLELRDEELSKESQETNWFSAPSALRVYGQYLNLDKDHNGMLSKEELSRYGTATMTNVFLDRVFQECLTYDGEMDYKTYLDFVLALENRKEPAALQYIFKLLDIENKGYLNVFSLNYFFRAIQELMKIHGQDPVSFQDVKDEIFDMVKPKDPLKISLQDLINSNQGDTVTTILIDLNGFWTYENREALVANDSENSADLDDT	693691	685378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_685654_687067_687128_689734_689873_691181_691319_692108_692185_692269_692326_693558
803123	contig_4301_pilon	+	2549	2	Intergenic	novelGene_65139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTACTTTCTGTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600752	605838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_600978_603514
803124	contig_15043_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_175503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106524	108946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_106500_108900
803125	contig_1034_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_175514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAGAATAAAATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5632	4684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1034_pilon_-_4700_5600
803128	SIRV6	+	235	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-400	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
803129	contig_2487_pilon	+	501	3	Intergenic	novelGene_148493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTCAAGAAAGGTATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300191	432345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_300305_413339_413508_432125
803130	contig_2487_pilon	+	419	3	Intergenic	novelGene_148496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTACGATGTTACAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432295	437941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_432358_434027_434222_437778
803132	contig_987_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_72353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCTTTTCTTCCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294708	1295051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1294700_1295100
803133	contig_6017_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_152567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTGGAGAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483986	486226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_484000_486200
803134	contig_15114_pilon	-	1242	7	Intergenic	novelGene_121133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	123.629486773989	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	446	1132	112655	100551	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125327	100440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109612_112541_112704_115280_115439_123580_123705_125212
803138	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803141	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	38	3364	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
803142	contig_14322_pilon	-	322	2	Intergenic	novelGene_116174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671835	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
803145	contig_11115_pilon	-	1563	6	Intergenic	novelGene_102801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	964	1563	157409	154961	FALSE	20	GAAGTGACCCTGGCCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFGGALAGVAAGQQLIQGDPERPDVRRIVELALLQALWGVPEHGAVPVLAHAVVLVAFRHGLGQAKVPDLDQPVIVQEHVAGSQVSVDIVLRVQVSHALADLLGEEQQLSQPHTVPGQVVSEAAQGHVLHDQLHRLLACVLAAALVLDDVLVVERAQDVDLAPPTRMELGAAACLEGLHGHHLASAVVSRVVAVQADLA	158461	154960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_155141_155461_155583_156006_156179_156385_156504_157400_157511_157599
803146	contig_8673_pilon	-	2388	15	Intergenic	novelGene_129913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	36.4157540476254	24	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1767	621	2387	235031	216055	FALSE	40	TTACTACAGCAAGTACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLEAEKKKLRTILQVQYVLQNLTQEHVQKDFRAGLHGAVYLPSKELDYLIKFSKLTCPERNESLSVEDQMEQSSLYFWDLLEGSEKAVVGTTYKHMKDLLSKLLNSGYFESIPVPQNAKEKEVPVEEETLIKSEKKKQLLKTESVKESESLVELAQPEIQPQEFLNRRYLTEVDYSNKQDEEQSWEDYARKPNLPKCWDTLTEPDSQEKKSESFKSWESPVKHQELSKPTVSSEQRKQEISKLRSTLQEEQKKQETSKPKPTPGQWKQETPKSKAGYIQEEQKKQETPKPWPVQLQKEEDPKKQTPKSWAPSQQNEQAITKSWTTPMCEEQDSRQPEALKSWENNVESPKHPLTPQSQISPKSWGVATTSLIPNDQLLSRKFNTEPKDVPKPMHQPVSSSSTLPKDPVLRKEKLQDLMTQIQGTCNFMQESVLDFDKPSSAISSSQPPSTTPGSPVASTEQNLPSQNEFLQEPLQATSSPVTCSSNACLVIADQASSGSETEFMTSETPEAAVPPSKQPSSLASPNPSMSVGSEQSFQSPPASSSSVTINTAPFQAMQAVFNVNAPLPPRKEQEIKESPYSPGYNQS	246453	216053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_216139_218635_218783_220851_220957_223384_223441_224483_224566_225761_225885_228515_229191_230094_230139_231672_231841_233526_233610_234831_235071_239890_239978_243491_243559_245057_245324_246292
803152	contig_7057_pilon	+	868	6	Intergenic	novelGene_123321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	536.194591543033	17	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	437	868	943281	943712	FALSE	5	CTCTTCGTGGCATCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLL	936056	943712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937013_941235_941288_941405_941523_942970_943030_943206
803154	contig_3900_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_84179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206173	205612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_205600_206200
803155	contig_15628_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_147695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107870	105787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_105800_107900
803161	contig_13051_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_140106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTTGCATTCACTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129439	127636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_127600_129400
803163	contig_9730_pilon	-	1521	3	Intergenic	novelGene_150626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.5	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	62	361	410322	389356	TRUE	30	AGAGGAGAATGTTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFGRSRDHRLSPYGCSREIMTGKKSSREKRRKRSSQEAAAAVSAPDPVPILASSGSGSTSGCGSTSGCGSVTCCGNTSFSGSVTGGGSVGSCWGGSSVERSERRKRRSTDSSSNKTSV	410383	374726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_375830_389298_389373_410039
803164	contig_3320_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_133063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCAAGCCAGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149148	148371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_148400_149100
803168	SIRV5	+	341	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	894	-30	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTCCTCGTAGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
803169	contig_2596_pilon	+	2490	22	Intergenic	novelGene_53461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	54.872641659766	1	103	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1512	1991	652915	656411	FALSE	50	AGAATCCATTAAATAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMARDKHPLELQVVFADCAADIKSTYESQDARQTHSDWSARTLNCIAVLFLRAGRTQEAWKMLGLFRKHNKIPRNELVNEFMDSAKASNSPGQAIEVVRLASTFSLLVCEDLTQRVMADFALSQEQKDTLRKLTALTSDSDSSSDSDSSSDTDISEVK	627594	656910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_627703_629245_629299_629409_629447_635397_635467_635920_636026_637149_637274_640892_641009_642809_642874_644570_644659_645004_645066_645334_645421_646135_646281_647122_647174_649069_649175_650907_651015_651657_651737_651829_651921_652892_652948_653620_653770_655372_655415_655821_655981_656314
803172	contig_16884_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_161821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGAATTAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49594	50633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_49600_50600
803174	contig_4315_pilon	-	1958	2	Intergenic	novelGene_46832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCATGCAGAGTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384122	381629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_381938_382472
803175	contig_4531_pilon	+	1581	4	Intergenic	novelGene_47931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	50.4468917663803	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1155	1580	637041	639403	FALSE	55	AAATACCCAGAAAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSATKKLIGEWKQFYPISSCLKEMSEEKQEDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSSVGSSHCSASCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSAQKWVKFSSVSDGFNSDSTSHHGG	634684	639404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_635786_636987_637186_638569_638765_639317
803177	contig_6958_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_69954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGATCATCAGGCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175433	176809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_175400_176800
803178	contig_13292_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_142945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGGAAGCACAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270030	267680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_267700_270000
803183	contig_16310_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_70101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336233	336653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_336200_336700
803184	contig_9011_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_159326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGATGGTTAGTTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574429	572627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_572600_574400
803185	SIRV6	+	313	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-244	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAATTTACACATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3161_10721_10819_11031_11109_11205
803188	SIRV6	+	292	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10532	2	1295	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11532	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
803189	contig_6039_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_175517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAATAAATAGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246208	247086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6039_pilon_+_246200_247100
803190	contig_17198_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_62326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGACAAGTGCGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418630	419736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_418600_419700
803194	contig_10011_pilon	+	2296	2	Intergenic	novelGene_68123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	12	779	345983	360156	FALSE	40	ATCTACAAATAATAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLVNDGNHEGDTHQKEPAENEDYREKSSGCGEMDCSLVSEQSPDYHKEERLNTFIPHERKLRNLLVTIENDTPLEELSKYVDINVIALTRNRRTRRWYTCPLCGKQFNESSYLISHQRTHTGEKPYDCSHCGKSFNHKTNLNKHERIHTGEKPYSCSQCGKNFRQNSHRSRHEGIHIREKIFKCPECGKTFSGNEEFVLHLQSHEAERPYSCKKCGRRFGRLSNCTRHEKTHSVCKTRKQKWDWERSNSPAST	345971	361673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_345996_359401
803196	contig_18272_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_6975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114667	116633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_114700_116600
803197	contig_5092_pilon	-	1265	2	Intergenic	novelGene_62315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1471	junction_1	0	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	100	402	449514	447791	FALSE	50	AAAAAGTTACAAGACCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCFRATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKVILFTLCHPLHSQG	449613	446927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_447995_449415
803199	contig_1939_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_144881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGATTATTTGGCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443277	442576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_442600_443300
803200	contig_1939_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_144880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442429	441347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_441300_442400
803205	SIRV4	-	262	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1261	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
803207	contig_5945_pilon	+	946	4	Intergenic	novelGene_104545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.4740326617051	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	62	721	196496	197866	TRUE	45	TCAAAAGACTCAGACTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPAAEPESEPAALSGGERAMLALLGLKPEVQDTCTSLGLMLSVVLFMGLARVIARQRLHSPKAHAFVLEFLATFQLCCCTHELLVLSEQDPANPTWPLTLIYFFSLVHGLTSVGTASNPCGVMMQMMLGGMSPELGAIGLLAQLISALCSRYCIGALWSLRLTKYHVSERSFACRNPIHVDLPKAVVIETIFSFIFHSALLHFQEIRTKLHLRSSLYILNGTRKSKKQALYDKMCHFK	196434	208902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_197070_197780_197890_205293_205411_208817
803208	contig_17796_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_33820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58368	56232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_56200_58400
803213	contig_628_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_130249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280177	282144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_280200_282100
803214	contig_1146_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_84828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846731	848860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_846700_848900
803215	contig_1008_pilon	-	1282	11	Intergenic	novelGene_121632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	118.351848316788	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	7	1107	1406535	1345288	FALSE	10	TTCTTCTGCTTTATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPCVFCGAAGFYRFFLGSRVPLAQRPGIWKAAAAAELQTGTRSQIVRLKHVTVVTTKKNVAASRHETYTADFIKKQLEEFNIGKRHLANMMGEDPETFTQEDIDRAIVYLFPSGLFEKRARPVMKHPDHIFPKQRAIQWGEDGRPFHFLFYTGKQSYYSLMHEAYGKLLDIEKRQNQLQAEGLDLEKTKTKDLIGSRWLIKEELEEEFVQRFRKSITVQSKKQLIEPLQYDDQGMAFSTSEGKRKSAKAEVVVYERGNGKIKVNGVDYLLYFPVTQDREQLMFPFHFLDRLGKHDMNCTVSGGGRSAQAGAIRLATAKALCSFVTEDEVEWMRQAGLLTTDPRVRERKKPGQEGARRKFTWKKR	1406541	1345112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1345380_1348387_1348558_1352233_1352343_1353224_1353333_1356383_1356428_1357174_1357261_1366566_1366647_1377655_1377687_1377773_1377837_1399022_1399203_1406397
803216	contig_9389_pilon	+	1072	5	Intergenic	novelGene_83902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1095.76283360041	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	42	338	159587	164450	TRUE	45	GGAAAAAAAGTGGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQRTSPTSSRPWSATA	159545	168388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164405_164540_167743
803217	contig_11850_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_125201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTTAATATACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188740	186225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_186200_188700
803219	contig_9705_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_41767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCCAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550701	550266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_550300_550700
803221	contig_17459_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_175521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGACACAATAGCCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24960	25317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17459_pilon_+_25000_25300
803225	contig_12106_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_83735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	136	369	102122	102355	NA	60	ATTTAAAAAAAAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVNKTTQRIYRVKRDEGPRLENPEVHQCLTQRKKLANKLRSGQRGMKQTRKIQCLRKDKSNRRHSYRDLLDISKHLAGLVYWVKRLRTIVSWDNSLNWHNIVHKDNILHPSLVNSIWVLKSL	101986	103341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_102000_103300
803226	contig_15384_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_85108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31670	29616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_29600_31700
803228	contig_10386_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_173545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAACAGAGTAGAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131286	133216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_131300_133200
803235	contig_14208_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_129085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	780	1178	132109	131711	NA	20	GGGGACCAAATGTCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLECYGGLSEQWFKTHETVSLKRSFLYEISQCVVCILWSCPWRSKTNGSWELCSEGPFWHMLAMSLTRQDMQEPKGKVVFQCEDVATLYYKRIPGGAVVKSSAANQKVHSSNLRATPWRPFGAVLLCPV	132888	131185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_131200_132900
803236	contig_10182_pilon	-	1659	11	Intergenic	novelGene_134623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76.9	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	49	1200	429480	338374	FALSE	15	ACCACTGTCGAGTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNGNRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDNVLVRIISAKNSPPTIVQDKVLALIQAWADAFRSSPDLTGVVHIYEELKRKGVEFPMADLDALSPIHTPQRSVPEVDPAATMPRPQSQTSAGSFSSPPAPFSAPQAPPLSVTGPITANSEQIARLRSELDIVRGNTKVMSEMLTEMVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNVFLRYERFERYRSGLSVQKATNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSSLQAWTWGQRVSVAPSVHSSSVTPVTASTCFPRQEGIPWLNNARRIPPTHPCRVTASRRHQLQ	429528	337914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_338429_355050_355173_356975_357099_357542_357592_360179_360314_372403_372521_375511_375662_377063_377199_399763_399914_404440_404520_429442
803238	contig_14341_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_111766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGAAATGAAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267894	268417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_267900_268400
803239	contig_11413_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_103171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATGTGAGGTGTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406145	405346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_405300_406100
803240	contig_11413_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_103170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404180	403872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_403900_404200
803241	contig_7272_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_25280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGCAGATATTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303349	304947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_303300_304900
803242	SIRV4	-	507	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	7	103	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	288	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
803245	contig_5881_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_129045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCTCTTTCATATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363877	365334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_363900_365300
803247	SIRV5	+	212	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	41	-2535	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTAAATTGTTAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8242	8454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_8200_8500
803248	SIRV5	+	288	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	209	171	95	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACGTCCTCGTAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8410	10971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
803249	contig_10734_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_51545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444232	2442480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2442500_2444200
803250	contig_12931_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_166762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCCATTTATTTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73596	75555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_73600_75600
803251	contig_10159_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_30797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCCTTGTGACGCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332256	331431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_331400_332300
803256	contig_16776_pilon	+	1009	3	Intergenic	novelGene_130513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCAGCGCTGGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34700	41787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35273_37056_37129_41422
803257	contig_14855_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_146024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACCTCAAGGTTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528337	530201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_528300_530200
803259	scaffold_13505_pilon	-	762	4	Intergenic	novelGene_111444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	370.514357196707	102	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535618	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532929_532999_535516
803260	contig_15354_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_65699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92690	94530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_92700_94500
803261	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	15	1151	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
803262	contig_14734_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_175376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTGAGTTGCAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45955	47131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14734_pilon_+_46000_47100
803263	contig_4732_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_75487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGACAGCGAGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747855	747163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_747200_747900
803264	contig_6785_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_132580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534370	535312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_534400_535300
803267	contig_987_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_72266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCAAATCCCAGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437567	438375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_437600_438400
803268	contig_15114_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_121240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699306	1700746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1699300_1700700
803269	contig_3529_pilon	+	861	7	Intergenic	novelGene_105386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGCAAGATGGCCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777356	790206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_777508_778712_778890_784511_784655_785222_785333_787003_787145_789783_789828_790111
803270	contig_2596_pilon	-	1700	2	Intergenic	novelGene_53533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	610	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAATTTAAAGGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120619	1101506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1103114_1120526
803273	contig_10331_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_54111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCCCCCCTCCCTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313903	313667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_313700_313900
803274	contig_5600_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_174961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTCCCCCCACCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325504	324494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_324500_325500
803280	contig_14516_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_153900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTGGCAGTCTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140192	138982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_139000_140200
803282	contig_990_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_76034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	59	376	843911	844228	NA	35	AACACATTCCTTGACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLAPKGQDDSFFRANSSRKRKSQTRGNLVSKQAIKLGCMIHKTTSSITQYTMKNVDAFFQGKKKKTSCHQVNSNSQRKDLQNKEKCLFTEPSSTFTQMTNTFF	843852	844962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_843900_845000
803285	contig_10196_pilon	+	1161	4	Intergenic	novelGene_132114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	200.905173872872	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	28	312	922274	924513	TRUE	20	CCCAGTGTCTTTATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922246	926565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925750
803287	contig_3123_pilon	+	1746	4	Intergenic	novelGene_162981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	41.3548331180555	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGACTGATGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200802	291519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_200901_220729_220826_231751_231837_290052
803291	SIRV6	+	262	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	115	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
803292	contig_9345_pilon	-	1509	14	Intergenic	novelGene_24498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	304.98867958427	1	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	489	1466	670230	667061	FALSE	15	GTAATGCCTGGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIISSRDIDFLKEEEHDRSLEEVMAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNALPLSTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFRAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLYEKRLF	671875	667017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667176_667255_667334_667440_667568_667733_667841_667943_668928_669025_669114_669206_669301_669490_669566_669627_670157_670369_670722_670778_670910_671013_671225_671275_671731
803294	contig_9363_pilon	+	1802	2	Intergenic	novelGene_6784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532429	1534597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1533814_1534179
803298	contig_12125_pilon	-	1984	5	Intergenic	novelGene_76219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	34	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACACGCGTGAGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341765	335841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_336646_338332_339240_340402_340577_340737_340815_341743
803299	contig_9415_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_109953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATGGAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520295	2519598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2519600_2520300
803301	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	57	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
803303	contig_11356_pilon	+	1964	11	Intergenic	novelGene_175261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.08044115262063	35	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	798	1508	139895	146996	FALSE	10	CTGCTTCCTTCTGAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRTEELIYLSQKIEFECRIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDRLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSAVRGEKCEMKLHGAHKNLFRLFLLHNTQGSQAEFLFRTETQSEKLRWISALALPKEEMDLLECYDSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPQQQVEFISNRDVCARNLKEAQRVKTARLQLVEQQA	133967	147452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_134138_137340_137577_138303_138457_138729_138860_139363_139439_139861_139952_141554_141713_142518_142681_144509_144581_146433_146539_146838
803304	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
803307	contig_12923_pilon	+	1245	14	Intergenic	novelGene_30173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_6	72.8787596592276	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1182	63	1244	311762	346708	FALSE	35	AGAAGGGACAGCAAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILN	311699	346709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601
803312	contig_6837_pilon	+	1236	10	Intergenic	novelGene_149816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	29.7960143162773	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	145	1086	11753	17185	FALSE	15	TTGTATGTTGGTAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQVIAYSEHRYRIFGETIDIAVGNCLDRFARVLKISNDPSPGYNIEQMAKRGKKLVELPYTVKGMDVSFSGILSFIEETVFAMLVEITERAMAHCGSQEALIVGGVGCNIRLQEMMETMCQERGARLFATDERFCIDNGAMIAQAGWEMFQAGHRTHLSDSGVTQRYRTDEVEVTWRD	11608	17335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15176_15273_15420_15471_15617_15697_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
803315	contig_9730_pilon	-	2622	6	Intergenic	novelGene_150625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	41.6816506391002	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	601	1086	403073	375483	FALSE	50	AATTACAAAATGCAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSDMEEEADDGSKTGSDLVSQQDICIDSASSQRENKQPEGLELKQGKGEDSDVLSINADAYDSDIEGPCNEEAAAPEVPENTVQNEAGQIDDLEKDIEKSVNEILGLAESSPKEPKAATLTVPPPEDVQPSAQQLELLELEMRARAIKALMKAGDVKKPA	410326	373946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_375830_389298_389373_403008_403078_404009_404095_404952_405154_410016
803318	contig_13542_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_131523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTTTGCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471183	469747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_469700_471200
803321	contig_16322_pilon	-	1293	6	Intergenic	novelGene_87510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	350.270752418754	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	219	632	37060	32956	TRUE	55	AGTTAAATAAAAAGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57646	31705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32334_32922_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
803323	contig_4832_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_163411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCGTAAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485464	484378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_484400_485500
803325	SIRV2	-	529	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4331	47	3156	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACGTGGTGATTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1576	1047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
803327	contig_2480_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_63564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376022	374697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_374700_376000
803330	contig_15691_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_60789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTTTATTTTATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190807	189377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_189400_190800
803334	contig_6084_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_127032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCGAGGTTCACCGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247570	247925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_247600_247900
803335	contig_4402_pilon	-	1339	2	Intergenic	novelGene_140873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTTTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625829	623825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_625094_625758
803336	contig_546_pilon	-	1812	2	Intergenic	novelGene_117260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGTCGCATTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766088	762687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_763981_765569
803339	contig_8027_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_158847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCTAAGTAAGAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345426	343543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_343500_345400
803340	contig_9582_pilon	-	1708	12	Intergenic	novelGene_106853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	17.4786765011372	36	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	3	1202	828141	772271	TRUE	5	GGCTCCTTCGTGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGRPEPGPEGLSRHHGALASDHQPPPTAPVSWSLPRWRAYVAAAVLCYINLLNYMNWFIIAGVLLDVQKCFQISDSNVGLLQTVFIGCLLLSAPVFGYLGDRHSRKAMLSFGILLWSGAGFSSSFISPQYSWLFFLSRGIVGAGTASYSTIAPTILGDLFVKDQRTRVLAIFYIFIPVGSGLGYVLGSAVTELTRNWRWALRIMPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDRSSWPLGSCCYPATGQWLLTSCCLWWCPGAGGQQRRYRSRWAMSWEMPAAPTSLDFSPAPCGLGALTPTYSTSSACNRASCAVPLSSPWAAAASC	828143	769374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_769559_770826_771098_772219_772392_772508_772608_782168_782235_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817393_817921_818059_824373_824440_827951
803344	contig_20675_pilon	-	1431	2	Intergenic	novelGene_161687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	178	969	28172	20469	FALSE	30	TTTCAAATTGGATTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFGRRMAGGRDSEDMEVDGDPFSAFGFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVSLEEIYSGCTKRMKISRKRLNPDGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREGDETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYNAKISLREVSL	28349	20006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20675_pilon_-_21050_27961
803345	contig_5686_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_45351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122346	121388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_121400_122300
803347	contig_10286_pilon	-	1107	2	Intergenic	novelGene_98406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTTAAAGAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381434	380026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380779_381079
803351	contig_19416_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_175526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGGCCCGTGATTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44009	43500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_-_43500_44000
803353	contig_3380_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_60127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATGTATTCTGCATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459870	457638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_457600_459900
803355	contig_5018_pilon	+	714	4	Intergenic	novelGene_47195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	228.94006979023	965	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCTGTGTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591756	1593202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1591826_1591943_1592093_1592607_1592706_1592804
803358	contig_2062_pilon	-	1457	5	Intergenic	novelGene_139026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	160.48753845704	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	23	1168	1183359	1168954	TRUE	15	CATGGTCCCCTCTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKQCRQNMWTKKGYDLAFRFCSCRCGQGHLKKDTDWYQVKRMQDEKKKKSGLEKNTGKPLAEAVEEVKKCRPQNKPQKGLNHDLPRRHSMDRQNSQEKAVSAVAYGARSPCASPGQSPPTGYSILSPAHFSGPRSSRYLGEFLKNAIHLEPHKKAMAGGHVFRNAHFDYSPAGLSVHRAGHFDAPVQFLRRLDLSELLTHIPRHKLNTFHVRMEDDAQVGQGEDLRKFILAALSASHRNVVNCALCHRALPVFEQFPLVDGTLFLSPSRHDEIEYDVPCHLQGRLMHLYAVCVDCLEGVHKIICIKCKSRWDGSWHQLGTMYTYDILAASPCCQARLNCKHCGKPVIDVRIGMQYFSEYSNVQQCPHCGNLDYHFVKPFSSFKVLEAY	1183381	1165198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1165425_1165606_1165654_1168937_1169119_1174187_1174343_1182533
803362	contig_9915_pilon	-	1777	11	Intergenic	novelGene_174165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	23	junction_7	42.0732694237089	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	138	1691	803062	329802	FALSE	25	CTTTTAAGGGAACTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSSSSSSSSSSSSSSSSSCGPLPGKPVYSTPSPVENTPQNNECKMVDLRGAKVASFTVEGCELICLPQAFDLFLKHLVGGLHTVYTKLKRLEITPVVCNVEQVRILRGLGAIQPGVNRCKLISRKDFETLYNDCTNASSRPGRPPKRTQSVTSPENSHIMPHSVPGLMSPGIIPPTGLTAAAAAAAAATNAAIAEAMKVKKIKLEAMSNYHASNNQHGADSENGDMNSSVGLELPFMMMPHPLIPVSLPPASVTMAMSQMNHLSTIANMAAAAQVQSPPSRVETSVIKERVPDSPSPAPSLEEGRRPGSHPSSHRSSSVSSSPARTESSSDRIPVHQNGLSMNQMLMGLSPNVLPGPKEGDLAGHDIGHESKRMHIEKDETPLSTPTARDSLDKLSLTGHGQPLPPGFPSPFLFPDGLSSIETLLTNIQGLLKVAIDNARAQEKQVQLEKTELKMDFLRERELRETLEKQLAMEQKNRAIVQKRLKKEKKAKRKLQEALEFETKRREQAEQTLKQAASTDNLRVLNDSLTPEIEADRSGGRTDAERTIQDGRLYLKTTVMY	803199	329715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_329840_369391_369461_369973_370118_373266_373415_381448_381601_465883_466019_470183_470320_484453_484627_547622_547785_604521_604638_802781
803365	contig_6740_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_142657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGATTTAAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45696	46965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_45700_47000
803374	contig_1443_pilon	+	1528	14	Intergenic	novelGene_28241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.5579791406816	1	62	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	437	1027	537672	541059	TRUE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELCSVPCAELPTIDMAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKRSHLWTLDLVLSLPHVPMNFLVLS	535997	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536384_536470_536604_537612_537715_538013_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540753_540798_541028_541125_541340_541526_541599
803375	contig_5092_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_62281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAGGCCAGGCGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254619	254093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_254100_254600
803376	contig_15185_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_99417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	18.6726180988812	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGGCTAATGGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228707	230851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_229487_229942_230003_230083_230471_230574
803377	SIRV5	+	416	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10863
803378	contig_10734_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_51402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCATGGTTATGGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2054236	2053002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2053000_2054200
803382	contig_8853_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_159164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATAATTATAGTGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99917	102435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_+_99900_102400
803383	contig_7229_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_39855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCCAGCATGTGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363702	1362847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1362800_1363700
803385	contig_11281_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_125450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAACACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809398	810687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_809400_810700
803386	contig_7428_pilon	+	1619	11	Intergenic	novelGene_77727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	151.776282732184	2	82	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	826	1371	434083	435117	FALSE	35	TTTATTATGAAAACAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	429282	435365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_429465_432553_432725_432893_432990_433156_433254_433360_433445_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
803387	contig_7963_pilon	+	1070	6	Intergenic	novelGene_58575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	135.080124370686	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	5	835	254707	257509	FALSE	20	TAAATGAGTCTGTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMALLEVCGASRGQREDWALPGVGSRHRSDVGHYSFSKRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGDRERNVQIEMAHGTTTLAFKFQHGVIVAVDSRASAGSYIANLRVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254702	257744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_255753_255911_256024_256447_256578_256972_257178_257420
803388	contig_6960_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_60239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGACATTTCTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288531	288867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_288500_288900
803389	SIRV4	-	195	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	416	6	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATAAAAACTATCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
803392	contig_4125_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_25221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	59.3588428308893	21	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	99	677	1702282	1711138	FALSE	25	CGACTCAGTGGCATTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTKGSGQEDVLFPEVDKTRC	1702183	1712194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1710887_1710920_1711115
803396	contig_11396_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_71417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAATAACTACTCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659102	1658725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1658700_1659100
803399	contig_7342_pilon	+	280	4	Intergenic	novelGene_71202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGGTGCCGTGCGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665447	667029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_665499_665571_665684_666735_666821_666997
803403	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	880	23	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
803404	contig_16525_pilon	-	454	4	Intergenic	novelGene_133871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.735560873374	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	50	352	181436	178530	TRUE	40	TGTTGATAATAAACAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYGESWELGTGWEGGGSRSKA	181485	178132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178145_178439_178686_181150_181250_181388
803413	contig_4531_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_47899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAACAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338195	337281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_337300_338200
803414	contig_11100_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_175530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTTCGGGGGACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161089	160492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_160500_161100
803416	contig_12021_pilon	+	1533	9	Intergenic	novelGene_172198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	29.0600133344773	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	289	1305	273810	318257	FALSE	15	AATGGTCTTTTTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSSGNKDFVVLSNGNIATSATNPSPLTSCDGDLAAQQLTPKEAPRTKVSPNGCLQINGTVKSSFLPLDNQRTAQMLPQCCHPCPYHHPLTSHNSHQECHPEAGPTAPSALASCCMQPHSEYSASLCPHHSPVYQTACCLQPSPSFCLHHPWPDHFQHQPVQQHIGNRRPSRPFKLPKSYAALIADWPVVVLGTCTVFTVVCALVGVLVPELPDFSDPLLGFEPRGTAIGQRLVTWNNMVKNTGYKATLANYPFKYADEQAKSHRDDRWSDDHYEREKREVDWNFHKDSFFCDVPSDRYSRVVFTSAGGETLWNLPAIKSMCNVDNSRVCKVKLKSL	129808	318485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_129835_164443_164543_175172_175319_273792_274319_304849_304880_313264_313389_314197_314326_314671_314770_318129
803419	contig_7056_pilon	+	1781	4	Intergenic	novelGene_43685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_1	30.6412938514171	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1764	16	1779	852463	859780	FALSE	30	GCACAGTAAGGGGACCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDLPCMIAGAGGSISQSNLMPDLNLNEQEWKELIEELNRSVPDEDMKDLFNEDFEEKKDPESSSSNTQTPLAQDINIKTEFSPAAFEQEQLGSPQVRAGSAGQTFMGPSSAPVSTASPSLGSSQTMFHTSGQPRTENTSANLMQSSAQTQNAQRARSGVVLPSQGTGGGAELSSAHQLQQIAAKQKREQMLQNPQQAAPAPAPAQMSTWQQTGPSHSPLDVPYPMEKPASPASYQQDFNNSKLLMMPSVNKSSPRPGGPYLQPSHVNLLSHQPPSNLNQNSVNNQGPVLDYGNTKPLSHYKADCGQGSPGPGQSKAAMLAYLPQQLPHLNSEQNPLFLMKPKSGNIPFRSLVPPSQEQNPANVPHASTSVPTQATSVGTQPPAVSMSNTHNSTSYLSSQQQAVVMKQHQLLLDQQKQREQQQKHLQQQQFLQRQQHLLAEQEKQQFQRHLTRPPPQYQDPTQNTYSQQVGQFTGSSAAVPGMNNLGPSNSSCPRAFPPTGNLMPLGPGHSVVSSLPSSSGQQDRGVAQFTGSQSLPQSSLYGMTSGITQIVAQPPQQATNGHTHIPRQASVSQNASVSAAYGQNSLGSSGLSQ	852447	859782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_853516_855636_855892_857871_857969_859421
803423	contig_14326_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_120761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGCTTTATAATGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598378	598750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_598400_598800
803425	contig_8598_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_22884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTATAAGTGTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62041	64444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_62136_62335
803434	contig_1337_pilon	-	1997	4	Intergenic	novelGene_84253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_1	34.7019051670398	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	221	652	450056	444372	FALSE	35	ACCTTAAGGTAGGCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKKRNTPHRGGSGGGGTGAAAATAVAAGSQHRNVQPFSDEDASIETMSHCSGYSDPSSFAEDGPEVLDEEGTQEDLEYKLKGLIDLTLDKSAKTRQAALEGIKNAMSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGIPLIFES	450276	443026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_444523_445308_445394_445524_445630_449965
803435	contig_7179_pilon	+	1526	2	Intergenic	novelGene_78065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	566	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGAGAAAGAGAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399606	401990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_400755_401612
803436	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803439	contig_8631_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_121979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTAAAAAGAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819741	821821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_819700_821800
803440	contig_5814_pilon	+	2107	3	Intergenic	novelGene_143045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	36	106	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	320	1453	148636	149769	FALSE	15	GCTGAGCTGTGGCCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLDPWNGTDNDTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNTVALYAFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLHWGQAHYARRVAAAVWVLVLACQAPILYFVTTSTHGTRITCHDTSAPELFSHFMAFSSVILGLLFAIPFAIILVCYVLMAQRLLKPTYGATGNLPRAKRKSVRTIAVVLAVFTLCFLPFHITRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKITRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDDKPAINPIPTIQARRRLGMRRSDISDAKRIENLSASREGSRQTASMPAGDENTKDVQL	138153	150423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_138178_144494_144786_148631
803442	contig_7057_pilon	-	1212	6	Intergenic	novelGene_123219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_5	31.928670501604	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	392	736	537793	537449	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPCTPSYLLSLTSGSLAVDSMRWGTVARGWGGHLGSETPECARGRGLPNALLSGLCPGNVLEVASATSCICGPSPGTSGGNSMGGALGAGTSGPASQDSSYPEASLDTLKAA	539708	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539654
803443	contig_7895_pilon	-	1748	8	Intergenic	novelGene_154436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_7	38.6744655517602	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	521	1126	435242	426514	FALSE	10	TTCATTCTGTTCTATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYRTDDCQPWVLPVVRKVQQKIANDNSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALKDKRVGAVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFSAAGFKDIRSYHYWDAEKRGLDLQGFLNDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASIMKRRFLFPFFDSAYQGFASGDLERDAWAVRYFVSEGLELFCAQSFSKNFGLYNERVGNLTVVGKETDSVLRVLSQMEKIVRITWSNPPAQGARIVACTLSNPELFKEWTCNVKTMADRILTMRSELRARLEALKTPGTWNHITEQIGMFSFTGLNSKQVEYLVNEKHIYLLPSGRINMCGLTTKNLDYVATSIHEAVTKIQ	443777	425891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_426654_431625_431769_432535_432702_432786_432938_435236_435342_435590_435704_436648_436773_443593
803444	contig_4769_pilon	-	2394	9	Intergenic	novelGene_118042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.1272188183869	43	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	604	1389	1583092	1528983	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDMERHLKIHTGDKPHKCDVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTAAELDNDVPKPPCLSAESSDTQKAPATSLPSEAKEQTATLGERTFNCCYPGCHFKTVHGMKDLDRHLRIHTGDKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSVKPHKCHLCDYAAVDSSSLKKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTGDTPLPVLAL	1604958	1527977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1529015_1532319_1532572_1544192_1544256_1544520_1544671_1578266_1578519_1583055_1583119_1585030_1585193_1600749_1600991_1604784
803445	contig_6954_pilon	-	917	5	Intergenic	novelGene_64413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.0936824891633	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	63	905	32466	18687	FALSE	65	AAGAGAACAAGAAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAKEATYNDLQVEYEKCQLQMKELTRKYKEIQTQNFSLKSENQSLKKNISALIKTARVEINRKDEEINNLHQRLSEFPHFRNNHKTARASDTVKTKDLKSRSPHLDDCSKTDPRVKSDVSRDLHHSASLPNLGKEGKSHSEKRSTSVLPPSIEKRCANGIWSRSHYHVGEGNSGEDNRREKKDIRHSQYSGGTDRIRKDFSTSCGSGELRNTETDQRLQGRSEKYGKGEPKAESKNSKFKSNTNSDYQSEHISSSREKEISRERSHIRVESQNDKRLERQSERSQNINKKCTFKSTKAQD	33049	18674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_18720_19027_19680_31423_31540_32424_32500_33020
803446	contig_12586_pilon	+	2363	1	Intergenic	novelGene_121799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40967	43330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_41000_43300
803448	contig_498_pilon	+	2242	2	Intergenic	novelGene_148552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	312	620	697817	698125	TRUE	45	TTAATGAAGTTAAAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKNFWLSACYRRSQAALGTVGLSRSSCPGVDPHEKATEAAPLILMSTEDYGSPIPTGSWVRVGHGLASECRESPKFSLLLPSQGGSECRIRPVLFQKERKM	697505	700034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_699215_699501
803449	contig_8616_pilon	-	1216	4	Intergenic	novelGene_72443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	476.537744803308	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATCTTGGTACTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255488	253306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_253907_254087_254223_254302_254668_255372
803450	contig_5247_pilon	+	2002	13	Intergenic	novelGene_81799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	225.864435127701	1	105	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	166	1071	144244	156390	TRUE	15	ATGGAATTGTTCCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDELHRKYGTDLSRGLTTARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDSSCHLSGL	141787	161548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_141833_144123_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147256_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
803451	contig_10733_pilon	+	663	2	Intergenic	novelGene_109956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCTGGGTGTGTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34931	62365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_+_35067_61837
803453	contig_7457_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_31389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCCTTTAGAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450719	452757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_450700_452800
803455	SIRV6	+	415	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	196	76	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	20	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
803457	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	10	1158	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
803458	contig_11386_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_82843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGCCAAGTTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250757	247181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_247519_250568
803460	contig_6344_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_157120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATACTGCTTTTGGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179733	1178451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1178500_1179700
803463	contig_6446_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_149168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGTCGACCTTTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104007	102636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_102600_104000
803464	contig_6102_pilon	+	461	5	Intergenic	novelGene_31969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2298	junction_1	260.182147735005	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	41	460	413086	414948	FALSE	25	ATGAAGGTGAGGGGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCIN	413045	414949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877
803465	contig_10904_pilon	-	1787	7	Intergenic	novelGene_22445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	22.7205242506026	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	755	1435	78169	71076	FALSE	55	GAGAGAGAATAAAAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLW	96586	70723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_93272_93354_96091
803466	contig_8140_pilon	-	733	4	Intergenic	novelGene_86423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	180.074675867788	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	211	732	9366	5578	FALSE	35	TAAGGCTGCTCAAACTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCHVREEWELTDMVVWVTGASSGIGEELAYQLSKLGVSLVLSARRVEELERVKRKCLENGSLKGKDILVLPLDLTNTSSHEAATKVVLQEFGKIDILVNNGGRSQRSLFVDTSLDVYKELIDLNYLGTVSLTKCVLPHMIERKQGKIVIVNSLMGIISAPLATGYCASKHALR	9576	5576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_5818_6243_6351_8777_8931_9344
803469	contig_8486_pilon	-	2156	11	Intergenic	novelGene_139290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	23.0045647644114	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	41	1948	59803	55211	TRUE	25	AAAGTGGGTTAGATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATTSELATNKSEMVFKAQNATTTVGPNATYNFSQSPNASEMTTSRSQTVFKDWNDTTKDPTADTQTQNVNQAKMATSQASIETDPGISEPEGAAAQASADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSNGDQRRAPLTSGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPSMLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPTWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTSPGWQTPPGWQGSPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPHDWIPTDWPVPPDWQNLRPSPNLRPSPISRASQNPGASQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPDSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAETRAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQTFAGPIIGPGGAASANFAANFGAIGFFWVE	59843	54816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8486_pilon_-_55017_55202_55589_55911_56027_56638_56702_56997_57041_57133_57214_57441_57534_57702_57783_58007_58072_58195_58865_59479
803470	contig_14681_pilon	+	1384	10	Intergenic	novelGene_134197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	197.309558127312	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	285	992	50409	71147	TRUE	25	TTGTAACACCCTACATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	23157	72859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_45548_45707_50350_50634_56129_56208_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71171_72490
803471	contig_13744_pilon	+	1174	2	Intergenic	novelGene_77200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	1079	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	236	688	1038850	1039302	FALSE	25	AATCACTTTGTGATTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKILQQNSAPGVNGISVIPTQAHASGLQQVPQLVPAGPGGGGKAVPPSKQSKKSSPMDRNSDEYRQRRERNNMAVKKSRLKSKQKAQDTLQRVNQLKEENERLEAKIKLLTKELSVLKDLFLEHAHNLADNVQPISTENTAADSDNTGQ	1032440	1039788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1032585_1038758
803474	contig_2114_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_104306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGGGTATATTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020932	1019417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1019400_1020900
803476	contig_20072_pilon	+	543	2	Intergenic	novelGene_175540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGGTCTCAGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	1807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20072_pilon_+_1442_1558
803479	contig_11816_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_98570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAATTAAGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281423	1279953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1280000_1281400
803483	contig_6710_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_95676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653684	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
803485	contig_13004_pilon	-	1419	1	Intergenic	novelGene_112625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGCATAGTTCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207825	206406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_206400_207800
803486	contig_9199_pilon	+	1005	9	Intergenic	novelGene_65636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	56.1970584194582	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	67	909	120933	122653	FALSE	15	TAACTCCTCACCCCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKAAGAEEELLPGVDVLLEVFPTCSVGQAQWALAKARGDLEEAVQMLVEGKDGPNQDLPRRLRGPQKDELKSFILQKYMMVDSAEDQKIHRPMTPKEAPKKLIRYIDNQVVSTKGERFKDMRNPEAEEMKATYINLKPARKYRFH	115828	122749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_121799_121872_122035_122230_122293_122367_122429_122506
803487	contig_987_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_72329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107563	1108861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1107600_1108900
803489	SIRV4	-	224	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1284	13	1284	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTACTTAAGAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
803491	SIRV4	-	324	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1199	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
803496	SIRV6	-	478	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
803503	SIRV4	-	351	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1172	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3986	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
803505	contig_6418_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_81223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATAGTCAAATACACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376298	1374298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1374300_1376300
803506	contig_730_pilon	-	1854	13	Intergenic	novelGene_155610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	168.216543644065	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	167	1519	150164	133025	FALSE	25	ATATAATAGGCTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPWEPQLVPALRPAGEAAGRRRWLWRRWCVPCPQDRGLLPARSVHLSIHPWGSAMATFSRQEFFQQLLQGCLLPTAQQGLDQIWLLLAICLACRLLWRLGLPSYLKHASTVAGGFFSLYHFFQLHMVWVVLLSLLCYLVLFLCRHSSHRGVFLSVTILIYLLMGEMHMVDTVTWHKMRGAQMIVAMKAVSLGFDLDRGEVGAVPSPVEFMGYLYFVGTIVFGPWISFHSYLQAVQGRPLSCRWLQKVARSLALALLCLVLSTCVGPYLFPYFIPLDGDRLLRKWLRAYESAVSFHFSNYFVGFLSEATATLAGAGFTEEKDHLEWDLTVSKPLNVELPRSMVEVVTSWNLPMSYWLNNYIFKNALRLGTFSAVLVTYAASALLHGFSFHLAAVLLSLAFITYVEHVLRKRLARILSACVLSKRCPPDCLHQHRSGLGVRALNMLFGGLAIFHLAYLGSLFDVDVDDTTEEQGYGMAYTVHKWSELSWASHWVTFGCWIFYRLIG	151000	132689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_133127_134620_134732_135693_135780_135863_135928_136024_136102_145603_145705_145853_145980_147438_147570_147649_147832_148223_148268_148720_148914_150028_150202_150871
803507	contig_19769_pilon	+	536	5	Intergenic	novelGene_102282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1575.13920019787	294	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	32	502	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHRRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_87958_89268
803508	contig_15039_pilon	+	712	2	Intergenic	novelGene_110171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	382	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	124	438	329947	343823	FALSE	20	TATAATCTGTGTCCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGKWLCKEV	329823	344097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_330236_343797
803510	contig_10734_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_51058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCAGTGACTCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428639	430169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_428600_430200
803511	contig_2069_pilon	+	952	6	Intergenic	novelGene_23463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.5600417972718	24	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	174	848	1433269	1439332	FALSE	20	TTTCTCTATGATGAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGRATQKAWLVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPALSVQRLPKSLHPACSPEAAPSAAHPTALQPHSRPPAPGLPHLFGGLAKAGTRSSGGAVREKGGLGHG	1432116	1439436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432146_1432942_1433064_1433245_1433305_1433701_1433913_1436052_1436270_1439121
803514	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
803515	contig_6684_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_168596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137231	135780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_135800_137200
803516	contig_7744_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_62516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGACAACCACTACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824431	822500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_822500_824400
803517	SIRV4	-	606	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	8	3	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
803520	contig_12125_pilon	+	1144	3	Intergenic	novelGene_76200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_2	116	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	345	713	73158	79822	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLVIDRFIFRIFFL	72813	80253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_73241_78372_78557_79720
803524	contig_2933_pilon	-	1654	2	Intergenic	novelGene_111343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	360	junction_1	0	453	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	676	987	741434	741123	FALSE	0	CCTGCGGGGTCCTGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCACVCVLCACLCSSLLGSSALWRSQQTRPCVCLLPFAYLPAPGPLPEGGSVCQKLLGGQFDGCLFSHRSAVWGQRSPCRCLSLLNTGHLCSGTLAPVWEPL	742268	740455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_741598_741756
803525	contig_960_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_108243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGAGCATGTACTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463810	462871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_462900_463800
803527	contig_5643_pilon	+	725	7	Intergenic	novelGene_39107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	863.906325297418	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	127	513	640257	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	637788	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_637798_638123_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
803529	contig_10437_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_38386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669436	670430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_669400_670400
803531	contig_2770_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_107500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGACAAGGTAGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830178	830473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_830200_830500
803532	contig_5549_pilon	+	902	5	Intergenic	novelGene_81573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	3	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	63	737	82155	96749	FALSE	30	ACTAAAATTTTCTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82092	96914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
803534	contig_2341_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_84354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66797	64773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_64800_66800
803535	contig_5602_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_133001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACCAGTTCTGACACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239063	239447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_239100_239400
803538	contig_15752_pilon	-	2420	5	Intergenic	novelGene_148785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	540	junction_4	518.826560615395	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	184	831	404541	360086	FALSE	30	GTTCTCGTGAAAAACGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAMLETPELPAVFDGVKLAAVAAVLYVIVRCLNLKSPTAPPELYFQDSALSRFLLKSCPLLTKEYIPPLIWGKSGHIQTALYGKMGRVRSPHPYGQRKFITMADGATSTFDLFEPLAEHCVGDDVTMVICPGIANHSEKQYIRTFVDYAQKNGYRCAVLNHLGALPNIELTSPRMFTYGKHWAWPSGWSPSFFWFSLLQVHCFFCFCLIFKFRM	440899	358496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_360364_367196_367373_404347_404549_407733_407834_440823
803539	contig_10861_pilon	+	946	3	Intergenic	novelGene_39378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	329	junction_2	17	385	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	68	427	1685906	1686383	TRUE	15	CGTGTCTGTAATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRLRELVPGVPRGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIQTAELTPELVISNDKRSFCH	1685838	1687450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686206_1686323_1686409_1686956
803540	contig_18606_pilon	-	241	2	Intergenic	novelGene_175541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCAGGTAAGAATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3711	2449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18606_pilon_-_2628_3648
803541	contig_14362_pilon	-	1441	5	Intergenic	novelGene_142519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.7913210563371	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	269	811	39779	37574	FALSE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITELTSSLPPGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	40156	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37753_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056
803544	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
803545	contig_10235_pilon	+	729	5	Intergenic	novelGene_46376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.922040419441	22	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	173	589	156263	158044	FALSE	10	CATGAGCTGGTCTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFACRGRVHGLRCSCRCRPLEAAAPLPAPVPALVLQVNEELEDNPNQSDLIEQAAEMLYGLIHARYILTNRGIAQMLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153833	158184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153950_156206_156323_156763_156840_156980_157171_157953
803546	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_97208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	55	GAATAAAAATGAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
803547	contig_8322_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_143232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	126	515	255481	255092	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPERLHCEETSAPILWSPSPTASAVLAKLEPGVCLLSPLFVCLHVILNFPCSSFPVSISVSPASPPGLKETGDAEEKSPQPLVYAHLRPADYNFLRFQKDLTPHPPQDPVSGPYSLSGCLLPCSDGSC	255606	253923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_253900_255600
803548	contig_4678_pilon	+	1632	6	Intergenic	novelGene_126071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	17.4882817909593	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	59	1048	723233	732428	FALSE	35	AAACAAAATGTGTTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REASRPGLEAEPHASPPPRMMFPSRRKAAQLPWEDGRSRLLVPVGLPRKCSFFHLFIACLLLGFLSLLWLQLSCSGDVARVARGQGQETLGPPRACLPEPLPEHWEEDPSWGPHRLAVLVPFRERFEELLVFVPHMHRFLSRKKIQHHIYVLNQVDHFRFNRAALINVGFLESSNSTDYIAMHDVDLLPLNEELDYGFPEAGPFHVASPELHPLYHYKTYVGGILLLSKQHYQLCNGMSNRFWGWGREDDEFYRRIKGAGLQLFRPSGITTGYKTFQHLHDPAWRKRDQKRIAAQKQEQFKVDREGGLSTVRYHVDSRTALSVGGAPCTVLNIMLDCDQAATPWCTFG	723174	733012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_723286_726965_727332_730123_730350_731372_731457_731707_731813_732272
803549	contig_9363_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_6844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCTAGAGCTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649809	1650519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1649800_1650500
803551	contig_2069_pilon	-	2985	12	Intergenic	novelGene_23344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2085	2417	716134	715802	FALSE	40	GAAATGGAGGGAAGCGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRTGKGFRGFMWFSVTEWLTGRLSGMTPGGAVVTSPIERSRGGSEPRMVLAVGLGWRPWLLRTGSSPTKATTTSNEGKIRGGERPQMPDHRGIILLPPPRRPQPLAKGE	774823	715233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_716204_762885_763348_766481_766734_767859_768074_769089_769303_770909_770996_771506_771581_771699_771874_772122_772236_772406_772509_773889_773960_774568
803552	contig_57_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_44907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATACACATGTAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124720	122799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_122800_124700
803554	SIRV6	+	231	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-396	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1889	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
803555	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
803556	contig_2596_pilon	+	2122	12	Intergenic	novelGene_53511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	126.996388313322	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	364	1287	1033998	1048002	TRUE	25	TAATATTTTGGTTCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDIKQTSLAGEKPALGPGPQQNPSVLEQAAVGGDAASKPASSTRPACPASTSPLTWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHNKLNTELWKPESFRKEFGDQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDIPNRLKNDKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRKYGTTNLPSRIWSSRLGYCTVSRGCCVYPSRSSTSGP	1030509	1049342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1030535_1030879_1031008_1032504_1032701_1033983_1034157_1034520_1034758_1036115_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046030_1047835_1047920_1047994_1048130_1048634
803558	contig_9696_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_68842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCTGTTACACACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581097	579609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_579600_581100
803559	contig_20890_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_147053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAACAACAGAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48560	49374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_48600_49400
803560	contig_20890_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_147054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49378	50886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_49400_50900
803561	contig_7179_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_78193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATATATACATGAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264040	1262206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1262200_1264000
803562	contig_14341_pilon	+	1192	6	Intergenic	novelGene_111807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	29.5255821280462	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	401	901	473414	486760	FALSE	15	TCCTATTCTCGGGCTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPRSPLSLTSWEQESFLQVKVEDDEAGVSQGQESGLGGHTAHPDAARLRFRQFHYQEAAGPHEALAQLHELCHQWLRPEMRSKEEILELLVLEQFLDVLPPEIHAWVGAQCPESGEEAAGLVEDLTQVLDKRVLLTEDSELPPDGNFGNRRQPHRSQARSRGTT	470200	487051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_470230_471115_471272_472806_472970_473361_473817_474986_475039_486714
803564	contig_3942_pilon	+	1287	5	Intergenic	novelGene_128856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_4	38.6328875441637	786	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	318	737	1485082	1486156	FALSE	15	TGTGAGGAATGGCGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSLVCPETVSRVSSVLNRNTRQFGKKHLFDQDEETCWNSGQGPFQWVMLEFPQCVRISRLQIQFQGGFSSRRCRLEGSQGSQALFGIVDFYPEDNNSLQTFPVPATEVDRLKVTFEDMADFFGRVVIYHLRVLGEKM	1484764	1486706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1485120_1485242_1485334_1485516_1485623_1485696_1485765_1486039
803566	contig_753_pilon	+	1855	2	Intergenic	novelGene_112972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACTCACAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185768	1188725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1185851_1186952
803568	contig_19974_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_130452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTTAGACATTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65598	66145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_65600_66100
803571	contig_6805_pilon	-	2253	5	Intergenic	novelGene_163900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	68.4634939219435	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	1567	2253	436865	432821	FALSE	25	TGGAATCAACTTTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVSLPESCLLTTDTVIRSYLGTYVTKWKPPPSPLLALCSFLVSEKHAGDQSPWKPYLETLPKTYTCPVCLEPKVVNLLPRPLRAKAQEQRAHVQEFFTSSRDFFSSLQPLFSEAVESIFTYSAFLWAWCTVNTRAVYLRHRQLGCFSAEPDTCALAPYLDLLNHSPGVQVKAAFNEETRCYEIIAASSCRKHEEVFICYGPHDNHRLLLEYGFVSTRNPHACVYVSRG	447688	432820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_432998_434586_435017_436785_436875_442598_442695_446227
803572	contig_2342_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_132758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGTTATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255381	253423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_253400_255400
803573	contig_935_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_45539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGAAAGGGCTGGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319831	321502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_319800_321500
803575	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	509	52	509	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803577	contig_20241_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_159735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	12.4899959967968	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1340	1981	213603	221924	FALSE	20	TATTTTATCTTTAAGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQEYFALNTEAGSHMAVLSCRHINWCYYSVHRHRHQSDHECGKLEISKPRMAATQRLGKDVIGSKTGETVSKRRKGAKNTETAAKVALMKLKMHADGDKSLPQTERIYFQVFLPKGSKEKSKPMFFCHRWSIGKVIDFAASLASLKNDNNKSTAKKLRLCHITSGQALPLDNILGTWMAKEDCPLHNGGNIILEYLNDEELFLKNVDSYLE	212263	222010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_213625_216096_216137_216616_216748_217495_217618_221499_221656_221753
803578	scaffold_17541_pilon	+	1797	1	Intergenic	novelGene_175243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1147	1473	380212	380538	NA	50	ATAAAGAGAAATACAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGNEQTFFQRIYTNGHQAHEKMLNVTSHEGDANQNHNQIPLHTHSQTKPNSLPCGFRLTATLQYRAELPPRVPKQQLVDSTADLLVSSHLSTTIPQRSHLHPPGWL	379065	380862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_+_379100_380900
803580	contig_17440_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_7587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCCAACCAAAATTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2761	2561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_2600_2800
803587	contig_13780_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_149032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAGAAAAAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481836	480402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_480400_481800
803588	scaffold_880_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_121513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569153	567363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_567400_569200
803589	contig_7138_pilon	+	1863	1	Intergenic	novelGene_120968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73630	75493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_73600_75500
803592	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
803593	contig_14405_pilon	-	1816	5	Intergenic	novelGene_85677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.0547739713155	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGGTATAATCATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996161	903903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_905183_979091_979165_989814_989909_993288_993379_995881
803596	contig_5419_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_15529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	712	1122	292581	292991	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPPRLTLSYIPIFTHLQAVCSWSNLGINLWFVRSPDHWQNFAGIGSAAAGSPLHSFGTDCSRVIGYSRIGCTKPGCSRNGCSKPGCSRNGCSTTGCSRSGCSKLSCSRSDCSTLGGFQKESIPGDRKSRGPGTL	291869	293326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_291900_293300
803597	contig_12150_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_6971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCTCTCCCTATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161538	160728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_160700_161500
803600	contig_12765_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_106571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCATCCTTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221524	221037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_221000_221500
803601	contig_9727_pilon	+	1753	5	Intergenic	novelGene_86256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	8.25757228245687	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	507	1409	29170	30780	FALSE	25	GAGGTCCAGTCTCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQEKAGPRLVQSCPTPVLQLFEFDSTNVSDVAAKFPGKPYPPYPLAEFSWNNITDSLDPATLSATFRGHPMHDPTNAFANGSLAFRVQAFSGSGRPIQPPRLLHTADTCQLEVALCGASPRGNRSLFGLEVATLSQGPDCPSVQEQLSIDDEYTPAVFQLDQLLWDALPSGFMQWRPVAFSQKQRGRESALPCQVSPLHPTLEYPLPQSPIVRAFFGSQTNFCAFNLTFGASTGPGYWDHYYFSWSMLLGVGSPPVDTLSALVLGIMAVALGAPGLMLLGGGLILLLRHKRYSEYQPIN	28145	31124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_28287_28804_29431_29542_29762_30245_30503_30614
803602	contig_383_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_126140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGAATATCAGGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214225	213428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_213400_214200
803604	contig_7426_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_27481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAAATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667097	664422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_664400_667100
803606	contig_7300_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_170458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCTTGCGGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495855	497268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_+_495900_497300
803608	contig_13542_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_131514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAGTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427072	428394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_427100_428400
803610	contig_2867_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_135184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGACTCAACTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794142	794986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_794100_795000
803614	contig_5495_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_157675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACCTCTATGATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596100	596736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_596100_596700
803616	contig_10015_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_170947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGTGCAAAGAGACTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26200	23885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10015_pilon_-_23900_26200
803617	contig_6823_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_131232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCTACTATATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318546	316679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_316700_318500
803618	contig_13292_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_142949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303598	305836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_303600_305800
803619	contig_8286_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_139789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	242	571	65424	65095	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAQGRGVKQQEPPRGPSEAVKLKLLLALLRVSHSLEGAGLLGEEQDTTEQHTTPPTEKSNPFKYVTLAFKNSPISLPVCPKNPEMFLVSRSSALLCGATQNHAFKRQ	65665	64457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_64500_65700
803620	contig_9389_pilon	+	1044	7	Intergenic	novelGene_84011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.5972755518115	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	317	976	534826	541916	FALSE	5	GCCCGCCCGCCAGTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRPVALASGVSDRWTPHSSGVGAAVQARGIHQSAATGRPSSAQPAVPKAGAVVPKPTALPSSRGEYVLAKLDDLINWARRSSLWPVTFGLACCAVEMMHMAAPRYDMDRFGVVFRASPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRYVVSMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGILQLQRKIKREKRLSIWYRR	534509	541984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_534885_535010_535080_535512_535631_539153_539334_539899_539947_540720_540810_541818
803623	contig_3172_pilon	-	1220	6	Intergenic	novelGene_173677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	72.3419656907386	18	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	218	1039	23286	12306	FALSE	25	GTATTTCTAACTGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYFEPIDITAEEEQEEVESLKSIRKYLTSNVAYGSTGIRDVHLELKDLTLFGRRGNLHFIRFPTQDLPTFIQMGRDKNFSTIHTVLCATGGGAYKFEKDFRTIGNLHLHKLDELDCLVKGLLYIDSVSFNGQAECYYFANASEPERCQKMPFNLDDPYPLLVVNIGSGVSILAVHSKDNYKRVTGTSLGGGTFLGLCSLLTGCESFEEALEMASKGDSTQADKLVRDIYGGDYERFGLPGWAVASSFGNMIYKDKRESVSKEDLARATLVTITNNIGSVARMCAVNEKINRVVFVGNFLRVNTLSMKLLAYALDYWSKGQLKALFLEHEGYFGAVGALLGLPNFS	23503	12124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_12357_13789_13916_15953_16078_16993_17171_20347_20602_23196
803627	contig_14133_pilon	-	481	5	Intergenic	novelGene_119964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_2	369.104998611506	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	45	479	209116	207450	FALSE	20	GGCGACTCAGCTGACCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELK	209451	207447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_207465_208214_208389_208585_208728_209012_209131_209421
803629	contig_12353_pilon	-	1066	5	Intergenic	novelGene_165773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	69.2111804551837	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	45	680	121330	113821	FALSE	60	CTTCAAAAAAAAAATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIDEKTQWILEEMESRRARRRQARVLSANCSHEEGTSSDDELPSAEMTDFQKSQDDILQDCKKIFEDVHDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAFISLCIPKLLNPLIRIQLIDWNPLKLDSIGLKQMPWFTSIEEFVDSSVEDSKKEDCSDKKILAAVINKTIIPRLTDFVEFVWDPLSTSQTTSLITHCRMVLEEHSTCENEVSKGKQVVFARVMNALI	121374	113434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_113979_117959_118111_119729_119930_120712_120826_121316
803630	contig_5003_pilon	+	1852	1	Intergenic	novelGene_120214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	414	836	143715	144137	NA	35	AAGAGTGTGGTGTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRCSQTGPLSGILSPRTCQLSSLIRPSSSFLLSSDSFLSVPLYLRPVGHRFSVPTMIYGRPNCRADLGTPTSFSWHFQHFRAVPCTNLRILSLPPHSYFPLPVHTTEQEANEGMRSNKGKFSGVMIIRKHKLIYKILI	143301	145153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_143300_145200
803632	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	495	55	495	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10732	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803633	contig_5145_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_131366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1	513	368391	368903	NA	35	TCCTTGGTAATTAACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSEKQEVFIPFPAYRQDGMRMTEVGSRALCGPNDQIQNDTDLQGHEQSPSSIAGPAKRWLLPPRPRSSAGNTAHIQHTSVHLPQYTRPRVFTWGKLCLRERWKHPWLSCLGGATGIETRDVAQHPTMNRMVPTPENDPKPKVYSATVRKFCTEGSSKAGILLFIFPST	368390	368914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_368400_368900
803636	contig_15120_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_107993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTTTCACTTTGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93154	94790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_93200_94800
803637	scaffold_9100_pilon	+	1558	8	Intergenic	novelGene_83270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.444456306541	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	71	778	647136	653333	TRUE	55	TACCAACTAAAACACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAAESGFHLLLPPTPASSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQCV	644845	654814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644899_647118_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652058_653324_653449_654149
803638	contig_4782_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_73668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	218	319	554759	554658	NA	35	CATTCTTAATAATTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGGRLRCFKCVSLSAVLPIIRFHALGSRAGLLRVFGVSHSRVSTRNFPIPVTFRITYIVKIRAWCGFDSSVMSELVRTGSKPGFEAAASRREGFHPASSDRYVF	554976	554027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_554000_555000
803640	scaffold_21177_pilon	-	1270	8	Intergenic	novelGene_145486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_6	169.274924309539	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	191	1270	218269	181565	FALSE	45	GGCAGACTGGCTAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGGTVDIVESEPENDHGVELLDQNSSIRVPREKMVYMTVNDSQQEDEDLNVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGNNSDGIENRNGTASALLHIDESAGL	254635	181564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_181642_182184_182341_182719_182864_183067_183218_217716_218287_219904_219960_221422_221512_254606
803645	contig_8308_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_173469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTCTGAAAGCATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23408	24284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8308_pilon_+_23400_24300
803649	contig_12157_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_135923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTCAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221205	219050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_219000_221200
803650	contig_10734_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_51269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCCGGATGGCTCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321447	1318848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1318800_1321400
803654	contig_9121_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_134473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266645	267223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_266600_267200
803655	contig_500_pilon	+	1638	2	Intergenic	novelGene_31108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	482	838	1554183	1557514	FALSE	10	TAAGCCGTGTCTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPFFLLVRREKSAFSPVPIGSLRARVFRSKTVLCDSFQQSNNPPLQRSSSLIQLTSQNSSPNQQRAPQVIGVMQSQNSSAGNRGPRPLEQVTCYKCGEKGHYANRCTKGHLAFLSGQ	1553701	1558314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1554471_1557445
803656	contig_7229_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_39871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1521057	1523265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1521100_1523300
803657	contig_9481_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_149639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCCAGGCCCGTGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124156	124602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_124200_124600
803659	contig_4402_pilon	+	1379	5	Intergenic	novelGene_140812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCAAAATAAGGACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383301	388090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_383445_385642_385854_386143_386226_386694_386822_387274
803660	contig_953_pilon	-	879	5	Intergenic	novelGene_129996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	26.099568961958	127	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	118	780	252230	250164	FALSE	30	AGGAAACCACCGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLADEEVAGKLVLGTFLWHRSLRALHDSPSGSPTESLARMEAVVNLYQEMMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVFFVLSLGPRIMANRKPFQLRGFMIVYNFSLVALSLCIVYEFLMSGWLTTYTWRCDPVDYSSGLHLRQHPSVSSPPTPVTRACMVKTEQGTGPPLPTAGSQGPPPHPLLQASPRDMASLLSATPKLGAKRAGHYFPLPALNLGEGHSGLAPTRVLWPFSHIEEVSNNLSLWIQAPSFSTRTH	254966	250064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_250530_251594_251655_251821_252013_252184_252245_254863
803664	contig_9363_pilon	-	1096	5	Intergenic	novelGene_6642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_2	34.128433893163	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGCTCTGGACTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941629	939820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_939993_940322_940478_940670_940822_940913_941008_941105
803665	contig_11160_pilon	+	2341	1	Intergenic	novelGene_168802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGCTAATTTTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276131	278472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_276100_278500
803666	contig_5698_pilon	-	1127	5	Intergenic	novelGene_55053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	7.28010988928052	125	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	113	694	53786	51247	FALSE	5	CGTGTGTGGCAGCTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLGHRPRSWRRRSGREVFLDLLAFPKIPTASSPPAPAMAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYIADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRQDEHTRRELAKMKQEPVRSEEGRDMANRISAFGYLECSAKTKEGVREVFEMATRAGLQVRKNKRRRGCPIL	57030	50813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_51421_52350_52482_52808_52930_53630_53854_56985
803667	contig_3095_pilon	+	1240	5	Intergenic	novelGene_74990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
803670	contig_8651_pilon	-	1928	3	Intergenic	novelGene_168168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACCAAGGTACCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152032	134185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_134963_137181_137283_150982
803671	contig_5711_pilon	-	1658	7	Intergenic	novelGene_80277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAACCAATGCAAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122755	98861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_99028_101967_102090_105493_105638_107303_107417_108769_108937_113379_113572_122001
803672	contig_15498_pilon	-	1038	7	Intergenic	novelGene_42677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	128.844113391166	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	8	451	697708	688828	TRUE	45	CACTCATTTCTAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYGV	697715	688023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_691510_691595_692421_692509_697262_697374_697554
803673	contig_5620_pilon	+	2169	3	Intergenic	novelGene_161359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416741	433741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_417847_419281_419352_432747
803674	SIRV4	-	325	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1188	8	1188	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
803675	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
803676	contig_20951_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_43137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327794	327483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_327500_327800
803679	contig_9888_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_162263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57695	59412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_57700_59400
803680	contig_11896_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_88041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACGTGCTCAAAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171362	173164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_171400_173200
803682	contig_11386_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_82827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGTGGTGCTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211377	213141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_211400_213100
803683	contig_12201_pilon	-	1851	8	Intergenic	novelGene_159976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	280.311270132446	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1156	1656	124452	110501	FALSE	20	CAAGTTTAATTTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQLLITVAFNQPVKLYSMKFQGPDNGQGPKYVKIFINLPRSMDFEEAERSEPTQALELTEDDIKEDGIVPLRYVKFQNVNSVTIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	139108	110305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329_125106_130805_130980_132873_132971_138877
803686	contig_6946_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_59776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGAGGGTAGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418703	419301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_418700_419300
803687	contig_5881_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_129066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	126	506	740988	740608	NA	10	TCTTCCCTTGCATCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEYELCIWVALGRNTLAQTTAVTSLHRKTIFKILSSEDADNLVNINHKDLVEHYFSGVATLLESVPKRLDVLPLHSTQGNVFIPQMFVECQLCTKPWESVREQERHWPFPYETYSLWRNQTVSK	741113	738825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_738800_741100
803690	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	383	553	210	37	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
803691	contig_5429_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_127826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTCCTCTAACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607788	608907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_607800_608900
803693	contig_12157_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_135932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTGAATGCCCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369072	367033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_367000_369100
803694	contig_4982_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_172239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTATGTTGTCCAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168712	169060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_+_168700_169100
803695	contig_4982_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_172240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCTGTATGCTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169210	169816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_+_169200_169800
803696	contig_12157_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_135927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTGCCTAATATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256500	255602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_255600_256500
803698	contig_12277_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_139722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACAGGACTATTTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436993	437474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_437000_437500
803699	contig_7457_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_31317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTACTGATTTATCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194653	195251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_194700_195300
803702	contig_17829_pilon	+	1228	4	Intergenic	novelGene_157024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	34.7211110933328	199	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	380	1105	22214	25781	FALSE	15	AGAATTTGTGGCTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQTPDADLDVTNIIRAEPTALKTSALDLNSVLGKDYGALKDIVINANPAEPPLSLLVLHRLLCDHYRVLSTVHTHSSVKSVPENLLKCFGEQTKKQSRHEYQLGFTLIWKNVPKTQMKFSVQTMCPIEGEGNIARFLFSLFGQKHNAVNLTLIDSWVDIAIFQLKEGSSKEKSAVLRSMNSALGKSPWLVGNELTVADVVLWSVLQQTGGANGTVPANVQKWMKSCENLAPFNTALKLLK	17345	25904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_17540_22028_22319_24361_24594_25392
803706	contig_11978_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_62923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	925	1293	865905	865537	NA	15	GTATAAGTTGCCTCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGCCSARSPSPPPPPGRAACSPSSGRKGTLFKIRTISLTLGSSLTSSRLCPTKRGSRFRYLEPSRKGFRTWNGRKEWLTGEEWEEELTALVTAGLRLREQPKGLFTLYLQCRHHRLEGCL	866829	865255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_865300_866800
803707	contig_5968_pilon	+	1118	8	Intergenic	novelGene_112193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	744	1118	638272	732368	FALSE	45	AGCCGGACAGGAAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTGTSPRGDDQCLHGEGSASFPSDTAFIKISIILCMLGERKAVGNFKPIFYNQAQKHSLDNFSSLSFFLIMFDYYPTHQAIDLHLLHGRVSGAAFAFAFPCSARGGAGRGGDRAGAFLAGRHLP	622516	732368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_622718_625825_625909_631643_631765_635195_635348_636586_636696_638194_638351_700584_700732_732219
803708	contig_5696_pilon	+	1522	16	Intergenic	novelGene_117530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	66.0842559834707	1	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	67	441	635115	641916	TRUE	40	AGTATTTAAATTACTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGQSGGPAGWAIELYNTFKNKMDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVIDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNT	632370	653247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_632404_635081_635171_636703_636782_637113_637151_637360_637448_638513_638565_638908_638964_641905_642002_643311_643403_643580_643666_644176_644285_645344_645404_647462_647567_648142_648246_651345_651399_652854
803717	contig_14333_pilon	+	1996	2	Intergenic	novelGene_49104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1535	1843	343490	343798	FALSE	85	AATAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLIICRIHYLQPLKPIMKSDRCQFKMCGRIHSFSAFLGGEVSKSLKTLYYFLTDSSAYNTVLPFPSTLQLRTVEIVGFILLTIQKIPSPKFFLPHSAAHLL	340683	343951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_340991_342262
803718	scaffold_6394_pilon	-	1304	13	Intergenic	novelGene_111065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	36.62308015446	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	120	929	518212	510487	TRUE	5	CGCGCGGTGCCCACGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLLDVLGLALACGFVHATLSKSDAKKAASKTLLEKTQLADRPVQERGLVVMDVRAEDVVLEYRSYCSARVQERHFDGAVLGYVTPWNSHGYDVAKTFGSKFTQVSPVWLQLKRRGREMFEVTGLHDVDQGWMRAVRKNAKGLRIVPRLLFEDWTYDDFRSVLDSEDEIEELGKTMVQVAKDQHFDGFVVEVWSPPAGRAGHPALCHPRDPSAGHVHAQGVRAVGPGAGRLQPHDLRLLHGAAAWPQRASVLGPSLRPGPGPQVQVAE	525709	501593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_501767_502099_502143_502334_502416_510408_510565_510748_510851_511977_512025_513496_513534_513800_513908_514609_514655_515506_515640_517036_517187_518101_518255_525632
803719	contig_7171_pilon	-	1183	4	Intergenic	novelGene_101422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	4.92160768674447	261	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	151	492	1471711	1469312	FALSE	15	GCTGACGGGCAATTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEGFRGWEVEHGGNGWAVEKNVILVPGAPSQTCFVTSFEWCFKRQLVDLVMEGVWQELLDSAQIEICVADWWGARENCGCIYRLRVRLLDVYENEVVKFSASPNPVLQWTERGCRQVSHVFTNFGKGIRYVSFEQYGRDTRSWVGHYGALVTHSSVRVRIRLS	1474212	1468620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1469456_1470751_1470888_1471649_1471746_1474096
803724	contig_11982_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_100265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135768	134020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_134000_135800
803726	contig_4413_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_116989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACCACAAGTGGACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136522	135198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_-_135200_136500
803732	contig_11933_pilon	+	1806	2	Intergenic	novelGene_107248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCTTTTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88378	90497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_88790_89102
803733	contig_10985_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_175543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGTCTCTGTGGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54785	52576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_52600_54800
803735	contig_11171_pilon	+	871	10	Intergenic	novelGene_48526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	41	847	31058	65800	FALSE	40	GTCCGAGAGACGTACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDPPPALALA	31017	65824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64833_65773
803736	SIRV6	+	327	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	561	171	382	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
803737	contig_12886_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_135476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTCTCATGTACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308724	308298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_308300_308700
803738	contig_6914_pilon	+	1754	10	Intergenic	novelGene_151737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	65.6810474946921	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	151	1206	126550	129956	FALSE	5	TGTGTGATCTGTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWTVHLEGGPRRVNHAAVAVGHRVYSFGGYCSGEDYETLRQIDVHIFNAVSLRWTKLPPVRPATRGQAPVVPYMRYGHSTVLIDDTVFLWGGRNDTEGACNVLYAFDVSEYGSQEAADCFSNDIHKLDTNTMTWTLICTKGNPARWRDFHSATMLGSHMYVFGGRADRFGPFHSNNEIYCNRIRVFDTRTEAWLDCPPTPVLPEGRRSHSAFGYNGELYIFGGYNARLNRHFHDLWKFNPVSFTWKKIEPKGKGPCPRRRQCCCIVGDKIVLFGGTSPSPEEGLGDEFDLIDHSDLHILDFSPSLKTLCKLAVIQYNLDQSCLPHDIRWELNAMTTNSNISRPIVSSHG	124244	130504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_124336_126490_126704_126882_127083_127512_127585_127715_127930_128008_128096_128249_128359_128472_128547_128667_128747_129889
803739	contig_6100_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_168113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGATGCTTCCTTCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447606	448221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_447600_448200
803741	contig_15787_pilon	+	1323	6	Intergenic	novelGene_143969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	726.760923550517	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	19	813	56226	96074	FALSE	65	GAAAGGAGGAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRKRNIKNQSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQVSKPMVCSVELLEDGRI	56207	96584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79246_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813
803742	contig_10159_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_30801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359174	360614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_359200_360600
803743	contig_13406_pilon	-	1197	4	Intergenic	novelGene_175549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	9.46337971105226	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	86	661	49394	42068	FALSE	50	GTTGTAAGGAAATATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKLVMAQKRGETRALCLGVAMVACAVITYYILGTTVLPLYQKSVWTQESTCHLIETHIRDQEELEGKKVPQYPCLWVNVSAVGRWAVLYHTEDTRDRNQQCSYIPGSLDNYPVARADVEKVRARFHERQVFYCFRTSRENETSVLYQRLYGPQALLFSLFWPTFLLTGGLLIIVMVKINQSLSILAAQK	53815	41531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13406_pilon_-_42338_47590_47763_49260_49419_53754
803744	contig_7733_pilon	-	773	3	Intergenic	novelGene_147122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	12	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGCTGTTTCTTAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32513	26271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_26851_27855_27988_32451
803745	contig_6760_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_150797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAAAAATTATCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216073	217478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_216100_217500
803746	contig_6215_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_21179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCCTCTAATCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218177	217306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_217300_218200
803747	contig_11986_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_69191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	973	1575	725462	724860	NA	30	GCTCTTAATTGTGAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVNKPLFNGNVSGRACSAPKRTLENPVSEIGGELGCDQNPLVGPGTGLQHHGIFKNTLALASNQVHRSMGSLTLQQLSEEVEGASSAWRGSQDERPLSRELTGPHQGPPRPSRISWNAWEACLLSVPSQTFLPPVQYSQWDTRVMGLVCGMSNASPEKVATGACRGFCPLTSSCPATPRRRRKHSHFLLCKSNKCVFM	726434	724783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_724800_726400
803752	contig_14508_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_79034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGCATCTATTAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7724	9086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_7700_9100
803753	contig_1244_pilon	-	2162	5	Intergenic	novelGene_37963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	31.5	743	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	90	503	911358	900905	FALSE	30	ACAACACATTTTTCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAQPGAAAGNLDWAVLASTSFCPDRPAGMEDEEAEEQQRFSYQQRLKAAVHYTVGCLCKEVASEKEMQFSKQTIAAISEVTFRQCENFAKDLEMFARHAKRSTINTDDVKLLARRSNSLLKYITEKNEEIAQFNLEQKAKKKKKFENGNKDSREPAEAGVVESEN	911447	899245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_901046_903292_903360_906509_906544_907474_907599_911310
803754	SIRV6	+	417	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	3	363	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	231	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
803757	contig_1734_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_164392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACTGGAAGTTGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670431	671826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_670400_671800
803758	contig_10982_pilon	+	1425	2	Intergenic	novelGene_87900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	24	704	286318	301739	FALSE	25	TGAGAGCTAGCATGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCILAFPMYLLNFLGIWSWICRTLFPHFLAWVSVIYNEKMASKKRELFSNLQEFAGPSGKLSLLEVGCGTGTNFKFYPPGCRVTCVDPNPNFEKFLIKSIAENRHLEFERFLVAAGENMHNVADGSVDVVVCTLVLCSVKSQEQTLQEVYRVLRPGGVFCFLEHVAAKPLTWNYFWQQILDPVWFLLFDGCSLTRDTWKTLERASFSKLKLQHLQAPLSWELVRPHIFGYAVK	286294	302460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_286762_301502
803762	contig_6361_pilon	-	663	5	Intergenic	novelGene_24000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4287.0236980334	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436361	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415472_419490_419591_420870_421003_436288
803764	contig_17427_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_30269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCATCTTGTTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26794	28156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_26800_28200
803766	contig_7870_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_108925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTGAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262683	263644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_262700_263600
803768	contig_16907_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_87487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGAAAACTAACCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540804	539058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_539100_540800
803775	contig_9482_pilon	-	2305	11	Intergenic	novelGene_44266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	77.7200102933601	1263	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	47	913	773701	757014	TRUE	60	AATCCAGAAAAAGTAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLRQPERTPAPQS	773747	747963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_749099_751176_751253_754752_754886_756965_757048_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
803776	contig_9752_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_122006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACTCTGAACTAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42388	44684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_42400_44700
803779	contig_3942_pilon	+	1342	2	Intergenic	novelGene_128791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	858	944	798678	798764	FALSE	15	CAGCTGCTCCACCGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCSRVGGVQVPGVSVRFAAKVGRVLLWARSSRPLAGTQGVPPLLDALRRGFPLITNREGWACLGHPWGVRVSSVLQLPVGGPEVVSRAQGLGARPQDPHLPQSSPPVRAQRPALRLPALPGLGAQGNPGLRRRLAGGTGPGGRAGRAPSTAVARRPRARPAAAGADSPGHGGPAAADGGTGAEGAGGRLPDASAEDEVSLTPSGALATFAGYLPAPTPVSGPQSCPCQTSTLHAALRVCTLRTHLVAHSSHTPPSAHTADSHQLHPGTPRSYTQGWTQLPRLHTTMHIASKAHACAHAPHHAHSVYMAVHLAS	797311	799162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_797825_798333
803780	contig_6710_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_98281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	10	GGCATCCATGTCTGGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
803781	contig_1910_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_168271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAATTTTTTTAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9913	9151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_-_9200_9900
803782	contig_5718_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_110308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGATGTCTGTTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189413	190652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_189400_190700
803784	contig_9058_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_149375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCCACTATGTCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337868	337109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_337100_337900
803787	contig_13494_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_167519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	265	573	84021	83713	NA	70	GAAAAAAAAGAAGGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKLEFPSLPQCKDDAEVSQCPATATHRPPVVAPRPRDDPRPQPSKSPALSEPCCLLRGVPGLLGGASRSVAVCSDLGLLSSSSSPETPAEGLVLVSLLW	84285	82374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_82400_84300
803788	contig_9633_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_139660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	962	1336	1220758	1221132	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWRFLKKLNIELPEIPVQSIHPEKVKAGTQAGMQTEACTPMFIAALFTIAKRWKQPKCPSKDEWINKTWHIHTMEYYPAMKSNEVLVHATTWMNLQDIMLSEIKSVEKGQTLDDLT	1219796	1221365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1219800_1221400
803790	contig_2100_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_50623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824980	822956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_823000_825000
803792	SIRV6	+	229	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	503	51	503	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803793	contig_15741_pilon	-	1044	7	Intergenic	novelGene_159672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	570.311805555133	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	234	677	60541	50105	TRUE	40	AAAGAGAGGTATTTAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60897	49605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_49783_49914_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681
803795	contig_7294_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_172598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171541	172216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_+_171500_172200
803796	contig_10437_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_38456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTCAGAAACGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023096	1021987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1022000_1023100
803797	contig_17198_pilon	+	904	8	Intergenic	novelGene_62407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_4	73.9050687278854	671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	22	834	1100207	1103875	FALSE	30	AACCATTCATAGTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLRPRASCTPAEADAMVDEGQPASEEVAEHGLLLGQPSSGAAAEPLEEDEEGDDESDDEAPEELTFASAQAEAREEERRVRETARRDKILLKEKRKRREELFIEQKKRKLLPDAVLEKLTTTSQTNIKKSPGKLKEGTTHRSNLSVDLQKKHEGHDKGSDSKKAGTQKVQPGSQNKSYVALRLKDQDLRDARQQAAKAFIQNSLYGPGTNRMTVNKFLSLANKRLPVKRAAAQFLNNTWGAQKKQNAKRFKRRWMFRKMKASGRVNGS	1100185	1103945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1100470_1100544_1100606_1101271_1101331_1102662_1102722_1102950_1103033_1103178_1103301_1103379_1103458_1103786
803798	contig_2032_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_175551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2708	5025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2032_pilon_+_2700_5000
803799	contig_7452_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_109156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTCTGACTTCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171347	170922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_170900_171300
803800	contig_11815_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_50883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATTAAAAAGAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53103	55207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_53100_55200
803802	contig_18303_pilon	-	797	3	Intergenic	novelGene_146799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	12	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	257	796	26035	10806	FALSE	25	TAAGTTTGCCCAGTAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKAVSRKRKAPASPGAGSDAQGLQFGWDHSLHKRKKLPPVKRSLVYYLKSREVKLQSETSYFRVLHGYAAQQLPSLLKEREFHLGTLNKVFASQWLNHRQVVCGTKCNTLFVVDVQTSQITKIPILKDREPGGVTQQGCGIHAIELNPSRTLLATGGDNPNSLAIYRLPTLDPVCVGD	26291	10804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_11013_24633_24889_25957
803803	contig_19701_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_147884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGCTTGAGGATAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47302	48537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_47300_48500
803805	contig_8978_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_49359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCACCAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212101	212825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_212100_212800
803806	contig_8452_pilon	-	780	4	Intergenic	novelGene_48083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1357.13546363901	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTAGTGGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991132	962608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_981586_981738_991058
803807	contig_6654_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_85773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633745	634322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_633700_634300
803808	contig_12654_pilon	-	841	9	Intergenic	novelGene_129333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	166.327237697258	15	35	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	487	825	812716	808478	FALSE	10	TATCTTATCCTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827343	808461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817719_823815_823887_827115
803813	SIRV7	-	265	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91636	-7	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
803814	contig_8310_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_75542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAAGTGAACCACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172849	174526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_172800_174500
803815	contig_5302_pilon	+	1296	7	Intergenic	novelGene_81369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	4.83045891539648	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	23	1030	5493	33363	FALSE	50	ATAAACATGGAAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAYPATAMAENSDKVPIALVGPDDVEFCSPPVYATVTVKPSSPARLLKVGAVVLISGAVLLLFGAIGAFYFWKGSDNHIYNVHYSMSINGKLQDGSMEIDAGNNLETFKMGSGAEEAIEVNDFQNGITGIRFAGGEKCYIKAQVKARIPEVDTMTKQSISSELEGKIMPIKFEENSLIWVAVDQPVKDNSFLSSKVLELCGDLPIFWLKPTYPKEIQRERREVVRKIVQPTTRPSSRPPPRGNLGPGRLNNETRPNDQVDSEPFNPDNPYHQQEGESMTFDPRLDHEGICCIECRRSYTHCQRICEPLGGYYPWPYNYQGCRVACRVVMPCSWWVARILGMV	5470	33629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_5565_6089_6231_12463_12605_21534_21649_25863_26018_29266_29437_33147
803816	contig_15084_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_116701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGGTTTAAAAAAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232156	230818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_230800_232200
803822	contig_7816_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_66474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATTTGGGAGTTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152789	151002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_151000_152800
803824	contig_12425_pilon	+	1230	10	Intergenic	novelGene_46642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	261.206223811809	1	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	3	1082	167145	198400	FALSE	75	GAAAAGAATATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKVMGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHQFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVTNMPAVKAIIYQYMEEIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167142	198548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179220_179342_181651_181819_186767_186872_186919_186945_190682_190746_190787_190836_198229
803827	contig_10437_pilon	-	2143	4	Intergenic	novelGene_38130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_3	180.535007377763	13	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	934	1359	141468	139108	FALSE	20	TGTATTTCAGAGCCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMTALHWATEHHHRDVVELLIKYGADVHAFSKFDKSALDIALEKNNAEILVILQEAMQSQVNANPERANPTTNPVTVAAPFIFTSGEVVNLASLVSSASTKTTSGNVLIMWHLDLNMNRTSGVPGRWMENLSDNPSPLY	148815	138323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_139366_141300_142177_143555_143696_148730
803828	contig_13744_pilon	+	1633	14	Intergenic	novelGene_77148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	47.5507825706047	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	190	1632	116284	167185	FALSE	30	TACCGATATTAATACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRQRKGIKATELSEDRPAQDENVKVENKLPSGCTSGGVWRILSFAVGGTVALCSGLLTSVYLATLHENDLWFSNIKEVEREISFRTECGLYYSYYKQMLQAPTLKQGLHGLIYDNKTESMRTINLLERMNIYQEVFLSILYKVLPIQKYLEPVYFYIYTLFGLQAIYVAALYVTSWLLSGTWLSGLLAAFWYVTNRIDTTRVEFTIPLRENWALPFFAIQIAAITYFLRPNLQPLSERLTLLAIFVSTFLFSLTWQFNQFMMLMQALVLFVLDSLDMLPAVKKNLKTGSFFHRLGKLLLHLFMVLCLTLFLNNIIKKILNLKSDEHIFKFLKAKFGFGATRDFDANLYLCEEAFGLLPFNTFERLSSTLLFYAYVFVLSVTVIAAIAVAFHNLSDSTNQQSTGKMGKWTVELKPETAYNLIHTILFGFLALSTMRMKYLWTSHMCVFASFGLCSPEIWELLLKLVHLYSPKRICVIRYS	113684	167186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_113835_116244_116384_121070_121205_140241_140333_144434_144557_145170_145317_146734_146859_147392_147528_159533_159636_162017_162092_162266_162426_165964_166088_166481_166594_167164
803830	contig_7151_pilon	-	822	7	Intergenic	novelGene_40801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	957.916257068203	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	146	691	551060	529905	FALSE	40	GAAACAATTATAATCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVYRMKS	579285	529773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529924_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996_551120_579199
803831	contig_500_pilon	+	1664	8	Intergenic	novelGene_31107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	5.28378343111627	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	54	863	1541573	1557514	FALSE	15	AAGCCGTGTCTTGTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEIIANVDHIKFDLEIAVEQQLGAQPLPFPGMDKSGAAVCEFFLKAACGKGGMCPFRHISGEKTVVCKHWLRGLCKKGDQCEFLHEYDMTKMPECYFYSKFGECSNKECPFLHIDPESKIKDCPWYDRGFCKHGPLCRHRHTRRVICVNYLVGFCPEGPSCKFMHPRFELPMGATEQPPLPQQTQPPTKQSNNPPLQRSSSLIQLTSQNSSPNQQRAPQVIGVMQSQNSSAGNRGPRPLEQVTCYKCGEKGHYANRCTKGHLAFLSGQ	1541519	1558315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1541676_1545635_1545687_1547942_1548096_1550879_1550976_1551356_1551451_1552685_1552759_1554299_1554471_1557445
803832	contig_12619_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_73567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817129	815322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_815300_817100
803834	contig_3797_pilon	+	1936	6	Intergenic	novelGene_120089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.89293217755	295	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	228	569	346123	379493	TRUE	0	GCTTGTTTTCCTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQGNGRASAARLLLLLLVPLLWAPAGVRAVVDEDLSHRNKEPAAPAQQLQQQPAAVQGPEPARAEESHQQLRFILIMKIQPPKGIWDLSMHLLLLYQLSLYLNWGTRHSL	345895	394455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_346327_379355_379578_386444_386621_387159_387343_392785_392892_393637
803835	contig_16775_pilon	-	1960	20	Intergenic	novelGene_107790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.9377481019575	2	74	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1457	1858	179136	177291	FALSE	25	AACAGTTGTTGTACAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIKLAKELPPPSEEIKTGEDEDEEDNDALLKENESPDVRRDKPVTGEQIEVFANKLGEQWKVLAPYLEMKDSEIRQIEGDSEDMKMRAKQLLVAWQDQEGIHATPENLINALNKSGLSDLAESLTNDNETNS	235732	177188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_177587_178278_178355_179106_179249_181575_181664_187782_187849_188395_188492_189711_189783_189871_189922_190118_190186_191684_191816_210581_210691_217036_217111_219402_219486_227461_227558_227944_227994_228445_228565_231987_232060_233253_233307_233399_233474_235686
803841	contig_8330_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_71776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGATAACCCTTATTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701501	700345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_700300_701500
803842	contig_14755_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_129395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTACAATTTAGTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348564	347964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_348000_348600
803843	contig_10238_pilon	-	2240	1	Intergenic	novelGene_170088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	166	483	43682	43365	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLPQASQGPAETHSIGFRVSSLAQLRGGWNYSRRECLGGAGEGAGSAELPTAGKMKGDLSAPHVPEIFSELMGPDIGLAAGGGASELQISLPATEHRHSSLHSPPALREAMAAPCWAGGQRGKGVSYPHHAPQATQQHGCCCHDHCCLPQGPEQSLASS	43847	41607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_41600_43800
803844	contig_7627_pilon	-	1414	3	Intergenic	novelGene_175561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8	42	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAACAATGTGTGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159583	148699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_-_149498_152468_152690_159188
803847	contig_5255_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_171557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62322	64096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_62300_64100
803848	contig_7426_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_27496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919817	918844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_918800_919800
803849	contig_9696_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_68747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTTGTACTTTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27072	25543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_25500_27100
803850	contig_19701_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_147891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAAAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92840	90940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_90900_92800
803851	contig_7870_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_108880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATTTATTGCCATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139030	137622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_137600_139000
803854	contig_7895_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_154446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTCTTTGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701321	699676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_699700_701300
803855	contig_5084_pilon	-	2193	10	Intergenic	novelGene_64618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	9.5102284117914	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1815	377	2191	1135120	1121024	FALSE	30	TCCCAGCAAAAGCCCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVCSEANEENDKIARTVRRRHSSILKPPRSPLQDLRSGNEAVPESNPVRNRKSSRRVSFADTIKIFQTESHTKTLRKSEIAEKEAGENVLLMQNKSPEDNHCEITGMNTLLCAPIQNLMQQREFSVIEHNQGRTHENDHQTVISSDENQMELTASHTVMISKGLSDCTKSEKSTKIDTKSFLASLKLHTEDSKMRKELNVSMDQNTSSEKKINFSDFIKRLKMGKPNASPSEESDKENCDLSVHAKESKNASSIHHMDVSLNVDENSSNRTRIFREQDDGMNFTQCHTANIQTLVPISNKTSLREVKSDDITIYGGDFMDLTINRTTQILPSADNLSEIENQTQNVRMDVTTGYGTKSPGKKKIFKNKLNAAFQDSTLSPEDEIHITRSHLMGAETHTVTQACNEDSKSLAMGSESICSSSAVQDYKTVFYSRCSDSMELTKCLSSMREEKILLKHDSNYYKMCPNSDAISLITEKTLYSGEDSMNITKSHTVAIDNQIFKHDQTNVQITATPMSEKEMILQNHISVAEDGKMNVNCSSVPHVFKERLQQSLANSLSISLTDRKTKLLTDEDMDLTKCHTGNLGSQTPLASYNLAPENSSKSQ	1145240	1121021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1122464_1123351_1123405_1125345_1125384_1127749_1127784_1128034_1128088_1131216_1131279_1133501_1133562_1134563_1134604_1135085_1135138_1144881
803856	contig_4211_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_80235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	112	303	519028	516700	FALSE	80	ATAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTYQDRLTKLQDHLRQLSILFRKLRLVYDKCNENCGGMDPIPVEQLIPYVEEDGSKNDDRAGLPRFASEERREIAEVNKVSYWSVNFTFSKLSIKNYKGI	519139	516443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_516871_519007
803857	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
803859	contig_8710_pilon	-	2476	18	Intergenic	novelGene_73513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1008	1415	438078	418285	TRUE	25	CGGAAGCCGGGGACGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRKHALAPLYRPKRPRSRSTLRALTLGPVVISPATCRRIFTISSGLVKMTWEPPAQPPAKISAKSGMDPSLLVNLSRTKSLTVSLMAFSGATPKSCGIRPRYSPKKPSYRKTFLKQSKLFLYISSPTTEPLPR	444124	347348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_347367_348356_348420_368570_368703_378229_378334_386205_386355_398329_398470_401126_401265_401940_402035_403626_403710_416876_416960_418227_418387_421451_421507_421746_421828_436144_436284_438047_438193_441522_441677_441810_441903_443477
803861	contig_3789_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_79826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGAGTACTTTATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204663	206876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_204700_206900
803863	contig_14060_pilon	-	2330	1	Intergenic	novelGene_156055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	187	519	66841	66509	NA	30	ACTCCTAGCATCCTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLGLRRPHYGKSRGYGVAAELRKGAQAQAGAGGWGSDPGYAGQGAVFSLTLRGFGGCTGPGAMWSLHVHPGNLSLWFKEYPGFRSLPLLQGATFLHCLKEIRWFGLSHRSHRFSVVIDPLRHSSFSSLLICFVLFFNFSVFCASLSLFLSLTGVVYLTVVSFHKLHTFILSY	67027	64697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_64700_67000
803864	SIRV6	-	408	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9445	-122	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTCGACTGTCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11265	1666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
803870	contig_18620_pilon	-	1049	7	Intergenic	novelGene_168575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	49.4146289630465	549	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	33	746	54372	44563	FALSE	20	GTTTTTTTTTGTACCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGCEGSCRVMLGGSLGSRLLRSVGGSCGQFWGRGVREGGAAMATGESMAQRMVWVDLEMTGLDIEKDQIIEMACLITDSDLNILAEGPNLIIKQPDELLDSMSDWCKEHHGKSGLTKAVKESTITLQQAEYEFLSFVRQQTPPGLCPLAGNSVHADKKFLDKYMPQFMKHLHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEYEFAPKKAASHRALDDISESIRELQFYRNNIFKKKTDEKKRKIIENGENEKTVS	54404	44259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_44693_46638_46693_48072_48182_49498_49611_50211_50290_53171_53256_54225
803872	contig_18438_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_171398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCCAGCAAAATTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314933	316270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_314900_316300
803875	SIRV5	+	352	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	167	149	53	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8368	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
803877	contig_11017_pilon	+	1111	11	Intergenic	novelGene_128081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	638.867435388594	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	175	819	233889	294618	TRUE	40	TCAAGGATTGAGATATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPKPVKPGQVKVFRALYTFEPRTPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233714	294955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559_294837_294881
803878	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
803880	contig_10549_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_110637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTAAACATAGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463248	464994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_463200_465000
803883	contig_13015_pilon	-	1559	7	Intergenic	novelGene_165549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	13.2003787824441	7	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGTCTGAGGCAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371592	350498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_351076_351800_351864_351964_352130_368116_368517_369169_369274_369354_369486_371473
803884	contig_13015_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_165548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTACACCCACTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350443	350115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_350100_350400
803885	contig_5917_pilon	-	1229	10	Intergenic	novelGene_122162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	227.067021160638	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	335	1225	759810	698367	FALSE	35	GATAAATGCACTCAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENILLMGSTILVLNVHQPCLAPSLEIYS	793021	698362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_698444_737211_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_792827
803886	contig_8412_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_118404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCATCCAACCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805023	806858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_805000_806900
803890	contig_2078_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_100154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGACAAAATCTTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346096	346487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_346100_346500
803892	contig_11445_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_175566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTGCTGAATAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36708	35463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11445_pilon_-_35500_36700
803893	contig_8978_pilon	+	1898	2	Intergenic	novelGene_49489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	343	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	866	1657	1758895	1763042	FALSE	20	GTTTTATTTTTGGTTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIGTCFQKGIYVQDRFLEEMKTINYNWLGLWGNRVCFLPLKSYGLFWVVFLPSSALPFPPRLLSETAIRFFLLPFREAS	1758029	1763283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1759055_1762410
803894	contig_817_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_132466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTGTGCAGAGTAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644919	645607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_644900_645600
803899	contig_7887_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_124859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTTTTAAGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127809	126072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_126100_127800
803901	contig_15136_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_175567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1642	2145	5530	5027	NA	30	TCCACGATCAACATCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPSLPILTPTVPPTVLTTCLLSSIIHCNGHTELTENTHDYGVYYRSSGLKFRFRNAQDTVPSIRTASSQLCCRHTCPWPLGLCPAQASITKLFHYSTSKLSAQSHSAFSLCGLGGPLPGLLPISPATASHRLQGYSCLSHSLSWFQELLSSGIPSPLLAVLHWWW	7171	4889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15136_pilon_-_4900_7200
803902	contig_10263_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_135813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCATAAACACAATACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22938	24049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_22900_24000
803903	contig_9609_pilon	+	1032	6	Intergenic	novelGene_23142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	34	351	520917	521467	TRUE	25	CATGATGGGCACCAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLAADLIVAVTTRVKPGRVAPLLPRHPHRVLLQPPDEVLHKPKLDQLPGVGYDFAHWESPASPRTRAPERCRGSFCPQATPSCSRDPSLTAHQRAAAAGGGGQ	520883	522748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_520925_521008_521161_521309_521860_521980_522081_522171_522309_522696
803904	contig_10042_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_79259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCACACACACACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267987	1269736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1268000_1269700
803905	contig_12864_pilon	+	537	4	Intergenic	novelGene_76406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	561	junction_1	532.909831856093	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	155	451	227975	229231	FALSE	15	AGCAGTTTCTGGGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETGRLSRAADTQALLRNDQLYQPLRDRNDGQYSRLGGNWPRNK	227820	229317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_228030_228490_228623_228901_228946_229165
803906	contig_10749_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_133423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1583	1900	100918	100601	NA	25	AAGCTTGCGAGCAGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKTKYMLLTPKVPSTAFPLNCGPIKPTACLTSPPTCLASETQSKTELLIHLPNHLLLHFSPSQLMATPFLQIPRLKTLVQFSILLFLVCITPSGLSSNPVTLG	102500	100502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_100500_102500
803909	SIRV6	+	162	2	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	788	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11025	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_11114_11205
803910	contig_11656_pilon	+	1872	11	Intergenic	novelGene_54008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	139.769667667917	2	91	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	806	1279	520424	536764	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSVTMLDTLSAHLEGLHRRDPAHFDAK	464949	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522845_536687
803911	contig_7569_pilon	+	2159	1	Intergenic	novelGene_114599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCAGGGGGGTGGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159967	162126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_160000_162100
803913	SIRV1	-	154	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3654	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
803917	contig_3787_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_102345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3923	2359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_2400_3900
803920	SIRV6	+	378	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	26	379	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
803921	contig_6059_pilon	+	1589	3	Intergenic	novelGene_44779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	13.5	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	47	658	64732	66575	FALSE	30	TATCAGTATACTGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKVLLLDPSIVEAKMELEEVARFLNIKDNTASFNKEKERRKIEIQEVNEGSGETTGETTERTSPEVSIDSLASEKGSESSGPPEPCEKLQICKPNNAYEFGQVINAVNTRKDKDACAELLAITEPKDLPMLLSNKLEGDTFLLLIQALKNKLIDKDPSLVYQHLLYLSKAERFKMMLTLISKGQKEQIEQLFDDLLNTSTNQFTLEDLQALKRQYEL	64685	67506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_64828_65951_66336_66443
803924	contig_8140_pilon	-	716	2	Intergenic	novelGene_86464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCAAATGTCTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895979	894911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_895167_895518
803925	contig_6361_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_23922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACTCAGGTTTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239013	237763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_237800_239000
803931	contig_3727_pilon	-	643	7	Intergenic	novelGene_146733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAAGAACACAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307445	300431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_300501_301345_301414_301685_301734_302573_302661_303621_303704_304912_305089_307332
803935	contig_13481_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_119518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCACAGATCTGGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421041	1420658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1420700_1421000
803942	contig_5797_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_56963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417186	414862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_414900_417200
803946	contig_7630_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_133639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAAGATATGTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411973	414035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_412000_414000
803950	contig_8228_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_81780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51240	49733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_-_49700_51200
803951	contig_1666_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_160584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCCACCTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695031	696874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_+_695000_696900
803953	contig_5965_pilon	-	1355	3	Intergenic	novelGene_154653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	33	546	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	192	506	62963	51642	FALSE	20	AGTCTTTGACTATATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQLLTDESLESVTFRDVTVDFTQEEWQQLKPAQKDLYRDVMLENYRNLVSLGKGGSFAEFHHRPTTGGPQINKKRKKRWTDLTDVESLNYSKLKIKLIDDKM	64917	50792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_51924_62930_63019_64781
803958	contig_8576_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_88744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	673	1035	686698	686336	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRGRDRGDWMYRGRDRGDWMYRGRDRGDWMYRGRDGETGCTGAGTGEIGCAGVGEIGCTGAGTGEIGCTGAGVGEIGRTGAGVGEIGCTGAGVGTRFLEVITTSKYYLFKKKKGAGGVV	687370	685466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_685500_687400
803959	SIRV4	+	301	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTTTGCGTTTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
803962	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	32	8115	19	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
803963	contig_11386_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_82846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGGCCAAGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250666	247184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_247600_250556
803966	contig_7230_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_52524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23026	24664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_23000_24700
803971	contig_11338_pilon	+	1047	5	Intergenic	novelGene_6409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315146	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_315642_318591_318769_319185_319289_321316_321441_323166
803973	scaffold_12124_pilon	+	798	2	Intergenic	novelGene_22021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTAGAGGTTAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829182	971590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829221_970830
803974	contig_13004_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_112660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567936	565904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_565900_567900
803975	contig_8864_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_135976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGTAACCTATATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99572	98460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_98500_99600
803979	contig_1694_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_144996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTTTTAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702223	1703296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1702200_1703300
803981	contig_13530_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_175569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTAAGGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26452	25642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13530_pilon_-_25600_26500
803982	contig_11281_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_125437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGACCTGGCTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797269	796810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_796800_797300
803985	contig_13481_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_119320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTAATACCCAGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292870	293285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_292900_293300
803986	contig_1213_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_76469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65851	67250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_65900_67200
803988	contig_9653_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_48234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTTTAAGCACCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808175	810308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_808200_810300
803990	contig_10531_pilon	+	2273	12	Intergenic	novelGene_114522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_4	100.100280297822	18	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2016	257	2272	466144	513703	FALSE	35	AGGAAGAAGGCTCCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPLQWARYHWQRLIGGANRDDNERPYNYSSLLACGGKTSQTPKLAGKHRVVVPHLQPFKDEYEKFSGAYVNNQIRTTKYTLLNFVPRNLFEQFHRAANLYFLFLVVLNWMPLVEAFQKEITMLPLVVVLTIIAIKDGLEDYRKYKIDKQINNLVTKVYSWKEKKYIDRCWKDVTVGDFIRLSCNEVIPADMVLLFSTDPDGICHIETSGLDGESNLKQRQVVRGYAEQDSEVDPEKFSSRIECESPNNDLNRFRGFLEHSNKERVGLSKENLLLRGCTIRNTEAVVGIVVYAGHETKAMLNNSGPRYKRSKLERRANTDVLWCVLLLIIMCFTGALGHAIWLSRYEDIPFFNIPKPDGHVISPLLAGFYMFWTMIILLQVMIPISLYVSIEIVKLGQIYFIQSDMDFYNEKMDSTVQCRALNITEDLGQIQYLFSDKTGTLTENKMVFRRCSVAGFDYCHEENAKRLESYQEAISEDEDFADTPSGSLSNMAKLKAHSCRMAHNGSLGNKPSNHLSGSCFALGSGEGASEVPPSRQAAFSSPIETDVVPDTRLLDKFSQITPQLFTSPDETVHSPPLETLCIIDFFIALAICNTVVVSAPNQPRQKIRLSSLSGMPIKSLEEIKNLFQRLSVRRSSSPSLARGKEPSSGVPNAFVNRLSLFSRMKLASPV	429098	513704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_429318_466106_466434_467898_468094_481531_481737_485780_485867_491937_492045_492311_492444_492842_492971_493102_493356_500663_500903_511056_511246_513511
803998	contig_7733_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_147148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCATATGCTCTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160633	158790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_158800_160600
803999	contig_9527_pilon	+	1220	6	Intergenic	novelGene_134070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	51.2226512394663	1208	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	102	752	486523	487885	FALSE	50	TTAAAATGAAATCTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484671	488353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484732_486481_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
804001	contig_20842_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_160979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTATACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160411	162730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_160400_162700
804003	contig_14322_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_116302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAGCAGTATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671651	671363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
804004	contig_8241_pilon	+	1287	14	Intergenic	novelGene_157484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	69.6454248827631	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	90	1286	155828	176811	FALSE	30	AGCACCTGACAATCCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EESLGKCLLASTYLARLGLCESDENCKRFMDRCMPEAFKKLLTSSAVHKWGTEIHEGIYNMLMLLIELVAERIKQDPIPIGLLGVLTMAFNPDNEYHFKNRMKLSQRNWAEVFGDGNMFAISPVSTFQKEPHGWVVDLVNKFGELGGFAAIQAKLHSEDVELGAVSALLQPLGVCAEYLNSSVVQPMLDPVILTTIQDVRSVEEKDLKDKRLVSIPELLSAIKLLCMRFQPDLVTVVDDLRLDILLRMLKSPHFSAKMNSLKEVTKLIEDSTLSKSVKNAIDTDRLLDWLVENSVLSIALEGNIDQAQYCDRIKGIIELLGSKLSLDELTKIWKIQSGQSSTVIENIHTIIAAAAVKFNSDQLNHLFVLIQKSWEIESDRVRQKLLSLIGRIGREARFETTSGKVLDVLWELAHLPTLPSSLIQQALE	154441	176812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_154496_155792_155861_159484_159629_160317_160441_164672_164709_165277_165344_169094_169161_171631_171707_172296_172456_173962_174078_174275_174380_176026_176135_176551_176648_176739
804005	contig_8241_pilon	+	691	6	Intergenic	novelGene_157486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_5	37.3277376758892	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	165	527	691	184346	185353	FALSE	70	AGGAAAAAAAATTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHLPTLPSSLIQQALEEHLTILSDAYAVKETIKKSYIVKCIEDIKRPGEWSSLDKNKKDGFKSSQLNNPQFVWVVPALRQLHEITRSFIKQTYQKQDKSIIQDLKKNFEIVKLVTGSLIACHRLAAAVAGPGGLTGSTLVDGRYTYREYLEAHLKFLAFFLQEATLYLGWNRAKEMWECLVTGQDVCELDREMCFEWFTKGQHDLESDVQQQLFKEKILKLESYEITMNG	176762	185353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_176902_177105_177154_182709_182818_183477_183628_184264_184397_185239
804006	contig_6710_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_98256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	CCCTCCCCTCCTTAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
804007	contig_6227_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_49694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940458	938716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_938700_940500
804008	contig_19098_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_65853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTAACGGAGTGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453011	454167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_453000_454200
804009	contig_19098_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_65855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCAGCAGTACGTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455429	456126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_455400_456100
804010	contig_2093_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_152953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAACTTCCCCAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992351	991545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_991500_992400
804014	contig_12540_pilon	+	778	2	Intergenic	novelGene_148107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	684	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	10	297	1054241	1054765	FALSE	20	TTTCCACTCGTTTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDMASSAGSLRILWSPAGRSAALLGGRWLQPRAWLGLPDAWGLPTPQPARGKARGNEYQPSNIKRKHKHGWIRRLSTPAGVQVILRRMHKGRKSLSH	1054231	1055246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1054315_1054551
804017	contig_3601_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_132881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_2	7	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCCCACATATCTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188289	168938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_169200_170691_170868_187636
804019	contig_4093_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_27643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATACACACTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46314	45403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_45400_46300
804020	contig_14811_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_74500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386880	388817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_386900_388800
804027	contig_17936_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_29959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATATCTCAGATGCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80828	79044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_79000_80800
804033	contig_3627_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_78458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAGGAGGGTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310753	308849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_308800_310800
804035	SIRV6	+	389	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	378	0	212	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
804037	contig_8020_pilon	-	855	7	Intergenic	novelGene_114362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	135.217622947438	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	491	793	105876	104794	FALSE	5	CAGGGCTGTGTTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107291	104731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106000_106095_106587_106715_106803_106892_107130
804041	contig_1964_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_130934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAACTGGTAACCGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694600	694995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_694600_695000
804045	contig_13021_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_8109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCCTAAAATCAGCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126228	128165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_126200_128200
804046	contig_5003_pilon	-	2641	19	Intergenic	novelGene_120190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	228.387888859672	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	45	1856	81162	30133	FALSE	35	CCCAGCATACATGGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSCGRDSQGRIGTMEGPRAAPQPYLGLVLEKLRRVVAALPEDMRPGPDPYGFPWELVTGAAIFGFFAVLLFLWRSFRSVRSRLYVGREKKLAVKLSTLIEEKCKLLEKFSLVQKEYEGLESSLKDGKESTEAQSLETTYEKLDRSKSELEDEILFLEKQLKEEKSKRSEKDELGMDISERIQSLEDESKSLKSQVAEAKMTFKIFQMNEERLKIAIKDALNANSQLQESEKQLLQEAEEWKEQLSELNKQKITFEDYKVHVEQVLSDKENQIKSLTEHLLKMKDWTAVLGEDVVDDDSLELEMKSESEYGTYLDDQPRGALKKLIHAAKLNASLKTLEGERNQIYIQLSEVDKTKEELTERIKDLQTEQSSLQSENAQFENENQKLQQKLKVMTELYQENEMKLHRKLTVEENYRLEKEEKLSKADEKLSHAAEELEIYRKRAKDLEEELERTILSYQGQITSHEKKAHDNWLAARTAERNLNDLRKENAHNRQKLTETEFKYELLEKDPYALDVPNTFGREHSPYGPSPLGRPSPETRAFLSPPTLLEGPLRLSPLLPGGGGRGILFKHLYYSRFLPYFIFSSQLIFTMICEIHLWKIQAFLALIIGYVFGKGAL	81206	29347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_30420_32065_32146_33647_33716_38164_38201_39044_39106_40063_40166_43948_44088_46242_46334_47075_47123_48362_48484_50755_50879_56381_56487_60549_60622_61267_61379_63554_63618_66502_66592_66684_66707_71647_71780_81099
804050	contig_9099_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_149892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACAAACCAACCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257244	258802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_257200_258800
804051	contig_11396_pilon	-	760	4	Intergenic	novelGene_71355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	42	junction_3	247.435288958997	1575	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	361	501	544494	544354	FALSE	15	GCCTGTGATGTGTATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACARRGRGAAFRGLPCGWSQWLSPVSPRRATRDRAPRRRGVAAEVSTRPKARAWQPSPPAARSWLRTTITGAAWGPLPVTAPVEVLSTLEKPSPTTQGFPRLTRATGGQASFFGKSAVPFMATVLESPESSGPLQTSSGMITCDLAQGAIGKQPGSPPATPAPGPS	545598	544094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_544564_544687_544766_545026_545108_545466
804055	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	540	53	540	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10777	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804057	contig_6710_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_96909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	653864	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653866	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
804058	contig_6533_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_114659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260893	261117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_260900_261100
804060	contig_7271_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_159953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCCAAGCAGAGGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475877	477232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_475900_477200
804062	contig_10658_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_130074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAATAGCAAGGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183383	182363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_182400_183400
804063	contig_16647_pilon	-	2087	5	Intergenic	novelGene_170317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	64.4204936336256	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	155	811	377045	364281	FALSE	60	AGATTTATAGAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPLGGPRPLLCALVAERLSLGHSWSRSGTGTDNRAPAWPSRRLCDLPAGGMWRLRRAAVACEVCQSLVKHSSGIKGSSPLQKLHLVSRSIYHLHHPTLKLQRPQLRTSFQLFSSLTNLPLRKLKLSPAKYGYQPRRNFWPARLAARLLKLRYIILGSAVGGGYTAKKTFDQWKDMVPDLSDYKWIVPDIVWEIDDYIDFEKIRKALPNSEDLAKLAPDFDKIVESLSLLKDFFTTGSSGETVFRATDHGSESDKHYRKVSIKENSSLR	377199	363004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_364382_365635_365744_367878_367976_368838_369158_377013
804064	contig_5217_pilon	-	1394	6	Intergenic	novelGene_135749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	102.100734571305	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	302	370	532753	532685	TRUE	20	GCGCCATGACTTCTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAKSHQREKILNEIELHRDLQHRHIVRFSHHFEDDDNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRGILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPDQRKK	533374	531499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_531679_531766_531876_531948_532777_532869_533000_533128_533246_533343
804070	contig_6710_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_97800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653401	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
804072	contig_2069_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_23311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	874	1209	517898	518233	NA	10	CTTTCTTCCCCTGCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDFMTAASMVMGSILTVFYFFLIAFVSNFFLWYLKNNEREKEYHLGSVNDFGFNVRYPPNLVYQNGSIGSVENMDAGGYPPPPPQSDSTSPPSPSFSEDNLPPPPAEFR	517024	519275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_517000_519300
804073	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
804074	contig_9375_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_136072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCACAGCAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527449	526809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_526800_527400
804075	contig_6589_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_25825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820731	819981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_820000_820700
804076	contig_2704_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_75303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	172962	172600	NA	60	AAAATTAAACAGTACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACASESSRKLPVPARDPRATADPRAAADTGQEFAASAPAPVPWPPGGPGTRQGGGDDGSEPRGPAGTWPSASRPLQWGHPKPSGTLDPRFSGPWILGPGIPGLPDADTDTPDPQPLILEP	172964	170890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_170900_173000
804077	contig_6283_pilon	-	1872	7	Intergenic	novelGene_100218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	181.089910142878	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	201	707	615125	613173	TRUE	15	TCCTGTGCTTGTCATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSPQPGQPSSQPNSNVSSGPAPSPSSFLPSPSPQPSQSPVTARTPQNFSVPSPGPLNTPVNPSSVMSPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITYVRLACRGWPRPGPCSPRTSFQGPCGVYPEA	615581	610866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_613035_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526
804079	contig_593_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_102004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAATAAGGCTGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358509	356602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_356600_358500
804086	contig_15866_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_63668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGCAAATTACTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603623	601721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_601700_603600
804087	contig_15866_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_63667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACTTTCAAAATCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601672	601099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_601100_601700
804089	contig_11846_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_106002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTTGAATTGTCATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417777	416215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_416200_417800
804091	contig_5891_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_151580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATGCTTTTGCTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116968	118218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_117000_118200
804092	contig_16156_pilon	-	2040	9	Intergenic	novelGene_137073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_5	25.5819760769179	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	8	1198	160245	99837	FALSE	45	GCTAATAAACTGTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQESAAQLSMTLKVQEYPTLKVPYETLNKRFRAAQKNIDRETSHVTMVVAELEKTLSSCPAVDSVVSLLDGVVEKLSVLKRKAVESIQAEDESAKLCKRRIEHLKEHSSDQPAAANVWKKKRMDRMMVEHLLRCGYYNTAVKLARQSGIEDLVNIEMFLTAKEVEESLERRETATCLAWCHDNKSRLRKMKSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160252	98994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116981_117105_123176_123381_133371_133555_160176
804094	contig_7530_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_141848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCGAGGACAAGGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291227	292871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_291200_292900
804096	SIRV5	-	599	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACATGTAGAGAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10967	8021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
804097	SIRV6	+	757	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	25	1	25	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10262	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804098	contig_5878_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_145720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAATTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204249	203329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203300_204200
804100	contig_12622_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_5774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAACTTTCACCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111272	113524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_111300_113500
804101	scaffold_13505_pilon	+	1395	7	Intergenic	novelGene_111655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_6	403.96675468272	66	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	447	1286	829683	851102	FALSE	20	GAGAGAGGACCGGGGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESHNKIYEKLSHGSHSIYMLFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRQSLKVEQHVELYQKYSNDSWRYLSDRLLAPSESSEWLSFDVTGVVRQWLSHGGEIEGFRLSTHCSCDDKDSKLQVEIKGLNNNQRRGDLAAIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLHSSRHRRALDTSYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPFIWSLDTQYSKVLALYNQYNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS	829236	851211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_829702_832738_832900_834199_834318_836032_836111_836528_836680_849865_850020_850943
804106	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1209	0	1209	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3949	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
804107	contig_11145_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_160524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGAAGTGGTTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138616	136894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_136900_138600
804108	contig_12312_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_63977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCTCCAAAAACAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271331	270862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_270900_271300
804112	contig_6589_pilon	+	1413	14	Intergenic	novelGene_25982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	73.4719686514169	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	475	1335	1331872	1336231	FALSE	15	CTGTTCATGCATGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDMAPVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIISTSPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLRYAIQLITAASLVCRKRKGTEVQVDDIKRVYSLFLDESRSTQYMKEYQDAFLFNELKGETMDTS	1324122	1336309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1324179_1327141_1327199_1327503_1327646_1330373_1330504_1330641_1330709_1331849_1331910_1331996_1332091_1332495_1332620_1333015_1333111_1333194_1333314_1334933_1335054_1335429_1335560_1335988_1336104_1336205
804113	contig_20996_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_175576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTACCAGATGGAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57580	56597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20996_pilon_-_56600_57600
804114	contig_20996_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_175575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGGTCTGTCTATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56647	55368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20996_pilon_-_55400_56600
804115	contig_12464_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_68669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCGAACAGGTAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149769	149368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_149400_149800
804116	contig_15361_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_167872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGCTGTAAATCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487650	488915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_487600_488900
804119	SIRV6	+	624	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	964	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11201	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_11200_11800
804120	contig_15118_pilon	+	1904	7	Intergenic	novelGene_74569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.8378960736144	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	567	1385	237605	252657	FALSE	45	ACATGAAGATCAGCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCQPCGPRHAAPAAAAAPAVGGGSLQEYPGYKLQIPELVTVQEGLCVIVFCEFFYPRHVSFTTDQLCIYWYWTGDNTYSNRLVATNCQNLVVKTETQGRFHLLGDPKTNNCSLSIRDARKSDTGIYEFRVWGQYVQYSYRTQLNLQVTDLTEKADIHILEPLQSGSPTNLTCSLPGSCDGGRPLTFSWMGDALNMLDPSTLQSSVLTLTPRPQDHGTYLTCQVKRRWPQVTTERTIRLNVSYPPQMLGSSCSWEAEGVHCSCFAQAWPAPFLHWWIGDRLVEGNSSDASFSVTSSSIGPWTKSSLSLSMELTSVLRLCCEAWNDHGNQSVTVLLLPGKSASRAEVALGALGGAGTMALLSLCLCLTFFFIVKARRKQAAERPGGMDDEDPVMGTVTWSCRQKPWPESTPAQQSHSGDTPPSREEQDVHYASLSFHGMKPQKSKDEEATSTTEYTEIKTSK	236752	253176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_236822_236895_237274_237485_237765_239320_239606_239792_239893_240762_240845_252465
804122	contig_6589_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_25848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAACTGCTTTCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940799	941434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_940800_941400
804126	contig_12050_pilon	-	2169	6	Intergenic	novelGene_62699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_5	99.0971240753232	4	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	177	1172	619215	616574	TRUE	20	GCTAAAGCCTCTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQVRRGGRCCEVVGAAGGWDCRAPACLCIWDGSRGQIQSFLKGNQRHQALGDTGPLARSCSLLKRRWRKLNWPPEGVSPGDGAYHRGLCRGLLGRGRPPGL	659659	615488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_617366_617771_617890_619129_619256_619530_619612_659604
804127	contig_3575_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_141121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAATAGCTGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738199	736031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_736000_738200
804128	contig_13201_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_130886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	93	338	216277	216522	NA	25	AATCCGGTTAACTTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSAFHHLVVYDVKEERCFGYDAHYGTEKPHMGLVVDDTTCGPGRYCLEQNHTCYQDLKFTCNVSTCNYRAVCNNNNCHCLRGWKPPLCEGRESGGSVDSGSPPDNMIFEAE	216184	216792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_216200_216800
804129	contig_19402_pilon	-	2153	1	Intergenic	novelGene_80747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21767	19614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_19600_21800
804131	contig_3469_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_34142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGTCCATGTGCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246436	248435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_246400_248400
804132	contig_8650_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_162637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGATACCCAGCAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388335	385914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_385900_388300
804135	contig_17785_pilon	+	1993	1	Intergenic	novelGene_175578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28418	30411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17785_pilon_+_28400_30400
804137	contig_14635_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_84382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646480	648937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_646500_648900
804139	contig_16532_pilon	-	1378	2	Intergenic	novelGene_110068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTCTCCACCTCTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589802	586879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_586961_588505
804140	contig_8674_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_102900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159640	158146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_158100_159600
804142	contig_4531_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_47863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGGTTTTGCAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178257	177178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_177200_178300
804143	contig_3942_pilon	-	262	2	Intergenic	novelGene_128741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAACGCTTAACAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790104	784710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_784815_789946
804144	contig_13702_pilon	-	740	7	Intergenic	novelGene_102596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_2	26.9010532631469	625	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	17	655	99578	68217	FALSE	15	GCTTGTCATTGACTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVLEQLGALWMQNLRSQGKLALGLLSPHNVLLQSHIHTSASLDISRKWEKKNKIIYPPQLPGEPRRPAEIYHCRRQIKYSKDKMWYLAKLIRGMSIDQALAQLEFSDKKGAQIIKEVLLEAQDMAVRDHNVEFRSNLYIAESTSGRGQCLKRIRYHGRGRFGIMEKVYCHYFVKLVEGPPPPPEAPKTAVTLAKEYIQELRNRTIIHTL	99594	68131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_68429_75046_75117_76558_76637_78077_78144_84002_84139_99421_99471_99550
804146	SIRV6	+	405	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	554	3	375	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	445	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
804147	contig_5797_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_56939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCACCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305516	303424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_303400_305500
804153	contig_10235_pilon	+	1756	9	Intergenic	novelGene_46540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	3.46184560603156	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	103	1050	409582	412159	FALSE	15	TGGTAGCCCTTTGTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVYVFGIGPLVDQANINALASKKDKEQHVFRVKDMEHLEDVFYQMIDESQSLSLCGMVWEHREATDSHKQPWQVKISITRPGKGFENCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVEDEKHSIKVSVAKDARGTVKKQELDIEEVLFHPSYNINGKKAEGIPEFYDYDVALIKLKTKLKYSQTLRPICLPCTEGTTRALRLPQSATCQQHKEELLPVKDVKALFVSEEKKTLVRKEVYIKNGDKKTSCEKDARNAKGYDKVKDISQVVTPRFLCTGGVDPYADPNTCRGDSGGPLIIRKKSRFIQVGVISWGVVDVCKDQKQGQKWEVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLKDEDLGFL	409479	412865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_409619_410097_410196_410343_410474_410675_410836_410937_411015_411218_411320_411425_411559_411638_411689_411997
804154	contig_19577_pilon	-	1691	8	Intergenic	novelGene_119833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	69.3803477438765	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	38	862	60130	14526	FALSE	55	GAATTAAGGGAAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFLSTLFCLGLCLRQAIQTRQVPLPKPSLQASPSALVPLKKSVVIQCQGPPGVDLYRLEKLKPRSYEDQAVLSIPVMKESFAGQYRCSYQNGTLWSPPSDLLDLVATGVFSKPSLSAWPSSAVSPGGDVTLSCQAQYGFDRFALHKEGDPGPSKSPERWYQAEFPIITVTAAHSGTYRCYSFSSSSPYLWSHPSDPLELVVTGTSVTPSWLSAEPSSFVSGTSKNTVFSTESGSPTGHQERLHGLTGLTPWFLTRAPQKQDLANCFHEDHSY	60167	13696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_-_14581_19735_19791_41350_41399_46577_46632_51818_52104_54854_55113_55259_55296_60096
804155	contig_6673_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_164034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCCTATATATGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248237	249293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_248200_249300
804157	contig_9875_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_154403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCACAGCGACCCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56729	56192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_56200_56700
804161	contig_5947_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_101604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCCTTCTCTAGCGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962266	961797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_961800_962300
804162	contig_8697_pilon	-	838	3	Intergenic	novelGene_83209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3685	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATACATCTGGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19102	16464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18573_18816
804164	contig_15449_pilon	+	1163	5	Intergenic	novelGene_33669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	210	539	191181	194692	TRUE	25	ACAACACTGCAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLDLQLLKKVPVQNLGDHLRLRQGDSGSQKTSVRRGRGCSMPLMRSLGSWDSEEVLGEEGLGTTEVPTLPTVTSSLSSCRRCRRISWDSEKLLPSADSGRISRRYPM	190971	196205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_191486_194667_194772_195026_195205_195335_195569_196071
804170	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
804171	contig_11370_pilon	-	1603	8	Intergenic	novelGene_98768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	119.520299701834	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	20	898	217758	215829	TRUE	15	CACCATTTGGAGCCCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTENGLMLLDRSGQGKVYGLIGRRRFQQMDVLEGLNLLITISGKRNKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDMEGCGHYRVVKYERIKFLVIALKSSVEVYAWAPKPYHKFMAFKSFADLPHRPLLVDLTVEEGQRLKVIYGSSAGFHAVDVDSGNSYDIYIPVHIQSQITPHAIIFLPNTDGMEMLLCYEDEGVYVNTYGRIIKDVVLQWGEMPTSVAYICSNQIMGWGEKAIEIRSVETGHLDGVFMHKRAQRLKFLCERNDKVFFASVRSGGSSQVYFMTLNRNCIMNW	217777	215071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_215578_215629_215913_216319_216460_216563_216724_216804_216955_217036_217138_217311_217447_217649
804172	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
804177	contig_9002_pilon	+	1902	12	Intergenic	novelGene_116727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1481	1888	328334	337854	FALSE	25	TTCATCATGTCTGCGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDYLTIHFGLVIKSKLALHLLMVVDFTIVTEPQIRVSLQSNWLHPKQRINHRQPMKSKAAVGVSVDIFKTKGIWTPVCNLHSTQTLNREAFIAAKEGPNAAHGRLEPQALSYGTGCGLRTEHLASSHLISTSLS	316750	337868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_+_317086_317507_317671_317757_317837_319052_319153_319663_319768_321083_321201_322686_322826_324227_324323_324599_324776_328161_328394_331605_331880_337780
804178	contig_17066_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_130947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111446	110556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_110600_111400
804179	SIRV6	+	259	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8451	-1	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
804180	contig_14618_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_136828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTCCCTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086411	1088818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1086400_1088800
804182	contig_10638_pilon	-	2284	4	Intergenic	novelGene_164312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	15.121728296285	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533717	503494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_505550_510629_510701_528491_528570_533637
804183	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
804184	contig_14790_pilon	+	2418	1	Intergenic	novelGene_127904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAAGACCCAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137210	139628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_137200_139600
804186	contig_6919_pilon	-	1221	5	Intergenic	novelGene_163986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	23.1449238495183	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	580	1101	67864	65000	FALSE	10	TTCTCTATCCCCTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREWETDETEELSSGQRQALVCFLENSHYGSLINADGHAEVWTDWNDMSKFFQYGWRCTTNENSYSNRTLMGNWNQERYDLKNIVQPKPLPSQFGHYFETTYDTSYNDKMPLSTHRFKQEPHWFPGHQPELDPPRYKYTEKSTYMDSYSKPQITRHLECVWDPNNGQFQSPGF	68539	64879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_65176_65425_65493_66017_66249_67816_68383_68478
804188	contig_5620_pilon	-	3061	1	Intergenic	novelGene_161343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAGATACTGATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234858	231797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_231800_234900
804189	contig_11855_pilon	+	1491	8	Intergenic	novelGene_67063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	63.9591706497519	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	776	1372	2013753	2016987	FALSE	65	AACAAGGAAATAAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2011138	2017106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011338_2012006_2012111_2012699_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
804190	contig_4429_pilon	-	1454	9	Intergenic	novelGene_50774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	15.9094115227434	227	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	94	1140	89277	33847	FALSE	15	TATTGTTTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGVHRPRVKIRQEQKTSPCVLELKKEGGDFRMRAWPGRRQLGEPPSWKGVESRQEEAARVKVPTMAAWRCSRSLLLLLLLLLLLLLLAAGVDARWSGEGTSPHLQTIFLGRCSEYSKLLSPEQRVKNCTAIWEAFSVVLDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPRDKSLFWENNHLLVTSYSENTRRITPLCDVLYGRVGDFLSWCRQKNASGLDYQSCPTSDDCENNPVDSFWKRASIQYSMDSSGVIFVMLNGSDPNGAYPVRGFFADYEIPYFQKDKITRFEIWVMHEIGGPNVESCGEGSVKILEERLKEMGFQYSCINDYLPVKLLQCVDHSTHPDCALNSAAASTQREIPSLYEELSASLIIPFLVTLASDAQI	89370	33532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_33953_66306_66367_70911_70999_73811_73905_74650_74728_76955_77039_83513_83650_86560_86688_88999
804191	contig_6375_pilon	+	1116	6	Intergenic	novelGene_72925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	270.759376568938	174	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	196	1071	20957	28155	FALSE	15	TGTTTCAGTGCATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMVR	16548	28200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_20907_20997_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959
804193	contig_6102_pilon	+	377	2	Intergenic	novelGene_31794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCCGAGTGTAACGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360808
804194	SIRV5	+	344	5	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	901	64	872	-64	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTGTAGAAAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1928	3534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
804197	contig_9683_pilon	+	677	5	Intergenic	novelGene_151298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	191.386225993408	3165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	21	581	932275	936708	FALSE	10	TTTGTGCCTCATTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVKKVKMAAARAGVLGVRWLQRAARNMVPLGTRTASHITKDMLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPDRSQQERDPWYDWDHSDLRLNWGEPLHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMCKHLFGFVAFMLFMFWVGEKYPSYQPVGPKQYPYNDLYLERGGDPSKEPEPVVHYEI	932254	936804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_932360_932589_932717_934040_934141_934565_934722_936615
804198	contig_16578_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_148614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAGATTATTCATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54005	55055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_54000_55100
804199	contig_14142_pilon	-	1200	11	Intergenic	novelGene_120605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	129.026353897179	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	179	1114	598441	584636	FALSE	25	TCTTTCCTTCATAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQVAGACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598619	584549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585568_590840_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
804200	contig_18108_pilon	-	754	5	Intergenic	novelGene_33498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	509.13505084604	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	205	435	269954	267016	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVLKTPSAAYLWVGAGASEAEKTGAQEVLRVLGSQPLQVAEGSEPDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSVQLSGISRRTQPIGIGGLPSPS	271383	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267084_267699_267728_269574_269653_269897_270023_271247
804204	contig_5253_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_61599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGACAAAAGTAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359001	358175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_358200_359000
804207	SIRV4	-	281	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1242	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3916	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
804210	contig_14029_pilon	+	1037	8	Intergenic	novelGene_151936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.564553020232	139	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCCCCCACACAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131672	135611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131876_133106_133298_133407_133472_133564_133600_133959_134021_134104_134162_134258_134319_135245
804212	contig_1034_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_175516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7951	7097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1034_pilon_-_7100_8000
804213	contig_10399_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_114477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128195	125621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_125600_128200
804216	contig_10300_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_152929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140571	139563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_-_139600_140600
804217	contig_11908_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_133233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAGAGAAAGAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715638	713861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_713900_715600
804218	contig_3382_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_124019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	684	1001	150325	150008	NA	25	GCTTGGGTAATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFHKADPATRQPAVVEWTQPTVGSLCQAKKPAGLSARRVCSSTGMQAGQGRTDKAGARSRGCAEQLSCAPDGHWDMIRVSRKASLGMPALTHHVCRTWAQVQ	151008	148806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_148800_151000
804219	contig_20293_pilon	+	1559	3	Intergenic	novelGene_153517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAAGGAAAGTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51090	116224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_52469_68597_68701_116146
804221	contig_10299_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_79735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCATCAAAGTCAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367720	368116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_367700_368100
804222	contig_10299_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_79736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAATTCCAATACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369076	369650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_369100_369600
804226	contig_17470_pilon	+	1194	8	Intergenic	novelGene_110473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	217.551119960156	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	239	886	88138	89971	FALSE	20	CCCTAAAGGCTTTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAFDYIEFTRSLFVN	84445	90279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_84496_84990_85009_87600_87674_88040_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88983_89845
804228	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	539	0	373	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
804229	contig_10341_pilon	+	798	6	Intergenic	novelGene_47214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	428.948761508878	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	141	554	63271	65122	FALSE	25	CCCAAACTTAGCTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGKAGKDSGKAKTKAVSRSQRAGLQFPVGRIHRHLKSRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGVIPHIHKSLIPVDCISVKNTILPFCNSI	63130	65366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_63760_64039_64154_64484_64615_64936_64964_65060
804231	contig_1406_pilon	-	1177	2	Intergenic	novelGene_25434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	367	junction_1	0	348	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCATTTCTTAATATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241706	239444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_240126_241210
804232	contig_3948_pilon	+	857	6	Intergenic	novelGene_53232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_4	24.0116638323961	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	62	553	933984	965383	FALSE	5	GTCTTCTCCTCCTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLYCTQDPVPEAVGGDMQQLNQLGAQQFSALTEVIFHFLAEPKEVERFLAQLSEFATTNQISLGPLRSTVKSLLLVPNGALKKSLTAEQVRADFITLGLSEDKATYFSEKWKQNSQTLAQWAIGQTLMINQLIDMEWKFGGNYLEPGLGHSGDVELGCRAF	933922	965687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_934068_940742_940797_940893_940997_964583_964641_964723_964762_965227
804233	SIRV6	+	321	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	12	1256	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGTTACGCTAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
804234	contig_4783_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_108363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGACACCACGAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135097	137395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_135100_137400
804236	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	171	14	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	823	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
804237	contig_7870_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_109038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCCAAATGAAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608753	610354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_608800_610400
804240	contig_6710_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_89381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653745	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
804241	contig_12050_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_62606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAATGACGAAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314865	313879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_313900_314900
804242	contig_5780_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_29806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGTCCAAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126954	126455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_126500_127000
804243	SIRV6	+	346	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	171	363	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
804245	SIRV6	+	266	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	8117	164	622	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106
804247	contig_5236_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_100973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	648	1088	1040715	1040275	NA	15	CATAGGGTTTTCAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQALCPVRQEAKHLVVSLVSAPPPTASTLWLPVAFPGESLTSSWPSWGSPWLLDGLPGGVPDFLMAFLESLTSSWPSWGSPPLPHSLLGAHRDSSLIGSLVPGSHTTCCRFWLLLVLSNLLLQPEALDGLCHSTPSFVPTFWVSP	1041362	1039906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1039900_1041400
804250	SIRV7	+	379	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56091_70873_70987_78840_78962_114683
804254	contig_5935_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_102751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTACCACTGAGTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318088	1316722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1316700_1318100
804258	contig_10037_pilon	+	1268	7	Intergenic	novelGene_148942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	195.821985486819	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	148	906	115453	425697	FALSE	25	CGCACTTAACCATTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTASTRRVTFEADENENITVVKGIRLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERSAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFKRYDFHPVCADLQAQILQCYRQHTHQTLSCSALAAQYMHCVNQAKQVGVQTTLTRHQENRKPDFTGSGGIKWANECEKAS	115305	426059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_378523_378595_425456
804259	contig_2219_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_67188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTAAGGAAGTCAGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152853	152121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_152100_152900
804262	contig_11493_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_143684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCATCACCATCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185862	186564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_185900_186600
804263	contig_3787_pilon	-	2029	3	Intergenic	novelGene_102393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACTTAAACATACACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492636	450882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_451166_484447_485344_491786
804264	contig_7293_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_54273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTAAGTGAATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570452	570809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_570500_570800
804265	contig_16757_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_175582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATAAGATGTCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128166	126885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16757_pilon_-_126900_128200
804266	SIRV6	+	438	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	76	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1856
804268	SIRV2	-	281	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	648	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963
804270	contig_10923_pilon	+	759	5	Intergenic	novelGene_66213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	932.622746613013	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	10	759	21667	30290	FALSE	20	CTCTTCACCTTGGCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQIHFEATKAGGDSPSSVKGHCPFMLSELQDGKSKFVQKAAPEIQEDVKAFKKAFGRITIPGNRHKYGSLPVSWPGNHIFGYDQFFRNKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADSYPFAQHFSEASVSSKDVSVWCSNDYLGMSRHPRVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDST	21657	30290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_21848_22992_23116_26049_26116_29348_29572_30133
804271	SIRV6	+	478	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	-42	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAAAGTGCCAACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
804279	SIRV6	+	400	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	269	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1572	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
804281	contig_15893_pilon	+	1622	10	Intergenic	novelGene_128502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	459	junction_9	643.495834399018	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	250	1476	30444	58419	FALSE	10	CCTTGTCTTTAGGGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKSSVLIEDGLVQDEFSESVKMSTYLVAFIVGEMKNLSQDINGTLVSVYAVPEKIDQVHHALETTVKLLEFYQNYFEIQYPLKKLDLVAIPDFEAGAMENWGLLTFREETLLYDNNTSSVADRKLVTKIIAHELAHQWFGNLVTMEWWNDLWLNEGFATFMEYFSLEKIFEELSSYEDFLDARFKTMKKDSLNSSHPISSSSVQSSAQIEEMFDSVSYFKGASLLLMLKTYLSEDVFQHAVVLYLHNHSYASIRSDDLWDSFNEVTNKTSDVKKMMKTWALQKGFPLVTVQRKGKELVVQQERFFLNTKPELQPSDASYLWHIPLSYITDGKKNRSLLLLDKKSGVINLTEEVQWVKVNINMNGYYVVHYADEDWEALIKQLKTDPYVLSDKDRANLINNIFELAG	30194	58565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_30453_31947_32080_41642_41764_42443_42599_43553_43668_45063_45199_48944_49077_51469_51631_51863_51944_58231
804287	contig_3846_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_137147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATGGCACCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185991	185714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_185700_186000
804288	contig_16951_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_98626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACCCCACAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60932	59443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_59400_60900
804290	contig_14882_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_115036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGATGGCTAAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341794	340822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_340800_341800
804291	contig_7904_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_160018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364088	366157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_364100_366200
804294	contig_1516_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_50014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAGAAAAGTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354319	353219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_353200_354300
804296	contig_18184_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_123878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCGCAAGTAGAAGCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516389	515819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_515800_516400
804298	contig_10902_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_65672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGACTCACCTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110795	112083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_110800_112100
804299	SIRV5	+	265	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	252	151	138	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8453	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
804301	contig_614_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_132664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAATAATAAGACTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156254	1154276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1154300_1156300
804302	contig_10235_pilon	-	704	6	Intergenic	novelGene_46363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	43	junction_3	100.398007948365	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	23	355	132090	131467	TRUE	40	AAATAAAAGTCGGATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQALPEEPMEVQGAERTSPEPQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	132112	130297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131535_131619_131765_131864_131925_132030
804304	contig_12250_pilon	+	1893	17	Intergenic	novelGene_80548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_6	62.3768474175315	2	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	116	1819	272853	278399	FALSE	10	CCTGCTGCCTCTGCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGRLKVKTSEEQAEAKRLEREQKLKLYLSATQAIFQKRQAGELDESVLELTSQILGANPDFATLWNCRREVLQQLETQKSPEELAALVKAELGFLESCLQVNPKSYGTWHHRCWLLSRLPEPNWARELELCARFLEVDERNFHCWDYRRFVAAQAAVPHTEELAFTDSLITRNFSNYSSWHYRSCLLPQLHLEPDSGPEGRLPEDVLLRELALVQNAFFTDPNDQSAWFYHRWLLGRADPQDALHCLHVSRDEACLSVSFSRPLLVGSGMETLLLMVDGSPLAVEWRTPDGRNRPNRVWLCDLPAASLNDQLPQHTFCVIWMAGDAQKECVLLKGRQEGWCRDLAMDEQLFRCELSVEKSTVLQSELESCKELQELEPENKWCLLTIILLMRALDPLLYEKEMLQYFQTLKAVDPMRAAYLDDLRSKFLLENSVLKMEYAEVRVLHLAHKDLTVLCHLEQLLLVTHLDLSHNRLRALPPALAALRCLEVLQANDNAIESLDGVTNLPRLQELLVCGNRLQQPTALQSLASCPRLVLLNLQGNPLCQAVGISEQLAKLLPSVSSILT	272430	278473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_272493_272799_272856_273020_273132_273484_273610_273800_273989_274221_274426_274764_274849_274934_275018_275106_275209_275337_275444_275537_275590_275732_275822_275973_276063_276154_276272_277117_277232_277503_277592_278250
804305	contig_10990_pilon	+	1710	8	Intergenic	novelGene_7413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	72.4858888448825	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	1012	1710	604903	609886	FALSE	55	GAAAAGGAGAAAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLSSWRSLPSSPWSCPSTAPPGGENEQCGQGASTAEDEGEAEAGWIEGAAILFSVLIVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFSIIRNGQIIQLPVAEIVVGDIAQIKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGINSQTGIIFTLLGASEGDGEEKKKKGKKQGVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGTDSE	541873	609886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_542104_590666_591334_604788_604988_605603_605862_606343_606470_606931_607058_608237_608274_609818
804307	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	558	486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
804309	contig_6954_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_64468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACAAGAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899878	900118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_899900_900100
804310	SIRV5	+	413	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
804311	contig_10811_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_165812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCCAACCTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444769	442602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_442600_444800
804313	contig_4315_pilon	+	1237	4	Intergenic	novelGene_46717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	26.0298973404728	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTTTGTGTAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62903	76641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_63167_67262_67480_74926_75101_76058
804315	contig_13823_pilon	+	1174	6	Intergenic	novelGene_145232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_5	24.8483399847958	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	69	776	26575	39418	FALSE	75	CAAACATTAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHSLWSNTVRCYLIYTEETQPEMELFLKDYSPKLKRMCETMGYFFQAVYFPIDIENQYLTVRKWEIEKSSLVILFIHLTLPSFLSEDCEEAFLKNPEGKPRLIYHRLEDEEVSSDSVQQLIDQISNLNKTNKAKIIDHSGDPAEGVYKTYIYVEKIIKQDILGFENTDLESRGLSSENSIPEEDDFGDVLWDIHDEQEQMETFQQASHSAHELGFEKYYQRLNDLVTAPAPIPPLLVSGGPGSGKSLLLSKWYDAVQ	26506	39816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_26593_28294_28456_32811_32969_35508_35584_37198_37373_39295
804316	contig_366_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_51571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGGAAAGAAAGGAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751852	751066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_751100_751900
804317	contig_10982_pilon	-	2147	2	Intergenic	novelGene_87861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90463	84121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_85360_89554
804318	contig_934_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_129026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163942	162189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_162200_163900
804320	contig_15327_pilon	+	1347	5	Intergenic	novelGene_70833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	26.9478663348325	90	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGCTAGTGTAGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639620	1645262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1640265_1640871_1640969_1641609_1641709_1643312_1643431_1644873
804321	contig_14516_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_153895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCAGCAGCAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51344	53164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_51300_53200
804323	contig_15123_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_110916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGATTTGTGTGGTGCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220088	221247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_220100_221200
804324	contig_15123_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_110917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCTCTACTGTCTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221445	222238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_221400_222200
804327	SIRV2	+	404	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	1	118	1	-118	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTGCAACTTGGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109	1513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
804329	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	3	340	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
804331	contig_9833_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_68481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTTCCCCACAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163048	162746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_162700_163000
804332	scaffold_19766_pilon	-	1227	8	Intergenic	novelGene_34323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	533.336245740347	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	159	995	622205	596633	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVSPSKTPRRNMRILGIKDRIQTPSWTTRMMVSSMPPLSSPVQPPQEHLPANLPMGSPRQRPYTLS	623659	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597243_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153_622285_623580
804335	contig_6710_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_95993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653685	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
804337	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
804338	SIRV6	+	379	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	5	500	-1	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
804339	contig_13457_pilon	+	932	5	Intergenic	novelGene_118329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	102.38255466631	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	162	521	55746	57600	FALSE	20	TTCCCGATGGCCTCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYEMVQAR	55584	58011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56553_57583
804342	contig_9679_pilon	+	1269	2	Intergenic	novelGene_173413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTGCTGAGGACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58334	84942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_59548_84886
804347	contig_9185_pilon	+	306	2	Intergenic	novelGene_166872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	3	305	19940	20321	FALSE	35	TACCACCACCAGTAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQQQYQQHQHHQQHQQTINSNNINIINIDNTINNSNNINVINIIITINTITAINTITAINTITAINTITVINTITTINTIIPSPPSTPSPPSSSLTTSTSS	19937	20322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_20182_20260
804349	contig_6764_pilon	-	2330	2	Intergenic	novelGene_173738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTGAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105324	44188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6764_pilon_-_46369_105174
804350	contig_8611_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_166560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCATGCAACAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56801	55824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_-_55800_56800
804352	contig_7410_pilon	-	1448	9	Intergenic	novelGene_106063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAATGGAAGCAGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338979	312679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_312763_314520_314799_323389_323484_323571_323650_326729_326872_328017_328093_332552_332688_336174_336376_338617
804353	contig_13161_pilon	+	1252	11	Intergenic	novelGene_173924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	25.8812673569128	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	97	1251	17259	35425	FALSE	25	GTAAGTGTTCATTAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWQPRWFLLCGGILSYYDSPEDAWKGCKGSIQMAVCEIQVHSVDNTRMDLIIPGEQYFYLKARSVAERQRWLVALGSAKACLTDSRTQKEKEFAENTENLKTKMSELRLYCDLLVQQVDKTKEVTTGMSNSEEGIDVGTLLKSTCSTFLKTLEECMQIANATFTSELLCRTPPGSPQLAMLKPSKMKHPIVPIHNSLERQMEMNSCENGSLNMEINDDEEILMKNKSPLSLKSAERDCSISSEENINNITVQGEVMKEDGEENLGNHDSLAQPESNSANSSESHWEEGNEVIPTFFSTMNTSFSDIELLEDSGIPTEAFLASCYAVVPVLDKLGPTVFAPVKMDLVGNIKKVNQKYITNKEEFTTLQKIVLHEVEADVAQIRNSATEALLWLKRGLKFLKGFLTEVKNGEKDIQTAL	17162	35426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13161_pilon_+_17281_18276_18433_20003_20126_22123_22283_23474_23516_25235_25391_26772_26927_27321_27408_33703_33763_34599_34731_35355
804359	contig_15114_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_121193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745978	747271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_746000_747300
804364	contig_16722_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_118307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182787	180726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_180700_182800
804365	contig_10235_pilon	-	774	6	Intergenic	novelGene_46351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	100.734502530166	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	135	548	132171	131467	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPSSAGDGSAHDQGYTDLTISDGAFKDCLGFYDAGLFAFPQRRMSRGVNPSLVSWLTTMMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQALPEEPMEVQGAERTSPEPQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	138287	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_131425_131535_131619_131765_131864_131925_132030_132231_138212
804366	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
804368	contig_6726_pilon	+	1400	12	Intergenic	novelGene_86233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	772.292904653741	1	70	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	610	1260	309177	333034	FALSE	20	TTATCTTATTGTGAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSLVSVCFLQPPQRPYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287835	333174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_301418_301541_308106_308233_309138_309227_321665_321793_322621_322709_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
804369	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
804376	contig_8616_pilon	+	1082	9	Intergenic	novelGene_72382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_8	49.6737795521943	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTGTACCTTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196914_197236_197268_197609_197657_197845_197881_198085_198124_198540_198588_198825_198858_198952
804378	contig_7887_pilon	+	687	5	Intergenic	novelGene_124900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	56.7819293437622	2376	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	132	494	375247	378325	FALSE	15	GTTGTGTGAGCTGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGTGTSLALSSLLSLLLFAGMQMYSRQLASTEWLTIQGGLLGSGLFVFSLTAFNNLENLVFGKGFQAKIFPEILLCLLLALFASGLIHRVCVTTCFLNLNLDSFPHAGICPRGCQLAA	375115	378518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_375251_375570_375726_375862_375927_378067_378135_378252
804380	contig_5649_pilon	-	527	3	Intergenic	novelGene_82319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	140	439	207546	207006	FALSE	45	GCCAATAAAAATGTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWRPRLSAGGPEEERRRLLQGTGVPEAVEKDLANIRREYYTIVLPFMEAHPELFSPRVRSLELYQQLVALVMAYSFQEPLEEDDDEKEPNSPLMVPAADILNHLANHNANLEYSPVSRSCPVLVFLCAVMIGLVIQTNVTFMLAW	208602	206917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_207220_207460_207656_208572
804381	contig_14225_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_52752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGGCAGCTGTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332698	332246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_332200_332700
804382	contig_12841_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_55882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTATTAAACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731383	733569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_731400_733600
804383	contig_16907_pilon	+	1082	7	Intergenic	novelGene_87479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	71.1510521511961	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	262	300	525169	535486	TRUE	35	TGAGTTAACTCTCAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAWRTRFARFNPSTESGSPERVVRTAPAYNLRGCKAGGERRAEKTGAGIRTGISATRAGCCSGPTLIRTQSGSRDRPAAESSPHPEMSARPLRAARVL	524907	540717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525201_535479_535559_536232_536302_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
804384	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
804385	contig_7171_pilon	-	728	7	Intergenic	novelGene_101181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_6	296.955898334341	290	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	79	477	47684	37659	FALSE	5	CCTGTGTCTCTGGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50438	37407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_50365
804386	contig_6056_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_157886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTTTGGAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310597	312359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_310600_312400
804387	contig_4686_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_118493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTATCTTTGCAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357601	356899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_356900_357600
804388	contig_7049_pilon	-	878	5	Intergenic	novelGene_171446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	94.8762351698253	1213	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	72	518	161445	157378	FALSE	15	TTCCTGCTGTGGTAGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGSGAAAAEPLDGAADRARPAMAESDWDTVTVLRKKGPTAAQAKSKQAILAAQRRGEDVETSKKWAAGQNKQHSITKNTAKLDRETEELHHDRVTLEVGKVIQQGRQSKGLTQKDLATKINEKPQVIADYESGRAIPNNQVLGKIERAIGLKLRGKDIGKPIEKGPRAK	161516	157017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_157440_158441_158536_158849_159011_159432_159485_161367
804389	contig_6137_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_59321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTGAATGTAAACAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690247	1689649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1689600_1690200
804390	contig_18850_pilon	+	821	4	Intergenic	novelGene_142453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	25.694789787469	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	181	684	253252	254888	FALSE	10	CGAGGCCAGGTGTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLTLVVLGTPTCWAGTMYGYGGGKYFSASAGSEDEITGIRFCVGPAGLFKSVQLRVGSSWSERHGAPGGNCQEFILWPDEHIVSVYGTYGLFLRSLVLYTDQGRVATFGSDSGQSFFAYPEEDGQVLTGVSGQHKLLGISGLIFKWNFPPGEATAASRSTTTIT	252505	255025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_252660_253225_253307_253488_253595_254545
804391	contig_20356_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_159551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACTTATCTTAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166465	164716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_164700_166500
804392	contig_13074_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_153435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1	390	443993	444382	NA	30	ATCTCACCCAACATCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNNSYHLLCACYIQSSPLQVLYRASSFKPYINPVKQVDKVDSTPVSIRKGALVAQWLKCLTANQKVDSWNPSAALQERCGSVLPERCTALGTLWGNSTLSYRVTNSRNRHSGDRFGFRGSVENRRLIS	443992	444991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_444000_445000
804393	contig_9771_pilon	+	1846	2	Intergenic	novelGene_156923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340654	347214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_342187_346900
804395	contig_8354_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_24170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCATCCCCCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601744	601247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_601200_601700
804396	contig_13868_pilon	-	1500	4	Intergenic	novelGene_172655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_3	52.6898683071254	81	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	109	669	98723	80312	FALSE	80	ACCTAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARGPWLWDARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKVV	98831	79480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_80471_82044_82275_84692_84855_98713
804397	contig_5815_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_141195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCTGAACAAACAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231709	232398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_231700_232400
804398	contig_13004_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_112639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCTGTTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268198	269153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_268200_269200
804399	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
804403	SIRV4	-	713	5	NNC	SIRV4A	novel	570	5	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGATATTTAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15117	8323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8748_8846_8991_13672_13833_14875
804404	contig_17194_pilon	+	501	2	Intergenic	novelGene_155355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATATATGTTAATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75833	191198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_190807
804406	contig_13982_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_163494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATTTATTAGTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456847	454737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_454700_456800
804407	contig_18116_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_175447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	38	481	63876	63433	NA	10	CTAGCAGCCCTTCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVLPKRRRAQVGSPAGATASSAEPSARFPGVAIYLAEPRMGRSRRAFLTRLALSKGFRVLDEYRYARSERYTRRPAGRREVVSDSRAGALLQRVAAAGTRMVLGEGTSVPHQQIVASSRCRDGDAERFCTDRSTSACGTLALEFG	63913	63010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_-_63000_63900
804409	contig_405_pilon	+	2313	1	Intergenic	novelGene_135336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639565	641878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_639600_641900
804411	contig_1107_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_126583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCATCATTGACCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752514	753769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_752500_753800
804412	contig_1107_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_126584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGAGGTAAGTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763156	763602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_763200_763600
804414	contig_15049_pilon	+	1013	3	Intergenic	novelGene_160720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	46.5	482	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	533	853	224060	226557	FALSE	15	TGTCTTGAGGCCTGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVIEHQLDELLEGLERMPPSKIEQAAKAKEKERCMRLREEKVMIQKQLQEERLQRAQARAQAEIKKKKGRKLVCRSQPPILKTKMAPSHALMDKDKEEQLFFFT	223527	226717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_224173_225307_225402_226443
804421	contig_6958_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_69957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTCTGTGCTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188790	190052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_188800_190100
804423	contig_2636_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_52044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34914	33086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_33100_34900
804424	contig_1009_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_121783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGTAGGCTGGATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321459	323138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_321500_323100
804425	contig_14142_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_120567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGTCGGTTGCTGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453158	451656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_451700_453200
804426	contig_2251_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_128469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATGTATTTTTAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66318	65221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_66159_66235
804427	contig_6710_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_89540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
804429	contig_14563_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_135051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAATTCCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128479	129555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_128500_129600
804431	contig_10331_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_54051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAATCATACGTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27430	25196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_25200_27400
804433	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	154	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
804435	contig_960_pilon	-	2127	2	Intergenic	novelGene_108209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGATGCATATTCGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262790	258984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_259998_261676
804436	contig_12050_pilon	+	2770	8	Intergenic	novelGene_62591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	10.4939243841183	15	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	189	1004	120317	128662	FALSE	35	ACCTTGAAAACATCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAGLLQSFERRFLAARALRSFPWQSLEEKLRDSSDSQLLLDVLQKTVKHPLCVKHPPSAKFMRCFLSELIKKHEAVHAEPLDELYEALAEVLTTEESTQCHRSYLLPSGEAVTLSESTALVSHGTTGLVTWDAALYLTEWAVENPATFTDRTVLELGSGAGLTGLAICKLCRPKAYVFSDCHSQVLEQLQGNVLLNGLSVEPGVTPPRQHPGCDTPDSEKPTVTVAQLDWDLVTAPQLSAFQPDIVIAADVLYCPETILSLVAVLQTLSACRKDRSALDAYIAFTIRNLETCQLFTAELGRAGIRWEAVPRHDQKLFPYEVLSEMGMLKLTL	113567	130428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_113645_116303_116367_120268_120350_121849_121952_124909_125044_125129_125426_126886_127037_128561
804437	contig_12644_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_44461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTCTCTCTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976594	975245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_975200_976600
804438	contig_14133_pilon	+	2440	6	Intergenic	novelGene_119922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.064210946896	1	142	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	97	675	136738	146688	FALSE	10	AGAGCTTTTGTGTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPQFTAKQLEKLAKKAEKDSKAEQAKVKKALQQKNVECARVYAENAIRKKNEGVNCLRMASRVDAVASKVQTAMTMKGVTKNMAQVTKALDKALSAMDLQKVSAVMDKFEQQVQNLDVHTSVMEDSMSSATTLTTPQEQVDSLIMQIAEENGLEVLDQLSQLPEGAAAVGESSVRSQEDQLSRRLAALRN	136641	148453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136745_142274_142361_142941_143089_145605_145735_146042_146231_146666
804439	contig_13780_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_149106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTAGGAGTTGAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817207	817533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_817200_817500
804440	contig_10958_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_5340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTGCATGATACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577398	575862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_575900_577400
804442	contig_9363_pilon	-	1103	8	Intergenic	novelGene_6754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	510.57782392669	167	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	158	841	1548961	1505583	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKHIVGA	1549118	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505601_1543572_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
804444	contig_19957_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_57730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272588	271340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_271300_272600
804445	contig_5918_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_99534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACAAACCAGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703952	702362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_702400_704000
804447	contig_14682_pilon	+	925	5	Intergenic	novelGene_139093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_4	62.4554841467104	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	37	771	50956	72608	FALSE	15	GTCGTGGTTTGTTATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHLISELRKEYGMTYNDFFMVLTDVDLRVKQYYEVPIAMKSVFDLIDTFQSRIKDMEKQKKEGIACKEDKKQSLENFLSRFRWRRRLLVISAPNDEDWAYSQQLSALSGQACNFGLRHITILKLLGIGEEVGGVLELFPINGSSVVDREDVPAHLVKDIRNYFQVSPEYFSMLLVGKDGNVKSWYPSPMWSMVIVYDLIDSMQLRRQEMAIQQSLGMRCPEDEYAGYGYHSYHQGYQDGYQDDYRHHESYHHGYPY	50919	72762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_51010_52982_53132_57772_57877_71146_71228_72261
804451	contig_12951_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_68253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	520	852	850263	850595	NA	65	ACCAAAAAAAAAAGCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNHPGYKYQQLILNCFKNMVWVRPDTSSGGYWDFCLPVPDLWLNCRAGSQPIPSTSRPHPTQTAPKAQMEQTLPWVPHAHPTGGAQRETLEQLGAGISIPDGKKHVCTT	849743	851093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_849700_851100
804452	contig_14711_pilon	-	1979	13	Intergenic	novelGene_68934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	385	825	135293	132423	TRUE	15	GCCTGCCAGGTAGGCGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVANHHGALLHHAFLKHWGHLSQLFTVIRALLFPPQAGGHEPETHVDKLRLHDQLKSFPLLYFLHQVPVSWRRRAEHCRPAVRSLWGFQATELALPGDACVSVTAGHSHPRRPPRAATARDAGTHQQLPLGGQRPPARWFQRWH	135677	100659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_100781_118993_119131_119767_119897_119981_120075_120453_120554_120991_121108_121812_122250_132401_132519_132594_132649_132950_133032_133923_133976_134104_134195_135225
804453	contig_10506_pilon	+	1024	2	Intergenic	novelGene_125177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	859	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	149	1024	58361	59236	FALSE	35	GAGGTGAGTAGAATTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDRNLLRIRDKERRNQEAHQEEAFPEKIPLFGEPYKTEKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLNTKPHPHRFDVSENRLGKPRYPLFPEKGSSIPPHSFHTSVHHQPVNTPASGPLPVGNISHNPKMAQPRMEPSLRAKSYGPPDSQHLTQDRFGQERYGSSHHKKGDHRADGDHCTSMTDSAPERELSPLLSSLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSNKVHSSNNNNKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDTLVALTSLGVAPPQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSV	57814	59236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_+_57924_58321
804457	SIRV7	-	283	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	11	91632	11	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147946	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
804458	contig_6434_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_61847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGCTGAAGCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789020	791127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_789000_791100
804462	contig_15691_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_60785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156860	158869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_156900_158900
804463	contig_14822_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_145432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTTTTCCCCAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212280	212927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_212300_212900
804464	SIRV6	+	166	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	556	61	556	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10793	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804466	scaffold_9100_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_83318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847753	845537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_845500_847800
804468	contig_8520_pilon	-	878	4	Intergenic	novelGene_85443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	38.3086877294897	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	54	572	387839	215717	FALSE	20	TTTGATATTTATGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLVSGHLDSWDVGQGAMDDGGGAFISWEALSLIKDLGLRPKRTLRLVLWTAEEQGGIGAFQYYQLHKANISNYSLVMESDLGTFLPSGLQFTGSDKARAIMEEVMRLLQPINITQVFRNAEGTDINYWIQAGVPGASLLDDLFKYFSFHHSHGDTMTVMDPKEMNIAAALWAVVSYVVADMEEMLPRS	387892	215410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_292468_292671_321751_321844_387778
804469	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
804470	contig_3081_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_133977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTATTTGTTTTAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1206788	1207545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1206800_1207500
804472	contig_10711_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_118449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTTCTCCTATTTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834535	833417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_833400_834500
804474	contig_2332_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_58652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAAACAGAAACTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265453	264717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_264700_265500
804479	contig_9609_pilon	-	1652	2	Intergenic	novelGene_23154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_1	0	375	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	181	660	786296	785817	FALSE	50	TTATAACAAAAAATCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFLEEVAEETPAQPESEQLKVLDPEEDLLCIAKTFSYLRESGWYWGSITASEARQHLQKMPEGTFLVRDSTHPSYLFTLSVKTTRGPTNVRIEYADSSFRLDSNCLSRPRILAFPDVVSLVQHYVASCAADTRSSSPDPAPAPALPTPKEDGTSNPVLPAPAATAVHLKLVQPFVRRSSARSLQHLCRLVINRLVADVDCLPLPRRLADYLRQYPFQL	786683	784824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_786350_786556
804482	contig_5711_pilon	+	1592	2	Intergenic	novelGene_80293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2166	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	1184	1591	226406	227897	FALSE	55	TGGAAAAAAAAACTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNGTDKTPALISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYETVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESSKLNNQARFILEKIQGKITIGKVQTLKIGMLVK	225222	227898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_226580_227663
804484	SIRV6	+	300	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-239	-35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2784	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11031_11109_11205
804485	contig_10765_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_122956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCACAGAGGCCTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352396	353240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_352400_353200
804487	contig_10968_pilon	+	1087	2	Intergenic	novelGene_84301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAATTATGACTCCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175718	178387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_176248_177829
804488	contig_6286_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_165667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428686	430351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_428700_430400
804489	contig_4891_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_124601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949445	951617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_949400_951600
804492	contig_14142_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_120483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGTTTACCTAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265214	265730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_265200_265700
804493	contig_11363_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_160494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATATATATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174693	173416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_173400_174700
804496	contig_6189_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_164929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTTCCCCAGCAGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19488	18419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_18400_19500
804497	contig_8697_pilon	-	476	4	Intergenic	novelGene_83210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3038.38454884609	50	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTATTAAAAATACATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19209	16471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18297_18393_18573_19181
804498	contig_6048_pilon	+	1144	6	Intergenic	novelGene_73088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	213.753502895274	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	56	532	130291	135654	TRUE	45	AAGGAAAAACATTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGAYGGRRGTRRAGGCRMMRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	130235	136357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_132370_132550_133132_133242_134181_134320_135606_136047_136137
804501	SIRV6	+	192	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	510	-1	-340	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGGTAGTCGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
804502	contig_1339_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_163120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATGGTGTACTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341498	341011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_341000_341500
804508	contig_12142_pilon	+	2409	6	Intergenic	novelGene_147832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	8.20731381147328	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	35	694	183476	188995	TRUE	25	TTTTAAAGAGCCTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPAIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI	183441	197002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_183556_185222_185338_186203_186343_186428_186560_188800_189745_196036
804513	contig_8106_pilon	-	866	3	Intergenic	novelGene_139746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	72	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	113	544	134968	128810	FALSE	20	CAGCAGTTACAGGTGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCSQVKPPPQGTFQVLRGNGTSVGTVLLFHCPSGHQMGGSGLVTCAWKGSVAEWSSGTPTCKSVPPHETFGFRVAVIASIVSCAIILLMSVAFLTCCLMKCVKRTEKRHSDRDHGKGTTELASMGPSVNKHPWTPLPDALSPSVSRVMVHIESPAQTLPASGPTPEMPGMPGQVSANLG	135080	128487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_129015_132743_132892_134889
804514	SIRV6	+	335	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	537	-1	-46	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGTCGAAGTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
804516	contig_18081_pilon	-	1283	6	Intergenic	novelGene_23849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	376	junction_5	195.798467818316	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	23	1063	485227	435421	FALSE	80	AAAAACTAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRSGLAMAAAPLKVCIVGSGNWGSAVAKIIGNNVKKLQKFASTVKMWVFEETVNGRKLTDIINNDHENVKYLPGHKLPDNVIAVSNLNEAVQDADLLVFVIPHQFIRRICDEITGRVSEKALGITLIKGIDEGPDGLKLVSDIIREKMSIDISVLMGANIASEVAAEKFCESTIGSKVMENGLLFKELLQTPNFRITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQGSPHLPSPPPLPSHSGLPDCPRQWPLGHPAHSELKPLSKSTFQTKIRQAYETNHNTREERAS	485249	435200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_435844_448204_448318_454649_454789_456513_456655_465890_466069_485180
804517	contig_7356_pilon	-	861	4	Intergenic	novelGene_60374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	745.665251078972	8	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	73	549	457848	407115	FALSE	35	GAAGTGTGTAATATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDVPAVALDEEPARGSDSYPGPPPELASVPPAVVHPDPARTLELFGVTSLPSVASSPAPDEGPAGEVDFHLLGPLQPATR	457920	406802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_407351_435516_435623_437474_437529_457767
804518	contig_3018_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_78778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382633	381265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_381300_382600
804519	contig_10962_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_103899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGCCAACCCCAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324080	323831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_323800_324100
804520	contig_17753_pilon	+	1328	3	Intergenic	novelGene_105053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTAATACAGTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45473	81741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_74923_75173_80872
804521	contig_12019_pilon	+	840	7	Intergenic	novelGene_87690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	96.6116222592062	1976	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	51	557	66581	80104	FALSE	35	ATGAAACATTCTAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFRAARNGAGNGWWSSMPKFYCDYCDTYLTHDSPSVRKTHCSGRKHKENVKDYYQKWMEEQAQSLIDKTNVRNFLALKAAAFQQGKIPPTPFSAPPPAGAMIPPPPSLPGPPRPGMMPAPHMGGPPMMPMMGPPPPGMMPVGPAPGMRPPMGGHMPMMPGPPMMRPPARPMMVPTRPGMTRPDR	66530	80387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_66589_66928_66972_72165_72275_73427_73455_74438_74529_76915_77021_79979
804523	contig_4059_pilon	-	1366	2	Intergenic	novelGene_140605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAATTTACAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436369	430084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_431388_436306
804524	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
804525	contig_7058_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_136018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114113	116245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_114100_116200
804528	contig_9235_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_156240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAACCATTGTGTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195466	194495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_194500_195500
804531	contig_17880_pilon	-	1230	8	Intergenic	novelGene_167325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.0881781221968	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	13	987	46189	28098	FALSE	50	AAAGGAAGAACATAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEDVNALLVQACRLVPLSQNHLVSKVSQLIHHLLNRLQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKYLPDSVGKTGLLMKLSDPAQSDPEVRRAAVHCMANLCLSVPGQPYLDEPYQSICFQTFLTTLQSPKLSDMDDITFCMLLQNALKGIQSLLNSGKMKLTLAEELGALLAVLKKAMFHGLPGLNIEIPTVLYPTLLPQYDGRPPAKPQQSESCASRPTVPSKTLRQMTFA	46201	27854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_28134_35770_35909_37047_37150_39669_39785_40628_40745_41000_41142_43188_43297_45970
804533	contig_10962_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_103915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATGCACCGATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393711	393022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_393000_393700
804534	contig_13740_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_34774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGCCCGTGTTTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768878	771186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_768900_771200
804535	contig_2799_pilon	+	1594	4	Intergenic	novelGene_85571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1492	junction_1	183.292722774861	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	629	1387	758469	762419	FALSE	40	AGGGGAAAGGGGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKGKAYFV	757840	762626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_758715_761269_761396_761508_761627_762150
804536	contig_7870_pilon	-	2323	1	Intergenic	novelGene_109007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504652	502329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_502300_504700
804537	contig_17989_pilon	+	1637	13	Intergenic	novelGene_150803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	9.28708781050335	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	29	1408	157130	199705	TRUE	15	GGAAGTGGGTTCATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADQRGKAETLALRRRLIGSSCRLFFPEDPVKIVRGQGQYMYDEQGAEYLDCINNVAHVGHCHPLVVQAAHEQNQVLNTNSRYLHDNIVNYARRLAETLPEQLCVFYFLNSGSEANDLALRLARQYTGHQDVVVLDHAYHGHLSSLIDISPYKFRNLDGQKEWVHVAPLPDTYRGPYREDHPNPAEAYASDVKHVIDSARERGRKIAAFFMESLPSVGGQIIPPEGYFPRVAEHVHRAGGVFVADEIQVGFGRVGKHFWAFQLQGEDFVPDIVTMGKPIGNGHPLACVATTQAVARAFEATGVEYFNTFGGSPVSCAVGLAVLEVLEKEQLQAHATHVGSFLMERLRQQKAKHPIIGDVRGVGLFIGVDLIRDEATRKPATEEADYLVSRLKKNYILLSTDGPGRNVLKFKPPMCFSLDDARHVVATLDAVLTDMEEVLRTCATLRLQPCPALQVSCP	157101	200361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_157189_158322_158442_159800_159961_162569_162645_165218_165307_165382_165500_167732_167816_168066_168293_196277_196433_196886_196977_198654_198786_199628_199707_200133
804538	contig_9848_pilon	-	1827	1	Intergenic	novelGene_79974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	497	997	112179	111679	NA	20	TGAGGGTGAGAGTGGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFVAGPHDRRSPRVSPFSQSPEGQWCWDSAAETRSALSGSPPSPHPVPKVGGPYQAYPAPGLRQDHGVTWTFLPPHGASTSSCGWEILLFPLTHLTLGGGGDRCSCQPLTVAQHSEVMQRHCHSHGASTVSQAEIPEVETRLRPHGWQATQPRPSPGLRGLSGV	112675	110848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_110800_112700
804544	contig_8284_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_125671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	959	1360	247217	247618	NA	60	AAATAGACATATATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGSHLWAQGTLLNFLICLLESLLPPPCWQATTCVHPQGQRKEQRRLDSRSRPHRDRKKNRGDWTPDLGPTGTDKRAEETGLQIGTSKEELVTEPRRRRGKLCDSAKSLQGSSGVLKETVTNGTRRGCRLKN	246258	247780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_246300_247800
804549	contig_8978_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_49458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAATTAAAGAAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680800	1683147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1680800_1683100
804550	SIRV5	-	265	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACTAACGTGTACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10973	8361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
804553	SIRV6	+	194	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-9	410	-2	-240	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAAGACGCTTCCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
804555	contig_1301_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_47364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAATAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558553	557426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_557400_558600
804556	contig_366_pilon	+	2102	1	Intergenic	novelGene_51548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTAAAAGTACCTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37242	39344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_37200_39300
804557	contig_18272_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_7019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	142	300	187247	187089	NA	35	AAAGGGTTGGAAGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLEPQLCLACSLLRHLCCEPRFCHLLVPLDLTILPSLASCLPSLEIMMVGTLPPSPDHSCAQSCLPGLCASRISSSSTLTYRRGGRRNSFTGNFKIHI	187388	186128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_186100_187400
804559	contig_6914_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_151758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	590	901	298970	298659	NA	25	CCCACCTGAGGAGATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYTVSSQPNERESPWECGPHLNISRRSDFLLSLDPVAVSCHLISCSWDLSCQLICRSRDSSICTACKREPCSPTCQSWACQLLRLCDLGEASTLIHGLGVF	299559	297906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_297900_299600
804561	contig_19564_pilon	+	1305	5	Intergenic	novelGene_29656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	12.0078099585228	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	238	690	35185	35995	FALSE	15	CCTGACTTTTCTACATCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYWEPIPRGPVLWEARAEPWATWVPLLCFVLHVISWLLIFSILLVFDYAELMGLKQVYYHVLGLGEPLALKSPRALRLFSHLRHPVCVELLTVLWVVPTLGTDRLLLALLLTLYLGLAHGLDQHDLRYLRAQLQRKLHLLSRPQDGEAE	33620	36610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_33760_34345_34385_34827_34881_35178_35356_35713
804562	contig_14142_pilon	+	1110	3	Intergenic	novelGene_120426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	9	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	108	563	22531	23571	FALSE	15	CTGCAGCCTGAGTTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVHNLYLFDRNGVCLHYSEWHRKKQAGIPKEEEYKLMYGMLFSIRSFVSKMSPLDMKDGFLAFQTSRYKLHYYETPTGIKVVMNTDSGVGPIRDVLHHIYSAVSASPRDLPPKLLNSYGPLEPQDSLSFPPNRIISSLLKSEFPWGLLGP	22423	24118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22630_22780_22852_23285
804564	contig_8317_pilon	-	1940	2	Intergenic	novelGene_20745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTATGAAATTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40706	34631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_35546_39680
804566	SIRV5	+	416	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7473	2	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
804567	SIRV4	+	257	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1514	632	1059	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
804568	contig_7996_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_165153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACCTCTGCATTATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221869	220920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_220900_221900
804570	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	3	1165	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
804571	contig_8954_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_130253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAGAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37319	35043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_35000_37300
804573	SIRV4	-	303	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1218	0	1218	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3940	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
804574	contig_4305_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_136652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGACTTGTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456721	456489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_456500_456700
804575	contig_4305_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_136651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATGCTCGTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456438	454444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_454400_456400
804576	contig_14546_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_157425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATAGGGTTGCTATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175041	174463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_174500_175000
804578	contig_5189_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_34816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACATCACAGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176746	177167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_176700_177200
804580	contig_11933_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_107277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397026	399291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_397000_399300
804581	contig_14472_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_111199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATTGTCGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557721	557071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_557100_557700
804583	contig_7909_pilon	+	1533	2	Intergenic	novelGene_155924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547613	550617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_548619_550089
804586	contig_14563_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_135028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGGTCCCAGAGACAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57758	57445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_57400_57800
804587	contig_15866_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_63588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCTACCCAAACACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214938	217168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_214900_217200
804588	contig_9053_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_87945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTGTTTACAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270267	271847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_270300_271800
804589	contig_7230_pilon	+	1046	4	Intergenic	novelGene_52525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	470	877	23514	29124	TRUE	25	AGGATCCCCCTGAGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGPILVSSRRGSPIFIFWVCFTTSSVNLSRISFWTNTLVPLQQTSPCVRKLAISAPFTAFSMTQSEKMMSGDLPPSSKVTGLIPLAAISMIFVPVGTLPVKETLATSGCWHRNWPVAAPPCTTLKSPEGTPASV	23044	32737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_23646_28166_28310_28991_29184_32627
804593	contig_3700_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_138076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCTAATGACTCAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219159	220239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_219200_220200
804594	contig_3700_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_138077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCAGAACCACTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220390	220747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_220400_220700
804595	contig_3700_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_138078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTCTGCCCCCACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220696	221360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_220700_221400
804599	contig_7530_pilon	+	790	5	Intergenic	novelGene_141846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1882	junction_1	189.807138959524	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	136	552	276460	300561	FALSE	30	TCCCAGCAACCCCTTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNQNKGKPDLNTTLPIRQTASIFKQPVTKVTNHPSNKVKSDPQRMNEQPRQLFWEKRLQGLSASDVTEQIIKTMELPKGLQGVGPGSNDETLLSAVASALHTSSAPITGQVSAAVEKNPAVWLNTSQPLCKAFIVTDEDIRKQEERVQQVRKKLEEALMADILSRAADTEEMDLEMDSGDEA	261158	300799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_261177_276342_276481_293747_293839_295176_295355_300434
804602	contig_3747_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_24947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTCTCTCCTTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205201	202583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202737_202867_203526_205067
804604	contig_12566_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_86030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACCACTATTTTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312904	311651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_311700_312900
804605	contig_19604_pilon	-	768	5	Intergenic	novelGene_77229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.9432141495683	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	118	567	257693	255833	FALSE	0	GGTGGCTGTGTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKGCFQAEIVPVTTTIRNDKGTERSVTVAQDEGIRANTTMEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGLTVGDVDIFEINEAFASQAVYCVEKLRIPPERVNPLGGAVALGHPLGCTGTRQVVTLLNELKRQAAREN	257810	255631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_255853_256734_256871_256979_257036_257273_257454_257635
804608	contig_11448_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_66334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAATCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110195	111518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_110200_111500
804609	contig_13283_pilon	-	2429	2	Intergenic	novelGene_154009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAAATAAAACCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11186	8703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_10093_10146
804610	contig_9995_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_47811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867259	866379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_866400_867300
804611	contig_6915_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_162416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAGCATAGTGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225996	228158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_226000_228200
804614	contig_14528_pilon	-	1685	10	Intergenic	novelGene_111277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	111.178979272607	1	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	831	1487	192862	190953	FALSE	40	TACTGGTTGTGAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	198500	190754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749_192916_195071_195273_196725_196887_196976_197075_197183_197272_197815_197903_198057_198159_198459
804617	contig_2367_pilon	-	1801	2	Intergenic	novelGene_65305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	220	1140	130889	129969	FALSE	20	TGTATGAATTTCTGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEAFLIELSYKEQKYTKFCKPLTCKKTSNDKKETWKKQLLDIKDNSLSLAKMEYQEKVMKESLTEQCNDTNTIKSVDKKTVEKCKCVHLSGNVSLPIPKREGNDERQLDLYRSWSCTSICQNYPDLQIGGDHVGNMYDSGCFVEHTQEDAVNGPLLLSVDIPLGCSPVTEPLEKLPVSKLMDGDEIREKSMVSHKQPLSNSMLNNYMEKKVDELYKQFLEENLTRCHSISNLMASNLLMNNVNQISLQISQEQNIDPLKVRETLLHSLALCNLHNVSHENSSEFSTPNLQISNQTSRELVTHLQ	132231	129307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_130932_132054
804619	contig_16882_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_148254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGTTCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586704	585207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_585200_586700
804624	SIRV4	-	516	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	101	0	101	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	765	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5057	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
804626	scaffold_8345_pilon	+	1586	8	Intergenic	novelGene_107033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	310.560520244757	1	79	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	288	1175	789261	797396	TRUE	15	CTGCTCTAGAGTGACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKASPEVCNDTMTALWEECKPCLKQTCVKFYTRICRSGSPAVGHQLEEFLNQTSPFYIWIDGDRVDTLLENNQEQTHMLDDMEDRFSQVSRAMDKLFQSRLFSFEPPKPFFPFPFSSFRDNSFHKPRFLYPKSRVVRDTVPFFIHEHLNFPDLFRPFSDLIRQAQQAMDISRLMGDFATGNNNDTRLVCREMRRNSTGCLKMKNQCEKCQEILSVDCSASNPAQAQLRQELKTALQMAEKFTKQYDELLKSYQQKMFNTSSLLSQLNQQFSWVSQLANHTQNDKQAYLQVFSY	785008	798054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_785145_786706_786848_789250_789402_790271_790675_792008_792117_795998_796229_797390_797565_797811
804627	contig_9098_pilon	-	2217	2	Intergenic	novelGene_75859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_1	0	36	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	746	1117	345375	343614	FALSE	75	GAATAGAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTCGISAPYPVHPYELCLPSSFSMQILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLR	346120	342513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_343767_345156
804629	contig_7915_pilon	+	1276	7	Intergenic	novelGene_42975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	264.14558275483	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	22	546	128274	134196	TRUE	65	GAAAATAAAAGATACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKVAFKKITV	128252	138404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_128409_129868_130010_133759_133919_134106_134219_135458_135669_137701_137787_137991
804631	contig_12411_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_145674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTCGCTTTGTTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197986	200123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_198000_200100
804632	contig_1093_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_139975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	156	467	90091	90402	NA	25	TTTAAAGTATACTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHWIIHKQTGNPKMTGLAYVACIICHFISQVDLNTKLETQNIYSFDQGTNSFKHQYNQILPPQSQKLEDIPTEQDITEQSAGSDFGDHVIQYPQFTIKEALA	89935	91467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_89900_91500
804634	contig_9363_pilon	-	1911	2	Intergenic	novelGene_6740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1288	1617	1496122	1493275	FALSE	15	CCGTGAGTATGGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEPRVLCIRAVNLDGINSTAVNNYLDKQRSWLGAEMASSILLRREIGDGPHYHRRELGVECVLWIQGPSSENLLDPGDRVVTLEMAREGSKKQETSVRQLQWTSWPTE	1497409	1492980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1493469_1495986
804636	contig_8310_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_75535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	124	528	162479	162075	NA	20	TCAATGGCTGATCTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKRLNRWCIRQSPGSSMACGVWMVPTSLPLLFHLLHPWALAPCSQPLLPRWDALLPRGCKHMAAPGLECSGLPCLEENLSLKTEPALWGKSVRALTPQASGCSVPPLHLTLHCALSGSDQFCPHHGHRTLRG	162602	161462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_161500_162600
804637	contig_12570_pilon	-	2539	1	Intergenic	novelGene_79363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATAAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214484	211945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_211900_214500
804639	contig_12951_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_68237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGCTTCCATAAAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808339	810030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_808300_810000
804641	contig_2798_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_120007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTCAAGGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105281	107486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_105300_107500
804642	SIRV6	+	230	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	65	488	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804643	contig_2783_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_119661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780823	781146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_780800_781100
804644	contig_5715_pilon	-	1397	3	Intergenic	novelGene_127980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_2	3.5	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCCCGTTGCCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635248	629566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_630823_631704_631757_635159
804645	contig_8688_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_175586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTTTCCAGTACAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38556	38005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8688_pilon_-_38000_38600
804647	SIRV6	+	206	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9670	561	520	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10757	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
804648	contig_9354_pilon	+	1804	2	Intergenic	novelGene_108058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211276	215351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_212443_214713
804650	contig_10017_pilon	+	1902	2	Intergenic	novelGene_156978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	235	315	32836	32916	FALSE	25	AAAACACGTGCGTGCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSEEEPHAAGRECTPLHADQQLHRGPGPGGGDAAGTHHPRLTGTWRWWCCSVALEPSPTQAEAFCRTKRNAAQSCAIFMSVRMLESTAAATVSIHLMEGFPRFC	15401	34503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_15528_32727
804651	SIRV2	-	223	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	703	22	703	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4029	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
804652	contig_14209_pilon	+	1833	3	Intergenic	novelGene_88361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	222.5	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1208	1642	40116	40625	TRUE	25	TGAATTCACTTAGGGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLALFPLQLSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	38908	41001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_40344_40418_40717_40901
804653	contig_9819_pilon	-	1640	2	Intergenic	novelGene_175593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAAATGATCCTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166138	164438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9819_pilon_-_166036_166095
804654	contig_9819_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_175592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCAGGAGGAAGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158579	158221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9819_pilon_-_158200_158600
804656	contig_5236_pilon	+	1691	10	Intergenic	novelGene_100878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_9	135.231306186251	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	104	1351	62791	73162	FALSE	55	AACTATAGACAGTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPGLCSDVASFRIITISFRICQLPSPMLFLSVYPVQCKGWLSTFF	60622	73502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875
804657	contig_6593_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_49856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTACTAATGAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263875	1263307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1263300_1263900
804659	contig_16185_pilon	+	1864	9	Intergenic	novelGene_144742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1058	1387	96735	105407	TRUE	55	CTATTTTAAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSSFSHMSRAYRMDSIMNSNCRQVPIHSDTSTSTFSGSTTSSTFCWNTVMVSAKPFCRTSWPVCCAISLASTAYTSGLSVMRTEEADDPGSTANVQNHFIFQGIFIL	81718	127463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_82419_86023_86140_87639_87768_96621_96803_104051_104214_105307_105472_110484_110665_111383_111492_127338
804660	contig_14727_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_56685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATATCTGCCGCTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428659	428082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_428100_428700
804661	contig_10446_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_162495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTGACTGTAGAGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887863	890205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_887900_890200
804663	contig_6805_pilon	-	987	6	Intergenic	novelGene_163893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_5	65.7102731694215	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATATTTCTAGAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442694	421959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_422083_425011_425093_425979_426062_432822_432998_434586_435017_442598
804664	contig_1925_pilon	-	2073	9	Intergenic	novelGene_162206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	171.679934762336	136	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	595	1827	161590	135632	FALSE	30	AACATGTGAACAGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLGLFSLLVLQSMALGATFPDETIAELSVNMYNQLRATGEDENILFSPLSIALAMGMVELGAQGSTLKEIRHSMGYDSLKNGEEFTFLKEFSNMVTVEESQYVMKIANSLFVQNGFHVNDEFLQMLKKYFNAEVNHVDFSQNIAVANYINKWVENNTNNLLKGLVSPRDFDAVTHLALINAVYFKGNWKSQFRPENTRTFSFTKDDESEVQIPMMYQQGEFYYGEFSDGSNEAGGIYQVLEIPYEGDEISMILVLSRQEVPLATLEPLVKAQLIEEWANSVKKQKVEVYLPRFTVEQEIDLKDVLKALGITEVFIKSANLTALSDNKDIFLSKAIHKSFIEVNEEGSEAAAASGMIAISRMAVLYPQVIIDHPFFFLIRNRRTGTILFMGRVMHPETMNTSGHDFEEL	224698	135385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_135709_135969_136060_137432_137520_149651_149750_155727_155933_157393_157589_159046_159278_161340_161609_224122
804666	contig_6272_pilon	+	1948	17	Intergenic	novelGene_160443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_15	108.724134855146	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	152	1864	133604	189506	FALSE	35	ATTTAAAAATGTCGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFAIRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWETFKKKPDHFPFFFKCILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQPARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSIPLSEPVTVDKVHYCERFIELTIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCSLSCLVRREEDGHLFSQLLDVLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQRAAFAHFPELYDFALSNVAEVDTRESLVKCFGPLSSNTLHQVASYLCLLPALPKNEDTAFDKEFLLELLVSRHERRISQIQQLNQMPLYPTEKIIWDENIVPTEYYSGEGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYEIRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADITINLNVRDHIKDEWEGNRVLPERSYLSPSFK	133452	189590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_133679_136037_136095_139069_139111_146394_146431_150176_150298_152348_152490_153855_153925_154949_155051_162090_162168_164423_164489_165672_165790_167196_167311_170027_170132_175031_175135_178313_178435_186638_186781_189277
804667	contig_17144_pilon	-	1066	2	Intergenic	novelGene_29151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	0	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	341	706	101676	101311	FALSE	5	CTGTCCTCTTTTCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSHSVKERTISENSLIILLQGLQGQVTTVDLRDESVARGRIDNVDAFMNIRLANVTYTDRWGHQVELDDLFVTGRNVRYVHIPDDVNITTTIEQQLQIIHRVRNFGGQGRQEFSSKNYK	105828	100950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_101701_105512
804668	contig_10013_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_125055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTTCTGAAAGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245526	244055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_244100_245500
804670	contig_2890_pilon	+	380	2	Intergenic	novelGene_60297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGTGCAAGCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386981	389053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_387260_388951
804673	contig_3975_pilon	+	2050	5	Intergenic	novelGene_54684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	58.1936422644261	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	42	752	1049918	1058772	FALSE	5	TTTCTTCTGTGCCTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQQDHTTTTDSEMEEPYLQESKEEGTPLKLKCELCGRVDFAYKFKRSKRFCSMACAKRYNVGCTKRVGLFHSDRSKLQKAGATTHNRRRASKASLPTLTKDTKKQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQSQRDLELPDMHMRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKLGPALKIYARISMLKDS	1049876	1060070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1049940_1050847_1050963_1052559_1052702_1053672_1053950_1058617
804677	contig_5620_pilon	+	1096	9	Intergenic	novelGene_161368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAGGAGCCGGTTCGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454708	514385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_454859_455526_455655_458624_458798_460214_460287_460393_460531_480782_480866_491224_491339_492828_492923_514240
804678	contig_6266_pilon	-	2836	1	Intergenic	novelGene_171013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAGGAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895109	892273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_892300_895100
804682	contig_9335_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_147452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486334	484133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_484100_486300
804684	SIRV6	+	413	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	258	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGTATCTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	2535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856_2026_2470
804685	contig_15114_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_121221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1630370	1628999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1629000_1630400
804688	contig_4469_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_21978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937664	939528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_937700_939500
804693	contig_16625_pilon	-	1171	2	Intergenic	novelGene_171125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102961	100827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_101305_102267
804697	contig_18970_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_157820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	79	75	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	195	806	39892	31496	FALSE	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGPDPGDRGRRWLLLLLLLALSPLGLWPLTATPRSSAPGPRAPAGGSRSRLRSLWGRFLLWPGPQGTGPRCWPHQFWYEPESPWYVFGSGTQLTVLGQPKASPSVTLFPLPSEEFQANKSTLVCLMNDFYPGAVTVTWKEDGTTITQGVKTTKPSKPSIKKYAASSCLTLLTQWRSHNSYSCQVTHEGSTMEKKVVPAECV	40086	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31813_33342_33462_39716
804699	contig_6375_pilon	-	1470	6	Intergenic	novelGene_72997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	15.0678465614699	51	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATGCCATTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320053	315515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_316434_318798_318865_319257_319396_319480_319656_319731_319850_319998
804700	contig_5981_pilon	-	1559	7	Intergenic	novelGene_35530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	2.54405625374562	239	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	391	1149	288539	282616	FALSE	20	TTTGAATCGCACTTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGLIQRFARRLGITEPDVLRKAEEYLRLSQVKCVGLSAHTTETSNAVMCLDLAASCMKCPLDRAYLIKLSGLNKKMYQSCLKSFECLLGLKSNIGIRDLAVQFSCTEAVNVASKILQSYEASLPQAQQVDLDLSRPLFTSAALLSACKILKLKVDKNKMVATSGVKKAIFDRLCKQLEKTGQRIDREPGDLATPPRKKKKTVVEPAAKEREKTVEIPHQLQKNEDPTQDYEEWKRRILENATKASKATAE	288929	282205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_282744_283357_283427_283897_284011_285414_285505_285713_285878_287045_287176_288474
804703	contig_8773_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_74510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTAAGTCCTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22979	21076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_21100_23000
804706	contig_10235_pilon	+	1703	4	Intergenic	novelGene_46291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	24.5673676969177	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	196	900	79066	80884	FALSE	15	CATGGTCTCTTTCTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTPSARTPGDQTGGREATPDTPGKNPSDTTPPDKQLGGILSFIHTLPQGFTIFQLHLSPSAKDAMSTESMIRDVELAEEALPKKAGAPQGSRRCLCLSLFSFLLVAGATTLFCLLHFGVIGPQREEQFPDGFHLINPLAQTLRSSSRTPSDKPVAHVVANPQAEGQLQWLSRRANALLANGVELIDNQLMVPSDGLYLIYSQVLFKGQGCPSTHVLLTHTISRIAVSYQTKVNLLSAIKSPCHRETPEEAEAKPWYEPIYLGGVFQLEKGDRLSAEINLPNYLDFAESGQVYFGIIAL	78870	81687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_79252_79841_79891_80080_80129_80462
804709	contig_9646_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_117417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30361	28510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_28500_30400
804710	contig_13901_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_146643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGAATGGGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175709	173950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_174000_175700
804712	contig_10324_pilon	+	1854	6	Intergenic	novelGene_7845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	52.5486441309383	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1010	1477	286974	296100	FALSE	10	GGAGGTATGTTCTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRGREYANWLDSSFACSPGSNYTQTTRLEHIGESWLPKVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTKMVSEEDSTTLDAQSSSTAASSISQTWKRPTSTSSSLESPEFSTFRAPL	285964	296477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_287092_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
804713	contig_12019_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_87770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1206	1607	691826	692227	NA	10	CGAGGACTCCTGGCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCCCRAERLGESALASSLVPAASPYIAHSQWPPGKELDLGPWPKQPGEEQALCSGEFFPGSGPPQALHLGVTPRALVATMQDGGALGEREPQRETVFTDSRLTTCCSCNPRRTVTTLDSFEVAPSPSCQTG	690620	692865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_690600_692900
804715	contig_8260_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_163226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11836	10906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_10900_11800
804716	contig_13744_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_77194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTGATTTGCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753541	753319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_753300_753500
804717	contig_13744_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_77192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCTTCAAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752515	751517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_751500_752500
804718	contig_1442_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_172158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACCATGGGTCTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427075	427897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_427100_427900
804720	contig_8898_pilon	-	731	4	Intergenic	novelGene_137240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	45.38232646698	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTTTGCTTTCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286769	281875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_285082_285249_285321_285492_286564
804722	contig_11292_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_109434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCTTTCCCTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271711	270503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_270500_271700
804724	contig_14142_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_120547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2	400	433280	432882	NA	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433281	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433300
804725	contig_1443_pilon	+	1709	12	Intergenic	novelGene_28237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.5680612873253	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	610	1428	538016	541541	FALSE	45	ATAATAAATTTTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLDGGFAAVSRAFHEIRARIPEFQPQTLMDFGSGTGSVTWAAHNTWGQSLREYMCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535997	541822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536522_536604_537612_537727_537987_538070_538404_538479_538913_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
804726	contig_10051_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_175595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCAAGTAGGACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231035	231575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_+_231000_231600
804727	contig_2504_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_166864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGTTCTTGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425786	424962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_425000_425800
804729	contig_9434_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_150488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90153	91277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_90200_91300
804730	contig_10246_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_46910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCTGAGTAGTATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142420	143584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_142400_143600
804731	contig_11338_pilon	+	1336	11	Intergenic	novelGene_6222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCTCCACTCACTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12412	21394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_12566_12646_12792_12883_13031_13118_13231_13327_13420_14083_14170_14653_14710_15092_15191_16643_16772_17076_17288_21286
804732	contig_8377_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_35026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAATCAGCCGTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69316	68253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68300_69300
804733	contig_1686_pilon	+	2750	14	Intergenic	novelGene_165594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGAGCCGCCTAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275751	310215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_276387_277676_277857_277973_278067_279395_279515_284975_285177_287523_287729_292130_292213_293179_293345_295159_295284_296936_297317_299668_299785_301826_301983_307857_307987_310050
804735	contig_9752_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_122007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGAATTCAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69638	68166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_68200_69600
804736	contig_4782_pilon	+	283	3	Intergenic	novelGene_73694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	13	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTGAGACATTATCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787261	798001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_787390_793914_793964_797895
804739	contig_4742_pilon	-	1707	2	Intergenic	novelGene_131010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACTCAATCGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269829	266658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_267536_268999
804740	contig_953_pilon	+	2567	4	Intergenic	novelGene_130004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	1.63299316185545	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	22	588	285594	301541	FALSE	70	AAAAAAAAGAAGTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRRRAVMASERPEPEVEEAGQVFLLMKKDYRISRNVRLAWFLNHLHQTVQATPQELLLQSEQELEVLSVLPPGWQPDEPVVPSPFLLVPSTRVTFLAWQYRFVIELDLSPSTGIVDDSTGEILFDEVFHALSRCLGGLLRPFRVPGSCIDFQPEIYVTIQAYSSIIGLQSHQVLYPLSKFIPSDLISDSPLTKS	285572	303520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_285621_300427_300554_300835_301010_301301
804743	contig_8616_pilon	+	731	5	Intergenic	novelGene_72572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1278.46871295312	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	18	656	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVSRDTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425760	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427058_435726_435900_435993_436119_436357
804744	contig_11978_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_63006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCAGGGGCTAGAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562262	1560074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1560100_1562300
804745	contig_11258_pilon	+	2200	2	Intergenic	novelGene_67831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTTCTACCCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340005	349391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_341694_348879
804747	contig_7622_pilon	-	2500	4	Intergenic	novelGene_132421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	76.0058477282432	17	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1961	2266	274515	269125	FALSE	45	AAAAAAAAGTTGCTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	290756	268890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274601_288881
804748	contig_5797_pilon	+	2243	12	Intergenic	novelGene_56926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	83.0893176692636	22	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	496	1557	254852	273501	FALSE	15	TTAGCTGTCAGTGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRIHKFHRLESTLSPAENRVFSLQQPLPGEGSREPEHTGDFHVEEALDWPGVYLLPGQVSGVALDLKNNLVIFHRGDHVWDGNSFDSKFVYQQRGLGPIEEDTILVIDPNNAAVLHSSGKNLFYLPHGLSVDKDGNYWVTDVALHQVFKLDPNSKEGPLLILGRSMQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGDSEHKLETGSGRVLGRLRGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	221697	274187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_221816_230464_230595_250787_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_272595_272650_273319
804749	contig_6589_pilon	-	1531	8	Intergenic	novelGene_26212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	62.8051733212987	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	197	691	2032681	2030536	TRUE	25	AACTGGTTCCTGTTACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033640	2027945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
804753	contig_10734_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_51115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	206.852604527959	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTGTTGTGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739501	737232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737597_738019_738138_738215_738501_738948_739007_739342
804754	contig_1154_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_87233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654301	1652991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1653000_1654300
804759	contig_12512_pilon	-	751	2	Intergenic	novelGene_24190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCCAGTATTAGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599939	599094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_599329_599422
804761	contig_18364_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_102576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACCACCATGGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145835	146900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_145800_146900
804762	contig_6326_pilon	+	1936	6	Intergenic	novelGene_168534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	51.1601407347556	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1275	1751	284987	291496	FALSE	10	TGTTTTTGCAATGTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEVEESQLKDEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLPNGADILFEPKLKFA	282838	291681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_283762_284585_284635_284684_285143_286930_287015_289403_289467_291322
804763	contig_11855_pilon	+	1257	4	Intergenic	novelGene_67049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_3	98.3564944474944	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	615	1256	1995409	2002433	FALSE	35	CATCCATCCCCAGCGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSERSLHRPTTSAQEAVYLVPQCLPGKLLCLTVLLSLQTPLSWQELEGEQASSCTHKRSASWGSTDHRKEITKLKQQLQRTKLSRSGKEKERGSPLQGDHAVRGALRTSPPSFPSGSTVLRLSPCLHRSLEGLNQELEEVFVKEQGEEELLRILDIPDGHRAPAPPQSSSCDPSLLPLEPGNLASSPSMPLASPQPSGCASHEEHRGAVEEL	1994794	2002434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1995625_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253
804766	contig_6471_pilon	+	1966	2	Intergenic	novelGene_172095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTATTGTTTTTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78586	85608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_78688_83743
804770	contig_8174_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_160064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTTAATATTATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302462	303982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_302500_304000
804771	contig_6589_pilon	+	640	5	Intergenic	novelGene_25768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2003.36098843918	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	137	634	669670	672840	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENALYHEARRALLCHWLLPALHQRGSIHWSPDLCHPLQGDPEASPAWGQLRLLLCPGLGGLPPCPGQRHHLHPPAEAGVSTLRCLLPALPLHPEAPVPDCLPENKTI	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669650_669748_670000_670104_671126_671188_672584
804772	contig_10494_pilon	-	785	4	Intergenic	novelGene_102185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	26.5371856499935	434	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	38	388	1059298	1056692	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPIPGVLFRDMSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKEPCGQPASC	1059335	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1057167_1057302_1058719_1058827_1059218
804773	contig_15407_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_123105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATCATGGCCCAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585299	587236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_585300_587200
804774	contig_5279_pilon	-	2321	7	Intergenic	novelGene_105542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_4	125.246091090035	134	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	65	763	117981	33398	FALSE	10	TTCTTGTACAGGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEKGMSSGEGLPSRSSQVSAVKVTAEELETKQSHKEKRVGFVLVHAGAGYHSESKAKEYKHVCKRACQKAIEKLQAGALATDAVTAALVELEDSPFTNAGMGSNLNLLGEIECDASIMDGKSLNFGAVGALSGIKNPVSVANRLLCEGQKGKLSAGRIPPCFLVGEGAYRWAVDHGIPPCPPNIMTTRFSLAAFKRNKRKLELAERVETDFIQLKKRRQSSEKVRKYLKY	118045	31839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_33529_52926_53007_70529_70615_76203_76325_111969_112039_113731_113800_117836
804775	SIRV2	-	376	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4489	42	3314	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
804776	contig_10324_pilon	+	1496	11	Intergenic	novelGene_7910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	92.7869064038671	97	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	381	1463	824693	836239	FALSE	5	CCAGTCCTTTGTGTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSLLLLLPFCSAVEVKRPRGVSLSNHHFYDESKPFTCLDGSATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGNFHCTNTGYKPLYIPSSRVNDGICDCCDGTDEYNSGIVCENTCKEKGRKERETLQQMAEVTREGFRLKKILIEDWKTAREEKQKKLIELQEGKKSLEDQVEMLRTAKEEAEKPEKEAKEQHRKLWEEQQAASKAQQEKELVASTFQELDDDMDGMVSVAELQTHPELDTDGDGALSEGEAQALLGGDSQTDANAFYDRVWAAIRDKYRSEVLPTDQPAPTTDLTEPKEEQPPPVPSPPSEEDEEEEEAEEEEEEEEEEEEPVSSLVAHLCPLPGTSAFPPVGEVT	824312	836272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_824778_824994_825112_825629_825726_825821_825880_826747_826866_828320_828451_831514_831600_832602_832682_833524_833612_833912_834063_836161
804778	contig_6364_pilon	-	784	2	Intergenic	novelGene_51836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	799	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGGCTTCTTAGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604210	1603140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1603467_1603752
804779	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
804781	contig_14807_pilon	-	2052	11	Intergenic	novelGene_124719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	412.684443612792	3	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	904	1980	55483	45280	FALSE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGLTVEGPCEAQLECLDNGDGTCSVSYVPTEPGDYNINILFADTHIPGSPFKAHVVPCFDASKVKCSGPGLERATAGEVGQFHVDCSSAGSAELTIEICSEAGLPAEVYIQDHGDGTHTITYIPLCPGAYTVTIKYGGQPVPNFPSKLQVEPAVDTSGVQCYGPGVEGQGVFREATTEFSVDARALTQTGGPHVKARVANPSGNLTETYVQDCGDGTYKVEYTPYEEGLHSVDVTYDGSPVPSSPFQVPVTEGCDPSRVRVHGPGIQSGTTNKPNKFTVETRGAGTGGLGLAVEGPSEAKMSCMDNKDGSCSVEYVPYEAGTYSLNVTYGGHQVPGSPFKVPVHDVTDASKVKCSGPGLSPGVVRANLPQSFQVDTSKAGVAPLQVKVQGPKGLVEPVDVVDNADGTQTVNYVPSREGPYSISVLYGDEEVPRSPFKVKVLPTHDASKVKASGPGLNTTGVPASLPVEFTIDAKDAGEGLLAVQITDPEGKAKKTHIQDNQDGTYTVAYVPDVTGRYTILIKYGGDEIPFSPYRVRAVPTGDASKCTVTVSIGGHGLGAGIGPTIQIGEETVITVDTKAAGKGKVTCTVCTPDGSEVDVDVVENEDGTFDIFYTAPQPGKYVICVRFGGEHPPVASQLSLGKRRRGSHSVSCLSSLVL	56632	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45364_51495_51717_53654_53679_53836_54027_54398_54556_54644_54769_55120_55292_55377_55539_55619_55783_55863_56038_56121
804782	contig_8978_pilon	+	1716	2	Intergenic	novelGene_49395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATACCCATTGCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331588	341448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797
804784	contig_11017_pilon	-	2263	1	Intergenic	novelGene_128087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246957	244694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_244700_247000
804791	contig_7919_pilon	+	1751	2	Intergenic	novelGene_28043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	97	1662	349195	350760	FALSE	15	TTGTGTTTGTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSELVKLPSSAHWWEAELVEKAPGRDSEVTIMSLRLHTLPTQLGVVRPSCRELLCLLVITATVSGGSSRMCPTACICATDIVSCTNKNLSKVPGNLFRLIKRLDLSYNRIGLLDSEWIPVSFVKLNTLIIRHNNITSISTGSFSTTPNLKCLDLSSNKLKTVKSAVFQELKVLEVLLLYNNHISCLDPSAFGGLSHLQKLYLSGNFLTQFPMDLYVGRFKLAELMFLDVSYNRIPSMPVHHMNLVPGKQLRGIYLHGNPFICDCSLYSLLIFWYRRHFSSVMDFKNDYTCHLWSDSRQSHQVLLLQDSFMNCSDSIINGSFRALGFIHEAQVGERLIVHCDSKTGSANTDFIWVGPSNRLLEPDKEMENFHVFRNGSLIIESPRFEDAGVYSCIAMNRQRLLNETVDVTINVSNFTVNRSHAHEAFNTAFTTLAACVASIVLVLLYLYLTPCPCKCKTRRQKNMLNQSNVHSSILNPDPASDAPADERKAGAGKRVVFLEPLKDTAAGQNGKVRLFPRETVIAEGILKSTRVKSDSDSVNSVFSDTPFVAST	348720	350849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_348754_349131
804792	contig_2043_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_169932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAATAGCAGTTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830620	831476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_830600_831500
804793	contig_2043_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_169933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATAAACCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831925	832381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_831900_832400
804794	SIRV7	-	549	4	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-34	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	23	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114950	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78847_78964_114686
804795	contig_2924_pilon	-	2118	15	Intergenic	novelGene_140245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	301	735	297543	287669	TRUE	30	GCTCGCCGAGAACTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLLSSRTCVLSSSTAAWLLAAGSTFGFPSVPNRDGELALCPAVPKEDERGEGAAADSGAGPPPAAMAPGLGGKEALLSDTWDMVTVFDVFFDASAPLCASETCSSLSSSGLGESNISGLERDEDVRDWDGGRLPVAFGRLVVG	297843	17825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_17944_66032_66157_125501_125606_135677_135810_147478_147684_185697_185775_199571_199667_221845_221956_236286_236343_239715_239790_242627_242785_259355_259440_287621_287733_293259_293387_297299
804796	contig_11602_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_166585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69272	66919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_66900_69300
804797	contig_14983_pilon	+	1707	5	Intergenic	novelGene_175605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10.0249688278817	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAAGCTTTTGTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5191	16111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14983_pilon_+_5324_12563_12683_13671_13737_14581_14690_14828
804799	contig_15039_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_110110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCCTGGCCCCAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161293	161883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_161300_161900
804800	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
804801	contig_3463_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_61988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505910	507572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_505900_507600
804803	contig_14326_pilon	-	2315	8	Intergenic	novelGene_120727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	52.3364312961471	1	143	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	803	1180	443129	442066	FALSE	20	ACCTTATGTCAGCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493179	440930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443919_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
804805	contig_6710_pilon	-	502	2	Intergenic	novelGene_97935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
804807	contig_13300_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_125805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	28.8020061029706	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1	384	250794	248617	TRUE	40	TCTGAAGCAATATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGGVLDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250794	244131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_248525_248782_250575
804808	contig_8254_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_48374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTCACTTCATGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53715	52832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_52800_53700
804810	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804811	contig_8587_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_159096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCAGCAGACGGCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6274	6615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_6300_6600
804813	contig_7730_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_156257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACGAAACTAAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13877	13367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_13400_13900
804814	contig_7730_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_156258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAAAAATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16102	15605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_15600_16100
804816	contig_9515_pilon	+	1156	8	Intergenic	novelGene_73815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	295.607226997347	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	699	1154	68341	72652	FALSE	5	CCTTGGCTCTCTGCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGKLDLSLTVPAGGDSAPGPRESHLQAILQELEMRALVSLHPTLLPGHHLPALFPLANGQCGREPCGCSIKEANA	57289	72654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57358_66074_66248_66345_66494_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_72431
804817	contig_13245_pilon	+	694	3	Intergenic	novelGene_148807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCGATTACACAGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25117	26457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_+_25637_25998_26073_26356
804818	contig_1996_pilon	-	1968	15	Intergenic	novelGene_131910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_10	5.32418432959549	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	31	1773	301505	283320	FALSE	15	CAAATCGTTTTCCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRPSWLCGFHSALLLSRTKPRPPPTASFGRNIRVSHASSGRPKPLWKKVMSATVVGVPLLLGVRYLMAEAREKRRMRLMVEGVGRFSRSLSIGLQISVDYWWCTNVLLRGVDENSPRYVEVMSACHQRAADALVAGAISNGGLYIKLGQGLCSFNHLLPPEYIRTLHVLEDKALTRSFREVDELFLEDFHAPAHEIFQEFDYQPIAAASLAQVHRAKLHDGTDVAVKVQYIDLRDRFDGDIYTLELLLRLVELMHPSFGFSWVLQDLKGTLAQELDFENEGHNAERCARDLGHCHYVVVPRVHWDKTSKRVLTADFCEGFKVNDVEAIKAQGLALQDIAQKLIQAFAEQIFYTGFIHSDPHPGNVLVRKGPDGKAELVLLDHGLYQFLDEKDRSALCQLWRAIILRDDASMKLHAAALGVQDYFLFCEVLMQRPVRLGQLWRSHLLSREEAAYMQDMAREHFEDIMSVLKALPRPMLLVLRNINTVRAINASLGAPVDRYFLMAKSAVKGWSRLGGGTYQGIYRFSLLRQIKVVWELLKFEVALRLEIVLMRVTALVVRTLVHLGLVTEPEGLYEYLET	301535	283124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_283426_283512_283630_283696_283950_284038_284131_284208_284288_284369_284452_284862_284947_285013_285146_285229_285344_285431_285573_285648_285850_285999_286076_291431_291582_292270_292375_301493
804819	contig_4114_pilon	-	1590	11	Intergenic	novelGene_15647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	113.665518078263	21	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	97	1059	592330	573446	TRUE	20	AGCTGATTTTCTATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLFKEVFCSRFAQCNTSFDFLTAASICVDCGSR	594223	566987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_574099_574192_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127_592346_594142
804820	contig_12270_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_113384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGCCTGATGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13846	14419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
804821	contig_12402_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_133350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAGAGTGTGGACGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315359	314078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_314100_315400
804822	SIRV6	+	350	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	530	-2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
804826	contig_13481_pilon	-	1583	2	Intergenic	novelGene_119507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	818	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTTATGTGAAAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413952	1411852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1411960_1412476
804827	contig_348_pilon	-	1414	8	Intergenic	novelGene_67588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	17.2520333022292	17	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	117	341	254084	253457	TRUE	5	GGTGCTTTCTGGGGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLFRDARGWDLVSAVAEFWCSRVEWSPGEEKYHLRGVMPPDEFHPGVNNSVYTNVLVQNSLHFAAALAEDLGLPVPNRWLVVADKIKVPFDPERNFHPEFDGYQLAPQERR	254296	251834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_252461_252588_252720_252876_252975_253145_253242_253334_253477_253718_253856_254016_254090_254185
804830	contig_10616_pilon	-	2393	3	Intergenic	novelGene_175607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_2	274	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCCTTATTTCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978440	975092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_-_977046_977683_977810_978126
804832	contig_2768_pilon	+	1672	6	Intergenic	novelGene_57513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	319.473942599393	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	196	861	789389	792735	FALSE	30	ACCAGCTACATTATGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDGSLERVLVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNKPSKWEEGLGPLPHSLDNDLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFITAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI	788283	793546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_788336_788886_789006_789364_789586_790781_790898_791504_791674_792551
804834	contig_9582_pilon	-	1665	8	Intergenic	novelGene_106858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.9111779924262	31	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	54	971	828141	813948	FALSE	15	TTTTGTTGATCCATTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPVVGQELQAGVAVGMSTGRPEPGPEGLSRHHGALASDHQPPPTAPVSWSLPRWRAYVAAAVLCYINLLNYMNWFIIAGVLLDVQKCFQISDSNVGLLQTVFIGCLLLSAPVFGYLGDRHSRKAMLSFGILLWSGAGFSSSFISPQYSWLFFLSRGIVGAGTASYSTIAPTILGDLFVKDQRTRVLAIFYIFIPVGSGLGYVLGSAVTELTRNWRWALRIMPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDR	828194	813253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_813952_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817393_817921_818059_824373_824440_827951
804835	contig_16724_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_105273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTACGGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353010	354065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_353000_354100
804836	contig_12540_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_148104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGAATTCGGACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040391	1042670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1040400_1042700
804837	SIRV4	+	392	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCCGCCGATAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
804839	contig_11742_pilon	+	1551	3	Intergenic	novelGene_166532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.5	50	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATCTTATTAACTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72719	117567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_72827_115621_116632_117133
804840	contig_2069_pilon	+	1576	8	Intergenic	novelGene_23454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	342.575300824058	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	211	1563	1433269	1439381	FALSE	15	GACAGCTCTGGGGAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGRATQKAWLVSSAFRPLPEPNTVNTHGPSCASWLCPLPLAPARSALLACPQGLDLYLCTLQPAPLGTALQSLRDDALSMKRQPPQLQASSTDDKKLTAKYPPSREKMGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTAPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432000	1439394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432060_1432935_1433064_1433245_1433305_1433701_1433913_1436052_1436453_1436494_1436748_1437870_1438000_1439057
804847	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	522	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
804849	contig_3081_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_133914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158617	160190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158600_160200
804850	contig_5210_pilon	-	2983	18	Intergenic	novelGene_65477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	165.057922097241	47	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	924	2775	24	2798	1090975	1074643	FALSE	30	CATTCATGTCCGCTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVDWNQMDSNGPAGLGHRGGASGCPLEGSPQSSDRSNLVQTCLQQFTVTVAQLQQIRTSLLGSMEQALMGQNDPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASVRVLWVTLTGTEGHRVEPRSQEFVIPPEVMLGPGKQLFDFAACCLTKFLEALPVSNQCLPLGFSFSFPCHQTGLDRSILISWTKGFRCSDVEGQDVVQLLRDAIERQGAPSLNVVAVVNDTVGTMMGCDPELGPCEIGLLVDLGTKACYMEETKHVAVLGEDLGSVCVSIEWGSFCDDEALGPVLTSFDHALDQESLDPGAQRFEKMIGGLHLGELVRLVLVDLAQRGLLFGGCTSPALLSQGSVALEHVAEMEDPSAGTARVLAVLQNLGLSPEASDVELVQRVCAAVTTRAARLCAAALAAILGRLQHSREEHALQIAVATGGRVFERHPSFLGLLKETVMLLAPECGVSFIPSVDGGGRGVAVVTAVVTRLATNRRLLEETLVPFRLDREQLAAVQVQMQEAMAKGLRGEASSLRMLPTYVRAVPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVAATGVQITSEVYTIPELMAQGPGQQLFDHIVDCIVDFQQKKGLVGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFSASDCVGQDVVALLREAIRRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYKDPRCEVGLIVGTGTNACYMEELQNVAGVDGDSGHMCINMEWGAFGDDGTLGVLSTHFDASVDGASINPGRQRFEKLISGMYLGEIVCHILLHLTRLGVLFQGQQTQQLQARGIFKTKFLSQIESDSPALRKVRDILQGLGLSLTSDDALIVREVCQAVSRRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELTVTVGVDGTLYKLHPHFSRLVEATVRDLAPRCKVTFRQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQTPRI	1090998	1074457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1074788_1074863_1075098_1075277_1075434_1075537_1075722_1077494_1077595_1077772_1077869_1080241_1080362_1080439_1080580_1080675_1080972_1081294_1081529_1081660_1081817_1082332_1082517_1082601_1082702_1083791_1083888_1083977_1084098_1084188_1084344_1084501_1084665_1090879
804851	contig_1443_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_28215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAATGAGTGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344325	344893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344300_344900
804853	contig_12677_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_110688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_700
804858	contig_10235_pilon	+	606	5	Intergenic	novelGene_46332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	274.874971577989	2333	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	110	511	109120	111229	FALSE	10	TCCAGTCAGCTTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGRPLRRPVGQASWQKKAKPASFVCLLTSASICGAMSQIRDLQGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKNIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKMILMYEEKAREQEKPMGPPAKKAISELP	109010	111324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_109553_110144_110308_111144
804861	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1157	1	1157	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATTTAAAAATAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
804863	contig_10011_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_68077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	538	1617	28	1644	289051	290667	NA	55	ATATAAATATATTCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTTLNLEEKMKVLSRIEAGRSLKSVMDEFGISKSTFYDIKKNKKLILDFVLKQDMPLVGAEKRKRTTGAKYGDVDNAVYMWYQQKRSAGVPVRGVELQAAAERFAQCFGRTDFKASTGWLFRFRNRHAIGNRKVCGEQVLSSVSESVEPFRQKLSMIIKEEKLRLAQLYSGDETDLFWKSMPENTQASRKDICMPGKKINKERLSALLCANADGTHKLKSVIIGKSKLPKSVKEDTSVLPVIYKPSKDVWFTRELFSEWFFQNFVPEVRHFQLNVLRFHEEEVRALLLLDNSPAHLSAEALTSEDGRIKCMFFPHNTSTLIQPMNQGVILSCKRLYRWKQLEESLVIFEESDDEQDKGEKGVSKIKTCNIKCAVFNWAKSWDEVSQITIASAWENLLYKKEPEYDLQGLYDGDYKDILEKCGELETKLDDDRVWLNGDDEKKGCPPKTKGGITKGIVPKGGGTDEEHQQPAAFKLSTVRDSLDYLLDFVDATPEFQRFHFMLKEMQQEIIKKQFQTRIHSRIGSFLKPRPHNIKDSFNMPSTSGSNN	289023	290811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_289000_290800
804866	contig_5551_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_134236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACTCATTGCTGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389292	388840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_388800_389300
804867	contig_2204_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_71685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAACATCCTAATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48174	48954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_48200_49000
804868	SIRV4	+	360	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTAACAGTTTCCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	4000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
804871	SIRV6	+	300	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	171	409	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
804874	contig_5769_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_138764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATTACAGTTTTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179099	178498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_178500_179100
804875	contig_17936_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_29947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCAGTCCTATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55892	55386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_55400_55900
804877	contig_1009_pilon	+	2304	1	Intergenic	novelGene_121744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1585	1953	212022	212390	NA	50	ATTGAATTAGTAGGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLAAVLVVYSLVFCLHFCMPLLLPSYSHSRSGRGPGRYGHTPLIDVVLCLSTSFKKLYQQFEIFYYCITRTVTVRKGIDVSRRAHKASISFVYYVCINVNDLMGLGSFLGSVSFNAAAEA	210437	212741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_210400_212700
804878	contig_10765_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_122895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90554	90285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_90300_90600
804882	scaffold_6394_pilon	-	1401	13	Intergenic	novelGene_111066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_9	36.7714412131057	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	677	1330	513818	501668	FALSE	5	GGCCGCGCGGTGCCCACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVAKDQHFDGFVVEVWSQLLSQKQAGLVHMLTHVAEALHQARLLAVLVIPPSVTPGTHQLGMFTHKEFEQLAPVLDGFSLMTYDYSTAQQPGPNAPLSWVRACVQVLDPKSKWRSKILLGLNFYGMDYSASKDAREPIVGSRYIQMLKEHRPQLVWDSQAAEHVLEYKKSRGGRHIVFYPTLKSVQVRLDLARELGVGASIWELGQGLDYFYDLL	525689	501596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_501767_502099_502143_502334_502416_510408_510565_510748_510851_511977_512071_513471_513534_513800_513908_514609_514655_515457_515640_517036_517187_518101_518255_525632
804883	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	515	52	515	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10752	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804884	contig_1308_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_172685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165005	165403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1308_pilon_+_165000_165400
804886	contig_3700_pilon	+	1147	2	Intergenic	novelGene_138072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGACACACTCCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186076	194335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_186920_194031
804888	contig_10286_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_98435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCTTGAGTTAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485784	485172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_485200_485800
804891	contig_10609_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_123900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153992	155992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_154000_156000
804894	contig_6929_pilon	-	2505	10	Intergenic	novelGene_139446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	29.2211660138653	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	855	1604	351305	348169	FALSE	35	ACATGGTTTTAAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEESRQMMREKKVTILELFRSPAYRQPILIAVVLQLSQQLSGINAVFYYSTSIFEKAGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHLIGLAGMAGCAVLMTIALALLEQLPQMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGFSNWTSNFIVGMCFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVVFFIFTYFKVPETKGRTFDEIASGFRQGGAGPSDKTPEELFHPLGADSQV	378796	347267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_348370_348979_349184_350365_350468_350886_350992_351167_351356_351442_351606_352693_352936_353150_353312_365376_365473_378654
804895	contig_3410_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_58955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTAGCCTTTTGTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374198	371914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_371900_374200
804896	contig_10642_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_78757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTGTATATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477122	1476006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1476000_1477100
804898	contig_9833_pilon	-	1055	2	Intergenic	novelGene_68488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTTCTGTCCTCTCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221953	199262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_200101_221736
804899	contig_9833_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_68483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTACATGGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177560	176637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_176600_177600
804900	contig_6886_pilon	+	2757	1	Intergenic	novelGene_175612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATTCCCAAAGTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172137	174894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6886_pilon_+_172100_174900
804901	contig_8636_pilon	+	2300	13	Intergenic	novelGene_141904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_12	47.0841445357847	6	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	9	1523	271439	293232	FALSE	20	TCACAGACCCTTTGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLMERQKRKADIEKGLQFIQSTLPLKQEEYEAFLLKLVQNLFAEGNDLFREKDHKQALVQYMEGLNVADYAASDQVALPRELLCKLHVNRAACYFTMGLYEKSLEDSEKALGLDSENIRALFRKARALNELGRHKEAYECSSRCSLALPHDESVTQLGQELAQKLGLRVRKAYKRPQELETFSPLSNGMATGMADQGTSNGLGSIDDIETDCYMDLRGSPAPLPSSPTMPLFPHVLDLLAPLDSGSRALPSTESLDDFSDGDVFGPELDTLLDSLSLVQSGLPGSGLPSELPQLIPVFPGGTPLLPPVVGGSVPVSSPLPPASFGLVMDSSKKLAASMLDALDPPGSALDSLDLLPYSETRLDALDSFGSTRSSLDKPDSFSLEETNAQDHRPPSGTQKPAPSPEPSMPNTALLVKNPLAATHEFKQACQLCYPKTGPRAGDYTYREGLEHKCKRDILLGRLQSAEDQTWKRIRPRPTKTSFVGSYYLCKGGDRRVDRGAEGHPQP	271430	294009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_271492_277831_277866_277987_278186_279156_279316_280602_280684_281532_281590_283052_283096_283710_283905_284180_284506_285520_285580_285788_285889_289884_290047_293182
804904	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11574	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
804906	SIRV6	+	367	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	449	40	276	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAGTGCCAACTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1579	2500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
804907	contig_5084_pilon	-	2001	14	Intergenic	novelGene_64662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_13	11.2349834032368	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1563	439	2001	1602550	1579597	FALSE	45	AGAAACTCTGCAGAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINSRITVFDENADAASRAELSKPAVQPWVAPPVPRAKENELQAGPWNTGRPLEYRPHGSAASAAAAPSVLPSFAPYVEETAQQPVMTPCKIEPSINHVLSTRKPRKEEGDPLQRVQSHQQESEGKREKMMYCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVFRKKLKEQREAELLTNAKKRAEMQKQIEEMEKKLKEIQTTQQERVGDQQEERLPAKETAEPRIASESQETPGMVLSSSLCPVNSCAREPSLAENICQEQPRSKGPSIPFSIFDECLPSEKKNISPPTDPPGALAQRRPLTILKTSESITSNEDVSPDVCDEFTGMEPLSEDAIITGFRNVTICPNPEDTCDFARAAHFVSTPFHEIISLKNLPSGPERLLQEEDLDVKTSDDQQTVCGAVYNQTLSVKKLSPIIEDSHEATHSSGFSGSSASVTSTSSSIKCLQIPEKLELTNETAENPTQSPWCSQHRRQLLKSLPELSASAELFVEDKPMPILEIGREIELGNEDYYIKEEYLICEDYKLFWVAP	1605044	1579596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1579668_1584025_1584167_1585078_1585216_1587572_1587848_1589782_1589889_1590013_1590075_1591204_1591255_1591811_1591928_1592445_1592559_1597488_1597719_1602124_1602217_1602379_1602595_1604380_1604551_1604820
804909	contig_7513_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_88930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCAGCCAGGAGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29829	29244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_29200_29800
804911	contig_9609_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_22974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATACGGTCCTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302225	301222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_301200_302200
804912	contig_9609_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_22973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTAAAGGTTCGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300557	300088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_300100_300600
804914	contig_15732_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_88922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382875	380601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_380600_382900
804915	contig_18108_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_33467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGTAAATAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226517	226070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_226100_226500
804918	contig_7457_pilon	-	2267	6	Intergenic	novelGene_31462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	6.40624695121879	189	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	275	2038	491280	484749	FALSE	15	GTCCTGGCCTGTCAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGGGAGARVRVSGSTGVAAAAGLHRYLRDFCGCHVAWSGSQLRLPQPLPVVPKELTEATPNRYRYYQNVCTHSYSFVWWDWARWEREIDWMALNGINLALAWSGQEAIWQRVYLTLGLTQSEIDEYFTGPAFLAWGRMGNLHTWGGPLPRSWHLKQLYLQHRILDRMRSLGMIPVLPAFAGHVPKAITRVFPQVNVTQMGSWGQFNCSYSCSFLLAPGDPMFPIIGSLFLRELTKEFGTDHIYGADTFNEMQPPSSEPSYLAAATAAVYEAMITVDPDAVWLLQGWLFHHQPQFWGPAQVGAVMRAVPRGRLLILDLFAETQPVYIRTASFQGQPFIWCMLHNFGGNHGLFGTLETVNQGPAAARLFPNSTMVGTGMAPEGIGQNEVVYALMAELGWRKDPVPDLGAWVASFADRRYGGFHQDAEAAWRLLLRSVYNCSGEACVGHNHSPLVRRPSLQMHTTVWYNRSDVFEAWRLLLAATPTLAASPAFRYDLLDITRQAAQELVSLYYGEVRTAYLNKELVHLLRAGGILAYELLPALDEVLASDSRFLLGSWLEQARAVAVSEAEAHFFEQNSRYQLTLWGPVGNILDYANKQLAGLVSDYYTPRWQLFVGALIESLVQDIPFQQRLFDENVFQLEQAFVLNTRRYPTQPKGDTVDLAKRLFLKYYPRWVAGSL	492451	484519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_485960_488371_488629_489875_489962_490119_490267_491217_491366_492262
804920	contig_6710_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_98299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	1	366	657526	653571	FALSE	25	GAGTGTTAGAGGGAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRD	657526	653570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
804923	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	3	-244	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
804924	contig_8636_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_141935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	8	325	457650	457967	NA	20	TAAATGTCTTTGCTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHMLLPGVGLKGGRPHGHSVTRKRLTTKWASWSQQKWVKELEEPGQATPLNKQYGACPGTRICGGTSRPTGPSWQELSWECWLAPGLLLDRWCGGRERTSVVTAPSP	457642	458365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_457600_458400
804925	contig_614_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_132632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635209	633322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_633300_635200
804928	contig_3575_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_141111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAAATTCTATTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422738	424063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_422700_424100
804930	contig_10042_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_79164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTTAGATATGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714564	716059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_714600_716100
804932	contig_10263_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_135855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914719	914172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_914200_914700
804936	contig_10324_pilon	-	691	3	Intergenic	novelGene_7847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCAGGCTTAGGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296552	287220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_287270_290726_290766_295949
804938	contig_16766_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_153354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAGGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120111	118026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_118000_120100
804939	contig_4315_pilon	-	2236	15	Intergenic	novelGene_46733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.039817275023	1	119	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	172	1611	162010	147905	FALSE	45	TTTTTGTAAATATATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIRLAASVTSISGDTGVIHVVEKEEDLQWVLTDGPNPPYMVLLEGKLFNRTIMEKLKGRTGRIAGLAVSLAKPRPPAGFSPSVPCPNDGFGVYSSSYGAEFAHCKDLPWNPLGDGLAYEDFHFPIFLLEDENETNVIKQCYRDHNLSPNGSAPAFPLCAMQLFSHMHAVISTVTCMRRSSIQSTFSINPEIVCDPLSDYNVWSMLKPINTSGTLEPDDRVVVAATRLDSRSFFWNVAPGAESAVASFVTQLAAAEALQKAPDVSALPRNVMFVFFQGETFDYIGSSRMVYDMEKGKFPVKLENIDSFVELGQVALRTSLELWLHTDPMSQKNESIRNQVEDLLTTLESSAAGVPAVLLRKLNQSQPLPPSSLQRFLRAHNISGVVLADHSAAFHNRYYQSVYDTAENINVSYPERLSPEEDLNFVTDTAEALAHVATVLGRALYQLAGGSTFINTIQADPQTVTRLLYGFLVRAVSY	163749	147279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_147922_150135_150167_150425_150522_150635_150739_152924_153098_153955_154034_154217_154323_154979_155133_155369_155480_155797_155949_156694_156841_157304_157427_157843_157968_161979_162089_163656
804940	contig_4857_pilon	+	1831	2	Intergenic	novelGene_48704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158701	1162065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1160091_1161623
804943	contig_3151_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_139181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTGAAAAAGAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42003	43357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_42000_43400
804944	contig_10339_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_125278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGACATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354071	353220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_353200_354100
804945	SIRV4	-	296	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1217	8	1217	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
804946	contig_5210_pilon	+	1042	5	Intergenic	novelGene_65423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGAGCACTGGCTGCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439114	444325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_439609_439773_439962_442676_442761_443011_443119_444156
804949	contig_13700_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_68273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTATTTTTCTATATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94025	94866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_94000_94900
804952	contig_9389_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_84010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	70	549	531648	532127	NA	50	CCGGAAAAGTATGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCTSGGLRCGAGLGGDLQTPLWPRERSHWLRTTQRGRGRCGQTIRFPGPHSKVQADMADVLFSRTTQRGWGRCGQTVHFPGPHSEVGADVGRQHVFQDHTMRSGQTWADGLSSSRWSVGPSGAQSVVAQGGTPWTRACVYCPGLGSLRSKTSKPYKYV	531578	532935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_531600_532900
804953	contig_5201_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_82168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAATCAAAGGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206052	205219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_205200_206100
804954	contig_13542_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_131554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCTGATTGAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617619	618582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_617600_618600
804956	contig_6102_pilon	+	438	2	Intergenic	novelGene_31800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360808
804957	contig_7272_pilon	-	560	6	Intergenic	novelGene_25417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	47.5335670868493	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	17	559	915864	886710	FALSE	30	TGGATGACATCGACGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPFKQMPYFGEKEIEMYQGAAQYENPPHIYALADNMYRNMIIDRENQCVIISGESGAGKTVAAKYIMSYVSRVSGGGPKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSPGGEPDGGKISNFLLEKSRVVMRNPGERSFHIFYQLIEGASAEQKHSLGITSMDYYYYLSLSGSYK	915880	886708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_886803_888272_888405_892139_892230_896374_896463_912460_912556_915819
804960	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	70	486	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
804961	SIRV4	-	516	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	101	0	101	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	732	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5057	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
804962	contig_8330_pilon	+	1920	9	Intergenic	novelGene_71863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.265910259006	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	205	675	923753	926109	TRUE	5	CTTGTGTTGAGGCTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGSWGPTAKWPYSWLAVTHWPRSQRTSHMQSCGWGPTPGGDAKILDNHISQKTLGQWIAENRDSLGSKVKDSFNGQLPFLFKVLSVKTALSIQAHPNKELAEKLHLQAPEHYPDANHKPEMAIALTSFQGLCGFRPVEEIVTFLNSKRCPSSSF	916037	930411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_916160_916221_916274_923722_923851_924644_924847_925609_925757_926085_926269_928093_928269_929180_929390_929709
804965	contig_11512_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_43329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCCTCAGTGAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546698	548565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_546700_548600
804968	contig_16310_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_70096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	957	1379	289250	289672	NA	65	AAGAAAAAGTTAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTYTHTHTHTHKREIAPGCNLRPLGPLLLSENKCLQWVGVGSLLCPVCETAETDQGHSTPTESVPGSVVNPYSDCHWVGGSESFPGWLRTAVWLTWSPIAFQVRKRMEMKMRRLMQLRANGQLKMMRWVLALGGGAIGS	288293	289936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_288300_289900
804969	contig_11338_pilon	-	2026	11	Intergenic	novelGene_6234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	104.702865290306	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1238	1906	13877	12549	FALSE	30	ACTTTTATTATGGAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21396	12428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_13964_14167_14528_14713_15095_15189_16641_17288_21286
804970	contig_13917_pilon	-	1829	2	Intergenic	novelGene_175615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1008	1358	229444	211070	FALSE	65	TACAGAGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDTVPKDEAPRLEGTQNTTGEELPPQSRVDLNDVDGVKLSRPSFADVARLKLRRNSCKHPLIIGTWNIQSMNLGKLEFIKNEMECININILGISELKWTGIGHSFLHSI	230451	210598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13917_pilon_-_211090_229113
804971	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
804972	contig_12842_pilon	+	2206	2	Intergenic	novelGene_168353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGCCAGACTGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223301	225966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_224746_225204
804973	contig_15066_pilon	+	1862	5	Intergenic	novelGene_149565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	11.5542200082913	218	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	9	1394	136867	139185	FALSE	40	AAATTTATTGTCATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAMDGAEMEGPLFLQSQRFGTKRWRKTWAVLYPASPHGVARLEFFDHKGSGSGGGRGGSRRLDCKVIRLAECVSVVPVAVESPPEPGAAAFRLDTLQRSHLLAADARSSAAWVQTLCRNAFPKGSWALAPPENPPKLSALEMLENSLYSPIGEGSQFWVTVQRTEAAERCGLQGSYVLRVEAERLTLSAVGTQSQKLEPLLSWPYTLLRRYGRDKVMFSFEAGRRCPSGPGTFTFQTAQGNDIFQAVETAICQQKAQAKASQGHDVRRADSHEEVAEGKVASPCGPQEHLGNPLSLYAEPLDSLRIPPGPSQDSLYSDPLNSTPRPAGEGAQLKKPLYWDLYEHAQQRLMKANLKDPKEDPIYDEPEGLAPAPPRGLYDLPQEPKDAWWCQARVKEEGYELPYNPATDDYAVPPPRSTKPLPAPKPQGLVFLEPGTETGSGSKGHSSNAALYSQVQKNGASGS	136858	139653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_136927_137271_137572_137707_137802_138019_138205_138438
804975	contig_13878_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_165744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384621	386738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_384600_386700
804976	contig_5229_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_117678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	5.8970764115858	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	232	1221	309525	268400	FALSE	30	CCTGCAGGCTTAAAGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPTRPPPLPDPQFVLRGTQSAVHALHFYRGTQGQGCPLLLSGSLSGLVHIWSLHTRRALTTLDGHGSQCVTWLQTLPHGHQLLSQGRDLRLCLWDLAEGRNAVVDSVRLESVGFCRSTVLAGAPPRWMVAMPGRGSDEVEILEMPSKTSVCTLKPEADAKPGMPMCLELWQQADSSPRPRLLAGYEDGSVALWDVSERKVCSRITCHTEPVMGLDFDSQKARGVSGSAEKVLAVWSLDEQQSLKVCRTHELTNPGIADVMIRPDRKLLATAGWDHRIRIFHWRTMKPLAVLDFHTATVHCVAFADDGLLAAGSGDRRISIWSLYQRT	346279	268047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_268652_284317_284537_289680_289780_294302_294466_308635_308762_309394_309547_345788_345884_346164
804977	contig_7909_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_155881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTGGCTATGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119071	117862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_117900_119100
804979	contig_18081_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_23831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGTCTTCTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419409	419880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_419400_419900
804980	contig_14522_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_147342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175807	174269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_174300_175800
804981	contig_12919_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_75880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	626	1881	23	1903	642753	640873	NA	20	TTCTGACTCATAGTGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDQEEKMVKQECIKVANQAHDTKISSEVDISKTCDKKDESSTAPLQDSTTASDLFEGEDVPNTHEGKSKTNRCAEYSFTSPSVPESNLRTRNANKRLHKRDSSENNSVGETSRTGTSDISLLSEKTLQTLECQHKRSKRVRRSKGCDCCGEKSQPQEKPSKNAENYDIKISETKKTDLQTAVAISETSKANLYSEVELSDEHHSVNFHSGLKEENDNDSSVVLETDLKENTIQESHPSEIVNFKEEICDMDSSEAVSLESQEPSNKEFGTVAPCLDDSKDVSQEEKPEATPKMEPCLENIVSFEVNSCKVKESNLGEIEVTELNLEGNKSETTFSEQENAQTDISEKETTEEKNEGSSDSEADTAEELNVKEAATEKFNSGCVHSGTTTPVKKSAQAEISDPTAVGEPDGGSDKCDPGSSEKVNVELENREEAVVGEVNAETDCFNVTEAGSMTTKTTKPEEAETERLNAEIDSCVPHILEMNTEEGRIDSNKTEKSIELNKSEETKLGDNQMLVDNYDETLEEAHHTSEKVEESPESLTSETAISELITEENLSPQKLRELDPCLVSANDSPSGVQTRCVWSPLASPSTSILKRGQKRPQEDEIPSPVNKVGGMRLNVNGPMFSWNIFAIQ	642775	640574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_640600_642800
804983	contig_2332_pilon	-	1492	11	Intergenic	novelGene_58655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	13.9860644929158	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	77	1195	330530	318116	FALSE	25	CTACTATTATCTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGRYVFSRESVISRALDPTKPKKGMSLRCGGAARTLRPQVFGRYLCSPVRTLSSLPDKKKEFLQNGPDLQDFLSGDLADKSTWDDYKGILKRQKGERLRLPPWLKTEIPIGKNYNKLKNTLRNLNLHTVCEEARCPNIGECWGGGEYATATATIMLMGDTCTRGCRFCSVKTARKPPPLDANEPFNTAKAIAEWGLDYVVLTSVDRDDMPDGGAEHFAKTVSHLKERNPKILVECLTPDFRGDLKAIEKVAVSGLDVYAHNVETVPELQRKVRDPRANFDQSLCVLKHAKEVRPDVISKTSIMLGLGENDEQVYATMKALREADVDCLTLGQYMQPTKRHLKVEEYITPEKFKYWEKVGNELGFLYTASGPLVRSSYKAGEFFLKNLVAKRKTKAL	330606	317818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_318169_320365_320478_321258_321330_322403_322550_324592_324722_325094_325153_325235_325393_326225_326307_327167_327262_329104_329278_330485
804984	contig_10618_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_170043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTATGGAATAATATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136989	135341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_-_135300_137000
804985	contig_10263_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_135862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984102	984732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_984100_984700
804987	contig_4469_pilon	+	2132	14	Intergenic	novelGene_21900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_12	100.740218959343	11	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1905	228	2132	415702	507835	FALSE	60	AATAAGAAGAAAGATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHAVVLELLQIPYEKAEDTKMQEIMRLAHEFLQNFCAGNQQNQALLHKHINLFLNPGILEAVTMQHIFMNNFQLCSEINERVVQHFVHCIETHGRNVQYIKFLQTIVKAEGKFIKKCQDMVMAELVNSGEDVLVFYNDRASFQTLIQMMRSERDRMDENSPLMYHIHLVELLAVCTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHEDCIPEVKIAYINFLNHCYVDTEVEMKEIYTSNHMWKLFENFLVDICRACNNTSDRKHADSILEKYVTEIVMSIVTTFFSSPFSDQSTTLQTRQPVFVQLLQGVFRVYHCNWLMPSQKASVESCIRVLSDVAKSRAIAIPVDLDSQVNNLFLKSHNIVQKTAMNWRLSVRNAARRDSVLAASRDYRNIIERLQDIVSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENTDARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEENEEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGEKGEALRQILVNRYYGNVRPSGRRESLTSFGNGPLSPGGPSKPGGGGGGSGSGSVSRGEMSLAEVQCHLDKEGASNLVIDLIMNASSDRVFHESILLAIALLEGGNTTIQHSFFCRLTEDKKSEKFFKVFYDRMKVAQQEIKATVTVNTSDLG	414650	507835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_414791_415614_415753_417867_417994_421055_421257_423552_423805_426386_426513_428316_428446_432995_433117_435295_435481_439771_439921_440840_440953_462579_462713_465134_465326_507706
804988	scaffold_9100_pilon	-	2592	2	Intergenic	novelGene_83239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACAGGCACGTGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592310	581035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_581204_589886
804989	contig_6710_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_90538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGATGGTGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
804990	contig_9633_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_139617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGTTCTGACTGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649277	649680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_649300_649700
804994	contig_14744_pilon	+	707	6	Intergenic	novelGene_66089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5260.8	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	141	455	1383156	1385854	TRUE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRNCRLKRRRRRKFLLLSQNQLVVTRMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTESDFPEAAGQWLATCDRTSVPQSSSSA	1383015	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383188_1383296_1383370_1384429_1384557_1385183_1385233_1385820_1385997_1386583
804997	contig_7361_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_163385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	149	355	308137	307931	NA	50	GAAAAAGAAAACATCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFVLHLAVPTGLSPSRLCFNWLLGLLSVRILPFVSVCLCHLRACLTSCCMSRVIGLDFSGMSLESLVLVSVFVLFYVCSANHFVRTSSALMFPSWYLCMLLYNFPTAKHSRFDIKKK	308285	307903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_307900_308300
805009	SIRV5	+	523	6	FSM	SIRV5A	SIRV507	533	6	10	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8729	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTAAGTGGTCAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	3598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1925_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
805016	contig_18363_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_157717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1104	1421	283626	283943	NA	70	GTAAGAAAGAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANFKPNRMAKLTNPINKVPHTLFAWPHPHRMPCILFTLLASYPIPLVGFKHLICIVPPSHLVGVTKTMARRAILSNSLHCRLEMSSLGKFISRIVNEEHFHNHI	282522	284578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_+_282500_284600
805017	contig_17880_pilon	-	1904	4	Intergenic	novelGene_167333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_2	6.64997911442	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	6	461	40708	35750	FALSE	10	GGGGCTTTCCTTCCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMKLSDPAQSDPEVRRAAVHCMANLCLSVPGQPYLDEPYQSICFQTFLTTLQSPKLSDMDDITFCMLLQNALKGIQSLLNSGKMKLTLAEELGALLAVLKKAMFHGLPGLNIEIPTVLYPTLLPQYDGRPPAKPQQSESCASRPTVVCHSYL	40713	34306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_35909_37047_37150_39669_39785_40628
805018	contig_8276_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_174478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTCGGGTTGGCAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145350	143032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_143000_145400
805019	contig_13112_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_98851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAATAGGAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775749	773766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_773800_775700
805023	contig_5799_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_50251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	738	1052	179948	179634	NA	50	AACAAAAAGCCAGAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIQFSVLCPNALEFLTFQSVRSFEIMMEAMSHFSKKHPHTQTLTCIFRAFPDPVKLIHAPRSRMLASEGDLTMIPPLLSFPVNMIIKKRTPPGQKQVTVRGC	180685	179569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_179600_180700
805024	contig_10494_pilon	+	1057	4	Intergenic	novelGene_102205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	75.9122300203773	62	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTGGAGTTTTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083259	1087195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083306_1085096_1085423_1086217_1086314_1086606
805029	SIRV6	+	434	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	351	515	178	75	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
805030	contig_19977_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_175618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAACCCCATGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40081	41782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19977_pilon_+_40100_41800
805033	contig_3103_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_146179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTCCTAGGTATATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25711	24124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_24100_25700
805034	contig_3956_pilon	+	1355	3	Intergenic	novelGene_14698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_1	6	45	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	87	557	12062	40654	FALSE	55	TACAACTCAATAATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETEENRLRCSRTPEPDIRLRKGHQLDDKRRIDNDNHQGDLEPILEAAVLSSHHKKSSEEHECNDEASQEDERFMGMSPLLQAHHAMERMEEFVCKVWEGRWRVIPHDVLPDWLKDNDFLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGI	11975	41452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_12233_35907_36028_40474
805036	contig_16724_pilon	-	1163	5	Intergenic	novelGene_105311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	830.855733566303	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGTCAACCAAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567656	541155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547996_560935_561029_567595
805037	contig_9945_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_104806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAATCAATACTGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45005	43050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_43000_45000
805043	contig_2027_pilon	+	441	4	Intergenic	novelGene_39880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	21.2759645296439	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	252	188	439	58584	89458	FALSE	25	GCACAGGCACAGCCCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAAGRGDVGEPSLDSPDREESLQEASPRLADHGGSSGGGWEVKRSQRLRRGPSSPRRSYQDMEYERRGGRGDRTGRYGATDRSQDDGGENRSRDHDYRDMDYRSYPREYGNQEGKHDYDDSSEEQSAEDSYEASPGSETQRRRRR	56614	89460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_56677_58458_58601_87683_87868_89407
805045	contig_14219_pilon	-	1761	3	Intergenic	novelGene_54300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_1	71	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGCAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633950	627803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_628672_632777_632922_633201
805046	contig_7057_pilon	+	582	3	Intergenic	novelGene_123243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	296.5	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539896	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_541177
805047	contig_12379_pilon	-	1174	2	Intergenic	novelGene_148936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCACGCAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200200	197872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_198165_199318
805048	contig_7157_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_131263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	13.1402688962847	3537	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	29	397	88955	92988	FALSE	10	TGCTTCTCTGTCTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVTSPHLEMAPQKDKKAKRSTWKFNLDLTHPVEDGIFDSGNFEQFLRGKVKVNGKTGNLGNVVHIERSKNKITVVSEKQFSKRYLKYLTKKYLKKNNLRDWLRVVASDKETYELRYFQISQDEDGSESED	88926	93104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_88964_90914_91008_91172_91295_92843
805049	contig_5210_pilon	-	964	4	Intergenic	novelGene_65432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_1	25.381533094402	577	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	304	672	474776	470588	FALSE	15	CTCTCTGATATCTTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAMDPNKAVPLRKRKVHAMEVDVETTKELVRKPYVLNDLEAEASLPEKKGNTLSRDLIDYVCYMVENHGEDYKAMARDEKNYYQDTPKQIRNKINVYKRFYPAEWQAFIDSLQKNKMEVQ	475079	470295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_470732_471333_471441_472753_472821_474725
805050	contig_6589_pilon	+	461	7	Intergenic	novelGene_26116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_4	2566.73851089926	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	19	459	1876599	1880189	FALSE	25	GTACCAGGCGGTGACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGW	1876580	1880191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150
805051	contig_12485_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_147273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACACCGGTTGGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58285	58903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_58300_58900
805052	contig_6102_pilon	-	1536	2	Intergenic	novelGene_32106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	0	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTTAAATATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818515	816570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_816861_817269
805053	contig_12496_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_170714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAGAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323478	325685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_323500_325700
805057	contig_5316_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_61255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCACTGAAGAAAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510869	511736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_510900_511700
805061	contig_7744_pilon	-	898	7	Intergenic	novelGene_62491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCATTTTCCGCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675234	670993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_671085_671775_671896_673752_673826_674032_674105_674198_674316_674590_674692_674910
805062	contig_4982_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_172225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGCGACAAAATATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18446	16906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_16900_18400
805064	contig_14727_pilon	-	2232	3	Intergenic	novelGene_56635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1534	1875	163241	162900	TRUE	35	AGTTTTCCATGCACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRDPEHTLLIIFPNQPWIHVAVDLFDEPLPQPPPAVPVTHPWKEDSTFCDVNNIVSFSTMTHGLLSQRLLSGKSEGGDRGGGLGGKPPAPGTQGETCCEKTVLASQAESQE	171354	159554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_159662_162649_163288_169867
805065	contig_15304_pilon	-	459	2	Intergenic	novelGene_30548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	194	424	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54293	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53100_54044
805066	contig_5229_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_117703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	9	638	581989	597095	FALSE	25	TGCATGAACTCTTTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGKEGGTWLGISTRGKLAALTNYLQPRLDRDARGRGGLVTHFLTTDIDSLSYLKKVSMEGHLYNGFNLIHTCFGQWIFALVKMTGENFCLKVALPPGHAGHMRDSIFDNQTCSERGDLGHVWSEASGRKTQEKPTLNNSTAWLGDPPALCALGGPVCSRWFRVLWAVLCVPAVPCALDSPVCALAVPRTPLQPLTQASCCSSRGCVF	581980	598106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_582101_582738_582840_596678
805067	contig_6279_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_164772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116276	117521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_116300_117500
805068	SIRV6	+	188	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	541	54	541	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10778	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
805069	contig_5945_pilon	-	1453	7	Intergenic	novelGene_104553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	356.636330485583	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	447	788	225769	219523	TRUE	15	GACTGTGCCTTCGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249754	215587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216240_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235613_235755_249559
805071	contig_9571_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_136290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCTCAATAAATTTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500838	500164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_500200_500800
805072	SIRV4	-	344	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	25	248	25	-248	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACGGCGGTATCGGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5133	3885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805074	contig_2894_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_86559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTAGTGATTAGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325697	326599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_325700_326600
805075	contig_2894_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_86560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGTAATTTTAGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326599	327048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_326600_327000
805076	contig_10861_pilon	-	1256	10	Intergenic	novelGene_39421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	123.375168079989	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	37	1029	2226766	2202111	FALSE	35	GACACTTTCCCCATAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAFQSRLPHDRMTSQEAACFPDIISGPQQTQKVFLFIRNRTLQLWLDNPKIQLTFEATLQQLEAPYNSDTVLVHRVHSYLERHGLINFGIYKRIKPLPTKKTGKVIIIGSGVSGLAAARQLQSFGMDVTLLEARDRVGGRVATFRKGNYVADLGAMVVTGLGGNPMAVVSKQVNMELAKIKQKCPLYEANGQAVPKEKDEMVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNVLNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVNLKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAETQGKLEEKLQELEANPPR	2226802	2201883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2202189_2202978_2203114_2208661_2208753_2209068_2209212_2218122_2218218_2219415_2219498_2222263_2222371_2223158_2223252_2223883_2223963_2226676
805077	contig_8538_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_4707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAAGATCAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
805080	contig_10196_pilon	+	982	4	Intergenic	novelGene_132107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	326	700	925908	926282	FALSE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGQAGGSSWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	922241	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925787_925869
805081	SIRV6	+	220	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9650	567	500	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
805083	SIRV2	-	564	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	122	0	122	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5773	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
805084	contig_15732_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_88852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22734	21348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_21300_22700
805085	contig_12429_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_136214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCTCCCAGGTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303459	303171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_303200_303500
805086	SIRV7	-	287	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91639	0	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
805088	contig_12057_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_131620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTGATGGTAAACATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20749	19679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_19700_20700
805089	contig_4732_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_75394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_2	176.5	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	523913	523596	TRUE	10	GCTTCTGTTTTCACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSRTEDGVCHSLHPAVEELDIWGSRGGQGRAGGAVGSVVPRPAPATHLPPAPLSLRSLERRCLQAEIFGPGFFQGRNRHSAQGLLGPPNSWPLQPGLARPTPTP	523914	516590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_516777_519120_519271_523305
805092	contig_5671_pilon	+	827	4	Intergenic	novelGene_79420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4559	junction_3	639.178118106891	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	118	489	370430	392984	FALSE	35	CTTTAAAATGACATCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKVCLHTLCVYICKIVRSCCIFT	368807	393322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775
805094	contig_3861_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_57894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTTAAAAATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143406	144325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_143400_144300
805095	contig_11378_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_112229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCTACATTCTTCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307770	305464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_305500_307800
805097	contig_8019_pilon	+	1452	4	Intergenic	novelGene_126990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	11.7756811551038	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	327	533	195310	215202	FALSE	10	ATATGTGCTTTGTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DECKKVQEELSHLQQELKIKQRLSQIFSQKLVEYKYFWNKTLLFLTSTKRELSSIKNEVYDNFQNWTSLKEEVFLQIKSISETALTEIATLNNSLTVSQRNKVCLEEEMKNLKLLSDAAILRSQQIHTSDQQEVNLHTRCYDLQKEVLDLQGQVEALGLKLQKAVTERDNYKEMCT	152468	216121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_152554_170553_170730_195244_195431_215116
805098	SIRV4	-	459	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
805100	contig_10437_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_38243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371021	369736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_369700_371000
805103	contig_11448_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_66450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704894	703554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_703600_704900
805105	contig_6418_pilon	+	1961	3	Intergenic	novelGene_81137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCAGAGCAGCTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158485	166260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_159937_164830_165006_165925
805106	contig_5200_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_140168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCTAGGGTTTTACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409500	410077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_409500_410100
805108	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_95766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
805112	contig_10732_pilon	-	1329	4	Intergenic	novelGene_114750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	290.280707055927	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1	717	574364	573109	FALSE	10	CACGGTCTCCTTCCATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGAPGPSRRSQTSPTRSASCLAPAGEPSAILGAPKCLVQKGASLLPTHSLLKGIF	574364	572496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573274_573332_573510_573617_573758_574129
805114	contig_6364_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_51815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	204	512	1533849	1533541	NA	65	ATTACTCAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIYPGVWQSADFARTELVLNTPPNSPFFKKMRTKDIGQLPIKQDNVTKLRLPPAHACFSWPSQRAEGLNRNNQPSIFSTITQVVVASGLTGRRVKKNLSSL	1534052	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1533300_1534100
805116	contig_5649_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_82478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654032	1655914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1654000_1655900
805118	contig_5574_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_155835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGCTGATTCTGACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101893	103910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_101900_103900
805120	contig_2342_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_132766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTAGCAGCCAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447487	447972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_447500_448000
805122	contig_11227_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_163185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAAAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151233	151955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_151200_152000
805123	SIRV5	+	264	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	255	149	141	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8456	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
805124	contig_6241_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_156442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTACATATTATAATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356063	357689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_356100_357700
805125	contig_1339_pilon	-	1112	3	Intergenic	novelGene_163112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	7.5	276	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1	426	260106	259360	FALSE	15	GCTGGTGCTGCAGGCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATRDPSTSVPATRAQQPPRDHRGGEESSALGATPKPERPAPPAASDAQWLHSGWACGPGLPVTAWSWWWRAVVAIAPILPWTWPGVGAGPGPGPPPHPHPINPHPHSLSGLPGAGARGRPPTPSQFALKIDGALPPRIKI	260106	258673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_259600_259842_259915_259992
805126	contig_10074_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_57101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGAAAAAAGAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205350	205679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_205400_205700
805128	contig_9937_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_129225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTTGAATTGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280798	280525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_280500_280800
805129	contig_6217_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_109646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGACATCTTCTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717263	715750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_715800_717300
805130	contig_15182_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_136459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530501	532607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_530500_532600
805131	SIRV6	+	423	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	108	0	-79	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	65	304	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2393	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
805132	contig_2487_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_148463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGCTTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136580	136045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_136000_136600
805136	contig_6710_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_97810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	TCATACTAATATTTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
805137	contig_8415_pilon	+	1780	13	Intergenic	novelGene_141691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	29.1417750927351	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	11	616	231693	246314	TRUE	60	AAGGGAAAGAAAAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAMLDFAIFAVTFLLALVGAVLYLYPASRQAAGIPGITPTEETDGNLPDIVNSGSLHEFLVNLHERYGSVVSFWFGRHLVVSLGTVDVLKQHINPNKTSDPFETMLKSLLRYQAGSGGASENHMRKKLYENGVTNSLQSNFAVLLKLSEELLAKWLSYPESQHVPLCQHMLGFAMKSVTQMVMGSTFEDDQEVIRFQKNHGLV	231682	261602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_231765_237871_237922_238826_238994_241140_241284_244869_245033_246303_246383_249579_249669_250504_250573_253232_253344_255464_255577_256798_256864_260793_260884_261041
805138	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
805139	contig_4732_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_75458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTCATCTGCCATGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678273	677775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_677800_678300
805140	contig_20951_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_43108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1744	2118	131964	132338	NA	50	TTTTTTTTTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGEGPSPLELLGSTGLREPHVSIPLPLLLRRPGVKLSGRGETLVLRWSENGVQPAFVKFKVLGEWSGLSESHLPCVLGGGRGVVKITLTAAICRSAMEQQRDSEDLCSVSVMVLPPRSFQKR	130220	132436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_130200_132400
805142	contig_7919_pilon	+	1876	3	Intergenic	novelGene_28030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAATTTCTATTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160155	173143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_161865_167575_167662_173062
805143	contig_12958_pilon	-	1043	4	Intergenic	novelGene_136197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_3	14.3836326735943	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	10	678	70628	63086	FALSE	25	GTAATATGTTTCACGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVTMASRPIMTAPICLVENQKEQLTVNPKALKILNEIYQPVVVVAVVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGISAWLGEGRFSRG	70637	62720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_63327_63529_63640_65624_65753_70438
805144	SIRV1	-	154	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3654	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
805145	contig_4364_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_3585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533048	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
805147	contig_5916_pilon	-	1232	7	Intergenic	novelGene_158068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	29.7643522803146	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	291	1232	750913	737197	FALSE	25	GTGGGCAGATGAGAGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARFCQRRARGAQGTRSPPELRPRAQAPGRVALVLRSTPPAAAATRLPPPASRVRSTALLSSPCEWDWHPNHTSRYEFSPRQRPVLVDSLPHQAHGMEELIWEQYTVTLQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLQGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMEDVLHSFAVQQLRKSGKIAVIVVKRPRKVQLAPLQNSPPVDHNDRGFEVMDEFDGRSARSGYSERSWHGSHDGRSRSWDESPDRGHPHDRARSRERLHSRDRSRGRSLERGLDHDYGRARDGSRGRSIDREGSYERNYDQTYDRAYSPSGEYSYGAQADARYEVSRSRSREHLHSRSLSPELRGRPAHDSQQDSARPIGVLLTKSKANEEYGLRLGSQIFIKEMTRTGLATKDGNLHEGDIILK	843898	737196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_737301_743264_743830_746387_746491_748094_748220_750868_750923_811731_811853_843738
805148	contig_3424_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_55557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAAATACGATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387451	386491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_386500_387500
805149	contig_6199_pilon	+	1254	4	Intergenic	novelGene_126387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	147.691119119149	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	15	479	461129	513685	FALSE	25	CCAGCCGGAAGACACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRSKMAASRRLMKELEEIRKCGMKNFRNIQVDEANLLTWQGLIVPDNPPYDKGAFRIEINFPAEYPFKPPKITFKTKIYHPNIDEKGQVCLPVISAENWKPATKTDQVIQSLIALVNDPQPEHPLRADLAEEYSKDRKKFCKNAEEFTKKYGEKRPVD	461114	514460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_461156_478402_478499_501226_501414_513530
805150	contig_9375_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_136054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGAACCAAGTGGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200611	198712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_198700_200600
805153	contig_6270_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_99840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246753	248743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_246800_248700
805154	contig_14443_pilon	-	876	3	Intergenic	novelGene_126666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	902	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTGGCCATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39458	29092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_37689_37863_39371
805155	contig_776_pilon	+	1735	1	Intergenic	novelGene_139957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189403	1191138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1189400_1191100
805156	contig_10434_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_82025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126194	125425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_125400_126200
805161	contig_5337_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_136569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATAACTTCTTTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363138	363406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_+_363100_363400
805162	contig_10792_pilon	-	1923	12	Intergenic	novelGene_160999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	30.8381538931433	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	176	1768	219828	60660	FALSE	55	AGAAAAATTGTCAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAIIENMSTKKLCIVGGILLVFQIIAFLVGGLIAPGPTTAVSYMSVKCVDTHKNHHKTKWLMPWGPNKCDKIRDFNEAITKEIQANDIVFSVHIPLPSMEMSPWFQFMLFILQLDIAFKLNNQIRENAEVSMDVSLAYRDDMFAEWTEMAHERVPRKLKCTFTSPKTPEHEGRYYECDVLPFMEIGSVAHKYYLLNIRLPVNEKKKINVGIGEIKDIRLVGIHQNGGFTKVWFAMKTFLTPSIFIIMVWYWRRITMMSRPPVLLEKVIFALGISMTFINIPVEWFSIGFDWTWMLLFGDIRQGIFYAMLLSFWIIFCGEHMMDQHERNHIAGYWKQVGPIAVGSFCLFIFDMCERGVQLTNPFYSIWTTDVGTELAMAFIIVAGICLCLYFLFLCFMVFQVFRNISGKQSSLPAMNRVRRLHYEGLIFRFKFLMLITLACAAMTVIFFIVSQVTEGHWKWGGVTVQVNSAFFTGIYGMWNLYVFALMFLYAPSHKNYGEDQSNGMQLPCKLKEDCTLFWNFPKNCSPL	220003	60504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_60737_102219_102374_111253_111338_112633_112778_114739_114804_115152_115251_116733_116903_120172_120310_121596_121759_128375_128501_172883_173157_219722
805164	contig_266_pilon	-	1536	5	Intergenic	novelGene_166292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	13.5462171841441	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	64	1212	147399	130728	FALSE	20	TCTAAAGTTTACTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRGVRVVELAGLAPGPFCGMILADFGAQVMRVDRLGSRGDISHLGRGKRSIAVDLKRPRGAAVLRRLCAGVDVVLEPFRSGVMEKLQLGPEILQQVNPKLIYARLSGFGQTGRFSGVAGHDINYLALSGVLSKIGRSGENPYAPLNLLADFGGGSLVCALGIMMALFERTRTGKGQVIDANMVEGTAYLSSFLWKTHKVGLWEQPRGQNLLDGGAPFYTTYRTADGEFMAVGALEPQFYELLIKGLGLNSAELPNQMSMADWPEMKKKFALAFAKKTKAEWCQIFEGTDACVTPVLTFEEVAHHDHHKERGSFITDEEQGVSPRPAPLLSSTPATPSFRRDPFVGEHTEDILKEFGFSQEEIDQLNSDKIIEIHELRANL	147462	130403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_131138_135446_135634_141380_141542_143946_144091_147152
805165	contig_7398_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_166153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	410	772	78718	79080	NA	65	AAAATATTATTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVGAVEWVSSPPCSEEVRTDEGQQQPASRLEPGEERTPQPGTGRNDRNRFHGSPFLGREFIFAFFFFFFLVYSAVGSCKMNFFIQPIRTLMFGRLLFQFQNLTRKIKTSILSSHSALF	78308	79831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_78300_79800
805168	contig_15897_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_49539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGCATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614576	612004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_612000_614600
805171	contig_18072_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_173568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATACTTGATCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232379	231350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18072_pilon_-_231400_232400
805174	contig_19269_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_175633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGATATACTTAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19265	18971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_-_19000_19300
805178	SIRV6	+	478	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	357	21	184	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCTTGAAGCAATCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
805182	contig_7697_pilon	-	324	2	Intergenic	novelGene_128277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	99	323	173721	173497	FALSE	25	GTAAATTTGTCTCTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLEHNPLSLIGWIYTPPFRLVNQPIPASSCDMSLPKSLACRLTCRFWICQPHNHVSRQRPSPCCLTYRLWIPQPLQSCEPAEVFSLSPDPRILTCQPLQLHEPFP	174049	173495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_173732_173961
805183	contig_7775_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_37511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAGGAAATAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333984	332222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_332200_334000
805185	contig_4305_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_136703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTATGCCAGACATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732073	730007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_730000_732100
805186	contig_6589_pilon	+	1250	5	Intergenic	novelGene_25700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	489	686	179302	179861	TRUE	25	TTCCTCAGAGAGGACGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEREGGPLVSRAVGRAVDPPLPLFKVHCAVGWRCKLGGEGNQECWERSEVGNCDPSALPGRLAGQGGSLPGCCPSSPQRLRAGRATRQAPRPSETPSHPRRRKGRQHPFVGGCGAGWQAPHSWTSQISDSRGGSFLSWSRRAKTCSECTELSVRRLTSFISMRGKRSCSYLWPLDARVGEQRLHIGLLQCLHTAGLLHVGPVSREDVDGNEEGILSIVQAQPPHGP	178813	185509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_179322_179683_179902_183729_183828_184901_185082_185263
805188	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
805189	contig_9705_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_41707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCAGTTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101086	101435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_101100_101400
805195	SIRV6	+	295	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10530	1	1293	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11530	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
805198	contig_3948_pilon	-	1874	3	Intergenic	novelGene_53407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	301	432	1883942	1883811	FALSE	50	GTAATAGCTCATAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAEQRQLRAFRIGGTLTGSQSPGACGKEIEPSDLISLCLQSQSVPAARTAGRGRLFPGSGLQGAVLHRPAGSVLQDINREPPQGLPPPTARSPEGRTSRQMFCVTTSPHIWGLEFPQGRGWGRAGKNRGLHSPNAFPWEALKR	1888343	1882368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1884095_1884168_1884277_1888303
805199	contig_7571_pilon	+	1751	4	Intergenic	novelGene_106408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	18.8325958557674	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	79	456	323822	334240	FALSE	30	AAGGACTGGCTCTTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLKARISKQWADIGFQGDDPKTDFRGMGILGLINLVYFSENYTTVAHQILSRSNHPKLGYSYAIVGINLTEMAYSLLKSEALKFYLYNFVPGIPTMEHFHQFYCYLVYEFDKFWFEEKPESIMYFNLYREKFHEKIKRLLLDSNVALTLKI	323743	335535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_323851_326685_326755_327490_327625_334094
805200	contig_6946_pilon	+	1421	6	Intergenic	novelGene_59747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	15.6384142418597	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1401	19	1419	1729	45898	FALSE	30	AGGTGAGAGTGTAATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVDKLDMFRNMPDILHHLTTDRSTQIHACRHPKAEEYFQWNKLPCGITSKNRIPLHTISIKPSTIWFGERTRKTHVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYIRPMNAYANVIPVGTTMDKVTEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTAHLDSEEEDDDLFDDPPPVPLRHKVPNQETLHPEVFSMTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYLYEKLA	1710	45900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_28232_28288_35894_35984_38551_38647_44954
805201	contig_14322_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_116609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGACATTGTTAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678994	679836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_679000_679800
805206	contig_8122_pilon	+	2680	13	Intergenic	novelGene_40215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	17.475975572832	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	193	1773	384937	406538	TRUE	35	GCTTAATAAAAATGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLTDRQTISKESLSHALVHSSPEKANDTQLDCPEEVLWTTRADGQVRLRIDPSCPQPPYTVHQMFYQALDKYGNLSALGFKRQGKWERISYFQYYLLSRKAAKGFLKLGLERAHSVAILGFNSPEWFFSAVGTVFAGGIVTGIYTTISPEACQFIAHDCRANVIVVDTQKQLEKILKIWKHLPHLKAVVIYQEALPKKMANVYTMEEFMELGNELPEEALDTIISAQQPNQCCVLVYTSGTTGSPKGVMLSQDNITWTARYSSQAGDIHPAEIQQEVVVSYLPLSHIAAQIYDLWTGIQWGAQVCFAEPDALKGSLVNTLQEVEPTSHMGVPRVWEKIMERIQEVAAQSGFIRRKMLLWAMSVTLEQNLSCPGSDLKPFMTRLADYLVLAKVRQALGFAKCQKSFYGAAPMTTETQHFFLGLNIRFYAGYGLSETSGPHFMSSPYNYRLYSSGKVVPGCRVKLVNEDAEGIGEICLWGRTVFMGYLNMEDKTCEAIDADGWLHTGDAGRLDADGFLYITGRLKELIITAGGENVPPVPIEEAVKMEVPIISNAMLIGDQRKFLSMLLTLKSSQTSAIRPPQRPELGSSD	372463	408981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_372567_384847_385069_385515_385605_385968_386090_397038_397120_397208_397359_397709_397887_398618_398801_399768_400000_400769_400988_405891_406032_406478_406818_408353
805207	contig_312_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_128323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAGAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572770	575215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_572800_575200
805211	SIRV2	-	474	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	45	3213	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
805212	contig_7286_pilon	-	510	4	Intergenic	novelGene_108707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3079.69883087436	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	361	408	287038	286991	FALSE	20	ATTGATTAATTGCCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWSQEAPEACSSSKALDAGQTDWCVYVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGQQTMDLSSPRKRYPPHHC	292101	286888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_289249_289422_290758_290857_292022
805214	contig_6589_pilon	+	968	6	Intergenic	novelGene_26066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.7652958811576	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	190	891	1757003	1763824	FALSE	20	GCAGCACTATTTCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQSPTIVTGFHFESWDQKSPWTAGGVRESVDLTVGWHRGETQRTARSVGEGLSRRSSLPFRPEMWRPLVLLLLLPSILVPPSTAAPIRDGDFQESSSGLLGLQSLLQGFSRLFLKDDLLRGMDSFFSAPMDFRGLPRNYHQEENQERRLGNNTLSSHRQIDKMTDNNTGEVLISEKVVASIEPAEGSFEGDWKVPKMKEKEALVPVQKAVDDFHVEPRPRVAFWIMKLPRRRSHQDTQEGNHWLSEKRHRLQAIRDGLREGTHEDLLHEGPQGSLHPRLPARKAHFLYILRPSQQL	1756318	1763901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1756373_1756615_1756732_1756983_1757159_1757897_1758039_1758165_1758259_1763512
805215	contig_11136_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_169016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	19	372	127904	128257	NA	5	GCTGCTGTCAGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKSKAKAQSKAEAPAKASTQVLAPGQAPKGTQAPTKASE	127885	128363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_127900_128400
805216	contig_5279_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_105576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGTTAGCTTCTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399508	400225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_399500_400200
805217	contig_16869_pilon	-	1373	8	Intergenic	novelGene_137591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	85.959173982983	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	504	1271	79386	51916	FALSE	25	GGCCCAAATGAGTAGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRGVYLSSI	84013	51813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_82132_82316_83855
805221	contig_14754_pilon	+	1744	3	Intergenic	novelGene_174849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	3.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	93	899	151457	153107	FALSE	70	ATTAAAAAAAAAAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKANLKKEIISQFHCSAAEGDIAKLTAILSHSPSLLNETSENGWTALMYAARNGHPEVVQLLLEKGCDRSIVNKSKQTALDIAKFWGYKHIANLLANAKGGKKPWFLTNEVEECENYFSRTLLDRKSEKRNNSDWLLAKESHPATVYILFSDLNPLVTLGGNKESFQQPEVRLCQLNYTDVKGYLAQPEKITLIFLGVELEMKKELLSYAEEVPKEEEDGLVAWFALGIGQIAAEEFKQRHENCYFLHPPMPALLQLKEKEAGKK	148605	153952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14754_pilon_+_148692_151450_151663_152506
805223	SIRV4	-	240	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	9	368	9	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5149	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805224	contig_7887_pilon	+	649	2	Intergenic	novelGene_124926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCCACCATATCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575199	578590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_575232_577973
805225	contig_10424_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_56787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACCAGAGAGTCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37413	36486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_36500_37400
805230	contig_7066_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_42118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	688	1020	584436	584104	NA	60	TACCTTGATAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQLQGEGLGRLEQWFSKCGPHTGSLLQVQIFELQFRHVDLETLGVGLVMGVGLVMCAFTSLTMGSVRTTAVEEDNRSRSVLFPHEGKQQKKQLRTEKVWPWREDEETAF	585123	584058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_584100_585100
805234	contig_6270_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_99837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCAGATTTAAAAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221482	219309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_219300_221500
805235	contig_3942_pilon	+	664	3	Intergenic	novelGene_128779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	12810	junction_1	1165.5	6	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	259	570	793767	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSPSLCPGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793508	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793882_795075_795179_795313
805236	contig_13565_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_162387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCTCTTTTTGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166952	165613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_165600_167000
805237	contig_9463_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_83837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211567	212038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_211600_212000
805238	contig_1239_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_150396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAAATGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161779	159686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_159700_161800
805239	contig_3004_pilon	+	1730	14	Intergenic	novelGene_127490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_10	190.945978915256	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	105	884	277854	281328	TRUE	15	AGCCTGTAGTTTTGGCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275528	287259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105_284156_284376_284415_285297_285349_285713_285751_286379_286451_286738_286875_287113
805240	contig_6227_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_49662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	973	1728	469303	470058	NA	40	AGAGTCATCAGAGACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRPPCLAQDGASVLLILTSLSLEHGWVQPRPRGSVHESKTPQRRGRAGTRWALPHTLAKVNKRRNLQLGTLPTHGPQGRRRPDEETEAVRLPACLAAWEGWLAHCRGRRKPGTKNVLRVQAGLLLCPLPSRGAKSGGGGREGQVGRAESSRLGLQWFPARDVAQPPPPPLPRSWGKHQRYAECPSLSPRGCLLFPGHGDSWATLSPLPHMRLDGAAGLAGLDVSTKPTPGGDPKKMGQEPGLASQPNRIR	468330	470286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_468300_470300
805242	contig_16761_pilon	+	1091	8	Intergenic	novelGene_146895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	82.5113473952498	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	166	717	25740	63217	FALSE	15	TATGTGAACGCCTCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSFSLCRPPRHGLEAPKTGPRVRVRARPRGGRPAHGQGVVLERSIFSDFVFLEAMYNQGYIRKQCVNHYREVKKITASEYLPPHVVIYVDVPVPEIQSRIQKKGDPHEMKITSAYLQDVENAYKKTFLPEMSENCEVLQYSAWEAQDAEKVVEDIGYVKLEKGPWLKQDDRTFYHLRMLVQNKLKVLNYTTIPVYLPEVTIGAHQSDRVFHRFRELPGRRYEPGYNADVGDTWIWLK	17790	63591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_17900_25683_25771_26902_27025_30882_30963_38402_38458_39772_39859_47080_47190_63148
805244	contig_13224_pilon	+	1553	6	Intergenic	novelGene_104112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	41.9733248623456	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	117	566	291364	299359	TRUE	30	TTCATGAGAAACTATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYRLLSIVRQQRVSPGWQNWPSARSSTSAAEAHSIALPAQAQVVICGGGIMGTSVAYHLSKLGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLCHQLEQETGIQTGYVRTGSISLAQTQDRLISLKRINSRLKYV	283561	302647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_283616_291301_291588_293361_293496_299267_299608_300338_300461_302030
805245	contig_13547_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_104879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92524	94302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_92500_94300
805246	contig_11375_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_152652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127509	125418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_125400_127500
805249	contig_10988_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_104740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAGATGAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310323	311729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_310300_311700
805250	contig_15691_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_60788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTGATTGACCCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186796	183923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_184196_186770
805251	contig_15691_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_60787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTACTTACTGCTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183269	182789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_182800_183300
805252	contig_8019_pilon	+	1260	9	Intergenic	novelGene_126978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	16.6132477258361	79	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	318	1085	195310	242466	FALSE	25	TACCACAGACTTATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLKLLSDAAILRSQQIHTSDQQEVNLHTRCYDLQKEVLDLQGQVEALGLKLQKAVTERDNYKEMCTNKSNEADDCQRKLRKLKFESIVSESRHTRLLKEKEESLMACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKTPPECLLLEQQRDLSCLCLCRSCPSLHSHPARGFQILLTGEEVSVFRSCSSTPAHRGLVLRC	91593	242641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_195244_195431_215116_215199_231345_231424_231758_231963_240500_240595_242277
805253	contig_12540_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_148081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCCTGCTTTTTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927903	928319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_927900_928300
805254	contig_8558_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_123170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAAGATATTGTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586902	588338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_586900_588300
805257	contig_12201_pilon	+	1518	5	Intergenic	novelGene_159981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTTTTTAAAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110384	125353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_110528_117211_117320_120742_120914_122308_122381_124329
805258	contig_7045_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_77482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536605	537925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_536600_537900
805259	contig_10803_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_170121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	47	301	81777	81523	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPGGGRGGGTGEIGMRPGASLLIHSGDLGSLKRLKKPKLTDFKLILTHSNLIGQIRMAYGVSKAVNLYRSRLPHLSPAEWLVGSNCQTTDLLVSSQVF	81823	80157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_80200_81800
805260	contig_5210_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_65440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	73.2340236653854	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	240	932	611037	616751	FALSE	40	ATATGAGTCATTTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSFEEKYGRAHPVFYQGTYSQALNDAKRELRFLLVYLHGDDHQDSDEFCRNTLCAPEVISLINTRMLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRVTDLVLTPCNLQPAGILPSWSFLKCERKNKKLE	565729	616753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565827_591290_591360_610963_611103_613063_613150_613245_613338_614670_614849_616480
805261	contig_7452_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_109150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTATATTGATGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133288	134033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_133300_134000
805263	contig_7720_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_155786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811126	810114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_810100_811100
805264	contig_4295_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_169979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCAAGCTGCACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101075	99943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_-_99900_101100
805265	contig_13206_pilon	+	1852	1	Intergenic	novelGene_161900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	908	1207	155423	155722	NA	15	TCTTAATTTTCTTTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNRTKTLPISALSSQSLLCLSPLLQPLCQFISLKVFSFLLTLYFTKHDVLLQGLITPDKTGMKSSLSLLSFVTCSFGVIFKKTIAKSKIMNICRCVFF	154515	156367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_154500_156400
805266	contig_9833_pilon	-	759	2	Intergenic	novelGene_68550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGTGGATCCCTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235099	233427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_233872_234784
805268	contig_15165_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_145325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243744	244408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_243700_244400
805269	contig_6710_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_97862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
805270	contig_9345_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_24458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	184	297	466906	467019	NA	55	AAAAGGCAGAAGGAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATGSQCPQGYSHSLSLLLPGGSQCRDPGSKGYAGSQLIFLGGGRILLLASQVAHFKPSGMAKLTNSFGGPQLPYHTVSPNHLGGSYKTMGKKCLSK	466722	467906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_466700_467900
805272	contig_9273_pilon	+	1037	2	Intergenic	novelGene_171825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	525	863	52753	53892	FALSE	20	GTCTTGATTTATTATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIIGNKHKVICCFFLNSDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV	52228	54066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9273_pilon_+_53002_53802
805273	contig_6710_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_95724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
805274	contig_11115_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_102861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.5717947266145	330	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	21	515	173602	186858	FALSE	35	AAGAAAGCAAGGCTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGFTKMAADVSVTHRPPLSPEAEAEAGDASERRVPEEELPPLDPEEIRKRLEHTERQFRNRRKILIREPALGPHGPSRLKMSPPPSGFGDRSGGGAPLSLLFGLTHFLLRQRPAGWPQAEPPQQGGWLLSAGLRRRAPGPKPRAQWPQPPAEDPTGWPETQLCPPAALA	173581	188142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_173784_185597_185641_186134_186268_186633_186718_186805
805278	contig_13004_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_112651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGATTGGGTATACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449349	450120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_449300_450100
805283	contig_17796_pilon	-	2053	2	Intergenic	novelGene_33783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTGTTTATGATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42663	39254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_40953_42308
805284	contig_13744_pilon	-	1189	6	Intergenic	novelGene_77150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAGGTATAAAAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159634	144005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_144555_145168_145314_146731_146857_147390_147526_157665_157798_159531
805287	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	487	60	487	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10724	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
805289	contig_14513_pilon	-	1076	2	Intergenic	novelGene_70228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	170	523	18880	11833	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19049	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12042_18735
805290	contig_14814_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_137732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCAGGGCTGCCCTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345508	344930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_344900_345500
805292	contig_17311_pilon	+	1626	2	Intergenic	novelGene_57874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	397	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGCCACTCCCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209649	211681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_210155_210560
805293	SIRV6	-	172	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTCAAGCGGCACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
805296	SIRV4	+	388	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCATTGCCGCCGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
805298	contig_8900_pilon	-	1374	7	Intergenic	novelGene_171614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	37.8579215253852	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	170	772	226855	170247	FALSE	10	TTTGGGGCTTGTGTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQSRHPTPHQAAGQPFKFTIPESLDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASEKTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTICAQVIPFLSQEHQQQVAQAVERAKQVTMAELNAIIGQQQLQAQHLSHGHGPPVPLTPHPSGLQPPGIPPLGGSAGLLALSSALSGQSHLAIKDDKKHHDAEHHRGERPGKPD	227024	169644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_170478_184178_184254_185870_185934_224238_224284_224394_224459_225940_226042_226831
805299	contig_2933_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_111350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTCGAGCTACAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846305	847507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_846300_847500
805301	SIRV6	+	380	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	500	-2	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
805302	contig_20614_pilon	+	821	10	Intergenic	novelGene_107534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	452.094986195611	69	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	8	619	69268	123283	FALSE	20	CAGTTATGTGTTTTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAETVELHKLKLAELKQECLARGLETKGIKQDLINRLQAYLEEHAEEEANEEDVLGDETEEEEPKPIELPVKEEEPPEKTVDMAAEKKVVKITSEIPQTERMQKRAERFNVPVSLESKKAARAARFGISSVPAKGLSSDTKPMINLDKLKERAQRFGLNVSSISRKVRYIGWKQRRGKEQSALGLPDEKFLILSVLRWFPLF	69260	123485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_69304_81157_81258_82948_82996_83222_83291_86601_86654_87522_87597_88010_88040_98515_98542_99107_99197_123192
805305	contig_1008_pilon	+	997	4	Intergenic	novelGene_121599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_3	91.6963588275032	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	48	311	750514	750777	TRUE	25	CATTGTTGCATATATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVELKSFGALAPAGQMRAGRPKGTRKQKLKRQGTQEAEQPQSQKVGPPPLEFLRVESPLRWTRRMGPPKFEGRVAVPVGLKGRAEAQDQGASTQNPESVANT	750466	775564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_768733_768862_771060_771135_775331
805308	contig_5482_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_144470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACAGTCTTGCTGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370049	369003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_369000_370000
805309	contig_9272_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_125907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTTTGACATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287977	288511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_288000_288500
805312	contig_11978_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_63040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTTGCATGGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650307	1652457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1650300_1652500
805318	contig_9580_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_167734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAAATTGCAAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781160	782497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_781200_782500
805319	contig_9471_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_21849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGGCCGCTTGCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430218	429329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_429300_430200
805321	contig_15042_pilon	-	1110	3	Intergenic	novelGene_115435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	250.5	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	138	377	35339	31273	FALSE	35	TGTGCTGTAATTAGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNVRLFSCLKVWTL	43086	30539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_31450_35276_35376_42985
805324	contig_3382_pilon	+	1489	5	Intergenic	novelGene_124018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_1	80.5698454758354	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	151	861	144970	167869	FALSE	50	ATGAAAAAAAAATTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGSCTFQTQCIKLHICQYFLQCECKFGASCKRSHDFSSPETLVKLKKLGMSPDLVRRLPAIYRNANDIKNRGSAPDIPLPQATSERRNSSGPGSPNAASQEENDQICLYHIWKSCSFQGRCQRVHFHLPYRWQFLCEGTWKDLDEMELIEEAYSNPGKDGVSCAESADKLLVYWLCFDSMKFGVFPARRLSTASSVTKPPYFILTTEWVWYWTDQTGTWQEYGKQGTQHPVATVSSPELEKAYLAYCTPGSDAQVATLKFKAGKYKYELDFKGIFLTPSLHPRNP	144819	168497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_145076_147915_148018_152130_152255_163712_163909_167686
805325	contig_7457_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_31582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGACCAGAGAGCCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930537	927924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_927900_930500
805326	contig_6710_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_97233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
805327	contig_2550_pilon	+	913	7	Intergenic	novelGene_135626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	161.119003638098	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	448	783	409589	478483	FALSE	10	GGGTGGTTAAGGCCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDLTSTASILMDQLINCLTSPWEEEAKTLVSEAIAAGVFNDLGSGSNIDLCVISKSKLDFLRPFSVPNKKGTRFGRYRCEKGTTAILTEKVTTLEIEVLEETVQTMDTS	397127	478613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397198_397613_397708_398493_398592_401128_401270_409544_409661_473100_473253_478371
805328	contig_14796_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_159379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTACCATTTTGGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218197	220288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_218200_220300
805329	contig_16220_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_163633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACTTGAAGTATCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181338	181950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_181300_182000
805330	contig_16220_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_163634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAGACAACCAACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182716	183304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_182700_183300
805331	contig_15442_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_119149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265630	263025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_-_263000_265600
805332	contig_8588_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_146504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTGCTATTGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336802	337818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_336800_337800
805336	contig_16362_pilon	-	1478	5	Intergenic	novelGene_161171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.95823643358446	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	231	368	347351	347214	TRUE	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKEVFEKLLPDQLVLLLERLLEQKTLHSRTLQRLQQTYRLHEQDAEVRHRWCELIVKHKYAKAYGQVERFLQGDQAMGIYLYGELMVSEDAWQQQLARKCFELTKEQMDRASAQVVAEMLF	429317	342445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_343552_347209_347355_349338_349426_373425_373543_429294
805338	contig_935_pilon	-	1733	4	Intergenic	novelGene_45510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	58.2637680438424	19	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	93	683	27171	19993	FALSE	35	GTTTTATATTACCAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDCIKTIVCQERKKDPIEMFCSGRLVKVCAPMVRYSKIHDDLTRTVDLCRKAEATGVSWITVHGRTVEERHQPVHYDAIKIIKENMSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	32105	18942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_27055_27193_32034
805340	contig_11629_pilon	-	2002	4	Intergenic	novelGene_161204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.5134350376268	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTATATTAATATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506525	500105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_501035_504362_505312_505896_505955_506459
805344	contig_10482_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_152856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTATACCTGTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240043	242151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_240000_242200
805345	SIRV4	-	296	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1222	3	1222	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3936	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
805347	contig_9345_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_24457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGTACTAAACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462856	463179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_462900_463200
805348	contig_753_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_112926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATAAAAAATGAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414456	414951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_414500_415000
805349	contig_17198_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_62423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCAGCATAGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162753	1164969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1162800_1165000
805350	contig_7839_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_45674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	398	469	89676	89747	NA	35	TTGCCTAATTTATATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSEEDLLASWQRAFVDHTPPPAAVTQHAGFGRDVLPELQRHFALSHTNRDDEVQAPSSPSGERLLLPTEPDSGFPREEEEEELNLPISPEEERQSLLPNDSGTEESPGTFHTEGRAWPLPSSSRPQRSPKRMGVHHLHRKDSLTQAQEQGNLLS	89278	90429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_89300_90400
805352	scaffold_16539_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_68384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624604	623675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_623700_624600
805353	contig_854_pilon	-	1489	13	Intergenic	novelGene_36436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	165	335	1460800	1460172	TRUE	35	AGACGCCACTACGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVAVVLQLRGNDGTSLRVQFLTPVNAVTPGIPFVEGLDVEEGHLPVGSSHDTIMLAADNQVNVVAKLPPAVTVCNGGNFILIHVILHKRVRVGEVDPSPFSSTAERNCG	1464297	1451068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1451308_1453642_1453792_1454101_1454134_1454899_1455034_1455688_1455792_1456398_1456461_1457298_1457411_1458333_1458449_1459057_1459169_1460074_1460217_1460549_1460620_1460744_1460876_1464208
805359	contig_3948_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_53265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385600	1383401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1383400_1385600
805362	contig_6361_pilon	+	1620	10	Intergenic	novelGene_23932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_4	229.653738280423	483	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	28	1248	284786	345856	FALSE	25	TAGTACTTTGTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVRQDLAQLMNSSGSHKDLAGKYRQILEKAIQLCGVEQLEALKAFVEAMVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDSTAKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDDPVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQQRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAMEAQMAQ	284758	346228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_284860_305941_306022_308749_308902_309697_309802_317331_317486_317640_317792_325203_325375_341173_341290_341875_341961_345722
805364	contig_1516_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_49925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATAGAAGAAAACTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100780	101078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_100800_101100
805365	contig_10855_pilon	-	1291	3	Intergenic	novelGene_124278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	10.5	157	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	558	965	37920	35696	FALSE	5	TGCCACTGGGTGTTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARRLFGATRAWANWRTRELPDSLAPVMVLVRDYAKKPVMKGGKGGVVSEALKDPDVCTDPVRLTTHAMGVNIYKEGQDVVLKADAEYPEWLFQMNVGPPKKLEELDPETREYWRLLRKHNIWRHNRLSRNKKF	38477	35369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_35829_36803_36961_37802
805367	contig_2033_pilon	+	2234	2	Intergenic	novelGene_71539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1830	2138	139612	142433	FALSE	30	TAAAGCTATTCTTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHSEPENRGPDASLHFFFATSLCLTSTILYLQKPKPVAVELIPTHRDTTGQSWNRLNGNGFGWFFGIRQVRNIYLELRREARTRDMKLEFVSIGGEEIDQN	137782	142529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_139769_142281
805368	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
805372	contig_7457_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_31368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353108	351414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_351400_353100
805374	contig_14953_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_137274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAGCAGCTCACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93219	91502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_91500_93200
805376	contig_20064_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_175637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACTAGTTAAACTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76574	76813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20064_pilon_+_76600_76800
805377	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
805378	contig_12735_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_140775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138865	137466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_137500_138900
805379	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
805380	SIRV6	-	460	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACCAATAGTTCGACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	10291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10300_10800
805384	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	26	875	26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8341	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
805386	contig_3975_pilon	-	1815	10	Intergenic	novelGene_54912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	8.68516544260569	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	470	1603	2207690	2194884	FALSE	10	CAAGCCTGTGTCCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNFHLIDFNLLMVTTIVLGRRFIGSIVKEASQRGKVSLFRSILLFLTRFTVLTATGWSLCRSLIHLFRTYSFLNLLFLCYPFGMYIPFLQLNCDLRKTNLFSHMASAGSRETVSGLSRSRDYLLTLRETWKQHTRQLYGSDAMPTHACCLSPSLIRSEVEFLKMDFNWRMKEVLVSSMLSAYYVAFVPVWFVKNTHYYDKRWSCELFLLVSISTSVILMQHLLPASYCDLLHKAAAHLGCWQKVDPALCSNVLQHPWTEECMWPQGVLVKHSKNVYKAVGHYNVAIPSDVSHFRFHFFFSKPLRILNILLLLEGAVIVYQLYSLVSSEKWHQTVSLALILFSNYYAFFRLLRDRLVLGKAYSYSASPQRDLAHRFS	2210895	2194671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2195127_2196781_2196903_2200386_2200575_2201706_2202044_2207000_2207156_2207485_2207570_2207684_2207768_2208125_2208346_2209047_2209175_2210850
805393	contig_12951_pilon	-	2073	12	Intergenic	novelGene_68256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.0824899781787	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	67	1080	868734	854435	FALSE	45	AGAACGCCTGGCAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCPHCTRRQDKRKSINRNSVRSRMPAKPSRMYGTLRKGPVCLDPKPQQVKKIFEALKRGLKEYLCVQQAELDYLSGRHKDTRRNSRLAFYYDLDKQTRSVERHIRKMEFHISKVEELYEGYCIQCRLRDGASNMQQAFSRCLPSRASRESLQELGRSLHECTEDMWLIEGALEVHLGEFHVRMKGLVGYARLCPGDQYEVLMRLGRQRWKLKGRIESDDSQTWDEEEKAFVPTVHENFEIKVTELRGLSSLAVGAVTCDITDFFTTRPQVIVVDITELGTIKLQLEVLWNPFDADSFLVSPSPMGKLFVGSRKGSLYNWTPPSTPSFRERYYLVL	868800	853441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_854444_854801_854932_855939_856086_856170_856297_856468_856513_856817_856882_856987_857138_857878_857933_858229_858254_861336_861416_864892_865040_868693
805395	contig_16310_pilon	-	622	3	Intergenic	novelGene_70097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTCCCCATTTTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290354	288987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_289060_289557_289631_289877
805399	contig_5020_pilon	+	749	5	Intergenic	novelGene_27807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	28	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	365	679	122915	126015	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVP	118460	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123334_126007
805402	contig_8050_pilon	+	2162	2	Intergenic	novelGene_114824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1042	junction_1	0	1	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	74	442	294062	294675	FALSE	40	CTTATGAAAGGGATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVRSCSHSAHSPFLFGSECFPVSIIYPEFLVISVNEPLTVILR	293988	296395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460
805403	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2005	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
805407	contig_11378_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_112325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCCAAAAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228607	1227311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1227300_1228600
805408	contig_2933_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_111361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGATCTTTCCGCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854857	848364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_848806_854278
805409	contig_10531_pilon	+	1208	5	Intergenic	novelGene_114524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_4	147.405054187433	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	246	1025	466144	485870	FALSE	85	AGAAAAACAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPLQWARYHWQRLIGGANRDDNERPYNYSSLLACGGKTSQTPKLAGKHRVVVPHLQPFKDEYEKFSGAYVNNQIRTTKYTLLNFVPRNLFEQFHRAANLYFLFLVVLNWMPLVEAFQKEITMLPLVVVLTIIAIKDGLEDYRKYKIDKQINNLVTKVYSWKEKKYIDRCWKDVTVGDFIRLSCNEVIPADMVLLFSTDPDGICHIETSGLDGESNLKQRQVVRGYAEQDSEVDPEKFSSRIECESPNNDLNRFRGFL	429109	486053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_429318_466106_466434_467898_468094_481531_481737_485780
805410	contig_8464_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_125405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAGCTCAGCAATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906422	904442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_904400_906400
805413	contig_1575_pilon	+	1673	3	Intergenic	novelGene_45157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_1	28	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACTTTATTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39938	131760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_104379_104481_130614
805414	SIRV6	+	567	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1736_1845_2027_2470
805415	contig_12622_pilon	-	1206	11	Intergenic	novelGene_6052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.389359729867	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	3	1154	1691275	1685282	FALSE	20	TGCACTGATTCCACCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLIQPDGVTLQYNPYSWNLIANMLYLESPAGVGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYHTRLWGQAPASTNHPPSQALSIPEGHSTSCRQPRVVSTLFLQ	1691277	1685229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685411_1687818_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309_1690397_1690492_1690544_1690814_1690927_1691093
805416	contig_15570_pilon	+	1563	2	Intergenic	novelGene_137841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGTTGTTTATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490776	493574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_492128_493362
805417	contig_9415_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_109900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTTTTAAAGTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2097585	2096120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2096100_2097600
805421	contig_9673_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_119178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2415	2726	165004	164693	NA	65	CAAATATAGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGLGCQMKGWKFESTQRHPGRKAWQSTSTENPMEHSSTLTHLGLLHALESTQRQPSVCLLLPLFLYFPDGGDKRERQPTVQRSCGWQCVTVWKKKSFSTSR	167418	164663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_164700_167400
805422	contig_6533_pilon	+	1292	7	Intergenic	novelGene_114637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	49.9458039612271	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	146	490	113865	146933	FALSE	65	CGAGAGAGAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTHRKISLMVSLGNKMHQLHWKDEENNDQRNPETFWTTTGMFPQEFIICFHKHVRIEKLVIQSYFVRTLRIEKSTSKEPVDFEQWIERDLVHTEGRLQNEEIAQQRKKENQE	103166	147735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_103233_113785_113899_115183_115245_125966_126074_127313_127383_141030_141075_146903
805423	contig_12270_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_113126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	27	386	14409	13827	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAYSCWY	14435	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
805424	contig_6364_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_51733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGTCCACCATTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447560	448459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_447600_448500
805425	contig_15354_pilon	+	1600	8	Intergenic	novelGene_65750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	34.5087980500211	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	889	1314	642871	648206	FALSE	30	ATCAAAGCTGCCTCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGRFYLSCLMLGSLGLLCILFTIYWMRYWHNGFTIFLLPWASPWQRSLLKPIHVFFGAFILSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPLLHDGE	638971	648492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639699_640818_640895_641713_641787_642858_642970_645027_645174_646352_646510_647085_647106_648202
805429	contig_1986_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_64134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGACTCATAGCGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335951	334748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_334700_336000
805431	contig_2209_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_141012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAACCACAATAAAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161316	160626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_160600_161300
805433	contig_15354_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_65707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	511	855	215286	215630	NA	15	AGCTGGAGGTCTGGTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQNLVGTREEVQPEGSRGSTQGQTASGWKEASALEDRQNVTDRCGAQGDRHQADKLEMRGKCDQWMCCTGLGVSGGVWCLVQYTEKKCLEISSRHWHGLSHALEVSFGIMRKG	214775	215652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_214800_215700
805434	contig_5260_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_144429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCCATGGAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582744	583480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_582700_583500
805435	contig_14801_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_166527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCAAAGGATTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38555	36407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_-_36400_38600
805436	contig_5419_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_15482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133402	131579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_131600_133400
805439	contig_13145_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_116637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAAATTATGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95936	94289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_94300_95900
805441	contig_6710_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_95823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGGGTGATGTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653362	653762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
805442	contig_3948_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_53168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGGGTGAGGAGGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269008	269498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_269000_269500
805443	contig_15327_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_70587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830051	829270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_829300_830100
805444	contig_10196_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_132221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACTCAACAACAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380626	1380073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1380100_1380600
805446	contig_2100_pilon	+	2512	9	Intergenic	novelGene_50587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	9.32737905308882	38	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	93	1385	631446	636191	TRUE	15	AGCCTGCAGTGTCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAHAAGRDPASARDASCLDPQEYPRALPTMIPPASSTPPGEAFFPTLAPQDFWRSQVSSYSGSVTRHISHRANNFKRHPKRRKRIRPSPPPPPNTPCPIELVDFGDLHPQRSFRELLFNGCILFGIEFSYAMETAYVTPVLLQMGLPDQLYSLVWFISPILGFLLQPLLGAWSDRCTSRFGRRRPFILVLAIGALLGLSLLLNGRDIGIALADTASNHKWGILLTVCGVVLMDFSADSADNPSHAYMMDVCSPMDQDRGLNIHALLAGLGGGFGYVVGGIHWDKTNFGRALGGQLRVIYIFTAVTLSVTTVLTLVSIPERPLRPLGEKRATMKSPSLPLPPSPPVLFEESAGENLPSHTATNLYASFTSPISPLSPLTPKYGSFISRDSSLTGLSEFASSFGTSNIDSVLIDCFTGGQDSYLALPRQLPETDHQRQLPPGPPKASTTRTTGFWSAGRPP	609550	650401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_609619_631421_631843_632416_632510_632953_633179_635613_636356_643855_644010_645341_645519_647729_647936_649975
805451	contig_17440_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_7658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGAGTGGTGGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4014	3562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3600_4000
805453	contig_9646_pilon	+	1053	4	Intergenic	novelGene_117416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	74.3699461401505	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	166	591	49015	50711	FALSE	15	CTCTTCAGTTCTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGGEDPLYVARRLVRFASEDIGLADPSALTQAVAAYQGCHFIGMPECEVLLAQCVVYFARAPKSIEVYSAYNNVKACLRNHQGPLPPVPLHLRNAPTRLMKDLGYGKGYKYNPMYSEPVDQEYLPEELRGVDFFKQRRC	27977	51173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_28057_48928_49085_49771_49852_50435
805454	contig_10238_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_170113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATATATTTTCCTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452191	452592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_452200_452600
805455	contig_5247_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_81816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCTTTGCTTATCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337320	336874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_336900_337300
805456	contig_10734_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_51132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	858	1235	848366	848743	NA	15	AGCGGCTCTGACTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVVVKGPQAGHTTSPCHAQGCALKLNDLLMNKRDPNNPVTYLLGDIRHVFGSRMSVISVPAVNGLAALVVQLKHPPETAQVATVRQAPGTSSRAISCVCAGDVPVNVREGQKAVPPAPHHRPA	847508	848878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_847500_848900
805457	contig_20234_pilon	+	2972	3	Intergenic	novelGene_174322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	6.5	14	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	128	526	114105	119525	FALSE	20	TTCATGTGATCTCTTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSLIPDSFIQTKAELQVLTPAQIKSICQAILDSGKQYAIKKRKPFPLMYSYYGTEYLGAAHGLSSILQMLLSYHEHLKPSDQELVWQSVDFLMEQEQNCNWPPELGETIERENELVHWCHGAPGLTHFIT	113977	121971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_+_114159_115560_115685_119304
805458	contig_6870_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_104007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGGTATGTGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1597503	1599818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1597500_1599800
805460	contig_5018_pilon	+	843	2	Intergenic	novelGene_46982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTGGGCCGCAATTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631845	634741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_632412_634464
805464	contig_11335_pilon	-	1970	9	Intergenic	novelGene_104928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	101.625230627045	309	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	124	528	459255	427425	TRUE	50	TAAAAATTTAAGTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVLNPPVRLRSLREGDVYEIGEDGELAAILLAVSLPLEFEMLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVLRAAKRGIPYRVIHNASIMNAVGCCGLQTLGDQKASLTE	459613	417209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_419081_419145_420501_420606_422034_422075_427382_427461_442122_442232_451414_451540_459120_459279_459513
805467	contig_10765_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_122963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACCCAGAGGCTACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385746	384389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_384400_385700
805469	contig_3817_pilon	+	1482	4	Intergenic	novelGene_78322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	612.928670854575	8	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	50	463	178717	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARGAGWGITAGLDPEMALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178667	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_201782_201852_204349
805470	contig_5569_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_86758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGCCCTAGGCACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493559	493092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_493100_493600
805471	contig_10372_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_112508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAATTTCACTCTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20644	21648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_20600_21600
805474	contig_10349_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_175639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40031	42338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10349_pilon_+_40000_42300
805475	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	57	513	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
805476	contig_10437_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_38348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGGCGGCCCTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525790	523202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_523200_525800
805478	contig_10523_pilon	-	1634	2	Intergenic	novelGene_120953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	489	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAAAAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95367	37835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_39255_95152
805479	contig_8420_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_69332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10917	12214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_10900_12200
805481	contig_2933_pilon	-	1789	2	Intergenic	novelGene_111360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	59	832	850204	849321	FALSE	10	TCTGATCTTTCCGCGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLI	850262	848363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_849324_849433
805484	contig_12277_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_139678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCCCCAAAATCAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118617	118211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_118200_118600
805485	contig_12277_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_139677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCACTTAGCATGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117258	116279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_116300_117300
805486	contig_7057_pilon	+	703	7	Intergenic	novelGene_123315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	554.045024243417	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	243	416	941435	943233	TRUE	5	CTGCTCTTCGTGGCATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGCARADRRVLSHRPRPREPNAAGGPGAADEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	936019	943709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936115_941067_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943325_943513
805487	contig_14441_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_100802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGGACTCCTTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146698	148290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_146700_148300
805488	contig_935_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_45537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	861	1256	305307	305702	NA	30	TAAACATATGTGCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSCCSPFRVLPICLLISIPVASDLVKALIILQLYHYCGLLIDPAVFSLFIQSALQHNFSENHIFTYIFSLLKIHRSFLSAFRINSSLLSSSHKAHLLLPLSLPCRQAPYTPSVLNALQFLKCITFPAPMP	304446	305703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_304400_305700
805489	contig_15245_pilon	-	614	4	Intergenic	novelGene_145213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1315	junction_1	454.16761467791	279	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	98	424	131120	42989	FALSE	40	TACAGAATATTTTTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGHWDTTASSALSSSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQAEILQESRMMIPDCQRRLEAAYTDLLQLLESEKELEEAEEYKEARSVLDSVKLEA	131217	42798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_43070_47639_47727_56801_56908_131067
805490	contig_8149_pilon	+	2224	3	Intergenic	novelGene_169960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGAGGTATTTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838207	843220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_838289_840628_840761_841209
805491	scaffold_19766_pilon	+	1338	5	Intergenic	novelGene_34295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	84.2418393673832	411	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	548	847	523592	529612	FALSE	15	GAATTTGGGGGCTGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAISGHLDSDDDSGSGSLVGIDNKIEQAMDLVKSHLMFAVREEVEVLKEQIRELAERNAALEQENGLLRALASPEQLAQLPSSGVPRLGPPAPNGPST	519363	530103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_519769_520209_520252_523491_523633_528931_528981_529402
805492	contig_10523_pilon	-	1051	7	Intergenic	novelGene_120928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	568.473980641741	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	202	984	39240	12800	FALSE	5	TTGCCAGGTTGTGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEREMT	39441	12732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12815_15096_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_31045_31138_39162
805498	contig_5236_pilon	-	2003	7	Intergenic	novelGene_100927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.56802016507934	43	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	348	1073	926345	919844	FALSE	10	TAAGGGTGTTGCCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGHKAEPLHLCHRLDKETTGVMVLAWEKEVAHRVQQLFKTRQVAKKYWAVTVHVPVPSAGVVDIPIMEKEVQGQQQHRKMTLSPSYRMDNGKMVKVRSSRNAHIAVTQYRVLSSTLSSALLELQPVTGVKHQLRVHLSFGLDCPVLGDHKYSDWNRLAPQKLSAGTLKKLGLPQSKARHIPLHLHARQLILPALGPGKEDLSLVCKLPHFFVRSLSRLGLEMPSQDHTGGDEAGHLGAQ	928354	918913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_920084_920608_920707_921282_921428_921502_921597_926196_926399_927647_927780_928192
805500	contig_16103_pilon	-	2807	1	Intergenic	novelGene_118777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519907	517100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_517100_519900
805502	contig_6361_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_23876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAATTAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70129	71688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_70100_71700
805503	contig_8127_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_175066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGTGACAACTAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251683	252335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8127_pilon_+_251700_252300
805505	contig_9852_pilon	+	864	9	Intergenic	novelGene_138454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_3	380.979658249624	5543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	346	687	31690	35457	FALSE	40	AATAATATATGATCTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIAKRYSTNGKITFDDYIACCVKLRALTDSFRRRDTGQQGVVNFPYDDFIQCVMSV	21335	35634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_24546_24617_29817_29870_30839_30884_31683_31832_32069_32184_33374_33434_35430
805506	contig_16322_pilon	-	180	1	Intergenic	novelGene_87523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATGCCCGCCGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57644	57464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_57500_57600
805511	contig_3386_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_34595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGCATGGGTAGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523769	523077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_523100_523800
805512	contig_3386_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_34594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTCCATATCATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522625	521538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_521500_522600
805513	SIRV5	-	349	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10866
805515	contig_2733_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_128601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049894	1048345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_1048300_1049900
805518	contig_2987_pilon	-	2007	3	Intergenic	novelGene_125868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	25	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1596	1916	603709	603389	FALSE	10	TGTCTCCTGCGTCTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPQRGKMESRPQGEMENWHGLGEVWVQVRVAVCVSTLSFLLPSSWVGYQYPGYRGYQYLLEPGNFKHWNEWGAFQPQMQAVRRLRDRQWHREGSFPAPATELPK	610714	603297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_604936_606079_606213_610478
805519	contig_2646_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_69661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	651	1076	2172072	2171647	NA	30	AATTGTTGGCTAAACGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPAASCPVAASPPPRPPSSTGPGAPGNHASVSSPLLLCCLPCAQPPSLGLDQPHREWQWQSGLWAPWAGGSGVPAPFICLSWPSANLSCEFCDQSQVGPLSSCPLWPQLSGVGGLAAPHLGAPLKASNGSPALSPSSALG	2172722	2171580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2171600_2172700
805520	contig_987_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_72263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAACAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422684	420445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_420400_422700
805521	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_96479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653744	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
805522	contig_5451_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_167157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACAGATTTGTATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77729	77481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_77500_77700
805523	contig_5451_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_167156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGAAGCAGTTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76115	75412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_75400_76100
805524	scaffold_14128_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_169523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270598	268676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_268700_270600
805526	contig_10451_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_138331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAAAAAACAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465589	464590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_464600_465600
805527	contig_5423_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_85287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACACACACATATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578422	578926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_578400_578900
805528	contig_4486_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_38615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385664	383937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_383900_385700
805530	contig_15543_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_164341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAATTGACTCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45062	44214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_44200_45100
805532	contig_9185_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_166906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATCATAAACTAAAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406369	408798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_406400_408800
805535	contig_10861_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_39406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTCCAACAAGTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1918380	1918891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1918400_1918900
805538	contig_8550_pilon	+	1589	12	Intergenic	novelGene_72370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.6022516748301	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1098	490	1587	164974	183933	FALSE	65	TACGAAAGAAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPNINWKDIMKVDPDDLPRQEEVADNLLIFLSKVEINEIKSESQESLIHLFRVTQSLMKMKAQEVELALEEVEKAGEEQAKFENQLKSKLMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRDEIRQLEKQLEQKDRELEDMEKELEKEKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENEQLRQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSKKNYELVQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDDYNRMKAIVHQTDNVMDQLKKENEHYRLQVQELTELLKVKNEEDDPVMVAVSAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQKMLHNLREKLKNAQLDADKSNVMALQQGIKERDSHIKMLTEQIEQ	164310	183935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_164772_164945_165076_165234_165313_166346_166417_166722_166770_169394_169539_177885_177940_178681_178835_179229_179413_179982_180073_182584_182708_183879
805539	contig_10766_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_151239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575293	577064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_575300_577100
805540	SIRV6	+	367	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11033_11109_11205
805542	contig_4228_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_151169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385264	387296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_385300_387300
805546	contig_14814_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_137684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAACAAAGAAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28828	29587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_28800_29600
805547	contig_2716_pilon	-	1565	11	Intergenic	novelGene_173550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.341398651124	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	86	1351	294268	282193	FALSE	40	AAAAGTGAGTTTATACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARRNKKQVPSFRKLLKTSKVKLENKLKNKQFKQQSTLKKYRKEQRKLRQAVKDAVSKKPIPLEDPKEKRPGKRIEWEGEEEEEVLPLDMMDEDDLQLMKDLGQRASFLTRDLSSSEPVHAKKRKHENIIEKYEKIPRSLQTAPEKELIHLLPIKDKSGIIPQTREKPVIESNKDEEDQEEKGLEEEIIEEPIPELTLEEHVMERKKKLQEKKMHIAALASAILSDPESNIKKLKELRSMLMEQDPDVAVTVRKLVVVSLMELFKDITPSYKIRPLTEAEKSTKIRRETQKLREFEEGLVSQYKFYLENLEQMVKDWKQRKLKRSNVVSLKAYKGLAEVAVKSLCELLVALPHFNFHNNIIVLIVPLMNDMSKSVSDMCCEAVKKLFKQDKLGQASLGVIKVISGFVKGRNYEVRPECSL	294353	281978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_282205_282470_282600_283227_283404_284297_284392_284557_284720_286613_286745_288014_288069_288998_289157_290608_290742_293028_293237_294259
805549	contig_1996_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_131860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAAGAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51298	52754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_51300_52800
805551	contig_10734_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_51076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATGCTCAAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481900	479867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_479900_481900
805552	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_94318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
805553	contig_4852_pilon	-	1337	2	Intergenic	novelGene_153977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	0	221	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAGTTAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99991	94758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_95993_99888
805556	contig_20241_pilon	+	1480	10	Intergenic	novelGene_159745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	38.1779459315919	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	258	995	239418	252697	FALSE	70	GCACAAAAGAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFVVNKKMEFGVVYSCVEDKMYTGRRGHGAFCDGQKLQVSQQEDITKSLLVTELGSSRTPETVRTVLSNMEKLLCIPVHGIRGVGTAAVNMCLVAAGGADAYYEMGIHCWDMAGAGIIVTEAGGVLTDVTGTVMGQ	235266	253182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235754_235868_235947_236036_239404_239481_240085_240220_241925_242031_243723_243770_246679_246789_248322_248432_252525
805557	contig_5642_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_153032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94336	92536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_92500_94300
805558	contig_8242_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_80199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTATCTGTAATATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188168	186457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_186500_188200
805559	contig_10982_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_87858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72266	73145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_72300_73100
805561	contig_3525_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_135115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGACATTGTGATAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35178	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_35200_36800
805563	contig_8452_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_48073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGTAAACTACTCGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949933	948654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_948700_949900
805565	contig_7171_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_101347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTGGGAGTCCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302813	1303863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1302800_1303900
805566	contig_7171_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_101348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTACTACTAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304524	1305123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1304500_1305100
805571	contig_3975_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_54749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCTTTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760997	1759305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1759300_1761000
805573	contig_10940_pilon	+	1965	2	Intergenic	novelGene_49288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	172	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1103	1807	960841	962598	FALSE	30	CATATTATCTTGCTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQRRVDFYLASIEDMLVAVGGRNENGALSSVETYSPRTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRMDVWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESGVAVWQGRIYILGGYSWESTAFSKTVQVYDCEKNKWSKGIDLPKAIAGVSACVCALKPRLEDKKKKGKSRRHQDQGQ	959738	962756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_960990_962042
805574	contig_12920_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_166357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTCCTTGGAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339699	338731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_338700_339700
805581	contig_11642_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_172917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251284	252760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_251300_252800
805584	contig_14514_pilon	+	1713	3	Intergenic	novelGene_137480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7	40	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	95	394	94296	94749	TRUE	25	TGTTCGTATGAGAGTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRMWALGRPSTASPPSPWSSPFVQRKGKRRKGSRSQPRRARGPEGRPPGPLAAFGPQNVRYLHFLEGTRDYEWLEALLLNQTLMGNNFHWFRYPLPSP	94201	96354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_94365_94518_95176_95461
805585	contig_6191_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_107852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGATGATTTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177390	178451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_177400_178500
805586	contig_7058_pilon	+	368	3	Intergenic	novelGene_136014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_2	151.5	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAATATGTGATTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46672	126099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_46768_106394_106592_126023
805589	contig_9706_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_20970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTTTAAGTGAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330379	329330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_329300_330400
805590	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
805592	contig_10732_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_114684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTTTGACTAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65880	67202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_65900_67200
805594	contig_7513_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_88986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAACCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327439	325311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_325300_327400
805601	contig_10331_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_54216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTCTGATATGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352266	1351600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1351600_1352300
805602	contig_16411_pilon	+	1233	3	Intergenic	novelGene_77269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	770	junction_2	24.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	18707	22115	FALSE	75	GAAGTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKRTLKGSIELSRIKCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKYHPNFWIDGRWRCCAQLEKLAAGCAEYDPTKNGKKLRSSLSSF	18705	22996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18812_20432_20515_21951
805604	contig_5770_pilon	-	1536	2	Intergenic	novelGene_74164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGTTCTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255890	254292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_254966_255027
805605	contig_9921_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_23734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCGAGCTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157155	156958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_157000_157200
805606	contig_10864_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_107057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCTTTTGTACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759090	758206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_758200_759100
805607	scaffold_6394_pilon	-	1812	11	Intergenic	novelGene_110969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.2883344135493	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	628	1479	250850	249049	TRUE	15	TCCAAGAGTCGGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDNSGDPADPHKVYAVSPAPGWGGQGSDRTEEEAPTDGRLMRGEPPGPFLGEAGERPEPVLGWAGATGQRSEPCTSSPQPTPAADARDLLHQALQHTHLGDHLLEEAWRMDSAPQQPPGPALVSEELYLPWAEAAPSCPPQPPAQHQALMTDAAWTPALEPSQEAGPAPSPLTGAPLAEGGLAVLEVTILYKGRPVLQEVVGRASCVLLYRTPGPAAEAVDAQLVAFPSPAELPDQKQLRYTEELLRHVDPGLLGGGRPPGLRQPLQPRLPAASQLRHPHL	251645	248563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_248758_248834_248954_249028_249135_249193_249419_249495_249577_249650_249750_250025_250255_250350_250407_250774_250983_251068_251231_251312
805609	contig_6710_pilon	+	510	2	Intergenic	novelGene_97912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGATGGCTCTAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653409	657180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657141
805610	contig_17753_pilon	+	1711	2	Intergenic	novelGene_105117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	179	316	146734	146871	TRUE	25	GAAGAGCTATTTTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	146555	148311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_147950_147994
805613	contig_13982_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_163486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGCACTTTATAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380575	379814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_379800_380600
805614	SIRV2	-	283	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	643	22	643	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4089	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
805616	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
805618	contig_4392_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_117329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTACGGAAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532402	532935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_532400_532900
805619	contig_19533_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_175640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19533_pilon_-_0_1100
805621	contig_14686_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_88073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTTAAGCCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80162	81988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_80200_82000
805624	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
805628	contig_6241_pilon	-	1455	2	Intergenic	novelGene_156412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	187	675	195215	182199	FALSE	65	CAGAGAAGACAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPGSTVPVTSHLLLLRPQPRSPHYRRTRQPPLLSMEDMQAIYLRPSLLLLFRFPFMMSTRHTETGDKSEDKPQRYH	195401	181418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182424_194951
805630	contig_7356_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_60354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAGCTAAAATACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101869	104562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_101900_104600
805631	contig_10857_pilon	-	858	10	Intergenic	novelGene_160879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTGGTGCTTCTCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66897	21830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21948_58301_58390_58780_58874_59615_59660_59828_59905_61399_61500_61881_61960_62092_62197_66446_66500_66792
805633	contig_960_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_108246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGGTATATAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480957	480424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_480400_481000
805634	contig_11978_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_62966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGAGTAAAACCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229127	1231086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1229100_1231100
805636	contig_6208_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_53002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAATTGCTAGGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417231	416458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_416500_417200
805638	contig_6975_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_74241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30724	32504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_30700_32500
805641	contig_6479_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_160623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACCATGGTAATGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651735	652338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_651700_652300
805642	contig_6479_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_160624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATGTAAGACAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652490	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_652500_653400
805643	contig_8464_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_125411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941594	940246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_940200_941600
805645	contig_13597_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_175642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAACCCTTCCAGCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67570	67946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13597_pilon_+_67600_67900
805646	contig_13597_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_175643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGTAACCCTTACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67847	68920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13597_pilon_+_67800_68900
805651	scaffold_12510_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_151376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGGCAGGGTTCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230066	232143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_230100_232100
805652	contig_9561_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_100860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCCCAAATTGATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235873	237672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_235900_237700
805657	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	55	TTTGTGGAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
805658	contig_11448_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_66400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACCCTTCTCCCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460597	460391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_460400_460600
805660	contig_20819_pilon	-	2390	7	Intergenic	novelGene_55614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	136	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGAAGGGGATGGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25484	22064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_22321_22474_23308_23442_23646_23808_24000_24180_24623_24806_25031_25243
805663	contig_6710_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_97649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	50	TATTTGTGGAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
805664	contig_1694_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_144953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTCTAGACACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808977	806983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_807000_809000
805666	SIRV4	-	403	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	194	20	-194	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTTGGACACGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805668	contig_12312_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_63988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTGGCTCTCCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437225	435507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_435500_437200
805669	contig_5586_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_143618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCACACACTTAACATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832831	833077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_832800_833100
805670	contig_5586_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_143619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	35	379	833316	833660	NA	35	TATGGTGTAATAAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNQLLTLPTTWMDLKLCQVKETRHMRVYTVWFHLYEILENTKLIYSNKKQVSGCLESRVKWRIILKEFKGTFWGHENVLYLDCGGCYTSVYMCQKFMDFCTKNVLLLLCIIKFIMYNNKTSIKFI	833281	833693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_833300_833700
805671	contig_5586_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_143620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAGAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833941	834721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_833900_834700
805673	contig_7963_pilon	+	970	4	Intergenic	novelGene_58363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1479.74690028021	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	94	756	51450	57839	FALSE	45	AAAAGCATTGAGCTGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWARSQSRCLRRQRLWSVL	51356	58053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57786
805674	contig_10479_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_147108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTGCAGGAAATTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108502	109616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_108500_109600
805675	contig_21007_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_161534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	77	457	589	969	NA	45	ATTGCATTGCAATACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMR	512	969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_500_1000
805681	contig_5316_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_61233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTTATGATAACAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450429	452028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450400_452000
805686	contig_11364_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_65166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTTCCAGTTCTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96872	95647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_95600_96900
805688	contig_16541_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_126738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322877	320999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_321000_322900
805689	contig_15323_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_148526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	167	298	113373	113504	NA	70	ACAAGAAAGGAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKTKERDKGLITTAGGGRQWSSYFLLCQKTSEWQLLNLGSRLLSDIDNQRNLQRKMTQATSYKGETCRRLCGIVFIIFIYLKSWHGRGIILVLCDPKK	113206	114037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_113200_114000
805690	contig_15146_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_116944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGTCACATTCAGAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252323	251516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_251500_252300
805691	contig_3861_pilon	+	1286	2	Intergenic	novelGene_57881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	149	610	57858	58371	FALSE	20	TCTTACTATATCACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAFSFLRDHLRCLHVKFTDVAEIPAWVYLLKNLRELYLIGNLNSENNKMIGLESLRELRHLKVLHVKSNLTKVPSNITDVAPHLTKLVIHNDGTKLLVLNSLKKMMNVAELELQNCELERIPHAIFSLSNLQELDLKSNSIRTIEEIISFQHLKRLTCLKLWHNKIVAIPPSITHVKNLESLYFSNNKLESLPVAVFSLQK	57709	59047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_58314_58365
805693	contig_11396_pilon	+	1476	6	Intergenic	novelGene_71352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	95.2693025061063	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	13	684	510074	511723	TRUE	15	CTGAAAGCCCTTTCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQYRMHKDICAFPSTEFYKRKLKTWQGLRRPPSILGHADRESCTVIFGHLQGCEQSLLVSTDEGNENSKANLEEAVEVVRIAKQLTLDRTVNPKDIAILTPYNAQVAEITKRLLQEGVTGVTVSSITKSQGSEWRYVLVSTVRTCPEGEIDQRPTKSWLKKFLGFVVDPNQVNVAITRAQEGLCLIGDHLLLRCCPLWRRFLDFCHSQQSLVPAHLVRVRRRPAVSR	510061	512903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_510077_510227_510447_511027_511185_511275_511444_511598_512314_512701
805694	contig_14681_pilon	+	986	8	Intergenic	novelGene_134204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	167.975095335771	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	260	967	50409	71147	FALSE	30	GTAAGTGTTTCACGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	49066	71166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_49268_50350_50634_56129_56208_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088
805695	contig_5954_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_28750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302828	1304145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1302800_1304100
805696	contig_7009_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_23683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCCTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546793	546345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_546300_546800
805697	contig_12379_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_148939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	796	1122	207844	207518	NA	40	AAAAAAAGCTTCCTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINARRKFTNQRKNKQDFSDSLLLTMQASTLGMVSKLYPLPSPSSRLQLYVFISYLAINASHIGLLTILKTCPCFPTSVSFHWVFHLEFLMPTNVYLLKFYHKSQLLY	208639	207295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_207300_208600
805698	contig_14472_pilon	-	1551	6	Intergenic	novelGene_111168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.8616908494129	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	201	662	281325	245058	TRUE	15	TTTGTCTTTTTATTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETVSESRFSLKTAALRVFDLPLSWYYSLSQIKFSPGIKKLFVVTALSAVSVIFLAHHFKRRRGKKKGKTLPWQPEHLILEYTKRAASDKGSSCSSSRQNLTLSLSSAKDKGSQSCNYANGGLFSKYSGSAQSLASVWNCLKRHCVDGNKH	285152	243414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_244215_244968_245106_252560_252698_255167_255346_281226_281340_284966
805699	contig_8735_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_173715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42050	40169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_-_40200_42000
805702	contig_6885_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_83661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTTCTGAACAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190739	191994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_190700_192000
805705	contig_4392_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_117332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTATTGTTGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541792	539558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_539600_541800
805708	SIRV6	+	430	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	400	26	227	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTCGTCTTGAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530	2514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
805711	contig_18787_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_175646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCTGCCTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87453	88294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18787_pilon_+_87500_88300
805712	contig_5718_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_110307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTTTTTAAATTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188597	190359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_188600_190400
805713	contig_4686_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_118521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCACCAGGCCTTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437170	439532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_437200_439500
805715	contig_8020_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_114357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	639	938	99104	99403	NA	20	TCCCTAGGGAAGGCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWRWPRGDSVPLNWEPGLALMPFLVGKCTGYKLGKDQGFTISCFGSFPDQSGWRVSYSPRTLRDNYFWNNPPSTGPSFLAALFHGILILKIMLQLEA	98465	100791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_98500_100800
805718	contig_13224_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_104116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGATGCTTCTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316755	316004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_316000_316800
805719	contig_3233_pilon	-	1360	7	Intergenic	novelGene_56533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	106.898186243838	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	467	916	706773	702290	FALSE	15	TGTTGAACTGTGATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWFSTAVLIGLFVFEHFPTYMIGVGLFTNLVYFGLLQTFPFIMLTSPNFILSCGLVVVNHYLAFQFFAEEYYPFSEVLAYFTLCLWIIPFAFFVSLSAGENILPSTMQPGDDVVSNYFTKGKRGKRLGILVVFSFIKEAILPSRQKIY	716860	701845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_702406_702578_702682_703401_703470_705474_705629_706764_706845_713652_713798_716610
805724	contig_4891_pilon	+	1158	7	Intergenic	novelGene_124564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	606.595325475633	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	86	742	701017	755930	TRUE	40	GCGCTATAAGAACAGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGWHDRGSPEIRLPQSTY	700931	756910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755878_756027_756590
805726	contig_8616_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_72490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	613.336252005938	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	534	1025	327034	330137	TRUE	10	TTCCTTGACTCTCTGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTGLRYLLYNFPMTCAFIGVASNFTFLSVIVLFSYMQWVWGGIWPRNQLSLQVVRGRDPFSSLLVTLL	321548	331073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_321601_322267_322585_323789_323876_326955_327100_328047_328183_328360_328459_329944_330292_330467_330546_330638_330720_330844
805727	contig_5423_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_85249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTGAAAGGAAATATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530291	532560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_530300_532600
805729	contig_5153_pilon	+	1075	3	Intergenic	novelGene_74408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_2	37	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGAGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019846	1022706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1020207_1020453_1020577_1022114
805730	contig_7870_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_108918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228533	230980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_228500_231000
805731	contig_20759_pilon	+	2703	1	Intergenic	novelGene_163720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13682	16385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20759_pilon_+_13700_16400
805733	contig_5896_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_159251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGCACGGTATATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370670	371165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_370700_371200
805736	contig_17131_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_175648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTTATTTATCAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12994	14108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17131_pilon_+_13000_14100
805737	contig_17127_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_168305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	136	456	73370	73690	NA	25	TCACAGGTTTTGTTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTGIRLLSLIRNGNINLDLVPALHTVRLSIQVQRSCLPVVTSGLVLSNFPLPPGRAPPDCWYLFESPFQVSQQRLLPAMFHRKVYFHQPPPDLQNPHIHGSHCAS	73234	73802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_73200_73800
805738	contig_6418_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_81157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGCCTAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298362	295652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_295700_298400
805740	contig_16703_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_72784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAAATTTCTATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37300	36513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_36500_37300
805742	contig_854_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_36763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	174	506	1768817	1769149	NA	15	TCCTTCTGACTTGGAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCFNLTDNSKLIEQKVNHVKHELLKIKICEGFDFSWLTFWLPNLTWLKTLFISAIGEVVIGLLICCCRQFISTCGMAFSILNQTIQWMAQTHCRQKAQSLCLKYSDLRY	1768643	1769659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1768600_1769700
805743	contig_4732_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_75505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAGAGTGCATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044073	1067221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1044323_1065011
805744	contig_2799_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_85468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406803	405273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_405300_406800
805747	SIRV6	+	419	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	437	0	264	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1567	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
805748	contig_1008_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_121558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCGGAACTCAGGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545360	544368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_544400_545400
805750	contig_521_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_174726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCCTCCTCTGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11725	11036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_11000_11700
805751	contig_521_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_174725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGGTCTGCCCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	9503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_9500_11000
805754	contig_11964_pilon	+	825	8	Intergenic	novelGene_164724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACATTGTATAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238532	275195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_238833_245996_246048_252922_252981_253366_253459_253889_253973_258242_258295_258686_258799_275118
805755	contig_7839_pilon	-	2142	8	Intergenic	novelGene_45668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	518	838	16977	15679	TRUE	10	CGGTCACCCACGCTGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMTTGRAAHRYTQAASRYLMTRSRPNSRARQASTRVPSACSHPQNLMTRMPLSSSVISLTRTSLCCSIAWLLAMMRVAITLLTGTSSSARTRPPTKAMPTCWCNR	21170	11971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_12028_12274_12447_14602_15822_16799_17028_17869_18026_18295_18407_20134_20214_21049
805756	contig_9389_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_83885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	32	99	252	350	45029	44931	NA	20	AGCTCTGCAGTCCAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDQPTFLGRQGSLFFPVNTQIKEGGRSHRVKQESVCPPPGSKRPVCEYLPRGPPAPLTWVLTQKPGWPLEAYPRLGGEKGGGRMSGIPGSLSATPQCQQCSQQALHPSVPQFPHL	45280	43473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_43500_45300
805758	SIRV4	-	611	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805759	contig_12050_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_62755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	555	980	746696	747121	NA	60	AAAATAAAATAAATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQSRCWPGLQSSEGGSASKMAPSHSAGCWLEVSVPPPMGLSMGCLSALVMWQLASLRVNDPRERNQGGRRVRNRRRKWNVWLIASMNNYLLCHETRTGWCLATITEHFDERVYGRILIERGEIQKRISNCHGIWIFWSS	746141	747483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_746100_747500
805760	contig_5253_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_61558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAACCAATTTGGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188100	188720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_188100_188700
805761	contig_5253_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_61559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACCAACAACAACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188871	189273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_188900_189300
805763	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805764	contig_4125_pilon	-	1235	9	Intergenic	novelGene_25208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.4881586297561	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	88	609	1634299	1628078	TRUE	25	AGTGAAACCAGGTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLARPLVDLPLLLDPSSYVPDTVDLTEDPMARKYWLSCFEEALDGVVKRAVASQPDSIDAAERAEKFRQKYWNKLQTLRHQPFAYGTLTVRSLLDTREHCLNEFNFPDPYSKVKQKENGVALKCFQQVVRSLDALGWEERQLALVEGLLAGNVFDWGAKAVSDVLESDPQFGFEEAKRKLQERPWLVDSYNDWLQRLKITVE	1634386	1625624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1626094_1627414_1627516_1628021_1628093_1628557_1628608_1629837_1629894_1631137_1631290_1632326_1632415_1632927_1633041_1634251
805765	contig_12148_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_140324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	2.05480466765633	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAAAAAAAGAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123297	44256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_45550_62247_62290_108198_108251_123186
805766	contig_11815_pilon	-	778	5	Intergenic	novelGene_50913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	482	junction_1	28.2079332812597	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	94	333	196254	190956	FALSE	20	CAGGATGTGTGGCTTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PENNQVLTKKKLQDLVREVDPNEQLDEDVEEMLLQIADDFIESVVTAACQLARHRKSSTLEVKDVQLHLERQWNMWIPGFGSEEIRPYKKACTTEAHKQRMALIRKTTKK	201769	190510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_190992_192707_192797_196139_196255_199989_200068_201754
805768	contig_9771_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_156925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAATAGCAATATGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448589	446947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_446900_448600
805769	contig_11003_pilon	-	1964	9	Intergenic	novelGene_105425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	123	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	916	1404	64888	61008	TRUE	35	TCACGGGAAAGGCAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAFWKVPSCSLARRAALALWHAVPSPTLDTEEVISNCDRCQWRAINIPKVAFRCLGPQDVLPHCPDGQGDPFSLLGVEVGAFQTGEGQACHGHRVHREVALVQRVVVFHGVQEFAHHTVMDPLLVNTQGQDGQAVLVVAGVGVALVITNGPLLILQEPLEL	73032	55843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_56078_60014_60204_60870_61053_62756_62913_64473_64642_64768_64964_66250_66426_70019_70133_72480
805770	contig_17449_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_173768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAGAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20257	18516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17449_pilon_-_18500_20300
805773	contig_6795_pilon	+	1164	8	Intergenic	novelGene_27783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	26.6458251889485	198	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	160	1029	564994	579327	FALSE	20	TATGCCCTATTTTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRSCLQLWDWGPRLLKWPLGGPICSVVPGPIPQLRARAYAPPKERKRFYQNVSITQGEGGFEINLDHRKLKTPQAKLFTVPSEALATAVAMEWDSQQDTIKFYTMHLTTLCNTSLDNPTQRNKDQLIQAAMKFLDTDTICYRVEEPETLVELQKNEWDPIIEWAEKRYGMEIGASTSIMGPSIPAKTYETLASHLASYNMWALQGIEFVVAQLKSLVLTLGLMDLRLTVEQAVLLSRLEEEYQVQKWGNIEWAHDYELQELQARAAAGTLFVHLCSESTTVKHKLLRE	564834	579462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_565127_571150_571196_571486_571633_573048_573147_574677_574759_576812_576926_577480_577597_579189
805774	contig_3380_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_60121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453042	451031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_451000_453000
805775	contig_15047_pilon	-	1627	7	Intergenic	novelGene_52284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	20.7926268983343	23	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	283	1128	84499	82103	TRUE	20	TTTGTCTGTGTATTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRGLHSLQETLDCEIQEDNGTWGFWDYRYDREPFLSYLPETQRWTVPQSLAQTLALEMKKTWDADRDKHKYYGHHVQGDICKRLWSYLDSGRDFMERIAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPAFMRKPRKRSMSQVHGMASEPPA	93346	79348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82051_82174_82700_82842_82958_83229_83873_84162_84423_84686_93250
805777	contig_755_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_119792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAGATAAATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612333	610239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_610200_612300
805778	contig_19558_pilon	+	1305	2	Intergenic	novelGene_164748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_1	0	213	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAACAAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94561	118446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_94601_117180
805784	contig_3727_pilon	+	651	7	Intergenic	novelGene_146746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	401.177433728934	9	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	19	486	300452	305046	TRUE	15	TATTGGCTTTTAGTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEALSCRRPEPDSVWGSLLTDWWLTVIDLQQEVVGCQAKLNLFSS	300433	307457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_304914_305091_307336
805790	contig_9335_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_147471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAGAAAGAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714749	713811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_713800_714700
805792	contig_6076_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_81766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCTCTCGTGAACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413590	413035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_413000_413600
805793	contig_11307_pilon	+	2449	15	Intergenic	novelGene_105254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	545	1063	142277	148066	TRUE	20	CGCGACTAGTTCCTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLMSRTSVAIGSSLFRLTHSMKRDMVWIAWLVSLNASLQVYTEPLMASTSSGCLARNTAMSWAVHPKPSNRSSQKWSLPLLSNSVSDKVHFLAALHKGPDLGAEFFPHAFQIMEHSQLLEGLVHLESAITCLVAGVSGVYKIFPTSRGLRAFQIMRERGLDSKFFIKSLQ	139525	231206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_139749_141366_141540_142128_142339_143190_143391_147474_147601_147935_148071_150226_150468_155369_155465_168987_169159_171244_171370_188092_188212_189566_189708_194142_194238_206712_206878_230976
805796	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	15	1151	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
805797	contig_6031_pilon	-	1053	3	Intergenic	novelGene_56742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	7	166	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	208037	206425	FALSE	50	AAAATTATGCCTAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHQLPGFQPAPRTQEQLPSAFSYLCSALYRERLSHSREEPGRCHLWMQSRREVMLMWSPGGSLAFNSELMTAGAKRSMRPDAPSPSSFASRRLNLNA	208037	205671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_206442_206951_207080_207882
805798	contig_10958_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_5325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAACATTTAGAATGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82299	83010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_82300_83000
805800	contig_3866_pilon	-	1936	6	Intergenic	novelGene_112419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCCGAGAAGCCGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254625	224227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_224392_225365_225430_228061_228147_239656_239700_239790_239821_253075
805802	contig_11883_pilon	+	1732	1	Intergenic	novelGene_163767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACTAGAGAAATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49815	51547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_49800_51500
805804	contig_6069_pilon	-	1430	5	Intergenic	novelGene_8050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.92078264374	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	39	1292	362227	360022	FALSE	5	GCGTGGACCTCCGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPATCAIAAAAAMREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	362265	359883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_360505_360588_361083_361559_361671_361753_361863_362170
805808	contig_17863_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_157619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTCTGAGATTGGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762	2423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17863_pilon_+_800_2400
805809	contig_2817_pilon	+	2022	2	Intergenic	novelGene_104353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	2	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTGTGCTTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420889	424164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_421054_422306
805810	contig_3161_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_84530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATATAATGGGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455364	454351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_454400_455400
805811	contig_3575_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_141130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	387	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCAGGCTGTGCTCACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820904	833872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_821029_833092
805812	SIRV6	+	469	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1856
805814	contig_5210_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_65420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440943	439098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_439100_440900
805815	contig_18610_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_168055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATGAAGCATGAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8828	10524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_8800_10500
805816	contig_8447_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_69444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGATTTACTGAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127878	126407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_126400_127900
805817	contig_8447_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_69443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCCTCTGACTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126306	125130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_125100_126300
805819	contig_14722_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_110221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGGTATGTTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93152	92473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_92500_93200
805820	contig_18173_pilon	-	1791	1	Intergenic	novelGene_160771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	107	412	52663	52358	NA	15	TTTTCATGTTCTTCCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKTKAFYFKQCKQNGKTVICFFWGRCLQHDKVGLMSSIYVANELKKKKKQISSEKDGQKAFIVCKRTIDTWIKEMKIEPRCHSLHVKFANVKNKKNLGIATELKVQFFSLVFCHIFRKGIGKRSHLPSLTMKVEK	52769	50978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_51000_52800
805821	SIRV6	+	359	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	513	-1	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGAGAGTTAGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
805822	contig_9997_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_169471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGATTATGTTACTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31326	33661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_+_31300_33700
805824	contig_8453_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_125102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAGTCATTCTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23705	21424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_21400_23700
805825	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805826	contig_8617_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_73408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62418	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62400
805827	contig_14525_pilon	+	1644	3	Intergenic	novelGene_149782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	43.5	27	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	124	483	235549	237374	FALSE	45	TTCAAAGTAAATATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQELVHQAASLYSDRIAVCFDECNSQHPIYYTYKTLVNDASKLSNFLQLHCDFQGIQEIGLYCRPGINLPSWILGILQVPAAYVPIDPDSPPPLSTYVMKKCNLKYILVEKKQVDVS	234621	238535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234709_235512_235779_237244
805831	contig_4845_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_53654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTAGCAATGTCCGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466598	467817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_466600_467800
805832	contig_12533_pilon	-	1771	17	Intergenic	novelGene_175393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	33.1817320788111	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	48	1625	115076	73376	FALSE	5	TGTCTTTGTCTCTGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKEVLNEERFLGNTKEGAAQDQTMFTAMETFQMSDPKPKKRNGVKCFLALVTVYLILLTTGGGLLVVQVLNLQERIRALEIYLFNDTLAADDSSFFSLRQEMHHPHLARGAWDGEKLQNLQAQLMQVHASQQHLRWQVDNFTQSPELFGSKGEPGSPGLPGQKGAPGMPGTPGLPGPPAEKGARGPMGPSGATGPPGPQGPPGIKGEAGLQGPKGEPGKPGATGTPGPQGQKGSKGDGGLIGPKGESGAKGDRGEMGLPGSKGDVGVKGDMGVTGRPGAPGSKGDSGKPGPPGVTGLPGIKGNQGQPGVQGLPGHPGPAGSPGPKGDPGRAGSAGPTGPPGTPGSPGAAGVKGSKGDTGLQGQKGTKGELGVPGLAGVKGERGSPGPAGPKGASGPAGQKGDPGMKGSPGQKGVKGEQGQKGESPIPVRIIGSPSRGRAEVYHNNVWGTICDDGWDNSDATVFCRMLGYSSGRAIFGVLAGTGQIWLDEVACRGSEESLWQCNKNAWGSHNCAHAEDAGVECS	115123	73229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12533_pilon_-_73507_74623_74801_76418_76464_77237_77337_78478_78524_88140_88204_88285_88385_88872_88909_89011_89111_91957_92066_92391_92437_96002_96048_96127_96236_98551_98588_99898_100130_100968_101071_114967
805833	contig_6233_pilon	-	1501	11	Intergenic	novelGene_74798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	322.203103647373	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	298	1137	149777	143464	TRUE	20	CCTGCTCTGAGATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250174	141555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_141916_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_166962_167024_199837_199943_200462_200546_250135
805834	contig_9233_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_78245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGGTGGGTTCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582760	583743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582800_583700
805837	contig_4531_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_47929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGAGAAGCTTAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626491	625280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_625300_626500
805839	contig_13055_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_104965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGAGATTGCAGTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159629	161122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_+_159600_161100
805840	contig_7728_pilon	-	966	9	Intergenic	novelGene_64711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.771896173901	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	44	892	752150	713565	FALSE	30	TTTATGGAAAAGGCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEGNIWSL	752193	713490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713574_716025_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
805844	contig_6346_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_172088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACACTGCTGTTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241742	243249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_+_241700_243200
805845	contig_6058_pilon	-	1646	9	Intergenic	novelGene_172369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_6	61.036362113088	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	170	1210	255318	239178	FALSE	40	TAGCGAAGAACAAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVEKTTNRSEQKSRKFLKSLIRKQPQELLLVIGTGVSAAVAPGIPALCSWRGCIEAVIEAAEQLEVLHPGDIAEFRRKMTKDRDLLVVAHDLIRKMSPDCLMEIFDNLEQHIQNPLVLQCILSLMERGTMVLTTNYDNLLEIFGQQQSRPMESLDLKDKSKVLQWARGHIRYGVLHIHGLYTDPCGMVLDPSGYKDVTQDPEVMEALQNLYRTRSFLFVGCGETLRDQIFQALFLYSVPNKVDLEHYMVVLKENEDHFFKHQADMLLHGIKVVSYGDCFDCFPGYVQDLTMQICRQCSPDADRVDSTTFLGNACQDCAKRKLEENGIEVSKRLRQSDTDDAGGS	259138	238741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_239198_242721_242806_243703_243737_245311_245598_246881_247011_249235_249425_254038_254292_255271_255328_258978
805846	contig_17840_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_154294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATGAATTCACGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17813	18919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_17800_18900
805852	contig_9727_pilon	-	1328	12	Intergenic	novelGene_86382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	256.940196276896	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	802	1113	582378	578319	FALSE	25	TAGGTGTTCTGTTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622864	578103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583149_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584837_584956_585066_590071_590174_591628_591752_622824
805859	contig_177_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_41775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAAATAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200061	197886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_197900_200100
805860	contig_4151_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_65226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAAAAAACTCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505515	503527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_503500_505500
805861	contig_18967_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_165309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17154	18732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_17200_18700
805866	contig_11702_pilon	-	2031	16	Intergenic	novelGene_142003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.517468008638	181	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	42	1793	527480	506242	FALSE	10	CGCCAGCCAGCTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHGKLRRERAPQAEYETQVKEIRWQLSEQLRCLELQGDLRRELLQELAEFMRRRAEVELEYSRGLDKLAERFSSRGGRLGSGSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQQTRQQSRESAALSEVLTGSLVQRLTHLSEYVGRIVRKSKDLEQQLQEELLKVVSELQTARKTYQVYRTESVNAETKLREAERQEEKRAGRSAAAAAATATTTTEAGPSRKSSIKKGRLVEKVAEIQVEMELRDEIMPRAQNIQSRLGRQTIETEEVNKTLKATLQALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAGRRRGQQQETETFYITKLQEYLSGRSVLAKLQAKHKQLQEAIQRGDKEEREMSWTQYSQRKVQRSRQPRPSSQYSQKLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSRPPP	527521	506003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506257_508408_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277_509339_509956_510060_510269_510298_510545_510631_510707_510900_511114_511217_518380_518570_518801_518865_519090_519254_519327_519536_527413
805867	contig_4364_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
805868	contig_7457_pilon	-	1697	7	Intergenic	novelGene_31439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.723268894491	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	18	695	473193	469283	FALSE	55	TATATCAAACTACATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGFKMTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHLLSLPDPTRDCDWRPAPAKKPALLTGPWKPSEQPARGP	473210	468280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469399_470300_470479_470904_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
805869	contig_13272_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_163946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73320	72959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_-_73000_73300
805870	contig_13702_pilon	-	944	9	Intergenic	novelGene_102595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	42.8806483159945	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	479	859	78098	68217	FALSE	15	GCTTGTCATTGACTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYLAKLIRGMSIDQALAQLEFSDKKGAQIIKEVLLEAQDMAVRDHNVEFRSNLYIAESTSGRGQCLKRIRYHGRGRFGIMEKVYCHYFVKLVEGPPPPPEAPKTAVTLAKEYIQELRNRTIIHTL	99580	68131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_68429_75046_75117_76558_76637_78077_78144_80872_80983_82758_82867_84002_84139_99421_99471_99550
805871	contig_9921_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_23712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23333	22231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_22200_23300
805872	contig_12625_pilon	+	1400	9	Intergenic	novelGene_140480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	556.707718982771	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	187	1131	15248	28904	TRUE	55	GTAACTTGAAAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDHSAQQTNTTGSNVTTSSAPNSNSTSGSATSSPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTSNFSELQSQMQRQLMSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGLFWNEWV	9292	30633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_9405_15173_15431_15913_16073_16678_16914_23321_23465_27153_27238_28478_28595_28879_29011_30470
805873	contig_2438_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_111992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	423	1272	144	1415	176662	177933	NA	20	TCGTTCATCTTTAAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSKHWGEWFLNLRVLPAGVFGVAFLARVALVFYGVFQDRTLHVRFTDIDYQVFTDAAGFITKGRSPYLRATYRYTPLLGWLLTPNIYLSELFGKFVFISCDLLTAFLLYRLLLLKGLGRRQACGYCVFWLLNPLPMAVSSRGNADSIVASLVLMTLYLIEKRFVACAAVFYGFAVHMKMYPVTYILPIVLHLLPERDNEEGVRQSRYSLQGRLYEFLKRLCSWAVLLFVAVAGLTFFALSLGFYYKYGWEFLEHTYIYHLTRRDIRHNFSPYFYMLYLTAESKWSFSLGIAAFLPQFVLLSAVSFAYYRDLIFCCFLHTAIFVTFNKVCTSQYFLWYLCLLPLVMPLVRMPWKRAVALLMLWFMGQALWLAPAYLLEFQGKNTFLFIWLAGLFFLLINCSILIQIISHYKEEPLAERIKYD	176518	178583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_176500_178600
805875	contig_14446_pilon	-	2171	2	Intergenic	novelGene_160709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGTATTTCACTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167464	110277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_-_111948_166963
805876	contig_17753_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_105035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTAAAGTTTATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25681	26558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_25700_26600
805877	contig_16625_pilon	-	1256	5	Intergenic	novelGene_171111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_3	4.43705983732471	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	393	1070	65826	32740	FALSE	40	CAGCTTTGAATAATAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFPKISLRPEVENYLKEGFMNKEVVTSLGKQEAERKFQTLLNHLSHPPSFTTVRVNTRLASVQHVKNLLLDELQKQFNGLNVPILQHPDLQDVLLIPVIGPRKNIKKQQCEAIVGAQCGNAVLRGAHVYVPGIVSASKFMKAGDVISVYSDIKGKCKKGAKEFDETKIFLGNGISELSRKELFSGLPELKYVIKCCLGRISILFVVQRKLKTILRIYLVALYK	66218	32553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_32997_34818_34929_54768_54849_63713_63870_65751
805879	contig_11552_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_171668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTGTGATGCAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84854	85636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_84900_85600
805880	contig_5003_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_120221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCTAACCAAAAGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173938	174244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_173900_174200
805882	contig_3270_pilon	+	982	2	Intergenic	novelGene_104444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11401	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTGTTGAGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45051	46757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_45211_45934
805883	contig_3424_pilon	+	1690	2	Intergenic	novelGene_55554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	146	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1512	177	1688	376440	377951	FALSE	15	TATGCATTCTCCTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWSRQLRYFQCRKKVRPIQKTWIQDESLFAKTKSNVAAPNVSTFSSKVKRKGTEQFVSSSRTILELQSEKLLSLAKNSDHEYGGERSLLKAGADLPANSVLGQASGRRPRTEPHASDFPMKFNGESQNPGESGTIVVTLSSHKRKRFCYGCCQGLEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKVSPLMMYEKLSMIRFRYRILRSQHLRTKRKICKQKKSQQSWVQKVTGDYQETFRENCEGGSCSLFPSPEPKDSSCRHPPYFPDMDSDAVVKEKNSPAPDGHSKGSPFLGKELSLGEAFPDQQNGSATYTWDQSSSSSPKWECTELIHGTPLPEHHSSNVFISETERDSMTLGQDSQTSDVDDGRVKLSVSGADKSLGCMDGPVSEETVQNESSYQMEEDGSLKQNILSSKLLDHPYCKSPLEAPLMCGGLKLENQVGGGKNGQKASPVDDEQLAVCLS	364897	377953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_365043_376408
805884	contig_12837_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_57282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	66	395	60580	60251	NA	30	TAAGAGCTACGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAGLPVSGGGSGEERTLLVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTGKPPHQPVPILALTPGKCGGGGGVKFWGQGVGPGERRVTREPERWGLSAQPRPERVRCQLSALGCRLAAVCGMVS	60645	59695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_59700_60600
805885	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
805887	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
805888	contig_2730_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_135398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAACAGTTGCCTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454058	453572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_453600_454100
805889	contig_11285_pilon	+	1299	5	Intergenic	novelGene_5505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_3	65.9185102987014	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	70	657	542637	546213	FALSE	5	GATTCCTTTCTTGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAQGAGIAVAEALQNQMPGLEKLWLWVTFLGDPKCLFLFYFPAAYYTSRRVGVAVLWISLITEWLNLVFKWFLFGDRPFWWVHESGYYSQAPAQVHQFPSSCETGPGSPSGHCMITGAALWPVMTTISSQLATRTHRCCPGLADDPPGAHGTGAKLLWFDGTGSHAGRQPHLLDPLYTGPGSFLVHQPSFQVV	542567	546855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_542855_544727_544835_545243_545335_545818_545961_546183
805891	contig_16382_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_160228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCCAGCACTATTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215312	213719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_213700_215300
805894	contig_7410_pilon	-	2667	5	Intergenic	novelGene_106075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	2.69258240356725	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	689	2401	378956	377244	FALSE	25	TACTCTCTGATATGTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGSKNGSDKEDKFEDAYEVIPVATTMNLISSLEECTTGLYLFLNNRFSDAINLIYPWSHNSMYHALIYDILMVVKAILTFEPYDIQIGMTTTKNALKTCNSFRRKSRMTSLARIVTKQGIKDIQEEELHAEICYAECLILKSAVTFIQDDTLLGFLKSGINVGLSYQIYKDCQQVLIQISNYESKAHKHLVGGIKFGLGAFNLMLSLVPPKTLKLLNIVGYFGDREVGLALLHESASESHINNILSAFTLLFYYNYIYIAFGVEKGYNSAIDGLFLTYLEKFPNCVILIFFHARFRMLKGHFEFAQLKLRKCIFVQNEWKQIHHLCYWELMWCHIFLQEWKEAYYYASLLSQHSRWSKAIYMYSKAILLALLPSDSVNEDMNALFLKVDSLRIKIFGTSVPIEKFVAEKGERYATTSGWFTAQPILEFLYAWSGFRVMSKRLDLISSWLSLIDKGEDMLKENPSKEYGTDDISLLHLLKGLCLKHLGKYSRAEHYFNRVIQKEKLLKYDHYLAPYTHYELGILYYLKRDYVSAIRSLDKIKNYKDYAMEARLQFRAHIALEQIAKEK	405009	376977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_379104_381064_381171_397109_397214_403970_404062_404769
805896	contig_5302_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_81401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCAAACCTGTTGCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156094	157441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_156100_157400
805898	contig_7945_pilon	+	1924	9	Intergenic	novelGene_161589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	26.3696677074248	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	94	1461	366072	524517	FALSE	65	GGAACATATCAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTIKEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSNDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQPPTRVTIKMECNPNQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHIPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYSLPDVDILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSNCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHTHSQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPASHMPSHLGTYY	365978	524980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_366090_433799_434018_465816_465969_499460_499665_500474_500556_513319_513389_514010_514068_515597_515646_523996
805903	contig_11294_pilon	-	1143	2	Intergenic	novelGene_50048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGTGAGCAAGCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234559	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_233270_234434
805909	contig_14722_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_110230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAAGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143340	141684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_141700_143300
805910	contig_6885_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_83631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAGAGGGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7305	6300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_6300_7300
805912	contig_15327_pilon	+	2827	1	Intergenic	novelGene_70805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCCTTCCATGCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292370	1295197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1292400_1295200
805914	SIRV4	-	354	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	260	3	-260	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCGGACGTTCAAACGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
805916	contig_6175_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_16312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTATGCTATGCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467098	1467787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1467100_1467800
805917	contig_9937_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_129201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	57991	57674	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVVRNMYLKENEMITLKTKVCLSFLSSAVELSMLIFILFSRMSVFLLNKLLRLLLKYPL	58213	56895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_56900_58200
805921	contig_116_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_154889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTAGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61492	63614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_61500_63600
805922	contig_14068_pilon	-	159	1	Intergenic	novelGene_165962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTTGTTAATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37309	37150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_37200_37300
805925	SIRV2	-	426	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1418	1	255	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4477	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338
805926	contig_11003_pilon	-	1585	13	Intergenic	novelGene_105413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.6449329016041	99	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	46	1473	27839	12844	FALSE	15	GTTGGATTCTGTGTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRSFGGDVSWDKSLCIGATYDITDSCITHQIVDRPGQQTPIIGRYYVQPQWVFDSVNARLLLPVEDYFPGVPLPPHLSPFISEKEGDYIPPEKLKLLALQRGEDPGEREGSASLGPLWCQARFGAPRSQ	27884	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_12904_14974_15174_15307_15434_15827_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
805927	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	20	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
805929	contig_8587_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_159138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGGCTCTCCCTGCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478328	478581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_478300_478600
805933	contig_13823_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_145231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18255	19152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_18300_19200
805934	contig_5479_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_133562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTTTTGTTACGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72923	74173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_72900_74200
805935	contig_7909_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_155925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAACAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548657	550606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_548700_550600
805936	contig_9683_pilon	-	2523	3	Intergenic	novelGene_151292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_2	11.5	23	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1248	1814	546674	543440	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGNVSGESLRSEYGTPTKSPPAALEVVPCIPSSTAPSDKAPPDKESSGNSNAGSSALKRKLRGDFDSDEESLDYNLDSDEEEETLKSLEEIMALNFSQTPAAARKSPALPKGLSSQSSDYTEHVHCGTYTNTLERLVKEMEDTQRLDELQKQLQEDIRQGRGIKSPLRIGDPDTTGDEDGLLEEHR	547921	542730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_543567_545257_545329_546305
805940	contig_15031_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_138420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148822	147769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_147800_148800
805941	contig_19769_pilon	+	641	6	Intergenic	novelGene_102263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1486.43016653996	115	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	36	374	87249	88883	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGAPRRSSPQPTEPWLVWWLVVAALTSPS	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87584_87997_88040_88841_88958_89163
805943	contig_6550_pilon	-	1708	9	Intergenic	novelGene_110657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	134.405868547471	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1329	378	1706	97436	48167	FALSE	35	ATATCATACGCTGCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESDTEEFYDAPEDVHLGGGYPLTSAGKVRLSTLKQETENTASKVRNESPVQELKQDVSKKIIESIIEESQKVLQLEDDSLDSKGKGLSEQATASSIAAGTDLSSIPGLLAIDQVLQEDSKKAESQNVFEETELESKKCSPSDDTYEKPADETTTLTEVSSTEQLNVPETEGEVVNKEATEVKRSDVLEPASSNSSSAKDFTAMEEVAPAKPPRQLTPEPDIVASTKKPVPARPPPPTNVPPPRPPPPSRPAPPPRKKKSESEFEALKTPDLEVAKENVVSDTLLTTNIVSESTAKDSQPSLDLASATSGDKVVTAQENGKAPDGQTVAGEVMGPQRPRSNSGRELTDEEILASVMIKNLDTGEEIPLSLAEEKLPTGINPLTLHIMRRTKEYVSNDAAQSDDEEKLQSQSTDTDGGRLKQKTAATNIFVCIACSIFKYYP	97813	48164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_48222_51298_51383_52419_52557_53692_53789_54865_54997_55473_56111_60069_60148_66156_66191_97359
805944	contig_1308_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_172683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGGCCAGATAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58339	59044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1308_pilon_+_58300_59000
805945	contig_7744_pilon	-	1646	5	Intergenic	novelGene_62498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	66.6609893415932	238	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	153	602	807379	796824	TRUE	25	TCAACCATTCTTTTACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTYGVGCIALGEAGPVGSMTVVDSPGQEVLNQLDVKASPEMTNAEASIEMSLPTPLPEFEDSPDKKRFPLEQESLSRLEQQDLSSEMSKVSKPRASKPGRKRGGRTRKGPKRPQQPNPPSAPLVPGLLDQSNPLSTPMPGQTAAGGYS	812529	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_796545_796822_796854_806786_806960_807132_807404_812401
805947	contig_18735_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_132677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGGTTCTGCCATCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64841	63774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_63800_64800
805948	contig_12619_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_73564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796643	798660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_796600_798700
805949	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
805950	contig_10765_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_122964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAGCAGCGAGGGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392093	391443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_391400_392100
805953	contig_3529_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_105366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588610	586872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_586900_588600
805954	contig_11615_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_151264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAACTAAATGCAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64688	63923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_63900_64700
805955	contig_4125_pilon	-	1740	2	Intergenic	novelGene_25241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	813	1130	2798547	2797797	FALSE	35	TCATAAAATCATTGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAFSPDNYYLATRNDNIPNAVWIWDVQKLRLFVVLEQLAPVRSFQWDPQHARLAICTGGSRVYLWSPAGCVSVQVPVEGESVPAGECAAVDCCTACHQTQGETM	2799359	2797186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2798069_2798501
805957	contig_9363_pilon	+	666	4	Intergenic	novelGene_6629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1235.46761277754	712	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	94	564	872605	873683	FALSE	5	CTTGTGTTTTTCCTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	872391	873785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872469_872588_872729_873004_873095_873426
805961	contig_12151_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_54989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCCTGAACCATTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015887	1015413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_1015400_1015900
805962	contig_4402_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_140805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTCTACTTGTCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250430	249751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_249800_250400
805965	SIRV6	+	284	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	8133	14	606	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTCGAAATCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	3146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106
805967	SIRV6	+	411	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	114	6	-73	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	59	298	2458	3109	TRUE	40	AGTGCCGCTTGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2399	10782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
805971	contig_9440_pilon	+	1827	1	Intergenic	novelGene_59042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAAGGTAACCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336002	337829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_336000_337800
805973	contig_13744_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_77198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	568	876	956814	956506	NA	25	AATTTTGGTGTCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLVRSVGEGPRLSFLLVLELLLLQWDQGGEVGFPLPLSFLWGWLWASVPSSPSCPQDWPPRGPGSRSGKEAAPSQHAAGNTVAGGQGRKGQFESRVFGRS	957381	956450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_956400_957400
805974	contig_6589_pilon	-	1514	8	Intergenic	novelGene_26213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	62.8051733212987	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	194	688	2032681	2030536	TRUE	35	CACCTTGACCAATAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQKPRILPWLISQLDMGQLEGVAWVDANRTRFRIPWKHRLRQDTQQEDFRIFQAWAEVSGAYNPERDKPDPPTWKRNFRSALNRKDVLRVAEDRSKDPLDPHKVYEFVTPGVRDFPESDTSPDTNDRGSTSDTPADILEELLGDMVLASVPDGGALRPGCGL	2033637	2027959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032516_2032690_2033452
805975	contig_5711_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_80267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAATTTGTTGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57901	58639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_57900_58600
805976	contig_7308_pilon	+	1070	5	Intergenic	novelGene_159631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_4	107.035916869058	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	57	392	614741	616253	TRUE	15	AACCCCTTGGCTCTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAPLFLSRRLAPDTADIMGFGDLKTPAGLQVLNDYLADKSYIEGYVPSQADVAVFEAVSSPPPADLYHALRWYNHIKSYEKEKASLPGVKKALGKYGPANVEDTTGSGATDSKDDDDIDLFGSDDEEV	614684	617527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_615491_616120_616604_616998_617125_617325
805980	contig_11986_pilon	-	1210	8	Intergenic	novelGene_69162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1010.77252734768	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	365	1063	523776	507353	FALSE	15	TCATCTTGCGTGTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEPEAQEM	525682	507205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507377_515283_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_525350
805981	contig_11590_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_125617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGTCAAAATGTCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038452	1036226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_1036200_1038500
805983	contig_12278_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_152593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGCAAGGAGGTCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189634	190120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_189600_190100
805984	contig_1948_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_31159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGCGGGTAGTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465597	465216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_465200_465600
805986	contig_4364_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCAGAGTTGAAGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021410	1021906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1021400_1021900
805987	contig_4364_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	247	585	1017647	1017985	NA	60	AGAGAGATAAAGAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKFGSHSLTGLRKQEIKPRTQPKWESNGQVSSPPTYKTGNSQCRGEPGALPAPSHPIRTCEENERLDLWQNGRQRADSYHLQPQVSALVVYSPSSLYLDDLINLRLKMLI	1017400	1018418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1017400_1018400
805989	contig_7965_pilon	+	1721	5	Intergenic	novelGene_174403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	13.3299474867683	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	52	819	216355	227555	FALSE	10	TAGCATGTTTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEEWQKSKGKVYKRPPMELKTKRKVIEKMNVSFWKSIEKEEEEKKAQFELSSKINNTLTECLQLIEGGVFSNEVFTILSSIPEAEKFAKFWICKAKLLARKGTFDVIGLYEEAIRNGATPILELREVILNILQDPNRTVEGITSDSLAAEELIKKMESEKSCLSPKEREQVTATPQVTKACQDNHPGIKLQIAPIPRLIGMPEVQDMKLITPVRRSARIERAVSRYPEMLQDHDLVVASLDELLEVEETECFIFRKNEALPVTVEFQILES	216303	228457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7965_pilon_+_216508_220958_221115_225347_225412_226771_226941_227329
805991	contig_4640_pilon	+	1218	8	Intergenic	novelGene_147972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	74.2923073997269	12	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	231	1217	476761	491736	FALSE	50	AAGTATATCTTAATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERRRLKNAIIIQSFIRGYRDRKQQYSIQRSAFDRCANLSQSGGTFSIASGPSLTLLVRQLLFFYKQDEDSKRLIWMYQNLIKYSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENTYLPVLHDASYVVSVIEQILHYMIQNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLARVPVAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFVIPALADVQTVFPYEPFLNALLLIESRYSKKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGTLSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSSANTSCHDSASDSEDENEEADKQTSTPEDGRLSLPYITEECLKKLDTKQQTNTLLNMVWRDSASEEVFTMMASICHMLMVQHRMMVPKVR	468881	491737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_468959_469592_469740_476754_476871_484825_484984_489424_489579_490009_490231_490663_490819_491547
805992	contig_14575_pilon	-	1881	18	Intergenic	novelGene_101891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTCAGTAAGCTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63885	22684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_22716_23512_23677_26336_26426_27682_27778_28956_29020_30471_30769_32697_32847_33859_33910_39337_39553_41532_41657_42763_42849_44947_45004_47300_47374_59250_59380_59885_59981_61546_61637_62293_62355_63870
805993	contig_11961_pilon	+	2145	4	Intergenic	novelGene_153687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	6.64997911442	58	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTAGCTTTGAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81607	102575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_+_81699_98903_100894_101385_101417_102542
805994	contig_11161_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_175650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGAGGCTCCACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286225	285661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11161_pilon_-_285700_286200
805995	contig_11304_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_156674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCCCAAAAAAAGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261730	263374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_261700_263400
806001	SIRV6	+	389	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	378	0	212	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
806002	contig_333_pilon	+	1525	1	Intergenic	novelGene_170915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17144	18669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_+_17100_18700
806003	contig_1009_pilon	+	2599	9	Intergenic	novelGene_121716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	6.24374687187109	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	78	1550	66739	78759	FALSE	30	TCAGTGCAGGCAAGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLNLPFHGCFLLTLLGLWKTAPEAHALSAGTPAISAVSFLQDLMHQYGEGDSLTLQQLKALLNHLNVGLGLDNVTQPEQEQRNISRCFSSRDLFAAHNLSDQSWIGRSKFQEFCPTILQQLNSRACTSENQENEENEQTEEGKPSNIEVWGYGLLCVTIISLCSLMGASVVPFMKKTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEKVLKMLLKQKNEHHHGHSHYTSETLPSKKDQEEGVTEKLQNGDLDHMIPQHQNSELDGTTPVMDEKVIVGSLSVQDVQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGASFTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYVGLAFGILAGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVSQEDERKGSVLISFVIQNLGLLTGFTIMLVLTMYSGQIQIG	29694	79808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_29757_66723_67003_68927_69115_72035_72206_74067_74191_75254_75444_75559_75768_76935_77121_78612
806005	contig_15777_pilon	+	1796	4	Intergenic	novelGene_75741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGGACTGAGCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204809	215784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_205203_206905_206979_210065_211019_215407
806006	contig_1624_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_138370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76540	77493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_76500_77500
806007	contig_152_pilon	+	720	6	Intergenic	novelGene_162641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_3	182.083057970806	2699	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	61	549	723004	731492	FALSE	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGERRRQFSGRGGERIPTVYVDGSCKNNGRDGAKAGCGVFWGPNNPLNVSERVSGRQTNQTAELRAAHKAIEQAKSLNMDKLIIETDSKFVIQGVTKWMDNWKQNGWKTASGRDVVNRSDFEKIDQASRGMDIQWKYVPGHQGIKGNEEADRLATEGSRK	722943	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
806008	contig_4156_pilon	+	2121	2	Intergenic	novelGene_88118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTCTGAGTGTGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411550	434142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_413081_433551
806010	contig_7057_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_123178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGATTAAAAAAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20596	20909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_20600_20900
806014	contig_10235_pilon	-	1586	11	Intergenic	novelGene_46278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	391.622522334965	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	124	1398	25335	14151	FALSE	20	TGAAACAGTGTGCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	27252	13962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_19632_19752_20850_21023_23722_23816_24175_24304_25124_25338_27131
806015	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	23	8027	23	221	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGGGACGTATCGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2308	2761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
806017	contig_5779_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_106523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATAGCTTGTTGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314743	311833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_313429_314264
806018	contig_8452_pilon	-	1392	5	Intergenic	novelGene_48071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	850.280247918297	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	56	493	991128	918284	FALSE	35	ACAGATGCATGAGGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQRGTKGRAMAMHPRRFQSLEQWRCSLQTCSIALQVPRSF	991183	917384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_918399_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
806020	contig_3900_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_84182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGATTGAGACATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216394	215301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_215300_216400
806024	contig_10235_pilon	+	1740	8	Intergenic	novelGene_46583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	27.7437251592912	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	237	1052	567174	581650	FALSE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	565822	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566051_567165_567360_567602_567757_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
806026	contig_8394_pilon	-	1249	2	Intergenic	novelGene_27305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	3	677	33434	32690	FALSE	20	TTAACCCTTTTCATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLNPQSTKPS	33436	32117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_32718_32787
806027	SIRV7	-	817	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113098	1	112920	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1818	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_1800
806030	contig_6227_pilon	-	2211	7	Intergenic	novelGene_49800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	88.152172721695	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1128	1490	1290927	1260481	TRUE	55	CTAAAGTACAATAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1308753	1253885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1290995_1291058_1292061_1308695
806031	contig_6710_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_96621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653795	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
806035	contig_7165_pilon	-	1458	9	Intergenic	novelGene_116824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCCGCTGCACGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256609	231708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_232049_233709_233872_238291_238413_239902_239988_245487_245599_254161_254227_255052_255138_255598_255653_256174
806036	contig_10013_pilon	-	868	7	Intergenic	novelGene_125068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	97.5746153236361	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	127	804	454180	452428	FALSE	5	CGGTCTGAGCCTCCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNIYIKRAAEIYGVTHTRGIYQKAIEVLSDEHAREMCLRFADMECKLGEIDRARAIYSFCSQICDPRTTGAFWQTWKDFEVRHGNEDTIREMLRIRRSVQATYNTQVNFMASQMLKVSGSATGTVSDLAPGQSGMDDMKLLEQRAEQLAAEAERDQPPRAQSKILFVRSDASREELAELAQQANPEEIELGEDEDEDEMDLEPNEVRLEQQSVPAAVFGSLKDD	458684	452363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_452490_452571_452682_452808_452939_453487_453660_453778_453902_454099_454199_458576
806042	contig_8322_pilon	-	2646	1	Intergenic	novelGene_143220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCACCAGCCCCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122469	119823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_119800_122500
806043	SIRV6	+	412	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	20	53	20	-53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATAGAGGCACCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
806045	contig_4426_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_15390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAACAAGATAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451678	452568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_451700_452600
806046	contig_5145_pilon	-	767	2	Intergenic	novelGene_131417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3907	junction_1	0	344	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	294	311	823503	823486	FALSE	80	AATAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKPKRGRRSWPRKRTATHTCSYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYHCNWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCHLCDRAFSRSDHLALHMKRHL	824478	823029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_823662_824343
806048	contig_14509_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_168564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	709	1131	280701	281123	NA	65	AAAGAAAAAAAAAACGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRAGTSTGTVLLRTQDGLEIKFKVKELLYGSLMVSLYSHSRRANTGIQRLGWPCVVVGGCGSVQKCSLGDQCSECPRSPGILGVRELANSLGGWGVGVGEWYKHTQQLRFTFHFCNLQLCHLELAAQTLSLYLSFALM	279992	281214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_+_280000_281200
806049	contig_6954_pilon	+	1253	3	Intergenic	novelGene_64435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	14	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTACAAAGCTTTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257139	259535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_257209_257924_258031_258457
806050	SIRV6	+	168	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	222	490	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
806052	contig_6616_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_141763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	504	8	511	346125	346628	NA	25	AGTAAGCCGGCCAGTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQMLTALWYRRQRLLAKTLRIWFEKSSRGQAKLEQRRLKEALERKKEEARQRRREVKRRLLEELASTPPRKSARLLLHPPRDVAKAMAERRPTTLPTSRKAPGSRLKQHRKPAMAPGVTGLRNLGNTCYMNSILQVLSHLQKFRECFLNLDPSKTEQLFSKATNGKAQLS	346117	346628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_346100_346600
806054	contig_3825_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_78000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTAAACAGACGTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385825	1387492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1385800_1387500
806056	SIRV7	-	269	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69007	4	35788	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
806058	contig_16716_pilon	+	1189	6	Intergenic	novelGene_169288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	10.6845683113545	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	13	348	180574	194835	TRUE	15	TGGTGTTCTCCATTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVKAMRSSTAELFWRDAVMPYSAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIGFLIGPFVYKTQVSTANQIAIAFRKCRYYYF	180561	204882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_180628_183761_183834_184294_184410_186426_186479_194792_194902_204107
806059	contig_19098_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_65867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTGACCATCCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489467	491359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_489500_491400
806060	contig_14441_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_100792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	142	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	126035	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWPLLGFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	126033	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_126055_126175_126283_126514
806072	contig_10126_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_105775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTATTTGATGGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398130	400217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_398100_400200
806073	contig_14029_pilon	-	1275	5	Intergenic	novelGene_151952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGGTCGAAGCAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135622	131771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_131838_133181_133340_133560_134019_134102_134317_135243
806074	contig_7070_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_104028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGTCCTTTAGCTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33281	33636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_33300_33600
806075	contig_8954_pilon	+	1314	4	Intergenic	novelGene_130313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_3	144.799478206549	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	880	1218	623271	638614	FALSE	30	GAATTTTTGCCTAAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFSFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQMEFKAVQQVQRLPFLPSSNLSLDILRGTDETIGFEDILNDPSESEVMGEPHLMVEHKLGLL	622391	638710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_623346_627018_627121_632111_632206_638546
806076	contig_10904_pilon	-	1055	6	Intergenic	novelGene_22615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.080854108971	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	355	765	510205	499423	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLQWISPTPSCKIKVLPGEEPPLCTCYSAPGIQKARSIPKTSEAAGGGLFLHKFPFCGATVWG	515076	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499610_507413_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034
806080	contig_20199_pilon	-	980	3	Intergenic	novelGene_82588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	166	459	43987	41171	FALSE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44152	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41943_42078_43906
806081	contig_15219_pilon	+	636	3	Intergenic	novelGene_40847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	9	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	36	341	61074	63995	FALSE	5	ATCCCTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAADRPYHSGDMEDASGGRGDDRVRDLQSEVEGVKNIMTQNVERILARGENLDHLRNKTEDLEATSEHFKTTSQKVARKFWWKNVKMIVLICAIVFIIILFIVLFATGVIPV	61038	64290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_61077_62372_62532_63851
806082	contig_8852_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_159841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCTGTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61066	59718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_-_59700_61100
806084	contig_2715_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_173177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCGTCTAGAGGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139982	140703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_140000_140700
806085	contig_8476_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_121340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTTAAAAAACTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138302	137802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_137800_138300
806088	contig_12638_pilon	+	1220	11	Intergenic	novelGene_33157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	197.089218375841	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	55	1026	269238	274265	FALSE	20	AGACCACTGCTTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVKQDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYPYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235621	274459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270923_271155_271236_274182
806090	SIRV7	-	320	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	14	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114724	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
806093	SIRV6	+	352	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	0	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	225	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
806094	contig_12948_pilon	+	1002	5	Intergenic	novelGene_126188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCGGGAGTGGCGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203057	209706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_203590_204892_204999_205869_205986_206247_206372_209582
806101	contig_6189_pilon	-	2067	11	Intergenic	novelGene_164961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	256.548026692859	2	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1104	1631	191251	188226	FALSE	35	ATACATTCTGAACATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSATNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFES	202743	187789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_188337_190412_190640_191061_191253_192179_192288_193662_193833_194666_194823_198484_198644_200065_200169_200270_200403_201997_202154_202625
806103	contig_1939_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_144875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATCTGATGAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398013	398543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_398000_398500
806106	contig_5780_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_29771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAGCAAAGTAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68455	69459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_68500_69500
806107	contig_10494_pilon	+	1590	9	Intergenic	novelGene_102227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	58.7493351026205	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	141	1535	1254986	1299973	FALSE	50	TGTTTTTTAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRTALVDQHGHHTYKDLYQRSLRLSQEICRLRACTSGDLGEERISFMCSNDASYIVAQWASWMSGGVAVPLHSKHPAAQLEYFIQDSRSSVVMAGPEHLELLGTVASKLGVPLLPLLPDIYSGAAEGLVGGEAPAPSWKEWGWKERGAMIIYTSGTTGLPKGVLSTHCNVSSMVTGLVDKWTWTPDDVILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTGDTVMFKDGRYWIRGRTSVDIIKSGGYKLSALEIEQHLLAHPSITDVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLRDGHSLSQQELREWARGSTAGQLKIHPDLQNHSWKTTV	1254845	1300028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1255367_1256236_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283905_1284033_1297703_1297839_1298214_1298327_1299903
806108	contig_14704_pilon	-	876	9	Intergenic	novelGene_82705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	361.254671250075	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	116	748	111918	77673	FALSE	30	CCTGCCTACATAAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHKLLRPQTRLTKGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDEEWTLLL	116446	77544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85406_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_111873_111947_116359
806113	contig_15236_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_141600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519867	520381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_519900_520400
806120	contig_11935_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_175654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGGAGACAGAGTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37364	37706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11935_pilon_+_37400_37700
806123	contig_6710_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_98199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	ACAAAACACCTATCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
806124	contig_11328_pilon	+	824	6	Intergenic	novelGene_88406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2297.08453479623	7	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	37	408	643683	645256	TRUE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKEGYSRTD	643646	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645233_645376_647064_647223_647899
806125	contig_10857_pilon	+	944	9	Intergenic	novelGene_160926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	376.32264664115	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	197	694	530230	532828	TRUE	25	TATGTCAGCACGGCTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKCIKYLLFVFNFVFWLAGGVILGVALWLRHDPQTTNLLYLELGDRPAPNTFYVGIYILIAVGAVMMFVGFLGCYGAIQESQCLLGTFFTCLVILFACEVAAGIWGFVNKDQIAKDVKQFYDQALQQAVLDDDASNAKAVVKTFHETLNCCGSSALSTLATSLAKNSLCPSGSTVLSNLFKEDCHQKIDELFSGKLYLIGIAAIVVAVIMIFEMILSMVLCCGIRNSSVY	512743	533262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_512793_527516_527632_530197_530296_531019_531095_531428_531534_531931_532034_532604_532692_532765_532883_533066
806126	SIRV2	-	632	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	50	4	-50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTTAGACCTACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
806127	contig_14876_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_170244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTTGTGAAATAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78517	77344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_77300_78500
806128	contig_13460_pilon	+	791	6	Intergenic	novelGene_162169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	70.2242123487334	306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	254	658	7936	19547	FALSE	25	GATTTTTTTAAGTTCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENSPSPLPERAIYGFVLFLSSQFGFILYLVWAFIPESWLNSLGLTYWPQKYWAVALPVYLLITIVIGYVLLFGVNMMSTSPLDSIHTITDNYAKNQQQKKYQEEAIPALRDIPISEVNQMFFLAAKELYTKN	6232	19680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_6402_7676_7737_7911_8018_13302_13376_17726_17846_19416
806129	contig_1596_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_131582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTTACTCAAATGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70329	72375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_70300_72400
806130	contig_9185_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_166886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207189	209401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_207200_209400
806131	scaffold_12510_pilon	+	2335	7	Intergenic	novelGene_151394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	64.6462596666573	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	124	1413	360239	393867	FALSE	25	GGGTGGTGAAGCTCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPEGAGMELGGGEERLPEESRREHWQLLGNLKTTVEGLVSANSPNVWSKYGGLERLCRDMQSILYHGLIHDQVCCRQTDYWQFVKDIRWLSPHSALHVEKFISLHENSQSSTDGVSERAIAELWLQHSLQCHCLSAQLRPLLGDRQYIRKFYTDTAFLLSNAHVTAMLQCLEAVEQNNPRLLAQIDASMFARKHESPLLVTKSQSLTALPSSTYTPPTSYTQHSYFGSFSSLHQSMLSHGSERKSSSLSGPSQKPQESRGHVSPAEDQPVQASLLSISALARNSPLSSNEMSSSTLTSPLEASWVTSQNESPSDASEGPEYLAIGNLDPQSRTTSCQSHSSNTESSSFNLFSSSSSQKPESTASSLGDQEGGGQNQLSSVLRRSSYSEGQTLTVHIGAKKSHTRSHSDTNIISSGAPGNDKRQAASWI	360115	394789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_360304_375286_375441_388578_388663_390165_390326_391159_391267_392503_392661_393304
806132	contig_15839_pilon	+	1890	10	Intergenic	novelGene_136416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	45.6849111973648	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1680	210	1889	106637	154376	FALSE	40	AAAACTTTGCTGGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRKGQGPGGGRGRKKRGLSDISPSTSLPPLVEGQLRCFLKLTINKIIWKIAKPPTCVLVRVRWWGETSDGTLFCPRDALQPEPKAVRTTTRYAIRCGPKQFTSYLTDMAVLVLDVITKLDHLPIGRVQISGLAQLSPTHQINGFFTIVSPTSKKLGELQVSLALEPLSETYDSYSPLPTTDVTENVHLSEQGFRENIEPSNTQFLVPSRPHGIPVTKIDGKELATNSSRSTTPRGKDHLYFAENSDTIKDSFFELQHHLNSGQSLESVTLKGKAPQKQMSLLNSSEFQPQTRTVAKSRSDSCVLSSNNPPTKDLLSALLEQGNKLRNAMVVSAMKSSPDTSMLLDEVHPPMKGDSLRASTQIRAWPRNHFKDHIEDHLLHPTENAFWKHDPKADTRAIQLLLGSAELSQGHYWNGLGSPPDSPSPGSDVYCSSELNDPQYDQSLLENLFYVAPKSDSSISDCPSEDGDIIPSKKMNQSKALARSPKAVDSSSHKLKKAADKKNRNLVEQQMLSETLEDAQMMTLSVDRLALLGRTHSVRIIIETMGVPPDSPQMMLGK	106427	154377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_+_106692_110017_110288_115459_115618_121717_121942_122839_123088_128654_128788_129958_130088_149858_150007_153194_153347_154213
806133	contig_15236_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_141647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATAGCAACCCCAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682562	681064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_681100_682600
806134	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	54	497	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806135	contig_15691_pilon	+	1172	2	Intergenic	novelGene_60771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTTTAGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68553	114428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_69581_114283
806136	contig_8060_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_104834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201865	203205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_201900_203200
806141	contig_10319_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_147247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTGAACCGAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120508	119003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_119000_120500
806142	contig_12540_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_148063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACTTAAAAAGAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220550	219287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_219300_220600
806144	SIRV4	-	357	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1166	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3992	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
806145	contig_8063_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_152443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATATGAAGAAGCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727531	729542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_727500_729500
806146	SIRV4	+	303	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTTTGAAAGCTGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
806148	contig_15029_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_128197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTGTCCTATAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166271	167128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_166300_167100
806149	contig_12638_pilon	-	2537	11	Intergenic	novelGene_33197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2.00249843945008	44	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	329	1060	279670	277322	FALSE	45	ACATGTATAAGACCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTMSEYYERVRSQGQQLQQLQAELDKLHKEMSSVRAANSERVAKLVFQRLNEDFVRKPDYALSSVGASIDLEKTSHDYEDADTAYFWNRFSFWNYARPPTVILEPDVFPGNCWAFEGDQGQVVIRLPGRVQLSDITLQHPPPSVAHTGGANSAPRDFAVYGLQVDDETEVFLGKFTFDVEKSEIQTFHLQNDPPAAFPKVKIQILSNWGHPRFTCLYRVRAHGERTSEGAGDSTTGVTGGPH	281111	275844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_277481_277594_277685_278348_278517_278833_278950_279087_279164_279427_279537_279656_279683_279990_280035_280284_280347_280560_280599_280939
806150	contig_6871_pilon	+	1028	4	Intergenic	novelGene_21518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	33.3099918276117	102	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCTCATAACTGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52465	58825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54467_54521_54695_54740_57960
806151	contig_13215_pilon	+	920	7	Intergenic	novelGene_145884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	345.658630571969	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	59	442	103354	180336	FALSE	20	TGATCCTTTGTGCTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHEPPPRVVRFGPGWEAEKMPQSKSRKIAILGYRSVGKSSLTIQFVEGQFVDSYDPTIENTFTKLITVNGQEYHLQLVDTAGQDEYSIFPQTYSIDINGYILVYSVTSIKSFEVIKVIHGKLLDMVGKVQIPIMLVGNKKDCCGCF	103295	180814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_103406_142187_142260_156089_156158_169217_169301_173174_173232_173352_173385_180316
806152	contig_17068_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_172575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	166	549	187665	187282	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQSSEATCPGSQWQKRRQDCARIWLLPSRPASGPRQSLIPSFWGNRCQKPSHRPPVGAVWGGGEASQPCSQLPVQQASHSLLPLAQHWAPQALAPGYHICLVEKWVGLKEQIYCLPSALGSIPAA	187830	186180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_-_186200_187800
806153	contig_8330_pilon	+	1379	7	Intergenic	novelGene_71924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	908	1378	1319006	1345059	FALSE	35	CTAAGAAGCGGCCACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMTLDHLAPVRLHSCGVMMAAVNCCYGGSVTAGALWHSRNLDSWVSQSTESPWLTAWCQTPLHTREGQGQALGAGEEKPPCCQGSDAAGPHTPVTPGHPNVASFCTHAQGCTTKPQSCFSRSSLCVPLSVSLGLSREALRTARGAGPPKRTGSLLS	1282974	1345060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1283267_1309800_1309898_1311109_1311467_1312058_1312163_1318948_1319133_1323302_1323520_1344932
806154	contig_7866_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_171186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131284	133232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_131300_133200
806156	contig_91_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_127103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGGTTAAGAGTTCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342333	341621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_341600_342300
806159	contig_12485_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_147272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAGAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38801	38327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_38300_38800
806160	contig_17549_pilon	+	2066	3	Intergenic	novelGene_162605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACATATGAGTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373262	448878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_+_375027_436355_436506_448726
806164	contig_12638_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_33250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1224	1688	764082	764546	NA	5	TTGTCCATTGTGTCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESFFLAETVKYLYLLFDPTNFIHNNGSTFDAVITPYGECILGAGGYIFNTEAHPIDPAALHCCRRLKEEQWEVEVLMREFYSLKRNRSRFWKKTVSSGPWEPPAGPGTFSSPENQDRAREKKPVKQKIPLLSCPSQPFTSKLALLGQVFLDST	762858	764597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_762900_764600
806166	contig_2924_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_140269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTATGCATCTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142007	140387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_140400_142000
806168	contig_2380_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_117888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACATCTTTAGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103841	102284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_102300_103800
806169	contig_8735_pilon	-	1525	2	Intergenic	novelGene_173713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45590	40165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_-_41443_45342
806170	contig_3424_pilon	+	2195	10	Intergenic	novelGene_55584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	52.4766850052078	39	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	146	1273	1138724	1146306	FALSE	20	TTCATAACACCGGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLSRARSLVIPDAPAFYERRSCLPQLDCERPHGGDLDSHFFGIRPTFMCYVPSPVLASVGDTDFGCGKGRGTKESPPGAHETCFGDDKVELEEANPFSFKEFLKTKNLGLSKEDTPSSRIYAKEAPRHSLGLEHSPPSAQTMGYGLEYPQPFFEDPTGAGDLLDEDEDDAWTGTYLPSAVEQTESLRAASTSPCSTYVSFFSGPSELAGPESLPPWTLSDTDSRISPASPGSSPNPDFAAHGESLGDRHLRTLQISYEALKDENSKLRRKLNEVQNFSETQTEMVRTLERKLEAKMIREESDYRDLESVVQQVEQNLELMTKRAVKAENHILKLKQEVSLLQAQVSNFKRENEALRCGQGASLTVVKQNTDLALQNLRVVMSNAHASIKQLVSGAETLNLVAEILKSIDRISEIKDEEEEES	1138370	1147228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1138412_1138619_1138770_1140217_1140287_1141858_1141972_1142219_1142628_1143787_1143862_1144223_1144336_1144708_1144772_1145415_1145556_1146203
806171	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	527	51	527	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806172	contig_7898_pilon	-	901	5	Intergenic	novelGene_47591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	347.366791014916	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	378	653	502396	500592	TRUE	20	AATTGACATGTGTGGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDRGGEGDGRIYVGNLPTDVREKDLEDLFYKYGRIREIELKNRHGLVPFAFVRFEDPRDAEDAIYGRNGYDYGQCRLRVEFPRAYGGRGGWPRGGRNGPPTRRSDFRVLVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVQKDGMGMVEYLRKEDMEYALRKLDDTKFRSHEGETSYIRVYPERSTSYGYSRSRSGSRGRDSPYQSRGSPHYYSPFRPY	508362	500213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_500315_500444_500736_502264_502438_505661_505823_508187
806176	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
806180	contig_2069_pilon	-	1167	11	Intergenic	novelGene_23185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTTGCTGTCGCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90087	69985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_70054_70298_70403_75454_75527_75844_75947_76068_76187_80971_81045_81589_81706_87419_87528_87704_87803_89407_89579_89950
806181	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_89319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653740	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
806185	contig_4531_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_47952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCTTTCATGGGGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909150	907277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_907300_909200
806186	contig_16510_pilon	-	970	9	Intergenic	novelGene_139080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	72.6102609828666	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	23	706	288583	277346	TRUE	5	TTTTGCCTCCATCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRREARLRREYLYRKAREEARQTAHEKKERLRRALEENRLIPTELRQEALALQGSLEFDDAGGEGVTSHVDDEYRWAGVEDPKIMITTSRDPSSRLKMFAKELKLVFPGAQRMNRGRHEVGALVRACKANGVTDLLVVHEHRGTPVGFIVSHLPFGPTAYFTLCNVVMRHDIPDLGSLCPRSLTSCGTCFLYPKMTATGLSPSRTRMTISPSGTTSTRRWIPTTWS	288605	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_277390_277488_277599_277724_277816_277901_278035_278140_278251_278978_279063_287990_288100_288580
806187	contig_15304_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_30526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	369	398	52954	52925	NA	20	AGAAGCAGCCCTGCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53322	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52900_53300
806188	contig_19579_pilon	-	797	6	Intergenic	novelGene_59395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	643.716397181243	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	13	606	13090	7943	FALSE	25	TTCCAGATTCTTCATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHIGATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13102	7751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12900
806191	contig_14357_pilon	+	2217	2	Intergenic	novelGene_121689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCAAACAGCCCCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587578	608832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_589742_608778
806193	contig_2100_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_50653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGGAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128494	1126138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1126100_1128500
806195	contig_4832_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_163409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAAATAGCCACAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417563	416369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_416400_417600
806199	contig_14814_pilon	-	1469	14	Intergenic	novelGene_137744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_7	119.96957207914	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	708	1469	406622	398392	FALSE	70	AAGAAGAGAAGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSAANPKSTPGNSEERPGKLHLKIQPSNTLRSSSALTYGVALLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTVVQTIARGVFGVMVAQSPFVPEEMVEEQRTRVGDSKLSEEEISENEMSWRETISRKKTALDKHHANDGISGDSERDSGGACEDPEPLLQFDYKAVADRLLEITNRKNIPPFNRKCLSKLIKKFQDLSEGSVSQPGFAEDNSADEDDHAVGQGRNKNKGSKPAEKTHLGKEKGSKFFRTEEEENEGSTQ	419210	398391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402158_402251_404264_404447_405639_405705_406496_406695_406814_406945_407717_407780_408364_408451_409637_409696_411513_411597_418994
806201	contig_1264_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_161299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCACCCTTCGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128214	126350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_126400_128200
806202	contig_3380_pilon	-	304	3	Intergenic	novelGene_60076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCATAAGGTAGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325063	39922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_40026_226563_226680_324978
806203	contig_15313_pilon	+	882	2	Intergenic	novelGene_175656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTCAACATTATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38165	120876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15313_pilon_+_38338_120166
806204	contig_15120_pilon	-	2502	13	Intergenic	novelGene_108032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	9.35822573402079	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	91	1719	395116	366496	FALSE	5	GTTGAGCTCTGTTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVKKYLLKCLHRLQKGPGYTYKELLVWYCNNTNTHGPKRIICEGPKKKAMWFVLTLLFTSLVCWQWGIFIKTYLSCKVSVSLSMDFKNMDFPAVTICNASPFQYSKVKHLLKDLDELMEAVLERILAPESSHANATRALNFTIWNHTPLVLIDERNPHHPVVLDLFGDNYNGSASSSPAPGRICNAQGCKVAIRLCSSNGTVCTFQKFTSATQAVMEWYVLQATNIFSQVPRKELMKMGYPAEQLILACLFGAEPCSYRNFTSIFYPDYGNCYIFNWGMTDKTLPSANPGAEFGLKLILDIGQEDYVPFLTSTAGARLMLHKQKSYPFVKDEGIYAMAGMETSIGVLVDKLERKGKPYSQCTMNGSDVPIRNLYSDYNTTYSIQACLRSCFQELMIQNCSCGHYLYPLPHGEKYCNSQDFPDWAYCYLALRISVKQREACISKCRESCNDTTYTMTISMAEWPSDSSEDWIFHILSQERDQSDNITISRKGVVKLNIYFQEFNDRTIQESPANNIVWLLSNLGGQFGFWMGGLSAVSHRVW	455613	365712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_366580_366826_366903_369054_369117_370488_370547_370641_370718_372320_372439_376084_376193_376536_376701_378102_378207_389975_390167_391830_392108_394805_395125_455531
806207	contig_14144_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_175660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAACCCTTGTTTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39301	41411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14144_pilon_+_39300_41400
806210	contig_3424_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_55492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAGTTCCTGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155072	154485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_154500_155100
806211	contig_821_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_149427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCACGCAGAAGACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441671	441128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_441100_441700
806218	contig_848_pilon	-	711	3	Intergenic	novelGene_83345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	633	junction_1	108	288	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	206	514	571558	566190	FALSE	35	AGTTGAGTAGTTGCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTSSNLQKAIDLASKAAQEDKAGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVKYEAQGDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKKKEKKPQKPVKEGQPSPAEDKGYVF	571763	565992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_566360_567558_567671_571531
806222	contig_7775_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_37485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTATTTGTGAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179121	177111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_177100_179100
806224	contig_14528_pilon	-	1935	13	Intergenic	novelGene_111261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	134.539414918702	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	722	1687	197057	189058	FALSE	10	GCCAGGATGTTTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRTLTEPCPLASESRVYVDITNHSQDSETLEVNPPPTTTYQDTVLGTRKTYAVYDLFDTSLITSSRNLNLQLKWKRLPENEAPPVPFLHAQRYVSGYGLQNGELSTLLYNTHPYRAFPVLLLDTVPWYLRLYVHTLTITSKGKENKPSYIHYQPAQDRLQPHLLEMLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGQKSWSHP	201823	188809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_189084_191155_191413_192556_192626_192749_192916_195071_195273_196725_196892_196976_197075_197183_197272_197815_197843_198035_198159_198459_198588_200925_201104_201663
806225	contig_3472_pilon	+	2209	10	Intergenic	novelGene_166947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_7	68.7320795948449	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	89	1285	971571	1061241	FALSE	50	TAAACTTTTTAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYRELPCNQHTGTTTALQKLEGFASRLFHRHSKSATYDPKTALENDSLHFSEHTALWDRSMKEFLAKAKEDFLKKWENPAPNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVKHKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF	971482	1062165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_971758_1015670_1015733_1018108_1018238_1023061_1023161_1024614_1024698_1039535_1039663_1040832_1040929_1044191_1044315_1054006_1054172_1061115
806226	contig_18637_pilon	+	1035	7	Intergenic	novelGene_81842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.977676346672	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	36	956	141663	177073	FALSE	40	TAGAAAACTGTGGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACPLWLAVFTAMAAAGLSAWLALQPGARTLRAFSTAVSPATRTPRPRLRKTEKMAVDQDWPSVYPVAAPFKPSAVPLPVRMGYPVKRGVPMAKEGNLELLKIPNFLHLTPLAIKRHCEALKDFCTEWPAALDSDEKCEKHFPIEVDTADYVLAGPSIRNPKARVVTLRVKLSSLNLDDHAKKKLIKLVGERYCKTTDVLTIKTDRCPLKRQNYDYAVYLLTVLYHESWKTEEWEKNKTEADMEEYVWKNSSSEKNILETLRKIKAAEKNMEVNKEEFLGTKEVEDYKKSVVSLKNEGENENTISQYKESVKRLLNLA	141627	177152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_141779_148236_148391_149544_149606_153201_153342_160263_160374_161804_161875_176803
806227	contig_20493_pilon	-	1198	10	Intergenic	novelGene_86415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	77.825699522541	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1158	40	1197	49056	37430	FALSE	15	TGTGGCTGCGCTTAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKKALICRNMEMLMEQLILPLGINQKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGG	49095	37428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_44502_44575_45931_46203_46996_47119_48978
806228	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806229	SIRV6	+	470	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	212	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
806230	contig_17436_pilon	-	1515	6	Intergenic	novelGene_164172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	27.6738143377453	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTCAAAGTAAGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67499	44106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_45136_47203_47306_61778_61825_63635_63785_66757_66854_67406
806231	contig_753_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_113042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTAAGAAAATAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490365	1488956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1489000_1490400
806233	contig_8138_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_52490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGACAATTGTAAAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310328	309582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_309600_310300
806234	contig_8138_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_52489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	127	309	309193	309011	NA	25	AGCTAATCCCACCCTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGCDIRLSPLAQGLLPCLRFQAAAPGGTTLPLAASAQHVIHMVHVFPAEPAVRRAPLPPTGLLKSKEAQDSTPCPANILGPRTGSKGHHLSPGSVCSEVQP	309319	308948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_308900_309300
806237	contig_13004_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_112654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGTAGGACCCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521121	519759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_519800_521100
806239	contig_8377_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_35163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGAAGCACTTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345755	344506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_344500_345800
806240	SIRV4	+	343	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGGGGCCGCTTGCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
806242	contig_2940_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_81879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363184	362195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_362200_363200
806243	SIRV5	+	343	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	880	-18	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
806244	contig_4519_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_123698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGTCGCTAGGAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542347	542814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_542300_542800
806245	contig_4519_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_123697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCGTACTAACTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537722	538274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_537700_538300
806251	contig_5297_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_175672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGTATCATTCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88582	88256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_88300_88600
806255	contig_12540_pilon	+	805	7	Intergenic	novelGene_148099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	25.1710812905074	497	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	12	410	986533	988348	TRUE	0	CCTTGTCTGCCCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVMAASRLELNLVRLLCRCEAMAAEKRDPDEWRLEKYVGALEDMLQALKAQASKPASEVINEYSRKVDFLKGMLQAEKLTSSSEKALANQFLAPGRVPTTARERVPATKTVHLQSRARYTGEMRSELLGTACRA	986521	989254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_986635_986929_986980_987104_987184_987272_987426_988333_988370_988645_988821_989055
806257	contig_3233_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_56614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	237	714	932	1645	1016087	1016800	NA	30	TGATCCAGTGATTTAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKGISEKSKMDEKEENEFNTKETTVDLQIGTEKTEKNKAGMVAEKLEKIVAVMKEKPAENTVSKAYPNKGVGQANKLDETSKTSMPTTSHVSSSKSAIKAAIVSSPKAKTTASKTENQKSFLKSVLRDQINAEKKLSAKELGLLKPTSAGSGLGEGSSKLKLTQSGVTRGGSGRISAPQGKDSKLDYRDITKQSQETETRSSIMKRDDTNTKVRRVGRLAQYIFEVISSAALTME	1015155	1016867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_1015200_1016900
806259	contig_5341_pilon	-	1227	1	Intergenic	novelGene_168033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCACTGATGGAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339204	337977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338000_339200
806264	contig_15236_pilon	+	1028	4	Intergenic	novelGene_141569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	282.371307953828	346	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	172	732	419232	451408	TRUE	10	GTGTTCTTGTCATTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPPLLRRKMWQLASIKDLQPWKPYEAVLLCPIGFL	419060	452553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426007_451306_451434_452282
806265	SIRV6	+	279	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	107	-9	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3130	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
806268	contig_15188_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_163072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25153	23096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_23100_25200
806271	SIRV4	-	231	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1284	6	1284	-6	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
806274	contig_12786_pilon	+	1993	9	Intergenic	novelGene_103450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCCGGCGGCCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648985	674529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_650124_653176_653226_653303_653397_655353_655455_660806_660964_664260_664369_669384_669571_673970_674043_674440
806276	SIRV4	-	202	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1321	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3837	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
806280	contig_12125_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_76262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	5	343	700738	701076	NA	5	CCCGACTTGTGGTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMQRIAGGCQKCSLKPEMFFQEKKKVENLVQAFSSKKKVNTNSFSGGSSSRLPILRAGGETHWVGRGSFRPAAPPSCLLALCLGFPFWKRPLLPQDTRAVLILPGSAPTPPPP	700733	701444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_700700_701400
806283	contig_6576_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_42305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTTCTCATCAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495566	495939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_495600_495900
806285	contig_15888_pilon	-	1102	8	Intergenic	novelGene_84415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1536.59007585774	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	56	865	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259781	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251828_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
806286	contig_7513_pilon	+	2198	2	Intergenic	novelGene_88944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACACTAAAATGTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128633	131463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_130143_130774
806288	SIRV6	+	474	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	155	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
806290	contig_6823_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_131207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCTCATACAAGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83588	83219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_83200_83600
806291	contig_6710_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_95992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653683	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
806292	contig_6058_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_172383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	85	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	156	785	376322	376951	TRUE	35	TAAAATCAGTCTGTACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAILRSSGQGLHRRGTRPTSLLTLSEKGWWAWARRPASLSTLPLSEQCVRAARGRPRPPELEQSAQGAFPDTPSPSLCPEWLRYSCFFRDFSSRSFWGLKTDAQIWGGHGQDEDTRVVQKHRFLPPSSEARSTRGCLGLAQLAARPHAQTDPSSVRWQMFWLLVVIVRLGYRKVGKCSAGVCVWRYFRAPACIFRACRRVTAWLFSV	376166	379135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_377772_378784
806293	contig_15067_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_154314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	318	1458	1775	318	1	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHPAGDKTTGNFWCRFPPPPSSPCLASSASRGHGLLIWKCRLLGFHKPKQAALWVPFVGCQCCFFFPASFDFSLASHHLPLFHSNAWLRVPSLLLPEGLQSAGKL	1775	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_0_1800
806294	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
806296	contig_7864_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_164858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCAAAAACAAAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87138	86402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_-_86400_87100
806298	contig_11492_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_152260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGCTTTAGGTGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411067	409970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_410000_411100
806299	SIRV6	+	343	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	363	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11031
806300	contig_13900_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_115092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGAGCTAGCAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18199	19053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_+_18200_19100
806301	contig_7816_pilon	+	1297	10	Intergenic	novelGene_66456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	209.563096364853	19	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	21	1088	94386	148859	FALSE	90	GACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPGFKMESLSRAGQEMSLAALKRHDPYITSIADLTGQVALYTFCPKANQWEKTDIEGTLFVYRRSASPYHGFTIVNRLNMHNLVEPVNKDLEFQLHEPFLLYRNASLSIYSIWFYDKNDCHRIAKLMANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSAPSGHKHLTVEELFGTSLPKEQPMVSMQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKNDSGFLSTLHEVYLQVLTKNKENLSL	94365	149068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_143942_144021_146636_146703_148224_148444_148778
806302	SIRV6	+	238	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11107_11205
806305	contig_9653_pilon	-	797	10	Intergenic	novelGene_48226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	633.566000147743	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	122	679	544351	529500	TRUE	60	AAAGAAGAAAAGGAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETAFC	544472	529144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_529193_529429_529511_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_543009_543086_544336
806306	contig_16599_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_175676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAACAGGTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718568	718113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16599_pilon_-_718100_718600
806307	contig_5935_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_102670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGCCGCTCCTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431687	430134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_430100_431700
806313	contig_15105_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_150933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTGTGAGTTCAAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251871	252976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_251900_253000
806314	SIRV6	+	487	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	13	518	6	72	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
806315	contig_13680_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_149569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	355	690	106782	106447	NA	30	TTATTTTAGAACAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRWRDLYHIRNPNLRILHVLNFAWIHNQRPWKQQSRNQKTHGIGQSAVKDLFKVLKSKDVTLKAKVRLTQAMVFSIVSHACKSWTMNKEERRRIDAFELWCWRRILDIP	107136	105182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_105200_107100
806317	contig_20609_pilon	+	1791	13	Intergenic	novelGene_118478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	62.6832314100031	2	88	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	182	1297	52568	58681	FALSE	40	GAGTGAAGGGAGGTATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKERAMSTTSIPSPQPGRLRSPFLQKQLTQPETPVTREPVPASLRPSTDFLEDPEPIVPQSPVQVEGEAVCKEPLEEENLYEEPPLVQQEDAASEHSICYKQGTGLLGKGLCARALYDYQAADDTEISFDPENLITGIEVIDEGWWRGYGPDGHFGMFPANYVELIE	43736	59175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56588_57337_57434_57554_57668_58017_58124_58541
806319	contig_5018_pilon	+	1811	10	Intergenic	novelGene_46943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTAGAACTGGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301101	312533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_301854_301968_302059_302233_302328_305684_305849_305918_306014_308067_308256_308355_308540_309844_309902_310012_310174_312507
806320	SIRV6	+	506	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	350	0	177	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
806321	contig_8681_pilon	+	1895	3	Intergenic	novelGene_157199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTATTTTAGTATTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116198	118427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_117081_117237_117697_117873
806322	contig_5765_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_141425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	560	862	932791	933093	NA	20	GTGCGTGTGTGTGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIHASAYTQLEMSFAADFPKPKIPPMLQGQMPGQTPPWSLDTLSNSASHCRCVFGVGLCVCVCSPCIRIPHSFLGPPTAQCLGLFLAQIPPCFSMSFSH	932231	933450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_932200_933400
806323	contig_11337_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_107176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139544	138599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_138600_139500
806327	contig_3233_pilon	-	2507	12	Intergenic	novelGene_56526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	49.9935533034093	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	25	1686	374832	337110	FALSE	60	ATGAATAAAAAAAGCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNFSTMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDIYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMKWGLLPVSHSALLVGDMAYYDFNGEMEQEVDRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKYRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPVVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGTPVPVLRHHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIENPNQFVPLYTDPQEVLDMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSKGDVDTKDDSEETMPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKEIATEGPGSPVKSAPTSPVKSPSESETKSPVVSPSKTLDGELAE	374856	336288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_337253_340063_340212_342151_342242_343121_343242_344438_344697_349376_349554_354682_354782_356914_357059_358494_358645_367017_367099_367532_367685_374732
806328	contig_5649_pilon	-	1527	6	Intergenic	novelGene_82303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTTTATGGTACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180046	175359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_175652_175975_176053_176223_176404_177179_177309_178571_178873_179498
806330	contig_5231_pilon	+	1726	9	Intergenic	novelGene_65891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAATTTCCTTATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208840	222528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_209484_210710_210864_211519_211570_212538_212655_213365_213475_216442_216562_219041_219165_219283_219379_222210
806331	contig_6494_pilon	-	821	7	Intergenic	novelGene_108567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	939.276213664306	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	30	572	8286	2808	TRUE	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVCWASK	8315	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3313_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
806333	contig_17563_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_175682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCAAAATCTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92983	93701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17563_pilon_+_93000_93700
806334	contig_8291_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_99960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTCAACTTCACATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550735	552120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_550700_552100
806335	SIRV6	+	358	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	605	164	-15	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAGTAGCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
806337	contig_5549_pilon	+	814	5	Intergenic	novelGene_81581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1425.2600420625	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	62	529	82155	96636	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPAMETV	82093	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93318_96620
806338	contig_3285_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_153376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAAAAAAAAAAAGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55153	53144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_53100_55200
806339	contig_12324_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_166653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	646	1005	165547	165188	NA	50	TTGTCAGGGTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSILAGQRREEHFNLGAQRRHRGGTHWGLEGSLTLLGGLTGGAGLTVRGGWSQTVLRNVHDKLACLEVRLQRKVGARVYKAMDARLNVFYSLSRRKPLESFEHESETSPRSSGMLAGP	166192	165120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_165100_166200
806340	scaffold_14128_pilon	+	284	4	Intergenic	novelGene_169518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	335.142092584954	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGAGGGTTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118445	323672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_118479_286890_286988_316132_316218_323603
806341	contig_9363_pilon	-	1385	2	Intergenic	novelGene_6525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTATTGTTTGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571089	566898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_567830_570635
806343	contig_10626_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_138203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATAACGGATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196436	195395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_195400_196400
806344	contig_9202_pilon	+	1821	12	Intergenic	novelGene_168941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	568	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262337	286243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_262892_265227_265264_267563_267760_267991_268186_268797_268960_269245_269362_270145_270217_272099_272195_281600_281669_282797_282902_285767_285839_286089
806348	contig_5083_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_151624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCGCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59284	60987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_59300_61000
806349	contig_17522_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_160795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCATGACTGTCAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62107	63677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_62100_63700
806350	contig_17522_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_160796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGAGGTATGGAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63803	64174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_63800_64200
806354	contig_7376_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_108097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTGCAAGATCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253462	254853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_253500_254900
806356	SIRV6	+	235	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	60	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806357	contig_641_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_170137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACAATCAATCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43653	44766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_43700_44800
806358	SIRV4	+	367	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAACAGTTTCCGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
806359	scaffold_19766_pilon	-	1623	8	Intergenic	novelGene_34245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.845922442903	20	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	248	1507	155718	152785	FALSE	20	TGCCTGACTGAGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIGPVSELLPLGQVVVGQVSLLMTCFLQLRECELSPGVNRDLTRRVRNINGITQHKQIVRNDIKLAAKLIHTLDDRTQLWASEPGTPPLPTSLPSQNPILKNITDYLIEEVSAEEEELLGSSGGAPPEEPPKEGNPAEINVERDEKLIKVLDKLLLYLRIVHSLDYYNTCEYPNEDEMPNRCGIIHVRGPMPPNRISHGEVLEWQKTFEEKLTPLLSVRESLSEEEAQKMGRKDPEQEVEKFVTSNTQELGKDKWLCPLSGKKFKGPEFVRKHIFNKHAEKIEEVKKEVAFFNNFLTDAKRPALPEIKPAQPPGPAQILPPGLTPGLPYPHQTPQGLMPYGQPRPPILGYGAGAVRPAVPTGGPPYPHAPYGAGRGNYDAFRGQGGYPGKPRNRMVRGDPRAIVEYRDLDAPDDVDFF	155965	152668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_153647_154068_154263_154454_154609_154706_154881_155442
806361	contig_2455_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_119188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAATCCAGAAGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144797	142947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_142900_144800
806363	contig_14023_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_165356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCAACCTCCTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75294	77728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_75300_77700
806375	contig_6205_pilon	+	1760	6	Intergenic	novelGene_160332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	80.2196983290264	230	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	114	650	27057	55482	FALSE	35	ACTACCACACTGAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSARGLAAVERWNGGKSGLQARGPEPEHRQGQPSGPSMNDVLCKKRDDYLEWPEYFMAVAFLSAQRSKDPNSQVGACIVNTENKIVGIGYNGMPNGCSDDLLPWRRTAENKLDTKYPYVCHAELNAIMNKNSADVKGCTMYVALFPCNECAKLIIQAGIKEVIFMSDKYHDSEEATAARLMFDMAGVTFRKFTPKCSKIVIDFDSINSRPSQKLQ	24891	56592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_24998_27049_27165_27540_27677_52523_52641_54002_54100_55403
806376	contig_13245_pilon	-	509	4	Intergenic	novelGene_148826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	16751	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	118	477	26752	25454	FALSE	25	GTAAATTTTGTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26869	25421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
806377	contig_19559_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_163437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACTGTACACCCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86602	87355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_+_86600_87400
806378	contig_1154_pilon	+	1187	8	Intergenic	novelGene_87170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	31.276254277529	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	124	717	919915	924251	FALSE	5	TCTGTGGCTTCTCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHHCPWLNNCVGHYNHRYFFSFCFFMTLGCIYCSYGSWDLFREAYAAIEKMKQLDKNKQQAVVNQTYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGRHWLTRVLLPSSHLPHGNGMSWDPPPWVAAHSASVMAV	919482	924721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_919508_919816_919931_920589_920724_920860_920909_921741_921828_922770_922895_923093_923165_924136
806381	contig_5145_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_131365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	396	842	346084	346530	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAHTQAAQEVEAHLVVDALDLIEQTLGAQGFGVILLEVHSLVVERLEVGLLVLLPPYLVETTLRLPPLLLLGFQPMGRRGPGLSGGHTCPPAHPHCQQHPPPITTVVLDGFSTIVASWPSVDPSVDQVLTGHLPTENHVCLVRASP	345688	347155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_345700_347200
806383	contig_8102_pilon	-	1426	4	Intergenic	novelGene_85338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	880	1185	178126	177313	TRUE	45	GAAAGAAAGCGTTGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENVSMQKLHYPCYLLQCYHYPKVFPLGTPDPPRMEGATYRDAFLCRRDPRDRSCWEGVSRSDARSGLPGAPEAILWSPRVSSGTLQLLRSQKHQGAHQSS	179005	173533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_173647_175151_175206_177238_177353_177860
806384	SIRV4	-	208	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1313	0	1313	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3845	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
806385	contig_5947_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_101461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33621	32777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_32800_33600
806386	contig_13653_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_175683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTACAGTCTCTGTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42414	42797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_+_42400_42800
806387	contig_13653_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_175684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTTTATTTAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44377	44692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_+_44400_44700
806391	contig_5346_pilon	+	1566	8	Intergenic	novelGene_161850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	70	348	115648	115926	TRUE	30	TTTCAGCTACGGAAATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLVFLHPSPLIRTRLQPPHFVLMLFGTKQVDLVHVLADELEGVLHTEVEVTVPPVRQVHERHGVHVHPAFVVEHIPAQQVLLAGHQLVVKQEESPLLALALLRDFGQLSRMDQF	115578	150783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_115953_117770_117895_121588_121831_125749_125927_128544_128734_129051_129231_130625_130766_150642
806393	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	499	57	499	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806394	SIRV4	-	335	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1188	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
806399	contig_6710_pilon	-	467	2	Intergenic	novelGene_98134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	15	TACCCACCCATCTCGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
806401	contig_12019_pilon	+	1680	5	Intergenic	novelGene_87751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.736275950599	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	302	766	633175	642306	FALSE	35	AATATGTTACATTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIPASTPQEDKLDPAPEN	628130	643220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_628324_633066_633208_633848_634035_635731_635922_642250
806403	contig_12270_pilon	-	373	2	Intergenic	novelGene_113302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	27	371	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14435	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
806404	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
806406	SIRV6	+	388	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	518	221	72	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
806409	contig_1172_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_162038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACCCCAGGCTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652146	653902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_652100_653900
806410	contig_15471_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_175214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTGTTATGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220687	219403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_219400_220700
806411	contig_10953_pilon	-	1756	9	Intergenic	novelGene_42615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_8	32.4489984437116	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	181	1755	484591	469551	FALSE	15	GTAAGTGACTGGCTGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KASQVKAASASTKGSPGKGAPPAPPGKTGPAAIQAGKPEEDLESSSEEESDSEEETSAAVMPAQILSPRKEDNCKPARSKTLAPASPEKKAEGSSESSEEELPSGQVIKPPLIFVDPNRSPAGPAATPVPAQAVSAPRKAQASESTARSSSESEDEDVIPATQCSTPPVIRTNVVASSSEESRRVAEGEQQKAPATQVTKNPASLPLTQAALKVLAQKANEAQSPTARTQTSSGVGSALGKPPGLSPQSSPVQARGTNKLRNPKLPEAQPAAATPSRRPKAKASGTSEDSSDSSSGSEQDVEGAQRAKSAHRPVGPVPTGKETLVEETTESSEDEVVEPSQSLLSGYVTTRLTPASSKASKATPRPDPKPSVSSPPATKDALDGKLEAEPQQAVATTSAKTGKREATSGTKPRKPRKPKKGAVSPQASPLALQSDIAQRLLSEPWPLSEAQVQVSVAKVLAELLEQERKKAADAAKESSKKARVGLKRKLSGDQPAAETPKSKKKKKLAAEGGGEVAPSLEKAPKAPKGKSKRDKASGDIKEKKGKGSPGSREAGEKPEGGLGVVKVDGGDQSNPKSKKEKKSDK	484771	469549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_470102_472071_472253_472807_472891_473138_473377_473806_473918_475531_475618_476888_477076_482497_482624_484579
806412	SIRV6	+	368	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	12	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
806413	contig_3948_pilon	+	1583	10	Intergenic	novelGene_53179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.0191941558076	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	267	1526	346422	364186	FALSE	45	TGCTCAATACAATAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLQHVLRAQGSLRQGTLASVSWLLLRNCRAHSGLPSTACPSPERQEDGVPKDFSSRLATGPTFQHFLRSASTPQEKPSSPEVEDPPPYLTVDELLGRQRKVYLETYGCQMNVNDTEIAWSILQKSGYLRTSNLQEADVILLVTCSIREKAEQTIWNRLHQLKALKTKRSRSRVPLRIGILGCMAERLKEEILNREKMVDLLAGPDAYRDLPRLLALAESGQQAANVLLSLDETYADVMPVQTSRSATSAFVSIMRGCDNMCSYCIVPFTRGRERSRPVASILEEVRKLSGQGLKEVTLLGQNVNSFRDNSEVQFNNAVPTSLSRGFTTNYKTKQGGLRFAHLLDQVSRVDPEMRIRFTSPHPKDFPDEVLQLIHERDNICKQIHLPAQSGSSRVLEAMHRGSGLLGEKGIPHLSMFP	343588	364243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_343726_345535_345645_346401_346729_349290_349395_350025_350061_351133_351235_353034_353246_355712_355834_361249_361481_364036
806414	contig_6505_pilon	+	1963	8	Intergenic	novelGene_175695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_4	122.302235199091	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	838	1962	119571	165764	FALSE	20	ACATCTGTGAGTTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSLYLKKKDSEGDTPLHDAISKKRDDILAVLLEAGADVTITNNNGFNALHHAALRGNPSAMRVLLSKLPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLDIQNVNQQTALHLAVERQHTQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQLRQLQDMQDVGKVDAAWEPSKNTLIMGLGTQGAEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQSPLDLCPDPSLCKALAKCHKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECVVCSDMKRDTLFGPCGHIATCSLCSPRVKKCLICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCASLMKKCVQCRAVVERRVPFIMCCGGKSAEDTTD	118733	165765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_119753_142219_142353_149815_149903_151338_151501_156056_156239_157918_158112_162921_163001_165657
806416	contig_9784_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_165700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGGAGCTCGCTCAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29480	30914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_29500_30900
806417	contig_11978_pilon	+	1437	5	Intergenic	novelGene_63034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	612.282206176204	24	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	145	546	1644712	1646860	TRUE	5	TGACTTGGTTTCCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1633571	1649719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1646973_1648940
806418	contig_15400_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_175700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGAGGGCAAGGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4450	3612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_-_3600_4400
806421	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1155	8	1155	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4003	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
806424	contig_9038_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_143329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGGCAATCTATCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419386	420977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_419400_421000
806426	contig_312_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_128297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTAGTTATACTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13654	13101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_13100_13700
806429	contig_11498_pilon	-	2019	14	Intergenic	novelGene_65512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	541.990414553113	129	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	163	996	200916	174942	TRUE	10	TACATGCGCGTTCGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWDAAPRPLSAAKPRPRPREPLPPSPSGREPCPLPPGKLDFRGWRRLADWVGTTMGNAAGSAEQPAGPTASPPKQPTTPKQPMPAAGELEERFNRVLNCMNLPPDKVQLLSQYDNEKKWELICDQERFQVKNPPAAYIQKLKSYLDTGGVSRKVAADWMPNLGFKRRVQESTQVLRELEISLRTNHIGWVQEFLNEENRGLDVLLEYLAFAQCSVTYDMESTDNGAPSSEKSKPLDQSVEDLIKGPPSSCPPQPKSRHLTIKLNPAHSRKTLRNSRIVSRKDDVHVCIMCLRAIMNYQSGFSLVMNHPACVNEIALSLNNKNPRPLCSCWR	201078	172643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173555_173677_173933_174030_174180_174283_174499_174664_174824_174967_182905_182983_183596_183706_185276_185415_185823_185908_186258_186333_187914_188029_189602_189687_200787
806430	contig_1406_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_25657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTTATCCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2783351	2782905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2782900_2783400
806431	contig_3862_pilon	-	2140	2	Intergenic	novelGene_137407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489084	486789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_488350_488504
806433	SIRV6	+	361	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	587	14	408	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
806435	contig_2113_pilon	+	1682	6	Intergenic	novelGene_161153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	76.2731931939394	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	285	539	377027	378163	TRUE	10	TTTCCTGCGTTCAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAVSQPEEAATAPREQDEEQSGAVHVSETVEQKPHFEPSAVKTETISFGSVSPGGVKLEISTKEVPVVHTETKTITYESSQVDPSADLEPGVLMSAQTITSETTSTTTTTHITKTVKGGISETRIEKRIVITGDADIDHDQALAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHKETEITPEDGED	375176	380440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_375293_376067_376200_376990_377090_377558_377640_378052_378170_379303
806436	contig_5797_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_56901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATCTTTAAGATACTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5521	4551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_4600_5500
806438	contig_5229_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_117685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	370707	370411	NA	5	GGGTGTTTTCCTGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVHLKLSSEEEEVTSPSFASVKGCTCSGTSHLPSLSGALLRPSLGPVAPRVHPELSAPPRIGSFGPPPSTGWVEGSGAAPRAYPVGCIPPQPSERGCL	370707	369839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_369800_370700
806442	contig_6914_pilon	-	1201	10	Intergenic	novelGene_151722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	6.09391520035648	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	611	1201	85421	83786	FALSE	25	ATCCAGCGCAAATTTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSRAQGLPADVQTAFPHELEVPVLTEGQRLSILQALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFLVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGWSEEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQAAHSQAVGAPKIPSVSWQDVGGLQEVKKEILETIQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGVSEDRASQLRVLSAITRKFKLEPTVSLVSVLDLCPPQLTGADLYSLCSDAMTTALKRRVRDLEEGLEPGSPALLLTMEDLLQAAARLQPSISEQELLRYKR	86579	83785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_83896_84106_84247_84367_84446_84614_84732_85025_85135_85384_85447_85574_85781_85860_85994_86133_86211_86410
806444	SIRV4	-	450	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1063	8	1063	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4095	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
806447	SIRV4	-	236	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	369	12	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGCAAGCGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
806449	contig_7379_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_150043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTGACACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591737	593923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_591700_593900
806450	contig_2903_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_148977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGGTGTGATTAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152360	154323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_152400_154300
806451	contig_9400_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_146571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATATTTGTATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38388	37714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_37700_38400
806455	contig_11448_pilon	-	1209	2	Intergenic	novelGene_66438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684711	649680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_650826_684647
806459	contig_3132_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_127464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGTTTCTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501360	499257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_499300_501400
806462	contig_10569_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_44066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGGGACAGTCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242004	242826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_242000_242800
806466	contig_16121_pilon	-	1960	5	Intergenic	novelGene_6850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTCAGCTCTCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63319	33596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_33706_57740_58202_58896_59370_60684_60863_62580
806468	contig_16103_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_118923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATCTATTAAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780915	780625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_780600_780900
806472	SIRV4	-	364	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1159	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
806473	contig_9535_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_124499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCACCAGGGCTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611848	614241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_611800_614200
806474	contig_4891_pilon	-	1094	6	Intergenic	novelGene_124598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.76411595413	60	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	71	397	964296	940000	TRUE	10	CTCAGCTCTGTGTGATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964366	937407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937485_937951_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
806475	contig_13823_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_145283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347146	345136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_345100_347100
806476	contig_14142_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_120568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454735	457173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_454700_457200
806477	contig_2161_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_114961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATCTTGAGAACTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022454	1021223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1021200_1022500
806478	contig_2161_pilon	-	866	8	Intergenic	novelGene_114954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	232	540	1000592	992102	TRUE	30	CAGTGCTGTAAGTGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDSLLFSPDPVGSLKREPHLVYLALWVGLGEDSSPLEFLFRYGDLDRGGDVAAKEGDFDVGVLVSCFLQVNLHEAVMYTVRSFGSGQEVDFHFRGKWLYPDTAMFYRPNPWTGKQERVKAIQAVSSKEGLVAGTGKGHQWAGTLQGTDVEMHSPHVITDQITDLHKWMWDSQVGPGLR	1005993	986455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_986530_987543_987651_988933_989044_992066_992153_994345_994508_996222_996313_1000586_1000697_1005866
806480	contig_5894_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_83028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTGTATATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347390	346020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_346000_347400
806481	contig_9833_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_68551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234141	235087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_234100_235100
806482	contig_5711_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_80266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTAGGAGCCCTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57430	56418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_56400_57400
806484	contig_11378_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_112312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTGAAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110987	1112227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1111000_1112200
806485	contig_13828_pilon	-	2264	8	Intergenic	novelGene_158281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	37.3466934306651	1	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	20	1138	323602	50314	TRUE	45	TAATAAAGTACCCACTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLKGPMSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRYMPKHKITHLKKMLSLERNNGAAPSMALPSQQEQRGSESVLKNFTGESGLCGAVSGLGTIQQESLGSSLMQLSDLNQSNSSDDSNSYQEEKKQNPTLNPSDTLGGVDDQQRPLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMRLKELGLKFHVSVLGETFTDLGWKLRIVVVTHFVPRIWFIPKYSQLNICILHLNSFQKGSRISARDQIL	323621	44225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_45335_50296_50389_51088_51164_72616_72720_115165_115529_247016_247173_250617_250786_323423
806486	contig_6738_pilon	-	3012	2	Intergenic	novelGene_166144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117410	113604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_116296_117089
806487	contig_500_pilon	-	852	6	Intergenic	novelGene_31012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCCCCGCGCGCTGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499589	1485750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485801_1491813_1491949_1496838_1496902_1497876_1498076_1498880_1498972_1499275
806488	contig_854_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_36110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	181	396	114883	114668	NA	45	TTTTCATAAAGGGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSTCPAHHAAPPQVSSNRSSPPAPPLPPGSGSSVTPQALPRRLVGSNLRAPTVPPPLPPMPPQPARRQSRRSPASPGPASPSPGSLSIPVQGDLGVATEEGEDPEAIGRVTTPPPVPPQPQPRSLASETD	115063	114258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_114300_115100
806491	contig_8354_pilon	-	1460	8	Intergenic	novelGene_24092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	133.69841175617	38	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	94	702	198044	183560	TRUE	40	AAAAAGTGTGGCATGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGDILAHESELLALVREYLDFAEFQDTLKTFSKECKIKGKPLSKAAGGAFRDSTSLIIQKDLIAAFDSGDQKTFFHLWKEHVPTSIRDGDALAQKLEFYLHIHFAIYLLKHSIGRPDKEELDERISYFKTYLETKGAALSQTTEFLPYYALPFVPNPMVHPSFKELFQDSWTPELRLKLEKFLALIFKASNTPRLLTLCSN	203471	182165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_182878_183513_183569_187891_187985_189565_189722_190261_190433_195734_195861_197990_198079_203412
806495	contig_9363_pilon	+	740	7	Intergenic	novelGene_6823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	238.134707442844	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	34	342	1622283	1623113	TRUE	10	CTGGGGCCACGCGAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDW	1622249	1625964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623180_1624314_1624445_1624573_1624655_1625843
806496	contig_3818_pilon	-	2150	20	Intergenic	novelGene_99320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	12.2003133332453	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	33	1874	1192428	1141559	FALSE	35	TCCAATAATTCGAATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHQLGPAETAMLARRPRDPLQALRRRNQELKRQVDSLLSESQLKGALEASKRCDIYQRCIQLKRAIDENKNTLQKLSKADESAPVGNYSQRKEEERDLLDKLTHQLQELAVAISRESITETGTLTEREEDDDSAEEGDDEEDEEDDEDNSEECGEEEKGTEEEEKQGNESHRQAARGEYVAVGDFAAQQVGDLTFQKGEILLITEKQPDGWWVAENAKGNKGLVPRTYLEPNNKEKGEESSEEGSEEDVEVVDEAADGAEVKQRAGSHWSAVRKSISEQINTVDVLTTMGAIPAGFRPSTLSQLLEEGNQFRACYFLQPELTPSQLAFRDLIWDGKAGTIRSRTSRISLILTLWSCKMIPLPGTSIQVLSRHIRLCLSDGSKVLSNIHTVRATWQPRKPQTWTFSPQVTGILPCLLDGDCFIRSNSSSPDLGILLELGISYIRNSTGERGELSCGWAFLKLFDTSGIPIPTRTYELFLNGGTPYEKGVEVDPSVSRRAHGSVFYQMMTMRRRPQLLVKLRSVSRGWRSTLSLLPETLIGSMCSVHLLAFYRQILGDVLLKDRMSLQSADLISNPVLATFPRLLEQPDIMDALRSSWAEKESTLKRSEKVGRGGDGGHTLETHR	1192460	1141282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1141607_1143317_1143363_1148619_1148694_1151183_1151297_1157549_1157650_1158474_1158552_1160426_1160510_1161592_1161704_1165698_1165774_1174960_1175090_1175283_1175379_1178427_1178516_1179384_1179428_1179757_1179859_1180747_1180850_1182074_1182304_1184086_1184212_1185851_1185913_1188054_1188129_1192359
806497	contig_4385_pilon	+	1808	10	Intergenic	novelGene_141522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.4744752812996	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	565	1305	465403	473797	FALSE	10	CATTCTCTCTGCTGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLADLREQKKILQHLEGEGLKNVIFTNCVKDENIRQIIPTVTELIESSYRYHRGENLEYCIMVIGIPNVGKSSLINSIRRLHLRKGKASRVGGQPGVTRAVMSRIQVCERPLVFLLDTPGVLAPRIESVEMGLKLALCGTVLDHLVGEETMADYLLYTLNRHQLFGYVQHYGLDSACDDVESVLKRVALKLGKTQKVKVLTGTGNVNIMQPNYAAAAGHFLRAFRSGLLGPVMLDRDVLACCVDR	463031	474300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_463524_465330_465433_466487_466569_468044_468102_468286_468378_469448_469511_469989_470087_470532_470615_472693_472807_473669
806502	contig_7657_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_30053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377164	375533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_375500_377200
806504	contig_9375_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_136036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTGAGGATGCTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101029	101746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_101000_101700
806505	contig_12866_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_174650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTTGCCACCTAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665660	665136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_665100_665700
806506	contig_4271_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_171862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370129	371269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_370100_371300
806507	contig_16205_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_156855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATACTACATTTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16388	18473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_16400_18500
806508	contig_16205_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_156856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGAGCACTAGCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18423	18955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_18400_19000
806512	contig_7963_pilon	-	1066	5	Intergenic	novelGene_58296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	3	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	53	349	48841	43622	TRUE	0	GTTGTTGTCTGTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48893	38325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39276_39405_39949_40227_43546_43819_48741
806513	contig_7744_pilon	+	1407	9	Intergenic	novelGene_62469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	7.19374728496908	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	345	1241	452324	460938	FALSE	5	GCCAGCCTCCTCTGCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKQILCVGLVVLDIISVVDKYPEEDTDRRCLSQRWQRGGNASNSCTVLSLLGAPCAFMGSLAPGHVADFILDDLRRYSVDLHYVVFQTMGSVPVSMVIINEAKGSRTILHAYRNLPDVSAKDFEKVDLTRFKWIHIEGRNASEQVKMLQRIEQHNARQPPEQKIQVSVEVEKPQEELFQLFGYGDTVFVSKDVAKHFGFWSSAEALRGLYGRVRKGATLICAWAEEGADALGPDGQLIHSDAFPPPRVVDTLGAGDTFNASVIFSLSQGKSIQEALRFGCQVAGKKCGLQGYDGIV	451803	461104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_452005_452180_452416_453715_453833_455868_456004_458201_458275_458966_459114_460376_460466_460608_460767_460852
806514	contig_7446_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_101944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCTGAGCACTTAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159118	158421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_158400_159100
806516	contig_3942_pilon	+	661	4	Intergenic	novelGene_128758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	6958	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	41	418	793521	795263	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKYAPTHTVWAVWVGGVSALTALCAPFIV	792274	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
806527	contig_7379_pilon	-	1043	10	Intergenic	novelGene_150021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_2	92.0946909369125	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	26	970	569807	536814	FALSE	15	ATAACGGCTCTGTGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGPSVWVMALVARLWHFLPLGRGTVLGLRLLMGASGSRGRCGLWRLRGFEVMGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	569832	536740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549784_553209_553328_569678
806528	contig_14822_pilon	-	1137	8	Intergenic	novelGene_145393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	117.723300625679	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	402	1046	56093	53461	FALSE	15	CACTGCTTACTTGTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWPHAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEALVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLQDPVVLALAEKYGRSPAQVLLRWQVQRKVVSIPKSITPSRILQNIQVFDFTFSPEEMKQLDDLNKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY	69758	53369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_53527_54175_54263_54412_54486_54726_54927_55232_55429_56070_56220_56390_56511_69603
806529	contig_2550_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_135710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766756	1767627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1766800_1767600
806530	SIRV6	+	473	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	171	14	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
806531	contig_6048_pilon	-	1012	4	Intergenic	novelGene_73100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	63.442012017975	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	423	752	235115	219453	FALSE	15	TTGGCACTGTCTCTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAYAECVGAWRGSWRELLPKGSKEEQRDYVFYLAVGNYRLKEYEKALKYVRGLLQTEPQNTQAKELEHLIDKAMKKDGLVGMAIVGGMALGVAGLAGLIGLAVSKSKS	235537	219192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_219551_219872_219979_220412_220490_235066
806534	contig_7080_pilon	+	1088	7	Intergenic	novelGene_100117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	118.539374611702	22	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3	560	527338	540726	TRUE	5	GTTGTTGTCTTTGTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	527335	542188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540938_541871
806535	contig_11026_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_167687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGAACTCTAGACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282777	283894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_282800_283900
806536	contig_11026_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_167689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATGCAGATAAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283894	284782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_283900_284800
806537	contig_5936_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_53560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATTAGTTTCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165150	163424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_163400_165200
806538	contig_5153_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_74398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTAAATATATAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999136	998632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_998600_999100
806540	contig_10734_pilon	+	1253	3	Intergenic	novelGene_50968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	7	167	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTGATGTTCCCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217145	230871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_217415_227956_228009_229939
806543	contig_12019_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_87717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344334	345700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_344300_345700
806544	contig_12939_pilon	+	1798	3	Intergenic	novelGene_166205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	186	1166	54785	67308	FALSE	35	TCAAAATAGTGTTCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTDLPDSVLLEIFSYLPVRDRIRISRVCHCWKRLVDDQWLWRHVDLTLYTMRPKVMWHLLRRYMASRLHSLRMGGYLFSGSQAPQLSPALMRALGQKCPNLKRLCLHVADLTMVPITSLPCTLRTLELHSCEISMAWLLKEQDPTVLPLLECIVLDRVPAFRDEHLQGLTRFRALRSLVLGGTYRVTETGLDASLQEMSYLQRLEVLGCTLSADGTLLAISRHLRDVRKIRLTVRGLSAPGLSVLEGMPALESLCLLGPLITPEMPSPTEILSSCLTMPKLRVLELQGLGWEGQEAEKILCRGLPHCMVIVRACPKESMDWWM	54599	67940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_54871_54978_55052_66486
806545	contig_6654_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_85776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTATTCTCAGTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685121	683380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_683400_685100
806546	contig_15732_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_88859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTATTCCTCCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57161	59604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_57200_59600
806548	contig_6589_pilon	+	1422	11	Intergenic	novelGene_25939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	314.699157927059	138	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	569	1126	1252699	1258364	FALSE	10	TTCTAGGCTCTGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLVSPQLLESCLLPGAQPLWLVVALCGPTKPSLMFLGAAVPRGQCLPQG	1228316	1258660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228890_1231854_1231963_1234419_1234562_1243552_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256379_1258219
806550	contig_13211_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_123146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGATAATAAAAGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251749	253850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_251700_253800
806552	contig_8354_pilon	-	853	4	Intergenic	novelGene_24129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	692.055071668594	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	70	540	513617	500293	FALSE	10	TGACTGTGACTTGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYAEEGRFSVLSHGPETELSVEVSCGFSQVGGVYCFL	513686	499979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500401_503721_503824_505824_505966_513497
806554	contig_10196_pilon	+	879	5	Intergenic	novelGene_132118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.222440293453	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	18	302	922274	924513	TRUE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922256	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701_925736_926055
806555	contig_9373_pilon	-	2161	9	Intergenic	novelGene_162721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_5	276.53161550716	50	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	341	1351	226305	206692	FALSE	85	AAAAAAAAAGTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAVNRVWTELIHSKKQVLEEIFKVTLPVNERGHVDIAIARPLIEEASLKCWQNHLAHEKKCISRGEALVPTTQSKLSRVSSGFGLSKLTGSRRNRKESGLNKHSLSTQEISQWMFTHIAVVRDLVDTQYKEYQERQQNALKYVTEEWCQIEYELLRERGLWGPPIGSHLDKWMLEMTEGPCRMRKKMVRNDMFYNHYPYVPETEQETNVASEIPSKQPEAPDDIIPQKKPARYRRAVSYDSKEYYMRLASGNPAIVQDTIVESSEGEATQQEPEHGEDTIAKVKGLVKPPLKRSRSAPDGGDEENQEQLQDQIAEGSSIEEEEKTDNATLLRLLEEGEKIQHMYRCARVQGLDTSEGLLLFGKEHFYVIDGFTMTATREIRDIETLPPNMHEPIIPRGARQGPSQLKRTCSIFAYEDIKEVHKRRYLLQASPFSTNPFVMFLYLEDVLF	230958	205881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_206876_208020_208170_210660_210825_213365_213535_216493_216548_224540_224769_226242_226321_229822_229981_230791
806556	contig_7758_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_163537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTGGATTGATCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152443	154594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_152400_154600
806560	contig_10042_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_79192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAATAAAAATATAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938009	936373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_936400_938000
806563	contig_13224_pilon	-	2390	2	Intergenic	novelGene_104139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCACACGGACCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427071	423929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_426270_427021
806566	contig_6102_pilon	+	606	6	Intergenic	novelGene_31964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1222.8278047215	135	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	42	449	413086	416047	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414330_414627_414788_414877_414956_416018
806568	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
806569	contig_521_pilon	+	1642	8	Intergenic	novelGene_174733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGATGTACAAGGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30512	41370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_+_31419_32213_32384_34270_34350_34603_34749_35885_35995_36622_36761_39336_39413_41351
806570	contig_9345_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_24558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGGCTAAGGAGCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738551	738147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_738100_738600
806571	contig_6513_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_117768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	3	428	171082	170657	NA	10	GTCCACTCTTCCTGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGVSGRPSPFCFGVSGCPSLFCFGVSGRLSPFCFGVSGLDFVVSALPLLCLLSFGFGSDSLFSFCLGSAIVLSLCLDSVILLSFCLGSSVWISVLASNLFSIDFVSTNLFSFGLDSANLLSFCFISLFESSGSDFFLGVSG	171084	170528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_170500_171100
806574	SIRV6	+	178	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	415	2	-245	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACGGTCAAAGACGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
806576	contig_13901_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_146658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	772	1116	253266	253610	NA	40	TGGGCTGGAGATAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVDPFCIRYMKGIWWDGGLHIRKLGVEQEATLPPAMKSYGPRHPGRCLSCVILWPLSKLPTLPSKILLSPWSSNKPDESIPVPRGHPHLSTLSILLLGCRIMLEEANSFSPT	252494	254440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_252500_254400
806577	contig_8701_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_173288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTCACGACCTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123390	122428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8701_pilon_-_122400_123400
806578	contig_11639_pilon	-	1192	9	Intergenic	novelGene_151148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_4	29.2123154679666	440	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	171	1190	79829	3775	FALSE	30	AACTTCTAAAACTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEDARYLKRKVKGGNIDVHPSEKALIVQYEVEATILGEMGDPMLGERKECQKIIRLKSLNANTDITSLARKVVEECKLIHPSKLHEVEQLLYYLQNRRDALTGKEKKEKSSKPKDPPPFEGMEIDEVANINDMDEYIELLYEDIPDKVRGSALILQLARNPDNLEELLLNETALGALARVLREDWKQSVELATNIIYIFFCFSSFSQFHGLITHYKIGALCMNIIDHELKRHELWQEELSKKKKAVDEDPENQTLRKDYEKTFKKYQGLVVKQEQLLRVALYLLLNLAEDTRTELKMRNKNIVHMLVKALDRDNFELLILVVSFLKKLSIFMENKNDM	79999	3772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_-_3954_27183_27283_29603_29729_30868_30969_43506_43649_44209_44266_46813_46969_51022_51155_79797
806579	contig_13158_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_107292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTTATAATCAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140093	141772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_140100_141800
806581	contig_6102_pilon	-	776	8	Intergenic	novelGene_32210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1796.75054768664	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	40	543	905250	895585	TRUE	20	GGATGAACCCAGTGGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESR	906122	894896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895824_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
806584	contig_5643_pilon	+	971	7	Intergenic	novelGene_38732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	313.18187828942	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	479	805	156118	157138	FALSE	15	ACACGCTGCAGCTGTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLLQSPVLTAAPERRKAAPFPSRRITANQSPLSTRLKKWLYETGNDEGKWE	152288	157304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152456_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156552_156846_156945_157085
806587	contig_13481_pilon	-	2033	6	Intergenic	novelGene_119441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_5	36.372517097391	66	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	493	1461	1055585	1033428	FALSE	45	AGAAAGGAAGGAGCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGGAGRRRDRKARVAPHLAWRGEGALLAVPSGEPPPTRSLAGDTYQHVPAVVISSHVIAPPPGLGPRPHYAWAHPHALTRSPARTLSSTSLSPLRQRAPGLGPPRKTLVSTFSPLSSPCLAPPQAWELRALWPFVPAPGPALTTSSVLAPDRRVSPGNAPQPRMQSSGWAAAREAAGRDVLAADLRCSLFASALQSYKRDSVLRPFPASYARHDCKDFEALLADASTLPNLNELLQSSGDKDKRARDLVSWILSSKVLTIHSAGKAEFEKIQKLTGASHTPVPTPDFLFEIEYSDPANAKFSETKGERDLIYAFHGSRLENFHSIIHNGLHCHLNKTSLFGEGTYLTSDLSLALIYSPHGHGWQRSLLGPLLSCVAVCEVIDHPDVKCQTKKKDSKEIDRRRARIKHSEGGDVPPKYFVVTNNQLLRVKYLLVYSQKPPKRASSQLSWFSSHWFMVMISLYLLLLLIVSAVNSSAFQHFWNRAKR	1056077	1032855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1033564_1035139_1035282_1036839_1037012_1041380_1041588_1044039_1044178_1055411
806590	contig_990_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_76133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGGAGTCTCTCGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606810	1606054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1606100_1606800
806592	contig_7730_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_156267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAATAAAGAAGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71832	72555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_71800_72600
806593	contig_5988_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_16170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	2086250	2085873	NA	10	GGAGGCTATTTGTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGAAGGCPAAIAGCSDRDRSGGFWTGLDRDVEHNSNPRKRTGFAGLGEAGEALRVWPPNTLLARWWGYLRGSLFGLGVDSRIEPDETGEVQGSGDGGWRAGGTGKLVVRSPGLSEDIVVIGQHL	2086250	2085630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_2085600_2086200
806594	SIRV4	+	302	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTTTTATCTGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3837	5043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
806599	contig_6870_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_103986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	528	junction_3	79.2338311581612	798	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	147	533	1488054	1502554	FALSE	15	TCCTTGCTTGGAACTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKVTSESSTAVSSVSDNLSKVSLGIVSICVAHKQPLF	1481034	1503495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1493506_1493613_1502310
806600	scaffold_13505_pilon	+	954	3	Intergenic	novelGene_111558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	87.5	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGATTATGTTGATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608562	635456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_609623_635129
806604	contig_10238_pilon	-	1790	2	Intergenic	novelGene_170089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	871	1194	63440	63117	TRUE	25	CATAGGAGGGGTATGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGSAGLDSTTRPSCWTVPEIPAASDSLMVPLGSMPSFPVHPSTQHTQLLFQEALSHSLHHSQQSQWAPDPTQSPQLLCGGARWDPESFSSLDAPQLAVLMSTYYV	64310	43115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_43271_62675
806605	contig_12943_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_140363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTGGGTTCGAACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84215	82705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_82700_84200
806607	contig_11126_pilon	+	1633	8	Intergenic	novelGene_138104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_7	86.396806441357	79	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	341	1543	118054	160845	FALSE	15	GCCACCCAGTTTGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGETQLYAKVSNKLKSRSTSLLLEPLLALGFPAHTALKALAATGRKTAEEALDWLHCHCNDPSLDDPIPQEYGLFLCPTGPLLEKLQEFWRESRRQCAKNKAHEIFPHVTLCDFFTCEDHKVECLYEALKRAGDRILGSFPSVIPLVLHSSVSYLGFFIHDSSADIIREFAMSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQTLKATFQYKPQNTDELNLSPGDYIFVDPTQQKEASEGWVIGISRWTGCRGFLPENYTERANESDTWVKHRTYTFSLAMDLNSRRDGEASSRRNGEFHPPQTSRSLSSVQALQTEAEGDSTHRRGGGNVPTKAETEVMWPQSKKCLEPPASGRRKDWILT	117713	160935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121535_133242_133430_137634_137834_143405_143576_145083_145293_158694_158822_160701
806610	contig_6589_pilon	-	1417	12	Intergenic	novelGene_26247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_10	52.3655302687806	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	372	875	2230610	2228934	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPVRPAFRWEGSHVGMDWGLIFPVWPPRGLSPPRGLSASLSLAPF	2232043	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230959_2231914
806613	contig_20927_pilon	-	1581	3	Intergenic	novelGene_175706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACTAACCATAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14667	9961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20927_pilon_-_11265_13249_13401_14540
806614	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	11	355	14409	13842	FALSE	20	TAGCTGCTGGTACCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14419	13839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
806616	contig_11427_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_79014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTAACTCTACAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747330	745733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_745700_747300
806619	contig_16098_pilon	-	784	9	Intergenic	novelGene_45774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	378.849244423161	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36361	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_35211_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36299
806622	contig_13780_pilon	+	1265	3	Intergenic	novelGene_149012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	123.5	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGTTACACGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288629	295821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294733
806623	contig_18113_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_137523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATCAGGAGGGACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88867	89541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_88900_89500
806624	contig_18113_pilon	+	1518	1	Intergenic	novelGene_137525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99824	101342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_99800_101300
806626	contig_1107_pilon	+	2600	2	Intergenic	novelGene_126568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAAAATGAAGTTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494446	497866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_496910_497729
806627	contig_14666_pilon	-	398	3	Intergenic	novelGene_39661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	363	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492455	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
806629	contig_4952_pilon	+	1861	12	Intergenic	novelGene_145518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	151.883382841808	7	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	131	910	355970	400428	TRUE	30	TAACTATTCTGCTTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVPNGYVRSTAAAAAAAAGQIHHVTQNGGLYKRPFNEAFEETPMLVAVLTYVGYGVLTLFGYLRDFLRHWRIEKCHYATEREEQKDFVSLYQDFENFYTRNLYMRVRDNWNRPICSVPGAKVDIMERQSHDYNWSFKYTGNIIKGVINMGSYNYLGFARNTGSCQEAAARVLEEYGVGVCSTRQEIGNLDKHEELEKLVATFLGVEASMAYGMGFATNSMNIPALVGKGCLILSDELNHASLVLGARLSGATIRIFKHNNMQSLEKLLKDAIVYGQPRTRRPWKKILILVEGIYRGIHCSPS	332806	454418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_332868_355900_356096_381347_381503_384289_384439_386788_386914_398188_398283_399566_399673_400403_400619_407004_407132_442835_442972_445591_445718_454046
806632	contig_20165_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_54465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCCTCAGCACCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10291	10614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_10300_10600
806633	contig_4156_pilon	-	2241	7	Intergenic	novelGene_88101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	53.4009987422208	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	302	1282	433791	310019	FALSE	25	ATTTGTTGAGCACTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLCEQILDLSKRYIKTLADENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESRVDNLVINGTGVNSTNSTTAVPSLVALEKINMADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPRLPWRGKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYNMMKKHEEFRWMRLRIRRMANAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKE	434092	309059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_310193_313916_314079_328806_328879_353899_353990_355258_355336_412913_413079_433550
806634	contig_11642_pilon	+	550	3	Intergenic	novelGene_172922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.5	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	182	550	275271	456995	FALSE	20	GTGAGTGCTCGTTATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLQSLRNLNFSTLAQGYCDRFYDIQSLRVQAPGQADSIWWDKLLSKNATQSKQHVCALTSLAADVLVCPLRPVERFHDLRPDEVADLFQATQRVGTVVEQYFQGTSLTFAIQDGPEAGQTVK	275089	456995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_275349_453433_453695_456965
806635	contig_6364_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_51736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTCTCATCAATATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463494	465579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_463500_465600
806636	contig_3130_pilon	-	1812	2	Intergenic	novelGene_103560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63100	61242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_62052_62097
806640	contig_12580_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_172902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGCTTTCCTGGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180301	181327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_180300_181300
806641	contig_11708_pilon	+	1362	2	Intergenic	novelGene_138954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATAGCAACCAATGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219341	220961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_220385_220642
806645	contig_11370_pilon	+	540	2	Intergenic	novelGene_98747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5354	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147418	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_147616_148205
806646	contig_16126_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_141885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTCTGAAACCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77906	79054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_77900_79100
806647	contig_16126_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_141886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAATGTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79104	79993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_79100_80000
806648	contig_6079_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_160104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457848	455763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_455800_457800
806649	contig_7455_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_168656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAAATGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394335	391877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_391900_394300
806652	contig_9571_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_136254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304346	304073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_304100_304300
806653	contig_11017_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_128089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	635	1000	260029	260394	NA	35	CCTAATGCCAGAATGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCSAVNRKVSGLNPPAAPQEEDVAVCFCKDYGLRSPMGQFYSILQGCYVSESTLWQRVWFGFWYVLDTGIGDSAGNYTKDGFMELASQWEENDSQQRKEGDCWADKFCEEEGQRGQRRD	259394	261858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_259400_261900
806656	contig_593_pilon	+	648	5	Intergenic	novelGene_101978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_4	947.714454622277	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	42	647	146142	151641	FALSE	45	CGACCAATAGCCAGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRELRVEGLGGWDMADFDGPAKPLLSLNPQEQAKFQKQVAQVRRRATQQKKLTPGVVYVGHIPRGLFEPQLKAYFSQFGTVTRLKLSRSKKTGNSKGYAFVEFESDDVAQIVAETMNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQN	146100	151642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148891_149001_151208_151421_151590
806657	contig_401_pilon	-	863	2	Intergenic	novelGene_42883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	292	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	175	666	1778606	1778115	FALSE	10	TGCTCAGATGTGGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRFQELDSGLSSGGPSEGISSEPVSAATTQTLEGNSSEVGNEGKSKMAKQMAEGSPPEAPAKARPTKGAQKAQDSSSEFGKVTRMCFAVFLCFALSYIPFLLLNILDARVQAPRVLHMLAANLTWLNGCINPVLYAAMNRQFRQAYGSILQRGPQSFCRLR	1779897	1777917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1778694_1779810
806659	SIRV6	+	203	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	314	14	83	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2599	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
806660	contig_12050_pilon	-	1497	5	Intergenic	novelGene_62752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_1	58.5619330282053	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	172	840	697920	692882	FALSE	5	TTGCCTCATTCTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGKPFLQSAACTVEMTERHVAALSPPEDGRIRRGLLGVFHSGVLTLH	698091	692224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
806664	contig_4305_pilon	-	1943	14	Intergenic	novelGene_136716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	29.8070719538424	2	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	338	1771	829845	808195	FALSE	55	GGACCAAAAAAAAACGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVSQDFPFLHPSETSVLNRLCRLGTDYIRFAEFIEQYTGHVQQQDHHPSQQGQGGLHGIYLRAFCTGLDSVLQPYRQALLDLEQEFLADPHLSIAHVNYSLDQFQLLFPSVMVVVEQIKSQKIHGCQILETVYKYSCGGLPPVRSALEKVLAVCHGVMYKQLSAWMLHGLLLDQHEEFFIKQGPSSGNVPAQPEEDEEDLGIGGLTGKQLKELQDLRLIEEENMLAPSLKQFSLRVEILPSYIPVRVAEKILFVGESVQMFENQNVNLTRKGSILKNQEDTFAAELHRLKQQPLFSLVDFEQVVDRIRSTVAEHLWKLMVEESDLLGQLKIIKDFYLLGRGELFQAFIDTAQHMLKTPPTAVTEHDVNVAFQQSAHKVLLDDDNLLPLLHLTIEYHGKEHKDATQAREGPSRETSPRETPASGWAALGLSYKVQWPLHILFTPAVLEKYNVVFKYLLSVRRVQAQLQHCWALQMQRKHLKSNQTDAVKWRLRNHMAFLVDNLQYYLQVDVLESQFSQLLHQINSTRDFESIRLAHDHFLSNLLAQSFILLKPVSRADWFPDCFWHGLSSRHSLTGYGVIIQRLFKLHF	833874	808022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_808441_809001_809180_812297_812437_812807_812916_817212_817319_817741_817793_818485_818611_818861_819028_821210_821413_828152_828233_829812_829870_830330_830385_830788_830912_833738
806665	contig_12113_pilon	-	961	7	Intergenic	novelGene_134743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	269.378709048969	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	323	817	231875	217850	FALSE	30	AAAAATTCTGCATGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAYALELLFDQLHEGAKALDVGSGSGILTACFARMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRWK	233270	217705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_218030_220158_220245_222269_222391_222749_222855_231872_231905_232488_232679_233167
806666	contig_15837_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_147520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCACTTGGAACTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5432	4988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_5000_5400
806669	SIRV6	+	429	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10396	1	1159	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11396	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
806670	contig_13214_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_175713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTAGCATGTATCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13433	11445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_11400_13400
806674	contig_5084_pilon	+	544	3	Intergenic	novelGene_64674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3637	junction_2	134.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTGTCTCTTATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1752171	1756002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1752279_1754409_1754443_1755598
806676	contig_16685_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_115066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCCAAATAAACGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618799	617151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_617200_618800
806678	contig_11631_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_104172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGATTCAAGCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44928	43321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_43300_44900
806679	contig_9424_pilon	-	530	5	Intergenic	novelGene_143796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1699.04487874806	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	22	462	280461	277586	FALSE	20	GCTTGAAGCTACCTGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSWAAEMPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDLADIFLHTCHSRLLPWCIINPFLCSSRATTKFWGRESSQSNLSS	280482	277517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277721_278598_278762_279552_279629_280079_280144_280458
806680	contig_6842_pilon	-	1208	2	Intergenic	novelGene_130669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288316	285780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_286396_287723
806684	contig_10756_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_170667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATTGAGTAACCATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91384	91913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_91400_91900
806686	contig_10331_pilon	+	1623	3	Intergenic	novelGene_54112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCCCCCTGTTGCGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320147	333027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_321525_325327_325411_332864
806689	contig_10813_pilon	-	2043	2	Intergenic	novelGene_87023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69692	65867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_-_66213_67994
806691	contig_11933_pilon	+	2425	1	Intergenic	novelGene_107246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCCATAGGGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82981	85406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_83000_85400
806692	contig_3817_pilon	+	1699	2	Intergenic	novelGene_78400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	0	18	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	362	793	1263498	1264952	FALSE	80	AAAAAAAAACAAAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSQDLENVTSKEIRNELEKQMNCNLKEFKEFIDNEMLLILGQMDKPSLIFDHLYLVRGTSHGSIWFGERKSDLSCLELAVNKRGKQTQNLSSWRPRSQFFRVSPVDPLWPAALLSSQMLARHCPAELRAPVLRLTTFVSSRH	1263136	1265858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1263537_1264559
806693	contig_8259_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_148849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2022	2342	49609	49929	NA	80	AAAAAAAGGAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLAVSPHEAAGGLTCRAGWGPSRYTGNLAGSAPPHRLHRALLYIPWSLHRNHNISFRSCCSGDNSLLPSCRTLSGFERSNIHTQRTTQHFTLQNPALIILLTCS	47587	49945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_47600_49900
806695	SIRV6	+	372	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1848
806696	contig_10019_pilon	-	1747	2	Intergenic	novelGene_86679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1460	junction_1	0	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTCTGACTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261604	258353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259853_261356
806697	SIRV6	+	462	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	0	221	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
806698	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
806699	contig_3150_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_171915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAGGCATTGAGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264557	266237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_+_264600_266200
806703	contig_5302_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_81463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGTTTAGATAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225665	226294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_225700_226300
806704	contig_10042_pilon	+	1284	13	Intergenic	novelGene_79197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	62.1129683184867	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	210	1175	1054190	1090129	FALSE	20	ACGCCTACAGTTGCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1028881	1090238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1029045_1054143_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
806706	contig_12000_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_43184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCATATTACTCCGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536868	537341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_536900_537300
806708	contig_13464_pilon	+	2068	3	Intergenic	novelGene_125237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGAGTGCACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233129	299472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_233153_233717_233859_297568
806710	contig_14814_pilon	+	1997	2	Intergenic	novelGene_137698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGACAGCACACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119833	127780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_120827_126776
806711	contig_16503_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_162076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGCCTAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136661	138999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_136700_139000
806712	contig_12644_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_44587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	482	784	2105012	2105314	NA	45	GGGTGAAGTAGAACAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRTPSPSFCVGNKDILVQMESKTSQDRQRPCLLGCRYNVLSQHSLSHSAPTHGGATRILRSQDLTDVNRAARTVDMHMVQIASTRAHAPFQSPRSGIK	2104530	2106626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2104500_2106600
806713	SIRV6	+	247	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	17	31	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
806715	contig_5770_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_74152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123006	123874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_123000_123900
806716	contig_16098_pilon	-	857	5	Intergenic	novelGene_46156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2153	junction_1	1689.12469936355	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	79	681	457605	456273	FALSE	45	AGCCTACTGCCAATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	457683	456096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557
806717	contig_4271_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_171873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACACCTAGGCAGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583297	584220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_583300_584200
806718	contig_7919_pilon	-	1888	7	Intergenic	novelGene_28073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	1116317	1115964	TRUE	35	CTCTAGAAGTCTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSGLIQTRQPHHYSFTTASLLCGGKRYTVDPSPPLAKCGIPLNYLSSFNAECTHCILSDYNLSYQLFKQKVPFCFVWLISTRNKSPQVGISVSPDALCLTLGPEARTLGLLAFLILP	1116319	1066936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1067288_1068300_1068517_1079489_1079568_1079847_1079962_1113430_1113509_1114963_1115057_1115361
806720	contig_8377_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_35166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAGCACTGCCCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353886	354582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_353900_354600
806721	contig_9216_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_163506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGCCACATCTTTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520773	519671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_519700_520800
806723	contig_13375_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_151076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTTTAAAGCAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16266	14367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13375_pilon_-_14400_16300
806728	contig_7253_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_140198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164049	161887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_161900_164000
806730	contig_2636_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_52093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAAGCCACAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64361	63961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_64000_64400
806732	contig_8616_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_72409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACACCCTCTAGGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235333	234568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_234600_235300
806733	contig_8570_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_120171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACATCACTTAGGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404087	404770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_404100_404800
806734	contig_6915_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_162411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTAGGTGAAGCCTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187508	187741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_187500_187700
806736	contig_6915_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_162412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCAAAATAATTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188485	189473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_188500_189500
806737	contig_1275_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_108736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTATTTAAATATTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350473	351734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_350500_351700
806738	contig_2278_pilon	+	2406	12	Intergenic	novelGene_118083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_10	94.7851855774872	33	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	211	1962	637285	689299	FALSE	85	AAAAATAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKAGRDGDGAPRGPVLHIVVVGFHHKKGCQVEFSYPPLIPGDGHDSHTLPEEWKYLPFLALPDGAHNYQEDTVYFHLPPRNGNGATVYGISCYRQIEAKALKVRQADVTRETVQKSVCVLSKLPLYGLLQAKLQLITHAYFEEKDFSQISILKELYEHMNSSLGGTSLEGSQVYLGLSPRDLVLHFRHKVLILFKLILLEKKVLFYISPVNKLVGALMTVLSLFPGMIEHGLSDCSQYRPRKSMSEDAGLQETNPPADDFVSVSVPDISISISGTVKKTMTGNRGGDAVIQTREPLFQVESDSSKGPEPNNTNQFLKPPSRPSPESSESDWETLDPSILEDPSLKEREQVGSEQTNLFPKDSVPSDSPPITVQPQANTGQVVLIPGLISGLEEDQYGMPLAIFTKGYLCLPYMALQQHHLLSDVTVRGFVAGATNILFRQQKHLSDAIVEVEEALIQIHDPELRKLLNPTTADLRFADYLVRHVTENRDDVFLDGTGWEGGDEWIRAQFAVYIHALLAATLQLGKKPHKACSCPLYYDFSSCNIYDVLNCTRNTCSFVEKLPVIAPDRTPWVVQMVKCSTTS	637074	689743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_637378_658556_658678_660064_660151_668820_668893_673789_673880_674516_674584_675836_675878_676658_676698_681433_681504_681819_682359_687595_687731_688900
806743	contig_12644_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_44581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2076782	2078007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2076800_2078000
806744	contig_14023_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_165378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAAAGGCCTGCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258871	259201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_258900_259200
806745	contig_14023_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_165379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTATCGAGTGGACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260461	261196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_260500_261200
806747	contig_6286_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_165657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222609	223593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_222600_223600
806749	contig_4519_pilon	+	1556	3	Intergenic	novelGene_123688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	383	junction_2	24.5	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	246	581	520840	602213	FALSE	60	GATAGCAACTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCRLNKLEKRDEKRPGNIYSTLRRPQVETKIDMSYEYRFLEFTTLSAAELPRSSAVRLASLRDLPAQLLELYQQGFSLAALHPFVQPTHEREKTPLERIFRAILVKKTER	496136	603188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_496374_520831_520985_602022
806751	contig_10904_pilon	-	1345	8	Intergenic	novelGene_22608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	20.2796771700747	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	753	1136	489299	488436	FALSE	30	ATACAACTGGAAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNCFFPLVLVLGLAISAVPVLCSIFLIPPSKLCGPFQGQPSIWAQIPESIYSLPQATQNFLFFLGTQAFAVPLLVISSILMAYTVSLANSYGRLISELKRQIETEAQNKVFLAQRAVALSSANGAL	492088	488226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_488505_488603_488683_488965_489122_489219_489351_490474_490573_490979_491113_491377_491542_491782
806754	contig_4114_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_15623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTTAAAAGACTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409209	409711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_409200_409700
806756	contig_10732_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_114720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTCAGCACTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146234	145985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_146000_146200
806758	contig_9098_pilon	-	1348	11	Intergenic	novelGene_75796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	446.189825074485	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	309	1103	288130	264388	FALSE	25	GGACTACAACTTGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295258	264142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265639_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289198_289280_292840_292905_294101_294178_295200
806762	contig_11378_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_112234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	60	494	322446	322012	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLQKQRNINGCQGLRNKGWQEKWVYLYKGNMRASSGDGNGLSFDYQRQILVGIFYFRWQGVTIEGSWVMSTQDGSVLFLTTACECTISQNQSLIFKQVNCSLGKKACKINVSSQNEIFCYPTSINSLIYSFQVFSIYVMYVK	322505	320438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_320400_322500
806765	contig_366_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_51554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGTTCAGAGGTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620673	621536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_620700_621500
806766	contig_11564_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_158593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	35	346	195780	196091	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSGPKTAGAKMRSCSLYSPRIPRSLVVLTHAAPTFPAARQSSLLSGLWSITAVRGLPCVDCSLCGIFPSGTIRLLIGAVWELTLSAPPLWPSGSREGWGRGADFPRLKMIPLD	195745	198484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_195700_198500
806767	SIRV7	-	383	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33185	1	-34	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114772	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
806768	contig_17042_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_140184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCCAGCATTCACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9943	10707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_9900_10700
806769	contig_12327_pilon	+	1224	6	Intergenic	novelGene_140664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_5	20.0559218187547	933	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	68	604	1124059	1137031	FALSE	15	TGTTTTATGGAAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLRAFTCDDLFRFNNINLDPLTETYGIPFYLQYLAHWPEYFIVAEAPGGELMGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERKGGFFVDLFVRVSNQVAVNMYKQLGYSVYRTVIEYYSASNGEPDEDAYDMRKALSRDTEKKSIIPLPHPVRPEDIE	1123991	1137651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1131157_1131801_1131938_1136332_1136479_1136945
806770	contig_16870_pilon	+	807	5	Intergenic	novelGene_155487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	949.359356355643	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	278	619	96164	98992	FALSE	20	CACTAGGGCCCTGAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYATTYELKEDGSYNVTSTLLKAGFTPCHPPAGFPDLHSYTVRVAATNYNQFAIVFFKKVTKNQEYFKTTLYGRTKELTTELKERFVRFAKSLGLTDDHIIFSVPIDQCIDDA	95615	99180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95823_96093_96229_97702_97855_98087_98190_98969
806772	contig_5083_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_151679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGACTGCCTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601836	599842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_599800_601800
806773	SIRV6	+	321	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10726
806774	contig_6710_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_97854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
806775	contig_753_pilon	-	1755	6	Intergenic	novelGene_112891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACTTCCGGGGCAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269451	246500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_246642_257418_257461_262702_262825_265304_265437_267399_267506_268239
806776	contig_15304_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_30560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	189	530	54100	52925	FALSE	25	CCGTGCTCCACCAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54288	52897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53180_54013
806779	SIRV6	+	357	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	500	14	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
806780	contig_18414_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_170014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTAGTTCTTGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106408	107054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_106400_107100
806781	contig_18414_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_170015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTGTTTTTTTAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107000	107962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_107000_108000
806782	contig_18414_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_170016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTGGCCCCACCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108359	108838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_108400_108800
806784	contig_6684_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_168590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATACAGAGACTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56277	54768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_54800_56300
806786	SIRV6	+	360	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	592	10	413	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
806790	contig_10734_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_51035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	8.49836585598797	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	306	1085	385659	384880	FALSE	35	AACAAGGTTGGAGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	391751	384817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_385663_385971_386084_388027_388143_391676
806797	contig_6710_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_89106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653624	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
806798	contig_18794_pilon	-	1483	6	Intergenic	novelGene_54662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	97.5233305419785	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	82	774	349249	325647	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	349330	324937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327662_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159
806800	contig_3155_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_26443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGAAAGCAGTTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326229	324944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_324900_326200
806801	contig_6375_pilon	+	1338	8	Intergenic	novelGene_72922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	233.528829667162	43	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	28	1056	16563	28930	TRUE	30	AAACTGCTGGCAGTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTRQCLFTMADDLEQQPQGWLSSWLPTWRPTSMSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16535	30368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840_28943_30098
806802	contig_5253_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_61547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGCTATGAGTCAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110492	111649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_110500_111600
806803	contig_5253_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_61546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAGAAGGTTATTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109660	110212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_109700_110200
806806	contig_8964_pilon	-	2267	4	Intergenic	novelGene_168685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	20.0720922897661	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	53	1552	430584	416334	FALSE	70	AAAAAGAAAAGTTAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPERSGFSGLCVFTKINQKRTGQFLNSKTMAHGLVTFADVAIDFSQEEWACLDTAQRDLYWDVMLENYSNLVSLDLVSTYETESLPTEKNIYEISFSQWNAHRKSKSTGLDWKCTGEFEASPGHQERYIHQMIINCEKTPTCRESTSGRPPQKPHNRENSFECKDCGKAFSRGYQLAQHQKIHTGEKPYECKDCKKAFRWGNQLTQHQKIHTGEKPYECKDCGKAFRWGSSLVIHRRIHTGEKPYECKDCGKAFRRGDELTQHQRFHTGEKDYECKDCGKTFSRVYKLVQHKRIHSGEKPYECKDCGKAFICGSSLVQHKRIHTGEKPFECQECGKAFTRVNYLTQHQKIHTGEKPHECKECGKAFRWGSSLVKHERIHTGEKPYKCTECGKGFNCGYHLTQHERIHTGETPYKCKECGKAFIYGSSLVKHERIHTGKKPYKCNECEKAFGHRHQLTQHQKIHTGEKPDECKECGKAFSNVIQLREHQKIHTGEKHCA	430636	415618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_417608_421155_421283_425200_425286_430570
806809	contig_11003_pilon	-	1467	12	Intergenic	novelGene_105410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.807155721348	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	397	1416	19803	12783	FALSE	15	GTTGGATTCTGTGTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPKLEGQTHAELKASEGAYALDSESSVEKLAALSASLARVVVPATEEEAEMDEFPVDGEVASQEEDRRKELETQEKHRKLFEGLKFFLNREVPREALAFIIRSFGGDVSWDKSLCIGATYDITDSCITHQIVDRPGQQTPIIGRYYVQPQWVFDSVNARLLLPVEDYFPGVPLPPHLSPFISEKEGDYIPPEKLKLLAPSGAKPDLVLPGVSDLGSRGPAVHHDNFPQPRVL	24895	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_12887_15009_15174_15307_15434_15827_15959_16127_16218_16449_16525_16651_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812
806810	contig_9995_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_47758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAGTAGAACTACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666353	668012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_666400_668000
806811	contig_3394_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_152672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGAGAGAACCTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398657	398996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_398700_399000
806821	contig_12638_pilon	+	1609	4	Intergenic	novelGene_33077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	913	junction_2	442.325169480051	558	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAGAAGAGAATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170755	179265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085
806823	SIRV1	-	177	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3648	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6466_6557
806826	contig_7457_pilon	-	1449	2	Intergenic	novelGene_31391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATTAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460636	458345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_458755_459596
806829	contig_1910_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_168280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGAAGTAAGGAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53480	54029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_53500_54000
806832	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
806833	contig_11227_pilon	-	1620	5	Intergenic	novelGene_163199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_2	53.2846131636517	28	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTAAAAAGTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292564	279170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_283410_284651_284832_285014_285114_291670
806835	contig_14621_pilon	+	1218	11	Intergenic	novelGene_105869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTTCCGCTTGGGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402003	463832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_402125_403705_403795_413475_413560_425865_425971_427329_427449_428930_429101_431642_431781_432844_432926_437117_437280_437848_437947_463781
806836	contig_9389_pilon	+	924	7	Intergenic	novelGene_83983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	767.533006890692	439	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	351	668	383666	386638	TRUE	0	TTCTTTGTGTCTCTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYG	381999	387006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_386633_386771_386882
806837	contig_8631_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_121938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATGTCAATTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640372	642283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_640400_642300
806838	contig_15036_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_107156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	221	529	173559	173867	NA	25	CCTACCTCTTATCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCICRSLEIQTTTHPSVCLTLVVCMLLCCWKLCQRNSKYLQGRPWWTGCSGASRLRQMRKKGLVMYFQKLANEYPVGHNRILSDIVLEEEPPQLIVIQNT	173338	174503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_173300_174500
806840	contig_6589_pilon	+	1991	10	Intergenic	novelGene_25698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAACCCCGCTGTGCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178785	188187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_179322_179683_179902_183729_183828_184901_185082_185263_185526_185612_185905_186215_186351_186458_186517_187836_187946_188084
806844	contig_10446_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_162497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACACAGCCTCAGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938675	936626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_936600_938700
806847	contig_5988_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_16141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTTACGCTTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620113	1619710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1619700_1620100
806850	contig_11346_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_175717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTGGTTTAATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131943	131382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11346_pilon_-_131400_131900
806851	contig_3270_pilon	+	991	4	Intergenic	novelGene_104442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2675	junction_1	4172.66735900298	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTTGAGTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44243	46758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44307_44596_45211_45934_46067_46576
806853	contig_18967_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_165338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGCACAACGAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350543	349936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_349900_350500
806858	SIRV4	-	208	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	406	3	-406	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCGGCGGCAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
806859	contig_13494_pilon	-	1849	5	Intergenic	novelGene_167506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATAAAATTTTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24417	17137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_17304_18511_18577_20425_20554_21975_22040_22991
806860	contig_9833_pilon	+	2621	5	Intergenic	novelGene_68494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7.49583217528247	6	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	875	1312	210440	218991	TRUE	5	CTTGCTTTTCAGCCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTDPQAPRHQQQSVLLVPMDTPGIKVIRSLTVFGLEDAPGGHGEVLFEDVRVPKEHIVLGPGRGFEIAQGRLGPGRIHHCMRLIGLSERALALMKARVKSRSGLRETPGGAGHAPGRHCSVTSGDRADPAAGAQSCPPHGHGW	208442	221172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_209282_210404_210564_211205_211379_218850_218996_219867
806862	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	51	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
806863	contig_10304_pilon	+	1190	7	Intergenic	novelGene_166490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	16.6833250083229	58	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	15	902	60416	154097	FALSE	65	AAAGAAAAAAAAACTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLKKMQEMEKSNDSSTDLNELKNADWARFWVQVMRDLRNGVKLKKVQERQYNPLPIEYQLTPYEMLMDDIRSKRYTLRKVMVNGDIPPRLKKSAHEIILDFIRSRPPLNPASARKLKPTPPRPRSLHERILEEIKAERKLRPVSPEEIRHSRLDVTTRESPKNVIESSVVNGDLTSSTKENSLSATQQVPVQRKKLLKAPTLAELDGSDSEEETVHKSTSSSSVSPSFLEDPLLETMSVKKKPPKFLPISSTPQPERRQPPQRRHSIEKETPTNVRQFLPPSRQSSRSLVSNPKAQCAV	60401	154385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_60482_84071_84237_114254_114342_115773_115904_131936_132110_145489_145581_153921
806864	contig_7521_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_160534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	348	2033	2380	26323	26670	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPTCRAFFCLTCVSFVCHLKYCLDWWLVSGWRSRAPPRPPTPPPLVFSTCWMSILNPLSTVAQGANASQPGATSSDATAKPGAVTASLLESFLVSQSSIQSPITRYHFKIILFI	24290	26672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_24300_26700
806866	contig_15325_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_157166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACATTTTAGGAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90563	88805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_88800_90600
806867	contig_13412_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_80013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTGCTCTATAGATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403976	404629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_404000_404600
806871	contig_5935_pilon	-	1737	6	Intergenic	novelGene_102713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.8760184877832	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	640	1386	1028481	1021110	FALSE	60	AGAGAAATATATATAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRKLVKHRIRHTGERPYSCSACGKCFGGSGDLRRHVRTHTGEKPYTCEICNKCFTRSAVLRRHKKMHGKADMESRSAPEGFSRVIEAPDLDRSQSSDSFSQDMSVTLMPLSVKLPVHPAENSTTEFDSHSAGPYCKLRPMIQSHGISDQEKLSLDPVKLAKPQMQPTAHPAYAYGDVEASAVDEPLPADSMSIIRSSLAALDNHCSDALGSRAPSTAYRNSEGQFFSSMTLWGLAMKTLQNESELDQ	1056999	1020758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1049159_1049331_1056780
806872	contig_401_pilon	-	1732	4	Intergenic	novelGene_42866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_3	52.6561170868748	2	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	353	1474	1724288	1721973	FALSE	35	TACAGAAATATACTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCPPQQSRNRVTQLPTPDLGEMELTWQEIMSITELQGLNTPSEPSFESPAPAPYPGPPQPPTYCPCSIHPDAGFPLPPPPYDLQAPTSHVPDSPYSYGNMAIPVSKPLTLSGLLSEPLSDPLALLDIGMPAGTPKLQEDPESDSGLSLNYSDAESLELEGTEAGRRRNEYVEMYPVEYPYSLMPHSLAHPNYSLPPTETSLALEPSSGPVRAKPSARAEAGSRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1728716	1721714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1722981_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
806876	contig_16620_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_156005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36252	36603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_36300_36600
806878	contig_3818_pilon	+	2116	12	Intergenic	novelGene_99244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	473.008168293876	1	99	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	167	1741	447303	455535	FALSE	10	TTTCTTCTGTCTTTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVALSSSLSNAKDVAHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSARPQDFFKKFLYEPLPVESHLDHCTHDHFNAETVTKTVENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	447050	455910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_447178_447263_447443_447733_447886_451458_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452871_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
806879	contig_15206_pilon	+	715	3	Intergenic	novelGene_175721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	17	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	221	652	12303	13758	FALSE	15	GAGTGAAGGGCTGGTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELPQQGFQGVASGFELLTFWLAARAPYSLCSSINVTLGAHNIKEQEKTQQHIPVRRAIRHPDYNEKTISNDIMLLQLETEAQRMAAVRPIRLPGKKAQVRPGQVCSVAGWGQVAPMDKYAATLQEVALTVQEDKKCESYFNNYSSDSEVCVGDPKKKMASFKGDSGGPLVCNNMAQGIVSYGRKDGTSPRVFTKVSSFLLWIKETMKHLQLQESD	12082	13821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15206_pilon_+_12315_12520_12779_13596
806881	contig_7171_pilon	+	2210	12	Intergenic	novelGene_101429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3.39420994592627	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	413	1387	1627780	1638056	TRUE	10	GGGTGCCCACAGGGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLCPCWPCCCLLLLFSRGVQGAPGDAIPEQVHLSYPDEPGAMTVTWTTWVPAPSEVQFGLQLSEPLPFQTLGTSSPFVDGGILHRTLYMHRVTLRRLLPGVQYVYRCGSAQGWSRHFRFKTLKNGTQWSPHLAVFGDLGADNPKALPRLHRDIQKGMYDAVLHVGDFAYNMDEDNARIGDRFMRLIEPVAASLPYMTCPGNHEERYNFSNYKARFSMPGNTEGLWYSWDLGPAHIISFSTEVYFFLHYGYHLVERQFRWLESDLQKANQNRAVRPWIITMGHRPMYCSNADLDDCTRHESKVRKGLFGRLYGLEDLFYRYGE	1573733	1644547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1573837_1576514_1576666_1627621_1627895_1634881_1635083_1635382_1635566_1637011_1637136_1637426_1637490_1637585_1637701_1637791_1637900_1637990_1638383_1642040_1642179_1644188
806883	contig_11986_pilon	+	1164	2	Intergenic	novelGene_69134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	81	299	187195	187413	TRUE	20	TAACCATTTGCGCTGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAVLWLLLFIAPPAGTRFCALEKGAMGQPSPAQHHCGILLQVLEACPCRWNSNPGSDEGQPALSLLKSILPVRPAHVMFSTLCSQDEGPQIAQGGMA	187114	188934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_188260_188915
806884	contig_11986_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_69135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATTATTTGTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188934	189909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_188900_189900
806885	scaffold_6394_pilon	-	1331	12	Intergenic	novelGene_111067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.170710105912	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	45	1130	518212	502331	TRUE	25	GAATGATGGAACGGCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLLDVLGLALACGFVHATLSKSDAKKAASKTLLEKTQLADRPVQERGLVVMDVRAEDVVLEYRSYCSARVQERHFDGAVLGYVTPGGAHRAPCPASFLQWNSHGYDVAKTFGSKFTQVSPVWLQLKRRGREMFEVTGLHDVDQGWMRAVRKNAKGLRIVPRLLFEDWTYDDFRSVLDSEDEIEELGKTMVQVAKDQHFDGFVVEVWSQLLSQKQAGLVHMLTHVAEALHQARLLAVLVIPPSVTPGTHQLGMFTHKEFEQLAPVLDGFSLMTYDYSTAQQPGPNAPLSWVRACVQVLDPKSKWRSKILLGLNFYGMDYSASKDAREPIVGSRYIQMLKEHRPQLVWDSQAAEHVLEYKK	518256	501608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_501767_502099_502143_502330_502416_510408_510565_510748_510851_511977_512071_513471_513534_513800_513908_514609_514655_515506_515682_517036_517187_518101
806886	contig_2365_pilon	-	1410	6	Intergenic	novelGene_103759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAAAAAGGAAGCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272917	253457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_254240_256887_257044_258064_258246_260405_260535_261544_261676_272886
806888	contig_7630_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_133628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTCCTCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223026	223390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_223000_223400
806891	SIRV6	+	485	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1842
806892	contig_6397_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_146273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGGGAGGGGGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518173	520283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_518200_520300
806893	contig_4803_pilon	-	295	3	Intergenic	novelGene_150728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	98.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGCATCTACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93259	65674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_65756_66818_66879_93105
806896	contig_7707_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_72128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGGAGAAGGGTGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67275	65291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_65300_67300
806899	contig_253_pilon	-	376	4	Intergenic	novelGene_129641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	19.8158185969358	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	107	376	260304	258372	FALSE	15	ACCCCGCGACCTGCTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGLRRRERSSASGRAHSEGQSGAEQCCEQPTPGTMGTMFRSEEVVLAQLFLPTAAAYTCVSQLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDIRRCEELEKTFLFLQEEVRRAGLVLPAPEGEAAGAP	263791	258371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_258446_259467_259547_260187_260309_263689
806900	contig_116_pilon	-	2836	9	Intergenic	novelGene_154894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1477	1782	236842	236537	TRUE	30	AAGGTCTGCATTTGAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVDMGDTPPGILQVDGEPLDWVLRSYSGDSGHCLGLLQTRSQVLEKKLTCPCSLYWHSLLPLGTLIQEPERPLPSLVPHVSMDSESRLGFLGWQSLMLA	249423	231490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_231547_233015_233165_233909_234374_236151_236927_240022_240162_240887_241023_242207_242375_245659_245822_248634
806902	contig_10734_pilon	+	1118	4	Intergenic	novelGene_51357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	12.0369800568452	191	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGAGTTGCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1780529	1787987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1780679_1781473_1781580_1783470_1783581_1787234
806903	contig_11396_pilon	-	839	4	Intergenic	novelGene_71397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_3	291.577700717245	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	47	442	1555280	1554662	FALSE	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNDAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIQMNVAEVDKVTGRFNGQFKTYAICGAIRRMVSVQRRPLGSTVEGPVSWGCRVPLPSGLAGRSRGGSQSLTLLCGSISSVCPGSRERAVLGKQTGGGPCL	1555551	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554944_1555079_1555144_1555230_1555294_1555518
806904	contig_11816_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_98482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACTATTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469833	469078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_469100_469800
806907	contig_6047_pilon	-	1091	2	Intergenic	novelGene_24222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	30	junction_1	0	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTATGGTGTGAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140013	134063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_134544_139402
806908	contig_8676_pilon	+	2623	5	Intergenic	novelGene_142205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	31.8158765398661	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	352	657	400076	402071	FALSE	70	TTTGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSKKMDSLGSLQTNPPLKLISDRSAGAAVFVPEQGGYKEKFVKTVEDKYKCEKCRLVLCNPRQTECGHRFCETCMAALLSSASPKCTACQESIIKDKVL	307148	404037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_307218_346326_346469_367644_367768_400058_400321_402010
806912	contig_2867_pilon	-	1571	4	Intergenic	novelGene_135261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.80679300992	2	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1	453	1289412	1286221	FALSE	35	CTCACCAACCCCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQRKAAFKELQSSWLKGTCSLLVCLPSPPSFLPFPSLSLVTSFQS	1289412	1285102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286661_1286781_1288013_1288149_1289316
806913	contig_5018_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_47142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	361.061546000124	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	3	644	1497681	1500271	FALSE	10	TGCGAATCTGTGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AENESLRVWLSVRSALDHAAFSHGLRQRAHRKARPRLPGHCSGGWRLQGGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497678	1500519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498290_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
806914	contig_5419_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_15533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCTGAGCTCATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397632	396523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_396500_397600
806918	contig_7569_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_114603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTATATTCTCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239397	241001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_239400_241000
806919	contig_10855_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_124302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGGGCCTCCGGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297456	298836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_297500_298800
806920	contig_20356_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_159527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTGATTGAAAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35426	36923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_35400_36900
806922	contig_13481_pilon	+	1618	2	Intergenic	novelGene_119361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAACCATTGCACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445405	451080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_446958_451014
806928	contig_5727_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_7988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTGTTAAAGCCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493363	494182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_493400_494200
806930	contig_7412_pilon	-	1667	8	Intergenic	novelGene_76285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	114.587458800192	138	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	6	896	280454	272428	FALSE	0	TTGTGCCTTTGTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAVLAPLIALVYSVPRLSRWLARPYYLLSALLSASFLLVRKLPPLCHNLPTQREDGNPCDFDWREVEILMFLSAIVMMKNRRSITVEQHIGNIFMFSKVANAILFFRLDIRMGLLYITLCIVFLMTCKPPLYMGPEYIKYFNDKTIDEELERDKRVTWIVEFFANWSNDCQSFAPIYADLSLKYNCTGLNFGKVDVGRYTDVSTRYKVSTSPLTKQLPTLILFQGGKEVMRRPQIDKKGRAVSWTFSEESVIREFSLNELYQRAKKPSKAGDHIPAERPEAPTPTPVPDGESKKDK	280459	271656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_272575_273687_273818_273905_273972_274142_274250_274485_274563_274852_274967_275202_275264_280265
806932	SIRV6	+	354	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	176	1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2461	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
806934	contig_12543_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_168357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	3	392	22612	23001	NA	10	GTCCTGCTTTTCTTACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLPQKRALQTLSHALSPGVREDGPVAAAPAEGGQDGAWASCYDHSGPSHCLSLWGTQEGRPIAGRGGISKSPPEQPSIEVGLALDTSCLQLRKSRSSSLRPAATLHVPEGGRVCSLAVHRRPGRGFPA	22609	23275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_22600_23300
806935	contig_1154_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_87195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1218	1535	1061565	1061248	NA	20	CCTAAGCTTGTCTTACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFLRLSRAGYLTKELLRILFQEHNCSSVVLLCFLVSSLGKPSPTDVTKLKPVLPVRLLGLPSSFTVLRDTFIIPQRQCSTVDIEGSRVRLPEFAFWLYYLIGV	1062782	1060614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1060600_1062800
806937	contig_15631_pilon	-	1328	9	Intergenic	novelGene_151533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.5752851649187	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	68	931	362316	353766	FALSE	35	CTTGGATGGAAAGCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRHVRRLPELTPAERDDLASVMKKLLTKYDNLFETSFPYSMGWHGAPTGSEAEADWDHWQLHAHYYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAQAQRDLTPEQMSSSCSGLSRVLVAVATALVSVSSPCPQAWGPPGVQYGQLGRSVMLCCPGVTAGSPVSWFRDGEPRLLQGPDSGQVHQLVLSRADSTDEGIYICRTLDGAVGDPPARPVVSCQAADYENFSCTWSQGQVSSLPTRYLTSYRKKTLPGADDQRIHSATGPWLCPQEPPGAARCVVHGAEFWSQYRINVTEVNPLGASTRLLDVSLQSICECPP	362485	353368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_353950_354034_354068_354212_354328_354484_354631_356287_356349_356606_356707_361771_361927_362246_362331_362432
806938	contig_8673_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_129922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACAGTGGTTGATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317938	316981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_317000_317900
806939	contig_15066_pilon	+	1205	8	Intergenic	novelGene_149559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	58.3668902508179	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	288	1010	115715	117881	FALSE	45	ATAGTCAAAATGAGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGRHPFSSREVPISNGSGFVVAADGLIVTNAHVVADRRHVRVRLPSGDTYEAMVTAVDPVADIATLRIQTKEPLPTLPLGRSADVRQGEFVVAMGSPFALQNTITSGIVSSAQRPARDLGLPQTNVEYIQTDAAIDFGNSGGPLVNLDGEVIGVNTMKVTAGISFAIPSDRLREFLRRGEKKNSLFGVSGSRRRYIGVMMLTLTPSILAELQLREPSFPDVQHGVLIHKVILGSPAHRAGLRPGDVILAIGEQLVQSAEDVYEAVRTQSQLAVRIRRGPETLTLYVTPEVTE	115325	118076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_115465_115566_115772_115860_116056_116270_116304_116524_116631_116789_116860_117518_117615_117715
806940	contig_9633_pilon	-	973	2	Intergenic	novelGene_139615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCACTCTGTCATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641144	640117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_640361_640414
806943	contig_4531_pilon	+	1355	8	Intergenic	novelGene_47912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_3	79.9971938283348	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	363	1163	397354	406716	FALSE	55	AAAAACTTAAAATAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQSEEDVSQFDSKFTRQTPVDSPDDSTLSESANQVFLGFTYVAPSVLESVKEKFSFEPKIRSPRRFIGSPRTPVSPVKFSPGDFWGRGASTSTVNPPTPVEYPMETSGVEQMDVTMSGEASAPLPIRQPNSGPYKKQAFPMISKRPEHLRMNL	396991	406908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_397356_397538_397630_398158_398267_398552_398616_398792_398871_402240_402349_405389_405503_406478
806944	contig_16948_pilon	-	818	4	Intergenic	novelGene_166424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	36.2338086445365	808	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	38	577	423823	420549	FALSE	35	GTTCTTGGAGAATTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWATHGLAVALALSVLPGSRALRPGDCEVCVSYLGRFYQDLKEKDVIFSPATIEKELINFCREARGKENRLCYYIGATDDAATKIINEVSKPLAHHIPVEKICEKLKKKDSQICELKYDKQIDLSTVDLKKLRVKELKKILDDWGETCKGCAEKSDYIQKINELMPKYAPKAASSRTDL	423860	420307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_420734_422002_422145_422931_423060_423738
806945	contig_7733_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_147149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGTGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178537	180167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_178500_180200
806946	contig_15888_pilon	-	936	4	Intergenic	novelGene_84416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1669.71481264183	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259781	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252548_253383_253461_259705
806947	contig_15230_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_146450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCCAGAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175820	176141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15230_pilon_+_175800_176100
806949	contig_14755_pilon	-	2139	11	Intergenic	novelGene_129375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_4	37.6203402430122	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	636	1202	198187	128904	FALSE	20	ATGTTTTTGTTACGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIQPSDEWENFSKRTDDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	368708	127966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_198132_198217_225825_225938_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
806950	contig_7202_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_17137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCTTTGATGGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
806951	SIRV6	+	259	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	8451	-1	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
806952	contig_6062_pilon	+	1464	3	Intergenic	novelGene_5269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	407	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	809	1201	662655	688068	FALSE	15	TTTCATTGGAGTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKAVTSSIMEWRHSCTACVFLRIKLPERAYRTTIKG	660868	688331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999_662943_687963
806954	contig_9099_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_149885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191102	189418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_189400_191100
806955	SIRV6	-	351	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8930	416	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAAGGCGGCGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	1128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105_3164_10723
806956	scaffold_13505_pilon	+	1603	4	Intergenic	novelGene_111567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	79.163684154345	109	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGCAATGTGGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608577	635980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_634895
806958	contig_10765_pilon	-	352	3	Intergenic	novelGene_122977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	971	junction_1	19	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	80	352	476595	423075	FALSE	45	TCACATGAATACAGACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVGNGYIKPPVAPVSGTQKEKGPPTMLPISVDPDSKPGEYVLKSLFVNFTTQAERKIRIIMAEPLEKPLTKSLQRGEDPQFDQVISSMSSLSEYCLPSILRTLFDWYKRQNGIEDE	476674	423074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_423174_440143_440198_476475
806964	contig_1275_pilon	+	653	3	Intergenic	novelGene_108845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746553	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747532_747793
806965	contig_13217_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_140889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	773	1105	16581	16249	NA	25	ATGACTGCAGGATCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKSSNLFKVLKSKDVISRTKGQLTQAMVFSIALCTCESWTMNKEDRRRIDTFELYCWQRILNIPWTARRMNKSVLEEAQPERSLEARMAKLRLTYFVMLSGGTSP	17353	15317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_15300_17400
806966	contig_18869_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_56454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCAAATTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173454	174599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_173500_174600
806967	contig_9919_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_137977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAACCCAAACATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606835	608714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_606800_608700
806973	contig_960_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_108330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTCTTGACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079735	1078491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1078500_1079700
806976	contig_5375_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_169227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAGCGAGAGGCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121392	119091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_119100_121400
806977	contig_11978_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_62928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCAGGTTTCAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882365	881707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_881700_882400
806979	contig_3602_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_60586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGACCTCCGTCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672654	674514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_672700_674500
806980	contig_15720_pilon	-	1809	4	Intergenic	novelGene_41862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52.5758711028379	83	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1267	1569	260343	260041	FALSE	25	TCAAATTCTCTTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	262789	259800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_260733_261064_261341_261661_261826_262352
806981	contig_15039_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_110178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	643	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGCAACACTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346915	348667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_346900_348700
806982	contig_6593_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_49832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1238	1549	193579	193268	NA	25	ATCACATTTACTTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTELSAFPLGIVPHPWPKHLSGSLTPLPALDPVGLGEVMSSHWCLSIPWGSPNSAHTSYIASSPNSLRTSTLNALSVTYQDPNVAKVFQNQFNKPPFWGVWC	194816	193083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_193100_194800
806983	contig_9683_pilon	+	1015	3	Intergenic	novelGene_151282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	5	1276	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	35	502	487041	487695	FALSE	30	TGTGTGCATATTTTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARGTASRFLTSVLHNGLGRYVQQLQRLSFSLSRDSPSSRGAREFVEREVVDFARRNPGVVIYVNPRPCCVPRVVAEYLNGAVREESIHCKSAEDIATLVQKLADQSGLDVIRIRKPFHTDSPSIQGQWHPFINKPTAPGGLRPREFQDAAPAQ	487006	488208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487172_487259_487367_487465
806984	contig_18533_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_174053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAACCAGTGAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174098	171900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_-_171900_174100
806986	contig_12120_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_21437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAATTCTGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240616	239575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_239600_240600
806991	contig_13244_pilon	-	477	5	Intergenic	novelGene_86969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3014	junction_2	913.463566596939	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	237	440	297313	296091	FALSE	25	AACTCTAGATTGTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQKPEVRKAQREQAIRAAKEAKKAKQASKKTAMAAAKAPTKAAPKQKIAKPVKVSAPRVGGKR	299251	296053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254_297392_298566_298678_299204
806993	contig_3584_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_108152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTAGAGGTCTCTAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342449	341573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_341600_342400
806994	contig_13760_pilon	-	2067	9	Intergenic	novelGene_61286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.8975153607594	1	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	935	1684	166139	161870	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLGSTPCPSCWRWTSWAAPAPLRSGRRCCTRPSNWRPSCGGTMGNMFSFAAVMGALDMAQITRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEGPPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPAEGPEPWDNTEHGVEVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	171089	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161732_161785_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166057_166170_167061_167602_169072_169199_170851
806997	SIRV6	-	238	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11269	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
806998	contig_8710_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_73544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAAAAAAGCTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510908	511447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_510900_511400
806999	contig_9919_pilon	-	1645	9	Intergenic	novelGene_137998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.421410226267	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	29	874	866377	845522	FALSE	15	TGTCCCTTGTAAACCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLSECSVVMGRRKATGGGSLGRTLIRRKNLQSRSQRHTDSWVHTAELSDGYDWGRLNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEKLNIKFVPREARTGLLSFEESQRIKKLQEENKEFLCIPRRPNWDKQTSPEELKQAERENFLEWRRQLVRLEEEQKLILTPFERNLDFWRQLWRVIERSDIVVQIVDARNPLLFRCEDLECYVKELDDHKENVLLINKADLLTAEQRSAWASYFEKEDVKVIFWSALAEAILTKAEMICNGILPIDQMRDHVPSVSLIARIFRDVF	866405	844750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_845550_850457_850536_855917_856076_857302_857364_860474_860562_861091_861179_861358_861480_864591_864719_866278
807001	contig_10864_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_107056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGACGACAGTTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755017	753224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_753200_755000
807003	contig_6059_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_44804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTCTCACTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417401	415663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_415700_417400
807004	scaffold_12510_pilon	+	1763	4	Intergenic	novelGene_151367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAACCCATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198681	208761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_199444_206082_206221_206837_206955_208015
807005	contig_18869_pilon	-	1582	2	Intergenic	novelGene_56447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	979	1317	120066	119728	FALSE	60	AGCATACAAGAAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFSPEKFYRKQTNHSPHSLTSKTKSLKRLTFLRILFPCMSTSLLPRIQIQPKLFKTKRIPLHSCVSTIPPTAGAAKSSVKLLSTLISASPSGNRTCRTICLLMNNNDVLL	122511	119462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_120166_121632
807006	contig_20017_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_174905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	698	1009	30236	30547	NA	30	ATCTAGTGTAGCATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKILLQMMWWRVHCIYGNSQPSLCFLIAERFSASFSLCLLTFLFEKLHFSFSHLMLLLAAIESAFDWWRPLAQQNRTLPRPVPSPWWLVFQTVVTHRVFTG	29538	31030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20017_pilon_+_29500_31000
807008	contig_17127_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_168306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTAACCAAGTTTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76528	75339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_75300_76500
807010	contig_2341_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_84342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTAGTTGTTTCATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18809	18302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_18300_18800
807011	contig_9505_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_121813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	48	371	395401	395724	NA	60	CATCTAAAGTACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKAEPDGHCWPPFSSMAWIQTLLASFLLHGLDTDTAGLPTPPWPGYGHCRLPFSSMAWIQTLLASLLLHGLDAHPVDCPAGVKAKATQHSILKSKHLPGQGGLHLPCFSNRQESQSHSKRRR	395353	396945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_395400_396900
807012	SIRV5	+	336	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-17	886	-17	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
807013	contig_9290_pilon	+	1085	5	Intergenic	novelGene_77564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	3.56195171219375	492	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	128	694	498370	502040	FALSE	20	GTTGCAACTGTGTCTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGAAGWCCLVLLFPACVAVHGLHIHDYLYFQVLSPGDIRYIFTATPAKDFGGIFHTRYEQIHLVPAEPPEACGELSNGFFIQDQIALVERGGCSFLSKTRVVQEHGGRAVIISDNAVDNDSFYVEMIQDSTQRTADIPALFLLGRDGYMIRRSLEQHGLPWAIISIPVNVTSIPTFELLQPPWTLW	498242	502431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_498437_500519_500621_501151_501262_501530_501699_501919
807014	contig_6710_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_97148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
807015	contig_9931_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_134823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTTTCACTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306825	307237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_306800_307200
807016	contig_16098_pilon	+	913	5	Intergenic	novelGene_46063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	431.294200633396	11	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	163	522	436826	438839	FALSE	15	GTTCCAGGCTCGCGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIKDNGWD	436016	439230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436759_436943_437045_437090_437263_437373_438749
807017	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
807019	contig_1813_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_105484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATCATATTGGTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108956	109535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_109000_109500
807022	SIRV6	+	276	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	110	-9	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3133	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807023	contig_2894_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_86556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318637	317296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_317300_318600
807024	contig_1406_pilon	+	1802	4	Intergenic	novelGene_25653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	16.1107279647928	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	163	648	2778873	2791476	FALSE	30	AATGTGTGTAGATTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHEFKNGGAYLSSTNHLLRPSPLPKLWLGGAPLHPRGADQPEGWAFRSEPAPSAMASRGVVGLFLLFALPVLCLELRRGIPDLDEEEEENEKRQKLVRKKQQEAQGEKASRYLENVLKPHQEMKLKKLEERFYQMTGETWKLSNGHKLGGDEDLLLDNASQTSFETANREAAKRRNLPKPVTKVSPPAEQPPQKKVRYGMPPHGIVSVCCGGIVL	2778710	2792630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2778961_2786024_2786099_2789060_2789184_2791275
807025	contig_11017_pilon	+	2185	3	Intergenic	novelGene_128076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1064	junction_1	67.5	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233691	270710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803
807026	contig_9727_pilon	+	2223	2	Intergenic	novelGene_86325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359212	362415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_360169_361148
807027	contig_675_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_136354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1410	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	249	581	244023	244355	NA	70	TGGGAAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHEPCIEETGEYFRLTYDTRGGFALHRITAEEAKYQQCKMRKIFVGTKGIPHLVVTHDAGTSRHPDPLIKVNDTVVIDLGTDMITDFWWGQSWPCWCDHQQKRISWFF	243774	244562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_243800_244600
807028	contig_8907_pilon	+	1367	3	Intergenic	novelGene_85834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0.5	106	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	532	822	454170	454460	FALSE	25	GTATCAGTGTATTTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QERQKTLQRLRAFKEKCPGRSVLKNSCSEPVTPNLPGELSQQASPPASQTVSVIHPSSKKTRSTPSSKVSNVKSPRCQDYPGNIPVQNFVPVGDHTHSKSSEELSLPSPPPPPPPPPPPPPPLPSPLPTRPFSSQSVTHRNLHFRTSVKDDQPLPLVCESLPERPRDSSESFKCSGSMDEVLALLRSGKSPLQKVDVPTLPSPRTSVNEHLLAAIRQGVKLKKVHPNLGLSPSHKPPTDLERSIKAALQRIKKVSADSEEEDGSEQSSSEWDQ	449005	455005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_449051_451137_451619_454164
807030	contig_5588_pilon	-	600	4	Intergenic	novelGene_172849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	10.1980390271856	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	85	327	1071130	1064617	FALSE	20	TGAGGCCAGGCCCTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALWSWRQDHVVDSWQSAVCGAFAGGFAAMVTTPLDVAKTRIMLAKAGSSTATGNVLSALHEVWQTQGLSGLFAGVFPRMAAISLGGFIFLGAYDQTRSLLLGLGRETP	1077398	1064343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328
807033	contig_6102_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_32021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTGACCCCATGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512415	511119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_511100_512400
807036	contig_10467_pilon	-	1159	5	Intergenic	novelGene_175402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.53325958665968	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	44	736	87391	29470	FALSE	15	TTATATTTCTGAGCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRDTRTSAVASEFSSWARVSRSSRAAPSTPCAGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQSRIEQQQQQMRNSARTLNFVKHSSPKDKMSPASPMDDIERELKAEASIMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSENEECSSSPSDPGNYNSGHHTMSAMLQCKIPDMEASHNRFYDNSGLMMNTLRNDLQLSDSGSDSDY	87434	29046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_29517_58991_59253_62533_62680_64976_65114_87289
807037	contig_14744_pilon	+	2009	2	Intergenic	novelGene_65941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTAAACTTATGAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207529	213454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_208651_212566
807038	contig_14928_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_98794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292507	290700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_290700_292500
807040	contig_5039_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_64831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCGTGTTCCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279138	278511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_278500_279100
807044	contig_6182_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_171653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1473	1865	117830	118222	NA	35	ACCCTGAGAAAAGCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKADRGRTDAFELWCWRRILNIPWTAKRMNRSVLEEVQPECSLEARMMRLRLTYFGHVTRRTQALEKDIMLGKVEGQQKRGRSSMRWIDTVAATMGSSITTFVRMATDQAMFRSVVHRVAMSRNRLNGT	116357	118545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_116400_118500
807045	contig_13051_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_140112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172754	171239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_171200_172800
807048	contig_8702_pilon	+	1283	10	Intergenic	novelGene_157738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	302	934	132440	134302	TRUE	40	AGACTGTCTAACAACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELASMSADSAWPNSPAPCRDICMAYAICSSSVMLLKSGSPARPNSCWLMVIFSRVSSESSVPAAAIPASAAEAAAARRASSSCRCRCSSMETRRAWASSGSALGSTPNSKSLAPRPSMAPPSPARTGELMRASARLGPGGTVTRWEPVPSLPFSVFTKAVSFSVFTSSSPKLIISTFTFSFLRRLASFTRSFSLSSTGLPTKAMMRIL	131574	140286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_131853_132416_132484_132557_132695_132845_132958_133560_133773_133939_134010_134244_134335_134713_134829_135907_136049_140225
807049	scaffold_880_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_121422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	900	1394	371275	370781	NA	30	CCACAATGGAAGTTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWWFSLVAFKSALTHGDLMYKCCANFMIVQTHGDLIYKRRAVFMIVQTHRELMYKHHAIFMIVQTHGELMYKHHAIFMIVQTHGELMYKRHAVFMIVQTHGDLMYKHRAVFMTVSVFECIVVALASIHLIEGFPPFHKPSTLPNTMSFSRDWSLLMAHPKQAR	372174	370614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_370600_372200
807050	contig_7513_pilon	-	2537	1	Intergenic	novelGene_88964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAGAAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171571	169034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_169000_171600
807051	contig_8616_pilon	+	776	3	Intergenic	novelGene_72523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	18	113	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTGTGTGATTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347983	349502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_348333_348990_349089_349173
807052	contig_11364_pilon	+	1855	8	Intergenic	novelGene_65165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	201	452	85037	85288	TRUE	25	CCCTCATTGTACAGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGAPPWGERHDHGVTAFCKEHQTVFVSIVWDAPFLSCNSELRNAREGKRGGWGPYDLDARETRTQMFCDRDIQRWYDGGRKKAQMEPLFTGHPDSGPEPLHGTPGRNSMLWGTLTVPKPLGFLLRGLCSGQGPTGRPWTWRLKLQAGT	84836	95671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_85591_86484_86592_90472_90678_92017_92115_92229_92337_94560_94667_94954_95058_95295
807054	contig_18869_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_56235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGCACTACCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73350	73592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
807055	contig_18364_pilon	+	2149	2	Intergenic	novelGene_102561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACAGATCTGGTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104713	111103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_105360_109600
807057	contig_10753_pilon	-	1418	3	Intergenic	novelGene_105145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	502	junction_1	87.5	508	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	26	607	330074	323783	FALSE	5	TGGATTGTGTGTTTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQNSKLRPEVLQDLRENTEFTDHELQEWYKGFLKDCPTGHLTVDEFKKIYANFFPYGDASKFAEHVFRTFDTNSDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQKLKWAFSMYDLDGNGYISRSEMLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTDKIFRQMDTNNDGKLSLEEFIKGAKSDPSIVRLLQCDPSSASQF	330099	322971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_323881_327580_327687_329696
807058	contig_9505_pilon	+	1228	9	Intergenic	novelGene_121853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	268.466216450041	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	52	804	530721	621024	FALSE	20	GTTCATTGCCGCATTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDETGRPPAFQPHHRGADHDLRVMHGLEERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFANKHLNKLNLEVTELESQFADGVYLVLLMGLLENYFVPLHNFYLTPDSFDQKVRGLSQSSVVA	530669	621448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886
807059	contig_19132_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_170009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAAAGGGAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479662	478447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_478400_479700
807062	contig_8452_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_47994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGATAGAGACACAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146025	145045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_145000_146000
807065	SIRV6	+	433	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	178	76	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
807066	contig_12229_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_169390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGAAGCTGAGTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83128	83425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_83100_83400
807068	contig_12229_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_169391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGGAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83915	84479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_83900_84500
807070	contig_2114_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_104298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAATTAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808397	808689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_808400_808700
807072	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
807073	contig_12050_pilon	+	1249	4	Intergenic	novelGene_62647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	274.964644191859	74	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	185	445	359783	362088	TRUE	5	CTTGGAGCCCTCTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKWPRLWETSAPGGSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKPRPGSQQNLPAGGNSRPGPAGHAAVCSTLSPS	359598	363966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_361989_362656_363729
807075	contig_5019_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_109212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTATTTGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216381	218474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_216400_218500
807076	contig_1076_pilon	+	1887	12	Intergenic	novelGene_101125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	11.1028251932887	42	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	124	1347	755471	775033	FALSE	30	GGAAATGTATCTGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSAGGEPPASSACPSTCAKFCFIDDILLNRPKKKKPRPKHTLVSTSLDGLVQAAVHKPPKGSEPPTEEPIEHPEAPVQRRYKKKRQSLELETSFTQKKVSSPSSLQNENGVDVEPTEEAVIQKPRKKTKKTRPSELQYANELGVEDEDIITDEQNSPEQQSVFTAPTGISQPVGKVFVEKSRRFQAADRSELIKTTENIDVSMDMKPSWTTRDVALSVHRAFRMIGLFSHGFLAGCAVWNIVVIYVLAGDQLSNLSNLLQQYKTLAYPFQSLLYLLLALSTISAFDRIDFAKTSVAIRSFLALDPTALASFLYFTALTLSLSQQMTSDRIHLYTPSSANGSLWAAGIEEQILQPWIVVNLVVAILVGLSWLFLSYRPGMDLSEELMFSSDVEEYPDKDKGIKASS	755347	775573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_755502_757687_757720_759284_759355_764639_764778_768008_768130_768851_769010_770284_770409_770710_770903_771443_771518_772168_772263_773078_773201_774965
807077	contig_14868_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_150439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAAAGAGTTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112378	113504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_112400_113500
807082	contig_13300_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_125778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGTCCTTGAACGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57235	57827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_57200_57800
807083	contig_12414_pilon	-	634	6	Intergenic	novelGene_59662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333.468799140189	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	88	633	795027	774262	FALSE	5	GTTTGCTTTTTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPTKEGGWSLFRDRDNDTPSECLGPKGEMLWFQGSIPAAIALAKRNGSVFVVFVAGNDEQSTQMAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQIIKEEKVQAMPLPLRILVSVQIQDLQKTSPSEWK	795114	774260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_774364_781996_782108_782791_782911_783428_783458_787129_787233_794945
807084	contig_6710_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_96811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
807086	contig_18419_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_141475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTCTCAGCTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79248	78542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_78500_79200
807088	contig_11363_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_160503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222036	221388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_221400_222000
807089	contig_18735_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_132669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	10647	10351	NA	45	TTCTAAAGAATGAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAPARPLPHLCCILCGCCISVDFFYEVFFFFFNLICSGRSQLPVLCCCHSTNRECAVLLPGAEFRTLRILAKEKLSARGQSQPEKTAFFGGGETRNT	10649	8771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_8800_10600
807090	contig_13565_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_162396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACCTTTCAGCTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200505	201972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_200500_202000
807091	contig_7321_pilon	-	1500	2	Intergenic	novelGene_53138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	49	309	173630	169423	FALSE	20	TTTTCTTTGAGCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYGWTFCSTFLHITYCVLE	173678	168231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_169617_173563
807092	contig_2311_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_169825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501692	502971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_501700_503000
807093	contig_9389_pilon	+	1502	10	Intergenic	novelGene_83893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	8.79955105476592	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	2	1288	115268	127297	FALSE	0	TCTCTCCTCCCGGCCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAVCTDSAGQLWSCVVWELHSGANLLTYRGGQAGPRGLALLNGEYLLAAQLGKNYISAWELQRKDQLQQKIMCPGPVTCLTTSPDGLYVLAGIEESIHLWEVSTGNLLVILSRHYQDVACLQFTGDGSHFISGGKDCLALAWSLYSVLQADPSRIPAPRHVWTHHTLPITDLYCGFGGPLARVATASLDQTVKLWELSSGELLLSVLFDVAVMAVTLDLAEHHMFCGGSDGSIFQVDLCTWPGQREKSFQPEQESGKVFRGHRNQVTCLSVSTDGSLLLSGSHDETVRLWDVQSKQCVRTVTLKGPVTNAFIMLAPVTMLSSDLRPSLPLPHFNKHLLGAEHGDEPRRGALTLRLGLHRQGSEPSYLERAEQLHGVMCSTMEKSVLGGQDQLRIRVTELEEEVRNLRKINRDLFDFSTRIITRPAK	115266	127511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_115466_116550_116662_118487_118622_118828_118971_123964_124109_124254_124320_124550_124676_125795_125963_126727_126797_127165
807094	contig_9683_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_151268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACCACCACCCAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26025	23675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_23700_26000
807097	SIRV1	-	212	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3596	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
807099	contig_4845_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_53681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAAAAAAATTAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800729	801858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_800700_801900
807103	contig_3948_pilon	-	1666	3	Intergenic	novelGene_53363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	792	1325	1813942	1813150	TRUE	10	CGGCAGCGCGCGCGAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSPLSKTPAQSLSLVSVSGSLLRSKTKIRLFKSVSDGGRQVQPPEDLLYHRSREEGAARTPVTQPASRRLAKNNKTAPAGGIMRPSRLGALKATLEPRRSGTGSLACFLLHRPDRGRPLRSLGLLPPGSPAPSLLHAPWLSASYWEPELSRRWLSCGLFIYFFKDQMRVRLLKP	1814733	1812268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1812366_1812905_1813586_1813844
807104	contig_8710_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_73526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAACTAAGCCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411025	412734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_411000_412700
807105	contig_8182_pilon	+	1936	11	Intergenic	novelGene_173259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1287	1910	344410	417541	FALSE	5	TTAGCTTGCTCGCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLARIWSRFCSGRPRQRQSELGSRCPFCTSLGPSSIPSSWFTQSSHKAGRKPSLLIVDLAPPPILVGSIQDFDDVASLKCQLPVGHGDVIPYCLSTNDGISSDQISQRGHVEAHNVFPPSKKACSLSLSLFPCLGLSVPPPPPVALGMKSKRQFATDQEKAKSWFSKGKAGGNLWEVLRRLFSQSVPVFVRPPAWLPVSLGLPYSL	254667	417567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_+_254899_260069_260144_272885_273128_280191_280329_288165_288299_293555_293789_332475_332656_344353_344546_377444_377624_416820_416983_417394
807106	contig_4654_pilon	-	2654	1	Intergenic	novelGene_103035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25703	23049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_23000_25700
807109	contig_2377_pilon	-	1234	3	Intergenic	novelGene_67878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	9	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	269	895	92953	87872	FALSE	30	AGAAATGTCTGTGTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPPVTMMPVTGGTINMMEYLLQGSVLDHSLESLIHRLRGLCDNMEPETFLDHEMVFLLKGQQASPFVLRGRRSMDRTGAPWHLRYLGQPEMGDKNRHALVRNCVDIATSENLTDFLMEMGFRMDHEFVAKGHLFRKGIMKIMVYKIFRILVPGNTDSIEALSLSYLVELSVVAPAGQDMVSDDMRNFAEQLKPLVHLEKIDPKRLM	94121	87532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_88426_92880_93028_93927
807110	contig_6488_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_44749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGGAGACACTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166068	164933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_164964_165321
807114	contig_2596_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_53486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACATAAAATGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719398	719025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_719000_719400
807115	contig_16098_pilon	+	1162	10	Intergenic	novelGene_45906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	47.4786501727063	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	190	1071	321962	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294677	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
807116	contig_12250_pilon	+	1458	5	Intergenic	novelGene_80520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	9.60143218483576	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	505	1128	62743	64563	FALSE	10	GCTTCGACTCATCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASTISKAPQPPKTWILVTGVAYYQPSLTAEYDEDSPGGDFDFFSSLVTKWEAAARLPGDSTRQVVVRSGVVLGRAGGAIGHMLLPFRLGLGGPIGSGHQFFPWIHISDLVGILAHALEARHVQGVLNGVAPGPTTTNAEFAQALGAALGRPAFIPLPSTVVKAIFGRERAIMLLEGQKVVPRRTLATGYQYSFPKLGAALKEVVA	61780	64893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_62147_62225_62309_62687_62810_63712_63857_64150
807117	contig_9673_pilon	-	1901	2	Intergenic	novelGene_119175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAGTAAATTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153402	149479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_149543_151564
807120	contig_14814_pilon	-	1479	2	Intergenic	novelGene_137690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	791	1114	56649	56326	FALSE	25	CCCAGCCACACCCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFWSGFSAQPLTLTQSPDSLPAAPASVSVAVLVHSHTSSHIITHHHTSSHIIPRVCVCKSTYLRPGHTGYRQLSCLQFGKMEGDEVPLQGSNLWEMAAASRGEET	57941	55960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_57098_57599
807124	contig_11429_pilon	+	1107	7	Intergenic	novelGene_60466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1129.30948666283	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	47	487	46162	48504	TRUE	20	TCGATACTGACAGTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEEGKLFVGGLNFNTDEQALEDHFSSFGPISVKDRETQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGEIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGRSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45445	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46260_46519_46620_47281_47370_47457_47552_48443_48530_48899
807127	contig_4156_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_88119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATCACAATTTGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446517	447361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_446500_447400
807129	contig_12756_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_153218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCGTATGGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162567	165051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_162651_163578_163672_163793_163975_164382
807132	contig_14158_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_136130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	478	789	32307	31996	NA	95	AAAAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDPQFQFDAIVSELIAKLMIQMEVLKIGFYLTSHVLYLGNCCSLKCGCRWIALSTWPDTSIKLETSDTRGIHQLPCTETAFPPLAHFPISLSSLQRSTQSL	32784	30730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_30700_32800
807133	contig_14300_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_133089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGAAGACATGGCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144289	145122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_144300_145100
807134	contig_14300_pilon	+	2055	3	Intergenic	novelGene_133131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1011	1382	392240	392611	FALSE	45	GACTGAGGGCACATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METAWEGNDFNIQKREVEFGRTGVHLMAKRNGRSPVGRASVLSLSSAGEPGDVFWVSALAGSFAGNAQHCLHRDRKSPCSFHCTWLSPFGSSFMKWGPASCHANSFVVLWGSNEIQSGGDSEN	388983	393284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_389100_390573_390761_391532
807135	contig_10902_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_65670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTGCACAGTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96781	97264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_96800_97300
807136	contig_6418_pilon	-	850	8	Intergenic	novelGene_81092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.155107504606	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	61	411	78210	71817	TRUE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVSVSRTSPCILRIDSTTP	78270	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71869_72380_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209
807138	contig_401_pilon	-	1357	3	Intergenic	novelGene_42792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_2	40	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	342	779	1116560	1114797	FALSE	20	TTGGTCTAACCCCAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPPYGLCERGDPGSSPTGPRESSPLVVISQPAPIAPHLSGPAEDSSSDSEAEDEKSVLMAAVQNGGEEANLLLPELGSAFYDMARGFAVGSLSEASTGGPVIPPWKECPICKERFPAESDKDALEDHMDGHFFFSTQDPFTFE	1116901	1114218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407
807139	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_97031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
807140	contig_17936_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_29974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATAAACCTGAATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126170	126562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_126200_126600
807142	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
807148	contig_5569_pilon	-	1792	15	Intergenic	novelGene_86751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	147.990709167839	5	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	600	1235	490858	467456	FALSE	75	CAACAAAAAAAAAGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVLRVTGYFSYPLALIVNLALSAIDACIILWIFISLTQTMKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	503051	466898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260_487366_490017_490094_490831_490926_493008_493089_493479_493580_495265_495450_498327_498393_502948
807149	contig_17737_pilon	-	1409	7	Intergenic	novelGene_72908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	103.534213346764	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	51	662	68869	52301	FALSE	40	ACAAAATTACCAACGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCCQRLGSSALIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPAA	94206	51553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_52309_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_94171
807152	contig_4388_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_161973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1135	1491	811626	811270	NA	35	TGCTGAGTGAAATAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEPRTVPGRQEGRRISKLVSFSPLSHFQSRGGRRGGVCICILFYRLRRQASKYFTALATPALAILGCHVSLDPHLGFPVPTDVAARNSHHASHLGTGLAVWGRIIGGQSFPSKAQMF	812760	811024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_811000_812800
807153	contig_2455_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_119203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852978	854235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_853000_854200
807155	contig_9516_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_106208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTATGTTTTCTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440561	1440972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1440600_1441000
807156	contig_11285_pilon	+	1267	6	Intergenic	novelGene_5508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	63.593710380823	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	266	961	545264	546547	FALSE	10	TAGATTCCTTTCTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGAALWPVMTTISSQLATRTHSRWVRMLPSLAYCTFLLAVGLSRVFILAHFPHQVLAGLIAGAVLGWLMTPRVPMERELSFYGLTALALMLGASLIYWTLFTLGLDLSWSINLASKWCERPEWLHMDSRPFASLSRDSGAALGLGIALHSPCYAQVRRAHLGNGQKIACFVLAMVLLGPLDWLGHAPQISLFYIFNFLKFTLWPCLVLALVPWVVHLFSAQEAPPIRSS	542980	546853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_543119_544727_544835_545243_545335_545508_545628_545818_545961_546183
807158	contig_9185_pilon	-	2051	2	Intergenic	novelGene_166891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACAGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247998	243589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_244026_246383
807160	contig_11416_pilon	+	2271	13	Intergenic	novelGene_145379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_10	200.806014739488	423	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	182	1438	789614	796928	FALSE	0	TGGGCTGGTCTGGTTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVAIVKEGWLHKRGEYIKTWRPRYFLLKNDGTFIGYKERPQDVDQRESPLNNFSVAQCQLMKTERPRPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVETPEEREEWTTAIQTVADGLKRQEEEIMDFRSGSPSDNSGAEEMEVSLAKPKHRVTMNEFEYLKLLGKGTFGKVILVKEKATGRYYAMKILKKEVIVAKDEVAHTLTENRVLQNSRHPFLTALKYSFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFSEERARFYGAEIVSALDYLHSEKNVVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGIKDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLSGLLKKDPKQRLGGGAEDAKEIMQHRFFASIVWQDVYEKKLSPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQMITITPPDQDDNMECADSERRPHFPQFSYSASGTA	775670	797761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_775712_787314_787444_789602_789715_790633_790782_791233_791366_791564_791631_792446_792516_792876_793003_793085_793215_793534_793750_794117_794206_796409_796513_796848
807163	contig_1055_pilon	-	2358	9	Intergenic	novelGene_149722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	78.3867614779435	3	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	93	1076	97026	56813	FALSE	15	TGTGTGTGAAGACGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALIAQNPKNGPTLQEKLKSFKAALIVLYLLVFALLIPVIGIVAAQLLKWDMKNCTAGSINTNGISTSLTGKENDSKGETRFREIVMEHMSILEKRIHYIADTETNLIDSEHFQNFSVTTDQRFNDVLFQLSTLVSSVHGHGNAIEEISKSLMSLNTTLLDLLLRTETLNGKVQENTFKQQEEIRKLEEHVYNASAEIMSMKEEQVHLEQEIKGEVKLLNNITNDLRLKDWEHSQTLRNITLIQGPPGPRGEKGDRGLTGERGPPGIPGPMGPPGLKGDQGAIGFSGSRGLPGPSGRTGRPGNSGQKGQKGEKGSGSTLRPVHLMT	108816	55530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_56836_59241_59296_69383_69474_75880_75962_82675_82863_84653_85067_95486_95601_97004_97099_108796
807165	contig_3223_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_151833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGTGGAGCTGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981070	980793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_-_980800_981100
807166	contig_5084_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_64569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGAATAAATATGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605689	604629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_604600_605700
807167	contig_8712_pilon	-	2330	1	Intergenic	novelGene_58754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTACAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170369	168039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_168000_170400
807168	contig_10734_pilon	+	1272	2	Intergenic	novelGene_51107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638218	641401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_639323_641233
807172	SIRV4	-	449	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	17	1055	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGGTATTACTTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
807173	contig_11052_pilon	+	854	3	Intergenic	novelGene_115452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2262.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	110	484	102902	159107	FALSE	30	CACCCAAAGCTGATTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKALRMRTSL	102792	159477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_159080
807174	contig_5936_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_53587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	465	1398	147	1544	447354	448751	NA	45	AAAGCCTTGAAAACATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALQKKPLTSEKDPLGILDPIPSKPVNQNPVIINPTNFHSNVHSQVPVMNVSMPPAVVPLPSNLPLPTVKPGHMNHGSHVQRVQHSASTSLSPSPVTSPVHMMGTGIGRIEASPQRSRSSSTSSDHGNFMMPPVGPQATCSGIKVPPRSPRSTIGSPRPSMPSSPSTKSDGYHQYKDIPNSLIAGMSNVLNTPSSAAFPTASAGSGSVKSQPGLLGMPLNQILNQHNAASFPASSLLSAAAKAQLANQNKLAGNNSSSSSNSGAVASSGNTEGHSTLHTMFPPTANMLLPTGEGQSGRAALRDKLMSQQKDSMRKRKQPPTTVLSLLRQSQVDSSAVPKPGPDLLRKQGQGSFPISSMSQLLQSMSCQSSHLSSNSTSVCGGSNTALPCSANQLHFTDPNMNSSVLQNSLTQNIPLRGEAVHCHNANTNFVHSNSPVPNHHLAGLINQIQASGNCGMLSQSGMALGNSLHPNPPQSRISTSSTPVIPNSIVSSYNQTSSEAGMVLLEKSTQRY	447207	449351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_447200_449400
807175	contig_5210_pilon	+	1112	9	Intergenic	novelGene_65444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.9345529229859	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	418	1110	611037	616751	FALSE	40	ATATGAGTCATTTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSFEEKYGRAHPVFYQGTYSQALNDAKRELRFLLVYLHGDDHQDSDEFCRNTLCAPEVISLINTRMLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRVTDLVLTPCNLQPAGILPSWSFLKCERKNKKLE	565762	616753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565827_591290_591360_606728_606863_608380_608458_610963_611103_613063_613150_613245_613338_614670_614849_616480
807176	contig_8317_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_20243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
807181	contig_9199_pilon	+	1015	2	Intergenic	novelGene_65646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCTGGAAATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150789	152215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_150954_151364
807185	SIRV6	+	226	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-406	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCGGTGGCTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879	2105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
807186	contig_15666_pilon	-	901	5	Intergenic	novelGene_70219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	114.792203568012	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	780	120	899	132068	128569	FALSE	20	TTACTCTGTATCCATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWPSRDATSSRKPSLMPQWKQPCLVWREP	132187	128566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_128651_129280_129375_130515_130795_131446_131711_132007
807187	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
807189	contig_17500_pilon	+	1096	3	Intergenic	novelGene_157915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	107	junction_1	332.5	176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	7	738	222961	277386	FALSE	25	CAACTCACTCTCATGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDMLSVRRLDLRADGADRQQDLQGEHRAGDRPSGTMVDTSAYNLPSPSGEEAAMASGPSDSANNLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMTDGLYLLRQSRNYLGGFALSVASGRKAHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCLYHSQETDGLVCLLKKAFSRPPGVEPKTGPFEDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISRDESEQIVLIGSKTNGKFL	222954	277744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_223063_272680_273146_277221
807190	contig_14923_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_157752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAATAAGTGAATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355083	357225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_355100_357200
807192	SIRV4	-	448	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGCGGTATTACTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
807193	contig_5316_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_61243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461885	464067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_461900_464100
807195	contig_5965_pilon	+	2347	2	Intergenic	novelGene_154661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTATCTTAGCTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177259	203168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_179014_202575
807196	contig_16322_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_87519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44286	45837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_44300_45800
807198	contig_8848_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_140472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTACTACAGTAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353481	354502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_353500_354500
807199	contig_5880_pilon	-	2319	11	Intergenic	novelGene_151120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	58.1260698826267	241	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	147	1763	224452	157805	FALSE	10	GCTATTTCTTGATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVTVKTHAYPDQKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIISTVEPALRQEATLVIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISSGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYVICPDLKIDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVETYGTMLRNIFDFNALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMKTGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIPYFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVANATKISLYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSILATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDMEALMFDRSFVGKQFSAGDKVYTVEKADNFEYSDPVDGSISRNQGLRLIFTDGSRIIFRLSGTGSAGATIRLYIDSYEKDIAKIHQDPQVMLAPLISIALKVSQLQERTGRTAPTVIT	224598	157248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_157895_161111_161247_164537_164722_167818_167955_177259_177376_180301_180457_181729_181921_184511_184638_186266_186414_187133_187297_224278
807201	contig_4486_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_38627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686579	686084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_686100_686600
807202	contig_4486_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_38626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTCTTATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684956	684648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_684600_685000
807203	SIRV6	+	319	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	383	-1	-213	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTGGACGCCGTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
807208	contig_6076_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_81756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAACTAAGGCCATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280781	281364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_280800_281400
807209	contig_6496_pilon	+	1225	5	Intergenic	novelGene_103469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28.3813318926368	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	257	913	148763	155676	FALSE	20	CAGTATTTTATCTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFLRAVQHAEKLHRATGARLFGPRLVFNKACLNTEPGLKWGPPEQNKTLLPRGILGLTRRTIWTQGQGLRRAKEDGSKQVSVHRSPRGETDVSTSQKVKEAGRDFTYLIVVLIGISITGWEEQQVIGVFGEPIKGYGETTRRGRRQHVSFIEYVKDGLQHMRLKFYIEGSEPGKHGTVHLEVKENPESGEYEFRYIFVEVEAYPRRTIVIEDNRS	148506	155988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_149064_152081_152162_155023_155098_155185_155292_155580
807210	contig_14333_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_49108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATAGGACAGAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352325	350835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_350800_352300
807214	contig_15236_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_141607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAAAAGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568006	569211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_568000_569200
807216	contig_9177_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_32803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTCAGAATCGACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544216	1545348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1544200_1545300
807217	contig_14525_pilon	-	1490	15	Intergenic	novelGene_149758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	269.048777915751	5	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	534	1121	148448	137022	TRUE	25	GTAATGTTTTTCATTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGATGGASVPALWSEINRYGQNGDFTRALKTVNKILQINKDDVTALHCKVVCLIQNGSFKEALNVINTHTKVLANNSLSFEKAYCEYRLNRIENALKTIEGANQQTDKLKELYGQVLYRLERYDECLAVYRDLVRNSQDDYDEERKTENLGLQEGTHELCYNAACALIGQGQLNQAMKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQIIKLKPTDVGLLAVIANNIITINKDQNVFDSKKKVKLTNAEGVEFKLSKKQLQAIEFNKALLAMYTNQAEQCRKISSSLQSQSPEHLLPVLIQAAQLCREKQHIKAIELLQEFSDQHPENAAEIKLTMAQLKISQGRYR	157407	134605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137036_140186_140260_141223_141353_142242_142375_145157_145216_145303_145429_146713_146746_148423_148536_148665_148759_153473_153598_155326_155448_157299
807218	contig_859_pilon	+	726	5	Intergenic	novelGene_132823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	253.049896265539	360	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTCTCTTAACATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94618	131160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_94884_111900_111942_118678_118764_119225_119338_130937
807221	scaffold_880_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_121466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAAGCTTTCCTGTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459929	458823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_458800_459900
807231	contig_7164_pilon	-	2285	8	Intergenic	novelGene_172135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	3	5	junction_2	13.5300119914875	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	160	846	140107	122117	TRUE	50	ATAAATGTTTGAATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLGSMSQQRPARKLPSLLVNPAEETVRRRCRDPINVEGLLPSKIRINLEDNVQYVSMRKALKVKRPRFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSDFGAIPQQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREESFY	140266	118194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_119458_119933_120082_122088_122132_122675_122790_124141_124299_126040_126258_129569_129625_139978
807234	contig_5643_pilon	-	1310	5	Intergenic	novelGene_38961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	3.57071421427143	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	305	1108	534101	532578	FALSE	20	TGTTTTTAAATGTTATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAKSVPVTPARPPPHNKHLARVADPRSPSAGILRTPIQVESSPQPSLPSGKQLEGPNQTQDSDPRSPTLGIARTPMKTSTSEPPSPLVKQLSEVLDTEAPKSNLSPKSVLPLETPSSSELDLPLGTQLSAEDQMPPLSQTELPSKQVFSKEEAGQPTETAVASRGSDKPLRDPETPRSSGSNRNRRKPNGKVLGRSPLTILQDDNSPGTLTPRQGKWPSPLSENVRELKEVTILGTGRLLKTGGRAWEQGQDHDKENQHFPLVEN	534405	532375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_532734_532832_532937_533071_533366_533597_533728_533981
807237	contig_6241_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_156424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTCAAATAAATTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232800	233732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_232800_233700
807238	contig_7398_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_166146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCAGGTGACACAGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22568	20782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_21455_21603
807239	contig_16098_pilon	+	1525	8	Intergenic	novelGene_45817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	84.62932381261	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	273	818	151768	152636	TRUE	15	GACTAGCTTGTGTGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGTGSLGTQGLTPG	150540	154035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152878_152983_153104_153689
807240	SIRV6	+	490	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	-30	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTAAGGTTCGTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
807243	contig_8712_pilon	-	1845	4	Intergenic	novelGene_58737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATGTAAATATACCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83684	76388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_76571_78080_79412_79859_80145_83637
807244	contig_15042_pilon	-	1114	3	Intergenic	novelGene_115436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	159.5	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGCTGTAATTAGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43086	30539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_31450_35276_35376_42981
807246	SIRV4	-	238	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1285	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3873	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
807250	contig_6477_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_154199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGAAGCTTAAACAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821714	823119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_821700_823100
807253	contig_10000_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_139311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTTGATTTAGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160435	162243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_160400_162200
807256	contig_2069_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_23272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332177	331202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_331200_332200
807257	contig_15093_pilon	+	2166	6	Intergenic	novelGene_143306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_5	81.7469265477302	6	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	1080	2084	147517	164042	FALSE	35	AACTCATGTAAGAAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVRSSHQLSKQISDLIRQPSTAPQPVKEDIATPLPSEKTPTSVNQTPVETNEFPQLPEGLEKKPVVLKFSAMLDGIAIGAALLPSLKAEYKMGRMRSHGMTGAQTRFTFELPNHRLRFTSKVSATDMSTIPPSASLNLPPVTMSGKYIMEEHDSYSDQVWSIDELPSKQGYYLQGNYLRCVAEVGSFEHNLTTDLLNHLVFVQKVFMKEVNEVIQKVSGGEQPIPLWNEHDGTADGDKPKILLYSLNLQFKGIQVTATTPSMRAVRFETGLIELELSNRLQTKASPGSSSYLKLFGKCQVDLNLALGQIVKHQVSPEYTDISRTTAFNFCTSI	146437	164124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_147585_149036_149276_153800_154046_156651_156758_162970_163069_163793
807258	contig_19825_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_59698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTTATCGACTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119196	117817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_117800_119200
807259	contig_18108_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_33460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	388	744	111443	111087	NA	45	CTTTAAAAAAAAGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGCMRFLSLFPFHRDRFSCSDSRSCGFPQYLLACKSHSCPYILRFTCYHWPIGVRIIVLLKHLGKNIQTLRFSSKVYYKGLICTKTLQNQECSQWHCCLHSPHHLLQSYGFTVHGAG	111830	110326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_110300_111800
807260	contig_835_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_152144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCAAATCACTGAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138702	136788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_136800_138700
807262	contig_7912_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_129577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	249	368	327866	327747	NA	35	GAATGATTCTTACTTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYYIGEKKARKFALRNFFHHDDAPAHSWRVARAVLPEFHWKPYLIHHTALIFPLQTFLFSKLKELLKGTQFESFKDAQTSVLMWLKLKNADYFREGLERWKYLLQKCIDLDGGYVKKQSFL	328114	326016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_326000_328100
807263	contig_10377_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_115398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_3	178.417114276256	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	37	495	219517	237533	FALSE	30	TACGATTAATGTTGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRLRIPRFLKFFPSGKPAALSC	219480	238512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_219615_227487_227752_235978_236012_237469
807264	contig_14142_pilon	+	901	3	Intergenic	novelGene_120579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	285.5	231	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	9	815	526719	527752	FALSE	20	GAACTCTGGAGTCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGQGTGAGTGIVDIPGTTFGVWCRGGAYGKCPISHRPGSPRRLKPFKVPHPGPVGSQNCPMCPVPGCLRKGGEVTALFPASRFRVYERTKSGVPKGSGCVWGEGVRSPGLSSNKDCRLEAWVPEGGISWDCRGEVGVCELLFLVSPRDLRLLRWLGSPPPPFLLFLQLFDKTNKHHFLHSLALLAVPHCRKPLWAGLLLTSGTTLFCTSFYYQALSGDPSVQPLAPVGGSLLLLGWLALAL	526710	527838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526982_527102_527503_527608
807266	contig_14525_pilon	-	3095	3	Intergenic	novelGene_149794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	268	381	284774	284661	FALSE	35	AAATGTCCATTATTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKQAREAKQSEKLSKESVSVSLQPESSSVSRAGSLHKSTAQPAEERKPETAVARLERREQLKKASTLPTSVTVEISDSAPPTPLVKEAMKRFSTPDAAPVSTEPAWLALAKRKAKAWSDCPQIIK	292123	281946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_284822_290977_291144_292069
807267	contig_15084_pilon	-	1623	7	Intergenic	novelGene_116663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	25.7385357435543	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTAGAGAAACCCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18858	6709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_7557_9074_9220_9734_9849_10398_10476_12467_12691_18369_18482_18753
807268	contig_10005_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_148903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCTGTAATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71318	70056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_70100_71300
807269	contig_9243_pilon	-	591	2	Intergenic	novelGene_60327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATAGGGTTTCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27580	24907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_25224_27305
807270	contig_6710_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_94786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653711	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
807271	contig_14326_pilon	-	2145	2	Intergenic	novelGene_120712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATAAAATGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364575	362076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_362643_362996
807273	contig_5083_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_151650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAACCTTGAAAACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300434	299124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_299100_300400
807275	contig_20819_pilon	-	1445	5	Intergenic	novelGene_55698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	44.7576809050692	99	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTCTTCCCTGCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120221	118087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_118266_118455_118531_118722_118766_118972_119257_119356
807278	contig_2596_pilon	+	532	2	Intergenic	novelGene_53441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGAGGAGCCGCCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23097	23712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_23506_23588
807279	contig_2596_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_53443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCGCAAGCAACAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24419	25241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_24400_25200
807280	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	38	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
807283	contig_3862_pilon	-	592	3	Intergenic	novelGene_137406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_2	98	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	210	590	485018	482108	FALSE	10	GGTAGGTGGCCTCCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHNSPSKPPLPVPPTSAFSFFPSLPKSKGGGAGGGSRSSTGGVLSASASSSKLLKSPKEKLQFRGYTGPMHPTQPSRGPNSRIMTPSVKVEKMHPRVAGTLLKPATGPSCPAPVSSSVKPGLNCPSIPKPTLPSPGQILNSKGLPAPPAPEKKSEDNSSNRKFLNKRLSEREFDPDIHCGVIDLDTKKPCTRSLTC	485227	482105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_482188_482637_482898_484977
807285	contig_9852_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_138474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	366	929	328087	328650	NA	25	AAATAGGTGTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMEAAVRKSNNVLHWANLLQKTSLKCLKKHVTLRTKVHLTQAMVFSVTSYACKRWTINKEDQRRIHAFELWGWCRILNIPRTVRRTNKSVLEEVQPECSLEVRMTRLRLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKIEGEQKRGRPAVRWIDTVAATVGSNIVTIVRITIVRMTQDQALFPSVVHKVSESQN	327721	328746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_327700_328700
807286	contig_3424_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_55535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATCACACTCTCATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265245	265786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_265200_265800
807289	contig_11078_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_171996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGATTCTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241722	243737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_+_241700_243700
807290	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	100	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
807291	contig_4574_pilon	+	2501	6	Intergenic	novelGene_174917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1675	2073	20360	21916	TRUE	15	ATACTTTCTGCCATTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTCSSPKKGFFMEQDTFLLELSLTMRAASIWNNPSSSWVSSSETDDIFSPLSSFHSTSGWGNHPFPVHVTLIPSSSGPTMRMRGPEPRPITFSSKMASSKSPPFLKKHLYIPLSETRRLWILTPTLPSVI	16136	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4574_pilon_+_17528_19960_20233_20348_20629_21786_22139_22643_22777_23379
807293	contig_11258_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_67805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAGCACAGAGAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292450	293484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_292400_293500
807294	contig_1666_pilon	-	1374	1	Intergenic	novelGene_160593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	954	1307	755742	755389	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRLRRLSAERRRMNRQTCCSKGCRLQTNPAARRNSDSFHLPALSMSQEWRGEFCSLAAGKRRLFFSCLMKHPALLLIISPCWHTEHTSCTVCRRHCQEIYISKDDKQPLAPLQAD	756695	755321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_755300_756700
807296	contig_3825_pilon	-	2107	4	Intergenic	novelGene_77966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	14.8174071805952	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1259	1633	17907	16415	TRUE	35	AAAACTCCTGGGCTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDPAREAQEAGRISSSAKSGAYVITPLHCSDLGTTILVNRGFVPRRKVNPETRQKGQIEGEVDLVGMVRLTETRKPFVPENNPEKNQWHYRDLEAMARATGADPIFIDADFRTLSPAQLCKIK	19165	15869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_16029_16099_16616_16697_16771_17806
807298	contig_3960_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_138020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTACAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440732	441083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_440700_441100
807300	contig_3018_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_78930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATCAAGCTGTTACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643319	642464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_642500_643300
807301	contig_7751_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_174504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	238	717	528	1244	364978	364262	NA	10	GCTGTGTTACTCATCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQKSGLLFHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSRKSGLLLHQATHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYLCLECGRGFSQNSGLLFHQRTHSGEKPHVCRECGRNFSQKSGLTTHQRTHSDKKPYVCSECDRGFNRNSRLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFTQKSVLIMHQRTHSGEKPYVCKECGRGFNRKSNLITHQRTHSGEKPHVCEECGRGFSQKSNLITHQRTHSDEKPYVCLECGRGFSQKSSLLLHQGTHSGEKPYVCKECGRGFSQKSNLIRHQRTYSSEKTFMCLECGRGFSQKSGLFFHQATHTGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYICLECGRGFSQKSGLLLHQGTHLGGKPHVCKECGQGFSYKQSLIRHQHAQSGEAVCLP	365505	363688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7751_pilon_-_363700_365500
807302	contig_10341_pilon	+	2036	2	Intergenic	novelGene_47263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	0	74	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	11	313	512513	513997	FALSE	25	AAATAGTGTGCCTTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVKMNSRKVLAVNHVFEIILEYLETRDWQEAFFTILPQRKGAVPTDKACESSSHDKKSASVEDGLDSDSSEEEYSRNELDSAHEEENQDKENGMESTVNSVPH	512502	515720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_512547_513728
807306	contig_5415_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_146146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTCATACAAATCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279235	278398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_278400_279200
807309	contig_12644_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_44589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGAGTCGACTCTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2128969	2129902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2129000_2129900
807310	contig_12644_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_44590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGGCCCCCGACCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2131323	2131946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2131300_2131900
807311	contig_7357_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_36912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468671	468891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_468700_468900
807313	contig_12078_pilon	+	1445	2	Intergenic	novelGene_74101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218161	221743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_218420_220556
807316	contig_5229_pilon	+	2107	11	Intergenic	novelGene_117675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.9728114616671	76	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	201	1169	191372	194367	FALSE	10	CGCTACGGGTGTCCGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNSECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLIPSEIRKLKERIREEIDKFGIRVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQKMKQQMQDQ	186298	195305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_186403_191275_191382_191486_191574_191825_191950_192046_192182_192345_192464_192600_192703_193488_193586_193669_193806_194067_194171_194310
807317	contig_10005_pilon	-	1622	8	Intergenic	novelGene_148909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_7	154.795454239009	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	461	1357	138325	105919	FALSE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGLFQVNGNAETVEWLRQRYDNGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVEDLKEQEVVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILEPNGVTASTSAHMSPISILPASAE	180629	105653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_105965_120369_120531_131709_131852_132123_132302_137513_137727_138168_138361_139667_139835_180371
807318	contig_6504_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_158781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGGCTTGCTCAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222735	222236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_-_222200_222700
807319	contig_9484_pilon	+	2304	1	Intergenic	novelGene_105684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	132	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTATGGGAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199421	201725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_199400_201700
807320	SIRV4	-	441	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAAGGTGGCGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
807321	contig_10399_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_114496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCGCTGAGTTGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390909	388443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_388400_390900
807322	contig_7839_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_45742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	25.8920837322916	179	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	230	1312	969212	962993	FALSE	20	TTTTTAAAAGTTTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEARKGPDEADESQYDSGIESLRSLRSLPESTPASGPSDSGSPQPWTQPRGNAKEPQEKEDADGERADSTYGSSSLIEPLPLLGGAEAEDPAPGSPLLPAGALSPQQLEALTYISEEGDTLVHLAVIHEAPAVLLCCLALLPQDVLDIQNNLYQTALHLAVHLDQPGAVRALVLKGASRVLQDRHGDTALHVACQRQHLDCARCLLEGRPEPGRGPPHSLDLQLQNWQGLACLHIATLQRNRPLMELLLQNGADIDVQEGTSGKTALHLAVETQERSLVQFLLQAGARVDARMLNGCTPLHLAAGRGLSSISSTLCEAGADSLLRNVEDETPQDLAEDPFALLPFDDLKISGKPLLCAD	969441	962469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_963059_963822_964063_964229_964319_965496_965720_966423_966527_968850
807327	contig_8866_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_77802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	519	893	412374	412000	NA	45	CCAGAAAACGGTGCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRGRWFSSSLEETPEMPSEPILSWKLLDGSIEKLWTLELGRQCGEESECPHHQVPPALRSEPVCTMLAPCSWPQSSNHNSFCNQSVAIHSTSSAGSLIRFNKHALSPYCSSGTGDTKRNVLP	412892	410712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_410700_412900
807329	contig_14575_pilon	+	1863	2	Intergenic	novelGene_101923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATTCAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385121	387246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_385949_386210
807333	contig_8538_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_5079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842857	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
807338	contig_776_pilon	-	1267	10	Intergenic	novelGene_139944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAATAGGAAGGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072879	932275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_932516_953025_953062_974916_975039_1001134_1001264_1016453_1016586_1022958_1023098_1036263_1036355_1040813_1041001_1070128_1070240_1072799
807339	contig_19628_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_166569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGAAAATCAAGGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15652	16270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_15700_16300
807340	contig_18869_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_56372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73753	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
807341	contig_14732_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_169709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74944	74468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_74500_74900
807342	contig_7887_pilon	-	1733	8	Intergenic	novelGene_124915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10.40211909337	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	177	1649	551798	545894	FALSE	10	CCCGTTACTCCAGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRASESPPGRSVTAGIIIVGDEILKGHTQDTNTYFLCRTLRSLGVQVCRVSVVPDEVATIAAEVTSFSSQFTHVLTAGGIGPTHDDVTFEAVAQAFGDELKPHPELEATIKALGGEGREKMSLVPTSARLHYGTDPHTGRPFKFPLVSVQNVYLFPGIPELLRRALEGLKGLFQNTAVQFHLRELYVAADEASIAPVLAEAQARFGCRLGLGSYPDWSSNYYQVKVTLDSEEEESLEEGLAYLTARLPQGSLVPYVPNAVEQASEAVYRLTESGSPLGQKVAGALQIIETALARYSLTQLCVGFNGGKDCTALLHLFHAAVQRKCPAAQEPLQILYVRSISPFPELEQFLQDTIKRYNLQVLEAQGDMKQALGELHARHPQLEAVLMGTRRTDPYSCSLRPFSPTDPGWPSFVRVNPLLDWTYRDIWDFLRSLFVPYCILYDRGYTSLGSRENTVRNPALKYLSPGGHPAYRPAYQLENEDEERNSRT	552662	545809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_546030_546123_546198_547215_547406_547483_547583_547970_548119_548994_549740_551717_551943_552630
807343	SIRV6	+	448	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	515	164	75	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
807344	contig_16595_pilon	+	1573	6	Intergenic	novelGene_150139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	26.1105342725881	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	9	755	108688	352118	FALSE	40	TGGATCTCAAAAGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMYGFVQGMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLAIFHELHVDLDLYTLLFGESVLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNVFDAAAFFQSVGNFLGIFAGSFAMGSAYAVVTALLTKFTRLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEASGLTGIVAVLFCGVTQAHYTYNNLSSDSKMRTKQLFEFMNFLAENVIFCYMGLALFTFQNHIFNALFILGAFVSFEIELMGWLGKGTNYLGLLIILLNC	108679	352936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_108797_154580_154687_255545_255684_260139_260247_287558_287648_351920
807345	contig_10962_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_103922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAACATGAACCTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416121	413536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_413500_416100
807346	contig_4924_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_84633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1020	1367	56664	57011	NA	30	TTGTTTCCAAAGTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFFLNTTCSPTLPSSNRCNLLAPLILLLSLLLGCLIPHFHYEFFWFVLFSGDKFMSWRFEVGGSRKWNNNFGLSVDFSLIMLSLTLITRDGYDLFCKGFASRRSLGVSLRIKH	55644	57598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_55600_57600
807349	contig_960_pilon	-	2012	2	Intergenic	novelGene_108269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652497	650126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_650642_651000
807351	contig_20951_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_43115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	792	1127	191674	192009	NA	15	CATCTTGCCTTTTGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCFTHEESNNFICQFHKPNQTSFQSSNGNAWVTQSPSLLVRKASSLRERRQLEAGLWLAARCPQLLSICCQWAPLAERRVERGRSADFQCFPLSTKPVTSPTTLLFRAVK	190882	192581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_190900_192600
807352	contig_20951_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_43116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192776	193635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_192800_193600
807353	contig_7426_pilon	-	1055	9	Intergenic	novelGene_27480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	97.7726156702376	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	21	878	668289	642448	TRUE	25	GTAAGCGAAGCATGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGPGWMMAQGAVICVAPEKPTHAVCVLGTKSRVDVFSSAPNGCTSFSISASPEVVVNVAHIRPVKKNPTGSSTWPLDPRLEVTVMMKASSSSISDQKVRISYCGPQSQPTQALLYLTGVEISLRTDISRAAKVKPGKVKPTGRAGNHQRTWTWGPRGQGAILLVNCDKDDPRSSTMDLMNNEVNSGKDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTKYKLVLHVAKKEMNKVRVFQAKWGKLPSEYRVVLGPQQPSHALELPSGQHSTNFYVEGLSFPDANFPGLPCRTSSPPSRCRPL	668309	642075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_642179_642373_642494_650087_650227_652724_652851_654838_654957_655893_655980_656986_657054_659250_659432_668194
807354	contig_6223_pilon	+	713	4	Intergenic	novelGene_175723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_3	53.3853912601566	1260	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	96	503	46965	51814	FALSE	15	CTAGTGTTGTATTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFIKELCAGYPLAALQVRPICRSAQPSVAPTMATVQQLVGRWRLADTKGFDEYMKELGVGMALRKMGAVAKPDCIITCDGKNLTIKSESTLKTTQFSCNLGEKFEETTADGRKTQTVCNFIDGVLVQHQEWDGKESTITRKLQDGKLVVECVINNVNCTRIYEKVE	46869	52024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6223_pilon_+_47044_50212_50386_50774_50877_51760
807356	contig_16382_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_160231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCTCTTCCAAGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239714	241508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_239700_241500
807358	contig_6199_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_126333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCTTAGAATACATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66047	63699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_63700_66000
807360	contig_17440_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_7682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3716	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
807363	contig_6375_pilon	-	1735	8	Intergenic	novelGene_72951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	968	1291	199588	196838	FALSE	25	ACCTGACGCTGAGACCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGKTRQRARTVDAAMAPHQGRPRSTCMNSSKFWISPTGVYDPSPSSAKLCSAAAWTTSAVSPGATSVTAVGEGVTGTAGGEAWTWASANETAEVLRQRGPAAART	201485	196393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_196903_197538_197758_199548_199693_200148_200233_200429_200904_201014_201180_201260_201343_201427
807364	contig_7898_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_47624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATCCTTTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596712	595100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_595100_596700
807366	contig_8628_pilon	-	2127	17	Intergenic	novelGene_164402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	54.079224291774	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	240	1970	316457	283624	FALSE	25	TTTGGGCCTCAGAGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVVALCDQWYLDYGEENWKKQTSQCLKNLETFCEETRRNFEATLDWLQEHACSRTYGLGTRLPWDEQWLIESLSDSTIYMAFYTVAHLLQGGNLHGQGESPLDIRPQQMTKDVWDYIFFKEAPFPKTQIPKEKLDQLKQEFEFWYPVDLRVSGKDLVPNHLSYYLYNHVAMWPEQSDKWPTAVRANGHLLLNSEKMSKSTGNFLTLTQAIDKFSADGMRMALADAGDTVEDANFVEAMADAGILRLYTWVEWVKEMVANWDSLRSGPASTFNDRVFASEMNAGIIKTDQNYEKMMFKEALKTGFFEFQAAKDKYRELAIEGMHRELVFWFIEVQTLLLTPFCPHLCEHIWTLLGKPGSIMKASWPVAGPVDEALIRSSQYLMEVAHDLRLRLKNYMMPARGKKTDKQPPQRPSHCTIYVAKNYPPWQHTTLSVLRNHFEANSGKLPDNKVIASELANLPELKKYMKKVMPFVAMIKENLEKLGPRVLDLQLEFDEQAVLMENIVYLTNSLELEHIEVKFASEAEDKVKEDCCPGKPLNVFRTEPGVLVSLVNPQPSSGHFSTKIEIRQGDNHDSIIRRLMKMDRGIKDLSRVKLMRFDDPLLGPRQIPVLGKEYSEKTPISEHAVFHVDLTSKKIHLTENGLKADIGDTVIYLVH	317267	283466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_283830_288549_288683_290224_290321_292286_292392_295808_295920_298162_298274_298523_298665_299636_299778_300855_300947_302354_302539_308021_308086_311459_311518_313307_313521_316380_316520_316905_316989_317085_317152_317239
807367	contig_10377_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_115408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCTTGGTTAATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239263	239646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_239300_239600
807370	contig_10095_pilon	-	492	4	Intergenic	novelGene_57247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294385	287653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_287865_289680_289766_291771_291863_294280
807371	contig_8712_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_58861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTTAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787837	790280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_787800_790300
807374	scaffold_19766_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_34413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCAGCGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840597	839375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_839853_840030
807376	contig_753_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_112993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252281	1252829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1252300_1252800
807380	contig_7697_pilon	-	982	3	Intergenic	novelGene_128274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_2	23	41	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTCCTTTCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120608	118853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_118940_119437_120272_120546
807381	contig_14322_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_116221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTATATTTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
807384	contig_9345_pilon	-	1828	6	Intergenic	novelGene_24722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	24.1379369458121	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	309	629	1013536	1012336	FALSE	10	CATGACTCTGCTGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVLELRLILRQPSPLWLSFTVEELQIYQQRPKSPSMAFPKWLSHPVPCEQPTPLHEGLPDPGRVSSEVQQMWALTEMIRASQTSTRIGRFDVDGCYDLNLLSYT	1015302	1011136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1012378_1012451_1012557_1012902_1012975_1013434_1013549_1013824_1013977_1015158
807388	contig_2043_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_169913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGAGAAGAATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695325	694028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_694000_695300
807389	contig_15105_pilon	-	894	4	Intergenic	novelGene_151027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	798.651780606959	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	38	592	839916	828669	FALSE	45	ATGAATTACAACCTATAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQKIQSRP	839953	828366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828690_832201_832309_836187_836548_839849
807393	contig_15327_pilon	-	1527	7	Intergenic	novelGene_70596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	10.6458129484475	335	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	779	1405	886296	882963	FALSE	15	GCCTGCCTGCCCCAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQLIALMGQKGHALLIDCRSLETTLVPLLDPRLAVLITNSNVRHSLGSSEYPLRRRQCEEVAHALGKESLREVKLEELDAGKELVSKEGFRRARHVVGEIRRTAQAADALNRGDYRAFGHLMVESHHSLRDDFEVSCPELDQLVEAALSVPGVYGSRMTGGGFGGCTVTLLEAATASRTMQHIQEQYSGTATFYLSQAADGAMVLPL	888407	882840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_883035_883137_883301_883389_883541_885928_886111_886237_886691_887140_887331_888213
807394	contig_13625_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_150150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23021	21593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_21600_23000
807395	contig_3382_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_124222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1896853	1899237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1896900_1899200
807397	contig_10477_pilon	-	2400	1	Intergenic	novelGene_112490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGAGCACAGGGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251046	248646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_-_248600_251000
807401	contig_12802_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_114259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTGAAATTTCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236772	237014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_236800_237000
807402	contig_10436_pilon	-	746	4	Intergenic	novelGene_108488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2483.15690648461	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	228	311	102553	102032	FALSE	15	TGAACTGATTTTTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRPPSRPPRVPSVQPEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103559	101596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102858_103502
807403	contig_19559_pilon	+	2495	6	Intergenic	novelGene_163439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	1687	2493	88326	96009	FALSE	5	CGTCAGTGTTGCCTGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLQAYCSPQSLLTPHLTQDRGQGREEGSTAIQNNHILWFEGYRALAVERQEPGHFLPEEQMPPPVRVLQQGWLHPQHVTLTHPPGQQVKAEFVLTGAQVNDATWVFVLIILIQVVGPVALLGRVPEPLNDTASRGQVGAARGECGSGITHSIELLIWFSGALSFWTIVTATSQVLCGGWAWTGGRCPGFLLREGEHLGELEKTGRGPLEKRVKCPFPRPGNSLNLGEDSDGTGPGAWRLRDPRGRLRRDRVPGLQGRGLLPTTQAGG	86639	96011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_+_88434_88893_88967_90108_90173_91350_91417_94134_94418_95796
807405	SIRV6	+	329	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	23	-244	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807410	contig_14814_pilon	+	580	3	Intergenic	novelGene_137711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.5	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279385	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279463_282885_282992_283413
807412	contig_4812_pilon	-	640	5	Intergenic	novelGene_103661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	5092.905868706	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	16	417	82626	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAIMIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQ	82641	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
807413	contig_9345_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_24701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTTGGTGGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954441	955980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_954400_956000
807415	contig_10962_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_103872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20033	21229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_20000_21200
807417	contig_16599_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_175677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAATAATTTCTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762329	760749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16599_pilon_-_760700_762300
807419	contig_10857_pilon	+	499	7	Intergenic	novelGene_160896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1654.09899105895	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	210	290	499	61421	66898	FALSE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAEEERLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSLHPSDPHHHCCHLLLFLDPSIPPCPLLHPSAPANLLCVIKLPCVP	58375	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_58392_58782_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61491_66553_66619_66823
807420	contig_8801_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_66292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCCCCGTATGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495292	496081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_495300_496100
807422	contig_7870_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_109062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAGGAAAAAAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676999	675399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_675400_677000
807423	contig_11081_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_167071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCAGATAAATTTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12078	10422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_10400_12100
807424	contig_10311_pilon	+	1406	10	Intergenic	novelGene_50393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	41.4472742554909	7	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	178	1200	52491	64913	FALSE	40	GCAACTTTTAAGTGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFLKGASISTKPPLTKDRGVAATAGSSGENKKAKPVPWVEKYRPKCVDDVAFQEEVVAVLKKSLEGADLPNLLFYGPPGTGKTSTILAAARELFGPELFRLRVLELNASDERGIQVVREKVKNFAQLTVSGSRSDGKPCPPFKIVILDEADSMTSAAQAALRRTMEKESKTTRFCLICNYVSRIIEPLTSRCSKFRFKPLSDKSQQQRLLDIAEKENVNISNEGIGYLVKVSEGDLRKAITFLQSATRLTGGKEVTERVIMDIAGVIPAETIDGIFTVCQSGSFDKLEAVVKDLIDEGHAATQLVNQFHDVVIEKDLSDKQKSVITEKLAVSRHFHLL	50915	65119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_51081_52478_52622_56175_56255_59300_59381_61184_61305_62478_62623_62822_62944_63585_63712_64622_64704_64772
807425	contig_14734_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_175375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATAACCCTTTCAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45593	46007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14734_pilon_+_45600_46000
807426	contig_11448_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_66397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446220	444752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_444800_446200
807428	SIRV4	-	439	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1056	26	1056	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAAGGTGGCGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
807432	contig_5145_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_131392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCAAACGTTGGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638568	637839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_637800_638600
807433	contig_7188_pilon	+	1431	2	Intergenic	novelGene_108536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	153	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	275	1387	153428	154540	FALSE	15	TTTTGTTTTGAGTGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQFNFTIEDHLGNELIPFEDEDLTLYSSKESSVSESQKGKQGPRKCSTEQFDLPQYDFWKHESVGDAAPSQDRDSPLSAANSSDNLEPHKRQPGLRVAKEHAMPKDLKKLLENKVVETLPGLQHVNVSLVKTILLEKNFPGENIVSKSLSSHSDLITGVYEGGLKIWECTFDLLAYFTKAKVNFAGKKVLDLGCGSGLLGIIAFKRGAKEIHFQDYNSLVIDEVTLPNVVANSTLENGINEPAVKRGRKSKLAQEQFKCRFFSGEWSEFCELVLSSEKLFVKYDLILTSETIYNPDYYSTLHQTFLRLLDKNGQVLLASKAHYFGVGGGVHLFQKYIEERNIFETRILEIIDEGLKRVLIELTFKHLS	151273	154584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_151343_153222
807435	contig_5217_pilon	-	1090	5	Intergenic	novelGene_135782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_4	2581.82671523478	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	24	581	560372	558259	FALSE	25	GCTAGAGGGCAAGGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLGEMAVACRGRGVT	560395	557749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
807440	contig_7411_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_137016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCCAGAAAAGAAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334166	333495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_333500_334200
807441	contig_7411_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_137015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333251	332744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_332700_333300
807442	contig_5361_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_167201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACAGTCCAGCTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225759	227916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_225800_227900
807443	contig_9335_pilon	-	1022	3	Intergenic	novelGene_147460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38.5	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	54	776	758602	642197	FALSE	40	AATAAAGTCTCCTAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVEAGGIFHRARGRTLDAFSAGMPWRKEQTEDLQRVLKDVDREIPLVFVSGNHDIGNVPTAESIAEFCQTWGDDYFSFWVGGVLFLVLNSQFFYDASRCPALKQAQDQWLDEQLSIAGERKCQHAIVFQHIPLFLQSLDEEDDYFNLSKSVRQEMADKLTEAGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758655	641950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_671128_671552_758532
807444	contig_6954_pilon	-	1272	8	Intergenic	novelGene_64429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	305	622	231268	228935	TRUE	25	ATGGAGTGAGCGGTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSICVLVISSCVHLFLPSHLVIFTGPFLRLVLTLTFILFSLTFFIYFLSLMTCFFCIHWLFFYLQRILFSPSSLSVSSSPFLSSLSRFKSSGRSKASGSGTFS	233358	223549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_223695_223831_223974_225876_226044_226653_226807_228891_229039_231054_231381_231661_231827_233331
807446	contig_4364_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_3727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAATACATCAGCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
807447	contig_15666_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_70203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.997671307783	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	6	467	131534	129088	FALSE	20	CAAGTGAATGGTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGYCLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	131539	128407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129350_130511_130795_131446
807448	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807449	contig_3601_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_132951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATTCATAGGGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454754	453806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_453800_454800
807450	contig_4803_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_150734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAGAAAAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95566	94890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_94900_95600
807452	contig_4732_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_75495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	11	301	780679	780389	NA	10	GTGAGGGGCCTTGGCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIAMATQNLQMILTIMGFIREVAVTVQAQEHSGYSSSIRTTSFQLCPQACLSQAPWPLPCSGKCYKVLLVLPISASRHANSPVSLTQKVLNSSSLVWQT	780689	779529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_779500_780700
807453	contig_3817_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_78383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTAAGTATTATAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939777	938765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_938800_939800
807454	contig_3817_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_78382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938208	937668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_937700_938200
807455	contig_6069_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_8047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	299	900	91	990	360921	360022	NA	10	GGACCTCCGCCTCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA	361011	359879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_359900_361000
807458	contig_9363_pilon	-	1563	13	Intergenic	novelGene_6542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.2559187057206	1	31	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	7	1413	720977	713931	TRUE	40	CCAAAGGGTAAGTGATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSSYSLSGPGSWSPMPDLPLMTRTVLLLLMALPSSLCFNLDMDQPTVFHMDSAGFGHSVVQYADSWVVVGAPQEVKASNQTGGLYRCAYSMGKCEPLPLLVPPEFVNVSLGLSLAATTNPSQLLACGPTVHHACNRNIYLTGFCFLLTSPSQQVQRRLAALQECPKQEQDIVFLIDGSGSIAPHDFARMLNFVKAVMSQFQRPSTQFSLMQFSQSFQKHFTFRDFIRSSDPQVLLNGVKQLRGLTYTASAILMAMETMFSATNGARENATKILIIITDGQKEGDPQDYKNAIHKSEAAGIIRYAIGVGSAFQKTLSKKELEVITSEPSQEHIFQVENFDALRDIQTQLKEKIFAIEGTQSTSTTSFEFEMSQEGFSAVFTPDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYSKNMNPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGMQSLVLGAPPPPAHRKGFHLHPGVEAMEAAG	720983	713623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_713758_713914_714059_714171_714302_714469_714544_714705_714857_715166_715321_715569_715716_715942_716074_718982_719098_719242_719314_719590_719695_720186_720293_720880
807460	contig_8310_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_75536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTCCATGACACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167860	166931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_166900_167900
807461	contig_8310_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_75541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACAGCGACCCCGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171854	171250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_171200_171900
807465	contig_10135_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_106627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAGGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84703	84931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_84700_84900
807467	contig_10197_pilon	+	1280	1	Intergenic	novelGene_115315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1557365	1558645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1557400_1558600
807470	SIRV6	+	451	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	24	10	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
807476	contig_6871_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_21644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTCATGTGGAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695778	694288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_694300_695800
807477	contig_15918_pilon	+	2123	4	Intergenic	novelGene_132712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTTCCATCCACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36929	61677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_38736_42044_42181_51388_51440_61547
807482	contig_3181_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_136942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTCATCATTATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402476	402272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_402300_402500
807483	contig_2209_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_141020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212916	215165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_212900_215200
807484	contig_6710_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_97662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653393	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
807485	SIRV6	+	204	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	54	525	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
807487	SIRV6	+	402	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	560	0	381	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	144	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807488	contig_20719_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_140568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGGTTCTGCATTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31637	29964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_30000_31600
807489	contig_9017_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_130335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTCATCCGTAGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223620	222307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_222300_223600
807495	contig_6202_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_139827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTTTTGGAAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482212	480746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_480700_482200
807498	SIRV6	+	474	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
807499	contig_10003_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_88211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTCCCTCCCCCTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525329	524870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_524900_525300
807500	contig_10003_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_88210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCCTGTGTGAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524867	524224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_524200_524900
807501	contig_18671_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_150003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCTACCCCTGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64767	66181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_+_64800_66200
807503	contig_5727_pilon	+	767	6	Intergenic	novelGene_7950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_1	785.036406799073	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAGGACAGAAGCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168158	172687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577
807504	contig_14882_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_114992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAATTAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212687	212314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_212300_212700
807507	contig_14811_pilon	+	456	4	Intergenic	novelGene_74501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_3	34.6698716467194	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCAGAAATATATAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386922	395146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_387028_390696_390893_394903_394979_395066
807512	scaffold_19766_pilon	+	1856	3	Intergenic	novelGene_34463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	974	1813	908670	909791	FALSE	40	CAATAACTGAAAGGTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPRGKGNYFCLASQTSQVNLGDHLTTSNYELFCFFIQTGPGHGKGPDRWSLPWIFLSSWVKSCSSSISSICRGSQDSYLFLAGRGCMPLRDSFAVPEDDIFSHSCFCSSGGAGTSCPGSSSSRSRSSRRVTASSALSGQCSCTQVWSSLGRMVRNCSSTRSSRICSLVCNSGLSHSQQSTRSWLRASRGPGVSWYPNCLKRWRNISRPGRHFFFSSSSSSTFTITGPTCFCGGLGPRTVAMPSTLVITQTQETALLKMRLCVPGILVPLVFWFFKATG	907696	912751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_909012_909293_909792_912708
807513	contig_3386_pilon	+	1414	11	Intergenic	novelGene_34553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	765.78963168745	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	729	1325	494402	506163	FALSE	65	GAAAAAAAGAAACAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRYRSENTPDPGFLT	470059	506252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470273_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488103_488190_491949_492060_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996
807514	contig_11264_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_154207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402545	403494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_402500_403500
807515	contig_14679_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_174185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGGAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100815	103135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_100800_103100
807516	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653760	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
807517	contig_3382_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_124071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCCAGGAGAAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316155	314274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_314300_316200
807518	SIRV5	+	405	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2048_2270_2316_3298_3405_3483
807519	contig_9739_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_165088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGCCAAGTAGAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183440	182810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_182800_183400
807521	contig_9739_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_165087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAACCAAGAAGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182764	182091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_182100_182800
807523	contig_9188_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_175729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	90	1178	31941	33029	FALSE	35	CCCCCTAGAAAAGCATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAKVFPLREGAHQPGAQPGGHLIASLKTMEMHVFDYSEPANFSDISWPCNSSDCIGVDSVLCPVMPHKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVNIQAKTTGYDMHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKITHLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTSSCRKKMVRRLVCVLVWLLAFCVSLPDTYYLKTVTLAANNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVILGFAVPFSVIAVFYFLLARAISASGDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHAAVLLDIFSVLHYIPFTCQMENFLFTALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYKYELMKAFIFKYSAKTGLAKLIDASRVSETEYSALEQNAK	21371	33832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_+_21435_31914
807524	contig_5918_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_99518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTCCCTGAGTGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549448	550194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_549400_550200
807525	SIRV1	-	195	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3613	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6753	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
807528	contig_5889_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_133687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCAGCCAGTGATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186089	187383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_186100_187400
807529	contig_15063_pilon	-	1020	3	Intergenic	novelGene_14396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTCCACCGACTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36789	35201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_35380_35839_36130_36237
807531	contig_21207_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_175732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCACGGCAACTGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28781	26967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21207_pilon_-_27000_28800
807532	contig_12157_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_135892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTGCCTGGCCTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90298	89301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_89300_90300
807533	contig_11448_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_66414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCTAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533265	533665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_533300_533700
807534	contig_11448_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_66415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTAGAACCCCAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533769	534504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_533800_534500
807538	contig_7527_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_139560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	100	315	80173	80388	NA	70	AATTGAGAATAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPGHLVGRAEAGALGSARPAAIRGGTRRRATIMPGHLQEGFGCVVTNRFDQLFDDESDPFEVLKAAENKKKRSRRGRRWGPWGQERSSGRSPDQLQRGRQTAA	80073	81517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80100_81500
807541	contig_10753_pilon	+	450	2	Intergenic	novelGene_105149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	447	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355079	356611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_355143_356224
807545	contig_5389_pilon	+	1999	8	Intergenic	novelGene_142996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	24.9382911873877	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	243	746	74054	79148	TRUE	15	TCCCAGCAGAGGGTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVGTYNVNGQSPKECLRPWLSHGIQAPDVYCVGFQELDLSKEAFFFHDTPKEEEWFKAVSDGLHPDAKYAKVKLIRLVGIMLLLYVKQEHAAHISEVDAETVGTGIMGRMGNKGGVAIRFRFHNTSICIVNSHLAAHTEEYERRNQDYKDICSRMQFYQVDASLPPLTISKHDVILWLGDLNYRIEELDVEKVKKLIEEKAFQTLYAYDQLKNQVAAKAVFEGFTEGELTFQPTYKYDTGSDDWDTR	71223	83781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_71324_73072_73188_74026_74144_75158_75347_77021_77134_79034_80154_81618_81730_83644
807546	contig_16883_pilon	+	937	5	Intergenic	novelGene_161753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_3	69.8605754342176	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	472	936	519520	533045	FALSE	25	AGCTCCATTTAATTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDGGVKLLKERLEKFFHRYLQTLHLQSCDLLDIFGGISFFPLDKMTYLKIQSFINRMEESLNIVKYTAFLYNDQLIWSGLEQDDMRILYKYLTTSLFPRHIEPELAGRDSPVRAEMPGNLQHYGRFLTGPLNLNDPEAKCRFPKIFVNTDDTYE	519048	533046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_519577_526114_526291_529884_529967_532608_532671_532957
807549	contig_14773_pilon	+	1694	10	Intergenic	novelGene_174765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	6.8168274000791	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	55	1323	105153	209488	FALSE	25	TAGTTTAGTGGCTACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSFREARAGRRGVLYRMRPPKQRLVLKVLIRMNVIWRNSISCLRIGQVPHRYQSDYHPAAPLGSRILTDPTKVFEHNMWDHMQWSKEEEEEARKKVEENSAVRVLLEEQVKYESEASKYWDTFYKIHKNKFFKNRNWLLREFPEILPVDQKTTEKAGELSWDHVKTNAASCFSRTHGPNVPEEKDHYKKNSGSSNGQSKARSNFSNSDSEEHRKGPLKTDLFPGSNATFRVLEVGCGAGNSVFPILNILQNVPGSFLYCCDFASEAVELVKSHSSYRAAQCSAFVHDVCDDGLPYPFPDGILDVILLVFVLSSIHPDRMQSVVNRLSKLLKPGGMLLFRDYGRYDKTQLRFKKGCCLSENFYVRGDGTRAYFFTKGEVHNMFCKAGLDQKQNLVDRRLQVNRKKQVKMHRVWVQGKFQKPLHLTQNSSKLFFSLLSDD	105098	209859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_+_105186_155865_156021_176189_176282_188638_189010_190586_190637_197056_197121_198712_198853_208220_208328_208465_208532_209297
807553	SIRV6	+	212	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	525	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
807555	contig_5881_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_129031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGAAGCCTTGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181770	182273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_181800_182300
807557	SIRV7	-	621	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	282	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147636	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56094_70877_70988_78841_78966_114689_114989_147608
807559	contig_8885_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_115573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTGAATAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65191	65806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_65200_65800
807561	contig_11978_pilon	+	1482	8	Intergenic	novelGene_62911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41.6163233280757	140	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	48	1340	848223	851690	FALSE	20	TGAACTGGATCCCAGGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPEALEVAAGTELGIMEGERMASLTPDTPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAAMHAPGSRLQCTYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRLALERGSSAQEALHVITGLLERYGQGGSCREDPMPFCYHNTFLLADRTEAWVLETAGQLWAAQRIREGARNISNQLSIGTDISAEHPKLRAHAQTQGWWGGQGTFDFAQVFSLTQQPVRMEAAKARFQVGRELLRQQQGGITAEVMMGILRNKESGICMDSGGFRTTASMVSILPRDPTQPCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPKVLSPTFGAQDPARTLPRFQTQVDRRHILYQGHQVALGLMESEQDQGQQLRQKQQALEQEGLEAARGLLARQRAPPLQEWGGLFQTFVERESQMYA	848175	851832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_848238_848605_848780_849083_849266_849842_850043_850524_850741_850841_851008_851099_851281_851531
807563	SIRV4	-	394	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1112	15	1112	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
807564	contig_10082_pilon	+	699	5	Intergenic	novelGene_63913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	290.16417766499	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	75	593	580253	585004	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAQSPSRSATSSAELSGAAVAAAMAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLDARPRTAAAAHQELLSHGHGPAAPSASPEASGGPG	574373	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_574419_580223_580435_583586_583726_584706_584796_584895
807566	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
807568	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
807569	contig_15084_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_116683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	923	1222	163674	163375	NA	75	CTAATTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTEVLRTGLWHMVSIQYVATCSGVGRQFMLTPCTVERKTARSCTILTISCRLDHCDPQGFHWLIFESRSPDHPSWSFSLHASLKPVQHHSNTQTSTDR	164596	162783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_162800_164600
807571	contig_8712_pilon	-	1721	5	Intergenic	novelGene_58880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	6.72681202353685	110	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	978	1487	1009057	1003480	FALSE	10	CTTCTCCAGGGCTTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKQFLRDVDWGEIDYLIVDTPPGTSDEHLSVVQYLSGAHIDGAVIITTPQEVSLQDVRKEINFCHKVKLPVIGVVENMSGFVCPTCKKESQIFPPTTGGAEAMCQDLKIPLLGKVPLDPQIGKSCDKGQSFLTEAPDSPATLAYRSIIQRIQEFCSLHPSHEEQLTGS	1010034	1003245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1003539_1004233_1004318_1007841_1007945_1008229_1008341_1008904
807573	contig_366_pilon	+	1890	4	Intergenic	novelGene_51556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	9.17726659862414	351	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	17	694	624623	631136	FALSE	35	AAGTGAGTTTGTGAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSLWAVPRWVQRLLASSAASYGRGWLHPFSTATQRTTGEDCSSEDPPDELGPSLAERALRLKAVKLEKEVQDLTVRYQRAVADSENIRRKTQRCIEDAKIFGIQSFCKDLVEVADILEKTTECISGGTESGDQKLTLEKVFRGLSLLEAKLKSVFAKHGLEKMTPIGDKYDPHEHELICHVPAGVGVQPGTVALVRQDGYKLQGRTIRLARVEVAVESQRRL	624606	632332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_624700_626457_626612_628609_628692_630771
807574	contig_10642_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_78688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCAGCTTGTTTTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217043	216705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_216700_217000
807575	contig_3627_pilon	+	863	3	Intergenic	novelGene_78467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_1	153	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	502	861	329583	330952	FALSE	55	GCAAAAATTAGAAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTVKQESKDVEENVGLIVYNGAMVDVGSL	329081	330954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_329712_330619_330741_330842
807577	contig_8017_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_65339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTATAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123719	125323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_123700_125300
807578	contig_12128_pilon	-	868	8	Intergenic	novelGene_131986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_7	58.7036834362171	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	183	836	410049	393395	FALSE	50	CAAAAAATCTTGGAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLAPSKSTVYVSNLPFSLTNNDLYRIFSKYGKVVKVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNMLGEREPPKKKEKKKKKKISEPEEQIEEVEESDNEGEDPALDSLSQAIAFQQAKIEEEEKKWKPSSGNPSTSDDSRRPRIKKSTYFSDEEELSD	411674	393362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_393527_394327_394404_394488_394602_396936_397045_397580_397693_404592_404622_409965_410052_411494
807579	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	508	3	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
807580	contig_6210_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_171876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGTTATCATTCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61492	60194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_60200_61500
807581	scaffold_19766_pilon	-	1062	7	Intergenic	novelGene_34340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	528.033353323654	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	171	473	621659	605195	TRUE	55	AACAAAAGTACCTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIIRRICSQLPAPPPRAPPPPPPRNSAWMKGAQSLGF	622168	596410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596995_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621461_621815_622153
807583	contig_10667_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_137324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTAAACAGTATTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238248	236341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_236300_238200
807584	SIRV6	+	273	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-9	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807585	contig_602_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_134928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1649	1963	90989	90675	NA	40	CTGGAAAACTATCCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSKSNPTLGWDKKFQTAHVTTFFVILELLKKLSQKNRILRWERSEHKKMSHQRRKNTDQIAETLYLGFINGNGQRDECLMKFKLALIIWTQCTEFSLYSLAS	92637	90431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_90400_92600
807587	contig_753_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_112948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGACCTGGCAGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819111	818513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_818500_819100
807589	contig_10627_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_60003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGGTTCTGACTTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308995	308331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_308300_309000
807591	contig_8615_pilon	+	2054	15	Intergenic	novelGene_165211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.40806468346	2	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1067	1729	90095	101123	TRUE	75	CAGAAAAATCAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHEAMTLNLQTKKPNPMRLLVVENGEKEPPTTLLWVRYFLAQHFDKLGQYSLALDYINAAIASTPTLIELFYMKARIYKHIGNLKEAAKWMDEAQSLDTADRFINSKCAKYMLRANMVKEAEEMCSKFTREGTSAMENLNEMQCMWFQTECISAYQRLGKYGDALKKCHEVERHSPSKWTTGGKEPLMRPLRQSSAALSCGVSRHHCSHADRSIKPQAS	25715	107471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_25820_27074_27233_29232_29363_43082_43237_52424_52545_55001_55098_60417_60525_89003_89077_89970_90165_94892_95063_95392_95546_100245_100375_100982_101128_106274_106489_107364
807593	contig_10861_pilon	-	2297	11	Intergenic	novelGene_39250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	100.264699670422	1	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	781	1518	825476	803471	FALSE	80	CCACAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGENITRHLVSWPFLLYMLVVIILFCLLLYFYKEKNANNIIVILLLVALLGSMTVVTVKAVAGMLVLSIQGNLQLDYPIFYVMFVCMVSTAVYQAAFLSQASQMYDSSLIASVGYILSTTVAITAGAIFYLDFIREDVLHICMFALGCLIAFLGVFLITRNRKKAIPFEPYISMDAMPGMQNMHDKGMAVQPDLKASFSYGALENNDSISEIYAPATLPVMQEEHGSRIASGVPYRVLEHTKKE	859949	802691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_803671_808569_808665_814141_814206_816018_816108_818105_818242_821698_821796_825419_825566_829658_829704_832180_832364_855236_855616_859865
807594	contig_12951_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_68207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAACAATAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765456	763314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_763300_765500
807597	SIRV1	-	239	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3569	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6797	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
807598	contig_13226_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_175341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155760	153713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_-_153700_155800
807601	contig_8102_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_85325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46900	49399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_46900_49400
807602	contig_11338_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_6238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	444	555	998	13152	13595	NA	35	ATTTCTCTATCAAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKFCSTRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIK	12597	13595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_12600_13600
807603	contig_9609_pilon	-	926	2	Intergenic	novelGene_23027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTGAATCACCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322710	320977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321038_321844
807605	contig_7182_pilon	-	1104	5	Intergenic	novelGene_117156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1102.38998884242	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	101	400	889318	888811	TRUE	25	GTTGTTCTGTTAACTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPP	891360	886699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887222_888162_888345_888810_888961_889168_889333_891274
807609	contig_16883_pilon	-	1791	1	Intergenic	novelGene_161727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGCGTGCACCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258073	256282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_256300_258100
807611	contig_12626_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_80465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTAGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184307	182941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_182900_184300
807612	contig_16103_pilon	+	1602	11	Intergenic	novelGene_118931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	272.680765731652	2	101	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	721	1260	794268	799889	FALSE	15	CTTTAGCTAACTCTGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTRAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSRSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	790837	800231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_791018_791769_791813_792256_792432_792782_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
807614	contig_6919_pilon	+	810	8	Intergenic	novelGene_163993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.1379306683382	59	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	442	525	100120	110152	TRUE	30	GTGAGTGGCATGAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRRSAGPRRWEATGYSSARLSGNKAGQVWAPEGSTAFKCLLSARLCAALLSNISDCDETFNYWEPTHYLIYGKGFQTWEYSPVYAIRSYAYLLLHAWPAAFHARILQTNKILVFYFLRCLLAFVSCICELYFYKAVCKKFGLHVSRMMLAFLVLSTGMFCSSSVYLLPLICWS	75712	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_75772_76830_76970_77810_77946_81058_81130_100082_100172_110120_110209_110383_110490_117672
807616	contig_6069_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_8055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	220	630	400345	400755	NA	25	AGTGAATAGTGAGTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSLRELVQWLGFATFEIFVHLLALLVFSVLLALRVDGLAPGLSWWNVFVPFFAADGLSTYFTTIVSVRLFQDGEKRLAVLRLFWVLTVLSLKFVFEMLLCQKLVEQTRELWFGLITSPVFILLQLLMIRACRVN	400125	401664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_400100_401700
807617	contig_6489_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_128934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGGAGAAATAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205922	207545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_205900_207500
807618	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
807619	contig_20879_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_168603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCCCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220906	222130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_+_220900_222100
807620	contig_7457_pilon	+	1837	13	Intergenic	novelGene_31524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	379.05396676756	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	43	1152	747093	758691	TRUE	35	TAATAGGAAGCTTCTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVWIQAQQLQGDALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDSIDLDNPQENIKATQLLEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRLVREANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLITQDTESELKKLQQTQEYFIIQYQESLRIQAQFAQLAQLNPQERLSRETALQQKQVSLETWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLLRKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLCQQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGEAERAHEPPLR	704873	762977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_704906_747082_747221_750048_750206_751601_751692_752634_752810_757014_757146_757403_757556_757976_758133_758570_758753_759126_759215_759289_759413_760428_760522_762657
807624	contig_13349_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_161138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377210	375187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_375200_377200
807625	contig_7146_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_162055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATATACAACCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179469	179868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_179500_179900
807628	SIRV2	-	590	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	96	0	96	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5799	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
807630	contig_12884_pilon	+	1774	7	Intergenic	novelGene_105028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	130.040271540097	177	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	122	1237	1304216	1306272	FALSE	10	AACGCCTTTGCCCTCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHEKSFLVSGDNYPPPNPGYPGGPQPPVPPYGQPPYPGAPYPQPSFQPAPYGQPGYPQGPAPYPQGPSPYPQGPYPQGGYPQGPYPQGGYPQGPYPQGGYPQGPYPQSPFPPNPYGQPQAFEDPGSPLQGNYHEEGPPSYYDNQDFPATNWDDKSIRQAFIRKVFLVLTLQLSVTLSSVAVFTFVRGVKDFVRANVWTYYVSYAVFFVSLIVLSCCGDFRRKHPWNLIALSILTVSLSYMVGMIASFYDTEAVIMAVGITTTVCFTVVIFSMQTRYDFTSCMGVLLVSVVVLLIFAILCIFIRNRILEIVYASLGALLFTCFLAVDTQLLLGNKQLSLSPEEYVFAALNLYTDIINIFLYILAIIGRAKE	1303263	1306809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1303360_1304190_1304595_1304679_1304793_1305309_1305511_1305674_1305804_1305891_1306036_1306122
807631	contig_3601_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_132967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTTATATTTAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140263	1142271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1140300_1142300
807632	contig_14441_pilon	+	605	4	Intergenic	novelGene_100585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111198	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111381_112097_112190_117270_117344_117539
807633	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
807636	contig_6710_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_96464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653687	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
807637	contig_10581_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_41419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAAATGGATGGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639778	639998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_639800_640000
807640	contig_10976_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_155606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCTCATTGTGTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241138	240634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_240600_241100
807641	contig_10976_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_155607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCATTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242206	241589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_241600_242200
807642	contig_15118_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_74557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCCTCCTCCCTCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153819	153623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_153600_153800
807643	SIRV6	+	280	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	20	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11114_11205
807646	contig_7056_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_43633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCAATTTGTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722547	721899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_721900_722500
807647	contig_10765_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_122988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAACCAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514667	513978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_514000_514700
807649	contig_13097_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_107688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145125	144661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_144700_145100
807652	contig_20819_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_55657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42707	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_42700_43600
807653	contig_15120_pilon	+	1780	6	Intergenic	novelGene_108028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	88	junction_1	31.4095526870409	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	135	1073	261742	290974	FALSE	25	AGAAAGCCCCTGTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKFLADDFDVKEWINAAFRAGPKEAAAGKADSHAATLVMKLQLFIQEVNHAVEETSHQALQNMPKVLRDIEALKQEASFLKEQMILVKEDIKKFEQDTAQSMQVLVEIDQVKSRMQLAAESLQEADKWSTLSADIEETFKTQDIAMISAKLTGMQNSLMMLVDTPDYSEKCVHLEALKNRLEALVSPQIVAVFGSQSIDQAKAFVKVFTEIDRMPQLLAYYYKCHKVQLLAVWQELCQSDLPLDRQLTGLYDAMLGAWHAQIQWAAQVTARLTSRENKACVTRGWMTASGMVSLNCRVPLPSCHCHQRG	261607	291681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_261911_263575_263725_265286_265404_269577_269747_289890_289974_290722
807655	contig_10456_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_163450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCATACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11376	13018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_11400_13000
807658	contig_14563_pilon	+	1442	6	Intergenic	novelGene_135049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGAGCTCTGCCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122396	159412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_122953_125258_125367_131682_131744_133438_133529_158445_158577_158916
807659	contig_8617_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_73462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCTAATCAACATGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62700_63000
807661	contig_19145_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_164146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATTTTAAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213020	215728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_+_213000_215700
807662	contig_1037_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_84596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACACAATAAAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199016	199650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_199000_199600
807663	contig_9937_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_129195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAGTCAAATTTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30511	31827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_30500_31800
807666	contig_7171_pilon	-	684	7	Intergenic	novelGene_101194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	367.136554976483	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	83	601	47684	37493	FALSE	5	GCCCTGTGTCTCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSESIRSGGRCPNGHPDTKLPHQLTVPSLLPPVIEPTEWCVYEAQPEREDRWNQSWD	50442	37409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37663_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_50365
807669	contig_16970_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_157614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTTAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187750	187968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_187800_188000
807671	contig_10306_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_175734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATATGTAAAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10258	11731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10306_pilon_+_10300_11700
807673	contig_11908_pilon	+	1787	15	Intergenic	novelGene_133232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	96.7693713139121	1	73	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	133	486	698161	752834	TRUE	5	TATTTCCTTTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSLFH	698028	837353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752823_752878_783983_784110_788412_788559_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_836668_836741_836941
807674	contig_7164_pilon	-	1979	6	Intergenic	novelGene_172133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	6	junction_5	34.2485036169465	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	122	745	126195	119408	FALSE	30	TGAGTGAGTGAGTGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGDRSPPLQRPHQRGGPVEALKVKRPRFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSDFGAIPQQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREDSITVHIRSTKGPIDVYLCEVEQENTSNKVSEDIGTSSSESKPPENPDKEENPPQQSEELLEVSN	140037	118173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_119458_119933_120082_122675_122790_124141_124299_126040_126258_139978
807676	contig_15021_pilon	+	979	2	Intergenic	novelGene_26939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238858	241722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_239245_241129
807678	contig_14405_pilon	+	2470	2	Intergenic	novelGene_85683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCTTCCAGGACAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986969	989862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_988603_989025
807682	contig_15182_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_136429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAGCATAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2312	3432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_2300_3400
807684	contig_14909_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_155704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCAACAATATCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103862	103440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_-_103400_103900
807685	contig_2730_pilon	+	1305	2	Intergenic	novelGene_135393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATTCATTTCCTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392630	394308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_393285_393657
807688	contig_13048_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_138925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGTTTCACCTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421916	423384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_421900_423400
807692	contig_9708_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_67277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGGCAGTTGCCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770303	769247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_769200_770300
807693	contig_11678_pilon	+	2018	2	Intergenic	novelGene_160855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	0	199	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGCTTTTTGTCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312170	314298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_312295_312404
807694	contig_10436_pilon	-	1144	8	Intergenic	novelGene_108510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	58.2675041581182	185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	10	744	110740	105285	FALSE	40	AAAACTGATCTAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIGMMRTQCLLGLRTFVAFAAKLWSFFIYLLRRQIRTVIQYQTVRYDILPLSPVSRNRLGQVKRKILVLDLDETLIHSHHDGVLRPTVRPGTPPDFILKVVIDKHPVRFFVHKRPHVDFFLEVVSQWYELVVFTASMEIYGSAVADKLDNSRSILKRRYYRQHCTLELGSYIKDLSVVHSDLSSIVILDNSPGAYRSHPDNAIPIKSWFSDPSDTALLNLLPMLDALRFTADVRSVLSRNLHQHRLW	110749	104884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_105346_105650_105736_106186_106299_106526_106644_107071_107144_107339_107459_107555_107623_110638
807695	contig_3825_pilon	-	966	5	Intergenic	novelGene_78015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	521.981560977014	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	148	687	1465317	1462075	FALSE	15	TGATTTGCATTTCTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1469127	1461795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465366_1469028
807696	contig_5791_pilon	+	1269	8	Intergenic	novelGene_35813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_4	110.779612063681	206	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	291	1004	325962	349481	FALSE	30	CTTAAAGTGAAGATGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKKKRKSPGVAAAVAEDGGLKKCKISSYCRSQPPARLISGEEHFSSKKCLAWFYEYAGPDEVVGPEGMEKFCEDIGVEPENIIMLVLAWKLEAESMGFFTKEEWLKGMSSLQCDCTEKLQNKFDFLRSQLNDISSFKNIYRYAFDFARDKDQRSLDIDTAKSMLALLLGRTWPLFSVFYQYLEQSKYRVMNKDQWYNVLEFSRTVHADLSNYDEDGAWPVLLDEFVEWQKVRQAS	325671	349746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_326048_328474_328567_334698_334770_335182_335275_345642_345752_345836_345942_347551_347655_349425
807697	contig_5515_pilon	-	1993	4	Intergenic	novelGene_52304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	22.4845626053867	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATGCACTCCTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37561	33006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33386_33476_34899_36599_36700_37469
807698	contig_934_pilon	-	763	5	Intergenic	novelGene_129010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	32.2374006396297	198	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	56	304	57683	54258	TRUE	30	GTTGAAGAGTATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPGGTVARPLAVLPGTKMAMASDFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDVMIRKEAYVHKSVMEELRRIIDDSEITKEDDALWPPP	57738	49284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_49645_52243_52327_54241_54354_55210_55270_57589
807699	contig_11846_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_105991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384341	385574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_384300_385600
807702	contig_8885_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_115576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACAATTTCTACATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71835	72173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_71800_72200
807703	contig_1624_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_138361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGGCAATGGATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13422	13674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_13400_13700
807704	contig_8357_pilon	-	1586	9	Intergenic	novelGene_39777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	493.123574142425	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	260	550	891622	891010	TRUE	40	ATAGAAGGGACAGGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKFTAL	891881	884082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885477_885549_887117_887179_887257_887410_887707_887787_890560_890614_890873_891025_891346
807706	contig_14341_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_111896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGTATGGTGGTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734325	735066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_734300_735100
807710	SIRV1	-	160	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3648	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6700
807711	contig_2033_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_71547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGAAGGATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413335	414542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_413300_414500
807716	SIRV6	+	202	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	521	60	521	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
807719	SIRV2	-	480	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4392	35	3217	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
807724	contig_7272_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_25322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTCTCCGTAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521349	519171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_519200_521300
807727	SIRV6	+	278	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	171	-244	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
807728	contig_6872_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_175739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAAAATGCCGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296972	296530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_-_296500_297000
807735	contig_13044_pilon	-	1431	6	Intergenic	novelGene_99978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	15	junction_3	49.0493628908674	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	79	1089	51209	31690	FALSE	50	AAAATAAGAGGATCCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRLDGRWLRRLPVLQLGARGLPPAPAPTGGTERPALPAWAVASVSPVAPGGTSGWYEALAASAPVRGAEEVLLSAHAATGLPWWGSILLTTVAMRGAVTLPLAVYQHHILAKVENLQPEIKNIARHLKQEVAVRANQLGWSKRVARITYLRNMRRLVSELYVRDNCHPFKATVLVWIQLPMWIFISVALRNFSMGATHSEGFSVQEQLATGGVLWFPDLTALDSTWILPVSVGVINLLIVEIFALQKIGMSRFQKYVTYFVRGVSMLMIPIAATVPSSVVLYWLCSSFMGLSQNLLLRSPGFRRLCRIPLTKSDSDTPYRDLFAAFCAKFFSRK	51287	31347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_31864_35195_35304_36991_37114_37823_37988_48844_48946_50867
807737	contig_18613_pilon	+	840	5	Intergenic	novelGene_80215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1026.15285776535	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	113	553	24385	31077	FALSE	10	ATATGGTCTTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQCEFPNSGLPGVTQSCGEF	23702	31364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28676_31058
807738	contig_16122_pilon	+	2653	8	Intergenic	novelGene_134485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	2.99659670905758	27	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	294	1724	97172	101184	FALSE	35	TTAATAAGATGCACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRWTSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWLDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAICVFTMKDVQKAFNGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPMPRPGACITSSARERRINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMDGQVRSHMLLLQPRARYQRVAVHRVVGLHDTYDVLFLGTGDGRLHKAVNVGSRVHIIEELQVFPPGQPVQNLLLDANRGLLYAASYSGVVQVPVANCSLYQSCGDCLLARDPYCAWSGASCRHISLQQPELASRLWIQDIEGANAKGLCNTSWPRSRTIMSTGKKLCEQVQFQPNTVNTLACPLPSNLATRLWMHNEVPVNASASCRVLPTGDLLLLVGSQQRLGLFQCWSLENGFQQLVASYCPEMVEDGAADQADQGGSVPVIINTSRVSAPVGTGTWSADKSYWNEFLVMCVLFVFAVVLLTLFFLYRHRDGMKVFLKQGECASVHPKTRPVGRLPETRPLNGVGPPSTPLDHRGYQALSGISPGPRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPMCPRPRVRLGSEIRDSVV	95652	102113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_95721_96809_96992_97128_97280_98383_98595_98692_98809_99092_99260_100102_100189_100441
807740	contig_12278_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_152601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAAACCACAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218903	218606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_218600_218900
807743	contig_9995_pilon	+	1417	4	Intergenic	novelGene_47727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	80.9444253793922	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	676	1023	610635	610982	FALSE	50	GGAAATAACGAATATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSFAILASKEYINPGKLEIVKNEMERINIDILGMSELKWTGIGHFELDSHMVYYVGNDKLKRNGVAFVVKKNFSRSILKYNAVSDKILSICIKERPVIKDYYSNLHTSHEGQR	485895	611376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_486036_502881_503029_606460_606635_610420
807745	contig_6494_pilon	-	730	6	Intergenic	novelGene_108577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	606.596604012914	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	309	662	3457	2635	TRUE	40	TTAAAAGACACATGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	6842	2112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751
807747	contig_9484_pilon	+	1108	13	Intergenic	novelGene_105657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_1	290.757093636596	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	70	1056	126829	204920	FALSE	85	GTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGMLSRNSF	126759	204972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859
807748	contig_4783_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_108430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGTCTTCCCTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452595	451742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_451700_452600
807755	contig_13272_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_163945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGAAAAAAACTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71020	69479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_-_69500_71000
807756	contig_12250_pilon	-	2318	6	Intergenic	novelGene_80522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	22.9259678094514	323	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	494	1180	76823	67450	FALSE	20	AGTGAGGCACACTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTTSPAGGVAIAVQYFWDRGHRDITVFVPQWRFSKDAKVREGHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQFRDLAEESEKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPVRKQGSSEAQHPSRGITKHDNQQQGREEEKGSGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQREPYCRDINQLSEALLSLNF	77453	66311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_67700_68569_68672_68878_68987_76511_76609_76693_76826_76962
807758	contig_16846_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_82930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCTTATGGATAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511232	510545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_510500_511200
807759	contig_6059_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_44792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAGAACTGCCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381334	381785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_381300_381800
807760	contig_21404_pilon	-	727	6	Intergenic	novelGene_169134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	392	junction_5	53.5552051625237	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	5	655	5716	1446	TRUE	50	TAAACATTCAAATAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMKTLLEGLGYSVNVKQNLTASDMTAELKTFADRPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKVRLSFESPDGKAQMPTVERMTLTRYFYLFPGY	5720	320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_388_1440_1545_2004_2115_4453_4598_4996_5232_5653
807761	contig_8235_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_175746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGGATTTGTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198860	199687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8235_pilon_+_198900_199700
807763	contig_1863_pilon	-	1643	5	Intergenic	novelGene_156533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	62.0458499820899	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	35	457	74120	68179	FALSE	35	ACCTGTACTTTACATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKSEQ	74154	66992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_68231_71638_71738_71837_71925_73209_73342_74067
807764	contig_8801_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_66288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCGAAAGAAAAATGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468988	467373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_467400_469000
807769	contig_6630_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_30741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGCCTCTTTCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822541	823518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_822500_823500
807771	contig_14133_pilon	-	499	5	Intergenic	novelGene_119955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1835.01462868828	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	287	460	207422	206601	FALSE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGCSALRRAIGSHGAQPEWHDPEAPLPQGLAAARSHVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209451	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208344_209045_209131_209421
807778	contig_12008_pilon	+	1955	14	Intergenic	novelGene_25012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	94.6254528726861	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	320	1894	74641	79434	FALSE	20	AATGAGATGGGCTGGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIINGPIKSFCYRRLQYLSSKFQMHVLLNEMKELAAQKKVPHRDFYNIRKVDTHIHASSCMNQKHLLRFIKRAMKRHLEEIVHVEQGREQTLREVFESMNLTAYDLSVDTLDVHADRNTFHRFDKFNAKYNPIGESVLREIFIKTDNRISGKYFAHIIKEVMSDLEESKYQNAELRLSIYGRSRDEWDKLARWAVMHRVHSPNVRWLVQVPRLFDVYRTKGQLANFQEMLENIFLPLFEATVYPASHPELHLFLEHVDGFDSVDDESKPENHVFNMESPLPEAWVEEDNPPYSYYLYYTFANMAMLNHLRRQRGFHTFVLRPHCGEAGPIHHLVSAFMLAENISHGLLLRKAPVLQYLYYLAQIGIAMSPLSNNSLFLSYHRNPLPEYLSRGLMVSLSTDDPLQFHFTKEPLMEEYSIATQVWKLSSCDMCELARNSVLMSGFSHKVKSHWLGPNYTKEGPEGNDIRRTNLPDIRVGYRYETLCQELALITQAVQSEMVSELWPDLDPGWSDVSYSGPRLLL	73912	79495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_74024_74322_74467_74576_74667_74874_75005_75169_75365_75443_75576_76300_76465_76729_76857_76933_77098_77397_77519_77800_77975_78180_78292_78451_78604_79355
807781	contig_5696_pilon	+	888	4	Intergenic	novelGene_117503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	55.2408866289776	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	93	332	301672	308689	TRUE	25	TTCAGATGTTTCCTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGHDGQQSGVRQQGRSGKELGRLSAPCFVGMVLTIATALGRKGYGGGCAVIAALSRAGGGAQGCVCDNWTFEPVGLGSEPGSGAEGSSPAAECGIWAGSKATYAINKVP	301579	314786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_301874_308651_308716_310355_310544_314444
807782	contig_15491_pilon	-	1633	6	Intergenic	novelGene_75984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_4	89.824272888791	2	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	48	881	91394	80831	FALSE	80	AGAATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91441	80078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
807783	contig_16948_pilon	+	1577	9	Intergenic	novelGene_166403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	824	1123	205924	208830	TRUE	45	CAATCTGACAAGAGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSNMLLNSCRVPRKSGRTKSTMHQYSMRLFCRGYPVSTTRRRERMFFRACEVLAWQFLMRCPSSQITTSGPGRHKAFSNSLRNSCCRSSSSRSMMTG	197730	210719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_197787_200561_200682_202065_202184_202403_202657_203853_204024_205817_206168_208774_208971_210262_210396_210538
807784	contig_8161_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_156787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAATATATTAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602532	601886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_601900_602500
807786	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
807787	contig_9468_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_59531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAAAAAAAATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579725	581450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_579700_581400
807788	contig_13481_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_119260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCTCTGATAAGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18801	16733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_16700_18800
807789	contig_6208_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_52966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAATTTTACCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324911	323749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_323700_324900
807793	contig_11932_pilon	-	1399	7	Intergenic	novelGene_85406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_4	50.8068236886871	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	885	515	1399	255495	249381	FALSE	15	GAAGTGCCCCGGCTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVVKVTPNEGLTVSFPFGKFGRASIFHVSDSYSETPLEDFVPQKIVRCCVLSTADHVLTLSLRSSRTNPETKSKIEDPEINSIQDIKEGQLLRGYVKAVEPHGVLFSLGPSVVGLARYSHVSQYRPSKKALYSKYLPEGKLLTAKILSLNHKRSLVRLSFLPSDTGKPDVLPASVGLPLLEEEERETEAERGDQKGNAAKKNQERKEKKNQKGQEEVKWPSKEKSEPRQPQVKKQGKRGRPESGSEQERVNKKQKKAGLSEEDDSGVEVYYREGEEETEEMTVLPKEKPTKLT	256009	249380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_249402_250265_250383_250607_250906_251489_251613_252213_252337_253075_253133_255349
807797	contig_3410_pilon	+	1435	4	Intergenic	novelGene_58959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	47.3661857822176	54	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	884	1270	411582	412811	FALSE	75	CACACACAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASTAVNYCGLETILHMTCCHQSREEITGHLHKAKRLGLKNILALRGDPIGEQWEEEEEGFSCALDLVKHIRSEFGDYFDICVAGECLEPPSGWGQRGEGTRRPGLSRGTESRQYSTGTWLSSAPRA	407311	412976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_407851_409951_410201_411486_411727_412569
807798	contig_1107_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_126533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGTAAATACTACGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98816	99415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_98800_99400
807799	contig_9038_pilon	-	1605	3	Intergenic	novelGene_143320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_2	68	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	1257	1604	354883	349940	FALSE	65	AGAAAAAAGAGAAAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLYGVFLYMGVSSLKGIQFFDRIKLFGMPAKHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKASSAAVVFPMMVLALVFVRKLMDLCFTKRELSWLDDLMPESKKKKEDDK	356139	349938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_350054_353248_353423_354823
807806	contig_8710_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_73545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTGAAGTGGATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511486	512794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_511500_512800
807808	contig_10549_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_110612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	525	842	199165	198848	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSSLKFSLGKTRGNFIGNPNLIYLYMFKVALSFLTQNPNYNTVTKKKFLPPESTITFVDLFPNTDSKSTLRPVEGCGCATGEGVNPEKNQNGKKCNSLISLHL	199689	197513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_197500_199700
807809	contig_6654_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_85779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	512	901	752333	752722	NA	50	ATTGTGCAACTATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNITAHLPLNQCLSSLLLAPPKTVKPPEDQLKSENLELSSSFNYNVLQHLGQFPPLMPNKQIAESASSSSQQSSVGSKPAMSYASALRAPPKPRPPPEQTKKSSDPLSLFQELSLGSASGGNGFYSYFK	751821	753008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_751800_753000
807810	contig_16431_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_87603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90158	91196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_90200_91200
807811	contig_12709_pilon	-	849	3	Intergenic	novelGene_147408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	100.5	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAATATGCAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59056	41514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_42166_57378_57450_58929
807817	contig_835_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_152146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTCTAGTGAAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167801	167202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_167200_167800
807818	contig_15631_pilon	+	963	2	Intergenic	novelGene_151544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	362	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	108	599	396107	396598	FALSE	15	GATGAGCCTCTGCATCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSALPTCAPSWLRIAREAGAVEAWAARFTDITANRMEHYRKAGSVELPAPSPMPQLPPNTLDMRVEDGSKIRNLLELALGQLEGGSARHVVFSGSGRATGKAVSCAEIVKRRVPGLHQLTKLRFLETEDSWVPASPDTGLDPLTVRRHVPAVWVLLSRDPLDPNECGYQPPGASPGLGSTPSSSCGPRPQRRARDTRS	395292	396962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_395364_396070
807820	contig_20507_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_164211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCTCAGAAGATGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136983	136432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_-_136400_137000
807821	SIRV4	-	600	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	9	8	9	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	995	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5149	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
807822	SIRV6	+	325	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3163_10724
807825	contig_10324_pilon	+	2215	1	Intergenic	novelGene_7786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACCTGGTGATGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118811	121026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_118800_121000
807830	contig_253_pilon	-	912	5	Intergenic	novelGene_129708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.3184506858514	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	25	807	513615	507405	FALSE	10	TCTCTGGTCTGTTAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPGIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKADFAKVLELDPALEPVVSRELRTLEARIRQKDEEDKARFRGIFTP	513639	507299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507543_508150_508328_508835_509025_510269_510450_513516
807831	contig_6375_pilon	+	1321	3	Intergenic	novelGene_73043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	72	junction_1	28	760	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	265	690	500167	500592	FALSE	20	CATAAGTCTCTATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRESSSSIPLSFPSPLSSVPDNIINSSLPSMSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498171	501223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498294_498529_498671_500165
807834	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
807835	SIRV6	-	415	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8241	-43	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCGCCACGACCAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10788	2401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2815_3106_3164_10723
807836	contig_15491_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_75996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAATGGTTTTATCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260832	260434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_260400_260800
807838	contig_20822_pilon	+	1547	2	Intergenic	novelGene_170635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	721	1287	8374	9398	FALSE	20	AGAATTTTCTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGAGQNELLSPESWPPWTWEGCSVSTDESGVPEGAARPRRSGSHHSCQPGGSAPPAFVDRPPGGCYRLLARWQQSAPDPLDGPASFSAAKASPLWVPIACVSASAARCIAIETWALVESSEAQGTVYNRMKYRGTSYHQESCARSRVPPLDRGPCAEKLLVHGNTDEKANRERKTSPGADALNLDF	7653	9658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_8766_9223
807839	contig_10732_pilon	-	1639	4	Intergenic	novelGene_114740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.28653526310404	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	22	384	530345	525608	FALSE	25	AGACTGGAGAACCTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVGGGGMGARLLPPAWQLYLKDHRISTFKNWPFLEGCSCTPERMAEAGFIHCPTENEPDLAQCFFCFKELEGWEPDDDPIEEHKKHSSGCAFLSVKKQFEELTLSEFLKLDKERAKNKIVRKGNQQ	530366	524352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_525628_528243_528366_529877_529988_530234
807840	contig_9389_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_84046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGTCCACGCTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618687	617405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_617400_618700
807841	contig_10205_pilon	-	1577	11	Intergenic	novelGene_143118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	74.2630459919333	29	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	484	1455	237302	229163	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMQSSDSKDTSLEARRQLALKAFTHTAQYDEAISDYFRRQYSKGISQMPLRYGMNPHQTPAQLYTLEPKLPITVLNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDRSLFSNVVTKNKDVSLNISAMNINNFSRSVYNIINLYIYQKPKPNPLQLSRYRLIATLQDRVELPHRVSRKQLVDLSCQPFG	256334	229040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911_235038_236736_236894_237236_237389_237897_237987_242569_242647_255694_255822_256230
807842	contig_2054_pilon	+	658	3	Intergenic	novelGene_51657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	603	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTATTTTTATTTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	19452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890_17059_19133
807843	contig_11615_pilon	+	1290	4	Intergenic	novelGene_151250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	126.9094165143	185	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1	414	32075	32488	TRUE	25	ATTATAGTTGCTTCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRLRSGNQTKDTGPPRPGRSLLAAQQPLLPPRRLCFVAGAAVWPQGVVPLGLAKWSRAGLCAAREDAPARPWAPGRSLEHREGSRTPTPPPPRRSPGAERFQPCQLLGLLLRTWGAFPPLAAIRISFSILSARLFL	32074	36647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_32808_33435_33562_33986_34086_36315
807845	contig_4392_pilon	+	2724	1	Intergenic	novelGene_117349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	935	1291	672747	673103	NA	65	TTGGACAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLCPVYPVSVFLYPEHSNLGRKVIMPVICLHFEGEHEKTESCLNLLTLKMLWKLRRGQILSQFGDWRGWRRWLLDLSFNDGEDVDRYATGGNISGKDLDRKDSRRGVVRCSQSSGA	671812	674536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_671800_674500
807846	contig_504_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_54452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGGTGGCGAAGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285755	286671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_285800_286700
807848	contig_14288_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_153818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTGAGAACTGAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280533	279617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_279600_280500
807849	contig_13501_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_169059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21224	19771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_-_19800_21200
807850	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	51	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
807851	contig_6589_pilon	+	827	6	Intergenic	novelGene_26084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	68.7476545054448	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	27	539	1865997	1874896	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEGPRAEMTVLAPAWSPTSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRGL	1865970	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1867326_1867381_1867928_1868073_1868960_1869046_1872601_1872787_1874884
807852	contig_6270_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_99838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAGTAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224760	222152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_222200_224800
807853	contig_987_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_72317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	5	370	1000945	1000580	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMFLDKTHLVPSIRIVIVQAKMCIYKIFSKSSHFYTYIIRYNRQEFLLYYLLLYRRQFQSTSCSLETLWGSSTLPYRVAISQNQQQWAWFFFALYNLYAADKHLLSQVFILDQLLSLYSLSR	1000949	999151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_999200_1000900
807854	contig_11896_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_88017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150561	149672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_149700_150600
807858	contig_1244_pilon	+	1896	3	Intergenic	novelGene_38053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGATATCTTAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006952	1009397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1008699_1008879_1009010_1009377
807860	contig_9366_pilon	-	1956	3	Intergenic	novelGene_166281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1150	1461	1059697	1058337	FALSE	10	GCTTTACTGGGCCTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAAVGCRVIATDIRLDLGPFGDVPKGDVKNKVPGSVLMSFLLDSELFPVLLGRIGMIGEGTGSGGSSLTNDKSGYLLTAVPTTLSGEDEGTKLSGVSRSPQ	1060846	1057841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1058507_1058657_1058793_1059690
807861	contig_12767_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_175747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGACTCTGTAAATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2597	3433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12767_pilon_+_2600_3400
807862	contig_14029_pilon	+	852	8	Intergenic	novelGene_151940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	309.608706305892	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAAAGTTATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131693	135622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_131842_133185_133231_133402_133472_133564_133600_133959_134021_134104_134162_134258_134319_135245
807865	contig_13894_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_62182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCAGGGCAGGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698057	697290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_697300_698100
807867	contig_11978_pilon	-	554	4	Intergenic	novelGene_63102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	236	553	1831234	1830001	FALSE	40	CTGAGAATACAAATCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFHENPLVLEHVPLHLQVQAVIHVAVNLLRFTVSSEQPAQNSHPPHPGHLLGHSSIGSTLSHLPMPICLPFRRAKVFFRHRAREWTVTGLRMIRPSLISFRIC	1831965	1829999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1830132_1830670_1830785_1831161_1831268_1831763
807868	contig_10299_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_79782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCTGAATTTAAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670043	668700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_668700_670000
807870	contig_3975_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_54925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2254921	2257253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2254900_2257300
807871	contig_7694_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_159940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTATTTTCTCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255617	256566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_255600_256600
807872	contig_3132_pilon	-	654	5	Intergenic	novelGene_127426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	163.88639357799	42	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	246	635	229252	210794	FALSE	15	TGTTAACCTGCTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKHNQSWAGS	229497	210774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210822_225933_225975_227106_227258_228800_228929_229210
807873	contig_6576_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_42453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAGACAAATTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335139	1334397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1334400_1335100
807874	contig_3818_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_99221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGGAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250202	249934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_249900_250200
807875	contig_366_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_51645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	464	781	1407029	1407346	NA	35	AACAGCGTCTGAGTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPYSSGPTWPALATPALSLALLTCSFLSTLACSRRRKQICLKVGLRVGSRSQQACMMLYLETGQGACERLPRVGGFFSPAPNRVLLSRVLQTRSEVSLAQDLW	1406565	1407819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1406600_1407800
807877	contig_2215_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_163879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGGACAGAAAAAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445713	444000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_444000_445700
807878	contig_10904_pilon	+	1363	5	Intergenic	novelGene_22644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	17.2699160391705	258	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	99	1049	518823	526209	FALSE	35	AAATGTCAAGTCTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVEVANGRSLVWGAEAVQALRERLGVGGRTVGALPRGPRQNSRLGLPLLLMPEEARLLAEIGAVTLVSAPRPDPRDHGLALASFKRQQEQGFQEQSALAAEARETRCQEFLEKIAEGQAVKKQKLQQDSGSGGSQEAAGSQEAAGSQAVGENEANASQASREHEEAGSSSSQPGPSDGVAPLPRSALLVQLATARPRPIKARPLDWRVQSKDWPHAGRPAHELRYSIYRDLWERGFFLSAAGKFGGDFLVYPGDPLRFHAHYIAQCWAAEDPIPLQDLVSAGRLGTSVRKTLLLCSPQPDGKVVYTSLQWAGLQ	517466	526523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_517561_518818_519066_519831_520094_520253_520512_526021
807879	contig_4364_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
807880	contig_11338_pilon	+	985	10	Intergenic	novelGene_6260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	111.954135229842	1	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	102	791	119147	150508	FALSE	15	AGCTGGACCCAGGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWRFWTRRRGRSCASWTRWNPTPPLPRSRTSSPRPLPVGTTATLYFRDLGAQISWVTVFLTEYAGPLFIYLLFYFRVPFIYGHKYDFTSSRHTVVHLACICHSFHYIKRLLETLFVHRFSHGTMPLRNIFKNCTYYWGFAAWMAYYINHPLYTPPQVQDKEDPIPHQEPLHVALPAGVLPQLHLRGRLLDWLHHHDTVPPSGSLLPGWLHPNDHLGQGQAPKLPEGVP	119045	150702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_119152_147568_147620_148324_148377_148954_149021_149100_149217_149301_149408_149503_149578_149940_150030_150264_150311_150423
807882	contig_6837_pilon	+	1542	4	Intergenic	novelGene_149842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.82842712474619	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	126	959	131674	143078	FALSE	20	AAAGATTTGTTCCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCEDMLLCNYRKCRLKLSGYAWVTACSHIFCDQHGSGEFSRSPAICPACNSTLSGKLDIVRTELSPSEEYKAMVLAGLRPEIVLDISSRALAFWTYQVHQERLYQEYNFSKAEGHLKQMEKIYTQQIQSKDVELTSMKGEVTSMKKVLEEYKKKFSDISEKLMERNRQYQKLQGLYDSLRLRNITIANQEGTLEPSMIAQSGIFGFPLGNNSKFPLDNTPVRNRGGGDGDFQFRPFFVGSPTAPEPSNSFFSFASPSRELEHQQVSSRAFKVKRV	130308	143661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_130397_131636_131971_138304_138639_142875
807883	contig_12689_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_145071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTCTGTGGAAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598654	597756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_597800_598700
807884	contig_12689_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_145069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAAGGAACTAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596078	595720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_595700_596100
807887	contig_5316_pilon	+	1068	3	Intergenic	novelGene_61229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	467.5	202	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTTCCAAAATAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450355	474690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453775_453972_474052
807890	contig_3410_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_58963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	493	792	413882	414181	NA	10	CCTTTCCCTATTGTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGIRFGSTEKNRYSLLFKCSLLILAVRQSVNWGMWIGAPVMGGVGHGWELAKLCAHSGCTVLCLAYHQVGDKEDQWISSTKLVVIAKECSKLSRIQM	413389	415307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_413400_415300
807892	contig_15939_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_160256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTTTAGATAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76254	77008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_76300_77000
807896	contig_3960_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_138031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTCTGTAGGTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548503	549962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_548500_550000
807897	contig_11855_pilon	-	846	6	Intergenic	novelGene_66903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	286.500541011706	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	248	706	738197	733972	FALSE	15	TACCATCTCTTGTGCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAPHRKQRVGRSIPSSFLVPAPCRSPTGSALPRDPCRVPSAPLGICTGAAASGPGRAEAAEKPRVPWRLAEGPARPVAARTMANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738672	733831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071_738202_738329_738515_738614
807901	contig_14575_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_101904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAGAAAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62927	63887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_62900_63900
807904	contig_9070_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_171955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGAAGGGCCCAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199309	200359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_199300_200400
807905	contig_9070_pilon	+	776	6	Intergenic	novelGene_171956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCCTGGAAGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200712	212075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_200886_204870_204994_205822_205877_206912_207082_209898_210022_211941
807906	contig_6829_pilon	+	1811	4	Intergenic	novelGene_123772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61321	74194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_61940_63347_63503_70418_71149_73886
807909	SIRV6	+	426	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	256	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1559	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
807912	contig_11986_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_69240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATGTCTCAAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798301	796483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_797550_798142
807917	contig_12050_pilon	+	1455	2	Intergenic	novelGene_62681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	239	766	467327	470619	FALSE	25	AGGGTCAGAGTGGGATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQAPGWGSNLDQAQACCSRGWYTAGMQYTRAHSGAPSQVLQPTAQPGDRQVHRYRVAGGSSQGGPGRTMHASCWTLSVCVHMSFKAKRLTRASGVNLQFAFALKVSQRSCHPCAFQRQPRARGRGQSPPQLRGGRERRVVRAGCPQLCRCQYVLPHPDLAPLNRAGCGFTPSRA	467088	471308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_467670_470434
807920	contig_10734_pilon	-	700	6	Intergenic	novelGene_51317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	63	junction_1	49.1471260604321	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	137	700	1469395	1466743	FALSE	5	CCTGCTCCCGCCCTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYHKWRTYFKKRLQQHKDEDLSSLAQDDDTLYWHKHGDGWKTPVPMEEDPLLDTDMLMSEFSDTLFSTLSSHQPVAWPNPREIAHLGNADMIQPGLIPLQPNLDFVDTFEPFQDLFSSSRSMFGSMLPTPTPAPAPDPIRLPAQENILPTATLPTVSLQDSFIGPTATASLDPSEQQSCDHGPRTGDPYVQPTDFGALDPPLSVPQPFLPIFTMPLLPPSPAPTPASPTLPLT	1470296	1466742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1467010_1467931_1468024_1468533_1468624_1469280_1469453_1469781_1469824_1470259
807921	contig_10629_pilon	-	2058	19	Intergenic	novelGene_52936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	272.274127704569	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	20	841	383003	370441	TRUE	20	GCTGCCACTCACAGCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYYPA	383022	356363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_356395_357347_357457_357911_357973_359037_359122_360253_360328_360849_360986_363537_363644_364297_364490_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372217_372258_372880_373047_374990_375096_377674_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
807922	contig_10904_pilon	+	2542	8	Intergenic	novelGene_22518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	162	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCCTTGCTCCAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346086	362527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_347435_348716_348866_349530_349624_349922_350117_351959_352142_353959_354254_354559_354695_362380
807923	contig_602_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_134926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTTTATAAAACAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50297	51495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_50300_51500
807926	contig_8020_pilon	+	2781	7	Intergenic	novelGene_114441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7.80313327381308	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	330	1340	321966	331625	FALSE	20	CTGGATGCTGTAAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNPALAGELATLSPPDRLIYNGTSRATQFPDGVDVRVPGFGQTFSLEFLDPSKSSVGSYFHTMVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317344	333066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_321514_321672_321945_322006_328260_328396_328645_328745_329219_329445_331113
807928	contig_6805_pilon	-	2334	6	Intergenic	novelGene_163899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	41.4584128977461	57	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	1389	2318	446300	432794	FALSE	20	TTCCCATCTGGAGAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGRGRTSRMRRRKLCKSSESRGVNESYKFEFIELKKWLKDRKFEDPNLTPARFPGTGRGLMSKTSLQVGQMIVSLPESCLLTTDTVIRSYLGTYVTKWKPPPSPLLALCSFLVSEKHAGDQSPWKPYLETLPKTYTCPVCLEPKVVNLLPRPLRAKAQEQRAHVQEFFTSSRDFFSSLQPLFSEAVESIFTYSAFLWAWCTVNTRAVYLRHRQLGCFSAEPDTCALAPYLDLLNHSPGVQVKAAFNEETRCYEIIAASSCRKHEEVFICYGPHDNHRLLLEYGFVSTRNPHACVYVSRGWNQLWFYQ	447688	432777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_432998_434586_435017_436785_436875_440054_440093_442598_442695_446227
807929	contig_1443_pilon	-	1258	8	Intergenic	novelGene_28309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	346.085809814708	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	135	533	776427	750475	TRUE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSSFDLDYDFQRDYYDRFLLLLLLLGL	809443	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748990_749254_749349_750369_750509_766777_766826_767479_767556_776186_776514_809395
807931	contig_11986_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_69180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	452	772	559782	560102	NA	20	GTTGGAACTGACTCCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHHRGRTAGPGQPGGHLWRAGGQQGTQRFPTSYLRQALMPQCPQVLGSWGCKVDSRSPGGSGQGARDPALCCSSSSSCPQPTSCEVGSSHHCTPGRCKFTPLHSS	559330	560531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_559300_560500
807933	SIRV6	+	558	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	13	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
807936	contig_13700_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_68287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTAGGAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136142	134341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_134300_136100
807937	contig_12353_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_165776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	1146	1562	141265	140849	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRILKEIKENTDKTLEEFRKTIQEQNDKINRQLETIQKQQLEIQKINNKVSEIGNSVEGHRSRIESIEERISKIEEKSLVGFELLTFQLAAKCLTTVPSGQPKLGKDTTKKENYRPVSLMNVDRKILNKILANRIQQH	142410	140846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_140800_142400
807938	SIRV7	-	259	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146660	1	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
807940	contig_10734_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_51034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	55	834	385659	384880	NA	35	AACAAGGTTGGAGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLAQSRRYLNACSYPSQNMNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	385713	384817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_384800_385700
807943	contig_7180_pilon	+	2055	2	Intergenic	novelGene_169042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207162	211191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_209036_211009
807944	contig_10014_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_174562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAACAATATTTAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33026	34788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_33000_34800
807947	contig_1575_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_45185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATACACTGTTACAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162850	163915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_162800_163900
807948	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	102	0	-85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
807949	contig_6227_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_49647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420717	422692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_420700_422700
807951	contig_18613_pilon	+	828	5	Intergenic	novelGene_80220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1026.15285776535	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	100	483	24385	31020	FALSE	5	TATGGTCTTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPL	23715	31365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28631_31013
807952	contig_4962_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_107378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAATTAGACATTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133982	131819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_131800_134000
807955	contig_4678_pilon	-	1313	8	Intergenic	novelGene_126025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	22.5288930133765	209	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	421	1032	340016	338487	FALSE	10	GACGTTCAGCCCCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQRVDVKVVMLGKEYVGKTSLVERYVHDRFLVGPYQNTIGAAFVAKVMSVGDRTVTLGIWDTAGSERYEAMSRIYYRGAKAAIVCYDLTDSSSFERAKFWVKELRSLEEGCQIYLCGTKSDLLEEDRRRRRVDFHDVQDYADNIKAQLFETSSKTGQSVDELFQKVAEDYVSVAAFQVMTEDKGVDLGQKANPYFYSCCHH	340436	338205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_338552_338662_338726_338864_338916_339100_339201_339285_339354_339459_339539_339747_339817_339899
807962	contig_10549_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_110607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTACACATAGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163270	164292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_163300_164300
807964	contig_10345_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_158374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7013	7690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_7000_7700
807965	contig_11285_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_5750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTTGCACGCGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229316	1227309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1227300_1229300
807966	contig_18822_pilon	-	1699	3	Intergenic	novelGene_111745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	56	junction_1	1.5	79	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	220	522	440507	433913	FALSE	30	CATAACCATGAGTACGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFNLGSAYCLRSEYDKARKCLHQAASMIHPKEVPPEAILLAVYLELQNGNTQLALQIIKRNQLLPTVKTLSEMRKKPVFQPVHPIQPIQMPAFSTVQRK	440726	432735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_434068_435018_435095_440435
807968	contig_10437_pilon	+	1017	3	Intergenic	novelGene_38184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	13	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	123	581	206866	208508	FALSE	5	GGTCTGTTGTTTGCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAPQLALSSSLQSHLYLLVTDQGFLQEEQVVWESLHNVDGDSCFCDSNFHLSHSLVRGPEAEGGSGSPEKQRQVDQDYLIALSLQQPQGTLGLSDLELAQQLQQEEYQQQQAAQPVRTLVPSPQGRGSASGRPAGERRQRPKQESDCALL	206743	208944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_207100_207432_207577_208427
807969	contig_3155_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_26346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141870	141672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_141700_141900
807970	contig_15752_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_148784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACCTCATACGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355533	354207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_354200_355500
807972	contig_10013_pilon	+	1619	10	Intergenic	novelGene_125091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGGCCAGGTGGAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520234	528434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_520697_521563_521665_521798_521962_524052_524146_524238_524296_524434_524498_524714_524778_525330_525803_526931_527049_528406
807974	contig_16907_pilon	+	1818	15	Intergenic	novelGene_87468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAACAAAGATACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480601	518383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_480712_482740_482841_485630_485693_489784_489851_491537_491623_493503_493608_495044_495149_499435_499599_502081_502230_503136_503294_505626_505805_512218_512366_514183_514277_516853_517026_518254
807976	contig_16098_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_46031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAAAGTACCGGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348297	349464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348522_348849_349064_349174_349233_349348
807977	contig_4426_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_15353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAACTGAGTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26940	25534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_25500_26900
807979	contig_1867_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_54527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTACATTTATAGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229368	231305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_229400_231300
807980	contig_3424_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_55460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	679	1083	98255	97851	NA	40	ATTGACCTCTGGGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRQVQIHVFVLIISMKIQQILLCLSRALLSIAQQVLSRCCLLHPQCPCEVVTGGSRDGFSILQMRKLKVNFRSVVLNLGRILNTPREVVKNPDGRVRYQTNISESQGQNQASVFFKCTRFQSTAQVENHWLR	98933	97728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_97700_98900
807981	contig_3424_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_55459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTTCAAGTCCCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97627	96681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_96700_97600
807983	contig_20844_pilon	+	1505	12	Intergenic	novelGene_78590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	56.1460609953117	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	25	1185	198086	201406	FALSE	15	AGCGTTTCTATCAGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRKRSRHQKRARAQAQLHNLEAYAAQPHSFVFTRGRAGRSVRQLSLDVRRVMEPLTATRLQVRKKNSLKDCVAVAGPLGVTHFLILSKTETNIYFKLMRLPGGPTLTFRINKYALVRDVVSSLRRHRMHEQQFAHPPLLVLNSFGTHGMHVKLMATMFQNLFPSINVHKVNLNTIKRCLLINYNPDSQELDFRHYSIKVVPVGASRGMKKLLQEKFPNMSRLQDISELLATGAGLSDSEAEPDGEHNITELPQAIAGRGNMRAQQSAVRLTEIGPRMTLQLIKIQEGVGEGNVLFHSFVHKSEEELQTILAAKEERLRLKAQRQDQQAHNVQRKREQREAHKKKSLAGMKRVQAEADGDSDAEDPGAPPEAEPEREEDETCSLG	198061	201726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_198104_198191_198363_198877_198980_199172_199224_199329_199501_200059_200137_200329_200438_200536_200661_200756_200836_200943_201074_201155_201268_201388
807985	SIRV6	+	350	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	337	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1851
807989	contig_5894_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_83056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAAAAGACAAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568486	567063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_567100_568500
807990	contig_8587_pilon	-	1263	5	Intergenic	novelGene_159124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	39.8120584747888	234	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	176	442	325655	307667	FALSE	15	CTTTTTCTCTGGGAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETRGVHKAEPGSPVRVSAARGLPRPEVPHDRRSLPVRSLPWPEVSRGPRSPRPRGQPTMRLRSPGLFLLLLSGLQAEPSSGTKDKITDKPARPQEKNITVFIVFGILCVLVAVAVAAGWFYRNRRSSGSYIGALCAKPELKLTGHV	325830	306845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_307678_308817_308854_310615_310781_323141_323183_325641
807992	contig_5954_pilon	-	799	6	Intergenic	novelGene_28560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_5	203.982352177829	1955	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	165	653	861192	858737	FALSE	15	CCTCCTTGTTTCTGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIKVGDTLPSVVVFEGEPGNKVNLAELYKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAGALKAKGAQVVACLSVNDVFVTGEWGKAYHAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVPLFGNRRLKRFSMVIEDGVVKALNVEPDGTGLTCSLASNILSQL	861356	858590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_858843_858963_859026_859148_859188_859263_859396_859910_860046_861177
807993	contig_11678_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_160839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTATCGTTAATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207669	208799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_207700_208800
807994	contig_13112_pilon	-	1965	3	Intergenic	novelGene_98821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGATGTTGTCTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222149	211509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_212673_212921_213022_221447
807996	contig_11335_pilon	-	965	3	Intergenic	novelGene_104935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	35.5	244	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATATTGTTTTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420949	417726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_420501_420606_420764
807999	contig_10135_pilon	+	1334	7	Intergenic	novelGene_106582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	34.3288832067433	307	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	25	1062	25077	27694	FALSE	10	GTCCTGTGTTTGGACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLDRILRMVSAVSSCRTCSRSHRPRLGFIIRPRHQLLPLLLCPGLRIPRLSVLCAQPRPRAMAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKGSVVAAYRKTHLCDVDIPGQAPMHESDSTMPGPSIEPPVSTPAGKIGLAICYDMRFPELSLALAQAGAEILTYPSAFGFVTGPAHWEVLLRARAIETQCYVVAAAQCGRHHQKRESYGHSMVVDPWGTVVARCSDGPGLCLARIDLSYLRQLRQHLPVFQHRRPDLYGSLGHPLS	25052	27966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25130_25663_25763_26029_26285_26387_26492_26718_26853_27021_27148_27427
808004	contig_10801_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_74044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGGAGAAGGGGAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274400	275089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_274400_275100
808005	contig_6589_pilon	+	620	5	Intergenic	novelGene_26148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	10	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	23	499	1885124	1887829	FALSE	30	ACAGACCAGACTCATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885101	1887950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
808006	contig_10734_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_51366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGAGTTGCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1786265	1787987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1786300_1788000
808007	contig_5836_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_106270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAACAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22512	24657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_22500_24700
808008	SIRV6	+	348	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	30	-1	-30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
808011	contig_16831_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_134805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533381	534677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_533400_534700
808013	contig_10732_pilon	-	1367	11	Intergenic	novelGene_114742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	5.3665631459995	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	11	931	558188	534779	FALSE	15	GCCACGCTCGTTCATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHAESRWDEAPWKKLSEEELETQYSPSRWVVRLGAEEALRTFSQMGAQATRQARASRRSLLHVPYGQGDGEKLDLYFPDGVSEALPFFVFLHGGYWQSGSKDTSAFMVDPLTSQGVAVVIVAYDIAPKGTLYLMVDQVTRSIAFLQKRYPSNKGIYLCGHSAGAHLAAMMLLANWTEHGVTPNLKGLFLVSGVYDLEPIMHTSQNDPLLLMWEDTQRHSPQLLLQAAPKPPVAPALPTLVIVGQHDSPEFQRQSREFFQVLCRGGWKATFEEIPNVDHFEIIENLTQKGYVLIQIILGIIFQQS	558198	534342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_534812_537862_537968_538375_538518_538606_538686_539643_539742_539941_540015_540100_540187_541444_541494_541579_541685_556001_556093_558128
808017	contig_8069_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_136776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAAATTATAACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414001	415118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_414000_415100
808023	contig_13894_pilon	-	976	3	Intergenic	novelGene_62049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	257.5	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	250	900	287445	286290	FALSE	15	AGTACTTCTGCAGGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288289	286213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286847_287351_287538_288132
808024	contig_15706_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_172038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATAGAAATATTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57995	59551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_58000_59600
808027	contig_6740_pilon	-	2061	1	Intergenic	novelGene_142648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14909	12848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_12800_14900
808028	contig_8683_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_150253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACCCCTGATTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584817	584385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_584400_584800
808030	contig_12951_pilon	-	2066	4	Intergenic	novelGene_68249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	9.97775303139718	131	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	579	623	841878	841834	FALSE	10	GTGGTGTTTCATTTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHSYLQKQSVSDLEKHFTQLTKEVTLIAELQCAGQARAVKKLQGKRLGQLQPLPQTLRAWALLQLDGPPRVCRAASSRLASAARNKSFREKALLFYTNALAEADPKLQQAACVALKHLKGIESIDQIASLCQSDLEAVRAAAREATLSFGKVPPPTLRSALWSRGPYRRRAKKTQPSATTGAISNPSAESASMCNCILANAGFLHG	845899	840390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_842098_843511_843596_845148_845352_845827
808031	contig_2219_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_67162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATAGTGACCCTTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59851	59306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_59300_59900
808033	contig_2219_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_67161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATATTTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58376	57710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_57700_58400
808035	contig_12427_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_40590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTGCTGGCGCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623864	623386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_623400_623900
808036	contig_8864_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_135969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGCAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78129	77366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_77400_78100
808038	contig_12485_pilon	+	2188	3	Intergenic	novelGene_147287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1247	1627	203197	203577	FALSE	75	AAAAGAAAAAAAAAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFFFFSYCCKDIDNTAFANSALCACTIQRDQLHLSCCTRHHQCPSLNFPPPYTESAIGARATWSGTCPSQLVNHSHLRPILPLPPSPVSDYNPSHTGRQAGTDALLYTAVTFKGPGVITPVRKTR	142613	204138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_142869_165141_165265_202328
808043	contig_16098_pilon	+	1206	10	Intergenic	novelGene_45903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	40.3506237808807	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	374	1123	328217	336931	FALSE	15	CCCCATTACCTGCATCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294677	337014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306428_306572_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
808045	contig_91_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_127115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAGACTATTCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434859	435487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_434900_435500
808049	contig_5954_pilon	+	1064	4	Intergenic	novelGene_28815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	54.4691553898983	628	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	364	852	1530879	1556854	FALSE	0	TGCCTTGGTCCGGTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALIPEPRPGDLIEIFRPFYRHWAIYVGDGYVVHLAPPSEIAGAGAASVMSALADKAIVKKELLYDVAGKDKYQVNNKHDDKYLPLPPSKIIQRAEELVGQEVLYKLTSENCEHFVNELRYGVSRSDQVRDVVMTAGIAGVGLAAIGLIGIMFSRNKRQKQ	1530515	1557066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1530894_1542641_1542745_1547935_1548205_1556752
808050	contig_12842_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_168350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACGGATCTCCTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188283	186741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_186700_188300
808052	contig_8744_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_173638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1048	1383	17608	17273	NA	25	CCAGCATTAATCCAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQRNCIQPVFYWQYLVNGPLILILSSLSSEQLVENRKLKREGQYFLQETGSQTNECDIKLQTKLMACQEVLMSIRFQDCETWTCHGCNITFHEPISLVSLAFHTEHYMAK	18655	16566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_-_16600_18700
808054	contig_8812_pilon	+	1483	7	Intergenic	novelGene_57261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	94.9923973566072	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	152	637	15339	22770	TRUE	5	TTTGTATTTGGTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKDADDSLSEWQDINLEELETLESSLLEQQNSLKAQKQQQERAAATVTGQMFLESQELLRLFGIPYIEAPMEAEAQCAILDLTDQTSGTITDDSDIWLFGARHVYKNFFNKNKFVEYYQYVDFHNQLGLDRNKLINLAYLLGSDYTEGIPTVGCVTAMEILNEFRGHGLEPLLKFSQWWHEAQDNKKIRPNPYDTKVKKKITEVATHAWFP	14846	25782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_14896_15236_15357_15519_15734_17209_17355_22661_22864_23482_23568_25114
808055	contig_11338_pilon	-	1475	11	Intergenic	novelGene_6231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	109.81024542364	1	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	682	1350	13877	12549	FALSE	30	TATTATGGAAACCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR	21381	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12566_12646_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14565_14713_15095_15193_16641_16770_17075_17288_21286
808056	SIRV6	-	296	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1319	415	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGAAGGCGGCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3139	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1747_2791_2828_3105
808058	contig_8312_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_152918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATGAAAACTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590223	1589089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1589100_1590200
808061	contig_11932_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_85419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTCAATCCAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330436	328767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_328800_330400
808062	contig_6710_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_98212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCCTGAGGAAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653485	653876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653500_653900
808063	contig_8017_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_65349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTTCACACTACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882457	882706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_882500_882700
808064	contig_8017_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_65347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGACAGTTATTTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882269	880819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_880800_882300
808065	contig_10855_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_124349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTGCACCCAGATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569031	567497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_567500_569000
808067	contig_3960_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_138042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAAGAAAGCTCTTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686819	687158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_686800_687200
808068	contig_12566_pilon	+	1701	6	Intergenic	novelGene_86016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121.670703129389	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1012	1578	78924	86354	FALSE	30	TATATCTAACTCTTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	77854	86477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_78003_78060_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
808071	contig_12761_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_164046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCACTGCACCACCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52580	53611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_52600_53600
808073	contig_14651_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_157221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCTGACTTTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91403	93094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_+_91400_93100
808080	contig_2236_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_98678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15818	17482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_15800_17500
808081	SIRV2	-	473	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4400	34	3225	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
808086	contig_8606_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_159392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAATAAACAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40690	41855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_40700_41900
808087	contig_5515_pilon	+	1391	6	Intergenic	novelGene_52319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	908	1270	60873	63880	FALSE	15	GTTAGGATCCACCGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSGVSNQSSRRITPGCPPPAPTFHSSATSSGHAAESVEGNQPSTRFRGITLMATWSRSATRCPAKTVPKPPLAQEGAESVLGLKSFPILASWGRHGGHGGAREAPAEVWSTWRRRCAD	59300	64001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_59881_59978_60177_60743_60989_62830_62880_63554_63667_63794
808088	contig_9014_pilon	-	2116	10	Intergenic	novelGene_106730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	80.515622285981	2	120	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	40	465	46682	44513	TRUE	10	CTTGGGTTGTTACTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCELLRQS	51587	41316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42274_42831_42961_43054_43194_43275_43397_43480_43559_44086_44236_44434_44531_44785_45016_46504_46686_51551
808089	contig_6608_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_162534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACAACAACAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156821	158994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_156800_159000
808091	contig_8864_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_136011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATCAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747648	746082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_746100_747600
808092	contig_14184_pilon	-	928	4	Intergenic	novelGene_66583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.675405038571	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTGTGTTGTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126303	88544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89175_105848_105915_109168_109327_126229
808093	contig_12622_pilon	+	2071	6	Intergenic	novelGene_5797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	88.7251937163284	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	59	676	349741	404682	FALSE	5	CTCTATGGTGCTGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKVGLYQRTSTL	349682	406077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398346_398491_401825_401940_404556
808095	contig_2854_pilon	-	1348	4	Intergenic	novelGene_120835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	71.565044229397	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	592	891	274434	262691	TRUE	15	GAGCTCTTCCGTGACTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNVGGWCVLM	275025	257646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262717_264212_264421_274368
808096	contig_9698_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_82492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1053	1466	154044	154457	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILQCMLIVFLSVRLACCYHGGRVYSSSFSCFKHTVYSFSETPGIIPLLLQCPMSSTFPLFISHRAHSSCNSLSFPLPPGWYRLLKNSTVSSTTNSSTTNRKVRSSGSPRGTSEERPGDLLLKNQPLKTLWSTVLL	152991	154735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_153000_154700
808098	contig_9189_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_165131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498573	497027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_497000_498600
808099	contig_12079_pilon	-	748	5	Intergenic	novelGene_67390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	3.96074487943871	1873	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	34	375	471245	462454	FALSE	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGGGDGAGGKMEDYQAAEETAFVVDEVSNIVKEAIESAIGGNAYQHSKVNQWTTNVVEQTLSQLTKLGKPFKYIVTCVIMQKNGAGLHTASSCFWDSSTDGSCTVRWENKTMYCIVSAFGLSI	471278	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_462525_462981_463060_463673_463798_467104_467147_471218
808100	contig_5549_pilon	-	1913	3	Intergenic	novelGene_81652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	681	junction_2	105	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACATCTGGAAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444658	441974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_443683_443958_443989_444483
808102	contig_10404_pilon	-	1228	2	Intergenic	novelGene_138715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253315	1251252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1252297_1253131
808103	SIRV2	-	449	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4424	34	3249	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
808104	contig_18869_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_56383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
808109	contig_14441_pilon	-	2042	3	Intergenic	novelGene_100458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1634	1957	87387	87064	TRUE	5	GGGCTCTCGGCATCCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEPAPAFCSEKMWLHLAVDSLLAHRYTEDWLGLANPRVREKPPFVFLETLYPSRASPFSVLSTSYEHGSAAAPKLGLVDTRTFCLVHSSKTLFSDLLTEYLGVWIT	89541	85399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_85470_87048_88876_89396
808111	SIRV3	+	317	3	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	3	4164	3	-1943	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8205	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTGTCTGCTATCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	4775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574
808113	contig_10774_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_158686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGACCCTTAAACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56805	58827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_56800_58800
808114	contig_7318_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_152224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270025	270969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_270000_271000
808116	contig_4442_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_127960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAAAATTTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355029	1355843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_1355000_1355800
808117	contig_15752_pilon	-	2169	12	Intergenic	novelGene_148771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	561.449275764248	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	187	1620	404541	327884	FALSE	10	TTTCTCCCTCACTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAMLETPELPAVFDGVKLAAVAAVLYVIVRCLNLKSPTAPPELYFQDSALSRFLLKSCPLLTKEYIPPLIWGKSGHIQTALYGKMGRVRSPHPYGQRKFITMADGATSTFDLFEPLAEHCVGDDVTMVICPGIANHSEKQYIRTFVDYAQKNGYRCAVLNHLGALPNIELTSPRMFTYGPQPSLPSPHGLTEGNIHGLSGSPGHATGAMGSYTPSLCEHQAQHGRPSSCRGCTWEFGAMVNYIKKTYPLTQLVVVGFSLGGNIVCKYLGETQANQERVLCCVSVCQGYSALRAQETFMQWDHCRRFYNFLMADNMKKIILSHRQALFGDRVKKPRCLEDTDLSRLYTATSLMQIDDNVMRKFHGYNSLKEYYEEESCMRYLHRIYVPLMLVNAADDPLVHESLLAIPKSLSGKRENVMFVLPLHGGHLGFFEGSVLFPEPLTWMDKLVVEYANAICQWERNKSQCSDTEQVEADLE	440906	327334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_328081_330870_330956_332465_332536_333157_333269_334073_334167_343267_343452_356494_356651_360195_360364_367196_367373_404347_404549_407733_407836_440829
808119	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
808123	contig_165_pilon	+	1952	12	Intergenic	novelGene_117060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	388.332587284543	87	109	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	64	627	45144	61962	TRUE	25	GTGGAGTGTTTTTGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEGSR	45080	72445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_45165_55359_55465_56647_56753_58873_58996_60303_60428_61102_61179_61951_62058_62145_62211_63661_63758_64905_65066_69629_69716_71622
808124	contig_12810_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_145707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	311	388	630140	630217	NA	15	AGCACCTGTGTTTCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKIKRKTSFTSRRDLAICVCCCFALNTLGAAVLPCELCPSEDRVRKALCLPCFKCSQWHAVLVDAVSRDAFPWSEHWGRSSRNRADLRPTSSHLTSANWPEALMAPVVWPAAQKPSENRSSTATQCVS	629829	631395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_629800_631400
808125	SIRV4	-	237	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	368	12	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
808127	SIRV2	-	513	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	310	4	-310	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACAGTGGTTGTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
808128	contig_4974_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_161396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAGCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26121	24406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_24400_26100
808129	contig_13148_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_162927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGTAAAAATAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79710	80746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_79700_80700
808131	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
808133	contig_4686_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_118592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTAAACTTGGAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840785	841000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_840800_841000
808136	contig_6278_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_119810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360476	362421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_360500_362400
808138	contig_1443_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_28173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	105	569	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343644	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
808139	contig_14362_pilon	-	1005	9	Intergenic	novelGene_142501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGAAGAAGAACAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18629	4682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_4762_5189_5242_5399_5504_6337_6423_8670_8826_8930_9042_10254_10344_17251_17311_18358
808141	contig_10937_pilon	+	1723	6	Intergenic	novelGene_67296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.4258798253127	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	108	1568	35798	42004	FALSE	20	GGTATACATGCCCCTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVRSVLPFPRSLPSSLPANGSALQGQLGGREEKRQRVLAEEPWRQRQENEKHLVQGVGQGQHWLGPGHPRDCWGQKKAGSSEPPCRNPDIPAAV	33202	42159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33257_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40733_40892_41611
808142	SIRV6	+	235	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	497	51	497	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10734	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808150	contig_7728_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_64715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAATCAACAGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735555	734301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_734300_735600
808151	contig_9548_pilon	-	934	2	Intergenic	novelGene_141045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGTGGGTATATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44885	42083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_42918_44785
808152	SIRV6	+	436	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	19	4	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
808154	contig_21299_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_175751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATTGGCGTGGCGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3921	3520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21299_pilon_-_3500_3900
808155	contig_9389_pilon	-	822	9	Intergenic	novelGene_83958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.424276375821	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	17	649	215498	207870	TRUE	15	AACCGCGTCTGTGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ	215514	206832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_206955_207178_207215_207854_207936_208221_208301_208414_208474_208771_208853_209776_209893_213629_213805_215441
808156	SIRV4	-	488	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	129	0	-129	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	213	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATTTAAGCTAGCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
808157	contig_17768_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_140401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCCTGTAAATCTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72712	72371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_72400_72700
808158	contig_11248_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_142543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCACATAGGAAATAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184702	182677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_182700_184700
808159	contig_8710_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_73539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGTAGAAGCCTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465413	464858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_464900_465400
808168	contig_5954_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_28537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACCGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504901	505626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_504900_505600
808169	contig_15114_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_121106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACGCACCGCTCCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54724	56321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_54700_56300
808171	contig_11386_pilon	+	1096	6	Intergenic	novelGene_82790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	491.241692041708	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	55	678	17940	27749	TRUE	15	CCACTCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KINFHTGPSPLTARKGSEMASRQRVQKLDRMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	17885	32453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_17975_19644_19980_20816_21022_27700_27893_31990_32187_32374
808172	contig_6589_pilon	+	2535	5	Intergenic	novelGene_26197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	90.4474985834324	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	312	518	2012923	2013129	FALSE	60	AAAAAGAAGGTAAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPDRDSTLSPSAFILRAIQQAVGSSLQGELPNEKDGSRRHGLRWRRCRSPRSEPRAQESGGTDTATVLDLATDSFLAGLVNVLEPPDTWVPSRLDLRPDESEDMLELVAEVRIGDRDPVPLPVPSLLPRLRAWRMGKTGMWGQGGAVATGLREGQFVACSGNCSCDFVVYS	2011060	2015146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2011108_2011334_2011393_2012127_2012223_2012724_2012826_2012912
808173	contig_5832_pilon	+	1214	3	Intergenic	novelGene_134113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	62.5	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	36	422	28124	55089	FALSE	40	CCTAACTGCGTTAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREAAGRAGPDMAEEEVAKLEKHLMLLRQEYVKLQKKLAETEKRCTLLAAQANKESSSESFISRLLMIVADLYEQEQYSDLKIKVGGRHINAHKFVLAARSDSWSLANLSSTQELDLSGEPLAGQGLKTASARTLGRRL	28088	55881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_28134_47435_47629_54905
808174	contig_9995_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_47659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATAGTGACATGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120789	119621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_119600_120800
808178	contig_14814_pilon	+	632	3	Intergenic	novelGene_137714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1173	junction_2	77.5	171	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	68	364	279456	283542	FALSE	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGPRYPPAVCSAPIVPKLAAEMLCGGPSATRPATAETQEIADQVKPQVEEKEKKKFPVFKAVEFKSQVVAGTNYFIKVHVGDENFLHLRVFQSLPHEQRPPALVDYQTDKTRHDELVYF	279388	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_282889_282992_283413
808180	contig_13051_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_140135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTACTACCCTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425962	426653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_426000_426700
808181	contig_211_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_129886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAGTATTTAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345205	345421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_345200_345400
808182	contig_2987_pilon	-	1521	4	Intergenic	novelGene_125864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	264.958277637988	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	196	1293	545821	539422	FALSE	30	ATATACCTGCAATGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSVRRLLLVAGCALALVLAVQLGQQVLECRAVLAGPRSPRRVMRPEQEELVIVGTNHVEYRYGKAMPLIFVGGVPRSGTTLMRAMLDAHPEVRCGEETRIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVSARAHMKMGSRASAGAA	593482	539193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_539678_544979_545901_553777_553850_593438
808186	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808188	contig_14744_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_66107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519299	1517909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1517900_1519300
808193	contig_5780_pilon	-	2588	14	Intergenic	novelGene_29803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	35.2045586074526	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	90	2114	183256	117335	FALSE	10	CGTTTCTTTCCACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSYTVTVATGSQWFAGTDDYIYFTLVGTAGCSEKHLLDKPFYNDFERGAVDSYNVIVDEELGEIQLVKIEKRKYWLRDDWYLKYITLKTPYGDYIEFPCYRWITGEGEIVLRDGRAKLARDDQIHILKQHRRKELETRQKQYRWIEWSPGFPLSIDAKCHKDLPHDIQFDSEKGVDFVLNYSKAIENLFINCFMHMFQSSWSDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDSMFGYQFLNGCNPVLIQRCRKLPEKLPVTTEMVECSLERQLTLQEEIEQGNIFIVDFELLDGINANKTDPCTHQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQVPGDKNPIFLPSDAKYDWLLAKIWVRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQLICEYGLFDKANATGGGGHVQLVHRAMQELTYISLCFPEAIKARGMDSTEDIPYYFYRDDGLLVWEAIKKFTAEVIGIYYESDQVVEEDQELQDFVKDVYVYGLRGRKASGFPSSIKTREMLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFSQYDWCSWIPNAPSTMRAPPPTAKGVVTIEQIVETLPDRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLDTIVSVIAERNKEKKLPYYYLSPDRIPNSVAI	183345	116860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_117515_118059_118231_118619_118721_119105_119228_119544_119724_121292_121380_122016_122221_128336_128484_134216_134390_135378_135486_144378_144502_165648_165731_175445_175645_183106
808194	contig_12050_pilon	+	924	9	Intergenic	novelGene_62635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	182.280990163538	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	37	714	357478	363762	FALSE	5	GCCCTCTGTCTGTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAERAVLEEEFRWLLHDEVHAVLRQLQDILKEASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLGWISSPFPC	357441	363972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360847_362036_362184_362571_362656_363729
808195	contig_6902_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_135616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGATCAGCTCACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546372	544430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_544400_546400
808199	contig_20374_pilon	-	1423	10	Intergenic	novelGene_166013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_9	61.5078033792722	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	199	1326	20872	3786	FALSE	30	TTCAGTACTAATATAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISNFPVLQMHKSQTAMRASQKDFESAVNQMKLLTKDPGNEMKLKLYALYKQATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLRDFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDIVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYMFPKIMGSAKAAEMLIFGKKLTAREACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAYSKLPPNAMRISKQLIRNVEKEKLHAINSEESSVLQGRWLSDECTNAIMNFLSRKAKL	22885	3688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128_5273_6728_6819_8068_8190_8942_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_20713_20877_22691
808200	contig_1813_pilon	+	2205	13	Intergenic	novelGene_105478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	363.273045456934	68	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	433	978	131019	150040	TRUE	15	AGGGAGGGGGGGTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSMLSKSSKNKQGTVGVEYFERWRHYISVKETNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPVLQNTWPLRWWRSSRMRLLFMTSAVTCGAWAWSSTSC	102756	155794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_113656_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138160_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147690_149930_150119_152059_152225_153457_153502_154854
808201	contig_6102_pilon	+	423	3	Intergenic	novelGene_31981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3008	junction_1	243	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414628	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414788_414877_414956_416018
808202	contig_3382_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_124081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	54	437	458278	458661	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHQRLSVLIYGFGICSCSTTVGMLLSYRQAKPKLPGGRDHGACIPHEPCSTGGPTRVCPVSGEPPSAFQETPHLSHPTSGLCAPVTPCLATAHNCSRLCIPPVCFSKLLVLPRVSGCPFYLPRT	458224	460446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_458200_460400
808205	contig_7410_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_106050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTCACTGGGATGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68564	67115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_67100_68600
808207	contig_12701_pilon	+	1316	7	Intergenic	novelGene_169553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGGGAGAGCTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26285	52393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_26578_29682_29813_30468_30610_33152_33253_35586_35717_40226_40573_52216
808208	contig_12884_pilon	+	1471	3	Intergenic	novelGene_104978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	36	425	622313	623640	FALSE	40	AAACCCCATGATCATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPECSPVRGSVVPVRREDAGVQSCPWERRPCQRTRDSRADELLLLGRFQMPRSIPTAETCGAVRAAHPHNPKFLLKYTQGGAFETDKENSLFPSSKEEQRLREKSLWKEKGNFVGWNQHPRASSSHVKE	622277	624686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_622411_622584_622670_623433
808209	contig_13301_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_153114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTAGCCCGGCCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157496	158072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_157500_158100
808213	contig_5423_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_85163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCTCTTTATAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51053	51685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_51100_51700
808217	contig_16776_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_130525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTGTAGGACACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44825	45220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_44800_45200
808222	SIRV6	+	297	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	591	171	412	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
808224	contig_1339_pilon	-	1497	8	Intergenic	novelGene_163117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	7.90504876128967	108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	192	1286	308072	295093	FALSE	15	TCACTGCCACCTTTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQRSGGNRLPLALPSASQGCSTGAGGSSAGTSGSPPASGNPPPPRNLQGLLQMAITAGSQEPDSPPEPMSEERRQWLQEAMSAAFRGQREEVEQMKSCLRVLSQPTPPAAGEADLAADQQEREGALELLADLCENMDNAADFCQLSGMHLLVGRYLEAGTAGLRWRAAQLIGTCSQNVAAIQEQVLGLGALRKLLRLLDRDACDTVRVKALFAISCLVREQEAGLLQFLRLDGFSVLMRAMQQQVQKLKVKSAFLLQNLLVGHPEHKGTLCSMGMVQQLVALIRTEHSPFHEHVLGALCSLVTDFPQGVRECREPQLGLEELLRHRCQLLQQQHEEYQEELEFCEKLLQTCFSTPTDDSMDR	308596	294881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_295168_295252_295368_296766_296864_296977_297134_299134_299360_302453_302659_307850_308168_308500
808225	contig_12543_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_168364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGTTAAAACTTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187688	189657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_187700_189700
808226	contig_7202_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_18940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACGACCGCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30110	29911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
808228	SIRV4	-	298	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	70	1153	-70	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTGTAATCGATTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
808229	contig_15327_pilon	-	1176	7	Intergenic	novelGene_70479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	193.665877795295	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	64	387	390867	379051	TRUE	10	TTATGTACTGCTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKGEGDIHVQ	390930	372574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_374889_375249_378885_379059_380246_380266_381621_381720_382830_382974_390811
808230	contig_6654_pilon	+	647	6	Intergenic	novelGene_85755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	155.072112257491	23	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCCAGCATTCTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573078	616845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_600119_600348_602764_602802_613656_613874_616762
808231	contig_12969_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_61677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAACAAATAAGGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399652	398668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_398700_399700
808232	contig_9955_pilon	-	923	7	Intergenic	novelGene_21344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34.9511563947938	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	33	764	113724	86976	FALSE	25	AACTTGTTTAAGTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	113756	86816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91286_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113655
808233	contig_12654_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_129252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTCGTAGTCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35873	34878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_34900_35900
808234	SIRV5	+	399	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_3247_3405_3483
808235	SIRV6	+	426	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1640_1736_1845
808236	contig_253_pilon	-	692	6	Intergenic	novelGene_129683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	815.859154511365	336	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	93	617	421711	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421803	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
808237	contig_1516_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_49913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGTTTCATGGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52400	54250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_52400_54200
808238	scaffold_12124_pilon	-	970	4	Intergenic	novelGene_22111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	1076.111621637	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	75	758	899419	894260	FALSE	0	GTGTGCTTCTCTGCGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGGS	899493	894047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894269_895203_895281_895908_896396_899308
808242	contig_12090_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_80500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGCAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246867	246625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_246600_246900
808243	contig_11543_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_175753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	299	604	136086	136391	NA	50	AAAAGCATCAAAATATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRELPHVVLHFSYLLIRQSKNILHFFHLSLLSLQSISKILQLFQQACVCSLLGTCLHHTPTLSQLLVLSIVTEETNIQQEEPKLGVQFGEKHHLVTRMSN	135787	136549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_+_135800_136500
808244	contig_11543_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_175754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAATTGGCTTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136623	137629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_+_136600_137600
808245	contig_5899_pilon	-	2526	1	Intergenic	novelGene_146971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATCAATCAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82756	80230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_80200_82800
808249	contig_15123_pilon	-	841	7	Intergenic	novelGene_110931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	70.7454356596004	910	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	192	557	320397	318930	FALSE	10	CCCTTTGTCTATTCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI	321831	318645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319292_319627_319688_320277_320408_320544_320630_321613_321683_321804
808251	contig_8660_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_136482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTCTCTCAAAGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65185	66451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_65200_66500
808252	SIRV6	+	519	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	173	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
808254	contig_13097_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_107672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38293	36555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_36600_38300
808255	contig_15066_pilon	+	1758	7	Intergenic	novelGene_149555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	61.3878833502363	162	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	4	510	114962	115468	TRUE	45	GCAACACGTTATAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMAALRAGQGAGWSLRGLRALGGIRWGKGPLLTPDLRALLTSGTSDPRARVTYGTPNLRARLSAGVPEPRPCLTSGTPDPQARLTAEIPDPRTREASGTPGTRPRVWLAVALGAGGAVLLLWGGGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGR	114958	118066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_115772_115860_116056_116270_116339_116465_116631_116789_116860_117518_117615_117715
808262	contig_4659_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_118210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCAATACAAGCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449879	451616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_449900_451600
808263	scaffold_17907_pilon	-	1978	16	Intergenic	novelGene_150759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCCCTTCTTGTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81647	33791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_-_33864_34288_34364_41626_41762_46174_46272_53604_53679_55152_55355_56657_56786_57274_57380_58385_58476_67566_67685_72984_73089_76861_76960_77365_77467_79542_79658_80186_80274_81270
808264	contig_13707_pilon	+	1675	4	Intergenic	novelGene_43577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGTTGCCATCGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272610	274861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_272980_273326_273835_273955_274038_274145
808266	contig_8050_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_114880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAACAAAGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449034	450928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_449000_450900
808268	contig_15465_pilon	+	2543	1	Intergenic	novelGene_175759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTTTGAAATGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15147	17690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15465_pilon_+_15100_17700
808269	contig_10904_pilon	+	1256	10	Intergenic	novelGene_22582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	228.772786087683	164	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	68	1003	439135	454029	FALSE	20	GTCCTCGGAGAGTGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARTQRQGPL	438408	454282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448399_454003
808273	SIRV6	-	197	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGAACAACTTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
808278	contig_10734_pilon	+	2276	3	Intergenic	novelGene_51455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	263	550	2222677	2222964	TRUE	15	CTGTTGTGTGAATTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCFRRQERAGRALQARTPQVPAPAQGCLADILPHLDVKGDPWRCCQELVLGGLGASTGKKTSHSHPPTTKKQAPRWLPPEIVAGRHVMFGVTVVKATEGVAGQAEGGGSVQVAFPLDLDAYDAPLCARGRWRARPQSASQRERRRAAGQRGPHLPPLPCPGSCVPRSPRFCPDGRWGRRDLF	2222414	2227128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2223203_2225533_2226169_2226275
808279	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_90540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
808280	contig_8195_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_170061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1	456	445486	445031	NA	50	AACATGCCACGAGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSAQSWFRGGGCLTYLPSPTFFTISDTSHFRHSTLYFSAGINNLLPWPHRTHTKLTVTWFIRKVSRQQLGIRINLEVTGLKANIFPQEGSSDLALSSICLLLLCSFCSSHPGSLGVPRPRESHSCLLLLLLQLTCRSSTRCLHGLSLVHS	445486	443203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_443200_445500
808283	SIRV1	-	234	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3870	0	3596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
808284	contig_7839_pilon	+	1580	8	Intergenic	novelGene_45679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	5.69998209807429	108	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	818	1342	103166	104122	FALSE	20	TACTTCTGTCACACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVPLGNQADVFPEGTIRPVHDDILIAQLRPGQEIDLLMHCVKGTGKDHAKFSPVATASYRLLPDITLLEPVEGEAAEELRQCFSPGVIEVQEVQGKKVARVANPRLDTFSREVFRNEKLKKIVQLARVRDHYIFSVESTGVLPPDVLVSEAIKVLMGKCRRFLDELDAVQMD	100452	104360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_100534_100655_100728_102183_102292_102512_103055_103151_103305_103491_103642_103738_103856_104003
808286	contig_5549_pilon	-	507	2	Intergenic	novelGene_81665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGAATCTTATTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473433	472876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_473253_473302
808287	contig_10549_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_110604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTACTTTTGTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154062	154796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_154100_154800
808290	contig_10600_pilon	+	2213	17	Intergenic	novelGene_169853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	35.7927519722918	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	52	1968	62873	83076	FALSE	10	CCTGGTTGTTGCACGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQAIPLKTLNAVASVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLHNIPYMGDEVLDQDGTFIEELIKNYDGKVHGDRECGFINDEIFVELVNALGQYSDDDDDDDADDPDEREEKQKDLEEPRDDKESRPPRKFPSDKIFEAISSMFPDKGTAEELKEKYKELTEQQLPGALPPECTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNTYKRKNTETALDNKPCGPQCYQHLEGAKELAAALTAERIKTPPRSAPGGRRRGRLPNNSSRPSTPTINVLESKDTDSDREAGAETGGENNDKEEEEKKDETSSSSEANSRCQTPIKMKPNAEPPESVEWSGAEASMFRVLIGTYYDNFCAIARLIGTKTCRQVYEFRVKESSVIAPAPAEDVDTPPRKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDGSSNHVYNYQPCDHPRQPCDSSCPCVIAQNFCEKFCQCSSECQNRFPGCRCKAQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISEYCGEIISQDEADRRGKVYDKYMCSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGEELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP	62821	83321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_62909_65562_65684_66458_66600_67404_67508_68087_68252_71742_71835_74975_75220_75621_75792_76202_76298_77150_77192_77588_77715_79397_79577_81110_81207_81532_81615_82172_82254_82327_82413_83015
808291	contig_14744_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_66114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTCTGTAAACCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566075	1567774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1566100_1567800
808292	contig_11631_pilon	-	1207	5	Intergenic	novelGene_104188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	39.4112927978771	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	23	550	139514	108521	FALSE	20	CCAATGTTGACTTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKIRDHRMPRNDPPDFLKNSLLESDSAFIGAYGETYPAIEDDALPPPSQLPSARERRRNKLKGLDFDNVHPNVPPDGLSLKSVSSINVDEVRMRNEERMRRLNELQTKPLNTDDESSLVDPDDIMKPVGDDGTNSVATEPWLRPGTSETLKRFMAEHMNQEQQQVPGKPGTFHWQGLSTAHG	139536	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_108733_110516_110656_114887_114998_135391_135456_139511
808293	contig_2550_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_135618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1013	1345	148909	149241	NA	80	AAAAAAAAAAAATAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGFGLGHFLSLSTFQITKKFPHPLHFLMPTLDPSIFLIPCVRVFVTLHSFTGLDLARLPQRRCIPLDCTKRSWENGWQFQNLVTIARMSTSHIRAPFTTRPPPTPAAG	147896	150011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_147900_150000
808294	SIRV4	-	206	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	408	3	-408	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTATCGGCGGCAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
808295	contig_7051_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_64301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191137	192427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_191100_192400
808296	SIRV4	-	301	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1217	3	1217	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
808300	contig_4125_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_25139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTTCTAGCTCGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835620	836349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_835600_836300
808303	contig_10494_pilon	-	980	4	Intergenic	novelGene_102181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_3	24.7521042876493	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058922	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057302_1058582
808304	contig_11281_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_125470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAATTTCACAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858129	857731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_857700_858100
808306	contig_2933_pilon	+	1353	2	Intergenic	novelGene_111315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	176	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTCTACCACTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333905	336952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_334505_336198
808307	contig_8954_pilon	+	1868	2	Intergenic	novelGene_130300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTAAATATTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186579	188504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_186820_186876
808310	contig_12635_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_60854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAAGATCTTTTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590312	590658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_590300_590700
808312	contig_4065_pilon	-	1854	16	Intergenic	novelGene_133405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGGCATGCGCGGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881048	819049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_819122_823798_823853_826629_826804_828778_828895_831593_831745_832757_832867_833854_833929_835625_835690_836993_837046_837986_838047_838327_838538_839034_839113_842860_842958_847361_847481_863325_863482_880780
808313	contig_7086_pilon	-	1679	8	Intergenic	novelGene_175761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.10391691639019	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	27	1211	177673	74247	FALSE	15	TTTGCTCATGACCCGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGRGSPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGVTLAGHQKKILNSIHSMRVQMSQSPTAMA	191028	73778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_-_74356_79110_79267_81763_81958_90112_90263_145383_145600_155800_156049_177561_177685_191013
808314	contig_7086_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_175760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAGAATGGCGTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73778	72900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_-_72900_73800
808317	contig_3787_pilon	-	771	4	Intergenic	novelGene_102415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	344.617984956612	4384	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	87	401	565100	561628	TRUE	10	GTCTGGTATGGCTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLPAPPLRLQASGFPGALAAAEGEPAVMAFSGPAAYLTHQQKVLRLYKRALRHLESWVIHRDKYRYFACLMRARFEEHKNEKDMVKATQLLREAEEEFWHCQHPQPYIFPDSPGGTSYERYECYKALSVTL	565186	559676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559901_561481_561649_562118_562312_564999
808318	contig_6503_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_145791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTGTTCTGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868543	869005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_868500_869000
808321	contig_3529_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_105333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467239	467864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_467200_467900
808322	contig_7004_pilon	-	1340	9	Intergenic	novelGene_126500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	81.1957511203634	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	527	976	433956	432521	FALSE	10	GCATTCAGGTCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGLSEDEALQRALELSLAETKSQVPSSQEEEDLALAQALSASEAEYQQQQAQSRSLKPSTCSLC	435037	432156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_432779_432853_433184_433253_433335_433397_433473_433570_433849_434002_434135_434268_434503_434636_434820
808323	scaffold_12510_pilon	-	1654	11	Intergenic	novelGene_151396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	382	789	409932	399405	TRUE	15	TCACCAGCAGCGGGCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATASADVECRKQWDKDWDERKDLLFEAVLLLMSASWISNSSTSSAEPESENCVESRELSWELLEVTQKPPCSVSWYPGNRFLVRICWRRRRIFCFSSWISLSLSSSSSSSSRHWLIMLHFISSMAAIKDSEMLK	412237	392537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_392659_393302_393830_397723_397821_398563_398673_399393_399603_400049_400152_409097_409161_409887_410019_410602_410751_411613_411678_412154
808324	contig_3193_pilon	-	1493	3	Intergenic	novelGene_126299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	62	junction_2	13.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2	454	61749	61297	TRUE	10	GGCGTCACTTTGTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPLPVPSQAAPSVLLGSPNSTANPLSGSPVCIAGEPQLHCQCPLRQPCLRCWGAPTPLPVPFQASLSALVGSPNSTADSLSGSPVCVVGEPQLHCQSPLRQPCLRCWGAPTPLIPSQAALSALLGSPNSTASPLSGIPICTGGEPQLHC	61750	46610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47329_50395_50448_61027
808326	contig_3747_pilon	+	1216	9	Intergenic	novelGene_24978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	49.1361310544491	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAGACCTTACATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260008	266659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_260094_260361_260422_260554_260898_261272_261410_261520_261641_262927_262994_263920_264147_265290_265391_266580
808328	contig_8616_pilon	+	839	10	Intergenic	novelGene_72379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_9	52.617651828551	669	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTACCTTGAGTGTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195756	199034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_196640_196862_196914_197236_197268_197609_197657_197845_198124_198540_198588_198825_198858_198952
808329	contig_14133_pilon	-	2505	22	Intergenic	novelGene_119898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	7.02764221499934	28	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	270	1100	94062	88667	TRUE	10	CGCTGGCACAGCTGGGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCSRKRRAFVISPSGSSWFWYCWLWVAKVGRVLVSPATKSRISFRYMSTATCKKAASLMRALGSRRGSRLKKASGSSLMCWSEATRSRTRPSPAPVSVNWKSANQGTFLLSRHSRISAQTSNVFRGSMASLGARYVESRPIIEKKKRNSTTSSRSKSSLFSSLLPCSLRACWMAKCKEAAKTQVGRGMGRVVSRERKLLARSLASASCCNARGSGLCECCFHWHVSTGSRHGHHSRAEVRIIGHSVWQVARVRLTSKGGSWPRRQVLRSPGRSVQ	94539	72724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_72796_73183_73310_73647_73713_74023_74121_74445_74637_75525_75623_80912_81088_82045_82122_83816_83946_84900_84985_87149_87309_87861_87957_88626_88685_88863_88969_89940_90053_90978_91118_92256_92322_92745_92849_93371_93445_93548_93708_94005_94101_94308
808330	contig_8801_pilon	-	1209	6	Intergenic	novelGene_66242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	41.8157864926633	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	122	577	199038	193594	TRUE	5	TCCTCAGCTTCTCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	204545	180721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_183962_184124_193584_193615_194487_194715_198830_199065_204450
808332	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
808333	contig_21208_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_175776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGCTGTACAAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44937	45390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_44900_45400
808336	contig_5057_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_151499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACATATCCATGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362340	360213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_360200_362300
808337	contig_2036_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_131818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGAGCACTTGGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590010	589046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_589000_590000
808339	contig_5684_pilon	+	1386	2	Intergenic	novelGene_81011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCATCCTGTTCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315056	317736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_316349_317642
808342	contig_5041_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_27096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTCTTTCGTAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570884	571283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_570900_571300
808343	contig_13863_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_42000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67162	65026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_65000_67200
808344	contig_9981_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_121059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	194	796	296823	296221	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGPLTRIGAKHERHIFLFDGLMISCKPNHGQSRLPGYNNAEYRLKEKFVMRKTQVCDKEDTCECKHAFELISKDENSIVFAAKSAEEKNNWMAALISLQYRSTLDRMLDSVLLKEENEQPLRLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPIIKGGTVVKLIERLTYHMYAGM	297016	295448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_295400_297000
808345	contig_13481_pilon	-	1603	10	Intergenic	novelGene_119422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	44.382178605582	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	651	1181	779744	765792	FALSE	35	TCAAACTCAAGGAGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISVLKNLPESLNSGRQQPAEGVTYAPKISAGKSCIKWEEQTSEQIFRLYRAIGNIIPLQTLWMDNTVKLLDLVEVNSSILADPKLTGQAVIPGSLMYHKQSQILLVSCKDGWIGVRSVMLKKTLTATDFYNGYLHPWYQTNSQAQPSQCRFQTLRLPAKKQQKKKIVAMQQCIK	785527	765369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_765990_768792_768876_769889_769969_772727_772820_778106_778183_779741_779845_781113_781213_783134_783345_785212_785298_785371
808346	contig_9629_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_171602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTACAACTACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66885	66590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_-_66600_66900
808350	contig_18859_pilon	+	1478	7	Intergenic	novelGene_150545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1050	1427	118513	148496	FALSE	55	ACCTAGAGAGAGAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFPVHFFQETRSQTISTLTYPENICLVFKKTDKIFIVGISPELGMIIIPKWSRATRLVTVPVQKLFKCSFHVTTCGFKLRDCNCVFHSHSESYLLSMKDLRKVFSIPVPCWPIKNHVTEDCRLL	97230	148547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_97833_97947_98058_111649_111729_114356_114535_118432_118563_131856_132058_148369
808353	contig_10861_pilon	-	1193	10	Intergenic	novelGene_39322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	308.600064808807	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	281	1171	1491130	1489353	FALSE	5	GTTTGGGCTTGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQALGQDRPRPGPACPPGLSHLALSAAGDNLVSCLFSSRLSIMNVSTALPLAAVGHLSLGRSAGEGVEPSEGPSLRCSLPLGGWAHLPFLLLPCRPGACRAGLRLKVSTSCPTHTSSPLLGQGGGGGGVVSRLLSPCGFWVFFLLCPGFQ	1493789	1489330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489721_1489941_1490021_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1492101_1492227_1493725
808354	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808355	contig_11250_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_127160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGACCAAAAATAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183036	182173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_182200_183000
808356	contig_19564_pilon	+	1729	5	Intergenic	novelGene_29651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	24.7727168473706	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	93	1727	19890	22511	FALSE	25	GAAGCATCAGGTACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDTQVIDWEADEEEETEQSTESVGCHLEPLGRLHIFSSAHGPEKDFPLYLGENVVGRMPDCSVALPFPSISKQHAVIEILALNKAPILRDCGSLNGTQILRPPKVLSPGVSHRLRDQELILFADLPCRYHRLDVPLPFASRGPLAIEETPRVQGGTRPQGLLLAEDSDGEVDSLSESCVVKDSRTTSSPLATVVPESDEEGASSARDGPGVPFAFSLNSDTDEEEGQQPASRQASSAARRGAPAEPEQSDVDGVTAELQLEKDQPLAKERDSDTKVERDAGNVVVPVGVILERNHPVGEDSDTDVDEDSRPPGRPPEGHLERGQLSGFIDSDTDVEEEGIPATPAVVPMKKKQIFYGVGMHGLRVPTLAHLQKSQAGGDADVEQGEAPVVVRLERSQGSMVINSDTDDEEEVLAALTLARLKESRAVTHHRDTDVEEDRSPPVVLLERSQTSTERDNGTDVEKEERCPVEKRQTILKGPTDKDGALVIAHSGKSQPPLRDDDIDMGEEKGSPGAHLERRQAFTTMDISTEVEEDVSLEPAVTHL	18131	22513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_18221_19886_20026_20647_21029_21114_21191_21469
808358	contig_9098_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_75799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAGAAAGATAAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273858	273217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_273200_273900
808359	contig_9098_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_75798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTCCCCCCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272977	271880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_271900_273000
808361	contig_9738_pilon	+	1829	15	Intergenic	novelGene_169261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	120.688501050076	15	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	818	1702	187746	214267	TRUE	5	GCCGGCTTTGTGATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVTFEQAIEAVQAISMFNGQFLFDRPMHVKMDDKSVPHEDYRSHDSKAPQLPRGLGGIGMGLGPGGQPISASQLNIGGVMGNIGPSGIGFGGLEAMNSMGGFGGVGRMGGLICCIIFSELYRGAVTSSMERDFGRGDIGISRSFGDSFGRLGGGMSSMNSVTGGLGMGLDRVSSSFDRVGPGIGAVLERSIDMERGFLSGPVGSGMRDRIGSKGNQIFVRNLPFDLTWQKLKEKFSQCGHVMFAEIKMENGKSKGCGTVRFDSPESAEKACRIMNGIKISGREIDVRLDRNA	173594	237631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_173798_180046_180256_181492_181559_182890_182985_186784_186945_187660_187795_188314_188365_188498_188563_202377_202480_205049_205119_205399_205526_207609_207819_207898_207951_214103_214280_237516
808362	contig_16831_pilon	+	1863	5	Intergenic	novelGene_134786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	17.4839211849059	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	4	342	96182	128859	TRUE	15	TTTACAGCGTTTGACTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMNGVINHNETIQWLYTLIGSKFRLVVKTALKLLLVFVEYSESNAPLLIQAVSAVDTKRGIKPWSNIMEILEEKDGVDTELLVYTMTLVNKPRRSPGRFMRMLLQMEILCSKR	96178	130465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_96245_116899_117012_126176_126272_128790_129444_129528
808368	contig_405_pilon	-	2692	1	Intergenic	novelGene_135295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAGATAGAAGCAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155238	152546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_152500_155200
808369	contig_6496_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_103525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAACAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904671	904429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_904400_904700
808371	contig_501_pilon	+	953	7	Intergenic	novelGene_134903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	22.3264914893098	295	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	204	953	793438	808589	FALSE	30	GTACGTTGTTTCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIRHSEQTLRTALISKTPALVLQYENLDAGERRLMNEAFQPNSALFEPITLHSQSDWITSHPEAPQDFEQFFNDAKRKTPSPEKCNIYIQSIGSLGNTRIISEEYIKWLKGYCEAFFYGLTVKLLEPIPVSATRCSFRVNDNTKNLQIHAGDILNFLKRKKPENAFCVVGITMIDLYPRDSWNFVFGQASLTDGVGIFSFARYGSDFYSSHYEGKVKKLEKSSSSEYSVFDNYYIPEITSIFLLRSCK	791716	808589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_791770_792225_792286_792607_792698_793437_793721_794083_794258_794349_794479_808425
808372	contig_3942_pilon	-	1195	9	Intergenic	novelGene_128861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	15.6504792258895	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	196	1026	1491123	1486376	FALSE	15	CTCCAAGGACTTGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQGRTPPLGSAVWHGCTDAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1492105	1486206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490888_1491132_1491918
808376	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_90846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
808380	contig_14516_pilon	+	2076	1	Intergenic	novelGene_153946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368135	370211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_368100_370200
808383	SIRV7	+	284	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTATCCTCTAAATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	78954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70988_78840
808385	contig_16620_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_155998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGGAATGTTTATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15102	14087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_-_14100_15100
808386	contig_6137_pilon	-	1511	6	Intergenic	novelGene_59128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_4	29.6067559857543	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	27	602	891608	872237	FALSE	20	TAACAGTTTGTTTCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPWTIPNMLSMTRIGLAPVLGYLIIEEDFNIALGVFALAGLTDLLDGFIARNWASQKSALGSALDPLADKILISILYVSLTCADLIPVSLTYMIISRDIMLIAAVFYVRYRTLPTPRTLAKYFNPCYATARLKPTFISKVNTAVQLILVAASLAAPVFNYVDSIYLQILWCFTAFTTAASAYSYYHYGRKTVQVIKGR	891634	871327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_872325_873565_873658_875177_875247_876892_876979_887143_887274_891497
808387	contig_5602_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_132995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACCAGCAACTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75816	74534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_74500_75800
808388	contig_14341_pilon	-	476	4	Intergenic	novelGene_111848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAAAGACCGCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550442	547744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_547804_548745_548860_549934_550149_550353
808389	contig_2867_pilon	-	1981	2	Intergenic	novelGene_135191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_1	0	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	86	493	866341	828547	FALSE	80	TAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARLPVLKGSYQAGEGEPAAAVAGTAPSMVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDG	866426	827058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_828872_866258
808390	contig_14441_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_100559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.064333633354	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	186	391	576	116728	117795	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	111196	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111386_113156_113209_116578_116841_117722
808391	contig_10437_pilon	+	1853	1	Intergenic	novelGene_38093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAACCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28129	29982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_28100_30000
808393	contig_5640_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_27243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGAAGAGTGCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21758	20713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_20700_21800
808394	contig_13412_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_80014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACCCAGCAAATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410472	409413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_409400_410500
808396	contig_5033_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_29086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACTCTGTGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672162	672710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_672200_672700
808397	contig_4732_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_75373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATGTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205567	203415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_203400_205600
808398	SIRV6	+	396	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	567	164	23	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCCAATCTGTATCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
808399	contig_5278_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_139768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAGGAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188560	186951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_-_187000_188600
808401	contig_3818_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_99293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTCTATTTTGGGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931687	932405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_931700_932400
808402	contig_17014_pilon	+	995	2	Intergenic	novelGene_163162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTGTTACTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15374	16414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_+_16184_16228
808403	contig_10958_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_5388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACCACTGCTTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874674	872862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_872900_874700
808405	contig_7806_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_157532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGAATCAGTCAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206383	207226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_206400_207200
808406	contig_7840_pilon	-	551	3	Intergenic	novelGene_69040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_2	493	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	122	307	389470	378748	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDDFHPLERSTSTPAGISHYDQCPHGPDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSRWFLFDNFLVV	393240	378503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_378873_389409_389509_393157
808407	contig_13421_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_166819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404583	403110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_403100_404600
808408	contig_8273_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_113102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505313	506401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_505300_506400
808412	contig_10541_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_144656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCTTTTCAATCCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350445	348313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_348300_350400
808413	SIRV6	+	372	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	381	547	208	43	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
808414	contig_3956_pilon	-	2780	19	Intergenic	novelGene_14735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	4.93569763165361	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	566	2554	463903	435539	FALSE	20	AGCATTCTTCCTCTTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLHFYKFYLEFGFLRRAFRHKFRLPPPSSDFLADIIGLQKKQTSGDLPRTMEGSSPFASVRASINLQNDPIIQKFGFNRVGLTRCLLTKEEMKTFHFPLQGFSDCENFVPTKCSGSVMDNSPLFGLDCEMCLTSKGRELTRISLVAEGGCCVMDELVKPDNEILNYLTSFSGITKKILNPVTTKLKDVQRRLKALLPPDAVLVGHSLDLDLRALKMIHPYVIDTSLLYVREQGRRFKLKFLAKAILGKDIQCPHRIGHDATEDARTSLELARYFLKYGPKKIAELNLEALASRQELHAAGQELRNKTEVVQQPNTSVLECLDSVGQKLLFLTRETDASELSSSRNCQSIKCLSNKEVLEQARVEIPLFPFSIVQFSFEPFSPSLTEEMNKRMRVKWSEMSTVYVGPFSKNCNLKVLKRLFKSFGPVRSMTLVLETHQPHLCIQYEVLEAAQLAIETLDGVLVEDICIKVQRPVTELTLDCDTLVNELEQDSENQGTIYLSGVSETFREHLLQQSTLFFGLEAVILPKDLKSGKQKKYCFLKFRTFGSAQRALNIFTGKDWKLKGRHALTPRHLHAWLRGLPPESRRPPGIRVLPPPSEQQALQVLKMDHPKIAAWRWGRKIGKLYHSLCPGTLCLILLPGTKSAHGSLSGLGLMGIKDEE	467643	435312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_435594_438035_438155_439163_439352_439573_439791_440416_440510_441608_441747_442250_442356_449613_449735_450466_450571_452944_453048_454220_454316_454463_454603_455686_455803_457215_457305_459578_459723_462814_462912_463837_463965_464942_465054_467250
808415	contig_4364_pilon	-	2952	1	Intergenic	novelGene_224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1896	2291	1398557	1398162	NA	25	TGAGTGTAAACACGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLQPSVSAQPSPLTCWRLFWAWPATSSDLLGLPCTQFLVTCSVRAQACAWWLPHSPRLRLWQSLHPAWQELQVRPPEARASPATAPKAQVTHLEVERVSHGQLLTRDRQGKGKSPGRCSSPHLPPWVDF	1400452	1397500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1397500_1400500
808419	contig_12157_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_135900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTTAAGGCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124258	125769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_124300_125800
808421	contig_12464_pilon	+	1076	3	Intergenic	novelGene_68735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	90.5	158	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	152	1075	421103	422026	FALSE	70	TATATAAAAATGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVIRLLGLPFIAGPVDIRHFFKGLTIPDGGVHIIGGEIGEAFIIFATDEDARRAISRSGGLIKDSYVELFLSSKAEMQKTIEMKRTDRTGRKRPGSGGSGAGSLSNFAGAVKEEASNSGYQDAEFHTNGTGRGDLKPRSTRPARAKNPYLFLRGLPYLVNEDDVRVFFAGLCVDGVIFLKLHDGRNNGDAIVKFASCVDASGGLKCHRSFMGSRFIEVMQSSEQQWIHCGGKQDEVPMRTEEHSPARGINDRHSRKRSHSKSSRRTRSRSPVGHYVHLKNLSLGISKRDLRNFFRDTDLTNEQITF	416327	422027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_416402_420438_420487_421073
808422	contig_11720_pilon	+	547	5	Intergenic	novelGene_43914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0.5	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	8	547	190431	208803	FALSE	30	CAGTAAGTCCCTGACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPGWPALWLWVAGFGLLIFVLVLLVSPRGCRARRILRGLLMARSERLLFRIGYSLYTRTWLGYLFYRQQLRRARNRYPKGHSKTQPRLFNGVKVLPIPVLADNYSYLIIDTQARLAVAVDPSDPRAVQASIEKEGVTLVAILCTHKHWDHSGGNRDLSRRHRDCRVYGSPQDGIPYLT	190423	208803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_190592_206121_206238_206371_206485_207174_207234_208712
808423	contig_11720_pilon	+	1431	6	Intergenic	novelGene_43917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	0.632455532033676	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	245	592	209983	211348	TRUE	25	TGATTGAGGTTTGATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCRVYGSPQDGIPYLTHPLCHQDVVSVGRLQIRALATPGHTQGHLVYLLDGEPYKGPSCLFSGDLLFLSGCGRTFEGTAETMLSSLDTVLGLGDDTLLWPGHEYAEENLGFAGMVEPENLARERKMQWVQRQRMERKSTCPSTLGEERSYNPFLRTHCLALQEALGPGPGPTEDDCSSRAQLLEELRRLKDMHKSK	208754	213193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_208806_209151_209316_209953_210041_210846_210963_211174_211378_212383
808427	contig_15123_pilon	-	2325	14	Intergenic	novelGene_110920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_13	290.767114359412	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2091	233	2323	302042	229564	FALSE	25	TGAGAGAGAAGGGGTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAGVTGITKMTLHATRAAALLTWVNSLRVANPVEAVLQLQDCSIFLKIIDSIRGTEEGQQIMKQPVPERWDFVCSFLQKNRKHPSSPECLVSMQKLMEGSELEMAKITMLLLYHFTMGSKSLRDWDQFEYKIQAELAVILKFVLDHEDGLNLNEDLESFLRKAPVPSTCSSTISEELSPPSHQTKKEIRFLELQNVASSSSGNNFLVGSPASPMGDILHTPQFQVRRLKKQLADERNNRDELELELAENRKLLTEKDAQIALMQQRIDRLALLNERQAASPPETRELEELRGKNESLTMRLHETLKQCQDLKTEKSQMDRKINQLSEENGDLSFKLREFASHLQQLQGALNELTEEHGKATQEWAEKQAHLEKELSTTLQDKKYLEEKNEILLGKLSQMEEHSTQLQKNPPQEKGEVLGDALQLEALKQEAATLAANYAQLQAKVGELETERGQQEAKLLAERGHFEEEKQQLAGLIADLQSSISNLTQAKEDLEKASQAQNAELTAQVATLTSELTTLNATLQQQDQELTGLKQQAEKEQAQLAQTLQQQEQASQGLRHQVEQLSSSLKQKEQQLEEAAKEQEATKQDHAQQLATISKKQEATLRERNTALQQLEALEKENAAKLEILQQQLQAANEAQDSAQTSVTQAQREKAELSQKVEELHACIEAARQEQREAQVQVTELEAQLRSEQQKA	302274	229561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_230383_230531_230655_231604_231746_232065_232184_232275_232394_232678_232837_233351_233476_234790_234879_236236_236318_236895_236979_238060_238141_244656_244743_250005_250076_302040
808430	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	517	57	517	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808433	SIRV4	-	329	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1194	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3964	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
808435	contig_1443_pilon	+	1162	6	Intergenic	novelGene_28318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	278	607	748643	749324	TRUE	50	CTGGAAGGAAAAAAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRVILAIGAVSVILSFLSLFFIILDQLQLPRSSLSSSSSRSPSSAESSAPPSDSIFTLVSSFFRELLLCSSSDLSFFISIVCSVPFQFFPGFPVENPLFVLSGSTPS	748365	776461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748840_748993_749238_749349_750369_750545_767467_767550_776187
808437	contig_14537_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_158661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTCTGTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102003	101788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_101800_102000
808441	contig_7630_pilon	-	1621	6	Intergenic	novelGene_133652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	18.3477519058875	241	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	181	861	458381	450247	FALSE	15	TTCTTCCACATTGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARPAQEWGSAPLNPAGNALGRAARFRDPQLGNCGYRLFSWRFLSRCPPTPRAGAPAVQIMSRIYHDSALRNKAVQSARLPGAWDPAAHQGGNGILLEGELVDVSRHSILDAHGRKERYYVLYVQPSRIHRRKFDSKGNEIEPNFSATRKVNTGFLMSSYKVEAKGDTDRLTTEALKRLVNKPELLALTESLTPDQTVGFWMPQTEMEAIELELGAGVRLKTRGDGPFLDSLAKLEAGTVTKCNFAGDGKTGASWTDNIMAQKSSEGAAAETREQGDGAEDEEWDD	458561	449486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_450256_451545_451710_452120_452328_454764_454898_456684_456761_458289
808442	contig_854_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_36093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	390	705	1094	15152	15541	NA	25	GTCATCATGCCCATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIALHYPHHDNQRYLQTWPNVPWVTKLLRLRTTVLSRLHATQGPLEAPMSPRPHCTGPSVLCRTPTSPGWYWGRGGIHQAQSVTQELTHGLCSQPDPSSNPTSDTCRLVTSGKSGNLSELSGLVCKTGM	14447	15541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_14400_15500
808445	SIRV6	+	527	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1600_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10853_11156
808450	contig_6418_pilon	-	298	2	Intergenic	novelGene_81257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	799	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGGTGAGAATTGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482922	1477834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1477905_1482694
808452	contig_7229_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_39842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	32	334	968771	969073	NA	35	GTATCTGATTACATGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQFYNRGTWSSGKHSGHESSTHMGTNSLLAKIPFFLPNQATSDDPISRNLTLSHLDGLSAILIVLPLQSPGSIFQHCLHMHTAVVTLQIKCIVSNHSDT	968739	970357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_968700_970400
808453	contig_9098_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_75771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCTGTGACCTTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45360	46141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_45400_46100
808454	contig_5515_pilon	+	1229	2	Intergenic	novelGene_52345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCAGGTCCGTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99800	101157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_99916_100043
808459	SIRV2	-	248	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4151	397	2972	-397	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGAAGCGTTGTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760	1432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
808463	contig_16632_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_154137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96095	94263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_94300_96100
808465	contig_13958_pilon	-	1433	1	Intergenic	novelGene_129544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAAATTAAATCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236231	234798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_234800_236200
808466	contig_5171_pilon	+	634	3	Intergenic	novelGene_161223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	44.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	42	428	15871	25851	FALSE	30	TTTCCAATCACCTCATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEHIDYCGYAVLPMAVEQDMLIAVEPVKTQTIRLINTNPLYPDFSTSVNNIQIDKTKPQWHNYFLCGFKGIQERFCLSNLTGMNCLVDGNIPPSSGLSSSSALVCCAGLVTLTALGMSLSKVTNFECKPLSTTFLFKAVSI	15829	26057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_15957_22610_22702_25641
808467	contig_5171_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_161226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGAGGAGATGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28061	28336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_28100_28300
808468	contig_14184_pilon	+	1589	2	Intergenic	novelGene_66595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTCCCAGCCTGGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88569	90336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_89232_89409
808469	contig_11375_pilon	+	969	8	Intergenic	novelGene_152657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	197.991960257306	811	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	245	967	180735	182541	FALSE	30	CAGACCTACCATACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFTCGPNEAMVVSGFCRSPPVMVAGGRVFVLPCIQQIQRISLNTLTLNVKSEKVYTRHGVPISVTGIAQVKIQGQNKEMLAAACQMFLGKTEAEIAHIALETLEGHQRAIMAHMTVEEIYKDRQKFSEQVFKVASSDLVNMGISVVSYTLKDIHDEQDYLHSLGKARTAQVQKDARIGEAEAKRDAGIREAKAKQEKVSAQYLSEIEMAKAQRDYELKKAAYDIEVNTRRAQADLAYQLQ	180159	182543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_180366_180696_180778_181047_181124_181211_181303_181578_181723_181877_181998_182083_182180_182388
808473	contig_5935_pilon	-	2053	9	Intergenic	novelGene_102714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	25.5587558382641	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1830	222	2051	1049311	1021578	FALSE	15	GCAGAGCTCCGACTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVAAHSCHLLQQLHEQRIQGLLCDCMLVVKGVCFKAHKNVLAAFSQYFRSLFQNSSGQKNDVFHLDIKNVSGIGQILDFMYTSHLDLNQDNIQVMLDIAHCLQVQNVLNLCHTFLKSTTLDQPPGIPCNSTFSPQSALTPDANCVINENYPPQLLQECSPDAQHNKVADEPHSSAAPSVNLHNSSGEIPKQAPDTLDSSCTELPFKQPNYYYKLRNFYSKQYYKQATCPNHERIIEQPFAFSTSTDLNAVENPPCAVSHPECILESSEHLPSNFLAQPLSESAPDPESDCTCPQPAKQMRLKKAIHLKKLNFLKSQKSAEQTSEPKSNDDVTKRIGSTSENLIEKASSQSTEEKESEELASSENFSCMNETERLEDPAVLEDQSQALQSQRQYACELCGKPFKHPSNLELHKRSHTGEKPFECNICGKHFSQAGNLQTHLRRHSGEKPYICEICGKRFAASGDVQRHIIIHSGEKPHLCDICGRGFSNFSNLKEHKKTHTADKVFTCDECGKSFNMQRKLVKHRIRHTGERPYSCSACGKCFGGSGDLRRHVRTHTGEKPYTCEICNKCFTRSAVLRRHKKMHGKADMESRSAPEGFSRVIEAPDLDR	1057411	1021575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1041487_1041535_1045190_1046294_1049159_1049331_1056780_1056941_1057369
808474	contig_6710_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_98176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	15	CCCTATTTCAGCCTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
808476	contig_14755_pilon	-	2173	10	Intergenic	novelGene_129376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	44.2085405971334	199	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	133	1236	364298	128904	FALSE	20	ATGTTTTTGTTACGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELCKTISVARLEKHKNLFLNYRNLHHFPLELLKDEGLQYLERLYMKRNSLTTLPENLAQKLPNLVELYLHSNNIVVVPEAIGSLVKLQCLDLSDNALEIVCPEIGRLRALRHLRLANNQLQFLPPEVGDLKELQTLDISTNRLLTLPERLHLCLSLQYLTVDRNRLWCVPRHLCQLPSLNELSMAGNRLAFLPLDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	368731	127966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_225825_226033_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
808480	contig_2069_pilon	-	1167	6	Intergenic	novelGene_23429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	817.559881598895	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAATGCTGCCTCTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331335	1327099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329459_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
808485	SIRV6	+	493	7	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	140	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034
808487	contig_17059_pilon	-	1450	2	Intergenic	novelGene_166080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATTGTCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403391	401900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_402225_402265
808488	contig_7057_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_123288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGGAGCGGCTCCGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841456	843280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_841500_843300
808489	contig_6710_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_96022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653363	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
808491	contig_3727_pilon	+	1689	9	Intergenic	novelGene_146754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_8	38.9543001477372	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	83	1198	358476	375693	FALSE	25	CTGAAGCACTGACTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFGSSGKLSNVEQWRCVSILRSHSGDVMDVAWSPHDAWLASCSVDNTVVIWNAVKFPEILATLRGHSGLVKGLTWDPVGKYIASQADDRSLKVWRTLDWQLETSITKPFDECGGTTHVLRLSWSPDGHYLVSAHAMNNSGPTAQIIEREGWKTNMDFVGHRKAVTVVKFNPKIFKKKQKNGSSAKPSCPYCCCAVGSKDRSLSVWLTCLKRPLVVIHELFDKSIMDISWTLNGLGILVCSMDGSVAFLDFSQDELGDPLSEEEKSRIHQSTYGKSLAIMTEAQLSTAVIENPEMLKYQRRQQQLDQKSAVAREMGSATSVAVNGESLEDIRKNLLKKQVETRTADGRRRITPLCIAQLDTGYSCIHQAFCDLVWGGLPVSFHQLVLSYSGSSQVLGPF	350431	376184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_350509_358470_358567_359783_359945_361900_362069_364553_364668_371424_371496_372140_372247_374320_374525_375492
808494	contig_11719_pilon	-	573	6	Intergenic	novelGene_154742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1554	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGGCTGAAAAGAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20085	13009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_13033_13918_14075_14331_14502_16245_16326_19126_19183_19997
808496	contig_9216_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_163519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703045	705172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_703000_705200
808497	contig_5718_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_110402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATAAGTTATCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348238	1347960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1348000_1348200
808501	contig_19069_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_175783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2923	3168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19069_pilon_+_2900_3200
808502	contig_20116_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_159085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGGTAATATGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15692	14611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_14600_15700
808507	contig_19744_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_120402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219664	220790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_219700_220800
808508	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	875	-18	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
808510	contig_9200_pilon	-	2489	22	Intergenic	novelGene_173990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_21	25.866831474333	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2448	40	2487	273116	228530	FALSE	30	GCCTCAGCAAAAACTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLVGAESGDSGTMAPVHGDDCEPGASAMSDSGSFVLSRSRREKKSKKGRQEALERLKRAKAGEKYKYEVEDFTSVYEEVDEDQYSKLVQARQDDDWIVDDDGIGYVEDGREIFDDDLEDDVLDSSQKGKDNKAPKKDKRIVKKAAVAKPNNIKSMFIASAGKKSTDKAVDLSKDDLLGDLLQDLSTEKSQVTLPPVTILKKKRSIGALLNPFSVYTPKAVPSGKTAPPVSRKEPPSTPVHRKCVEFTGETVQATHTEDEEKSGAMDFEDGDFDEPMETEEVTMEPVAAKTWNQKSEPAEEVKHEADPEKETTACLGHFLPDVSCWDIDQEDESCFSSQEVQVDSNHLPLVKGADEEQVFQFYWLDAYEDQYNQPGVVFLFGKVWIESAKTHVSCCVMVKNIERTLYFLPREMKIDLNTGRETGTPVTMKDVYDEFDEKIAAKYKLMKFKSKIVEKNYAFEIPDVPEKSEYLEVRYSAELPQLPQDLKGETFSHVFGTNTSSLELFLMNRKIKGPCWLEVKNPQLLNQPVSWCKVEAMALRPELVNVIKDVGPPPLVVMSFSMKTMQNAKIHQNEIIAVAALVHHSFALDKAPPQPPFQSHFCVVSKPKDCIFPLAFQEVIKEKNVKVEVAATERTLLGFFLAKVHKIDPDVIVGHNIYGFDLEVLLQRINVCKVPYWSKIGRLRRCNMPKLGGRSGFGERNATCGRMICDVEISAKELIRCKSYHLSELVQQILKTERVVIPTENVQNMYSESSHLLYLLEHTWKDARFILQIMCELNVLPLALQITNIAGNVMSRTLMGGRSERNEFLLLHAFYENNYIVPDKQIFR	273155	228527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9200_pilon_-_228632_229122_229253_229907_230084_233864_233982_236693_236784_238233_238296_239590_239676_242209_242365_243181_243321_244193_244269_245460_245578_246552_246666_251637_251817_251902_252105_252376_252465_252893_252987_253827_253891_254350_254467_264144_264226_265193_265291_268500_268626_273073
808511	contig_15918_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_132724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGAAAAAGACACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259406	261192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_259400_261200
808512	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	51	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808515	contig_7912_pilon	+	2183	2	Intergenic	novelGene_129561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	869	1996	50821	51948	TRUE	30	AGCATCACATCGCTGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQIHTCSITPVKFLMLSKGGDLAKGFPTFTTYIQAYSSMNSPMFIKSGIVAKAFPTFATLIRPFSGVDCLVLTEGRTLSKEFSTFAALIRLFSSMDSSVLNEARALTKGFSTFITHIRLYSYVTSLVLNEPRSLAKGFLTLIALIRPVSSMRSPVLTESRATAKEFATFAALIRPFSSVNSAVLNESGVFTKGFPTFDTLIRLCSCVKSLVLNEAATSNKGFSTFTALISPSTSVNSLVSTKGGVVGKRFPTFTTLIRPFSSVYSLVSTNGGVMGKGFPTFTTLIQPFSIVNLLLLNTSVFVANGFLIFAILTKPLSSTDVLVVNKCVFMAGSFPTFSSLVMTSSIVKSLSTLGAAVCLLTVGSRQVLEKDRWD	49952	53514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_52105_53483
808516	contig_5389_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_143034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACACTTTTAGTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459237	460587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_459200_460600
808518	SIRV2	-	535	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1102	0	-61	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4793	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
808519	contig_13048_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_138942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAGTGAAATAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521401	522399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_521400_522400
808521	contig_5718_pilon	+	1117	6	Intergenic	novelGene_110452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.427205372505	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	75	644	1624795	1631112	FALSE	35	CAAGATTCAAACTTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKSITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPVFPTQDEEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR	1624132	1631585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1624201_1624788_1624894_1625477_1625616_1628563_1628635_1629215_1629346_1630980
808522	contig_10054_pilon	-	2172	1	Intergenic	novelGene_171208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTATTTGGTATTTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66692	64520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_64500_66700
808528	contig_6446_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_149262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATATATGGGGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734354	732507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_732500_734400
808529	contig_10437_pilon	-	1196	3	Intergenic	novelGene_38270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGGTGTGCACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424116	419511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_419917_421607_422272_423989
808531	contig_14513_pilon	+	1024	3	Intergenic	novelGene_70270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGATGTGGATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11287	15058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12158_13087_13136_14952
808533	contig_11998_pilon	-	1026	4	Intergenic	novelGene_175785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	8.52447456836295	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	17	790	151975	99353	FALSE	75	CAAGAAAGAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPLITRSPASPLNNQGIPTPAQLTKSNAPVHIDVGGHMYTSSLATLTKYPESRIGRLFDGTEPIVLDSLKQHYFIDRDGQMFRYILNFLRTSKLLIPDDFKDYTLLYEEAKYFQLQPMLLEMERWKQDRETGRFSRPCECLVVRVAPDLGERITLSGDKSLIEEVFPEIGDVMCNSVNAGWNHDSTHVIRFPLNGYCHLNSVQVLERLQQRGFEIVGSCGGGVDSSQFSEYVLRRELRRTPRVSSVIRIKQEPLD	151991	99116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11998_pilon_-_99512_102774_103081_115600_115746_151811
808538	contig_15610_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_154279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTCTCCAGGAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638209	636675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_636700_638200
808539	contig_5620_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_161340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCATGGTAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180344	182230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_180300_182200
808540	contig_10734_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_51152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	44.5236945344835	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	118	1170	946522	918004	FALSE	50	GTACAACAGAAGGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSTARGAGLAPAASGGRAYGVFKVTLPTPTFPGAGETPMNLSATFLAGCQNLGSEVEISTIEKQRKELQLLIGELKDRDKELNDMVAVHQRQLLSWEEDRQKVLTLEERCSKLEGELHKRSEIIRSLIKKIKTLESNQNECQMALQKTQQQLQEMAQKAAHASLLSEDLEARNQNLSNTLVDLSAQVGQLQAREQALTTMIKLKDKDIIEAVNHIADCSGKFKVLEHALRDAKMVETSIVKEKQDYKQKLKALKVEVSKLKEELNEKTTENNDQREEIIRLKQERSYLHDELVFTVEREKRKDDLLDIAKSKQERTNTELHNLRQIYVKQQRDLQFLHVNVENSQELIQLYDSKAEEPKALESGTIFLPQVSCSVCWQNPVRWCLIWS	946639	917862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_918080_927718_927835_928205_928295_934893_934996_937941_938114_940494_940597_942037_942205_943852_944046_946486
808541	contig_1309_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_73985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	71	415	305132	305476	NA	55	GAAGAAGAAAGAGAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIIPCLHVCTPVSESSSAAVTNTQVVGFSKEFILSQSSRLQVQIQSVSSRGTLYPSTLEEGPCHQSSFGLGASLHRNLRSKGRALLLALFSWWYEVPVCLCLLLSFTSQQRLD	305061	306203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_305100_306200
808543	contig_14450_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_49059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGTAAGAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433713	1432346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1432300_1433700
808544	contig_11396_pilon	+	1324	6	Intergenic	novelGene_71301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.1277705159929	292	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	53	442	372974	378548	FALSE	5	GCTCTGTGCTCGTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERRGQEELQSLWDKYYAECHGVIYVIDSTDEERLSESKQAFEKMVTSEALEGVPVLVLANKQDVETCLSIPDIKTAFSDCTSKIGRRDCLTQACSALTGKGVNEGIEWMVKCVVRNVHRPPRQRDIT	372921	379430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_372988_373529_373564_377454_377537_377647_377719_378290_378392_378460
808545	contig_14341_pilon	-	1586	2	Intergenic	novelGene_111796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACCCACCCCCGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385446	383778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_383886_383967
808547	contig_7025_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_104364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTAAAAATACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10263	12593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_10300_12600
808553	SIRV6	+	292	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	308	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1611	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1763_1882
808555	contig_10482_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_152822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCATATGGTAGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105137	104925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_104900_105100
808556	contig_17453_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_175789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGATTTTTATATGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15566	17277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17453_pilon_+_15600_17300
808562	contig_3846_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_137146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAGGAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176785	177929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_+_176800_177900
808563	contig_2069_pilon	-	415	3	Intergenic	novelGene_23518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	69	413	1509802	1508371	FALSE	5	TTGGCATTGTGTCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQSNCSHLSSIQRQHSLPTSLKQQLQCRLSQPALRLPPCLVLADRYLCWCHQPGLCQRPRNPCPGSTQRQLNVPF	1509870	1508368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508590_1509032_1509111_1509754
808564	contig_2069_pilon	+	1407	7	Intergenic	novelGene_23456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	350.535621902001	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	478	1338	1436155	1439381	FALSE	10	GTTGAGGCCTCTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGPPAHPPRPVTALPQSPGRTERAPAPWLSVPAPLPPPPPRSSHSTSTPSTLRTYFFCLHLISPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432020	1439450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432060_1432938_1433064_1433701_1433913_1436052_1436348_1436532_1436748_1437870_1438000_1439057
808565	contig_5041_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_27041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGTAATACTGAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416022	413832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_413800_416000
808566	contig_6710_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_98141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGGAAGGAAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653449	653881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
808567	contig_663_pilon	-	1242	3	Intergenic	novelGene_163745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	300	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103325	80337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_81270_102049_102194_103159
808568	contig_14300_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_133154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGGTAACTATGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606727	605771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_605800_606700
808570	contig_3878_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_174798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCCAGTGATTCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572379	569112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_569676_570868
808571	contig_8598_pilon	+	450	2	Intergenic	novelGene_22916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	2	448	231702	232662	FALSE	50	AGAAGGAACTGGAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLELNDLKLISQGERNSPSDSGQGSCETTGALSERDSDEEIFVSKKLKSRKVLPDSDSETEDINASPEKTTYDNTEEEDKENLYAGKHGNIRRIYKSLADSDEGDTEGSLYQKNLETQATPCLELDLQSEKSVDFTVDRRISKKSVRD	231700	232664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_231811_232324
808572	contig_8598_pilon	+	969	4	Intergenic	novelGene_22917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0.942809041582063	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	16	969	235735	242995	FALSE	40	GAGGGGATGGAGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWGNGMALLKSSKYQPSHNKEIINTAHTTEMNSDSHSKSSEQATGTEYEMEINPLLEALKEPQNTAGSNKSCCKDLVGSEEPETQEKQKQTDASGGSSVEQKEPSFLGTKEGGEEYQAGGLVAPEPHALEGEEGLKKTEEADGKVEEPRQQTKSAAAVPPEKVRRFTLDRLKQLGVDVSIKPRLGADEESFVILDEPETNRELEALKQRFWKHACPAAKPRASQTVNVNVIVKDVGMDGKEELKADVVPVTLAAEKLDGGSYTKPGEKLQVLKAKLQEAMKLRRLEERQKRQALFKLDNEDGFEEEEEEEEEETTDESEEDGE	235719	242995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_235749_235935_236511_240960_241153_242822
808574	contig_9272_pilon	-	1692	9	Intergenic	novelGene_125949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	44.4295439431917	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	385	1047	459290	453257	FALSE	5	GTTTGTGTGGCATTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDILGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP	475995	452611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_453365_453470_453531_454256_454356_455795_455889_458697_458892_459181_459350_474920_474966_475078_475146_475782
808575	contig_10019_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_86669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAAAGAAAAGATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234240	234825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_234200_234800
808576	contig_3233_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_56537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGGAAATACCGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732093	730967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_731000_732100
808577	contig_8978_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_49474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTTTCTAATTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697966	1699550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1698000_1699600
808578	contig_8594_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_140071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562071	560410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_560400_562100
808579	contig_1008_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_121551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524894	526169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_524900_526200
808580	contig_6710_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_93524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
808581	SIRV2	-	657	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	25	4	25	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	700	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATTGACGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5870	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
808582	contig_12080_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_128375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAACAAAATTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151171	149500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_149500_151200
808584	contig_11825_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_155401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTGAAATGGTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25830	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_25800_27600
808585	contig_15236_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_141664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAATCCCAGATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722881	721850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_721800_722900
808587	contig_8616_pilon	+	1286	4	Intergenic	novelGene_72531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	37.0255167268316	251	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	493	882	386673	387435	FALSE	10	GGGGCCTCTCTGACCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLRQKDLKISQLQADLRRPPPAPAQPPEPEALPTIYVVTPTYARLVQKAELVRLSQTLSLVPRLHWLLVEDAEGPTPLVSGLLAASGLLFTHLAVLTPKAQRLREGEPGWVRPRGVEQRNKALDWLRGGGGAVGGEKDPPPPGTRGVVYFADDDNTYSRELFEEMRWTRGVSVWPVGLVGGLRFEGPRVQDGRVVGFHTAWEPNRPFPMDMAGFAVALPLLLAKPNAQFDGTAPRGHLESSLLSHLVDPKDLEPRAANCTRVLVWHTRTEKPKMKQEEQLQRQGRGSDPAMEV	384612	387839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_384744_386114_386476_386672_386964_387336
808588	contig_9582_pilon	-	1614	8	Intergenic	novelGene_106837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	31.3127736861232	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	106	1437	431196	417410	FALSE	60	AAGGAGAAGGAAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGRPVPTCVHLASDVQLDGRCDPRKLQTQNQLQFNRNVPTHSSNLAIRYSCPHAIRIEKLKHSFNESYHCKDSNFRDGPDPSSSVSFSVISEEKLSYAVHLAKRDVKRRQFEEHMKEHHLRSQPQISQKCGHTTKSKIPEHRLEKKETKGHEVFPCSHQPSKVEISSSGAKVYLYTSHPGQPDLTVQNSPPTRDPGLQPHSRIGEHKSLLEVQRLQKELSSCIHKIEEVTKKDKIEEALDPDEERRVQIRRQEQAVRSARMLYVLQQQVKEIQEELDKLSPHKIKHTKKSWAVSRLAAAHRGAIRALQMFVTQFTDRGEHPVPTRGRELGSLIRQLSLCSAKLDSDPSVPDVVIDILQQIEDLESLLEKKLSPKKVKKYASEIRNKFPVGSQRVLERWPSTSSKSERRLFGAKEMFPQETRRPSVAKKLLVGIGQWTMQMR	436688	417232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_417442_418011_418223_420110_420327_420724_420788_422905_423013_425333_425944_431103_431267_436653
808589	contig_13014_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_169382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674992	676542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_675000_676500
808590	contig_8693_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_150877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCCTCTCCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158952	1161166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1159000_1161200
808593	contig_11629_pilon	+	1414	2	Intergenic	novelGene_161177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	31462	67190	FALSE	10	CTTCCTTAGCTATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQVSACHYSLSTFQPHSTLL	31460	68306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007
808594	contig_10196_pilon	-	494	3	Intergenic	novelGene_132320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24890	4311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	33	407	2389772	2389023	FALSE	0	CCTGGTGTGGCCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTQTQKQPTMVLSDEDKTNVKTFWGKIGTHTKTYFPHFDLSHGSGQIKAHGKKVADALTRAVGHLEDLPGTLSELSDLHAHRLRVDPVNFKLLSHCLLVTLSSHLREDFTPSVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR	2389804	2388935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2389152_2389265_2389446_2389706
808596	contig_2487_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_148439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73789	73425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_73400_73800
808599	contig_15888_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_84391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTCCGACTTCCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37288	36412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_36400_37300
808600	contig_19960_pilon	+	932	6	Intergenic	novelGene_164187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_5	76.8208305083979	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	79	825	35948	60083	FALSE	35	GTAAGCATCTAAGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLSGSTIGDHCEEKMHLLLLISLLFWRPGCSVVWGPNVTSGPEGSSLTVQCHYDLGWEPHYKWWCRGAVWATCKILVKTTGSEQEVKEGRVSIRDNHKKRIFTVTMERLTEDDADFYWCGIERFGTNHTVKVKVSIDPDLEFEPINLEVKNLNGKPSAVIVNCQPPLEANGNITALTSVPMRIKRISRGGDLRAIVLNCQPPLTIGGEKTDPNSANIHLEEINREGGAAYCLWELPASSGRQREIC	35869	60190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_36039_37668_37999_41230_41339_44035_44144_51751_51861_60082
808601	contig_5954_pilon	-	2680	14	Intergenic	novelGene_28480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_13	145.819252631022	312	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	546	2039	295969	289124	FALSE	20	AACTGCTGGCTTTATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKLPPASTPTSPSSPGLSPVPPPDKVDGFSRRSLRRARPRRSHSSSQFRYQSNQQELTPLPLLKDVPASELHELLSRKLAQCGVVFDFLDCVADLKGKEVKRAALNELVECVGSTRGVLIEPVYPDIIRMISVNIFRTLPPSENPEFDPEEDEPNLEPSWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPSVAKRYVDQKFVLMLLELFDSEDPREREYLKTILHRVYGKFLGLRAYIRKQCNHIFLRFIYELEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKTEHKQFLVRVLIPLHSVKSLSVFHAQLAYCVVQFLEKDATLTEHVIRGLLKYWPKTCTQKEVMFLGEMEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQVARCVSSPHFQVAERALYFWNNEYILSLIEDNCHTVLPAVFGTLYQVSKEHWNQTIVSLIYNVLKTFMEMNGKLFDELTASYKLEKQQEQEKARERQELWQGLEELRLRRLQGAQGAKEAPLQRLTPQVAASGGQS	296961	288482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_289272_289622_289725_289973_290102_290944_291065_291196_291248_291324_291379_292116_292226_292325_292386_293737_293869_293996_294090_294251_294354_294936_295134_295770_296233_296679
808602	contig_3004_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_127473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTCCCTCACGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235562	233584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_233600_235600
808603	contig_21315_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_151575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCTGGGACCAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62631	64242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_62600_64200
808604	contig_15039_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_110162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248342	250623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_248300_250600
808608	contig_17795_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_175790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAACCTTATAGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4231	5547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17795_pilon_+_4200_5500
808609	contig_6101_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_114281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAATGTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218455	217222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_217200_218500
808610	contig_10451_pilon	-	2794	1	Intergenic	novelGene_138341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTCAACAGTAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603443	600649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_600600_603400
808611	contig_13496_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_107666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAATAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508064	508260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_508100_508300
808612	contig_7428_pilon	-	1820	3	Intergenic	novelGene_77750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	404	1	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	149	532	515377	514339	FALSE	35	GAGAGTTTCAAAACATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARGRDERLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515525	513050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515026_515350
808614	SIRV2	-	537	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1100	0	-63	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4795	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
808615	contig_6958_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_70009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAATACATACTCAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753170	753615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_753200_753600
808617	contig_817_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_132470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	49	399	667976	668326	NA	30	AGATAGAAATGGTTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQFEECSQCHRIVCVEIVELVYVLLWIFSTTTKLCTTRHRMEFSFLVWRFRVMISLGIPVNWPHIMFIASILPPSLLCLKSLQAAIQGTTIGLYSLGTTEEEGESGIRGYGMCG	667927	668980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_667900_669000
808619	contig_3113_pilon	-	3067	1	Intergenic	novelGene_175793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	879	2637	429	3065	29542	26906	NA	55	AAAAGGCCAAGAAAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRKELKSLSHGKKQPHKADNNENNTTKLIENGAVLHLLQRLGLEHHYPKKLGRANFHLIYKTSVYNTQPSSEQELPFYFLQKLLVLDYEVRYLVFKDGGNTEDPVYPSQENEAFDPYEEICEDSDNPINPSATNLRRHIHPMDIQMAIYHCADDLARQYILDKLAMCQFALPLVVPNPCSSQIEFSLWSLGKIRRSWQQTGKSEKRKNNCKNQQMCRVATSIVSFIRVGNGFSASKSQIMNCLLSKRKHDVFFHRHCSGSSKDCLLMEGVVEICWFCPGGKDKDRFDKCITFTNLHGDAKEHERQLTFLKEVSSLIVILMSASDSNDKNRKIVRDLCQSSKPLICLLDDKEKTMANNSNRKLRIGIKNRNESELTEELMCTIRRLLELSDRTQSLEDCASIARKQGFLIDEDERDCKKAKEKAQSLTDLLRKMKLNMIKENLLPLQGKLWHLWCKKDKELYHLREKGNRSIEQHKSEIQTEKQRIRHRQLTKAFPLNDLMRSFLEILQDTSETHNKLYFLQWLSVFLDNLTADHLENLREKQSSLWSQVQTEKQKAPNSNSLRYWQNEIEAISTKISDCILGTEHLLREAGQIYEALEEVCSTRDTLFLSLPQIAADLMISGLPIELMDGDTSYVPLKWVAAVFDKVSEKLGDKRLFVLSVLGLQSSGKSTLLNTLFGLQFTVSAGRCTRGAYMQLLRIEETFREELGFDFVLVVDTEGLRAPELSNKSQNRDNELATFVIGLGNLTLINIFGENPSEMQDILQIVVQAFLRMKQVKISPSCLFVHQNVGEVTAKEQTMEGRRRLEQKLDEMAETAAEQEQCSDVTRFSDVINFDVRTHVYYFAHLWDGNPPMAPPNPHYSHDVQELKSRILGTAKEESRGSIMKISDIKFRVQDLWRALVCENFIFSFRNTQEVMAMSKLETRYNHWTWELRSHMVDLQNKLTNQIQNGKIQTLRTSEVEAPVTEKYEAIKQDLENFFNEDPDNEILVQWKAMFENKLRLLKETLISDMERKANELICL	29970	26903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3113_pilon_-_26900_30000
808620	contig_7839_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_45760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATCAGGCCCTGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1588254	1589253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1588300_1589300
808622	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
808624	contig_9687_pilon	+	382	4	Intergenic	novelGene_172725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	136.407070523814	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	258	123	380	18896	23215	FALSE	25	TAGTAAAGTCTTCTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNEIRLIVYQDCERRGRQVLFDSKAVHRIEEAAQSTEDVPMKMSAKCCQGSGIVNSSVSSSSSSLSSQSSSGGSLQHAKEQLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGPTLKIHYIRSPPQLM	15028	23217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_15133_18877_19034_22998_23100_23196
808628	contig_5482_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_144459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTAATAAGGGATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317446	315758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_315800_317400
808630	contig_7201_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_152535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTTGTAATTTACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820575	820123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_820100_820600
808631	contig_10299_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_79801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGAAAAAAAAATGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804606	803004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_803000_804600
808632	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
808633	SIRV4	-	396	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1122	3	1122	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4036	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
808635	contig_6795_pilon	+	999	8	Intergenic	novelGene_27782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	26.8244481845976	255	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	283	864	573013	579327	FALSE	20	TATGCCCTATTTTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADHGGFCLLIQTTLCNTSLDNPTQRNKDQLIQAAMKFLDTDTICYRVEEPETLVELQKNEWDPIIEWAEKRYGMEIGASTSIMGPSIPAKTYETLASHLASYNMWALQGIEFVVAQLKSLVLTLGLMDLRLTVEQAVLLSRLEEEYQVQKWGNIEWAHDYELQELQARAAAGTLFVHLCSESTTVKHKLLRE	564800	579462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_564866_571150_571196_571486_571633_572986_573147_574677_574759_576812_576926_577480_577597_579189
808642	contig_3326_pilon	-	1162	3	Intergenic	novelGene_170604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	44	252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	136	852	227100	222394	FALSE	15	TGGGCACGGCTCAGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSQPLLLLLLALPLRGQASTSCYGIPGMPGMPGAPGKDGHDGLPGPKGESGIPAIPGTRGPKGQKGEPGTPGHPGKNGPMGASGIPGTPGIVGPPGEPGEEGRYKQKHQSVFTVTRQTSQFPAPNSLVKFNTVITNPQRHYDTSTGKFTCHVPGLYYFAYHTSHTANLCVKLYRSGIEVTTFCDHMSNSKQVSSGGVLLRLQVGEQVWLAVNDYNGMVGTAGSDSVFSGFLLFPD	227516	222083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_222951_226940_227120_227400
808643	contig_5059_pilon	-	1356	14	Intergenic	novelGene_140706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	141.01634468194	2	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	191	1174	221645	166409	FALSE	55	AACTAACACAATAAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFEDLATAWLLTKRSPVRIHQLFLENSMRAVLLCPVGSLEDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231734	166226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_221526_221669_226820_226893_231639
808645	contig_10403_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_175807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTACTACTGTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101546	100896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_100900_101500
808646	contig_5964_pilon	-	2263	3	Intergenic	novelGene_80349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	35.5	1	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	216	1628	16488	8681	FALSE	65	GGGATAGAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTEARSASQLRSPLPKQEKPRGPHRSPASQYWPLLSTESRDGGGAEAPGAGYPVLKPELTYDLKLGQELWAMKKDLSQSTCPGDKAKLESTEPTAPEPVLSDGASVQAQLTPGASRDSQLRREKDQEGPPEVQDQHLQPGVDPQKEQLPGKMSPEHDGFGTDDGACSRILQERVSPQVAVHDGDSHGPDKDAMTHKERHPYVCNECGKVFNRKHLLVQHERIHSGTKPYECTECGKTFSKSTNLLQHHVIHTGEKPYECTECGKAFSFRSHLTRHQQFHTREKPYVCTECGKAFSHRSHLAQHQRSHTGQKPYKCTECGKTFSRSSYFTRHQWIHTEEKSNKCIECGKAFSRRSHLARHQRIHTEEKPYVCTECGKTFTQSAHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKTFAHLSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPAFIRHYSIHTGDKPYECIECGKAFNRKSHLTQHQRIHTGRSPVSVTDVERPFTSEQTSVNIQGLLLGTDSLNVTTEENLWPEEPSYPASDYSYQSKSSQVSSL	22335	8045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_10060_16454_16551_22182
808647	contig_16525_pilon	-	449	5	Intergenic	novelGene_133873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	50	448	181436	178199	FALSE	10	GACCCGGTGCCCGCGCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFG	181485	178197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
808648	contig_13292_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_142956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCTGTGCTAAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371373	369883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_369900_371400
808650	contig_1244_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_38069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAGACAATTAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242841	1242331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1242300_1242800
808652	contig_6137_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_59147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCATACTCTCCCCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032772	1031887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1031900_1032800
808653	contig_8576_pilon	+	1605	11	Intergenic	novelGene_88743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	121.675634372704	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	213	1355	689872	715062	FALSE	75	GACCAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPIPQEETSFAETALAPGSSPPAPPSDSPGPPILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRNQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGME	685236	715312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_685398_689820_689925_690741_690845_694836_694986_695960_696081_700724_700885_707554_707592_710387_710525_711469_711588_713469_713555_714881
808654	contig_12624_pilon	+	1308	10	Intergenic	novelGene_60961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_8	306.016339433044	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	757	1308	39740	55145	FALSE	20	GAAGCCTGTAGCTAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNL	6115	55145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39362_39840_41857_41951_42823_42973_50396_50437_54975
808655	contig_4895_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_175811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10740	12430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4895_pilon_+_10700_12400
808656	contig_15112_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_124748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAATAGTCTGTTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15240	15698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_15200_15700
808658	contig_6217_pilon	+	753	3	Intergenic	novelGene_109626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAAGAGGAACTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448535	451686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_448650_450336_450487_451197
808659	contig_14450_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_49016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1760	2104	1181611	1181955	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRHPNQHLNPSPLTHFIPPNTFTAFSKHSIVIYSTWSDLSPGSTSSWFATRPPENVQEVPLVLPTVGTGIYMKKGHSRSCSNTQRASHFSYVSCIEFPLFEVQNSGIEIDRFL	1179851	1182318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1179900_1182300
808661	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808669	contig_17195_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_168972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGATGTTCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52568	50467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_-_50500_52600
808670	contig_18919_pilon	-	1224	3	Intergenic	novelGene_156015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	338	814	167194	59368	FALSE	0	GCGCTTTCGGTGGTGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGALEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGICPKQEHIAGSSHTPIRRSAQRAQDVWQFSDGSSRALKF	167531	58957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_59460_159885_160216_167139
808671	contig_17198_pilon	+	804	3	Intergenic	novelGene_62406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_2	26.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	22	339	1100207	1100524	TRUE	40	AAGTGACTCCAAGAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSAAWAMVQLRPRASCTPAEADAMVDEGQPASEEVAEHGLLLGQPSSGAAAEPLEEDEEGDDESDDEAPEELTFASAQAEAREEERRVRETARRLGARRLAPPGPACPSPS	1100185	1102987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1100606_1101271_1101331_1102662
808672	contig_10437_pilon	-	1376	6	Intergenic	novelGene_38261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	504	929	407733	401538	TRUE	30	TTTTCCCAAATTAAACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGWDAGGWLESHPGEAGQVGNATGAVLIPGHEDIAFVSPVFSPAVFNYPVLVPLLGPVPHCQNRVVQVIAIASFILLTSAVKLEGGQACINGHRDGAHSGHCPLQRFLIAHRDLSVASAFSRLACRAVHTIFILTCPTYG	408236	398667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_398755_398839_398993_401330_401560_405377_405554_405827_405921_407598
808673	contig_3095_pilon	-	1086	6	Intergenic	novelGene_75240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	3	746	255427	246716	FALSE	20	TATCTGTACTCTGAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255429	246375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
808679	contig_21388_pilon	+	1403	2	Intergenic	novelGene_136615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAATCCAGTGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7094	10436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_+_7748_9686
808682	contig_5125_pilon	+	2100	2	Intergenic	novelGene_43491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCAAGCACATCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563833	570571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_564292_568929
808684	contig_3679_pilon	+	2202	3	Intergenic	novelGene_112131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_1	6	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	125	424	1079232	1086361	FALSE	35	CTTGGAAAAATACACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGGSLLGCFPGSFLPTQLHTLRSVWCCRCISPVAALTTAAMISLTDTQKIGMGLTGFGVFFLFFGMILFFDKALLAIGNVLFVAGLAFVIGLERTFRFFFQKHKMKATGFFLGGVFVVLVGWPLIGMIFEIYGFFLLFR	1079107	1088139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1079257_1084741_1084834_1086178
808685	contig_14954_pilon	+	319	3	Intergenic	novelGene_165173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGATGGCTTGGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64227	64788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_64319_64394_64555_64720
808686	contig_8900_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_171612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1040	1357	123626	123309	NA	50	GAACAGCATAGGAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTQGLLSSLTLFLNSKLSLKVWSSVVIIRYEGWRGDKRKKGLLHSVESENGVQTSHLFSSLSCQLPCSLQSRTLKDSCQHCPQAARPAVLTRTVPHAYRLFSA	124665	122815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_122800_124700
808688	contig_11126_pilon	+	1086	4	Intergenic	novelGene_138107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	138	junction_2	8.99382504215469	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	241	834	118054	137874	FALSE	15	CAGGGTCTTTTCTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGETQLYAKVSNKLKSRSTSLLLEPLLALGFPAHTALKALAATGRKTAEEALDWLHCHCNDPSLDDPIPQEYGLFLCPTGPLLEKLQEFWRESRRQCAKNKAHEIFPHVTLCDFFTCEDHKVECLYEALKRAGDRILGSFPSVIPLVLHSSVSYLGFFIHDSSADIIREFAMSFATEASVLAGRQSPPSAPSWIS	117813	138126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121535_133242_133430_137634
808689	contig_9133_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_109305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCTTATTTTTGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283290	285490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_283300_285500
808691	contig_10642_pilon	-	1183	3	Intergenic	novelGene_78717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	91	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGGTCATTTGCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921325	915414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_916462_920788_920866_921266
808692	contig_2854_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_120898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCACCAGCAATGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235030	1236014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1235000_1236000
808697	contig_2093_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_152999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGGGTCACCATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1412469	1411625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1411600_1412500
808698	contig_12427_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_40589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATAAAGATTCATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606463	604381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_604400_606500
808700	contig_9415_pilon	-	1961	13	Intergenic	novelGene_109883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_4	84.8902477712644	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	45	1856	2064717	2051762	FALSE	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCSFIKLEAHQNRVMTCVWCNKKGLLATSGNDGTIRVWNVTKKQYSLQQTCVFNRLEGDAEESLGSPSDPSFSPVSWSISGKYLAGALEKMVNIWQVNGGKGLVDIQPHWVSALAWPEEGPAASWSGESPELLLVGRMDGSLGLIEVVDVSTMYRRELEHCYRKDVSITCIAWFSEDRPFAVGYFDGKLLLGTKEPLEKGGIVLIDAHKDTLVSMKWDPTGHILMTCAKEENVKLWGPVSGCWHCLHSLGHPSVVNGIAWCGLPGQGSKLQLLMAVGCQSGLVCVWRIPQDITQTTVTSSEGWWDQESSCQDGYRKSAGAKCVYQLRGHITPVRTVAFSSDGLALVSGGLGGLMNIWSLRDGSVLQTVVIGSGAIQTTVWIPEVGVAACSNRSKDVLVVNCTAEWAAANHVLATCRTALKQQGILGLNMAPCMRAFLERLPMMLQEQYAYEKPHVVCGDQLVHSPYMQCLASLAVGLHLDQLLCNPPVPPHHQNCLPDPASWNPNEWAWLECFSTTIKAAEALTNGAQFPESFTVPDLEPVPEDELVFLMDNSKWINGMDEQIMSWATSRPEDWHLGGKCDVYLWGAGRHGQLAEAGRNVMVPAVAPSFSQAQQVNG	2065571	2051656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2051900_2052047_2052114_2053310_2053605_2054966_2055141_2056334_2056437_2056804_2056952_2058479_2058586_2059010_2059211_2060697_2060829_2062782_2062984_2063788_2063917_2064592_2064721_2065530
808702	contig_19311_pilon	+	2406	1	Intergenic	novelGene_144088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAGGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167041	169447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_167000_169400
808703	SIRV2	-	469	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	50	3213	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1500
808704	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
808707	contig_3270_pilon	+	523	5	Intergenic	novelGene_104441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2675	junction_1	3621.23979977852	29541	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	19	489	44259	46726	FALSE	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAATKMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44240	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
808708	contig_5794_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_69747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492519	491748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_491700_492500
808710	contig_13904_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_165496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCTTTGCCCTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107563	108446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_107600_108400
808713	contig_1008_pilon	-	2764	1	Intergenic	novelGene_121581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683154	680390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_680400_683200
808715	contig_5954_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_28477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1155	1502	208506	208853	NA	10	TTTCCAGTCTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQTAGGKNEGRGRCKVVRKQVPGSQAFVSPGLCLLLYPSPQALRSSSPPLLAAWPGLMAAGRAGAATRRGLSCICSERGASHSDSRWTLSGGLRWKIPGLCLDFHTHGSKTLC	207351	208917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_207400_208900
808716	contig_12151_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_54965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATACAGCAAGCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964068	964855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_964100_964900
808717	contig_12151_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_54966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCTCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965841	966662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_965800_966700
808719	contig_12079_pilon	+	1151	3	Intergenic	novelGene_67558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGAAAAACAACCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866011	868597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_866649_867246_867409_868245
808722	SIRV6	+	367	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	560	35	381	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
808723	contig_9258_pilon	+	617	4	Intergenic	novelGene_104605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5135.81758069952	93	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	114	467	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDEYPGQGLPIIAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96707	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327_99394_99432
808724	contig_8866_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_77881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGACTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005099	1003227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1003200_1005100
808727	contig_13558_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_123035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATTGAGCAGTACAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579653	577878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_577900_579700
808729	contig_7426_pilon	+	1996	8	Intergenic	novelGene_27492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_7	85.4390820098968	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	1414	1995	917183	922273	FALSE	30	GCAAGCCCTGTATATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYMNRGDRWIQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGSLKDFPVKQLLGPDFGYVTREPLFEPVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKVYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVCDFLQAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMTFVPIPGTKSSPRNLDTPEQYSPAETECDPQ	906198	922274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_906232_906717_906844_913446_913626_916107_917294_918331_918440_921076_921229_921896_922042_922207
808730	contig_14023_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_165381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACATCTAGTTAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271056	271961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_271100_272000
808733	contig_10095_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_57231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATTCTTAATGTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190033	188612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_188600_190000
808734	contig_15376_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_154688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGACAATTTTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181265	180233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_180200_181300
808737	contig_14768_pilon	+	880	3	Intergenic	novelGene_115074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	2.5	415	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTCTGATATATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174337	189295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_174424_176301_176398_188597
808738	contig_14744_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_65979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGTCAGGCATCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932628	931140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_931100_932600
808739	contig_10609_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_123930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGGTCTTGCAGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363512	364140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_363500_364100
808740	contig_15264_pilon	-	1310	2	Intergenic	novelGene_158880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTCGATTTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151018	149665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_150898_150940
808741	contig_4803_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_150730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCTTCCAGCCAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82508	83006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_82500_83000
808742	contig_5765_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_141385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620533	622465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_620500_622500
808743	contig_2161_pilon	-	1475	5	Intergenic	novelGene_114962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3064.74324984981	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	355	915	1044555	1038651	TRUE	15	CCCCTGTTGTTTCATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPEWESLQPSEEGVFQVTLTAETTCSYISWPRKSLHVLLAKDRYISRLFSTLLGYDISEKLYALNDKFFAKFGLRFDIRLPSLYHVLGPAAPDAGPESKKNDEEVCEPAMSSPQALPTSAQKTPPCPPPPAATNPPVPPSQVRMSRPDSGILGEDSTSLVLEDFEEVSGSESFMDYRSDGEYMR	1066428	1033129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1033646_1038606_1039158_1044501_1044611_1063660_1063751_1066219
808744	contig_9389_pilon	-	1688	5	Intergenic	novelGene_83864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.619429464124	14	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	665	1216	15752	14071	FALSE	10	CCCACGAGCCTGTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVIRIWGLLKPSCLPVYTATSDTQDSMSLLFRLLTKLWICCRDEGPTSEPDEALVDECCLLPSQLLIPSLDWLPVSDGLISRLQPKQPLRLQFGRAPTLPGSAAASQLDSLARAPGQPKIDHLRRLHLGAYPTEECKTCTRCGCVTMLRSPNKTTAVKQWEQRWIKNCLCGGLWRRMPLSCP	17083	13598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_14198_14693_14778_15075_15293_15628_15822_16488
808745	contig_6027_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_74430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTAGGAAATCCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222735	220221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_220200_222700
808747	contig_1262_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_133557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292090	290832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_290800_292100
808749	SIRV6	+	200	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	526	57	526	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10763	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808750	contig_6208_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_53016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACACAGATTCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472625	471968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_472000_472600
808752	contig_14441_pilon	+	1300	6	Intergenic	novelGene_100335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	448.535126829549	2	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	68	448	6011	121862	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKEEQGPNLLGDGVVRGQLWRMLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTREQKLRPSAEAPG	5943	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_121820_121865_125517_125886_126031_126283_126514
808754	contig_753_pilon	-	1469	3	Intergenic	novelGene_112917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	9.5	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	228	824	324764	324168	FALSE	30	CTTAACATATTAGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGHSTLPRTLMAPRMISEGDIGGIAQITSSLFLGRGSVASNRQLLQARGITCIINATIEIPNFNWPQFEYVKVPLADTPHAPIGLYFDTVADKIHSVSRKHGATLVHCAAGVSRSATLCIAYLMKYHNVCLLEAYNWVKARRPVIRPNVGFWRQLIDYERQLFGKSTVKMVQTPYGIVPDVYEKESRHLMPYWGI	342504	323522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_324860_325958_326053_342466
808758	contig_4151_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_65280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCAGTTGAAGTCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653329	654954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_653300_655000
808760	contig_9921_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_23736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGTCTTTTACCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186038	187373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_186000_187400
808761	contig_14647_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_167376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63163	62749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_62700_63200
808762	contig_8167_pilon	+	506	5	Intergenic	novelGene_155637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_4	45.0444225182208	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	31977	48750	FALSE	5	CATTTGCCTTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVEHDRRRRQFTVRLNGCHDRAVLLYEYVGKRTVDLQHTEVPDAYRGRGIAKHLAKAALDFVVEEDLKAHLTCWYIQNAGRSSQPTPRVFVVTSPVTTIKCSNHWTPKLCLQEALHPGWP	31975	50048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_32029_41208_41328_43620_43686_48620_48751_49909
808763	contig_6546_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_140961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAATGTTCTCCTGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552858	554673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_552900_554700
808764	contig_2069_pilon	-	1907	4	Intergenic	novelGene_23370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.483844059096	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	140	1624	1047442	1039906	FALSE	40	AAGCATAGCAGAGATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPLDPSRKEVLRFAVSCRVLTLVLQALFNAIIPDHHAEAFSPPRLAPSGSVDQLVEVLLGGLSRWDAEHFLFIAEHGYLYEHNFAFFPGFPLALLVGTELLLRPLRGLLSLRSCLLISVALLNSLFSVLAAVALHDLGCLVLHSPHQAFYAALLFCFSPANVFLAAGYSEALFALLTFSAMGQLERSRSWTSGLLFALATGVRSNGLVNIGFLVHAQCQGFFSSLKVESPLRQLIKLMTSVFLSMLTLGLPFVLFQYYAYTQFCLPGPTQPIPKPLLQLAVDEGYRIANGNEPPWCSWNFPLIYNYIQDVYWNVGFLRYYELRQVPNFLLAAPVAILVAWATWIYVTTHPWLCLTLGLQRNKNNKTLEKPDPGFLSPQVFVYLVHAAVLLLFGGLCMHVQVLTRFLCSSTPIVYWFPAHLLQNQEPLLRTLETVPWKPLAGDSPPGQKVPRNPIRELLYNWKTCSPVTRYILGYFLTYWLLGLLLHCNFLPWT	1051136	1039622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1040188_1041502_1042628_1047364_1047499_1051053
808767	SIRV6	+	214	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	516	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
808769	scaffold_13505_pilon	-	1068	2	Intergenic	novelGene_111662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	283	723	858173	857733	FALSE	25	TTTTTCCATAAACAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRVGKTLKPHRTSVPQPQHQLCPLGQPELESDTESESWARRVFRWGHRQAITATVTEQFRPPPGLSEGLPPRWMLQRACELETISSLTDGSRRPRKEELRKVAQPSEAKLRWVPGSRTTQVLETSLLARLQIRGAAQGQAEREG	858952	857387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_858289_858785
808770	contig_9752_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_122015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81244	79582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_79600_81200
808771	contig_6325_pilon	-	858	10	Intergenic	novelGene_143340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_9	151.994964179089	1394	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	10	858	182776	114751	FALSE	45	AAGCGAATGCAGGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAMERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLE	182785	114750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_114823_115253_115280_116468_116635_118233_118341_125704_125793_127615_127704_128782_128892_130009_130129_182201_182263_182763
808772	contig_9505_pilon	+	1252	2	Intergenic	novelGene_121878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGATTAAAAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676752	678044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_677185_677224
808773	contig_2750_pilon	-	657	4	Intergenic	novelGene_164480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	70.8284312029193	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATACCTGCCTTATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158274	146198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_146679_147262_147336_148578_148630_158221
808775	contig_7530_pilon	-	2262	10	Intergenic	novelGene_141838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_7	61.1012113193459	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	359	2185	192932	171432	FALSE	45	ATTAAACATTAATAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSYVKTCSKLMEEFSPVVERLGFDENFVDITEMVEKRLQQLQSDECSSVTVSGHVYNDQSINLHDISHIRLLVGSQIAAEMREAIYNQLGLTGCAGVASNKLLAKLVSGIFKPNQQTVLLPESCQDLIHSLNHIKKMPGIGYKTTKRLEALGINSVRDLQTFSSKILEKEFGISVAQRIQKLSFGEDNSPVTPSGPPQSFSEEDSFKKCSSEVEAKKKIAELLASLLNRVCQDGRKPHTVRLIIRRYSSEKHYSRESRQCPIPSHVIQKLGTGNYDVMTPMVDILMKLFRNMVNVKMPFHLTLLSVCFCNLKALNTAKKGPIDYYLTPSLSTTKCSGKRSLKMKDTHMEDFSKDKETNCDFLPSGRIESTRNGKSPVNNTDFSKEKGINDFPLYSFPEGIDQEVFKHLPVDIQEEILSSKSREKFQGKGSLSSPLHASGGVFSFFSTKQMQDSPSNPTDQLSSSKQVSSVSPCEPGTSGLNSSSSSYVSIQKDYEDERMSQGPKESQGFHFSNTTPTISVFHSFPDLQSEQLFSKNHTTDSHKQPSAIASHHEGFTENRQQNSAEEKITFPSDIDPEVFYELPEEVQKELLAEWKTTGSYFQLVHK	196731	171354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_172230_179259_179466_182112_182244_185539_185632_186434_186614_189495_189733_191528_191682_192901_193057_193856_194022_196662
808776	contig_5450_pilon	+	1041	2	Intergenic	novelGene_170922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	29	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	216280	218230	FALSE	20	TTCATCCTTGGAAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YISSYSSPAREQNRRLQHQQLYYTQDDSNRKNFDAYRLYLQSPHSYEDPYFDDRVHFPASTDYSTQYGLKSTTNYVDFYSTKQPSYRAEQYPGSPDSWV	216278	218970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_+_216331_217981
808779	contig_9571_pilon	+	1286	3	Intergenic	novelGene_136313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	13.5	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	744	1088	601982	602326	FALSE	25	TACTGTGCCAAACAGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVQAYVIHGGPVLYQVYPFRYWGYRGNTGAVNKWGTLWRSEVWLPTKRYCCAGPHSLSISAFLRPQMPSQNIACIPHLNRILASLPHATFTDGGWHFAHTSGSTRPEGIGLSP	592830	602524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_600426_600593_601528
808780	contig_12644_pilon	-	1616	16	Intergenic	novelGene_44541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	74.2336850762509	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1044	573	1616	1654290	1483332	FALSE	10	GTATGTTGTTTTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWLPLGPFHAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAFEYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLTEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRKIPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFME	1654862	1483331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1483404_1495636_1495688_1496652_1496727_1524339_1524389_1529799_1529862_1550127_1550210_1550302_1550372_1564675_1564716_1593651_1593717_1601003_1601053_1608763_1608832_1609758_1609800_1614602_1614673_1631094_1631163_1647252_1647302_1654155
808781	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
808782	contig_9516_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_106140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562354	561345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_561300_562400
808783	contig_14687_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_107968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATAATTTCTCCTTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691949	689440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_689400_691900
808785	contig_10159_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_30806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402877	405027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_402900_405000
808788	contig_10434_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_82012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAAAATCTGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76713	77963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_76700_78000
808790	contig_10658_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_130090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368733	366919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_366900_368700
808792	contig_16622_pilon	-	300	4	Intergenic	novelGene_48514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	1.24721912892465	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	219	81	299	212116	206865	FALSE	10	TCCCTATTTGGGTGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKRSKTWLKPQGSFWGLSVAKLLSSIMAKVKEMVLPQLSVAMEGSHFPPMLKSSTPQSPPGVMCRTLMCFLKAGLNVQEETLGLRGPGPGLMAFMKKYL	223502	206863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_206915_211682_211803_212067_212161_223466
808793	contig_762_pilon	-	938	7	Intergenic	novelGene_135938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	46.8852025933793	689	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	94	816	266669	255361	FALSE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP	266762	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_256436_256765_256905_257514_257668_259724_259837_263903_264056_266666
808794	contig_16525_pilon	-	452	4	Intergenic	novelGene_133863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	961.527950711783	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	77	397	181180	178157	FALSE	20	AAGGTTCGAGGACTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181256	178101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150
808795	contig_5515_pilon	-	917	5	Intergenic	novelGene_52303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_2	27.4454003432269	1055	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATGCACTCCTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37517	33006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33386_33476_33802_34833_34899_36599_36700_37469
808799	contig_5481_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_144563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCTGGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71272	69976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_70000_71300
808800	contig_3700_pilon	-	1382	2	Intergenic	novelGene_138085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGATGGAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265094	259902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_260927_264736
808801	contig_9185_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_166884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGAGACTAGTCGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189767	188456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_188500_189800
808802	contig_16650_pilon	-	1004	2	Intergenic	novelGene_61954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAAAAAACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244361	239704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_240514_244166
808803	contig_21388_pilon	-	744	3	Intergenic	novelGene_136634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	14	307	28487	22275	TRUE	20	TAATAACCTGCGTGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMVSSGDWGCSPGI	28500	21399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22163_22464_28382
808807	SIRV6	+	224	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-390	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACAAGTCAAGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1895	2119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
808810	contig_9242_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_155074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGTTAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708481	707959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_708000_708500
808813	contig_10341_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_47244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAGCTCTAATGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147331	145693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_145700_147300
808821	contig_9727_pilon	-	2155	2	Intergenic	novelGene_86270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	541	897	103874	103518	TRUE	10	CCCCGGAGCTTTGGCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFPQSQFPIPEVPGALGQYKLLASPGPEDYSGGHSSKLMRVFGTHWTWTVPWKVRLREQSIWKATRGVCAQHVSPRPAGPSLGGQWRFSAPGSPRHTQVYSNHWNSWKQMLSHNGYL	104414	102209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_102717_102766
808822	contig_5640_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_27241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGTTCAAAGACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14264	14775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_14300_14800
808823	contig_5640_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_27242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTGCTGTCGCTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14876	16328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_14900_16300
808824	contig_10003_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_88218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAAAAGAACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557285	557848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_557300_557800
808825	contig_6589_pilon	-	1303	2	Intergenic	novelGene_25851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3317	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956656	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955831_956001
808827	contig_20675_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_161688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGACAATACTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35362	34937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20675_pilon_-_34900_35400
808829	contig_17897_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_153395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGCCCAGTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15232	13210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_-_13200_15200
808835	contig_3269_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_117044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCTCAGGGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229545	230062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_229500_230100
808838	contig_5643_pilon	+	1856	10	Intergenic	novelGene_38983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2.34652356466032	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	448	1479	592022	596906	TRUE	5	CTCTCGCGTCTGAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEDDLEDFDPDQDDLEKEDDEKETEEGEDYRKEGEDFTEDWMPNALTEDLMKEGLSLLCKTGNGLAHAYVKLEVKERDLTDISLLRSYIHLRYVDVSENHLTDLSPLNYLTHLLWLKADGNRLRSARLDELPYLQIASFAYNQITDTEGISHPRLVSLDLKGNRIRMVTGLDPQKLNSLHTLELRGNQLDSTLGINLPKLKNLFLAQNMLKKVEGLENLSNLTTLHLRDNQIETLSGFSGEMKSLQYLNLRGNMVTDLGELAKLRDLPKLRALVLLENPCTDESDYRQEALVQMAHLERLDKDFYEEEERAEADEIRQRMREDQEHEAEHDHEEDLDQSPN	555838	597888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_555981_583863_583982_584671_584809_591971_592148_592238_592349_592794_593049_593733_593865_594521_594659_596632_596931_597535
808841	contig_18272_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_7041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	917	1372	356030	356485	NA	30	TAAAATCGCTTTAGTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNQGRLLELLPWGQRRRWSSGCSSWRLSWGWGEGKSGSRRGTHRYTSPRCRPGLRLISDLQRWRGRGCLPLLPCKTMTQEYCPHPQDGRELKINQEKCRPKRPSEGVVEGSSREPKGRRPEMEGCRLGQRSTRGAGDSPKVETELDDERQ	355113	357672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_355100_357700
808842	contig_10940_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_49277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883721	881812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_881800_883700
808843	contig_10848_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_133529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	891	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGCAGTTGAATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57471	58545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_+_57500_58500
808844	contig_7285_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_143402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCTGTGATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277666	279782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_277700_279800
808845	contig_13952_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_133251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	519	821	63022	62720	NA	45	CAGATAATAATATTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSVLEEIQPERSLEARMVRLHLTYFGLVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRRPSRRWIDTVAATMGSSITMIVRMAQDRAGFRSLIHRVAVGWNRLDGT	63540	62525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_62500_63500
808849	contig_6086_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_171462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79982	79153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_79200_80000
808851	contig_11316_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_122702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGTCCTCGTAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140158	140521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140200_140500
808853	contig_14514_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_137471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCTGAAGATTAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48542	47498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_47500_48500
808858	contig_10196_pilon	-	1023	8	Intergenic	novelGene_132241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.910345097551	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	89	565	1442405	1433608	TRUE	20	TAGAAAGGTTTTGGTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448602	1433077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433476_1433547_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
808859	contig_3964_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_174206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	466.049353609679	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACTATTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79101	86266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_79155_79760_79965_82024_82240_85266
808860	SIRV4	-	194	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1329	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3829	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
808864	contig_27_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_175814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTTGTGCCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143932	145174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_27_pilon_+_143900_145200
808867	contig_7057_pilon	+	556	8	Intergenic	novelGene_123334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	761.609011051134	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	132	554	938907	943712	FALSE	5	CTTCGTGGCATCTGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLL	938319	943714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941495_943646
808868	contig_5921_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_142235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAACATTTGACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45274	44584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_44600_45300
808869	contig_12626_pilon	+	931	6	Intergenic	novelGene_80421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_1	229.022269659525	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	24	857	107206	155805	FALSE	65	TGAAAAAGAGGGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQVRNNRK	107182	155879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637
808870	contig_13464_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_125238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAACAGAATTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240251	239637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_239600_240300
808871	contig_15299_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_175457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	63.1734824818839	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	185	736	203459	210517	TRUE	15	TACTCTTGCTGTAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGGGGTGAVGGGGAGQASAGAASGVTGAGGSGGPINPASLPPGDPQLIALIVEQLKSRGLFDSFRRDCLADVDTKPAYQNLRQKVDNFVSTHLDKQEWNPTMNKNQLRNGLRQSVVQSGMLEAGVDRIISQVVDPKLNHIFRPQIERAIHEFLAAQKKEATPAPPPEPESQDPSAPSQDTS	203274	212287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15299_pilon_+_203690_207704_207830_210321_210519_211538
808873	SIRV4	-	354	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1164	3	1164	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3994	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
808874	contig_6634_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_171130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGTGTATCAGTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50078	49784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_49800_50100
808875	SIRV4	-	366	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1157	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4001	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
808876	contig_8330_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_72002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGAAAGGTGAGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2115224	2114923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2114900_2115200
808879	contig_5967_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_44404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTAAAGGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419703	421531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_419700_421500
808887	contig_6270_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_99844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297777	297478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_297500_297800
808890	contig_16594_pilon	-	1978	10	Intergenic	novelGene_53846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2617.66469289794	1	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	367	1236	165546	121101	TRUE	35	GTACTAATCAGTCAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306494	117822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121086_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_242309_242430_306350
808891	contig_8801_pilon	-	1480	3	Intergenic	novelGene_66300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	65.5	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	194	796	547914	545797	FALSE	10	CCCTCTGTTTCCATGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAFLIHTLRAPHAEDTGFCRVLYSCVFAAEKSPDDPRPHGAERDRLLRKEQILAVARQVESMCRLQQQASGRSPMDLPPQSSDEPTSLHEAPHGAFRLAAGDPFQEPRTVVWLGVLSLGFALVLDAHENLLLAEGTLRLLTRFLFDHLRLLAPSANLLLRADRVEAILTRFLPHGQLLFLNDQLVQGLEKELSAAWPL	549353	545112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_546224_547738_547949_549194
808892	contig_9706_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_21034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGACCACGTTGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618619	620106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_618600_620100
808894	contig_7622_pilon	+	2472	2	Intergenic	novelGene_132432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATAGCCCTAACCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282381	290756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_282528_288430
808900	SIRV5	-	359	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
808901	contig_14643_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_99145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAGCGCTTACGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166485	164367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_164400_166500
808904	SIRV6	+	345	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	3	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAAGTCGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_3065_3165_10724
808905	contig_5033_pilon	-	2836	1	Intergenic	novelGene_29083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2221	2571	661830	661480	NA	40	CCTTGCTGAAAATAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRCSGQCWACWVLSLIFPMYNGGCYVPFLSPAPWTCTRFKRRRKSEREIASLKTKIGQGCLVQWLKNLAANQEVSSLNPPAAPREKNVAAGFGKDYSLGNSKWQLYPVLWGCCE	664050	661214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_661200_664000
808906	contig_5696_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_117603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	475	777	807999	808301	NA	50	GACAAAAGATAAATGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRPITKNPLFVELVLTQRPYGVSEVVYLYRTRLPHLSSVCGAFGGFELPTFRLAVQHFNHCATKAYLCCDRKVKNFILPFSLSFLCWPELVLSIGCLFC	807524	809334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_807500_809300
808907	contig_10253_pilon	+	1239	8	Intergenic	novelGene_76869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.868236081168	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	35	1237	41610	100247	FALSE	35	TGAAACAACAGTTGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLFADAGLVCITSFISPYTENARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAGEIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVPENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDVVLTATQEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLHVLDRIYWHDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGVLN	41575	100249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_41814_47132_47263_52948_53068_78973_79088_81286_81399_84042_84222_84985_85122_100038
808908	contig_6823_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_131247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCAATCTGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443979	444717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_444000_444700
808910	contig_14101_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_122756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	660	1049	249580	249969	NA	15	ACTGCCTTGGCATCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSAIAQDKRTRLACLAGTPTTYTLHCLAGAGSGKHLPLWTNGKENGQRALHQGQAQMAESATFPLDQASRPTLSPLSAGHAFHAPGSFYNPGGETTEPSTFLSLRTLTLSGPRKKLVWFHPLWATLSL	248920	250822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_248900_250800
808915	contig_10135_pilon	+	1701	13	Intergenic	novelGene_106602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	6.6765551663181	70	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	189	1622	79294	83614	FALSE	0	GCTTTGTCTGGCTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTVVVLGGGISGLAAAYHLSRAPSPPKVVVVEGSKRLGGWIRTVRGPDGAIFELGPRGIRPAGAVGARTLLMVSELGLDSEVLPVRGDHPAAQNRFLYIGGALHPLPNGLRGLFRPSPPFSKPLFWAGLKELTKPRGKEPDETVHSFAQRRLGPEVASLAMDSLCRGVFAGNSRELSIRSCFPSLFQAEQTHRSILLGLLLGTGQSPQPDSALVRQARAERWSQWSLRGGLEMLPQALDTHLTSRGVSVLRGQPVRGLSLQAEGRWKVSLGDSSLEADHVISAVPASVLSDLLPAEAAPLARALRTITAASVAVVNLQYRGARLPVQGFGHLVPSSEDPGVLGIIYDSIAFPEQDGSPPGLRVTVMLGGSWLQMQEASGCVLSQELFQQEAEKAAATQLGLKEPPSHCLVHLHKNCIPQYTLGHWQKLESATQFLAVQRLPLTLAGASYEGVAVNECIESGRQAAARALGIEPAR	78943	83693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_79124_79285_79381_79531_79667_79799_79916_80087_80221_80518_80664_80772_80964_82423_82485_82666_82786_82862_82974_83060_83211_83340_83384_83471
808916	contig_10197_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_115194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	905	1417	551098	550586	NA	55	AAACAAAGAATTACTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSGSAIFTLLPSVVRGQTQLLHQRTGGITLASSRRPGGWGARLDSVRMEKNVIRTPAYLTYLPQKVLALSLQLTGPIVTCVPLLGIPEKGQPTAWGEHWTGSQRPGFESQDYHEHAASHHMPATLSAPLRLCERLKRGSVLALMITPDLGAAASSHSNAIRKPGLTKFN	552002	549869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_549900_552000
808917	contig_12150_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_6961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62028	63877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_62000_63900
808920	contig_14526_pilon	-	1904	8	Intergenic	novelGene_111224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	60.2931613545222	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	221	1003	433618	393443	FALSE	20	TTTATTTTGCCTGTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDGINRELSEAVPRLPGETRITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSALILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHDWRVTFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNRQISKLTIYDARPNVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKASVF	451878	392541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_393644_398981_399171_403582_403733_405946_406031_427855_427958_433561_433673_449990_450086_451807
808923	contig_4180_pilon	-	2089	4	Intergenic	novelGene_8423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1376	1765	1125469	1076172	TRUE	40	GGGGTGGAAATAAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHQGFHLLLDALMPLGNVHMQRVVTAGLAVSPFPPLVKGSQQACPRFRNNMVNDHGGSPSQGRLGPLEEVISRGHSLVRHLETGMDINSSRYHHPRMGFDRLHPSRHNQIFSYLLDQPIFHVYVCIE	1126844	1072457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_1072733_1076122_1076213_1078057_1078243_1125305
808925	contig_10437_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_38107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70480	69504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_69500_70500
808926	contig_11885_pilon	-	1319	6	Intergenic	novelGene_159704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.6180624622728	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAATTTGTTTGATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66498	32170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_-_32937_35061_35210_51739_51817_52789_52925_57073_57180_66411
808927	contig_11708_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_138981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGGAAACAACCAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323313	322016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_322000_323300
808928	contig_5918_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_99479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATACTATACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160679	162492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_160700_162500
808932	contig_14514_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_137461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	22	303	30691	30410	NA	50	CAAAAATAAAAACCCGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRGGAAMRWAEPEEELCPLLSYHGLPPPNTGSKGTQGYWAWLKTVVMTCREDSNSATLSARVELPHRVSKAEIFTEADCHVFFLRSSWWVRTFDLLVGS	30712	29314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_29300_30700
808936	contig_5039_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_64810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCCTCCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215825	216529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_215800_216500
808938	contig_3948_pilon	+	1128	9	Intergenic	novelGene_53418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	618	1127	1944214	1953301	FALSE	55	AAAGGAAAGACAAACAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRSSKAMKIPGMTISPSPSMAKLSASRPFSSRSWGNTNFIGASKDLATVTITFVPNTEGAGCPCLTHPEDVVDEESTQQDAASADVVQVQELHPVEGKGQAKEVVGNPVLPQQVPDADDAAQAQAHQVLGVKLIIDDLFFVLPRALREEQLVLSIWEVGWKKLIHEGA	1933189	1953302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1933615_1936662_1936752_1942183_1942284_1944210_1944247_1947250_1947336_1950371_1950431_1951112_1951269_1951356_1951443_1953210
808941	contig_2854_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_120844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGCTAACAAAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288899	290823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_288900_290800
808942	contig_1154_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_87049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1428	1805	92251	92628	NA	75	AGACAAAGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMVQDEAAFHSTEHGVTRSQGPTQPQLTPTKSASLRAKTKSRKYEKMQQYKTAKNGTKYRTTFPLESLVCPKNKTFLRSYLCSTGNRNDLYSQEVSSVRSLLFKYSVYEPGEEPHKSFLPWQKS	90823	93155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_90800_93200
808943	contig_5083_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_151671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACGTATATCAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522837	521758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_521800_522800
808946	contig_10904_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_22593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	63	326	456751	456488	NA	75	GAGAAAAAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRIRNDSGYSSSIRTAVPAGMPLPGRLGLASPLPCLRKCYKALLAPLTRARRYPTLPASLLSKGAQLSCSVGQLAHCCCLAQQAGKPTMLSCTSLPVLWPPLFYCTC	456813	455993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_456000_456800
808949	SIRV6	+	496	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	8	514	1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
808951	contig_12270_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_113767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1	351	13854	14430	FALSE	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGTGPEQQGHEEQSLWHHLAAPACL	13853	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14138_14363
808953	contig_8729_pilon	-	1612	15	Intergenic	novelGene_40092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.9537839220098	148	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	551	1453	263489	257371	FALSE	0	GGCCGCTGCCTGTGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTCSSLSVLLRELIRSMVDRAEAERDVLFPGYTHLQRAQPIRWSHWILSHAVALTRDSERLLEVQKRINVLPLGSGAIAGNPLGVDRELLRAELNFAAITLNSMDATSERDFVAEFLFWASLCMTHLSRMAEDLILYGTKEFSFVQLSDAYSTGSSLMPQKKNPDSLELIRSKAGRVFGRCAGLLMTLKGLPSTYNKDLQEDKEAVFEVADTMSAVLQVTTGVISTLQIHRENMARALSPDMLATDLAYYLVRKGMPFRQAHEASGKAVFAAETKGIALNQLSLQELQTIRSPCSRVT	267989	257211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_257394_257495_257605_257721_257803_258981_259066_259327_259388_259474_259560_259742_259858_259995_260059_260411_260465_261060_261139_261239_261318_263415_263674_263921_264006_264378_264572_267900
808955	contig_3463_pilon	-	1017	6	Intergenic	novelGene_62002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	152.193823790586	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3	578	522782	508757	FALSE	35	TTTGGAAAGATGAGCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	522784	508317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651
808958	contig_4931_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_138351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTGCAAAACGTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162242	163655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_162200_163700
808961	contig_5018_pilon	-	2728	15	Intergenic	novelGene_47177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1886	2497	1560417	1558463	FALSE	20	CCCTGTACACTACCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSISEYFIPFTRMGINLDQMRGQDFLADGLLGQRQPELAGLEGHVLIVVLGPLQHVLDNAVHVRDKPVDPHFQQHHQSAAHVLPHLRVVIHGQGKQVLDEGVNVVHQSLGSVHDELVHTGNGMGPDLGAAVLEELQELGDHDVEGPVEGIAVQKLRRVFADLLQGSKGSLHREGKGDGHGSQFPASAPAGAGCSLSPTSQVL	1569051	1558231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1558698_1558776_1558857_1558932_1559055_1559153_1559276_1560364_1560427_1560521_1560686_1560858_1561025_1562665_1562885_1563094_1563269_1563744_1563830_1563914_1564029_1564134_1564285_1564864_1564954_1565140_1565574_1568769
808964	contig_15066_pilon	-	1342	7	Intergenic	novelGene_149540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	168.108843709465	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTCTCTTTTGCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113790	111682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111856_111932_112087_112275_112392_112487_112847_112954_113344_113441_113512_113709
808968	contig_10706_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_175161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9673	8562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10706_pilon_-_8600_9700
808969	contig_9014_pilon	+	787	2	Intergenic	novelGene_106822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	12	785	258622	259808	FALSE	30	CGAGAATCAGCCCCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPLLPPPPPPQGSGPGISNNQPNQIHLNSAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQGTGGPPQNSMLMASGGPDSLNAPCGSVPSSSQMMPFPPRLQQPHGAMAPSGGGGGGPGLQQHYPSGMPLPPEDLPSQPPGPMPPQQHLMGKGMAGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKPSSTLQYFPK	258610	259810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_258770_259182
808970	contig_6980_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_36083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAAAATGCTGTTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391896	391297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_391300_391900
808971	contig_13958_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_129528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	299	382	114673	114756	NA	40	TGCTTTGGAAAAAAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWVGSVWFSSEASCLLRFFWKPTFALGCGEQVFLGRSGCLRCSTRNPSPVETQSWGRARPVARGRGASYRCRRLGTDGLSLSSSLWRSQRPRSLCESAMADTAPNGPQGAGAVVSAWAGSPGLKQ	114374	116731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_114400_116700
808972	contig_20944_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_167533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACAGCTTTCTACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16353	15916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_15900_16400
808973	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
808976	contig_14666_pilon	+	841	3	Intergenic	novelGene_39605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	300	794	484281	485184	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKCTLC	477258	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_484119_484761_485169
808980	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
808982	contig_854_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_36187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	204	488	489516	489800	NA	10	CCCCATGGACCTCCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGTRWRSDWLRLSPLLPLLGPKPHHRSPGQLQWPPLWSPCSALDSYSSLPPTALIAARPILCPEPSMDPHLIPPPPSFPHSILVCPEHACSLSTSQPPGLFVPDNHVVPSITSCTFWSSTTFSVRPFLTTLFKTTARDPQPPALLISLLVSSLELVSPMW	489312	489818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_489300_489800
808984	contig_9177_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_32804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAAAAAAAAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1549262	1550386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1549300_1550400
808985	contig_9177_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_32805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTGTGATAAAATGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1550336	1551603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1550300_1551600
808986	contig_14866_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_175815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1755	152	1906	5486	3732	FALSE	10	GCAAGTCGGTCTCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKGYHSPPEDLEMERRWSQVSQSVEHTSLGPTERTDENKYMEIVNVSCVSGAIPNNSTQGSSKEKHELLPCLQQDSNRSGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSIRDADYTCDQQNQQGSVSPAKIYQNVEQLVKFYKENGHHPSTLSSVSRPLRSFMSDPGSCVNGGVMRAIVKSPIMCHEKSPSICSPLNMTSSVCSPAGINSVSSTTTSFGSFAVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSPISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNSTFSYAASGTPVGSSATRDMVPSPDTHEKGAPEAPFPKTEEGENVISNGVAGQLNIVQYIKPEPDGAFSSPCLGGNSKINPDSPFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGFDGNCEGSEFSMGIKQEPDDGSYYPETSIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSARDQSFQHLSSFPPVSTLVESWKSHGDLPSRRSDGYPVLEYIPENVS	10990	3729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14866_pilon_-_5489_10841
808990	contig_3862_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_137408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCTTCATACATACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490702	489907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_489900_490700
808991	contig_854_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_36543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCCCTACTCCCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1622577	1623833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1622600_1623800
808992	contig_6710_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_93472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653736	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
808993	contig_13481_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_119414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTGTGTGTGTGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718525	718123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_718100_718500
808994	contig_10196_pilon	-	1776	6	Intergenic	novelGene_132174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	4.53431361950185	132	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	23	928	1072541	1069737	TRUE	5	TGCGTGTGGTGTCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAGGGSMEAVEEPGNLSGVRHIILVLSGKGGVGKSTISTELALALRHAGKKVGILDVDLCGPSVPRMLQAQGCAVHQCDSGWVPVFVDQEQSVALMSVGFLLETPDEAVVWRGPKKNGNKTQVLSGPMRAVTRSWHHPGSTGRACEKLRDEAGSTVLGLEGHCSRVTGLQGWGPHWGFCWTIRPRAPAGVRSQPRASEPSRSPRGLLPGLGCSGLSLVWYRHQLMAPGWGGGRNSVLGNCACVCPPGSGLALWGPGQAGALSALEAAGGGGLLGAPSPAPGVLGRLRSAHKAVCVGRGLGGSWTSWW	1072563	1068310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068883_1069276_1069347_1069421_1069533_1069641_1070508_1070597_1070717_1072525
808995	SIRV5	+	321	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	198	149	84	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8399	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
808996	contig_4857_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_48706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTACTATTTTTTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172987	1174939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1173000_1174900
809000	contig_6199_pilon	+	1701	3	Intergenic	novelGene_126390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	46	6	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	18	428	478430	513685	FALSE	40	ATCATCAGATGAACTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRKCGMKNFRNIQVDEANLLTWQGLIVPDNPPYDKGAFRIEINFPAEYPFKPPKITFKTKIYHPNIDEKGQVCLPVISAENWKPATKTDQVIQSLIALVNDPQPEHPLRADLAEEYSKDRKKFCKNAEEFTKKYGEKRPVD	478412	514958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_478499_501226_501414_513530
809001	contig_12700_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_175819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	329	637	74472	74164	NA	25	GATGATAACCCTCCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLPLSEGPYLTEGAHTPKGLSFPGDLGLEAKKVSISDLHREEGLKSKWVRPGLGPHTPPSCPSPGLHEGEPGGIVPELSRDEPPPSLSPAYQRVFLLPHP	74800	72761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12700_pilon_-_72800_74800
809004	contig_6208_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_52967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCCTCCTCCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325419	325000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_325000_325400
809007	contig_7895_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_154451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAGGTATAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721773	723126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_721800_723100
809010	contig_10765_pilon	+	1122	4	Intergenic	novelGene_122860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	178.327414231987	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	98	430	15747	32220	TRUE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCRVRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMVTMRYERASAVCRALFVCCACFQRGLLVCLVL	15649	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_28914_29040_32032_32541_34727
809012	contig_19098_pilon	-	1424	4	Intergenic	novelGene_65862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.5750717662504	472	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGGACAATCGTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502979	485631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_486586_488386_488494_488671_488932_502876
809015	contig_5041_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_27021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATTGAGTTGATTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254335	252894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_252900_254300
809016	contig_8631_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_121968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGACCTAACAAGCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770267	771648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_770300_771600
809017	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
809018	contig_10753_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_105130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58350	56202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_56200_58400
809024	contig_16768_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_168320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGCAAAATGAGTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34180	32429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_32400_34200
809025	contig_10674_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_6468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392903	394498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_392900_394500
809026	contig_6048_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_73182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGATTGAAAACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328711	1330112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1328700_1330100
809027	contig_6954_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_64423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139379	137268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_137300_139400
809030	contig_12786_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_103435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	182	616	600902	600468	NA	25	TTCCCAGTTAGCAATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGKACGGLSSSGRSQNGEGQLRVGADPPFSGASVLWNLAQCFCLGIVSESFLTGSMKRSCFFFCCCCCPTHFPSLGPRTGCGKALPCTSANSHFGLPAFFFFFNMLLCF	601083	600444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_600400_601100
809031	contig_7428_pilon	+	1535	10	Intergenic	novelGene_77733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	97.2405696973322	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	401	1297	433375	435117	FALSE	45	CACAATAAAGTTTATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNLNRIPYKDTFWKGTTRTRPRNGTLNKHSGIDFNQLNFLAKLNENHSGELWKGRWQGNDIVVKILKVRDWSTRKSRDFNEECPRLRIFSHPNVLPVLGACQSPPAPHPTLITHWMPYGSLYNVLHEGTNFVVDQSQAVKFALDMARGMAFLHTLEPLIPRHALNSRSVMIDEDMTARISMADVKFSFQCPGRMYAPAWVAPEALQKKPEDTNRRSADMWSFAVLLWELVTREVPFADLSNMEIGMKVALEGLRPTIPPGISPHVCKLMKICMNEDPAKRPKFDMIVPILEKMQDK	432634	435355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_432721_432893_432990_433156_433445_433547_433634_433779_433890_433997_434126_434211_434334_434429_434530_434641_434773_434967
809033	contig_9440_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_59052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCCATTTATTTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475228	474471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_474500_475200
809035	contig_6098_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_145461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAGTTTCAGTTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18713	17102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_17100_18700
809036	contig_401_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_42740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTTAATAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159328	158257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_158300_159300
809042	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	657514	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657515	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
809043	contig_12532_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_111159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCTACCATTGGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132356	133285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_+_132400_133300
809044	contig_9363_pilon	+	932	8	Intergenic	novelGene_6816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	197.242004054069	6	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	45	581	1622283	1623633	TRUE	10	TGGGGCCACGCGAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWRATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGSGGHPGGWAFGDGLQALGLGSDQFLDAGSGP	1622238	1625965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623738_1624342_1624445_1624573_1624637_1625883
809045	contig_6710_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_93482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
809047	contig_18150_pilon	-	1491	5	Intergenic	novelGene_175820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	20.2854627751008	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTTTATTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21970	11009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18150_pilon_-_11161_11978_12083_12424_12553_18599_18911_21173
809048	contig_9227_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_154309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCCAGGAACTAACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59617	58777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_58800_59600
809049	contig_12301_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_110009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTCAAAAGTCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42757	41273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_41300_42800
809051	contig_5145_pilon	+	1146	2	Intergenic	novelGene_131420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTGTACCATTTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846323	848973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_846477_847980
809052	contig_2768_pilon	-	1735	16	Intergenic	novelGene_57472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	249.329286954688	1	40	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1518	216	1733	561921	540092	FALSE	35	TCAACAAGTGTCTCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKKPEERSPLVAAMQHFLPLLKDRFIQLLPDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDVPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGVQQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEQNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVLHYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIRPVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEGSDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLAHSLT	562505	540089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_540133_540215_540283_541777_541907_543104_543266_543458_543625_544016_544107_546707_546825_546967_547045_547804_547905_548490_548626_550212_550298_550410_550506_552439_552530_558103_558261_561913_562077_562445
809053	contig_9724_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_172582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTTCTTCAGAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21576	20413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_20400_21600
809054	contig_3382_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_124132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	3	428	784547	784972	NA	20	ATAACGTGGGTCTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQSPILHSTQSHLNQTTLPLCLISFNDFPLHTEQNPKSWSRPTDPHAVALVYSAVNTYQASLQSVLPAFTSRSFPSRWLHPYCPPCLHGFSLLLSHGSFSSLLQHFLLQGAFPDSSIHAGSNHSQSSCPGLVLHSTYQIS	784544	786822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_784500_786800
809055	contig_4364_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_35	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	673	1017	285374	285718	NA	65	GAAAAGAAAAGTCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAFDGLIRDWARNDERVSELEDMSTETPQTEKQREQRLKKKIEQNIQELWVSYKRYNMYNGNNWKDTKERKEQKKSLIMAEKFPKLLTDIKLQMLDAQETPNRLKNTKKIYT	284701	285739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_284700_285700
809057	contig_12923_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_30122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCACAACAGAGAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71695	72443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_71700_72400
809058	contig_11846_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_106001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTAAATCCACACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413215	415638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_413200_415600
809060	contig_7513_pilon	-	1328	5	Intergenic	novelGene_88938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	80.1373820385967	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	109	993	87692	63046	FALSE	35	ACACAATTGTATGATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLSAEPGSGCRGSPPRLPPGRWLWLRAGLPAVDFRMSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGDKIPLLCVPFEKKDFVGLDTDSRHYKKRCQGRMRKHVGDLCLQAGMLQDSLVHYHMSVELLRSVNDFLWLGAALEGLCSASVISHYPGGTGGKTGARRVQGSSLPAEAANRHRPVPWVQQTC	91725	62710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_63072_66270_66400_71522_71669_87108_87703_91627
809066	contig_5019_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_109233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370417	369853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_369900_370400
809067	SIRV6	+	355	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	608	164	-18	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCACGAGTAGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
809068	contig_11294_pilon	+	1543	9	Intergenic	novelGene_50057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	129.858516759587	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	4	921	251378	323802	FALSE	35	AATATATTTTACCTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELENKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGVKTT	251374	324424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693
809070	contig_6735_pilon	-	714	6	Intergenic	novelGene_15711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	847.932214271872	318	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	85	594	564868	542104	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKVSDSSLPMNVSSNPPPTPAKSAVLSGIPGLLTWEGT	568282	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542194_552819_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
809072	contig_14341_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_111868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1096	1437	594625	594966	NA	5	TCTTTAGGGTGTGTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALAKVSSTFIALKRAFSSVNFLVLSKVRVIAKGSSTLTAFIRSFSSVNSPVLNKSRAAAKGFPTLVALIRPYLGVNFLMPKEIGALAEGSSTSAALKRPFSSVNFLMSNEV	593529	595660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_593500_595700
809076	contig_7695_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_41680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTTAATTAGAATGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037583	1035569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1035600_1037600
809079	contig_15486_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_157312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATCATAACCAAACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56023	56714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_56000_56700
809081	contig_6506_pilon	+	1301	8	Intergenic	novelGene_153485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	421.585249325661	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	106	1299	154549	215849	FALSE	35	TCCTCCCAGCAATATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSALKRQNLYNNPFNSVSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSLSDRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATTSRRSSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRNSPRSRSPARGMEYSRVSPQPMISRLQQPRLSLQGHPADLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRTSTTQVDSVKSSRSDSNFQVPNGGIPRMQPQASATSQRLKNLPRTSLKAKQLLQTSSTKRVPSPGKFRSPAAPSPLALRQPVKAFSNHGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQNTVPA	114807	215851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_+_114879_154514_154664_158701_158867_161157_161320_164816_165177_165638_165777_176850_176929_215673
809082	contig_19769_pilon	+	815	6	Intergenic	novelGene_102274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1462.15192097128	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	32	787	87249	89322	FALSE	15	CTGCCACTTAGCTGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGEWQKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86998	89350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88051_88870_88958_89163
809083	contig_6661_pilon	+	1758	8	Intergenic	novelGene_174109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	18.8733696417109	36	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	64	1269	380292	404845	FALSE	30	TCTAATTACGATAGCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATKTLFDSRRLEKRTEVPLVVMGLLLTLLLLGHLTVVTYGHPILKAPESVTGLWKMDVNIPCTYGPLQGYTQILVRWLVQHGSDPVTIFLRDTSGDHIQQAKYRGRLHVNHEVPGDVSLRLNTLEMDDRSHYTCEVTWQTPDGNQLVRDKIIELQVQKFSVSKPTVTTGSGYGFTVFQGMRISLHCQARGSPPINYVWYKEQNNNQEPVKVAALSTLLFKSAAVADSGSYFCTAKGRVGSEQRSDLVKFVVKESSKPLKTKTEAPTAMPAPLEATSTANTFWGWTTEVDGYPGEISAGPGKGKGLPVFVIILIISLCCTVILTMAYIILSHKTSQQEHVYEVTRLHTRKASDSGETTRVAVFASGCSSEEPTATALHNDYSDELCLGQEYQIITQINSDYTHLLPTVPPDYEFLATQGKNVC	380228	405334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_+_380347_386103_386461_387204_387487_398564_398628_399168_399253_401901_402007_404251_404274_404607
809084	SIRV2	-	492	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	106	88	106	-88	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGTTACATCGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5789	3753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
809085	contig_4426_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_15343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGAGTTTATCTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7707	6427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6400_7700
809086	contig_5482_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_144508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGCAAGAAATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661615	660435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_660400_661600
809087	contig_6710_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_97035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
809088	contig_14202_pilon	-	1441	2	Intergenic	novelGene_157141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1049	1381	104572	99673	FALSE	10	TCAAGCCTGGGTTCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQEKLKVLGEAGLSETNFSETTEAADYFYKDPKQQTIYDLFQKSFEEDRSDMELLEALESFDPGSASGTSGSSSQDMGDTLDESTFTASPSKKRRFEFFDNWDSFTSPM	105620	99612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_99913_104479
809091	contig_17311_pilon	-	409	4	Intergenic	novelGene_57861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	2091.86461214763	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	34	408	126865	121546	FALSE	35	GTGCAGGCAAAAAGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANV	126898	121544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344_123555_123642_123709_126862
809093	contig_614_pilon	-	2441	1	Intergenic	novelGene_132608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCATTTAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223836	221395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_221400_223800
809095	contig_6208_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_52986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374137	375949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_374100_375900
809096	contig_4730_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_71710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGAGCTACAGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136852	138389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_136900_138400
809097	contig_7182_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_117118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTCCTAATGCAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312147	312744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_312100_312700
809098	contig_3825_pilon	-	1205	8	Intergenic	novelGene_78019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1096.81589250011	2	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	12	746	1470962	1462265	FALSE	15	TTTCCAGCTTTGATTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGPAVHLILFLSLQALTVQAADTCPEVKMVGLEGSDKLSILRGCPGVPGAPGPKGEAGAKGGRDQGPPGIPGKAGPKGNNVTKDEGEPGHSEYCRTAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGESQQPVLLHQRPGQ	1470973	1461805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462308_1463660_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1465864_1465898_1467905_1467972_1469010_1469125_1470880
809101	contig_9177_pilon	+	1293	9	Intergenic	novelGene_32811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	28.2046095523409	203	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	30	1010	1633066	1647103	FALSE	15	TCTTGGCCTGGAGCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFITRRIPPEGRAALAQAADCEVEQWDSDEPIPDKELERGVAGAQGLLCLLSDRVDKRLLDAAGANLKVISTLSVGVDHLALDEIKKRGIRVGYTPDVLTDATAELAVSLLLTTCRRLPEAIAEVKNGGWTSWKPLWMCGYGLTQSTVGIIGLGRIGQAVARRLKPFGVQRFLYTGRQPRPQEAEEFQAKFVSAPQLAAESDFIVVACSLTPATKELCNKDFFQKMKKTAVFVNISSIFQWKNSHSVGCSALKAACHSQGRCGKPGRLVPGLGQWSYCSCWTRCDHSRTTAYKPPSPDPEELCDPAPHWQCHPQNPQHYVLVGS	1633036	1647386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1633131_1635368_1635500_1636400_1636474_1637030_1637148_1638320_1638410_1639562_1639668_1640976_1641113_1644394_1644593_1647036
809102	contig_233_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_14539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3300	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79045	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974
809103	contig_19006_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_145585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACACCATATATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49351	47489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_47500_49400
809104	contig_4924_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_84743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAAGTCTGAGTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153207	155362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_153200_155400
809105	contig_13753_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_136512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188683	189362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_188700_189400
809106	contig_17198_pilon	+	905	8	Intergenic	novelGene_62404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	54.1682940624186	628	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	41	826	1100207	1103875	FALSE	20	TAGTTCATTTTAAGGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSEVRRSSAAWAMVQLRPRASCTPAEADAMVDEGQPASEEVAEHGLLLGQPSSGAAAEPLEEDEEGDDESDDEAPEELTFASAQAEAREEERRVRETARRDKILLKEKRKRREELFIEQKKRKLLPDAVLEKLTTTSQTNIKKSPGKLKEVDLQKKHEGHDKGSDSKKAGTQKVQPGSQNKSYVALRLKDQDLRDARQQAAKAFIQNSLYGPGTNRMTVNKFLSLANKRLPVKRAAAQFLNNTWGAQKKQNAKRFKRRWMFRKMKASGRVNGS	1100166	1103954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1100470_1100544_1100606_1101271_1101331_1102662_1102695_1102950_1103033_1103178_1103301_1103379_1103458_1103786
809107	contig_10674_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_6470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTGCCATGTCTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410977	409032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_409000_411000
809108	contig_18544_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_152762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATGGAATATTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194950	197126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_195000_197100
809109	SIRV6	-	388	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9439	-122	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTCGACTGTCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	1666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3131_10704_10825_11035_11109_11205
809113	contig_14467_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_138268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGAGAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324404	324803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_324400_324800
809114	contig_6919_pilon	-	1357	3	Intergenic	novelGene_163988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	14	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	783	1247	67864	64990	FALSE	10	TTCTCTATCCCCTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREWETDETEELSSGQRQALVCFLENSHYGSLINADGHAEVWTDWNDMSKFFQYGWRCTTNENSYSNRTLMGNWNQERYDLKNIVQPKPLPSQDLSKSLTGSQDINLNWILLDTNTQKSQLTWIAIQNLKSHVTLSVYGILIMANFRVQDSKKE	68646	64879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_65176_66017_66249_67816
809115	contig_11416_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_145355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACAATAGTTGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250211	249767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_249800_250200
809119	contig_8864_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_136003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTAGCCTAAATGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722913	724435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_722900_724400
809120	SIRV4	-	178	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1345	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3813	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
809122	contig_11493_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_143725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTTTGATTGTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350251	349036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_349000_350300
809125	contig_6929_pilon	+	702	3	Intergenic	novelGene_139416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6083	junction_1	1333	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	46	309	127755	130939	TRUE	20	ATAATTGCCTTTGTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127709	132310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127787_130707_130971_131948
809127	contig_3825_pilon	-	717	6	Intergenic	novelGene_77963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGACAAAGCGGGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15651	13665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_13769_14053_14238_14377_14469_14778_14894_15230_15300_15496
809128	contig_10079_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_175825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTACTTCATAAATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196976	198873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10079_pilon_+_197000_198900
809129	contig_3721_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_123815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGTTTGTGAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143223	144487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_143200_144500
809130	contig_9177_pilon	-	818	4	Intergenic	novelGene_32686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTTCTGCCGGTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415914	405502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_405555_405918_406003_407996_408074_415309
809133	contig_17518_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_117351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGACTGAAATCCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5235	5918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_5200_5900
809134	contig_160_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_156326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGTTATTTACTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192877	195012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_192900_195000
809136	contig_15039_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_110163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACTCAGTTTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253938	254395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_253900_254400
809140	contig_6418_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_81175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAATTATTGTTTAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573921	571969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_572000_573900
809142	contig_5959_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_150229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAGAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588172	585700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_585700_588200
809147	contig_3832_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_161422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGGTTTGCAGACCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45525	47080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_45500_47100
809149	contig_14275_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_162865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGTGAATTTAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318251	317968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_318000_318300
809150	contig_10904_pilon	-	1298	7	Intergenic	novelGene_22611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	310.33391514446	406	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	67	414	515110	510240	TRUE	5	CTCTGTGTGTGTATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVGWDCLAASWPGSAEPRTRTMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEESGQ	516027	499129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499852_507509_507532_510099_510254_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
809151	contig_13904_pilon	-	869	4	Intergenic	novelGene_165492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	214.100184233664	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGTCTTAGTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124914	107544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_108074_108597_108731_111535_111636_124807
809153	contig_6137_pilon	+	1421	3	Intergenic	novelGene_59156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_2	51.5	179	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCATCCTTTGTACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1238489	1269383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240550_1268908
809155	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_94313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
809156	contig_5643_pilon	+	371	2	Intergenic	novelGene_38987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	610441	615057	FALSE	30	TCTCCACAGCCTGAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICFGGRRAIRARWGGKGRWGPPSGGVGDAAVVVAAATEVGKRRGGGEWPPPPPGGAGAPNPARSQPAVLSYHQASLKRDPASSGTYTGNLEILLPTSQAIAVGNLG	610440	615104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_610663_614955
809158	contig_3584_pilon	+	1810	12	Intergenic	novelGene_108198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.8524094707248	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	566	1414	558597	562364	FALSE	35	TAAAATGTTATTGCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL	556471	562760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_556511_556602_556722_556936_557045_557457_557571_558259_558420_558570_558726_558981_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
809159	contig_11328_pilon	-	1843	7	Intergenic	novelGene_88376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.5361312797194	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	226	783	605565	590049	TRUE	30	AAAAATGTGGTATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASSRGPRPFSPSGIPAPVPESGHGRVALVGPTAGGQLGGGLVRGQLHHRACHCRVLQHGIGSVYFHATLSFLGQMLDELAILWVLMCALAMWFPRRYLPKIFRNDRGRFKAVVCVLSAVTTCLAFVKPAINNISLMTLGFPCTALLIAELKRCDNVRVFKLGLFSGLWWTLALFCWISDRAFCELLSSFHFPYLHCVWHILICLAAYLGCVCFAYFDAASEIPEQGPVIKFWPSEKWAFIGVPYVSLLCASKKSPVKIT	615651	581855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_582701_589647_589856_590041_590236_593081_593220_598060_598199_605470_605613_615473
809160	contig_9199_pilon	+	1481	11	Intergenic	novelGene_65653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGAAGAGAAAACAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172497	186138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_172600_173227_173323_173657_173872_174308_174489_175005_175230_175582_175719_179452_179515_181260_181414_181936_182058_184713_184773_186003
809162	contig_19744_pilon	-	769	2	Intergenic	novelGene_120393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGGTAAAAAAACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195190	194242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_194486_194664
809165	contig_6710_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_97750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
809166	contig_15456_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_139487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68451	70049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_68500_70000
809169	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
809171	contig_10904_pilon	-	945	4	Intergenic	novelGene_22616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.05621028085	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	4	414	515110	499664	FALSE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTLPNHHAFTWKFCEPACCRLPQKRVLERVLFPLATYLAPQ	515113	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499785_514097_514181_514793_514925_515034
809172	contig_6710_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_98287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	20	CTACTGAGGCATCCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653600_653900
809173	SIRV2	-	216	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1	1062	1	-1062	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTCACCCCCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5894	4727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
809180	SIRV4	-	294	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1227	0	1227	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
809182	contig_14984_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_174157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATACTTATAAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31758	29615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_-_29600_31800
809183	SIRV6	+	322	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	535	14	-44	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTCGAAGTCGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
809187	contig_8885_pilon	+	1374	2	Intergenic	novelGene_115589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	57	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	75	479	351242	351646	TRUE	20	TTCAATGCCTGACTGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTDPLAGLVLSDNDRSLLERWTRMAQPPAPAPPTVQPASPTPGPVAQQTGPPPQPAGSTPGPASQPACPPSEPAPHPTGPPGPVPAPLQSTTSSLLAPQPLVPPPGLPGPSALRVLPYFPSGPLPPDPEEAPQLSTSESPDVNLVTQQLSKSQVREA	351167	352679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_352109_352246
809189	contig_815_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_175032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAGGGTTTCCAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17058	16163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_815_pilon_-_16200_17100
809191	contig_5083_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_151651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	905	1210	305313	305008	NA	65	TCATAAAATAAAAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMKTLGAGHYPPQNLRHRKFFEKRGLEYCEIKHQNPQGVKDEVFRSNCVLNKHFILTSKSPCTRRLLAMSEETGKFTSPKTSIKPDNCQNNHFRALDND	306217	304417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_304400_306200
809192	contig_6365_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_134018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGTATATATCAGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149304	148942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_148900_149300
809193	contig_10437_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_38443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAATGAAATAAATTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939141	937695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_937700_939100
809195	contig_14566_pilon	+	1002	7	Intergenic	novelGene_148841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	395	junction_1	254.56367900128	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	123	1001	88884	125192	FALSE	35	CATATACTCTCATTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESV	88761	125193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
809197	contig_11846_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_105998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAACATTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408007	405837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_405800_408000
809198	contig_10009_pilon	-	933	5	Intergenic	novelGene_82721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCAGGTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68721	41538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42026_55196_55301_60319_60407_63216_63354_68603
809201	contig_12842_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_168344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCCCTGCAGACCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159997	161234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_160000_161200
809204	contig_13097_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_107735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGGTCTTCTATTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252912	253465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_252900_253500
809205	contig_10263_pilon	+	2255	10	Intergenic	novelGene_135827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCCGAGCTCCGACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592555	791104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_592594_593945_594089_624402_624574_642894_643062_646225_646307_647599_647753_659919_659995_692553_692972_749087_749914_790921
809206	contig_7412_pilon	-	1675	8	Intergenic	novelGene_76288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	114.587458800192	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	26	916	280454	272428	FALSE	5	GTTTCGTTTTGATTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLAPLIALVYSVPRLSRWLARPYYLLSALLSASFLLVRKLPPLCHNLPTQREDGNPCDFDWREVEILMFLSAIVMMKNRRSITVEQHIGNIFMFSKVANAILFFRLDIRMGLLYITLCIVFLMTCKPPLYMGPEYIKYFNDKTIDEELERDKRVTWIVEFFANWSNDCQSFAPIYADLSLKYNCTGLNFGKVDVGRYTDVSTRYKVSTSPLTKQLPTLILFQGGKEVMRRPQIDKKGRAVSWTFSEESVIREFSLNELYQRAKKPSKAGDHIPAERPEAPTPTPVPDGESKKDK	280479	271668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_272575_273687_273818_273905_273972_274142_274250_274485_274563_274852_274967_275202_275264_280265
809208	contig_12486_pilon	+	1656	3	Intergenic	novelGene_175830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	36	434	6918	11022	FALSE	15	GTCATGCTGACTCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGLQSMPGEYVARGGPMGVSMGQPSYTQPQMPPHPAQLRHGPPMHTYIPGHPHHPTVMMHGGPPHPGMPMSASSPTVLNTGDPTMSGQVMDIHAQ	6882	12244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12486_pilon_+_6943_8143_8234_10738
809209	contig_3077_pilon	-	1536	9	Intergenic	novelGene_26781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	101.122141492356	172	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	68	1267	241006	220397	FALSE	15	ATTGTGTTCTGACTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPGPLGQPRSNTVAMPKRGKRLKFRAHDACSGRVTVADYANSDPAVVKSGRVKKAVANAVQQEVKSLCGLEASQVPAEEALSGAGEPCDIIDSSDEVDAQEESIYERTVSRKKKSKRHKEDLDRAGGEEYPMDIWLLLASYIRPEDIVNFSLICKNAWTVTCTAAFWTRLYRRHYTLDASLPLRLRPESMEKLRCLRACVIRSLYHMYEPFAARISKNPAIPESTPSTLKNSKCLLFWCRKIVGNRQEPMWEFNFKFKKQPPRLKSKCMGGLQPPIQYEDVHTNPDQDCCLLQVTTLNFIFIPIVMGMIFTLFTISVSTDMRHHRVRLVFQDSPIHGGRKLRSEQGVQVILDPVHSVRLFDWWHPQYLKNILRKHLLNTAASHQLRLTLPRTQGGT	241073	220127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_220491_222001_222163_227127_227284_229751_229833_233967_234149_235066_235227_239666_239835_240624_240715_240897
809212	contig_8303_pilon	+	1911	14	Intergenic	novelGene_154925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	14.2874132548475	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	296	1657	81973	119238	TRUE	20	TTGTATACCTACTGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAFVIRAGVAGLSAWAEYTRLLPGLGAGKVTPIGYRVANCLTEKLPRLITPPEAKKFFNFRYPPAGAERVFYGRANDPQIAPNLTHGIKSRSSIPANMLINPQPITTFQQKIKDEKESIYFSHQRAPLGKSHDQTAGLPKGMDVINTTFGTAVIREFSARDVVNPPKSYEEVLKEGKEGHDLYIVSHNDYDVGEVKNRKYNPASFHRFGLYGVPTPHFNDGRTMAKTLYWLHELQMKRGAKVVSKRVDDFKEKFQHKLGRVLDPIAETMNVPPDHTFGACLRPEEYGAGDLIHNRLPGEYLRGKDRQRAMLAAVRHHLKKVNCQNFDTLLAAFKHYDKKGDGMIDKAELQEACDQANLHLDEKLLDQLFNYCDVDKDGMINYLEFANFLNWKDKLPLKEYEERVIIKGRKQDCTNLTEANVQESVPTLLIKPDDIILKEPGSSEKTLRTLLRPSDKVSNEYKTSSSEINAVVGAVPSTCYPIYGVPTIRSDIPAPRIRRVSDRTNYGEEGNAYSLLHPTIFSQKGVFERDFFKTRSKEELRKRKKEQFLP	55263	121985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_55346_80318_80382_81102_81247_81966_82148_84039_84151_88907_89038_92499_92584_93136_93205_102533_102689_113727_113936_116722_116936_118230_118413_119202_119277_121769
809213	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
809216	contig_5918_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_99496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCATACACCAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230618	228946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_228900_230600
809217	contig_18919_pilon	+	954	4	Intergenic	novelGene_156024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAGAGAGAGAGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69080	167424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_69250_159880_160218_165615_165708_167068
809218	contig_2312_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_160745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGGGTAGGGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251809	252508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_251800_252500
809219	contig_15775_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_148381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGTCCCAGCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68476	68033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_68000_68500
809221	contig_10962_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_103905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCCGTCCTGTCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350297	352580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_350300_352600
809223	contig_1143_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_86599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAATCATTAATATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202616	202335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_202300_202600
809227	contig_10307_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_170290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTGCCAGCTAATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561622	560017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_560000_561600
809228	SIRV6	+	256	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	8451	2	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
809229	contig_10940_pilon	-	770	3	Intergenic	novelGene_49247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	713	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAACAGTTTGATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917146	874037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874545_916707_916748_916923
809230	contig_11378_pilon	+	2049	10	Intergenic	novelGene_112230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_7	82.6143801191363	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	118	990	310056	334255	FALSE	35	GGTGAAAGGTATTGTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISPPESYYPDLTTLRETFGDSKERVRWRTKQNLDYCFLMMFAQEKGTYYIQLEDDIIVKQNYFNTIKNFALQLSSEEWMILEFSQLGFIGKMFQAPDLTLIIEFIFMFYKEKPIDWLLDHILWVKVCNPEKDAKHCERQKANLRIRFRPSLFQHVGLHSSLTGKIQKLTDKDYMKPLLLKIHVNPPAEVSTSLKVYQGHTLEKTYMGEDFFWAITPTAGDYILFKFDKPVNVESYLFHSGNQEHPGDILLNTTVEVLPFKSEGLEINKETKDKQLEDGYFRIGKFENGVAEGMVDPNLNPISAFRLSVIQNSAVWAILNEIHIKKASN	309116	335314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_309197_310018_310095_314822_314938_316246_316378_320448_320557_320679_320874_324159_324239_324904_324972_333988_334102_334228
809231	contig_19769_pilon	+	480	5	Intergenic	novelGene_102264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1575.13920019787	427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	36	446	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_87828_89198
809232	contig_18415_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_118315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCAAGTAGGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79776	80713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_+_79800_80700
809233	contig_835_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_152145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCCACAGCAATATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160954	162903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_161000_162900
809235	contig_11448_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_66355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCTTTCCTAGACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189739	191635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_189700_191600
809240	contig_3825_pilon	+	865	7	Intergenic	novelGene_77926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1368.96964498446	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	20	817	12232	15603	FALSE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGEWVLLRGVSGGASCCNDDDFSPEVTLVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12212	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14275_14780_14912_15231_15302_15498
809241	contig_12841_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_55849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCGGCTGGGGCGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256725	289291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_257550_257953_258019_263354_263502_267710_267838_273717_273823_275595_275712_286368_286454_289165
809242	contig_6724_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_167983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	81	308	385797	385570	NA	55	ATCGGAAAACTAAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAALGGGGRQAREPCCRVAAARLVTMIGTWCLQGTASVRRHAMPGPRGPWVSAVTPLSDRRQVPTLPGLLSPRTRHGPATVVVGPETKCVLSEPPPSCVG	385877	383681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_383700_385900
809243	contig_13048_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_138931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473908	472276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_472300_473900
809245	contig_7189_pilon	+	532	6	Intergenic	novelGene_117657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	224.345626210987	107	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGAAGAGGACACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537603	589025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_537788_541128_541194_562190_562239_580573_580718_585140_585214_589007
809250	contig_14275_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_162879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAAAAATAACTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465864	465131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_465100_465900
809251	contig_3817_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_78384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	189	488	946086	946385	NA	70	TATACACGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPGIHPGEVKAGTPTETCIAMFTAALFTIAKKWKPPKCPSTDEWMNTMWHIHTMVYYSAMKRNEIRMHATTKKDLENITLSEISQSQRNRYWMISPT	945897	946560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_945900_946600
809253	contig_2892_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_119000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117989	117225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_117200_118000
809254	contig_5718_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_110366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAAACAATGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940918	938782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_938800_940900
809255	contig_500_pilon	+	750	6	Intergenic	novelGene_31067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	987.53458673608	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491924	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1498047_1498078_1498882_1498974_1499277
809258	contig_4845_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_53686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATAACTTCATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830484	832456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_830500_832500
809259	contig_5434_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_74698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACAACCAACAATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432647	430771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_430800_432600
809262	contig_9784_pilon	-	2552	2	Intergenic	novelGene_165704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGTTACCAGGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363893	361264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_-_363206_363282
809263	contig_6496_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_103500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTTGCTTGATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595472	594220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_594200_595500
809265	contig_6227_pilon	+	1051	3	Intergenic	novelGene_49669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	156.5	257	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	153	362	495153	497963	FALSE	30	GGAAAGTCGTCAACGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPGSPGWTGHPVAQCAARTKQEASATGPDLLNPGPAGHLDTTSSLSPNSNMTTRELQEYWRNEKCHWRPSPRARGPCSACRPGRATGTTLLCWTPWPAWPTHWARTSCPCKRNWRSASS	493491	498652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_493612_495120_495200_497800
809266	contig_821_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_149405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211505	210479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_210500_211500
809267	contig_9698_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_82497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATCATATTCCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194426	195687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_194400_195700
809268	contig_6829_pilon	+	2099	5	Intergenic	novelGene_123762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	9.20597631976098	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	331	456	18531	18656	TRUE	40	CTAGAAAAAATTATTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFGLVFRGVGCPVGANEGILGSVGLRPCLLSISIIGRRNTCERGREEAQPSKKASGQSAVGQNWTVWRVPRGRSWSAPHSSKVWFRQSSGRSSGEDSSSAREFHHRGTGSMQSGEEKMSAQLPGSTLTGRSCGSSRSRKLSAHRGGSLSRW	18200	53956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_18868_33090_33222_33327_33365_34312_34519_52898
809269	contig_10436_pilon	-	821	3	Intergenic	novelGene_108492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1750.5	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	68	388	103480	102032	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVRRVARAAGADADATVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103547	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_103344
809270	contig_20263_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_175833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAAAAAAACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43035	43938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20263_pilon_+_43000_43900
809274	contig_6048_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_73154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGCTAGTATAACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117013	1117888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1117000_1117900
809275	contig_6691_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_60180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427746	426848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_426800_427700
809277	contig_16635_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_153133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53052	54070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53100_54100
809279	contig_7202_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_18128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27875	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
809281	contig_12178_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_156545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAAATATTCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237783	235427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_-_235400_237800
809282	contig_13519_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_124615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	86	310	53917	53693	NA	35	CATCTGAGTGAGTAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSFTPCVLEEDGRESAWSGGLSKHLEGGMTPPDWGSGGGLLSNKDSSLSPCSSHGRWQALGRNSYVMHLASLALGNLVSQLQQILVLRCITENKSYLPSRDS	54002	53472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_53500_54000
809283	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
809284	contig_10569_pilon	-	1263	4	Intergenic	novelGene_44100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1.4142135623731	141	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	112	366	466480	466226	TRUE	40	CTTAAAATTTGGAAGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARVGKRFRPLGRGQQVRLWARYKSAFDCWGRASSWWNMANSGYGNCSDHEENSFLYFAYGSNLLKERIHLQNPSAAFCCVACLQVSAPPPALQNVVPRLQTKEKNKRVAVRSVLTHSDPIG	466591	454834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_455398_457187_457290_458214_458365_466143
809285	contig_19769_pilon	-	769	5	Intergenic	novelGene_102309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	182	400	89175	87936	TRUE	20	TGTCCACGAATTACGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRTSFIESPTLVLFLLHSLGSPESSGPASSNKTHFAAGRGIPADGGGLANVLVVATSKRMLHGVHGHTPHTWPTVPLGLILVVGTAGLQDGLVNAATTSHHLLAEEMTFLEPEGSFTRVFLVSGLWEMTVA	89356	87271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87367_87449_87608_87819_88029_88843_88958_89163
809292	contig_2799_pilon	+	2382	10	Intergenic	novelGene_85560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	735.211299097741	33	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1273	2175	757727	762419	FALSE	40	AGGGGAAAGGGGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKGKAYFV	725758	762626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_725873_729189_729365_748953_749016_751394_751452_755302_755439_756998_757866_758463_758715_761269_761396_761508_761627_762150
809294	contig_13528_pilon	+	1052	7	Intergenic	novelGene_66852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_6	471.860295944561	334	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1035	18	1052	12393	32377	FALSE	20	GTACTTGCTTATTTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAGICGLGVKADMLCNSQANDILQHQDSNCDVTSNKHSLEEDEGSAFITNNRNLVSPAYCTQESREETPGQEARTDPPDGQQDSECNRNKEKTLGKEVLLLMQALNTLSTPEEKLAALCKKYADLLEESRNVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQSEHSKAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQVQLEQHDVHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKEADEKHQREREFLLKEATESRHKYEQMKQQEVQLKQQLSLYMDKFEEFQTTMAKSNELFTTFRQEMEK	12375	32377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_12682_13900_13993_21896_22068_25270_25466_27587_27708_29216_29292_32284
809295	contig_5023_pilon	-	2177	11	Intergenic	novelGene_7135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1585	1890	353590	353285	TRUE	0	GCCGCTCCTGGCCCGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKGPMKKQRQLQSGSRSSPWLPPGGRKSCNGGCTSWGLIQVTLGLENRMSTGEGEWSESERQGEPSTSTESSLILSQGSTEVSCRPVDCDSIFPGSGLV	405750	323638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_323838_353196_353854_358615_358687_359328_359540_373060_373207_375330_375397_387161_387402_388231_388290_402042_402192_403086_403177_405460
809297	contig_14289_pilon	-	1948	3	Intergenic	novelGene_110577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	6	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1142	1564	88974	86504	FALSE	35	CGCATAATTTGGTCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGERTALLVTSHVLWGVRAGRHSHTASGACACQQLPDEPLTFDDPGWFQILRYGRGAAPVWISGENVPQEKDIPNCPCGAKRIFEFQVMPQLLNLLKADSLGTSVDWGVLAIFTCADSCALGTGYAEEFVWKQDVTDTA	91897	86119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_86663_88710_90075_91856
809302	contig_10236_pilon	-	1484	4	Intergenic	novelGene_169124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	6.0184900284226	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	212	529	178439	175015	FALSE	30	ACTGACCTTGATATATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETEGKKDDADYKRLQTFPLVRHSDMPEEMRVETMELCVTACEKFSNNNESAAKMIKETMDKKFGSSWHVVIGEGFGFEITHEVKNLLYLYFGGTLAVCVWKCS	187009	174059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_175180_176558_176643_178370_178580_186938
809303	contig_11594_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_80903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	870	1181	159867	160178	NA	40	GTAGACTCAACATTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKGYTRKLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLHINKENNEKEIRKTIPFIIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLQQKTQRDLHKWKNIPYSWI	158997	160179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_159000_160200
809304	contig_10197_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_115230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACTTGCATTTTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934622	936704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_934600_936700
809305	contig_15134_pilon	-	2093	17	Intergenic	novelGene_140219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_16	93.9489347664464	5	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1986	108	2093	216759	184465	FALSE	15	TATGGTGGTTGATTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVDSILDELDKEDSTHDSVSQESESEEDGIHVDSQKALALKEKGNRYFKQGKYDEAVDCYTKGMDADPYNPVLPTNRASAYFRMRKFAVAESDCNLAIALNRSYTKAYARRGAARFALQKLEDAKKDYEKVLELEPNNFEATNELRKINQALTSIENSYPKEADTIIKSTEGEEKQIEEQQHKQQAISEKDLGNGFFKEGKYERAIECYTRGIAADGTNALLPANRAMAYLKIQKYEEAEKDCTQAILLDGSYSKAFARRGTARTFLGKLSEAKQDFETVLLLEPGNKQAITELSKIKKELIEKGHWDEVFLDSTQRQNVIKPIENPPHLGSTKPLKKVIIEETGNLIQTIDVPDITTAAAPERNPANSADGIATTGTASKKNSTQDDLLPTSDIPRAKVLKIEEISNTSALPPQGSLKQDVSQSFSEKISTEVEKTPAQLITIVLPSVPGNSFQLESDFRQLKSSPDMLYQYLKQIEPSVYPKLFQKNLDPDVFNQIIKILHDFYIEKENPSLIFEILQRLSELKRFDMAVMFMSEPERKIVHVLFNHIDKSGLKDKSVEELKKR	218107	184464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_184539_187358_187460_187934_188033_188959_189147_190356_190596_194698_194801_194917_194989_199386_199509_204639_204768_205886_206013_207057_207129_207896_208019_211114_211243_212055_212179_215644_215786_216606_216766_218006
809311	contig_4857_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_48900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAACAAGTTGTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479138	1480347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1479100_1480300
809312	contig_4857_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_48901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGTCTCTGATAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480546	1481137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1480500_1481100
809313	contig_8594_pilon	+	647	4	Intergenic	novelGene_140061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	21.4527905462721	400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGGCCTGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488127	537951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_488276_496157_496237_534656_534924_537798
809315	SIRV7	-	718	3	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-1	-22804	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATCCCCGAAGATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147924	78841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_78964_114680_114961_147608
809316	contig_7839_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_45671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCATAACATCTCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71040	70735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_70700_71000
809317	contig_14744_pilon	-	1806	5	Intergenic	novelGene_66136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_4	96.112889354134	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	66	719	1601809	1593918	FALSE	20	TGAGGTTGTTAGTTCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLREL	1604750	1592830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
809318	contig_9668_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_58075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	541	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47591	44379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_44586_45889
809319	contig_16535_pilon	+	603	3	Intergenic	novelGene_167704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	23	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	16	480	255787	256940	FALSE	5	CCCCTCCTGCCCCAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAPAMAAEGTAVAGGGAVGGCPASDSLELSKCADAAPIRRRTSSLSQDAERRAYQWCREYLGGAWRRVRPEELRVNPVSGGLSNLLFRCSLPEHLPSHGEEPREVLLRLYGAILQGVDSLVLESVMFAILAERSLGPQLYGVFPEGRLEQYIPVRAQP	255771	257063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_256011_256382_256492_256808
809320	SIRV6	+	393	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	607	11	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACGAGTAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
809322	contig_3986_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_52729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTTTTAAATACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149064	148820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_148800_149100
809323	contig_7457_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_31269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACCCCTACGGGGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50643	53071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_50600_53100
809324	contig_13004_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_112748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956240	957807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_956200_957800
809325	contig_10109_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_131325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAACAAGTTTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123993	125074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_124000_125100
809331	contig_20596_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_157242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGGCTATCGCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115757	115152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_115200_115800
809332	contig_11986_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_69169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTATTCCGCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511767	509482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_509500_511800
809334	contig_6283_pilon	-	2533	19	Intergenic	novelGene_100202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	234	413	588229	587876	TRUE	10	GGTGTCATGCCCCCGATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVWLPLLSEQCHGCGIEQVAQDEDQGAGQGPDAEQRGHKESQQEQEQRPVAAQEAQADPGDLGPAGSVRLSHGAQQMPVGQRRLSEVVAAEATQKVSPGTQGCHLACKSAVDGGGQPEEHTDQASDLIAPNGLQL	588462	565461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_565547_568332_568416_570591_570680_571548_571693_571835_571912_572479_572590_572742_572794_573520_573668_576592_576735_577532_577606_583266_583413_584152_584246_584746_584847_585566_585730_586393_586599_586976_587212_587528_587661_587828_587960_588133
809336	contig_14508_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_79051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61935	63746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_61900_63700
809340	contig_1725_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_24249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGTAGGAATCAACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193656	191872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_191900_193700
809341	contig_1399_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_166674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCAGAGGATTTTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573356	573882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_573400_573900
809343	contig_15021_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_26932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	1292	1816	178900	179424	NA	15	CAAGGCCTCTGGGCGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLWIQTGKQPAGTPTQASRWMDPAPRALLPRPPGGRALLSGHSYPGLQVDGPCSAGTPAQASWWTGPAQRALLPRPPGGWTLLRGHSCPGLLVDGPCSADTPARASRWTGPAEEELLQVPALFQTPGLLTSCPMLPSGCDRLHVPAGEGRQALPHNPRTLREQQDHIWKRQSR	177608	179655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_177600_179700
809348	contig_14807_pilon	+	1115	6	Intergenic	novelGene_124729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	353.315949257884	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	24	476	75260	76845	FALSE	10	TAACGTGTTGGCTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGAGRAMEDYTVLSDAELVAMLRQYNIPHGPVVGSTRKLYEKKIFEYETQRRRLSPSNSSASSFSYRFSDFDSTSSDSDKYDLPKKEDALFYQSKGSNDDYEESYLHTRTSGEPESVGASRNFREPVASLSNTETFGHQTREDDLFTSSEEESKDR	75236	77669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_75342_75435_75544_75934_76013_76211_76343_76791_76846_77030
809349	SIRV2	+	325	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-62	260	-62	-260	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACTGGGTTAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046	1371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
809351	contig_15304_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_30440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	369	398	52954	52925	NA	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53322	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_52900_53300
809354	contig_4223_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_117281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATATAGTACATACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298784	298028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_298000_298800
809355	SIRV6	+	265	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	112	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3135	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
809356	contig_18671_pilon	-	1130	3	Intergenic	novelGene_150007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	9	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTGTTATAAAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152975	138331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_-_139304_148261_148319_152874
809357	contig_11816_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_98551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCATGTAAAGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108343	1106814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1106800_1108300
809358	contig_12644_pilon	-	2204	3	Intergenic	novelGene_44468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATTTTTCACCCTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012585	1008364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1009788_1011523_1011868_1012148
809359	contig_16714_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_161574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCAATTAAGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871681	874128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_871700_874100
809361	SIRV6	+	328	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	545	0	379	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
809362	contig_10196_pilon	-	629	3	Intergenic	novelGene_132035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	936	junction_2	220.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	191	592	409216	404095	FALSE	25	AAGACCACCCCCCTCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLNDKISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK	409406	404057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404300_404421_404606_409203
809363	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
809364	contig_4974_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_161416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGTGCAGCAGGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115468	116171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_115500_116200
809367	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
809374	contig_12635_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_60875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTATGGAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879118	879970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_879100_880000
809375	contig_12923_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_30157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	8	328	265447	265767	NA	15	TGTGTTTGTTTCTATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCMGFRSLDGANSSLLATNLNKGWGFKPTQLHRGREAWRCASGKDYSQENPMNGSNLQPVGLPRGGMDWRATCLVLTFRMVKLGISRLGFLQIMWKGLQAQEGQRRLS	265439	266635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_265400_266600
809376	contig_17993_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_61924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41544	40298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_40300_41500
809378	contig_5196_pilon	+	2496	1	Intergenic	novelGene_38674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGCATATCTGTGTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78961	81457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_79000_81500
809379	contig_20719_pilon	-	1563	5	Intergenic	novelGene_140560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	19.1360262332596	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	481	1044	13123	8596	FALSE	15	AATGTCATGCCTCCTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLYPCSASELKALGYKDVSRAKLAAIIPDPVVAPSIVPVLKDEVDRKPEYPKPDTQQMIPFQPRHLAPPGLHPVPGGVFPVPPAAVVLMKLLPPPICFQGPFVQVDELMEIFRRCKIPNTVEEAVRIITGGAPELTVEGNGPVENNAVLTKAVKRPNEDSDEDEEKGAVVPPVHDIYRARQQKRIR	13603	8076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_8799_9398_9460_9604_9700_10437_10592_13072
809380	contig_5628_pilon	-	2275	6	Intergenic	novelGene_157572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	183.923244860458	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	242	922	281815	278863	FALSE	35	TTTGAATAAAAATCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAHLRAAPCNDLHATKLAPGKEKEPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGVRVADNLPVAIKHVEKDRISDWGELPSGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERSDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALPEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSPECQHLIKWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHSLSPEPNK	282362	277509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_279021_279775_279953_281469_281837_281925_281977_282079_282187_282300
809382	contig_6785_pilon	-	1631	8	Intergenic	novelGene_132589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	18.3592272301913	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	67	1047	779674	736576	FALSE	35	GGATTCTATCAAATTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVLFCRRLCAGADSRAPGADTMYGFVNHALELLVIRNYGLEVWEDIKKEAQLDEEGQFLVRIIYDDSKTYDLVAAASKVLNLNAGEILQMFGKMFFVFCQESGYDTILRVLGSNVREFLQNLDALHDHLATIYPGMRAPSFRCTDADKGRGLILHYYSEREGLQDIVIGIIKTVAQQIHGTEIDMKVIQQRNEECDHTQFLIEEKESKEEDFYEDLDRFEENGTQESRISPYTFCKAFPFHIIFDRDLVVTQCGNAIYRVLPQLQPGNCNLLSVFSLVRPHIDISFHGILSHINTVFVLRSKEGLLDVEKLECEDELTGTEISCLRLKGQMIYLPEADSILFLCSPR	779740	735991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_736714_737661_737779_739117_739349_742606_742805_757130_757250_758751_758853_778946_779021_779671
809385	contig_2033_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_71540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTACATAAGAACCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140459	141105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_140500_141100
809386	contig_11171_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_48548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGGCTGGGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46886	46681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_46700_46900
809387	contig_6109_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_160375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCATAAAATTATGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568325	568744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_568300_568700
809388	contig_6109_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_160376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569140	570716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_569100_570700
809389	contig_1719_pilon	-	733	5	Intergenic	novelGene_87375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	634.420207748776	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	86	316	803613	773631	TRUE	15	GGTTTGCATGATACTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLALLLLLAVFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACED	803698	766758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_767079_773533_773633_786536_786598_787980_788100_803564
809390	contig_7057_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_123203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1546	1941	419617	420012	NA	35	TTGATTTCTGAACAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCIILGPGLILLRSCPQPCCDFHTQKYGFVLSLSILLCLGLDGLTSPCLGTPESLPLPTHFPPGVTTMAEDIKIKIKNYRTAPFDSRFPNQNQTRNCWQNYLGKQGMVWENADLLVTCLRFLTLSPPPPR	418071	420113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_418100_420100
809391	contig_7057_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_123393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCAAGTTAGAGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218134	1217435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1217400_1218100
809392	SIRV5	+	410	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2151_2270_2316_3298_3405_3483
809393	contig_17882_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_175836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGGGCCCCCAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84222	83844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17882_pilon_-_83800_84200
809394	contig_10446_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_162457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTGAAATCCAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474628	476077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_474600_476100
809398	contig_7378_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_120272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTAATCTTTGGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522355	520649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_520600_522400
809399	contig_10494_pilon	-	1013	2	Intergenic	novelGene_102165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCGGTCTCAGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916470	914714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_915394_916136
809400	contig_4876_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_137890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	360	770	310787	310377	NA	30	AAAATGGGTATTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSGSDSSVGARACFGGLFANLIRPGDAKAVCGEMTRDQLMFDLLKLVNILVQLPLSGNREYSARVSVTSNTTDSVSDEEKVSGGKDGNGSSTSIQGSPAYVADLVLANQQIMSQILSALGLCNSSAMAMIIGMY	311146	309481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_309500_311100
809401	SIRV6	+	358	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	347	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
809402	contig_13496_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_107647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGCAATTTAAAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379456	381729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_379500_381700
809403	contig_12884_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_105019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCGAGTCCGCCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233986	1232918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1232900_1234000
809405	contig_2987_pilon	-	911	6	Intergenic	novelGene_125857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	137.157719432776	452	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	203	400	539583	535508	TRUE	10	TTTGTCTGTGCCTTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVYAVVLQCLARGLPADSLGDQGRGLEPRDENVQGRIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQVNQNSTSSHLGSS	593474	533287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_535550_538273_538325_539478_539678_553777_553850_593438
809406	contig_17427_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_30395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAAGACTCACTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234018	234745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_234000_234700
809407	contig_3700_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_138074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAGAAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204630	203858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_203900_204600
809409	contig_5999_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_45630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCCAAGTTGACACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166110	166942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_166100_166900
809410	contig_10196_pilon	-	917	3	Intergenic	novelGene_132206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	210.5	485	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	132	401	1260668	1256120	FALSE	15	GAACATGTGTCTTGTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRAHTLPHGGPLPPGPAPRGGDSRRGLAGLPLLSPESPCWEEAMAAAFQLASFVLVIGLVTFYRIGSYTSLSWSCYLNIGACLLATLAAAVLIWNILHRREDCMAPRVIVIRRSLAARFRRGMDNDYVESPC	1264936	1255603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1256365_1260643_1260719_1264855
809413	contig_14868_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_150426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACAGCACACTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50560	53035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_50600_53000
809415	contig_5590_pilon	+	1344	9	Intergenic	novelGene_163051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	88.8551313937468	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	162	305	425755	427107	TRUE	25	AGGATGCCTGTGACTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCFNTLGGHSCVCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICDTNPVNGRAICTCPPGLHRRGM	425593	432398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_425768_426976_427134_427216_427403_427983_428098_428339_428454_429095_429330_429582_429696_432073_432267_432339
809416	contig_13878_pilon	+	2923	1	Intergenic	novelGene_165742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAGGAAATCACATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316904	319827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_316900_319800
809418	contig_10642_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_78721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTCCTAGTGGGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918029	917722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_917700_918000
809419	contig_15104_pilon	+	1935	8	Intergenic	novelGene_163369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	26.5099134326026	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	142	960	927610	946721	TRUE	50	ATTTTTATAATAACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRQNEIAMFPHEVNHFFSGSTITDSASGVFDSISSRKRSSISKQNSFQTGSNLSFSCGGETRVPLWLQSSEDMEKCSKDLAHCHTYLVEMSQLLQNMDVLHRTYSAPAINAIQGGAFESPKKEKRSHRRWRSRAIGKDAKGTLQVPKPLSGPLRLHSSNPNLSTLDFGEEKNYSDGSETSSEFSKMQEDLCHIAHKVYFTLRSAFNTLSMEREKVKHLMEQDVTSSPSAQVIGLKHTLSSALAQNADLKERLRRIHAESLVLDPPGCCQVG	927468	954488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_927724_928346_928471_930502_930607_930810_930904_932193_932351_943499_943631_946625_946735_953526
809420	contig_5571_pilon	+	898	2	Intergenic	novelGene_75516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCACAGCTAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128512	130560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_129259_130408
809421	SIRV6	+	324	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-238	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2785	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_10727_10819_11040_11109_11205
809423	contig_17833_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_174609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215667	214801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_214800_215700
809424	contig_8552_pilon	-	2707	11	Intergenic	novelGene_80104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.9671656654676	4	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	1051	2541	551181	549691	FALSE	25	CAGGAAAGTTTTATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSKEYNLRRHYQTNHSKHFDQYTEKMRDEKLHELKKGLTEYLLGSTEIVCPEQNQVFANVSPAENAVVQPVEDVAGNLWEKLREKIKSFVAYSIAIDEITDTNNTTQLAIFIRGVDENFDVSEELLDTVPMTGTKSGNEIFLRVEKSLKKFNIDWSKLVSVASTGTPAMINVNDGLVTKLKSKVAMSCKGSNLKSVCCIIHQESLCAQKLKMDHVMDVVVNSVNWICSRGLNHREFTTLLYELDNQYGSLLYHTEIKWLSRGLVLKRFFESLKEIESFMLSKGKPVPQLSSKDWIKDLAFLVDMTMHLNTLNISLQGHSQIVTQMYDLIRAFVAKLCLWETHLARNNLVHFPTLKSVSRDESDGLNYIPKIAGLKTEFQRRLSDFKLYESELTLFSSPFSMKIDSVHEELQMEIIDLQCNTVLKTKYDKVGIPEFYKYLWSSYPKYKHHCAKILSMFGSTYICEQLFSIMKLSKTKYHSQLKDSQWDSVLHIAS	603952	549524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_551303_554558_554751_555842_555927_556820_556899_571703_571767_574411_574469_591163_591208_591574_591630_593920_594085_595383_595504_603880
809426	contig_2646_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_69558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAGGATTATATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863076	862366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_862400_863100
809427	SIRV1	+	261	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTCCCCCACTATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
809428	contig_14405_pilon	-	886	2	Intergenic	novelGene_85651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAGAGACGCAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491016	489800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_490439_490768
809429	contig_14405_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_85652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGGGTAAATCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491610	490932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_490900_491600
809430	contig_1428_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_158409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCAGAGTAAGTACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140446	141030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_140400_141000
809432	contig_16870_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_155488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	948.700789237576	105	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	246	302	96132	96188	TRUE	10	CCCTGAGACTGTGCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPSLPARLSSCLELRLPQPRNHAPKPPVARPHPVGSLADPGPETYPGPDPGPSSAQGPSAARLPARQVPGQVVRHRPGGAMQFRKNKANLRCTLPPTS	95615	99188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95823_96093_96229_97734_97855_98087_98190_98969
809433	contig_854_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_36327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCATTTTCCCTTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646648	644831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_644800_646600
809435	contig_12802_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_114244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGGGCTAGATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63868	65823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_63900_65800
809436	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
809438	contig_5217_pilon	+	1412	4	Intergenic	novelGene_135730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	4.89897948556636	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	75	821	507486	509786	FALSE	30	CATCTCAAATGACTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLAVCILLVCTFLVCALLLLNPWMAGLIVSTYRMGQRPSGPPSSLLPGALAEPCPPQVLVLAMMTVELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFTVHVALGFLTTQGSQNLRAARALEHTFAPVTDGAVSTLLGLLMLAGSSFDFIVRYFFVVLTVLTLLGLLHGLVLLPVLLSILGPPPEVVQIYKESPEILSPTAPQGGLRWGASPTLPQSFARVTTSMTVALHPPPLPGAYIHPASEEPAWSSAATPAAYVPDNLSSRGLCTDTE	507411	510377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_507726_508776_508920_509003_509104_509522
809439	contig_13226_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_175339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATGATTATTGAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142352	142997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_+_142400_143000
809442	SIRV6	+	259	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	124	-6	42	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3147	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
809445	contig_1406_pilon	+	1854	2	Intergenic	novelGene_25625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCTCCTTGAAAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2613554	2616870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2614234_2615695
809450	SIRV4	-	197	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	417	3	-417	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAATAAAAACTATCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
809452	contig_4519_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_123757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGGGAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438760	1437032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_1437000_1438800
809453	contig_9434_pilon	-	1111	2	Intergenic	novelGene_150471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	80	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTTCCATTGGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49756	46237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_47221_49628
809455	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1163	3	1163	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3995	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
809457	contig_5878_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_145713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATGGTATATGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200443	198568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_198600_200400
809460	contig_17270_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_67228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGAAAAAAGAAAATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103061	104774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_103100_104800
809461	contig_6434_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_61873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	31	303	856475	856203	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRERRGQVCEMMACSNNKIWEPKQVSVHKNRQMLTVSNSYLVSIYIFMYVYISLEIELNLRPFVPLRLLYMLNISVKFFEDENPFNSKSSQIPLLCILLD	856505	854335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_854300_856500
809463	contig_5515_pilon	+	1012	6	Intergenic	novelGene_52310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_5	101.35995264403	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	155	952	38249	49784	FALSE	20	CCCATGAGGCCTGAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVALQTRLAKRGILKHLEPEPEEEIIAEDYDDDPVDYEATRLEGLPPSWYKVFDPSCGLPYYWNVDTDLVSWLSPHDPNSVVTKSAKKLRNSNADAEEKSDRSHDKSDRGHDKSDRGHDKSDRSHDKSDRGHDKLDRDRERGYDKVDRERERDRDRDRDRGYDKADREEAKERRHHRREELAPYPKSKKVASRKDEELDPMDPSSYSDAPRGTWSTGLPKRNEAKTGADTTAAGPLFQQRPYPSPGAVLRANAEASRTKQQD	38094	49844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_38316_48213_48326_48565_48679_48868_49154_49390_49455_49627
809464	contig_10940_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_49283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCTCACTCAGATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905916	906269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_905900_906300
809465	contig_9901_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_126918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCAACAGAGTTTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104468	107041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_104500_107000
809466	contig_12042_pilon	+	2142	3	Intergenic	novelGene_170448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	0.5	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	176	511	318947	321969	FALSE	60	TCACCTAAAGCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRFKPSADAWPQELAPIGHNRMYNMVPFFPPVTNAELFLTADQLGYSYAIDLTVKETWGWTTILLMVIGVLMLLAGLFVLLAFLQYRRLRKGYTPLMETHLSNKRYVEEA	304099	323600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_304236_318907_319110_321796
809467	contig_6270_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_99869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGCCCGGCTACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045925	1046289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1045900_1046300
809468	contig_13780_pilon	+	2120	2	Intergenic	novelGene_149135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTTGGCAGCACTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905130	910556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_905233_908538
809469	contig_9305_pilon	+	1094	2	Intergenic	novelGene_148184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	255	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	97	474	48437	49489	FALSE	30	TGTCATTCCAGGTAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCVPVRPGPRPLGAHTSVRCQKLNKITSDKTTSCQREIRAKTGRRKQVMGQSLGAGSMGDFLSQDLGDEREQARKIRSKGIPEGTASAKALRGVADWTQRCVGDGGDRRLKRQGQALRAFQEVS	48340	50109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_48809_49483
809470	contig_4429_pilon	-	744	2	Intergenic	novelGene_50804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182615	174738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_174937_182069
809473	contig_10331_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_54183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTCCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602484	601158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_601200_602500
809474	contig_10948_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_124982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTATGTTCTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199463	197213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_197200_199500
809475	contig_7359_pilon	-	856	5	Intergenic	novelGene_139867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	19.0459969547409	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	315	665	356083	353029	FALSE	0	GCGTGCGTGTTCCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMTYAELSVYGRLRKIAKMGPYSMFCKLVNMWRDKYTPRQVAEKVKRFFSKYSVNRHKMTTLTPAYHAESYSPDDNRFDLRPFLYNTGWPWQFRCIERQVLRLEGSGQQDLDGVD	360968	352837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_353080_354571_354749_355960_356090_359775_359846_360730
809476	contig_10475_pilon	-	1022	2	Intergenic	novelGene_148730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	16	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	214	1020	84427	83621	FALSE	20	GGCAGCCCTGTACCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLA	90132	83618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_84503_89994
809478	contig_8330_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_71896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGAGATTATGCAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087184	1087528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1087200_1087500
809479	SIRV6	+	349	5	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1692	558	-244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
809482	contig_9819_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_175591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138790	139378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9819_pilon_+_138800_139400
809483	contig_5145_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_131416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1784	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACACTCCCAGTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823027	823936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_823000_823900
809486	SIRV6	+	521	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	7	3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
809489	contig_5196_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_38669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	651	1004	14523	14170	NA	55	CATCAGGGAAGAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTGIPLILTSLSFTYSIKDKVT	15173	13300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_13300_15200
809492	contig_18869_pilon	-	2051	2	Intergenic	novelGene_55982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	1	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	391	933	53041	52499	FALSE	15	TTGGAGGAGGGTGGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59874	51380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_53330_59772
809493	contig_8616_pilon	+	1028	9	Intergenic	novelGene_72386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_8	50.8685499596755	1203	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTGTAGTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195795	199039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_196914_197236_197268_197609_197657_197845_198124_198540_198588_198825_198858_198952
809499	contig_6415_pilon	-	1163	3	Intergenic	novelGene_175844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	3	121	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCATGAATAACAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121945	88176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_-_89148_89425_89598_121925
809500	contig_6415_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_175843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCCTAAGTAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87349	86802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_-_86800_87300
809502	SIRV2	-	521	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4344	42	3169	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTGATTCGCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1600
809503	contig_12409_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_169440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGAAATTGGTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133749	132885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_-_132900_133700
809505	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	20	-1	20	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAAGTCAAGCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
809508	contig_3161_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_84542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGACATTTTCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703064	702479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_702500_703100
809510	contig_9777_pilon	-	2115	7	Intergenic	novelGene_154425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	81.1000753527531	185	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	14	1027	12571	3047	TRUE	35	TCACAAATTTATTAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGMSLTHSQNFRKLLNEITGEAALRLAELSTKEFAGFQIGLLNKDLKPQTYRNAYDIPRSGLLDQLTRMRSNLLKTRKFIVGQDEDSLHSVPVAQMGNYQEYLKTLPSPLREIDPDQPKRLHTFGNPFKQDKKGMMIDEADEFVAGPQNKVKRPGEPNSPLSSKRRRSMSLLLRKPQTPPTVTNHVGRKGSLSASWFPSYPNLIKPTLVHTDATVIHDCHEEGMENGQTAPDGFLSKSVPPKLVNMAGDDIPANRVDSPSDDFACFRKDGLIHKPGSNALGGGTVNCSLSIDGPKVTTTSTLGTVANTLQITPAMAQGINADIKHQLMKEVRKFGRSKV	12584	1358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_2360_2959_3054_4072_4452_6891_7127_10149_10293_11287_11412_12445
809514	contig_10235_pilon	-	1473	7	Intergenic	novelGene_46556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	21.4476105895272	201	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1257	216	1472	431644	429582	FALSE	15	CTCCCCACTATGTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRHKLLKWWAQSFLPGVPNVVTGFRNPEGFICSLKTFPTMEMFENVRNDRDGWNPSVCMNFCAAFLSFAQSTVVQDDPRLVHLFSWEPSGPVTVSVHRDAPYAFLPTWYVEAMSRDLPSPPQDSLPPRTDASEGLVPSVCTDNKGIFLSG	432055	429580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430084_430221_430355_430576_430660_430897_431288_431651_431846
809515	contig_13823_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_145258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGGCAAAGGACAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238870	239730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_238900_239700
809518	contig_5260_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_144400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAGAAAATTTGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455942	454923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_454900_455900
809519	contig_7202_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_17547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCTCCCATCTTCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27624	27852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
809520	contig_3269_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_117014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80291	82475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_80300_82500
809521	contig_10734_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_51260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTTCCATTAACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287275	1286069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1286100_1287300
809526	contig_3380_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_60107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACACTCGGTAACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419947	418298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_418300_419900
809527	contig_5669_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_86104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGTGTGATGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387099	386035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_386000_387100
809528	contig_10159_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_30844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAATTCTAGAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615998	618058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_616000_618100
809530	contig_7853_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_172637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATTAACATGTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45580	44397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_-_44400_45600
809535	contig_4782_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_73650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGCTAGCTGAGGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467471	465874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_465900_467500
809536	contig_17768_pilon	+	922	6	Intergenic	novelGene_140385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	304.23832763148	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	90	437	21888	78309	FALSE	30	AATGCTCTCCCCAGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVKSKKATDTYKIYVEKYALAKADFEQKMTETAQKFQDIEETHLIRMKEIIESLSNAIKEIHLQIGQVHEEFLNNMANTTVESLIQKYVESKGTGKERPGLIEFEECDPTSAVEGIKPRKRKTFALPGIIKKEKDAESVTFLM	21798	78794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_21906_39953_40053_40789_40887_58293_58339_60536_60610_78293
809537	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
809538	contig_1275_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_108775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATGGCATTATATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422712	422122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_422100_422700
809539	contig_1275_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_108774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTTCCTTTTTCAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421968	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_420800_422000
809543	contig_2125_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_147739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	792	1124	659160	658828	NA	30	ATCATCTTTCATTGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVQLHFRFTQILHIHTNTSDSHNYCLVGNEYTYSTNRNLHDCIKATFWRIQISRYALFTNKFVKYFPSISKTKHIFVAKGAGAVLFTCARIPEFSWGCTNVRHHSFLHK	659951	657852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_657900_660000
809545	contig_10331_pilon	+	2334	1	Intergenic	novelGene_54117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTAAGGGGGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367189	369523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_367200_369500
809549	contig_4305_pilon	+	2112	6	Intergenic	novelGene_136656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_1	303.501828660059	47	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	189	989	496285	499641	FALSE	15	TGCATACGTGCATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVKVKRYVSGKRPDYAPMESSDEEDEEFQFIKKAKEQEAEPEEQEEDSSSDPRLRRLQNRISEDVEERLARHRKIVEPEVVGESDSEVEGDAWRMEREDSSEEEEEEIDDEEIERRRGMMRQRAQERKNEEMEVMEVEDEGRSGEESESESEYEEYTDSEDEMEPRLKPVFIRKKDRVTVQEREAEALKQKELEQEAKRMAEERRKYTLKIVEEETKKELEENKRSLAALDALNTDDENDEEEYEAWKVRELKRIKRDREDREA	490441	500764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_490619_496273_496494_498155_498286_498553_498742_499264_499374_499476
809551	contig_7843_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_152050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAGATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483549	483847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_483500_483800
809556	contig_14546_pilon	+	1796	11	Intergenic	novelGene_157420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_10	82.737899417377	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	190	1455	153679	229793	FALSE	30	TTAATGCACTTTTAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLSNFSSSGSYQRFGESNGTTWFQTLIHLLKGNVGTGLLGLPLAVKNAGILMGPLSLLLMGIVAVHCMGILVKCAHHFCHRLNKPFVDYGDTVMYGLESSPSSWLRNHAHWGRHIVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNCHNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSFLANISMLVSLVMIYQFIVQRIPNPSHLPLVASWNTYPLFFGTAIFAFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYCGMAIVTALYISLGCLGYLQFGVHIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSVGIFFTYALQFYVPAEIVIPFFVSRVPEHCELVVDLFIRTVLVCLTCAVKLVPSHSDPIGQSRTAPQDFQGAAGGFELLTF	142983	230134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_143168_153673_153822_159225_159317_160356_160446_160890_160987_162948_163034_163416_163636_175695_175795_178503_178671_182595_182766_229686
809558	contig_6740_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_142727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744672	745756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_744700_745800
809559	contig_7704_pilon	+	1947	3	Intergenic	novelGene_154601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.5	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	61	1668	214476	216576	FALSE	30	CATCTGGAGAGTGGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAESGREHPQGAARFSCPPNFAAMPPASELPRFSLEALMGPDTELWLIRAPADFTPDCLNGRLVPLSGSRTVKGKLAGKRHRYRILSSSGPQAGEATLLAPSAETDGGLTCAPAPQGSLRIFEGPQQSLSGTLLQPIPASPRPQIPPGLKPRFCAFGGSPPVTGSGSALALKTMASGKRKKKRQVPEASVPQEAVNGHGSLEVDTALGSPEMSVGKKKKQQLIEPEVTEPLATEPAAEMLEPLEVPFPPTTKKRKKQLRGAEVVKLEMGMPEPQEKTVELELVVKTEPLEETLLFPTKKRKRQKGMEGIEPVEEMIVDGPLQVKVEPQEEAIPLPSMKKRKKGKGYKVMTEPGTEGVEPEMRPVELHGEMMKPELPDDIEPPAEAAPPAEAAPASIRKRRKKEKWQEVMMEPEAEPQGEVVAPKLPGDTEPQAALASTKKRKKERGDKVMEPGTERIDPQGQMMELGLQDKGEPEAQAAPASTKKKKRGRESGGPEMAPQEKMPELLLNLEPGEVATGGREKKRKKYLQQDPV	214415	216855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_214513_214831_214974_215147
809560	SIRV4	-	568	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	46	3	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	390	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATGACAAAAAACTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
809561	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	104	3	-83	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	69	308	2458	3109	TRUE	40	GCCGCTTGAAAAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2389	10785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
809565	SIRV4	-	452	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
809566	contig_12079_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_67494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	78	410	823825	824157	NA	40	AGAAATCCGTTAACAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCPAKEARVAVVPSSGVEAGLVRLMSASFSLAHVLPAGRGVFCCFSSSHCCRPAAPRAAPAVTHAWHQLCYVPRGRASPGFPAPTPSSTLCPEPADAALQLVCAFPAYFSAYWSCQHSGGPLGAPIDKDCPAAV	823747	825355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_823700_825400
809568	contig_7234_pilon	-	1429	13	Intergenic	novelGene_145930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	223.278646911581	2	81	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	141	446	510034	454530	TRUE	20	TTGTGTCTGATGCAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNM	587404	411408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420275_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435226_437100_437137_454504_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
809571	SIRV4	-	392	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1099	30	1099	-30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTTTAGAAGGTGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4059	3667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
809572	contig_7694_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_159933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAATAAATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197892	199788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_197900_199800
809575	contig_9014_pilon	+	1123	3	Intergenic	novelGene_106791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1695.5	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAATCAAAAGAATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150626	152465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151763_152234
809576	SIRV6	+	368	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	588	6	409	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
809577	contig_5758_pilon	+	1863	1	Intergenic	novelGene_119066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACAGATTCCCACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78287	80150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_78300_80200
809583	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	101	0	-86	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	72	311	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2386	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
809585	contig_13014_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_169365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTCAGGTTCAACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459244	457354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_457400_459200
809586	contig_5084_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_64481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGGTAGAGAACTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69958	70959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_70000_71000
809588	contig_5389_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_143038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATCCTGTGATAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481538	480738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_480700_481500
809590	contig_5389_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_143037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAACATTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480345	479487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_479500_480300
809592	contig_5765_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_141376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCAGCTGGACGGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544537	545421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_544500_545400
809593	contig_2798_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_119993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1534	1854	66106	66426	NA	30	TTGAGCCACTACAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFTFVACIIFPLDGIKLDFHLQQVINCLNYLLPFHYVSQLYESGVQAGWAGQFFCTTWCGLGSLHSILMAARLVCRAQDASLAHLVPCWKAELTWAHSPLPSMPS	64572	66774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_64600_66800
809594	contig_10581_pilon	-	1141	7	Intergenic	novelGene_41340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.2829134239805	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGGAAGGTCATCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74122	63124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_63145_63891_63965_64835_65103_66013_66174_72948_73095_73534_73651_73763
809595	contig_19132_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_169988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313047	311702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_311700_313000
809596	contig_20420_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_172482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGAGCCACTGGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45634	46117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_+_45600_46100
809601	contig_3386_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_34590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGTTATGCAAAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516205	518346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_516200_518300
809602	contig_16643_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_158109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCCATCCCATGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152912	153499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_152900_153500
809604	contig_11978_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_62842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTGACCCTCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487342	485874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_485900_487300
809605	contig_513_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_80138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAATAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331973	330007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_330000_332000
809607	contig_8843_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_156633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3719	2635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_2600_3700
809608	contig_5092_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_62265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGAAGTAAGGAGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230604	229823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_229800_230600
809613	contig_8452_pilon	-	864	5	Intergenic	novelGene_48093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	1166.2980697489	6	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982015	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_981872
809615	contig_16532_pilon	+	1425	2	Intergenic	novelGene_110038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	76	486	138093	148629	FALSE	15	CCTGGATTGTTCGAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCRAVQFPHSSRASLLGSPRVAGTMSFAETNPAASSLPNGDCSRFRARPGGNRVTVVLGAQWGDEGKGKVVDLLSQDADIVCRCQGGNNAGHTVVVDSVEYDFHLLPSGIINPNVTAFIGKYIVLTELLGDFFPPVDNGIHFLSSTDFISHLPNGFIDSL	138017	149568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_138276_148401
809616	contig_19311_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_144090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGAGGAGATAGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198877	200547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_198900_200500
809618	SIRV6	+	785	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10240	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11114_11205
809620	contig_9516_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_106138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTAGGTATTTCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553325	551310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_551300_553300
809621	contig_1786_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_142586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCACATTTGGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38068	38476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_38100_38500
809622	contig_6631_pilon	+	2047	16	Intergenic	novelGene_174298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	24.0855881297417	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	58	1923	1060367	1097098	FALSE	20	ATATTTATTTTTTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVPVKQFVKHIGELYSDNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITAEHSNHPDNKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKDSKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQGPLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIIMITNLVEKGRRKCDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKVHACYTVRRFSVRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQYHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSSAARIPEMGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQIKDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTEEQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSILIPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGMKGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHPLPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEFVYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLCLSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGPTIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVFQVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFVYKAMLSLVSTKQSGTGPMTVDKNGAVLIADESDPAESMESLV	1050587	1097222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_1050640_1060361_1060454_1067995_1068093_1071526_1071610_1071802_1071938_1072905_1073041_1074907_1075081_1076571_1076708_1077282_1077430_1079245_1079340_1080159_1080237_1080733_1080863_1084504_1084652_1085267_1085411_1096239_1096376_1096951
809623	contig_11689_pilon	+	820	2	Intergenic	novelGene_175848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCTTTGTAAATGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2399	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11689_pilon_+_2612_3438
809624	contig_8260_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_163257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATATTTCTCAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206262	204375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_204400_206300
809630	contig_2504_pilon	-	1162	2	Intergenic	novelGene_166843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTGAACCAGATTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382618	381351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_381623_381727
809631	contig_7593_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_127285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACCAGCCACTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72968	72335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_72300_73000
809633	contig_12297_pilon	-	1791	2	Intergenic	novelGene_161372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAATAAACATCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638164	626942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_628525_637955
809634	contig_3382_pilon	-	2263	1	Intergenic	novelGene_124042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203055	200792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_200800_203100
809635	contig_5317_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_76604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAATAAGAGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702858	701047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_701000_702900
809637	contig_366_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_51647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409090	1408562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1408600_1409100
809643	contig_10861_pilon	-	1374	11	Intergenic	novelGene_39341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	260.399481566304	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	112	807	1492200	1490156	TRUE	5	GCTTCCTCAGTTTGGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRGKSVCLCRGKRRTAREVLKSPGSGGPSRGALKCMCGNTMSVPLLTDAATVSGAERETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIRLPHVKYICPHAPRIPVTLNMKMVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKKAAENIKALIEHEMKNGIPANRIVLGGFSQGGALSLYTALTCPHPLAGIVALSCWLPLHRAFPQAANGSAKDLAILQCHGELDPMVPVRFGALTAEKLRSVVTPARVQFKTYPGVMHSSCPQEMAAVKEFLEKLLPPV	1493810	1489339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1489693_1489941_1490207_1490294_1490469_1490572_1490675_1490751_1490826_1490957_1491029_1491107_1491156_1491638_1491705_1491804_1491837_1492122_1492227_1493725
809644	SIRV4	-	339	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
809645	contig_13699_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_158330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGCAGTATAGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88595	89578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_88600_89600
809646	contig_7840_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_69055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAGTAATAAGGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439639	439309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_439300_439600
809648	SIRV6	+	459	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	24	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
809649	contig_7902_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_175850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTGAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26022	26897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7902_pilon_+_26000_26900
809650	contig_6412_pilon	+	1870	2	Intergenic	novelGene_149990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTCTTTAAATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667333	669285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_667923_668004
809652	contig_1435_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_115502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATTAAGAATTATTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527425	528047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_527400_528000
809655	contig_5047_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_157988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAGAATAAAACTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889812	887607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_887600_889800
809657	contig_12409_pilon	+	947	6	Intergenic	novelGene_169442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.2588146369653	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	69	947	137809	152342	FALSE	30	ATCCTTTTTGAATAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRKPTSGDAGAAGPAPERQAVLSRFFQSTGSLKSTSSRTVAPQKAMEVDRSKKRALENNEPVKKRAKKVQEKEGGSDLVMSGDSEPKKCLRTRIVSKSLEKLKEFRCTSALLQDRVPTEPLQETFAVLPKCTDFDDISLKRAKNAVSSEDSKTQSHQKGKTLTSDSKPSNKRTKSIYTPLELQYIEMKQQHKDVILFVECGYKYRFFGDDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIGDNKSTVFSRKLTALYTKSTLIGED	137740	152342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_+_137947_139892_140014_142995_143217_149660_149823_151696_151814_152222
809658	contig_11294_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_50064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGTCTCTAATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289199	290687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_289200_290700
809659	contig_16098_pilon	-	727	2	Intergenic	novelGene_46074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2153	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456880	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459
809664	SIRV6	+	401	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	542	19	363	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
809665	contig_8195_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_170050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTAATAAAATGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114808	113271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_113300_114800
809666	contig_5485_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_37789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705349	704004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_704000_705300
809668	contig_3787_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_102455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTTTCCTGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129654	1128118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_1128100_1129700
809670	contig_13831_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_160996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAATATGTCTTAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124665	126144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_124700_126100
809671	contig_8443_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_150602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1168	1473	575205	575510	NA	75	GGATAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIYYGARCCSLPWGWPRFMVTPFTTEQNAVQSLPMIGFRWDHCDSWGFHWLIFGSDHQALLPSSLSLEDSLKPVSITAACKPPLTDIALAWPNGRREFYH	574037	576336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_574000_576300
809672	contig_6230_pilon	-	1783	13	Intergenic	novelGene_102096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	69.1368911813528	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	130	855	149461	128186	TRUE	20	TGTTTAGTAAAGTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLTGHLHSQGSPPYVISLDPAVHEVPFPANIDIRDTVKYKEVMKQYGLGPNGGIVTSLNLFATRFDQVIKFIEKAQNMSKYVLIDTPGQIEVFTWSASGTIITEALASSFPTVVIYVMDTSRSTNPVTFMSNMLYACSILYKTKLPFIVVMNKTDIIDHSFAVEWMRDFEAFQDALNQETTYVSNLTRSMSLVLDEFYSSLRVVGVSAVLGTGLDELFVQVTSAAEEYEREYRPEYERLKKSLASAQSQQQKEQLERLRKDMGSVALDTGTATAYLLCWTLLT	156732	117847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_118704_128113_128218_132861_132953_133621_133662_134932_135016_135714_135862_136512_136559_137144_137240_137622_137702_147637_147676_148371_148439_149453_149494_156635
809673	contig_17427_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_30406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTATTAGAATTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341880	340236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_340200_341900
809674	contig_12852_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_141436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTCCCCAGCTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318059	319317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_318100_319300
809676	contig_4891_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_124602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949446	951622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_949400_951600
809677	contig_4202_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_147074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGGTAAATGCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184501	182254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_182300_184500
809678	contig_3382_pilon	-	1390	8	Intergenic	novelGene_124101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	476.91204853811	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	4	924	694411	673341	TRUE	40	CGGTGTAACCAACATAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDIASRDRDRNSRDRSPRDRDRKDKNRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI	694414	672202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_672595_673266_673519_677153_677346_685166_685197_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303
809679	contig_6356_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_126435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGCTCAGTGGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113683	113263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_113300_113700
809682	contig_2219_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_67199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTAGTTGGAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205121	205736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_205100_205700
809686	contig_12270_pilon	+	371	2	Intergenic	novelGene_113375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13845	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
809689	contig_16072_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_175857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGTTCTCTTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36135	37540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_+_36100_37500
809692	contig_546_pilon	+	1049	7	Intergenic	novelGene_117243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	39.3432190966739	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	648	962	457610	464115	FALSE	40	TTTGGAGCTAGAAATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRYTICNALNLMQICKGKNIIISSAAEGPLEIRGPYDVANLGLLFGLSESDAKAAVSTNCRATLLHGETRKTAFGIVSTVKKPRSSEEDDSSLPACKKAKCEG	435798	464202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_436296_449749_449840_457549_457667_458256_458287_458699_458738_459118_459199_464005
809694	contig_5532_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_175863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAATGGCAGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41673	40435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_-_40400_41700
809698	contig_5827_pilon	-	1024	3	Intergenic	novelGene_129796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	649	894	454386	454141	FALSE	20	TGGCATCTCAGTTAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDPGQSGSAIRDRRSELTAPDHGSAPATRGSIVSLSVGEGTSVRTSVRTTTDDAKPKTTCASKDSWHGSTRKSSRGAVRTQRRRRSKSPVLHPPKFIHCSTIAASSSNQLKHKSQTDSPDGSSGLGISTPKEFNAGECATSPPDVNHTGAVVEPLRTSVLGLPSESKKEDSSDATQVSQASLKARDLSDFQSVSRLNQGKACACIGKECQCKRWHDMEVYSFSGLQNVPPLAPEQRSTLEDYSQSLHTRTLSGSPRSCSEQARVYVDDVTIEDLSGYMEYYLYIPKKMSHMAEMMYT	464827	454010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_454832_458199_458314_464738
809700	contig_7398_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_166183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTATGGGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324797	324214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_324200_324800
809702	contig_12943_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_140366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103409	105561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_103400_105600
809703	contig_19311_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_144081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129156	127963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_128000_129200
809704	contig_8682_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_165287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219795	217670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_217700_219800
809707	SIRV6	+	330	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	171	379	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
809709	SIRV6	+	541	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	33	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
809712	contig_6217_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_109580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTGTGAGGATAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174749	175794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_174700_175800
809714	contig_8729_pilon	-	763	4	Intergenic	novelGene_40164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	400.750129964629	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAAGATAGAGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770628	766748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_766779_768620_768822_769438_769629_770286
809715	contig_935_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_45575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611759	612832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_611800_612800
809718	contig_6361_pilon	-	726	5	Intergenic	novelGene_24011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.53553390593274	45	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	105	419	485483	474621	TRUE	45	AATCTAATAAAAGATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPVNVPVAQTSNWQTGICDCFSDCGVCLCGAFCYWCLACQVAGDMNECCLCGASVAIRTLYRTRYGIPGSICDDCLATSCCPLCTLCQLKRDINRRRAMHAF	496187	410960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_474562_474726_479208_479334_485398_485541_496140
809720	contig_17198_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_62342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTATCAAAATGCCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584378	585535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_584400_585500
809721	contig_15720_pilon	+	1218	2	Intergenic	novelGene_41975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	339	1217	380506	381384	FALSE	30	AATTGCAGACTCTCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEKALADGNLLEVVSVVEDTLKTASSTPVKIAVTGDSGNGMSSFINTLRGIGHEEEASAPTGVVRTTETPASYLSSDFPNVELWDLPGMGTSPQSLKEYVTEMEFNKYNLFIIIASEQFSMNHVMLAKTIEGMGKKFYIVWTKLDRDLSTSMLREEQLLKNIQENILEDLHKEQVCEPPIFLVSNFDPLLHDFPKLRNKLQMDLIHIRCDDPLQRLSHTFEEIINDKVTSLRARIYTESFQKTLGIQDPDDSEECLKTFKLLFGVDDESLQQVAQRMRTAATEYKNIMKSQ	376011	381385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_376227_380382
809723	contig_6738_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_166137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGATAGATACGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55770	54108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_54100_55800
809724	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_93134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
809725	contig_10937_pilon	-	1636	9	Intergenic	novelGene_67309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	111.613171265761	163	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	69	1238	125114	72144	FALSE	20	TCTGTTGTTGCCAAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWKELEFSKEILPQTDFQTGYSMENEYLGQLTSIPGYLNPSSRTEILHFIDNAKRAHQLPGHLTQEHDAVISLSAYNVKLAWRDGEDIILRVPIHDIAAVSYVRDDAAHLVVLKTAQDPGISPSQSLCAESSRGLASGSLSGSGVVPVEACCLVVLAAESKGAAEELCSLLSQVFQIVYTESTIDFLDRAIFDGASTPTHHLSLHSDDSSTKVDIKDAYEVEVATFSFPDPTDVGGLSSLSFCMPPSPHLKTASESELSTTATELLQDYMLTLRTKLSSQEIQQFATLLHEYRNGASIHEFCINLRQLYGDSRKFLLLGLRPFIPEKDSQHFENFLETIGVKDGRGIITDSFGRYRRAASTASSSTTNGNRAAGSSDDQSLPSEGDEWDRMISDISNDIEALGCSMDQDSA	125182	71745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_72425_73617_73757_74874_75014_75541_75600_78367_78504_79639_79777_81960_82145_82616_82701_125102
809726	contig_202_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_127069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATCCATTAAACCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158223	160404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_158200_160400
809727	contig_14243_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_57428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAAAGAAGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588073	588826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_588100_588800
809728	contig_10000_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_139353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTTTTCTACTAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351050	352297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_351000_352300
809729	contig_9678_pilon	+	573	3	Intergenic	novelGene_146377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	622	junction_1	149	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	65	403	263633	266767	FALSE	15	TCGGTCTTTATTTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETEVLKVIRTGKRKKKAWKRMVTKVCFVGDGFTRKPPKYERFIRPMGLRFKKAHVTHPELKATFCLPILGVKKNPSSPLYTTLGVITKGTVIEVNVSELGLVTQGGKVIWGKYAQVTNNPENDGCINAVLLV	263568	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_263711_265596_265790_266699
809730	contig_12468_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_164883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATAGCCCCTTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69536	71497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_+_69500_71500
809732	contig_8377_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_35172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGGACCATTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396123	394703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_394700_396100
809737	contig_10750_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_172611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAGGGAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163885	164786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_163900_164800
809738	contig_13680_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_149588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCCTATTTTTGCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331304	330385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_330400_331300
809741	contig_5451_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_167194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840591	841299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_840600_841300
809742	contig_11171_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_48553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1039	1467	67732	68160	NA	10	TTTAACTTTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKASVAGEDGGGSQEGKPEAKPQGWGAPHCSHPPHSSQPPLHKGARLGILSGWRKDSVWEPQTLRGPSPHLLCAGDCAEPLAHVRPVPHSCPHLRRRQRPEGQDLNADLPESTCSCLLELGRQRWIGPGPNSLPWPQVFHP	66693	68828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_66700_68800
809745	contig_9571_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_136253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGGACAAAACTTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302517	304129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_302500_304100
809746	contig_9548_pilon	-	2055	6	Intergenic	novelGene_141095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	14.4968962195361	26	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	274	993	342339	337688	TRUE	35	CTCATAATTGAATCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLFEEIKASIKNNYNQDRSFWRPVLPWGGVFTIKAGRKAVSCTPLYVEIRLKNTCTIDGFLMLLYVILNENENFPRELSLHLGREFIDCFLYLMDTYSFTTVKLLWIWDKMEKQQYKAEVHKASLIIDLFGNEHDNFTRNLENLMSTIQESYCSNWRCPTRVQEDQQRIIIINPPQEIPHGNLIRLAVDELFCSKIELCEEHGYNKTLVNRNPANRDSQLTGFFFCTSHLGERGVVA	345217	335580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_336522_337566_337702_338811_338904_339167_339258_341815_342341_344945
809747	contig_12677_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_110836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGCCACCATACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2700_2900
809749	contig_9124_pilon	+	1636	9	Intergenic	novelGene_173753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	28.7869327994491	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	139	1158	22430	71871	FALSE	40	GATTTAAGAGTGTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQARAAARLRIVLGHLGHPAAGAAVAYHTSELVSPANLSHQQFQYTLDDNVLSLEQRQFYEENGFLIIKSLVSDADIQRFRDEFERICKKEVEPMGLRIMRDRTIAKSKTVLSENVVSKIQDFQEDEELFRYCTLPEILKYVECFTGPNIMAMHTMLLNKLPDTGNKTSRHPLHQDLHYFPFRPSNTIVCAWTAMEHIDRNNGCLVVLPGTHKGPLKQHDYPQWEGGVNIWYYGIQDYDKNNARVHLVMEKGDTVFFHPLLIHGSGRNKTQGFRKAISCHYASADSYYINVRGTSQENIEKEVLKLLSRQYGMKENAVTLKDVWQFRARLVKGERLTL	22291	72349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9124_pilon_+_22505_25174_25234_26470_26582_27210_27380_40041_40124_43768_43951_56258_56409_58350_58489_71817
809750	contig_57_pilon	+	2177	2	Intergenic	novelGene_44886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	129	395	66895	74675	FALSE	80	CAAAAAAAAAGTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKVRAILIAFSSCTVASEHLMFLA	66766	76457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477
809757	contig_7870_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_109021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGAGCCCACAGTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549599	550958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_549600_551000
809758	contig_7870_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_109022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGCCTCTTTTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551258	552036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_551300_552000
809759	contig_20875_pilon	-	1302	2	Intergenic	novelGene_153090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGAGCTCTTAACCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9234	7790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_9047_9188
809760	contig_6710_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_93682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653849	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
809762	contig_5419_pilon	+	1890	4	Intergenic	novelGene_15530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	59.7457576364679	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	156	554	384039	391989	FALSE	80	GAAAATTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQGQPQGRETEVWWHQVKVWSAAVVSLLLLSACFIVSCLVNHDNFVYTKIGRKLHKLQDHQQYLSHLTCFKERKGLKDWHCCPTSWSPFQSSCYFISTELKNWTDSEKNCSEMGAHLMMINTKEEQVLSYR	383883	393325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_384067_384641_384735_388326_388441_391825
809763	contig_12409_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_169439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131788	130764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_-_130800_131800
809764	contig_4952_pilon	-	1296	9	Intergenic	novelGene_145534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	90.8584063254469	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	462	1076	493013	488749	FALSE	35	AACGCACATATCTGGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEGVKLLREAVGIYISTLKTEFTQGMILPTMNGESVESTRQPALKAEKWKANESAPLKTQARSVGVRIPTCKITLKETFLTSPEELYRVFTTQELVQAFTHAPAMLEADKGGKFHMVDGNVSGEFTDLVPEKHIVMKWRFKSWPEGHFATITLTFIDKSGETELHVEGRGIPAPEEERTRQGWQRYYFEGIKQTFGYGARLF	497117	488528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_488922_489123_489176_489682_489785_490458_490591_491384_491474_492946_493065_493469_493553_495193_495385_496981
809765	contig_7202_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_17332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATGCAGGTAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
809768	SIRV4	-	417	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1104	0	1104	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
809770	contig_12622_pilon	+	1211	6	Intergenic	novelGene_6058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	8.70402205879558	246	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	78	1031	1718004	1728437	FALSE	25	ACTTCAAGGTCAGAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPQALEDRQEGDDPPGDLRSVLVTSVLNLEPLDEDLFRGRHYWVPITQRLFGGQIVGQALVAAAKSVTEDFHVHSLHCYFVRAGDPKVPVLYQVERTRTGASFSVRSVKAVQHGRPIFILQASFQQIQPSPLQHQFSMPAVPPPEELFDHRTPIDQYLRDPNLYKKYQVGLNRTAAQEVPIEIKVINPPTLSQLQRQEPKQMFWVRAQGYIGEGDMKMHCCVAAYISDYAFLGTALLPDQWQHEVLSVTSLDHSMWFHTPFQADHWMLYECESPWAGGSRGLVHGRLWRRDGVLAVTCVQEGVIRVKPQKSESKL	1717926	1728617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1718123_1719338_1719476_1722850_1723077_1726108_1726267_1726785_1726981_1728318
809771	contig_11026_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_167672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184909	183468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_183500_184900
809774	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	51	514	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
809775	contig_5649_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_82285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGAGTACTGTGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103204	102404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_102400_103200
809777	contig_6164_pilon	-	864	7	Intergenic	novelGene_121273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	109.378166620827	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	107	709	485859	475276	FALSE	20	TATCTGTCTTTATATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRMGKPAPPGAAYPGPAPPGAAYPGPAPPGAAYPGPTAPGAYQSGAGAYPAASPYGGLAEPLTLPYDLHLPGGIMPRMMITILGTVKPNANRIALDFMRGNDIAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKQDNVWGREERQNAFPFESGKPFRIQVLAEADHFKVAVNDAHLLQYNHRMRNLGEIRKLAISGDIILTSASHAMI	493166	475120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_475432_481538_481705_483551_483641_485555_485723_485834_485904_486668_486691_493126
809778	SIRV4	-	296	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1227	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
809780	contig_6842_pilon	-	1582	2	Intergenic	novelGene_130668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCCAAAGATTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288415	285540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_286440_287732
809782	contig_7056_pilon	-	858	4	Intergenic	novelGene_43599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTGATTGAGAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704378	693344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_693442_694617_694736_695348_695516_703902
809783	contig_8801_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_66261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAATTAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375528	374574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_374600_375500
809784	contig_6403_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_139895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCCGACAAGGAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110832	1110318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1110300_1110800
809785	contig_6403_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_139894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGAACAGAGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110217	1108871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1108900_1110200
809786	contig_7359_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_139870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTAGCTGGCGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362958	361675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_361700_363000
809789	contig_12644_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_44543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGCACTGTGATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494870	1494475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1494500_1494900
809790	contig_3426_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_57957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGACAGGGTAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422915	423714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_422900_423700
809793	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	17	42	17	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGCGGTCGTTGAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154	2078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
809795	SIRV6	+	388	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	492	-2	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
809798	SIRV4	+	347	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGGCCGCTTGCACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
809799	contig_14871_pilon	+	1220	6	Intergenic	novelGene_63714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	851.616439484349	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	283	744	227668	233218	FALSE	30	TGGGCACAAGTGTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	219720	233694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_219858_224381_224446_227408_227475_227652_227827_230158_230300_233056
809800	contig_5389_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_143032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_5	92.4351123761961	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	13	588	437163	481284	FALSE	10	GCTATTTTGTGTTTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPNMAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKREPGSGTESDTSPDFHNQENEPSREDPEDLDGSVQGVKPQKAASSTCSGGHHSSHKKRKNKNRHRIDLKLNKKPRADY	437150	481887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_475994_476188_480732_480767_481275
809801	contig_1244_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_37960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCACTGCTGCTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892534	893689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_892500_893700
809805	contig_10803_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_170116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTTTATTAGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11281	12123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_+_11300_12100
809806	SIRV6	+	414	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	14	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1856
809807	contig_513_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_80145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTTTTTTAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386607	385635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_385600_386600
809813	contig_5935_pilon	-	1314	8	Intergenic	novelGene_102743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	177.518150839713	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	55	615	1418867	1332583	TRUE	70	TTATAAAAAACAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKYTLLVNNGFAISAALLMAFSLQAGAFEMLIVGRFIMGVDGGIALSVLPMYLNEISPKGIRGSVGQVTAIFICIGVFTGQLLGLPELLGKKSTWPYLFGVIVVPAFIQLVSLPFFPESPRYLLLEKHDETGAEKAFRTFLGKENVSQEVAEVKEEARERRNICLVSVLELLRSPFCPLASPHCDHHHGLLPALRPQCDLVLHQ	1418921	1296390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1296821_1300025_1300102_1303659_1303762_1332491_1332603_1346591_1346781_1358530_1358664_1392215_1392362_1418794
809814	contig_11047_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_173951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	602	1000	63408	63806	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPYKVVNFLSLKAFKERRQHPLWRTIICRIHQMKSGFYRLLKGPLLPYSAEIGSVTGKLHPLPSGHQRRGQALEHIQIGTWVAEEDFLPCRLSVRDAQHCHLGKCVAFLSFKMALVFPQVGGRAELQKRP	62806	64495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_62800_64500
809816	contig_10855_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_124336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	304	915	278	1192	540636	539722	NA	10	TGATCTGCTGCAGCCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSRRWVFYCLLNITVSDLLTGVAYLANILLSGAHTFHLTPTEWFFREGLLFTALAASTLSLLFTAFERFATMEQLMAQSRATKKGRVLGLMLLCWLLATLLGLLPVLGWNCVCHFQHCSSLLPLYAKEYIFFCVTVFALILATITMLYGAIFRVVRLNGRPTPRSRRLLQMVLMILVAFIVCWGPLLGLLLADIFSSNLWAQEYLRGMDWILTLAVLNSAINPVIYSFHSHEVCRAVLGFLCGGCLWLGIRGPGDCLARAAEAHSEASTTDSSLRPRDSFRGSRSHSFRMREPLSSISSVRST	540913	539363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_539400_540900
809818	contig_5093_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_135082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAGAAATGAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553384	553085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_553100_553400
809819	contig_3627_pilon	+	1699	4	Intergenic	novelGene_78547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	477	junction_1	121.58490403372	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	62	427	670480	676255	FALSE	20	TGCATTTCTTTAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDVIVGKIYFLLVRIKIQHMELQLIKKEITGIGPSTTTETETIAKYEIMDGAPVKGESIPIRLFLAGYDPTPTMRDVNKKFSVRYFLNLVLVDEEDRRYFKQQEIILWRKAPEKLRKQRTNFHQRFESPESQASAEQPEM	670418	677527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_670520_672027_672097_673913_674057_676141
809821	contig_9047_pilon	+	2172	4	Intergenic	novelGene_175866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	38.1313519298752	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	96	1730	40256	43844	FALSE	5	TTTCTTGCTGTGGTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFSYDPYYSTSYKRRYVETPRVHISSVRSGYSTARSAYSSYSAPVSSSLSVRRSYSSSSSSLMPSLENLDLSQVAAISNDLKSIRTQEKAQLQDLNDRFASFIERVHELEQQNKVLEAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRIAAEDATNEKQALQGEREGLEETLRNLQARYEEEMLSREDAEGRLMEARKSADEAALARAELEKRIDSLMDEIAFLKKVHEEEIAELQAQIQYAQISVEMDVSTKPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRFTVLTESAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISAMQDTINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTSVGSITSGYAQSSQVFGRSAYGGLPTSSYLMSARSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAEEAKDEPPSEGEAEEEEKKEEAEEEEGGEEEEAAKEESEEAKEEEEKGGEGEEREETKGAEEEEKKDEGAGEEQATEKKD	40160	44286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9047_pilon_+_41303_42304_42430_42812_43130_43698
809824	contig_11115_pilon	-	1677	8	Intergenic	novelGene_102873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	15.153634978487	151	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	288	989	238299	231015	FALSE	60	TAAACAAGCTAATAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAWVESLRGFDQERVGLAELHPDVFATAPRLDILHQVAIWQKNFRRISYAKTKTRAEVQGGGRKPWPQKGGGRARHGSIRSPIWRGGGIAHGPRGPTSYYYMLPMKVRVLGLKVALTVKLAQDNLHIVDSLELPTPEPRYLTELAQYRRWGDSVLLVDLAHEEMPQNVVSATSRLKTFNLIPAVGLNVYSMLKHETLVLTLRTIVFLEEKLLWHDSRYTPLYPFHLPYGDFP	238672	230326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_231161_232360_232438_232516_232627_232713_232821_233965_234084_235282_235335_238207_238359_238444
809827	contig_13968_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_106875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTCAGCAAAGATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52878	51987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_52000_52900
809828	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	159	-1	-28	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2444	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
809834	contig_1532_pilon	-	1846	7	Intergenic	novelGene_37431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1328.21439241646	1	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	297	1136	28887	13113	FALSE	45	TCTAAGATTATGGCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSSRQPMGYMGRKVIHKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEVNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32208	12402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13491_15732_15889_17971_18106_27260_27379_28833_28959_29438_29505_32049
809835	contig_3424_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_55559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2	388	935711	936097	NA	20	GTTTATTTGTTTGTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNHICLSPGSPTPSGPKARAHPPNLSHPLHPSPSKAPPCFSAPCPKQAAVQGSQHQPLEVQRGQQTLTQIGLGAPRQARDPATAGEEHPSLGPCAWPPRFLPHCWPQLRKEGLGGGRLSSSFLPSGQQ	935709	936887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_935700_936900
809836	contig_7323_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_173208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGGGGAGCAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37409	36972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_37000_37400
809837	contig_15952_pilon	+	1405	2	Intergenic	novelGene_154040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	330	728	63603	64001	FALSE	5	GCCTGGGCTGAGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVEKFRLQELCEAHCAHPEAGPQSSSLPQPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQVMPHAPRWCAGLGPVKERVVTPGLTGTSQLPNPTGRSHAAVPAH	62292	64678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_63344
809844	contig_9653_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_48256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATACTACCCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898498	896893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_896900_898500
809845	contig_7411_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_137058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGTGTGTTGGGGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003728	1005080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_1003700_1005100
809847	contig_11427_pilon	+	2139	15	Intergenic	novelGene_79007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_14	95.9273747399031	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	813	1742	688742	690619	FALSE	5	TAGCTGTTCTGCCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTSLHVQLQSGRFDCSDRQFHSVAAAWQTRLESPADVKELIPEFFYFPDFLENQNGFDLGCLQTSNEKVGDVVLPPWANSPEDFIQQHRRALESEYVSAHLHEWIDLIFGYKQRGPAAEEALNVFYYCTYEGAVDLDHVADERERKALEGIISNFGQTPCQLLKEPHPARLSAEEAAHRLARLDTNSPSIFQHLDELKAFFAEVVSEGVPLVLALVPHRQPHSFITQGSPDLLVTVSASGLLGTHSWLPYDRNISNYFTFSKDPTIGSPKMQRLLSGPWVPGSSVSGQVLAVAPDGKLLFSGGHWDGSLRVTALPRGKLLNQLSRHLDVVTCLALDTCGIYLISGSRDATCMVWRLLQQGGLSVGLVPKPVQVLYGHKAAVSCVAISTELDMAVSGSEDGTVIIHTVRRGQFVAALRPPGATLPGPVSHLALGSEGQIVVQSSARERPGAQVTYSLHLYSVNGRLRASRPLAEQPTALTVTEDFILLGTAQCALHILHLHKLLPAAPPLPMKVPICSVAVTKERSHVLVGLEDGKLIVVGAGQPSEVRSGQFARKLWRSSRRISQVSSGETEYNPSEER	683267	691016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_683305_683466_683598_683715_683826_683923_684042_684141_684240_684313_684431_688307_688398_688483_688594_688740_688914_689017_689113_689360_689478_689573_689733_689809_689959_690300_690437_690517
809850	contig_7378_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_120274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTTCAGTTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531564	531346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_531300_531600
809851	contig_15327_pilon	-	2189	8	Intergenic	novelGene_70782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	87.5792352614453	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	224	784	1154668	1137310	FALSE	15	CCAGCACGTCAGCTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHR	1157845	1135904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155516_1155669_1157798
809852	contig_11121_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_167062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262699	265018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_262700_265000
809853	contig_12654_pilon	-	1180	10	Intergenic	novelGene_129331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	182.829003291175	3	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	796	1134	815569	808478	FALSE	40	AAATAGTCAGTGAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827348	808431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812715_815567_815683_816771_816830_817710_818025_819375_819386_823819_823887_827115
809855	contig_9058_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_149371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCCCATTAAAACAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266001	264141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_264100_266000
809856	contig_8570_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_120155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCACAATCTGATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331172	329453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_329500_331200
809857	contig_6215_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_21245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGACTGCCAGGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589587	589145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_589100_589600
809858	contig_12790_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_35297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAAAAAGCACCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554249	553604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_553600_554200
809859	contig_7171_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_101320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	204	112	315	1084827	1085030	NA	15	TGTATGTATTTACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKQRIRSFILPEVAKQTADRDRCVQDTRRWPQWSRSLMERGSLVERDGRSRAAQRGAPQAGRAEGLSVLAGQRGPVQMGERSEALWLEGGLLTTWGLLTALSFT	1084715	1085133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1084700_1085100
809862	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3656	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
809863	contig_3817_pilon	-	1554	12	Intergenic	novelGene_78340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.2102925470067	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1470	84	1553	514660	468958	FALSE	5	CGTTGCTTGTGTTTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEVLLVSAPGKVILHGEHAVVHGKVALAVALNLRTFLQLQPHSNGKVGLSLPNIGVKRDWDVASLQLLDMSFLDEYREEKPEQGVVTVPTPEQVEKLKEVAGFPEDCAISEQVAVLAFLYLYLSICQKQRALPSLDIVVWSELPTGAGLGSSAAYSVCLAAALLTACEEIPNPLRDDDHVSRWTQKDLELINKWAFRGEKVIHGNPSGVDNAVSTWGGALRYQQGQISSLKKPPALKILLTNTKVPRRTKALVAGVRNRLIKFPEIVAPLLTSINAIALECERVLGEMAADPTPEQYLVLEELIDMNQHHLNALGVGHASLDQLCRVTMAHGLHSKLTGAGGGGCGITLLKPDVEQPAVEATKQALTGCGFDCWETSIGAPGVSVHLSSSGLYPWELHPCQVHRFKRWLKTGRICGFLRSVPEQSAEKMERGSKKLSIPQGFPLCPGRRPRIQWTPDHPYRLPRAPVPAAALFPQNSSGVEVNKGVCI	515675	468956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_469261_469927_470032_471989_472144_475299_475417_475814_475906_482218_482265_482895_483000_491023_491180_492936_493082_513601_513774_514582_514675_515606
809864	contig_11121_pilon	-	2767	1	Intergenic	novelGene_167066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	724	1035	315672	315361	NA	70	AAAAAAAAAAACAGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGLRKQVRIDGGIWTWGQWCDVSIQTSGQALVLEGSVDQTDLSSILSTQMESWGKVVSHWGHLNLLLCKKVIESQTTAPLVPTAPTEQGIAVASRVRVSGD	316395	313628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_313600_316400
809865	contig_12485_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_147298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGCGGTAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766600	766132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_766100_766600
809866	contig_12485_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_147297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTGAGTGTCCAGTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765878	764973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_765000_765900
809867	contig_6914_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_151742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCATTTGCCTATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135497	137062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_135500_137100
809869	contig_19564_pilon	-	873	5	Intergenic	novelGene_29678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	48.3993801613202	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	3	572	91577	84392	FALSE	0	TGTTTTTGTCTTGCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVVSTLLRRLPSLSLFRSAYGVQRGNKVAGNPCPICRDHKLHVDFRNVKLLEQFVCAHTGIIFHAPYTGICMKQHKKLTQAIQKARDHGLLSYHIPQVEPRDLDFSTSHGAVSSTPPAPTLISGDPWYPWYSWKQPPERELSRLRRLYQGHLQEESGPPPEKMPKAPPTAPSEAASTDQAGPQSAV	91579	84090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_84688_85117_85178_87022_87090_89834_89904_91499
809874	contig_9940_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_125338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATTTTGTATTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53057	50492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_50500_53100
809875	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
809876	contig_7202_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_17286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
809877	contig_11816_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_98591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGAGAAGATAATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383905	1383378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1383400_1383900
809881	contig_7963_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_58425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATGTAGTCATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99272	99731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_99300_99700
809882	contig_3942_pilon	+	518	5	Intergenic	novelGene_128637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1219.80756679076	63	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176951	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178455_179111_179177_179714_179825_179974
809885	contig_2278_pilon	+	1403	2	Intergenic	novelGene_118128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	485	790	1025485	1026549	FALSE	50	AAAAACTATTAACACCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKLSPCQSESELSFDLEDLCFLFFFFFFSFFLFLCFSFFFFFLCFSLHSEELELLPSSSEVESSSNCFNCCILTSFSCLLFSRMMSYMGSSCALEVRES	1025000	1027162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1025706_1026464
809889	contig_15326_pilon	-	1697	11	Intergenic	novelGene_157699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	257.117016161902	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	77	925	93110	15820	FALSE	35	ATCATGCTTTAAAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVHLESDAFLVCLNHALSTEKEEVMGLCIGELNDDTRSDSKFAYTGTEMRTVAEKVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEMLAELTGRPMRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSESPHGPRDFWSSSQHISIEGQKEEERYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	93186	15047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_15972_19883_19928_20501_20634_41216_41292_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83619_83742_89514_89570_91776_91794_93089
809890	SIRV5	+	400	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	1	151	1	-151	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCACATTGATTAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
809892	contig_854_pilon	-	1333	5	Intergenic	novelGene_36749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.8016461751128	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGGGGTTATGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783786	1720345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1720859_1736945_1737316_1760381_1760508_1783363_1783486_1783584
809893	contig_1093_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_139973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80840	78660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_78700_80800
809894	contig_17968_pilon	+	2833	1	Intergenic	novelGene_154549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAGTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109606	112439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_109600_112400
809895	contig_3449_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_73741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAATCTGCTCCCGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516071	516752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_516100_516800
809897	contig_15859_pilon	-	550	5	Intergenic	novelGene_50180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	388	junction_4	51.1028374946049	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	74	550	278658	262232	FALSE	10	GTGAGTTCCTGACGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDGGTIPKRHELVKGPKKVEKVDRAAELVAQWNYCTLSQEILRRPVVACELGRLYNKDAVIEFLLDKSSEKALGKAASHIKSIKNVTELKLSDNPAWEGDKGNTKGDKHDDLQRARFICPVVGLEMNGRHRFCFLRCCGCVFSERALKEIKAEVCHT	278731	262231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_262311_264929_265070_267481_267576_268824_268920_278589
809899	contig_7146_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_162058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAATGAATACATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217773	218504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_217800_218500
809902	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	23	355	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14431	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
809903	contig_10734_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_51236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCTGATGACTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213692	1214448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1213700_1214400
809904	contig_13051_pilon	-	2567	1	Intergenic	novelGene_140107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTATTTTTTTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141478	138911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_138900_141500
809905	contig_7286_pilon	-	679	6	Intergenic	novelGene_108712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5276.36139778162	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	137	628	291382	286948	FALSE	35	ACAGCATGATTGATTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292044	286896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288469_289316_289422_290758_290857_291315_291497_292022
809908	SIRV4	-	305	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1216	0	1216	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3942	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
809909	contig_12520_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_161050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTTGAATTCTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51226	50895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_50900_51200
809910	contig_8693_pilon	+	1331	6	Intergenic	novelGene_150856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	13.1848397790796	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	100	564	1055936	1073759	TRUE	30	CTGAGGTTATATAATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLEEDGQHTIENRGLGCQGRWKSGEVHWLKPWMWVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGAEGFVRVDRDYVLKSAELAKAGGVQTFQLAVLSRSR	1055836	1076809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1055942_1056608_1056852_1061608_1061717_1073651_1073791_1075676_1075739_1076135
809915	contig_4732_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_75385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245931	247266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_245900_247300
809916	contig_2036_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_131820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAGAAAGAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595401	595122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_595100_595400
809917	contig_2036_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_131819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAACAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594919	593945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_593900_594900
809918	contig_8276_pilon	+	1975	5	Intergenic	novelGene_174481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.3399281149701	54	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1162	1587	157825	164086	FALSE	10	TACTTGGGATTGGCGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYARNVIEEFRKAKHYKSPPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGALRYGRKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLENKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIRHEIESH	155780	164474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_156879_157761_157883_159084_159263_161606_161716_164005
809922	contig_13014_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_169341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTGACCTTTTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378223	376720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_376700_378200
809923	contig_6677_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_114215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCAAATCAGTAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594949	592717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_592700_594900
809924	contig_5093_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_135079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529495	531280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_529500_531300
809925	contig_10446_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_162465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGCAGAAAAGGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592464	593851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_592500_593900
809926	contig_4857_pilon	-	1705	1	Intergenic	novelGene_48679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACATTGTACCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102077	1100372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1100400_1102100
809929	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-45	880	-45	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8270	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
809931	contig_5013_pilon	-	721	6	Intergenic	novelGene_110085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	287.461301743382	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAAATTTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216413	173824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174017_174599_174716_176215_176266_187933_187998_205757_205926_216282
809936	SIRV4	-	464	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2576	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
809938	contig_12884_pilon	-	1708	6	Intergenic	novelGene_105007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	2.93938769133981	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	17	844	924334	921127	FALSE	35	AACAAAGGCTTGAGCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGGEMAAAEGLAPWRVGFVGAGRMAEAIARGLVRAGKVEAQNVLASAPSNRNLCRFQALGCQTTHNNQEVLQSCSLVFLATKPHTLPAVLVEVAPVVTGEHILVSVAAGVPLSTLEELLPPSARVLRISPNLPCVVQEGALVLARGRRAGSSEAELLQTLLAACGQCEEVPEAYMDIHTGLGGSGVAFVCTFSEALAEGAIKMGMPSDLAHRIAAQTLLGTAKLLLQEGRHPAQLRTDVCTPGGTTIHGLHALEQGGLRAATMSAVEAATSRAKELSRK	924350	920262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_921310_921439_921533_921846_922060_922353_922534_923246_923312_924240
809939	contig_7976_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_169418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAAATGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840721	838621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_838600_840700
809940	contig_7979_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_125530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCGATCCGCTGTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438846	437161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_437200_438800
809943	contig_6674_pilon	-	798	3	Intergenic	novelGene_147994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAAATATGCAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104967	103400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_104053_104361_104466_104925
809944	contig_6674_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_147993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTTTAAAATACTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103003	101760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_101800_103000
809945	contig_3424_pilon	+	828	3	Intergenic	novelGene_55525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_2	167.5	160	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATCTTGTCCAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249067	277406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_249338_276267_276476_277056
809946	contig_7202_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_18477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGTAATTTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27906	27644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
809947	contig_12050_pilon	+	1190	6	Intergenic	novelGene_62655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	216.054622723051	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	387	998	362088	363762	FALSE	15	CTTCAGACTTTGCTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMLSLCSPATGATDPSEQSTPEPVSLARDPGRPVPPLTPCVPLEPGAWALQTIYFPLSPALPVTSHPWEQPLGGREAGIGWLWREVRRRLRAGPHSEPCPRWGSLDSVELGWISSPFPC	359656	363954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_361989_362184_362571_362686_362766_362817_363410
809948	contig_8453_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_125111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATTAACATGCAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73131	74209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_73100_74200
809950	contig_5954_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_28489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAAACCGACTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357243	355033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_355000_357200
809953	contig_18419_pilon	+	1166	9	Intergenic	novelGene_141473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	214.184499906039	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	22	1005	75445	83519	FALSE	25	ATAATGTGTCTTTGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRVARRMADAGFRRVVPSDLYPLVLGFLRDNQLSEVANKFAKATGATCQDANASSLLDIYSFWLKSSKAPKRKLQANGPVVQKAKKKTSSSDSSEDNSEEEKTEVPPVKKAAAKRASLPQHPGKAAAKASESSSSEESSDDEEGEEDKKKKPVQKGVKPQAKAAKASPKKAESSGSDSSSEDEAPKNQKPKTTSVTAKAQAKAPAKAGMPVQATPKVANGKAASSNSSSSSSSSSDDSEDENAAAISKKTVPKKQIVAKPPVKASAASAQNSSSSEDSSSEEEEEQKKPIKKKPGPYSSVPPPSAPLPKKTLGCPCGGKVCPKISRMRCRSSG	75423	83680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_75565_77415_77472_77585_77726_77833_77962_78482_78643_79208_79334_79452_79589_79940_79990_83449
809955	SIRV4	-	348	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1173	0	1173	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
809956	contig_6654_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_85706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161629	163035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_161600_163000
809957	contig_6102_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_31768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3839	junction_2	3153.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGCATGTTAAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296480	298519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296604_297810_297942_298418
809959	contig_4125_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_25254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGAATTTGAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3008104	3006376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3006400_3008100
809960	contig_10331_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_54057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGGAACCATCATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45404	44308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_44300_45400
809964	contig_4364_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_2800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
809965	contig_8710_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_73518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAAGAGCTTTCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376040	377319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_376000_377300
809966	contig_3942_pilon	+	1076	10	Intergenic	novelGene_128811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCGGAGGGACACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050125	1060183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1050336_1050455_1050534_1051203_1051268_1052694_1052815_1053143_1053231_1053738_1053789_1054379_1054532_1054810_1054915_1056020_1056084_1060035
809967	contig_12864_pilon	-	2127	7	Intergenic	novelGene_76376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_6	140.738133504115	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	113	886	208748	203029	TRUE	20	TTCTCAAAATTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQCDEPPASPDDSDNSVSESLDEFDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMAVDLDDQDWLDMNNIEQALFSRLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSTDRDAGEKHSFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDVLLEAIQGAREYISKIRELQHFDFPM	213587	200602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_200954_202138_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
809971	contig_11253_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_126852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAATATCTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305135	304606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_304600_305100
809972	contig_7815_pilon	+	1833	2	Intergenic	novelGene_134355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1226	1543	129529	129846	FALSE	55	AATAAGTACAAAGGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSCMVLGWAQVTCGGPANSGWRSASPAQCGQIFQFVFFSPGVAEKPSFLKNNVKLAFKYWLFFLFFKTQRIKSSSRILSLQSSAFETAINNEYVFRQVENSDL	128085	130136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_129145_129362
809974	contig_13379_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_175877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAAAAAAAACCAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182216	180137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_180100_182200
809975	contig_14300_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_133084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTCCCCTGCCTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139341	137232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_137200_139300
809976	contig_7733_pilon	-	2113	8	Intergenic	novelGene_147150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204359	181157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_181688_191107_191196_191466_191546_194504_194553_196473_196541_196624_196748_200077_200184_203287
809978	SIRV6	+	476	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	536	-1	54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
809979	contig_7356_pilon	+	1905	1	Intergenic	novelGene_60343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54638	56543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_54600_56500
809980	contig_6677_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_114223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679089	680329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_679100_680300
809982	contig_11846_pilon	+	446	3	Intergenic	novelGene_105983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATACAATGGGAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339683	400107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_339946_356655_356766_400033
809983	contig_11846_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_106008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAAACAAACTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437103	557982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_437159_454708_455003_467815_467905_476995_477072_557805
809984	contig_10197_pilon	-	1506	7	Intergenic	novelGene_115181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAACACGAAAGCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483838	448680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_449023_449467_449608_451565_451710_463996_464098_471196_471294_480303_480547_483399
809985	contig_10734_pilon	-	1439	7	Intergenic	novelGene_51333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	16.8720676464584	16	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	298	921	1642408	1616113	FALSE	15	GCAATCGACTGGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPGTQCRVRRRQDENYTVALYQVVVKHGQRVWEYLARLRSHHRSIQSLLFGVNLDSNEPRLLSLGRDRLLIEYNLLKTCKDHLEVLDIHRTDQGCYPTCMVWYPPLTKELFLLICNSGYKVKLFNSTTKMCRKTLLGPTYGSPIEQIQLLPVKTTSELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHKTSAIICHPNGVAGMTLSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWEINLSALEAAVSLGGEDLTPFYGLVAGGREGQFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETREVSEHICLSEVPYVMRAIGFYPSEEKVGE	1645077	1615594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1616269_1616476_1616568_1623239_1623404_1624479_1624595_1642310_1642496_1643488_1643663_1645041
809988	contig_5039_pilon	+	2043	1	Intergenic	novelGene_64949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAAAATTCGGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607262	1609305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1607300_1609300
809989	contig_15084_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_116682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCTACATTAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161777	161368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_161400_161800
809990	contig_2867_pilon	-	1533	1	Intergenic	novelGene_135186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAACAGAGAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798227	796694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_796700_798200
809991	contig_10732_pilon	-	2247	10	Intergenic	novelGene_114743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	5.37713494780572	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	11	676	558188	539540	TRUE	45	AAGAATAGTATTTTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHAESRWDEAPWKKLSEEELETQYSPSRWVVRLGAEEALRTFSQMGAQATRQARASRRSLLHVPYGQGDGEKLDLYFPDGVSEALPFFVFLHGGYWQSGSKDTSAFMVDPLTSQGVAVVIVAYDIAPKGTLYLMVDQVTRSIAFLQKRYPSNKGIYLCGHSAGAHLAAMMLLANWTEHGVTPNLKGFCGAAAFPSPGAPEGLNQPQGISDSCEGPDLGV	558198	534420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_534812_537862_537968_538375_538518_538606_539742_539941_540015_540100_540187_541444_541494_541579_541685_556001_556093_558128
809992	contig_8259_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_148864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACCAGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134564	134247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_134200_134600
809993	contig_14142_pilon	+	640	2	Intergenic	novelGene_120450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	199	357	95155	95313	FALSE	5	GTCGCCTGTGTCTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAGVSVGSGSGNEGQSGSCGYAGLRPAGAARSERVFRPAQDSDGEREDSPAARARQQLEALLNKTMRIRMTDGRTLVGCFLCTDRDCNVILGSAQEFLKPSGQWPGNAHLPGECGGA	94880	95596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_94933_95008
809994	contig_10235_pilon	-	1339	11	Intergenic	novelGene_46284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	400.211644008517	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	126	884	24268	14903	TRUE	55	TTTTTAACAAAACTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVSGDLCEVCAALHCPGPAPGGAEFPSHCHPPWDAPGGEAFSVPAV	25470	13981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17488_17625_19632_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25163_25418
809995	contig_15629_pilon	+	1970	3	Intergenic	novelGene_122477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_2	60.5	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	106	693	180200	181354	FALSE	70	GAAAAAAAACAAAAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLCWIFLWLVSRERINGFNISDCSTKKLIWTYHATSEEEFILFCDLPELQKSHFFRRSQLSPTQVPELVPCRGSKDLSNVQWYLQPQNGDPLREITRDHPSIKSALHFSTIQMNDAGSYICRPRIRSPQDDACCIKMVLEVKPKKNTSFPCFEHKHKQFLLLGSIDPIYCPSLHCQSDTQCPEVTWYQVRMIL	180094	182631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_180270_180739_181053_181149
810000	contig_14326_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_120645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGACCTCTGATTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17892	18584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_17900_18600
810001	scaffold_880_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_121502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCAGCTAACAGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554828	553783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_553800_554800
810002	contig_8156_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_98924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCAAGAAATCAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269847	271690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_269800_271700
810006	contig_7357_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_36936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829208	829609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_829200_829600
810010	contig_15866_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_63648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGGCAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521180	520786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_520800_521200
810011	contig_6199_pilon	-	1234	2	Intergenic	novelGene_126353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	477	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	744	490	1233	116125	103527	FALSE	25	GTGCTTACGACAAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAANLPTAEENLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSSTPGATINPLPSTQNGPVFAKAIQKRVP	116614	103525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_103960_115814
810012	contig_5602_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_133047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAATAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689482	687783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_687800_689500
810015	SIRV6	-	293	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1331	400	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCCCCATCGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3151	1144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_2779_2828_3105
810016	contig_8710_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_73543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGCACTTAACCACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509276	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_509300_510800
810018	scaffold_6394_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_111017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400162	398857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_398900_400200
810020	SIRV6	+	214	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	518	51	518	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10755	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
810021	contig_498_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_148562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777791	776942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_776900_777800
810022	contig_3797_pilon	+	1879	6	Intergenic	novelGene_120090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	63.5893072772459	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	182	1153	346123	393714	FALSE	15	AGTGGTATGACCGGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQGNGRASAARLLLLLLVPLLWAPAGVRAVVDEDLSHRNKEPAAPAQQLQQQPAAVQGPEPARAEKGVTPAAPVHTNNEDPATQGNLGFIHAFVAAISVIIVSELGDKTFFIAAIMAMRYNRLTVLAGAMLALGLMTCLSVLFGYATTVIPRVYTYYVSTALFAIFGIRMLREGLKMSPDEGQEELEEVQAEIKKKDEELQRTKLLNGPGDVETGTSTTIPQKKWLHFISPIFVQALTLTFLAEWGDRSQLTTIVLAAREDPCGVAVGGTVGHCLCTGLAVIGGRMIAQKISVRTVTIIGGIVFLAFAFSALFISPDSGF	345941	394440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_346327_379351_379578_386444_386621_387159_387343_392785_392892_393637
810023	contig_6101_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_114273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	297	1748	2044	168970	169266	NA	35	CTCACTTAACCTACCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQHLHLCVHEVKVNMTKTEKLTTPKKCPHPVSSPTQTTASLPAELLRPKIQESSLIISFLRPLMQIQILLGPVPKYIPSMTTAHYLMPTTHVQAHHH	167222	169266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_167200_169300
810024	contig_14219_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_54306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGATGCTTTCTGGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648420	649803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_648400_649800
810027	contig_6726_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_86210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35423	36245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_35400_36200
810028	contig_14925_pilon	-	783	4	Intergenic	novelGene_55086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1620.70540197779	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	188	580	29675	25993	FALSE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTRLRVQPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETGKRRLLPDFDSLASPGNATNWILPSTGDQDAEELPNILQVPLFPYCCFSPPSVLSKGRAAATSPGCGETPSSQEIVTGPQ	33211	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26210_27970_28041_29569_29828_33176
810029	contig_11258_pilon	+	319	5	Intergenic	novelGene_67745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5543	junction_4	1699.91167049938	61168	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCAGTGTCTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49147	53623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49173_49379_49422_50092_50154_52748_52872_53555
810030	contig_3797_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_120083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCACATCTTGCTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323677	322414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_322400_323700
810032	contig_10319_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_147245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGGAAAATAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83600	84460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_83600_84500
810033	contig_20356_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_159547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1272	1637	123366	123001	NA	15	TTTATTTTATTGTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSEIITKLVSISTYGKLSPLWRLLARSKPYKVTCVLSEEMLRSCSFPSLIIVRLRRLEHFKANSKASIQHLPRKHRFVSSMIQETIKSSIPLNLALLTLNILLIFLRNMYWKLILNIKNL	124637	122983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_123000_124600
810034	SIRV4	-	501	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	96	20	96	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5062	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810035	contig_16999_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_84980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATCAAGAAACATTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84305	86674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_84300_86700
810037	contig_2455_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_119234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTAGCTGATTAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455151	1457731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1455200_1457700
810038	contig_7119_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_40865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52109	51816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_51800_52100
810040	contig_14450_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_49058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421620	1422993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1421600_1423000
810041	contig_10642_pilon	+	2705	2	Intergenic	novelGene_78745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTTTTGATTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292041	1294996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1292679_1292928
810043	contig_5696_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_117509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCGGAGGACTGAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333786	334700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_333800_334700
810044	contig_8616_pilon	+	1636	12	Intergenic	novelGene_72484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	663.363941594857	1	91	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	427	1236	322373	330241	TRUE	25	CCCGTTTTTCCCCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNDPPLPALLWAQEVGYILAGRARKLLLQFGVLLCTILLLLWVSVFLYGSFYYSYMPTVSHLSPVHFYYRTDCDSSTSSLCSFPVANVSLAKSGRDRVLMYGQPYRITLELELPESPVNQDLGMFLVTISCYTRGGRIISTSSRSVMLHYRSDLLQTLDTLVFSSFLLFGFAEQKQLLEVELYLDYRENSYVPTTGVIIEIHSKRIQLYGAYLRIHAHFTVPAVQLPDDLCLHWRRQQLHLPQRHRALQLHAVGVGGHLAPKPALFAG	318305	331035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_318439_320288_320477_322267_322585_323789_323872_326955_327100_328047_328183_328360_328451_329944_330087_330236_330298_330467_330546_330638_330720_330850
810048	contig_5894_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_83041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423336	422283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_422300_423300
810049	contig_7202_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_18346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTGGTACCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27847	27638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
810050	contig_5361_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_167214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAACCCAGGGCAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484779	484449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_484400_484800
810051	contig_5361_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_167213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484261	483614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_483600_484300
810052	contig_9363_pilon	+	2041	4	Intergenic	novelGene_6532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	2.16024689946929	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1624	1932	624343	624651	FALSE	40	TAAACGTCATTTAATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALSSSPFITPRPLSTPRIVAFETSVQSYTIFLLVVFAQFLPAASPPFSTCGTLPILPGPALLSCPPVSPSPAQQRHKTKALYGLSRWHSVPLSHQSNPVF	621270	624760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_621641_622468_622613_622737_622816_623311
810054	contig_5549_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_81679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAAAAAAAAGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561866	563741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_561900_563700
810055	contig_16846_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_82975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	459	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	101	619	555239	551492	TRUE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558750	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551108_551488_551665_552661_552824_555055_555278_558688
810056	contig_11994_pilon	+	2017	11	Intergenic	novelGene_129346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	77.6080537057849	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1043	1603	102991	108340	FALSE	50	CAATTCAATATAAGCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93707	108754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93885_94954_95436_97358_97423_98570_98727_100323_100486_102988_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
810057	contig_11215_pilon	-	713	2	Intergenic	novelGene_118966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	0	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2	559	4979	1722	FALSE	75	AATAAAAATAAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVSLDPPWYRLLEKDNVSLKCLPEGNSTQWWHNGSLISSQSSSYFIKSARVNDSGEYQCQTSSTLHSDPVQLEVHIGWVLLQAVRQVFLKGETIELRCHAWKSKPLHKVSYFQDDRRKKFSHHNTIFHIPKATGQHNGSYFCRGLIGNRNESSGSLNIYIQGERCAALESPDPLCVEPCTHTGG	4980	1567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_2048_4747
810059	contig_13982_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_163473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGGCAAGATAAATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329818	328766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_328800_329800
810061	contig_7070_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_104063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGCTTTTCAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258909	258626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_258600_258900
810062	contig_5815_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_141174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGGAGAAAGGGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95834	96607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_96167_96295
810064	contig_11264_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_154205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATAGGAATGCTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270346	268268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_268300_270300
810066	contig_4364_pilon	+	946	2	Intergenic	novelGene_72	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	217	567	707882	708232	TRUE	20	TATTAGTGTGATTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARAGPQLPDSRARAFGGCGRLQWGLRNPKSNPPHPCRQQYPLSGWTPSPRALEGPAAGGAGMQVSWHQGHCSGAPAVPSGTTGPWSGREPWCRPSPPSLARAVWQEEVSFCSLK	707665	709035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_708462_708885
810068	contig_3018_pilon	-	1121	5	Intergenic	novelGene_78952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATATGCTGAGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439580	1389927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_1390021_1395832_1395881_1399264_1399375_1429666_1429754_1438797
810070	contig_7408_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_168746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAGGAAACGACCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14929	16176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_14900_16200
810071	contig_9706_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_20960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCTTGCTTACTGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307249	308277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_307200_308300
810072	contig_9706_pilon	+	186	1	Intergenic	novelGene_20961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTATTTCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308629	308815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_308600_308800
810073	contig_10064_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_122736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1008	1328	439381	439701	NA	30	ACACTCGACAAAGGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVHKGYPRFQLQTQAPASKHCGRSECKRTLDHPVQLPHLINEELTPKDKEVFLQKGFGIWKVLNATHKTVMFPTRAIPLDCKLHAVGILSALSACSPKPRTVPIT	438373	440837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_438400_440800
810074	contig_12864_pilon	-	1743	7	Intergenic	novelGene_76374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165.954813126947	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	578	1633	198457	187886	FALSE	20	CTTTTAAACTTTATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADSLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFPHAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTETYRESIKADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSGKDMSPAFPRNVVVKICFI	199933	187775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_188120_191141_191250_191350_191452_194814_195003_196047_196181_198165_198471_199369
810075	contig_14326_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_120778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGCTAACACACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822568	823387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_822600_823400
810078	contig_10861_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_39292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCACATCATCCAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402250	1403166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1402200_1403200
810081	contig_10196_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_132280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTTAGGGTCTAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2191929	2189581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2189600_2191900
810085	contig_9752_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_122031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	952	junction_3	281.178867547964	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	158619	192723	FALSE	50	TAAATATATAATTATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGIETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITDNGTVCQQLVVHIKACHGLPLINGQSCDPYATVSLVGPSR	158616	193820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_158707_165525_165621_177497_177575_192635
810086	contig_4769_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_118004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGTCGTCGTTCTGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963621	965385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_963600_965400
810087	contig_405_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_135296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTGTGTGTGAATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164851	163627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_163600_164900
810088	contig_11507_pilon	+	1147	2	Intergenic	novelGene_103369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGGATCACTCACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124809	126028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_125763_125834
810089	contig_10003_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_88266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGATTCTTATGTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784426	783143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_783100_784400
810092	contig_15327_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_70415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCCAAAGGTCACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28331	27724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_27700_28300
810094	contig_5832_pilon	+	605	2	Intergenic	novelGene_134107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTATCTTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5403	20528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
810095	contig_10176_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_72702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTTCTGTTGTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236278	235127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_235100_236300
810096	contig_10176_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_72701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGATAAATTTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234473	233969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_234000_234500
810097	contig_15047_pilon	+	685	4	Intergenic	novelGene_52208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.225805240841	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	289	324	3482	4178	TRUE	20	AATCTGCATCTTTGCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_3270_3498_4158_4313_21435
810098	contig_6871_pilon	+	1304	11	Intergenic	novelGene_21520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	389.673773815996	1	56	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	287	1258	63442	72153	FALSE	25	AATGCTTTTTTGAGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYMRYSRKVGIWDPERNLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	52491	72199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54467_54521_54695_54740_57960_58066_63397_63494_64480_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
810099	contig_10003_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_88281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACCAAAGCTCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852154	852798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_852200_852800
810102	contig_14925_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_55386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTTAGGAGCCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258552	259463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_258600_259500
810103	contig_14925_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_55387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTATTTAAGCAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259661	260668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_259700_260700
810105	contig_7580_pilon	+	1030	4	Intergenic	novelGene_108601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	153.974745403986	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	153	650	103420	109647	FALSE	35	TGAAACCTATTTCATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPRNSLSRALPAEPMKGPIDMYPVQKINPQRMLSVVGPAQHFFMRESKALGAVQIMNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMNVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96491	110027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_103406_103579_104052_104173_109428
810106	contig_12520_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_161091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	75	299	616238	616014	NA	30	CAGCTCAAATCACTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFIACLVKSSDACSLHLYGAEERMSASSWSCCYSWYCCEALSQLFSIMLFQVRLVWQARQDTVVVNIRNEAQVRDSSGIQLVTPLLVPLRSSVSWGC	616312	614389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_614400_616300
810109	contig_10581_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_41442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790589	792626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_790600_792600
810111	contig_4769_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_117991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861808	861551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_861600_861800
810113	contig_5059_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_140751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTATCTACAATGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427729	428486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_427700_428500
810114	contig_5059_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_140752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTGACAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429146	429595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_429100_429600
810115	contig_6842_pilon	+	1644	7	Intergenic	novelGene_130728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTCGGTCATCTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526769	533416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_527150_528253_528311_529364_529438_529973_530111_530511_530592_531310_531471_532659
810117	contig_10377_pilon	+	1471	3	Intergenic	novelGene_115382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.5	8	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	133	498	219517	227755	FALSE	50	TTTGTAAATGAGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGEDPPRCHPKLQLSRLYEYRSGGRTSKHFAYITFVAVLEEEVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDR	209083	228728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219513_219615_227487
810120	contig_14326_pilon	+	1917	10	Intergenic	novelGene_120770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	8.47800349197124	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	124	1383	736867	757217	FALSE	40	GGGAATAAAGCTTGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHPSTGVQLLSEQKGLSPCCFISAEVVHWLVNNVEGVQTQVMAIDIMQKMLEEQLITHASGEALRTFIYGFYFYKIVMDKEPDRVAMQQPTTWHTTAVDDFASFQRKWFEVAFVAEEHLHSEIPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSRSFGGRSQAAALLAATVPEQRTVTLDVDVNNRTDRLEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTAAVLFEMVQGWHRKATSCGFLLVPVLEGPFALPSYLYGDPLRAQLFIPLNISCLLKEGSEHLFDSFEPETYWDRMHLFQEAVAHRFGFVQDKYSASAFNFPAENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKFSGQQRRRRNSTSSTSQNMFCEERVGYNWAYNTMLTKTWRSSATGDEKFADRLLKDFTDFCVNRDNRLVMFWTSCLEKMHASAP	736515	757751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_736575_736802_736881_737357_737491_739214_739324_740136_740362_747036_747207_750146_750319_752851_752913_756655_756739_756924
810122	contig_14959_pilon	+	603	2	Intergenic	novelGene_166726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGGGGAAAAGACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60210	64573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_+_60437_64196
810124	SIRV6	+	453	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845
810126	contig_18251_pilon	+	987	4	Intergenic	novelGene_50172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	76.3718971000896	1283	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	459	926	110201	119066	FALSE	40	GAATCACGAGCCATCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEDGYVALNIKTRRPAFTSAHKCSPCDTNWRYYGDSCYGFFKHNLTWEESKQYCTGMNATLPKIASQNILEYIKARTGLIRWIGLSRQNSNGVWTWEDGSVFSKNLFELPGDGNPNMKCAYFHHGKIHPSSCKNRHYLVCERKAGMAKVDELL	109742	119127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_110265_112324_112477_116797_116905_118921
810127	contig_10711_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_118411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGAAATGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187620	185914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_185900_187600
810128	contig_7720_pilon	-	1981	16	Intergenic	novelGene_155780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.171879689481	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	168	1229	860670	798987	TRUE	10	ATCTCCGAGGCTCCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASSADQLMENIGAIQVLPKLSSSIIHEIDSILGNKPYSKKDYRS	872302	795753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796159_798639_799077_800535_800625_801279_801401_802389_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_860593_860723_872187
810129	contig_8453_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_125142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAGCTTAGCTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263985	261894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_261900_264000
810131	contig_13224_pilon	-	1167	4	Intergenic	novelGene_104095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTCTCTCTTGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254198	248795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_249165_250727_250851_251507_251615_253630
810133	contig_4769_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_117981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	639	1097	440680	441138	NA	40	ATTCCAAACCCATTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPAAGSLLPLLAFSVNSCLSLSPGSRSFSAQRSRVQRMCCLLLVLPWWWWYLLPASGMAHFKPRGIAKLTNPLGRSQLFLQSHPITWLERPHKSDPLHRNFLTLWHKRMFQVHLEPACLSPRTSHFSDEPFQWGMVLETKIWVEGVVIAR	440041	441761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_440000_441800
810137	contig_15543_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_164334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGGTTAAGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23982	24787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_24000_24800
810139	contig_1380_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_138876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTATATACCACAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95046	92595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_92600_95000
810142	SIRV5	+	428	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1992_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
810143	contig_9272_pilon	-	2607	7	Intergenic	novelGene_125945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	1964	2605	448696	444696	FALSE	25	AGGAGCTCCCGGCACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHHASGTMLSSDDSFLLRHLPKVCGHASQHAGGASALGTSHTHKVTGPHEVSCRFCSQLMGNDCIFSNLLQNLDFLDIGVPLSHCLHTVHKLFVEPLHGLVYHHLQPKYLAHIRDHFTQHCVPICLLVLLLPALLVAEDPQGLLHGFLSLPNIDHLLVAVESLFQPRTWQRTPTPDLVDPCTRGRAAQCPQVQLLANGQHCLVPEALHVAHVS	451190	444693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_444717_445813_445925_446252_446383_447532_447692_447834_448018_448658_448752_449282
810144	SIRV4	-	607	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	-2	12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	260	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810146	contig_5005_pilon	-	890	5	Intergenic	novelGene_84324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	498.614267244731	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	397	726	520418	512817	FALSE	35	TTTAAGATGTAAATGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	539215	512652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539140
810147	contig_8576_pilon	+	1658	7	Intergenic	novelGene_88749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	95.8273911201223	32	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1020	1406	710522	715062	FALSE	75	CCAAAAAAAAAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGME	695392	715314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_696081_700724_700885_707554_707592_710387_710525_711469_711588_713469_713555_714881
810148	contig_17270_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_67223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAGTTACTAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45030	46608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_45000_46600
810149	contig_7887_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_124866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCCCAGCTCTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168935	170347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_168900_170300
810154	SIRV4	-	342	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	23	1156	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
810155	contig_9363_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_6719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGGCCCCCTGGCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370595	1369390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1369400_1370600
810156	contig_6658_pilon	+	1753	8	Intergenic	novelGene_168399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGGATCAGAGTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116347	124254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_117444_117946_118093_118420_118483_121145_121279_122210_122293_122381_122417_122731_122881_124204
810157	contig_5005_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_84323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCTGTAACAGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512363	521939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_512952_515555_515745_521805
810158	contig_4816_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_115597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACTTAAAATGAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15675	15141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_15100_15700
810159	contig_5770_pilon	-	460	4	Intergenic	novelGene_74174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2618.28837220043	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	150	425	263612	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264012	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926
810161	contig_13607_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_170209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCAGATGCCTCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328164	328624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_328200_328600
810162	contig_13607_pilon	+	1525	1	Intergenic	novelGene_170210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACATTAAGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329032	330557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_329000_330600
810165	contig_401_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_42738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150802	151895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_150800_151900
810166	contig_13110_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_138744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACAAGGGGGCAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542911	540957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_-_541000_542900
810169	contig_9955_pilon	-	1324	4	Intergenic	novelGene_21300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	437.139438725092	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTATTTTGGTGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49829	44890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590_47724_48794_49380_49692
810170	contig_12543_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_168393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	39	371	494494	494162	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATQISQTIFTIMGFIREVTVTIQVQEHSGYSSSIRPASSQPCSQAYLSLALCLKARRFLTPRVGKPTEKSLLPLLLTVFRVTPCSLSLSLSLSLSLGSRSFSVQGSQAQTTQSPLLAVLPW	494532	493185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_493200_494500
810171	contig_3081_pilon	+	1209	2	Intergenic	novelGene_133968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	491	886	1185696	1186091	TRUE	55	TTTAATTATAACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKCSQSLAIREVQIKTTVRYHLIPTRLAFIQKTQNNQCWRGCGETGTLIHCWWKCKMVQPFWKSIWRFLKKLEIEVPYHPAVPLLGIYPREIRAVTRIDICTPMFIATLFTIAKRWKQPRCPSADKWINT	1185205	1191269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1186277_1191131
810175	contig_10494_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_102171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	465	767	921072	921374	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSIATVVIILWLVWTVFTAEPLTPSAAESSFTHIHVALSLPTLTWSWCRVTLREELRGRTSSSSRFPPGADNQRQGPSVFQPTSTSFPTAGSLPSHTDI	920607	921890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_920600_921900
810179	SIRV5	+	424	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7460	-1	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
810180	contig_4336_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_152366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACAAATTAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370099	369715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_369700_370100
810181	contig_9389_pilon	-	1506	6	Intergenic	novelGene_83863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	25.136427749384	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	88	1029	16996	14071	FALSE	10	GAGCCTGTGTTGGTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSQRSLARPLTPPAHPGHPQVLSTRILAMKASLCKLSPCTVTRVCDYHAKLFLIAISSTLRSLLRPHFLNTPDKSPGDRLTEICSKITDVDIDKVMINLKTEEFVLDMNTLQALQQLLQWVGDFVLYLLASLPNQGSPLRPGHSFLRDGTSLGILRELMVVIRIWGLLKPSCLPVYTATSDTQDSMSLLFRLLTKLWICCRDEGPTSEPDEALVDECCLLPSQLLIPSLDWLPVSDGLISRLQPKQPLRLQFGRAPTLPGSAAASQLDSLARAPGQPKIDHLRRLHLGAYPTEECKTCTRCGCVTMLRSPNKTTAVKQWEQRWIKNCLCGGLWRRMPLSCP	17083	13593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_14198_14693_14778_15075_15293_15628_15822_16490_16625_16809
810182	contig_5832_pilon	+	734	7	Intergenic	novelGene_134133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_4	24.870777140161	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	147	734	205023	213462	FALSE	50	ATTATAGTAGAAAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLKQNTREECIYAQTLLLQLLQSCFSVLQGDAPVVSEKEEAPKQIPKGMEAAKELYTHLCDVVDRVSGDSVPMEILKQEVRNTLLNGAAIFFPDRQTRRNHLFIMMKNVTEQEHKQSLQLTFRSLCTYFSDKDPGGLLLLPEKSDLADMNISEVLAVMNTLLSVAARECELLMLSGAQGEVGSVLFSLFWSVQGSLFSWCYLQLKSTDARAKGLAVDLIEKYVQQFLARMRVILESLLSQYSGK	204367	213462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_204384_204892_205063_205679_205814_207445_207517_208507_208623_212363_212524_213394
810184	contig_5145_pilon	-	1094	5	Intergenic	novelGene_131439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.545691441907	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGATTCCGTCCTGCCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920292	915557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_915732_915770_916420_916540_916617_917117_917244_920223
810185	contig_935_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_45533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCACCATGATAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234486	236530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_234500_236500
810188	contig_7275_pilon	-	651	5	Intergenic	novelGene_111234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	9.67923034130297	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	11	577	203318	188054	FALSE	20	AGGTTATGTATTTTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFQMQRLCANDILDGVDEFIESISLLPEPEKTLHTQDTDHQHNSSHGEEEASKEDPPSNLLEERKSDQLGLPQTLQQEFSLINVQIRNVNVEMDAADRSCTVSVHCSNHRVKMLVKFPAQYPNNAAPSFQFINPTTITSTMKAKLLKILKDTSLQKVKRNQSCLEPCLRQLVSCLESFVVRRMKLLYPHML	203328	187979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_188189_190413_190579_193242_193368_202185_202319_203309
810189	contig_7275_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_111232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTTACCAACACCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187189	185762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_185800_187200
810191	contig_17964_pilon	-	1688	5	Intergenic	novelGene_33936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	12.1655250605964	25	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	5	766	693144	669413	FALSE	35	TAAAAGCTTCTTTAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIEQQKRKGPELPLVPVKRQRHDLLLGAAGSGTGAGQQQGALLQAGPPRCSSLQAPIMLLSGHEGEVYCCKFHPNGSTLASAGFDRLILLWNVYGDCDNYATLKGHSGAVMELHYNTDGSMLFSASTDKTVAVWDSETGERVKRLKGHTSFVNSCYPARRGPQLVCTGSDDGTVKLWDIRKKAAIQTFQNTYQVLAVTFNDTSDQIISGGIDNDIKVCLMLNHSLSPFSTHRGESFQTSEIVVALYLIPVEGG	693148	668490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_669650_685918_686085_687203_687298_688016_688147_693009
810193	contig_15029_pilon	+	1402	11	Intergenic	novelGene_128214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	827	1381	240163	242575	FALSE	35	TGCAGCAGAAGGTATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLHTSRAFRPHHACEVKGRDIRPPVGILGKLQLPELAMGGKVSSCPGKALQSLGHHIGTSQEPIGLRIVLAQHPQPQQGLLLGCHHKVVGVILVIYNVLQINACGLQQALEEALIVDPGHATDFGHLCLLHGAPIHKVGRDANGQFASHFSNCEAWGDEFTSSSRDENIKFIVGQLGRGAGL	234772	242596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_234814_234938_235050_235335_235442_235586_235807_238958_239016_239163_239294_239477_239599_240122_240375_241285_241387_242007_242171_242496
810196	contig_3942_pilon	+	2302	16	Intergenic	novelGene_128801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_13	85.2576226634441	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	111	2201	1012885	1019274	TRUE	40	AAACTGAAGCACCACTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGDEIAIELRSSVGAPVEVTHNFQVDFVWKSTSFDRMQSALKTFAVDETSVSGYIYHKLLGHEVEDVIIKCQLPKRFTAQGLPDLNHSQVYAVKTVLQRPLSLIQGPPGTGKTVTSATIVYHLARQGNGPVLVCAPSNIAVDQLTEKIHQTGLKVVRLCAKSREAIDSPVSFLALHNQIRNMDSMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVGAGDPRLAKMQFRSILIDESTQATEPECMVPVVLGAKQLILVGDHCQLGPVVMCKKAAKAGLSQSLFERLVVLGIRPIRLQVQYRMHPALSAFPSNIFYEGSLQNGVTAADRVKKGFDFQWPQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKLLKAGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILSCVRANEHQGIGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSKQPLWNHLLNYYKEQKVLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFMTTAMYDAREAIIPGSVYDRSSQGRPSSMYFQTHDQIGMISAGPSHVAAMNIPIPFNLVMPPMPPPGYFGQANGPATGRGTPKGKTGRGGRQKNRFGLSGPSQTTLPSSQASQDVVSQPFSQGALTQGYVSMSQPSQMSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKSQIDVALSQDSTYQGERAYQHGGVPGLSQY	1012701	1019650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1012811_1012883_1013044_1013120_1013240_1013523_1013689_1013783_1013899_1014458_1014603_1014916_1015131_1015214_1015333_1015578_1015736_1016328_1016472_1017101_1017277_1017436_1017519_1018549_1018712_1018802_1019021_1019154_1019282_1019556
810197	contig_10593_pilon	-	1072	5	Intergenic	novelGene_172828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAAAAGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75707	25952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10593_pilon_-_26038_52472_52519_62210_62293_71133_71202_74916
810198	contig_20614_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_107582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284190	283645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_283600_284200
810199	contig_11829_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_128146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAATCTTGTGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198045	197375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_-_197400_198000
810200	contig_6589_pilon	+	1384	6	Intergenic	novelGene_26316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	47.4147656326592	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	2	610	2353597	2354298	TRUE	10	CCCACTTTGTGGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVGSQGSQAGAGASTNPRSPRWYRDLVDGYQLQVQKSVTVQEGLCVFIPCIFSYPPDGWKDSDPVLGYWFQEQAYNFNHEQVAPVATNNPYRKVDSQTRDRFQLLGEPWNRSCSLVIRDAQRRDTATYFFRVERGNTVKFSFKKYTLALEVTGLTQKPDVYVPETLEPGRPVTLLCVFPGDFEGCPAPKFSWTGVAVSPPRS	2353595	2371607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2354054_2354146_2354433_2354880_2354981_2355976_2356059_2358346_2358558_2371360
810206	contig_15108_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_131172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1189	1533	61896	62240	NA	20	GTCCACAACACGTTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSPVGATVKCSTANARSNVQTRSAAAWEKDLAICSCKDYSLENSIRQLYFGTWGCYESEVNSTAPNNNNLYGSRSPGGLETLTFWLASECLIVAPPGLLQFKGTQDKISPMA	60707	62732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_60700_62700
810207	contig_13982_pilon	-	1421	6	Intergenic	novelGene_163476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	86.887513487267	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	15	1121	389553	353170	TRUE	45	ACCAATAAAACCAACGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQNGVRDNNQPRHLPRNDTRQLRNEKPPRFQRDTQNSKSVFEGCGLPRNRGSEKPTSSVSEVWAEERIKCDRPYSRYDRTKDTSYPSSSQHNDGAFKKRDNSMQSRPGKGPSYAEAKENPLPQESIDYNNQKRGKRENQPANLDHFYDRKPRTMSNEAFSGVKTEKHFNVNTDYQNPVSTNSFIGVPNGETEMPLKGRRVGPIKPAGPIAATPYDDKIFYNSGPKRRSGPIKPEKIIESSIPMEYAKMWKPGDECFALYWEDNKFYRAEVEALHSSGMTAVVKFIDYGNYEEVLLSNIRPVQTEAWSFWKALLKLKRHFLIFQLQGSWKVHRRNQKTWVRVLALPITTYVTLGRRHLRPNSGVPKRR	389567	343304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_343529_353093_353217_372108_372197_379610_379662_383217_383344_388758
810208	contig_10658_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_130095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGCTAGATAGAAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429933	427198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_427200_429900
810209	SIRV6	-	246	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11275	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11111_11205
810219	contig_10312_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_159036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTAAAGTGATAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620146	622325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_620100_622300
810220	contig_12157_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_135909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTAATATTAAAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167321	168678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_167300_168700
810222	contig_4876_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_137888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262713	263927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_262700_263900
810223	contig_1867_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_54548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	487	858	391448	391819	NA	20	GTTGGCTGCTTATGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPKSSQLSLHTAASSDTAFACMGLDCSCFLFTGHPAPLVTPCLEVPSSAHWPTRPPLPSAGHVVPNTHTASTFSLLLGFAVLAPISLPLPAVFSVTTLSSGSRRFSAQGFWVLRTCCAPDSS	390961	391850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_391000_391800
810224	SIRV6	+	342	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	12	530	-1	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
810226	contig_6102_pilon	-	615	5	Intergenic	novelGene_32190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.80913287991	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	132	464	896355	895751	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVYQEMFYIFNPFRIAVYLC	896938	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895724_895940_896211_896359_896627_896706_896888
810227	contig_9463_pilon	-	1468	2	Intergenic	novelGene_83810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGAGACACCAACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33337	31380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_31808_32296
810228	contig_11933_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_107267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCATGAAAAACATTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158436	157306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_157300_158400
810232	contig_11720_pilon	+	1548	3	Intergenic	novelGene_44045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15	58	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	48	980	511775	541961	FALSE	50	TTAATAAAAAATATTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAISTSFLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRELPMSLLTRLALTDPTSLSQFVNTVAASPSPIVSFFSVALLGDQPLLTSDLLSLLAHTARVLSPNHLSFIQELLAGSDESYRPLRSLLGHPENSVRARTYGLLGHLLQHSMALRGALQSQAGLLNLLLLGLGDKDPAVRRSASFAVGNAAYQAGPLGPALAAAVPSMTQLLGDPQAGIRRNAASALGNLGPEGLGEELLQCQVPQRLLEMACGDPQPNVKEAALIALRSLRQEPCIHQVLVSLGASEKLALLSLGNQLLPHNGSSPRPASAKHCRKLIHLLRPTHST	511727	542529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_511844_539905_540620_541811
810233	contig_6477_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_154160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	15.0561449249135	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	317	784	748456	761236	FALSE	25	AATAACCATTTTCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGVLSSPDPALPQEESTGEEGMAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDSLFWRAIKPIHDRIPSYVEIHRDAINLKWESLSGSCINVHLYNAL	748139	762002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_754498_754588_757413_757541_758317_758414_761096
810234	SIRV6	+	284	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	102	-9	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
810236	contig_10307_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_170286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGCCTTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531979	532924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_532000_532900
810237	contig_9828_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_172252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124385	123684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_123700_124400
810239	contig_10197_pilon	-	2119	3	Intergenic	novelGene_115180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	82	306	453080	452856	TRUE	40	TGGAAAGTGGAGCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLHCFTVKQTSRAWLVADKLILTHGDPMCYRLELLHRVFLAVILTEADRHAFSSMAPLGGFEQPTFRSAVKRKLFVPPRDLTKGLENSKCFSEVVGGRGAG	453161	448639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_449023_449467_449608_451565
810241	contig_13366_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_99776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAAGGCCTGGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62171	62692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_62200_62700
810242	contig_13366_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_99777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63054	64756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_63100_64800
810243	contig_9091_pilon	-	986	2	Intergenic	novelGene_32437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTAACACTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67152	65942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_66862_67085
810249	contig_10163_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_82641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152193	151852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_151900_152200
810250	contig_2550_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_135686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	1581475	1581846	NA	40	TGTGTTAGAAATCATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNKQIIHKPYVHFTSFASLSSLAKHLGKICKRRKACLRAGRTRGLGQVRVSNLLTQGCLCRSVSCTKFQITLGFKLPEYVVNLFGIVYCFTCNVPPIRSIFFPDCNTSRSCRITTSPLLHPSC	1581473	1582367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1581500_1582400
810251	contig_826_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_154942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGTTTGACATCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330170	329479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_329500_330200
810260	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	521	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11109_11208
810261	contig_6589_pilon	-	1325	4	Intergenic	novelGene_26273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	47.4622657135821	12	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	88	552	2229483	2228934	TRUE	15	CTATTTTTCTTCAAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHCLLSILLSLPSGQRGRTSLHRGQPLRGRRSRSPCQLGPWAEEERLLLCRPPGEAPAPILALWEPLGSPSYLCPHPQFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPVRPAFRWEGSHVGMDWGLIFPVWPPRGLSPPRGLSASLSLAPF	2229570	2227818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2228119_2228208_2228489_2228740_2229304_2229388
810264	contig_6876_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_147026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1	480	140987	140508	NA	15	TTTGTACACACTCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KARFPIDLAIQDFWNAEHNCNHPDGETNHFAIQKPFLPPVLCFHGLDNGNVPVHTDTHDQQHTAIEVHLVHAVDQFAHEAREFPLVSSSNGPEGKSDKKEKVSNRQIQKKHVGHGLHSCAVPVDKDDQTVAQSPYNEREPVEGWDEIARKLPDIVFLAE	140987	139686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_139700_141000
810265	contig_854_pilon	-	1417	12	Intergenic	novelGene_36567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1061	1381	1680811	1677600	FALSE	10	GGCCTCCAGGATGGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPICSSSGMPMILMASMVSWNMSLSCCPGMVTCPLDRKRYLLYGSNRRSALQVLPSPREEIVEDVEGALLLGLADSTGFLQKIRLNVGSHDVAIDIKVDTNEFAKA	1716388	1677563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1677609_1678131_1678196_1678749_1678848_1679248_1679394_1680806_1680918_1681777_1681885_1683921_1684079_1685074_1685249_1686940_1687083_1689321_1689453_1692601_1692747_1716290
810267	contig_9683_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_151291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543976	542730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_542700_544000
810273	contig_12977_pilon	+	1201	12	Intergenic	novelGene_122798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	693.321517964593	1	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	345	806	50609	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKSKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKLYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	38206	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_38274_46988_47024_47258_47366_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52438_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
810274	contig_7446_pilon	-	2007	7	Intergenic	novelGene_101946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_6	241.126119604566	19	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	80	1159	260350	168352	FALSE	70	TGAAAAAATAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTSQSDVSSLPPVPSSTDLEVGETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTVSAQALLASSSAESPPSTSLLSSSDSEQRQSVEASGHHTHHQSDDSNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSTASSSRGNGSHCKSEGQEEDFAPLSSMQPPKGDSETKAPEASSEDVTRYQEGTSAENTVENRIDVDKFTSEPLDSSSGEKNDLNLDRPCGVPEESILSEKGKEPETSDQLSTKSATNQNTTNPEPQSQTEAIESSVHEETSARYSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRCSRFDSCVFHLATSTCIVAVYVGEKRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMVPNAHGVIWEKL	260429	167503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_168530_178286_178365_185009_185329_185568_185656_186937_187054_193589_193708_260166
810275	contig_5947_pilon	-	1639	6	Intergenic	novelGene_101548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	74.2417672203457	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	114	746	589186	583853	FALSE	50	GGAGCTCAGAGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQNYPLLLLTLLEKSQDNVIKVCASVTFKNYIKRNWRIVEDEPNKICEADRVAIKANIVHLMLSSPEQMQKQLSDAISIIGREDFPQKWPDLLTEMVNRFQSGDFHVINGVLRTAHSLFKRYRHEFKSNELWTEIKLVLDAFALPLTNLFKVWINDFGDNFKLLCIFKLLIP	601458	582959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_584010_584448_584595_584681_584784_586374_586518_589101_589198_601356
810276	contig_4388_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_161949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATTCTGACTCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307725	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_306300_307700
810277	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_94857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
810278	contig_8597_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_158727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGTAATGAGGACTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146835	145897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_145900_146800
810284	contig_7051_pilon	+	1841	3	Intergenic	novelGene_64371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	9	27	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354389	375614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_354515_368164_368292_374025
810285	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
810286	contig_14882_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_115027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGATATTATTCCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313470	311994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_312000_313500
810287	contig_5640_pilon	+	640	3	Intergenic	novelGene_27276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	148	303	959160	959315	TRUE	20	AAGGTATGGCTTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSVSGKQPGERGWKPNRVEAADCLSVCGSLRADSYLGFGLEELRPALVMVHQGLRPRLSRELNWSLKRASLPRFPRLRLRDGRVATERSSSCLAAGALS	959012	961325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_959439_960305_960384_961189
810290	contig_9146_pilon	+	645	5	Intergenic	novelGene_79490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	323	544	142828	146911	TRUE	35	GGCGAGAAGGAAGAAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHVKKKLYYFYNSHLCFLARCLRSRCFLGWGFLALLSFWRPSLLSWSFLLLACCLFFLGRSLLACSGHLLCWNLCSSCCCSCSCSLCSSCFFGRSFQESCPLKLLNFMLYYSVPHFLCLHDFITIKIRHLGFLFSGFNLLGPSCGCPFCTDICLLPGLSDILLAGTRKVRTTDQGISFQQ	142505	147503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_142849_143321_143378_143481_143621_146905_146994_147484
810292	contig_3382_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_124144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGAGCAGTTTGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850974	851866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_851000_851900
810293	contig_12622_pilon	+	1935	12	Intergenic	novelGene_6008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	7	junction_1	42.1598688975019	230	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	29	1651	1634963	1644642	FALSE	5	GCCCTGGCCGGCTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTALDLLLNMSAQRELGGPPLQVAVVKSEDAEAELASSGGQPSPAGAAPQVVTLHVAEPGGSVAAESQLGPPDLQQITLAPGPFGGAGYSVITAPPMEEGTSAPGTPYSEEPPGEAAQAVVVSEALKEASTHYIMAADGTQLHHIELTADGSISFPSPEALASGTKWPLLQCGGLSRDGPEPPSPARTHQSGDLQASASPSPAASKALGLVVPPSPPSAAAAASKKFSCKICAEAFPGRAEMESHKRAHAGPSAFKCPDCPFSARQWPEVRAHMAQHSSLRPHQCSQCSFASKNKKDLRRHMLTHTNEKPFECHLCGQRFNRNGHLKFHIQRLHSPDGRKSGAPPARAAARTPTQTIILNSDETLATLHTALQSSHGVLGPERLQQALGQDHIIVAQEQTVTNQEEATYIQEITTADGQTVQHLVTSDNQVQYIISQDGVQHLLPQEYVVVPEGHHIQVQEGQITHIQYEQGTPFLQESQIQYVPVSPGQQVVTQAQLEAAAHSAVTAVADAAMAQAQGLFTSEEAVPEHIQQLQHQGIEYDVITLTDD	1634934	1644926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1635002_1639965_1640226_1641607_1641720_1641796_1642172_1643063_1643207_1643283_1643436_1643584_1643689_1643778_1643857_1644033_1644118_1644205_1644272_1644353_1644436_1644514
810294	contig_8866_pilon	-	740	5	Intergenic	novelGene_77862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	369	junction_4	60.3505385228666	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	289	738	686785	684093	FALSE	50	GAGAACCAAAACCAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLDEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSALSSPSALNSPGLGIEGLNRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSL	695650	684090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_684273_685274_685421_686661_686804_690845_691020_695554
810297	contig_13300_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_125797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	237	575	206719	206381	NA	40	AGAGTCAGAGTGAGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEDTRFSLFVYIYFEPCLFACNKFCDSVEPTAPGFQPATVPWWSGAQLLSVFTQGMCVCAWEGEGDLGRAGDRRMQMWGQEEEEHNCGPDKVKMWGWAASPERLCRSRQAE	206955	205609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_205600_207000
810298	SIRV4	+	320	1	NIC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	871	-125	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGATGACGCGTACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2326	2646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_+_2300_2600
810300	contig_5039_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_64833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281893	281483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_281500_281900
810301	contig_6743_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_33557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259475	260727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_259500_260700
810302	contig_9505_pilon	+	1296	14	Intergenic	novelGene_121824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	52.2081632284867	19	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	797	1240	423416	447457	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGDYLGGEAYWAGGLHLYTPLPFRPGQGGFGELFRTHFFLKRLSLRVRALA	404061	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418505_419156_419280_419515_419583_422601_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915_433984_437898_438017_447423
810303	SIRV6	+	383	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	386	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	6	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10727_10819_11033_11109_11205
810304	contig_12694_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_171984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACACAAAAGAGACAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324844	325403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_324800_325400
810306	contig_19604_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_77224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCGCCTGTGGATCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125071	127252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_125100_127300
810308	contig_6191_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_107870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	11	36	349	384	547438	547473	NA	10	CGTTGCTGTTGAGTCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTIGNLAPTFIICTRRSRILCPFPPVVTSYTPEVPYQKQETDIGIIERVYSDFTSFTCTHLCVCVYVCAVLCNCITCVHSSNHCHLQDAELFHQHKTALHHSFVTTSLSPPPPSLMWQPPICSLFL	547089	547521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_547100_547500
810311	contig_5302_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_81547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGTAGGTAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649408	1649909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1649400_1649900
810313	contig_2940_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_81913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGCCCTGAGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529498	530139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_529500_530100
810316	contig_4751_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_173722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGATATAAAGATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143711	142400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_142400_143700
810323	contig_5039_pilon	+	1511	2	Intergenic	novelGene_64935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	816	junction_1	0	36	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTAAGTGTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366994	1368828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1368321_1368643
810325	contig_3469_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_34164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTCTGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388654	390277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_388700_390300
810328	contig_14868_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_150452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTCATATAAGTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183560	181786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_181800_183600
810329	contig_8651_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_168164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTATCTTTCAATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126902	125447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_125400_126900
810330	contig_8651_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_168163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTTACTTTACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125447	124772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_124800_125400
810331	contig_6233_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_74774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCCCCTCTGATAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128619	128170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_128200_128600
810333	contig_8980_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_74004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTAAGCATATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618847	619844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_618800_619800
810334	SIRV6	+	453	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	547	11	43	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
810336	contig_7179_pilon	+	1568	7	Intergenic	novelGene_78055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	267.166406737241	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	416	1042	397096	402057	FALSE	20	AATGGCTTGGTTTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392249	402583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_392418_395399_395492_396250_396344_397033_397105_397713_397795_400662_400755_401612
810337	contig_12620_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_98818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATACTGTTCATATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492293	489966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_490000_492300
810338	contig_15353_pilon	-	1854	14	Intergenic	novelGene_151962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	348	725	244602	232265	TRUE	10	CTTGATTGGGGCCTGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLSSSDSECIRLLLSIGPFCLMPARKVGFSSRLSWSVASRILYLLFLLGFPFCLLQQQIIVQDRIPKATTMIKEAMITYNTLHSQLLSPSLSCTLMKFSIQKGSQTQRLVNESQWPWSEQFS	259994	219879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_220003_221292_221418_222029_222169_223918_224061_225121_225273_225639_225778_227279_227447_231276_231417_232260_232382_232954_233046_234388_234479_244522_244683_257382_257431_259775
810339	contig_16315_pilon	+	1522	14	Intergenic	novelGene_166321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.96443379366848	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	144	1316	11269	13576	TRUE	20	TAGTCATTTTGGAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKASRQEGGDKCVLNSSQAKPSVPDGQAEGEVDLDRRAYAVWVSEIMLQQTQVATVIDYYTRWMQKWPTLQDLASASLEEVNQLWAGLGYYSRGRRLQEGARKVVEELGGHMPHTAETLQQLLPGVGRYTAGAIASIAFGQATGIVDGNVVRVLCRVRAIGADPSSTLVSQQLWSLAQLLVDPARPGDFNQAAMELGATVCTPQRPLCSQCPVQSLCRAHQRVKREQLSASQSLPHSPDVEECAPNTGQCQLCPPPTKPWDQTLGVANFPRKASRRPPREECSATCVLEQPGALGGSRLLLVQRPSSGLLAGLWEFPSVTMESSGQYQHEALLQELQSWAGPLPATRLKHLGEVVHTFSHIKLTYQVYGLALEGQIPVTTAPPGARWLTREEFHTAAVSTAMKKVFRMYEGQQPGACKVSLLALTSHFGLQELSVS	10240	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16315_pilon_+_10322_11099_11145_11251_11326_11459_11502_11583_11656_11736_11851_11937_12036_12116_12262_12341_12406_12593_12786_12890_13028_13122_13276_13477_13592_14244
810341	contig_15327_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_70498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGAAATCTAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402772	405054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_402800_405100
810343	contig_755_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_119785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAACGGTGAACTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556387	555332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_555300_556400
810344	contig_10436_pilon	-	804	4	Intergenic	novelGene_108484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	8	361	103480	102032	FALSE	0	TTTTTGCCTTGTGTCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103487	101588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
810345	contig_11115_pilon	+	1089	4	Intergenic	novelGene_102820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	780.594787468006	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	237	1001	165608	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165371	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165675_172339_172595_172714_172964_173047
810346	contig_7870_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_109075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATCTACTTCCAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746931	748085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_746900_748100
810348	contig_4232_pilon	+	767	3	Intergenic	novelGene_63201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	909	11	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCATTAATGGGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146283	149696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148806_148884_149087
810350	contig_15327_pilon	+	1223	9	Intergenic	novelGene_70732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	109	534	959632	960557	TRUE	15	ACGATCACTCCGCCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAYFSASGAYYQPGRKRKGKGPFSQPPGSPGDMMGWTCPLQFQSEKPLLEEKKCEKARETNSRNTRREAEGLSLSHRGLGLMPPKPWQPTLKSHRGGNRMTKDRKGKGRPCDRGWGWAWARNGMWTDSWGSTGSSCLRGG	959523	967435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_960022_960521_960578_960683_960756_961478_961608_961817_961935_962807_962903_963794_963923_965032_965148_967422
810351	contig_4686_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_118597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGTCTGTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867348	866341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_866300_867300
810353	contig_14243_pilon	-	820	8	Intergenic	novelGene_57445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	118.826403992186	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	241	639	705976	702904	FALSE	40	GTTGGAAAGCTTTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMKSLILF	708125	702722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_706122_706192_707740_707817_708092
810354	contig_6735_pilon	+	652	3	Intergenic	novelGene_15825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGAAATGCTATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645672	661818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_646113_647253_647392_661744
810355	contig_13292_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_142973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513812	511461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_511500_513800
810356	contig_6710_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_96690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	653885	653562	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653885	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
810361	contig_10734_pilon	-	1942	8	Intergenic	novelGene_51445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	86.9036529609612	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	84	749	2226326	2218369	TRUE	10	CTTAATCCGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKVAPLNPLCSHPGLGQEPSPYPLSAPTYP	2226409	2216274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218550_2222650_2222788_2222878_2222925_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
810362	contig_17075_pilon	-	517	5	Intergenic	novelGene_131752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2358.59370176383	3693	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTATCTGTTTTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91175	87992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90528_90723_90984_91038_91136
810369	contig_7171_pilon	-	973	11	Intergenic	novelGene_101182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	403.528487222402	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	357	842	49603	37539	FALSE	5	CCTGTGTCTCTGGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCRAYRVVRV	50446	37407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37564_37662_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_49818_50062_50264_50365
810370	contig_6533_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_114634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88468	90623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_88500_90600
810371	contig_11227_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_163168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGTTACAATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91086	90470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_90500_91100
810372	contig_9995_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_47775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTGACAAGTCGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737055	735859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_735900_737100
810373	contig_15486_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_157313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGTACAACTTGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57614	57915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_57600_57900
810375	contig_6914_pilon	-	1211	7	Intergenic	novelGene_151766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	16.7273893825533	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	221	634	400139	398613	FALSE	10	TGCCTTCAACTCTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGSLWTQGGEHWRCGFLRLQSSHFHACQQHSPQPQQLQPPQTQDWPPPGQEKGPPHMKTFTGETSLCPGCGEPVYFAEKVMSLGRNWHRPCLRCQRCRKTLTAGSHAEHDGVPYCHIPCYGYLFGPKGGQPHPRH	401066	398035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_398697_398797_398893_399014_399089_399881_400014_400110_400169_400560_400681_400995
810377	SIRV4	-	308	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1210	3	1210	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3948	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
810379	contig_15185_pilon	-	1558	5	Intergenic	novelGene_99398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	24.2744721878767	88	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	135	464	171550	170451	TRUE	35	TAAAAATATTATTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPKECEEWVGSAYLFVESSVDKVILSDTYANPQKKVAVYSALRTALAESSGSPDQLQMLKIHRSDPQLILQLRFCGRQPCDRFLRAYREGGRCAPRCRGAWRRHLP	172926	169134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_169937_170077_170269_170349_170630_171399_171559_172800
810380	contig_13780_pilon	+	1327	2	Intergenic	novelGene_149014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTTCTGCTGCTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293833	295833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_294758_295430
810382	contig_6589_pilon	+	1206	10	Intergenic	novelGene_26222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	193.511476037016	4	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	26	1012	2048791	2059863	FALSE	10	GACTTGGCTCAGCTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMENFVATLANGMSLQPPLEEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKVRAPWRAGPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048765	2060057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051047_2051102_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056434_2058175_2058313_2059779
810383	contig_17158_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_141160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATGCATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203494	202256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_202300_203500
810384	contig_12671_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_19199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGACCTCATGTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109442	109693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_109400_109700
810387	contig_2365_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_103746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTCTTTTAAATGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197450	196722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_196700_197400
810388	contig_15720_pilon	+	654	6	Intergenic	novelGene_41914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	278506	279803	TRUE	35	AAGGCCACACTCAGCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278504	281877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279856_280272_280386_281461_281555_281785
810390	contig_20868_pilon	-	2179	9	Intergenic	novelGene_175398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	40.4629460123704	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	17	1396	150621	134168	FALSE	25	CTGACTCATGGCAACGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRIYILFLLDIPCDIRHVSPRKIECTTRSPGKDARLTAPQAGNRGLLFEVGDAAEGLDLTEATPGYRWQIVPNASSPFGFWSKEGQPFRARLSGFFVAPETNNYTFWIQADSQAALHFSWPEDPRTKVEVASIRVGTADWFDSWEQNGNEGTWHRKTPKLELLGGVKYYLEAEHHGISPSRGMKIGVQIHNTWLNPDVVSTYLREKHQIRARAQRLPEVQMLNVSGRGNFFLAWDNVSSQPIPANATAQQIQTAIEELLAVKCKLEPLSANILLWLGFEQGPQGSSSDGEFTSTTEPFCGRFSLHQPRHLVLTPPAGQKGYQLDQYAHLCFAYKGYMNGVLKMILTFTTDFQSIEKNITCDWSPVETKPESWLFTCTDLWETCVHPSGYLQPPLANSSVLVHRIDLLPLAQEMGLFYVDEIIITDKNLTGDHQSHSSPWACLSNAYLVLICLGLLFF	150637	133384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20868_pilon_-_134430_135848_135977_137359_137503_138482_138574_138679_138770_139735_140015_141571_141687_147410_147553_150491
810399	contig_6674_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_148029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCTACATTGAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340045	339797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_339800_340000
810400	contig_16510_pilon	-	1171	8	Intergenic	novelGene_139078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	74.3801597421336	554	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	71	787	288583	277461	TRUE	15	CCTCCATCTGCCTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRREARLRREYLYRKAREEARQTAHEKKERLRRALEENRLIPTELRQEALALQGSLEFDDAGGEGVTSHVDDEYRWAGVEDPKIMITTSRDPSSRLKMFAKELKLVFPGAQRMNRGRHEVGALVRACKANGVTDLLVVHEHRGTPVGFIVSHLPFGPTAYFTLCNVVMRHDIPDLGTMSEAKPHLIMHGFSSRLGKRVSDILRYLFPVPKDDSHRIITFANQDDYISFRWVCGPGPQ	288653	276985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_277584_277660_277816_277901_278035_278140_278251_278978_279063_287990_288100_288580
810401	contig_5539_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_104775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAATGAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265675	265362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_265400_265700
810402	contig_18869_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_56470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCCTAGTGGCACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202884	201598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_201600_202900
810404	contig_3956_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_14776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	97	333	951417	951181	NA	45	TTAAGAGTCTTTCGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLTSSSFWWLLVILGLPCLWPHHCSLCHHVHMVIFPVGLCLFSYKDTSPCTRARPTPLGGPGRCKQWTRSAVNQKVGSLSPPNGTLEERPGNLLPKNQPLKTLWSTVLL	951513	949972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_950000_951500
810406	SIRV2	-	293	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4580	34	3405	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
810407	contig_4654_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_103064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	216	569	449017	448664	NA	25	AACCCCTATACCTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDTELSAIHKGTKHLLIYSPATELGTPGKRQYEIAGCLEDIHAVTICACVYLILLQKARKLNKRNNKGKEQDGRCCNKWTDQMLQRHETQRLTLPCQVTQDSAREAISELDLAGL	449232	448277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_448300_449200
810409	contig_14483_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_133751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAAATCTGGTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54382	53119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53100_54400
810410	contig_2125_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_147715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAAAGTGCCACTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392970	394130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_393000_394100
810414	contig_4426_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_15458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGTATACACACATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905326	905956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_905300_906000
810415	contig_16098_pilon	+	1467	10	Intergenic	novelGene_45818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	62.9557947989336	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	30	1388	150572	153863	FALSE	20	AGCTGCAGCCCTTGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTRGACTTTMAATTLLRATPRFCGLGASPSPLLQGLLRPPKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150542	153942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150713_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
810416	contig_8850_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_172431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATATATATGTAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28811	30810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_28800_30800
810417	contig_6576_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_42376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAATGAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261462	1261167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1261200_1261500
810419	contig_17833_pilon	+	479	3	Intergenic	novelGene_174603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	404	418	154899	154913	FALSE	20	ATCTTCTGATGCTAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKDFQEETKKDYESGQLYGLEKFWAYLKYSQSKTQSVDPKLQEYLCNFKRLEDFRVDPPISEEFGRKRHSSTSGEESSCHRRPSDSSTKPSNAAKPPSASQLQVPVNSPRRNTSQESSVSLHPDSAASVSTNGEMPEK	151789	154974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_151834_152746_152875_154667
810423	contig_20939_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_172446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCTAAACCTAACAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111375	110651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_110700_111400
810426	contig_4857_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_48678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGACATAGTTCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099272	1098910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1098900_1099300
810427	contig_10197_pilon	-	1145	7	Intergenic	novelGene_115222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1291.08680532677	19	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	71	847	952331	909999	FALSE	30	GATACAGAATCTGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVRGCLGSLL	952401	909700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910029_910551_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
810429	contig_3243_pilon	+	1282	6	Intergenic	novelGene_147526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	297.04922151051	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	358	855	20577	33350	TRUE	20	TATTCAATGGAGTTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPGSSSQPPPVTAGSLSWKRCAGCGGKIADRFLLYAMDSYWHSRCLKCSCCQAQLGDIGTSCYTKSGMILCRNDYIRLFGNSGACSACGQSIPASELVMRAQGNVYHLKCFTCSTCRNRLVPGDRFHYINGSLFCEHDRPTALINGHLNSLQSNPLLPDQKVC	17478	34141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_17833_20573_20813_28044_28142_28539_28696_33341_33582_33945
810430	contig_8576_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_88764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGCCTGGGAAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738975	738210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_738200_739000
810431	contig_8576_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_88763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAAGGATTCTCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738209	736743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_736700_738200
810437	contig_16977_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_169601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAGAGAGAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43827	46315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_+_43800_46300
810438	contig_5350_pilon	-	2225	1	Intergenic	novelGene_99365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1448	1858	217128	216718	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALLKPAIQCHNKAQRPSALFKQTANHAANSAARHQVSRHFTLQRNSLACFSRCWLPHSSCPPSLPLSIQRPGAANTKSFMPWRLPQRGWGRHLVNPPAHPLKHVSAGDGSFWGCSLTSYSETPRFGGCDTHCGI	218575	216350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_216400_218600
810439	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
810440	SIRV6	+	299	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	2957	4	-2930	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCAAACGTGAGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	7858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
810442	contig_6876_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_147032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200775	202394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_200800_202400
810444	contig_5935_pilon	-	1758	6	Intergenic	novelGene_102710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.1208465371486	80	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	515	1261	1028481	1021110	FALSE	15	TAATACTGTGTGTTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRKLVKHRIRHTGERPYSCSACGKCFGGSGDLRRHVRTHTGEKPYTCEICNKCFTRSAVLRRHKKMHGKADMESRSAPEGFSRVIEAPDLDRSQSSDSFSQDMSVTLMPLSVKLPVHPAENSTTEFDSHSAGPYCKLRPMIQSHGISDQEKLSLDPVKLAKPQMQPTAHPAYAYGDVEASAVDEPLPADSMSIIRSSLAALDNHCSDALGSRAPSTAYRNSEGQFFSSMTLWGLAMKTLQNESELDQ	1057463	1020612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1021787_1028411_1028574_1028662_1028746_1030987_1031062_1049159_1049331_1057369
810445	contig_5620_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_161358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTTTTACTTCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414601	413314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_413300_414600
810446	scaffold_12124_pilon	+	773	2	Intergenic	novelGene_22199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGGGGAGGGAAGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347475	1348286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1348185_1348222
810449	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
810450	contig_9206_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_137496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307232	306531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_306500_307200
810453	contig_513_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_80149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATGCTTTTCATTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445474	446647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_445500_446600
810455	contig_6159_pilon	+	1305	10	Intergenic	novelGene_128237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	82.2340832285765	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	72	1160	27886	45745	FALSE	10	GCCTCAGCATCCTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSLAAPQCCVTPKCHSPSLSCWMSRAMKKRYAVLGLVAVVLAFYNGSLTAQIVQDIQAAGGIVTAEDLNNYRAELIEHPLNISLGDSVLYMPSAPLSGPVLALILNILQGYNFSQASVETPEKKGQTYHRIVEAFRFAYAKRTLLGDPKFVNVTEVVHNMSSEFFAAQLRARISDDTTHPISYYEPEFYTPDDGGTAHLSVVSEDGSAVSATSTINLYFGSKVRSMASGILFNDEMDDFSSPSITNQYGVPPSPANFIQPGKQPLSSMCPSIIVGRDGQVRMVVGASGGTQITTATALAIIHSLWFGYDVKQAVEEPRLHNQLLPNTTTLERHMDQAVTAALESRHHYTEVTSTFIAVVQAVVRTASGWAAASDSRKGGEPAGY	27814	45890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_27894_34604_34654_40004_40060_41556_41707_42111_42249_44448_44637_44892_45021_45104_45218_45286_45401_45598
810457	contig_11933_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_107276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTACTTTTCTTATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271407	272310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_271400_272300
810458	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
810459	contig_6102_pilon	-	945	6	Intergenic	novelGene_32334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	302.453037676926	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	423	647	1687243	1685481	FALSE	35	TACAGACTATATACAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGQRAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1688974	1685182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688478_1688581_1688896
810460	contig_12626_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_80435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTTCCTTTCTTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129965	129125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_129100_130000
810463	contig_16525_pilon	+	1137	2	Intergenic	novelGene_133876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAAGGCGGTGGGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180213	181486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_181253_181388
810464	contig_9345_pilon	-	2667	13	Intergenic	novelGene_24435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	31.0951720082431	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	96	2006	348427	341171	FALSE	15	CAGACTTCCCTGTGTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPAYLRRLQGLEQDVLQAIDRAIEAVHNAAMRDGGKYSLEQRGVLQKLICHRKETLSRRGPSAPSPAAMTLSTSDHHLDAASARQPNGMCRTGFKWQHSLPSSEHVGAAGGLYQISPQPHRVAPAMPPPPVNRQDREALVALGSGGRTATPSVGSSVSGSPSVSSTSLDTLYTGSSPSEPGPSCSPTPPPVPRRGTHTTVSQAQPPPSKVSTPEPPADEVAVGTTSAPDELEALGALSLGTTEEKAGAETAVPRSIGAELMELVRRNTGLSHQLCRVAIGVVVGHIQTSVPASSPVMEQVLLSLVEGKDLSTALPSGQVCHDQQRLEVIFADLARRKDDAQQRSWALYEDEGVIRCYLEELLHILTDADPEVCKKMCKRNEFESVLALVSYYQMEHRVSLRLLLLKCFGAMCSLDAAIIATLVSSVLPVELARDMQTDTQDHQKLCYSALILTMVFSMGEAVPYAHYEHLGTPFAQFLLSIIEDGLPSDTTEQLPDLCVNLLLAVNLHLRAPDQNVIMAALSKHANVKVFSEKLLLLLNRGDDPVRIFTHEPQPPHSVLKFLQDVFASPATATIFYHTDMMVLIDITVRHIADLSPGDKLRMEHLSLMHAVVRSTPYLQHRHRLPDLQATLRRILAEEDASPQCQMDRVIVREMCKEFPVLGEAPS	351079	340509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_341375_344144_344318_344457_344551_344644_344774_344967_345049_345131_345271_345355_345443_345602_345774_347043_347535_347793_347885_348022_348228_348380_348491_351047
810470	contig_6871_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_21597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGCAGGTTATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359458	357123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_357100_359500
810471	contig_7945_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_161614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500005	502140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_5e+05_502100
810472	contig_10074_pilon	+	928	4	Intergenic	novelGene_57202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	37.5322083904833	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTTCTGAGTTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597081	690905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_597190_609693_609820_611370_611431_690271
810473	contig_5718_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_110318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473097	472513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_472500_473100
810474	SIRV6	+	408	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	331	28	165	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCGAAGACGCTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
810475	contig_11986_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_69181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAACAACCCTACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573550	574045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_573600_574000
810477	contig_4114_pilon	+	1172	5	Intergenic	novelGene_15584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	469.508785860286	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	207	575	218346	247929	TRUE	30	GAATTTTTAAGTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFSSRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRQAVMLPEGEDLNEWIAVNTVDFFNQINMLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRCPISQKLYVCGKDYSKASVQGLCPYLPSAL	218139	250119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_218360_222874_223042_232345_232440_247835_248000_249592
810479	contig_12257_pilon	-	930	4	Intergenic	novelGene_152112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	211	405	157454	152909	FALSE	25	ACAGACAGACTTTTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQIPIILFFSLSLRAPNFKSFASVSTVLSEGVQSFLKRCPDQHYFRQRGSFRCLKLQLQQRTKYPVKSIVMLPTPLPFTVLLHLVHPFCRAPKSLIREKLEVVSLVRGSKILLSVERLSNKGTGDSLSSLGLIS	159027	152383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_152945_156676_156785_157403_157514_158876
810481	SIRV4	-	360	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	3	1158	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
810483	SIRV6	+	447	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	76	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
810486	contig_8620_pilon	-	1300	6	Intergenic	novelGene_173886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150017	128576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_129229_129388_129516_133509_133691_134326_134441_136637_136726_149879
810487	contig_9436_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_60889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAACCAGAGCCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347591	346873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_346900_347600
810489	contig_14176_pilon	+	1212	2	Intergenic	novelGene_74862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456719	458748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_456777_457593
810490	SIRV6	+	498	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	514	-1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
810492	contig_15613_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_147209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTGGGTAAGGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145077	142826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_142800_145100
810494	contig_9995_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_47710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAAATGCTACTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340700	342210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_340700_342200
810495	contig_3334_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_137668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCACAAAGACTTGGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428169	427497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_427500_428200
810496	contig_5676_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_159092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGTGTGTGTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422537	422821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_422500_422800
810497	contig_5676_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_159093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACTCATAGCAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422873	423354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_422900_423400
810498	contig_3825_pilon	-	1270	10	Intergenic	novelGene_77991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748614	731104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_731682_731904_731993_732240_732328_736388_736447_740455_740504_744961_745042_745839_745872_746253_746329_747138_747226_748476
810499	contig_12837_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_57281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATCCTATAGGACAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59321	59598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_59300_59600
810500	contig_12837_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_57271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAGCCTTCAGATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42833	44156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_42800_44200
810501	contig_10711_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_118450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGTTGTATAGAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840830	841368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_840800_841400
810503	contig_18934_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_175884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTCCTCTTCTCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105843	107772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_+_105800_107800
810508	contig_1076_pilon	+	1101	2	Intergenic	novelGene_101133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945725	974696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784
810509	contig_4845_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_53678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782691	783994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_782700_784000
810512	contig_14683_pilon	+	1245	4	Intergenic	novelGene_166034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	20.0720922897661	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	146	448	20207	52703	FALSE	40	AAAATGGACTTGGAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDDPEILEGRTEKYVDTPFGKPSDALILGKIKNVDCVLLARHGRQHTIMPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLREEIQPGDIIIIDQFIDRIWPSFQFYCRDTKIAWLPRRKEDFLIPVTSGIPAKFEKTWKIHAAFVPLSA	16555	53500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_18293_18353_20184_20353_52546
810513	contig_8762_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_145296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148808	150441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_148800_150400
810514	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	51	491	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
810515	contig_10907_pilon	+	1102	8	Intergenic	novelGene_144903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	577	1008	16815	37012	TRUE	15	CGGGTCACCTCTACCGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRVKQLKFSLGMDGADFMAVRQLVLAGFPTTITLTDFLAYLSKAAPWDLKIFTFAFSKSFLSMPSRLGMEPTRMATSRSLKAISSLSVAMMSMNSAQSCSSITTPSRTPVMGVISNSSRIRGWSLPKIEPFPILYSSEYAI	14594	41063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_+_14957_16089_16194_16704_16818_28353_28453_30316_30505_36045_36129_36953_37051_41007
810516	contig_1939_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_144876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATTTCATTCACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399951	398488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_398500_4e+05
810518	contig_11281_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_125509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962258	964053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_962300_964100
810519	contig_6589_pilon	-	1277	7	Intergenic	novelGene_26209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	115.277443105271	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	308	1195	2031410	2028014	FALSE	30	ACAATCATTGCATGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAVPPILRQTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEGWEFEVTAFYRGRQVFQQAVFCPGGLRLVGSEAANSTLSGQPMLLPDPGMALTDKGATSFVRRVLSSLGGGLALWRAGQQLCARRLGHCHTYWAMGEELLPDGAHGPDGEVPKDWEGVVFNLGPFVADLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2032522	2027931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2029944_2030326_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032429
810521	contig_2414_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_158461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCAGGCCTGTAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164823	166239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_164800_166200
810522	contig_501_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_134893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAAATCACTGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732621	731623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_731600_732600
810523	contig_11126_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_138127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACGGCCTGGTGCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307670	308275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_307700_308300
810525	contig_10307_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_170287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552505	550749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_550700_552500
810526	contig_5959_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_150228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTTATCCCATTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579140	578488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_578500_579100
810527	contig_14637_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_114557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTACAACATCTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376556	377252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_376600_377300
810528	contig_13412_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_80029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGGAAAGCTAGTGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741738	742747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_741700_742700
810529	contig_10058_pilon	+	1901	3	Intergenic	novelGene_67665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	119	346	28433	28983	FALSE	15	CATGTTACGCCTGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRRLHSHNADPRSQPEESVGLRAEGHPDSLKDNSSCSVMSEEPEGRSYSTLTTVREIETQTELLSPGSGRAEDEEDQDEGIKQAMNHFVQENGTLRAKPTGNGIYINGRGHLV	27899	30538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_27946_28360_28436_28758
810530	contig_3956_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_15292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGCAAACAGCAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421597	1420438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1420400_1421600
810533	contig_10506_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_125176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42313	43676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_+_42300_43700
810536	SIRV5	+	401	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3401_3488
810538	contig_9937_pilon	+	2081	12	Intergenic	novelGene_129216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	6.57945713553536	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1584	496	2079	186312	212147	FALSE	30	TGTTCTTGAAGAAAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPCGSEFLFEKAPPVSAHPLEQPERIRQRTQFVISTYREQLQRALDFRNSSATFPFLSESIIASERKKRIFVEISEVRWPILDTDDAMIRMESGTVKISSLDGHAYLCLPEAQHEFTVHFLCKVSQKPDSSVVLSEKNNQAKRGKLFEKADKNCTFGSLSGQKLKNKENELYCHSMKSEEPSEKKSCVNGTEGREKLPVPGTKHTCVYTWVNQHWSVASCPEEWKYPLSLAINFHNKISEMSKIDADTTQNRVLTPDVSEEREEISVLPKALLLSCPVPHLHRWYFCDSSLQRQFDEEYSYPELVKVVWYKGVTYRLTHKNVNSIEIYPGDGSVFKSKGTYFGKYFTYYPIQEGSEERKEKTYSINNLPPDRPGSLFSVCSLLKQATRILQHCAKIRLSLSHNYHICCWKMVPGINDNNILPLLLRESLIPSVGRFLAYSDDKVHAVFLDGITLTLNWNFSFFTEKRQVNQSLSLGWCKLTFPDGQDKLIQIEHPGRYERYVTTVISWCRKLTQASLKEMPTHPSS	185178	212149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_185486_186123_186315_191591_191709_191870_191961_194918_195563_198804_198904_200039_200164_203304_203397_205566_205637_208779_208951_209621_209717_212068
810539	contig_4128_pilon	+	1993	3	Intergenic	novelGene_161262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_2	32	88	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	116	1552	38150	42383	FALSE	50	TTTAAAAAATAATAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLVSFLTRPFRSRVSDSSFQAREPGEEFPGVGLWAVAMGAGMAQLEGYYFSAALSCTFLLSCLLFSAFSRALREPYMDEIFHLPQAQRYCEGHFSLSQWDPMITTLPGLYLVSVGVVKPACWIFGWSEHVVCSIGMLRFINLLFSVGNFYLLYLLFRRVQPKNKAASSIQRILSTLTLAVFPTLYFFNFLYYTEAGSMFFTLFAYLMCLYGNHKTSALLGFCGFMFRQTNIIWAVFCAGNVIAQKLTEAWKTELQKKKEERLPSTKGPFSEFRKILQFLLAYSMSFKNLSMLVLLTWPYILLVFVFCAFVVVNGGIVIGDRSSHEACLHFPQLFYFFSFTLFFSFPHLLSLSKIKAFLCLVWKRKIQFFVITLVSLFLVWKFTYAHKYLLADNRHYTFYVWKRVFQKYEIVKYLLVPVYIFAGWSIADSLKSKSIFWNLMFFICLFMVTVPQKLLEFRYFILPYVIYRLNIPLPPTSRLVYELGCYAVVNFLTFYTFLNKTFQWPNSQDIQRFMW	38034	42824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4128_pilon_+_38333_39585_39784_41327
810540	contig_10765_pilon	+	2023	6	Intergenic	novelGene_122862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	187.390074443659	1	117	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	102	1853	18249	34929	FALSE	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15665	35099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32041_32122_32463_32541_34727
810541	contig_5917_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_122169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCAGCCATTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721382	722498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_721400_722500
810542	contig_10857_pilon	+	1012	7	Intergenic	novelGene_160881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	720.918723266053	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	59	775	21903	62184	TRUE	25	AGAGGGATGCTCTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAASDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRPQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLCLRPVVEPQEEPGLEETEPRDLEELAQDPQGPAEAGEAEEEDIVAGDMSKRSLWEQRGGSKTSSTVKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVDEDVAP	21844	66671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56561_58201_58392_61883_61962_62094_62198_66447
810543	contig_960_pilon	-	1952	14	Intergenic	novelGene_108241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	461.967620986836	4	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	362	1807	483146	441887	FALSE	80	TACTAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALFLIPRNPPPRLSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPAGEVVSPMSEEFCIRPTSQLPFKLSFSSAYVSCLSSTCCFFLFYNFKTKLLLQLFLTHKICYVNFFLITEYIF	495643	441741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_442106_442977_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483102_483167_487099_487267_489758_489850_495560
810544	SIRV5	+	399	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2100_2157_2270_2316_3298_3405_3483
810545	contig_4678_pilon	+	1409	4	Intergenic	novelGene_126003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	455.204227670272	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	206	1408	159465	251190	FALSE	65	GGAAACAGAAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQTCELPRRNCMLSFSNPVNLDAPEDKDSPFGNGQSNFSEPLNGCTMQLPTASGTSQNAYGQGSPSCYIPLRRLQDLASMINVEYLNGSADGSESFQDPEKSDSRAQSPVVCTSLSPGGPTALPMKQEPSCNNSPELQVKVTKTIKNGFLHFENFTCVDDADIDSEMDPEQPVTEDESIEEIFEETQTNATCNYEPKSENGVEVAMGNEQDSTPGSRHGAVKSPFLPLAPQTETQKNKQRNEVDGSSEKAALLPAPFSLGDTNVSVEEQLNSINLSFQDDPDSSTSTLGNMLELPGTSSSSTSQELPFCQPKKKSTPLKYEVGDLIWAKFKRRPWWPCKICSDPLINTHSKMKVSNRRPYRQYYVEAFGDPSERAWVAGKAIVMFEGRHQFEELPVLRRR	158117	251191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_158306_159447_160392_229297_229434_251050
810546	contig_5602_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_132999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCTTAATAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94924	94273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_94300_94900
810547	contig_8954_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_130278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAGAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123357	122297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_122300_123400
810548	contig_3948_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_53227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAACAGCTTAACAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855228	854184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_854200_855200
810550	contig_7056_pilon	+	1910	17	Intergenic	novelGene_43592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	197.138236714748	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1875	34	1908	661004	717152	FALSE	10	TGTGAGGTCCCTGGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLGGLAAKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKVRGVNLYPPAPRLELLCASLISLAPLSHTELPHWLERPSHPTRCITLGLSSLLCHHPASSQKNSPKLSCPCP	660795	717154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_660815_660989_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858
810551	contig_9468_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_59530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAAAGTCTTCTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573453	574925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_573500_574900
810554	contig_8954_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_130263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76060	77539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_76100_77500
810555	contig_266_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_166307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAGAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716819	717283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_716800_717300
810556	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
810557	SIRV6	+	480	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
810560	contig_14530_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_108452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCCAACGGCGCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62038	59831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_59800_62000
810561	contig_7963_pilon	+	1027	6	Intergenic	novelGene_58608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	112.29853071167	7	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	52	594	293211	298445	FALSE	40	ACTCATAAAAACCTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGWVSWVVALLVSLIRLDSSVTQGRNSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNLEEYVRFDSDVGMFVALTELGRPDAERWNNRTDILERSRASVDVLCSLLSPVSVEWSERAQSEYSWRKMLSGVGGFLFGIIFLLVGIVIHFRAQKAYVKTQLSDDEVSTGVLPPQPYQGPN	293159	298878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_293302_296097_296324_297068_297104_297827_297939_298192_298225_298397
810562	contig_10003_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_88261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACCTAAAACCAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754483	753136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_753100_754500
810566	contig_12603_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_105804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	745	1221	601474	600998	NA	60	AAAAAAAAAGGGCGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNVLVGNYLSIQGSWGILSETYSQVVQEKYYFYYACYSSVSLKFFQIKKKKIIITLKEVLYNMTFHMYHQAVLKKLAQEEQPGSGRLKSAVHKEVTRHDSLHHVQREKAKTLHGTLNFLTILGMKACKQRRLSGNSPLFKEQSCQETHCDVSVYSW	602218	600833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_600800_602200
810567	contig_9548_pilon	-	1892	6	Intergenic	novelGene_141074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	14.430523206038	60	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	13	993	213246	199885	FALSE	25	GATGTGTAAGAGGTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLMMCHPNFDKMLEKYVPSKDLPYIKESVKNLRQKGFGEIPLDPPSAKGRRSHTGSVGNTRSSSVSRDAFNSAEREVTEVREVTRKSVPRNTLESTEYIKVITGLLNAKDFRDRINGIKQLLSDTENNQELVVGNIVKIFDAFKSRLHDSNSKVNLVALETMHKMIPLLRDNLSPIINMLIPAIVDNNLNSKNPGIYAAATNVVQALSQHVDNYLLLQPFCTKAQFLNGKAKQDMTEKLADIVMELYQRKPHATEQKVLVVLWHLLGNMTNSGSLPGAGGNIRTATAKLSKALFAQMGQNLLNQAASQPPHIKKSLEELLDMTI	213258	198985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_200139_200990_201078_204139_204360_205768_205959_210761_210881_213135
810569	scaffold_12124_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_22147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	50	403	966384	966737	NA	20	CAGGAGATTGCCAGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSSNPVKKTPFHMWGNRGTQGLRVLRGKQEAPLQFFCLRKMPQSATLSKYEYLCGIQAHVSQPLVPLHPRPRLPSSLPPSRDFWGRALCQEFLRRRRGPARDPGMHPLLVTRVFL	966334	967100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_966300_967100
810571	contig_9900_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_159519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAAACTGATTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350875	350322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_350300_350900
810572	contig_9900_pilon	-	166	1	Intergenic	novelGene_159518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATCTAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350322	350156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_350200_350300
810573	contig_10352_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_49610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTCAAAGTCCAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35925	36881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_35900_36900
810574	contig_10352_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_49611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAGAATTAAGAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37182	37643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_37200_37600
810576	contig_12886_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_135484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGAAAAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342377	340663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_340700_342400
810580	scaffold_19766_pilon	-	795	2	Intergenic	novelGene_34446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	0	175	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	855769	855194	FALSE	15	CCTTTGAACTGCTGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGGGGSCCERDRREHRDGGGCISSPQRDGFWSDWECLRRSSSPCHSQHLRPLDPHALPGGAAYAGWVFGIILRSSSHWSPSPNGGLFRVNYSFLLLRPTPPPSNRCFPNTWFILTSGD	855770	854759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_855483_855698
810581	contig_5039_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_64877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATATAAAAATAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415465	415227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_415200_415500
810582	contig_8687_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_169659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1629	2039	93445	93855	NA	30	AATGCATGTTACTTTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSMGRGSALAFSQHSIRGWETPWEEAQPYHCPSIPREDGRLHGKRLSFTIVPVFHPRMGDSMRRGSALPFSQLSIRRWETPWEGAQPYHFPSIPSEDGRLHGKRLSFTIVPAFHVRMGDSMGRGSASPLSQYST	91816	94074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_91800_94100
810584	scaffold_15568_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_122581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67961	70125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_68000_70100
810585	contig_5549_pilon	-	1618	2	Intergenic	novelGene_81668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGCAAAAACGTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524836	523174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_524298_524341
810588	contig_10864_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_107094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAACTCCCAATATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947464	949096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_947500_949100
810591	SIRV6	+	231	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-396	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1889	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
810594	contig_9373_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_162736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAAACTAAACCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354634	355031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_354600_355000
810596	contig_9471_pilon	-	1273	3	Intergenic	novelGene_21718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_2	70.5	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	121	669	128705	126302	FALSE	40	AACTGTCATTAAATGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIGNDKDLLQDTFTSLGFEVQYFRYLSVDGIIQILHQVACMPQHQNYDSFVCVLVSRGGSQSVFGVDQTRSGCPLDQIRRMFMGDLCPSLLGKPKLFFIQIYVVSEDQQEVSSLLEVDGAGMNIVESKVRQPGPCMVHREADFLWSLCRADVALLEQSPCSPSVYLQCLSQKLQQERKRPLLDLHIELHSKVYDWNSRVSAKEKYSVWLQHTLRKKLILSCK	141012	125697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_128295_128807_140993
810597	contig_20724_pilon	-	1048	5	Intergenic	novelGene_175890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	12.5996031683542	90	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	193	945	9696	6386	FALSE	20	TAACTGATTTCTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLLLLLAFLLSPGARAGEIIGGREARPHSHPYMAYLQIWTPNGGMGACGGFLVREDFVLTAAHCLGSQIIVILGAHDIQRSESTQQHIPVLRAIPHPDYNPQIKWNDIMLLQLENRTRRNRAVRPVALPRTQARLRPGTLCTAVGWGLVGLNRKTSTLQDVQLRVERDEECSIRFDLYTGQLQICVGNPRVRKSVFLGDSGGPLVCSNVAQGIVSYGNRNGTPPAVFTKISSFLSWINRTMRRFKQQG	9888	6282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20724_pilon_-_6542_6970_7226_7437_7574_8017_8169_9641
810598	contig_16204_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_154520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAGGTTAACACACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379139	378448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_378400_379100
810599	contig_12250_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_80688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAATGATTATATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398141	398586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_398100_398600
810600	contig_3948_pilon	-	1232	11	Intergenic	novelGene_53421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	197.592105105442	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	10	639	1975635	1944217	TRUE	5	GCGGGCACTGCGCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLMALLPIFFGALRSVRCAHNPSDMPETITSRDAARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKCKDLHRLAAAF	1975644	1933216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1950367_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964770_1975581
810603	SIRV4	-	439	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	175	3	-175	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAACGCTAAGTCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810607	contig_15236_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_141539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACGCTTAAGCCCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105527	104268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_104300_105500
810609	contig_4469_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_21870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGAAGACTTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53215	55816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_53200_55800
810610	contig_20374_pilon	-	1133	9	Intergenic	novelGene_166012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	78.6380156158585	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	60	1034	23097	3786	FALSE	35	CAGTACTAATATAGCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATEGPCNMPKPGMLDLISKAKWDAWSALGSLPKETAKQNYVELVSSLSSSASSSQGKPDADSKQPGYETLVVTSENGITKIMLNRPTKKNAITTQMYQEIMLALEAAAKDDSAITVLTGNGDYYCSGNDLNNFTDIPPGGVEEKAKNSAILLRDFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDIVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYMFPKIMGSAKAAEMLIFGKKLTAREACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAYSKLPPNAMRISKQLIRNVEKEKLHAINSEESSVLQGRWLSDECTNAIMNFLSRKAKL	23156	3686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_3942_5128_5273_6728_6819_8068_8190_8942_9046_15986_16057_18244_18431_18626_18726_23091
810611	contig_3151_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_139189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGTTTACAATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175606	177128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_175600_177100
810612	contig_5928_pilon	+	1505	7	Intergenic	novelGene_40355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	60.0539109652504	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATTTGATCACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141769	183581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_141791_156187_156366_172519_172673_177706_177774_179822_179870_180458_180594_182677
810613	contig_21232_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_165981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACTCATAGCAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16795	15928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_15900_16800
810615	contig_18113_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_137519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATGTGGGGGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55868	56625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_55900_56600
810618	contig_12270_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_113350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTATAGCTGCTGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
810619	contig_7045_pilon	-	2832	1	Intergenic	novelGene_77487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAAAGGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551224	548392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_548400_551200
810621	contig_9839_pilon	+	990	3	Intergenic	novelGene_88594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_2	2	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480466	483167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_480794_481360_481421_482564
810622	contig_1244_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_37942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784011	785511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_784000_785500
810623	contig_253_pilon	+	1116	4	Intergenic	novelGene_129698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	171.010720911488	1316	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	488366	488713	TRUE	5	GCTCTGAGCCTTTCTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPALYLPGACSPLANQRAAERPAANPGAAAGRRPPAPRSRGCRTSPSPPPPAALPAPVPLGLALRSLQVRTQLHPCSPPRVLEVSQRRRPEFCITGPAAYAPGASVSCPAKWAW	488363	490481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_488715_488881_488983_489064_489198_489950
810626	contig_5794_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_69750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTGATTTTAGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499107	499359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_499100_499400
810627	contig_8487_pilon	-	352	3	Intergenic	novelGene_111913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.5	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	217	306	142853	137900	FALSE	25	GTCACGGATCAGGATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFGLFAFIHLFIPRSLGRYLGDRIEKALEKAQRNCPHCPEAGLGLSSGAGLDWGLRCSGPSAPVPAPPTGSMGAGALRDPALVPMTGEPFMDPTQVFVMG	143069	137853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_137918_142076_142116_142820
810629	SIRV4	-	148	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	1370	3	-1370	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACGGGATATCCACCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	5007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_5000_5200
810633	SIRV6	+	439	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-88	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2384	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2737_2813_3106_3165_10724
810635	contig_9801_pilon	+	398	2	Intergenic	novelGene_167560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTTAAAACTACTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90719	93706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_90794_93382
810636	contig_7342_pilon	-	1159	13	Intergenic	novelGene_71103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.380374402175	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	74	1009	86720	76246	FALSE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLALRQHRPPGPLGKGPCRRPCRTMGSIAEGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEAQSPAFPGAASRAGSPPALQRAGSP	86793	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76324_81078_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913_83979_86703
810637	contig_9185_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_166879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAACCAAAGGCACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81601	80579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_80600_81600
810641	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
810642	contig_19769_pilon	-	1838	2	Intergenic	novelGene_102337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	34	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATCATGAGTACTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165186	163218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_163659_163788
810643	SIRV6	+	230	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9649	558	499	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10736	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
810647	contig_12148_pilon	+	1640	1	Intergenic	novelGene_140319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATGTCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7868	9508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_7900_9500
810648	contig_15066_pilon	-	552	3	Intergenic	novelGene_149532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	12.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	25	384	95894	94927	FALSE	25	CAACTTGGAGACTGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPGSAFKMASPQGGQIAIAMRLRNQLQSVYKMDPLRNEEEVRVKIKDLNEHIVCCLCAGYFVDATTITECLHTFCKSCIVKYLQTSKYCPMCNIKIHETQPLLNLKLDRVMQDIVYKLVPGLQDSE	95918	94758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_95088_95265_95372_95801
810649	contig_7412_pilon	+	1563	7	Intergenic	novelGene_76287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCGCTTAGCGGCGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271666	280475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_272577_273689_273814_273897_273970_274140_274249_274484_274563_275202_275264_280265
810651	contig_12057_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_131617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10670	12946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_10700_12900
810652	contig_1450_pilon	+	2078	2	Intergenic	novelGene_27385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1290	1667	278735	279112	FALSE	25	AGGTGGCATGGTGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILNPSLKLIVKSQCDHQYAVLSDYLSVSVSVAIVVPFPTQERSQQQPGLGRLPVGRRGFWDTPGALPLLSAVLSQVQFPLERLDEERKGLWGWQLPLQEEIASSRGKWELLNSWHGAGYSSAL	275643	279523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_276083_277884
810653	contig_15543_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_164338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGTAAGTACAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35661	36808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_35700_36800
810656	contig_5575_pilon	+	883	2	Intergenic	novelGene_122055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	0	301	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	7	429	92855	94910	FALSE	35	TTAAGAAGTGTCTCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMHRRVSPAFLLVRKMAASSAEPQFLVQYLVLRKDLSRAPFSWPAGALVAQACHAATAALHIHRDHPHTAAYLQELGRMRKVVLEASDENTLKELAETLQQKNIDHVLWLEQPENIATCIALRPYPKEEVNQYLKKLRLFK	92848	95364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_+_93107_94739
810657	contig_6412_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_149961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTTCAAATCCACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238006	238510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_238000_238500
810658	contig_16643_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_158119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACCTGAAGCCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232124	230647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_230600_232100
810660	contig_12644_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_44572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2024407	2023217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2023200_2024400
810662	contig_5551_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_134218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGGAATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95858	97405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_95900_97400
810663	scaffold_19766_pilon	-	1400	8	Intergenic	novelGene_34335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	482.703018513074	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	306	965	622205	597214	TRUE	30	AGTACCTAGAGAATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGTPIQGALPKHRGEI	623662	596404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596995_597196_597257_605094_605300_621454_621815_622153_622285_622591_622736_623580
810670	contig_8050_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_114853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCAAACGATGCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375355	373588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_373600_375400
810671	contig_6175_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_16320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGAACGAGCTGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484499	1485160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1484500_1485200
810673	contig_1996_pilon	-	2627	5	Intergenic	novelGene_131926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	9.61769203083567	35	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	429	809	431057	427533	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPNLTVLFHTCHSIAQIIGKRLPPDQLISLLLTMFEGLGDPDKNCSRAATVMINCLLKERGAVLLEKVPEIVSVLRSKLQQTQEEHILKAAQHSVYLLASWHRAAVVSSLLGSPLPFDRYGPTAV	434252	425714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_427710_430657_430811_431006_431120_431227_431364_434022
810674	contig_14546_pilon	+	1651	5	Intergenic	novelGene_157421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	4.9749371855331	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	129	551	153679	160990	FALSE	65	ATGGTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLSNFSSSGSYQRFGESNGTTWFQTLIHLLKGNVGTGLLGLPLAVKNAGILMGPLSLLLMGIVAVHCMGILVKCAHHFCHRLNKPFVDYGDTVMYGLESSPSSWLRNHAHWGR	143044	162090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_143168_153673_153822_159225_159317_160356_160446_160890
810675	contig_8538_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_4688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	GTTGCATTCCCAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
810676	contig_1694_pilon	+	2278	16	Intergenic	novelGene_144938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	34	junction_15	46.0099506145742	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	1254	2276	569307	749185	FALSE	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYERENRNLREARDNAVAEKDRAVMAEKDALEKHDQLLARYRELQLNEESKVTEFLHQSKLKSFECERVQLLQEETARNLTQCQLECEKYQKKLEVLTKEFYSLQASSEKRITELQAQNSEHQARLDIYEKLEKELDEIIMQTAEIENEDEAERILFSYGYGANVPTTAKRRLKQSVHLARRVLQLEKQNSLILKDLEHQKDQGTQLSQELDRANSLLNQAQQPYRYLIESVRQRDSKIDSLKECIAQLEKDVSNLNKEKSALLQMKNQMALDLEQLLNHREELAAMKQILVNMHTKHHEGSLLLTKKDSKTVTENQKSQTLDVPKEHEDNIFIPKPTLFV	502735	749187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_502922_504116_504415_511220_511322_513612_513812_522468_522589_557155_557290_567211_567321_569200_569327_586221_586321_616111_616278_621268_621420_628749_628841_646386_646490_698762_698894_707991_708077_749008
810679	SIRV6	-	392	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	20	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTTACAGTTACGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
810681	contig_6497_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_35592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGCGCAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353473	352117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_352100_353500
810682	contig_21414_pilon	-	1065	10	Intergenic	novelGene_170482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCCTACAGAAGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21881	11168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21414_pilon_-_11220_11843_11917_18907_19047_19298_19385_19467_19519_19737_19862_19954_20128_20924_21079_21211_21270_21725
810684	contig_1244_pilon	+	2334	9	Intergenic	novelGene_38048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	979	1449	979774	980947	TRUE	40	CGATTGCTATTTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTRFSAQEKRKEHRAMEMGDRRARKSAGRGGRVVKPQDYIREQPSRITDRMRGNTFFIFLKASEDRSRVSSSAGSCVCGRVLTCIVPARSGLKAYNQSFMSLSLRACRRTPRCFVHTAKVLGLTFTMACWSSLYSTCAVDRLMIPRSTGSLSLL	978795	987732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_980030_980530_980645_980846_981047_981419_981569_983046_983170_984185_984258_985467_985706_985894_986042_987675
810685	contig_10460_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_157462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGCTCAGCACAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50937	49790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_49800_50900
810687	SIRV4	-	543	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	71	3	71	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	317	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5087	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810688	contig_817_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_132459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568996	568163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_568200_569000
810689	contig_6062_pilon	-	1458	10	Intergenic	novelGene_5299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	23.0603074085706	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	12	1340	791577	770133	FALSE	35	AAGATAGTGCCATGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLRTGVGTLCAAARAVIPCLWRGKCFSSGKELGENSPVTPMLRHLMYKIKSTGPITVAEYMREVLTNPAKGYYVHHDMLGEKGDFITSPEISQIFGELLGIWLISEWMATGKSSTFQLVELGPGRGTLTGDILRVFSQLGSVLKNSDISVHLVEVSQKLSEIQAVTLIEENVPLEQNAGSLVYMKGVTKSGLPISWYRDIQDVPKGYSFYLAHEFFDVLPVHKFQKTPQGWREVFIDIDPQASDKLRFVLAPCATPAEAFIWSGETRDHVEVCPDAGVIIQELSQRIARAGGAALIADYGHDGTKTDTFRGFCGHKLHDVLIAPGTADLTADVDFSYLRRMTQGKVASLGPITQQMFLKNMGIDVRLKVLLDNSDEPSTRQQLLQGYDMLMNSKKMGERFNFFALVPHQRLPNGSHQMNARKSNPSPAPVAGFDELAWR	791588	770014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_770349_770837_771012_772256_772401_774626_774738_775433_775493_776297_776512_783038_783150_784740_784822_791045_791210_791522
810694	contig_11413_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_103169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACAGGGAGCTGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391293	390808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_390800_391300
810696	contig_4531_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_47932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCAGATTCACCCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639724	640967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_639700_641000
810699	contig_14559_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_83727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCACCTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285019	282502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_282500_285000
810704	contig_11396_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_71324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTGTCCCACTCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463734	461078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_461100_463700
810706	SIRV6	+	432	5	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	12	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7814_7924_10724
810708	contig_3130_pilon	-	2302	5	Intergenic	novelGene_103575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_4	103.262711081978	125	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	7	684	167769	133495	FALSE	60	GAAAAAAAAAGTGTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVGVRGRCELPPCSGPGWLLSLSALLSVAARGAFATTHWVVTEDGKIQQQVDSPMNLKHPHDLVILMRQETTVNYLRELEKQLVAQKIHIEENEDRDTGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRGVQERVNLSTPLLPKEDPVFTYLSKRLGRSIDDIGHLIHEGLRKVSHQ	167775	131876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_133642_133929_134042_134805_134976_143287_143378_167610
810709	SIRV2	+	239	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	358	-74	-358	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTGCGAAGCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
810711	contig_7182_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_117117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAGGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238631	239875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_238600_239900
810712	contig_12414_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_59625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTCACTTAAAAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610256	611623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_610300_611600
810714	contig_4364_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_3029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
810715	contig_14322_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_115613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	57	369	425	8711	8767	NA	35	ACAAACCCTCTGGGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAVATENSQTILTVKWFVKEVKGYNSNQDRPTTTQDQDQEACRQSLPSVQDSSLSSSWPCRPPLSPLRTGLLSASKTGLSALGHPTIGTATRPLPGLSSPSVLQPLTYVTVLLGRSLPPHSMLLSSASVCQSLWDWRHI	8342	9558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_8300_9600
810718	contig_12886_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_135513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCAGATAATAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623017	622380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_622400_623000
810720	contig_6710_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_95063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
810722	contig_12638_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_33358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426501	1424526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1424500_1426500
810724	contig_8145_pilon	-	1926	2	Intergenic	novelGene_118656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTCCTTGTGTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828279	816613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_818443_828182
810725	contig_5526_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_111683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAGTCCTCCATCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112423	110721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_110700_112400
810726	contig_5571_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_75520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCTACTCAGGTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160346	159182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_159200_160300
810727	contig_4364_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_2801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAACCCTGTCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
810728	contig_4065_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_133414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGGTGGTTCGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873352	871572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_871600_873400
810729	contig_4418_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_98387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACAGGCTAATGCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879792	880839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_879800_880800
810735	contig_9807_pilon	+	1223	6	Intergenic	novelGene_32923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	521.942372297939	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	347	685	149051	157176	TRUE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPAQDGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQA	147022	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147279_148960_149056_154085_154270_156624_156770_157171_157384_158676
810737	contig_10689_pilon	+	769	4	Intergenic	novelGene_118620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1733.91759383836	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	98	469	57608	61101	FALSE	30	ACATTGTGACCCAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51264	61401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57671_58237_58374_60928
810740	contig_7919_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_28110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTTGATTATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403518	1405390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1403500_1405400
810742	contig_6710_pilon	-	505	2	Intergenic	novelGene_97999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657518	653562	FALSE	30	CTTCTTTAACTTTAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRSQFRRRDQTSGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653888_657484
810744	contig_8330_pilon	-	1132	6	Intergenic	novelGene_71985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_5	286.206498877995	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	247	867	2056301	2039646	FALSE	10	CTTTCTCTTATGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGNDISVARGGG	2056547	2039380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056297
810747	contig_8133_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_98669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGGATTTTATGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317462	318363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_317500_318400
810748	contig_14133_pilon	-	441	4	Intergenic	novelGene_119965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_1	414.627811684434	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	42	440	209116	208236	FALSE	35	CCAAGAAGGGAGACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSA	209448	208234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_208389_208585_208728_209012_209131_209421
810749	contig_6871_pilon	+	463	4	Intergenic	novelGene_21583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	4.96655480858378	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	123	340	462	254497	254619	FALSE	30	TTAGATTTGTTATAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTCQLSEKFIKAAIGCGIVESILNWVKFKAQIQLNKKCSAVKHNRIKGIPKLDDANDAGGRNSTDCTLILTEGDSAKTLAVSGLGVVGRDKYGIFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKSYDDEDSLKTLRYGRIMIMTDQ	251910	254620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_251950_253199_253339_254037_254196_254493
810751	contig_6496_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_103540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTGATACCAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160405	1161216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1160400_1161200
810752	contig_9575_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_169711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	67	342	46665	46390	NA	15	AGATTTCTACTCTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVGLVWFGKGENNPNPCILATMFQPRPVVTSWSQTWKSHQAGSGLCFVRACCSLGVPSAHAGFHQGYWCELVCVPLFPGETSLATVLPDPSPVHGHRHVCVCFMALGQSFTP	46731	44478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_44500_46700
810754	contig_4364_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_2978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533313	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
810756	contig_3270_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_104508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCAGTTCTACTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387253	388466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_387300_388500
810759	contig_401_pilon	-	1259	3	Intergenic	novelGene_42894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	6	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGACCAGAGCTGGAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1810254	1807766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1808842_1809493_1809617_1810193
810760	contig_19865_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_170159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCAGAGAAAGTTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63642	62613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_62600_63600
810764	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
810765	contig_3004_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_127518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAATACTCGGGATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329744	328823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_328800_329700
810766	contig_3004_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_127517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGGTATCTATTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328791	327759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_327800_328800
810767	contig_6871_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_21590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCCATTTTGAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308505	309277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_308500_309300
810768	contig_6760_pilon	+	1636	7	Intergenic	novelGene_150788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_3	53.1904335592616	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	299	1168	153799	165420	FALSE	40	AAGAGAGAGATTGAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQALMERNSELQALRQYLGGKDFMTSQALMSNQSAEVTAIGLHLGGQPDQDSMQIPSRDDSACLTAKGDSSIPRSTLGDLGTVAGMEKELSNAKEELELMAKKERESRMELSALQSMVAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDIPAMECLTQEVLLLREKVASVESQGQGTSGSRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSERDRTLQVELEGVQVLRGRLEEVLGRSLERLSRLETLAAIGGGELESVQVHHKHAF	153500	165888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_153952_154128_154211_156044_156137_162647_162765_163058_163197_164170_164284_165245
810769	contig_11681_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_102963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91506	91258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_91300_91500
810770	contig_2027_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_39939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	507	175	681	430332	429826	NA	30	TGGTGACTGTGGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYECSDCGKSFSKNSQLHVHQRIHTGEKPYVCTECGKVFSHRTNLITHQKTHTGEKPYMCTECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHVGERHYECNECGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLHVHQHIHTGEKPYICAECGKAFNDRSNLLTHQKVHTREKPYK	430506	429823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_429800_430500
810771	contig_7513_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_88984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCTTGGAGTTTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310601	310098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_310100_310600
810772	contig_18113_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_137533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAGAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147392	149075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_147400_149100
810773	contig_675_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_136358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	200	532	244023	244355	NA	25	CTTCTTGGTAAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSHEPCIEETGEYFRLTYDTRGGFALHRITAEEAKYQQCKMRKIFVGTKGIPHLVVTHDAGTSRHPDPLIKVNDTVVIDLGTDMITDFWWGQSWPCWCDHQQKRISWFF	243823	244448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_243800_244400
810774	contig_6102_pilon	+	1390	7	Intergenic	novelGene_31751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	13.1866936299017	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	208	978	238110	243682	TRUE	40	AAAAAGACTAACTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNKVTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINAEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDETVWPGVTSMPDYKASFPKWARQDFSKVVPPPG	237902	244372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_238226_238937_239016_239120_239242_240311_240483_242256_242359_243499_243705_243982
810776	contig_14341_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_111795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383767	384822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_383800_384800
810777	contig_8673_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_129915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240813	241586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_240800_241600
810778	SIRV4	-	582	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	32	3	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	655	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGTTTAGAAGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810779	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
810780	contig_16187_pilon	-	667	7	Intergenic	novelGene_101070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.6833660400677	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATTTTTATTTAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53100	41423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_42021_42110_46088_46170_47823_47902_48721_48836_53034
810783	contig_12624_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_60998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTACACAGAACACCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137632	140042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_137600_140000
810785	contig_16119_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_164273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87316	84831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_84800_87300
810786	contig_19564_pilon	+	1335	4	Intergenic	novelGene_29658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	694.309729155512	1705	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2	493	37429	45847	FALSE	0	CTCTCCTGCTGCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSSSLPLSSSSSPLLSPDAWLFCTPSPRGPAAPPATPAAPATADAAVPGAGKKRYPTAEEILVLGGYLRLSRSCLVKGSPERHHKQLKISFSETALETTYQYPSESSVLEELGPEPEAPSAPGPPAAQPDDDEDEEELLLLQRELQGGLRTKALIVDESCRR	37427	46689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_37529_40071_40233_44755_44967_45827
810788	contig_4336_pilon	-	2086	4	Intergenic	novelGene_152351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.65383665716478	43	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	166	1467	282030	269774	FALSE	25	AACAACTTTTGTTTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEESMVIAVVMDVFTDIDIFRDLQEICRRQGVAVYILLDQALLSQFLDMCMDLKVHPEQEKLMTVRTITGNIYYARSGTKIVGKVHEKFTLIDGIRVATGSYSFTWTDGKLNSSNLVILSGQVVEHFDLEFRILYAQSTPISSKLLSNFRISSKFDHLVEHKPPSKELTLGNLLRLRLARLSSTPKKTDLEPEVPTEGRAETRRHDSESSTIGEEDYLNSHKDELESRRATDVATQTEPREEMPTVHGSDMGTQTRISTASNGTQTTVATRVASSQTTIWSKSATTQTDVDENILFSQGTQSKEGSPVSKMSVSTSSSLKSSSSLSSQGSVASSTGSQTSMRATDFHNPGYPKYLSTPHLDLCLRDSFRNLDKERQFHFAGIRSRLNHMLAMLSRRTFFTENYLGFNPGNFNRASVNLLATRDIALYPSCQ	282195	269154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_270762_273562_273688_281667_281836_282009
810789	contig_18363_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_157719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAAAGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293858	291534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_-_291500_293900
810790	contig_3575_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_141099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAACAGGCTAGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370446	371007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_370400_371000
810792	contig_2710_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_161806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170902	1172357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1170900_1172400
810793	contig_1639_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_74898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGAAGCATACAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288403	290463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_288400_290500
810796	contig_9363_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_6504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	304	444	462799	462659	NA	50	CTTCAAGAATTAATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKNNAEHTGAHDLTWGGKRGRHSPAVLDNKRPRRARASAWGCGENFLRGWGSRVRAWLPFCCTTWYNWWAKCRKTGLPWPYSGPCTWWVFLFPTSLAGPLVMFKYREQASGLCSVHILFVSHMDTRLRHSQPANSFIRAVATYRCWC	463102	461959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_462000_463100
810797	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	756	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
810803	contig_8978_pilon	-	2573	2	Intergenic	novelGene_49441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTCTCTTGTGTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177509	1163418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1165865_1177382
810804	contig_4732_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_75369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATCCAGAAGAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187588	187051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_187100_187600
810805	contig_4732_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_75368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	186852	186538	NA	45	CAATAAAATGAATCCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEQLGLCERTWFRLNDPVLPLALPFIWLFSIKGQAVVLSAGCASGHKYCDCASPPRGLCPLHCHHLARPFEIGASGPLCRWCWVGSCLPGSQKVSLPHSKGLNT	186853	185522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_185500_186900
810808	contig_15491_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_75963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAGAAACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40339	38466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_38500_40300
810809	contig_6102_pilon	-	1058	7	Intergenic	novelGene_32133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	367.572970835573	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	330	1058	821069	818926	FALSE	45	TCCGTACAGGTAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSIT	822102	818925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_820920_821096_821337_821517_821978
810816	contig_7078_pilon	+	1057	7	Intergenic	novelGene_130109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	144.663978469648	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	99	1055	182358	242912	FALSE	35	TGAATTCAAACCCATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNSILWKKKVSQMQQTVKVVCQKDDLPADQTVLPGSSDREGNAQSCWEDDAGKERQEILGPEAQADEARCTVKDDECDSDAENEQNRDPNVEEFLQQQDTAVIYPEAPEEDQRQGTPEAGGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLMPVNGRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVD	29624	242914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29678_182312_182515_219233_219297_227970_228133_231995_232199_236108_236215_242646
810819	contig_14176_pilon	-	1719	13	Intergenic	novelGene_74860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	15.2688863015247	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	499	1719	431829	419244	FALSE	10	CACTCCGCCTGTGGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDASLQGKGTPAAGGARLQPVTAFLLRDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFF	452391	419243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_419286_419757_419969_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431945_451351_451519_452175
810820	contig_10962_pilon	-	1632	4	Intergenic	novelGene_103873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1074	1538	34208	28916	FALSE	50	GTCTAGAAAACGCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKCEKKSWDYLDPFTVKFAQRKIHPEKKQFWIQPPNTVAAQGWKSLSSYPTHFLVMRLKLLGTLLHHTFSNTHFCSLLVHMVVGQAPPLTLLHWSFGELQDYWSLLHHKVVAWAFLLILLLHLLVELQIHRTHFGSFGKPQLNQDRPSGSPC	35281	28821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_28978_31029_31113_32453_32538_33972
810821	contig_11145_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_160523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95599	94516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_94500_95600
810824	SIRV4	-	469	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1054	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
810825	scaffold_19766_pilon	+	2454	14	Intergenic	novelGene_34261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	499	1008	175046	176249	TRUE	30	GGGCCAGAAAACACTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPLAHGGRQCEVHKGLHLGPVHQAQPRPVLRLHRVRGQGVKVTQGDVAQHIEAPLLELVGQPQQRQGAPGISYQEQQLWPPELHVLLPDVQPEQVLAYLVEKQGLADIAPAAGASSSCEQGRKQAHEKQGAAGGPGTDEKHHEQAGGHPQQAGVPGEQVEGGAEVRG	172243	181455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_172715_175018_175171_175384_175558_175721_175917_176232_176358_176763_176849_176955_177110_177689_177805_177939_178052_178719_179024_179455_179590_180016_180151_180387_180609_181376
810827	contig_13292_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_142961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGTGTGTACTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390296	390966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_390300_391000
810828	contig_14441_pilon	+	692	5	Intergenic	novelGene_100574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.603391243885	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111197	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_122140_122188_125804_125902_126159_126283_126514
810832	contig_7571_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_106409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGGCCTTTCTGTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335822	337618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_335800_337600
810833	contig_998_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_153787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCAGGTCCATAGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322305	321697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_321700_322300
810834	SIRV1	+	180	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGTAGATTTCCCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
810838	contig_5894_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_83025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAACAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311471	310248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_310200_311500
810839	contig_7342_pilon	-	412	4	Intergenic	novelGene_71196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5266	junction_3	3402.61197056353	6137	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	36	353	666818	665411	FALSE	20	CATGGGGCTCCAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTHIRAKRKREELSNVLAAMRKAAAKKD	667030	665351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665709_666725_666821_666997
810840	contig_10599_pilon	+	2046	9	Intergenic	novelGene_49864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	891.533431439898	1	138	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	213	1112	146918	163915	FALSE	50	AGATCCACAGAACATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123182	164849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123584_146891_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
810842	contig_3529_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_105375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	675	1061	745173	745559	NA	20	GAGGGTCCTGGACAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMDEKVKESFVLDTASAICNYDAHYKDYPKYWCRGYFRDYCNIIAFTPNSTGRVALRDTGNQLIVTVSCLTKEDTGWYWCGIQRDFARDDMDFTELVVTDNRGALTDDFSSEKGKETFRSLVEGSPQ	744498	746106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_744500_746100
810846	contig_14807_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_124656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37622	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485
810847	contig_8538_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_4737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	TGCATTCCCAAATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
810850	contig_8538_pilon	-	2213	18	Intergenic	novelGene_4611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	97.9240225218062	11	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	107	2011	742030	689643	FALSE	85	TAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKERRIRREEIMECKVMWEPASKKNTQMDRFRAAVGASCGLALDNYDDLYHWSVKSYSDFWAEFWKFSGIVFSCMYDEVVDTSKGITDVPEWFKGSRLNYAENLLRHKDNDHVALYVAREGKEEIVKVTFEELRQQVALFAAAMRKMGVKVGDRVVGYLPNSMHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGGTLIQHLKEHILHGNMGSNDIILYYTTIGWMMWNWMVSALATGASVVLYDGSPLVPTPNVLWDLVDRIGITILGTSAKWLSVLEDRNMKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPLTEDRSY	742136	689440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_689667_692701_692905_693724_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928_697994_702430_702556_703455_703537_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672_724787_729514_729636_730740_730845_741897
810851	contig_14353_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_82154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGCTTAGAACACACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418189	419732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_418200_419700
810852	SIRV5	-	369	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCGTAAGCACTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8377_8451_8590_10866
810853	contig_3068_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_137631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	746	1279	239862	239329	NA	70	TAAAAAAAAAAATTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKRLLTPFGPVQTFTQPANCLVSRDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVFDKSLSSSDSTPESPISFLKYLLKKPSYGFGSQGASYVLFGGHSHEKWISVNTWPPSVHWSVCRTQSSLPLAQFGMRGDSFNSSFASVITYQVYILYNYH	240607	239328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_239300_240600
810856	contig_13201_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_130875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100162	101674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_100200_101700
810857	contig_11413_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_103165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATCAGCATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377986	379647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_378000_379600
810858	SIRV6	-	408	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8241	-62	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACGTTCTGGGCTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10788	2420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2826_3105_3164_10723
810860	contig_16122_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_134526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	325	657	142082	142414	NA	70	TGGAAATGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQVSARHAWGLYCINSLALAGCVFLLCQALLILFLALVLVAFGAFAAGPKWSTQRENQRAVRAAWDLAKELMEITFFIQA	141757	143268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_141800_143300
810863	contig_3942_pilon	+	1184	4	Intergenic	novelGene_128788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.49443825784929	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	374	439	798352	798417	FALSE	15	CAGCTGCTCCACCGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITAEEAASAPGAPGRAEPAWPWKGAPVHALVQRIHQLQAERAQAFRRLEEAHRQYVRSGPHYDFPRYRGSVHKVTQAFAAASREVLALEAELAGPRAQPLLAGHVRALQQLEQTRLATVALLQLMGAPELRGQEDASQMHQLKMK	797067	799162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_797135_797228_797312_797619_797825_798333
810864	contig_6710_pilon	-	328	2	Intergenic	novelGene_98302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	2	328	657824	653586	FALSE	25	AGCTTCATCAGGGACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVE	657825	653585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
810865	contig_753_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_113013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAGAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355280	1353547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1353500_1355300
810866	contig_2100_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_50606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728745	726995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_727000_728700
810867	contig_4469_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_21921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGTTAGGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517785	516864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_516900_517800
810870	contig_13625_pilon	-	1548	11	Intergenic	novelGene_150146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	128.87315469096	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	11	1441	43661	27060	TRUE	50	TATAATGGAGATGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFGKEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43671	12079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_12139_19781_19822_27051_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34254_34999_35127_37918_38046_39877_40001_43361
810871	contig_16934_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_132541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGATCTACTTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259454	261170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_259500_261200
810872	contig_18967_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_165336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAGAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340817	338957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_339000_340800
810873	contig_14519_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_66840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAACCAATCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391726	387681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_388294_391318
810874	contig_19692_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_174881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATAATAAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50439	51488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_50400_51500
810875	contig_5083_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_151680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCCCCGAATTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631308	632796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_631300_632800
810876	contig_859_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_132829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGACATGTTGTGGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128641	129333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_128600_129300
810881	contig_817_pilon	+	1082	4	Intergenic	novelGene_132442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	5.8878405775519	135	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	256	558	643363	643780	FALSE	20	CCCTAGAACCTGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDGNIGGRQTSCYGVTSDCWRPRVCHSTTAPWGFQGCDLSEVDRQAFLLRHIWASSSPFRLIATLWTTEQNAARSCAILMIIIKLEPIVAVSYCVNPSR	542656	644304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_542818_622221_622296_643342_643525_643639
810882	contig_3721_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_123824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGGAGGTCTTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220266	219344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_219300_220300
810883	contig_4336_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_152365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTATTGATTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368233	367470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_367500_368200
810884	contig_10312_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_159020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAGAAAAGTCAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79365	81353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_79400_81400
810887	contig_15047_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_52292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	13.0724477007517	135	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	451	1257	131962	129138	FALSE	5	TCTGGCTCTTTAGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQGTLVNNVRLPRGHRLELSDGDLLTFGPEGPPGTSPSEFYFMFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGRE	132809	128713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129148_130052_130621_131733_132294_132690
810888	contig_3817_pilon	+	1116	4	Intergenic	novelGene_78386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.49443825784929	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	296	1099	1012491	1017458	FALSE	5	GTACTTCTGTTTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLVKRALGDRLGKSEERNVGEEQDQTGEGPAVLEGEEGSSRKRPRRETAEDGVSSAGPRWRHIRAQGLDCDYTVLFGRAEADEIFQQLEKEVEYFTGALTRVQVFGKWHDVPRKQATYGDAGVTYSFSGLTLSPKPWIPILERIRDRVSWATGKTFNFVLVNRYKDGFDHIGEHRDDERELDPRSPIASVSFGACRDFFFRHKDSRGKSPAQRVEAVRLQLAHGSLLLMNPPTNTNWYHSLPVRKKILAPRVNLTFRNILLTKK	1011724	1017475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1011859_1012329_1012789_1015286_1015486_1017151
810891	contig_5019_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_109209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAGAGAACGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193326	193824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_193300_193800
810894	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
810895	SIRV5	+	414	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	882	23	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
810897	contig_2419_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_137126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTCTTTATCCTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122882	124741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_122900_124700
810898	SIRV6	-	392	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-294	34	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATAACTGTTTGTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2114	1510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1530_1631_1735_1844
810901	SIRV6	-	266	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACCATTCATGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	3135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10797_11017_11109_11205
810902	contig_14640_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_168054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496021	496330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_496000_496300
810903	contig_17470_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_110465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAGCAGCCCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36590	34933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_34900_36600
810904	contig_15631_pilon	+	1111	2	Intergenic	novelGene_151546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	254	745	396107	396598	FALSE	10	TGAGCCTCTGCATCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHYRKAGSVELPAPSPMPQLPPNTLDMRVEDGSKIRNLLELALGQLEGGSARHVVFSGSGRATGKAVSCAEIVKRRVPGLHQLTKLRFLETEDSWVPASPDTGLDPLTVRRHVPAVWVLLSRDPLDPNECGYQPPGASPGLGSTPSSSCGPRPQRRARDTRS	395365	396964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_395583_396070
810905	contig_7057_pilon	+	765	4	Intergenic	novelGene_123247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	259.004933457947	1411	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539967	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540323_540643_540891_541177
810906	contig_152_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_162653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGTTGAAAATCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729901	730727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_729900_730700
810908	contig_11281_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_125430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237148	235670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_235700_237100
810910	contig_7356_pilon	+	2297	4	Intergenic	novelGene_60348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	20.0166597280032	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGCCGTAGCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83555	92226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_85478_87954_88054_88639_88819_92129
810911	contig_513_pilon	+	1566	2	Intergenic	novelGene_80144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCTGTTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363243	366214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_364237_365641
810913	contig_11304_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_156702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCCCCTCTCGACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365240	364649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_364600_365200
810917	contig_13074_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_153444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537226	538915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_537200_538900
810918	contig_2463_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_43010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCATAATATATCATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403909	403060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_403100_403900
810920	contig_5429_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_127816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTCTTGCTATGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492484	494394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_492500_494400
810922	contig_19438_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_175891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTTTGTATTTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2669	3169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_+_2700_3200
810923	contig_18231_pilon	+	1086	8	Intergenic	novelGene_105886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCACGACCCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246939	277190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_246987_249439_249577_250801_250879_255751_255817_258557_258763_272879_272982_274583_274764_276917
810924	contig_16724_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_105263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAAAATTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319696	318839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_318800_319700
810925	contig_10500_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_41188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	125	541	1355400	1355816	NA	45	GATATAAGTCACAAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQFNQPEQHLCGCKTDVWLFLSLQFCRSYSFPHSFPFIIKGYANRELGGRRDNKALKKEKMGQEKARSSIIHLLPIRPSPRAKDPNQFTVNVSNAGQNNSLCLTHTTYPETTKELKRGSKQIRELCPSTAIVRGSKL	1355275	1356873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1355300_1356900
810926	scaffold_880_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_121473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACTGCCATATCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472624	472177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_472200_472600
810927	contig_20241_pilon	+	2145	9	Intergenic	novelGene_159723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	6.5752851649187	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	204	1151	99491	138737	FALSE	80	AAAAGAGAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPYVPLPMPVGNPVSSFTTNRNQRSPSFGSISTSSNSSKGQLEDTNMGTDSSIEYSARPRESEEQNPETVSWEDRPSTPTILGYEVMEERAKFTVYKVLVKKTPEESWVVFRRYTDFSRLNDKLKEMFPGFRLALPPKRWFKDNYNADFLEERRLGLQAFLQNLVAHKDIANCLAVREFLCLDDPPGPFDSLEESRAFCETLEETNYRLQKELLEKQKEVESLKKLLSEKQLRINTLEDRIRMLSLEPEDSLCMSGTEGGQILKVESSVLESDQGVLDEPSRADSKPCLSCSELENSVSEIEVAEVAYNADED	97669	139731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_97772_99389_99639_99725_99866_107573_107661_113677_113827_127889_127960_137181_137319_137850_137971_138640
810928	contig_9505_pilon	+	1330	12	Intergenic	novelGene_121826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	40.9752999575546	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	57	1295	404142	434147	FALSE	35	CAAGCTTGAAGTGACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPSARRVLCKAAAREGAMGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVTGQFPWSSLRETDRGLSAEYSFPVWKTSHTVKWEGVWRELGCLARTASFAVRKESGHSLKSSLSHAMVIDSRNSSILPRKGALLKVNQELAGYTGGDVSFLKEDLELQLNKQLVLDSVISASLWGGMLVPIGEKPSSIADRFYLGGPTSVRGFSMHSIGPQSEGVSSHDPATPNNGHRSCESLRLFVFSRPRCSYLSLPNQHLIPCLPHSRQGVDSC	404085	434182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419604_422552_422682_423409_423482_424523_424611_431207_431279_433915
810929	contig_6654_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_85771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAAATGTATGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629023	630761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_629000_630800
810933	contig_7342_pilon	-	489	3	Intergenic	novelGene_71195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6216.5	55496	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGGGCTCCAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666823	665351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665761_666670
810934	contig_8980_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_74017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTATGAATATGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670788	670130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_670100_670800
810935	contig_15456_pilon	+	985	4	Intergenic	novelGene_139504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	642.806865758811	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTTCCACTTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131426	143135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_137564_137602_142349
810938	contig_9505_pilon	+	955	6	Intergenic	novelGene_121848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	129.301817465958	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGCGCTCTTTTAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530651	598399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_589574_589716_593382_593499_597932
810943	contig_4364_pilon	+	1109	4	Intergenic	novelGene_146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	21.483844059096	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	55	549	1214061	1214979	FALSE	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPRPPREAHRRAVLGSGMGEWAERVCLLRPRVMTTPNKGSKALKVKREPGENGTSLTDEELVTMSVRELNQHLRGLSKEEIIQLKQRRRTLKNRGYAASCRVKRVTQKEELEKQKAELQQEVEKLASENASMKLELDALRSKYEALQNFLPSSSSWLPPSSSSSSRPPPRPAKHNPHRAPG	1214006	1215539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1214077_1214154_1214220_1214354_1214666_1214876
810944	contig_1331_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_37870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTAACTGTGTGAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327877	327201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_327200_327900
810946	contig_5217_pilon	+	1897	4	Intergenic	novelGene_135792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.29983164553722	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	40	993	664082	683085	FALSE	20	TGAATGAGCTTACTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGRPALRAGVFTMVSAELDYTIEIPDQPCRSRESSPEQGRKEAGTRQPVVILLGWGGCTDKNLAKYSAIYHKRWSAQPLCAPQLWSVLPVAAGAWLVVLGGASTPRTFSSNQGCIVIRYTAPWHMVFFSESLGIPSLRVLAQKLLELLFDYEIEKEPLLFHVFSNAGVMLYRYVLELLLTHRRFCHLRVVGTIFDSGPGDSNLVGALRALAAILEHRPAVLRLLLLVAFALVAVLFHILLAPLTALFHTHFYDRLQDSASRWPELYLYSRADEVVLARDVERMVETRQAHHVLVRSVDFVSSAHVSHLRDYPTYYSSLCVNFMRSCVQC	664042	683989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_664143_677445_677568_677848_677966_682431
810948	contig_10196_pilon	+	414	4	Intergenic	novelGene_132095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	12042	junction_1	953.887834076942	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	133	372	908085	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	907872	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_907912_907991_908152_908260_908353_908475
810951	contig_9345_pilon	-	759	2	Intergenic	novelGene_24604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	218	634	945468	944755	FALSE	10	CAACGTGGGCGCTTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945685	944629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945094_945390
810952	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	7	1152	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
810956	contig_3153_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_104636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTACCTTGGTGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	64565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_63000_64600
810957	contig_9177_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_32775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTTGTTTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370010	1368615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1368600_1370000
810958	contig_15893_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_128504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGATGAGGAAACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36850	37257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_36800_37300
810959	contig_348_pilon	-	722	2	Intergenic	novelGene_67579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	1874	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	176	571	168193	167144	FALSE	25	CAGTGCTGTGACATCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKEELEMAVLGAPVSTAPHSSAPMTSTVISIHSETSVPDHVVWSLFNTIFLNCCCCLGFAALAYSVKSRDRKMVGDLMGAQSYASTAKYLNIFTLVFSLLLIIVFIILVAPAAMMGLQAFSQMLKDYAGY	168368	166992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_167336_167989
810962	contig_11370_pilon	+	996	2	Intergenic	novelGene_98743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5354	junction_1	0	124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAAGTGCTGTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146957	148543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_147616_148205
810964	contig_8354_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_24090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATTAAAAACAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181555	181174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_181200_181600
810965	contig_20819_pilon	-	430	6	Intergenic	novelGene_55685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_2	597.272132281425	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	34	429	70235	65504	FALSE	40	GCCAGCACACAAAGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVR	70268	65502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_69625_69725_70232
810967	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
810968	contig_6414_pilon	-	1887	11	Intergenic	novelGene_157009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	397.265213679728	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	463	1377	85578	47241	TRUE	10	GCTCTGTGTTATTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTANAPGRKSWGKGKWKSKKCKYSFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSHPLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNSLVKMPLCAGNLAKWKMI	86040	44739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095_46170_47136_47296_59286_59421_63319_63412_67557_67640_69124_69251_70319_70386_72834_72928_74835_74989_85464
810970	contig_8978_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_49472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACCAAAAGGTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692896	1692075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1692100_1692900
810971	contig_7345_pilon	+	2243	11	Intergenic	novelGene_159185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_10	170.038701477046	34	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	322	1953	267103	314638	FALSE	30	TGAGGAATTTTTAATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQCVQSVQELIPDSFVPCVAALCSDEAERLTRRNHLTFAELLKPFSRLTSEVHMRDPNNQLHIIKNLKIAVSNIVTQPPQPGAIRKLLNDVVSGSQPAEGLVANVITAGDYDLNISATTPWFESYRDTFLQSMPASDHEFLNHYLACMLVTSSSEAEPVEQFSKLSQEQHRIQHNSEYSYPKWFIPNTLKYYVLLHDVSAGDEQRADSIYEEMKQKYGTQGCYLLKINSRTSNRSSDEQIPDPWSQYLQKNSIQNQESYEDVSCTITSNKNSDSNLLSLDGLDNEVKDGLPNNFRAHPLQLDQSSDRSNSIDGPDHVKSASSSHETKKASTGITHGACLTLTDHDRIRQFIQEFTFRGLLPHIEKTIRQLNDQLISRKGLSRSLFSATKKWFSGSKVPEKSINELKNTSGLLYPPEAPELQIRKMADLCFLVQHYDLAYSCYHTAKKDFLNEQAMLYAAGALEMAAVSAFLQPGAPRPYPAHYMDTAIQTYRDICKNMALAERCVLLSAEILKSQSKYSEAAALLIRLTSEVLKLYNVLYSN	266781	314928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_267260_275831_276027_294657_294748_295535_295711_299853_300008_302251_302346_303007_303265_304318_304435_305150_305302_311018_311120_314496
810978	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
810979	contig_7455_pilon	-	1986	2	Intergenic	novelGene_168657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_1	0	15	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTCTTCTACCGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394350	392275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_394188_394276
810980	contig_10196_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_132209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2	403	1264891	1264490	NA	0	TGGCCCTCGTCTCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHHAAVTPGEDTGVTAARCTPACPSSSPRWPTSRLAWGVWPGQTPLPPAPQLLCSLLPASEKSRRRRPRPHVPTSREDGAGPWALAALRPRDGPRGKGALHRPGPAPGAGSRVIGIKRGDPAAPLSPARPQE	1264892	1264348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1264300_1264900
810982	contig_8447_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_69423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACGGTTAAGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78165	76353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_76400_78200
810983	contig_19692_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_174879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGCAAGACCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27479	28614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_27500_28600
810984	contig_15456_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_139508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	751	junction_1	348.198488652665	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	6	311	131507	142382	FALSE	30	GTTCTTGAAGTCAGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMVCEKCEKKLGTVITPDTWKDGARNTTESGGRKLNENKALTSKKARFDPYGKNKFSTCRICKSSVHQPGSHYCQGCAYKKGICAMCGKKVLDTKNYKQTSV	131501	142942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136500_137564_137620_141935_142040_142317
810988	contig_12619_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_73570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATCAAGATAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832772	832418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_832400_832800
810989	contig_14546_pilon	-	1152	5	Intergenic	novelGene_157414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	12.1140414395857	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	98	664	78938	67548	FALSE	65	AAAAAGAAAAGAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTESVRGLQGAVSLKLDFMSPPESAKELQNKASSFLEGSPSESPGLQKTKGITGFQTLVHLVKGNMGTGILGLPLAIKNAGILMGPLSVLAMGFVACHCMHILVRCARHFCHRLNKPFMDYGDTVMHGLESSPSSWLQNHAHWGRCVVIFFLTVTQLGFCCAYIVFVADNLKQVESSREDGREEDK	79035	67059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_67675_71344_71441_74551_74641_75454_75546_78774
810994	contig_8284_pilon	+	2810	2	Intergenic	novelGene_125665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	15	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	194	1150	208004	208960	TRUE	40	AGGGGCATAAAGAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLKCSFHNDVIESLVIALLTLEFGLGLLTNVIALWTFSFRLKVWKPYSVYLFNLVIASLLLTVCLPFHITFYQRRKTWSFGDTSCQALLFLLSLSCGVGVAFLTAVALDRYFRVLHPHLKVNLLSPRWAWVISGCVWLLMVVLTHQSLLVPEAAGNSTECRSSYPREEFSFSVWQEAVFFLQFLLPFGLILLCNAGIIRMLQKRLRDPEKQPKLQRAKALITMVMVLFGLCFLPRILARILMDIFWRSESCQMRRVVEHTSDVANSLIYLNSVLNPVIYCFSNSTLRYSYRKVSNTLWGRRQEAEPRGSDRKDSYS	207810	212425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_209460_211264
810997	contig_12250_pilon	-	1023	10	Intergenic	novelGene_80708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	196.261415489333	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	56	619	401239	399347	TRUE	25	AACCCAAGTCTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQVKVLPHTPAIPSPPVHTSFYFPLLLAFSRKRCLS	401294	398577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
810998	contig_8045_pilon	-	1581	5	Intergenic	novelGene_35333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	190.641515677987	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	101	364	115779	102674	TRUE	20	ATACTGTGCTGACTACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASKGAADVGRPGFVRTQATTRGCCGSTQGLFPMSRRRRPLPRRAAGGIEVCAGAVRPPARAGIRIGRRRGRGACASRSHSGGEMIRGQRKVQEVESIIKSMTAEYHLKKFKNKILDFHF	115879	82748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_83606_98059_98115_100942_101059_102484_102764_115605
810999	contig_4732_pilon	+	626	3	Intergenic	novelGene_75401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5423	junction_1	73	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524031	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524671_525073
811000	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811001	contig_16930_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_139166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	139	465	213325	213651	NA	35	TAAATTTCTATTCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWDGVLFFICTQLVFFMCHHVLVCLFCMFGIIFSICLSGLACGSRPPMSRVRLPQTSAESCRPAHQALELGHWPTLQGVAMPLGLPSEQALWRGTQMGLSFGFCEA	213186	214296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_213200_214300
811002	contig_4244_pilon	+	1030	2	Intergenic	novelGene_175903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGATTTCAGCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58711	62063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4244_pilon_+_58826_61147
811003	contig_9739_pilon	+	782	5	Intergenic	novelGene_165095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	200.201148847853	1734	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGAAAGTAAGGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204566	234648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_204672_206141_206286_224819_225015_234141_234261_234429
811004	scaffold_9100_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_83225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTACCATCACTAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220941	220539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_220500_220900
811005	contig_6058_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_172422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTTCTTAATTTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396957	395771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_395800_397000
811008	contig_6069_pilon	-	247	3	Intergenic	novelGene_8054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGGCCTTGGGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400007	394172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_394240_399431_399461_399856
811009	contig_6069_pilon	-	974	4	Intergenic	novelGene_8052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	58.231339404902	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	250	381	386962	386831	FALSE	10	ACTGTACTGCTTTCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAQGQTGNLLFFGCRHRDQDFYWEAEWRELERRGCLTLVTAFSREQEQKVYVQQRLRELGPLVWELLDRRGAHFYLAGNAKSMPADVTEALTSIFQEHGGLSGRDAASYLARLQRTLRFQVETWA	388578	386237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_386976_387051_387147_388296_388416_388556
811010	contig_5586_pilon	+	1740	4	Intergenic	novelGene_143576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	548.245889684141	1	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	694	1278	392777	430164	FALSE	15	TCAGGACAGGTGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCFVPRKFTRFLKRWRRKSSEITKSCGHGSTGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	392083	430626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_392877_392983_393128_416881_417014_429955
811011	SIRV4	+	190	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGTTGACTGGGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3800
811013	contig_14322_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_115975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATTTCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
811014	SIRV4	-	291	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1215	15	1215	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3943	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3900
811015	contig_10196_pilon	-	897	8	Intergenic	novelGene_132276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	4.94871659305394	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	126	896	2080146	2076461	FALSE	15	TGCAGGTACTGCCCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLWPLPFICSKLSTCEQVRHRLGQLSLVFSTQKAENPTQLMRKANVLISVLLDVALGLALLTWLHGKDRIGQLADALIPVADRVAEELQHLLQWLMGAPAGLKMNRALDQVLGRFFLYHIHLWISYIHLMSPFIERILWHVGLSACLGLTVAVSLLSDIIALLTFHIYCFYVYGARLYCLKMYGLSSLWRLFRGKKWNVLRQRVDSCSYDLDQLFIGTLLFTILVFLLPTTALYYLVFTLLRLLVVAVQGLLHLLVDLINSLPLYSVGLRLCRPYRLAAGVKFRVLEHEAGKPLRLL	2080271	2076459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2076517_2076820_2076936_2077146_2077228_2077697_2077810_2078169_2078324_2078427_2078555_2079938_2080060_2080141
811017	contig_3153_pilon	+	909	7	Intergenic	novelGene_104695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	134.929611279363	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	312	611	448580	456427	FALSE	20	TAAAGTAGTTTTTGTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKTQFEDRN	447982	456725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448084_448169_448252_448352_448445_448543_448616_448707_448756_454168_454312_456354
811018	contig_19082_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_175905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAACAAGTCCCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112010	110521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19082_pilon_-_110500_112000
811019	contig_11677_pilon	-	1970	6	Intergenic	novelGene_85902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	49	393	469461	469117	TRUE	15	GCACCACGGCAGTCTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGQCSIQAPDQTCSIHMQEQLHRLGQNQEWGIRTKGHPQHPCQDTWAWALLSPPEQGERGLGSFRIAGTLPLGQKERWHRGYGAWPACSTQFCTQPCLLAGPDSQGSTALAGKVYILSCPHWPGPDPRKA	469509	466454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_466507_466606_466720_466807_467033_467452_467625_467990_468146_468256
811020	contig_1309_pilon	-	1545	13	Intergenic	novelGene_73989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3.20156211871642	38	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	540	1358	373530	356901	FALSE	35	ATACATATTTTAGTTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAERKRIKSLLPKLSCGVTNSEHIRRKRVVGGKAAEAGDFPWQVAIRDGEKINCGGIYIGGCWILTAAHCVRVSKAHRYQIWTAFLDWLKPNSELTVFWVNKVIIHENYNGATYENDIALIEMKKYSNQRECELHHSIPACVPWSPYLFQPNDKCVVSGWGREKDNQKVYSLKWGEVKLIGNCSKFYQDRYYEKKMQCAGTDDGSIDACKGDSGGPLVCMDINNVAYVWGVVSWGENCGKPDFPGVYTKVANYFDWISQHVGRSLISQHNV	392401	356713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_357119_358838_358944_363806_364085_371302_371407_371589_371694_373520_373557_377084_377106_383040_383062_383226_383264_388084_388109_389593_389705_389846_389964_392219
811024	contig_6740_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_142668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAGTATTGTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564742	563817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_563800_564700
811025	contig_12619_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_73569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCAAAATATGTTAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828301	826281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_826300_828300
811026	contig_11224_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_124457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGTAAGATGATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215288	213216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_213200_215300
811028	contig_7979_pilon	-	2169	13	Intergenic	novelGene_125537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	96.8102382097174	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	259	1155	1089836	1063750	TRUE	80	AAAGAAAGGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLVQQPILPVVKQSVKERLGPVPSSHTEPAEAQSASSDLPQNVTKLSVKDRLGFVSKPSVSATEKVLSTSTGLTKTVYNPAALKAAQKALLVSTSAVDNNEAQKKKQEALKLQQDVRKRKQEILEKHIETQKMLISKLEKNKAMKSEDKAEIMKTLEVLTKNITKLKDEVKAASPGRCLPKSIKTKTQMQKELLDTELDLYKKMQAGEEVTELRRKYTELQLEAAKRGILSSGRGRGIHSRGRGAAHGRGRGRGRGRGVPGHAVVDHRPRALEISAFTESDREDLLPHFADFTHTV	1095987	1048091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1048889_1050534_1050649_1061526_1061614_1063733_1063771_1065029_1065231_1077636_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080767_1080894_1088414_1088487_1089707_1089840_1090379_1090520_1095872
811029	contig_8312_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_152903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCCATTGTTGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287938	287169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_287200_287900
811030	contig_10135_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_106671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGACGCAAGGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270830	222418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_222456_227987_228047_233654_233754_265105_265271_269972
811031	SIRV2	-	275	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4587	45	3412	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGTGGTGATTCGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	1045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
811032	contig_6048_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_73341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTGCTTCTTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2899383	2901089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2899400_2901100
811033	contig_5725_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_167147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250287	249293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_249300_250300
811034	contig_7882_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_175011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGCTGAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247106	245540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_-_245500_247100
811035	contig_18869_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_56189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73702	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73700
811037	contig_6233_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_74813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAATAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220907	220655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_220700_220900
811041	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
811042	contig_16204_pilon	+	2059	4	Intergenic	novelGene_154479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	40.3429740544194	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	103	831	176941	179732	FALSE	40	AAATAAAGTGCACGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGSSSPWGKHLFKAVLMVLVAFVLLYSASSEPRNFAPPGQQKREAPVDLLTQIGRSVQGTLDAWIGPEITRLVSETLSQVMWAFSSAISVAFFALSGIAAQLLNALGLDGDHLTQGLKLSPVQVQTFLLWGAGALVVYWLLSLLLGLLLALLGRILWGLKLVIFLAGFVALVRSVPDPSTRALLLLALLTLYALLSRLTGTRASGAQLEAKVRGLERQVEELRWRQRRAAKGPRSVEEE	171841	180960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_171936_176932_177175_178558_178662_179340
811043	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
811046	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811047	contig_6497_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_35542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	124.760520598465	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	6	728	1598	131614	FALSE	75	ACAGCAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSPQPIEKFVTDIDELGKDLLLCPVSPILPRPGEVQGKPGFPSAAWPEHLGAEYSLRPQRLPCADCTHNALGGWQVPREGSTELMRISVRRPCSRHLLDGLCFSKETA	1592	132109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_1763_61858_61969_120471_120523_125061_125198_131353
811049	SIRV6	+	423	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	344	533	171	57	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTCGGCCTGGATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811050	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811051	contig_15025_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_155967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAATCAGTGTCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30667	29611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_29600_30700
811053	contig_12379_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_148934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATCCCTGTAATGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181442	182604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_181400_182600
811055	contig_6807_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_84556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCAATGCTCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78095	76135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_76100_78100
811056	contig_19564_pilon	+	2020	12	Intergenic	novelGene_29697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	26.1046843584546	65	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1119	1913	145751	151531	FALSE	20	TATCCCCTTCCCCAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPIGPTRERYKDGVVTIGCVGFPNVGKSSLINGLVGRKVVSVSRTPGHTRYFQTYFLTPSVKLCDCPGLVFPSLLPRQLQVLAGIYPIAQIQEPYTAVGYLASRIPVQALLRLRHPEAEDPSAEHPWCAWDICEAWAEKRGYKTARAARNDVYRAANSLLWLAVDGRLSLCFHPPGYSEQKGTWESHPETMELVVLQGRVGPAGDEEEEEEEEEELSSSCEEEGEEDRDADEEGEGDEDTPTSAPGSSLATRNPYALLGEDEC	142148	151638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_142185_142607_142774_143116_143254_143413_143566_143677_143750_144769_144978_145145_145266_145523_145815_150033_150213_150292_150456_150747_150889_151283
811057	contig_11978_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_62906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTGAATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781394	782885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_781400_782900
811058	contig_12414_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_59633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATGAGGTGATGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653393	655414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653400_655400
811060	contig_6902_pilon	+	1189	7	Intergenic	novelGene_135555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.6209461580639	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	494	1189	282480	295268	FALSE	40	CATGAGAATTATGGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTWSPSALREETSKDGMTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFN	278405	295268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278668_280110_280240_282377_282513_283762_283952_284527_284691_294102_294246_295100
811061	contig_3975_pilon	-	1236	2	Intergenic	novelGene_54705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACTGAGTTTTGGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391373	1374377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1375535_1391294
811062	SIRV6	+	474	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
811066	contig_521_pilon	+	1885	15	Intergenic	novelGene_174734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAGAGAAGGACACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34356	62492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_+_34749_35885_35995_36622_36761_39336_39413_41351_41459_45708_45805_47735_47860_48457_48512_49453_49602_51534_51633_52676_52758_56530_56618_58455_58620_60125_60176_62331
811067	contig_12270_pilon	-	306	2	Intergenic	novelGene_113447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1	306	14376	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14376	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
811071	contig_2161_pilon	+	1358	9	Intergenic	novelGene_114953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	21.9302872758202	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	88	1008	986528	1006745	FALSE	30	CATAAGGTGTGATTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTALKSGRVFKVSEPQVLLYKTCHCTLEMVLGVPESSIHIIGVSLGAHVAGMVGHFYKGQLGQITGLDPAGPEYNRVSLEERLDAGDALFVEAIHTDTDNWGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTSIYAGYSYLICDHMRAVHLYISALESSCPLMAFPCASYKAFLAGHCLDCFDPFLLTCPRIGPVEHGGVRIEPLPTEVKVYLLTTSKAPYCVHHSLVEVYLKETRNKNTNIEVTFLGSNITSSVKITIPKQKLQGRGILPQPHPQCQINQVRLAFQTSNRVWRKKQTITVGKFCTTRLPVHDSKKMICLPEPVNLEANRAVFHDLKIACV	986440	1007095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_986531_987544_987654_988936_989039_992059_992150_994340_994509_996223_996314_1000587_1000697_1005866_1006032_1006660
811072	contig_4364_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGTTGGGTGCCCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453035	1451095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1451100_1453000
811073	contig_4364_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCGTTGTTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451142	1445488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1445563_1450986
811076	contig_11136_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_169028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACGCATGCATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145696	146486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_145700_146500
811078	contig_14357_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_121657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465762	467357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_465800_467400
811079	contig_7079_pilon	+	1540	4	Intergenic	novelGene_129236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	626.400830139935	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	26	502	342490	349800	FALSE	20	TGTCTGGATCATTGTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPLAAPYSLHPGTKPCFFPVNPSSAVIPDWPTLTLAKFLNPPHSFLKQR	342464	350838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344774_349651
811080	contig_15021_pilon	-	1419	1	Intergenic	novelGene_26920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	78152	77805	NA	55	TTATGGCATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWDSPWSRTDSKQPQVLAPLLKGAAAHQPLWPAHLRIPAPKKSLSLRGIAPGEQEHQSRGTLGGHGRRTASVSQSESIRLLQPSHAPSCLSTSPLKFTRGPYLQVDPASSWALPP	78153	76734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_76700_78200
811081	contig_15021_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_26919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATGAGTATGCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76536	75921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_75900_76500
811082	SIRV4	-	503	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	106	8	106	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	876	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5052	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811083	contig_12884_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_105010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGTTCCTCATATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955211	956042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_955200_956000
811084	contig_12884_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_105011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCATTTCTCTAAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956446	957271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_956400_957300
811087	contig_14357_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_121713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTTTATAACCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878848	880844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_878800_880800
811090	contig_6497_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_35617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646853	648261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_646900_648300
811091	contig_11989_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_68448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58243	60290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_58200_60300
811093	contig_10324_pilon	-	1729	6	Intergenic	novelGene_7896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	170.053403376704	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	142	801	761911	755303	TRUE	15	CAAGCGCGTCTGTTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGEPPTGQRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFKVKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDVANQESFAAVQDWATQIKTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPTEDGRRLADDLGFEFFEASAKENVNVKQVFERLVDVICEKMNESLEPSSSQGSNGKGPALGDAPPPQSSGCSC	763774	752071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_752596_754898_755491_760887_761013_761092_761212_761683_761971_763692
811094	contig_16907_pilon	-	742	4	Intergenic	novelGene_87454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	62.9144039328215	252	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	141	515	467716	449131	FALSE	20	AGGGAAGCTTTGTACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGCLRSGEVRKLSALSSRAAVWRLHHPDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGCKLNRLNLVVGEYASACLKVAQDCGTDVLDLWTLMQKDNQDFSSYLSDGLHLSPKGNEFLFSHLWPLLEKKTSSLPLLLPYWRDVAEA	474495	448903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_459295_459418_467610_467773_474411
811095	contig_7357_pilon	+	1612	14	Intergenic	novelGene_36887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	95.3085304489129	1	83	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	29	1231	250864	273311	FALSE	40	TGAATTTATACAAATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRWNRQSASMAHITINQYLQQVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250835	273692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
811096	contig_16098_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_46190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAACTATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676777	677977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_676800_678000
811097	contig_7704_pilon	-	877	9	Intergenic	novelGene_154603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	151.134821847912	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	42	821	230301	216744	FALSE	0	GGCTCCTGCTGGGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGKDEEGVPQPPGPPQRKKFIIPLDEDEVPPAGAKLLFKSTRSLPTVETPAQVAPQTYAEYAISGPPGGAAVTCPSPTGPDPPAGETPNQAPKPGAKSNSIIVSPRQRGNPVLKFVRNVPWEFGDVLPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHQRLQSLGKNFARRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	230842	216687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219285_222526_222598_223587_223692_228371_228594_230196_230309_230808
811098	contig_7720_pilon	-	2278	11	Intergenic	novelGene_155747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_10	35.7770876399966	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	162	2228	291389	283623	FALSE	15	CTTGGGTGTTCCGGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSVGHVRSGRLVRGLWGRRGLEHWGRHGEDLSGAFSSAWPARCPFCLPPFQTMDGSFVQHSVKVLQELNKQRETGQYCDATLDVGGLVFKAHWSVLACCSHFFQSLYGDGSGGSVVLPAGFSEIFGLLLDFFYTGHLALTSGNRDQVLLAARELRVPEAVELCQSFKPKNLVGQAPNGQSGLGKLASQDGSGCLKEPEGLEEEEVVETLGQAPRAQDTSNSHSPQRPPLCPSAQSESPSFLHVKFKQALRPGPPEDKEPEDCKVPPRPLEAEGAQLQGGSHEWEVVVQVEDDGEGDYVSESETVSAERKSNVITKACVAKPALGSGSPVAEPTENRRGTVGPVECPTCHKKFLSKYYLKVHNRKHTGEKPFECPKCGKCYFRKENLLEHEARNCMNRSEQVFTCSVCQETFRRRMELRVHMVSHTGEMPYKCSSCSQQFMQKKDLQSHMIKLHGAPKPHACPTCAKCFLSRTELQLHEAFKHRGEKLFVCEECGHRASSRNGLQMHIKAKHRNERPYVCEFCSHAFTQKANLNMHLRTHTGEKPFQCHLCGKTFRTQASLDKHNRTHTGERPFSCEFCEQRFTEKGPLLRHVASRHQEGRPHFCQICGKTFKAVEQLRVHVRRHKGVRKFECTECGYKFTRQAHLRRHMEIHDRVENYNPRQRKLRNLIIEDEKMVVVALQPPAELEVGSAEVIVESLAQGSLASQLPGQRLCADESFASPGVMEPSLIITAAISEDCDT	292005	283572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_283920_284557_284647_285101_285267_285345_285483_285975_286131_286286_286374_286719_286813_287379_287492_290054_290297_290699_291449_291903
811099	contig_1867_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_54554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	423184	423480	NA	75	CCACCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKAPSSVVLWSVSVTPISAQRHPTLPESLLWSPGSAASVAAISLPLLLAVFGVTALSPGSRRISAQGSQIQRTPSAPLLSFVLSGSEVPLCSGILALF	423183	424662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_423200_424700
811100	contig_7308_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_159600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGGGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492031	494432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_492000_494400
811101	contig_11978_pilon	+	428	3	Intergenic	novelGene_63108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5399	junction_2	483.5	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	19	345	1830693	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1830674	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830785_1831161_1831273_1831759
811108	contig_3449_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_73742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTGGCAGTCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532958	531781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_531800_533000
811109	contig_3727_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_146759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402953	401498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_401500_403000
811110	SIRV6	-	774	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGTTCCCCAATAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
811111	contig_10780_pilon	-	2152	5	Intergenic	novelGene_155429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	56.2094298138666	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCGTGAGTACACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104375	94760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_-_94946_97504_97670_98429_98519_102076_102199_102784
811112	contig_13123_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_136907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTATCAGCAACAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442028	440989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_441000_442000
811113	contig_13123_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_136906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440891	440311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_440300_440900
811115	contig_15456_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_139483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57716	60101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_57700_60100
811116	contig_16220_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_163626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGGCAATGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66942	65921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_65900_66900
811117	contig_16220_pilon	-	619	6	Intergenic	novelGene_163624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGATGTTCAAACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55582	29338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_29414_30893_31009_31933_31997_33497_33615_50451_50567_55448
811118	contig_12638_pilon	-	2065	1	Intergenic	novelGene_33296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCCGCAGCTGCCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178553	1176488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1176500_1178600
811119	contig_10496_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_59430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAATTGGTCCTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45763	44983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_45000_45800
811120	contig_11292_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_109477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTGCTAATGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462424	463662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_462400_463700
811123	contig_5959_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_150226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGATTGGAGTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521400	519406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_519400_521400
811126	contig_3602_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_60562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTCCTGGAGACCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503964	503554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_503600_504000
811130	contig_3654_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_174986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCTGGCTAGAATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159251	160890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_+_159300_160900
811131	contig_5210_pilon	-	891	2	Intergenic	novelGene_65487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATGTTTGACTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204115	1173025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1173761_1203959
811133	contig_12740_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_159206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCTCTGAAACTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44534	43821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_43800_44500
811136	contig_9011_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_159314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACTGGTTTTGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501845	499954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_5e+05_501800
811138	SIRV6	-	326	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
811141	contig_13283_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_154021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCTCCCAGCTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66802	68877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_66800_68900
811142	contig_776_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_139922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAAGGGAGAACCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810817	812864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_810800_812900
811144	SIRV6	+	493	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1741_1845
811145	contig_8671_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_126272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTGGTTGTACTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546068	546464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_546100_546500
811146	contig_8671_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_126273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546766	547299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_546800_547300
811147	contig_14528_pilon	-	1082	4	Intergenic	novelGene_111279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	33.2899717966571	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	137	619	212001	210110	FALSE	20	CCATTCCACTTCATTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQGSTVPGEPGGALPAGAGRSHAPAAFWSARTHRGWGAGAAGADMDPNPRATLERQQLRLRERQKFFEDILQPETEFVFPLSHLHLESQRPPIGSISSMEVNVDTLEQVELIDLGDQDGADVFLPCEEAPPTPQTSGVDDHPEELSLLVAVSDRTTSRTSSSSSDSSTNLHSPNLSDGGADTPLAQSDEDDDGGDGGAEPGACS	213837	209646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_210316_211529_211668_211862_212010_213709
811149	contig_5549_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_81683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTTGGTAAGATCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590201	588320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_588300_590200
811151	contig_8059_pilon	-	1705	3	Intergenic	novelGene_111114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTCATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277047	254816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_255004_266054_266139_275613
811152	contig_5413_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_168092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338521	336403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_-_336400_338500
811156	contig_19974_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_130478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTGAGGTAGGGGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243736	244388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_243700_244400
811162	contig_8044_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_132389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	129	365	539819	540055	NA	70	ACTTAACATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSKRERSDHHPSTATITPSENTHFRVIPSEDTLVSEVEKDASMEDTVCTIVKPRPRALCKQMSDTTSTAELLEPPPGTTQISSMLDADHLPNPSLVEASSELKPAAKVDSPSKKKGNRFV	539690	541041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_539700_541000
811163	contig_3862_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_137443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649336	647870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_647900_649300
811171	contig_5227_pilon	+	1246	12	Intergenic	novelGene_175907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.65223807756376	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	7	990	1565	19453	TRUE	15	GTCCTCATCCACCTCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFDLAWMMSKDLNDMLWWAIVGLTDQWVQDKITQMKYVTDVGILQRHVSRHNHRNEDEEHTLSVDCTRITFEYDLRLALYQHWSLYDSLCNTCYTASRFKLWSVHGQKRLQEFLADMGLPLKQVKQKFQSMDVSLKENLREMIEESANKFGMKDMRVQTFSIHFGFKHKFLASDVVFATMSLMESTEKDSSGTDNFTQALDSLSRSNLDKLYHGLELAKKQLRATQQTIASCLCTNLVISQGPFLYCSLMEGTPDVMLFSKPVSLSLLSRHLLKSFVYSTKNRRCKLLPLVMAAPPERGARHSDSGGHSSRDRQLRQKELFWEGV	1558	23010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5227_pilon_+_1621_3567_3619_4975_5096_7169_7302_7585_7685_8395_8558_12888_13028_13119_13204_15953_16074_19432_19510_21080_21148_22877
811172	contig_6710_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_98293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1	351	657179	653568	FALSE	25	GTTAGAGGGAGGCCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDE	657179	653566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
811177	contig_15108_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_131191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTAGATGAAGGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157174	159184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_157200_159200
811179	contig_12250_pilon	-	2586	12	Intergenic	novelGene_80734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	127.034322166352	35	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	713	2179	416521	410501	FALSE	60	CAGACAAAAAGAATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRNSSSAGSGSGDPSEGLPRRGAGRRLSEEEEEEDEDVDLAQVLAYLLRRGQVRLVQGGGAGNLQLIQALSDSEEEHDSAWDGRLGDRYNPPVDATPDTRELECNEIKTQVELATGRLGLRQAAQEHSFPRMLHQRERGLCHRGSFSLGEQSRVMSHFLPNDLAFTDTYSQKAFCGIYSKDGQIFMSACQDQTIRLYDCRYGRFHKFRSIKARDVGWSVLDVAFTPDGNHFLYSSWSDYIHICNIYGEGDTHTALDLRPDERRFAVFSIAVSSDGREVLGGANDGCLYVFDREQNRRTLQLESHEDDVNAVAFADVSSQILFSGGDDAICKVWDRRTMREDDPKPVGALAGHQDGITFIDSKGDARYLISNSKDQTIKLWDIRRFSSREGMEASRQAATQQNWDYRWQQVPKKAWRKLKLPGDSSLMTYRGHGVLHTLIRCRFSPTHSTGQQFIYSGCSTGKVVGKDCVRKGGLRKGMDVSPAFHL	417233	410093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_410722_411491_411646_412088_412275_412371_412430_412787_412857_413209_413265_413474_413622_413855_413957_414264_414330_414605_414734_414989_415118_416366
811181	contig_7173_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_37552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGCTGTCACAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624115	625200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_624100_625200
811183	contig_3123_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_162982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	633	1902	13	1914	201397	203298	NA	25	TTTGTGAATAGTGTACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSDMNRKTKNRAMCGLQFSLPCLRLFLLVTCYLVLLFHKEILGCSSVCQLCTGRQINCRNLGLSSIPKNFPESTVFLYLTGNNISHISESEFKGLYSLVALYLDNSRIVYVYPKAFVELKHLYFLYLNDNFIKRLDPGMFEGLSNLRNLYLQSNQLSFVPRGVFNDLVSVQYLNLQRNRLTVLGSGTFVGMIALRILDLSNNKILRISDSGFQHLENLDCLYLEGNNLTKVPSNAFGVLRSLKRLSLSHNHIEAIQPFAFKGLVNLEYLLLKNGRIKNVTRDGFSGVNNLKHLILSHNDLENLNSDTFSLLKNLIYLQLDRNRIISIDNDTFENMGASLKILNLSFNNLTDLHPNVLMPLSSLTHLQANSNPWECNCKLLSLRDWLVSSAITLNIYCQNPPSMRGRPLHYIKWTDFTNCAASSTNVSRTWAVKSLHIHHKTTALMMAWHKVTTNEKHLENTETESVTFGEQIHTSPASRLFQENTFGNLLETTAVTPVQIELTSSVNLNLEKNSALPSDAASVSGKTSLICAQEVEKLNEAFDILLAFFILACVLIIFLIYKIVQFKQKLKAPGNSGENRLEYYSFYQSARYNVTASICNTSPNSLESPGLEQTRLHKQIVPEGEAQVIIFEHSAL	201384	203441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_201400_203400
811184	contig_2027_pilon	+	921	7	Intergenic	novelGene_39883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58.6612213381966	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	346	714	102784	103591	FALSE	15	CAACTTGCATGTCTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRRKYGGMSAASVDFEQPTRDGLGSDNIGSRMLQAMGWKEGSGLGRKKQGIITPIEAQTRVRGSGLGARGSSYGVTSTESYKETLHKTMVTRFNEAQ	89604	103798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_89640_91495_91548_102438_102628_102714_102790_103049_103157_103233_103364_103465
811186	contig_6710_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_89116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653641	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
811187	contig_4125_pilon	-	1242	4	Intergenic	novelGene_25268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	47.3943268991366	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAATTTTGCAAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3086914	3077332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3077881_3079097_3079590_3080429_3080578_3086860
811188	contig_9099_pilon	+	2565	1	Intergenic	novelGene_149897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	570	914	280251	280595	NA	20	ACAGATGTGTTTACTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAAERPLPLGGPPVVSGKVTLLPPSLCSLLQQGHSVQLPHKAASCVVTAPGRRAGSEPAGACSGFPAPVWPEGLQLNTAMGRKGERKRHQRGCLEEVHVTLMTPQSEPNWA	279681	282246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_279700_282200
811189	contig_14546_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_157422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGCCACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147032	148384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_147000_148400
811191	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
811192	contig_19098_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_65868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATTTCTAGTGACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491692	491103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_491100_491700
811193	contig_7695_pilon	-	1794	6	Intergenic	novelGene_41608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	18.2274518241031	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	208	1410	512946	504301	FALSE	35	GAAATAACCACCATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSSEGSTPSGASQPSLRSRDIGTESLCDFGQVPPMSGPPFPSLCSGVGGSGSPLPGGSEKAAHVTILNVRGTECVSAPAAPAVGPLFPHLSSHSSGPWIPGLKAWVGQGHLSLTGPAFMTLLLQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEASSWRQAHMQARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	513153	503916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510644_512050_512172_512295_512421_512505
811194	contig_9242_pilon	-	1792	5	Intergenic	novelGene_155073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	15.6044865343272	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	289	1050	762013	705758	FALSE	25	CCCCACTGATTGCAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSRCSHLPEVLPDCTSSAVPVVKTVEDCGSLVNGQPQYVMQVSAKDGQLLSTVVRTLATQSPFNDRPMCRICHEGSSQEDLLSPCECTGTLGTIHRSCLEHWLSSSNTSYCELCHFRFAVERKPRPLVEWLKNPGPQHEKRTLFGDMVCFLFITPLATISGWLCLRGAVDHLHFSSRLEAVGLIALTVALFTIYLFWTLVSFRYHCRLYNEWRRTNQRVILLIPKSVNVPSNQQSLLGLHTVKRNSKETIV	872329	705015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_705917_713705_713916_758592_758798_761825_762070_872097
811196	contig_12624_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_60989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGCTTTAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95376	94603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_94600_95400
811197	contig_9924_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_175924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCAAAACTGTCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75904	77351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_75900_77400
811198	contig_6946_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_59763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378412	377432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_377400_378400
811200	SIRV6	+	411	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	134	0	-53	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	106	321	39	359	2458	10736	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2419	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
811201	contig_13215_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_145882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATCATTTTGTTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35433	36659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_35400_36700
811202	contig_5836_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_106282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTCATCCAGCCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106179	107214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_106200_107200
811204	contig_7272_pilon	+	1459	9	Intergenic	novelGene_25404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	18.9917745353087	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	132	1328	777240	799019	FALSE	10	TATTCCGTGCGTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLRCPTVPSDLENIDRGINSKPKSHVTIRRAVLEEIGNRVTTRAAQVAKKAQNAKVPVQTTKTKNANKQLKPTASVKPVQMEMLGPKGPPPPPEDVSMKEENLCQAFSDALLCKIEDIDNEDWENPQLCSDYVKDIYQYLRQLEVLQSISPRFLDGSDLNGRMRAILVDWLVQVHSKFRLLQETLYMCIAVMDRFLQTHPVSRKKLQLVGITALLLASKYEEMFSPNIEDFVYITDNAYTSSQIREMETLILKELKFELGRPLPLHFLRRASKAGEVDVEQHTLAKYLMELTLIDYDMVHYHPSKVAAAASCLSQKVLDQGKWSFKQEYYTGYTEKAVLEVMQHMAKNVVKVNENLTKFIAIKNKYASSKLLKVSTIPQLNSTAIRDLAAPLLGRS	777108	799150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_777264_779273_779403_781148_781263_789562_789734_789834_789994_791513_791751_792058_792200_797655_797767_798908
811206	contig_7963_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_58527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGGAGGCGCTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213243	215448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_213200_215400
811214	contig_9363_pilon	-	1579	6	Intergenic	novelGene_6668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	8.01498596380555	124	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	75	929	1053839	1050465	FALSE	10	GTGCTTGCTTGGTCAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRPPPPPPPPPPPTFEPRSEFEQMTILYDIWNSGLDLEDMGYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVHHTITNLNTPKRKRRPQDGPREHQTGSARSEGYYPISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGVDTQGTNRVLSERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVIEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYAKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN	1053913	1049814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1050639_1050731_1050870_1052591_1052712_1052917_1053029_1053115_1053289_1053700
811217	contig_14219_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_54282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299659	297603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_297600_299700
811218	contig_9297_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_69840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTTCAAGTCAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673169	672917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_672900_673200
811219	contig_20739_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_83170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTAAGGGTGATCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107358	106377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_106400_107400
811221	contig_8286_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_139794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101705	101265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_101300_101700
811224	contig_9463_pilon	-	290	3	Intergenic	novelGene_83854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	1	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTGAGGGAGTAGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683655	681809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_681892_682317_682462_683591
811225	contig_6544_pilon	-	1502	2	Intergenic	novelGene_142099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107089	105407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_106852_107031
811226	contig_12301_pilon	-	1225	10	Intergenic	novelGene_110013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	201.198507713583	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	72	503	136698	115891	TRUE	30	GCAGAAGATACTTTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEESVYGGEGKLSF	136769	75455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_75536_75681_75874_94261_94394_110665_110786_113599_113750_115842_115927_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
811228	SIRV4	-	228	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	386	3	-386	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTTTCGGAAACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811229	contig_10561_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_175933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	376	681	112950	112645	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDEVLCSDNRFTSSILTSDSTIWISSQTTTPSIFQSSSSIICTIHCVQGLHLKYIVIAFPQQRDVTWQISILAKSLRLGRTQTGSFGLAGGWSIITVFIY	113325	112532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10561_pilon_-_112500_113300
811231	contig_987_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_72342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	411	713	1286769	1287071	NA	25	AGGGAAGGTCAGGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGESAAGTETSAEPSPPSRVGE	1286358	1287073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1286400_1287100
811234	contig_8375_pilon	-	1867	2	Intergenic	novelGene_141293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133019	127969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_128051_131233
811235	contig_11855_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_67014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	170	694	1413836	1413312	NA	50	GGCAGGGAAAAATGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPRVGNDPGWASQRTWGASPGAAHSPGQWATVAAGKAPVGCLVLISRQSWEGPGSWATLLAVLSGPPDPFTLQTPARLHPLPLQQVSRPTFFARKFESTVNQEVLEILDFHLYGSYPPGTPALKAYWENTYDVADGPSGLSDILLTAYTAFARLSLRHAATAAPPPATALCR	1414005	1413222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1413200_1414000
811236	contig_9144_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_151140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTATGAGAATACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620303	620858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_620300_620900
811239	contig_14556_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_138527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAAATAACACCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144933	143517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_143500_144900
811240	contig_11338_pilon	-	1118	10	Intergenic	novelGene_6216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	123.650043806435	1	48	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	449	982	13820	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYSKQSR	21332	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12562_12642_12795_12886_13032_13118_13207_13381_13458_13760_13827_15132_15189_16641_16770_17075_17288_21286
811242	contig_12622_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_5779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGCATGTTTTTAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139492	137788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_137800_139500
811244	contig_2342_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_132765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435205	433590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_433600_435200
811248	contig_16724_pilon	-	1254	10	Intergenic	novelGene_105322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	800.31577101375	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	245	688	569099	560936	TRUE	5	CTTTGTTTCTGTCTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSM	575899	541807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_553367_553527_557699_557766_560935_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
811249	contig_15350_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_164259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242998	244041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_243000_244000
811250	contig_6100_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_168112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAACTTAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443505	444740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_443500_444700
811251	SIRV5	+	370	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-40	875	-40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8275	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
811252	contig_10312_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_159021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGAATATTTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123037	124210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_123000_124200
811254	contig_18272_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_7003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAAGGGAAAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152303	150105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_150100_152300
811255	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
811256	contig_2817_pilon	+	2077	3	Intergenic	novelGene_104345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.5	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1335	1718	291913	292296	FALSE	25	AAAATTGTAGTCTGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVHVRGPGGAVVKCLDANQKVGGSNPPATLREKDVAVFFHKNLQPWKPMRQFYSVHVQKCSTSPVMGGMQTNMQVLLCTCGTSKLNRMIVCNVSQSVAGNGHKYPAGERVNCCNVLEGRSGQCLF	287106	292655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_287167_289783_290408_291262
811257	SIRV4	-	521	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	98	-2	98	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	229	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811258	contig_8210_pilon	-	1421	5	Intergenic	novelGene_30228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	797.176384183576	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGATAGAGAATAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24031	14995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15993_18144_18325_19798_19851_21487_21615_23966
811259	SIRV4	-	607	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	-2	12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811260	contig_14895_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_106691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTAGTAACGTAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21432	21187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_21200_21400
811261	contig_14895_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_106688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGAACTTGCTAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21234	19807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_19800_21200
811264	contig_9753_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_41337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAGGAAGCATTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91141	90461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_90500_91100
811266	contig_10494_pilon	+	763	5	Intergenic	novelGene_102202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	65.9142435289976	2080	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGAGTTTTCCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083240	1087197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083306_1085096_1085423_1086217_1086314_1086606_1086687_1087001
811269	contig_12000_pilon	+	2018	1	Intergenic	novelGene_43189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATATATAGCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574907	576925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_574900_576900
811271	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7456	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
811274	contig_6710_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_96084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653828	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
811275	contig_12786_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_103436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGGCACTCCTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602724	604217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_602700_604200
811276	contig_7870_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_108958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345193	343765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_343800_345200
811277	contig_3942_pilon	+	568	5	Intergenic	novelGene_128654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1476.94048204388	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	136	516	178379	180067	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFAPNHVVAKSRFWYFVSQLKKMKNFGIWLRYDSRSGTHNMYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHDSKIKFPLPHRVLRRQHKPRFTTKWPNTFF	177628	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177695_178309_178457_179076_179177_179714_179825_179974
811279	SIRV6	+	339	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	15	530	2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
811280	contig_11163_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_153062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	243	398	117158	117003	NA	40	AGATAAACAGTGTTATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGGSWDGVGFNSPAAVYGVAGWEAHRLSDLPAWLRWIAVLRSGFLQLGKLPPLHSPSAAPVERRRAQGLEGSETVAVAGMVPRRPPCFLLSIFLLLPTILASGPCPRPFSTTPPPLHAPQGNPYYPEPLP	117400	115880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_115900_117400
811282	contig_18869_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_56303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAAATTTGGCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73578	73355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
811285	contig_7943_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_173142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTATGGCACACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170020	169328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_169300_170000
811288	SIRV4	-	467	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1056	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
811289	contig_8452_pilon	+	420	4	Intergenic	novelGene_48111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGACAACGTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962878	991093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_963082_968669_968752_981637_981737_991057
811292	contig_11396_pilon	+	1115	9	Intergenic	novelGene_71314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	74.1972666275517	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	227	868	453291	468229	TRUE	20	CATGACACTGACGCCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDVSVHMEEVVVVTTPDTAGDGVEEVKTVLVTTNLAPHGGDLTEDSMETENAAAAAAAAFTASSQLKEAVLEVKVAEEEESLEAEVVYPITCGDSRANLIWRKFVCPGINVKCVQYDEHVISPKEFVHLAGKSTLKDWKRAIRMNGIMLRKIMDSGELDFFQHDKVCSNTCRSTKIDLSGARVSLSSPTSAEYIPLTPAAADGTCPAWGP	441739	470082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_441908_453232_453416_459307_459406_460467_460599_464821_464926_465823_465996_468217_468275_468445_468569_470003
811293	contig_7111_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_175938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAGTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75046	76755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_+_75000_76800
811295	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811296	contig_10446_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_162516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGTCACACTTTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153849	1152427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1152400_1153800
811298	contig_567_pilon	+	726	5	Intergenic	novelGene_33993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	193.273607872363	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGATGCTGTCTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443051	458815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_443237_444625_444705_452579_452767_455775_455862_458626
811299	contig_11883_pilon	+	1847	1	Intergenic	novelGene_163763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21475	23322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_21500_23300
811300	contig_8330_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_71938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAACTCTTTGTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331948	1333010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1331900_1333000
811301	contig_5814_pilon	+	1707	4	Intergenic	novelGene_143042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	33.2365260920372	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	161	1231	148636	157531	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLDPWNGTDNDTWDGDELGYRCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVLGLCLNTVALYAFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFYTNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSLHWGQAHYARRVAAAVWVLVLACQAPILYFVTTSTHGTRITCHDTSAPELFSHFMAFSSVILGLLFAIPFAIILVCYVLMAQRLLKPTYGATGNLPRAKRKSVRTIAVVLAVFTLCFLPFHITRTLYYSFRSLDLSCHTLNAINMAYKITRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDDKPAINPIPTIQARRRLGMRRLPTAPCPALLYLRLMG	138112	158007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_138178_144694_144786_148631_149655_157479
811302	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_97679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	653861	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653863	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
811304	contig_9239_pilon	+	862	2	Intergenic	novelGene_137198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACAAAAATTACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239793	279130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_240519_278993
811306	contig_6842_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_130841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCACTAGGATGGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1915634	1913867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1913900_1915600
811308	contig_4952_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_145526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTGGCAATATAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390767	389806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_389800_390800
811309	contig_10902_pilon	+	1245	7	Intergenic	novelGene_65676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_1	311.512796241538	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	469	819	189165	209479	TRUE	40	TAGGTATGCAAACCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGGSATVVFCSHSKKHRGE	160602	218575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_209426_209783_218452
811310	contig_9400_pilon	-	664	6	Intergenic	novelGene_146594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	580.817837191662	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	115	483	135537	129121	FALSE	55	AATCCTAAAAAGATCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVV	158630	128939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_129126_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
811312	contig_9177_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_32733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAATGACTGATTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688450	688124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_688100_688400
811314	contig_8357_pilon	-	1746	11	Intergenic	novelGene_39700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	81.3491856136249	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	671	1516	318016	312261	FALSE	15	GGCTTAGTACTCTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVAQLSQFDEELYKVIGKGSEKSDDNSYDEKYLIATSEQPIAALHRDEWLRPEDLPIKYAGLSTCFRQEVGSHGRDTRGIFRVHQFEKIEQFIYSSPHDNKSWEMFDEMITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333174	312030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315295_317968_318080_318980_319118_320111_320260_321805_321883_325429_325501_333000
811316	contig_4388_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_161956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAGAAGAAAATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416296	417506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_416300_417500
811318	contig_7020_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_57049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53589	51485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_51500_53600
811319	contig_13938_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_175942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4843	6423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13938_pilon_+_4800_6400
811320	contig_8259_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_148865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCATTACCACTACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135830	134658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_134700_135800
811321	contig_4392_pilon	+	1995	1	Intergenic	novelGene_117297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108086	110081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_108100_110100
811322	SIRV6	+	366	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	2	2892	2	-2865	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATGTGCCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2518	7923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
811323	contig_5758_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_119125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559893	559155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_559200_559900
811325	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	530	55	530	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10767	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811326	contig_10057_pilon	-	709	5	Intergenic	novelGene_162339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	154.732632304889	93	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	21	485	64936	50181	TRUE	70	AAGAAGAAGAAACACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKVSTLLLLFYILVSKF	64956	35434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50082_50372_52130_52232_63462_63555_64855
811329	SIRV6	+	233	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	493	57	493	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811330	contig_1516_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_49911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTGGTGAAAATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41984	43390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_42000_43400
811332	contig_9900_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_159505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTAAAAGTTTCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54654	56355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_54700_56400
811333	contig_6343_pilon	-	1447	2	Intergenic	novelGene_175944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	32	700	289685	284081	FALSE	20	TTTTAAACTTTGACTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAENSDDYDLMYVNLDNEIDNGIHSTEERCETAILFPMRSKKIFGSVHPVTPMKLESFSACLWVKATDVFNKTILFSYGTKRNPYEIQLYLSYQSTVLVVGGEGNRLVADTVISVGRWTHLCGTWASETGRMSLWVNGELAATAVKMVPGHVVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDHVLSHEEIRETGEAESCHLRGNVVGWGVTEIQPHGGAQYIL	289716	283333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6343_pilon_-_284695_289630
811335	SIRV6	+	222	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	500	61	500	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10737	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811340	contig_12313_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_171841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTTCACTGTTCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66480	64179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_64200_66500
811341	contig_5854_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_68867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAGGAAATAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439290	437654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_437700_439300
811342	contig_15236_pilon	+	1218	4	Intergenic	novelGene_141604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	289.569795846643	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	34	567	547536	568547	FALSE	65	AGAGCTAGAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEGSGLEDTNMNKLKSSQKDKVRQFMIFTQSSEKTAVSCLSQNDWKLDVATDNFFQNPELYIRESVKGSLDRKKLEQLYNRYKDPQDENKIGIDGIQQFCDDLALDPASISVLIIAWKFRAATQCEFSKQEFMDGMTELGCDSIEKLKAQIPKMEQELKEPGRFKDFYQFTFNFAKNPGQKGLGKHF	547502	569198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_547539_563914_564132_565387_565557_568402
811345	contig_13490_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_129127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATAAAATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79723	79930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_+_79700_79900
811351	contig_15087_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_37242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAGGAAAAAACCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190698	189539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_189500_190700
811352	contig_11702_pilon	-	1257	12	Intergenic	novelGene_141973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	76.1055161389558	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	198	1163	376758	372981	FALSE	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380784	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374078_374165_374269_374525_374628_374913_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
811356	contig_5765_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_141433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	36	416	975907	975527	NA	85	TGAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTPAPLPAPTMVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTATKQKTNSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQNGSRHFEDWVSRSASRPGA	975942	974473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_974500_975900
811359	contig_15070_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_164897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGACTCAAGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490001	489528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_489500_490000
811360	contig_10011_pilon	+	2155	17	Intergenic	novelGene_68014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	53.2703892889849	302	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	344	2038	9017	35455	FALSE	15	GATCATGCTTTTGTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPVLCPWRTTVQSESPWRNLATASVPVGQTYSTQAAEDQKEEPLHSIISSTETVQGSVSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNSSDALEKLRHKLVCEGQTLPEMEIHLQTDADKGTITVQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGSKAFLDALQNQAEAGSKVIGQFGVGFYSAFMVADRVEVFSRSAAPGSPGFQWLSDGSGVFQVAEASGVRPGTKIIIHLKSDCREFAGEARVRDVITKYSNFISFPVYLNGRRMNTLQAIWTVDAKDVSESQHEEFYRYVAQAYDRPRYTLHYRTDAPLNIRSIFYVPETKPSMFDVSRELGSSVALYSRKVLIQTKAADILPKWLRFVRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQRLIKFFVDQSKRDPEKYARFFEDYGLFMREGIVTTTEQEVKEDIAKLLRYESSALPAGQLTSLMDYANRMKAGTRNIYYLCAPSRHLAEHSPYYEAMKQKNMEVLFCYEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDGSPADGRLSEKETEDLMAWMRNALGSRVTNVKVTLRLDTHPAMITVLEMGAARHFLRMQQLAKTHEERAQILQPTLEINPRHALIKKLSQLRAGEPELAQLLVDQIYENAMIVAGLVDDPRPMVGHLNKLLTKALEKH	6594	35572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_6765_7613_7697_8926_9068_12225_12298_16750_16912_18943_19054_19731_19806_20597_20754_22295_22417_23020_23091_26651_26800_28398_28585_29042_29182_29913_30000_31694_31841_35156_35230_35353
811364	contig_6740_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_142716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGAGTTAAACACAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723079	723531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_723100_723500
811370	contig_13780_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_149132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGAGCAAGTGACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848765	851105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_849814_850609_850766_850984
811371	contig_3382_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_124064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAACGCGTGTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272930	273578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_272900_273600
811372	contig_7840_pilon	+	1335	2	Intergenic	novelGene_68945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCACTTGTTTTTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9987	11464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_11146_11287
811374	contig_10734_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_51319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTCTACGGAGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484175	1486032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1484200_1486000
811379	contig_12638_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_33305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258762	1257280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1257300_1258800
811380	SIRV6	+	441	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	21	221	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCTTGAAGCAATCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
811381	contig_5039_pilon	-	1610	2	Intergenic	novelGene_64793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAAGGAGATACACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165631	162225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_162757_164552
811382	contig_11115_pilon	+	1559	8	Intergenic	novelGene_102785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_5	52.2040736544807	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	30	1172	111227	121411	FALSE	40	ATAAAGGATTTCAGATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYSVWDHIEVSDDEDETHPNIDTASLFRWRHQARVERMEQFQKEKEELDRGCRECKRKVAECQRKLKELEVAEGTGSQVELERLQAEAQQLRKEERSWEQRLEEMRKKEKSMPWNVDTLSKDGFSKSMVNIKPEQADEDSEEAREQKHKTFVEKYEKQIKHFGMLRRWDDSQKYLSDNAHLVCEETANYLVIWCIDLEVEEKCALMEQVAHQTIVMQFILELAKSLKVDPRACFRQFFTKIKTADRQYMEGFSDELEAFKERVRGRAKLRIEKAMKEYEEEERKKRLGPGGLDPVEVYESLPEELQKCFDVKDVQMLQDAISKMDPTDAKYHMQRCIDSGLWVPNSKSSEAKEREEAGPADPLLEADPKPGDEKDVSA	111197	121798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_111329_117829_118112_118425_118535_118631_118748_118832_118956_119566_119750_119849_119922_121255
811383	contig_2236_pilon	+	1737	12	Intergenic	novelGene_98682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_11	47.0141529596397	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	383	1270	52528	65229	FALSE	70	GAATAAAAAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLPAELTAEEKEDLLKYFGAQSVRVLSDKGRLKHTAFATFPNEKAAIKALTRLHQLKLLGHTLVVEFAKEQDQVHSLLSSSNTEKKKRSDDPVEDDKEKKEFGCLTIENGIAPNHGLSFPLNSCLKYMYPPPSSTILANIVNALASVPKFYVQVLHLMNKMNLPTPFGPITARPPLYEDYMPLHAPLPPASPQPPEEPPLPDEDEELSSKESEYESSDDEDRQRMTKLMELANLQPKRPKTIKQRHVRKKRKIKDMLNIPSSASHSNLHPVLLPSDVFDQPQPVGNKKIEFHISTGMPATFKKDLEKEQNCEEQNYDLPDAEVDTSNVGFGKIFPAPNLNITEEMKEDSDEMPSEFISRKELKKGRISREEMETLSIFRSYEPGEPNCRIYVKNLAKHVQEKDLKFIFGRYVDFSSETERIM	41126	65696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_41224_43195_43244_49203_49323_50578_50663_52493_52606_53481_53551_54643_54787_57723_57850_61109_61262_63781_63944_64983_65079_65166
811384	SIRV6	+	384	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	340	576	167	14	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTACGCTAGTCCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811385	SIRV5	+	435	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
811387	contig_4797_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_6949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATCCATTCCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662370	661658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_661700_662400
811388	contig_5732_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_119605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAAACCTGGCAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425103	422476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_422500_425100
811390	contig_5690_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_119689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAATAAAAGGAACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485299	486385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_485300_486400
811391	contig_8570_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_120166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACCTGACATCAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383159	382723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_382700_383200
811392	contig_19851_pilon	-	1049	7	Intergenic	novelGene_29812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_5	56.7961755363471	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	125	718	36836	23145	FALSE	50	CAGGAAAAAGTACTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGACGPGSEGPACARVCGSLSFPPGSARASLLQRRALRPSTMRRAALRLYTLNKVLLTPGRGLAQGSQDPKNQGPLHIHEVRVKLREIVGASTNWRDHVKAMEERKLLHSFLAKSQKALPPRRMKDSYTEVLLPLGSQPELREKYLTVQNTVRFGRILEDLDSLGVLICYKHSKIQATQASPLSIVTALVDKIDMCKKSISPEQDIKFSGHVSWVGKTSMEVKMQMRQVCMFSEGKAY	36960	22813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_23282_23843_23928_27405_27444_27708_27880_30130_30177_32061_32160_36816
811394	SIRV6	+	308	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10517	1	1280	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11517	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
811395	contig_7593_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_127342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAGAGGCCAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609761	607754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_607800_609800
811396	contig_10324_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_7781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGCTGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102228	101127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_101100_102200
811398	contig_13863_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_41993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGAAGAGTTTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57304	55105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_55190_55262
811400	SIRV4	-	444	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1077	0	1077	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4081	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
811402	contig_6270_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_99903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGAGTGTCAGCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217820	1219095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1217800_1219100
811403	contig_4754_pilon	+	1012	7	Intergenic	novelGene_35908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	8.30160627027485	119	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	461	1012	166779	174347	FALSE	35	TCCAATAGCACTAAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEAQESLAFEDVAVKFTWEEWQLLDPAQKNLYRDVMLENFRNLVSVGYQVTKPDALSRLRRGELPWSILDEIDSRNFLEIWKVDDHLPEHLQNESRVNRSEQRHKHNTWENIFHQHRSHFPLRQNHNMFDLHEKSVKSNLTLINQSRSYKVKNSTEFNRDEKTFLHANHEQFHTEIKFPESQK	163126	174347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_163188_163715_163798_164269_164394_166585_166794_168152_168280_168552_168649_174033
811404	contig_13780_pilon	+	642	4	Intergenic	novelGene_149007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	104.295520304352	3430	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTGCTGCTTGCTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288594	295836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294733_294758_295430
811405	contig_9177_pilon	-	733	2	Intergenic	novelGene_32828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	0	2489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGTTTTTATTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784739	1781491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1782028_1784542
811407	contig_4125_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_25185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGACGCCGGAGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271716	1271199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1271200_1271700
811409	contig_14158_pilon	+	1244	4	Intergenic	novelGene_136116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_2	57.7831194111991	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	79	549	18010	25162	FALSE	50	AGCTAAAGAAAGCAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPVPPPLPPQPHCSRSRGVPVHLRTMSGGLLKALRSDSYVELSQYRDQHFRGDNEEQEKLLKKSCTLYVGNLSFYTTEEQIYELFSKSGDIKKIIMGLDKMKKTACGFCFVEYYSRPDAENAMRYINGTRLDDRIIRTDWDAGFKEGRQYGRGRSGGQVRDEYRQDYDAGRGGYGKLAQNQ	17931	25857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21301_24096_24236_25090
811410	contig_5816_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_158261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334526	336421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_334500_336400
811412	SIRV6	+	199	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	524	60	524	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10761	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
811413	contig_5690_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_119678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282091	279869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_279900_282100
811416	contig_6589_pilon	+	633	3	Intergenic	novelGene_26032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1054.5	46	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATAGCTTTATATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725379	1731816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725709_1731406
811418	contig_10058_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_67703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	99	junction_1	0	256	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGGAAGCATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54199	55531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_54474
811419	contig_8487_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_111914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTACAGAGGAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191796	192196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_191800_192200
811421	contig_7678_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_175949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45635	46909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_45600_46900
811422	contig_14483_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_133773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCTAGAAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169763	171230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_169800_171200
811424	contig_5229_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_117721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	192.537788498778	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	93	611	658024	667261	FALSE	20	TCAGAGGTCAGGACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGKELRLAAERPRSQRRPNQSSCRRRRAPMAAAKDSHEDRDTTENVDESNHDPQFEPIVSLPEQEIKTLEEDEEELFKMRAKLYRFASENELPEWKERGTGDVKLLRHKEKGSIRLLMRRDKTLKICANHYITPLMELKPNAGSDRAWVWNTHADFADECPKPELLAIRFLNAENAQKFKTKFEECRKEIEEAKEKTEEKQ	657931	667559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_658039_660570_660705_662746_662905_664881_665011_666201_666253_667229
811425	contig_12624_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_61001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAAATCTGAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416532	418646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_416500_418600
811426	contig_14546_pilon	+	1737	13	Intergenic	novelGene_157432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	197.728138277451	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	122	724	514567	526755	TRUE	25	AGGAATGTGTCTTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKEIHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSVANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEPEERQQTPEVVPDDAGTFYDQTVSNDLEEHLEEPVAEPEPDHLQT	498455	534266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_498559_514548_514662_517685_517768_518157_518332_523716_523808_525315_525410_526579_526632_526740_526782_528373_528476_528722_528835_529060_529190_529581_529692_533732
811427	contig_10494_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_102221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	417	749	1240712	1241044	NA	50	TCCAGATGGCAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRASVEEALAGASPSARSDRTGGHCRLLINTDCPYRLLHPVFLPCSQRPPGSVREAEHTVWSGKLHLNLPCHLLACGLGRVVHLHGPQLPRLSSGEDSTHLAGTLGGKCM	1240295	1241938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1240300_1241900
811428	contig_3161_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_84525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGTCCAGCAGGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432431	433789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_432400_433800
811429	SIRV3	+	646	5	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	3	-135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCGTTGACGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	8802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4775_6057_6327_8741
811430	contig_1084_pilon	-	1817	7	Intergenic	novelGene_152391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	71.899621386733	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	404	1003	565857	538696	FALSE	50	AAACTTAATAAATTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVILDNYDLASEWAAKYICNRIIQFKPGQDRYFTLGLPTGSTPLGCYKKLIEYHKNGDLSFKYVKTFNMDEYVGLPRNHPESYHSYMWNNFFKHIDIDPNNAHILDGNAADLQAECDAFEKKIKEAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSRTRLKTLAMDTILANAKYFDGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREV	569136	537881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_538702_551706_551892_559741_559925_560979_561082_565733_565896_568478_568748_569040
811432	contig_10235_pilon	-	1720	11	Intergenic	novelGene_46611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	239.689298885036	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	43	1155	607523	604239	TRUE	30	GTAAACTTGTAGTTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLLWGAQPVPQQIMTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGGWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN	607900	602733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_602918_603857_604332_604460_604548_604672_604762_605139_605294_605419_605556_605714_605906_606003_606252_606487_606562_607482_607530_607864
811435	contig_6842_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_130667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTGTCAGCATTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284570	283323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_283300_284600
811437	contig_9682_pilon	+	1499	8	Intergenic	novelGene_125283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_3	187.517182886132	9	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	312	782	10767	19072	FALSE	20	CAGAGCCTCAGTTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTR	2375	19789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_5575_5702_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990
811438	SIRV6	+	480	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	202	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
811439	contig_5018_pilon	-	1442	9	Intergenic	novelGene_47188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	6.34305722818264	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	665	1303	1590576	1586939	FALSE	15	CTGGGCCATCAGCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPVLQKVNTVQFNEEATVILSGSIDSSIRCWDCRSRRLEPVQTLNEARDGISSVKVSDHEVLAGSVDGRVRRYDLRMGQLFSDYVGSPITCICFSRDGQCTLVSSLDSTLRLLDKDTGELLGEYTGHKNQEYKLDCCLSERDTHVVSCSEDGKVFFWDLVEGALVLALPVGSGVVQSLAFHPTEPCLLTALGGSVQCWREEAYKAEGGAG	1591452	1586799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1587089_1588169_1588285_1588368_1588478_1588568_1588637_1590294_1590422_1590506_1590824_1590874_1591013_1591093_1591215_1591294
811443	contig_4531_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_47934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAAACGCTTCCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664896	662940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_662900_664900
811444	contig_5482_pilon	-	1794	1	Intergenic	novelGene_144465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGATTTTGTTGCTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338213	336419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_336400_338200
811445	contig_3825_pilon	-	1805	5	Intergenic	novelGene_77972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	93.6335943985918	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	17	697	31499	27914	FALSE	10	GCCTTATACTGTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGIRMWFQWSEQRDYIDSTWNCGYLLASSFVFLNLLGQLTGCVLVLSRNFVQYACFGLFGIIALQTIAYSILWDLKFLMRNLALGGGLLLLLAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	31515	26805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_28181_29179_29367_30072_30117_30782_30860_31393
811446	contig_11427_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_79001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	390	413	600715	600692	NA	20	GGTGGGATGAGGGGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAGRWAASPLWHCQLHPPQRITDSARAGNWASKKPSVTLTADAQIGLTTAERLSGHWEDLPCPLCWAQALSLRPSRGPCGALGETTPLRRPSRLRSGSGSGTLRKQGRVMGPLGPG	601104	600574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_600600_601100
811447	contig_9363_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_6503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGAGTACAGGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459663	461357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_459700_461400
811448	contig_6576_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_42325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599334	601046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_599300_601000
811449	SIRV7	-	378	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	-1	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78839_78966_114687
811450	contig_9888_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_162268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGGAAACTAACCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124018	125002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_124000_125000
811452	contig_3155_pilon	+	1075	4	Intergenic	novelGene_26422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	34	junction_3	1041.49219872258	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	109	435	259780	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	259268	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261082_261733_262413
811454	contig_2078_pilon	-	1109	5	Intergenic	novelGene_100180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	78.1164995375497	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1	600	522386	505518	FALSE	20	TGACTGTATCTGAGGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIGGLVLPCLSPLSHSYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	522386	505008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514752_522146
811455	contig_12740_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_159212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAGAGGACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78385	76294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_76300_78400
811457	contig_6065_pilon	+	1573	3	Intergenic	novelGene_132690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	54	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACAGAATATTTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460460	463110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_460842_461600_462465_462782
811462	contig_2377_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_67913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGAGCAGGGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254176	254759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254200_254800
811463	contig_2377_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_67915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAGCAACAATGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255010	256112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_255000_256100
811465	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
811466	contig_12654_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_129254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAACTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44213	45064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_44200_45100
811467	contig_11285_pilon	-	1465	12	Intergenic	novelGene_5537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	326.943142123853	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	70	879	744458	741959	TRUE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMPS	745391	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741656_741737_741819_741892_741968_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
811468	contig_9900_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_159513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAATAATATAGCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227505	228245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_227500_228200
811469	contig_15888_pilon	-	745	5	Intergenic	novelGene_84437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1731.8379507044	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	10	369	253673	252475	TRUE	10	CACATTTCGGCTCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	253682	251600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251822_252151_252301_252468_252539_252807_252833_253402
811470	contig_7962_pilon	+	674	7	Intergenic	novelGene_149310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	54.9648877820094	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTGTCTTATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444819	446297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_444848_444930_444983_445214_445425_445586_445647_445751_445798_445922_445973_446069
811471	contig_12402_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_133381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGTTGCCCCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638144	637539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_637500_638100
811472	contig_13293_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_146437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGGTATCTATTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160581	159305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_-_159300_160600
811473	contig_804_pilon	-	1371	7	Intergenic	novelGene_138790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	68.2584956047394	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	112	888	204639	169516	FALSE	20	TTTACATTCTATCTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMALQPGALQLIPKRPALEKTNGATPIFNPSVFHCQQAMANLQLPQPAFIPAGPILCMAPTSSIVPMMHGATPTTVSAATTPATSVPYVATTTGNQLKF	204750	169032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_172738_172834_175918_175955_178352_178504_183049_183287_184285_184478_204585
811474	contig_8354_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_24066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGATAAACAAAACATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33001	32588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_32600_33000
811475	contig_6589_pilon	-	1624	12	Intergenic	novelGene_26246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.5390632670788	1	83	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	653	1447	2230610	2227982	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYR	2231368	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228053_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737
811477	contig_12528_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_81270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACTGTTAAAGAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185444	184687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_184700_185400
811479	contig_3463_pilon	-	1415	3	Intergenic	novelGene_61986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCCATGAAGTGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206096	171891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_171995_180539_180654_204898
811481	contig_8674_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_102941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATCCATTCTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478870	479929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_478900_479900
811483	contig_3132_pilon	-	1569	2	Intergenic	novelGene_127433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGTACCTGTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229572	227721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_228929_229210
811486	contig_1090_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_131103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	856	1341	301640	302125	NA	45	TGTTAGTGTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGHSRLLLAGGLSQVQAYWALMAPWLLTPQSRLVSPAAFPKYDSGGAATPNMSLRSCRDPKLHLRWNLLGVTKESQKLPLQGLKLWLLSCATDTTQARDILDWRMWDILSQTKSMCVGRRLGFPACQNQGVGENGIPLISLPLPLPHSSPEHQTTMSPSE	300784	302233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_300800_302200
811487	contig_4769_pilon	+	173	2	Intergenic	novelGene_117977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCTTATTTAAGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434006	437080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_434056_436956
811488	contig_2636_pilon	-	733	4	Intergenic	novelGene_52068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	199.671396716372	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	161	460	62513	59826	FALSE	40	CAAGAAGTCATGGATCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85677	59552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62548_85551
811489	contig_11416_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_145350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAGTTCATGAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187830	189179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_187800_189200
811490	contig_10135_pilon	+	995	8	Intergenic	novelGene_106601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	42	junction_1	23.3036740556032	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTGTAGCGCCCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75193	77912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_75423_75918_75984_76239_76345_76528_76616_76887_76967_77185_77294_77378_77494_77705
811492	contig_6028_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_156568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACTGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282797	284525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_282800_284500
811494	contig_8616_pilon	+	801	8	Intergenic	novelGene_72503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	228.965642195772	136	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	86	724	336939	339260	FALSE	5	CGCGCTTGACTCCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPPSAFFFLVPTADPEPGPRGGGGDGAMAELTALESLIEMGFPRGRAEKALALTGNQGIEAAMDWLMEHEDDPDVDEPLATPLGHVLGREPISSGQGGPEGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEEGRSLEGARTLCSCSVASPDGPFQRLTWSGLCRNWDLCLLLSSSWPRNVPVEGRLS	336758	339337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337383_337467_337538_337778_337959_338926_339030_339194
811499	contig_3825_pilon	-	904	5	Intergenic	novelGene_78021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	521.981560977014	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	126	665	1465317	1462075	FALSE	20	GGTGTTTATTTTTTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPHGEKAPQTCKELLTQGNALSGWYTIFLPDCRQLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFFQDWAAYKRGFGSQLGEFWLGNDNIHTLTAQGTSELRVDLVDFEGNHQFAKYTSFKMAGEEEKYKLVLGAFAGGTAGDSLTDHNNQSFSTKDQDNDKGSASCATRFEGAWWYNDCHSSNLNGHYLGGAHESYANGVNWKSGKGYKYSYKTSEMKLRPA	1466929	1461835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1462323_1463664_1463800_1464677_1464808_1465290_1465419_1466905
811500	contig_19604_pilon	-	1220	5	Intergenic	novelGene_77227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_3	28.1635846440044	381	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	163	597	257693	257077	TRUE	0	TGGCTGTGTTTTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAFALASQQKAARAQSKGCFQAEIVPVTTTIRNDKGTERSVTVAQDEGIRANTTMEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGKVAPSHPRSGSHSHPACCYWGWGDRPAPTPKSLVIPHVVRLALVDRHTRWPAGHRWGEAQGESC	258498	255629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257454_257635_257827_258469
811501	contig_8954_pilon	+	1649	2	Intergenic	novelGene_130299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAACTTGTCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185935	188699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_186074_187188
811502	contig_5935_pilon	+	1202	2	Intergenic	novelGene_102683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	0	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	84	668	775541	783172	FALSE	35	TATGGAAAGACTTATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSLLLVASISLVPSLEGEAFGEVHGLMSSKAGPIPVHVMSSFEDVDTEETVTCLQMTLYHPGLLQTGIFQSIRFCHREKLSSSEVVKFGRNATICRYTFLDKQVSRVQFSLQPFKDFSSSVLSFEIKNMSKKTSLIVDSRELGYLNKTNLPYRCMVRFGDYQLLMEKEDGESLDFFETQFILSPRPLSQENICAATNPVPENGNCSTRSTSPTEMDENEA	775457	783706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_775553_782599
811503	SIRV5	+	474	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1136_2039
811504	contig_1516_pilon	+	798	5	Intergenic	novelGene_49973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	1705.50241864384	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAACGTGTAAGTCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335194	350225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_336185_336551_347227_347395_347975_348068_350125
811506	contig_5071_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_171281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATATGAATGAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205358	204534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_204500_205400
811507	contig_10235_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_46562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	32.2438624650749	230	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	81	845	432382	440204	FALSE	5	TGAGGTTTTCTGGTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKRHRLVSETFGLKRRREREDGEVDPLRGESGSARAAVAELVRLFPRGLFEDALPPIALRSQVYSLLPDRTVADRQLKELQEQGEIRVVQLGFDLDAHGIIFTEDYRTKVLKACDGRPFAGAVQKFLASVLPACGDLSFQQDQMTKTFGFKDPEITQLVNAGVLTVRDAGSWWLAVPGAGKFIKYFVKGRQAVLGMVRKAKYRELLLSELLGRRAPAAVRLGLSYHVHDLIGAQLVDCISTTSGTLLRLPET	432301	440550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_432482_432629_432767_438244_438341_438610_438751_439591_439690_439801_439950_440158
811509	contig_5217_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_135733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1001	1327	520065	519739	NA	30	TGCTTCACAAATATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPNVRLDWTATVFFFLVLFHKEFKEGEKQDTINLKGGTVDYLEENKVRFLSQGLYTKIYSTWIKEGYLALSLKTENVVTQQYPFHSSIVWIMKIEKNLYVHQYRTD	521065	519209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_519200_521100
811510	contig_17470_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_110539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTCTGATTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277518	278698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_277500_278700
811513	contig_20429_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_169244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATCCATCTCTTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103299	102313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_102300_103300
811514	contig_2444_pilon	+	895	3	Intergenic	novelGene_83778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_1	48.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	134	427	242606	243030	FALSE	30	TAACTGTATTAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	242205	243498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_242301_242567_242747_242877
811515	contig_14441_pilon	+	861	5	Intergenic	novelGene_100581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	247	675	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111198	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111254_112111_112154_116578_116963_117220_117344_117539
811519	contig_7895_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_154466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	47	310	929762	930025	NA	35	CAGTGGGAGAGCCATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFEEPWTISFSELKSMIEKLHKTLSGSVPGPDKLFSNSISCWVNLESRSALSSPCSSAIVSTAGPLPCRPGIISDLSNTELKLEARSLDLWCFLAHLAMPWS	929715	931217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_929700_931200
811520	contig_7895_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_154467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCACCACCAAGGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931167	931689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_931200_931700
811521	contig_7333_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_142746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATCCCAATTAATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48388	47058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_47100_48400
811522	contig_12098_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_160660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGCAGAACCAGTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85773	83480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_83500_85800
811523	contig_10159_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_30811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAGGAAAAGGAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419303	417791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_417800_419300
811524	SIRV6	+	218	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	517	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10754	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11028_11109_11205
811525	contig_16525_pilon	-	572	4	Intergenic	novelGene_133866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	68	junction_1	994.193251949651	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	125	517	181436	178157	FALSE	20	AAGGTTCGAGGACTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYDVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181560	178101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178588_178686_181150_181253_181388
811527	contig_11964_pilon	+	1314	4	Intergenic	novelGene_164713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	30.0037034751082	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTCTCTAATGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174127	204740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_174176_180106_180361_195807_195893_203813
811528	contig_12977_pilon	+	1254	12	Intergenic	novelGene_122774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	764.28962317905	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	220	876	48712	57283	TRUE	30	TAAAGAAGTGCCTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAGLEKGWARHRGPPSHHWAGPSGLTSPYSAPEIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10578	58779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10641_47220_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
811529	contig_10235_pilon	+	764	4	Intergenic	novelGene_46452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	221.734576063866	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	178	327	211879	212152	FALSE	15	CATCTGATTGGCCTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRPSTRPGPWHPAAGAAPERGRFGHLFLRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210878	212589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210968_211659_211704_211834_211924_212047
811530	contig_12799_pilon	+	1640	2	Intergenic	novelGene_173280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	105	557	16875	17327	FALSE	45	TTAGAAGGCAGAAGTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAALVEAIVEEVACPICMTFLKEPVNIDCGHSFCHSCLSGLWEVPGESQNWSYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLGLHPGMGLKGDICELHREWLKLFCKEDGLMMCEACSQSPEHETHSVVPMEDVAWEYKVRDGGWAA	10432	18410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_+_10482_16819
811536	contig_14666_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_39479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38975	38335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_38300_39000
811537	contig_6710_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_96026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653762	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
811538	contig_14684_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_99684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTATGATGCTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418123	418884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_418100_418900
811540	SIRV4	-	370	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1153	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
811541	contig_6552_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_163610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACGTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176277	174035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_174000_176300
811542	contig_2069_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_23387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	8	421	1099069	1099482	NA	75	AGTTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAEVAAAGRETVSVAASRGAGSGGAAVSWTAGRGMELGTADAEAGMAVGSMEAEKTRAVVAETAAAADMKVGHEGSGMVAAGSRVAAAAGGEDFAGCNMESGPADHTRWGLVVHKEESVGKERILLAPAVWDEDR	1099061	1100501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1099100_1100500
811543	contig_8907_pilon	-	2333	5	Intergenic	novelGene_85852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	369	692	785141	784818	TRUE	5	GCCGGGGCGCCCCGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNLLIKASMTSSTGSSKKYGQANRGRYSQTDTEHLGHLHKDVNQRCLVNTVTRTGHPRGSSPWRRSSLQWPMDVCEPCGFKSRLHLNLIKSPLRDNYNFRMADYRF	785509	763986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_764115_772864_772966_777378_777479_781521_781627_783610
811544	contig_9216_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_163522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCATTGTTTGCTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860918	859138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_859100_860900
811548	contig_6316_pilon	+	1727	3	Intergenic	novelGene_134705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	47	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATGAAAAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136302	142050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_139486_139564_140479
811550	contig_5690_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_119755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGATCCTATTTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249087	1247389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1247400_1249100
811552	SIRV6	+	402	5	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	57	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10718
811553	contig_15390_pilon	-	546	5	Intergenic	novelGene_174292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	2.34520787991171	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	37	546	81093	25173	FALSE	30	TCAGTCCCAGGGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSMSLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLHAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERQKQLRDQYCFECDCFRCQTRDKDADMLTGNEQVWKEVQESLKKIEELKAQWKWEQVLAMCQTIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFYGIRTMEPYR	81129	25172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15390_pilon_-_25349_32011_32100_66761_66873_79163_79267_81061
811555	contig_6418_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_81162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAGTTGATTCCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310071	312192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_310100_312200
811556	contig_2773_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_174280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206613	204837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_204800_206600
811557	contig_14838_pilon	-	763	2	Intergenic	novelGene_151911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	6	572	176763	109062	FALSE	10	GCATTGTGGTCTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMMAACDPPPWPLPDRGRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	176768	108870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_109582_176716
811558	contig_11378_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_112296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1108	1410	935371	935673	NA	70	ACAATTCGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSMAVGYTNLIFHQFREYICHVSKQYMPVTGGVSDGLRSGSVLSALHAVSHSILTSGLCGQQLSSFPHLKPSVCPELPFPSGWQFCWGAAWFLQYNTRF	934263	936033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_934300_936000
811559	SIRV6	+	303	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	618	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCGGTTATTGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	3158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2788_2829_3106
811561	contig_1516_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_49997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	977	1432	336610	336155	NA	20	GAGGGCTTTGAGGAGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSSRKISLPSPITCSHTHPVASAFYNQGAFVKTHEEQAKNPVSPTPGDRSEASGSFSGRRLGLARQGWSSSGVGPGHGTATCSLDAAGWSSTNSSERAYCHAATLQGLRKVRGLRGESRPIEPRAAQNRNSPQEKSLLFPCSREGPTVM	337586	335451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_335500_337600
811562	contig_16204_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_154491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCATAGTGACCCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248236	247102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_247100_248200
811563	contig_2453_pilon	+	2040	13	Intergenic	novelGene_147756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_1	51.4400271081664	1	111	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	114	1904	56543	62827	TRUE	5	TTTCTGGGTTTATTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTSESRSDLTRFQAEASEEDSSLVMQTLLAVTQNLEVSEAPKASKAPEVSETLKVSNVPGVSKATEISKAQEAQEAAVTQTSPTTQLTDIQVLAAENKSPAADTKMQNADLQAVPMPATESKKVSCMADTQVNTKALETEAPASQAPTDEPEPEGAAAETQENQDTRPKVKAKKARKVKHLNGEEDGSNDQSQASGNTGGRRVSKALMASMARRASRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQEPEIPPPRDVALLQGRANDLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTAVYPEIIERAGYSLEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLRKLGLRPGVHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAATEAKARAEIRAQMGIGLGSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGGTSAGASGSSSGGFNASSSLTATFTFGLFAGLSGAGTSTNSSSGACGFSYK	54923	63154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_55008_56513_56588_56930_57423_58044_58354_58464_58529_58789_58870_59400_59496_60185_60266_60357_60401_60722_60786_61900_62016_62422_62836_63026
811565	contig_14727_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_56652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATATGTATTCTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295911	295150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_295200_295900
811566	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811567	contig_12270_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_113637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
811569	contig_9195_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_155669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACAGGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25405	24168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_24200_25400
811570	contig_3817_pilon	-	1955	7	Intergenic	novelGene_78385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	12.733376963276	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	331	930	1003106	993773	FALSE	50	AAAAGATTGTTGAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSPNPAGKRRARSPEPVDPGTGVAAAAAAAIAKDTGDVAASPAKKARAGQDEPGTPLSSPLSPEQLLRIQRNKAVALLRLASRNVPVGFGESWKKQLSQEFGKPYFIKLMGFVAEERKHHTVYPPPQQVFTWTQMCDIRDVKVVILGQDPYHGPNQAHGLCFSVQRPVPPPPSLENIYKELSTDIDGFVHPGHGDLSGWAKQGVLLLNAVLTVRAHQANSHKERGWEQFTDAVVSWLNQNSNGLVFLLWGSYAQKKGSAIDRKRHHVLQTAHPSPFSVHRGFFGCRHFSKTNELLQKSGKKPINWKEL	1005468	992747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_993914_996301_996481_998088_998178_998894_998993_1003013_1003110_1004489_1004697_1005348
811572	contig_6227_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_49696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATAGGAGATTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944804	945006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_944800_945000
811573	contig_10446_pilon	-	2753	6	Intergenic	novelGene_162523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1734	2129	1706893	1697008	TRUE	20	ACCTTTATTCTCGGGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTIGPTTGIHQKLFPAVKTSDPHPAKAVNSLGLRSRAGFMAQPLFSPKEEAMTIIRRPMTIGCRPLGTPQFLESKTAKTIITRNVVATTWSANAFARDRYEAGYVAKMCAVAFSPTVSNCPPAKDISPS	1708626	1668685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1669050_1692388_1692515_1696873_1697011_1698373_1698495_1701132_1701351_1706839
811575	contig_8628_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_164422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_2	50.8002624665136	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	495	719	430473	430697	FALSE	25	TGTGGAAAGTATGGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEGPLTKKPWLGKQGNNSQSKPGFLRKNQYTNTKLEVKKIPQELNNITKLNEHFSKFGTIVNIQVAFKGDPEAALIQYLTNEEARKAISSTEAVLNNRFIRVLWHRENNEQPALQSPTQLLLQQQQTLSHLSQQHHHLPQHLHQQQVLVAQTPPSTVHGGIQKMMNKPQTSGAYVLNKVPVKHRLGHASGNQSDAAHLLNQSGGAGEDCQVCFCEPPVYLELLNVNGFGFGNDTKKL	417367	431282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_417411_419330_419485_424952_425250_430472
811576	contig_7171_pilon	-	708	9	Intergenic	novelGene_101192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	390.48397454313	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	94	579	49603	37539	FALSE	5	GCCCTGTGTCTCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPCRLGTPSSDVSPSSNPPPSAPLCQGRAQMSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCRAYRVVRV	50401	37409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37564_37662_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_50308
811579	contig_10765_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_122953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTAGAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338421	337299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_337300_338400
811582	contig_5429_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_127775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	215	529	108501	108187	NA	30	AGTAATGTACTCCCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFILPLETEQKLNDICCGCSRRNSRFKWQVVLDALCKIPLRFYIPFRFPLPSWTVAGPAASRRQYDVGERHWQAELGSQLTLIRSVVSGKSLLARSKEMEQIG	108715	106851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_106900_108700
811583	contig_1719_pilon	-	1300	8	Intergenic	novelGene_87386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_7	268.801041664648	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	147	689	851446	848543	TRUE	55	ACATCGGAAAATGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKSAFAPFGKISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVIQFFIEHFKVSILHIYIKPLETL	853628	847163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392_851469_853348_853437_853592
811584	contig_9931_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_134825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTCATAGCAACCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310091	309538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_309500_310100
811585	contig_9053_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_87923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88314	86562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_86600_88300
811586	SIRV6	+	475	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	26	517	19	73	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
811589	contig_9435_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_156963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	264	641	384768	386855	FALSE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSANDFSQAYIFIILMPVITSFMVLILTSVKAAVLLRSDENNFPMQLCKGRRIITTAIPARHDIPISIQRRTVTAIACSGPAHRKCKNIVTLKEKDKESLGLYKSKTIKNPVWKQSGLCEQTKI	382784	386890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_383032_384751_384878_386587
811590	contig_2550_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_135651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCATCTAGTAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847653	849454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_847700_849500
811591	contig_4974_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_161401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAAGTAATTCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61461	60176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_60200_61500
811594	contig_7963_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_58528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAGCAACCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231570	230559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_230600_231600
811596	contig_8907_pilon	-	561	5	Intergenic	novelGene_85803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6559	junction_1	1762.90901282511	56190	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	106	513	179842	173397	FALSE	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179947	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391_179544_179839
811599	contig_10958_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_5343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTCGATGTCACTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609486	611029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_609500_611000
811605	contig_6576_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_42341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTACATTAATGTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682557	683065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_682600_683100
811607	contig_348_pilon	+	2000	4	Intergenic	novelGene_67625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	12.675435561221	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	874	1536	357226	357888	FALSE	15	GAATAGTGTCTGGTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLQGLLHTLSTHPPTTTPSEASPAPASSGAFCVMRHHWTPTLIPSLCADHPPCPSPGLTTYLVGPCLVTTWLPPHSQTPAHSFLCGTLRTSLQSCAFPALIQSLCFPVTLLLQGRHPGVHPARSALPQKSMLAFSPSLGPQRPIQKGSPFPPLYSPKLSPPIPAAHTLLLPLSGWMPLGYGPDALPGLVSCTQGLPAQTSSLFSHHRALSADPILGA	353066	358352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_353167_355480_355573_355804_355862_356601
811608	scaffold_19766_pilon	-	1162	6	Intergenic	novelGene_34275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	27.483813418083	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	257	964	381018	379177	FALSE	35	GTGAGAAATGTTGGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAPRDQELVGPGAPGPGSRGAAPPLGPVVPVLVFPPDLVFRADQRSGPRQLLTLYNPTGAALRFRVLCTAPAKYTVFDAEGYVKPQSCIDIVIRHVAPIPSHYDVQDRFRIELFEEGAEGRVVGRKDIPSVLRAPAYPLELQARQDSAPHPGPPAWTPPPAARHFQENAHPQLATSSFLLFLLTGIVSVAFLLLPLQDELGSQLPQVLHVSLGQKLVAAYVLGLLTMVFLRT	381617	378978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_379209_379327_379493_380094_380325_380552_380629_380813_381076_381418
811609	contig_7593_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_127333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545028	543180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_543200_545000
811610	SIRV6	+	98	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	557	225	557	137	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10794	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
811614	contig_11396_pilon	+	785	5	Intergenic	novelGene_71430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	337.803474671295	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	131	565	1782334	1789666	FALSE	25	GAGAGCGTGTTATTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRRGESAAAAHECALLRRNAGGVLGGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYFKS	1782203	1789886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787846_1787920_1789652
811615	contig_15897_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_49530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATTTCCCGCTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549291	547811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_547800_549300
811616	contig_14953_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_137282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTCTTATAAAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162200	161063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_161100_162200
811617	contig_12000_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_43199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611815	609829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_609800_611800
811618	contig_16310_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_70054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAGAACAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98662	99725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_98700_99700
811619	contig_9177_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_32817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCTCTGACTAAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650170	1648309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1648300_1650200
811621	contig_8044_pilon	-	1812	2	Intergenic	novelGene_132359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCTTCTAAAAAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236743	231655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_231990_235265
811622	contig_6589_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_25709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	274	825	3	827	431944	431120	NA	45	GTAAATGTAAAGCACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGKAFSQNRQLIRHQRIHSRAKPYECGECGKTFSRSSSLTEHQATHTSEHPFKCNECGKTFNQSTHLSEHQLVHTGEKPFKCNKCDKVFTQINYLIQHQRIHARKKPFECNECGKTFRQSSCLSKHQRVHTGKKPYKCSDCGKTFSLGAQLIRHQRVHTGEKPYVCKECGKAFSQSSCLSIHQRIHTGEKPYVCAECGKAFAQKANLTQHERIHTGEKPYACDVCGKAFGLSTHLSQHQRIHTQEKPYQCQHCQKAFRCCSGLSRHQRVHTQNK	431946	430736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_430700_431900
811623	contig_3817_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_78294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCAGGTGAAGCCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100704	98375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_98400_100700
811625	contig_6589_pilon	+	544	5	Intergenic	novelGene_26146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	45	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	23	499	1885124	1887829	FALSE	40	ACAGAAGCTTTGAGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885101	1887874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
811626	contig_4151_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_65221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAAGAAAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456198	458214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_456200_458200
811627	contig_10904_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_22509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334446	335496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_334400_335500
811629	contig_9332_pilon	-	1542	2	Intergenic	novelGene_60698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGCATGATGGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86307	38252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_39650_86162
811630	SIRV6	+	417	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	350	0	184	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
811632	contig_11378_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_112237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAACCCCAATTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331747	332748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_331700_332700
811633	contig_7912_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_129555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	1	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCTTGGGCTTCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38503	34022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_35309_37604_37644_38262
811639	contig_19677_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_125154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTTGATTCTTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51667	52066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19677_pilon_+_51700_52100
811640	contig_2323_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_151847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCTGTGATTATAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83293	82710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_82700_83300
811642	SIRV6	+	450	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	405	1	232	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1535	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
811643	contig_12270_pilon	+	339	2	Intergenic	novelGene_113274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	13839	14364	FALSE	10	TGGCACCATCTTGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTGT	13838	14400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
811644	contig_12635_pilon	-	1269	9	Intergenic	novelGene_60818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	463.880035677329	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	91	1266	252849	180251	FALSE	35	CAGGAGAAAATCTACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLKFSAFVSNISFVAFPAPNTNSPTKILPKTLGPINVNVGPQMIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	252939	180247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_252818
811645	contig_4059_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_140594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTCTAGTAAGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398147	397568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_397600_398100
811646	contig_10986_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_71489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGTTACTGCTTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70162	69402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_69400_70200
811654	contig_10196_pilon	-	942	8	Intergenic	novelGene_132237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.910345097551	157	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	145	621	1442405	1433608	TRUE	5	GGTTTTGGTTGCGTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448658	1433071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433297_1433511_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
811655	contig_15952_pilon	+	1276	3	Intergenic	novelGene_154039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	42	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	174	602	63396	64001	FALSE	15	AAGGCCTGGGCTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGPSLEAASWGTRRLPSQLPKGPRRKQQQQRRRRRGRTEVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQVMPHAPRWCAGLGPVKERVVTPGLTGTSQLPNPTGRSHAAVPAH	62241	64675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_63344_63519_63695
811661	contig_7095_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_166462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAAACCAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477580	476958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_477000_477600
811662	contig_9706_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_20811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2064	1783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1800_2100
811664	contig_10196_pilon	-	2559	21	Intergenic	novelGene_132083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_15	17.8753321647459	4	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	44	2539	901296	895099	FALSE	5	CCTCCCTGTGTCTTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDSSGSDGVRGGGNMAETAAGVSRFKANYAIERKIEPFYKGGKVQLDQAGQHLFCVCGTRVNVLEVASGAVLRSLEQEDQEDITAFDLSPDDEVLVTASRALLLAQWAWREGSVTRLWKAVHTAPVATMAFDPTSTLLATGGCDGAVRIWDIVRHYGTHHLRGSAGVVRLVAFHPDPARLLLFSSAADAAIRVWSLQDRSCLAVLTAHYSAVTSLVFSADGHTMLSSGRDKICVVWDLQSHRAVKTVPVFESVEAAVLLPEELAPELGVKSPPGLHFLTAGSQGSLRVWEVASGQCVYTQPRLTGPGQELTHCALARAAGLLLSVTADHNLLLYEAHSLQLRKQFAGYSEEVLDVRFLGPEDSHVVVASNSPCLKIFELQTSTCQILHGHTDIVLALDVFRKGWLFASCAKDQSVRIWRMNKAGEVACVALGSGHTHSVGTVCCSRLKESFLVTGSQDCTVKVWPLPEGLLSRTTAPSGGPVLLQAQATQRCHDKDINSVAIAPNDKLLATGSQDRTAKLWALPQCQLLGVFSGHRRGLWSVQFSPMDQVLATASADGTIKLWALQDFSCLKTFEGHDASVLKVAFVSRGTQLLSSGSDGLLKLWTIKNNECVRTLDAHEDKVWGLHCSRLDHHALTGGSDSRVILWKDVTEEEQAEEQAKREEQVVKQQELDNLLHERRYLQALGLAISLDRPHTVLTVIQAIRRDPEACEKLEATVLQLRRDQKEALLRFCVTWNTNSRHCHEAQAVLGVFLQHEAPEELLAYEGMRATLEALLPYTGAWHGLGWAEQAPGPGDLLTHLCTPPERHFQRLSRTLQAATFLDFLWHNMKLSPVPAGPPGPLSRS	901339	895078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_895458_895535_895608_895747_895852_896068_896128_896195_896353_896441_896513_896579_896811_896897_897046_897404_897509_897608_897668_897747_897890_898017_898200_898292_898390_898460_898537_898622_898794_898878_898964_899054_899197_899304_899353_899434_899531_899619_899672_901255
811665	contig_15952_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_154036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_4	42.7865340966057	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	215	823	63396	64518	FALSE	20	ACACCGCTCCCAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQGARRVATAGHAPLGPSLEAASWGTRRLPSQLPKGPRRKQQQQRRRRRGRTEVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVHPSHYPEIRRLFPRAQMQTVLNAGHWIHADRPQDFMAAIQGFLA	62200	64664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_63344_63519_63695_63867_63969_64152_64385
811669	contig_10135_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_106663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTCATTCATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119178	120168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_119196_119619_119641_119801
811670	SIRV5	+	250	3	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	7	1452	6	-252	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACACGCGAGTAAAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	2146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1925_2034_2119
811671	SIRV7	-	381	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	1	-32	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
811676	contig_16666_pilon	-	1253	3	Intergenic	novelGene_61753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	5	313	59688	56040	FALSE	10	TCATACCTTGTCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNGKTR	59692	55099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_58085_58258_59552
811678	contig_11823_pilon	+	1338	2	Intergenic	novelGene_171021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_1	0	218	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAAATCTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29231	31149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_29481_30060
811679	contig_11416_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_145367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	661	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	170	535	569053	569418	NA	25	CTCCCTTTTAATGTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSPHGADTRPASPHGADGRPASPHGEDTRPASPHGADTRPDSSNNFISWALVQASCGSWLGLLPWDASANGAESSVSSQGRVTAEQLRTRQGQEFTAWALSGAGTVLSRAHAAGCWGTP	568883	570032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_568900_570000
811680	contig_19769_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_102313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	25	480	87859	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87297	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87306_87842_88040_88841_88958_89163
811682	contig_10973_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_150329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTAGGTCGGTGCCGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177	545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_200_500
811684	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
811685	contig_21388_pilon	-	615	5	Intergenic	novelGene_136637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	788.967996816094	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	32	610	28487	21424	FALSE	30	AAAAACCGGTGGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRRTPFSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVLASDGADPRPTFHRPSFVTNSCQH	28518	21418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21502_22340_22499_26756_26851_27534_27649_28352
811688	contig_10734_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_51069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTAGCATTGTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455652	456147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_455700_456100
811690	contig_9121_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_134437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCTCAAATATAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73822	73112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_73100_73800
811691	contig_13428_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_143451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAACCATGTAAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93838	91971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_92000_93800
811692	contig_9995_pilon	-	861	2	Intergenic	novelGene_47687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGTGGTCTTACGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289028	275216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_275775_288725
811693	contig_5903_pilon	+	1383	7	Intergenic	novelGene_173230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_5	16.2241246981839	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	197	949	528015	534211	FALSE	15	ATATGTGGGGGCTGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGIEAKLSVKFTSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKETVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPATPGQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV	527818	534645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_+_528024_529093_529204_530784_530925_531973_532109_533014_533121_533546_533710_534121
811694	contig_10855_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_124362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAATATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692400	690535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_690500_692400
811695	contig_5954_pilon	+	936	4	Intergenic	novelGene_28570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	27.3536509852382	387	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	69	572	889079	899818	FALSE	5	CGCCGAGTGTCCTCTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLEGDCRPGSRGPRARAWAQSMFQIPEFEQSDREDSSPADRCLGPSPKRGRPSGPRNRHHASPGPLGDASHQQGQPTSSSHHGGADTVETRSRHSSYPVGSEEGEGLEDEPSPFRGRSLSAPPNLWAAQRYGRELRRMSDEFEGSFKGLPRPKSAGTATQMRQSPSWTRIIQSWWDRNLGRGGSAPSQ	888737	900182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_888798_889070_889266_897858_898050_899692
811696	SIRV5	+	428	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2310_3290_3405_3483
811699	contig_12528_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_81366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCCCCATCTGTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056134	1057828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1056213_1056336
811700	contig_12724_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_146876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAACAAATAGCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501860	504029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_501900_504000
811701	contig_17066_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_130943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	251	325	75221	75147	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEREESERQRRNLVKGRQPAIVSEGRDARSYDECKLKRPSETRQQKHSDRDSAVDTESSSRELQGSWLRSGYSWGTEVDNNVGMGEARLTLGYLPGLPMETRAQPGQ	75471	75003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_75000_75500
811702	contig_10058_pilon	+	1408	9	Intergenic	novelGene_67671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_2	362.764881672689	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	61	450	31601	39923	TRUE	25	ACCTCTATCCTCAATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGRGLGGQRWLGQSPGAPAMKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRSLRQTGSQTCVGMFTSRTFTVSPPCARPISENCQTPCSLTGSMTSLLRLWQCRWSLSAWSRS	31540	42991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38861_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41822_41898_41977_42737
811703	contig_7870_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_109017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATGGCATAAGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541353	542956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_541400_543000
811704	SIRV4	-	449	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	165	3	-165	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCAACTGTAGCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
811709	SIRV6	+	267	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	110	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3133	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
811710	contig_4131_pilon	+	589	2	Intergenic	novelGene_127885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1369	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	240756	241064	TRUE	10	GTTTATTTCTTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240755	248860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248714
811712	contig_14868_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_150443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGAAAAAAGAAATAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124124	122961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_123000_124100
811714	contig_9437_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_141747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATAAAGAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534952	533902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_533900_535000
811715	contig_3155_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_26340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAGACGGGAGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123563	124381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_123600_124400
811717	SIRV6	+	323	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	10	374	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811718	contig_8617_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_73439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62450	62037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62400
811719	SIRV1	+	189	1	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTACGGTAGGAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6558	6747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6600_6700
811724	contig_10331_pilon	+	1384	2	Intergenic	novelGene_54184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	32	316	604724	605125	FALSE	15	TGAACTTCCACGTTTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSGTRKCGFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKVSHWIL	604692	606193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929
811727	SIRV6	+	150	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-315	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1970	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2000_2100
811728	contig_4891_pilon	-	917	5	Intergenic	novelGene_124586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	197.122423889318	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	79	405	964296	940000	TRUE	20	TTTTCTGACCATTGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964374	928398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_928875_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
811729	contig_4857_pilon	-	1159	3	Intergenic	novelGene_48837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATCCTAAGAACAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410865	1331394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1405451_1405567_1409976
811730	contig_5229_pilon	-	1986	18	Intergenic	novelGene_117684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	35.9361217202226	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	7	1566	455049	371213	TRUE	0	TGTGTGCTCTGCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALWRRGWRFRWRAPAAAGRVRGAAGAAAAGQRNYDLLVIGGGSGGLACAKEAAQLGRKVAVADYVDPSPRGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGGLIRDAQHYGWEVTHPIPHNWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVDYFNIKASFVNEHTVCGVTKGGKETLLSADHIVIATGGRPKYPMHVEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALECAGFLSGMGLDTTVMIRSIPLRGFDQQMASLVTEHMASHGTQFLRGCTPLQVRRLPDGHLQVTWEDRASGRQDTGTFDTVLWAVGRAPETRSLNLEKAGVNTNPDNQKIVVDAREATSVPHIYAIGDVAEGRPELTPTAIMAGKLLAQRLFGQSLDLMEYDNVPTTVFTPLEYGCVGLSEEEAVARHGQEHVEVYHAYYKPLEFTVAERDSSQCYIKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNAGEVTQGFALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCAEEVAKLRISKRSGLDPTVTGC	455055	369825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_370147_371113_371337_374365_374464_374779_374852_376983_377077_377707_377804_381475_381613_396235_396411_399927_400020_400687_400708_409295_409367_419509_419573_420299_420379_422209_422285_423211_423357_423736_423794_450729_450799_454955
811731	contig_5718_pilon	+	1153	3	Intergenic	novelGene_110428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	428	junction_1	263	145	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	460	1056	1536654	1537774	TRUE	30	TGACTCCATGGAATGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNVRVSNGSPSLERMDARQAEYPKPSACRNLFGPVNHEELTRDLEKHCRDMEEASQRKWNFDFQNHKPLEGKYEWQEMEKGSLPEFYHRPPRPPKGACKVPTQESQDVSANRQAVPLIGSQANSEDTHLVDPKTDTADSQTGLAEQCAGVRKRPAADDSSTQNKRANRTEENVSEGSPNAGSVEQTPKKPGLRRRQT	1536194	1539971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1537129_1537652_1537783_1539882
811735	contig_5566_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_153651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_3	72.8631594154412	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	146	1603	176330	164772	FALSE	30	TTAGCAAGACATGTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGGSRIIRRVSLRKRNRPSLGSVCAAPAAAELKPGNVEDEEMVAGSRRRKTVGVQPVEYDSEEDMFGDYDSFTENSFLAQVDDLEQKYMQLPEHRKHDTDLAIEDLCSESIKDSKLNITTVDNFTALKTDEPTKNQCGQEDVAIEPGTDLLYDVPSSQVLYFENLQNSSNDWGNQFTKEKDWNSSSHQTVNEELSHSCIEQPQQNDQSSSEVRTSSDTTRRKSLKDHLKSTMTGNAKAQTPVFSKTKQLKESLLSEEINVAKKTLESSSDDRGPFYSLPSKVRDLYVQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCRRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSTFGMELGFFVEEYAGSKGRFPPVKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETERISNLGLVVVDELHMIGAGSRGAVLEMTLAKILYTNKTTQIIGMSATLNNVEDLQEFLQAEYYTNQFRPVCT	176475	164443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_164882_167749_167823_168362_168564_169131_169311_173166_173882_176150
811736	contig_5588_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_172837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGGACTTTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950653	951991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_+_950700_952000
811737	contig_16464_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_175956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTGATTTTAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663	1263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16464_pilon_-_1300_1700
811738	contig_13461_pilon	+	1446	2	Intergenic	novelGene_146603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	216	536	45659	49850	FALSE	60	ATCCCTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYRRLLMSRVVPGQFDDADSSDSENIDFKTIKEEDGVPLEDLLNKGEDEIEEEEEEDYDDDDDWDWDDGVGKLTKGYASNRGNNPQVFYKWSYTSLGCLLCLFFL	45443	50760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_45730_49600
811741	contig_9133_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_109303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCCGGGAACACGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268119	267670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_267700_268100
811743	contig_4812_pilon	-	296	4	Intergenic	novelGene_103678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3455.89477077452	4	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTCATTTATTTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82707	79129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79140_81635_81739_82268_82343_82598
811744	contig_9799_pilon	+	1615	10	Intergenic	novelGene_145576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_8	7.08327886689299	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	19	1281	1196390	1235529	FALSE	30	CTTTAATCAAAATTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWELPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLTTLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKFTAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVIVIEGESKVMSSRFLPYDNIVTDAILSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYTHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL	1196371	1235863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1196468_1198282_1198391_1204046_1204167_1212175_1212309_1215133_1215253_1216375_1216472_1221021_1221112_1227355_1227517_1230744_1230917_1235343
811745	contig_10002_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_157658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCACGGACAACAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414979	416426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_415000_416400
811746	contig_13740_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_34719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGCTGTTACGCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163325	164480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_163300_164500
811749	contig_12799_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_173286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAGAAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152749	152142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_-_152100_152700
811750	contig_10667_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_137326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	920	1399	294485	294006	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGQLSIWQDPIHCLSFAALLLVPVSFLCPRVGPSKGLPLMRLPPLLAALGLGDVTQLVSPTPHFSTVRSPPRRHGQRDQMHWSKASCPQQSPRMLGVGNVPRHPLGRAGRLSLLHPEGCPRPYSRVSASARTAHSSLCAPILACFSPEKRQGGQTKS	295404	293206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_293200_295400
811752	contig_6902_pilon	-	978	2	Intergenic	novelGene_135609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAGTAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528885	526526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_527423_528803
811753	contig_6842_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_130647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194105	193246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_193200_194100
811754	contig_11416_pilon	-	674	2	Intergenic	novelGene_145340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1097	junction_1	0	1705	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAACGCCCGTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124643	122802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_123404_124570
811755	contig_13028_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_175959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	606	1172	11637	12203	NA	25	ATTATTTGGAACTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHPVASSNPAFCGPGKPSCLSEEAMRAADQFDIYSSQQSKYNHTVSHKPMACQRQDPLNETHLQTTSGRSIEIKDELKKKKNLNRSGKRGRPSGTTKSAGYRTSTGRPLGTTKAAGFKTSPGRPLGTTKAAGYKVSPGRPPGSIKALSRLADLGYGCGTAAFPYPMMHGRVVHGVEETSNEVKPPSE	11031	13090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13028_pilon_+_11000_13100
811756	contig_15866_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_63639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACAGGATCACAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463907	462753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_462800_463900
811758	contig_5084_pilon	-	1545	5	Intergenic	novelGene_64488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.9728423152472	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	210	1178	95355	89840	FALSE	10	TGAACCCGTGTTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPASPDAGFPFVSRTGKTNDFTKIKGWRGKFHSASAARSEGGNSEGSLKNRSAFCSDKLDEYLENEGKLMETSMDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQASLKTKPIHTIIRKRAPPCNNDFCRLGCVCSSLALEKRQPAHCRRPDCMFGCTCLKRKVVLVKGGSKTKHFQRKAVHRDAVVYDALGEEPREEGEEGGREEEELLKEKKKRKKLEYRRSFGSLTLNQIHPL	97166	89472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_89887_93274_93624_94782_95442_96630_96736_97148
811759	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	6	337	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811764	contig_5122_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_175961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTGACAAGACCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89683	87937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5122_pilon_-_87900_89700
811766	contig_18420_pilon	-	1529	9	Intergenic	novelGene_109365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460.191807836689	2	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	88	750	142813	111132	TRUE	10	AGTGGCCTTGTGACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLRRPQVPPRLARCRPGVPASLRPGSGKMTLKASEGEGGGGMRTALSDLYLEHLLQKRSRPEKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYDTATQEG	142900	108949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109549_110723_110774_111001_111160_112319_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_142711
811770	contig_4469_pilon	+	1742	12	Intergenic	novelGene_21879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	119.710118188456	32	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	208	1182	224138	376733	FALSE	25	CAATGACTGGGTACTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKMSSFLHIGDICSLYAEGSTNGFISTLGLVDDRCVVQPEAGDLNNPPKKFRDCLFKLCPMNRYSAQKQFWKAAKPGANSTTDAVLLNKLHHAADLEKKQNETENRKLLGTVIQYGNVIQLLHLKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVTLDEAGNEGSWFYIQPFYKLRSIGDSVVIGDKVVLNPVNAGQPLHASSHQLVDNPGCNEVNSVNCNTSWKIVLFMKWSDNKDDILKGGDVVRLFHAEQEKFLTCDEHRKKQHVFLRTTGRQSATSATSSKALWEVEVVQHDPCRGGAGYWNSLFRFKHLATGHYLAAEGCRNQRN	193201	377293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_193317_194149_194226_224121_224230_228130_228202_355200_355317_365421_365509_367846_368006_369951_370051_371164_371249_371355_371503_375928_376025_376709
811772	contig_7426_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_27567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGGTAGGTGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217537	1216409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1216400_1217500
811773	contig_5988_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_15903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGCTGTACCTCTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583747	584653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_583700_584700
811774	contig_11720_pilon	-	1685	12	Intergenic	novelGene_43881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84.2164664607848	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	485	1330	110844	108190	TRUE	30	CAGAGACATGTATGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKVVGVFRPETVASQPSLGEGEESESNSVESLGFCSVMPLAAVGYLDGTLAIYDLSTQTLRHQCQHQSGIVQLLWEAGTAVVYTCSLDGIVRLWDARTGRLLTDYRGHTAEILDFALSKDASLVVTTSGDHKAKVFCVQRPDR	113312	107784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_107956_108005_108266_108866_109022_109209_109301_109506_109611_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112683_113170
811775	contig_20378_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_159563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATGTATAAAACACAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17685	16765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_16800_17700
811777	contig_5084_pilon	-	1840	1	Intergenic	novelGene_64650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAGAACTTGTGTGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444949	1443109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1443100_1444900
811782	contig_9054_pilon	+	1646	9	Intergenic	novelGene_160673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_7	62.4538579673025	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	249	1403	426380	489660	TRUE	15	GTGGGTACACAGTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFYPAVEGTLCLTGHHLILSSRQDNTEELWLLHSNIDAIDKRFVGSLGTIIIKCKDFRIIQLDIPGMEECLNIASSIEALSTLDSITLMYPFFYRPMFEVVEDGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYINKEFAVCLSYPPIVIVPNSIDDEAVRKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDEKLINATLRAGKRGYIIDTRSLNVAQQARAKGGGFEQEAHYPQWRRIHKSIERYHILQESLIKLVEACNDQTHSMDRWLSKLETSNWLTHIKEILTTACLAAQCIDREAASVLIHGTEGTDSTLQVTSLAQIILEPRSRTIHGFEALIEREWLQDNCSSYNHWWHSG	426131	490260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_426562_441717_441827_461791_461918_470405_470580_473074_473293_474378_474541_479481_479624_489618_489683_490039
811783	contig_6599_pilon	-	884	3	Intergenic	novelGene_175963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGAACTTTGAAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	260447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260593_260688_261309_262599
811784	contig_7594_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_55444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATAAATACAGAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557062	556295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_556300_557100
811785	contig_11978_pilon	+	675	5	Intergenic	novelGene_62992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	390.008573623709	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	122	598	1517714	1527267	FALSE	5	CCTACTGCTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPDMDPEHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD	1517261	1527344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683_1517869_1523599_1523778_1526094_1526190_1527218
811787	contig_15570_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_137867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAGATTAGGGAAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737629	738974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_737600_739000
811789	SIRV1	-	176	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3928	0	3654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
811791	contig_12157_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_135920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	728	1222	214455	213961	NA	70	CCAAAAAAAGGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPVSESVVKREKLEDKDGLKEKVWTESSSDDLRSVTWRGAEILRGSPSYTQASLGLLTPVSGTQEQTKTLRDSPNVEAAHLARPIYGLAVETKGFLQGVPAGGEKSGALTQQYPASGESKSKDESQSLLRVGRFNFLNNFYILKGKWSTHFLDLVLHFLKGN	215182	213553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_213600_215200
811793	contig_1380_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_138872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACAGGGACCCCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66404	64804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_64800_66400
811794	contig_15974_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_164820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	289	405	321065	321181	NA	40	CATGAAGCTTAATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETPSRPFPTAVGSADQDVGDGRFLGGCCRGGGGLRARPTQLSFPSAPLPAPRRGDRGDRLGRGGRKEKHSLWVLQDCCDNTLPRVSVGKGKNRTLKMGTQKGLSFDHSPSLPLRLPVVSISHCVFTGEPSHILI	320776	323082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_320800_323100
811796	contig_5499_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_57035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATAATAACAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574790	1576205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1574800_1576200
811797	contig_10140_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_148411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAGTGGAAGAGTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234211	233577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_233600_234200
811799	SIRV6	+	399	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	451	6	278	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTATCTGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581	2534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
811800	contig_12250_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_80527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACCAATGGCCCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107606	107396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_107400_107600
811801	contig_11396_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_71245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.628983469984	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	250	765	88067	90215	FALSE	15	AAGTCTCTCTTCTGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDAAPPAVPAAPGRNPCCLCWCCCCSCSWNEERRRAWWTSRETKLQPLPTGRNVFREFLRTEYSEENMLFWLACEELKAEANKHVVDEKARLIYEDYVSILSPKEVSLDSRVREGINKRMQEPSAHTFDDAQLQIYTLMHRDSYPRFLGSPVYRALLLHGSTPSFSEA	85256	90739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_85470_88030_88162_89479_89542_89769_89937_90023
811803	SIRV6	+	216	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	314	1	83	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2599	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
811804	contig_20641_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_52881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAATTGATTGTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69125	67214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_67200_69100
811805	contig_7272_pilon	+	1872	3	Intergenic	novelGene_25401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	65	301	772576	772812	TRUE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKDLQPWKPYGDSSTLSYRVAMNRIGPDGSGFGLIEMEDCQHMSYFPCLRPSRQEPACPSIPVNAVLQAATTSGSELAQAMKTFTFSDQKGIFNGKTNT	772511	776943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_774192_776592_776753_776911
811806	contig_12427_pilon	+	1222	6	Intergenic	novelGene_40598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_1	308.466789136205	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	99	983	644824	656818	FALSE	35	AAAATTTTCAGTAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILPAAAQDVYYRDEIGNVSTSHLLVLDDSVEMEIRPRFPLFGGWKTHYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALKMRFVDHVFDEQVIDSLTVKIILPEGAKNIQVDSPYEISRAPDELHYTYLDTFGRPVIVAYKKNLVEQQIQDIVVHYTFNKVLMLQEPLLVVAAFYILFFTVIIYVRLDFSITKDPAAEARMKVACITEQVLTLVNKRIGLYRHFDETVNRYKQSRDVSTLNSGKKSLETEHKALTSEIALLQSRLKTEGSDLCDKVSEMQKLDGQVKELVLKSAVEAERLVAGKLKKDTYIENEKLISGKRQELVTKIDHILDAL	644725	657057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_644921_649146_649247_650460_650600_650876_650997_655080_655327_656635
811810	contig_4964_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_157264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATAGTTGTTAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173687	174106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_173700_174100
811812	contig_14322_pilon	+	381	2	Intergenic	novelGene_116447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	144	238	381	671606	671905	FALSE	15	GAAGCCGGGCCCGCGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLFAQLQHADTPRREGQPDTLRPPAADTVDSTVTGTASHGVGGLLQTAGQGRPLLLLRGVSLKHVDHEAGVGSLGDKGMPRSHNLKAQKAEGTEQCGSVISVLVEANEDVVHVELLLGKLKDNCEA	671368	671905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_671664_671819
811813	contig_10437_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_38245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375526	377479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_375500_377500
811818	SIRV6	+	228	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	262	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCTTACAAATGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780
811820	contig_5569_pilon	+	1512	7	Intergenic	novelGene_86716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_5	45.5390552773721	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	28	1053	39917	63783	FALSE	10	AGGCTGTGACTCTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVSGAAAAVMAEAALDAVRRALREFPAAARELSVPLAVPYLDEPPTPLHFYRDWVCPNRPCIIRNALQHWPALQKWSLPYLRWAVLGWGGGWCFVASGHGLSVPSSRATVGSTEVSVAVTPDGYADAVRGDRFVMPAERRLPLSSVLDVLEGRTQHPGVLYVQKQCSNLQTELPQLLPDLEPHVPWASEALGKMPDAVNFWLGEAAAVTSLHKDHYENLYCVVSGEKHFLLHPPSDRPFIPYELYTPAIFQLTEEGTFKVVDEEAVEKVPWIPLDPLAPDLARYPGYRRAQALRCTVQAGEMLYLPALWFHHVQQSHGCIAVNFWYDMEYDLRYSYFQLLDSLTKASGLN	39889	64242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_39981_61025_61509_61913_61971_62797_62894_63097_63175_63416_63577_63694
811824	contig_6929_pilon	+	1554	2	Intergenic	novelGene_139442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	67	897	300889	301719	FALSE	15	GGACTCGTGTACTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSFPGRPRQRCPRPSRGSEGSEMGSEKEQNPEQHLPEEGQLGKPWRVDDSDGEKEDKQESLSDRLQGSDLKPWGKVTPAVESGGLIARPRPQVDEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYKCTLCGKHFSRSSNLIRHQKTHMGEQTGKDFS	297929	302376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_297987_300879
811825	contig_3822_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_133293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTTTTTCGATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259989	259345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_259300_260000
811827	contig_13244_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_86916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCATCCTATCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184352	183594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_183600_184400
811828	contig_13244_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_86915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGTACTTTTCTGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183643	183320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_183300_183600
811829	contig_6914_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_151760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAACTTGTATCTAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310693	310509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_310500_310700
811833	contig_10861_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_39407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGCAAATATAACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1919997	1922052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1920000_1922100
811835	contig_15384_pilon	-	2330	20	Intergenic	novelGene_85138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.0110374385368	1	146	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	21	1082	127943	123227	TRUE	5	GCCTGGTTCTCGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGQAVTMDRQVLLNEPEEAAALYRGLSRQPALSAACLGPEVTTQYGGLYRTVHTEWTQRDLERMENIRFCRQYLVFHDGDSVVFAGPAGSSVETRGELLSRESPSGSMKAVLRKAGGTGPGEEKQFLEVWEKNRKLKSFNLSALEKHGPVYEDDCFGCLSWSHSETHLLYVAEKKRPKTESFFQTKALDVSASEDEMARLKKPDQAIKGDQFVFYEDWGENMVSKSTPVLCVLDVESGNISVLEGVPENVSPGQAFWAPGDMGVVFVGWWHEPFRLGIRFCTNRSASLLMLMFPSGPELLSDDTLAVSSPRLSPDQCRIVYLKYPSLVPHHQCSQLCMVSWRRLLRDLLQPAASGVLVG	127963	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_119045_119135_119243_119327_119431_119544_119740_119849_119939_120301_120383_120461_120546_121025_121165_121578_121668_122514_122567_123183_123282_124736_124908_125573_125666_125761_125900_126060_126225_126313_126390_126488_126583_127000_127128_127723_127857_127931
811837	contig_8100_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_176004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACGACTTCTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378485	379851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_+_378500_379900
811839	contig_4364_pilon	+	1082	8	Intergenic	novelGene_187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	932.253775557287	10	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	67	729	1268714	1270358	TRUE	25	CCAAAGGAGCCAGTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEDPPPCIPAPSCRPQPPLWSSWSASCCCFCLCCGPGGPGHTSLSVPRFLPAFWPEGGMGCHRCSVPL	1267039	1271068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1269887_1270159_1270591_1270947
811841	contig_10861_pilon	-	307	3	Intergenic	novelGene_39368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3034	junction_1	897	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2	307	1584595	1582712	FALSE	30	GTGGTATGAATATTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFY	1584596	1582711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1582841_1583241_1583349_1584525
811842	contig_7963_pilon	+	1629	9	Intergenic	novelGene_58584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.332678905588	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	134	1393	264138	269915	FALSE	35	TTTTCATTATTACATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	259770	270151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259900_264133_264231_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
811843	SIRV6	+	309	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	24	374	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
811844	contig_10003_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_88190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACATGCCTCACTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463860	465379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_463900_465400
811846	contig_5084_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_64469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGCTTAAAAAAAATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43864	42986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_43000_43900
811847	contig_3948_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_53166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCAGCTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233732	232281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_232300_233700
811848	contig_7057_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_123277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	554	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	121	561	705764	707670	FALSE	20	GAGGAAGTCTGAGGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSRRQAVGCCGLGSSVILPLCVEITVDIRPRTLELLVRRLRLVHALFPAHCLRSPAFLRDQPSQRIHRQGDEERQQQVPQHNPSQHARAHAEPEAGGRCRRPQLTTGSQKESQKQQSTGGSDAPHVAGDAAGHQSEGHWMWLCV	705643	707680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_705874_706663_706712_706884_707004_707506
811849	contig_6710_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_89138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653668	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
811850	contig_5947_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_101600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAACTGCTCTGCCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926210	924884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_924900_926200
811851	contig_5947_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_101599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAGCCAGGACTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924859	924382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_924400_924900
811854	contig_13245_pilon	-	508	4	Intergenic	novelGene_148825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	16652	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	117	476	26752	25454	FALSE	25	GTAAATTTTGTTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26868	25421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
811855	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
811858	contig_6839_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_161875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286550	283894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_-_283900_286600
811859	contig_3975_pilon	+	1785	7	Intergenic	novelGene_54682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	91.7122613879349	33	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	52	1023	1047959	1058772	TRUE	20	GTAAAACCCGTTTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGQGIVHALTDLSSPGMTSGNGNSASSITGTAPQNGENKPPQAIVKPQILTHVIEGFVIQEGAEPFPVGRSSLLVGNLKKKYAQGFLPEKLPQQDHTTTTDSEMEEPYLQESKEEGTPLKLKCELCGRVDFAYKFKRSKRFCSMACAKRYNVGCTKRVGLFHSDRSKLQKAGATTHNRRRASKASLPTLTKDTKKQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQSQRDLELPDMHMRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKLGPALKIYARISMLKDS	1047907	1060060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1048112_1049809_1049940_1050847_1050963_1052559_1052702_1053672_1053950_1058617_1059464_1059989
811861	contig_8674_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_102943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTATTTTTACCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527280	528323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_527300_528300
811862	contig_1009_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_121739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGGCTGTGTTCATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186738	188094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_186700_188100
811864	contig_7695_pilon	-	1136	2	Intergenic	novelGene_41656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAACTTTCCATCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863367	856381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_857280_863129
811865	contig_11989_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_68454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79986	78620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_78600_80000
811866	contig_9144_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_151145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779901	781934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_779900_781900
811870	contig_15323_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_148533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTCATTGAATTAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144896	146774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_144900_146800
811874	SIRV4	-	419	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1104	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
811875	contig_2987_pilon	+	1171	6	Intergenic	novelGene_125848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	31.0444842121753	108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	658	966	506398	507623	FALSE	5	TTCTCTATCTTTTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIIGNSFRGLEERLLTRILQKNYPYIAKIFKGLEELEFPQTPQYTDIFNDTSVHWFPAQKLKQLSADTWVFREEPDYQDCEDLEIIRKKTEDPSAGDSSSL	499423	507828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_499599_503481_503751_503855_503955_506283_506439_506936_506983_507401
811876	contig_8964_pilon	-	985	6	Intergenic	novelGene_168710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	54.9741757555309	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAATGTCTGATTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549472	543127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543276_543392_543520_547370_547457_547844_548009_548900_549323_549434
811878	contig_6710_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_94872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653781	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
811879	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	507	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
811880	contig_9679_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_173410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50479	52184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_50500_52200
811881	contig_14445_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_137380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTAAGGAGGGTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346785	346484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_346500_346800
811882	contig_7775_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_37457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGCTGACTTTCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53389	54887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_53400_54900
811883	contig_15530_pilon	-	2245	13	Intergenic	novelGene_176009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_11	11.9475125258589	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2154	90	2243	271009	210681	FALSE	65	GTCAATGAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRELKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLIKAVHWCHKNDIVHRDIKPENLLISRNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSPELLLGAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFYSNPHFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSTKRKPYHVESSTLSNRNQASKSAALQSHHRSNSKDIHNLSVGLSRADEGLPANESFLDGNLAGATLSPMHSKTYQASNQPGSASKDLTNNNMPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKPSEGPGTKYLKSSSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPSEKQSRHSYIDTIPQSSRSPAYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARGQMAESNTSRYFLSSCLDLNSPTSPTPTRHSDTRTLLSPSGRNNRSEGTLDSRRTTTRHSKTMEELKLPEHMDSSHSYSLCTPHESFSYGLGYTSPFSSQQRPHRHSMYVTRDKVRAKGLDGSLSIGQGMAARANSLQLLSPQPGEQHPPEMTVARSLVKESSREGASSFHSRQKSEGGVYHDPHSDDGTAPKENRYMYNDPVPRRVGSFYRVPSPRPDNSFHENNVSTRVSSLPSESGSGTNHTKRQTAFDPWKSPETLGHSEQVKEKEKQGFL	284416	210678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15530_pilon_-_210745_221666_221791_224397_224504_224791_224894_228590_229558_232385_232538_237823_237905_245351_245542_253791_253883_256953_257014_258764_258886_270913_271051_284368
811884	contig_4732_pilon	-	1314	3	Intergenic	novelGene_75456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.5	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	67	1311	684664	676230	FALSE	5	GTGAGCCCTGCTTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEHQDFWSLQAKFQASQPEPSEFPKKPPKLEFNKLPKKFPQPESGEHPKKPSQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKASQPEFSAGPKKFPPLEACPFPKKHEFSAGPKKASQPEFNAGPKKASQPEFSAGPKKFPPLEACPFPKKPEFSEAPQKPLQPEPSNPTRLPSEPKFSALPRKPWPPESSEATLKPPQLEVGTFSKKPPQPESGVHPWKPLLQPELSEAPQTPPLRPEPSEPHPHPSKPELGAFPKKGLQPQLGNCPRKSPEPKFSDLTRTASDPKFGVFPKKPQQPERQALLKKTPQAELGTLPRTSSEPEVNLLPSKFLQPEGHRPSHSFSQHDAGSLPKTNPATVTAGPQFSSRRCPGSSGHSVTDHIKLL	684730	676226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_676333_681091_682231_684661
811885	contig_9097_pilon	-	1267	2	Intergenic	novelGene_173581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	298	1266	213211	212243	FALSE	55	AACTTAAACAGGAACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNREPRPPSYTISVVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYLEHTSVLSTIDFGGRVVNNDHFLYWGDITQNGEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAAATKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLSVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFVNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNVETCFTALVQMLDKTRGKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNHPDYEEYINLEGTKKARNAFSKHIE	231224	212241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_213383_231098
811886	contig_8650_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_162617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAGACAGGTAGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100503	100854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_100500_100900
811887	SIRV7	+	383	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTCACTATGTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841_78963_114679
811889	contig_9406_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_136162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	873	1424	47152	47703	NA	30	CTACTCCCAATATCATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKPKNPAGVRSLCTARRHQGRRHSCIKQLGWLFCIYSGGQEKGRWTMRAEAAAVFQSAPPHATKRRALLPLQLWGWLEAGTVLLLTLISTASHAAEPGGTRVRSGLQATSVSPGERHLCWTAVPLHHQGGPSTATGRRCYYYRLARKVSQHSPALQGQGLRKPSLRPQCTAWCLVHGRCLTW	46279	47987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_46300_48000
811890	contig_19974_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_130461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTCTGATATGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127102	128151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_127100_128200
811891	contig_19974_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_130462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTACTACTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128238	128480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_128200_128500
811897	contig_7234_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_145940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	371	706	422681	422346	NA	75	AGAAAAAAATTATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLYTFHCHPHNLLWTGFCTTVVAVARVPVLSVLFNLISSLCHSVIMDSAFSLKLAIEELLLFSYTLQRLLQVKNILPYHFKLFRYGPVSWVGISFRDLILAQFCVLHMSF	423051	421605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_421600_423100
811898	contig_5408_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_173963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATGGTTAGCAGATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36800	35955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5408_pilon_-_36000_36800
811899	contig_9706_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_20962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTAAGAAATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310238	308833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_308800_310200
811902	SIRV4	-	234	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1284	3	1284	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
811903	contig_5602_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_133036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGAAATATAGGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585882	585233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_585200_585900
811907	contig_1143_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_86577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTAAAATGATAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101705	102967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_101700_103000
811908	contig_6215_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_21238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCCGCACACATAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572722	573508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_572700_573500
811909	contig_4519_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_123646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAACACTTAATTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10902	12999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_10900_13000
811911	contig_5758_pilon	-	1967	3	Intergenic	novelGene_119109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	12	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	249	656	250807	250400	FALSE	15	AGCTTTTCTTCATGCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRRCVPPLEPKLAAGCCGVKKPKLSGSGTHSHGNQSTTVPGSSTGPLQNHQHVDSNSGRENASDLTLGPGNSPITRMNPASGALSPLPRPNGTANTTKNLVVTAEMCCYCFDVLYCHLYGFPQPRLPRFTNDP	267748	249088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_250846_265838_265948_267647
811913	contig_1939_pilon	-	2049	6	Intergenic	novelGene_144887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	191.60417531985	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	69	1412	965468	937790	FALSE	15	TTTCCAGCTTTGTGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKYITSGKGTVSGVLLVTPNNIMFDPHKTDPLVQENGCEEYGIMCPMEEVMSAAMYREILDSKIKESLPTEIEQLSVRDFCHLKKMSRSNPDEIDSRVRDIGNDSASTAPRSTEESFSEDVFAESELSPIREELISSVEPWQDKSSDVSSESVQTVSQTATERVAVISESASIPGHLKFNSGHSTNEVGTLSHKTDLNNVEMAIKEGYQVTDNFQEISGPEEQSTSIKGNGDQNVLLAENSLHQGEGEKKSMPYAEVTEFKQKQTVNKGKLGKEQNRDSETEVEELRKLWKTHTMQQTKQQRENIQQVSQKEIKHKIAAADGHVEGSALLKEKRRHRLHKFLCLRVGKPMRKTFVSQASATMQQYAQRDKKHEYWFAVPQERTDHLYAFFIQWSPEMYAEDTGEYTREPGFIVVKKIEESETNEDSTNEAAAKEWEVVSVAEYHRRIDALNTEELRTLCRRLQVPPSVV	972633	937152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_937892_949448_949612_954148_954318_961331_962099_965325_965511_972607
811914	contig_13894_pilon	+	2078	2	Intergenic	novelGene_62183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1248	1556	700379	700892	FALSE	30	ACACAGCTGCTACATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEGVSAPCRRSPLSRRPHALGSLRSCSASLLEGSKTLLCLPEPSAALARRKEVQDGQLPVILSQPEDPAGCALLLCRCPAGRKVCFPCCGLEAPPLQRGA	699131	701414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_700505_700709
811915	contig_9177_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_32779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391687	1390680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1390700_1391700
811916	contig_7744_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_62464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACACACACACCTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432653	431512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_431500_432700
811918	contig_7057_pilon	-	1791	5	Intergenic	novelGene_123417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	13	junction_4	35.1523470055699	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1665	127	1791	1520335	1493199	FALSE	15	TTCTCTCAGTGTTCATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTALARAYLRVAFARLPRNCAPEALPAAWHSQDPALSREEEAMTRSLDTVTFKDVAVDFTQEEWQQMKPAQRNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVGEEETLGRHCPEIWEVDEQIEKQQETLVRKVTSISKETLIKDKVNECKKVAKIIHLNSDIATSRQSFCECDSLDKDLEHNLDLLYFEKSCVKEKNYEYNEYGKLFYHFSSHVTPFKCNQCGQEFNHKFDLIRHERIHAGEKPYQCKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECNQCGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECNECRKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKTFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFICNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKA	1526261	1493198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1494626_1502639_1502736_1503033_1503161_1520320_1520380_1526179
811919	contig_7378_pilon	-	1669	2	Intergenic	novelGene_120242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGAGTGCTCTGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282699	279056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_279225_281198
811920	contig_935_pilon	-	2419	4	Intergenic	novelGene_45557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	186.39802097185	7	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	223	543	361950	358165	FALSE	55	ACGGGAAAGAAAGGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKR	368168	356288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_358314_359247_359405_361935_362067_368062
811921	contig_16126_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_141867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAACTTAAGGAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21959	20303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_20300_22000
811922	SIRV5	+	333	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	902	-30	-25	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGGTGACGTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
811923	contig_12694_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_171977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAGTCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209635	210318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_209600_210300
811924	contig_14258_pilon	+	930	5	Intergenic	novelGene_176010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	2.44948974278318	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	384	560	57414	74314	FALSE	30	ATTCTTAATAAATTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLTWQSKWEGPEDPLQYLRGLVSRALAIQNWVDKAEKQTLLSDTLDLSELFHPDTFLNALRQEAARAVGHSVDSLRFVASWKGRLQEAKLQIKISGLFLEGCSFDGNRLSENQHDSPSVSSVLPCFMGWIPQGAYGPYSPDECISLPLYTSAERDRVVTNIDVPCGGNQDQWIQCGAALFLKNQ	1977	74684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14258_pilon_+_2070_33822_33933_35152_35235_57314_57432_74155
811925	contig_6833_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_175137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273939	275864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_273900_275900
811926	contig_8628_pilon	-	231	2	Intergenic	novelGene_164414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAGAGAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388272	384734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_384854_388160
811927	contig_14060_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_156059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGGCTATTTACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92059	91002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_91000_92100
811930	contig_6842_pilon	+	858	7	Intergenic	novelGene_130774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	381.709167939269	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	96	644	1345633	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPLPRPLLLKSLDQKKKVSRKQILRTKDGLMWEGQGRRAGSKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1345537	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1345665_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
811931	contig_3975_pilon	-	1036	10	Intergenic	novelGene_54869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	157.39507576968	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	140	964	2097890	2091957	FALSE	15	TGGTTTCTGGTCAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PILLQGHERSITQIKYNREGDLLFTVAKDPIVNVWYSVNGERLGTYMGHTGAVWCVDADWDTKHVLTGSADNSCRLWDCETGKQLALLKTNSAVRTCGFDFGGNIIMFSTDKQMGYQCFVSFFDLRDPSQIDNNEPYMKIPCNDSKITSAVWGPLGECIIAGHESGELNQYSAKSGEVLVNVKEHSRQINDIQLSRDMTMFVTASKDNTAKLFDSTTLEHQKTFRTERPVNSAALSPNYDHVVLGGGQEAMDVTTTSTRIGKFEARFFHLAFEEEFGRVKGHFGPINSVAFHPDGKSGGEDGYVRIHYFDPQYFEFEFEA	2099455	2091884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2092030_2092164_2092258_2092979_2093054_2093360_2093451_2093572_2093684_2096132_2096261_2096347_2096498_2097473_2097540_2097850_2097939_2099364
811932	contig_13547_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_104891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128759	130353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_128800_130400
811934	contig_5917_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_122144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1808	2143	217647	217312	NA	25	GAGACAACTCGCTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKREVGYIDYLLLPSGLVALVDCTPLRVPSLPQTSSSLQRDNAAPSILGFTHTLLIFSQPKGERRKGRGRRGEKEDRERRWGGREGGRERGQGKETGRERGRKREVYFI	219454	217215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_217200_219500
811935	contig_15866_pilon	-	1843	2	Intergenic	novelGene_63678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623576	621412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_622525_622845
811937	contig_2323_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_151840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44249	42678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_42700_44200
811938	contig_14666_pilon	-	596	2	Intergenic	novelGene_39536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2524	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450831	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765
811943	contig_6710_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_97850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	35	AATCATACTAATATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
811944	contig_4315_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_46773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	476	784	289799	289491	NA	25	ATCAAGAGATGGTCGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWPRGGHSDLRLSGTACKTTVYDQERPLLTSFSAEVSLGLHHVLGWFTTNDTEGPVHQALTARAGNKTGKSETHLELLESSPLAYMPQKLWISKKLKRNLK	290274	289400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_289400_290300
811946	contig_6191_pilon	+	833	5	Intergenic	novelGene_107858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	88.5928185577138	779	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	154	588	195609	215702	FALSE	20	GTGTGCATATTTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSGGVSCEEFAEFQELLKVMRTIDDRIVHELNTTVPTASFAGKIDASQTCKQLYESLMAAHASRDRVIKNCIAQTSAVVKNLREEREKNLDDLTLLKQLRKEQTKLKWMQSELNVEEVVNDRSWKVFNERCRIHFKPPKNE	195455	215947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_195660_205890_206017_207543_207691_212868_212929_215651
811948	contig_10722_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_70984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTACATCTCACATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17749	24697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_18451_23742
811949	contig_5092_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_62282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTTCTCATACTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358197	356799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_356800_358200
811950	contig_10045_pilon	+	1285	3	Intergenic	novelGene_163756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	15.5	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATAGACTTTTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9134	53824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_9237_15996_16117_52761
811951	contig_5499_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_57039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCATGGTGACCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602032	1602510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1602000_1602500
811952	contig_15905_pilon	+	622	5	Intergenic	novelGene_154707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	253.748891623195	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	103	477	130312	135820	FALSE	15	AAGATTGTTTTCTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARGPCGDASLCIRLGHIRGPEEDEQAPVLSSGSMEPAFHRGDLLFLTNFQEDPIRAGEIVVFKVEGRDIPIVHRVIKVHEKGNGDIKFLTKGDNNEVDDRGLYKEGQNWLEKKDVVGRARGFLPYVGMVTIIMNDYPKFKYALLAIMGAYVLLKRES	117213	135965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_117299_130294_130455_133188_133309_134885_134944_135766
811953	contig_1379_pilon	+	550	3	Intergenic	novelGene_134577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	18.5	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	363	386	384164	384187	TRUE	35	AGCCTTCACCTGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQAPSSRVFVELVPWADRGQENSLVSGRETLPGIRRPLSSAQSQTTTREVHVSGTAEVSADPDRAQVAVRVSSTKAAAAEAKKSVYRRLDYITQSLQQQGLQAENVTVTKDFRRVENAYHMEAEVCS	362570	424815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_362879_384109_384312_424775
811954	contig_1379_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_134582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGACTGGAAAGGAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391356	392795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_391400_392800
811956	contig_9258_pilon	+	614	3	Intergenic	novelGene_104613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6340	junction_1	3120	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	72	464	97238	99582	FALSE	0	GTGCTTGGCTTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	96749	99732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99327
811958	scaffold_8345_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_107011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGAGCAGCAGCGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571160	570448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_570400_571200
811959	contig_5307_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_176013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1525	1893	142176	141808	NA	30	GGAATTTATTGCTGCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSEPEEESGSTYQPSAGCHCINLLSYLFFPELSWFVGVGFLILLGYLENKHLPSASSSFTDTHLPKICPNTDVSFSALQGHFFTLSQKCVDIMVIILMKNLNFKVLKIHCAYLEPWWHSG	143700	141640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5307_pilon_-_141600_143700
811960	contig_3948_pilon	+	1510	14	Intergenic	novelGene_53287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	133	456	1419351	1423780	TRUE	20	TGTCGCCGTAATGACGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQFNTKQMPNTTPGRILTQKAPFFHRWPFRVRYRRPAENPPYPMNMKRKQAVVMSAPRLEGDSMPSRKEAYPALPEACGRDSHASELGPHAPHATAPHLALLGTHR	1417092	1458417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1417201_1419326_1419395_1422629_1422710_1422793_1422872_1423658_1423907_1425301_1425383_1426895_1427004_1427092_1427212_1429093_1429217_1430585_1430715_1430815_1430940_1434909_1435015_1439636_1439748_1458389
811961	contig_5302_pilon	-	2373	3	Intergenic	novelGene_81388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTATAAAGTGAAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151648	147360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_149412_150566_150749_151508
811963	contig_4797_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_6927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652128	650502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_650500_652100
811965	contig_7138_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_120987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164450	166456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_164400_166500
811967	contig_5727_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_7982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGACTGAAGACAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426536	427747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_426500_427700
811968	contig_13740_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_34772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGAAAAAAGAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762270	760806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_760800_762300
811969	contig_7057_pilon	+	1117	10	Intergenic	novelGene_123317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	852.553477559482	70	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	143	1117	936984	943715	FALSE	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRESRPALPRWGLVNLQWPGAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	936019	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941578_943513
811971	contig_16098_pilon	-	1412	4	Intergenic	novelGene_45890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	26.6624996744283	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	808	1155	247137	244355	FALSE	15	CAGTTTACTTTCTTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQAGVFASRSSLRCCRIRYTWILALLQCFNLGFLMADVWFSFLPSIYLIFLIILYEGLLGGAAYVNTFHNIALETSDEHREFAMATACISDTLGISLSGALALPLHDFLCHLS	248617	244097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_244475_244573_244715_247050_247612_248284
811972	contig_5954_pilon	+	764	2	Intergenic	novelGene_28400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATCGTGAGTATTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7873	8761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_8508_8631
811974	contig_20842_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_160966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTATCTTCAGTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46267	46665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_46300_46700
811977	contig_5020_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_27922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	387	15	401	132871	132485	NA	20	TTAAGTCAGTCACCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDQLMGAAWHLRLQSQSHDMPCHLNHKFLVLMARGWEWRWLITRILSLNTNPREPPSCVQRPNSCLCSWKSNQTPCPRTSSLQVLNPDGYSSTIKDKILTIDVKPGWRQGTRITFEKEGDQVRGKRGQCPSPH	132885	132482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_132500_132900
811978	contig_10405_pilon	-	2005	11	Intergenic	novelGene_165861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	21.5427481998003	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	296	1420	290652	271412	FALSE	25	GAACTTTTCAGTTTAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVFGLLSTSCRSVLASSQPFPAEPVQKKEEDSNMKREREQLKEHFSAWDRPHGLVGLHNIGQTCCLNSLIQLFIMNVDFAKILKRITVPRGVEEQKRSVPFQLLLLLEKMQDSRQKAVQPLELAYCLQKYRVPLFVQHDAAQLYLIVWNLIKDQITDVDLVERLQALYTIQMKETLVCLDCSVESSRNSKMLTLPLSLFDIDSKPLRTLEDALQCFFQPKELSAESKCFCQNCGKKSHGKQVLKLNRLPQTLTIHLLRFCIRNSKTEKICHSLCFPQSLDFNQVLPTEQDLCNAEDQPEGRYELFAVIAHVGVADFGHYCAYIRNSVDGKWFCFNDSSVCSVSWEDIRCTYGNHNYRWNETAYLLVYTKLEY	297507	270826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_271458_274384_274435_275084_275217_278831_279000_279885_279982_280683_280831_281122_281203_283893_284040_289014_289112_290489_290756_297315
811980	contig_14450_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_48999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTATCCTGTGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097090	1095634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1095600_1097100
811985	contig_960_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_108289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTGGGGATGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028434	1027358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1027400_1028400
811987	contig_1275_pilon	-	748	3	Intergenic	novelGene_108815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATATACAAAACCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741221	729836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_730446_738582_738645_741144
811989	contig_15518_pilon	+	1406	4	Intergenic	novelGene_127581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	126.323218592449	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	589	1044	15096	38055	FALSE	60	CAAAAAAGAAAAATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPAPSFLL	11042	38417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_38035
811990	contig_4469_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_21875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCCTGAAAATATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98359	99155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_98400_99200
811991	contig_12410_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_167271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73593	72058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_72100_73600
811992	contig_2596_pilon	+	1187	5	Intergenic	novelGene_53434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	185.855286446203	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACCCATGTGGTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9091	11481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_9953_10147_10223_10378_10454_10666
811996	contig_8538_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_4610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGCCAGTGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691634	689426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_689400_691600
811997	SIRV2	-	340	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4533	34	3358	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
811999	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
812003	contig_5434_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_74688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATTACAGTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378581	376260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_376300_378600
812005	contig_16622_pilon	-	1237	6	Intergenic	novelGene_48417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1425.15691767609	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	713	1222	115540	108220	FALSE	20	CCAGTCTCTTTTCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQATQWKTQKVWIFYSLGFSPKMKLKFLILLLFSELTVK	121952	108204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108333_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
812007	SIRV6	+	385	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	578	164	12	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTTTACGCTAGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
812008	contig_6980_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_35994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAACAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232317	234692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_232300_234700
812009	contig_6102_pilon	-	776	2	Intergenic	novelGene_31944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGGGGAGAGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408564	407460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_408175_408502
812010	contig_10159_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_30821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCACTAGTTGAGCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508116	509101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_508100_509100
812011	contig_2069_pilon	-	277	3	Intergenic	novelGene_23473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509102	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508423_1508557_1508720_1509047
812015	contig_16870_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_155532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	36.0581128180608	156	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGCTTGGAGCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296277	314044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_296528_300446_300518_310906_310989_312531_312581_312940
812016	contig_6672_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_176014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGATGAAAATGAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23195	20881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6672_pilon_-_20900_23200
812019	SIRV4	-	466	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	148	3	-148	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	145	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACATTGAGTATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
812021	contig_12270_pilon	-	338	2	Intergenic	novelGene_113937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	11	337	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14419	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
812022	contig_7004_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_126523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602812	604322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_602800_604300
812024	contig_12425_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_46645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAGAATAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172299	173271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_172300_173300
812027	contig_2550_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_135674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATTAGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263135	1264100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1263100_1264100
812028	contig_12886_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_135543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGTTTCCTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888614	890279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_888600_890300
812029	SIRV6	+	408	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	437	11	264	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1567	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
812033	contig_165_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_117053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35065	35821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_35100_35800
812034	contig_160_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_156328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATGGCTACCCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216271	215249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_215200_216300
812036	contig_16076_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_173866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154182	154590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16076_pilon_+_154200_154600
812039	contig_7230_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_52558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTTGCTAAGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137628	136666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_136700_137600
812040	contig_7230_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_52557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAGACCCATACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136097	135075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_135100_136100
812042	contig_10940_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_49286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGTAGAAGAACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911644	910817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_910800_911600
812044	contig_15146_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_116966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTGCAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607778	608131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_607800_608100
812046	contig_3774_pilon	-	1212	12	Intergenic	novelGene_142043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	150.997783356288	1	47	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	322	1020	198922	144743	FALSE	5	TGCCTGTGTGTTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVVGGVTAPRQLCWVELARAVPPSPDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQRLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	210567	144550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152142_153075_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294_210352_210490
812047	contig_5744_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_149345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTATGATATAGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660343	662431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_660300_662400
812048	contig_12622_pilon	-	1321	11	Intergenic	novelGene_6044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	369.638756084911	1	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	178	741	1689951	1686196	TRUE	30	ACAGCTTAAAACCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYYRRIYQTMNTQYLKIPDLDIQWRCRHGLQFHGG	1690357	1685122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686902_1686943_1687818_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309
812049	contig_10331_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_54219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATATATCATCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407669	1406813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1406800_1407700
812051	SIRV6	+	323	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	389	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10721_10819_11031
812052	contig_8017_pilon	-	687	5	Intergenic	novelGene_65376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	255.480307460282	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	91	492	1509852	1496306	FALSE	15	CTCAGAGTGCCCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLNYILSISASSGLIALLSTGSK	1510167	1496110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1496373_1497435_1497568_1503095_1503195_1509748_1509876_1510100
812053	contig_12540_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_148078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	237	575	921939	922277	NA	65	AAAAAAAAAACCAAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEKLVTWKPSSRAFCQNCEVFLGCGKMVLAPGPPQPHLLGPHPPSSHLTPLAPSRGRLQPYDLHGKDNSTPCCEHQTSISSLAQMSNYTNRIFLDRLLRHAVCWDRIPDA	921702	922584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_921700_922600
812055	contig_7171_pilon	-	1145	9	Intergenic	novelGene_101378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	987.155185051976	3	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	85	846	1370644	1363653	FALSE	15	CTAGAGCGCTTGCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRILGITQTPISADKVTLAATPTNVRDSPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1370813	1363353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1366976_1367262_1367306_1370596_1370670_1370754
812056	contig_4674_pilon	-	2103	14	Intergenic	novelGene_174140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	99.9911238664263	30	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1602	500	2101	356875	248027	FALSE	30	ATTACTTTGTAGCATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREGSGTRLVAEVIKDRLCFAILYSRPKSASNLHYFCIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMIRKKIIHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRVLMFGDTSYIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEYYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHTRTRLESGYHQHSPEAYIPYFKNHSVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMSAAETIAWIRICRPGSVIGPQQQFLVMKEASLWLEGDYFRQKLRGQENGKHRAAISKLLLSVDDISINGVKNQDKQEPEPYSDDDEINGVTQGDRLRALKSRRQSKANTIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSASRKSSFKSLVPQRERRKRNALQQMPLMALWYFHYSAAFAFPSFFEILFIFSFFCRTEPFSALPSSPVCLSFMVDNCTVFSKVFVIKNLYKVL	357374	248024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_248280_261406_261524_271190_271289_271977_272138_272342_272482_274350_274582_274889_274978_278391_278455_281209_281277_313985_314063_351305_351399_354635_354712_355292_355384_356826
812057	contig_4654_pilon	+	1387	5	Intergenic	novelGene_103061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	214.034313837758	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	57	617	444670	458283	FALSE	10	TGTCCGTTGTACTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKSPDSVEGLRAAGNQSFRNGQYTEASALYGRALRVLQARVSTRAGSSDPEEESVLYSNRAACHLKNGNCSDCIKDCTSALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPNMPQSKL	444613	459053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_444797_449177_449293_450644_450798_453119_453264_458261
812058	contig_6084_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_127050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTATTCAATGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367334	368272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_367300_368300
812059	contig_13901_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_146680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	450	1664	2113	335816	336265	NA	15	AGGCCTCTCTGCTGAGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPISRLKLWLPWELRGSQCCLPASGTTQGWCLWAAGSSPPSCSSGIACSTSSIFPCLPLQGEAFTHKATSCLPILSPQLETTTHPQQIYSPAPLYCFMLRVPFHQASGFFPGWHLPMLSRAPTLQTISHVLLCVVGGAQSVRCGSKPFRF	334152	336267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_334200_336300
812061	SIRV6	+	249	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10575	2	1338	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11575	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11600_11800
812062	contig_2537_pilon	+	1290	13	Intergenic	novelGene_33415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	252.051292729608	1	70	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	78	1289	205895	235588	FALSE	25	TAAAGTGTTTCTACTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLFCLCLWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVVKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLSDLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDE	205817	235589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228782_230768_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233588_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480
812063	contig_6102_pilon	-	1620	14	Intergenic	novelGene_32389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	180.84495958772	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	136	630	1743430	1732546	TRUE	5	GGGTTGGGTCCTGCCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGDYEMLGEGLGIKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIRTTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAISWYYYLVS	1743565	1728563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728948_1729886_1729979_1730098_1730202_1730455_1730528_1730620_1730699_1731756_1731796_1731998_1732065_1732389_1732573_1732770_1732900_1733184_1733284_1733600_1733663_1733866_1733964_1742375_1742445_1743418
812067	contig_12139_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_146464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGAGCTGTGCTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76110	77051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_76100_77100
812069	contig_4364_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_77	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	162	365	816430	823208	FALSE	25	AGTCTGGAAGCTCCGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAELLQITRSRGSEGRKAGDGRGRELTTVETWDRCICRQGSSLCAYLCSKFSIMRAVFWIRSLPGISPVSLPQRPRLRSGKRAQRTWDMRPRDTLELARGGVNIVGKPLGKFNSKMDRNT	816268	823395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_816572_823146
812070	contig_7962_pilon	+	682	7	Intergenic	novelGene_149309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	54.9648877820094	1084	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTGTCTTATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444811	446297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_444848_444930_444983_445214_445425_445586_445647_445751_445798_445922_445973_446069
812071	contig_2550_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_135692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAAGTTGGTTCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632788	1632101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1632100_1632800
812074	contig_6975_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_74299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACACTAAACCACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486342	484296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_484300_486300
812076	contig_9121_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_134438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTTTTGGGGACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79366	79131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_79100_79400
812078	contig_12543_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_168397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGGAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553325	552923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_552900_553300
812080	contig_13699_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_158309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACAAGTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21427	22816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_21400_22800
812081	contig_10002_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_157659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCGGGAAAAGGTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420849	422621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_420800_422600
812082	contig_7733_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_147153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTAAGTTAACGGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193429	193106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_193100_193400
812084	SIRV1	+	200	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTACGGTAGGAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6457	6747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6465_6554
812088	contig_3797_pilon	+	1958	19	Intergenic	novelGene_120106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTCTTGTATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410937	543849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_411010_411847_412006_415487_415575_416097_416199_417204_417347_421826_421903_422465_422614_427724_427827_428039_428128_430561_430682_430814_430927_434595_434718_443894_443984_454960_455056_458095_458244_459559_459620_461763_461853_489597_489687_543789
812090	contig_10581_pilon	+	1169	4	Intergenic	novelGene_41357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	418.197986073051	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	231	437	85078	87174	FALSE	10	CTTCCGCCTTTGGGCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSVMEWELLDDKGQRLFCWKIPLEIIS	74590	87906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85211_87100
812091	contig_6842_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_130675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTCATTATCTCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328418	327288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_327300_328400
812092	SIRV6	+	182	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	522	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
812097	SIRV6	-	423	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-256	394	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAATTGTCGCCCCCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2076	1150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1540_1647_1735_1844
812098	SIRV6	+	422	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1322	225	84	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10321	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10300_10700
812101	contig_10005_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_148904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	461	880	83279	82860	NA	30	CTGGCATTGTCACTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGKTSSKFGPNGLSGSLTFLGKVTKRHLRNLKQKYIFAHLDEDPWVVLSFASYLMTYGGNSKRNCNAVNSFYHLKCTHLITFGVVFFFFLSSSQFFFKGSNQVFVCANLYYCSLSSPLFLILMFGIPSGILCVLTLD	83739	82726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_82700_83700
812102	contig_1154_pilon	-	618	5	Intergenic	novelGene_87147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_4	7.90569415042095	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	63	617	881770	877028	FALSE	30	AGTTCTCTGACACCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSGKLPSGVSAKLKRWKKGHSSDSNPAICRHRQVARSRFFSRPSGKSDLTVDAVKLHNELQSGSLRVGKSEAPETAMEEEVDLAVTEKSSGTFLSGLSDCTNVTFSKVQRFWESNSAAHKEICAVLAAVTEVIRSQGGKETETEYFAALMTTMEAVESPESLAAVAYLLNLVLKRVPSPVLIK	881832	877026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_877053_877625_877703_878832_878917_880879_881110_881631
812103	contig_13905_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_130410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCTATTCCTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63695	62391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_62400_63700
812106	contig_266_pilon	+	870	7	Intergenic	novelGene_166303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.22812904711937	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	726	145	870	673087	692843	FALSE	25	AAAGCGTATGCCATGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWDSCFHLSQQTNIPAHQQIDDLYHTGGSGESEEDATSKEEEEKIIDRMSLPKDKLAQSQKKTAVLIKEKMNTQANQELIRCVILSRIIFGEEHWKCAQALANLAYGYLTLRGLPAQAKKHAESARSTLLTWKVNTTSNKEKKEIVETLIVLYYTLGVAWLLQNHGREAYFSLQKAERSMKELKELDKGGICGLQVSEKDLTVALGRASLAIQRLNLALAYFEKATDNIIAAKGEKTSDLISLYQEIAQIEQLRRNHQQAIQYLQQAYSICVSVFTEVSPRTAEASALLA	666786	692843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_666810_672965_673156_677810_677935_686669_686827_688416_688543_691593_691772_692771
812107	contig_5050_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_110287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586794	588780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_586800_588800
812108	contig_6344_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_157124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTGGCAGTGCCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1283249	1282831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1282800_1283200
812109	contig_2204_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_71678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAAAATGTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25595	27753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_25600_27800
812110	contig_12951_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_68254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	16	junction_1	20.1736265111549	21	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	96	1700	868734	851935	FALSE	25	CTAATTTTTTGTGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCPHCTRRQDKRKSINRNSVRSRMPAKPSRMYGTLRKGPVCLDPKPQQVKKIFEALKRGLKEYLCVQQAELDYLSGRHKDTRRNSRLAFYYDLDKQTRSVERHIRKMEFHISKVEELYEGYCIQCRLRDGASNMQQAFSRCLPSRASRESLQELGRSLHECTEDMWLIEGALEVHLGEFHVRMKGLVGYARLCPGDQYEVLMRLGRQRWKLKGRIESDDSQTWDEEEKAFVPTVHENFEIKVTELRGLSSLAVGAVTCDITDFFTTRPQVIVVDITELGTIKLQLEVLWNPFDADSFLVSPSPMGKLFVGSRKGSLYNWTPPSTPSFRERYYLSVLQQPPQQALLLGGPRATSILSYLSDNDLRGPGLQSRSQELPEMDSFSSEDPRDTETSTSASTSDVGFLPLALGPNTSIEEEACEDPSSLGLLPEMAQLAGGSFVEQPGWRDLGVESPNLSRGSPMYNCMIPGSREGQDEGETEDGVDGTGMALEQPLQEVLELLRSTAPTQPPLRELEYQVLGFRDRLKVGPPAAGQ	868829	851441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_852535_854801_854932_855939_856086_856170_856297_856468_856513_856817_856882_856987_857138_857878_857933_858229_858254_861336_861416_864892_865040_868693
812112	contig_10159_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_30799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGATAAAAGGGAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346805	344802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_344800_346800
812113	contig_21315_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_151576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64431	64736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_64400_64700
812114	contig_1986_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_64138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353544	355172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_353500_355200
812116	scaffold_4805_pilon	+	2192	1	Intergenic	novelGene_161036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	760	1164	546275	546679	NA	40	ACCTACAATGAAAGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSRFLRNGKKEDALACQINLDKTVQPSIRSNTLGCIKCSASAGSDLRQSQPLRSQRSSQSPGREHRMFRRRLQREAGRVRRTPGRHAQLYLPVPVSQSYNSLMPNLGVMVNSLVFFVNINRLCLKDKVFKGY	545515	547707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_545500_547700
812118	contig_9571_pilon	-	2203	3	Intergenic	novelGene_136249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	1	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	28	429	352858	276763	FALSE	45	GACTGTGAAGACAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSSTEKSRFFKPDYEAWLRIQRAERGGVVIFHDVAVLTDKLFPIVEAMQKHFSAGSGTYYSDSIFFLSVAMHQIMPKDRIIFIYLYSSSILKSSRISFYFNQQSTPMEAAVKKSNNILHQSKLWQKISLKS	352885	274988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_276927_321690_321839_352768
812120	contig_4125_pilon	+	1992	1	Intergenic	novelGene_25249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2994241	2996233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2994200_2996200
812123	contig_10904_pilon	+	1759	3	Intergenic	novelGene_22664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	3	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1051	1371	533625	534035	TRUE	30	CCGGATCAGAACTTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYSQYFVSGSSGLTATNTRLRPIRILNQCFLSLFPGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHISLRRWHV	532574	535184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_533924_534013_534186_534946
812125	contig_14556_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_138510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAGAAGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45523	47101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_45500_47100
812127	contig_9099_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_149927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACATATTCCAGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423538	422842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_422800_423500
812128	contig_11068_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_130554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATCTTCCGTTCTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412985	412645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_412600_413000
812130	SIRV6	+	371	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	213	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGACGCTATTTCGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516	2098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845
812131	contig_9727_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_86328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTACTGTAAATTAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368345	366894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_366900_368300
812132	contig_12697_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_122834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259244	257668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_-_257700_259200
812133	contig_12672_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_141482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTAGAAGAGAGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109724	109942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_109700_109900
812134	contig_12672_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_141481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105069	106385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_105100_106400
812138	contig_12638_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_33354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACCTCTCTCATGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406008	1406711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1406000_1406700
812139	contig_5649_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_82328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444590	442498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_442500_444600
812140	contig_5816_pilon	-	1497	6	Intergenic	novelGene_158237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_5	27.5056357861439	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	587	1465	65669	48888	FALSE	45	TAAATCCCGAAAATTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVKTETESEEEEEVALDNEDEEQEASLEESAGSLGENQAKYTPSLTVTVENSPKETSLKVPEWNNKGEQSCKIETQEPEPKFNLMQILQDNGNLSKVQARIAFSAYLQHVQIRLMKDSGGQTFSASWAAKEDEQMELVVRFLKRASSNLQHSLRMVLPSRRLALLERRRILAHQLGDFIIVYNKETEQMAEKKSKKKLEEEEEDAVNTENFQEFIRKASEAELEEVLTFYTQKNKSASVFLGTHSKSSKNSSSYSDSGAKGDHPETLEEVKTKQPKQQRATEIHSDKLSRE	66255	48855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_48980_53765_53894_56603_56708_57816_57964_60946_61068_65382
812141	contig_14954_pilon	+	1470	12	Intergenic	novelGene_165169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_3	8.59463603621708	159	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	29	589	56390	57601	TRUE	20	GTGCTGTGAGTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGSLILRPWIRELVLGLEALSGPRAGQLLEVLQEAEAPGPSRAPDALFVGAALLVSDGTHSIRCLLTRKALNTSDWEKEFGFRGTEGRLLLLQDCGVRVQVSERGAPAEFYLQVERFSLLPTEQPLIRVAGCNQDPEVQKKLCDCLEEHLSESTSPNPGLTLSQLLDEVQEDQEHRGGAGALG	56361	59036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_56489_56566_56704_56799_56891_56977_57055_57183_57229_57338_57374_57524_57679_57756_57839_57932_58020_58190_58583_58714_58807_58885
812142	contig_7078_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_130145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	171	518	237905	238252	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRELLPVVQRSSQGWVGLQVSCVLLYAPATAAAVCSCHCCCCILLPLLLLYTAATAAAVYSCHCCCCILLPLLLYTPATAAVVYSCRCLCCCSGSQITEHRAPTVLSTLSIHY	237734	239384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_237700_239400
812146	contig_10494_pilon	+	1696	4	Intergenic	novelGene_102139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	12.1197726417986	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	18	704	379676	396617	FALSE	35	AAATTGGAAAGTGTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVAKMDDPLSNRAPDSLENIISNAVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHNEDGESGSEASDSVSNCGQSGSQNIGNNVTLITLNSEEDYPNGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYGIRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPSSSSYSTSGTLWRLSLSLLQPSG	379658	397609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_379732_381404_381581_393361_393602_396402
812147	contig_1154_pilon	+	1130	5	Intergenic	novelGene_87204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	89.1585666102815	179	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	185	739	1152989	1163677	FALSE	70	AGAACTAAAAAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTSEREGSGLEVSPSVILEAPPESPPAPTKSPAFDLFNLVLSYKRLEIYLEPLKDAGDGVRYLLRWQTPLCSLLTCLGLNILLLTLNEGAWYSVGALLISVPALLGYLQEVCRARLPESELMRRKYHSVRQEDLQRVRLSRPEAVAEVKSFLIQLEALLSRLCCTCEAAYRVLHWENPIVSSQ	1151289	1164068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1151473_1152987_1153186_1156378_1156450_1158091_1158279_1163577
812148	contig_12312_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_63924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63021	65031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_63000_65000
812150	SIRV6	+	275	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACAAGTCAAGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
812151	SIRV5	+	388	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	7	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1925_2034_2119_2157_3327_3405_3483
812152	contig_13425_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_170847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAAGCAGAGGTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113260	114279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_113300_114300
812158	contig_7110_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_176019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAATGTAGAACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267672	266748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7110_pilon_-_266700_267700
812162	contig_14882_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_115028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGCCTCCACAATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315879	316355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_315900_316400
812165	contig_10904_pilon	+	612	6	Intergenic	novelGene_22792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	224.109794520454	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	125	610	845659	849120	FALSE	25	CCAACCCCCTCAGCCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGDQRSTDWSSQYSMVAGAGRENGMEAPMHENPEWEKARQALASISKAGAAGSSTKTSSNGAVANAQYVSQAEASALQQQQYYQWYQQYNYAYPYSYYYPMSMYQGYTSPSQYGIPTSYGSATPQQPSAPQHQGTLNQPPVPGMDESMSYQAPPQQLP	842766	849122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_842836_845603_845697_846559_846735_847151_847254_848107_848219_849060
812167	contig_6302_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_171688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGATAATGGAAATGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58051	58384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_58100_58400
812168	contig_13097_pilon	+	816	10	Intergenic	novelGene_107726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	696.407040050644	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	22	816	196348	263462	FALSE	50	AGAGCAAGCCGAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERH	196326	263462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_196396_196695_196765_205974_206085_225265_225360_226996_227048_227110_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407
812169	contig_4686_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_118506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAACCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400035	397637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_397600_4e+05
812170	contig_12638_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_33219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCGTAAAAGGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552192	552433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_552200_552400
812171	contig_13481_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_119264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAGTATTCCTAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28035	26323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_26300_28000
812172	contig_2219_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_67160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTCCTATACTGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54820	54580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_54600_54800
812173	contig_10437_pilon	-	2348	10	Intergenic	novelGene_38246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390701	375526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_376799_379151_379226_380471_380626_387220_387330_387490_387556_387709_387848_388027_388127_388502_388644_389953_390113_390564
812175	SIRV6	+	353	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1843
812176	contig_10953_pilon	+	1410	6	Intergenic	novelGene_42541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	44.7883913531174	18	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	299	376	188443	188559	TRUE	10	GGAGCCTGGGTGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDP	186049	191997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_186113_187038_187128_187328_187461_188428_188514_188552_189438_191841
812179	contig_500_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_30912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACATTTCTTTTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977931	979163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_977900_979200
812181	contig_10109_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_131342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTAATCCAGTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344990	345243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_345000_345200
812182	contig_1380_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_138891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	112	498	159512	159898	NA	30	ACCCCATGCACAAGGTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWVLPLFLSPPILFLFFSHILQLRPPFLSFNYIFWVEESKPASLDPNFSKHLFQNLNFLLNTFTKIHRQLVKLNTPKIKLIQPTFKPTPFPICLPPFHPCLSCPIYHLQCLKSTPPLNFHCHYFNYS	159400	160073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_159400_160100
812183	contig_10323_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_123535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATACCTTATTCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222974	222028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_222000_223000
812184	contig_5770_pilon	+	377	3	Intergenic	novelGene_74173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAAAATGAAGGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261899	263678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_261983_262764_262956_263575
812187	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
812189	contig_12841_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_55880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726768	724831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_724800_726800
812190	contig_5523_pilon	-	1423	3	Intergenic	novelGene_169105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	14.5	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	109	1212	410975	409260	FALSE	45	CCTGATTTGTAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMMKLLIILIFSGLITGFRGNSSYSLPPKLLLVSFDGFRADYLQNYEFPHLQNFIKEGVLVEHVKNVFITKTFPNHYSIVTGLYEESHGIVANSMYDVITKKHFSDLNDKDPFWWNEAVPIWVTNQLQGNRSSAAAMWPGTDVLIHNTTPSYFMNYNSSVSFDERLNNITMWLSNSNPPVTFATLYWEEPDAGGHKYGPEDKENMRTVLKEVDDHIGDLVHKLKVLGLWENLNVIITSDHGMTQCSKERLINLDTCISHTSYTLIDVSPVAAILPKITNHDFFFFAVSFFPDRTEVYNKLKICNPHMNVYLKEDIPARFHYQHNDRIQPIILVADEGWTIVQNKTLRKCKYLFRIFLLYPRDKSQL	420697	409048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_409529_410140_411000_420613
812191	contig_11594_pilon	+	2060	12	Intergenic	novelGene_80908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	47.1628092729048	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	44	925	275667	341499	TRUE	20	AGAAGCACTTTTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPIVLRRVAWRRRMTPDFDEEVVFENSPLYQYLQDLGHSDFEICSSVSPKTEKCTAREGPQKTPMRALSEQGILLKVAETIKSWISFSQCSKKDDLLHKLDIGFRLDSLHTILQQEVLLQEDVELIELLDPSILSAGQPQQQENGHLPTLHSLATPDIWDVSMLFVFISLLVMLPAWWIVSSWLVWGVILFVYLVIRALRLWRTAKLQVTLKKYTAHLGNTAANSRAFTNLVRKSLRLIQETEVISRGFTLLLDRVSAACPFNKAGQHPSQHLIGLRKAVYRTVRANFQAARLATLYMLKKLPPEL	275623	364355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_275703_318196_318332_326126_326217_330580_330757_332491_332768_335649_335801_341481_341630_343220_343553_347276_347471_352803_352905_361775_361984_364185
812193	contig_7376_pilon	+	1087	9	Intergenic	novelGene_108084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30.9424869717998	34	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	191	1087	102857	147803	FALSE	40	GAGAGTAAGTATGATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVKKRTKTPTDIYPVETLVNMSLNPSRPSSSEVVELHVFYVPEGSWNYKLNTISKEVVNKFISAGFIRVSPQLTLQALRESLGEFLGEDAVAEKFLFLKCIGNNLAVVKAKQESELKLKSFAPPYALQPELYLLPIMDHLGNIYSASSTVALDGQQTNNGVTQADGTVHRPVSVTLSKEKPGTDPSLLENTLKELLNKNQEEARGKTTPKESQTGKNQIRNSKLPGSLEDSNTDYFNSKKSQYPGKNEDDTANISRREDSETGEKECVILPNLTNFPSLPCQPAISPGITDISSIQI	80024	147803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_102779_102959_104743_104851_108846_108965_112441_112496_112599_112832_129280_129396_130280_130342_147695
812194	SIRV6	+	453	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	32	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
812198	contig_7459_pilon	+	966	5	Intergenic	novelGene_174775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	549.443809683939	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	595	966	86057	99890	FALSE	25	GCAGAAGCTGTCTTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQVDKVESFKYSQSTKDSLHAKYNTKTCATVVGDDQWGHLQLDATSVYLLFLAQMTASGLHIIHSLDEVNFIQNLVFYIEAAYKTAVSTHFGMDFKHDIFVFNTTLKLLMLPFIVNQSKRLL	76418	99890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7459_pilon_+_76820_78027_78187_86022_86069_88689_88859_99699
812199	contig_13004_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_112635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGCAAGTATCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255649	256864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_255600_256900
812201	contig_8020_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_114449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGGGTTGCAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356535	357342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_356500_357300
812203	contig_10973_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_150324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	5	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
812204	contig_6424_pilon	+	994	9	Intergenic	novelGene_109263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	65.0821596138297	245	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	81	716	77681	82431	FALSE	15	TGAGCTGGGCTGTCATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRRECCGLRLLAPGLELRPEPVAGRMTTLTRQDLNFGQVVADVLCEFLEVAVHLILYVREVYPVGIFQKRKKYNVPVQMSCHPELNQYIQDTLHCVKPLLEKNDVEKVVVVILDKEHRPVEKFVFEITQPPLLSISSDSLLSHVEQLLRAFILKISVCDAVLDHNPPGCTFTVLVHTREAATRNMEKIQVIKDFPWILADEQDVHMHDPRLIPLKTMTSDILKMQLYVEERAHKSS	77173	82709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_77242_77668_77721_77810_77930_79342_79415_79909_80011_81041_81137_81469_81544_82045_82139_82389
812205	SIRV6	+	471	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
812208	contig_5039_pilon	-	1617	6	Intergenic	novelGene_64945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_2	43.1156584085179	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	193	798	1497124	1479854	FALSE	75	AGAAAAAAAAAAGAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNKSRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLLTVKRALEAKELARQQLRDQLDEVEKETRAKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSIEAERLKQKEQERKILELEKQKEEAQRRAQERGKQRLEPMQREDEHQRPRKLHDEERLKRDECVKKKDMEDKGRPEVQDKLTRLFLQHPEPAKAAVQAPWSTAGNGGKNRSRN	1501573	1479034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1480116_1481900_1482029_1496769_1496910_1497048_1497137_1501310_1501452_1501534
812209	contig_1982_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_151307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1093	1464	98104	98475	NA	60	CCAAAAAAACGAACACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGRNIPVTLIDMDNVLLYFVHIIDHIAVKEYVSVYFHTLTSEYNHLDSDFLKQLYDVVDIKYQRNLKAVCSSNILFKDVNMVCHHLFYLRTEGQNPPRGEPPPAIFCHNSRTDRLSSLCS	97011	99119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_97000_99100
812210	contig_2799_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_85579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772132	770597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_770600_772100
812211	SIRV6	-	205	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGACTTCGACTCGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10814_11031_11109_11205
812212	contig_5590_pilon	+	1604	12	Intergenic	novelGene_162988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	83.1443035126975	343	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	48	1211	174610	184249	TRUE	15	TCTGTGGTTTCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSLGLVRKSRRPLTMDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSQVSPGPGSPPLCLVSRRCPGSASWISRGTGIRRRASTDPWASWPSCSARWPLFARSRKSCPASWRRWSPRSGPWKSSRSICGASFRT	174424	185300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174459_174596_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177924_183583_183702_184110_184269_184806_184871_184990
812213	contig_7575_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_176020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACACACACACACACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19411	18935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7575_pilon_-_18900_19400
812214	contig_5526_pilon	+	1434	2	Intergenic	novelGene_111703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	45	362	332197	332514	TRUE	20	TTTGTCTTGATTACTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTVRELHRGQVEDRISRCMVCLYNTRHLIVHRHSSKLWRLNAECGSGGRSLVTPLSLFGVRAASLMARCKTNSERCICFSPVFVKVKILFGFLLISKNRYKCR	332152	334538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_332737_333688
812216	SIRV6	+	224	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-389	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1896	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
812219	contig_9121_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_134436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTGTTGTTGAGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67128	66308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_66300_67100
812222	contig_7730_pilon	-	1293	4	Intergenic	novelGene_156245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_3	230.165640837685	1114	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	161	649	43591	2339	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSYTPSKIRHA	43751	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2445_4051_4177_7798_7895_43429
812223	contig_4156_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_88105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTATTTTCCATAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336710	335590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_335600_336700
812227	contig_8729_pilon	+	1985	4	Intergenic	novelGene_40107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.4165045389453	1	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAATCTAACTTAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276511	323917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_287035_322203
812229	contig_753_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_112974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTCAGCATGCACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185805	1186509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1185800_1186500
812230	contig_9609_pilon	-	1123	4	Intergenic	novelGene_23143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	322	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	639	1022	526146	524576	TRUE	20	CGGGTGCGACGTCCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCGQVGFALLLLVEDDKAQAQQRTQQGQQLQHPVAACSTLPREGAQQRTFRREHQQCLGHQEGESKRHKHRVPGEQAGARPGKHSHKDGEAQGHKVGSSTRGSAQSLIDVRLGLHSQGHGQAGLWL	526784	524045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_524145_524573_524727_525205_525244_525951
812234	SIRV6	+	379	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1633_1736_2780_2829_3106_3165_10724
812235	contig_19007_pilon	-	1495	3	Intergenic	novelGene_168450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	9.5	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	270	1493	77931	76040	FALSE	45	AGGAGAGAAACCTTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKELLVSDSNGFKERKSLKNPYTGDESKNHLETVQHNNPKTNKLKEKPSKWCKRDGPRNSKHEDTKETLLALSKGDEIWCLDSCENNGKSESQWENSIGKEEEKSDHWEWDLGEHASFSTKKNKPSGGKPYKCPECWKSFNNSSHLRIHQRTHSGEKPYKCSVCGKCFSNSSHLIQHLRTHTGEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKHFSSSSHLIQHHRSHTGEKPYECPVCGKCFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKNFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCLECGKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYKCPECEKNFSRSSNLITHQKTHIREKSYESSEREESLSQDCNMIEECGIQPGEKPYRCCECGKSFSLSSHLIRHQRTH	80249	76037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_77185_77852_78081_80129
812240	contig_2703_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_101820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCACTGTACCACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143637	1143130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1143100_1143600
812241	contig_7744_pilon	+	953	2	Intergenic	novelGene_62585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021799	1023278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_1021908_1022433
812242	contig_4315_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_46824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCTGAGGGCTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355456	357054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_355500_357100
812243	contig_9099_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_149917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAAGCTAAAAATAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396725	397816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_396700_397800
812244	contig_5586_pilon	-	1591	9	Intergenic	novelGene_143563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGGAATGTAGCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430564	380681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_380722_383477_383572_384575_384727_388434_388596_391063_391233_392795_392875_392971_393126_416879_417011_429952
812245	contig_13718_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_142903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	129	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTATTTTGAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254484	256695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_254500_256700
812246	contig_7027_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_164324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCGGTAAACCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5076	7271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_5100_7300
812249	SIRV4	-	392	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	33	192	33	-192	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTGGACACGGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5125	3829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
812251	contig_7694_pilon	-	2219	6	Intergenic	novelGene_159921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	8.79545337091841	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	331	1410	83479	71443	FALSE	10	CTGTTGGGGAAGGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVHLLQEEMSSSYTTTTTITAPPSKMLQNEGGKLEKTLVHLEEEIRPEMKDDIYDPTYKDKEGPRPKTEYVWRNIILMFLLHLGALYGIILFPTGQFYTWLWVFFYYMMSALGITAGAHRLWSHRTYKARLPLRVFLIICNTMAFQNDVYEWARDHRAHHKFSETDADPHNSRRGFFFSHVGWLLVRKHPAVKEKGSLLDLSDLKAEKVVMFQRKYYKPAILLMCFIVPTLVPWYFWGETFQHSLFLATLLRYTMVLNVTWLVNSAAHLYGYRPYDKNISPRENILVSLGAVGEGFHNYHHSFPYDYSTSEYRWHVNFTTFFIDCMAALGLAYDRKKVSKAAIQARIKRTGDGSYKSG	83809	70633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_-_71643_74817_75051_76577_76784_78664_78796_82647_82931_83452
812253	contig_15459_pilon	+	618	3	Intergenic	novelGene_106365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	383.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	190	354	9151	16848	FALSE	10	CTATTTGTCTTAGTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKVVVWKYCCALIRTLS	8161	17112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_16800
812254	contig_6048_pilon	-	1281	11	Intergenic	novelGene_73327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.7510655613615	95	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	24	950	2727399	2589914	TRUE	10	TTCTCTGACTGGGCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYWPAGMFQFSAPSGQAPEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGAPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYMEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGAPQVREAGPATL	2727422	2588100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2588315_2589796_2590009_2590685_2590768_2612162_2612285_2620452_2620514_2631321_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2727363
812255	contig_10074_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_57143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTTTTGAAAAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444777	442726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_442700_444800
812257	contig_8896_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_171572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCCTTGTGCTAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24879	23582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_23600_24900
812258	contig_18869_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_56422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACCAATGCTGTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79446	78093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_78100_79400
812262	contig_13004_pilon	-	1060	9	Intergenic	novelGene_112687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	30.6227039955651	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	18	980	836491	807359	FALSE	15	CAAGGTATTTTCCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTVAPAGAGSSGTRSGSKQSTNPADNYHLARRRTLQVVVSSLLTEAGFESAEKASVETLTEMLQSYISEIGRSAKSYCEHTARTQPTLSDIVVTLVEMGFNVDTLPAYAKRSQRMVITAPPVTNQPVTPKALTAGQNRPHPPHIPNHFPEFPDPHTYIKTPTYREPVSDYQVLREKAASQRRDVERALTRFMAKTGETQSLFKDDVSTFPLIAARPFTIPYLTALLPSELEMQQMEETDSSEQDEQTDTENLPLHISTDDSGAEKENTSVLQQNTSLSGNRNGEENIIDNPYLRPVKKPKIRRKKLILKQLLNSLNTK	836508	807278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_807402_819974_820115_827778_827922_829552_829701_830675_830801_831944_832008_832343_832443_834847_835005_836446
812264	scaffold_15027_pilon	-	1890	3	Intergenic	novelGene_163573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84589	81370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_82058_82608_82707_83484
812265	contig_10467_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_175410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCTATGTGCCGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119786	120913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_+_119800_120900
812266	contig_9460_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_155318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462262	460959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_461000_462300
812267	contig_11855_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_67026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGTAAATCAAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1906623	1909386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1906600_1909400
812268	contig_4151_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_65263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617375	616189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_616200_617400
812269	SIRV6	+	510	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	-13	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAATCGGTAGTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2031_2470
812270	contig_13245_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_148803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTATTTAAGCTTCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23296	22642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_22600_23300
812271	contig_13245_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_148802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTTACTTCAAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22642	22102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_22100_22600
812272	contig_4392_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_117338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTAAGAAAAACATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602916	600576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_600600_602900
812273	SIRV6	+	238	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	54	491	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
812274	contig_6059_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_44805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAAGGATAGGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425635	426431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_425600_426400
812275	contig_11010_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_176023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGTGGTTGTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168820	167971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11010_pilon_-_168000_168800
812276	contig_8743_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_149489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	7.39553091745416	75	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	11	856	81031	84266	FALSE	25	TCATTATTATTCCCAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALATEVEAAALKALAEVSTILEPVGLQEEAELPSEILAEFVMDSRKKDKLLCNQLQVVDFLQGFLVHEDTAQGLDPLASEDISRQKATEAKEHWKELKATYQEHVEAITCALTQALPQMEEAQRKRAQLQEALEQLQAKKQVAMEKLREAQKQWQLQQEKRLQHLAEVRDRQRGTQQEVDRLYQELRSLKHQAGQEQDKLQRHQAFLQLLYTLQNKTLLPGAEAEPQPLQGVPLRQDLLEDKAQQLTGPQHQNTGDNIAGDRGVTPQLFPWPHSLPNGL	81020	84864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8743_pilon_+_81072_82023_82115_82266_82391_82538_82706_82842_82900_83482_83614_83691_83888_84227
812277	contig_2693_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_167600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299791	298279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_-_298300_299800
812280	contig_9233_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_78258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCTGAGCAAACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679051	677406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_677591_677805
812283	contig_10904_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_22646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGGTGATGATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521094	522040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_521100_522000
812284	contig_3233_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_56499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAAGCCTGCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55596	56000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_55600_56000
812287	contig_4211_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_80239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCTTGTCACATGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123076	1124566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1123100_1124600
812293	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
812295	contig_7135_pilon	+	2241	4	Intergenic	novelGene_136946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	0.942809041582063	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	126	572	245986	251737	FALSE	45	AAAATTGTTACAGCACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPPSNLEESKTKMSFTAWNAEGSAQAKQASFFVVYNMVTTEVIAVFENTSDELLELFENFCDLFRNATLHSEVQFPCSASSNNFARQIQRRTCGITCVLAVIPARLHMSCRKIETVPLLFIAISSAVHCQDLKYLLNQLGNHFRTFG	233945	253406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_234051_245965_246073_251198_251387_251565
812300	contig_16362_pilon	-	764	6	Intergenic	novelGene_161161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAATAAAGAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231366	73290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_73532_82686_82773_97334_97430_201042_201156_202100_202167_231203
812303	contig_11285_pilon	-	1567	2	Intergenic	novelGene_5502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCTTCCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520770	518466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_518911_519647
812304	contig_2894_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_86543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGCACACACACACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255513	254334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_254300_255500
812306	contig_6871_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_21639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAATTCATTTATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669748	670692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_669700_670700
812307	contig_16948_pilon	+	1429	2	Intergenic	novelGene_166404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	510	830	202542	202862	FALSE	40	CCATCTCAAGCAATATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGCWSLLSQALPRLGPARWPGSPSEGLHTAHPGDSRSEAQGKGEMAQGREHSKGVPESRNMWLLKHTPPTAHTVTPEIKVSSTLSQPKSLHTRFPQLALMAMTR	201812	203461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_202184_202403
812308	contig_7707_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_72216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768946	767236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_767200_768900
812309	contig_8616_pilon	+	716	6	Intergenic	novelGene_72554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1151.06778253933	103	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	216	641	427779	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFSAESPWRLGPCTHILKTGGPSRPSLLLSTAGLRSACSPHHPTSTLAKPTAPLNFSANFLPARFQHLRVTMDSVCLRAMPLPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425755	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427807_435785_435900_435993_436119_436357
812311	contig_17768_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_140396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57960	59767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_58000_59800
812312	contig_14698_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_168134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAAAGTGAATCTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101375	102898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_101400_102900
812313	contig_7179_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_78204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTATGTATTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656451	1655319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1655300_1656500
812314	contig_12638_pilon	+	1354	10	Intergenic	novelGene_33298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	95.3303547838246	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	470	1084	1256219	1283566	FALSE	30	TACCCTGGAACCACAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVGSLVVIVCLSFFLLSSWDFIPAVYGFILSVPDLTPNIGLFWYFFAEMFEHFSLFFVCVFQINVFFYTIPLAIKLKEHPFFFMFIQIAVISIFKSYPTVGDVALYMAFFPVWNHLYRFLRNIFVLTCIIIVCSLLFPVLWHLWIYAGSANSNFFYAITLTFNVGQILLISDYFYAFLRREYYLTHGLYLTAKDGTEAMLVLK	1176596	1283836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1176714_1190109_1190175_1205821_1205882_1207256_1207320_1242583_1242682_1256152_1256308_1257964_1258109_1260881_1261007_1267724_1267868_1283452
812315	contig_2069_pilon	-	1246	2	Intergenic	novelGene_23329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGGTGCCCTGTCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588549	587045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_588164_588421
812318	contig_6048_pilon	-	805	5	Intergenic	novelGene_73099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	35.7027659992892	1324	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	87	545	223290	219453	FALSE	15	TTGGCACTGTCTCTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGTPPLSVGHGEWCCSVCVVRLAGAAAMEAVLNELVSVDDLLKFERKFQSEKVAGSVSKSTQFEYAWCLVRSKYNDDIRKGIVLLEELLPKGSKEEQRDYVFYLAVGNYRLKEYEKALKYVRGLLQTEPQNTQAKELEHLIDKAMKKDGLVGMAIVGGMALGVAGLAGLIGLAVSKSKS	223376	219192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_219551_219872_219979_220412_220490_222244_222378_223245
812319	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
812320	contig_1982_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_151342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425172	423432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_423400_425200
812321	contig_4812_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_103703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910451	912464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_910500_912500
812323	contig_10953_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_42545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGCTCAGAGAGGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376515	378084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_376500_378100
812325	contig_5649_pilon	-	2087	15	Intergenic	novelGene_82419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_14	19.8725531159672	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	162	1634	1383191	1348064	FALSE	5	TCCCTGTTTCAGCTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGAPAAGVAPVGTQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENDGRWMEYDRTETAVNNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMQLDEHDFLGQFSCSLGTIVSSKKMTRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRKLDKKDLFGKSDPFLEFYKPGNDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFAVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHDFIGEFQTSVSQMCGAHDGVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHVARFAAQATQQQTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFTAMEFLDGDSRTLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNLPPTNSELA	1383352	1347610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1348172_1349496_1349734_1357712_1357847_1359410_1359463_1365989_1366045_1368554_1368689_1370859_1370920_1372393_1372481_1373031_1373131_1374114_1374205_1374474_1374559_1375603_1375676_1378579_1378655_1380642_1380823_1383185
812327	contig_5928_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_40398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCGGTACCTAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376615	375267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_375300_376600
812328	contig_10596_pilon	-	652	7	Intergenic	novelGene_173590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_6	21.8816259806157	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	17	652	812769	802131	FALSE	20	GGGTGCAGGCGCCCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRAGVTKQDIREKIWDYMESQNLADFPRPVHHRIPNFKGSYLACQNIKELETFARTWNIKVGPDKPLEGVRLLALQSHKTLLVPTPRLRTGLFNKIIPPPGATKDILRKCATSQGVRNYSVPVGLDSRVLVDLVVVGSVAVSEQGWRIGKGEGYADLEYAMMVSMGAVCEETPVVTVVHDGQVVDIPEALLEDHDLTVDYVLTPTRVIMT	812785	802130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_802215_802517_802631_805195_805287_806271_806386_808121_808236_810055_810160_812753
812330	contig_9389_pilon	-	2354	1	Intergenic	novelGene_84113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACTTCTAGAATGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1400750	1398396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1398400_1400800
812331	contig_6440_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_161661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATGAAATAACTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22221	23554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_22200_23600
812332	contig_12871_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_140375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTCCTCTAGTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28751	29741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_28800_29700
812334	SIRV4	-	343	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	20	1158	-20	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
812335	contig_8671_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_126276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564861	565186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_564900_565200
812339	SIRV4	-	260	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1261	0	1261	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
812341	contig_14341_pilon	+	743	6	Intergenic	novelGene_111844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	4	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	78	692	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
812342	contig_5815_pilon	+	392	5	Intergenic	novelGene_141231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	14408.2615602126	123	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	21	368	1041346	1046032	FALSE	10	CCTTCGTGCGATTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDKTSPTESASGCPENVTRTKTHQTSSIHWLPMSLSPLSKIYRQSTWMRISS	1040936	1046056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1044211_1045493_1045607_1045993
812344	contig_5935_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_102744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGCAGCCCAGGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297318	1296435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1296400_1297300
812346	contig_14357_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_121677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAGCACCATAATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541531	539890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_539900_541500
812352	contig_870_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_176028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACCAAGGCCTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37994	36283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_870_pilon_-_36300_38000
812356	contig_14666_pilon	-	551	4	Intergenic	novelGene_39653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_2	2369.79609999585	1631	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3	395	492459	490408	TRUE	0	CTGCTGTTGGTTTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGLTFRRWAAGCSDIDSVLAIRTEAPPPRHHGGVLATGWAQVTKQARKVEGHPVRKSGSKHWNSGPQNKLRHEKRQDSPPLPVFKKCKNYIRYSQICAKAVRDALKTELKANAEKTSGHTVKIVKVKKE	492461	488759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_491165_491309_492333
812359	contig_1331_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_37859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCACCCTTTGTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248198	249463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_248200_249500
812360	contig_1331_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_37861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTAATCTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250386	250849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_250400_250800
812364	contig_5031_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_133208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAGAGGTCAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84040	84277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_84000_84300
812365	contig_10937_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_67302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGGGAAAGCCGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34545	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_33500_34500
812369	contig_14722_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_110216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCGGTATATAAATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55847	56376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_55800_56400
812370	contig_6509_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_145661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGTATGTGGAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219672	220364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_219700_220400
812371	SIRV6	+	441	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	345	514	172	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
812373	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
812374	contig_5415_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_146125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	271	609	26014	25676	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLWLFCADGQLRVEPGTYVRSYTELGDSLFPVLSSPGFFLLLSPYVYWLVHLTRKIGFSQSVSLLHCRAVLCNWGHLQGKVLRKPNSKTKSIAVELIPTHSDPIGQSRTAP	26284	25218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_25200_26300
812375	contig_11615_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_151257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACCCCCCCCTTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45134	45367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_45100_45400
812381	contig_16846_pilon	-	2213	1	Intergenic	novelGene_83000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAGAAACTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624935	622722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_622700_624900
812382	contig_15631_pilon	+	1600	4	Intergenic	novelGene_151537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.02768199119819	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	79	750	368010	369760	FALSE	30	CTGTCAAACAATTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQCHGPRLQLYSRSPSALRRARPPSRMQWAVGRRWAWAALLLAAAAVLAQVVWLWLGTQSFVFQHEEIAQLARQYAGLDHELAFSRLIVELRRLHPGHVLPDEELQWVFVNAGGWMGAMCLLHASLSEYVLLFGTALGSGGHSGRYWAEISDTIISGTFHQWREGTTKSEVFYPGETVMHGPGEATAVEWGPNTWMVEYGRGVIPSTLAFALADTVFSTQDFLTLFYTLRAYARGLRLELTTYLFGQDC	367931	370610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_368161_368310_368512_368633_368727_369533
812383	contig_6902_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_135586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGACCCTATAGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444643	443838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_443800_444600
812386	contig_15867_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_170892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCATTGTCAGAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96990	95335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_95300_97000
812389	contig_14362_pilon	-	1256	2	Intergenic	novelGene_142518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	490	918	37710	37282	FALSE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLKTATGTTAASPAPAAPPPWWAKASCPTETKCCARAAARQGPEAGLLGPGPPKPGLQDYGSLSIPPLGPRPLPKMGLPLGSKIQPPHPSISKLVLHDPGPPNLASYGASRIQAPTPTWILELSPLPYDLIPRPLHKSEL	38265	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37779_37844
812390	contig_11933_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_107254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCTCAATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111883	113004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_111900_113000
812393	contig_12841_pilon	-	1809	12	Intergenic	novelGene_55841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_10	17.4147273097435	52	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	226	1245	180521	169048	FALSE	65	AAAAAAAGTTAAAATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILQRGCSKFKLLGKIAWRSFLLICIGIVIVNPNYCLGPLSWDKVRIPGVLQRLGVTYFVVAVLELLFAKPVPENCASERSCSSLRDLTSSWPQWLFILLLESVWLSLTFFLPVPGCPTGYLGPGGIGDLGKYPNCTGGAAGYIDRVLLGDDHLYQHPSSAVLYHTEVAYDPEGILGTINSIMMAFLGVQAGKILLYYKDQTKDILIRFTAWCCILGLTSVALTKVSENEGFIPVNKNLWSISYVTTLSSFAFFILLVLHPIVDVRRLWTGTPFFYPGMNSILVYIGHEVFKNYFPFQWKLEDNQSHKEHLTQNIVATALWVLIAYILYKKKVFLKI	187231	168483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_169230_170777_170891_170981_171053_171690_171769_174319_174407_175984_176112_176780_176903_178907_179024_180397_180559_184092_184124_184859_184937_187151
812394	contig_9366_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_166245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGCATGACATTGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859071	858473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_858500_859100
812395	contig_9366_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_166244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857023	856392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_856400_857000
812396	contig_12479_pilon	-	1095	5	Intergenic	novelGene_56819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_4	13.5346776836392	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	254	793	46875	10864	FALSE	5	GTGCTGCTTGATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLVAVWDVALSDGVHKIEFEHGTTSGKRVVYVDGKEEIRKEWMFKLVGKETFCVGAAKTKATINIDAVSGFAYEYTLEINGKSLKKYMENRSKTTNTWVLHLDDEDFRVVLEKDTMDVWCNGKKMETAGEFVDDGTETHFSIGNHDCYIKAVSSGKRKEGIIHTLIVDNREIPEILE	57605	10561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_11014_14161_14212_46195_46425_46764_46898_57374
812397	contig_7057_pilon	+	1236	12	Intergenic	novelGene_123307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	779.247942167255	10	36	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	186	989	936984	943233	TRUE	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	935976	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943305_943539
812398	contig_14829_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_163827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	191	517	226861	226535	NA	30	AAGTTGATTCCACCTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVICISSKRNPLPSSLFQLIATLLDIIELPVGFPRLKSLQKQIATSFSGGTAGGFEPLTLQSAAECLNHYSTRLPLYLRRQVLFIILTSNRRPSKEEKHMHQNVNYR	227051	225931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_225900_227100
812400	contig_13828_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_158296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCAAACCAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417148	418532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_417100_418500
812402	contig_9366_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_166246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTAAAGGAGTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867209	867822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_867200_867800
812404	contig_7234_pilon	-	1083	9	Intergenic	novelGene_145936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	225.330555795258	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2	508	463571	411996	FALSE	20	GCTTTCATTAAATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSEILP	463572	411420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420181_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_449290_449340_454533_454602_463523
812408	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
812409	contig_3948_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_53349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAACTCAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508597	1509133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1508600_1509100
812412	contig_4156_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_88129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAAAGAGAAGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567550	568311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_567600_568300
812413	SIRV4	+	342	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACTGGGGCCGCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
812414	contig_12635_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_60833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTATTTATTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417886	416486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_416500_417900
812418	contig_9363_pilon	+	896	5	Intergenic	novelGene_6799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	230.285013624422	146	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	274	639	1622283	1625712	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPSEAPVSALPYFGSAFSLSLAQSPRPSQPSA	1622009	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623072_1625613
812420	contig_20822_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_170642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTCAGTTGTCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79543	80199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_79500_80200
812421	contig_6589_pilon	+	719	5	Intergenic	novelGene_25789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2022.82603985118	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	216	713	669670	672840	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENALYHEARRALLCHWLLPALHQRGSIHWSPDLCHPLQGDPEASPAWGQLRLLLCPGLGGLPPCPGQRHHLHPPAEAGVSTLRCLLPALPLHPEAPVPDCLPENKTI	668461	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_671126_671188_672584
812422	contig_9653_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_48210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAATCTTGTGGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238798	236713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_236700_238800
812423	contig_10451_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_138303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAACCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121099	120343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_120300_121100
812424	contig_10235_pilon	-	1640	5	Intergenic	novelGene_46554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	15.6264999280069	189	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	153	794	431644	430611	TRUE	15	TGTCTTCTGAGCTGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCAGESCPCSVALSAFPRD	431992	429570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430084_430897_431288_431651_431846
812425	contig_20332_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_156181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGAACGGCCGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641802	639839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_639800_641800
812427	contig_8795_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_146880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90456	92142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_+_90500_92100
812428	contig_5050_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_110248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGGTGTTACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111223	110769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_110800_111200
812431	contig_6595_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_122539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCATCACTCAATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538517	538189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_538200_538500
812433	contig_408_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_84927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173381	171582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_171600_173400
812434	contig_16831_pilon	+	1197	7	Intergenic	novelGene_134795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	51.1938038785511	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1188	10	1197	382417	611010	FALSE	40	GAGACAAAGCTTCTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVAAPSFPSAAAFWSRDFSDEEQSVVYVPGITAEGNTRSRHKLMSPKADIKLKTSRVAAASISMESLKGAGDSVEQQNFFKGGIKSASLKDLCLEDKRRIANLIKELARVSEEKEVTEERLKAEQESFEKKIRQLEEQNELIIKEREALQLQYRECQELLSLYQKYLSEQQEKLTMSLSELGAAKMQEQQVSNRKSTLRSSSVELDGSYLSVAKPQTYYQTKQRSKSANQDSASESLMEFRNNSLKPAALHHPSESLDRVPLETRKFNYSSPRRKPVDVAPKEKASPEELKMKECPDLKPPSSQCCGHGLSENAGHVHESHPTNMAPWCSSTHPESCIYCGLSWASLMHGRGALHPSETDVKKQLSEDRRQQLMLQKMELEIEKERLQHLLAQQ	382407	611010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_382475_389316_389353_390080_390224_404533_404629_434881_434998_529163_529292_610398
812436	contig_10235_pilon	-	1257	2	Intergenic	novelGene_46535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGGCCAGAAAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362322	360785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_360930_361209
812437	contig_10323_pilon	-	793	10	Intergenic	novelGene_123559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	290.094152447013	68	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	121	639	305132	273868	FALSE	15	ATTCCTACATGCTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVPPKVKCLTRIWHPNITETGDICLSLLREHSIDGTGWAPTRTLKDVVWGLNSLFTDLLNFDDPLNIEAAEHHLRDKVDA	309163	273713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_273880_275265_275329_277887_277921_278700_278759_279648_279720_285482_285551_292633_292700_295187_295218_305014_305149_309059
812438	contig_8558_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_123172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140278	1141012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_1140300_1141000
812440	contig_12894_pilon	-	3043	11	Intergenic	novelGene_140958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.04403065089106	13	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	313	2304	173298	126655	FALSE	30	TTTGGAATTAAAATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRRVDNSNTRLAVQIEKDPGGDDNNLNSIFYEHLTRALQESLCGDLVLGRWGNYSSGDCFILASDYLNAFVHLIEIGNGLVTFQLRGLEFRGTYCQQREVEAIMEGDEDDGGCCCCKPGHLPHLLSCNAAFNLRWLTWEITRTQYILEGYSIIDNNAATMLQVFDLRRLLIRYYIKSIIYFMVTSPKLLSWIKNESLLKSLQPFAKWHYIERDLAMFNINIDDDYVPCLQGITRASYCNVYLEWIQYCAQKQQEPSETLDSDEDSPLVTLSFALCILGRRALGTAAHNMVLSLDSFLYGLHTLFKGDFRITARDEWVFADMDLLHKVVAPAIRMSLKLHQDQFTCPDEYEDPVVLYETIQSFERKVVICHEGDPAWRNAVLSNREELLTLRHVVDEGTDEYKVIMLHKNFLSFKVIKVNKECVRGLWAGQQQELIFLRNRNPERGSIQNNKQVLRNLINSSCDQPLGYPMYVSPLTTSYLGTHRQLKNVWGRPVSLDSIQTWFQTKWLRMRKDCHVGQHSGGNIEDVDGARAPSTGHATGGESQESSAELPRKDGHHDEVSRTGRSQSVQAHGSLSQRPPILSLSGPILDSHQPFMQTSTSVHELAPRLSRSQLSLHNSSASLHSQPPPATTMGHLSVRERAEALIRSSLGSSTSSTLSFLFGKRSFSSVLVISGLSAAEGGNTSDTQSSSSVNIVMGPSARASGQATRHFSEPCEPVDATEQGQLCDGSLAGAVAENLGVMCRRASQEDMGLDDTASQQSASDEQ	215392	125915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12894_pilon_-_126829_129134_129572_138974_139139_140686_140962_141588_141820_142561_142707_161256_161370_163482_163717_173079_173334_204159_204376_215331
812441	contig_7426_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_27491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904828	905087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_904800_905100
812444	contig_9571_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_136283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAAAAAAAAATCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455019	456722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_455000_456700
812446	contig_405_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_135321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTGTTTCAAGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501353	499495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_499500_501400
812447	contig_8900_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_171634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAGCAATAAATAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370479	372467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_370500_372500
812450	contig_14838_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_151927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTCTGATGCTTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252060	253714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_252100_253700
812452	contig_5019_pilon	+	2352	2	Intergenic	novelGene_109218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	360	431	268800	268871	FALSE	15	TCTATTCTGTTGTGTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRVCWRRPGPAEPPCPLPPPPVPLRGRPRRSPENRRRSSSPERRSPGSPVCRGSEPNPPVLPGCVSPTVPSVETSASPGFSLLVHYRRCESGFGNLPPLRSQRGLAERTENCNFYLTLMPPLRFYLPTFVCIERFFSLIDD	268099	270792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_268180_268520
812454	contig_10235_pilon	-	1270	8	Intergenic	novelGene_46553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	25.7832408786033	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1158	111	1268	431644	429573	FALSE	15	TGTCTTCTGAGCTGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPASPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRHKLLKWWAQSFLPGVPNVVTGFRNPEGFICSLKTFPTMEMFENVRNDRDGWNPSVCMNFCAAFLSFAQSTVVQDDPRLVHLFSWEPSGPVTVSVHRDAPYAFLPTWYVEAMSRDLPSPPQDSLPPRTDASEGLVPSVCTDNKGIFLSGSPH	431950	429570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430084_430221_430355_430576_430660_430897_431288_431435_431542_431651_431846
812455	contig_8900_pilon	-	1882	1	Intergenic	novelGene_171626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236968	235086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_235100_237000
812457	contig_2341_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_84345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCTACTCACAGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32555	24188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_25249_32252
812460	contig_5020_pilon	+	808	6	Intergenic	novelGene_27836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1315.62091804592	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	314	751	124540	126023	FALSE	10	AACCTTGGTGTCTCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	118462	126080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119554_124444_124547_124909_125091_125657_125762_125877
812462	contig_9848_pilon	+	559	3	Intergenic	novelGene_79934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	6	junction_1	82	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGACAGTTTGGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89007	95575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_89082_90104_90219_95204
812463	contig_13176_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_159711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGGCACTCTCAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113551	111870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13176_pilon_-_111900_113600
812465	contig_6101_pilon	+	1992	2	Intergenic	novelGene_114288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337454	343353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_338387_342293
812467	contig_4838_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_144786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATAAGATTTACATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218083	218566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_218100_218600
812470	scaffold_15568_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_122582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAGATGATGGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70018	71328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_70000_71300
812473	contig_10003_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_88238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGGCCTCCATCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662111	662650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_662100_662600
812474	contig_8571_pilon	+	2047	2	Intergenic	novelGene_169176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGGAAAAGCAGGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433005	435573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_434673_435193
812476	contig_6929_pilon	-	2498	10	Intergenic	novelGene_139445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	29.773631552138	39	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	848	1597	351305	348169	FALSE	35	ACATGGTTTTAAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEESRQMMREKKVTILELFRSPAYRQPILIAVVLQLSQQLSGINAVFYYSTSIFEKAGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHLIGLAGMAGCAVLMTIALALLEQLPQMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGFSNWTSNFIVGMCFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVVFFIFTYFKVPETKGRTFDEIASGFRQGGAGPSDKTPEELFHPLGADSQV	378795	347267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_348370_348979_349184_350365_350468_350886_350992_351167_351356_351442_351606_352693_352936_353150_353312_365376_365473_378660
812478	SIRV6	+	440	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	242	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1545	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
812479	contig_5928_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_40373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAATATTTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229461	228882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_228900_229500
812481	contig_17074_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_145197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCATCGAACCTGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644636	643861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_643900_644600
812483	contig_6735_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_15834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676747	677261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_676700_677300
812485	contig_2550_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_135642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCTGAAGCTTTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479726	480548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_479700_480500
812488	contig_7839_pilon	-	1112	8	Intergenic	novelGene_45702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	19.9846880161298	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGTTTACCCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249646	228435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_228880_231906_231977_232135_232260_234883_234992_237435_237468_245753_245892_246509_246587_249527
812492	contig_21414_pilon	-	1377	8	Intergenic	novelGene_170481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACAGAAGGGCGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21877	11163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21414_pilon_-_11220_11843_11918_18909_19047_19298_19385_19467_20128_20924_21079_21211_21270_21725
812493	contig_7976_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_169406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCAATGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735866	737629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_735900_737600
812495	contig_5649_pilon	-	2626	12	Intergenic	novelGene_82352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	16.0927066278973	26	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	650	1657	862238	856146	FALSE	30	GAACGAATGCATGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSCVFWDATKGPTGDWASKGCSTEHRARRTVCHCDHLTFFTLLLRPILDKATVQVITYISQAGCGASMFFLAFTIVLYTVLRFFRQKLKSEDTPKIHMALSVSLFLLNLVFLISLGNGSQGSDAACWARGAIFHYFLLCTFTWMGLEAFHTYLLAIKVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLPALMVIGTGSTNSYGRYTIQDEENRTTLELCWFREKTALYVTVHGYFLIIFLFSATILALVAWKIFTLSSIAAGKEQGTNWKRVLTVLGLSSLMGWTWGLAILTPLGLPTVYIFALLNSLQGVFIFTWVTVLYFPRQSASSSGAAPADQTHSVSPG	875580	855176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_856253_856820_857096_858177_858272_858478_858760_861707_861821_861962_862064_862201_862242_862767_862904_863602_863750_865641_865781_870675_870836_875516
812496	contig_14133_pilon	-	1653	13	Intergenic	novelGene_119907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_12	16.7207455974108	86	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	32	1111	129584	123285	FALSE	20	TGCAGTGTCACTCGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPEPESEQIRLKCIRKKGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTDEVVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCITLQVLRGLQYLHRNFVIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTPTQTTSIDMWAVGCVLAELLAHKPLLPGSSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLASQYSLRKQPYNNLKHKFPWLSEAGLRLLNFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHHRNKRAASAAEGPSKRGRL	129615	122742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_123380_123620_123674_123950_124091_124246_124371_124641_124702_125128_125199_125328_125382_125889_125958_126305_126388_126575_126679_126799_126872_127642_127716_129497
812497	contig_15153_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_166453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102339	103153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_+_102300_103200
812500	SIRV4	-	441	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1055	25	1055	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAAGGTGGCGGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4103	3662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
812502	contig_6785_pilon	-	2425	7	Intergenic	novelGene_132594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	259.04595259443	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	110	1876	865289	834348	FALSE	75	TATACAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTKLKDLKITGECPFSLLTPAQLPKEPAEEDAEGSDCCKATPPICQDVPEKNVQENLPQRKTSRSRVYLHTLAESICKLIFPEFERLNLALQRTLARHKIKESRKSLEREDFEKIIADQAIAAGVPVEILKESFGEELFKICYEEDEHILGVVGGTLKDFLNSFSTLLKQSSHCQEAEKRGWFDDASILCLDKDHNFLNVYCFFPKRTTSLILPGIIKAAAHILYETEVEVSLMPPCFRNDCSEFVNQPYLLYSVHVKSTKPSLSPGKPQSSLVIPASLFCKTFPFHFMFDKDMMILQFGNGIRRLMSRRDFQGTPNFEEYFEILTPKINQTFSGIMTMLNMQFIVRVRRWDNSMKKSSRVMDLKGQMIYIVESSAILFLGSPCVDRLEDFTGRGLYLSDIPIHNALRDVVLIGEQARAQDGLKKRLGKLKATLEQAHQALEEEKKKTVDLLCSIFPCEVAQQLWQGQVVQAKKFNNVTMLFSDIVGFTAICSQCSPLQVITMLNELYTRFDQQCGELDVYKVETIGDAYCVAGGLHKESDTHAVQIALMALKMMDLSDEVMSPHGEPIKTAAACTTGYRKKNYTQ	865398	833798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_834399_834701_834846_840529_841016_842847_843558_852849_852909_858805_858868_865034
812503	contig_8865_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_164458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGTTGTTCCTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399932	399520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_399500_399900
812505	contig_3942_pilon	+	439	5	Intergenic	novelGene_128754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	41	427	793521	795407	FALSE	0	GCCGGTTCCCCTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792274	795419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
812508	contig_3747_pilon	-	1046	7	Intergenic	novelGene_24970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	98.6842608187006	356	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	159	602	220068	217418	FALSE	5	CAGCCTTCCTGTCCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLPYFIRPAVPKRDVERYSDKYQMSGPIDNAIDWNPDWRRLPQELKIRVRKLQKERTTILLPKRPPKTPEDKEETIQKLETLEKKEEEVTSEEDEEKGEEEEKEEEEEEYDEEEHEEETDYIMSYFDNGEDFGGDSDDNMDEAIY	226325	216973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_217505_217816_217928_218058_218133_218368_218426_218771_218841_220022_220186_226284
812511	contig_3818_pilon	-	1833	9	Intergenic	novelGene_99228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	20.2789145419571	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	21	854	383157	377332	TRUE	35	ATATACCTGGTAGAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDIRTMCPLLSMKPGEYSYFSPRTMSMWAGPDHWRFRPPHKQDASSKSENKKKSTKKDFDIDFEDDIDFDVYFRKTKAATILSKSTLENQSWKSTTLPTDFLYETNNLVQLHLKPGVRFFQAAQEQRAGAEQYEDLRHYDYNNPNDTSNFCPGLQAADSDYEESDNLFVGPTGAFDLTLCPGHPPKTMQENNDTPEVQGLDIMTYGESELVAEPQKVNKIEIHYAKTAKKMDMKKLKQSMWSLLTEFSKKQADAEVPGFPLISRCLIVQALEWLVSKSLGIP	383177	373103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_373609_374541_374618_375801_375894_377025_377533_378188_378372_379638_379750_381651_381775_382330_382438_383048
812518	contig_1009_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_121762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGCTAATATGTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291334	290825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_290800_291300
812520	contig_7179_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_78161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAATCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043353	1043657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1043400_1043700
812521	contig_11328_pilon	+	795	6	Intergenic	novelGene_88412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2522.77756451099	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	34	594	643683	647151	TRUE	40	TTAAATCATCTTTACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVARNPGPKHPRFSVLLLHVSCNTSVGVLL	643649	648033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645354_647064_647219_647899
812522	contig_18967_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_165326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAGAGCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101245	102210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_101200_102200
812525	contig_14687_pilon	+	1703	2	Intergenic	novelGene_107900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGAATCTGTTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415350	417370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_416249_416565
812526	contig_11590_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_125608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGACTGAGATGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865250	864672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_864700_865200
812527	contig_7457_pilon	+	683	2	Intergenic	novelGene_31353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGAATGTTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300008	301161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_300206_300675
812529	contig_16098_pilon	-	1763	6	Intergenic	novelGene_45806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	9.65401470891774	116	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	56	793	133249	131603	FALSE	5	TTCTTCCCTGACGGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASQTAPRHPSPPVLPPLPPPILTQWNCSPQSCPPASPSKRDPHQGQFIPSQPLTLPWTLRKRPQGHSCSRGESEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQLVLAGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDMLEHFQVHPIPLESGGSSDVVLVSYVVSSQRQQGEQSRSAGEEVPVHPRSEAGSRPGAMQGCAREIDATPMPPPPSCPSERVTV	134917	130632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_131605_131784_131885_132258_132484_132622_132836_133051_133256_134868
812530	contig_7229_pilon	-	1120	6	Intergenic	novelGene_39824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.464312323905	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	32	607	978686	898841	FALSE	5	CCCATGCCGTTGTGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDDDSRASTSSSSSSSSNQQTEKETNTPKKKESKVSMSKNSKLLSTSAKRIQKELADITLDPPPNCSAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFTPEYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYMTNLRYLATVDRIGNSNF	978717	898327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_898889_899094_899139_899986_900135_902753_902887_973898_973950_978534
812531	contig_14205_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_162113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12627	13234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14205_pilon_+_12600_13200
812532	contig_9011_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_159347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGTCTCCTAAATTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727548	725559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_725600_727500
812533	contig_1244_pilon	-	1373	11	Intergenic	novelGene_37935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.1621135177553	33	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	25	1071	870512	720716	FALSE	5	CCCCTGGCTGTGACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSEQAEQPSQPNSAPGSENVLPREPLIATAVKFLQNSRVRQSPLTTRRAFLKKKGLTDEEIDLAFQQSGTAADEPSSLGRATQVVPVQPPHLLPQPYSPVGSRWRDYGALAIIMAGITFGFHQLYKKYLLPLIVGGREDRKQLERMEASLSELSGSVAQTVTQVQTTLASVQELLIQQQQKVQELAHELAAAKATTSTNWILESQNINELKSEINSLKGLLLNRRQFPPSPSAPKIPSWQIPVKSPSPSSPAAANHHSSSDISPVSNESTSSSPVKESHSPEGSTYHLLGPAEEGAGVLDVKGQARSPEASAFRRLAQHLYQTDILSRVCLLSVFTLTPRMTRARP	870536	720413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_720727_720962_721081_721557_721799_723587_723680_727655_727754_728925_729029_732208_732295_755798_755928_813306_813392_851591_851640_870476
812542	contig_14868_pilon	+	1727	9	Intergenic	novelGene_150425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGAAGAACACCTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50441	89726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_50547_50755_50819_52398_52450_53513_53608_59854_59945_66900_67074_69348_69500_81297_81531_88959
812544	contig_13760_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_61369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAAAACACAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472279	473118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_472300_473100
812545	contig_20819_pilon	-	1926	9	Intergenic	novelGene_55689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	278	757	88313	87624	TRUE	30	AAAACACCTCTTCCGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMDKIEKMIKVILGAQGEVVLGNLKTWGDSESQGNLAYPDGNEGRMRHVKGLGGKRRTGRETQVKKDMGWGAEVHGEGWQIPGFGTSEVRLVLLELHHKVVNIDELSPGREGSELRLGQYPVESMIELDQLGQRSLNDTGSISEIGKTPHYVLTQRLH	88590	73582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_74027_74165_74226_74600_74734_75196_75351_76228_76361_76632_76714_87239_87356_87574_87693_87902
812546	contig_4824_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_176031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAATTTAAAAGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667111	668024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_+_667100_668000
812547	contig_5018_pilon	-	1363	9	Intergenic	novelGene_47186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	6.34305722818264	128	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	266	1213	1591397	1586939	FALSE	5	GCTGCTCAGTCCTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPEPKPRAPELPQKRLKTLDCGQGAVRAVRFNVDGNYCLTCGSDKTLKLWNPLRGTLLRTYSGHGYEVLDAAGSFDNSSLCSGGGDKAVVLWDVASGQVVRKFRGHAGKVNTVQFNEEATVILSGSIDSSIRCWDCRSRRLEPVQTLNEARDGISSVKVSDHEVLAGSVDGRVRRYDLRMGQLFSDYVGSPITCICFSRDGQCTLVSSLDSTLRLLDKDTGELLGEYTGHKNQEYKLDCCLSERDTHVVSCSEDGKVFFWDLVEGALVLALPVGSGVVQSLAFHPTEPCLLTALGGSVQCWREEAYKAEGGAG	1591662	1586788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1587089_1588169_1588285_1588368_1588478_1588568_1588637_1590294_1590422_1590506_1590556_1590906_1591013_1591093_1591215_1591294
812548	SIRV6	-	335	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAGCCGAATTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	11489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
812549	scaffold_8345_pilon	-	638	2	Intergenic	novelGene_107021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTCCACATGAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598727	591086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_591121_598123
812550	contig_11978_pilon	-	710	7	Intergenic	novelGene_62998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAACCACCCTCGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527344	1517284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1517352_1517682_1517738_1517787_1517869_1520333_1520440_1523597_1523777_1526093_1526190_1527218
812551	contig_10299_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_79807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAACCTTGCTGCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952995	954323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_953000_954300
812552	contig_10299_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_79808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTCAAGATATATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954971	955692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_955000_955700
812554	contig_10857_pilon	+	984	8	Intergenic	novelGene_160875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1537.31211229608	115	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	81	620	21903	62184	TRUE	0	GCGCTGCCTCTCTGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAKRLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSCKDIVAGDMSKRSLWEQRGGSKTSSTVKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVDEDVAP	21822	66899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21919_58780_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61962_62094_62198_66548
812556	contig_19825_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_59689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCCTTAAGAAAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40495	37696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_37700_40500
812557	contig_8075_pilon	-	977	4	Intergenic	novelGene_42481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	26.1916017074176	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	353	742	613028	606255	FALSE	25	CTGAATCAGCCTAGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRLKLILKCSWLQNLPLLQLRKMAALSLQHSMIPEVWKFCANLSHSFCVENPFQNECFRPKHWYHIILMQGIVVTWRILPNFLKQDLNLPGSMVIFYLISRKMNSSKCSVLEKIHGRSSLVLLQAGW	620529	606019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_606528_612911_613036_616670_616837_620350
812558	contig_7165_pilon	+	1892	7	Intergenic	novelGene_116878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	54.7461312686923	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	139	1512	677174	708464	FALSE	65	TTAAAAAAAAAAAAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSLLDICLNFLTTHLEKFCSARQDGTLCLQEPGVFPQEVADRLLQTMAFHGLLNDGTVGIFRGNQMRLKRACIRKAKISAVAFRKAFCHHKLVELDATGVNADITITDIISGLGSNKWIQQNLQCLVLNSLTLSLEDPYERCFSRLSGLRVLSITNVLFYNEDLAEVASLPRLESLDISNTSITDITALLACKDRLKSLTMHHLKCLKMTTTQILDVVQELKHLNHLDISDDKQFTSDIALRLLEQKAILPNLVSLDVSGRKHVTDKAVEAFIQQRPSMQFVGLLATDAGYSEFLTGEGHLKVSGEANETQIAEALKRYSERAFFVREALFHLFSLTHVMEKTKPEILKLVVTGMRNHPMNLPVQLAASACVFNLTKQDLAIGMPVRLLADVTHLLLKAMEHFPNHQQLQKNCLLSLCSDRILQDVPFNRFEAAKLVMQWLCNHEDQNMQRMAVAIISILAAKLSTEQTAQLGAELFIVRVSLLPSLCRPLESSGFQTVLYIF	677035	708844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_677187_682139_682895_693736_693878_699093_699271_703815_703881_708009_708110_708341
812559	contig_6654_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_85704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGCTCAGCTGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158876	159430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_158900_159400
812560	contig_6654_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_85705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCAAGGAGGAGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159430	160674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_159400_160700
812562	contig_9995_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_47768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	148	345	716357	716160	NA	40	TATTTATAGAAGCCGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLQSKNGLNYLKIEKWLNKFCPIHLTKYHTTIKITLSERFSDTVISQIMMCHEVEEKRIATCNSNFIRKNMHAQENDHIEIPQKCSWSLVMSLGGGIACDFFFISKLLYNKHV	716504	715636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_715600_716500
812566	contig_8291_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_99943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGTGGTCCTGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199249	200549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_199200_200500
812568	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1165	3	1165	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
812569	contig_3202_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_167394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATACATACATATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80663	79799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_-_79800_80700
812573	scaffold_16539_pilon	+	883	5	Intergenic	novelGene_68331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	188	junction_1	185.920682012518	1804	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	154	774	415666	433538	FALSE	25	TAGAGGACCGGACTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIKKIAIFGATGKTGLTTLAQAVQAGYEVTVLVRDPSRLPPEGPQPAHVIVGDVRKAADVDKTVTGQDAVVILLGTGNDLSPTTVMSEGAQNIVVAMKAHGVDKVVACTSAFLLWDPAKVPPRLQNVTDDHIRMHKVLQESGLKYVAVMPPHIGDEPLTGAYSVTVDGRGPSRVISKHDLGHFMLHCLTTDEYNGHNTYPSHQYE	415512	433647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_415745_424683_424849_424983_425074_429264_429394_433380
812576	contig_4505_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_176042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192319	193272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_+_192300_193300
812577	contig_5153_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_74338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1171	1494	641390	641713	NA	30	GCAGGCCTTGAGACCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWACGGGGLLPRRMSHSHDSLAAPLCGHTSASAAGAGWPCAGTVSAMPPCMFVCLPPPPGVHTHMPLHTCACWCAPSLLEAKAQQTAGCPVWEHGFTLLLTECGVEG	640219	642114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_640200_642100
812578	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	16	360	14409	13842	FALSE	25	ATAGCTGCTGGTACCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAA	14424	13840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
812579	contig_12630_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_173062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTTTTGTGGTGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32612	31416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_31400_32600
812581	contig_500_pilon	+	1874	10	Intergenic	novelGene_31127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	47.2866227527197	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	15	875	1740213	1774828	FALSE	45	CCAAAGTAAATAATTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLRARGAVSVGGLLQRVSPCSLLPGLRGLTSSSVRPGEDSWLKSLFVRKVDPRKDAHSNLLAKKETSSLYKLQFHNVKPEYLEAYNKICQEVLPKIHEDKHYPCTLVGTWNTWYGEQDQAVHLWRYEGGYPALTEVMNKLRESQEFAEFRKARSDMLLSRKNQLLLEFSFWNEPVPRSGPNIYELRSYQLRPGTMIEWGNYWARAIRFRQDGNEAVGGFFSQIGQLYMVHHLWAYKDLQTREDIRNGVWHKHGWEELVYYTVPLIQEMESRIMIPLKTSPLQ	1740198	1775827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1740305_1755485_1755626_1755708_1755755_1758980_1759076_1759406_1759478_1760559_1760701_1761554_1761587_1771929_1772025_1772907_1772992_1774763
812585	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
812587	contig_14142_pilon	-	1368	8	Intergenic	novelGene_120464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	12.1755861443786	48	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	210	1193	121833	119738	FALSE	35	AGAGCTGAGTGCAGTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWDALKYLIAGVNYGGHVTDDWDRRLLTTYINDYFCDQALSTPSYRLSVLETYFIPKDGSLASYKEYISMLPGMDPPEAFGQHPNADVASQITEARTLFETLLSLQPQITPTGTGGQSREEKVLELAADVKQKIPEMIDYEGTRKLLALDPSPLNVVLLQEIQRYNKLMETILFSLTDLEKGIQGLIVMSTSLEEIFNCIFDAHVPPLWGKGYPSQKPLAAWTRDLAMRVEQFALWASRARPPVIFWLSGFTFPTGFLTAVLQSSARQNNISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVWVRGLYLEGAGWDRKNSCLVEAEPMQLVCLMPTIHFRPAESRKKTAKGMYSCPCYYYPNRAGSSDRSSFVIGIDLRSGTMTADHWIKRGTALLMSLDN	122286	119562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_119893_120040_120192_120362_120438_120535_120713_121210_121326_121445_121598_121674_121904_122147
812589	SIRV4	-	224	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1294	3	1294	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3864	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
812592	contig_20951_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_43138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTATGTATAGCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337873	337006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_337000_337900
812593	contig_2342_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_132757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTAAAACTGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241816	240862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_240900_241800
812594	contig_2342_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_132756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTATGCCTTTGTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240756	239820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_239800_240800
812598	contig_9146_pilon	-	657	7	Intergenic	novelGene_79485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1835.22000649029	171	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	24	647	147490	142514	FALSE	25	ATGTTTGCACCTATGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFRRFVEVGRVAYVSFGPHAGKLVAIVDVIDQNRALVDGPCTQVRRQAMPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTSEGWASKSSEGPESPSPENTCSEGIGQESIDGCYKSNKVSF	147513	142503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142641_142705_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_146997_147487
812600	contig_19186_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_176046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTCTAGGGTTTTCCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33571	34987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_33600_35000
812602	contig_678_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_167848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACCTGGAATTTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502310	504004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_502300_504000
812605	contig_6048_pilon	-	1579	9	Intergenic	novelGene_73219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.5323059086064	3	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	43	1266	1643326	1609163	TRUE	15	GTGAGCAGGCCCTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGMTSILMSAIGLPVCLSRAPQPASPPASCLASKSHSSVKRLRKMSMKGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1643368	1608724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1608984_1609108_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1627230_1627372_1634441_1634567_1643078
812606	contig_12626_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_80458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAATGTAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174834	175710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_174800_175700
812607	contig_15066_pilon	-	1468	10	Intergenic	novelGene_149551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_8	136.551261120431	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	751	1377	113086	111830	FALSE	25	GTAAAGGGAGGGATGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGWQPLPWVPPTWPWIVFCRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSAPSSFPSSPGPSPDVQLATLVHRVKEVLPHVPLGVIQRDLARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114408	111738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112487_112608_112743_112847_112954_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324
812608	contig_8260_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_163241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126618	127013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_126600_127000
812611	contig_2027_pilon	+	1681	13	Intergenic	novelGene_39919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	181.455458262719	1	54	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	18	806	146413	148249	TRUE	5	TGCTGCCTGCCTACCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNVINMHNVKVGVGQEAGAQVGPHLHTPPQRSPRNGLFPFGCFTGSSWRVLGPCLHLYGKVLGSFPVWEGEQCWLGVGLVDTP	146395	150940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_146524_146606_146733_146821_146879_146977_147093_147768_147864_147964_148399_148649_148823_148930_149029_149113_149220_149304_149348_149494_149586_150639_150718_150803
812613	contig_6674_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_147984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAGGAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53133	50777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_50800_53100
812616	contig_6192_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_170346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGCCCGTTTGCTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836993	837268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_837000_837300
812620	contig_6589_pilon	-	1117	10	Intergenic	novelGene_25914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	220.000505049925	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	650	973	1160565	1158634	FALSE	35	AGAAGGAGGGCATCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178516	1158489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160978_1171911_1172004_1176090_1176151_1176854_1176938_1177210_1177243_1177923_1178100_1178424
812621	contig_21203_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_84493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111958	112365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_112000_112400
812622	contig_8365_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_150909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1648	2022	30773	62551	FALSE	50	GAATCACACATGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLQLHTVLLGRLQSTPISSVHLPALGRRLTEEVVNHIKFFLFHYHKALLFGIFPIDVRRPLNKERVQVIHPLPRNGKPVLWLLSSSAILLDHGGRVGGKGFSHRFSHLDAQKHGRSLAFLFF	29125	62564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_30989_62392
812623	contig_1719_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_87303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTATATTTATAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406770	410344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_406834_408898
812626	SIRV4	-	258	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1265	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3893	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
812627	contig_11978_pilon	+	1485	2	Intergenic	novelGene_62783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	228	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	161	487	155432	156422	FALSE	5	CTGCCCTTCCACTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKPSASSPSDQATPASSSANFTEIDEASASSEPEEAASQLSSPSLARAQPEPMATSTAAPEGQTPQIFPWMRKLHISHDMTGPDGKRARTAYTRYQTLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDNKLKSMSLATAGSAFQP	155271	157420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_155511_156174
812628	contig_13593_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_156116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGACCTCATGTTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43473	42626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_42600_43500
812629	contig_13593_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_156115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGCTTACACCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42038	41664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_41700_42000
812631	contig_4103_pilon	-	1006	9	Intergenic	novelGene_51925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	436.594706220769	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	404	853	87845	77689	FALSE	10	CCTACTGTCTTATCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRAAPTSAPPSKSRHHEKPEDKKQLGDFFGMSNSYAECYPATMDDMAVDSDEEVDYSKMDQGNKKGPLGRWDFDTQEEYSEYMNNKEALPKAAFQYGIKMSEGRKTRRFKETNDKAELDRQWKKISAIIEKRKKMEADGVEVKRPKY	91952	77535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80646_87789_87883_91263_91331_91653
812632	contig_6175_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_16290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	78	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTGGTGGGATTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389907	1396597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154
812634	contig_6163_pilon	+	2003	15	Intergenic	novelGene_103832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_4	38.4368020925524	60	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	107	1858	359389	362504	FALSE	20	TGTCGCCAAGGAAGGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWKPSCCSGHYGSECRACPGGPSNPCGNHGVCLDGMSGSGQCRCHSGFTGTACELCAPGAFGPRCQACHCSSHGRCDEGLGGSGACFCDEGWTGLRCEVQLELQPVCTPPCAPQAVCRENNSCECSLGYEGDGRECTVADLCQDGRGGCSEHANCSQVGTVVTCTCLPDYEGDGWICQARNPCEDGHRGGCSEHADCLSTGPNTRRCECHAGYVGDGLQCLEEAESPVDRCLIRPRPCHVDAVCTDLHFQEKRAGVFHLQATSGPYGLTFSEAEAACEAQGAVLASLPQLSAAQQLGFHMCLVGWLANGSAAHPVVFRAADCGDGKVGIVSLGARQNLSERWDAYCYRIQDVECQCRDGFVGDGTSMCNGKLLDILAATANFSTFYEMLLDYANATQQGLDFLDFLDDELTYKTLFVPVNEGFVDNMTLSGPDLELHASSTTFLSANASQGTLLPAHSGLSLVISDLGPGNSSQAPVVPGAVVVGGVIQWDIIAVNGIIHALASPLLAPPQPRAALAHEAPPVVASVGAVVAAVALLGLVAGAFYLHARGKTTGFGFSTFQAEDNADDDFSPWQEGTSPTLVSVPNPVFGSPDAFCEPFDDSLLEEDFPDTQRILEVK	358873	362649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_358924_359332_359483_359578_359684_359847_359956_360041_360236_360334_360480_360562_360697_360784_360951_361032_361143_361238_361359_361440_361591_361665_361771_361844_361992_362080_362198_362447
812636	contig_6915_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_162420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAGTAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264919	263224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_263200_264900
812637	contig_1007_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_176053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAGGAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291229	293360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1007_pilon_+_291200_293400
812638	contig_13744_pilon	-	1127	5	Intergenic	novelGene_77171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	13.7908484148003	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	94	717	531986	512480	FALSE	35	GTAGAAATATTTTGCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTEAVPDLGRWGLGTSERAQRLFWDQWLLGAMTDRSSLFSHQTFGDRVLYPASWVIPLFVAFSTIGAANGTCFTAGRLVYVAGREGHMLKVLSYVSVKRLTPAPAIIFYGIIATIYIIPGDINSLVNYFSFAAWLFYGMTILGLVVMRFTRKELERPIKVPIVIPILMTLISVFLVLAPIISEPTWEYLYCVLFILSGLVFYFLFVYHKFGWAQRISKPITMYLQMLMEVVPPEEEPK	532079	512069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_512545_514588_514764_523043_523194_524181_524279_531849
812639	contig_504_pilon	+	1602	2	Intergenic	novelGene_54405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAGGAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29208	31756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_29887_30832
812640	contig_7411_pilon	-	1496	5	Intergenic	novelGene_137047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	19.7547462651384	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	7	1209	916738	902236	FALSE	20	TTTACGAGATCCTCCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNVKASVPVGAKEEQDKKGWSRQGRARVWEETEQKAKKLKSNEDEGQSTKLPKRKVVLLLAYSGKGYHGMQRNAGSSQFRTIEDDLVSALVQSGCVPESHGEDMKKMSFQRCARTDKGVSAAGQVVSLKVWLIKDILEKINNHLPSHIRILGLKRVTGGFNSKNRCDARTYCYMLPTFAFAHKDQDVQDESFRLSAETLQRVNGLLACFRGTHNFHNFTSQKGPQEPSARRYILEMHCGEPFVREGLEFAIITVKGQSFMMHQIRKMVGLVVAIMRGHAPESLLEQSWGPAKVDVPKAPGLGLVLERVHFDRYNQRFGGDGLHEPLDWVAEEGAIAAFKECHIFPSIVDTERRERSMAQWLSTLPAHDFSASALTMAGGAPKASSPLRGSEEGEGDTD	916744	901948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_902287_907139_907832_912562_912666_914925_915064_916519
812641	contig_8687_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_169652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTACATAATAGAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21773	19646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_19600_21800
812642	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_2780
812643	contig_9828_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_172251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAATACAAAATGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119228	120383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_119200_120400
812645	contig_9415_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_109863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2008712	2006802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2006800_2008700
812650	contig_12951_pilon	+	1732	3	Intergenic	novelGene_68156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	12	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	76	732	218904	224359	FALSE	15	TCTCTACTTGGTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSFLVRKPACSRRRPNYSELHDSSLEFTFQQPYDQAHLLAAIPPPEVLNPTASLPTLIWDSLLVPQVQPSGWASLRPQECPKAAELTSLSDEDSGKGSQPPSPPSPASSSFSSGSASSLEAEAYAAFPGLSQVPKQLAVLAVAKDPQSRKAFNCKYCDKEYVSLGALKMHIRSHTLPCVCDTCGKAFSRPWLLQGHVRTHTGEKPFSCSHCSRALR	218828	225359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_218986_219624_220153_224312
812651	contig_7695_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_41683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048320	1047281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1047300_1048300
812653	contig_11328_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_88380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACATCTCTCTGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598795	598124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_598100_598800
812654	contig_10800_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_152622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGCCCCCACGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434656	436378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_434700_436400
812656	SIRV6	+	460	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	346	50	173	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
812657	contig_17198_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_62398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTCCCAGAAGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079924	1080513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1079900_1080500
812660	contig_9375_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_136082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	636	941	643997	643692	NA	30	CCTAAAAATCTCCCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQVVKGKAGNVEAGRLPEPAEVLLSFSSYSSSFRDMENSVHPFSSFSALASQEGYPRGACVSLLLKLPQIPEGQAISNVFYFLVLAQGLLPAGLLCLARA	644632	643531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_643500_644600
812661	contig_8050_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_114843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGTTAAAAATGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349302	350051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_349300_350100
812662	contig_6726_pilon	-	901	5	Intergenic	novelGene_86212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	524.966367970368	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	16	387	76688	41423	FALSE	25	AGTTATTTTTAGTTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSVKMAKVSELYDVTWEEMRDKMRKWREENCRNSEQIVEVGEELINEYASKLGDDIWIIYEQVMIAALDYGRDDLALFCLQELRRQFPGSHRVKRLTGMRFEAMERYDDAIQLYDRILQEDPTNTVS	76703	40908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_41490_49977_50064_52417_52483_53014_53129_76648
812664	contig_1694_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_144995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	1699882	1699568	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLDRKKKVAIELIPTHSNPVCCRVELCSVEFSWLCPFGSRPPTLSSTVPLAEFKPPTFLVVSQVLNCLHHPGIAITKQTKTKPIAVELILTDSDPVRQSRTAP	1699882	1698532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1698500_1699900
812670	contig_9696_pilon	-	993	4	Intergenic	novelGene_68767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	362.340846288255	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	79	402	150836	138024	TRUE	35	AATTAAAATGTTCTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLSDDYDPYAVEEPSDEEPALSSSEDEVDVLLHGTPDQKRKLIRECLTGESESSSEDEFEKEMEAELNSTIKTMEDKLSSLETATMVLEYKAHVNNSLFLIVMPS	150914	135834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_136383_137980_138092_146412_146595_150762
812672	contig_13014_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_169346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAAAGTTCTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391994	391395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_391400_392000
812673	contig_16442_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_172294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATACATTTCAAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4735	3854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16442_pilon_-_3900_4700
812674	contig_8418_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_166072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAGTAAATACAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213984	1215176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1214000_1215200
812675	contig_13097_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_107674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCTGTGCTCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51196	49748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_49700_51200
812676	contig_5918_pilon	+	1462	2	Intergenic	novelGene_99638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCCCCCACCCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2260356	2261981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2260903_2261065
812677	contig_9195_pilon	-	1428	8	Intergenic	novelGene_155695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_5	8.02546966010751	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	206	1039	823352	757166	FALSE	60	TTAAAACAAAGAGAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGDTVWAPSILPHDFLGVLSQHPQPHFGRRMESKVSEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGETVKKMREESGARINISEGNCPERIVTITGPTDAIFKAFAMIAYKFEEDIINSMSNSPATSKPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGSKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAVTISGTPDAIIQCVKQICVVMLEVHCRRGAQPAQGGLPSPLAEARPSSWEPAAQPRCDWPPLGSGPPAHPSRGCPGHGCLPVSCGQRLAVWGDHGRPWGV	899640	756776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_757529_758193_758326_764841_764959_765335_765369_768133_768158_770862_771018_823342_823479_899561
812679	contig_7022_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_142140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTGGTCTACTTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107738	106208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_106200_107700
812682	SIRV3	+	321	2	Antisense	novelGene_SIRV3B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTAACTGCTTACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998	1684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_+_1168_1532
812683	contig_19604_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_77222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTTTGGCCTTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100514	101504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_100500_101500
812685	contig_12810_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_145702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGACGTATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351671	350352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_350400_351700
812686	scaffold_880_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_121420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATCAACACTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357930	356611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_356600_357900
812687	contig_7292_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_175371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTACTTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263265	264389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_+_263300_264400
812689	contig_5586_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_143493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100982	100222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_100200_101000
812690	contig_6710_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_96812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	657158	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657159	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
812692	contig_2377_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_67929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGACGAGAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368239	369952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_368200_370000
812693	contig_9528_pilon	+	971	8	Intergenic	novelGene_172338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_6	33.5851035977778	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	2	970	168362	218550	FALSE	20	GGGAATATGCTGTGAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAIDAAINRNSSNLPLPLPPKKTRIISHVWENNHPFQIVLVKGNKLNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVSAEISGKSDHIWNELLEFDINTCDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVFDFKGQLRSGDITLHSWSSFPDELEEMLNPMGTVQTNPYTENATALHIKFPENKKQPYYYPPFDKIIEKAAEIASSDGANVSSRGGKKFLAVLKEILDRDPLSQLCENETDLIWTLRQDCRENFPQSLPKLLLSIKWNKLEDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYV	168360	218551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_+_168446_169353_169432_175583_175836_176174_176272_179908_180040_182500_182552_198543_198733_218463
812695	contig_19098_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_65792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGGAGTCCTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93608	93963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_93600_94000
812697	contig_6424_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_109261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	129	344	20105	19890	NA	60	AACTGAAAAGAGGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLSPAFLFQASRKPPLCALRKTLWGFLGCLHFLSCVFSAVTMPGAVLLFLPAHLKVPSGLLSADKGAGPLAFVRKAEPWTKAFWVLLQPPLRPYPGMLFYSGVTNHLAPRGA	20233	19527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_19500_20200
812700	contig_5649_pilon	+	871	7	Intergenic	novelGene_82358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAGCGAAAGTCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976160	980774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_976258_976516_976637_977349_977506_978193_978307_979027_979145_979895_980075_980685
812701	contig_6418_pilon	-	933	12	Intergenic	novelGene_81105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.298876743958	4	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	45	908	106563	68237	FALSE	20	CAACTACTTTGTTCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSTMCLSVLCHR	117999	68211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68269_71819_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117966
812702	contig_14720_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_164995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCCTCTGGGTGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229558	229857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_229600_229900
812703	contig_10734_pilon	+	1955	2	Intergenic	novelGene_51542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1232	1543	2343040	2343351	FALSE	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNQEIVNWILSKCYLFSRCTDKHARVDARTRVFFFFRSTFRQGLVIGSKPVIYPVLHWLLQRTNDLKKRAYLARFLIKLEVPSEFLQDETVADTNKQVHNM	2338879	2343763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2338911_2341839
812704	contig_15849_pilon	+	1715	1	Intergenic	novelGene_176063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAACAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96704	98419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_96700_98400
812705	contig_3956_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_14770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCACATCTTTCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922014	920495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_920500_922000
812706	contig_4812_pilon	-	400	3	Intergenic	novelGene_103682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_2	1451.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGATGTTGGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82733	81547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_81739_82268_82343_82598
812708	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
812709	contig_15114_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_121242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATTCAAGTTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702310	1703493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1702300_1703500
812711	contig_4422_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_155956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATCTCCAAAGACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58438	58756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_58400_58800
812716	contig_12948_pilon	-	1284	6	Intergenic	novelGene_126191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	19.8131269616888	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	341	775	207573	204814	TRUE	55	TAAAAAGAAAATTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPGTVYQKYEPVFFQSIGNPFIFRCLDGVLIDGNDKGISKVVYRSCNGRDQLGPLKMSDSTWLTSEMHNPLAVGQYVNNCSNDKAANVCYQEFDVPAVFPVELKQYLPNIAYSYDKQRLVFYKSSSYLLPYAVLKNFFSEKAI	209702	203088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_203590_204805_204999_205869_205986_206247_206372_207563_207792_209580
812717	contig_6069_pilon	-	1429	6	Intergenic	novelGene_8007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	66.7850282623284	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	857	1249	71527	71135	FALSE	15	CTGGAGCTGCCCAGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVTCTGSCGVSNKINDATWVVEEGYFNSSLSLADKGSLPAGEHNFPFQFLLPATAPTSFEGPFGKIVHQVRATIDTPRFSKDHKCGRVFYILSPLNLNSVPDIEQPNVASVTKKFSYKLVKTGSIVLTASTDLRGYVVGQVLQLQADIQNQSGKDTGPVVASLLQKVSYKAKRWIYDLRTIVEVEGAGAKAWRRSEWKEQILVPALPQSALPGCSLIHVDYYLQVSLKAPEATVTLPVFIGNIAVNHTPLRALPGLASPPSQGVPSAPPQEEVEAEAVAGAPHFMDPVVALATKSHWQPPLPATFSAASGAPEPCAQDRSPASHTLPPPLCISTGATVSYFADGPGGPVPATSTLIPPPAYSSWGYPHGESGAGRVPGRGASRAPCRPHSLPTEAPPSYEQSCSDADLGQSPGS	73207	70954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_71708_71792_71970_72067_72251_72427_72583_72689_72741_73097
812718	contig_7411_pilon	+	1271	10	Intergenic	novelGene_136996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	62.64006527597	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1203	69	1271	232588	249199	FALSE	15	TCGGAGGACCTGCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPEEGEQAQQQPWGRLLRLGAEEGESHILLWKREWTIGRRRGCDLSFPGNKLVSGDHCKIIVDEKSGQVSLQDTSTNGTVINKLKIVKKQTCPLQTGDVIYVVYRKNEPEHNVAYLYESLKEKQGVTQESFEANKENVFHVTKDTSGAGSGGDAQALPPPPATPTCFEEPQPSTSTSDLFHTASTSSVEPASVGQEQISMSGPGGAVPPSQGCGPTVADEEASSSVSVLPDTEGRPLCLSEPQGWEDWEPTKKKMRGDGEPRLSPRLLVADLCQDAPAGREDSRAAAVKPDRMEETLTCIICQDLLHDCVSLQPCMHTFCAACYSGWMERSSLCPTCRCLVERICKNHILNNLVEAYLTQHPDKGRTEEDLRSMDARNKITQDMLQPKVRRSFSDEEGS	232308	249199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_232365_232575_232718_237819_237920_241058_241169_242816_242877_243006_243217_245868_246037_247558_247719_248852_249008_249089
812720	contig_3942_pilon	-	1867	4	Intergenic	novelGene_128837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	215.215137840152	18	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGAGTCCCTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284865	1276216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1276393_1276599_1276670_1276972_1277045_1283316
812722	contig_1694_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_144971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	338	664	1589752	1590078	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTKVTVSMKVGFQEIVAAMKETFLQSCLQSTLKALIIHQSLEAGSHSSIPDRGTNLNFQKILQRTFNSLNNLSCVSGNSSYVSQVPHLQIFFHTSNKPRCQDLQHL	1589414	1590715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1589400_1590700
812724	contig_6710_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_94850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
812726	contig_17157_pilon	+	903	8	Intergenic	novelGene_171738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_3	38.8066899345135	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	239	901	20141	31660	FALSE	25	TCCTGTCTTGTGGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYVAAFAVSAYASSYFRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPISACHAESRNFVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPAFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLNDDSCHCKVNFIKAKYWSTNSHEIEGTVFDKRGKPVHRLFGKWHESIYCGGSSSSACVWRANPIPKGYEQYYGFTQFALELNEVDPLSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRERRRVLEENNLEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLD	5177	31662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17157_pilon_+_5317_16049_16114_20105_20185_21497_21643_22845_22991_26192_26320_27998_28122_31581
812729	contig_5280_pilon	+	951	5	Intergenic	novelGene_52648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.944208299407	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	21	872	258898	293071	TRUE	35	GGAATTTATACTTTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQFGFWMCLGRMGASSPRSPKPPGPPAPCLSCAGGALLAVLVLLALPAAWGQCKAPEFFLFAKPVNLTDESEFPIGTSLKYECRPGYYRKLLPPIICLENSIWSSLENLCKRKSCRPPPDPVNGIVHVNTGIEFGSTVNYSCNDGFRLIGHSSNTCIISGKTITWEKEAPICERELKSSFQLPLPIDPISPWNYKNLNQIPFLHFFLQIAEDSCNVLKYTYGVSESCFLKLFLILGRSFSGSGNLIHKILQTSFSFQLTCNCVGSTIPSTIIILLDNLVKIFRSDTIYP	258877	293197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_259031_272773_272957_273638_273739_292635_293132_293178
812730	contig_5280_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_52655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCGGCCATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293197	293441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_293200_293400
812731	contig_15897_pilon	+	2602	1	Intergenic	novelGene_49581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAGAAAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850637	853239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_850600_853200
812732	contig_1450_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_27336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTGGACTTGACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198289	198643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_198300_198600
812735	contig_15063_pilon	+	981	3	Intergenic	novelGene_14413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	16	837	35271	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35255	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
812736	contig_7057_pilon	-	1634	2	Intergenic	novelGene_123287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGAGCTGTCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843281	838874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_839050_841822
812737	contig_7426_pilon	-	1077	8	Intergenic	novelGene_27549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	280.72340952094	2	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	53	748	1102797	1087105	FALSE	35	CAAAAGAAGGGGTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAAGKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102849	1086775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093429_1094510_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
812739	contig_5968_pilon	-	1232	8	Intergenic	novelGene_112189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	443.091550866161	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	17	1066	732362	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVSWVWSPRAHVGSAVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732378	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700691_732187
812743	contig_10023_pilon	-	774	6	Intergenic	novelGene_123524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	547.201461986351	6	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	24	374	458219	457679	TRUE	30	AAACACTTGCAGAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAIVTKMEAFLESRSGLWAGGPALGQFYRIPPSPSSFVDVASAPYGGPSTRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMV	458242	456018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_456714_457083_457166_457678_457890_458079
812744	contig_5018_pilon	-	949	6	Intergenic	novelGene_47057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	582.838914280781	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	71	703	1402792	1399331	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVPLLLGLLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKRQGV	1402862	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399345_1401135_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
812747	contig_2646_pilon	+	1393	9	Intergenic	novelGene_69645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	27.1888649082671	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	60	1271	2124554	2130275	FALSE	30	AAAGCACTCACTGGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAETRPGWCRGPGSGSLRAMAAARLARTALVAGGAALHAAGGRLPLPSGDTEIDWKAYMTEVEGVINGTYDYTQLQGDTGPLVYPAGFVYIFMGLYYVTGRGTDIRVAQHIFAVLYLATLLLVFSIYHQTCKVPPFVFFFMCCASYRVHSIFVLRLFNDPVAMALLFLSINLLLAQRWGWGCCCFSLAVSVKMNGLLFAPGLLFLLLTQFGLRGALPKLGICALLQVVLGLPFLLENPTGYLSRSFDLGRQFLFRWTVNWRFLPEAVFLHRAFHLLLLAAHLTLLLLFALHRWHRTGESILSLLKDPSKRKVPPQPLTPNHIVSALFTSNFIGICFSRSLHYQFYVWYFHTLPYLLWAMPARWLTHLLRLLVLGLIELSWNTYPSTSGSSAALHVCHAVILLQLWLGPQPYPKGIQHSKKAP	2124494	2130397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2124645_2126068_2126169_2126655_2126804_2126915_2127077_2127581_2127703_2128171_2128378_2128534_2128614_2129810_2129954_2130112
812748	contig_6870_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_103975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGGATACATGCCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438754	1437883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1437900_1438800
812749	contig_3326_pilon	-	928	2	Intergenic	novelGene_170599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	226	junction_1	0	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	27	782	214350	212417	FALSE	25	GATAGTGGTCTGATTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILWGGVLALLPLLLLSLLGVSWAESSCSGYPAIPGIPGIPGAPGSDGNPGTPGIKGEKGLPGLAGDHGEFGEKGDPGIPGNPGKVGPKGPIGPKGSPGPPGARGPKGESGDYRATQKIAFSVLRNIHTPLRRDQVIRFDQVITNENHNYEPRNGKFTCRVPGLYYFTYHASSRGNLCVNLVRGRERVQKVVTFCDYVHNTFQVTTGSVVLKLDQGENVFLQATDKNSLVGIEGANSIFSGFLLFPDIEV	214376	212270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212992_214169
812750	contig_7158_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_163728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCCTGGTGGCACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100258	1100616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1100300_1100600
812751	contig_7158_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_163729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102979	1104577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1103000_1104600
812752	contig_1759_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_171330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47799	45826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_45800_47800
812757	SIRV6	+	317	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	550	6	384	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
812758	contig_9633_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_139592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACTAATTCCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29799	31583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_29800_31600
812759	contig_3900_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_84178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACATACATATACATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201539	203111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_201500_203100
812762	contig_6375_pilon	-	1045	3	Intergenic	novelGene_73022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	30.5	1915	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	35	826	440438	435715	FALSE	0	GCCTGTGTTGTGTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALASVLQRPLLVNQRGVFGLEGRADLLDLGPGSSSDGLSLAAPKWGVPEEPGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAVDSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAIYQATYRDAYSGGVVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHDKYSRPAP	440472	435495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_436002_439202_439510_440240
812763	contig_5959_pilon	+	1269	5	Intergenic	novelGene_150171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	39.6421492858296	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	401	1186	71790	88346	FALSE	45	ATCTACTGGAAAATCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKALSTLVTQDPQEQELIVVKVEEGLSWGQKSKQDGSAQSCQEMFRQQFRKFCYKETPGPREALGRLHELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQVWVQQQSPKSGEEAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASLQGPAVPWKDLTSLGASQESTNVQLQPLKTQLKSWEPCLSLKSDCKNNESTTKEEVLGEKSQGLAQEPSFREVSECENHLEWQQGSATGAKLRRFSSQGDSFSQVIFTHESLGKRDQHDFS	70377	88429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_70682_71693_72198_72439_72582_75140_75366_88335
812764	contig_7031_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_132794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTATGTTGTTGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310460	310209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_310200_310500
812765	contig_5690_pilon	+	1315	11	Intergenic	novelGene_119702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	44.4595321612812	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	83	1165	924747	939107	FALSE	35	TTTAACAAATCTATAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARSARSSGRGWLGRCPGGAGPARAAAMDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLSAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVEHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRMVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAGPLGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQRQMKETH	924664	939257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_924750_930470_930565_930991_931079_931573_931698_937441_937577_937689_937808_937894_937997_938193_938291_938381_938545_938702_938803_939047
812766	contig_3382_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_124083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488975	487963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_488000_489000
812769	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
812770	contig_990_pilon	+	942	8	Intergenic	novelGene_76064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	117.198767145428	244	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	166	783	1082680	1091532	FALSE	10	TTTGTTTAGATTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTRLRDAAACRGAASAAAAVCRGPRPSPPVSGGNGATCLTHCDGTDTKAEVPLIMNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIAVNIKTAEIYRASFPDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067194	1091691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087593_1087692_1090825_1090940_1091352
812771	contig_10765_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_122903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCAACGAGTATCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102965	103966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_103000_104000
812773	contig_12079_pilon	+	1128	5	Intergenic	novelGene_67398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	129.977882733948	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	563	1012	491184	531301	FALSE	65	TTAAAAAAAAGAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEINLNSLKELEREVILQVLYRDQKVQNIEEERIRNLKTHLQNLRWKGVKSTDQDCRGESCARCQRALGLLLNRGAVCRGCSYRVCAECRVFLRKTRAWKCTVCFEDRNVKIKSGQWFFEERAKKFPTEGKHETAGAKLLQSYQKLR	478366	531417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_478403_490657_491294_494619_494839_510897_510963_531245
812774	contig_4364_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
812775	contig_2940_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_81999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174482	1175577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1174500_1175600
812776	contig_13021_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_8100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGCTTTCTCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89747	87577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_87600_89700
812778	contig_15434_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_56711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTACTATGCAGACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43420	42514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_42500_43400
812779	contig_12292_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_167002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTATGTCATCTATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262523	261955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_262000_262500
812781	SIRV6	+	459	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	24	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
812784	contig_2703_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_101833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGGGATTTAGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244765	1244415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1244400_1244800
812785	contig_2703_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_101832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTGGTAGGAATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244415	1243575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1243600_1244400
812786	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
812787	contig_6664_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_176069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACTCACAGTAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27085	24670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_24700_27100
812788	contig_5539_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_104772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAATAATAAAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256069	255182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_255200_256100
812792	contig_6397_pilon	-	2043	16	Intergenic	novelGene_146248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_15	102.971840810971	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	336	1589	520231	437797	FALSE	35	GTGTAAAGATACTCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYNFIHKMNTAEFKSATFPNAGPRHLLDDSVMEPHAPSRGQAESSTLSSGISIGSSDGSELSEETSWPAFESSAESEDLAVHLYPGAVTIQGVLRRKTLLKEGKKPTVASWTKYWAALCGTQLFYYAAKSLKATERKHFKSTSNKNVSVVGWMVMMADDPEHPDLFLLTDSEKGNSYKFQAGSRMNAMLWFKHLSAACQSNKQQVPTNLMTFE	546281	437342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_437827_440746_440839_443267_443374_451594_451688_455499_455606_459880_459936_463248_463401_464045_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_546153
812795	SIRV6	-	376	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9439	-148	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATGGCGTCTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	1692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3163_10722_10825_11035_11109_11205
812796	contig_8964_pilon	-	676	2	Intergenic	novelGene_168688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTATTAACGTAACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469964	452274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_452842_469855
812797	contig_3077_pilon	-	937	6	Intergenic	novelGene_26899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_5	59.9019198356781	590	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	31	546	1559214	1544006	FALSE	35	AATAGAAGTTGTAGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYAREPCPWRIVDDCGGAFTMGTIGGGIFQAIKGFRNSPVGVNHRLRGSLTAIKTRAPQLGGSFAVWGGLFSMIDCSMVQVRGKEDPWNSITSGALTGAILAARNGPVAMVGSAAMGGILLALIEGAGILLTRFASAQFPNGPQFAEDPSQLPSTQLPPSPFGDYRQYQ	1559244	1543614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1544092_1547626_1547738_1548638_1548768_1552947_1553012_1553147_1553248_1559188
812798	contig_9931_pilon	+	908	2	Intergenic	novelGene_134812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	385	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	74	772	364058	364756	FALSE	75	AGAAAAAAAAAAAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSRQPSSLGESPGTSYQSFQNSKMGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	296459	364892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_296524_364048
812799	contig_5766_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_175056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGACTTGACAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143864	1144866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_1143900_1144900
812800	contig_12000_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_43203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGTGATGACCGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640226	640968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_640200_641000
812801	contig_1244_pilon	+	962	9	Intergenic	novelGene_37920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_8	148.747899144828	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	246	851	287141	294829	FALSE	0	GCTGGTTCCTGGGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESFENPFRMYLPSLEHRAHISQAAKLDPSSKIYEISNRWKLASQVQVQKESKETAKKKAAEQTAAREQAKEEYKATAEQAMSVRQQATLENAAKKRERTISDPRTTDQKQGKKRLKISKKPKDPDPAEKEFTPYDYSRSDFKAFAGNSKSKPSQFDPNKQTQSGKKCIAAKKLKQPTGNKSMSFPTGKSDRGFRHNWPKR	284789	294940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_284969_287074_287171_287422_287498_289999_290088_291705_291780_292446_292619_293412_293472_294003_294081_294798
812802	contig_13403_pilon	+	500	3	Intergenic	novelGene_158089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTCACAGGGTTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48981	63215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_49160_62800_62957_63049
812803	contig_7887_pilon	-	1233	10	Intergenic	novelGene_124880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	24.6351149558692	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	131	1189	238804	228721	FALSE	10	TTCTTGTTTCACCTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIENYSTQRAERGAGLAFRSIPPTVWTKQEPAYRNRALCSSLRMNGDQKSDAYAQEKRDFIQHFSQILNVLTEETGQPETGDAIARLKEVLEYNAIGGKYNRGLTVLAAFQELVEPKKQDADSLQRVLTVGWCVELLQAFFLVLDDIMDSSLTRRGQLCWYKKPGIGLDAINDALLMEACIYRLLKLYCREKPYYLNLIELFLQTTYQTETGQTLDLITAPQGDVDLDRFTEKRYKSIVKYKTAFYSFYLPVAAAMYMAGIDGEEEHANAKKILLEMGEFFQIQDDYLDLFGDPSVTGKVGTDIQDNKCSWLVVQCLQRASPEQRQILQENYGQKEAEKVARVKALYEELELPAVFRQYEEDSYSCLMGLIEQYAAPLPPAIFLGLACKIYKRKK	239984	228676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_228922_229418_229554_229655_229734_230434_230508_230600_230690_231172_231296_231450_231532_236391_236533_238666_238827_239876
812804	contig_7057_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_123364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	185	298	978103	977990	NA	65	AGTTTGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLGFQGIFKLKSQCSQCEKPEIRCCCGLNCVPPKCVSTWLGRDSQYCVVVHHFVICCDFLMCCKSCLYDDNEVGLEAVMLMRQDSIYKIRLCLKSIS	978287	977511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_977500_978300
812807	contig_6356_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_126433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGATGTGCAATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98526	97328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_97300_98500
812808	contig_9429_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_155100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCCAGACACAAACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65718	66220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_65700_66200
812809	contig_6958_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_69971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTCGAAGTCCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290489	291117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_290500_291100
812811	contig_10196_pilon	+	1548	11	Intergenic	novelGene_132291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_6	235.195004198644	61	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	744	1331	2368768	2374406	FALSE	10	CACACTGGGGTCTCGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2346686	2374623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497_2352597_2364367_2364479_2365373_2365564_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
812813	contig_10953_pilon	+	751	3	Intergenic	novelGene_42526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	102.5	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	7	399	126980	134062	FALSE	55	AAGATGGATAACCAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVGE	126973	134414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875
812816	contig_10732_pilon	-	1663	4	Intergenic	novelGene_114737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	3.09120616516523	159	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	35	463	530345	525538	FALSE	20	TCTCTTTTTAGCACACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARLLPPAWQLYLKDHRISTFKNWPFLEGCSCTPERMAEAGFIHCPTENEPDLAQCFFCFKELEGWEPDDDPIEEHKKHSSGCAFLSVKKQFEELTLSEFLKLDKERAKNKIAKETNSKQKEFEETAKKVRSAIEQLAALE	530379	524337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_525628_528247_528366_529877_529988_530234
812821	contig_15123_pilon	+	1121	6	Intergenic	novelGene_110926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	4.69041575982343	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	163	765	300089	307685	FALSE	20	TTAAGCTTGTCCAGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRDYMKTSVQEPPLDYSFKSIHVIQDLVSEEPRTGLRPLRHSKSGKSLTQSLWLNNNVLNELRDFSQVVSQLLEHPENLAWIDLSFNDLTSIDPVLTTFFNLSVLYLHGNSIQRLGEVDKLAVLPRLRSLTLHGNPMEEEKGYRILLKTPYDKKILRLKTCLLTPAQVLPSQLVWPPCLLTAPQLLGIPLSLRQGPQQ	292459	308041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_292490_299380_299459_300034_300171_305469_305676_306554_306704_307519
812822	contig_8954_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_130268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAATTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102683	104485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_102700_104500
812824	contig_10252_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_162912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81384	82288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_81400_82300
812825	SIRV6	+	447	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	76	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
812826	contig_7066_pilon	-	2136	4	Intergenic	novelGene_42110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGTTTTGGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551635	544251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_545969_549056_549149_549438_549593_551462
812827	contig_6227_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_49636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATTTGTCAACCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362589	359875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_359900_362600
812828	contig_7695_pilon	+	1008	7	Intergenic	novelGene_41619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	53.9382362831168	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	159	803	669566	672683	FALSE	5	TTTCTCTGACCCTCGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHLGYGAHGSKHRARTAPDPPPLFDDTSGGYSGEPGGYPAPGADVAFNVNHLLGDPMANVAMAYGSSIASHGKDMVHKELHRFVSVNKLKYFFAVDTAYVAKKLGLLVFPYTHQNWEVQYSRDVPLPPRQDLNAPDLYIPTMAFITYVLLAGMALGIQKRFSPEVLGLCASTALVWVVMEVLALLLGLYLATVRSELSTFHLLAYSGYKYVG	669407	673473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_669597_670224_670437_670630_670736_670869_670949_672358_672417_672523_672684_673268
812829	SIRV6	+	481	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1473_1535_1640_1736_1845
812831	contig_11126_pilon	+	984	6	Intergenic	novelGene_138118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_3	50.7716456302137	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	224	631	187515	193136	FALSE	65	AAAAAAAAAAGGATATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSCGIFQSRLVGEALLDSGIRITSVFVSPALRCVQTAKHILEELKLEKKIKIRVEPGIFEWTKWEVGKNIPTLMTLEELKEANFNVDANYRPAFPLSSLIPAESYEEYVQRCSASVERITSICSQDLGVTVVISHGSALDSCTRPLLGLPPRESGDFAQLVRKIPSLGMCFCEENTKEGKWELVDPPVKTLTHGSNSAFNWRNWILGS	167821	193489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_167860_169695_169789_187422_187568_187870_187978_189682_189793_192998
812832	contig_5918_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_99599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCTGATAAAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2077341	2076076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2076100_2077300
812833	contig_15104_pilon	+	2464	13	Intergenic	novelGene_163366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	26.5057645721748	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	239	1489	894804	946721	TRUE	50	ATTTTTATAATAACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEKNLGVSQKLVSPSRSTSSCSSKQGSRQDSWEVVEGLRGEMNYTQEPPLQKGFLLKKRKWPLKGWHKRFFYLDKGILKYAKSQTDIEREKLHGCIDVGLSVMSVKKSSKCIDLDTEEHIYHLKVKSEDGFDEWVSKLRHHRMYRQNEIAMFPHEVNHFFSGSTITDSASGVFDSISSRKRSSISKQNSFQTGSNLSFSCGGETRVPLWLQSSEDMEKCSKDLAHCHTYLVEMSQLLQNMDVLHRTYSAPAINAIQGGAFESPKKEKRSHRRWRSRAIGKDAKGTLQVPKPLSGPLRLHSSNPNLSTLDFGEEKNYSDGSETSSEFSKMQEDLCHIAHKVYFTLRSAFNTLSMEREKVKHLMEQDVTSSPSAQVIGLKHTLSSALAQNADLKERLRRIHAESLVLDPPGCCQVG	792085	954488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_792177_894656_894897_921582_921700_921851_921906_923006_923121_927555_927724_928346_928471_930502_930607_930810_930904_932193_932351_943499_943631_946625_946735_953526
812834	contig_5590_pilon	+	1740	12	Intergenic	novelGene_163059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	27.179841825384	15	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	185	676	521411	523302	TRUE	10	TGGCCCTCGAGGGCGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPTAAAPAGSLIPSILLLASGTVVVALLGAAHHLGLFYQLRHKVDKASVRHGGENVAAVLRAHGVRFLFTLVGGHISPLLVACEKLGIRVVDTRHEVTAVFAADAVARLTGTVGVAAVTAGPGLTNTVTAIKNAQMAQSPVLLLGGAASTLLQNRGGTPGH	520334	530732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_520509_521400_521546_522770_522973_523064_523193_523275_523416_523492_523605_525724_525825_525957_526056_526175_526227_529621_529708_529851_529958_530334
812835	contig_11846_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_105990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAGAAAGGAATAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370033	369367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_369400_370000
812838	contig_5084_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_64576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTTAACCAATGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698228	699688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_698200_699700
812839	contig_5594_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_150119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTATCCACTGAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97008	96470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_96500_97000
812841	contig_2854_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_120896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGACCTGGCAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171776	1171299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1171300_1171800
812842	contig_546_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_117247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459145	460596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_459100_460600
812847	contig_21377_pilon	+	1654	5	Intergenic	novelGene_174773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.737739202857	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGAATGGATTGCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19126	23856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21377_pilon_+_19294_20248_20394_21372_21456_22212_22497_22881
812848	contig_7376_pilon	+	1053	7	Intergenic	novelGene_108086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.7105797647853	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	244	906	102857	112881	FALSE	75	TTTAAAAAAAAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVKKRTKTPTDIYPVETLVNMSLNPSRPSSSEVVELHVFYVPEGSWNYKLNTISKEVVNKFISAGFIRVSPQLTLQALRESLGEFLGEDAVAEKFLFLKCIGNNLAVVKAKQESELKLKSFAPPYALQPELYLLPIMDHLGNIYSASSTVALDGQQTNNGVTQADGTVHRPVSVTLSKEKPGTDPSLLENTLKELLNKNQEEGDFNWIGKERGYYSSF	80077	113028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_93590_93697_102779_102959_104743_104851_108846_108965_112441_112496_112599
812849	contig_10811_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_165790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGACAGATTAGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204423	206320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_204400_206300
812850	contig_6557_pilon	+	2009	5	Intergenic	novelGene_33038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	56.1487978499985	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	54	404	656776	658829	FALSE	20	TTCTATGGCGCATCCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATAATAPPAAPAGEGGPPAPPPNLTSNRRLQQTQAQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNLKMMIILGVICAIILIIIIVYFSS	656722	660434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_656778_657302_657424_657908_658068_658163_658216_658812
812852	contig_15165_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_145327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTAAAAAAAACTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342366	343636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_342400_343600
812853	contig_10711_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_118460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTCCTTCATTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876300	874616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_874600_876300
812854	contig_11258_pilon	+	437	5	Intergenic	novelGene_67737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	3916.37348193453	27424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCAGTGTCTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49136	53623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49280_49379_49422_50092_50154_52748_52872_53555
812856	contig_3277_pilon	-	2496	1	Intergenic	novelGene_74737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTATTTCACGGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268837	266341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_266300_268800
812857	contig_9332_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_60723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCAGCGGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161978	159943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_159900_162000
812858	contig_6079_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_160108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAGGCTTAACATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475752	476365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_475800_476400
812861	contig_2757_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_164598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCTCAAGATTGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472471	472213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_472200_472500
812862	contig_8980_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_73994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAATCTATTAAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83145	85279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_83100_85300
812863	contig_6069_pilon	+	1914	9	Intergenic	novelGene_8088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	115.623783777387	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	191	1204	601955	604732	FALSE	5	CGAGCCTGTGTGTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQFDALFDELTAREHLQLYTRLRGISWKDEARVVKWALEKLELTKYASKPAGTYSGGTKRKLSAAIALIGHPAFIFLDEPTTGMDPKARRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDGYMITVRTKVSQSVKDVVRFFNRNFPEAVLKERHHTKVQYQLKSEYISLAQVFSKMEQVVDVLGIEDYSVSQTTLDNVFVNFAKKQSDNLEQQELGPPSGLQSPLGRLLSFFRSRPTPTELRALVADEPEELDTEDEGLISFEEERAQLSFNTDTLC	601764	605442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_602011_602140_602283_602357_602493_602568_602673_602842_602936_603042_603146_603221_603360_603432_603640_604696
812864	SIRV4	-	377	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	219	21	-219	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCGGACAACTCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	3856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
812866	contig_1996_pilon	-	1969	12	Intergenic	novelGene_131957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	32.3429453776628	212	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1047	1889	525328	523904	FALSE	5	TCAGGTGCTCTTTGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKLNHLLERLHQSFFLYLLPALSRFVSIGLYMPAAGFLLLVLGLKALELWMQLHEAGAGPEEAGGTPGRVPPLPPAQDVGLASLVAPLLISQAVGLALYFLPVLGQHVAARHFPVGEAEAVVLTLLAIYAAGLALPHNTHRVVSTQAPDRGWMALKLVALIYLALQLGCIALINFSLGFLLAATMVPAAALTEPRGPRSLYAALLVLTSPAATLLGSLFLWRELQEAPLSLAEGWQLFLAALSQGVLEHYTYGALLFPILALGLYPCWLLFWNVLFWK	527326	523823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_524148_524357_524529_524601_524793_524924_525021_525187_525342_525461_525659_525727_525926_526031_526134_526208_526357_526590_526703_526786_526967_527230
812868	contig_19012_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_159496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGTAAATATTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113974	113298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_113300_114000
812871	contig_7933_pilon	-	530	3	Intergenic	novelGene_164706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4810	junction_2	276	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	62	364	238534	233326	FALSE	30	CATACTGGAGCGTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPTALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	238595	233159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430_234584_238531
812873	contig_414_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_115102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	258	777	215	991	373842	373066	NA	10	TGATGGTGTTTTATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	374056	372615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_372600_374100
812875	contig_2854_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_120912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGAAACATATAGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336602	1337748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1336600_1337700
812876	contig_4223_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_117266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATATTACAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148817	150202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_148800_150200
812879	contig_3948_pilon	+	1483	11	Intergenic	novelGene_53420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCACTGCAGGGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1933212	1975823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1933618_1936666_1936752_1942182_1942297_1947245_1947336_1950371_1950423_1951139_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959335_1964663_1964770_1975575
812880	SIRV4	-	255	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
812881	contig_14014_pilon	+	694	4	Intergenic	novelGene_176072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.49443825784929	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	8934	18093	TRUE	15	TGATTCTGACTCTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIDFATRKIAKLLNPQKVIEQDGDSFTIHTYSSLRNYLVKFKVGEEFDEDNKGLDNRKCKNLVTWDNDRLTCVQKGEKKNRGWTHWLEGDKLHLVFVVRGTAGSI	8931	19118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14014_pilon_+_9114_9757_9860_18057_18231_18881
812884	contig_5935_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_102758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361860	1363567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1361900_1363600
812885	contig_6277_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_80399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAAGTTTATTAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219178	219893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_219200_219900
812888	contig_2027_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_39959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	728.577353477309	4615	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	255	878	661342	664407	FALSE	10	GCAGGCGGTGTCCTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	660227	664504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_660373_661232_661463_662681_662762_662944_663072_663312_663438_664236
812889	contig_20487_pilon	+	1005	7	Intergenic	novelGene_154384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGTCCCTCGGCGCGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8298	22198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_+_8409_12726_12762_13744_13876_15072_15198_17373_17523_18096_18294_21940
812891	contig_2924_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_140248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAATGTCTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19898	19526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_19500_19900
812892	contig_3942_pilon	+	745	5	Intergenic	novelGene_128625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.98623656967	2035	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGGCCCAAATGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176915	180121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178221_178490_179045_179177_179714_179825_179974
812893	contig_12410_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_167277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGTCGTGATCACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126389	125648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_125600_126400
812895	contig_8866_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_77856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACCTCTGGCCAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658533	660744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_658500_660700
812896	contig_10626_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_138200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGATATGAAGTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103064	103944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_103100_103900
812897	contig_2487_pilon	-	1499	2	Intergenic	novelGene_148437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	13	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAGAATTTTGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16111	2140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_3614_16085
812898	contig_14882_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_114986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAATTGGTTGCTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58787	59378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_58800_59400
812899	contig_11498_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_65488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGGTTCATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16194	15196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_15200_16200
812901	contig_6136_pilon	+	696	2	Intergenic	novelGene_154110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	757	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2	520	460110	461008	FALSE	30	CTTATGGTTACCAACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDELLLPRLPELFETSKQLLDEVEVATEPTGSRIVQDKVFKGLDLLEKAAEMLSQLDLFSRNEDLEEISSTDLKYLLVPAFQGALAMKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERWVDSCNLKDT	460108	461184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460680
812903	contig_2577_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_172058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATATTTTCCAGGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114994	114578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_114600_115000
812904	contig_14362_pilon	-	881	4	Intergenic	novelGene_142526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88.2660120821649	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	158	676	40212	37341	FALSE	25	CCATTCCACTCCCATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPAASLAACSAAARPDPQVGTAERLGPGFSTRTSAAPRCCLLLRGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEAQRRPSAVPGLQPGRALKQGSWAQALPNQGSRTMAPFPYHLWDPGPSPRWDFPWAPRFSLLIPASPNWYSMTQGPQTWPLMEPPGFKPPPQPGF	45447	37135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37626_39869_39948_40056_40233_45310
812905	SIRV6	+	393	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	-2	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1783_3092_3165_10724
812907	contig_9727_pilon	-	896	4	Intergenic	novelGene_86293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	27.3292679903595	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	391	786	246351	244984	FALSE	5	TGCCTGGCCATCCTGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPPSLSCSWVTRVISARPGRCPLRRPACSLKTMGCSSWKPQPWTPPMLSWLLRLSSKRSSQRCPSRGRTAPGLVPSPWAVARLDRSWALGRKGPVASASDLGQRKPCPHGRSGRHPTPKPQTLSPSFGS	252511	244873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_245203_245515_245597_246255_246450_252219
812908	contig_3602_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_60691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAACTATTTTTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327247	1328074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1327200_1328100
812913	contig_3382_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_124216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCTAATTGCTCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492661	1491528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1491500_1492700
812914	contig_12619_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_73574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAAGGAAAAAAATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852729	855017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_852700_855000
812915	contig_4418_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_98359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCCTTGTCAAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687278	687751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_687300_687800
812916	contig_8636_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_141902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	533	835	256513	256211	NA	25	CAATTGTTGAAGCCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTTITSHKKVFTAFKVPSLDPHSTSQADETGSARPFHRRETEAKNDEMMQPQVTQPECAGVGNELGTLDSLPYAPPVGGQGTKWNALGNQSTDEHGDL	257045	255546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_255500_257000
812918	contig_938_pilon	-	1214	2	Intergenic	novelGene_143924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAATTGGGAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145467	142922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_143035_144365
812919	contig_10082_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_63836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACATGTACAATTCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24832	24158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_24200_24800
812923	contig_15021_pilon	-	948	7	Intergenic	novelGene_26990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	134.568962080992	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	26	817	421625	389550	FALSE	10	CTGAGGTGTATGGTGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQELPVDMEAISLDGDAEDVDLNHYRIGKIEGFEVLKKVKTLCLRQNLIKCIENLEALQSLRELDLYDNQIRKMENLEALTGLEILDISFNLLRNIEGIDKLTQLKKLFLVNNKISKIENLSNLHQLQMLELGSNRIRAIENIDTLTNLDSLFLGKNKITKLQNLDALTSLTVLSMQSNRLTKIEGLQSLVNLRELYLSHNGIEVIEGLENNMNDNLIESWSDLDELKGARSLETVYLERNPLQKDPQYRRKIMLALPSVRQIDATFVRF	421650	389418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_389727_416003_416109_417090_417208_419336_419500_420184_420316_420895_420962_421592
812924	contig_7179_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_78205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	806	1135	1662021	1661692	NA	20	TTTGCATTTTTAAATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIWVFPTFWLLSIIIAAVNICEQVFVWTYVFISFKFILRSGIVVSNGNIFNFLRLVFIQSTSHLSVSLLYCGGLHVAVMLEPMRPVFQLPAGSLLVDRFQWSFQTKRD	1662826	1661429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1661400_1662800
812925	SIRV6	+	151	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	794	51	794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11031	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
812926	contig_15350_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_164255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGCGAAGGAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231154	229155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_229200_231200
812929	contig_10780_pilon	+	676	4	Intergenic	novelGene_155431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTACTGAAGCAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94923	102477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_+_94945_97503_97669_98428_98523_102081
812932	contig_11413_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_103179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATGGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458408	460095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_458400_460100
812933	contig_11832_pilon	-	1023	2	Intergenic	novelGene_106912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	366	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTAGACTTTTCATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74391	72343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_72850_73874
812934	contig_12638_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_33071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGGTGTACCAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114457	114162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_114200_114500
812936	contig_12638_pilon	+	1529	11	Intergenic	novelGene_33347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCAATCCCTCGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387078	1463516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1387426_1390900_1391077_1393563_1393667_1394917_1395104_1397315_1397474_1405545_1405590_1411270_1411411_1412314_1412447_1415911_1416043_1434422_1434513_1463494
812937	contig_8674_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_102910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	268	306	189236	189198	NA	50	TAAATAATACCACTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAGQSAPGSVSPPLSPPPLRTASAPPSPNPALRSFPSPPSSHLPASNEDVLVFLFLGSWFVVSQLRTVEQSGLLDRLDAFVLCPGRYQMGVGTPVRPDSS	189503	187296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_187300_189500
812938	contig_6710_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_97600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGGCATTATCCACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653389	653741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
812940	contig_10734_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_51323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.5948100502085	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	148	525	1563632	1530696	FALSE	45	ACTAATATAGCAAGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGDTSLRIYKWVPVTEPKVDEKNKNKKKGKDEKCGSEVTTPENSSSPGMMDMHDDNSNQSSIADASPIKQENSSNSSPAPEPNSAVPGDGTEAKTDDQADGKEHLAAEDASDEQNSQSSMENSNSSEKAERQPSGDVGLSTDMSAISQPIVAAPVSVHLVEHLPLFCRLLYQA	1568709	1529985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1530774_1549844_1549964_1556973_1557139_1563616_1563714_1568643
812942	contig_18637_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_81857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183468	183234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_183200_183500
812943	contig_9415_pilon	-	1189	8	Intergenic	novelGene_109805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	189.10983742853	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	156	992	1819921	1753898	FALSE	20	CACTGATTTTTGGGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARREDVLAAATGSAHAVQVRAPPPRALRDPRVTKSGSRGAAGASESPSLPKMPHRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPLNGSKWTYVGPDGERSWSKKYSSCGGLMQSPIDLHSDIIQYDASLVPLEFQGYNVSANEQFILTNNGHSVKLSLTPNMYLLGLPFRYSATQLHLHWGDQSNPHGSEHTISGRHFAAELHIVHYNSDLYPNASTASNKSKGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQDVKYKGQEVPVPGFNVKELLPERPEEFSPLGRPKSVCSVPLALAGKNGQNLCLFLSQPSSNFAAFLMLLIPFQAQTPNSSPCHRNSL	1820076	1753700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1754080_1772021_1772088_1772616_1772681_1773499_1773596_1776039_1776183_1777877_1778058_1811720_1811742_1819836
812944	contig_6710_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_89345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGGCATTATCCACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
812945	contig_7914_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_165019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTGGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97444	96186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_96200_97400
812947	contig_3161_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_84512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368721	367233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_367200_368700
812948	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_97171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATGAAAATGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
812950	contig_5918_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_99577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1842328	1840989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1841000_1842300
812957	SIRV6	-	665	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACGTCGTTACCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11121	10237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11043
812958	scaffold_19766_pilon	-	1152	5	Intergenic	novelGene_34277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_4	23.6008474424119	88	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	250	957	381018	379177	FALSE	45	AAAGTGAGAAATGTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAPRDQELVGPGAPGPGSRGAAPPLGPVVPVLVFPPDLVFRADQRSGPRQLLTLYNPTGAALRFRVLCTAPAKYTVFDAEGYVKPQSCIDIVIRHVAPIPSHYDVQDRFRIELFEEGAEGRVVGRKDIPSVLRAPAYPLELQARQDSAPHPGPPAWTPPPAARHFQENAHPQLATSSFLLFLLTGIVSVAFLLLPLQDELGSQLPQVLHVSLGQKLVAAYVLGLLTMVFLRT	381267	378981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_379209_379327_379493_380094_380325_380552_380629_380813
812960	contig_8312_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_152914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTTTTTTTAGTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566593	1567615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1566600_1567600
812961	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	57	513	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
812962	contig_9180_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_109102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTATCTGTTTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233845	232060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_232100_233800
812963	contig_2933_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_111317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCAGCAGATTCGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401987	402404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_402000_402400
812964	contig_18299_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_135348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAATGCAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58876	61340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_58900_61300
812965	contig_13424_pilon	+	1945	4	Intergenic	novelGene_151596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCGGTGCTTCTTCCGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47640	62018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_49207_54158_54333_55993_56134_61953
812966	contig_15764_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_176073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAACATCTTGTATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204245	205582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15764_pilon_+_204200_205600
812967	contig_15185_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_99384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACAGTAATGATTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65165	67358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_65200_67400
812968	contig_4301_pilon	-	827	4	Intergenic	novelGene_65121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	423.223607827142	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	192	449	543732	539500	FALSE	50	AAAAAAAACCTTTACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVLCCLRALETLPPSRRLRPPPPAAADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNEMD	575627	539121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_575543
812970	contig_10159_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_30830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535365	533811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_533800_535400
812972	contig_5954_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_28542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGGAAGGCTTTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527592	525519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_525500_527600
812973	SIRV4	-	272	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1246	3	1246	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3912	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
812974	contig_9375_pilon	+	1453	1	Intergenic	novelGene_136076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAAAATTAGGCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607118	608571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_607100_608600
812978	contig_9437_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_141737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403240	405226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_403200_405200
812979	contig_6881_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_164841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAACAAAACAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84334	86455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_+_84300_86500
812983	contig_3975_pilon	+	671	5	Intergenic	novelGene_54888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	144	335	2096277	2096468	TRUE	30	TGGGGAGACAGGACGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVLVELSTLVACNDTLSQGPPNRTGDLGVVARDLHVGLVIVCERQQMSGAGLQSQTLHLNPSPAPAAALTDLAWVPQVKEAHKALVAHLLVRGEHDDIAPKVKATGPDS	2096133	2099458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2096501_2097313_2097366_2097472_2097545_2097852_2097939_2099364
812985	scaffold_13505_pilon	-	582	6	Intergenic	novelGene_111473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4575.41476152709	31	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	138	563	547393	540211	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTGSTHELPLARELCASDRGPFPQPAPFVEGMPEESPHISLSCPSFHSTAPVPPGRRWGWLHDQDLRGAAEKWRHAQPLQPRLQERGPPGPPSPGGAQNGGEGPRWGPQTDTSGTERSGQNRRTGGSCQQETLEQMMLG	548323	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542143_547363_547465_547767_547806_548295
812986	contig_5324_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_102051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88878	90978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_88900_91000
812987	contig_14801_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_166526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTATAGGTAGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26283	27807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_+_26300_27800
812988	contig_6031_pilon	-	2023	2	Intergenic	novelGene_56736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAATGGAACTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160670	157713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_158046_158979
812989	SIRV6	+	272	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	584	0	411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
812990	contig_7179_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_78208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGGACTAATGGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681312	1681513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1681300_1681500
812993	contig_17075_pilon	-	974	6	Intergenic	novelGene_131762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	7.15541752799933	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	65	478	144847	135037	FALSE	15	GCAGATTTTTCTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLIRKVISTAKAPGPLGAYSQAVLIDRTVYISGQIGMDLSSGQLVPGGLVEEAKQALINIGEILKAAGCDYTNVVKTTVLLADINDLTAVNEIYKQFFKSSFPARAAYQVAALPKGSRVEIEAVAVQGPLSPALL	144911	134540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_135100_136432_136489_137050_137120_137393_137449_138764_138871_144782
812994	contig_15385_pilon	+	1905	4	Intergenic	novelGene_173120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	6.16441400296898	50	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTATGGTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19672	31146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15385_pilon_+_19809_19950_20049_28498_28554_29530
812999	scaffold_17306_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_175323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	258	777	926	1702	310209	309433	NA	25	CATGCCTTGTGTAAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLHKKAAAGQHARATVGHHPGSANMRKKKTFQKKQRGRPSSQPRRNIVGCRISHGWKEGNEPITQWKGTVLDQVPINPSLYLVKYDGIDCVYGLELHRDERILKLKILPDKVPFSRVRDVRLANTIIGKAVEHMFEGEHGSKDEWRGMVLAQAPIMKAWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPESSESPPAEREPEGVVDGLIGKHVEYTKEDGSKRTGKVIHQVKAKPSVYFIKFDDDFHIYVYDLVKKS	311134	309264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_309300_311100
813000	contig_11386_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_82828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAGAATATAGTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213655	214557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_213700_214600
813002	contig_4402_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_140809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGATCACTAAGTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360641	361080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_360600_361100
813003	contig_19185_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_163657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151398	149368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_149400_151400
813004	contig_5947_pilon	-	2065	2	Intergenic	novelGene_101549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	285	junction_1	0	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATAAACTGATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586325	584173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_584595_584681
813005	contig_6710_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_97989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657514	653562	FALSE	30	TCTTTAACTTTAATCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRKYRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657462
813006	contig_5988_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_15904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	198	1223	585609	584120	FALSE	30	AGTAAGGAGAGGCCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPPPLSPIITAVAPPALSPLGELEYAFAAKGDSDPESPLAAPILETPISPPPEANCTDPEPVPPMILPPSPGSPVGPASPILMEPLPPQCSLFLQPSQPPQNSPPSQGSPPALPLSVPSPLSPMEKTAEVSDEAEPHEMETEKVLEPECPALEPSPTSPLPSSMGDLSCPAPSPAPALDDFSGLGEDTAPLDGTDTPGSQPEAGQTPGSSMACELKGSPVLLDPEELAPVTPMEVYGPECKQAGQGSPCEMQEEPRAPVAPTPPALIKSDIVNEISNLSQGDASASFPGSEPLLGSPDPEGGGSLSMELGVSTDVSPARDEGSLRLCTDSLPETDDSLLCEAGTTVSGGKAEGDKGRRRSSPACSRIKQGRSSSFPGRRRPRGGAHGGRGRGRARLKSTASSIETL	585806	584117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_584231_584694
813009	SIRV6	+	417	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	257	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
813010	contig_4407_pilon	-	1095	6	Intergenic	novelGene_122264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	102.90850305004	978	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	528	1022	23771	10463	FALSE	5	GTGTTTCGGTGTTTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSEETSAIPPSKRAHPAEDGGPRLRFARLSEHATAPTRGSARAAGYDLYSAYDYTIPPMEKALVKTDIQVALPSGCYGRVAPRSGLAAKHFIDVGAGVIDEDYRGNVGIVLFNFGKEKFEVKKGDRIAQLICERIFYPEIEEVQVLDDTKRGSGGFGSTGKN	24298	10389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_-_10520_10947_11019_11171_11247_18416_18462_21224_21317_23616
813011	contig_6316_pilon	-	1293	8	Intergenic	novelGene_134710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCGACAAACACTCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149671	136313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_136380_140477_140643_144109_144168_145288_145514_147101_147170_148632_148750_148840_149304_149540
813013	contig_16492_pilon	+	2334	1	Intergenic	novelGene_100321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAAGAAAAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198272	200606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_198300_200600
813014	contig_15182_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_136455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGAGGTTCGAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498155	499007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_498200_499000
813015	contig_15182_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_136454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTGCCGTCAAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497342	497813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_497300_497800
813016	contig_3787_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_102355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTACATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108242	110524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_108200_110500
813018	contig_5039_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_64936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTTAAATGATTACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367412	1368470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1367400_1368500
813019	contig_13680_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_149587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGTGAGCAATTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316043	315014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_315000_316000
813020	contig_13680_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_149586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314837	313912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_313900_314800
813023	contig_9668_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_58257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAACTGAAAGGTCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626657	627428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_626700_627400
813024	contig_18272_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_7026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCATACAGAAAACTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209659	211601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_209700_211600
813025	contig_8310_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_75581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCCGAGCGCATTCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285678	283494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_283500_285700
813027	contig_14034_pilon	+	2000	3	Intergenic	novelGene_72678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGATGGGTCATATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407027	409113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_407407_407450_408844_408885
813028	contig_12078_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_74138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	114	305	815795	815986	NA	20	TTCACTTCATTCTTGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQKLSKGCQLRSFVEKSYFLKVNRSKLLTAGGKGLLKMKSVLAASVSRFKMLIIHTGIDMAFDGQIINRFLDGSDAHAGKLGLELPNALSFKSRTLVNQT	815681	816917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_815700_816900
813029	contig_7057_pilon	+	930	6	Intergenic	novelGene_123184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	41.3134360710895	304	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	108	662	239166	240663	FALSE	15	GGAAGATTGTTTCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLFHFGNCFALAYFPYFITYKCSGLSEYNAFWKCVQAGVTYLFVQLCKMLFLATFFPTWEGGIYDFIGEFMKASVDVADLIGLNLVMSRNAGKGEYKIMVAALGWATAELIMSRCIPLWVGARGIEFDWKYIQMSIDSNISLVHYIIASAQVWMITRYDLYHTFRPAVLLLMFLSVYKAFVME	239058	240931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_239243_239318_239389_239913_239974_240064_240202_240355_240441_240537
813030	contig_15628_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_147697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTCTAAGTGAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114126	113127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_113100_114100
813031	SIRV6	+	473	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	186	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
813033	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
813034	contig_2027_pilon	+	633	3	Intergenic	novelGene_39934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	8	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTACAGCAACCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296091	361943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_296413_297987_298200_361843
813035	contig_2027_pilon	+	403	2	Intergenic	novelGene_39935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	3	401	362285	363608	FALSE	40	TCACAAAACTCACACAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFKLERGEELWILEEESSGHNYSGSLSLLCGNNSVEGNALLLDKDILQHQKIQTLDQTVEYNGYGKAFHKKTDFVRHRRTHTGEKNFECHECGKTYCRKSNLVEHLRLHTGERPYECGECGKTFSARSYLVA	362282	363610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_362358_363282
813036	contig_2027_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_39936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	47	547	364008	364508	NA	20	ATGTGCGTTGCCAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEKPYKCSECGKFFRMKMTLNNHQRTHTGEKPYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNECGNAFYVKARLIEHQRMHSGEKPYECSECGKIFSMKKSLCQHQRTHTGQKPYECNECGNAFYVKVRLIEHQRVHTGERPFECQECGKGFCRKAHLTEHQRTHISWSLSCTIDKASA	363961	364863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_364000_364900
813037	contig_10446_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_162506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	126	479	997641	997288	NA	40	GATGCCATTATTATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEPPRKVSWAVILTRAGHQVSSPMEMLGGFEPLTFWVAPPLHHQGSLCLNCKTYNSVIAFLLAHLSPHRTDPQTSDHIFLTFVPSATSTTHKMHSSIWSKVNQPFSDSYSVSYNL	997766	996083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_996100_997800
813039	contig_20819_pilon	+	810	2	Intergenic	novelGene_55658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42712	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_42957_43051
813040	contig_2054_pilon	-	1187	7	Intergenic	novelGene_51686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	90.249038160464	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	314	982	150933	123376	FALSE	40	GAAAGTATCCATTAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSLQTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQEYGGRLP	203929	123170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_123400_124994_125109_127144_127254_130938_131141_132268_132354_150798_150952_203634
813041	contig_10143_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_163344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248906	250294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_248900_250300
813042	SIRV6	+	465	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	156	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
813044	SIRV4	-	407	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	98	112	98	-112	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAACATTAAAAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	3749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
813047	contig_15327_pilon	-	1498	9	Intergenic	novelGene_70743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	26.0228265182705	104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	155	1297	1012665	1007545	FALSE	5	GCTGTAGCTGGTCTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKTWTRVCKATSSGRNAETRGGEGPPAARSGAVWPPLRGVLGAAAAQTWAKMAAPWWRAALYGSRRWRAFSTSAACSRRTAPLGPMPNEDIDVSNLERLEKYRSFERYRRRAEQEARAPHWWRTYWEHFGEKSDPKDKIDIGLPPPKICRTQQLLERKQVLRELRANVEEERAARLRTAQIPLEEVRAEWERTCGPYHKQRLAEYYGLYRDLFHGATFVPRVPLHVAYAVGEEDLMPVYHGNEVTPTEATQAPEVAYEADQDSLWTLLLTSLDGHLLEPDAEYVHWLVTNIPGNRVAEGQETCPYLQPFPARGSGFHRFAFLLFKQDKPIDFSEDTRPSPCYQLAQRTFHTFDFYKKHQEAMTPAGLAFFQCRWDDSVTHVFHQLLDMREPVFEFVRPSPYHPKQKRFPHRQPLRYLDRYRDSHEPTYGIY	1012819	1007343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1007682_1007861_1007999_1008209_1008369_1009197_1009244_1009372_1009446_1010350_1010560_1010642_1010778_1012304_1012485_1012598
813048	contig_14711_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_68936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAGAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110160	110981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_110200_111000
813049	contig_14807_pilon	+	1637	3	Intergenic	novelGene_124734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	154	79	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	19	1509	201090	260642	FALSE	30	AGTAAACTTAGAGTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAAAPSGGGGGGEEERLEEKSEDQDLQGLKDKPLKLKKLKKDKKEDKEAKHEPLQSSAHHSAEPAEAGKAETSEGSGSAPAVPEASASPKQRRSIIRDRGPMYDDPTLPEGWTRKLKQRKSGRSAGKYDVYLINPQGKAFRSKVELIAYFEKVGDTSLDPNDFDFTVTGRGSPSRREQKPPKKPKSPKAPGTGRGRGRPKGSGSARPKAAASEGVQVKRVMEKSPGKLLVKMPFQASAGGKAEGGGATTSTQVMVIKRPGRKRKAEADPQAIPKKRGRKPGSVVAAAATEAKKKAVKESSIRSVQETVLPIKKRKTRETVSIEVKEVVKPLLVSTVGEKSGKGLKTCKSPGRKSKESSPKGRSSSTSSPPKKEHHHHHHHSEAPKAPAPLLPPLPPPEPESSKDPKSSPEPQDLSSSVCKEEKMARGGPLESDGCPKEPAKTQPAVAPAAAAAEKYKHRGEGERKDIVSSSMPRPNREEPVDSRTPVTERVS	201071	260770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_201152_257713_258065_259564
813050	contig_6361_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_23913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204601	205813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_204600_205800
813051	contig_11171_pilon	+	1324	6	Intergenic	novelGene_48593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	507.737491229474	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	1	837	212056	251467	FALSE	10	GATGGCTCCACCTCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTKEEGGTGTPAFPTKRPGLRGGGAPGPPAPIRPPHDLPAPGLAPVLLGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKKQIQVPGKQQAQKCQDPRSASSSKKPLSDSIYTDLQRRDTEVYACIESEANNLPFSRSPLSQAGLHRSEDEGEFGLVYENL	212055	251954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212204_235063_235394_236868_236982_239236_239336_249980_250068_251407
813052	contig_11594_pilon	-	2160	12	Intergenic	novelGene_80900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	5.22391196311223	32	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	25	1137	178580	148843	FALSE	90	AAAAAAAAAAATAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANHANDTMKQGDNFQKLMQIQYSLNGHHEIVQPGRVFLKEGTLMKLSRKVMQPRMFFLFNDALLYTTPVQSGMFKLNNMLSLAGMKVRKPTQEAYQNELKIESVERSFILSASSATERDEWLEAISKSIEEYAKKRITFCPSRSLDEADLENKEEVSPLGSKAPIWIPDTRVTMCMICTSEFTLTWRRHHCRACGKIVCQACSSNKYGLDYLKNQPARVCEHCFQELQKLDHQHSPKIGSPANHKSPSSALSSVLHSIPSGRKQKKIPAALKEVSANTEDSSMSGYLYRSKGNKKPWKHLWFVIKNKVLYTYAASEDVAALESQPLLGFTVTQVKDENSESKVFQLLHKNMLFYIFKAEDAHSAQKWIEAFQEGTIL	178604	147819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_148880_153387_153537_154360_154490_164382_164511_166604_166708_167779_167927_168408_168512_175504_175585_176356_176441_176975_177045_178413_178486_178568
813055	contig_10986_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_71514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAGAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196774	197865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_196800_197900
813056	contig_14467_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_138223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCAGGATAGAGCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118579	117370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_117400_118600
813057	contig_11572_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_100070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGGAGCGGCGGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297057	295752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_295800_297100
813058	contig_11572_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_100069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCTTACAGCCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295406	294744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_294700_295400
813059	contig_5253_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_61575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTTAAAAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248834	246874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_246900_248800
813061	contig_19132_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_170004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATATAATCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438022	436504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_436500_438000
813065	contig_9535_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_124466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAATAAGAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235645	237278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_235600_237300
813066	contig_12270_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_113742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
813067	contig_5936_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_53586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTACAAAGAGTCCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446789	447088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_446800_447100
813068	contig_5936_pilon	+	1776	2	Intergenic	novelGene_53588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1665	111	1775	447354	464198	FALSE	30	TCCAGCCTTCAGCAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLGILDPIPSKPVNQNPVIINPTNFHSNVHSQVPVMNVSMPPAVVPLPSNLPLPTVKPGHMNHGSHVQRVQHSASTSLSPSPVTSPVHMMGTGIGRIEASPQRSRSSSTSSDHGNFMMPPVGPQATCSGIKVPPRSPRSTIGSPRPSMPSSPSTKSDGYHQYKDIPNSLIAGMSNVLNTPSSAAFPTASAGSGSVKSQPGLLGMPLNQILNQHNAASFPASSLLSAAAKAQLANQNKLAGNNSSSSSNSGAVASSGNTEGHSTLHTMFPPTANMLLPTGEGQSGRAALRDKLMSQQKDSMRKRKQPPTTVLSLLRQSQVDSSAVPKPGPDLLRKQGQGSFPISSMSQLLQSMSCQSSHLSSNSTSVCGGSNTALPCSANQLHFTDPNMNSSVLQNSLTQNIPLRGEAVHCHNANTNFVHSNSPVPNHHLAGLINQIQASGNCGMLSQSGMALGNSLHPNPPQSRISTSSTPVIPNSIVSSYNQTSSEAGCSGPSSSIAIAGTNHPAITKTTSVLQDGVIVTTAAGNSLQSQLPIGSDFPFVGQEHALHFPSNSTSNNHLPHPLNPSLLNSLPISLPVNQQHLLNQNLLNI	447243	464199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_448714_463893
813070	contig_6084_pilon	+	1847	2	Intergenic	novelGene_127066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCAGAAAAAGAGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435160	437590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_436732_437314
813072	contig_7070_pilon	+	2259	1	Intergenic	novelGene_104059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGACACCAAAAGCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225317	227576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_225300_227600
813077	contig_11056_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_130402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACACCAGTCTTGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658925	659388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_658900_659400
813078	contig_4654_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_103053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGACTACATCAGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425626	424712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_424700_425600
813079	contig_7171_pilon	+	1228	7	Intergenic	novelGene_101233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	397.131135632663	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	525	746	760687	764486	FALSE	35	AAAAGAGATTTCAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSSRRRPSPSARTPPRRPSASGRRRPAQPGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	733736	764968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733830_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
813081	contig_6102_pilon	-	797	8	Intergenic	novelGene_32202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1290.43035061793	6024	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	40	687	905250	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906122	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
813082	contig_17968_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_154543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATGTACTTACCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47044	44694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_44700_47000
813083	contig_12427_pilon	+	1616	3	Intergenic	novelGene_40507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	495	junction_1	137.5	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1197	1511	414506	415919	FALSE	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLPLSSLIQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVVRS	413044	416024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_413162_413426_414711_415809
813085	contig_5623_pilon	-	1821	2	Intergenic	novelGene_154855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCCAGTGATCAGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275928	237679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_239459_275886
813086	contig_3018_pilon	-	1910	11	Intergenic	novelGene_78948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGTAGAAAAGACAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439568	1354409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_1354504_1356660_1356864_1362065_1362139_1365531_1365653_1368033_1368178_1384701_1384798_1388932_1388986_1389907_1390037_1399264_1399375_1429637_1429759_1438802
813087	contig_10801_pilon	-	2190	9	Intergenic	novelGene_74031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGGGACCGGCCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358733	235468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_235551_319906_319966_323389_323478_345671_345822_347620_347686_352562_352658_354571_354673_356984_357117_357315
813088	contig_5978_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_152405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGTCAAATATAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455881	454223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_-_454200_455900
813093	contig_8461_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_163926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTAGAGCCCGGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396730	397255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_396700_397300
813096	contig_19722_pilon	-	1388	5	Intergenic	novelGene_171892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	617	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTCCCCGAACCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82276	68295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_68832_75202_75284_76545_76615_76799_76942_81716
813099	contig_1594_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_138834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGCCTTTAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623831	621420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_621400_623800
813102	contig_1154_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_87107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390056	388426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_388400_390100
813104	contig_10331_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_54094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACGATTTACCAGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116556	117998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_116600_118000
813105	scaffold_880_pilon	+	1574	2	Intergenic	novelGene_121467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459867	464990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_461024_464572
813108	contig_3942_pilon	-	1484	8	Intergenic	novelGene_128731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	3.6922422809486	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	689	1384	701224	700275	FALSE	20	CCAAGCCTCTGCCTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVSYNHLGNNDGQNLSAPSQFRSKEVSKSSVVDDMVLSNPVLYGPGEEPDHCVVIKYVPYVGDSKRALDEYTSELMLGGTNTLVLHNTCEDSLLAAPIMLDLVLLTELCQRVSFHTDADPEPQGFHPVLALLGFLFKAPLVPPGSPVVNALFRQRSCIENILRACLGLPPQNHMLLEHKMERPDPALKSMGPTACPMPCKKRPVPAASTGCTGDANGHPQDEAPQTPTT	702438	700174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_700477_700559_700778_700856_700971_701062_701228_701343_701561_701643_701794_702028_702223_702314
813109	contig_15732_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_88882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGGACATGCCTAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196007	193436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_193400_196000
813110	contig_10082_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_63896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCGTAAAAGCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412255	412036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_412000_412300
813111	contig_567_pilon	+	649	5	Intergenic	novelGene_33984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	158.081268656347	159	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCTGTCTCTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442596	458818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442818_444625_444705_452579_452651_455775_455862_458626
813112	contig_10197_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_115320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAGGAGGTGAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601292	1602363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1601300_1602400
813113	SIRV6	+	392	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	375	0	209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
813115	contig_9706_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_20951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279751	278086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_278100_279800
813116	contig_12689_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_145030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTAGCTTTCTCTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41445	40585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_40600_41400
813117	SIRV4	-	266	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1257	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
813121	contig_10235_pilon	+	1120	6	Intergenic	novelGene_46405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	68.5174430346025	133	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	59	850	195539	198082	FALSE	30	ACAAAAACGTGTGGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLKAAAENIQAIYVALGEAMELPCPSPPTLHGDEHLSWFRSSAAGSSTVLVAQAQVARPAPDQGKLGRESRPKLLGNYSLWLERTKEGDAGRYWCAVLGQHYTYQNWRVYDISVLRGSQLSARTADGSPCSVLLCSVIPPRRLDSVTWLEGKGPVRGRVQSFWGEGAALLLVCPGEGLPEPRGRRPRIIRCLLPQNKGISFSLAASVDASPAVCAASTGWDMPWILMLLLAAGQGVIILTLSIVLWRHRTQRASCRNASIPQFKPEIQVYENVHLACLRFLS	194992	198352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_195013_195500_195831_195950_196215_197088_197245_197415_197483_198069
813125	contig_8133_pilon	+	1487	8	Intergenic	novelGene_98671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	933	1238	335647	340182	TRUE	40	TGCACTGACACCCTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATSLFGDKVTAGIECILGSAIYLKSTGISHSQTLRLLSSDVLTNLLFSSTKTMVLTAPKCRSYSCTISPLRMSHCTIFLSDIPATNRFCLSSSGLNLTQ	333709	348416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_334512_335516_335664_336856_336932_339729_339867_340105_340219_342112_342211_344303_344358_348355
813126	contig_15575_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_170932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGCTTGATATTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4576	5011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15575_pilon_+_4600_5000
813128	contig_5236_pilon	-	2636	1	Intergenic	novelGene_100922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCCAGCATTAAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692577	689941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_689900_692600
813129	contig_3818_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_99218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	115	354	225684	225923	NA	40	TGAACATGAACATAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQSSLSLVRIPCSATRKPWRTSGRRSGLRTAWWWSGELMITSGGSLLPELQESCTACRRDVTIDQSASVKSGHVIFFCLFTFLNNFRLTKSCKNHSENSHIFFSCISHILTSSIDTG	225569	226484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_225600_226500
813133	contig_8729_pilon	-	1312	8	Intergenic	novelGene_40091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	129.508647571961	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	443	1114	217975	209748	FALSE	35	AGTATAAGGAGTTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVRRDKNHPAVVMWSVANEPASFLKPAGYYFKTLIAHTKALDPYRPVTYVTNSNYAVDLGAPYVDVICVNSYYSWYHDYGHLEVIPLQLTTQFEQWYSTYQKPIIQSEYGAETIAGFHQDPPLMFTEEYQRRLLEQYHLVLDQKRREYVVGELIWNFADFMTDQSPQRAMGNKKGIFTRQRQPKGAAFILRERYWRIANETKHLPSVVKAQCLGNSLFTL	219670	209549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_209918_212114_212251_213980_214158_216069_216155_217871_218033_218237_218281_218513_218667_219481
813134	contig_1544_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_167936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAGACCACCAATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65722	67563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_+_65700_67600
813135	SIRV6	+	403	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	345	552	172	38	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813138	contig_10299_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_79729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTGTAAAGATTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344053	343806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_343800_344100
813139	contig_2726_pilon	+	1723	13	Intergenic	novelGene_165886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2.49443825784929	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1317	407	1723	98214	129772	FALSE	15	CCAGCGGGCACTCAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATGAKLGSDEKELILLVWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLELTEDCKEETKIDAETLSSAPQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHPEASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDMDKLDIAAMTECLNTEKNSSVSRYGASQVEDMGNIILAMISEPYNHKFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQDIARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKATGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGILFVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAPLIPLPTPPIIPLLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFSTDIRTHGVHMVLNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKTMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRNGLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPTAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYY	93502	129772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_93585_94077_94207_95337_95452_98132_98248_115895_115995_116121_116177_118078_118190_118310_118444_118534_118578_120475_120778_123575_123795_125973_126173_129650
813140	contig_2726_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_165887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACTCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149750	150014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_149800_150000
813142	contig_17753_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_105085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGATTTTTCAGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79996	79799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_79800_80000
813146	contig_16643_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_158142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAGCAACTGCCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317607	318294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_317600_318300
813148	contig_6227_pilon	-	1245	6	Intergenic	novelGene_49710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_3	2.1540659228538	108	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	783	1199	1197155	1170696	FALSE	20	AATTTGGTATTTTTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLLSQSLSSDGGDEKYEKTIIKSGDKMFYKFMKRIAACQEQILRYSWDGEPLFLSCLAPEVIELPACSHCGGRRIFEFQLMPALVSMLRSADLGLSVEFGTILIYTCEKSCWPQNHHTPVEEFCIVQEDPDELFFK	1199228	1170649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1170827_1175946_1176096_1194730_1194845_1197132_1197504_1198645_1198707_1198855
813149	contig_3584_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_108138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGATCATCTTCTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324693	322799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_322800_324700
813150	SIRV4	-	442	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	101	74	101	-74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCTGTGGTGTAATCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5057	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
813154	contig_19640_pilon	+	1841	2	Intergenic	novelGene_134860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGCAACATTTTAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46910	48972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_47667_47887
813156	contig_4838_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_144787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCACTCAGTTGATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226945	225680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_225700_226900
813161	contig_11012_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_163687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGAAGAGCCTCTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425470	423456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11012_pilon_-_423500_425500
813163	contig_19007_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_168437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTCATATTTCAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7486	7833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_7500_7800
813165	contig_4392_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_117344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTTTCCAATTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652182	651743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_651700_652200
813166	contig_13048_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_138907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACACCACAGAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283084	283549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_283100_283500
813167	contig_4125_pilon	+	1756	12	Intergenic	novelGene_25104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1198	1515	738707	740552	TRUE	0	CCTCCTCCTCCTCCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPSFSFSIFSRFRATISSRFFVLCSVDHPVRAFFNPIQALELLHTPAALQGGQVLGQLLLELDWRQSRRVGHAVSFSEGAALRGPLTPFFLPFLTLPRIAVKS	735998	741166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_736341_736596_736782_736984_737135_737291_737409_737521_737627_737814_737942_738286_738393_738641_738767_739545_739635_740383_740561_740743_740908_741097
813168	contig_7410_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_106117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAATTAGTATACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599553	600057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_599600_600100
813170	contig_13227_pilon	+	1468	6	Intergenic	novelGene_176074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	4.16653333119993	64	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	789	1400	7802	9118	FALSE	0	CCTTGTGTCTGGGTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMVVADLFSAGMVTTSTTLDWALLLMLLHPDVQRRVQQEIDEVIGQVRPPEMEDQARMPFTTAVVHEVQRFGDVVPLNLPHMTSRDTEVHGFHIPKGTTLILNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGRFVKPEAFMPFSAGRRSCLGEPLARMELFLFFTCLLQRFSFSVPPGQPRPSDHGVYAFLVTPFPYQLCAVPR	6767	9186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13227_pilon_+_6920_6994_7592_7762_7905_8072_8261_8697_8840_8939
813171	contig_1107_pilon	+	2912	6	Intergenic	novelGene_126606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	8.10925397308532	31	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	28	1104	1154128	1203845	FALSE	20	GTGATTCTTTGTTAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWVEVSLVEMKAFLGYMISTSIYHCESVLSIWSSGFYSNRSIALVMSQARFEKILKYFHVVAFRSSQTTHGLYKVQPFLDSLQNGFDSAFRPSQTQVLHEPLIDEDPVFIATCTERELRKRKKRKFSLWVRQCSSTGFIIQIYVHLKEGGDPDGLDALKNKPQLHSLVAKSLCRNAAGKNYIIFTGPSITSLTLFEEFEKQEIYCCGLLSSRKSDCTGLPLSMLANPATPQSRGQYRIKMKGNMSLICWYNKGHFRFLTNAYSPVQQGVIIKRKSGEIPCPLAVEAFAAHLSYICKYDDKYSKYFISHKPNKTWQQVFWFAISIAINNAYILYKMSDAYHVKRYSRAQFGERLVKELLGLEDTSPAH	1154100	1205653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_1154389_1160899_1161035_1190134_1190316_1195651_1195850_1201992_1202099_1203649
813173	contig_1335_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_166514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTCTGTGGCTTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417311	416501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_416500_417300
813174	contig_9875_pilon	+	2036	3	Intergenic	novelGene_154400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	3	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAACTTTCAGTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18008	22029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_19288_19388_19468_21351
813176	contig_12142_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_147834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGCTGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198917	197474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_197500_198900
813177	contig_16622_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_48503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACACTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134769	136100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_134800_136100
813180	contig_9593_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_59707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTTTTTTTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169723	168333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_168300_169700
813181	contig_11378_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_112277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCACCTGTAAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457268	458216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_457300_458200
813183	contig_5686_pilon	+	822	8	Intergenic	novelGene_45397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2604	junction_7	1162.32560684454	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	29	715	170242	198609	FALSE	30	AAAATTTTGAGATTGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEVSAV	170213	198716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550
813185	contig_16311_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_176076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAATAATATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	4952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16311_pilon_+_3100_5000
813187	contig_5302_pilon	+	1547	7	Intergenic	novelGene_81485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_3	96.4952503148903	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	397	786	328325	337399	FALSE	15	TAGAGTCTTCCATTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	318937	338160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
813189	contig_1225_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_44210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCTACACAGTCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276798	275850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_275800_276800
813192	contig_6360_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_165880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAATAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26829	25160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_25200_26800
813194	contig_14341_pilon	-	450	3	Intergenic	novelGene_111755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGGTTTCTGTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136133	134362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_134478_135604_135674_135867
813195	contig_14341_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_111754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	133	870	128421	127684	NA	35	ACTATTCCAAAGAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHIGEKPYECNECGKAFKKIASLSHHLRNHNKEKAYECNNECGKSFWQSLHLILHQTAHTGEKPYKCNKCGKSFSQNFHLNVHQRTHTEEKPYKCDECGKSCSGRSNLNVHKRTHTGEKPYKCNECGKAFSDRSSYMQHERTHTGEKTYKCNECGKAFSHSSHLTVHRRIHTGEKPYKCDECGKTYSFHLSFTQHKRTHTGEKPYKCHQCGKAFNQGSIFIGHQRTHTKGKNLHISFSCIKAS	128553	127486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_127500_128600
813196	contig_5935_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_102696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	97	375	840323	840045	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVSKQFVYKFFNEKLICAVNFHLHHDKIKRKMLPLSGFQLIAIPCVSVELCTTGFSVVDFSEVDHQAFFSRCLWVDLNLQPFSYQPSVLTICPAEGLLCMNMLQFTHPPVHEHLGYFQVCLLS	840419	839372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_839400_840400
813198	contig_14577_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_164657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATGTAGCAGTTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115623	115014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_115000_115600
813199	contig_2480_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_63503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91910	91371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_91400_91900
813204	contig_8505_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_173186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGTGGAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24492	22291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_22300_24500
813207	contig_19775_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_147747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGTATTTGTATTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191177	191601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_+_191200_191600
813208	contig_10642_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_78697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	310	933	129	1061	467031	467963	NA	40	TTAAATGGTTATAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSHAFVGLSKITTWYQYGFVQPQGPKANILISGNEIRQFARFMRDKLNVSNTGAPLGEEYILVFSRTQNRLILNEAELLLALAQEFQMKTVTVSLEDHAFADVVRLVSSASMLVSMHGAQLVTALFLPRGATVVELFPYAVNPDHYTPYKTLAMLPGMDLQYVAWQNTVPENTVTHPERPWDQGGIAHLDRAEQARILQSREVPRHLCCRNPEWLFRIYQDTKVDVLSLIQTIRRVVKGRPGPRKQKWTVGLYPGKVREARCQASVQGASEARLTVSWQIPWNLKYLKVREVKYEVWLQEQGENTYVPYILALQNHTFTDNIKPFTTYLVWVRCIFNKNLLGPFADVLVCST	466902	468425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_466900_468400
813209	contig_10642_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_78698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGCATTCAGCCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468425	469387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_468400_469400
813211	contig_8065_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_107331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACCTAAGCAAGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134626	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_134200_134600
813213	contig_14638_pilon	-	1089	5	Intergenic	novelGene_71585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	55	AATAAACACTTTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	253866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
813216	contig_11417_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_103297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTCTTCCTCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502710	503570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_502700_503600
813217	contig_15327_pilon	+	1738	16	Intergenic	novelGene_70500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	11.8894911581615	51	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	73	1083	427355	443249	TRUE	20	AGTCCGTCCAGAGTCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEREARAVSIVGSSSCRRLRRGAMEELDGEPIVTSIPGVNSKKKQLCFDWGPGEMLVCETLFNKKEKSEAVPGCPFIYIIRKDVDVYSQILRKLFNESHGIFVGLQRIEEELTGKSRKAQLVRVSKNYRSVIRACMEEMHQVAIAAKDPASGRQFSSQVSILSAVELIWNLCEILFIEVAPAGPLLLHLLDWVRLHVWEVDILSAEVLGSENPSKHERFWNLVTILVLQGQLDEARQMLSKEADASPASAGTCKVLGDLMRTMPILSPGNTQTLTELELKWQHWHEECERHLQDGTFASSPHLETLCKIMLGDEEALLGQKELLSNWYHFLVTRLLYSHPTVKPTELHFYAQSSLDLHL	427282	446093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_427388_430560_430655_432411_432575_433557_433629_434459_434504_436289_436360_437492_437615_438050_438186_438266_438390_438601_438734_438943_438959_443240_443352_443433_443535_444967_445120_445425_445528_445895
813219	contig_7416_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_134326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTTTTACCTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642772	644596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_642800_644600
813223	contig_4418_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_98360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAATTGGGGCACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687973	689455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_688000_689500
813224	contig_9706_pilon	+	1144	2	Intergenic	novelGene_21057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGAGTTGGGGAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729842	731389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_730165_730567
813227	contig_11338_pilon	+	242	2	Intergenic	novelGene_6248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGCATCCTCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82551	84087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_82637_83930
813228	contig_5732_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_119604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATGCCAAAGGAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381883	380773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_380800_381900
813229	contig_12629_pilon	+	1257	7	Intergenic	novelGene_150648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_6	48.1412851234087	219	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	100	828	81972	128225	FALSE	25	GATTTTTTGTTTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCHGPEGDCCSQRCLAQDKEHPRYLIPELCKQFYHLGWVTGTGGGISLKHGNEIYIAPSGVQKERIQPEDMFVCDINEQDISGPPPYKKLKKSQCTPLFMNAYTMRGAGAVIHTHSKAAVMATLLFPGQEFKITHQEMIKGIRKCTSGGYYRYDDMLVVPIIENTPEEKDLKERMAHAMNEYPDSCAVLVRRHGVYVWGETWQKAKTMCECYDYLFDIALSMKKVGLDPTQLPVGENGIA	81872	128654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_+_82029_109082_109184_121893_121943_123337_123456_124268_124405_127356_127525_128125
813230	contig_1309_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_73959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93078	95126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_93100_95100
813233	contig_12964_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_131667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGAGCTGATTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180509	182172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_180500_182200
813235	contig_6233_pilon	-	1325	10	Intergenic	novelGene_74792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	332.042983979298	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	206	586	149777	145724	TRUE	35	TTAAGCCACAAAGCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASASSSTIGAACHQCQCPGRSP	250161	136687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148122_148189_149521_149787_176316_176404_200462_200546_250135
813236	contig_14341_pilon	+	726	6	Intergenic	novelGene_111829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	79	693	548758	551737	FALSE	5	CCTTGGGGTGGCCCCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547737	551770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
813237	contig_15970_pilon	-	1364	14	Intergenic	novelGene_144049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.879053413614	1	49	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	369	1100	207067	178273	TRUE	40	GACTTTTAATAATATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIKLSDNIGELEAVRDKAAEELQYLRSLDTAGDDISTIKNQINSLLFVKKVCDSRIQRLQSGKEINTVKLAANFGKLCTVPLDSILVDNVALQFFMDYMQQTGGQAHLFFWMTVEGYRVTAQQQLEVLLSRQKDGKHQTNQTKGLLRAAAVGIYEQYLSEKASPRVTVDDYLVAKLADTLNHEDPTPEIFDDIQRKVYELMLRDERFYPSFRQNALYVRMLAELDMLKDPSFRGSDDGEIF	221102	162351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_162393_167409_167535_172368_172439_178244_178283_183969_184098_185045_185151_190522_190717_201786_201887_206505_206595_206961_207101_211549_211602_219477_219567_220817_220920_221010
813240	contig_5145_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_131371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535559	536229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_535600_536200
813241	contig_10904_pilon	-	837	5	Intergenic	novelGene_22628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	271.269584546443	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	118	549	515110	499423	FALSE	15	GACTACTCTGTGTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLVSLASEVQDLHLAQRKEMATGFSKGPTLGLLPDCTCYSAPGIQKARSIPKTSEAAGGGLFLHKFPFCGATVWG	515820	499134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499546_510157_510260_514793_514925_515034_515114_515706
813244	contig_13760_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_61269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATACTGTGTGATGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20799	21787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_20800_21800
813245	contig_4908_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_117375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACCACTTTGCCACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54500	55282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_54500_55300
813246	SIRV4	-	513	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	98	6	98	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	293	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
813248	contig_9535_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_124503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAACCTTTCATGGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632120	630789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_630800_632100
813250	contig_17171_pilon	-	1907	2	Intergenic	novelGene_147355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGGTATACTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68036	61250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_61430_66308
813251	contig_5918_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_99527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGTGAATCGATTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639197	638127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_638100_639200
813256	contig_9440_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_59022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTCACAAGTCAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233493	235088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_233500_235100
813257	contig_5967_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_44407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGTTATTTAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423276	424863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_423300_424900
813258	contig_10135_pilon	-	2090	9	Intergenic	novelGene_106608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	47.1750397456112	1	126	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	485	1183	88066	85988	TRUE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDPPIPSVFRRGLSTHSRPVPEDEWFPQ	89530	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84788_85945_86069_86269_86390_87014_87251_87804_88231_88518_88681_88920_89057_89508
813262	contig_10734_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_51431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	249	563	2189208	2189522	NA	10	TGGTACAGGGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWASPFLQGSYGVVKLAYNENDNTYYVSIHSPSPPIPCCPKKTPPFQHSASGEDVIAVVSFYCQAIVCIRKGVLFPFYRWGNGVVKQTSLMPNWAAFLHPLWH	2188959	2190185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2189000_2190200
813263	contig_10074_pilon	+	976	3	Intergenic	novelGene_57149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_2	20	121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	135	323	467237	468640	FALSE	20	TGTTTGAGTGAGCAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVGEGEAARSEVRVRTVRGRVEAAGRLPLAGAAFSKERIQLFSMFPLIAENKRVAWLLLSTGTCPRCIFRFCAVDFHAPYKLPYKMKKLRLRGVKQPVQSYTPIK	464069	469293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_464189_467221_467363_468577
813264	contig_15405_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_112092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAGTGAAGATAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25362	25743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_25400_25700
813265	contig_11681_pilon	-	2024	2	Intergenic	novelGene_102982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCCTAGAAAGAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192331	190273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_191116_191149
813271	contig_6589_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_26236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2185304	2186919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2185300_2186900
813274	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
813276	contig_2438_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_111997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATCTTCAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181444	182057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_181400_182100
813277	contig_5062_pilon	+	1082	4	Intergenic	novelGene_157825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	30.9012764928714	728	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGGTCCAGTTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117006	130443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_117220_123813_123917_128897_128955_129734
813279	contig_11677_pilon	-	497	5	Intergenic	novelGene_85936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17817.0836909411	61	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	12	473	598052	594908	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKRRRHMFDWLLTMMLWMLPTKLGSSKLNPAG	598063	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595226_595731_595892_597212_597397_598027
813281	contig_10581_pilon	+	955	2	Intergenic	novelGene_41450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTAATTGTCTTCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796722	799361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_796832_798515
813282	contig_12993_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_136729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGAAACCAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88320	87769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_87800_88300
813284	scaffold_19766_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_34464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915771	914500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_914500_915800
813285	contig_12965_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_65204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAATTCCGACTCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377642	376944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_376900_377600
813286	contig_1996_pilon	+	1174	7	Intergenic	novelGene_131949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTTGATGGCCTCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507998	509870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_508504_508627_508761_508918_509046_509160_509238_509350_509513_509582_509712_509829
813287	contig_8820_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_79272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTTCAATTACGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102537	103096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_102500_103100
813288	contig_5649_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_82438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTAGCCTGGAGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474271	1474751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1474300_1474800
813289	contig_5331_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_112757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTGCAACACTGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54555	54192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_54200_54600
813291	contig_13744_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_77176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCCCTTTCCCCATCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645782	646462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_645800_646500
813292	contig_17753_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_105095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCTCGTGTCTTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107390	106708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_106700_107400
813295	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
813296	contig_3817_pilon	+	2169	9	Intergenic	novelGene_78343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1066	1503	475160	482939	TRUE	20	TCCGGAATCTCTCCACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVWAQAGDADPAGQRQGLGRCVLAPGGSEPQPRQLSNPGSCAQTLTSRTRYCSGVGSAAISPSTRSHSRAMAFIEVSSGATISGNLISLFLTPATSALVLRGTLVLVSKIFKAGGFFKDEICPCWYRSAPPQVLTALSTPEGFP	474094	515647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_475417_475814_475905_482217_482264_482894_482998_491021_491179_492935_493084_513603_513776_514584_514675_515606
813297	contig_11292_pilon	+	995	4	Intergenic	novelGene_109437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	16.0277537068951	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	20	820	312995	324135	FALSE	30	GGCTAGAGAGGAGCGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSLRAMVPAPGAPGPPRDSLGSCPRVPTCEGTSSKASDCLQPSSSSSFQLSSRLSTATSGAERSPLCQAPKRGMAAAALLEAGLARVLYYPTLLYTLFRGNMPGRGHRDWYHRIDPTVLLGALPLRSMTRRLVQDENVRGVITMNEEYETRFLCNSSKEWKKVGVEQLRLSTVDMTGVPTLANLQKGVEFVLKYQSLGQCVYVHCKAGRSRSATMVAAYLIQVHNWSPEEAVRFITKIRPHIHVRPGQLEVLKEFYKEITPGAAKNEASHT	312975	324310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_313373_313499_313581_322455_322648_323985
813298	contig_6710_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_97681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	50	AATATTTGTGGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
813299	contig_6795_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_27707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAGGTTCCTGGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127154	127907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_127200_127900
813300	contig_10475_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_148724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACATTTCATTGTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78906	77790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_77800_78900
813302	SIRV6	+	327	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	43	337	-43	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCAGCGGTCGTTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813303	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
813305	contig_5649_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_82418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACAACCCGATATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341208	1339727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1339700_1341200
813306	contig_6557_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_32961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAAACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374612	373145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_373100_374600
813308	contig_12746_pilon	+	2069	5	Intergenic	novelGene_152205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.4740689654011	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	82	648	770909	772562	TRUE	40	TGACATACGGGTGAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFSPESLERHSIPEALRLKWKNLPSPIMPVDLGQALVLLPPLAKAEDPPFPGPDAAPQGELSNPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLRQLRQLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDPRRLWQWISIQVLGQEISEKMESPSCQVREAESHHEVVPQELGLQSSASEPADQLSHAVKEESDAE	770827	786410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_771296_771969_772147_772559_772652_779295_779381_785163
813309	contig_12654_pilon	-	634	2	Intergenic	novelGene_129308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	690	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAATTCTTTTGGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788066	775379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_775989_788041
813310	contig_12654_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_129307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1197	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCCCAGTGGAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773125	771289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_771334_771768
813311	contig_16204_pilon	+	1814	6	Intergenic	novelGene_154508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.2701462706758	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	19	807	283104	288360	FALSE	25	GGAAACTGGAGTGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVTVRMEDKESLQLILLIPCIILGILLLGSFISIVFLLLKVKGKYVPKLPIQVRAPPPEDSDSGSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYSECLGLAPEGPPPVPGQGIFSGFHLVTPPHGGTGSPMTKPSRAGSRCPPLEEDPPTLAPQHHPGHSSGSSTSSGEDYCNSPRSKLPAWNPQVFSSEKNLLLHQPPNLELAGSQPILSEGDAPGLPAGPSADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPLLVQQSECPGSPSPQPDSTDNDDYDDIGAA	283085	289367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_283225_284821_285036_286678_286744_287149_287345_287610_287740_288295
813316	SIRV6	+	346	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	265	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
813317	contig_9939_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_158606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATGACACTATAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360069	358803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_358800_360100
813318	contig_11281_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_125511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTGCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965059	964067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_964100_965100
813319	contig_3960_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_138049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGTCACTGGATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712811	714232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_712800_714200
813323	contig_15777_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_75753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCTAGTGAAGGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236260	235465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_235500_236300
813324	contig_4857_pilon	-	1332	3	Intergenic	novelGene_48843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACATCCTAAGAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411065	1331396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331562_1406985_1407073_1409985
813325	contig_9852_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_138461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATTTTAATAATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33820	35625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_33800_35600
813326	contig_12270_pilon	-	358	2	Intergenic	novelGene_113822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	15	TGGTTATGCTGCTTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
813328	contig_9575_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_169733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTAAAACAATTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749117	751373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_749100_751400
813329	contig_11081_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_167086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGAAATGTTACAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57909	58182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_57900_58200
813331	contig_15420_pilon	-	1697	6	Intergenic	novelGene_175296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_1	215.490695854833	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	948	1502	155560	148687	FALSE	30	TGTGGGGAATGAGGATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLTNIGTSVQNVRREMDSDVETMQQTIEDLEVASDPLYIPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQFYFTQGGNLMTQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEVIF	156507	148491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_148756_150086_150130_152127_152317_152965_153125_154514_154598_155548
813333	contig_9721_pilon	+	2285	2	Intergenic	novelGene_155986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCTCGTGAGATGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296935	300844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_+_297011_298634
813334	contig_11328_pilon	+	1340	3	Intergenic	novelGene_88442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	52	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	119	355	830591	830916	FALSE	25	GATTCTTTATATGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPANTALDAVWVVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQSEF	829333	831901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709
813335	contig_14814_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_137688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCCTCCTGGTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54908	53027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_53000_54900
813336	contig_9415_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_109820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1811608	1809136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1809100_1811600
813338	SIRV6	+	333	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	11	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
813339	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813340	contig_7870_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_108906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATGAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207875	206867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_206900_207900
813342	contig_4000_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_176082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACGATGAACGAATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271103	270578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_-_270600_271100
813344	contig_8920_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_146054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTCAAAGACACTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35252	35841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_35300_35800
813345	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813349	contig_12735_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_140781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	29	304	204113	204388	NA	35	GAATTGAAGAGGGGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISQQKYLTVMDVSLCPITARYIKQKLRGWKGEIDNSAVIVGDFNIPLSILDRTTRQKIKREIEDLDNTINQIDLTDIYRTMHPKTKEYTTFQVYIEHSLG	204084	204910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_+_204100_204900
813350	contig_11082_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_142058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTCTCTGCAAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137149	137998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_+_137100_138000
813351	contig_578_pilon	+	789	7	Intergenic	novelGene_176086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	4.3365372770859	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	19	789	3067	17850	FALSE	45	AAAGCACATGTGATATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSGFTMFLNDHPALKNPKFQLLHHSINELSISLSNITVQDEGAYKCLHYSNTSVKTMEIKVIVLATPSKAFLEVSPIKGQNVKQHVVFKCYTIRSMPTPQITWRLDNGMEFSSGPYHSFEPDRKKSNTTSIINVFTYDKNSTVDCIIRHEGLRERKLVTTFRFKDLVADQEDISDTQKASSASSQSPQYSTGAVTIMKIFTISENDKKKEEGTIQDPDLTTKEKSKSIGLMSRKSGIILLSLVSLLMLALLIIVQLFIMKLR	3048	17850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_578_pilon_+_3089_5209_5366_6921_7066_8321_8484_12922_13004_15758_15843_17728
813352	contig_578_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_176087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAATTGTGGAAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23916	25362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_578_pilon_+_23900_25400
813355	contig_13899_pilon	+	2878	1	Intergenic	novelGene_165572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20993	23871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13899_pilon_+_21000_23900
813356	contig_15132_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_176091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGTAGAAGCTCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120943	120393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15132_pilon_-_120400_120900
813357	contig_15244_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_118049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATAGGCTAGTAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529078	528279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_528300_529100
813358	contig_15628_pilon	-	1537	13	Intergenic	novelGene_147698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	126.26416312196	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	49	597	189985	122606	TRUE	15	TCAAGGTTTTCTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLTRLRLRGRRALAVMETSLLRQCPLLLPQNREKTVYEGFISAQGRDFHLKILLPEDLQMKNARLLCSWQLRTILNGYHQIIQQRMQHCPDLVSFMMELKMILEVALKNKQELHAPPPPPQFYSRLIHELGTLGWDKVVYMDTGFSTFKLKAQDASGREHLITLKLKAKYPAESPDCVVDFPVPFPISWTPQGLTHQ	190033	116215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_116773_118317_118390_120619_120737_122051_122134_122219_122266_122539_122624_141277_141347_147271_147369_159259_159361_167407_167465_173238_173300_176265_176325_189898
813359	contig_6674_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_148005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATATAAAAAGAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155262	156736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_155300_156700
813360	contig_5023_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_7388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1264	1575	643620	643309	NA	15	TGTGTTGCGGAGTACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALAIDFPAISLPVWSFGPGLRFIYVLCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLHGEKRRVFQHVQKLHQFGSREMDDSFLFNIKFI	644883	643140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_643100_644900
813365	SIRV2	+	367	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	44	112	44	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1200_1500
813366	contig_4315_pilon	-	1017	3	Intergenic	novelGene_46845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	643	1017	580236	575466	FALSE	5	CTCGCTCGTCCTCGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFWPDVTDKGQQVIQDFIPVLPEVGLKDSHLLLGLLLHFSAATAMGSQSLDLLGLELFLPLQAVLFNFNLSFFFGLLQPPVLSLAGLGHLLRGTLLRLQQLLDALRLTGHGGRDSKAEVTRLNQ	580878	575465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_575590_578761_578858_580081
813367	contig_14289_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_110569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	574	1089	60341	60856	NA	70	AAACACAATCGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTLLGCTCLRHRATPLNTVLQSAPAPTLHCCQVRKERALSGHHCARPTFIDSISWSLLSPSPHQVQKCLCSAGSDGSVPHLPNCRLAAVTVPTHTHGHSGVRLVLVSSSYSPVFHPVSTVCEAFSSAGYRVKSSRLEGWSGCCPGCEGAVVGCESSSRRLLIPPLRLVN	59767	61733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_59800_61700
813369	contig_2069_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_23411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTAGTGGGGCGGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244528	1243284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1243300_1244500
813370	contig_2069_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_23386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTGAATCAGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094813	1095151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1094800_1095200
813371	contig_2203_pilon	+	1546	15	Intergenic	novelGene_176093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	4.96364332945477	31	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	95	1288	341084	429378	FALSE	30	AATTGAACCCTGGAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKVVIDCKQVGEKAINASANITSDGVEVLGRMVRSRGPNGNSVPFQLQMFDIVCSTSWANKDKCCELPGLRDEETCPELPNSCSCSELSKGALGPAGPPGSPGLRGPKGQQGELGPKGPEGLRGETGPSGPQGPPGPQGPSGLSIQGMPGIPGEKGEKGDAGLPGPQGVPGGVGSPGRDGSPGQRGFPGKDGASGPPGPPGLIGIPGAPGVPGITGSTGPQGALGPPGAPGLKGERGERGDLQSQAMVRAVARQVCEQLIQSHMARFTTILNQIPSHSSSVRTIQGPPGEPGRPGSPGAPGDQGPPGSPGFPGNAGVPGTPGERGLTGIKGEKGNPGIGTQGPRGPPGPAGPSGESRPGSPGPPGSPGPRGPPGHLGVPGPPGPSGQPGYCDPSSCSAYGGRASHPDEPEFTPVQDELEAMELWGPGI	340989	429636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2203_pilon_+_341123_351632_351711_354769_354857_363623_363678_365807_365904_367099_367154_367499_367554_381243_381298_381754_381827_390421_390458_391980_392048_395885_396075_424605_424684_427526_427683_429298
813374	contig_12299_pilon	-	1260	2	Intergenic	novelGene_29720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAATATTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29153	27831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_28853_28914
813375	contig_6344_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_157093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGTAGCTTTCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783311	785017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_783300_785000
813380	contig_3077_pilon	+	1248	7	Intergenic	novelGene_26798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	857.747907151176	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	218	676	473998	479486	TRUE	10	GTTTTAATTTTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLDWTIQGSLY	467393	482228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_479457_479646_481023_481197_481988
813381	contig_5765_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_141411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTCCATGCCCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848348	849580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_848300_849600
813382	contig_2215_pilon	-	1000	13	Intergenic	novelGene_163874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	189.557525715957	1	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	27	488	452462	410651	TRUE	20	GACTCCAATCATCCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPGPRRAMAVYRTEEHGQPHSRDYRLFFKNVAGHYISPFHDIPLNVDSTEENGIPTKKARNAEYENLFNMVVEVPRWTNAKMEIATKEPLNPIKQDVKDGKLRYVANIFPHKGYIWNYGALPQIQSNCPTSAWHRLGKIPIKKIRAQTAVEITILLMFVK	452488	325615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_325672_326852_326890_338363_338434_345443_345530_355020_355149_382433_382561_410642_410730_414262_414298_419864_419985_422712_422767_433675_433721_437384_437450_452398
813386	SIRV6	+	304	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	584	171	405	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
813387	contig_7426_pilon	+	784	6	Intergenic	novelGene_27512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_5	253.96109938335	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	4	636	970086	987945	FALSE	40	TATTCTACTTTATTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIEDREKLDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDFTEERLAKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	970082	988093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_970162_979923_980061_980784_980902_983658_983761_985081_985205_987867
813388	contig_5041_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_27049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506548	505384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_505400_506500
813389	contig_8729_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_40106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.2508771875827	1	123	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCTACCAACTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276507	323845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286886_286999_292842_292938_306155_306214_322203
813390	SIRV6	+	381	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	3	500	3	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
813394	SIRV6	+	459	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	24	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
813395	contig_1154_pilon	-	1449	12	Intergenic	novelGene_87247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	36.1941504794023	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	307	1302	1875601	1863962	FALSE	35	TTTGAAGTACATTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCVLVATEGAEVLFYWTDEEFEESLRLKFGQPENEEEELPALEDRLSTLLAPVIISSMTMLEKLSDAYTCFSTENGNYLYVLHLFGECLFIAINGDHTESEGDLRRKLYVLKYLVEVHFGLITVDGQLIRKELRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETETDSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSEHRTLTPASPLLSLLAPA	1880488	1863814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1864018_1864160_1864231_1864370_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1869642_1869786_1870002_1870141_1875484_1875602_1878694_1878812_1879869_1880033_1880462
813396	contig_16255_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_176096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAATAAAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18376	16475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_16500_18400
813397	contig_10734_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_50980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGTTAAATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282179	280531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_280500_282200
813398	contig_13740_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_34780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806969	805248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_805200_807000
813399	contig_7173_pilon	+	1717	14	Intergenic	novelGene_37545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	36.3685929919349	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	106	1716	567479	620286	FALSE	35	ACTGAAATCCTTGTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHIDSEVKEECLREDLKFYFMNPCEKYRARHQIPWKLGLQILKILMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDSTVAFKHLFLKGYSGIDEDDYSCSVYTQEDTYESIFFAINQYHHLKNITLGTVAYGENEDNRNGLKVCKQHYKKGTMLPSNETLNIDSDVETECIHLSLQVLSKNPQDWKNSSFFCLEFYRLLQIEISFQLKGIDLQTIRSRELPDCYVFQNRITYDNKAHSGKIKIYFDSDANIEECKVLNISGSIQKNTQYVLVFDAFVIVICLASLILCTRSIILALRLRKRFLNFFLEKYKRHVCDADQWKFINGWYVLVIISDLMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSILLGTSTLFVWVGVIRYLGYFQTYNVLILTMQASLPKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFEDLGTVAECLFSLVNGDDMFATFAQIQKKSVLVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKYQQSGLPETDLQKFLKECSSKELYQKEPSAFLSSFCCLRRKGSDDHLILF	536245	620287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_536344_567471_567632_579730_579905_583021_583176_591905_591991_592089_592187_594817_594918_603796_603910_605086_605237_607407_607510_607627_607751_615381_615589_617132_617255_620255
813402	contig_348_pilon	+	1041	3	Intergenic	novelGene_67576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	347	907	159558	161229	FALSE	15	GTGCCTGTGTGTGCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKLLRNRNYCGERRFWKSHPTPDPTDCWSSFGTMNLTSQSFLPHAVTGLPTSYELLKEENEVAVLGAPVSPSPRSSAPMTSTVISIHSETSVPDHVVWSLFNTVFLNCCCLGFVAFAYSVKSRDRKMVGDLMGAQSYASTAKCLNICALVFSILLIIGFIILSATGTVMSLQAFSQTLKDHGGY	159211	161363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_159560_160016_160384_161037
813403	contig_13412_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_80001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAACAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300087	301707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_300100_301700
813405	contig_15172_pilon	+	1100	8	Intergenic	novelGene_158735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	455.059717991799	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	79	813	215528	237132	FALSE	10	TGAGGGCATTTGGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGWRPGRRCCNVAESSLRPRVPPRLAMAGLNSLEAVKRKIQALQQQADEAEDRAQGLQRELDGERERREKAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	215449	237419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227641_231618_231682_231767_231838_237049
813407	contig_21388_pilon	-	593	3	Intergenic	novelGene_136621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	101	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	34	384	26799	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	26832	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756
813409	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813412	contig_5482_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_144442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACATCTCAATCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261526	260581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_260600_261500
813413	contig_3825_pilon	+	848	7	Intergenic	novelGene_77946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1367.66634170116	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	521	793	14814	15603	FALSE	10	TCCATTTGGCATTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRADTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12982	15658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14396_14471_14780_14912_15231_15302_15498
813414	contig_20819_pilon	-	499	5	Intergenic	novelGene_55673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_2	634.564811504704	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	209	457	65941	65441	FALSE	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	69725	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_69625
813416	contig_12270_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_114002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	11	334	14409	13863	FALSE	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14419	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
813419	contig_12689_pilon	-	1236	6	Intergenic	novelGene_145055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	49.7393204617835	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	163	1107	271573	266204	FALSE	25	GCCTTCAGCTATATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRDYISYWKAYIQENDSSPKGCLYLKDWHLCRDTSAEDVYSLPVYFSSDWLNEYWDAINVDDYRFIYMGPAGTWSPFHADIFRSFSWSVNVCGRKKWILFPPGQEEALRDCHGSLPYDVTSPALLDVRLHPARAHCSPPLEVTQEAGEMLFVPSGWHHQVHNLEDTISINHNWVNGCNLAPMWHFLQQELRAVQREISEWRDAMPDWYHHCQVIMKSCTGINYEEFYHFLKVIAEKRLLTLANGTGTGTAGSVDDTRLGAQQAAFDVSRITEVLASLIANPDFQRVDTSTFSLQPEELLQQLEEAVTATASL	272722	266074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_266507_267060_267208_268078_268347_268822_268949_271472_271639_272625
813420	contig_11396_pilon	-	1402	7	Intergenic	novelGene_71285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	737.247225984759	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	99	578	249053	238728	TRUE	0	TGCCTTGCTTTGCCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYAASDSRRCSSGSSRSRPRPRRLLRPGRRLNMDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDLYKKTQETLSQAGQKTSAALSTVGSAISRKLGDMR	249151	231647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238699_238834_242979_243040_243744_243894_245696_245843_249034
813421	SIRV4	+	281	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGGGCCAATAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
813422	contig_11630_pilon	+	394	2	Intergenic	novelGene_147171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACAGGTAAGTGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77618	109510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_109204
813424	contig_6175_pilon	+	1154	4	Intergenic	novelGene_16294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	19.1369334592098	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	677	1003	1401423	1403619	FALSE	35	AGACTTCCATCCCCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSQYEIQEEEKLQEKKNYCHTTDGAPNKHRGDRSLLVVTGAHVYRCTKINPFSQETGFVFPTGSRVSLLRAVVYLSAVVTGLFSAYTACSWSQRKQDSGKNYKCGL	1398716	1403770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1399292_1400927_1400981_1401374_1401479_1403348
813425	contig_6175_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_16296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAGGCCAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404642	1404958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1404600_1405000
813426	contig_5574_pilon	-	1184	2	Intergenic	novelGene_155829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGTCTAGTTAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83300	61775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_61861_82201
813427	contig_1009_pilon	+	1016	5	Intergenic	novelGene_121750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.3163454381133	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	211	600	269175	272389	FALSE	25	TAAAGTAGGTGCCATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQENREGRVAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQASLSTGRALATPPKLHTCEKCSTSITNQAVRIQEGRYRHPSCYTCADCGLNLKMRGHFWVGDELYCEKHARQHYSASSTLSSSQA	259110	272805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_259174_268824_268917_269119_269266_270765_270884_272208
813428	contig_5258_pilon	-	1601	13	Intergenic	novelGene_100230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	62.4892768578916	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	211	1599	227517	62405	FALSE	30	GTAATGTACGTTAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLRVFAYDHCFWSMDESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGLFARTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKNIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKSPELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVLLTPQKNT	248776	62402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_62534_70947_71083_75784_75896_97662_97876_112359_112472_113950_114064_116236_116372_117308_117397_120813_120995_122677_122771_124268_124330_227499_227605_248653
813429	contig_10494_pilon	-	703	6	Intergenic	novelGene_102161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1605	junction_5	562.589157378633	3560	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	52	642	912923	903512	FALSE	0	TGGCGGGGCGTGGGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQIEWAMWANEQALASGLILITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERCGQKYMTSVVKMFGPLTRNYYIRAFLHLVLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLAAIRGEQWTPIEQKPQERPQVGGTIKQPPSNPPPRPPAEARKKPSEEKEEDTAAGGSPGGAQTNPLPVTDEVV	912974	903450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_903734_906373_906456_907136_907221_907637_907713_908356_908427_912865
813430	contig_6975_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_74235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25694	25265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_25300_25700
813432	contig_5758_pilon	-	850	2	Intergenic	novelGene_119106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTGAATTCAGAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246739	245734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_245798_245952
813435	contig_1982_pilon	+	1103	10	Intergenic	novelGene_151326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	22.2566400135186	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	203	1102	253172	269806	FALSE	50	AAGAAAATGGACATAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQVDFLDTNIIITEPYFNFTSIQESMNEILFEEYQFQAVLRVNAGALSAHRYFRDNPSELCCIIVDSGYSFTHIVPYCRSKKKKEAIIRINVGGKLLTNHLKEIISYRQLHVMDETHVINQVKEDVCYVSQDFYRDMDIAKLKGEENTVMIDYVLPDFSTIKKGFCKPREEMVLSGKYKSGEQILRLANERFAVPEILFNPSDIGIQEMGIPEAIVCSIQNLPEEMQPHFFKNIVLTGGNSLFPGYRDRVYSEVRCLTPTDYDVSVVLPENPITYSWEGGKLISENDDFEDMVVTREDY	249920	269807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_250063_253111_253181_254228_254353_255455_255592_255682_255740_259471_259571_259666_259746_265429_265602_267302_267442_269721
813438	contig_14341_pilon	-	1782	6	Intergenic	novelGene_111750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.4268073587049	105	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	660	1082	115501	113541	FALSE	25	ACCCTCCAGTGTCTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISPWASWAESTSCIPIACRGVASPSSDLLQPGVRIREPALYPRDSSWPVEGTPEEERRTAWLPTDQVQNYTTITMIFFQNIFIIPKRNPMSIKQSSPFPFLQPLVTTNLFLYGFTSSDTSYERNLTICGPLRLASFT	118560	112840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_113751_114863_114953_115377_115528_116275_116352_117822_117907_118087
813440	contig_10511_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_126911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCTCTAATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615047	612956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_613000_615000
813441	contig_10002_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_157654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTTACTAATCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313163	311759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_311800_313200
813442	contig_10002_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_157653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311709	311212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_311200_311700
813443	contig_5623_pilon	-	2296	3	Intergenic	novelGene_154878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	16	119	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	239	472	314313	312932	FALSE	30	AACTATACATGAGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSLASSSSSLRHRRPLISPARLNLKGQKLLLFPSRPGEAPNTPSSSDEPSPHDGSLFTIEPPQATLRPPLRDTKHTVDMGAVPERGRACSSLSIKKEDDSSQSSTCVVDTTTRAGSEEAATWRGRFGPSLVRGLLAVSLAANALFTSAYLYQSLR	315319	311107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_313030_314177_314316_315083
813446	contig_17500_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_157932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATCAGCCACTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291194	290924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_290900_291200
813447	contig_9290_pilon	+	874	4	Intergenic	novelGene_77565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.1928941054479	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGCTACTTATCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498325	502413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_498437_500519_500621_501530_501699_501919
813449	SIRV4	-	304	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1219	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
813450	contig_12570_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_79361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACTGGAACACGCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206584	205449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_205400_206600
813452	contig_5250_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_176102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGATTTGACGCACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388681	388201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5250_pilon_-_388200_388700
813454	contig_12079_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_67475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGAAGCCCCAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598434	599414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_598400_599400
813455	contig_2342_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_132773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCATAATTCTAACTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554768	555101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_554800_555100
813457	contig_9682_pilon	-	1166	5	Intergenic	novelGene_125317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	6.53834841531101	116	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	79	636	566842	556439	FALSE	15	CCTGAGACTCTTTGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAAEVEFLAEKELVTIIPNFSLDKIYLIGGDLGPFNPGLPVQVPLWLAINLKQRQKCRLIPPEWMDVEKLEKRRDHERKEETFTPMPSPYYMELTKLLLNHASDNIPKADEIRTLIKDTWDTRMAKLRVSADSFVRQQEAHAKLDNLTSMEISTSGAFLTQALNHMYKLRTSLQLTDSTQSQDF	566920	555908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_556565_556783_556911_559629_559730_565692_565808_566752
813458	contig_6325_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_143370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCATTCTTAGCTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430717	428975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_429000_430700
813465	contig_5643_pilon	+	834	8	Intergenic	novelGene_38746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	301.394310849168	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	59	733	152703	157107	TRUE	30	TGACAGACTACCACACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152644	157292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085_157112_157195
813466	contig_9668_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_58091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCATTTGTGTCCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139321	141383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_139300_141400
813467	contig_5200_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_140161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAATGTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321137	320051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_320100_321100
813470	contig_12626_pilon	+	1239	8	Intergenic	novelGene_80462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	308.584060588002	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	143	1189	180275	196455	FALSE	40	TACAAGAACTTAGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	179383	196505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_179494_180242_180350_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
813472	SIRV6	-	422	3	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	32	4	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTACTTGGGCACCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2515	1540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1731_1842_2030_2470
813475	contig_6919_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_163979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35419	36955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_35400_37000
813476	contig_9435_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_156959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTACGTTCTCAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329398	329848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_329400_329800
813479	contig_3942_pilon	-	2035	7	Intergenic	novelGene_128886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.87909372276815	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	356	1630	1601666	1590626	FALSE	15	GTGGACAGTGCCTGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQALDALREAVACSQPREVSVPLARFRDQCQQHRPCRFLAAQKGAYPVLLAIWQLAAAGDPALLLQVLDALTVLTDGQPDLLDAQGLQLLVATLSQGAGVANLTCAALRLVRHVCLKHEQNRQALVKAGVLPLLTGAIAQHSRCADVVREACGALRIMTFDDDIRVPFGHAHSHAKMIVQENRGLKVLVKAAQAFPDDPGVLGELCSTLSRLAVRNEFCQEIVDIGGLGILVGLLADYTNHQDLMKQVLSALRAIAGNDDVKDAIVHAGGADSVVATMTRHLASPQKQACMLIRNLVARSQAFSQPILDLGAEALISKARAAHRDCEDVAKAALRDLGCRVELCELWTGQKGNLAL	1628120	1590220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1590839_1592275_1592408_1593160_1593307_1595408_1595983_1600394_1600478_1601539_1601707_1627805
813482	contig_10811_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_165799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTTTATTAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349145	347600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_347600_349100
813483	contig_6277_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_80380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6882	6376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_6400_6900
813484	contig_10042_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_79248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTAGTCTACTTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202245	1200722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1200700_1202200
813485	contig_1154_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_87194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTCCACAACCTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058330	1069323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1059907_1060160_1060274_1060700_1060815_1062301_1062400_1069214
813487	contig_546_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_117261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAAACAAACAATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764511	763048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_763000_764500
813488	contig_19954_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_173751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGGGCAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103966	104412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_+_104000_104400
813491	contig_7909_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_155892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCCACAAAGCTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379400	377347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_377300_379400
813492	contig_7088_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_159782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTGCCTCCCTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605716	605022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_605000_605700
813493	contig_7088_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_159781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGGGAATGTGAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604673	603758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_603800_604700
813494	contig_10627_pilon	+	2178	3	Intergenic	novelGene_60026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	4.5	34	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	373	420	515603	515650	FALSE	25	CAAACCTCTTGCCTATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYADLYSLHSWCGILVFILYFVQWLVGFSFFLFPGASFSLRSCYRPQHIFFGATIFLLSVGTALLGLKEALLFKLGTKYSTFAPEGVLANILGLLLACFGVVVLYILTRADWKRPPQAEEQALSMDFKTLTEGDSPSSQ	514503	517408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_514573_515073_515232_515457
813495	contig_10923_pilon	-	1609	7	Intergenic	novelGene_66225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.42670329642684	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	71	1459	51580	43875	FALSE	20	CCACATCGTGTGGACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVVSWNINGIRSPLQGVVCQEPNNCAATTLGRLLDELDADIVCFQETKVTRDVLTEPLAIVEGYNSYFSFSRNRSGYSGVATFCKDSATPVAAEEGLSGLLATQNGDVGCYGSMDEFTQEELRALDSEGRALLTQHKIRTWGGQERTLTLINVYCPHADPGKPERLAFKMHFYRLLQMRAEALLAAGSHVIILGDLNTAHRPIDHWDAVNMECFEEDPGRKWMDGLLSVLGCQAGAHVGPFIDSYRCFQPKKEGAFTCWSAVSGARHLNYGSRLDYVLGDRALVIDTFQDSFLLPEVMGSDHCPVGAVLSVSSVPTKQCPPLCTRFLPEFAGTQLKILHFLVRLEQDAVFGQSALQLSNQTRVQTLQNKACARSTRPRPSQPGSSRGQKNLMSYFQPSSSRPQASPDLELPSLMGSLVTPFLSPPPPSRTPPFSLSYPPPRPVFLSLPALLLLIGEFFAP	51650	43724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_43998_44378_45006_47834_47905_48689_48837_49396_49578_50238_50323_51423
813497	contig_13457_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_118332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAAGGGAGGGTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58690	57069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_-_57100_58700
813498	contig_8978_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_49452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATTCACAATGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664294	1666145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1664300_1666100
813499	contig_6929_pilon	-	721	3	Intergenic	novelGene_139437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_2	19	294	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCACTTGTTTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243015	236479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_236901_241957_242114_242871
813501	contig_19812_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_101014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103008	105146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_103000_105100
813504	contig_5018_pilon	-	1687	2	Intergenic	novelGene_47034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTTAAGAAGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394019	1392251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536
813505	SIRV6	+	465	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	168	-49	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	21	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
813506	contig_6589_pilon	+	1297	6	Intergenic	novelGene_26178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	50.4483894688423	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	35	610	1901836	1911368	TRUE	20	ACCTGAATTGATTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLLPPGLRLRMRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLPPCA	1901801	1913570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901909_1903195_1903448_1903648_1903885_1911353_1911619_1912478_1912598_1913252
813507	contig_3009_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_132511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGGAGAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57696	58013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_57700_58000
813511	SIRV4	-	217	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1306	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
813513	contig_14522_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_147344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218323	216232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_216200_218300
813514	contig_8674_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_102892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTAGTGGTTTCTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115745	117350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_115700_117400
813516	contig_10299_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_79777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCATCTCTTAGTAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646966	646738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_646700_647000
813517	contig_10299_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_79776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAGAAAAATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645052	644702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_644700_645100
813519	contig_11855_pilon	-	2198	3	Intergenic	novelGene_67011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	46	271	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	748	1350	1412173	1410010	FALSE	15	TCTAAGCTGAGCCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLDEPVAMQRWARGPNLTATVVWIDPTYVVATSYDITVDAETEVTQYKPPLSRPLRPGAWTVRLLQFWEPLGETRFLVLPLTFNRKLPLRKDDASWLHAGPPHNEYMEQSFQGLSSILNLPQPEPAEEAARRHAELTGPALEAWTDGELSGFWSVAGLCATGPSTCPTLEPCRLTSWSSLSPDPKSELGPIKADGRLR	1414008	1409161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1410333_1411893_1412228_1413315
813520	contig_18081_pilon	+	1266	2	Intergenic	novelGene_23833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTTGTCCGTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421615	423355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_421884_422357
813522	contig_1706_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_155041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGGGTTTCCAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126671	128361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_126700_128400
813523	contig_9239_pilon	-	955	3	Intergenic	novelGene_137199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	3	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAGAAATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279130	239793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_240519_265907_266001_278993
813524	contig_3424_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_55524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTAAAGTAATTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248834	246349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_246300_248800
813527	contig_20004_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_167530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACATTGGCTCTTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54276	53157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_53200_54300
813529	contig_12761_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_164061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTAAAACAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287784	288510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_287800_288500
813530	contig_12603_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_105799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTTTGGTAATATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593753	594780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_593800_594800
813531	contig_12603_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_105801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATGAAGAAGCCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594729	596195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_594700_596200
813532	contig_4952_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_145525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGGCACAGTTATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389453	388533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_388500_389500
813533	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	27	7460	7	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
813536	contig_5936_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_53585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTCTATTCAGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414590	413408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_413400_414600
813537	contig_2093_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_153007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426728	1425246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1425200_1426700
813538	contig_1706_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_155031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	320.502730097577	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	51	656	14289	28937	FALSE	30	GATAAAATTGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALWGFLSVLLLLLSGDVQSSEAPGAAAEGSGGSGVGVGDRFKIEGRAVVPGVKPQDWISAARVLVDGEEHVGFLKARYVNYIKTSEVVRLPYPLQMKSSGPPSYFIKRETWGWTDFLMNPMVMMMVLPLLIFVLLPKVVNTSDPDMRREMEQSMNMLNSNHELPDVSEFMTRLFSSKSSGKSSSGSSKTGKSGAGKRR	14238	29245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_14522_23535_23675_26188_26270_28784
813541	contig_14727_pilon	-	1475	8	Intergenic	novelGene_56672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_5	88.4660663642234	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	229	699	365108	363131	FALSE	5	GGTTTCACTGTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEICADELKNVLNTVVNKHKDLKTQGFTLESCRSMIALMDTDGSGKLNLQEFHHLWNKIKTWQKIFKHYDTDHSGTINSYEMRNAVNDAGFHLNNQLYDIITMRYADKYMNIDFDSFICCFVRLEGMFRAFNAFDKDGDGIIKLNVLEWLQLTMYA	365713	362354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365112_365488
813543	contig_11987_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_168956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191149	190413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_190400_191100
813544	contig_7760_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_138428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTTTACTGAATACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15704	17964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_15700_18000
813545	contig_5643_pilon	-	1889	10	Intergenic	novelGene_38720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	333.324925819896	1	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	452	1489	36806	31788	FALSE	35	GTTGCACTAATAGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	41527	31387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37472_37616_41350
813549	contig_14322_pilon	-	167	1	Intergenic	novelGene_115700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTGCTGGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671441	671274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671400
813550	contig_18518_pilon	+	2459	1	Intergenic	novelGene_176106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACACTGTGGTAAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319007	321466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18518_pilon_+_319000_321500
813553	contig_16098_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_46183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTTCTGAGTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628393	629451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_628400_629500
813554	contig_16098_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_46184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTGCTAAGTTTGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629402	630692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_629400_630700
813555	contig_7411_pilon	+	1934	5	Intergenic	novelGene_136984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	33.741665637606	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	459	779	165590	179703	FALSE	25	GTTTACTGAGTAAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKSQVSFEDVAVDFTLEEWQLLNLTQKNLYRDVMLENYSNLVFLGYQIIKPNAIFKLEQGEEPWIIDEEMISQNFSENFIYLMMPVCNLGTANITSHGRLKRKFK	162651	180858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_162835_165314_165605_169336_169458_169688_169785_179614
813556	contig_11115_pilon	+	719	6	Intergenic	novelGene_102844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	763.891091713996	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	285	647	172756	173241	FALSE	30	AAGCCTTCAAACTCCGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQSDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVNSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165650	173313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166363_172500_172595_172714_172881_172919_172964_173047
813557	contig_7291_pilon	-	1354	6	Intergenic	novelGene_106307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	755	junction_2	24.7903206917539	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAGATTTGGGAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206350	178225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_178254_179492_179590_180125_180179_180619_181570_183797_183868_206194
813559	contig_4689_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_165414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATTTTCTAGTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141789	1143154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1141800_1143200
813561	contig_14519_pilon	-	1633	12	Intergenic	novelGene_66823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	177.52252796162	1	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	59	424	283786	282104	TRUE	35	AGTATTTGAGTAAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENRRKPTENFSQS	287169	270205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272070_272275_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282138_282222_282309_282713_282806_283632_283788_287112
813564	contig_14357_pilon	+	943	3	Intergenic	novelGene_121659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGACCAATAACAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467866	488298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_468552_487293_487490_488236
813565	contig_7342_pilon	+	1642	2	Intergenic	novelGene_71242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	793	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAAAAATAATACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733609	735341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_734667_734756
813567	SIRV6	+	472	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	384	0	211	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
813568	contig_9091_pilon	-	2028	8	Intergenic	novelGene_32440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAGAAAGTCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90169	67145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_67233_72065_72281_73532_73848_75325_75444_85769_85895_86400_86553_87127_87268_89293
813569	contig_7157_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_131319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGACATAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006743	1004737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_1004700_1006700
813570	contig_8330_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_71992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGGGGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2059792	2061177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2059800_2061200
813571	contig_14450_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_49010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAGAAAGAAAGGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145685	1143512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1143500_1145700
813572	contig_4315_pilon	+	1434	2	Intergenic	novelGene_46716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACCCAGATATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62797	68327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_63167_67262
813574	contig_3818_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_99260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGCTCAAATAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505087	505844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_505100_505800
813575	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	20	-1	20	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	938	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAAGTCAAGCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
813579	contig_10732_pilon	+	2082	12	Intergenic	novelGene_114741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCATCCCAGCGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534342	558152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_534812_537862_537966_538373_538517_538605_538920_539076_539340_539392_539752_539940_540014_540099_540189_541445_541492_541577_541685_556001_556095_558129
813584	contig_1982_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_151318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAATTACTTGCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165163	164111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_164100_165200
813585	contig_5039_pilon	+	834	6	Intergenic	novelGene_65002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.9927774155158	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	316	663	1713512	1717980	FALSE	10	TACCTCTTTGGCCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVRAGGVPCRHCPEGRARVAVLISGTGSNLQALIDSTREPHSSARVVVVISNKAAVAGLDKAETAGIPTRVINHKLYKSRVEFDNAVDQVLEEFSTDIVCLAGFMRILSGPFVRKWNGRMLNIHPSLLPSFKGANAHEQALEAGVAVTGCTVHFVAEDVDAGQIILQEAVPVKRGDSVATLSERVKTAEHKIFPAALQLVASGAVQLGENGKICWVKKE	1700946	1718151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1700997_1712189_1712222_1713013_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
813588	contig_12886_pilon	+	1941	8	Intergenic	novelGene_135533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	15.6700676580595	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	499	1941	872121	876205	FALSE	40	ATCTTTAAAGAGATTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEPPDPQVLAEKRQLGSKDGPPHHVLVVPLHNRISLPEAFRLLQDSDTGTVHLSEWGSTSSFMLLCPRLKHRWFFTSAKPGDLHTVLDVAKVADTILFLLDSVEGWDSTGDYCLSCLFAQGLPTYTLAVQGVSGLPPKKQIDARKKLSKAVEKRFPDDKLLLLDTQQEAGMLLRQLANQKQRHLAFRDRRAYLFAHAADFVPSEENNLVGTLKVSGYVRGQTLNVNSLLHIIGHGDFQMKQIDAPMDPFPLNPRVIKSQKDQGMAMEICATDAVVDMEEDLKVLMKADPDRQESLQSEVIPDPMEGEQTWPTEEELSEANDLLKESSKIVKKVPKGTSSYQAEWILDEDGQSGGEGDEYDDTEYEDFMEEESQDESSEKEEEEECETMTIGESVHDDLYDEKVDEEAEEKMLEKYKQERLEEMFPDEVDTPRDVAARIRFQKYRGLKSFRTSPWDPKENLPQDYARIFQFQNFTNTRKR	871432	876205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_871557_871746_872368_872466_872602_872985_873411_874139_874300_874734_874893_875186_875384_876084
813590	contig_6726_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_86243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTTATTTTAAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309884	311548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_309900_311500
813591	contig_11335_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_104919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAGGGAAGAGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341615	340331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_340300_341600
813593	SIRV6	+	212	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9664	561	514	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
813595	contig_6048_pilon	-	879	3	Intergenic	novelGene_73351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.5	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGAGTTTCCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2975509	2968054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2968735_2973668_2973785_2975426
813596	contig_5878_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_145726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTGGCCTAGGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267028	267685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_267000_267700
813597	contig_14142_pilon	+	742	3	Intergenic	novelGene_120427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	38	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	134	466	22565	23846	FALSE	20	AGCCTGAGTTTGTCATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECVCTTASGTARSKRGSPRRRKDGFLAFQTSRYKLHYYETPTGIKVVMNTDSGVGPIRDVLHHIYSALYVELVVKNPLCPLGQTVQSELFRSRLDSYVRSLPFFSARAG	22431	24122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22630_23285_23425_23717
813598	contig_16666_pilon	+	1638	8	Intergenic	novelGene_61720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCGGAGGAGAGCGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24000	47942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_24656_30557_30645_30735_30823_42434_42529_42637_42704_43363_43507_44969_45089_47555
813599	contig_14909_pilon	-	958	8	Intergenic	novelGene_155709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACAAATACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131461	119371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_-_119520_120069_120210_121369_121511_123936_124029_124108_124216_124286_124440_131056_131199_131426
813604	contig_5765_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_141428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTGGTTAACAGCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937473	937689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_937500_937700
813606	scaffold_16539_pilon	+	1189	2	Intergenic	novelGene_68338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	134	844	450108	450818	FALSE	15	ATCTGAAGTCTGTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTASPVLGAGSSSRAGERCCRRCRFLIGCGWLTLRSDWQLVNWTMLSKGLKRKREEEEEKAALAVDAWWLDPGHPDVAQAAPAVASSSLFDLSVLKLHHSLRQSEPDLRHLVLVVNTLRRIQASMAPAAALPPVPSPPAAAGAADSLLASSDAALSASMASLLEDLSHIEGLSQAPQPLADEGPLGRPTGGAPPSLGALDLLGPATGCLLDDGLEGLFEDIDTSMYDSELWAPASEGFKPGPVEGPGKEEAPELDEAELDYLMDVLVGKQALERPPGPGR	448309	451163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_448440_450104
813607	contig_7457_pilon	+	1598	12	Intergenic	novelGene_31652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	124.34941439148	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	80	1567	1013247	1030482	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPTAAHTANFLLNASGSTSTPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQGNSYRSQAPCRKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVCSGPFFRSMFHKTLTL	1013167	1030513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1019001_1019771_1019893_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317
813608	contig_2867_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_135198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTTAAAGGGCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876726	875695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_875700_876700
813611	contig_5350_pilon	+	1825	2	Intergenic	novelGene_99342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	173	529	176617	176973	FALSE	15	TATACGTTTCCCTGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCKLLRLVHYSSHQGLGQSYFGSRVVGPLLTVPRALLTSTFPRQSSASVEPDPYGCCYVLSAQPMLTYLTVSWVDTYAYVVAHYTGHLYESESIAVPVSHSSHVMIAPSVSTIAFS	142201	178269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_176587
813613	contig_6199_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_126382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410291	410756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_410300_410800
813615	contig_12697_pilon	+	2059	18	Intergenic	novelGene_122830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCTACAGTATGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236252	278026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_236364_240603_240655_240810_240836_242373_242538_243517_243693_256066_256163_256241_256346_257146_257289_258209_258366_258469_258545_260394_260507_263501_263691_265879_266018_269188_269313_271405_271470_275426_275569_275870_276013_277977
813617	contig_11855_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_67083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGTGTGAGCAAGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2281575	2282282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2281600_2282300
813619	contig_3942_pilon	+	2097	2	Intergenic	novelGene_128819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	1224	2015	1155109	1155900	FALSE	30	TGTATAATTCAATAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECQLQGPSPIYGEHHLWGPPPINMLHHLWGLPHSTENITCGTRPGSMKIINSGTCPQFTGSTTGRALTQSTQSITFGAHPRSIRSIIYGDHPPIHTEPHLRSPLPIHRKHHLWDQPPIDTWHHLWVPSWIHTDHQLCSPPLIHGEHHLRYWPPVHVEHHMGAPAPTNMKHHLEGMPPINTEHHLEGRPQSIGNITGGSAPNSQTASPAGPAPSLHGTSHPELALEQGEPQHLLASIPEPKLVPSLLALHLRRHLFIFWHFFS	1152559	1155982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1153519_1154844
813621	contig_14341_pilon	+	1609	7	Intergenic	novelGene_111752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCGGAAGCTGCCGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112844	118560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_113753_114865_114953_115377_115525_116272_116352_117822_117905_118085_118200_118368
813622	contig_13565_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_162386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCAAAAGGTCGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160132	158577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_158600_160100
813623	contig_2830_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_165852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2148	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	311	622	695770	696081	NA	20	ATCTCAGTATCTGATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVQELSPLAKEMLGQKPKGKLVKLYVLGSVLAFFGIVLGLVETVCAPFTAARRLRDEEAAVASLQAALERQALRTQALQEKDKQQEAVQCSRGLSNRQHAS	695459	696383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_695500_696400
813625	contig_5260_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_144418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCATAGCGACCCTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516858	517343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_516900_517300
813626	contig_5260_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_144414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTTTAATTTTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502950	504203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_503000_504200
813627	contig_9415_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_109780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTTGTGTTGAATAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639827	1641193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1639800_1641200
813628	contig_17144_pilon	-	845	6	Intergenic	novelGene_29427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1679.49985412324	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	405	767	166514	166152	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183255	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166587_166765_166840_167248_167313_179743_179786_181794_181850_183158
813630	contig_5075_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_174081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571108	572566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_571100_572600
813631	contig_3942_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_128619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGAGGTGGGGGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148528	149228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_148500_149200
813632	contig_3942_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_128620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATAGAGCATGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149689	150499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_149700_150500
813634	SIRV4	-	411	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1112	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
813635	contig_10500_pilon	+	2150	8	Intergenic	novelGene_41142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.31234486517695	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	347	1126	293349	312772	FALSE	35	AATATGCCTACATATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTLIDTLFNTNFEDHEAPHFYPHVRLKAQTYELQESNVRLKLTIVNTVGFGDQINKEESYQPIVDYIDAQFEAYLQEELKIKRCLFSYHDSRIHVCLYFISPTGHSLKTLDLLTMKHLDSKVNIIPVIAKADAISKSELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDETIAKINSSMNAHLPFAVVGSMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEELGFKDVGPENKPVSLQETYEAKRHEFYGERQRKEEEMKQMFVQRVKEKEAILKEAERELQAKFEHLKRVHQEERQKLEEKRRLLEEEIAAFSKKKASCEIFQNQSFLPSGSKKDKDRKNSNFI	286279	313796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_286460_293182_293370_298464_298627_301164_301262_303423_303593_305022_305156_310748_310931_312756
813636	contig_6589_pilon	+	723	8	Intergenic	novelGene_26110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	3283.69833808013	15	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	21	626	1876599	1880585	FALSE	25	TGCCACAGGAAGCCTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRMKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876578	1880682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879020_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
813637	contig_10855_pilon	+	679	3	Intergenic	novelGene_124304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	21.5	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAAGCCTCTGTGGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303654	306664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_303715_303968_304035_306111
813638	contig_8606_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_159391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCCTAGCCAAAACCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33989	35001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_34000_35000
813640	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	36	337	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813641	contig_6414_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_157013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTTACCAAAATGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54682	56342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_+_54700_56300
813642	contig_14829_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_163823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGATCTATAGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157102	155914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_155900_157100
813643	contig_14829_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_163822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAGAGCTGCCCCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155383	154856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_154900_155400
813644	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	539	0	373	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813645	contig_7362_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_147565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	576	977	700257	699856	NA	75	AAAAAAAAGTCAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCKKINISVITTPRANDPSAGPPCNRHTPASWLGCLLQTSLGGQRDWGPPFFWLLPYAFSPAQPASPPLGGILIFTGECRSTNLAPAGATRGAEEQRTPRRLPFQKRLPMTPQKKTSFPSVSLQTNESGDQL	700832	698621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_698600_700800
813646	contig_10734_pilon	-	1018	4	Intergenic	novelGene_51030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	25.4863798048204	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	172	951	385659	384880	FALSE	15	GGTTGGAGTAAGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	391709	384812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_385663_385971_386015_388027_388120_391676
813647	contig_5961_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_144167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTAAGATGGCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247515	246716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_246700_247500
813650	contig_6192_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_170348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAGGTTCATAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897103	895543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_895500_897100
813652	contig_9505_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_121828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGACTAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435141	436723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_435100_436700
813653	SIRV4	-	371	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1152	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
813656	contig_6740_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_142670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGTATGAATAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579815	578646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_578600_579800
813657	contig_10756_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_170656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTGGCCTAAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14765	14382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_14400_14800
813658	contig_7119_pilon	-	1198	5	Intergenic	novelGene_40996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_4	315.700312796804	2290	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	7	510	196804	188651	FALSE	10	TCCTGAAGGTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196810	187962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196690
813659	contig_10734_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_51374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATAAATAAAAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1856936	1855918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1855900_1856900
813660	SIRV6	+	444	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	338	518	165	72	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813661	contig_10003_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_88283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTGGATGTAGAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861303	861068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_861100_861300
813663	contig_6929_pilon	-	1180	7	Intergenic	novelGene_139429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	34.4597188355074	110	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	23	853	179145	175095	FALSE	10	TTTTACTTGGTAGTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEGISLTMNSKLLNGSQRVVMDGVISDDECQELQRLTNAAATAGDGYRGQTSPHTPNEKFYGVTVFKALKLGQEGKVPLQSAHLYYNVTEKVRRVMESYFRLDTPLYFSYSHLVCRTAIEESQAERKDSSHPVHVDNCILNAEALVCVKEPPAYTFRDYSAILYLNGDFDGGNFYFTELDAKTVTAEVQPQCGRAVGFSSGTENPHGVKAVTRGQRCAIALWFTLDPRHSERDRVQADDLVKMLFSPEEVDLPQEQPLGAQQGRHQQVEESLSGSESRHKDEL	179167	174767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_175251_175659_175801_176109_176186_177682_177801_178190_178342_178790_178887_179052
813664	contig_18251_pilon	+	1138	7	Intergenic	novelGene_50159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	549.600890545939	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	50	742	35759	53991	TRUE	40	AAGAATAGTGTGAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35709	55320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_48577_48794_50696_50876_53925_54012_54944
813666	contig_401_pilon	+	2291	3	Intergenic	novelGene_42764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1612	1959	1021218	1021565	FALSE	50	AAAAAAAAGCAGTCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRQTIRQGVKSCPQTCFLLSEQSFKNQLFDIEFQISRLPWKSGRPGNMAPYGDLYPIRQGRTASPTAACAAPQVYTASRLPPSHLTWALWESKCVTLPEPTFQKGDNYKDTHL	1018922	1021897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1019409_1019700_1020694_1021085
813667	contig_15230_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_146447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCTCCTGTGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113797	115478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15230_pilon_+_113800_115500
813670	contig_8153_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_34791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	694	999	25312	25007	NA	15	TTACCGCACTCTGTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYLNAIQLLSPDGAVVKSYSRQPKGRQFKSTSCSLETLWGGSTLSYMVAVSQNQLDGNGFDFLGGVLVAEWLSTWLLTQKLAVRTYPAALQEKRPGDLLP	26005	24467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_24500_26000
813671	contig_13828_pilon	-	1219	4	Intergenic	novelGene_158292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	36.0585942907128	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	95	703	323602	246911	FALSE	35	TGGAATTACTTTCGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRSVCLTLFSILCHKLLFKYIEIGVLASLY	327018	246394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_247173_250617_250786_323423_323628_326949
813672	contig_11702_pilon	-	1157	11	Intergenic	novelGene_141974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	79.302522027991	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	554	1063	374527	372981	FALSE	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380788	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374078_374165_374269_374525_374647_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
813673	contig_11590_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_125597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTAGTAAACAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727686	729143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_727700_729100
813675	contig_5936_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_53546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAACAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74932	73501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_73500_74900
813676	contig_4418_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_98382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTGGAATCTACTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821576	819811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_819800_821600
813677	contig_6710_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_96122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
813678	contig_12102_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_151046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCTATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11119	12480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_11100_12500
813679	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	101	0	-86	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	72	311	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2386	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
813681	SIRV6	+	251	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTGGCATATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
813683	contig_14176_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_74870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGGATTTGTTTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501793	499828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_499800_501800
813686	contig_2069_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_23495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGGAGGGAGGTGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508364	1508813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508400_1508800
813689	contig_9972_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_162805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATTGCTTTGTGACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360047	359286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_359300_360000
813691	contig_9972_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_162803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATGGGTTACAGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354181	338440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_338517_353866
813692	contig_13014_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_169378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAACAAATTAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591185	591486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_591200_591500
813693	SIRV6	+	298	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	371	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1722_1845_2027_2470
813694	contig_21208_pilon	+	830	5	Intergenic	novelGene_175773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	105.236638106697	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	90	617	20536	23670	FALSE	60	GAAGAAAACAAGATACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVMNVSQELDQQFQCYKFEQFEDIGLLMEEYWTTSFPIALIYLLLIFVGQNYMKARKGFNLQAPLILWSFCLAIFSIMGAVRTWSFMGTVLLRVGLKQSVCYSSFITHSTVKFWSSFFTFSKIIELGDTAFIILRKRPLIFVHWYHHSTVVIQPAPDPPRLLIWPWDRIAQFF	20446	23883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20637_21501_21634_22289_22442_22698_22773_23601
813695	contig_1275_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_108870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	168	629	747507	747968	NA	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	747339	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_747300_748100
813697	contig_15664_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_171505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAGAAAAAATAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51585	51155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_51200_51600
813700	contig_7898_pilon	+	1464	3	Intergenic	novelGene_47559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1006	1332	334052	334378	FALSE	20	GGGTGGGGTCAGTGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWPQWPELVHTKLWLPRQQTAQPSGNSTCRRSKHARVGVPALALTSSQPRRLGAVTELVGGYHRSQANAASSSDPAAGCPDPGLTHRGTTVRQAQIQIFHGNREAP	332746	338604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_333337_333636_334379_338472
813702	contig_5947_pilon	+	650	5	Intergenic	novelGene_101489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1643	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTCTCGCGCCTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391376	393990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_391633_392030_392118_392438_392501_393387_393495_393852
813703	contig_5643_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_38724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAGGAGGAAGACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45966	45445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_45400_46000
813704	contig_10494_pilon	-	1514	8	Intergenic	novelGene_102170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	73.8346193896072	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	311	922	920004	915313	FALSE	20	CACCAACCCCCGGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWVSTEKKLMGSTVGMQTSVKTSALLQFRVTSVVPARMAEMIRCIRERDFPGFGQLTMKDSNQFHATCLDTFPPISYLNDTSRHIMHLVHRFNTHYGQTKVAYTFDAGPNAVVFTLDNTVAEFVAAVRHCFPPESNGDKFLKGLPVRPVPLSDELKAALALDPTPDGVRYIIATKAGPGPQILDDTHLHLLGSDGLPKPAA	923185	914720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_915394_916136_916246_917054_917171_917609_917829_917971_918047_919992_920140_920415_920531_923125
813705	contig_13831_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_160990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAGAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103038	102600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_102600_103000
813706	contig_5125_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_43452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCTAAATCTGTACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54338	52592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_52600_54300
813707	SIRV6	+	307	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	553	13	387	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813709	contig_14546_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_157453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	129	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTATAAGAAATATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536313	534330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_534300_536300
813711	contig_14150_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_173118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGAGGATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14741	12072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14150_pilon_-_12100_14700
813714	contig_17144_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_29131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACATGTTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29673	27958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_28000_29700
813715	contig_8712_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_58836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTACTAAAAACTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347549	346981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_347000_347500
813718	contig_1836_pilon	-	870	1	Intergenic	novelGene_71089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTTTTCAAATTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140462	1139592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_1139600_1140500
813720	contig_10904_pilon	-	1413	8	Intergenic	novelGene_22607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	19.5082400172704	238	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	298	1188	491823	488436	FALSE	20	CTGGTGGTGCAATGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSGLRSTPWSCRTVVLRLASLFSLLFSLWTQITCRGRGNAKAKDCKTCGYNYEELPCWETRVGQEMYKLLLFDLLTGLAVSLLIQFPRKLLCGLFPGALGRLAGTQEFQVPDEVLGLIYAQTVVWVGSFFCPLLPLLNTAKFLLLFYLKKLTLFSTCSPASRTFRASMVNCFFPLVLVLGLAISAVPVLCSIFLIPPSKLCGPFQGQPSIWAQIPESIYSLPQATQNFLFFLGTQAFAVPLLVISSILMAYTVSLANSYGRLISELKRQIETEAQNKVFLAQRAVALSSANGAL	492120	488210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_488505_488603_488683_488965_489122_489219_489351_489965_490150_490474_490573_490979_491113_491782
813721	contig_11105_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_159825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCACTGCAGAAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402656	400878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_400900_402700
813723	contig_5095_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_74938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGCTTAAGACACACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128985	128429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_128400_129000
813724	contig_7870_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_108879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAGAAAAAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129423	127238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_127200_129400
813725	contig_9901_pilon	+	1698	12	Intergenic	novelGene_126934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACACCTAGAAAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171210	215669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_171335_172048_172174_177797_177830_178095_178342_184550_184689_185238_185382_185867_186004_197332_197518_198642_198796_199191_199294_207322_207492_215524
813726	contig_500_pilon	+	2020	4	Intergenic	novelGene_30915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_3	199.454255407098	18	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	230	979	987952	1003414	FALSE	65	AAATCAGAAAAAGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELAQTAKEPYNYFLLLRALFRSIGGGSHDLLYQEFLPLLPNLLQGLNMLQSGLHKQHMKDLFVELCLTVPVRLSSLLPYLPMLMDPLVSALNGSQTLVSQGLRTLELCVDNLQPDFLYDHIQPVRAELMQALWRTLRNPADSISHVAYRVLGKFGGSNRKMLKESQKLHYVVTEVQGPSITVEFSDCKASLQLPMEKAIETALDCLKSANTEPYYRRQAWEVIKCFLVAMMSLEDNKHALYQLLAHPK	987722	1004455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_988088_990427_990685_993044_993246_1003258
813730	SIRV4	-	406	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	63	148	63	-148	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACATTGAGTATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5095	3785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
813732	SIRV6	+	384	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	363	553	190	37	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGCCGCTTGGTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	1987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813733	contig_1143_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_86593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAATGAGAGAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154264	153988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_154000_154300
813734	contig_12050_pilon	+	1158	3	Intergenic	novelGene_62664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGCTTCAACTCGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441466	443328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_442249_442878_443141_443214
813736	contig_401_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_42769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTCGTCAATTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082369	1078875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079803_1081656_1081755_1082304
813737	contig_9189_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_165118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAGAGTAGATTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335186	336080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_335200_336100
813739	contig_5018_pilon	+	1243	3	Intergenic	novelGene_46951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCTACTGAAGCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301106	302637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_301854_301968_302061_302233
813742	contig_7629_pilon	+	2178	8	Intergenic	novelGene_153553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	70.1648205357666	3	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1169	1561	230464	231914	FALSE	65	AAAATAAACTAATAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPLRRNHNHIWQVLMYARRVFYKIDTASPLNPEAAVLYEKDVQLFKSKVVDSVKVCTARLFDQPKIEDPYAISFSPWNPSVHDEAREKMLTQKKPEEQHNKSVHVAGLSWVKPGSVQPFSKEEKTVAT	223207	232531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_223290_225870_225983_227159_227366_229608_229674_229760_230580_230674_230783_231579_231641_231806
813743	contig_6227_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_49672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCCACTGCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639502	640864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_639500_640900
813744	contig_12735_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_140777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTATGTATGTCCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172351	170167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_170200_172400
813745	contig_15687_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_129132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTCTTCATGGCGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114910	112994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_113000_114900
813746	contig_8017_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_65345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTGTTAAAGCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877572	875499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_875500_877600
813749	contig_6710_pilon	-	256	2	Intergenic	novelGene_98323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAACCGAGTACAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657178	653661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
813753	contig_9609_pilon	+	1234	2	Intergenic	novelGene_22941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	350	406	79279	79335	TRUE	5	TCAGGGGTTCCGCCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQHLLGSYCTQHGRHGAQVTGATQGNCPHQGLIQWLFLYPLQWSQGLGQAHHSLCITLQGGTSWAQQPSPELYPLSHPLGSHPPCFTRGSRSLSGRAWPRCLTHTECLLCRVPGAVMDQALASRQSLSSPFYKW	78929	80246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_79600_79682
813754	contig_12119_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_88642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124352	124708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_124400_124700
813758	contig_3241_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_146389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757086	759168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_757100_759200
813760	contig_4678_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_126017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	448	795	293727	293380	NA	25	TGGATCAACTGTAGTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYKSIIYKELLQQTTQLKKKQRHFIKEDIQTANEHMKRCSTSLVISKMQIKNTMTYCYTLIRMAKIKRLTISSVGEDVEELELSHTIDGNVKQYNHFGEQLGSFFTKLNIYLMI	294174	293238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_293200_294200
813765	contig_15631_pilon	+	978	2	Intergenic	novelGene_151545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	505	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	121	612	396107	396598	FALSE	10	TGAGCCTCTGCATCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHYRKAGSVELPAPSPMPQLPPNTLDMRVEDGSKIRNLLELALGQLEGGSARHVVFSGSGRATGKAVSCAEIVKRRVPGLHQLTKLRFLETEDSWVPASPDTGLDPLTVRRHVPAVWVLLSRDPLDPNECGYQPPGASPGLGSTPSSSCGPRPQRRARDTRS	395317	396964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_395402_396070
813766	contig_7945_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_161596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGGCTTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379138	378254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_378300_379100
813767	contig_5526_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_111695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATAAAAAAAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230360	231422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_230400_231400
813769	contig_6102_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_32371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	30	620	1719004	1718414	NA	65	GTGAAAAAGAGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMNGWQRQSQNQSRNLRRKVSTASPPTLYPPILEELSSQSWSIRSLGCGPTPSTVKLVTSAGGMQRILYFVGCLQTSLPSNDVTLLLSGSRALFCAVGRRGTGGPRETHYFRLLILGLLVRPASGRRGNCTHPRAEKPGRPWLLPPPPPLLFRHQRPNPTPSPVPAASWGQLGYGSIGVWDSWSRHLKENFKET	1719033	1717703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1717700_1719000
813770	contig_13457_pilon	+	727	7	Intergenic	novelGene_118339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	37.1752605908822	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	174	725	60777	68570	FALSE	10	TGAGGACTGCGGGGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQV	59237	68572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534
813772	contig_10922_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_176107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACTCCAGGAGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136445	136733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10922_pilon_+_136400_136700
813773	contig_21248_pilon	-	1784	6	Intergenic	novelGene_176109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.58483105326173	46	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	58	1014	18396	6530	FALSE	55	AAGGAAAAAAAATGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFLVIGPTDPIVAVLGRDTMLPCSLIPAMSAENMELRWFRSKFSEAVFIYQNQREQKEGQMPQYAGRTSLVKDFLTQGEAAVRIDKVRISDNGQYTCFFRKGRFYEKATLEVKVAGVGSAPEMRIEGPEEDGVRVACTASGWFPKPQVQWRDLSGEKFLAFSEAHAQDSDGLYRVEASLVVRDSSAGKVTCSILNPILGQEKAKAIFIPEPFFPQASPWKPAFAVSLIILCLLILGAGYFLKKEHSAKVQARQKQETLQQAQEEDRQKTEEALKARGKAGEGRGWVRAELPGGRPSCMQIGGRSSSRPGLSLWIHVLPIPTCPSHRKTCISPGSTPG	18453	5759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21248_pilon_-_6620_7040_7068_12314_12342_14124_14367_14478_14761_18107
813774	contig_10051_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_175600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331978	331450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_331400_332000
813775	contig_11328_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_88458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	666	980	833148	833462	NA	75	AAAAAAAAAAAAATGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINVLAVFFNNKAKSLGPSNVCSFHACTVTLTFPVCDSSVAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVSLRPSDESCHFACFHVLSVYHRLCVPYTGKYLEES	832482	834432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_832500_834400
813776	contig_8581_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_22857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	363443	363036	NA	5	TTTTCTCTCCTCTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPCLQAGLSLALGLSALDLLVSRPLAPCPGLYPQASVTKLFSSTLKYPEAPHSSSKPQPEGAQSLALWVGKPSAPSSAWRYPTLPASLLPKGAQLSCSTGWEAYRAVSCLSPGFAAASSLLCLLLLFTVLCHLQC	363443	362252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_362300_363400
813777	contig_504_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_54393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTCATTTTGGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	2447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_1000_2400
813778	contig_13780_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_149039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAGGAGATAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537357	535996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_536000_537400
813779	contig_3825_pilon	+	658	7	Intergenic	novelGene_77962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1242.76127366978	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	77	610	13665	15603	FALSE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLHSAKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	13071	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13685_14069_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
813781	contig_1637_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_142390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	611561	611241	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMGFVFVFVFFFKVKRKFYLAYIQQDKNGKRTSMLPELECLPESKEYHRIGKNGTTDMHAATAVSAQVPGFIFYDTGNFNCWFFLLLKIQPTFLFWASVGSNCAP	611563	609273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_609300_611600
813782	contig_10437_pilon	-	1620	7	Intergenic	novelGene_38248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1228	1575	398754	396464	FALSE	20	CTTACCCCGCTCTGTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKWFMASSYVCTPREASRLWMEIYFKFFSQIKRREISSHLAIILLPVGLLPQLPLGVQDLLRVHSKAHHGQQQNLEPPHPAPFSSGLRSEFVRLLLQVLPGELRERLAVFTSP	408246	396418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_396567_397107_397234_398635_398755_398839_398993_401330_401556_405379_405581_407598
813785	contig_9843_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_114321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTCTCATTACCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59454	58670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_58700_59500
813786	contig_21412_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_142859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAAAAGACAGATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57283	58084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_57300_58100
813787	contig_21412_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_142860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCCAATTTTGAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58088	58953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_58100_59000
813789	contig_8710_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_73528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTCTCATCAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424393	424736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_424400_424700
813790	contig_12671_pilon	+	1634	1	Intergenic	novelGene_19204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154419	156053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_154400_156100
813795	contig_4924_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_84767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTACCCAATAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230886	231732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_230900_231700
813796	contig_2924_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_140272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCACCCTGCACAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223017	221270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_221300_223000
813797	SIRV6	-	367	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-297	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
813800	contig_987_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_72319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAAATATTACTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018525	1017403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1017400_1018500
813802	contig_9363_pilon	+	794	6	Intergenic	novelGene_6818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	229.889886684908	193	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	42	581	1622283	1625756	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRATAGAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISTLLRLRLQSVSCPIPEAQPAQRLITEPQPVGRPLPWL	1622241	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623521_1625640
813803	scaffold_6394_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_110956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	337	681	128974	128630	NA	10	CCTGTCTTGACCTCTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCKFLQLLPIVQSVAPSTSSSICHTSKCGGLRPSAGTALWNLHFPHCPTTSLILLLRKGPLVAPQPQEAGCSPGCPGLGQVYVGCAELRETLCRPVVGEMSACPAGPGVFRAS	129310	128565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128600_129300
813804	contig_1836_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_71067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTAAATTGGCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954956	956276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_955000_956300
813805	contig_15044_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_174964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57334	59367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_+_57300_59400
813808	contig_5084_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_64565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTGTACTTTAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546588	546987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_546600_547000
813809	contig_18272_pilon	+	752	2	Intergenic	novelGene_7040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAGACAGGCAGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352883	354743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_353033_354140
813810	scaffold_19766_pilon	-	1065	6	Intergenic	novelGene_34278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	53.8575899943546	92	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	220	990	386168	383370	FALSE	15	GGCTGGCGTCAGATCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNFAGGRLEKAQGTLTTPNWPESDYPPGISCSWHIIAPPDQFVSDLSVTADGFSASYRVLPRGAAESGPARSPGEDGQPGPSPKPGAGPKVKPPTKPRLSPAEKPKASPEAEATPLGPDVPSTPCPKQCRRTGTLQSNFCASSLVVTATVKSMVRGPGEGITVTLSLIGAYKTGDLDLPSPPTDTPLKLYVPCRQCPPMKKGASYLLMGQVEENRGPVIPPESFVVLYRPNQHHILTNLSKRRCPSQPVMAAGS	386387	383294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_383531_383650_383822_383952_384031_384276_384509_385465_385592_386165
813813	contig_12701_pilon	-	762	5	Intergenic	novelGene_169552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_4	64.6505027049288	271	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	120	602	33228	26442	FALSE	40	CAGATATGAGAGAGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKSFLPVRTALMIARYLDIFHLMDGVMKKKDEKTSSTSDAIRYPNPT	52314	26281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26578_29682_29809_30464_30610_33152_33253_52219
813814	contig_2480_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_63567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442558	441111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_441100_442600
813816	contig_730_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_155612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAAGGAAAATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178820	179382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_+_178800_179400
813817	contig_3252_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_61519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCTCCATCATCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744073	744436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_744100_744400
813819	contig_8552_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_80111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTTCTGAAAAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569780	570275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_569800_570300
813821	contig_12250_pilon	+	1116	4	Intergenic	novelGene_80611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.008416435139	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	468	944	350196	354786	FALSE	50	AAGAAAAAGAATCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVELLLFYLKLFLHAPLISPTSFSSD	349311	354958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350163_350544_351345_351394_354705
813822	contig_11292_pilon	-	643	5	Intergenic	novelGene_109394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	39	416	56183	55345	TRUE	15	CCAGTTTCAAGCTGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAMPPRPARAYDCSRLSTVHLSRSNIPLYTFRLISTSGMMSWRASSSDCTVRFSLLRTKTRSCSLSSSRRTFFMLSQPTPWPSRTLCTTSFRNCWFSLWELLDRPWGDGGSLFTVGLCLMTDDF	56221	52594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_52697_53513_53620_55325_55422_55785_55979_56075
813824	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813825	contig_10134_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_16172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAATCACCCAAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14163	14785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_14200_14800
813826	SIRV6	+	372	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724
813827	contig_7070_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_104040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGTGCTGTTGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84828	84225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_84200_84800
813834	SIRV5	+	242	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	275	151	161	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8476	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
813835	SIRV6	+	401	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	382	517	209	73	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813836	contig_15548_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_173486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	772	1209	282757	282320	NA	60	GATATTTAATGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLGRPKKGLSLLHIFSSEISCFSQSPLILFRGANKVSTPCAPVSPFRAGKLYVNLHSLLLSWALEACWVVFKVLGWFGAGFRGDFQVSCCCCYQNDKHQQRNCSRGKKNESGDQVAARTSSFRQDGDISYCSIRIFQEQLDSAV	283528	281838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_281800_283500
813837	contig_6674_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_148025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGACCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324165	326477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_324200_326500
813838	contig_9242_pilon	+	1729	6	Intergenic	novelGene_155058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	5.38144961882948	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	57	563	296828	306890	FALSE	30	GGTTAAAATGCCCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDEFSDLDGVVQQRRQDMEGYSSSGSQTPESENSRDFHVTESQTVLNVSKGETKSAWADAHVNRMPEGKAKSLPVHGQSETVGILHKVKSQKCLTLHHILIVYAIVVCALIISTFYMRYRINTLEEQLGSLTSIVDTHRTEQTAPSGLGSQVQLNVEVLCQELTTNIMKLEKIQNNLQKLLENGD	296771	308056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_296883_297408_297532_298122_298211_299126_299232_302333_302428_306848
813841	contig_5690_pilon	-	1595	2	Intergenic	novelGene_119714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCGGAGGGGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075237	1044650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1044776_1073767
813842	contig_6436_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_134921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTTAAGATAGACTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927160	929175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_927200_929200
813843	SIRV5	+	449	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7440	2	-47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
813847	contig_517_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_171305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCAGCTGCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108214	109832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_+_108200_109800
813849	contig_6674_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_148024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAGAAAAAATAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314769	316039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_314800_316000
813850	contig_10976_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_155598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGAGTTCACGTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208603	208902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_208600_208900
813851	contig_10490_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_169888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGCTCTCTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39039	40793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_39000_40800
813852	contig_12654_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_129332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAATAAAATAGTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810014	808439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808400_810000
813854	contig_10990_pilon	-	1666	11	Intergenic	novelGene_7395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	144.345038016553	3	43	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	207	1325	37762	29709	FALSE	10	CTCCCCCAGGTGTGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNHQLSVIRWNDKTLYKDFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFDTQKFTSMVATANNRRTFINSAIKFLRKYDFDGLDLDWEYPGSRGSPASDKQRFTALVQELGDTFRQEAQSSGKERLLLSAAVPSARVYVDAGYEVDKIAQNLDFINLMAYDFHGTWEKITGHNSPLYKRQGESSAAAEVNVDFAVRYWLQRGAPANKLILGMPTYGRTFTLASSSDTGVGAPATGPGTPGPFTKEGGVLAYYEVCSWKGATKVRIQDQKVPYAFQGNQWVGFDDVESFKTKGSKTQPSRLPAQVSYLKQKGLGGAMVWTLDLDDFTGSFCNQGRHPLIRTLRQKLSLPYVLSGTREPEVLTADKPSETERGHSPGEDTF	42366	29367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_29813_30612_30740_30880_30917_32140_32255_32553_32740_34277_34402_35098_35224_35445_35612_36933_36991_37682_37916_42313
813855	contig_14450_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_49034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1157	1534	1268514	1268137	NA	30	GAAAACCTGGCCTCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPGQEGRDWNSPPLPWSMPRVGVAHFTHEQMQGQAAYSIIPRSRPQSVGIGVRKETCLISMEEVTFEVPFSANDSRKFPNVPPSSLLPLFIVFSLLMLVCPYLPLSRDTWHVLICLFAMLCVV	1269670	1267986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1268000_1269700
813858	contig_8260_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_163261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGCGAAAAATCGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303940	305859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_303900_305900
813860	contig_7202_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_17601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
813864	contig_14481_pilon	+	1640	1	Intergenic	novelGene_153851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGCCTCCGTCCTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182740	184380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_182700_184400
813866	SIRV2	-	673	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	7	6	7	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGGTAATTGACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	3671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
813867	contig_12619_pilon	-	1039	7	Intergenic	novelGene_73556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	32.6024027744378	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	87	824	987941	721383	FALSE	0	TGCCCTGTGTCCTGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFQRQCIIILTHKSYSTVFENLGNNFKMPGRSTSGSTGFISFSGVESALSSLKNFQSCISSGMDAASSVALDLVETQTEVSSEYSMDKAMIEFAIMDRELNHYIKAVQSAINHVKEERPEKIPDLKLLVEKNFVALQNKNSDTDFEKNEKFVQFKQQLKELKKQYGLQGEREADGPEGVDEDMIVTQSQTNFICPITQLEMKKPVKNKVCGHTYEEEAIVRMIESKHRRRKKACCPKIGCSHTDVKMSDLVQDEALRRAIESHNKKRNRHSE	1004993	721167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_721501_729611_729719_730134_730236_906437_906592_936811_936919_987790_988004_1004969
813869	contig_2100_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_50629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCTGACAATAACAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887304	885171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_885200_887300
813871	contig_8415_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_141697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAAAATTGCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237370	238171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_237400_238200
813872	contig_9481_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_149700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	17	340	725163	724840	NA	30	GCATCGTATAATATTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGEWQMVPPRNNKLALWEARNWPTWKQRISPPGNPGSARWEAVNWPSMKPGISPPGSRRLAGQKVAKVKQGEAGWGVGKHVSLVSGCSVSCWELCESAFPYSLPLISKSPRR	725179	723784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_723800_725200
813874	contig_8934_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_167253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGACCCCATAGGACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802090	801556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_801600_802100
813875	contig_3472_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_166930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTTTCTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234238	232858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_232900_234200
813877	contig_14516_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_153904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGGAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182429	183990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_182400_184000
813878	contig_16846_pilon	+	1255	15	Intergenic	novelGene_82897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	215.574457992536	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	229	1005	424351	453011	FALSE	10	CCTGATTGCTGATTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQDVQLTEIKPLLNDKNGTRNFQDFDCQEHDIETAHGVVHVTIRGILKGNRPVILTYHDIGLNHKSCFNAFFNFEDMQEITQYFAVCHVDAPGQQEGAAPFPSGYQYPTMDELAEMLPSVLTHLSLKGIIGIGVGAGAYVLSRFALNHPELVEGLVLINVDPCAKGWIDWAASKLSCLTTNVVDIILAHHFGQEELQANMDLIQTYRLHIAQDINQENLQLFLSSYNGRRDLEIERPLLGQNGNTKTLKCSTLLVVGDSSPAVEAVVECNSRLDPINTTLLKMADCGGLPQVVQPGKLTEAFKYFLQGMGYIGEKRPIFKGSPVHVSSLLTTAL	401096	453261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_401145_411066_411103_423148_423255_424312_424434_426259_426323_427772_427834_430939_431027_434887_434945_442194_442299_443342_443406_443528_443581_446845_446894_449079_449116_449200_449253_452940
813879	contig_15327_pilon	-	839	5	Intergenic	novelGene_70471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	62	junction_1	71.4720224983175	277	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	24	593	368635	367221	FALSE	5	CTGGTTTCTTAGGGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRVLVDMDCVLADFEGGLLRSFRRRFPADPHVPLEERRGFLVCEQYRALRPDLADKVASVYEAPGFFLDLEPIPGALEAMREMKDMEDTEVFICTSPLMKYEHCVREKYRWVEKHLGPQFVERIILTRDKTVVLGDLLIDDKDTIQGQEKTPRWEHILFTCCHNQHLALPPTRRRLLSWSDNWREIIDSKRGTSL	368658	366974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_367370_367476_367592_367753_367815_367895_367997_368491
813880	contig_11855_pilon	+	517	4	Intergenic	novelGene_67017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	202.560827626886	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	112	516	1592925	1609774	FALSE	0	GCCCCGCTGCCTGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVDVSAYSGLGEDSGGSALEEEDEEDGEPPYEPESGCMEIPGLSEEEDPAPSRKIHFSTAPIQVFSTYSNEDYDRRNEDVDPMAASAEYELEKRVERLELFPVELEKDSEGLGISIIGMGAGADMGLEKLGIFVKTLPRDRVSVYNIYMYVLFPVLYGPCPLSGRPHKSSPQ	1592813	1609775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1593003_1597293_1597427_1599451_1599538_1609666
813881	contig_3825_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_77987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACTCTTCCTCCGTTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634425	636517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_634400_636500
813882	contig_8260_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_163230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59075	60344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_59100_60300
813886	contig_12079_pilon	+	1647	7	Intergenic	novelGene_67381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	49.3040453602835	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	64	561	405237	458858	FALSE	20	GTCCTTTATGATTTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSCECRCRSCCAGPRARGAEMEPLAPMRLYTLSKRHFVLVFVIFFVCFGLTVLVGIKGPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQIVSNPLSTYNQQLWLTCVVELNQSKETSVQTRFTMTVKVNGVAQDGTIMFIHNEVHNRTRTLTCAEKCAEIIVAHLGYLNYTQYTVTVGFEQLLIKEMNFTGKG	405173	459944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_405245_421006_421111_423247_423304_426831_426923_429608_429731_433416_433522_458846
813888	contig_4364_pilon	-	1316	2	Intergenic	novelGene_44	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	206	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	844	1251	509526	509119	FALSE	25	CATGTGAGATTATTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPGCGQGAIPAAWGRLSMSSPPPRPGLFSRMLLGGGTSRHKTVFRKLLTGPVPELTHSMICIALCPAAAGRSGHGRWLGLTLGCPPVTLELVGVDPSACCLKPGWALLAACRVSAASVVSPPSALPDEISIS	519083	509053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_510255_518968
813890	contig_17973_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_176111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATAATAACTATTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15221	14542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17973_pilon_-_14500_15200
813891	contig_18967_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_165318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGCTTTGGGAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61800	62504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_61800_62500
813892	contig_18967_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_165319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63540	64742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_63500_64700
813897	contig_18150_pilon	-	1001	7	Intergenic	novelGene_175822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	16.9771087709958	154	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	522	956	18848	11055	FALSE	5	TTGGTTTATTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVGILLANLFARNGEQNRKTSFNSTLSSTNDHWIGFRNSCYHLFKESKTWSESYAACKELNSRLMKIHIKEELKLLTLFGMEGWIDLKMNKTDGPLVWQDGTQMNQSLLKFPGKKNHTCAYVSGIYIYSDNCSSGESYICEL	23975	11009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18150_pilon_-_11161_11978_12083_12424_12553_18599_18666_18817_18911_21173_21452_23794
813898	contig_19182_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_165576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAATACAGCTTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3355	4985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19182_pilon_+_3400_5000
813901	contig_19851_pilon	-	579	5	Intergenic	novelGene_29887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.5975771647454	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	258	443	132194	131036	TRUE	5	CTTGTTGGACTCCTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIQKSVGPASLSLLTFKVYASPKKDSPNKNSIKVDELSLYSVPEGQSKYVEEPRTQLEENISQLRHYCEPYTSWCQEKYFYTKPKMQSIVQWGVAAIELVPTHSNPVYNRMKHCLVLHHPHIVATFEPVAAATVSVHLVESLPLFR	134355	124389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_124461_130970_131194_132166_132222_133049_133170_134245
813902	contig_11328_pilon	+	726	6	Intergenic	novelGene_88413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1838.7062190573	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	92	685	644303	647995	FALSE	35	AATCATCTTTACACAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANFKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643649	648036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644318_644838_645017_645228_645376_647064_647223_647899
813905	contig_3975_pilon	-	837	6	Intergenic	novelGene_54900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	4.3081318457076	318	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	99	698	2116028	2112185	FALSE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTRSWFPGGESGRLEEPAPKPRSRLRASSQHPMDDKKKKRSPKPCLTQPAQAPGTLRRVPVPTSHSGSLALGLPHLPSPKQRAKFKRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGKECSFEQLEHVREMQEKLARLHFSLDVCGEEEEEEEEDGVTEGLPEEQKKTMADRNLDQLLSNLEDLSNSIQKLHLAENTEPEEQSAV	2117432	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2112988_2113492_2113684_2113803_2113971_2115864_2116039_2117344
813906	contig_10777_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_101166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31846	30361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_30400_31800
813907	contig_20890_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_147050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	8	436	39522	39950	NA	55	GCAAAAGAGAGAGAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRMFQSIPGLYQLDISSAPTRPRPRPPPQLLLLKVSPDTANVSQGTKSTLAENCSSRHCASMTSNFTLPKKRHVFPRENTSPPMKQSCPPPKNKSKLNQASTSNCQFRKKIPRTQEKLNTSKGVNQQNLNHRKVYTTSSVSLLNN	39514	39952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_39500_40000
813908	contig_20890_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_147051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	331	378	40635	40682	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKITHKLITVKAGDRFTGIHSCLLFYVLKIFQNRTFKKKKIISRYYLRFNWNINYTKSPSGLIRRYILQLAHPGSESDTLWSTLKLLTSLCFTTRTCSEKVPDPNYLCSIMWELCGNSIQALKQI	40304	40943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_40300_40900
813911	contig_10263_pilon	-	2130	4	Intergenic	novelGene_135817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.82842712474619	90	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	61	1140	109031	95360	FALSE	5	AGGCTTCTCTCCTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWKLSVLGDFPGHWRGVRPTMPALRLLFTAALLSSWAQLLAEANSWWSLAMNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQYQFRQRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDQLKEKYDSAAAMRITRKGKLELVNSRFNQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNETTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKSVQVERCHCKFHWCCFVKCKKCTEIVDQYVCK	109091	94369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_95819_102045_102339_107484_107733_108951
813912	contig_14450_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_48930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATACATTTTTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461009	460296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_460300_461000
813913	contig_1594_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_138812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAGATGGTTTATATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452244	453416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_452200_453400
813915	SIRV6	+	438	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	17	4	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	9	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
813916	contig_9027_pilon	-	3190	1	Intergenic	novelGene_156367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCCTTCTTCAAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185653	182463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_182500_185700
813919	contig_18544_pilon	-	1364	4	Intergenic	novelGene_152757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	25.781130050226	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	78	1169	121262	111124	FALSE	25	AGAACAGCATCCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMDVTFLGTGAAYPSPTRGASAVVLRCEGECWLFDCGEGTQTQLMKSQLKAGRITKIFITHLHGDHFFGLPGLLCTISLQSGSVVTKQPIEIYGPLGLRDFVWRTMELSHTELVFPYVVHELVPTADQCPTEEQKELTHVKRADSCPKEGQGRTILLDSEENAYLLVDDEQFVVKAFRLFHRIPSFGFSVMEKKRPGKLNAQKLKDLGVPPGPAYGKLKNGISVVLENGVTISPQDVLKKPIIGRKICILGDCSGVVGDGGVKLCSEADLLIHEATLDDTQMDKAKEHGHSTPQMAAAFAKLCQAKRLVLTHFSQRYKPVALAREGETDGVAELKKQAESVLHLQEVTLAEDFMVIGIPIKK	125182	110928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_111591_113106_113575_121105_121271_125113
813920	contig_19851_pilon	-	1220	12	Intergenic	novelGene_29810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_10	64.1094106112794	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	140	1135	36836	10128	FALSE	25	GGAATACGTTGTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAALRLYTLNKVLLTPGRGLAQGSQDPKNQGPLHIHEVRVKLREIVGASTNWRDHVKAMEERKLLHSFLAKSQKALPPRRMKDSYTEVLLPLGSQPELREKYLTVQNTVRFGRILEDLDSLGVLICYKHSKIQATQASPLSIVTALVDKIDMCKKSISPEQDIKFSGHVSWVGKTSMEVKMQMRQLHGDEYSPVLDATFVMVARDSENKGPAFVNPLLTESPEEEELFAQGELNKGRRIAFSSTSLLKVAPSAEERTTIHEMFLNTLDSKTISFRSRVLPPNAVWMEDSKLKSLLVCHPQERNIFNRIFGGFLMRKAYELAWATACSFG	36975	10042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_10218_10391_10483_10630_10743_11862_11931_17803_17878_23177_23282_23843_23928_27405_27444_27708_27880_30130_30177_32061_32160_36816
813923	contig_20402_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_72847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGAAACACATACATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192887	192134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_-_192100_192900
813925	SIRV4	-	502	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	112	3	112	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	478	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5046	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
813929	contig_12080_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_128356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	493	822	73080	73409	NA	45	GTGGAAGAAGACATTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILKFKTTANEMKTSIDGLNRRLNTAEKVSELEDRSIEKIQTKAQREMESKKKECKGGVKLRHVRALNTDNLWCPLLCLLTHSDRIYELYIYMYTCVCVLAIHDITTF	72587	73726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_72600_73700
813931	contig_15003_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_137343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAAGTAACCTGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261981	262577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_262000_262600
813932	contig_15732_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_88897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCCAAGAAATCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238558	239201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_238600_239200
813934	contig_17198_pilon	+	1582	10	Intergenic	novelGene_62386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_8	93.6626465461269	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	118	1092	1060803	1096421	FALSE	30	AAGAGATGTCTTGTCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVQIISRRLISQPYCGLKSAASAQTKIHPTMARPSSNMADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRKSWKTLDCSFWLACFPVAASSFCLFLISFPGALWHNSS	1047675	1096911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1092386_1092466_1096382
813935	contig_5935_pilon	-	1631	3	Intergenic	novelGene_102668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_2	1.5	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431642	422263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_422428_422509_423851_431516
813936	contig_16535_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_167702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCCGTTGGGTGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208542	209893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_208500_209900
813937	contig_2924_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_140252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	374	709	36827	36492	NA	25	AATCACTAATGTGGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPKKYVSNLIPRTCDCDLIWRKGLCGCNKVKDLEMKRPSWIIQVGPKFNDKCPCRRHTEKTDTEVTRRLRQRVELSSHKPRKPRNANSHPKLEEADSSSPRGSRGEPPC	37200	35860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_35900_37200
813938	contig_5236_pilon	+	2311	9	Intergenic	novelGene_100888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_8	136.585996262428	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	89	796	62791	69904	TRUE	65	AGACAGTGAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGWQTEPSGFLRNVGQLFECHLLPPTDVRMTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVTFHFILPGVSLGLLGSTDMSWTLNSLTGG	60637	73508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_70606_71870_72052_72875
813939	contig_11989_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_68451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72401	70435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_70400_72400
813940	contig_2940_pilon	-	339	2	Intergenic	novelGene_81936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	19376	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTGGTATGTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720929	717653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771
813941	contig_10734_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_51414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2083747	2084751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2083700_2084800
813942	contig_12079_pilon	-	846	5	Intergenic	novelGene_67391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.834816109386	1820	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	34	366	471245	462920	TRUE	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGGGDGAGGKMEDYQAAEETAFVVDEVSNIVKEAIESAIGGNAYQHSKVNQWTTNVVEQTLSQLTKLGKPFKYIVTCVIMQKNGAGLHTASSCFWDSSTDGETSVSAFLDHAETYLIKAV	471278	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_462525_462883_463060_463673_463798_467104_467147_471218
813943	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_96994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
813944	SIRV4	-	314	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1199	8	1199	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3959	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
813947	contig_9443_pilon	+	2428	5	Intergenic	novelGene_167128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	32.8100594330458	106	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	365	1360	110845	111840	FALSE	25	GAAACTACTGCTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALALWTTLPSRMSLRSLKWSLLLLSVLSFLVMWYLSIPHYNVIERVNSMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQQAEREDKMLALSLDDEHVLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYIMKTDTDVFINTGNLVKYLLNLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKAHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIISRDLVPRIYEMMSHIKPIKFEDVYVGICLNLLKVDIHIPEDTNLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY	67710	112908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_67795_68648_68746_105724_105809_106532_106598_110810
813949	SIRV6	+	183	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-348	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1937	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
813951	contig_10013_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_125037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	183.59281300654	153	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	255	1421	161763	228534	FALSE	45	AAGCACAGTGAGGAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTRSTEDIAPSGSDSKPCVQPFDSGAAASATNSSSGSCPGHWRRENSDFFSTTRDEQEEDGFPGRLDESSEDLSLDLGALQGSDYLQDLGLGAPSHSLSEEANDSSPPSGAGGDSPFYSWAGSLGPQARRRSWERSRSCSESWQRLSLDILEVDEGPSLPRTLASLTLNLSGGGLQAWTQGCLTGGESPTEHPGKEGGGTEKRRRSWSVPVSSDEISSLKLPQALEVPSPAVQGLDPPVLEWVEKDHVEPDHVARQRARLPASPGASQSNITWFEFLSESEDGGGRTERSDRGARVKRSLSSLRSRVTRQKEKGKNPAHQKDKGQDAPERRECVNGHQLVQGTFRNHFSCPLCGKPFLRSARNQPRKTQTKPIAVDSDSWHDALMTYQ	161508	228536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_161800_188439_188577_203147_203411_204114_204266_205150_205266_206160_206219_207531_207610_209961_210065_210250_210393_228451
813956	contig_9982_pilon	+	683	6	Intergenic	novelGene_55737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	117.172351687589	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	370	681	315214	317409	FALSE	30	GGGAAATACATGTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSN	307581	317411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313152_315168_315273_316048_316153_317260
813957	contig_9389_pilon	+	1261	5	Intergenic	novelGene_83950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	259.413280307697	1603	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	483	884	202108	204320	FALSE	10	AGTCTGTCTTCTCTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFGRAAGSTADGVPFIIKKCVGEIERRALHTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGQELVELSQASPHDISNVLKLYLRQLPEPLLSFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRPDSGESEAVPVATVTAMAVRLRELLRDLPPENRATLQYLLRHLRRKGPRWWCRCHSRRWARWQLSPRRRRPRMGPEDLTYRPTTQTQSWRKPRTCCCRCRRPTWRRRRRVAAARSRWRLLMTERRSWPSSSWCTTPTSPTTQPAPSCPA	201398	204697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_201590_201664_201803_201954_202194_203757_203852_204098
813960	SIRV6	+	419	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	363	518	190	72	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
813961	contig_17157_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_171741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACCTTTGTCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33567	35507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17157_pilon_+_33600_35500
813962	contig_13055_pilon	-	1329	7	Intergenic	novelGene_104955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.4885042281291	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	44	679	143110	88291	FALSE	15	CAGTGCTTTGGTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKGCSHLLSRNTLCCHGYCRGYRRAAGCNCGSGPSSVPYCLIRNGTPAAQPSLSNHRNQTSDLSGNIQWHPDCGTAWRTAISGRSHQNSIQDPTGRNARVG	143153	87640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88371_89894_90042_98669_98742_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034
813963	contig_12671_pilon	+	813	7	Intergenic	novelGene_19213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	21	junction_3	517.025037003905	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	101	400	197316	207086	TRUE	20	CATGTTTCTTCGTGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSQGLHRKNGI	197215	212407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286
813964	contig_1516_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_50024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438857	437032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_437000_438900
813965	contig_14755_pilon	-	1497	10	Intergenic	novelGene_129378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	39.6820698384883	143	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	689	1255	198187	128904	FALSE	0	CCCTTTGTTTTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIQPSDEWENFSKRTDDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	368707	128661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_198132_198217_225825_226033_321120_321259_321858_321897_364130_364359_368659
813966	contig_15410_pilon	+	1050	5	Intergenic	novelGene_130614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	972.927894296386	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	253	594	146836	148093	FALSE	35	TGTGGATAAATTTCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTDPADGPV	145471	148549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146824_146980_147081_147178_147750_147830_148070
813967	contig_4364_pilon	-	1443	12	Intergenic	novelGene_131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	156.411673382289	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	32	1222	1097596	1092058	FALSE	20	AACACTCCCTGGCTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQSPPREGSQGELTPANSQSRMNTNM	1097627	1091836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093425_1093639_1093726_1094116_1094178_1094340_1094419_1094490_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1097563
813970	contig_5050_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_110243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	774	1130	69789	70145	NA	50	AAAGAGAAAGACCCTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKLCHPLGIGEDLLITGRDRRKEKHPLPRGGPGNCPGNRLLEVTDYWGRCKIPEKTSSQHSVTKGQSQTEAVSGPQKPTTTRGATAVYHWGGSRETLFEAQAKKGLKLRVEYTGRE	69015	70713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_69000_70700
813971	contig_3241_pilon	+	2020	2	Intergenic	novelGene_146398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	64	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	188	496	816109	819565	FALSE	30	GGGAGCCAGGTGACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPLDPHRSPLITLETQVSTFPWPLSLVSTQVFLDPPPGDICASSWPHGSESGFNGRHFWLSQLGGVLLASSRYQEARDAAKQLTMPKTAPHHKERSGLKCQ	815921	821089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_816121_819268
813976	contig_7718_pilon	+	2013	8	Intergenic	novelGene_129409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_7	52.4361613813231	7	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	47	748	257538	284723	FALSE	50	TTAAGAGAACAAAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	254897	285988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_254936_257529_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
813978	contig_12923_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_30123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGGGGCTGATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77182	76597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_76600_77200
813980	contig_6364_pilon	+	601	5	Intergenic	novelGene_51868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.6984250992003	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCCGGGTCACTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485583	2489310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2485716_2486458_2486530_2487476_2487586_2487738_2487843_2489125
813981	contig_1244_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_37903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTGCTGTGTTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192232	190570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_190600_192200
813982	contig_11017_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_128077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233694	234627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233700_234600
813984	contig_5255_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_171553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCTTCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18269	16782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_-_16800_18300
813985	contig_9683_pilon	-	273	3	Intergenic	novelGene_151289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	4.5	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGTCTTCATTTGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520538	518308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_518411_519834_519923_520455
813987	contig_9698_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_82505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGCTCAATTTCCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246426	247126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_246400_247100
813988	contig_9698_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_82506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGCCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247624	248127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_247600_248100
813990	contig_9705_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_41733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCGGCCCGCGCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233698	235676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_233700_235700
813991	contig_3153_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_104685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAATATCTTACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307107	306407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_306400_307100
813992	contig_10011_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_68021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCACTTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32882	31172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_31200_32900
813994	SIRV6	+	763	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10257	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
813996	contig_11160_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_168855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	410	1233	464	1696	822965	824197	NA	30	TGAAAATGCAAGCCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHHCSRPADRSACPLCPTLCPGHSSRGRRAPPETSSLRPRQEQPMRLHNLSSPAPVPSLPSFSSLPPALIPSAFTTVLESQVEGCFLNSSSTVSAFLAPVLGMEFVLGLAGNSLAFFIFCFHTQPWTSNTVLLVCLVIADFLLIINLPLRVDYYLLREMWRFGATACQINLFMMSTNRTASVIFLTVIALNRYLKVVWPHHVLSRASVGAVARVSGGLWVGILLLNGHMVLAMNSNNTCLSYRLGRNSSASLRWHQALFALEFFLPLVLILFATVSIWQTIRRRSLGGQAGPQRAMRVLAMVVVVYIICFLPSVIFGIMSLVTFRLGACRTLNICMQLFHGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQTRALLGLTNGWQGPSGEESSYLPSTQRPAAPRKAEATVKVKD	822501	824559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_822500_824600
813997	contig_5083_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_151676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTGGCCCACCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578350	578822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_578400_578800
813999	contig_987_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_72336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACGAATTGTTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231331	1232233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1231300_1232200
814000	contig_6589_pilon	+	1401	5	Intergenic	novelGene_26198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	6.57647321898295	135	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	478	1119	2019523	2026694	FALSE	15	TGAGCCATGCTTTTAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWNLPAGVDCTTSGVLALTALLFKMEEANLASRAKAQELIQATNQILSHRKPPSGLGVTPAPVPTSLGLPPGPSSYLLPGSLPLGGCGSTPPTPTGLAAASDKREGSSSSEGRGDTDKYLKKLHTQERAVEEVKLAIKPYYQKKDITKEEYKDILRKAVHKICHSKSGEINPVKVSNLVRAYVQRYRYFRKHGRKPGDPPRTPSATQGARAP	2019045	2026976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2019578_2020132_2020216_2020443_2020663_2026110_2026240_2026538
814002	contig_5978_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_152406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCCGTAGTGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684268	686100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_684300_686100
814005	contig_5153_pilon	+	167	1	Intergenic	novelGene_74333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600124	600291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_600100_600300
814007	contig_11363_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_160505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATACAAAAAGACGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226637	226033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_226000_226600
814008	contig_13453_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_146714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCACTGAGTTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126313	125197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_125200_126300
814009	contig_7622_pilon	+	959	6	Intergenic	novelGene_132404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.894890676162	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATTTCACCTGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251958	274828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252123_252974_253180_254141_254222_255063_255135_256374_256447_274461
814010	contig_9114_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_155183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	344	724	150793	150413	NA	55	ACGGCTATATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPKEREETMIKESTLGLPGSLQGLMLSVRHGSLLCCSSPLCSQRPHWSSFSSSKAQMLALLGSSTLAVPSTCSTSPPPPCFSPSLLSELLFFLLETAASGKYLQTSLTTFILLIRFDCLCASLS	151136	148441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_148400_151100
814011	contig_7457_pilon	-	1210	9	Intergenic	novelGene_31415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.347713576363	2	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473249	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_468296_468963_469374_470282_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473150
814012	contig_15543_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_164342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGGAGTCTTGAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47739	47051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_47100_47700
814013	scaffold_13505_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_111406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCACCAGCCGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294088	293838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_293800_294100
814017	contig_14508_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_79070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175359	176013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_175400_176000
814019	contig_19957_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_57721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAGCATGTTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234883	234336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_234300_234900
814020	contig_7594_pilon	-	1030	4	Intergenic	novelGene_55447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	424	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGCACTTCCGCCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566711	559128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_559180_561091_561214_561536_561750_566067
814021	contig_4686_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_118572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAAAGAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742384	740895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_740900_742400
814022	contig_12050_pilon	+	1803	12	Intergenic	novelGene_62597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1147	1491	304606	311049	TRUE	20	GCAGGGTCCCCGAGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEELLLALSVSSSGSLSQLLNALLQGRGQAFGEGGGLPEFRVRPQPKGSAFIIHIMEGASFRRLTEQPLQVQIGQRAHGSGRLQQVVVRGGAKERQQGVGGALQGPQALSFCG	291827	312804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_291939_298735_299128_300174_300221_300316_300365_302032_302180_302362_302491_302686_302807_302981_303113_304582_304657_310755_311192_311928_312035_312740
814023	contig_1435_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_115522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGGGAATGTGTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579637	578899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_578900_579600
814025	contig_4924_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_84775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308407	310435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_308400_310400
814026	contig_8864_pilon	-	2254	2	Intergenic	novelGene_135991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGATTAGGGAGCACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460599	458177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_458507_458674
814027	contig_5586_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_143616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829433	831003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_829400_831000
814028	contig_5862_pilon	-	1752	3	Intergenic	novelGene_54960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	36	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	107	814	204014	202458	FALSE	60	TAATGAAAAAAATATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPTDDLVPTILDKAHKYNLKVTFHIEPYSNRDDENMYKNVKYIIDKYGNHPAFYRYKTRTGNALPMFYVYDSYIVKPEKWANLLTTSGSQSIRNSPYDGLFIALLVEEKHKFEILHSGFDGIYTYFATNGFTYGSSHQNWASLKVFCDNYNLLFIPSVGPGYIDTSIRPWNTHNTRNRVNGKYYETALSAALQTRPSLISVTSFNEWHEGTQIEKAVPKRTSSTVYLDYRPHKPGLYLELTRKWSEKYSKERATYASDHQSPGLNALIKV	215960	201519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_203134_203982_204060_215899
814029	contig_1244_pilon	-	1971	5	Intergenic	novelGene_37901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.06155281280883	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	220	1026	186778	182167	FALSE	10	CTTATTTGTTTTCTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALSAVTWLCIFIVAFVSHPVWPQKTPKHKTPAQLKVAACCEEVKELKAQTANLSSLLSELSQKQERDWVNVVMQVMELESKSKRMEVRLTEAEGKYSEMNNQIDIMQLQAAQTVTQTSADAIYDCSSLHQKNYRISGVYKLPPDDFLDIPELEVFCDMETSGGGWTIIQRRKSGLVSFYRDWKQYKQGFGSIRGDFWLGNKHIHRISRRPTRLRVEMEDWEGNMRYAEYSHFVLGNELNSYRLFLGNYSGNVGNDALFYHNNTAFSTKDKDNDNCLDKCAQLRKGGYWYNCCTDSNLNGVYYRLGEHNKHLDGITWYGWHGSTYSLRRVEMKIRPEDFKP	186997	181221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_182337_182551_182751_183238_183434_184034_184136_186636
814030	contig_14807_pilon	-	415	2	Intergenic	novelGene_124657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	16	318	37635	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	37650	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485
814031	SIRV6	-	138	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACGACGACAAACCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11259	11024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11109_11205
814033	contig_9389_pilon	-	705	3	Intergenic	novelGene_84055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGCCTGGATGGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748571	744979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_745427_746766_746919_748465
814034	contig_5605_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_143937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATGCTTTTGTATCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281267	280335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_280300_281300
814037	contig_10159_pilon	-	1923	4	Intergenic	novelGene_30904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_3	45.6970701710976	1	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	32	376	1016524	1004067	FALSE	40	TAACTATATTATACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVDRHVDLLEVAQETDGFSGSDLKEMCRDAALLCVREYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1016555	1002519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1006171_1006306_1012821_1012873_1016485
814038	contig_5429_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_127770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTTCCATCTAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19136	17831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_17800_19100
814039	contig_20017_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_174906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCCCAAACAAACTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31575	32839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20017_pilon_+_31600_32800
814041	SIRV6	-	518	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8241	60	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAACAATATTCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10788	2298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2815_3106_3164_10723
814043	contig_7976_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_169426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGGTTGTTTGCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920377	918694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_918700_920400
814049	contig_6503_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_145773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGCAGAAAAAAGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200811	200071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_200100_200800
814052	contig_1309_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_73979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	808	1140	244814	245146	NA	55	GATGCAATAAAGTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYNTLYVFDNTHTYNMNLYLIPTVQSNTTDYILILLLSIFVTDFSNSEEPVCRYFSIFNHLLRPGIHKVVVLKSLIHVNCKKQTYSLEFSICLYTFSSLTVSLSDISHL	244006	245273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_244000_245300
814053	contig_17158_pilon	-	1961	14	Intergenic	novelGene_141164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCGCCGCGCGCCGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260748	231746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_231781_232371_232565_233214_233351_235750_235865_236236_236343_240273_240373_241535_241620_242436_242529_246164_246237_246327_246420_256100_256263_257706_258144_259830_259923_260500
814055	contig_13680_pilon	-	1512	2	Intergenic	novelGene_149572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	26	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCTGTTCCCTGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205099	203204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_204499_204881
814057	contig_7467_pilon	-	920	4	Intergenic	novelGene_69482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_3	236.58167487971	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	202	606	92058	85992	FALSE	15	CTGTGTTAGGTGCTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGKISTDPTL	133011	85677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_86166_86612_86735_91949_92093_132844
814058	contig_15327_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_70524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	17.2530190594767	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	331	1287	488304	478231	FALSE	10	CCTTATCTTTGTTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYDPRADGRNISKVEVAVAGSVSGLVTRALVSPLDVIKIRFQLQIERLSHSDPSAKYHGILQAGRQILQEEGPAAFWKGHIPAQLLSIGYGAVQFLSFDLLTELVHRASVYNARDFSMHFVCGGLSACVATLAMHPLDVLRTRFAAQGEPRVYKTLRDAVVTMYRTEGPLVFYKGLSPTLIAIFPYAGFQFSFYSSLKQAYEWAMPAEGKTNGNLKNLLCGSGAGVISKTLTYPLDLFKKRLQVGGFEQARVTFGQVRSYRGLVDCAKQVLQEEGSQGFFKGLSPSLLKAALSTGLVFFWYELFCNLFHHIKKADS	488736	477742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_478414_480129_480261_481318_481503_485822_485994_487817_487974_488172_488343_488444
814060	contig_13048_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_138924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416514	417054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_416500_417100
814064	contig_15825_pilon	+	2536	2	Intergenic	novelGene_160213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	55	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	23	1486	211571	214657	FALSE	30	ATGAAAGCGTTGTGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFKVATKMADKTPVPQVSRQSPSESAFCPAPKLDPSHKAKLSGGAARRRARKRKLPDEILTFQGKRRRCVINKCRNGKERVKTDLQESTEQRPVKKYRSIMPKPILVMPALAAPASPAATLQSPTPSGQGQDAAGSHPHNSEALGGERSDSPSTKPSSAFKNGCAGLRKPRHRCQVCSHHFQFKQHLQEHMDTHTNRQPYSCRVCHKTYVRPGSLSTHMKLHHGESRPRRLVCCEFCAKVFGHVRVYFGHLKEVHRVAISTEPSPSEPQPGDMPKTRDPRVRGTEGPAQRENKSSLEEDPFLNQVDEVKLQIRCGRCQITTQSFAEIKFHLLYVHGEEIQGRLQEEILPGSKGAQEELVKHVTPYQKQYPERRKLVKHCSSEEDLTAFPKLKRQLRLHQQTNMQIQMKNGEAQPGASEPGEGPQGPTHPTPDTIVFCSHLGFNCLLCAQTLGRREELLLHWGQQHNCEDPSKLWTILNAFSLRGATESSSEIEK	211548	215707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_212419_214041
814069	contig_6847_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_143886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	881	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTGTGGTATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115016	115957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_115000_116000
814070	contig_13878_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_165739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAATGAGAAAAATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293787	294825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_293800_294800
814071	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
814072	contig_252_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_99927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1347	1757	354070	353660	NA	25	AAGTTGGATTGAATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDPKDVLILIPRTCEYVTLHDKRAFADIIKLRNLRWEDYLGLSEWAQCNHKGSYQKSVRVRRRCDDRSRGQRKRERFEDTMVPTLKVEEGPGVKECRQPLDMGKGKEPDSRVEPPEECRPVNVLILGLLTSRTVR	355416	353580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_353600_355400
814074	contig_12277_pilon	-	1171	7	Intergenic	novelGene_139669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.8498269031663	211	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	422	934	84655	70379	FALSE	10	CCATGGCTCTGGCTGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRYFCDYCDRSFQDSLHNRKKHLNGLQHLKAKKVWYDMFRDAATILVDEQNKRPCWKFLLIGQCDFGSKCRFSHMSGRDLQELSLQVEEERRAKEWPVDAVELPEVRLEDWLEKRAKRLSSAPSSRAEPARTAIFQYPMGWPPIQELPPSLRAPPPGGWPLQPSIQWG	99268	70141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_70509_76302_76415_78338_78420_79707_79771_84528_84684_96888_96999_98985
814075	contig_2733_pilon	+	827	2	Intergenic	novelGene_128538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAAGCAAAGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478541	485597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_479315_485543
814076	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
814077	contig_12123_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_144602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTTTGGTTAGGAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123648	124620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_123600_124600
814078	contig_12312_pilon	-	1827	4	Intergenic	novelGene_63989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	35.3647658929996	300	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	218	874	438789	436461	FALSE	10	GACTTTGGCTCTCCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGCLTCPTSHSNYQKKEDYIIYLGRSRLNSNTPGEMKFEVKELILHEDYSSETLAHHNDIALLKIRSNTGQCAQPSRTIQTICLPPQNDDARFGASCEITGFGKENPTDYIYPEQLKMTVVKLVSHKVCQQPSYYGSEVTHKMLCAADPQWETDSCQGDSGGPLVCSNEGRLTLTGIVSWGRGCALKDKPGVYTRVSRFLPWIHTHIGEEENGLSL	439006	435507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_436641_437328_437478_437806_437948_438602
814079	contig_18967_pilon	-	2122	7	Intergenic	novelGene_165340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.46100976186646	25	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	532	801	453935	446493	TRUE	10	GCTGGTTGTGTGGGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHSHAETLEVDIQLSPTPVPVARCVSTGGRPPAHISWSSPLDWKANTSQVPGPLPGTVTVSSVLTLVPSSEADGKNVTCKVEHESFEEPDLQVVTLTVHYPPEVSISGYDDNWYLGLNNATLSCDARSNPEPIDYIWNTTVGSLPPSAVAQGHQLLIRTVDESINTTFVCKVSSAIGMGQAELAVLVRDRPPEEQSHPGIKSLIIILVVVSVILLLVGLYFLVFRRKRQDSYSPSANNTSAHGDVSYSSVALQDSAPQDPLTEGTR	459306	443961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_444130_445339_446565_447595_447643_452922_453040_453901_454051_456454_456573_459008
814080	contig_3956_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_14707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41766	40144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_40100_41800
814081	contig_15010_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_175326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTGGAAATAGCAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7943	9165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15010_pilon_+_7900_9200
814084	contig_1719_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_87335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACAGCACTCATAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516147	515099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_515100_516100
814088	contig_6101_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_114279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	76	396	198274	198594	NA	70	CTTTTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNRQGRCSLAKMSATAKNHRPPLKVSSLSSLFFLLKTMTVSSIFELRWQVSTRTTWMLSLIRFNSTISPEKQHSPLHRFIPAEIFKQEEETVGLESHRKPYYSQ	198198	199595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_198200_199600
814089	contig_2367_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_65333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGAAATAATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258107	256466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_256500_258100
814092	contig_6677_pilon	+	1563	11	Intergenic	novelGene_114186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_5	38.6477683702436	8	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	97	1065	527055	550370	FALSE	45	AAACAGAAATTTATTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQREILQKFLHEAQDKKIKKEEFANEFLKLKRQSTKYKTDKIYPTAVAEMPKNIKKNRYKDILPYDHSLVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLPTTLLDFWRMIWEYNVLIIVMACMEFEMGKKKCERYWAEPGQKQLQVGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKAKFNSETRTIHQFHYKNWPDHDVPSSTDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAVDYTWMLLKDGIIPQNFNIFSLIQEMRTQRPSFVQTQEQYELVYSAVLELFKRQMDIFRDKHSGTEVKFKLDILSIIFFHICC	526958	550868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_527142_540550_540660_540919_540997_541119_541216_543701_543741_545172_545245_545351_545412_546027_546171_546674_546742_547569_547648_550229
814093	contig_7467_pilon	+	1128	2	Intergenic	novelGene_69466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCTTGACAACTCTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67515	69307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_67699_68362
814094	contig_3817_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_78368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	775	1077	637808	637506	NA	60	ATAAAAAAAAAACCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVISSFLLLRASRSLAHRSFRTLRQAVFKTAFGFKKDQLGTLMTWTESLLPGNSTALVCCPSGLRAVSRKRAAPQVGPRHWTHRLETLLLQSSILRFWLQ	638582	636518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_636500_638600
814096	contig_12353_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_165771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATGAAATGTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103038	101043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_101000_103000
814097	contig_20819_pilon	+	1840	6	Intergenic	novelGene_55703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_3	10.0598210719674	144	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	2	709	128006	129928	FALSE	15	GGACCGCGGTGACTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDRILEAELAVEQKSDQGVEGPGGTGGSGSSPNDPVTNICQAADKQLFTLVEWAKRIPHFSSLPLDDQVILLRAGWNELLIASFSHRSIDVRDGILLATGLHVHRNSAHSAGVGAIFDRVLTELVSKMRDMRMDKTELGCLRAIILFNPDAKGLSNPSEVEVLREKVYASLETYCKQKYPEQQGRFAKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTFLMEMLEAPHQLA	128004	131059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_128105_128505_128636_128841_128975_129094_129187_129546_129653_129780
814098	contig_10324_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_7793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGGAAGTTATTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129865	128722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_128700_129900
814099	contig_15543_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_164354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCCTAGTAAGAACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78732	78300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_78300_78700
814100	contig_11217_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_176114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGCTTGGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124787	124140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11217_pilon_-_124100_124800
814104	contig_7057_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_123365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACACATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009141	1007408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1007400_1009100
814105	contig_10399_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_114495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTCCCATGCAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369347	367838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_367800_369300
814106	contig_546_pilon	-	1349	7	Intergenic	novelGene_117175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACTACACTTCCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146830	61159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_61244_119793_119882_123932_124065_136648_136837_139865_140257_140367_140637_146633
814107	contig_15991_pilon	-	1000	7	Intergenic	novelGene_70913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	72	935	105108	100445	FALSE	20	TAAAGGTTGTGTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106353	100379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103607_103703_104975_105142_106315
814109	contig_3463_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_62005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGATGTGTGAGTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510396	509388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_509400_510400
814110	contig_9653_pilon	-	2181	3	Intergenic	novelGene_48255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	111	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTCTGATTATTGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916200	877678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_879638_913559_913689_916107
814111	contig_14501_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_172029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTAATGTCGGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163435	167720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_163514_166894
814112	contig_935_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_45562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTCCATAGAGATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377439	369821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_370822_377395
814114	SIRV1	+	171	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTCCCACAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6457	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6465_6554
814115	SIRV6	+	484	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	20	514	13	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
814116	contig_8866_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_77865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCAAACCCGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792479	791742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_791700_792500
814118	contig_6552_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_163612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTCTAAGTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198284	197391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_197400_198300
814120	contig_1309_pilon	+	864	3	Intergenic	novelGene_73960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_2	165.5	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	310	660	109580	124537	TRUE	25	ATGAGGAAGCAGGTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHIALCLLVIHMGKCLPHRMFLLSGHLKIVHFLVIIHLSVIHRRFHLHRHNSTSSSRAFQDTILCRGQLQAFSQPKTVSSETILDPWIQTATTQHILILYPVLLCKMFSLPSPAQ	109270	133758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_109874_124480_124649_133665
814122	contig_614_pilon	+	1589	1	Intergenic	novelGene_132653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGAGCTGTGCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040679	1042268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_1040700_1042300
814124	scaffold_13609_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_124427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGTGGGCAGCGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780812	781410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_780800_781400
814126	contig_8773_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_74512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGGAAGGGAAGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27753	26325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_26300_27800
814128	contig_9653_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_48171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAATAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132624	130895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_130900_132600
814130	contig_6159_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_128271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1275	1577	319129	318827	NA	30	CCAGGGAGTAACTCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLAGPTLHWAWPHGVTGHAPTLPCPPSVAILLYLSRKYETPDHLYPQDIQTCIHVDEYLAWQHMALRSSCTCTLWQKVRRGGWGRHHPGCFLYKKFCQT	320403	318323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_318300_320400
814131	contig_11590_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_125610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTTTGTCAGGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890954	889158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_889200_891000
814132	contig_10864_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_107122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161967	1160253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1160300_1162000
814134	contig_11047_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_173949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGTGTCTCTTTTGTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17709	18239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_17700_18200
814135	contig_14225_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_52735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTACATTCCATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142316	140283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_140300_142300
814137	contig_10638_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_164313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAGTGAAAAATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536117	537965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_536100_538000
814139	SIRV6	+	375	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	384	541	211	49	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGCTATTGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	1999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
814140	contig_14357_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_121675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533239	534473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_533200_534500
814141	contig_10235_pilon	-	1144	5	Intergenic	novelGene_46616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.106074633713	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	118	600	610325	609176	TRUE	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPPAGPHPFQPPHPPWNPGFQPSSQIPATPPPSVSPLQGMEAKRAQEGEEDGEQGPSQDEQGWPPLNTTTRPWRSAPPSPPPGNRHTALGPRSASLLSLQTERLLDLVAEVQSRRLEEQRATFCVPQSPKKRAPAPPRPVEDREQLYSTILSHQCQRMEAQRSEPPLPPGGQELLELLLRVQGGGRMEEQRSRPPTHTC	610442	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_608954_609060_609314_609537_609738_609955_610056_610280
814142	contig_5222_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_58971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20558	18917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_18900_20600
814143	contig_20614_pilon	-	607	4	Intergenic	novelGene_107593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.71708159548	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAACCAGTGTGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302083	292140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292448_293300_293369_295570_295693_301973
814144	contig_10990_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_7416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTATTTTTAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568774	566693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_566700_568800
814145	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814149	SIRV4	-	554	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	40	23	40	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	281	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5118	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
814150	contig_8594_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_140072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTATTAAAGACAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565298	566139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_565300_566100
814151	contig_2227_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_142353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAATCGACTCAACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721863	720112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_720100_721900
814152	contig_18916_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_136882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68604	69713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_68600_69700
814153	contig_7376_pilon	+	702	5	Intergenic	novelGene_108083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.6039769962151	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGCTGTGATCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79976	107382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_102779_102959_104743_104851_107036_107237_107327
814154	contig_7376_pilon	+	182	2	Intergenic	novelGene_108095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAAGTAAACTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147779	148495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_147808_148341
814155	contig_10426_pilon	-	1596	7	Intergenic	novelGene_144668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_6	47.8553956089477	243	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	75	695	104586	73619	TRUE	45	ACAACATTTCATAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGKHKCIENVSRQNCPICLEVSLKTNFVGFLKSPHLNLKYLDIHIVFIGAVAFISFVGYSHISCCCSCLAVWTSFT	104660	68370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_69031_72438_72560_73498_73835_76253_76333_96657_96774_97008_97129_104496
814156	contig_10009_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_82745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCCATGTTGGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88067	87342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_87300_88100
814157	contig_15327_pilon	+	1950	9	Intergenic	novelGene_70568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	62.8359719826152	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	268	1215	668099	670731	FALSE	45	TAAATTGCTTAAGAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAPDGLSPLQLSGQLNSLPCSLTFRQEETISIIRLIEQARHATYGIRKCFLFLLQCQLMLVVIQFLSCLVQLPPLLSTTDILWLSCFCYPLLSISLLGKPPHSSIMSMATGKNLQSIPKKTQHYFLLCFLLKFSLTIASCLICFGFTLQSFCDTSRTRNLTNCSSIMLPSNADAAPGWLEDFANGLLLAQKLTAALIVLHTVFISVTHVHRTKPLWRKSPLTNLWWALMVPVVLLGQVVQMAVDLQLWTHRDSRVHFGLEDVPLLTWLLGCLSLMLVVVTNEVVKLHEIRVRVRYQKRQKLQFETKLGMNSPF	667831	671466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_668219_668496_668575_668847_668934_669176_669259_669630_669780_669887_669983_670098_670193_670385_670557_670658
814158	scaffold_19766_pilon	-	1442	6	Intergenic	novelGene_34462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.5791481024591	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	344	1093	909694	906736	FALSE	40	TAAGATGAAAACAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVLGMATVLGPRPPQKQVGPVIVKVEEEEEEKKKCLPGLEIFRQRFRQFGYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPNELQTWVQEHCPESAEEAVTLLEDLERELDEPGQEVPAPPDEQKQLWEKMSSSGTAKESLSGMQPRPARNKYESWEPLHIEEIDEEQDFTQELRKIQDSFRIMAGIKRKSYTIDFKLKVVVRVEKTSSRVAARVFEVAESSIRERKKSWRK	915348	906386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_906900_908826_909014_909295_909794_912710_912821_914968_915068_915313
814160	contig_14666_pilon	-	1383	6	Intergenic	novelGene_39509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1084.54554537834	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	243	755	458202	393072	FALSE	15	GACATCTTGCATTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWYVE	475139	392443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_393084_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_475054
814162	contig_10734_pilon	-	1301	2	Intergenic	novelGene_51139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	433	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	298	360	863125	863063	FALSE	10	CCACTGCCCCCTGCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALCAGRRGGHAWRGGARPAQPCPPQRGPREAAPGPQAHCGSQAGPPAGQKGQRLHSSARELLGTRATAGRLVAALRSRGSPELAQASEGTGSRRWQQPMPKERAGLRSQPRAVSLYLQ	863516	862121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_863281_863374
814164	contig_1262_pilon	+	1754	2	Intergenic	novelGene_133545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133984	136517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_135340_136118
814165	contig_3817_pilon	-	1598	10	Intergenic	novelGene_78310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	38.0012995229387	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1134	463	1596	165128	156355	FALSE	25	GATTCCAGTGGGCAGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPTLPSYWCSRRLLGQQLARQQEQADRLRQQWDQNSRYFQLSDICSSKQAEWSSKTSYQRSMHAYQREKMKEEKRRSLEARRERLRQLMLEEQDLLAKELEDLRLSMNSRERRIRERHGNLKSAREEQRKLIAEQLLYEHWKKNDPKLREIELDLHKKHVINSWEAQREEKKQQEATEEEEKKRYENEYETARREAMERMKAEKERRQLEEKLQAEVLLQQMEELKVKEMEATKLKKEQENLLKQRWELERLEEDRKRMAALRQKAELGRFLRHQYNVQLNRRTQQIQEELEADKRILQALLEKEDENQRIHLARREQALADVAWMKQVIEEQLQLEREREAEQQMLLRDEAKEMWEKREAEWARERSARDRLMNE	166558	156352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_156437_157226_157400_158371_158439_158628_158742_159622_159797_160471_160541_161333_161391_162147_162359_164940_165129_166096
814167	contig_11026_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_167649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGTAAAAAACAGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81661	81319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_81300_81700
814168	contig_11026_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_167648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGCTTTGAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80209	78874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_78900_80200
814170	contig_11564_pilon	-	1628	6	Intergenic	novelGene_158553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	991	junction_2	168.260512301609	7	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	561	1397	56152	41045	FALSE	5	GCCCCTGGTCATCGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	56712	40813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119
814171	contig_3575_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_141106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAACCCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392004	393261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_392000_393300
814172	SIRV6	+	424	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	262	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1847_2027_2470
814173	contig_7933_pilon	+	475	2	Intergenic	novelGene_164677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCCTTTATCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	189459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_186078_189402
814175	contig_7275_pilon	+	1232	6	Intergenic	novelGene_111244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	23.0443051533345	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	249	311	406475	406537	TRUE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTALSGRRDPCLLASLLPCAVTRLALSREWRLCPPGLDIIHRKQGLSSAFIVLCIYPKAVENEQIPGIGFIHGCDCRLYPGGMGATGPLTEDPVHGCDAGEL	401681	410903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_402438_402473_405425_405485_406427_406555_408457_408563_410104
814178	contig_9389_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_84142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGGAGACTCAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772250	1770322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1770300_1772200
814179	contig_6050_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_123127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGAAAGAAGAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387896	386401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_386400_387900
814180	contig_211_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_129873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGTAGAACTACCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249057	249817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_249100_249800
814181	contig_13577_pilon	-	980	5	Intergenic	novelGene_176116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	122.142335003061	1506	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	45	860	31100	22292	FALSE	45	AATAATACAGCAAGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQIFTLINVGTPATMRNSCTFLASILSIVIFLLLIPEDFCAKIIGGNQVHSHSRPYMVFIKGKETCGGALIAKNWVLTAAHCALDKRTKVILGAHTINNTEPENQIMSIKKQIAYPCYDPDTHDGDLKLVQLNKKAKLNKNVAILPLPKKGEDVKPGTVCRVAGWGKFHNNSPQPSDTLREVNITVIDRKICNDEKHYNYNPVIGLNMICAGSLKGGKDTCNGDSGSPLICDGIFRGITSFGLPKKCGDPRGPGVYVLLSQKYLTWITKTTKGKAWITKNINGTA	31144	22171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13577_pilon_-_22484_24990_25264_25460_25603_27253_27393_31030
814182	contig_20742_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_150660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATACTGAGAATCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133017	133525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_133000_133500
814184	contig_2637_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_100024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACCCAGAAGCCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18030	18937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_18000_18900
814185	contig_8241_pilon	+	1128	3	Intergenic	novelGene_157492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTCCCCCATTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452042	514760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_452420_461602_462232_514638
814186	contig_10437_pilon	-	1720	9	Intergenic	novelGene_38450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	23.7483552062032	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	466	1209	1018122	951463	FALSE	40	GTGAAGAGATACAAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQNDHSSALQNVKRLLQNPRVTELDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMVDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGKLKETQYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKSFLEEVLASGLHGRSKEGSQVTARSASRR	1022165	950951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_951551_986392_986525_1006041_1006164_1007555_1007664_1007873_1008033_1017987_1018185_1019043_1019222_1021496_1021608_1022051
814188	contig_11258_pilon	+	264	4	Intergenic	novelGene_67749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4174.91032505157	59	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTGTCTTGTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49379	53625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49390_50092_50154_52748_52872_53555
814189	contig_3866_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_112446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	306185	305757	NA	30	TAGATGGTATTAACTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EACPFWGLRPYHLPPSQHAAVRGPWERRGENGNSDRPGRGLYQVSDAALAAVGLRGPSPRPGPGPHSRLAGQLAATSPPPPTPSANDSLYYFLSGRCECRGSGGRARFDSQRGLGGFRRIAFTPPRTGPQTEQTLYDHRCRG	306187	304057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_304100_306200
814194	contig_15244_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_118064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCAGGGGGCCAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658673	660175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_658700_660200
814195	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
814196	contig_6028_pilon	+	2003	2	Intergenic	novelGene_156606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAACAACAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384393	404203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_384631_402437
814197	contig_5917_pilon	-	1021	7	Intergenic	novelGene_122173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	146.799655615703	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	217	822	759810	741675	FALSE	20	TTCCCAGTGGGACACGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDTVLRGLEKRREQSGVPVGRRPQEDAPTSENAKAPGTKSRRPKSSLSTVLGTESDATVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEELWWCSG	792903	741475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_741698_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_792827
814199	contig_12841_pilon	+	1342	2	Intergenic	novelGene_55858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315144	317740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_315737_316990
814200	contig_8375_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_141311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCATCGCTAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207587	209599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_207600_209600
814201	contig_6159_pilon	-	1397	3	Intergenic	novelGene_128266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	58	80	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	744	1043	312199	311900	FALSE	35	AGTTTCCAATGAAATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVFRATVFHVHQLLKSEGEGLSLEAQCSYPCAGLAGREGWAAGPACIFLQTPLTRCTCLQPGVVWVVLHHTTVPDRGGRQPGLQGPSLGIPEHHLLP	314668	311545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312555_314132_314421_314568
814204	SIRV6	+	406	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	20	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATAGAGGCACCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1851
814206	contig_5039_pilon	+	684	7	Intergenic	novelGene_64930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	414.093689076921	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	42	611	1361490	1368757	FALSE	25	TATTAAGTGTATTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRAVTGFCLQVRCFSTSVTRPFAKLVRPPVQAHGVEGRYATALYSAASKQKKLNPYVKRSIKVKSLKDITAKERFSPLTSNLINLLAENGRLNITPGVISAFSTIMSVHRGEVPCTVTTASPLDSASLSELKTVLNSFLRPGQVLKLEVKTDPSILGGMIVRIGEKYVDMSAKSKIQKLSKVMRETA	1361448	1368830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1361526_1362687_1362739_1363908_1363984_1365576_1365671_1366437_1366551_1368233_1368321_1368643
814207	contig_12981_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_176121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAATTTTTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149414	150360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12981_pilon_+_149400_150400
814210	contig_5643_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_39154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAACACATACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669663	669260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_669300_669700
814211	contig_9177_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_32690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCCGTAAGTTTCAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426395	427122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_426400_427100
814213	contig_5574_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_155855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGGCTCTAGTGGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166900	166161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_166200_166900
814215	contig_8238_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_165240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATTAAAGACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351355	350617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_-_350600_351400
814217	contig_10750_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_172604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43825	43222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_43200_43800
814219	contig_11548_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_66721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACCTCATCAAAGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59649	58902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_58900_59600
814220	contig_10734_pilon	+	1020	3	Intergenic	novelGene_51080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	67.5	184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	34	297	518540	523268	FALSE	25	TTCATTAACAGTTTGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGGVHSPSTSMATSSQYRQLLSDYGPPSLGYTQGTGNSQVPQSKYAELLAIIEELGKEIRPTYAGSKSAMERLKRGIIHARGLVRECLAETERNARS	518506	523991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_518609_520571_520699_523200
814221	contig_13004_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_112752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGGCTGTAAATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999913	1000712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_999900_1000700
814222	contig_11413_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_103206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	9.39081998549647	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	92	739	729381	738394	FALSE	75	GTTAAAAAAAAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPELNNLLNTTPDRAEQGKLTLLCDAKTDGSFLVHHFLSFYLRANCKVCFVALIQSFSHYNIVGQKLGVSLTTARERGQLVLLEGLKSSVDVFFRAQEEPHPLQFLREANAETLQPLYEFVQEALKPVDSEEAVWRYPVLLVDDLSVLLSLGVGAVAVLDFVHYCRATVCWKLKVPSGLLPMLLPGASQSPDWSRPHLLAVIFLIHLFGVFALC	729289	739196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_729435_732105_732185_734375_734447_736698_736818_738069
814223	contig_6027_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_74428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGCCCCCAGAGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217712	217228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_217200_217700
814225	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
814226	contig_546_pilon	+	1180	11	Intergenic	novelGene_117240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	59.1155647862727	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	712	1026	457610	464115	FALSE	55	ACCCAGTGAAACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRYTICNALNLMQICKGKNIIISSAAEGPLEIRGPYDVANLGLLFGLSESDAKAAVSTNCRATLLHGETRKTAFGIVSTVKKPRSSEEDDSSLPACKKAKCEG	432306	464269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_432396_433960_434229_434760_434818_435224_435300_436223_436296_449749_449840_457549_457667_458256_458287_458699_458738_459118_459199_464005
814227	contig_16124_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_175392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459615	458444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_-_458400_459600
814229	contig_14338_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_174833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTAGTGGGGTGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18296	17131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_17100_18300
814230	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	878	36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
814231	contig_5954_pilon	+	343	4	Intergenic	novelGene_28440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	532	junction_1	1917.19013141629	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	168	174	341	98153	98959	FALSE	20	GGGCCCCAATGCCAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKK	97887	98961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97926_98017_98163_98637_98694_98857
814232	contig_5302_pilon	+	2458	1	Intergenic	novelGene_81465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	245	445	254759	254959	NA	55	GAATATTTACTACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLGVSDSVGLGKDLRISISNKLPADGDAAGPESLSQGVGCSAPTYLKNHITHRKQCSVGIHPGPLPLLRGGCFNWNLSWFMALQGTSLEVWLARLSGLMFWLGLKARGLLTLDTASGPAFWAASPSPACAAPAPFLPLEPNEGLLG	254514	256972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_254500_257000
814233	contig_6999_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_176123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	552	2	553	133448	133999	NA	50	AGGCTGAAGAAAAAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAYFKKVSEPASQEIAEEVMASSSSDSGEESDSSSTSSSSTSCSSSSSSLSRSHRKKRVPGPSRRARRARSGNHFVDRLPQAVRNRVQALRNIQDECDKVDALFLRAIHDLERKYAELNKPLYDRRFQIINAEYEPTEEECEWNSEDEVFSSDEEVEDDTPGEMPALEGEEEDEDPKEKPEV	133446	134000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6999_pilon_+_133400_134000
814234	SIRV4	-	608	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	6	3	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3637	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGAACATTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
814237	SIRV4	-	255	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
814238	contig_13760_pilon	-	1314	4	Intergenic	novelGene_61338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	42.9444085093999	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	66	788	329678	324174	FALSE	5	TGCCTCTGTGTGGTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQPLVREPCRSCAVVSSSGQMLGSGLGTKIDGAECVLRMNQAPTMGFEADVGRRSTLRVISHTSVPLLLRNYSHYFQQARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRRQSGSFLSTGWFTMILALELCEEIVVYGMVSDSYCREESHPSVPYHYFEKGRLDECQMYLAHERAPRSAHRFITEKAIFSRWAKKRPIVFAHPSWWAQ	329743	323647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325726_327791_328205_329666
814239	contig_6726_pilon	+	855	2	Intergenic	novelGene_86241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1065	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCGTGATAACATTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307461	309222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_308233_309138
814241	contig_15236_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_141556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAAGGAAGATAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333945	332091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_332100_333900
814242	contig_8138_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_52482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACACTTTGGGAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289679	287464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_287500_289700
814243	SIRV6	+	221	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-386	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1899	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
814245	contig_18869_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_56272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTCCCAGACACCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73352	73602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
814247	contig_1225_pilon	+	1109	2	Intergenic	novelGene_44118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1325	junction_1	0	22	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	26	391	147032	148934	FALSE	0	TGTTTTTGGTCCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRTSAVKMGRIFLDHIGGTRLFSCANCDTILTNRSELISTRFTGATGRAFLFNKVVNLQYSEVQDRVMLTGRHMVRDVSCKNCNSKLGWIYEFATEDSQRYKEGRVILERALVRESEGFEEHVPSDNS	147006	149652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_147173_148709
814250	contig_5041_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_27022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGTGAGTAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255242	256117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_255200_256100
814251	SIRV6	+	181	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	551	51	551	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10788	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814252	contig_4496_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_66651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACCCTAGCAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739576	737920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_737900_739600
814253	contig_4114_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_15613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGTTTGAGTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361751	363911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_361800_363900
814254	contig_16846_pilon	+	1756	4	Intergenic	novelGene_82933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	6.79869268479038	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1295	1624	576790	577119	FALSE	20	TCTGAGATGTCAATTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQALGCTGSLMYAKETDVFIYKEVTEHTLQAMVPQQGREAKVHTQVGVVTEAKSAHSSSLTAHPTNPYRSWRQCELPPLSGYTDWASWREPTLQQALTGEGEENQHA	518567	577251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_518861_520467_520574_574808_575051_576136
814255	SIRV6	+	370	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	9	505	3	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
814257	contig_3604_pilon	+	599	4	Intergenic	novelGene_139994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_3	379.010114201015	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGCCTGTGTCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47637	51565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_47666_47849_47925_48032_48132_51168
814259	contig_3111_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_129963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37114	35171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_35200_37100
814260	contig_9940_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_125340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGTAGACAGACAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83387	81695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_81700_83400
814262	contig_9366_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_166279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	423	1168	1590	1050102	1049680	NA	15	GCACCACCCATGCCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCRTRSSTEWSKKLTETRERAELRSGGPLLANAAQICHLGPQPPRMAYREYRKATSQSSQQETGHLVTRDTHFHTPHPSSLYEASAALQQASNLAGETPAYQHPNSTPPHQLTPTEPYFVVVVSSLSFPSFPFSCLPSP	1051269	1049677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1049700_1051300
814263	scaffold_8345_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_106989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACATCAGGGAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75412	77491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_75400_77500
814264	contig_6630_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_30730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	140	454	765936	765622	NA	40	AAGAACAAGATTTGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTQVRFPANAPHAQPPPVCQGRLACCYDAEQVSVKLPDQNGLGRKDWGLLLKNQSVKTLWITTGQSKTHQGEGSGSGSVLFCCDRGHHESGADSTAGSNNNN	766075	765040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_765000_766100
814265	contig_6630_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_30729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGACAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763166	763493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_763200_763500
814271	contig_7919_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_28039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATAATCAGAAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254755	255950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_254800_256000
814272	contig_6102_pilon	-	2438	16	Intergenic	novelGene_32065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	33.6548494111753	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	106	1371	631852	628051	TRUE	50	AAAATTAAAAGTAGCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQLQCCAQAPELSLDSVVPFDAASEVPVEEQRAEAMVRIQDCLLAGQAPQALSLLRSAREVWPEGDVFGCQDISPEEEIQLLKQILSAPLPRQQEPEEQGAEEEEEEEEEEEELQVVQVSEKEFSFLDYLRRFACSTVVRAYVLLLRSYKQNSAHTNHCVVKMLHRLAHDLKMEALLFQLSLFCLFNRLLSDPAAGAYKELVTFAKYILAKFFALTAVNPKAFVELLFWKNTAVVREMTEGYGSLDGGSSSRKPTMWSPEEEAQLRELYLAHKDVEGQDVVDAILAHLPTAPRTRKQIIHHLVRLGLADSVKDFQRKGTDIVLWTEDQELELQRLFEEFQDSDDVLGHIMKNITAKRSRARIVDKLMALGLVTERRELYKKRRKKLAPSSLPSGEESLKDFCQEDIKEEESLSEENCEDEEEEGLGVDQAQGSSVLPTEDLGQNLLQEELPDSSSR	632057	625314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_625930_626068_626174_626303_626518_627811_627931_628036_628077_628187_628360_628569_628713_628945_629029_629117_629236_629325_629412_630085_630232_630496_630699_630804_630926_631010_631109_631781_631934_632033
814274	contig_19744_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_120366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCCTTACTGCACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112321	114331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_112300_114300
814275	SIRV6	+	349	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	5	-2880	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	90	273	48	320	2569	7879	FALSE	30	AGTCGAAGACGAATGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPGQKEEISIAKITIGTSLKKPNVSF	2521	7908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7804
814277	SIRV6	+	338	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	535	0	369	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
814279	contig_10003_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_88157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACCACTGCGAGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383216	383666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_383200_383700
814283	contig_11855_pilon	-	754	5	Intergenic	novelGene_67133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	36.5444934292432	278	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	241	651	2676275	2674178	FALSE	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTTGALLIPPALFRYNTRGLIRPMSASFLSRSEIPSKQPSYSSSPLQLARREFQTSVVSRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	2676907	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674293_2674641_2674821_2675231_2675310_2676236_2676481_2676872
814285	SIRV6	+	208	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	514	61	514	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814289	contig_9995_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_47790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTACCAAAACAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772397	774074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_772400_774100
814291	contig_15293_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_146534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124217	122705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_122700_124200
814292	contig_1516_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_49943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCTTATATTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228195	226541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_226500_228200
814295	contig_3380_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_60139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCAACCTTTTAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623703	624971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_623700_625000
814296	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	54	488	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814299	contig_16666_pilon	+	1111	4	Intergenic	novelGene_61765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGAAAGGAAGAGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55272	59647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_56038_56582_56664_58098_58271_59554
814300	contig_6842_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_130852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTATCTAACTAGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2138270	2136916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2136900_2138300
814301	contig_11702_pilon	-	969	10	Intergenic	novelGene_141980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.0447374501741	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	195	887	376758	372981	FALSE	20	CCCTGCCCCCAACCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAVEA	380781	372898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_372992_373998_374078_374165_374269_374525_374660_374903_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
814305	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
814306	SIRV6	+	207	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	525	51	525	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10762	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814307	contig_6005_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_158881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118213	117534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_117500_118200
814308	contig_11574_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_64116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACCTTCACTTCTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817917	818745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_817900_818700
814309	contig_1534_pilon	-	1419	1	Intergenic	novelGene_176127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29117	27698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_-_27700_29100
814310	contig_253_pilon	-	2075	2	Intergenic	novelGene_129616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACTCAGGCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118908	116474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_117725_118083
814312	contig_12019_pilon	-	1243	10	Intergenic	novelGene_87728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGGTTACAAATCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619004	606514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_606669_611572_611653_611767_611848_613068_613266_615361_615480_615812_615896_616495_616617_617745_617971_618077_618205_618946
814313	contig_4783_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_108406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTCAAAAACACAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298371	299534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_298400_299500
814314	contig_6048_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_73137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAAGTCACCTGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000372	999687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_999700_1000400
814315	contig_9815_pilon	-	599	3	Intergenic	novelGene_164244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1233	junction_2	1105	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAAACAAATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77342	73937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_73989_75764_75981_77010
814318	contig_13966_pilon	-	1103	6	Intergenic	novelGene_158147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	95.0254702698177	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	547	1041	427369	412840	FALSE	35	TAATGATATGAATTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQFHRWTSLVMDNFLIQVTGKKRVVLFSPRDAQYLYLSGTKSAVLNIDNPDLAKYPLFSNARRYECSLEAGDVLFIPALWFHNVISEEFGVGVNVFWKHLPSECYDKTDTYGNKDPTAASRAAQILDRALKTLAELPEEYRDFYARRMVLHIQDKAYSKNFE	430026	412777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_413097_415225_415343_415726_415815_427336_427473_429308_429644_429918
814319	contig_14441_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_100397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCAGATCGTCAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65382	64531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_64500_65400
814321	contig_20356_pilon	+	1592	3	Intergenic	novelGene_159552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	10.5	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	63	1283	166667	170442	FALSE	15	TTTTTTTAAATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVGCLKAALQVAEVLETIVSNCVGPEGRQVLCTKPTGEVLLSRDGGRLLEALHLEHPIARMVVACVSSHLKNSGDGAKTFIILLSHLLRGLDAATDKEKDSLVSENIQTHGRHWKNCCQWKFISQALLTFQEQVLDYFMDQCLSRHFLSVFSSSTQEKTLCRSSTELLLEAYFCGRVGRNNHKFISLLMCDYLFKCVAYNSRIEEVFELVDDYFAELNVGVIGLPVSDSRIVAGLVLHRDFSVYCPADGDIRVVIVTETIQPLFSSSGTEFVLNSEAQFQASQFWIMERTKTIMKYLQGQNVKLLLSRVKQPDLVIYYAELNGISVVECLSSAEVSLIQRITGLSPFVLPQTCSQHEVSNTALLKFCKPLILKSKSLHWTTNLKVGNLNPPGSATEERPGYLLP	166604	170751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_166852_167216_168165_170354
814322	contig_6674_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_148001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAGGGAATATAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137260	138098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_137300_138100
814323	contig_10009_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_82734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55471	54402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_54400_55500
814325	contig_15360_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_171262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGCGACACTTCCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206219	206618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_+_206200_206600
814326	contig_2924_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_140293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACACACAGGACATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453199	453913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_453200_453900
814327	contig_2924_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_140294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTTCAACTTTTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454416	455363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_454400_455400
814330	contig_6726_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_86237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCATCTTCCTTATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287893	290032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287900_290000
814332	contig_7201_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_152508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225611	227393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_225600_227400
814334	contig_8729_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_40168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATGTAGAACAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802408	803069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_802400_803100
814336	SIRV2	-	276	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4597	34	3422	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
814337	contig_366_pilon	+	2322	18	Intergenic	novelGene_51552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_9	18.1883646597637	25	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	20	2227	566489	620412	FALSE	10	GTAGCTCCCTACTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLEKKMAVASILQSLQPLPAKEVSYLYVNTADLHSGPSFVESLFEEFDCDLSDLRDMPEDDGEPSKAASPEPAKSPALRNAADLPPPLPNKPPPEDYYEEALPLGPGKCPEYISSHNSCSPAHSIVDGYYEDADNSYPATRMNGELKNSYNDSDAMSSSYESYDEEEEEGKGQQPMHQWPSEEASMHLVRDCRICAFLLRKKRFGQWAKQLTVIREDQLLCYKSSKDRQPHLRLALDACSVIYVPKDSRHKRHELRFSQGGAEALVLALQSREQAEEWLKVIREVSKPVGAAEGMEVPRSPILLCKLDLDKRLSQEKQTSDSDSLGMGDNCSTLGRREAYDQGKGKKSSLAELKGSVSRAAGRKITRIISFSKKKTLADDLQTSSTEEEVPCCGYLNVLVNQGWKERWCRLKCNTLYFHKDRTDLRTHVNAVALHGCEVAPGFGPRHPFAFRILRNRQEVAILEASCSEDMGRWLGLLLVEMGSHVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSFLYARSCQNQWPEPRVYDDVPYEKMQDKEPDEHPTGAQVKRHASSCSEKSHRVDPQVKVKRHASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKEKLEKEKETIRTELMALRQEKRELKEAIRSNPGAKLKVLEEAVATLEAQCRAKEERRIDLELRLVAVKERLQQSLAGGPALGLSVTSKNKSGEVANKPQDNAPEQPLPVNCVSELRKRSPSIVTSNQGRVLQKAKEWEMKKT	566469	620507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_566532_567899_567984_568950_569049_570588_570698_574403_574503_575193_575406_577246_577427_579449_579543_580474_580569_580787_580941_582674_582887_585008_585155_585808_585882_588626_588742_610794_610960_613087_613267_616731_616861_620388
814338	contig_15219_pilon	+	667	3	Intergenic	novelGene_40849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	53.5	1717	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	82	432	66409	72008	FALSE	5	GCCTGTACGTTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASSPVAGITAARRAEEPGEGEAAAAEMAGKELERCQQQAVEVTEIMLNNFDKVLERDGKLADLEQRSDQLLDMSSAFSKTTKTLAQKKRCENVRCRIYLGLAVGGSLLIILIVLLAILLPQNSEGSSAPEAQGAGTASGPGD	66327	72243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_66412_71259_71398_71798
814340	contig_13112_pilon	-	1031	2	Intergenic	novelGene_98839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	425	1030	420211	417505	FALSE	25	CCGATGGCAGTGTCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTEIHRVGNTTSVRFRREVETEPILTYIEGVCVLWFTLEFLVRIVCCPDTLDFVKNLLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSSKAARDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGARPSDPRGNDHTDFKNIPIGFWWAVVTMTTLGYGDMYPKTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPKKRKKHVPRPPQLESPIYCKSEETSPRDSTYSDTSPPAREEGMVERKRADSKQNGDANAVLSDEEGAGLTQPLASAPTPEERRALRRSGTRDRNKKAAACFLLSTGDYAC	420635	417503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_417687_419787
814341	contig_13112_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_98838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGACTGCCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410015	409117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_409100_410000
814342	contig_7816_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_66565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACTGTGCTATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448019	448842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_448000_448800
814346	contig_11677_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_85877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	413	787	171221	170847	NA	15	GGGTCAGGAGCCGGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGPQKHQTGSLQGSPSRQLLQRFQQVPSLHIDSLLPCDLVQDTDDIEDGGCGHQHLLQDPEAEVRDKREVVVADVGAARLQSVAGELGLLIPIDSASHQGDQQDAEDQEDGEPQLADHGGMVLT	171633	170845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_170800_171600
814348	contig_3172_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_173680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTAATCATAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35307	33938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_33900_35300
814349	contig_3241_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_146417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGTACAGAGTATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927203	926148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_926100_927200
814350	contig_10500_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_41213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCAACAGGTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562291	1562763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1562300_1562800
814352	contig_14814_pilon	-	2289	4	Intergenic	novelGene_137753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	56.7881051707916	51	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	33	305	408418	406788	TRUE	60	TTGAAGGAAAAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLFIQTFWQTMNREWKGIDRLRLDKYHTLIRLVLRQSFEVLKRNSWEERQIKPFLDVLMKEILHPESQCPKGVKFHFIDIYLEELSKVGGKEVRERETSC	408450	403610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_404447_405639_406945_407717_407780_408364
814354	contig_6361_pilon	-	1830	5	Intergenic	novelGene_23899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.6817240078565	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAATATTGAATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128695	121278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122880_123928_123994_126515_126587_128203_128256_128654
814355	SIRV4	-	296	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1227	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
814357	contig_3825_pilon	-	764	3	Intergenic	novelGene_77973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	32	421	29302	27914	TRUE	10	TGCCTTATACTGTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	29333	26806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_27024_27787_28181_29179
814358	contig_8156_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_98925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCATCCTTTTGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284323	285394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_284300_285400
814361	contig_6842_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_130847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATAACAACACTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2113278	2112480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2112500_2113300
814363	contig_6137_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_59152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTTACTTCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125749	1124040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1124000_1125700
814366	contig_6589_pilon	+	911	6	Intergenic	novelGene_26090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.4422774416538	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	261	881	1867977	1875151	FALSE	10	CCAGCTCTGGCCAGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRRTLRPREGSPLPEDTQPGCGESQRQAGPLLGALPLSISPQDGGNTRTQAQPQDRREALCTKPSSL	1866786	1875181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866869_1867326_1867457_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1874950
814367	contig_14101_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_122754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAAAGTAGAATTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80764	79259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_79300_80800
814368	contig_748_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_176130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAACTTTATGTTTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2296	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_748_pilon_-_1100_2300
814369	contig_9995_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_47661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAAAGCCTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129697	128937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_128900_129700
814371	contig_4114_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_15622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTCACTCTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400608	399599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_399600_400600
814372	contig_13593_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_156138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTATGAATCAGTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458607	457187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_457200_458600
814373	contig_17068_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_172563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	113	475	9770	10132	NA	15	CAGATGGCATGGTTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9657	10193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10200
814377	SIRV4	-	467	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1056	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4102	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4100
814378	contig_7234_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_145945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTAATATCCTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448779	446473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_446500_448800
814379	contig_8375_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_141314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCCAGGCCAGGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215065	213599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_213600_215100
814381	SIRV6	+	250	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	222	2908	222	-2881	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCGAAGACGAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	7907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805
814382	contig_9363_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_6836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGCGAGTCTTCTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624148	1625971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1624445_1624578_1624674_1625564
814384	contig_2332_pilon	+	1209	6	Intergenic	novelGene_58712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	41.7449398131079	13	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	60	452	808593	842357	TRUE	25	TAGCAAAATGTTTCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTALLKLFVAIVITIILILPEYFKTPKGNVLELSCLEVCLQHNFTYSLSVLNFSFMTLLQPVREGQIIRGIFLNQSSFQNFTKLCQDIMSEFKMCSSCLVCESKGNMDFISQEQTSKGVICSMKITWS	808533	861246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_808681_829351_829622_839941_839970_842350_842435_857439_857546_860672
814386	contig_5361_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_167212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTATTTGTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474488	475105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_474500_475100
814387	contig_1706_pilon	+	943	4	Intergenic	novelGene_155033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	126.059069046574	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	14	658	14289	28937	FALSE	45	ATTAAAATAAGTCTTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAVMAAALWGFLSVLLLLLSGDVQSSEAPGAAAEGSGGSGVGVGDRFKIEGRAVVPGVKPQDWISAARVLVDGEEHVGFLKTDGSFVVHDIPSGSYVVEVISPAYRFDPVRVDITSKGKMRARYVNYIKTSEVVRLPYPLQMKSSGPPSYFIKRETWGWTDFLMNPMEMEQSMNMLNSNHELPDVSEFMTRLFSSKSSGKSSSGSSKTGKSGAGKRR	14275	29222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_14522_17170_17291_23535_23675_28784
814388	SIRV6	+	387	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	17	-15	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAGTAGCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154	1935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1847
814390	contig_14516_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_153958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1611	1922	425229	425540	NA	20	TGTCATTTGATTATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTIVWLFPQSVKDFVLVVHSALILYSRPRRVSLETILYRKQVYSDQFRISVQKKVRCLLFRELETLPALMYILRKALLIHVIMKVLYRAELKFFKSVNKAKN	423618	425542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_423600_425500
814392	contig_11115_pilon	+	720	4	Intergenic	novelGene_102857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	786.020073252303	15	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	24	719	171830	173330	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGGGGAVLSCGPLGSQAKDHGGAGCIPGVHINKAFKLR	171806	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171981_172339_172595_172714_172893_173218
814394	contig_13300_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_125750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1516	1836	15256	14936	NA	45	CAACACCCAGGAAAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASMPLVFQIPTGHPWWTGFRGASRLRCTKKKDLAIYFLKKMAAENLMNSRGTLSDIVPEDEPLRLERTENTTGEELSPQSRVDLNDVDGVELLRPYLLIQHNSK	16771	14582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_14600_16800
814395	contig_3382_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_124126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	67	600	766711	766178	NA	45	ATTTATCCTGTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGQGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGRGTLCEWMGGIGLSGQGTLCEWMALELGETGSGPVDWGRTFGLVEGAAL	766777	764687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_764700_766800
814396	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4572	34	3397	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
814398	contig_14219_pilon	-	2147	4	Intergenic	novelGene_54312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	253.406568361771	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	196	564	676735	673835	FALSE	50	TACAAATTTGAAAAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQGKRTDLIFWHVELVSGFPCVPSPFRVLLIHFLCLNY	883624	672251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_674118_676649_676755_767883_767941_883505
814399	contig_7165_pilon	-	778	7	Intergenic	novelGene_116821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_4	11.13552872566	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	171	776	178938	177060	FALSE	20	TGAGCCCAAGGCCTCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISSQPETSPLGSPGIFAPLDSDPDQRALLSARQREYKVAALSAKRAGDLDHARELMRIGKRFGAVLEALERGQPVDLSAMPPAPEDLKPQASKAPTAPVVVPPGVERVQPVMAPEAPATPAAPAEPQTVLDALQQRLNKYREAGIQARGNGDERKARMHERIAKQYQDAIRAHRAGRKVDFAELPVPPGFPPIPGLGPTKGTAEDVVAATLAAAQKLATSEDTAPAEEDEEDEDEPPAQAPVAKKPAQPLVPSSRPP	179108	177057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_177132_177542_177677_177880_177954_178220_178352_178432_178538_178644_178721_178923
814401	SIRV6	+	352	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	24	508	11	-17	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
814404	contig_5467_pilon	-	1589	12	Intergenic	novelGene_111967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.942839828806	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1527	63	1589	140185	125709	FALSE	10	TGCCGCAGTGCTCCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVALSRTQVCGIYREELHQGGAFHQSDTHIFIIMGASGDLAKKKIYPTIWWLFRDGLLPENTFIVGYARSRLTVADIRKQSEPFFKATPEEELKLEEFFSCNSYVAGQYDDPASYKRLNSHVNALHQGSPANRLFYLALPPTVYEAVTKNIRETCMSQTGWNRIIVEKPFGKDLQSSDRLSNHIASLFREDQIYRIDHYLGKEMVQNLMVLRFANRIFGPIWNRDNIACVILTFKEPFGTEGRGGYFDEFGIIRDVMQNHLLQMLCLVAMEKPASTDSDDVRDEKVKVLKCISEVEANNVVLGQYVGNPDGEGEATKGYLDDPTVPQGSTTATFAAVVLYVENERWDGVPFILRCGKALNERKAEVRLQFRDVAGDIFHQQCKRNELVIRVQPNEAVYTKMMTKKPGMFFNPEESELDLTYGKRYKNVKLPDAYERLSTTGHSRSPVGRDLCAAQHCRVSDPLGAPSPQQLFLGRPLCTPWHHRESRGRQLGSSPRPLPLKLSLPP	140784	125708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_125920_126746_126776_126883_127120_127540_127728_128061_128156_128423_128550_128773_128933_129359_129578_129945_130055_130148_130187_140065_140194_140730
814405	contig_5894_pilon	+	1904	4	Intergenic	novelGene_83069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3708994574027	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGAACAAACGTGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867761	874175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_867836_870349_870523_871623_871703_872597
814406	contig_9199_pilon	+	1503	12	Intergenic	novelGene_65654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1035	1355	180755	184759	TRUE	60	CAAGAAGAGAAAACAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRVCSADFLNNSAQAKPHFKADPKARLHNLTHRFIGQVGTHWGQQQSPQNLKDFHQDNLIAGRICTHKTGVGDSICHVLHALCCALMNGILAHGLAIREKNPGS	172497	186138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_172600_173227_173323_173657_173872_174308_174489_175005_175228_175573_175720_179454_179503_180727_180809_181313_181414_181936_182058_184713_184773_186003
814407	contig_1244_pilon	-	1072	9	Intergenic	novelGene_38009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	634.583869555475	3	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	89	709	947623	927219	TRUE	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNLILNMNDHGFVVSHGTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEVSI	948499	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923003_927069_927227_928754_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946603_947567_947653_948440
814408	contig_20332_pilon	+	895	4	Intergenic	novelGene_156185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	381.513652005622	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	254	571	642243	644522	FALSE	65	CAGCTTAACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLEQLKVHGF	641989	644846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932_644029_644495
814410	contig_6710_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_95711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAGGAAGGAAGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653360	653880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653900
814411	contig_2940_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_81915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTAAATAAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533898	532009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_532000_533900
814412	contig_8900_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_171618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	827	1225	204515	204117	NA	75	AGACGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLAASLLFKIGYLQFTSLQNACPAMQSALSRWWRGLFPLPGQQRVQSSVIGRIIFVVLWPCPATVLFGLCGHSNVFFKQGVSLLALLLVGGKTQFPTSTSCEMTGHWFCILILSYNLGQIISFRFLFLHV	205341	203579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_203600_205300
814415	contig_15277_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_175428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACCCTAGCTAATATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253735	256286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_253700_256300
814419	contig_1639_pilon	+	922	9	Intergenic	novelGene_74921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	115.174799218405	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	8	637	341627	396943	TRUE	20	CATTGCCTGCCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRMAPLVLQLVVLGVALAAAALIVISFVAFVTAVKMPHLYQHEDEKFFLNARGQKETLPSIWDSPTKQLSVVVPSYNEEKRLPMMMDEALDYLEKRQKQDPMFTYEVIVVDDGSKDQTSKVAFKYCQKYGSDKVRVITLVKNRGKGGAIRMGVFSSRGKNILMADADGATKFPDIEKLEKGLNDLQPWPDHMAIACGSRAHLEKESIAQGI	341619	399760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_341693_343053_343226_343614_343662_344780_344850_354138_354232_357538_357653_374183_374244_396934_397021_399552
814420	contig_11370_pilon	+	826	3	Intergenic	novelGene_98714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	3	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	166	588	145831	148303	FALSE	25	TAACAAAGTGCTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGASAAAQLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145665	148541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
814422	contig_1274_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_137799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	635	1908	105	2012	423124	421217	NA	35	GTGCCAAGTACAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGEIKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVQSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNAVESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVISWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLYQGGPGGGGSGASGGPTIEEVD	423228	421136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_421100_423200
814423	contig_5586_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_143622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848168	846283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_846300_848200
814426	contig_8167_pilon	+	1124	3	Intergenic	novelGene_155650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	169	747	121062	132413	FALSE	5	TTGCAGGTGTTTTCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQDGRLGKEAPGPGQQWRQHSREGINSVCNEEHQTLSCNLNSCPKSCTLAASTSNRMPLVLSASVRHICPPRKAQCRASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	117383	132790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_117453_120962_121124_131896
814427	contig_10019_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_86696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCAGTTTTGGATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376765	377614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_376800_377600
814428	contig_1301_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_47370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGCAAAGATGTGGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599133	600913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_599100_600900
814429	contig_2890_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_60302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCACCTGCCTGGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428274	426531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_426500_428300
814430	contig_11269_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_145818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAACACTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324191	323534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_323500_324200
814432	contig_854_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_36632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	61	297	1695712	1695476	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLFQHHKLRFCLSPRSSELMLEHASGCSYRPTAGEPDPKGVAQDLRTASCPGSKDTLGTTRLGCCPHTRHTARNTSNGRVWGGKALRSTTAPLQPSL	1695772	1694165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1694200_1695800
814433	contig_9333_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_120335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCAAAGACATGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398988	397567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_397600_399000
814435	contig_5954_pilon	+	1035	5	Intergenic	novelGene_28572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	36.0996883643059	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	180	335	889218	894036	TRUE	5	GCCGAGTGTCCTCTGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHGGLELGLGPRVCSRSQSLSRVTGKTPVLQIGAWAPAPKGAGPQAPETATTRPQAPWGMPVTSRDSRPAAATMEKHTEQEGRKNTQWEKQPGIRLWARLPGFNHSFPVY	888765	900183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_888798_889070_889266_893928_894055_897858_898050_899692
814438	contig_7171_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_101245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTTAGTCTCTCATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743442	744742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_743400_744700
814440	SIRV6	+	405	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	170	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847
814441	SIRV6	+	486	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	350	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
814442	contig_11929_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_171233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTTAACATTAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50420	51002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_50400_51000
814443	contig_12464_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_68743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433793	432524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_432500_433800
814444	contig_8365_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_150915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108764	106638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_106600_108800
814445	contig_6595_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_122551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGACTGGAAAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665842	664574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_664600_665800
814446	contig_3986_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_52726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	931	1233	130343	130041	NA	75	TACAAAAAAAAAAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFAKVLQCALGPTEKGTINLSSGQRSLHRRAEGGEGFTEACLPVCLSAGCCGKEMQLCAECSPSGCSYYSYPSSYKCWSLQIRERQLGAQSRGSELGL	131273	129250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_129200_131300
814450	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
814451	contig_5350_pilon	+	1132	8	Intergenic	novelGene_99336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_7	38.1115441292841	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	143	697	142324	225365	FALSE	30	ACTTAGCCAAACTGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGMNKILPGLYIGNFKDARDAEQLSKNKVTHILSVHDSARPMLEGVKYLCIPAADSPSQNLTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILATPGVLKYLDFLRRV	142181	225800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
814453	SIRV6	-	326	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAATTTGGCAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
814455	contig_16360_pilon	+	1878	3	Intergenic	novelGene_170076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	279	junction_2	14	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAAAATGTATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127912	131480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_128235_129369_129523_130077
814456	contig_8122_pilon	-	1161	4	Intergenic	novelGene_40258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744730	736736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_737014_737504_737594_742060_742161_744035
814458	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
814460	contig_5959_pilon	-	1930	2	Intergenic	novelGene_150203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGCCTCAATGCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403413	390694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_391500_402288
814462	contig_18109_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_176133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59797	61228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18109_pilon_+_59800_61200
814463	contig_17075_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_131764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	26	481	176315	176770	NA	35	ATGAAATGTTTATATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSPEPHTMICVPAKEDLLRLCQGQLYCGPQESKHSDPFKSKLLKQKEKKKMEKRQRRGSAAPEGLAGEDSTAGHEALTLGLWSGPLPAVTSHCSRVLLGFVTQGDFSMAVGCGEALGFVSLTGLLDMLSRQPADERGLVLLRPPASLQYRFARIAIEV	176289	176919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_176300_176900
814464	contig_10135_pilon	+	1215	5	Intergenic	novelGene_106670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	328	junction_1	98.3625309759768	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	22	435	222438	265281	FALSE	20	GGGCTCCCTTGATTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSPESKMAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMEQFWSKNTGSNRPLSPHITIYSWSLPMVMSVCHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGNFESHLELVKSLCLGPAVIYTAKFALVSPLMYHTWNGIRHLVS	222416	266061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222458_227989_228047_233654_233757_246597_246660_265108
814465	contig_6276_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_174117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTCTGAACTGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91257	89948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_89900_91300
814467	contig_14755_pilon	-	2014	8	Intergenic	novelGene_129377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	57.7294888038256	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	565	1110	225859	128904	FALSE	35	TAGGTTTATGATTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNRLAFLPLDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	364345	127999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_225825_226033_321120_321259_321858_321897_364130
814470	contig_5918_pilon	+	1725	4	Intergenic	novelGene_99485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	346.698716467194	1	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATGGAATAAGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183009	190442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_183064_184118_184264_188238_188308_188985
814473	contig_10451_pilon	-	1177	6	Intergenic	novelGene_138290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	9.47839648885823	116	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	131	1117	56034	40970	FALSE	10	CTATTTTATTCTGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFHLKEAVGSLFCFIFLSGSQFYNKKTPKFTARSLLTAISAKVMGDQELPGVLVSGFEGPHSICEDHIRKLQKHFNLITMQEFLENKTQFSQNIQAVYVWGGWPVIDKELLQSLPCLKIIASVGVGLDHLDLKLIAGFGVKVANTPQAVSKPTADMGMALLLASARKLVKGHQLAISPDTKNFNINWVGQDVTGATLGIIGMGAIGYKIAQRAKAFEMKILYHNRTRRKLAEEEAVGATYCERLDDLLQQSDFVMLAASLTPQTQNMIGKRELRLMKPKGILINVGRGLLVDHDALVEALQTGIINAAALDVTYPEPLPRDHPLLKLKNVTLTPHIGSATHQAKRQMVENLVESILACLNGLPIPNEVLLK	58142	40909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_41127_49887_49985_50858_51038_54595_54768_55652_56038_58015
814474	contig_10733_pilon	-	1892	6	Intergenic	novelGene_109960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	300.717408874179	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	53	1162	293467	279901	FALSE	5	GCAGCCCCCTTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAGCPGPLGRPVAACGMSRLLGGTLERVCKAVLLLCLLHFLVAVILYFDVYAQHLAFFSRFSTRGPVHALHPAASSSTNCSRPNATAPSSGLPEAPSARPGPTAPILPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQRENPSVLLGGRYAPPDCTPAQTVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGIYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEALKEDASYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKAQFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQRFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG	293519	279170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_280052_282963_283069_283182_283306_283545_283737_292710_292947_293163
814476	contig_3948_pilon	-	565	3	Intergenic	novelGene_53427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACAGCCCGGACTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2073941	2069371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_2069791_2072059_2072132_2073867
814477	contig_2867_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_135152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCCAGGAAATGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463126	463758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_463100_463800
814478	contig_17769_pilon	+	2760	10	Intergenic	novelGene_124274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.91893157523298	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	43	1404	135291	150949	FALSE	30	ATTATACTCCTTTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKGTPIVDGLAPEDMNKEQVEEHIKHVREELDREREERNYFQLERDKIHTFWEITRRQLEEKKAELRNKDREMEEAEERHQVEIKVYKQKVKHLLYEHQNNLTEMKAEGTVVMKLAQKEHCMQEGALRKDMRALKVELKEQELANEVVVKSLRLKHAEEITKMRSDFERQVREIEAKYDKKMKTLRDEMDLRRKTEIHEVEERKSRQIHMLMERHEEAFTDIKNYYNDITLNNLALINSLKEQMEDMRKKEDHLEKEMMEVTMQNKRLADPLQRARDEMSEMQRKLTHYERDKQILMCTKARLKFTEKELKDLQWEHEVLEQRFIKVQQERDQLYQKFTAAIQEVQQKTGFKNLVLERKLKALSTAVEQKEAQLNEVLATSNLDPSALTIVSRKLEDILESKNSTIKDLQYELARVCKAHNDLLRTYEAKLLAFGIPLDNVGFRPLETAIIGQTLGQGPAGLVATPT	135248	152305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_135306_141809_142008_142531_142739_143874_143930_145249_145456_145934_146103_146318_146406_148102_148313_149626_149693_150799
814479	contig_9415_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_109926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCCAAGATAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2221818	2223464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2221800_2223500
814480	contig_13021_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_8098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAGTGCTGCTATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65968	64835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_64800_66000
814481	contig_13542_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_131541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	824	1216	546668	547060	NA	30	AGATACTGGGTTATACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREDQRRIDAFELWSWQRILNIPWTAKRMNKSVLEEVQPECFLEARMARLCLTYFGHVIRRDQSLVKDIMLSKVESQQKRGRLSTRWIDTVAAPIGSSITRIVRMVQDWAVFRSVVHGVTMSQYQLDGT	545844	547714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_545800_547700
814484	contig_11566_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_166692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTCTTGCACGGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162934	163236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_162900_163200
814488	SIRV6	+	100	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	558	222	558	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10795	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
814489	contig_2703_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_101754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCTTATGGACTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565126	564626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_564600_565100
814492	contig_14322_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_115652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCCTGGCTCCGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473178	474061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_473200_474100
814493	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	55	486	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814494	SIRV6	+	759	2	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10863_11195
814495	contig_8552_pilon	+	2154	3	Intergenic	novelGene_80054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	9	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	85	459	74862	77259	FALSE	5	GGTCTGGGACCTCTGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKHWTRPSKWRSSWRPCGAARTSPRPSAMPGLRMASTSKTRPTNKRKSTDCEEPGGAAQCTPETAGLPWWRPLQAGARIVTLETRTVFVTIAYSLRTVPTPEPRAGPGGFLKHGFPQGAAQPQLELGTSAWTPRSFQSLFGRQRPSSQALSP	73730	78954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_73805_74851_74915_76937
814497	contig_10962_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_103878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTCTCTTTAAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161122	163473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_161100_163500
814498	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
814499	contig_3018_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_78800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAATGTATGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483851	482718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_482700_483900
814500	contig_12142_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_147792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26247	23673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_23700_26200
814501	contig_12948_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_126223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTACTACTCCACCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366033	366569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_366000_366600
814505	contig_11429_pilon	+	1288	3	Intergenic	novelGene_60478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	64.5	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	594	1214	63960	67460	FALSE	5	CTGTGGTTGTGCTGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAGCSGLATTVAVFSPSCSTWPQVGRQQACIWLLTPLPSQCIVIALTFVPSPFTAAGKLTKAKRLVVHEGSPVTSISARSWVSREARDPSLLINACLNKLLLYRVVDNEGTLQLKRSFPIEQSAHPVRSIFCPLMSFRQGACVVTGSEDMCVHFFDVERAAKAAVNKLQGHSAPVLDVSFNCDESLLASSDASGMVIVWRREQK	63366	67534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_64277_66731_66851_67275
814507	contig_5084_pilon	-	2042	2	Intergenic	novelGene_64623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1051	1845	1179371	1177907	FALSE	25	TAACACCTCAAGTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKTAAVSERIHEQVRDRQLEKEYVCRVEGEFPTEEVTCKEPILVVSYKVGVCRVDPRGKPCETVFQRLSYNGHSSVVRCRPLTGRTHQIRVHLQFLGHAILNDPIYNSVAWGPSRGRGGHIPKTDEELLRDLVAEHQAKQSLDVLDLCEGDVPSGLTGPTDPSSELGKGGQEELATAAWKMYRAREAAPQDLHTLALAPGDGAEADVVNQETDPLCAECRLVRQDPLPQDLVMFLHALRYKGPDFEYFSPMPAWAQDDWQED	1180421	1177709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1178642_1179311
814508	SIRV4	-	502	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	12	103	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTACTTAAGAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
814509	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
814510	SIRV1	-	551	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	43	241	43	-241	5prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	98	297	2	298	11599	11142	FALSE	25	TTTATGCTGCACGATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLSAAVPALLHPFPLIADGKVKVYSAVAVDLRFSIKNLLAKTVGASAPLFPAILLPVAFKLAICGFVERPGSIVICIVVTSITDYKISILHSPVRSI	11600	10888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_11243_11403
814511	contig_15471_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_175223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATGAAAAAAATTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333774	332121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_332100_333800
814513	contig_12080_pilon	+	1147	3	Intergenic	novelGene_128413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	80.5	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCTTTAATGGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531684	539661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_531784_537435_537612_538789
814516	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
814517	contig_1996_pilon	-	1551	2	Intergenic	novelGene_131864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGCCACTGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81612	79947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_81284_81397
814518	contig_8597_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_158711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATTTACTGATGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88779	90651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_88800_90700
814520	contig_11171_pilon	+	1505	4	Intergenic	novelGene_48569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	68.1974258230389	3	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	25	660	70574	107015	FALSE	15	CTACCTTTGAGCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQISISDQRGIFLLWQSVVKGAEQLFQASQWVVLHHGPWQLRLP	70549	107860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88420_106888
814521	contig_11304_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_156709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACCACTGTGCCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394367	396752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_394400_396800
814522	contig_10792_pilon	-	2406	13	Intergenic	novelGene_161002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	32.5630798092973	4	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	6	1532	219804	99486	TRUE	30	TTAACCTCTTGCTTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKKLCIVGGILLVFQIIAFLVGGLIAPGPTTAVSYMSVKCVDTHKNHHKTKWLMPWGPNKCDKIRDFNEAITKEIQANDIVFSVHIPLPSMEMSPWFQFMLFILQLDIAFKLNNQIRENAEVSMDVSLAYRDDMFAEWTEMAHERVPRKLKCTFTSPKTPEHEGRYYECDVLPFMEIGSVAHKYYLLNIRLPVNEKKKINVGIGEIKDIRLVGIHQNGGFTKVWFAMKTFLTPSIFIIMVWYWRRITMMSRPPVLLEKVIFALGISMTFINIPVEWFSIGFDWTWMLLFGDIRQGIFYAMLLSFWIIFCGEHMMDQHERNHIAGYWKQVGPIAVGSFCLFIFDMCERGVQLTNPFYSIWTTDVGTELAMAFIIVAGICLCLYFLFLCFMVFQVFRNISGKQSSLPAMNRVRRLHYEGLIFRFKFLMLITLACAAMTVIFFIVSQVTEGHWKWGGVTVQVNSAFFTGIYGMWNLYVFALMFLYAPSHKNYGEDQSNAWKRQKSTACH	219809	91479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_92323_99454_99521_102219_102374_111253_111338_112633_112778_114739_114804_115152_115251_116733_116903_120172_120310_121596_121759_128375_128501_172883_173157_219722
814523	SIRV2	-	543	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1094	0	-69	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4801	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
814524	contig_11396_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_71386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTGCTGTGGGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133982	1134259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1134000_1134300
814526	SIRV2	+	662	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-390	-12	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	458	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCTTGACAGTCGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3643	4445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967
814527	contig_15350_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_164249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGACTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212764	211761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_211800_212800
814528	contig_20716_pilon	+	1676	2	Intergenic	novelGene_176140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCCCAGCAAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135886	138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_136205_137155
814529	contig_12570_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_79337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATTTAAAAGAAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88242	85900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_85900_88200
814530	contig_4180_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_8317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775441	773494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_773500_775400
814531	contig_6829_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_123769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATCAAATGAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50897	48902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_48900_50900
814533	contig_12951_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_68174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCAGACAATTACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317705	317102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_317100_317700
814534	contig_12951_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_68173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGGAGACTTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315491	315220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_315200_315500
814535	contig_12464_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_68744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATCAATGAGTCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434965	434415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_434400_435000
814536	contig_8866_pilon	-	1399	8	Intergenic	novelGene_77884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	26.5852498616071	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	172	933	1021731	1009538	FALSE	20	ATTCTAACTCTTTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICSSLARKFPKLTIIGEEDLPSEDVDQELIEDGQWEEILKQPCPSQYSAIKEEDLVVWVDPLDGTKEYTEGLLDNVTVLIGIAYEGKAIAGVINQPYYNYQAGPDAVLGRTIWGILGLGAFGFQLKEAPAGKHIVTTTRSHSNKLVTDCIAAMNPDAVLPVGGAGNKIIHLIEGKASAYVFASPGCKKWDTCAPEVILHAVGGKLTDIHGNGLCYNKEVKHMNSAGVLATLRNYDYYASRVPESVKNALVP	1031225	1009071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1009687_1010841_1010948_1013227_1013426_1017318_1017411_1018918_1018968_1020870_1020979_1021671_1021777_1031099
814539	contig_3281_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_128523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	34	339	130456	130761	NA	30	TTGAGATACTGTATCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFG	130422	130763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_130400_130800
814540	contig_3281_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_128524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	24	416	131752	132144	NA	35	TAAAGACTTTGGAGCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	131728	132666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_131700_132700
814541	contig_11448_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_66404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAAATCATATTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499631	500919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_499600_500900
814542	contig_5643_pilon	-	610	4	Intergenic	novelGene_39108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCAGGGGTGGCAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641599	640385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_640536_640634_640723_641099_641238_641365
814545	contig_1008_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_121575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACTCCACAGCACCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662947	663257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_662900_663300
814546	contig_11294_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_50067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCTTGTGAAGATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302800	302544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_302500_302800
814547	contig_11294_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_50066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAGAAAAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302177	302598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_302200_302600
814550	contig_5482_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_144484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	7	438	497972	497541	NA	25	ACACTGTGTGGTAGGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTLLRRFSGLLAPARLPSGRECPSLHKQTPIPRVSLPGRAWLATVGGGCGLASPCRDLRRPEVRSPRLPPPRTPLSITHCRPTSKRYPTPLWPQRRNFGFPLPTPPSFCRFIVVDAVRGDPLEGASCPLTPSGVSGSGSP	497978	496534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_496500_498000
814552	contig_3223_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_151827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAATAGAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962393	963723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_962400_963700
814553	contig_12948_pilon	-	1219	6	Intergenic	novelGene_126186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	33.2710084007083	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	320	763	207573	203502	FALSE	15	GTAAATTGGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPGTVYQKYEPVFFQSIGNPFIFRCLDGVLIDGNDKGISKVVYRSCNGRDQLGPLKMSDSTWLTSEMHNPLAVGQYVNNCSNDKAANVCYQEFDVPAVFPVELKQYLPNIAYSYDKQSPLRCVVLVTLRDIKQGEELFSNYYTIVS	209047	203045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_203590_204892_204999_205869_205986_206247_206372_207563_207792_208946
814554	contig_9440_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_59062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGGCTGCGGGACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513883	514826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_513900_514800
814555	contig_9440_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_59063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAACAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514776	516175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_514800_516200
814556	contig_9903_pilon	-	799	7	Intergenic	novelGene_172012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	75.882950800705	7	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGTGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101506	82367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_98726_98800_101465
814557	contig_15720_pilon	-	1843	4	Intergenic	novelGene_41931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8.16496580927726	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	94	867	296726	291356	TRUE	30	AGCAGCCTTTTTAAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLYRGNANEDFQDQEDEPWVGDGGVRNWDNMNCVWDQEEDEEDRDYYLEGLRHDLRIDVYPEEQERLEEYDDDEELYPDTHLPLPSTPQRQFTCPQCRKNFTRRNFRPNLQLANMVQIIRQMCPTPYRGSQGNDQGTCSKHQEALKLFCEVDKEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVLEYKVQLLTAVLNSLKRLFKLLPLYSCGCTLDLIFTKTCYTSEILNSSFTLSLALSLPVHLNTLQLYLLFSFIQIIVPLTANFVPSQFIRHFLPLVPILPSLDPWLVLA	296819	284215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_284401_284497_284858_290924_291674_296270
814558	contig_12278_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_152600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACGTATTAAGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205501	206765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_205500_206800
814559	SIRV6	+	227	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10809_11040_11109_11205
814562	contig_13021_pilon	+	1609	2	Intergenic	novelGene_8105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112328	114372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_113017_113451
814564	contig_6488_pilon	-	776	2	Intergenic	novelGene_44757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCTGTACTCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182471	181620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_182327_182401
814565	contig_9177_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_32734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	688537	688845	NA	55	AAATGATCATATATATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSYRGRGTELLRWSSVLAQCSSVRFDFWVPSQGFEQPLHRIPCRGWGYGGGEACPDRWAKSPPSPGDGEKKEARKNGEKKAITVLCAVFRTSRNEVSDKEG	688535	689559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_688500_689600
814568	contig_11413_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_103164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGAGAAGTTCTCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376572	376996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_376600_377000
814569	contig_14243_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_57437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATATAAAAGAGAGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673266	674799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_673300_674800
814570	contig_4083_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_152345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTGGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431247	433629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_431200_433600
814571	contig_16110_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_126777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGCTTGAGCCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27967	26627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_26600_28000
814572	contig_2009_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_165447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAATCTATGAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35966	34214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_34200_36000
814574	contig_13558_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_123038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCAATTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587876	587551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_587600_587900
814575	scaffold_19766_pilon	+	2271	18	Intergenic	novelGene_34280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	41	junction_11	79.1450422721662	416	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	22	1638	399862	408733	TRUE	5	CCTCCAGGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSRRERMAAAVATPLAAGGEEAATTTSVPGSPGLPGSRSAERALEEAVATGTLNLSNRRLKQFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIGALGSLRQLDVSSNELQSLPPELCSLPSLRDLNVRRNQLSVLPDELGDLPLVRLDFSCNRVSCIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQICLKGKLHIFKYLSTEAGRRGGSALGDLAPSRPPSFSPCPAEDLFSGRRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFSELSFRISELAREPRGPRERKEDGLADGDPEQIDFIDSHVPGEDEDRGAAEEQRPPELSPVAGDGERAPSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQERERRQQQQQSGVWGTPRKDSFLKLGIRAAGGGAAAPSTQATSNGTPKSTATQVGALGGQGAPAPAPSSQEAPTRAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQGSSGPSSPDSLLRPRRSPPGSG	399840	411006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_400082_403613_403759_403924_404052_404238_404345_406219_406357_406499_406616_406759_406860_407110_407202_407291_407369_407480_407543_407644_407765_407964_408034_408124_408229_408356_408441_408674_408762_408943_409082_409180_409259_410617
814576	contig_6654_pilon	+	1158	2	Intergenic	novelGene_85739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443463	445893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_444348_445619
814579	contig_4519_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_123651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24414	25717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_24400_25700
814581	contig_3942_pilon	-	856	9	Intergenic	novelGene_128806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	115.967600539978	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	73	678	1054501	1050289	FALSE	5	CTTGATGCTGTGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAFYIGSYQHEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKDSGHPETLINLIVLSQHLGKPPEVTNRYLSQLKDSHKSHPFIKEYQAKENDFDRLVLQYAPSA	1060090	1050110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050337_1050456_1050532_1051201_1051271_1052698_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054824_1060061
814584	contig_5574_pilon	+	691	2	Intergenic	novelGene_155846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAGAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119719	126810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_119758_126157
814588	contig_12638_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_33067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGATTAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83321	81118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_81100_83300
814589	contig_15371_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_151433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTATGAATCACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26431	27804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_26400_27800
814590	contig_6418_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_81120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTCCCAAGGAAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68977	70143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_69000_70100
814593	contig_13349_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_161130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	272	819	845	1663	261212	262030	NA	15	GACTTCTCTGCCCACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSRPALKRDSRWGTGGQMGLKQLGGAGLGQDNGSSQQGCWEECGAWSRTSPGAQPSQPMCLWDWHSGSDGGKGRTPCGPGWAAEVGNVKSRGRCSPRACIWPGLGAGKEPIFQRRGWEAQPAWPHQRPGQELLGGGRARKGNQPRVSQQPALLSIPAKQDLPKGPGAQPWPVCSINQGLKDRVNVPLSEDLPGPGRGPGTLLVPAVRTRVGQSWKGLWVNQANAPEPRHLGQYSWCVQCLGRVKQGQETPQRSDRGSWSGESLPPALAAS	260367	262276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_260400_262300
814599	contig_15689_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_164156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	310	651	148360	148701	NA	30	TCTTAAAACTGTTGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVRHLYIWESSSQNEREGTRFGGFKEFMSASPNSGVRHLPLPAGVHATQTNPLLAATGKPQNLLWSPGGDLGAPYWLVAALASLGAGREGGASAKDRLGREAVPGPAPLCM	148050	150246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_148000_150200
814600	contig_6418_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_81226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAGGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396760	1397259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1396800_1397300
814601	contig_9440_pilon	-	1353	2	Intergenic	novelGene_59083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTATGCACTGTTCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390673	1387251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1388460_1390528
814602	SIRV3	-	305	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	314	-2	314	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
814603	contig_9931_pilon	+	1026	2	Intergenic	novelGene_134813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1679	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	193	891	364058	364756	FALSE	75	GAGAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	297125	364891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_364048
814605	contig_19352_pilon	-	1302	7	Intergenic	novelGene_122367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	800.134572014816	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTGTGTGTTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122803	103140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_103959_104027_104087_105884_106011_108444_108507_112796_112907_113281_113340_122734
814606	SIRV6	-	326	5	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9288	-140	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTTGTTCATTGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10825_11039
814607	contig_8538_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_4943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTGTTGTTTATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842798	843130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
814610	contig_10937_pilon	-	898	7	Intergenic	novelGene_67313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	126.257233016128	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	651	818	74961	73701	FALSE	5	TGGGTGAGCGTGCGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQLTSIPGYLNPSSRTEILHFIDNAKRAHQLPGHLTQEHDAVISLSAYNVKLAWRDGEDIILRVPIHDIAAVSYVRDDAAHLVVLKTAQDPGISPSQSLCAESSRGLASGSLSGSGVVPVEACCLVVLAAESKGAAEELCSLLSQVFQIVYTESTIDFLDRAIFDGASTPTHHLSLHSDDSSTKVDIKDAYEVEVATFSFPDPTDVGGLSSLSFCMPPSPHLKTASESELSTTATELLQDYMLTPQRLCCLAAAHQAVIPGDPAVRHIAA	82699	73620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_73782_74874_75014_75541_75600_78367_78504_79639_79777_81960_82145_82616
814611	contig_10982_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_87854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59675	57946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_57900_59700
814613	contig_1867_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_54539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTCAGAAAAGCACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343062	342153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_342200_343100
814614	contig_11855_pilon	+	1013	8	Intergenic	novelGene_67040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	259.252063932115	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCCCAGCAGCATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1980780	2008504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1980838_1981051_1981141_1986608_1986779_1995528_1995625_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253_2002336_2008231
814615	contig_9895_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_144699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348753	350547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_348800_350500
814617	contig_5799_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_50234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGATGGTAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168438	142334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_142719_166444_168282_168347
814619	contig_7887_pilon	-	1307	5	Intergenic	novelGene_124907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	572.311704842737	96	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	448	1020	395414	393753	FALSE	20	CATCACGGCTCATTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTRSVDNVQFLPFLTTDVNNLSWLSYGVLKGDGTLIVVNAVGAVLQTLYILVYLHYCPRKQTLLLQTATLLGVLLMGCGYFWLMVPDPASRLQQLGLFCSVFTISMYFSPLTDLANVIKTQSTQRLSYSLTIATLLTSASWTLYGFRLRDPYITVPNLPGIFTSVIRLWLFWKYPQEKDKQHYRLLQT	395861	393465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_393858_393937_394058_394356_394519_395112_395237_395352
814620	contig_10734_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_51376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAAAAAATCATCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1867816	1868448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1867800_1868400
814621	contig_12128_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_131975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196875	197499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_196900_197500
814627	contig_14635_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_84374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCACTGATTTGTAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603223	601113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_601100_603200
814630	SIRV6	+	305	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	385	11	-215	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
814634	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
814638	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
814641	scaffold_8345_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_106987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAAATACGTGCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37958	36808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_36800_38000
814642	SIRV4	-	434	2	FSM	SIRV4A	SIRV405	626	2	114	78	114	-78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCACTACGGAGTGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13823	8707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_8991_13672
814646	contig_678_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_167843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCACTCTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471723	473652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_471700_473700
814648	contig_16045_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_130859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGGGTGGATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19158	20219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_19200_20200
814650	contig_3426_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_57928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227186	225814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_225800_227200
814651	contig_12079_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_67353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTACAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90786	89101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_89100_90800
814653	contig_5642_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_153022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCAATTTGGGAGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34662	36177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_34700_36200
814654	contig_953_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_130020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCGGTGCATCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581122	582028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_581100_582000
814655	contig_20610_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_67633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAGGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6028	7385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_6000_7400
814656	contig_18869_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_56364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73577	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
814659	contig_14790_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_127912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170507	168906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_168900_170500
814660	contig_1813_pilon	-	1152	3	Intergenic	novelGene_105498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	17	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	306	890	296821	295428	FALSE	45	CAACCAAGAAACAGTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVEQLMPLKSSHCLPAWRTASHCGSVQTQGKVLGPELPSHCPCVGEPVWWAGSECCCQVYWCPPQVYRNTVVAQWRALDLDVLLTPMLSPALDLNAAGKAIGAISYTVLYNCLDFPAGVVPVTTVTAEDEAQMEHYKGYFGDSWDWMLRKAVKKSVGLPVAVQCVALPWQEELCLRFMQEVEQLMPCEKRPS	297126	295165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_295557_295807_295954_296511
814664	contig_3571_pilon	-	2290	10	Intergenic	novelGene_88709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	52.5060843035251	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	23	1762	100098	30354	FALSE	40	CGAGGTGAGCAGGAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGHLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSVSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWIRYDREQRGACLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMSERRPHLPAFRTRPRCCTSMAGLIYAVGGLNSAANFYAGDSLNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEVYNPETDSWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVESYSPETDKWTVVTPMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFNSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	100120	29825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_30741_31449_31562_33384_33490_36653_36892_38625_38763_40254_40416_41808_42008_45517_45659_49302_49434_99969
814668	contig_12881_pilon	-	1120	3	Intergenic	novelGene_176144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACAAGTGGGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34398	33025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12881_pilon_-_33677_33769_34026_34185
814669	contig_9389_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_83927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	981.569502124022	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	22	459	159587	167739	FALSE	30	ACTCACTGTGGACCAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFERVWVPPSLGFLPELSHQARGRGKGHISLHWGS	159565	168346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164490_167641
814670	contig_12357_pilon	+	506	4	Intergenic	novelGene_6066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	602.90187150702	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	117	494	26079	30933	FALSE	20	TTCAGTGATCGAGGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLVGDKNKKSKVFCFKLKIVRLCVSVP	25962	30945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29671_30871
814671	contig_9345_pilon	-	1185	10	Intergenic	novelGene_24506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	217.333333333333	1	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	94	1122	671783	667167	TRUE	25	AAGTAATGCCTGGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRRSSFSTAGMASPTNLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPSLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHS	671876	667019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667166_667255_667334_667479_667568_667714_667798_667943_668928_669025_669114_669206_669289_669490_669566_669636_671731
814672	contig_3787_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_102396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTCCTAATGAACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473202	471895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_471900_473200
814673	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814675	SIRV6	+	276	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
814676	contig_5502_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_155000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTATCTTTTTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437174	435247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_435200_437200
814677	contig_5684_pilon	+	1079	2	Intergenic	novelGene_81070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	112	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	22	558	443933	447039	FALSE	50	AAAAAATAGGGCTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	443911	447560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_443949_446518
814678	SIRV6	+	594	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	61	225	61	137	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10298	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
814681	contig_6589_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_25705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAAACTCAAGAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211252	212026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_211300_212000
814683	contig_12786_pilon	-	1181	8	Intergenic	novelGene_103415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	789.905677655147	2	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	542	1123	600878	590909	FALSE	25	AGAATCTCCTTTTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629486	590850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600898_602792_602956_604600_604719_614020_614079_629303
814685	contig_1244_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_37962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAATGAATTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896391	893717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_893700_896400
814687	contig_14357_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_121650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTGTGCCAGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453709	453260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_453300_453700
814688	contig_8538_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_4783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	65	298	842828	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842763	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
814691	SIRV6	+	477	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	377	2	204	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
814692	contig_7411_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_137001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATACATGATATTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246632	247129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_246600_247100
814693	contig_7411_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_137002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGATGTCCTTTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247129	248479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_247100_248500
814695	contig_14508_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_79048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51618	50957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_51000_51600
814696	SIRV2	-	472	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	474	2	474	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTTGTTATCCTATATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4258	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
814698	contig_6876_pilon	+	1488	4	Intergenic	novelGene_147024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	73.5949877520353	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	398	1393	133885	141512	FALSE	65	AAAGGAAATGAGAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTEFTSLILNMSDEYSYDSASSEMYEYINNFADLFCKKNNVRQFASYFIPPFYWLAFIVGTLGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAANQWKFPSFMCKLVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIVQAMKAQNWRQKRLLYSKMVCFTIWVIAVVLCIPEILYSQVNGEPGFAVCTMVYPRDDSTKLKSAVLTLEVIVGFFLPLVVMACCYTIIIHTLLQAKKSSKHKALKVTITVLTAFLLSQFPYNCCLNPVLYVFVGERFRRDLMKTLRNLGCISRAQWVSFTRREGSLKLSSGLLETTSGALSL	129122	141607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_129496_133860_133906_140423_141218_141331
814699	contig_5765_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_141396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAACTGCCGACCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689274	689674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_689300_689700
814701	contig_7179_pilon	+	1396	8	Intergenic	novelGene_78089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	70.1380562802785	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	473	1087	580021	586612	FALSE	30	TGAAATAGCCTAATTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGVSHLKQEPEKVKVSSSVRHPETPLLISGFHLPSKLKPPREKVDHEHPASEPENLEFSSFMFWRNPLPNIDHELQELLLDKGESVPSEEEDEEENGFEERKDEDSDADGGGWITPSNIKQIQQELEQCCVPNNVRVGCMTTDFAMQKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAVNPHLTEDQRFPQLRLSRKARQKTNVFAPDYIAGVSPFAENDICSRSATLQIRDSTLGAGRRRLNPNASRRKFVKKR	576848	586921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657_579730_579945_580075_580168_580373_583252_583340_586342
814702	contig_12837_pilon	+	1462	3	Intergenic	novelGene_57336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2280.5	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGAGGCTCTGTTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161405	167325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_161494_163916_163969_166003
814703	contig_6497_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_35579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACATAACTATGTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208382	209018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_208400_209000
814705	contig_5640_pilon	-	472	2	Intergenic	novelGene_27258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTCAGAGCGCCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161933	159926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_160336_161870
814707	contig_5551_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_134268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTCCAATACTGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631633	632499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_631600_632500
814709	contig_5485_pilon	+	603	2	Intergenic	novelGene_37788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGATCTAAAGAGCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696503	697567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_696911_697371
814710	contig_14426_pilon	+	1145	2	Intergenic	novelGene_170614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCACACACCTGGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32829	35015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_32916_33956
814711	contig_14426_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_170615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGGCAATGAATAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35144	36173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_35100_36200
814714	contig_678_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_167855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTCTGCTTCCATTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569118	568491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_568500_569100
814719	SIRV4	+	312	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGCTGGGCCGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	3949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
814722	SIRV4	-	250	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1268	3	1268	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
814723	contig_11448_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_66442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTACACTTTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664956	663593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_663600_665000
814726	contig_1734_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_164381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTAGGTAGGGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604498	603957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_604000_604500
814727	contig_500_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_30935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	145	327	1200406	1200224	NA	75	AAAAAAAAGAAAAATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGQGYKHFKNAKNRSCWLFLLCPVTFVADSITQLSRWRREGNTRSGAQMVATLRLTTPIPAGSAAGASVNKFPPEGRGAWPWVWSVPPPFVSFPDGYDFISQQCSRRF	1200550	1199804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1199800_1200600
814729	contig_3822_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_133338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	135	464	345552	345223	NA	15	GCTTGAACCCTGTCTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRVIISAQTAFEGGNARDGTFLVVCSQILISNKSYFHLLTCSGSDRKDVTFMEQSILVIGALFLMASWVSRIWVQPVSTTQTGVLSYSYGMVEQDVLSYTTPKLIHF	345686	344790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_344800_345700
814736	contig_8581_pilon	-	1828	6	Intergenic	novelGene_22802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	9.21737489744233	24	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	83	817	241556	187122	FALSE	50	TTGAAAGTAATCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGDSEKVRYCARLSYLWLKFSLIIYSTVFWLIGALVLSVGIYAEVERQKYKTLESAFLAPAIILILLGVVMFIVSFIGVLASLRDNLCLLQSFMYILGICLIIELTGGVVALIFRNQTIDFLNDNIRRGIENYYDDLDFKNIMDFVQKQFKCCGAEDYRDWTKNQYHDCNAPGPLACGVPYTCCFRNTTEVVNTMCGYKTVDKEVMSLNPFPREVLLFLSHPHSIKGALRGEAPEISQHSQL	241638	186110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_187287_191578_191696_193387_193484_202686_202762_204061_204248_241460
814737	contig_11285_pilon	-	1079	8	Intergenic	novelGene_5703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	425.123655480355	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	21	890	798530	784252	FALSE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGNLTVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798550	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_795328_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
814738	contig_5600_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_174960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303483	305589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_303500_305600
814739	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	61	513	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
814741	contig_15474_pilon	+	277	3	Intergenic	novelGene_136230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATACCATTTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57184	64285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_+_57219_58574_58655_64122
814742	contig_7887_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_124840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAGAAAAAAAAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15216	15663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_15200_15700
814744	SIRV6	-	209	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCGACTTCGACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
814745	contig_11978_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_62826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTATGTAAACATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440069	438030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_438000_440100
814749	SIRV6	+	227	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-392	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1893	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
814750	contig_6630_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_30714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	226	318	381682	381774	NA	5	TTTCCTTTTTTTTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEWIGVGAGGGAQKLWGGSLAEESPEGHLGSKGDKGTGDTSGCGGGAQKREGDNSKLCLFQHLIQSLQILRKRKEMFPPSLFSCAPSPSWTPKIKLLLRALDLLH	381456	382562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_381500_382600
814751	contig_16934_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_132522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152321	151670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_151700_152300
814754	contig_9646_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_117445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223960	223180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_223200_224000
814756	contig_615_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_80049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGGTCTAAGGCCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53776	54283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_53800_54300
814757	contig_715_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_167548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGGAATTAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87801	90062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_87800_90100
814758	contig_5871_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_160178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	85	582	359298	359795	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYKYSGSLRYKGSSNSFPASFPELHQVYRKECEHDRRLGSLIWVQESKETLPVPRRFSQMEQKLKVKRAAKPFTLQGTGKHSWWLEVRKKIANKSHPLPLEEEKKTVLSPISYTSIIGEEPGNTPTQTCNRYIPSGEGTGMLWKLHPQAPVTQGLPKTKAEPVR	359213	360260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_+_359200_360300
814760	contig_19680_pilon	+	1563	7	Intergenic	novelGene_132007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1183	junction_1	1067.06711233278	4211	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	400	606	215487	216765	FALSE	15	GTTCGCTGGTTTCGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAPKRRGSSGSAVVDLLYWRDIKKTGVVFGASLFLLLSLTVFSIVSVTAYIALALLSVTISFRIYKGVIQAIQKSDEGHPFRAYLESEVAISEELVQKYSDSALGHVNCTIKELRRLFLVDDLVDSLKFAVLMWVFTYVGALFNGLTLLILALISLFSVPVIYERHQAQIDHYLGLVNKSVKDVVAKIQAKIPGLKRKAE	153473	217722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_153514_203135_203344_207103_207243_215474_215545_216030_216078_216275_216335_216722
814761	contig_8242_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_80200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGATTGTCATTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186457	188267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_186500_188300
814762	contig_20614_pilon	+	609	7	Intergenic	novelGene_107546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1349.55825077031	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	59	562	152671	155145	FALSE	30	AGATAGTTTGTCTTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGMKCIKFLLYVFLLAFCACAVGLIAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLVALVGCCGACKENYCLMITFAVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPPLSRGVG	152054	155192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152659_152737_153645_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154446_155118
814763	contig_504_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_54450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATGCCATCAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252882	252493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_252500_252900
814764	contig_15114_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_121186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTGGACCCCAGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695836	696807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_695800_696800
814765	contig_8571_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_169183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	14.6692706021806	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	131	508	482050	514280	FALSE	10	CATGGCCTCTAGTCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARWEQKTRRLSKAFGSPYLACYALGGAILLLNLVRSHCFTQAMLSQPKMESLDNAGAYRVGLVLLGVGALFVLTSFSALGFTGTFLGDYFGILKEARVTTFPFSVLDNPMYWGSTANYLGWAIMHASPTGLLLTAIVAIVYVVAVLYEEPFTAEIYRQKAAKSHKRS	471124	514512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_471242_482036_482183_510795_510908_513706_513782_514222
814766	contig_10196_pilon	-	1389	6	Intergenic	novelGene_132266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_5	49.0656702797384	314	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	109	849	2004523	2002980	TRUE	10	CACGGTGTGTGCTGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKEEKEGGARLGAGGGSPEKSPSAQELKEQGNRLFVGRKYPEAAACYGRAITRNPLVAVYYTNRALCYLKMQQHEQVLADCRRALELDGQSVKAHFFLGQCQLEMESYDEAIANLQRAYNLAKEQRLNFGDDIPSALRIAKKKRWNSIEERRIHQENELHSYLTRLILAQRERELEECQRNHEGDKDESHVRAQQACIEAKHVRTPPSPTMGVCLHAHGEAGSGASSSCPAACFSTGQIPGRHG	2004631	2002290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2002683_2002758_2002876_2002948_2003197_2003373_2003540_2003618_2003818_2004364
814767	contig_13424_pilon	-	1598	2	Intergenic	novelGene_151604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCACTTAACTGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159892	155688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_-_156824_159429
814768	contig_6634_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_171132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAGAAAATGGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88084	89425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_88100_89400
814772	contig_17880_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_167321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCATGATTAAAGTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16931	16435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_16400_16900
814773	contig_19362_pilon	+	1515	2	Intergenic	novelGene_157792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1435	junction_1	0	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTCTATTATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41612	43526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_42994_43392
814774	contig_12638_pilon	-	2311	15	Intergenic	novelGene_33283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	5.06337388527065	20	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	244	1572	949397	937321	FALSE	25	CAGGAAGGTAGTGACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACARLGALHSIVFAGFSAESLCERIVDSSCSLLITADAFYRGEKLVNLKELADEALEKCREKGFPVRCCIVVKHLGRAELGMGDSPNQPPPIKRPCPDMQISWNQGVDLWWHELMQEAGDECEPEWCDAEDPLFILYTSGSTGKPKGVVHTVGGYMLYVATTFKYVFDFHPEDVFWCTADIGWITGHSYVTYGPLANAATSILFEGIPTYPDVGRMWSIVDKYKVTKFYTAPTAIRLLMKFGEEPVTKHSRASLQVLGTVGEPINPEAWLWYHRVVGAQCCPIVDTFWQTETGGHMLTPLPGATPMKPGSATFPFFGVVPAILNESGEELEGEAEGYLVFKQPWPGIMRTVYGSHARFETTYFKKFPGYYVTGDGCRRDQDGYYWITGRIDDMLNVSGHLLSTAEVESALVEHEAVTEAAVVGHPHPVKGECLYCFVTLCDGHTFSPTLTEELKKQIREKIGPIATPDYIQNAPGLPKTRSGKIMRRILRKIAQNDHDLGDTSTVANPSVISHLFRHRCLTTQ	950345	936581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_937449_937579_937655_938195_938373_938697_938767_940363_940473_941659_941741_941934_941992_942072_942206_942404_942539_942856_943028_944063_944202_949340_949456_949630_949707_949979_950053_950309
814775	contig_34_pilon	-	1431	3	Intergenic	novelGene_40041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2924	junction_1	982	1041	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	62	487	247052	230182	FALSE	45	AAACTGTTCAAAGTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIGKKLYVGMWLPLLGF	247113	229237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_230387_243214_243354_246970
814776	SIRV1	-	174	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	8	3648	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTAGGGCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
814777	contig_10003_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_88162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTCCACCAGTGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400367	398299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_398300_400400
814778	contig_9188_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_175726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTCGATGACCCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15845	14749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_-_14700_15800
814779	contig_19851_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_29884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCTAAAAGAGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56522	55842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_55873_56001
814783	contig_9363_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_6728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCATAGTCTCCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455256	1456715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1455300_1456700
814784	contig_366_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_51621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCCTTGAATTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332510	1332228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1332200_1332500
814789	contig_6710_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_97339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
814790	contig_10554_pilon	+	1732	2	Intergenic	novelGene_166958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10674	13583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_+_10836_12012
814791	contig_7370_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_173666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCATCTGTAAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42837	41908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7370_pilon_-_41900_42800
814793	contig_8772_pilon	+	490	3	Intergenic	novelGene_21129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12775	junction_2	1031.5	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGCTGTGTCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21476	23421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_21523_21966_22053_23063
814798	contig_7165_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_116896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCACCTTTAATAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056209	1056617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1056200_1056600
814799	contig_9656_pilon	+	860	9	Intergenic	novelGene_121932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTCACGAGCCACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430449	446620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_430617_431077_431139_432062_432071_438017_438111_440922_441016_441181_441307_442127_442240_443248_443384_446554
814800	contig_7704_pilon	-	794	8	Intergenic	novelGene_154608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_4	168.82015548494	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	293	376	220403	219376	TRUE	10	CATTCCAGGCTCCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPRFPSGVFLAASDWERGNPVLKFVRNVPWEFGDVLPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHQRLQSLGKNFALRVLLVQVDVKDPQQALKELAKMCILADCTLVLAWRVAMSQNQLDGNGF	230860	216694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219419_220362_220440_222497_222598_223587_223692_230808
814804	contig_11902_pilon	-	1599	4	Intergenic	novelGene_176150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	23.0988215187606	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2	496	14669	11233	TRUE	25	TAGGGCCCCAGAGCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGNKARASQSCPCFPGLRSRRDEDSLSGDRSDLKAPSTPGKRKKRRHRTVFTAHQLEELEKAFSEAHYPDVYARETLAVKTKLPEDRVQVHKGLLLPRDTSETTGLLSSSHTVSSLIATSIYPEHSFHLQTDGHLSQGHNTGASTQVLQKDIPVTLSLFSFD	14670	8978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_9087_10237_11579_12057_12137_14599
814805	contig_11115_pilon	+	1723	8	Intergenic	novelGene_102799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_7	129.832702399068	1	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	185	1228	154256	157736	TRUE	15	TTCTGGTGTTGGCCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEQLPTSCAPQKSGPAGKGPVLASSSTSFLDLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	154071	158461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967
814806	contig_8616_pilon	+	723	5	Intergenic	novelGene_72598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2010	junction_2	643.597894651622	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	118	723	430606	436444	FALSE	15	GAGTACTTTTCCTGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVR	430488	436444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
814807	contig_8615_pilon	-	1788	2	Intergenic	novelGene_165220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACATTCTTGGAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164847	162443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_163951_164566
814808	contig_16156_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_137074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGAACATGCTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107916	106763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_106800_107900
814811	contig_3956_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_14748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	909	1322	691548	691961	NA	15	CACGCATCCCTGATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRSKCLKYHVGVTKPIFSPNKACRPLDCNLCPKQTWFCKTASQQHLPASPSPLTYKITFLTWAWQCFATLSPPDTPTLQTRPAHHTPAENLCSSLVSPETKKPGLAFLPMVCLIKNSTGFVRSFVPEREIIILKF	690639	691962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_690600_692000
814812	contig_10800_pilon	-	1137	6	Intergenic	novelGene_152620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.210172248202	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	71	691	457582	429975	TRUE	15	TACTTTTTATGCCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCGTSPSSSGSSVCVLQPQKTSRMAANKNKSQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVQIEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRAKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL	497156	428976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_429316_429867_430095_432709_432888_436425_436635_457468_457632_497135
814814	contig_14322_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_115615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAATATTTTCAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18911	20056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_18900_20100
814816	SIRV6	+	419	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	544	164	46	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATGGCTATTGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
814818	contig_20612_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_174678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGAGGTGTATGGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62871	65076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20612_pilon_+_62900_65100
814819	contig_13494_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_167512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAGCAGTCATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29850	31199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_29800_31200
814822	contig_11227_pilon	-	2052	5	Intergenic	novelGene_163220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	901	1623	541719	526100	TRUE	15	GCACACTCACTCTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWCQKDCRGVCMPLPRHPQRWVVDVSCQHVDAKGNGKAVLNLNSCQQWELVHPGSWVHNVLHLEVSEEADARLKEQYVKASEDAKLASKGGIKGDVIHFGRGIKSGLKVQVVFAVAVNKGSITAEHNICVKLVSPIIWAPWVTAMTRLLRAEIGHQEHLSPEGHTTQALEDLRVIEPVRLQAWVPPHQPGRRHEVQKWVYGCSCKVESMNAIFWKHYNLYTLLGCSHHLLFIDVEVLVH	542709	512269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_512474_525874_526155_539916_540067_541201_541758_541847
814823	contig_2310_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_71637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	719	1060	491423	491082	NA	55	AACAAAATTCTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLRILCHSTASLAWALRSLLSGTATHLVPSEAESCSSEGASPTWTMGKCQAPSLLAPRTRRHGRRGTGHSQGSLWHCYQKWQQMVGGRPLQKPLCSGPPAPTFPRPSCKGP	492141	490692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_490700_492100
814824	contig_11815_pilon	-	954	4	Intergenic	novelGene_50907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.276610841139	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGCATATCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156959	153850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153979_154794_155255_155551_155640_156681
814825	contig_1813_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_105518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGCATATTCAAAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429262	431147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_429300_431100
814827	contig_12837_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_57346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	58	453	213153	213548	NA	50	AAAAAAAATTTATTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHLFLLLALCQAGHIARACSYSLRGSWQIRNANGSLELPGTVPGCVHSALFQQGLIQVLCATDPPRLRGPRSSGGERGPGTAWQLPSVGCSRRFCTNLPFESSGLWREMPGQFFPVGEEHRWGTGLDRD	213095	214692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_213100_214700
814829	contig_12842_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_168354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAGACTGCCAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224134	225969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_224100_226000
814830	contig_12550_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_175280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCACCAAAACTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87482	90283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_+_87500_90300
814833	contig_3797_pilon	-	2090	2	Intergenic	novelGene_120075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAACTGGAAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123952	86196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_87688_123353
814834	contig_2209_pilon	-	1074	5	Intergenic	novelGene_141004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	99.8974474148364	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	41	520	248781	120917	FALSE	20	AGTCCCTGCAGTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLRRPQTAAAACAMCAHNPGTEFALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAGSDFIKTSTGKEAVNATFPVAIVMLRAIRDFFWETGNKVGFKPAGGIRTAKDSLAWLSLIKEELGNEWLKPELFRIGASSLLSDIERQIYHQVTGRYAAYHDLPMS	248821	120362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_120974_122030_122181_125972_126086_184487_184617_248750
814835	SIRV6	-	400	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9459	-141	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTCTTGTTCATTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	1685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10818_11031_11109_11205
814837	contig_6842_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_130699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTATATGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385959	384708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_384700_386000
814838	contig_6842_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_130697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAAACATTCTTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384351	383962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_384000_384400
814840	contig_1443_pilon	+	859	2	Intergenic	novelGene_28188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	9	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	93	557	344128	344592	FALSE	25	CTAATGAGTGAGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343656	344894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
814841	contig_6283_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_100198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1618	1929	554238	553927	NA	25	GGATCCAGTTCAAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPWFLTTVFVSTQGETKAAPHSVEPRPWQNGAAGREPARGCPDSPVPPGCPRGVGLGRAPLGAAPETGVSHATRARVEEVSCTTILRAGHWWFPSADNKPF	555855	553918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_553900_555900
814842	contig_9706_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_20983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382744	383917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_382700_383900
814844	contig_16411_pilon	-	1374	1	Intergenic	novelGene_77305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105520	104146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_104100_105500
814845	contig_7342_pilon	-	583	4	Intergenic	novelGene_71193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	127	junction_3	5825.05589863498	590	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	83	400	666818	665411	FALSE	30	ACCAGGCTCTGATTAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTHIRAKRKREELSNVLAAMRKAAAKKD	667009	665227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665709_666725_666821_666929
814846	contig_5797_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_56914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGGGAACAGAGCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119741	118021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_118000_119700
814851	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
814853	contig_1856_pilon	-	925	3	Intergenic	novelGene_84895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	7	179	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTGTTTTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557604	552607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_553345_554547_554676_557544
814854	contig_3942_pilon	+	486	5	Intergenic	novelGene_128636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	1214.61279838474	1333	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGGGGCCCAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176951	180118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178441_178490_179045_179177_179714_179825_179974
814855	contig_7593_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_127348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAGAGTCCACTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636611	637199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_636600_637200
814856	contig_6202_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_139834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACTAGAAGAAAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811351	809777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_809800_811400
814858	contig_16103_pilon	+	2256	3	Intergenic	novelGene_118733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_2	114	8	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCTTCATTGGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294836	299534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_296110_297637
814860	contig_7594_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_55403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	66	401	397200	396865	NA	55	GGCAATAATAATGAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLNQPLRALQGPLFPPKDLVEEDIDCLKEDVEEDEDPVFVDAEELCSGGVKAGCLPGRLPGEDTRPTPGGGIAGRVYCFFPILALLLERLPVTAKTYLWDGLAASSYLG	397265	396349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_396300_397300
814864	contig_1399_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_166670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTGCAGCATCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458491	457451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_457500_458500
814868	contig_16103_pilon	+	429	5	Intergenic	novelGene_118803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_3	10249.5986384834	28892	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603899	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604359_604759_604845_605006_605118_605495
814874	contig_10050_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_119637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295844	295045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_295000_295800
814875	SIRV6	+	454	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	22	9	22	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGCTTGGTCACAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
814876	contig_15236_pilon	+	1001	4	Intergenic	novelGene_141646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTGATGTCTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679756	685137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_679805_683370_683475_684093_684221_684415
814877	contig_12279_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_50136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86796	86015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_86000_86800
814878	SIRV6	+	315	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	558	0	392	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
814879	contig_10159_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_30856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGCAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760266	758548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_758500_760300
814880	contig_11258_pilon	-	1355	4	Intergenic	novelGene_67819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_2	2.44948974278318	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	162	473	336931	328661	TRUE	35	CTTAAATGTCTTTTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRRKRLRKEAALWHKEKQKCESWRFGPPFLGRAETWYPAGAQAISADTCLRGMTQRDRAVWLLSVLLLLWVPAATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRVELLHRVFLAAIFMEADCQDFLHGAAWWVQTANL	337092	326765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328660_328767_330514_330660_336870
814881	contig_10500_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_41307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATTTCTTTAGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659147	1659900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1659100_1659900
814882	contig_9836_pilon	+	477	2	Intergenic	novelGene_176154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATATCCTTTTGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15104	35902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_15266_35586
814883	contig_12019_pilon	+	502	2	Intergenic	novelGene_87655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5301_8341
814885	contig_14807_pilon	-	1182	5	Intergenic	novelGene_124732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.84767985741633	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	13	591	100771	95442	FALSE	20	AGCAGCTGCTTGATTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEDLAMFRVIPSCTIFYPSDAVSTEHAVYLAANTQGMCFIRTTRPETAVIYAPEERFEVGQAKLVRHSASDKVTVIGAGVTLHEALEAADELSKEDHRVLLLQGFRSASSTCLPLNPWMLPPSYPVQKSQAATLSLWRITTEKVALGKPSLQLLLWSLTSWSISWQCRECRRAGHRATCWTCLESAPGTS	100783	94850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_95586_96714_96858_96951_97049_98316_98401_100660
814888	SIRV6	+	405	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	267	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1570	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
814889	SIRV4	-	422	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1096	3	1096	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4062	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
814890	contig_4896_pilon	-	1322	12	Intergenic	novelGene_164320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_11	402.896434819275	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1170	151	1320	119292	22648	FALSE	45	AGACAAGGAGAGAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFGEANQLRRSVWSVAPSGSLVAVGAGWGFGDDPALRTWSPLLSQELCISMAESSSDSDYYRHQDQFSRWAPRSTHRRTQNHPTADVTKKVNTITSTLQDTTRNLRQVDQMLGHYREYSNEQAGAIEKLKESLEQSIGQLRNQRLLRNSGGRSISVTSLSASDLDGGTATDSHRFPPTSPLKDYGDPQGSKPMKSRPTGVRFVRETDDVGQLHILHQSLRDLSSEQVRLGDDLNREFSRRSRSDAETKRALEELTEKLHVQRQEVISDRVEQRLQEIEREMRTERELVEKRQDQLGLMSLQLQEALKKQEAKADENEGIMKNKLKQTETEKSQLEQELELSRRLLNQSEGSRETLMYQIEELRTQLMKAEGDRKGLQHQVSQISKQQSNHQDEQAGDWRFRRGVEREKQDLEKQKSDLRVQLNFNAMASELEEVKRCMER	187542	22645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4896_pilon_-_22761_28642_28776_30687_30763_33829_33917_72639_72757_92824_92895_98809_98902_101644_101767_103473_103601_116107_116195_119145_119308_187407
814891	contig_5549_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_81626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCGCAGTATTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395729	395277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_395300_395700
814895	contig_10732_pilon	+	1195	2	Intergenic	novelGene_114716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGAGTTAATACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135376	143555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_136317_143300
814897	contig_10801_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_74045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAACCAAACCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276998	275315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_275300_277000
814899	contig_2750_pilon	-	1230	3	Intergenic	novelGene_164481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	85	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGCCTGCAAAATACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158274	146209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_147336_148578_148630_158221
814901	contig_9150_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_140908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAGCAAATAACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55870	55184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_55200_55900
814903	contig_16643_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_158130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259227	260077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_259200_260100
814904	contig_5988_pilon	-	1916	8	Intergenic	novelGene_15878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	150.374634204858	1	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	70	1440	394282	387838	FALSE	30	TCAAGTCAGGAGCTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRKKEAKQRWDDRHWSQKKLDEMTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQNRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	394351	387361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390433_390653_390806_391212_391456_392440_392619_393678_393825_394138
814906	contig_11720_pilon	+	1560	3	Intergenic	novelGene_44034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTGGCTTGGGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471585	473579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_472318_472673_472824_472901
814907	contig_2380_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_117893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGGGGCAGGGAGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184305	184703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_184300_184700
814908	contig_2380_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_117894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTTTGCAAGCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184913	186810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_184900_186800
814909	contig_9423_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_99185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78830	78157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_78200_78800
814911	contig_11493_pilon	+	2917	1	Intergenic	novelGene_143658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGATAAAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118679	121596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_118700_121600
814914	contig_4131_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_127896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGCAACCTACATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304818	306906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_304800_306900
814918	contig_10990_pilon	+	1308	2	Intergenic	novelGene_7409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	225	401	122426	122602	TRUE	30	GCTATGTGGTATAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWNFGTQRVSSGDVFWPKSFFLEPHESPGAAAIPPLRGDSEATGDSRSCTTAFFAKAQQSFSLTLPSLAPSGWVMELRYFLGQKFSVAVQYGLLAPRRVWRRTGPQSLLVPQLWEPSLLLSPGLWLAGLPGR	122201	123567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_123079_123136
814919	contig_10732_pilon	-	1209	2	Intergenic	novelGene_114758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1	600	574325	573109	FALSE	15	ATTCACGGTCTCCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSGTSPGLPGLPALQGWGGRLHPGHPELRGPHSQPQHGLRLLPHLCGQLPATALHPGCGDHRGLPAAPCVLSHSGGGKGSREGAPGPSRRSQTSPTRSASCLAPAGEPSAILGAPKCLVQKGASLLPTHSLLKGIF	574325	572499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573500_574116
814921	contig_19957_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_57750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATGTTATATTTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404916	406897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_404900_406900
814922	contig_18184_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_123858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAAGCTGAAAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43318	43755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_43300_43800
814924	contig_4900_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_159042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAGATGATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185610	183223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_183200_185600
814927	contig_11416_pilon	-	611	5	Intergenic	novelGene_145339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	436.448951768703	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	422	478	123185	123038	TRUE	10	AACGCCCGTGGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGSARLCPSHLFLSVSVSPPSLSRCVCVSPGPCLLQSLCLSLSLSPASLGPAFSLPPSPPARPGRGPRGEEGAAAEPALSRNRLGNQRPGRETAERVTSLGKDWHRPCLKCEKCGKTLTSGGHAEHEGKPYCNHPCYAAMFGPKGFGRGGAESHTFK	124177	122799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_123893
814929	contig_3942_pilon	-	389	5	Intergenic	novelGene_128773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCCTCGAAGAGAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795365	792292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_792322_793507_793623_793793_793885_795076_795177_795311
814931	contig_14522_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_147336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACAGCCAAGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157939	158809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_157900_158800
814933	contig_5454_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_145507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGTTGACATAACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575946	574583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_574600_575900
814934	contig_3817_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_78363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	71	442	602609	602238	NA	40	AGTGATTTAACTTGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEKLPNLLLYQPSEFLNDTQKQTKALKHKQAPLHCFRAPGRKQLHARLKNKDQLNGGNSGLENYNREKRLQTSNSLMFSTQLTVELFPWRGERRLSMEEKLDPLSGKLDCKPSSTTSCVVFR	602679	602235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_602200_602700
814935	contig_9653_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_48172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	3	419	137874	137458	NA	30	AGTGCCCAGCGGGAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKCSQNPQSLRLIFRGLIKLILTIFCRFSPFIEESISETTDSTIFSDNPFAWASASHTVRPPGLDVSPPSPHSGSDSQCQACLLCRCPIHVAWTNSPCHATSPTVSPTCRHLPYPKLGPSNPHRTASTGECSLTLIRL	137876	136317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_136300_137900
814936	contig_5217_pilon	-	1174	9	Intergenic	novelGene_135721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	39.5029666607459	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	133	1110	297658	295104	FALSE	30	CAGAGTTGGAATCTAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSCEQPGGKQQTTFPFGACGRQAATYQPLRRFPLDAAIIFSDILVVPQALGMEVTMVPGKGPSFPEPLREEQDLEHLRDPAAAASELAYVFQAITLTRQRLDGRVPLIGFAGAPWTLMTYMIEGGSSSTMAKAKRWLYQRPQASHRLLRILTDTLVPYLVGQVAAGAQALQLFESHAGHLGPQLFTKFALPYICDVAKRVKVGLQEAGLAPVPMIIFAKDGHFALEELAQAGYEVVGLDWTLAPQKARERVGKTVTLQGNLDPCALYASEEEIRQLVQQMLNDFGPQRYIANLGHGLYPDMDPEHVGAFVDAVHRHSRLLQQN	298393	295039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_295266_295596_295664_295759_295861_296020_296159_296511_296674_296793_296992_297229_297293_297571_297733_298335
814938	contig_3866_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_112444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAATACAGCAGCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298176	298622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_298200_298600
814939	contig_2438_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_111996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACTAGAGGAAAACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181359	180692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_180700_181400
814940	contig_10749_pilon	+	345	5	Intergenic	novelGene_133418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_4	26.9293055981769	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTTCCACACCAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21842	87050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_21876_42202_42272_78597_78695_82960_83080_87023
814942	contig_15182_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_136457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510930	512887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_510900_512900
814943	contig_11851_pilon	+	1678	2	Intergenic	novelGene_146548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	219	401	21555	21737	FALSE	25	CAGTAGCATTTCTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLFPYIKENIKEYLQTHWEEEECQQDVSLLRKQAEEDSHLDGAVPIPAASGNGEDDLQQAIQAVVDNVCWQMSLDRKTTALKQLQGHMWKAAFTAGCMKAEYVAVQVTLNIFPAPNPNTLFTSPLSHVYIA	20252	23014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_20357_21440
814944	contig_17936_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_29950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATATCAGTTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60946	61713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_60900_61700
814945	contig_9415_pilon	-	493	4	Intergenic	novelGene_109932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_3	20.0720922897661	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	75	419	493	2337679	2337605	FALSE	30	GGAGTTGAGTTTAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKVEDFYDIGEELGSGQFAIVKKCREKSTGLEYAAKFIKKRQSLASRRGVRREEIEREVSILRQVLHPNVITLHDVYENRTDVVLILELVSGGELFDFLAQKESLSEEEATSFIKQILEGVNYLHTKKIAHFDLKPENIMLLDKNIPIPHIKLIDFGLAHEIED	2427916	2337604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2337692_2352329_2352469_2359975_2360198_2427871
814946	contig_9415_pilon	-	1468	8	Intergenic	novelGene_109929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	12.5908940208747	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	140	625	2329039	2305546	FALSE	5	CCTGATGCTTGGCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPHIKLIDFGLAHEIEDGVEFKSIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANITAVSYHFDEEFFSQTSELAKDFIRKLLVKETRKRLTIQEALRHAWITPVDNQQAMVRRESVINLENFKKQYVRRRWKLSFSIVSLCNHLTRTLMKKVHLRPDEHLRNCESDTEEDIAKRKALRPRRRSSTS	2337656	2304702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2305627_2308622_2308707_2308819_2308910_2323052_2323099_2324497_2324651_2328223_2328251_2329034_2329084_2337561
814947	contig_8554_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_160281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATGGTGTGATATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65791	66782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_65800_66800
814948	contig_960_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_108206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1461	1799	260077	260415	NA	25	TACTAGGCTGTGAGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHALKERDKRKSLLFPPCFPANGFSDSSNPMAALGPHSSATSTTKAFASPAIISPSSEFTKHLIWTFITVLTNFYKGALVAQWLSTWLLTERLEVRTISHSKGERCGSLLP	258616	260564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_258600_260600
814949	contig_18208_pilon	-	313	2	Intergenic	novelGene_176177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	8	4759	junction_1	0	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGTGTCTTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154831	154372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713
814950	SIRV4	-	562	3	ISM	SIRV4A	SIRV404	592	4	800	0	114	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13823	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672
814955	contig_12050_pilon	+	1169	6	Intergenic	novelGene_62645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	192.004791606876	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	202	978	359783	363762	FALSE	15	TCTTCAGACTTTGCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSCSLSKWPRLWETSAPGGSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMLSLCSPATGATDPSEQSTPEPVSLARDPGRPVPPLTPCVPLEPGAWALQTIYFPLSPALPVTSHPWEQPLGGREAGIGWLWREVRRRLRAGPHSEPCPRWGSLDSVELGWISSPFPC	359581	363953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362686_362766_362817_363410
814957	contig_13901_pilon	+	1634	6	Intergenic	novelGene_146622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	92	junction_5	178.931718820337	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	614	1402	64511	105111	FALSE	40	CTTATAATGCCACAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFPNILPPAGDGGLTSSQSEFQKMLIDERLRCEHHKTNYQTLKAEHTRLQDEYIKSQNELKRLLNEKQTHQEKFQLLLEELREELVEKTKDLEEMKLQVLTPQKLELLRAQIQQELETPMRERFRNLDEEVEKYRAEYNKLRYEHTFLKSEFEHQKEEFGRILEEGKIKYESEIARLEKDKEEVHNQLLSVDPTRDSKRVEQLVREKIHLCQKLKGLEAEVTELRAEKENSGAQVESVQRIQVRQLAEMQATVRSLEVRF	2215	105343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2704_64385_64660_65112_65264_90152_90246_93293_93426_104847
814959	contig_1082_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_170424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGCACATGACTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31642	31196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_31200_31600
814960	contig_1082_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_170423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTAGCTGTAAAGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30491	29790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_29800_30500
814962	contig_16411_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_77326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCACAGTGATTAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157482	156711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_156700_157500
814963	contig_8651_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_168179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTTGCTGATTAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177174	175747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_175700_177200
814964	contig_1301_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_47377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCCAAGGCAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679709	681055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_679700_681100
814965	contig_10235_pilon	-	853	6	Intergenic	novelGene_46269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	471.415909786677	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	141	662	20866	14151	FALSE	20	AACAGTGTGCGTCTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLIAQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	21006	13959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15144_19673_19752_20850
814966	contig_11978_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_62969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACGAGTCAGCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319860	1321124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1319900_1321100
814970	contig_15752_pilon	-	1569	2	Intergenic	novelGene_148775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	871	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGAATGAATGTGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333533	331342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_332536_333157
814973	contig_7775_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_37487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188698	188981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_188700_189000
814975	contig_10765_pilon	-	2089	5	Intergenic	novelGene_122907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	11.7473401244707	63	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	386	1138	127221	121731	FALSE	20	GTTTGTTTGCTTTCATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYQQLPASDEIRFQVYQPREPLHFNRLLDPDFHPPCSEVDLIGFVVSVVKKTGFAPVVYLSNECRDLLAVKFWSDLNEDIVKPPVLIAASNLQWRPLSGSGIPTLFAGDVSTFSASPKESHFQEAFSKMKNAIENIDVFCNDAENKLMHILNANDPKWSTPNKDCLSELHAAQAVLSADSKFLPEGKAPSTPVSAQKTLKSWCKGEKESDDHRAARKRRALDLLSRLPLPPPVSPVCTFVSPAAQKAFQPPRSCGTKYKTPIKKKELTSPQLTPRKKVSESSLLESDSIADEELALIDTQALLSGSAGESPLTPIGGPTRTAATRSEGQPGLQTLYGASVVREREDPPAGAEEGGTPVQETSVTQSTPTRLHRRPKRT	138698	120779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_122319_124923_125071_127203_127449_138443_138583_138679
814978	contig_7996_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_165157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATTGAAGTAAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257144	256802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_256800_257100
814979	contig_10042_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_79218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAGAAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084433	1085855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1084400_1085900
814980	contig_8254_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_48390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCCATATTTGCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100001	97392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_97400_1e+05
814981	contig_8624_pilon	-	2510	9	Intergenic	novelGene_112579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_8	94.3076746611854	89	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	210	746	1186213	1179179	TRUE	5	TGTATTTGTTTGGCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAFIQQSQQQPPPAAQATTALTAVVLSSSVQRTAGKTAATVTSALQPPVISLTQPTQVIQQPQKPGTLMRPPQVTLTQTPMVALRQPHNRIMLTTPQQIQLNPLQPVPVVKPAVLPGTKALSTISAQAAATQKNKLKEPGGGSFRDDDDINDVASMAGVNLSEESARILATNSELVGTLTRSCKDETFLLPAPLQRRILEIGKKTRHHGVASRRSKLRVTRHAAEAAESCGENIRDGAAEELLLQG	1188147	1154427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1155894_1177304_1177425_1177911_1177969_1179057_1179184_1180130_1180263_1180627_1180798_1185755_1185871_1186098_1186247_1187971
814982	contig_4538_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_153080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCCCTGCCCAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107804	107603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_107600_107800
814983	contig_12786_pilon	-	1341	9	Intergenic	novelGene_103409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	752.660271553508	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	432	1280	604678	590909	FALSE	15	ATCTCCTTTTGTATGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	629461	590847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604693_614016_614079_628740_628938_629303
814984	contig_7106_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_148318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCATGTCAATAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537139	538769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_537100_538800
814985	contig_9415_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_109719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAAAAAAGAAGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446499	446193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_446200_446500
814986	contig_15732_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_88898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246880	248376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_246900_248400
814989	scaffold_19766_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_34469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAGAGAAGAGAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928280	925862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_926034_927869
814990	contig_12654_pilon	+	1049	3	Intergenic	novelGene_129274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	93	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGAAATAAATGCTTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650918	655004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_651238_652960_653031_654344
814992	contig_3465_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_173393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	105	437	754781	755113	NA	50	TCTTAGGAAATGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVFPVSLSLSEQFYSGHRSPHIPYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGGGLPPSPLPRHPSGCRADLFPMNGIQQASVHSVFWMLQVTNCILFD	754676	756695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_754700_756700
814993	contig_12922_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_157780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGATCACCTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75718	77119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_75700_77100
814994	contig_12922_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_157781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCCTGGAATTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79651	80359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_79700_80400
814996	contig_16578_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_148655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAAAAAAGTCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196530	197809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_196500_197800
815000	contig_13300_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_125791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	204	542	157718	157380	NA	15	CTCAGCTGAAGGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALHGTHLECLRLREYPELLAGGKVQKSGFHSEYSYNTAYTQAPSDYRYHSYRSFQTPQHPSFLFHNMFLSWSLSYLPTVQSCWNYGFSCSSDEVPALGLTRSGYPDPAIGYENKALMLCSGSFVAAVTDFRGQKTPIPNTLSTNGSSNASLFSCPTGSFSSFYAVIRPFYLTNSSGVY	157921	157350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_157400_157900
815004	contig_3878_pilon	-	2849	1	Intergenic	novelGene_174800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGCTCCACTTGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584990	582141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_582100_585000
815008	contig_10749_pilon	-	754	6	Intergenic	novelGene_133453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	853.45195529684	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	74	403	145217	136250	FALSE	10	GGACTGGAGCTTTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSPPKGVTIPYRPKPSSSPSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	149677	135898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145230_149616
815010	contig_8538_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_4742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	72	305	842828	843061	NA	25	AAATAGTGTTGTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842756	843128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
815011	contig_8122_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_40237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCATTAAACAGTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688549	688807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_688500_688800
815012	contig_11370_pilon	+	644	3	Intergenic	novelGene_98742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2677	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAAAGTGCTGTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146813	148542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_146928_147422_147616_148205
815014	SIRV6	-	394	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-297	37	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTTTGTCCAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117	1507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844
815015	SIRV6	-	480	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	30	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1183_1466_1736_1846
815017	contig_5954_pilon	-	984	2	Intergenic	novelGene_28794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	135	506	1415148	1414777	FALSE	35	ATTAAGATTTAAGTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKEYSLHYGLHPNIKKTKTLTTGLISHIMMNREKIEIVRDFILLGSTISAMEAAVKKANDVLHWANLLQSVRKQGCHLRNKVCLTQAMVFSVNSCACKSWTMNKEDRRRINAFELCCCEEY	1431105	1414298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1415162_1430984
815018	contig_14326_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_120744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCATCACTAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493224	491960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_492000_493200
815020	contig_19680_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_132018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCACTCCCAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210328	209497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_209500_210300
815021	contig_15828_pilon	+	1400	3	Intergenic	novelGene_173245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	4.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGATTATATACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35785	39433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15828_pilon_+_36233_38226_38365_38618
815022	contig_7057_pilon	-	919	3	Intergenic	novelGene_123304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGATTTCTGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935890	930503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_930942_932962_933079_935525
815023	contig_15120_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_108035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAGAGAGGCCTAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659528	657945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_657900_659500
815024	SIRV6	+	307	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	581	171	402	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
815025	contig_1443_pilon	-	1728	10	Intergenic	novelGene_28352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_9	212.667189132065	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	78	1328	937429	910530	FALSE	20	TCCCCCAGCCCTAGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRERVVEPGPRVILGTRGGAASGAMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEVCIDS	937506	910129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913985_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
815028	contig_12761_pilon	+	1745	1	Intergenic	novelGene_164045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1150	1536	51645	52031	NA	30	AACGGCAACAGGTCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRFSCVIRGHSKSELTQWHRMTTIPTSDSVITDILQMMKPRPTERMSFAQSHRAWGRGPRLSGKSASSFCNHWGLSRAGLGWKGDGVRELGWEGTVGKESQPEKTETAGPGDPRVSELPETGTDTAG	50495	52240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_50500_52200
815029	contig_3654_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_174995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTGGTTTAAAACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554254	556251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_+_554300_556300
815030	contig_4923_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_109325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296888	298887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_+_296900_298900
815031	contig_6628_pilon	+	1320	10	Intergenic	novelGene_170611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	38.6407959430329	368	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	459	1181	252329	257143	FALSE	20	GGTACTGTGTACAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNAKQPEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGVGRAAGRGVPAGVPIPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAVAATASIAGAPTQYPPGRGTPPPPVGRATPPPGIMAPPPGMRPPMGPPIGLPPARGTPIGMPPPGMRPPPPGIRGPPPPGMRPPRP	213261	257282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_+_213344_221655_221752_223823_223965_252189_252332_253161_253314_255219_255332_255785_255939_256388_256528_256864_256991_257105
815032	contig_9988_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_113058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGTACTAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117065	115319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_115300_117100
815034	contig_5744_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_149335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTAATCGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626066	626621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_626100_626600
815035	contig_10711_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_118431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACAAGCCCACTTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756904	757914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_756900_757900
815036	contig_2799_pilon	+	2191	2	Intergenic	novelGene_85562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGCACTATTTGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726722	730855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_728121_730062
815037	contig_10437_pilon	+	1628	12	Intergenic	novelGene_38411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	859	1176	784355	786461	TRUE	25	CCTGAGACGGAGCCCGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIGQAHHVGVANEPWLQGQLGLDAGLQFSGFPRLLDGVIHEGGSLGGLNGVADWKALWLGGRRRLCLSCRGADEAQLFLPLLDLPCCCLHHLFDLKLSEHAGAL	779111	792961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_779208_779380_779472_780252_780400_781788_781865_782612_782779_783422_783687_784336_784558_784802_784885_786428_786581_788626_788752_789435_789625_792942
815041	contig_3745_pilon	+	1270	3	Intergenic	novelGene_85064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	83	junction_1	125.5	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	141	626	363058	369359	FALSE	15	AAACTCCTCCTTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGQQRARGPGHSHSLCCTLRRWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGYRMERPDNCSEEMYSLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRTLPSTWIENKLYGRISHAFTRF	362917	370003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_363264_364271_364372_369179
815042	contig_6785_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_132584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCTTTCATATAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552638	551049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_551000_552600
815045	SIRV6	+	196	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-380	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1905	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
815047	SIRV6	+	454	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	402	0	229	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
815048	contig_19405_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_176207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTAAGATTAGTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79211	77507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_-_77500_79200
815049	contig_10437_pilon	-	1183	2	Intergenic	novelGene_38120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	112	666	80783	80229	FALSE	45	CAAAAACATGAACAGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGPHLGASPFCQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82857	79711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80788_82750
815050	contig_5231_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_65886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAATACTAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130790	131428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_130800_131400
815051	contig_12079_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_67365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAAAGAATGGAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287051	287495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_287100_287500
815052	contig_8729_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_40149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCACAATCATTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694266	693873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_693900_694300
815053	SIRV2	-	297	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4571	39	3396	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTCGCTCTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336	1039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
815054	contig_9828_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_172259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTATTATTTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242614	241460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_241500_242600
815055	contig_5765_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_141417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	343	798	883866	883411	NA	80	AATAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTSGGWAPFFVVLFSGSGSSSWGLRKLDTTSLTSGCEVTGGHSAVGSCMGLWENKQDREKVDEWLHETHSQLKHIPLSRIDCIIFIIRACSQHEQPRVQQCRSRTKSARGPYLQPPPHARVSCLFILFSVLHLSFLLQWPEGCYSDPVRL	884208	882574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_882600_884200
815056	contig_14142_pilon	-	1245	5	Intergenic	novelGene_120572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	34.7994252826106	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	25	711	479825	477881	FALSE	30	TCGGAAAGCAAGTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPDAGEKMGLSIFALLTLTVFLLLLADKVPETSLSVPIIIKYLMFTMVLVTFSVILSVIVLNLHHRSPYTHQMPLWVRQIFIHKLPRYLGLKRPKPERDHMPEPPPLALKDSPGSGWGRGTDEYFIRKPPSDFLFPKLNRFQPELTAPDLRRFIDGPNRAVGLPPELREVVSSISYIARQLQEQEDHDALKEDWQFVAMVVDRLFLWTFIIFTSVGTLVIFLDATYHVPPPDPFP	485063	477346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_478022_478506_478655_479019_479202_479609_479834_485047
815057	contig_10324_pilon	+	808	9	Intergenic	novelGene_7706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	906.767576339163	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	50	808	51839	80763	FALSE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKDPRGRIPSPGSPVSCACPSPHSHPPIQPAHPPRVIAFQPLIKCLLY	51789	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_80624
815059	contig_5260_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_144411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAAGCTCTATTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483126	484233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_483100_484200
815060	contig_5467_pilon	-	602	3	Intergenic	novelGene_111953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	989	junction_2	411	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	90	518	88969	88200	FALSE	5	CTGTCTCTTGCTAGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RACEGFTAQPTAGSTPASHLRPAQVSEDEMVSSLKLLVSEQLNVPVRQQRLLFKGKALADGKRLSDYSIGPNSKLNLVVKPLEKVLLEQGTARRQAETQSRPLAPPSETWQVIAKVLGRHFSAADANRVQEQLQREYERSLSRLTMDDIERLASRFLNPEVIEATEKGLSK	89058	88115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_88311_88417_88645_88878
815061	contig_18518_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_176105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTACTAACTGTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56446	57337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18518_pilon_+_56400_57300
815063	contig_11250_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_127163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTAGTGATTTTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221978	222585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_222000_222600
815064	contig_11250_pilon	+	1891	2	Intergenic	novelGene_127164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	246	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCGTCACTTTTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222535	225540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_223199_224312
815066	contig_10399_pilon	-	605	2	Intergenic	novelGene_114490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	0	1491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	57	359	349751	347187	FALSE	10	TTGTGTGATGTCTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLGEYVGRDGQRQRLQVSCEALGDADPFQGLLLGLAEMRERVAELLGALVQREAQDPVAVAGEEAMNGDDEDGAEDENNIDNRTNSDGPSAKRPKPPS	349807	346940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_347282_349543
815067	contig_15760_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_131056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGCCTGGTGATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40372	41254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_40400_41300
815068	contig_5954_pilon	+	682	3	Intergenic	novelGene_28566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	331	junction_1	7.5	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	14	304	862040	862416	TRUE	40	CAAAACCAAAAGCGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSDMKLLTHNLLTSHVRGGGAPRLPPAAPGHRGPHQPCGVQPRVRGKDDTQGGVGGASGGGRYRKDSPLAGAHPGGGLTAPPGTKIRPEGKGRGCPDMT	862026	862875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862119_862204_862522_862602
815071	contig_6710_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_96006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
815074	contig_13456_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_153256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACTGTAAGTTCATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765	1910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_800_1900
815075	contig_17158_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_141143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCCACCGCCCCCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112464	113458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_112500_113500
815076	contig_10494_pilon	-	1272	4	Intergenic	novelGene_102193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	24.0970260959038	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	505	837	1058822	1056860	TRUE	25	AAGTACCAGCTGCTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGEGPA	1059326	1056299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056846_1056956_1057167_1057302_1058719
815077	contig_15029_pilon	-	2523	3	Intergenic	novelGene_128201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	3	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	193	405	219128	218916	FALSE	30	AATACTATTTCAGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVVGLFKSSSFQIAKSTAESLKTTYPSKFEDPIVVPLQEFAWDQYLQEKKRELNGETWEYSSYVMCFVNDRLLGDALELQKWAHRVWDILDVKPIALYEALTLDYSSKFLRETKASYSDFFFFLMVGSLIIYSD	229684	216797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_219168_226520_226617_229627
815078	contig_2069_pilon	-	684	3	Intergenic	novelGene_23534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	470	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	179	313	1509011	1508747	FALSE	15	CATTCCATTGGCATTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGVVSWPCCCRYRCLSVCRSFRPPAIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509883	1508375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509804
815079	contig_9272_pilon	+	974	5	Intergenic	novelGene_125940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	40.4683518320181	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	163	633	422182	432083	FALSE	25	CAGTATTATCCTCCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGRPRRLKAGAGVWSRDGFLSRSRRGGGCSRRREVLDALACCRFTLQPYLSSKMNYMPGTASLIEDIDILHFQLPADFLPRCPDSTSESQTEKHLVLLRDGRTLIGFLRSIDQFANLVLHQTVERIHVGKKYGDIPRGIFVVRGENVVLLGEIDLEKESDTPLQQVSIEEILEEQRVEQQTKLEAEKLKVQALKDRGLSIPRADTLDEY	422019	432424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_422228_424497_424567_426318_426388_427642_427759_431912
815080	contig_15039_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_110197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTCCGGCTTTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395932	395060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_395100_395900
815083	contig_3956_pilon	-	1282	4	Intergenic	novelGene_14764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	13.5236418500672	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	68	385	852076	847715	FALSE	20	CTTTTGCCTACAGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASRCRRCCRRRLPRLGPPAASMPHAFKPGDLVFAKMKGYPHWPARIDDIADGAVKPPPNKYPIFFFGTHETAFLGPKDLFPYDKCKDKYGKPNKRKGFNEGLWEIENNPHASYSAPPTLRVHDLEK	852143	846817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_847745_849404_849544_849638_849716_852004
815084	contig_12250_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_80569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	715	1029	304091	304405	NA	70	TGCAAAGAAAAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPRPLEAGASQTLEATVTLGRPSLWHLEVGLSSGPGAMGLDSDEQGHCPKAGAPCRVAPQGLKWGGPCTWGGSRSSLAVGGLINFFHEAALLSICQSMKGQGV	303376	304968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_303400_305000
815088	contig_13992_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_147639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479307	481557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_479300_481600
815089	contig_6275_pilon	-	2071	10	Intergenic	novelGene_142467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	139.377983276493	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	137	1876	182628	142601	FALSE	5	TGTTTTGCATTGTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLCDICGETVASEPDMKTHLLIVHMENEVICPFCKLSGVNYDEMCFHIETAHFEQNELERNFERINTMQYGTSDSKKDNTLQHRMEVNSNLQSACASNHPKSSAQSLPEDGTLKHKAFCSENLTESRKLLKSREKQFDLTKIKGPIYETMYSPPECPFCGKIEVCSQDMETHVKTKHANLLDTPLEDHDQPLYDCPMCGLICSNYHILQEHVDLHLEESSFGQGMDRVQCSRDLELAHQLQQEEDRKRRSEESRQELEEFQKLQRQYGLDNSGGYKQQQLRNMEIEVNRGRMHPSEFHRRKAEMMESLAVGIDDGKTKSSGIIEALHRYYQNAATDVRHVWLSAGVDHFHSSLGDKGWGCGYRNFQMLLSSLLQNDAYDDCLKGMSVPCIPKIQSMIEDAWKEGFDPQGASQLNNRLQGTKAWIGACEVYTLLTSLRVKCHIVDFHKSTGPLGTHPRLFEWILNYYSSEREGSPKVVCTSKPPVYLQHQGHSRTIVGIEERKNRTLCLLIFDPGCPSREMQKLLKQDIEANSLKQLRKFVGNLKHKQYQIVAVKGVLSQEEKVARRQASQVFTAEKIP	185049	142405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_142649_149840_150062_151081_151234_157915_158082_158370_158560_160689_160859_165857_165980_171255_171367_182066_182643_184927
815090	contig_3602_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_60561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTCCTTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500606	500038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_5e+05_500600
815092	contig_7887_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_124871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTCACAGATCCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198110	196859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_196900_198100
815094	contig_8452_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_48050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCAACTTCTTAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428938	427658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_427700_428900
815097	contig_14682_pilon	+	2466	2	Intergenic	novelGene_139092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	41	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	775	1986	22513	23724	FALSE	55	GAAAAGCAAGCTAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSFTMLLALWLVCGSEPHLHATKRGNQGRRKLPLVSQVGSRPVQFLRRAGRSQGIERSTLKEPSLQPIQRRRSVPVLGLAHSTVLPVPVGINGALVRPEQKPTARRSPREMARDEGSFARTRMLRFPSGSSSPNILASFAGKNRVWVISAPHASEGYYRLMISLLKDDVYCELAERHIHQIVLFHQAGEEGGKVRRITSEGRVLEQPLDPSLIPKLMSFLKLEKGKFSMVLLKKTLQVEERYPYPVRLEAMYEIIDQGPIRRIEKIRQKGFVQKCKASGVEGQVVEEGISGGGGAGRPSLDTEKRKEDLRRAQVPPTRESRVKVMRKLATTTAAPSPPPPTPRATTPPLAPATTVSRATSQMVTAAARPTTTTAFPTTQRPWTTWMHASSHSHRPPPPRLR	21324	24204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_22076_22489
815098	contig_9345_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_24340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	314	945	330	1274	139909	140853	NA	15	CACTGAGTGGTCATTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEAPSGGHMQTLIFLDLEATGLPFSQPKVTELCMLAIHRCALENSPSPQGPPPTVPRLPRVVDKLSLCVAPGKACSPSASDITGLSTAALAAHGRQRFNADLANLLRAFLQRQPQPWCLMAHNGDRYDFPLLQAELAALGLASALDRAFCVDSITALKALECASSPSERGLRKSYSLGSIYTRLYGQAPPDSHTAEGDVLALVSICQWRPQALLQWVDVHARPFSTVTPMYRVEASTRTNPGPSAPTATAALVTARDTSPNLVGGRRPKSPLCMEGPGAPSREGLLAPLGLLAFLTLAVATLYGLSLATPQP	139579	140889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_139600_140900
815099	contig_10855_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_124383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCGTCTAGGGGAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798733	799863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_798700_799900
815101	contig_253_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_129625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCACCGTCCATTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139724	138832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_138800_139700
815102	contig_12046_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_83468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCCACTCCTTCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287491	288385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_287500_288400
815103	contig_20739_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_83181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTATCTTCAAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145561	143289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_143485_143630
815104	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
815105	contig_6589_pilon	-	1704	11	Intergenic	novelGene_25885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	10.356157588604	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	21	1358	1155176	1136678	FALSE	10	CCTCTGATTTCCGGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALGQPQTWARKLLPVPWLLCGSRRCVSSSFKATDLHLEMTQEPHKKPNPSEPLVFGSTFTDHMLMVEWTREKGWGHPQIKPFQNLTLHPACSGLHYSLQLFEGMKAFKGQDQRVRLFRPWLNMDRMLRSAQRLCLPSFDKVELLECIRRLIEVDKDWVPEDPGTSLYVRPVLIGNEPSLGVGLSTQALLFVILCPVGSYFPGDAVTPVSLLADPTFVRAWMGGVGDCKLGGNYGPTVFVQQEAKKRGCQQVLWLYGPDHQLTEVGTMNIFVYWTHEDGVLELVTPPLDGVILPGVLRQSVLDLAQSWDEFRVAQRKVTMKELLRALAEGRVREVFGSGTACQVCPVHKILYQGKQLHIPTMENGPELILRFQKELKAIQFAVAGHSPAGGRPCGTIGETLWPVHQPSSFCIARRIPVCWGSKQPIDTPSHSLLSVIAQSSS	1155196	1136331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1136867_1139613_1139689_1139764_1139906_1140120_1140207_1140397_1140541_1141879_1142044_1142286_1142407_1142496_1142608_1149994_1150199_1150524_1150606_1155152
815106	contig_14925_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_55366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTAAGAAGTCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124479	123685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_123700_124500
815107	contig_11720_pilon	-	1884	12	Intergenic	novelGene_44033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCCTTCTCTGTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473553	459320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_459351_459453_459597_460227_460382_462056_462203_469112_469286_470612_470769_471086_471205_471439_471611_472178_472316_472668_472823_472899_473049_473200
815108	contig_11872_pilon	+	2233	5	Intergenic	novelGene_143150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	80.9394063482059	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	120	503	62398	68671	TRUE	15	CATTCGGCCCAGCAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTGTADGRVVKLENGEVETIARFGAGPCKTRDDEPACGRPLGVRAGPNGTLFVADAYKGLFEVNPWKREVKMLLSSETPIEGKKISFVNDLTITRDGRKIYFTDSSSKWQRRDYLLLIMEGTDDGR	60113	70789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_+_60228_62392_62486_64364_64482_68492_70330_70717
815109	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	17	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815110	contig_14158_pilon	+	1000	4	Intergenic	novelGene_136123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	133.878883904653	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTTGAATTTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17987	26238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_18088_21118_21273_25330_26007_26168
815113	contig_7695_pilon	+	1055	8	Intergenic	novelGene_41620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	53.93571381274	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	637	978	672579	673393	FALSE	15	TAATTTCTCTGACCCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLALLLGLYLATVRSELSTFHLLAYSGYKYVGMILSVLTGLLFGSDGYYVALAWTSTALMYFIVRSLRTAALSPDSIAGPAPRQRLQLYLTLGAAAFQPLIIYWLTFHLVR	669420	673470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_669597_670224_670437_670630_670736_670918_670949_672358_672417_672523_672680_673069_673164_673246
815114	contig_2770_pilon	-	2137	1	Intergenic	novelGene_107403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCATAAGAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106094	103957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_104000_106100
815115	contig_11968_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_172507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33762	33132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_-_33100_33800
815117	SIRV6	+	411	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	41	7	41	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAGAAAGTAAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
815118	contig_13481_pilon	+	2013	5	Intergenic	novelGene_119444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	73.9539552694783	47	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATCCTCTCAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066915	1093301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071054_1071222_1083899_1083990_1084549_1084701_1091839
815119	contig_19155_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_173370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATGAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616657	615671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_-_615700_616700
815120	contig_8195_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_170054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCTGTGTATAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274254	276255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_274300_276300
815121	contig_7512_pilon	-	1050	4	Intergenic	novelGene_153189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	64.9991452935259	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	102	329	109148	108364	TRUE	15	CTTCGAGAGTGCCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSQLVLALEAARWPDSVRVLVAVSWQCLTRVAFMLQPGEASEVAGGTEPAAGGQEPRETAASETASSSLPAVVVETISATVNGAVEGGSGAGRLDLPPGIHVQGTGPA	109249	105712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108809_109049
815123	contig_14640_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_168045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAACAAACATCTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327023	325482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_325500_327000
815124	SIRV4	-	494	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	21	102	21	-102	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	342	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACTAACCAGCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5137	3739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815125	contig_5997_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_168610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATATATGTTGATTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254345	253210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_253200_254300
815126	contig_3975_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_54680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAACTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045899	1045562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1045600_1045900
815128	contig_935_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_45578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAGGCAGCAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616411	615608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_615600_616400
815129	contig_935_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_45577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTAATGGCATTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615652	615200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_615200_615700
815130	contig_935_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_45576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCGGAGCAGGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614894	614253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_614300_614900
815131	contig_6871_pilon	-	503	5	Intergenic	novelGene_21619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	145	297	534257	523388	TRUE	15	GTAGCGGCGAGCTTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQLLLPGSWDAGLQPLPKPLCRGCGAAQQPVEGAEKGSAQPDALLGFAMTAQLVTKHVHDVQQCLDTKVPGKVIKLTDSCEDRGVGHHLGTDGVLQVG	534401	523097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_523247_523330_523417_533467_533509_533821_533896_534248
815132	contig_6397_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_146270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511349	512527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_511300_512500
815133	contig_990_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_76170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTGCACAAACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1920898	1920248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1920200_1920900
815137	contig_2278_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_118102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTATTACCAGGGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743468	741397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_741400_743500
815138	contig_6442_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_166478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACATTACATATATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141430	140975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_-_141000_141400
815139	contig_10235_pilon	-	1600	6	Intergenic	novelGene_46559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	22.8683186963974	202	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	220	1065	431644	430322	TRUE	15	TTCTAAGTGGTTCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRFRVGIGRTRA	432059	429592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_429796_429878_429974_430084_430576_430660_430897_431288_431651_431846
815140	contig_1406_pilon	-	2243	1	Intergenic	novelGene_25674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3096835	3094592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_3094600_3096800
815143	contig_9053_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_87963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAGTCAAACACAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357663	358247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_357700_358200
815145	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1152	8	1152	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4006	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
815146	contig_2069_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_23347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	394	879	775415	775900	NA	30	TAATAGAGTCGAGGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPSDGLVTHGRATPASSVTWPATPTCPHSELWAEGSLSCSGWSWGALDSEVTNAELPTLCSCWCRRLFRGCCQGRGCQGAPERPTFLFCLFTPPCVILFAQRALLFFKHFYTSVLPELSPLTHSSCSRELPAPHLCLCVQHPPPRSVLCLMDSQLWPKWF	775021	776459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_775000_776500
815147	contig_5255_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_171552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14084	15752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_14100_15800
815149	contig_9177_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_32747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156259	1155630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1155600_1156300
815150	contig_14288_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_153806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAGAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147301	146123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_146100_147300
815151	contig_19769_pilon	+	996	3	Intergenic	novelGene_102334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5	91	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAATGGAGTTGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93159	98022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_93218_96599_96730_97214
815152	contig_1996_pilon	+	1366	12	Intergenic	novelGene_131915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_2	146.158354064384	303	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	270	1091	368903	370754	FALSE	10	GAGTGACTCCCTTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVEKRLAVGALTERAGLLLHVANLATILCLPAAVACLVESITPVGAVLALSVYTVLFLKLFSYRDVNLWCRELRAAAKAGERRPGAGARMAKPSPRALLGASADKANGAAAQRWVSYPDNLTYGDLYYFLFAPTLCYELNFPRSPRIRKRFLLRRLLEMLFFTQLQVGLIQQWMVPTIQNSMKPFKDMDYSRIIERLLKLAVPNHFIWLIFFYWLFHSCLNAVAELLRFGDREFYRDWWNSESVSYFWQNWNIPVHKWCQRHFYKPMLRRGASRWMARTGVFLASAFFHEYLVSIPLRMFRLWAFTGMMAQIPLAWITSRFLQGNYGNAAVWLTLIIGQPVAVLMYVHDYYVLHHEAATTGP	368277	371029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_368304_368463_368570_368765_369009_369261_369366_369454_369494_369580_369623_369702_369748_369816_369930_370031_370098_370269_370358_370452_370516_370598
815153	contig_6958_pilon	+	1764	5	Intergenic	novelGene_70024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_4	74.7127833774114	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	151	861	814206	832328	FALSE	75	CAAAAAAAAAAAAAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKTVLFQQERDQVMLALKQKQMENSALQNEVQHLRDKELRLNQELERLRNHLLESEDSYTREALAAEDREAKLRKKVTALEEKLVSSSNAMENASHQASVQVESLQEQLNVVSRQRDETALQLSVSQEQVKQYALSLANLQMVLEHFQQEEKAMYSAELEKQKQLVAEWKKKAENVEGKLISLQERLDEANAALDSASRLTEQLDLKEEQIEELKKHSRFFLFSVRLVLESNVH	814055	833231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_814302_814837_815032_817770_817935_820207_820312_832175
815157	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815158	contig_9434_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_150521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGAAGGTCAGGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474479	473838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_473800_474500
815159	contig_13607_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_170186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1434	1883	237175	237624	NA	10	CCTTTTCCACCAGTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGWSWLPPGCQLQCLLMKPLMGPACSEWMCAKGVQTLFPALPLASWIRACTALHPNSWPLSLLPSCFLHPSSTPPDLSTAIKFLAALHSPQGAAQTPGQRLPSPPTPAPHGRSTGLSTLCILTCLNLIMLFFIVVNMNVANCLPFQHS	235741	238057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_235700_238100
815162	contig_13699_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_158340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150898	148330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_148300_150900
815164	SIRV6	+	418	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	113	0	-74	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	60	299	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2398	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
815165	contig_11931_pilon	-	2228	5	Intergenic	novelGene_159903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.49106001094224	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	28	870	183380	179667	FALSE	15	ATCGATAGCTTGCCTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSSYKVGTMSEKFDCHYCRDPLQGKKYVQKDGHYCCLRCFDKFCANTCAECHKPIGADSKELHYKNRYWHDTCFHCYKCHHPLANETFVAKDNKILCNKCTTREDSPKCKGCFKPIVAGDQNVEYKGTIWHKDCFTCSHCSQVIGTGSFFPKGENFYCVTCHEAKFAKHCVKCNKAITSGGITYQDQPWHADCFVCVTCSKKLAGQRFTAVEDQYYCVDCYKNFVAKKCAGCKNPITGFGKGSSVVAYEGQSWHDYCFHCKKCSVNLANKRFVFHEEQVYCPDCAKKL	183407	178308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_-_179822_180990_181178_181689_181860_182540_182716_183224
815166	contig_6847_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_143902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAATATCCGATTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246752	245839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_245800_246800
815167	contig_5780_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_29797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	732	1124	112782	113174	NA	25	AAGGAGTTTTGCATGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMHHVHIPDGSWLDLLEPGSACRSQGPEDWCLWAQQGEREAASSRFGLCSPRSHGRTRVLLISFGAVVWFMRSDLMLDIPGNPVKELFPLQAFTESSFLLWLAPLNLVWPSFQTCQRTYLTRDGRAPGS	112050	113723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_112000_113700
815171	contig_3068_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_137659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTATTACAATTTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423150	425402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_423200_425400
815172	contig_6608_pilon	-	1435	7	Intergenic	novelGene_162531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCCGTGATGCGCACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60309	54917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_55016_55516_55729_56588_56655_57140_57300_57391_57531_58644_58702_59605
815173	contig_8453_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_125112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTATCTTAATACACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75594	74804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_74800_75600
815175	contig_11656_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_53985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTCAGATAGTAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357511	356587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_356600_357500
815177	contig_15182_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_136464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCACAGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567965	568915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_568000_568900
815178	contig_9272_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_125946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCGCTGAGTTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452380	451532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_451500_452400
815181	contig_13625_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_150166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCCTCCGGAAACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30531	28923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_28900_30500
815182	SIRV5	-	297	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
815183	contig_6710_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_97491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	75	GAAAAAGAATAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
815185	contig_9682_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_125313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	671	1222	505740	506291	NA	35	GTGGCGTATTTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIPPQNLRLSLNPPVSSHLGPPSPPQRYSGLFTWLPSDPQTQGLRPPTTGLPLLQDLPAASALLCPWFSLANLHLLVSPHTSVHFGRLPAPCSPERGFSRGPCLKLLYPPPSFVTNMVVVGGRIPMWCSPQLPPFAAGAAQAERGVPGGCQATPRIDSETRSLVGQAACSRDPSGGRLCPG	505069	506595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_505100_506600
815186	contig_500_pilon	+	1021	3	Intergenic	novelGene_31123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23	370	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	88	561	1735075	1737122	FALSE	45	AGAAAATTTTTTACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVRSSVHAKWIVGRVIGTAMQKTAKVRVTRLVLDPYLLKVRSIPVFKWHWQITSMFQAPQQKNTSLSYYNKRKTYFAHDALQQCTVGDIVLLKALPVPRSKHVKHELAEIVFKVGKVIDPVTGKPCAGTAYLESPISSEPTHLTERLKELTISAQ	1734398	1737582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1734469_1735057_1735282_1736855
815189	contig_13224_pilon	+	1880	11	Intergenic	novelGene_104133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	82.7369929354457	117	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	10	1491	393528	413151	FALSE	30	TCGCCAACTGAGAAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTMATDSWALAVDEQEAAAESLSNLHLKEEKIKLDANGAVVKTNTNTEKTDEEEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLTFIFNCFSRKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPTNRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFSESLECPLPGAFSRPGGGEKRGVFL	393518	413540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405013_405134_408438_408542_409052_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882
815190	contig_10003_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_88262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTGAGGAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757883	756204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_756200_757900
815192	SIRV6	+	296	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	-2	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_3065
815193	contig_9516_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_106155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAACAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698874	698396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_698400_698900
815196	contig_13206_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_161912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCTTGTAGAGGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234249	235355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_234200_235400
815198	contig_8850_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_172440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTGATAAAAGAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327226	328300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_327200_328300
815199	contig_7870_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_108983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTGTACTGGTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412980	415231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_413000_415200
815201	contig_9705_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_41734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGCAGCACATATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235682	235962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_235700_236000
815205	contig_10238_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_170111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGGGGATGGGACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444185	444710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_444200_444700
815206	contig_2940_pilon	-	831	11	Intergenic	novelGene_81923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	96.3464581601213	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	126	683	613834	595880	FALSE	10	GTGGTGTTAACGTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFHEQDGKAGLFSQEQNEKAKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGAEHGKPDISKDELQLYEDGYHCSSFCADVPGEMVPSGESGLRQRGSDPASGEVEASPLRRVNIKKDDEFFHFVLLCFAIGALLVCYHYYADWFISFGVSLLTFASLETIGIYFGLLYRIHDVLQGFIPLLQKFKLLGFRRTD	636627	595731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_595900_596704_596768_597258_597334_597738_597811_602034_602083_602447_602481_603102_603169_605244_605299_613707_613843_614467_614549_636591
815207	SIRV5	+	397	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	13	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2074_2270_2316_3298_3405_3483
815208	scaffold_19766_pilon	-	830	6	Intergenic	novelGene_34327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	341.538050588803	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	72	608	622201	596625	FALSE	30	TACCTAGAGAATTTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCCCCCCYCQHFHRQHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622272	596402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196_597247_598328_598360_621454_621687_622153
815209	contig_4156_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_88125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520514	521320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_520500_521300
815213	contig_7229_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_39850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	167	580	1248347	1248760	NA	20	TTTTCTATTAGGATTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWSIDSSSVILMERKVHYLLGRWWSQITVCGEGGVLCIRTYSKNACNRSVVFILQTIGSREQQSPWANTDRWSTAHTYSKNACNRSVVFILQTIGSREQQSPWANVDRSQISEKACVGHKRLRNTAYMMFYFLFGR	1248180	1248815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1248200_1248800
815214	contig_7229_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_39851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCTGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248864	1250262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1248900_1250300
815215	contig_6589_pilon	+	934	6	Intergenic	novelGene_26013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1136.41319950096	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	120	647	1725483	1728022	TRUE	30	TTTTGGTAAAATAGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLPIQWFLGRKDVAICSQKVTALEILWSSSTLHTCGRHESESTGRQLTTEIMIETEGNGQKDC	1725363	1731810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1728043_1731543
815217	contig_15146_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_116945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGGTGGTTTGGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354128	355227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_354100_355200
815219	contig_19769_pilon	+	606	4	Intergenic	novelGene_102310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1775.16428034766	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	90	572	87361	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87271	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87369_87839_88040_88841_88958_89163
815223	contig_8122_pilon	+	1233	2	Intergenic	novelGene_40270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759132	768339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_759238_767211
815224	SIRV4	-	593	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	24	0	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGGTGGCGGTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	3661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815226	contig_6287_pilon	+	578	3	Intergenic	novelGene_160436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	3	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	141	578	369525	379987	FALSE	20	AGCTGTCTTAGTTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQMLQSGFPALCIFGVLTLLHCPSAMCDCSLPPSIAHGSYEDVSSFMSFTTEVKYTCDEGYVLVGKAKITCRYSGWLSPAPQCKALCLKPEVENGKLSVDKDQYIETENVTIQCDRGYRVVGLQSVTCSEKRTWYPEVPKCEWVS	369384	379987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_+_369610_374774_374946_379805
815230	contig_6589_pilon	-	888	6	Intergenic	novelGene_25771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	185	367	672646	671356	TRUE	5	TCTCTTACTCTGCTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFLEDSRGRGLRGAAEGPGAGNAGCSLPLPQVDVDDAAGQGKGEGHPGQGKAVAEAAPRRVMLQDLLGVDGIDQGSSEYCHACAETETTGHGGPSRRLHFPPAHARFPVTQEPMLQPPISH	672830	668297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_668404_669649_669746_669995_670103_671045_671187_671284_671412_672519
815232	contig_5649_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_82359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAACCGACCTTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995799	993496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_993500_995800
815233	contig_3018_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_78807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGGCTCCTTTGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522376	522696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_522400_522700
815234	SIRV6	+	508	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	11	164	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	91	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
815236	contig_20753_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_168254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTCCTATAGGGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59302	58015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_58000_59300
815238	contig_7815_pilon	-	703	2	Intergenic	novelGene_134373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	116	703	390364	343638	FALSE	70	GTGAAGAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTFKSASLNERKDHSSERVVSKYVKRSSPESPGQDQGWMVLGHNEVGDPTSEGGSSQLEARISGSGWSAEAMEPASDPSPGKGYQTQVLGEVKPPESLVLEEASGLSSQSRKTKSRGGAGPDAVILQAVAHDNEWEMLSPQPSQKNMIPEAEVEEETEFLEPRKRKPRTNGLLSEDVGMDTPFEEGMLSPSAADMRPGERSICSFSAPLSYTQTFLLFSEDHFLCIQLVISVRK	390479	343637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_343828_389966
815239	contig_17068_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_172571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAACCTAGGGAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49005	50485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_49000_50500
815242	SIRV6	+	269	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-437	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1848	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
815244	contig_12638_pilon	+	1210	10	Intergenic	novelGene_33190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	188.25973652128	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	33	698	269990	273823	TRUE	15	ACCACTGCTTGCCACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPAPSSPLWPYQLCTHHQPRSQVCSSGCTSKDCLAILRAAAADRWCCDRCGGHT	269957	274461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271213_273482_273584_273761_273999_274124
815246	contig_6929_pilon	+	756	10	Intergenic	novelGene_139362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	382	junction_4	445.619169745248	3469	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	23	556	77555	90425	TRUE	0	TGTTTTGGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRVEAMAVANSSPVNPVVFFDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRQFCTGEFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77532	96489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_78374_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356_90447_96310
815251	contig_6205_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_160340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTTCTTGCTTCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61887	63646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_61900_63600
815253	contig_6506_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_153491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTCAATATAAAGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225592	226346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_+_225600_226300
815254	contig_6189_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_164940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59766	61020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_59800_61000
815255	contig_935_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_45531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTCAGTCCTATTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141640	140743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_140700_141600
815256	contig_10627_pilon	+	2479	6	Intergenic	novelGene_59980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	27.9642629082191	71	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	486	965	268023	269862	FALSE	40	ATACATAATGTGCTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYRPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFSHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFTDGMNELVIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSALQSVHPLLKQVSVPLSPQINS	245943	271376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_246298_255307_255388_267971_268075_268512_268635_269423_269533_269665
815257	contig_9363_pilon	-	981	7	Intergenic	novelGene_6776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	451.549800378898	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	88	654	1548961	1505750	FALSE	25	GACTGTGAACTCAAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFILVGFPYYTLF	1549048	1505422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505784_1544402_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
815258	contig_1948_pilon	+	928	4	Intergenic	novelGene_31169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	186.211946149781	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	56	382	478740	484610	TRUE	15	TCTGAACTTTTAGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIVGSLEADHFGKLESTKLAIIRNLSNQVLFIDRKHKPVFEDMPDTDYKDNAPEAIFIITVYKDSQPRHLAVTISVKCRKRISTLSCENKTINFKGRAWPSRLRSRQ	478684	485925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_478891_480516_480654_484571_484686_485454
815261	contig_2069_pilon	-	1376	3	Intergenic	novelGene_23468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	1208.5	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	706	1116	1459469	1459059	FALSE	20	TTTATTTGTGTGTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALTRGTFWREPRTVETRQPMAVRVGNSPSERMCWSPSKFFSSNRIQLGMGERREWEWVCEPTPFSACSGPPEIQKSGCRPDPPSSGEVQEKQALQQQGLRSGSRKDLMKSYCPYGPEFGNIKQTTCAITQQSHF	1468071	1458798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1459870_1466438_1466627_1467954
815262	contig_20241_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_159729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCTGGCAGTTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132345	130960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_131000_132300
815263	contig_20241_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_159728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACCAAAAGCATGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130462	129726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_129700_130500
815264	contig_6227_pilon	-	1266	2	Intergenic	novelGene_49791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253424	1249825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250498_1252830
815265	contig_15422_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_173114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTGGAATTCTTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119533	120269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_+_119500_120300
815267	contig_10861_pilon	+	1799	9	Intergenic	novelGene_39343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	327	554	1489678	1490159	TRUE	30	CGGCACAGACACACACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWNPGHNKKNTQKPHGDRRRDTTPPPPPPWPKSGDEVWVGQLVETLSLSPARQAPGLQGRSRKGRWAQPPRGREHLREGPSEGSTPSPALLPRDRWPTAARGRAVDTFMIERRLENSARWLRPGGQAGPGLGLSCPKACGREQVEEGGDKGSTGSDPRWCRACWVPQELRDCAGGQQLWLDSG	1489351	1493775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1489700_1489953_1490213_1490299_1490471_1490576_1490676_1490750_1490817_1490955_1491032_1491110_1491701_1492088_1492224_1493720
815268	contig_10937_pilon	+	850	6	Intergenic	novelGene_67342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	22.0599184042009	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCTTAATGTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180636	185974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181255_181397_181497_181654_181931_182017_184579_184669_185657
815269	contig_9982_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_55711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	418	732	198941	198627	NA	25	CCTCACTGACTAATAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPNPLWKDSHAPLSASGSPRCSLPCGLYMIVVGEKHHKVYSKAKRKFCLAYIQRSKSGKTDKHAATAMSARVQRILQNRQDWEKGQACCHSHVCPSPKNITE	199358	197342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_197300_199400
815270	contig_9180_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_109108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAATAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352815	350542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_350500_352800
815271	contig_10437_pilon	-	683	7	Intergenic	novelGene_38425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1291.90157003801	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	122	586	829731	823713	TRUE	10	TACTCCTCCGTGAGGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGSSRTVLLVSSEAESEMHISKALGQEYEHEEILEEDDYYQVIYYYTVTPNYDDLGANFTIDYSMFESEDRLNRLDKEVTEAGETNINLETEAGETNLNPETERQDHLKPVTRKPATMETQSPDLKDAVSSLQSPVSLILSWALIQGGMSFT	830641	822979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_823074_823709_823812_827630_827775_828698_828758_829177_829262_829652_829800_830588
815273	contig_5317_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_76630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCCCCTCTTTACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890503	890102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_890100_890500
815275	contig_2114_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_104270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGTAGCAGGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559863	557465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_557500_559900
815277	contig_14333_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_49150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	169.123886216255	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	444	482	441645	441607	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGEAWPQRTSLGGAGVGLWLRPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIWWFVDLILLITGGLMPSDGSNWCTVY	447001	440786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441821_443131_443248_445731_445820_446937
815281	contig_6872_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_175737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	5	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCTCGTGTGTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236358	451975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_+_236430_417939_418044_451664
815283	contig_5643_pilon	+	487	4	Intergenic	novelGene_39112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1017.15627554909	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640432	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_640513_640642_640729_641102_641244_641412
815284	SIRV6	+	189	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	501	11	-331	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTCGAAGTACTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
815286	SIRV6	+	350	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	530	-2	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
815289	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	24	164	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
815290	contig_8284_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_125667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	584	964	219947	220327	NA	25	AGCTGCTGTTCCAGCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKWSSMPTSDALSVPSCGKVQSHGSEVYLTHQEATARMCGCSTLPWGVWNLDYNPISHRQDQSEDGKLAFDGEGCFPYQKREQGYQESKAGRVGEFSWSRAEPPSDGVIHSQLRSMNGRKANLWE	219363	221089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_219400_221100
815291	contig_9243_pilon	-	1309	9	Intergenic	novelGene_60324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.097472505616	2	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	25	549	64617	27314	TRUE	35	AGAGGGAAAGCATTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVSHQCASAFGMVVGGQSGSSQSLLQPLKWLAS	64641	19551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21201_21254_25168_25224_27305_27386_34476_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
815294	contig_12915_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_148348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAACCGTTGCTGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99395	98189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_98200_99400
815295	contig_859_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_132824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCATTAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97540	98525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_97500_98500
815296	contig_12528_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_81273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTGTTAAATGCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236678	237699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_236700_237700
815297	contig_11338_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_6299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1800	2156	199908	199552	NA	55	CAAAAAAAAAAACTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSHQPLSDRSWWINTPAPSPHEWDGSEVQVLCFLPGVPNGTEPGLPTVETSLIKIHPLLAIFSYVSHFPTALLFFPGISSQINVLHLNLYVRVLGDSQQRQVEGDYQHIISSSL	201707	199461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_199500_201700
815298	contig_6710_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_98001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	25	TCTTCTTTAACTTTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
815300	contig_6048_pilon	-	1113	3	Intergenic	novelGene_73363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	38	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6	359	3111867	3055444	FALSE	10	TCTGCATGGTTTTTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMTKQKRKIPEVTEKKNKKLKKTSAKEVLLVPGTTSDKKEVHPEAHTNARDPHVLQVCLNPAIQEVLVQLYLLLVVGGSPVPSSLYLPVCEVDQTPLPAWRLHPARLGGRVPGSLLHH	3111872	3054689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3055618_3056061_3056113_3111738
815303	contig_8248_pilon	-	2632	18	Intergenic	novelGene_125017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	31.8768174052755	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	299	2374	158805	89305	FALSE	20	CATGTACCTTTCTCTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSGLGKAATLDELLSTCIEMFDDNGELNNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCIYQNASGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRITEEFREVASQLGYEKHISLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWMEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTMPNKPVVPLEWISGVMPKPDPTVINKHIRKLVESVFRNYDHDHDGYISQEDFESIAANFPFLDSFCVLDKDQDGLISKDEMMAYFLRAKSQLHCKMGPGFIHNFQEMTYLKPTFCEHCAGFLWGIIKQGYKCKDCGANCHKQCKDLLVLACRRFARVPSLGSGQGSLPGSPSLPPVQDEVFEFPGVAAGHQDLDSRAITLVTGSSRKISVRLQRATTSQATQTEPVWSEAGWGDSGSHTFPKMKSKFHDKAAKDKGFAKWENEKPRVQAGVDVVDRGTEFEFDQDGADMSEAREDGEDG	201891	89046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_89314_94922_95288_95606_95733_98038_98076_103765_103914_117512_117629_129590_129705_136163_136242_146568_146845_148727_148845_149217_149392_151124_151273_152671_152804_153329_153388_157642_157751_158735_158924_160569_160697_201838
815305	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815307	contig_6270_pilon	+	1289	5	Intergenic	novelGene_99828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_3	3.53553390593274	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	17	1126	89318	96461	FALSE	35	TCAGAGTTTAGCTATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDCVIMAWALYLFLVMFWAAPMPLTMPHSAASLETLRCEGATAPGSVSNQDSNCHTSDNLTGPEEDGFQIKGYTFSKPFHLIVSYDWLILQGPSRPVFEGDSLVLRCRAWQNWPLTQVTFYRDGSALGPPGPDREFTIAVVQEANSGHYHCSGIFKSPGPRSLETASSVAIRVQELFPTPVLRATPSAEPQEGSPVTLNCQTKLPLQRSATRLLFSFYKDDRAVRSRDLSPEFQIPTASEEHSGSYWCEAATKDNQLLKRSLQLEIRVQRLSSTAASPTLTSAPQKPAASETASTEPPGPLPPPTTPSSEDPCLSSPLVVPDPHLHHQMGILLKHVQEVRVLLGHLVIELRDLSGHRKPETTNAPAK	89301	96624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_89397_93552_93736_94041_94309_95057_95343_96165
815308	contig_17796_pilon	+	1066	6	Intergenic	novelGene_33807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	414.281546777068	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	111	929	53527	91442	FALSE	90	AACAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKGLFACVVVCSVKHASCSGLQSKASENTNYPDSIGLFLEYPSLHRLFSS	53416	91579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_91296
815310	contig_6397_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_146235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCATCCTTCCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272704	273496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_272700_273500
815312	contig_6589_pilon	-	1711	10	Intergenic	novelGene_25696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	144.126830291506	19	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	195	1319	186498	179178	FALSE	75	AAAAAGAAACAGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGVQGDTEKEEAGQRKRTEPGQREQETPRGRPRDPPARSHEPRPPAGVRRGAEPGVRLLRDPTMSAPTTSSLDSPLPGNGPPQPGAPSSSPAIKEEGPEPWPGGPDPDVPGTDGAGSACSVVIPDPAEEPERKRKKGPAPKMLGHELCRVCGDKASGFHYNVLSCEGCKGFFRRSVVRGGAGRYACRGGGTCQMDAFMRRKCQQCRLRKCKEAGMREQCVLSEEQIRKKKIRKQQSRDARQQRFAHFTELAIISVQEIVDFAKQVPGFLQLGREDQIALLKASTIEIMLLETARRYNHETECITFLKDFTYSKDDFHRAGLQVEFINPIFEFSRAMRRLGLDDAEYALLIAINIFSADRPNVQEPSRVEALQQPYVEALLSYTRIKRPQDQLRFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE	188151	178785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_179325_179690_179900_183727_183828_184901_185055_185476_185527_185613_185905_186215_186348_186455_186518_187837_187947_188085
815313	contig_7057_pilon	+	1117	4	Intergenic	novelGene_123206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	78	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	57	818	509186	510654	FALSE	45	GACAAGAAAACCGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGQSSVGHGGEDGKPGAMWLRDSPGGSEDSLWESPSPLPPPGSLQASVMPRPWWAEAPWLGEGQPTLQSILLLPPRYGTPFSHSTPITGAWQEVWPRDQRIPLPLNLQKGLWSQNLLASSSPTPGLIATCVGHDGKAGRLSPQHPSPPPPARVRPYSCSVCGKRFSLKHQMETHYRVHTGEKPFSCSLCPQRSRDFSAMTKHLRTHGAAPYRCPLCLAGCPSLASMQAHMRGHSPSQLPPGWTIRSTFLYSSSRPSRASPSPCSPPSSTT	509129	510953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_509434_509683_509758_510068_510234_510379
815314	contig_6403_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_139886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGTGTTCCAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997157	998685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_997200_998700
815315	contig_13607_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_170217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414843	412292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_412300_414800
815317	scaffold_12124_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_22388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGCCATGCTCACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501481	1500423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1500400_1501500
815319	contig_6364_pilon	+	1220	2	Intergenic	novelGene_51732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTTATTAAATCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444294	447432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_445153_447070
815320	contig_8617_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_73412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGAGTGGTGGTTAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62027	62481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62000_62500
815321	contig_10095_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_57241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTAAGGAGATCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248366	247295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_247300_248400
815322	contig_6576_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_42450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATACAATCAATCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313668	1314136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1313700_1314100
815326	contig_11104_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_112468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333366	335104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_333400_335100
815327	contig_7919_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_28134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGAAAAAAAATTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560906	1563088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1560900_1563100
815329	SIRV4	-	368	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1153	0	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
815335	contig_4364_pilon	+	2244	10	Intergenic	novelGene_50	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_6	48.5732233302604	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	67	1101	583085	599744	FALSE	45	ATTTAATCATGAAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPTAASRAACGAEERRTDGGTMNLLPCNPHGNGLLYAGFNQDHGCFACGMENGFRVYNTDPLKEKEKQEFLEGGVGHVEMLFRCNYLALVGGGKKPKYPPNKVMIWDDLKKKTVIEIEFSTEVKAVKLRRDRIVVVLDSMIKVFTFTHNPHQLHVFETCYNPKGLCVLCPNSNNSLLAFPGTHTGHVQLVDLASTEKPPVDIPAHEGVLSCVALNLQGTRIATASEKGTLIRIFDTSSGHLIQELRRGSQAANIYCINFNQDASLICVSSDHGTVHIFAAEDPKRNKQSSLASASFLPKYFSSKWSFSKFQVPSGSPCICAFGTEPNAVIAICADGSYYKFLFNPKGECIRDVYAQFLEMTDDKL	583018	600887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_583152_588635_588711_591549_591652_592467_592556_593930_594026_596828_597020_597709_597796_598672_598775_599207_599330_599637
815339	contig_5302_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_81373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42006	43448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_42000_43400
815340	contig_7843_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_152026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206544	205505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_205500_206500
815341	contig_14341_pilon	+	1983	2	Intergenic	novelGene_111760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1	681	218759	219522	FALSE	30	GCAATGTTATTGTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYECRECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECGKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCNQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKGFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECNELWENLQSQLITQPARKDTHRRKAL	218758	220824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_219366_219448
815342	contig_2054_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_51690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACCTGGTTCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135468	137087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_135500_137100
815343	contig_8464_pilon	-	1731	2	Intergenic	novelGene_125380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGACAGTGTATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796040	793769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_794583_795122
815345	contig_5832_pilon	+	942	5	Intergenic	novelGene_134130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	14.1133801762724	35	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	428	940	182857	204315	FALSE	5	TTTTCTGGATTTTGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRGGIGAQCGLVFAYNSPSDKFHAEEHFKRFEKYDKWKLQELRQFVKSRIGCSSDDLGEDDPIGWFELEEEWDEADVKLQQSRIAKYLMVKFLCTRQESAERLGVQGLSISGYLRPARADAEQSVVCVHCRKDSEESVCGATLLLKTLQFIQQLAHDLVQQKESSLKYK	182429	204317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_182860_183235_183385_201603_201716_202823_203040_204282
815346	SIRV4	-	417	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1104	0	1104	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4054	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
815347	contig_9609_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_22947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATCAGTGAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169544	169167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_169200_169500
815350	contig_9919_pilon	+	1054	2	Intergenic	novelGene_137971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594877	610762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_594886_609716
815355	contig_5019_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_109204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAGACTGGGATTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180298	179652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_179700_180300
815356	contig_5019_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_109203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACCTACCTGAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178657	178263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_178300_178700
815358	contig_7457_pilon	-	1796	12	Intergenic	novelGene_31380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	50.6517848232925	342	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1125	1601	437993	437249	FALSE	10	GTCACGGGTCTCTTTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDIFKENFDELDTSREVVQELIDEYHAATRPDYISWGTQEQ	442431	437053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_437447_437632_437795_437876_438030_438414_438566_438678_438766_438987_439115_439569_439651_439898_439968_441329_441498_441683_441797_442096_442234_442276
815359	contig_16185_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_144765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162617	163091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_162600_163100
815360	contig_16578_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_148607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAACAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5071	5958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_5100_6000
815361	contig_14273_pilon	-	1883	17	Intergenic	novelGene_21165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.1604669171837	1	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1254	629	1882	298889	279456	FALSE	40	CAACAAGCAAGCAGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKVYSTATEECVHILHGHSDLVTGLQLNPSNHLQLYSCSFDGTIKLWDYIDGILIKTFTVGHKLHALFTLAHTKDSVFVTINKEKPDIFQLVSVKLPKSSSQEIEAKETAFVLDYINQSPKCIAFGNEGEYVAAVRDFYLSVYFFKKKTTSRFTLSSSRNRKHAKNNFTCVACHPKEDCIASGHKDGKIRLWSDDDKKYTYTCLHWHHDMVKGTSLLSGGRESVLVEWRDATEKNKEFLPRLGATIEHISVSPAGDLFCTSHSDNKIIVIHRNLEASAVIQGLVKDKNIFTGLIIDPRTRALVLNGKPGHLQFYSLQSDKQLYNLDIVQQEYISDNDLIQIELRKAAFGCQGHWLATVEQRQEKETELELQMKLWAYNKKTQGFVLNTKVSMPHEDHITALCFCNAEKFENPTLVTASKDGHFKVWILTDDSDIYKKAVGWTCDFVGSYHKYQATNCCFSEDGSLLAVSFEEIVTIWDSETWELKCTFCQRAGKIRYLCFGRWTCSKYLLGATENDILCCWNLLSCALEWSTKLNVRVMEPDPNSENIAAISQSSVGSDLFVFKPSEPRPLYIQKKISREEVHWGVFVPRDVPESFTSEAYQWLNRSQFYFLSLLTFSAKSPEEKLT	307844	279454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_279501_280234_280393_281543_281640_282520_282616_283481_283663_284135_284294_285172_285349_286402_286519_286608_286669_287688_287851_298882_298938_299821_299946_301011_301083_303482_303608_304462_304554_305437_305504_307741
815362	contig_1244_pilon	-	1357	11	Intergenic	novelGene_37937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.1621135177553	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	20	1066	870512	720716	FALSE	20	CCACTATTTAACCCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSEQAEQPSQPNSAPGSENVLPREPLIATAVKFLQNSRVRQSPLTTRRAFLKKKGLTDEEIDLAFQQSGTAADEPSSLGRATQVVPVQPPHLLPQPYSPVGSRWRDYGALAIIMAGITFGFHQLYKKYLLPLIVGGREDRKQLERMEASLSELSGSVAQTVTQVQTTLASVQELLIQQQQKVQELAHELAAAKATTSTNWILESQNINELKSEINSLKGLLLNRRQFPPSPSAPKIPSWQIPVKSPSPSSPAAANHHSSSDISPVSNESTSSSPVKESHSPEGSTYHLLGPAEEGAGVLDVKGQARSPEASAFRRLAQHLYQTDILSRVCLLSVFTLTPRMTRARP	870531	720424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_720727_720962_721081_721557_721799_723587_723680_727655_727754_728925_729029_732208_732295_755798_755928_813306_813392_851591_851640_870476
815366	contig_9871_pilon	+	246	2	Intergenic	novelGene_75625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGACGATTAAAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331201	352062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331374_351988
815367	contig_13542_pilon	+	1451	8	Intergenic	novelGene_131501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1134.06077294592	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	51	728	346638	505589	FALSE	80	AAACAACCAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVTNAGTGTAVAAATMLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346587	506312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417058_417137_453984_454107_464621_464724_487359_487502_499871_499938_500886_500964_505501
815368	contig_14635_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_84373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAGCTGAAAACGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597783	598397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_597800_598400
815369	contig_9440_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_59057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATAATCTTACATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496554	495976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_496000_496600
815370	contig_9440_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_59056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	696	1100	495131	494727	NA	60	GAAAAAAATTATACTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSRQPAFLPRAWFERCILTLSGLSGQYCGESREPSSSYGRCVSVTVTTANGKPQQLVRELENRWKCSFLAPDWSFCPRWLTVPTLILWKLVIRENNSTQHIATAISTKVQVTYLPAIESLEGLCKSIQRLAC	495826	493976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_494000_495800
815371	contig_16907_pilon	+	1335	8	Intergenic	novelGene_87480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	43.7063484857656	427	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	547	1149	530225	540528	FALSE	35	CAATGAGTTAACTCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKGKKRHSSSSSQSSEISTKSKSVDSSLGGLSRSSTVASLDTDSTKSSGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	524920	540714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525324_528591_528703_530192_530297_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
815374	contig_6418_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_81133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139951	142415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_140000_142400
815375	contig_6589_pilon	-	1269	12	Intergenic	novelGene_26250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	64.3686438730038	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	70	1209	2233261	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQEFSGRKWRLSPSSVHRPGPRMAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWNFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233721	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229091_2230878_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110_2233275_2233665
815376	contig_4364_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGAAAAAAAATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996762	998037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_996800_998000
815377	contig_9668_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_58260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACTCACAGCAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635891	636995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_635900_637000
815380	contig_11978_pilon	-	788	3	Intergenic	novelGene_62956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_2	69.5	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	479	787	1067968	1064385	FALSE	40	TGAGCCATACTTAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENWGLVTYRETALLIDPKNSCSSSRQWVALVVGHELAHQWFGNLVTMEWWTHLWLNEGFASWIEYLCVDHCFPEYDIWTQFVSADYTRAQELDALDNSHPIE	1068446	1064383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1064550_1066985_1067101_1067939
815381	contig_20190_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_176210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTTACATCAGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7309	9298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20190_pilon_+_7300_9300
815384	contig_16322_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_87557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGTGACAGCCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138272	138898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_138300_138900
815387	contig_15185_pilon	-	2176	11	Intergenic	novelGene_99421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	64.6993817590246	37	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	248	1972	238118	231191	FALSE	30	TTCTTAGCCAATCTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTYPLQKSCMAPVALNSAAPSVPDGPVLPTKRKTVKLFWRELKLAGGPGGSGSRFGPCPTLWASLEPVSVDTARLEHLFESRAKDVLPSKKAGEGRRTVTTVLDPKRSNAINIGLTTLPPVHVIKAALLNFDEFAVSKDGIEKLLTMMPTEDERQKIEEAQLANPDIPLGPAENFLLTLASIGALAARLQLWAFKLDYDSMEREIAEPLFDLKVGMEQLVQNATFRCILATLLAVGNFLNGSQSSGFELSYLEKVSEVKDTVRRQSLLHHLCSLVLQTRPDSSDLYSEIPAVTRCAKVDFEQLAENLGQLECRSWAAKESLRALAKHELAPALRARLTHFLAQCACRVAVLRVVHRRVCNRFHAFLLYLGYTAQGAREVRIMQFCHTLREFALEYRTCRERVLQQQQKRATYRERNKTRGRMITETEKFSGVAGETPSNTAVPVAVGSGPGRGDADSHASMKSLLTSSPKDATHGRRSRGTVQSSSPVIPTPVGPSTAPPEEPLGSGSPTDTSDEIMDLLVQSVTKSSPRALAARERKRSRGNRKSLRRTLKSGLGEDLVQALGLSKGPGLEV	238365	230986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_231274_231347_231549_231623_231787_231867_232061_232154_232346_232776_232939_233015_233136_233221_233405_233631_233788_234113_234322_238053
815390	SIRV6	+	271	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	113	-7	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3136	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815391	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
815393	contig_5419_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_15546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAATAAATACATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448614	448902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_448600_448900
815394	contig_11498_pilon	+	1060	11	Intergenic	novelGene_65496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	101.042614772184	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	896	1015	54400	55181	FALSE	35	CAACTCCATTTTACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKTSAPNSLKQPSKLSTPEYTVQLKGASLAWAPKDKSSKKNVLELRSRDGSEYLIQHDSETIISTWHEAIAQGIQELSVDLPPEEESESCSPEFGSSERLGSWRDKEGDARPGAAGGQESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLRDRGYIKDQVFGCALAVLCERERSQVPRFVQQCIRTVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFCKFIAAIKLQDQAQRSRCVRDLVCSLPTPNHYTLRLLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPQTEDSALPDPSSTCSAGVPPIH	46755	55226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_46784_47287_47393_50748_50848_52976_53089_53212_53318_53388_53488_53685_53764_53857_53993_54158_54265_54371_54462_55123
815395	contig_12010_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_160944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	65.4437841883314	900	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	532	858	189529	183382	FALSE	25	AAATGTTCTTTTGTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILQRLFRFSSVIRSAVSVHLRRNVGVTAVAFNKELDPIQKLFVDKIREYRSKRQASGGPVDTGPEYQQDLEKELFKLKQMYGKADMNTFPSFAFEDPKFEAVEKPQS	195289	183293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_183420_184223_184349_189365_189543_194771
815396	contig_18231_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_105906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTAAAAAAGAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530317	528002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_528000_530300
815397	contig_2854_pilon	+	1960	6	Intergenic	novelGene_120802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	179.268067429757	1	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	176	1465	68566	86695	FALSE	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQDVVEKAIREFGPSAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLSPSSEPCQMWACLTPASESLASRQPAPATSLQPGFREPFRATGVLSNPPSHSFPAASRTCPCQPRGLLRKPTS	68390	87190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_82393_82502_84541_84650_86475
815398	contig_2332_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_58653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTTGTTGACTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282052	283140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_282100_283100
815399	contig_10074_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_57163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528301	526920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_526900_528300
815400	contig_11071_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_131050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479760	477554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_477600_479800
815402	contig_12622_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_5902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCAAGCACTATTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583531	1584228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1583500_1584200
815404	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
815405	contig_2219_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_67198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTACCCATATGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202110	203500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_202100_203500
815408	contig_4951_pilon	-	1976	4	Intergenic	novelGene_122126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	13.7679176187089	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	8	562	213620	206644	FALSE	60	TAAAAAAAAAAAGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMVQIMRQFLYQALPEDSYKFATGKLHVALTRLTDGESVVVSEFTSKEELIEALYCSCFVPVYCGLIPPTYRGERYIDGGFTSMQPCSFWTDSITISTFSGQQDICPRDCPAIFADFRLFNYSFQFSLENITRMNYALFPPDLQVLHEYYYRGYEDAVLYLRRLSKYHGGPWGKGKLGGWGKDRK	213627	205229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_206770_207903_208114_210690_210757_213467
815409	contig_4301_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_65138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTCCTTTTCCCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588381	586767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_586800_588400
815410	contig_10135_pilon	+	558	3	Intergenic	novelGene_106658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4106.5	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTACCATATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116696	120180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118819_119758
815411	contig_211_pilon	-	1346	6	Intergenic	novelGene_129860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	55.8082431187365	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	57	881	98758	78599	FALSE	25	GAAGCTTTGAGGCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGLYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYIGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIITKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERSYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKVKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRRALLSSGDPGCPEQDAG	98814	78133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_78654_92983_93223_95861_95993_96865_97075_97505_97619_98680
815417	contig_12437_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_169073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAGAAGGTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44606	46039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_44600_46000
815421	SIRV5	+	390	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-11	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2120_3298_3405_3483
815422	contig_15036_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_107157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGCCTAAAAATCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185919	183472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_183500_185900
815426	contig_8075_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_42509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAAGAGACAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751157	750454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_750500_751200
815427	contig_6544_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_142062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGCCCTGTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6014	7869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_6000_7900
815429	contig_3948_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_53258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGCTATTTATTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294464	1292784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1292800_1294500
815430	contig_9706_pilon	+	1572	2	Intergenic	novelGene_20907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99600	105922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_100412_105161
815433	contig_1154_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_87131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCAGGCCGCTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479822	478188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_478200_479800
815436	contig_11285_pilon	-	1328	13	Intergenic	novelGene_5553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	311.917312315656	1	65	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	101	1012	744458	741800	TRUE	40	TAAAGATGATAAACTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKLPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLRVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSGTLYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVSGSHPDSALRCGEDSAPGCAGSSGGCESAVPSC	745422	741229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741287_741458_741656_741737_741819_741892_741975_742184_742299_742574_742752_742933_743062_743218_743287_743609_743744_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
815438	contig_15991_pilon	-	659	6	Intergenic	novelGene_70889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3186.46251507844	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	72	590	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEHAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106353	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102047_105001_105142_106315
815439	contig_5423_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_85309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAATAATTATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741391	739723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_739700_741400
815440	contig_3818_pilon	-	1492	5	Intergenic	novelGene_99251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	8.69985632065266	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTACGATGTCGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463624	461001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_461071_461711_461914_462151_462241_462340_462453_462604
815442	contig_14528_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_111292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGTGCAGTGACGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279375	278635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_278600_279400
815444	contig_14333_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_49087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAATTTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279536	278230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_278200_279500
815445	contig_5485_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_37720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTACTATGTTCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216776	216031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_216000_216800
815448	contig_18126_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_176211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCACAATAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45967	46820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18126_pilon_+_46000_46800
815449	contig_12543_pilon	+	1240	3	Intergenic	novelGene_168374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	4	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGTTAAAAAACACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304435	312164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_304551_310655_310735_311118
815451	contig_6102_pilon	+	1668	4	Intergenic	novelGene_32019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	48.8148429157453	130	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	364	1023	508813	511792	FALSE	15	AGTGTGAATTTGGCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEYKNRDVASLFGLRFLTSCSLLLPRAAQILASETGLPPSRSFMGFTASFTNKRKAYSERRIMGYSMQEMFEVVSNVQEYREFVPWCKKSLVVSSRKGHLKAQLEVGFPPIMERYTSAVSVVKPHMVKAVCTDGKLFNHLETIWRFSPGIPAYPRTCTVDFSISFEFRSLLHSQLATIFFDEVVKKNVAAFERRAATKFGPETAIPRELMFHEVHQT	508449	512437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_509010_510377_510571_511221_511324_511624
815452	contig_5827_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_129789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTCCAAATTCCCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232939	233736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_232900_233700
815454	SIRV6	+	336	3	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	231	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2833_7766_7924_10724
815456	contig_7327_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_172117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTACAACAATAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104496	103422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_103400_104500
815457	contig_2278_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_118084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637080	638522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_637100_638500
815460	contig_7357_pilon	-	2303	16	Intergenic	novelGene_36933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	27.0896454182938	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	44	2176	831404	782072	FALSE	40	TAATTTTACATTCAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVFTDKTGTLTENNMEFKECCVEGHVYVPHVICNGQVLPDSSGIDMIDSSPGVSGREREELFFRALCLCHTVQVKDDDNVDGPRKSPDSGKSCVYISASPDEVALVEGVQRLGFTYLRLKDNYMEILNRDNDIERFELLEILSFDSVRRRMSVIVKSATGEIYLFCKGADSSIFPRVIEGKVDQIRSRVERNAVEGLRTLCVAYKRLIPEEYEGICKLLQAAKVALQDREKKLAEAYEQIEKDLILLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMETAAATCYACKLFRRNTQLLELTTKKIEEQSLHDVLFELSKTVLRYSGSLTRDNFSGLSTDLQDYGLIIDGAALSLIMKPREDGSSGNYRELFLEICRNCSAVLCCRMAPLQKAQIVKLIKFSREHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLKKMLLVHGHFYYIRISELVQYFFYKNVCFIFPQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNISFTSLPILLYSLMEQHVSIDMLKRDPSLYRDIAKNALLRWRVFIYWTFLGVFDALVFFFGAYFMFENTTVTSNGQIFGNWTFGTLVFTVMVFTVTLKLALDTHYWTWINHFVIWGSLLFYIVFSLLWGGIVWPFLNYQRMYYVFIQMLSSGPAWLSIILLITVSLLPDVLKKVLCRQLWPTATERTQVRGRFSHPGNHCMLWSPSFKAEKY	831447	781944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_782313_784983_785088_785934_786001_790032_790169_792546_792675_794179_794240_794849_794996_795245_795349_800854_801030_802440_802693_805736_805919_818563_818668_824876_824951_827201_827274_829431_829596_831278
815461	contig_6505_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_175697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166788	168614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_166800_168600
815462	contig_11720_pilon	-	1913	3	Intergenic	novelGene_44040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	1.5	61	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	133	441	492981	492673	FALSE	45	CAAGAAAAGGCCTGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPVFDSQPANSTGEMDGLCSELLLIPQPLSNCGILEPVQSPCPSGNPTPLPTDPSCLLVEATATEEGAGNMEIIVEAVAGNLSPDAPGDAQGTNTVARGQ	495060	491200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_493016_494635_494690_495016
815463	contig_9415_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_109913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2134375	2134913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2134400_2134900
815465	contig_4315_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_46756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	309	638	240276	240605	NA	85	ACCAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIYHEDQQTRAPRPDLAQCLFLSTGIFALWWQSCDRVIRPTKPKISSGPFQRKFVDPRSSKCILSVPVRKEHLRQFAFAKHRQEYMFTVLPQSCVNSLPLSECTSP	239967	241231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_240000_241200
815466	contig_10437_pilon	-	1579	4	Intergenic	novelGene_38127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_2	181.978631224169	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2	640	141459	129298	FALSE	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALHWATEHHHRDVVELLIKYGADVHAFSKFDKSALDIALEKNNAEILVILQEAMQSQVNANPERANPTTNPVTVAAPFIFTSGEVVNLASLVSSASTKTTSGDPQASRVQFSNATPSVLATLAALAETSAPLSNPHRATDSSEEMVEGNSVDSSLQQVVGSGGQRVITIVTDGVPLGSLQTAIPTGGIGQPFIVTMQDGQQGELSRLDNC	141460	128358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_129513_131551_131666_139214_139366_141300
815468	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_98088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
815469	contig_15221_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_133076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAGAAAAGGGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163995	164472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_+_164000_164500
815470	contig_12128_pilon	+	1037	10	Intergenic	novelGene_131992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	71.4735554999363	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	77	1036	434447	551394	FALSE	50	AAAAAGATCCTTCATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQGAGDYIYGVSRRPRVVAYKRDEMWSEGRYDYERLPRERAAPRSHPSDGYHRVVNIVPKKPPLLDRPGEGSYNRYYSHVDYREYDEGRSFSHDRRSGPPHRGDESGCRWTRDDHSGGRQPEYRDVRDGFRRKSFYSSHYARDRSPHKRDNPFFRESPVGRKDSPHSRSGSSVSSRSYSPERSKTYSFHQSQHRKFARAGASYKRQNEGKPERGKERPVQPLRTSRDTSPSSSSAVPSSKVLDKPSRLTEKELAEAANKWAAEKLEKADDSNLPEISEYEAESTASLFINQPEEPESNATDGIELFEDSQLTSRSKAIASKTKEIEQVYRQDCETFGMVVKMLI	411746	551395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_411803_434426_434519_449493_449659_461896_461959_482850_483063_490631_490689_493333_493414_496544_496665_504175_504317_551343
815472	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_90847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653879	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
815475	contig_11096_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_143474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241622	242660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_241600_242700
815476	contig_9177_pilon	+	2300	17	Intergenic	novelGene_32735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_15	6.16916475302776	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	103	1953	768745	884938	FALSE	10	TAGCAGGCTTCTTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDYDELLKYYELYETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKSALGSDLPRIKTEIDALKNLRHQHVCQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHNLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYEVPKWLSSSSILLLQQMLQVDPKKRISVKNLLSHPWIMQDYNCPVEWQSKNPFIHLDEDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGRPVRLRLPSFSCGQASATPSRDFKSKNLSLEDVTTSDENYAIGLIDYEWCEDNSSTGVATPQTPQFAKHWTESNDLESKSLTPVLCRASANKIKNKENVYTPKSTVNNEEYFLFPEPKTPVNKNQHKRGVLTTPNCYTTPSKDRNQCLNETPIKTPVNSAGTNKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHVEDTPKRKGTKVFGSLERGLDKVITVLTRSKRKGSAKDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSVLPKKHVDFVQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV	767193	885285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_767249_768697_768784_772115_772233_783881_784026_784953_785023_787240_787334_796364_796464_820628_820698_822194_822294_829473_829561_837690_837823_844228_844352_870265_870498_873224_873322_874788_874958_882605_882710_884760
815477	SIRV6	+	334	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	530	7	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
815478	contig_10937_pilon	+	450	4	Intergenic	novelGene_67348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	221.722048219537	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	157	411	207712	209271	FALSE	5	TGTCCACTTCTGGTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQTLREKDGFGAVLFSSHVRKVNRFLKSRDRALLLTDHHLYKLEPGKQYRVMRAVPLQAVTGVSVTSGKDQLVVLHTRGQDDLVVCLHRTRPELDNRVGSQRGARRLVSVEVKPEQPVPDFRCSRAGFTLLWPSR	207277	209310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_207344_207621_207736_208862_208982_209159
815479	contig_9345_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_24708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCACAGCGACCCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984851	986500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_984900_986500
815483	SIRV2	-	501	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	4	322	4	-322	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGATCTACATACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5891	3987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5751
815484	contig_13607_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_170172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGCTTTCCAATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158223	156721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_156700_158200
815486	contig_15952_pilon	-	911	9	Intergenic	novelGene_154042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.680480480416	55	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	27	626	105377	97622	TRUE	5	CTCTCTGGCTCTCGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGRRPEHGGPPELFYDENEARKYVRNSRMIDIQTKMAGRALELLYLPEGQPCYLLDVGCGSGLSGDYLSDEGHYWVGIDISPAMLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKK	105403	93271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_97621_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102732_102816_102901_102998_105197_105236_105329
815487	contig_8696_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_153327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAGAAAGAAAACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668406	669212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_668400_669200
815488	contig_9036_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_155435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGTCAGTCTCCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16683	15995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_16000_16700
815490	contig_12790_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_35186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACTACACTGTGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129338	128281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_128300_129300
815491	contig_15888_pilon	+	720	7	Intergenic	novelGene_84453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	251690	253440	TRUE	20	AACCGGCGGAAGCCCCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALWLRWRGPSLAVPHCSPRQAEGVDAWTVGLEVGTPWAWGSPERVRRDPWAGQAPSLFLFPGGCLHSVGVPLTDVLVLVVHVVSAALPGGEPRASPSRTSSGFHRFS	251689	259784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_251830_252245_252300_252467_252548_253387_253469_254198_254281_254526_254688_259662
815496	contig_17311_pilon	+	244	3	Intergenic	novelGene_57857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAAATGGGTTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118845	123427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_118889_121523_121642_123344
815498	contig_11572_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_100041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCACAAATATAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152081	152809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_152100_152800
815499	contig_15029_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_128177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTATAGTAGGTAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156384	154217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_154200_156400
815502	contig_20739_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_83166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	519	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATGGATGTAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93308	94599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_93300_94600
815508	contig_10627_pilon	+	1090	5	Intergenic	novelGene_59929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_4	100.688566878271	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	343	606	108135	109221	FALSE	25	CGCACAGACTTGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVPTTKADETSNSSGGSCSRVWQSPRFVARKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	106072	109705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_106116_107835_108139_108453_108573_108962_109005_109122
815509	contig_10148_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_172867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATATATTAAAATAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292642	293422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_292600_293400
815511	contig_6241_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_156416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188318	185982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_186000_188300
815513	contig_4891_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_124612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	61	387	1073827	1073501	NA	70	ATCCAATACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGASEQRNDNEWQVLQPEGPMLVAEGETLLLRCTVVGSWIDDMIKWIRVRNQDQQEIYNFKHGFFPGVMPLAQWTLKSLNWDYSIHIPHVTKEDAGTYHCVRFDGLSQHLEKTLDEGTSVLVKGEYQA	1073887	1072791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1072800_1073900
815514	contig_755_pilon	-	1550	4	Intergenic	novelGene_119772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGTATAGAATCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89043	83038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84118_85517_85698_87670_87817_88898
815515	contig_3601_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_132978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159516	1160032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1159500_1160000
815516	contig_13481_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_119315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	524	826	262200	262502	NA	75	TATGTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCISKLAFSLNTSIDPQSLICSSKTQKAPKTESFCKIGTSLTSTHKRLFIVFFCCVSSEYPFCCRNINEFEFRVLLRFPLREYYTIYDILIIPPFKQMK	261676	263614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_261700_263600
815518	contig_16385_pilon	-	1716	3	Intergenic	novelGene_86181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCAAATCAGGGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5483	2955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_-_3113_3413_3537_4047
815520	contig_19892_pilon	+	1432	2	Intergenic	novelGene_158948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	582	1064	7948	18968	FALSE	30	TTTTCAGAAGTAGATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQACALEAGACSAFSANALRVERGPEPGRRPETCHSLLLNTVSSPSFHFRSQVWCREKESSPGSRGPRVPILHIHKSQGRISTALAGVWTKHYSSASKLPSALLPLPSLFLTWLHGLRDDIPLDFQKLEKEMAVKSREAGKVESVSRQFSDGLQSCPLDD	7366	19336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_8344_18881
815523	contig_715_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_167554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	343	2211	155678	125017	TRUE	15	CCGGTTTATTTGTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGTVSSCAVVNSVPNAATGMTVGLVSSQQQQPAVNTSRFRVVKLDTSSEPFKKGRWTCTEFYEKENAVLVTEGVINKVVETVKQNPVEVTSERESTSGSSVSSSVSTLSHYTESVGSGEMGAPTVVVQQQQQPALQGVAPQQMDFSSTGPQSVSAASIPQSVLQSQISQVQLQSQELSYQQKQGLQPVPLQTTVSAATGIQPLPVNVVGVTSALGQQPSSLAHPHLPYSQTAPPVQTPLSGAPPQQLQYGQQQPAVSTPMAPGHGKSVTQNPTSEYGHVQQQPILQTAVSSGQPSSAGVGAGATVIPVAQPQGIQLPVQSTVVQAQPAGASGQAIGQAQTAVSAVPTSSQIANIGQQANIPTAVQKPSTQVTPSVQQGAPPSSQVVPPAQTGILHQGVQTSASSLPQQLVIAPQSTLLTVPPQPQGVESVTQGVVSQQLPAVSPLPSASSISVTNQVSATVPSAMPSAPTNVVPPQNIAQTPATQNGNLVQGVSQPPLIATNISLPLAQQVPLSSAQFSAQSLAQAIGSQIEDARRPVEPSLVGLPQTISGDSGGTSAVSDGSSSSLAASASLFPLKVLPLTTPLVDGEDESSLFQCFSPTRGARSDPRTTDTAKTTESF	156020	124095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_124115_124934_125105_153897
815525	contig_16846_pilon	-	673	4	Intergenic	novelGene_82968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3759.16217024781	11	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	26	544	555239	551492	TRUE	5	TACTTCGGGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555264	550863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550987_551485_551665_552661_552824_555055
815530	contig_9437_pilon	+	576	7	Intergenic	novelGene_141746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	173.808003907249	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	76	474	527782	550859	TRUE	35	AGTGACCATCACAACGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNEYPSTAPPIYQLNAPWLRGQERMDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPEPETTKKTEEEDVECEEDLALACDSESPVKALETDISENKTETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQESEDLKGLKMMYSRLHNL	526430	551980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_526478_527753_527817_535608_535695_538464_538588_549658_549757_550802_550885_551903
815532	contig_6272_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_160453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGATATCTGTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169492	171296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_169500_171300
815533	contig_13224_pilon	+	1708	8	Intergenic	novelGene_104111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	28.6997120087947	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	207	1208	291364	302188	FALSE	75	ACAATAAAATACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYRLLSIVRQQRVSPGWQNWPSARSSTSAAEAHSIALPAQAQVVICGGGIMGTSVAYHLSKLGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLCHQLEQETGIQTGYVRTGSISLAQTQDRLISLKRINSRLNVMGIPSEIISPKKVAELHPLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALALASAASQNGVQIYDRTTVLHVIVKKDQVTGVETDKGQIDCQYFVNCAGQWAYELGLSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLETPLQSNTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFEKNPKPIFTEGKNQLEIQNLQEDWDHFGV	283471	302688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_283616_291301_291588_293361_293496_299267_299350_299443_299608_300338_300461_301171_301290_302030
815534	contig_14450_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_49051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGTATACTGTGGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359683	1360211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1359700_1360200
815535	contig_14450_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_49053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAAGACAGGGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375721	1376436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1375700_1376400
815537	contig_7914_pilon	+	2184	2	Intergenic	novelGene_165035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	193	1692	227172	231057	FALSE	45	AAGGAGCACTTAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSIELDVSDGPDNEPIVCNRNNVTTHLSFRSVIEVVNKFAFVASEYPLILCLGNHCSLPQQKVMVQHMKKIFGNKLYTEAPLPSESYLPSPETLKRKIIVKGKKLPSDSDILEGEVTDEDEEAEMSRRMSVDHNEEQKQIWLCRELSDLVSICKSVQYRDFELSMKSQNYWEICSFSETEASRIANEYPEDFVNYNKKFLSRVYPSAMRIDSSNLNPQDFWNCGCQIVAMNFQTPGPMMDLNTGWFLQNGGCGYVLRPSIMRDEVSYFSANTKGIVPGVSPLALHIKIISGQNFPKPKGACAKGDVIDPYVCIEIHGIPADCSEQRTKTVQQNSDNPIFDETFEFQVTLPELAMIRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFECLQPGYRHVPLRSFVSDIMEHVTLFVHIAITNRSGGGKAQKRSLSVRMGKKVREYTMLRNIGLKTIDDIFKLAVHPLREAIDMRENMQNAIVSVKELCGLPPTASLKQCLLTLSSRLISSDNTPSVSLVMKENFPYLEPLGMIPDVQKKMLAAYDLVGNCEPIFLTCVCGKSLMAGTLLWNPNV	226979	231549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_228381_230766
815538	contig_9909_pilon	+	1766	10	Intergenic	novelGene_42473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_8	28.1297698287292	527	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	18	1544	663000	688744	FALSE	20	TTTTTTTAAAGGCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAVRFFARRGRLVRPAASASAPGLGGAAVLPFRPSNAARMASQSSYRIEYDTFGELKVPNDKYYGAQTVRSTMNFKIGGVTERMPAPVIKAFGILKHAAAEVNQDYGLDPKIANAIMKAADEVAEGKLNDHFPLVVWQTGSGTQTNMNVNEVISNRAIEMLGGELGSKKPVHPNDHVNKSQSSNDTFPTAMHIAAATEVHEVLLPGLQKLHDALDAKSKEFAQIIKIGRTHTQDAVPLTLGQEFSGYVQQVKYAMTRVKAAMPRIYELAAGGTAVGTGLNTRIGFAEKVAAKVAALTGLPFVTAPNKFEALAAHDALVELSGAMNTAACSLMKIANDIRFLGSGPRSGLGELILPENEPGSSIMPGKVNPTQCEAMTMVAAQVMGNHVAVTVGGSNGHFELNVFKPMMIKNVLHSARLLGDASVSFTENCVVGIQANTERINKLMNESLMLVTALNPHIGYDKAAKIAKTAHNNGSTLKETAIELGYLTAEQFDEWVKPADMLGPK	662982	688966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_663126_667925_668061_673977_674089_675268_675446_677306_677490_679713_679880_681361_681566_683048_683177_685476_685631_688601
815539	SIRV4	-	612	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	7	-2	7	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5151	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815543	contig_16650_pilon	+	864	5	Intergenic	novelGene_61967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	31	junction_4	1139.09415765335	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	83	484	244670	255622	FALSE	30	TGTCATCAAAGCTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTVCVWNPCLC	244587	256002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186_254358_255594
815545	contig_10063_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_127768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784428	786092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_784400_786100
815546	contig_11855_pilon	-	802	5	Intergenic	novelGene_66905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	287.690263130333	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	206	664	738197	733972	FALSE	15	GGTACCATCTCTTGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSERTFIAIKPDGVQRGLVGDIIKRFEQKGFRLVAMKFVQASEEHLKQHYIDLKDRPFFPGLVKYMNSGPVVAMVWEGLNVVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIVHGSDSVKSAEKEINLWFKPEELIDYKPCAHDWVYE	738662	733833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_734090_735083_735197_736448_736551_738071_738206_738465
815549	contig_5590_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_163010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTTCAAGGACCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288192	286170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_286200_288200
815550	contig_7915_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_42970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGATTAGAGGCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111623	110551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_110600_111600
815552	contig_5549_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_81677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547018	548809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_547000_548800
815553	contig_8020_pilon	-	729	4	Intergenic	novelGene_114351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGTGTCGCCCAGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53769	47464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_47566_51342_51416_51504_51553_53262
815554	contig_18607_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_175109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGCAGCTTTCCCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81856	83090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_81900_83100
815558	contig_10667_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_137321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117630	116149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_116100_117600
815559	contig_1406_pilon	-	1185	7	Intergenic	novelGene_25629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	308.611226122591	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	86	781	2692029	2614118	FALSE	35	GATTTTAAAGATGTTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSVSSESSSSSLSKKKKAKLEHGGSSGSKQNSDHNNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALGDQIIFVNRPDKKKILFFNDKSCQFSVDEEFQKLWRSVTVDSMDDEKIEEYLKRQGISSMQESGPKKVAPVQRRKKPASQKKRRFKTHNEHLAGVLKDYSDITPGK	2700462	2613713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2635836_2635931_2645903_2646012_2660128_2660221_2691860_2692034_2700381
815563	contig_12884_pilon	-	542	4	Intergenic	novelGene_104996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	459.985748571506	301	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	269	484	899974	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPQRPLPAAPASFLRGRRVLVWRKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915305	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900355_915235
815564	contig_4301_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_65142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCCCTGCATGATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661093	660521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_660500_661100
815565	contig_5779_pilon	+	1450	2	Intergenic	novelGene_106505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCTACAGGGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210863	214327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_211075_213088
815566	contig_13004_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_112647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTATGGCTGCAAACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423048	423871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_423000_423900
815567	contig_13004_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_112648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	45	275	319	424498	424542	NA	40	CTGAAGGAGACCAGACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSFFFFFLLKNLSFFRSQYRIQTSSLCRRSFLTYFECSVCLVLCRGCGVGFQGLSLDPWSPWFTGLLLSLLPLGVSLHWEPGEGRTGSSLMLVPPAPSTEPGTS	424223	424677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_424200_424700
815569	contig_3155_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_26327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTATACATTATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51152	50196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_50200_51200
815570	contig_9527_pilon	-	955	6	Intergenic	novelGene_134092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	34.3895332913955	650	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	44	910	628863	626376	FALSE	20	CTTTCCCAGAACCGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGPVGLGVCSEGCMSGLRALLGLGLLVAGSRLPRVRSPAGVCRSGPVWWRPQRLISGVHEDPAAMASAAVKYLSQEEAQAVDQELFNEYQFSVDQLMELAGLSCATAIAKAYPPTSLSRSPPTVLVICGPGNNGGDGLVCARHLKLFGYQPTVYYPKRPNKPLFTALVTQCQKMDIPFLGEMPLEPMMIDELYELVVDAIFGFSFKGDVREPFRSILKVLSGITVPIASVDIPSGWDVEKGNSEGLQPDLLISLTAPKKSASQFTGRYHYLGGRFVPPALEKKYQLNLPSYPDTECVYRLQ	628906	626330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_626579_626891_627040_627959_628074_628151_628263_628423_628533_628681
815571	contig_5832_pilon	+	3116	26	Intergenic	novelGene_134162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	4.67948715138743	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1016	3048	68	3115	459130	509836	FALSE	25	TACTTAAATGCGGTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLFHTLLYMTSLSPLVGFNVDVAQTWVTPEGSPFVLSSLLHQDSSTNQTWLLVTSPRANGSAGHLHRCSLFLNELSCQPVEHGPIPKGRHQGVTVVQNHHGVLICIQVKTRKPHSLSPELTGTCNLLAPNLQPRAQAYFFNLDNLQDPDAHVGVGDCYRNKKSSMEGTKNSARWRRALEEVEEEEEEAGTEIAIILDGSGSIDPPDFQKAKDFVSNMMRTIHEKCFECSFALVQYGGVIQTEFDLRDNQDVMASLARVQNITQVKNVTKTASAMQHVLHNIFTPSHGSRKKATKVMVVLTDGENFGDPLNLTTVINSPEMQGVERFAIGVGDAFNKDRSDKELKLIASDPDETHAFKVTNYTVLNGLLSKLQQSIIHTEGASGDALHFQLAQIGFSAQILDEEQVLLGAVGAFDWSGGALLYNTSSCRGRFLNQTSVDTQAAQYGYLGYSLAVLHGADDRFYVAGAPRYKHRGAVFEFREKGPEANFLPVLEGEQMGSYFGSELCPVDIDKDGTTDFLLVAAPFYHVHGEEGRVYVYRWNKQYGSFSLARTLSGHPKFTNARFGFTMAAVGDISQDKLTDVAIGAPLEGFGADDGASFGSVYIYNGRQDGLSASPSQRIRASAVGPGLHYFGMSLAGGFDFSGDGLADITMGTLGRAAVLRSRPVVHLKVSMNFSPEAVPIGFNGSVNVHLCFEISSGTPATETGLREMSLNFTLDVDVKKKRKRLQCLDVKTCLSTLKEWGSGSCLCESFQLLPTERKLYEEDRFSNVSVKVSYQLQTPKTHRDHPCPILDLYTEPSAIFQLPYEKACKDKLFCEAKLQLTTTISQEELVVGLTKELTMNINVTNAGEDSYRTNLTLKYPRNLQFKRIQKPPFPNIQCDDPKPVVSILVMNCKIGHPIFKRSSADLLVVWQLEENAFPNRTADITVMITNSNERSSLPLPSKTTLRFKHAFIAVLTKPSVMYMLTSQRPSDHKEFLFNIHGENLFEAKFQLQICVPLRIQAFQVVRVKNLTKTQ	459062	509837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_459164_471843_471962_481489_481582_483132_483201_483585_483704_483933_484072_484668_484785_485424_485577_486824_486979_487651_487803_488218_488287_488965_489102_489599_489743_490277_490419_491069_491295_492395_492527_494017_494149_495699_495864_497268_497398_501165_501240_504883_505017_507538_507638_508315_508396_508836_508918_509577_509642_509728
815572	contig_4971_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_174755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	8.36566644087606	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	320	1204	417763	362355	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGQNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELEGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVRKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALKLTCEAIGKPQPMMISWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGSAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTILTIIADSRAGEEGSIRAVDHAVIGGVVAVVVFAMLCLLIILGRYFARHKGTYFTHEAKGADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI	427912	362207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4971_pilon_-_362474_364663_364796_395275_395357_400361_400535_403858_403959_415025_415185_417642_417781_425561_425715_427763
815573	contig_7171_pilon	-	759	8	Intergenic	novelGene_101195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	341.959002197154	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	92	676	49603	37493	FALSE	5	GCCCTGTGTCTCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSESIRSGGRCPNGHPDTKLPHQLTVPSLLPPVIEPTEWCVYEAQPEREDRWNQSWD	50456	37409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37663_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_50365
815574	contig_9804_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_176212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAGTCAATAAACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23817	24165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9804_pilon_+_23800_24200
815577	contig_10324_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_7818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAGAAAAGCCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232502	230934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_230900_232500
815578	contig_15062_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_162306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261474	263841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_261500_263800
815580	contig_10016_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_117857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTCAATCTCATATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337008	336669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_336700_337000
815584	contig_12503_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_143827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGACACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132288	133099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_132300_133100
815587	SIRV1	-	176	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3928	0	3654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
815588	contig_7426_pilon	+	2787	3	Intergenic	novelGene_27457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	35.5	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2091	2528	587458	589692	FALSE	60	AAAAAAAATCAAGCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFPCDAVGPLLSSALLFGSCSAGRNEKGQLGHGDTKRVEAPKLIEGLSHEVIVLAACGRNHTLALTETGSVFAFGENKMGQLGLGNQTDAVPSPAQIMYNGQPITKMACGAEFSMIMDCKGNLYSFGCPEYGQLGMEVYFLKAL	585367	589951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_587660_588066_588156_589545
815589	contig_5935_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_102745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTAGCAGCCAAGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298473	1297973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1298000_1298500
815591	contig_6497_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_35622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAATAAAATAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680099	678446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_678400_680100
815593	contig_5145_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_131410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGACCATGGTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777980	778682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_778000_778700
815594	contig_6710_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_98331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCAGGACAGCAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657533	653713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
815598	contig_20823_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_159910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCGGGGCCGGCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34710	34213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_-_34200_34700
815599	contig_9363_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_6506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGATGCTTTCCGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479490	480081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_479500_480100
815602	contig_4989_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_160783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTTACAGATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87161	88083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_87200_88100
815603	contig_20819_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_55690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGCAATGTCTCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79807	79466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_79500_79800
815604	contig_8671_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_126291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	125	493	948900	948532	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWALRRAFLCGKASPQAVFSLPPGTFSAFASPHHPEDHTLLLLVTANSGGCSQFESFGHRVGDCSRRRGDPGRSVCRQGSSDTTGELTALAPRKAGGRTYPLSFSVLALVHKVSHQCSYFYPT	949024	948531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_948500_949000
815605	contig_7272_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_25319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATCCAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496270	494199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_494200_496300
815606	contig_7446_pilon	-	1232	4	Intergenic	novelGene_101942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	44.9691252107735	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	462	842	166804	156374	FALSE	30	TGTTTTAAGATATCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE	167265	155983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_156439_163488_163595_165971_166061_166683
815607	contig_19378_pilon	+	2589	13	Intergenic	novelGene_73790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	66.4571708362277	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	331	1023	20180	38380	TRUE	25	CACGTCTACTGGAGGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPESKKLFNIIILGVAFMFMFTAFQTCGNVAQTVIRSLNNTDFHGSGYTSMAIIYGVFSASNLITPSVVAIVGPQLSMFASGLFYSMYIAVFIQPFTWSFYTASVFIGIAAAVLWTAQGNCLTINSDEHTIGRNSGIFWALLQSSLFFGNLYIYFAWQGKTQISESDRRTVFIALTVISLVGTVLFFLIRKPDSENVLGEEESSDDQDLEVSESPQNNMTKAVDARKVS	19849	50583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_20276_20775_20832_23010_23119_24164_24245_24377_24475_26588_26648_27175_27321_29928_29965_38364_38450_40439_40518_46836_47012_47746_47878_49470
815608	contig_6710_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_96095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
815610	contig_5253_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_61562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATTAAATATTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194189	193392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_193400_194200
815614	contig_2733_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_128595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAAATGCCCAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912420	913434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_912400_913400
815615	contig_15407_pilon	+	614	2	Intergenic	novelGene_123071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGAATGTGACGGTGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449444	451036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449967_450944
815618	contig_14744_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_65938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192929	194540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_192900_194500
815620	contig_14683_pilon	-	1229	1	Intergenic	novelGene_166051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCCAGAGCATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172330	171101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_171100_172300
815621	contig_9858_pilon	-	1912	7	Intergenic	novelGene_140531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTTTCACAGCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234662	216793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_216875_223896_223991_224112_224277_227121_227293_230609_230711_232241_232359_233478
815622	contig_15918_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_132710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAATCCTTAACAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35181	35795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_35200_35800
815623	contig_15918_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_132711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGAAAAGATGGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35992	36904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_36000_36900
815624	contig_5145_pilon	+	1307	4	Intergenic	novelGene_131377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	17.6320415405843	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	224	661	553862	554299	FALSE	45	ATACACAGACTGCTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLRSSVPDYFKNVFGTFRQPAQKVQVCGGWNNVLQDASGFPAMPFLSFRFVSKILSLRPLNWNAVHLRSVRSCDKITSLVDEKNILDCFIALESLFQQAFTRYLFLDIFLFLFNNHLFVYNCTGVFVIFTWGSEQIAWHVSVT	544009	554945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_544058_544138_544181_544683_544731_553775
815625	contig_1450_pilon	+	1093	2	Intergenic	novelGene_27411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	339	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGAGTGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416680	418070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_416778_417074
815626	contig_14450_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_49023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCCTGGGTGGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197955	1198663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1198000_1198700
815628	contig_15236_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_141665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGGCCTGTGGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723909	723607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_723600_723900
815629	contig_6048_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_73204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCCAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501822	1502821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1501800_1502800
815630	contig_13004_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_112593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTATCTCTGGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58021	57458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_57500_58000
815631	contig_7720_pilon	-	1724	16	Intergenic	novelGene_155773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	121.100876224007	4	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	342	992	816558	799033	TRUE	5	TCCGAGGCTCCTGCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKGFQCRPADGEHRSNTGPSKIVVFHYPRDR	905283	795750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796061_798610_799077_800535_800583_802432_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_859303_859346_860591_860723_905197
815633	contig_9002_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_116730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAAAACTGGTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524358	523379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_523400_524400
815635	contig_14176_pilon	-	2130	15	Intergenic	novelGene_74857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	11.8588639026352	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	288	1967	451505	413308	FALSE	60	AAAAAACTTACCCTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLQQAYQRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIMLKQEGFYSSLCTAENITNVTLDEQLWWPSCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPIRLIGSACFVASCTLMALASRDPEVLSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTFMALMIGSYASSAITFPAIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCALNWPSEAFPAPEEVNYMMFKLKGLALDHKVTGERFYTHMTIVGQRLSQKAPSLEEGGNIFISSQDVRGPSETPSERSIPFRRSLCSPIFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAMNKMLEYIVTHGQEHEMNDVRQLAAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDNPTEGVALRDARDGITVKSTKRRYRKIQKLTNAISAFTLTNFLLVGFGITCLITNLHLQLVTFVLHTVVRGFFHSACGGLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLEGDPFYVNLGLLVFSLLGFLLPSYLCYFRARLQREYPTDWTDPQKVHSNSELTAV	453137	413144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_413458_415414_415539_419211_419286_419757_419900_421553_421693_421918_421955_422047_422195_424021_424198_424966_425101_427682_427776_431345_431423_431555_431612_431719_431898_451351_451519_452863
815636	scaffold_16539_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_68383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTACTGCACTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622276	623555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_622300_623600
815637	contig_11427_pilon	-	2112	17	Intergenic	novelGene_78980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	58.0479327797295	4	23	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2094	18	2111	138608	106823	FALSE	20	TGGATTTTCTTTTCTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQDPDMRLVFATLLSLGALGLCLATPENTVRWCTISGDEATKCSEFQKNMARVGAAPLTCVNRTSYRECVKAIVKNQADAVSLDSGLVFKAGQAPYKLKPVVAEVYGSKEQPQTHYYAVAVVKKDTNFQLNELRGKKSCHTGFRRSAGWYIPIGTLRPFLEWTGPPASLESAVSSFFSGSCVPCVDARQFPKLCSLCAGQGANKCACSSQEPYFGYSGAFRCLQDGAGDVAFVKDSTVFENLPNKNDRDQYQLLCPNNTRKPVDAFKSCHLGRVPSHAVVARSVNGKEDLIWELLRQAQARFGKTKAPEFQLFASPPGKKDLLFKDSALGFLRIPSKIDSALYLGFKYLSALQNLKKKKSSLDARRKQIVWCAVGREEQSKCNQWRRWSRRQVSCALASTSEDCIALIMKGEADAMSLDGGLVYTAGKCGLVPVLAENARSQESNGSDCVTRPSKGYLAVAVVRKSDADLTWNSLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLFNQTGSCRFGEFFRQSCAPGADPGSNLCALCIGDDSGQNKCVPNSKERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLDNTDGKNTQEWAKNLKPEDFELLCLDGSRKSVSEAWKCHLAVAPSHAVVSREEKAEYLENVLLQQQEQFGQNGSKCPKQFCLFQSKTKNLLFNDNTESLAPSLPEDGVCQSHLCSQVPAVIIARNKIRNA	138625	106821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_106921_108809_108904_110424_110610_111779_111848_115228_115371_116173_116330_117356_117405_118609_118701_120840_120996_121855_122031_123102_123282_127146_127203_128162_128311_128662_128846_129192_129302_131655_131820_138565
815638	contig_4845_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_53689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACGTTATGAAGTGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854139	852126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_852100_854100
815640	contig_5033_pilon	-	1095	6	Intergenic	novelGene_29058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3060.15657115776	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAATGATTTTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547681	531050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531123_531577_532161_533382_533491_533794_533908_534125_534215_547551
815642	contig_2646_pilon	-	2217	13	Intergenic	novelGene_69598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	119.919301569384	15	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	218	1162	1481821	1462718	FALSE	70	GTTTAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDLASGKLLRSITDAHPPGTAILHIKFTDDPTLAICNDSGGSVFELTFKRVMGVRTCESRCLFSGSKGEVCCIEPLHSKPELKDHPITQFSLLAMASLTKILVIGLKPSLKVWMTFPYGRMDPSSVPLLAWHFVAVHNYVNPMLAFCRGDVVHFLLVKRDESGAIHVTKQKHLHLCYDLINFTWINSRTVVLLDSVEKLHVVDRQTQEELETVEISEVQLVYNSSHFKSLATGGNVSQALALVGEKACYQSISSYGGQIFYLGTKSVYVMMLRSWRESGSPPETRLPHRSLGSCVVFPRRKSKSRSGIIRGCQ	1492518	1461662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1462740_1463164_1463254_1464121_1464158_1465150_1465226_1467346_1467518_1471527_1471609_1474912_1475021_1476564_1476625_1476727_1476882_1478147_1478216_1481740_1481828_1482718_1482844_1492432
815645	contig_9321_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_174720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATTTCACACCAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37671	36125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_-_36100_37700
815646	contig_3602_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_60585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCCCGTAAAGATTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663943	666061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_663900_666100
815647	contig_8864_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_135977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAGAAAAAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104074	105602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_104100_105600
815651	contig_5782_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_162133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTAGGTATCTCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352074	349960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_350000_352100
815653	contig_6740_pilon	+	1188	3	Intergenic	novelGene_142649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	13	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGTCTGATTTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19190	46959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_19605_44182_44288_46290
815654	contig_10437_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_38503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAGTTTACATCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305495	1305248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1305200_1305500
815655	contig_15760_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_131057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAAATTTAAGTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44480	46450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_44500_46400
815656	contig_10861_pilon	-	1443	6	Intergenic	novelGene_39408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	1934870	1934490	TRUE	25	TAAATCTCTTGGTATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKNVDLEPIVSCQYHFQTLTCLFPLLPISILIKFLVVIIVTIVTRIVTTLLKRLLSDGLGTPVLLVVGLTALGIRLVVPICLSLASYIAPTIASSSTGTTASLLLCRTPSATPRASWWSQRCPPL	1934871	1924561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1924706_1926361_1926500_1928884_1929088_1933415_1933570_1933930_1934055_1934191
815657	contig_6954_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_64464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCAAATAAAGTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823479	822151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_822200_823500
815658	contig_9177_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_32706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATATATATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510628	509366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_509400_510600
815660	SIRV6	+	219	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	230	-244	81	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTTAACAAAACGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
815661	contig_8656_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_162363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATATGAATGTAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637815	639821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_637800_639800
815662	contig_11932_pilon	-	2046	8	Intergenic	novelGene_85417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	15.2127765851133	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	151	1230	297029	292102	FALSE	25	TTCCAGGTTCATAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGENEEGKPKKKKPKKDSIGSKSKKQDPNAPPQNRIPLPELKDSDKLDKIMNMKETTKRVRLGPDCLPSICFYTFLNAYQGLTAVDVTDDSSLIAGGFADSTVRVWSVTPKKLRSVKQAADLSLIDKESDDVLERIMDEKTASELKILYGHSGPVYGASFSPDRNYLLSSSEDGTVRLWSLQTFTCLVGYKGHNYPVWDTQFSPYGYYFVSGGHDRVARLWATDHYQPLRIFAGHLADVNCTRFHPNSNYVATGSADRTVRLWDVLNGNCVRIFTGHKGPIHSLTFSPNGRFLATGATDGRVLLWDIGHGLMVGELKGHTDTVCSLRFSRDGEILASGSMDNTVRLWDAIKAFEDLETDDFTTATGHINLPENSQELLLGTYMTKSTPVVHLHFTRRNLVLAAGAYSPQ	297287	291285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_292320_292916_293095_293282_293461_294117_294283_294923_295054_295767_295889_296939_297076_297183
815663	contig_7396_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_79518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	447	902	37293	37748	NA	40	CCTCTTAATAAATTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEAHRNISCQSPGSAASAATLSLTLLLAVSGVTSLFFYLLGLVLGARILGPRMCSTPTSSFLVAVRYPLPASEMAHFKPSGMAKLTNPLIRVSYTLLAWSHPLKGATHLICIISRLSNPLSGPQAPYLYSSTQSFGGSYKTTVRKAMQK	36846	38901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_36800_38900
815664	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
815667	contig_14744_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_66069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	1192.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	3	359	1382976	1384453	FALSE	15	GTGCCTCGGAAGCTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTED	1382973	1384453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429
815671	contig_4315_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_46831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAGAAAAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377272	377564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_377300_377600
815675	contig_17940_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_173960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	21	311	8254	7964	NA	25	CAGAAACCTGTTACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFFETLMYSQSSEVFIINAVLLTVMFFLGRIAVIPAFYYCMYYVYGNVVYTGLELLIPCSLASGLVVLQVMTIIWMIQIIRMWLCLNQHSHKTRQSNWKCSS	8274	7708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17940_pilon_-_7700_8300
815676	contig_6079_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_160084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	355	780	400909	400484	NA	15	GATGAGGGTGGGGCGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLMNKQISVRRNATGRLLRNEIGEILSCLLWTCQRKGQLLEKDIMFGKVEGQRKRGKPSVIQMDRVAPSAIGSHMSKIMEMAQGRAMVRSVLYKRAVSRADLTATNDNNLLKKLRVAHMLSARHGSRHFGYCSEQIRHS	401263	399828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_399800_401300
815678	contig_6164_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_121278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTAGAAAAAAAGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554542	552631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_552600_554500
815684	contig_12756_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_153231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGTAGTTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266108	267885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_266100_267900
815685	contig_7412_pilon	-	1765	7	Intergenic	novelGene_76286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	123.27667617554	19	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	16	633	280454	273902	TRUE	0	TTGTGCCTTTGTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLAPLIALVYSVPRLSRWLARPYYLLSALLSASFLLVRKLPPLCHNLPTQREDGNPCDFDWREVEILMFLSAIVMMKNRRSITVEQHIGNIFMFSKVANAILFFRLDIRMGLLYITLCIVFLMTCKPPLYMGPEYIKYFNDKTIDEELERDKRVTWIVEFFANWSNDCQSFAPIYADLSLKYNCTGLNFGKVDVGRYTDVSTR	280469	271656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_272575_273687_273972_274142_274250_274485_274563_274852_274967_275202_275264_280265
815686	contig_9646_pilon	+	1867	3	Intergenic	novelGene_117420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	149	junction_1	11.5	241	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	980	1405	49015	50711	FALSE	15	CTCTTCAGTTCTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGGEDPLYVARRLVRFASEDIGLADPSALTQAVAAYQGCHFIGMPECEVLLAQCVVYFARAPKSIEVYSAYNNVKACLRNHQGPLPPVPLHLRNAPTRLMKDLGYGKGYKYNPMYSEPVDQEYLPEELRGVDFFKQRRC	48035	51173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_49085_49771_49852_50435
815688	contig_11294_pilon	+	1242	9	Intergenic	novelGene_50056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_7	111.227174624729	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	4	951	251378	319241	FALSE	40	AATCCAAAATGATTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVK	251374	319532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137
815689	contig_5075_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_174077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554424	556440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_554400_556400
815690	SIRV4	-	205	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1308	8	1308	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
815692	contig_9335_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_147469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATATATGTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696849	697807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_696800_697800
815694	contig_4931_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_138354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193215	191242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_-_191200_193200
815695	contig_15350_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_164260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTGGATGATATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250877	251786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_250900_251800
815701	contig_15741_pilon	+	848	7	Intergenic	novelGene_159660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGGGGGCACAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49558	61273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_+_49922_50347_50418_50651_50749_60115_60172_60469_60558_60680_60837_61255
815702	contig_5815_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_141240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	1046091	1046492	NA	30	CGGTGATAACATCTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIICLWQGVVLKRLSVLKSFGELFLNADAYAHHLSSGGKKAKCSATQWLCRRKYLVFCSCKGHSLEKLTGWFCSVTWGRCEPESAHLTTGSPPYHESLSPGSLQVTNELRSQLPLRILGTSGAYGFISPLQEG	1046088	1046790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1046100_1046800
815707	contig_16882_pilon	-	583	7	Intergenic	novelGene_148203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	2054.7245557495	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	28	549	189133	181967	FALSE	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPALSKEKAMFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	189482	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187562_188683_188756_189058_189143_189464
815709	contig_4754_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_35978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTCTCTGTCTCTCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478683	477163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_477200_478700
815710	contig_1406_pilon	-	1314	8	Intergenic	novelGene_25627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	296.673668036316	24	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	105	464	2692029	2644126	TRUE	30	AAAGATGTTAGTGAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSVSSESSSSSLSKKKKAKLEHGGSSGSKQNSDHNNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDMPSSLSTT	2700481	2613707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2635836_2635931_2644012_2644154_2645940_2646012_2660128_2660221_2691860_2692034_2700381
815711	contig_14516_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_153937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320378	319153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_319200_320400
815714	contig_8686_pilon	+	2183	3	Intergenic	novelGene_154681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	36	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTAAGTTTGTAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236534	260489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8686_pilon_+_236653_239290_239382_258515
815716	SIRV4	-	350	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1173	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3985	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
815719	contig_5260_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_144417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTATGATTCTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515762	516336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_515800_516300
815720	contig_4911_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_176213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCATTACTTTTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45443	43451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4911_pilon_-_43500_45400
815721	contig_953_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_130019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580226	579281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_579300_580200
815723	contig_16951_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_98664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATGTGACTCTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111959	112832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_112000_112800
815724	contig_7179_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_78194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATTCCTCTAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268722	1266770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1266800_1268700
815725	contig_9727_pilon	-	1433	12	Intergenic	novelGene_86377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	255.069104232332	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	262	1200	585596	578319	FALSE	45	TATAATATGGAAAGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	591752	578085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_585584_585632_590071_590174_591628
815727	contig_5092_pilon	-	1234	3	Intergenic	novelGene_62318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_2	387	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	103	390	451516	447791	FALSE	75	AACTACAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIATTPPTFLPLCPAAVQAEPCRRPSPTVSAAAKMATGAPAGSSTASGSNRRLQQTQNQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAKLKRKYWWKNCKVILFTLCHPLHSQG	451618	446946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_447995_449415_449498_451514
815728	contig_7707_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_72119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCCTAAAGTAATCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29758	29349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_29300_29800
815729	contig_4385_pilon	-	1605	7	Intergenic	novelGene_141500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.4599751091468	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	82	543	307648	302988	TRUE	40	CAAATTTTAATGTCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHPGWAPPDCAKPVSDVHTASGNLPMGVLVSVVLLVVVLLLVVGVIFYRKAWGHGRKRNTAPKTSTGLTNPMFHEKGSTAALGRSSAAAPTAGPPEAVSSTHSHQPPRPLVSTETPKWPRPVPPRRHVQAPLPGSGVHTTGAGAAQAFPTQQAPPGAEAQAGHQANCCTPKATCQAQC	310663	301441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_302422_302905_303041_305403_305455_305721_305789_306246_306440_307550_307666_310599
815730	contig_1596_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_131613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGTTTTCAAGAAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166007	164927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_164900_166000
815732	contig_14048_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_146331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGGTCCACTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167372	166123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_166100_167400
815733	contig_3525_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_135128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCAATTTGTAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55918	54373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_54400_55900
815734	contig_7078_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_130142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232623	231877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_231900_232600
815735	contig_10734_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_51159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTGAAAAATCACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960964	962198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_961000_962200
815736	contig_11142_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_176216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAAGAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11645	11134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11142_pilon_-_11100_11600
815738	contig_7816_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_66515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCCAGCTGTGCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175551	175255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_175300_175600
815739	contig_4388_pilon	+	2759	1	Intergenic	novelGene_161982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGAACCATTTAGATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296696	1299455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1296700_1299500
815740	contig_1694_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_144963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAAAAAAACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547185	1545189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1545200_1547200
815743	contig_6630_pilon	-	1312	1	Intergenic	novelGene_30715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383893	382581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_382600_383900
815744	contig_13215_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_145898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174237	173731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_173700_174200
815745	contig_10331_pilon	+	1112	4	Intergenic	novelGene_54180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	244	junction_2	99.569071503153	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	671	979	589019	595092	FALSE	60	TTACTAGAAGTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPHPSPEEAVAEEPLHTVAEEESCSPSAELEKPLSASVDSKPVEDKTVEVNDKKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEAGRQQSSVTVSETLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPTGFDASVSSSSSNHPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNSKKKGKGTNSSDSEELSAGESVTKTQPVKSVSTGMKSHSTKSPARMQSPGKCGKNGDKDSDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERITILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERESKCFFYLT	583338	595225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_583815_586578_586693_588938_589155_594919
815747	contig_8330_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_71995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAACTGCCCCATAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2087219	2088167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2087200_2088200
815748	scaffold_19766_pilon	+	1860	4	Intergenic	novelGene_34381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	285	1472	723607	727329	FALSE	15	TTGGGCTATGGTCATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVSPARTMRLWLWGPRSLGVALGVFMTIGFALQLWGGPFQRRLPGVGLQLRQPWAPSRGPSVPSCTPRQRLVFLKTHKSGSSSVLNLLHRYGDRHGLRFALPTRYQFGYPRLFQASRVKNYHPQDGRDMRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722595	727717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722709_723435_723738_723925_724183_726529
815749	contig_401_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_42949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTATTGGGAGTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2256468	2257388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_2256500_2257400
815753	contig_5260_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_144399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	132	338	452254	452460	NA	25	ACGTTCCAATTCAGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLQTTDSFTSSHCQLLSLHSLGISPLPSPFWFSILVSKLARIQMHAFNCCQLSAWGGGGGSSEVTPCQWASLITEETFLNPRDGENHHHYYLSGNCGVRQRLRLPPLIMRS	452122	453426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_452100_453400
815754	contig_11590_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_125613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATACTTAAATTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940536	940771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_940500_940800
815756	contig_10437_pilon	+	2320	10	Intergenic	novelGene_38384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	16	516	648165	648665	TRUE	10	AGGCCGGGGGTGGGGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPGLMILESKDAVSTLLDVGLSITSSWVGVPPRSSRTGVPSVLSIEVLGGPRWKSEGWFSAGALDPKLLRIGMFKFKPLKPGLPFKKLWIFISKLGEVDSDSSFGLEISEDWHMATSAGGTTGLVLLWGPGNPRELDGSLKVVLGSPGLCPMEGLLAEVEETSEADELGE	648149	753300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_648828_652005_652208_653742_654001_655241_655524_665486_665664_668595_668723_669284_669338_671550_671651_701290_701422_752988
815762	contig_14362_pilon	+	2699	1	Intergenic	novelGene_142511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGTCTTGTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15964	18663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_16000_18700
815764	SIRV4	-	286	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1220	15	1220	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3938	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3900
815766	contig_6589_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_25745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCTCTCCGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482751	481549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_481500_482800
815767	contig_14525_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_149770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTTAGAAAGTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164958	166308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_165000_166300
815768	contig_14525_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_149771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAAAAAAGCAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166457	166811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_166500_166800
815769	contig_960_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_108275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAAAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966532	968635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_966500_968600
815770	contig_9678_pilon	-	1675	14	Intergenic	novelGene_146353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	1350	1673	195524	190943	FALSE	15	GGGGCCTGCCAGACCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLIETKNILIISEKPPAGWRRRGRPWNWDRGRWRSSWGQEAAGAGTSPRRAAGATGPLGRPGSSPLPARAAAPAAQAASVGTARAGGEATADFFAWPLAALPRLLG	213293	190940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_191225_195482_195629_199413_199480_200863_200913_201169_201280_204660_204762_206751_206790_208342_208502_209056_209145_210397_210469_211274_211451_212326_212418_212585_212689_213100
815771	contig_10239_pilon	+	1538	3	Intergenic	novelGene_175244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	15	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAATCTCTAGCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29513	35299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_29643_29885_29982_33986
815772	contig_7728_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_64740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAGAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869450	867801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_867800_869400
815773	contig_3426_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_57926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCACCTCGGGGGCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205072	205503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_205100_205500
815776	contig_9706_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_20782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTTGAGCTTTAACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890	688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_700_900
815777	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	0	340	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
815781	contig_12923_pilon	-	1592	3	Intergenic	novelGene_30109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	676	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCCCATGTCCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51729	45982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49301_50890
815785	contig_16492_pilon	+	1217	5	Intergenic	novelGene_100270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	85.0029411255869	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	104	979	78509	100927	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQEATNQLLDVNLFENQRFVKVTESGHRSESEHLEVTVGATVPTGFEQTAADEVREKLGSSCKISKDRGKIYFDISVESLAKVHCLRSVDNLFVVVQEFKDYQFKETKEEVLKDFEDLAGKLPWTDPLKVWKINTSFKKKKAKRKKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVASNNELLLHFVTSVCPTTR	76788	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78764_79866_79945_85572_86057_100868
815788	contig_6634_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_171145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTTAGGATATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272377	271645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_271600_272400
815789	contig_6634_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_171144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGTTTGTTCACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270635	270261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_270300_270600
815790	contig_11832_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_106908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	94	528	70797	71231	NA	10	TTATCAGCTCTTCTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPLHKSQAGQKHSPPLSTQVPEPTKGASSDMGTPAQTYLPSTLQSTQRPTLPAAPPSLDRGHTHFNEIITSTVDHSLGAGPEARENQKQLQANVGPSAGRSAAAPVVSLLAITFVLSGVLVYMLCKKRREQAGPYCPGKLDLGHPSREVQSLPVRGPVPVAPRWLEDLTQADKY	70703	72061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_70700_72100
815792	contig_3727_pilon	-	1109	3	Intergenic	novelGene_146752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	107.5	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	521	1009	319555	317185	FALSE	25	TTACTCAAAACTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAEPLRKKKKVDPKKDQAAKDRLKRRIRRLEKASQELIPIEDFITPVKLLDKARQRPQVELSFEEAERRALLLKKWSLYKQQEHEMERDAIRSLLEAQQEALQELHLTSPELHAEAIKRDPSLLPFEREGPHYTPPVPNYQPPEGRYNNITKVYTQVEFKR	320075	317084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_317510_318461_318621_319550
815793	contig_16594_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_53856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAATCTTAAGCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129439	130159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_129400_130200
815794	contig_16594_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_53858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGACTATGGTAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130905	131538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_130900_131500
815796	contig_12603_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_105818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	742	1173	717340	716909	NA	10	ATTCCGGCACTGCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSSSVFLAGDSCVCAGSCKCKECRCTSCKKSECGTFPGNLGAEQGPDSGLSRQEQVNDPASAHPLLPATDSKLELKALEMVESQPFILEGGNRCWCSRFLQRQPRPSVGCQMVLSHGFPPTVILRTILTLCMVLETDIPFP	718081	716439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_716400_718100
815799	contig_6270_pilon	-	1501	2	Intergenic	novelGene_99891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGCTCTGATCCTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145907	1144333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1145303_1145375
815800	contig_8045_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_35475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATGATTCCTCAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596146	594431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_594400_596100
815802	contig_15105_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_150946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCTGATCCAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339087	341026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_339100_341000
815803	contig_5899_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_146969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCAGACCTGGTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73540	75654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_73500_75700
815805	contig_5586_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_143605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATCTCACTCATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667512	666199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_666200_667500
815806	contig_10599_pilon	+	983	9	Intergenic	novelGene_49874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	793.701839090096	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	107	517	123528	154650	TRUE	35	GGGTAAAGGATCTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEDFWAKYGGIDGEKIRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTVVF	123421	164043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_130743_130783_146885_147018_150905_151011_154179_154252_154639_154681_158529_158682_161352_161395_163801
815807	contig_11933_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_107270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACCAAAAAAAAAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203876	202124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_202100_203900
815808	contig_5549_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_81706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCTGAGCACCCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870254	868314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_868300_870300
815809	contig_8674_pilon	+	1968	5	Intergenic	novelGene_102925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	529.37557556049	14	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1500	468	1967	451273	452772	FALSE	45	AATCAACTGTAATGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWNAKPESATMPSSYPKSQSSFLQQALINPLASASQSSFNYPGSNQEACMYSSNSNLISQPLLNIKNYTTPQQISVSDMHNGANVASQTSVERKTYVNVQGPKQLNHNLQMSSGVAQNAWLNSQMRNPMLSHTGTTVVSNQTGVTVVSNQTGFGANRSNINTLQNQFIPSDTYSLQLQTIPSNSVRVPVTYQGNQGLNPSLSEQQVDWAQHCTANGLIFPDNSSLPKQYCYSQQGFLQDTALQKRNPMLSALLEVKNSQFPNPALSLQLQQNAAVQSHQYAVTQIDNRPPPPSYDCIYARQPLQNTQQVSKHSPMEVPQNQETHLPEVLKDLCSGFQQQWQNPNKGINTIGNFCNLKVNGKVSTNGNFCNLKVNGSVNQPANKPVRSLVDGVQTFAQNNKDKRMDSGSSTSNPILDTNVTKEGLVRDIKKLVDTRKKLLELARKIKINQNILMAAGCSKATNTSHSESAQNSELSLKQTSKIQSGSQVTPVTPEISEGQ	427680	452773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_428773_428980_430045_430137_445723_445790_451215
815810	contig_18822_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_111715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116001	116209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_116000_116200
815812	contig_13607_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_170193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCAAACCCACTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276258	275315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_275300_276300
815814	contig_4125_pilon	+	1688	2	Intergenic	novelGene_25040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	117	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTTCTGTGTCCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184317	186168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_184436_184598
815817	contig_14530_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_108450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGAAGGAGGAACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58956	59790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_59000_59800
815818	contig_8710_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_73525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGTAAACTTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405056	407056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_405100_407100
815819	contig_1450_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_27388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAGGCACTTTAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291390	292658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_291400_292700
815820	contig_5084_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_64665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGCTTCTCCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682797	1683200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1682800_1683200
815825	contig_7695_pilon	-	945	7	Intergenic	novelGene_41583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	46.7926869879852	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	99	776	417419	410001	FALSE	10	TGGGACTTTGTGTGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVHTTLPSPKVQALLESTGRQAALKGMGTSLLQNLGAAVAILAGVGPVQGVVRFLQLSPERCLIEGTIDGLEPGPHGLHVHQYGDLTRNCASCGDHFNPDGMSHGGPQDANRHRGDLGNVLADADGRVVFRMEDEKLKVWDVIGRSLVIDEGEDDLGRGSHPLSKVTGNSGKRLACGIIARSAGLFQNPKQICTCDGLTIWEERDRPISGEGRKQPAQPPAHL	423141	409831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_410155_410252_410357_410427_410506_416413_416475_416919_417098_417316_417455_423078
815826	contig_11493_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_143676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGGAAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161893	162251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_161900_162300
815828	contig_5598_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_148296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAACAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799339	797425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_797400_799300
815829	contig_1719_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_87346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCCCCGGAGCAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655869	655014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_655000_655900
815830	contig_998_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_153803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494330	496422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_494300_496400
815831	contig_18231_pilon	-	1002	3	Intergenic	novelGene_105890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	131	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCAGCAAACACAGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275326	258605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_258763_272879_272982_274583
815834	contig_12638_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_33255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTTACAGTGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807871	806763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_806800_807900
815836	contig_11416_pilon	-	1654	2	Intergenic	novelGene_145359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	0	179	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	29	1144	379558	378292	FALSE	25	CCATGGCCACGCGTAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPVTPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHNIFLWYTAAKKPPLEFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFVAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFVSDGSSNTFPVWFENPVQVEQDTFYTVSAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVTFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA	379586	377781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_379325_379475
815839	contig_12479_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_56849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTTAAGAATGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216969	217864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_217000_217900
815840	contig_15084_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_116674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGATCCTTTTCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89451	87899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_87900_89500
815842	contig_16492_pilon	+	2117	10	Intergenic	novelGene_100275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	96.2877631546882	1	118	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	645	1367	86032	100411	FALSE	25	AGTACACAATGGTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76793	101161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78830_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
815845	contig_16503_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_162074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCAGAGGCTGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120324	119555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_119600_120300
815846	contig_1276_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_159760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGGCATCACTCAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114047	114488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_114000_114500
815847	SIRV6	-	259	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-1008	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2828	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_2779
815848	contig_14549_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_176219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGCTTCAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11767	12416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14549_pilon_+_11800_12400
815849	contig_9901_pilon	+	894	2	Intergenic	novelGene_126945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	142	717	301993	302568	FALSE	30	TCTCAACATGCTCCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSDYTSFISHSWDFTDSQKAAVRRSEPKKRSFPPQSNNTEDLAVASMGSVNSRGHQAKAQVVMMGLDSAGKTTLLYKLKGHELVETMPTVGFNVEPLEVPGRVSLTLWDVGGQTQLRASWKDYLEGTDILVYVLDSTDKDRLPEAVAGLREVLDNPNMASVPFLVLANKQEAPDALPLLDIRDRLGLERFQDHCWELQACSALTGEGLPEALQSLRSLLKSRSHLCLQERSEESKKS	301078	302745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_301202_301974
815852	contig_348_pilon	+	1473	7	Intergenic	novelGene_67604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.5530178837489	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	238	1044	320222	345268	FALSE	15	ACTGTATCTCTTCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314476	345697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314584_320091_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
815853	contig_1337_pilon	-	1433	1	Intergenic	novelGene_84221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTTAACCTTTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68812	67379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_67400_68800
815854	contig_11370_pilon	+	710	3	Intergenic	novelGene_98738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	43	465	145831	148303	FALSE	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145788	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
815856	contig_7753_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_41487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGTAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034217	1032581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1032600_1034200
815859	contig_11126_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_138143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736398	737730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_736400_737700
815860	contig_17880_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_167338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42470	44207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_+_42500_44200
815861	contig_17859_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_155716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACAAACTTTACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195030	194287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_194300_195000
815863	contig_19821_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_176221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1	579	113225	113803	NA	35	ATTTCAGTTTACATATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNISSNISAFQSLHIVMLGLDSAGKTTVLYRLKFNEFVNTVPTIGFNTEKIKLSNGTAKGISCHFWDVGGQEKLRPLWKSYSRCTDGIIYVVDSVDVDRLEEAKTELHKVTKFAENQGTPLLVIANKQDLPKSLPVAEIEKQLALHELIPATTYHVQPACAIIGEGLTEGMDKLYEMILKRRKSLKQKKKR	113224	115928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19821_pilon_+_113200_115900
815866	contig_9678_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_146370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAGCAAATTCATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239037	240435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_239000_240400
815867	contig_15867_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_170900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATATGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187801	185734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_185700_187800
815868	contig_1008_pilon	+	543	2	Intergenic	novelGene_121614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	153	299	774488	774634	TRUE	25	TCTATGGGCTGCAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSASLRLELQQISSTSDSHPAHPQPPSTAGLHGGVNPPAPSALTGGTRGRMFPRVPEMKREPVALSSKLFNSFCFLDFLLSPFNSLLLPWDHLANKLQ	774335	775494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_774759_775374
815871	contig_6418_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_81155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTATCGTATTAGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290248	289478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_289500_290200
815872	contig_19459_pilon	-	626	4	Intergenic	novelGene_59809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5073.27674081445	296	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	26	352	16240	6939	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHDIIQ	16265	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6953_12625_12704_15503_15702_16203
815873	contig_15123_pilon	-	853	5	Intergenic	novelGene_110913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.223963167085	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	370	840	250047	217220	FALSE	10	CCCTTTAGTGCTGAGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLHATRAAALLTWVNSLRVANPVEAVLQLQDCSIFLKIIDSIRGTEEGQQIMQSTKGPVPVSGPTCVPNAALAWSFFYCPSQCLLSAPRPTVAKPQETVMPPTPRAPCLRGGVGWQPSQAAHPQLPRTCTGVGFGVMGKLLRARDGSFLNVITCK	256073	217206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217533_238110_238141_244656_244743_250005_250076_255732
815874	contig_11105_pilon	+	1913	2	Intergenic	novelGene_159833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	88	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1334	1678	576477	576821	FALSE	25	ACACCTGTTCGAAGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGFKLSMQIPCSWSVSKLLLRLQRQPSRTHPAITLSWAGTSTTCWAVVSLRDGSVDTGPKFREHDILKCAPPCPHPHFSPPTVDDFGGYLLGSGAEITNRLSKVHHYCPFF	571299	577056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_571532_575375
815875	contig_15327_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_70459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1164	1517	306321	305968	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSWWHDCTVWPWDREGRGAGASSPLGTYSRVCQQSKCWKGIPLRLALSSLTKLRLPVDTVKVKTLDTKLGDTVLFPSLPAHQCSSCITVQTVHAEWLSFPMCLNGQCPALLLSQGY	307484	305385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_305400_307500
815877	contig_5018_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_47003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	141	809	1215079	1214411	TRUE	40	ATTTGAGTAAAAAATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQKEAQRIMTLSVWKMYHSRMQRGGLRLHRSLQLSLVMRSARELYLSAKVEAHEPEVPLPTGRSPDPRLHPPREAEAAAQAAPPDGEPPSPEPMDTQETPRAEETPSRCSPRPAKASRKRRSSSLSDSGDAGLVPSKKARLEEEEAEETPSEVPDRLQPPPAQAEGAFPNLARVLQRRFSGLLNCNPAAPPTAPPACEAKPACRPADSMLNVLVRAVVAF	1215219	1213461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1213862_1214013
815880	contig_2365_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_103768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACTTAAATGCAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300435	299157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_299200_300400
815881	contig_11281_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_125416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39400	40972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_39400_41000
815883	contig_14454_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_161871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGGGTTTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38156	39064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14454_pilon_+_38200_39100
815884	SIRV4	-	557	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	62	-2	62	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	515	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5096	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815887	contig_9937_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_129199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTGGTCCCATCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47879	49425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_47900_49400
815888	contig_3942_pilon	-	964	8	Intergenic	novelGene_128859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	8.30539534499922	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	11	793	1491123	1486376	FALSE	15	CCAAGGACTTGGCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCMEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1491133	1486204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490936
815889	contig_3588_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_72875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCAGTCACCAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98777	97991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_98000_98800
815890	SIRV6	-	385	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-205	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2025	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1542_1647_1735_1844
815893	contig_12790_pilon	-	2221	13	Intergenic	novelGene_35193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.6402905455419	1	105	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	162	944	242434	203441	TRUE	55	AACTTAAATCAACAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIEKMSILGVRSFGIEDKDKQIITFFSPLTILVGPNGAGKTTIIECLKYVCTGDFPPGTKGNTFVHDPKVAQETDVRAQIRLQFRDVNGELLAVQRSMVCTQKSKKTEFKTLEGVITRTKHGEKVSLSSKCAEIDREMISSLGVSKSVLNNVIFCHQEDSNWPLSEGKALKQKFDEIFSATRYIKALETLRQVRQTQGQKVKECQTELKYLKQNKEKACEIRDQITNKEAQLTSSKEIVKSYENELDPLKKLNKISLK	242595	196627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_196790_197692_197852_199630_199789_199935_200107_201577_201785_202200_202395_202987_203125_203351_203468_215516_215722_216251_216438_220406_220559_240647_240732_242305
815896	contig_16776_pilon	-	1135	5	Intergenic	novelGene_130517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	417.25471836757	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCCTTAACAGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57964	34737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37154_41422_41567_42702_42804_57706
815897	contig_15123_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_110896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTGGTAAAATATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40838	40338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_40300_40800
815898	scaffold_19766_pilon	+	1771	11	Intergenic	novelGene_34440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	169.611467772672	1	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	237	1601	845891	851417	FALSE	10	TCTGGGCCCATCTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	845136	851587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846621_847932_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
815901	contig_678_pilon	-	1003	4	Intergenic	novelGene_167821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	43.9621048934951	324	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	74	922	148882	145019	FALSE	20	GTCATACTGATGGTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLRLRKRELHRRNSWGWSPGPAGRRVQNATQSALCLPQFPCRLSPSCVDAGAEPGRSRMISQDEFARQLQLSDPQTVAGAFSYFHQDTKGSVDFRDVALALAALDGGRSLEELMCLAFELFAEEQAEGRGRLLHQDGFSSILHLLLGSPRPAAATLHAELCRELCQAGPGQGLSLQGLSLRQFQDFSLRDPLYGKVFSTYLCLPHAPRGTPQRSKASSPRRPHCSGQRDRAGAQAEGRLSAWALLAASPPAGTRPADSGQRQGHPVPHPPLLLSEFLSLF	148955	144937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_145321_145530_145715_146490_146590_148618
815902	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
815904	contig_13992_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_147663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGACTCTGCTCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773934	775089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_773900_775100
815905	contig_12884_pilon	+	881	6	Intergenic	novelGene_104985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	90.4796109629125	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	5	880	874572	876908	FALSE	15	CCTTGCTGATGAAGTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPSSSFEGVARSVVRELDHSGKLIPVDSLRSSASFQPYCLVGRKPSRSWFWRPRYIPVNLSIWDILEPNAPEPAMQRSGPFHFHDTVDRQMKGSMELKVQGQWEISGRAAISSSSSTSMDVFMLRVDPSTWEALHQERRLRQPVHKVLQQLRNRGDNVYMVTEVLQTQKEVEVTCTHKQEGLGQFSLLGAACLQGDSQGHLSRKNTITIPSGSILAFQVAQLVISSDWDILLFPDKKQRTFPKSPAGETMGPLRVVVCPKRMSHEPWMLRSKQNPANKPTSPVAGHSPPPGL	874567	876909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_874792_874961_875155_875873_876043_876247_876351_876597_876739_876858
815906	SIRV5	+	414	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1104_2039_2157_2270_2316_3298_3405_3483
815907	SIRV6	-	161	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACGTCCCACGACGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10787	2774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2815_3106_3164_10723
815908	contig_7963_pilon	-	914	5	Intergenic	novelGene_58330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	67	405	48838	40105	TRUE	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPACLPCDRFLSRQHSNPVVPEWT	48904	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38573_39293_39405_39949_40178_43649_43819_48741
815909	SIRV6	+	364	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	14	-1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815910	contig_9443_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_167132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153482	153135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_-_153100_153500
815913	contig_8304_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_153165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAGAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52087	50262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_50300_52100
815916	contig_12635_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_60849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGAGAAATGAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555881	554267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_554300_555900
815918	contig_13051_pilon	+	1492	12	Intergenic	novelGene_140143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	365.155961245408	9	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	566	901	695546	699228	TRUE	15	TTCCTGCGGAATTCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLGISDYFFNTAGFVYQRAGVLKLTLTDDMIPKESKFRLTTKLFGTLIPEVTRRFPNMKVRILLSVTSPPHLTVDSTGLALTPELEAQTFVVLPNSSLAPLFQLARTFL	659722	709904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_659852_661933_662050_680921_681051_682927_683069_695495_695642_696735_696796_697731_697893_699209_699278_701884_701928_706424_706489_707612_707690_709546
815919	contig_6710_pilon	-	600	3	Intergenic	novelGene_95982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4151.5	14	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689768	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142_657193_689737
815920	contig_15327_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_70803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGCGGGAAGCAGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261093	1261785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1261100_1261800
815921	contig_9014_pilon	+	1699	13	Intergenic	novelGene_106773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	59.5106783135038	6	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	59	1456	106932	117993	FALSE	10	TATGGTGTGCTGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLLANMLALSDTLAVMSVDLGSESMKVAIVKPGVPMEIVLNKESRRKTPVTVTLKENERFFGDSAASMAIKNPKATLRYFQQLLGKQADNPHVALYRARFPEHKLGIDPQRQTAHFQISPQLQFSPEEVLSMVLNYSRSLAEDFAEQPIKDAVITVPAFFNQAERRAVLQAARMAGLKVLQLINDNTATALSYGVFRRKDINTTAQNIMFYDMGAGSTVCSIVTYQTVKTKEAGMQPQLQIRGIGFDRTLGGLEMELRLREHLAGLFNERQKGKSSKDVRENPRAMAKLLREANRLKTVLSANADHMAQIEGLMDDVDFKAKVTRAEFEELCVDLFERVPGPVQQALQSAEMSLDEIEQVILVGGATRVPKVQEVLLKAVGKEELGKNINADEAAAMGAVYQAAALSKAFKVKPFIVRDAVVYPILVEFTRETEEEPGVRSLKHNKRVLFSRMGPYPQRKVLW	106873	118236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_106969_107204_107299_107488_107568_107701_107857_107981_108059_108364_108547_108799_108916_110812_111006_111218_111354_111513_111597_111734_111868_112047_112152_117983
815922	contig_14441_pilon	+	633	4	Intergenic	novelGene_100531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	189.033212837204	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	401	625	116728	117775	FALSE	10	TGCTTGGCGCTGCCTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPTHAGTLLVHTPLDMQGRDPLPRGALASLNPRGPNQ	111195	117783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111984_112040_116578_116841_117663
815925	contig_11121_pilon	+	497	3	Intergenic	novelGene_167055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGCAAAAGTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55031	57580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_55316_55514_55664_57516
815927	contig_4071_pilon	+	1896	2	Intergenic	novelGene_151885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	0	62	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	66	614	338050	338598	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRRCFAVHSLNSLGRLISSLNSGIGQGSL	331770	339880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_331835_338048
815928	contig_14133_pilon	-	544	5	Intergenic	novelGene_119952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	1803.45312872278	41	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	44	505	209116	206601	FALSE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209450	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208585_208728_209012_209131_209421
815929	contig_13501_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_169061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26244	28176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_26200_28200
815930	SIRV4	-	551	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	51	15	51	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	220	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5107	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815931	contig_14925_pilon	-	730	4	Intergenic	novelGene_55214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1732.87352875698	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAATTTGGAAGAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87434	25808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_87375
815932	contig_10134_pilon	-	993	3	Intergenic	novelGene_16266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	1290	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGAGCACCCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39688	37479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_37774_38558_39164_39594
815934	contig_10733_pilon	-	871	9	Intergenic	novelGene_109962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	64.2354069030469	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	70	546	299663	297360	TRUE	5	TCGGTGCAGCTTGTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLVLLYSGVSVAFWATMLVVGTCYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGGVKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFTATNPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLLHWLMLRTPASL	299732	296341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_296599_297291_297400_297445_297483_297867_297920_298037_298108_298312_298391_298518_298603_298831_298881_299596
815936	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1171	3	1171	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3987	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
815937	contig_12327_pilon	+	1072	5	Intergenic	novelGene_140668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	53.2370876363461	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTATGGAAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124007	1137651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1131157_1136332_1136479_1136945
815939	contig_14322_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_115759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671650	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
815940	contig_3153_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_104686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATCCTCACAATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308751	308458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_308500_308800
815941	contig_10134_pilon	-	751	3	Intergenic	novelGene_16267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33.5	395	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGAGCACCCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39783	37479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_37774_38558_38817_39584
815942	contig_5171_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_161233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAGACACACAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490500	491625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_490500_491600
815943	contig_5171_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_161234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTCTGACTCATAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491832	492645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_491800_492600
815946	contig_3751_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_158639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAACATGAACACAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185692	187082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_185700_187100
815947	contig_3751_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_158640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAATGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187082	187551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_187100_187600
815948	contig_9127_pilon	+	1264	2	Intergenic	novelGene_102998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	26	973	55614	59835	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGNPQGEGTVTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVKNNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLSSAENVPQAEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRTPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVSDLTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTASK	55588	60126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_55717_58990
815949	contig_8377_pilon	+	1185	10	Intergenic	novelGene_34996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3617.5177800377	1	70	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	55	1083	68257	172874	FALSE	45	ATCTATGACCTGAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGKFILGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVF	68121	172976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68336_131421_131572_136291_136373_142302_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_172865
815952	contig_2069_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_23414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACTGTATGCCAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249875	1250502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1249900_1250500
815957	contig_12793_pilon	+	2046	2	Intergenic	novelGene_164121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACATGGAGCTGCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236438	239127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_238264_238906
815962	contig_8822_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_117929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65353	66526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_65400_66500
815963	SIRV4	-	224	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	390	3	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
815965	contig_11068_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_130547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGAATTTGTGAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201049	199649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_199600_201000
815966	contig_12622_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_5791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCGCCGTCGCTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192417	194572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_192400_194600
815967	SIRV6	+	253	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	110	14	28	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3133	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
815971	scaffold_14325_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_162660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTTACAATTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92378	93167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_+_92400_93200
815972	contig_1450_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_27444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATATTTTTGGTCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537956	539155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_538000_539200
815973	contig_1450_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_27445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACAGGCATATTTTGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539455	540087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_539500_540100
815974	contig_13244_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_86923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	165	572	239906	240313	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRRGKWRTGRRERRSRRIRNVLEPPEVNTTPASRAAGNAVVHFFKPSRGGGCAMGENGRVWLALTRPGVGPRRAPGTPGAAAGNLAHIASLLGESPPLCVTSWPQRTSRSEERGDRPQRTSHSEERGDRPQKWSPNSGWDSERRCRNRYRHIRDTHHTKRTPYTGHRAVASGTGRRPSFRRCWPFSYT	239741	241037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239700_241000
815977	contig_9011_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_159306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	43	483	455113	454673	NA	15	CTAGGGTTTTCAGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGIRLGPVTFLNSPSQSLAPSYILFPATRYQHSGASTDSHLQAEACPHCLDQVNLHPKRHTSRPLLCDLVSGSCHDFGSGLMPILIISCVPEILRISQRSCSDDWPSVLGSYLNLSLNTLHIPLESELYLAFVSPHPRKIFLCRM	455155	454525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_454500_455200
815978	contig_3601_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_132912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGAAGCCTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251716	250659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_250700_251700
815979	contig_11933_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_107263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAGATGTTCTGTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146634	147051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_146600_147100
815981	contig_14744_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_66045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAGATGCTAGATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322165	1320340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1320300_1322200
815982	contig_19781_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_176223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTGCAAGTTCCGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2190	4038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19781_pilon_+_2200_4000
815984	contig_8075_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_42483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663742	663470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_663500_663700
815985	contig_9708_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_67278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCCTTAGTTTCCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770909	771445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_770900_771400
815986	contig_2093_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_153000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATATCACAAGATGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414626	1413992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1414000_1414600
815987	contig_1172_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_162031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	116	457	609543	609884	NA	20	CGCCCAGCAACTGTCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVRPNSSLALSTGVVFMLSNPMHSRGAGAVVDKKITWGQRWHLFPGDIEEKTIDHSRDCCNPPPPFLVSASDHGQQLQLRGSKWGQPRSFCLHGTLSFQKKDKNVIVSLHS	609427	610614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_609400_610600
815989	contig_18364_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_102594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231409	230277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_230300_231400
815992	SIRV1	+	262	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6453	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
815993	contig_7963_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_58530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAAGCAACTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235439	236035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_235400_236000
815995	contig_10937_pilon	-	1396	11	Intergenic	novelGene_67312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	109.158096355699	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1320	77	1396	125114	71897	FALSE	20	TCCAGTGTCCATCCAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAEWKELEFSKEILPQTDFQTGYSMENEPGIVSPFKRVFLKGEKSRDKKAHEKVTERRPLHTVVLSLPDRVEPDILLNDYIEKEVKYLGQLTSIPGYLNPSSRTEILHFIDNAKRAHQLPGHLTQEHDAVISLSAYNVKLAWRDGEDIILRVPIHDIAAVSYVRDDAAHLVVLKTAQDPGISPSQSLCAESSRGLASGSLSGSGVVPVEACCLVVLAAESKGAAEELCSLLSQVFQIVYTESTIDFLDRAIFDGASTPTHHLSLHSDDSSTKVDIKDAYEVEVATFSFPDPTDVGGLSSLSFCMPPSPHLKTASESELSTTATELLQDYMLTLRTKLSSQEIQQFATLLHEYRNGASIHEFCINLRQLYGDSRKFLLLGLRPFIPEKDSQHFENFLETIGVKDGRGIITDSFGRYRRAASTASSSTTNGNRAAGSSDDQSLRAQQPCVGLGQRLTHHSPAATPA	125190	71896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_71969_72239_72425_73617_73757_74874_75014_75541_75600_78367_78504_79639_79777_81960_82145_82616_82701_117512_117687_125102
815996	contig_14687_pilon	+	1005	5	Intergenic	novelGene_107921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGCAGTAGCTTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458158	528020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_458274_458370_458519_459965_460089_523471_523544_527473
815997	contig_17108_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_109525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAATAGATGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59412	60869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_59400_60900
815998	contig_5018_pilon	+	1712	4	Intergenic	novelGene_46935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	3.39934634239519	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	130	738	238216	245936	FALSE	20	CATTGAGACTGATTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVRVVRRRARLWETLVPDPPDEDPSLAPARPQPWYQPQPGEAMAKVSVLNVAVLENPSPFHSPFRFEISFECSEALADDLEWKIIYVGSAESEEFDQILDSVLVGPVPAGRHMFVFQADAPNPSLIPETDAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYPNPELRENPPLKPDFSQLQRNILASNPRVTRFHINWDNNTDRLEAIDNQDLSLSGGLPLSCTPVKGLGLPGCIAGLLPENSMDCI	238086	246910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_238325_243372_243489_245203_245381_245729
816000	contig_5071_pilon	-	1086	7	Intergenic	novelGene_171275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.6830419909815	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	261	770	303096	130091	FALSE	55	GGAAACAACAGCAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWSKGKGLGAQEQGATDHVKVQVKNNHLGFGATVNNEDNWIAHQDDFNQLLAELNTCHGQEATDSSDNKEKKSFNLEEKSKISKNRVHYRKFMKGKDLSSQSKTDLDCIFGRRQNKKTSEGARLRIHCAEPRPNEQLDQQLDEVPGPAPARAVPWEPRRSPPLASLSP	307921	129774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_130238_251079_251157_258097_258191_293754_293834_295391_295485_303075_303186_307750
816001	contig_12479_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_56888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATTGTGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575302	573957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_574000_575300
816002	contig_9647_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_127387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87368	88464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_87400_88500
816003	contig_10240_pilon	+	2468	7	Intergenic	novelGene_176224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	54.3611891783917	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	129	833	93386	111399	FALSE	55	AAAGCATTAAATGTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSLVRRAALTHNDNHFNYEKTHNFKVHTFRGPHWCEYCANFMWGLIAQGVQCSDCGLNVHKQCSKHVPNDCQPNLKRIKKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDMCIREIEARGLKSEGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANNYPDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDTYSKFIEAAKVPNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDNLMNAENLGIVFGPTLMRSPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF	67397	113034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10240_pilon_+_67478_93337_93423_98329_98504_102741_102820_107032_107171_109006_109113_111227
816004	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
816008	contig_13148_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_162929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATTCCACGTTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87933	86563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_86600_87900
816010	contig_2550_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_135647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGGGGACCATGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544535	545122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_544500_545100
816011	contig_3602_pilon	-	1757	11	Intergenic	novelGene_60635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	5.86600375042499	67	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	988	1464	1096746	1093201	FALSE	15	CACGGTTGTCTACATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPAVVYRDLLHQGLEDQLILPGSDQFDSILCGLVTDMDLDGRLEVLVATYGQELLCYKYWGPESGLPKAESGFRLLWQRSFSSPLLAMAHVDLTGDGLQELAVVSLKGVHILQHSLIQASQLVLTRLRHQVEQRRRQQQQGLGGRVGPGAAETPAS	1101528	1092907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1093333_1095500_1095684_1095766_1095903_1096720_1096797_1097665_1097744_1097828_1097939_1098328_1098403_1098523_1098600_1100719_1100775_1100863_1100949_1101069
816012	contig_20614_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_107600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACATTTAAAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425261	425850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_425300_425800
816013	contig_9121_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_134456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAGAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160191	160726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_160200_160700
816016	contig_9363_pilon	+	727	4	Intergenic	novelGene_6625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1235.46761277754	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	101	625	872479	873683	FALSE	5	CTTGTGTTTTTCCTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	872378	873785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872480_872551_872729_873004_873095_873426
816018	contig_16831_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_134792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCTAAAATCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380273	379737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_379700_380300
816019	contig_7887_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_124948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGCGTAGGAACTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837665	838845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_837700_838800
816021	contig_10674_pilon	-	1861	6	Intergenic	novelGene_6472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	29.0957041502693	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	360	758	447616	434003	FALSE	25	GTTATGAGTTAATCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLEKEALKQKDREDFVPFTGEKKGRVFIPKEKPVETHKEEEVTLDPELEEALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETAGTKSGKGPVRKHSSTNPEGICKSSGDQHSRREVQPGRNPQQRPCGNCE	467199	432899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_434119_440728_440816_444948_445072_447543_447699_449519_449715_467117
816022	contig_5649_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_82421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATTAGGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368756	1367628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1367600_1368800
816026	contig_15062_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_162307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266343	265905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_265900_266300
816027	contig_11003_pilon	+	1894	9	Intergenic	novelGene_105426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	184.487635087016	2	128	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	151	819	56015	64604	TRUE	15	CACATGCCGCAGCGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVEPQPRAERTDHPGHQDSAGERPAGPDT	55864	73033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60024_60209_60874_61051_62751_62914_64521_64648_64778_64966_66252_66425_70010_70127_72476
816028	contig_9752_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_122029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156877	155026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_155000_156900
816030	contig_7412_pilon	-	1832	6	Intergenic	novelGene_76269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	81.3107618953358	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	274	1701	228446	220371	FALSE	35	ACAGATTTGTTTAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVPMGPDGLPVDASVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYNRHYEDGYPTGSDNYGSLSRVTRIDERYRPSMEGYRVPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPSSWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGEF	253658	220239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_220846_224026_224560_224978_225132_225891_225964_228251_228542_253480
816032	contig_4891_pilon	+	2671	1	Intergenic	novelGene_124603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTATGAGCAAACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953539	956210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_953500_956200
816033	contig_7622_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_132429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCCATCTTCAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273296	275271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_273300_275300
816038	contig_10948_pilon	+	1634	6	Intergenic	novelGene_124972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_2	24.2206523446418	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	152	1096	137961	151428	FALSE	45	AAGTCTAATAAAGTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVTVAGLPARLTLSVLTGAGRFSILGSGVATRKDLPEVLRRGFSDSRPQPLPCPDIRESSSCVSKCRLDYKRYVISRRLAETLAQILQGKRKTPQLVLECNPGPGILTQALLETGARVIALESDKTFIPHLESLGKNLDGQLDVVHCDFFKLDPRNGSLVKPPIMISQMLFQNLGIRAVPWSAGIPLKVIGIFPIKSEKKALWKLIYDLYSCTSVYRYGRVELNMFISEKEYQKLKARPKNPNLYQALSVLWQVACDIKLLHMEPWSSFDLHTQNGQLEKTKRRVRVKEHLSFSSSAWDVLYFFKIIWYSVLI	137809	151966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_138271_139024_139114_146844_146999_147337_147487_148692_148783_151275
816041	contig_18184_pilon	+	2314	4	Intergenic	novelGene_123870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	332.618232947157	114	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACAGTGTAAATGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119971	132236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_120108_124439_124521_127205_127284_130217
816042	SIRV6	+	429	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-80	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	66	305	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2392	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3177_10731
816043	scaffold_880_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_121518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGCCGTCGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573879	574934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_573900_574900
816045	contig_12654_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_129305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATCTTATAGAAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769796	769208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_769200_769800
816046	contig_4896_pilon	+	1775	1	Intergenic	novelGene_164321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACACAATTTGTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104686	106461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4896_pilon_+_104700_106500
816047	contig_9646_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_117427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAACTTCCTTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138354	136247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_136200_138400
816049	contig_8538_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_5071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842837	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
816050	contig_9705_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_41768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTCCTCCTGAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553131	550760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_550800_553100
816051	SIRV6	+	462	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
816052	contig_4336_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_152361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTGGAAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357129	356459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_356500_357100
816056	contig_615_pilon	-	2158	2	Intergenic	novelGene_80042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTAGAGAAGGCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27185	21941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_22407_25492
816057	contig_13542_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_131521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCCCGACCTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464518	464164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_464200_464500
816059	contig_7078_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_130157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCCTCTAGGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556432	554868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_554900_556400
816064	contig_11227_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_163173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110749	112705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_110700_112700
816065	contig_7272_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_25412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	574	909	849541	849876	NA	15	TCTTTCATAATTGGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLWKAPPCMAPRAGVAPREVSTVCPARSRHSSVQELQTSNTAFSGCLGHGKAQSLPAGVHGCPAVPSAVQLTVLLMEISFLSFSPSSLLLFPSLPFSCLLSSPLLLSFF	848967	849895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_849000_849900
816066	contig_11126_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_138149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGTCAAAAGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825432	823073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_823100_825400
816068	contig_19816_pilon	+	1233	2	Intergenic	novelGene_156513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGAATGCCTGCACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126781	128675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_127791_128451
816072	contig_20605_pilon	-	1211	10	Intergenic	novelGene_176229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	21.1735917513851	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	30	1142	50880	4418	FALSE	15	ATTACCTTATTTTGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKANSTCGMDDVIWAHGSRKNAVPPATSLVKSNDQKVQKNKKYIEYYLVLDNGEFKKYNKNPEEIRKRVFEMANYVNMLYKKLDTRVALVGMEIWTDEDKIKITPNASFTLENFSKWRASVLPRRKHHDIAQLITATELSGTTVGLAFMSTMCSPYHSVGIVQDHSDNLLRVAGTMAHEMGHNFGMFHDSYVCKCPSTICVMDRALSFHIPTDFSSCSRVSYDKFFEDRLSNCLSNVPLPTDIISTPICGNHLIEMREDCDCGTPEECTNICCDAKTCKIKAGFQCALGECCERCQVKAAGTVCRPAKDECDLPEMCDGKSGNCPNDRFRVNGYPCQNGKGYCLMGMCPTLQEQCTEMWGPELQSVAKPGERKSLAQR	50909	4348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20605_pilon_-_4471_5883_6080_8405_8496_9909_10088_10979_11111_22552_22638_25893_26064_31622_31695_32631_32704_50814
816073	contig_15471_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_175225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAGAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357227	355389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_355400_357200
816074	contig_14807_pilon	-	1320	9	Intergenic	novelGene_124721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	675.163487145891	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1293	26	1318	63253	45210	FALSE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILHYSISMPMWDEEEDEEAKKQTPKQRLLGWIQNKLPQLPITNFSRDWQSGRALGALVDSCAPGLCPDWDSWDASKPVNNAREAMQQADDWLGIPQVITPEEIVDPNVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLRPKLNPKKARAYGPGIEPTGNMVKKRAEFTVETRSAGQGEVLVYVEDPAGHQEEAKVTANNDKNRTFSVWYVPEVTGTHKVTVLFAGQHIAKSPFEVYVDKSQGDASKVTAHGPGLEPSGNIANKTTYFEVFTAGAGTGEVEVVIQDPTGQKGTVEPQLEARGDSTYRCSYQPTMEGVHTVYVTFAGVPIPRSPYMVTVGQACNPGACRAVGRGLQPKGVRVKETADFKVHTKGAGSGELKVTVKGPPCAALTRLPHLWPRSFHLEKGDEGAIRCPACLLWSCEGWGVLYHHPLVLYPAKRNKVLLL	63278	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45394_60724_60858_61309_61511_61596_61760_61848_61927_62007_62127_62649_62798_62881_62980_63084
816075	contig_709_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_57570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139087	2140674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2139100_2140700
816077	contig_10003_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_88258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	125	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATGAATCACCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747822	749994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_747800_750000
816078	contig_1008_pilon	+	1452	6	Intergenic	novelGene_121615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	48.3462511473227	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	164	1003	1082557	1108273	FALSE	35	ATTCAGTACAAAATCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLRSRVQEPPPQTAASGYRVATAPPSPPRAVPVGPVQETPARRGSVVETPGVKMTERFDCHHCNESLFGKKYILREENPFCVECFETLYANNCEECKKPIGCDCKDLSYKDRHWHESCFHCSQCKNSLVDKPFAAKEDQLLCTECYSSEYSSKCHECKKTIMPGTRKMEYKGSSWHETCFICHRCQQPIGTKSFIPKDNQNFCVPCYEKQYAMQCVQCKKPITTGGVTYREQPWHKECFVCTACKKQLSGQRFTSRDEFAYCLNCFCDLYAKKCAGCTNPISGIGGTKYISFEERQWHNDCFNCKKCSLSLVGRGFLTERDDILCPDCGKDI	1067506	1108722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1067646_1082532_1082713_1098455_1098631_1105955_1106126_1106988_1107176_1108121
816079	contig_6589_pilon	-	655	4	Intergenic	novelGene_25919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	289.372117216262	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAACCACCTGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178511	1158508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1177927_1178100_1178424
816080	contig_12277_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_139663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTTCAGTTAGATCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3276	4681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_3300_4700
816081	contig_14133_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_119979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGAGTTGATTCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261912	262496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_261900_262500
816083	contig_1339_pilon	+	1102	2	Intergenic	novelGene_163159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	113	631	678845	679363	FALSE	15	CACCATTTTCTGGTTCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRRDLGPLLRTQEAAAPGTGAGKEGGASLRTALPLQMLLLPPRPPHPRSSSPEAMDPPPPKAPPFPKAEGPSSTPSSAAGSRPPRLGRHLLIDANGVPYTYTVQLEEESRGPPQREAPPGEPGPRKGYSCPECARVFASPLRLQSHRVSHSDLKPFTCGACGKAFKRSSHLSRHRATHRARAGPPHTCPLCPRRFQDAAELAQHVRLH	677551	679834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_677652_678832
816084	contig_11630_pilon	+	1393	3	Intergenic	novelGene_147168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	180	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGAAAAAGCCATAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77614	155847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895_132059_154709
816086	contig_15500_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_128969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAGTAATTTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139629	141371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_139600_141400
816087	contig_5059_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_140766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTCCCTGTACCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558870	557005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_557000_558900
816088	contig_14514_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_137470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGGTCCCTTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45057	45841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_45100_45800
816089	contig_10019_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_86695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAAATATTGCTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356554	355188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_355200_356600
816091	contig_10197_pilon	+	1083	8	Intergenic	novelGene_115176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_7	86.7718095856915	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	103	858	383793	446362	FALSE	85	TAAAAAAAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEEEELEFVEELEAVLQLTPEVQLAIEQVFPSQDPLDGADFNAVEYINTLFPTEQSLANIDEVVNKIRLKIRRLDDNIRTVVRGQTNVGQDGRQALEEAQKAIQQLFGKIKDIKDKAEKSEQMVKEITRDIKQLDHAKRHLTTSITTLNHLHMLAGGVDSLEAMTRRRQYGEVANLLQGVMNVLEHFHKYMGIPQIRQLSERVKAAQTELGQQILADFEEAFPSQGTKVLLCVFPPVFRYYYHSWWIHTH	383690	446587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_383880_387697_387779_396878_396929_400177_400245_419509_419597_423922_424039_425888_426009_446214
816092	contig_990_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_76017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAACTGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561286	562873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_561300_562900
816094	contig_7131_pilon	+	784	6	Intergenic	novelGene_175335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	7.78203058333749	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	13	435	126497	128690	FALSE	30	AAAAGAATCCTGGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLEMDSRIPYDDYPVVFLPAYENPPAWIPPHERVYHPDYNNELTQFLPRVITLKKPPGAQLGFNIRGGKASQLGIFISKVIPDSDAHRAGLQEGDQVLAVNKVDFQDIEHSKAVEILKTAREISMRVRFFPYNYHRQKERTVH	126484	129039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_+_126584_127211_127296_127567_127625_128104_128204_128436_128498_128655
816095	contig_5145_pilon	+	2163	15	Intergenic	novelGene_131401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	50.7965128161935	11	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	12	1739	693521	751725	FALSE	20	TTTAAAGTATCTTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPLIPLSQQIPTGNPLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDITLGKIWDLADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHDVSLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMAAVPPAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPAVLPPSLVPPAKRKKTVFPGAVPVLPASPPPRDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHGVKQAQPVVSWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVKDIFMHSGLTQSLLAHIWALADTRQMGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGLDPPQVLSPDMVPPSERGTPVQDGSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTNEVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMVSSFLSTTLRLGPLWLFLNTFLLSVTKLLGLEDLRGDMPSPNRFRATLDTPFCLASWPTWLCCHPVTRTSLSPWSVNGAFLMCSWACCQLYCSLFSFFF	693509	752149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_693554_715248_715291_715812_715903_716421_716470_718772_718869_719044_719108_724140_724267_725568_725629_726482_726717_729680_729839_733079_733237_733632_733719_735692_735766_745681_745851_751432
816096	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
816099	contig_7308_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_159611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGTGGTTACCAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528195	529915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_528200_529900
816100	contig_6175_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_16275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	10	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAAAACGGAGACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545622	549156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_545792_547354_547461_548998
816101	contig_19012_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_159489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACTTAGGAAAAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91050	89359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_89400_91000
816102	contig_8843_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_156649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGAAGTCTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53454	54243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_53500_54200
816105	contig_1939_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_144874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGATATCTTAAATAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397770	398033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_397800_398000
816107	contig_14288_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_153810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAATTAAATTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165681	166486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_165700_166500
816110	SIRV6	+	219	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	305	7	74	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCCGCTTGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
816111	contig_2894_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_86557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGATGGAGACTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320914	320314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_320300_320900
816112	contig_6902_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_135615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536789	534966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_535000_536800
816113	contig_10861_pilon	+	897	4	Intergenic	novelGene_39380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.695516805508	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	68	376	1685906	1686383	TRUE	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIQTAELTPELVISNDKRSFCH	1685838	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686035_1686085_1686206_1686323_1686409_1686956
816114	contig_3787_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_102408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACCCCTTCTTTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545598	546840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_545600_546800
816116	contig_14744_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_65960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655304	657548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_655300_657500
816117	SIRV4	+	233	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAACATCTGATGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	5142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
816118	contig_4654_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_103077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTATAGGGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492441	493106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_492400_493100
816119	contig_7467_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_69488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCTAAGAAGCCTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125406	127567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_125400_127600
816120	contig_14694_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_152471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107384	109232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_107400_109200
816121	contig_3862_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_137420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGATTAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592037	590051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_590100_592000
816122	contig_5461_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_156834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCATATACTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804158	802808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_802800_804200
816123	contig_13744_pilon	+	2086	2	Intergenic	novelGene_77153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGGAGTAGAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152943	155079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_154478_154527
816124	contig_6056_pilon	+	938	7	Intergenic	novelGene_157885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	89.7496518099096	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	32	727	287191	312153	FALSE	15	TTTTGGAGACTTTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTTPGKGGKMHLDLPVFNTVKEAKEKTGATASVIYVPPPFAAAAINEALEAEMPLVVCITEGIPQQDMVRVKHALLRQGKTRHIHKKGRVGIVSRSGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFIDCLEVFLKDPATEGILLIGEIGGNAEEDAAEYLKQHNSGPNAKPVVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKISALQSAGVVISMSPAQMGSTIYKEFEKRKML	287159	312364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_287230_291373_291552_291751_291779_296259_296344_298038_298191_310502_310692_312126
816128	contig_17936_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_29968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTAATCTTTGTAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100545	99867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_99900_100500
816131	contig_10235_pilon	-	1171	10	Intergenic	novelGene_46353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	92.7762474923697	89	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	115	945	140447	131467	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDSTSTTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTQLPSSGASSGTGSPSATHGGGPPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNLPSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLLSRMECRGGGPKPSTVSRRRRCRLLSRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	141018	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_131425_131535_131619_131765_137527_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_140917
816132	contig_7976_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_169414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817705	818392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_817700_818400
816134	contig_14450_pilon	-	2761	1	Intergenic	novelGene_48993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073541	1070780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1070800_1073500
816138	contig_15720_pilon	-	1771	4	Intergenic	novelGene_41865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52.1301789327023	72	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1235	1537	260343	260041	FALSE	40	ACTAAATCAAATTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	262856	259806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_260733_261064_261341_261661_261826_262451
816142	contig_18613_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_80224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1045.92527816283	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	80	526	24385	31105	FALSE	10	GTATATGGTCTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGCPGVEATPSLPPPRGGTRGQEPQMKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQCEFPNNLVENFDEASKDEAN	23973	31362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_24053_24384_24454_27952_28067_28436_28654_31058
816146	contig_5643_pilon	+	1005	6	Intergenic	novelGene_38980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_2	588.139643282104	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	68	571	551251	552476	FALSE	20	CACAAAGCCTTGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHIFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ	551069	552910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_551130_551243_551329_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357
816147	contig_7189_pilon	-	1229	9	Intergenic	novelGene_117654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_6	45.2726117536861	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	351	1175	537152	505088	FALSE	50	ATTATTATACATATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIYIQEPPTNGKVLLKTTAGDIDIELWSKEAPKACRNFIQLCLEAYYDNTIFHRVVPGFIIQGGDPTGTGTGGDSIYGAPFKDEFHSRLRFNRRGLVAMANAGPHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKEKPEEEVKKLKPKGTKNFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDVSINFSINIHLNNL	537502	505033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_505164_506157_506238_520885_520956_523229_523334_524020_524120_526777_526922_529072_529186_532684_532782_537110
816148	contig_15245_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_145223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCTACAGGCATACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80031	82408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_80000_82400
816149	contig_11448_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_66398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAGAAATTAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451529	449228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_449200_451500
816150	contig_10263_pilon	-	1797	8	Intergenic	novelGene_135836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875114	858826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_858986_866403_866502_867600_867703_868277_868373_870539_870655_871590_871671_873822_874021_874164
816151	contig_6069_pilon	-	1697	2	Intergenic	novelGene_8034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	350	682	257840	257508	TRUE	95	AATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSAELRVHGRRAGQAAAEPPPTLHAPSQTLTLQRPLHPNAPVWGSHGRVGGSEPDTRTPDPPRQPGPGPSSQPAPHINVLVCANCRRPPAGLNSDPQGHGVGWGSYVSSRKKSTAPMALQVPLRGCPPWEDLLKAPGPVQGPRVFTACPQLLPTPLVNTPPPQCWTQWVTGHREPLGPLPGILLEWPRYRKVTRRHCFIPDVTFTFKNRCIPGKKISCQVNFDKDP	258189	256340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_256456_256607
816152	contig_3233_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_56514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1055	1372	134874	135191	NA	70	AAACCCAAGTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHPALGSCSAESLNAYWSRPKIGLCSEVPRAELKTKDPCPQGAIQLVGKRGQMPADNSLKQNMEEPGLCYWGSQSEKLTHSKIKTQKDQAIAGWMKGVTCRSPS	133819	135690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_133800_135700
816154	contig_13206_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_161904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAATTGAAAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194222	192554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_192600_194200
816155	contig_7171_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_101281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCTGCCTCTCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018876	1017893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1017900_1018900
816159	contig_13460_pilon	-	789	6	Intergenic	novelGene_162172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGGGCAGGCCGGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19658	7305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_7490_7672_7735_7909_8017_13300_13374_17724_17845_19415
816160	contig_14467_pilon	+	2276	3	Intergenic	novelGene_138285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	460	junction_2	5	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1465	1767	378013	387086	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGNKPTLTLGTNTNTSNFGTYKKQV	376548	387595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_378016_384889_385028_386924
816162	contig_2710_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_161789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTCAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034479	1035554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1034500_1035600
816163	contig_14855_pilon	-	1911	6	Intergenic	novelGene_146027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	42.8186875090772	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	450	1178	535978	531925	FALSE	55	ATAAATAGAAATCTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCVSEVSVPEVLEEDEEPDTTERACDTLLMCIVTVMNHGLRNGGGVGDILRKPSKDESLFPARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKLEHNMWNYLYFIVLVRVKNKTDYTGPESYVAQMIKNKNLDWFPRMRAMSLVSNEGEGEQNEIRLLQDKLNSTMKLVSHLTVQLNELKEQMTEQRKRRQRLGFVDVQNCMSR	536427	531191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_531994_532472_532635_533802_533964_534665_534832_535720_535849_535935
816164	contig_7695_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_41675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTTTCCTTGGTGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017329	1018608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1017300_1018600
816166	contig_5918_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_99611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTACTAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2107118	2108291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2107100_2108300
816167	contig_10864_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_107123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAGAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172376	1174036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1172400_1174000
816168	contig_10296_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_168869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37255	36403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_36400_37300
816170	contig_6658_pilon	-	1211	2	Intergenic	novelGene_168409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	756	1061	209947	209642	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNHCAIRQEIFPLVTDSNEGTRECSISIRNHFLTKKRTKRHRRQGYLDVMDGNSCCCSAVEGQNDAEKQSMKDSYGPGTHSCPCHPPSNNQSRENQLIKK	222737	209491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_-_210596_222630
816171	contig_5302_pilon	-	1102	2	Intergenic	novelGene_81489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGTACTTTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334719	328122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_328414_333908
816172	contig_14202_pilon	-	429	4	Intergenic	novelGene_157135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2321.64180412627	52336	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGATTTGTTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88601	86147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084_88214_88510
816173	contig_20550_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_142634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACAAGGGAGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41424	42920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_41400_42900
816175	contig_8866_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_77759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGCCGTTTTGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231567	229688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_229700_231600
816178	contig_14621_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_105866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAATTAAAAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398366	396086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396100_398400
816179	contig_12270_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_113932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13857	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
816180	contig_9535_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_124480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302327	304079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_302300_304100
816181	contig_7513_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_88937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.9170821991212	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	137	1021	87692	63046	FALSE	30	CACAATTGTATGATTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGDKIPLLCVPFEKKDFVGLDTDSRHYKKRCQGRMRKHVGDLCLQAGMLQDSLVHYHMSVELLRSVNDFLWLGAALEGLCSASVISHYPGGTGGKTGARRVQGSSLPAEAANRHRPVPWVQQTC	89158	62709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_63072_66270_66400_71522_71669_87108_87703_89032
816183	contig_6451_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_173705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCTTAGAGTCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174113	173270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_-_173300_174100
816186	contig_3942_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_128675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATATTTGCTTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401397	400164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_400200_401400
816187	contig_20199_pilon	-	725	5	Intergenic	novelGene_82582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1146.27091038724	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	44134	41055	TRUE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44134	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40915_40966_41250_42110_42171_43906_43943_44053
816188	contig_4385_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_141523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGAGCTGCTACCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468979	470083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_469000_470100
816190	contig_10003_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_88229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGACGTTCTTTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630591	631940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_630600_631900
816191	contig_6710_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_95777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
816192	contig_8317_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_19446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
816193	contig_11258_pilon	+	457	5	Intergenic	novelGene_67744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3820.51233475302	336	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	70	297	49419	52781	TRUE	10	TTCAGTGTCTTGTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPPRFWLLAVLVRARLSARVVAMVSTASAWNLLGRGARAPEPGQDEFSENLRRPRRGGQHDDHHQKNLAKSRKSRTFCSQPGERMPNLSRSRKTRIM	49142	53625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49173_49379_49553_50092_50154_52748_52872_53555
816196	contig_1715_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_127193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255580	254553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_254600_255600
816198	contig_9609_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_23159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCTTATCCACAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805387	804306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_804300_805400
816200	contig_1964_pilon	-	927	6	Intergenic	novelGene_130924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	12.0099958368019	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	909	17	925	579155	548369	FALSE	15	GTCCGAGGAGCTCTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAVMQSPAVLVTSRRVQNVHTGLDLTVPQHQEVRGKMMSGHVEYQILVVTRLAVFKSAKHRPEDVVQFLVSKKYTEIEEFYQKLCSHYSKASLPPLPRKVLFVGESDIHERRAMFDEILRCISKDAELAGSPELLEFLGTRSPGAVDLASRDVSILDADSQAGDDGEAFDFFGQQDGVAGESLLILGLKGKDAGNPLEEEEEEEVALDPLGIMRSKKPKKHLKVATTLKPMPRLTIFDEEVDPDEGLFGPGRKLSPQDPVEDMSPRDPLKLFDDPDLGGAVPLGDPLLLPAIHESGQPASSLGHRE	579171	548366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_548485_551697_551859_566233_566460_568328_568537_574982_575149_579123
816202	contig_5253_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_61572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATAGGGTCACTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230620	231080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_230600_231100
816207	SIRV4	-	226	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1297	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3861	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
816208	contig_10750_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_172607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAGAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83734	84043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_83700_84000
816210	contig_9053_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_87959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTTGTTAACATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319891	318848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_318800_319900
816213	contig_10864_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_107069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACTTTTATTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836499	838332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_836500_838300
816214	contig_500_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_31129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATAGCCGTTCGCAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751272	1752266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1751300_1752300
816217	contig_19476_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_116802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAGTCTCTCTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122883	121443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_121400_122900
816218	contig_9091_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_32452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACAGTATGCTCTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235388	236380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_235400_236400
816220	contig_15230_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_146448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAGAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115583	117169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15230_pilon_+_115600_117200
816226	contig_7057_pilon	-	1079	5	Intergenic	novelGene_123212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.7769323391806	178	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	143	1078	536193	534231	FALSE	10	TGCCTACTGACTCTGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRHLLTAALLLAQAKPLKASLLCGRLEYWNPDNGCCGSCLQRFGPPSCPDYEFTENCGLDDSGDHLVPPFKECAPGWCNPDGAELCRPCGGGAAAPAPARSSGGTQRRCGKRPVPTKKPCPLSKPGVLSSQEPSPPAISSVSWTSQRGHTPAGDVFPRALQSFAPSVVLVSLVTLSLILLLAVGRAADPGNATAVSPPGRAGGARGADRAAGPRAWAGAGGHGLRHDSAPGCKIRAARCLVHLCLLAAAQSLAAAGPARGGCSKGAHRLSGPACRAPGPARAGRRTAGVVQAQLIWGGPTECSIKFPLKY	536900	534229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534852_535074_535348_535534_536039_536305_536869
816228	contig_11294_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_50070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGCCCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329192	328819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_328800_329200
816229	contig_2636_pilon	-	791	4	Intergenic	novelGene_52074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	293.574522055304	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	121	396	85555	59950	FALSE	35	GTCAAGAAGTCATGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQILAFW	85675	59554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471_62624_81113_81216_85551
816230	contig_12915_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_148339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAAAAGAAAAATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64029	62540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_62500_64000
816231	SIRV6	+	274	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-439	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1846	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
816232	contig_13607_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_170171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCCTACGACAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155246	153112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_153100_155200
816233	contig_15977_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_137225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAGAAAGAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143895	144479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_143900_144500
816237	contig_9706_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_21045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGTGCATAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686260	687511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_686300_687500
816238	contig_11978_pilon	-	1640	15	Intergenic	novelGene_63112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	197.247436029998	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	253	1530	1979308	1877984	FALSE	45	AGAAGACATAATTATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGTHCPDLVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLREISCEDFSFRYGNSLTWSCESSFP	1979560	1877873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1878059_1886351_1886565_1887741_1887799_1891020_1891066_1891955_1892017_1894716_1894848_1900191_1900267_1901514_1901642_1903702_1903799_1918757_1918827_1919301_1919397_1920809_1920885_1925532_1925588_1940593_1940656_1979266
816239	contig_521_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_174737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATTTAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47676	46851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_46900_47700
816240	contig_4989_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_160791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	101	547	193339	193785	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFPVPPPVPALPADHCFGSSPCTPLRENHAQDIRPSFLYEACSYIQEQGAEGSITQPPGALPQTGAWENQWKGPRAVATVGAHEKPWRSGHEHHNAIYTDLSLDSPNAVSHVYLNKYASIYWGCMSKFVMMRYTIKEVGDFPKGRGP	193238	194256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_193200_194300
816241	contig_6375_pilon	-	1472	7	Intergenic	novelGene_72996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	15.3993145590604	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	128	580	319794	316401	FALSE	5	CATTGTGTTTTCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLATGCRYGQSNSSHFREKSPVREPVDNLSPEEHDARTVFCMQLAAHIQPRDLEAFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVLLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKILLAAMANNVQKGSGGPVHLYMGSRHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSRGYGFIMVNSWPGTLPP	320520	315508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_316434_318798_318865_319257_319396_319480_319634_319731_319850_319998_320053_320502
816243	contig_11316_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_122701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACCTATCGCAGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140158	140481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140200_140500
816244	contig_14450_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_49002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCGATCCCATATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103797	1105148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1103800_1105100
816247	contig_9696_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_68783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGCAGTAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202891	201513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_201500_202900
816248	contig_19402_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_80828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCAGTTCTACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116579	114801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_114800_116600
816249	contig_3426_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_57935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGATAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324373	322466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_322500_324400
816251	contig_5718_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_110384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACATCTGCCTTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204945	1203743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1203700_1204900
816254	contig_3787_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_102388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTTATGCTCTCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438686	439175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_438700_439200
816255	contig_5640_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_27285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATCTCTCGGTTCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120117	1121949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1120100_1121900
816259	contig_3018_pilon	+	674	2	Intergenic	novelGene_78911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	0	1593	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGGTGATTCCGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625235	626025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_625447_625562
816260	contig_8354_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_24069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64817	66193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_64800_66200
816261	contig_5718_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_110304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAATAAAAGAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184805	183304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_183300_184800
816262	contig_9505_pilon	+	601	5	Intergenic	novelGene_121864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	243.048863399934	391	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617425	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_617499_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632605
816266	contig_5253_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_61554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGCCCCGGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165919	165422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_165400_165900
816268	contig_2342_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_132743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCAATAGTTTGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14638	16097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_14600_16100
816269	contig_15543_pilon	+	1412	9	Intergenic	novelGene_164359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	72.4654012270684	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	14	946	194078	215910	TRUE	20	TGGAAGGCCTTGTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGHKNEHARRYLSKATTLERTYGPAWIAYGHSFAVESEHDQAMAAYFTAAQLMKGCHLPMLYIGLEYGLTNNSKLAERFFSQALSIAPEDPFVMHEVGVVAFQNGDWKTAEKWFLDALEKIKAIGNEVTVDKWEPLLNNLGHVCRKLKKYDEALDYHRQALVLIPQNASTYSAIGYIHSLMGNFENAIDYFHTALGLRRDDTFSVTMLGHCIEMYIGDSEAYIGADIKDKLKCYDFDVHTMKTLKNIISPPWDFREFEVEKQTVEETGLAPLETSRKTPDSRPSLEETFEIEMNESDMMLETSMSDHST	194064	217709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_194119_194564_194691_202041_202195_203537_203602_206569_206632_207648_207785_209402_209494_215650_215951_217283
816270	contig_4315_pilon	+	996	3	Intergenic	novelGene_46718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	8.5	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTTTTGCTAGAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62912	76626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_63167_74926_75101_76058
816271	contig_8375_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_141269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCCAACAATTCTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21563	22180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_21600_22200
816272	contig_6568_pilon	+	1395	6	Intergenic	novelGene_152866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	18.8827964030755	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	328	1395	160292	172846	FALSE	35	GTTAGTACAGTTACTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKTNVISELSKWRLNFIDWHRMEMRKEKERHAAHLKQLYNQINDLKELQKAYEVSIGRKDEVISSLSHAIGKQKERIELMRTFFHWRIGHVKSRQDVYEGKLADQYFQRTLLKKVWKAWHSTIQKQWKDMVERACQARAEEVCVQISNDYENKVAALTGALENAKAEIQRMQHEKEHFEDSMKKAFMRGVCALNLEAMTIFQNRNDTGTDITSNKKEEYAPGVQVKEPSAHLDSSAPLMPSVVLPPPRPPTPAATVTVGTASTAAVPSAASITSAGAASAASVHVPVSVPLVAGSAATAAPEEM	159964	172846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_160454_161758_161936_163634_163740_165393_165574_169003_169158_172556
816273	contig_7549_pilon	+	1639	13	Intergenic	novelGene_164540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	254.687867245816	72	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	4	1530	838462	899461	TRUE	70	GAAGAAAGAAGAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMIYDDVENGDEGGNSSLEYGWSSSEFESYEEQSDSECKNGTPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMKDLMANTVGAVEIQQLKQKHELKMQRLMKAAKEGTKDGLEKTKAAVKRGRSFIRTKSFISQDHRSCLEEEQSLFIDFDCKHPEAVMTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKILSERKLKMVFYRIKEILQCHSMFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQCQESSPDRITLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLNERKRDADQRCEIKQIAKAINERYLNKLLSSGNRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVKTKERRIFMLNDVLMCATVSARTSHESNAMISTSQRYLLKWSVPLGHVEVIAYGNNEGPGENSSYPPCTRWKAWWLLLMLSQTKFTRDQGNCTKICKTCCMT	838458	900010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_838621_841003_841121_847255_847371_850478_850586_854813_854892_855391_855572_857661_857779_860748_860842_867189_867361_869475_869622_874252_874434_899398_899515_899954
816274	contig_2733_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_128574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721882	723863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_721900_723900
816275	contig_3187_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_176232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAAGTAAACAAATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137722	139498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3187_pilon_+_137700_139500
816277	contig_6674_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_148034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	75	311	396280	396516	NA	15	TCTTTGTACCTCATGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHYGPAGKGPIETSDTVTFRSIIPMDGSFSQCSSLNSVFWNILQNHRGQMLSLRSLDSVFGRKHLGLAGCLFTLLLRTRKGEEEENACVVGGARGNQAWFPL	396205	398634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_396200_398600
816279	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
816281	contig_3233_pilon	+	1277	11	Intergenic	novelGene_56568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	302.287760255026	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	177	1145	740857	747909	FALSE	15	CCCCAATGGGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSGPHVCRVKLLQTVFKAVTFQKQISRSVFQAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738724	748041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743202_743290_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
816282	contig_9415_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_109757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496003	1498245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1496000_1498200
816283	contig_5799_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_50322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTAACCTTTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652207	653006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_652200_653000
816284	contig_11386_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_82824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAACAAGGGAGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188055	186658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_186700_188100
816285	contig_4301_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_65104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	178	744	530392	530958	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	530214	532642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_530200_532600
816286	contig_6434_pilon	-	947	3	Intergenic	novelGene_61822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_2	22.5	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	21	422	347897	337655	FALSE	35	TTATTCATTCAGTAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSSGDMAGIKALVALSFSGAIGLTFLMLGCALEDYGVYWPLFVLIFHAISPIPHFIAKRATYDSDATSSACRELAYFFTTGIVVSAFGFPVILARVAVVSFIFCCLARLSLSLLQRPVSESSVSFSLLILHIQNQTSF	347917	337129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_337965_343386_343463_347881
816289	contig_3111_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_129968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGACAAGCAAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51438	49465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_49500_51400
816290	contig_12157_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_135928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258445	256652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_256700_258400
816293	contig_6098_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_145471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAAATGTCTGAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65062	64513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_64500_65100
816295	contig_744_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_145076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTCAGCAGCATAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194872	193395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_-_193400_194900
816296	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
816297	contig_5928_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_40380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAGTTAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287028	287427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_287000_287400
816298	contig_3975_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_54730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGCTACTGCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637271	1635803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1635800_1637300
816300	contig_7380_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_157523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGGCCAAACTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210852	209069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_209100_210900
816301	contig_3132_pilon	-	1669	9	Intergenic	novelGene_127463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.7522521608607	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	97	945	522800	458556	FALSE	0	GCCTGGGCTGTGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDGPSGFGFELTFRLKRETGESAPPTWPAELMQGLARYVFQSENTFCSGDHVSWHSPLDNSESRIQHMLLTEDPQMQPVQTPFGVVTFLQIVGVCTEELHAAQQWNGQGILELLRTVPIAGGPWLITDMRRGETIFEIDPHLQERVDKGIETDGSNLSGVSAKCAWDDLSRPPEDDEDSRSICIGTQPRRLSGKDTEQIRETLRRGLEINSKPVLPPINPQRQNGLTHDRAPSRKDSLESDSSTAIIPHELIRTRQLESVHLKFNQESGALIPLCLRGRLLHGRHFTYKSITGDMAITFVSHSPSICLLRRPP	522896	457831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_458595_473035_473109_474931_475067_490202_490315_492332_492487_495265_495339_495616_495703_496627_496771_522766
816302	SIRV4	-	333	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1188	0	1188	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
816303	contig_2596_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_53485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTTTTCTGTTCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719042	718529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_718500_719000
816305	contig_8330_pilon	+	1219	10	Intergenic	novelGene_71745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAAAAGAACAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515309	526226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_515528_517905_517992_518613_518791_519047_519086_519345_519484_519761_519821_520378_520463_521227_521314_524732_524852_526012
816307	contig_10403_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_175804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTGCTTTCACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90881	91671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_90900_91700
816309	contig_15327_pilon	-	869	4	Intergenic	novelGene_70693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGATCCAAGTGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902147	900562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901025_901120_901281_901400_901536_902035
816311	contig_17059_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_166078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAACCAACATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396326	395004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_395000_396300
816314	contig_8712_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_58830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGAAAACGATACCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323152	322632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_322600_323200
816315	contig_12429_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_136209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTTGTTGCTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219312	219599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_219300_219600
816316	contig_16930_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_139159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTTTGTTTTATGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121511	120460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_120500_121500
816318	contig_4232_pilon	-	1504	13	Intergenic	novelGene_63180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	38.4122376333376	139	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	173	613	143519	140910	TRUE	20	CATAGCTTTATGTGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDERLQQHRASGGDHTPVSPSGEKSSAPEGPAAEAQDPSLPVSAQPRSRGSGGYWPARHSGARAVLLLLYQEHLNPSGCSFLTKEELLQRCAQKAPRVSILFPQWCQRRGGPAATTGAGAWRVQGAVVCGCQRDYRGRAQAGAAS	143691	138423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_138595_138681_138766_139300_139405_139484_139614_139779_139876_139965_140083_140633_140732_140817_140940_141029_141139_142221_142299_142484_142584_143153_143240_143479
816319	contig_9373_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_162737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACCACTACTAACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391447	393072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_391400_393100
816320	contig_6375_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_72968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGACAGGGCAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214626	215498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_214600_215500
816321	SIRV4	-	263	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1248	10	1248	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3910	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
816322	contig_10106_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_73848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAGTCTATAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22271	23692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_22300_23700
816324	contig_19977_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_175616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGGAAGTCCAAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22051	21618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19977_pilon_-_21600_22100
816325	contig_5728_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_126690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTGACCAGAGGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250224	249552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_249600_250200
816326	contig_2365_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_103755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACGCCTTTTTCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246689	245713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_245700_246700
816328	contig_13697_pilon	+	2274	7	Intergenic	novelGene_165944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	128.39738661238	227	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	336	1130	624246	628041	FALSE	20	GCCCCTGTTTGGTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMDERTLLREAKEVSLEKLHQAVRQNGVMSGLMQMLLLKVSAHITEQLGMAPGGEFREAFKEASKVPFCKFHLGDRPIPVTFKRAIAALSFWQKVKLAWGLCFLSDPISKDDVEKCKQKDLLEQMMAEMIGEFPDLHRTIVSERDIYLTYMLRQAARRLELPRASDAEPRKCVPSVVVGVVGMGHVPGIEKNWSTELNIQEIMTVPPPSVSGRLSRLAMKAAFFSLVGYSLYWLGRRTVGLVLALPVAQDCLQRVSTVLPKK	623432	629185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_623708_624185_624327_626795_626907_626996_627137_627337_627511_627587_627700_627863
816329	contig_6278_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_119832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGCTTCCTAGCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604837	602931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_602900_604800
816331	contig_6608_pilon	+	2685	22	Intergenic	novelGene_162540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	12.2923570081708	70	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	32	2287	230159	244895	FALSE	15	CTTTTGGTTCTCTTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVDGGEHIREATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAHNLVKLGITNLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKTGKITEEEAKKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDRNGQPITSENIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQMTKDVTRAMNEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHIRPPMSKAFSHTIAVMNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEKISANITKFNIHGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQYDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFTVGADTALNTICMTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEDPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWISGKIKESYRNGRVFANSPDSGCVLGMRKRALVFQPVTELQDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHISQKRSGETPV	222072	245293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_222102_230156_230231_231091_231170_232619_232810_233291_233458_234171_234217_234626_234736_234808_234905_235154_235248_236028_236155_237310_237376_237858_237923_238859_239010_239456_239528_239882_239971_240056_240210_240703_240869_242279_242342_242582_242695_244222_244323_244402_244509_244750
816332	contig_1154_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_87183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGATGGTGCCCAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966435	966060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_966100_966400
816334	contig_6028_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_156571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAAAGTTCTGGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301936	300837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_300800_301900
816336	contig_7720_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_155754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCAGCATCATCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487022	487390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_487000_487400
816340	contig_12520_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_161081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGAGTAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547026	548549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_547000_548500
816342	contig_5317_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_76606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGTACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709147	708235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_708200_709100
816343	contig_6164_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_121261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGGCCTTGACACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240245	240738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_240200_240700
816345	contig_7045_pilon	-	1283	8	Intergenic	novelGene_77491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_2	106.524309767436	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	140	1234	585475	568421	FALSE	50	TCCAAAAAAAGTTTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQVILFYC	591055	568371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585486_590926
816346	SIRV1	-	244	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3564	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
816347	contig_7457_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_31628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCTGAGGTGAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955504	955793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_955500_955800
816349	contig_10599_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_49878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGATATATTATTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137939	136472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_136500_137900
816352	contig_8276_pilon	+	1092	2	Intergenic	novelGene_174492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	996	97	1092	474012	479559	FALSE	60	CAAATCAAAGGAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSEQRAREVGHLEEELQKARQCLNQSQKFADEMRVKNTSQETALRDLQEKINQQENALTLEKLKLALADLEKQRDCSQDLLKKREHHIEQLNEKLSRTEKESQALLSALELKAKEYEELKEEKTLLTRWKSEKEQLVNQMEAEKETLQCKIHHLETCLKTQQVKSQEYNERVQTMEMERENLNAEIRNLHNTIDSRSVEIEAQKRAYTELQQKAELSDQKHKKEIENMCLKASQLTGQVDELEHKLQLLSNEVREKDQHYRDLHAEYESLRDLLKSKDSSPEMKEDHHTSLLASEQQPARNNSFAKISGEQGSMPLERSECRSAADQSPPDSAVLQNRVISLEFSLESQKQVNSDLQKQCEELV	473915	479559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_474019_478570
816354	contig_6076_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_81728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCGTTATCCCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32180	33673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_32200_33700
816355	contig_3601_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_132980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATACATTATGCTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180549	1181546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1180500_1181500
816356	contig_7297_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_169700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTCAAGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157864	156495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_156500_157900
816357	contig_817_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_132458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGAGTGTGTCCTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567729	566139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_566100_567700
816360	contig_3424_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_55542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAATAATGAAAATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288658	289704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_288700_289700
816361	contig_5832_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_134112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGCCAAAGACAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24694	23367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_23400_24700
816362	contig_11427_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_79024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	397	1191	727	1917	818300	817110	NA	10	TATTTTCTTCTTGTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLGKSSRSKTERDDKYFSYSKLERDTRYISSRCRSDRERRRSRSRSRSDRSSRTSLSYSRSERSHYYDSDRRYHRNSPYRERTRYSRPYTENRARESSDSEDEYKRTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSSYSKSDRDCKTESSYIETEKRGKYSSKLERESKRTSENEVLKRCCSPSNDVGFRRGSSYSKHDNSASRYKVTPSKPIPKSDKFKNSFCCTELNEGIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKIPEREKTGSPSPSNQLKDSPTFKKLDESLIFKSEFIGHDSHDSIKELDSLSKGKYDQLRTYHPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTETLLMSSDDSVTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDATCMQHSKSESPFRETEPPVSPHQDKLVTLPVMVIDYSKTVVREPVDKRVSCCKTKDSDVYYTSNDSNPSLCHSEAENIEPSVTKISSNSFMNVHLESKTVICDNRNLTDQNSKFGCEEYKQSVGSTSSTSVNHFDDLCQPVGSSSIASSLQSLPPEIKADSLTHLRCAENTSPVLDAVLMSKTSTEFLKHTGEETIVEVGSGLPDSRRGFSSWENRHNNGLSEKCLQETQEEGNSRLPDRRRRSEISLDEGGRRHVRTSDDSEV	819026	817108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_817100_819000
816363	contig_9038_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_143324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGCGGTAAGTGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370596	371099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_370600_371100
816364	contig_9038_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_143317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343848	344372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_343800_344400
816365	contig_16934_pilon	+	789	4	Intergenic	novelGene_132534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	5.8878405775519	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCTCTGGATTGTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208348	238848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_208484_212877_213278_238330_238463_238726
816367	contig_19743_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_173163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACATAAAAAATAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290525	290233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_290200_290500
816368	SIRV4	-	357	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	257	3	-257	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGACGTTCAAACGGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
816371	SIRV6	+	384	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	20	379	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
816372	contig_16525_pilon	-	444	4	Intergenic	novelGene_133870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	68	junction_1	994.193251949651	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	9	401	181436	178157	FALSE	20	TTATGGGATTTTAAGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYDVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181444	178113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178588_178686_181150_181253_181388
816374	contig_4364_pilon	+	2116	8	Intergenic	novelGene_142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.15581743348207	28	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	46	1008	1201758	1204324	FALSE	15	TCCCAGCTCTCAATGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSAGEAEPAAGLDTMSVGFIGAGQLAFALAKGFTAAGIVAAHKIMASSPDMELTTVSALRKMGVNLTPHNKETVQHSDVLFLAVKPHIIPFILDEVGADIEDRHILVSCAAGVTISSIEKKLMAFHLAPKVIRCMTNTPVVVREGATVYAMGTHAKVEDGRLLEQLMGSVGFCTEVEEDLIDAVTGLSGSGPAYAFTALDALADGGVKMGLPRRLAVHLGAQALLGAAKMLLDSEQHPGQLKDNVCSPGGATIHALHVLESGGFRSLLINAVEASCIRTRELQSMADREKVSPATIKKTVLDKVKLDSPVGNSLSPSSRAKLVPRSLAPAGKKE	1201283	1205432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1201303_1201731_1201825_1202033_1202105_1202759_1202940_1203041_1203264_1203457_1203551_1203660_1203825_1204158
816375	contig_9646_pilon	-	361	3	Intergenic	novelGene_117450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCCTACATGAGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297783	260068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_260190_286423_286534_297653
816377	contig_14176_pilon	+	1296	2	Intergenic	novelGene_74863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAACTCCTGTTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456725	471181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_456777_469936
816379	contig_7078_pilon	+	926	5	Intergenic	novelGene_130200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_3	174.241929511814	546	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951268	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325_965478_975279_975387_982119
816381	contig_5226_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_140501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17269	17771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_+_17300_17800
816384	contig_9656_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_121910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTAGAAAGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227984	226876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_226900_228000
816385	contig_1719_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_87312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATACTCTCACAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433916	433606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_433600_433900
816386	contig_10126_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_105713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1053	1367	135936	136250	NA	25	CTGACCCATTTTTAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKVPGPRQGASPPLQAEAKHRHYVPTMAAFIHAAIDPSDQGKPCYSYFTDEEIEAPNTFFSPNHKSQIWQSWPRFPPPLSFQQTLKQERDRTDLSKGVPLAA	134883	136492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_134900_136500
816388	contig_16870_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_155502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGCCCACCAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124015	108995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_109160_123875
816390	contig_6975_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_74236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAACAAGTGTAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26091	25639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_25600_26100
816392	contig_10042_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_79124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTTTTGTCTGTTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51998	50648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_50600_52000
816397	contig_14225_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_52757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTGTAAGATTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377765	376672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_376700_377800
816398	contig_9221_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_176235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAACAATGGGCTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14038	12724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_-_12700_14000
816399	contig_11227_pilon	-	1932	6	Intergenic	novelGene_163196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	29.2684130078827	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	227	1063	297894	279312	FALSE	25	AATCAAAGTTCTGTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQRKGLQARILSFEEEEKLKRDQALVSDFKQQKLEKEAQKNWDLFYKRNSTNFFKDRHWTTREFEELRSCREFEDQKLTVLEAGCGVGNCLFPLLEEDLNIFAYACDFSPRAVEYVKQNPSYNTERCKVFQCDLTKDDLLEHVPSESVDVVMLIFVLSAIHPDKMHLVLQNVYKVLKPGKCVLFRDYGLYDHAMLRFKAGSKLGENFYVRQDGTRSYFFTDEFLAQLFMDTGYEEVVNEYVFRETVNKKRRSVCAQSFPSEQIPEASKELSTHLP	299114	278442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_283410_291670_291842_296562_296698_297669_298045_299038
816400	contig_18794_pilon	-	1675	8	Intergenic	novelGene_54664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_5	48.130774236152	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	88	987	353203	325647	FALSE	35	TGAGTGCCACTATTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAGWPRTLAAASPCRCVKLLLLLPFGFEMEHFDASLSSYFKTLLGPRDTRVKGWFLLDNYLPTFICSIIYLLIVWLGPKYMRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404629	324958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_353145_353212_404550
816401	contig_11279_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_136524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTATTAAGAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15756	16652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11279_pilon_+_15800_16700
816406	contig_1107_pilon	-	1943	2	Intergenic	novelGene_126544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAACATGTTTGGTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162551	159857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_161668_162418
816408	contig_12312_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_64022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATGCGAGAGAGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565897	564116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_564100_565900
816410	contig_12050_pilon	-	1588	4	Intergenic	novelGene_62673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.3687382483624	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	154	483	452520	447168	FALSE	20	GCAATATCCTGTCCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLRSPSSPIREEDEEKLSEDSDAPPPLSGRDLALRKSSSPESFITEEVDEMSVKQGSQAPSVESILPDSSPEHHGLGPPADIFLMLRLHGDAPRPRHHWPTLASAGWPSSRPRGHRADPPLRAGPASSMELSAPQCCQGAAWAQCDSGLPPARAHSHRF	453412	446062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_447397_451590_451676_452504_452548_453286
816412	contig_16724_pilon	-	1571	8	Intergenic	novelGene_105317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	797.716639374342	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	297	1004	569099	541872	FALSE	30	TTTCAGCAGTTTATCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575951	541304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567757_568918_569140_571072_571184_575806
816413	contig_252_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_99926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTGCCACTAATTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260365	261428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_260400_261400
816414	contig_10236_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_169125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGATGAGACTTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180525	181383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_180500_181400
816416	contig_11356_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_175266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	966	1268	286200	286502	NA	30	CTTCAAATTGTTTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSQVILLSPNESIYRMQFQLKFQWNCVCEREREKLVKLILIFRKKSKKSGIAMKILKNKSGGLHFSLSHTYDTALVKKSRKTHVRHGKRRDSQETHSL	285234	286657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_285200_286700
816419	contig_7057_pilon	-	645	6	Intergenic	novelGene_123278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1065.83995046161	2690	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	52	375	707634	706443	TRUE	20	CACTGTTCTGTTATGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFTLSDAKPHPVALRLMSSSVTCNMGGIRPSRRLLLLAFLLTAGGLSPAQAQSECKCATMSPGVLAGIVLGDLLLTLLIALAVYSLGRLVPQKRGAAEMSGKQRMNQTESTYQLKMCAEDTWG	707685	705643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_705875_706403_706476_706664_706709_706884_707020_707173_707201_707549
816420	contig_19012_pilon	+	1950	2	Intergenic	novelGene_159467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	283	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAGAGAAACTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5305	10302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_5386_8432
816423	contig_13982_pilon	-	730	2	Intergenic	novelGene_163495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	90	320	463819	459692	FALSE	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGPCVLQIQKIRNVAAPKDNEESQAAPRMLRLQMTDGHISCTAVEFNYMSKISLNTPPGTKVKLSGIIDIKNGFLLLNDSNTTVLGGEVEHLIEKWELQRVSVN	463908	459281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_459849_463745
816425	contig_10811_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_165808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGCCCTGAGCACCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417030	415202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_415200_417000
816427	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	102	0	-85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
816428	contig_10311_pilon	+	94	1	Intergenic	novelGene_50468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65223	65317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65200_65300
816429	contig_6870_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_103979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCGTGTCACTGCTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454183	1454785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1454200_1454800
816434	contig_14882_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_114997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAGAATGGAGTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252665	251573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_251600_252700
816435	contig_4989_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_160789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAGAAATGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136601	135028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_135000_136600
816438	contig_8286_pilon	-	1967	9	Intergenic	novelGene_139810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTTTACCTACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222594	196637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_196667_199668_199739_200987_201042_203600_203692_205642_205719_217000_217092_217599_217682_219965_220047_221201
816440	contig_9875_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_154407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75970	74142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_74100_76000
816441	contig_5815_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_141182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGTGGTTCTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167051	169017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_167100_169000
816442	SIRV6	+	534	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	32	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	28	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2026_2470
816444	contig_14041_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_144036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCGAGAGAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71842	70254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_70300_71800
816446	contig_8491_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_154226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCAGGAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292912	294556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_292900_294600
816447	contig_5445_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_135433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAGGTAGAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133220	132165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_132200_133200
816448	contig_8017_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_65351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904362	905756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_904400_905800
816449	SIRV4	-	289	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	55	-270	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTAAACTGCCCGGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5103	3907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
816450	contig_11978_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_62841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTATATATTTGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482150	480160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_480200_482200
816455	contig_9646_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_117486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540896	541437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_540900_541400
816456	contig_1925_pilon	+	1032	9	Intergenic	novelGene_162214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	408.257271827459	89	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	235	867	254564	284492	TRUE	35	TATTTCTTTACTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGKAINVFISANRLIHQTNLILQTFKTVA	225058	284894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225172_254442_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713_279797_284410_284570_284806
816457	contig_10319_pilon	-	2669	9	Intergenic	novelGene_147241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_6	51.8043193179874	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	310	1152	250190	59074	FALSE	10	TACTCTCTTTGGCTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQVCENLGMLYI	251650	57556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_59227_63369_63502_67769_67878_71419_71525_79991_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
816458	contig_211_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_129861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCAGCAGTGTGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99203	101660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_99200_101700
816459	contig_2933_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_111302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAGCCGTAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238397	238990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_238400_239000
816463	contig_6424_pilon	+	1526	7	Intergenic	novelGene_109273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	183	548	93721	94086	TRUE	0	CGCGGGCCTGCGGCGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDEWSLATPYPLTQGSLVPAVRIRAQSCPLPALGHPGQDSGGPLGSPASTWYPSGFWGFNDMRIVQTQAGPLLHPGSAHLRLGLSLWAKANSSEQDSLGAAKRSRGQDRRALPLLSRYV	93538	98945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_94200_94483_94661_95622_95762_95865_95959_96104_96235_97634_97927_98911
816465	contig_16917_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_161932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCATTATAGAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132056	133241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_132100_133200
816466	contig_8017_pilon	-	694	5	Intergenic	novelGene_65375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_4	75.8699545274676	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	42	443	1509852	1496306	FALSE	35	CAGGGGAGAAAATGACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLNYILSISASSGLIALLSTGSK	1511158	1496054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1496373_1497435_1497568_1503095_1503195_1509748_1509876_1511140
816468	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
816471	contig_5469_pilon	-	2196	4	Intergenic	novelGene_176246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	3.09120616516523	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	453	788	121006	119678	FALSE	35	TACAAAGAATCCTAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAVSCPLLFGFNTTGDPSVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLRQRRRKRILTRQNSQCISVRPSFSQQEHSDDKKYPQKCEDPLLSHLQPLSPGQAHKELKHYYSICQDTALGQPGFQEGEGDLKREERTGNSLSPTMAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRAVPLREKKATQMLVIVLGTFIVCWLPFFLTHVLNTHCQACHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNVEFRKAFLKILSR	137565	118269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5469_pilon_-_119875_120867_121214_126968_127166_137517
816472	contig_11948_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_174381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAAATCCATCCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114491	113980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_114000_114500
816474	contig_10751_pilon	+	2238	6	Intergenic	novelGene_174821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	6.44980619863884	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	22	1614	228799	275050	FALSE	25	TTATAAAAGCCTTGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVSEDSFHRSANSTYRTRSSSLLADEDELLEKLLDSPSSGLQRPEDRYNGTYIIFFSLGIGTLLPWNFFVTAKEYWVFKLGNSSSPATQEGAVGSDILNYFESYFAVASTVPSVLCLVVNFMLVNRVPVRVRVLASLAIMLTIFVMMTLLVKVDTSSWTCSFFAVTMTCMVILSGVSTIFSSSIYGMTGSFPMRNSQALISGGAMGGTISAVALLADLAASSDVTDSALAFFLTADVFLALCIVLYLLLPRLEYARYYMRPARPAHVFSGEEEQPQDSPDASSLAPGSSNHPLPALRSILKTTAGLGFCTVYIFFISGLVFPAISSNVESLNKGSGSLWTDKFFVPLTTFLLYNFADLCGRQITAWIQVPGPKSKLLLGLVLLRTGFIPPLCVLQLPAPCTPEDGGLHVRHLPGPLHLPAGAQQRLPQHPGSHLRAKDCVQGAGGGHRGSDVLLPVFGFAAWLSLLCPAGTPHLGGWWPGHQGHVTLWSLCKVVRKCWQGLAGMEEGAGASLGAEGRAYPGLISAPRE	228777	275674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_+_228800_232892_233192_254897_254981_264408_264636_269238_269402_274230
816477	contig_4418_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_98386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAACAGAAGTCTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860538	858425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_858400_860500
816479	contig_5222_pilon	-	1833	14	Intergenic	novelGene_59001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	33.7333785500707	2	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	124	975	216927	203505	TRUE	15	TATGAGCGGTTTCAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKAFRVKSNTAIKGSDRRKLRADVTAAFPSIGTDQASELVPGKEELNVVKLYAHKGDAVTVYVSGGNPILFELEKNLYPTVYTLWSYPDLLPTFTTWPPVLEKLAGGADLMLPGLVVPPAGLPPVQKGDLCAIALVGNRKSGDRSSPPSIAPLAVSPPDLSEEKGCVLVDPGLHEDMRHLHLKGVDEENGEVLQLRGEKALSEASEDTSVGVLNQDSAGSKALHEQMDELLQRCFLHALKSRVRKADLPLLTSTFLGSHMFSCCPEGQQLDIKKSSYKKAL	217050	193220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_193351_195007_195183_199851_199973_201671_201768_202692_202783_203139_203290_203408_203513_203905_203953_205664_205783_206278_206536_211807_211899_212402_212487_215489_215681_216871
816480	contig_19311_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_144079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAAGAAAATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108823	107083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_107100_108800
816482	contig_12864_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_76356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115832	117134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_115800_117100
816485	contig_5084_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_64578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGGTGAATTGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724525	725220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_724500_725200
816487	contig_6278_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_119809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTTCATAGAAGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348434	348725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_348400_348700
816490	contig_5350_pilon	+	1064	7	Intergenic	novelGene_99356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	48.2424432769873	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	45	614	178819	225365	FALSE	20	ACTTTATGTATGCTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIALGYQISKLCNSERSAWLHDARDAEQLSKNKVTHILSVHDSARPMLEGVKYLCIPAADSPSQNLTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILATPGVLKYLDFLRRV	178774	225815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_178889_184664_184748_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
816491	contig_7119_pilon	-	1608	6	Intergenic	novelGene_41022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	362	457	215736	215641	TRUE	65	CTAAAAAAAAAAACAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIFKPHVGVLGVSFGHDAVPEFPGFLHIIAQSSLNSSPVLHDHAAWVSTLVETLFDLLFQILQSTSERGPQLFQLFTGVLLEINPSPQVIKVRLPNLHIIGGLNKAGIQSFLEGRRNLLMINFVSLHGQEIPTPQGDCPGAVSNSTIMYR	218449	213780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_214900_215608_215749_216230_216338_217061_217142_217268_217326_218344
816492	contig_6436_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_134920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAATTACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920535	920179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_920200_920500
816493	contig_2987_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_125866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCATTTTGAATGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542486	541335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_541300_542500
816494	contig_14209_pilon	+	1109	11	Intergenic	novelGene_88337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	228.066306148015	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	28	732	32366	37358	TRUE	30	AAGCTTGAATTCACTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRVRAFGVMDTSDLFASCRKGDVARVRYLLEQRDVEVNVRDKWDSTPLYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLINPVAFGALLQYLYTGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFGAGLQTWHLCEGPDHRAAPS	32338	40996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35355_35503_35664_35769_35816_37100_37222_37300_37421_37712_37812_37909_38031_40901
816495	contig_15105_pilon	+	347	3	Intergenic	novelGene_150926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	21	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCATGCGAATGACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175483	197917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_175606_189867_190034_197858
816496	contig_15105_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_150927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	19.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	15	392	204946	215500	FALSE	40	TAAACTTGAAAGTATAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLLMMGLRSWQLWSATFITFFLTLLVTISLMTVSLFIKIVKLPIIRYSDPALVFSFLLFYGITTVLFAFMLTTFFNKANMAIAVGGFIYFVSYLPYFVISPHYVGMPFRGKLFSCLLSNVAMTFGINLL	204931	215502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_205051_211098_211217_215345
816497	contig_17518_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_117359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTCCCCAGGTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109214	110580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_109200_110600
816498	contig_3277_pilon	+	1882	7	Intergenic	novelGene_74717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	778.560851828552	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	190	900	240775	262381	FALSE	45	AAGGAAGAAAAATTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASL	188787	263363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261290_262375
816500	contig_1225_pilon	+	1224	4	Intergenic	novelGene_44123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	228	545	250814	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250586	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274865_276571
816501	contig_500_pilon	-	2419	18	Intergenic	novelGene_30926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_2	77.1168169740402	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	517	2187	1119646	1099212	FALSE	15	AGGCAGGGTCAGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTRRNGSSIKIRLTVLCAKNLAKKDFFRLPDPFAKIVVDGSGQCHSTDTVKNTLDPKWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRLLSNAISRLKDTGYQRLDLCKLNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVVDCRGLLENEGTVYEDSGPGRPLSCFMEEPAPYTDGTGAAAGGGNCRFAESPSHDQRLQVQRLRNPEVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPRDLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRLHHIMNHQCQLKEPSQPLPLPSEGSVEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKAIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSNIVRWFWQAVEAFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE	1228755	1098979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1099312_1100545_1100631_1103146_1103349_1106896_1107018_1107764_1107903_1108896_1109076_1109968_1110084_1113950_1114055_1115745_1115945_1117073_1117221_1118852_1118938_1119450_1119693_1122670_1122747_1123995_1124062_1124208_1124343_1125514_1125624_1126942_1126982_1228709
816504	contig_15449_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_33573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGGTCAGACTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22550	22800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_22600_22800
816509	contig_5605_pilon	+	1568	8	Intergenic	novelGene_143943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	18.7757985780871	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	449	880	406483	450994	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKCGRKKCIKTNLRQMTMETIESQQDGSVTASVAENESAHMQTQTGPNSIPTLAQVTTITETDESAESEGIIDCHKRREILSRRPSYRKILNELSSDVSGVPKIEEEKSEEEGTPPNIATMAVPTSIYQTSTGQYSMYATIR	390938	451682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391019_395086_395128_398213_398373_405195_405311_406429_406527_417962_418087_450591_450690_450828
816512	contig_2069_pilon	+	2091	7	Intergenic	novelGene_23354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	15.283433296656	47	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	361	1578	939799	946103	FALSE	20	TAGATTTTTCTGTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSGRQWLDSQGSWLPGRCLIRRLRLPTEASDLGSFPFKTRKELQSRKAKSEAFTLADLRQLPELNPPVLMPNGNVGTPLRVFLEFIRACRLPPRIITQLQLQFPKTGSSRRYGNVPFEYEDSETVEQEELVYTAEGEEIPQGACLVATPASPCGEPEEEDKEEEEESNSDDDDDRGEEWERHEALHEDVTRQERTTERLFEEEIELKWEKGGSGLVFYTDAQFWQEEEGDFDEQTADDWDVDMSVYYDRDGGDKDARDSVQMRLERRLRDGQEHGSMIDRQVGTFERHTKGIGRKVMEQQGWAEGQGLGSRCSGVPEALDSDGQHPRCKRGLGYHGEKLQPLGQLKRPRGTGLGLISTIYDEPLPQDQQESLLRRQPPTSMKFRTNMAFVRGSSCALDSASEPD	939438	946616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_939893_941598_942021_943579_943755_944106_944167_944750_944873_944975_945104_945886
816513	contig_7839_pilon	-	977	2	Intergenic	novelGene_45745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079084	1074317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1075157_1078946
816516	contig_6227_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_49670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCTGGGCCCAGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502321	501680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_501700_502300
816517	contig_5939_pilon	-	1559	4	Intergenic	novelGene_176250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	3.29983164553722	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	71	790	407859	396642	FALSE	10	TGTCACTTTGCGGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAHPAQKPSVRNSLINDAKARLKKHDVGTRFSHLLSNKCSVLLPLLIKEGKFHLLFTLRSEKLRRSPGEVCFPGGKCEPADMDEVATALREAQEEVGLRPHQVEVVCRLVPHIFDKEILITPVVGFIDQDFQAKPNPDEVKDVFLAPLDYFLHPHVYHQNYLTYSDHRLVLHCFEYTNPENGMTYQIRGMTAKFAVFVALIILEKRPTFEVEYNLDDLISSSEESLLKLHKYVTSKL	407929	395872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_-_397011_403668_403828_406453_406608_407821
816518	contig_5947_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_101480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTTTCATCATGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355551	355037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_355000_355600
816519	contig_6065_pilon	-	953	9	Intergenic	novelGene_132697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	228.136335334817	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	322	792	501780	495700	FALSE	20	CATCGGCTTTTTAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA	507466	495538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_495817_495900_495959_497087_497162_498680_498763_499497_499621_501763_501897_503182_503260_505263_505358_507432
816520	contig_6975_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_74232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATAAATCAATGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15881	13631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_13600_15900
816523	contig_13224_pilon	-	1509	6	Intergenic	novelGene_104103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	37.4197808652055	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	419	814	263277	262566	TRUE	25	ATAAACACTGTTGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGQGNPQIWRVVQGSSARAHVLSWYQQLKGSGPTFLLSQREGPPPTYGLGVNPRFLAELGLAQNGACRTVGNASPADEGICYCAMWFSGQCIFGEGTRLLYQERMLEAPREDTCGRDKLRVHALLNKLG	283305	260550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_260922_262070_262365_262535_262649_262964_263325_281754_282020_283199
816524	contig_13680_pilon	-	440	2	Intergenic	novelGene_149574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTCGGCAACTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250231	249707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_249898_249981
816526	contig_5039_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_65001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCACAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701798	1700716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1700700_1701800
816527	SIRV5	+	212	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1120	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGCGGCTTTGGTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2176	2388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2200_2400
816528	contig_9888_pilon	-	1383	5	Intergenic	novelGene_162252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	5.59016994374947	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44055	19195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_19638_19952_20080_22080_22166_37446_37784_43663
816529	contig_11708_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_138993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAATGAGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405485	406893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_405500_406900
816531	contig_3334_pilon	-	2152	11	Intergenic	novelGene_137671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	5.24976189936267	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	54	1838	692886	656781	FALSE	20	GCATATCCTTGTGTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPDSWDSIFGDIERIIMPGVVHWQSPHMHAYFPALTSWPSLLGDMLADAINCLGFTWASSPVCTELEMNVMDWLAKMLGLPEHFLHHHPSSQGGGVLQSTVSESTLIALLAARKNKILEMKTSEPDADDSFLNAQLIAYASDQAHSSVEKAGLISLVKMRFLPVDDNFSLRGDTLQKAIEEDKDQGLVPVFVCATLGTTGVCAFDCLSELGPICAREGLWLHIDAAYAGTAFLCPEFRGFLKGIEYADSFTFNPSKWMMVHFDCTGFWVKDKYKLQQTFSVNPIYLRHANSGAATDFMHWQIPLSRRFRSIKLWFVIRSFGVKSLQAHVRHGTEMAKYFESLVRNDPFFEIPAKRHLGLVVFRLKGPNCLTESMLKEIARSGHLFLIPATIQDKLIIRFTVTSQFTTRDDILRDWNIIRDAATLILSQHCTSQPSPRVRNLIPQTRVMVNGMPPQSVSETGDDPAPTGKIITQPQHVGASPTRAEDSCYLETLLDPLDDCFSEEAPDVTKHKLSSFLFSYLSVQNKKKTVRSLSCNSVPMSAQKPLPSDGSMKNGGFSRVRICSRFPEEMMMLKKSAFKKLIKFYSVPSFPECNPQCGFQLPCCPLQAMV	692939	656466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_657519_657671_657774_662694_662794_668076_668168_668257_668421_669440_669508_671018_671163_671668_671804_673891_674015_687838_687953_692877
816532	contig_11105_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_159821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1657	2028	283807	283436	NA	25	AACATTTTAGAGGCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPGQHLVLPCPSNAMEGFLRAHLLPVTEVKAKETLGNKGTPPFFSLLVSTVIFQIIAEKVNNTSVGESFEYLQSFPKHDDVLRGKESYFIAQPLIISNLHISIKKDTLNISFNLISGIHHG	285463	283367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_283400_285500
816533	contig_12724_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_146863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAATCAAGATAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255098	255444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_255100_255400
816534	contig_12724_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_146864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCATTTGGGGGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255999	257302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_256000_257300
816537	contig_5954_pilon	+	2288	17	Intergenic	novelGene_28521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.77756075541112	46	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	36	2036	451515	461457	FALSE	10	TGGGAGCCTCCTTATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNQKISGGWQMEEADDWLRYGNAWEKARPEFMLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVILAMPYDTPVPGYRNNVVNTMRLWSAKAPNDFNLKDFNIGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTTFDTFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERLDWDKAWEVTVKTCAYTNHTVLPEALERWPVHLMETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFPGDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKFQNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEEFIADLDQLHKLLSYVDDEAFIRDVAKIKQENKLKFSAYLEKEYKVQINPNSLFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHIITLYNRIKKEPTKFFVPRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPVVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVEKLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEDYVKCQEKVSALYKNQREWTRMVIRNIAASGKFSSDRTIAEYAREIWGIEPSRKRLPAPDETV	451153	461709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_451189_451514_451647_452870_452983_453075_453159_453728_453873_454243_454337_454507_454655_454809_454974_455272_455388_455930_456033_456370_456519_456828_456888_457013_457156_457810_458019_460757_460893_461118_461186_461307
816539	contig_5936_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_53569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTATACCAATTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195680	194503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_194500_195700
816540	contig_14687_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_107947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCTTCATATAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563161	565158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_563200_565200
816543	contig_7357_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_36860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCTACTGGTATAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205897	204660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_204700_205900
816544	contig_7357_pilon	-	894	2	Intergenic	novelGene_36859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGTCGGTTCAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204707	203620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_204452_204644
816545	contig_5954_pilon	+	358	4	Intergenic	novelGene_28437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	532	junction_1	1917.19013141629	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	11	358	97851	98929	FALSE	15	GTCAATGTCGTGCCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRF	97840	98929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97926_98017_98163_98637_98694_98857
816549	contig_13409_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_128446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTCCCACCCCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54008	52420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_52400_54000
816550	contig_5574_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_155871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1584	1901	248258	247941	NA	50	AAAGTAAAATATGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSRDGTHSMAMSLDLVIRALLLLPKQSRTLPAFSRKCWKESSGRQWHPYSEAKLHKLGPDVAIGPLGSPRPCLPEQQPPFWVVDEHMKSGHSKLKCVVSIKHT	249841	247916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_247900_249800
816551	contig_15897_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_49569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGAAAAGAATAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813627	814101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_813600_814100
816552	SIRV6	+	469	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	383	4	210	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTATCTGCAGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513	2536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
816554	SIRV4	-	350	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	15	1156	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
816556	contig_9752_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_122013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	915	1223	73938	73630	NA	25	AGATTTTGAGGGCAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSYPPKSIPSLLLGDITNWREKPKSSELLLRNESLATLDFHLSNPMNTNACRSPLNQVPDSAHIGDQRVGMFSPLLFCQFKKNHEFQFPRNLVHRVNHPKGQ	74852	73627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_73600_74900
816559	contig_567_pilon	+	630	5	Intergenic	novelGene_33986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	234.054480837261	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	17	316	442621	452722	TRUE	30	CTAAAACAGATGCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCVSKMAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNVRKHLYLSAWLVNLLPLFLLCQS	442604	458810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_452767_455775_455862_458626
816561	contig_7816_pilon	+	1416	2	Intergenic	novelGene_66532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAAAAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230141	233420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_230558_232420
816562	contig_5238_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_176262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	62	1162	191406	189395	FALSE	20	CCAGGGTGTGTGAGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STQAEGQAARSPSCQSTSPAMDPEMSKHQVLDASDFAFLENYTSSYDYEENETDSCCASPPCPQDFSLNFDRAFLPALYGLLFLLGLLGNGAVAAVLLSQRAALSSTDTFLFHLAVADALLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLSIVHATQLYRRGPPGRVALTCVVVWGLCLLFALPELIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALRMLQLVAGFLLPLLVMAYCYARILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVMVVVAFALCWTPYHLVVLVDTLMDLGALARNCGQESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWILLMRLGCPGQRWHQRQPSSYRDSSWSETTEASYSGL	191467	188942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_190484_191394
816563	contig_13295_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_31202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCAGCAAGTCGGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12903	11839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_11800_12900
816566	contig_665_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_158213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTTAGTCAACATCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282112	281394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_281400_282100
816569	contig_7318_pilon	-	1595	1	Intergenic	novelGene_152230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGGACAAAAACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313595	312000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_312000_313600
816571	contig_2419_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_137134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	34	105	289	393	157641	157537	NA	75	CAAAAAAAAAAACAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGYNGAGARRIIPPSLLHQIYQPHKPTYEALHQVQRRKCCSGYAKSEPGAPRLGRGHLGKLKFSTDPWKSYGHTEVRNLRLLLPLPATKRQRTTAIMKFHMYKVGETEAQRDAAMPWAAQQEGPAGSGGD	157929	155476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_155500_157900
816572	contig_2799_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_85478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469169	467755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_467800_469200
816575	contig_11413_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_103211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGTTACATGCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789881	790839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_789900_790800
816577	contig_10627_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_60043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814719	812607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_812600_814700
816580	contig_12046_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_83481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAATAACTAAAGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386234	387204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_386200_387200
816581	contig_504_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_54419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATTAATTCCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149265	151573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_149300_151600
816584	contig_12923_pilon	-	1627	9	Intergenic	novelGene_30112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.463921044376	1	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	32	1018	68226	51391	TRUE	35	CATCAAGCTACCAATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGR	68257	46220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46387_48961_49071_51056_51400_53867_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196
816585	SIRV2	-	431	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	2933	703	1754	-703	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTGTAACTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2978	1738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881
816586	contig_8820_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_79322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTAAACTGTAAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390740	390266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_390300_390700
816587	contig_18420_pilon	-	857	8	Intergenic	novelGene_109343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGGACCCGCCCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96832	92267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_92370_93030_93098_93509_93595_95281_95374_95504_95689_95966_96034_96349_96474_96696
816590	contig_15720_pilon	+	1597	3	Intergenic	novelGene_41932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATAGCTATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284343	292006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_284766_288657_288754_290927
816592	contig_19973_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_173775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16891	15259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19973_pilon_-_15300_16900
816593	contig_7202_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_18514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAAAGTAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
816596	contig_8322_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_143227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195467	193203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_193200_195500
816597	contig_3004_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_127561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATGCCTTTTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857519	859186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_857500_859200
816598	contig_14683_pilon	+	1077	5	Intergenic	novelGene_166028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	27.7938842193746	4	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	171	680	20207	45082	FALSE	65	GAAAAGAAAAAAACACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGIIGGTGLDDPEILEGRTEKYVDTPFGKPSDALILGKIKNVDCVLLARHGRQHTIMPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLREEIQPGDIIIIDQFIDRTTVRPQTFYDGSCSSARGVGHIPMAEPFCPKTREVLIETAKKLGLRCHSKGTVITIEGPRFSSRAESLMFRTWGADVINMTTVPEVVLAKEAGVCYASIAMATDYDCWKEHEEAVGEILL	16530	45479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_18293_18353_20184_20353_40569_40673_44821
816599	contig_7839_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_45701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCACTGGGTGTGTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230388	228426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_228400_230400
816600	contig_5408_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_173964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGGGACTTGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46955	46061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5408_pilon_-_46100_47000
816602	contig_12150_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_6964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTCGGTCCTTCAGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100597	101154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_100600_101200
816603	contig_1472_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_86130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCATTATATCAGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562654	563543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_562700_563500
816604	contig_7695_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_41676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATAAACCAATTATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022840	1023686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1022800_1023700
816605	contig_1996_pilon	-	1097	10	Intergenic	novelGene_131928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	13.1402688962847	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1095	2	1096	469061	456681	FALSE	35	AGGCAATGATGGAGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKAMEAVVRSHISKLDKDMARAIILLASSEMTKAKDLVPDWQQAASSVLVAVGTRFINAVMEELLSRFQPGLLPHHFIVQTLASLAASNVFGMVPFLTSILSTMLPMLPMAKQDAMRVVFCSALRHFSESILEYLADLDQAPDPTVRKDAFSSHIFSAHDVLFNHWLQSREAKLRLAVVEALGPMSHLLPNERLEEQLPRLIPGVLALYKKHAETFHVSKSLGQILEAAVSVGSRTLEVQLDALLAALHAQICVPVESSSPLVVRNQKEVLRCYTVLACFAPDRLLAFLLPKLDTSNERIRVGSLQVLRHVINSAAAQMEIRKLFILSSMRLPLLDTNNKVKRAVVQVISAMAHHGYLEQPGG	469062	456679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_456750_458059_458134_459313_459428_460116_460196_465531_465625_466171_466313_467538_467691_468099_468199_468349_468513_468950
816606	contig_7816_pilon	+	2129	5	Intergenic	novelGene_66557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_4	32.1121083082379	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	1086	1787	342527	351499	TRUE	10	TGTTTTTGTATGGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPSLFPWPQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	341441	354114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_342705_346827_346934_350736_350987_351331_351687_353959
816607	contig_13074_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_153445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACAAAAACCTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537328	538881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_537300_538900
816617	contig_11815_pilon	+	1159	10	Intergenic	novelGene_50895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5176881685662	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	520	1053	137027	152169	FALSE	25	ACCATGTTTCCTATGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALMDCHWQPLDTVSSEIPAMM	126061	152275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_126130_126649_126748_134759_134860_135233_135382_135466_135520_136974_137107_139155_139276_142441_142605_142770_142805_152032
816618	contig_5210_pilon	-	852	5	Intergenic	novelGene_65433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.5843881791533	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	64	435	475032	470715	FALSE	20	TACTCTCTGATATCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKAKGKTRRQKFGYNVNRKRLNRNARRKAAPRIECSHIRHAWDHAKSVRQNLAEMGLAMDPNKAVPLRKRKVHAMEVDVETTKELVRKPYVLNDLEAEASLPEKKGNTLSRDLIDYVCYGPG	475095	470297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_470732_471368_471441_472753_472821_474725_474835_474925
816620	contig_5031_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_133201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGGAATGCTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61103	63089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_61100_63100
816624	contig_8744_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_173636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAGGAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3106	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_-_2100_3100
816626	contig_15706_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_172044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATTTTTTTTGAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113457	114094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_113500_114100
816628	scaffold_6394_pilon	+	1638	7	Intergenic	novelGene_111060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_6	86.0821635932142	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	142	903	464827	468063	FALSE	35	TGACTAGTAATGGAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFNDKNETCGTICLKYLLFTFNCCFWLAGLAVMAVGIWTLALKSDYISLLSSNTYLATAYILVVAGVVVMVTGVLGCCATVKERRTLLRLYFILLLIIFLLEIIAGVLAYVYYQQLNAELKENLKHTMTKQYRQPGRQGVTSAVDKLQQEFHCCGSNNSKDWRDSEWIHSGEAGGRVVPDSCCKTVVDGCGQRDHASNIYKVEGGCITKLETFIQEHLQIIGAVGIGIACVQVFGMIFTCSLYKSLKLDHY	464685	468798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_464911_464995_465188_465563_465639_466503_466609_467023_467183_467308_467396_468003
816632	SIRV6	+	350	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGAGTTAGGTAGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10721
816633	contig_6710_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_98219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGCACAGTGACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653491	657521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
816635	contig_10864_pilon	+	1159	4	Intergenic	novelGene_107080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	894719	897109	FALSE	60	TACTCAGCAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAFIFSSRLARWLLVSSISSTLSSAVRTSLCSFLFSAFSSSSTFSAFSAAVLYRSTCPSSRPILCSKVVISCSAFESLNLYSLICLLASLCISISCKSVPFCSPARSPTALSLLGPFCRSSSSCSFSFLI	894718	897872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_894801_895371_895481_896060_896140_896983
816638	contig_11933_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_107237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23115	25213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_23100_25200
816643	contig_18184_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_123886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATACTAAAGCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603460	603718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_603500_603700
816644	contig_9535_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_124472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGGGAGATTACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261376	263082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_261400_263100
816645	scaffold_19766_pilon	-	1989	6	Intergenic	novelGene_34259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	62.9901579613831	101	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	158	613	180569	179450	TRUE	25	AAACTGCAGGCTGGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESSPLLAYRLLGEEGVAFPANGAGGPGGTSARRLSTFLGVVVPTVLSMFSVVVFMRIGFVVGHAGLLQALAMLLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVRGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANICGCAICVLGLVEAVLDVFGAGL	181494	171412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_171948_177940_178049_178716_179590_180016_180152_180388_180611_181378
816646	contig_6412_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_149978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCCTGTCTAATAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565550	566914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_565600_566900
816647	contig_12120_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_21449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296169	295560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_295600_296200
816650	contig_10371_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_175483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	363	716	748000	747647	NA	30	TGCATCCATGGAGCAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQPPQQATFSLELGVTGQLAQKEGEVEAEAVTSLITSLTSLRWVLEPLPPVAWGAHGHGHCNTDRGLRDSIRPSLSALKAGLHPPGRRYMGRLLPCKQDHPEGNALPVLNMGVSLQ	748362	746803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_746800_748400
816652	contig_17194_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_155384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAAGTGCTTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305944	304001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_304000_305900
816653	contig_15021_pilon	-	1525	12	Intergenic	novelGene_26928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	179	520	149842	147533	TRUE	20	GCGCCGGAGAAAGCTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQDSSARLKAFSSSSSAPARPPLCLCFSLSSPKTGRTSVDRLWDLGCRWTGSADFWEPCRADPLCSLLWGLGRIVGGNVQIGPWSPSSASPSMSESSELDSSPWPSDFQRL	150454	141106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_141164_141356_141475_144756_144988_145272_145329_145408_145518_146323_146482_146916_147105_147444_147593_147871_147985_148231_148304_149745_149883_150316
816654	contig_11978_pilon	-	1769	6	Intergenic	novelGene_62881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	84.0918545401396	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	597	1121	660350	654829	TRUE	10	CACACTGCTCCCCCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRNTLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPSSGLTLESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFSEDLEDLGAVAPPVSGDLTKGHRSD	662461	652321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_652522_653703_653863_654069_654160_654629_654846_659842_660863_662377
816655	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
816657	contig_11752_pilon	+	1289	8	Intergenic	novelGene_37595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1664.96767143953	1	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	107	1150	84194	105602	FALSE	35	ATCTAGAAAGATTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKA	84087	105741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96484_96572_105597
816658	contig_9049_pilon	+	764	8	Intergenic	novelGene_83143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1604.91806644451	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	87	674	90226	112652	TRUE	20	GTATGTGTTTCTCACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNGAAPDLAAVQVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88349	112808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90177_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112654_112719
816660	contig_4388_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_161951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347996	345967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_346000_348000
816661	contig_11285_pilon	+	1269	7	Intergenic	novelGene_5506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	58.8314447288938	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	47	1087	542637	546547	TRUE	25	CGCCTCAAGGAGGCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVEPAPVRPALVAMESAQGAGIAVAEALQNQMPGLEKLWLWVTFLGDPKCLFLFYFPAAYYTSRRVGVAVLWISLITEWLNLVFKWFLFGDRPFWWVHESGYYSQAPAQVHQFPSSCETGPGSPSGHCMITGAALWPVMTTISSQLATRTHSRWVRMLPSLAYCTFLLAVGLSRVFILAHFPHQVLAGLIAGAVLGWLMTPRVPMERELSFYGLTALALMLGASLIYWTLFTLGLDLSWSINLASKWCERPEWLHMDSRPFASLSRDSGAALGLGIALHSPCYAQVRRAHLGNGQKIACFVLAMVLLGPLDWLGHAPQISLFYIFNFLKFTLWPCLVLALVPWVVHLFSAQEAPPIRSS	542590	546815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_542855_544727_544835_545243_545335_545508_545628_545818_545961_546183_546612_546697
816662	SIRV4	-	538	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	76	3	-76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1496	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGCTGTGGTGTAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
816664	contig_7171_pilon	-	841	3	Intergenic	novelGene_101413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	8.5	187	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTTTGTGGATCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452364	1451006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451621_1452054
816665	contig_593_pilon	-	811	2	Intergenic	novelGene_102032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTTACAGTAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537167	530662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_531174_536867
816667	contig_17737_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_72914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCTATTTCAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75913	75524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_75500_75900
816668	contig_11285_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_5529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGCTATATGGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738125	739277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_738100_739300
816670	scaffold_12510_pilon	-	2118	15	Intergenic	novelGene_151395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	366	773	409932	399405	TRUE	25	GTTGGCTGACACCAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATASADVECRKQWDKDWDERKDLLFEAVLLLMSASWISNSSTSSAEPESENCVESRELSWELLEVTQKPPCSVSWYPGNRFLVRICWRRRRIFCFSSWISLSLSSSSSSSSRHWLIMLHFISSMAAIKDSEMLK	412221	375350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_375438_388575_388661_390163_390323_391156_391266_392502_392659_393302_393830_397723_397821_398563_398678_399393_399603_400049_400152_409097_409161_409887_410019_410602_410751_411613_411678_412154
816671	contig_8017_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_65373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	635	976	1488712	1488371	NA	40	GACCGTTTTTACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWRRLKENEDVGNLRRSQLELMRALTVVGAVGGERRHLGGCGVFSTEGGARRMLMEIIETGSQMRSNLGTMKGVWSRMCELKVPVGHPCGNDFQAAGNAAVALGSMKPGGED	1489346	1487605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1487600_1489300
816672	contig_11056_pilon	+	1586	4	Intergenic	novelGene_130356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.42809041582063	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	214	1245	112932	114044	FALSE	25	ATGATGTCCACGGCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETGEEEKVSAEALGFSDLSDSEFLDLEDAQGLDASLSKPGPSCELSGNDGKPRSLQKWKRGLDVSSPMERFHFKYLCVTDLSTQNWCEQQMVYGKEFPGFLTPEKAALLDTGASIHLARELEVHDLVTIPITTKEDAWAIKFLNILSMIPTLQSEGHIREFPVFGEVEGVLLVGVIDELHYTAKGELELAELKTRRHPMLPVEAQKRKDYFQVNLYKYIFDAMVQGKVTPASLIHHTKLCPEKPLGPSVLRHAQQGGFCVKSLGDLMELVLGTEIVAFEEKEMKGKVQHYMAYWMGHREPQGVDVEEAWKCRTCNYVDICEWRKGGWVPTSTLEPKTKKKK	102528	114385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_102669_103515_103559_112901_113745_113825
816673	contig_5033_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_28890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	116	349	405136	404903	NA	25	GAGAGGAAGCATCTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLTAPGTPGTPVEAAFPFPVLIALACIFLLLATCLLFMTLCKPTALDPSRRGPRECMPHHPGSPSEPQLRLWKRLGSLRRSLHSFRRGWPAAPRRPLTAREGNSDCDCMESTKM	405251	403168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_403200_405300
816674	SIRV6	-	370	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATAGGCCTCTTCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	3032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11109_11205
816675	contig_5451_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_167196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGATCTTATGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867151	865005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_865000_867200
816676	contig_13245_pilon	-	516	4	Intergenic	novelGene_148809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	117	476	26752	25454	FALSE	25	TGTTGACTTTTACTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26868	25413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
816679	contig_15118_pilon	+	731	6	Intergenic	novelGene_74630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.7190760566165	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	365	724	451962	458938	FALSE	45	TCCCTGAAACTGCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGFLDWPQGTFASQVTLEGDKLKVEREIDGGLETVRLKLPAVVTADLRLNEPRYATLPNIMKAKKKKIEVIKAGDLGVDLTSKLSVVSVEDPPQRSAGLKVETTEDLVAKLREIGRI	438471	458945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_438559_448781_448941_449190_449273_451925_451992_457612_457772_458767
816682	contig_19545_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_170832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	529	1590	321	1910	5036	6625	NA	15	CTTGGTTTTAGTTTTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDSASPTPGTGAPLSESVLAEAAVVFAMVLSIHATVWDRYSWCAVALAVQAFYVQYKWDRLLQQGSAVFQFRMSANSGLLPASMVMPLLGLVMKERCQAAGNPHFERFGIVVAATGMAVALFSSVLALGITRPVPTNTCVISGLAGGGIIYIMKHSLSVGEVIEVLEVLLIFVYLNMILLYLLPHCFTPGEAVLVLGGISFVLNQLIKRSLTVVESQGDPVDFLVVVVVGMVLMGIFFSTLFVFMDSGTWASSIFFHLMTCVLGLGVVLPWLHRLIRRNPLLWLLQFLFQTDTRIYLLAYWSLLATLACLVVLYQNAKRSSSESKKHQAPTITRKYFHFIVVATYIPGIIFDRPLLYVAATVCLAVFIFLEYVRYFHIKPLGHTLRSLLSLFLDERDSRPLILTHIYLLLGMSLPIWLVPRPCTQKSSVGGARALVPYAGVLAVGVGDTVASVFGSTMGEIRWPGTKKTFEGTMTSVFAQIISVALILIFDSEVDLNYSYAWILGSISTVSLLEAYTTQIDNLLLPL	4715	6801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_+_4700_6800
816686	contig_10711_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_118436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATATTCCTCCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784975	784484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_784500_785000
816688	contig_7171_pilon	-	854	8	Intergenic	novelGene_101183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_7	348.859307352593	3276	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	139	603	49603	37659	FALSE	5	CCTGTGTCTCTGGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCR	50446	37407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_50308
816690	contig_14362_pilon	+	1005	8	Intergenic	novelGene_142505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	99.2923944309771	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2	9	503	511	8959	8967	TRUE	20	TCAGCATTTCTTCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETSSALTHAGAHLDLSAFSSWEELASLGLDRLKSALLALGLKCGGTLEERAQRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPTGYISFMA	4682	18649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_4753_5174_5243_5400_5509_6338_6409_8660_8826_8937_9042_10254_10346_18320
816691	contig_11281_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_125489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACATCTTTCTCCCACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909123	909786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_909100_909800
816692	contig_9975_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_176263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAACCAGTTGCAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330385	329242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9975_pilon_-_329200_330400
816693	contig_6227_pilon	-	1167	5	Intergenic	novelGene_49799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	101.388793759468	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	84	389	1291967	1260521	TRUE	65	GTTTAAAAACAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLYKYICSFLLQTLQLGAHPVWTHLLLMLQGNCYLSKQKERRLLITNAKFFKSCFQKTEEIWKFLALRRSFTGVGTMFLDSGASPFPVFDPGITEGPASGPLLLCRGCHAREKEQQQWQWLTWHEPHT	1292050	1253868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1291831
816695	contig_15114_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_121165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	802	1194	187096	187488	NA	30	CAGAGCTTTCTATAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLQCLAILAYELIFHGRGIGLSVSQCLWKKTWTLCTSAPRRWGVDGSVPDTCIPSSITPLPAKQLFRPALHPVSPGKDYFGGDTPWVVILLPSGLGRGGVGVGKAEQPPGSHFSPPVFLSSLQAQDF	186294	187706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_186300_187700
816696	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
816697	contig_4364_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_1116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGCTGCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532893	1533295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
816698	contig_6277_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_80384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCCCAGAATTTAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31816	32509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_31800_32500
816699	SIRV6	-	277	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGACCATTCATGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11111_11205
816701	contig_9239_pilon	-	847	2	Intergenic	novelGene_137200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	219	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	110	367	279021	240289	FALSE	50	ATACATAATCTCTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGELISIWNNLTIKCIVITNFYWNVSFQSKSI	279130	239808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_240519_278993
816703	contig_10163_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_82670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAATAATAATGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412662	411141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_411100_412700
816704	contig_21315_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_151574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAAGTTAGGCACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59237	61054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_59200_61100
816705	contig_10603_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_173373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	95	499	52995	53399	NA	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFFFIFSGTFAVMDSVCLPTSLRAVSVLVYPSHLRRARNARVLSWFLSSQKELVLVILQYSSTLWTPGAGCYWHQRSAVWSPHYRVLPNRNCHRASEAGGCTNHNANAKGILGCLCLKKVHLPSRGISGFRL	52900	55284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_52900_55300
816706	contig_15732_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_88912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGTGTTCTTGGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332477	332035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_332000_332500
816708	contig_8110_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_158618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGCTCAGAGACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164850	165772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_164800_165800
816709	contig_5917_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_122151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCACAGCAGTGCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283060	283874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_283100_283900
816711	contig_11483_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_172693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGCTGTAAGGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150722	151498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_150700_151500
816713	contig_3601_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_132918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTATGAGGTTTCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311825	310537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_310500_311800
816715	contig_13680_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_149570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCAGGGGAAAGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142064	143012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_142100_143000
816716	contig_11630_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_147180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	749	1096	116354	116701	NA	70	ACTACAAAAACAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEKNLNQPLLELHAVGSTCADLHLCNFLESQFQEEKLIKKMGDHLTNLHRLSSPQSRWASISSGNSPSNLSRSLQSPVSFECPPPRISLVSALLPEPFPPAKRQLFNNPGSLS	115605	117605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_115600_117600
816718	contig_1016_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_173253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.871965661856	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTACTTGACCTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226084	263735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1016_pilon_+_226284_247977_248057_253225_253274_258019_258104_262710
816720	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	99	-2	99	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5059	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
816722	contig_7452_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_109161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATCCACCAGGCGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189011	190091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_189000_190100
816725	contig_8312_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_152916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCTAAGCATTTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575318	1574219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1574200_1575300
816726	contig_10063_pilon	+	1865	18	Intergenic	novelGene_127762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	1165	1863	737119	738774	FALSE	25	CTCCAGGCCTGACAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVTSSKVFPRPFDVNQDVTFFGGGTLPMFQVPMKTEIMSGSSCFECLFFMSCSSWQKASRFLALTKMKSLRCVRSFSFSNTTPSLFCTRWDLMSWRMRSCVKVVQSSCESRCLRSSTSRPPSTSTLSVNFCDFPILVRSPRVTSSFTSKACTGMVLALRVDGCNGAGGAVELMSCRAFRATFFWMPDRKSLSTDSFSTRLSSSCSPVCGGLCCCKRRVTMGELCWSNTLDR	733032	738776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_733072_733162_733252_733729_733819_733944_734058_734627_734720_734842_734927_735187_735273_735351_735456_735570_735716_736001_736095_736637_736757_737006_737203_737291_737396_737771_737879_737969_738119_738239_738339_738511_738607_738713
816727	contig_14537_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_158645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCTCTTCTCCCTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15291	13786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_13800_15300
816728	contig_12057_pilon	+	1596	2	Intergenic	novelGene_131623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACTGAACAACTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21859	24400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_22460_23404
816729	contig_567_pilon	-	1759	9	Intergenic	novelGene_33947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	15.9251177389682	194	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	111	1034	298111	219351	FALSE	30	AGACATTCTTGAAAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLSYESLVHAVAGAVGSVTAMTVFFPLDTARLRLQVDEKRKSKTTHMVLLEIIKEEGLLAPYRGWFPVISSLCCSNFVYFYTFNSLKAVWVKGQRSTTGKDLVIGFVAGVVNVLLTTPLWVVNTRLKLQGAKFRNEDIVPTNYKGITDAFHQIIRDEGIMALWNGTFPSLLLVFNPAIQFMFYEGLKRQLLKKRMKLSSLDVFIIGAIAKAIATTLTYPMQTIQSILRFGRHNLNPENRTLGSLRNVLYHLHQRVRRFGIMGLYKGLEAKLLQTVLTAALMLLVYEKLTAATFTVMGLKNARKH	298221	218625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_219499_227993_228077_229515_229612_229892_230039_231030_231148_242221_242374_243888_243956_246396_246458_298057
816731	contig_11846_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_106016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513342	511889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_511900_513300
816733	contig_7457_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_31663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGGATTGAGGGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043515	1045449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1043500_1045400
816734	contig_11120_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_161291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATAAAAAAAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26170	27202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11120_pilon_+_26200_27200
816735	contig_2799_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_85475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCAATCAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433615	433403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_433400_433600
816736	contig_2010_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_176269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181809	183884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_+_181800_183900
816739	contig_5954_pilon	+	563	4	Intergenic	novelGene_28532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	303.941149274366	762	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	127	549	465084	467077	FALSE	30	CTTGAATGAATGAGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVCVVGGAESSASHPICA	464957	467091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_465157_465770_465874_466439_466503_466893
816740	contig_14618_pilon	+	1548	8	Intergenic	novelGene_136808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAAACTCCCTTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559455	570003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_559735_561292_561503_562215_562410_563699_563869_565414_565589_566228_566298_567306_567552_569795
816741	contig_13295_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_31230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGACTTTGATGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83358	84856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_83400_84900
816742	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
816743	contig_5988_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_16119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTAACCTTTTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226169	1226926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1226200_1226900
816746	contig_5231_pilon	-	847	3	Intergenic	novelGene_65879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	36	521	106781	104433	FALSE	65	AATTTCAAAAGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFLSGWKDNPAMPLGLIYEGVSKEPLKYSGGSAAQSSVLHAFDEFLGIRHSKESADFLHRMRDYMPPSHKAFTEEIQSAPSLRDYTLSSGNCQLLTAYNQCTEALAELRSYHITVVTKYLITAAVKAKVRRPSHLPGPPQALEERGTGGTAVLSFLKSVRDKTLESVLHLTG	114155	104106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_104789_106651_106801_114139
816747	contig_6418_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_81224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTATAAATGAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383417	1384696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1383400_1384700
816748	contig_7629_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_153562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTCTTCTATTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245485	243157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_243200_245500
816749	contig_4857_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_48677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAAAAAAAAAGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092741	1090811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1090800_1092700
816751	SIRV6	+	396	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	57	6	57	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2573	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
816752	contig_10958_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_5334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGATGAGTGAAAAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509319	507885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_507900_509300
816753	contig_9114_pilon	-	1163	4	Intergenic	novelGene_155178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	2.44948974278318	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTTTTATGTATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155215	15767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_16564_43882_43944_53561_53639_154986
816755	contig_9580_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_167742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	759	1088	1102035	1101706	NA	20	CCCCCGACACTTTGTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVRAQSHNKSLLRDDQKRATGQFYFTFWKKAQTHLHCSLELCLRRGEHTPCTLPSCRFSFLFVLEGGWLNVCARLRNCGESESSSGKVCQAGDSGEAGGVPGGESPGE	1102793	1101450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_1101400_1102800
816756	contig_7318_pilon	-	1467	6	Intergenic	novelGene_152219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	7.11055553385247	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	48	524	273453	259781	FALSE	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLGSRCTLPCYPRPCVIICLLILTAAFLTYPILKTLSLQLHSSVTGSYVSGTHSIVFVNCPNEQIARDIARALLDKKLAASVNILPKASSLYYWKGEIEEATEILLLIKTKTSKVHMLSSYIRLVHPFEIPEVFSLPMNQGDAHFFKWLEEGMEEN	273500	258837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_259884_263195_263246_263499_263546_265174_265235_269790_269940_273384
816757	contig_6062_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_5300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTTAATCTTTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773087	775153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_773100_775200
816758	contig_6102_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_31934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	284	640	392993	393349	NA	10	GGTGAGTGTCTGGATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGVSARRWWAGRGKAFTADEPPQEGRNRGWCPYSALPTSQLSCPPRSWCHSTREWRLIATATAIAPHL	392709	394270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_392700_394300
816759	contig_14243_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_57417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1215	1613	523130	523528	NA	40	TTAAAAAACCACCTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDHPEALRHICPNFRQLLGLSHIPPLYNAVGYSLPSAGPSIHSYFKSPDNGFVSWPALILCLTHHVRLSSFQDSSAVGTSGKLGGFRVASQPLGSLMPVCQSSTFWLWMAHKIKQLLLFLEFILITCVFL	521915	524589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_521900_524600
816760	contig_3601_pilon	+	1815	3	Intergenic	novelGene_132925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355559	359064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_355577_355915_356300_357650
816761	contig_17753_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_105033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTCTTCAAGACAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22634	20700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_20700_22600
816762	contig_15042_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_115438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGCTGAGTTAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43086	42142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_42100_43100
816765	contig_9482_pilon	-	905	6	Intergenic	novelGene_44241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGCCGCGCCCGGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290351	263335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_263370_264007_264071_278051_278098_285421_285580_288832_288941_289855
816766	SIRV6	-	378	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-135	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1955	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
816768	contig_5988_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_16164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCCTTTTTGGCTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2027647	2029814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_2027600_2029800
816769	contig_9578_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_67982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGAGTTTCTTGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133241	1131529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1131500_1133200
816771	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	15	1151	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
816772	contig_2058_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_171563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTCACATTACAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88258	86811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_-_86800_88300
816774	contig_18869_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_56318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTCCCAGACACCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73355	73601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73600
816776	contig_13760_pilon	-	806	3	Intergenic	novelGene_61304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	76.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	5	379	167463	161870	FALSE	10	TATGACTCTTTCTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMPAPPIASARPPHPHLSAATVTRTLAITASSSLPCVAAVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	167467	161442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163343_167349
816777	contig_9468_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_59533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATTTAGGGGGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595997	597371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_596000_597400
816779	contig_10444_pilon	+	2791	1	Intergenic	novelGene_139475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	542	1629	68	1696	892431	894059	NA	10	TCCTGGTCCAGTTTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGAIPQIPASSATSPSTPTSTMNTLKRKLEEKASASPGENDSGTGGEEPQRDKRLRTTITPEQLEILYQKYLLDSNPTRKMLDHIAHEVGLKKRVVQVWFQNTRARERKGQFRAVGPAQAHRRCPFCRALFKAKTALEAHIRSRHWHEAKRAGYNLTLSAMLLDCDGGLQMKGDIFDGTSFSHLPPSSSDGQGVPLSPVSKTMELSPRTLLSPSSIKVEGIEDFESPSMSSVNLNFDQTKLDNDDCSSVNTAITDTTTGDEGNADNDSATGIATETKSSAPNEGLTKAAMMAMSEYEDRLSSGLVSPAPSFYSKEYDNEGTVDYSETSSLADPCSPSPGASGSTGKSGDSGDRPGQKRFRTQMTNLQLKVLKSCFNDYRTPTMLECEVLGNDIGLPKRVVQVWFQNARAKEKKSKLSMAKHFGINQTSYEGPKTECTLCGIKYSARLSVRDHIFSQQHISKVKDTIGSQLDKEKEYFDPATVRQLMAQQELDRIKKANEVLGLAAQQQGMFDSAPLQALNLPTAYPALQGIPPVLLPGLNSPSLPGFTPSNTGGFCSRRFFLL	892363	895154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_892400_895200
816783	contig_14522_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_147337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTGAATCCCCGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167459	165809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_165800_167500
816784	contig_14666_pilon	+	1358	12	Intergenic	novelGene_39495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1091.17060501839	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	47	694	307554	322302	TRUE	30	GGCAAAAGATGTGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGLMERGGEEDPHAARSNSDGEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWS	307507	323510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_307576_310679_310726_315323_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322112_322296_322434_322677_322746_323045
816785	contig_4884_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_63789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATTATGGTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191526	191972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_191500_192000
816788	contig_8873_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_162892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1269	1643	1488	1114	NA	25	GGGTTAAGACTGTTCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSAKGKSSPALPSVAAFKSLTRKHCCLESMLWFPHSTLGAPWIFRGARALAPLPVSRHRVALIVKLRSALISPMKAFTTAGTLSGWKFSVGIFVFRTVTVFLKMSRFTTPKTGGSGWTESCC	2756	637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_600_2800
816789	contig_1964_pilon	-	553	3	Intergenic	novelGene_130929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	22	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	4	504	663394	621781	FALSE	20	GGTTTATTCTACTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMLFPTIERMSQSPSGRIATPLLCWFRFALYAISYLLLKPLPEKIKFLITRMVFQVKNIPNECLCMSLLNPFCLANAAYLGGQEMVQVVERDNETIKKNLSKLTFYYGTIDHWCPKEYYEDIKKDFPEGDIRLCEKKIPHAFVMSHIHSLEMAEMAADWLKDDLSKI	663397	621731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_621979_644554_644638_663174
816790	contig_4083_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_152314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21254	19770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_19800_21300
816791	contig_1009_pilon	-	1545	8	Intergenic	novelGene_121777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	72.3105547380921	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	221	820	313273	301449	FALSE	30	GCCTCAAAGAACAGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSAVKISLDLLSNPLCEQDQEFLKMVTALDTAMKRMDAFNQEKVNQIQKTVIEPLKKFGSVFPSLNMAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356433	300723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_301596_304758_304894_305141_305284_312521_312563_313138_313285_319458_319533_326889_326939_356347
816792	contig_13494_pilon	-	1805	2	Intergenic	novelGene_167516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAGTTTCATATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84288	56994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_58476_83964
816793	contig_5585_pilon	-	1885	4	Intergenic	novelGene_143059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	12	332	97747	63033	TRUE	70	GAAAAATATTAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTGPFKTCFFASNPKNGGNTNYECHQVFHQKKNQVRTAHLSNLIWTWNVIFSAAFLYPCCFPNATVSLLIKVASNYNQEWYKIKNAENTNPDHKLHQFILVFLF	97758	10152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_10678_50184_50381_62200_63220_97613
816794	contig_7457_pilon	+	2526	13	Intergenic	novelGene_31366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_12	149.411321711427	280	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	123	1667	359261	371026	FALSE	35	AACCACAGTCCCTTAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIPNAPTSKCITYWKRKVKSEYMRLRQLKRLQANVGAKALYVANFAKVQEKTQILNEEWKKLRVQPVQLMKPVSGHPFLKKCTIESIFPGFASQHMLMRSLNTVALVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLCNIPYMGDEVKEEDETFIEELINNYDGKVHGEEEMIPGSVLISDAVFLELVDALNQYSDEEEEGHNDTSDGKQDDSKEDLPVTRKRKRHAIDGNKKSSKKQFPNDMIFSAIASMFPENGVPDDMKERYRELTEMSDPNALPPQCTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHPFHATPNVYKRKNKEIKIEPEPCGTDCFLLLEGAKEYAMLHNPRSKCSGRRRRRHHVVSASCSNTSASAVSETKEGDSDRDTGNDWASSSSEANSRCQTPTKQKASPAPPQLCVVEAPSEPVEWTGAEESLFRVFHGTYFNNFCSIARLLGTKTCKQVFQFAVKESLILKLPTDELMNPSQKKKRKHRQGLDEGLFVTRQFPVL	350143	371885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_350163_358575_358668_359249_359378_359511_359641_360766_360887_362202_362324_363701_363879_364869_364973_365433_365598_365943_366036_368845_369027_369288_369486_370882
816795	contig_2537_pilon	+	1121	11	Intergenic	novelGene_33418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	258.961696009275	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	55	762	205895	234961	TRUE	25	TAAAGTGTTTCTACTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWLRSSAGLAAATSWVIAMGVPAFFRWLSRKYPSIIVNCVEEKPKECNGVKIPVDASRPNPNDVEFDNLYLDMNGIIHPCTHPEDKPAPKNEDEMMVAIFEYIDRLFNIVRPRRLLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASKEGMEAAVEKQRVREEILAKGGFLPPEEIKERFDSNCITPGTEFMDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADAR	205840	235589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234953_235029_235110_235245_235431
816796	contig_4732_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_75451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1574	1894	668296	667976	NA	45	AAAATGAAACCAGGCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLLRAVTLGVLRRNRSHGPNQRAGLQAAGTPSPADVSFQIMKGAAFPAAQQRNLTGKNSTPTSVPRVSYCRRRAPSGGRGLKVQHKNKILPEGAKPSVLLLFSP	669869	667894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_667900_669900
816799	contig_7285_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_143410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323881	323371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_323400_323900
816801	contig_2798_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_119996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTCCAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72412	72126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_72100_72400
816802	contig_7004_pilon	-	1377	8	Intergenic	novelGene_126509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	89.5312053682618	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	504	953	434061	433168	TRUE	10	GGGCTGCCCCCATGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRKKVRVSAKTNLPTPPQIFTNKCERSGCRQREMMKLTCDRCGRNFCIKHRHPLDHDCSREGHPTSRAGLAATSRAQGLASSTSTVPSPSQTLASSTSPSRATTHSPSPTAPPVIALQNGVRMRLCNEPWNCRWQRPSPRSLGTYSW	435072	432224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_432779_432853_433157_433253_433339_433397_433473_433570_433849_434268_434503_434599_434870
816803	contig_6445_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_77137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513644	1512070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1512100_1513600
816804	contig_5023_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_7109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTGTTAAGGGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65929	67541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_65900_67500
816806	contig_2892_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_118997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCTCCTTCTCTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92590	91749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_91700_92600
816809	contig_1008_pilon	+	1424	3	Intergenic	novelGene_121621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCCGGTCACCCACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117940	1126369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1119077_1123558_1123731_1126253
816810	contig_2069_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_23419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCTTTATAAAGACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255623	1253345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1253300_1255600
816811	contig_15744_pilon	+	709	4	Intergenic	novelGene_83584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1740.85694096008	8	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	181	495	152344	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQTLLRESVFSCVTAAPSHGQPYGVLRHRRRRQNFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149604_152263_152353_152532_152706_153245
816812	contig_8375_pilon	-	1811	9	Intergenic	novelGene_141274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	647	961	41413	37315	TRUE	20	AAGTGCACTTCCTACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGRLDCQLVALGEASGEVGSIGGRAVILSFLLLASLCLVPNCLGVICSGLMEGLVLIFSVKPIGDWTRPFIHTALEHKGLSRLHLLTQHDSQLDLLNRGLSP	60013	31023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_31356_35204_35457_37048_37327_40523_40810_41396_41517_43344_43430_45559_45625_51030_51140_59729
816814	contig_9848_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_79930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACAATTTCATTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75742	75133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_75100_75700
816816	contig_18392_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_143100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCCATGGTGGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237963	237659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_237700_238000
816817	contig_18392_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_143098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	317	682	223929	223564	NA	55	TTTTAAAAAAAAAAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLLRKAEYRDIGSRRKARCLHNCRCLNREQGEGKKLEIGSGISLLLSITINMVLDETEFYLNTVKCCYIASLITELWTDLFNQLTISTETTVEISNLAKSYKLLKGKARPSSSSYSRRY	224245	223447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_223400_224200
816818	contig_9955_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_21369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	405	509	913	299900	299496	NA	30	TTAATTAAGCACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPPRRAIHALPGLGQGVSSPALAGGGEVEGEEGKALLPSSAHKPQALTPNKAPAVGGLQAAVEGPKGKRGGLTDQGPVRTQPPRTKCPSGAAFLMAYPQAEGSHGYRDGPWENGEMPPPSGYTKISSPKNNPG	300408	299493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_299500_300400
816819	contig_10907_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_144911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAACAAGATGGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41129	38841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_38800_41100
816820	contig_11708_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_138991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	110	304	399590	399784	NA	25	TATTTTCTGCCAAGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLNFLIFFPVSLKDIFDIIVLNYLGPLLAFLEEKTMKSILKNQLKSQEYASCMPPPDTALMRLTFDSSYIPLHLALCSARTNAVLLPLPIKNLICRIMK	399480	399900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_399500_399900
816821	contig_4531_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_47923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATTCATATACGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413921	412745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_412700_413900
816823	contig_5247_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_81833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAAGAGGAGTTAGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375927	376974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_375900_377000
816825	SIRV6	+	543	4	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	8	-15	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2026_2470
816827	contig_11258_pilon	+	512	5	Intergenic	novelGene_67743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4194.41523784901	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTTCAGTGTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49142	53621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49232_49379_49553_50092_50154_52748_52872_53555
816828	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
816829	contig_7976_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_169415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820338	819156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_819200_820300
816830	contig_11413_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_103199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	236	637	607050	606649	NA	40	GTCAATATAGGCATTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSEIFIGTSSASCSGWRDTNHQVHQNTTEAHVSTHYTGRGAERARLSQSGKGMCDRRLHEHFLGTRLCVLGGAMVVHVYRKASQGEETKRHKSARQIQVTGQDYNGKNRREKSERKNNTGKVRIIKCPECGY	607285	605207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_605200_607300
816833	contig_15787_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_143995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTACTTGCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97611	99598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_97600_99600
816835	contig_12050_pilon	-	1137	8	Intergenic	novelGene_62683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	127.469724296575	59	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	215	775	486455	470439	TRUE	60	AAAAAAAACCAACTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDELNFDLDRGRVSGGRPGRGGRRGRCGGDWPRPRALGCL	511552	467311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_467670_470434_470485_471184_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
816836	contig_17158_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_141150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATACATCCAATCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135960	135770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_135800_136000
816838	scaffold_13505_pilon	+	1648	4	Intergenic	novelGene_111631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	47.1192341005478	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	503	604	739601	739702	FALSE	15	CCCGGTTCAAATTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQGNQRKRRTLVQFLADHFYDVQALREYFLHKQALKVHQENRFQGQEWIRPNGRGHFSLDFLKFQAVPVEAVDASGCTLNYSGLDNLLPLKELQSLWLQRCPHVDDWCLSHLHPLADSLQELSLAGCPRISERGLACLHHFQKLRKLDISDLPSVSNPGLTRILVEEMLPNCEVLGADWAQGLKSAPEEQRRDAAGPVPA	735352	740746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_735479_737892_738030_738222_738386_739524
816840	contig_10286_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_98421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGACAACAGTAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423134	424716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_423100_424700
816842	SIRV6	+	461	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	21	536	14	54	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATTGTCGGCCTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
816843	contig_10064_pilon	+	973	4	Intergenic	novelGene_122728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.579052259116	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	123	470	395972	404100	TRUE	45	AAAGAGGAATGTCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQASFRGHMARKKIKSLLSPQFPSRDGCRVPFAVTRLPCRVCDPLLPTNPPASGAPLRPQETPPRQAPSRSRQVRALSVSSPV	395849	404707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403097_403894_404498_404601
816844	contig_2793_pilon	+	2090	15	Intergenic	novelGene_142878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.1924905147695	1	53	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	480	1979	364550	416823	FALSE	35	CTCATCTCGCAAAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSEQKVNCTSQPCPTARVPTCGPCEVARLHQNPNQCCPEYECVCDLVSCDLTPVPHCEGGLQPTLTNPGECRPNFICACRKEECRRESPPSCPPHRTLTLRKTQCCDEYECACNCVNSTVSCPLGYLASVIINDCGCTTTTCLPDKVCVHRGTIYPVGQFWEEGCDVCTCTDMEDAVMGLRVAQCSQKPCEDSCTLGSTYVLHEGECCGRCLPSACEVAIGSPRGDSQTSWKSVGSHWASPENPCLLNECVRVKEEVFVQQRNVSCPQLDIPTCPMGFQLSCKTSGCCPTCRCEPVEACVLNGTIIGPGKSLMIDECTTCHCTVQVGVVSGFKLECRKITCKACPLRDETIQDGCDSHFCKVNERGEYIWEKRVTGCLPFDEHKCLAEGGKIMKIPGTCCDTCGEPECKDITARLQYVKVGDCKSEEEVDIHYCQGKCTSKAMYSIDTEDMQDQCSCCSPTRIEPMRVPLHCINGSVVYHEVLNAKQCKCSPRKCTK	354243	416934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_354478_356224_356425_364504_364608_365077_365153_366370_366476_367707_367914_373121_373272_377963_378075_380511_380693_381757_381799_382281_382399_413436_413566_414101_414142_415825_415924_416634
816847	contig_4059_pilon	+	1858	1	Intergenic	novelGene_140591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTAATGCTTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259003	260861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_259000_260900
816848	contig_165_pilon	-	1527	4	Intergenic	novelGene_117068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1002	1307	61738	61433	FALSE	35	CTAAAGCCACTTACCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKVLASSTGYRNTTATPTALPGAGLLPCAVHIHLVCVTCACGLSRWTWLAPTGRQCWHLLSNDQGCHMPPCNATHLTLCQGHSTFSEYSLVIKGEGGSE	64235	61212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_62056_62143_62227_63550_63586_63669
816849	contig_12485_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_147289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212107	214162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_212100_214200
816851	contig_13481_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_119503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATTAATGGGAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402321	1402789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1402300_1402800
816852	contig_6286_pilon	-	830	7	Intergenic	novelGene_165671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_6	19.6694913225759	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	78	830	464608	457236	FALSE	15	CACGGGGTGGAGGGCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVCGMHPDHQEALKRNRVVLAKQLLLSELLEHLLEKDIITLEMRELIQARVGSFHQNVELLNLLPKRGPRAFEAFCAALRETKQAHLEDLLLTTLSGLQHIPPPLSCDYDLHLPFPVSESCRPLKQPRLSADPMEHSLDSGDGPPCLQVKPCTPEFYQRHRQMAYRMQAQTRGLALVLSNVRFTGEKDLEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDVHVLHDQTAQEMQEKLHSFAQLPAHRLTDSCIVALLS	467523	457235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_457317_462786_462964_463182_463278_463813_463896_464018_464187_464458_464610_467447
816853	contig_14923_pilon	-	1502	2	Intergenic	novelGene_157744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTATCCTGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216095	212205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_213583_215970
816854	contig_12327_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_140651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATATCTACTTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192743	194119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_192700_194100
816855	SIRV6	+	472	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	6	7	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
816858	contig_5083_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_151695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCCAGCATTCTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397287	1395429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1395400_1397300
816860	contig_6364_pilon	+	1468	5	Intergenic	novelGene_51802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	28.3581998723473	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	118	693	1465500	1469110	FALSE	30	AACTACCAGTATTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSHHTGMSYMDHNDTTSPPHHHPTTSVSHSHAEGHGDTMMMMPMTFYFGFKNVELLFSGLVIHTAGEMAGAFMAVFLLAVFYEGLKIARESLLRKSQVSIRYNSMPVPGPNGTTLMETHKTVGQQMLSFPHLLQTVLHIIQVVISYFLMLIFMTYNGYLCIAVALGAGTGYFLFSWKKAIVVDITEHCH	1427037	1469885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1427127_1465471_1465632_1466135_1466209_1467459_1467629_1468908
816861	contig_8978_pilon	-	1578	4	Intergenic	novelGene_49361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1159	1497	215708	214666	FALSE	40	AACAGGGACATGCTAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTAITPTPISVDHAPGVGARGMLLGTKTEGRGEDALLVGLHVDSATDDDLQEEDSPLGGLLGAALHRVKHAPDLPELSRSLSASCINCFGLQSSKYWSSRQLFTIWCTWL	217127	214584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_214683_214873_214963_215475_215960_216220
816862	contig_12622_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_6063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTCCCTCTTGATGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762983	1765216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1763000_1765200
816863	contig_4385_pilon	-	2748	5	Intergenic	novelGene_141519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2240	2746	463832	461644	FALSE	10	CCGGCGCAGCGCGGCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRPHTRNSGLIGLEWGRGTGLFKSFSGNSTYNSGWDPLLSKPVTNTGEAAGLCGHSLNQGRLQTGRWMETRQAKNASAVSLKNSTPWFREHNGDPPAPQKDIRASWTSMIQSTSFRLLCIFFRPLAIWPGNQRAGSRPPRGKLSRQAARAALQTACVNNLMEPPSRK	468786	461641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_461774_463455_465431_466485_466565_468040_468101_468284
816864	contig_5744_pilon	+	511	3	Intergenic	novelGene_149328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_2	214.5	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	109	339	294152	297257	FALSE	35	CATTCTTGGATAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSNICPGPVQSNIVKNAVTEEVTKSVGNPGDQSYKMATSRCVRLMLISMANDLKEVWISDHPFLLAAYLGQYMPTLTFWIIGKLGKKRIENFKSGLDADSSYFKPLKKKHD	293327	297429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_293403_294118_294335_297209
816865	contig_15304_pilon	-	714	2	Intergenic	novelGene_30547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	176	679	54100	52925	FALSE	25	CACCAGAAGCAGCCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54275	52889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53991
816868	SIRV6	+	464	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
816869	contig_14980_pilon	-	830	6	Intergenic	novelGene_78217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	13.847743498491	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTTGGTCTGGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240480	202905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_203143_206114_206271_207925_208050_212379_212451_216619_216786_240404
816873	contig_15866_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_63682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATCATTTTGAGATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627987	628331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_628000_628300
816874	contig_15866_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_63683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCATGGCTGAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628237	629500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_628200_629500
816876	contig_11056_pilon	-	2500	1	Intergenic	novelGene_130387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCACTTGTTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622548	620048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_620000_622500
816877	contig_12756_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_153214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTAAGTTCACTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160297	159195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_159200_160300
816879	contig_11115_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_102862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.5717947266145	335	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	21	515	173602	186858	FALSE	35	AAGAAAGCAAGGCTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGFTKMAADVSVTHRPPLSPEAEAEAGDASERRVPEEELPPLDPEEIRKRLEHTERQFRNRRKILIREPALGPHGPSRLKMSPPPSGFGDRSGGGAPLSLLFGLTHFLLRQRPAGWPQAEPPQQGGWLLSAGLRRRAPGPKPRAQWPQPPAEDPTGWPETQLCPPAALA	173581	188142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_173784_185597_185641_186134_186268_186633_186718_186805
816880	SIRV6	+	332	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	541	0	375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
816882	contig_9883_pilon	+	592	3	Intergenic	novelGene_87588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_2	324	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	21	590	83842	96082	FALSE	50	AGGAGGAGGAAGCAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSWARTAVVLLCACDLVLLLLLPPRACATGDPAGTPGEATPPPRKKKKDIRDYNDADMARLLEQWEKDDDIEEGDLPEHKRPSAPIDFSQIDPGKPESILKMTKKGKTLMMFVTVSGSPTEKEMEEITSLWQGSLFNANYDVQRFIVGSDRAIFMLRDGSYAWEIKDFLVSQDRCADVTLEGQVYPG	83821	96084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84049_94067_94301_95952
816883	SIRV6	+	485	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	527	-1	63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTGGATGCAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
816884	contig_4305_pilon	+	2843	14	Intergenic	novelGene_136713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAGAAAAAACACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803946	830386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_805268_806778_806894_808303_808439_808999_809178_812295_812437_812807_812916_817212_817317_817734_817795_818487_818610_818860_819028_821210_821413_828152_828235_829814_829862_830325
816885	contig_11096_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_143490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346714	345032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_345000_346700
816886	contig_5999_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_45609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTGGCTCTCCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95521	96032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_95500_96000
816887	contig_6635_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_127015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATTGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362927	363425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_362900_363400
816889	contig_7165_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_116816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTCACAGAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162960	161105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_161100_163000
816891	contig_11794_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_173195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATCTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44283	45630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11794_pilon_+_44300_45600
816892	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
816893	contig_7744_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_62488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670966	672131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_671000_672100
816895	contig_17976_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_32537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCTCTATAGTATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53412	54044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_53400_54000
816897	contig_9146_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_79512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAACAGAGAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315481	314796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_314800_315500
816901	contig_9505_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_121880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGGATTCAAACCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694635	696692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_694600_696700
816902	contig_12078_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_74110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTATTGCTATGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334031	333661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_333700_334000
816903	contig_15691_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_60783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTGTTTTATGATTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119663	120792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_119700_120800
816904	contig_6020_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_155577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAAAGGGGCTCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347179	349395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_+_347200_349400
816908	contig_3832_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_161449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACGGGGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306113	306401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_306100_306400
816909	contig_3832_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_161448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGCTCTGTGGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304411	304932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_304400_304900
816910	contig_10549_pilon	+	1344	6	Intergenic	novelGene_110626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	287.192618289538	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	866	1342	414568	441238	FALSE	25	TGGTTTATTTCAGACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDLSFLTEEEQEAIMKVLQRDAALKRAEEERVRHLPEKVKDDQQLKNMSGQWFYEAKAKRHRDKIHGADIVRASMRKKRLQVAELAGVKEEPEEDAAPTSPSSGVVDPASTVINMSQEHTRKSAVSPAKQRKNPFNSSKLPEDHLSQQTKNEQSKNGR	371153	441240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_371181_413729_414669_426015_426168_428797_428853_440133_440216_441151
816914	contig_3817_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_78365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1474	1890	623927	624343	NA	30	TTTTTTACTAACTGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKQRWAHIPAWLSWLGLKSLTPVGQAHACSPSATRLSPAPLHSFKLLPAGPCRHLSLLESSYMYFLLFIFFLVKIYTQKNIHPFSNFYIYSSVTLAVFFILCHHSHHLYPDYFSTINLDSWLLKLLVYALELLLSV	622453	624390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_622500_624400
816918	contig_14704_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_82707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTACCTTTTAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81512	82164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_81500_82200
816921	contig_8907_pilon	+	1750	2	Intergenic	novelGene_85795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	892	1215	171212	171535	FALSE	35	TGAACAATTGGTAAATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERQTTMNNRHLPGVETPLLLPLPQLAPALSRITERVIDRLLETECDSLERLKTPAGLALAVPLCPHPTFPPEASLGFHCEAGRKIPSCFQQQERKSHHFEIVLCC	163133	172070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_163191_170377
816922	contig_14536_pilon	+	561	3	Intergenic	novelGene_69272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	79.5	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTTCGGTTCTGTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23337	24207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_23428_23629_23860_23966
816923	contig_6929_pilon	+	736	8	Intergenic	novelGene_139359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_2	457.951784290327	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	72	536	77555	90425	TRUE	0	TGTTTTGGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVANSSPVNPVVFFDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77483	96489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356_90447_96310
816925	SIRV4	-	359	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	0	1162	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
816926	contig_6375_pilon	-	1108	2	Intergenic	novelGene_73006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCCCACTGCCCGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329292	327212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_327751_328722
816928	SIRV4	-	353	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1159	9	1159	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3999	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
816931	contig_12250_pilon	+	766	10	Intergenic	novelGene_80674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_7	297.479784560602	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	80	598	391631	394722	TRUE	10	TGTGTGGATTACTTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALDLGSESESPGGEPGDRKSCNWRNMAKPCGVRLSGEAREQVDVFRQNLFREAEEFLCTFLPQKIIYLNQLLKEDSFNVADLTSLRAPLDIPIPDPPPKDDEMETDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQVLLRTWGCSGQGLQGDPCDGLPGPGARAR	391551	394983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392016_392628_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_393955_394326_394382_394687_394775_394867
816932	contig_6227_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_49822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTCCTTAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367226	1369129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1367200_1369100
816933	contig_7945_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_161586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACCAGATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184621	184986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_184600_185000
816936	contig_6589_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_25834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCCGACTCATAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905057	904014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_904000_905100
816937	contig_3382_pilon	+	1420	3	Intergenic	novelGene_124003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	453	junction_1	54	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGACAAAAAAGACAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108035	118130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_108858_116177_116388_117742
816938	contig_12920_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_166333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTGAAAATCCCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133479	133042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_133000_133500
816940	contig_4364_pilon	+	870	2	Intergenic	novelGene_174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	220	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	1266997	1270512	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRRPGGRVGFRDVRHFVQEGARGRAVEPSGSCQLSGRRVVWGVTGAQCPSEPLRVPRLSPASPPAPGTWSPPRCCQSPCNHDALTCGVRAGPSLTSYPVSA	1266996	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1270294
816941	contig_5018_pilon	-	897	2	Intergenic	novelGene_46959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	0	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	23	451	318549	316841	FALSE	5	TTTGCAGCCTGTGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAPLSSMAKRMLLLLLEVWVLAGELWLRAEVQAAPYSVKLCGREFIRAVVFICGGSRWRRADVLTYEAMGDAFQDAATDSDSLAGELDEAVASSEWLALTKPRQAYPSGQSSWQGTPGALRGGRDVLAGLSSNCCKWGCSKSEISSIC	318571	316394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_317080_318359
816943	contig_5479_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_133579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTATTATTAGGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160550	162301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_160600_162300
816944	contig_20561_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_166366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAGAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52555	54375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_52600_54400
816945	contig_19957_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_57718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAGAATAGAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215734	217542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_215700_217500
816946	contig_2854_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_120857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGTGAAAAAAAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324426	324258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_324300_324400
816947	contig_3601_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_132973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTATGAGTTGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151324	1151719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1151300_1151700
816951	contig_7204_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_176272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	941	1285	16932	16588	NA	75	AAAAGTGAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDFWFEHGGIKGGISFLPGSQPEATRDSETKTKFFVKTRRYLRPQPPLVGRIDKSRRDQARGHVGVNRERKKKPTERGHSGCIFQKELSAILKVERQNLTLLFATLGQACFC	17872	16272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7204_pilon_-_16300_17900
816952	contig_12837_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_57353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGATCATGTTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253234	254619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_253200_254600
816953	contig_8156_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_98949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	163	420	440697	440954	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKVRTRALYQLLVTPALLPSRFPSTSASQRLSGQARLSKTAPHFSNPNQVSPLMCLQSCSRPGGGREARCQGKYEAPASRRLPAIPRSAHTLHSQGGGKEGKARGGEHSTFLGKGGMWEMGGSPKFRGGGAEPASHRS	440534	441765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_440500_441800
816954	contig_2799_pilon	+	1983	2	Intergenic	novelGene_85538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	560	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1162	1689	696442	699261	FALSE	20	TTCAAGGAATTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPFAPSEITEVVCFVLPFLTMCAFSSLQPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRRYRVH	695280	699555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_696900_699191
816955	contig_2062_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_139048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCAAGTTTGCCGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311909	1310929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1310900_1311900
816958	contig_9415_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_109852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAAGGCCTGTGGCACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982207	1981955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1982000_1982200
816959	contig_5415_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_146141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAGAAAAACAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209316	208438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_208400_209300
816960	contig_11378_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_112292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTACAAGACCAGGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564048	566255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_564000_566300
816961	contig_7810_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_144228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469257	467668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_467700_469300
816962	contig_5201_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_82182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGCCGTATGGAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297681	298708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_297700_298700
816963	contig_7963_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_58423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAGAAACTGAGACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93621	95171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_93600_95200
816964	contig_16714_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_161571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797790	798769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_797800_798800
816965	contig_9332_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_60739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577668	579280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_577700_579300
816966	contig_7568_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_174015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144452	142741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_142700_144500
816967	contig_10056_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_170929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCCGACGGTTCAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58292	59256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_+_58300_59300
816968	contig_7861_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_77413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGCCTATGTCTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129256	128708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_128700_129300
816969	contig_5084_pilon	+	1011	11	Intergenic	novelGene_64601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	20.4	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	26	940	982509	1025529	FALSE	20	GTTTGTGCCTATTACGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTKELLQMDLYALLGIEEKAADKEVKKAYRQKALSCHPDKNPDNPRAAELFHQLSQALEVLTDAAARAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLDLEAREREAQAHGNEEEEETRSTRTLEQEIERLREEGSRQLEEQQRLIQEQIRQEREQRLRGKAENTEGKATPKLKLKWKCRKEDESKGGYSRDVLLRLLQKYGEVLNLVLSKKKAGSAVVEFATVKAAELAVQNEVGLVDNPLKISWLEGQPQGTVDPSHPGLSQGSVLSERDYESLVMMRMRQAAERQQLIARMEQEDKEGPPT	982483	1025600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_982587_1014389_1014460_1014754_1014814_1015070_1015159_1017086_1017173_1017384_1017482_1018060_1018105_1018495_1018574_1019302_1019384_1019908_1020020_1025406
816970	contig_6069_pilon	+	457	2	Intergenic	novelGene_8037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATATGAAAAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319887	321398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_319920_320973
816972	contig_3956_pilon	+	480	2	Intergenic	novelGene_14796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	433	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	63	479	1218010	1223737	FALSE	10	TGCACACGGGCCTGCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGTTVAGAADSDEESRAEDKGVMDYYLKYFSGAHDSDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMR	1217947	1223738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1218315_1223625
816973	contig_17074_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_145182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTTCTCTAATAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602949	605023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_602900_605000
816974	contig_2033_pilon	-	1344	2	Intergenic	novelGene_71536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	543	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	720	1184	132135	130833	FALSE	40	AGAAATCCCAGCATGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIQQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPNSDMHPMRVLFLIPKNNPPTLVGDFSKSFKEFIDACLNKDPSFVSIYCYYYYLFSVIRSTYSKGSFSYSEGYNACENCLRSIQEAGSSLYIANPMQLLTIPIVPFSFPCTFFLVPPSSLFY	132854	130672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_131256_132093
816975	contig_10426_pilon	-	1551	2	Intergenic	novelGene_144672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTACCAATATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97838	96052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_96774_97008
816976	contig_11986_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_69108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCAATCCCATGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72907	72529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_72500_72900
816978	contig_6503_pilon	-	1455	7	Intergenic	novelGene_145779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	7.2033942616581	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	125	610	374042	333873	FALSE	40	AAAAATCCTTGATCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEHGYPTINLGIVGDNPDDLLNALNEGISRADVIITSGGVSMGEKDYLKQVLDIDLHAQIHFGRVFMKPGLPTTFATLDIDGVRKIIFALPGNPVSAVVTCNLFVVPALRKMQGILDPRPTIIKARLSCDVKLDPRPEYHRCILTWHHQEPLPWAQSTGNQMSSRLMSMRSANGLLMLPPKTEQYVELHKGEVVDVMVIGRL	393788	333027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_334007_335263_335361_342428_342533_345689_345755_350352_350427_374030_374119_393740
816979	contig_2062_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_139066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482724	1483939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1482700_1483900
816980	contig_11052_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_115468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAATGATGTTGACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110629	108834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_-_108800_110600
816982	contig_299_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_129473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1339	1767	1306691	1306263	NA	20	TGGGTGTTCGCTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSTRQDAIYALDQNFYIMPCPQKEPRRYKWLRAQLLTERLAAGTHPVAPWEKDLVTCFHKDYRQENPVGQFYSATWGCYESKTTRPQFREYMGLGTKGRREEYPPHTITPNDPLADCTSLQSLRSWSSKGTHFCKETREES	1308029	1305647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1305600_1308000
816983	contig_5445_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_135436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGAGTATCACTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159019	159398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_159000_159400
816984	contig_16098_pilon	+	1302	10	Intergenic	novelGene_46008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	667	1167	349624	350800	TRUE	25	TCAGGGCCACAAACTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVSGSKKGSRTPLLVSSSCRDSGSSRCFCRHRLKPVVRIFPSDTNTARTGRVPSWGRSFSCAFAGLDDAHTLVTAGGADEATVMAPVHAVDCVRVHVRAQRQHSRPSAHVPHQNHVVTATFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSRRGSVKPPSGISLCSPRSHWR	348290	352202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348522_348849_349064_349174_349233_349348_349492_349603_349720_349989_350079_350247_350422_350525_350638_350770_350895_352161
816985	contig_12624_pilon	+	1800	7	Intergenic	novelGene_60944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	120.043626329023	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1130	1606	39740	44609	FALSE	50	CCTATAGCGAAAGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGRWASFAPACTWPTTAARTWHLRMSLHSTT	6018	44803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_44521
816986	contig_6795_pilon	-	1837	7	Intergenic	novelGene_27689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	115.185357865775	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTCACAGCTCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134273	73515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_74765_110795_110852_119021_119195_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
816987	contig_8259_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_148882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAACGCAGAAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225991	227263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_226000_227300
816989	contig_9272_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_125916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGAAACAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312679	310656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_310700_312700
816993	contig_253_pilon	-	640	4	Intergenic	novelGene_129678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1178.80476189514	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	110	565	421635	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSRGAGLRSIELGLPGGLGVLLLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421744	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_420224_420329_420752_420841_421560
816994	contig_6958_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_70029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATTAAGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846565	847189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_846600_847200
816996	contig_13542_pilon	+	991	8	Intergenic	novelGene_131503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	469.799262386368	1	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTAAAAAATGTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346596	505937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454080_464640_464718_487359_487490_488004_488024_500843_500964_505521
816997	contig_3163_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_168071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644483	642386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_642400_644500
816998	contig_11978_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_62808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTTACTCTCCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346651	347325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_346700_347300
816999	contig_14516_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_153905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1211	1558	189611	189958	NA	60	GAAAGAAAAATAATGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHHLPVSGGLRVAVMLKRFQWSFQTNMDWKERSGDPLLQISQQKTPCIATVQSVDGTGLGSVLFHCTSVATSQGVTRRQLTATAIYQVDQAVLFCIVDLRNYFYTYCMHSTLF	188400	190233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_188400_190200
817002	contig_7234_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_145917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279314	276877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_276900_279300
817003	contig_17753_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_105034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGGTTTGCAATGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23991	22603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_22600_24000
817004	contig_12257_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_152115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTAGAGCATTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162790	161190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_161200_162800
817005	scaffold_880_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_121421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGAGCACTGACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366658	365937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_365900_366700
817007	contig_5229_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_117696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTACTTCAGGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544439	543908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_543900_544400
817008	contig_5836_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_106271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTGCCAAACAATCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25887	26870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_25900_26900
817009	contig_5836_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_106272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29007	29363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_29000_29400
817010	contig_10526_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_142572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAACTAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223356	225624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223400_225600
817011	contig_16798_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_172268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCTCCAGCCTCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235469	236645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_+_235500_236600
817013	contig_5954_pilon	-	1096	8	Intergenic	novelGene_28584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	35.4861283619733	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	186	638	933480	932026	TRUE	5	ATGGTCCCTGCCTGCGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVPAGLGSAPTVPPPDLLPPAQGRPQGLEIRRRQQSAPGGSWARAGLRWPGEDRPLPPSLMPLATRRKWCHGWMYMPVHRCGGCCPDDGLECVPTGQHQVRMQILMIRYPSSQLGEMSLEEHSQCECRPKKRETAGKPDRDSTPHHRPQPRSVPGWDSVPGAPSPADITHPTPAPGPSAHAAPSAVSTLTPGPAAAAANAAASSVAKGGA	933838	930961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_931398_932003_932240_932472_932509_932700_932775_932941_933020_933111_933139_933456_933500_933672
817015	contig_11574_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_64036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299190	300071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_299200_300100
817016	contig_18889_pilon	-	991	2	Intergenic	novelGene_167114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	2	772	161202	155423	FALSE	35	CCCAGCAAATCCAAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSFLGDLSSASDKLLGEKLATVPAPFSEEEVFTPFSRLAVDSHLSRSAEESFLSPIISQSRKSKIPRPVSWANTDQVNSSTSSQFLPRPPPGKPPTRPGVEARLRRYKVLGSSNSDSDLFSRLAQILQNGSQKPRSTTQCKSPGSPHNPKTPPKSPVVPRRSPSASPRSSSLPRTSSSSPSRAGRPHHDQRSSSPHLGRSKSPPSHSGSSSSRRSCQQEHCKPSKNGLKGPGSLHHHSASTKTPPGKSKAASKLSR	161203	155203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_155886_160894
817017	contig_6589_pilon	+	1171	8	Intergenic	novelGene_26000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	990.40031073814	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	146	640	1725483	1729133	TRUE	20	GCCTACCACCTCCCCGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQTALLRLEFSAGLAPGPQPERQRVGGVPRALLLLQLVVDQRLRNLR	1725337	1731753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725727_1726937_1727040_1727175_1727251_1728198_1728242_1728996_1729234_1730067_1730152_1731406
817019	SIRV4	-	255	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1268	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
817020	contig_15744_pilon	+	362	4	Intergenic	novelGene_83573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	446.432027923127	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	59	361	149562	152646	FALSE	40	ATGCTGGACCCAATACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMA	149503	152647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532
817024	contig_11855_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_67074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCCTGACAATCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2059873	2059289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2059300_2059900
817029	contig_10638_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_164314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	385	726	541290	541631	NA	65	CATTAAAAATCACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRSFVQGPGLSSRPFYSFIHSFSTHSLGSYYVPGAEDRKTGNSCPKKSPAYSPSPLTCPLGLQIQHIPMCSSSCVFYLTDHSFRTDSWEPVFSYLICLSSDRIRNFIASTS	540905	542175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_540900_542200
817030	contig_9199_pilon	+	1110	9	Intergenic	novelGene_65632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	56.1970584194582	938	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	83	925	120933	122653	FALSE	15	GTGTGAGTGCATTCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKAAGAEEELLPGVDVLLEVFPTCSVGQAQWALAKARGDLEEAVQMLVEGKDGPNQDLPRRLRGPQKDELKSFILQKYMMVDSAEDQKIHRPMTPKEAPKKLIRYIDNQVVSTKGERFKDMRNPEAEEMKATYINLKPARKYRFH	115812	122838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_121799_121872_122035_122230_122293_122367_122429_122506
817031	SIRV6	+	480	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
817032	contig_12689_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_145024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	15	326	22855	23166	NA	75	TGAAAATGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG	22840	24405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_22800_24400
817033	contig_11846_pilon	-	1215	2	Intergenic	novelGene_106018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524282	522871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_523455_523650
817038	contig_5084_pilon	-	1215	7	Intergenic	novelGene_64526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	322.715905334019	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	427	981	443121	432179	FALSE	35	AAGATATATATGGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLTEFQNQEQPENQDLKTAGEAPTPPDESQGDENADSMEESRINGNEDSKIPSERKKYLCTDAFLKAGKNNKTGSTTPNFKKLHEAHFKKMESIDQYIERKRKHFEEHSNSLNELKKQPFHKGAVTAPTVTPVPVRGRSSGARAPGHGRSQRGSQGTAGRSILGPRRSVKPFALSATKMNVR	467777	431944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_432380_439640_439754_440829_440932_442982_443143_444435_444610_448313_448383_467615
817039	contig_14508_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_79053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTATCTGCAGAATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71575	72851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_71600_72900
817040	contig_1996_pilon	-	1979	2	Intergenic	novelGene_131959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	62	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1492	1935	528982	528442	FALSE	15	CACATGCCCTACTGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLQLRQTFEAAILTQLHPRSQIDIYVQVLQADGGTYAACVNAATLAVLDAGIPMRDFVCACSAGFVDGTALADLSHVEEAAGGPQLALALLPASGQIALLEMDARLHEDHLERVLEAAARAARDVHTLLDHVVRQHVCEASLLLGD	530473	528397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_528802_528898
817041	contig_11720_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_44027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGCAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401672	400052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_400100_401700
817043	contig_8674_pilon	+	661	2	Intergenic	novelGene_102929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	113	412	439464	439763	TRUE	20	CAAGGACCGCGTTCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAHCSPYTIWYLNTQSSLLCRHLSLRDSWSFLVQREISGTDPGIYCLFLESDLCPLKPHLPLVWWGAIGAGHGLPQYNRSIFVKFFLFMCVCKILIFP	439351	440442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_439957_440386
817046	contig_11948_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_174388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161797	159583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_159600_161800
817047	contig_9915_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_174176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCCCCATAGGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768910	769245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_+_768900_769200
817049	contig_2703_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_101799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCCTCCACTCCGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615151	615908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_615200_615900
817052	SIRV7	-	262	3	ISM	SIRV7A	SIRV708	889	6	69007	11	35788	-11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
817056	contig_709_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_57645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATTTAAAAATAGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3050120	3051150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3050100_3051200
817057	contig_8615_pilon	-	1676	1	Intergenic	novelGene_165232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAGCCTTAATCTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465108	463432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_463400_465100
817058	contig_1244_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_38065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGACCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210555	1212532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1210600_1212500
817061	contig_8864_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_136010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747615	746077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_746100_747600
817062	contig_20241_pilon	+	1527	2	Intergenic	novelGene_159739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAACTATGAACTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220476	222101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_221656_221753
817063	contig_3382_pilon	+	1889	2	Intergenic	novelGene_123996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	0	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGACACAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96744	99811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_97806_98983
817064	contig_12142_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_147843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCACCCAGTTTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243626	243843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_243600_243800
817065	contig_8065_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_107344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACACGGGCAGGTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259772	259115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_259100_259800
817066	contig_116_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_154892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229900	228975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_229000_229900
817067	contig_10857_pilon	-	1436	2	Intergenic	novelGene_160867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAACTCAGAATCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22141	20665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21801_21840
817071	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817072	SIRV6	-	474	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	396	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	322	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTCGCCCCCATCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
817073	contig_6048_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_73368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAACGACTCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3093680	3094114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3093700_3094100
817074	contig_6503_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_145787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778843	779543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_778800_779500
817076	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	10	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817077	contig_13051_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_140134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCTAAGATAACGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423694	421899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_421900_423700
817079	contig_14882_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_115025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGGAATAAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307895	305797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_305800_307900
817081	contig_13780_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_149048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596726	597686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_596700_597700
817082	contig_14744_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_66040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310101	1308101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1308100_1310100
817083	contig_5816_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_158238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92763	91719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_91700_92800
817084	contig_16930_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_139145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	411	773	51447	51085	NA	30	GTAGGAATTACTGAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNSDTIVNNEVSSESKKKKVYILLKARKKYIFCWLVYCYYGCKGIQWWRVHFRDCFWTQRFLDYDKNTKDKEQAVCFKSAKLPSLLNSTRSYITLGAGEVGDIVQTASFKHIELILSL	51857	49693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_49700_51900
817085	contig_7415_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_168671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTAGTGTGATTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219935	219627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_219600_219900
817089	contig_11855_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_67003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACCATCTGCACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317034	1317862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1317000_1317900
817092	SIRV4	-	262	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1261	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
817093	contig_5047_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_158014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGCACAGTAAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671736	1669984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1670000_1671700
817096	contig_13831_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_160991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGTAGTACTATGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104275	103162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_103200_104300
817097	contig_4364_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_69	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703344	702641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_702600_703300
817100	contig_6589_pilon	+	713	4	Intergenic	novelGene_25773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	1999.16271362677	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	272	622	669670	672754	FALSE	5	GGCCCTGACTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668303	672845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669650_669748_670000_670104_672584
817101	contig_7070_pilon	+	393	3	Intergenic	novelGene_104036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	54	junction_1	10.5	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATCTTGCATAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66427	257859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_66691_165610_165659_257777
817102	contig_3130_pilon	-	2061	2	Intergenic	novelGene_103566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATACTCTTCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94124	74327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_74458_92193
817104	contig_14528_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_111284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACTAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244460	244849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_+_244500_244800
817106	contig_6557_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_32954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTGAAATGTTAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346711	348062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_346700_348100
817107	contig_7513_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_89022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCTATAAGCAGGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677663	678762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_677700_678800
817108	SIRV6	+	328	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	27	529	14	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGAAGTTGTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
817110	contig_18634_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_174240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGATTATCTCAAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29827	29186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_29200_29800
817111	contig_4924_pilon	-	1810	2	Intergenic	novelGene_84766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTCGTATCTAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230555	228700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_229692_229736
817113	contig_6477_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_154198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAATATCAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819931	820610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_819900_820600
817114	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	272	14	41	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
817115	contig_10569_pilon	-	1777	2	Intergenic	novelGene_44101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTGAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466705	456953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_458365_466339
817116	contig_348_pilon	+	1840	8	Intergenic	novelGene_67619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	886	1287	347880	349761	TRUE	15	GAGAGGGCGGCAGGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRTSLLRSSPPTSGRVLTSRSGGSTWAFRNFLAGRCARAHSVSTLSTGATLSFSRCVWSRRRSRKSRRAQIRSMFTPMNSREPACSSGVRRTSRHSRGKFPRRFTAWPWNSSVRSPAAETITQCRRRVPKCR	346363	350699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_346924_347242_347355_347599_347745_347811_347955_348037_348138_349149_349299_349683_349775_350159
817117	contig_11285_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_5503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGCACTCCCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519207	520844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_519200_520800
817121	contig_2867_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_135188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAACAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798400	800241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_798400_800200
817122	contig_10235_pilon	-	853	4	Intergenic	novelGene_46296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	50.5239217269074	4898	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	635	688	83700	83647	FALSE	20	GTGCTGCCAATGTAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLLLAVAGAIVLGSVVLSVPITVLTVLALVPQERGGLVTETADLGGQTQQQLEFQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGSWKTGQGLGWETKKEEAFLRSGTQFLGAEGLALPQDGLYYLYCYVGYRGRAPPAGRGPLGRSVTLRSSLYRAGGAYGPGIPQLLLEGAETVTSVLDPARRHEYGPLWFTSVGFGGLVQLRRGERVYVNISHPDMVDYRRGKTFFGAVMVG	85383	83481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84102_84567_84640_84830_84877_85268
817125	SIRV4	-	413	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1058	50	1058	-50	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGCATGACAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
817132	contig_12810_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_145711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGCCCTCAAACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630038	630686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_630000_630700
817134	contig_6807_pilon	-	1446	7	Intergenic	novelGene_84570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	114.362605582225	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	520	858	146580	144980	TRUE	40	CAATCAACCCTAATTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEKEEKENHCVRHGEKLTLFCKLDGKLICWLCERAQERCGHPTFLVEEAPQEYQENLQTAFESLGQEQQKAEKWEADLREERASWKTQIQTERQSVQANFSQLQGILDNE	156055	132517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_132827_133089_133190_134561_134585_144823_145055_145728_145825_146412_146980_155935
817135	contig_17471_pilon	-	2149	2	Intergenic	novelGene_168659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	519	878	23580	23221	TRUE	45	ACAAGGAAGCGAAAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNLMCSALRFSRRKARAGASILAAVWYSHSSLRPVSWAMLGGIVTSGISSSFSTSSSTRSNTVSGMPLSMNRCSSSLSCAFLVSRCRSLSSVHSLLRFSCRSLFSLTSERKTAKRFE	24098	8098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17471_pilon_-_8207_22057
817136	contig_13542_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_131509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGATAAATTAAACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377534	378024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_377500_378000
817137	contig_7943_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_173133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100762	101436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_100800_101400
817138	contig_7410_pilon	+	1359	3	Intergenic	novelGene_106099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	424.5	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	218	364	407113	407259	TRUE	30	AGATCGGCTTCACTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	406609	408350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_406784_407069_408214_408309
817141	contig_3789_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_79900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	8	325	638479	638796	NA	20	CTTTTAGCTCAGTGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIMSFTICPRLVQCLLIKLAARTQALQTVRVHFKATQLPVVWKNLLKHHANHLIHFPSPFLMQNTLICCWRVQQRNLLETGASCSWKLNQGLVGIWRGKNNGPFSLQ	638471	639682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_638500_639700
817142	contig_4686_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_118498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	317	778	381607	381146	NA	25	CGAGCAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTFLTESWSSMTRRLSLTFTGTTHLQTVYFPPSPPPTPPSPWPSPSGASGQDETPRPAWTPSPWSGIMTMTLVVTWSLRCPEPCIPRMKRAKKTKISTSEELLAYQVGKIFLYGSLKENKRKFMLYQKHIGYLQSFFFPSPVRGNCVSGYN	381923	380417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_380400_381900
817144	contig_16378_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_163373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	167	538	17168	16797	NA	35	ACGGCATTAGAGTTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLYISFVHWNFFALLAVGLGQWKLEQPDMSISKAASKSAHITCNVAVEDFENAYIGWFRLKPNQGVEYLIYIHSTTTPNYASLGGKSKKLEASKNSRSSTSILKINSVEKEDEAMYYCAWYI	17334	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16378_pilon_-_16800_17300
817145	contig_8064_pilon	+	1267	4	Intergenic	novelGene_164550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.9614813968157	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACACATGTGTGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22889	49547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_22939_24134_24261_41868_41955_48541
817148	contig_11846_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_106015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATGCATATTCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511176	509780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_509800_511200
817152	contig_6175_pilon	-	1698	6	Intergenic	novelGene_16285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	11.84229707447	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	30	971	1389754	1374867	FALSE	75	CAAGAAAAAAAAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAPGPAAAMASATVESFVTKQLDLLELERDAEVEERRSWQESISLKELQSRGVCLLKLQVSSQRTGLYGRLLATFEPRRCGSAAVLPSNSFTSGDIVGLYDAANEGSQLATGILTRVTQKSVTVAFDDSDDFQLSLEREKSYRLLKLANDVTYKRLKKALLALKKYHSGPATSLIEVLFGGSDPSPADVTHPLTFYNTSLDTSQKEAVSFALAQKELAIIHGPPGTGKTTTVVEIILQAVKQGSKVLCCAPSNVAVDNLVERLAGCEQRVLRLGHPARLLESIQQHSLDAVLARSDSAQIVADIRKDIDHVFVSVSSPAPT	1389783	1374139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1375098_1379555_1379720_1382534_1382633_1383097_1383291_1387258_1387429_1389668
817154	contig_11719_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_154771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATTCACCCCCATTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128114	128409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_128100_128400
817155	contig_211_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_129872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAATAAATAAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242225	242553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_242200_242600
817157	contig_15732_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_88858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	436	891	53502	53957	NA	75	AGCATAAAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYFSLLTENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSVAKSYFAY	53066	54016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_53100_54000
817158	contig_5899_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_146956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	292.091690322672	216	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	220	711	53130	12694	FALSE	20	TGAGTCTGATGTCTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEIDHWNNEKEKIVLITDKTLFICKYDFIMLSCVQLQRIPLHAICRICLGKFSFPGMSLEK	84492	12693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_43099_43192_52908_53140_84282
817161	contig_7050_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_153638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834261	835475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_834300_835500
817163	SIRV6	+	340	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	204	1	17	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2489	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
817165	contig_343_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_163904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGCTGACTTAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127411	126643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_-_126600_127400
817166	contig_19210_pilon	-	1386	10	Intergenic	novelGene_168934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	21.2184406171194	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	65	1168	216882	191677	FALSE	35	TAAATCTATGGTCAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTQYGNFIDNLRLFTKGGSGGMGYPRLGGEGGKGGDVWVVAEKKMTLKQLKDRYPQKRFVAEGGANSRVSALKGSRGKDCDIPVPVGISVIDENGKIIGELNKEKDRILVAEGGLGGKLLTNFLPLKGQKRVIHLDLKLIADVGLVGFPNAGKSSLLSQVSHAKPVIADYAFTTLKPELGKIMYTDFKQISVADLPGLIEGAHMNKGMGHKFLKHIERTKQLLFVVDISGFQLSSQTQYRTAFETIILLTKELELYKEELQTKPALLAVNKMDLPNARDKFRELMNQLQNPKDFLHLFEKNMIPERTMEFQHIIPISAITGEGIEELKNCIRKSLDEQTNKENNAYHEKQLLNLRIFNTVSYHEPS	216946	191458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19210_pilon_-_191901_194566_194691_197484_197563_198123_198232_201291_201345_203481_203556_208713_208859_209260_209353_214164_214359_216870
817167	contig_5286_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_157388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653409	651744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_651700_653400
817168	contig_3948_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_53263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTCCTTCATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361731	1361318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1361300_1361700
817172	contig_11512_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_43209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	30	350	4011	4554	FALSE	15	CTGTGCTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVY	3981	4556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
817174	contig_5419_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_15561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555639	557394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_555600_557400
817175	SIRV6	+	357	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10450	19	1213	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11450	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
817177	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	98	0	-89	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
817179	contig_7513_pilon	+	1548	3	Intergenic	novelGene_88996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.5	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	291	302	515455	515466	TRUE	5	AGCTGGTGTTGTGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPWSEYRGGVRKTGAQWQHAPAPLGAPRSPEDVYPRRHPSPVGRSRCRTSTARPGSAAFSPLFALTLVPLIQGALAGLLQVTTPPGRTSSESFPGMRF	511686	521663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_511893_515370_515597_520547
817180	contig_18081_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_23804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCACATACACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138150	140152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_138200_140200
817181	SIRV6	+	473	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
817182	contig_4742_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_131012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281368	279461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_279500_281400
817183	contig_14811_pilon	-	766	2	Intergenic	novelGene_74496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	121	699	386597	375065	FALSE	15	TAGGTTTTACTTCCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRWRSWPRGGTEALLLLLASLQVSFELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGTIFVLLLIRGC	386717	374997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_375566_386519
817187	contig_16776_pilon	-	1078	6	Intergenic	novelGene_130516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_5	278.368532704399	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	185	712	43087	35073	FALSE	10	CCACCAGTTCCTCTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	57750	34706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43228_57706
817188	contig_7708_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_61535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269781	267908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_-_267900_269800
817189	contig_7135_pilon	-	2324	3	Intergenic	novelGene_136949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCGGGATGGAGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269412	251783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_253234_264803_264996_268730
817190	SIRV4	+	370	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
817191	contig_3602_pilon	-	1578	8	Intergenic	novelGene_60530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	127	junction_7	50.4052961260126	108	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	248	1351	241592	226476	FALSE	30	CCACACGCTTGAATCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPTLTSASSLSPGQASLSISVSNSQIQENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPSPWSHISKGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHSWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFITEHPLPGPGLPFDAELSGILPLQEHEMQGLAERVSVL	241839	226248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_226689_226970_227057_231337_231606_234511_234611_238853_239016_239810_239918_241285_241359_241496
817192	contig_3956_pilon	-	1339	4	Intergenic	novelGene_14728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	3.29983164553722	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	114	482	361228	350911	FALSE	0	GTTTTGGTCTCTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTATRQEVLGLYRRIFRLARKWQAASGQIEDTIKERQYILNEARTLFQKNKNLTDADLIKQCTDECTARIEIGLHYQIPYPRPIHLPPMGLTPLQGRGLRSQEKLRRLSKPVYLKSHDEIS	373845	350053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_351028_356473_356567_361069_361229_373732
817193	contig_14563_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_135043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGGTGGTGTGGAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115859	113900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_113900_115900
817194	contig_11016_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_163304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAGAGGGAAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255348	253184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_253200_255300
817196	contig_3948_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_53345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAAAAGGAAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505344	1503368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1503400_1505300
817197	contig_12078_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_74076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTACTGCCTATGATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60748	59151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_59200_60700
817198	contig_8289_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_171175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192835	192206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_192200_192800
817200	contig_50_pilon	-	1805	3	Intergenic	novelGene_122237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	2.5	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATTCTGTCCTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214364	201714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_203029_205066_205248_214054
817201	contig_6929_pilon	+	732	9	Intergenic	novelGene_139363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	423.864051760703	3434	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	23	532	77555	90425	TRUE	0	TGTTTTGGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRVEAMAVANSSPVNPVVFFDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM	77532	96489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_89524_89566_90356_90447_96310
817202	contig_10182_pilon	+	1527	3	Intergenic	novelGene_134618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	13	142	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	79	450	305121	306630	FALSE	15	GAAGTCTGCAGCCCGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQASEAAVVTTLNGWGSCRSPLDHLPLKEGSRLRVRSRSLIQIPDLGSGHRGLRLVALTGQKTPSEAACSQEPDGMWRFRPLARSRVWRGACEAARLLGAPSLWWVWERALAWERASPPRKF	300752	307707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_300797_305086_305137_306274
817203	contig_5153_pilon	+	1726	2	Intergenic	novelGene_74317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGACACCGCGGCAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403810	409980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_405505_409948
817204	contig_5590_pilon	+	1427	11	Intergenic	novelGene_162990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	89.2637104315074	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	16	1095	174610	184848	TRUE	15	TCTGTGGTTTCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSRQRGAGGDVADRVGARGAGRPGPGHGRAAGVSAGPASGPERQAWCWDLAAGTRAGPSKQ	174594	185300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177918_178717_178766_184179_184269_184806_184871_184990
817207	contig_2550_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_135675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277583	1276975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1277000_1277600
817208	contig_11493_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_143705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCAGAGAAATACGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244613	246587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_244600_246600
817209	contig_8475_pilon	-	2153	4	Intergenic	novelGene_171102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	50.4667107001129	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	133	1617	86794	81856	FALSE	35	TATTGAAGTGAACTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVLLPLAPKELKGLFKVNNKEGPGRGQGSSPQGSSPNNQELFRQRFRQFCYKETPGPREALSQLWILCCEWLRPEMHTKEQMLDLLVLEQFLTILPEELQAWMRDHHPESGEEAVAMLEDLERELDEPGQQVLAEACAQEVLSETSVPSVPAKQARYLLLQPLETQTKSESQDEHHQDCDGVIRTDKGELTQKQELTADVQSQEKLPGQINGESTECGETQEHEIWLERHQRNTSTERRCKCDECGKRFTQKSSLIRHKRIHSGERPFSCNKCGKAFIQSSQLIDHQRMHSRLKPYQCDECGKAFYYSSHLVQHQRTHTGEKPFQCNECGKAFHYSSGLIRHQRTHTGEKPYQCNDCGKAFCLSSHLIQHQRVHTGEKPYQCSECEKSFSQRSGLFHHQRIHSGEKPYECDECGKAFSHSSALVGHQRIHSGERPYECDVCGKAFSYSSHLLGHRRIHTGEKPYECAVCGKAFRRSSHLIVHQRIHSGEEPQ	89199	81319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_82797_86119_86265_86395_86857_89129
817210	contig_3103_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_146214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	1118	1432	459262	459576	NA	0	CTTCCTCTGGGCGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPELVCTQEGPSCVPAPYMCPCQQVSTAASTAPLGRDKSVTGKLEMWEQGRGVQGRAWVSLLSDYKDLSMGLGLYAQGSRNRVWQRGLELCPVTYTPGWWHRP	458144	459576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_458100_459600
817211	contig_5758_pilon	-	1068	3	Intergenic	novelGene_119073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	561.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATATGTAAAGTAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179150	92247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_93084_93307_93404_179014
817214	contig_8354_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_24106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTGAAAAAGAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230385	229169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_229200_230400
817215	contig_4402_pilon	+	933	7	Intergenic	novelGene_140815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTTGACGAATCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388176	398805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_388232_392100_392159_392508_392590_394135_394166_395266_395447_396322_396496_398449
817217	contig_13528_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_66861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41007	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_39800_41000
817219	contig_9683_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_151280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGCTGTAAAGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486889	486520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_486500_486900
817220	contig_11751_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_150285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAAGGAGCTAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112060	110628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_110600_112100
817225	SIRV5	+	403	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7486	2	-93	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACAATTCCACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
817229	contig_1618_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_141780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCATCACTGTGGTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153752	155291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_153800_155300
817230	contig_1618_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_141781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGATGCAGTAAGCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155240	155591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_155200_155600
817231	contig_1618_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_141782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTAAAATAACGCCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155839	156293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_155800_156300
817232	contig_10399_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_114483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTACTCCCCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245754	244457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_244500_245800
817233	contig_9468_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_59485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268531	267278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_267300_268500
817234	contig_21203_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_84492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGCTACTGCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106618	107213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_106600_107200
817239	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817245	contig_12802_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_114251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139577	140837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_139600_140800
817247	contig_15732_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_88860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAAGTCCAGATCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62918	63414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_62900_63400
817249	contig_9389_pilon	+	1247	3	Intergenic	novelGene_83943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1141	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	97	600	165615	167739	FALSE	45	AGGGAAAAAAAGTGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKVRESEDAPELLARLGLVLPEVGKAGHPQSSMMGGLTWRRPSGGAEQQAEGAEPRGFLGEARGTCSPAPVPALGLHALAWIKGVPMPPDNPSSPCPSQAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTISLQMGTNKCARGRGKGHISLHWGS	165518	168386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_165933_166074_166218_167696
817251	contig_10658_pilon	-	2090	18	Intergenic	novelGene_130081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_2	111.773869593369	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	41	1993	360630	229446	FALSE	45	AAATGTATTGACACAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPATSDIKDIDSLMRISGKVECESPNRHLYDFVGNIKLDGQSTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNSTSPPLKLSNVERITNVQILILFGILIAMSLICSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLLVTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQFKKCTIAGVAYGQSSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEFLTMMAVCHTAVPEREGDKIIYQAASPDEGALVRAAKQLNFVFTGRTPDSVIIDSLGQEERYELLNVLEFTSARKRMSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDRLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSHHCTTLGDALQKENDFALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVITLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMVHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEVIAG	360670	229348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_229572_229667_229852_251942_252116_273600_273666_278118_278258_295746_295887_299521_299607_306829_306900_308978_309029_315395_315479_316792_316899_319557_319631_341019_341109_344331_344410_347204_347333_348575_348742_351493_351606_360544
817252	SIRV6	+	269	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-434	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1851	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
817253	contig_15596_pilon	-	1011	8	Intergenic	novelGene_139545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	152.766595344209	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	69	1010	217105	198090	FALSE	75	GAAAGAATAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSHQPSVRLLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKKKTYSEPKFDNKRADGTISSDIKSAKGSHLSVHAENSLKSVTDVCHKRTDRKSRITEKSGSTSRPEFEFTRLDFPELQSPENSGILEIPEQPKWGPLHSAATSVSLLRERKPPAVLAEGEIAVKSKNPAASVADSAASSSSSCTREKHTVHPTKKSKVLQGGNPEQNEVS	217173	198088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_198135_199636_199666_201847_201930_204476_204710_206206_206328_206575_206826_215682_215829_217069
817254	contig_6014_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_176283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGGTAAGAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300567	302667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_300600_302700
817255	contig_12993_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_136741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGATAAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144074	146607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_144100_146600
817256	SIRV7	+	375	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70979_78836_78963_114680
817257	contig_4989_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_160778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACTCAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60444	61778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_60400_61800
817258	contig_11265_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_174510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGGCAGTGCCATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36371	35984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11265_pilon_-_36000_36400
817260	contig_9185_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_166871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12338	13489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_12300_13500
817261	contig_4659_pilon	-	1158	3	Intergenic	novelGene_118250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	366	junction_2	115.5	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884161	853084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_853937_859916_860039_883977
817262	contig_10426_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_144659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAGGACAGTAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45133	43976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_44000_45100
817263	contig_4732_pilon	-	2450	21	Intergenic	novelGene_75475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	383.661230775277	18	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	130	2316	747726	700746	FALSE	40	GTGGGATGAAAGCAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIVGNLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGGEPDGGKISNFLLEKSRVVSQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSDTYKVDGTDDRSDFNETLSAMQVIGILPSIQQMVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESIDVTLNVEQAAYTRDALAKGLYARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEEGRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFPKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLQAVNMDPDQYQMGGTKVFIKNPESLFLLEEMRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEASASLCVQRG	747855	700611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_700778_706555_706671_712566_712712_712811_712911_713353_713461_715492_715575_720150_720237_721485_721654_722527_722612_723828_723916_724035_724117_727095_727293_727793_727927_728152_728288_728409_728542_729165_729256_729369_729458_730958_731054_731135_731226_732091_732230_747723
817264	contig_10003_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_88154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGGTGTATGCAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379608	380909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_379600_380900
817269	contig_18794_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_54637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGCATCACTTAACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120627	121604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_120600_121600
817271	contig_6634_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_171133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1276	1581	106767	107072	NA	45	GAAATTAAAAGTGGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEIDNSTIIVGDFNTPLSIIDTTAKKKITKDTENLNKTISRLDLTDIYKTLHPASKQCTFFSSVHGSFSRIDHMLDTKQVSTHLKRLKSYKASSQTVIV	105491	107168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_105500_107200
817273	contig_16620_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_156009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAGCCTAGACTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48841	49502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_48800_49500
817274	contig_5302_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_81535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAGAGACTGAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1577009	1575125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1575100_1577000
817276	contig_7963_pilon	-	633	5	Intergenic	novelGene_58314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1666.66993958012	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	57	416	48841	38544	FALSE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKGKEPSGYRVPDLN	48897	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38568_39276_39405_39949_39979_43739_43819_48741
817277	contig_6433_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_162757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143466	144749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_143500_144700
817279	contig_10466_pilon	+	1720	5	Intergenic	novelGene_173627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6.60965203320114	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	498	974	165422	165898	TRUE	45	TTAAAATACACAACTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDHQPVAITVEVKQEEDIKPPPPLALNSQQSDTLEQREEHDLVHVMERSLSPSLSSVDMRMTLSPSSIPRRDGFFRHESGEHFRSILGYDPQILQMLKEEHQIILENQKNFGLYVQEKRDGLKRRQQLEEELLRAKIEVEKLKAIRLRHDLPEYNGL	127894	167336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_128035_132513_132665_136852_137010_165372_166169_166860
817280	contig_18113_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_137536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCACCCATGATATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167533	166973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_167000_167500
817284	contig_8576_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_88820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACACCACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995703	995365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_995400_995700
817287	SIRV6	+	358	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817288	contig_4407_pilon	-	906	7	Intergenic	novelGene_122265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_6	149.424916113597	45	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	297	833	24348	10463	FALSE	5	GTGTTTCGGTGTTTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRRVYSARRVIRGCNGSQTSAIPPSKRAHPAEDGGPRLRFARLSEHATAPTRGSARAAGYDLYSAYDYTIPPMEKALVKTDIQVALPSGCYGRVAPRSGLAAKHFIDVGAGVIDEDYRGNVGIVLFNFGKEKFEVKKGDRIAQLICERIFYPEIEEVQVLDDTKRGSGGFGSTGKN	24644	10389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_-_10520_10947_11019_11171_11247_18416_18462_21224_21317_23616_23756_24290
817289	SIRV7	-	291	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	2	35774	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
817290	contig_12619_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_73572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAACATCAAAGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842888	841201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_841200_842900
817291	scaffold_6394_pilon	+	655	5	Intergenic	novelGene_111012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1253.69314427415	310	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	24	482	398246	406106	FALSE	5	CTGTGTTTTGATTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARHLIELYKEAGISKDRVLIKLSSTWEGIQAGNLPGAHVQR	398222	406279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402973_403239_403372_406078
817292	contig_8689_pilon	+	1912	1	Intergenic	novelGene_170026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTGGAAATTATGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122609	124521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_+_122600_124500
817293	contig_6710_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_89281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653734	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
817295	SIRV1	-	264	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	2	3564	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
817296	contig_10940_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_49196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCTAAATGCAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417971	422256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_418555_421626
817299	contig_4469_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_21919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCTCCAGATGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484346	483045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_483000_484300
817300	contig_12644_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_44567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	492	809	2003162	2002845	NA	50	AAAAACACTCCTCAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVTARGPPGLLGCNPSGHSGIPFLFFPYKQEFPERQACVSHSPLPAPTPTADCTDTHTAAGASTLQLTLPFASLFQMFGIHFVLQSFCTQAKPISVLALGHHL	2003653	2001701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2001700_2003700
817302	contig_13565_pilon	+	888	4	Intergenic	novelGene_162378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	185.257178598353	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAACAACAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132338	195928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_132369_134059_134215_173044_173125_195305
817303	contig_9582_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_106860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAACAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873207	875193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_873200_875200
817305	contig_12250_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_80519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	11.2805141726785	59	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	582	1205	62743	64563	FALSE	15	AGCTTCGACTCATCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASTISKAPQPPKTWILVTGVAYYQPSLTAEYDEDSPGGDFDFFSSLVTKWEAAARLPGDSTRQVVVRSGVVLGRAGGAIGHMLLPFRLGLGGPIGSGHQFFPWIHISDLVGILAHALEARHVQGVLNGVAPGPTTTNAEFAQALGAALGRPAFIPLPSTVVKAIFGRERAIMLLEGQKVVPRRTLATGYQYSFPKLGAALKEVVA	61780	64892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_62147_62225_62386_62687_62810_63712_63857_64150
817306	contig_11285_pilon	-	1273	13	Intergenic	novelGene_5702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	416.99389650476	1	44	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	15	926	798530	794649	TRUE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTGKSMSSVPPPGVGPWERWRF	798544	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784207_793851_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794960_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
817307	contig_14225_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_52768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGATTCCCAGAGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521247	519364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_519400_521200
817308	contig_11126_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_138159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	337	735	997453	997055	NA	20	CCAGCTACGCCAGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSCCETNFQERFSLAGAVFNICTLAVTEINSPGLPLRLLNGLAPEKRGHGSLDLLRLFPRRWKMQRGFLLSVGVTQPPSKRGWSDCLSPDLSCCVLRGLSSILGVFHSLRPLVEETAGCITCCGILKNEA	997789	996506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_996500_997800
817309	contig_13048_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_138946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537002	539043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_537000_539000
817310	contig_3825_pilon	+	1353	2	Intergenic	novelGene_78036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTAATAAAGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941912	1943338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1942762_1942834
817313	contig_4059_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_140607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGCAGAGCGGCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439084	437217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_437200_439100
817314	contig_3155_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_26342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACCCACCCACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129544	128987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_129000_129500
817315	contig_3155_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_26341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128987	128180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_128200_129000
817316	contig_6446_pilon	+	824	2	Intergenic	novelGene_149232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	96	380	487354	488172	FALSE	10	CATTTGGATTTCTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNKANGSKKPPWPGSTHWPLQLDFYIGVFNKMFHSQQKSVDMLGSSWGHCCPRPLPFPTEPQPPGARRMQQGRPFSFLCSPIVQGRPVPIYHKASVGREGDVSHKDSGCICCQATALWPVRGHPQ	487258	488616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_487592_488125
817317	contig_13366_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_99791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGGGATACAATTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159786	159095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_159100_159800
817318	contig_5317_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_76602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690254	688360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_688400_690300
817319	contig_9995_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_47824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGGGCAATTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921198	922268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_921200_922300
817320	contig_15613_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_147226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTTAAGATAAACACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275120	276472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_275100_276500
817321	contig_12837_pilon	+	746	7	Intergenic	novelGene_57301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3183.79179944641	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTCCTTTTTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128587	166103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128706_129650_129802_153829_153925_159321_159400_161387_161494_163874_163973_166003
817322	contig_14814_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_137685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1198	1548	46656	46306	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVHSVLSSSVRFDKYILSCVHHHSILQNNFFYIFKRLIWMVKLMGQSPPSVYDHLIEYAHGANKLYSNFFISFNLRKETKHVAVKSIRSPKIRVSASPSSREPMPPTFLALLGTV	47853	45878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_45900_47900
817323	contig_9180_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_109119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATCCAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481603	481097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_481100_481600
817324	contig_8885_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_115575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCTCTGTACTACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70227	71035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_70200_71000
817325	contig_5084_pilon	+	2136	1	Intergenic	novelGene_64485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAGAGAAGCACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77522	79658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_77500_79700
817327	contig_5640_pilon	-	2557	2	Intergenic	novelGene_27282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089843	1086892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1088039_1088432
817329	contig_19647_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_144013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87259	88967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_87300_89000
817331	contig_6182_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_171647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAGTGTCACAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21461	19765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_19800_21500
817332	contig_17198_pilon	+	1644	11	Intergenic	novelGene_62389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	99.8643580062477	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	278	1138	1063432	1093400	FALSE	15	TGTTAGGACCCTTGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRKSWKTLDCSFWLACFPVAASSFCLFLSLYFHSLCHKDLC	1047717	1093906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1092386_1092466_1093358
817333	contig_12150_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_6954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATAAGAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18486	16718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_16700_18500
817335	contig_10013_pilon	-	1279	9	Intergenic	novelGene_125097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	39.0398434295016	343	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	364	897	552546	551115	FALSE	10	TTTCGGCTCCTGGTTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQGSALNELRERVTKDVAQAGRDREDIRSELFRALEAAKLGNISCEPCPTSWMPFEGSCYLFSPQRASWKEAQKSCADRSAHLVIVANLEEQTFLSRNTRGRGYWLGLRAVRRQGKIQRYQWVDGVQLTFSHWNLGEPNDSRGREDCIMMLNTGLWNDAPCDSERDNWICEKRRSC	553868	550732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_551254_551526_551643_551755_551905_552076_552167_552506_552612_552779_552843_552981_553036_553383_553497_553800
817336	SIRV6	+	405	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	125	1	-62	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2410	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
817337	SIRV6	-	304	2	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-267	-32	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACCCGACCACTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2814	2390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738
817338	contig_11016_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_163302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAGGACACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235231	233967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_234000_235200
817339	contig_12050_pilon	+	1300	3	Intergenic	novelGene_62687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_2	44	200	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	76	603	517528	521971	FALSE	10	CCATCAGGCTCTGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELKHQVMINQFVLTAGCAADQAKQLLQAAHWQFETALSAFFQETNIPYSHHHHQMMCTPANTPATPPNFPDALTMFSRLKASESFHGGGSGSPMATGATSPPPHFPHTTAAGNFAAPSWPTAASPPGGTQHHQPQQLPLWTPAPPSPTSDWPPLAPQQAASEPRAHPAMEAER	517452	522668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_517636_521083_521147_521614
817340	contig_3018_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_78795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTGTAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474620	476746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_474600_476700
817342	contig_2027_pilon	+	2168	14	Intergenic	novelGene_39920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_13	177.11614883323	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	42	1235	146488	151155	FALSE	20	GCCTGATTGCAAATCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNVINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHASRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFFSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEANLRSSSMPDSVAGGQHGRASLPH	146446	152088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_146524_146606_146733_146821_146879_146977_147093_147768_147864_147964_148028_148274_148399_148701_148823_148930_149029_149113_149220_149304_149348_149494_149586_150639_150718_151114
817346	contig_1786_pilon	-	1359	11	Intergenic	novelGene_142593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.393393176995	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	94	1242	79935	40841	FALSE	50	CTATATAATGAAAATAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSRRVSRLVGLSGPESAVASEGPWTWTDGAMPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTASI	80028	40723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_40852_54425_54470_55558_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_68182_68321_79932
817347	contig_5954_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_28699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACCCCACCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954779	954100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_954100_954800
817348	contig_5059_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_140758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGGAGAAAAATGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498750	496504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_496500_498800
817349	contig_6710_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_97769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	ATACTAATATTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
817350	contig_13481_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_119283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCCGTAAATGTAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169739	171766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_169700_171800
817351	contig_6724_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_167951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGTTTGCCATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18698	17311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_17300_18700
817352	contig_5189_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_34886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCCCCAAGCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256671	256166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_256200_256700
817353	contig_15093_pilon	-	2357	9	Intergenic	novelGene_143305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATATCTACATGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164423	137497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_137987_138420_138666_140886_140984_147377_147585_149036_149273_153797_154046_156651_156755_162966_163067_163791
817355	contig_15777_pilon	-	2122	16	Intergenic	novelGene_75736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_15	38.6629883307882	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	201	1550	141177	101624	TRUE	40	TGTTCACAGATTAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTGMAGVSLKRGSLAVKDNDSQAPGEEVKRQKVSECCLSEGQDGLESDSLPSDENVPAVPEAVSAGEGKNNSDAPLEDEEEEEEDGLSEEGEEEEEVESFADMMKHGLTELDVGITKFVSSHQGFSGILKERYSDFVVHEIGKDGRISHLDDLSVPVDEEDPSEDVFTVLTAEEKQHLEELQLFKNKETSVAIEVIEDTKEKRTVIHQAIKSLFPGLETKTEDREGKKYIVAYHAAGKKALANPRKHSWPKSRGSYCHFVLYKENKDTMDAINVLSKYLRVKPNIFSYMGTKDKRAITVQEIAVLKVTAQRLAHLNKCLMNFRLGNFSYQKNPLKLGELQGNHFTVVLRNITGTDEQVQQAMHSLKEIGFINYYGMQRFGTTAVPTYQVGRAILQNSWAEVMDLILKPRSGAEKGYLVKCREEWAKTKDPAAALKKLPIKRYQEITA	152459	88606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_88750_96014_96107_97082_97213_99693_99796_101518_101646_102702_102791_103665_103728_110781_110908_111303_111433_125163_125242_127325_127438_133496_133642_136261_136364_139709_139795_140776_141210_152291
817357	contig_6510_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_173519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATATTTTGCCTAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205228	204570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_-_204600_205200
817359	contig_13966_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_158163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACATCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539490	540454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_539500_540500
817362	contig_7361_pilon	+	1743	3	Intergenic	novelGene_163382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	9.5	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	1405	1743	266818	277306	FALSE	20	ATCGGCATTGCGGTGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKGQEDEGEFVKPLLETDSSFRPNNFESKLLPPENKPLETAMLKHVKELLTNHDPKVIAQHMLQMDCKVARILEVSEEMQRNMGVSSGLELITLPFGHQLRLDIIERHNTMV	265413	277306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_+_267025_272871_272988_277290
817363	contig_10196_pilon	+	689	3	Intergenic	novelGene_132108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106.5	86	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	32	322	922274	926193	FALSE	15	CCAGGCCCAGTGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGVLRQVWQWVGSRVPQRFLSLAASPCLSGFTPAGHNSQRGSNIHQGPFPLPKLCERHSASRGCPSQLFQPGHCMIRSA	922242	926560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924484_926008
817365	contig_6199_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_126355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAATAGAAGAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108424	108078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_108100_108400
817369	SIRV4	-	425	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	189	3	-189	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGACACGGTAAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
817370	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817371	SIRV6	+	435	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	96	0	-91	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2381	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
817373	contig_7272_pilon	+	2631	2	Intergenic	novelGene_25303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAGAATGGGAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412879	416722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_414729_415940
817374	contig_11413_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_103180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACAATCTGCTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484727	484208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_484200_484700
817375	contig_6497_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_35546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17098	15623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_15600_17100
817378	scaffold_15027_pilon	+	749	5	Intergenic	novelGene_163562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	150.454312002016	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	26	481	48927	67340	FALSE	35	TAGAACATGTGTTAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGRLWEDMAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKDSRPPWISRTACRTASFNIYVHAFIEFPQGSRHCRAPDIFSVEASRDT	48901	67608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_66198_66324_67318
817379	contig_9909_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_42464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACCTGCAAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541975	544196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_542000_544200
817380	contig_11338_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_6239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	447	136	582	13152	13598	NA	40	TCTATCAAAAGCTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKFCSTRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKI	13016	13600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_13000_13600
817381	contig_19405_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_176209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	596	940	100886	101230	NA	10	GTGTTCCAGCGCTCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSLCVYVCVCIFLCVCVYVCVREMPSLLPPTSYPHSPHLSSTVLVLLPQSGQLTKAFISNPRGDGAGEGGDCSSPEASKTWEKSQQPMPRPTCLTTPAHPTTKLKAQQETPY	100290	101404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_+_100300_101400
817382	SIRV6	+	292	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	36	2932	36	-2905	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAAATCCATTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	7883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
817383	contig_15365_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_111130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTAGTTTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56137	56751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_+_56100_56800
817384	contig_14666_pilon	+	1463	4	Intergenic	novelGene_39617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1654.15846345573	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	141	1355	479860	484940	FALSE	25	TCTGCACTGCAGACACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQEVTTATRPCSWRGSVCTGLSWWTWSLGPWTASDLANLEPCNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477281	485048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479927_483221_483291_483861
817386	contig_3948_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_53340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAACAAAAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480776	1482998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1480800_1483000
817387	contig_5643_pilon	-	710	3	Intergenic	novelGene_39123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651424	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_651152
817388	contig_19990_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_30769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132542	130246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_130200_132500
817389	SIRV6	+	464	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	19	2	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
817392	contig_10861_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_39420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTGCTAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2201731	2201546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2201500_2201700
817393	contig_14219_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_54316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGAAGAAGAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690371	689008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_689000_690400
817394	contig_12479_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_56892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAATAAATTTATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586622	587711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_586600_587700
817396	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
817397	contig_10949_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_146688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAATATATCTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46500	47969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_46500_48000
817400	contig_5549_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_81666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAACAACCTACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478841	479459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_478800_479500
817401	contig_15405_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_112100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACCCTATAGGACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82584	82200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_82200_82600
817405	contig_1516_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_49926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTACAGTATTTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103154	102007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_102000_103200
817406	contig_1008_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_121584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGAGTCAATTCCTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691905	692993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_691900_693000
817407	contig_6504_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_158787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTAAAACAATGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259989	258877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_-_258900_260000
817409	contig_10603_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_173372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATAAATAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15847	16206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_15800_16200
817411	contig_12583_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_175076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGAAAAAGAGGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2220	3690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_+_2200_3700
817413	scaffold_19766_pilon	+	1103	3	Intergenic	novelGene_34301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	107	junction_2	60.5	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	199	879	531365	534493	FALSE	15	GTAGATCTGGAGTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVVKFFRWVWRKVSCWILSWRKKAKLSIQEHPDSMKNVLKRMEKPLKMAEPSKMVETPKEIKPPKEAKPLEEANPPKMDEFFKMEEFSNMDESLRASESCVLAETTDGMELGHTGRSLLRLPQTAIQSVSTLMVSALQSGLHMCSWKSSVSSASVTSQLRTGPPLELPEAEMLREVYLVLWAIRKQLRQLARRQERRRRRHIRAHASPQPDPVKGLKQDARSPL	531166	534717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_531419_531689_532083_534259
817415	contig_11370_pilon	+	737	3	Intergenic	novelGene_98728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2677	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTGTGGTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145691	148548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145897_147426_147616_148205
817416	contig_6278_pilon	+	1281	3	Intergenic	novelGene_119798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	75.5	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	183	605	306445	328444	FALSE	65	AAAAAAAAAAACACTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSMNGRNPGGRGGNPRKGRILGIIDAIQDAVGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDR	305042	329120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_305211_306430_306613_328189
817417	contig_7019_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_149466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGTCCCTGGGTGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169491	1168077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1168100_1169500
817419	contig_5039_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_64837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296767	297858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_296800_297900
817421	contig_5041_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_27019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGCAGAGCCAGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246912	246279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_246300_246900
817423	contig_9696_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_68787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGATAAGGATTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215515	217157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_215500_217200
817424	scaffold_17542_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_139240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451316	451737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_451300_451700
817427	contig_12064_pilon	-	1437	6	Intergenic	novelGene_176286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	20	junction_4	25.7480096318143	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	62	793	82316	37314	FALSE	15	CTGTCATTTCTTACTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATDANVKNESLSSVQKLGIKMTVRYGKFLNLLKDGAENHLSLVLKHCERFLKQQQIPIKSSLLCLQESYTGHDWFVSSLFMIMLGDKEKTFQFLQQFSRLLTSAFLWLPRLHISKYLPIDIIESGIHPVYFSSTHYVEMLLKAEVPLVFSAFHMSGFAPSQICLQWITQCFWNYLDWIEVCHYIATCIFLGPDYQVYICIAIFKHLQQDILQHTQTQDLQVFLKEEALHGFRVSDYLEYMEILEQNYRPVLLRDMRNIRVQST	82377	36669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12064_pilon_-_37434_60644_60834_73229_73371_79156_79312_80424_80541_82305
817428	contig_10494_pilon	-	801	5	Intergenic	novelGene_102182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	25.3475837112732	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	59	517	1058822	1056579	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1058995	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057302_1058719_1058827_1058941
817429	contig_1719_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_87262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153947	152349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_152300_153900
817430	contig_9995_pilon	+	983	2	Intergenic	novelGene_47677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	146	625	224465	250535	FALSE	40	ATTTATTTAATGAATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSSKMEFFQKLGYGQEDVVRVLGKLGEGALVNDVLRELIQTGSRPATQGRPAGGAAAAAVPLLVPRGSCGRSDSVQCRLGTDPEEECGSPAGALRPIVIDGSNVAMSHGNKEAFSCRGIQLAVDWFRDRGHTAIKVFVPSWRKEPSRSDTPIRGMLE	224319	250893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_224791_250381
817431	contig_15087_pilon	-	1453	7	Intergenic	novelGene_37251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	536	junction_6	534.812973539972	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	116	793	258337	222807	FALSE	45	ATGGCAAAATTAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGRSKLSCCKPPKKRHREPEQPHRPVPPESGPLNEDTATTVHLCVLEEAEQHQKDITRILQQHEEEKKQWEQQVEKERELELQEKLAEQRLVLKGEHEEALRVLRAAHEQEKEALIQSSQEAKAALQETIDGLTSQLQAFQAKMKRAEESILSRNYKKHIQDYGSPSPFWVQELESLHFVIEMKNERIHELDKRLIHMETVVRGWEQLGGCSPRLLFLGHCLF	258452	222146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_222996_223823_223926_224919_224994_231735_231824_234067_234175_236371_236442_258289
817434	contig_5791_pilon	+	2049	4	Intergenic	novelGene_35826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	343	junction_1	718.073502891978	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	195	779	999654	1038328	FALSE	35	TTCATTGACAAAACTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGVRLPLRTRFPRPIWSFGGQAREGSRVRRKGTRSGRREFGEATLSCRHLGSGLTRPPRPALGTMRLGARGVWAALLLGALQVLALLGTAVDSSGSAESTSQNSSVGQQNSGANSSGNPQQVLSSDKNPSCNNTVKLSTTAVSSVSSNVSVTTSKPKVTSHTSAITTSTTVKPAPNRTSISQSTSQMLTSTMTTTHNSSVTSASSSVTTSINFKENKGSKFDTGSFVGGIVLTLGVLSILYIGCKTYYSRRGIRYRTM	999459	1039598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_999754_1003677_1003735_1036750_1037027_1038176
817435	SIRV3	-	271	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAACAGGCTTCGTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6766	6495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6500_6800
817436	SIRV4	-	373	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	107	137	107	-137	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAAAATAGATTTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5051	3774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
817438	contig_14357_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_121654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGTTTGATTTTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461199	462281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_461200_462300
817439	contig_14357_pilon	+	1060	2	Intergenic	novelGene_121655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462231	469308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_462361_468377
817442	contig_11656_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_54033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGGGGATGTTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505287	504996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_505000_505300
817445	contig_12540_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_148093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCCCCTGCTAACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964820	965851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_964800_965900
817446	contig_10437_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_38492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACCAATTAATTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214668	1215703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214700_1215700
817451	contig_12050_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_62713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656501	655798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_655800_656500
817453	contig_12492_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_77503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATTGAGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316838	318298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_+_316800_318300
817454	contig_3269_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_117046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCCCATAAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240146	241710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_240100_241700
817456	scaffold_16539_pilon	+	1758	12	Intergenic	novelGene_68376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_4	31.1618011552553	45	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	70	1641	587312	617625	FALSE	5	CCAGCTCTTTCTTCGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEVSVIKEGWLQKRGEYIKTWRPRYFLLKSDGSFIGYKERPEAPDQTLPPLNNFSVAECQLMKRERPRPNTFVIRCLQWTTVIERTFHVDSPDEREEWMQAIQMVANSLKQRGPGEDSMDYKCGSPSDSSAAEEMEVAVSKAQAKVTMSDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKATGRYYAMKVLRKEVIIAKDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKTFCGTPEYLAPEVSGAGGTGTCEARAACLTRSDPKGRAVSPRGPCQLLTVLLPQVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEIDTRYFDDEFTAQSITVTPPDRYDSLGSLELDQRTHFPQFSYSASILE	587242	617742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_587358_595050_595180_597092_597205_609699_609854_610348_610481_612155_612222_613174_613244_614032_614156_615281_615752_616279_616368_616464_616568_617545
817457	contig_10427_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_142184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGAAAAAAGAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59076	57536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_57500_59100
817458	contig_10675_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_176290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAAATGACTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131849	133503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10675_pilon_+_131800_133500
817459	contig_7753_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_41482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCATCTAGATGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013013	1014273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1013000_1014300
817461	contig_2903_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_148988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCTGTCCTAAGTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229935	229134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_229100_229900
817464	contig_50_pilon	+	1202	3	Intergenic	novelGene_122218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	4.5	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATTTTTTTAGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63518	67599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_63633_65076_65205_66639
817465	contig_990_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_76108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1463	1768	1389997	1390302	NA	10	CAGTGTTTTCTTTCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQWLRAQLLTRRSAVRIYQPLLGNLMRQLYSVLWGLSESESTRQQWVWFSFTQQAFGGSGGSVEEFLPSLWEMTWVQFPANASHAQPPPDYQWRLTCMLL	1388534	1390447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1388500_1390400
817466	contig_7342_pilon	+	759	4	Intergenic	novelGene_71162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_2	39.9694327649962	5709	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	273	698	429165	436458	FALSE	5	CACTCTGCCTCCTCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLLQRYWDIPDGTECHRKTYASTSIGGATGLVASAYSLTLSPPGSFFEGVARAGRYTFTAAAIGAIFGVTSCVSAQVREKPDDPLNYFIGGCAGGLTLGARMHSYGMGAASCVCMGTAAALVKMGQLEGWKVFVEPKV	428892	436519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_429262_434295_434389_434771_434895_436345
817470	SIRV7	-	434	4	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	87	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114829	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686
817471	contig_6710_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_93398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658063	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658043
817472	contig_15384_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_85112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTCGACCCGACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72926	71516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_71500_72900
817475	contig_12596_pilon	+	701	5	Intergenic	novelGene_172738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	42.3851389050455	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	82	699	79247	85205	FALSE	35	AATACGAATCAATCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGTETLGYCTDFQVVPGCGISCKVSIMDSILTLSMQAGHQNSVGSTPAEKDTAPETFSVLIGNREWMRRNGLTISGDISDMMTDHEMEGQTAVLVAIDGVLCGMIAIADAVKQEAALAVHTLKSMGVDVVLITGDNRKTARAIATQVGINKVFAEVLPSHKVARIQELQKEGKKVAMVGDGVNDSPALAQADVGIAIGTGTDVAIEAADVVLIRNDLLDVVASIHLSKRTVW	79165	85207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_+_79320_82278_82423_83766_83910_84844_85049_85151
817477	contig_4736_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_168638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345508	344349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_344300_345500
817479	contig_1443_pilon	-	785	8	Intergenic	novelGene_28262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	61.7641993919666	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	195	641	560906	557964	FALSE	70	AAAAAAACCAACAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYAVRNKNS	562617	557819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_561750_561837_562575
817480	contig_10197_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_115229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTGTTTCTGACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928364	927605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_927600_928400
817484	contig_10765_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_122917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACATCAAATAATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169686	169495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_169500_169700
817485	contig_10765_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_122916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	98	490	167935	167543	NA	45	TTGGAAAAAGAAGAAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVLQKTVSLLKFLRISLSVSKVNSSWHQEPKASLVENVYLLGKEQTLPRNIKMKIGNIKTFSNLPVKTNVEVRSTYSKDPENCFETEAVEIARAFMEDDEMTDSELPSRARHSQFTCPKNEETAMLNSR	168032	167541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_167500_168000
817486	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10406	2	1256	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
817487	contig_15471_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_175230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTAAAACTTTAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409403	411510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_409400_411500
817489	contig_9107_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_176291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGGATGGGGAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138223	140328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9107_pilon_+_138200_140300
817490	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_98089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
817491	contig_11363_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_160488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAAAATGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150269	151558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_150300_151600
817493	contig_4364_pilon	+	2442	7	Intergenic	novelGene_141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.05505046330389	11	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	58	927	1201758	1203897	FALSE	30	CCTTTAGGTTCAATAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVTERSAGEAEPAAGLDTMSVGFIGAGQLAFALAKGFTAAGIVAAHKIMASSPDMELTTVSALRKMGVNLTPHNKETVQHSDVLFLAVKPHIIPFILDEVGADIEDRHILVSCAAGVTISSIEKKLMAFHLAPKVIRCMTNTPVVVREGATVYAMGTHAKVEDGRLLEQLMGSVGFCTEVEEDLIDAVTGLSGSGPAYAFTALDALADGGVKMGLPRRLAVHLGAQALLGAAKMLLDSEQHPGQLKDNVCSPGGATIHALHVLESGGFRSLLINAVEASCIRTRCALGPALGPQSQPWGDRHGGINT	1201271	1205412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1201303_1201731_1201825_1202033_1202105_1202759_1202940_1203041_1203264_1203457_1203551_1203660
817495	contig_11335_pilon	-	1393	3	Intergenic	novelGene_104940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	78	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGTTGTGAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459610	441060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_442232_451414_451540_459513
817496	contig_12008_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_25006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCTCCATAACTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53023	50518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_50500_53000
817498	contig_12139_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_146470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	106791	106441	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPTAALWTLPPYPGCLSQLPSRKPPLGAGTCHPHPLSSAVTLAEEAETGTAVTAEVTLLASGSSPGGAGWRCSARVPRTPLCCPGPWGWADSGLEAVGSLSSAPLGSTSAFGSLC	106791	105402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_105400_106800
817499	contig_2646_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_69600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAACAAAAAAACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481498	1480426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1480400_1481500
817503	contig_13772_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_176294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTCTGCTCCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100759	101489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13772_pilon_+_100800_101500
817504	contig_15471_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_175213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATGTGTGAGAGAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218806	217989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_218000_218800
817505	contig_2069_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_23191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGATGAAGCCTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81539	82436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_81500_82400
817506	contig_8354_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_24162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATGGCTATTATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575388	576934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_575400_576900
817507	contig_16948_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_166399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACAATTGTTCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180009	182058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_180000_182100
817509	SIRV6	-	248	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
817510	contig_5125_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_43479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTGTTCTATCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116464	117600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_116500_117600
817511	contig_5125_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_43480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAATTTTTAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118297	118695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_118300_118700
817512	SIRV6	+	537	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	28	9	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	134	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817513	contig_4083_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_152334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTGTTTTTCTGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141568	138899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_138900_141600
817514	contig_21013_pilon	-	1133	6	Intergenic	novelGene_38523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	177	641	82218	69333	TRUE	25	CAACCAATTCTTTTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPSPTVLVLIIEKFILWEDVMVAWDEPIRSNRSEEFEAAEGGPKAGCEPLKSSTAGWEALLKSSPLEAAGPDGAWLKALQSPKSPFPLAAVPWAGKLPDAAAEPKSANPPNKSADPPVDWLAPSNRSTRSPDDLPLGTEVLTEDCGVWVEAF	82394	59460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_59572_62443_62616_69123_69371_71482_71553_78663_78739_81936
817516	contig_1452_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_115164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGACAAGAGCCCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705453	705758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_705500_705800
817517	contig_8260_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_163247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGATGGATGGGTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157657	158513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_157700_158500
817518	contig_2342_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_132741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGACTAGATCCTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8722	7887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_7900_8700
817519	contig_5945_pilon	-	1227	7	Intergenic	novelGene_104570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.354837987851	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	234	734	225769	216153	TRUE	15	TATATGACTGTGCCTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEGECSFFSVGNTQKGHLALGHSTRYCRRELGASYTVESGLMKIFFLLQNSPEPVLSWDRLYCDSKLSPAKETYDLY	249588	215592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_215864_215930_216323_224309_224541_225669_225802_226485_226536_235617_235749_249568
817523	contig_6630_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_30740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCCCAGCTTACCGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816009	818058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_816000_818100
817525	contig_9415_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_109765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCATGAAACGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595163	1596502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1595200_1596500
817526	contig_11986_pilon	-	1708	5	Intergenic	novelGene_69104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	84.2748479678249	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	91	1338	75578	53563	TRUE	25	ATGGGCTGCAGTATTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDPQTSTSQNVSFSVQPQNLNTDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGGGEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFNQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGNGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNSGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSSSDINGKGSTGWDSPSVSSQNPAMQPGSEQMNSWAKAASSGTATSEGSSDTSGHHNEGSTGREGAGEGRRRDKGVVDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQPSNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVSSPPAAVPANTGWGDSNNKAPNGPGVWGDSISSTAVNNAAAAKSGHAWSGTVSQEDKSPTWGEPQKPKSQNWGDGQKSSPAPGAMPPKKDFQRA	75668	50677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_50916_51981_52040_53488_53570_57243_57281_74374
817527	SIRV6	-	382	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-205	11	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCACCTTGCTTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2025	1533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
817529	contig_6027_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_74462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382758	381328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_381300_382800
817530	contig_4364_pilon	-	1331	12	Intergenic	novelGene_138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	19.818598827973	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	24	1259	1149832	1130058	FALSE	0	TCGGGGTTCTCCTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDEVSGPAALQRTTLQSLGVTGGSAIIRFVMKPCGSASKPEPAGVRSKTPGSPAPSISADQAAGHPVLPLDIGGLSGGDLSRPEDAGPSGTGHVDGRGPKPVESPAQPDAEVPSPTPFVPFSGGGQRLGGPSGSSRSLMSPSAKSPKSFSSPGGPSEPKKSKPGPESPQEPEPPGDREPVVCHPDLEELLQAWPAELPDEFFEVTVDDVRQRLAQLKSERKRLEEAPLVTRSYRETQIKEKLERYPKVALRVLFPDRYILQGFFRPSETVGDLRDFVRSHLGNPELNFYLFVAPPKTVLGDNTLTLFQANLFPAALVHFGAEEPTDLYLEPKLLEHTISPSSADVLVARCMARAAGPPPLLPTSDSELIESEQTTEAALRPPEATPGPAQPVQRSLGKVPKWLKLPATKR	1149855	1129985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1130072_1130149_1130323_1130391_1130462_1130660_1130713_1134316_1134370_1134859_1134923_1135480_1135548_1135968_1136051_1136219_1136360_1146988_1147425_1147891_1147966_1149820
817531	contig_2757_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_164586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCTACTGGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209417	207687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_207700_209400
817532	contig_10424_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_56807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAGAGCTCTTTATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301389	303188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_301400_303200
817533	contig_11130_pilon	-	663	6	Intergenic	novelGene_53102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	392.933887568889	11	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	163	345	62581	62318	TRUE	5	TCCTTGCAGGCTTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIICSHRAHQEQLLILKQQVYNFLLLWPKPPQDQENRLTHIFSEPGIIGIIFGVMVGIVGTVLSIAYCVRFLIKTQREKQIAKTQSFSTGHIEVTVLFPQNFCLHLPSKRETQI	66980	55933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61257_61340_62312_62441_62521_62608_64167_64208_66884
817534	contig_6076_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_81759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGTATCATCCTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330475	330195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_330200_330500
817535	contig_18735_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_132667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTCTGTAAACTATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4452	5859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_4500_5900
817539	contig_7411_pilon	-	1621	15	Intergenic	novelGene_137039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	30.197394805864	73	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	43	996	780162	775444	TRUE	20	AGAATTGTGACTCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDRGPGGAGRVLGRLLEAVLASRGEANAVFDILAALQSEDPEEIQEAVRICSRLFGALLERGELFVGRLPSEEAVMTGSQGATHKYKVWMRHRYHSCCNRLGELLAHPSFQVKELALGTLMKFVQLEGSHPLEKPKWEGNYLFPRELFKLVMEGLLSLEEDRALLLSQLQEYLEYDDIRYHTMQAAVGVMARVTDGQAEVPLTFWNNAFTLLSAVSLPRQEGSTPSFYVKHTEPSDKWKVAHLKEHRKAFQLMWLSFLKHKLPVSLYKKVLVIMHDSILPHLAQPTLMMDFLTSAYDIGGRHQPLGPERTFHPDP	780204	773874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_774022_774237_774352_774585_774669_774747_774909_775152_775264_775434_775497_775714_775827_775928_775980_776497_776533_776721_776822_776911_777062_777171_777280_778675_778783_779560_779682_780045
817541	SIRV6	+	471	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	167	-38	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTGCCAACTAAGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2000_2450
817545	contig_19701_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_147886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAATCCACCAGGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68454	66846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_66800_68500
817546	contig_14450_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_49044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAATCAAAGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311997	1313459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1312000_1313500
817547	contig_6589_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_26167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8966	junction_1	3715.87576039171	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	156	395	1886667	1887829	FALSE	35	AGAAGCCGTTACAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885996	1887864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
817551	contig_6189_pilon	+	1400	2	Intergenic	novelGene_164955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGGGCGCGAGCCCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170376	172515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_171598_172336
817552	contig_16724_pilon	-	1197	10	Intergenic	novelGene_105312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	809.908789255667	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	193	984	569099	541872	TRUE	25	AGCCCATGTGTGAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMAYQQILDVLDENHSVRRQNEIRCERPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575958	541215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541869_542004_543916_544002_547919_547980_549491_549525_553367_553410_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575806
817553	contig_6589_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_26171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10963	junction_1	3346	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886303	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886335_1886652_1886783_1887705
817557	contig_3285_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_153390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234417	236067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_234400_236100
817558	contig_5502_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_154976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCATTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358436	359779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_358400_359800
817559	contig_3866_pilon	-	1144	10	Intergenic	novelGene_112428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	111.671918063364	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	32	688	265887	242015	FALSE	25	TTCTGTCACTCTTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTKGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM	265918	241558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_242060_242535_242601_243133_243202_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253781_253854_257352_257477_265864
817560	contig_15327_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_70443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	48	530	130709	131191	NA	25	TTACCCTTCTCCAACTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTAIFCFRSDSLLDMYTLNFAHCDVVGLAAVRFFLALFPVFTISTNFPIIAVTLRNNWKTLFHREGGTYPWVVDRVVFPTITLLPPVVVAFCTHDLESLVGITGAYAGTGIQYVIPAFLVYHCRKDTELAFGYSIVNKHRSPFRHTFWVGFVLLWAFSCFFFVTANIILSETKL	130661	132779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_130700_132800
817561	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
817562	contig_5988_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_16028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACATAAGACAATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802752	801451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_801500_802800
817564	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817565	contig_12638_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_33226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGCCTCTATCCACCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617902	617660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_617700_617900
817566	contig_13349_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_161131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265362	264747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_264700_265400
817567	contig_13048_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_138943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGTCAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526053	526606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_526100_526600
817568	contig_9297_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_69845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTTATACCCAGATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692992	694149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_693000_694100
817569	contig_12920_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_166358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGGGATTTTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341876	339812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_339800_341900
817572	contig_8303_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_154924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAAAACTTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54808	50087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_51593_54676
817573	contig_14472_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_111198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCACAGTGGTTAAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553013	551715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_551700_553000
817575	contig_960_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_108276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGAATTATAGCGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973175	972216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_972200_973200
817577	contig_1719_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_87333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCAAACTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511856	512985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_511900_513000
817578	contig_7135_pilon	+	996	4	Intergenic	novelGene_136957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	16.8193010820572	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	227	862	319771	329058	FALSE	20	TGTAAGTCTCAGCTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALLKQIEVERSLYSDHELRALDEAQKLARKKADLYEEEEDGKEILLVQDLEDMWEQTFLQFKPGARITEADKKNDRTSLHRKLDRSLILLVKEKLGDQDVWMLPQAEWQPGETLRATAERTLATLSENNIEAKFLGNAPCGHYKFKFPQAVRTESNIGAKVFFFKALLQTGDFSQPRKKGQHVWVSKEELGDYLIPKYLAQVRRFLLDL	319544	329192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_319792_322789_322980_323922_324097_328807
817580	contig_12520_pilon	-	1747	2	Intergenic	novelGene_161069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGTCACCCCAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437287	434332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_434807_436014
817583	contig_4654_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_103072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTCTGTATTCTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471473	472308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_471500_472300
817585	contig_11017_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_128094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTGCTAGAACAGACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285102	285450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_285100_285400
817586	scaffold_9100_pilon	-	683	2	Intergenic	novelGene_83305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTATCATTATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795130	790606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_790728_794568
817587	SIRV4	-	299	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	8	1214	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
817588	contig_13004_pilon	-	1574	2	Intergenic	novelGene_112672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658040	654562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_655308_657211
817593	contig_13453_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_146716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	88	327	126520	126759	NA	20	TTAGGTGACAGCAGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVAPRAQRYVKNCRPGPEPGRIFCHSWNMGGKNKKHKAPGAAAVRAAVSASRAKSAEAGAAVEAQNKKPVARPPPLRRCQHQGVPSQARYERSPSPGLSVLTPCCWS	126432	126797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126400_126800
817594	SIRV6	+	265	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	4	8453	-2	286	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTACGTTTGGGGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128	2826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780
817597	contig_11338_pilon	-	1127	4	Intergenic	novelGene_6253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	109.993939226971	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	492	968	109583	108824	FALSE	25	GCGCACTAGACTTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISHKRLNPDGKSVRSEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNIFKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTLPVVFKDVIRPGMRRKLPGEGLPLPKTPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI	111731	108664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_109055_109337_109715_109842_109919_111447
817598	contig_4754_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_35980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCTTTTAACCAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489118	488852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_488900_489100
817602	contig_2684_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_172700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGGGGGAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145903	143828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_-_143800_145900
817605	contig_21369_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_176301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATAAAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28341	27827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_27800_28300
817606	contig_4803_pilon	-	494	3	Intergenic	novelGene_150736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	370	junction_2	205	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	40	318	134971	101613	FALSE	25	AAGGTTGGAGGTTCAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRPLGGSARRLAMSQPGQKPAASPRPRRAAASRPTEEHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSPFLSRKRPILYGCSIRRWGL	135010	101436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_101754_119613_119677_134896
817607	contig_16970_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_157609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149628	151177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_149600_151200
817608	contig_1452_pilon	-	1472	2	Intergenic	novelGene_115161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTCCAGAACTAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699887	698354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699034_699094
817609	contig_3081_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_133918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAACTGATAGAAGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167622	167401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_167400_167600
817610	contig_5084_pilon	-	1826	2	Intergenic	novelGene_64609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	0	23	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	228	605	1027381	1027004	FALSE	0	TGGTTGCTCTTCTGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSAFSLPAPRLAPGPFTQPPNPGPAPLPSLGARLPVPWALFSVGSILYPQHLLALQAFPLALPSRGVLRTPAQSPVRWVWDSISRCFLLCPYSAKLDPQGKGRHREEDFCLRNSWVSHDTKP	1029171	1025782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1027484_1029046
817611	contig_7009_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_23582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	13	561	205018	204470	NA	20	TTAACCTGGGTTGCGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTHMASSLTRSILYLFRVCSLQSRAVSVSSGQFHNLFVSSRGAVVKSLAATQQGGSSNPPAAPWKPCGAVLLCPIGYYESESTRQQWFWVLGGALVKRPAVQTHQPLHGRKMWQSASIKITALETLWGSFTLSCRVTVSRNWLDSNKFGVFFVFVFGFFFLERYSLSGVVLGRNQAGLAPESFQK	205030	203297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_203300_205000
817612	SIRV3	+	386	2	Antisense	novelGene_SIRV3B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	11	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTACCAAAAGCTAGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001	1752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_+_1168_1532
817613	contig_5959_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_150227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGACATGCAAATAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523817	526037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_523800_526000
817616	contig_6497_pilon	+	2318	3	Intergenic	novelGene_35558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	93.5	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAGGTAATAGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156412	165861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_163481_165792
817617	contig_7914_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_165030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAACCAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172946	173176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_172900_173200
817620	contig_7379_pilon	-	1002	10	Intergenic	novelGene_150020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_2	90.7717256244449	440	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	113	925	553324	536814	FALSE	0	CGGCTCTGTGTCTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	569938	536736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549784_553209_553328_569829
817621	contig_5765_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_141367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACTTACTAATTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452706	450503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_450500_452700
817622	contig_2987_pilon	-	878	4	Intergenic	novelGene_125872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	26.5455583227527	1955	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	366	788	606175	603389	FALSE	15	ATGTCTCCTGCGTCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLEKGEYPRWDTWSSSYRSDRLVSFRPVKMDSQEHKICLFEGANFKGNALEIQGDDVPSLWVYGFCDRVGSVRVSSGTWVGYQYPGYRGYQYLLEPGNFKHWNEWGAFQPQMQAVRRLRDRQWHREGSFPAPATELPK	610806	603298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_603573_604792_604936_606079_606213_610478
817623	contig_7357_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_36948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131071	1129181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_1129200_1131100
817624	contig_4232_pilon	-	2444	5	Intergenic	novelGene_63495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	16.9466073300823	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	271	741	681480	667060	FALSE	65	TCTAAAGAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSAQQLAEELEIFGLDCEQAVIEKLVELCILHGQNEEEMAGELVAFISTHGVNLTSETLNSFEHEFLSKRSSKARHSASKDSGHAGARDIVSIQELIEVEEEEETLLNSYTTPSKGSQKRAITTPETPLTKRTVSARSPHQLLSPSSFSPRYSS	681750	665356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_667180_672369_672428_674125_674218_674969_675092_681401
817627	SIRV4	-	350	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
817631	contig_10163_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_82674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTCTGTCCAGGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577605	577988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_577600_578000
817633	contig_5469_pilon	-	1935	3	Intergenic	novelGene_176247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	60	605	125779	119678	FALSE	25	CTTCTAAGAGCTGTTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPIRQFSLRARFPSDATGKMEHSDDKKYPQKCEDPLLSHLQPLSPGQAHKELKHYYSICQDTALGQPGFQEGEGDLKREERTGNSLSPTMAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRAVPLREKKATQMLVIVLGTFIVCWLPFFLTHVLNTHCQACHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNVEFRKAFLKILSR	125838	118347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5469_pilon_-_119875_120867_121214_125776
817634	contig_14516_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_153922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTGTGAGTGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249144	246837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_246800_249100
817635	contig_13211_pilon	+	1902	3	Intergenic	novelGene_123133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_2	3	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	240	545	38334	57864	FALSE	20	CCCATGCAGTGCTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESYVTPILMSYVNRYIKNLKPSDLQLSLWGGDVVLSKLELKLDVLEQELKLPFTFLSGHIHELRIHVPWTKLGSEPVVITINTMECILKLKDGIQVRNY	37619	59221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_37827_38301_38481_57705
817636	contig_15613_pilon	-	1189	3	Intergenic	novelGene_147201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_1	26	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	378	1079	111749	107153	FALSE	35	CTGGGACATCAACCATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSVGAIMWHVIARDYGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVIFNCSCRDVIGWTSGLMSIKVFYERGECILLSAVDNCAEDVREIVQRLGIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHDDGSPRR	117894	107042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_107432_111326_111904_117671
817638	contig_5799_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_50326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATAGTAGAGGGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678254	677295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_677300_678300
817639	contig_15629_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_122462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGAAAACTTGACTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126381	125303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_125300_126400
817642	contig_15039_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_110157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTGGTTTTTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227324	228825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_227300_228800
817643	contig_10734_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_51126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAAGGACCTGTCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741700	742141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_741700_742100
817644	contig_987_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_72269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATAGAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463009	461302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_461300_463000
817645	contig_5338_pilon	-	1253	8	Intergenic	novelGene_114584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	21.4666328642992	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	308	331	389918	389724	TRUE	20	TGGAAAGGGCTTTCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLPYLEGGHWGQGLEGFCPHLELYTQYAANAESSWTTLQEQLKKNKRFRRFVQLQEGRPEFGGLQLQDLLPLPLQRLQHILCGLTFTLGSVASLPLTLQCEMEEGHVV	390812	387541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387965_388106_388196_388459_388690_389294_389410_389658_389730_389900_389986_390314_390434_390691
817648	contig_8286_pilon	-	1581	9	Intergenic	novelGene_139818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	23.5235918813433	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1419	163	1581	315198	296763	FALSE	15	TTTGCCCAGCCCTATGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVATLGTCLGLLAAAAAATSANPAQLDTSSMMSSHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTLLPHYVGKIKSSANSKNAKYLLRGDSAGKVFRVDEKTGDVYAFERLDREKISEYHLVALIVDKNTNKNLEPPSSFTIKVHDVDDNLPVFTRQLFNASVPEMSPAGTSVIRVTAVDADDPTVADHTTVMYHIRKGDDKFSINDFGVISTKTAHLDRETQAKYEIVVEARDAQGKQGESGTATVLVTLQDVNDNFPIFTQAKYTFAVPEDIRVGSPLGSVFVEDPDEPQNRMTKYSIVQGEYRDTFTIETDPTRNEGIIKPIKPLDYERIRQYSFTVEATDPTINLRYLSSSTARNITRIIISVTDVDEPPVFQQPFYHFQLRENQKKPLIGLVLATDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRITKQGNIYNEKELDREIYPWYNLTVEAKELDSSGNPTDKESIVQVHIEVLDENDNAPE	325693	296762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_296837_298256_298400_301841_302093_302292_302481_303324_303490_304406_304524_305746_306036_315006_315232_325564
817650	contig_14341_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_111814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACTTGTCTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524568	523165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_523200_524600
817651	contig_7411_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_136999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	492	890	244886	245284	NA	10	CCCTTTGCCCAGCTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASTLSIPHCFGRLPFCPRAFHLVVTRWLPLFRAPQQHSRQEAVGDSVKQDILKWLCWVIFPRRRLLPSHWPTWLLYCGIFFIFMPLQLLFWWDFVQEQQQCRDSVCVLGTGSPPTLLEPVSIFVASSLTS	244394	245380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_244400_245400
817652	contig_7411_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_137000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAAAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245932	246624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_245900_246600
817654	contig_8636_pilon	-	2259	12	Intergenic	novelGene_141903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1245	1622	284368	283715	TRUE	45	GGGGAAAGAACACAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAASFLEESMTRPKEAGGSGLETGTEPPTTGGSSGVPPGNTGISWGNSLGRPLPGRPLWTRDCESRRVSSSGPKTSPSEKSSRLSVLGRALLPLSRGASRSRTWGNRGIVGLEGRGAGEPRRSM	290832	271430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_271492_277831_277864_277985_278185_279155_279316_280602_280681_281529_281588_283050_283094_283708_283902_284177_284505_285519_285578_285786_285887_289882
817655	SIRV4	+	360	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTAACAGTTTCCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	4000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
817656	contig_4364_pilon	-	1726	12	Intergenic	novelGene_33	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_8	75.7956146924845	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	96	1322	315953	283469	FALSE	40	CAAAATAGAATGCCTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVHCVQVLAGLRAVTHISPKDVSFAEARRDSLRAIARICQTVGVSAGGVPDKVLCEANVPQIYSTLLDCMNDYTTDSRGDIGACVREAAMTSLMELTLLLGRSQPQLIGASVCERVLCYVAQQASEKIDRVRAHAGNVLLTLLHFDSPPLPHVPHREELEQIFPRSDVATMNWNSPSQVFPRITQFLGLPAFRYHVLLGLAVSAGGLTESTVKYSMQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	316048	283064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_314033_314111_314271_314370_314455_315013_315155_315840
817658	contig_9468_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_59464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTTTCACCTAAAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159476	160211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_159500_160200
817659	contig_4782_pilon	-	1005	2	Intergenic	novelGene_73691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTAACATTGTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752570	750949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_751845_752460
817662	contig_20614_pilon	-	832	4	Intergenic	novelGene_107583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.71708159548	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTGGCAGGGCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302081	292133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_292497_293129_293369_295570_295693_301973
817663	contig_14953_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_137286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACAACCTACAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269837	268162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_268200_269800
817666	contig_10311_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_50480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGCACCTTACGAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77093	76509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_76500_77100
817667	contig_9415_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_109825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATGTGTACTGTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1921530	1920238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1920200_1921500
817671	contig_15559_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_141900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193800	192813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_192800_193800
817673	contig_8879_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_158993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAAAACTACTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294641	294866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_294600_294900
817675	contig_6241_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_156451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATTAAATTGAGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605404	606058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_605400_606100
817678	contig_11846_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_105911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCCATAGCTACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108808	108366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_108400_108800
817679	contig_11846_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_105910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCCTCATAAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100678	99689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_99700_100700
817680	contig_5039_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_64853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGGATGATATTACAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333362	332306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_332300_333400
817681	contig_11396_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_71424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	12	308	1754254	1750018	FALSE	70	TCTGAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAMLPFEPVAMVPARLFSARWQTALEGVGRWTPPTRLVLRPSQLLQPTAKLLSVSCASCAKRQESPRKKLLSEKKLVRILTLKALACSFSLETLLIIVSI	1754265	1748924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1750297_1754236
817682	contig_5039_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_64821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCTGGAATTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241988	240440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_240400_242000
817683	contig_15952_pilon	-	1027	11	Intergenic	novelGene_154046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	39.125567088542	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	213	800	102908	93502	FALSE	10	GCACTCTCTGGCTCTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKKFYLCLLSGPSSFLPKGLSDQKDGDEERESAFTKERVPHRAARRGMVRKSRDWVLEKKERRRRQGKEVRPDTQYTGRKRKPYF	105414	93274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93708_93799_97043_97103_97395_97442_97625_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102901_102998_105197_105236_105329
817684	contig_16098_pilon	+	1068	9	Intergenic	novelGene_45904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	38.6619968444466	14	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	231	980	328217	336931	FALSE	10	TTACCTGCATCCGTCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294677	337019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
817685	contig_2768_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_57501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAGTAGTTAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738378	737624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_737600_738400
817687	SIRV5	-	352	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTCTGCAATCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
817689	contig_6795_pilon	-	2103	2	Intergenic	novelGene_27711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132681	130525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_130594_130646
817693	SIRV5	+	411	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-5	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
817694	contig_6710_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_89125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGATCGTCAATGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	653659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
817695	contig_16907_pilon	-	767	4	Intergenic	novelGene_87456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	37.6651917115348	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGGAAGCTTTGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474495	448905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_467610_467773_471189_471339_474411
817697	contig_9377_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_176306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGTTAGGCTCACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448314	446587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_-_446600_448300
817701	SIRV6	+	218	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	511	54	511	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10748	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
817702	contig_8386_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_82223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCCCCATCTTCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42121	42570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_42100_42600
817703	SIRV6	+	452	5	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	4	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10721
817704	contig_2093_pilon	-	1284	2	Intergenic	novelGene_152968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCACCGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297385	1290354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1291575_1297321
817705	contig_9995_pilon	+	1145	3	Intergenic	novelGene_47675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	60	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	275	754	224465	250535	FALSE	75	ACTTAAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSSKMEFFQKLGYGQEDVVRVLGKLGEGALVNDVLRELIQTGSRPATQGRPAGGAAAAAVPLLVPRGSCGRSDSVQCRLGTDPEEECGSPAGALRPIVIDGSNVAMSHGNKEAFSCRGIQLAVDWFRDRGHTAIKVFVPSWRKEPSRSDTPIRGMLE	216958	250926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_217166_224397_224791_250381
817706	contig_15893_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_128507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1447	1755	53455	53147	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPTVPRVEIVAVVATLYSGKRAMTLACSYISGGIIKSYHPKEGQISNMSQITKGNKVISFWRNIPKKRNSYSGKSLRCQIFIEVFLNKDTAIKYPIIKEG	54901	53122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_53100_54900
817710	contig_16826_pilon	-	1578	2	Intergenic	novelGene_176312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	1113	1577	7967	6720	FALSE	20	GCCCAGCTTCCCTGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQHPQVKGPGIGLLGISLGADICLSMASFLKNISATVSINGSGFSGEKTIQYKQTNIPSLGHELRRIKVTFSGLMDIVDIRNDIVGGCEHPSMIPIEKAQGPILFIVGQDDHNWRSEFCAQLASERLQAHGKEKPQIISYPGTGHYIEPPYFPM	9079	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16826_pilon_-_7167_7949
817712	contig_7898_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_47594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508086	506145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_506100_508100
817713	contig_15244_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_118054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	1095	1616	574560	575081	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNIYEHLGALVEPGLMKANAALGLAAVSLSLRGSLDSGVAFLLFSIYKCFWSSLACSFPLLSLAFLSLVPSVSSFFQLLYNFFLPFPIPFHCMHHFNITSYSFCLAYSAPHSDSRERQCDRPSYRDIPWSWPNHSNPCPRSRNDCPHCVTSASTSLIRIHGIAFRAFLGSPR	573465	575319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_573500_575300
817714	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817716	contig_14744_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_66150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	717	1091	1654456	1654082	NA	50	CAGACATTTCAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLKKDLYLEYIKNSQNSTVKAHNSVRKWAKGTERHFNQEDTQIGNKHMKSCSTSFTIRKTQIKTTMRYHYIPIRMAKRKNSDNAKCWRGGRKRGPSYVAVGTVKWYSHSRKQFGSFLSNLTCN	1655172	1653213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1653200_1655200
817717	contig_10988_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_104734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTGGAACAGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144768	143529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_143500_144800
817719	contig_14871_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_63686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	391	711	171216	171536	NA	25	GGGATCGACTCGATGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPWDAEQAMGRCLPIVTRGGGGLGPACSLITRTKQSSERTNPPHTPHSPHQHCGDPPEREGAAENLHHEPQTPRQKGKRSWEETQMFQKTLKELRELRKDPANMQ	170825	172528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_170800_172500
817720	contig_14871_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_63687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAATGACACGGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172627	172986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_172600_173000
817723	contig_6137_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_59198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGGTAACCTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301558	1300407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1300400_1301600
817725	contig_17470_pilon	-	1000	6	Intergenic	novelGene_110487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.853858494926	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	33	377	167807	165368	TRUE	5	CTCATGTGGCGCCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTELRQWEEQGELLLPLTFLLLVLGSLLLYLAVSLMDPGYMNVQPQPQEELKEEQMAMVPQATPPSALQILPGAAATEGPALP	167839	164350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_164529_164699_165006_165228_165397_165582_165662_166040_166178_167707
817727	contig_1893_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_172349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCTATACCATTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141518	138838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_-_138800_141500
817730	contig_8554_pilon	+	1747	2	Intergenic	novelGene_160276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCGGTTACACATTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40372	42835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_42043_42758
817731	contig_6175_pilon	-	2307	10	Intergenic	novelGene_16353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_9	420.720487253784	74	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	452	1471	1719629	1693793	FALSE	65	AGACCCAACAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKVGLLSYILPKSMNGVELKLRKTFSCLGNSAFCSFLYKFSGT	1793688	1692956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719717_1746007_1746156_1770748_1770887_1793610
817732	contig_6589_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_26239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGGGAAAAGAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2203500	2201390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2201400_2203500
817733	contig_7619_pilon	-	1848	7	Intergenic	novelGene_162162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	32.380120787641	73	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	107	1279	419355	414985	FALSE	15	TTCTAACAGCGTGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDLFFFVSFHLYWAAAPTPGRGSACVCCPDLAGEGGGGGTKAYTEPPLPHLQIYLHLRSYTVPNEQRYIIRLLFIVPIYAFDSWLSLLFLGGHQYYVYFDSVRDCYEAFVIYSFLSLCFQYLGGESAIMAEIRGKPIKSSCFYGTCCLQGMSYSIGFLRFCKQATLQFCIVKPAMAALTIVLQAFGKYHDGDFNIRSGYLYITLVYNVSVSLALYALCLFYFATRELLRPFEPVLKFLTIKAVIFLSFWQGMLLAILEKCEVIPEVQAIGVGAGTLAAGYQNFIICIEMLFASIALRYAFTCQVYSEKKENSPVSPAPMVSISSGLKETMSPQDIVQDAIHNFSPTYQQYTQQATQEVPGPGPHAGPMDGGRRSRGVEKTMLIPAEDL	419461	414415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_415212_416033_416223_416708_416879_417035_417128_417699_417776_418319_418411_419027
817734	contig_9668_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_58065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTCCCCACTTTGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27166	28135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_27200_28100
817735	contig_10861_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_39447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCACAAGCAGGATGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2556796	2557263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2556800_2557300
817737	contig_18415_pilon	+	1980	5	Intergenic	novelGene_118311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	38.3560621023587	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	2	808	280	19625	FALSE	20	TTCCACCCAGCATCCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLMHAAYKGKLDMCKLLLRHGADVNCHQHEHGYTALMFAALSGYKDIVWVMLEAGAETDVVNSVGRTAAQMAAFVGQHDCVTVINNFFPRERLDYYTKPQGLDKESKLPPKLAGPLHKIITTTNLHPVKIVMLVNENPLLAEAAALSKCYKVMDLICEKCMKQRDMNEVLAMKTHYISCIFQKCINFLKDGENKLDTLIKSLLKGRATDGFPTYQEKIVRESIRKFPYCEATLLQQLVRSIAPVEIVRLFFNSAVSVEPNHCLLNS	278	20797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_+_413_2117_2217_6425_6587_18367_18583_19426
817739	contig_9706_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_20843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2275	2739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
817740	contig_7342_pilon	+	978	4	Intergenic	novelGene_71204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	29.7993288515027	2190	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	480	848	673029	674781	FALSE	5	CCCGACTGGCGTGGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVARVWSLMRFLIKGSVAGGAVYLVYDQELLGPSDKSQAALRKAEEVVPPAMYQFSQYVCKQTGLQIPQLSPPLKLNFSLRDSWNSGILTVMSALSVAPSKAYHYSKAGWDYVKERAKEYSK	672549	674911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_673058_673691_673870_674045_674098_674671
817742	SIRV4	-	301	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1217	3	1217	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3941	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
817744	contig_17093_pilon	+	404	3	Intergenic	novelGene_176313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	673.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGTCCACATTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27528	29290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17093_pilon_+_27580_28482_28605_29059
817745	contig_4059_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_140606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCGGGCGCCCGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433944	436379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_433900_436400
817748	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	111	0	-76	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	62	301	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2396	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
817749	contig_8263_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_83113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACTGCTCCCTCCCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188442	187138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_187100_188400
817750	contig_2577_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_172072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAACTGAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238690	240449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_238700_240400
817751	contig_348_pilon	-	1789	11	Intergenic	novelGene_67590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_8	15.628179676469	348	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	63	1244	255100	252385	FALSE	0	TGTGTGGTGCTTTCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGSRGECYWGHVFWDQDLWMFPNILLFHPEAARAILEYRIRTLAGARKNAHNLGYQGAKFAWESAGSGLEVCPEAIYGVQEVHINGAVVLAFELYYYTTQDVQLFRDARGWDLVSAVAEFWCSRVEWSPGEEKYHLRGVMPPDEFHPGVNNSVYTNVLVQNSLHFAAALAEDLGLPVPNRWLVVADKIKVPFDPERNFHPEFDGYQLGEEVKQADVVLLGYPVPYPLSPSIRRRNLEVYEAVTSPHGPAMTWSMFAVGWMELKDPGRVQGLLDRSFANITEPFKVWTENADGSGAVNFLTGMGGFLQAALFGFTGFRITRAGITFDPMCPAGVSAVFVSGLSYQGSKVNFSFSEDSVTIEVTARAGPWAPPTGGRAEAITGSAPPAPRTQGLVSPIRWPDTKVPPVAASLRK	255981	251839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_252461_252588_252802_252876_252975_253145_253242_253334_253469_253718_253856_254016_254090_254185_254298_254549_254682_254989_255110_255928
817752	contig_10437_pilon	-	1102	3	Intergenic	novelGene_38116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.5	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	82	636	80783	80229	TRUE	25	CAGGGCTCAATGTTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82827	79699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80109_80171_80788_82750
817753	contig_10734_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_51102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGATTCATATTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597295	596993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_597000_597300
817755	contig_12638_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_33269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAGCTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841692	842389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_841700_842400
817756	contig_7815_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_134417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTCTCTGATTGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942654	942006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_942000_942700
817758	SIRV6	+	337	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	536	0	370	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817759	contig_12969_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_61692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTATGGGCTAACTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568670	569124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_568700_569100
817760	contig_6881_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_164846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACACTGACTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102796	101944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_101900_102800
817763	contig_10307_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_170299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGAGCACTTTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641011	641669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_641000_641700
817764	contig_5777_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_173323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTAACAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47377	46163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_46200_47400
817765	contig_14744_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_66047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACCACCACATATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338086	1340530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1338100_1340500
817770	contig_6277_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_80410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGAAAAAAAAAATCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716542	717205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_716500_717200
817771	contig_15120_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_107996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116196	114813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_114800_116200
817772	contig_15410_pilon	-	1149	10	Intergenic	novelGene_130576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	98.9988153065418	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	16	990	57724	54277	FALSE	25	AAGCAATTCTTCCTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQSWTMTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISAVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELPSSSINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	57739	54117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54968_55069_55158_55355_55436_56111_56207_56333_56443_57295_57401_57488_57564_57669
817774	contig_16109_pilon	+	1672	4	Intergenic	novelGene_80326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	40.2850951207626	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1022	1528	227893	232725	FALSE	25	TTAAAACTCTGCCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATQAEGPKRVSDSAIIHTSMGDIHIKLFPVECPKTVENFCVHSRNGYYNGHTFHRIIKGFMIQTGDPTGTGMGGESIWGGEFEDEFHTTLRHDRPYTLSMANAGSNTNGSQFFITVVPTPWLDNKHTVFGRVTKGMEVVQRISNVKVNPKTDKPYEDVSIINITIK	226871	232869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_227991_229211_229294_231070_231254_232581
817776	SIRV6	+	469	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	17	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	301	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
817778	contig_7870_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_109063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678619	679264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_678600_679300
817779	contig_6088_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_161272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTAAAAATGTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146415	147073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_146400_147100
817781	contig_4678_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_126067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCCCAAATAATACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601586	599807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_599800_601600
817782	contig_253_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_129622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGAACAAATTAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133576	135681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_133600_135700
817785	contig_16385_pilon	-	1571	14	Intergenic	novelGene_86194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTCATAGTTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36827	3462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_-_3537_4047_4109_8914_9036_14034_14239_17193_17275_22389_22507_24753_24792_24964_25084_27152_27280_27560_27726_27906_28003_34229_34326_35623_35684_36615
817789	contig_16831_pilon	-	1594	1	Intergenic	novelGene_134801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCAGAATCACCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475580	473986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_474000_475600
817790	contig_9415_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_109803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGATTTTTGGGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754803	1753700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1754106_1754354
817792	contig_12050_pilon	+	1050	4	Intergenic	novelGene_62723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	100.180947401301	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	477	938	679869	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSLPMGDIPMDGMAVADLGPVVLSLLKAPEEYVGQNLGLSTCRHTVGEYTTLLTKHTGHAVHDAKTTPEEYEKLGFPGAQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	666074	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666392_679709_679960_681576_681768_682979
817794	contig_11543_pilon	-	1208	6	Intergenic	novelGene_175755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	25.9152464777011	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	19	978	159089	138700	FALSE	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGRGKMAAAAGAAAAEQQSSNGPVKKSMREKAVERRNVNKEHNSNFKAGYIPIDEDRLHKTGLRGRKGNLAICVIILLFILAVINLIITLVIWAVIRIGPNGCDSMEFHESGLLRFKQVSDMGVIHPLYKSTVGGRRNENLVITGNNQPIVFQQGTTKLSVEKNKTSITSDIGMQFFDPRTQNILFSTDYETHEFQLPSGVKSLNVQKASTERITSNATSDLNIKVDGRAIVRGNEGVFIMGKTIEFHMGGNMELKAENSIILNGTVMVSTTRLPSSFTGDQFSNGDWVRYKLCMCADGTLFKVQVTSQNMGCQISDNPCGNTH	159107	138469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_-_138904_142559_142692_143020_143213_151594_151781_155382_155593_159053
817796	contig_5515_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_52347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTTTTCAAAATGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99834	101141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_99800_101100
817797	contig_19352_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_122423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGTGACCCTATAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378420	377622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_377600_378400
817800	SIRV6	+	525	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	31	11	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTAAGGTTCGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
817801	contig_10074_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_57200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATTGTGAAGAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594901	594317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_594300_594900
817802	contig_1856_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_84898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCTGCCTAGTAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591773	593779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_591800_593800
817803	contig_8045_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_35342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGCAAAGTAAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107737	107152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_107200_107700
817804	SIRV4	-	361	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	9	1151	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTTAAGAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
817805	contig_7428_pilon	-	2702	12	Intergenic	novelGene_77675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	22.7926332886616	35	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	243	2579	70080	56635	FALSE	35	GGAGAACTTATTGCAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERMNWLSRLASRGPGHRVPQGASLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERRGPQAAPGGADDLSAVCNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTTPGPLLEFALREDLLSRVLAWQLQWDEFGDGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLILLDACGRPVPSSPALDEGLVLLLSQLCVCVAREPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTVGQQARDALLLLMALSAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGVPALALFMSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYLELFLRSISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSCEDVLLQLVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHCAPSPPRQEHASWARGPGSPSADSSSVVTAPRPSTPSRLALFLRQQSLGGSEPPGPAPRSPGLAASPTSSPGRRPSPAEEPGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGLVAQLACHPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKKYLIARGKLDWPEGPAAGPVPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGRDGAGLGLGGGSPGASTPVLLPRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHAVTSPFLLDTSEEGSGSPVSGFGPLNP	85314	56511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_56997_59587_59751_59903_60083_63380_63579_64004_64169_64381_64462_67981_68150_68365_68453_68645_68805_69174_69814_69942_70243_85234
817806	contig_16907_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_87485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGCAGTTAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530015	531210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_530000_531200
817807	contig_12964_pilon	-	1283	2	Intergenic	novelGene_131726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCGGTATTTCCCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615661	614334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_615506_615549
817810	contig_987_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_72279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGGAAATTACTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909668	910028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_909700_910000
817811	contig_13041_pilon	+	1230	4	Intergenic	novelGene_127719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_3	77.1592869041411	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	209	964	250442	275236	FALSE	5	TGCCTGATTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATGTGVEAGFSSEELLSLRFPLHRACRDGDRAALCALLQQAPTVHLAAEDSFYGWTPVHWAAHFGKLECLIELVRAGATLNVSTTRYAQTPAHIAAFGGHPRCLIWLIQAGANINKQDYEGETPIHKAARSGSLDCISALVANGAHIDLRNASGLTAADIAQTQGFQECTQFLLNLQNCHLNCFYNNGTLNGVHQNVFPNHVSMGTNRKRSLEDSESVGVKKARIEGETAFWVGRTEFFLCFLCLLSYG	250233	275502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_250646_256719_256873_262856_262949_274929
817813	contig_9678_pilon	-	2320	3	Intergenic	novelGene_146350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	11.5	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	469	2238	129840	128071	TRUE	60	TTTAATGAAGAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSVHENRKSRASTGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDNEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEQYDPTTNKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS	133891	123463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_123520_128044_129854_133436
817814	contig_8914_pilon	+	845	6	Intergenic	novelGene_112866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	144	551	264665	267401	TRUE	25	GACGGAAGTGCAACTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINIYELTCHFLTMEHILSRVRSMPWKLVRQFLP	264521	268967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264941_265591_265783_267307_267507_268075_268179_268881
817816	contig_7078_pilon	+	1463	2	Intergenic	novelGene_130116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAAAAAAAAGAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29763	183704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_182312
817817	contig_7457_pilon	+	1413	12	Intergenic	novelGene_31310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	43.0999223408247	10	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	53	649	183157	189081	TRUE	20	GTGGTTGTCGTATACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQLLSLPSIPGEGPRFAG	183104	195103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189030_189173_189404_189537_189996_190064_190243_190336_190768_190824_192098_192194_194871
817818	contig_3270_pilon	-	1342	3	Intergenic	novelGene_104483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCGCTACGGCAACGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309026	300141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_300415_307274_307341_308023
817819	contig_5728_pilon	+	2712	2	Intergenic	novelGene_126693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2025	2348	280653	281019	FALSE	40	GATGAGTGGGAAGATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNCSSLDSWPLYSCVAPLLARGPLYSCVAPLLARGTLYSCVAPLLARGTLYSCSAPAGTRDIVRLRSAPAGTRDIVRLRSAPAGTRDIVRLPPLLARGTLWQQQS	278628	281383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_280933_280975
817820	contig_383_pilon	+	1958	4	Intergenic	novelGene_126153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	8.48528137423857	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATGTCATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387160	452868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_387183_433097_433230_450278_450387_451172
817821	contig_2204_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_71689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52803	54022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_52800_54000
817822	contig_6576_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_42380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1	477	1283835	1283359	NA	75	TATTTAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAKPYEIVVDLTHTGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVSAVYVYNCNSWVREYTKYHERLLTGLKGSKRLIFIDCPGKLAEHIEHEQQKLPAATLALEEDLKVFHNALKLAHKDTKVSIKVSFAPCYINDSCLSSLTRIHPDSSRCPCHSSESHVK	1283835	1281559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1281600_1283800
817823	contig_9609_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_22924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	378	746	28989	29357	NA	35	TCAGCCCATTAACATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPQALIQTLIQIRCTYEGEREQFSFPQLHGLFQAMLTKLSFEEGNIGNVLEVSKAANLSRPFQPAWVGGHIPSLETRYVRRGLEQSGRFETREGLTGSILSFVLRDEMMDCLDSWVPLPKS	28611	29440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_28600_29400
817824	contig_6589_pilon	+	1110	9	Intergenic	novelGene_25988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	268.425239824797	447	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	291	701	1365296	1374664	TRUE	20	TTAATTTCCTGTTGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTIINLTVALHPTSESLRTLEMPLPLLVQKPGRNAWRGRREKIERRQQEVETELKMWDPHNDPNAQGDAFKTLFVARVNYDTTESKLRREFEVYGPIKRIHMVYSKRSGKPRGYAFIEYEHERDMHSTTQLACS	1364287	1384078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1364480_1365197_1365355_1367252_1367316_1367434_1367488_1371811_1371877_1372042_1372106_1373899_1373982_1374638_1374779_1383783
817825	contig_16666_pilon	-	2581	3	Intergenic	novelGene_61807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	210	644	214000	213566	TRUE	15	GCTGGTGAAGCCCTGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGHKGPQEPALALANWPQHGRQPGLEYGAQKRPEVVKGVLCVLRQAPCPRWASCFPRQHQWSWNKGCGLWEGDGAEDRKQGGRVGQEGILVTVGQPCVPSHPGARRLTELIIGSNAHLVCTKAQAGLQVCKAKVTSRVCAPH	214209	211040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_211198_211696_212012_212100
817826	contig_10042_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_79143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGGCCTGTCCCTGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91077	90310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_90300_91100
817827	contig_7019_pilon	+	1729	6	Intergenic	novelGene_149445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4.4	50	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	33	479	472590	496296	FALSE	40	GAAATTAATTTTATCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALWRLCNLLMAAFFALAASVQVNDPDAELWMVVYTIPAGLTLLVGLNPLVTGNFIWKSISAIHILFCIMWALGLGYYLLLHTRQNILHEEEGRELFGLVIIAVWMSLCRSSSKNPVGGRIQLAIAIIISLFPFISWIYIYINKEMRSSWPAHCKTVI	472557	497546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_472626_473451_473482_477548_477610_482580_482705_484042_484103_496160
817828	contig_14142_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_120586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	1	471	583832	583362	NA	30	AACCCAGCGAGTCTGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCGFSRGRRQRPGPETPGCFHQAYGLSQLELRTPSPPSRYRGGSAIRSRQPRLGPLRPAPGAQARPLTGPRSPAWTRPRRQRSALELRSWVCKASALCSPPSPAGWIPETHCPKTTERSRRRPKSNSSGLKAPFTSGFPLLFLIRSISLEEVSGP	583832	583286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_583300_583800
817829	contig_14142_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_120585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCACAAACTTGTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582115	581081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_581100_582100
817832	contig_5770_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_74144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACAGATGACTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26809	24866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_24900_26800
817834	contig_8518_pilon	+	1267	6	Intergenic	novelGene_176314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	1.46969384566991	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	367	813	140278	143931	FALSE	20	CCACACAATGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRVSAGFLLSQLPTLKPRYYSISSSRDHTPTEVHLTVAVVTYRTRDGQGPLHHGVCSTWLSNLKPQDAVPCFLRSASGFQLPEDPFQPCILIGPGTGIAPFRSFWQQRLHDIEHKGLQRGRMTLVFGCRHPDEDHIYREETLEMARRGVLHEVHTAYSRLPGQPKVYVQDILRQQLASEVLRVLHKEQGHLYVCGDVRMARDLAHTLKQLVAAKLSLNEEQVEDYFFQLKSQKRYHEDIFGAVFPYEVKKDTVVGQPSDPRAPMTHGTS	136892	144385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8518_pilon_+_137032_138896_138985_139411_139534_140260_140410_141434_141630_143811
817835	contig_9883_pilon	+	1053	3	Intergenic	novelGene_87590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	179	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	18	341	83842	84165	TRUE	70	AGAAAAATAAAACCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSWARTAVVLLCACDLVLLLLLPPRACATGDPAGTPGEATPPPRKKKKDIRDYNDADMARLLEQWEVRGSRSPSRFFSVPVPALTDPLPPCSPSDLLDLRLSIF	83824	96101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_84496_94067_94301_95952
817836	contig_5894_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_83011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATAAGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256940	254724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_254700_256900
817839	contig_12644_pilon	+	1255	3	Intergenic	novelGene_44430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	926	1237	22506	22817	FALSE	20	TTTCACCTTTTTTAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSPCFACLGTAPSNRKDDPFLAGGSVETTSGWPSPAASCAGSQVAGLLHPSSQPPSFQHLLSRWPASCSSPRGCRDAGHILWSQDEFVLACQRAMPSGSRP	18587	22835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_18874_20421_20724_22168
817840	contig_7887_pilon	+	678	4	Intergenic	novelGene_124901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	83.2839853886822	3086	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	99	380	375247	375848	TRUE	15	GTTGTGTGAGCTGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRADACARLTTHRFRSRSFLASGTDWTRRRGAMVVGTGTSLALSSLLSLLLFAGMQMYSRQLASTEWLTIQGGLLGSGLFVFSLTVSSLRRSGDGCWRVGRVESHTGLCPSRYPHCSASSPRPAP	375148	378518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_375251_375570_375927_378067_378135_378365
817841	contig_15029_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_128233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGCTCTGAATAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568161	569296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_568200_569300
817842	contig_15741_pilon	-	1439	10	Intergenic	novelGene_159671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	657.783614838966	2	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	214	939	61603	50105	FALSE	40	AAGAGAGGTATTTAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCWTRVWIPLLRPPLLPPPATTRDPKQKKASSCRKAGTALGRRSRRRWPSPASSRRRSATTTSSTSSAQKIMEDRYRVVQVTDGQLDGQGDTAGAVSVVSTAAFTGGQQAVTQVGVDGAAQRPGPTAASVPPGPAAPFPLVASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPYRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	62197	49604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60157_60466_60559_60681_60748_61248_61449_61592_61712_61823_61871_62139
817845	contig_730_pilon	-	1358	11	Intergenic	novelGene_155622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_7	29.2369629065674	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	232	1356	212398	207909	FALSE	20	GCCAAGTATCTGAGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTSKDKRDVYYRLAKENGWRARSAFKLLQLDEEFQLFQGVTRAVDLCAAPGSWSQVLSQKIEGGHVVAVDLQAMAPLPGVLQIQGDITQLSTAKEIIQHFDGCPADLVVCDGAPDVTGLHDVDEYMQAQLLLAALNIATHVLKPGGCFVAKIFRGRDVTLIYSQLRVFFSNVVCAKPRSSRNSSIEAFAVCQGYDPPEGFIPDLTKPLLDHSYDPDFNQLDGPTRIIVPFVTCGDLSAYDSDRSYPLDLEDGSEYKYTPPTQPPISPPYQEACTLKKKGRLAKEIRPQETPISIVDVLPQPLAIPPRHTLLASEVWKHGQGPQCPFCEPTVTPSQCASFYPQILWFWGPKFSSLPPNSYRTQWVKPTIINRKA	214574	207906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_208284_208374_208479_209285_209370_209471_209575_209656_209711_209795_209849_211334_211414_211753_211836_211931_212002_212277_212439_214383
817846	SIRV7	+	532	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCCGCGATAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70989_78844_78957_114676
817847	contig_16846_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_82874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTCGATTCCAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216285	215615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_215600_216300
817852	contig_5255_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_171558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGATTCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74604	76736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_74600_76700
817853	contig_10811_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_165810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432779	430534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_430500_432800
817855	contig_4847_pilon	-	1197	2	Intergenic	novelGene_156144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACATAAACCCTGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70208	67860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_67907_69057
817856	contig_4847_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_156143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACATCTGTTCCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55633	55360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_55400_55600
817857	contig_6494_pilon	-	482	5	Intergenic	novelGene_108583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1673	junction_4	467.524865648876	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	27	482	8286	3380	FALSE	20	GTGGATGGCCTGATGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKF	8312	3379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
817859	contig_14362_pilon	-	1560	6	Intergenic	novelGene_142524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	57.807957929683	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	88	930	40212	37574	FALSE	10	GCATCGGCCTCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSRSPTRSVAGSLLSSCSARPAGPTHSATMSEAFDCAKCGESLYGRKYIQTDGGPHCVPCYDNTFANTCAECQQLIGHDSRELFYEDRHFHEGCFRCCRCQRSLADEPFTCQDNELLCNDCYCSAFSSQCSACGETVMPGSRKLEYGGQTWHEHCFLCTGCEQPLGSHSFVPDKGGHYCVPCYENKFAPRCARCSKTLTQGGVTYRDQPWHRECLVCTGCQTPLAGQQFTSRDDDPYCVACFGELFAPKCSSCKRPITGLGGGKYVSFEDRHWHHSCFSCARCSTSLVGQGFVPNGDQVLCQGCSQAGP	45456	36943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_37729_37855_38043_38165_38336_39772_39948_40056_40233_45389
817860	contig_15371_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_151451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAATCTGCTTTATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159222	161435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_159200_161400
817863	contig_7230_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_52562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAGCATAATTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177613	175993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_176000_177600
817866	contig_1450_pilon	+	1181	9	Intergenic	novelGene_27405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	245.62102414085	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1170	12	1181	347103	355932	FALSE	45	AATTATTTTCTGCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGEIRFPLSALKGASWDPRGIESPCPRSDSLQ	347091	355932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589_355738_355846
817867	contig_13447_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_176317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTATATAATTTTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34410	35713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13447_pilon_+_34400_35700
817868	contig_6589_pilon	-	718	5	Intergenic	novelGene_25759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	92	307	672646	670092	TRUE	25	TGCTCCTCTCAATATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDVDDAAGQGKGEGHPGQGKAVAEAAPRRVMLQDLLGVDGIDQGSSEYCHAGAKLAEASGIEEPSSPHGIELEHEQDEGEAAEDEGEHHEDLHWLQPDHSR	672737	668287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_668405_669547_669746_669995_670106_671047_671188_672584
817869	contig_1406_pilon	-	712	5	Intergenic	novelGene_25613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACGCACACAACTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2232020	2218195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2218203_2227026_2227084_2228826_2228875_2229910_2230054_2231563
817870	contig_8914_pilon	-	448	4	Intergenic	novelGene_112879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_3	1997.6537904919	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	24	446	268944	265730	FALSE	55	TACTAAAAAACGCAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCLSSRMAVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVG	268967	265727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_265799_267319_267508_268075_268180_268882
817871	contig_5217_pilon	+	714	7	Intergenic	novelGene_135805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.6892802352841	227	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	117	713	1025137	1078871	FALSE	15	TACTGTGTCTGAGCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECAEHWGFPALTEHSASPAASLGIFEVRRVLDASGCSMLAPLQTGAARFSSYLLSRARKVLGSHLFSPCGVPEFCSISTRKLAAHGFGASMAAMVSFPPQRYHYFLVLDFEATCDKPQIHPQEIIEFPILKLNGRTMEIESTFHMYVQPVVHPQLTPFCTELTGIIQAMVDGQPSLQQVLERVDEWMAKEGLLDPNVKSIFVTCGDWDLKVMLPGQCQYLGLPVADYFKQWINLKK	1010043	1078872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_1010061_1012397_1012474_1025113_1025392_1043751_1043869_1050172_1050233_1054813_1054906_1078798
817873	contig_12740_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_159210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCAGCATAACTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56293	54210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_54200_56300
817874	contig_18283_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_170700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGCTAGAGGTAGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56939	56134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_-_56100_56900
817876	contig_2550_pilon	+	1134	5	Intergenic	novelGene_135621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_2	101.905286908972	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	26	595	397136	409719	FALSE	75	CAAAACAAAAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKCLFGKMAAVSVYERPVGGFSFDNCRRNASLEAEFAKKGYKLPAARKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGECNVSLLFQILLFTRMVS	397110	410258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397198_397613_397708_398493_398592_401128_401270_409544
817879	contig_11106_pilon	-	1129	6	Intergenic	novelGene_167449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	182.197036199824	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	547	903	151553	133474	FALSE	25	TCTAAAGCATATCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSVQNKIKSLNWEEMEKSQCIPGIEDSEFCVRIPGGGITKALHEESCCREIPMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQIIKPCMDDSTVSALPWKIPSSWRLLFGSGLPPALF	162150	133247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_133567_134427_134549_151410_151585_152477_152597_159246_159419_161926
817880	contig_10766_pilon	+	497	2	Intergenic	novelGene_151186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAGGTAAGGAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110693	113227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_110898_112934
817883	SIRV1	-	266	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3838	0	3564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6802	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
817884	contig_8286_pilon	-	761	5	Intergenic	novelGene_139800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	199.202158622842	2560	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	68	331	189967	185112	TRUE	25	CATATTGTCAGCAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVLRGERLQGERGAAAGSAGVMQAAQPRRPNSPPILAEGVASPLLPKRERPREDATAVLRRGKAFCSALGERREVRPCRLPQRVHGPVINQNHQIDMNDPHLDPQTRY	190034	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_179860_182810_182907_184959_185119_189628_189777_189858
817885	contig_20293_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_153530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACATAGGTTCAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100766	99864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_99900_100800
817886	SIRV7	-	381	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	33187	1	-32	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680
817887	contig_12050_pilon	-	1200	8	Intergenic	novelGene_62700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	113.618049730181	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	167	1069	619215	615621	FALSE	15	TGCTAAAGCCTCTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSIGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659649	615489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615884_615931_615964_616873_617366_617771_617890_619129_619256_619530_619612_659604
817889	contig_17603_pilon	-	2325	3	Intergenic	novelGene_152775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_2	15.5	8	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACAGAGATGTGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47122	28941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_30807_42451_42697_46907
817890	contig_7057_pilon	-	1882	6	Intergenic	novelGene_123418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	39.5848455851479	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1665	218	1882	1520335	1493199	FALSE	15	TTCTCTCAGTGTTCATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSLDTVTFKDVAVDFTQEEWQQMKPAQRNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVGEEETLGRHCPEIWEVDEQIEKQQETLVRKVTSISKETLIKDKVNECKKVAKIIHLNSDIATSRQSFCECDSLDKDLEHNLDLLYFEKSCVKEKNYEYNEYGKLFYHFSSHVTPFKCNQCGQEFNHKFDLIRHERIHAGEKPYQCKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECNQCGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECNECRKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKTFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFICNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKA	1526285	1493198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1494626_1502639_1502736_1503033_1503161_1520320_1520380_1524606_1524674_1526179
817891	contig_7707_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_72233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	448	822	1072536	1072162	NA	20	TTGCTGTTGGACTATCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVARWREISILFGGVESELNLQVGLGKGVLTSPCLLSVTPRPCSGVYKSLLLPLEFLFLLCGGHGATYFIYYFLNFHTVKLAFFWGVYSSMNCITSMDSCNYHHHNPDTEHFHHPRKLPQAIP	1072983	1071744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_1071700_1073000
817893	contig_11594_pilon	+	1574	1	Intergenic	novelGene_80890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89768	91342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_89800_91300
817894	contig_5018_pilon	+	739	6	Intergenic	novelGene_47138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	516.951990033891	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	86	664	1498209	1500446	FALSE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQKGQTCPLNTPQSGTLEGRAKALSCPHLEANEW	1497675	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497752_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499556_1500346
817895	SIRV7	-	293	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	68993	0	35774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
817896	contig_7356_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_60342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGCAAGATACAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41912	41157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_41200_41900
817898	contig_13530_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_175572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATGATTTCATTGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33079	32429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13530_pilon_-_32400_33100
817901	contig_4339_pilon	-	930	9	Intergenic	novelGene_146070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	71.4142842854285	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	175	816	997204	976186	FALSE	25	TATATTGAGTGTGTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPRWRCRAGFALLGVSDSPAVSVHGGNIDVLKATAEEISSQTGNKVHAIQCDVRDPDMVQNTVSELIKVTGHPDVVINNAAGNFISPTERLSPNAWKTITGIVLNGTAFVTLEIGKQLIKAQKGAAFLAITTIYAETGTGFLVPSSSAKAGVEAMYKSLAAEWATYGMRFNIIQPGTIKTKGAFSRLDPTGAFEKEMIHKIPCGRLGTVEEIANLAAFMCSDYASWINGAVIRFDGGEEAFISGQMNSLTKVTKEQWDTIEGLIRKTKGS	1027152	976071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_976246_976346_976410_976832_976980_979232_979306_984376_984477_995831_995980_997153_997241_997359_997418_1027072
817906	contig_12512_pilon	+	162	1	Intergenic	novelGene_24173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAACATTAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511773	511935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_511800_511900
817907	contig_12427_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_40572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCCCAGCAGAGAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524345	523717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_523700_524300
817908	contig_7004_pilon	+	954	2	Intergenic	novelGene_126453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	37	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAACTCATGCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279810	281121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_280619_280975
817911	contig_4531_pilon	+	1293	4	Intergenic	novelGene_47838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	39.8357739838062	207	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	104	670	44823	48327	FALSE	30	CTGTTTTAGATTGTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFPAVAGRAPRRQEESERSRDLQEERPSAVSIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRKKLIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYEAGFSQHGMIGVTQPRKVAAISVAQRVAEEMKCALGSKVGYQVRFDDCSSKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSVIILDEAHERTLTTVSILIY	44719	48950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_44935_45757_45926_46934_47081_48186
817914	contig_14483_pilon	-	571	3	Intergenic	novelGene_133763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAATGGTGTTTGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117852	111466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_111793_112557_112716_117765
817916	SIRV6	+	363	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	10	4	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817917	contig_5959_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_150217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCATGCAGGAACATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436923	438588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_436900_438600
817918	contig_7695_pilon	-	1033	5	Intergenic	novelGene_41563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	166.785041295675	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	79	588	380076	375878	TRUE	30	ACTTTTTTCTTTCCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDRAEFPVRHGSV	381083	373596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_375915_376459_376521_379664_380089_381017
817919	contig_19778_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_143758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	32	junction_1	247	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTGTTTCACTGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24008	29761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_24053_24873_25219_28501
817921	contig_18869_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_56271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
817922	contig_10016_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_117852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCATCAAAGGTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292317	294162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_292300_294200
817923	contig_15449_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_33619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGCTAGGGAATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58674	57122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_57100_58700
817924	contig_11855_pilon	+	1664	11	Intergenic	novelGene_67069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	114.894560358617	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	513	1289	2089364	2105965	FALSE	80	CAAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVKVPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNRVEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVENAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINYHASDVLETSGWKSMVVSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS	2034434	2106340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2034540_2071770_2071822_2075239_2075304_2086215_2086360_2089215_2089368_2089903_2090032_2097169_2097348_2100083_2100140_2100603_2100727_2104362_2104506_2105820
817925	contig_2332_pilon	-	1528	8	Intergenic	novelGene_58659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	13.3493101556842	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	267	617	326228	324589	TRUE	40	ACTTTAGGACAATATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQLSLGLWTLLSQKRGCLYAAGAPPALCDHRLRLPPWLKTEIPIGKNYNKLKNTLRNLNLHTVCEEARCPNIGECWGGGEYATATATIMLMGDTCTRGCRFCSVKTARKPPPLDANEPFNTAKAIAEWGLDYVVLTSVDRDDMPDGGAEHFAKTVSHLKERNPKILVECLTPDFRGDLKAIEKVAVSGLDVYAHNVETVPELQR	330579	321300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_321330_322403_322550_323852_324722_325094_325153_325235_325393_326225_326307_327167_327262_330485
817928	contig_16310_pilon	-	2158	3	Intergenic	novelGene_70060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	7	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	91	1377	145041	132554	FALSE	25	CGGAAATTACTGTCTGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLCLNCSILSGDLPPESTRIPVPCNGSRAWGLFEPEDLNLTDEMLRLKYLGPQQTDLFVPICATYLLIFVVGTVGNGLTCVVILYHKAMRTPTNYYLLSLAMSDLLVLLVGMPLELYEMWHNYPFLLGANGCYFRTLLFETVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSVVTRTHVCRVLGAIWGLAILCSVPNTSLHGIQQLDVPCRGLVPDSAICTLVRPQALYKLVVQTTALLFFCLPMATISVLYLLIGLRLRRESMLLRWEAKGRGAAEARSSDTCSLQQRLQDRGRRQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRLMWSLVSHWTDSLHLAYQYLHVISGVFFYLSSAVNPVLYSLMSSRFRENFQEALCFGAQCCHHRPRHGSHSFSRMTTGSTLYDLGSPGGRALPLAENGGPEGLQETDFC	145131	131772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_132937_136192_137094_145038
817929	contig_2940_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_81963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTAGAGGTAGTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019190	1020239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1019200_1020200
817930	contig_16846_pilon	-	1057	4	Intergenic	novelGene_82920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	178.389710714741	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGATCATACCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487437	477735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_478282_479461_479572_484888_484993_487140
817931	contig_1154_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_87173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCGGCTACAGGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922405	922869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_922400_922900
817933	contig_6102_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_31749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	313	324	227015	227004	NA	35	AGAGTGAGGCCAACCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVELLRILLSHDVEPVSNGGILGNSGHIRSEACLLSQHRTLSLLPCLGAACPKFFSYNSHCTATPDFPVTAPLTSPFPLRPPPASACFAPTSSPPPCPTPLTTPMEK	227327	224921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_224900_227300
817934	contig_6677_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_114221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATACTTTACAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632807	630921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_630900_632800
817935	contig_10003_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_88147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371535	373323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_371500_373300
817936	contig_12113_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_134749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTCACCACAGCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254645	256512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_254600_256500
817937	contig_7843_pilon	-	1423	4	Intergenic	novelGene_152023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.5781466273965	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	122	343	207304	201305	TRUE	85	AACAAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLANILFTQELARRLKGSGVTTYSVHPGTVKSELPRYSTFMTWMWWLFFFFLKTPQQGAQTSLYCALTEGLEILSGKHFSDCQVARVSAQARNETVARRLWDISCDLLGIPLD	208333	200182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_201225_201266_201408_207185_207376_208283
817938	contig_13542_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_131519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460021	458386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_458400_460000
817942	contig_8661_pilon	-	1137	11	Intergenic	novelGene_137935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	610.894794543218	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	268	888	312848	305355	TRUE	15	GAACTCCACCCTTTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKVIFPKWKPNSSIM	316077	301217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305393_307635_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312893_313796_313880_315937
817943	contig_1516_pilon	+	1539	14	Intergenic	novelGene_49944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	97.6938824827646	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	305	1354	231711	238082	FALSE	35	TAATGAACATGGATTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNTLTVFVATPGCHQLPSLESVENYTLTINDEQCFLLSETVWGALRGLETFSQLIWRSADGTFFINKTDIVDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSRILDTLDVMAYNKFNVFHWHLVDDPSFPYDSVTFPKLARKGSYNPATHIYTVQDVKEVIEYARLRGIRVVPEFDTPGHTLSWGAGVPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPILNSTYEFMSTFFLEISSVFPDFYLHLGGDEVDFSCWKSNPDVQAFMKKKGFGDDFKQLESFYIQMLLNIVSAYGKGYMVWQEVFDNKVKVQPDTIIQVWREEAPVTYLKELELITQAGFRALLSAPWYLNRITYGPDWKEVYMVEPLAFDGSPEQKALVIGGEACMWGEYVDSTNLVPRLCSHRGCSLTKPGGPRAGAVAERLWSNSRVTDLEFAFTRLTNFRCELLRRGVQAQPLSVGYCEQEFEET	226541	238267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_226616_227739_227806_230161_230209_230728_230840_231704_231807_232280_232414_233368_233550_234537_234625_234901_234975_235702_235887_236105_236197_236517_236554_236844_236950_238018
817944	contig_16103_pilon	+	651	3	Intergenic	novelGene_118720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1955	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	178	600	207347	209900	FALSE	30	ATAGAGCTCAGCCCTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFPRTFIEFAQQDAHAHIAAPPLPAGETPARRAPRRHRRSIHFFRGCLSGQPSKNSLHIMAMQDRKTQYSWKSTSLSLLLSKLLISFWNAASSVLFPKKLGSSRVSSSCSSDLLSLNLSPSLAEYLWKVDTITSRAFSRGCAMAAVRTSLYPGQVLPMAGGGGEQRHPPALGRCSKSHGPLNQPSLDTVFRPPAGTDGQ	207169	209951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_207457_208627_208781_209740
817945	contig_12884_pilon	+	1145	5	Intergenic	novelGene_104975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.6596032513375	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTGGGCGCATCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618063	621057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_618204_618389_618641_619243_619451_619940_620021_620590
817951	contig_11639_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_151153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTAAATAAAATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41992	39612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_-_39600_42000
817952	contig_8063_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_152425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCTCCCAGCAGTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122638	120588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_120600_122600
817955	contig_11832_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_106970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_4	29.6763794961582	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	101	553	463912	466401	FALSE	0	GGCTTGGTGTCTTCGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAVAGAVRSPGPLWSRLAWQWQQQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAKWTETEIEMLRAAVKRFGDDLNHISCVIKERTVAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPEAGGPPIKKQKADSLTLDSGTSHDLC	463811	466631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_464826_464929_465610_465802_466357
817956	SIRV5	-	363	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10990	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8380_8448_8581_10853
817958	contig_6227_pilon	-	1024	9	Intergenic	novelGene_49754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	371.322215198606	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	24	941	1224979	1202706	FALSE	20	AGAGGTTATGGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTVVLLVPIAIVCTAWSCPTLPRAPSGCRLGPQVSWGTRVWNPSTRLSPGPPALLRN	1225002	1202622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1202870_1212587_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
817960	contig_3386_pilon	-	1351	6	Intergenic	novelGene_34531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_5	630.228339572254	1	96	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	109	603	409604	404912	FALSE	30	TAAATTGTTGTTTAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	412202	404163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
817962	contig_10003_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_88209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523197	524127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_523200_524100
817963	contig_6795_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_27776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	206	661	498684	499139	NA	40	ACCAATGATTATGAGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTRPSLLALPTARLSLSAVPTPGPSLGLLPCLGKCYLALLTSAWRQPTLPESLLTKGAQLSCSWVGKTTTAVLHWSPGSCHSYRCTHLALSLAIFSATALSPVSRRFSAQGPGSKGCTPLQTLLLDGSEVPLNLYGFNPFINLFLSLRS	498478	500431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_498500_500400
817964	contig_6795_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_27778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCTAAGCCAAAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502606	503029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_502600_503000
817965	SIRV6	+	354	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	609	164	-19	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCACGAGTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817967	contig_614_pilon	-	1229	4	Intergenic	novelGene_132644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	122.486280410864	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	106	354	948565	943435	FALSE	70	TATGAAGAAGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQHFYICENFTLSPVGDVYCTRHCLSNISDPFIFNMCSKDRSCDHYACQRHRYTDIREIRQTHFLLQDIALEIFFQNGCSTFLVFHNNDRSKAFKSFCSFQPGLKGKGITEDSLNLR	966421	942559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_943502_945012_945099_948469_948591_966341
817970	SIRV6	+	366	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3034	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
817971	scaffold_19766_pilon	-	1264	5	Intergenic	novelGene_34405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	86.020346430365	27	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	21	491	830565	826089	FALSE	30	TATATATATGTATCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVRLGKLFFILAVFGAWSGTPKEQDDDSERLPSKCEVCKLLSQELQEKLSHTGRSREVLELGQVLDTGKRKKHIPYSVSETRLEEALENLCERILDYSVHAERKGSLRYAKGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQRV	830585	825315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_827289_827413_827987_828085_828182_828310_830450
817973	contig_11855_pilon	-	600	5	Intergenic	novelGene_67132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	29.6595262942617	2604	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	87	497	2676275	2674178	FALSE	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTTGALLIPPALFRYNTRGLIRPMSASFLSRSEIPSKQPSYSSSPLQLARREFQTSVVSRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	2676879	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674293_2674641_2674821_2675231_2675310_2676236_2676285_2676802
817974	contig_14618_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_136865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	486	1085	1370182	1369583	NA	20	CCCTGCACCAAGTCCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQVIKVSRGDDGSEAVERHQKTVGKRIKSVVVNSSSPCHAPSHHSPALLQTRKGFLCAKSKVPAPCPSWVPRPRRPATACFSSPTHHALDALAFFLFLDHARLVPVSGPLHLLVPLPSSLFPNLQKLGSFSSFKSQVKCHLLREAYLHHSKRAVPCASCHSPSYCRFLFFIVLLYHCQGALVVQWLKARLLTKRSVV	1370667	1369270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1369300_1370700
817976	contig_5280_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_52661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325587	323866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_323900_325600
817977	contig_19098_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_65829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTCCCATAGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387786	388396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_387800_388400
817978	SIRV6	+	388	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	357	555	184	35	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTGCCGCTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	1985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
817979	contig_4364_pilon	-	885	8	Intergenic	novelGene_4582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_7	56.6175857875286	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	93	698	1972876	1965812	FALSE	5	CTCTCTTGCTCTCAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEVRSTVAAVLPRRRFGLGRAGAAGPGVAMGNLFGRKKQSRVTEQDRAILQLKQQRDKLRQYQKRVTQQLERERAIAGQLLRDGKKERAKLLLKKKRYREQLLDKTENQITSLETMVRSIEFTQIEMKVMEGLQFGNECLRKMHQVMSIEEVERILDETQEAVEYQRQIDELLAGSLTQEDEDAILEELDAITQEQVELPEVPAEPLPDRIPEKVPVKAKPRQAELVAAS	1972968	1965624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1965868_1966748_1966804_1967829_1967911_1968146_1968213_1968957_1969045_1969502_1969591_1969678_1969789_1972813
817980	contig_18391_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_174092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42667	43415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_+_42700_43400
817981	SIRV6	+	434	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	3	164	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
817982	contig_7362_pilon	+	1544	1	Intergenic	novelGene_147560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471654	473198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_471700_473200
817985	contig_10235_pilon	-	1198	9	Intergenic	novelGene_46364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	111.984373909934	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	31	867	140447	131467	TRUE	35	TCCTTCACAGTATTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDSTSTTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTQLPSSGASSGTGSPSATHGGGPPPAHDQGYTDLTISDGVSGGGPQAQHSQPPPQMPTAVPEPVALSSQISEPVESEAPPREPMEAEEVEERAPAQNPELTPSGPAPAGPTAAPETQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	140477	130315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131535_131619_131769_137361_137591_138212_138255_138815_138939_139059_139178_140339
817986	contig_5018_pilon	-	1523	11	Intergenic	novelGene_46991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.6928806475278	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	270	1097	653432	644017	TRUE	15	GTCCCTGCCTCCAGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERKGVNKYYPPDFNPEKHGSLNRYHNSHPLRERARKLSQGILIIRFEMPYNIWCDGCKNHIGMGVRYNAEKKKVGNYYTTPIYRFRMKCHLCVNHIEMQTDPANCDYVIVSGAQRKEERWDMEDNEQVLTTEHEKKQKLETDAMFRLEHGEADRSTLKKALPTLSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRRQRRKPSRRRRKGTRRCRPRRAWPSHWCPRQRKTASWLPCSSSTPWTPTRTNRNSSGQRSSAAPGSPLPLDLEPAVATAKLAAS	656306	643529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_643701_643761_644131_644237_644379_646983_647157_647239_647383_648077_648139_649914_649971_650897_650981_652225_652280_653429_653656_656260
817988	contig_7234_pilon	-	1620	8	Intergenic	novelGene_145942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	171.972945190664	4	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	141	341	510034	454583	TRUE	25	AACCCATTGCTGTCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRHLTLGYHYRTMEVQ	587404	434085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454626_464420_464483_481374_481435_509998_510089_587318
817989	contig_16098_pilon	+	1078	9	Intergenic	novelGene_45907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	53.9976851355685	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	382	987	328979	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLTAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294690	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_321945_322037_328159_328236_328924_328992_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
817990	contig_12050_pilon	+	801	6	Intergenic	novelGene_62764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	130.643637426397	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	391	738	809452	811668	FALSE	10	CTTGTGTGTGCCCACCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVVGRAFARALRQEFAASRAAADARGRAGHRSAAASNLSGLSLQEAQQILNVSKLSPEEIQKNYEHLFKVNDKSVGGSFYLQSKVVRAKERLEEELKIQAQEDREKEQVPRT	799747	811731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_799809_808288_808591_809424_809510_810579_810717_811004_811071_811581
817991	contig_6673_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_164012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCTCTAAAGTAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50523	52974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_50500_53000
817992	contig_10240_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_176226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATGTTGGTCCATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509297	508998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10240_pilon_-_509000_509300
817993	contig_10240_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_176225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCCTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507840	507125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10240_pilon_-_507100_507800
817994	contig_500_pilon	+	1897	6	Intergenic	novelGene_30922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_3	66.6483308118065	828	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	65	1219	1079995	1089765	FALSE	15	GATTTATCGTCCTGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRFLSNFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQVLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPALRCRAAGEHGQPAAGLPGPEGGDRHCDAPAQPGAVRGWGEQGEHPGGRGQQPGQPVPHGPRLAPVAVTPCAAHPGM	1079930	1090443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1080033_1081309_1081528_1083490_1083676_1086058_1086263_1086347_1086543_1089450
817995	contig_9871_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_75657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGACCCTGTTTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402759	403316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_402800_403300
817996	contig_9871_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_75658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATATTTTACAGATAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403418	403864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_403400_403900
817997	contig_10734_pilon	+	748	6	Intergenic	novelGene_51293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	353.801865455794	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	16	555	1368595	1388902	FALSE	15	TCTCACCCACTGATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YARRGMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTESTRGRGREG	1368579	1389095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378259_1378362_1378533_1378631_1388870
817998	contig_14882_pilon	-	1938	5	Intergenic	novelGene_115031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.0499791840097	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTACCCAGAGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363656	319318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_320816_321327_321410_321539_321642_321721_321739_363416
818000	SIRV4	-	439	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1057	25	1057	-25	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAAGGTGGCGGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4101	3662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
818002	contig_12644_pilon	-	2157	9	Intergenic	novelGene_44565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_2	134.714512952391	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	496	1188	2024584	2001187	FALSE	20	ATGCTTTTTAAATGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSMDAGSPNLSPNPMSPAHNNLDLQPVTYCEPAFWCSISYYELNQRVGETFHASQPSMTVDGFTDPSNSERFCLGLLSNVNRNAAVELTRRHIGRGVRLYYIGGEVFAECLSDSAIFVQSPNCNQRYGWHPATVCKIPPGCNLKIFNNQEFAALLAQSVNQGFEAVYQLTRMCTIRMSFVKGWGAEYRRQTVTSTPCWIELHLNGPLQWLDKVLTQMGSPSIRCSSVS	2136904	2000217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2001311_2003805_2003951_2006804_2006943_2010317_2010531_2020634_2020686_2024562_2024638_2026769_2026903_2027062_2027257_2136789
818003	contig_6975_pilon	-	736	5	Intergenic	novelGene_74265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	386.113001594093	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	220	516	160757	159453	FALSE	20	CCACTGATGTTGATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGRTVVGSAARGKRLLFRHERTPWAPKPALLSPDRFFSPLNPIRVHIDIGADGRATGEADVEFVTHEDAVAAMSKDKNNMQHRYIELFLNSTPGGGSGMGGSGMGGYGRDGMDNQGGYGSVGRMGMGNNYSGGYGTPDGLGGYGRGGGGGGSGGYYGQGGMSGGGWRGMY	169935	159232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_159536_159679_159773_159846_159943_160732_160869_169827
818005	contig_7173_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_37553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704166	706359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_704200_706400
818007	contig_17781_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_163683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTGATGGTGTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417813	419886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_+_417800_419900
818011	contig_15029_pilon	+	1559	5	Intergenic	novelGene_128224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	48	junction_1	16.2941707368003	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	104	619	500567	517259	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELGGCVIPTGRRQTGVLRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLIDKPNLQFDTDAVRLFEELYEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDADRQDSINLFLGVFHPTEGKPHLWELPTDFYLHHKNTMGLLPTRRSYTYWWTPEVIKHLPLPYDEGRYTVALLVFTLPCFVIVPK	499758	518199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_499802_500506_500656_501630_501798_510824_510964_517138
818012	contig_11396_pilon	-	272	4	Intergenic	novelGene_71395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3956	junction_3	462.318072326834	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555161	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554413_1554470_1554871_1554944_1555079
818013	contig_17171_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_147366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCGATCACGGCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248787	247320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_247300_248800
818014	contig_7627_pilon	+	1594	3	Intergenic	novelGene_175562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.5	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGCTGTATCATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164390	177962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_164522_165042_165266_176722
818016	contig_4812_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_103699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315526	317346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_315500_317300
818018	contig_9011_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_159329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597186	597884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_597200_597900
818019	SIRV6	+	338	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	347	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1848
818020	contig_9571_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_136310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	25.8499946271217	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	856	1200	601982	602326	FALSE	25	TACTGTGCCAAACAGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVQAYVIHGGPVLYQVYPFRYWGYRGNTGAVNKWGTLWRSEVWLPTKRYCCAGPHSLSISAFLRPQMPSQNIACIPHLNRILASLPHATFTDGGWHFAHTSGSTRPEGIGLSP	592817	602524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_596578_596678_600426_600593_601528
818021	contig_10135_pilon	+	524	4	Intergenic	novelGene_106661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_2	1198.78197443164	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTCATTTACCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118746	120176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_118842_119162_119196_119619_119641_119801
818022	contig_4769_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_117989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGATTAACCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849052	848245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_848200_849100
818023	contig_1856_pilon	-	1275	2	Intergenic	novelGene_84884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_1	0	170	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	848	1267	259750	259331	FALSE	85	AAAAAGAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYIPALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSGKGKFHFPFPPPTTFDSTKPK	271583	259322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_260191_271176
818025	contig_15062_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_162311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGATAGTTTCATTTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333255	335238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_333300_335200
818027	SIRV4	-	177	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1346	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3812	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
818031	SIRV6	+	405	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	377	518	204	72	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818032	contig_7188_pilon	-	2001	15	Intergenic	novelGene_108528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	68.3560605974932	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	323	1867	121238	95694	FALSE	35	AACAGCTTTTGTAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NADYRLFHKTLKLCRFFANSLLHYTKKVTINVYDFLPLSSSKLPPSLYATTISKAQQEEIAGAFLVTLDPLITQLLTFQPFIQVVLDSQLDLPCELQFPQCLLLVAIMDKLPSQPEDVQVLWCTEGQLSEATARVSLLKAIFYSFEQCSGELSLPVRLQGVKTKGQAQVAVTLYQHVCVHLCTFIASAHPSLFPELDAALLNAVLSTKMITSLLAMDAWCFLARYGTAEICAHHVTIVAHLIKSCPGECYQLTNLSILLRRLFFFMAPPHQAEFIQKFSPKEAENLSLWQYISFQALSADLRKQTADEVTRTGTTQCREWLSSGRTLGELESLNTALSALLTVCNSAGEALDIGQQTEITEVGSQLWAFLNKQVTGQPYVQQTFSLLLPLLGFFIQTLDPQLISQVLTLQTSLLKLEPPDHACLAVLDFVSSLGKLFIPQAIQDKILPNLSCIFALLLADRNWLLEQHTLEAFTLFAEGTNHEEIVPQCLSSEETKNKVVSFLEKRTCMLFTWFCGLWQTGLIDETDAARVERVKQERGIFSEPFVKVTAEEARWSSLQPCAKRARHEPPLEEEYRAAVQTAAGALEAIELLLQKSPAPDWLLMKMEVLQGKIQKLKRCSL	132629	95559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_95883_96717_96880_97866_97948_98777_98883_103531_103646_107538_107635_108800_108921_110232_110419_116646_116737_118458_118511_118866_118950_119795_119983_121158_121289_121556_121750_132550
818033	contig_7078_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_130156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTATCAGACTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552918	554078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_552900_554100
818034	contig_11821_pilon	+	770	3	Intergenic	novelGene_176319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	79	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGAGTTTCAGTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7567	18099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11821_pilon_+_7600_7966_8279_17673
818035	contig_7272_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_25414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGAGATGTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872667	871718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_871700_872700
818040	contig_5910_pilon	-	170	1	Intergenic	novelGene_168423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAACAACAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152831	152661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_152700_152800
818041	contig_5145_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_131383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	145	498	612927	613280	NA	10	CCAGCCTGGGAGTCGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTQKEPVQAESPARTEPPRTELDAQEPRGGLQSPFEQTNWKELSRNEMIQSYLSRQSSLLSSSGAQTPGAHHFMSEYLRQEESAKRHGAHETHVLAPHSPPADLPGHTREITQDDLERIQAHQWPGVNGCYDTQGTWYDWTQCIALDPHGDDGRLNILPYVCLD	612782	614267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_612800_614300
818042	contig_7171_pilon	+	944	7	Intergenic	novelGene_101260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	63.046059000984	12	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	12	866	869817	876795	FALSE	10	GGATTGACCCTGTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVNGAPGASSSAASGAVLQAAAGMYEQLKGEWNRKSPNLSKCGEELGRLKLVLLELNFLPTTGTKLTKQQLILARDILEIGAQWSILRKDIPSFERYMAQLKCYYFDYKEQLPESAYMHQLLGLNLLFLLSQNRVAEFHTELERLPAKDIQTNVYIKHPVSLEQYLMEGSYNKVFLAKGNIPAESYTFFIDILLDTIRDEIAGCIEKAYEKILFTEAARILFFSTPKKMTDYAKKRGWVLGPNNHYSFASQQQKPEDTTIPSTELAKQVIEYARQLEMIV	869805	876873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_869979_871007_871081_871200_871304_872377_872544_873459_873561_875805_875918_876657
818043	contig_10546_pilon	+	781	5	Intergenic	novelGene_176321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	17.823790281531	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	89	781	382253	438955	FALSE	35	ATGAAGACTGGTGAGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGYNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEICEEKYPDILNFVDDLEHLDKASKVSVEMLEKNLKQMGRQLQQLEKDLETFPPPEDSHDKFVTKMSIFVISAKEQYEKLSKLHENMENLYQSIMEYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKRKEAEEKEKRARIAKELAEKERRERQQKKKRLLE	382164	438955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10546_pilon_+_382400_396399_396530_414169_414297_422783_422947_438829
818044	contig_12050_pilon	+	2637	6	Intergenic	novelGene_62590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.1788574998129	43	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1303	1818	129359	129874	FALSE	25	TGTTTTAAGAATCCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGRGISVRDFRWMDKSRGFISGPSGHVSTSKGSTVCFQLSCQRSCLDSRRFFRNWFSLPAGSGNFEKSIYKKNKDHDLTRQYPPPPPTPTHPEQSLLLRLGLCPPKTLAPSVTLSLESPSWAPSSDQLPPTTWLAPPAQLSTDPNVPTWQSHPPESTSLPSSPNLYTQQ	113535	130693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_113645_116303_116367_120268_120350_121849_121952_126886_127037_128561
818045	contig_10549_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_110582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCAGCTTAATGTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71419	72332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_71400_72300
818046	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818047	contig_6589_pilon	-	1387	6	Intergenic	novelGene_26228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	477	920	2057434	2053019	TRUE	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVVPLHLQAERGGEGQIFHFDGVDVHLLYEAGVSDQLLGVHHVHQRLLDGHILDARHVKAVHVLPPLDFVVLVLPVLDGCHVQRGSVWEDEAIRGLPLVTGVQHGVEHRLVEEAVAHPLADDDVHLLHWQLHFLHLPFDDGHHMV	2057910	2052415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2052828_2052963_2053028_2055073_2055215_2056134_2056224_2056308_2056425_2057345
818049	contig_19802_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_176325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	126	311	11820	12005	NA	45	TAGTGCAGATAAAATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSKVLRGRKICSRTVKDSLPCLSCHGGGGGNSEKAPLQGPGMQALPKSENGPRKLRPIPTPPTMSLVSISNSSLPLWQEQDGRVTPLDGIGRQGLLKAEGGA	11694	13203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19802_pilon_+_11700_13200
818051	contig_9951_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_176328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGTAGTATTTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203742	202964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9951_pilon_-_203000_203700
818055	contig_9727_pilon	+	1052	6	Intergenic	novelGene_86310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	160.403989975312	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	44	595	309192	314189	FALSE	60	AATAGAAACAAACACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSRGFRKVFGKRAMRLLTFVVLVLFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLSVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGFTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN	308422	314646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_308466_309191_309347_309988_310088_310904_311014_312912_312991_314078
818056	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818057	contig_16951_pilon	+	1297	6	Intergenic	novelGene_98650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_4	87.6296753388942	60	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	291	641	86293	91405	TRUE	20	CAATTTGCTTTGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDGANNNSYSTAISVCSAIRPTVLLYFLYTFGLRAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	85865	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_86165_86411_91172_91463_103952_104099_110476_110582_111169
818059	contig_3241_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_146427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATGATGATGTTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024383	1025911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_1024400_1025900
818060	contig_15070_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_164900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACACCATTCTTTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501999	501476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_501500_502000
818062	contig_5482_pilon	-	576	5	Intergenic	novelGene_144482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	483.7874016549	34	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTCAATCTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504978	492697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_492977_494097_494178_497265_497370_498101_498157_504920
818065	contig_11978_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_62853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTACTTATTCAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565690	567885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_565700_567900
818066	contig_5499_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_56979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATAATTAAACTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228312	227118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_227100_228300
818068	contig_9185_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_166912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATGCAATATGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495971	495265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_495300_496000
818069	contig_5350_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_99346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACTTGGCCACTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146244	144678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_144700_146200
818072	contig_6823_pilon	-	1046	7	Intergenic	novelGene_131211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	249.194480053008	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	69	971	227609	187659	FALSE	40	GAGCCTTTAATGAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSLFLFSVLLLLLVAEAAVAVKMASTSRLDALPRVTCPNHPDAILVEDYRAGDMICPECGLVVGDRVIDVGSEWRTFSNDKATKDPSRVGDSQNPLLSDGDLSTMIGKGTGAASFDEFGNSKYQNRRTMSSSDRAMMNAFKEITTMADRINLPRNIVDRTNNLFKQVYEQKSLKGRANDAIAFLEICAVSRISKKEIGRCFKLILKALETSVDLITTGDFMSRFCSNLCLPKQVQMAATHIARKAVELDLVPGRSPISVAAAAIYMASQASAEKRTQKEIGDIAGVADVTIRQSYRLIYPRAPDLFPTDFKFDTPVDKLPQL	227677	187583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_187793_189479_189770_191069_191144_191275_191423_193825_193960_221526_221634_227592
818073	contig_6710_pilon	-	404	2	Intergenic	novelGene_98252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	657821	653562	FALSE	5	CCTCCTTAGGCCTCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657821	653505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
818075	contig_5889_pilon	-	1523	12	Intergenic	novelGene_133672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGGGTTGAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323222	20412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_20522_84624_84708_128185_128282_138336_138466_139429_139487_140460_140553_168758_168918_196894_197032_201116_201207_255473_255588_273380_273603_322987
818076	contig_2710_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_161801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAATGCATTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109633	1110900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1109600_1110900
818078	contig_18391_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_174093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46494	44194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_44200_46500
818079	contig_14744_pilon	+	454	3	Intergenic	novelGene_66086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	1192.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	2	454	1382976	1384549	FALSE	20	CTCACTGGGCGCCACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLII	1382974	1384549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429
818081	contig_3627_pilon	+	1855	11	Intergenic	novelGene_78552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	60.5957919331037	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	377	757	703688	713217	TRUE	15	TTTTCCTCGTATGCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHVDDLFPFFLRHAKQIFPVLECKDDLRKISDLRIPPNWYPEARAIRRKIIFHSGPTNSGKTYHAIQKYLSAKSGVYCGPLKLLAHEIFEKSNTAGVPCDLVTGEERVTVEPDGKQAAHVACTVEMCSVTTPYEVAVIDEIQMIKDPARGWAWTRALLGLCAEEVHLCGESAAIDLVTELMYSTGEEVEVRNYNRLTPISVLDHALESLDNLRPGDCIVCFSKNDIYSVSRQIEIRGLESAVIYGSLPPGA	700355	720796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_700473_701597_701767_703597_703710_707156_707235_708348_708441_709420_709602_713209_713430_714898_714980_716412_716590_719359_719509_720317
818082	contig_3956_pilon	-	1476	5	Intergenic	novelGene_14727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.93190525885234	85	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	112	423	361228	356548	TRUE	0	GTTTTGGTCTCTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTATRQEVLGLYRRIFRLARKWQAASGQIEDTIKERQYILNEARTLFQKNKNISAQWTSGSVSSEDPGSQVTTRPMRVFRGGAVPHTEPVASHSHRSSQTQT	373843	350053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_351033_356473_356567_360724_360859_361069_361229_373732
818083	contig_11317_pilon	-	2788	2	Intergenic	novelGene_164082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_1	0	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	628	1002	114636	114262	FALSE	15	TCATTCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEAALPTPYVLHASALQCLEGIVVKDSGPPPYPASHTHMHIHFLAQAPPLVTFLHFDFPLPSPPAPTTRFMKRQKQGEDSPSALHPYSFPIYVASLLRCFFVEENGTFGEQVPLLCLLLALLQ	116270	112475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_115176_116182
818084	contig_1719_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_87387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCAGTGTCTGAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853341	852832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_852800_853300
818086	SIRV2	-	538	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1094	5	-69	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4801	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
818090	contig_2768_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_57500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTATTTTTCAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737515	734987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_735000_737500
818092	contig_6277_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_80415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTGGTACTGTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754083	754650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_754100_754600
818093	contig_6583_pilon	+	2123	2	Intergenic	novelGene_174588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGCTACAAAAACAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29651	32584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_+_31533_32342
818094	SIRV4	-	519	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	100	-2	100	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	362	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5058	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
818095	scaffold_4805_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_161045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGAAAAGAGCCTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915977	917050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_916000_917000
818096	contig_5765_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_141410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	248	334	847894	847980	NA	20	GGCCTGGCAATCTACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKSDGEREPRKAGTISFPLGIISPGPGRLPSEFHHKVSIRICLPSARLGNDSKFILYQVSASKSHITKYCQFSHWQIHPNLFMPWYSTFYIYKDFCCQWANIHYVTMSFT	847646	848198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_847600_848200
818097	contig_9713_pilon	-	1273	3	Intergenic	novelGene_170257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	6.5	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	7	471	554221	551178	FALSE	25	TACTTGATTGACAGCGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAMAKLRQKNPRAVRQAEEVRGLEQLHMDIAVNFSQGSLLSPHLRNVCAEAVDAIYTRQEDVRFWLEQGVDSSVFEALTKASEQVELPRCGQVGDRGKPCACRYDLSLAWYPCMLKYCHSRDRPTPYKCGIRSCQKSYSFDFYVPQRELCLWDEDL	554227	550375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_551444_552922_553104_554203
818099	contig_4857_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_48907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTAAAAGGGGGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508220	1509978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1508200_1510000
818100	contig_19957_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_57740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAATCCTCTCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364655	364094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_364100_364700
818101	contig_7527_pilon	-	1886	2	Intergenic	novelGene_139577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	95	622	116872	110732	FALSE	30	AAAAAATTTTTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFVLLSALRPQWYSRKIPDPANSTWAKKYPTMEEKTQLPVERLLTAGHTPEEPETLVINEVIHQVAPAFRHPHRLKWPERQQGVQGHCTSVEDIAPPRALTAETRQLGDLYKMLGGRVPDSKPGSQVSPLTVLPVDFLPTHEGYLPSNIDYLPSHEAAVPDPLEELEPQHISLSVFPSSSLHPLSFSCSEKLTLDQLKMGCGSLML	116966	109467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_111254_116866
818102	SIRV6	+	394	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	0	389	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818103	contig_9848_pilon	+	1390	7	Intergenic	novelGene_79972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCAGCTCCGGCTCCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98544	110526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_99385_104026_104150_104473_104539_104843_104912_105859_105911_107059_107192_110415
818106	contig_17144_pilon	-	743	8	Intergenic	novelGene_29160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_7	223.372115629539	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	243	728	162026	157620	FALSE	20	TTTCTTTCTGCCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERDRGRRAGPARVRSHHAESSVEGAEFGLLLQAARGFASQKPVQPSQEDDPPLSTLLKDYQNVPGIEKVDDVVKRLLSLEMANQKEKLKIKQEWLMNKIVANPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	164732	157604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875_162952_164215_164261_164648
818108	contig_14326_pilon	+	1512	10	Intergenic	novelGene_120695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	73.454109298524	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	107	1204	221889	245734	TRUE	10	CCTGGTCTGCCAGCTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVASGDGGKSAGVCVSGDSKCGRSYRFFPPGLATMSSTLAKIAEIEAEMARTQKNKATAHHLGLLKARLAKLRRELITPKGGGGGGPGEGFDVAKTGDARIGFVGFPSVGKSTLLSNLAGVYSEVAAYEFTTLTTVPGVIRYKGAKIQLLDLPGIIEGAKDGKGRGRQVIAVARTCNLILIVLDVLKPLGHKKIIENELEGFGIRLNSKSPNIGFKKKDKGGINLTATCPQSELDAETVKSILAEYKIHNADVTLRSDATADDLIDVVEGNRVYIPCIYVLNKIDQISIEELDIIYKVPHCVPISAHHRWNFDDLLEKIWDYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPDSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYFLLPFCLLGLITGLLYLVTLMVLLGCPLPG	221782	249132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_231908_231979_236605_236776_241172_241304_242428_242597_242864_242988_245640_245751_248840
818111	contig_12140_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_86526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATAAGACAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40806	42634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_+_40800_42600
818112	contig_1624_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_138375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACCATAATTTTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146337	147388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_146300_147400
818116	contig_1717_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_146123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCCCCAAAGTTCATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277814	278377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_277800_278400
818120	contig_14855_pilon	+	1579	7	Intergenic	novelGene_146042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	38.6584042896525	61	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	218	856	650839	654448	TRUE	10	CTGGTTGGTCATTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648622	655655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654023_654205_654340_654972_655455
818121	contig_10286_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_98434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCTGAACATTCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483860	485073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_483900_485100
818122	contig_20844_pilon	+	1311	6	Intergenic	novelGene_78587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	42.6314437944576	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	113	1147	185604	188634	FALSE	35	AACACCTCACCAGTGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSTADPPEDMKQDQDIQAVATSLLPLTEANLRMFQRAQDDLIPAVDRQFACPSCDHVWWRRVPQRKEVSRCRKCRKRYEPVPADKMWGLAEFHCPKCRHNFRGWAQMGSPSPCYGCGFPVYPTRILPPSWDRDTQRRSTHTHSCSAADCYNRREPHVPGTSCAHPKSRRQNHLPKVLHPSNLHISSGSTVATCLSQGGSPGRPGQPHPGGPEGGGGGRGRARGRDPCQVQMQTRHGLWILCVVIKYELKPRYKCPWGAVWVRATGRGMPGSHWQGPGKQIHTGGPLGHDQQSATKEVHPGQFGLLLTITLGDRWTDGHSLRGRISMAAFLREYAPPRNSAQ	185491	188798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_185625_186136_186176_186355_186506_187097_187202_187350_187506_188068
818123	SIRV4	-	372	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1146	3	1146	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
818124	contig_12402_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_133354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATACTTGCCTACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466533	467913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_466500_467900
818129	contig_5602_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_132997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTACTTTACTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86015	84961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_85000_86000
818131	contig_15354_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_65719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGTCTGGTGTCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230181	231419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_230200_231400
818132	contig_5988_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_15986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAAAAAAGAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664049	665501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_664000_665500
818133	contig_10082_pilon	-	1619	2	Intergenic	novelGene_63878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCACTTAAAGCACAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239873	234761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_234821_238313
818134	contig_6876_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_147030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCTAATACTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191146	192763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_191100_192800
818135	contig_4659_pilon	+	1274	3	Intergenic	novelGene_118258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	303	641	884590	890452	TRUE	90	AAATAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERRCLVWDAAKVQGRARRERKGQLRLYKRLLGLRPGRTLEHEDHCAGLEAENFPGLLHCSENQRGNLAPANQVFSKGEAALPYPPPPLSGSAKRQHLAEFSPAARAARTK	884287	904537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_884923_890446_890517_903968
818138	contig_6137_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_59141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940261	939510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_939500_940300
818139	contig_14744_pilon	+	573	5	Intergenic	novelGene_66084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5392.60611277145	5	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382973	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383030_1384484_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
818141	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818142	contig_537_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_167595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	747	10	756	548731	549477	NA	25	TCACTTATGATTCCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	548721	549663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_548700_549700
818143	contig_7521_pilon	+	1465	3	Intergenic	novelGene_160541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245550	383712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_246730_248014_248135_383546
818144	contig_10235_pilon	-	1352	7	Intergenic	novelGene_46267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.61876193118	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	187	1020	25335	19534	TRUE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDVNTLLPSLPPLPARCLLPFLALFLQTPLSFKR	27184	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14110_19353_19752_20850_21035_23722_23816_24175_24304_25124_25469_27131
818148	contig_12622_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_6061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAGATATTGAGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751805	1752152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1751800_1752200
818149	contig_15120_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_107989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	282.62735575705	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	75	392	116120	92198	FALSE	30	GAAGTCGTGTGAAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVAGNEVGQSLTRAGAVRRRWSAMELGELLYNKSEYIETASGNKVSRQSVLCGSQNIVLNGKGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV	116194	90908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_92296_99853_99957_115269_115339_116072
818150	contig_14807_pilon	-	415	2	Intergenic	novelGene_124658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	16	318	37635	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	37650	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485
818151	contig_8673_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_129917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265354	265738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_265400_265700
818152	contig_15219_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_40850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	81	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	246	539	71314	72008	FALSE	25	TAAAAGCCTGTACGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSSRWHHGRSAGRGARRGRGGGGGDGEGPGAGRRQAGGQWEVEVRSPWREHPLGTAGLRLGKAGKELERCQQQAVEVTEIMLNNFDKVLERDGKLADLEQRSDQLLDMSSAFSKTTKTLAQKKRCENVRCRIYLGLAVGGSLLIILIVLLAILLPQNSEGSSAPEAQGAGTASGPGD	66330	72238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_66522_71259_71398_71798
818153	contig_11417_pilon	+	1628	6	Intergenic	novelGene_103278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6.7705243519243	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	34	423	350502	354114	FALSE	15	ATTTTCTTAATGGTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSGAPEATVAMEASEDWLVKSLRLYGDFHAFDLSGATRVLEWIDDKGVFVAGYESLKKNEILHLILPLRLSVKENQGLFPERDFKVCHGGFSDKPVFDLKHVPETRLLVTSGRPGCSLQVWQIAEDSGKALLASVEVCL	350468	355319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_350543_351102_351171_351484_351574_352706_352796_353409_353475_354076
818155	contig_2209_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_141015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCTCTATATACTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180877	180271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_180300_180900
818157	contig_5643_pilon	+	1146	2	Intergenic	novelGene_39138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAATGGCAGCCGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649474	651581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_649530_650490
818158	contig_15029_pilon	+	1785	10	Intergenic	novelGene_128205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_6	30.1739811062854	285	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	516	1772	230413	233287	FALSE	5	TTAGTGGCTCTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPNFSLRLRVFNLNFWGIPYWSKHRVDRLQRLGDFLNFESFDLALLEEVWSEQDFESLKQKLLPTYPAAHYFRSGVFGSGLCVFSKHPIQELTQHVYTLNGYPYMIHHGDWFSGKAVGLLVLHLSGLVFNAYVTHLHAEYSRQKDIYLAHRVAQAWELAQFIHHTSKRADVVLLCGDLNLHPKDLGCRLLKEWTGLQDAYLETQDFKGCDEGCTMVPQNCYVNQQELEPYPFGIRIDYVLYKAVSGVCVSCKTLKTTTGHDPHSGTPLSDHEALMATLYVRHSPLQHSPSPTHGAAEMSPLITVLKEAWTELGLGMAQAHRWAAFASCVIGLGLLLLVLLCALVARGKTSEVTLLLLSPSVGLMLGAGAVYLFHVKEVKGLCRARAELLHMLRRARDAEDLGSVSQPAQQEDRAEEQ	229897	233300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_230463_230685_230783_230907_230985_231352_231447_231609_231700_231937_232021_232146_232280_232370_232476_232660_232815_232913
818159	contig_5018_pilon	-	1125	10	Intergenic	novelGene_47038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	218.234724692768	2	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	455	1048	1394992	1392342	FALSE	30	TATATATTCATGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397320	1392264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395012_1395148_1395205_1395340_1395450_1395757_1395852_1396391_1396439_1397191
818162	SIRV6	+	234	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10799_11014_11109_11205
818164	contig_17171_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_147357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACTGTAACATCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77005	76602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_76600_77000
818165	contig_17993_pilon	-	1592	7	Intergenic	novelGene_61933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAGCTCCTGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80303	67135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_67313_68440_68578_72501_72666_72886_73052_76161_76298_77878_78017_79628
818167	contig_19899_pilon	-	1978	7	Intergenic	novelGene_102531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	21.9424752984303	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	109	849	347197	199771	FALSE	35	AACTCTAGTCTTTGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLAAHVPPDLQTCATGAASPRGAREPGPRPPAVTAMGCFECCIKCLGGVPYASLVATILCFSGVALFCGCGHVALAGTVAILEQHFSTNASDHALLSEVIQLMQYVIYGIASFFFLYGIILLAEGFYTTSAVKELHGEFKTTACGRCISGMFVFLTYVLGVAWLGVFGFSAVPVFMFYNIWSTCEVIKSPQTNGTAGVEQICVDIRQYGIIPWNAFPGKICGSALENICNTNEFYMSYHLFIVACAGAGATVIALLIYMMATTYNYAVLKFKSREDCCTKF	347305	198641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_199852_200828_200895_201858_201933_203290_203463_207692_207850_210043_210231_347193
818168	contig_15047_pilon	+	1511	11	Intergenic	novelGene_52300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.733126291999	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	70	1410	139024	146390	FALSE	30	GTAAGAGCCATTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPELSKKFQSLLTCWREKVFALMVQLKAQELGHREYAEHLKGQVVELEGRVSAQSQEQAILQRSLQDKAAEVEVERVGAKALQGELSRALEAWRRQQQQTAVAEEQLKLVANSVCSSQIWLQNTVAKVEQAVIRLPSLSNRLSYAARKVHTIQGLVARKVALAQLRQESRPPPPSPPPPPLTTDVGVELQQLREERNRLDAELQLSAHLIQQEVGRAREQGEAERQQLSQVAQQLEQELQQTQESLASVGLQLEAARQGQQESTEEAASLRRELMQQQEIYGQALQEKVAEVETRLREQLSETERRLNEARREHAKAVVSLRQIQRKAAREKERNQELRQLQDEARREEGLRLTRRLQELERDKNLMLATLRQEGLLSRYKQQRLLAVLPSLLDKGRSVESSPKPPGSSAPSAPPAASSPAMAPSSRDPIKGSLSALLDDLQGLTEAIAKEEGLCQGDNQNSPVPVHS	138954	146491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_139087_139667_139779_139865_139973_142822_142936_143097_143144_143294_143450_143597_143787_143887_143990_145575_145728_145848_146039_146277
818170	contig_12128_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_131965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTATGAATTTGCTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128757	128393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_128400_128800
818172	contig_15196_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_176329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAACAAAGCTTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79668	78057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15196_pilon_-_78100_79700
818174	contig_7619_pilon	-	1691	8	Intergenic	novelGene_162161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	34.3915034594895	68	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	334	1116	418348	414985	FALSE	5	CAGCGTGTGTGGCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIRGKPIKSSCFYGTCCLQGMSYSIGFLRFCKQATLQFCIVKPAMAALTIVLQAFGKYHDGDFNIRSGYLYITLVYNVSVSLALYALCLFYFATRELLRPFEPVLKFLTIKAVIFLSFWQGMLLAILEKCEVIPEVQAIGVGAGTLAAGYQNFIICIEMLFASIALRYAFTCQVYSEKKENSPVSPAPMVSISSGLKETMSPQDIVQDAIHNFSPTYQQYTQQATQEVPGPGPHAGPMDGGRRSRGVEKTMLIPAEDL	419381	414409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_415212_416033_416223_416708_416879_417035_417128_417699_417776_418319_418411_419027_419194_419276
818175	SIRV4	-	211	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	12	-391	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGGTTTTTCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	4028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
818176	contig_8681_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_157196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAATGAAAAGATACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108283	106582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_106600_108300
818177	contig_14647_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_167380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141034	142915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_141000_142900
818178	contig_12503_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_143810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCTGTCCTTAAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33182	32478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_32500_33200
818179	contig_7376_pilon	-	1147	4	Intergenic	novelGene_108079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.07106781186548	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAACACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79836	74416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_74973_75162_75550_76910_76953_79674
818180	contig_10609_pilon	-	2413	13	Intergenic	novelGene_123913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAACGTCGCGGTGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310680	255779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_255835_287569_287651_288402_288549_290478_290642_294366_294550_295598_295720_299058_299177_300127_300203_300678_300773_305583_305661_305776_306022_307668_307814_309770
818183	contig_2358_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_156101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58523	56085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_56100_58500
818184	contig_11849_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_171754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTGCTCCTTGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143262	142907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_-_142900_143300
818185	contig_7157_pilon	+	2145	18	Intergenic	novelGene_131275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	368	709	692307	703679	TRUE	5	CCGCCGCTGCCTGTGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQVKCIAGKWGSDTFFCRHQKRIDILKTFKFRLVNLPHNVIIIWSELDRFISKLRIKVVQTKFPRNIWFKGRYHLLLLHHIPINISEEWVSLNISKSCLRMTTQSFFWILC	691939	779594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_692434_695923_696040_696554_696650_703675_703752_705216_705341_706316_706406_711450_711588_713511_713597_714266_714366_714769_714950_729483_729541_730544_730599_733937_734080_735396_735483_739465_739517_740934_741024_762004_762127_779545
818186	contig_10968_pilon	-	1085	6	Intergenic	novelGene_84302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	10.4422219857653	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	167	733	182951	181642	FALSE	15	TCTCCCGAGCCTCCGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSVPTALALGSAALGAAFATGLFLGRRYPPWQSRPEKRLLPPEDSPLWQYLLSRSMREHPALRNLRLLTLEQPQGDSMMTCEQAQLLANLARLIKAKKALDLGTFTGYSALALALALPPAGRVVTCEVDPGPPELGRPLWRQAEEEHKIDLQLQPALETLNELLAAGEAGTFDVAVVDADKENCAAYYERCLQLLRPGGVLAIPSVREEAGEKGPSPGWIPVVSLGPSLRPSSLSQSPPCTFL	183305	181289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_181893_182219_182275_182350_182470_182559_182666_182915_183044_183231
818187	contig_14450_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_48996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	549	863	1076188	1076502	NA	60	TGGAGAAAGCATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDGLQLPVSPLLTKDTCCTPAAGYSSVGNTLFSTGGVLPLLQRSSSHQGARAPNELKSQPSRMSQVGASPRWCRGGVCCLTPSRHQRYIISRKLRCSRVLTTS	1075639	1077971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1075600_1078000
818189	contig_5084_pilon	-	1037	3	Intergenic	novelGene_64611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	116.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	332	727	1028859	1026095	FALSE	10	AATGGTTGCTCTTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKGAGCMRPGDGATSGASSPTGPVAPSLRERPREPWPHTEPLRRKKERNSLGKEKDAEVGPTMVGDEHSDPELMQHLGASKRSVLGNNFCEYYVNDPPRIVLDKLERRGFRVLSMTGVGQTLVWCLHKE	1029190	1025784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1026219_1027388_1027484_1028682
818192	contig_6412_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_149981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCTCTCAATCCATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610614	610122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_610100_610600
818193	contig_10494_pilon	+	2020	12	Intergenic	novelGene_102133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	29.4427585843761	2	98	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	168	1103	361794	396418	TRUE	60	TGTTTATAACAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAKLQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRCVVPQTTVILNNDRQNAIVAKMDDPLSNRAPDSLENIISNAVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHNEDGESGSEASDSVSNCGQSGSQNIGNNVTLITLNSEEDYPNGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYGIRLCSYGVCSFRSPLL	344565	438500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_344646_361706_361861_366496_366589_369323_369524_379614_379732_381404_381581_393361_393602_396374_396571_403615_403747_405679_405752_437754_437930_438113
818194	SIRV6	+	441	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-79	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2393	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2833_3106_3165_10724
818196	contig_20819_pilon	-	418	5	Intergenic	novelGene_55686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_1	655.817953017451	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	36	416	70235	65653	FALSE	10	GTAAGTGGGGTGGGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFW	70270	65650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65743_65860_65963_66048_66136_69625_69725_70232
818197	contig_14322_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_115636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320182	321575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_320200_321600
818202	contig_1594_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_138807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATCCAAATCGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422955	421209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_421200_423000
818204	contig_11175_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_61181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGGGTAGTGATACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302758	302408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_-_302400_302800
818206	contig_5236_pilon	-	2117	7	Intergenic	novelGene_100926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.58022301426107	44	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	462	1187	926345	919844	FALSE	10	TAAGGGTGTTGCCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGHKAEPLHLCHRLDKETTGVMVLAWEKEVAHRVQQLFKTRQVAKKYWAVTVHVPVPSAGVVDIPIMEKEVQGQQQHRKMTLSPSYRMDNGKMVKVRSSRNAHIAVTQYRVLSSTLSSALLELQPVTGVKHQLRVHLSFGLDCPVLGDHKYSDWNRLAPQKLSAGTLKKLGLPQSKARHIPLHLHARQLILPALGPGKEDLSLVCKLPHFFVRSLSRLGLEMPSQDHTGGDEAGHLGAQ	928353	918913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_920084_920608_920707_921282_921428_921502_921597_926196_926399_927647_927814_928111
818207	contig_10734_pilon	-	1869	1	Intergenic	novelGene_51263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTGCTTTTTCTCTTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296326	1294457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1294500_1296300
818208	contig_11413_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_103186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGATGTTATCTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504841	504036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_504000_504800
818210	SIRV6	+	406	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	343	551	170	39	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818212	contig_14133_pilon	+	1334	5	Intergenic	novelGene_119904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	5.85234995535981	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	78	623	114968	117237	FALSE	15	ACCCTGCCTAGCTCACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLSLTLLAFEGLNTAAAKDRCLACMEEAFFSPLWAPLLALYRSVHRAREVALSRSMELYRNMAATALGVPTKLLPQDPEAQGAGAYPYHAAVQELGLLVLESCPQKKLECIVRALRVICACAEDCCRAQETSAPPGAAAIGADDLLPILSFVVLRSGLPQLVSECAALEEFVHEGYLIGEEGYCLTSLQSALSYVELLPRGALGK	114890	117948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_115021_115297_115507_115939_116025_116678_116784_117143
818213	contig_8636_pilon	-	792	3	Intergenic	novelGene_141923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	131	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTCAGTCACCTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391971	384318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_384992_391414_391439_391876
818214	contig_16125_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_155219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGCTGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109447	108605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_108600_109400
818216	contig_6344_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_157108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076764	1078688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1076800_1078700
818217	contig_16532_pilon	-	2367	1	Intergenic	novelGene_110048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAAGCCAGTATTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198587	196220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_196200_198600
818218	contig_13828_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_158297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATGTATACTTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431274	432302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_431300_432300
818220	contig_4857_pilon	+	1028	3	Intergenic	novelGene_48702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	399	junction_1	19.5	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	394	849	1157592	1161886	FALSE	75	CTTAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQSTSANHLSSFRCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPRGTGYIKTELISVSEV	1157198	1162065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1157782_1160368_1160555_1161806
818221	contig_8122_pilon	+	999	4	Intergenic	novelGene_40193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATCATTCCAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90550	98185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_90625_94324_94961_95625_95696_97966
818224	SIRV4	-	212	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1306	3	1306	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
818226	contig_3825_pilon	+	791	6	Intergenic	novelGene_77945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1433.8517357105	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2	550	12984	14892	TRUE	20	AGCCAGTGTCCATTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVLLNDSFWSECTLQLRLFSSWSSSYRPCVVRWGFLTASSRGRPDWDVSSTGRPAPL	12982	15650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14166_14723_14912_15231_15302_15498
818231	contig_15114_pilon	-	1278	8	Intergenic	novelGene_121153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	267.136898329264	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	103	840	154964	141206	FALSE	40	ATTAAACAATTTCTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSQNASAIRPLNLYPWVYISLVFGASLALPDKACTFKVALQNFQTIFSWELKNHSIVPTHYTLWYTIMSKYEDMKIVEDCTNITRLFCDLTGLWDNMPETYIPRVVGFKGNTVLVSCIDSVFLPMNMTLEPPDFEIVGSADHINVIVKFPSRAPKTIDVERLQHHFYLIIEQRSEEMVKKHKPRINGNITGDFIYVMDKLIPNTNYCVSIYFEPKNLGTITKSPLKCALLPGQEPEASERSTA	179454	140767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_141232_141879_142046_147669_147831_150654_150828_152061_152177_153332_153375_154909_155006_179393
818233	contig_3193_pilon	-	887	4	Intergenic	novelGene_126305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	37.2588542795162	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	90	620	61072	46895	FALSE	30	ATATGAGTCTCCTCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGQGLPEGKQAHQEPTDRAPAPSSRVPGMAARAKDSHGGTRGQEGDSVSMTSGEGTRRLPGGPGDPRWPGRAEPLWRSAPPSERGVDVASDVVSTCCVTCPHPAKTGHLQEESLLRHVLWGGGQRGGCRRHERLQHLSGPVNAEAATVVTTQNMPRPRPLSQGVCRWTVAHAQTCVQRQGTRAKEESSSLCVVLPWPGDPDHCP	62989	46627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_47329_50395_50448_61027_61108_62935
818234	contig_5145_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_131380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGCATTAGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548668	550713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_548700_550700
818237	contig_14679_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_174179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTCATCTTGGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52909	54798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_52900_54800
818238	contig_19957_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_57692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCTTGGTTGGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105020	102709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_102700_105000
818240	contig_10324_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_7728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACAGGAACTTCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52333	52693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_52300_52700
818242	contig_6958_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_69908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACATGAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44859	46636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_44900_46600
818243	contig_8330_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_71774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	524	934	683544	683134	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNKDDECFGDDIEEIPDTDFDFEGNLALFDKAAVFEEIDTYERRSGTRSRGIPNEKPTRYRHDENILESEPIVYRRITVPHNVSKEFCTGELHQVPRPTGYSSFSIMFETQRARFWQSFVPGIKWLGDWPIIIAF	684067	682255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_682300_684100
818244	SIRV6	+	369	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	504	0	338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818245	contig_8273_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_113086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTACTGCCTACATCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136838	137923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_136800_137900
818247	contig_8587_pilon	-	1493	1	Intergenic	novelGene_159126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	518	916	307835	307437	NA	20	GAGATTCCACTGGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNRLNSNGFVFFSVWCLETLPTKVLCFQDSVSRAGDKERVTASHLLASLPRPRLTEDSYGCWDVRETPWPDFTRQLGKVSLCETQGCDSDRLAPICITYKDKEPPQPEGTRRASLSKTTTRPGRMYRCRH	308352	306859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_306900_308400
818248	contig_18869_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_56074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
818250	contig_4496_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_66673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCTCAAAATAGTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865322	864447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_864400_865300
818251	contig_13780_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_149105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCAACCACCTATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809981	810918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_810000_810900
818257	contig_5482_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_144441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	43	903	256887	258995	FALSE	35	TAAAGCTAGTGCTTGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTDCPSSHPPIRVMQWNILAQALGEGKDNFVQCPVEALKWEERKCLILEEILAYRPDILCLQEVDHYFDTFQPLLSRLGYQGTFFPKPWSPCLDVEHNNGPDGCALFFLQSRFKLVNSANIRLTAMTLKTNQVAIAQILECKESGRQFCVAVTHLKARTGWERFRSAQGCDLLQNLQNITQGAKIPLIICGDFNAEPTEDVYKHFASSSLNLNSAYKLLSADGQSEPPYTTWKIRTSGECRHTLDYIWYSKQALSVRSALDLLTEEQIGPNRLPSFNYPSDHLSLVCDFSFNEDPEGVL	256844	260127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_256912_258159
818258	contig_12090_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_80505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAGAAACATCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266966	265963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_266000_267000
818259	contig_13699_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_158308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19260	17686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_17700_19300
818260	contig_5316_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_61244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGATCCCCTCCTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465131	464024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_464000_465100
818261	contig_13565_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_162392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTATGGCCTTCCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191823	193464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_191800_193500
818264	contig_2069_pilon	+	1009	4	Intergenic	novelGene_23171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	4.49691252107735	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGAATGGATTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25655	40235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_25815_30383_30474_38245_38370_39599
818265	contig_9668_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_58251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTTAGGAGATCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604654	605301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_604700_605300
818266	SIRV5	-	358	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCTTCTTTTTATATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11007	8375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10863
818267	contig_5302_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_81467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270607	268942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_268900_270600
818269	contig_6097_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_174441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTATATAGAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151575	153906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_+_151600_153900
818272	contig_16103_pilon	+	1314	4	Intergenic	novelGene_118731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_3	128.848748538742	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	298	819	296045	300704	FALSE	30	ACGTGTTGAATTGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSAPKVVLKSTTKMSLNERFTNMLKNKQPMPVTIRASMQQQQQLASARNRRLAQQMESRPSVQAALKLKQKSLKQRLGKSNIQARLGRPIGALARGAIGGRGLPIIQRGLPRGGLRGGRATRTLLRGGMSLRGQCCVPAYLIVVKPYPPSLFTWAASGHICFTSLSLNLY	294833	301199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_295114_296027_296110_297637_297792_300401
818273	contig_6424_pilon	-	1715	5	Intergenic	novelGene_109271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	15.833114033569	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	94	576	97897	95636	TRUE	10	GACAGTGCCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGNINELPENILLELFIHVPARQLLLHCRLVCSLWRDLIDLVTLWKRKCLREGFITEDWDQPVADWKIFYFLRSLHRNLLHNPCAEEGFEFWSLDVNGGDEWKVEDLSGDQKKEFPNSQVRCQAGLWVQVPAVRSAPVVSAHASGDLPAGPGNDPAEE	98971	93535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_94659_95619_95756_96133_96232_97632_97931_98911
818275	contig_5643_pilon	-	1296	3	Intergenic	novelGene_39178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	69	326	784100	782598	FALSE	75	AAATAAGTAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVSQWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTILSTNFQL	784168	781627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_782625_783328_783558_784098
818276	contig_18342_pilon	+	474	4	Intergenic	novelGene_154555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	210.254343329428	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGAGTACTGAGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26151	60755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_54740_54798_56452_56612_60655
818277	contig_4305_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_136671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1629	junction_1	0	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	80	346	514497	514231	TRUE	50	AAAAAAAACCTTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSPQLPRRGLFQGAFFRDSHTRSPEMEPFASPHFPRPPHPVAYALPNLPRCGEKPCAPGIGPESPYSGPQPLPPTDTQPVACTDHRLSGSPRRPEAQHPSDGSSGPQSLHLLI	514576	512818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934
818278	contig_14023_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_165376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTCCTTTCTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232963	230748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_230700_233000
818280	contig_15551_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_176333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGTGAATTTTACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142338	141147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15551_pilon_-_141100_142300
818287	contig_5643_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_38949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	233	702	176	877	464385	465086	NA	30	TCTTATTAACCTGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPVSSRQGVCACASVCVCVCVAGLEGAGGSYGKKIKVYVGPQTVTVVGLCPLPLLNLTPHPIPRGPGEESRNLKGWESVWLYVVILVSSLSWSLFVSLLISCSVHVSCLSEFLHFSPSASTFLYCSEFCVFVGSVKCSCCFNEFLWVFPCLPPSFSSSLETSVCFLGNLSFSLCSPMSFHPLASSFAFTPVSRTCSGDLSVLQLEGSLQIKKQTQTCCRQVDSDSQRPYRTK	464209	466293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_464200_466300
818288	contig_11855_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_67015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	570	1	570	1592169	1592738	NA	15	CAATGGCCGGGCCCCGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQDRKLDVVVRFNGSTEALDKLDADAVSPTVSQLSAVFEKADLRTGLHRGPGPPRAAAAGAPQVNSKLVSKRSRVFQPPPPPPAPSGDAPAEKERGPGGQQPPQHRVAPARPPPKPREVHKIKPVEVEESGESEAEAAPGEVIQAEVTVHAALENGSIVATAASPAPEEQKVQAAPEEEEAAAAVTDKGV	1592168	1592740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1592200_1592700
818289	contig_3077_pilon	-	1798	2	Intergenic	novelGene_26831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTCGCACTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507077	505113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_506598_506763
818292	SIRV4	-	366	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1147	8	1147	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4011	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
818293	contig_17060_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_176337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	326	667	2534	2193	NA	30	GAGATAGCCCACAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSSLHSKLLNFPRSESQTCSSDPTTISFFLEKKAFQNFILILFVSLSLTTHTYTHTHTHTHAHTHTHPTQDSHLISCSVKLVKPDGQVKPYWTFSELPKMQFQMLQPNTPE	2859	1820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17060_pilon_-_1800_2900
818294	SIRV6	+	463	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4039	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
818295	contig_3163_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_168064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACCACCTGCTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179494	178665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_178700_179500
818297	contig_6494_pilon	-	580	6	Intergenic	novelGene_108552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1003.29836040931	584	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	28	579	8286	2104	FALSE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHRSPWQLDLEFGCCSVKTFNKIFLKD	8313	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_3357_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
818298	contig_9415_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_109911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGATAACATGATCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2121925	2121154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2121200_2121900
818302	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818304	contig_4315_pilon	+	859	2	Intergenic	novelGene_46841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTCTCTCTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575439	580878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575594_580173
818306	contig_3181_pilon	-	1152	10	Intergenic	novelGene_136938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	86.385441160212	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	131	1003	319557	310415	FALSE	40	TACAGAATACATTGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFYYKHDQEGLLSMANAGPNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGMGVARILENVEVKGENPAKLCVIAECGELKEGEDWGIFPKDGSGDSHPDFPEDADIDLKDVDKILLITEDLKNIGNTFFKSQNWEMAIKKYAKVLRYMEGSKAVTEKADSSKLQPVALSCVLNIAACKLKMSDWQGAIDSCVEALEIDPSNTKALYRRAQGWQGLKEYDQALADLKKAQEIAPEDKAIQAELLKVKQKIKAQKDKEKAAYAKMFA	322452	310265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_310504_311292_311336_311428_311516_313189_313332_315990_316098_316236_316360_317405_317595_319464_319572_320966_320999_322368
818307	contig_4732_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_75491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAATAAAGTATTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756875	757721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_756900_757700
818311	contig_11846_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_106025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACACAGATGGCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591016	589959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_590000_591000
818312	contig_5315_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_175354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTATTTTACATTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232569	234072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_232600_234100
818313	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818314	contig_15449_pilon	-	896	4	Intergenic	novelGene_33660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	177.400363271581	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	129	593	195171	191270	FALSE	15	GAGATGTGGCAGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRPWSRGAVEPGLPSLSFSRSNLWSGWWRYQSSYWRAVRACMGCPIRRGALLLLSCYFYFCFPNMADLPLTWTLALLGLLQAMNILLSLQGLTPAEISAICEKRNLNVAHGLAWSYYIGYLRLILPESAEGSSFSLSQEILRHLRQEEREEVTVGSVGTSVVPSPSSPSTSSLSQEPKLLISGMEQPLPLRTDVF	196160	190966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_191479_194660_194770_195024_195209_196069
818315	contig_10431_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_117393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGCCCTGGTGGCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46484	47398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_46500_47400
818318	SIRV6	+	182	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	540	61	540	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10777	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818319	SIRV5	+	356	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-26	875	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
818320	contig_1735_pilon	+	1580	8	Intergenic	novelGene_106893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	691.736501679001	1	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	925	1473	132409	137764	TRUE	35	AGCATTCCCATCCCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETIPAMSIAMPLASAEPQSRLSQSLVMTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	127161	139715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_127633_131561_131841_132234_132494_134152_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
818321	contig_1276_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_159764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTATTACTTGCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147054	139820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_139886_146570
818322	contig_15882_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_144809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAATCAGACTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81014	79046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_79000_81000
818326	SIRV6	+	427	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	379	50	206	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCAGTTGCTAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509	2490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
818327	contig_15456_pilon	-	1114	6	Intergenic	novelGene_139493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	55.5697759577992	447	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATTGTGGCTTCAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131371	101998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_102318_115593_115703_126116_126234_127751_127844_128943_129193_131143
818328	SIRV6	+	440	5	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	12	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAGAAAGTAAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	10808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3152_7792_7924_10724
818331	contig_14142_pilon	+	1864	6	Intergenic	novelGene_120498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	9.2	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	220	444	308653	309174	TRUE	60	AATAAAGTACTATTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LADYENLLDQVKISEEALRADGFGDNPFFHCVVAEILPPHSEPQEPRVVGYGLYYFIYSTWKGRSVYLEDVYVMPEYRSQGIGSKIIKKVTEVALDKGCSQLRLSVLDWNKRAMNLYKALGAQDLTEAEGWHNFCFRGEAMREFAGN	308200	311741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308250_308382_308467_308566_308669_308814_308856_309006_310041_311187
818333	contig_15206_pilon	+	1566	2	Intergenic	novelGene_175720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAAGGGCTGGTGTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12051	13823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15206_pilon_+_12315_12520
818334	contig_3077_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_26859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAATTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126139	1126696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1126100_1126700
818335	contig_9239_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_137203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250989	248654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_248700_251000
818336	contig_6589_pilon	+	896	6	Intergenic	novelGene_26082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	73.6603013841241	518	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	42	608	1865997	1874896	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRGL	1865955	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1874884
818337	contig_14838_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_151918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCCACCTCGCCCCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112349	112892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_112300_112900
818339	contig_10042_pilon	-	905	8	Intergenic	novelGene_79163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_7	59.4340656800905	248	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	13	780	743386	714681	FALSE	30	TATAAATATGTCATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARLAWGGAAAAARLRRRFRHIMRSPHIIKKQPLHHFVQRPLFLLPTTLCTTVRNMFIQTQDTPNPNSLKFVPGKPVLETRTMDFPTPASAFRSPLARQLFRIEGVKSVFFGPDFITVTKESEELDWNLLKPDIYATIMDFFASGLPLVTEETSSGEAGSEEDDEVVAMIKELLDTRIRPTVQEDGGDVIFKGFEDGIVQLKLQGSCTSCPSSIITLKNGIQNMLQFYIPEVEGVEQVMDDESEEKEANSP	743398	714555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_714726_716942_717118_721699_721761_725762_725878_729321_729389_737192_737329_741097_741202_743321
818341	contig_11552_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_171667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAGTACTTACAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62167	62792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_62200_62800
818342	contig_8045_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_35341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACATTCCATTCAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107243	106785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_106800_107200
818344	contig_7919_pilon	+	1676	4	Intergenic	novelGene_28036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	2.44948974278318	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATGGCCCATCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173708	178425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_173879_174017_174082_174201_174260_177041
818347	contig_12157_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_135906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATAAATACACCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156325	155385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_155400_156300
818348	contig_12157_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_135905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAATACACATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155032	153986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_154000_155000
818350	contig_4659_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_118214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGGGTCAAAGAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567381	567825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_567400_567800
818352	contig_7056_pilon	+	1881	18	Intergenic	novelGene_43590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	211.458029570637	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1806	76	1881	661004	718396	FALSE	25	AGGACCACCCTGACCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLCCRKSGGALLILDLGGLAAKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKVPPLPQLRPHFLQHMLQQRAGPPILPQASAGVRQLPHSAPAALLLHRLL	660753	718396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_660815_660989_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858_716941_718253
818356	contig_8671_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_126271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAGTTTTTAGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540910	540530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_540500_540900
818357	contig_16766_pilon	-	666	6	Intergenic	novelGene_153348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	295.665351368739	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	312	539	108586	98812	TRUE	40	ATAAAATTGCTACTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFYSEDRDDSLRIAGQVHAVQALVQLFLERERAAQLAESKTDELIKDAPTTQHDKSGEWQETSGEIQWVSTEKTDGTEEKEKKEEEDEELDLNKALQHAGKHMEDCIVASYTALLLGCLCQESPINVTTVREYLPEGDFSIMTEMLKKFLSFMNLTCAVGTTGQKSISRVIEYLEHC	116832	96540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_96648_98791_98878_99170_99267_108520_108610_111647_111856_116752
818358	contig_6710_pilon	+	519	2	Intergenic	novelGene_97893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCACAGTGACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653407	657522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653874_657469
818360	contig_2455_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_119236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAGAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1477399	1477821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1477400_1477800
818361	contig_12090_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_80509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	942	1403	298188	298649	NA	30	ACACCCAGCAATGTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLWWRGCGDIGQTWVWGDDLSQKGGQEPWVIVQPPKPKLPASHFPHSRSLFLARSQRDPLETEITSAANLPQAPCLSPSKSQGYLQAPFLTRPPLLDRSLQHTGSCSCSGEDQPFPCLWPLPWLYPLPGIIPSLPKPRYRWPFSESFSGHPA	297246	299165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_297200_299200
818362	contig_6497_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_35644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATGAAAAATACTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760228	761584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_760200_761600
818363	contig_8676_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_142198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212785	210683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_210700_212800
818364	SIRV4	-	367	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1156	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
818367	contig_4364_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_4590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2103524	2104227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2103500_2104200
818368	contig_1008_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_121624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCCCTGTAATGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136666	1137767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1136700_1137800
818369	contig_1008_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_121625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138173	1138712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1138200_1138700
818371	contig_6488_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_44719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTGCTTAGGATCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34376	36321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_34400_36300
818372	contig_12923_pilon	-	1718	17	Intergenic	novelGene_30150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.904191659716	1	92	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	505	1269	231778	229467	TRUE	0	CCCGTTTCTTGCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSERRGLARGSPVEWGPRLLLLLLLAGCSGRIHRLTLTGEKRADIQLNSFGFYTNGTLEVDLSLLQLGPQKTEEKTPLVGFSLTRVRSGSVLSYSPQEPYDCPLQKNSSNLLVLFLINTKDLQVQVRKYGDQKKLFIFPGLLPEVPSNPGPPKPGPSATPKVDSVAPSMINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVMIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVW	236111	225504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225659_226180_226310_226394_226479_228671_228722_229434_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
818374	contig_5217_pilon	-	478	5	Intergenic	novelGene_135785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_4	2581.82671523478	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	13	477	560372	558352	FALSE	35	CAAAAATCAGCAGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKN	560384	558350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
818376	contig_6831_pilon	+	779	3	Intergenic	novelGene_165144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_2	0.5	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	233	328	52881	52976	FALSE	45	TAGAAAAGGAGGCAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILQRRAIRSWLQYLTDLEEEVRKLYVHFLQKKIFRAWLTVVREAKIASQSKYKTVAEHSDRRIFRTTFQTWKQSARCMKEERLKEERRAQLRRKVAEILPDFQTLAPP	48433	53427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_+_48471_48993_49140_52831
818377	contig_2550_pilon	-	2255	2	Intergenic	novelGene_135655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAGAGACAGAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077047	999085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_999207_1074913
818378	contig_17796_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_33821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1476	1823	60252	60599	NA	60	GGAAAACATAAGGAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIQRDSRAGSGEPRPSRDCVVCAQKKAPKLRPGLTKQIPLLDHLRCTGLSPHYQHLPQVVAVVPEEGTGAQPVAGDTQCEGKLWMGTEELFLVTPQIIREGWAQRSVAGMSQRS	58776	61022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_58800_61000
818380	contig_14575_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_101907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAACAAAACAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98934	97449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_97400_98900
818381	SIRV7	-	402	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	-32	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70989_78816_78964_114680
818382	contig_12299_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_29723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCAGTATTTCTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55629	53295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_54988_55123
818384	contig_8357_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_39684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGTATACTAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159456	160906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_159500_160900
818386	contig_9185_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_166913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAAAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501046	498642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_498600_501000
818387	SIRV5	+	352	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	167	149	53	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8368	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
818388	contig_18081_pilon	-	1180	5	Intergenic	novelGene_23801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_4	58.2859331228385	367	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	43	573	205697	134303	FALSE	20	TTGCAGAAGGATTTCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLPRERPAGWGRAMSHGAGLVRTTCSSSSNAPGPWAGTGQSSASPSEGMLDPDYPCTRTALLKVAQMVALLIAFTCVRTAVWTDYSAYSFFEVVTICDLIMILAFYLVHLFRLYRVLTCINWSLSELLHYLIGTLLLLIASIVAASKSYNVGGLMAGAIFGFVATTLCLMNIWLSYKISCVTQSTDAAV	205739	133695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_134317_137089_137172_140916_141016_146060_146235_205535
818392	contig_960_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_108233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAGAAACATTAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439925	439268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_439300_439900
818393	contig_14665_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_171055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1099	1554	99383	99838	NA	55	AAAAAAAACCAAATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILKKDEVFLGLFKKCYTESARCSLEILWGSSLSYRVAVSWNRLSGNGFGFVCVPSIRVGVPGWRKQLSDGLPAERLAVQTPPRGTSGDRLVIFFQKITALKTLWSSCTLHTWGHHKSESTCMATNHNKASDQWSLQLNRLPSETATTGS	98284	99970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_98300_1e+05
818394	contig_6458_pilon	+	1746	8	Intergenic	novelGene_163736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	418.132583211183	359	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	106	1311	33542	61473	FALSE	25	TTAGTGGTCTTGTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLDLSGKLIIKAQLGEDIRRIPIHNEDITYDELVLMMQRVFRGKLLSNDEVTIKYKDEDGDLITIFDSSDLSFAIQCSRILKLTLFVNGQPRPLESSQVKYLRRELIELRNKVNRLLDSLEPPGEPGPATSIPENDTVDGREEKPAASDSSGKQSTQVMAASMSAFDPLKNQDEVNKNVMSAFGLTDDQVSGPPSASAEDRSGTPDSIASSSSAAHPPGVQPQQPPYTGAQTQAGQIEGQLYQQYQQQAGYGAQQPQAPPQPPQQYGIQYSASYSQQTGPQQPQQFQGYGQQPTSQAPAPAFSGQPQQLPAQPPQQYQASSYPPQTYTTQTPQPANYTVAPSSQPGMAPSQPGAYQARPGFTPPPGSTMTPPPSGPNPYARNRPPFGQGYTQPGPGYR	29757	61908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_+_29820_33498_33726_36964_37049_42665_42813_51160_51329_54195_54337_57297_57397_61090
818395	contig_9582_pilon	-	973	5	Intergenic	novelGene_106859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.8015030930605	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	347	652	815278	813917	FALSE	30	CACACGTACGATTCAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDRR	817516	813595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_813924_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240
818396	contig_9437_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_141712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	264	623	96219	96578	NA	75	ATTTGAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPVKKPRLSKPKLQRFSGRSAPSPRVYAVFPASSERTLLLHWLVLHRCSNSAGPSSPANLVFPQCSRAQWMAPLEAWLHTPETWMEFTEMFHSNEITKDKISEADPNLGRSMIFTKA	95955	96695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_96000_96700
818397	contig_15047_pilon	-	1305	6	Intergenic	novelGene_52288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	14.0513344562002	154	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	251	808	84499	82103	TRUE	30	AATTTGTCTGTGTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRTQRWRLKSLRSSAFRAPILDSTVFVITSRWSPRRSVQPRFIAEGYIDGKLFLHYDSEKDRAEPQGPWGEANLGAETWDLETMDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPAFMRKPRKRSMSQVHGMASEPPA	96191	79350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82051_82174_82700_82842_82958_83229_84423_84686_96127
818398	contig_15070_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_164888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATGTACCTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349472	348347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_348300_349500
818399	contig_8576_pilon	-	2483	6	Intergenic	novelGene_88751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCTCTGGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715291	699188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_700885_707554_707590_710385_710524_711468_711587_713468_713552_714878
818400	contig_12761_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_164052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTCCCGTTGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217074	215865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_215900_217100
818401	contig_11855_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_66981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTCATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099821	1100740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1099800_1100700
818402	contig_7171_pilon	+	963	6	Intergenic	novelGene_101249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	382.993785850371	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	276	497	760687	764486	FALSE	30	AAGGGCTTTTCCTGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	755741	764952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
818404	contig_9029_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_155140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATACCCAGCTTAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911796	909866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_909900_911800
818405	contig_5217_pilon	-	1981	13	Intergenic	novelGene_135791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	24.8208861422974	37	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	496	1818	649005	610018	FALSE	5	TTTGTAGTTCTCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSIKEQAAISRLLSFLQDWDNSGKVARSHILNSFIETNQGKTAPELEQEFSQGASLFLYFRKEQLVIKISSQKSRTSSTSCLPHRNRYLIEFLEVGGVLTLLEILGLEKIKEEHKKESIKLLQLIANSGRKYKELICESYGVRSIAEFLAKSKSEETQEEVQVLLDALVHGNPKYQNQVYKGLIALLPCASPKAQQLSLQTLRTAQSIIGTTHPSIVDCVLKVLRTMHLEVQYEAIELIKDLVNYDVRKTLLQGLVALLIPSVKETSKLQPKILNDSSVLHLTAHLPVFLQQAAAAKAIGVLARSNLSIAEELLHLRVVHSLMAAMGNTDHSNSQRLASLTLEYFVQMFPVVEEHVRRSMGEELYNLFTSNAEDLYMKMDSIQADILAANKVNVTKALHDSGVYTNMSFYLGPSVNENHLAYITHFQKRNMEAKGEQSP	664110	609854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_610149_610223_610306_610592_610671_610749_610880_611021_611095_611180_611304_638080_638166_640630_640828_641821_641989_648631_648712_648828_649027_650080_650194_663749
818406	contig_16650_pilon	-	1220	3	Intergenic	novelGene_61955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	197	538	242730	240400	FALSE	70	GTGAAAATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRCVLEEVQTESSLEARMARLCLTYFGHVIRRDQSLEKDIVIVQVGGQGKRGRPSMRWIDTVAATVGSSISIKTNGKDIIKFSKAKRKFYLACIQRGESGKTDKHAARAMSA	244361	239717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_240514_242502_242784_244218
818411	SIRV6	+	341	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	368	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1671	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3171_10730_10819_11031
818412	contig_6279_pilon	-	1479	3	Intergenic	novelGene_164760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	258	junction_2	4	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	669	974	94249	32855	FALSE	20	AAGGTCGGTGGTTGGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLAATICRKLNGIRFTCCKSAKDRTSMSVTLEQCSILRDEHQLHKDFFIRALDCMRREGCRIENVLKNIKCRKYAFNMLQLMAFPKYYRPPEGTYGKADT	94917	32349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_32988_91066_91222_94231
818413	contig_12297_pilon	-	1503	9	Intergenic	novelGene_161373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_8	77.5580427808748	179	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	240	920	687704	682659	FALSE	15	ACGCTATTGTGGAGCGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRYIELFYFPIPEKREPCVQGETERKAVKIFGNSSRDQPIFLQLKDFFWVKTPSAYELPYGTKGSEDLLLRVLAITSYAMPESIQSLKCRRCVVVGNGHRLRNSSLGDAIDKYDVVIRLNNAPVAGYEGDVGSKTSMRLFYPESAHFNPKVENNPDTLLVLVAFKAMDFHWIETILSDKKRVRKGFWKQPPLIWDVNPKQIRILNPFFMEIAADRLLSLPMQQLRKMKQKPTTGLLAITLALHFCDLVHIAGFGYPDVYNKKQTIHYYEQITLKSMAGSGHNISQEALAIKRMLEIGVIKNLTYF	688800	682075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_682746_683062_683207_685888_686033_686765_686956_687063_687160_687684_687746_687953_688052_688280_688362_688781
818414	contig_14441_pilon	+	1621	2	Intergenic	novelGene_100360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	358	756	26892	27290	FALSE	45	AAAACCACTCTCTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTVLHVSCSWNTNASWPRSGNRWDMRLAGSNGNPT	23052	28155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_26886
818417	contig_6876_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_147029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCCTTTCAGTCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173963	173121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_173100_174000
818418	contig_12019_pilon	+	1436	3	Intergenic	novelGene_87743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	249.5	4	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	2	757	623205	633717	TRUE	10	TTATTGGCTCAGGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVRPSCGGAGNSSKLSHFPSLASTTPTPPPLINSHFTPLSLLPYLHPKHPSHLPLLAPISSPSIPLISILASTLPTTFHSILRLPPVSSCNLHKGLSSPPQSLPHTVLSASHSCHCLPRFLLTMHLPLGFPSFLPWADGLVSLLAGDLCVGVGGLGARTSLLPVNHFKVS	623203	642653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_634017_642273
818420	contig_10003_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_88161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGGTACATATGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400367	398266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_398300_400400
818423	contig_8964_pilon	-	896	4	Intergenic	novelGene_168711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	148.600134589441	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	319	873	549121	543155	FALSE	25	CTTTTTAAATGTCTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPGDGLAAFSPRSLSHRGQRWLLRLLPVGLSNRRLLPRPRAPPSLRPPHTDSCCSPTLPRHPLPPCWERGSSFDFSRLILPENEAWRRREKRGIRNSFFPGTVNIQGCGHRILSGGVAIPGLCSEGFVQGRDVGELQELGLPGETEVHSEMKSFIMQHLGFHLPVSSDDLPFSCYISGDSKA	549439	543131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543276_543392_543520_547370_547457_548900
818425	contig_11285_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_5749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	4	15	307	321	1219847	1219861	NA	85	ACAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHSCNLYRSSLPDLSSVEPLGRFEPTTFRLAADLKPLVPPRLPENYSEVENKYHEVWLKGFGVNWVEKYISHRVAGGFKPPTFRLAVERLTTAPPGLPLNSLMESK	1219540	1220828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_1219500_1220800
818426	contig_2933_pilon	-	1422	4	Intergenic	novelGene_111344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_3	152.975669815679	403	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	12	347	742940	741531	FALSE	0	CCTGCGGGGTCCTGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKMSPWASGGHFLSTAERIRLPDDCTIGYIVEALLGVPLTRSGLFHSHLENLQQVPASELHEQVTLSYGMFENKRNAIHMKGAFSVETDPSRFRSIHCHLYPDTPWCPRTAVF	742951	740455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_741598_741756_741843_742358_742525_742923
818427	contig_15326_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_157707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCCTATTAAATCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93220	91511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_91500_93200
818429	contig_16666_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_61796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCAGCCTGGTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124904	123247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_123200_124900
818431	contig_17178_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_176341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGTGGAGAAAAGAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110489	112085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17178_pilon_+_110500_112100
818432	contig_11292_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_109392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGAGCGAGCTCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51199	52620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_51200_52600
818433	contig_20026_pilon	+	1417	2	Intergenic	novelGene_175414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19673	119746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_+_19710_118365
818434	contig_17059_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_166081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTATGTATCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410926	408985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_409000_410900
818436	SIRV4	-	515	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	94	8	94	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5064	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
818437	SIRV6	+	498	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	285	0	285	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10522	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818438	SIRV6	+	234	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-399	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
818440	contig_10765_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_122914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCATCAAATTGTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163446	162822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_162800_163400
818442	contig_1450_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_27397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAGTACCAGAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318067	319270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_318100_319300
818443	contig_7070_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_104037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTAATAATAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75384	77144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_75400_77100
818445	contig_14322_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_115660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAACGACCACCATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532784	532152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_532200_532800
818446	contig_14322_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_115659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	238	402	530865	530701	NA	30	AAACACCTGACCCATGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVYLSGRGVNGKADVGGVGGGLRSHHLGASWHLQVCLRNTISVGKLQTEDTLLIRARVYVQWGGGASTPHHTGQESRTMGKGARSPPAGSSCRRRQALAAFHVDACLKRGALVSAVIKTAWPICTLRLYPFC	531102	530442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_530400_531100
818447	contig_6058_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_172423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398651	397271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_397300_398700
818448	contig_14441_pilon	+	185	1	Intergenic	novelGene_100576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACGGTGATTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111198	111383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111200_111400
818449	contig_11702_pilon	-	1255	11	Intergenic	novelGene_141976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	87.5988584400505	5	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	652	1161	374527	372981	FALSE	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380803	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374078_374165_374269_374525_374660_374925_375037_376288_376422_376699_376798_377234_377281_380672
818450	contig_5153_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_74318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGAGTGAAGCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421691	419550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_419600_421700
818451	contig_14333_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_49109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTCCCGTGAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353685	352517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_352500_353700
818452	contig_11498_pilon	-	1882	4	Intergenic	novelGene_65510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	473.761543394987	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCGCGTTCGCCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186928	172641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_172800_184511_185189_185530_185908_186258
818453	contig_13937_pilon	-	2069	7	Intergenic	novelGene_167350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	103.970615506925	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	705	1580	47100	35956	FALSE	50	ATATGGGAATAAAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKELNDGTINQLPLLLGEPVMKEFLWDFLNHQEGPRIRDRLSHGEVNLNEFPGEAANQLLAFSTVLLLRFTSGDVVSVLKEKAAIKSLISIAEGYSSHFHPASQLKKQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGRCGSRALGKPSGTGSYLGRQFLKIFTLRSSYLQGKLWYILQ	49274	35466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_36299_36824_36951_37711_37789_44217_44302_45274_45452_47031_47101_48570
818454	scaffold_880_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_121489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1157	1525	507842	507474	NA	20	ACCAATGCCCTCTCTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCYDAHFANSGPATSHGEGGRPGGEAPAAPVGGTCSAQHRPHGPLLLGSLHKDYLGLESPVLALLLAVWLLENVSTSLCLIFHACRNGDAIPALTEALPGEITQWKSSPQAPGTVCCCC	508998	507152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_507200_509000
818456	contig_12000_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_43205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAGTGCAAAAAACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660836	658335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_658300_660800
818458	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818459	scaffold_13505_pilon	+	1064	5	Intergenic	novelGene_111570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	213.185805109064	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTTCTCCAGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608601	613611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_609748_610099_613391
818460	contig_3627_pilon	+	1321	7	Intergenic	novelGene_78471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	221.577425645203	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	91	1200	432362	444221	FALSE	40	GAGACTGAGGAGCAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQRKERQKSDRKKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKTKMKEKLNGNTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLSNGDIDEYEKKSKRVSSLDGSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETVKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEVSSFPA	432271	444342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_432449_437114_437412_439734_439811_440170_440350_442901_443020_443133_443320_444054
818461	contig_3627_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_78482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGAGAAGACCTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444342	444804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_444300_444800
818463	contig_7057_pilon	+	666	3	Intergenic	novelGene_123251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_2	98	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	222	527	540255	541317	FALSE	20	TTCTCAATATTGACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLERVSNEEKLNLCRKYYLGGFAFLPFLWLVNIFWFFREAFLAPAYTEQSQIKGYVWRSAVGFLFWVIVLATWITIFQIYRPRWGALGDYLSFTIPLGTP	540033	541456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540316_540890_540996_541177
818464	contig_13300_pilon	-	1016	3	Intergenic	novelGene_125811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_2	26.5	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATTGTTTTTTTTTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250777	244153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_250575
818466	contig_10904_pilon	+	1147	5	Intergenic	novelGene_22591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	91.5624786689395	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	161	832	449112	453964	FALSE	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRGGGPRGSGGSGQMARWMTEDIRKGLQEPPLSPLPKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQRKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTASSVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKSEKSGIMST	448951	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_449357_449456_449530_451494_451624_451716_451816_453838
818467	scaffold_13505_pilon	+	873	6	Intergenic	novelGene_111385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	32.5490399243971	1405	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	68	838	127983	130608	FALSE	5	GCAGTCTCCCGCCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPPQCPGVLAAAAAVVCRSCGAEMSAEENPASKPTPVQDVQGDGRWMSLHHRFVADSKDKEPEVVFIGDSLVQLMHQCEIWRELFSPLHALNFGIGGDSTQHVLWRLENGELEHIRPKIVVVWVGTNNHGHTAEQVTGGIKAIVELVNRRQPQARVVVLGLLPRGQHPNPLREKNRQVNELVRAALAGHPRAHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSRLGYTPVCRALHSLLLRLLAQDQGQSVPLVEPTP	127915	130643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_128035_128296_128398_128585_128676_129406_129524_129614_129738_130320
818469	contig_14814_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_137682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTATAAAAGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13134	12667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_12700_13100
818472	contig_3787_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_102366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTTTTTTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365112	364571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_364600_365100
818473	contig_3787_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_102365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	943	1287	363569	363225	NA	25	AACTGCAGGACTCTGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPFILEKQMLPIKPSSMHLFHPSPTSRLKSKTKNVIKMAFQMGFQHLRLSLEANRQGTKGILNPSWEFREEKKRIDKSSESQLMSDIKNNFYCWQLHTYAYCTLLIPYTQDL	364511	362776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_362800_364500
818475	contig_3095_pilon	+	696	4	Intergenic	novelGene_75181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2216.07265223864	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	216	620	225596	226669	FALSE	10	CATCATCCGTGGCCTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPNLRFQLQ	220485	226745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225489_225711_226126_226393_226645
818476	contig_10235_pilon	-	1577	19	Intergenic	novelGene_46401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	110.001753633609	1	74	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1033	1386	178699	177880	FALSE	25	CCTGCGTTAAATGAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192402	177688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178704_178856_178918_179496_179561_179767_179887_180375_180466_180843_180894_181307_181364_182373_182421_182532_182557_185205_185289_186962_187049_190070_190158_190402_190470_191199_191257_192265
818477	contig_8394_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_27330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1244	1546	162380	162682	NA	85	ACAATACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESIEKTRNSLGAILKQVVNMNPKNLSFTLKDYVFKELQRDWLRYNETDRQSFELVLSRKPNPSQNAASMSLQNLLYVLVNELHLPLRYGFWIHISLILS	161136	163222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_161100_163200
818478	contig_5047_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_157991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976605	974950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_975000_976600
818480	contig_7530_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_141832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAACTCATCAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138440	139343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_138400_139300
818481	contig_7530_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_141833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139343	139540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_139300_139500
818482	contig_11594_pilon	-	651	5	Intergenic	novelGene_80878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	178.640700849498	3256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	17	370	56794	46235	TRUE	10	GCAGTGTCTTGTACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRDKMEYLQVVKRGLQQISGHGGLRGYLRVLFRTNDVRVGTLVGEDKYGNKYYEDNKQFFGRHRWVIYTTEMNGKNTFWDVDGSMVPPEWTVTRRARENIQDGSHSLFKSHLGSDIPYFCF	56810	24857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_25135_46230_46332_51461_51550_55728_55812_56708
818483	contig_10627_pilon	+	1148	5	Intergenic	novelGene_59903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	40.7760652834478	415	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	183	1019	29280	32932	FALSE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYEPMQDNQMIIIVTVVSVLLFLFVTSVLLCFVFGQHWHQKRTGTYGVLAAWRRLPWAHQAQVA	24159	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_24308_29245_29341_30032_30300_31515_31837_32744
818484	contig_15937_pilon	-	462	4	Intergenic	novelGene_143131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	2012.79943252068	946	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGTATTTGTGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30552	28029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_29194_29246_29914_29960_30533
818485	contig_19185_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_163660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157902	155491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_155500_157900
818487	contig_10855_pilon	+	758	2	Intergenic	novelGene_124288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	208	513	193869	197149	FALSE	15	CCCTCCCTATTCCAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTVQYPGSWCFLTLGTEPGDVAFGLLFVLLGSLSVGLSFLLNTVSVATLCHVYHGQEAAQQRPRDCEVEMMAQLTGIMVVATVCWMPLLVFIAQTVLRTPPLMSPAGQLPRATEKQLLIYLRVATWNQILDPWVYILFRRAVIRRLQPRLSARARPLSLRPQLTQGPMLQ	193661	197394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_193929_196903
818488	contig_10855_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_124289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGAGTATTGGGTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197444	198579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_197400_198600
818489	contig_7839_pilon	-	671	3	Intergenic	novelGene_45709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	11.5	828	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	86	523	802213	799239	FALSE	5	TGTTTTTCTCCTGAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFCPGLWGPLAHVNRALSQRCLSTTGNLSAIQKMTRVRVVDNSALGNTSYHRPPRCIHVYTKNGVGKVGDQILLAIRGQKKKALIVGHRMPGARMTPRFDSNNVVLIEDNGNPVGTRIKIPIPTSLRQREGEYSKVLAIAQNFV	818677	799090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_799606_802142_802236_818614
818490	contig_5039_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_64828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAACCTCTATAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263217	262379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_262400_263200
818493	contig_10451_pilon	+	800	4	Intergenic	novelGene_138292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	50.7805737134454	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	118	546	61240	83904	FALSE	30	TAATTGTTTGTTTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYLVDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEMIDIIETVYRGARKGRGLVVSPKDYSTKYRY	60700	84158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_60798_61219_61393_80280_80385_83732
818494	contig_12050_pilon	+	941	5	Intergenic	novelGene_62649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	244.716162114397	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	150	662	359783	362611	TRUE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTYVNPARVRGAHTWWCGKIPGAPRGSKAAQLHPSPWEEHLKDWGEVAHCPALGERARCGGLLYPPACHDSRSECSPRPCPRTCW	359633	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362359_362656_363729
818495	contig_16103_pilon	-	1771	7	Intergenic	novelGene_118902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	134.306448922687	2	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	144	548	766451	761682	TRUE	55	AGAAAGTAAAAAACTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSNWLSGVNVVLVMAYGSLVFVLLFIFVKRQIMRFAMKSRRGPHVPVGHNAPKDLKEEIDSRLSRVQDIKYEPQLLANDDARLLQLETQGNQNCYNYLYRMKALDAIRASAHIGPICKFGKLTRKTTEWEK	766594	758884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_759848_761334_761394_761480_761747_762206_762261_762483_762602_765904_766007_766385
818496	contig_10937_pilon	+	772	5	Intergenic	novelGene_67333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	13.729530217746	486	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTGTGATGCACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180581	185982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181497_181654_181931_182017_184579_184669_185657
818497	contig_8729_pilon	-	701	4	Intergenic	novelGene_40077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	719.796421836681	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGTGGTGTCTTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73492	69485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_69782_70467_70589_71566_71638_73279
818499	contig_17074_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_145187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATCTCCCTCACTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621626	619181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_619200_621600
818500	contig_2550_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_135619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCATTCTTTCAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299798	301719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_299800_301700
818501	contig_7131_pilon	+	1225	5	Intergenic	novelGene_175332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	15.5322245670091	12	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	79	429	126497	128227	FALSE	65	ATAGAAATCAGTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPVPNRIGGARSLRWLRPDPGALLEMDSRIPYDDYPVVFLPAYENPPAWIPPHERVYHPDYNNELTQFLPRVITLKKPPGAQLGFNIRGGKASQLGIFISKVIPDSDAHRAGLQEGDQVLAVNKVDFQDIEHSKVSTALEL	125886	129023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_+_125952_126483_126584_127211_127296_127567_127625_128104
818502	contig_11096_pilon	+	1692	11	Intergenic	novelGene_143472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_3	182.99934426112	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1479	212	1690	237498	275721	FALSE	15	TACAGTATGCCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDLQNELKTTENCENLQPQIDAITNDLRRVQDEKALCESEIIDKRRERETLEKEKKSVCDLIKRFDNLMNQKEDKLRQRYRDTYDAVLWLRNNREKFKQRVCEPIMLTINMKDNKNAKYIENHIPSNDLRAFVFEAQEDMEVFLKEVRDNKKLRVNAVIAPSSSYADKAPSRSLSELKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCFQYHIHEVPVGTERTRERIERVIQETQLKQIYTAEEKYVVKTSFYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEINRKLDAVGSGLIALCETNQHLEHKDNELRQKKKDLLERKTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIKEINVQKAELVTELTNLIKICTSLNIQKVDLILQNTTVNSEKNKLESDYMAASSRLRLTEQNFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTVPQEYQTAFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLN	237286	275723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_237673_239714_239870_243982_244097_252250_252346_252997_253131_254419_254594_254699_254870_256761_256886_257320_257444_272466_272593_275631
818504	contig_19654_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_176344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGTAAGGAAACAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216313	216050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19654_pilon_-_216000_216300
818505	contig_5916_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_158028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTGGAGAACACTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267447	266456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_266500_267400
818506	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
818508	contig_12019_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_87698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135577	135050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_135000_135600
818510	contig_5602_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_133052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	435	749	869877	869563	NA	25	CCAGCACTCCACCCAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMISERSKENMYSWNKTAEKSDFEAVEALMSMSCSWKSDFKKYTENRPVTPVSDMSEEENLLPGTPDFHTIPVFVSIIIFKMNVNYRISSNLHNECYFINFSC	870311	868935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_868900_870300
818511	contig_5317_pilon	-	1558	12	Intergenic	novelGene_76587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.661841602252	3	95	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	169	657	370406	361244	TRUE	15	CTAGATTTTTCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFVSGYRSFNSESLSLSPRRISLAYRGCQDEEAVKKLTVNPGTKSRLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGKLSKRQIQAAYSILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPPLLNNTDSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRGGSEDSTKDPIDVNYEKLKTEWLTEILKKPRSSGSMLRTLMQAHTMPMTWKSLISLR	373102	355235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355505_355579_355767_356227_356343_356925_356988_357964_358093_361103_361257_361766_361866_364153_364276_364800_364924_366581_366666_370358_370488_373015
818515	contig_7870_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_108960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	992	1309	351905	352222	NA	30	AGATTCTACTGAAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKHTHHAVPTAGKRKLPLLEHKRLHLFPAPHGSVIRRKAQKQTVFPLSLSQSWLSHQNITFSSFELIKGQLDISLLHRYQLCFVETWHLNVLVPWKFFTLCLSF	350913	352868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_350900_352900
818516	SIRV2	-	274	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	648	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969
818517	contig_19778_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_143742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAAAATACAAAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6909	5642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_-_5600_6900
818518	contig_14405_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_85676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAAGAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891987	889695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_889700_892000
818520	contig_517_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_171303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAATTAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91250	92797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_+_91200_92800
818521	contig_5988_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_16166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCATACGGTTGCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2053967	2052569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_2052600_2054000
818522	contig_5988_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_16165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	257	577	2052110	2051790	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPHMFQSITALHRAFNGCNLMEVDHQGFRWKDLNHQPLVSSQEQTICATQGPIHGIVIVFSCGQVSSDSWRPHACRVELLHRVFKAVTFQKLITKPVFQGVSAWV	2052366	2051709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_2051700_2052400
818524	contig_9437_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_141718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAGTTAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146339	147654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_146300_147700
818525	contig_11631_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_104200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCAAATGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200439	198717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_198700_200400
818526	contig_9548_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_141067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCATGTTTTCTATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149014	149548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_149000_149500
818528	contig_9132_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_121376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAAAAATAGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100046	100745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_1e+05_100700
818529	contig_6412_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_149988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAATTTCTGAGACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663311	661830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_661800_663300
818530	contig_2773_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_174278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGCGTAAGACTGACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155170	153489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_153500_155200
818531	SIRV6	+	437	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	14	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	17	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
818532	contig_6163_pilon	-	1151	2	Intergenic	novelGene_103863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGATGTTTCTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509585	508103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_509140_509470
818535	contig_15062_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_162297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAGAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51153	52322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_51200_52300
818536	contig_2161_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_114932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTACACCTAGGCTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855807	855371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_855400_855800
818539	contig_10734_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_51353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAGCAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760357	1761416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1760400_1761400
818540	contig_9389_pilon	+	1381	2	Intergenic	novelGene_83897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	141	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	397	915	157715	158233	FALSE	30	GTTATGTATTATTAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLLGGPKPQAHQPLCLFHGDLHVPTQEHLMTSASIIPPPHNLPGANSITESKGRGDLRGLRPLERKPRIPQAPAAEAEIPNISTSVDSTTPYLSLPCARLHPQHFTNIYPFHVYSSLHAVEAFSPQFYRRGDGGPERSGNCIRSHSQVGSRDLNWREGCRIIEHYILPEV	154309	158699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_154479_157487
818544	contig_5744_pilon	-	2069	3	Intergenic	novelGene_149329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7.5	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	171	1355	311325	308091	FALSE	15	GTTTCCAAACTTTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNILTPCTVLPVKLYSDARNVLSGIIDSHENLKEFKDDLVKVLVWIIVHYCSKRPSMQDSVHKTENKGKAPLIILPTLNPSPQPYCPEDMDSLNSETFDDWSDDNIFDDEPTIKKRKEEKDQLKVLPDTHLSLPGSVESRKVGDPGKVPENSLYKTVILGYPAIDKGKQEDMAYIPLTEFSGSHSHLLSLPKEWRSNCLPNSKMKEMSSLFPEDWYQFVLRQLECFYSEEKDSDVLEEIAKDKVLKDFYIHVVMTCYFSLFGTDNMAPSPGHILRVYNGVLPWSVALDWLMEKRELFQLALKAFRYTLKLMIDKASLSPIEGFKELSNCLEEYESDWYIGLVSDEKWKEAVLQEKPYLFSLGYDPNMGVYTGRVLTLQESLIQVGKLNAEAIRGQWANLSWELLYATNDDEERYSIQAHPLLLRNLTVQAADPPLGYPIYSSKPLHIHLY	311495	307376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_308343_310000_310188_310579
818551	contig_14822_pilon	-	902	7	Intergenic	novelGene_145400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.30662386291807	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	38	346	111467	109663	TRUE	10	CATTCCTTGCTTGTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGLGTWKSEPGQMKAVVKYALSIGYCHIDCAAMYGSETEIGEALKENVGPGKMVLREELFVTSKLWNTKHQPEDVEPALQKTLADLQLECLDLYLMNWPCAFEWNATHTWLRKS	114005	108298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_108456_109000_109088_109234_109384_109499_109700_111026_111179_111347_111468_113968
818552	contig_9375_pilon	+	1136	3	Intergenic	novelGene_136058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	40	junction_2	133	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGTGCTGGGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284008	352515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_284133_299685_299787_351604
818554	contig_151_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_132557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAGAAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148598	150235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_148600_150200
818556	SIRV4	-	312	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1162	47	1162	-47	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCATGACAAAAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3996	3684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
818557	contig_11986_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_69206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	269	637	734679	734311	NA	40	AAAGAAAAAGGTGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	734947	733987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734000_734900
818559	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	5	4	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818560	contig_6462_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_176346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTTAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128914	131046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6462_pilon_+_128900_131000
818562	contig_3601_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_132908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGATCCAGATAACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232506	231982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_232000_232500
818563	contig_3601_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_132910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243861	242950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_243000_243900
818564	SIRV5	+	407	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_3253_3405_3483
818565	contig_8295_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_176347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTCTCAAAAAGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412175	413115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8295_pilon_+_412200_413100
818566	contig_5753_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_174320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTGCAAAGGAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181166	181619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_181200_181600
818567	contig_14341_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_111762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGAGCCTACATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239885	241506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_239900_241500
818568	contig_1107_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_126601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGATAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892788	893569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_892800_893600
818569	contig_8317_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_20690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16494	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
818571	contig_11378_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_112242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	632	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGTATTTTATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343097	341762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_341800_343100
818573	contig_20646_pilon	-	2194	7	Intergenic	novelGene_145023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	22.5345413877353	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	19	1890	64508	49388	FALSE	15	AAGTGTGTGCGAGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQERGGWIVVNPDEDDEEPEEDDQEIRDKTLPRWQIWLGAERSRDQRHWRPWRPDKSKKQTEEDCEDPERQVLFDDVGQSLIRLSSQDLRFQLVEAFLQFLGVPSGFVPPASCLYLAMDENNIFDPGLSEEKPLTCSTLSFSGVGRVGRMDRLGCQRWAQGHNREGEEFIRNVFHLVMPLFSGKEKSQLCFSWLRHETAKVIWCLHTKNKKKLKSQGKNCKKLAKNLLKEPENCSSLCLWKQYAHLEWLLGNTEDARQVFDTALSMAGARELKDAELCELSLLYAELEVELLSDLRGAAMSRAVHVLTRLTERSPYGPYTGQVLAVHILKARKAYERTLQDCLDESCVSDPVPTSSVNRLVSLAKCFMLFQYLTTGIDAAVRIHEQVFAKLKGSVSPAGSGLEHSGSPHGLASAMEAVTLMHTSLLRFHVKVSVYPLTPLREALSEALKWYPGNRVLWRSYVQIQSKSHSASKTRRFFDGITRSTKSLEPWLFAIEAEKMRKRLVETVQRVEGREIHATVPESGLTNRIKALFEHAIQSDSGSQCPLLWRMYLNFLVSLGNKERSKGVFYKALQNCPWAKVLYMDAMEYFPDEMQEFLDLMTEKELRVRLPVEELELLLED	64526	49083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_-_49514_50103_50176_50761_50901_52159_53089_53890_54278_56854_57031_64465
818576	contig_17470_pilon	+	687	7	Intergenic	novelGene_110481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1162	junction_1	2323.96362206181	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	51	637	687	146413	146463	FALSE	40	GAAGAAGGTTTGGAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSNHDGADETSEKEQQEAIEHIDEVQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSALLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSKSTEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWPNPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDDDDEE	142254	146463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_142292_143892_143951_144618_144762_145162_145267_145372_145487_146100_146272_146403
818578	contig_7457_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_31589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940947	939609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_939600_940900
818579	contig_11498_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_65526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTCAGCTCAGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245497	246262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_245500_246300
818580	SIRV6	+	391	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	568	3	389	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
818581	contig_15859_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_50185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCCCAGATGCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296965	296083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_296100_297000
818583	SIRV4	-	301	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	313	3	-313	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGCAAAGTTGGACGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
818589	contig_5039_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_64799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACAGACACATGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181973	181358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_181400_182000
818591	contig_3018_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_78926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACACTATGGTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632243	631238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_631200_632200
818593	contig_11136_pilon	+	1518	15	Intergenic	novelGene_169034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	13.0033355218528	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	17	1444	179109	186424	FALSE	5	CCCCGTCTCCTGCAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIVDSMSATAAPRKRGKPASGLGASAGAGKRRRKADSAGARGKAKGGGKMNEEISSDSESDSLAPRKTEEEEEEELEETAQEKKLRLAKLYLEQLKQQEEEKAEARAFEEDQVAGRLKEDVLEQRGRLQRSVAKEIQAPALADIRVLRGHQLSITCLVITPDDLAIFSAAKDCTIIKWSVESGRKLRVIPRVKKGVEGQPPGHSSHILCMAISSDGKYLASGDRSKLILIWEAESCRHLYTFTGHRDAVSGLAFRRGTHQLYSTSHDRSVKVWNVAENSYVETLFGHQDAVAALDALSRECCVTAGGRDGTVRVWKIPEESQLVFYGHQGSIDCVQLINEEHMVSGADDGSVALWGLSKKRPLALQREAHGLRGEPGLEQPFWVSSVAALLNTDLVATGSHSSRVRLWQCGEGFRRLDHLCDIPLVGFINSLKFSSAGDFLVAGVGQEHRLGRWWRIKEARNSVCIIPLRRAPTPLAAGS	179092	186498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_179196_179479_179563_182122_182233_182607_182676_182755_182798_183054_183182_183789_183915_183995_184089_184505_184607_184688_184824_184901_184965_185192_185339_185417_185498_186117_186192_186330
818594	contig_8978_pilon	-	2185	3	Intergenic	novelGene_49500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	7.5	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	266	1492	2074863	2057862	FALSE	60	AAAAAAAAAATTGTCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQLKSHLTVCFLPSVPFLILVWTLATAKSVTNSTLNGTDVVLGSVPIILATMDHIIVKEGNSALINCSVDGVPGPQFKWYNSVGKLLKEEDEKERGGGKWQMHDSGLLNITKVSFSDRGKYTCVASNIYGTVNNTVTLRVIFTSGDMGVYYMIVCLVAFTIVMILNITRLCMMSSHLKKTEKAINEFFRTEGAEKLQKAFEIAKRIPIITSAKTLELAKVTQFKTMEFARYIEELARSVPLPPLIMNCRTIMEEIMEVVGLEEQGQNFVRHTPEGQEAPDRDEVYTIPNSLKRSDSPTADSDASSLHEQPQQIAIKVSVHPQSRKDHVDDQEHVQFEVKDDEETEPSAEHSPETAEPSTDITSTELTSEEPTPVEASDRVLPPAHPETAEPAVTHDKNTCIIYESHV	2103161	2057168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_2058794_2074568_2074997_2103029
818596	SIRV6	+	429	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	357	514	184	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818599	contig_14219_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_54362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTTCTCAGATTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875749	875297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_875300_875700
818600	contig_2310_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_71631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTCTTGTCCTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423357	425225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_423400_425200
818602	contig_11978_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_62835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTGCCTTGGCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473087	470812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_470800_473100
818603	contig_9784_pilon	+	1186	6	Intergenic	novelGene_165699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_1	64.2246058765642	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	280	765	24780	261840	FALSE	30	TAGTGAGATGACTCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPWQAWTHGWGRAPTTAAGLTDEKVKAYLSLHPQVLDEFVSESVSAETVEKWLKRKNNKPEDESAPREVSRYQDTNMQGVVYELNSYIEQRLDAGGDNQLLLYELSSIIKIEPLCVHTTWSEGWKTTAHPGRAHNPGHHRICLCGQVQENSAGRRHPWG	24500	262261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_24841_147611_147741_218175_218205_244078_244200_257546_257688_261835
818604	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
818605	contig_7378_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_120268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGGCTGGCTCTCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504417	506910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_504400_506900
818606	contig_16917_pilon	-	2524	1	Intergenic	novelGene_161937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGGCAGTTGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150787	148263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_148300_150800
818608	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
818609	contig_5769_pilon	-	1005	3	Intergenic	novelGene_138755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	122	922	126343	116976	FALSE	15	TTTTTGTTGTTGTTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPVTVATDGGDRPGSPAASSLSASQRRAELRRRKLLMNSEQRINRIMGFHRPGSGAEEESQTKSKQLDSDKLNSLTVPSVSKRVVLGDSVTTGTTDQQGGVVEVKGTQLGDKLDSFMKPSECSNDVNIELQQRNREDLTADTVQGASRHGLEQYLSRFEEAMKLRKQLISEKPTSLPTSGMACFKPSEMVKLTNPLFRVPYILFTWSHPHKSAMHLIYIIRKLSDPLGGPQAPHLHTPIHLVEVNIARRAILNHHTVLLNRVYKT	126464	116892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_117254_124106_124458_126171
818610	contig_11932_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_85411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTGTGAAAGAGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283954	282988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_283000_284000
818611	contig_11932_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_85410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282935	282505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_282500_282900
818612	contig_18184_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_123885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	22	315	564025	563732	NA	45	AAAGAGATGCAGAAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDGGTPMGRCSEPGDFEEIGLAKEEFEEGTDHPGVDGGAGLAPGCLGFGAGCLRHPQAWKEPFGAGSTVFEMHNSQFGRLDSGQSRIDDTFNPFGAHARPLLY	564046	563706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_563700_564000
818613	contig_5084_pilon	-	1782	3	Intergenic	novelGene_64622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	8.5	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	75	1580	1181797	1177907	FALSE	10	CCTCAAGTGTCTGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLPIGAEVVGGLKAPAEQNGDAGSREPSGPGVELAPGSGEHAVAVTPGPGKRKKRRGATGERIVPPPKKRRAGVSFGDEHFAETSYYFERGLRKVRPYYFDFQTYCKGRWVGHSLLHVFSTEFRAQPLAYYEAAVRAGRLHLNEERVQDLSIVLKDNDFLRNTVHRHEPPVTAEPVRLLAENEDVVVVDKPSSIPVHPCGRFRHNTVIFILGKEHQLKELHPLHRLDRLTSGVLMFAKTAAVSERIHEQVRDRQLEKEYVCRVEGEFPTEEVTCKEPILVVSYKVGVCRVDPRGKPCETVFQRLSYNGHSSVVRCRPLTGRTHQIRVHLQFLGHAILNDPIYNSVAWGPSRGRGGHIPKTDEELLRDLVAEHQAKQSLDVLDLCEGDVPSGLTGPTDPSSELGKGGQEELATAAWKMYRAREAAPQDLHTLALAPGDGAEADVVNQETDPLCAECRLVRQDPLPQDLVMFLHALRYKGPDFEYFSPMPAWAQDDWQED	1181871	1177704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1178642_1179311_1179609_1181323
818614	contig_1996_pilon	+	1155	9	Intergenic	novelGene_131908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	32.2371582959789	5	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	110	445	279625	280872	TRUE	30	TTTGTTTGGAAAAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMGIDGPIDSFAPFHNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKVPLRCTAHYVAYHVESKVYAVATSTNASCTRIPRMTGEEKEFETIERGVSFLHTACLGRPA	279438	283120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_279479_279555_279709_280528_280646_280737_280878_281155_281360_282389_282502_282583_282714_282787_282927_283000
818615	contig_3797_pilon	-	1077	4	Intergenic	novelGene_120084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	117	416	333248	332949	TRUE	35	ACCATGAAGCCAGTTCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVCLMMFIQVSLLLKWLGGVSSTFLQLACFIKHLWKQTQQSQVCQKYFFSEDTLRFIFSRGMALFIKGGLWGIKTEQRVSNSSTETVLWSLDFFVLRN	333364	326417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_326451_328171_328381_331635_331752_332645
818618	contig_4315_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_46860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTGTTAACTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747818	747417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_747400_747800
818619	contig_10197_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_115178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402118	399709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_399700_402100
818620	contig_6464_pilon	-	1361	3	Intergenic	novelGene_176353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	49.5	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTAAATGGTATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125810	100828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6464_pilon_-_102008_122004_122117_125740
818621	contig_15838_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_174335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAGAAATAAAGATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190811	189382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_189400_190800
818622	contig_6109_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_160367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGGTGGAGGGTGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211247	211999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_211200_212000
818624	contig_6069_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_8004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCAAAGAGAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25132	24126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_24100_25100
818627	contig_4426_pilon	+	192	1	Intergenic	novelGene_15356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAATTAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47834	48026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_47800_48000
818628	contig_16831_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_134799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATACCATATTTTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445554	445039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_445000_445600
818629	contig_16362_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_161174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419175	417135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_417100_419200
818631	contig_5145_pilon	-	1217	5	Intergenic	novelGene_131460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	370.379535071796	948	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	26	361	956111	949748	TRUE	15	TTAAATGTGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYRFRGCVMEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVEDFNRHLDTLTEHYDIPKVSWTK	956136	948699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949117_949308_949817_952957_953012_955790_955930_956037
818632	SIRV6	+	353	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	345	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCGGTGGCTTGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	2106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845
818633	contig_8362_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_150685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATGACCCCCATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99533	101042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_99500_101000
818634	contig_11115_pilon	+	1839	10	Intergenic	novelGene_102789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160.231776568264	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	227	1354	135422	157736	TRUE	10	ATTCTTGTTATTCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCQWGGTARGSKPNGDGAQSMVTGEGLRVHLHWAGPGGGEPWVTFNEASLTAEEVCIHNLVDVSAVSPDSPASDPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDCTGEMVAVKSLKAGCSPQLHSGWRREIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDAGEKSVQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSVGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVCEDGDSPVFWYAPECLKECKFYYASDVWSFGVTLYELLTRCDSSQSPPTKFIELIGLTQGQMTVLRLTELLEQGERLPRPEACPCEIYHLMKNCWEAEASFRPTFQNLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC	134638	158451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_134846_135402_135603_154352_154451_154951_155145_155465_155585_156008_156182_156388_156507_157401_157513_157601_157738_157967
818636	contig_8682_pilon	-	2175	9	Intergenic	novelGene_165270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	306.920185064456	1	145	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	295	1680	133808	55026	FALSE	35	AGGAAATACTGCGCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQAVAGLLLLAAAGLGEAAAGHGLAFSEDVLSVFGANRSLSVPQLGRLLELLGSAPVKGAPELGQLHFNQCLSAEEIFFLHGFSNATQITSSNFSTICPAVLQQLSFHPCEAKSKHHTKPSLSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLVLTPMIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFVAILLITLFAGDIELE	134864	54530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589_134063_134824
818638	contig_6027_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_74429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218863	217793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_217800_218900
818639	contig_5958_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_140077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100509	100966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_100500_101000
818640	contig_15307_pilon	+	1958	12	Intergenic	novelGene_174780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCTGAAGAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100309	133892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15307_pilon_+_100379_106861_106959_109108_109254_112284_112933_115670_115882_120423_120533_121695_121853_122905_123039_128934_129041_131104_131217_133191_133332_133861
818644	contig_11413_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_103192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGACAGTAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558252	559641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_558300_559600
818645	contig_8358_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_173291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAATAATGCTGCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257768	256883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8358_pilon_-_256900_257800
818646	contig_7426_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_27523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTCTGCCATGCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016832	1017576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1016800_1017600
818648	contig_5791_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_35814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATACTTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346264	346980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_346300_347000
818651	contig_15613_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_147220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTAATGGGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230558	232814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_230600_232800
818652	contig_16948_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_166409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTTAGCGAGGACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292536	293881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_292500_293900
818653	contig_3948_pilon	-	2002	1	Intergenic	novelGene_53256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTAAAAAAACCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281047	1279045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1279000_1281000
818654	contig_11337_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_107193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGTTATTGTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210536	211784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_210500_211800
818655	contig_9424_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_143797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	210	326	280247	280131	NA	25	TAGCGGAGGGTGGATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFLWLPLCCCCSLGPLLPLSPNLGSVFQAAFGGRRAGWPAWARGGEPACSCGVRITEARGPERLGAALMSPHGSWPFRNPAAWAISPLVPKALRTTKLQFPHSHPD	280456	279009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_279000_280500
818656	contig_8954_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_130301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGAATTACAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186620	188684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_186600_188700
818658	contig_504_pilon	+	874	7	Intergenic	novelGene_54462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGATGTGATGATTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718645	729600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_718703_720753_720891_722218_722357_722833_723000_723388_723573_726928_727048_729527
818659	contig_2033_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_71545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCCTTATTCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172340	173163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_172300_173200
818660	contig_7189_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_117666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGAACATCAACCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585199	584395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_584400_585200
818662	contig_6710_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_94293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGAAGATGAAGACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	653845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
818664	contig_15114_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_121189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCGTACCACAGTGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723286	722569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_722600_723300
818665	contig_3243_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_147529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAGAAAAAGAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20246	21386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_20200_21400
818666	contig_11816_pilon	+	971	2	Intergenic	novelGene_98564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	24	junction_1	0	429	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	254	649	1236029	1236424	FALSE	35	CTACAAATTTGAGTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAQRVLLTWLFTLLFLIMLVLKLDEKAPWNWFLIFIPVWIFDTILLVMLIVKMAGRCKSGFDPRHGSHNIKKKAWYLIAMLLKLAFCLALCAKLEQFTTMNLSYVFIPLWALLAGALTELGYNVFFVRD	1232458	1236746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1232656_1235972
818669	contig_18391_pilon	-	1322	8	Intergenic	novelGene_174100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.16653584115759	73	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	4	885	204585	196379	FALSE	80	AATGTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMSSKPTFRAVGISPDQDLDVIEITENSQELRVQNSSGPCLSGSLVSLHCLACGESLKAPRVVGGEKASVDSWPWQVSVQYDRKHICGGSILDPHWILTAAHCFRKHLDVSNWKVRVGSDKMGNFPSLPVAKIFIIELNTMYAKEKDIALMKLQFPLTFSDTVRPICLPFSDEELAPATPLWIIGWGFTEQDGGKISDALLQASVQVIDSTRCNAEDAYQGDVTEKMLCAGTLEGGVDTCQGDSGGPLMYQSDLWQVVGIVSWGHGCGDPSTPGVYIKVTAYLNWIYNVRKAEL	204588	195941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_196391_196826_196977_198487_198631_198855_198955_199784_199952_201030_201191_203446_203488_204475
818670	contig_12922_pilon	+	1434	3	Intergenic	novelGene_157782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCACTTTGTATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85984	87605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_86085_86157_87367_87480
818671	contig_10103_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_86168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGTGAAAATATACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650647	649042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_649000_650600
818672	contig_7201_pilon	+	1818	2	Intergenic	novelGene_152531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	127	357	350144	350374	FALSE	75	ATAAGACAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGSGVNFQLSNQHKFNILILYSTTRKERDRAREEHTSAVNKMFSLQNEGNDQQGSRYSVIPQIQKVCEVVDGFIYVANAEAHRSKHSLVLKTLLSLWKANTKITFFSLSILIFTVPS	349908	351835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_349986_350094
818673	contig_8453_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_125113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTTGCAGTTAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94729	92749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_92700_94700
818674	contig_5602_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_133005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAGACCAAATGGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379525	378022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_378000_379500
818675	contig_7272_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_25306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAGATTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428017	429661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_428000_429700
818678	contig_8628_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_164434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTTCCAAATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645210	645558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_645200_645600
818679	contig_8357_pilon	+	2030	7	Intergenic	novelGene_39687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	58.8550479285054	27	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	106	1065	213860	232218	FALSE	25	GACACTTTAGTTGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALELWRTSDLGKSFKTIGVKIYSFGLGGRFLFASVMADKDATRRIHVSTDQGDTWSMAQLPSVGQEQFYSILAANDDMVFMHVDEPGDTGFGTVFTSDDRGIVYSKSLDRHLYTTTGGETDFTNVTSLRGVYITSVLSEDNSIQTMITFDQGGRWTHLRKPENSECDATAKNKNECSLHIHASYSISQKLNVPMAPLSEPNAIGIVIAHGSVGDAISVMVPDVYISDDGGYSWAKMLEGPHYYTILDSGGIIVAIEHSSHPINVIKFSTDEGQCWQTYTFTREPIYFTGLASEPGARSMNISIWGFTESFLTRQWVSYTIDFKDILERNCECLLWHFLPETCKPIFLNNQFDLI	213754	233183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_213872_217831_217977_218790_218947_228434_228542_230389_230493_231202_231372_231950
818680	contig_13697_pilon	+	1775	4	Intergenic	novelGene_165934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	41.7718671941881	148	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	503	769	295406	295754	FALSE	30	ATATAACAGGCAGTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPARVSATLRGSVRPPPAATESPTVPDRRPELRGVIRLLDWFERPDGFLLVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVCHCHGCGVVHRDIKDENLLVDLRSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMVCGDIPFEQDEEILRGRLFFRRRVSPECQQLIEWCLSLRPSERPTLDQISTHPWMLGADSALESCDLQLCVLDPDDGASTTSSSESL	293261	296760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_293361_294119_294428_295310_295488_295569
818681	contig_15888_pilon	-	753	6	Intergenic	novelGene_84446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1951.44606894477	19	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGACTCCACATTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259781	251610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251843_252021_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253487_259718
818682	contig_7435_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_165765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204380	203409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7435_pilon_-_203400_204400
818683	contig_9548_pilon	+	1141	2	Intergenic	novelGene_141088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	160	1134	309045	320218	FALSE	50	GATACTACCTATCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIYAHKVVLASISPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCHDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLCAVGGKSGLFTCLDSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGNNLLFSKHIAQYFLRM	308885	320225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_309758_319956
818684	contig_11937_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_171583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88117	89209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_+_88100_89200
818685	SIRV6	-	484	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-297	408	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1202	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1533_1637_1735_1844
818689	contig_10937_pilon	+	1140	4	Intergenic	novelGene_67334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	11.5181016954473	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATGCAGGAGAGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180588	184670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181397_181497_181654_181931_182017_184579
818693	contig_13904_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_165498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTTTTCTTAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119963	119223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_119200_120000
818696	contig_9696_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_68806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372091	373288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_372100_373300
818698	contig_10225_pilon	-	1340	5	Intergenic	novelGene_86879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.89897948556636	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	62	826	107928	101456	FALSE	10	GTCTCTTACGATGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGFQNVVTVDELRTAFPVLDMVDLERRPKTTPLLRNDFPAIEGVLLLGEPVRWETSLQLIMDVLLSNGNPGTGLATAPYPHLPVLASNMDLLWMAEAKMPRFGHGTFLLCLETIYRKVTGKELRYEGLMGKPSILTYQYAEDLIRQQAERRGWAATIQKLYAVGDNPMSDVYGANLFHQYLQMAKHQGTGELGASGLRKQQPSASQSCTSILVCTGVYSPKDPEQVESAQGREEPPFHGHRDFSFSPGLMEASHIVNDVNEAVQLVFRKEGWAL	107989	100941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_101790_101974_102164_104441_104617_106244_106279_107895
818700	contig_8683_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_150247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATATACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517036	517697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_517000_517700
818701	contig_11115_pilon	+	863	4	Intergenic	novelGene_102835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	593.606491429016	6	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	63	740	165608	173204	FALSE	15	CGGAGTCTGTGGCTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCTLDVEREKLPSPGVSGPGQPGSHDELFARSLQAQCARRDPIPRQVIPQWHLPLSGRQLAGHDHRGGGDGSSGLERPLRHHHHGGVSGLGPGDYYSSLTVRLRGAEAERHVPREGQEHLAAPHV	165545	173327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166478_172749_172964_173047
818703	contig_14553_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_124990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	62	715	5806	14421	FALSE	10	GTGAGTACCCCCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWTPGLPSRHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQ	5744	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_13796
818704	contig_2161_pilon	-	1453	2	Intergenic	novelGene_114944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTACTTCGTGTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021773	940117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_941511_1021713
818706	contig_11292_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_109427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237708	237362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_237400_237700
818707	contig_3679_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_112134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCAGTGTATTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088434	1088160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1088200_1088400
818708	SIRV4	+	532	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	331	26	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCTAAAGACATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3722	5158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
818709	SIRV6	+	459	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	353	44	180	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGCTAAAGTGCCAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
818710	contig_17796_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_33839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGATCACTTCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119128	118633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_118600_119100
818711	contig_12078_pilon	-	1732	4	Intergenic	novelGene_74079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	118.527071450647	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1058	1357	431967	64691	FALSE	65	AGGAGGAAAGAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVKEINKRREMEEKTRRAKLAKEKAEQEKLERQKKKKQLIDINKEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRIPRNPDNRRVPLERSRSRHNEAISSK	433024	64315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_64756_244439_244536_290430_290567_431964
818712	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_3013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
818713	contig_13954_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_130060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGCCTATTTGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105171	106341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_105200_106300
818714	contig_10515_pilon	+	2204	18	Intergenic	novelGene_174285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_17	10.1647331154319	46	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	178	1296	13053	76856	TRUE	70	AGAAAAAGAAAAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLAEGFFVRDPPVEKQTTEEPENKAEESTVQLVKLDKDTPTDLVPINLLLQMKKLLNAVNALPKGVVLHIKKFLQEDFSFQTMQREVAANSQNGEEIVPPLTLSVLITQLEAALKNIQANNYIAHQINIGYYLTLLFLYAIALTERGKKEDYLEAESKFLVMKIMIQENEICENFMSLVYFGCGLLRCAQKRYNGGLLEFHKSLQEIEDPNDYWFDIDPTEGDDLPTTFKDLLSNFIKTSESNIMRQTICSYLDCERSCEADILRNTTYKGFVQLMCSKSCCIYFHKICWKRFKNLKYLGENDQSFSGKKCLKEECTGDIVRMLECDTPGIVKILFEVVRKNEYITIENLGASYWQENSVMGTGHEEFQL	5274	82738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10515_pilon_+_5385_12985_13085_15861_15932_20348_20505_37441_37559_41378_41460_42748_42874_46138_46254_50640_50761_51190_51293_52693_52787_53578_53632_76083_76133_76850_76928_78531_79150_80704_80738_81743_81914_82722
818715	contig_8140_pilon	-	2193	2	Intergenic	novelGene_86462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTTCCCAACACAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891276	888923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_890730_890889
818719	SIRV6	+	481	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	23	514	16	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
818720	contig_1213_pilon	+	856	9	Intergenic	novelGene_76479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCTCTTCTGGAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77982	96667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_78039_81101_81220_82679_82744_83399_83469_84279_84382_85229_85344_85428_85548_92921_93089_96620
818722	contig_6589_pilon	-	1079	7	Intergenic	novelGene_26184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCCTCATCCTGAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1913493	1901845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1901899_1903191_1903449_1903646_1903726_1903865_1903924_1911346_1911615_1912472_1912593_1913249
818723	contig_14686_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_88071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAACACCCAGTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73575	74101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_73600_74100
818724	contig_14686_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_88072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTCAAAAAAGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75306	76343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_75300_76300
818725	contig_12709_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_147412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATCTTTCAACCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52107	53346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_52100_53300
818726	contig_8260_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_163229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAACCAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45129	44126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_44100_45100
818727	contig_7894_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_170793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACAACATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240739	239122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_239100_240700
818728	contig_14530_pilon	+	2522	8	Intergenic	novelGene_108443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	10.2180312812844	6	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	34	984	9663	34219	TRUE	25	TGGAAGGTTGCATGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYELFSHPAERGYRAGLCSKAALFLLLAAVFTYIPPLLVAFRSHGFWLKRSSYEEQPTVRFQHQVLLVALLGPERGGFLAWSTFPAFNRLQGDHLRVPLVSTREEDKNQDGKIDMLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNVTTILMDPNPIWLVGRAAEAPFVINAVIRYPVEVIAYQPGFWEMIKFAWVQYVSILLIFLWVFERIKIFVFQNQVVTTIPVTAAPQGELYKEHLS	9629	35843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10058_23780_23910_24255_24400_26701_26784_33247_33353_34037_35298_35383
818729	contig_6164_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_121280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTCTGGTAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562993	564842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_563000_564800
818731	contig_6724_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_167953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTTTAAGTTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29162	30738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_29200_30700
818736	contig_709_pilon	+	1210	9	Intergenic	novelGene_57539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	54.7823819763252	3	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	209	907	1506140	1526933	FALSE	25	CACATGTGCACGACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEAWKKSLKEKWNAKPAYVVGSATASLVRKIGLETEGEKCGNAEKLAEYICSRESPSLPLLFPCGTLKGEILPKMLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1498434	1527236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1498617_1506113_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511942_1512018_1515791_1515867_1520268_1520350_1523140_1523227_1526795
818737	contig_8729_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_40053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGAGTATCCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33764	33145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_33100_33800
818739	contig_2940_pilon	-	845	11	Intergenic	novelGene_81924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_4	87.0471136798918	1205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	170	697	613834	595880	FALSE	10	GTGGTGTTAACGTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFHEQDGKAGLFSQEQNEKAKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGAEHGKPDISKDELQLYEDVPGEMVPSGESGLRQRGSDPASGEVEASPLRRVNIKKDDEFFHFVLLCFAIGALLVCYHYYADWFISFGVSLLTFASLETIGIYFGLLYRIHDVLQGFIPLLQKFKLLGFRRTD	636671	595731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_595900_596704_596768_597258_597334_597738_597811_602034_602083_602447_602481_603102_603139_605244_605299_613707_613843_614467_614549_636591
818740	contig_1996_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_131961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAGAACTGACATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534497	536303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_534500_536300
818741	contig_7050_pilon	-	770	7	Intergenic	novelGene_153617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	156.53265544998	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	53	526	677188	595545	TRUE	15	TCTTGCTTTTCATTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLVGGVAALSVSLGHIAMAAGGGVAPAGEGLRYAEYSPPSARRPDADIDPGLARSLIAVGLGVAAFAFAGRYAFQIWKPLEQVITETAKKISNPSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGEQRPIVPWMAAWKLLRPQTLCNELGGRTEH	677240	585562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_595532_595640_631905_631977_637860_637938_651778_651853_654330_654383_677083
818742	contig_13014_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_169328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTCTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295025	293649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_293600_295000
818743	contig_5421_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_173685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	663	255	917	26679	26017	NA	30	GAAAACATCTGCTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPETEFEIDSFVDACEWKVSDIRSGHFRLLRGWLQSLVQDTKLHLQNIHLHEPNRGKLAQYFTTNKDKKRKLKRRESLLEQRSRMKGTFDRDAEYVRALRRHLVYYPSARPVLSLSSGSWTLKLNFFQEVLGASLRALYIVRDPRAWIYSILYSSKPSLYSLKNVPEHLAKLFKTEGGKGKCNLNSGYAFEYESLRKELSKSRSNAVSLLSHLWLANTAAALRINTDLLPTSYQLVKFEDIVHFPQKTTESIFAFLGIPLSLASLNQILFATSTNLFYLPYEGEISPTNINVWKQNLPRDEIKLI	26933	26016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5421_pilon_-_26000_26900
818744	contig_5041_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_27106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACAAATTATAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593841	595270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_593800_595300
818747	contig_7898_pilon	-	1312	2	Intergenic	novelGene_47583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCGTCGAGTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491450	489205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_490367_491299
818748	contig_11253_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_126831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGTGAAAGACGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159809	158914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_158900_159800
818749	contig_11253_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_126830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAGTGAAATTTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158672	157596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_157600_158700
818750	contig_1450_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_27382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264339	262750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_262800_264300
818752	contig_5136_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_126624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTTTTGTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229704	230052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_229700_230100
818753	contig_6533_pilon	+	1078	6	Intergenic	novelGene_114640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	45.0848089715372	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	59	406	113801	146933	FALSE	45	TTAAAAAGGATGTATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVDLCLSSEGTEVILATSSDEKHPPENIIDGNPETFWTTTGMFPQEFIICFHKHVRIEKLVIQSYFVRTLRIEKSTSKEPVDFEQWIERDLVHTEGRLQNEEIAQQRKKENQE	103189	147605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_103233_113785_113899_125966_126074_127313_127383_141030_141075_146903
818755	contig_11292_pilon	+	1338	9	Intergenic	novelGene_109413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGAGTAACACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161771	166132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_161951_162125_162203_163011_163159_163370_163466_164396_164551_164667_164827_165248_165388_165652_165712_165803
818757	contig_4857_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_48890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1429531	1427553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1427600_1429500
818758	contig_854_pilon	+	822	3	Intergenic	novelGene_36468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	18.5	287	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGACAGCTTCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513636	1527497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514651_1526816
818759	contig_19577_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_119835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATCTGAAATGAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34202	34537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_+_34200_34500
818760	contig_19577_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_119836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATATGCCCTGGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35098	36343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19577_pilon_+_35100_36300
818761	contig_6873_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_129820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCCGACACCCACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430288	431566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_430300_431600
818763	contig_11631_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_104213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCAGTATTTATTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274552	273591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_273600_274600
818765	contig_5671_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_79477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCATATATATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531229	531792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_531200_531800
818768	contig_5018_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_47013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1068	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATACATATTTTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259892	1260228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1259900_1260200
818769	contig_1836_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_71061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCAGCTTGCTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919078	918530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_918500_919100
818770	contig_17989_pilon	+	699	5	Intergenic	novelGene_150833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	158.992727821118	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	34	555	261854	265103	FALSE	5	TGTGAGTCTGTGGGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFINKGEKGIMVLAGDTLPVEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDLGAAAGSKRPTCVIMVKPHEEYQEAYDECLEEVQAPVLEAAVWAVGQPAATHAPSISSVA	261820	265247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262087_262158_264163_264270_264876_264982_265022
818771	contig_9440_pilon	+	2273	2	Intergenic	novelGene_59064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520487	523534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_521046_521819
818772	contig_10855_pilon	+	501	5	Intergenic	novelGene_124285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_3	52.9404146187013	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	176	499	169892	170849	FALSE	30	CATCACTGAGGATGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNNLLGTFIWNKALEKKGIGHLEEKELKERNKRIQEDNRLELQKVKQLRLEREREKAMREQELEMLQREKEAEHFKTWEEQEDNFHLQQAKLRSKIRIRDGRAKPIDLLAKYISAEDDDLAVEMHEPYTFLNGLTVADMEDLLEDIQVYMELEQGKNVDFWRDMT	167670	170851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_167711_169140_169237_169852_169999_170391_170555_170795
818773	contig_10855_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_124287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	119	685	181760	182326	NA	15	TTGTAGGCCTCCAGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRFLGPSADRLEAAVAATGPVGSGTGPNLAEPSSAVPSPMVSGHPDPPQEAGAGDTSPSTTQDSQSLSGTPRTAVGPSPRTEHRDQEGGRGLAVRHPHGRHALPCLGKPSSPDSSPMSQQPSPATKQPLSVSPFLRCEGRSWARNCHPQPQCPSEVGWAGRPRHELGPSHRGDVPRERAGPCQEPRPPRPLLRLPDQRPRPRAPTPLDSDAEPKHRVSSGSVLIYFS	181641	182419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_181600_182400
818774	contig_13490_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_129118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAACCTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22299	23844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_+_22300_23800
818775	contig_10434_pilon	-	1132	8	Intergenic	novelGene_82058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	272.007052729693	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	152	847	191899	164413	TRUE	40	ATCGTAAGTTTCTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVGVASPEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFNAVSGLNISADNEADFLAEIEALEKMNEDHVQKNGRKAASFLKDDGGPPVLHNE	192050	163765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_163936_164297_164521_165465_165526_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_191854
818776	SIRV5	+	223	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	291	154	177	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8492	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
818777	contig_10009_pilon	-	770	2	Intergenic	novelGene_82724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43869	41549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41913_43462
818779	contig_2069_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_23447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	466	834	1346645	1347013	NA	5	GTTACTGTTTTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGNLEGSVCWLQEHCLHVLHEDDAGKSGSPQTGSHTQKNELDPYLTPCTKINSKCIKDLNLTAKTIKLLEENVGEKLHDLGCGNRVLDTTPKAQKITEKMVNLEFVKIKSFCTSKTLSRE	1346179	1347709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1346200_1347700
818780	contig_821_pilon	-	1444	3	Intergenic	novelGene_149384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	73.5	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	348	818	171190	68751	FALSE	55	GAAGACATCATGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRVKLLIGPVQEIPAGQDQPPSGLMHQAFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQVPTGHGTQEQDVYQVPPSVQRSIGGTNGPHLSKKVSD	264083	68124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_69210_171178_171366_263911
818781	contig_10307_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_170289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCAGTCTACTTCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554754	555063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_554800_555100
818782	contig_15354_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_65713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	344	1035	96	1130	224792	223758	NA	25	GTAACTGGAATGCTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAKLIADVAPSAIRENDIKSYFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQGGDVLQNEEGETTSHLMGMFYRTIRMMENGIKPVYVFDGKPPQLKSGELAKRSERRAEAEKQLQQAQATGAEEEVEKYTKRLVKVTKQHNDECKQLLSLMGIPYLDAPSEAEASCAALVKAGKVYAAATEDMDCLTFGSPVLMRHLTASEAKKLPIQEFHLSRILQELGLNQEQFVDLCILLGSDYCESIRGIGPKRAVDLIQKHKSIEEIVRRLDPNKYPVPENWLHKEAQQLFLEPEVLDPASVELKWSEPNEEELVKFMCGEKQFSEERIRNGVKRLSKSRQGSTQGRLDDFFKVTGSLSSAKRKEPEPKGSAKKKAKTGAAGKFKKGK	224887	223036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_223000_224900
818788	contig_7025_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_104398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	900	1253	80480	80833	NA	40	AATATAAAAGTGCCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTQNSGQWFCVRRRQEDRTRAGYTGCCSSVSNNLGGKLVGGHMGLCFIIRPQNSHMYIYSFVYTKYFITKMIKEYLAIKKKVPGHASQNICILAHAPLTTSPNFESDQSLSSLIK	79580	81697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_79600_81700
818789	contig_14868_pilon	-	1260	2	Intergenic	novelGene_150445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGATATAGTAACAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125293	123000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_123606_124638
818792	contig_4180_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_8421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAGAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900359	901634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_900400_901600
818793	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	TTATGCTGCTTATAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
818794	contig_12919_pilon	+	1061	2	Intergenic	novelGene_75896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGTCCAAAAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719337	731062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_720303_730966
818795	contig_240_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_173797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506133	507899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_506100_507900
818797	contig_1009_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_121784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	845	1219	326090	325716	NA	65	ACTCACTAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFLSRIASSVPSPTNLSESLGFSMKDSNCRASFTTVSRKSSTVSVWGPLSLPCQPLRVLILIISSLLGSGLRTTGKRLLQFGGKFGTHLTSGSIFGKSKVRSLKRKWARVKRALPFFMQTGR	326934	325517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_325500_326900
818798	contig_6710_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_97722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	CTAATATTTGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
818800	contig_19173_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_176356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGCTATGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318	513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19173_pilon_-_500_1300
818801	scaffold_12124_pilon	-	1510	8	Intergenic	novelGene_22178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	94.534520204019	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	28	951	1368625	1242319	TRUE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSSGDWAAMSPLCAARAAVRVYVAGAAVILAQLLRRLRGALPEPVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSRRPGGISGLQSAAHRKVGGSSPPRGALEKRPGDLFLKNQPRKPSGAQFNSDTHGDPPESGANLKAAHNHHHDNIPSIATRPTEPTPRASWPWSSSPTTSSACWPPRGAT	1368652	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1245789_1246014_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368516
818803	contig_5018_pilon	+	917	6	Intergenic	novelGene_47137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	236.389509073478	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	73	669	1498209	1500271	FALSE	10	TGCGAATCTGTGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497675	1500519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
818804	contig_10531_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_114540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTGGCATTTCAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498306	498906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_498300_498900
818805	contig_10531_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_114541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAAACCAGGTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499676	500067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_499700_500100
818806	contig_15631_pilon	+	876	8	Intergenic	novelGene_151540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_4	120.208662121245	2210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	40	642	386533	393584	FALSE	30	GGAGTATGCCAACATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVTDLQRLQTNVEELERWVYGPGGARGSRKVADGLVKVQVALGNIASKRERVKILYKKIEDLIKYLDPEYIDRIAIPDASKLQFILAEEQFILSQVALLEQVEALVPMLDSPHIKGCCRVWILPSESLAAVPEHAARLQRLAQIHIQQQDQCVEITEESKALLEEYNKTTMLLSKQFVQWDELLCQLEAAKQVKPVEE	386493	393818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_386629_388588_388674_389347_389435_391521_391606_391894_391937_392557_392617_393240_393301_393494
818809	contig_12622_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_5775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAGTTAAGCAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113818	115323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_113800_115300
818810	SIRV2	-	246	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	51	3435	-16	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGACGTGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
818811	contig_5260_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_144396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445207	446558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_445200_446600
818813	contig_10339_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_125277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAACATGCTAACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338862	340264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_338900_340300
818814	contig_1141_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_136914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGAATCTCCACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356426	355284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_-_355300_356400
818815	SIRV6	+	753	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	29	1	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	45	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818818	contig_5551_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_134254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCAGCACATGGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579414	580668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_579400_580700
818819	contig_15820_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_174596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136177	137872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_+_136200_137900
818820	contig_10074_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_57159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511792	513622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_511800_513600
818821	contig_10324_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_7826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGGGGGAGGGGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261035	259929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_259900_261000
818822	contig_4252_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_176362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400732	402378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_+_400700_402400
818824	contig_11832_pilon	+	1325	4	Intergenic	novelGene_106973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.9326889224701	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGGCTTGGTGTCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463848	466627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464918_465610_465802_466357
818828	contig_11337_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_107207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAGGGAATCAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366636	365163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_365200_366600
818830	contig_5574_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_155872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249830	250284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_249800_250300
818832	contig_15120_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_108020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTGGCAATTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229084	230193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_229100_230200
818833	contig_18184_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_123857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCTTTACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42817	41175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_41200_42800
818834	contig_15744_pilon	+	694	5	Intergenic	novelGene_83601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	32	391	149562	153280	FALSE	25	TAAATGACAGTTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGWMASMWSLGK	149530	153583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152669_153245
818836	contig_1406_pilon	-	1076	4	Intergenic	novelGene_25526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_1	74.5311269798659	296	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCTGAAGTCTTAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058887	1828981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1829712_1977741_1977871_2012379_2012515_2058805
818837	contig_7362_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_147557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGAAATAAAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457309	458753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_457300_458800
818838	contig_11986_pilon	+	1601	13	Intergenic	novelGene_69079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	129.495468603689	652	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	5	1285	10419	18605	TRUE	20	AAACTGGGTCTGTCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMYYGYYSNTTLNQQCAPPLDGNQCTRGEGGLPYNMPLAYLFTMGVAFFITCITLVYSMSHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCYAVWQPWTPCMRRARCGCAAWSGQGPGSPGCPGSITTCWRTPSSSSWCRPCCSLSSTSTSRW	10414	22182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_10589_11809_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17285_17476_17620_18573_18653_21266_21335_21981
818844	contig_8921_pilon	-	2318	4	Intergenic	novelGene_161627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	5.09901951359278	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	200	1450	90832	78236	FALSE	5	TTTTTTGGTTGGGGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALMGPARVSVMFKDVAVTFTREEWGQLDLAQRTLYREVMLETCRLLISLGHPVPKPELTHLLEHGQELWRVKRGPSQSTGSGDRAKFQTREPTASKPILSKEDLLQRSLTQGSPKDSRLGQARDQETQKGQMRPGTNLHKQTHPGKMSIELDGWLTEESLHSRALQERVSPGDILHKLDSHRPRMTPAGKNPYECKECGKGFNRKWNLVRHQQVHTGMKPYECNECGKVFSQSSTLIRHYFIHTGEKPYKCVECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSECRMAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKTFSSREYLIQHYVIHTGEKPYDCAKCGKAFRCSSELTQHLRIHTGEKPYECVQCGKAFHRSANLIQHTVIHTGEMPYKCIECGKAFRRRSHLMQHHQTHS	91031	77367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_-_79231_82759_82856_86980_87108_90799
818845	SIRV6	+	240	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	57	486	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818846	contig_2710_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_161790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGTAAAGATAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048577	1046953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1047000_1048600
818847	contig_378_pilon	-	1390	7	Intergenic	novelGene_175166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	568	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGCTGGCGTCGGCGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238900	226174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_378_pilon_-_226378_228679_228748_232149_232325_234384_234487_235772_235949_236930_237000_238303
818848	contig_12543_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_168379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTGTTAGTTATTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348940	349955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_348900_350000
818850	contig_5018_pilon	+	516	3	Intergenic	novelGene_47166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	956	junction_1	19	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGAATCTGTGTCGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499235	1500518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1499288_1499456_1499588_1500185
818851	contig_13905_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_130412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66814	68079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_66800_68100
818852	contig_2310_pilon	+	1164	9	Intergenic	novelGene_71612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	273.966894669776	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	84	449	106726	115004	TRUE	15	GGAGCCTTTCCTGCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSVSI	106080	127689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107863_108061_110704_110785_114930_115017_122881_123054_124481_124637_126508_126652_127456
818854	SIRV4	-	607	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	12	-2	12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5146	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
818855	contig_12624_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_61011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCGATGTAAAAGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791703	790309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_790300_791700
818856	contig_16098_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_45798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTCCCCCCAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52962	52017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_52000_53000
818858	contig_4079_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_167484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCAATATCCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136430	138833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_136400_138800
818859	contig_9548_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_141070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCACGTGAAAAATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167475	166236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_166200_167500
818860	contig_9548_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_141069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAACTTAGTAGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166188	165484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_165500_166200
818861	contig_14441_pilon	+	646	4	Intergenic	novelGene_100428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.9394419523265	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	205	645	116728	117795	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGLQAAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKPINTACLAL	81885	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81901_113670_113711_116578_116957_117583
818862	contig_8269_pilon	+	2379	13	Intergenic	novelGene_106213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_2	479.025653163679	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	546	2144	342693	378321	FALSE	20	GCCTCAGCCACCATCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEGSIISSPHMRRRATSTRECPSRPHQTMPNSSSLLGSLFGSKRGKPPSQAHLPSAPPQPPLHPPILPHPQHPSAGHHQGSAEGQTQAQVHGHHSQYCHMQQNPPPYHHHHHYHPPQHIQHAHQYHHGPHGGHPPYGAHSHGHPPLPSAQVGHAAHHHGQPPAPPPPTSSKAKPSGISTIV	233270	378556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_233343_318457_318753_339814_339977_342676_342800_344516_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_376430_376481_377781
818863	contig_1090_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_131109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAACGGAATGAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313347	314198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_313300_314200
818864	contig_4103_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_52020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCTTCTGACCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528798	591621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_529278_577146_577334_591519
818865	contig_8177_pilon	-	1029	3	Intergenic	novelGene_86509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCTCCAGGCTGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104178	100317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_100395_101333_101535_103427
818866	contig_9272_pilon	+	1761	6	Intergenic	novelGene_125923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	119.095927722152	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	192	668	322791	327292	FALSE	35	CTCGTATGTAAAATACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLYRNPYVEADYFPTKPMFVIAFLSPLSLILLAKCLKKADTADSRQACLAASLALALNGVFTNTIKLIVGSCICWPGLCFLLPGREATLLHTTRPWEILEVLCLPVTSTFRSCDCTVPYLRLQASLARCPSWIHDWPDFCLRLLQAVLSSTDGCRMP	322422	328385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322565_322741_322851_323324_323416_323879_323944_325357_325529_327201
818867	contig_20996_pilon	-	1368	6	Intergenic	novelGene_175573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	16.5843299533023	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	141	551	60258	23510	TRUE	10	CTTCTGGACTCTGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLRRELSCLGENPKKVREETSEVGKRRQEMTEFERQNQGQHKKSQEVSSTSNQDNEDNNGLEEVCYTIIHHSRYQTSSLSSNDDGYENIDSNTNRVREFRDGSATEYALLRTACVSRRSSCTHEPDYELVLPY	60398	19488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20996_pilon_-_20267_23470_23753_24637_24667_38850_38901_47490_47551_60229
818868	contig_5217_pilon	-	453	5	Intergenic	novelGene_135789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	2.29128784747792	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	62	451	596937	589331	FALSE	20	GCCCATGCCTGCAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSIQNRLFPGLAIKIQRSNGLIHSASVRTVNMEKSCVSVEWTEGGATKGKEIDFDDVAAINPELLQLLPLRPENNLPLQENVTVQKQKRRSITSKIPAPKEALRGRSTRMSTVSEVRITTQENDMEVE	596998	589328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_589411_591246_591296_591459_591562_595681_595777_596873
818869	contig_5217_pilon	-	2202	15	Intergenic	novelGene_135788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	2.12011743995083	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	22	1557	587265	578570	FALSE	55	CAATAAAGAAAAATCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRAQNSEMRIKRAQEYDNSFPNWEFARMIKEFRANLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRKRPLNKQELAKKEIDVISVPSKCLLLVHEPKLKVDLTKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVYRFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHTMGGDLSGKAQNASKGIYAMASQDVFLLKNQPRYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKAKLRVLEDGKQQVQVVGLQEHLVNCADDVIKMIDTGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQILLRAKGRVHGKFSLVDLAGNERGADTSSADRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHTPFRESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIAMISPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGEQPTQMETEETEVSSNGALIEGNFSREEEELSSQMSSFNEAMTQIRELEDRAVEELKEITQQGPDWLELSEMTEQPDYDLETFVNKAESALAKQAKHFSALQDVIKALRLAMQLEEQASKQISSKKRPQ	587286	577924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_578653_578801_578926_580372_580487_580583_580690_581065_581134_581995_582107_582215_582421_583266_583410_584148_584241_584317_584382_584604_584696_585782_585946_586031_586087_586520_586617_587244
818872	contig_2069_pilon	-	1174	5	Intergenic	novelGene_23428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	652.117129049682	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTGCCTCTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331371	1327098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327966_1328524_1328599_1329447_1329503_1330139_1330201_1331254
818873	contig_2278_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_118159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510330	1509190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1509200_1510300
818874	contig_2069_pilon	+	1436	5	Intergenic	novelGene_23358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	37.2785125776231	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	105	1121	947018	955281	FALSE	15	CTTTCTGTGGCTTCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAPTTAFGQVVIGPPGSGKTTYCLGMSEFLRALGRRVAVVNLDPANEGLPYECAVDVGELVGLADVMDALRLGPNGGLLYCMEYLEANMDWLHAKLNPLRDHYFLFDCPGQVELCTHHGALRSIFSQMVQWDLRVRLRLGRPVMQIRLREEGRCHAPMSHSELTAVHLVDSHYCTDPAKFISVLCTSLATMLHVELPHVNLLSKMDLIEHYGKLAFNLDYYTEVLDLSYLLDHLTSDPFFRHYRQLNEKLVQLIEDYSLVSFIPLNIQDKESIQRVLQAVDKANGYCFGVHEQRSLEAMMSAAVGADFHFSSTLGIQEKYLTPSDQSVEQEAMQL	946913	955596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_947513_947996_948154_949924_950086_951355_951487_955208
818875	contig_6270_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_99900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATGGTGTATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1206845	1204706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1204700_1206800
818876	SIRV6	-	351	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8929	408	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGCTGCCCCTGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10749	1136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1533_1640_1734_2767_2828_3105_3164_10723
818877	contig_10867_pilon	-	414	4	Intergenic	novelGene_159453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2670	junction_1	1715.9722867485	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	53	382	87815	86811	FALSE	20	AATGTTAGGTCTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	88221	86778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193
818879	contig_9053_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_87926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTGTATAAGTCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95944	94448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_94400_95900
818880	contig_10140_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_148390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTTGTAGTTATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142661	144098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_142700_144100
818882	contig_15043_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_175510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTGCCCACAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269791	271955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_269800_272000
818883	contig_15838_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_174342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCACCCTTAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269448	269056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_269100_269400
818886	contig_5264_pilon	+	1997	2	Intergenic	novelGene_165055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAACAAAGCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106365	110768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_106430_108835
818887	contig_15866_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_63598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACAGCCACATCTTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258600	257103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_257100_258600
818888	contig_14483_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_133780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	902	1282	203700	203320	NA	35	AGGAGGTAATAAGTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLSPPPEGQGRSCSLFSKYTSTKSLGTLCRTSALFMKVCCGRTICSGSRTGKEVDVSEERLCALCIKSSTDIYFTYSSRGGQGGSCGDPAQFPASAPHVQPPPVCQWRLACCCDVEQVSAQLPD	204601	202140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_202100_204600
818890	contig_15185_pilon	+	1369	5	Intergenic	novelGene_99418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_3	19.704060495238	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAATGGCTGTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228707	230856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_229487_229942_230003_230083_230247_230385_230471_230574
818893	contig_5033_pilon	+	945	6	Intergenic	novelGene_29101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTATCAAAGGGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788658	859195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_788972_789753_789916_812829_812918_825674_825798_846032_846154_859057
818895	contig_3654_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_174985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136728	136403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_136400_136700
818897	contig_14445_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_137366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGCATATAAAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323501	321743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_321700_323500
818898	contig_20819_pilon	-	537	4	Intergenic	novelGene_55694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	45.0209827623619	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	222	536	116049	114553	FALSE	25	TGATCTCTAAGATCTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWRQRRRELLSEQGLQTERTRPAVQAQREALRQPGRRQLEPAFLSSSCSSSSSSSSSSSAAGPWWEGLCLVTMTTPANAQNASKTWELSLYELHRTPQEAIMDGTEIAVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCSDCIVTALRSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDA	116370	114551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_114629_114752_114914_115971_116142_116241
818901	contig_13143_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_176364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19035	17324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13143_pilon_-_17300_19000
818903	contig_14563_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_135070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTACACATTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242353	242733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_242400_242700
818905	contig_10861_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_39389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTAATGATTCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1884058	1884955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1884100_1885000
818908	contig_5120_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_169616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATAGCACCATGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253071	251993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_252000_253100
818909	contig_15207_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_176365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGCATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10099	12266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_10100_12300
818910	contig_7895_pilon	-	1267	4	Intergenic	novelGene_154439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_3	73.8572196124989	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	67	936	633502	624136	FALSE	10	ATGGTTTCATTTGGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQDPDSDPDYEALPAGATVTTHMVAGAVAGILEHCVMYPIDCVKTRMQSLQPDPAARYRNVLEALWRIIRTEGLWRPMRGLNVTATGAGPAHALYFACYEKLKKTLSDVIHPGGNSHIANGAAGCVATLLHDAAMNPAEVVKQRMQMYNSPYHRVTDCVRAVWQNEGAGAFYRSYTTQLTMNVPFQAIHFMTYEFLQEHFNPQRRYNPSSHVLSGACAGAVAAAATTPLDVCKTLLNTQESLALNSNITGHITGMASAFRTVYQVGGVTAYFRGVQARVIYQIPSTAIAWSVYEFFKYLITKRQEEWRAGK	633568	623804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_624654_626012_626070_627190_627420_633436
818912	contig_13702_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_102618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGAATGTAGAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198022	198254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_198000_198300
818913	contig_4301_pilon	-	1242	4	Intergenic	novelGene_65086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	366	junction_1	95.4195414414096	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	851	1153	424182	421030	FALSE	20	AGGGAGGATTTGGGGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDQETYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQVSVGVLLVSWSVVTLKGHREYMSIQ	425584	420940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_421196_422457_422553_424140_424210_424761
818914	contig_13542_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_131474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTGGTATCACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218274	219273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_218300_219300
818917	contig_7357_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_36766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	763	1065	72660	72358	NA	40	CAATGTGGTAACAGCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLTCFPLGTLHSPEGRGSYHLGMLCLTCFPLGTLHSPEGRGSYHLGMLSLTCFLPGTLHSPEGRGSYHLGMLSLTCFLPGTLYSPEGPGTVIILRCLP	73422	71673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_71700_73400
818921	contig_14925_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_55382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCGGGTCAGCAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150120	151016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_150100_151000
818923	contig_5023_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_7124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157899	156449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_156400_157900
818924	contig_10235_pilon	-	1057	4	Intergenic	novelGene_46497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_1	26.7124606795322	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	129	395	250336	249959	TRUE	45	AATCAGATTCTGCAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVNPSFALTSNLSRVRLGQNESAWGCLWLEVPDSAALDSVVMVTVTTAGREANSVPPTHAFLRLLVLAPAPQDELTAFAHSTGPVLTTASPAFRLSTLVTHGRARGQMAGSPWWGTVGGVLLLLCLASW	250667	248886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_249532_249941_250133_250243_250419_250621
818925	contig_5039_pilon	+	2238	14	Intergenic	novelGene_64940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTGCACTCAGTGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443810	1495402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1444167_1444511_1444711_1446787_1446899_1450880_1451007_1453258_1453301_1456630_1456802_1460821_1460900_1461725_1461935_1464676_1464833_1469128_1469377_1477865_1477992_1479887_1480116_1481900_1482028_1495341
818926	contig_1244_pilon	-	2069	3	Intergenic	novelGene_37945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	5	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGATGAAAAAGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870534	811428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_813392_851591_851640_870476
818927	contig_401_pilon	-	1609	4	Intergenic	novelGene_42888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	24.0970260959038	197	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	375	524	1784350	1784201	FALSE	20	CGCCCCGCAGACTCATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLEAHNKGTKHKTILEARSGLGPIKAYPRLGPPTPGEPEAPAQDRTFHCEICNVKVNSEVQLKQHISSRRHRDGVAGKPNPLLSRHKKPRGAGELAGTLTFSKELPKSLAGGLLPSPLAVAAVMAAAAGSPLSLRPAPAAPLLQGPPITHPLLHPAPGPIRTAHGPILFSPY	1785641	1783115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1784432_1784577_1784674_1785084_1785255_1785614
818928	SIRV6	+	235	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	488	60	488	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10725	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
818929	contig_6494_pilon	-	705	6	Intergenic	novelGene_108581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1066.53543776098	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	409	705	3457	2692	FALSE	35	CAGAAGGGTGGGAAGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISE	8312	2691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2829_3297_3486_5564_5660_6391_6490_6751_6883_8256
818930	contig_10020_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_168284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67038	67725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_+_67000_67700
818932	contig_15384_pilon	+	2228	18	Intergenic	novelGene_85132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	9.95595838010766	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	22	2154	113207	118314	FALSE	5	CGCCTGTGCAGGGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLPARRMEWLPFLLLLTQCSGAPGQRSLLNDFQVLRGTELQHLLHAVEPGAWQEDVVDAEECAGRCGPLLDCRAFHYNVSSHGCQLLPWTQYSPHTRLQRSQRCDLFQKKDYVRTCIMGNGAGYRGTVATTVGGLPCQRWSHKFPVDHKYVPTLRNGLEENFCRNPEGDAGGPWCYTTDPAVRFQSCGIKSCREATCVWCNGEDYRGAVDRTESGRECQRWDLQHPHPHPFEPSKFLDKNLDDNYCRNPDGSERPWCYTTDPLVEREFCRLPSCRSEAQPRQATTLNCFRGKGEGYRGVANTTAAGVPCQRWDTQSPHQHRFAPEKYACKDLRENFCRNPDGSEAPWCFTSRPGMRVAFCYQIRRCADDVRPEECYYGAGEQYRGSVNKTRKGIPCQRWSAETPHKPQFTPTSAPHAKLEENYCRNPDRDRHGPWCYTTDPGTPFDYCAVRRCDNDQPPSILEPPDQVLFEECGLRVDRPDHWHSKLRVIGGQPGNSPWTVSLRNRQGHHFCGGSLVKEQWVLTARQCFSSCHVPLLGYEVWLGMMFQNPQPGEPDLQRVPVAKMVCGPSDSQLVLLKLERPVTLNQRVALICLPPERYVVPPGTKCEIAGWGDTKGTGNDMVLNVASLRVISNQECNVKHRGRVRESEMCTSGPLVPVGACEGDYGGPLACLTHDCWVLEGIIIPNRVCARPRWPAIFMRVSMFVDWIHKVMRLG	113185	118388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_113259_113933_114082_114159_114273_114362_114478_114554_114692_114771_114893_115014_115134_115325_115492_115641_115773_115874_115978_116604_116742_116829_116866_116944_117066_117217_117296_117437_117585_117663_117771_117886_118027_118152
818933	contig_10003_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_88271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTCCATTGCCAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792646	792192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_792200_792600
818938	contig_18544_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_152758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCCTAAGGGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118731	118124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_118100_118700
818939	contig_1694_pilon	+	1443	3	Intergenic	novelGene_144931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497302	501953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_497977_498563_498766_501386
818940	contig_10050_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_119613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118337	117558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_117600_118300
818941	SIRV6	+	469	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	217	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1847_2027_2470
818942	contig_3153_pilon	+	940	5	Intergenic	novelGene_104701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	124.860922629941	886	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	212	511	448580	456427	FALSE	5	GCCATTTTTTCTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKTQFEDRN	448269	456856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448445_448543_448616_448707_448756_454168_454312_456354
818943	contig_9727_pilon	-	1041	5	Intergenic	novelGene_86265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	25.7038421252543	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	7	624	101964	76915	FALSE	15	TCTGTGAGGACACTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNMAEASGCDSSNRCEENGREGSSPKSLLPGTTISRVKLLDTMVDTFLQKLIAAGSYQRFTDCYKRFYQLQPEMTQRIYDKFITQLQTSIWEEISEIKQEGNLEAILNSLDKIVEEGRDRKEPAWRPSGIPEADLRSTMAPYLLQQRDALQRRVQKQEAENRQLADAVLAGRRQVEELQLQIQARQQAWQALHGEQRELAAVLREPE	101970	76497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_76969_78515_78712_80790_80892_81860_81967_101803
818944	contig_7695_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_41694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACAGCCCCGCCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154940	1153978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1154000_1154900
818946	contig_10848_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_133537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATACCAACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843700	841877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_841900_843700
818947	contig_10424_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_56817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411977	413389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_412000_413400
818948	contig_7135_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_136954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTAAACTTTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319226	316827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_316800_319200
818949	SIRV6	+	332	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	524	0	351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
818952	contig_18231_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_105895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAGTTTATCTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277608	278507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_277600_278500
818954	contig_11318_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_48164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTAAAAAAACCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59693	58788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_58800_59700
818955	contig_5588_pilon	-	2449	2	Intergenic	novelGene_172838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	544	915	988418	988047	TRUE	25	GGAAATGAAGCTGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDHGLQGPTASRPWPDPRSLIQFRHPGPAPEPSLGPLHLASSVHSTDISSIITFLTTLGQVSPLQNNKRKERSSHYPAQFPSLHLAALLVSMICARLPHPNVSSERRDLSAGVGMGEEVHRS	988961	971522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_971758_986747
818957	contig_15070_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_164891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAGAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398212	399772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_398200_399800
818964	contig_13300_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_125840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGGTGTACCGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208885	1209132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1208900_1209100
818966	scaffold_13505_pilon	-	563	3	Intergenic	novelGene_111441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	23	469	535595	530736	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRGECPRTCLLPFPGSSLLPAWWVMSP	535617	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_530794_532688_532999_535516
818967	contig_20610_pilon	+	737	4	Intergenic	novelGene_67648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	175.48092647224	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATGCTGTTAGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49825	53419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_49962_51483_51587_52403_52513_53030
818968	contig_6344_pilon	+	751	5	Intergenic	novelGene_157096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGCCCTGGGGGCTCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836285	846737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_836521_837527_837632_839174_839280_842316_842534_846647
818969	SIRV6	+	401	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	29	588	22	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGTTTATAGTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	1952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
818970	contig_8452_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_48072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAGAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942893	941124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_941100_942900
818973	contig_12227_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_127399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATCCTGAGTTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133823	132984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_-_133000_133800
818974	contig_9185_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_166903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332385	333340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_332400_333300
818975	contig_9609_pilon	+	1046	2	Intergenic	novelGene_22934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	146	1006	71026	72638	FALSE	15	GACTGTTCTGGCTCCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGATEREELRLKAEGARAPLARPLGPLSAAPAAVRGGTGRPGGGSGTGMHSARLDSFLGQLRWELLCGRDTGSPQMPGSLRPSPKPGRAVRPSHQLRASDASEEDSACCVEEEDEEEVVMTGDRAAALRGPREHTLDWDSGFSEVSGSTWREEELPVLQRPAPPSRPPHSQRLSASGLPLPSRASLASAPPAHRPRPKSTPDACLEHWRGLDSEDWTAALLSRGRSRQPLVLGDNCFADLVHNWMELPEAASEGGGGGGSGPRARPRPPQFLLGLSEQLRRRLAGARRAAMVGKRLSCPPRPEPELPADVSRFAALMSCRSRQPIICNDVISYL	70880	72678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_71077_71828
818976	contig_12050_pilon	+	869	9	Intergenic	novelGene_62634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	171.905088275478	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	37	666	357478	363762	FALSE	5	GCTTGGAGCCCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAERAVLEEEFRWLLHDEVHAVLRQLQDILKEASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLGWISSPFPC	357441	363965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362656_363729
818977	contig_10323_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_123537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1067	1462	239863	240258	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHGQVCRHNLGEPGRVQGQTVVWGHSLATPSSFRCSRGRRMESCSTVQVTKCGLAPLPRGSTPSSLAIWLSRKCLTIEWITKLFDCRDGAEKALTKSVLREELNNSLSHLYFLLWLTLKKKKKKVSDPSP	238796	240477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_238800_240500
818978	contig_19606_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_148285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGAGGCTTGTCCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173090	173890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_173100_173900
818979	contig_11816_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_98610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498831	1499664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1498800_1499700
818980	contig_20614_pilon	-	976	9	Intergenic	novelGene_107533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAGGACAGAGTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123480	69074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_69302_81155_81257_82947_82994_83220_83291_86601_86649_87518_87595_88008_88060_99106_99175_123190
818981	contig_15364_pilon	+	321	4	Intergenic	novelGene_176373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.49691252107735	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAGCAGCTGTCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14234	62330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15364_pilon_+_14356_48556_48635_49330_49401_62278
818982	contig_15364_pilon	+	1296	2	Intergenic	novelGene_176374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAATCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68451	70255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15364_pilon_+_68510_69017
818985	contig_1939_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_144855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	476	961	194082	194567	NA	40	GGGAAAACTCAAATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRNPENGGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTDQYNPNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKVSDCFQFLIAGRLFPCCTAANLQFLRREFVCLPFAPGGQCLQMQDSLVLGFTTSKPRFFGFC	193606	194917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_193600_194900
818987	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	3	1156	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
818988	contig_7050_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_153623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGGAAAAATAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670349	668668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_668700_670300
818989	contig_3818_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_99285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	690	1004	702994	702680	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGVYLGEQVTSLILRQQPAGGYSFLSVADGHRQGVPWASGGSPAGGPYLSPQPSELKCPREGTGWGGLKLDVLVCTTPGFRTEDFSVTWTWAEVDITGLPQV	703683	701875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_701900_703700
818990	contig_401_pilon	-	1449	3	Intergenic	novelGene_42741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1039	1413	238511	238137	FALSE	55	AATAAGAAGATATTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKCVKRSLAILASKEHSGCTSSKTDLFILLAVHSIFNILCHHHNSKASILLQSSLFIVQLLPAHEVVEKTMAWVKLTLVLKVTSLLFNIFKEIHTRTCIMYVHTHTYYSIL	242979	238100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_239289_239429_239582_242870
818993	contig_1406_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_25519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGCAAACATTCATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677663	1678592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1677700_1678600
818997	contig_8476_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_121347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAGAAAAAAATAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174244	172188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_172200_174200
818999	contig_9177_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_32731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCAACATTTTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684020	684396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_684000_684400
819002	contig_10861_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_39462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTACTTTGTGGGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2625646	2624773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2624800_2625600
819004	contig_1719_pilon	-	785	5	Intergenic	novelGene_87374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	559.780928131711	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	58	528	803613	767007	FALSE	20	GATACTTTTGCCTGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQGRWAMSGDIFGCPRRKVLVASGG	803670	766749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_767079_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
819006	contig_2455_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_119216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366362	1367029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1366400_1367000
819007	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819008	contig_6375_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_73054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTGCAATGTGAAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540632	541568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_540600_541600
819009	contig_5361_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_167208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGCTACAGTCGGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435406	436052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_435400_436100
819010	scaffold_16539_pilon	+	1753	14	Intergenic	novelGene_68375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	35.9412735991505	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	216	1661	587312	617625	FALSE	5	TGCCCCTCCCCTCGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEVSVIKEGWLQKRGEYIKTWRPRYFLLKSDGSFIGYKERPEAPDQTLPPLNNFSVAECQLMKRERPRPNTFVIRCLQWTTVIERTFHVDSPDEREEWMQAIQMVANSLKQRGPGEDSMDYKCGSPSDSSAAEEMEVAVSKAQAKVTMSDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKATGRYYAMKVLRKEVIIAKDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEIDTRYFDDEFTAQSITVTPPDRYDSLGSLELDQRTHFPQFSYSASILE	563622	617717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_563762_587235_587358_595050_595180_597092_597205_609699_609854_610348_610481_612155_612222_613174_613244_614032_614156_615281_615411_615536_615752_616279_616368_616464_616568_617545
819012	contig_3975_pilon	+	906	3	Intergenic	novelGene_54756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	73	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTATAATAAAATACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961310	1966606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790
819013	scaffold_16539_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_68374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATGGTCTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543133	544800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_543100_544800
819015	contig_14023_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_165345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACAAACTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24522	24847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_24500_24800
819016	contig_709_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_57607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCTGTCATAAGTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2377701	2375959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2376000_2377700
819017	contig_12278_pilon	+	1476	8	Intergenic	novelGene_152608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	47.2194183507988	22	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	105	584	246858	249463	TRUE	5	TAGGCTGGGCTCTGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHILEHRVRVLSLARPGLWLYTHPLIKLLFLPRRSRCKFFSLTETPEDYTLMVDEEGFKELPPSEYLQVAEATWLVLNVSSHSGAATAVQAAGVTKIARSVITPLAEHHVSVLMLSTYQTDFILGPAQRCILFRALKIASVSSRWTPRRCQPSPPRS	246753	251183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_246971_247586_247658_248744_248939_249361_249486_249924_250039_250197_250282_250365_250461_250606
819018	contig_6241_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_156396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCGCCCAGCTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97639	96562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_96600_97600
819019	contig_3942_pilon	+	453	5	Intergenic	novelGene_128763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	38	424	793521	795407	FALSE	10	CTGCTGATGGCCTCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792277	795436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
819020	contig_14687_pilon	+	1248	4	Intergenic	novelGene_107901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAAATTTCTTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415431	422953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_416249_416565_416696_421404_421585_422832
819021	contig_12019_pilon	+	1985	7	Intergenic	novelGene_87760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	32.6224190124249	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	296	1114	713694	726110	TRUE	15	CTCTTTCACTCACCTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPREEAAEVREEEEKEEVAEAEGAPELNGGPEHSLPSSSYSDLSQSSSPPSLLDQLQMGCDGASGGSLNMECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRRTIRMKLEYEKCERSCKIQKKNRNKCQYCRFQKCLALGMSHNAIRFGRMPEAEKRKLVAGLTASEGSRHNSQVADLKAFSKHIYNAYLKNFNMTKKKARGILTGKASHMAVSVTARLCSTPGSGPRCLLPASWENQASSLPSLPGTGRGCGKRMGVGGRRGLASNRAWVFSPL	648154	727753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_648265_652598_652683_713592_713824_723006_723162_723984_724124_725715_726552_727323
819023	contig_13702_pilon	-	1495	8	Intergenic	novelGene_102604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACTGATCCTGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137707	129871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_129953_130749_130868_131348_131559_132892_133145_134364_134529_135347_135853_136975_137075_137641
819027	contig_11104_pilon	-	1325	5	Intergenic	novelGene_112470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	81.3833521059436	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	142	627	359149	344102	FALSE	55	AAAAAAAACGGATGGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVLERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMETISPLKNGMVEEWDSFQAILDHTYKMHIKSEASLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAYP	359290	343403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_344210_344488_344590_349659_349835_349977_350055_359124
819028	contig_6270_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_99898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCACAGCAACCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200114	1198465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1198500_1200100
819031	SIRV6	+	366	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3034	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819032	SIRV4	+	377	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAAAAACCACTTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
819035	contig_6960_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_60234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATATTGTCATCACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249780	248654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_-_248700_249800
819036	contig_401_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_42900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCATTCTACGTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1828074	1827186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1827200_1828100
819037	contig_5039_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_64898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCAGACAGGAGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599563	601996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_599600_602000
819039	contig_11281_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_125488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAGTATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905223	906952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_905200_907000
819040	contig_6870_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_103994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAGAGAGAGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493404	1491352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1491400_1493400
819041	contig_9727_pilon	+	1803	1	Intergenic	novelGene_86383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCACTTTAAACAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580257	582060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_580300_582100
819042	contig_6434_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_61828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTATGCTGAGTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692075	693546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_692100_693500
819043	contig_12603_pilon	-	1274	7	Intergenic	novelGene_105815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	86.3346203250276	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	182	1054	643013	630997	FALSE	55	GTCGGCCAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPVFTLKLRHKIIPRMVAIGRYDGTHPCLAAATQADKVFIHNPHTRSQHFSASRVIQSPLESDVSLLNINQAVSCLTAGVLNPQLGYDALLVGTQTNLLAYDVYNNSDLFYREVADGANAVVLGTLGDISSPLAIIGGNCALQGFDHEGNDLFWTVTGDNVHSLALCDFDGDGKKELLVGSEDFDIRVFKEDEIVAEMTETEIITSLCPMYGNRFGYALSNGTVGVYDKMARYWRIKSKNHAMSIHAFDLNSDGVPELITGWSNGKVRLSSKVEVEVKIIIAGYVLAV	643194	630776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_631153_631228_631334_635905_635984_636778_636842_637113_637240_638248_638477_642896
819044	contig_9687_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_172731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81612	82871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_81600_82900
819045	contig_10734_pilon	-	1406	4	Intergenic	novelGene_51275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCACGTGACGGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342884	1336658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1336826_1339436_1339503_1339939_1340076_1341847
819046	contig_817_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_132472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTATTTTTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682652	684355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_682700_684400
819048	contig_9471_pilon	-	860	7	Intergenic	novelGene_21841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCCCAGCAATTCAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417524	413988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_414084_414633_414665_414822_414933_415628_415714_416194_416273_416938_417026_417150
819049	contig_7593_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_127337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575597	577382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_575600_577400
819050	contig_3147_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_142289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCCCCCAAGTAGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292292	294143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_292300_294100
819052	SIRV4	+	365	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTAACAGTTTCCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
819053	contig_8357_pilon	-	1548	10	Intergenic	novelGene_39702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	92.7840982544363	10	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	806	1321	314447	312261	FALSE	20	GAAGGCTTAGTACTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIAEEFYQSLEIPYHIVNIVSGSLNHAASKKLDLEAWFPGSGAFRELVSCSNCTDYQARRLRIRYGQTKKMMDKVEFVHMLNATMCATTRTICAILENYQTEKGIIVPEKLKEFMPPGLQELIPFVKPAPIDQEPSKKQKKQHEGSKKKVAAGDVALEGRLQNMGVTDA	333200	312033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_312419_312760_312891_313938_314097_314377_314508_315072_315185_319011_319112_320100_320260_321801_321883_325418_325501_332989
819054	contig_2204_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_71684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGCCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42904	41856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_41900_42900
819055	contig_2204_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_71683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAACTGTGCCCTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41257	40957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_41000_41300
819056	contig_12150_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_6962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAACCTTTGAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93502	93721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_93500_93700
819057	contig_6710_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_95821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653758	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
819059	contig_12622_pilon	-	872	6	Intergenic	novelGene_6049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	553.426779258106	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	208	522	1686921	1685486	FALSE	35	GAATTAAATCGGGACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEARQLPSRTRSSSSPGSPSSRVSINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSHMAFLTVKGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691217	1685135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685865_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687861_1691145
819064	contig_10627_pilon	+	1225	4	Intergenic	novelGene_59907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	32.3968448395142	477	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	128	1096	29148	32932	FALSE	0	CCTGTGCCCTTTCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAGRNCSFSCLSAPPQLPLCGFSVARSTGSQLVWWLPVTTQIMRGNAIINSKNAGNTGLQLLAATPDLHPPSLRRRPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPGSAEKAFEVYIWPEQVVVESSRSLEVNCSTNCAQPESGGLETSLTKTLLASQARWCQFLISDISQDTVLLCHFTCLGEQQSKNATISVYHPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYEPMQDNQMIIIVTVVSVLLFLFVTSVLLCFVFGQHWHQKRTGTYGVLAAWRRLPWAHQAQVA	29020	33061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_30032_30300_31515_31837_32744
819065	contig_2161_pilon	-	1173	4	Intergenic	novelGene_114963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.73488351136175	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	40	747	1066326	1033560	FALSE	5	TTGCCCCCTGTTGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLTAATPAPSESQEKKPLKPCCACPETKKARDAVRVSQDGQFLHYVFPYQFMDSPEWESLQPSEEGVFQVTLTAETTCSYISWPRKSLHVLLAKDRYISRLFSTLLGYDISEKLYALNDKFFAKFGLRFDIRLPSLYHVLGPAAPDAGPESKKNDEEVCEPAMSSPQALPTSAQKTPPCPPPPAATNPPVPPSQVRMSRPDSGILASQTPLQSYRQVMSKGQAPLVPTHTPEL	1066365	1033133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1033646_1038748_1039158_1044501_1044611_1066222
819067	contig_10958_pilon	-	1120	8	Intergenic	novelGene_5348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	2.67261241912424	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCTTTATTTGTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770845	764731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_764969_766459_766559_766694_766872_767187_767288_767837_767881_768066_768121_768756_768822_770500
819068	contig_5684_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_81085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGGTGCTGGGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481470	481978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_481500_482000
819069	contig_4388_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_161994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATTATTATTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311481	1309893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1309900_1311500
819070	contig_10235_pilon	-	954	5	Intergenic	novelGene_46501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	162	junction_2	4.06201920231798	196	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCGGTTTTGTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280954	275333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_275890_275996_276057_276171_276203_280028_280097_280715
819073	contig_6048_pilon	-	1270	11	Intergenic	novelGene_73252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	918	1241	1974299	1972063	FALSE	10	AGGCGCCTCCGCCTCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKSPWRSLIWFSSSCTASLAPDGREGLHLQDKAQLLELLLLPTDGAGTVVLQLGQLLQLQAVQPMGLLDALEVLLQILPVPQAVIQRAWGRRMHGCRAAGRRNGG	1978293	1972033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1972176_1973880_1973996_1974203_1974326_1976313_1976371_1976597_1976690_1976767_1976863_1977080_1977145_1977240_1977306_1977407_1977533_1977782_1977882_1977999
819074	contig_11476_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_170508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTTATTATGTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60882	60229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_60200_60900
819075	contig_11476_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_170507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59530	58829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_58800_59500
819076	contig_16156_pilon	-	1152	11	Intergenic	novelGene_137088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	46.6171642209176	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	119	1054	655076	640657	FALSE	15	TTGGTCTTGGATCTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQTRERALDMQADEDTGDGLQSSHRMLSFSDALLSIIATVMILPVTHTKIYPEEQFDTTIRKLLATKIAVYLMTFLLVTVAWTAHIRLFQVVGKIDDILALLNLACMMTITFLPYTFALMVTFPDVPLGIFLFCVCVITIGLTQAVIVGYAFHYPHLLNQQIAHSAHKAAFRQHILGIVLRGPALCFVAALFSLFFFPVSYLLMAMVIFLPYISKAAGWCKDRIRGPRDPPTQSLEFFTFDLHEPLSKERVEAFSDGVYAIVATLLILDIWRKTQQSASGKMTALETLWGSSTPSCRVTESLSGDLMV	658563	640558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_640772_641350_641487_641868_641948_644612_644778_645765_645850_646616_646653_647079_647132_649034_649133_654711_654751_654944_655108_658476
819077	contig_9515_pilon	-	818	2	Intergenic	novelGene_73840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	112	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGATTGTGTACTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96037	94946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_95482_95754
819078	contig_15518_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_127626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCTGTGTGCAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36386	34275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_34300_36400
819079	contig_5935_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_102661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTCAATTTGTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414288	412246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_412200_414300
819080	contig_6277_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_80411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719294	720178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_719300_720200
819081	contig_7308_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_159624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604694	606319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_604700_606300
819082	contig_14909_pilon	+	1583	11	Intergenic	novelGene_155710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_10	85.4601661594453	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	185	1258	120106	137710	FALSE	40	TTTATTAAAAAATTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNFPMRDGIDDESYGQIFKPIISKVMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDRLGCFNLTVKGHAKCVEVVKTFNLPLLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDCEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTPEYMEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAVHEDSGDEDGEDPDKRISIRASDKRIACDEEFSDSEDEGEGGRRNVADHKKGAKKARIEEDKKETEDKKADVKEEDKSKDSSGEKTDTKGAKSEQLSNP	119371	138035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_+_119521_120070_120210_121369_121512_123937_124031_124110_124220_131058_131200_131427_131537_132125_132257_133084_133241_135806_135865_137679
819084	contig_10011_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_68056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTACCATGGGCATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221233	219948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_219900_221200
819086	contig_19132_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_169996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGGAAACCCCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344957	346618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_345000_346600
819090	contig_11448_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_66375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGCCAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301960	303722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_302000_303700
819092	contig_5628_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_157560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTGTTGTTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70354	70610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_70400_70600
819093	contig_11994_pilon	+	1815	5	Intergenic	novelGene_129353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	87.8873568836838	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	601	1026	100357	105211	FALSE	35	GAAGAAGCCACCACTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTVRIFFNSTFHFVSSASALTPSMSR	94968	106000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_95436_97358_97451_100315_100486_102990_103045_104968
819094	SIRV6	+	221	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-386	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1899	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
819097	contig_57_pilon	-	1130	6	Intergenic	novelGene_44913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	33.3910167560079	163	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	160	837	265395	261995	FALSE	15	TGGCATTTTTGTTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHTEVKLKIPFGNKLLDAVCLVPNKSLTYGIILTHGASGDMNLPHLMSLASHLASHGFFCLRFTCKGLNIVHRIKAYKSVLNYLKTSGEYKLAGVFLGGRSMGSRAAASVMCHVEPDDADDFVRGLICISYPLHHPKQQHKLRDEDLFRIKDPVLFVSGSADEMCEKNLLERVAQKMQAPNKIHWIEKANHSMAVKGRSTNDVFKEINTQILFWIQEITEMDKK	269507	261701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_262169_262838_263045_263555_263608_264672_264904_265380_265449_269401
819098	contig_15182_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_136452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGCATTAGTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452867	451444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_451400_452900
819099	contig_709_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_57648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTATTTAACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3087286	3087674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3087300_3087700
819100	contig_709_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_57649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGCAATTTCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3087927	3089385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3087900_3089400
819102	contig_5590_pilon	+	1335	3	Intergenic	novelGene_163030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	396.5	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	52	429	352683	353983	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQKQACLRLVEGVCLPSGPLNHSGCELHWGVPAQELLNPSLLNILLWCSGGYNTNVSTSSPFLYLKNGKSYTHTLTV	352631	354889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_352704_353456_353586_353755
819104	contig_7019_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_149446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGTGGAATATTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475099	477095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_475100_477100
819106	SIRV6	+	364	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	14	-1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819107	contig_10135_pilon	+	1276	11	Intergenic	novelGene_106636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	81.8108183555207	2	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	17	727	106830	114536	TRUE	20	TGCGGCCCCTATGCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGNKMAALRALCSLRGIAAQVLLPGARVRLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQFGGAIMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTMVSNVTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIPSNHLTVFK	106813	116048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_106925_107738_107846_110508_110700_112344_112466_112698_112812_113079_113132_114504_114604_114885_114982_115157_115242_115381_115440_115804
819109	contig_14915_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_174308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACACAACAATTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118774	116943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14915_pilon_-_116900_118800
819110	contig_11145_pilon	-	885	7	Intergenic	novelGene_160519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	110	883	215710	73376	FALSE	30	GTGAGCAGTATGGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAFS	284081	73373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
819111	SIRV6	+	434	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	28	221	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTTCGTCTTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
819112	contig_8594_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_140041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTCATGTACACAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397905	399466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_397900_399500
819116	contig_5571_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_75517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCACAATTGGAAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140007	140616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_140000_140600
819117	contig_3269_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_117040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCATAGCACCTGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215515	214159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_214200_215500
819120	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	5	-1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819123	contig_12050_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_62680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	239	640	467327	467728	NA	45	ACACACATACGGGAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQAPGWGSNLDQAQACCSRGWYTAGMQYTRAHSGAPSQVLQPTAQPGDRQVHRYRVAGGSSQGGPGRTMHASCWTLSVCVHMSFKAKRLTRASGVNLQFAFALKVSQRSCHPCAARRRNKRLSRRAGTSQLY	467088	468537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_467100_468500
819125	contig_14184_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_66577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAATTTTGATAATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12161	10422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_10400_12200
819127	contig_14516_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_153894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTATTGTTTTGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48824	50018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_48800_50000
819128	contig_15172_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_158767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATCTTCAGATCGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262714	263767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_262700_263800
819129	contig_2730_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_135391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTACCAAAGATATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376164	377822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_376200_377800
819130	contig_3529_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_105360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545007	547608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_545000_547600
819131	contig_10838_pilon	-	2363	4	Intergenic	novelGene_129163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGACAATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75675	53395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_54230_69929_70081_73697_73879_74478
819132	SIRV6	+	234	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-399	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
819134	contig_500_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_30916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCACACACAATAGAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996451	996177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_996200_996500
819135	contig_8412_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_118405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGCGCTGCCCCGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806926	805123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_805100_806900
819136	contig_1986_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_64140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCAAGGGCAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356034	355288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_355300_356000
819137	contig_5479_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_133580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181256	183146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_181300_183100
819138	contig_12090_pilon	+	840	3	Intergenic	novelGene_80486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	79.5	474	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	164	730	74669	232997	FALSE	0	TCTTGCCTGCCTGCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAEQRLQHLSSQPRPLGGRALAFLEGLCPGFFGPSRPPWPGCAQLFVGGAPQTMAGELDSSKPLSGLLSGLAQDAFHGHPGITEELLRSQLYPEVPPEEFRPFLAKMRGILKSIASADMDFNQLEAFLTAQTKKQGGITSDQAAVISKFWKSHKTKIRESLMNQSCWDNGLRGLSWRVDGKSQSRHSAQIHTPVAIVELELGKSGHESEFLCLEVDEVKVNHILKKLSEVEESISTLMQPA	74505	233107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_74846_109066_109349_232889
819139	contig_14322_pilon	+	478	4	Intergenic	novelGene_115667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	32.3419232575925	938	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	14	325	619123	625253	FALSE	10	GGTGTTGAGGAGCCGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGKMADKEKKKKESILDLSKYIDKTIRVKFQGGREASGILKGFDPLLNLVLDGTIEYMRDPDDQYKLTEDTRQLGLVVCRGTSVVLICPQDGMEAIPNPFIQQQDA	619109	625406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_619129_619210_619302_621350_621423_625110
819140	contig_7345_pilon	-	925	5	Intergenic	novelGene_159167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.905067970256	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	77	535	139698	109342	FALSE	30	GTGGAGTTTTGTAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSRAPGRHRHLGHCRHRLDPPSPAMAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNSNRSETSTSDNTETYHTHTHTH	139774	108951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_109364_115427_115473_118503_118620_119857_120024_139588
819143	contig_14814_pilon	+	755	3	Intergenic	novelGene_137712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.5	77	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279385	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279534_282781_282992_283413
819144	contig_6445_pilon	-	756	9	Intergenic	novelGene_76965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	685.557152522676	1	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	68	727	89674	42950	FALSE	10	TGGGGGTGGCTACAGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATNAWAPVRSLGPSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISSLAGSILGAPDPSFVPCPP	96331	42920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43011_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89697_96286
819147	contig_11883_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_163784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGAGGTGATTCGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143458	141818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_141800_143500
819150	contig_7070_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_104035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAACAAAAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62056	62901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_62100_62900
819151	contig_8156_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_98917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCCAAATGTTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162981	164576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_163000_164600
819154	contig_11719_pilon	+	548	5	Intergenic	novelGene_154746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3152	junction_4	1718.95322434905	45	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1	498	13921	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13920	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
819157	contig_7056_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_43682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACTGTTGGTCTGAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834616	835928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_834600_835900
819158	contig_5643_pilon	-	758	4	Intergenic	novelGene_39128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.6003472215494	66	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	295	660	651279	646295	FALSE	25	TGAAGTCAAGCCCTCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNLKDLAGRLPAGPRGMGMALKLLLGAGAVAYGVRESVFTVEGGHRAIFFNRIGGVQQDTILAEGLHFRIPWFQYPIIYDIRARPRKISTLPATLGRLTLFQGNDFSSSPFCPGVLEHV	651573	646196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646388_650509_650571_650870_650956_651152
819159	contig_10765_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_122948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACGGCTGCTAACCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327225	327674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_327200_327700
819160	contig_18113_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_137551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTCCCCTAGAGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259305	258584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_258600_259300
819162	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	443	0	270	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
819163	contig_8594_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_140035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTTGCAGACCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342525	343568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_342500_343600
819165	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	51	491	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819167	contig_3916_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_141864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACTAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80322	82071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_+_80300_82100
819169	contig_11855_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_67088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2341638	2340892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2340900_2341600
819171	contig_15689_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_164161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	711	1154	178073	177630	NA	50	CCACCTGGATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPPTPPCAQSLTLAYAPARRAAAASAGPSDLTSSSTGPPPRVHAVSGTYLPHPTLSCSLGLELSSPRRFTAGSFRVPSLGLRLTKAFPDSLPPPHSHRPHEPVCFPPDTEQSLSEVTLLTYKPVCLPPQEVHSKGPKGLVASSLL	178783	176413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_176400_178800
819172	contig_2054_pilon	+	1283	2	Intergenic	novelGene_51662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17270	18589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_18092_18127
819175	contig_4131_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_127889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTAACAAAATTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275916	274966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_275000_275900
819176	contig_5954_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_28589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	4.84767985741633	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	566	982	943918	944732	FALSE	55	AAAGCCAAAAAGACACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLETPQALPPVLVHGTFWQHWPSILLRGLSCRGRTHIHLAPGLPGDPDVTSGMRPNCEVAVFINGPLALADGIPFFRSANGVILTPGNADGILLPKYFKEALQLRPTRKPLSLSGDEEGECQSGPEHNLREGRMVQQ	943263	944767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_943811_943899_944075_944279_944337_944412_944524_944640
819177	contig_5881_pilon	+	2270	11	Intergenic	novelGene_129029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.74804314527997	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	211	1977	36162	180010	FALSE	50	ACATACACAGCAGAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLESKEYRVFCHDNMTNSKGRFITNKTSGGPRSGGGFVDWTLNLNAIQSDKFLNLLLSMVPVIYQKNQEDRHKKTNGIWQDALSPAAQTYSNRSEQHVEYHSFPEQPFNGNNGHAPSSCSQKYDDYANYNYCDGREASETTAMLQNEDISSDGDEDTIVETNQKLPKESSGVMALQILVPFLLAGFGTVSAGMVLDIVQHWEVFRKVTEVFILVPALLGLKGNLEMTLASRLSTAVNVGKMDSPIEKWNLIIGNLALKQVQATVVGFLAAVAAIILGWIPEGKYYLDHSILLCSSSVATAFIASLLQGIIMVGVIVGSKKTGINPDNVATPIAASFGDLITLAILAWISQGLYSCLETYYYISPLVGVFFLALTPIWIIIAAKHPATRTVLHSGWEPVITAMVISSIGGLILDTTVSDPNLVGIVVYTPVINGIGGNLVAIQASRISTYLHLHSIPGELPDEFKGCYYPFRTFFGPGVNNKSAQVLLLLVIPGHLIFLYTIHLMKSGHTSLTVIFIVVFLFAAVLQVFTLLWIADWMVHHFWRKGKDPDSFSIPYLTALGDLLGTALLALSFHFLWLIGDRDGDVGD	12179	180303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_12257_36028_36762_81648_81757_88722_88795_92238_92384_100310_100458_117576_117725_121295_121376_138510_138643_140313_140463_179824
819178	contig_12145_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_172322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCTGTGGAAAGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154830	153947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_153900_154800
819179	contig_14157_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_171785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTTTTTTCTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311338	310571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_-_310600_311300
819180	contig_16103_pilon	-	558	3	Intergenic	novelGene_118728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	18	1176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	168	464	287149	276313	FALSE	15	GCGTGCTACTTATTGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESTTDIRHFWPCEQLFPPSPGAYKPQPCSSRSLHPISLPRSAPQDPGSSLRVLMAAEPLTELEMAIETVVTTFFTFAGQEGRRGSLNINEFKELATQQLPHLLKEVGSLDEKMKSLDVNQDSELKFNEYWRLIGELAKEVRKEKALEIQRN	288772	276218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_276457_286996_287190_288645
819181	contig_12644_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_44519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCCCAGATATACAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149131	1147168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1147200_1149100
819182	contig_6069_pilon	-	1503	8	Intergenic	novelGene_8008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	101.246113556048	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	31	1323	80405	71135	FALSE	15	CTGGAGCTGCCCAGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLQLFEIRLSHGRVVYSPGEPLAGVVCVRLGAPLPFRAIRVTCTGSCGVSNKINDATWVVEEGYFNSSLSLADKGSLPAGEHNFPFQFLLPATAPTSFEGPFGKIVHQVRATIDTPRFSKDHKCGRVFYILSPLNLNSVPDIEQPNVASVTKKFSYKLVKTGSIVLTASTDLRGYVVGQVLQLQADIQNQSGKDTGPVVASLLQKVSYKAKRWIYDLRTIVEVEGAGAKAWRRSEWKEQILVPALPQSALPGCSLIHVDYYLQVSLKAPEATVTLPVFIGNIAVNHTPLRALPGLASPPSQGVPSAPPQEEVEAEAVAGAPHFMDPVVALATKSHWQPPLPATFSAASGAPEPCAQDRSPASHTLPPPLCISTGATVSYFADGPGGPVPATSTLIPPPAYSSWGYPHEAPPSYEQSCSDADLGQSPGS	80435	70954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_71200_71274_71708_71792_71970_72067_72251_72427_72583_72689_72741_73097_73209_80287
819183	contig_7870_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_109013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	164	346	520815	520633	NA	15	TTGAAGTGTGTTTATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICFNSELSSVFSLLDLTSDLCCYVRTLSTSASALRGCGQWVGIRDRVTRVLLQAMYRLGDQEMLSGLVKNTNLCPCCLAGHFPLTPNHHYCNGSLAPGKGFPSTYDLTVNPSLN	520978	520011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_520000_521000
819184	contig_7870_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_109012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTATACAGAATAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519050	518578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_518600_519000
819185	contig_15739_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_176375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2.5	336	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	191	577	27876	28262	FALSE	40	TTTAAAAAAGCAATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGPLAVGRPFSVPVPGGPAGVRARGGPGTGRRSRSAGPGGAPGSEDREEDEEEETARIGPGVMESKEEQAGQNLNVENALQENEEKDEKEQDANKAEPLALPLEAGEYCVPRGSHRQLRVRQPILQYRWDMIQRLGEPQARMREENVERIGEEVRQLMEKLRGKQLSHSLRAVSTDPPHHDHHDEFCLVP	26705	28480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15739_pilon_+_26811_27260_27341_27870
819188	contig_8898_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_137259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTTTGCACCACCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340043	341262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_340000_341300
819189	contig_7300_pilon	-	1644	13	Intergenic	novelGene_170453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	193.461236427353	233	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	70	1260	504153	440577	FALSE	20	AAGTCGCTTTTGCTTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVKAAQAGKPGPAKRRLAEQFAAGEIITDMTKKEWKLGLPIGQGGFGCIYLADTNSSKSVGSDAPCVAKVEPSDNGPLFTELKFYQRAAKPEQIQKWIRTHKLKYLGVPKYWGSGLHDKNGKSYRFMIMDRFGSDLQKIHEANAKKFSRKTVLQLSLRILDILEYIHEHEYVHGDIKASNLLLSCKNPDQVYLVDYGLAYRYCPEGVHKEYKEDPKRCHDGTIEFTSIDAHHGVAPSRRGDLEILGYCMVQWLSGHLPWENNLKDPNYVRDSKIRYRENIPSLMDRCFPEKNKPDEIAKYLETVKLLDYTEKPLYQNLRDILLQGLKAIGSKDDGRLDLSVVENGGLKAKTVTKKRKKEVEESTESSVEDMECSSPKTEAFPPSRLRTRKRVQK	551216	440192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_-_440609_445428_445520_464275_464455_468159_468219_468514_468636_469429_469563_474926_475020_475152_475262_481496_481585_483014_483085_500494_500551_503993_504159_551152
819190	contig_16098_pilon	-	691	8	Intergenic	novelGene_45789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	382.94028947882	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	66	323	36010	35212	TRUE	5	GTGGTCTGTAGCTCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLLQAGGWAPEERRRGVEARMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIP	36360	31099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_32077_32118_35211_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
819191	contig_20844_pilon	-	952	8	Intergenic	novelGene_78597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	369.18741438296	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	261	842	206899	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGALGHRKPNPLPCPQIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	208364	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207979_208286
819192	SIRV6	+	376	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3023	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819193	contig_10923_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_66206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	496.420184924022	4	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	269	655	37471	42718	FALSE	15	CACTTGTAGGTAGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVQGNRTSGSRWWQWPCCYSAAQCCPGVSQASWARWLRLTSSCLVLDAVPSWPPKDQPILSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13842	42834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21812_37383_37540_38578_38738_42559
819194	contig_5451_pilon	-	2220	3	Intergenic	novelGene_167166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	58.5	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	76	414	376008	333495	FALSE	20	CTCCCAGCGCTGGTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVHCFHYLIPLAKEGNYAIVANVESMDYDPLVVKLNKDISAIEEAMSASLQQHKFQYIFEGLGHLISCILINGAQYFRRISESGIKKMCRNIFVLQQNLTNITMSREADLDFASPRNSSSKFSDINSRLEALTDQRP	376083	331688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_333568_372162_372323_375902
819197	contig_10749_pilon	-	995	10	Intergenic	novelGene_133459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1205.43172943182	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	91	555	153582	144621	TRUE	5	CCTTTCTCTGTTCAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESLPVPPEGRDHPVPAQAVQFSSHLCRWSGKKILIGGLECLSCFLSAVDQAAPVGNATVSFSYDAWQHRIQWH	154257	136083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142199_142349_143587_143644_144588_144628_145189_145286_149564_149681_150658_150760_151778_151900_153558_153648_154232
819198	contig_19402_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_80746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAGTTGCTGTCGAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14620	15071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_14600_15100
819200	contig_19402_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_80745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTCTCCAGAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9785	10531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_9800_10500
819201	contig_5894_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_83012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256599	258211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_256600_258200
819203	contig_401_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_42862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	29	454	1722398	1721973	NA	10	TATACTTCTGTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDERRALAMKIPFPTDKIVNLPVDDFNELLARYPLTESQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELEQLGSERERLLRARGEADRTLEAMRQQLTQLYQDIFQHLRDGAGNSYSPEEYALQQAADGAIFLVPRGTKMEATD	1722426	1721706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1721700_1722400
819204	contig_15039_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_110148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGATAATCTTGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191255	189586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_189600_191300
819205	contig_13051_pilon	-	1473	4	Intergenic	novelGene_140128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAGGAAGAACGACGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420915	389424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_389623_402643_402773_410937_411073_419904
819206	contig_12540_pilon	+	1084	6	Intergenic	novelGene_148098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	26.642822673283	451	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	482	1069	988416	989238	FALSE	5	ACCTTGTCTGCCCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLGATEAPQGSKQPIRSHFLEMLFPEAEAKKGKLRPQVWGSSWSCGLWAPCKHGSLFPSPTPPLMPTCPPMCGASGVTGPRPVDEKQSAAELDLVLQRHQNLQEKLAEEMLGLARSLKTNTLAAQSVIKKDNQTLSHSLKMADQNLEKLKTESERLEQHTQKSVNWLLWAMLIIVCFIFISTILFIRIMPKRK	986517	989253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_986635_986929_986980_987104_987184_987272_987426_988333_988821_989055
819208	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	0	1214	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
819211	contig_990_pilon	-	2714	13	Intergenic	novelGene_76008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	994	1293	543939	543640	TRUE	80	GAAAAAAATAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMISVKVSAMLVSSVLRLDCSEGDGEMGRGEFTLSTCAVLLAPVDDNSALSVETELVTELCSVVTGKAMVTSGLLVTMAGVGTATILPAATPLLFISW	552164	357181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_357246_435413_435631_507212_507279_509804_509863_510993_511068_514933_515096_516425_516604_530688_530825_537364_537615_542636_542768_543554_544629_546905_547066_552020
819212	contig_8900_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_171609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115522	117304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_115500_117300
819213	contig_5423_pilon	+	1192	10	Intergenic	novelGene_85244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTATGAGATTCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502734	532752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_502781_504058_504237_506639_506732_506931_507015_515746_515828_517365_517490_518877_518958_520068_520154_520547_520742_532523
819214	SIRV6	-	274	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTTCTTCGTAAACGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	11551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
819215	contig_8122_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_40184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61727	60182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_60200_61700
819216	contig_11538_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_152299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACAACAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218862	217005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_217000_218900
819217	contig_6710_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_98349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTGAATCAAATGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657169	656667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_656700_657200
819218	contig_5047_pilon	-	1322	6	Intergenic	novelGene_158013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	17.7696370249929	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	384	1001	1671909	1666216	FALSE	40	TAAATTTTGAAATGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPDNAGLRLDCTFSLPRSSQLNTTGSTRRRDSYRNSKTKIVPTPTNQFKIPKFSTGESPFSATPQHPREQRPQSCASAGRVVHSTPVRHWSGPTSQSLLPSARTPVSTKRLLAVPTPASHRLSGLPLMTLRTMPRALASPWCASARRLSSEPKKRSGARNQPTTESSTKGTSRPSDPSSDSFSPPSAVPQALNFSPEKRDFTFSKNITEATLTEAKTTGNTPLNEALLVDTQLNQLTIAPKAESGPLADPLLIDFCNTPEANGGQLLLKPSVALESESKPLIDLMINTPDMNKDVALKPLQVVGQLIDLASPLIQLSPAADKENVDSPLLKF	1682686	1665894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1666300_1666837_1667078_1668204_1668404_1671814_1672052_1674021_1674095_1682518
819219	contig_5258_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_100240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGTTTGCTTTTTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176136	177795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_176100_177800
819223	contig_9051_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_170818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGTTAACTGTATCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067063	1066321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1066300_1067100
819226	contig_8843_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_156636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTTGTTTTGTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9089	7321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_7300_9100
819228	contig_15084_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_116673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCAAAGGGTTCGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28950	28094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_28100_29000
819229	contig_160_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_156316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTCGGAACTCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32156	32916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_32200_32900
819230	contig_2988_pilon	+	599	2	Intergenic	novelGene_136532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCACCTAGGTCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22650	44085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_22756_43591
819231	contig_3426_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_57969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCATGTGTGTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527369	526551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_526600_527400
819232	contig_14184_pilon	-	1232	6	Intergenic	novelGene_66582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	507.173500885052	3	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGTGTTGTATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126326	88543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_89178_91977_92112_103407_103502_105799_105915_109168_109327_126229
819233	contig_5988_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_15909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGAGAACATGCGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629486	630177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_629500_630200
819234	contig_5988_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_15910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	700	1101	630974	631375	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADATHTMPSTSRVRSTNITTVSYTRPRTPYRKRQYMRQRRGCQPLCPPTLQSRVIPGVVRLQSPSPDPLSILVFPGRLTPEVCITQVLCPQVQFGQQAAPAEVEGRNRERQGYLSCVSSPYDSMVLAVVASF	630274	631564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_630300_631600
819235	contig_9297_pilon	+	1276	6	Intergenic	novelGene_69900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	572	junction_5	101.574800024415	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	98	781	964967	970821	FALSE	30	GTTGGATGATATTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTVCGDIHGQFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRTTTPYFL	955907	971316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_955942_964903_964970_966037_966180_968984_969065_969260_969471_970572
819236	contig_10235_pilon	-	1772	19	Intergenic	novelGene_46400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	78.3974717720343	1	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	665	1546	182366	177880	FALSE	40	ATAAAAAGGTATTTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVDRRGTAEPQGQKLVICCEGNAGFYEVGCVSTPLEAGYSVLGWNHPGFAGSTGVPFPQNEANAMDAVVQFAIHRLGFQPQDIVIYAWSIGGFTATWAAMSYPDVSAVILDASFDDLVPLALKVMPDSWRGLVSRTVRQHLNLNNAEQLCRYQGPVLLIRRTKDEIITTTVPEDIMSNRGNDLLLKLLQHRYPRVMAEEGLRVVRQWLEASSQLEEASIYSRWEVEEDWCLSVLRSYQAEHGPDFPWSVGEDMSAEGRRQLALFLARKHLHNFEATHCTPLPAQNFQMAWHL	192378	177653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_177964_178120_178168_178251_178351_178434_178512_178652_178716_178860_178918_179496_179561_179767_179873_180341_180466_180843_180894_181307_181372_182318_182447_182532_182648_184904_184999_185214_185257_186962_187049_190070_190148_191199_191257_192265
819237	contig_854_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_36295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTCTTTCATATGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544455	545358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_544500_545400
819238	contig_9646_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_117477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTTTGCTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414031	413073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_413100_414000
819239	contig_18618_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_148304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTTAATGGCGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45201	46661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18618_pilon_+_45200_46700
819240	contig_14666_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_39476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTGTGGCTGGGAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25720	25331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_25300_25700
819243	contig_1624_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_138365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28325	29874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_28300_29900
819244	contig_13044_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_100003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATATTATATCCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235032	236615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_235000_236600
819245	contig_11816_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_98471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCCTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443839	445995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_443800_446000
819246	contig_20878_pilon	+	1970	4	Intergenic	novelGene_173438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_1	107.021285525617	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	78	701	17330	20505	FALSE	15	TTCTGCCTTATGTTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLNINDVLGNYSLTLVDALDTLAIMGNSSEFQKAVKLVINTVSFDKDSTVQVFEATIRVLGSLLSAHRIITDSKQPFGDMTIKDYDNELLHMAHDLAVRLLPAFENTKTGIPYPRVNLKTGVPPDSNNETCTAGAGSLLVEFGILSRLLGDSTFEWVARRAVKALWNLRSNDTGLLGVGHLSAPLGLCASGPLSFHHPLFYLVPLDPKINSERMALSVHHIQFFYMTFCLE	13894	21774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_13969_17326_17431_18996_19169_20154
819249	contig_14142_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_120502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCTGTTGCCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315395	316002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_315400_316000
819252	contig_9706_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_20818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAATTCCGCTACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	2034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
819254	contig_9415_pilon	-	1329	3	Intergenic	novelGene_109770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	81	63	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	81	401	1599184	1597383	FALSE	35	TCAATAAAGTTTTGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLARDLLHPSLEDEKKKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGTRQLLSLPAKQQITNGACQRFYFYEQVLND	1599264	1596454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1597589_1598231_1598341_1599178
819255	contig_6217_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_109641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599765	601270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_599800_601300
819257	contig_6159_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_128241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56348	54984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_55000_56300
819258	SIRV6	+	480	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
819260	contig_13481_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_119547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	805	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGTTGTTAACTGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1543555	1542722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1542700_1543600
819264	contig_16870_pilon	+	548	3	Intergenic	novelGene_155496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	68	403	104553	107853	FALSE	10	CTGCACCTCTCTTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPNGDLGMPVEAGAEGEDDGFGEAEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQARLWPGHSPPGLGTFSRAGLWIPWWVCLSGPPSWHSPLPA	104485	107998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104632_107515_107646_107726
819265	contig_3077_pilon	-	1870	10	Intergenic	novelGene_26890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	102.883969164837	1	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	165	1469	1517496	1498272	FALSE	35	AAGTATTTAAGTTGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWLTPEQTAGKKKPFVYTQGQAVLNRAFFPCFDTPAVKYKYSALIEVPDGFTAVMSANTWEKRGPNKFFFQMCQPIPSYLIALAVGDLVSAEVGPRSRVWAEPCLIEAAKEEYNGVIEEFLATGEKLFGPYVWGRYDVLFMPPSFPFGGMENPCLTFVTPCLLAGDRSLADVIIHEISHSWFGNLVTNANWGEFWLNEGFTMYAQRRISTTLFGAAYTCLEAAAGRALLRQHMDITGEDHPLNKLRVKIEPGVDPDDTYNETPYEKGFCFVSYLAHLAYVDEFKFQSILADDFLEFYLDYFPELKKRKVDSIPGFEFDRWLNTPGWPPYLPDLSAGDSLMKPAEELAQLWVTKELDMKAINAVAISPWKTYQLVYFLDKILQKSPLPPGNVKKLGETYPNISNARNAELRLRWGQIVLKNDHQEDFWKVREFLQSQGKQKYTLPLYHAMVSGSEVARALAKETFASTASQLHSNVVNYIRQILEPKGS	1517991	1497870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1498431_1499811_1499955_1501401_1501627_1502946_1503056_1503272_1503350_1504902_1505017_1508719_1508956_1509681_1509799_1517371_1517521_1517851
819269	contig_8576_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_88815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATAAACACTGTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962293	964253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_962300_964300
819271	contig_13787_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_40633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCCTGGCAAAAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201426	202645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_+_201400_202600
819272	contig_15264_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_158877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAGAGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114952	113402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_113400_115000
819274	contig_7513_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_89024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	279	725	685293	685739	NA	10	CCCCAGCGCCCTTTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRATINCVCVCVCGCTPSEVYSCSRDGMVLAWNVSTLRVTSRFQLPGCTLMSARLHQGCLWCCKSSAYPGHSREWLPARGKGNPVSACPRPAATKWTALEKRNRSPHGLEAGGPNHGAGRGALSVRSRADPCQQPRVSLACGWDLR	685014	685990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_685000_686000
819275	contig_17432_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_159007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64189	66121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_64200_66100
819276	contig_9242_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_155081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCCCCTGACTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789668	791037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_789700_791000
819277	contig_3789_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_79896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATAAAAAAATACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611145	609995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_610000_611100
819278	contig_5815_pilon	+	1025	6	Intergenic	novelGene_141215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	283.368735043229	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGTGTAAGAGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561959	572107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564212_564448_566543_566635_566892_566997_567804_568014_571747
819280	contig_6634_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_171146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTCATGTGACTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273869	272371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_272400_273900
819281	contig_299_pilon	-	802	4	Intergenic	novelGene_129510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	273	572	1678192	1676718	TRUE	15	CTGTGACATCCCAGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKWRPRLPQGLRQRAKVTGHLLRYLVCVREVLLEEFIVGIIVICVSQLVFREHCPLSLSREDSCSSDLLSLPMLLQGERRGDSPPYEWLPPESRLCE	1678464	1675571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1675656_1676103_1676228_1676695_1676881_1678055
819282	contig_19514_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_166314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCACTGCTATGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24088	24771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_+_24100_24800
819283	contig_6710_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_94314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	653876	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653876	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
819284	contig_5018_pilon	-	811	3	Intergenic	novelGene_46958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.5	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	9	437	318549	316841	TRUE	5	TTTGCAGCCTGTGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSMAKRMLLLLLEVWVLAGELWLRAEVQAAPYSVKLCGREFIRAVVFICGGSRWRRADVLTYEAMGDAFQDAATDSDSLAGELDEAVASSEWLALTKPRQAYPSGQSSWQGTPGALRGGRDVLAGLSSNCCKWGCSKSEISSIC	318557	316394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_316590_316661_317080_318359
819286	contig_5643_pilon	+	1161	7	Intergenic	novelGene_38742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_2	264.803700880482	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	164	961	152580	157107	FALSE	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWPPPCWLWVLGTLVGLSAAPGPKGCPERHYQAQGDLCCQMCEPGTFLVKDCDSHGKAAQCEPCVPGVSFSPDHHTRPHCESCRHCNFGLRIRNCTITANAECACPNGWQCRDKECTECDQLPNTLLTRLPQAPGPHPQSTSLPYAEKMAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152416	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152716_152907_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823_156945_157085
819288	contig_15108_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_131171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGGTTGTCCCAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54785	54304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_54300_54800
819289	SIRV6	+	362	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	11	4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819290	contig_8895_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_170449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAATAAGGGAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4985	6291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8895_pilon_+_5000_6300
819292	contig_14744_pilon	-	479	2	Intergenic	novelGene_65956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTCACTCCCATGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599675	598002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_598405_599598
819294	contig_17414_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_156940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAAAATGGTTTTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18014	18670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17414_pilon_+_18000_18700
819295	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	539	0	373	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819297	contig_13607_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_170219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCCAGTGATGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434199	435269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_434200_435300
819298	contig_3948_pilon	-	1464	12	Intergenic	novelGene_53419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	206.205305700832	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	73	861	1975758	1944217	TRUE	5	CGCTCCTGGGAGGGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSALPDPHNGSAEAGSPTNGTTRPPSTPEGIALAYGSLLLMALLPIFFGALRSVRCARFPIIASCTLLGLYLFFKIFSQEYINLLLSMYFFVLGILALSHTISPFMNKFFPANFPNRQYQLLFTQGSGENKEEIINYEFDTKDLVCLGLSSIVGVWYLLRKHWIANNLFGLAFSLNGVELLHLNNVSTGCILLGGLFIYDVFWVFGTNVMVTVAKSFEAPIKCNGVPPGSAGEGPRSGQLCHAGTWRYRHSRDLHRLAAAF	1975830	1933206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1933615_1936663_1936750_1942180_1942284_1944210_1944248_1947251_1947336_1950367_1950430_1951142_1951269_1951356_1951443_1953210_1953300_1959254_1959338_1964670_1964724_1975583
819299	contig_10642_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_78725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGCACCTCTGCTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949826	951155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_949800_951200
819300	scaffold_880_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_121409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311313	312251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_311300_312300
819301	contig_11566_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_166691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCAGTAGAAACTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162861	160519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_160500_162900
819302	SIRV6	+	218	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
819303	contig_730_pilon	+	1705	16	Intergenic	novelGene_155624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	8.15243658191968	2	27	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	31	1416	223583	231431	FALSE	20	ATTCTATCTCTGGCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PILELRGTERMELQDPKMNGALPAGAVGYRQEHEGFLPSHSPAPGRKPTQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMAHTGVLFFLALLLCIALLSSYSIHLLLTCAGVVGIRAYEQLGQRAFGPAGKVVVAAVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIGTFLGMEPEGDWFLKGNLLIIIVSVFIILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLISVIYKKFQLGCAVGRNETAMESEAPLDHPTQGLNRSCEAQMFTVDSQMSYTVPIMAFAFVCHPEVLPIYTELCRPSQRRMQAVANVSIGAMFCMYGLTATFGYLTFYSSVKPEMLHTYSQKDLLILCVRLAVLLAIRRALQQLLFPSKAFSWPRHVAIALVLLVLVNVLVICVSTIRDIFGVIGSTSAPSLIFILPSIFYLRIVPSEVKPLCFWPKVWALCFGALGVLFMVISLGFMFANWATGQSRVSGH	222315	231720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_+_222345_223581_223636_223714_223791_224403_224520_224611_224686_225435_225529_225655_225735_227761_227845_228133_228193_228287_228426_228632_228713_229241_229343_229581_229665_230455_230601_230699_230804_231329
819304	SIRV5	+	284	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	951	-30	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTGTAGGTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
819305	contig_10042_pilon	+	2129	14	Intergenic	novelGene_79224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	228.462134161358	1	70	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	542	1294	1107174	1131849	TRUE	30	TTTGAATGGCCAGTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGSWKESSMNTIELEIPDQNIDIEALQVAFGSLYRDDVLIKPSRVIAILAAACMLQLDGLIQQCGETMKETINVKTVCGYYTAAGTYGLDSVKKKCLEWLLNNLMTHQNVELFKELSINVMKQLIGSSNLFVMQVEMDVYTALKKWMFLQLVPSWNGSLKQLLTETDVWFSKRRKDFEGMAFLETEQGKPFVSVFRHLRLQYIISDLASARIIEQDSLVPSEWLSSVYKQQWLAMLRAEQDSEASRNQ	1094924	1140401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1095324_1105095_1105220_1107155_1107253_1108989_1109088_1111263_1111377_1111998_1112065_1115829_1115915_1117491_1117583_1118643_1118782_1129053_1129119_1131831_1131908_1135430_1135577_1136612_1136701_1139858
819306	contig_20742_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_150667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCCCATAGGACTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191942	193210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_191900_193200
819307	contig_10446_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_162504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968921	967440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_967400_968900
819309	contig_16098_pilon	+	1153	4	Intergenic	novelGene_46065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_3	229.146726405206	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	298	771	436712	438839	FALSE	20	GTGGAGACAGTTCCAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVARGLTAHSLPPWQALSSLCSPWAAPRVGPLPPAPAMVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIKDNGWD	436414	439221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436943_437045_437090_437263_437373_438749
819312	contig_20716_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_176135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109008	109885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_109000_109900
819313	contig_10861_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_39252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTAGAAAGCTAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816288	814669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_814700_816300
819315	contig_610_pilon	-	1176	3	Intergenic	novelGene_76721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATTCCTGAAGTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252658	213487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214276_220563_220785_252491
819317	contig_740_pilon	-	1115	4	Intergenic	novelGene_158946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	38.3086877294897	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	143	499	223680	215349	FALSE	30	CATATTTCTAGTAAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAGLGEGVPPGNYGNYGYANSGYSACEEENERLTESLRSKVTAIKSLSIEIGHEVKNQNKLLAEMDSQFDSTTGFLGKTMGKLKILSRGSQTKLLCYMMLFSFFVFFVIYWIIKLR	223822	214732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_215505_217429_217487_219941_220067_223661
819320	contig_6102_pilon	+	555	4	Intergenic	novelGene_31958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1299.19085930008	16	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGATTTGGTCCTGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	416202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414194_414364_414613_414764_416010
819321	contig_14300_pilon	-	1009	8	Intergenic	novelGene_133094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	110.00445260005	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	119	901	180320	147960	FALSE	25	AAGCAGTTGCTGCAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMVRAAKPAGSGCTYLVWPSISSPILSHAAPTVTTTGPTRYQKSSTLRRRGRLVSPHRTKSPCVPGSISSAQGRGAPCLQEE	186570	147851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_148083_148561_148683_149611_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_186493
819323	contig_11364_pilon	+	410	2	Intergenic	novelGene_65177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAAGCTTTTCGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157296	161435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_157306_161034
819327	contig_253_pilon	-	885	7	Intergenic	novelGene_129642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	110.286621531756	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	198	830	269509	267057	FALSE	10	CCGCCTCCTGTCGTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLATPTVLRALAQASHAGHFSGRSVHSTSLAATYKYVNLQEPKMDMKSVTDQAAQTLLWTELVRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR	271060	267001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267397_268417_268591_268687_268778_269311_269363_269451_269510_270863
819329	contig_1594_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_138856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCACTATTACGTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765236	766262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_765200_766300
819330	SIRV6	-	331	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-269	-104	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTACTCTTTCAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2089	1648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
819336	contig_9799_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_145560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATCACATGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942032	940336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_940300_942000
819337	contig_15304_pilon	-	645	2	Intergenic	novelGene_30442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	573	602	52954	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	53698	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491
819338	contig_663_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_163744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82679	80337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_80300_82700
819339	contig_6191_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_107824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGGAGTAGATTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62124	63022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_62100_63000
819341	contig_6496_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_103543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCAGAACTGTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168260	1166995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1167000_1168300
819342	contig_6496_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_103545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCCAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176180	1175574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1175600_1176200
819344	contig_19098_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_65826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTCCCCTAGGGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370584	369439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_369400_370600
819347	contig_7066_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_42215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	441	743	1122656	1122958	NA	25	ATGCTGTTGTCACATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREHIQFCSWYLPSLNTNCSPPSHLLVAPGHFQRFQSAPVCYNSNPLGSSQHFPQSSKCLEAVFDYPTLSPANMVPKTKVASSLSGALGCLLMERHPFSY	1122215	1123276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1122200_1123300
819348	contig_990_pilon	-	829	10	Intergenic	novelGene_76038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	103.253134947774	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	136	828	865835	848230	FALSE	60	ATGAAGAAGAACGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGYPKGIHVETLETEKKERYIVISKV	865970	848228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_848260_849297_849341_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
819349	contig_11978_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_63013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	127	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1594282	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1591800_1594300
819352	contig_6873_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_129845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATTACTGGGACGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792976	794649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_793000_794600
819354	contig_1084_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_152379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACAGGCTGGGGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503834	504638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_503800_504600
819355	contig_3956_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_14785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGATTCCGACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053786	1052929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1052900_1053800
819358	contig_5018_pilon	-	1096	8	Intergenic	novelGene_47027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.973242025606	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	22	975	1397310	1392342	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAACTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVGVSCMLCEDPGAGSVARAPPWPSPSRSKRCSSRLSKSAWSLTRRCGPGRGPGAGATAESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397331	1392220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394416_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395468_1397153
819359	contig_11026_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_167685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276574	277813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_276600_277800
819362	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819363	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
819364	contig_1107_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_126607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGAGTGGCTGGTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179812	1178307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_1178300_1179800
819365	contig_3233_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_56588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGGGTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755256	752859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_752900_755300
819366	SIRV6	+	459	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	24	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1272	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
819368	contig_9646_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_117460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAAAGTTCCTGTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342074	341601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_341600_342100
819370	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	6	1243	-4	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTAGAAGACCGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
819371	contig_19744_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_120405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCACTGTGCCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228667	226311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_226300_228700
819374	contig_10800_pilon	-	1006	6	Intergenic	novelGene_152617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.210172248202	67	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	73	693	457582	429975	TRUE	10	CTTTTTATGCCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCGTSPSSSGSSVCVLQPQKTSRMAANKNKSQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVQIEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRAKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL	497158	428974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_429168_429854_430095_432709_432888_436425_436635_457468_457632_497135
819376	contig_7020_pilon	-	327	4	Intergenic	novelGene_57061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2057	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCTTACAGAAAGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81794	79950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_80016_80158_80226_81322_81446_81722
819377	scaffold_12124_pilon	-	1092	6	Intergenic	novelGene_22179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	47.4442831118777	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	42	800	1368625	1229379	FALSE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGRRGSSGDWAAMSPLCAARAAVRVYVAGAAVILAQLLRRLRGALPEPVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSRLPMKGLGPPSMQLWPRSWKELAAATCTTRRQPSPSRPRMMKSCSGNCGPGAVR	1368666	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368516
819381	SIRV4	+	390	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTGACATGGCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3656	4046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4000
819383	contig_1406_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_25455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532205	530999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_531000_532200
819384	scaffold_12124_pilon	+	939	3	Intergenic	novelGene_22144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	10	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATTCCTGAAGGTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954740	955955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_954826_955010_955115_955205
819386	contig_7234_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_145939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGCCCCATAGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417649	418010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_417600_418000
819388	contig_7234_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_145938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAGTACATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415180	415492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_415200_415500
819390	contig_12299_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_29742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCTATAGGACAGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135178	135958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_135200_136000
819391	contig_14755_pilon	-	1967	4	Intergenic	novelGene_129392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	7.40870359029762	21	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCATGAAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368709	320248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_321897_337676_337718_364130_364359_368659
819396	contig_5551_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_134253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAAAAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537196	538967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_537200_539000
819397	contig_8820_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_79315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTGCCATTTTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271526	273394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_271500_273400
819398	contig_8820_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_79316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGAACTTGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273444	273699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_273400_273700
819399	contig_1679_pilon	+	1139	7	Intergenic	novelGene_173496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	202.353376272522	11	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	674	784	143062	147485	FALSE	20	GCCGGCAAGGATGAGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCSRCCCSGPRRRPATAASTRGRRTNPRLHLSPVKLAELHADLKIQERDELSWKKLKIEGLDEDGEKEARLIRNLHVILAKYRLDGRKDAQVVNTNYLQDGTEEEGLEDPRLEKLWHKAKTSGKFSSEELEKLWRELKHHTEKVREYSVLLETLSRTEEIHENVISPSDLSHIKEEVLQSRHAELKEKLRSINQGFARLRKVSHLGYGTEHEFEEPRVIDLWDMAKSANFTQKELESFRVKKHLQDLAGRVSRGRHNEL	128797	147840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1679_pilon_+_128886_133892_134038_136698_136824_140447_140569_141738_141898_143026_143110_147422
819400	contig_17127_pilon	-	2002	11	Intergenic	novelGene_168308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_4	217.829956617541	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1857	146	2002	93830	76031	FALSE	15	GTGAGCCTTGCCGGAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANDAPAESAPDVKRAGKDGEKKSQKEKPPPASVPASRDHGQEADTKDKMALPGGKAGESKKAQPEDRKKPEESGRARAKAVKNAKEQRNQDACACEVESTLSPGEGIMVYFHAIVSKDFSFNPNQHRVLIRGGEEFGKPPWNRNVCEMSYTKDLGEYGSLLEGFAFISKQNLDKPIPYKYVIAYTKDSEEYEFIYKRQQKEGEYVNRCLCIRSSLLGSGDWHQYDDIICMKPPGKIQRFWDHVTDGTRKSLVRGKQIAARVMLDSIFSILQTWNAINLKKFFTQFKQFYSVVREPTVYEGGPQTWSSFLKYGETEVKKDLWHYLKEKMDLFLQRNSEEHPPEHWPVRSGLRMGLIVLFAMEEFALPMSDADLSSLCYLLCVSASSPDPLHRDLQPVFETSRSWRRYLVNLCGRCMYPSKDCWVLTLPVLHHCMGLAPQGKDIPPEDTWAALEGLSFSQFREERSDQNQLLQLMESNQHLLNVDGCLFRSWFSLLPLRDLADYMRTLVPYLAASPAHFLDCFLGVYYRLRGLYKISHRNLENIEKALKMLLHLLEADLNTVPVEPFLQSYLTVCLNLHETICKITKNPKFSEMPALSAEIVCRIVSLQPVVDWAEMHGSEIGKKDSVKMVFQGALTATRSWLQRIFANKMFQSSHPSGVSFRYPEEVE	94561	76030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_76202_81044_81199_83646_83703_84601_84825_85441_85634_87090_87351_88022_88310_91964_92168_92523_92683_93678_93852_94437
819401	contig_10968_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_84278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGGAAAAACAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96847	95049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_95000_96800
819403	contig_11098_pilon	+	2343	6	Intergenic	novelGene_166679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	300	junction_1	94.1594392506667	30	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	37	924	23788	32431	FALSE	45	ACAGAGGGAATGAGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFSPELIDYLEGKISFEEFEGRREERKNREKKSLQEKRKLSAEENKNDFEVPSSSGILSTKSQNKDVNDGETSDGVSKSVHKVFASMLGENEDDEEEEDEEEEEEETSEQPTAGDVFVLEMVLNRETKKMMKEKRPRSKLPRALRGLMGEANIRFARGEREEAILMCMEIIRQAPLAYEPFSTLAMIYEDQGDMEKSLQFELIAAHLNPSDTEEWVRLAEMSLEQDNIKQAIFCYTKALKYEPTNVRYLWERSSLYEQMGDHKMAMDGYRRILNYLTPSDGERFMQLARDMAK	23751	33850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_23890_24877_24990_28759_28948_29699_29824_31554_31747_32261
819404	contig_4486_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_38529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGGCTCTGGAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116760	116401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_116400_116800
819406	contig_5954_pilon	+	801	6	Intergenic	novelGene_28432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2093.74233371731	369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	53	454	97851	99572	FALSE	80	TAAAAAAAAAGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97527	99919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98637_98694_98857_98980_99568
819410	contig_2069_pilon	+	529	3	Intergenic	novelGene_23545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	68	319	1508642	1509023	TRUE	5	CCGCGCTCGGGAGCGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLQLEEKGPGLGGRGSKVRRLSMTGNWSQGPSWPGEGWGRRGECGDGVQWGTMGGLGSGQLQELLQCVLFHSLHEELIVPTVLVPVDNLGRGGLGVACQGSHLIP	1508574	1509877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
819413	contig_6059_pilon	+	481	4	Intergenic	novelGene_44778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	16.0069429380573	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	2	481	50469	64731	FALSE	35	ATGGAACTGGAAGAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDGPNWREKLSPIPSVPTSLQLRAWRPAAETTSAQAGDSGSGQQPVIPDEKMLRTLKEEGNQCVKDKNYKAALSKYSECLKINNKECAIYTNRALCYLKLCQFEEAKQDCDEVLQIDDGNVKAYYRRALAHKGLKNYQKSLNDLSKVLLLDPSIVEAK	50467	64731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_50620_53502_53636_55764_55892_64662
819414	contig_9366_pilon	+	1179	3	Intergenic	novelGene_166225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.5	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	70	912	427399	465041	FALSE	20	TTTATAATTTTGTGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDFHRAESGTELLARLEGRSSLKEIEPYLFADEESPVHGDILEFHGPEGTGKTEMLYHLTARCILPKSEGGLEIEVLFIDTDHHFDMLRLVTILEHRLSQSSEEIIKSCLGRFFLVYCNSSSQLLLTLYSLESMFCSHPSLCLLILDSLSAFYWIDRANGGESVNLQESTLKKCSQFLERLVNEYRLVLFASTQSIMQKPSNSTEGPSSAFKHPRNEDIDYRPYLCKAWQQMVKHRIFFSRQDDSKRNNQFSLVLRHLKSNTLKKHFFIIGESGVEFC	427329	465308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_427438_440414_440497_464319
819417	SIRV6	+	339	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	31	337	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819419	SIRV7	-	294	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91632	0	-91626	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTATAAAACTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
819420	contig_5454_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_145505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGCCTCCTAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569828	569186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_569200_569800
819421	contig_10855_pilon	-	656	5	Intergenic	novelGene_124294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_4	17.1828402774396	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	389	520	249726	249334	FALSE	35	GAAGATTTCCGATTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNLAWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDETLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR	251958	249197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_249376_249636_249730_250758_250864_251441_251676_251912
819422	contig_10855_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_124293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	97	618	248905	248384	NA	10	CAGCCAGTGCTGCTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAWQPAGAKAGPPFSACPLPPPRPTRGCEGPEAWGSSSPLDSRFLSSHLGPQRPHTDLRPSSAVTEGNVLLRLWPGQVHHHRPLRPEQAPVGSARPGRLDTAAGPTETTQDVLVRGQCCVVTLLTASEGPVRRAPVTAGPSHGSHALGPAGAHPHCASRCHPVPLCRPSTAR	249001	247608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_247600_249000
819423	contig_8373_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_176380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACTGAATTTTACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42815	44815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_+_42800_44800
819426	contig_17819_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_158793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAATTTTCATATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15211	14536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17819_pilon_-_14500_15200
819427	SIRV6	-	368	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCATAGGCCTCTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	3034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11109_11205
819429	contig_16977_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_169600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAAACACATATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40119	41114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_+_40100_41100
819433	contig_12586_pilon	-	1985	6	Intergenic	novelGene_121791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_5	86.3953702463274	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	1524	1985	18887	14812	FALSE	40	ATCCCAGTATATGAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAGAEKMVECLLRSDKENWPKVLKLALEKEEYNFNELWIVEKGVEDVETKDLQNDEMETSEVQIFYQEEPEYQNLGQSSCPPSSEVSYTNLYSPVKPRNYQLELALPAKNGKNTIICAPTGCGKTFVSILICEHHLKKFPQGQKGKIVFFAIQ	33123	14811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_14910_15292_15401_17557_17684_18757_20067_23780_23916_32914
819434	contig_12257_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_152114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTTTTATTTCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155547	156841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_155500_156800
819437	contig_5954_pilon	-	815	3	Intergenic	novelGene_28679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	840	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	196	696	945420	944848	FALSE	10	TGCTGGACCATCCGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVGTEWGRGWGRGLTPPGQGRAAPASHLSLSNRPPGRPPALRWPSSLTSTSTWPSAACLPAAASFTNTLGATSSCQRGSGPAGRSWMRTFSHSHWDSLPTPSPGIHRAQHVHLPSPWLCSDQGPNWARLCHHRAGEGKSPPSVARVAKTNTPTYL	946298	944728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945044_945115_945527_946209
819443	contig_12790_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_35184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123841	122042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_122000_123800
819444	contig_2770_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_107507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGAACTGTTCGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835510	834166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_834200_835500
819446	contig_11719_pilon	+	573	5	Intergenic	novelGene_154748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2553.12733476025	32	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTGAGTGTCCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13923	20085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14071_14299_14504_16247_16326_19126_19183_19997
819449	SIRV4	-	332	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	279	6	-279	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACGTCCTGTTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	3916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819451	contig_89_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_176387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	228	687	80	766	154181	153495	NA	25	TTCTGTGCTGACTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NESIAFFYNRSGKYLATEWNTVSKLVMGLGITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGKYCLDCNLLYRFPIS	154260	151970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_-_152000_154300
819452	contig_2867_pilon	+	1584	2	Intergenic	novelGene_135200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881533	884194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_881743_882819
819454	contig_8866_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_77800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTGTGTAGATGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408454	409582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_408500_409600
819455	contig_12090_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_80488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80524	80793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_80500_80800
819458	contig_9582_pilon	-	2089	11	Intergenic	novelGene_106835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	28.0791737770184	11	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	159	2045	431196	390727	FALSE	45	AAACGGAGGTAAATACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGRPVPTCVHLASDVQLDGRCDPRKLQTQNQLQFNRNVPTHSSNLAIRYSCPHAIRIEKLKHSFNESYHCKDSNFRDGPDPSSSVSFSVISEEKLSYAVHLAKRDVKRRQFEEHMKEHHLRSQPQISQKCGHTTKSKIPEHRLEKKETKGHEVFPCSHQPSKVEISSSGAKVYLYTSHPGQPDLTVQNSPPTRDPGLQPHSRIGEHKSLLEVQRLQKELSSCIHKIEEVTKKDKIEEALDPDEERRVQIRRQEQAVRSARMLYVLQQQVKEIQEELDKLSPHKIKHTKKSWAVSRLAAAHRGAIRALQMFVTQFTDRGEHPVPTRGRELGSLIRQLSLCSAKLDSDPSVPDVVIDILQQIEDLESLLEKKLSPKKVKKYASEIRNKFPVGSQRVLERWPSTSSKSERRLFGAKEMFPQETRRPSVAKKLLVDKHQPDTELPVTKRLEDELDVLAVDILQEETPSILDQNASFKDETSALARTRVVKKKPVTVKAPCRKKDALAPARLQQGLHRAERCRPTQPHIKSRLHQTTVSSRLKMNQQPVKDQRAPWIPPNPTSPPASPKCAAWTKVKRSPREATKEQSLQQEDTQEGSHSRGAIEHEAARSVLAFQIFEGSLGLMLKPPKD	436741	390682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_390765_393641_393791_395296_395464_397867_398101_418011_418223_420110_420327_420724_420788_422905_423013_425333_425944_431103_431267_436653
819459	contig_17768_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_140406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTACACTACAACCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105361	103413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_103400_105400
819464	contig_7379_pilon	-	605	6	Intergenic	novelGene_150031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	142.051258354159	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTCCACCTATGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569932	540890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_540959_547847_548008_549695_549784_551754_551823_553209_553328_569829
819466	SIRV2	-	514	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1099	24	-64	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACACAAGACATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4796	3689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
819467	contig_10437_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_38100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACATGGGTGTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56859	57835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_56900_57800
819469	contig_15042_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_115439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGCTGAGTTAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43086	42142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_42100_43100
819470	contig_5961_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_144173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATATATGAAAGAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272546	271485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_271500_272500
819472	contig_6445_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_77004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCAACATCACAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508009	508234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_508000_508200
819473	SIRV5	+	293	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	37	875	37	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8352	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
819475	contig_11378_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_112280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	454	492	485315	485353	NA	20	GCAGCATCGGCACGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRSSEPWQGQAPCPPRHPTCPTRHGRQEEETGEGAYITHQDLPHAVSPGPPWADVQPGTCFQEIALSDHKPHKAETGNQHAQHKICKDWISKYKIYRDANNESKFKITVTSGRGWGGRHSFTCNGDEHVLGWVGVYSIVYLFHVKYCLKEWMVNKLILEKYLK	484861	487106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_484900_487100
819476	SIRV4	-	341	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	18	258	18	-258	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGACGTTCAAACGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5140	3895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819479	contig_8712_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_58859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTCCCAGCAACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754258	752446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_752400_754300
819480	scaffold_19766_pilon	-	1106	7	Intergenic	novelGene_34276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	30.6412938514171	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	243	908	381041	379177	FALSE	35	GTGAGAAATGTTGGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRPEPACAAPPLGPVVPVLVFPPDLVFRADQRSGPRQLLTLYNPTGAALRFRVLCTAPAKYTVFDAEGYVKPQSCIDIVIRHVAPIPSHYDVQDRFRIELFEEGAEGRVVGRKDIPSVLRAPAYPLELQARQDSAPHPGPPAWTPPPAARHFQENAHPQLATSSFLLFLLTGIVSVAFLLLPLQDELGSQLPQVLHVSLGQKLVAAYVLGLLTMVFLRT	381626	378978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_379209_379327_379493_380094_380325_380552_380629_380813_380947_381011_381076_381418
819481	contig_15407_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_123091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTACTTTCTCAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518953	517322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_517300_519000
819482	contig_3202_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_167389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCCCAGGGCTCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17389	18197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_17400_18200
819484	contig_6003_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_176391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTAAAAGGTTTAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30705	29125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6003_pilon_-_29100_30700
819486	contig_9363_pilon	-	1556	8	Intergenic	novelGene_6666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.12485826771597	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	69	1076	1048791	1046236	FALSE	20	AAGCCAGTGTCCATCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDETALPVTSLGTVAQWLQPSMAGTAQAQKQVYLVTGGCGFLGEHVVRMLLQQQEPRLRELRVFDLHLSPWLEELKTGPVQVTAIQGDVTQAHEVAAAVAGAHVVIHTAGLVDVFGRSSPKTIHEVNVQGTKNVIEACVQTGTRFLVYTSSMEVVGPNIKGHPFYRGNEDTPYEAVHSHPYPRSKALAEQLVLEANGRKVRGGLPLVTCALRPTGIYGEGHQIMRDFYRQGLRLGCRLFRAIPASVEHGRVYVGNVAWMHVLVAQELEQREKLMGGQVYFCYDKSPYKSYEDFNMEFLGPCGLRLVGTRPLVPYWLLVILAALNALLQWLLRPLLLYAPLLNPYTLAMANTTFTEL	1049222	1045755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1046245_1046512_1046815_1047289_1047453_1047656_1047757_1047832_1047942_1048244_1048401_1048622_1048798_1049160
819489	contig_13300_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_125829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	542	955	1112487	1112074	NA	40	GGTGAATAAAATGGCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPHLTGTHRPLREETTGPQPRHSLSSRHPVPSQTSTCCMSQQRDLPVAVVKNSLHAPDPATRTRQPGSTASAVASCRRGARAKLFTGRGGSAGVSPSRIRDVETGGVLQSPGSGAPGLWGWRQPAVGLDFQVGRKH	1113028	1111808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1111800_1113000
819490	contig_333_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_170913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16786	14939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_-_14900_16800
819491	SIRV6	+	245	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	52	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCTGCCTAATTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819495	contig_19076_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_74229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAGTTCATGAACGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160501	160130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_160100_160500
819496	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
819497	contig_4730_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_71704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTCCACCTTACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127457	128045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_127500_128000
819498	contig_8317_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_20177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCTGTGTCTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
819499	contig_4256_pilon	-	1740	2	Intergenic	novelGene_176394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATCGAAAACCTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331898	321962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4256_pilon_-_323549_331744
819500	contig_11396_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_71420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGGAGATATATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677553	1676161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1676200_1677600
819501	contig_4519_pilon	+	1061	2	Intergenic	novelGene_123690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_1	0	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAATTAACACAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496212	521731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_496374_520831
819503	contig_15312_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_176398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28765	27706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15312_pilon_-_27700_28800
819508	contig_8464_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_125391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAACATTTACCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849693	850567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_849700_850600
819509	contig_12948_pilon	-	1071	5	Intergenic	novelGene_126190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	17.9304210770411	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATTCTAAAATAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209706	203077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_203590_204805_204999_205869_205986_206247_206372_209580
819510	SIRV2	+	315	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	282	-74	-282	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTATTTGACTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
819512	contig_6227_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_49659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAGACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457198	458201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_457200_458200
819513	contig_6227_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_49658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456525	456811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_456500_456800
819514	contig_7049_pilon	+	949	6	Intergenic	novelGene_171431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	44.5573787379823	293	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	100	426	90484	92038	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLGLSRVDDAVAAKHPGLGEYAACQSNAFMKGVVTFVTGTGAAFGLQMLIHRKFPYPLQWTVLVAVVTGSVASYGVTRVETQKCSNLWLFLETGRLPKDAGSDQHS	90384	93490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_90538_90815_90883_91084_91169_91549_91658_92024_92497_93425
819516	contig_6102_pilon	+	586	6	Intergenic	novelGene_31971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1530.32827850759	9	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	139	489	414294	416047	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413049	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414194_414364_414613_414788_414877_414956_416018_416073_416132
819517	contig_11566_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_166701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCCCTGTCTTTAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188645	190924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_188600_190900
819521	contig_15039_pilon	+	1601	7	Intergenic	novelGene_110127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTAAACTTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184482	260906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_185413_187757_187869_197516_197609_198501_198615_200451_200615_201173_201242_260782
819522	contig_12622_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_5778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACTGGTGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134796	134033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_134000_134800
819523	contig_11978_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_62825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAAAAATGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435593	437763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_435600_437800
819524	contig_1516_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_49923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAGACTACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91698	92960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_91700_93000
819525	contig_16860_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_155343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGGACAGAGAGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104999	105644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_105000_105600
819528	contig_6048_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_73136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAGATGAAGACACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990306	988903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_988900_990300
819529	contig_4931_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_138348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123763	125180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123800_125200
819531	contig_4686_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_118557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCTTATCTTCCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581613	581286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_581300_581600
819533	contig_14333_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_49125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATATTTTCATTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402461	403612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_402500_403600
819539	contig_9988_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_113046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAGGTACTATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17401	18860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_17400_18900
819540	contig_16776_pilon	-	829	4	Intergenic	novelGene_130499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	426.973067066296	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTCTGTTGTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57903	34677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41481_57799
819542	contig_6286_pilon	+	468	2	Intergenic	novelGene_165644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	88	468	101427	101807	FALSE	35	GACGCCTACAACGAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAPYRCGEPLPLRSGRRGRCWSREASTAMATPSAAFEALMNGVTSWDVPEDAIPCELLLTGETAFPVMVNDVGQVLIAASSYGRGRLVVVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLRSSPEAPIGVHPSLAPLAKILEGSSMESKIEPEVKDSLGVYCI	89818	101807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_89892_101412
819549	contig_11104_pilon	-	928	2	Intergenic	novelGene_112453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGATTCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309834	303719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_304534_309720
819551	contig_6842_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_130648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGGCCGGGGGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201513	202869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_201500_202900
819552	contig_2636_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_52087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCCATGGTCAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62625	59563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471
819554	contig_3942_pilon	-	1001	4	Intergenic	novelGene_128890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.90668171555645	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	210	527	1601666	1599011	FALSE	5	GTGTGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQRLGGPHYHQEEPGAKCVISTLGPCTENLLDLRESC	1628053	1598536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1599119_1600394_1600478_1601539_1601707_1627884
819555	contig_1666_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_160585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704734	706538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_+_704700_706500
819557	contig_1172_pilon	-	756	5	Intergenic	novelGene_162022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.5643824162734	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	20	574	483247	420848	FALSE	40	TTGGAATCAACTCAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFTSYSMYVITSTSFGLNIDSLNNTQEPLVEKVKMLGKIGFLDPLLFLITLFPFLTPICEALNISVLSREVTDFLTKSIQRMKESHLKDNQKYRMDFLQLMIDSQNFKETESYKALTDMELLAQSIVFIFAGYETTSTALSFLMYLLAIHPDIQQKLQKEIDAALPNKILVLLQFEALLPAYGLAQYTYS	483266	420665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_420917_429996_430158_434981_435049_439377_439506_483117
819561	contig_10689_pilon	-	1548	2	Intergenic	novelGene_118605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	93	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	453	818	36580	36215	FALSE	30	GCCTATTGCAGTGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPFYQKLHEHYDRSYHSKDLHTTTSQYQQEKKRSAIYTHGSAAYSSRSSAAHRQESQALSQASASSSYQQQGSQAYSLRATEYSLGSGVGQKAAAAYDYGYSHGYVKSSLPTSGKRHIL	51485	35484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_36607_51059
819567	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	0	374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819568	contig_16103_pilon	-	680	7	Intergenic	novelGene_118830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4076.93204709947	202	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	43	630	743628	722332	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESKCSELEEELKNVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEKEKPIVQLF	743670	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722362_733578_733606_734314_734391_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
819571	contig_19012_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_159494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTCACATGTGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98985	100640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_99000_100600
819575	contig_2817_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_104363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCACAAAACAAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925950	924225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_924200_926000
819576	SIRV6	+	414	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-72	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	7	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	79	240	58	297	2458	3109	TRUE	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2400	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10727
819579	contig_8615_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_165222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAACCAGGCACACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174211	173258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_173300_174200
819581	contig_18869_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_56180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
819582	contig_12466_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_176400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCCTGTTGAGATGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77962	78733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12466_pilon_+_78000_78700
819583	contig_610_pilon	-	2251	7	Intergenic	novelGene_76819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.168324276836	1	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	640	1485	334304	332842	TRUE	45	TGTATCTGCAATACATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSGAAGHLAHSWDSLKEGASPSPLSLSPAEPPEGGSQNPLGCVLREDSDPPLPGALRGA	343514	331689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_332395_332780_333015_333249_333517_333619_333950_334228_334500_338456_338808_343421
819586	scaffold_8345_pilon	-	2110	15	Intergenic	novelGene_106985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	43	junction_1	63.5494745398081	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	49	1692	150804	26366	FALSE	25	AAGTGTAGGAATTGTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKRKGDLSPAELMMLTIGDVIKQLIEAQEQGRDIDLNKVKTKTAAKYGLSAQPRLVDIIAAVPPQYRKVLIPKLKAKPIRTASGIAVVAVMCKPHRCPHISFTGNICVYCPGGPDSDFEYSAQSYTGYEPTSMRAIRARYDPFLQTRHRIEQLKQLGHSVDKVEFIVMGGTFMALPEEYRDYFIRNLHDALSGHTSNNIYEAVKYSERSHTKCIGITIETRPDYCMKRHLSDMLTYGCTRLEIGVQSVYEDVARDTNRGHTVKAVCESFHLAKDSGFKVVAHMMPDLPNVGLERDIEQFTEFFENPAFRPDGLKLYPTLVIRGTGLYELWKSGRYKSYSPSDLIELVARILALVPPWTRVYRVQRDIPMPLVSSGVEHGNLRELAFARMKDLGIQCRDVRTREVGIQEIHHKVRPYQVELVRRDYVANGGWETFLSYEDPDQDILIGLLRLRKCSEETFRFELGGGVSIVRELHVYGSVVPVNSRDPTKFQHQGFGMLLMEEAERIAREEHGSGKIAVISGVGTRNYYRKIGYRLQGPYMVKMLR	150852	25947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_26443_62067_62150_63046_63275_65067_65134_76330_76422_90778_90973_94151_94279_97906_98069_119389_119545_121711_121781_132437_132502_133284_133356_138101_138241_147412_147513_150785
819587	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819590	contig_10642_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_78655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGACACCAATTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147939	146560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_146600_147900
819591	contig_3153_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_104655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGAACAAATGAACTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127632	127880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_127600_127900
819592	contig_7285_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_143398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243953	243148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_243100_244000
819595	contig_15029_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_128232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATATGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541194	539299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_539300_541200
819598	SIRV6	+	428	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	34	221	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAACTAAGGTTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
819599	contig_13051_pilon	+	1623	14	Intergenic	novelGene_140100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	110.093236441024	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	752	1516	147354	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	99898	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_99985_103695_103803_112338_112479_124642_124741_133403_133498_136172_136265_145248_145338_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
819600	contig_7106_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_148312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGCAACTGGACAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439827	441897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_439800_441900
819601	contig_7165_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_116818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTTATTTTATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164668	163942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_163900_164700
819602	contig_17171_pilon	+	949	5	Intergenic	novelGene_147382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	142	450	333727	334035	TRUE	30	GATGGTCATGCAGAAGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHCLGAMSASLRKPNPTLGLASGAFSVRMVNPGLEKEGGSHPSAPCPMKNPGPAVTAYQGKATCEWRLDGRHHSPGPAHGKYRNRKLCRCGISHSILQNTL	333585	347388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_334270_337312_337352_338784_338874_343888_343980_347342
819603	contig_16768_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_168318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGACTTCTAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28775	26632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_26600_28800
819606	contig_10352_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_49595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCAGCTCAGGAACGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12294	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_11800_12300
819607	contig_16103_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_118953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTTTTGCAGCCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015895	1015254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1015300_1015900
819609	contig_6102_pilon	+	1171	11	Intergenic	novelGene_31777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	280.120134942135	2	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	691	1170	355299	356874	FALSE	25	TTAGTGCGGGATGGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMERKPLSRIPQTKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELK	349896	356875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353229_354962_355027_355271_355343_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746
819613	contig_859_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_132812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGACTACCCAGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22212	93848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_23058_41894_41988_82403_82470_93548
819615	contig_13301_pilon	+	598	7	Intergenic	novelGene_153109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_6	67.7659370349309	1403	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	82	540	133917	144539	FALSE	0	CTCCTGTGGCCTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPKRRALEATSEKVLRYEAFISDVLQRDLQKVLDHRDKVYEQLATYLQLRNVIERLQETKHSELYMQVDLGCNFFVDTVVPDTSRIYVALGYGFFLELTLAEALKFIDRKSCLLTELSDSLTKDSMNIKAHIHMLLEGLRELQGLHSLP	133656	144597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_133729_133907_134015_135003_135086_135217_135286_135556_135665_144234_144299_144500
819616	contig_9527_pilon	+	1101	6	Intergenic	novelGene_134065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	63.3359297713391	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	312	641	487135	487885	FALSE	60	CTAATAAATTAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484556	488345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486481_486658_486827_486883_487092_487197_487515_487647_487748
819618	contig_13224_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_104117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTGCGCCAACAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318146	318433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_318100_318400
819619	contig_7066_pilon	-	935	4	Intergenic	novelGene_42195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	80	562	1003575	1003093	TRUE	5	TTCTGGCTGCTCATGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGSEGVGDGEVKRGQRKAQKRRPLNLGAKQRTGPSPAQPGLLCPGSTEPGQKISGRSHSPQFPEKLSPFDRTATAMASGSPRKEVGLPSLPPSGQTARGQGEGYPSSSFRMLSRSFRVFQAWSFSFLVGVRFFCLAAMILRKASMTSLSAMRTRCLSS	1003654	998757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_998813_1000010_1000113_1000869_1001060_1003066
819622	contig_15245_pilon	-	660	4	Intergenic	novelGene_145212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1315	junction_1	454.16761467791	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	64	390	131120	42989	FALSE	25	TTTGAAGTCTAGATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSSSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQAEILQESRMMIPDCQRRLEAAYTDLLQLLESEKELEEAEEYKEARSVLDSVKLEA	131183	42718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_43070_47639_47727_56801_56908_131067
819625	SIRV6	+	267	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1655	182	-244	129	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATTTAAAGTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2779	11097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031
819627	SIRV6	+	323	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	550	0	384	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819629	contig_10324_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_7775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79574	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79600_80800
819632	contig_3269_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_117015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAATAGATTCAGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94821	92793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_92800_94800
819633	contig_3878_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_174790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGGTGAGAACCCCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184381	185520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_184400_185500
819634	contig_7720_pilon	-	1049	13	Intergenic	novelGene_155782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	111.832091398966	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	17	889	860670	795916	FALSE	10	TGATCTCCGAGGCTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAGSMYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYSTRYGSPKRQLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPLFPIRNDFVKPEVLRNDRGACSVVRSLQVL	860686	795755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796008_802412_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_859303_859346_860593
819635	contig_7106_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_148316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGTTATTTGAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537050	538487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_537000_538500
819636	contig_1624_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_138379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAGAAATACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194391	195519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_194400_195500
819637	contig_13901_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_146657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAGCCATTTCTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241903	243533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_241900_243500
819639	contig_10734_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_51387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1894896	1894060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1894100_1894900
819643	contig_12619_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_73558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAAAATTAGTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730514	729453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_729500_730500
819644	contig_5033_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_29076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCTTTGCTAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628442	629792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_628400_629800
819645	SIRV6	+	301	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	82	-6	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3105	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819646	contig_11311_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_170462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTGTAGCCTGTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967	1579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11311_pilon_+_1000_1600
819647	contig_12642_pilon	+	1031	2	Intergenic	novelGene_176403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	62	523	30976	31701	FALSE	40	AAAATAAACTATTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASEQPVAEPSRPSPSKSFAMVDELVLLLHALLMRHRALSIENSQLMEQLRLLVCERASLLRQVRPPSCPVPFPETFSGESARLPEFIVQTTSYMLVNENRFCNDAMKVASFPLSALRFSGSLPIPRSACLCSRNSAPVTCRWGGDLPRRTAAHSGQPQDPPSEFGLSPEPQL	30914	32209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12642_pilon_+_31247_31510
819648	contig_9434_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_150513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	383	808	392610	393035	NA	75	ATTAAATAGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQEKRGEQPEEDLMTRSLLTTSEKTKEISCHRVDSDSWRPCVCRVELLHRVFMAVTFQKQIIRPVLRDASGWVQTTNHWVSSHAFNHLHTQALLSTSEDSVFPSLLSLLSLGSPGEQSRSTFTKSTQQVTGSHDSSRFVF	392227	394119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_392200_394100
819649	SIRV6	+	457	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	22	6	22	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
819650	contig_2987_pilon	-	727	4	Intergenic	novelGene_125869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.4172680367631	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCCTGCGTCTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610748	603297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_603573_604886_604936_606079_606213_610478
819651	contig_10980_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_162557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140395	141143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_140400_141100
819658	contig_12622_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_6015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCAGCAGCTCATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650538	1649622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1649600_1650500
819661	contig_11816_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_98507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGATAGTAATGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956315	956714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_956300_956700
819662	SIRV6	-	521	3	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	7	76	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	25	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTATTTACAACTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2540	1468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470
819665	contig_14029_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_151934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTGCTCTACATCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108161	108505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_108200_108500
819670	contig_9345_pilon	-	1638	2	Intergenic	novelGene_24471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCTCGTGCAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620399	618397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_619494_619857
819671	contig_14664_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_169535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCAGTCAGTTTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7082	4885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_-_4900_7100
819675	contig_13868_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_172645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTAAATCTTACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44918	44646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_44600_44900
819676	contig_11253_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_126812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15521	16453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_15500_16500
819678	contig_13863_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_41997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTCATGACATGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57306	55136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_55100_57300
819682	SIRV6	+	343	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	530	0	364	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819683	contig_13894_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_62078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGCACCACTAGGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423875	429045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_424222_428858
819684	contig_2646_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_69595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTTAGTTGCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456077	1454506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1454500_1456100
819685	contig_14300_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_133098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATGAGAAAGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154793	154497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_154500_154800
819686	contig_7695_pilon	-	1226	7	Intergenic	novelGene_41605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.4222138301431	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	3	836	514355	504301	FALSE	20	ACCACCATCTTTGCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGERAGCGLCHAAGEAHLPGGGRQGPVHPLEGALFRRAGGAARAAGPRQRQALCAGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRSGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLCLNARFVILKVLLEAGEGLVTVTATTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRKLQVLKSTGDVAGGRLLYEGYAAVTDAPPECFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSEVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILIQLATADARFWKGPTEVPAGQA	514357	503910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_504474_506191_506355_510463_510632_512309_512421_512505_512559_513892_513986_514282
819687	contig_11335_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_104921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349738	349362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_349400_349700
819688	contig_2332_pilon	-	1150	10	Intergenic	novelGene_58658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_9	12.0185042515466	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	267	995	326228	318116	FALSE	25	AATTCACTTGGCTTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQLSLGLWTLLSQKRGCLYAAGAPPALCDHRLRLPPWLKTEIPIGKNYNKLKNTLRNLNLHTVCEEARCPNIGECWGGGEYATATATIMLMGDTCTRGCRFCSVKTARKPPPLDANEPFNTAKAIAEWGLDYVVLTSVDRDDMPDGGAEHFAKTVSHLKERNPKILVECLTPDFRGDLKAIEKVAVSGLDVYAHNVETVPELQRKVRDPRANFDQSLCVLKHAKEVRPDVISKTSIMLGLGENDEQVYATMKALREADVDCLTLGQYMQPTKRHLKVEEYITPEKFKYWEKVGNELGFLYTASGPLVRSSYKAGEFFLKNLVAKRKTKAL	330579	317960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_318169_320365_320478_321258_321330_322403_322550_324592_324722_325094_325153_325235_325393_326225_326307_327167_327262_330485
819689	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819692	contig_3150_pilon	-	2675	6	Intergenic	novelGene_171914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	4.62168800331654	24	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	315	1127	275943	259164	FALSE	30	CAAGCAAGTCATCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQLPVQRKESCANLISDEFLKKALAESPASEAARGRSAGSVVLTHQCFCLYSHLDDARGRHQKKIQSRTQNYLNVYAVEGLRTLCIARRVLSKEEYACWLQRHMEAESALDNREELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETIAKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDQDEEVITFNAESQEACAALLDQCLRYVQSKGPGSAQEKTSKDISVAFSPLSPPSVSTASGRSPSLVIDGRSLAYALEKSLEDKFLFLAKQCGSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPRFRYLERLLIVHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTVGI	276337	257615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_-_259302_262823_262901_265678_266007_269270_269456_275858_275986_276065
819694	contig_14519_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_66845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGCGATTAAAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397266	397598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_397300_397600
819695	contig_16036_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_114803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATTCATAAAAACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23081	24850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_+_23100_24800
819696	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	5	4	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819698	contig_13074_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_153462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAAGACTTCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704181	701907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_701900_704200
819699	contig_10235_pilon	-	1198	6	Intergenic	novelGene_46597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	40.6959457440173	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	591	947	588881	588231	FALSE	40	ATAATGAGTGAATGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLPGRCVPIAKRELLWAGSAGLACWLAGVIFIDRKRTGDAINVMSEVAQTLLTQDVRVWVFPEGTRNHNGSMLPFKRGAFHLAVQAQVPIVPIVMSSYQDFYCKKERRFTSGEGSC	594038	587979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_588321_588449_588546_588710_588887_589221_589357_589564_589774_593797
819700	contig_3241_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_146419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATGAAGTAATAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933811	935808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_933800_935800
819701	SIRV6	+	188	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	544	51	544	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819702	contig_10235_pilon	-	1287	4	Intergenic	novelGene_46560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	28.2488937836511	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	84	929	431644	430322	FALSE	15	ACGGCTGGAACCCCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRGTKKGAGKLEAAEPRNKLPRPAPSLPTDPALYSGPFPFYRRPSELGCFSLDAQRQYHGDARALRYYSPPPTNGPGPNFDLRDGYPDRYQPRDEEIREGLDHLLRWLLEHRGQLERDPGWLAGAIVTWRGHLTKLLTTPYERQEGWQLAASRFQGTLYLSEIETPAARAQRLARPPLLRELMYMGYKFEQYMCADKPTGSPDPSGEVNTNVAFCSVLRSRLGNHPLLFSGEVDCTDPQAPSTQPPACYVELKTSKEMHSPGQWRSFYRFRVGIGRTRA	431923	429963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_430576_430660_430897_431288_431651_431846
819703	contig_177_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_41797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGACGTGTGTGGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405205	403126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_403100_405200
819704	contig_13608_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_52384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTCATCAGTACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416846	417940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_416800_417900
819705	contig_13608_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_52385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417940	419112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_417900_419100
819706	contig_9290_pilon	+	838	5	Intergenic	novelGene_77514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	212.606443928682	522	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	100	627	46400	49973	FALSE	35	TTATTTTTATATAATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRTRDSESSLGASGQRERGESRGFCSRLPLVCEMQLTHQLDLFPECRVTLLLFKDVKNAGDLRRKAMEGAISGSLINPTVIVDPFQILVAANKAVHLYKLGKMKTRTLSTEIIFNLSPNNNISEALKNFGISANDTSILIVYIEEGEEQINQEHLISQVEGHQVSLASLPEITNITEVRKIYKLSSQEESIGTLLDGTICRMSTKDVL	45593	50184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_45662_46368_46541_47448_47572_49008_49186_49886
819707	contig_6602_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_166437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGCATTTTATCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306714	308116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_306700_308100
819711	contig_3410_pilon	+	973	4	Intergenic	novelGene_58960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	29.3371209675842	91	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	422	808	411582	412811	FALSE	75	CACACACAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASTAVNYCGLETILHMTCCHQSREEITGHLHKAKRLGLKNILALRGDPIGEQWEEEEEGFSCALDLVKHIRSEFGDYFDICVAGECLEPPSGWGQRGEGTRRPGLSRGTESRQYSTGTWLSSAPRA	407311	412976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_407389_409951_410201_411486_411727_412569
819713	contig_2067_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_158917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAGGAATCTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411429	413139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_411400_413100
819714	contig_15114_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_121228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	70	717	1687560	1688207	NA	30	ACAAACGTTAACGTGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLGGPGPGPGGPEERDGRQQPQQQPPPPQPQQQQPPPSQQPPPTQQQPQQFRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVENDRERYGSRNDDRDNSSRERREWGRRSPDRDRHRDLEERNRRSSGHRDRERDSRESRREKEETRAKEKPEGTDRAGGNKAVEPPVSQVGNVDTVSELDKGESEATVVKPSEESPAEATSSVEPEKDSGSAAEVPR	1687490	1688578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1687500_1688600
819715	SIRV4	+	190	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1581	632	1126	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
819716	contig_12977_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_122807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	537	293	829	58248	58784	NA	15	AAGTGCCTTCTATTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTPHLRVAVVTVCLLLSVGVGSSRERRPGCGGPTVTNWRGVKAKFHGVAHILYVSKGRPQLSPGSSQLTPPAQCTLNLLHRITTSWTSLQGTSSRSSWKGRTAGGQWNGMGSVALSLVPTWRSFEEGQELPPGPPPPVEPAVPPPLPWPCHGPRTEPSCPGDGCWPLPMESLPQGIK	57955	58784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_58000_58800
819717	SIRV2	+	485	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	112	-74	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1500
819721	contig_15517_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_176410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAATAAAAGATTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41376	43988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_+_41400_44000
819722	contig_5791_pilon	-	1706	2	Intergenic	novelGene_35806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	8	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207976	205092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_205484_206661
819723	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819724	contig_15185_pilon	-	774	2	Intergenic	novelGene_99430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	367	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	107	592	380670	380077	FALSE	15	TGCGGACTAGTCCTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMEGSGKETCTLLPHSAAAFWRYGVLGKCRPVSPVSPQKKRKRRVYKVPTSGTLDPTPPRPRLPGSRASGHRSSSSSDSAGASPVHAGGPAGAYHSASAESMDEILVAQTHLGSAALAAPGSKVRELGLGLALQARVPAVFVSPSSGEPGAPGGPETGLA	380776	379894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_380367_380474
819725	contig_11378_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_112313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCAGCTTCCGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133632	1135785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1133600_1135800
819726	contig_4732_pilon	+	840	4	Intergenic	novelGene_75416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	315.164507307956	181	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	75	749	596758	609401	FALSE	10	AACCTGCGCCTTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLAPTQRTFQADTCRARRCGGDRAGWTFLTLSILPAPQVQAGTPSAPSACLQLLLRWEKTPLPSSHFLHAARSPLSPYPVLSPHLVRNLFASEAISPCFVYTTALVAFGFCYCRETQILYTLCKIDAKP	596683	609492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607235_609013
819727	contig_12125_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_76236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	750	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	27	347	440685	441341	FALSE	25	TCCTTCTCGAAAGGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAPAAVVMEGRPACSGLPREAAAMRRIYSRIDRLEAFVRMVGGSVARMEEQVARAEAHLGTFPSAFKKLLHTISAPSLFSRASSPRRQPSGFEAPVVFRTEDHFPCWSERPQV	440658	441898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_440724_441059
819728	contig_2770_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_107423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAATCACCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273361	272284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_272300_273400
819729	contig_1551_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_173422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAATAAATAATATTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399798	400197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_399800_400200
819730	contig_1551_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_173423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	27	326	400375	400674	NA	60	AAAAAAGACAGACACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVDLEVWFPASNSYQRTLEFLKQPLPRQDTFPAWQTVFSSAGRNHFFRSRSSRRQGGWPQPRRCTSLRIRAREATGAVQASTASRLALWQAPCGAGAL	400348	401617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_400300_401600
819731	contig_3679_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_112129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCCCAGCTTCAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058816	1057304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1057300_1058800
819732	contig_8843_pilon	+	810	6	Intergenic	novelGene_156644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	343.792030157769	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	13	726	49851	87976	FALSE	70	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYDPPDPRRIYTIMSAEEVANGKKSHWAELEISGRVRSLSTSLWSLTHLTALHLNDNYLSRIPPDIAKLHNLVYLDLSSNKLRSLPAELGNMVSLRELLLNNNLLRVLPYELGRLFQLQTLGLKGNPLSQDILNLYQDPDGTRKLLNFMLDNLAVHPEQLPPRPWITLKERDQILPSASFTVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWEYRKKGIMEEIVNCDADIISLQVTL	49838	88060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_49963_53127_53315_54647_54734_66012_66103_83970_84040_87806
819734	contig_678_pilon	-	1025	7	Intergenic	novelGene_167827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_6	144.546897426252	248	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	49	789	153915	150261	FALSE	10	CTTTCCTGGGTTCCTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGRGPGALPAACSAAMSQGSPGEWAPLDLTAGTPNPFVHELHLSRLQRVKFCLLGALLAPIRVLLAFIVLFLLWPFAWLQVVGLTDEQLQEPVTGWRKSVCHSGVLGLGRLLFFLLGFLRIRVRGQRASRLQAPVLVAAPHSTFFDPIVLLPCDLPKVVSRAENLSVPVIGALLRFNQAIFVSRHDPASRREVVEEVRRRATSGGKWPQVLFFPEGTCSNKKALLKFKPGAFIAGVPVQPVLIRYPNSVDTTSWAWRGPGV	153963	150024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_150300_150481_150541_150984_151046_151167_151281_151690_151912_152220_152364_153810
819736	contig_11171_pilon	-	869	2	Intergenic	novelGene_48524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	206	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	229	468	33542	30656	FALSE	30	TCCAACAGACAGTGGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPCGAPWQAAWLEPPLAFYAAKTTLLGQGGSQQGPKGAQGAARAYHSDRWDGSWHRSPGSQTGCWQARRFLVCLTKMYGAPTVCQVPGMHGRIQPMPDGSEKYPGSQLGGQSARASEPRGHLNNEGREEDGAPLATAKVKPGSSTVACRAWPSLG	33770	30254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_30748_33394
819739	contig_11227_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_163184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139784	140184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_139800_140200
819740	contig_15613_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_147193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACAAAATGTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54694	55787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_54700_55800
819741	contig_5649_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_82482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666981	1668408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1667000_1668400
819742	contig_10857_pilon	-	863	5	Intergenic	novelGene_160860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2	673	6933	5675	FALSE	10	GGGGATCCTGTAGGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPDETRPGDEQPLLTSERGPARPGSVGGPCQAAGLGLGLEHLLPALHARLLLNVLPPVTHVTQVPLLFCVLLLHLLQVGPQVHAHLVLGAQQRLEHGVGRHADPPQWRPLELAPQVEQLLVHVLQLLAALLHLHLHVVLVLLGGVHLGVKLLTELLGHFSHGAGEVQGRAVIIQVRLLLCLTAALLLLQLCGRNLEHDALQVLPPGRDSPVLFLQGRGKRAR	6934	5484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_5745_5948_6077_6220_6315_6416_6594_6730
819743	contig_6805_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_163895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACATCAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426681	427871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_+_426700_427900
819744	contig_15744_pilon	+	459	5	Intergenic	novelGene_83576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1476.28120204113	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	59	421	149562	153543	FALSE	30	ACTAAATGACAGTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSIIFVLSLQCFGFHLFLILLQV	149503	153581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152641_153477
819745	contig_4782_pilon	+	1421	3	Intergenic	novelGene_73626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_2	32	102	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	166	492	249457	257216	FALSE	20	AAATCTCCTTTCTGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIVNTCSQLSFSSLHVPTIRIDVHRKENAGAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGSVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNVSFNMKDISFFA	249291	258145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_249486_250936_251060_257041
819746	contig_6192_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_170343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTTAAATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825167	823764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_823800_825200
819747	contig_14219_pilon	-	1348	11	Intergenic	novelGene_54375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	833.918437258705	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	127	768	1084399	1057664	TRUE	10	CTTTGATTCTTGCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLRRGCEEQPGGGGGGSLSVSSREERTQGGAPAGTGGGPTMAIRKKSTKNPPVLSHEFILQNHADIVSCVAMVFLLGLMFEITAKASIIFVTLQYNVTLPATEEQDTESASLYYYGVKDLATVFFYMLVAVIIHAIIQEYVLDKINRRMHFSKTKHSKFNESGQLSAFYLFSCIWGTFILISENYISDPTILWRAYPHNLMTFQMKFFYISQLAYWLHAFPELYFQKTKKEDIPRQLVYIGLYLFHIAGAYLS	1084525	1047160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1047336_1055720_1055882_1056614_1056759_1057563_1057669_1057778_1057846_1068386_1068472_1070549_1070609_1071992_1072110_1072229_1072352_1077145_1077210_1084276
819750	SIRV4	-	509	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	5	103	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGAACATTTAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819751	contig_8598_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_22885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTTTGTGTTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63472	64487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_63500_64500
819752	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
819753	contig_5586_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_143516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256247	258415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_256200_258400
819755	contig_854_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_36462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465004	1463968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1464000_1465000
819760	contig_6199_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_126392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAACAAACAGCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489430	487930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_487900_489400
819761	contig_9738_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_169269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209915	209446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_209400_209900
819762	contig_5479_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_133602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	945	1259	311686	311372	NA	10	TATTTTTTGTCTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPSITYSQELKYFYPLASSVASCLHTSNQWRYLADRVAPEEKRHTWGLDVTIHDALQPQLGRPYCPSTLLAVPSPLPLLFLTEEISSIFQGSHLILTSVSMR	312630	311141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_311100_312600
819764	contig_12724_pilon	-	1265	2	Intergenic	novelGene_146872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAAGTACTTTGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446522	440564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761
819766	contig_19146_pilon	+	2115	5	Intergenic	novelGene_172285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.7514969791503	103	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	462	794	17784	22668	FALSE	10	TCCATTTGTGGTATTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFACLSFRQPYAGLVLNRVKTLETRWRPLLSGHCNRTLAVHIAHRDWEDNAWRELLLDRLGMTPAQVQALRGAGARGMTLFALCQMLFARSTVRKLTPTDMSTCLARLD	15344	23989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19146_pilon_+_15543_16157_16209_17487_17646_17729_17996_22547
819768	contig_1719_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_87258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	127357	127004	NA	50	TATCCCAGGAATAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQGHSGCSSSIRTASPQRCSQALALGLCPEALNFPSCVLGSPLRHLLLPGFCCWVSPATTSHRLQGYSLLSLSISCFQGLLNTGILAPKDVLFAPGCFCLVVVEASSLLWNWLSFKA	127357	126382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_126400_127400
819770	contig_10732_pilon	+	1402	7	Intergenic	novelGene_114746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	18.7498148139003	135	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	48	752	558675	570665	FALSE	15	GTACAGGCATGGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRRGGPRSCEFPGGAMSCINLPTVLPGSPSKTRGQVQVILGPMFSGKSTELMRRVRRFQIAQYKCLVIKYAKDTRYGSGFSTHDRNTMEALPACLLRDVAQEALGVAVIGIDEGQFFPDIVEFSETMANAGKTVIVAALDGTFQRKAFGSILNLVPLAESVVKLTAVCMECFREAAYTKRLGSEKEVEVIGGADKYHSVCRLCYFKKSSSQPPGLDNKENCPVLGRPGEAVGVRKLFAPQQVLQCNSVH	558627	571315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_558741_558871_558904_560027_560139_562808_562903_569793_569884_570270_570391_570473
819771	contig_7097_pilon	-	1652	3	Intergenic	novelGene_174448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTCCTCCACCCACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304091	289940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7097_pilon_-_290021_294008_295130_303640
819773	SIRV6	+	243	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	54	486	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819776	contig_4151_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_65243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545052	546464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_545100_546500
819779	SIRV4	-	227	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	390	0	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819780	contig_9440_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_59115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCCAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1780456	1780046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1780000_1780500
819781	contig_14133_pilon	-	2043	14	Intergenic	novelGene_119970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	50.7874093328806	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	131	1876	225586	213631	FALSE	35	GAGATAAATGGTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEVKDRIPVSYKRTGFFGNALYALGMTAVGLAILWYIFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTVVDGKMGKGISFKDVAGMHEAKLEVKEFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARHRAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSSFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDSALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTRASSFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTSNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQRVVAFHESGHALVGWLLEHTEAVMKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	226386	213463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220461_220587_221852_222027_222355_222519_222935_223062_224401_224505_225467_225608_226277
819782	contig_9470_pilon	+	1096	4	Intergenic	novelGene_176414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.09120616516523	31	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTAATGACCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419229	432380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9470_pilon_+_419359_420273_420478_426533_426618_431701
819786	contig_3789_pilon	-	973	4	Intergenic	novelGene_79820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	20.5480466765633	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTTGTCTTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179413	154436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_155139_169288_169340_172991_173092_179293
819787	contig_14338_pilon	+	957	6	Intergenic	novelGene_174843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_5	20.8556946659659	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	768	189	956	128462	148188	FALSE	25	ACTTTGTTGATATATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVPEPRPVPKNDVGFKYTVKHRPFPEEVDKIPFVKADLSIPDLHEIVTEELEERHEKLRNGMAQQIAYEVRLEQQSEEEFRKKSFPDPITDCKPPPPAQEFQTARLFLSHFGFLSLEALKEPANSRLPPHLIALDSTIPGFFDDIGYLDLLPCRPFDTVFIFYMKPGQKTNQEILKNVESSRTVQPHFLEFLLSLGWSVDVGRHPGWTGHVSTSWSINSCNDSEGSEQDEVISSEDVGASIFNGQKKVLYYADALTEIAFVVPSPVESLTDSLESNISDQDSDSNMDLMPGILKQPSLTLELFPNHTDNLNSSQRVS	125937	148189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_126093_128428_128639_139386_139546_144283_144450_146773_146897_148045
819788	contig_17470_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_110477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGATTCCATTTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111080	112294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_111100_112300
819790	contig_3382_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_124055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTCTTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233121	233567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_233100_233600
819791	contig_12635_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_60825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCAGCAGCAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208350	209855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_208400_209900
819793	contig_9389_pilon	+	651	7	Intergenic	novelGene_83932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	832.173142374163	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	146	610	164237	168338	FALSE	40	TGTTTTTAGGGAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHMVPHSRSFWGPAPTRSPGTMK	159630	168379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_166074_166158_168274
819795	contig_19692_pilon	+	1512	2	Intergenic	novelGene_174882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGTTGAGTTACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52181	54030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_53482_53818
819796	contig_6027_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_74461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGATTATTTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346367	347266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_346400_347300
819797	contig_15323_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_148499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGAATACTAGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13432	15417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_13400_15400
819798	contig_12411_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_145679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATTTATGTTGAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375498	376396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_375500_376400
819799	contig_13412_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_80025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730714	732856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_730700_732900
819800	contig_19899_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_102511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTTTATAGGACAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128372	127264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_127300_128400
819801	contig_19899_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_102510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGTAGAACAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127010	126487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_126500_127000
819802	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819807	SIRV6	+	342	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	231	6	231	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
819808	contig_8312_pilon	+	1596	2	Intergenic	novelGene_152878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCATTGGTGTTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254346	256006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_255215_255278
819811	contig_3627_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_78554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707171	706067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_706100_707200
819812	contig_678_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_167840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAGAAAGCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437189	438232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_437200_438200
819813	contig_3601_pilon	-	1250	9	Intergenic	novelGene_132873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1297.6525861628	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	13	855	355137	144563	FALSE	45	AAAAATGTGAAGTTATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATASGALGALQASRARLVAAWCARLGLGLGLPGSVTSTRAGPAMWAQGWAPAAGGAVLRRGYSSEVNAENELRVRYLEEENRGIVVLGINRAHAKNAISKNLIKMLSKAVDALKSDKKVRTIIVRSEVPGVFCAGADLKERVKMHSSEVGPFVSKIRAVVNDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLAFKEKRPPRYKGE	355149	144167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_144641_145789_145838_147217_147269_169011_169113_254601_254662_274999_275087_312798_312887_312992_313061_354875
819814	contig_5551_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_134279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGGTGAAGGCCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770207	768728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_768700_770200
819815	contig_5495_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_157669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGCAAGGAGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544514	542491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_-_542500_544500
819816	contig_8820_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_79318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTGTGTAATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279774	278755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_278800_279800
819820	contig_9389_pilon	+	992	4	Intergenic	novelGene_83917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1040.33082345099	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGAAAAAAAGTGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159552	168386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164274_167654
819821	SIRV5	+	321	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1021	0	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2077	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2100_2400
819822	contig_6434_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_61850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCTATCCAGTCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792727	793492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_792700_793500
819823	contig_2278_pilon	-	547	5	Intergenic	novelGene_118080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	30.4055915910215	1988	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAGCTTTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632007	628384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_628649_629266_629340_630263_630292_630585_630682_631921
819824	contig_11003_pilon	+	1898	12	Intergenic	novelGene_105443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	46.079700986174	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	219	917	354082	361371	TRUE	5	TTTCCGCCACCTTGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWQRALQYEHEQRIHLEETIEQLAKQHNSLERAFRSAPGRPANPTKSFSEGSLLTPKGEDSEEDEDTEYFDAMEDSTSFITVITESKEDKKAEGGTGAVSVDDWTTADNVLDGTSPGPKGPPKVKRRSRIPDKPNYSLNLWSIMKNCIGRELSKIPMPVNFNEPLSMLQRLTEDLEYHHLLDKAVNCTNPVEQMCLVAAFSVSSYSTTVNRIAKPFNPMLGETFELDRLDDMGLRSLCEQVSHHPPSAAHYVFSKHGWSLWQEITISSKFRGEIPLHHALRCHPLRIPGQWESLRVEEEHLHCA	353232	369541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_353386_354016_354135_356420_356479_356685_356833_358435_358682_360914_361037_361298_361403_361474_361571_361646_361832_367447_367681_367992_368082_369194
819825	contig_13699_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_158332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGCATCATATACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106043	107611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_106000_107600
819832	contig_13074_pilon	+	570	2	Intergenic	novelGene_153464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715360	719893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_715475_719437
819836	contig_4732_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_75504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAATGTAAAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031742	1030524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1030500_1031700
819837	contig_7286_pilon	-	834	7	Intergenic	novelGene_108710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4737.12826744455	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATTGATTAATTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293145	286891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291352_291497_292022_292101_293119
819838	contig_7057_pilon	+	537	6	Intergenic	novelGene_123322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	304	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGGCATCTGCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936061	943717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936082_939052_939088_941405_941518_942970_943030_943206_943314_943513
819840	contig_5018_pilon	+	715	4	Intergenic	novelGene_47164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	418.264137703544	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	1498424	1499510	TRUE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIGPLHHRWQRCPSSDHGQ	1498421	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498555_1499164_1499280_1499456_1499588_1500185
819841	contig_5728_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_126714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATAGATAGGTTAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393701	394890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_393700_394900
819842	contig_5758_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_119126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACCTTTCAGATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563461	562780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_562800_563500
819843	contig_3424_pilon	+	1958	7	Intergenic	novelGene_55579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_3	8.86315720020555	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	427	861	1121657	1125685	FALSE	15	CTTTTTCTGGCCACAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYVLLQSAAHGVLYLSVFLRRDLIWFCSEVECSTVTTRIVSHIKTKGALGVGFTFFGTSFLFITSHFTSGDGKVAERLLDYTRTIRALALPRSVPDTNPYRSSPVDVTTRFDEVFWFGDFNFRLSAGRTAVEALLRQELETDMSALLQHDQLTREMRRGAIFKGFQEPDIHFLPSYKFDIGKDTYDSTSKQRTPSYTDRVMYRSRHKDDICPVKYSSCPSIRTSDHRPVYGLFRVRVRPGRDNIPLAAGKFDRELYLIGIKRRISKEIQRQQALKNQNSSAICTVS	1118521	1126782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1118607_1118769_1118890_1120780_1120889_1121543_1121706_1121785_1121902_1124927_1125065_1125552
819844	contig_2940_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_81881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373279	374912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_373300_374900
819845	SIRV5	+	414	6	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCCACTTTGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3411_3483
819846	contig_16121_pilon	+	1114	2	Intergenic	novelGene_6888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAAGTAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60965	62126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_61266_61312
819847	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
819848	SIRV6	+	359	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	14	4	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819849	contig_7887_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_124941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727173	725668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_725700_727200
819852	contig_13424_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_151609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCCAGTCCGGGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212368	210862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_-_210900_212400
819853	contig_17936_pilon	-	1235	7	Intergenic	novelGene_29981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.5628065724317	147	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	147	605	167355	161377	TRUE	30	TTTTGTAGTCAAGGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPRLRRGSADPVGASSSPASASSASSASLASAGSRDPGVCPTLDPTRDMSTPARRRLMRDFKRLQEDPPAGVSGAPSENNIMVWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLTIEFTEEYPNKPPTVRFVSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWRDC	167501	160227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_160590_161108_161506_161839_161929_162755_162846_166658_166685_167090_167172_167311
819855	SIRV6	+	205	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	527	51	527	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10764	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819856	SIRV4	-	208	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	406	3	-406	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCGGCGGCAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819857	contig_8377_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_35168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGTCCCAATTCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370610	369045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_369000_370600
819858	contig_7357_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_36869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAACACACACAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231347	231842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_231300_231800
819859	contig_7357_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_36870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCCAAATCCTCCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232398	232749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_232400_232700
819862	contig_3837_pilon	+	1545	11	Intergenic	novelGene_104019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	74.8342167728105	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	508	1545	67539	134105	FALSE	40	AATGCCAGGAAACACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESDSEKKMEKENLGPRMDSPMGEPEGSLGWVLPNTAMKKKVLLMGKSGSGKTSMRSIIFANYIARDTRRLVLDRLHSLQINSSLSTYSLVDSVGNTKTFDVEHSHVRFLGNLVLNLWDCGGQDTFMENYFTSQRDNIFRNVEVLIYVFDVESRELEKDMHYYQSCLEAILQNSPDAKIFCLVHKMDLVQEDQRDLIFKEREEDLRRLSRPLECSCFRTSIWDETLYKAWSSIVYQLIPNVQQLEMNLRNFAEIIEADEVLLFERATFLVISHYQCKEQRDAHRFEKISNIIKQFNSKLAASFQSMEVRNSNFAAFIDIFTSNTYVMVVMSDPSIPSAATLINIR	67031	134105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_67631_68419_68454_70834_70926_75761_75846_77748_77816_88997_89221_121918_122015_124345_124469_128629_128710_133147_133267_134076
819864	contig_7801_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_169685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGTAGGATTTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491796	491239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_-_491200_491800
819866	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819868	contig_13744_pilon	-	793	8	Intergenic	novelGene_77174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	2.0995626366713	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	89	793	645379	617593	FALSE	55	ACCAAAGAAAAATTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGFRRSQKSQFKHIVHGLLPAASIAPKPAVPRTPPPRSPNPSPERPRSALAAAILATTLTGRTVAIPQPRQRSRSESDTTCIGKDSSIEPYATTSELRLRPTWQSEMGRGTSFPSFETLDCREEEGTDTHLSSSDKESQDVSARNDAGGRSDAVYAVPHRDQVPLSHGVDSEEDENISEQDGFPDSPLTLQCTHEKDVKHPVLNLKDEKSPLCGKPPPSPDVTGRTRQRCIEI	645467	617592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_617631_620211_620255_621071_621101_626388_626492_629135_629323_631808_631968_642830_642938_645340
819869	contig_12802_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_114258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAACCAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218366	220077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_218400_220100
819874	contig_10148_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_172860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGATGAATTTCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245338	244722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_244700_245300
819876	contig_12761_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_164066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCCCACCTTGAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340430	340001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_340000_340400
819878	contig_1008_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_121630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191257	1189768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1189800_1191300
819879	SIRV6	+	169	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	563	51	563	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10800	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
819880	SIRV6	+	221	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
819881	contig_12050_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_62686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCCCAGCAACACACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507456	506019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_506000_507500
819882	contig_3721_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_123844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529994	527961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_528000_530000
819890	scaffold_12124_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_22429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATATATTTGTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1668864	1670032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1668900_1670000
819892	contig_2036_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_131841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAGAATACATTATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620797	622747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_620800_622700
819893	contig_11883_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_163768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1952	2254	54031	53729	NA	70	TTGTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACVWEIFLPVCALPLHISAVYSAKFLIFMKSNLTSFSFMDHAFSVVPKKSLPNPVSPGCSPRCCGVLCFTFKSVIHFELVFMRDVRSVFRFGFLHLDV	55982	53668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_53700_56000
819896	contig_1719_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_87314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGACTTTTTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441298	440075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_440100_441300
819899	contig_17781_pilon	-	437	2	Intergenic	novelGene_163678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACTGAATGATGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245765	216359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_-_216669_245637
819900	contig_678_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_167841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAGAAGAATGAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444509	443982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_444000_444500
819901	contig_16647_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_170304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAAGATCACTGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292851	294306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_292900_294300
819902	contig_6129_pilon	-	1289	7	Intergenic	novelGene_159970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10.3023729736837	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	108	908	239060	209106	FALSE	20	TCCTGATGTGAACTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQVTVQWDAVLALYLLFNWCHGGITNINCSGHIWVEPATIFKMGTNISIYCQAAIKNCQPRKLYFYKNGIKEIFQVTRINKTTARLWYKNFLEPHASIYCTAECPGFFQETLICGKDISSGYPPDVPANVTCVIYEYSGNMSCTWNIGKLTYIDTKYTVHVKSLETKEEQQYLTSNYINISIDSLQGGKKYVVWVQAANVLGMEESEQLQIHLDDIVIPSASIISRAENINTTVPKTIIHWNSQTTIEKVSCEMRYKVATNETWN	240496	208724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_209109_210220_210367_215575_215737_227129_227254_236130_236428_238990_239063_240391
819904	contig_1076_pilon	+	1164	4	Intergenic	novelGene_101115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	102.924999662645	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTTGCATAATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91491	132947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_91612_116257_116333_118268_118347_132056
819905	contig_9375_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_136083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAACCAAGCCCATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647963	648864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_648000_648900
819906	contig_9375_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_136084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAATGATCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649533	650896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_649500_650900
819907	contig_5954_pilon	-	834	5	Intergenic	novelGene_28449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.57071421427143	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	17	607	104430	103159	FALSE	5	TTGGTGTGGCTTCTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLVNGFQLLYVGDALWHEEAVLTTMDITHDGFGFMLVFGDLAWVPFTYSLQAQFLVHHPQALGLPMASTICLINAIGYYIFRGANSQKNTFRKNPSDPRVADLETISTATGRQLLVSGWWGMVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGASHLLPYFYLLYFTSLLVHREAHDERQCLQKYGLAWHEYCRRVPYRIVPYIY	104446	102931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_103320_103581_103705_103788_103870_104115_104285_104373
819908	contig_7179_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_78191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTCTGTCACAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256888	1257297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1256900_1257300
819911	contig_12391_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_103596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	10	408	56804	57202	NA	85	TGAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAKMSDMEDDFMCDDEEDYDLVRLRERNSGAGGGVRLSGPGQGLAAVFLRRACAPSSFSRCSDRTGLPPPLSRTGPGPCLSSMGEGRQRRWSRALRSKSERLPRLHGRPWPQMFGSRCPLSPLTPCERLRDHAAV	56794	57664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56800_57700
819913	contig_7308_pilon	+	1344	6	Intergenic	novelGene_159630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	220.591386957877	1147	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	78	356	614741	615737	TRUE	10	CCCCTTGGCTCTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRASPFACAPLFLSRRLAPDTADIMGFGDLKTPAGLQVLNDYLADKSYIEGYVPSQADVAVFEAVSSPPPADLYHALRWYNHIKSYEKEKARTGRTWTTAVQLFPTLPCQGASTLT	614663	617529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_614821_615367_615491_615661_615913_616120_616604_616998_617125_617325
819914	contig_18193_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_176415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGAAGAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17066	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18193_pilon_-_16600_17100
819916	contig_7870_pilon	-	449	4	Intergenic	novelGene_108966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	416.654399819429	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	441805	364867	FALSE	25	ACAGCCCTTGTATTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSPVFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQASQIE	441806	364745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364884_370811_370890_402901_403001_441672
819921	contig_1450_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_27384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAATCCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271199	272727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_271200_272700
819924	contig_3818_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_99267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATTCTTATTTGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543044	542580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_542600_543000
819926	contig_13744_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_77154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCACAAAAAAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166209	166795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_166200_166800
819928	contig_3153_pilon	+	1266	9	Intergenic	novelGene_104631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	377.731303309641	529	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	588	1241	100039	190713	FALSE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	57787	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_63010_95022_95116_99751_99862_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
819929	contig_10549_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_110644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTAGTCTCATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520971	520275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_520300_521000
819930	contig_10549_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_110643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGCGGCCTCATCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520227	516229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_516833_517040_517118_518203_518277_520033
819931	contig_9177_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_32714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGGAAAATACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590329	589767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_589800_590300
819932	SIRV4	-	572	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	42	3	-42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	390	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAAAAACTTACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
819935	contig_12790_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_35262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	243.906047485502	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	149	706	308748	310995	FALSE	70	TATAAGTAAATATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQHG	308599	311520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310466_310986
819937	contig_6283_pilon	-	2298	5	Intergenic	novelGene_100197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.29903810567666	6	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	41	1540	510825	508646	TRUE	10	TGCTCGGCCTTCCACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRLVLCPSLLSTMAQGLPSAASLSRFCQKLNRLKPLEESTMDTSLRRCLSMLDLTLLGVGGMVGSGLYVLTGTVAKEMAGPAVLVSFTVAAVASLLAALCYAEFGARVPRTGSAYLFTYVSMGELWAFLIGWNVLLEYLIGGAAVARAWSGYLDAIFSHQIRNFTEAHLGVWQVPLLAHYPDFLAAGILLLASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLGAILFIITLGFILARPHNWSAEEGGFAPFGFSGILAGTATCFYAFVGFDVIAASSEEARNPKRAVPMAIAISLSLAASAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYRRGYSWAGFIVAVGSICAMNTVLLSNLFSLPRIVYAMATDGLFFQVFARVHPQTQVPVVGILVFGVLMALLALLLDLEALVQFLSIGTLLAYTFVATSIIVLRFQKASPSSSPGPSSPGPLTKEHSSFSDHLQLVGTGQAAASTPSLSAQPPTAPSPGVFTLSPLLPQNEQRLGGLRGHYLHTRCLSVW	510865	507642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_507703_507843_508079_508182_508792_509073_509446_509843
819938	contig_18850_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_142429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAGAAGAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176064	177072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_176100_177100
819940	contig_7083_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_125168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACTGTTCTGATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247395	245744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_245700_247400
819942	contig_7180_pilon	+	1087	7	Intergenic	novelGene_169041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	28.992336152086	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	139	771	34705	323284	FALSE	25	GGAACATTTTAGCATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGSYLAEFLLDKGYEVHGIVRRSSSFNTGRIEHLYKNPQAHTEGNMKLHYGDLTDSTCLVKIINEVKPTEIYNLGAQSHVKISFDLAEYTADVDGVGTLRLLDAVKTCGLISSVRFYQASTSELYGKVQEIPQKETTPFYPRSPYGAAKLYAYWIVVNFREAYNLFAVNGILFNHESPRRGANFVTRKISRSVAKIYLGQLECFSLGNLDAKRDWGHAKDYVKAFCCLLPSAAKKQGYDGPRFLSVTSCVRSTTA	22185	323600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_22234_32790_32879_34702_34813_191894_192088_192887_192993_242049_242178_323185
819943	contig_10980_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_162564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCCCAAAAAAAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258801	259900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_258800_259900
819944	contig_15236_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_141587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTAATAAAAGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447790	449255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_447800_449300
819945	contig_9593_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_59704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTGGGATGGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145928	145315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_145300_145900
819952	contig_4496_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_66690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGTTACCTTGATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945096	945865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_945100_945900
819953	contig_12250_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_80605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	144	662	342987	343505	NA	20	TGAATATTGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEACSKESNLEIHSILTPMTLNLVFLPSLWSFVFFAGSSSTIHPLIISLMVLSRTFFSQNFKSSLKDLTHPKASTTAFMLTVPNLHLCPRLSVEFQIQHPKVHWTSHGHVSPRHLKLTQSKTELLIFFPKTSPLCKVVLVVLNLDIGVSSQTLPFASASTSNLSHNPVSSIS	342843	344609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_342800_344600
819954	contig_501_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_134906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	25.8493230085432	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	474	1223	793438	808589	FALSE	30	GTACGTTGTTTCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIRHSEQTLRTALISKTPALVLQYENLDAGERRLMNEAFQPNSALFEPITLHSQSDWITSHPEAPQDFEQFFNDAKRKTPSPEKCNIYIQSIGSLGNTRIISEEYIKWLKGYCEAFFYGLTVKLLEPIPVSATRCSFRVNDNTKNLQIHAGDILNFLKRKKPENAFCVVGITMIDLYPRDSWNFVFGQASLTDGVGIFSFARYGSDFYSSHYEGKVKKLEKSSSSEYSVFDNYYIPEITSIFLLRSCK	792224	808589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_792698_793437_793721_794083_794258_794349_794479_808425
819955	contig_5947_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_101482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGTTTAGCAGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359704	359198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_359200_359700
819957	contig_1008_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_121542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCACTGGTCTGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310030	310880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_310000_310900
819961	contig_3787_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_102398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTGCTGCAGTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495180	496208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_495200_496200
819963	contig_5999_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_45636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	150.537555299518	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	141	512	243370	194805	FALSE	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGALTAANAKGAAMSPFLRIGLSNFDCGSCQPCQGETVNPYCAVLVKEYVESENGQMYVQKKPTMYPPWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWVNI	270535	194022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_195017_199940_200068_243337_243476_270500
819964	contig_12021_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_172192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACACACACGCACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42686	42050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_42000_42700
819966	contig_14722_pilon	-	1233	7	Intergenic	novelGene_110224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_6	136.410735973709	177	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	130	753	151970	105003	FALSE	25	TCCCTAGTTTTTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPAAAEEVGALHFTPVAAPRPGTASFGPSAGLGPAARQPSWIMGFPKGPEGQGLPEVETREDEEQNVKLTEILELLVAAGYFRARIKGLSPFDKVVGGMTWCITTCSFDVDVDLLFQENSTIGQKIALSEKIVSVLPRMKCPHQLEPHQIQGMDFIHIFPVIQWLVKRAIETKEEMGDYIRSYSVSQFQKTYSLPEDDDFIKRKEKAIQTVVDISDVYKPCRKYRRQRGAEELLDEESRIHATLLEYGR	152099	104522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_105108_120663_120721_127092_127192_136353_136466_140864_140960_142940_143055_151928
819968	contig_13496_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_107626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGGTTAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226145	227940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_226100_227900
819969	contig_5083_pilon	-	1066	4	Intergenic	novelGene_151705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.32049379893857	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	440	1066	1646782	1646156	FALSE	45	ATAAAGAAGTAAGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDVSPPRGSEEGAAERVRSPALFPTSDFLLPLPACRTPRWRSWPLSRSSSGLVRVRPEAGRSGEYNKRSPGGAVVKHLAANQKALIQQIFENLLCVRSSVQSSIKVYHDLLSFFTKFTPVDSTRPVCKRKIRSRFEEIQSELVPVSMSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHT	1656595	1646155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1646844_1648318_1648447_1648967_1649028_1656405
819970	contig_7695_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_41593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480990	479803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_479800_481000
819971	contig_6287_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_160435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCAGAAGGCTTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191604	191888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_+_191600_191900
819972	contig_3767_pilon	+	1208	6	Intergenic	novelGene_111140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGAAAAAAAAAGTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376889	417248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_+_377176_378670_378905_384161_384280_395381_395573_399192_399286_416962
819973	contig_14300_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_133123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTCCCAATTTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359787	358533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_358500_359800
819975	contig_5083_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_151666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487751	489143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_487800_489100
819979	contig_10460_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_157470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTTGTCTTTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79531	81011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_79500_81000
819981	contig_987_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_72249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTGGTGTTTCCCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352358	353172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_352400_353200
819988	contig_3627_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_78418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	159	359	34162	33962	NA	25	TTATGGTTTTTAGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAVSALRIGGRPVGLPPVHPARPLLCSLVGGSADLLATLESGHCVGDDSRLMAASAAALAVRLSRSVANRGSYGAFCKRLTRTLLAFFDLAWRLRMNFPYFYLVASVILNVRLQVHI	34320	33173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_33200_34300
819990	SIRV6	+	378	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	26	379	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
819991	contig_13216_pilon	+	1476	5	Intergenic	novelGene_47459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	552.458312906956	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	102	782	229682	247451	FALSE	75	AAAACAAAAAAAAACTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGRGSDVRPGLKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSESWTPLGQCYPKYLICKLLLASSEIRSLYQNVNQYASSFIKKVFQ	229580	248145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961_246135_247316
819993	contig_10904_pilon	+	1134	10	Intergenic	novelGene_22581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	228.772786087683	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	69	1016	439135	454161	FALSE	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESFPKN	438407	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442788_444386_444557_445256_445415_448343_448421_454145
819994	contig_10037_pilon	+	1343	2	Intergenic	novelGene_148948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	307	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127645	187679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_128108_186798
819996	contig_2988_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_136553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATTAAAGTTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171747	173563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_171700_173600
819997	contig_13800_pilon	-	1535	12	Intergenic	novelGene_153749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_7	44.6551524980948	65	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	2	979	224212	175776	FALSE	20	GAAGTGCATTGGTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAETLTVFLKLLAAGFYGVSSFFIVVVNKSVLTNYRFPSSLCVGLGQMVATVAVLSVGKALRVVKFPDFDRNVPQKTFPLPLLYFGNQITGLFSTKKLNLPMFTVLRRFSILFTMFAEGVLLKKTFSWGIKMTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYVFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAMDFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNISIAGSLVYSYITFSEEQLSKQSEASNKLDTKGKGAV	224213	175219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_175885_193490_193574_197498_197578_199922_199991_212666_212760_216415_216519_218999_219069_219784_219857_221991_222060_223012_223100_223196_223231_224099
819998	contig_11961_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_153690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGGAACAGTCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99816	100974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_+_99800_101000
819999	contig_11386_pilon	+	1119	4	Intergenic	novelGene_82789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	511.774255789492	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17842	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19725_19980_20816_21022_31990
820000	contig_1567_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_176417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAATACAATACATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378577	379241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1567_pilon_+_378600_379200
820002	contig_2069_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_23392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTTTGAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110487	1108997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1109000_1110500
820003	contig_11507_pilon	-	1174	2	Intergenic	novelGene_103368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126090	124803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_125755_125867
820004	contig_6364_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_51860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTTACTGTAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2200635	2200989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2200600_2201000
820008	contig_10855_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_124351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCACCAGCTGCTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572738	573706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_572700_573700
820010	contig_12886_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_135482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGTAAATTCCTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328490	327596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_327600_328500
820011	contig_12886_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_135483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTGAAAAGCAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328651	328394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_328400_328700
820012	SIRV6	+	467	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	7	11	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTGGTCACAAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
820014	contig_709_pilon	+	972	1	Intergenic	novelGene_57637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCCCTTGTTTCGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2937247	2938219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2937200_2938200
820015	contig_2799_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_85601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAAGCACTCCGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785820	784977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_785000_785800
820018	contig_5039_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_64823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTGAAGATAGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247608	245702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_245700_247600
820019	contig_11677_pilon	-	2219	17	Intergenic	novelGene_85960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_16	101.283308564393	13	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2076	143	2218	640992	631877	FALSE	30	ACCGAGACGAGTTCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFVESEAEESEEEYNDEGEVVPRVTKKFVEEEDDDEEEEENLDDQDEQGNLKGFINDDDDEDEGEEDEGSDSGDSEDDVGHKKRKRTSFDDRLEDDDFDLIEENLGVKVKRGQKYRRVKKMSDDEDDDEEEYGKEEHEKEAIAEEIFQDGEGEEGQEAVEAPMAPPEEEEEDDEESDIDDFIVDDDGQPLKKPRWRKKLPGYTDAALQEAQEIFGVDFDYDEFEKYNEYDEELEEEYEYEDDEAEGEIRVRPKKTTKKRVSRRSIFEMYEPSELESSHLTDQDNEIRATDLPERFQLRSIPVKVAEDDELEEEADWIYRNAFATPTISLQESCDYLDRGQPTSSFSRKGPSTIQKIKEALGFMRNQHFEVPFIAFYRKEYVEPELHINDLWRVWQWDEKWTQLRIRKENLTRLFEKMQAYQYEQISADPDKPLADGIRALDTTDMERLKDVQSMDELKDVYNHFLLYYGRDIPKMQNAAKASRKKLKRIREEGDEEGEGEEAEDEEQRGPELKQASRRDMYTICQSAGLDGLAKKFGLTPEQFGENLRDSYQRHETEQFPAEPLELAKDYVCSQFPTPEAVLEGARYMVALQIAREPLVRQVLRQTFQERAKLNIAPTKKGRKDVDEAHYAYSFKYLKNKPVKELRDDQFLKICLAEEEGLLTIDISIDMKGVEGYGNDQTYFEEIKQFY	651082	631875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_631923_632353_632509_632691_632843_632926_633057_634400_634500_634653_634803_635435_635579_635756_635847_636188_636306_636591_636694_637097_637372_638933_639019_639233_639427_639780_639858_639959_640116_640883_641022_650969
820020	contig_11171_pilon	+	711	3	Intergenic	novelGene_48613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1278	junction_2	46.5	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	189	494	251430	251735	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSKPRNARTRDRPAAPRSLYPIPSTRTCSAVTLRSTHASRAKPTTCPSRGAPSPRRDCTDLKMKESLAWSMKISRAKFCPGSEALGNPSLQSTGSVPARRPQGCPIASPHIQGPSCLGLTRSPILHPGHTHGVFCIFMPLPRLFPPPGVPFLPGPVAEAPFSL	239256	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_239336_249980_250068_251407
820022	contig_4891_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_124583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896052	894453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_894500_896100
820025	contig_1154_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_87111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGTAAAAAAAAAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398097	397463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_397500_398100
820026	contig_663_pilon	-	804	3	Intergenic	novelGene_163750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	259	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAAAAACAAACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103237	100303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_100607_102049_102194_102880
820028	contig_9955_pilon	-	1135	4	Intergenic	novelGene_21273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	952.237131997884	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49809	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45341_47586_47737_48794_49235_49720
820029	contig_9070_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_171951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAGCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130831	132258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_130800_132300
820030	contig_16934_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_132537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATCTGTATAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239278	239966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_239300_240000
820033	contig_9839_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_88543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTGTTTGTGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109626	108211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_108200_109600
820034	contig_2100_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_50636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGAACCTGTCAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932489	933113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_932500_933100
820035	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	126	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
820036	contig_675_pilon	+	2277	3	Intergenic	novelGene_136343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	22.5	5	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	62	607	95121	105145	FALSE	25	CATTCCCCAGCCAGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQELYHAEFARAGKEAGLQVWRIEKLELVPVPKSAYGSFYVGDAYLVLHTTKASRGFTYRLHFWLGKECTQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQSRELQGHESTDFVSYFKEGLKYKAGGVASGLNHVLTNNLTAERLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTVSLYTHLDF	95059	106815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_95320_100498_100654_104953
820037	contig_14508_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_79069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCTAACCTCTATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174111	174351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_174100_174400
820038	contig_14508_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_79071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAGAAAACTTGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176626	177178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_176600_177200
820039	contig_5084_pilon	-	1919	11	Intergenic	novelGene_64663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	12.1243556529821	31	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	439	1656	1602550	1587569	FALSE	40	AAACAGTAGTACACATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINSRITVFDENADAASRAELSKPAVQPWVAPPVPRAKENELQAGPWNTGRPLEYRPHGSAASAAAAPSVLPSFAPYVEETAQQPVMTPCKIEPSINHVLSTRKPRKEEGDPLQRVQSHQQESEGKREKMMYCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVFRKKLKEQREAELLTNAKKRAEMQKQIEEMEKKLKEIQTTQQERVGDQQEERLPAKETAEPRIASESQETPGMVLSSSLCPVNSCAREPSLAENICQEQPRSKGPSIPFSIFDECLPSEKKNISPPTDPPGALAQRRPLTILKTSESITSNEDVSPDVCDEFTGMEPLSEDAIITGFRNVTICPNPEDTCDFARAAHFVSTPFHEIISLKNLPSGPERLLQEEDLDVKTSDDQQTVCGAVYNQTLSVKKLR	1605044	1587305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1587848_1589782_1589889_1590013_1590075_1591204_1591255_1591811_1591928_1592445_1592559_1597488_1597719_1602124_1602217_1602379_1602595_1604380_1604551_1604820
820040	contig_8676_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_142212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	41	403	431112	431474	NA	5	TCTTGGCTTCTTCGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLPPHPCSQPRTMSVSGFRIPRVHLPQSKIHAQVRASESGLRLLVSGNASSVHLVARSGVELDSQGDGRPVGHHADTVGASGQGLPAAPRPTCLTTPPPRPSCCLQSTSFELSQWKRGQVRGRCPTPVIRGD	431071	432110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_431100_432100
820041	contig_13044_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_99993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTTAATATGAGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122202	120993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_121000_122200
820042	SIRV4	-	347	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	23	1151	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
820043	contig_8174_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_160068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353564	351813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_351800_353600
820046	contig_9091_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_32438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTAACACTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67124	65943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_66872_66931
820048	contig_14807_pilon	-	413	2	Intergenic	novelGene_124682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	16	318	37635	37247	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	37650	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485
820049	contig_11281_pilon	-	2144	2	Intergenic	novelGene_125520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	461	760	999229	998930	TRUE	70	TATTAAAAAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALPRSLLCHSVTFLLPPSSLTLPSCLPAESKEKEGRIALVCCEGAASLLSANGVLLGFWSTSVLLTQPQRSDRVCSTFYFHRCYTYTCVKSWEQIAL	999689	995630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_996198_998112
820050	contig_8888_pilon	-	2054	2	Intergenic	novelGene_167759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	0	29	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	957	1379	84349	83927	FALSE	15	GTGTTAAGGTTTCATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHREVGTALPCAEPSLPLSRAHISPVLVTIALSVDLMPRVCQVLCGGDLSPTRQHRPPWPSPRNTPTERGRGDVALLLLPGPPGIPLRCYKGQNPPPHPATSHAGSGFDSQPSPKRSLPGAGHLSRGTGLAASGPSMAL	86125	83251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_-_85205_86024
820052	contig_8775_pilon	-	2816	1	Intergenic	novelGene_166832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGAAAGTAACTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204007	201191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_201200_204000
820053	contig_14868_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_150453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTTATATTTTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184624	184041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_184000_184600
820054	contig_11026_pilon	+	1089	8	Intergenic	novelGene_167638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	224.944981935493	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	85	1089	43170	122224	FALSE	40	AGTGAAGTGGACGAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYETPVDVRVSSEESDEILPFHPFHPFPSLPESEGLSPILSVRIGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSK	43085	122224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104437_117449_117548_122129
820055	contig_8712_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_58854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTGATAATCTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712712	711381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_711400_712700
820058	contig_7412_pilon	+	970	3	Intergenic	novelGene_76291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	37.5	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	24	614	280907	285189	FALSE	70	GAAAAGAAAGAAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGAEGTMENFTALFGAQADPPPPPAALGFGPGKPPPPPPPPPGGGPGTAPPPSAATAPPGTDKSAAGCGPFYLMRELPGNTELTGSTNLITHYNLEHAYNKFCGKKVKEKLSNFLPDLPGMIDLPGSHDNSSLRSLIEKPPILGGSFNPITGTMLAGFRLHTGPLPEQCRLMHIQPPKKKNKHKHKQSRTQDPVPPGKKWWF	280883	285545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_281124_284648_284906_285072
820060	contig_4068_pilon	-	471	2	Intergenic	novelGene_161705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	8	403	58622	42964	FALSE	55	AAGGAAAGAGCGGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDMPQPSDPKRLFDLWLTRSSEMKHMIQIKSHSLSAVTNTYEKTKPIQDLFQKPYYDNCSANKYKSVEPELENGNSAAPDSDETSKVYLNEELQQDTHRFKNDIGVLQVEFLALEKEKVHLQKEVEGKEEVQK	58629	42895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_42987_58249
820063	contig_9995_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_47820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCATGGTGTACCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896311	897889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_896300_897900
820064	contig_10196_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_132314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.483175509874	298	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGGCCCCCCAGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387730	2380391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2380846_2385412_2385491_2386632_2386726_2387515
820065	contig_5346_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_161864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466763	466266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_466300_466800
820066	contig_401_pilon	-	1388	12	Intergenic	novelGene_42730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	50.2384397294172	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	117	1388	139369	110561	FALSE	40	AAGTAAGTACTCTAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAIAGEEHPKGSILQEVHLKFLLTGLLSGLPPPPFAVRMCPPLTTKNIHMYQPLLAVGTSNGSVLVYHLTSGLLHKELSVHSCEVKGIEWTSLTGFLSFATSTPNNVGLVRNELQLVDLPTGRSIAFRGERGNDESPIKMIKVSHLKQYLAVVFKDKPLELWDVRTCTLLREMSKNFPAITALEWSPSHNLKSLRKKQLATREAMARQTVVSDAELSVAESSVISLLQEAESKSELSQNISAREHFVFTDNDGQVYHLTVEGNSVKDSARIPPDGSMGSITCIAWKGDTLVLGDMDGNLNFWDLKGRVSRGIPTHRSWVRKIRFAPGKGNQKLIAMYNDGAEVWDTKEVQMVSSLRSGRNVTFQILDVDWCTSDKVILASDDGCIRVLEMSMKSTCFRMDEQELTEPVWCPYLLVPRASLALKAFLLHQPWNGQCTLDISQVDYPENEEIKNLLQEQLNSLS	139485	110560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_110622_111749_111859_115173_115346_115719_115835_116262_116370_121185_121334_122008_122134_124024_124134_128831_128908_130918_131026_135687_135773_139311
820067	contig_10196_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_132226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATGCAGAAAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408393	1408654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1408400_1408700
820068	contig_10196_pilon	+	1253	2	Intergenic	novelGene_132227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAACGGGTTGTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408706	1410954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1409913_1410907
820069	SIRV6	-	377	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-210	394	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAATTGTCGCCCCCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2030	1150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1542_1647_1733_1844
820070	contig_9113_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_68605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATATGCTGGATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387826	387571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_387600_387800
820071	contig_2010_pilon	-	2850	3	Intergenic	novelGene_176267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_2	42	18	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	407	1093	186491	177042	TRUE	55	AAATTAAACAGAAGCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIIRKVVESAEHWLDKAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQVGHQVLEAYARYHRPEFEAFFNKTFVLGLLQQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIISCPSVLDLFGLLQVEMLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQCVSTQEKELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPSTLLPSLQEVFASISSTE	186897	170043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_-_171676_176916_177047_185809
820072	contig_8330_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_71991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGACAGGGGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2059788	2061172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2059800_2061200
820081	contig_8616_pilon	-	1297	11	Intergenic	novelGene_72420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	251883	250632	TRUE	40	TCTGGAATTGGAAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLSPSGSLVSALRSKLRLPGTTEAQSSGSLPEGRRGDRSSSHSFLVTVTVTRWPRAGEEETISKGYLQGASRESESLHERHFRDLALSLRLREDLCRSGVVPVVVLKAPGTTRGSCQIE	251883	243485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_243637_243883_244048_244600_244659_244769_244879_245002_245093_245370_245461_245573_245682_245860_245889_250495_250662_251425_251486_251610
820082	contig_10023_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_123507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATAGAGAAGCATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427254	427663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_427300_427700
820084	contig_8866_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_77806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACACCAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420482	422004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_420500_422000
820086	scaffold_880_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_121498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGAATATCAAGACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541316	543326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_541300_543300
820089	contig_8900_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_171630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359849	361309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_359800_361300
820090	contig_8491_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_154225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGAGCCCGTTGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280772	283453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_280800_283500
820092	contig_4496_pilon	-	1853	1	Intergenic	novelGene_66640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661643	659790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_659800_661600
820094	contig_12496_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_170707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAACAGGGCTGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160402	159624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_-_159600_160400
820095	SIRV6	+	514	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	31	29	24	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	284	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAAGGTTCGTCTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161	2511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
820096	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820101	contig_9185_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_166878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	507	833	55792	56118	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHIRQHIILTGTSEYKLSTQKVPPRVVTSGTVCPWEVRGMEDWFTPWIISHRQPRILFEHKAVYVFSATTVAKPKQVSFCEALAIVKFCHSFFFFVAGCCQVDSDSW	55285	56941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_55300_56900
820103	contig_9683_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_151283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1458	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	377	685	487387	487695	NA	20	CGTCTGAGGTCTTACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGLNRGSSGSPSAQSPLPSTRPKSVNGAVREESIHCKSAEDIATLVQKLADQSGLDVIRIRKPFHTDSPSIQGQWHPFINKPTAPGGLRPREFQDAAPAQ	487010	488186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487000_488200
820104	contig_500_pilon	+	1627	8	Intergenic	novelGene_31105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	5.28378343111627	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	96	827	1541573	1557514	FALSE	10	TAAGCCGTGTCTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEIIANVDHIKFDLEIAVEQQLGAQPLPFPGMDKSGAAVCEFFLKAACGKGGMCPFRHISGEKTVVCKHWLRGLCKKGDQCEFLHEYDMTKMPECYFYSKFGECSNKECPFLHIDPESKIKDCPWYDRGFCKHGPLCRHRHTRRVICVNYLVGFCPEGPSCKFMHPRFELPMGATEQPPLPQQTQPPTKRAPQVIGVMQSQNSSAGNRGPRPLEQVTCYKCGEKGHYANRCTKGHLAFLSGQ	1541477	1558314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1541676_1545635_1545687_1547942_1548096_1550879_1550976_1551356_1551451_1552685_1552759_1554377_1554471_1557445
820111	SIRV6	+	351	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	19	337	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820112	contig_6589_pilon	+	1176	8	Intergenic	novelGene_25703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	476.535370338523	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	1	1062	205129	216262	FALSE	10	CCTACATTGGTTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPPLLLPLPLLLLPLLLVDPTIATLIRIPLHRVHPDPRTLNLPRGWRKPAEHPSLGASSPGNKSTFVPLSNYMNVQYFGEIGLGTPPQNFSVIFDTGSSNFWVPSKRCHFLSALWEPSLVFTFAHFDGILGLGFPILAVDGVRPPLDILVEKGLVDKPVFSFYLNRDPEAADGGELVLGGSDPAHYFPPLTFMPVTIPAYWQIHMERVKVGTGLNLCARGCAAILDTGTSLITGPTEEIQALNSAIGGVALMTGQYLIDCSKIPTLPPVSLLLAGVWFNLTAQDYVVQIARFGVRLCVSGFQALDVDPPVGPLWILGDVFLGSHVAVFDRGDKKGGARVGLARARPRGAGR	205128	216376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_205215_210348_210491_210575_210690_211438_211600_212765_212889_213033_213179_215758_215858_216070
820115	contig_7748_pilon	+	301	2	Intergenic	novelGene_101040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	1	300	133425	140836	FALSE	20	GAACCTTCTGGCTGAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHLQREALGEPQEYWQPPAGSGAAGASRQFVCRQCSDFLGPGNPHSCWALNEKAVGTDPFCDPNPRPHRRGQLRNTVATSPPQLSLAEGRILHLIKSAEP	133424	140837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_133512_140623
820117	contig_10811_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_165800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAGAAAATTAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360135	360426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_360100_360400
820118	contig_299_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_129507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTCAGCATATTAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660105	1661914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1660100_1661900
820119	contig_9415_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_109906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2107773	2109143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2107800_2109100
820120	contig_776_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_139911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	373	690	680345	680662	NA	80	AAAAAAAAAAAGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERYQYDVEVWLMNMCFFLRKGNQKNRSRILCFSRKLKKKKKKKALSLVAILGYTYQKGTPPALHDSTVVKLSPPPVSSLREAPLAQTSTSICIGSHTIVFVQL	679972	681766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_680000_681800
820121	contig_12324_pilon	-	1705	1	Intergenic	novelGene_166644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAATTTGGGACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68743	67038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_67000_68700
820122	contig_10056_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_170925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCCATGGGAGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27770	28216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_+_27800_28200
820125	SIRV2	+	321	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	276	-74	-276	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACTTTGATGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
820126	contig_8907_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_85836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456578	455820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_455800_456600
820127	contig_20742_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_150657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAATGCTATAGCTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108242	106583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_106600_108200
820130	contig_10056_pilon	+	1611	14	Intergenic	novelGene_170931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	19.264892802052	21	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	276	1385	89167	106918	FALSE	25	GAACATCTCTGTGTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLAEQSVLAALAQAVSLTPPSQEFPLAIVDAGKGKTAEARKTWLDEQGIILKQTFCEVPDLDRIVPVLLEHGLEHLPEHCRLSPGIPLKPMLAHPTRGVSEVLKRFEEAAFTCEYKYDGQRAQIHVLEGGEVKIFSRNQEDNTGKYPDIIDRIPKIKLPSVTSFILDTEAVAWDREKKQIQPFQVLTTRKRKDVDASEIQVQVCLYAFDLIYLNGESLVREPLSRRRQLLWENFVETEGEFVFATSLDTKDTDQIAEFLEQSVRDSCEGLMVKTLDVDATYEIAKRSHNWLKLKKDYLEGVGDTLDLVVIGAYLGRGKRAGRYGGFLLASYDKESEELQAICKLGTGFSDEELEKHHQSLQPLVLPSPRSYVRADGAVAPDHWLEPSTVWEVKCADLSLSPIYPAARGLVDREKGISLRFPRFIRVREDTPQVAQLYQAQSQIQNQKGASSESDLEDFY	87026	107144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_+_87099_87361_87462_88373_88460_89149_89266_91791_91888_95630_95742_96290_96363_98223_98369_99065_99149_100959_101113_102817_102872_103511_103656_106589_106651_106826
820132	contig_1679_pilon	+	1256	7	Intergenic	novelGene_173495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	184.24771972055	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	9	902	128777	147485	FALSE	25	AGCCGGCAAGGATGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGFQLLLLPLLLLGPAPAAGHGGKYSREKNEPAPPAKREPEAFRMEKLNQLWEKAQRLHLSPVKLAELHADLKIQERDELSWKKLKIEGLDEDGEKEARLIRNLHVILAKYRLDGRKDAQVVNTNYLQDGTEEEGLEDPRLEKLWHKAKTSGKFSSEELEKLWRELKHHTEKVREYSVLLETLSRTEEIHENVISPSDLSHIKEEVLQSRHAELKEKLRSINQGFARLRKVSHLGYGTEHEFEEPRVIDLWDMAKSANFTQKELESFRVRMRLYVKKHLQDLAGRVSRGRHNEL	128768	147839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1679_pilon_+_128957_133892_134038_136698_136824_140447_140569_141738_141898_143026_143128_147422
820133	contig_5549_pilon	-	773	12	Intergenic	novelGene_81636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	762.587461451889	3748	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTACTTTGTACCGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445634	441738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442936_443118_443145_443324_443363_443637_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
820134	contig_12352_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_57461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233552	231463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_-_231500_233600
820136	contig_7202_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_18172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
820138	scaffold_17306_pilon	-	1070	2	Intergenic	novelGene_175325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	236	1012	310209	309433	FALSE	25	AAAATGTTGCTTTTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLHKKAAAGQHARATVGHHPGSANMRKKKTFQKKQRGRPSSQPRRNIVGCRISHGWKEGNEPITQWKGTVLDQVPINPSLYLVKYDGIDCVYGLELHRDERILKLKILPDKVPFSRVRDVRLANTIIGKAVEHMFEGEHGSKDEWRGMVLAQAPIMKAWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPESSESPPAEREPEGVVDGLIGKHVEYTKEDGSKRTGKVIHQVKAKPSVYFIKFDDDFHIYVYDLVKKS	311134	309374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_310225_310914
820140	contig_16156_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_137077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAGGACCAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151077	149716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_149700_151100
820142	contig_3233_pilon	+	1077	9	Intergenic	novelGene_56577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	282.855942795975	1	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	121	546	740857	743745	TRUE	25	CCTTTTTTTTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPRSFLLSEDGQILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSGPHVCRVKLLQTVFKAVTFQKQISSLLDCTPSSEDSV	740582	747988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743202_743276_743705_743819_745289_745378_746333_746434_747718
820147	contig_10377_pilon	+	1554	3	Intergenic	novelGene_115389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	120	99	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	194	559	219517	227755	FALSE	20	TGTTTCATCCATGTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDR	209090	228750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487
820148	contig_11126_pilon	+	1645	16	Intergenic	novelGene_138133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	27.7411847860421	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	114	1415	539064	592842	TRUE	35	TACACAAATGGGTACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQVAEQFSRAFKINELKAEVANHLAVLEKRVELEGLKVVEIEKCKSDIKKMREELAARSNRTSCPCKYSFLDNSKRLTTQRDVPPYPKYLLSPETIDALRKPTFDVWLWEPNEMLSCLEHMYHDLGLVRDFNINPITLKRWLLCVHDNYRNNPFHNFRHCFCVTQMMYSMVWLCGLQEKFSQMDILILMTAAICHDLDHPGYNNTYQINARTELAVRYNDISPLENHHCAVAFQILAQPECNIFSNVQPEGFKQIRQGIITLILATDMARHAEIMDSFKEKMENFDYSNEEHMTLLKMILIKCCDISNEVRPMEVAEPWVDCLLEEYFTQSDREKSEGLPVAPFMDRDKVTKATAQIGFIKFVLIPMFETVTKLFPVVEEIMLQPLWESRDHYEELKQTEDAMRELQKQTENLTPGSSGKSREKSKDVKKN	527168	597403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_527259_539040_539096_539954_540026_565196_565282_572570_572653_575898_575974_581122_581210_582158_582264_582610_582694_582982_583140_586659_586774_587862_587968_589307_589437_590157_590254_592761_592845_597175
820149	contig_15327_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_70439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	626	1090	78949	78485	NA	75	TGAAAGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDTSERDLKSMRRGPWGLPVTHAPGSRCSPCSLGGLALLPDPTFPQPANDSSVSCFSTAMGPSQSIHSITAHQTGGSMKFLRGQGLGLAFLIIRCGPGPQGSPAILWWRVADLSKATVTICELGREESRGFQLGLILTPPPGTFGNFWRRF	79574	78069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_78100_79600
820150	contig_14441_pilon	-	697	3	Intergenic	novelGene_100687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	117785	116874	TRUE	25	GGACACGGCCTAGGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGLKKRSSPARPQTTALTFWVTGLGRVSPHSSSAESP	117787	114111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_114152_116572_116968_117525
820152	contig_12270_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_113524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	31	369	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14439	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
820155	contig_12756_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_153232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309950	308635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_308600_310000
820156	contig_8044_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_132380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	163	504	453293	452952	NA	70	AAAAAAGGTTTAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQNLRRQWVWFGYGYLYQHLSTEILQSDTPQPNAYSIGGKKLATSHVVLDSAFIIRLGKVYTDCPSGKGRCTGSPGTRAKLPGCCPCSLLRALPPPRFSITCQFSFLRHQYQ	453455	452770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_452800_453500
820159	contig_13593_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_156133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTAGTATGTAGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126386	125183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_125200_126400
820160	contig_15456_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_139488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTGGTGGTATAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74220	73256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_73300_74200
820161	contig_8934_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_167252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAAATACTCTACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801459	800482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_800500_801500
820163	contig_4305_pilon	+	1407	12	Intergenic	novelGene_136697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_7	10.9988729700624	17	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1278	129	1406	618924	624088	FALSE	45	GCTACAAGACAGGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLSASEGESATAHFFLGAGDEGLGTRGIGMRTEESDSELLEDEEDEVPPEPQIIVGICAMTKKSKSKPMTQILERLCRFDYLTVIILGEDVILNEPVENWPSCHCLISFHSKGFPLDKAVAYSKLRNPFLINDLAMQYYIQDRREVYRILQEEGIDLPRYAVLNRDPARPAECNLIEGEDHVEVNGAVFPKPFVEKPVSAEDHNVYIYYPSSAGGGSQRLFRKIGSRSSVYSPESSVRKTGSYIYEEFMPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEIRYPVMLTAMEKLVARKVCVAFKQTVCGFDLLRANGHSFVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNTIMRELAPQFQIPWSIPTEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAIIRHGDRTPKQKMKMEVTHPRFFTVFEKHG	618519	624089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_618620_618895_619071_619534_619731_620148_620240_620482_620569_621602_621758_621895_621998_622450_622613_622717_622840_623509_623612_623851_623939_624060
820164	contig_3269_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_117039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTGTCAAATTTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212588	212172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_212200_212600
820165	contig_4678_pilon	-	1521	6	Intergenic	novelGene_126049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	26.9918506219933	81	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	115	1398	569656	566129	FALSE	30	TTTGCTGATAATAAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPCSGTTWIVWEGLQEEDVTQRLLRSSEWRPCSPATAMEPPETPVKDGILYQQHVKFGKKCWRKVWALLYAGGPSGVARLETWEVRSGGLRSAGDKSARHGEPRVVRLADCVSVLPTDSESCPRDTGAFLLTTIERSHLLAAKHRQAWMGPICQLAFPGTGECSSASEEAESPTRVPVSMEENSIYSSWMEVVKFPVVVQKTEAATRCQLKGPYLLALGQDAIQLKDPSGLQALYTWPYHFLRKFGSQKGVFSFEAGRRCDSGEGLFAFSSSRAPDLCGAMAAAIARQREQLPELASPWPCPLPRATSLPSLEPPGELRETPGMEPRGCRKARAGLEPGPKSLPPLPDQAAENTAVYAVVAKRASGSPAVAAATQHLYENLCALEGGPEASRIYHNREDLSWSGPGPDESLEAQYRRLLELEVDEASDEAGGSSHSSAPAAFKAKLVTLLGRERRKGPVPCDRP	570455	566005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_566777_566856_567030_567165_567266_568360_568658_569590_569703_570387
820166	SIRV6	+	434	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-88	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	80	243	74	316	2458	3109	TRUE	40	CCGCTTGAAAAAGTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2384	10786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2815_3106_3165_10723
820167	contig_10626_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_138195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTACAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71019	72434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_71000_72400
820168	contig_253_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_129776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTAACCAACCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820600	820138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_820100_820600
820170	contig_11396_pilon	+	1152	7	Intergenic	novelGene_71247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	164.661015422595	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	281	967	87831	90556	FALSE	5	GTCTCTCTTCTGTCTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPHEAETQHTGPEEADQPPPMSRHDAAPPAVPAAPGRNPCCLCWCCCCSCSWNEERRRAWWTSRETKLQPLPSCEACAAPSPEEVRSWAQSFDKLMHSPAGRNVFREFLRTEYSEENMLFWLACEELKAEANKHVVDEKARLIYEDYVSILSPKEVSLDSRVREGINKRMQEPSAHTLAGSSSVTAPRGSCTWRVPPRRHLWPQELPLVETRTSTLSIFIIRGAPH	85256	90741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_85470_87763_87861_88030_88162_89479_89555_89701_89937_90023_90089_90405
820171	contig_7057_pilon	+	1018	8	Intergenic	novelGene_123257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_4	18.4921384288965	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	170	991	542770	570531	FALSE	5	AGTCCCGCTGTGCCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVKVKVEKSDMEMAKARNQLDAVLQCLLEKSHMDRERLDEEAGKTPSDTHNKDCSIAATGKRPSARFPHQRRKKRREMDDGLAEGGPQRSSEWAVPERAGRGPGGWVRVLTHLPPSPDAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEGSEVTNSKSRDVYKLPPPTAPGPPGDPCRSRIPSPLQPETQGTPDDEPSEPEPSRSTLIYHNMQRWKRIRQRWKEASHRNQLRYSESMKILREMYERQ	542600	570558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568676_568707_568785_569120_570061_570203_570293_570368_570449
820172	contig_6208_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_53039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	398	697	496435	496734	NA	65	AAAAACCACTAATGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDALVTPTIKTNQTRCRRGDSGSVITNRIADLLICTAPASTVIPRYHHVFVFVGCMYLIVCERLLFLLTWRERILHIIQFIFLQLSDQLLMLLNLDGA	496037	497732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_496000_497700
820174	contig_678_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_167851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559231	558194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_558200_559200
820175	contig_16360_pilon	+	1703	5	Intergenic	novelGene_170078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_3	57.6389625166866	15	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	119	586	128224	135138	FALSE	40	AGATACTAAAATGCTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKKFDEKENVSNCIQLKTSVIKGIKNQLIEQFPGIEPWLNQIMPKKDPVKIVRCHEHIEILTVNGELLFFRQREGPFYPTLRLLHKYPFILPHQQVDKGAIKFVLSGANIMCPGLTSPGAKLYPAAVDTIVAIMAEGKQHALCVGVMKMSAEDM	128105	136255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_128235_129369_129523_130077_130176_133137_133272_135066
820176	contig_13494_pilon	+	1793	4	Intergenic	novelGene_167507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	23.5843639350783	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	16	507	17153	23139	FALSE	10	TCCTAATGTCTGCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFTAKMKPDETPMFDPSLLKEVDWSQNTATFSPAISPTHPGEGLVLRPLCTADLNRESFEHMKKSGDYYVTVVEDVTLGRIVATATLIIEHKFIHSCAKRGRVEDVVVSDECRGKQLGKLLLSTLTLLSKKLNCYKITLECLPQNVGFYKKFGYTVSEENYMCRRFLK	17137	24425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_17307_20427_20556_21977_22040_22991
820178	contig_6433_pilon	-	2024	2	Intergenic	novelGene_162763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	0	30	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	336	1658	282523	281201	TRUE	20	TACCAATGTCAGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTFMNSYYYRATILLSTENKGNLHLRFLSDWEARPESKESTSVQDFSKEESCQVAIIDRLTRNSVYDSNLETTFDGENWLENQQGNQERHLREMFTHMNPLPREKAHEHDIYWKNFSQKPVLITEDRVPKGSYAFNKLEKKLKQKSNLMKRQRNYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFECRECKKTFIESSSLAIHQRIHIGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPYRCNECGKSFKCSSSLIRHQRIHIEEP	282858	279778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_280122_281177
820179	contig_11493_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_143685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTTTAATGTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187348	187596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_187300_187600
820180	contig_11493_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_143686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTTCACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187794	188783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_187800_188800
820181	contig_3700_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_138101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398796	399440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_398800_399400
820182	contig_1594_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_138854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAACTAAAGAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750019	748213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_748200_750000
820183	contig_6975_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_74243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTTATTTTAAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41972	43659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_42000_43700
820186	contig_7272_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_25318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATCCAAGATAAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490041	491188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_490000_491200
820189	contig_9578_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_67986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTACCATCGGACTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181141	1182812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1181100_1182800
820193	contig_5050_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_110246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTATAAGGAAATAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77364	79363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_77400_79400
820194	contig_15849_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_176062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCATATTTGTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95033	93027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_-_93000_95000
820195	contig_6048_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_73104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTTGGACTTAAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247305	247913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_247300_247900
820196	contig_9199_pilon	+	943	8	Intergenic	novelGene_65633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	64.1681464623076	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	79	759	120933	122653	FALSE	15	AGTGTGAGTGCATTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKTVSAALLAFVQTHLPEADLSGLDDVIFSYVLGVLEDLGPSGPSEEDFDMEAFTEMMEAYVPGFAHIPRGTIGDMMQKLSGQLSDTRNKENLQPQSSEVQGQVPIPPDPLQRPEKLKEETRSSPTAAEDTQDKDLPRRLRGPQKDELKSFILQKYMMVDSAEDQKIHRPMTPKEAPKKLIRYIDNQVVSTKGERFKDMRNPEAEEMKATYINLKPARKYRFH	115816	122837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_115885_120922_121007_121281_121426_121514_121577_121667_121799_122230_122293_122367_122429_122506
820197	SIRV6	+	364	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1552_2721_2829_3106_3165_10724
820198	contig_2027_pilon	+	747	6	Intergenic	novelGene_39960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	654.893701298157	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	90	524	661342	664277	FALSE	10	CCCAGCAGGCGGTGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSVSLFVHPLQAGE	660291	664500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_660373_661333_661463_662681_662762_662944_663072_663312_663379_664236
820200	contig_15909_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_176420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAAAGAAATAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20933	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15909_pilon_+_20900_21600
820202	contig_10037_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_148957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGTATTGCAGAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277094	275618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_275600_277100
820203	contig_6710_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_94821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGGCATTATCCACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653700
820204	contig_11855_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_66909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTACTTTCAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777598	779155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_777600_779200
820205	contig_13863_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_42099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAGTCCAACTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481550	482521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_481600_482500
820206	contig_8964_pilon	-	1230	3	Intergenic	novelGene_168707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	120	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	312	749	549121	543389	FALSE	20	CAAGCATCTCTCTTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPGDGLAAFSPRSLSHRGQRWLLRLLPVGLSNRRLLPRPRAPPSLRPPHTDSCCSPTLPRHPLPPCWERGSSFDFSRLILPENEAWRRREKRGIRNSFFPGTVNIQGCGHRILSGGVAIPGLCSEGFVQGRDVGELQELGLPG	549432	542907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543520_547370_547457_548900
820207	SIRV4	+	370	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3637	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
820209	contig_5039_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_64999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGACACTACAGAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1696937	1696270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1696300_1696900
820210	contig_5286_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_157389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGCAACCGTAGGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656963	655262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_655300_657000
820215	contig_4754_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_35885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58221	59053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_58200_59100
820216	contig_9609_pilon	+	1752	5	Intergenic	novelGene_22946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	546	848	166721	167023	TRUE	40	AGAAGGAGCCAACATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSLAQALLKAATAVGDSKEVLTVGGDQQQTEIGIRLQVRDVYVEEACCVKFGQAHGRPGLALTEGRRGTDEVEEQVQIDGVQELVLAAHKSHKLVSRQ	165445	169914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_165731_165829_165982_166612_167369_167969_168463_169848
820218	contig_4392_pilon	-	1066	3	Intergenic	novelGene_117339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTATCCACTAAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649465	601570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_602080_645307_645427_649027
820219	contig_10197_pilon	+	1131	4	Intergenic	novelGene_115291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	28.87136220471	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	341	1003	1259611	1263353	FALSE	5	CTTTTGTTACCTTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1259270	1263481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1259660_1260794_1260938_1261911_1262123_1263093
820221	contig_9144_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_151142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAATATACATATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640382	641335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_640400_641300
820222	contig_9290_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_77518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	123	437	149127	149441	NA	75	TGTAGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRIPNNNRNNRPNQTRGWLDGIIVKLWALGGRKRSNSDAGEKVLGLESRLILRPGFDSLCSCLYWSKPQPSVQFSPSRKGNNICISKIIEVLGRTNDLECKL	149004	149538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_149000_149500
820223	contig_14686_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_88066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAGAACTACTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46533	44754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_44800_46500
820224	contig_15185_pilon	-	1877	11	Intergenic	novelGene_99431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_10	65.7456462436867	509	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	233	1696	391646	380077	FALSE	15	TTGCGGACTAGTCCTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNICNKPSNKTAPEKSVWTAPAQASGPSPELQGQRSRRNGWSWPPHPLQIVAWLLYLFFAVIGFGILVPLLPHHWVPAGYACMGAIFAGHLVVHLTAVSIDPADANVRDKSYTGPLPVFNRSQHAHVIEDLHCNLCDVDVSARSKHCSACNKCVCGFDHHCKWLNNCVGERNYRLFLHSVASALLGVLLLVLVATYVFVEFFVNPMQLRTNSHFEVLKNHTDVWFVFLPAAPVETQAPAILALSALLILLGLLSTALLGHLLCFHIYLMWHKLTTYEYIVQHRPPQEAKGAYRELKSCPPKMRSIQEMEFYVRTFSHVRREPPGQARPTAVNVDPSQFFATRGQAEPAPPSSPEALALPPRIRPQKKRKRRVYKVPTSGTLDPTPPRPRLPGSRASGHRSSSSSDSAGASPVHAGGPAGAYHSASAESMDEILVAQTHLGSAALAAPGSKVRELGLGLALQARVPAVFVSPSSGEPGAPGGPETGLA	399386	379895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_380367_380474_380554_380696_380791_380986_381070_383995_384109_384344_384504_384584_384710_385072_385175_386764_386941_391403_391647_399154
820225	contig_6914_pilon	-	1230	7	Intergenic	novelGene_151763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.2856446670748	120	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	24	602	401038	398613	FALSE	15	GGGAGTGTATATCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAVSGAMSWTCPRCQQPVFFAEKVSSLGKNWHPFCLKCERCHSILSPGGHAEHNGRPYCHKPCYGALFGPRGVNIGGVGSYVYSPPTSMPASSTPLSPSSFSPPRRRTGLPQGKKSPPHMKTFTGETSLCPGCGEPVYFAEKVMSLGRNWHRPCLRCQRCRKTLTAGSHAEHDGVPYCHIPCYGYLFGPKGGQPHPRH	401061	397984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_398697_398797_398893_399014_399087_399881_400014_400110_400169_400560_400656_400995
820227	contig_6443_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_175150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	145	456	474006	437204	FALSE	35	CATTCCTGTTATTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKYHEDFEKTKGRGFTPVVDDPVTERVRKNTQVVSDAAYKGVHPHIVEMDRRPGIIVAPVLPGAYQQSHSQGYGYMHQTSMSSMRSMQHSPNLRTYRAMYDYSAQDEDEVSFRDGDYIVNVQPIDDGWMYGTVQRTGKTGMLPANYIEFVN	474150	436408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_437381_439686_439794_473978
820228	contig_15244_pilon	-	1723	11	Intergenic	novelGene_118062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	58	junction_5	16.9319225134064	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1686	37	1722	646382	616277	FALSE	90	AAAAAAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRALISFWESVEYLKTAHKNEIPQLVGEIYQNFFVESKEISVEKSLYKEIQQCLVGNKGIEVFCKIQGDVYETLKDRYYPSFIVSDLYEKLMTKEEEKHGPRLISDKDEMGQGGEAGEESVNEGTRGINEQASFAVNKLRELNDKLEYKRQALISIQSAPKPDKKIVSKLKDEIILMEKERTDLQLHMARTDWWCEHLGMWKASITSGEVTEENGEQMPCYFVMVSLQEAGGVGAKNWTVPRRLSEFQNLHRKLSECFPALKKVQLPSLSKLPFKSVDQKFMEKSKNQLNKFLQNLLSDERLCQSEALYAFLSPSPDYLKVIDVQGKKPTFSLASFLERLPRDFFSHQEEETEEDSDLSDYGDDVDGKKDALAEPCFMLIGEIFELRGMFKWVRRTLIALVQVTFGRTINKQIRDTVNWIFSEQMLVYYIGVFRDAFWPAGKLAPPTTIRSKQQSLETKQRAQQKLLENIPDMLQSLVGQQNARHGIIKIFNALQETRANKHLLYVSKLMPTRGLSISWPLYFCSHLGIDFNPLRCQSLLLLITLTPFSLLCVFCLFGSK	646418	616275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_616543_617144_617327_620847_620915_624851_624970_627190_627356_632745_632860_636158_636300_639037_639170_644302_644468_644944_645218_646319
820230	contig_2069_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_23396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTGTCCATCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234209	1233910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1233900_1234200
820231	contig_16110_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_126776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAAGGGGGGAGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25127	23703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_23700_25100
820233	contig_9438_pilon	+	2244	13	Intergenic	novelGene_154264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	30.643446825273	19	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	32	2230	58808	205449	FALSE	20	TGACCATTTTGGCAGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKNRKRLNQSAENGSPSLSAASSPAGASAPAGPGSAAAAGTLAVTNFIEKDDKVPKTFRNSLVQFGLNTMKSANICIGRPVLLTSLDGKQEVYTAWPVSGFPGGKVGLSEMAQKNVGVKPGDAIQVQPIVGAVLQAEEMDVALSNKNIEINEEELTGCLLRKLDGKIVLPGNFLYCTFYGKPCKLQVLRVKGTDGMILGWPQNDSDTGNQEVTSKQSSMEASSLDMALQLSRLGLEEPWEPASSSTPCKPVDDRIINKADDILLDVAQNPGEHSGLGLQEVTGLKCSVESAREGNEQLINEERLLKAASMGAKCNTDNFYFISSTTRVKFAKIRTNSKEQDNQFKVTYDMIGGLNSQLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPPPRGVLLYGPPGTGKTMIARAIANEVGAYVSVINGPEIISKFYGETEARLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLTLMDGIGSEGSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAEDRLDILQKLLRKVPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKALCNEAGLYALRRVLKKQPNLPDSKVARLVKITLHDFLKGMNDIRPSAMREVAIDVPNVSWSDIGGLENIKLKLKQAVEWPLKHPESFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAVKGPELMNKYVGESERAVREFFRCRECSRPCFGSALNRNGWD	58776	205463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_58968_65252_65375_69522_69681_72845_72905_73592_74238_75165_75296_76343_76401_77717_77842_80567_80824_107750_107906_150641_150852_172893_172948_205380
820234	contig_15196_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_176330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	34	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCCCAACAATTAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125813	123513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15196_pilon_-_123961_124498
820239	contig_1146_pilon	-	1772	7	Intergenic	novelGene_84787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	77.9930552463914	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	336	1163	149724	106770	FALSE	40	AAGTAAATGTCCTGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNHSRKTAAFVRACVAYCFITIPSLVGIFTRLNLYLHSGQVALANHCLSQADAFFTAAISLIPEVPKTINIDGKMRPSELFLLEFLCNFFSTLLIVPDHPEHGVLFLVRELLNVIQDYTWEESSDDKIRIYTCVLHLLSAMSQETYLYHVDKVDSNDSLYGGDSKFLAENNKLCETVMVQILEHLKALAKDEALKRQSSLSLSFFNSILAHGDLRNNKLNQLSVNLWHLAQRHGCADTRTMVKTLEYIKKRSKQPDMSHLTELALRLPLQSRT	150059	106160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_106869_107357_107505_114326_114446_126288_126455_134238_134379_148530_148646_149682
820240	contig_6742_pilon	+	1347	3	Intergenic	novelGene_144557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	5.5	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	121	327	27405	41178	FALSE	45	TTGAGACCAATACAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AESHHEVVPQEVRHQSSASEPAEQLSHAVKEESDAEQELVMAASQLLARPEERLVRDQDFGASLLQASSQEQWRHLDSTQKEYYWDLMLEAYGKMVSGGEGMEGLRSS	26855	42198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_+_26974_27402_27495_41061
820243	contig_17522_pilon	-	962	3	Intergenic	novelGene_160818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	6	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCAGTTGTCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96547	93685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_94332_95736_95890_96384
820244	contig_21369_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_176300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTACTTTTACTTTCTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23319	21672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_21700_23300
820245	contig_12050_pilon	-	1172	6	Intergenic	novelGene_62702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	78.3464102559907	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	98	1048	619215	615621	FALSE	30	AGCCAGATGCTAAAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQIFSELDQAGSMLAKETLKDGLPMHDGKGDVRKCPYYAAQQDKGALEGSSCPFQTAMAVLRMPSLQLIIAASVALAAGLLAWYYL	659661	615496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_615836_615964_616873_617366_617771_617890_619129_619256_659604
820247	contig_9807_pilon	+	1077	7	Intergenic	novelGene_32868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	646.794252877649	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	105	851	109130	158783	FALSE	40	ACGTGTGGAGCATAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	159009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128705_156674_156770_158676
820248	SIRV4	-	590	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	15	12	15	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTACTTAAGAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5143	3649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
820249	contig_5935_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_102732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.536321027872	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	55	615	1418867	1332583	TRUE	75	AATATGAAAATAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKYTLLVNNGFAISAALLMAFSLQAGAFEMLIVGRFIMGVDGGIALSVLPMYLNEISPKGIRGSVGQVTAIFICIGVFTGQLLGLPELLGKKSTWPYLFGVIVVPAFIQLVSLPFFPESPRYLLLEKHDETGAEKAFRTFLGKENVSQEVAEVKEEARERRNICLVSVLELLRSPFCPLASPHCDHHHGLLPALRPQCDLVLHQ	1418921	1210893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1211193_1273070_1273199_1300025_1300102_1303659_1303762_1332491_1332603_1346591_1346781_1358530_1358664_1392215_1392362_1418794
820251	contig_1596_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_131590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGTAAACTCTTACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98020	96594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_96600_98000
820252	contig_5649_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_82289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTAAACATTTGTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141905	142399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_141900_142400
820257	contig_6233_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_74821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAGCTGGGTGAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410752	411492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_410800_411500
820260	contig_11378_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_112256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAACGTGGTCGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380062	378411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_378400_380100
820261	contig_17074_pilon	+	1664	2	Intergenic	novelGene_145184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	0	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCTTCTTACTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611852	616866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_612923_616272
820263	contig_17743_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_176429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTCTTATAAGGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87971	88550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_+_88000_88600
820266	contig_12884_pilon	-	961	8	Intergenic	novelGene_105005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	506.961496746719	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	73	909	906341	899626	FALSE	15	CCAGCACTCTGACTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQHVSPMRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915300	899573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900394_900647_900749_901038_901133_905761_905834_906224_906349_915235
820267	contig_4678_pilon	-	1487	6	Intergenic	novelGene_126026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	22.4730950249404	200	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	272	826	340016	338979	TRUE	10	TGACGTTCAGCCCCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQRVDVKVVMLGKEYVGKTSLVERYVHDRFLVGPYQNTIGAAFVAKVMSVGDRTVTLGIWDTAGSERYEAMSRIYYRGAKAAIVCYDLTDSSSFERAKFWVKELRSLEEGCQIYLCGTKSDLLEEDRRRRRVDFHDVQDYADSIAPQSPGFGGGKSLLGCLGKVPEIFLGSVDLRGPDFLNC	340287	338206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_338552_338662_339201_339285_339354_339459_339539_339747_339817_339899
820269	contig_11566_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_166712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254354	255975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_254400_256000
820271	contig_8712_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_58792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	18	323	299679	299374	NA	30	CACCCGCAGCAGAAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHLSSVGSEGWWWTRDCGDMEETGPSLSLPPWPYSCGEPKRQQEPTWAHPGVDTKGKLSTGYEAGGESGWTGARAEQELRDSVDRHPGEGTPVCYGGVLL	299696	299180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_299200_299700
820272	contig_6001_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_128054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGAAGGCATTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742375	740611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_740600_742400
820274	contig_8740_pilon	+	2175	10	Intergenic	novelGene_167606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	56.9697775628057	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	62	1924	23197	62540	FALSE	50	CTAGATAACTGTGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARPVSRMLRRVLRTSTWSCSSEAPVTQPRPGKSTQPAPTELSRRRQFLREHAAPFSAFLTDSFGRQHSYLRISLTEKCNLRCQYCMPEEGVPLTPKADLLTTEEVLALARLFVKEGVDKIRLTGGEPLIRPDVVDIVAKLHQLEGLRTIGITTNGISLARLLPQLQKAGLNAINISLDTLVPAKFEFIVRRRGFHKVMEGIHKAIELGYNPVKVNCVVMRGLNEDELLDFVALTEGLPLDVRFIEYMPFDGNKWNFKKMVSYKEMLDTVRQRWPELEKLPEEESSTAKTFKIPGFRGQISFITSMSEHFCGTCNRLRITADGNLKVCLFGNSEVSLRDHLRMGASEEELLRIIGAAVGRKKRQHAELSLMHRDSPPAIPSISSWDSLHVQNLTPRMSFFNQMVTSWKGCRVSQTPLLAQQWLGSGFLQRHYSSLQDSATNPKCLSPGSQAPATHSGPLPPSDKLTHVDTEGRAAMVDVGGKPNTERVAVASAVVLLGPVAFQLIQQNQLKKGDALVVAQLAGVQAAKMTSQLIPLCHHVALSHVQVQLELDSMRHAVVIQASCRARGPTGVEMEALTSAAVAALTMYDMCKAVSRDIVLEEIKLVSKTGGQRGDFHRT	23135	62791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8740_pilon_+_23320_31363_31491_33098_33267_47562_47728_48334_48397_48746_48859_49271_49385_49899_50011_52042_52164_61779
820275	contig_4388_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_161953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	868	1185	367485	367168	NA	35	GACCCTATACGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGIWSPERSGIFKKASQGRKVMSGFESDSLSTWQNWHEDLPSSPNSPLRGRKALQRSKVFHLEGQLTAADTNCSQRLGDADTHPAGGLGPLPRLWGPPPMVPS	368352	366770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_366800_368400
820277	contig_15839_pilon	+	1655	4	Intergenic	novelGene_136415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	35.5621521658443	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	210	920	106637	121945	FALSE	60	TAAAACACAATAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRKGQGPGGGRGRKKRGLSDISPSTSLPPLVEGQLRCFLKLTINKIIWKIAKPPTCVLVRVRWWGETSDGTLFCPRDALQPEPKAVRTTTRYAIRCGPKQFTSYLTDMAVLVLDVITKLDHLPIGRVQISGLAQLSPTHQINGFFTIVSPTSKKLGELQVSLALEPLSETYDSYSPLPTTDVTENVHLSEQGFRENIEPSNTQFLVPSRPHGIPVTKIDGKELATNSSRSTTPR	106427	122680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_+_106692_110017_110288_115459_115618_121717
820278	contig_11932_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_85432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCCCCCTTTTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487418	488877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_487400_488900
820279	contig_8260_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_163265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCAGGACCGCTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506106	507281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_506100_507300
820283	contig_14522_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_147323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGACATGGAACCCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99944	101687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_99900_101700
820285	contig_12128_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_131997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529293	529985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_529300_530000
820286	contig_6191_pilon	-	1081	2	Intergenic	novelGene_107837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAGAGCCCAGACTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133067	131407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_132102_132680
820291	contig_8242_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_80192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGGAAACCCTTTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7195	5573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_5600_7200
820292	contig_6241_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_156434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322886	321552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_321600_322900
820293	contig_9098_pilon	+	1881	8	Intergenic	novelGene_75817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.0434850239137	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	574	1149	311424	332088	FALSE	45	TATTTTTTTAAATAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGIIDVTEVQIFIIIMHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIGLLIL	302685	332820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_303118_309932_310018_311367_311510_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488_331586_332071
820296	SIRV6	+	419	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	260	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470
820297	contig_8581_pilon	-	945	8	Intergenic	novelGene_22847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.600593654028	1	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	927	17	943	366690	306409	FALSE	20	CACTGGAATCTCCCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMWCGGRWQSCGKVSCLHLGKRNRPTNNA	366706	306406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306487_329822_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650
820299	contig_19957_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_57688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGATTATGTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91602	89852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_89900_91600
820300	contig_4469_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_21918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGAGAGAGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483004	482804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_482800_483000
820301	contig_4469_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_21917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCAGCAATGTTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482455	481465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_481500_482500
820303	contig_7398_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_166165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTACGGCCCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154294	156130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_154300_156100
820304	contig_10629_pilon	+	978	5	Intergenic	novelGene_52959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	206.993206410259	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	17	655	447968	452607	FALSE	5	TTTTTGTGTGGCTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGQKMEEVAVKQGFLHLQQQQTFGKKWRRFWAVLYRESGCALARLELQEYSEKQRRGEAARRIIRLSDCLRVAEASGEASSPRDTSAFLLETKERQWLLAAPTPEHGDWLQAICLVAFAGQRREFPGPGPEGVPGKSSGPCMADNELYSSSATVVAQKKFSVTIRPTEASERCRLWGAYTLRAGESALELWGGLEPGTLLYDWPYRFLRRFGLGLP	447951	452930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_448031_448988_449271_449518_449622_450546_450719_452588
820306	contig_5084_pilon	+	664	5	Intergenic	novelGene_64668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1728.040129019	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACGGTTGTCTCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751427	1755999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751509_1751646_1751698_1752180_1752279_1754409_1754443_1755598
820308	contig_11171_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_48552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCCCGATTTTCGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59768	58839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_58800_59800
820309	contig_5084_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_64586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATCTTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829146	828614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_828600_829100
820310	contig_15866_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_63653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACAGTTTCTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528470	528019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_528000_528500
820311	contig_6503_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_145789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTGTAAATCTACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800148	799602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_799600_800100
820313	contig_3975_pilon	+	939	6	Intergenic	novelGene_54706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	39.5555305867587	262	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	78	803	1395865	1416840	FALSE	10	TGATGTATCTTTGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSVPADELSQEYRKGIRAVLLGPPGAGKGTQAPKLAENFCVCHLATGDMLRAMVASGSELGKKLKATMDAGKLVSDEMVVELIEKNLETPLCKNGFLLDGFPRTVRQAEMLDNLMEKRKEKLDSVIEFSIQDTLLIRRITGRLIHPTSGRSYHEEFSPPKEPMKDDITGEPLVRRSDDNEKALKIRLAAYHTQTAPLVDYYRKQGIHCAIDASQTPDVVFASILAAFSKATCKDLVMFI	1395787	1416976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1395964_1407498_1407625_1410761_1410873_1411001_1411097_1415328_1415402_1416618
820314	contig_17212_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_88606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTTAATTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64398	65561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_64400_65600
820315	contig_10082_pilon	+	787	4	Intergenic	novelGene_63915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	321.498919991274	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	147	587	580353	584895	FALSE	25	AAATTTTTAACCTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACKSPPGTRPTGRSAPSGARSTRRWGRYSDRRLCCRYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	574401	585095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_574419_580223_580439_583559_583726_584706
820316	SIRV6	+	242	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	55	486	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
820317	contig_14665_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_171051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATTAAAATCCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67954	70006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_68000_70000
820319	contig_9505_pilon	+	1285	12	Intergenic	novelGene_121836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	260.696904532942	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	52	690	482124	597995	TRUE	5	CGCCTCTGTGTTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDESFLGKLGGTLARKKRAKEVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWTIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	482072	632889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_482194_555856_555947_560338_560404_577832_577936_589574_589707_593382_593499_597932_597996_614971_615049_617657_617727_620886_620989_631447_631521_632615
820320	contig_6589_pilon	-	584	7	Intergenic	novelGene_25859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1173.70623809083	218	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	29	544	959104	955223	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFGPRKGREVYRHFGKAPGTPHSHTKPYVRSKGRKFERARGRRASRGYKN	959132	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956053_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101
820321	contig_8330_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_71937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAGGTGTCAAGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325045	1324020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1324000_1325000
820324	scaffold_16539_pilon	+	1892	7	Intergenic	novelGene_68382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	74.8658058721663	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	755	1840	612051	617625	FALSE	25	TAAAACCTTTTTATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLFTKTRFLASLRVGRAGPVFPASLASGTLCLQDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKTFCGTPEYLAPEVSGAGGTGTCEARAACLTRSDPKGRAVSPRGPCQLLTVLLPQVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEIDTRYFDDEFTAQSITVTPPDRYDSLGSLELDQRTHFPQFSYSASILE	611296	617677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_612222_613174_613244_614032_614156_615281_615752_616297_616368_616464_616568_617545
820326	contig_12901_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_142980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	141	419	71503	71781	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGQELGVLTSLSPARGKGFPVVGRVFGPLTLELLIVQECRFGQCSMSSKCQSVGTGGEGLGFIEAPGRRLRGRLSEAQEGTGAGRGTPGGVPGPLTSTVRRTVTFGKNPAAKVIYFWLRRWAGKKGSQVHGMSVDRC	71362	72946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_+_71400_72900
820327	contig_9516_pilon	-	1307	11	Intergenic	novelGene_106199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	10.2805641868528	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	786	522	1307	1207943	1160158	FALSE	55	GAAAAAGTATGTACAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEKQVNKLYESKRALERPNIAQFQEWLFHKGPPITPEQDQLLKYRYLDMVRKELDKTEHTAEKQSTSRMMEEESRHRDHIRRKLSLRKQIEEEWKTKEMLLLTKIGEEVRRESRIEEHRRKSREETDRKKQALLEKKIAYHLQKIQKNSSKREVPEERRAENKGQDGAEGTTNTKTAPASAAPTKKNILRHSIHEIPKQEANDISYAPDANRTSVIYAKANEKRTKKLSFSYEPVLPTIKEVVSAHSPPIKEPSCGHCCCQ	1211616	1160157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1160189_1161264_1161314_1162973_1163035_1164843_1164978_1205245_1205367_1205781_1205893_1206594_1206737_1207806_1207947_1208318_1208409_1209328_1209491_1211350
820329	contig_12115_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_114472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATATGCCCAGCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53457	52151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12115_pilon_-_52200_53500
820331	contig_5999_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_45635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182378	183231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_182400_183200
820332	contig_13097_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_107736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGAAAGAAAGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255875	257349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_255900_257300
820333	SIRV5	-	354	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
820334	contig_6165_pilon	+	1320	3	Intergenic	novelGene_167401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAATGTGTGTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317211	437519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_317333_403981_404319_436657
820339	contig_15063_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_14464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	29	391	36299	36661	NA	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36270	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
820340	contig_12239_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_170478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACTGGTTAAAATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80611	82818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_80600_82800
820341	contig_5690_pilon	+	1045	5	Intergenic	novelGene_119685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.1603166558323	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	77	490	341945	359144	FALSE	20	TAAGCTTACTCCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRNRLDSSAIALLPTQQPCVQQNETLFQKADSDLDCILYRLEYEIKNNHPDSAGVKNPVTLLKELSAIKSRYQTLHTRFKPIAVEQKETKGHICVILNKTMTMIQELQKLTDMELSPLTEEEKTAEKQLKSHMPDL	341868	359699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_341970_344072_344129_347629_347717_352195_352373_359075
820342	contig_9679_pilon	-	2836	1	Intergenic	novelGene_173407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28579	25743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_25700_28600
820344	SIRV5	+	295	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	32	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8452_8586_10858
820346	contig_10867_pilon	+	790	3	Intergenic	novelGene_159464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACCAGAAAGTATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87154	88685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_87798_88190_88255_88602
820347	contig_5331_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_112771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTGAAACTTCTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245786	247869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_246648_246830
820349	contig_14289_pilon	-	1254	2	Intergenic	novelGene_110555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52902	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945
820350	contig_19769_pilon	+	1096	3	Intergenic	novelGene_102344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	11	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	162	635	200808	202034	FALSE	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKPAPEEPPASAEAQARAGLNREGGVPGCLQRARPRGRRGVGSAELHGGEGCGMEWALGSLQNGVGEGSGSAGSLCPLTAPPCNPSQAEQLARELAWCIEQLELGLRTQRPSPKQKVQATAAIRTLRSERTPLPRKRQLMHSLFGDYRAQMEAERREALRALRAAAHSAQVQPVGEATRKKSRRVCRPRPVGGAKATLDTPDEEFRFNFF	200646	202495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_200995_201126_201274_201894
820351	contig_2358_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_156108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAGAAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86399	85681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_85700_86400
820356	contig_7963_pilon	-	1001	5	Intergenic	novelGene_58312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.07950414219	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	49	321	48841	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMNYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48889	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39278_39405_39949_40193_43546_43817_48763
820358	contig_6102_pilon	+	509	4	Intergenic	novelGene_31965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1299.19085930008	7	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	171	509	414294	416204	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHDTVSSPEGFLRLPTPFPSCLSWIICQQHSPNKLVLCP	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414167_414364_414613_414772_416093
820359	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	1	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
820361	SIRV6	+	464	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	13	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	24	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
820363	contig_15277_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_175429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATAACCCCATCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253743	256389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_253700_256400
820364	SIRV6	+	198	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	534	51	534	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10771	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
820365	scaffold_7386_pilon	+	1833	8	Intergenic	novelGene_136595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1262	1591	305668	308250	TRUE	15	CGCAGCCGCAGCCGCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSVSIWNACLSSTFSTAILVSRVWKHSRTSCCSYTISQPQAAGDGSGGHRRLGILQVQEEPLQLCDQAGLSVVPAAARAGWAAGNSSSRTALRNSGVKKRHCRMLFR	298043	309072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_298979_304002_304132_305069_305166_305566_305696_306774_306858_307252_307381_308159_308285_308864
820368	contig_16102_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_176430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTGCCCAGTAGACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339332	338683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16102_pilon_-_338700_339300
820371	contig_7119_pilon	-	2017	2	Intergenic	novelGene_41025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	303	542	225214	224975	FALSE	15	GTCACCTTCTTCATCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKERKSTTQGPAGTPPPPGGNKHWPPFHIFTVQLQGLQGRLLIFKFHVAVPSEVPTVAEDGADLGDVATGLEERPELHVWLLHAVGQVADEDRDAVLTAVMGHLGHVPLQGGSLCLLLGRGGRHAQVPSSQPVLLPCLCLVLRRLEGRCSQLSCVWKVALQVFKRKTATINDFFSSVSC	226219	223499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_225460_226162
820372	contig_14326_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_120782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACACACACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860761	860365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_860400_860800
820373	SIRV4	-	348	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1175	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3983	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
820374	contig_4103_pilon	-	1381	3	Intergenic	novelGene_52029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	23	junction_2	76	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATAGGTCTCACATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591613	542280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_543381_577146_577338_591523
820376	contig_8631_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_121991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGGTTTGAAGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862420	861587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_861600_862400
820378	contig_12427_pilon	+	2050	10	Intergenic	novelGene_40593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	456.667639901639	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	15	1811	624033	656818	FALSE	35	AAAATTTTCAGTAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSAACLFLVLLLGAWAPALGSASSEVLPLVNEDVKRTVDLSSHLAKVTAEVVLAHPGGGSTSRATSFLLALEPELEARLAHLGVQVKGEDEEENNLEVREFFMVKLPFALDPGAKISVIVETVYTHVLHPYPTHITQSEKQFVVFEGNHYFYSPYPTKTQTMRVKLASRNVESYTKLGNPTRSEDLLDYGPFRDIPAYSQDTFKVHYENNSPFLTITSMTRVIEVSHWGNIAVEENVDLKHTGAVLKGPFSRYDYQRQPDSGISSIRSFKTILPAAAQDVYYRDEIGNVSTSHLLVLDDSVEMEIRPRFPLFGGWKTHYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALKMRFVDHVFDEQVIDSLTVKIILPEGAKNIQVDSPYEISRAPDELHYTYLDTFGRPVIVAYKKNLVEQQIQDIVVHYTFNKVLMLQEPLLVVAAFYILFFTVIIYVRLDFSITKDPAAEARMKVACITEQVLTLVNKRIGLYRHFDETVNRYKQSRDVSTLNSGKKSLETEHKALTSEIALLQSRLKTEGSDLCDKVSEMQKLDGQVKELVLKSAVEAERLVAGKLKKDTYIENEKLISGKRQELVTKIDHILDAL	624018	657057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_624294_627551_627597_635036_635337_643626_643837_644727_644921_649146_649247_650460_650600_650876_650997_655080_655327_656635
820379	contig_5041_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_27108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAACCCAAATCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594339	595764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_594300_595800
820380	contig_4952_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_145528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGGAGGGCACCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410769	408735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_408700_410800
820381	contig_14483_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_133771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAGGAGAACGTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165908	165521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_165500_165900
820382	contig_1735_pilon	-	1180	6	Intergenic	novelGene_106889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGACTTGTCTACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139733	126183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_126318_127267_127630_131559_131841_132234_132407_136628_136767_139640
820383	contig_12312_pilon	-	549	3	Intergenic	novelGene_64020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_2	41	818	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	6	362	564031	563009	FALSE	0	CTTGGTCTTTTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMATPSLRGRLARLGNPRKPILKPNKPLILANRVGERRREKGEATCITEMSVMMACWKQNEFRDEACRKEIQDFFDCASMAEAARKMRSIQDTLGESGSLPPKKLNQLLQRFPNKPHVS	564036	562821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_563123_563672_563792_563907
820384	contig_19564_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_29630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	231	671	12641	12201	FALSE	5	TGTCTCCTCTCTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSCRRVRTSLLQPPGHVPSPQPAIRRDKIIYRSLAPHTIEASKKKTNAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15688	12017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12727_15543
820385	contig_10864_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_107141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGGAGTTTGGTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1618091	1620259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1618100_1620300
820386	contig_16525_pilon	-	444	4	Intergenic	novelGene_133865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1896.08831252368	142	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	51	389	181436	178157	FALSE	20	AAGGTTCGAGGACTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181486	178101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181388
820387	contig_5236_pilon	+	1971	12	Intergenic	novelGene_100969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	10.8208552846302	82	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	162	1622	1012119	1019709	TRUE	5	CAGTCTTCTGCCCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKALQLSSCRRLSARGLSTRRGGSTLDWGGKVSEIKKKIRSVLPGGTWDLPYDTSHLPPEHADVVIVGGGVIGLSVAYWLKRLETQRGAIRVLVVERDHTYRQASTGLSVGGIRQQFSCPENIRLSLFSASFLRNINDYLAVVDDPPLDLQFNPSGYLLLASEKGAAVMESNVKVQRQEGAKVCLLSPEQLRSKFPWINTEGVALASYGLENEGWFDPWCLLQGLRRKVQSMGVLFCQGEVTRFISSSAHMENASGEEVTLKRIREVHVKMDHSLEYQPVECAVVINAAGAWSGQIAELAGIGNGPPGTLQGTKLPVELRKRYVYLWHCPQGPGLETPLVADTSGAYFRREGLGNSYLGGCSPTEEEEPDPGNLEVDHDFFQEKVWPHLAQRVPAFETLKVRSAWAGYYDYNTFDQNGVVGPHPLVVNMYFATGFSGHGLQQAPAVGRAVAEIVLEGSFQTINLSPFLFSRFYFGEKFQEATII	1011957	1020241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1012204_1014480_1014702_1015572_1015684_1015933_1016053_1017227_1017323_1017623_1017726_1018054_1018132_1018301_1018463_1018670_1018801_1019012_1019118_1019454_1019714_1019896
820389	contig_7473_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_176431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATAACTTTTCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21305	22793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7473_pilon_+_21300_22800
820390	contig_7378_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_120263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAATAATCATGAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448038	450148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_448000_450100
820391	contig_11136_pilon	-	1653	15	Intergenic	novelGene_169017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_14	12.9030924943739	113	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	306	1622	135067	130499	FALSE	20	CAGTGAGGACATTCGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESPEGEHPSVTLFRQYLRIRTVHPEPDYGAAVAFLEERACQLGLGCQKVEVAPGRVVIVLTWPGTNPTLPSILLNSHMDVVPVFKEHWSHDPFEAFKDAEGYIYGRGAQDMKCVSIQYLEAVRRLKAEGRRFPRTIHMTFVPDEEIGGHKGMELFVQRPEFQALRAGFALDEGLASPTDAFSVFYSERNVWWVRITCSGKPGHGSRFIEDTAAEKLHKVISSILAFREKEKQRLQSNPHLKLGAVTSVNLTKLEGGVAYNVVPATMSASFDFRVAPDVDLKAFEEQLQDWCQAAGDGVTFEFAQKWMEPRITSTDNSDPWWAAFSGACKDMNLTVEPEIFSATTDSRYIRAVGVPALGFSPMNRTPVLLHDHDERLHEAVFLRGIDIYTRLLSALASVPALPHATAEPHAPHLYPGASTQTSAKDPTVPHHANKI	135789	130467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_130754_130840_130902_131044_131125_131743_131813_131909_132055_132156_132207_132291_132366_132710_132768_132867_132958_133047_133125_133433_133529_133812_133918_134004_134070_134973_135086_135502
820392	contig_5967_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_44429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAGAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587273	588990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_587300_589000
820393	contig_7368_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_158800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCAGTGGTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54246	55162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_54200_55200
820394	contig_3602_pilon	+	2250	6	Intergenic	novelGene_60630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	61.8339712455864	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	306	2129	971037	985661	FALSE	30	CCGGCCCAATCACGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPRTREGRSHRDRHWAPHEKETPERWDWNCPETRRLLEDAFFRDEDYIRQGSEECQKFWAFFERLQRFQNLKTTRKEEEKDPGPPKHSVPALADLPPTYDPRYRINLSVLGPNTRGSRELGRRLPPERVSEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERVALPIAQYGKRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYQVLIVDEVHERHLHNDFLLGILRRLLPLRPDLKVILMSATINIALFSSYFGSAPVVQVPGRLFPITVVYQPPEVEPTTAKSEKLDPRPFLRVLEAIDKKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSTLSVADQDKVFDVTPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDALVLQVRNDWVRGGCILIASSQGGTGKHLDSASLSQGFWATTGRAGQAADGDSPLPNVKLCVEGRIVPQIHRVRKNPTTQ	965888	985782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_965920_970762_971745_975536_975849_980287_980543_983426_983530_985215
820396	contig_19743_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_173162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276577	275431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_275400_276600
820397	contig_6576_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_42452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAGCTTAATAATAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320243	1319219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1319200_1320200
820399	contig_15825_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_160215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATAAATTGTTGAACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225648	225166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_225200_225600
820401	contig_10883_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_176432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCGCGCGCCTCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34355	32151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10883_pilon_-_32200_34400
820403	contig_6266_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_171004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	578	925	812796	812449	NA	35	TTGTAGAGAGTCACACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIKNQHTEFCMFFCRLLVERIFAQYMVPHNLETTERMKCLYYLYATLDLNAVKYVSSIKLFSLFIFCSILKYMEKKLLLVAKHCLKGCCVLSSGFRLIVTLCDRVELSHRVSRL	813373	811351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_811400_813400
820404	contig_9582_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_106839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	18.5	119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	153	869	431196	425320	FALSE	85	AAAAAAAAAGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGRPVPTCVHLASDVQLDGRCDPRKLQTQNQLQFNRNVPTHSSNLAIRYSCPHAIRIEKLKHSFNESYHCKDSNFRDGPDPSSSVSFSVISEEKLSYAVHLAKRDVKRRQFEEHMKEHHLRSQPQISQKCGHTTKSKIPEHRLEKKETKGHEVFPCSHQPSKVEISSSGAKVYLYTSHPGQPDLTVQNSPPTRDPGLQPHSRIGEHKSLLEVQRLQKELSSCIHKIEEVTKKGEKN	436735	424937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_425944_431103_431267_436653
820405	contig_10795_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_171288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCACTGTAGTTCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84116	82919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_-_82900_84100
820406	contig_11378_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_112336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_2	209.5	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGATTGACTGGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247065	1245915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1246111_1246712_1246813_1246991
820407	contig_1856_pilon	+	1350	7	Intergenic	novelGene_84869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTCACACTCAGATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174466	271474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_174526_176910_176962_181398_181495_205250_205610_259395_259735_260037_260177_271167
820408	contig_7135_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_136944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	52.6705562909677	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	271	816	251223	268922	FALSE	25	TATAGCCTGTTTGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTEVIAVFENTSDELLELFENFCDLFRNATLHSEVQFPCSASSNNFARQIQRRFKDTIINAKYGGHTEAVRRLLGQLPISAQSYSGSPYLDLSLFSYDDKWVSVMERPKTCGDHPIRFYARDSGLLKFEIQAGLLGRPINHTVRRLVAFTFHPFEPFAISVQRTNAEYVVNFHMRHCCT	233911	269413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_234051_245965_246073_251198_251387_264805_264998_268732
820409	contig_10331_pilon	+	1234	3	Intergenic	novelGene_54190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	52	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	16	303	604724	608995	FALSE	50	TAAATTACAATTCCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKCGFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKGKCSSMC	604708	609926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605105_608971
820412	contig_16525_pilon	+	1237	7	Intergenic	novelGene_133884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	55.5927653166809	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	494	949	215857	217911	FALSE	10	AAGTCTCGTTCCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQASPSPSPVGYSPMTPGAPSPGGYNPHTPGSGIEQNSSDWVTTDIQVKVRDTYLDTQVVGQTGVIRSVTGGMCSVYLKDSEKVVSISSEHLEPITPTKNNKVKVILGEDREATGVLLSIDGEDGIVRMDLDEQLKILNLRFLGKLLEV	212634	218199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_212746_214696_214774_214865_215014_215699_215869_215975_216180_217584_217681_217767
820413	SIRV6	+	181	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	551	51	551	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10788	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
820415	contig_6344_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_157094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAATTGCAGGTGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785489	786028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_785500_786000
820416	contig_6344_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_157095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTGTGTCATGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786735	787388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_786700_787400
820417	contig_20183_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_174233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTATCATTGTCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35162	33962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20183_pilon_-_34000_35200
820420	contig_12761_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_164070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATACGGAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381164	381394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_381200_381400
820422	contig_10667_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_137320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTTCTCCTGTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113815	114976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_113800_115000
820423	contig_7179_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_78211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	152	496	1686143	1686487	NA	35	AATAAAGCTTGTTTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCVTRSVLNPEFSPNLFCSKLSSGTIIFFWVYASGRRGLLQFSCCLSNWLLTSQLSSSVACERSSVLQEIVDMPCCGFDDLASGVSQSERNPKCKSPYSLLLKQTATVGMRK	1685991	1688052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1686000_1688100
820424	contig_13021_pilon	-	1147	8	Intergenic	novelGene_8241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	390.970848122507	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	409	678	213159	210494	TRUE	50	AAACACTTACTAGATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	218307	205446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_205605_205976_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018
820428	contig_6117_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_167309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGGGAGGGGGATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136124	136678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_+_136100_136700
820430	SIRV6	+	237	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	60	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
820431	contig_998_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_153800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATTCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357811	358755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_357800_358800
820432	contig_6445_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_77050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTTGTCATTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649603	651660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_649600_651700
820434	contig_7057_pilon	+	688	4	Intergenic	novelGene_123250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	243.060120592051	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540009	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540282_540742_540996_541177
820435	contig_10106_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_73883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCACCACAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139493	137708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_137700_139500
820436	contig_14326_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_120738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCAAAATTACTAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461855	462658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_461900_462700
820437	SIRV6	+	343	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	400	130	234	40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCTTGGTATGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537	1990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820439	contig_10642_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_78713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892220	893876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_892200_893900
820440	contig_15825_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_160208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTATGGACACTGAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164018	162581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_162600_164000
820442	contig_3382_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_124065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATCTCATATCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277026	277275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_277000_277300
820443	contig_2798_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_120071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190101	189263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_189300_190100
820444	contig_4952_pilon	+	1334	7	Intergenic	novelGene_145537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	26.4806008659589	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	75	647	501121	507017	FALSE	50	CTTCCAGAAGAAAATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRTKGDEEEYWNSSKFKAFTFDDEDDELSQLKESKRAVNSLRDFVDDDDDDDDLERVSWSGEPVGSISWTIKETAGNSGSTHEGREQKSRNNFSSYGQLSKPVSTYSLSSLFKGRTRFGSFQSLSDALSDTSAKSYAPELGRPKGEYRDYSNDWSLSDTVRRLRKGKVRGRNLVEIWEPRQLVLTGRVS	497434	507704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_497509_501120_501214_501846_501953_505086_505231_505649_505689_506072_506138_506891
820445	contig_11413_pilon	+	1168	7	Intergenic	novelGene_103115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.7691682300198	158	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	449	784	46238	47264	FALSE	20	GTCAGTGTTCTACTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGPIRAYILARKDAIQLWRTLMGPTRVFRARHVAPDSIRGSFGLTDTRNTTHGSDSVISASREIAVFFPDFSEQRWYEEEEPQLRCGPVCYNPEGGIHCAAGTGGSGPA	41023	47648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_41095_41522_41598_43712_43810_45379_45483_46135_46246_46667_46829_47097
820447	contig_5947_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_101467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCACTGTCATAGGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45468	45116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_45100_45500
820448	contig_8059_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_111115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256113	254820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_254800_256100
820449	contig_17198_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_62345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610680	612450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_610700_612400
820450	SIRV5	-	349	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8579_10851
820452	contig_11375_pilon	-	1673	14	Intergenic	novelGene_152645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_2	18.0220115250292	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	153	1544	29341	24718	FALSE	25	CCCAATGGCTCAAGCGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTPSRGGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFSKAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVLHFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSAEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQLSFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTANQPGFIIVETNYRLYAYTESELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDRLRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS	30088	24588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_24891_25372_25452_25611_25660_26296_26428_26625_26759_26971_27056_27263_27333_27493_27606_27820_27910_28003_28101_28362_28495_28839_28945_29201_29345_29939
820453	SIRV6	+	434	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	3	164	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
820454	contig_6937_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_175012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGCCTTGCTAGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7126	9182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6937_pilon_+_7100_9200
820458	contig_10811_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_165805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTCTCCTAATCAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375200	377204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_375200_377200
820459	contig_5316_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_61245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTTAAAGGTGACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466240	465169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_465200_466200
820460	contig_1443_pilon	+	881	5	Intergenic	novelGene_28320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	277	732	748643	776436	TRUE	20	AAGCCGACTGCTGCTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRVILAIGAVSVILSFLSLFFIILDQLQLSRGDGEGCSGTDPYISAADRFTPAFPRFTFGSAARLISGNLASNHSAILSCYSSPGISLINVLNEGKALMNRATNNFAIFREDCLHIRLLDNKSIEISNKYTGVHGARICLVSNIAGHGV	748366	809461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_767442_767560_776189_776478_808694_808744_809402
820461	contig_5482_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_144494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATATGAGCACGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559217	557878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_557900_559200
820463	contig_14807_pilon	-	1396	7	Intergenic	novelGene_124730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.98887651569859	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	246	848	100771	95395	FALSE	10	GCTGCTTGATTCAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEDLAMFRVIPSCTIFYPSDAVSTEHAVYLAANTQGMCFIRTTRPETAVIYAPEERFEVGQAKLVRHSASDKVTVIGAGVTLHEALEAADELSKEGISIRVIDLFTLKPLDAATIISSAKVTGGHVITVEDHYREGGIGEAISAAVAMEPDILVHQLAVSGVPQSGPPSDLLDMFGISARHIIETVRRIVNKPVELIS	102928	94846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_95586_96714_96835_96951_97049_98316_98401_100660_100792_102466_102624_102860
820464	contig_2078_pilon	+	1733	1	Intergenic	novelGene_100190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATATGACATAATAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516065	517798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_516100_517800
820465	SIRV4	-	504	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	115	-2	115	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5043	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
820466	contig_6014_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_176276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCAGGATACAATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128653	128099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_128100_128700
820467	contig_9014_pilon	+	1574	1	Intergenic	novelGene_106745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	70	501	76333	76764	NA	20	AATGAAGTGTCTTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPAGGKKTTQASQEY	76263	77837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_76300_77800
820470	contig_5278_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_139765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGCCTTTTTATCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92584	94186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_92600_94200
820471	contig_10339_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_125257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAACAAAATAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243774	242748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_242700_243800
820472	contig_5906_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_174811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGCATTTACTCCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217265	215169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_215200_217300
820474	contig_16907_pilon	+	1093	7	Intergenic	novelGene_87482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	43.4335379887734	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	287	889	530225	540528	FALSE	20	TGAAGTTATTTATTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKGKKRHSSSSSQSSEISTKSKSVDSSLGGLSRSSTVASLDTDSTKSSGQSNSNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLPEGKSLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPLEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCSSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKS	524946	540732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525201_530192_530297_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
820476	contig_14289_pilon	-	667	6	Intergenic	novelGene_110565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_1	330.871818080658	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	119	667	66533	51656	FALSE	10	CTGAGCCTGGTGCGGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRA	66651	51655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52053_58622_58753_61210_61293_64645_64754_66468
820479	contig_6048_pilon	+	1186	6	Intergenic	novelGene_73090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	213.753502895274	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	38	514	130291	135654	TRUE	15	ACATTTCTGGACTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRGTRRAGGCRMMRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	130253	136365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_132370_132550_133132_133242_134181_134320_135606_136073_136111
820481	contig_5799_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_50236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGCCACAGAAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148555	149415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_148600_149400
820482	contig_5799_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_50237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAAATTCTAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149365	150647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_149400_150600
820483	contig_7151_pilon	-	1018	6	Intergenic	novelGene_40790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	886.432986750832	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	253	705	536425	529189	FALSE	15	CAATGTCTTTGTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551268	528875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549707_551152
820487	contig_10948_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_124983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283853	282312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_282300_283900
820489	contig_10661_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_174740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	111	416	526	127356	127466	FALSE	10	CCGCCCTCATCCGGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGGGGGSRSSGGSQGGGGALSRSSLGSSPGQGGAADNTRTGSQNRPGKLCAQPGASSCPLFGAVPRAPLKPPGGGHHGLGWSVAGPLAARLGPCFADCPTQLWCFLTDDVITVPGSLRLHFQKVPELSPSPWRPDRMKLLSTRGRQPLGTPRPKGQQKEPRTRQLRQRKGQCQ	114441	127468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10661_pilon_+_114746_127244
820490	contig_10661_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_174742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	264	792	174	965	129338	130129	NA	20	AGTCTGATGAGCTTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AREALTREAYAREAQAHEAHAREARSREAHAKEACAREARAREAQAREVQAWQEKPIMEYQMRPLGPSVMGLVAGASGVSQTSHHGTTSAFPATASSEPDWRDFRPLEKRFEGTCSKKDQSTCLMQLFQSDAMFEPDMQEANFRGSPRRAYPTYSPPEEPEEEEVEKGGNATVSFSQALVEFTSNGNLFSSMSCSSDSDSSFTQNLPELPPMVTFDIADVERDGEGECEENPEFHNEDLAASLEAFAMGYYHKHAFNNYRSRFYQGLPWGVSSLPRYLGLPGMHPRPPPAAMALNRRSRSLDTAEILELELSNSHLAHGYM	129164	130130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10661_pilon_+_129200_130100
820492	contig_6496_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_103547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGGGAAACAGACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1182853	1184389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1182900_1184400
820495	contig_8167_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_155639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCACATAAACTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39163	39479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_39200_39500
820496	contig_2940_pilon	+	351	2	Intergenic	novelGene_81937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCCAGTTACGCTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717653	720941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_717835_720771
820497	contig_5297_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_175664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	404	1215	40	1254	52333	53547	NA	20	ACTCGACTCTTCTTACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQELRSTDSILHTSDPHARRGGDSILHTRDPHARRGGDSILHTRDPHARRGGDSILHTRDPPARRGGDSILHTRDPHARRGGDSILHTRDPPARRGGDSILHTRDPPARRVETPYFTPGTPTRGGWRLHTSHQGPPRAEGGDSILHTRDPHARRGGDSILHTSDPHARRVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTPTRGEVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTPTRGGVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTPTRGGVETPYFTPGTPTRGGVETPYFTPVTRTRGGVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTPTRGGVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTRTRGGVETPYFTPGTRTRRGVEMHTRCIEAERANTPTYSVTARW	52293	53609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_+_52300_53600
820498	contig_1982_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_151329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	296	670	332262	331888	FALSE	35	GGAAGAACAGACTTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNTCLSSTDISRLKGVHLCQVLMNHKVFEPVGVKLFKNEKDLEFEDSNSNLYGFLGGMSSHVFCRRKKDVENGLINEIKAKEPSKLVLTKILLYTVFRPWQDCLHCSKFECYAFSFFRSQQKK	334669	330685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_332417_334528
820499	SIRV4	-	428	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1058	35	1058	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACAGTTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
820500	scaffold_20283_pilon	+	782	6	Intergenic	novelGene_176433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	19.0473095212946	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	174	782	57006	82621	FALSE	30	GTATGTAATTATTACACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTAPAPFADETSCQCQAPHEKLTIAQARLGTPVDRPVRVYADGIFDLFHSGHARALMQAKTLFPNSYLLVGVCSDDLTHKFKGFTVMNEAERYEALRHCRYVDEVIRDAPWTLTPEFLEKHKIDFVAHDDIPYSSAGSDDVYKHIKEAGMFVPTQRTEGISTSDIITRIVRDYDVYARRNLQRGYTAKELNVSFINEKKYRFQNQVDKMKEKVKNVEERSKEFVNRVEEKSHDLIQKWEEKSREFIGNFLELFGPDGAW	38948	82621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_20283_pilon_+_39051_56934_57052_69388_69541_72544_72624_79302_79446_82432
820501	contig_5684_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_81013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGTGAACTCGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351693	351253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351300_351700
820502	contig_17427_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_30275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAATATTTTTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84168	83624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_83600_84200
820503	contig_17427_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_30274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82717	82189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_82200_82700
820507	contig_6069_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_8084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGTAGAGTGTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566527	566837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_566500_566800
820508	SIRV6	+	397	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	353	17	187	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
820509	contig_9197_pilon	-	1002	4	Intergenic	novelGene_154362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAAGCCTCGCCCGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93134	52703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_-_52727_57608_57671_80733_80889_92372
820511	contig_12750_pilon	-	2353	10	Intergenic	novelGene_172625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTGACTGCATGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118737	93095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_93170_94746_94960_95815_95923_100994_101139_101828_102005_109921_110083_111272_111529_112548_112705_114102_114354_117922
820513	contig_6589_pilon	-	561	6	Intergenic	novelGene_25868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1284.10351607649	36	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	528	34	561	959104	955183	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVSGVWAPGHSGWFPQVHARAARCTGISARHREPRTATPNRTSAPRAGSSSVPEADGPAAATKTNPRSYSVIKKILDA	959137	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955840_956679_956815_957251_957360_957758_957846_959101
820515	contig_9895_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_144701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATCAACTAGAATGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352626	354738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_352600_354700
820518	contig_614_pilon	-	1912	1	Intergenic	novelGene_132637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGTTTGAGAAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884326	882414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_882400_884300
820519	contig_6710_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_94386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	24	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	657158	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657160	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
820520	contig_12624_pilon	+	936	2	Intergenic	novelGene_61125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGTATACACATCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947484	948521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_948236_948336
820521	contig_6076_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_81744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCGTTTCAGGGAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63454	63172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_63200_63500
820523	contig_15277_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_175420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGGAGTCTAATCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182636	181987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_182000_182600
820524	contig_15277_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_175419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181331	180619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_180600_181300
820526	contig_9233_pilon	-	843	2	Intergenic	novelGene_78251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATCTTTCTCCTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657602	645654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_646328_657432
820528	scaffold_17542_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_139234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423353	421942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_421900_423400
820529	SIRV6	+	398	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-63	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	113	342	49	390	2458	10780	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLELLMKHEWSVLWSLLSKSQVRIIDERVEVEVVQQES	2409	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2808_3106_3163_10724
820531	contig_8309_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_176435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATTGCTCCACCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15474	14193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8309_pilon_-_14200_15500
820536	contig_9538_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_176448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCGGGTAAACGGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27367	27185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_27200_27400
820538	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
820539	contig_10451_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_138334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491687	494151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_491700_494200
820540	contig_4339_pilon	-	1235	10	Intergenic	novelGene_146072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	70.5734885346517	326	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	336	1121	1001089	976186	FALSE	25	TATATTGAGTGTGTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVLSSLGAQCVIASRNIDVLKATAEEISSQTGNKVHAIQCDVRDPDMVQNTVSELIKVTGHPDVVINNAAGNFISPTERLSPNAWKTITGIVLNGTAFVTLEIGKQLIKAQKGAAFLAITTIYAETGTGFLVPSSSAKAGVEAMYKSLAAEWATYGMRFNIIQPGTIKTKGAFSRLDPTGAFEKEMIHKIPCGRLGTVEEIANLAAFMCSDYASWINGAVIRFDGGEEAFISGQMNSLTKVTKEQWDTIEGLIRKTKGS	1027254	976071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_976246_976346_976410_976832_976980_979232_979306_984376_984477_995831_995980_997153_997241_997359_997418_1001039_1001243_1027072
820541	contig_3975_pilon	-	1688	5	Intergenic	novelGene_54894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	13.1600721882519	31	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	28	1416	2111719	2109316	FALSE	15	TTCTTAGATTCTGAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEQLFRKVSALQACVRGFLVRRQFQSLRAEYEATVREIEGDQGMVQWTEGWIPRPQFLPEKVKSHRTWKAGERVTNPEKELGSHFPCKEPEEMVLKKSGESSANPGSLPCREDNPLLQDEQSRKTSHGETRDSSRTGNPETTDPGLPYSQLDLQEVQHLRSHLAMELLWLQQAISSRKEYLILKQTLSSPEAGQTRDGPTVCPNHLGQACERSHTQPSPPLEDHSYRDRTTRELDHVDDSCWRVKSQSHKSPESLVVTDKTTVGAKYREPRYRRAGSQLPTPSDNQATGDKLTKEPDHGEQASRGTCLKLMKYPEDQTPRGLKPRGHCSEKTRTQLLMLPEKPAIKDKSPRGPDYQEPDCQSAGAQESGLSEDRIIWDGNLAGPEHSGLDLWRTKPPKGQTPSDRTSKDGLSNEPSHEGWTNQRTELWRSRPSKYLSSTRSDHTGEDHQQGRPWKTGPPG	2111746	2109043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2110162_2110280_2110400_2110633_2110872_2111110_2111255_2111677
820542	contig_5549_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_81624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTAATCTCAATAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369618	368656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_368700_369600
820543	contig_7521_pilon	+	1751	2	Intergenic	novelGene_160553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGCGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318119	383726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_319691_383546
820545	contig_13348_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_162682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATACATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74875	73306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_73300_74900
820546	contig_2093_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_152948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATATGCAATAAAACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963230	961934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_961900_963200
820547	contig_12864_pilon	-	1163	4	Intergenic	novelGene_76439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	708.992399269712	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	344	763	244752	242640	FALSE	20	CCTGAAAGAGTTGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNSELAHPEGPAGPVCWPESEKHLRASDDPCLPPPRSGSSLGPLLLPVPWTNLGPRKRIVPLPCGEHTLYSLFPSSLLPAFSTGVRT	251963	242239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_244580_244767_245704_245915_251844
820549	contig_3655_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_176464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304506	305155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3655_pilon_+_304500_305200
820550	contig_9548_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_141080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATAAATAAGGGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291593	292334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_291600_292300
820551	contig_7816_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_66464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTTAGACCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124988	126929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_125000_126900
820553	contig_7593_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_127286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATCTAAAGCACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113173	114896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_113200_114900
820555	contig_5039_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_64996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAATCACTGAGTAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690942	1692585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1690900_1692600
820556	contig_13607_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_170208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACTATTTCTAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327607	326395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_326400_327600
820559	contig_13718_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_142898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTGCGTCCCTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234486	235030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_234500_235000
820560	contig_13718_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_142897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGTAGCATTTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231493	232142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_231500_232100
820563	contig_16541_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_126734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAGGTAATTTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307364	306765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_306800_307400
820565	contig_9965_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_176465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTTCTTTATCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51699	49021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9965_pilon_-_49000_51700
820567	contig_9706_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_21033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACGTTCAGAAATCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614603	614967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_614600_615000
820571	contig_5445_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_135426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2710	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTTGAATTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53158	53918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_53240_53646
820573	contig_4065_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_133404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATGTAAGACCCATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595645	594285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_594300_595600
820575	contig_537_pilon	+	1141	3	Intergenic	novelGene_167591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	23.5	569	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	131	952	547218	549477	FALSE	25	CTTATGATTCCTAATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFPTATLLDCHGRYAQNVAFFNVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	544519	549666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_544580_547147_547288_548725
820576	contig_7201_pilon	-	1591	16	Intergenic	novelGene_152495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	305.487588400358	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	82	1584	255800	69827	FALSE	35	GAAAGAGTTTTGTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEVEEIVDIGSFAPEDIHIPKIYVHRLIKGEAYEKRIERLSIRKEEDGKAKSVKPGDSVRERIIKRAALEFEDGMYANLGIGIPLLASNFISPNMTVHLQSENGVLGLGPYPLKNEVDADLINAGKETVTVLPGASYFSSDESFAMIRGGHVDLTMLGAMQVSRYGDLANWMIPGKMVKGMGGAMDLVSSAKTKVVVTMEHSAKGNAHKIMEKCTLPLTGKQCVNRIITEKAVFTVGAHIGCIFTCDMYVKLYAVLSR	255881	69819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_69911_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161658_161708_163992_164088_169479_169595_171320_171429_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_238453_238545_239711_239821_255722
820577	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
820578	contig_1062_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_171382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACAGGCCAGCTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230786	229881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1062_pilon_-_229900_230800
820579	contig_12528_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_81286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297279	298973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_297300_299000
820581	contig_5906_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_174816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTAGCTGTTTTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354279	353783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_353800_354300
820583	contig_15182_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_136461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGAATCCCAGCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564252	562828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_562800_564300
820586	contig_5727_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_7974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGAAGAAGAACGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203926	203408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_203400_203900
820588	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	8	1158	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
820598	contig_6058_pilon	+	2101	2	Intergenic	novelGene_172371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242169	244494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_242330_242553
820599	contig_7839_pilon	-	1863	5	Intergenic	novelGene_45686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_4	31.1076759016163	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	167	826	154505	146135	FALSE	30	TACTCTCTACCCAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDQVNALCEQLVKAVTVMMDPSSTQRYRLEALKFCEEFKEKCPICVPCGLRLAEKTQIAIVRHFGLQILEHVVKFRWNSMSRLEKVYLKNSVMELIANGTLNILEEENHIKDVLSRIVVEMIKREWPQHWPDMLIELDALSKQGETQTELVMFILLRLAEDVVTFQTLPPQRRRDIQQTLTQNMERIFSFLLNTLQENLNKYRQVVRDTLPQESPIS	154671	145097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_146357_146484_146623_151908_151982_153056_153179_154400
820601	contig_12080_pilon	-	1604	2	Intergenic	novelGene_128406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATGTTTCAACTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484315	476793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_478047_483964
820603	contig_6602_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_166441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354685	353958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_-_354000_354700
820604	contig_9345_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_24600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	209	646	945468	944755	FALSE	15	GGAGAACTGTGTGTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945676	944546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
820605	contig_1867_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_54547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTTTGAAAAATGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388244	388962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_388200_389000
820612	contig_10599_pilon	-	1194	6	Intergenic	novelGene_49893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.06862723900371	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	264	389	247335	238353	TRUE	20	TTGCTTAAATGTCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPAHRGPGDHFDPALDRFATEVEEFPDSSSCSTSREGPFRSGELILAETGKRQTQFKKLFRLSSVGHLNSNWGLVPFSEIVGKFPGQMLKSSSGKHFMLRRPALEDYVLLMKRGPCISYPKLDQKGKS	247598	231666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_231887_231969_232070_232717_232944_233588_233681_238185_238377_247233
820613	contig_6445_pilon	-	790	7	Intergenic	novelGene_76933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	573.218811236648	5	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	108	626	88578	43042	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQFPKYKH	96398	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43066_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
820614	contig_10159_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_30865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	822	1127	958288	958593	NA	70	TTGGAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASLCPGAATGRRFHLGAWACSILCDIVVACHPRHLLSPQTQTQHQRAPRRGGTPVHRERAGAAWVAVRPMDCTSWSLEPEDEPGGTVSELTNRLESKGN	957466	959047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957500_959000
820616	contig_7345_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_159194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATAAGAAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316767	317742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_316800_317700
820617	contig_3068_pilon	+	1840	11	Intergenic	novelGene_137598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	7.1805292284065	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	113	1330	12509	29930	FALSE	15	TGTCCCTATGCACTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLLWRPPEPSCVRVRWPCRLRPAIGAPVQGLRGAWAMVQPAPSPAMDEVTFKSDTVLSDVHLYTPNQRHLMVRLNGTGQPVFLSHFKLLWSQDSLADSGVEGGDHRDTQTDNTPPAGTGPPESPPGSDHSHKGFSLQTGAHTAGQDGSGAQLDEDGDLDVVRRPRAASDPDPARPSRDKVHPVILRQEEDDIIGDEAQESSLYSVIRIEHTMATPLEDVGKQVWRGALLLVDYILFRQDLLRGCTVLELGAGTGLASIVTATVARTVYCTDVGADLLAMCQRNIALNSHLTAAGGGIVKVRELDWLKDDLCIDPEVPFSWSEEEVSDLFNHTTVLLAAEVFYDDDLTDALFKTLYRLSHRLKNACTVILSVEKRLNFTLRHLDVTCEAYDHFRASLHMLEKLASSKVRFSVERVEATFPQRLAYERIQQLELWKITAEPVT	9996	30440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_10074_12473_12642_14241_14626_19162_19204_19292_19438_22002_22075_23887_23942_25785_25867_26109_26213_27967_28137_29894
820619	contig_6805_pilon	-	1949	2	Intergenic	novelGene_163898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	0	34	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGAGAAGTGGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436309	432771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_432998_434586
820620	contig_18272_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_7000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTCCCAAAGAGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135972	136365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_136000_136400
820622	contig_11719_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_154769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTTTGAGGGACACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121936	121065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_121100_121900
820625	contig_15042_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_115437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAATAAAAGAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40902	39066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_39100_40900
820627	contig_8864_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_135990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277061	278939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_277100_278900
820629	contig_3281_pilon	+	1511	2	Intergenic	novelGene_128527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	30	410	139814	140194	TRUE	80	CCAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIASEASRLAHYNKRSTISSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	139784	167883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_140204_166791
820634	contig_15631_pilon	+	664	7	Intergenic	novelGene_151541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	129.15806422967	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	185	460	391581	393584	FALSE	45	CACTGACAATAAACTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKRERVKILYKKIEDLIKYLDPEYIDRIAIPDASKLQFILAEEQFILSQVALLEQVEALVPMLDSPHIKGCCRVWILPSESLAAVPEHAARLQRLAQIHIQQQDQCVEITEESKALLEEYNKTTMLLSKQFVQWDELLCQLEAAKQVKPVEE	388635	393788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_388674_389347_389435_391521_391606_391894_391937_392557_392617_393240_393301_393494
820639	contig_12969_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_61711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAAAAAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658132	657263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_657300_658100
820641	contig_6954_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_64408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTATGCCATTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15519	15984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_15500_16000
820642	contig_6954_pilon	+	786	2	Intergenic	novelGene_64409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTCAATTGATGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16242	17814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_16678_17463
820644	contig_9833_pilon	+	1766	3	Intergenic	novelGene_68495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	179	517	211181	218991	TRUE	70	AGAATAAAAAGAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMCLGLSGGHGEVLFEDVRVPKEHIVLGPGRGFEIAQGRLGPGRIHHCMRLIGLSERALALMKARVKSRSGLRETPGGAGHAPGRHCSVTSGDRADPAAGAQSCPPHGHGW	211002	221112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_211379_218850_218996_219867
820648	contig_1331_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_37890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	493414	493755	NA	80	GCAAAAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAANGEGPKEGSQAGARVRRGFPAGRASTTQAPPPSAAVSARQNQTPRPTGREASDPLDYSRQVNPVLEAARAPAHAPAATSQPFLPNALGAATRRQNGYPAQEKLPIARDQL	493411	495042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_493400_495000
820651	contig_5549_pilon	-	1293	2	Intergenic	novelGene_81611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAAGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306994	305181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_305496_306015
820652	contig_8712_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_58864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACCACCTGCACTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829160	828201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_828200_829200
820653	contig_13778_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_70859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAACGTAACCCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308456	308107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_308100_308500
820654	contig_14142_pilon	+	685	4	Intergenic	novelGene_120580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	275.00343432199	267	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	9	599	526719	527752	FALSE	20	GAACTCTGGAGTCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGQGTGAGTGIVDIPGTTFGVWCRGGAYGKCPISHRPGSPRRLKPFKVPHPGPVGSQNCPMCPVPGCLRKGGEVTALFPASRFRVYERTKSGVPKLFDKTNKHHFLHSLALLAVPHCRKPLWAGLLLTSGTTLFCTSFYYQALSGDPSVQPLAPVGGSLLLLGWLALAL	526710	527838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526982_527102_527206_527421_527503_527608
820655	contig_6589_pilon	+	936	5	Intergenic	novelGene_25769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	47	junction_4	2024.6103791841	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	288	650	669670	672560	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTRAGGKCSLLEGPP	668287	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669650_669748_670000_670104_671046_671188_672519
820656	contig_10312_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_159034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTAGGAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592596	590622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_590600_592600
820657	contig_10042_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_79173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGACTCAGAGCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775878	776581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_775900_776600
820659	contig_5935_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_102684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTAGAAGAACCCTCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777010	775992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_776000_777000
820662	contig_8006_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_173933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCGTGGGGATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423383	422377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_422400_423400
820663	contig_9373_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_162716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAAAGATAGTACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176293	175519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_175500_176300
820664	contig_15952_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_154050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCACATAGTGGGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110318	108916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_108900_110300
820665	contig_7057_pilon	+	755	9	Intergenic	novelGene_123344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	732.704578940244	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	29	499	938907	943233	TRUE	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	938726	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943305_943539
820666	contig_17066_pilon	+	2099	5	Intergenic	novelGene_130951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	136.252293558677	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	104	958	165828	242780	FALSE	30	CAGCAAAGGATGCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPPQQQRPPPPPPPQSPEEGTTYIAPATEPSVNTALVPQLSTISRALTPSPAMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKMHQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTVMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRMNYIKELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDVSRAPGCLLQEGSAATHY	165724	243921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_165841_200598_200950_202742_202888_235006_235138_242565
820668	contig_7272_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_25294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAACAGTAAACAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343264	344024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_343300_344000
820674	contig_1154_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_87215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCCCACAGAGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571823	1570452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1570500_1571800
820677	SIRV2	-	304	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4146	346	2967	-346	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTGATAGAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1765	1381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
820681	contig_8330_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_71959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	60	581	1527276	1527797	NA	5	TGCCTGTTTCTGTGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHPSQPWARGTETSHGPQGPDGTFLEGTLRSCLIFEFTSNNSPYSRAGWDPRVSGASTPAPSSLTPSCCTMGNLREKDRGQGLPAHPPGLLGPPTQGQPHCDASPCSWVRLCYPLTYVYILRGLLPPLPPDCCGQQWGGGELAPQEVVACSWLLLLESFFFLFFLINLLQLK	1527216	1527805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1527200_1527800
820682	contig_6277_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_80394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAAGAGCGGGTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153868	152759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_152800_153900
820683	contig_17603_pilon	-	1475	2	Intergenic	novelGene_152776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTCTTGGTCCTCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41966	29527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_30807_41770
820684	contig_7594_pilon	+	678	2	Intergenic	novelGene_55452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	706	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGATCTTGAAGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561727	566723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_561752_566069
820685	contig_12113_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_134747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTCAGAAGCAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231908	231098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_231100_231900
820686	SIRV6	-	345	3	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	12	-47	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCATACCGATGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2535	1591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_1983_2471
820688	scaffold_12124_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_22201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGGGAATACGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350373	1351630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1350400_1351600
820689	contig_8443_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_150617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802693	803385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_802700_803400
820692	SIRV7	+	469	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTACCAGCTACCTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
820694	contig_20524_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_176470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAACCAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2512	2962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20524_pilon_+_2500_3000
820695	contig_9297_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_69832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTTTTCCTGGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582455	584053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_582500_584100
820696	contig_12265_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_149443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACCAAAAAAACACCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41325	39757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_-_39800_41300
820697	contig_6028_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_156572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATTCTAGACTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304549	305083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_304500_305100
820701	contig_11978_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_63051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCAGGCTCTGGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1806238	1804702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1804700_1806200
820702	SIRV6	+	429	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-88	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	78	237	74	310	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2384	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2743_2815_3106_3165_10724
820704	contig_3380_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_60101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGGTTAGGTGCTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401364	401881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_401400_401900
820705	contig_10864_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_107114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAGAATATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115361	1115839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1115400_1115800
820706	SIRV6	+	303	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	508	62	342	-62	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATCTACGCAATAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820707	contig_14925_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_55229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTATATTTAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42362	41935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_41900_42400
820708	contig_11413_pilon	+	645	4	Intergenic	novelGene_103126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2074	junction_3	1353.71152351189	123	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	19	519	87465	90735	FALSE	5	CTCAGTGTCCTCCCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87446	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624
820709	contig_10958_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_5323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTAGTCCTTTGCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50539	49423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_49400_50500
820710	contig_3679_pilon	+	955	7	Intergenic	novelGene_112110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	131.786443410036	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	948	8	955	502711	622704	FALSE	40	AGCGATATTGTACAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLMGHSEWDHKRGPRGSQSSGTSIIVDIAVMGEAHGLITDLLADPSLPPNVCTSLRAVSNLLSTQLTFQAIHKPRVNPVLSFSENYTCSDSEESSEKDKLAIPKRLRRSLPPGLLRRVSSTWTTTTSATGLPTLEPAPVRRDRSASIKLHEAPLLSAVSPDSWNNPVMMTLTKSRSFSSSYAVSAANHVKAKKQNRTDALAKISPLSSPCSSPIQGTPASSPISKISTVQFPESAETTGKPGLSSHRALTCYTQSAPDLSPQILTTPVICSSCGRPYSHGKPADGPLERSSATFRTPSRTDDTAQVTSDYETNNNSDS	502703	622704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_502759_585170_585429_588165_588321_593566_593692_606152_606376_609942_610029_622651
820711	contig_2125_pilon	+	901	4	Intergenic	novelGene_147720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	7.78888096369861	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGTATTTGTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420072	449193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_420158_423594_423665_444052_444223_448617
820712	contig_9239_pilon	-	1074	4	Intergenic	novelGene_137170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAGAGGTTCAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110613	107247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_107347_107581_107680_109269_109454_109920
820713	contig_18916_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_136879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50810	49710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_49700_50800
820715	contig_16622_pilon	+	2186	9	Intergenic	novelGene_48413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.79843682124227	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	279	1697	87341	101149	FALSE	30	TTTCATTAAAGTTCCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHPRRVRLKPWLVAQVDSGLYPGLVWLHRDAKRFQIPWKHATRHSPQQEEENTIFKAWAVETGKYQEGVDDPDPAKWKAQLRCALNKSREFTLMYDGTKEVPMNPVKIYQVCDIPQPQGSIINPGSTGSAPWDEKDNDGDEDDEEDELDQSQHHVPIQDTFPFLNINGSPMAPASVGNCSVGNCSVGNCSPEAVWPKTEPLEMEVPQTPIQPLYSSPELWISSLPMTDLDIKFQYRGKEYGQTMTVSNPQGCRLFYGDLGPMPDQEELFGPISLEQVKFPGPEHITNEKQKLFTSKLLDVMDRGLILEVSGHAIYAIRLCQCKVYWSGPCAPSLVAPNLIERQKKVKLFCLETFLSDLIAHQKGQIEKQPPFEIYLCFGEEWPDGKPLERKLILVQVIPVVARMIYEMFSGDFTRSFDSGSVRLQISTPDIKDNIVAQLKQLYRILQTQESWQPMQPTPSMQLPPALPAQ	82228	101638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_82414_86522_86613_87337_87515_93683_93889_94898_95028_97042_97217_98250_98644_99471_99591_100924
820718	contig_11292_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_109431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	387	692	259894	260199	NA	25	CATTGTTATGTGACCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTERFRSEFFTSFITVGNLNCISSVRKPELCPVLACSSQNCLFILTLPPPFFITMQGMGSMKAIPNLFGIFGKKSNSLVKEFRRKKSAKKTRVVVVEVPK	259507	260977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_259500_261000
820719	contig_12837_pilon	-	2436	2	Intergenic	novelGene_57291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128132	122408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_123082_126369
820721	contig_3942_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_128828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAATAAACCGTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193254	1194895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1193300_1194900
820722	contig_15732_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_88855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCAATAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38893	37465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_37500_38900
820723	contig_1996_pilon	+	1244	4	Intergenic	novelGene_131914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	1.24721912892465	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	50	901	334616	335709	FALSE	30	AAATCTTTAGGAACTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VESTAVVSCLEEAGPRMRRLWLTYSSQMTAILGALLGSCCPQLQVLEVSTGISRNTIPLQLPVEALQKGCPQLQVLRLLNLMWLPKPLGRGVAPGPGFPVLEELCLASSTCNFVSNEVLGRLLHSSPRLRLLDLRGCARITPAGLHHLPCQELEHLYLGLYDTSDRLSLAKEGSPLLTQKWYCTLRELDLSGQGFSEKDLEQALAAFSGVPRGSQLALCSLNLRGTRVMASTVRSAPTPSPWSQYGLLPCLLGAGMEHPACLTTSGGSERVAHTGQAPAWGWSSGGACRLRCARVLGCG	334566	336052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_334676_334759_334874_334943_335176_335263
820724	contig_10235_pilon	+	716	2	Intergenic	novelGene_46503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAACCCGGCAAAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279604	280939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_280097_280715
820725	contig_5799_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_50240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156390	153403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_154327_156269
820726	contig_16883_pilon	-	651	3	Intergenic	novelGene_161723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	170.5	347	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	64	441	174920	164281	FALSE	30	AGGTGAGGAATACTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPERSGAGTGSGARAGPPAMDHKPLLQERPPAYNLEAGPGDYACGPHGYGAIPAAPPPPPYPYLVAGLPTHHPRVYSIHSRDVTRYPANSIVVVGGCPVCRVGVLEDSFTFLGIFLAIILFPFGFICCFALRKRRCPNCGASFS	174983	164070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_164414_173688_173792_174778
820727	contig_16883_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_161721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTTTCTGGAGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164119	163805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_163800_164100
820729	contig_14679_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_174188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATCCAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165191	166134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_165200_166100
820732	contig_9771_pilon	+	1382	6	Intergenic	novelGene_156912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGAGAAGCTCCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332004	350094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_332831_334728_334800_341986_342198_346911_347064_347656_347752_350067
820733	contig_14577_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_164626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGAGCCGTATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41579	43716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_41600_43700
820735	contig_6192_pilon	-	1085	3	Intergenic	novelGene_170340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAATGAAAAGAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882991	799020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_799084_876091_876295_882172
820736	contig_16625_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_171126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAACAGTTTTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106925	108763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_106900_108800
820738	contig_9468_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_59535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622847	624868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_622800_624900
820739	contig_5954_pilon	-	1209	7	Intergenic	novelGene_28509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	223	558	444202	443867	TRUE	15	ACGGCTTCTCCTTCGCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRIKIKFKGNPSRKERNKWNLRPQWSGRQERMLGWLAGKPEVAALPIAGRGAGINVDPGTLENSPLLHFTRPCTRVAKIKNPKLIKTSMGWHWHPEKLRTKRAPSLLGGH	444424	430529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_430605_432407_432533_435586_435666_438684_438839_439035_439126_439443_439496_443790
820740	SIRV6	-	366	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-96	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1721_1834
820741	contig_13702_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_102600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGTCCTGTGCCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83587	81674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_81700_83600
820742	contig_11989_pilon	-	1357	11	Intergenic	novelGene_68453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	460.542462754522	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCAGGCACTCTGCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191139	70812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80442_90222_90278_91985_92052_92290_92387_135427_135505_164164_164315_166938_167018_191091
820743	contig_1996_pilon	-	1824	9	Intergenic	novelGene_131956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	35.4682957019364	202	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	902	1744	525328	523904	FALSE	5	TCAGGTGCTCTTTGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRKLNHLLERLHQSFFLYLLPALSRFVSIGLYMPAAGFLLLVLGLKALELWMQLHEAGAGPEEAGGTPGRVPPLPPAQDVGLASLVAPLLISQAVGLALYFLPVLGQHVAARHFPVGEAEAVVLTLLAIYAAGLALPHNTHRVVSTQAPDRGWMALKLVALIYLALQLGCIALINFSLGFLLAATMVPAAALTEPRGPRSLYAALLVLTSPAATLLGSLFLWRELQEAPLSLAEGWQLFLAALSQGVLEHYTYGALLFPILALGLYPCWLLFWNVLFWK	526960	523823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_524148_524357_524529_524601_524793_524924_525021_525187_525342_525461_525926_526031_526134_526208_526357_526786
820744	contig_13977_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_80958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195559	197248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_+_195600_197200
820745	contig_8161_pilon	-	555	5	Intergenic	novelGene_156756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCAGCCTCCTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306984	267022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_267161_286412_286585_288559_288654_297514_297575_306893
820746	contig_3700_pilon	-	381	3	Intergenic	novelGene_138062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.5	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTCCAGGTGAGAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266480	102443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_102526_264736_264850_266294
820747	contig_1141_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_136916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATTTGAAAATTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368816	370410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_+_368800_370400
820748	contig_7022_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_142154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCCATTAAGTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222222	222478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_222200_222500
820752	contig_6576_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_42378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTTTTATTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267697	1266587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1266600_1267700
820753	SIRV6	-	196	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGAACAACTTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11276	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11037_11106_11201
820755	contig_10734_pilon	+	1105	4	Intergenic	novelGene_51067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.2448917697763	221	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	111	374	518540	523268	FALSE	25	CAGTTTGTATGGAAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSGRLGLFKLSPAGRSRPGARSRWETGGVHSPSTSMATSSQYRQLLSDYGPPSLGYTQGTGNSQVPQSKYAELLAIIEELGKEIRPTYAGSKSAMERLKRGIIHARGLVRECLAETERNARS	452629	523999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_452711_518510_518609_520571_520699_523200
820757	contig_10642_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_78701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCGCTCGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604019	602451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_602500_604000
820758	contig_19744_pilon	+	2056	12	Intergenic	novelGene_120390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_10	127.2015385322	5	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2010	46	2055	177910	197909	FALSE	45	AAATTGAATTAAAGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAKKEKKKKEKAEVRPRGNLFGEMAQLAVGGPEKDTVCELCGESHPYPVTYHMRQAHPGCGRYAGGQGYNSIGHFCGGWAGNCGDGGIGGSTWYLVCDRCREKYLREKQAAAREKVKQSRRKPMQVKTPRALPTMEAHQVIKANALFLLSLSSAAEPSILCYHPTKPFPSQLPSVKEGISEDLPVKMPCLYLQTLARHHHENLVGYQDDNLFQDEMRYLRSTSVPAPYISVTPDASPNVFEEPESNMKSMPPSLETSPITDTDLAKRTVFQRSYSVVASEYDKQHSILPARVKAIPRRRVNSGDTEVGSSLLRHPSPELSRLISAHSSLSKGERNFQWPVLAFVIQHHDLEGLEIAMKQALRKSACRVFAMEAFNWLLCNVIQTTSLHDILWHFVASLTPAPVEPEEEEDEENKTNKENTEQEKDTRVCEHPLSDIVIAGEAAHPLPHTFHRLLQTISDLMMSLPGGSSLQQMALRCWSLKFKQSDHQFLHQSNVFHHINNILSKSDDGDSEESFSISIQSGFEAMSQELCIVMCLKDLTSIVDIKTSSRPAMIGSLTDGSTETFWESGDEDKNKTKNITINCVKGINARYVSVHVDNSRDLGNKVTSMTFLTGKAVEDLCRIKQVDLDSRHIGWVTSELPGGDNHII	177864	197910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_178151_179325_179496_180253_180499_183378_183547_186060_186219_187302_187503_188368_188519_192998_193160_194331_194489_194667_194893_196382_196449_197840
820759	contig_8683_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_150242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGACTAAATCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443022	442605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_442600_443000
820761	contig_11417_pilon	+	1349	4	Intergenic	novelGene_103288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2346	junction_1	238.888165373581	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	98	520	479699	517548	FALSE	45	AGCCATTAAAAATGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEQPAHSAGFSSAAAALPRSHRFLSRDPGLVAMSATDEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGEDLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWLNAMGEIGLPKVIDVIFIVLA	479601	518377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437
820762	contig_6424_pilon	+	1327	8	Intergenic	novelGene_109265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_7	54.2702985630487	275	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	414	1049	77681	82431	FALSE	15	TGAGCTGGGCTGTCATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLTRQDLNFGQVVADVLCEFLEVAVHLILYVREVYPVGIFQKRKKYNVPVQMSCHPELNQYIQDTLHCVKPLLEKNDVEKVVVVILDKEHRPVEKFVFEITQPPLLSISSDSLLSHVEQLLRAFILKISVCDAVLDHNPPGCTFTVLVHTREAATRNMEKIQVIKDFPWILADEQDVHMHDPRLIPLKTMTSDILKMQLYVEERAHKSS	77267	82709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_77721_77810_77930_79342_79415_79909_80011_81041_81137_81469_81544_82045_82139_82389
820763	SIRV6	+	213	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	51	519	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
820768	contig_709_pilon	+	1067	10	Intergenic	novelGene_57542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	50.3516032576648	73	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	106	903	1506140	1526933	TRUE	20	CATGTGCACGACTGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEAWKKSLKEKWNAKPAYVVGSATASLVRKIGLETEGEKCGNAEKLAEYICSRESPSLPLLFPCGTLKGEILPKMLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1506034	1527238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511942_1512018_1515791_1515867_1520268_1520350_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795_1527034_1527174
820769	contig_10159_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_30831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCATCCCAGCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539847	537778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_537800_539800
820770	contig_3382_pilon	-	1643	4	Intergenic	novelGene_124068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	471.212855889518	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	112	441	344734	296742	FALSE	10	TATGTTGTTGTTGTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGDCCTSHDVSKGTESKLHHPCFYGTFWLYFF	344845	295539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_296836_306326_306380_309848_309943_344645
820771	contig_14599_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_167902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTTTCATTGATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146994	145685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_-_145700_147000
820780	SIRV5	+	375	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	6	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
820782	contig_10331_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_54206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTATGTAATCTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672138	671475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_671500_672100
820784	contig_19352_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_122418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTCTGTTGTACACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348926	348124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_348100_348900
820785	contig_15361_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_167863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTACCAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429447	429981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_429400_430000
820786	contig_11285_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_5751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATTGGACCAGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230690	1229301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1229300_1230700
820788	contig_9955_pilon	+	666	4	Intergenic	novelGene_21334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	471.130083475419	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCTTAAAAACTATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71956	85022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_72022_75469_75563_78450_78512_84575
820789	contig_17066_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_130963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTTCTATAGAGGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374556	375672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_374600_375700
820790	contig_6602_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_166440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343564	344993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_343600_345000
820791	contig_9481_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_149701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATCAGTAAACTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764363	764847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_764400_764800
820792	contig_10792_pilon	+	1577	12	Intergenic	novelGene_161005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	166	636	99489	114792	TRUE	30	ACATGTAGGACACTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGTLLSLPCIGLVFPIVLMGWCIQEHQSKDIQVPHPIDACEKGTVHLNCDAAPFPMAFSHLTNDEEDDSHSSTGQGDEHKELKPENQPLIVQPPDPIHGRQAGLLPADVPKHLKYHEAQKQEVEAEADPSHNDEGHLMPTLFQHLWSRYCRKDS	97419	173123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_+_97545_99448_99521_102219_102372_111251_111345_112640_112784_114741_114804_115152_115250_116732_116900_120170_120309_121595_121759_128375_128500_172882
820794	contig_9995_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_47707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGCTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325291	325029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_325000_325300
820798	contig_10023_pilon	+	3272	1	Intergenic	novelGene_123471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124819	128091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_124800_128100
820799	contig_12142_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_147822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAACACTAGTACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132776	132303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_132300_132800
820800	contig_12142_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_147821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCCAGCCGGACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132257	130499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_130500_132300
820801	contig_2770_pilon	+	1184	6	Intergenic	novelGene_107497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	149.301574003759	285	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	751	1182	845211	855046	FALSE	5	TGAGGTGCCTCTCGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIDGVAVSSKTEPPSSEPASFIPVKDSDDVAPSVTTWLNPLGIYDLSITQWSQGQGPGEQESKPPDSQPDRECRSQGQGEEFNRKIRENPQDTQLWMAFVTFQVEFFELFWDTGVPQAMEKGAQGWRAWMHQQEWGGWIVVNP	819016	855048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_819161_830373_830483_831499_831711_834922_835073_845074_845523_854926
820804	contig_6589_pilon	+	374	4	Intergenic	novelGene_26155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	4041.69966996834	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	21	374	1885124	1886783	FALSE	25	TGAGCACAGGGCACCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAAGKMADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFR	1885103	1886783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652
820805	contig_7457_pilon	+	1740	12	Intergenic	novelGene_31535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	386.401174647018	10	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	256	1059	751623	758691	TRUE	40	AAAGTAATAGGAAGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVRCIRHILYNEQRLVREANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLITQDTESELKKLQQTQEYFIIQYQESLRIQAQFAQLAQLNPQERLSRETALQQKQVSLETWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLLRKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLCQQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGEAERAHEPPLR	749773	762973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_749851_750048_750206_751601_751692_752634_752810_757014_757146_757403_757556_757976_758133_758570_758753_759126_759215_759289_759413_760428_760522_762657
820806	contig_6589_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_26192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941864	1942854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1941900_1942900
820807	contig_12756_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_153222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	173592	173203	NA	20	AATATGTATTTGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHRHFRSWSCHCLRHFVSVEKEASVAAGSGRRSPVRRRRFIPEVPPVSSPNPPPRSACGEAGAARDPGKGRGVGREAGYRERLQLQLRRTSEGGPRRNVRADAGGGRCCGGPGGRLSGLSIIARRPDLQ	173593	171863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_171900_173600
820810	contig_7271_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_159950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAATGTTAAAACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463160	464322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_463200_464300
820811	contig_18869_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_56393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCACATAAAATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73566	73381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
820812	contig_13428_pilon	+	2097	2	Intergenic	novelGene_143458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1079	1699	151943	152563	TRUE	10	CTTTTGTGGTCAGTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFCPVNHQLPALTGSTAQLFWQLLGKLHVKLGQQQSRHEPEACRLVAHPGEPLQVCKHLQGHLQEQRGSGAGGEMTQPEMRGEDLGLGKCTGEAPWQCASGKTMAIKTNISPLWPSSMRRVLGDFPGVSSVSPGTKSRILIRRSSTAYSAQGSLQSAGVRRRVRPSFASCVQGVHSPVEETERHSPYIVLNAMMEVSNGTLGAQ	150864	157612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_152685_157335
820813	contig_10734_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_51285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAAATTAGCTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345255	1343321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1343300_1345300
820814	contig_14467_pilon	-	1977	12	Intergenic	novelGene_138217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_5	52.0001589317342	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	79	1635	71109	57859	FALSE	30	TAAGTGACTGTGTCAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAVSCIRATGSYIAGTNGNSNGLVPMLRVYNNTARYVDQGGNKRPGAFAIYLEPWHLDIFEFLDLKKNTGKEEQRARDLFFALWIPDLFMKRVETNQDWSLMCPNECPGLDEVWGEEFEKLYESYEKQGRVRKVVKAQQLWYAIIESQTETGTPYMLYKDSCNRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIVEYTSKDEVAVCNLASLALNMYVTSEHTYDFKKLAEVTKVIVRNLNKIIDINYYPVPEAFLSNKCHRPIGIGVQGLADAFILMRYPFESPDAQLLNKQIFETIYYGALEASCELAKEHGPYETYEGSPVSKGILQYDMWNVTPTDLWDWKLLKEKIAKYGVRNSLLIAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYTRRVLSGEFQIVNPHLLKDLTERGLWNEEMKNQIIACNGSIQSIPEIPDDLKQLYKTVWEISQKTILKMAAERGAFIDQSQSLNIHIAEPNYGKLTSMHFYGWKQGLKTGMYYLRTRPAANPIQFTLNKEKLKDKERVSKEEEEKERNTAAMVCSLENRDECLMCGS	72992	57516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_58048_58732_58922_60040_60137_61333_61470_63038_63116_64970_65193_65403_65554_68553_68756_69423_69504_69857_70020_71055_71140_72944
820816	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820817	contig_5779_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_106412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGATACCAGAACAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42230	40997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_41000_42200
820818	contig_15067_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_154345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232075	230314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_230300_232100
820820	contig_8270_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_143800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAAACACTCATTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379876	381804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_+_379900_381800
820821	contig_1694_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_144965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566155	1566682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1566200_1566700
820824	contig_9609_pilon	-	1382	6	Intergenic	novelGene_23137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	139.522614654399	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	574	1266	523112	520853	FALSE	25	TCATTTTAACCTACCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKLIGCPVCIEHKKYSRNALLFNLGFVCDAQAKTCALEPIVKKLAGYLTTLELESSFVSTEESKQKLVPIMTILLEELNASGRCTLPIDESNTIHLKVIEQRPDPPVAQEYDVPVFTKDKEDFFNSQWDLTTQQVLSPGTTVRDLIGRHPQQLQHVDERKLIQFGLMKNLIRRLQKYPVRVSREERSHPARLYTGCHSYDEICCKTGMSYHELDERLENDPNIIICWK	523685	520736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_520921_521005_521149_521424_521497_522169_522309_522696_522806_522950
820827	contig_9132_pilon	+	835	7	Intergenic	novelGene_121367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.7032930884901	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	11	718	93567	95729	FALSE	15	CTCTTGGCCACACACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWQGLATEFLQVPAVTRAYTAACVLTTAAVQLDLLSPFQLYFNPHLVFRKFQVWRLVTSFLFFGPLGFSFFFNMLFVFRYCRMLEEGSFRGRTADFVFMLLFGGVLMTLLGLLGSLFFLGQALMAMLVYVWSRRSPRIRVNFFGLLTFQAPFLPWVLMGFSMLLGNSVLADLLGTAVGHIYYYLEDVFPNQPGGKRLLLTPSFLKLLMDSPEEDPNYLPLPEEQPGPHLPPPQQ	93556	95846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_93660_93828_93895_93971_94046_94138_94233_94822_95019_95443_95535_95635
820830	contig_7945_pilon	+	1827	5	Intergenic	novelGene_161591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	19.4743420941504	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	177	821	433878	500623	FALSE	20	TTGTGGATTCCAATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASSSNDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQPPTRVTIKMECNPNQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHIPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYSLPDVDILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGNAALPSRPQYRCKGLSTGCML	367106	501629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_367205_433799_434018_465816_465969_499460_499665_500474
820834	contig_3584_pilon	+	796	3	Intergenic	novelGene_108109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	67.5	145	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTTGTCTCATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178796	180256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_178867_179331_179430_179628
820835	contig_2069_pilon	-	1356	7	Intergenic	novelGene_23363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	42.1215173304835	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	4	648	979042	971562	FALSE	10	CTAACCTGTGTCCCGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMINGQMVKLKYCFTCKMFRPPRTSHCSVCDNCVERFDHHCPWVGNCVGRRNYRFFYAFILSLSFLTTFIFACVVTHLTLRSQGSNFLSTLKETPASVLELVICFFSIWSILGLSGFHTYLVASNLTTNEDIKGSWSSKRGGEASVNPYSHKSVITNCCAVLCGPLPPSLIDRRGFVQSDTVLPSPIRSDEPACGAKPDASMEDTCQDFAISCTA	979045	970853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_971604_973947_974048_974876_974990_976427_976531_977102_977152_977252_977391_978942
820836	contig_2069_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_23362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTGTACCTTTTTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970904	970228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_970200_970900
820837	contig_6589_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_25841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGGGAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918243	917037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_917000_918200
820838	contig_6885_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_83693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCCAGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273138	271303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_271300_273100
820839	contig_9345_pilon	-	1453	12	Intergenic	novelGene_24424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	102.978213213739	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	583	1317	269853	266016	FALSE	0	GCTGCGTTGTCCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAAAGDLAQKHFSSVSGTYAEDTVPTVEPCRFTGSEIRHRDDALPLAHVAIAVEGPGWANPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGKHLSSPLASVAAANKLCQSFQTFNICYAETGLLGAHFVCDRMTIDDMMFFLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLSEWESRISEVDARVVRDVCSKYFYDQCPAVAGFGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF	277207	265879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_266081_266519_266596_266946_267036_267348_267435_267540_267702_267828_267973_268204_268297_269831_269908_270476_270676_270897_271028_272003_272091_277095
820840	contig_15039_pilon	+	859	3	Intergenic	novelGene_110185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	170	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	92	640	360991	414815	FALSE	35	ATATGATTTTCAACTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVVLEEPFVAVVGGAEVISHSQYQKSKRVSIFLSMQDEIETEEIIKDIFQQGKTCFIPQYQFQSNHMEMVKLASPEEISLLPKTSWNIHQPAEGEVREEALSTGGLDLIFMPGLGFDKHGNRLGRGKGYYDTYLKRCLQQQEVKPYTMALAFKEQICLQVPVDESDMKVDEVLYEDSSTS	360899	415034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_361045_367985_368248_414582
820843	contig_14450_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_49042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGAGTCCTACCCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297609	1296436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1296400_1297600
820845	contig_7839_pilon	+	1448	9	Intergenic	novelGene_45680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7	113	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	688	1212	103166	104122	FALSE	30	AATACTTCTGTCACACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVPLGNQADVFPEGTIRPVHDDILIAQLRPGQEIDLLMHCVKGTGKDHAKFSPVATASYRLLPDITLLEPVEGEAAEELRQCFSPGVIEVQEVQGKKVARVANPRLDTFSREVFRNEKLKKIVQLARVRDHYIFSVESTGVLPPDVLVSEAIKVLMGKCRRFLDELDAVQMD	100456	104358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_100534_100655_100728_102183_102292_102512_102646_102771_103055_103151_103305_103491_103642_103738_103856_104003
820847	contig_9706_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_20860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2430	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
820851	contig_9670_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_169938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCCTACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95766	95298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_-_95300_95800
820852	contig_16714_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_161578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAATGAGTAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935028	933788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_933800_935000
820854	contig_10494_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_102129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294604	295813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_294600_295800
820855	contig_17270_pilon	-	1559	2	Intergenic	novelGene_67221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39240	37594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_-_38855_38941
820856	contig_9363_pilon	-	1137	8	Intergenic	novelGene_6692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	182.69758663777	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	358	1092	1276884	1272765	FALSE	5	TGTGCCCCCAGCCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGNLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRVYIS	1277612	1272719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272942_1275152_1275255_1275337_1275479_1276490_1276617_1276695_1276909_1277098_1277296_1277385_1277504_1277594
820859	contig_10923_pilon	-	1734	5	Intergenic	novelGene_66227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.5	25	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	164	1369	49473	44094	FALSE	30	TACACCACATCGTGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVEGYNSYFSFSRNRSGYSGVATFCKDSATPVAAEEGLSGLLATQNGDVGCYGSMDEFTQEELRALDSEGRALLTQHKIRTWGGQERTLTLINVYCPHADPGKPERLAFKMHFYRLLQMRAEALLAAGSHVIILGDLNTAHRPIDHWDAVNMECFEEDPGRKWMDGLLSVLGCQAGAHVGPFIDSYRCFQPKKEGAFTCWSAVSGARHLNYGSRLDYVLGDRALVIDTFQDSFLLPEVMGSDHCPVGAVLSVSSVPTKQCPPLCTRFLPEFAGTQLKILHFLVRLEQDAVFGQSALQLSNQTRVQTLQNKACARSTRPRPSQPGSSRGQKNLMSYFQPSSSRPQASPDLELPSLMGSLVTPVTTEEEAAAKVVEVQAKASEAKYEKEVRTLCWKSVLGGPSPMPLCWGHGEPCVIRTVKKPGPNLGRCFYMCARPRGPPTDPSSRCNFFLWRRPS	50297	43728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_45006_47834_47905_48689_48837_49396_49578_50238
820860	contig_18869_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_56371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTCTACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73752	73370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
820862	contig_21013_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_38518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46056	43897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_43900_46100
820864	contig_9647_pilon	-	697	2	Intergenic	novelGene_127386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAACAATTTGTGCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88464	86312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_-_86848_88302
820865	contig_12050_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_62704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAGAAAACACACCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619143	619516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_619100_619500
820867	contig_18251_pilon	+	1189	5	Intergenic	novelGene_50164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	1217.21431453134	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	161	754	48213	53991	TRUE	45	ATCAAGAATAGTGTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSSLCVSLCQLSSYKDTCHIGLRPTFLQDDLVLTNYICKGYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	48052	55317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48337_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
820869	contig_2646_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_69606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	88	426	1635455	1635793	NA	10	TTCTTTTGTGTGATGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAPPHHPAARTPLGRWTRSAPACPQPWCGRPRAGVSSGRGGKDGSRDGEAASQGETPSPLLQESPVEPRGARGRRGPRSAPRRREARAELVQLQLVKDKKSRVARSETVK	1635367	1636782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1635400_1636800
820870	contig_9389_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_83965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	497	991	248320	248814	NA	60	AAAAATGAGAAAACCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGYPLCAHWSPTVCSKDILCELTGDPLCASRRPTGCLRETHCVKDILCALTGDPLCARRRPTVCSETRYALEGDPLRASRRPAAPLLETYCAPGPSSSIRGTQDKGLQHRLGARGGGGGAPVWPGHVVPVGAAVRAGGSRDQHEDERRALSSVQGAGDRVAP	247823	249515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_247800_249500
820871	contig_9049_pilon	+	788	6	Intergenic	novelGene_83124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1932.00227743137	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	269	571	108630	112652	FALSE	35	AGCTGTGGATTTTATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88299	112869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90223_104295_104393_108616_108724_111558_111685_112569
820872	contig_8006_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_173938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAATAAAAGCCATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522654	523103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_522700_523100
820873	contig_8006_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_173939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAATCAGAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524222	524747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_524200_524700
820876	contig_20786_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_159699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTTGTGTGCATGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32804	33481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20786_pilon_+_32800_33500
820877	contig_9724_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_172585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28602	26549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_26500_28600
820878	contig_8636_pilon	-	972	7	Intergenic	novelGene_141937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_3	35.8096821171779	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	72	647	468713	458644	FALSE	25	CGGCCAGTGTCATGATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPKARRLLGGCVWEPEPPAQARMFVLVEMVDTVRIPPWQFERKLNDSIAEELNKKLANKVVYNVGLCICLFDITKLEDAYVFPGDGASHTKVHFRYVVFHPFLDEILIGKIKGCSPEGVHESLQQPAKFDEAEQVWVWEYETEEGAHDLYMDTSEEIRFRVVDESFVDTSPTGPSSAEATSSSEELPRKEAPYTLVGSISEPGLGLLSWWTSN	469063	458318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_458698_459739_459942_461427_461453_461996_462084_465963_466061_468602_468734_469012
820879	contig_1380_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_138868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTATGTTTACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30705	30333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_30300_30700
820880	contig_3132_pilon	-	2042	10	Intergenic	novelGene_127452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	25.058942860463	1	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	159	866	369354	361121	FALSE	35	TGAACTGTCTGCAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNIIGRMSFQVPGGMIITGFMLQFYRQMALSYFTATTTAVATAVGMNLLTKRAPPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIQGICVKDKNHSEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMAAPGMILLPVLMEQLEKLHFMKKVKVLHAPLQVMLSGCSLIFMVPVACGLFPQTCELPVSYLEPKLQDTVRAKYGELVPYVYFNKGL	369685	359944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_361221_362047_362096_363923_363974_364326_364377_365018_365086_365467_365529_366805_366892_367360_367437_369184_369356_369528
820884	contig_1146_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_84798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGGCGCACTGTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220083	219547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_219500_220100
820886	contig_9098_pilon	+	1461	8	Intergenic	novelGene_75807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	49.1287355125412	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	208	1311	302799	331644	FALSE	30	TATTGGAACACAGCCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLEPLMQGYWEWLVGRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTVLLVYYCPTATEQAPLWAYIACACGLFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAVQLGTNPDWMFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGIIDVTEVQIFIIIMHLLAVIGGPPFWQSMIPVLNIEVKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIGSVITLAAVIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGPALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVSIVLCLTS	295401	331794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_295479_302668_303081_309869_310018_311367_311510_324228_324314_330307_330440_330825_330985_331488
820888	contig_10475_pilon	-	1541	3	Intergenic	novelGene_148722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	198	1091	26008	24889	FALSE	25	AGTACTCTGGGATGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHTPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNKKHKLKKETKNL	32171	24438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_24929_25154_26084_32049
820891	contig_14783_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_176472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTACTTTCAGTTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49191	48960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14783_pilon_-_49000_49200
820893	contig_11815_pilon	+	1777	3	Intergenic	novelGene_50899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	3	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1380	1682	142473	152169	FALSE	35	TTTAATAATGAACCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALMDCHWQPLDTVSSEIPAMM	141093	152264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_142605_142770_142805_152032
820894	contig_8050_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_114834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCATCATGTGTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328207	328775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_328200_328800
820897	contig_13721_pilon	-	592	5	Intergenic	novelGene_169483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	85.400161006874	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	4	591	29526	24978	FALSE	35	TCAATTACTCTGAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YMREWRAKVQGTVHCFPISARLGEWQAVLQNMVSSYLVHHGYCATATAFARMTETPIQEEQASIKNRQKVQKLVLEGRVGEAIETTQRFYPGLLEHNPNLLFMLKCRQFVEMVNGTDSEVRSLSSRSPKSQDSYPDSPSLSPRHGPSSSHMHNTGADSPSCSNGIASTKSKQNHSKYPAPSSSSSSSSSSSSSSPSS	29529	24976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_-_25106_25295_25445_25553_25663_27118_27232_29437
820899	contig_5860_pilon	+	1455	3	Intergenic	novelGene_147959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153676	156868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_+_153905_154400_154653_155893
820900	contig_5039_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_64876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGTCCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412262	410068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_410100_412300
820902	contig_9633_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_139618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	299	826	654083	654610	NA	10	TGGTCCTGGGGGTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFSRIGPRTTTPGGYFTKDCDKRLVQRLYTAAMLTCLSKIPANTMPVIFLPLGSAHRKDSRANSLSHFAKGKHWSPERYMDSYKSYNTSEARSGSKVQRCCLRSCCLRRQKFLGDALPCLQLPSFHPWRRKCPTPCLGPGWAAPPATPSHLQIYKHTAALPTLQERWVLGLSW	653784	654901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_653800_654900
820903	contig_8710_pilon	+	2069	2	Intergenic	novelGene_73521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	0	16	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAGAAGAAAGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385868	399911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_386349_398322
820904	contig_4802_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_172220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTTTTACTACAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577409	575606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_-_575600_577400
820907	contig_15613_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_147219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222689	224232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_222700_224200
820908	contig_4689_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_165393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	579	107	685	627617	628195	NA	40	GTAAGAAAAACATGGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKSCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPEKRKKLWDLLEKPNSSVAAK	627510	628195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_627500_628200
820909	contig_16870_pilon	+	776	3	Intergenic	novelGene_155497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.5	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	65	376	104553	107585	FALSE	20	CTCTCTACCACCACTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPNGDLGMPVEAGAEGEDDGFGEAGDREGQLKLPLPLQGCPPGDGNWGQVWSLEGTEEPSSGPWKVQHWKTGRSASVYRIRCHQLHAGPNQLLPGPPRGKE	104488	107985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104740_104808_104864_107515
820910	contig_15570_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_137842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCCATTCCACGCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492861	491000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_491000_492900
820911	contig_15350_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_164258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCATTTAAGGTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238179	236567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_236600_238200
820912	contig_6589_pilon	+	377	2	Intergenic	novelGene_26172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	17655	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	1886654	1887927	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGDQDEDAEDHCHPQRLPPLHPKIQSLREAPQEHVRAPVSLLQGRPDRRHRHSGRVPALEQDCALQRAQGDQGRRHQEAVSEVLIPDAYRRRPPAPRSRYRSFEPKYCHYRCHHPK	1886651	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886783_1887705
820914	SIRV6	-	379	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-96	403	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCCATCGCTGCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1916	1141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1183_1466_1736_1847
820915	contig_4364_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_4568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAACCCCATAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717739	1717531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1717500_1717700
820917	contig_9177_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_32730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678184	678814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_678200_678800
820918	SIRV4	-	212	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1306	3	1306	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3852	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
820921	contig_5832_pilon	+	1857	2	Intergenic	novelGene_134132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGTGTATCCATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203323	206173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_204176_205168
820924	contig_11217_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_176112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTTGCTTATTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79200	78548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11217_pilon_-_78500_79200
820925	contig_11566_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_166693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCATCCTTCAATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163586	164393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_163600_164400
820927	contig_4103_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_52037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	64	723	689108	688449	NA	60	TACAAAAAGTAATAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFLKIAEVGAGGNKSRLTLSMSVAVEFRDYLGDFIEHYAQLGPSQPPDLAQAQDEPRRALKSEFLVRENRKYYMDLKENQRGRFLRIRQTVNRGPGLGSTQGQTIALPAQGLIEFRDALAKLIDDYGVEEEPAELPEGTSLTVDNKRFFFDVGSNKYGVFMRVSEVKPTYRNSITVPYKVWAKFGHTFCKYSEEMKKIQEKQREKRAACEQLHQQQQQQQEETAAATLLLQGEEEGEED	689171	688182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_688200_689200
820929	contig_11978_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_62834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGTTAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467669	469610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_467700_469600
820930	contig_12654_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_129304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCATACTTTATCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762750	761059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_761100_762800
820931	contig_294_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_166749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATGTAGAAAAACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145556	144474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_144500_145600
820932	contig_5732_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_119588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	260451	260125	NA	25	TAGTGTTACCCCAGACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APINRCLLRIPKGLSSPFSQRACFSLPWLYFLLLSNFIGAKWLKSLSLAVNSPCRKLLPFYWPAKVWGWVSASLRLCLSDQGSQVCVTCPPLRGGGGGWFTRRSPPHP	260451	259657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_259700_260500
820935	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
820936	contig_7919_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_28124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAATATTTGCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456904	1456579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1456600_1456900
820937	contig_7919_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_28123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAATAAACACCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456442	1455065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1455100_1456400
820939	contig_253_pilon	-	819	6	Intergenic	novelGene_129645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	97.7805706671831	1198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	270	767	268751	267057	FALSE	15	CCACCGCCTCCTGTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMKSVTDQAAQTLLWTELVRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR	271303	267004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267397_268417_268591_268687_268778_269311_269510_271258
820941	SIRV6	+	275	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10526	25	1289	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11526	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
820942	contig_10479_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_147117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCAATTTATCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155430	157254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_155400_157300
820943	scaffold_13505_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_111643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCGGGTGCTCCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787895	786348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_786300_787900
820944	contig_17753_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_105097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	233	766	112477	113010	NA	30	CTGGGGCAAGAACATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTGKSRWGRELRRVVVDTTAPPPTRAHRSGQTQSHTPIGFRNEPAVAEWAMSSIPRTPGCGGARPSGPAVAPDASSCTVCRTSCPTTGEPSSKDPPSSTTSLRGFAVFPVLLFLQKPKEVSRPKLRLRSLRMADAQSGTSRAQLGEESPQTEGPEIRGQHTGRSVDRADLRLRLQ	112244	114215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_112200_114200
820945	contig_9706_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_20854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2347	2736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
820946	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
820947	contig_7806_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_157534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATACTACTCAGCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217398	217993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_217400_218000
820949	contig_6509_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_145635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCGTAAAAGAGATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85168	83364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_83400_85200
820952	contig_4754_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_35915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATATATACGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211418	212207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_211400_212200
820953	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	643	966	-11	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAACCGTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
820954	contig_7420_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_85863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAGGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304597	303793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_-_303800_304600
820955	contig_10962_pilon	-	1609	2	Intergenic	novelGene_103918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	37	306	405174	404905	TRUE	45	ACAAAAACGTGGTTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFLAHLPKNQKMHCRRVDSDSQRQSRTAPYCFQGTPRRVELLTFWLAAVALNHCATRVSIYLRDDPKRDCSSLKFTKLVNLNLTGSKNPKEDRSCLGKDG	405210	402582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_402792_403810
820956	contig_12694_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_171989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCCAGATATCCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369356	368136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_368100_369400
820957	contig_16210_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_147670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32939	32252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_32300_32900
820958	contig_4103_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_52015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAATTAAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467719	469759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_467700_469800
820959	contig_10323_pilon	-	1176	6	Intergenic	novelGene_123558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	184.756488384035	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGAGTTGTCTGCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280476	268245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_277887_277921_278700_278759_279648_279763_279838
820961	contig_15063_pilon	+	518	3	Intergenic	novelGene_14460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2992	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	19	468	36064	36740	FALSE	30	TATCAGTTCACAAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSLTRPTPATDHWAPRPYSAPCGDQPLCVCPCVHSN	36045	36790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266_36516_36633
820964	contig_14219_pilon	+	900	3	Intergenic	novelGene_54314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGTTAATAACTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676003	883272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_676755_767883_767941_883180
820965	contig_2219_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_67195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCAGAAGTACCATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196276	195810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_195800_196300
820966	contig_1939_pilon	+	1113	2	Intergenic	novelGene_144890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGAGATGGGGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971701	982114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_972761_982060
820968	contig_9099_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_149913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1377	1718	350798	350457	NA	50	GCAATTTACCACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICKNFLKFCGFMKVFNFEISFIRVSLVVVVVGCLLMLAFDVVSKKPMPNSTEYRFTLTSSSKRFSSYLALIHFASLLFYLSVFDFPFAYALVLPETLNAVSLVPSLRQEVPI	352174	350289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_350300_352200
820970	contig_10801_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_74023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGGATACAGTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104668	102688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_102700_104700
820972	contig_12090_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_80498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTGTCAAACTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243317	242313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_242300_243300
820976	contig_8330_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_71912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	15.0710252627064	91	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	50	523	1263824	1266225	TRUE	25	AACTCCTAGGAACTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGPELHLASLFVNEACRELVFGGRVEKSSVSRNPEVPFESSAYSISATARGKELRLTLSPLPGAQPPQEPLALVFRFGMSGSFQLAPSDALPPHAHLRFYTVSPGPGLALCFVDIRRFRSLGPRGRVAAGPRALCLAGVRAVQGERAAKPSRQSL	1262645	1268788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1262672_1263800_1264259_1266186_1266307_1266405_1266471_1266773_1266874_1267294_1267423_1267755_1267784_1267960_1268023_1268193_1268360_1268530
820977	contig_3602_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_60587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCCCCTGCCAGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674679	674870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_674700_674900
820979	contig_12886_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_135508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606260	607767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_606300_607800
820980	contig_9471_pilon	-	699	8	Intergenic	novelGene_21735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCCTCCCGCAGTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278372	210862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_210896_211704_211737_242818_242894_248956_249060_259416_259494_260219_260322_271739_271921_278276
820982	contig_3004_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_127514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGAGTGTTAACACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311737	312525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_311700_312500
820983	contig_10609_pilon	+	1645	17	Intergenic	novelGene_123963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	146.598396456953	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	61	903	574055	593767	TRUE	40	TCAGGAGTCAAAGGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDQWFSGAGSPGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKQDLINLLITQATPHVAPVMPLDRFITDFYMTVNNYWILNAQHINLTTLSVAGGFRDYQVRSGLTFLPQLSHHTSALSVVDIKYLVFNWNT	573994	618828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888_585065_589691_589864_593013_593172_593731_593778_596498_596552_597337_597405_599831_599938_600630_600687_603206_603291_606020_606068_606456_606509_609947_610026_613392_613469_618600_618675_618789
820984	contig_7138_pilon	+	998	6	Intergenic	novelGene_120988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGACATTCCTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168123	179527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_168384_169630_169715_169963_170151_172294_172532_176223_176333_179406
820985	contig_8063_pilon	+	1220	1	Intergenic	novelGene_152433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346062	347282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_346100_347300
820987	contig_16411_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_77320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGTAAAAAAAAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141591	139931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_139900_141600
820988	SIRV6	+	330	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	40	337	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGGTCGTTGAAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
820989	contig_11602_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_166590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAAAAAAAAAAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124211	125646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_124200_125600
820990	contig_2969_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_157078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGAAAAAAGAGATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954661	953806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_953800_954700
820993	SIRV2	+	267	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-73	329	-73	-329	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGACCACCAGCACGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	1302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
820994	contig_12793_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_164122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACATTATATATTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239464	240127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_239500_240100
820996	contig_6576_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_42287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTTTGTCTGAAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333785	332893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_332900_333800
820997	contig_13982_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_163497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	161	673	524728	525240	NA	5	TTGTGCTTTCTTTTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKETQTDPQQPETKCKKQDIRVEADSHNIDRMTSVPTTTTETETDNTPEKTNGALSSVPLERKLHGKSPSNTTPYRNTPPGSYAPEKEDLRTEYGSGSPAIQFLETFKETIPLYDSAYGKAMPEDRVQHNLISGNSMAGVHFNPPEGEDDITYTVSKELLVLSEQCPE	524567	526068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_524600_526100
820999	contig_4501_pilon	-	1568	6	Intergenic	novelGene_168979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	59.5469562614245	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	25	465	190111	71731	TRUE	25	ATTACTTTTTGTAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGQDGGWRMIGPGSHQQQRRPRGGGFSFECRPSSSPPPPEPLPSTHSSASRGGPGSRDSMSDSEEESQDRQLKIVVLGDGTSGKTSLATCFAQETFGKQYKQTIGLDFFLRRITLPGNLNVTLQVWDIGGQTIGGKMLDKYIYGAQLIWSTCEQ	190135	57359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_-_58308_67088_67167_71653_71758_179875_179965_185338_185436_189883
821000	contig_8020_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_114352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	232	351	52339	52458	NA	30	TCTTAACAGTTTAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLWLLSPQSLSLNSYLLCPNRPRLDSQLPKSSSFFPKQDKLTGPWQVPTPWACAYDGLNSRHTCFLPRPCWVGGGFMYPIWGEGAPRSLQWTQRHLLSVFFSCLAGMPCPNWPWG	52107	53766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_52100_53800
821002	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4583	34	3408	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
821003	SIRV6	+	664	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	101	18	101	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGGCGATGACTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10338	11312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
821004	contig_1090_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_131153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAATTAATTCTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540931	538949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_538900_540900
821005	contig_4684_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_175435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGATGAAGGTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300890	299893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_-_299900_300900
821007	contig_4604_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_19126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAACATTTTTAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310079	311074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_310100_311100
821008	contig_7410_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_106131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897032	898558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_897000_898600
821009	contig_4659_pilon	-	432	2	Intergenic	novelGene_118170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1327	junction_1	0	3105	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCTTTTAATGCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91131	87468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87670_90900
821010	contig_6418_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_81222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370893	1369369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1369400_1370900
821011	contig_5954_pilon	-	878	7	Intergenic	novelGene_28727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	102.997437940088	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	9	860	1178000	1170468	FALSE	0	GCTGCGTGTGTGCGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEEPQQQKQEPLGSDSEGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSERLELSVLYKEYAEDDNIYQQKIKDLHKKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSHLEALLDDSKELQRFKAVSAKSKEDLVSQGFTEFTIEDFHNTTTWWSTCGCSPQAICSARASSSSTSSKGGGLSRSSASRRWSPCARRATTSTSSRWPRPSASPSRWSTWTAVRAAPPTRTSFPRAQSLRSICSTGLDTTTSSTSRAAALPAARRQTCTEVFFVVVNGHISLPPFSVTPPSTFY	1178008	1170449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170784_1170931_1171045_1171244_1171330_1171616_1171736_1176032_1176132_1176381_1176444_1177942
821012	contig_9267_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_162015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTTCTGTAAAGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341340	343585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_341300_343600
821014	contig_8133_pilon	+	555	3	Intergenic	novelGene_98666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	31	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	21	413	103826	113827	FALSE	65	AAGAAATAAAAACCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGVVAAMGGKFVIGAAFGLIYLYTAELYPTIVRSLAVGSGSMVCRVGSIMAPFCVYLTSIWIFMPQLLVGIVAFLSGVLTLKLPETLGKPLATTWEEAAKLESGKDSCSGKLLPTTNNIVLEKIEVMNAGDCGLCE	103805	113969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_103906_104383_104484_113614
821019	SIRV4	-	359	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	56	202	56	-202	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTCAACAACTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5102	3839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
821020	contig_13901_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_146659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	242	598	254512	254156	NA	35	AAAAACCTGGTTATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNFIHSLGFLFHLYIHVFFISSPDSSSEFQAHIQLDISSRLSCRYLELTHSKLKILNFPPKICRFPQCVPSQYMVPASICICSPKSSISTFPTSKPLMLPLQDTLNLSNSSHFHCTI	254753	253057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_253100_254800
821021	contig_14483_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_133769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAGAACTCATAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151974	152827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_152000_152800
821022	contig_5954_pilon	-	2192	6	Intergenic	novelGene_28488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	117	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	522	1274	365425	361098	TRUE	15	GACGGGCGGCTGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMVGGVGAGRGRSLVPPLGGWDQVRGQVGGQLMALQLDLDEVVGQGKLLVVQQPVLVHVGQLPDLPQHRVGQLGLDHLFLGVGPRDLAVDGREGIEDLIIGGLVLAHHPLNIVDALAGPLAVAVPKGPVHGAVEGTALHSLRWHLGLLLAHHHHQPGNVVGQHVVHRVQQLGFQGLELAKVLRLEDLHLAEVREVAGGDLMLPLNLLVDLTQVVHQLLLFALLTKDVGHLLLEGTDDVGGLPWPAAPA	366968	344806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_345246_348626_348714_360705_361128_364261_364422_364862_365573_366594
821023	contig_10023_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_123498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAAGCTCCTGACCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232275	233328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_232300_233300
821024	contig_18364_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_102591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAACAGCTAGCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216357	214907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_214900_216400
821025	contig_4989_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_160790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGTCCTCCAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147038	147565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_147000_147600
821026	contig_18184_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_123876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	647	1944	25	1968	380844	378901	NA	35	TGAAAAATAGTGCCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGRSQNEMETLQEAGLRCLSLREVSCWHIRGHVSKLTRSQDSMMNIQGRIAQFPKQRDSPCQAGAEVSEDDNYIMNFIEDDSNVIENQEFPTGRTQNCWSKIYLSKTQNFQGSCKQTQMKDRLCIFTPCVNIFNCISHHHDNIVCKRDKTYSSNDYGEDLLKIPPLNQRSIILTGQKTYQCNKCENAFSDRSSLELHQQAHLGKKSPTCSTHGKDISYGSGIPYQQSVHTGKKRYWCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFTQRSHLQAHQRIHTGEKPYKCGDCGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQAHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWSLNLHNHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQSVHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQAHQRVHTGEKPYKCDICGKAFSQRSNLQVHQIIHTGEKPFKCEECGKEFSWSAGLSAHQRVHTGEKPYTCQQCGKGFSQASHFHTHQRVHTGEKPYICDVCCKGFSQRSHLVYHQRVHSGGNL	380868	378495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_378500_380900
821027	contig_7056_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_43598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683853	682533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_682500_683900
821029	contig_8762_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_145293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGATGTACACATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113646	112345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_112300_113600
821030	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
821032	contig_9995_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_47774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAGTACAAAATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733765	734321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_733800_734300
821034	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
821035	contig_5375_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_169228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122207	123160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_122200_123200
821038	contig_5935_pilon	-	1230	3	Intergenic	novelGene_102756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	0.5	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	55	432	1418867	1358505	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKYTLLVNNGFAISAALLMAFSLQAGAFEMLIVGRFIMGVDGGIALSVLPMYLNEISPKGIRGSVGQVTAIFICIGVFTGQLLGLPELLGKKSTWPYLFGVIVVPAFIQLVSLPFFPESPRYLLLEKHDETGAEKGRCPLPPP	1418921	1357706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1358664_1392215_1392362_1418794
821040	contig_2924_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_140287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	699	1112	405992	405579	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVVEPASISNIDGIASSIVNMQVTTLRQTDRWVVGQHISKSQNESENSPPRLSDLQKRLEKIVCCRHCSVFTDLHFFMETQLDYITQPPYQLGGAVLLSSGQWNVRRSDVHHPWAWFIKTSRAVAYILFPRLLTT	406690	405419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_405400_406700
821041	contig_11594_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_80945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGTAGAAAAGGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572714	574629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_572700_574600
821046	contig_4845_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_53670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATTGCTTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761814	762480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_761800_762500
821047	contig_9705_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_41731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATTGATATTTAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223581	224797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_223600_224800
821048	contig_1093_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_139974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAAAACGTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87842	89903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_87800_89900
821050	contig_10581_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_41384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1224	1568	574999	574655	NA	45	AGTAGATAAGAATTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTSTRLALIQTQNNKCWTACGENGTLTHCWWECKMVQPLWKSIWCFLKKLEIEVPYNPAIPLLGIYPREIRTITRIDICTPMFTAALFTTAKRWKQPRCPSVDE	576222	574423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_574400_576200
821055	contig_4136_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_161240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACCTTGCAAATGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41394	42243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_41400_42200
821058	contig_12479_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_56832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTATACTCAGATAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111545	109837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_109800_111500
821059	contig_8138_pilon	+	939	4	Intergenic	novelGene_52446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	500.631601080076	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280097	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306722_307015_307632
821060	contig_7866_pilon	-	428	2	Intergenic	novelGene_171191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGAGACCAGTGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218138	204071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_204208_217846
821062	contig_18919_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_156018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTAAACATAATGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63996	65188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_64000_65200
821064	contig_7801_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_169686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1193	1567	501331	501705	NA	25	TCTCTATGAATCCCCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNNWACHEEVWSCLSHHPLISWCSFHHYYFFFIEEVSLSAVLAVKTTLCLKNCNSLRAMFLDSSFLIHSAVQATCHIIGSGSYSGSLVSMKSSANPLFAAEASHISLRSLVSLCLPHVTPQP	500138	502010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_+_500100_502000
821065	contig_12566_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_86021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200088	202019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_200100_202000
821067	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821068	contig_15977_pilon	+	1315	2	Intergenic	novelGene_137221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGATCAAGAAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82920	91692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_84001_91457
821069	contig_10037_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_148965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAGTGAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419321	420581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_419300_420600
821072	SIRV6	+	732	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	14	37	14	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10251	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
821073	contig_12079_pilon	-	897	6	Intergenic	novelGene_67562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_5	244.724661609736	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	167	712	871668	867179	FALSE	40	ATGATCCAAGATTCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKVSSRHACQNSLSVGSDTFILRK	872424	866993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
821075	contig_10104_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_160152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589763	588579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_588600_589800
821078	contig_9332_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_60707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTCATAGAGTAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73229	72621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_72600_73200
821080	contig_12644_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_44553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTACCCACCCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609622	1607780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1607800_1609600
821082	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821083	contig_19957_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_57702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTTTTCTCAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151335	152262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_151300_152300
821086	contig_10855_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_124335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCCTTTCACTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539104	537174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_537200_539100
821087	contig_8248_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_125030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186930	185523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_185500_186900
821088	contig_6497_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_35584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTAATAGTGTGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277923	279184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_277900_279200
821089	contig_12157_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_135929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTTTTCAACCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279001	280780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_279000_280800
821090	contig_18822_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_111720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGTTGCTGTCAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137857	138453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_137900_138500
821092	contig_12042_pilon	+	2039	11	Intergenic	novelGene_170439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_1	60.8016447145963	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	14	811	194251	204005	TRUE	30	CTTCCCAGTACAATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNWEMSAAGWAGLLGPPGDFAKRLLVTGGAGFIASHVIVSLVEDYPNYMIINLDKLDYCASLKNLETISTKQNYKFIQGDICDSHFVKLLFETQKIDIVLHFAAQTHVDLSFVRAFEFTYVNVYGTHVLLNAAYEAQVEKFIYVSTDEVYGGSLDKEFDESSPKQPTNPYASSKAAAECFVQSYWERYKVRADSRNFGIFFILDVSVKLQVSVSSISFLAYKMYIVKSYVLRIFKKTTHFLYCVDKVGPTSCSARNLKEQFVYTFLLLQ	194237	210003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_194337_196693_196761_198510_198580_199736_199828_202096_202240_203663_204809_206042_206087_206674_206841_207484_207544_208232_208331_209945
821093	contig_12638_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_33332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTGTTCATAATTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330190	1329408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1329400_1330200
821094	contig_3529_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_105372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCCACTGGGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620351	620756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_620400_620800
821095	contig_17470_pilon	-	1188	5	Intergenic	novelGene_110490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	143.097868607467	414	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	29	352	167807	165575	TRUE	40	ATAAATCAAGCCACTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTELRQWEEQGELLLPLTFLLLVLGSLLLYLAVSLMDPGYMNVQPQPQEELKEEQMAMVPQATPPSALQILPGAGG	167835	164363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_165006_165228_165397_165548_165662_166040_166178_167707
821096	contig_3068_pilon	+	1345	9	Intergenic	novelGene_137608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	41.6171163705512	257	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	6	797	162547	188400	FALSE	15	GCCCCACCGACTCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMSGADGTGQMAAADTALCLFDVDGTLTAPRQKITKEMDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCSQEERIEFYELDKKENIRQKFVADLRKEFAGKGLTFSIGGQISFDVFPDGWDKRYCLRHVENDGYNPIYFFGDKTLPGGNDHEIFTDPPGTSLVIQERGKGLDKSQEQELLCVSAHVG	162541	188948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162640_167639_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175363_175530_175607_178805_178922_187344_187374_188303
821097	contig_3394_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_152691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTTTTTGAGTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460279	459337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_459300_460300
821098	SIRV6	+	235	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	57	491	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
821100	contig_8682_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_165272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1091	1483	58291	57899	NA	80	TTAAAAAATAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKGLPPTVKDFMVTTIFLSRHNPSPNFLYPLDFQEIGNHVDWFSAILQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGKGLHFLIVVV	59381	57809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_57800_59400
821101	contig_13201_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_130869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAATAAAAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37977	38934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_38000_38900
821102	contig_16882_pilon	-	394	4	Intergenic	novelGene_148200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	2402.40670994734	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	13	360	188737	181967	FALSE	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LELEMNSDLKAQLRELNITAAKRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	188749	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_188683
821106	contig_4385_pilon	+	1473	6	Intergenic	novelGene_141517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	4.83321838943783	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	185	607	449036	452350	TRUE	5	TGTCAGGGTTGCTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLGLPSVSYASSGQSVSLELVADTANLFYTLLDQTREFLHVAETPVPSVGEYLKQEISRHMANWTEDKETKKLKLAVLNTHFNLECCVSGTHSLDLLALGPFGEYTMLPGLDCTFREGYEGLTSCIVASLPKDILVFNKPVKTIHWGGSFQEETLPGETFPVSVECEDGDRFPAHHVILTVPLGFLKEHLDTFFQPPLPP	448851	459331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_449206_450019_450220_452297_452552_455284_455398_455928_456087_458937
821108	contig_12508_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_176473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCATATATACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10076	9640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12508_pilon_-_9600_10100
821109	contig_10523_pilon	-	1282	2	Intergenic	novelGene_120958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAATACAAAAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60697	58831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_59868_60451
821110	contig_6361_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_23858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36699	34462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_34500_36700
821111	contig_5023_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_7100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTATGCAAGCCCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12860	14927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_12900_14900
821112	contig_5770_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_74155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATATGGACGACATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173632	172080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_172100_173600
821113	contig_14895_pilon	+	1360	2	Intergenic	novelGene_106690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAGAGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19814	21269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_19912_20006
821114	contig_11855_pilon	+	793	5	Intergenic	novelGene_67080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	132.354401135739	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	82	645	2279887	2287923	FALSE	50	TAATTACTCTACCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWLGNSCGGQSGSRCEWAERQDPAEEDMAAKVFESIGKFGLALAVAGGVVNSALYNVDAGHRAVIFDRFRGVQDIVVGEGTHFLIPWVQKPIIFDCRSRPRNVPVITGSKDLQNVNITLRILFRPVASQLPRIFTSIGEDYDERAEQQKKAAIISAEGDSKAAELIANSLATAGDGLIELRKLEAAEDIAYQLSRSRNITYLPHGQSVLLQLPQ	2278561	2288071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2278603_2279846_2279975_2281322_2281485_2283589_2283691_2287710
821115	contig_9146_pilon	+	442	6	Intergenic	novelGene_79502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	51	440	142828	147505	FALSE	35	AGAAGGAAGAAGGCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRSFQESCPLKLLNFMLYYSVPHFLCLHDFITIKIRHLGFLFSGFNLLGPSCGCPFCTDICLLPGLSDILLAGTVWELEDEVSELHAFERHGLPPDLSARSINQSPVLINNINNRDQFPGMGPKGDVGHPANLHEAPEHHVGGVR	142777	147507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_142849_143321_143378_143481_143580_146303_146398_146893_146994_147484
821116	contig_5854_pilon	-	645	5	Intergenic	novelGene_68864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	29.4310635213884	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	258	305	385807	385760	TRUE	25	GTACAGAGACGTGATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCATCRPGRSAACTLGAGSRSPGNHSGGTPASVLEPGLRKACGGEFQLRGPLERRFSTTLTPFPSPQQHLRDSEAASNLNIQNHKMILQERVSISDSFES	387790	357947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_358028_382236_382348_385189_385249_385669_385899_387624
821117	contig_11370_pilon	+	671	3	Intergenic	novelGene_98739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	5	427	145831	148303	FALSE	10	AGTGCTGTGTGGTTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145826	148547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
821118	contig_6205_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_160341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATATGAGCATCAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64099	65576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_64100_65600
821120	contig_13496_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_107645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372008	370541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_370500_372000
821121	contig_13481_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_119434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCTCATCTGTCAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931865	930483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_930500_931900
821122	contig_13481_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_119437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTGGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950952	950717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_950700_951000
821124	contig_12079_pilon	-	668	4	Intergenic	novelGene_67389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	49.3040453602835	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471276	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_462525_463673_463798_467104_467147_471218
821125	contig_14184_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_66602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGCTGCCTGTGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116062	117891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_116100_117900
821127	contig_3068_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_137642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTTAAAACGAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260895	258875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_258900_260900
821129	contig_1301_pilon	+	2372	1	Intergenic	novelGene_47371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACCAGGTCCTGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602384	604756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_602400_604800
821132	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
821133	contig_10036_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_176474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCCCTACCAGATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10663	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10036_pilon_+_10700_11300
821134	contig_16311_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_176077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195778	197532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16311_pilon_+_195800_197500
821137	contig_10765_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_122982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGATAAAACACAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473055	472507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_472500_473100
821143	contig_10581_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_41370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTGGTTGCTAACCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441727	443273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_441700_443300
821144	contig_18420_pilon	+	361	2	Intergenic	novelGene_109352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAGAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101461	102700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_101756_102633
821146	SIRV7	-	228	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146691	1	-91657	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAAAACCGATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
821147	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
821149	contig_17171_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_147349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTGGACTGTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43916	43171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_43200_43900
821150	contig_9706_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_20846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2281	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
821151	contig_12010_pilon	+	509	4	Intergenic	novelGene_160942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3472	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCCTCCTCCCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183290	194708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_183420_184223_184348_189364_189543_194630
821152	contig_2646_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_69494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGTACATGCAAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191090	189676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_189700_191100
821153	contig_11922_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_176476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAGAGAAGGAGGAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19317	21239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11922_pilon_+_19300_21200
821155	contig_3900_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_84170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTTGATGGTGAATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153557	154653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_153600_154700
821156	contig_1090_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_131169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGGAGTATAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019037	1019614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_1019000_1019600
821157	contig_8687_pilon	+	2120	12	Intergenic	novelGene_169661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_11	35.5792678047295	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	83	1600	232985	299313	FALSE	20	AACTAATGTTCTTCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRVGNNFLRLCVLKVTQQSEKHLEKILNVDEFVKRIFSVIHSNDPVARAITLRMLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLDSHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLVTSYPSTRMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSREDIQALCECALQTPYDSLKLGMLSVLATLSGTIAIKHSSSLAPGDAGSSPRASDLVKLAYECCYHNSRGIAAHGVRVLTNIAVSCQEKDLLALEQGAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPHLSQSVVEALLTQLHSAQDAARILLCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLVELYKVIGRSATDKQQELLRRNEDASLHTRQTMN	232902	299833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_233079_249705_249836_250659_250807_252258_252397_260931_260979_266534_266735_267221_267345_280565_280684_295435_295571_297034_297133_298711_298952_299265
821158	contig_14807_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_124739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATCCGGGTGGCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237905	238255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_237900_238300
821159	contig_15327_pilon	+	897	6	Intergenic	novelGene_70445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	15.7810012356631	600	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	24	644	275426	280549	FALSE	15	TAGGCTTCCTTTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRPGAPDMAAAWCLRWGVSRAGAWLLPPPACCPRRTLHKQVDGAEFQSIYSLDKLYPESNGPDTAWKVPDDAKQANNDIPIDRLTISYCRSSGPGGQNVNKVNSKAEVRFHLATADWIAEPVRQKIAITHKNKINRAGELILTSECSRYQFRNLAACLQKIRDMITEASQTPKVPSKEDAVLRRIRTENMNRERLRQKRINSAIKTSRRVDMD	275402	280802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_275612_276943_276981_279030_279091_279626_279710_279797_279968_280464
821162	contig_4769_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_118030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGTAAATTTCGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242675	1241763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1241800_1242700
821163	contig_6497_pilon	+	520	2	Intergenic	novelGene_35646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCGCCGCCATCTTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773905	790200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_774185_789959
821164	contig_2069_pilon	+	1362	6	Intergenic	novelGene_23458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.123089182711	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	493	1299	1436394	1439381	FALSE	15	TGATGAGTTGAGGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1432102	1439444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1432232_1432938_1433064_1436052_1436259_1436361_1436748_1437870_1438000_1439057
821165	contig_11428_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_138495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125350	126227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_125400_126200
821166	contig_10426_pilon	-	1061	3	Intergenic	novelGene_144673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_2	59	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	131	469	104586	96645	FALSE	35	AAATGTTACCAATATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAREDGVSGKEQVRRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCSICHLFDKDKKQYHCENCGICRYCM	104716	96052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_96774_97008_97129_104496
821169	contig_4469_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_21895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTGAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363729	365559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_363700_365600
821172	contig_15092_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_57830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTAATGCTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362018	361786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_361800_362000
821174	contig_6222_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_176478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTAGTAACAACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80351	79398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6222_pilon_-_79400_80400
821175	contig_2757_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_164610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGAAGAGCATTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553245	554174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_553200_554200
821177	contig_16882_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_148261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTATTTTCAGAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634439	633736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_633700_634400
821178	contig_14326_pilon	+	2208	7	Intergenic	novelGene_120765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	36.2292085968705	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	215	631	621824	629613	FALSE	60	GTGCATATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTTKVYKLVIHKKGFGGSDDELVVNPKVFPHIKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKETISVDQTVTQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYITQKVEFAGIR	620974	631190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_621123_621757_621882_624824_624913_625586_625634_627286_627373_628437_628522_629559
821180	contig_9653_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_48344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGACAAACGCAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098772	1099916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1098800_1099900
821183	contig_9132_pilon	-	740	2	Intergenic	novelGene_121361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	6866	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	322	645	36482	36033	FALSE	10	CATGCTGCCTCGGCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRGAWGGERTVTRAPSCPAADFSSPQYIAVHVVPEQLMAFGGSSEPCALCSLHSIGKISGSQNRAYSKLLCGLLAERLRVSPDRIYINYYDMNPANVGWNSSTFN	36803	35937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_36100_36225
821184	contig_366_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_51618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACTTTAGCTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177704	1179374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1177700_1179400
821185	contig_16666_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_61818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	1232	1849	299517	300134	NA	5	CTTCCGGTCCCGTCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNSLIISEAERLVKCSLASSQTRFHIWRPLKTSLRTRVLTLQAVPVRTLGQCGPGARTSSFSPLRQEHSCTSLFLRPWTHLPSSFGFALCSQMTSTLRIPPPRDRPGKPAKFRNKQTTLHNSPAEKPVSLTDPASTDDLQNCLKKKKVKDKTVPAQNSWVSDTGTLPASQVPTPPQPSGSIDDERAFPHSMADSSFNTDFAAFG	298285	300250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_298300_300200
821187	contig_5881_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_129057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTCTTGACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548179	546586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_546600_548200
821192	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
821193	contig_9727_pilon	-	1345	13	Intergenic	novelGene_86379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	245.914096902873	1	64	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	335	1123	590077	578319	FALSE	35	TCTGTTAAATTTATAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLSVLRCCGSSLLDDRSPTHECGDNAERNGKAYLQGPLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622889	578096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584768_585035_585066_590071_590174_591628_591752_598027_598078_622824
821194	contig_7202_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_17696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27862	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
821196	contig_9871_pilon	+	1526	9	Intergenic	novelGene_75623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	297.74359774813	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	834	1301	349812	352392	FALSE	15	ATCCTCTCAGTGTCTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPAEKKKPNATRPVTPPRVASGLNPSIQKASNYRNNTVLYE	331194	352617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_331416_341139_341261_342254_342387_344560_344792_348534_348640_349788_350013_350219_350355_351364_351426_352321
821197	contig_8712_pilon	+	1275	2	Intergenic	novelGene_58725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	182	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACCCAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960	3240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1100_2104
821198	contig_10765_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_122940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253608	255858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_253600_255900
821199	contig_3787_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_102359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTGTCCCTAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159934	160362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_159900_160400
821200	contig_15952_pilon	+	1193	8	Intergenic	novelGene_154078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	19.6208968153022	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	6	764	534671	537946	TRUE	30	AGAGATCACAGTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMALYVAAAAVLEGVENRQGSIKGLVYGRRFQNVKQLYALVCETQRYSVVLDAVIASAGLLRAEKKLRPHLAKVLVYELLLGRGFRGSGGRWKPLVARHQARLKAELARLKVHRSVSRNEDLLELASRPGPALQVPRFVRVNTLKTCSDDAIDYFKRQGFSYQGRASSLEDLRTLKGKHFLLDPLLPELLVFPAQTDLHEHPLYQAGHLILQDKASCLPAMLLAPPPGSHVIDACAAPGNKTSHVAALLKNQG	534665	539612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_534764_534916_535040_535482_535658_535745_535855_537602_537742_537826_537947_538401_538584_539365
821202	contig_1618_pilon	-	1342	5	Intergenic	novelGene_141797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	402.158162294389	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	44	766	353751	317166	FALSE	40	CAAACTTGATGAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDVEKLGRRRGRKMDSVEKGATTSVSNPRGRPSRGRPPKLQRNSRGGQGRGVEKPPHLAALILARGGSKGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGMKCLMKSA	353794	316589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
821203	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
821204	contig_19769_pilon	+	656	4	Intergenic	novelGene_102265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1636.50623789421	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	36	389	87249	88883	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKVRNTGPGRVAGGGGPPGPCPHAASARRTSSTIRAAARPLPRWSSGTRIGLKSGQSSLLVWWLVVAALTSPS	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87561_88841_88958_89163
821205	contig_3161_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_84529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTGAACCTCAGGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446526	445650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_445600_446500
821206	contig_5758_pilon	-	1027	9	Intergenic	novelGene_119136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAGGTACTCCAGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652360	636744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_636856_637368_637453_639346_639435_640444_640535_641041_641146_642362_642447_643440_643627_650197_650360_652242
821209	contig_4392_pilon	-	1738	2	Intergenic	novelGene_117311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280617	278785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_279565_279658
821212	contig_5988_pilon	+	1272	11	Intergenic	novelGene_16057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	2.11896201004171	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1236	36	1271	1116577	1124899	FALSE	30	CAGGTAAGCAGTTGCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLQHFLEQHERMTSTTRYRRAEQTFGELEVWAVVPERDRKEVYDDVLFFLAKKEKEQAKQLRRRNIQALKSILDGMSSVNFQTTWSQAQQYLMDNPSFAQDHQLQNMDKEDALICFEEHIRALEREEEEERERARLRERRQQRKNREAFQTFLDELHETGQLHSMSTWMELYPAVSTDVRFANMLGQPGSTPLDLFKFYVEELKARFHDEKKIIKDILKDRGFCVEVNTAFEDFAHIISFDKRAAALDAGNIKLTFNSLLEKAEAREREREKEEARRMRRREAAFRSMLRQAVPALELGTAWEEVRERFVCDSAFEQITLESERIRLFREFLQVLETECQHLHTKGRKHGKKGRKHHRKRSHSPSGSESEEEELPPPSLRPPKRRRRNPSESGSEPSSSLDSVESGGAAIGGRGSPPSHLLLG	1116541	1124900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1116600_1116700_1116810_1117164_1117316_1117978_1118113_1118654_1118770_1118917_1119010_1123405_1123523_1123734_1123873_1124081_1124178_1124409_1124497_1124725
821214	SIRV4	-	396	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1122	3	1122	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4036	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
821216	SIRV7	+	268	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56099_70889_70987_78840
821218	contig_12299_pilon	-	913	3	Intergenic	novelGene_29751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGAGAGGAGCCGCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365630	355956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_356041_359504_359593_364889
821220	contig_16714_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_161553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546421	544207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_544200_546400
821222	contig_846_pilon	+	1047	2	Intergenic	novelGene_136096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	540	1046	121194	123143	FALSE	25	GGATACAAGTCCTCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRGCLILYCQIAGPDPEEPPTCPLCKEPFRPGGFRLNWQLASVVDNIERLKLVSSPGSAEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVMCRDAREHRAHTVRFLEDAAGPYREQIQKCLECLRKEREEIQGIQSRENQ	120654	123144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_121623_123065
821224	scaffold_19766_pilon	+	1476	3	Intergenic	novelGene_34411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	4.5	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	914	1330	838602	839298	FALSE	35	AAAAGTTTGATTTGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSSSASSTQQVLSLSTSAPGSGSTTTSPVTTTVPSVQPIVKLVSTATTAPPSTAPSGPGSVQKYIVVSLPPTGEGKGGPTSHPSPVPPASSSPSPLGGSALCGGKQEAGDSPPPAPGTPKANGSQPSGSGSPQPAP	837176	839444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_837928_838439_838638_838917
821226	contig_9011_pilon	+	1360	5	Intergenic	novelGene_159286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_3	246.394373921159	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	407	865	317573	646072	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTGDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLIKNTKGNTLKEEWIAYICREILRVCNKWGLASLPMS	317166	646567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_317630_421427_421494_598551_598609_625098_625225_645919
821227	contig_665_pilon	+	893	2	Intergenic	novelGene_158231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	965638	967375	FALSE	30	TAAATTATGTTTTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIKRANKLFTNDCIFLKKTLNIPVISEKPLLFNGINSIDSPENETVYSSLSHEEEPVVAREALSPPSPQESDIQPVQSEEVSARDFLQRLDLQIKLSTQAAKKLKEESRDEESPCATSLHHS	965636	967892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_965970_967332
821228	contig_10923_pilon	+	746	5	Intergenic	novelGene_66184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	465.040589626325	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	51	632	21667	42718	FALSE	25	AACACTTGTAGGTAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSFVLSAGQQDFGLKMVAVALLLQCCPVLSRGLTGLLGKVVKTHQFLFGVGRCPILATQGPTYSQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	13828	42832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_13864_21651_21814_37431_37540_38578_38742_42554
821229	contig_2798_pilon	-	2258	1	Intergenic	novelGene_120002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1156	1491	96317	95982	NA	65	CATTAAAAAGGAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPSSSSPPGSQGYGGDQQGLNRCKCPALGYRSQGLQEAMMVENSFWRRVTTILVCWRQQGLPGYGIFSPGHTGTGWLPYSRMWKWQFQPPESRVSSRFRVDCSSGCLRL	97472	95214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_95200_97500
821230	contig_9919_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_137987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTTCTCCCTCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797923	798151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_797900_798200
821233	contig_9189_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_165130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGCTTTGAGAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492140	492971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_492100_493000
821236	contig_9927_pilon	-	829	2	Intergenic	novelGene_137103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTGGTTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38600	36939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9927_pilon_-_37711_38542
821237	contig_11160_pilon	-	603	5	Intergenic	novelGene_168799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.14578098794425	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAGTAAGGAGCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114885	95987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_96144_97927_98086_108745_108819_113762_113914_114820
821238	contig_3789_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_79835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTGGCACTGGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302290	302888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_302300_302900
821239	contig_5988_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_16135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGATTTATTGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562337	1562054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1562100_1562300
821240	contig_20819_pilon	-	1062	4	Intergenic	novelGene_55662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	13.5728487143349	299	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	251	640	54136	53161	FALSE	25	GGTTACCATTCTTATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELIQKKLQGEVEKYQQLQKDLSKSMSGRQKLEAQLTENNIVKEELALLDGSNVVFKLLGPVLVKQELGEARATVGKRLDYITAEIKRYESQLRDLERQSERQRETLAQLQQEFQRAQAAKAGAPGKA	54386	52738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_53291_53542_53668_53753_53825_54072
821241	contig_12050_pilon	+	946	5	Intergenic	novelGene_62717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_4	57.3803102117791	86	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	117	674	666343	682999	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHYVVYSGLENIKKLTGGKLAAGHFDGKGEVEEYFRDIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLNDSRGI	666010	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668370_679709_679960_682979
821242	contig_1521_pilon	-	1096	5	Intergenic	novelGene_145441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGGTTTCTGACACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179158	160441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_161724_161775_163669_163981_165931_166103_179059
821245	contig_13992_pilon	+	805	2	Intergenic	novelGene_147648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_1	0	258	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAACTTGTAACATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575001	577584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_575090_576867
821246	contig_14326_pilon	+	1541	2	Intergenic	novelGene_120774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	225	755	818394	818924	FALSE	30	GTAAATAAATGCTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSAAFAAEPQNAGRASEPGSAVLPAASGRPEPVTELNEPLSNEDRNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTMADGNEKKLEKVKAYREKIEKELETVCNDVLALLDKFLIKNCNDVQYESKVFYLKMKGDYYRYLAEVASGEKKNSVVEASEAAYKEAFEISKEHMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEIQNAPEQACLLAKQAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDQQDEEAGEGN	803862	819710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_803964_818270
821247	contig_776_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_139909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGACTTAGATGTTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593309	592207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_592200_593300
821250	contig_7733_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_147123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTTTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38715	37314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_37300_38700
821252	contig_6418_pilon	-	868	8	Intergenic	novelGene_81097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	493.239851411469	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	40	429	106563	71817	TRUE	10	CTACTTTGTTCACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQLSAPGPASFEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAISVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKAVSRTSPCILRIDSTTP	117987	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71869_81723_81828_85894_85990_103037_103129_106515_106575_117959
821253	contig_10793_pilon	+	1001	12	Intergenic	novelGene_83371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2739.11274166841	1	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	11	559	152890	163236	TRUE	40	ATGTCAAATACAATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIAWVPVFSHKLLNHFSDLRSSMQFMNLQKKNVNGNQMRRMKFEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGNTRDVEQFAL	130870	167257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130878_152886_152966_159519_159642_160427_160557_161400_161448_162548_162690_163202_163288_163944_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
821254	SIRV6	+	473	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
821256	contig_14333_pilon	-	883	6	Intergenic	novelGene_49144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	169.103045507761	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	91	726	446908	438990	FALSE	45	AGAAGAAAAGCTTCACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIWWKKITSLESYMGTFGVTVRIKV	446998	438832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_439016_441048_441090_441682_441821_443131_443248_445731_445820_446681
821258	contig_5018_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_47167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	390	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	477	1079	1503725	1503123	NA	5	TTTCTGGAGTCTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHVTPPNVSLGASGGPPAGPGGVYAGPEPPPVYTNLSSFSPASATSGGSGAAVGTGSSYPTATISYLPHAPPFAGGHPAQLGLGRGGASTFKEEPQTVPEARSRDATPPVSPINMEDQERIKVERKRLRNRLAATKCRKRKLERIARLEDKVKTLKAENAGLSNTAGLLREQVAQLKQKVMTHVSNGCQLLLGVKGHAF	1504201	1502611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1502600_1504200
821264	contig_10196_pilon	-	1043	7	Intergenic	novelGene_132235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	230.032364872617	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	136	582	1442405	1433533	FALSE	5	GGTTTTGGTTGCGTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCKNLFTTLLQI	1448649	1433071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433567_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
821266	contig_11448_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_66395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACTCATGGCGATCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434654	435746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_434700_435700
821268	contig_7272_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_25394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTGTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755349	756996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_755300_757000
821269	contig_4931_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_138356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGGAAGTTTCTCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216969	216018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_-_216000_217000
821270	contig_5954_pilon	-	1362	8	Intergenic	novelGene_28457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	54.1924010035596	160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	164	1102	129485	125812	FALSE	10	CACCCGAGCCGCCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLCKCPKRKVTNLFCFEHRVNVCEHCMVANHAKCIIQSYLQWLQDSDYNPNCHLCNMPLTTRETIRLICYDVFHWACLNERAAQLPRNTAPAGYQCPNCNGPIFPPSNLAGPVASTLREKLATVNWARAGLGLPLIEEVVSPESEPLNTSDFSDWSSFNASGTPGQEEMASASAATALYSQAPQPPASPGRPEQHTVIHMGGPEPLAHASAQRKVYDTREDDPAAGLLGDCDDDKYRRRPALGWLAQLLRSRAGPRKRPLTLLQRAGLLLLLGLLGFLALLALMSRLGRAAADSDPNLDPLMNPHIRVGPS	130001	125551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_125999_126536_126661_126850_126998_127071_127145_127251_127446_128959_129072_129383_129494_129846
821271	contig_19680_pilon	+	1624	4	Intergenic	novelGene_132004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.05480466765633	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	243	581	86704	102384	TRUE	25	TTTGAATTGTATTTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGKSKATLQLGNFPKSLPVSRFQEFQESWLKHFTSGSLPWNESSKKAKPRLIYPLLYPQHRNSPWSPGGAQELPAKLSHARYCCGSIPSATYIHRCHCCVPMSSFRLRANL	86461	103854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_86762_88251_88304_102155_102482_102908
821275	contig_16594_pilon	-	1076	2	Intergenic	novelGene_53873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	219	380	165546	165385	FALSE	60	TCAAAAAAAAGAAATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKPKVAAAAALRAALPGALRTVSERSLERRRGESEKQGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVVSVFSVFIEFVIPCAQLHVGDDRPGSSEHR	306162	164688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_165649_306046
821277	contig_13697_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_165946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	956	1330	640643	640269	NA	10	CCACTGCCTGCGGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSSRATLARLPTSASSCGFDCASISISESCLQGWGRSRVPLTLEQQSPSVWKVVQGHLGPGKAKDVTPWRPSGIPTSSGGILSNASTKVAAAGATAWTPSWPKPRPTLALTSLCSSNKPFCLL	641598	640267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_640300_641600
821278	contig_12694_pilon	+	479	2	Intergenic	novelGene_171982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAAGACCAAACCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313834	327375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_313906_326967
821280	SIRV6	-	394	3	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	33	-23	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCGTCGTTCCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2514	1567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1736_1847_2030_2470
821282	contig_13780_pilon	+	1336	7	Intergenic	novelGene_149062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	92.0810331537753	139	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	9	1154	641859	644556	FALSE	10	CCTCTGACTCCGAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSNTHNALKLRFPAEDEFPDLSGHNNHMAKVLTPELYAELRAKSTPSGFTLDDVIQTGVDNPGHPYIMTVGCVAGDEESYDVFRELFDPIIEDRHGGYKPSDEHKTDLNADNLQGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIRGFCLPPHCSRGERRAIEKLAVEALSSLDGDLSGRYYALKSLTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKTFLVWINEEDHLRVISMQKGGNMKEVFTRFCNGLTQIETLFKSKNYEFMWNPHLGYILTCPSNLGTGLRAGVHIKLPHLGKHEKFSEVLKRLRLQKRGTGGVDTAAVGGVFDVSNADRLGFSEVELVQTVVDGVKLLVAMEQRLEQGQAIDDLMPAQK	641850	644738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_642052_642287_642443_642531_642665_642937_643110_643847_643972_644101_644292_644377
821285	contig_7230_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_52565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACCCTGCTAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177741	179504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_177700_179500
821286	contig_7933_pilon	-	641	3	Intergenic	novelGene_164697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	36	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAGCTAATCTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197972	185670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
821287	contig_1450_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_27412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGAGTGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416689	418070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_416700_418100
821289	contig_14536_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_69287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAAAAAAATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72793	72554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_72600_72800
821292	contig_5649_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_82389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCCCGGTTTCTCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084356	1082145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1082100_1084400
821294	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1719	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
821295	contig_5153_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_74331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590648	589254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_589300_590600
821297	contig_3382_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_124115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGAGAGAAAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725699	727125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_725700_727100
821299	contig_10176_pilon	-	2522	6	Intergenic	novelGene_72695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	238.51926546927	6	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	1286	2395	224092	214602	FALSE	5	GCTTGTTCTATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIVKHFMEDLKFLEIGGIWSLSPVCNRLIGLGNYLSSCLLEWGFIVLWGEQEQVLASKQCLSLTFFQSLSVQLKAECNKGYVKVKQVGINPTSIDSVIIGKDQEVKLQPGQVLHMVNELYPYIVEFEEETESPGLETHRKRKRSGDSDSIERDVAQEGEPGTGLDPRSSPTQCSVPAKKGEDASTKKESLGHWSQGLKISMQDPKMQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	225377	214474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223007_223311_223831
821301	contig_6506_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_153478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTTTTTGTGAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27363	26131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_26100_27400
821302	contig_2161_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_114952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	23.7297711918241	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	94	846	986528	1006745	FALSE	30	CATAAGGTGTGATTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSLTALKSGRVFKVSEPQVLLYKTCHCTLEMVLGVPESSIHIIGVSLGAHVAGMVGHFYKGQLGQITGLDPAGPEYNRVSLEERLDAGDALFVEAIHTDTDNWGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTSIYAGPVEHGGVRIEPLPTEVKVYLLTTSKAPYCVHHSLVEVYLKETRNKNTNIEVTFLGSNITSSVKITIPKQKLQGRGILPQPHPQCQINQVRLAFQTSNRVWRKKQTITVGKFCTTRLPVHDSKKMICLPEPVNLEANRAVFHDLKIACV	986434	1007095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_986531_987544_987654_988936_989039_992059_992150_996223_996314_1000587_1000697_1005866_1006032_1006660
821305	contig_14953_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_137297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCCTGCTTCAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410814	411700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_410800_411700
821306	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
821307	contig_14467_pilon	+	887	3	Intergenic	novelGene_138249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	125	781	318578	319628	FALSE	0	GGCCCTGGCTCCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDAAAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVCCCLLWCLRLEALSHPNICLRCSWNCPLPPRCSLPSLRKEPQNPEKMNVP	306503	319734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_319081_319474
821308	contig_14034_pilon	-	2198	18	Intergenic	novelGene_72629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	51.4437913437576	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	1306	2196	132391	122735	FALSE	25	TGATGAATTTTTATTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDPVTPYQLHVLCQGWHYLCYEWHWTTDRSSGDNASDLANVAVIDGYRVLVTVFRQTVVPPPLCTYQLLLPQPVNQVVFSTHPQKSNDLAVLDAINQISVYKCGDSPCADPTVKLGAVGGNGFKVSLSIPHLEKRYKIQFENNEDQEVNPLKLGLLTWIQEDIFLAISHSPSSRQSFIHRMTMALSETDEEQGQLNVSSSVVVDGIIISLCCNSKTKSIALQLADGQIFKYLWESPSLAVEPWKNPGGVAVRFPHPCMQTELAIIAGEECVLGLTDRCRFFINDTEVASNITSFAV	152256	122732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_122765_122858_122913_124516_124621_124945_125053_126068_126252_127568_127669_130958_131130_132249_132481_135094_135189_136776_136901_138034_138126_138859_138957_141172_141234_145163_145245_145953_146036_147942_148096_148315_148516_152023
821310	contig_7976_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_169412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTTGATTGGGGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786338	787675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_786300_787700
821312	contig_5039_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_64886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACAGCAGTGTACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562018	561369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_561400_562000
821313	scaffold_13505_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_111660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAATTGCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851227	852331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_851200_852300
821314	contig_5217_pilon	-	524	5	Intergenic	novelGene_135784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_4	2581.82671523478	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	22	522	560372	558316	FALSE	20	GGGCAAGCTTCTTGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQ	560393	558313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
821315	contig_5826_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_71519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_2	410.420109968635	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTATAGTTTGGAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174685	188849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_175006_184633_184715_185354_185452_187989
821320	contig_5816_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_158266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCCCCAACGGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362093	363037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_362100_363000
821321	contig_15456_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_139482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCCAGCCTGTACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55548	57833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_55500_57800
821322	contig_12697_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_122831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAATCAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239782	241019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_239800_241000
821323	contig_4125_pilon	-	808	4	Intergenic	novelGene_25183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	38.2186690854963	249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTCTGCAGTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271257	1265320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1265572_1270087_1270432_1270688_1270811_1271166
821327	contig_3942_pilon	+	681	5	Intergenic	novelGene_128638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1120.25563488875	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176951	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179172_179647_179825_179974
821329	contig_13456_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_153282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	326	742	285201	284785	NA	10	CTGTCTCCTTCACTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLCLIPTSGFPRPLESNRKWCPQPAVPTPHLLPVPHIHQPPFCPQTHPVPSCLRVFVRATLTVWNKLIPQTSSGSLLISRFQVKFHLQILKLAPLTILSKAAPIPSSLKSPWVFEFSFSSKHLSPLSEHRLPSQTA	285526	284272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_284300_285500
821332	contig_6823_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_131216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	118	327	227586	227377	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSRSPSVLSPQSLPVLGVAVVACCGSRSGCEDGVYQPVSMSDCARLAEGGRVSRRPLKQPRRAKRAAGDRGGGATGLAGRSGQRRLQTAGLSGCRRGYLAVSVVAPVS	227703	226531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_226500_227700
821335	contig_6929_pilon	+	1001	5	Intergenic	novelGene_139405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7773.47555794704	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	319	408	127176	127738	TRUE	15	TAATTGCCTTTGTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEVRCGRTR	126561	132311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_126643_126938_127246_127718_127787_130707_130945_132003
821341	contig_6424_pilon	+	1359	8	Intergenic	novelGene_109264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	66.2780167944401	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	490	1125	77681	82474	FALSE	15	CTGAGCTGGGCTGTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLTRQDLNFGQVVADVLCEFLEVAVHLILYVREVYPVGIFQKRKKYNVPVQMSCHPELNQYIQDTLHCVKPLLEKNDVEKVVVVILDKEHRPVEKFVFEITQPPLLSISSDSLLSHVEQLLRAFILKISVCDAVLDHNPPGCTFTVLVHTREAATRNMEKIQVIKDFPWILADEQDVHMHDPRLIPLKTMTSDILKDALAPLLMPTCWT	77191	82708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_77721_77810_77930_79342_79415_79909_80011_81041_81137_81469_81544_82045_82139_82432
821342	contig_7707_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_72120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCATTTGTAATCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34030	33001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_33000_34000
821343	contig_9011_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_159324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTTTTGCCTCATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563333	562526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_562500_563300
821344	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_95787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	57	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
821347	SIRV5	+	411	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-7	-73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTCGTTCTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1925_2034_2119_2157_3280_3405_3483
821349	contig_10962_pilon	+	2108	8	Intergenic	novelGene_103926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.1105688599974	140	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	321	1187	732813	808850	FALSE	30	AAGTCAAGGATGCACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAQQTRVSGQAPLLTGGVNLCEPRHLLLLSLRISKIRGCCYTGELCQSKIDFCILEPCRNGATCVSNLSGFTCQCPEGYLGSTCEEKVDPCASSPCQNNGTCHADGMHFSCSCSPGFTGPACGQLVDFCALSPCAHGTCRSVGTSYKCLCDPGYHGLYCEEEYNECLSAPCLNAAPCRDLVNGYECMCLPDYKGVHCELYKDPCANVSCLNGGTCDGEALNGTCVCTPGFAGEECDIDINECDSNPCHHAGTCLDQPNGYTCHCPHGWVGANCEIHLQWKSGHVAESLTNMPRHSLYIIIGALCVAFILMLIILIVGICRISRIEYQGSSRPAYEEFYNCRSIDSEFSNAIASIRHARFGKKSRPAMYDVTPIAYEDYSPDDKPLVTLIKTKDL	690783	809771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_690904_705615_705730_732726_732952_759801_759925_772764_772879_784828_784961_797269_797517_808738
821350	contig_14341_pilon	+	624	5	Intergenic	novelGene_111836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	47	junction_1	2371.04829136819	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	187	576	550058	551737	FALSE	5	GCCTACCTGTGTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVCARAARGARRATETPRLSPQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
821353	SIRV4	-	266	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1257	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
821354	contig_8823_pilon	+	1746	2	Intergenic	novelGene_53075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATTTCCTAGCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66731	70284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_67513_69319
821356	contig_15839_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_136417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAGGAGAATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106440	106798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_+_106400_106800
821357	contig_1225_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_44211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCCCAGCAACACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306963	308900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_307000_308900
821360	contig_14333_pilon	-	1934	2	Intergenic	novelGene_49161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACTGAAAAGCTAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486827	484039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_485037_485890
821361	contig_2890_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_60273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	314	340	295187	295161	NA	20	CAGGAGCCTCAGTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPFPFRFLSRVSSHWIFLCQTDPRHWSRTGQHWVGFAGPRRWWSWSGSKCLQSACSITRPVLGPRVGRTSKVDEARAASRELRPTLQVRNRHGAQAPAPTGPQEMGVQLLMD	295500	294039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_294000_295500
821362	contig_2480_pilon	-	1142	4	Intergenic	novelGene_63508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	33.5062183283442	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	290	1087	130212	123268	FALSE	20	ATACTTATTTTCTGTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYTEYTWEVLGYCQELEFSLYYLLLPYLLLFVNLFFFTLSCVTNPGTITKANELLFLQVYEFDDLMFPKNVRCPTCDLRKPARSKHCRVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQYLFLLFPRIIFFLGFVLVLSFLLGGYLCFALYLAATNQTTNEWYRAGRAPRQHCRHEAQPLSAEPQVFQNIHSHGVWSNLREVFLPATRYEKKKK	130501	123212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123556_127197_127443_128835_128962_130073
821363	contig_8907_pilon	-	950	4	Intergenic	novelGene_85794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	4724.71036149307	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	170	382	178678	160662	FALSE	50	GAGATAATGTGAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLVYLGVQLLGHMVVLCLTI	179544	160093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_160719_177972_178039_178588_178695_179391
821364	contig_8801_pilon	-	1388	9	Intergenic	novelGene_66327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	645	956	941789	940086	TRUE	55	TTTCAAAATATTAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTSNSKESCATIDLPSMGFRTWSATKSTIEVHTRQNKFNCLFHINSIQLPQQRQCCHCTKRKSCIDFSLSFRLAPSVPMFLYADTTTTVHAGTSSRPVNSH	944352	936729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_936839_938901_939097_939693_939802_940065_940187_940882_940937_941017_941128_941742_941869_942884_943036_943938
821367	SIRV6	+	324	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	372	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1843
821370	contig_15327_pilon	+	1887	11	Intergenic	novelGene_70572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.295630140987	145	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	262	1536	688472	694648	FALSE	10	CTCCTGTCGTGGCTGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYSEQGRQRLHPEEALYLLECGSIQLFHQDLPLSIQEAYQLLLTEDTVTFLQYQVFSHLKRLGYVVRRFQPGSVLSPYERQLNLDGSTQHLEDRKGKRKRRSSSSRSIPKKSRTPESPLQGVNGTPESQATSSLAPCSQNSPFPEEKAQELSPRKDAELLGSLDPWPGLARDRVGCSQESGKVENGAPGACKPRWNFEHISFPNMASDSRHTLLLAPAPELLPANIAGREIDAESWCQKLNQRKEKLSRREQQAGARHFREDVNMDPEVQRCSSWQEYKALLQRRHLWKTQSRPPHLWDQPVTPLLSPDQADSPATVLQHISVLQMTHLADGGARLLEKTGSLEISFDVYQANAVATFRKSNPGKPYARMCVSGFDEPVPGLSTLKRLSYQSGDVPLIFALVDHGDIFFYSFRDFTLPSDLEH	687872	694999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_687924_688047_688182_688313_688372_688453_688538_688842_688942_690222_690276_691982_692085_692284_692911_693551_693613_693905_694023_694497
821371	contig_19378_pilon	+	2632	13	Intergenic	novelGene_73789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_8	54.0809578317544	393	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	337	1686	20180	49635	FALSE	30	AACACGTCTACTGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPESKKLFNIIILGVAFMFMFTAFQTCGNVAQTVIRSLNNTDFHGSGYTSMAIIYGVFSASNLITPSVVAIVGPQLSMFASGLFYSMYIAVFIQPFTWSFYTASVFIGIAAAVLWTAQGNCLTINSDEHTIGRNSGIFWALLQSSLFFGNLYIYFAWQGKTQISESDRRTVFIALTVISLVGTVLFFLIRKPDSENVLGEEESSDDQDLEVSESPQNNMTKAVDAFQKSLKLCVTKEMLLLSITTAYTGLELTFFSGVYGTCIGAVNKFGMEEKSLIGLSGIFIGIGEILGGSLFGLLSKNNRFGRNPVVLLGILVHFVAFYLIFLNMPADAPIAPVEGTDSSAYITSSKEVAILCSFLLGLGDSCFNTQLLSILGFLYSEDSAPAFAIFKFVQSICAAVAFFYSNYLLLHWQLLVMVMFGFFGTISFFAVEWEAAAIVARGSDYRSI	19843	50581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_20276_20775_20832_23010_23119_24164_24245_24377_24475_26588_26648_27175_27321_29928_29970_38367_38434_40391_40518_46836_47012_47741_47878_49470
821373	contig_10023_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_123482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATTCATGAGGGAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164277	165659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_164300_165700
821374	contig_14514_pilon	+	1299	2	Intergenic	novelGene_137467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGCTGAAATAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37765	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_38795_39482
821375	contig_20614_pilon	-	1395	5	Intergenic	novelGene_107617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.47034846243791	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	315	755	554443	543776	FALSE	25	GCACAGGCTCAGGCAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLREDCASQLNVHLAKSLPLPSNVTRPRIDLIVFVVNLHSKYSLQNVEESLRHVDASFFLGKVCFLATGAGQESRCSIHHNTVVTLAHTYRSPLLFCDLKMEDFRVTMAQRLVRMLQICAGHTPGISALSLLSLLQSPESPSLEDL	554757	543135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_543917_549276_549369_550676_550757_553091_553185_554408
821376	contig_11677_pilon	-	1148	3	Intergenic	novelGene_85886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	803	1147	277208	276864	FALSE	15	GATGGCAGCCTCCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQTRSLFFFFLIWTSSCSFETAPSFAAACALRNLLSWSWSCCCCCSFSYSGSSGHCGTKRHRQQRRSGGCWWLSLGGPVGHYGHFGCSSGHHPQSRAPGCSAGMGRVCSSRPH	281076	276862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_277852_278200_278300_281016
821377	contig_5574_pilon	-	1295	1	Intergenic	novelGene_155860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAATAAACTCAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193431	192136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_192100_193400
821378	contig_9027_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_156351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	644	991	53546	53199	NA	25	GCCTTGGCCGCAAATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSINTKIINIAYKALLNLAPSYLSRLTLHHSSSRSLFQPGWPSFSSWMAAVHMLFPLLKTPQPPPHTYPSFRSQGSHHVFNKIFPEPHQWEVLFGLCSHGTPGTHHSGIQHLA	54189	52514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_52500_54200
821379	contig_3627_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_78419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTGGTAGGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51831	51512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_51500_51800
821380	contig_19758_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_176479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCAGGCAGTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26144	24461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19758_pilon_-_24500_26100
821382	contig_5003_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_120192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGACCGCAGCTACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80114	81185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_80100_81200
821384	contig_8286_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_139782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30338	32354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_30300_32400
821385	contig_16870_pilon	+	679	4	Intergenic	novelGene_155498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8.5764535535124	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	105	536	104689	107853	FALSE	10	CACTGCACCTCTCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGARFGAWKGPKNPLLSHPWVSAELQAPPRGCRASACERVLGKCSIGKLDDLPRFTEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQARLWPGHSPPGLGTFSRAGLWIPWWVCLSGPPSWHSPLPA	104489	107996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104578_104672_104864_107515_107646_107726
821386	contig_7379_pilon	-	961	9	Intergenic	novelGene_150022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	92.3755074410961	249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	111	746	553324	537436	TRUE	20	TACCATAACGGCTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEWIQTSIAKTYYF	569936	536744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549784_553209_553328_569829
821387	contig_14363_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_112533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161553	163038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_+_161600_163000
821388	contig_2463_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_43011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAACTCCAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406775	412263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_406858_411492
821392	contig_2834_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_28021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAGGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329504	331868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_329500_331900
821393	contig_9423_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_99190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAGAAAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106390	104272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_104300_106400
821394	contig_8864_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_136012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATATCGAGTTGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759675	758397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_758400_759700
821395	contig_7412_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_76264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTCGAACCACCGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201324	201595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_201300_201600
821396	contig_14202_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_157150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	296	891	653	1543	154582	153692	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLTEEQRKKIEENRQKALARRAEKLAQQHQSTGSGSSITVNPSQSKQGSSQNPPRDSSKPVTRDVIFKQWNPTNSSNGDKRSHNSHKFRLSTPEPAEGIWKSQEEKPIACPSHRPPSQTTVTGVSPPLAQSSPEVPNQQHLGYKLGRGHAQASHKTKLTPFANTTHELLAVTVSSQETPASSPGQPPGDPELLAERVRPSTSGQTISDLHYGSGYVTPRTEGKRQQNLELSLHKEVSSQKGMCIQNGDRFQVKIGYNAELLAVFKSLPSRSYGNKPFVLFFKCFFLFLESLLI	155234	153227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_153200_155200
821399	contig_7201_pilon	+	1585	7	Intergenic	novelGene_152529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	95.9803220572958	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	129	1292	344333	358524	FALSE	5	TGTTTGTGCCTCTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLARQAGEAEEREGWSEGRPEGIPGGGHAGAGLRRVTRGAAAMAGSELRSGGSSAPTPYSDWSRLEAAILSGWRTFWQSVGKESAAPAASREEAVEEASTLTRLPIDVQLYILSFLSPHDLCQLGSTNRYWNETVRDPILWRYFLLRDLPSWSSVDWKSLPDLEILKNPISEVTDSAFFDYMAVYKMCCPHTRRSLKSSRPVYGAVTSFLHSLIIHNEPRFAMFGPGLEELNTSLVLSLMSSEELCPTAGLPQRQIDGIGSGVNFQLSNQHKFNILILYSTTRKERDRAREEHTSAVNKMFSLQNEGNDQQGSRYSVIPQIQKVCEVVDGFIYVANAEAHRRHEWQDEFSRIMAMTDPAFGSSGRPLLVLSCISQANVKRMPCFYLAHELRLNLLNHPWMVQDTEAETLAGFLNGIQWILEEVVSKNAR	344204	358817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_344522_345936_346173_348324_348546_349909_349986_350094_350271_354095_354272_358434
821402	contig_10937_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_67329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACATAATCTTACAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167277	168721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_167300_168700
821403	contig_3529_pilon	+	1726	2	Intergenic	novelGene_105374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	346	1302	734777	737540	FALSE	55	AGTGAATAAAAAATTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNSTALTLPSITYITAEILIGLCAIVGNMLVIWVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIAVGVLVMPLAIVISLDIMIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYRRVTTQRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKMTPGYNRNVTYFPCQFRSVMKMDYMVYLSFFTWILIPLIVMCAIYLDIFCVIRNKLNQKFSSSKEMSTFYGREFKTARSLFLVLFLFALSWLPLSIVNCITYFGGEVPQILLHLGILLSHANSMMNPIIYACKIKKFKETYLLIFKACVICRSSDSLDTSSEQTSE	734431	737964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_735127_736933
821404	contig_15866_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_63646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508020	506818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_506800_508000
821408	contig_709_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_57641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAGCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3011997	3013418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3012000_3013400
821411	contig_3270_pilon	-	885	2	Intergenic	novelGene_104456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATATAGTTTAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78136	70024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_70822_78048
821412	contig_13424_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_151599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	959	1279	68778	69098	NA	75	TACTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRGALEVRLKAALASWRRGIVGLTNLDFGPNWERAILSQPLCTFKFLFSKYNAESESSGLKLYIQRHTHLNMCSQVREPYSQTDTVLLTGSYKKNYYLSSLMDR	67819	69626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_67800_69600
821414	contig_8616_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_72387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTGTTGGAGTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195821	196198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195800_196200
821415	contig_18406_pilon	-	1036	6	Intergenic	novelGene_88049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	107.778290949523	1119	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	123	596	61017	43696	TRUE	20	ATGTCTTTTGAGCCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLALRNELVVDKTKRKKRRELSEEQKQEIKDAFELFDTDKDEAIDYHELKVAMRALGFDVKKADVLKILKDYDREATGKITFEDFNEVVTDWILERDPHEEILKAFKLFDDDDSGKISLRNLRRVARELGENMSDEELRAMIEEFDKDGDGENIPE	61139	42053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_42475_43676_43710_49582_49775_57039_57155_58991_59128_61000
821416	contig_1337_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_84241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423295	425163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_423300_425200
821417	contig_9363_pilon	+	1959	4	Intergenic	novelGene_6640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	652	1296	931935	933106	FALSE	15	CATTGACACGTGGCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METQTCPPHTEHGACGLQPEASQMGVLWPWLAEVHVAGDRVCTGILLAPSWVLAATHCVLRLGSTSVPYIQVYLGRAGASPLPQGHQVSRFVISIRLPRHLGLRPPLALLELSSRIEPSPSALPICLHSGGIPLGASCWVLGWKDPQDRVPVAAAVSILTPRLCHCLYQGTLPPEALCVLYAEGQEDRCEVSGPEHPGPGRGKAVLGGWSPERD	931283	933769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_931975_932122_932265_932545_932812_932909
821418	contig_11932_pilon	+	1801	3	Intergenic	novelGene_85400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	29	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	339	1310	241177	243522	FALSE	45	AAAGCTTCTTAATATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALIAENFRFLSLFFKSKDVMIFNGLVALGTVGSQELFSVVAFHCPCSPARNYLYGLAAIGVPALALFLVGVILNNHTWNLVAECQHRRAKNCSAAPIYLLLSSILGRAAVAPVTWSVISLLRGEAYVCALSEFVDPSSLTAEEKAFPPAHATEILARFPCREGPANLSVFREEVSRRLKYESQLFGWLLIGVVAILVFLTKCFKHCCSPLSYRQEAYWAQYRANEDQLFQRTAEVHSRVLAANNVRRFFGFVALNKDDEELVAKFPVEGTQPRPQWNAITGIYLYRENQGLPLYSRLHKWAQGLAGKGSAPDNVEMALLAS	236127	244013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_236326_241036_241732_243105
821420	contig_13982_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_163485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378457	379765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_378500_379800
821421	contig_8357_pilon	-	1049	2	Intergenic	novelGene_39706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	143	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAATCTATATGTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472319	470708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_471700_472261
821422	contig_5317_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_76573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTACACTTTTTCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155723	154195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_154200_155700
821423	contig_3081_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_133932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCCCCAGTTTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203746	204769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_203700_204800
821424	contig_10307_pilon	+	598	3	Intergenic	novelGene_170280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	36	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACTTGAGAACTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437738	615671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_437904_524295_524661_615603
821425	contig_10864_pilon	-	2266	1	Intergenic	novelGene_107138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGACTAGGAACTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591218	1588952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1589000_1591200
821426	contig_1225_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_44200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGGGCAACTGAGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266846	268931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_266800_268900
821427	contig_6361_pilon	-	693	5	Intergenic	novelGene_24009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5039.94903248039	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	89	427	420979	415399	TRUE	20	TGCTATCAAGACTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436353	410943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411206_415394_415504_419465_419591_420870_421003_436288
821428	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
821429	contig_7909_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_155945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCTGAAGGAGTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046304	1047950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_1046300_1048000
821430	contig_11078_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_172001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284103	286206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_+_284100_286200
821432	contig_16303_pilon	+	1183	3	Intergenic	novelGene_34057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAACAGCCCACTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32583	36447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33122_35585_35766_35982
821433	contig_16870_pilon	+	972	4	Intergenic	novelGene_155523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	3.09120616516523	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2	514	209531	211697	TRUE	30	GATATCAGTCTGTACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGPLCSSPWTLLCCRPPPKRGPGTPGLRRWARSGQNRTVPFPNSSQLCPRLSRPLKTPRCDHTPPPENPSSRPDIPSPIKTSPSSWVPTLNPGVYLHPLQRDPVPVAPTSQLFLLPHPTLPLISQSQLQAQPAPSRIPLQDSTRTLQKLPRGLPIPSAIAQVWPGQWGQ	209529	214435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_210003_211656_211779_212472_212568_214153
821435	SIRV6	+	480	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	6	-1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2747	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
821437	SIRV6	-	419	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-286	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2106	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1721_1834
821439	contig_8447_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_69458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATGAATATTATGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268529	268816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_268500_268800
821441	contig_12970_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_50558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAATCGGTTTTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610661	609527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_609500_610700
821443	contig_12543_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_168365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATTAACAGTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225595	224354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_224400_225600
821444	contig_8683_pilon	+	958	5	Intergenic	novelGene_150255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	13.0575648572006	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	69	857	597870	606012	FALSE	15	GAGGACGGCCGCCCTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLKYSKKASLDTSELERAVEVMCIVPKRCNDMMNVGRLQGFDGKIVAQGKLLLQDTFLVTDQDTGLLPRCKERRVFLFEQIVIFSEPLDKKKGFSMPGFLFKNSIKVSCLCLEENVENDPCKFALTSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWIHEINQILENQRNFLNALTSPIEYQRNHSGGGGGSSGGGGGGSGGPSSSSSNHSGGPSSCSGMPSSSRSRPSRIPQPVRHHSPVLVSSAASSQAEADKMSGTSAHGPSLPPPSSGLAPGGPPQPAEQAPSWRRM	597534	606113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_597588_597854_597933_598852_599045_602880_603059_605656
821446	contig_8149_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_169958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	559	858	744925	744626	NA	30	TTGAACAGTACCATCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTAIKFPRYIPNNKMKYKKDRLHIRIRETKVLIKVEKHTHYFRLVWESPYSKNWQTFSNSKRSEGNISDFENHMVSRNYSPLLLQHKSSNSQCVNEWM	745483	743788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_743800_745500
821448	contig_17753_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_105098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCTGTTTAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116478	114760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_114800_116500
821451	contig_19564_pilon	-	1162	6	Intergenic	novelGene_29668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	63.2600980081441	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	94	768	70080	66907	TRUE	35	AGTGAATATATGATAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFTKPASGRAHPCEEAGGRLGRRFLRSRNIMYQSCRGTTRRLSPCLRAYQTRPQNQLSPRALPFPPLWPHSTTTTSPSFPLLWSPPHPCPSTWPLLQAPSLPLPQVQALSSPWVVLPPGNGEEGLGPELHRGCLDGLRSLFEGPPCPYPGALIPFQAPGTTHSSPATPSGDPSMEEHLAVMYEKLRQELPNLFLHSHDYTLYSSDVEFINEILNIRTKNMTVSSPRQTLIYPGWTVSSLRAGIFCYSNVTNRDF	70173	66078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_66367_66452_66523_66870_67019_67454_67544_68286_68689_70008
821452	contig_709_pilon	+	999	6	Intergenic	novelGene_57605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	16.252999723128	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	3	722	2353742	2379351	FALSE	10	GCGTGTATTCTTGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTVVPGAGEMSAVAARSREGSPEEDGFGPSALGTREHWDAVYERELHTFQEYGDAGEIWFGEESMSRLIRWMEKQKIPLDASILDIGTGNGVFLVELAKFGFSNITGIDYSPSAIQLSGSIIEREGLSNIKLKVEDFLNLSTKLSGFHICIDKGTFDAISLNPDNAVEKRKQYVKSLSRVLTVKGFFLITSCNWTKEELVNEFSEGFELCEELPTPRFSFGGTSGSSVAALVFQKT	2353739	2379628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2353861_2355012_2355079_2356273_2356389_2371166_2371275_2374120_2374338_2379256
821454	contig_2251_pilon	-	1325	3	Intergenic	novelGene_128475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	24.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145275	108109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_109286_137988_138042_145179
821455	contig_7260_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_169137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTACAGATTAGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302832	301260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_-_301300_302800
821457	contig_14441_pilon	+	922	4	Intergenic	novelGene_100529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	366	722	116728	117560	FALSE	55	GGACCAAACCAATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGLSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111195	117760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_116558_116957_117236_117344_117539
821462	contig_5350_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_99370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACCCCAGTAAGATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237177	238510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_237200_238500
821463	contig_12977_pilon	+	1043	12	Intergenic	novelGene_122789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	759.259088609655	3	49	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	89	1042	10884	58793	FALSE	5	TATTTCTCCTTGGCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGQCSWLLALGRPCLGQESVLCCSRRPRMMPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAGNCLPPGPPPPVEPAVPPPLPWPCHGPRTEPSCPGDGCWPLPMESLPQGIKKCL	10795	58794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_52410_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57015_58640
821465	contig_14687_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_107980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGGTAATTTTTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812736	811578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_811600_812700
821466	contig_7644_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_64230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92817	91062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_91100_92800
821467	contig_4852_pilon	-	1578	6	Intergenic	novelGene_153979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.748331477354788	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	142	1158	139846	127485	FALSE	35	TGAAAGGAAATGTTGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLLSLILAVCTGPGLLESSHTVRLVRGPHSCEGQVEVKHRGHWYTVCDYGWDLKDVSVVCQELDCGEAKGTLPGLTPRAQENQDIFKQQFNCNGREKTLAECETEDIDDGSCSHQHVAGASCENTVQLADGPGRCTGRVEVKHQDQWGTVCKAGWNLQAAKVVCRQLGCGRAILTRGHCDDATQGQGPIWLSQVSCSGTEMTIQDCSFRNWGENNCTHDEDTWVQCEDPFELKLEGGDSPCLGRLVVLHKGVWGSVCDDGWGEKEEQVVCKELGCGDPHPLRHRLQKDFGLGVGRIWLDDVRCSGSEQSLEKCRHRFWGYHDCTHKEDVAVICSGQ	139987	127064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_127493_128226_128548_132407_132720_133845_134167_137536_137564_139818
821468	contig_10711_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_118459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATGAAAGAAAGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874023	873636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_873600_874000
821470	contig_7942_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_155324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTCAAAACTGTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12600	14432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_+_12600_14400
821471	contig_9696_pilon	-	861	5	Intergenic	novelGene_68789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_4	645.959170536343	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	13	435	255810	240665	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAAMMEGLDDGPDFLSEEDRGLKAINVDLQSDAALQVDISDALSERDKVKFTVHTKSSLPNFKQNEFSVVRQHEEFIWLHDSFIENEDYAGYIIPPAPPRPDFDASREKLQKLGEGEGSMTKEEFTKMKQELEAYVICYCCFG	255822	240238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_240818_242363_242475_243101_243207_255599_255648_255804
821472	contig_7867_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_162743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGGAATTCTTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218880	220626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_+_218900_220600
821473	contig_10369_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_171062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	229.762679495363	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACTTCTCTTTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318066	305396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10369_pilon_-_305571_310246_310350_311515_311618_317955
821474	contig_10466_pilon	-	2109	10	Intergenic	novelGene_173630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTATTCAACATCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218964	190120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_190227_194631_194858_195120_195328_200015_200155_200794_201090_205017_205193_207372_207635_209165_209239_209612_209807_218532
821476	contig_7426_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_27458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACTTGGGATGTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588758	589244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_588800_589200
821479	contig_4686_pilon	-	1438	7	Intergenic	novelGene_118543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_6	237.375932506506	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	46	1230	532011	506884	FALSE	60	TGGGAAAAGAAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMMTAGRCHTLLSPVTEESGEEGTNSEISSPPACRSPSPVANADASVNQDIAYYQALSAERLQTEAARIHPSAPSSQEFYEPGLESSTTAKLDDLQRSWETLKNVISEKQRTLYEALERQQKYQDSLQSISTKMEAIEMKLNESLELGKSPESQMAEHQALMDEILMLQDEINVLQSSLAEELVSESPESDPAEQLALQSTLTVLAERMSTIKMKASGKQQLLEEKLNDQLEEQRQEQALQRYRCEADELNHWLLSTKATLDITLGTPEEPMDMEAQLVDCQNMLVEIEQKVVALSELSVHNENLLLEGKAHTKDEAEQLAVKLRTLKGSLLELQRALHDKQLNIQVRVLGH	532056	506675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_507097_509797_509972_511588_511784_521407_521570_521780_521949_530671_530813_531879
821486	SIRV6	+	392	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	514	221	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821487	contig_20451_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_176480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1096	1473	3367	2990	NA	55	TTTGCCACAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLWAKGKRSRGLTCHKGAVEALGTARQVLWLANGGFRRFSCREKRAKELGGCVKYLMYHGKERMNLLKEYKVRWASCYFYSARRAQLEYSAAGEVAQLQEQLRWAPYCKIGGSNPLKRHLGKKA	4462	2589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20451_pilon_-_2600_4500
821489	contig_7157_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_131280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACACGCTGCTGTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830228	829248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_829200_830200
821491	contig_16535_pilon	+	1783	9	Intergenic	novelGene_167698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3.17952433549423	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	98	586	80801	95406	TRUE	35	TGGATTACATTAACCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDRAKPCELDQEKYDADENVKIICLGDSAVGKSKLMERFLMDGFQPQQLSTYALTLYKHTAMVDGKTVLVDFWDTAGQERFQSMHASYYHKAHACIMVFDVQRKVTYKNLSTWYTELREFRPEIPCVVVANKIDADIKVTQKKLQFCQEVLPASVLCLSC	79683	97054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_79747_80766_80908_89797_89828_91099_91180_91771_91852_95017_95130_95326_95426_95720_95805_95960
821492	contig_6424_pilon	-	1947	5	Intergenic	novelGene_109267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	18.7416648139913	90	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	90	581	87743	84307	TRUE	15	GCCTGGGGTTGGAGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPRLIAARFRFGCPPRAQACACARTTTAMAPVSINQLPENILLELFTHVPARELLRNCRPVCSLWRDLIDVVTLWKRKSLRDGFITEDWDQPVTDWKIFYFLSSLRRNLLRNPCAEEDMGFWRIDSNGGDHWKVESLPGGHGTNFPDPKVKKYFVTSYGMCLKSQLVDLKAEGYWEELLDTFRPDIVVKDW	89621	82834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_83289_83394_84407_85061_85189_87478_87774_89562
821494	contig_16776_pilon	-	1013	4	Intergenic	novelGene_130511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	27.3536509852382	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	268	630	57717	35073	FALSE	10	GCCCTTGTCCAACCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGSMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLPRRQRELQQRGASLCLISVTGAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	57984	34689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_41422_41487_42716_42804_57706
821495	contig_8020_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_114346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	261	533	36345	36617	NA	10	TTATTTGAGTTTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTAQTAQLQPNLVSASAAVLLTLQAAVDSSQAPGSVPPAPTTPTGEDVKPIDLTVQVEFAAAEGAAAAASELEAATAGLEAAECPMGPQLVVVGEEGFPDSGSDHSYSLSSGTTEEELLRKLNEQRDILALMEVKMKEMKGSIRHLRLTEAKLREELREKDRLLAMAVIRKKHGM	36084	37326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_36100_37300
821496	contig_9706_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_21060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTACTTTAAGGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735765	734446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_734400_735800
821497	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	GTATGGTTATGCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
821499	contig_7806_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_157531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTAAAGTACACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204816	203013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_203000_204800
821500	contig_10025_pilon	-	1195	2	Intergenic	novelGene_176481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	41790	34224	FALSE	30	AAGACTCAGAGTGTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPGLGGLADAPAPSSTSEASATSTAQQNPSTSTPKDNSQADVGGLWDRAVTTARVPRLPSLSASSSASGVDFLGPAVSNIQSHCFPHRSSFLTIERAAFLAAWSRAGPELGWGVVCVKIGHF	41791	33401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10025_pilon_-_34538_41732
821504	contig_7521_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_160554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	817	1131	320695	320381	NA	25	GAAAGAATTGTTTGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNSRPGLGLTCCCGNADSSPLLEEQLPPQSVRAADLDTKLVCGAAVQTFRRCSGQYFRITLSFYLSLEVSVHLFGRTENDHPQTVCSLGAKSYWSQVAKQLS	321511	319382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_319400_321500
821505	contig_9440_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_59060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504419	504153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_504200_504400
821506	contig_6740_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_142679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGCCAGGCAAAAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615681	615000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_615000_615700
821507	contig_262_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_140610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	359	679	8808	8488	NA	35	TTAAAGTATATACGCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERKKHFYCSLNAWSHIFIFHRVQVMSPVLPQIVSFACSHHKLLKPFPALSQREWQVSRSIGIMKDNMNESKQIDGNWGKCGKICSIERDYHSSSNQLFHGGMWT	9166	7232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_-_7200_9200
821508	SIRV6	+	367	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	1	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
821509	contig_3077_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_26825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGCAGTTGACTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484389	483681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_483700_484400
821512	contig_1996_pilon	-	1485	6	Intergenic	novelGene_131945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	508.906907007559	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAGTGCGGACCCGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511103	507991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508626_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_510673
821513	contig_11082_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_142059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGATTATCAATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142659	143722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_+_142700_143700
821514	contig_4640_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_147977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTACCTTTTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492818	494877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_492800_494900
821515	contig_2069_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_23342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAATAAATAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666777	668441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_666800_668400
821516	contig_1948_pilon	+	516	2	Intergenic	novelGene_31188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	1869	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATTTTAGGACTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552183	554587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_552302_554189
821517	contig_16703_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_72770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATTCACAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20285	19353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_19400_20300
821519	contig_9273_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_171826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAACTCTTAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53532	56012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9273_pilon_+_53500_56000
821520	contig_16315_pilon	+	1633	15	Intergenic	novelGene_166319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_14	6.46537086393064	1	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	9	1574	10210	14376	FALSE	20	TAGTCATTTTGGAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMRKPRPTGRSHRKKASRQEGGDKCVLNSSQAKPSVPDGLVRQQKKVVLQASVSPYHLFKDTAEITAFRGSLLSWYDREKRNLPWRRLAEGEVDLDRRAYAVWVSEIMLQQTQVATVIDYYTRWMQKWPTLQDLASASLEEVNQLWAGLGYYSRGRRLQEGARKVVEELGGHMPHTAETLQQLLPGVGRYTAGAIASIAFGQATGIVDGNVVRVLCRVRAIGADPSSTLVSQQLWSLAQLLVDPARPGDFNQAAMELGATVCTPQRPLCSQCPVQSLCRAHQRVKREQLSASQSLPHSPDVEECAPNTGQCQLCPPPTKPWDQTLGVANFPRKASRRPPREECSATCVLEQPGALGGSRLLLVQRPSSGLLAGLWEFPSVTMESSGQYQHEALLQELQSWAGPLPATRLKHLGEVVHTFSHIKLTYQVYGLALEGQIPVTTAPPGARWLTREEFHTAAVSTAMKKVFRMYEGQQPGACKGSKRSQVSISSSRKKPSPGQQVLDHFFRPHVPTDAPSLNSVAQ	10201	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16315_pilon_+_10322_10867_11017_11104_11145_11251_11326_11459_11502_11583_11656_11736_11851_11937_12036_12116_12262_12341_12406_12593_12786_12890_13028_13122_13276_13477_13520_14244
821522	contig_10734_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_51028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	1	540	364872	364333	NA	70	GTGGGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHFCRPQTGLSRPREIAKALSKVAIGPISSGLSRLSTRDTEAAQVISDKPKPSKGWSQVPGDTLGPAAPREPQRLATSNGACLEALVGVAPSLSSPSKTWPPGIRTAALGHQGHFLCPPQSLNIPLHSPWPSKGEQIGVLWSPLAFPGLKKNSCCGVDSKSQQPCVCQSRTVLYRVFSG	364872	363502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_363500_364900
821524	contig_5514_pilon	+	1573	14	Intergenic	novelGene_75285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_1	15.8476474277441	12	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	441	1571	78074	89195	FALSE	15	CAAGCTGATCCTGTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTGQDSTTTGQGRSRHTPHSPPHNSSVILTSKRGVKKGAVPCSSPSLAEVKKKGRMKKLSQAAEQDLIMGLQELDLNLEPKVLSGTGLVFDEQLNEFHCLWDDSFPEGPERLHAIKQQLTQEGLLDRCISFQARSAKKEELMMVHSLEYIDLMETTQYMNEVELHILANNYDSVYLHPNSYTCACLASGSVLRLVDAVLGAEVQNGMAIIRPPGHHARHSLMDGYCMFNHVAVAARYAQQRHDIQRVLIVDWDVHHGQGRQFIFDQDPSILYFSILHYVHGQFWPHLKASNWSATGFSQSQGYNINVPWNEVGMRDADYIAAFLHILLPVALEFQPQLVLVAAGYDALQGDPKGNMAATPAGFAQLTHLLMGLAG	77271	89197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_77682_78043_78173_78250_78380_78511_78601_80966_81052_81148_81190_81917_82015_82183_82282_82972_83078_83197_83267_88601_88729_88837_88904_88994_89055_89129
821526	contig_3241_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_146425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981607	983260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_981600_983300
821527	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821528	SIRV6	+	425	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	333	9	167	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGCTTGGTCACAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
821529	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
821532	contig_14890_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_122509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1060	1380	13626	13306	NA	40	GTTAACACATATAGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIRVGLYNTLTKVTSLIQCKRSFPRVSPAPPFILEEIKGKGSKQRIGDLIPPRKQHQEQSASFGPEVPALRYSQTKGRLMTRTFFQRRQRKPSPGADTLNLDF	14685	12805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_12800_14700
821533	contig_2550_pilon	-	2671	1	Intergenic	novelGene_135653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTCTTTGATGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916044	913373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_913400_916000
821534	contig_6048_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_73145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGCATGAAAAAAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025995	1026714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1026000_1026700
821535	contig_14553_pilon	+	1537	3	Intergenic	novelGene_124995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	390	junction_1	6	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	43	969	5787	14427	FALSE	35	AATTTTTGAATAGATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVEDGLDARAAIPVIKKKLVGSVKALQKQYVSSDTVVTSEDGDANIMCSALEAVFIHGLHARHIRAEAGGKRKKSAHQKPLPQPVFWPLLKAITHKHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQE	5744	14995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_6138_6387_13796
821537	contig_1435_pilon	-	990	2	Intergenic	novelGene_115521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGAATGTGTCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581939	578897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_579790_581841
821538	contig_20199_pilon	-	699	3	Intergenic	novelGene_82601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCTTAATAAAAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44105	40676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40778_40854_41250_43902
821539	contig_253_pilon	+	1998	4	Intergenic	novelGene_129610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	135.534333493604	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	424	1653	79654	82225	FALSE	5	GGCACCGTCTGTCTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTALVLVWVFCSFLSKSQVTSHSSGYSVPNERWSRSVQNSTAREAVARAENGTTERTIVGTPSPVTLTKGTLVADSHSTEVTTETTNRTEAGVTAATAGPTILVASGAPTGPTSSVPTSASQTLPAAATGHPPPSTPHAHVPTSSMLPGTAAVTSAPSTKTVAAARPSTRGPLSTHRPSGPTTGNSTAALTPATSPQAPNTPAQSPTAQLSASWSEVNRTGGSTPILSDATPKPTTLPSVAWVSTTTAGTTKAPTEEPPASTAPAPHSSPAPAAKATSATTQMPSDLTSSTRGPTGPVATQTPGWVGTEATLGTAPAGPTLSNSGDTKVPATDACPLSTQGQYLVVTTEPLVLALVNKGILLAVLLLGVTLFLAILVLFALQAYESYKKKDYTQMDYLINGMYADSEM	69872	82570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_70011_73824_74015_79558_79730_81071
821540	contig_14846_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_85390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	299	751	275648	275196	NA	10	GTGCTCTCACTGGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFVANSSWDLTGIPSPGQHICARRGPTGMMPGSVSCCMRPKPELVVRAWDLRGTAQSSVTAWLSVTAPSCFLHAHGAHQKRTRSYQSVRTCRQRFLRFLRGSALLGANSLMPLTDVRTNHTWPVSLKGKFLWLLEGAEQRLSWVALMSP	275946	274143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_274100_275900
821541	contig_9027_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_156363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGAAATGGCTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154122	156399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_154100_156400
821544	SIRV6	+	367	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	338	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
821545	contig_3975_pilon	+	1041	11	Intergenic	novelGene_54885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGGACCGGAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2091896	2099586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2092036_2092160_2092256_2092977_2093052_2093358_2093447_2093566_2093656_2096137_2096263_2096348_2096513_2097490_2097545_2097852_2097939_2099364_2099458_2099552
821546	contig_12622_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_5790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATATTTAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188121	189871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_188100_189900
821547	contig_833_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_176486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594831	593456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_-_593500_594800
821548	contig_1288_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_147910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_4	34.6914975174033	478	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	171	575	21657	28941	FALSE	15	TATGTGATTGTTTTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDDIDWLHSRRGVCKVDLYSPTGQQDQDRKVICFVDVSTLNVEDKDAKDATGSSSEGDLNLENLEEKEIIVIKDTEKRDQSKLPEVSAKAAEKGYSVGDLLQEVMKFAKERQLDEAVGNMARKQLLDWLLTNL	19585	29137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_19756_21656_21753_22822_22874_23357_23460_28785
821550	contig_10399_pilon	-	2275	2	Intergenic	novelGene_114501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	108	junction_1	0	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	24	1091	449018	410299	FALSE	85	GAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTLQKDMADLYEYKYCTDVDLIFQETCFPVHRAILAARCPFFKTLLSSSPEYGAEIIMDISTAGIDMPMFSALLHYLYTGEFGMEDSRFQNVDILVQLSEEFGTPNSLDVDMRGLFDYMCYYDVVLSFSSDSELVEAFGGNQNCLDEELKAHKAIISARSPFFRNLLQRRIRTGEEITDRTLRTPTRIILDESIIPKKYAKVILHCMYTDVVDLSVLHCSLSVGSLSEVQALVAGKPNMTRAEEAMELYHIALFLEFNMLAQGCEDIIAESISLDTLIAILKWSSHPYGSKWVHRQALHFLCEEFSQVMTSDVFYELSKDHLLTAIQSDYLQVIIYTPLKFIVIHMYTKKLICTLFYFHLG	449041	409114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_410598_448249
821551	contig_19469_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_134992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99773	100754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_99800_100800
821552	contig_5765_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_141429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTATTAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940436	938424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_938400_940400
821553	contig_3960_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_138011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTACGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364831	364068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_364100_364800
821554	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
821555	contig_14928_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_98795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTGTTGAGTACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306067	305065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_305100_306100
821556	contig_3825_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_77984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGCTTGAGATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479936	479128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_479100_479900
821557	contig_3825_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_77983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGAAAAAAAAAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477370	476477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_476500_477400
821558	contig_10040_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_176490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATGGGATAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89980	88540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10040_pilon_-_88500_90000
821559	contig_13992_pilon	-	2348	4	Intergenic	novelGene_147636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	32.8261413442938	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	32	895	447540	427983	FALSE	10	CTCCTGTGTGTCAGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSADPLLHTCTKLKGQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESARQAPTKAEKIKLLKPISGKLRAQWEMGIVQAKEAASMSVDERKAKFTFVYVGDQLHLNPCVAREAGIAMETPGEVVDSSGVSDNLESTKEEGVPVKRRRRAKLRSSAEGQESEPGTVNTTPQKTAEADPKRGVGSPPGRKKATACTPRSRKGDAVSQFLVFCQKHRDEVVSEHPDASGEEIEELLGSQWDMLNAKQKARYNTKFALVTSPQSEEDSGKRKAVLVCSA	447571	426529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_428163_435392_435864_436347_436515_447494
821560	scaffold_16539_pilon	+	660	7	Intergenic	novelGene_68405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.117292323665	368	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908231	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913631_915323_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
821561	contig_14559_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_83730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTCCTTAGGAGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335436	336287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_335400_336300
821563	scaffold_19766_pilon	+	1126	3	Intergenic	novelGene_34297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	64.5	379	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGGGGGCTGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519392	530103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_519769_528931_528981_529402
821564	contig_1107_pilon	+	1978	3	Intergenic	novelGene_126535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACATTTTCTAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115647	122355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_115924_117460_117727_120919
821565	contig_4857_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_48665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGGGGGGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023841	1025870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1023800_1025900
821566	contig_8775_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_166834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCTAAGAAATAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230854	229783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_229800_230900
821568	contig_11363_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_160504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGATTCAAACCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225822	224965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_225000_225800
821569	SIRV5	-	282	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACGTGTACCTACCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8382_8459_8590_10863
821572	contig_5643_pilon	+	948	7	Intergenic	novelGene_38733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	331.33752512439	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGCAGCTGTCCGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152320	157307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_152456_152907_153040_155745_155909_156150_156206_156463_156584_156823_156945_157085
821573	SIRV6	+	485	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	19	514	12	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
821575	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
821576	contig_3942_pilon	-	330	3	Intergenic	novelGene_128785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATCCTCCAGCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795507	793850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_793885_795076_795177_795311
821579	contig_15498_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_42620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGGTTAGGGCTGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518429	518653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_518400_518700
821580	contig_15172_pilon	+	1839	8	Intergenic	novelGene_158750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_7	144.244548583017	1	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	23	646	243174	267627	FALSE	20	GCAATAGTCTGCTCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243151	268820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534
821581	SIRV6	+	433	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	6	162	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	165	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
821584	contig_7057_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_123362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTATTCTGTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969993	969022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_969000_970000
821585	contig_990_pilon	-	955	11	Intergenic	novelGene_76037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	99.6696543587867	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	124	852	865835	849271	TRUE	60	GAAGAACGCAAAAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWKYPKGIHVETLETEKVTPRIFQG	865958	848223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_848260_849203_849341_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
821587	contig_19680_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_132011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTTAAAGAAATTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165372	167131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_165400_167100
821589	contig_11253_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_126846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATACTTAAAAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262037	259691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_259700_262000
821590	contig_6424_pilon	-	1059	4	Intergenic	novelGene_109253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	431.278976482225	348	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	240	449	7936	6307	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVCFPSLEARSPYRCHAGALGLVRDGAARREPEGNPPGSLDADNLFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21114	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842_8039_12062_12098_21012
821591	contig_5791_pilon	+	1808	2	Intergenic	novelGene_35864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACCAGAGGGGTAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079307	1081525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1080039_1080448
821593	contig_5999_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_45641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGGGAGCAATTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235202	233163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_233200_235200
821594	contig_13456_pilon	+	1519	3	Intergenic	novelGene_153259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	60	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	20	613	13362	38792	FALSE	30	TTAGAAGTTATGCTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPFSFGMNHRTPPYPAGDYCLLCRSERKDSSFLESGIKTASKLALSTAPKGSNVLHLPLWVCPDCRRTVEKEERHGLDHTSGQDFLLHNPLGGSQPEAGGSGRLALGAQTLPSAGLSNSTPADAACTCEACSERREISAETDRESQQLQNYWSEVRYMVRCIYRQAGTPLADDQDQSLVPDKEGMKELVDRYVWPLIQLPLRG	13342	39698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_13587_37409_37571_38584
821595	contig_13456_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_153267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACGTATTGTAATACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39648	40419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_39600_40400
821596	contig_7182_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_117109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGTCACACAGGAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144774	143494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_143500_144800
821597	contig_401_pilon	-	1351	2	Intergenic	novelGene_42919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	374	709	1943877	1941954	FALSE	75	ATAAAAATAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATRLPLSPFQTTKQVLGDLVHLQDILPDEGNVQGALQTQLPQLLTLGIGVEASMAKKKPNCRWVKQCRERLLERVIHIMLLRPFPFNFTKLTDNPALHHVHGQVLTGHL	1944250	1941311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1942269_1943856
821599	contig_7749_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_170872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACTAAATATAGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34711	37104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_+_34700_37100
821600	contig_4125_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_25137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	140	463	814753	814430	NA	20	TCAGATCCCGTGTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGEKQAEVDGAGTWGDLWPRHWGWTEVLERWEAGMPWAASHQPGFVSLTVPSAVLLLEACPLSCHHPSSLLPDGCVFGQSSCPLLALTRALLASPVLSPAASHTG	814892	812806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_812800_814900
821601	contig_9436_pilon	+	2012	9	Intergenic	novelGene_60919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	124	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	771	1292	441998	444031	TRUE	10	CACTGGGTGGGGGCCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTAQHHSAVLPSGTQGEVEGSKGGRTSLERFWTPWRGNCSGGLRSQTRPGPLCPPHPESPKPGGNCSPALSAAAALSVPLQLPAPENIEENLLEVFRVFISQPARVLLSPFSPRSDNFDLNFTWLRGGRRLFGDNPPFPVPLHQLWTLFFLQPFDELVDSGCQGQYCPFTL	441227	446972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_442260_442545_442661_443886_444071_444807_445092_445311_445399_446108_446169_446363_446436_446667_446779_446905
821602	contig_10135_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_106595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	125.387399685933	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	230	601	67361	70941	FALSE	0	GCTTCCTCTGGTGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEATRRVVSEIPVLKTNAGPRDRELWVQRLKEEYQSLIRIPITYPTTAPEIAVPELDGKTAKMYRGGKICLTDHFKPLWARNVPKFGLAHLMALGLGPWLAVEIPDLIQKGVIQHKEKCNQ	67131	71293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_67484_70239_70317_70562_70654_70860
821605	contig_16204_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_154519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTATGGAACGTTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376068	377631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_376100_377600
821607	contig_2854_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_120904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATATAGGATAAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300790	1301887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1300800_1301900
821608	contig_18145_pilon	+	1722	4	Intergenic	novelGene_37319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	6.18241233033047	107	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGTCTGCCTACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82275	84836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_83325_83516_83673_84166_84291_84443
821609	contig_9177_pilon	+	1639	6	Intergenic	novelGene_32812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_5	17.3827500701126	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	865	1416	1638352	1647158	FALSE	15	GACTATCTTGGCCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGYGLTQSTVGIIGLGRIGQAVARRLKPFGVQRFLYTGRQPRPQEAEEFQAKFVSAPQLAAESDFIVVACSLTPATKELCNKDFFQKMKKTAVFVNISRGDVVNQDDLYQALASGHIAAAGLDVTTPEPLPTNHPLLTLKNCVILPHIGSATHRTRNTMSLLAANNLLAGLRGEPMPSELKL	1636314	1647381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1637148_1638320_1638410_1639562_1639668_1640976_1641113_1644461_1644593_1647036
821610	contig_20842_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_160967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAACAGGTAGAAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51655	50298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_50300_51700
821612	contig_14357_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_121658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469284	467662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_467700_469300
821615	contig_11328_pilon	+	792	6	Intergenic	novelGene_88400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2297.08453479623	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	38	409	643683	645256	TRUE	55	AAGAGTGACTAATAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKEGYSRTD	643645	648005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645233_645376_647064_647223_647899
821617	contig_8972_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_167624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACACCACGGTGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234889	234097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_-_234100_234900
821618	contig_8972_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_167623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	349	420	233699	233628	NA	70	AGAAACTAGAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLCKDIAVTKHSPSVLYRPAPCPGAEAGHGQADRLFVIPSSALRGHRSCGPSSPSYSYRSTAPNADDASRKGLASSCRRSLGSTGLSSGSYLQERGREDADGDACGWVGCYDVRLMGAQPGPQPWHQEGPVARKGRHA	234047	232662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_-_232700_234000
821619	contig_4803_pilon	+	1526	4	Intergenic	novelGene_150726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTAGGATACTCCCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58537	93267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_58574_59983_60023_65589_66876_93102
821620	contig_10800_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_152625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	177	377	490321	490521	NA	45	AAAAAAAACCCCAGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKFSVGNLSETQILSRDVNLNEWTPKPCRPVALSLCLLPSPSPLPGNPPSWVLALLISMLPPWTNSSIPVALYAAPKLLKCSPSPSPDAQTHTAQPNCHLSPLEYPAGISNLTFPKHNSWFFPP	490144	491316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_490100_491300
821625	contig_11338_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_6268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCTCTGACTGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151352	150798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_150800_151400
821626	contig_7549_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_164534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGTTGGTGTGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709675	711428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_709700_711400
821632	contig_3956_pilon	+	1163	8	Intergenic	novelGene_14791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_2	106.488669513211	824	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	276	908	1164864	1176884	FALSE	20	GCAAGTGGTGCCCATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELSIGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGAEGEPHSISPRPRPPGRPISGHGVDNRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFTQDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLMNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV	1162909	1177139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1163143_1164821_1164874_1165018_1165144_1166342_1166557_1169323_1169389_1172241_1172304_1173525_1173572_1176773
821633	contig_6735_pilon	-	1145	3	Intergenic	novelGene_15814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	15	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	372	770	577409	573953	FALSE	20	GTCCAGTATCATTTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLPFIRSFSEAQQQLCNTKQEVSELRKLLEEERDQRVAAETALSVAEEQIRRLEHSEWDSVRTPIIGSCGTQEQAILIDLTSSGCRRTRSGAGWKRVLRSLCHSRTRVPLLAAIYFLMVHVLLILCFTGHL	577780	573577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_574088_574402_574509_577251
821635	contig_12520_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_161060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTCTTTCTGTAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365485	364708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_364700_365500
821636	contig_12520_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_161059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTGTTTGTTAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364603	364201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_364200_364600
821638	contig_8017_pilon	+	2014	1	Intergenic	novelGene_65350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1289	1612	886359	886682	NA	45	AGAGACAAATATTGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALLPELQRVRRDLNYYSNGEAKGPVKCEPCLELKWPQTNTLGNFSSGNNTHSNWEVLLEQSIMSSMFGREITFTPLQLYLVEQSDIHSSGIKRTLFLHKVKIKLK	885070	887084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_885100_887100
821639	contig_15629_pilon	+	1879	2	Intergenic	novelGene_122458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGTATTCTAGATTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115371	122915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_115437_121101
821640	contig_11816_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_98529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTTATTTTATTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011879	1014385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1011900_1014400
821641	contig_10196_pilon	+	764	4	Intergenic	novelGene_132111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCCAGTGTCTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922245	926562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925812_926106
821642	contig_12654_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_129311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCTGTTTGTACATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788151	781580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_782051_788041
821643	contig_12654_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_129310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGTAGAACTGCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781629	781312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_781300_781600
821645	contig_9571_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_136244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCGTATGCCCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209506	208769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_208800_209500
821647	contig_5649_pilon	+	1028	7	Intergenic	novelGene_82270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	176.87511287786	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	42	956	21190	35773	FALSE	35	AACCACTGTCTACTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTEAFKRDTNSKKMNLGVGAYRDDNGKPYVLPSVRRAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGKLTGPISASALVIVELPPVGMSPLPVWTSCLGWVWLCSHSSHNVSQAVQGRTRRGDILGFACHLYVLPVGLRLHPLER	21148	35845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_21259_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28469_35552
821648	contig_6589_pilon	+	590	5	Intergenic	novelGene_25781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1866.63989564136	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	65	556	669670	672754	FALSE	15	GCACCCCGAAGCCCCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668307	672788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668370_669667_669748_670000_670104_671046_671188_672584
821649	contig_14687_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_107969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTAACTCTGCGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730172	731790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_730200_731800
821650	SIRV4	+	209	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1562	632	1107	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2600_2800
821651	contig_17880_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_167319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACGAAAAAAAAAGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13911	12003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_12000_13900
821652	contig_8291_pilon	+	1081	11	Intergenic	novelGene_99952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.1369181623589	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	349	1080	468159	481293	FALSE	50	TCTTAAAAAAATTTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIVKQILEEAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVQVAASVKEVISAVADKLSSGEGLMIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQ	446847	481294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_446888_451515_451605_455210_455288_468016_468174_470105_470195_470940_470972_471194_471274_472604_472752_473916_474015_480608_480735_481146
821653	contig_9646_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_117474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGAGGTACATTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399639	398020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_398000_399600
821656	contig_1274_pilon	-	1998	7	Intergenic	novelGene_137787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	766	1230	117673	98345	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGTAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMHDVMFTVVEGRRGRTFFICDGLVAAVTDPHFKLEAHQGDGGALGTAFAANGLPALTTMVLSEADFLTVPHLLEVPEERLITFLTGVTVQPLRGLLPLDVHVPDDNPTITATGDELPRVLRIGEGLDFVTVSLELDGCSFSPTNVPHDDRVI	119565	88463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_89174_98286_98414_108168_108274_113873_113976_115511_115646_117618_117726_118852
821657	contig_12106_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_83736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTATCCATTGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129196	129505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_129200_129500
821658	contig_2878_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_176501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATTCAATAAGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293245	291693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_291700_293200
821659	contig_15882_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_144805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51698	52999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_51700_53000
821660	contig_3754_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_146838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAGACACAGTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357841	355457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_355500_357800
821662	contig_13149_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_116926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53485	54547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13149_pilon_+_53500_54500
821663	contig_4202_pilon	+	1436	3	Intergenic	novelGene_147069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	25	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGTGTTATTGTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28844	40624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_29871_31725_31833_40321
821667	contig_20753_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_168250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAGGTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39797	38327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_38300_39800
821668	SIRV1	-	278	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3826	0	3552	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	282	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6814	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
821673	contig_9436_pilon	+	1435	4	Intergenic	novelGene_60898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.84754619472471	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	10	567	393187	395688	FALSE	25	TCAAATCACCTGTCCACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIMAGVETGNAAGAEAPQPQKRYYRQRAHSNPMADHTLRYPVKPEEMDWSELYPEFFAPLTQNQSHDDLKDKKEERPQAQVEFADIGCGYGGLLVELSPLFPNTLILGLEIRVKVSDYVQDRIRALRAAPGGGFLPDPHFKRTKHKWRIISPTLLAEYAYVLRVGVSWEWEGGSDEWSVQGPSLRIK	393177	396556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_393300_394038_394203_395226_395347_395527
821674	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
821675	contig_11378_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_112297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACCCCTCCATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985592	984210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_984200_985600
821678	contig_1719_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_87251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTATGTACTCAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87357	88472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_87400_88500
821679	contig_12540_pilon	+	908	5	Intergenic	novelGene_148123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_2	547.382122013498	325	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	85	705	1245671	1252921	FALSE	5	GTCTCATCTGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVQRAECCLAGARARFALGLSGGSLVSMLARELPAAAAPAGPASLARWMLGFCDERLVPFEHPESTYGLYRAQLLSRLPIPEGQVITINPSLSVEEAAEDYAKKLREAFQGDSIPVFDLLILGIGPDGHTCSLFPDHPLLQEKEKIVAPISDSPKPPPQRVTLTLPVLNAARTVIFVATGEGKAAVLKRILEDHEENPLPAALVQPHTGKLCWFLDEAAARLLTVPFEKHSTL	1245586	1253124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1245803_1250202_1250311_1251168_1251271_1251605_1251747_1252783
821680	contig_11248_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_142540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAATGTATAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163357	164232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_163400_164200
821683	contig_7963_pilon	-	983	5	Intergenic	novelGene_58345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.07950414219	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	53	322	48841	43622	TRUE	60	AACGCCATAAATAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPGNYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48893	38351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38555_39293_39405_39949_40232_43556_43788_48737
821684	contig_9548_pilon	+	1191	8	Intergenic	novelGene_141055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	279.369406532144	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	23	412	127751	134402	TRUE	15	GACTGATTCGTTTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRQRGKMAANVPQRAWTVEQLRSEQLPKKDIIKFLQSHGSDSFLAEHKLLGNIKNVAKTANKDHLVTAYNRLFETKRFKGTESINKVSEQVKNVKVNDDKPKETKSEETLEEAYWRVPELRIQTNPSMNSSSTTL	127728	141972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_127859_130889_130992_132207_132316_134330_134519_137208_137341_137799_137868_139965_140064_141607
821688	contig_7179_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_78186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATACTATTCGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215736	1214557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1214600_1215700
821689	contig_5640_pilon	-	804	6	Intergenic	novelGene_27269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	11.2889326333361	290	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	129	737	920135	912628	FALSE	20	TAGACTTTTCCTAATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLIFVDKENGEVGTRVAPKDGLKLGSGSTVKALDGRSQVSTPHVGKIFDAPSALPKATRKALGTVNRATEKSVKTNGPLKQKQPTFSAKKMTEKTGKAKSSVPALDDTCPEIEKFFPFNPLDFESFDLPEEHQIAHLPLNGVPLMILDEERELGKLLDMGPPSPVKMPSLTWGSNLLQSPSSNLSTLDVELPPPCYHLDI	920752	912560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_912708_913439_913599_918104_918199_919513_919699_920044_920146_920634
821694	SIRV6	+	360	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	10	337	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821696	contig_11551_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_168474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467647	468412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_467600_468400
821697	contig_16360_pilon	+	846	6	Intergenic	novelGene_170079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	90.37698822156	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	138	728	128243	136142	FALSE	30	CTAAAATGCTGTTAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDCQCRPSSCKGICRTLLNSISFPIRALPYRRPLHLGSCSRSKDMLWSPSAAHKGGGGGWGRGFDEKENVSNCIQLKTSVIKGIKNQLIEQFPGIEPWLNQIMPKKDPVKIVRCHEHIEILTVNGELLFFRQREGPFYPTLRLLHKYPFILPHQQVDKGAIKFVLSGANIMCPGLTSPGAKLYPAAVDTIVAIMAEGKQHALCVGVMKMSAEDIEKVNKGIGIENIHYLNDGLWHMKTYK	128105	136260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_128299_129369_129523_130077_130176_133137_133272_135066_135135_136060
821699	contig_13794_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_168552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGAAATCAGGGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60087	59220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_-_59200_60100
821701	contig_934_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_129027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCAAATATGGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167820	168725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_+_167800_168700
821702	contig_18272_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_7069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTCAAGTTCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515537	512029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_512713_514111
821703	contig_11293_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_134671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGATCCCATGGCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65157	66502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_65200_66500
821705	contig_2209_pilon	-	1486	9	Intergenic	novelGene_141005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	73.8880064692505	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	26	607	248781	184503	TRUE	50	AAATGAAAAAAGTCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAAAACAMCAHNPGTEFDLSWISNIQVNQPAVLRRAEQIQARRTVKKEWQAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVPFMMRFVSFARPVERLISKPSWQQENLDVSLTSTKPA	248806	120372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_120974_122030_122181_125972_126086_184487_184617_202275_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248750
821706	SIRV6	+	448	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	18	552	11	38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCCGCTTGGTATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	1988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
821707	contig_10734_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_51147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAATTCATTCTATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890427	892567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_890400_892600
821709	contig_9706_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_21001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGGCTATGTGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477681	478101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_477700_478100
821710	contig_11512_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_43384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTACAGTGGCCAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555383	556388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555400_556400
821712	contig_9389_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_84123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGACTGAACGGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430100	1430438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1430100_1430400
821714	contig_6084_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_127052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTAGAGAAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382433	381903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_381900_382400
821715	contig_2377_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_67926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293745	293034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_293000_293700
821718	contig_7914_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_165040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACCAACTCCTGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328135	329441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_328100_329400
821719	contig_7914_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_165041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTCCACTGCAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329391	329591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_329400_329600
821720	contig_12701_pilon	-	858	6	Intergenic	novelGene_169551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	65.0765702845502	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	150	698	35628	26442	FALSE	40	CAGATATGAGAGAGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LESGRAANQKRGCEGRVSAVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKSFLPVRTALMIARYLDIFHLMDGVMKKKDEKTSSTSDAIRYPNPT	52278	26281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26578_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_52219
821722	contig_2867_pilon	-	1431	8	Intergenic	novelGene_135208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.4686461250442	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	428	907	968109	966435	TRUE	5	TGCCATGGCTGTCGTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADWMQHLCQAVSKGVIPQGVAPSPCIPCCLVITDDRLFTCHEDCQTSFFRSLGTARLADISAACSEPGKEYCVLEFSQDGQQLLLPWVIYLSCPSELDRFLSALGAAWKTIYQVDLPLKAIQEASSQKKFEDALSLIHSAWQRSDSLCRGRASRDPWC	969859	965578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_965736_966067_966573_967360_967478_967552_967733_968064_968164_968818_968885_969260_969452_969743
821723	contig_5039_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_64795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGGTTTGTTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167875	170012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_167900_170000
821725	contig_12102_pilon	-	413	3	Intergenic	novelGene_151049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTAAAACCCCACGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31351	15411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_15638_19444_19522_31241
821726	contig_1639_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_74925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCATTTATTTCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361123	359592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_359600_361100
821727	contig_9955_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_21321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATCTTATGAAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55861	55042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_55000_55900
821728	contig_9955_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_21320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTTTTCAGCAACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54786	54234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_54200_54800
821731	contig_6710_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_95028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
821732	contig_3394_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_152723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	372	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGAAATGTACAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565432	565175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_565200_565400
821734	contig_1337_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_84248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACAAACGCCAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433701	434419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_433700_434400
821736	contig_252_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_99915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCATATTAAAACTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42710	43831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_42700_43800
821737	contig_8075_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_42507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGCAAATGGTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725132	725892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_725100_725900
821738	contig_3068_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_137609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1612	1911	163550	163251	NA	20	ACTCGTTGGCACCCGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHARSFTYGLWLLLQSLVVTTDYMLHKDENLLFGPLQKQECPDSKQLWIFNSPQVGDHWISQPKEVLGNLLPTPGFCFYRQRQVSAKINIFANTIWNR	165161	162545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_162500_165200
821739	contig_16098_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_45821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTACTTTTTGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156305	155174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_155200_156300
821740	contig_9919_pilon	-	1181	2	Intergenic	novelGene_137968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTTCTTTTTGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584584	583310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_584443_584535
821742	contig_8864_pilon	+	1751	7	Intergenic	novelGene_135953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	59.0096508114468	34	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	31	1125	11740	55304	FALSE	40	AGACAATAAATCTGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIVHVACGESHNLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSVAIPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFSWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKNGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARAGKRIFIGT	11709	55930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_11966_47582_47743_50998_51076_51928_52151_53077_53170_54205_54337_55117
821745	contig_12402_pilon	-	2019	4	Intergenic	novelGene_133351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	14.0554457615387	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1668	2018	320191	319268	FALSE	25	CTCCTCTAAGAACTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRFMKNTWSSILEENSESCGNQDQHKNQKGCMRSHTVENLCENNKGSQPVKTFSWIPYQTVLKISPQEVNPFECCECGKAFMDHSSHNHQARSHTGCNTCHSKECGEACNCPPHLA	336088	319266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_319518_320090_321285_330315_330563_335761
821746	SIRV2	-	298	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4575	34	3400	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
821748	contig_5059_pilon	-	1142	11	Intergenic	novelGene_140701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	139.047473907295	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	28	594	231713	186517	TRUE	25	CCATGCTGTTGTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGSGGGSWRMKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFSYQVFLKGTTHNTMIIFLNKRKKFADAYKTFSRNIYSINS	231740	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186644_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_226820_226893_231639
821752	contig_1450_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_27434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGTGGAGGGAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419805	421539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419800_421500
821755	contig_10286_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_98412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAATGATTTAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397639	396006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_396000_397600
821758	contig_7457_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_31498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACAAAAACTTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650976	649884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_649900_651000
821759	contig_2940_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_81866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89515	87273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_87300_89500
821763	contig_15273_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_140416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAGAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18705	19991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_18700_20000
821764	contig_14514_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_137474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTATTCTTCCAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70680	71693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_70700_71700
821765	SIRV6	+	450	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	406	0	233	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
821766	contig_3948_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_53295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCATCTCCCACGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461848	1462239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1461800_1462200
821767	contig_10904_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_22595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460803	459854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_459900_460800
821768	contig_7070_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_104057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATAGTGAACATTAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223761	223358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_223400_223800
821769	contig_14209_pilon	-	1220	8	Intergenic	novelGene_88364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	11.3820481640241	149	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	178	1089	168418	52977	FALSE	55	AAAAAAAAAGACATTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAEPGSGIKWRLRRRALSPRSLRQATGPSPGPRQTRTTRRSGDADGGARVPGLANPFRMPEESSPRRTPQSALCQDLPHLVNADGQRLFCRYWKPTGEPKALVFISHGAGEHCGRYEELAQMLMGLGLLVFAHDHVGHGQSEGERMVVSDFHVFVRDVLQHVDVMQKDYPRLPVFLLGHSMGGAIVILTAADRPGHFAGMVLISPLVLASPESATTFKVLAAKVLNLILPNMSLGPIDSSVLSRNKTEVDLYNADPLICRAGLKVCFGTQLLNAVSRVERALPKLTLPFLLLQGSADRLCDSRGAYLLMEQAKSQDKTLKIYEGAYHVLHKELPEVTNSVFHEINMWVSQRTPVAGAGSPP	169865	52845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_53103_54078_54295_69935_70026_83413_83525_84975_85113_131363_131471_168293_168439_169708
821770	contig_8873_pilon	-	2173	8	Intergenic	novelGene_162898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	8.68496237346895	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	115	1086	233435	214001	FALSE	55	AGAACAAAATGAAATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSSVSAAVEDSAKQLAGKNSFKITGVVPTAPEQPASEMEKQIKSQDPRPDAPPGYNSHFVPGPPRPAVFPSAGCQGGLPMGYYSPQQPSTFPLYQPSGGIQTIQYQPGKYPLPNQCAPITWMPAPTPRPDCPPGLEYLAQLDNIHVLQHFEPLEMITGFETNNRYDVKNNSDQMVYIVNEDMEDFTRNAYRTLRPFVLRVTDCMGREIMTIQRPFRCTCCCFCCPSARQELEVQCPPGVTIGYVAEHWNLCRAVYSIQNEKKESVMRVLGPCSTYGCGSDSVFEIQSLDGVFNIGNIIRKWNGLLSAMADADHFDIHFPLDLDVKMKAMIFGACFLIDFMYFERSPEQNSGSQRDTANQQ	260102	212913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_214073_215215_215375_217221_217384_220137_220365_221274_221318_224881_225118_233362_233476_260028
821771	contig_14443_pilon	-	949	4	Intergenic	novelGene_126674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	943.141912262766	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCACTGCAGTGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39506	29097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29709_37689_37833_38984_39045_39371
821772	contig_17198_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_62432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTATTGGGAGTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222010	1220925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1220900_1222000
821774	contig_12424_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_174273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACCTATCTAACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150400	151450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_150400_151400
821775	SIRV6	+	423	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	261	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2476
821776	contig_2093_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_153018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGAGGCTGCTCATGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481234	1479523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1479500_1481200
821779	contig_10299_pilon	+	989	4	Intergenic	novelGene_79752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	23	junction_1	14.8996644257513	182	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	8	625	524552	526049	FALSE	30	CAGGCGTGTAAATTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMLRALSGLGARPQCRPSALVLLPARGRKTRHDPPAKSKVGRVATPPTVDPAEFFVLTERYREYRQIVGALRLEFVTEVRKKLYEARVGVLAERRAQEKAAEHRELMAWNQAENQRLQELRIARLQQEAQEQERRRAEEQACQARETQAWMQLKEQEVLQLQEEAKNFITRENLEARVEEALDSPKSYNWAITREGQVVRPQHKGS	524544	526413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_524764_524864_525012_525097_525222_525914
821782	contig_7853_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_172634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATTCTCTTTCAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39428	41335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_+_39400_41300
821786	contig_11126_pilon	-	1679	3	Intergenic	novelGene_138139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	0.5	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	371	826	691054	689243	FALSE	25	GAATCCTTTAGCAGCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSIPVVCIFQLDVPRHLLVYRQQLSFQHRVWDVAFEETQRLWVLQDCQEAPLVLYQPVQGQWQSVSEDDVLKKVSSHLRGNWAMLEGSAGVGDSFSSLYKASFDNMATYLHKKEERLQQQLEKRQRRKSSQPGPNGHAKKLKSGDASSGC	691424	688389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_689437_689941_690012_690862
821787	contig_6513_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_117778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTAGGCTTGCTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203849	202740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_202700_203800
821788	SIRV6	+	607	2	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10799_11061
821790	contig_6227_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_49691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGCAGACAGCCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896637	897615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_896600_897600
821792	contig_1443_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_28373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAAACATTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000680	999260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_999300_1000700
821794	contig_9698_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_82483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTCTCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132894	131048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_131000_132900
821795	contig_12293_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_165583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5239	4146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_-_4100_5200
821796	contig_15062_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_162308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274561	276094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_274600_276100
821797	contig_10569_pilon	-	2509	7	Intergenic	novelGene_44090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	16.9746543083766	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	937	1563	400672	400046	TRUE	40	ATGATGAAGTGGCAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPDRALQVCLLDQLEANPNLCSLCTVPLFCWIIFRCFQHFHATFDSTLQLPDCKVTLTDVFLLVTEVHLNRMQPTSLVQRNTRSQSEAFRSGQGLLHSLGQVAHWGMEKSLFVFSQEQVHASEMQEEDLQLGFLRAVPELGPEGEQPSYEFFHITLQAFFTAFFLVVDDKVGTEELLRFFQEWAPPGEATVASCFPDFLRFQCLGGQ	401608	384146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_384167_388062_388147_388904_388989_391574_391659_392389_392474_396092_396177_399539
821798	contig_7561_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_170571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCACTTGTCACCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15441	16425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7561_pilon_+_15400_16400
821799	contig_8487_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_111909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACATAAAACATTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85868	84570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_84600_85900
821801	contig_9424_pilon	-	391	3	Intergenic	novelGene_143795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4531	junction_2	355	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	35	370	279584	277512	FALSE	20	ATGTTAAATGCTTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	279618	277490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552
821803	contig_10708_pilon	+	722	8	Intergenic	novelGene_174351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	34.4371654952457	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	71	634	372424	430503	TRUE	45	AAATAAATCACCATGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRFCDRCHLIKPDRCHHCSVCAMCVLKMDHHCPWVNNCIGFSNYKFFLQFLAYSVLYCLYIATTVFSYFIKYWRGELPSVRSKFHVLFLLFVACMFFVSLVILFGYHCWLVSRNKTTLEAFCTPVFTSGPEKNGFNLGFIKNIQQVFGNNKKFWLIPIGSSPGDGHSFPMRSMNESQNPLLANEEPWEDEDDSRDYPEGSSSLAVETET	372353	439046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_372426_389823_389857_390610_390732_395182_395316_397919_398047_419558_419660_430456_430534_438988
821804	contig_6496_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_103539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATGCTTGCAGGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152820	1154981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1152800_1155000
821805	contig_15966_pilon	+	1690	3	Intergenic	novelGene_176502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAATAGAAAATATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15241	18491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15966_pilon_+_15295_16788_17490_17555
821806	contig_10437_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_38135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	76	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCAATCCCAGGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156189	150583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_151882_155714
821807	contig_12090_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_80481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57724	59234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_57700_59200
821808	contig_15732_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_88902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATCTCAAGTGTGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252888	251180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_251200_252900
821810	contig_9797_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_65594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGAAAAAGAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174823	175702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_174800_175700
821811	contig_10689_pilon	+	1075	3	Intergenic	novelGene_118617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3742	junction_2	42	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	120	503	57608	58411	FALSE	20	CTTGTTTGCAGAGTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGKSEITFNYKVI	51242	58983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211
821812	contig_11855_pilon	-	912	4	Intergenic	novelGene_67134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	18.5532267334343	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	50	349	2676275	2674638	FALSE	10	TCCATATGCCTGTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTTGALLIPPALFRYNTRGLIRPMSASFLSRSEIPSKQPSYSSSPLQLARREFQTSVVSRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYAR	2676912	2674074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674821_2675231_2675310_2676236_2676285_2676872
821813	contig_2716_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_173548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAAAATTTTCTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250436	250082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_250100_250400
821814	contig_3602_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_60545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCCCTCCATCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290607	291190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_290600_291200
821816	contig_6885_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_83702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACTTTGCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289791	290670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_289800_290700
821817	contig_9927_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_137102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTACCATTTCAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35676	36433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9927_pilon_+_35700_36400
821819	contig_7543_pilon	+	2765	1	Intergenic	novelGene_176507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	291	876	33	908	186362	187237	NA	35	GCTCAATATCATAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLINGKPFRLMWSQPDDRLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNRALFYLFSAFGNILSCKVVCDDNGSKGYAYVHFDSLAAANRAIWHMNGVRLNNRQVYVGRFKFPEERAAEVRTRDRATFTNVFVKNFGDDMDDEKLKGLFSEYGPTESVKVIRDVSGKSKGFGFVRYETHEAAQKAVLDLHGKSIDGKALYVGRAQKKIERLAELRRRFERLRLKEKSRPPGVPIYIKNLDETIDDEKLKEEFSSFGSISRAKVMMEVGQGKGFGVVCFSSFEEATKAVDEMNGRIVGSKPLHVTLGQARRRW	186329	189094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7543_pilon_+_186300_189100
821820	contig_8106_pilon	+	1158	4	Intergenic	novelGene_139723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	140.153090900233	147	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	89	547	37957	52512	TRUE	5	TGTGCCGCGTCCTTTACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEADSGGGGGGGGKGGLLGRERGGPGGRAMDSGAEEYELNGDVRPGFHGSPNASPLRWVGRTQPININHYANKKSAAESMLDVALLMANASQLKAVIEQGPSFAFFMPLVVLISISLVLQIGVGVLLIFLVKYDLNNPAKHVKLDFLNNLATGLVFIIVVVNIFITAFGVQKPVTDMAPQQ	37868	55180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_38032_49055_49285_52357_52522_54578
821822	contig_7411_pilon	-	1383	2	Intergenic	novelGene_136976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTGTTAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124505	122321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_122760_123560
821823	contig_9235_pilon	+	1993	1	Intergenic	novelGene_156239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGAGATGGTTTGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182517	184510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_182500_184500
821825	contig_13607_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_170218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTTATATCAGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432043	433053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_432000_433100
821826	contig_13101_pilon	-	819	7	Intergenic	novelGene_172771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTACAAAATGGGTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21579	6721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_6896_7081_7153_11885_12014_12105_12319_12842_12931_20537_20603_21499
821828	contig_10129_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_128158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATATATCACATCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514515	513613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_513600_514500
821829	contig_6279_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_164773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121060	122773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_121100_122800
821830	contig_12964_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_131729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTACCACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619529	619171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_619200_619500
821832	contig_7568_pilon	-	1946	11	Intergenic	novelGene_174000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	252.865102376742	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	909	1232	58460	28429	FALSE	35	AAAAGTCCTGCACCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTHVSRQCQPTVSSHSETAAIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNLHGSPRSAVVRRSNTSPLGFRRLGSCTPVPADPVQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLGKESL	126687	27714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_28592_50582_50721_58437_58581_64619_64681_93727_93887_103969_104059_104596_104645_116677_116761_119295_119398_125890_125965_126515
821833	contig_9243_pilon	-	1174	10	Intergenic	novelGene_60325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	243.65093428464	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	18	854	64617	20056	FALSE	25	ACCCTAAAATTGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64634	19735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20173_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
821837	contig_13800_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_153753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGAGATCTAGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214252	215952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_214300_216000
821839	contig_10988_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_104729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTACAATAACTGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91544	90738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_90700_91500
821840	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	94	3	94	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	430	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5064	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
821847	contig_13510_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_164196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTGAAATTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44886	43711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_-_43700_44900
821848	contig_11931_pilon	+	1109	2	Intergenic	novelGene_159900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGAGACTCTGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120124	135327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_+_120486_134579
821850	SIRV6	+	331	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	542	0	376	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1679	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821852	contig_710_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_162942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAACAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256745	255380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_255400_256700
821854	contig_10404_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_138689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113664	1112301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1112300_1113700
821858	contig_15371_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_151431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	139	321	23591	23409	NA	35	GGGCAGAGAAACTAGACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THLVGAGIVGRCSADHTGWTQVSQRIHPPPPWCLKNPQPLLKVNAVMIMMLKYLCDRVPTNARHRGLLILAAVSEVDAPYFTPWALSSICNKELMCLLHGLVMRIK	23729	22745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_22700_23700
821861	contig_3386_pilon	-	856	7	Intergenic	novelGene_34536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	779.879834048525	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	98	592	409604	404912	TRUE	35	AAAGTTTTGGTTATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	412191	404176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404234_404704_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
821864	contig_18081_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_23822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192292	192812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_192300_192800
821866	contig_9900_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_159507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1224	1598	126332	125958	NA	75	CAAAAAAGAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRTCMLYRSFTWVSALISLVLAESRDTIRFSYNRAIMALFRLHAVNPHHNILSFFLNNCFNAFYWIAVCMMFPDKWNVSASFCTQVSFSFPRVQGVSMYFLSFPFSRAGLVINDPLGYYDVM	127555	125391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_125400_127600
821868	contig_6589_pilon	-	893	6	Intergenic	novelGene_26208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	156.937694643448	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	305	811	2031410	2028014	FALSE	30	ACAATCATTGCATGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAVPPILRQTFWRSYWVTWYWPQSQMGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEDLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2032519	2027931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2030428_2030623_2031381_2031453_2031545_2031718_2032429
821872	contig_50_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_122220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATCATTTGCCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68065	67681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_67700_68100
821873	contig_8691_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_72691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_2	63.9902336298282	39	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	59	475	106100	144073	FALSE	40	TATGACAAGGATTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSEWLLLRKGNITLQSKMGNITIDSFSGCLKASTHQGSIDVHVSQLGEVDLKSHKGSIIVKVPSSLQTHLQLSGKEVDVNSEVHVQEIAEAHKDDGVTITGIMNEAGKHEKWIKADAPKGTVSFRSQSWFQSLQLQD	106041	144983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_106131_119013_119056_128309_128406_131745_131881_143960
821874	SIRV6	+	401	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	130	0	-57	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2415	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
821875	contig_6410_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_108651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAAGTGTGTGCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476650	475347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_475300_476600
821878	contig_13740_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_34783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAATAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831634	829116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_829100_831600
821880	contig_1666_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_160591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751412	750399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_750400_751400
821881	contig_14871_pilon	-	1196	4	Intergenic	novelGene_63684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_3	36.0647565729573	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	85	1194	184506	73450	FALSE	20	AACTGTATCTTCTTTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLVAYDDSDSEAEPEPAGSLTPAGQMKDTPGVGKPCGWDFAPGLLDMTEGGPQPTHPGPEALSSLCEGPGGHCLPLVQLGRGDRRSCPSQRLQWPRQEPAVTFPTSEPPHPSPWTSRAPAGHVPPAAARFKGAKLSWDTCDYPEPTFCRQAKSRVTGKIDSSCQKKRREDCVVPYTPKRLRQMQAVNTDTGTSAGVEPQGPSARGTPGPAPLCVAPRVSEFIRPYLDSQYKETKIPRNVLFHLRGHGGPVNGIQWCPVLSQSHMLLSASMDKTFKVWDAVDSGHCLQTYTLHTEAVRAARWSPCGQRILSGGFDFALHFTDLETGTQLFSGQSDFRITTLKFHPKDHNLFVCGGFSSEIKAWDVRTGK	193612	73447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_73581_89808_89957_183675_184547_193568
821883	contig_6192_pilon	-	1649	10	Intergenic	novelGene_170324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.07634712297	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	80	1489	123448	111394	FALSE	20	ATCAAGTTGGCTTGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVPAIKPSREEFLSSRMLMPQDIMAYRGREVVDNTLPLRNAPGCESRTFPPSLYSGLSTPPASYPMYSHLPVSSFLFSDEELRDARMPMANPFPKERALPCDSARPVPSEYSRPTMEVSLSVCHNNIYSPKEAAPEDARSDMHYSVAEGPKPAAPSARNPPYFPCDKASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPRT	135717	111233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_111402_112329_112451_114911_115050_115166_115298_116340_116459_118638_119150_121262_121485_123287_123460_124896_124936_135688
821884	contig_5598_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_148289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTCATTAACAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605433	604571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_604600_605400
821886	contig_3103_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_146210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCTTTCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150091	148335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_148300_150100
821888	contig_7410_pilon	+	1860	2	Intergenic	novelGene_106124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	283	junction_1	0	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAACAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633178	639867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_633816_638644
821889	contig_5954_pilon	-	959	5	Intergenic	novelGene_28471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	64.1502143410293	350	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	62	616	187314	180716	FALSE	10	CTCCTGGCTGAGTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLTILKKMKEKERELRLLMLGLDNAGKTTILKKFNGEDIDTISPTLGFNIKTLEHRGFKLNIWDVGGQKSLRSYWRNYFESTDGLIWVVDSADRQRMQDCQRELQSLLVEERLAGATLLIFANKQDLPGALSSNAIREALELDSIRSHHWCIQGCSAVTGENLLLGIDWLLEDISSRIFTAD	187375	180372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_180851_181846_181928_183697_183861_183957_184069_187249
821893	contig_960_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_108201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTACTGAGTTTTGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95450	93851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_93900_95400
821895	contig_14516_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_153923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCATCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249618	251276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_249600_251300
821896	SIRV6	+	320	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	509	44	343	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821897	contig_6589_pilon	-	396	5	Intergenic	novelGene_25857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1448.45562151555	107	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	17	394	959104	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	959120	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956779_959098
821898	contig_3320_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_133068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGCAATTTGACTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178024	177235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_177200_178000
821899	contig_17068_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_172572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAAGGCACTGCCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104272	106520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_104300_106500
821900	contig_116_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_154904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAGGATTAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305864	304896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_304900_305900
821901	contig_13888_pilon	+	744	4	Intergenic	novelGene_151781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	683.24048149649	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	132	662	337589	361893	FALSE	65	CAAAAAAAAAATCATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQLTKSETKSNVTTLFSIQSGRYTYVTDTPLSFSLLVH	337457	361975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_361679_361707_361809
821903	contig_5419_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_15544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACAGGGCTTAGTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442394	443177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_442400_443200
821906	contig_16382_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_160234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAGTCATTTCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260597	258873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_258900_260600
821907	contig_10016_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_117872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACAGTCTACTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427536	429682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_427500_429700
821908	contig_4659_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_118249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTTCTAGCAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846883	846525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_846500_846900
821910	contig_7569_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_114596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGAAAACAAACTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129816	130702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_129800_130700
821913	contig_9177_pilon	-	1435	5	Intergenic	novelGene_32667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	458	1030	154707	153728	TRUE	10	GCGCAGCCGCACCTCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRNTACLSSLGKGSLPQGRVHVPKGPGPKPHSAGTDAADSGPSWAHKAQFLLLIDAQLVTTAPGPGSRWDPVVSLGTRGQQEAHAAGDEHMPNAVNVEVVVPGFHKSIEQDSTACNKAAWAQVEEPAAPRGWVTVPAADAAYCPGCGQDPQGEETGSKQVPESMPVKLQSHGQQHSPQQIQHLLDHRL	155164	147883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_147981_148242_148424_153600_153747_153910_154029_154271
821915	contig_6710_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_94851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTCAGGGTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	653757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_653800
821916	contig_10324_pilon	+	1099	4	Intergenic	novelGene_7842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	51.2661898547398	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	68	544	283476	295997	FALSE	15	GGCCTCTCTGGAGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKENGFRRGFDHLGCSV	283408	296552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287181_287272_295950
821917	contig_5643_pilon	-	1210	3	Intergenic	novelGene_38982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	3.5	185	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	140	931	555049	553320	FALSE	25	CAGAAACCTGTTCATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTALAGGSSSTPTPQTLCPDLSCPEGLEELLSAPPPDLGAQRRHGWNPKDCSENIEVKEGGLCFERRPVAQSTDGARGKRGYSRGLHAWEISWPPEQRGTHAVVGVATALAPLQADHYAALLGSNSESWGWDIGRGKLYHQSKGPGAPQYPAGPQGEQLEVPERLLVVLDMEEGTLGYAIGGTYLGPAFHGLKGRTLYPAVSAVWGQCQVRIHYLGERRAEPHSLLHLSRLCVRHALGDTRLGQVSALPLPPAMKRYLLYQ	555469	553040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_553448_554385_555129_555409
821921	contig_10197_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_115240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978511	977065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_977100_978500
821922	contig_4604_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_19177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGCCAAAAAGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376482	374738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_374700_376500
821923	contig_14215_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_59350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25968	24455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_24500_26000
821925	contig_11429_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_60439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCATGGTGGCGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22302	22898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_22300_22900
821928	contig_602_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_134963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530362	531533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_530400_531500
821929	contig_7057_pilon	-	1074	6	Intergenic	novelGene_123229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	44.7392445175374	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	249	689	538082	537363	FALSE	10	TGCTAGCCTGTGGGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRYLGTGLPRLLIPRGQPGYPESGLILSLSDSTPSPLCPEASPSYILRSAPES	539281	536977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539195
821930	contig_9437_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_141730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGATAAGAAAAATACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236985	235799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_235800_237000
821931	SIRV6	+	222	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	486	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11029_11109_11205
821932	contig_5799_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_50282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTTGAAAATAATTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319976	318459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_318500_320000
821933	contig_7189_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_117670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCCACTTTTCAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078833	1077671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_1077700_1078800
821934	contig_11498_pilon	-	1704	9	Intergenic	novelGene_65516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_8	440.032225382414	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	282	785	176010	174697	TRUE	45	ATTAATAAAGATGTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSALKGKASQKAPTKATLIEANRAKNLAITLRKGNLGADRICQAIETYDLQTLGLDFLELLTRFLPTEYEHSLIARFEREKRPIEELSDEDRFMLRFSRIPRLPERMATLTFLGNFPDTAQMLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQSLDVLLEMKSTDRKQTLLHYLVKVITEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGTGVGPSGLWVRRGAQPGTIGLGSVGEWQGDHRMSTIGVGVLLL	176729	172663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173555_173677_173933_174030_174180_174283_174499_174955_175035_175117_175666_175736_175914_176150_176587
821935	contig_17194_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_155375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGAGGAGAAAGTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253222	254304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_253200_254300
821936	contig_6279_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_164766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACAGTTGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93863	94930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_93900_94900
821937	contig_8259_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_148888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278283	280679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_278300_280700
821938	contig_8686_pilon	-	2569	14	Intergenic	novelGene_154684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	11.9768020348609	7	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	174	1433	376169	249028	FALSE	0	CTTTTCCTCCTCCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AITLLTELIRENFRNSKLKQCLLPTLGELIYLVATQEDKKKNPRECWAVPLAAYTVLMRCLREGEERVVNHMAAKIIENVCTTFSAQAQGFITGEIGPVLWYLFKHSTVDSLRITTISALCRITRHSPTAFQNVIEKVGLNMVLNSLASAICKVQQYMLTLFTAMLSCGIHLQRLIQEKDFVSTIIRLLDSPSTSIRAKAFLVLLYILIHNREMLLLSCQARLVMYIERDSRKTTPGKEQQSGNEYLSKCLDLLIRHIVQELPRILGDILNALANVSGRKHPSTVQVKQLKICLPLMPVVLHLVTSQVFRPQVVTEEFLFSYGTILSHIKSVNSGETNIDGAIGLTASEEFIKITLSAFEAIIQYPILLKDYRSTVVDYILPPLVSLVQSQNVEWRLFSLRLLSETTSLLVNQEVGDDKKEASLDSDSNLLALVRDVLLPQYEHILTEPDPVPAYALKLLVAMTEHNLTFTRILSG	384182	247891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8686_pilon_-_249044_250908_251002_268491_268637_268733_268786_282264_282360_282458_282511_290593_290651_290817_290940_292379_292514_317514_317643_361074_361258_369543_369706_376148_376233_384072
821939	contig_20378_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_159574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAATATTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112268	110199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_110200_112300
821943	contig_11932_pilon	+	479	4	Intergenic	novelGene_85412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_2	151.772490553753	6791	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACAAAGGCAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285538	291338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_285670_289580_289677_289769_289863_291179
821944	contig_14618_pilon	+	1151	3	Intergenic	novelGene_136821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACCAGTGTGGATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018160	1031933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1018735_1029281_1029378_1031452
821945	contig_1008_pilon	+	1627	10	Intergenic	novelGene_121538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.846929339383	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	191	949	280354	329175	FALSE	50	TTTAATAAAATATTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNPIKTLKTNTIGTLNMLGLAKRVGARLLLASTSEVYGDPEVHPQSEDYWGHVNPIGPRACYDEGKRVAETMCYAYMKQEGVEVRVARIFNTFGPRMHMNDGRVVSNFILQALQGEPLTVYGSGSQTRAFQYVSDLVNGLVALMNSNVSSPVNLGNPEEHTILEFAQLIKNLVGSGSEIQFLSEAQDDPQKRKPDIRKAKLMLGWEPVVPLEEGLNKAIHYFRKELEYQANNQYIPKPKPARIKKGRTRHT	266009	329853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_266191_280344_280412_289286_289347_292120_292243_308208_308329_318553_318598_322911_322973_326154_326213_327713_327818_329043
821946	contig_7593_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_127295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175544	176222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_175500_176200
821948	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
821949	contig_11448_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_66388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGGATGTCCCATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401397	399220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_399200_401400
821950	contig_19957_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_57734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296794	295559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_295600_296800
821951	contig_6589_pilon	+	1253	8	Intergenic	novelGene_25989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	225.368088934978	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	762	1085	1383587	1383910	FALSE	20	TTAATTTCCTGTTGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLMTGLLESLVLMAPMVQRRRAGIATGNDGGATGASGSGAGTGTGTGTASTSGESGVVSGAGMRPEVGVVVVARTTGWRVWAMTVETCIWSLRGATDTWLQRTGI	1367470	1384078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1367488_1371811_1371877_1372042_1372106_1373899_1373982_1374638_1374699_1377082_1377185_1383102_1383191_1383302
821953	contig_6726_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_86208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTATACTATTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13050	12029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_12000_13000
821954	contig_13831_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_160994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGAGATGTTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110669	112748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_110700_112700
821955	contig_9272_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_125914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTATAAGGCCCCATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307953	306401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_306400_308000
821958	contig_14034_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_72625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	656	1051	76786	76391	NA	25	CTTGTCGGAAGAGATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQLPVCRTGAHPAKLMHCNHSHHASLQSSEASSVEEERPVFLVLKAVDPQWLEALERGEDGATSPHCSVSFQQYIYLRRVIGTHAAQLLLQAVRETTEHRAAPAEQDVRHEVPFEGDVTLVEAGHRLGV	77441	75857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_75900_77400
821959	contig_12300_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_176509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATTAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87857	86870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_-_86900_87900
821960	contig_7066_pilon	-	1132	6	Intergenic	novelGene_42199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	42.8980186022618	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	61	603	1035034	1029451	TRUE	45	GGAAAATGCAATGGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRTLSSAPALWASIPCPRSELRLDLVLASGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLYCTVYRGNKGQVGKPTQEELQAIRSYFQLDVSLAQLYYHWGSVDPHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICSSNNNITRITGMVERLCQAFGPRLVQLDDITYHGFPSLQALAGG	1035094	1028459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1028795_1029107_1029158_1029306_1029459_1033225_1033406_1034370_1034619_1034927
821961	contig_8571_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_169175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGACAACTTAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428968	430581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_429000_430600
821967	contig_13201_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_130895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTTTATGGCATTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541755	542074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_541800_542100
821969	contig_7171_pilon	-	1174	6	Intergenic	novelGene_101364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	21.3354165649513	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGACCTTGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357618	1353397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1354041_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398
821970	contig_7411_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_136977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127369	129094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_127400_129100
821971	contig_1009_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_121717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCTATATTCTGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79861	81748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_79900_81700
821972	contig_7457_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_31542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769773	767196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_767919_768701
821973	contig_8616_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_72601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAACTTCATTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436216	434550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_434600_436200
821974	contig_299_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_129521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAGGAAAAAAGTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1732006	1732247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1732000_1732200
821975	contig_15457_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_168454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTACAGCTTTCCTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17041	16368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15457_pilon_-_16400_17000
821976	contig_12694_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_171980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAGGTATATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244679	247043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_244700_247000
821978	contig_8980_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_73995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTCACCAAATGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89901	88311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_88300_89900
821980	contig_8616_pilon	+	1075	7	Intergenic	novelGene_72388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_6	44.0053658344323	10	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTACCTCTCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196150	199002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479_196914_197236_197268_197609_197657_197845_198124_198540_198588_198825
821981	SIRV6	+	342	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	28	337	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCGAAGACGCTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
821982	contig_4103_pilon	-	760	3	Intergenic	novelGene_51976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	47	495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	95	373	178679	177340	TRUE	10	TGCCTTGGTTCTAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARGRLSPPQAQSCAPRPQHQPPAFPSLLAMSTSTSCPIPGGRDWLPDCYSTTPGGTLYASTPGGQRAGLGSARREQAPGSSTTESSCWSARTHPLPGHPPAASLRFPGSQLQQHHSPSWRS	178773	176805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_177160_177306_177478_178538
821984	contig_19934_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_166635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTATAAATTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278519	278190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_278200_278500
821985	contig_19934_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_166634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTTAGTGCCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276729	276129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_276100_276700
821987	contig_6418_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_81174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560687	561888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_560700_561900
821988	contig_1406_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_25641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTATAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2683584	2685023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2683600_2685000
821991	contig_5019_pilon	-	290	3	Intergenic	novelGene_109215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGGTAGATTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267396	241693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_241811_266560_266699_267361
821993	SIRV6	+	423	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	17	19	17	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAATAGTGCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2533	10796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
821994	contig_6102_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_32061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_7	46.1107805359295	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	206	991	591254	588940	FALSE	85	AATGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASGSQGRGARILIVNSGFSRPSEAGNEGAGRSRRQGRWSWCRTRSGNEEPLQEPPVGAGTATPTRRQMAQWEMLQNLDSPFQEQLHQLYSNSPLPVDIRQYLAAWIEDQNWREAALGNDDSKANMLFFHFLDQLSYKCGPCSEDPECLLLQHNLRKFARDIQAFSKGPAQLAEMIFNLLLEEERILIQAQRAQSDQKEPALDAPVESQQHEIESRILELRAMMEKLVKSISQLKDQQDVFCFRYKTQTPVRTPSLDHHQARQQQLLQETINELDKRRKEVLDAVKALLGRLTTLIELLLPQLEEWKVQQQKACIGAPLDRGLEQLEKW	598653	588655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_589093_589255_589342_589720_589797_589888_589979_590356_590453_590810_590965_591123_591262_598455
821995	SIRV6	+	387	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	441	28	268	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTTCGTCTTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571	2512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
821998	contig_11978_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_63091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2699.5	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829100	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1831161_1831273_1831759
821999	contig_6079_pilon	+	942	3	Intergenic	novelGene_160077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	323.5	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	18	560	394897	478259	FALSE	20	TAACAATTGTTGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSCVMSNMTGSRICCNFLNMWKKSKISTMYYLNQDAKLSNLFLQASSPTTGTAPRSQSRLSVCPSTQDICRICHCEGDEESPLITPCRCTGTLRFVHQSCLHQWIKSSDTRCCELCKYDFVMETKLKPLRKVLNPAPGNRFLLFYYEGERRTTLSPKYPMALHTGLYIKDAKYFDAWWTKMEEN	394879	478641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_395097_439214_439396_478097
822000	contig_4531_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_47936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTGCAATTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691340	692156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_691300_692200
822001	contig_11017_pilon	+	753	4	Intergenic	novelGene_128075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	536.233987069907	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTTTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233683	295075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_268803_268855_294659
822003	contig_6634_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_171136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTGGGATGAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124518	123472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_123500_124500
822005	contig_21203_pilon	+	1135	2	Intergenic	novelGene_84472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	919	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	100	438	53950	93370	FALSE	85	CAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTVCANL	53850	94067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211
822007	contig_5988_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_16118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAAGAATGACAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225278	1226715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1225300_1226700
822010	contig_8907_pilon	-	564	4	Intergenic	novelGene_85819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3234.77782166806	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATCTTTCTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179864	173399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173521_178588_178855_179391_179544_179839
822012	contig_11126_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_138148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATGAAATGATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800531	799270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_799300_800500
822013	contig_14341_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_111763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242089	242549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_242100_242500
822015	contig_3754_pilon	+	828	5	Intergenic	novelGene_146839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	46.3546114210873	115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCTATGCTGCATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358350	422179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_358481_403487_403631_408103_408143_420785_420922_421799
822016	contig_11908_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_133242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTGTCTTTAGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794781	793146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_793100_794800
822017	contig_3942_pilon	+	857	4	Intergenic	novelGene_128794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	16.1107279647928	155	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	130	384	820672	821322	FALSE	25	AGACGTCTGGAACTGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALEVHVDPVGPLDKVRKAKIRVKTSSKAKVESEEIQDNDFLSCMSRRSGLPRWILACCLFLSVLVMLWLSCSTLVTAPGQHLKFQPLTLEQHKGFMVEPDWPLYPPQSHPCEDSPPPYQLKLDLTQL	820145	821795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_820165_820561_820680_820783_820902_821193
822018	SIRV5	+	388	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-7	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
822020	contig_12250_pilon	-	1060	11	Intergenic	novelGene_80713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	352.543671053672	2	57	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	78	770	401239	399049	TRUE	25	CCATCAACCCAAGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVSTEGSRKGLSGRRGSEKPRASPTLLQPLTRVEVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQEKVFELMTTLQTKLEGFHTQISKYFSERGDAVTKAAKQPHSPSG	401316	398582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399064_399134_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401101
822021	contig_9888_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_162273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACCAAGAACCAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210697	209070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_209417_210472
822022	contig_9888_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_162272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCCTTATATATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209120	208418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_208400_209100
822023	contig_13256_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_176517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTTCTGCTTTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21937	23579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13256_pilon_+_21900_23600
822024	contig_1450_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_27380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	156	488	246994	246662	NA	60	ACTGAAAAAAAAAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVQTFWVQPRAPSAMSLSINPNWSWYWLSLVQSPAQAPETWPSFPASLTKEGKWRRSCLPRLHSSPTIHQPQDSALVTPLFFPVSSFSHVPGSQSCWEYQLRQYIWCD	247149	245797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_245800_247100
822025	contig_8452_pilon	-	761	4	Intergenic	novelGene_48105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	1344.50908017264	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	44	397	991128	962980	FALSE	15	TGTTTCAGGCTAGTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANSCCLCWADVPVCETKVLRWLPRREDAEHTWVHIRETHHPIPVPHVPRWYTQLLPHPLFRK	991171	962615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_981637_981738_991058
822027	contig_18735_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_132668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATAACGGACTGAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5821	6984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_5800_7000
822028	contig_15066_pilon	-	1155	10	Intergenic	novelGene_149550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	176.019429342822	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	55	1029	114591	111830	FALSE	25	TAAATTCAGGGTTTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRRFTERQAQEAD	114645	111703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112087_112275_112392_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114541
822029	contig_2646_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_69710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGGAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2549021	2549659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2549000_2549700
822030	contig_8330_pilon	+	846	8	Intergenic	novelGene_71909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_4	92.6289503825861	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	54	386	1254118	1258834	TRUE	20	TAAAGGAGCGTGTGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQAGQEEEIPGPGPPGEMRFRFCGDLDCPDWVLAEISTLAKISSVKLRLLCSQVLRELLGQGIDYEKILKLTADAKFVRPSIAWMASPCPVNCSSWGCPKSMRPASVVAMRRSRAPCRSTCEPAACA	1254064	1259383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1254121_1257178_1257251_1257473_1257540_1257753_1257794_1258140_1258209_1258387_1258469_1258831_1259009_1259097
822031	contig_9373_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_162728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGCCATTGAGTCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287506	286088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_286100_287500
822032	contig_3409_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_172311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAAAATGAAACTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155292	157201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_155300_157200
822034	contig_5981_pilon	+	326	3	Intergenic	novelGene_35523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	22	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	17	325	176470	200751	FALSE	45	AAAGTGCATCTGCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGDRSMSATRAKKVKMATKSCPECDQQVPVACKSCPCGYIFISRKLLNAKHSEKSSSSTENKHEAKRRRTERVRREKINSTVNKDLENRKRSRSNSHSDHIRRGRGRP	176453	200752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_176536_183650_183748_200605
822037	contig_120_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_165253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	39	junction_3	21.2289111041209	186	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	2	436	118850	111483	FALSE	60	TGAAAAAGAGAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANKQDKEGALGEADVIECLSLEKLVNEHKCLCQIEPCSAVLGYGKKIDKSIKKGLYWLLHIIARDFDALNERIQKDTTEQRALEEQEKRERAERVRKLREEREERERDQAELDGNSGLTELDPEPITVNPFQPIASVIIENEKK	118851	111480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_111495_114441_114557_117708_117912_118745
822038	contig_4364_pilon	-	393	3	Intergenic	novelGene_652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAAGACTGAGACCGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531297	1530457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531002_1531078
822039	contig_12128_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_131968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	38	304	140540	140806	NA	60	AAAAAAAAAATTGCATTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETKQKIYNTELTMLLALCLPSTLRNIDFQEKTSILYHGRSSQPPFPPSSPNTSYLHPTFQSTYTSQCLTAAWIFSQALSLFSGSPLPRLLLLIRQTHTHL	140502	142133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_140500_142100
822040	contig_11370_pilon	+	647	3	Intergenic	novelGene_98740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	29	418	145864	148303	FALSE	40	AGATTCCACTAACAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145835	148532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
822043	contig_6576_pilon	+	1075	3	Intergenic	novelGene_42392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	126	614	1301228	1303819	FALSE	20	AGAGAAGTTTCCTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTRIYIYTCYLFYVHICIHPYTNTPIPIHMCSNICFYFGHAVFTTSTFSATFPITKKKGKNKSLRSKVYFSLALLSNEHWTL	1295651	1304280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301473_1303575
822046	SIRV4	-	433	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1051	-37	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTTACAGTTTAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4107	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3700_4100
822047	contig_2043_pilon	+	907	2	Intergenic	novelGene_169895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	329	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	66	605	638792	640585	FALSE	10	GCTATATTGTGGTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEASSGQFRQENAAGRSSACVMHRQNFRPPTPPYPGSGVGGWGSGSSFRGTPGGSGPRPPSPRDGYGSPHHTPPYGPRSRPYGSSHSPRHGSSFPGGRFGSPSPGGYPGSYSKSPAGSQQQFGYSPGQQQSHPQGSPRTSTPFGSGRGREKRISNEVESYFKPSMLEDPWAGLEPISVVDISQQYSNTQAFTGKKGRYFS	638726	640887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_639131_640384
822049	contig_16185_pilon	-	815	4	Intergenic	novelGene_144734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	120.006481306451	308	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127431	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82251_110559_110665_111387_111496_127364
822050	contig_17753_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_105086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	281	667	82153	82539	NA	25	TGCAAAGGCCGGGAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRPLGIISLFFSPSIISQPSSLLRPLPPACGERNWENPISGGLGSFAWGFGCLLCDAHSLVCVLTRVPALHGSVNQTKKPTAAGSMPTPSNAVGQSRTAPQGFQRCNLYRSILLHLSAAEGLVGLNC	81872	83615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_81900_83600
822051	contig_17501_pilon	+	1474	5	Intergenic	novelGene_174154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.90512483795333	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTGAGCGTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32776	69983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17501_pilon_+_32961_67154_67300_67652_67754_67843_67974_69069
822052	contig_6684_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_168588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATCATATACAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44116	42711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_42700_44100
822053	contig_5033_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_28892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAATTAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432697	431308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_431300_432700
822054	contig_5485_pilon	+	2353	8	Intergenic	novelGene_37783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	85.3487443566999	18	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	417	1580	673770	681071	FALSE	25	TGCATGTTCAGATAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYVIGGITVSVVAFFFTIKFLFELAARVVSFLQNEDRERRGDRTIYDYVRGNYLDPRSCKVSWDWKDPYEVGRSMAFRVHLFYKNGQPFPAHRPVGLRVHISHVELAVEIPVTQEVLQEPNSNVVKVAFTVRRAGRYEITVKLGGLNVAYSPYYKIFQPGMVVPSKTKIVCHFSTLVLTCGQPHTLQIVPRDEYDNPTNNSMSLRDELNYSLSIHELGPQEEESAGVSFEKSVTSNRQTCQVFLRLTLHSRGCFHACISYQNQPINNGEFDIIVLTENEKNIVERNVSTSGVSIYFEAYLYNATNCTSTPWHLPPMHTSSSQRRPSTAVEEEDEDSPSECYTPEKVKKPKKVYCYVSPKVGMPILASKSPCQIYLVFGNKNHEITV	653779	681844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_653837_670487_670802_673724_673786_674741_674969_675926_676165_679771_679942_680208_680390_680739
822057	contig_10135_pilon	+	654	6	Intergenic	novelGene_106649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3321.94039681629	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	67	354	116715	120008	FALSE	35	ACCTGAAGTACAGCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYSCALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPPDSTPVMTLAPH	116648	120308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801_119853_119966
822058	SIRV4	+	262	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1509	632	1054	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
822059	contig_6102_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_32042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACAAACTGTTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554227	553677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553700_554200
822060	contig_14744_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_65958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACACACCCCCAGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637021	635545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_635500_637000
822062	contig_8273_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_113087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161044	161615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_161000_161600
822063	SIRV4	+	485	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	32	433	32	-433	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATTGCTCGTCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1886_2251
822064	contig_6441_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_172892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAACAAACTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323347	321178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_321200_323300
822069	contig_9185_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_166888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCATCTGCCACTGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218946	217938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_217900_218900
822070	contig_7530_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_141844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261494	259370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_259400_261500
822072	contig_753_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_112947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAAGGGTTCCCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778813	778024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_778000_778800
822073	contig_7707_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_72227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGACACCCTGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904957	906282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_905000_906300
822074	contig_14441_pilon	+	457	3	Intergenic	novelGene_100720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116577	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116638_116839_116963_117523
822076	contig_19850_pilon	-	1390	3	Intergenic	novelGene_170859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	58	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAAATATTTACAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35498	29531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_30478_32120_32463_35396
822077	contig_5499_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_56978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAGAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226827	226227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_226200_226800
822078	contig_1255_pilon	-	2367	5	Intergenic	novelGene_176518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.58287544405155	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	90	917	570297	453176	FALSE	40	ATAAAGGAATGAGGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVWRLVAVEENVWIQLTFDERFGLEDPEDDVCKYDFVEIEEPSDGTILGRWCGSGAVPGKQISKGNQIRIRFVSDEYFPSEPGFCIHYNIVMPQFTEAVSPSVLPPSALPLDLLNNAVTAFSTLEDLIRYLEPDRWQLDLEDLYRPTWQLLGKAFVFGRKSRVVDLNLLKEEVRLYSCTPRNFSVSIREELKRTDTIFWPGCLLVKRCGGNCACCLHNCNECQCVPSKVTKKYHEVLQLRPKIGVRGLHKSLTDVALEHHEECDCVCRGNTGG	570386	451725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1255_pilon_-_453293_457454_457673_462327_462536_525041_525223_570193
822079	SIRV3	-	401	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	218	-2	218	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
822080	contig_5415_pilon	+	1341	10	Intergenic	novelGene_146129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_6	45.3768853976897	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	90	1325	139741	146480	FALSE	35	ATCTGTTTTAAAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTGDSRNAGAQVRWPLVRSRGSKDPVATMLSRLFRMHGLFVASHPWEVIVGTVTLTICMMSMNMFTGNDKICGWNYECPKFEEDVLSSDIIILTITRCIAILYIYFQFQNLRQLGSKYILGIAGLFTIFSSFVFSTVVIHFLDKELTGLNEALPFFLLLIDLSRASALAKFALSSNSQDEVRENIARGMAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCCFGCMSVLANYFVFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSHFARVLEEEENKPNPVTQRVKMIMSLGLVLVHAHSRWIADPSPQNSTAENSKVSLELDENVSKRIEPNVSLWQFYLSKMVSMDIEQVITLSLALLLAVKYIFFEQAETESTLSLKNPITSPVVNQKKVPDNCCRRESPLVRNNQKFHATGEEAGINRERKGDFFFYALHSPFLQC	134784	146496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_134851_139717_139906_140372_140485_140773_140862_141682_141768_142724_142831_145035_145143_145266_145384_145901_146063_146185
822082	contig_15114_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_121249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGTAAAACATTAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768228	1768681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1768200_1768700
822084	contig_6589_pilon	-	1511	15	Intergenic	novelGene_26263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	49.5490377591447	1	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	314	1453	2231995	2227865	FALSE	15	AAGCTTGGCCAGCGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKSAGRVVGRVSWAGILWSEVAPEPEQRAQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWKILYPEIPRKLRELETKGYKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2233759	2227806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228749_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2230878_2230959_2231914_2232215_2233665
822085	contig_9593_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_59705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTTTATAACGAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148052	145904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_145900_148100
822086	contig_8464_pilon	+	2502	1	Intergenic	novelGene_125409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAGACAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928701	931203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_928700_931200
822087	contig_5947_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_101577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGAAGTGTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826455	828770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_826500_828800
822088	contig_5649_pilon	-	1739	9	Intergenic	novelGene_82371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	47.3022198210613	1	116	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1	552	1064304	1057321	TRUE	35	GAGCACAATATAATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064304	1055345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
822090	contig_9594_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_73916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAGATTCAATTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126489	128337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_126500_128300
822091	contig_4769_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_118018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTGCTTTCTCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118061	1116656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1116700_1118100
822092	contig_10235_pilon	+	310	4	Intergenic	novelGene_46309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1321.72185677118	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	12	308	88925	91714	FALSE	30	CGAGGGAGACGGGAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQEMPEGKLWGPRHSLMPHFSPSPTCEEQLSTPGELCIYAAPALGGLLLLVMIILSTCLCWLHRRVKRLERSWPQALSSEQELHYASLQRLPGTGGAEGLDL	88913	91716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_89016_90395_90492_90833_90857_91627
822093	contig_366_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_51617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAATAAACCATTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176048	1176866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1176000_1176900
822094	contig_17274_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_26593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCGCAATGATTAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254202	255514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_254200_255500
822096	contig_11978_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_62968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	498	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTACCTGAGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231350	1232734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1231400_1232700
822097	contig_6684_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_168583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAACGTCTCTTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16725	17623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_+_16700_17600
822101	contig_9435_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_156955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCACCCCGAGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271247	271822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_271200_271800
822102	contig_8475_pilon	-	1818	4	Intergenic	novelGene_171101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	10.9645894689324	74	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	644	1687	74209	65685	FALSE	40	CAGAGAATCTACTTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALEPEEQNGLLILKVEDHYGGQNSISQKNCHHRRELFRQRFRKLCYQDSPGPREALTQLWELCRQWLRPEYHTKEQILDLLVLEQFLRILPKDLQAWVQAHHPETGEEALTVLEDLERELDEPEKKVPANSERQDILLDNLAPLGRPHESLTIQLHPKKNQLEQESVEPQRNGDKTRTRNEELTQKEDMPKDIESLGEKNNRFNKDIPQHAESKDATENERLEWQQRERRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDMCGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKEFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHHRIHTANKLY	74977	65553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_66203_72315_72455_73822_74828_74952
822107	contig_934_pilon	-	768	5	Intergenic	novelGene_129011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	32.2374006396297	235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	61	309	57683	54258	TRUE	30	GTTGAAGAGTATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCQAPGGTVARPLAVLPGTKMAMASDFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDVMIRKEAYVHKSVMEELRRIIDDSEITKEDDALWPPP	57743	49284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_49645_52243_52327_54241_54354_55210_55270_57589
822110	contig_3529_pilon	+	1389	5	Intergenic	novelGene_105399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	39.5126562002607	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	70	705	790486	806158	FALSE	35	GGTAAGACTTCATATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSVLLLSIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEVRQLLPLPFPLLNHTQALQRPKTT	790416	806842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792154_792661_792725_806012
822111	contig_18391_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_174090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGCTGCAGGCGCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33962	32633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_32600_34000
822112	contig_18391_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_174089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGACAATATAAAGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32425	31565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_31600_32400
822113	contig_11978_pilon	+	845	3	Intergenic	novelGene_62986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_2	7	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCCATCCAGAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495521	1499995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1495843_1496425_1496546_1499591
822114	contig_10000_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_139329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242516	241211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_241200_242500
822115	contig_10235_pilon	+	306	3	Intergenic	novelGene_46330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_2	1434	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTCAGGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90431	91874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90492_90833_90857_91651
822119	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
822121	contig_960_pilon	+	1942	3	Intergenic	novelGene_108267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	10	339	648850	708347	FALSE	75	GAAGAAGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTMAGPPAQTRCPAPGVGPPSPNPSAPSKTAKPGDRERRDERGCAGPRKVLRIHSPSFSTGSRTKGLTSVDTNLSPCLSAFGWNQPMGSTSRILEAPQADITGNGAVKAGL	648840	709950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_649000_698997_699128_708297
822122	contig_8357_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_39689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTGTCTCCTGGAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239246	238219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_238200_239200
822126	contig_3529_pilon	-	984	6	Intergenic	novelGene_105352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	402	junction_5	315.458016224029	46	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	30	584	550554	529100	FALSE	70	AAAAAAAAAAAATTCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	550583	528699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497
822128	contig_21357_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_171859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91619	92604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21357_pilon_+_91600_92600
822130	contig_8673_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_129942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGATAACAGAGTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550447	549301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_549300_550400
822133	contig_2940_pilon	-	2245	12	Intergenic	novelGene_81894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.3878169449384	1	139	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	59	1330	472751	453140	FALSE	25	AGGTTTAATGGCTGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRVIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPRTPVPAQRERAPGSGTQEKNKIRSRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSILWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLLSCLPLSCSSTLYRKSTGVLLSHPCTGRPTLRISMPAR	472809	452224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453473_453602_453741_453874_454236_454356_455835_455883_458238_458416_459146_459232_466868_466987_467360_467489_467597_467626_470951_471106_472710
822134	contig_14970_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_45101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAACCCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252924	251896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_251900_252900
822135	contig_4364_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAACAATAAAATACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386230	1386573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1386200_1386600
822136	SIRV5	-	535	2	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	8	1147	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTACAAGTCTTGCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2398	1030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1154_1986
822137	contig_12050_pilon	+	827	3	Intergenic	novelGene_62722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	66.5	107	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	293	715	666343	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	666050	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666392_668130_668370_683024
822138	contig_14034_pilon	+	2135	3	Intergenic	novelGene_72671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	190.5	1	145	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTATGCTGAAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391385	408984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_391498_404226_404352_407086
822139	contig_8161_pilon	-	2129	3	Intergenic	novelGene_156771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	5	19	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	216	1388	354813	345999	TRUE	30	TAGGAATGCTCAGAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLQAVDQGPLRSKPDLADYINGGERRRDAGEGALHRLAGELHRWVLPPPPPRNSERKCRACGNRLKQQRPMEAKAPPNPRILQELGAACGVEGLLAEPHSSGGLSSPVRFLLAEPGLHADWIRETHIGDILPPAEVDSTLDSTSDSCRTDSEEAGTSQPSRARGRIRGSRPRGGHRWSRKLQHGVDHVEVGDEPKEGRGHTPAGTLCSREDAVPKPPALESKRASLGSQWQPGPGLGNCPAHLPDSPPPCRTAYAMTSSMKFGLSGPGRQAQVIESHESLETASTSSLQQSHAEPSAPNQAQQPTASLSSEGRVPTPPSSRKTASSPVPHRKAAPAGPHRPGDQPDPGDTPLPPSRSVVPRTCEHTPPQTQSCSPQVTHPLLALSTNCNNSVALELQEPWGEAIPESRVEGGLCSQEPELPLENSREEHHQGSVQDPACPQLPLLKGTRKAAAASPLPWG	355028	341243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_341827_345840_346100_353741
822144	contig_407_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_176520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTAAGAAATCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239545	237838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_407_pilon_-_237800_239500
822145	contig_10000_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_139324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGACCAGAAAGAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212144	213361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_212100_213400
822147	contig_8330_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_71957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	13	567	1507227	1506673	NA	0	CTTTTTGGTCTGCCGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAIMVRKFKFHEQKLLKQVDFLNWEVTDHNLHELRVLRRYRLQRREDYTRYNQLSRAVRELARRLRDLPENDPFRVRSSAALLDKLYALGLVPTRGSLELCDFVTASSFCRRRLPTILLKLRMAQHLQAAVAFVEQGHVRVGPDVVTDPAFLVTRSMEDFVTWVDSSKIKRHVLEYNEERDDFDLEG	1507239	1506167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1506200_1507200
822149	contig_6361_pilon	-	595	4	Intergenic	novelGene_23946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	1345.59800832195	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTTTGTGCTTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368242	351715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351991_354928_355044_359308_359434_368162
822152	contig_8885_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_115569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	806	1177	51328	51699	NA	15	CCCTCCTGGCCTGCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPWNPLLWTLTLGSQPARAPGPETDAVMPTCCCLSDLFHTPRGACGPVSSGAIVPEPEHRCPHVELSKGSWHFRAQDPRAQECVNLGDLYVTALTYACSSRCSENDRSCPPPIWPHDWCYK	50522	52587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_50500_52600
822153	contig_12250_pilon	+	1347	6	Intergenic	novelGene_80516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	10.1390334845093	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	396	1019	62743	64563	FALSE	15	TAGCTTCGACTCATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASTISKAPQPPKTWILVTGVAYYQPSLTAEYDEDSPGGDFDFFSSLVTKWEAAARLPGDSTRQVVVRSGVVLGRAGGAIGHMLLPFRLGLGGPIGSGHQFFPWIHISDLVGILAHALEARHVQGVLNGVAPGPTTTNAEFAQALGAALGRPAFIPLPSTVVKAIFGRERAIMLLEGQKVVPRRTLATGYQYSFPKLGAALKEVVA	61665	64891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_61739_62039_62147_62225_62386_62687_62810_63712_63857_64150
822154	contig_9673_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_119182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATACAGGTTGTTTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205971	205109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_205100_206000
822155	contig_2257_pilon	+	956	6	Intergenic	novelGene_122489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	191.345760339758	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	179	955	288451	331956	FALSE	55	TACAAAAGAGAGAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAVVTPSGLEDGVSRSRGEGAGEVVVERGPGAAYHMFVVMEDLVEKLKLLRYEEELLRKNNLKPPSRHYFALPTNPGEQFYMFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLDMNESAKQEDILESTTDAAEWSLEVERVLPQLKVTIRTDNK	288272	331957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_288663_291408_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_331833
822156	contig_15610_pilon	-	1204	1	Intergenic	novelGene_154275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGAGGAAGTGAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454049	452845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_452800_454000
822158	contig_18799_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_171419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30861	32188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_30900_32200
822159	contig_12019_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_87766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTCCCTACTGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673565	671655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_671700_673600
822161	contig_7630_pilon	-	1111	3	Intergenic	novelGene_133653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.5	101	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	181	357	458381	450247	FALSE	40	AAATAATTCTTCCACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARPAQEWGSAPLNPAGNALGRAARFRDPQLGNCGYRLFSWRFLSRCPPTPRAGAPAVQIMSRIYHDSALRNKAVQSARLPGAWDPAAHQGGNGILLEGELVDVSRHSILDAHGRKDD	458561	449492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_450256_456684_456761_458289
822162	contig_12464_pilon	+	2375	2	Intergenic	novelGene_68725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	159	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGCTAAGAACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375164	379173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_376344_377977
822163	contig_7887_pilon	+	748	3	Intergenic	novelGene_124888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_1	124	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATCATCTTCGAGTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290318	291822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_290895_291549_291680_291780
822164	contig_16303_pilon	-	1242	7	Intergenic	novelGene_34064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	522.544867823701	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	475	1116	38748	33093	FALSE	25	ATATATGCATCACTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKAALED	45531	32966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40524_40731_45370
822167	contig_10523_pilon	-	1109	5	Intergenic	novelGene_120948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_4	601.31745983299	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	323	880	39240	20830	FALSE	25	GGAAGCTATTGTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQVCLWRPPHRLPSREASMRPQENAFEAQVLGVF	43260	20600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_42952
822168	contig_17829_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_157045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTCTTTTCCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98714	99681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_98700_99700
822170	contig_11121_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_167051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAACAAAGAATAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19724	17594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_17600_19700
822173	contig_13992_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_147657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTTTGTGAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674955	676475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_675000_676500
822174	contig_14220_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_159855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGAATAAAAGGCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293178	293595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_293200_293600
822175	contig_11068_pilon	+	813	10	Intergenic	novelGene_130544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGCAAGCCCTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144231	242365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_144297_149379_149453_149885_149986_171657_171740_182882_183007_184513_184564_194499_194608_201037_201099_241946_242036_242304
822176	contig_6833_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_175121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGTGTCAAAGAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61972	62362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_62000_62400
822177	contig_6833_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_175122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTTGTTTGTAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62314	63469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_62300_63500
822178	contig_3111_pilon	+	2009	13	Intergenic	novelGene_129989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	29.1519010243472	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	1	1545	170278	179786	FALSE	25	CAAGTGGCATCATGGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQMLGFEHMGLDPRLLQAITDLGWSRPTLIQEKAIPLALEGKDLLARARTGSGKTAAYAIPMLQLLLHRKATGPVVEQAVRGLVLVPTKELAKQAQSMIQQLATYCARDIRVADVSAAEHSASQRAVLIEKPDVVVGTPSRILSHLQQDNLKLHDSLELLVMDEADLLFSFGFEEELKSLLCHLPRIYQAFLMSATFNEDVQALKELVLHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPVCVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGRRRGRGAKGDRASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARADNPGVVLTFMLPTEQAHLGEIEELLSGENGAPVLLPYQFRMEEIEGFRYRCRDAMRSVTKQAIREARLKEVKEELLRSEKLKTYFEDCVPWGRHSSGPQCHKQARFGVLPLRRIKVLAAPLCLRHAGRDCPLKPWE	170277	180250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_170335_170471_170634_171443_171605_171747_171919_172045_172137_173110_173356_173662_173783_174349_174464_174560_174656_175819_175894_176028_176119_176859_176873_179634
822179	contig_11285_pilon	+	1333	3	Intergenic	novelGene_5515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	13.5	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	517	1170	634410	637557	FALSE	10	TGTGGAGCCTCCTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDPVSSQTMELSDVTLIEGVGNEVTVVAGVVVLILALVLAWLSTYVADSSNNQLLGTIVSAGDTSVLHLGHVDHLMASQGTPEPTELPHSSEGNDEKAEEAGEGGGDSTGEPGAGGGVEPSLEHLLDIQGLPKRQAGPESGSPESPLRSEDSTCLPPSPGLINVRLKFLNDTEELAVARPEDTVGALKRAQLGRGLGHKAKPPALGEARPQLLLP	633893	637720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_634415_635674_636242_637475
822180	contig_10642_pilon	+	1617	3	Intergenic	novelGene_78731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266178	1271067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1266336_1269504_1269608_1269710
822182	contig_12939_pilon	+	598	4	Intergenic	novelGene_166194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAACCTGGCCGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42119	46774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_42174_45738_45887_46029_46379_46727
822184	SIRV6	+	339	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	342	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
822187	scaffold_8345_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_106990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGAAAATAAAGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85642	84489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_84500_85600
822192	contig_10985_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_175545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTGCAGCAGGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143189	141276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_141300_143200
822193	contig_9440_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_59021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231074	232516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_231100_232500
822195	SIRV6	+	399	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	204	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845
822196	contig_1735_pilon	+	833	6	Intergenic	novelGene_106897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	480.916042568763	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	348	671	134293	137764	TRUE	20	TAATGCAACCTGTCCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	132288	139770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169_139202_139653
822197	contig_18283_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_170702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAGTTCCAACTCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59905	59209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_-_59200_59900
822198	contig_11292_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_109402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGAAAAGAAAAAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129988	129253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_129300_130000
822200	contig_20822_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_170643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAAAGTGAGTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80309	82180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_80300_82200
822201	contig_10037_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_148947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	68	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTGAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115330	187674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798
822202	SIRV7	+	230	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACTGTTCGTTCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56102_70889_70988_78840
822204	contig_9345_pilon	-	1894	8	Intergenic	novelGene_24555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	48.9839623900371	243	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	627	1529	736960	734158	FALSE	20	CTTAGTGACTGTGATGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHTPQFFIYKIDASNREQRLEDKGEAPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLGPTAEAAASQGLGPGQAPEAAPPRTAPDRFAPPVDCPAPTYSNMEEVD	737918	733792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_734275_735785_735965_736045_736207_736307_736461_736543_736761_736884_737422_737529_737668_737891
822206	SIRV7	+	376	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
822207	contig_6589_pilon	+	1115	8	Intergenic	novelGene_26226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	154.972545297283	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	19	936	2051722	2059863	FALSE	25	TAAATCCTCAGCTGGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGVMVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2051703	2060042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2051776_2052672_2052833_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
822208	contig_7513_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_89042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1438	1869	902762	902331	NA	65	GAGAGTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHRFLRWPTLQSSCGHTVGPRRGPVSRAAEVWSQEKSLTMTQPAAGSPLLAPRHHPLLPTPAHLDEGVEGGISGVVCDEEAHVLVAHLHGGGPVHPRHGSAPQGAGRSWGGDSGYGGEKTPPAPQNSTRMRSLCLSKTENT	904199	902266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_902300_904200
822210	SIRV6	+	422	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	332	13	166	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
822211	SIRV6	+	387	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	377	3	211	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
822215	contig_10855_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_124347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACCACAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561219	561470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_561200_561500
822216	contig_7202_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_17287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACCTGCTCATGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
822217	contig_3900_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_84167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAACCACTGCACCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145044	145781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_145000_145800
822219	contig_14142_pilon	-	1750	8	Intergenic	novelGene_120473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	27.9255570167164	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	151	906	259646	248154	TRUE	35	GGATCACCAGGGCAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYADVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLVWTCQPSLSSSPGQAFLP	259796	246319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246597_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248302_258460_258569_259008_259108_259245
822221	contig_2310_pilon	+	654	5	Intergenic	novelGene_71624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.5920668421968	3736	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCCCGTCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195334	208930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_195410_199428_199499_204122_204254_208109_208307_208749
822223	contig_7171_pilon	-	1160	8	Intergenic	novelGene_101253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_7	27.8047125648931	120	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	9	941	795857	788002	FALSE	10	GCGTGACAGCCTCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPTGLAAAAGTPRQPSKRRIPVSQPGMADPHQLFDDTSSAQSRGYGAPRAPSGLGYSAASTSPQAAFLADPVSNMAMAYGSSLAAQGKELVDKNIDRFFPISKLKYYFAVDTMYVGKKLGLLVFPYMHQDWEVQYQQDTPVAPRFDINAPDLYIPAMAFITYVLVAGLALGTQDRFSPDLLGLQASSALAWLTLEVLAILLSLYLVTINTDLTTIDLVAFLGYKYVGMIGGVLTGLLFGKMGYYLVLGWCCASIFVFMIRTLRLKILAEAAAEGVPVRGARNQLRMYLTMAVATAQPLLMYWLTFRLVR	795865	787782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_788158_789197_789292_789363_789520_790745_790804_790937_791017_791171_791277_791436_791676_795811
822225	contig_8276_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_174487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGCAATAAACCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168338	168048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_168000_168300
822226	contig_6488_pilon	-	1524	3	Intergenic	novelGene_44722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_2	712.5	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	156	971	91238	36838	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGVPSPLQGGSNSAATLGKPSGELRAGGASPPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFR	91393	36284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_37030_53885_54122_90850
822227	contig_10734_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_51365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCTTCTCATCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783731	1784862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1783700_1784900
822228	contig_17198_pilon	+	1507	9	Intergenic	novelGene_62387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	80.4565099914233	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	118	1050	1060803	1096458	FALSE	15	GATGTCTTGTCAGAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVQIISRRLISQPYCGLKSAASAQTKIHPTMARPSSNMADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1047675	1096915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1047746_1060755_1060918_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
822229	contig_3081_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_133936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220349	218714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_218700_220300
822230	contig_10042_pilon	+	2053	2	Intergenic	novelGene_79226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTAAAGCCCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100135	1104623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1100806_1103240
822232	contig_12270_pilon	-	355	2	Intergenic	novelGene_113618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	2	355	14434	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGQQDGATDSVPHVPVALGLCGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14131_14360
822235	contig_6062_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_5277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAACCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709437	708620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_708600_709400
822238	contig_14326_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_120703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATTTAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221833	223271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221800_223300
822239	contig_7728_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_64733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774542	773471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_773500_774500
822241	contig_4857_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_48672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCATGTGCCAACCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064163	1064720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1064200_1064700
822243	contig_10141_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_84628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397635	395587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395600_397600
822244	contig_10045_pilon	+	1510	5	Intergenic	novelGene_163752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.59522876548166	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCAGTGTTTGGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6945	25459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_+_7134_9136_9237_15996_16117_22672_22923_24607
822246	contig_7398_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_166178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297908	298828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_297900_298800
822248	contig_19469_pilon	-	834	6	Intergenic	novelGene_135001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_4	30.5378453725865	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	210	761	153553	144902	FALSE	30	AATGTGATGTATGATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKGNY	155562	144828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488
822249	contig_11281_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_125448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAAGGAGCCCTGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805057	806077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_805100_806100
822251	contig_11987_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_168955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCATCAACAAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178467	181195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_+_178500_181200
822252	SIRV4	-	363	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1158	0	1158	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
822253	contig_17989_pilon	+	658	4	Intergenic	novelGene_150827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	117.774737906263	26	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	80	514	261854	265103	FALSE	5	TGTGAGTCTGTGGGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFINKGEKGIMVLAGDTLPVEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDSGSNLAPVLEAAVWAVGQPAATHAPSISSVA	261774	265247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262087_262158_264163_264270_265004
822254	contig_6098_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_145467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGGGCTGTGAGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33973	34368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_34000_34400
822258	contig_2033_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_71554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTAGACAACCACTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459712	458381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_458400_459700
822259	scaffold_6394_pilon	-	756	5	Intergenic	novelGene_110996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGTAACGCTGGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406279	398196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_398312_402117_402222_405302_405498_405714_405870_406092
822260	contig_16303_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_34124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAAGTTTTTTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46863	46130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_46100_46900
822262	contig_5083_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_151673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATGGAATTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562109	560524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_560500_562100
822263	contig_12689_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_145063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGCCCCCTCGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327367	328068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_327400_328100
822264	SIRV4	-	250	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1268	3	1268	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3890	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
822266	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
822267	contig_5083_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_151670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518943	518079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_518100_518900
822269	contig_641_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_170136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	343	765	42311	42733	NA	50	CAAACTGAAGAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGQEARIEQKEQYSRHQFPLYAASPDSDSFLQEASVLNLKTSCLVTQGTTLPPDPASRQKCHLHPGGRLCPAGPKPASLSCWHPYSWCIAPALTYNPVWDVSPGARANGPQKCTSGISPQPSASPPSNSGPGRNTQLL	41968	43654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_42000_43700
822272	contig_12644_pilon	+	1044	3	Intergenic	novelGene_44470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	1.5	153	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	125	370	1013295	1017132	FALSE	25	TACAAATTCTCATTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLKIRFPAGLGLQPHGVPRRGAAGEAADKNGELDFSTFLTVMHMQIKQEDPKKEILLAMLMADREKKGYIMASELRSKLTRLGEKLTDKEVDELFREANIEPNDKVKYDEFIHKITLPARDY	1012659	1017806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1012743_1013253_1013443_1017034
822275	contig_7057_pilon	-	1006	3	Intergenic	novelGene_123216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTTCCCTTGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535612	534249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534688_535074_535348
822276	contig_5479_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_133576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145059	145966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_145100_146000
822282	contig_3942_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_128734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	756	1055	736135	736434	NA	60	GTCCATATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSNLLDQESGHVTHSSHPSRPYVRSQGSAHVTHPVHPSSPGSSHMITSVHFFYTRSQVKDTVWPTPFRPGVRLHAFYKEPDRKYFQLCSPDCLCHNN	735379	737257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_735400_737300
822283	contig_19727_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_169001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTCTTTGTTCCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26035	26427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_26000_26400
822285	contig_6163_pilon	-	1240	3	Intergenic	novelGene_103862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	1	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	492	908	509085	508435	FALSE	20	CAAGATGTTTCTTGGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASTCSFNPGVFVANLTEWKRQNITNQLEKWMKLNVEEGLYSRTLAGSITTPPLLIVFYQQHSTIDPMWNVRHLGSSAGKRYSPQFVKAAKLLHWNGHFKPWGRTASYIDVWEKWYIPDPTGKFSLIRRHVEISNIN	509576	508102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_508626_508765_508879_508972
822287	contig_9646_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_117446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTAACACCCGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228491	227599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_227600_228500
822288	contig_10196_pilon	-	2347	7	Intergenic	novelGene_132036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.53160335006952	29	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	72	1283	432758	426432	TRUE	5	CTCCAGGGCCCCCCGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVVALLLHYSLDEAECFEKACRMLACNDPGRKLIDQSFLAFESSCMTFGDLVNKYCQAAHKLLVAMSEDVLQVYSDWQRWLFAELPLGHFARVFDVFLVEGYKVLYRVALAILKFFHKVRAGQPPDSDNVRQDIRTFVKDIAKMVSPEKLLEKAFAIRLFSRKEIQLLQMANEKALKQKGITVKQKRQFVHLAVHAENFHSEIVSVKEMRDIWSWVPERFALCQPLLLFSSLQHGYSLTRFYFQCEGHEPTLLLIKTTQKEVCGAYLSTDWSERNKFGGKLGFFGTGECFVFRLQPEVQRYEWVVIKHPELTKVSSLMSSETTATPALPGHSISTDPADRLSPFLATRHFNLPSKTESMFMAGGSDCLIIGGGGGQALFIDGDLNRGRTGHCDTFNNQALCSENFLIAAIEVWGFQDPDIQNPDQ	432829	423711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_424759_426414_426599_427952_428185_428477_428574_429266_429331_429945_430105_432264
822289	contig_10732_pilon	-	1523	4	Intergenic	novelGene_114757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	584	junction_3	26.1916017074176	3	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	36	716	576361	573306	FALSE	10	TTCACGGTCTCCTTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAFGGGGGGGDMESGAYGAAKAGGSFNLQRFLSQPQVVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSALWTFLWFVGFCFLTNQWAATKSEDVLVGADSARAAITFSFFSIFSWGVLAFLAYRRYKAGVDDFIQDIQNYADPTPNPSTAYASYPTSVDSYQQPPFTQDAETTEGYQPPPVY	576396	572498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573758_574129_574368_576262
822291	SIRV6	+	334	6	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	20	530	7	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724
822293	contig_5210_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_65425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAACTTAAAACAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444375	442528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_442500_444400
822294	contig_17066_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_130942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57518	56208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_56200_57500
822295	contig_8620_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_173887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATACCAAATCTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146529	145519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_145500_146500
822296	contig_5415_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_146139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCTAATAACATTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184974	185556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_185000_185600
822297	SIRV4	-	299	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	8	1214	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
822298	contig_10299_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_79750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_2	9.93310961716756	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	614	1168	511618	517350	FALSE	30	GTTTTATTGGGGAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQPCLYHTYSSNPHLSHLPLQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK	511004	517538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_511810_511888_512041_516300_516437_517275
822300	contig_3095_pilon	-	570	3	Intergenic	novelGene_75217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1831.5	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	50	529	255481	246415	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNRGYFDWDCFLFFCNVCLIIAQSPSRLCLPGPPRRSESFSGSGTAARSPPMTLAPGTLLCALTQEPLPCVLPAASLQTPWTFLFLFPPQTAQEIHSEPI	255530	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246708_253715_253806_255384
822302	contig_5765_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_141362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379659	381125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_379700_381100
822303	contig_14274_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_176522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATAGCCAGCCACGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136437	135731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14274_pilon_-_135700_136400
822304	contig_3942_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_128658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1188.37732503892	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGGCCCAAATGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178331	180121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179177_179714_179805_179974
822306	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	17	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
822307	contig_2069_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_23304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504415	503016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_503000_504400
822308	scaffold_7386_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_136578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTGTGATGCTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283285	285281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_283300_285300
822309	contig_252_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_99907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTCTCTACAGAAGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30858	30151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_30200_30900
822311	contig_9297_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_69828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTTACAGTCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543935	544367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_543900_544400
822313	contig_12644_pilon	+	1271	5	Intergenic	novelGene_44558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	37.4799946638203	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	13	552	1944794	1965626	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAAMAAGVPCALVASCSSTFTGDRLVQHILGTEDLIAEVTSSDAVRFYPWTIDNKYYSADINLCVVPNKFLITAEIAESVQAFVVYFDSTQKSGLDSVSSWLPLAEAWLPEVMILVCDRVSENGVNRQKAQEWCIKHGFELVELSPEELPEEDDDFPESTGVKRIVQALNANVWSNVVMKNG	1944781	1966345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1944867_1963297_1963489_1963619_1963717_1964051_1964142_1965537
822314	SIRV6	+	263	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-431	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
822315	contig_10734_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_51149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGGACTATACTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909844	907618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_907600_909800
822316	contig_19185_pilon	-	1591	4	Intergenic	novelGene_163644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1086	junction_2	363.437599718148	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	18	1409	145272	109420	FALSE	40	ATCTGGCAAGAGATTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVTDNNGAFKLRQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPHEVCVAVWRKNDENITLETICHDPKLPYHGFVLEDTASSKCIMKEKKTVGETFFMCACSAEECNDHVIFSEEYNTSSPDLLLVIIQVTGVSLLPPLGVAIAVIITFYCYRVHRQQKLSPSWETSKPRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLHLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGGTYGPPSLCSSGRPFKMIPCSFFKPGSRGSQNC	145289	109237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_109663_111372_112173_138347_138539_145114
822317	contig_6589_pilon	+	449	5	Intergenic	novelGene_26142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	26	448	1885124	1887775	FALSE	25	TGCTCAAGGTGACCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFN	1885098	1887776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
822319	contig_91_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_127131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAACTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842236	840876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_840900_842200
822320	contig_8110_pilon	+	2570	16	Intergenic	novelGene_158612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_13	7.04461969638295	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	243	2018	25766	82281	FALSE	35	TAAATAAATTTTAGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLELEVINLQKEKEELVLELQTAKKDVNQAKLSERRRKRLQELEGQIADLKKKLSEQSKLLKLKESTEHTVSKLNQEIRVMKNQRVQLMRQMKEDAEKFRQWKQQKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLERNFQKQSNVLRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVADKRKENQSRGMESTATRVKNWLGNEIEVMVSTEEAKRHLNDLLEDRKILAQDVAQLKEKRETGENPPPKLRRRTFSLAELRGQVSESDDSITKQIESLETEMELRSAQIADLQQKLLDAESEDRPKHRWENITTIMEAKCALKYLTGELVSSKIQVSKLESSLKQSKASCADMQKMLFEERNHFAEMETELQSELVRVEQRHQEKVLYLLSQLQQSQMSEKQLEESVSEKEQQLLNTLKCQDEELEKMREVCEQNQQLLRENEIIKQKLTLLKVASRQKPHLPKDTLLSPDSSFEYIPPKPKPSRVKEKFLEQTMDIEDLKYCSEHSVNEHEDDDGDDDDEDDEEWKPEKLVKVSRKNIQGCSCKGWCGNKQCGCRKQKSDCGVDCSCDPTKCRNRKQGKDSLGTVERTQDSEGSFKLEDPTEVTPGLSFFNPVCATPNSKILKEMCDVEQVPLKKTTLAPSSLDLLESKHIATESQENKAPGKKKKRALASNTSFFSGCSPIEEETH	23868	82833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_23963_24845_24991_25762_25874_38640_38725_39651_39766_53106_53263_53387_53489_65665_65796_67321_67493_67840_67949_70035_70114_70907_71007_71543_71727_79988_80106_81710_81834_82077
822321	contig_9183_pilon	-	1171	5	Intergenic	novelGene_40336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.8400802362146	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	316	690	320566	314785	TRUE	30	TCTATTATCATTTGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSSNGGLHGDPGEDLCRAGLQPGRRKGLTPRRQASHH	326023	311861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314766_314888_315229_315493_320557_320727_325868
822322	contig_13481_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_119543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGATCGGGTTCCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493208	1492113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1492100_1493200
822323	contig_13481_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_119542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAATATGAGTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491710	1490762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1490800_1491700
822324	SIRV5	+	452	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1940_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
822325	contig_6842_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_130725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTAAAAAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501664	503103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_501700_503100
822326	contig_3745_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_85092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTCTCCTACGGAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414705	413242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_413200_414700
822327	contig_11594_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_80906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	651	962	260810	261121	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGEGKGEEKGIIRIKGGKKIHYMLISNQPTHSSLLLITPNVFLTAAQPPISLFSVASPFSQTLMKTSDLVELFLLGLNNTLANAPSSAPACIRGTHRSTER	260159	262226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_260200_262200
822329	contig_4782_pilon	+	1435	10	Intergenic	novelGene_73671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	326.547937607261	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	211	1248	646398	667997	FALSE	35	TTTATTTCAATAGAGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTSEKGVVEEWLSEFKALPETSLSNYATNLKDKSALVSSLYKVIQEPQSELLEPVCHQLFEFYRSGEEQLLQFTLQFLPELIWCYLAVSASRNVHSSGCIEALLLGVYNLEIVDKEGHSKVLSFTIPSLSKPSVYHEPSSIGSMALTESALSQHGLSRVVYSGPHPQREMLTAQNRFEVLTFLLLCYNAALTHMPSVSLQSLCQIYSRICVCGYPRQQVRKYKGISSRIPVSSEFMVQMLTGIYFAFYKGEWDLAQKALDDIIYRAQLELYPEPLLVANAIKASLPHGAMKSSKEGTRCIQVEITPTSSRISRNAVTSMSIRGHRWKRHGKKYIALQVRALSIL	588728	668184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_588911_646369_646449_657911_658014_658646_658827_659620_659702_660215_660332_660711_660808_664148_664266_667196_667285_667790
822330	contig_5643_pilon	-	1239	2	Intergenic	novelGene_38901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	362	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	235	651	264888	263731	FALSE	75	TGAAGAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVGRFSSGRLFLQSNSGTCNFTLCPQLYILKQVGLFYQ	265122	263142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_264009_264749
822331	scaffold_13505_pilon	-	1092	5	Intergenic	novelGene_111439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	309.352852742625	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	20	577	535595	531157	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLA	535614	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531306_531369_532376_532496_532707_532999_535516
822332	scaffold_17542_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_139238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442062	442537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_442100_442500
822333	contig_15882_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_144799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	113	499	27016	27402	NA	50	TGGGGTTAAACAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTWTGEYIQSSYSFQVCSGFYFLSSTLRVSLHMYVVSKSTRDFWSAKAFSRLCCVRTLPQSARDVWRVWASLGLSCANTQPPNQLEMCVESLSCPSRALSFPGIHHLLMSGWSTALPLILSGNSTSG	26903	27836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_26900_27800
822335	contig_14508_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_79062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108590	110039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_108600_110000
822336	contig_8063_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_152439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTCCAGCCAGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695003	696186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_695000_696200
822337	contig_8063_pilon	+	327	3	Intergenic	novelGene_152453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAGCAGAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945445	1220824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_945562_1031599_1031684_1220697
822339	contig_6058_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_172370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_8	80.7092582979177	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	82	849	255318	242770	TRUE	50	AATAGCGAAGAACAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTASAAEEEAAGARAPTSVSVAPQDSQMDSVEKTTNRSEQKSRKFLKSLIRKQPQELLLVIGTGVSAAVAPGIPALCSWRGCIEAVIEAAEQLEVLHPGDIAEFRRKMTKDRDLLVVAHDLIRKMSPRTGDTKPNFFQDCLMEIFDNLEQHIQNPLVLQCILSLMERGTMVLTTNYDNLLEIFGQQQSRPMESLDLKDKSKVLQWARGHIRYGVLHIHGLYTDPCGMVLDPSGYKDVTQDPEVMATCRTSPCRSADSAAQMRTVWTAPHFWVTHVRTVQRGS	266680	238743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_239198_242721_242806_243703_243737_245311_245360_246881_247011_249235_249458_254038_254292_255271_255328_266608
822340	contig_2332_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_58716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGACCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827055	828949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_827100_828900
822341	contig_14868_pilon	-	1533	1	Intergenic	novelGene_150433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGTACTATATGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99041	97508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_97500_99000
822343	contig_19990_pilon	-	1633	2	Intergenic	novelGene_30773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGTTCCTCCTAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143888	141525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_143051_143780
822344	contig_16431_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_87608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCAATTTGTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177957	178469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_178000_178500
822345	contig_8823_pilon	+	682	3	Intergenic	novelGene_53078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	13.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	121	516	85153	85815	FALSE	35	TAAAAGCCCAATACCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCNLIAGSETKGPFSIPSSKEALHGAQGSLSPSASNGSPRETWTLGLMPCKSRRAMPLQTGYPTMYALSQDAGAPSRTELLAKIPISWGIKNQLLIHTRQGTLWKAGRSSERKAVGASTMVRTPWTSRL	77828	85981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_77899_85102_85376_85642
822347	contig_8954_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_130315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTTGAAAAAGCCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642111	642847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_642100_642800
822349	contig_12969_pilon	+	1677	5	Intergenic	novelGene_61694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.8587515271537	62	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	151	1497	586087	594778	FALSE	45	GAATGGCGTTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPDSIFKLEQRETPWIVEGAIHSQSSPEKIWAIDHMQQHPENQNELKSLERCLQSFALGDNFGLSKNLVPSTQRHNMVDSHCGNLKPHLDFVTQNRRDARNDSDKFSDYGKSSVRLKHDKASSGIKYHGCVKPSNTKSQLNNHQKTSTEEKPHECSECGKVFSRKSLLLIHQRIHTGEKPCVCSECGKAFTWKSRLKRHQQSHTGEKLYRCNECGKSFSQKAYLIVHQRLHTGEKPYECSECGRSFVFKSDLTKHQRIHTGERPYKCSECEKAFRSKSELIQHQRTHTRERLYGCSECGKDFTHMSFLIKHKETHAKEKAINSVKVRKPSGRHSSLYMCQLIQEQNPMNTVPLEMLSSGTQPLNICELQGGKNVVIVEQPFQEVRPQYIIGNFHRE	580143	594958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_580224_586016_586102_590444_590572_590858_590955_593669
822350	contig_4812_pilon	-	492	4	Intergenic	novelGene_103666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3455.89477077452	86	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82741	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79092_81543_81739_82268_82343_82598
822352	contig_13021_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_8225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACTACAGTCTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198930	198391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_198400_198900
822353	contig_8019_pilon	+	1763	3	Intergenic	novelGene_127000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAAGACCACCGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382758	389605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_382891_384520_385254_388707
822355	contig_5643_pilon	+	562	4	Intergenic	novelGene_39110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	925	junction_3	718.554567633292	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	34	354	640424	641217	TRUE	10	GTCATTGTGTGTGTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	640390	641594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_640538_640636_640729_641102_641244_641412
822357	contig_7996_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_165162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336436	335915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_335900_336400
822359	contig_3942_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_128847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	226	681	146	826	1384496	1383816	NA	35	GATTACATAAATCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVQVWARDTELEQGFQPGMRGLSSQQLCGPLLRRRAPPTSLPHRVSQSWSQALCRPQTAGQPYTLSGCPEGTPAGIGNQAMQPHPVPSTPSTQGGQSGSLTGLLTGISAHLCCEAATSSIRLCQECGDFLSLCSSLGAWPCLSLAGTLSLHHLGLPQEPLACLPPKPCPLPSPTRTEPLEGAPGPCIPWPGPATWLLSPASAQSRCSSCSSAYLLSLSLLIRCLC	1384641	1383534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1383500_1384600
822361	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
822364	contig_13481_pilon	-	628	3	Intergenic	novelGene_119378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	586	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAACGTTCACTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536879	520954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_521325_536157_536304_536767
822371	contig_5315_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_175351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGGTATATTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139496	141435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_139500_141400
822372	contig_10749_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_133419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTGCTGCATCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35744	36387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_35700_36400
822373	contig_5643_pilon	+	703	5	Intergenic	novelGene_38747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	266.426701927566	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	389	703	156118	156930	FALSE	15	CCCGTTATCTACCCGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPE	152830	156930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_153040_155745_155923_156115_156206_156463_156584_156823
822374	contig_16122_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_134540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGACCTTGAACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228195	227484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_227500_228200
822375	contig_7457_pilon	+	415	5	Intergenic	novelGene_31270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	10.9201648339208	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAACTTGTTGAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54037	69570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_54196_54744_54845_62268_62323_68784_68863_69545
822377	contig_18251_pilon	+	1169	4	Intergenic	novelGene_50173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	116.964382042854	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	35	568	110201	112584	FALSE	35	AAAATTATTTTTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPELTCIPSEVMQDEDGYVALNIKTRRPAFTSVDPASSSLWRVMALVLLILCMGMVVGLVALGIMTVMQQNLLQAENENLSGTVQQLAKRFCQDLIKKSKEEAHKCSPCDTNWRYYGDSCYGFFKHNLTWEESKQYCTGMNATLPKIASQNILVRRFLHRVFWSRDEKLSNVTHGVFNVFAYVFNGLC	110166	113185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_110265_110917_111017_112045_112157_112324
822378	contig_6192_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_170347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGATTTTATTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853764	852790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_852800_853800
822379	contig_5585_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_143065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAGGCTTAACCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380213	378838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_378800_380200
822380	contig_15543_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_164353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAGTTGGTAATGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59066	57018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_57000_59100
822382	contig_4071_pilon	+	1123	4	Intergenic	novelGene_151889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	38.9643711898732	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	250	1089	338050	343578	FALSE	40	CACAAAACCAAGTTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRPTLTKELTFSSNIGQHDLDTKSKQIQQWIEKNYQVQITIKKGKNVEDPENKMEAIFNQILQTMPGIATFSSKPQAVKGGRAVMCVLRHLSTKEENMYREAQKTQKGDILNKENRNDRPPDVLHQ	332235	343612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_332484_338048_338513_342301_342460_343359
822383	contig_9965_pilon	-	936	3	Intergenic	novelGene_176467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	241	936	70517	69822	FALSE	20	TTTGAGAAGGTTGGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDVEGFCSSIHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALLATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMSTVHEILQAAMYVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDAFLLDNFVPLMSRPDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMTPSSV	87740	69821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9965_pilon_-_70525_86913_87112_87705
822384	SIRV6	+	414	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	339	547	166	43	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTGGTATGGCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	1993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822385	contig_7106_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_148328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687069	685770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_685800_687100
822386	contig_5718_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_110341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTAGATCAGGGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585835	585264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_585300_585800
822387	contig_1301_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_47391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAGAAAAATAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744422	743719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_743700_744400
822388	contig_11105_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_159829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACCCCCTAAACTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413376	413838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_413400_413800
822389	contig_11105_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_159830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414963	415395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_415000_415400
822390	contig_5484_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_151084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCCCCTCATATGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56276	55942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_55900_56300
822391	contig_2646_pilon	-	780	2	Intergenic	novelGene_69559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	325	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCCCAGGACCATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867373	864791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_865467_867268
822393	contig_3818_pilon	+	947	2	Intergenic	novelGene_99282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTGTTGCTACGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699422	701820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_699846_701296
822394	contig_9945_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_104794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAAGCACCACGCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3177	1228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_1200_3200
822396	contig_5643_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_39161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCTGTAGGGTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700594	701817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_700600_701800
822397	contig_17563_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_175680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGAAGTTCAGTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19235	21254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17563_pilon_+_19200_21300
822398	scaffold_19766_pilon	+	1590	12	Intergenic	novelGene_34409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	29.7329713748367	36	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	107	1579	834478	839446	FALSE	20	GTAAGTTGTGATTCACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEKKLKLSNTVLPSESMKVVAESMGIAQIQEETCQLLTDEVSYRIKEIAQDALKFMHMGKRQKLTTSDIDYALKLKNVEPLYGFHAQEFIPFRFASGGGRELYFYEEKEVDLSDIINTPLPRVPLDVCLKAHWLSIEGCQPAIPENPPPAPKEQQKAEATEPLKSAKPGQEEDGPLKGKGQGAAPADGKGKEKKAPPLLEGAPLRLKPRSIHELSVEQQLYYKEITEACVGSCEAKRAEALQSIATDPGLYQMLPRFSTFISEGVRVNVVQNNLALLIYLMRMVKALMDNPTLYLEKYVHELIPAVMTCIVSRQLCLRPDVDNHWALRDFAARLVAQICKHFSTTTNNIQSRITKTFTKSWVDEKTPWTTRYGSIAGLAELGHDVRPPFLLPHHPLPRLGAVPSVGESKKLGIAPLQLQGLQRLMAPSPLDLAPLSLLLDTVTQPLTVFPPAGFYTHTQTYTRWVEGSSGLLLLHNFLFRYCTVSSSE	830954	839457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_831003_834419_834634_834739_834827_834960_835115_835334_835392_835483_835604_835839_835986_836096_836175_836284_836387_836464_836648_836920_837008_839143
822400	contig_6710_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_90184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653808	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
822402	contig_5799_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_50328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAACCAATAGCAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684753	682197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_682200_684800
822403	contig_18634_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_174238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23604	22197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_22200_23600
822404	contig_2867_pilon	+	2682	16	Intergenic	novelGene_135171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_1	38.1671179012627	46	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	205	2580	764545	770901	FALSE	10	TGCTGCCTAGAGCTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFPQHSQHVLEQLNQQRQLGLLCDCTFVVDGVDFKAHKAVLAACSEYFKMLFVDQKDVVHLDISNAAGLGQVLEFMYTAKLSLSPENVDDVLAVASFLQMQDIITACHALKSVAEPAASPRENMEATAMEGGDKRAKEEKAAATTLSRLDQAGSSPLAGPGREPKEERGGQAESAASGAEQTEKADAPREPPPVELKPDPTSGMAAAEAEATLSESSEQEMEVEPARKGEDEQEVDSAGPASVKEEGSQLENGEDNEESAGTDSGQELSMEARSLRSGTCGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGEKPFSCRECSKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYRCEDCGKLFTTSGNLKRHQLVHSGEKPYQCDYCGRSFSDPTSKMRHLETHDTDKEHKCPHCDKKFNQVGNLKAHLKIHIADGPLKCRECGKQFTTSGNLKRHLRIHSGEKPYVCIHCQRQFADPGALQRHVRIHTGEKPCQCVMCGKAFTQASSLIAHVRQHTGEKPYVCERCGKRFVQSSQLANHIRHHDNIRPHKCSVCSKAFVNVGDLSKHIIIHTGEKPYLCDKCGRGFNRVDNLRSHVKTVHQGKAGIKILEPEEGGEVSVVTVDDMVTLATEALAATAVTQLTVVPVGAAVTADETEALKAEITKAVKQVQEADPNTQILYACDSCGEKFLDANSLAQHVRIHTAQALVMFQADTDFYQQYGPGGTWPAGQVLQAGELLFRPRDGAEGPPALAETPPTASECPPAE	734951	771003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_735067_737063_737151_764542_764750_765591_765781_766434_766576_766850_766977_767584_767818_767924_768068_768171_768473_768959_769048_769131_769249_769337_769459_769693_769825_770136_770347_770450_770541_770620
822405	contig_8651_pilon	+	426	4	Intergenic	novelGene_168191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3160.6362580271	64	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	16	387	185122	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185106	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_187011_189168
822406	contig_13305_pilon	+	924	7	Intergenic	novelGene_146782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	69.6650717520783	555	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	39	839	202161	217917	FALSE	20	GAATCTGACTACTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRVAGRQLSQSARSGAPILLRQMFEPKSCTYTYLLGDRESREAILIDPVLETADRDAKLVKELGLRLLYAVNTHCHADHITGSGLLRSLLPGCQSVISRLSGAQADLHIEDGDLIRFGSFALEARASPGHTPGCVTFVLNDHSMAFTGDALLIRGCGRTDFQQGCAKTLYNSVHEKIFTLPGDCLIYPAHDYHGLTVSTVEEERTLNPRLTLSCEEFIKVMDNLNLPKPQQIDVAVPANMRCGVQTPPPADAPLCQVLISVMVG	202122	218002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_202233_202691_202837_203008_203158_214336_214467_216457_216548_217347_217465_217819
822409	SIRV6	+	348	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	525	0	359	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822411	contig_10074_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_57209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAATGAAAAAACAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614662	613956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_614000_614700
822412	contig_10074_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_57208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAGACCCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613752	612937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_612900_613800
822413	SIRV5	+	406	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_3271_3405_3483
822414	contig_10437_pilon	-	1203	3	Intergenic	novelGene_38407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	4	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATTTGGGATGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778315	773849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_774203_776147_776210_777527
822415	SIRV4	-	223	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	391	3	-391	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGGTTTTTCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
822416	contig_7720_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_155772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCAAGTCCCCTTGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710722	710515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_710500_710700
822417	SIRV6	-	360	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGATACGAGGCATAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11270	3042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3164_10723_10825_11035_11109_11205
822418	contig_294_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_166756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTGGCTATATAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235511	234809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_234800_235500
822419	contig_8156_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_98901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	606	70	675	53967	54572	NA	35	AGTAGTCAGGAGGAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGNSIGYENIISDIGYFESVFVKMEDVALTEALSFTFVEKSKQECFLNLKMASLHYNHSAKFLKELTLSMDELEENFQSMLKSAATKVTTVLATKTAEYSEMVSLFETPRKTREPFILEENEIYGFGLAASHSDTVKLILNINIESPVVSIPRKPGSPELLVGHLGQIFIQNFVTGDDESRSDRLQVEIKDIKLYSLNCTQLAGREGPGSEGSRTVCPPSGSASV	53897	54572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_53900_54600
822421	contig_4180_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_8307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734747	735706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_734700_735700
822422	contig_9668_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_58224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTATATTTTAGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553567	554510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_553600_554500
822427	SIRV6	+	265	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-430	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1855	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
822428	contig_9727_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_86254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAGTTCTTACAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18373	20373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_18400_20400
822429	contig_9833_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_68539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	18	317	230823	231122	NA	40	TCTCCTAAAAGGAAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGCTMLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKVSRPLPGPAWPSFVLQPETLQAAWWTGPRDVPGDFARPLTHFGPQFTYMGPRGVCCA	230805	232626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230800_232600
822430	contig_13498_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_176526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTGCTCCAAACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190388	189956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_-_190000_190400
822433	contig_18967_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_165334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCAACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249510	249853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_249500_249900
822434	contig_4305_pilon	-	559	3	Intergenic	novelGene_136675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814.5	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514659	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514547
822436	SIRV6	+	283	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	545	45	379	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACCAGCGGTCGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	2075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822437	contig_1339_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_163156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644677	643418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_643400_644700
822438	contig_8597_pilon	+	1235	3	Intergenic	novelGene_158706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAAGTTTAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54418	60435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_55387_58900_59054_60321
822442	contig_3153_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_104643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCACAATAATAATAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98402	99138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_98400_99100
822444	contig_12993_pilon	-	2153	1	Intergenic	novelGene_136738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACTAATGGTGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132053	129900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_129900_132100
822445	contig_13571_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_128103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59341	60780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_59300_60800
822448	contig_5732_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_119590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTGTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279409	278452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_278500_279400
822451	contig_3588_pilon	+	1292	8	Intergenic	novelGene_72887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	612.258048838353	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	140	778	127468	140944	FALSE	5	TATTTGGTGGTTTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGEHLPKIQKPPLPPATERHERSPLPGKKPPVPKHGWGPDRRENVMHQRPLPQPALPSMSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQDGTFLVRDSSKKTVTNPYVLMVLYKDKVYNIQIRYQEENQVYLLGTGLRGKEDFKSVAGIIDYFRKMPLLLIDGKNRGSRYQCTLTYAAGYP	125606	141458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_125712_127433_127469_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
822452	contig_3942_pilon	-	1080	7	Intergenic	novelGene_128826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	565	957	1190939	1190126	TRUE	40	CTAGGAGAGAACAGATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCTSRARCSISAVHLVTTKGTSSGKSLGSCRKSTPNRVVRAGSRLCPQRISSVSRQRLWQVKKHSSHSVPLTMKASHSRHLAGPRSRRSRWVCAALDSVHFLKGPAIPFSSPSPRSGLSPQSHLRTRCL	1191927	1189683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1189770_1190088_1190168_1190237_1190393_1190636_1190823_1190929_1191071_1191168_1191364_1191689
822453	contig_5918_pilon	-	1169	3	Intergenic	novelGene_99629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	526	846	2238859	2233976	FALSE	15	TTGATTGAGTGCTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGMFSGHTECAGEVIERNGQKLKLFYGMSSDTAMKKHVGGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAARLKELSRRATFIRVTQQHNTLFS	2241979	2233652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2234157_2238719_2238880_2241474
822454	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_94491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	18	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
822455	SIRV1	-	417	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	183	235	183	-235	5prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACGATTTAATTACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11460	10882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_11243_11403
822457	contig_6062_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_5274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGAAAGAAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691872	690986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_691000_691900
822458	contig_5278_pilon	+	1680	3	Intergenic	novelGene_139771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	17	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	102	482	194722	200668	FALSE	25	TCTGAGTTAACTGTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDCALCSLVEELIPRETKVGFRMAKEEPQSISKDLQELQKKLSLLIESIQTNSKVVAFMTSPVGQYLDRHPFLALTLLMFIAMSAVPVGFFLLLVVLTSLAAFVGVILLEGILLNYSPPWRMTQP	191770	201866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_191845_194694_194887_200452
822460	contig_10130_pilon	+	865	4	Intergenic	novelGene_172715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTTCTCTGTTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11898	56884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_+_12093_19821_19948_48818_49239_56759
822461	contig_7898_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_47648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGGGGGTGGGAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799423	801024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_799400_801000
822463	SIRV4	-	354	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1169	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3989	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
822464	contig_5954_pilon	+	842	5	Intergenic	novelGene_28523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	278.449726162552	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	150	392	465084	466506	TRUE	25	TGAATGAGGGTCACGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARPAARAQEGGAGPPGAGSVRQVPRGSGPSWLEAPGAQLGPSPPAPVAMAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVR	463171	467097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463252_465014_465157_465770_465874_466439_466731_466871
822465	contig_12969_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_61676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTGCCTGCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396571	395165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_395200_396600
822466	contig_11677_pilon	-	543	5	Intergenic	novelGene_85948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	17855.9332576038	42	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	294	506	595842	594927	FALSE	20	TCACCACATATGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKPVRREKGPFYEDGAESEEGSPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598094	594889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597390_598027
822467	SIRV2	-	412	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-389	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGACGTCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	4054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
822468	contig_14219_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_54332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAAAATTCGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776366	774381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_774400_776400
822470	contig_4716_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_166625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAAAAAAAAGCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835887	837291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4716_pilon_+_835900_837300
822471	contig_16122_pilon	-	2320	14	Intergenic	novelGene_134539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.2396683579256	2	122	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	264	1460	225232	219821	TRUE	15	GAATGTGTGCCGTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHRHPARELKVLISNLLELLTEVGVSGQGRDNALTLLIKVAPRKSPKDPNNSLTLWVIDQGLKKILEVGGSVQDSPGELAVTANSRMSASILLSKLFDDLKCDAERENFYRLCENYIKSWFEGHGLAGKLRAIQTVSCLLQGPSEAGNRALELSGVMESVIALCASEQEEEQLVAVEALIHAAGKAKRASFITANGVSLLKDLYKRSEKDSIRIRALGLCKLGSAGGTDFSMKQFAEGSTLKLAKQCRKWLCNDQIDAGTRRWAVEGLAYLTFDADVKEEFVEDEAALKALFQLSRRSVLFAVASALVNCTNSYDYEEPDPKMVELAKYAKQHVPEQHPKDKPSFVRARVKKLLAAGVVSAMTCMVKTESPVLTNSCRELLSRVFLALVEEVADRGTVVAQGGGKALLPLALEGTDVGQIKAAQALAKLTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRRS	226565	218738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219645_219771_219831_220669_220786_221002_221117_221575_221643_221827_221956_222156_222289_222932_223075_223335_223431_224216_224515_225137_225310_226075_226247_226550
822472	contig_7066_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_42167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876527	874992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_875000_876500
822473	SIRV5	+	416	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	880	23	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
822474	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
822475	contig_665_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_158185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAATGTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72279	74077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_72300_74100
822477	contig_4803_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_150714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGTGTACCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20133	21462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_20100_21500
822478	contig_6233_pilon	-	1255	8	Intergenic	novelGene_74785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	257.305504117148	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	187	789	149777	144489	TRUE	30	GCCACAAAGCTTTGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQK	250229	136683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136971_144309_144492_144775_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
822480	contig_3627_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_78466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTACTGAAGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330723	329045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_329000_330700
822481	contig_15123_pilon	-	1067	6	Intergenic	novelGene_110935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	61.0278624891942	871	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	428	793	320397	318930	FALSE	10	GATTATTTTTCCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI	321368	318655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319292_319627_319688_320277_320408_320544_320630_321036
822484	contig_2066_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_176531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGGTGGCAGCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97208	94974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2066_pilon_-_95000_97200
822485	contig_7428_pilon	-	1402	8	Intergenic	novelGene_77693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.8533953340731	16	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	108	1376	243098	225895	FALSE	15	GCTGAGCTGTATGCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCCDGETTAKPEPRSLSRLRHLGLGPRRAGSSKAMSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPISPLPCGHLPLY	250497	225868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_225932_235618_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_243113_250404
822486	contig_4315_pilon	-	997	5	Intergenic	novelGene_46863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	53.2323914548276	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	336	698	880689	804607	TRUE	20	AGAGAATGGCTTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVPASSVASHLGTTSRSYFYFTTATLAVCLVFAVATIMVLVVQRTDSISSPPDNSPLKGGNCSEDILCMLKRAPFKKSWAYVQGSSQRDQKWKGWNEPSIKGKFRSPAWPKQQVHAGKW	881024	798469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_798739_804576_804717_855434_855507_870361_870405_880551
822487	contig_15787_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_143989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACAAATTGACCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82315	83532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_82300_83500
822488	contig_11964_pilon	+	1708	15	Intergenic	novelGene_164714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	445.949502952603	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	184	1578	203864	234930	FALSE	35	TGAAGACCAAGGTCCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFPLFMDEVFYKYFNTSDNNLQYWGLDYPPLTAYHSLLCAYMAKFINPDWIALHTSRGYESQAHKLFMRTTVFIADLLIYIPALILYCCCLKETSTKRKITNALCILLYPGLILIDYGHFQYNSVSLGFALWGILGVSCDWDLLGSLAFCLAINYKQMELYHSLPFFCFLLGKCFKKGLKGKGFVLLIKLACTVVASFIVCWLPFFAEREQTLQVLRRLFPVDRGLFEDKVANIWCSFNVFLKIKDILPRHIQVIISFCFTFLSLLPACIKLTLQPSPKGFRFTLVSCALSFFLFSFQVHEKSILLVSLPVCLVLNEIPFISTWFLLVSTFSMLPLLLKDELLMPSVVTTMAFFIACATSFSIFEKTSEEELQLKSFSISVRKCLPYFTFLPRIIQHLFLISVIAMVLLTLMTVTLDPPQKLPDLFSVVVCFVSCLHFLFFLVYFNIIIMWDFRNGRNQKKIN	174127	235060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_174176_195807_195893_203813_203902_212355_212446_213716_213806_215470_215554_216225_216291_217370_217557_218143_218280_220528_220615_222042_222128_225061_225133_231783_231853_231976_232176_234732
822489	contig_5585_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_143066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTATTAGTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380215	380655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_380200_380700
822491	contig_817_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_132475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713463	714907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_713500_714900
822492	SIRV6	+	337	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	4	1248	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
822494	contig_1939_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_144882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATATTTGTGCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469756	471529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_469800_471500
822495	scaffold_13505_pilon	+	839	6	Intergenic	novelGene_111639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	21.4009345590327	569	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	62	769	773167	787825	FALSE	0	CCTGGCCTCTCTGTCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEMQIDTPIRAETGAEAGPRGPGCSLRHFACEQNLLSRPDGSASFLQGDTSVLAGVYGPAEVKVSKEIFNKATLEVLLRPKTGLPGVAEKSRERLIRNTCEAVVLGALHPRTSITVVLQVVSDAGSLLACCLNAACMALVDAGVPMRALFCGVTCALDSDGNLVLDPTLKQEKEARAVLTFALDSVERKLLMSTTKGLYSNAELQQCLAAAQAASQHVFHFYRESLQRRYSKS	773105	787895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_773315_782407_782522_783056_783179_785077_785219_786650_786741_787732
822497	contig_15327_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_70468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTTTTTAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355124	355486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_355100_355500
822498	contig_2704_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_75300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82393	83777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_82400_83800
822502	contig_10765_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_122931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTCAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207564	207903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_207600_207900
822503	contig_5484_pilon	-	556	3	Intergenic	novelGene_151095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263952	246331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_246695_250576_250683_263865
822508	contig_19155_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_173369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATAATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533389	534715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_533400_534700
822509	contig_12654_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_129280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGACAGCCCCGTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700190	699740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_699700_700200
822510	contig_3533_pilon	-	1416	10	Intergenic	novelGene_176538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCGAAAGACCAGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498953	427776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_427802_430002_430045_443345_443536_444292_444462_462785_462937_470094_470285_474898_475052_476094_476140_482054_482285_498732
822511	contig_10937_pilon	+	799	5	Intergenic	novelGene_67338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	23.6696007570892	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGATGCACAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180607	185983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181255_181397_181497_181654_181931_182017_185657
822512	contig_7202_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_18219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27827	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
822514	contig_7058_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_136023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATTAGCGTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168392	167847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_167800_168400
822515	contig_5413_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_168095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTTCACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403146	404462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_+_403100_404500
822516	contig_7594_pilon	+	1274	2	Intergenic	novelGene_55404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCCAAACCTGTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397368	401485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_398328_401170
822518	contig_13224_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_104066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1438	1776	29455	29117	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTTDPWSHRQGDQREDWKAHALSKEGRGYLLSHQLLLFKHKGPSDERSSSCSRAARNLDFYVKFLNHSFKYCNQVKKYFKNCAVQHRVSQMKHVCQMNIAHEHLVCNIGQ	30892	28582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_28600_30900
822519	contig_12429_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_136206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAGTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109120	108609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_108600_109100
822522	contig_7457_pilon	+	752	2	Intergenic	novelGene_31351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	756	junction_1	0	2134	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	24	344	300019	300753	FALSE	20	GCCAAGTGAATGTTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGPGDSYDAKSGKGPLAQRIDPTREKLTPAQLQFMQQVQLAQWQKTLPQRRTRNIVTGLGIGALVLAIYGYTFYSVSQERFLDELEDEAKAARARALERASAP	299995	301161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_300233_300646
822524	contig_5718_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_110405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTCCTTTCCTCCACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361980	1363818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1362000_1363800
822527	contig_294_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_166733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTAAAAAAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25169	27253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_25200_27300
822530	contig_10446_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_162514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATACCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129411	1130821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1129400_1130800
822531	contig_11378_pilon	+	1264	11	Intergenic	novelGene_112327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	37	junction_8	61.7301385062434	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	72	1202	1228994	1236886	FALSE	10	GGGCCTTTAACCCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACLSACRFLLQPACWAGPAWPAMEAYDIIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDLFIGPKAEEHRGLLTIRYPMEHGVVRDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPSKNREKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSITRVDIAGRDVSRYLRLLLRKEGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSINPQKDEALETEKVQYTLPDGSTLDVGPARFRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVLAFAVHKSDVDLRRTLFANIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIKISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSRKEYEEGGSRAVHRKTF	1228922	1236948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1229042_1231108_1231174_1232361_1232438_1233475_1233602_1233946_1234072_1234310_1234528_1234659_1234753_1234879_1235055_1236260_1236323_1236554_1236596_1236783
822533	contig_6445_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_77081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAAACTTTTCAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756515	757569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_756500_757600
822535	contig_15093_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_143297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTGACTTTTAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66355	67972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_66400_68000
822536	contig_1321_pilon	-	1339	8	Intergenic	novelGene_176543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	75.2383966238689	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	58	1296	114094	79969	FALSE	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APERGGQWLPAVPSVRGAVMQENLRFASSGDDIKIWDASSVTLVDKFNPHTSPNGVSSMCWSSNNNFLVTASSSGDKIVVSSCKCKPVPLLELAEGQKQTCVSLNSTSMYLVSGGLNKTVNIWDLKSKRVHRSLKDHKDEVTCVTYNWNDCYVASGSLSGEIILHSVTTNLSSTPFGHGNNQSVRHLKYSLFKKSLLGSVSDNGIVTLWDVNSQSPYHNFESTHKAPASGICFSPVNELLFVTIGLDKRIILYDTSSKKLVKTLVADAPLTAVDFMPDGATLAIGSSRGKIYQYDLRMLKSPVKTISAHKTSVQCIAFQYSVVLSKSSLNKGCSNKSMAVNKRTVNVSSTSGGVQNSGIVREATTTSVATVLPQPMTTVVGKGTVAVQDKAGKCCISMRFSFFFFSQIYIVSTFSSRTYNSNLHEYLRQNY	116436	79925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1321_pilon_-_80287_80661_80864_82540_82771_102056_102198_105277_105395_111022_111118_113958_114103_116387
822537	contig_9578_pilon	-	1077	3	Intergenic	novelGene_67987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_2	121.5	25	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	276	638	1182606	1182244	FALSE	20	TTAAGTAGTACTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNPNSPVRTFGLSLSSDSSALGAAASDSEQNKTEEERESRSLFPGSLKHKLGKRDYLEKAGELIKLALKKEEEEDYEAASDFYRKGVDLLLEGVQGTILSVLMCMGMFLCWFLGKISM	1204430	1181804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1182678_1198800_1198895_1204320
822539	contig_6446_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_149258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACCCACTATGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688913	687667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_687700_688900
822541	contig_14300_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_133120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTTAAATAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342070	343424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_342100_343400
822542	contig_5981_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_35524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	459	782	204992	204669	NA	20	AGGGGAGGGGTGGGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIISTLAKDVSDSLDFLKKQRFVFFNLFLPVVSVSAFHTTCFLPGIWVILGKMFIFKSGTPKILMRSSCKCGAYCGSHLRMICLGHLIANSLIKIYLLYTFSPGLF	205450	203863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_203900_205400
822543	contig_8697_pilon	-	314	3	Intergenic	novelGene_83205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7372	junction_1	851.5	973	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATCTGGTGTTTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18550	16460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436
822547	contig_8412_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_118365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCATCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514588	512874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_512900_514600
822548	contig_10297_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_112559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGCTACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704759	705784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_704800_705800
822549	contig_7629_pilon	-	1752	2	Intergenic	novelGene_153547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222785	217367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_218706_222371
822551	contig_854_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_36124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGCCTCTTCTTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306729	307423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_306700_307400
822552	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	22	-1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
822553	contig_10235_pilon	-	1774	6	Intergenic	novelGene_46526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	43.3912433562349	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	875	1252	328688	328214	FALSE	25	GAACATTTGTAGAGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	331986	327691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328950_329127_329952_330023_331063_331257_331623
822554	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
822557	contig_8712_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_58857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAGGGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730926	732483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_730900_732500
822559	contig_1694_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_144967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571716	1571306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1571300_1571700
822560	contig_14643_pilon	-	1337	2	Intergenic	novelGene_99114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTGTCCTGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27251	25647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_26234_26500
822561	contig_998_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_153786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAGTTACCCTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319111	321047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_319100_321000
822562	contig_11285_pilon	-	1590	12	Intergenic	novelGene_5552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.114886179658	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	87	1223	745067	741595	FALSE	40	AAGATGATAAACTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILCRVSSAESPACILGREGGEIALPVQMPGAGRRGEPGVPACSPEKADGPFTAISLVYKFRLLPGPTSHPDQNYMMADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGEDHQGRPLLCHHDQHL	745153	741227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741644_741733_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_744938
822563	SIRV6	+	394	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	224	72	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCACTAACGTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527	2022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1756_1856
822566	contig_8554_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_160290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109802	111487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_109800_111500
822569	contig_7202_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_18272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTACCCAGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27893	27634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
822570	contig_1867_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_54538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAGCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337071	338928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_337100_338900
822571	contig_16920_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_138450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCCCCTTATAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11048	10074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_-_10100_11000
822574	contig_6833_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_175136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGCTATTTTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255914	254761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_254800_255900
822575	contig_10496_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_59433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATGTTAAGAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119384	120508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_119400_120500
822576	SIRV4	-	463	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	30	124	30	-124	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGCTAGCGTTAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5128	3761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
822577	contig_10197_pilon	-	922	5	Intergenic	novelGene_115273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	248.669459323014	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	278	739	1168498	1167782	FALSE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA	1170163	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168536_1168688_1168856_1170090
822582	contig_2069_pilon	+	1176	2	Intergenic	novelGene_23556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGCTGTCTTGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1882949	1898859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1883076_1897809
822584	contig_14288_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_153839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATCATGGAATTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466628	467960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_466600_468000
822586	contig_13176_pilon	-	1501	10	Intergenic	novelGene_159709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTACCTGGGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110017	2910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13176_pilon_-_3004_10067_10176_12565_12682_13069_13238_14033_14157_23393_23494_53858_53915_54096_54287_61538_61634_109565
822588	contig_10235_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_46402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGATCCAAAAACTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182403	181712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_181700_182400
822589	contig_14093_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_174213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTAAAATGTTTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122905	124166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14093_pilon_+_122900_124200
822590	contig_5935_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_102750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	796	1098	1315443	1315141	NA	10	TTTCTTCTCTGCACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQSSLGLGESQHRNLRSKGPALLPALLSWWYGGSCLCAHFSLLYLKRDWLKTLPNLVDLINIIATNPSYYTTVIEFTIHREITSDNKIVDNHTTLGIMT	1316238	1314996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1315000_1316200
822591	contig_16846_pilon	-	963	3	Intergenic	novelGene_82923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	39	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	205	534	487254	478170	FALSE	35	GAAAATCTGTTGATCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGRRKEEPPQPQLANGALKVSVWSKVLRSDAAWEDKDEFLDVIYWFRQIIAVVLGVIWGVLPLRGFLGIAGSFGSSFTLPSTMTDGVQPSPAPCPKDLLNYSTEAQL	487458	477740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_478282_484888_484993_487140
822592	contig_17737_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_72913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAGAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55548	56931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_+_55500_56900
822594	SIRV6	+	319	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	432	122	266	48	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCTATTGTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569	1998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822595	contig_9460_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_155320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCAAGGAGTGGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474627	475186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_474600_475200
822597	SIRV2	-	195	2	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	7	1077	7	-1077	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAAATGGTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5888	4742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4801_5751
822599	contig_5836_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_106269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCTTCTAATTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20638	22425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_20600_22400
822602	contig_5057_pilon	-	780	7	Intergenic	novelGene_151519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	576.314728830234	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	348	749	511257	507037	FALSE	10	CCAGCTTTTTGTCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523491	507005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511248_511321_514151_514273_523328
822604	contig_715_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_167553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAGCATAGAAGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124078	123461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_123500_124100
822605	contig_10446_pilon	+	858	2	Intergenic	novelGene_162493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCCAGCCTGCCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866316	867655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_866553_867033
822608	contig_1435_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_115482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTACTTTTCATACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365057	363920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_363900_365100
822609	contig_1435_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_115481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGTCACATATTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363783	362883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_362900_363800
822610	contig_15244_pilon	-	1506	8	Intergenic	novelGene_118050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	5.11101251999952	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	384	1316	557203	536776	FALSE	35	AATCTAACATATCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAEGGKSDMDRIGLFSEMEYITIGDKYVSPFNRPFNEAASKNRQMLPGGSKEMSHLQQGYFDPHFVRIFEGEGYINLNQVRRRHMMEEAKKNLGKPFLPSSGGKKPCGFGSYYGTIGGPVPFFSVQLKPREKYQAPGKNLYTNPGKKGTGYGYANLTIGKQPSHSADFYDEPKLTNKKDNEAHRHLLKGSPFKLSSYPKEYFDNNPYFFDKPLPPIKKAEKPGSLATPFKPSSPGKKAGGMKAGTFDPYPSHSADPYVTKLPRRISGKIDKIFHPPGGPKSRPMTSIMTLNVKRALNMKNYKTASVQSY	560217	536585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_536825_541314_541485_549750_549931_551044_551121_551222_551361_552048_552269_557103_557281_559911
822612	contig_13021_pilon	-	1385	7	Intergenic	novelGene_8276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	61	junction_3	541.312910123772	403	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	87	809	270418	258084	TRUE	15	CATCTCTTTCAAGCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTGMTSLWEMCLVMTLGLCGLTS	270504	249537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249915_251082_251152_252257_252369_258064_258149_259754_260040_265837_266120_270327
822613	contig_9468_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_59527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAATAAACAGGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532767	533829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_532800_533800
822614	contig_7428_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_77732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCCCTTAAGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431135	431768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_431100_431800
822621	contig_3382_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_124204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGCTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397117	1398576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1397100_1398600
822622	contig_14333_pilon	+	741	2	Intergenic	novelGene_49088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1254	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACAAGAAGTCCTGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281909	285956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_282597_285902
822623	contig_14333_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_49091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAGGAGAAAGAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285906	286832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_285900_286800
822624	contig_10958_pilon	-	968	4	Intergenic	novelGene_5353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_3	47.1333804808817	679	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	117	647	802556	796210	FALSE	15	CTCTTATGTTTTGGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRSQLLPEGLWLRLQTAETPARSKRRGYSEAFPEVPSAMALRSRFWALSVCRNPEFGFAALSTSSKSAVKPEVANEAVASEFTNRNPRNLELLAVARKERGWGTVWPSREFWHRLRVIRTQHHIEAFVEHLNGQIVVSASTCEWAIKKHLYRTTNVVACESIGRVLAERCLQAGINFMVYQPTPWEAASDSIKRLQSAMTEGGVVLQEPRRIYQ	802672	795888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_796282_797033_797266_802040_802219_802507
822625	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
822626	contig_7119_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_41039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTACCACGTGGCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445875	445107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_445100_445900
822627	contig_6109_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_160379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTTTGGGGTTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575003	576197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_575000_576200
822629	contig_15062_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_162292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGATCACAACAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39312	40006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_39300_40000
822632	contig_4336_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_152378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTCAACCCCATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622195	620785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_620800_622200
822636	contig_9389_pilon	-	954	9	Intergenic	novelGene_83956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.424276375821	299	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	8	640	215498	207870	TRUE	10	CCGCGTCTGTGTGTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ	215505	206830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_207094_207178_207215_207854_207936_208221_208301_208414_208474_208771_208853_209776_209893_213629_213805_215441
822637	contig_14563_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_135018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAACCTATTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35980	35153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_35200_36000
822639	SIRV6	+	366	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	507	0	341	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822640	contig_5765_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_141371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGCGAGACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526047	526696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_526000_526700
822641	contig_5765_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_141373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	37	477	528444	528884	NA	30	TTGAAACATCATTTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISETLKTVAPILMHPPITSERCNHFSEVNSDGGQEVALQNHQGSMHSWKKSTSDFDNCVFCPPSLLYHLPPHTAKYFCPEVFWDGRKNLSLVTRKISRMSLGLNPIEGLRTQTFVKKVYVCRADGKISLFLCKWAVSLSEGILIRKVLQCCLLHVQGI	528407	529228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_528400_529200
822642	contig_10658_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_130091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAATATCAGTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370233	370932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_370200_370900
822645	contig_10126_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_105731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAGTCTACACAGAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147034	145693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_145700_147000
822646	SIRV6	+	320	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_3065_3165_10724
822648	contig_1406_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_25472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGACCAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836050	837051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_836000_837100
822649	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822650	contig_11104_pilon	+	1558	3	Intergenic	novelGene_112465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330355	335113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_331284_334326_334408_334564
822653	contig_9668_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_58074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44771	44375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_44400_44800
822654	contig_6488_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_44770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCAGTATCTAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232614	233652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_232600_233700
822655	contig_16776_pilon	-	1184	6	Intergenic	novelGene_130509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	336.219571113878	4	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	268	795	43087	35073	FALSE	10	GTCCAACCCTGTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	57990	34683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43163_57798
822656	contig_11538_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_152292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATTATTTTTCAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187092	187530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_187100_187500
822658	contig_4496_pilon	-	1603	4	Intergenic	novelGene_66676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAACTTTCTTTGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901049	878547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_878624_881171_881323_891911_891993_899754
822659	contig_17130_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_176546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCTATGAAAATGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13410	13824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_+_13400_13800
822660	contig_5848_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_163808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCATAAGCTCCTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279095	280754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_+_279100_280800
822661	contig_5302_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_81504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCCCAAAAAATAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347713	346813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_346800_347700
822662	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
822663	contig_11551_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_168472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAGGAGCGCCTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449311	448628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_448600_449300
822665	contig_10299_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_79659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTCATGGCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182242	180945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_180900_182200
822667	contig_9440_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_59068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1735	2172	545802	546239	NA	55	AGCAAAGACGGGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPCLPHTKSHKHNENANPPRWGGGARHGEREPHRHPSHPHLRITDKALSIATNPSITDALHPVQITSTHTPKRGTSLKKKTKTPLSQWSRKSPAKPEAPGSSACARGVGGAERRGGKRVEWILRLFAAAQRKYSFKKIKKRKS	544067	546281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_544100_546300
822668	contig_13021_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_8223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAACAAATGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182656	184025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_182700_184000
822670	contig_2987_pilon	-	982	7	Intergenic	novelGene_125855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	126.229178701105	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCTTACTTTACAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593485	533280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_535550_535713_535767_538273_538325_539478_539678_553777_553850_593438
822671	contig_7728_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_64744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTAAACCTATTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881054	880273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_880300_881100
822672	contig_3132_pilon	-	1355	9	Intergenic	novelGene_127425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	91.5101599550564	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	498	1283	227252	210841	FALSE	20	CCTGCTTTTTCTCAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVWSSLSVWKTAGFWTWVVEVVEIAMHSVSWLVRRDISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229574	210768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_227136_227258_228800_228929_229210
822673	contig_6175_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_16345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGTGTCTGAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674323	1673208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1673200_1674300
822674	contig_3832_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_161453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAGTGTCCCCAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317818	317374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_317400_317800
822676	contig_4600_pilon	+	888	7	Intergenic	novelGene_174017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	4.99165971062398	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	34	888	172922	184530	FALSE	55	CGTAAAGAACTTAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKKWQSKVEGMRNKLKEKEGEVYTLTKQLNTLKDLFAKADKEKLTLQRKLKTTGITVDQVMGVRALESEKELEELKKRNLDLESDITYMRTHQALPRDSVIEDLRLQNRYLQEKLQALEKQLSKDAYSKPSTSEAGSDDHCQREQELQRENLKLSSENIELKFQLEQANKDLPRLKNQVRDLKEMCEFLKKEKAEVEQKLGRVRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENEQLKKASGILTSEKMANIELENEKLKAELEKLKVHLGHQLSMYYESKTKGTEKIVAENERL	172888	184530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4600_pilon_+_173005_173349_173506_176919_177044_181193_181329_181752_181840_183721_183887_184425
822677	contig_15720_pilon	-	1907	4	Intergenic	novelGene_41866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52.5758711028379	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1371	1673	260343	260041	FALSE	40	ACTAAATCAAATTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	262893	259806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_260733_261064_261341_261661_261826_262352
822678	contig_3866_pilon	-	1429	15	Intergenic	novelGene_112405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.332271443101	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	179	1198	222507	183386	TRUE	45	GACTTAGAAGAATCAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPLRVGAIVETKTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVSVMSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGYSNQQTTCFGL	223775	182200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_182276_183054_183153_183327_183424_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
822679	contig_6048_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_73094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATCTTTCTCCCACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132682	131201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_131200_132700
822680	contig_2940_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_81969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCAGCACTAATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069388	1068084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1068100_1069400
822681	contig_19459_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_59900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAACCTTCATTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10291	11004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_10300_11000
822682	contig_12414_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_59671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAACCTAATTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867513	867925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_867500_867900
822684	contig_7188_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_108530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101778	103145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_101800_103100
822685	contig_15114_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_121210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAAGAGCAGGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914464	914782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_914500_914800
822687	scaffold_13505_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_111431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGCAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527909	526625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_526600_527900
822688	contig_2799_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_85609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTCTAACGACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829486	829927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_829500_829900
822689	scaffold_9100_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_83311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAACCATAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831896	833597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_831900_833600
822690	scaffold_17542_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_139230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTTGGTGTTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356387	357518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_356400_357500
822691	contig_2371_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_176558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACTGACCCAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293561	294118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_+_293600_294100
822692	contig_8538_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_4823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842771	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
822694	contig_6674_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_148013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207443	208875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_207400_208900
822695	SIRV6	+	344	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	2	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
822700	contig_9727_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_86387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAATCTTACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618856	618188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_618200_618900
822702	contig_3916_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_141863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77816	76769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_76800_77800
822703	scaffold_13505_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_111675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACGGGAACTACGACTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871505	870835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870800_871500
822707	contig_5643_pilon	+	479	2	Intergenic	novelGene_38995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	18	398	623729	624854	FALSE	5	GCCTTGGTGTCAGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSPVMLRHVPRDTFLGFLWGAVVLAEVIQAFAAPENAVRMDEARDNACNDMGKMLQFVLPVATQIQQEVIKAYGFSCDGEGVLKFARLVKSYEAQDPEIASLSGKLKALFLPPMTLPPHGPAPGGSVAAS	623711	624935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_623958_624702
822708	contig_5317_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_76594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	200	319	384026	383907	NA	15	CCCACCAGTTCCCCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKVSPELCVSFLSSLLHPGKKVQGGISLTKTFKNSQMDNLLNSMAYFPDCFRPSSQRENPPGAAGAHPQPGSIGN	384225	381556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_381600_384200
822709	contig_14635_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_84375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATTGGATTACGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603253	603781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_603300_603800
822710	contig_10722_pilon	-	1093	3	Intergenic	novelGene_70995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTATACAGGTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32471	30790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_31130_31536_31749_31929
822713	contig_5375_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_169215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCGACCCCATGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81871	82617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_81900_82600
822714	contig_5375_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_169216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTTGGGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84206	87486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_84969_87403
822715	contig_11061_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_173345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACAGAGGAGCTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33586	34318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_+_33600_34300
822716	contig_11061_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_173344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32925	33431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_+_32900_33400
822718	contig_11071_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_131031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGTATAGTTAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101176	103163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_101200_103200
822723	contig_4364_pilon	+	1164	4	Intergenic	novelGene_83	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	30.2324329156619	127	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	70	705	848260	851164	FALSE	10	TTTCTGAGTCCCCATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTTGRCNRKILCSIRALPVSTASMAPRGPCLPLLLALTLALPVSLATQEVLQSPCYAIVPEGSSVNITCSSSGWLRGIYLNRDWPSASSPISYYEDGKTPTVDKLFRMRINFSGSQHNLTITMQRLQPADTGVYTCQAIVDDKISGAGTLVVVTDKSSPRADLCRNDWARAFGLPVALAVCCFLAGLVLGVVCAPRTTQIKKLCSRTDRSADVVVYEDMSCSRHNTLSIPNQYQ	848190	851623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_848336_849346_849665_849901_850036_851056
822725	contig_3575_pilon	+	976	2	Intergenic	novelGene_141131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	0	391	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	283	375	833179	833271	FALSE	15	TATCAGGCTGTGCTCACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSAGGCSAEQLDALVKKDKVVVFLKGTPEQPQCGFSNAVVQILRLHGVRDYAAYNVLDDPELRQGIKDYSNWPTIPQVFLNGEFVGGCDILLQMHQNGDLVEELKKLGIRSVLLDEKKDQDSK	821330	833872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_821527_833092
822726	contig_10813_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_87013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	187	306	55359	55240	NA	70	ATAGAAAAAAGGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAVHVLVTELGSRPSVSAPGGYRRHGGSHCVSSYLRGPGRRGVNGSRAYDGPGPVGVRVVRMEHDIPPRPIRESGGGRERWGAVQPRAAPARSRENTLRR	55545	53042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_-_53000_55500
822727	contig_5643_pilon	-	854	6	Intergenic	novelGene_39114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.237851895587	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	336	497	648450	647313	TRUE	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDYEERVLPSIVNEVLKSVVAKFNASQLITQRAQVSLLIRRELTERAKDFSLILDDVAITELSFSREYTAAVEAKQVAQQEAQRAQFLVEKAKQEQRQKIVQAEGEAEAAKMLGEALSKNPGYIKLRKIRAAQNISKTIATSQNRIYLTADNLVLNLQDESFTR	649448	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646547_647309_647394_647935_648014_648447_648552_648661_648792_649344
822729	contig_5317_pilon	+	642	2	Intergenic	novelGene_76632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	3	473	893712	894182	TRUE	35	GCGACAACAAACCATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPEPRTSQGLTALWGYAAVSPQIGLGCVDSAGPHGFPPSGRSALLGTGLSLFLGRLQVKRQSQDPPRVLLTWHVACAKVHFCSHPFSVGNLSWLPTAELRQWWFSARIRVFHTGDPGWIPGQCTSHSYHLSCSGGLCVVMMLKRFQRSFQTKTD	893709	947065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_894302_947015
822730	SIRV5	+	350	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	106	96	58	-96	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAAGGTCGCCGTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
822731	contig_2799_pilon	-	1495	3	Intergenic	novelGene_85557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	350	652	749744	749442	TRUE	35	AGAGGAAGCCAGAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVIDGEAHNMLSFCVDISGEYSSDKEQKDMCERNTENHTGYLKGIPPNPYSFLRATYKGHLISSTHYHITCVLRAGCTTEPALFTLVSCVQSQYMHPV	750093	725698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_725871_729187_729365_748947
822733	contig_7412_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_76278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	259928	259560	NA	70	TACCCAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRRPEFTVRPHRHLQAAQDLQPHLGTLLLPRPPAPTCTGWCWQRELEAPRPTGHAPPSSRRASRDPTSFLLPPALWPSSAEYVIPIGRGRLGEPIREGGELWEGGYVSRDLRAEATWLGCER	259930	257888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_257900_259900
822736	contig_16204_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_154492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTATGGAGCAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249211	248555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_248600_249200
822738	contig_610_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_76781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAAAAAACCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247948	249049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_247900_249000
822739	contig_7171_pilon	+	1172	6	Intergenic	novelGene_101409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	31.6644911533408	134	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	724	1119	1444722	1446020	FALSE	15	CCAGAGGGGTCCCTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLLREAGADLNKPEPTCGRSPLHLAVEAQAADVLELLLRGGADPAARMYGGRTPLGSATLRPNPILARLLRAHGAPEDEDDKPGPCGSSSDSDSGDEGDEYDDIVVHSGRSRDQLPPTPVANPLPDDPV	1437833	1446073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1438072_1443207_1443314_1443395_1443731_1444677_1444767_1444851_1445107_1445924
822740	contig_7138_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_120993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGGCAAATATCTATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231839	233528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_231800_233500
822742	contig_9029_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_155133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAACGATAAGATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459886	458509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_458500_459900
822743	contig_9333_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_120309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGACAACATTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2989	2113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_2100_3000
822744	contig_6217_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_109594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279509	277663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_277700_279500
822746	contig_12964_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_131682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAACCCACCAGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399249	399770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_399200_399800
822747	contig_15952_pilon	+	1616	3	Intergenic	novelGene_154038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	38	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	550	948	63603	64001	FALSE	15	GCTCCCAAGGCCTGGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVEKFRLQELCEAHCAHPEAGPQSSSLPQPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQVMPHAPRWCAGLGPVKERVVTPGLTGTSQLPNPTGRSHAAVPAH	62208	64669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344
822748	contig_9706_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_20809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATCCCCTAATCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2100
822751	contig_12178_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_156541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCACAAATGTTCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31055	29286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_-_29300_31100
822752	contig_17144_pilon	-	1563	4	Intergenic	novelGene_29130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22751	16860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_17651_19969_20171_20622_20765_22321
822757	contig_11126_pilon	-	1964	1	Intergenic	novelGene_138116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAAGAGCCAGGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163097	161133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_161100_163100
822759	SIRV6	+	465	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	25	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847
822761	contig_15327_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_70465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAGATTAAACACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350639	351572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_350600_351600
822764	contig_5434_pilon	-	1678	11	Intergenic	novelGene_74645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_10	42.4863507493877	349	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	102	836	136094	128288	TRUE	10	GGAAGTTTGCTTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTGCWTVCRQVQGAEIRPLWGTADSTRVGRLLCLSAGSQRPCARTEASELLSGSQRLFFFLLWRGLCRSGSDHGVPLMAGQRVEVDGGIMEGGGQILRVSTALSCLLGLPLRVQKIRAGRSTPGLRPQHLSGLEMIRDLCDGQLEGAEIGSTEITFTPEKIRGGIHTADTKTAGSVCLLMQVSMPCVLFAASPSELRLKGGTNAEMAPQIDYTVMVFKPIVEKFGFTFNCDIKMRGYYPKGGR	136195	116507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_116851_119223_119329_120540_120636_126854_126914_127803_127929_128172_128316_129676_129736_131514_131639_134396_134541_135615_135717_135815
822766	contig_4754_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_35985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	225	815	1039	497567	497343	NA	25	CGTGAGTGGTGCAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPYKCSECGKAFRWRSVLTKHQRIHTGEKPYECIVCGKAFIQRANLVKHHRIHTGEKPYKCNECGKAFINNSSLVEHQRIHTGEKPYKCNDCGRAFKWGSNLTSHQRTHNGEKLFKCNVCGKFFSQNSSLITHYRIHTGEKPYECNYCGKAFIHNSSLVEHQRIHTGEKPYKCNECSKTFKWGSVFAKHQRIHTGEKPYKCNVCGKLFTQSSSLTTHYRIHTGEKPYECNECGQAFIHSSSLVYHQKIHIGEKHYKRIERAQAFAQSTSFMEHQRIHSGQGPYKCDECGKEFMHSYQSVHERIHTGEKMSKCNECWKALNVAHFSLDIRESIMEQNYIDVKYVAD	498381	497340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_497300_498400
822769	contig_8538_pilon	-	2218	1	Intergenic	novelGene_5113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	648	1118	1132601	1132131	NA	20	CACGGCTTCTCTTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQKGVPTASPEKAWKAGCGQVWARKQSRAHVHLSRSFLWQQHRGKLLTVSPLVPRKHDVDRHTRGCGATLVSRHCKPITAIGARKGVQRRGRHRGSATPKASSPMISPNLSTPPFPPLQKVLWAELCRPRRYEVLTPVPLIVTLFGSRVFADVIS	1133248	1131030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_1131000_1133200
822770	contig_12450_pilon	-	2115	11	Intergenic	novelGene_162312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	15.0864177325169	65	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	131	1555	157193	133300	FALSE	20	CTTACCTTGACATGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPNTIPLPLPQPNTCKDNGPCKQVCSIIGDTAVCSCFPGYSLMADGVSCEDINECVTALHTCSRGEHCVNTMGSFRCYKALTCEPGYAITDGECTDVDECALGTHNCQAGLTCQNTKGSFYCQARQRCMEGFLQDPEGNCVDINECTSLSEPCKPGFSCINTVGSYTCQRNPLLCGRGYHASEDGTKCVDVNECETGVHRCSNSQVCHNLPGSYRCDCKPGFQRDAFGRACVDINECWASRGVMCQHTCENTPGSYRCSCASGFLLAADGKHCEDVNECESQRCSQECANIYGSYQCYCRQGYQLAEDGHTCRDIDECAQGASILCTFRCLNVPGSYQCACPERGYAVTANGRSCKDLDECALGTHNCSETETCHNIQGSFRCLRFECPPNYVRVSETKCERTTCHDLMECQNSPARITHYQLNFQTGLLVPAHIFRIGPAPAFTGDTISLTITKGNEEGYFGTRRLNAYTGVVYLQRSVREPRDFALDVEMKLWRQGSVTTFLAKIHIFFTTFAL	158004	132739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_133658_136829_136954_142023_142153_142630_142748_145493_145620_146011_146141_146260_146405_148216_148355_150376_150512_157168_157271_157951
822771	contig_19604_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_77225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTTTACTATAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232183	232621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_232200_232600
822772	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
822773	contig_7444_pilon	-	1188	7	Intergenic	novelGene_174922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGCCCGCGAGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59976	51242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_-_51299_51642_51899_53764_53920_54525_54584_56823_56967_58806_58872_59521
822774	contig_10732_pilon	+	3305	4	Intergenic	novelGene_114724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	251	577	357874	362734	TRUE	15	GGGCCTGGATGCCCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLECKRRGPALQCQLFSAQSGRLGSHGMHVADLRSPVSAPLVAVPGPAWPLHLGAGPGLHTRQNPPCPRRRSLGHTDRSHRRSAAEGADAGHASHLHQGHPSVLRRSS	357623	378711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_358178_362711_362837_368156_368236_376164
822775	contig_6445_pilon	-	2019	5	Intergenic	novelGene_77085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	9.47034846243791	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	34	975	765711	761453	FALSE	15	CACCTTTGGACTGTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAVGGLPGRRMQLAGRLGGAAVLRLLLAAQVVSAFEPISIGIAIGAASALTGYLSYTGFYCRFAECCRPEQPLNASALKLDLKEKLFGQHLAAEVIVKALTGFRNNKNPKKALTLSLHGWAGTGKNFVSQIVAENLHSKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQNWIRGNVSTCASSVFIFDEMDKLHPGLIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLSNAGGDLITKTALDFWRAGKKREDIQLKDLEPVLSVGVFNNKHKYRHVKMCVRAEMEARGSPINEDIVTRVAEEMTFFPKDEKIYSDKGCKTVQSRLDFH	765744	760408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_761626_762009_762138_762608_762785_764426_764693_765512
822776	contig_19769_pilon	+	486	4	Intergenic	novelGene_102317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1731.46880486546	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87320	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87375_87910_88040_88847_88958_89163
822777	contig_5569_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_86732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAAAACCCCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219910	219298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_219300_219900
822778	contig_3975_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_54726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGTAAGGGATATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1597025	1596428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1596400_1597000
822779	contig_17440_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_7629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3427	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3400_4000
822781	contig_10183_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_169504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATGCCCAGCATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44560	46041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_44600_46000
822783	contig_91_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_127146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTACACATATTCCTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200583	1202452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1200600_1202500
822786	contig_15104_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_163357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTAAAAAGTTAGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614039	611815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_611800_614000
822788	contig_5350_pilon	+	1200	8	Intergenic	novelGene_99341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	55.9562511326154	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	378	770	184722	225365	FALSE	30	GGGCAACTTAGCCAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVPGLCWRTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILATPGVLKYLDFLRRV	142200	225795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_179375_179518_184664_184748_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
822790	contig_12799_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_173282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	57	509	16875	17327	NA	35	ATTGATAAACCTTTAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAALVEAIVEEVACPICMTFLKEPVNIDCGHSFCHSCLSGLWEVPGESQNWSYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLGLHPGMGLKGDICELHREWLKLFCKEDGLMMCEACSQSPEHETHSVVPMEDVAWEYKVRDGGWAA	16818	18843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_+_16800_18800
822791	contig_10546_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_176323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504184	502313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10546_pilon_-_502300_504200
822793	contig_15003_pilon	-	1358	13	Intergenic	novelGene_137340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_11	46.0406674099709	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	130	1173	273275	239526	FALSE	25	TGACAGTGAACTTTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENHHYRTMRKRGKKERAMVDKVFFSRLTKILKIMVPRTFCKETGYLILIAVMLVSRTYCDVWMIQNGTLIESGIIGRSRKDFKRYLFNFIAAMPLISLVNNFLKFGLNELKLCFRVRLTKYLYEEYLQAFTYYKMGNLDNRIANPDQLLTQDVEKFCNSVVDLYSNLSKPFLDIVLYIFKLTSAIGAQGPASMMAYLVVSGLFLTRLRRPIGKMTITEQKYEGEYRYVNSRLITNSEEIAFYSGNKREKQTIHSVFRKLVEHLHNFILFRFSMGFIDSIIAKYLATVVGYLVVSRPFLDLSHPRHLKSTHSELLEDYYQSGRMLLRMSQALGRIVLAGREMTRLAG	313626	239340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_239622_239917_240016_240106_240177_242386_242457_245915_246059_248538_248596_252630_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265957_273246_273284_313505
822795	contig_11823_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_171035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92270	91067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_91100_92300
822797	contig_13592_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_33744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308760	307873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_307900_308800
822798	contig_10857_pilon	-	1257	10	Intergenic	novelGene_160893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	541	903	61903	58794	TRUE	25	GCCTGGAGCAGGGGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPATISLQEGPLDVDWVCTSPVSHRLFVLATAMLGSSMEVWRASLGVRPAVSTAWVYCSRRSSILEIGWAGSDFFTLLLFSMERFKDSVLSMSLVVGLRGGGLCSAVPSKAKGLGVLGC	66895	56406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_56562_58203_58390_58780_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61960_62092_62197_66446_66480_66548
822799	contig_8942_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_143206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAAATGGCACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486052	484399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_484400_486100
822801	contig_15010_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_175328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAGGGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70174	69405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15010_pilon_-_69400_70200
822804	contig_4364_pilon	+	1128	8	Intergenic	novelGene_67	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	38.7740708648005	165	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	73	651	703017	707465	TRUE	20	TATTAGTGTGATTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGCRSIGCGPAAGSLSPPSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPESPRDVSQSSDSDPDAGGHS	701287	709035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_701336_702992_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707632_708724
822805	contig_13853_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_176561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTGAAAACTTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43511	43885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13853_pilon_+_43500_43900
822806	contig_10949_pilon	+	1650	9	Intergenic	novelGene_146687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_4	139.430986513042	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	84	1193	30749	60295	FALSE	10	TTAGCTTGATTTCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFKFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGKTSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHCTSDSMSRLSLPSKSGSKKKGLKPTDFFKKAERKGKESSALGPAGQLSYNLMDTYNHQTLKTGSSQKAKFNITGTCLNDSDDDSPDLDLDGNESPLALLMSNGSTKRMKSLSKSRRAKIAKKADKARLVTEQVMEDEFDLDSEDELQIDERLGKEKTTLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGTGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALT	30665	60752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_30760_31127_31235_32517_32610_39743_39834_41673_41977_42753_42858_58890_59070_59582_59669_60157
822807	SIRV4	-	221	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1300	0	1300	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3858	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
822810	contig_4923_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_109323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGCCATAAAACAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115148	113775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_113800_115100
822811	contig_10930_pilon	+	237	4	Intergenic	novelGene_37113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9652.619725005	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339569	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339622_339803_339921_340994_341036_342077
822812	contig_11677_pilon	+	1281	3	Intergenic	novelGene_85965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	57.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	272	907	651345	660493	FALSE	25	AGAATTTCATTGTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTRLSAFVREGESWQKRFRKTAVTEFREPSEGIGSNQSQPFPQATLAKGTIKPRTRPSSLPPLRCSAAASGSGEGAGFSSKIRTAYPVRMAVVPLLLFGGLWGAVGASDLAVVTCGSVVKLLNTRHNVRLHSHDVRYGSGSGQQSVTGVTSVDDSNSYWRIRGKTTTVCERGTPIKCGQPIRLTHVNTGRNLHSHHFTSPLSGNQEVSAFGEEGEGDYLDDWTVLCNGPYWVRDGEVRFKHSSTEVLLSVTGEQYGRPISGQKEVHGMAQPSQNNYWKTMEGIFMKPSELLKTEVHHVEL	651073	660867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_651496_654172_654370_660205
822814	contig_10063_pilon	+	641	5	Intergenic	novelGene_127757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	26.4480623108764	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	3	590	682823	685050	FALSE	20	GCTGTGGCATGGCAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALELSHNRIAENLGDVQISDKITISKNFKENVIRPILKAHFRRDEFLGRINEIVYFLPFCHSELIQLVNKELNFWAKRAKQRHNITLLWDREVADVLVDGYNVHYGARSIKHEVERRVVNQLAAAYEQDLLPGGCTLRITVEDSDKQLFKGPELPSPQAEKRPPKLRLEIIDKDSKTHKLDIRAPLHPEKVCYTL	682820	685101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_682863_683648_683723_683884_684005_684239_684345_684801
822815	contig_10103_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_86149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444772	445986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_444800_446000
822816	contig_12503_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_143811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCAGCTATGCTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34068	35179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_34100_35200
822817	contig_7662_pilon	+	1682	4	Intergenic	novelGene_176562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAAACGCGAACTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371051	375335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7662_pilon_+_371799_372108_372850_374776_374846_375210
822818	contig_3426_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_57908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCCAGGGACTAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144254	143954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_144000_144300
822819	SIRV4	-	205	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	3	-406	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCGGCGGCAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
822822	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	10	-1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
822823	contig_9828_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_172258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	158	382	239118	239342	NA	65	GTAAAAAAAAAACAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWPSSGPPSSFRAAVSEKRSPFSHTLHFQATCQEGHAISNSLQGGYHHLLHIMTEETKEELKTHMSMWPSRGHAAASGREEERKLSSTSSPGPIHTSCHSHKRPLPHFLHSQVVKRDTSFISTPVP	238960	240152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_239000_240200
822824	contig_8065_pilon	-	359	4	Intergenic	novelGene_107348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	303	347	599984	578872	FALSE	15	ATCTGCCACCTGCTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGSGLVFTHTGKYFSFYLQGSLIQGPVLALDPVPGASLEARVLGSCEDGAVFPQVLWGWILSTGEHLDGLLAALDLLNFGLGQGDPLANGLQLASAQFYMLGDPAKDVSRDLL	600694	578859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_578900_599967_600082_600306_600458_600640
822826	SIRV7	+	291	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAATGCGATAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
822827	contig_12031_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_137565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTAGATGAAAAAGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288933	287899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_287900_288900
822828	contig_7512_pilon	-	1133	8	Intergenic	novelGene_153192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	133.701006666642	518	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	7	447	140730	108329	TRUE	15	CTTCGAGAGTGCCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMLRKIKVLQKLGKADETKDEQFEQCVQNFNKQLTEGTRLQKDLRTYLASVKAMHEASKKLNECLQEVYEPDWPGRDEASKIAENNDLLWIDYHQKLVDQALLTMDTYLGQFPDIKRGRALGPAPRDSCSRYRPSMITRPLTRTSFS	140736	105712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_108278_108381_108696_108741_128472_128569_128951_129047_129306_129362_134475_134557_140712
822829	contig_4071_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_151868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAACAACAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43278	43867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_43300_43900
822830	contig_10986_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_71495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAGTAGTCAAGTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136185	135833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_135800_136200
822831	contig_3948_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_53242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	4	333	1045277	1044948	NA	75	AAGTGAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLHQRGSVTYPRSLSEVHDDTKTQTQGLCCDIWAHLTLSMPLSVLGTQWAKQGPGCLAPRKQTIPPWLEHSYLWTGSRHVISPLVVTVWGWGKEGMAEGFKRESSDD	1045280	1043036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1043000_1045300
822833	contig_18898_pilon	-	919	4	Intergenic	novelGene_77640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62790	59825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_-_59963_61113_61333_62140_62300_62386
822835	contig_5050_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_110286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTCAAAGGTGGAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563055	562250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_562200_563100
822836	contig_2646_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_69593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGGTTCTTAAGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451677	1453605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1451700_1453600
822837	contig_7909_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_155893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTGATCAGGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382527	384352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_382500_384400
822843	contig_14711_pilon	-	1730	11	Intergenic	novelGene_68869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	3.9255572852781	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	434	1636	6509	3476	FALSE	20	GCTGTTTTATGCAACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICDSLSLAFRGVSHCPPSGLYAHLCRFLALCLGHRDPCATAFLVTESVSITCRHQLLTHLHRQLSKAQKHQGSLEVAEQLQRLSLQERAGDVPLARIQRLFSFRALRSGHFPQPEKESFKERLALVPSGVTVCVLALATLQPGTMGNTLLLTRLEKDNSPVTVQIPTDQSKLPLSSALKEFDAIQKEQKENSSCTDKREWWTGRLELNHRMEVLITSLEKYVLGCWRGLLLPSSEDPRPGQEASRLQELLRECGWKYPDPTLLKILLSGAGAVTPQDIHALAYGLCPAQPEQARELLSEAVGRLQGLTVPSNRHLLLVLDKDLQKLPWESMPSLRTLPVTRLPSFRFLLTYSIIKESGASSVLSQGVDPRNTFYVLNPHNNLPSTQEQFRATFSSEAGWRGVVGEIPSPEQVQAALTDHDLYIYAGHGAGARFLDGQAVLRLSCRAVALLFGCSSAALAVHGNLEGAGIVLKYIMAGCPLFLGNLWDVTDRDIDRYTAALLQGWLGAGPGAPLLYYVNQARQAPRLKYLIGAAPVAYGLPVSLR	7599	3381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_3678_3956_4122_4244_4329_4497_4614_4802_4908_5026_5198_5312_5469_6170_6294_6428_6557_7092_7284_7404
822844	contig_6557_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_32932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGGAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238606	240194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_238600_240200
822846	contig_9434_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_150470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAGCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39800	41304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_39800_41300
822848	contig_5918_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_99483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTGTAAAGAAAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177967	177321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_177300_178000
822849	contig_5928_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_40356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGCCATATGACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160336	158644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_158600_160300
822850	contig_12622_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_5783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAAAGAATGTGCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154794	156601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_154800_156600
822851	contig_8020_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_114413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189201	190597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_189200_190600
822853	contig_12644_pilon	+	832	7	Intergenic	novelGene_44448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	357.174288299455	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	640	669	374746	374775	TRUE	10	CCCTGCTGCCCCCCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DASLGTSPPGQHEPPDQLSLGVKELVLDNCRSIEGKIEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSVANLPKLNKLKKLELSDNRISGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDLFNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYDEDAQVVEDEEDEEEEEEGEEEDVSGEEERRMKKVITTGK	336428	375233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_336492_367593_367744_367994_368118_370700_370900_372113_372212_374739_374806_375100
822854	contig_4519_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_123666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCAGCCCAGACCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68236	68859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68200_68900
822855	contig_16644_pilon	-	945	2	Intergenic	novelGene_176567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATCAAAAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230734	227383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16644_pilon_-_228252_230657
822857	contig_6503_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_145782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTTGAAATTAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484623	483591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_483600_484600
822858	contig_5039_pilon	+	1191	2	Intergenic	novelGene_64992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687256	1689690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687322_1688564
822859	contig_9053_pilon	+	893	1	Intergenic	novelGene_87935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATGGGAAAAATACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142951	143844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_143000_143800
822860	contig_9053_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_87936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGCATCCTGAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144042	144441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_144000_144400
822861	contig_16578_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_148654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTTCAGTGGTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195706	194797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_194800_195700
822862	contig_2854_pilon	+	961	6	Intergenic	novelGene_120806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	175.88109619854	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	440	688	78938	82444	TRUE	40	AAAGCCTTAAAATCCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDSCGKSAGIREDKWIREDKWWQIFLCAPACPLLTFSPLALQPRLASSVKMHQSLLVSSTLSRQNWWHNCNK	68942	84757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_80617_80778_82393_82502_84541
822863	contig_8317_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_19459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
822864	contig_5551_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_134234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385261	386816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_385300_386800
822865	contig_6109_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_160369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTAGTTGCCAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488740	488100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_488100_488700
822867	contig_7045_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_77495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCAAGTGCAATCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590309	589750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_589800_590300
822868	contig_7045_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_77494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAATAAAAGAGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589750	588481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_588500_589800
822869	contig_10307_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_170292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGAAAGAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615638	616917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_615600_616900
822870	contig_11338_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_6241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	459	842	16800	17183	NA	30	CAGAGGAGGGTAGAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGAHSVQTPHRRAEGPGEGRERRPSPVMSQTTVSLGYPPGKAECHTAKGSYWAPVDHGPHHAHWEGKCSHPGTEMVLMRGPWQEETDKEAYPQMGAQSHSPRWPLVALALAESPGSQSCGWKHRNP	16341	17299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_16300_17300
822872	contig_8383_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_172761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTCAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313037	314710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_+_313000_314700
822873	contig_5539_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_104770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACATATTTTGAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177088	175965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_176000_177100
822874	contig_15185_pilon	+	1358	3	Intergenic	novelGene_99396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	261	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGATAGTGGCCATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169128	171896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_169698_170338_170630_171398
822877	contig_14196_pilon	-	1964	1	Intergenic	novelGene_169966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCATTGACTTACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49362	47398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_47400_49400
822879	contig_14876_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_170243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGCAGCCAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71863	70679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_70700_71900
822880	contig_10523_pilon	-	446	3	Intergenic	novelGene_120939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	422	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	128	334	15943	12969	FALSE	15	ATTTGTCTGATTGTGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQWADKGQEGGTGGKRKNWSGEDEHWERQGRKESATKKDKRNRRKRTKAKKTY	18268	12856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13125_15892_16007_18204
822882	contig_11845_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_148151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGATTAGTCTAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88221	87614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_-_87600_88200
822883	contig_1450_pilon	-	1289	9	Intergenic	novelGene_27404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	49	528	355898	352449	TRUE	15	TCAGGGCTCCCAGATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVVPGQDLEGSHDLVCRICVSRLTRHKVDEGLECHYPQAVGIHDAHDAGNTWGSLPIS	355946	346527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_346548_347006_347182_348153_348207_348947_349076_350343_350524_351264_351413_352391_352477_354183_354327_355589
822884	contig_6902_pilon	+	1204	7	Intergenic	novelGene_135558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	25.6255081250434	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	389	1204	282413	295289	FALSE	40	ATCACAAAGGGGTACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRVAVIGAGVSGLSSIKCCLDEDLEPICFERSNDIGGLWKFTETSKDGMTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFNHENYGLS	278441	295289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_280099_280240_282377_282545_283762_283952_284527_284691_294102_294246_295100
822885	contig_7840_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_69056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443241	443776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_443200_443800
822887	contig_7775_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_37493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237975	237707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_237700_238000
822888	contig_10389_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_176569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGCAATTTTAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19894	21283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10389_pilon_+_19900_21300
822889	contig_5331_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_112791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATACCCGGAAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352046	350791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_350800_352000
822890	contig_5331_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_112790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTTAAAAAAAAAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350539	349868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_349900_350500
822891	contig_10196_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_132172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGCTCACAGGACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053254	1055972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1053300_1056000
822892	contig_9705_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_41712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACCGCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128414	128959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_128400_129000
822893	contig_9705_pilon	+	562	3	Intergenic	novelGene_41713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAGTAACACAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129307	133794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_129687_133472_133563_133701
822896	contig_7056_pilon	-	1270	6	Intergenic	novelGene_43739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_5	649.926334287202	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	36	1043	1211543	1094841	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRRSAAAGGTMTGAARAGPARFAALVLLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPIHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGARMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRHLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVVCFLFCYSICVMSYLKCNML	1211578	1094613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1095001_1099856_1099940_1109072_1109145_1146709_1146961_1176499_1176695_1211296
822897	contig_6557_pilon	-	1300	8	Intergenic	novelGene_33044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.38505138783324	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	457	873	863826	861591	FALSE	25	AACTTGATTGTTGTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLFRVPELPSTHSQGSGPSSGSPERGGDGLPSPRQLIELSQLLRLYQARGWGTLSAADLLLYLKRLEHSRADGQVDNVPRRNTDSRLGEIPRKEIPSQAVPRRLPTVPKTEKPPGRKKSGHPAPSSVRSRGGIWR	865223	861163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_861717_861961_862035_863494_863628_863741_863913_864056_864121_864416_864554_864664_864714_865103
822898	contig_10904_pilon	+	645	6	Intergenic	novelGene_22654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1093.76132679849	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	58	576	530908	535124	FALSE	25	AACTTTGGAATTGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGRRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530605	535193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530638_530882_531005_531238_531362_533736_533772_533837_533924_534946
822899	contig_10855_pilon	+	456	2	Intergenic	novelGene_124356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGTTTCCGTTTGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655586	659294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_655710_658961
822900	contig_7733_pilon	+	892	7	Intergenic	novelGene_147135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	48.7399562303182	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	137	637	88179	107199	FALSE	40	TATTATTAGCAACAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGRARAGGISGAPHSCLHLGRGLVKEFAGLQNWESVEGGERSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGPTPRNHHLSGTPHGRVHRHPLARGCPPEGSERLAEMGLRG	86821	107454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86948_88168_88285_91178_91225_92135_92193_93204_93373_106056_106176_107194
822901	contig_7004_pilon	+	1065	8	Intergenic	novelGene_126486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	32.1945615891623	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	46	900	405526	408168	FALSE	10	CACACCTCTGTGGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKFQEIPLGPLPAPSPKMMLGPLTLHLDGSLLAFLDFLCPQGPIRSILPMTFEAVKQDHGFMLYRTHLVNTFTEPTSFWVPNNGLHDRAYVMVNGVFQGVLERNIKHRLFLTGKMGDKLDVLVENMGRLSFGSNSSDFKGQVWINGFNLGRYWTKRGPQQTLYVPKPLLFPRGTFNKITLLELENVPPRPQIQFLDRPILNSTLYRTYLYSLSAGEQMELSGH	405480	408333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_405555_405663_405705_405918_406038_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407913
822903	contig_16722_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_118298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTACTATTTCTTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152397	153700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_152400_153700
822906	contig_1239_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_150409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTCAGTTGTTTCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639960	638590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_638600_640000
822907	contig_11285_pilon	-	1560	10	Intergenic	novelGene_5531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	381.871706205108	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	370	1182	744156	741595	FALSE	25	CTTTTGTCAAGTGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCLQPTGKCLLYCNGVLEPLYLCPNGVRCATWFQDPTRFTGTMDAFVKIVRHEGTKTLWSGLPATLVMTVPATAIYFTTYDQLKTFLCGRALTSDLYTPMVAGALARLGTVTVISPLELVRTKLQARHVSYRELGACVQAAVAQGGWRSLWLGWGPTALRDVPFSALYWFNYELVKSWLSGPRPKDQTSVGISFVAGGISGMVAAILTLPFDVVKTQRQVALGAVEAVRVRSPHADSTWLLLRRIRAESGTRGLFAGRPLLCHHDQHL	744792	741216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741633_741737_741819_741892_741975_742188_742299_742577_742752_742933_743059_743218_743287_743609_743744_744155_744220_744486
822909	contig_4087_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_156076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTTAAGTGCTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114331	115618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_114300_115600
822911	SIRV6	+	354	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	14	9	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
822912	contig_17198_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_62383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATGTAATCACCTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045139	1047005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1045100_1047000
822913	SIRV5	+	522	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-195	878	-81	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	204	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8120	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
822914	contig_10627_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_59964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTCCCACTGTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196550	198731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_196600_198700
822915	contig_2817_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_104362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1098	1424	922191	921865	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNGEPSPQGQVKSVPSLSGALNSGHRLSPLFTIPSSARASPSVTRNEVGNSPSHPQPPNRGSESATKPTHECSLCHPPKPRARHMCPRTCPWGTRASPCSMCAPST	923288	921341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_921300_923300
822917	contig_7840_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_69016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACCATCCTCTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305495	303311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_304308_304818
822918	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
822919	contig_9113_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_68604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387487	386271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_386300_387500
822920	contig_9185_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_166902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316472	318284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_316500_318300
822923	contig_4900_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_159055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACTTAACTTTGATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786393	787210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_786400_787200
822925	contig_13592_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_33748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATTCTTTGGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346478	348284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_346500_348300
822926	contig_20844_pilon	-	953	9	Intergenic	novelGene_78614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	380.698350896087	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	387	953	206899	205184	FALSE	15	TAAGGCCCCTGCCCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAK	209157	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_209085
822928	contig_11476_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_170504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTATGTGTTGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49026	47384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_47400_49000
822930	contig_5620_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_161345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	72	398	327535	327209	NA	25	TTTAAGCAGCTAAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASNQYLASLQVYLHRFSVSSWEFMMLPSCAPQLGSLLALSQDVHAVPGRLAGHLCLVSFLICCYLSSFFFQSVFDLILYPFRIPELSSISVSLCFSGLFCRGILWCLTRPPSWLLPSSFYYFYGVSFFFFA	327606	325940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_325900_327600
822932	contig_6506_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_153477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCTCAGAAGAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23058	23958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_+_23100_24000
822933	contig_11416_pilon	-	1110	3	Intergenic	novelGene_145344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCACTTGTAGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133180	131584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_132584_132661_132720_133127
822934	contig_9609_pilon	+	1290	2	Intergenic	novelGene_23036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_1	0	6	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTGAAAAATGATACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331030	333321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_331694_332694
822935	contig_6286_pilon	-	716	3	Intergenic	novelGene_165658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	4315	1580	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCGGTGGACTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360037	357439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_357977_358289_358411_359979
822936	contig_9199_pilon	-	979	2	Intergenic	novelGene_65626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	76	414	62832	60972	FALSE	15	CAGTCTTTTCTAGGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTDLVDEDLVLNHRKQAASALLFGMVALVTKPGQTFAPLLGTWLLCFYTGHDLFQQAPLAPVGSAQPWPEPPAPPPAQAPTLRQGCFYLLVLVPITCALLQLFTWSRFTLHGRYLHTVKAQRQNLSQAQTLDLKTV	62907	60406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_61235_62756
822937	contig_8017_pilon	-	766	5	Intergenic	novelGene_65377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_4	75.8699545274676	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	14	571	1511273	1496306	FALSE	15	CTCAGAGTGCCCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLNYILSISASSGLIALLSTGSK	1511286	1496110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1496373_1497435_1497568_1503095_1503195_1509748_1509876_1511140
822938	contig_9516_pilon	-	2083	6	Intergenic	novelGene_106148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	46.3793057300344	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	287	1084	627217	602497	FALSE	35	AGTTGCACTGAATAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVMVVRKKVTRKWEKLPGRNTFCCDGRVMMARQKGIFYLTLFLILGTCTLFFAFECRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAVPQGQRPPPRIKNFQINNQIVKLKYCYTCKIFRPPRASHCSICDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTYPLWEGCPFEALLNYSSPCFLPATLQPSSFSQIKECQSLK	629752	601497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_602670_603803_603942_609228_609388_617435_617597_627050_627353_629601
822939	contig_4832_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_163422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_4	13.4721935853075	5	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1015	1467	505263	509953	FALSE	25	TTATACTGAAACTCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQEIPKTPDHAPSRTFYLYTVNILSAARMLLHRCYKSIANLIERRQFETKESKRLLEKSQRVEAIIASMQATGAEEEQLQEIEEMITAPERQQLETLKRNVNKLDASEIQVDETIFLLESYIESTMKRP	504248	510053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_505332_506088_506191_506558_506609_507026_507177_509871
822942	contig_7753_pilon	-	1102	7	Intergenic	novelGene_41522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGACCCGCCCCTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345628	1310325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1310585_1311879_1311930_1313294_1313451_1318681_1318818_1328370_1328547_1342863_1343052_1345491
822944	contig_7342_pilon	-	404	4	Intergenic	novelGene_71199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5266	junction_3	3402.61197056353	54	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	36	353	666818	665411	FALSE	30	TCCAGAAACATGGGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTHIRAKRKREELSNVLAAMRKAAAKKD	667030	665359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665709_666725_666821_666997
822947	scaffold_14128_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_169529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458960	459675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_459000_459700
822948	contig_13014_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_169377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGCTCTGAAGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584419	582759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_582800_584400
822950	contig_13292_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_142965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGCAATTTTTCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401773	402165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_401800_402200
822951	scaffold_19766_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_34470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTTTTGAATATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935203	934284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_934300_935200
822953	contig_8866_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_77899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAAAGTTAGACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113133	1112891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1112900_1113100
822954	contig_5317_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_76609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	17	54	337	390	756191	756138	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVQVQHSQATRRVRHGPLYFTGLTGNGHTAQHPGILELGVSGTNPLTFLNESESTHRHLTTTPPRAYISDITAPKVEFNASSCITCFYYKTLRIRGRKLQRGRWAGGPDSQMDDRLGVPYLHEEIFSA	756527	754771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_754800_756500
822955	contig_4891_pilon	+	565	4	Intergenic	novelGene_124566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	630.994981490873	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	50	529	701017	756950	FALSE	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDVPRRSLSPPAPPHLLGETLATYTLDPMQRYKNRTHFGCYY	700967	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708969_756827
822958	contig_5075_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_174083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTTTTTAAATTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594810	593403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_593400_594800
822959	contig_5551_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_134221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160377	159410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_159400_160400
822960	contig_11518_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_109139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAACGATTATTATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457612	456660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_456700_457600
822964	contig_14563_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_135067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183324	181897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_181900_183300
822965	contig_16411_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_77336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCTGGGAGAAGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188743	187189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_187200_188700
822966	SIRV6	+	355	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	518	0	352	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822969	contig_5549_pilon	-	714	11	Intergenic	novelGene_81653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	691.454814141893	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACATCTGGAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442936_443118_443363_443637_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
822970	contig_14322_pilon	-	330	2	Intergenic	novelGene_115775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671835	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
822971	contig_6361_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_23907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACTGGGGTTGCATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170039	170483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_170000_170500
822972	contig_9995_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_47836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976760	977991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_976800_978000
822973	contig_5200_pilon	+	1375	9	Intergenic	novelGene_140156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_5	36.2560339805666	25	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	84	1001	187531	314634	FALSE	75	AAACAAAAAAATTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPGPSEVTGADASGPDPQLAVTMGFTGFGKKARTFDLEAMFEQTRRTAVERSRKTLEAREKEEEMNREKELRRQNEDTEPTSSGLNVVRDNSKSSSRDTSSRESEESSDSSDDELIGPPLPLEMTKEPDNLMEEGILGSLPRPRHEEVEDDDDDDDSEEEENPVQKIPDSHEITLKHGTKTVSALGLDPSGARLVTGGYDYDVKFWDFAGMDASFKAFRSLQPCECHQIKSLQYSNTGDMILVVSGSSQAKVIDRDGFEVMECIKGDQYIVDMANTKGHTAMLHTGSWHPKIKGEFVTCSNDA	187447	315008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_187556_187662_187729_189054_189139_194501_194623_202480_202674_248426_248487_262831_262966_294935_295090_314553
822978	contig_13780_pilon	+	653	4	Intergenic	novelGene_149011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	230.745651216996	258	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	65	316	292779	294587	TRUE	5	CCTCTGCCTGTACCGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTFRVVGCGSSVRRSRSSCAEMLQGLIKNVWIPMKPYYTQAYQEIWLGTGLMSFIVYKIRSAEEEENFICEENFEDMAAVSPARAVACSHSIFGSSLAVLGCET	288618	295597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294459_294758_295430
822979	contig_9646_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_117418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGATTGAGAGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37525	36148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_36100_37500
822980	contig_5569_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_86760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTGTGCTTTAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506499	505444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_505400_506500
822981	SIRV7	-	949	5	FSM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3574	49	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147608
822982	contig_18869_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_56359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTACAACTAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73592	73363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
822984	SIRV4	-	220	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	3	-391	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGGTTTTTCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
822985	contig_12464_pilon	-	1244	8	Intergenic	novelGene_68640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTCCATTAACTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114082	89237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_89276_89880_89967_94189_94372_103449_103607_105124_105273_112060_112189_113100_113188_113664
822986	contig_14322_pilon	-	393	2	Intergenic	novelGene_116192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
822987	contig_14509_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_168566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	8.9938250421547	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGTTCCAAGGAGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454193	443004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_-_443438_445523_445678_452923_453017_454116
822990	SIRV2	-	461	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4388	58	3213	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATCTAAGGAGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	1058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
822991	contig_8330_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_71900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAATGCTGTTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116898	1117382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1116900_1117400
822992	contig_11413_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_103218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	65	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAACTTCTGTTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822939	822358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_822503_822709
822993	contig_15613_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_147223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATTATCAATTTTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251185	252720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_251200_252700
822994	SIRV6	+	320	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	50	337	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAGGCACCAGCGGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
822995	contig_3754_pilon	+	1219	2	Intergenic	novelGene_146845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408113	525512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_408143_524322
822996	SIRV4	-	222	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1284	15	1284	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3874	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_3900
822997	contig_15304_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_30582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGAGGGCAAGGCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54288	53991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_54000_54300
822998	contig_1008_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_121622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCCCAGGAGAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121590	1120799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1120800_1121600
822999	contig_8598_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_22876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	303	641	23534	23872	NA	45	TCATTGCAAAATATTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGYRIKAKINHISINQQQTCGNQNLKTQYNYNHTKENEILTCKSNKTKQSLLRNCRTVFQSLGMCLFNCTGIFIRIVTVLIMLYAQVSTGQLQTYFFLPLRLMRTIYTTL	23231	25332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_23200_25300
823000	contig_9363_pilon	+	819	5	Intergenic	novelGene_6838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	371.825563940943	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCACCCACGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624409	1625924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1624445_1624573_1624637_1624822_1625066_1625343_1625435_1625537
823002	contig_6494_pilon	-	780	7	Intergenic	novelGene_108578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1141.59172503425	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	449	772	3457	2123	FALSE	35	TTTTAAAAGACACATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQALWNPKMRYYPPPPSRSRRVGSQSRLPCPSQSPLHNRVSLATGSGVWMLLCKDL	8294	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2741_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8194
823003	contig_2768_pilon	-	2063	18	Intergenic	novelGene_57471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	262.405283620533	1	70	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	566	1501	558220	543591	TRUE	20	ACTACCCCTTGTATTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHFLPLLKDRFIQLLPDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDVPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGVQQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEQNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARAGSSIIFVK	585759	540059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_540133_540215_540283_541777_541907_543104_543266_543458_543621_544016_544107_546707_546825_546967_547045_547804_547905_548490_548626_550212_550298_550410_550506_552439_552530_558103_558261_561917_562077_562480_562600_567694_567777_585594
823004	contig_12884_pilon	+	850	7	Intergenic	novelGene_104984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	37	junction_1	80.2075432861523	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	53	850	874572	876917	FALSE	20	ATGAAGTCCGTCCGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSSFEGVARSVVRELDHSGKLIPVDSLRSSASFQPYCLVGRKPSRSWFWRPRYIPVNLSIWDILEPNAPEPAMQRSGPFHFHDTVDRQMKGSMELKVQGQWEISGRAAISSSSSTSMDVFMLRVDPSTWEALHQERRLRQPVHKVLQQLRNRGDNVYMVTEVLQTQKEVEVTCTHKQEGLGQFSLLGAACLQGDSQGHLSRKNTITIPSGSILAFQVAQLVISSDWDILLFPDKKQRTFPKSPAANKPTSPVAGHSPPPGLTLL	873503	876917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_873553_874568_874792_874961_875155_875873_876043_876247_876351_876597_876652_876858
823006	contig_16742_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_176571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTCATGGCAACCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19053	16829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16742_pilon_-_16800_19100
823007	contig_8677_pilon	+	2170	3	Intergenic	novelGene_174030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.5	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	553	1809	119439	149029	FALSE	20	GCTATAGAGTGTGAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSDTPSSTASKITISVILTVLILITIAGNVVVCLAVGLNRRLRSLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSYSWSFGQIFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVTISLVFIWVISITLSFLSIHLGWNSRNKTVGSNHTISKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKIARNQAKRINHISSWNAATIKEHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTVFVYRGLRGDEAINEVTEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTAYQQLFCCRSTGHNSHGTSLRFTNSQMSRSQSRKHKGQEENPLKLQVWSRTEFTAPQGATDRKPVMPRTLVSSNLLSCCKSLWGLQFLQRYLGAPSEEQLGELPAEEPLIRTLLPEPLRTPPSGAL	78507	149390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_+_78581_118959_120500_148833
823008	contig_14711_pilon	+	1640	10	Intergenic	novelGene_68929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	22.8040498893952	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	235	957	119007	122444	FALSE	30	TTGAACCCACCCAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEFRSLEV	100562	123127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_100757_118709_118739_118995_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_122423
823009	contig_348_pilon	-	1070	6	Intergenic	novelGene_67593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	128.844712735913	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	350	829	300580	296436	FALSE	0	CTTTTTGTGGTTCCGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPVLESLRNTDRRWLIDTLYAFNSGNVEKFQTLKTAWGQQPDLAANEAQLLRKIQLLCLMEMTFTRPANHRQLTFEEIAKSAKITVNEVELLVMKALSVGLVRGSIDEVDRRVHMTWVQPRVLDLQQIKGMKDRLELWCTDVRSMEMLVGHQAYDILT	301005	296194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_296532_297064_297182_297350_297432_298791_298855_300457_300584_300659
823010	contig_12756_pilon	-	2730	1	Intergenic	novelGene_153230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGACCTGGCGATCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261134	258404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_258400_261100
823011	contig_1867_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_54520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATTCACACTCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201451	202757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_201500_202800
823012	contig_8268_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_147007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	728	1093	282110	281745	NA	30	GAAATATCTGTCAACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKISHANSNQKRAGVTVLIPNKTDFKSKSVIRDKKGHCIMIKKVNSSRRYTKRVAPTWCYRRKHHDIPPQQRPKKLSKTETNVNPGTLSIKQRDKEFNQALTGIRNREQRATTYELSSLS	282837	281149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_281100_282800
823015	contig_14621_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_105871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	114	452	405282	405620	NA	20	TAGGGTGGCACTGTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGERIRAVKVLDTTVGGLFSGSRNRCCHKKTHQEYFRMCPSQQGLPCTLGMEMSMTVKKRKDLPQAQTSWQQVATVTWPFASSDPRGPHFKDTASVLAHSVVNPFASRHICHLEAREDNISGDIWLISKRVPRYMDDWCDTPEAGLQIS	405168	405634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_405200_405600
823017	contig_4151_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_65241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGATCCCTGCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535187	537079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_535200_537100
823018	contig_2750_pilon	-	691	5	Intergenic	novelGene_164478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	43.0290599479003	535	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGCCTTATAGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158274	146194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_146679_147262_147336_148578_148630_151848_151879_158221
823019	contig_10196_pilon	+	751	7	Intergenic	novelGene_132090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5943.01973373432	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	111	440	906823	908055	TRUE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKSLEEIYLFSLPIKESEIIDFFLGMALKDEVLKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRALCWCASSPHPEALA	906516	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_906588_906783_906874_907382_907491_907737_907860_908006_908152_908260_908353_908475
823020	contig_13958_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_129542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGAACACTGTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204506	202784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_202800_204500
823027	contig_11825_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_155410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGAGAGGAGTTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78697	79254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_78700_79300
823028	contig_13744_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_77149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAGGATCCTCTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141435	142045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_141400_142000
823029	contig_7720_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_155788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAGAAAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822966	822695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_822700_823000
823030	contig_7593_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_127261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTGAATTTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_2500
823032	SIRV6	+	426	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	57	2	-57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACGCAATAGAGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
823034	contig_12603_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_105787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGTGTTGAACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553707	552797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_552800_553700
823036	contig_5084_pilon	+	1995	1	Intergenic	novelGene_64564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTGATGGGCCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541880	543875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_541900_543900
823037	contig_253_pilon	-	1844	5	Intergenic	novelGene_129782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	38.7459675321187	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	24	326	1103445	1093378	TRUE	45	AACAAACATTTTTATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQSILLGMSAKLMWTLEETSCFPDTSGVSPFQMIFEVDEKHRTLMTDCLAIKNFLRKIIMVHPKMRFHFSIKVNGTLSKEIFGVEDEPILNLPNGIALVVNYQHYIR	1103468	1090200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_1091242_1092900_1093454_1093822_1093879_1097363_1097448_1103358
823038	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823040	contig_8801_pilon	-	1079	4	Intergenic	novelGene_66245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.0971379741328	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	184	756	199038	181046	FALSE	5	CTCCTCAGCTTCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEPMQVLFSGEATHRKYYSTTHGALLSGQREAARLIEMYRDLFQQGT	218789	180722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_194487_194715_198830_199065_218632
823042	contig_987_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_72350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	651	959	1289789	1290097	NA	90	TAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTGRTLLSPGWDSFPPASPLCLIQGREKRASSRAPQGS	1289138	1290922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1289100_1290900
823043	contig_6325_pilon	+	1384	12	Intergenic	novelGene_143371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.70168601300042	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	66	1166	448742	458059	FALSE	15	TGGAGAATCGCCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTRRKGFYKQDVNRTAWELPKTYVSPTHIGTGAYGAVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPFQSELLARRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNLHDFYLVMPFMQTDLQKIMGMEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHTDAEMTGYVVTRWYRAPEVILSWMRYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTGVPDAEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQSPKKDFSQLFPRASPQATDLLEKILELDVDKRLTASQALAHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFRPIVRKDSRRRSGMKLQ	448676	458277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_448861_449557_449688_450934_450994_454602_454712_455165_455196_455585_455634_455751_455867_455997_456070_457003_457084_457337_457417_457542_457720_457976
823044	contig_15867_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_170896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131918	132231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_131900_132200
823045	contig_14047_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_176590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAACACTCTTCATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73843	75524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_73800_75500
823046	contig_5461_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_156844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866454	864669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_864700_866500
823047	contig_2480_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_63572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGCTGTGTCCTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519453	520251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_519500_520300
823048	contig_9363_pilon	+	1482	5	Intergenic	novelGene_6521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCACACCGCGCCGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553621	571089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_554477_555235_555288_558639_558723_560024_560054_570626
823049	contig_11082_pilon	-	2130	3	Intergenic	novelGene_142054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	278	1531	81354	80101	FALSE	65	AAAGATAAACCTAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATHSPEKTHKCNYCEKMFHRKDHLKNHLHTHDPNKETFKCEECGKNYNTKLGFKRHLALHAATSGDLTCKVCLQTFESTGVLLEHLKSHAGKSSGGVKEKKHQCEHCDRRFYTRKDVRRHMVVHTGRKDFLCQYCAQRFGRKDHLTRHMKKSHNQELLKVKTEPVDFLDPFTCNVSVPIKDELLPVMSLPSSELLSKPFTNTLQLNLYNTPFQSMQNSGSAHQMITTLPLGMTCPIDMDAVHPSHHLSFKYPFSSTSYAISIPEKEQPLKGEIESYLMELQGGVPSSSQDSQASSSKLGLDPQIGPLDDGAGELSLSKSSISIGDPLNTPALDFSQLFNFIPLNGPPYNPISVGSLGMSYSQEEAHSSVSQLPPQTQDLQDPASTIGLGSLHSLSAAFTSSLSTSTTLPRFHQAFQ	136608	79501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11082_pilon_-_81359_84820_84920_136434
823051	contig_8853_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_159163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTCCTGGAATTACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99917	101994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_+_99900_102000
823052	contig_3233_pilon	+	1010	3	Intergenic	novelGene_56617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	91	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTGTAGACAAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023468	1026773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_1023999_1024773_1024893_1026412
823053	contig_3942_pilon	-	279	3	Intergenic	novelGene_128663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGTCATAGCGCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180076	179107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_179173_179712_179825_179974
823055	contig_5018_pilon	-	1772	6	Intergenic	novelGene_46986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	9.72830920561225	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	71	1147	642430	637994	FALSE	50	AATAAAATATGATTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEAIRYSRGSLQILDQLLLPQQSRYEAVSSVRQAWEAIRAMKVRGAPAIALVGCLSLAVELQAGAGGPGLTALVAFVRDALSFLVTARPTAVNMARAARDLAEIAAQEAEREGATDEAVRERVICYAEDMLEKDLKDNRSIGDLGAHHLLERAAPGGGKVTVLTHCNTGALATAGYGTALGVIRSLHRLGRLECAFCTETRPYNQGARLTAFELVYEQIPATLITDSMAATAMAHRGVSAVVVGADRVVANGDTANKVGTYQLAITAKYHGIPFYVAAPSSSCDLRLETGQDIVIEERPGQELTDVNGVRIAAPGIGVWNPAFDVTPHDLITGGIITELGVFAPKELRAALGTTIS	642500	637368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_638122_638653_638879_638956_639134_640993_641170_641978_642218_642298
823056	contig_408_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_84931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATAGAATAAATTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209466	209033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_209000_209500
823059	SIRV6	-	405	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	32	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCATAACTGTTTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1738_1834
823061	contig_9389_pilon	+	1529	3	Intergenic	novelGene_84076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTCTTGACATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050593	1052502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1051214_1051358_1052122_1052356
823062	contig_7157_pilon	+	1444	3	Intergenic	novelGene_131277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50.5	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	20	373	806224	814642	FALSE	60	ATTCCTCAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDGGEKMAEAEFKDHSTTMDSEANPGTSSVSTTTSSTTTTTITTSSSRMQQPQISVYSGSDRHALSQVIQQALHRPPSSAAQYLQQMYAAQQQHLMLHTAALQQQHLSSSQLQSLAAVQVRLI	806204	815713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_806238_809724_809885_814462
823064	contig_9653_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_48209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224368	224980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_224400_225000
823065	contig_15867_pilon	+	2151	2	Intergenic	novelGene_170890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTCTTTCGTTTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76883	83602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_76978_81545
823066	scaffold_16539_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_68337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4	278	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	354	947	438928	439521	FALSE	15	GTGGTGGTGCTGCCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGLKRKHSDLEEEEEEKWGWGPAGLRSYQQALLRISLDKVQHSLGPHAHCLRRHVLIHNTLQQLQAALRLAPAPALPPEPLFLGEEDFSLSATIGSILRELETSMDEAEHPPNPVTPPGPQDEALPQPDPVFLESLSSQYLGDSGLDDFFLDIDTSAIEKEPVLAPPEPSHSLFCAPGSWEWNELDHIMEIILGS	436990	440165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_437065_438434_438708_438921
823067	contig_5566_pilon	+	375	2	Intergenic	novelGene_153663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	536	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCACAAAAGCAATTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180482	181597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_180832_181571
823068	contig_4857_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_48771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGAAAAACTTTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211093	1209976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210000_1211100
823072	contig_3184_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_169787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCATAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20063	18068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_-_18100_20100
823074	contig_4156_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_88128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTATAATACAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564596	563840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_563800_564600
823075	contig_3382_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_124008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGGAGCTATTTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118138	115915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_116386_117740_117868_118059
823076	contig_11044_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_176594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65231	66355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11044_pilon_+_65200_66400
823077	contig_3081_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_133945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGCAGCATCAGCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275014	277158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_275000_277200
823080	contig_15859_pilon	+	1912	9	Intergenic	novelGene_50206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	69.1410469619892	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	59	1273	357922	375993	FALSE	35	CTGTGTGCACTTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKSKENCISGPVKTILPLGDGPKRVLVTQPFPSQNPLSASGGQAQRVLCPSNSSQSGPSQAQKLVSSRKPVQSQKQKPLQITTVPRPVSRPPNNTPKSEQAQPPASGDNSGEELASKQKKEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQVRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELADALSYCHSKKVIHRDIKPENLLLGSTGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEASTYQETYNRISRVEFVFPDSVTAGARDLISRLLKHNPSQRLTLKEVLEHPWITANSAKPPSSQNKDPASKQP	352983	376632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_353037_357916_357964_361884_362165_364777_364833_365927_366120_367454_367594_372607_372757_375496_375672_375810
823081	contig_2703_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_101677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181978	182604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_182000_182600
823082	SIRV6	+	555	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	846	-405	846	45	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAAGTTTGCGTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11083	11735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
823083	contig_13421_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_166817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTGGCAAAGGGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301172	303074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_301200_303100
823084	SIRV4	-	355	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	15	1151	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4000
823085	contig_6505_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_175689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATCTCCCAGCAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36937	38385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_36900_38400
823086	contig_15744_pilon	+	583	6	Intergenic	novelGene_83588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1648.60285090133	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	58	420	149562	153378	TRUE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149504	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152611_153282_153421_153471
823087	contig_8954_pilon	+	663	7	Intergenic	novelGene_130308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	156.748648762562	4469	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	40	447	618527	632173	TRUE	30	TCGGCGATTATTTGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLLRGGAEIGLKMNSRGLGSQLKDSIPVTELSASGPFESHDLLRKGFSCVKNELLPSHPLELSEKNFQLNQDKMNFSTLRNIQGLFAPLKLQMEFKAVQQVPFYRFAYKDVFPTPPNLPHPRRFTLIGSASSVSSELKPFTGYFEGY	618487	638730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_618530_621521_621620_623284_623346_627018_627121_630859_630942_632111_632206_638546
823088	contig_6513_pilon	-	716	4	Intergenic	novelGene_117779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAAACAGAAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205689	203018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_203567_203802_203876_204020_204055_205628
823089	contig_1154_pilon	+	1473	10	Intergenic	novelGene_87168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.2976129531137	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	475	1068	919915	924251	FALSE	20	AGGTCACTGCCACTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHHCPWLNNCVGHYNHRYFFSFCFFMTLGCIYCSYGSWDLFREAYAAIEKMKQLDKNKQQAVVNQTYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGRHWLTRVLLPSSHLPHGNGMSWDPPPWVAAHSASVMAV	914573	924656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_914751_919076_919272_919418_919508_919901_919931_920589_920724_920860_920909_921741_921828_922770_922895_923093_923165_924136
823091	contig_2310_pilon	+	530	5	Intergenic	novelGene_71622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.5920668421968	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	103	441	195390	208840	FALSE	10	AGCCCTTTCCCGTCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD	195287	208929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_195410_199428_199499_204122_204209_208234_208307_208749
823093	SIRV6	+	223	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	74	486	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
823096	contig_6740_pilon	-	1499	2	Intergenic	novelGene_142673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTATGAATGAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596487	588561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_588862_595288
823097	contig_10011_pilon	-	1976	9	Intergenic	novelGene_68046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	286.924097105837	8	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	131	859	194838	186602	TRUE	20	GGTCACATCCTATCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTNNTAINFYENRDFKQHHYLPYYYSIRGVLKDGFTYVLYINGGHPPWTILDYIQHLGSALASLSPCSIPQRLYRQAHSLLCSFLPWSSISAKGGIEYSRTM	212630	184611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_185104_185328_185437_185609_185927_186401_186759_188132_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_212506
823098	contig_5084_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_64492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGATAAAACATGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110764	112281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_110800_112300
823099	SIRV6	+	344	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	14	19	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823104	contig_9389_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_83994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTCTTTGTGTCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385794	387004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_385800_387000
823105	scaffold_19766_pilon	+	866	6	Intergenic	novelGene_34254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCCAGGGACCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167500	169593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_167765_167879_168001_168229_168409_168842_169013_169128_169231_169563
823107	contig_4678_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_126023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTTGTTGAATAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328264	328656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_328300_328700
823109	contig_12427_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_40579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTTCTTTTATTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549516	548445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_548400_549500
823110	SIRV6	+	513	7	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	343	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	266	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823113	contig_2867_pilon	-	1495	2	Intergenic	novelGene_135163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATGAACTCTTCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549512	545646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_547097_549467
823114	contig_13876_pilon	+	715	5	Intergenic	novelGene_174248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	131.86735759846	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGTCGTTTATTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44395	69653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_44474_47151_47286_61740_61813_65260_65324_69285
823115	contig_14704_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_82683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAGGAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29917	29533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_29500_29900
823116	contig_11338_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_6249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTATGCATCCTCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83610	84085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_83600_84100
823118	contig_15320_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_176595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTCTCACTTGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153305	152710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15320_pilon_-_152700_153300
823122	contig_6137_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_59322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCCCATCACACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690171	1690446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1690200_1690400
823123	contig_15628_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_147701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137933	135799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_135800_137900
823124	contig_5549_pilon	-	2334	2	Intergenic	novelGene_81634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTTTGTACCGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445628	441736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442644_444201
823125	contig_17008_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_124238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATAGCATTAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240188	239267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17008_pilon_-_239300_240200
823127	contig_5696_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_117525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	259	333	442292	442366	NA	65	GTGTTTAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDPSFDDFSENTNISTTLTASSLGVNNSSYRRKNVPSTLENRFPARKKGKLSSLEQICGLENSKDYLPENEPWVDKYKPETQVLNSMQTCLGDLISRSVREDGKERDIYF	442033	443549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_442000_443500
823128	contig_253_pilon	+	1653	3	Intergenic	novelGene_129735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	1	78	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	17	694	606183	614495	FALSE	20	CCAGAACTTATTCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPSPMDLRAGDSWGLLACLCTVLWHLPAVPALNRTGDPGPGPSIQKTYDLTRYLEHQLRSLAGTYLNYLGPPFNEPDFNPPRLGAETLPRATVDPDVWRSLNDKLRLTQNYEAYSHLLCYLRGLNRQAATAELRRSLAHFCTSLQGLLGSIAGVMAALGYPLPQPLPGTEPTWAPGPAHSNFLQKMDDFWLLKELQTWLWRSAKDFNRLKKKMQPSAAAVTLRLEAHGF	606166	615454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_606199_612093_612261_614000
823130	contig_2988_pilon	+	603	2	Intergenic	novelGene_136533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCTAGGTCTTTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22650	44089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_22756_43591
823131	contig_10490_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_169886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCAGTGTTATCTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31746	32246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_31700_32200
823133	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823134	contig_12967_pilon	-	1093	2	Intergenic	novelGene_169795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTCACGTTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91870	89690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_-_90610_91696
823137	contig_15114_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_121219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCCCCTTCCAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108849	1107752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1107800_1108800
823138	contig_14744_pilon	+	932	2	Intergenic	novelGene_66115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	21	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	12	362	1580152	1580955	FALSE	35	TCATTGTTCTGAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHTMYQVGLMETDQHIEFFWGALEMFAQEELCKFIKFACNQERIPFTCPCKDGGPDTAHVPPYPMKIAPPDGTAGSPDSRYIRVETCMFMIKLPQYSSLEIMLEKLRCAIHYREDPLSG	1580140	1581525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1580366_1580818
823139	contig_7378_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_120281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCACTAGCACAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576093	576474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_576100_576500
823143	SIRV6	+	376	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3023	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823144	contig_5690_pilon	+	949	4	Intergenic	novelGene_119683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	36.7544403968948	499	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	22	387	327887	359144	FALSE	20	ACTCCTCTGTGACAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EECQLFNMEAEVDKLELMFQKADSDLDCILYRLEYEIKNNHPDSAGVKNPVTLLKELSAIKSRYQTLHTRFKPIAVEQKETKGHICVILNKTMTMIQELQKLTDMELSPLTEEEKTAEKQLKSHMPDL	327865	359706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_327920_347629_347717_352195_352373_359075
823145	contig_9527_pilon	+	1627	3	Intergenic	novelGene_134083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_2	24.5	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	306	845	495981	499603	FALSE	35	TAAGAACAATTGTGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWKVPPLPKKKKTAASSSGSEQSLDKKATVPWLTPAPSQEGHSVAAKVDLLGEFQSALPKIKTHLVCSQKKHPQKNPPQKNASQNSTPAHSENNCPGVSQEMPRKMVAVDCEMVGTGPKGHVSSLARCSIVSYDGDVLYDEYILPPCHIVDYRTRWSGIRKQHMVNATPFKIARSQILKILTGKIVVGHAIHNDFKALQYFHPKSLTRDTSHIPLLNRKADCPENTTMSLKRLTQKLLNRDIQVGKSGHSSVEDAQATMELYKLVEVEWEQHLAQNPPED	495675	500385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_496206_498389_498591_499489
823146	contig_9267_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_162013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	1355	1876	339977	339456	NA	20	AAATCTGGATTTCTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTKLNRTSWVPVTPAGVKAAQLSPGASCGVCFPPHPRDTRAEGPERHCAAALGGLGGVASRALFTLNCVASTCYIMEPRGPSPPSGEEGCSEGGGPCQASQGDTRVQFRLNFSKTVALVCSNSHCWVGEEGLQVFMKILWSLSLQSMQLPLMGWYRVLSYKRGRLSGRQRWG	341331	339171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_339200_341300
823149	contig_5758_pilon	+	1884	1	Intergenic	novelGene_119068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATCTCAAAAAAGACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86340	88224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_86300_88200
823150	contig_14546_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_157442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTAGAACTGCCCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515111	513823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_513800_515100
823151	contig_8864_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_135986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153952	155003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_154000_155000
823152	contig_8138_pilon	+	710	2	Intergenic	novelGene_52486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTTCTTTCCGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306381	307520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_306923_307351
823153	contig_3243_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_147537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAGAGTTAAGGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34260	35439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_34300_35400
823155	contig_13888_pilon	+	675	6	Intergenic	novelGene_151795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	837	junction_2	283.780901401063	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	39	674	337751	361961	FALSE	70	AATACAATCCAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVVWANSYKVGCAVQFCPKVSGFETLSAGAHFICNYGPAGNYPTWPYKKGATCSACHKNDMCLDKLCANQERDKVKRYYSLQYPEWPIYLRNRYTSLFLIVSPLIHILTVIITILIKHKYPNLVLLE	337712	361962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_355083_355197_358600_358687_361679_361707_361809
823158	SIRV4	-	205	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1313	3	1313	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3845	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
823159	contig_7963_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_58498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAATAATCAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141477	142377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_141500_142400
823161	contig_13700_pilon	+	1359	2	Intergenic	novelGene_68290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGCTGTTTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145356	152830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_145615_151729
823163	contig_14357_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_121695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTACCTTTTGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635936	633676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_633700_635900
823164	contig_10627_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_60035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTCTTTTGTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630401	629294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_629300_630400
823166	contig_13901_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_146678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAGAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307944	308310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_307900_308300
823167	contig_11964_pilon	-	689	6	Intergenic	novelGene_164722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_5	18.0155488398217	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	82	360	253966	245996	TRUE	20	AATGGTGTCGTTGGTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKEKLNNLNSRLTERKEPRTNDNDEFMMLWSKVEKSSEEIMEIMQNLSSIQALKGRKELENLIGISCASSFLQREMQKTKELMRKVTKQRLFEKRSTGLPNKELRHLDSYEFLKASLN	275195	238502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_238831_245994_246046_252920_252981_253366_253461_253891_253971_275118
823168	contig_14030_pilon	-	1010	5	Intergenic	novelGene_62237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	772	junction_4	441.417248756774	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGGAACTCTGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394735	337372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344383_350784_350849_394346
823169	contig_57_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_44899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101337	101723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_101300_101700
823173	contig_5167_pilon	-	1185	7	Intergenic	novelGene_164098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	24.9599679486974	7	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	169	441	395989	340112	TRUE	35	AAAAGCTTATATGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTARSLPAVQSDERLQPLLNHLSHSYTGQDYSTQGNVGKISLDQIDSLSTKSFPPCMRQLHKALRENHHLRHGGRMQYGLFLKGIGLTLEQALQFWKQEFIKGKMDPDKLWKGRQEDRLYTLQLPEDYSNQSPKPRGLSWVPIPSQ	425231	292228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_292843_305083_305153_340050_340134_345711_345804_395830_396017_398807_398881_425163
823175	contig_4392_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_117324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCCCATGGAGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444503	443858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_443900_444500
823176	contig_4426_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_15443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843369	841081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_841100_843400
823177	contig_9186_pilon	-	1006	10	Intergenic	novelGene_85346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	76.43216955713	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	188	1006	302315	274277	FALSE	15	GCGTCATCATCGCGCGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRHEIASPAWLRRPWHSGNTPGSQGHRGA	308874	274276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274359_283226_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_308758
823179	SIRV6	+	208	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	522	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
823180	contig_10674_pilon	+	1610	6	Intergenic	novelGene_6440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	279.948852471304	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	2	814	198581	211827	TRUE	10	GTGGAGTCTGTTCCTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLLIMMMRNRILMMKNGHRYLMRRNKILTMKDHRPPMKNAGIQMMKRNRTINQNLQEAVIVKMKFYE	198579	224655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209159_209204_209364_211782_211888_223316_223412_224014
823181	contig_2414_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_158514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512778	514963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_512800_515000
823182	contig_14362_pilon	+	840	7	Intergenic	novelGene_142508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	123	junction_3	76.6369507628156	9	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	408	611	10276	18437	FALSE	15	TGTGTCTTGTTTTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYEDSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL	5468	18666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_5509_6338_6409_8660_8826_8930_9042_10254_10346_17259_17316_18359
823183	contig_987_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_72264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433062	430760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_430800_433100
823185	contig_5549_pilon	-	2290	2	Intergenic	novelGene_81704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	143	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTCTGATACCTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856510	852616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_852818_854421
823187	contig_11832_pilon	+	1208	3	Intergenic	novelGene_106977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	2.5	90	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	291	836	482142	485701	FALSE	40	CTGGATAACAATCATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRAEPPDGGWGWMVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEERAARVSWIASIGIAVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMAGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLSGYLRDVTGNYTASFVVAGAFLLAGSGVLITLPGFFSCFSPSTSRPQDLVTEALDTKVPLPREGLAED	481851	486073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_482341_482470_482615_485498
823189	contig_8386_pilon	+	1227	2	Intergenic	novelGene_82221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAGACAATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31008	35386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_31423_34573
823191	contig_5479_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_133618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416271	414899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_414900_416300
823192	contig_7457_pilon	-	428	3	Intergenic	novelGene_31725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_1	380.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTTGTAGAGGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176986	1175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1175642_1175967_1176132_1176811
823194	contig_7471_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_161280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAGGAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14135	13220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_13200_14100
823196	contig_16897_pilon	-	829	4	Intergenic	novelGene_174461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	6.37704215656966	780	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	156589	156251	TRUE	25	ATTTCCCAGCATGCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCMPTVARRNSAMVGGGGGMAGGPLENANPLIYERSGERPVTAGEEDEQVPDSIDAREIFDIRRCWTGAGSWGPGREGDMVSSGRSSSTRAGYTWRRALKWAETQSSFSFTCHI	156597	154565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_154802_155273_155320_155804_155931_156176
823197	contig_3135_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_176602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAAAAACAATCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133836	135297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3135_pilon_+_133800_135300
823198	contig_16666_pilon	-	1219	10	Intergenic	novelGene_61817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	66.654072884549	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	148	1131	314876	295843	FALSE	35	TAATTGCACTAATAGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDEVEKYNRNGVNALQLDPALNRLFTAGRDSIIRIWSVNQHKQDPYIASMEHHTDWVNDIVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALAYAKDKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNTVTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPRTCAKLMKLKGHTDNVKALLLNRDGTQCLSGSSDGTIRLWSLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYCTDLRNPDIRVLICEEKAPVLKMELDRSADPPPAIWVATTKSTVNKWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPLTPLCTQPDQVIKGGASIIQCHILNDKRHILTKDTNNNVAYWDVLKVGILLD	317399	295754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_295962_296833_296937_298351_298427_300178_300404_311349_311452_311843_311933_313887_314018_314136_314220_314818_314898_317273
823199	contig_19362_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_157799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTGTGACTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70947	70578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_70600_70900
823202	contig_11908_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_133241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGAATTGTGTCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750446	748689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_748700_750400
823203	contig_13697_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_165925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGCTTTAACTTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232926	232124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_232100_232900
823204	contig_13481_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_119504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATTGATGAATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406971	1405821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1405800_1407000
823205	contig_13048_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_138906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCCTTAAATTCGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235898	236334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_235900_236300
823209	contig_6446_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_149251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATAGATAGATAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617116	615822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_615800_617100
823210	contig_6446_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_149250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGATAAGCACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615779	615540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_615500_615800
823211	contig_9668_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_58201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCTCTTTTGAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514429	514064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_514100_514400
823212	contig_1143_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_86613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTATGTTTTGTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627359	627891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_627400_627900
823213	contig_6496_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_103510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747701	749706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_747700_749700
823214	contig_9549_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_176603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	92	388	22426	22130	NA	10	TGCTGTCAGACTCCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQFREAFLEYRATIDYVLLQHNHGCQEFKAMCCFNLIDNSELTEQKVNYVKDELQKVKIHEGFDFPWLTSRLPDLTWLKALFISRIGLVATGLLICCCLQFMPICGMAFSVPNQTVKPIAGKRPNPFT	22517	21682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9549_pilon_-_21700_22500
823216	contig_12654_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_129253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACCCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41460	43360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_41500_43400
823217	contig_10765_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_122879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTAAGAGCATCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41752	42266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_41800_42300
823218	contig_11281_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_125486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTACAGCCTTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895290	896941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_895300_896900
823219	contig_3077_pilon	+	522	3	Intergenic	novelGene_26620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9557	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9616_17554_17706_17775
823220	contig_10990_pilon	+	509	5	Intergenic	novelGene_7521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_4	56.455734872553	2341	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTATTGTTTCTTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783817	790141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_783932_784442_784470_785394_785458_786477_786557_789915
823221	contig_5992_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_176605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	28	417	168622	168233	NA	35	GGAATTGCAAGGGACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDSQTIVTIMGFIREVTGHNSGSGTLKDIVFPSGQPLPSHAHWHVSPWPSLGLCPKALSFLAPWARKPTELSPAAGFLLPGLSCWDSPATASHHLQGYGLLFLSPGPRSMAKLTNPFGGPQLPYHPVPPNHLGGSYKY	168649	167965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5992_pilon_-_168000_168600
823222	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823223	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	6	337	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823224	contig_2342_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_132752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGTTTTAATAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150276	151641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_150300_151600
823225	scaffold_6394_pilon	-	1807	11	Intergenic	novelGene_110967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	115.632348415139	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	683	1765	250850	248602	FALSE	10	AGAGTCGGTGGTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDNSGDPADPHKVYAVSPAPGWGGQGSDRTEEEAPTDGRLMRGEPPGPFLGEAGERPEPVLGWAGATGQRSEPCTSSPQPTPAADARDLLHQALQHTHLGDHLLEEAWRMDSAPQQPPGPALVSEELYLPWAEAAPSCPPQPPAQHQALMTDAAWTPALEPSQEAGPAPSPLTGAPLAEGGLAVLEVTILYKGRPVLQEVVGRASCVLLYRTPGPAAEAVDAQLVAFPSPAELPDQKQLRYTEELLRHVDPGLQLELRGGSLWARRLELVEFRERRRQGSPHYTIYLGFGQDLSAGRPKEKSLVLVKLEPWLCRMYHEGAQREGTSSLNSSSLGLCVSSSNSLYDDINHFLMELGQPP	252571	248559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_248758_248834_248954_249151_249419_249495_249577_249650_249750_250025_250255_250350_250407_250774_250983_251068_251233_251312_251643_252515
823226	contig_9931_pilon	-	652	2	Intergenic	novelGene_134819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	2	652	364680	297251	FALSE	0	GTTGGCGTCGTCGGCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAWALGVELGASVAAGGSLEAGAASVLLGFESEAGAPSLFVSWSAGAAGASVFLGSPSSSLLSSTLVGAVVSALASALASDAFGASPLAAGAEAAACSCSVSFGGSGLASAAPSVFSGSAFGASSLATAVPLSPSFSSLLFAVSWVSSGFSSLPSFTSVVSTAAWVSFSFAVPSSSVPVPSAFLSLSLAFSSFTLLTGSGCVYHPGCARCRRKARV	364681	297250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_297315_364093
823227	contig_10732_pilon	-	1398	4	Intergenic	novelGene_114760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	276.010064228744	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	328	405	573685	573500	FALSE	10	TTTTCTCATTCACGGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVRAVCTVFALIVFACIFGEGYSNIHTSQQRHCVFNHNEDACRYGGAIGVLAFLASAFFFVIDAYFPQISNATDRKYLVIGDLLFSGPSCGSLVSASSPTSGQPPSLRMCWWAPTRPARPSPSASSPFSPGVC	576286	572506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_573510_573617_573751_574129_574368_576262
823229	contig_17936_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_29993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTATTCTTACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287825	284744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_285888_287743
823230	contig_17936_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_29992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATCATATATATGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284600	284389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_284400_284600
823232	contig_14855_pilon	+	1469	7	Intergenic	novelGene_146040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	35.3647658929996	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	221	817	650839	654448	TRUE	20	CATGGGGGGGCAGATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQGPGPPRQDCGDSTPSSASEEQVAWETEEVFRSYVFHRHQQEQEAEGAATPIDPEMVSLPLEPNSIMGQVGRQLAIIGDDINRRYDVEFQTMLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648619	655582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652424_652780_652925_654065_654205_654340_655008_655489
823233	contig_11378_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_112282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCCCCTGATGGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496378	498124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_496400_498100
823235	contig_253_pilon	+	943	7	Intergenic	novelGene_129712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	13.3510299228187	227	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	55	642	520668	527175	FALSE	10	GACAGTTGCCCTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRRHGWRRLRAPELAGAMSAARPQFSIDDAFELSLEDASPGPESSGVARFGPLHFERRARFEVADEDKQSRLRYQNLENDEDGAQASPEPDGGVNTRDSARTSTRSSQWSFSTVSSSTQHSYSACCSWIQHPLIQKNRRVVLTSFLLLLLGLVLILIGVGLEVSPSPGVSSAIFFVPGFLLLVPGVYHVIFIYCAVKGHRGFQFFYLPYFEK	520613	527476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_520842_521759_521825_522270_522361_522479_522557_526662_526708_526920_526975_527092
823237	contig_11292_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_109446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	262.399663363605	458	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	61	846	329340	334081	FALSE	10	CCGTGTCTTGTGTGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGLRGLPAFPQLPGLHPGNMAAARGWWRGLVGAAALARGVVRPSALLLPVRRESATADTRPTVRPRNDVAHKQLSAFGEYVAEILPKYVQQVQVSCFNELEICIHPDGIIPVLTFLRDHTNAQFRSLADLTAVDIPTRQNRFEIVYNLLSLRFNSRIRVKTYTDELTPIESTVSVYKAANWYEREVWDMFGVFFANHPDLRRILTDYGFEGHPFRKDFPLSGYVELRYDDEVKRVVAEPVELAQEFRKFDLNSPWEAFPAYRQPPENLKLEAGDKKPEAK	329279	334169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_329398_329507_329574_330709_330808_331218_331369_332049_332176_332265_332386_333913
823240	contig_854_pilon	+	1365	10	Intergenic	novelGene_36419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	97	300	1064699	1064902	TRUE	25	CCAGAAGCTGTCTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FESKWFISEIKCGNRESTRESQAQWGRETWTRMSVPCSQAFLEVLKSLFQVSQGHLRSGDGVVDPVVVLLGDVQLPGEEAFLGREASGLPHHELHILVR	1064602	1081793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1064974_1067173_1067232_1067533_1067665_1069791_1069891_1070787_1070849_1072018_1072145_1074128_1074198_1075237_1075393_1075804_1075957_1081650
823243	contig_13305_pilon	+	1692	7	Intergenic	novelGene_146781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	30.5582322059957	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	741	1148	180662	181651	TRUE	5	CCCAGCTTTTGGTCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGTLTVAAAGMKPPGFLTRSDASSRAGRVPWKTWVSCGISISPASCTHTPHSHTHAAPAPCDPAHLPVPLALLSPHRPQPSPLRQQDPAHPRGPPPLKRPNQPHQGPRRILTLKGNRQKDRTMGRKILGTPRMS	175977	184759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_176683_180626_181019_181600_181656_181737_181875_183844_183936_184340_184417_184523
823244	contig_4964_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_157257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGCAATGTCAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135627	137759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_135600_137800
823246	contig_20378_pilon	+	1781	2	Intergenic	novelGene_159576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114154	116166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_114342_114572
823247	contig_17144_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_29122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	177	618	794	9922	11709	FALSE	55	ATACTGATAAAGAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQT	9304	11710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_9985_10056_10116_11654
823248	contig_11309_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_149851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCCTGTTGCCGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39410	37880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_37900_39400
823249	contig_7201_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_152513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCACTAAAAGATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252363	251701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_251700_252400
823250	contig_7201_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_152512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250428	250062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_250100_250400
823254	contig_20742_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_150662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCCTGTGTTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145583	147064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_145600_147100
823255	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	11	1	11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3034	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823258	contig_5039_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_65055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCCTCAGTCATGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1825492	1826335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1825500_1826300
823259	contig_4496_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_66705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGCTGGTAGAGAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994408	994129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_994100_994400
823260	contig_4496_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_66704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGTACAGAAAGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993333	992628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_992600_993300
823261	contig_5217_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_135801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGCCTCTGTGAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699792	698069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_698100_699800
823262	contig_8377_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_35107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTCGATTCCGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156062	156764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_156100_156800
823264	contig_12250_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_80541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAATAACACAAATGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258302	257811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_257800_258300
823269	contig_2892_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_119005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	318	289	606	170255	170572	NA	25	ATCAGTGACACCTATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSSLMASNTIYMLIMKFLTLVWDTPYFDLQNHTHNCLFDMSTQMSIRHFKLSMSKNGTSDHSPKSALPTFSHTSVNSAIILPFAQDKNLGIIFFALFSHTPNPI	169966	170573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_170000_170600
823270	contig_6929_pilon	+	607	3	Intergenic	novelGene_139374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4374.5	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGTATCTTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101616	132318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101665_130781_130971_131948
823271	contig_5018_pilon	+	2072	17	Intergenic	novelGene_47008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	33.3201796963942	33	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	84	1301	1246072	1250366	TRUE	15	CCCCAACTGTCATTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRARILLWLSLTLRSSRSVCRARFMVRQPQEPLNPDAMENGTGTSGEECPPEAQETTVTEGAAKIAFPSANEVFYNPVQEFNRDLTCAVITEFARIQLQTKGIQIKVPGEKDVQKLVVDLSEQEEDKAELKEGENLAPGDQPRTASVREICEEGLRVLEGLAASGLRSIRFAQEVPGLRSVVANDASSQAVHLIRRNVLLNDVAHLVQPSQADARMLMYQHQSVSERFDVIDLDPYGSPAPFLDAAVQAVSEGGLLCVTCTDMAVLAGNSGETCYSKYGSMALKSRACHEMALRIILHSLDLRANCYQRFIVPLLSISADFYIRVFVRVFTGQAKVKASASKQALVFQCVGCGSFHLQRLGRVSAASGKQVKFSTACGPPRGARLRALWAETPAWRPHVGRAHP	1245839	1253052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1245894_1246042_1246332_1246425_1246482_1246723_1246867_1247032_1247221_1248283_1248400_1248476_1248590_1249480_1249630_1250009_1250097_1250177_1250249_1250331_1250467_1250556_1250643_1250925_1251035_1251128_1251206_1252372_1252493_1252573_1252704_1252903
823273	contig_8712_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_58867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCAGCACCTTCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852723	850785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_850800_852700
823274	contig_4884_pilon	+	564	5	Intergenic	novelGene_63782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_1	77.4770127199029	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	49	564	142853	166476	FALSE	30	CACCATGTGAAGTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQPSLFYHLGVRESFSMANNIILYCDTNSDSLQSLKEIICQKNTMCTGNYTFVPYMITPHNKVYCCDSSFMKGLTELMQPNFELLLGPICLPLVDRFIQLLKVAQASSSQYFRESILNDIRKARNLYTGKELAAELARIRQRIDNIEVLTADIVINLLLSYRDIQDYDSIVKLVETLEKLPTFDLASH	142804	166476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_142913_156379_156404_162919_163114_164286_164456_166407
823279	contig_11719_pilon	+	213	3	Intergenic	novelGene_154754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3152	junction_2	632.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16260	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_16326_19126_19183_19997
823280	contig_7629_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_153549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTCAAGCCCTTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222850	221166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_221200_222800
823282	contig_2987_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_125854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	194	361	528359	528192	NA	45	GATGTTACCAGACTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIVTDPQVVAKIVHKSPVSPSPASPSDDIIVVQHQNQESDIRTVLSTRLQTLFGFHHFFHAFICMCCVCLWILIRFQTNESQDSCFPVVLEARPSIHILPQIKSYVEAQSIRHMKRLPL	528552	527909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_527900_528600
823283	contig_16846_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_82878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTCTTAGAATACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228636	229103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_228600_229100
823284	contig_7898_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_47649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807585	805680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_805700_807600
823285	contig_10857_pilon	-	1098	6	Intergenic	novelGene_160902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	243	320	117635	117558	TRUE	15	GGTCTCGCGGGCGGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCTRGLLLGPPTCRAGQGPGHRLNQAGTLPRRGSLLCRCCSTSWSCRSRWALRSGLCSFSGNRLGNLKVCPWAYSSPQAGMALHVHWPRVPTDSSEHARASLVPT	118437	110349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_110378_112636_112757_113580_113666_114297_114372_117086_117652_118211
823287	contig_9415_pilon	+	1842	2	Intergenic	novelGene_109840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATTACCGTTCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1937124	1939104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1938125_1938262
823288	contig_4769_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_117958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTCGCATTGTGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400857	401615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_400900_401600
823289	contig_3817_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_78362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAACCAACAACATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601889	601190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_601200_601900
823291	contig_12119_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_88637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAAGTCAAGATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96677	95391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_95400_96700
823292	contig_710_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_162941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCTCACAATCATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166743	167540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_166700_167500
823293	contig_7171_pilon	-	1060	9	Intergenic	novelGene_101416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	12.0772254677968	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	430	738	1454360	1451329	FALSE	15	GAGCTTTGTGGATCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPDLLRGAVFEGCGMTPNANPSQIYNIDPSRFEDLNLCCPPSPHCPPGELSAKGWLGPCTPRPPALPQHRSDHGPCPRASPVHRSQPAPDAQLLDQPALS	1462743	1451006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451608_1454041_1454119_1454324_1454373_1455041_1455148_1455380_1455445_1456373_1456429_1456508_1456534_1462576
823294	contig_20819_pilon	-	1417	5	Intergenic	novelGene_55706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	52.3664969231282	82	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATATTAGTGTCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181322	173344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_173565_174827_174939_175016_175779_176312_176489_181174
823295	contig_13004_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_112722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTAAACTTTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895957	897083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_896000_897100
823296	contig_12765_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_106570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCATAATGTCAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215965	215129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_215100_216000
823302	contig_6497_pilon	-	1397	3	Intergenic	novelGene_35571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTCCTTTAATGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181112	174110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_174194_176994_177038_179841
823303	contig_14414_pilon	-	1803	2	Intergenic	novelGene_166502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	139	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTGGCCTGGTTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80928	77754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_-_79422_80792
823304	contig_2854_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_120913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATAAATTCTAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338516	1340002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1338500_1340000
823306	contig_11986_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_69179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTATACATTAGACATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560396	559028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_559000_560400
823309	contig_12410_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_167270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGAATTTATAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66219	67138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_66200_67100
823311	contig_9668_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_58154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAACCAGTCTGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370892	371891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_370900_371900
823312	contig_4388_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_161966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655781	657267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_655800_657300
823313	contig_16221_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_176608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGATATTGCCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53809	52950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_-_53000_53800
823314	contig_7593_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_127319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCTATCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406433	405257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_405300_406400
823315	contig_8615_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_165225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGAAAGTAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362801	361787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_361800_362800
823316	contig_9389_pilon	-	1022	6	Intergenic	novelGene_84012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.4	107	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	81	614	547405	545216	TRUE	20	TACCGTGTAAACGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTGPTGRATQSAPRSGDPGAPASRTMSAPRAAPIFAPGENCSPAWGAAPAAYDAGDTHLQILGKPVMERWETPYMHSLAAAASSRGGRVLEVGFGMAIAASRIQEAPIEEHWVIECNDGVFQRLQDWAPRQPHKVIPLKGLWEEVAPTLPDGHFDGILYDTYPLSEDTWHTHQFNFIKEHALSPAEAGGHPYLLQSHVLGGS	547485	543446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_543817_545177_545291_545510_545579_545962_546027_546218_546365_547224
823317	contig_4732_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_75382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAAACTTTTTCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224382	223085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_223100_224400
823319	contig_1349_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_171635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11415	9154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_9200_11400
823320	contig_5062_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_157841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623272	624676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_623300_624700
823321	contig_10755_pilon	-	1336	8	Intergenic	novelGene_174289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.2324426449187	54	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	462	953	65161	47228	FALSE	15	TCTGCATCTGATTTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNVAVISALAILSTFLIGLLVVTLVILRKKHLQMARECGAGTFVNFASLETDGKLPYSWRRSIFAFLTLLPSCLWTDYLLAFYINPWSKNGLKKRKLTNPVQLDDFDSYIKDMAKDSDYKFSLQFEAPRHCQPPALPSPHILGFSVRVSSSVSKETLCSHA	71553	46844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10755_pilon_-_47336_49093_49176_52196_52233_58150_58235_60883_60953_65048_65170_68715_68849_71233
823323	contig_9481_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_149628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGCTTTGGCTGCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95512	95847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_95500_95800
823324	SIRV6	+	287	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	12	-2930	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCAAACGTGAGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	7858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2750_2829_3106_3165_7805
823325	contig_14684_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_99676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAATACATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355636	357401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_355600_357400
823326	contig_3960_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_138016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGTTATCAAATACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383962	382542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_382500_384000
823327	contig_4769_pilon	+	847	6	Intergenic	novelGene_117945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	24.5650157744708	247	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	55	486	301872	362527	TRUE	10	CATGCGTGGTCTGGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCNPLPASLRGPDPAALLMLLVDADRPEPVRSGARELALFLTPEPGAEAKEVEEAIEEMLLRLEEFCSLTDMIRNDTSQILEENIPLLKAKVTEMSGVYAKVDQLEAFVKMVGHHVSFLEAHVLQAERDHRAFPQALQRWLVSAGLPLLQEQTVHTSTPSV	301817	363017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_301962_320366_320439_331411_331514_338554_338691_362495_362616_362744
823328	contig_4686_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_118483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGTGCCCCATAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335773	336531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_335800_336500
823329	contig_366_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_51605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAGTTTAAAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802263	801064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_801100_802300
823330	contig_7119_pilon	-	1145	5	Intergenic	novelGene_41003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_4	315.700312796804	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	2	505	196804	188651	FALSE	10	GTTTCTTGATGCTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196805	188010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_196690
823331	SIRV4	-	526	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	13	78	13	-78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	253	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACGGCTGTGGTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5145	3715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823332	contig_1406_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_25486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGCACTCAAAATACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321435	1320791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1320800_1321400
823333	contig_3533_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_176534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	5.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCCCAAAACCTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161846	313882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_+_161945_265853_266035_313728
823334	contig_2278_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_118155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTATTGGGATTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500188	1497890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1497900_1500200
823335	contig_8182_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_173264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCCAGGCACCAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413712	413248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_413200_413700
823338	contig_753_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_112937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709308	711009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_709300_711000
823340	contig_13004_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_112612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172316	173639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_172300_173600
823341	contig_5964_pilon	+	1668	9	Intergenic	novelGene_80373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	25.5917467164709	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	170	1327	392087	406510	FALSE	20	GATATTTTTCAGTGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPKLLSATKSQKSRAPGLYELDSALIKEPDATIGEGASDSEFSHQRFRNLLYIEFVGPRKTLIQLRNLCLDWLQPETRTKEEIIELLVLEQYLTILPERIKPWVQAKKPENCEKLVTLLENCEEMYEPEDDDVHSDDDMSRVGAESPPPRSVHSFCSDWDWRGRNRDTEFRDHWPYTRTSRNRLLQHNLSLPLMEKTTFEMEREDDNDRDSMMDFESASQDAESYQDVVDLTEDRKPQNPIRDNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHLTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVIMEKFIKDVSRNSKSGRARESNDWPQRFPRMPDDDWKDISFSKRESLVPVHESDYYGVHISMQRRVKDGKKY	389877	406851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_389961_392000_392481_393075_393157_393934_394013_395086_395200_398121_398225_399261_399355_399496_399712_406429
823342	scaffold_12124_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_22117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGTCCCAAGCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898502	897895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_897900_898500
823344	contig_5445_pilon	+	824	4	Intergenic	novelGene_135431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	119.51847834819	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	246	398	126593	130921	FALSE	5	GCTGGCTCCTGTTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEGVCSRPRCPRHRCRPLRPCICLSIWGNRGPERLSNLPKVTQLGSRGTGIQTQFSLALKHHCSADASDTTPCCFAYHPRKMPRAHVKEYFYTSGKCSMQAVVFVTRMNRQVCVDLEKKWVQEYINSLEMS	124842	131347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_124922_125877_125997_126545_126658_130833
823346	contig_8310_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_75549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTACTTCCTAGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185859	186833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_185900_186800
823347	contig_10129_pilon	+	1499	7	Intergenic	novelGene_128151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	3.94405318873308	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	52	966	180362	185227	FALSE	30	AAGCTTCTGGACTTAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLQPSQPDTNQGKTTTMRIAVIYFCLLGIAYALPVKHQADSGSSEEKQLYSKYPDAVDTWLKPDPSYKQILLAPQNAVSSEETDDLKQETLPSKSSESQDQTDSVDDEDDGEQVDSQDPIDSDDTHEDDHTDDSNHSNESNHSDESDELVTDFPTDDPATSVFTPAVPTVDTYDGRGDSVVYRLRSKSKKIPRSDIQHPHATEEDSISQMESKMLDDAHKAIPVISSLKKPFDWDSYQQDSRETSQQDDHSVETHSQEQYKVYKLKANDVSSEHSDTIHSQEDSRVSDELHSREDKYYPDPKSEEEDKHLKFRISHELES	179209	185760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_179247_180347_180416_180523_180566_182560_182642_182916_182959_183796_184121_184855
823348	contig_6364_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_51699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTGATCAAAACAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429113	430841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_429100_430800
823349	contig_8907_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_85840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	892	1224	497344	497676	NA	60	AACAATGAATAAGGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHILEIQKQYGDATHTYRHLHIHPHRYMHAQHTHSFSVTLKNSLTHTHTHTYTLMLSHLTYTLTHTHIQELTPVSSVRQRAAMKACWSSFDQTTRLDAPGKAKSPLPTS	496452	498244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_496500_498200
823350	contig_3004_pilon	+	2448	1	Intergenic	novelGene_127537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520637	523085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_520600_523100
823352	contig_13571_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_128124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATTCATTTGATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252877	251208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_251200_252900
823353	contig_5145_pilon	-	961	2	Intergenic	novelGene_131464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	918	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	52	411	956111	955644	FALSE	35	AGACGTCAGGGTTAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRVRWGPEQEGRGAESGLVVHPGSSEEGERPEKKTHNPLSSSPFRLIATL	956162	955093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_955930_956037
823356	contig_19680_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_132013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	870	1681	2550	175622	176491	NA	75	AAAAGATAGAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEQPGNTVSAGQEDFPSVLLETAASLPSLSPLSAASFKEHEYLGNLSAVLPTKGTPQETSNEACKEFLEQAKNPFVDRDLTEFSELGYSEMGSSFSGSPGAESATIVANPREEVIVKNKGEDLVSNTILQNPQELPIAITESVKEDNVMSPEKTKDSNEKGVAVVFKGAPMREEYAEFKPFERVWEVKKDRDIEDSGLVAAGGKIESQLESKVDKKCFGDSLEQTKPEKDSDSSNEETSFPGTPEAVKDGSEAYITCASFSPAATKSIATNIFPLLEDHTSENKTDE	173941	176492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_173900_176500
823357	contig_8260_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_163271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550353	551606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_550400_551600
823358	contig_9436_pilon	+	1440	8	Intergenic	novelGene_60899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	169.491556589413	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	203	1114	413118	415035	FALSE	70	AAAAACAAACAAACAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSWSHGEGGGEGAALAWALCLRSGPSCPAAGDRTRVYGASGPGSGAPITGRPRSSWPGVGVSPDLRMATPRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGTGGGLPISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATARTDRETKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPVETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWPRDVSLPRGAFSPRGPRPVQSVVPEVEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYLQKGEGNPE	412493	415361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_412677_413098_413336_413489_413626_413730_413899_414030_414141_414395_414447_414574_414711_414942
823360	contig_3832_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_161470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGCTGAGCGCTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380820	381324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_380800_381300
823362	contig_3975_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_54905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	2131001	2131312	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGIWLPPSEPTYITKRGNPTLSPVKEHEVQSTKRTAIESILTHRDPIGQRRTAPQGFQGCLIFLEADCHISSHGAADKFELLASQLAAACLTTVNHQGTEHHP	2131000	2132928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2131000_2132900
823363	contig_2463_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_43023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCACAGTCAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512457	512929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_512500_512900
823364	contig_2380_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_117898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAGGTTATCATGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479621	477764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_477800_479600
823366	contig_7308_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_159617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATATTAATCAGCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567081	568165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_567100_568200
823367	contig_11855_pilon	-	1445	7	Intergenic	novelGene_67008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.25830573921179	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1422	24	1445	1394632	1389887	FALSE	10	GTGGACTGCTCTGGCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKKSSLLMDSSESDSEELPVFTFLKMEPSSTKRWLPQREEKIVVINASDSEASCPPSPGVKDPPPVPDTLETVTVTQTEPVRVLSSGSEDEVEFIPLAERLKCKFLTHKQLSPEDSRSPIKSVLGHQNNEGALCDWKKQPFPKILSVPLHNSSETSTSHNKDPILDKPSYQLPAYHSTCPIQDNNLTITTYSEVHLPQKRTRHNQKARRRDWHQGQANQKESTLRQQERKKAVQANRLKAQRPGECLKHIAAVLDPVLLQMEGGSQLLGALQSMECSCVIEAQAVPCSITWKRARLSEDGGEDWAEEPMILVLLLAEAVVSMINNLKQGSLDSTEKGKETLQSFVTDITTKTAGKALSLVIVDQEKCFSAQNPPRRRKQGVTNREQPKEKKQRQPEANTGPVPLVTRVDLEEALVDLQLHTEAQVQILQSWKELADFACTFTKAVAEAPFKKLRDQTGFSFCLESDWAGGVK	1394655	1389886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1389951_1390747_1390864_1391094_1391225_1391429_1391552_1391646_1391737_1393647_1393773_1393857
823368	contig_6445_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_77045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAACATCTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621333	622775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_621300_622800
823369	contig_1339_pilon	-	924	3	Intergenic	novelGene_163109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	23.5	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	14	619	257300	255087	FALSE	25	AATGTGTCATTATTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LETSMDTRGRGTPQEPGLAAHDPPSPLGALVKCLPVLSLAVSLWAVSPSSGYTALLQGALLCSAVGDICLIWPDAFLYGMAAFATAHLLYLAAFSFSPLQPATLLPVALACGPYYGLLLPRLPPDMALPLVAYALLLATVLWRGLVRGGSAGLGALLFTISDSVLAWDAFAQPLPHARLVVMTTYYAAQALIALSAVSGLRHKTN	257313	254781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_255470_256675_256848_257249
823370	contig_5297_pilon	-	731	1	Intergenic	novelGene_175671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGTGAAGTATGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88268	87537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_87500_88300
823371	contig_11978_pilon	-	248	3	Intergenic	novelGene_62932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCACGAATGGGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941329	930520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_930589_936505_936622_941265
823372	contig_11978_pilon	-	1241	3	Intergenic	novelGene_62930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	16	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	213	830	917197	916580	FALSE	15	TTGCATGTGTGTTAATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLHKYQPRLHIVEINDSEPEAACSASNTHIFTFQETQFIAVTAYQNAEITQLKIDNNPFAKGFRENFESMYTSVDTSVPSPPGPNCQLHGGDHYSPHLPNQYPVPSRFYPDLPGQAKDVVPQPYWLGAPRDHSYEAEFRAVSMKPAFLPSGPGPNLAYYRGQEVLAPGATWPVAPQYPPKMGPASWFCPMRTLPMEPGPGTSEGRGPENQGSPSVWTEITSIRPESSDSGLGEGDSKRRRVSPYPSSGDSSSPAGAPSPFDKEAEGQFYNYFPN	917810	916168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_917199_917462_917525_917661
823379	contig_6397_pilon	+	1597	6	Intergenic	novelGene_146233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	834	1202	272391	281153	TRUE	20	TGGGCCGCAACTGGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLQWQEGDEEVYQVLFHKTAVAKATVCGLHNLSLEVWLQVFHCNFFPGLSSFKQIQDHLIDDIALFALGARRSRCGSRASSSPGCNFSASSKIKRVWRQRCCVSWIWLVSCSLYMSTYLG	271557	293068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_272474_273211_273324_279151_279297_281124_281392_291873_291988_293025
823380	contig_5686_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_45497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTGAAAACCCTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266520	265976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_266000_266500
823381	contig_12503_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_143831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAATAACTACTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155045	156932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_155000_156900
823382	contig_5145_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_131403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAAGTCAGTTCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696405	695503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_695500_696400
823383	SIRV6	+	561	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	3	10	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGTAGTATCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133	2530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
823385	contig_19564_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_29680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCATGACCTCTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84098	89969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_84686_85115_85177_87021_87092_89835
823386	contig_4845_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_53635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAGTCCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275996	276270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_276000_276300
823388	contig_13241_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_158909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTCAAACCGCCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171104	173303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_+_171100_173300
823390	SIRV5	+	479	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-152	878	-38	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8163	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
823391	contig_151_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_132566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201376	199390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_199400_201400
823392	scaffold_12124_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_22156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATCAAACGACACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980763	981234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_980800_981200
823395	contig_19032_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_172517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGAAATGTTTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30277	31002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_30300_31000
823396	contig_2069_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_23351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACTGATGGAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914809	916915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_914800_916900
823397	contig_9389_pilon	+	867	7	Intergenic	novelGene_83960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	215.068722866798	1116	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	397	732	229365	229973	FALSE	5	CCTGCTGGCACCTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKVCVNGDDAHPLWKWMKVQPKGRGILGNAIKWNFTKASGVSRRVPPSFSCPFSYRQERLCGEAVRPHGGAPGDRKGPALFPLVPRAPTRAPPPCLSPRRPPEPSTRHP	227562	230108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_227659_228779_228875_228961_229107_229304_229457_229561_229633_229719_229780_229860
823398	contig_9995_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_47828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTATGAGACAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942451	942114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_942100_942500
823399	contig_9995_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_47827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937216	935922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_935900_937200
823400	contig_3825_pilon	-	1588	5	Intergenic	novelGene_77965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	18.4661853126194	123	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	998	1489	17907	15956	FALSE	25	TCACACACTGTACCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDPAREAQEAGRISSSAKSGAYVITPLHCSDLGTTILVNRGFVPRRKVNPETRQKGQIEGEVDLVGMVRLTETRKPFVPENNPEKNQWHYRDLEAMARATGADPIFIDADFQSTVPGGPIGGQTRVTLRNEHLQYIVTWYGLCAATSYLWLKKFMRRPALLR	18904	15856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_16029_16099_16182_16452_16616_16697_16771_17806
823401	contig_11642_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_172924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307217	306785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_306800_307200
823402	contig_7322_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_164914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATCTGCTGGGATGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216467	218086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_216500_218100
823403	contig_6412_pilon	-	2053	5	Intergenic	novelGene_149977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	257	568	570869	557688	FALSE	40	GAGTAAAAGGCTAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSPSDLGQNSERARLSSSSPRTPVFSILNQSLLAGITVSRYVIKLRIAFHNVFSWWAILLFTVTLESSSLSLCYLLSSLGTHAGDCGLPWDINCSFNSAQCR	640911	556202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_557827_570696_570871_571426_571462_610198_610387_640879
823404	contig_9070_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_171952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCAGCCAGCAATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149572	149803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_149600_149800
823405	contig_9516_pilon	+	1296	9	Intergenic	novelGene_106193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	14.4086562524061	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	1046702	1063684	TRUE	5	CTTTGGCTTTGTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIAVAFPIVGASASQSSDEPEQHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQTIDVRFKEIKYRGMFHALFRIYKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLEDSNAGSRKLVPREHDRQLHRYIPTGRHQGSVEGCGPNCAACCHRCGSRASSL	1040885	1079227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1040952_1046671_1046766_1048549_1048698_1050939_1051035_1056903_1057000_1063622_1063748_1064513_1064650_1077401_1077483_1078772
823406	contig_5452_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_101039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAATAGTCTTCACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647428	646883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_646900_647400
823408	contig_14618_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_136813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGCTTTTTTCATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588490	586594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_586600_588500
823411	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
823412	contig_13211_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_123141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	222	308	208136	208050	NA	70	AAAAAAAAAAGGCAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGFPGQKHCIHVTAFFIAGNRNTFKCTPLHEAKSIRKPVHGFLQTPPVLFFFYVLAIYPYYFTIINPRHECNCMLSTASPCKSPNVGLVLGMPDTRTHILL	208357	207802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_207800_208400
823414	contig_9571_pilon	+	1857	3	Intergenic	novelGene_136326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	41	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAAGTTGGCAGGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731107	752582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_731274_746063_746191_751018
823415	contig_10158_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_150774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGCTCAGCTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117030	118047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_117000_118000
823416	contig_12485_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_147290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGCTGTCAAGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291779	292635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_291800_292600
823417	contig_19352_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_122350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTAATAGAGGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102385	101100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_101100_102400
823418	contig_826_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_154950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGATTTTTTGTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413100	412141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_412100_413100
823419	contig_9097_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_173576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTGTATTCATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143193	142268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_142300_143200
823420	contig_17382_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_165187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAGCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26793	25972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_-_26000_26800
823422	contig_2969_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_157067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTTTATTACTCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852921	853658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_852900_853700
823425	contig_6635_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_127005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336074	336914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_336100_336900
823426	contig_6048_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_73143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	871	1260	1022415	1022026	NA	60	GAAATAATACAGAATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEHTCGLKYLITATLGRTDFPQSCAEAQKSNLPASSQRNKDLNPGLHGSKAQAVNTMRARHLELEDTGVQPWEGHKPPWQHERPSLALGDQAGSLRAGSAQPAAPGRRRNDSRGGKTWARGTFTQS	1023285	1021840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1021800_1023300
823430	contig_2114_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_104262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486264	486877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_486300_486900
823431	contig_6325_pilon	+	1405	4	Intergenic	novelGene_143338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	321	680	101805	113927	FALSE	20	GGTCTTTCAACAGGACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKQIVTCSQFKGHACSAPNVSRSIIARSYQNFQGAILPRLNIFSKMFVHPTGISKISNLHLELFCIFWFKRINKKISSSGFCTFIVQWSIMFLLLLVFTRYLCPNAFLKLADVLVYI	101484	114652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_101846_108424_108534_113340_113441_113817
823433	contig_18850_pilon	-	596	5	Intergenic	novelGene_142451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	218.573071305685	120	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193218	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_190748_191759_191866_192447_192581_192915_193051_193161
823436	contig_11338_pilon	-	1066	3	Intergenic	novelGene_6254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	134	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	188	910	109829	108824	FALSE	25	GTCGCGCACTAGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVPAVCPCRPPPLDWRLPDGRRSPGRAARPEGLKGGGPSGGSSGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDNFFGQRNGEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTNMNFGRSRPAQEPTRKKQDPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSVRSEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQTSNNIPADIVFVLKDKPHNIFKRDGSDVIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTLPVVFKDVIRPGMRRKLPGEGLPLPKTPEKRGDLIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI	111320	108667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_109055_109337_109919_111222
823437	SIRV5	+	422	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7467	2	-74	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGGTCGTTCTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
823438	contig_12588_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_173089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATCTCCGAGGGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68695	69362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12588_pilon_+_68700_69400
823439	contig_9609_pilon	+	1236	3	Intergenic	novelGene_23082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1060.5	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAGAACTGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453956	456275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_454016_454418_454622_455301
823440	contig_6418_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_81264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTAGAACAGTCAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1558885	1558179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1558200_1558900
823441	contig_15410_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_130560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	56	499	47766	48209	NA	10	GACCCATGTGTTGCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAAEVPGPLSRRDGPLAMLPGSPPVYTADGSSPLLRSKDPHARATRTKPCGLPLEASEGPEGHPTPLLWMPPPTRIPLAGERSGHKNLALEGLRDWYIRNSGLAAGPQRRPVIPHMGPPHQPFLHARCNEVGQALYGTPSQVPLPHSRSFTAPPVSGRYGGCFY	47710	49795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_47700_49800
823442	contig_14472_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_111183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGATTAGAAAATGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390700	388688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_388700_390700
823446	contig_20890_pilon	-	873	2	Intergenic	novelGene_147052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2186	junction_1	0	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTTAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45633	41980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_42695_45474
823447	contig_12313_pilon	-	1003	4	Intergenic	novelGene_171855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	1.88561808316413	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	76	348	80413	73274	FALSE	5	ATCCTCTGTTGGTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	80488	72618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410
823448	contig_14563_pilon	-	969	8	Intergenic	novelGene_135027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	611.736738094659	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	13	669	76494	59228	TRUE	35	CAAAGCGCCCAGGCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATMEDEEELEERPHKEWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETDDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCASAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKSTV	76506	56527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_56569_57838_57958_59087_59239_59437_59573_65265_65406_66607_66650_75198_75375_76341
823452	SIRV6	-	365	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATCCCCTTCACTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11279	10606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
823453	contig_9982_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_55789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1321	1680	748910	749269	NA	40	ATTATTAACCAATTATCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNQHKASPGPNTVDEVIFIRRGSLFNSQELKSTFTCDAESGSQRALSSSLRFLHVTFLSLLKSHGRHSHNSGKDDVSVAFTQSRGTGDELQFPVSNAEKVMVSLYFVAVRCIKSCESW	747589	749269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_747600_749300
823454	contig_9646_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_117419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTATAAAAGGAAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39869	37487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_37500_39900
823456	contig_9098_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_75800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATGACTATCGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288193	286081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_286100_288200
823458	contig_11846_pilon	-	2358	1	Intergenic	novelGene_106003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTAGTTCACTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425360	423002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_423000_425400
823459	contig_7119_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_40875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTTTCTTCTTGCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120342	120917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_120300_120900
823461	contig_6654_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_85700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAATAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130806	128903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_128900_130800
823464	contig_6191_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_107825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTTTAGAGGTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63028	64287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_63000_64300
823465	SIRV2	-	445	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-63	-88	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGTTACATCGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4795	3753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4342_4480_4687
823466	contig_12324_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_166645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGGAAAGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87291	86409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_86400_87300
823467	contig_8020_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_114425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTTACCCCCAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258997	260317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_259000_260300
823469	contig_11448_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_66446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAGGGTCTAACCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680316	682368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_680300_682400
823470	contig_14333_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_49165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGTCCACTTGGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535217	537047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_535200_537000
823473	contig_8712_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_58756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	518	1099	179205	179786	NA	20	GCTTGAATGTCTGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVTLIFHSFSFLSRKDLSVKYPEDLPITLPNLLKFILHHSDRAPAPQNLANPPTKECLQSEATLQQGHISHLEREIQKLRAEISALHQAQVQVEAQLASARRDEHRLLRQQQTLEKQHSLLRLHSEQLRALYEQKTSELEEVARRLQELADASENLLTENTWLKILVATMERKLKDKDAAETLAPPEGGTL	178687	180008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_178700_180000
823474	SIRV6	+	190	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	540	53	540	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10777	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
823475	contig_9363_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_6651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	132	425	972893	972600	NA	15	CTTGGCCTTTGTGATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSGQRGRVIAPSTYPGTSPGTFTPVACRPQLFPLNSKSPKIRMGGGGREGFDLHVSLRSSLGIQTTYFPSPCKEDPALTSFPGREWDVLHVPVLEGPPSSSLCYHALPRDQPTPTPGRGSQRAMGRNVACGRGDFCYNL	973024	972511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_972500_973000
823476	contig_16098_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_46207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATCTGTTTCTCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713945	714576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_713900_714600
823477	contig_19769_pilon	+	715	7	Intergenic	novelGene_102289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1742.55785811803	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	28	306	87249	87866	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALVGRPAAMGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAAEHRQCPPGGHHA	87002	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87567_87825_87933_88005_88040_88841_88958_89163
823479	contig_7416_pilon	-	2071	8	Intergenic	novelGene_134324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	28.1801782992867	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	107	1207	480940	447217	FALSE	40	AAATATTGTGATTTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRVVLKRVLLAYARWNKNVGYCQGFNILAALILEVMEGNEGDALKIMIYLIDKVLPESYFVNNLRALSVDMAVFRDLLRMNLPELSQHLDTLQRTANRESGGGYEPPLTNVFTMQWFLTLFATCLPNHTVLKIWDSVFFEGSEIILRVSLAIWAKLGEQIECCETADEFYSTMGHLTQEMLENDLLESYELMQTVYSMAPFPFPQLAELREKYTYNITPFPATVKVTSVSGRHGKVRDSDEENDPDDEDAIANAVGCLGPFSGLLAPELQKYQKQIKEPSEEQSLRSNNIAELSPGAINSCRSEYHAAFNSMMMERMTTDINALKRQYSRIKKKQQQQVHQVYIRADKGPVTNLLPPEVNNSPVINHLLLGKQMKMTNRAAKNAVIHIPGHTGARLSPRLL	481046	446352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_447384_451557_451765_454238_454379_456671_456785_466415_466522_471708_471878_475921_476091_480910
823487	contig_11328_pilon	+	525	4	Intergenic	novelGene_88389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2756.69903245812	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	40	408	643683	645256	FALSE	35	AGGTAGGAGAGATTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIRGEGYSRTD	643643	645373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645007_645226
823488	contig_9243_pilon	-	1547	8	Intergenic	novelGene_60320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	346.762107479571	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCATGTCTCAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64630	19264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_27290_27385_32837_32918_34512_34741_45071_45116_47712_47767_64578
823491	contig_8682_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_165274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTCCCTGCATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83229	83953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_83200_84000
823493	contig_5815_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_141242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAAATCTTCACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048992	1049559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1049000_1049600
823495	SIRV5	-	420	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACTTCGCACGTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
823497	contig_9955_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_21303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	875	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAATTATTTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47696	44893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_47590
823499	contig_4769_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_118024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCTAGCCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189394	1187752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1187800_1189400
823500	contig_11258_pilon	-	994	4	Intergenic	novelGene_67848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_3	56.6411707349188	110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	50	781	360471	352060	FALSE	45	AAAGAATATTCAACACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWTETLSWGSGRQGECMRGREAKEVSHEEPQIWTLTPFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVPAQQHPLPAPSLSEGALVLEHAQCCPLGEQASEGS	360520	351846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354741_355099_360299
823503	contig_11994_pilon	+	1773	10	Intergenic	novelGene_129343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	81.6319654166049	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	461	1243	95169	108340	FALSE	30	TCTTTTTGCTGATGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIHAAFIFIMTMYTQLYNRLSFGWNTVRIDMSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEGVSRMRGWFPRNCVEKCPCDAETDQAPEGEKKNR	93700	108870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_93947_94954_95173_98670_98727_100323_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200_107248_108236
823504	contig_19558_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_164751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTTTAAAAAAAAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163117	161493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_-_161500_163100
823506	contig_15185_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_99423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCACTGTGCCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251197	250426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_250400_251200
823507	contig_9516_pilon	-	1785	8	Intergenic	novelGene_106156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1280	1717	703946	702965	TRUE	20	CCTCTGAAGCTCAGCACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGGCSGSFWISTSLASLVQLLRIQGFGSFAFMWTSFTTSGTRSSFSSTPPPSSSLSDAAWSFCVSSLFLANCSCMAWRAWSYLAIIAFDLAHFPLFWCLRLIRSIILAFSIFSSSSNAAVGSTFRRVSKSFRAFLAFPFLTTL	710980	702295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_702359_702959_703085_703167_703241_703701_704094_706496_706911_707642_707846_707977_708077_710564
823509	contig_4891_pilon	-	1329	3	Intergenic	novelGene_124521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_2	131	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	243	338	67986	65864	FALSE	50	AGTTACATACATAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRVSPPPPPPYCLCEVRGERPPPLPLPPQLKKHSLKQGLRLPAASKVSDCWISKHQVQLCSPTCLTCRDPCQAGPEFTQMLIRTDPGNTGIMSHMWWNGETKMTTSWFEN	92811	64872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_65899_67925_68137_92719
823510	contig_9333_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_120318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTTCTAGGCAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107538	109502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_107500_109500
823513	contig_11026_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_167651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGACCCCACGGTATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98094	99700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_98100_99700
823514	contig_14322_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_115646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTGGGGCAGTCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408183	407837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_407800_408200
823517	contig_8291_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_99942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	66	470	136073	136477	NA	90	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAHAAHSSSSAEWIACLDKRYLEKGPLKPQPDAGAQRGWGVGWRGSPEQGKRLRVLVGDAEEHRPQPLLGCHLHEIITRGGENAAQWGERAPSFAIPLALAFPFSSPPRPAPTPASAFGWGFIFSWHHGTEE	136007	138015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_136000_138000
823518	contig_17603_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_152777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	683	1003	32778	33098	NA	55	CGTTGAGAGAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQREKKNEKNGTEYSKTVGQLVKESHPRIENTRKERQQKQKEELFEVTMTEKFRKSMMHTKRKTQEVQEIPSKIDSKLHLVMGKRGNCTKSKRKHCKKPEWGKITY	32095	33179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_32100_33200
823520	contig_5623_pilon	-	1284	7	Intergenic	novelGene_154880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	48.2930866918053	183	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	245	1021	363838	339867	FALSE	0	TTTGGTTTTTGTCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPTSVTPGLLQVLKSILEKEGPKSLFRGLGPNLVGVAPSRAVYFACYSKAKEQFNGIFVPDSNIVHVFSAGSAAFVTNSLMNPIWMVKTRMQLERRVRGSKQMNTLQCARYVYQTEGIRGFYRGLTASYAGISETIICFAIYENLKKYLKEAPLASSTNGTEKNSTNFFGLMAAAAISKGCASCIAYPHEVIRTRLREEGTKYKSFIQTARLVFREEGYLAFYRGLFAQLIRQIPNTAIVLSTYELIVYLLEDHAQ	371985	339603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_340070_341498_341780_344636_344704_346714_346816_349055_349134_363791_363972_371874
823521	contig_10734_pilon	-	791	5	Intergenic	novelGene_51122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	198.610642967591	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTAGACTCCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739503	737241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737446_737526_737597_738019_738138_738215_738501_739389
823522	contig_12046_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_83453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTATAGAACTACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140822	142061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_140800_142100
823523	contig_7171_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_101285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCTGGTGGTGTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050043	1049711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1049700_1050000
823524	contig_7171_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_101284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGGAGGCCCTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049761	1049357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1049400_1049800
823525	contig_7428_pilon	+	1453	2	Intergenic	novelGene_77707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_1	0	69	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTTACCTCAATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322082	323744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_322447_322655
823526	contig_5954_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_28545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATTACCACCAAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543562	542538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_542500_543600
823528	contig_16999_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_84954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAGAGGGCATTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42332	41063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_41100_42300
823529	SIRV6	+	353	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	352	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
823530	contig_9515_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_73821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCTCAGTACCAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57620	59307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57600_59300
823531	contig_19701_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_147892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93850	94581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_93800_94600
823532	contig_4392_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_117318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCAGCTAGTGGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372885	374114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_372900_374100
823533	contig_6410_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_108652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482545	481090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_481100_482500
823534	contig_12901_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_142985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138328	136847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_-_136800_138300
823536	contig_15036_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_107161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAATCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226067	225090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_225100_226100
823537	contig_863_pilon	-	1299	3	Intergenic	novelGene_176617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_2	66	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1293	6	1298	18801	8069	FALSE	35	AAGAGGGAAACTGACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMATQVMGQSSGGGGGLFTSSANIGMALPNDMYDLHDLSKAELAAPQLIMLANVALTGEVNGSCCDYLVGEERQMAELMPVGDNNFSDSDAEVLEESPEIKGEPNGLENMELESLELSVVEPQPVFEVSATPEIYNSSKDLPTETPGTEDKCKNLKTKPFRCKPCQYEAESEEQFVHHIRVHSAKKFFVEESAEKQAKAREYGSSTAEEGDFSKGPIRCDRCGYNTNRYDHYTAHLKHHTRAGDNERVYKCIICTYTTVSEYHWRKHLRNHFPRKVYTCGKCNYFSDRKNNYVQHVRTHTGERPYKCELCPYSSSQKTHLTRHMRTHSGEKPFKCDQCSYVASNQHEVTRHARQVHNGPKPLNCPYCDYKTADRSNFKKHVELHVNPRQFNCPVCDYAASKKCNLQYHFKSKHPTCPNKTMDVSKVKLKKNQ	18806	8067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_8380_14545_14630_17903
823538	contig_13365_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_168085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCTCTAACGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44944	46437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_44900_46400
823539	contig_6269_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_170535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAAAATACTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168263	169281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_168300_169300
823540	contig_17074_pilon	+	1245	7	Intergenic	novelGene_145170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	674.97516415215	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	214	1245	610974	636787	FALSE	60	ATGTTTAAAGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRAPAPGNSLAPPPAPSHADAESRGQAVRGSIAESGARRPEIRRAGNPRLVEGSAGERSAASVAATPESEEMATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRQVSARRAWCTLEMMMMM	563533	636787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631
823541	contig_17500_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_157929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGGTATAGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279686	279192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_279200_279700
823542	contig_12841_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_55883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	609	992	761662	761279	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGTQIPLFFSENPSRLQSRRLSSRNKVTVKSMAIWSYSVRASGSITILRDRDLGGECRPPAKAAERNRAGGQVCSQLDVVRTTAMEGTGVHSTRNETRNSLQVTKLPMFLSTWIPHFCLYESSSL	762270	761000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_761000_762300
823543	contig_3320_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_133066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGACATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169013	168432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_168400_169000
823544	scaffold_13505_pilon	+	830	5	Intergenic	novelGene_111418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_1	143.021851477318	833	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	111	830	455671	458422	FALSE	20	AGACATTCTCCCAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKNQQKDAEAEGLSATTLLPKLIPSGAGREWLERRRATIRPWGGFVDQRRFSRPRNLGELCQRLVRNVEHYQSNYVFVFLGLILYCVVTSPHAVGGSGGLLWCLLHPLSAHTAVQACALWPRGEPSPSVRSGRRCLLPLLLAGGCRLGRLLGPGSHPRGHRLPRCLPPDRGCGRGGAADGACVRCPQEPAGLPGLPPCPCSPPCCTALLLRPKSPSPLQAQEGISALEIKLLQLSFC	455560	458422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_455727_456025_456239_456548_456648_457989_458092_458172
823546	contig_7898_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_47640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATATCATTAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738339	740121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_738300_740100
823547	contig_15420_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_175291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATAATATTCTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128212	126875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_126900_128200
823548	contig_8611_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_166559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54523	53310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_-_53300_54500
823549	contig_2703_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_101847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGCTGAGTAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340421	1339428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1339400_1340400
823550	contig_11832_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_106981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490676	491544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_490700_491500
823551	contig_6842_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_130781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTCCTGAAGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373658	1374461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1373700_1374500
823552	contig_7919_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_28027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCCTACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106971	106195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_106200_107000
823553	contig_14322_pilon	+	1332	2	Intergenic	novelGene_115634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	232	690	251171	251629	FALSE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVRTADAAAESGVDRAAPESDPESDPQCQQRRPAGVTTDCPSENHIRPSADWALPHVLPFSPVRLPKREKEKNWTCMFRRIFMFLLAPPFCTPPRPPGPQILFRRKEPASCDHKPATIFPQAPESPVDKVFSRILGLGVGPPAAGHQVAGFMFETPRTPSSGESFVAPALPLSLFVSPFLPCLEAPSSQHLSPCWEELTASRRPGTGVLPASLDRAFLRERGRSVVGD	249118	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_249238_251058
823554	contig_10575_pilon	+	1718	3	Intergenic	novelGene_141823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	6	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	221	1624	765678	767081	FALSE	60	AGAGAAGCTTTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGANSFRVEFPDFSSTILQKLNQQRQQGQLCDVSIVVQGHIFRAHKAVLAASSPYFSDQVLLKNSRRIVLPDVMNPRVFENILLSSYTGRLVMPAPEIVSYLTAASFLQMWHVVDKCTEVLEGNPTVLCQKLNHGSDHQSPSSSSYNGLVESFELGSGGHADFPKAQELRDGENEEESTKDELSSQLTEHEYLPSNSSTEHDRLSTEMTSQDGEEGASDSADFHYTRPMYSKPSIMAHKRWIHVKPERFEQACEGVDVHATYDEHQVTESIDTMQTEHSIQPSGVEEDFHTGEKKVEAEFDEQAEESNYDEQVDFYGSSMEEFSGERSDGNLIGHRQETSLAAGYSENIEMVTGIKEEASHLGFSATDKLYPCQCGKSFTHKSQRDRHMSMHLGLRPYGCGVCGKKFKMKHHLVGHMKIHTGIKPYECNICAKRFMWRDSFHRHVTSCTKSYEAAKAEQNTAEAN	740227	767175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_740304_744703_744825_765654
823557	contig_7919_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_28038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTAGGACATAGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179620	181727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_179600_181700
823558	contig_9297_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_69841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTGAAGAAATTAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676507	678495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_676500_678500
823560	contig_6497_pilon	+	2055	1	Intergenic	novelGene_35625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCCTGTTAACATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698414	700469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_698400_700500
823561	contig_6975_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_74278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAGAGAGAAATGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209551	211479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_209600_211500
823562	contig_11816_pilon	+	1248	2	Intergenic	novelGene_98585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATACATACATTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347594	1351488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1348103_1350748
823563	contig_504_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_54454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	139	513	297200	296826	NA	30	ACTATTGTGCTCAAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCRNQQVIISPANTYLAFITCARGHSPPLICQFVILWWLACCCDAGTYATSISNASRYHPWWAGFSGASSLRQIRKKGLVISFQKQANEKLWITTEYYPMDRSNECEDDAGLVNVSFCYMGPP	297338	296631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_296600_297300
823564	contig_5899_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_146976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTGACTGTTAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149345	147404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_147400_149300
823565	contig_6079_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_160115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTAACAATCCTATCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496662	495191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_495200_496700
823572	SIRV6	-	406	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8242	-53	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCTAACTATGAGCGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10789	2411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2815_3106_3164_10723
823573	contig_18491_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_176623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTTTTCTTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28284	29248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_+_28300_29200
823575	contig_8491_pilon	-	2396	3	Intergenic	novelGene_154227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCCCATAAGGGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309615	298985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_-_299094_300266_300840_307900
823576	contig_5033_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_29074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625418	624734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_624700_625400
823578	SIRV2	-	284	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4573	50	3398	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGACGTGGTGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334	1050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
823582	contig_2646_pilon	-	788	5	Intergenic	novelGene_69609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	24.4578719434051	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	28	411	2013948	2008302	FALSE	15	TTCCATTTGTGTGTGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGKCRVNTIPQMTGLPGLTSLSTSCMGKCIGSRAMKLPLKRQRASLPTSPMEACSCGCREMPITCTDLRWIPECTC	2013975	2007924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2008400_2011714_2011799_2012331_2012367_2012497_2012592_2013875
823583	contig_2214_pilon	-	614	5	Intergenic	novelGene_144262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTCGATAACGCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311619	306105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_306174_308088_308227_308331_308464_309974_310105_311473
823584	contig_11493_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_143724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCAAGCAATCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347705	347130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_347100_347700
823588	SIRV6	+	358	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	17	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
823589	contig_6299_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_172943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTATTGGCTGCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958235	958711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_958200_958700
823590	contig_6374_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_158445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATCTTTCAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380601	382859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_380600_382900
823591	contig_6958_pilon	-	1959	14	Intergenic	novelGene_69911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	622	1350	138028	127159	TRUE	0	GGCGGGGCGCCTCCGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSILVHGGVPVEAVCAEVHGGLLVAGILRELHSLGEELLCLSVGHHQQGDDLLHGLLHDVSGLQVPADLLEKNPGLLQVIGGHQLPFQDRKGYLRARGEVKVSDRRQRDGRADFVSDTLKLHQLHGRDGFVSVLHDVAGVGAGLDQLVLLVKGLLCQVLHVRVFQPVDAVPVPQVRAPLFVIVAGVGRLPGVGRSGSIHIDVIGQVFHHGPRLTGFNVEHHLLVLLVFVHVTDGLIQVLH	138860	89763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_89863_99714_99876_121571_121674_122965_123046_124491_124578_126345_126424_127155_127217_127877_127946_129770_129890_129975_130067_132013_132213_135016_135189_138006_138074_138284
823593	contig_11932_pilon	-	2244	3	Intergenic	novelGene_85422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	11.5	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	211	597	362661	360996	FALSE	10	CTTCTTCCCCCTTACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTSGLSISGLNPLPNPSYLLPSRIFSSTTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIGESFEEILEETVISTKKTEKSNIEESTISSQKI	423209	359348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_361306_362584_362710_423047
823595	contig_17194_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_155365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTTGATCCAGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115585	116491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_115600_116500
823596	contig_10904_pilon	+	522	4	Intergenic	novelGene_22573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	279	junction_3	141.875532304435	9583	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGACTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423052	426363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_423280_423523_423599_425434_425513_426221
823599	contig_6424_pilon	-	2473	5	Intergenic	novelGene_109266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGCTTGGGCGGCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82681	78090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_80009_81039_81133_81466_81542_82043_82137_82387
823600	contig_16643_pilon	+	839	2	Intergenic	novelGene_158105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGGCTTTCCTCGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114477	132181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_114674_131538
823604	contig_14405_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_85681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969376	968044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_968000_969400
823605	contig_20819_pilon	-	971	9	Intergenic	novelGene_55696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	45.4544758522194	212	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	22	801	120222	118249	FALSE	15	CCTGCCACATCCAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQLRLGSALALVTGAGSGIGRAISVRLAREGAAVAACDLDGAAAEKTVRLLGGPGSEEGAPRGAHAAFQTDVSEAGAARRLLEQVQARLSRPPSVVVSCAGITRDEFLLHMSEDDWDKVIAVNLKGIFLVTQAAAQALVSNGCHGSIINISSIVGKVGNVGQTNYAASKAGVIGLTQTIARELGRHGIRCNSVLPGFIATPMTQKMPQKVLDKVTGMIPMGHMGDPEDVADVVAFLASEDSGYITGASVEVTGGLFM	120243	118078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_118266_118455_118531_118722_118766_118972_119058_119170_119257_119356_119450_119558_119676_119774_119993_120176
823606	SIRV6	+	255	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	41	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10727
823608	contig_5302_pilon	+	1912	2	Intergenic	novelGene_81524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	847	1161	1494968	1495282	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKREWHKLKLQQFVAYIMQGPSQMSLFCKPFFYQHAYINNLNRFFILSSFHAITVCTPLMHRSPYIFMFVYTSFLRALFFLFSTASDSTLMRGAQGERVRIKT	1493766	1496033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1493824_1494178
823609	contig_6589_pilon	+	744	4	Intergenic	novelGene_25684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	48.5821183381522	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	116	556	73445	77654	FALSE	5	GCCTGCCTGTGTCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAELPAPNSAPGATAQGDAGAPGSGEPRGRRGAEDVMSQAPGARPSPPCVYHERQRLELCAVHALNNVLQQQLFSQEAADEICKRPLSQLALPQVLGLILNLPSPVSLGLLSLPLRRRHWVALRQVDGVYYNLDSKLRAPEALGDEDGVRAFLAAALAQGLCEVLLVVTKEVEEKGCWLQTD	72667	77842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_72769_73430_73591_77247_77443_77554
823610	contig_15244_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_118072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGGCCCAGGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764536	763427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_763400_764500
823611	contig_5484_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_151108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	214	570	321685	321329	NA	25	GCTGCTAACTGAAAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLNIKRIILSFHQVAHLTRGFLDYFILGNKILFGEDALVCKKPQSMLVWETLRSPDRSSKKEAKKFNINLVVPVGKTPEVQMPDVTVYKPFIDHFKKQYSKQSFCSDNKYIHGDTTG	321898	321321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_321300_321900
823613	SIRV4	-	529	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15121	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8911_13732_13829_15019
823614	contig_18919_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_156013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGGTGTTCGCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67566	58950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_59460_67509
823615	contig_10451_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_138314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172223	170824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_170800_172200
823618	contig_5059_pilon	+	902	5	Intergenic	novelGene_140721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	85.9142013871979	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGGAAGTGTGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232082	251378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_232206_243396_243504_244759_244828_250083_250134_250824
823620	contig_2069_pilon	+	866	3	Intergenic	novelGene_23359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	12	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	115	543	947408	950175	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWLHAKLNPLRDHYFLFDCPGQVELCTHHGALRSIFSQMVQWDLRLTAVHLVDSHYCTDPAKFISVLCTSLATMLHVELPHVNLLSKMDLIEHYGKLAFNLDYYTEVLDLSYLLDHLTSDPFFRHYRQLNEKLVQLIEDYSLVSFIPLNIQVLGTRRPLPPGFPRAWDLITSRVQEALRA	947293	950498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_947429_947996_948154_949924
823621	contig_15236_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_141636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGCGCATGATAAAAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662324	663369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_662300_663400
823623	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823624	contig_18081_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_23769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTTTTTGTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63769	64382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_63800_64400
823625	contig_16103_pilon	-	642	4	Intergenic	novelGene_118717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	500.202847741683	474	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	212	517	208768	207292	FALSE	10	GGCTGCTGGTCTGCGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	211853	207166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627_208784_211521_211602_211737
823626	contig_7593_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_127331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTATAATCCTTCTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539515	541148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_539500_541100
823627	contig_4659_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_118261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAGAGAAAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889985	888883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_888900_890000
823628	contig_5253_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_61543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCTTCTGGAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59396	57566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_57600_59400
823629	contig_20742_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_150661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGACGCACTAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141611	139750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_139800_141600
823631	contig_12943_pilon	+	337	2	Intergenic	novelGene_140352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGAAAGAAGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29114	30141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_29386_30075
823632	contig_870_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_176025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAATAGTTAAGTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26434	27042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_870_pilon_+_26400_27000
823633	contig_870_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_176026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAACTAACCAGAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27549	28477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_870_pilon_+_27500_28500
823635	SIRV6	+	330	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	558	171	379	140	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031
823636	contig_513_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_80123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGCCCAGCTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277492	277710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_277500_277700
823637	contig_513_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_80124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGAGTTCATGTCGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277761	279019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_277800_279000
823639	contig_12789_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_176629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCAATTTGTCAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296315	295527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_-_295500_296300
823642	contig_10225_pilon	+	1033	2	Intergenic	novelGene_86846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGCCTCCAGGATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35185	37465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_35785_37031
823644	contig_2365_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_103751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCATTACATTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220209	222512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_220200_222500
823647	contig_2036_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_131856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	383	697	678968	679282	NA	35	ACCTTGAAGACTAAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENIKYKRLSSGLCSTDNLLSCVALGNSPEFHVLTCAVKRLNYMMPKASQSPGSLLLQHQWSVCLHKFQCVIRHGWPCSSMLLHWPYLLLPTPAIFSVTEKKQL	678585	680392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_678600_680400
823648	contig_11115_pilon	+	796	4	Intergenic	novelGene_102818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	593.606491429016	185	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	239	706	165608	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165369	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166356_172874_172964_173047
823651	contig_14807_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_124733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAAATTTTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156285	157238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_156300_157200
823652	contig_16882_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_148224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATGGCAGGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249458	248958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_249000_249500
823655	contig_10399_pilon	-	2079	5	Intergenic	novelGene_114498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_2	6.72216482987438	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	171	1739	400821	392870	FALSE	40	ACATATAAAGGACTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNVPDTLYMVSNAVPQCCHMISHQQISSNQSSPPSVVANEIPVPRLLIMKDMVRRLQELRHTEQVQRAYALNCGEGATVSYEIQIRVLREFGLADAAAELLQNPHKFFPDERFGDESPLLTMKQSGRCRVNSTPTAETMFTDLDSFVAFHPPLPPPPPPYHPPATPIHNQLKVGWKQRPPSQHPSRSFSYPCNHSLFHSRTPPKVVPPPVYLPSVKAAPPDCTNTAGLGRQTVAAAAAAASATITSEKQVCTQPVLNDLMPDIAMGVSTLSLKDRRLPELAVDTELSQSVSKVGPGPPQHLSCIPQRHTHTSQKKHTLERKTDARENQQEYPDFYDFSNAACRPSTPAPSRRSPPPSHGGYFGPDLYSHNKSSPSGLKSAYLPSQTSPKKQEEARREYPLSSDVHLHRQKNEPIHLDVVEQPPQRSDFPLAAPENAGNGPAHVRGRTAVETDLTFGLTSNRPSPSACGSEAPEERSSRRLADSESLGHGAQRNPDLEREDSVSRGRRSPSKPDFLYRKSAL	402557	392529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_393686_395681_396126_397427_397607_400691_400882_402447
823657	SIRV6	+	385	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	52	164	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGAGGCACCAGCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
823658	SIRV4	-	581	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	38	-2	38	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5120	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823659	contig_9579_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_150590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACACAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801327	800067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_800100_801300
823663	contig_7070_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_104041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	3	512	91984	92493	NA	90	AATAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPPRRFQSVNNVISSARCVLPGTCQPIGEPLFLAASPNAKWALLQQDPEKNLSGQGSLKAAVVCVKERGRAPEWALGSSPQTGAGKAGIWELQVCTGIFLKFDGPFCGHLSQVSSLLASSASGKPCVSLGSGHLSEVVVVLKFQSQPPCLPHHCFISSRDGNTSSTQLQ	91981	93311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_92000_93300
823666	contig_11978_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_62837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATTTGCACCATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477042	476292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_476300_477000
823667	contig_6557_pilon	+	834	7	Intergenic	novelGene_33009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACGTCATCCACGTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563638	569419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_563727_564292_564403_564514_564701_565076_565182_565650_565788_565870_566031_569371
823668	contig_7202_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_17484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGGTAATGAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27622	27917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
823670	SIRV6	+	331	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	542	0	376	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1679	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823674	contig_10302_pilon	-	967	4	Intergenic	novelGene_175201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.69967317119759	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	373	966	22332	20006	FALSE	20	GTACCTTTCATCACCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDHKKPTLTAWPSHVVPQGQRVKLRCQSHFRFTLLRVYKEHGPLVSKFQNTRSGKNFIIGPVTPAHAGIYRCHGFYHNFSTRSALSDPLEIVVTGVYRKPSLLAQPDPLVKLGENATLQCCSEIMFDTYILYKGEETKDPLRLTGRLHGGGSQADFSLGSMTLAHVGTYRCYGSLSHSPYEWSVPSDPLKLVITGLHKKPSLFAQLGSLVKSGENVTLRCHSESSFDTYHLSRKEDTHEYWLHGVQSHNGAFQADFLLGPVTPAHGGIYRCYGSFNRSPYAWSDPSDPLHLLVTENDFPEGKYRYNSSNFGETPRHPRLLSA	24299	20004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_-_20089_20467_20768_22121_22422_24016
823675	contig_7391_pilon	+	1268	4	Intergenic	novelGene_112138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	6.84754619472471	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGTTAGCAGTATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267134	282682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_267211_273515_273600_274663_274730_281640
823677	contig_10549_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_110594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTGAATAATTAATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120153	121869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_120200_121900
823681	contig_6710_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_97667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
823686	contig_5686_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_45465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223022	221980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222000_223000
823687	contig_9415_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_109818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1804912	1806419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1804900_1806400
823689	contig_4055_pilon	-	2682	11	Intergenic	novelGene_158175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	19.6216716922896	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	197	1069	947242	929489	TRUE	15	CAGTGTTCTTGATCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLEGRDDALLPDFPKGPLQAYRARASFSWKELLLFLEGEETVRFKRTVFSALENDPLFAQRGRADLPLERYRELTFLRCKRVFEYNFLSAEEMLQMPQKVSALVNCLGMYDWSLAVKYSLHMLIFSSAIYSLGSERHFKYIAKIFSMEIFGCFALTELSHGSNTKAIRTTAHYDPSSEEFIIHSPDFEASKFWVGNMGKTATHAVVFAQLHTPGGQCHGLHAFIVQIRDPKTLLPMPGVMVGDIGRKLGQNGLDNGFAMFHKVRISRQDLLNGVGDVTPRGHLRHSV	953825	917726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_919033_921018_921142_922878_923062_929487_929586_937112_937202_938570_938715_941848_941939_942811_942887_945114_945349_947098_947257_953643
823691	contig_10482_pilon	-	1882	3	Intergenic	novelGene_152857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGCTGGAGTTCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246520	242613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_244137_245255_245319_246224
823693	contig_7088_pilon	+	1361	9	Intergenic	novelGene_159785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	121.826464694663	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1278	83	1360	689656	718540	FALSE	55	TAACCAATGCAGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYLNPWRRPLLSCSWSKLCLLKQCLFTMKLRSPEFQSLFTEGLKSLTELFVKENHELRIAGGAVRDLLNGVKPEDVDFATTATPAQMKEMFQSAGIRMINNKGEKHGTITARLHEENFEITTLRIDVLTDGRHAEVEFTTDWQKDAERRDLTINSMFLGFDGTLFDYFHGYEDLKNKKVRFVGRAKQRIQEDYLRILRYFRFYGRIVEEPGDHDPETLEAIAENAKGLAGISGERIWVELKKILVGNHVNHLIHLIYDLDVAPYIGLPANASLGEFDKVSKNAEGFSPKPMTLLASLFKVQDDVTKLDLRLKISKEEKNLGLFIVKNRKDLIKATDSSEPLKPYQDFIIDSRESDATTRVCELLKYQGEHSLLKEMQQWSIPPFPVSGHDIRKAVSETMEKIPVSTHLWNLNYSFHCLFLIGSS	688550	718541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_688606_689628_689804_698510_698705_701957_702097_706157_706285_710886_711081_712085_712340_712577_712711_718451
823694	contig_10436_pilon	-	876	4	Intergenic	novelGene_108505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	7	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	97	450	103480	102032	FALSE	30	CCACCAAGCTGAACTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103576	101605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
823695	contig_6424_pilon	-	1013	5	Intergenic	novelGene_109244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.993035119487	3	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	43	402	21039	6307	FALSE	15	CTGAGCTGTGTTTTGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTAVTQVPWAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPRDAPGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21081	5695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6431_7970_8039_9173_9280_12062_12098_21012
823698	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
823699	SIRV6	+	156	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	53	787	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
823701	SIRV6	+	448	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	515	164	75	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823702	contig_6102_pilon	-	1798	8	Intergenic	novelGene_32027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	101.912727770542	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	152	826	545300	514164	FALSE	25	GTTAACAATTCTTGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTAAARFFGAKHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNPLLFP	545451	513191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514181_516665_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_545258
823703	contig_5210_pilon	-	836	2	Intergenic	novelGene_65424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	172	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444376	442502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_443119_444156
823704	contig_11948_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_174385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCTGACTCATATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144096	143508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_143500_144100
823705	contig_17212_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_88604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	110	433	48379	48056	NA	35	TACATTCAGGGAAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLELGDEKWAGSGICDSHVRGRSAKPGCGWDCLRKERSRLRPCVQKMVLPGVTSMTSGKLVNLTKLTYLSGLLRKKLMNLGLSVVLSLVHSVSSLEIAFSSPLGCV	48488	46555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_46600_48500
823707	SIRV5	+	393	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_10866
823708	contig_7171_pilon	+	1225	7	Intergenic	novelGene_101242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_5	366.101723872235	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	518	739	760687	764486	FALSE	15	GAGATTTCAGCTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWCRALLALLGSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	734354	764972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
823709	contig_5260_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_144423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	2	442	546419	546859	NA	30	AAGAAGTGTCGGGATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVILYSHIVIFLLFSCVQNSSILHSEPPGNRGNRPLFRRSLLKTSSYVRLTGSSGKASHTGNIPLHIQGYRQSPETKRVSIPLQHKDGQADRNTEDSASHLDTAAWIHFLQKVTLDTATLPSGTNSTASKSCHSLPIPFSFGHFPD	546417	546986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_546400_547000
823711	contig_12540_pilon	-	1254	4	Intergenic	novelGene_148114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.262975904404	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	28	513	1108562	1092362	FALSE	30	TTTAAAGACTTCAGAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPASRGLHMGLVMERGGPYSRGLHKAGGGERGCWYYSPQPPAHRLSYSGGIQEEDPGVPEALCKQRGSPIQWLRRLQASRTEGAPNSMMQQDACGANTTLPPSPSPGRRWTSFPLTAPKSSPPPRTPPVLAHIPTPTPRDHSHVMSPHSVNVTGTVTISHRVILSPPDT	1108589	1091620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1092659_1099535_1099618_1099772_1099795_1108477
823712	contig_10427_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_142180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGAACTGGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50172	49834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_49800_50200
823713	contig_5039_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_64822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTATCAACTGAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243091	243530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_243100_243500
823717	contig_10331_pilon	+	801	7	Intergenic	novelGene_54095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	20.5426385841741	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	75	785	293069	303074	FALSE	45	AGGGTAAGGTGAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVNDGGGVLRVIAAGEGALPHEFMDGVEGVAGGFIYTIQEGDALLKNLHSRPQRLIDHIMDLHEEDALLKEESSIYNDIVFVDVVDTYRNVPAKLLNFYRWTVETTSFDLLLKTDDDCYIDLEAVFNRIAHKNLDGPNFWWGNFRLNWAVDRTGKWQELEYPSPAYPAFACGSGYVISRDIVHWLAGNSERLKTYQGEDVSMGIWMAAIGPKRYQDSLWLCEKTCETGMLSSPQYSPQELTELWELKELCGDPCQCEAR	290522	303090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_290567_293038_293118_296006_296191_299325_299452_300091_300252_300764_300822_302939
823721	contig_9727_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_86353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487224	486678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_486700_487200
823722	contig_10135_pilon	+	1153	8	Intergenic	novelGene_106578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	40.0907134648717	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	37	1044	25077	27851	FALSE	15	CCTTAAGTCCTGTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPGRSLDRILRMVSAVSSCRTCSRSHRPRLGFIIRPRHQLLPLLLCPGLRIPRLSVLCAQPRPRAMAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKGSVVAAYRKTHLCDVDIPGQAPMHESDSTMPGPSIEPPVSTPAGKIGLAICYDMRFPELSLALAQAGAEILTYPSAFGFVTGPAHWEVLLRARAIETQCYVVAAAQCGRHHQKRESYGHSMVVDPWGTVVARCSDGPGLCLARIDLSYLRWNTGSAFWERRFHLS	25040	27960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25130_25663_25763_26029_26285_26387_26492_26718_26853_27021_27148_27427_27615_27801
823724	contig_7338_pilon	+	1673	4	Intergenic	novelGene_156798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTATCAATTCGAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266498	274071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_266540_269922_270012_271329_271414_272612
823725	contig_16510_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_139076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGGTGAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238043	240190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_238000_240200
823727	contig_8580_pilon	+	1225	9	Intergenic	novelGene_156089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	50.7635449904752	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	291	1130	262115	273102	FALSE	5	TTTTTTGTGTGTGGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAQCLLECACGTFTLSVRCSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETSSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCRLILCCNSTSKVIAPIRSRCLAVRVPAPSIEDICHVLSAVCRKEGLTLPAELARRLAEKSRRNLRKALLMCEACRVQQYPFTADQDIPETDWEVYLREAANAIVSQQSPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	253023	273197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262103_262275_266363_266546_267528_267666_267739_267839_271126_271197_272910
823728	contig_12596_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_172739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	353	796	87987	88430	NA	10	CATGCCTTGGTCATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAICEKRKTSSGPKTERGLSVELIQTAREAFGDAACIVHLRSQFTLSATVVFCWRCLFLLCPCVLGVQPAPVILGTGLTSSRSLLLFQAFLQTYWGRALPARICLLTHTHARELATVLFKSRILSSLKPSLFKESWLLIPETRECWY	87634	89684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_+_87600_89700
823732	contig_3948_pilon	-	1949	15	Intergenic	novelGene_53173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGCAGCGGAAGCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384429	343559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_343633_345534_345643_346399_346727_349288_349393_350021_350059_351131_351231_353030_353254_361300_361363_361418_361481_364035_364134_364810_364865_368828_368961_371243_371395_379630_379771_384150
823733	SIRV6	+	307	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	563	3	397	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1700	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823736	contig_4891_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_124537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409462	410082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_409500_410100
823737	contig_8044_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_132384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGGAAAAACTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482667	480468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_480500_482700
823738	contig_2032_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_175550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCTTAAGAAGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231	1868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2032_pilon_+_1200_1900
823740	contig_5236_pilon	+	1182	10	Intergenic	novelGene_100872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	167.748562577787	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	165	971	26719	36296	FALSE	40	ATGTTAAATAAAGCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSVKTFLQDLARGIKDSIWGICTISKLDARIQQKREEQRRRRASSVLAQRRAQSIERKQESEPRIVSRIFQCCAWNGGVFWLSLLLFYRVFIPGLQSVTAHIIGDPSLHGDVWSWLEFFLTSVFSALWVLPLFVLSKVVNAIWFQDIADLAFEVSGRKPHPFPSVSKIIADMLFNLLLQALFLLQGMFVSLFPIHLVGQLVSLLHMSLLYSLYCFEYRWFNKGVEMHQRLSNIERNWPYYFGFGLPLAFLTAMQSSYIIRVAMNQN	26462	36507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_26556_26647_26761_30428_30575_31676_31738_32910_32978_34063_34189_34494_34615_35078_35191_35655_35768_36274
823742	contig_8160_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_136402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCTGATAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48252	50281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_48300_50300
823744	contig_5400_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_162810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACTGAAGCCGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51656	132170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_51726_130480_130782_132139
823745	contig_5039_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_64875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	169	519	409494	409844	NA	20	TTTTTAAGGACATTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNKLHDTRSFNTPTPESPVTRKLLNNVDFNYLRSKDILGGSGWCRGARGVQWISTRLRTERWAVQTHQQFHRRKRWQSASVTITALETLWGSSTLSYRITMSQNPLDSNGFGLV	409325	410053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_409300_410100
823746	contig_19769_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_102340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	1413	1439	186836	186862	NA	25	TCTCTCTTTATAATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCGKAFSHSSNLIHHQRIHSGEKPYKCEECGKDFNRQSHLVQHQRIHSGERPYDCNDCGKAFSARLSLIQHQRIHTGEKPYGCNECGKSFSLNRTLIVHQRVHTGEKPYRCNECGKSFSQRSQVIQHKRIHTGEKPFNCNECGKSFSARLSLIQHQRIHTGEKPYGCNECGKTFSQKGHLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSFNLIHHQRTHNGEKPYECNECDKAFSVLSSLVQHQRVHNGEKPYECHKCGKAFSQGSHLIQHQRSHTGEKPYECNECGKTFGQISTLIKHERTHNGEKPYKCSDCGKAFTQSAHLIRHRRIHTGENPYECSDCGKAFNVRSSLIQHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQHSQFIQHQRIHTGEKPYVCNECEKSFSARLSLIQHKRIHTGEKPYECSECGKSFRQSSHLIRHQRIHSGEQPYTCNECGKTFSQRITLTSHEKIHKIHMREKSYKC	185423	187252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_185400_187300
823748	contig_6199_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_126360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAGTACATTAACTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137847	138355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_137800_138400
823749	contig_13496_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_107651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	967	1473	392747	393253	NA	75	AAGAAAGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLLPLTTFLSSSLIARSLRSLFNHEPTSLSFSNTAWPWVCSFTSCGSCLLPSVGTFECFSLNQSWGCHFVFCSRFCKCMPTRVSVYMCVRVYACALHVQIKSAPGSLADEAAVALTRWCTAVVNNFQSFHNICLLLWLWSPAGAVVKSSAANQNPPAAPWKPYSVL	391780	394339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_391800_394300
823753	contig_6340_pilon	+	1123	4	Intergenic	novelGene_176634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	3.39934634239519	56	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	16570	67127	FALSE	85	AGAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNFAVLVDLHVSPQGSNRDTSWFSEEKKEEVCLLLKEAIDSRVKEYLEVRKQHRPSNAEFTRSSPLSLKGYGFQITAYFLKRGIHLRCIRSSPRAELCVFPDRFVVCVSQLTF	16569	67905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_+_16660_21919_22041_64401_64480_67071
823754	contig_14727_pilon	+	775	5	Intergenic	novelGene_56630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	714.392880353661	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	142	651	47396	55271	FALSE	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	46590	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46731_47394_47469_51362_51531_54130_54263_55134
823755	contig_6870_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_104004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAAAAGGTCAACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537853	1536736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1536700_1537900
823757	contig_16211_pilon	-	1208	3	Intergenic	novelGene_150056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	427	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTAAGTCGAAAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86306	73423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73517_80384_80505_85311
823760	contig_6446_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_149246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582306	581097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_581100_582300
823762	contig_10003_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_88291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTCGTGGTGATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897064	896561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_896600_897100
823763	contig_10003_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_88290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACCCCACTGTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896076	895323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_895300_896100
823765	contig_7408_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_168755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTCTTATTAAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51090	51570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_51100_51600
823767	SIRV6	-	385	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-206	14	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCTTGCTTTACAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026	1530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1736_1846
823768	contig_1339_pilon	-	754	6	Intergenic	novelGene_163105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	52.1022072469104	48	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	214	690	164607	162104	FALSE	10	CTGGGAGTGACTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVIKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADVMMQALLGTRAKETFDLRAHLKQVKKEDTEKENRGVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG	166385	162039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_162188_162910_163088_163842_163933_164481_164614_165174_165217_166220
823769	SIRV4	-	490	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	124	3	-124	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	326	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGCTAGCGTTAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823770	contig_15474_pilon	-	837	3	Intergenic	novelGene_136234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	25	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	200	640	73894	70025	FALSE	15	ATGTGTGGCCCGAGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHSDTRDYICEFCARSFRTSSNLVIHRRIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHRRKHAETAAALLFPCEFCGKRFEKPDSVAAHRSKSHPAPLLGPQESSGPLNPSPSISIPGLLGSTEAPGAMQLGARPSVSPQAQALLPQK	74093	69827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_70350_70511_70612_73878
823771	contig_2940_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_81900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTAAAAAAGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452264	454497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_453255_453466_453577_453747_453872_454235
823772	contig_15857_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_152082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	262	339	143693	143770	NA	55	TACAAATACCATTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQGSSQFRRVEIQIQGAISRGDLLSLSALGEGSYLFSASIPWLLGDLHVAWHVSSLISAFFSQSNLLFLYLRGDWFETQPTLIWPLTMTKKKPISKCGYNHRYRGQDLQRNF	143431	143865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_143400_143900
823773	contig_7963_pilon	-	726	4	Intergenic	novelGene_58303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43725	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_39293_39370_39949_40185_43546
823776	contig_3233_pilon	-	1067	8	Intergenic	novelGene_56576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	83	553	747951	745312	TRUE	40	TACAGAACACAAGGGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLGRGGARTRPLGKGVGVEGNGIDVVVHGEEVPDVLSPKAGPTQGRGVPQLHQGEAGERVLSLHLSAMCQRQNETFLQQLPALPHRAHTQDGEANLPLEQDRVNLRQHGYNVSAQHLPSFPEDVPGEGVSLLSTWVSGKTQQTCIYQSPYTGG	748033	740576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_740676_740828_740913_741755_741904_742727_742857_745257_745368_746320_746423_746935_747014_747716
823778	contig_7171_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_101219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	969	1283	493083	492769	NA	20	CTGCCCCATAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVVGESLRRKKTSALSQSNSPKMSTSYKGRKQQCNGEPWQTPRNPVIPVSITGNKTPRHWELPAALRGACHSCDVLPDTAQPLSKTIAVELIPTHSDPTGQSR	494051	492767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_492800_494100
823781	contig_7056_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_43744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTGTCTGTTAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139803	1140432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1139800_1140400
823783	SIRV6	+	268	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	164	-215	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1500_1700
823785	contig_1143_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_86624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCAGATGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244807	1246572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1244800_1246600
823786	contig_18406_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_88053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGCAACACAACACTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59106	61133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_+_59100_61100
823787	contig_6494_pilon	-	417	5	Intergenic	novelGene_108576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	926.182757343279	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	30	416	8286	2113	FALSE	40	TAAAAGACACATGGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYRSPWQLDLEFGCCSVKTFNKIF	8315	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_5592_5660_6395_6490_6751_6883_8256
823790	contig_10857_pilon	+	1133	8	Intergenic	novelGene_160895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1243.11370094187	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3	578	58203	61960	TRUE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLCLRPVVEPQEEPGLEETEPRDLEELAQDPQGPAEAGEAEEERLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEHPPDLHRAAQHGRGQYKESVGDRRSADPVHIQGPLLQGYCRWRHEQEKPLGAERWLQDLINS	58200	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_58392_58782_58876_59617_59662_59830_59894_61391_61502_61883_61962_62094_62198_66447
823791	contig_4626_pilon	-	556	3	Intergenic	novelGene_158825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	392	junction_1	41	7507	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	113	502	176122	169756	FALSE	20	TAGTTTCTCTTTCTTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPKYNPSRLATLPATLDQAEYDVPPETRRAQAERLAIRSRLKREYLLQYNDPNRRGIIEDPALTRWTYARSANVYPNFRPTPKTSLLGALFGIGPLFFWFYVFKTDRDRKEKLIQEGKLDRTFNVSY	176234	169701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_-_169819_170998_171146_175942
823792	contig_15354_pilon	+	1324	3	Intergenic	novelGene_65705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAATGTCCGCCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132565	136492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_133697_134717_134839_136420
823795	contig_3463_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_62006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATACATTACTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511728	513072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_511700_513100
823796	SIRV6	+	375	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	359	566	186	24	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCAATCTGTATCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	1974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823797	contig_5954_pilon	-	1502	12	Intergenic	novelGene_28408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.2597957291925	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	71	715	41040	38145	TRUE	20	CCATCATGTCTAGCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPELPSPSQLQGPQGPPKHPLPRMAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVHSAQGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGQHLGGL	41645	16425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16659_24691_24725_35373_35535_35645_35721_36230_36317_36623_36708_38029_38200_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_41576
823798	contig_14621_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_105870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403960	402433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_402400_404000
823799	contig_567_pilon	+	438	4	Intergenic	novelGene_33989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	117.548098902345	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATGCTGTCTCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442607	458816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_452579_452651_455775_455862_458626
823800	contig_3822_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_133288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATTTCTTTTATACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187115	185715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_185700_187100
823803	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	539	0	373	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823806	SIRV7	+	402	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTATGCGAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	114805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
823807	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823811	contig_8057_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_176640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGGCCACAGAATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31972	33652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_+_32000_33700
823812	contig_7379_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_150015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAATAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448987	448702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_448700_449000
823813	contig_16103_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_118934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTCTGGCGTTCTTTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799176	800240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_799200_800200
823815	contig_5515_pilon	-	951	6	Intergenic	novelGene_52336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	507.934247713225	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	117	623	99142	67947	FALSE	40	ATTACCTAGACAACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATPAPPLIAATTTTTCLSAS	99258	67618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68004_75537_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
823816	SIRV6	+	375	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10721_10819_11031_11109_11205
823817	contig_6470_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_145609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATAAATAGAATTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032843	1033572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1032800_1033600
823818	contig_14225_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_52759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAGCTTTATGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448287	449699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_448300_449700
823819	contig_17493_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_122202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGCAAGGTCCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151658	151195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_151200_151700
823820	contig_6277_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_80383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30886	29195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_29200_30900
823821	contig_13744_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_77210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	558	875	1069506	1069189	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTRKVKGSMCCAHDADSLPPPAGGCCPDTQPRSTLRCQGSKPSGSRGPTHIPGRVPCSALAGDLAPCWYSASCHVVCTMVMASLSRHTAGPQHVAALVTEGTQG	1070063	1068047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1068000_1070100
823822	contig_9653_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_48229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGGTGCTCTTTGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612482	614548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_612500_614500
823823	contig_1093_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_139970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	742	1167	91933	95066	FALSE	30	CTGTAAAGTTTCTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNWELYTSVESSAYPDPRTSSSPSLMCSSCSGILSLSLSSSGFVSRYCLFSFRKTSSSPLSTRGTGENVPELVPGLSEVFQVLSQMLSDKPTELHKPADEMRWLGTLENSLLSEKADVAKSTGCLVSLFSPPVHNISTP	8105	95506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_8163_12015_12132_14005_14089_14209_14407_91644_92037_94744
823826	contig_5039_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_64942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTATACATCCCTAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475816	1477737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1475800_1477700
823827	contig_7806_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_157548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAGATCCCAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281200	283409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_281200_283400
823828	contig_17989_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_150852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGACAGCTAAGACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374387	373946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_373900_374400
823829	contig_7411_pilon	+	2321	3	Intergenic	novelGene_137007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	23	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	241	549	277182	279136	FALSE	20	TTTTTAATTGTGTTATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLPCQVASWNPVVAPQRDPGPSWSPQTLQCGLMGGTQPGVPVEKQTQFQVKEKAWKCSARGMAVRTGHCHPPQALRCLSISPLTQWVLTRLQVWLVSMTT	271302	280908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_271351_276989_277305_278950
823831	SIRV4	-	490	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	112	15	112	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGTATTACTTAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5046	3652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823832	contig_14225_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_52742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGAAGTAATTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203839	204325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_203800_204300
823833	contig_3602_pilon	-	1108	4	Intergenic	novelGene_60535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	39.89987468652	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	333	824	241592	238800	FALSE	20	AAACCCTATGGGGCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPTLTSASSLSPGQASLSISVSNSQIQENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQVQPLPLPPSSLVLPPPQ	241924	238515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_239016_239810_239918_241285_241359_241496
823834	contig_8594_pilon	-	1852	5	Intergenic	novelGene_140062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTCAGTACAGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537944	488131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_489454_496156_496236_517944_517982_534655_534921_537795
823835	contig_11285_pilon	-	977	8	Intergenic	novelGene_5697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408.830287627559	5	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	354	854	796496	784185	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPRRLWEKEDGQSFVSTAWPLVPGVGTAALRTRWYPSNVGLEPGPSAAHCLHRPQWQPLWVFIGLLQGQHVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSASSSGIARPWKRKMKRSDGALTPFQQEGGAVPTLPFTLH	798563	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784304_795432_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798349
823836	contig_16870_pilon	+	728	3	Intergenic	novelGene_155501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	5	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	74	421	104689	107688	FALSE	10	CCACTGCACCTCTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGARFGAWKGPKNPLLSHPWVSAELQAPPRGCRASACERVLGKCSIGKLDDLPRFTEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQQQLGEASSDATH	104520	107995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104578_104672_104864_107515
823838	contig_8795_pilon	-	1038	3	Intergenic	novelGene_146888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52.5	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTTTGTGATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201595	173000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_173759_175266_175398_201446
823841	contig_3122_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_64400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAATCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417258	418663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_417300_418700
823842	SIRV3	-	446	3	Genic_Genomic	SIRV3D	novel	161	1	NA	NA	-1956	597	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10344	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCATAGAACAATATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV3_-_4090_4566_4779_6569
823843	contig_13760_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_61278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCCAGCCTTTCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108716	110261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_108700_110300
823844	contig_177_pilon	-	457	4	Intergenic	novelGene_41793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.49691252107735	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGACCTCAGGATATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412425	392720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_392848_401720_401806_402945_403136_412370
823845	contig_177_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_41792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGAGAATAAACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390593	389535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_389500_390600
823846	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
823847	contig_14694_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_152483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAATATGGTATTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217815	219014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_217800_219000
823848	contig_5753_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_174316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATTCAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173772	174054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_173800_174100
823849	contig_5551_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_134213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAACATTCACAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41290	40327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_40300_41300
823850	contig_8552_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_80092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTACCTCCTTCCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523203	525255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_523200_525300
823851	contig_4769_pilon	-	1431	9	Intergenic	novelGene_118037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	20.4129248271775	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	607	1410	1583092	1410907	FALSE	30	AACATGGGGATTCAGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDMERHLKIHTGDKPHKCDVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTAAELDNDVPKPPCLSAESSDTQKAPATSLPSEAKEQTATLGERTFNCCYPGCHFKTVHGMKDLDRHLRIHTGDKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSVKPHKCHLCDYAAVDSSSLKKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTAFRFQYFVKEMYREMG	1604961	1410885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1410957_1532319_1532572_1544192_1544256_1544520_1544671_1578266_1578519_1583055_1583119_1585030_1585193_1600749_1600991_1604784
823852	contig_9515_pilon	-	1149	9	Intergenic	novelGene_73825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	72650	69390	TRUE	50	GGAAAGACAGAAGAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFRCRSCHRARCPARSSHQIRAARVEKG	72651	65864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_65901_66100_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68350_68729_68826_69344_69472_71794_71873_72459
823853	contig_6871_pilon	-	1949	14	Intergenic	novelGene_21662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	8.81902193721016	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	113	1591	784881	780734	FALSE	40	TGACAATAAAGACTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLSPPQLSSSPEDLCPTPGTPPGTPLPPSAPLSGEVNRSQPVPIPASRKFLDEELRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGTSSARGLLPRNASRPHVVKVYSEDEACRSVEVAAGATAHHVCEMLVQRAHALSDENWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKNPPHSLFPEKMVSSCLDANTSMSHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNMYMVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGMQLYKNYQQAQSRHLRPSCLGSPPLKKTNHRLSLPTPSSGSSLSAAIHRTQPWFHGHISREESQRLIRQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL	789369	780375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_780881_781101_781196_781300_781389_781511_781573_781977_782059_782347_782447_782687_782799_783319_783458_783737_783816_783907_784030_784141_784299_784469_784621_784729_784887_789262
823855	contig_10642_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_78652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATCAGTCAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135206	133097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_133100_135200
823856	contig_7171_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_101250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAATAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761401	761632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_761400_761600
823857	contig_13074_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_153456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629122	627538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_627500_629100
823858	contig_13992_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_147646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	6	425	564640	564221	NA	10	CGTCTTCCTTTCCAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMMNSRTLNFSPRSSDSVKLCIYIYDPSGVNFCMLCELRTSRALFFCTWLSNCASTFVAKIALSFLLNYLRTSVENQLSLHIHAFFPDSILSHWSTYLPFCQHHTVLTAAFKSQSRAVPALRLCSFSRLFRLLWVLCLSK	564645	563857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_563900_564600
823860	contig_11964_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_164726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCAAGTATAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246751	248409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_246800_248400
823861	contig_7416_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_134320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGTTGTCACATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85413	83873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_83900_85400
823862	contig_15937_pilon	-	417	4	Intergenic	novelGene_143139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2016.99319670532	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATTGGTTCTTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30551	28047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28324_29167_29246_29914_29960_30533
823865	contig_12626_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_80436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTCCCTTCCTTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130474	131731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_130500_131700
823866	contig_9955_pilon	-	911	6	Intergenic	novelGene_21348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	36.5327250557634	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	29	760	127957	86976	FALSE	40	AGGCTAAAAACTTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLHRYGHRMGSEFSPSVRACLPLCALVLETAFVLIFCFFTSYNDSANNQTLTQNSQVFQDITIMAALGLGFLTSSFPKNSWSSVAFNLFILAIGVQWAVLLDGFLNKFSSGKIVIELSSIQLATMSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	127985	86824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_109880_110029_113655_113807_118303_118491_127812
823869	contig_9363_pilon	-	1171	9	Intergenic	novelGene_6749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	574.836049995997	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	101	928	1548961	1505564	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVSSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDTIPSH	1549061	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505582_1539072_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546223_1546310_1547626_1547730_1548903
823870	contig_20716_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_176142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCTGGACTGGCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156700	158439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_156700_158400
823871	SIRV6	-	367	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1731_1843
823872	contig_13945_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_173462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAAGTCTTTGATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135436	137483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_135400_137500
823873	contig_20314_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_125649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGATAAGAGGAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19845	20334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_19800_20300
823874	contig_3465_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_173389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGGAGATACCAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543168	544287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_543200_544300
823875	contig_5602_pilon	-	1405	7	Intergenic	novelGene_133035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_5	56.5668238064995	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	25	765	594433	586468	TRUE	45	CTAAAGAAGAAGAGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPKVGVLMESVWNMNDSCRFQLRSPESLKSMEKASKTTEAKPENKQEPVKTEMGPPPSPASTCSDASSIASSASMPYKRRRSTPAPKEEEKVNEEQWSLREVVFVEDVKNVPVGKVLKVDGAYVAVKFPGTSSNTNCQSSSGSDADPSSLLQDCRLLRIDELQVVKTGGTPKVPDCFQRTPKKLCIPEKTEILAVNVDSKGVHAVLKTGNWVRYCIFDLATGKAEQENNFPTSSIAFLGQNERNVAIFTAGQV	594457	583044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_583241_586023_586629_586890_587003_587099_587244_588589_588703_591628_591739_594332
823876	contig_5718_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_110369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952326	953272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_952300_953300
823877	contig_10020_pilon	-	2131	2	Intergenic	novelGene_168287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACCGTCGGTGACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151320	147851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_-_147884_149221
823878	contig_10496_pilon	-	1866	11	Intergenic	novelGene_59425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.765871356152	1	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	38	1837	64679	38747	FALSE	15	GGAGCTTTTTGTTTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64716	38717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39100_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
823880	contig_6102_pilon	+	2178	4	Intergenic	novelGene_32400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	7.84573486395988	149	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	165	1310	1797356	1799351	FALSE	30	ATGCAACTCTATGCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACGGTCKNKVTVSKPVWDFLSKETPARLARLREEHRVAILIDGETSDIYVLQLSPQGPPPAPPNGLYLARKALKGLLKEAEKELKKAQRQGELMGCLAFGGGGEHPELHRPGPPPLRAAPLLPPGARGILPPPPPLPPPLPPRLREEAEEQESTCPICLGEIQNAKTLEKCRHSFCEGCITRALQVKKACPMCGRFYGQLVGNQPQNGRMLVSKDATLLLPSYEKYGTIVIQYVFPPGVQGAEHPNPGVRYPGTTRVAYLPDCPEGNKVLTLFRKAFDQRLTFTIGTSMTTGRPNVITWNDIHHKTSCTGGPQLCETPSFPFPKLLPLDACPLREQHHVHHSGSLLTGEDHPPNCSTICPIPLSLTFNLVLCAQLNLQK	1796657	1800219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1796725_1796915_1796993_1797335_1798085_1798934
823881	contig_21388_pilon	-	724	4	Intergenic	novelGene_136626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	909.827944662555	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	14	577	28487	21541	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALAETLWAWLGEHGQRRQRHQRLPVLHHYSQDVLARWQACGVWQSSRGHGCSPEGGEHQHRWSGQAPEGCDDHRLWQDRGGEALCHRQGVGPQGPLPFERPFVQPCCPRG	28500	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22455_27545_27649_28352
823883	contig_7272_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_25289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCACATGTATAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335402	333231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_333200_335400
823886	contig_17366_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_161115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGTATATATTTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4355	2976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17366_pilon_-_3000_4400
823887	SIRV7	-	346	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	4	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680
823888	contig_4754_pilon	+	999	4	Intergenic	novelGene_35907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	9.53356643071673	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAGAGTGAGATCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163126	167317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_163188_163715_163798_164269_164394_166585
823889	SIRV6	+	423	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	331	13	165	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
823891	contig_16870_pilon	+	350	4	Intergenic	novelGene_155476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	17.4547032821147	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACAGGAACAGGGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19865	21095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_19980_20509_20590_20828_20890_21000
823892	contig_16870_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_155480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAACATTTCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30839	31426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_30800_31400
823893	contig_17474_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_176648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGAAATTCTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10202	12143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17474_pilon_+_10200_12100
823894	contig_8273_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_113094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427899	429739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_427900_429700
823895	SIRV4	-	260	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1263	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3895	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
823900	contig_14537_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_158666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCCAAAGACAGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113459	115107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_113500_115100
823901	contig_14289_pilon	+	1129	5	Intergenic	novelGene_110563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	51428	51811	TRUE	0	TTCTTCTCTGCCCTCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLINQAACRPRSPAAADHSQGHSWPGSTVVSGSVPPQVHSLLADALPGDDADPQRVPSVHVPLGSGDKDIPHQAQGPVQRQWDVLHVLHVLKSNLERKRRESGLGEADSPTEERKSPSTWTACDPP	51425	66643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_52054_58617_58761_61216_61294_64647_64754_66468
823902	contig_5988_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_16056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAAGTGAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052405	1051488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1051500_1052400
823903	contig_10159_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_30798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTATGAGGAGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333175	333444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_333200_333400
823906	contig_11832_pilon	+	1017	4	Intergenic	novelGene_106952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	9.84321537348893	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	463	573	179251	179361	FALSE	25	AGGGAGGGTGTGCAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAAAVSEIAETAPSSGRRIWSSVQEPGNSGDEFRFPCYHWVEGDGVLSLPEGTGRTVVDDPQGLFKKHREEELEKRGKLYRWGNWKEGLILNVAGNKLCDLPADERFLEDKRIDFETSPAKGLADLAVKDCLNVLTCWKDLDDFNQIFWSGQSMLAGQSPHPTTFAGPLPLDPTQSRGIDRLGDQKPGP	178319	179805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_178483_178690_178773_178872_178996_179156
823907	contig_13699_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_158315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCCTGGTGGCACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44566	42689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_42700_44600
823908	contig_12852_pilon	+	1070	6	Intergenic	novelGene_141454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_4	91.4789593294546	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	282	1070	561405	573125	FALSE	20	TACTTTGACTTCTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKWKKTCCLPSFVLVLFIFACIIAGITLLAIFRVDSKHLTVNAVLISVASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLNSQRKRLHSAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDGFTQNQTRLVVIIDGLDACEQDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHLPVFLNSRGLSSARKFLVTSATNGDIPCSDPAGIQEDSDRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNRRDTYRRRQIQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISFNWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGVPDQMTLKTIYER	561123	573125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_561411_562499_562641_563421_563666_563833_563923_565488_565634_572961
823909	contig_13048_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_138910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTTTAAAACCAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286078	288125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_286100_288100
823911	contig_14353_pilon	-	957	6	Intergenic	novelGene_82152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	150.713503044684	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	82	777	419972	407004	FALSE	0	TCTTTCTTTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSRTIGELLAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGKLLLNLVDHTEVVRDLTFAPDGSLILVSASRDKTLRVWDLKDDGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVVAAILV	420053	406823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_407028_407877_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415447_419968
823912	contig_12019_pilon	+	655	4	Intergenic	novelGene_87795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1334.61013866306	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	221	622	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTLRRTNASRAPSGWHRSDPTQPSVPPCLSSPFQAPAEPEAGLKSTPRPKFSVCVLGDQQHCDEAKAVDIPHMDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	765380	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765510_765772_765922_766639_766813_767133
823913	contig_12886_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_135445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAGGAAGAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225668	224535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_224500_225700
823915	contig_5423_pilon	+	1579	5	Intergenic	novelGene_85303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	84.0505800098964	76	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	89	547	765725	778935	FALSE	65	AGAAAAGTTAAATAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSGRSASRLRSERRLSGLRARPEAVSVTMAMTAGTTPTFPMSNHTRERVTVAKLTLENFYSNLILQHEERETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKADMLEKEQVCVFNTCNPKDHNDLIYFQNL	710164	779967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_710242_765713_765859_772687_772740_778415_778539_778785
823916	contig_2367_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_65310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGATTTAAACAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150678	149928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_149900_150700
823917	contig_11631_pilon	+	701	6	Intergenic	novelGene_104210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_1	465.209200252961	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	50	700	260386	281462	FALSE	20	GAGGAAGTTTCATGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLG	260336	281463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390
823918	contig_3077_pilon	+	1196	3	Intergenic	novelGene_26885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	6	189	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	585	1049	1358354	1358818	FALSE	5	TTGGGGGGCTGTATGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGLVRIWEGGILERRREMQGGLRASSDEERWSWQVGQVPAWALVAVPTSRWFPPLSLACPCRAGMPQAAGSLQRHLLCPSLGRAARHTQVPRPPGLRSRKPVSLQPRQPPSCPAPSPSLHGPPHFLFSFCRVAQGENSAWGVGSLGFVFLFV	1356997	1358965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1357017_1357255_1357327_1357859
823920	SIRV4	-	411	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1112	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4046	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
823921	contig_2069_pilon	+	675	5	Intergenic	novelGene_23233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	24.1039415863879	833	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	131	553	291743	294144	FALSE	15	CTTTGTCTTTCCGTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLASASSISRSRAERFFLLLPPRSSSLSAAFPGPAAKPVRGATMRQKVVSLFLCYLLLFTCGGVEAGQSKRPDKSEARSKDSGSGFWGALPYMVAGGGLMVAALPLVGFTGAGIAANSVAAWMMSWSAVMNGGGVPAGGLVATLQSLGAGGGGSALMAKVGAGLGYVAHKTLASGKEEENDEE	290372	294266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_290442_291681_291813_292393_292487_292589_292740_294034
823922	contig_6302_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_171716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTTATTAAATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567563	565540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_565500_567600
823923	scaffold_880_pilon	+	1596	2	Intergenic	novelGene_121505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	622	junction_1	0	23	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	683	1102	556500	557726	FALSE	35	TCCCAGAATAGAGCAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVVLLPLFPRGGLYETVNEVYKLVIPILEAHRDFRKLTSTHSKLQKAFDSIINKGHKRMFGTYFRVGFYGSKFGDLDEQEFVYKEPAITKLPEISHRLEVSKVACALDNVYFTINRVEWLIRGCLTKCKSWLHHWPT	555817	558220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_556668_557474
823925	contig_12081_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_166966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTATCAAACCCAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14813	13520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_-_13500_14800
823926	contig_21027_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_127567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	59	400	1729	2070	NA	30	CCCACATCCCCGTCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSFALPWSQDGNLKVSPQPPNLSNPSPVPFRGCLRPRSTKTVQDANLQVRLTQRRWGWMAREWGLAELPWGHWALQVWRLGFGLERGTCDSRKRRPHTRSSGLVFQNIPAA	1670	3062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1700_3100
823927	contig_9188_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_175725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	82	1170	31941	33029	FALSE	25	TTTTAATAAAGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMHVFDYSEPANFSDISWPCNSSDCIGVDSVLCPVMPHKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVNIQAKTTGYDMHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKITHLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTSSCRKKMVRRLVCVLVWLLAFCVSLPDTYYLKTVTLAANNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVILGFAVPFSVIAVFYFLLARAISASGDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHAAVLLDIFSVLHYIPFTCQMENFLFTALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYKYELMKAFIFKYSAKTGLAKLIDASRVSETEYSALEQNAK	7912	33812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_+_7968_31914
823928	contig_10437_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_38462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACATCTATAACTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102392	1103426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1102400_1103400
823931	contig_12964_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_131738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTATAGGACAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649608	648564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_648600_649600
823933	SIRV2	-	306	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4563	38	3388	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
823934	contig_12411_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_145676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTTTTAAAAGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279412	280547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_279400_280500
823935	contig_20487_pilon	-	931	9	Intergenic	novelGene_154383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	127.735077406326	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	73	687	22178	13795	TRUE	25	CAGTGTGTTGCAGTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPLPKLLAATTPARSRRVLLPLLLLLLPTGALRGWEAEERPRTREEECHFYAGGQVYPGEPSRVSVADHSLHLSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFRSINTEVVACSIDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIR	22250	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8409_8648_8696_12726_12762_13744_13802_13863_13876_15072_15196_17370_17488_18175_18294_21940
823936	SIRV6	+	469	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	805	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
823937	contig_4402_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_140822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAGGATAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444403	443657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_443700_444400
823938	contig_5954_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_28811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAGAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508079	1509322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1508100_1509300
823939	contig_18189_pilon	-	1115	2	Intergenic	novelGene_170757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	664	junction_1	0	266	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGGCTCCCGTGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53114	51915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_52114_52197
823941	contig_9437_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_141734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGAGCTTCCTACTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294451	294778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_294500_294800
823942	contig_9437_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_141735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGGTTCTAGGTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296811	297466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_296800_297500
823944	contig_12520_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_161083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGAATAAAGAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569202	568197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_568200_569200
823946	contig_8616_pilon	-	690	8	Intergenic	novelGene_72456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	56.5627699001341	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGAAGTGTTATCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274329	271062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271276_271486_271521_271722_271795_271904_271971_272093_272145_272904_272998_274035_274150_274282
823947	SIRV6	+	198	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	522	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11099_11205
823948	contig_15206_pilon	+	854	5	Intergenic	novelGene_175718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	24.0559244262198	747	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	31	789	10298	13758	FALSE	10	GTGAAGGGCTGGTGTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDLGSFPHKMQLLVLLLAFLLAPEAETGEIIGGHEARPHSHPYMAFLQFWKQKEKKRCGGFLIREDFVLTAAHCWGSSINVTLGAHNIKEQEKTQQHIPVRRAIRHPDYNEKTISNDIMLLQLETEAQRMAAVRPIRLPGKKAQVRPGQVCSVAGWGQVAPMDKYAATLQEVALTVQEDKKCESYFNNYSSDSEVCVGDPKKKMASFKGDSGGPLVCNNMAQGIVSYGRKDGTSPRVFTKVSSFLLWIKETMKHLQLQESD	10267	13823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15206_pilon_+_10353_11400_11549_12178_12315_12520_12779_13596
823949	contig_14454_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_161869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAGTCTAAGAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26024	27533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14454_pilon_+_26000_27500
823953	contig_12624_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_60975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCACACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66555	67693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66600_67700
823954	contig_6410_pilon	+	783	2	Intergenic	novelGene_108633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAGAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306425	310523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_306947_310261
823955	contig_15400_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_175701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACATAAGTCGAATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11009	12024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_+_11000_12000
823956	SIRV4	-	604	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	15	-2	15	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5143	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
823959	SIRV6	+	362	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	511	0	345	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
823960	contig_10324_pilon	+	463	5	Intergenic	novelGene_7851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	66	junction_1	47.3939605857118	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	70	462	331306	339760	FALSE	25	TGGCCAAGTCTGTCAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGILSFFAAQAGARKIYAVEASTMAQHAEVLVKSNNLTDRIVVIPGKVEEVSLPEQVDIIISEPMGYMLFNERMLESYLHAKKYLKPSGNMFPTIGDVHLAPFTDEQLYMEQFTKANFWYQPSFHGVDLSALRGAAVDEYFRQPVVDTFDIRIL	331236	339761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_331324_332591_332770_335157_335249_335459_335542_339736
823962	contig_5419_pilon	-	1077	9	Intergenic	novelGene_15471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	63.6901680010345	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	9	836	79704	70320	TRUE	35	TGAGAATGTCCAGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESEYESVLCVKPDVSVYRIPPRASNRGYRASDWKLDQPDWTGRLRITSKGKIAYIKLEDKVSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSRYFVIRIQDGTGRSAFIGIGFTDRGDAFDFNVSLQDHFKWVKQESEISKESQEMDTRPKLDLGFKEGQTIKLSIGSITTKKGGASKPRTAGPGGLSLLPPPPGGKITIPPPSSSVAISNHVTPPPIPKSNHGGSDADILLDLDSPAPVITPAPAPVSASNDLWGDFSTASSSVSNQAPQPSNWVQF	79712	66359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_66528_70246_70369_70693_70797_72459_72644_72723_72833_73654_73737_74407_74513_74670_74772_79609
823963	contig_4845_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_53713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGTTGAAAACAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012613	1014351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1012600_1014400
823964	SIRV6	+	529	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	45	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
823968	contig_10023_pilon	-	2064	2	Intergenic	novelGene_123526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	23	736	501222	499083	FALSE	50	CATGAAAATAAGCAGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPVFAKMAQLLNSILTVIKVFQEHAKENGDCASLCKKELKQLLLAEFGDILRRPNDPETVKTILSILDRDSNGCVDFHEYLLLVFQLVQACYHKRDIESCGDRTSQQEEGQEGAQDHKFPRNRGRQQRHRQEEERQDSHHGQSERQDRDYRHGQSERQDQDFCYSQSERQDQDSRFSQSERQDQDSRFSQSERQDQNSCHGQSERQDQDSCYSQSERQDQDSCHGQSERQDQESHYGQSEGQG	501244	497754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_499659_501084
823971	contig_7057_pilon	+	1359	8	Intergenic	novelGene_123209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	57.2538208331985	162	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	324	1097	532221	533605	FALSE	5	GACGCGGCCTTCCTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQERPSLLPPPDSGPPRVPDGPPDLLLESQWHHYSGEASSSEEEPPSPEDKENQAPKRAGPHLRFEISSEDGFSVEAESLEGAWRTLIEKVQEARGHARLRHLSFSGMSGARLLGIHHDAVIFLAEQLPGAQRCQHYKFRYHQQGEGQEEPPLNPHGAARAEVYLRKCTFDMFNFLASQHRVLPEGAACDEEEDEVQLRSTRRATSLELPMAMRFRHLKKTSKEAVGVYRSAIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYSGIVIRSVLTDKREKFYDGKGIGCYMFRMDDFDVVDATMHGNAARFINHSCEPNCFSRVIHVEGQKHIVIFALRRILRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKRCRRFLN	527980	533867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_528089_531820_531959_532045_532121_532218_532397_532680_532789_532906_532991_533108_533239_533329
823972	contig_2703_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_101852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCCTTCATTAACTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393084	1392203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1392200_1393100
823974	contig_2703_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_101851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391590	1390617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1390600_1391600
823976	contig_7513_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_88997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	288	326	574687	574725	NA	20	TACAGCACTTGCTTGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LICAIAFYRRENRGSRRWALDQLLPHRVHPTLFFLPELNRLSQPCGNIEEPSERRKSPHPGSELWGFLRALFTSRPRVDVTLSSVTRRELPQSSVMSCGHTSLVTRF	574399	576345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_574400_576300
823977	contig_10093_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_147511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACTAGACTTTAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106893	105205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_105200_106900
823978	contig_3269_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_117033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGAGCCCACTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184787	185300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_184800_185300
823982	contig_5696_pilon	-	902	8	Intergenic	novelGene_117516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	7.59161728890653	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	32	901	404478	372781	FALSE	25	GTTCCTGCGCCAAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPYDKAGIWLMSKVVRSSCESEVQIWETEEDDMTEGDLGYGLGRRPGGIYDVEVSHLFTSRKRSARKILSPPPSPRKGEESSGAIFQYSKHKSLQDAYPQGPRIPSYRRQCSTDSNSELSNVELRQRLHETLEEVEVLKTELEACQRQLEGKEEALKILQSLAVLGKATGHTQAVLQKTVEQKRSLEKEINALQWEIEFDQNRFKNIEESWTQKCDRLNCENAVLKETLKLKTEEIKMLKSENAILNQQYLETLAMLDIKQQKMAQENMCHSKSSCFTEVSALELAVLGACLCHGPGGSP	404509	372779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_372829_376242_376362_387945_388029_389644_389731_390435_390514_400964_401052_401820_401880_404168
823983	contig_5696_pilon	-	735	2	Intergenic	novelGene_117515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	56	379	366858	365512	FALSE	45	TTGATCTTAAGAAGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSSKKTEDQDNPQEVFKMLIDLLNDKEEALAHQRKVSYMLARALEDKDTASKQNKEKNAMKETFPFKKPWHKTSELSAVHDPICSNVQMFNSMGCICSAQHPQTDQNYTRTLKKSRSLPSDIIF	366913	365155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_365821_366843
823984	contig_8576_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_88766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGTTGTGGAAAGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751678	752978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_751700_753000
823986	contig_8330_pilon	-	906	8	Intergenic	novelGene_71983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	325.149196523688	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	21	419	2066383	2052327	TRUE	40	GAACAGACTGCACAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPFLQMKMAQRRVMIWPQLGKQLPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEENAILMKQIEIRNVT	2066403	2038946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2039000_2039656_2039897_2040609_2040682_2051201_2051234_2052236_2052370_2055977_2056187_2057892_2057985_2066328
823987	contig_11832_pilon	+	577	3	Intergenic	novelGene_106967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	855	junction_2	247	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAAGCCTTGTGTCCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461912	463584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_462080_462773_462851_463251
823988	contig_6375_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_73053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCTCTATACCCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539884	540345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_539900_540300
823989	contig_12098_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_160666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTCAGTTCTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111566	112334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_111600_112300
823990	contig_12098_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_160667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAACAGTTAACAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113589	114073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_113600_114100
823991	contig_15498_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_42700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAGGAAGAAGTAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882356	881908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_881900_882400
823993	contig_12032_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_139259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATGTGTGTAAGGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86799	88715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_+_86800_88700
823995	contig_15706_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_172039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTGATTAAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74255	76091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_74300_76100
823998	contig_13481_pilon	-	1191	4	Intergenic	novelGene_119392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	10	303	536852	527468	TRUE	25	GATGAGTTTAATGTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536861	526362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
823999	contig_6446_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_149272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTGCAACATTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824966	826006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_825000_826000
824001	contig_7080_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_100105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475162	473998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_474000_475200
824002	contig_7391_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_112171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	331	711	467186	466806	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIWWWCLRGGRRTKETSTFFCKHLGAFLPRVRQGPLTQLPHLWQYLSSYGLLKAFPWPLTSLLGSLCLSRRFSSVRSLLRRPLTNSPWKTCTFAVPSRKVQLSSIAASSLGHQQGAAAGTASSL	467516	466043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_466000_467500
824006	contig_3700_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_138086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	260	391	260866	260735	FALSE	50	TGGAAAGAGAAGAATGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRGPGDCQPCGPPPWHPEPPPAVPARRAGVHEKICTKSCRAGIIHEEGAGSVGQRTQDHFAIPRQKCRECGLTITSVFFCQKNEFKMSWQRPHAKQWYLLSQTLCSKLEGCLSYTSHAKLGLTFCCCAH	407505	260167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_260927_264736_264850_407419
824007	contig_9027_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_156350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41695	41263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_41300_41700
824010	contig_19237_pilon	+	501	2	Intergenic	novelGene_162957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	0	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	15	311	23905	28668	FALSE	35	ATTCAATTTGTTAAGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRKMAAAAELLLLEKSLGLSKGNKYSAQGERQIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVKQANKEYLLGSTPEEKAVVQQWLEYRVTQVDGHASKDDVRTLLKVL	23890	28858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458
824014	contig_7234_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_145963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATTATTGCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548038	546872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_546900_548000
824016	contig_20609_pilon	+	971	10	Intergenic	novelGene_118477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	82.103066813895	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	6	827	43732	59181	FALSE	5	TGCCTGCTACTGCCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAVNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKVGGGE	43726	59325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56544_59162
824017	contig_9609_pilon	+	1071	3	Intergenic	novelGene_23146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	147	815	524600	526455	FALSE	25	TCAGCACTGGCATTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVETESHIYQALRTASGAAAHLVALGFTIFVAVLARPGSSLFSWHPVLMSLAFSFLMTEALLVFSPESSLLRSLSRKGRARCHWVLQLLALLCALLGLSLVILHKEQQSKAHLATWHGRAGLLAVLWAGLQCSGGVGLLYPKLLPRWPLAKLKLYHATSGLVGYLLGSASLLLGMYSLWFTATVTGGAWYLAVLCPVLTSLVIMNQVSNAYLYRKRIQP	524453	526711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_524727_525205_525244_525951
824018	contig_1146_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_84830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAGTTTTAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866455	866852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_866500_866900
824021	contig_3018_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_78951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378885	1381126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1378900_1381100
824022	contig_8673_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_129914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATATAGAATTCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232734	232271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_232300_232700
824024	contig_6137_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_59137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAACCTACCAGCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916406	915538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_915500_916400
824027	contig_1274_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_137791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113444	112039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_112000_113400
824029	contig_4364_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_3396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533285	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
824030	contig_3956_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_14742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGAGGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615144	612824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_612800_615100
824032	contig_10658_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_130084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCATTCTGGTTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261985	262702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_262000_262700
824034	contig_7979_pilon	+	1439	6	Intergenic	novelGene_125545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061113	1081158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1061614_1065029_1065230_1077635_1077742_1078315_1078484_1080366_1080444_1080770
824037	contig_10057_pilon	-	547	5	Intergenic	novelGene_162344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	410	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	23	547	64936	35453	FALSE	65	GCAGCAAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSK	64958	35452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
824038	contig_13547_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_104850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTATTTTTCCTAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4035	5704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_4000_5700
824040	contig_8589_pilon	-	1040	6	Intergenic	novelGene_107365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	50.0615621010771	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	46	825	286339	245363	FALSE	50	AAAAACTGAAAGATTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIEIDFLQKKSIDSNPYDTDKMAAEFIQQFNNQAFSVGQQLVFSFNDKLFGLLVKDIEAMDPSILKGETSTGKRQKIEVGLVVGNSQVAFEKAENSSLNLIGKAKTKENRQSIINPDWNFEKMGIGGLDKEFSDIFRRAFASRVFPPEIVEQMGCKHVKGILLYGPPGCGKTLLARQIGKMLNAREPKVVNGPEILNKYVGESEANIRKLFADAEEEQRRKYIIHSSVLEFEKIPVGYHHLKLQNLSVYLFDQFHHLH	286384	245147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_245480_246824_247025_279373_279530_282112_282189_282692_282801_286216
824041	SIRV3	-	326	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	284	7	284	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCATAATTTTATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1698	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
824043	contig_14686_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_88063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATGAATCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39819	37916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_37900_39800
824044	SIRV6	+	461	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1843
824045	contig_7887_pilon	-	773	3	Intergenic	novelGene_124918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTTCTCTAATTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558899	555226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_555749_556379_556508_558776
824047	contig_15491_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_75995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTTTTAATAAAAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260162	258333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_258300_260200
824048	contig_5613_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_176652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATACCGCAAGTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46356	45816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5613_pilon_-_45800_46400
824050	contig_15093_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_143298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAAATGTTAGTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83033	82239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_82200_83000
824052	SIRV6	+	335	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	538	0	372	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824053	contig_8866_pilon	-	2504	1	Intergenic	novelGene_77876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916793	914289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_914300_916800
824054	contig_12644_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_44453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGGTTAGCAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359511	358464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_358500_359500
824056	SIRV7	+	218	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGACTGTTCGTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	78902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56093_70881_70987_78840
824057	contig_9683_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_151275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	424	564	468867	468727	NA	40	ATTTGTTTTTAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAERLREKAGQLDAEVAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRAELQQERRRGEEQRDSFDGERQAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEPAPCICLEEITATEI	469290	468067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_468100_469300
824060	contig_9195_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_155668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAGTAGGAGAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20730	20296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_20300_20700
824063	contig_10135_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_106629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	994	1347	88066	87713	NA	25	CTGGAGGGAAGTGAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLGEFRRKETVKERAGCGGRRLGQAWGGKSGT	89059	87368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_87400_89100
824064	contig_10196_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_132040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTCAGGACAATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635124	636002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_635100_636000
824068	contig_5428_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_160406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACCCATTCAGCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49709	48435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_48400_49700
824070	contig_10437_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_38365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGTTGAGTTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559737	560455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_559700_560500
824071	contig_3832_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_161477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436433	437586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_436400_437600
824072	contig_6842_pilon	-	1321	11	Intergenic	novelGene_130729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	24.320567427591	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	652	1038	530536	527055	FALSE	25	CATCAGTTGCTTGGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRALNILQSTNMAFGKVTEETVYTCTGHPLKSDIANILDWMLNQDFTTAYRNIMELKTLKGLALHDILTEIHLFVHRVDFPSSVRIHLLIKMADIEYRLSLGTSEKIQLSSLIAAFQVTRDLIVAQA	536927	526771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_527152_528255_528311_529364_529443_529978_530109_530509_530592_531310_531473_532659_532734_533361_533420_534671_534736_535005_535071_536754
824075	contig_17198_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_62369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGACTGCAATTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818085	816032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_816000_818100
824084	contig_10246_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_46921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCCCAGACTGAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191162	192255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_191200_192300
824085	contig_15882_pilon	-	394	3	Intergenic	novelGene_144820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	19.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	79	393	578573	577911	FALSE	30	TGAGTGGAGCGGGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAQAPPGSGSPFEHSVARAQRQAGRMSTSAGTADGGELAPVAAQPTHIDVHIHQESALAKLLLAVGSQLRTWARPKGTATQAPGSSRLLVASWVTQIVLGILSGVLGGFLYIFRYSHLLDSGAAIWTGVV	579447	577909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_578022_578369_578579_579374
824086	contig_11364_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_65179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTGCCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164720	164279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_164300_164700
824087	contig_6546_pilon	+	395	4	Intergenic	novelGene_140991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	14	358	597703	599657	FALSE	15	TTGCAGCTGTTGATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSRAMASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597689	599694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
824088	contig_4803_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_150723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAACCAGAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52728	51441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_51400_52700
824089	contig_17344_pilon	-	931	4	Intergenic	novelGene_169585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	19.6694913225759	417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	44	862	47692	46054	FALSE	15	GAAGCAGCTTCTTTCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVLLTLAVLFLPGSQARYFWQQDVPQTPWNRVKDLVTIYLDAIKDSGRDYVSQFETSALGKQLNLKLLENWDTVSSSFTRLQEEIGPVTQQFWDNLEKDTVHLRELMNKDLEEVKQKVQPFLDDFQKKWQEEVALYSQMGPLGEELRDSARQKLQELQEKLSPVAQELRDRVRVRVDELRTQLTPYSEELRQRLARRLETLKESNLANYHTKAMEQLSALGEKTKPVLEDFRQGLLPVLESLKVSFQTAIDEATKKLKASEGPAAAAPSA	47958	45984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_46676_47302_47457_47649_47713_47935
824091	contig_4151_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_65209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAATAAGGGTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110637	111700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_110600_111700
824093	contig_11372_pilon	-	643	3	Intergenic	novelGene_176660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_2	7.5	1704	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	81	470	671479	664596	FALSE	35	GAAACAGTTGTATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKVSSSVLKAAAHHYGAQCDKPNKEFMLCRWEEKDPRRCLEEGKLVNQCALDFFRQIKRHCAEPFTEYWTCIDYSSLQLFRHCRKQQAKFDECVLDKLGWVRPDLGELSKVTKVKTNRPLPENPYHSRPRPEPNPEIEGDLKPAKHGSRLFFWTM	671559	664422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_-_664734_668367_668534_671393
824097	contig_2455_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_119205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301109	1301966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1301100_1302000
824100	contig_1339_pilon	-	1457	11	Intergenic	novelGene_163099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	34.9491058540845	132	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	199	603	119259	117773	TRUE	10	CGCTCAGTGACTTCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEAEKAAGKSPEPEKPSLQILDPPRRPRVPGVENSEGPAQRAEAPDGQGQGPQAAREHHEVSKERRGPAEGEEAELAERSLESSTSDSGPTSGRQRPPAGPPPKPQARVQGAGWRFSEAVRRAASGKRAAA	119900	116180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_116869_116987_117039_117257_117309_117708_117814_118468_118573_118660_118702_118819_118906_119056_119118_119187_119313_119567_119659_119846
824101	contig_3068_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_137643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTCTGAAACTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260920	261529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_260900_261500
824102	contig_19604_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_77221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAGCAAGAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92221	93388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_92200_93400
824103	contig_1406_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_25484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCTTTTTTTTTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313474	1311709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1311700_1313500
824106	contig_20356_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_159538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTGGGAATTCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71981	72492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_72000_72500
824107	contig_1406_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_25670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGTTAGCAGTTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2825666	2826867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2825700_2826900
824109	contig_4392_pilon	+	947	8	Intergenic	novelGene_117284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_5	34.348751574022	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	45	947	55259	87201	FALSE	25	TCGGCTGATCAGACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIKYDEYPESGTLEMNVKDLRPRARTTLKWNELNVGDVVMVNYNVESPGERGFWFDAEITTLKTISRTKRELRAKIFLGGSEGTLNDCRIIFTDEIFKIEKPGAHPLSLADGKFLRKNDPECDLCGGDPDKKCQSCSCHVCGGKQEPNMQLLCDECNMAFHIYCLNPPLDKIPEEEYWYCPSCKTDSSEVVKAGERLKMSKKKAKMPSASTESRRDWGRGMACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHGRSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAP	33044	87201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_33064_55233_55453_68590_68701_69804_69992_74507_74632_74852_74961_79382_79488_87126
824111	contig_3832_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_161499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAAGTAAGTAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503626	502914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_502900_503600
824112	contig_5050_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_110290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	514	984	608795	609265	NA	10	TACGGGGCAGTTCTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGARRNQAATAGPATADSDRECCVGFTSTAGMGMPDEDSGEDLRGELAWPAEDHLQPSFLKSTPALHVEGGRRRRPGPSLFSLSLSLSVLSAQEPVTRRPEDLLSVPREGSTPLTTIPAQRAGHCARPSLRISFTSLTSERQSGLAEHGLWSQMG	608281	609499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_608300_609500
824113	contig_9463_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_83850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATGGAAGATGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223427	222821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_222800_223400
824116	contig_10042_pilon	+	2129	13	Intergenic	novelGene_79225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	208.741067673166	1	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	550	1410	1112027	1139987	FALSE	40	AAACAACTTATTTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHQNVELFKELSINVMKQLIGSSNLFVMQVEMDVYTALKKWMFLQLVPSWNGSLKQLLTETDVWFSKRRKDFEGMAFLETEQGKPFVSVFRHLRLQYIISDLASARIIEQDSLVPSEWLSSVYKQQWLAMLRAEQDSEVGPQEINKEELEGHSMRCGRKLAKDGEYCWRWTGFNFGFDLLVTYTNRYIIFKRNTLNQPCSGSVSLQPRRSIAFRLRLASFDSNGKLICSRTTGYQILTLEKDQEQVVMNLDSRLLIFPLYICCNFLYISPEKRIENNRHPENPEN	1094954	1140706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1095157_1105095_1105220_1107155_1107253_1108989_1109088_1111998_1112065_1115829_1115915_1117491_1117583_1118643_1118782_1129053_1129124_1131831_1131908_1135430_1135577_1136612_1136701_1139858
824117	contig_2636_pilon	-	925	3	Intergenic	novelGene_52071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	47.5	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	127	654	62741	59826	FALSE	35	GTCAAGAAGTCATGGATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPSSPKQIFPLVLNFNIMSTLKITLLMLCLYVLLPNTGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	62867	59554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471
824118	contig_7963_pilon	-	942	6	Intergenic	novelGene_58338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1023.6	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAATGTTGTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48891	38331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38568_39276_39405_39949_40227_43546_43640_44586_44613_48709
824120	contig_5451_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_167184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648360	646230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_646200_648400
824121	contig_10861_pilon	+	733	3	Intergenic	novelGene_39375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.5	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTCTGTAATCTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685836	1687450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1685979_1686311_1686409_1686956
824122	contig_1406_pilon	+	1919	5	Intergenic	novelGene_25654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	10.1118742080783	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	157	765	2778873	2791476	FALSE	30	AATGTGTGTAGATTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFKNGGAYLSSTNHLLRPSPLPKLWLGGAPLHPRGADQPEGWAFRSEPAPSAMASRGVVGLFLLFALPVLCLELRRGIPDLGIKDLILLCGRIFLLLGLLTLIISVTTSWLNSFKCSRVYLKDEEEEENEKRQKLVRKKQQEAQGEKASRYLENVLKPHQEMKLKKLEERFYQMTGETWKLSNGHKLGGDEDLLLDNASQTSFETANREAAKRRNLPKPVTKVSPPAEQPPQKKVRYGMPPHGIVSVCCGGIVL	2778716	2792630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2778961_2783752_2783876_2786024_2786099_2789060_2789184_2791275
824123	SIRV2	-	268	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	648	32	648	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGGTAATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4084	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
824124	contig_8259_pilon	+	1031	4	Intergenic	novelGene_148855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	109.259121154966	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATTTCTTTGTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53099	64581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_53172_57922_57986_62754_62830_63760
824126	contig_7549_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_164532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAAATTGACTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703594	705616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_703600_705600
824128	contig_5936_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_53563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181819	181181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_181200_181800
824129	contig_11115_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_102875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGTCCCAGGAATATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237272	236271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_236300_237300
824132	contig_3942_pilon	+	402	4	Intergenic	novelGene_128644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1401.20051701706	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	96	350	179125	180067	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGGRYSRSPPLRVKNFGIWLRYDSRSGTHNMYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHDSKIKFPLPHRVLRRQHKPRFTTKWPNTFF	176954	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_179040_179177_179714_179825_179974
824135	contig_13700_pilon	+	1858	1	Intergenic	novelGene_68296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTATATTGTGGTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153016	154874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_153000_154900
824136	SIRV6	+	385	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	401	514	228	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1531	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824138	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824139	contig_12635_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_60823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCTGGAAAAGAACGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196610	194713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_194700_196600
824140	contig_7279_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_145993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCCAGCCAGAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194639	193808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_-_193800_194600
824141	scaffold_13505_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_111672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	544.138666967244	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	81	377	904535	897217	TRUE	35	GCAAGGACGCAGGGACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRKGLRGTEPWEARPGSGAAPRARAMDVRRLKVNELREELQRRGLVTRGLKADLAERLQAALEAEEPDDEPGRPGHSNEEMSWTILPGRTNSTRARSSSKRTSQATRGDHWKWSRSSRPIAQK	904615	869654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870261_897200_897223_900568_900695_904370
824142	contig_10017_pilon	+	892	7	Intergenic	novelGene_156980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	2.74873708374511	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	360	857	279668	288691	FALSE	10	CTCTGGACCTCCACCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLSPPEERPAALGRLGFCFGVGIIFGSLLGGTLSTTCGIQCPPLVGLTANLLGAILSFIFIPANTKGASADTQAAPPGGPKASVFDLKAITRLLLLPGVLPIFLIKVISGFPSGLFQIMFSIIAMDFFQLEAAQTGYLMSYFGVLQMVIQGLVIGRLSNHFSEGALLQASVLAFAVTGLAMALMSNVFHFCLVVPGLVFSLCTLNVVTDSLLTKAVSASDTGTMLGLCASVQPLTRTMGPTLGSLLYHSFGVAVFGHVQAAVNLLVLLALWRKPVPEKRDKLR	266934	288726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_267053_275822_275942_276554_276663_279653_279755_285915_286018_286278_286400_288503
824145	contig_4659_pilon	-	341	3	Intergenic	novelGene_118166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1327	junction_1	9	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTAGCTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91130	87448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87670_90900_90924_91033
824146	contig_8375_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_141280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCAAAAATAGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66560	68533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_66600_68500
824147	contig_5797_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_56920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGCAGGGGAGAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194851	195726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_194900_195700
824148	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	882	-30	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
824149	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
824150	contig_2646_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_69693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCACTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2386572	2384280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2384300_2386600
824151	contig_3151_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_139196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCAAAGTATACACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240970	239007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_239000_241000
824152	contig_7057_pilon	+	904	3	Intergenic	novelGene_123355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	922	junction_2	229	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	89	346	941435	943140	FALSE	10	GCACCCCATTGCTGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEVRPLTWWCWWLGGSLPSPVPQLHTQSFLPVFPATSG	941228	943698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_941288_941405_941523_942970
824155	contig_15114_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_121192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743404	745617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_743400_745600
824157	contig_14563_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_135071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAACATCACGTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244695	243690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_243700_244700
824158	contig_8724_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_169235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1141	1497	22432	22076	NA	35	GAATGAATACCTTCTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCRQGCQGTISSVYLTKERLTVMNTRMCAPHRIIMGLASVVWNILLLHTVHILHMLTVYIMHKQSTCTFKKHNILKLATSQQKQFNFLTCGREREYKYLLLKDAKHLNYKKYKMIPP	23572	20999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8724_pilon_-_21000_23600
824159	contig_8063_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_152426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCTTTCTTATCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123250	122649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_122600_123200
824160	contig_7593_pilon	+	2313	1	Intergenic	novelGene_127314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276890	279203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_276900_279200
824161	contig_5514_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_75279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	679	993	66253	65444	TRUE	15	GTGTGATCCCAGGAGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVQAPGSRGLDSAALSLRSPGSWCCLSHLDLQGPGEGSPHGWGTQLRQGRAPSCHRPSQHTVSPLESPPYSSAMGTPERLGNVCRLQRPCSRPVQQRQQWRC	68858	61080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_-_61137_65274_65514_66008_66384_67619_67670_68360
824162	contig_4151_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_65255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTACCTTGACTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572893	572089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_572100_572900
824163	contig_5136_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_126649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTGCTATAGATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326595	327210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_326600_327200
824164	contig_7993_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_170975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTAAAAGAAAAAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408694	407474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_407500_408700
824165	contig_13565_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_162391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAGGAGCAAAGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189342	187811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_187800_189300
824166	contig_19851_pilon	-	927	9	Intergenic	novelGene_29885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	38.9101529166874	306	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	50	643	156336	101715	TRUE	0	CTTGTTCTGCTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRGGGDPAGAAAASNMFKVIQKSVGPASLSLLTFKVYASPKKDSPNKNSIKVDELSLYSVPEGQSKYVEEPRTQLEENISQLRHYCEPYTSWCQEKYFYTKPKMQSIVQWGVDNYEYLQNAPPGFFPRLGVIGFAGLVGLLFARGSKIKKLIYPPGFMGFAASVYYPQQAISFAQASGEILYDWGLRGYIVVEDLWRNFQKPGNVKNPPGNK	156385	98426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_98682_101685_101751_113783_113862_119543_119636_124364_124461_132166_132222_133049_133170_134245_134354_156327
824171	contig_14546_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_157446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATTTAGTGGATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520989	522773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_521000_522800
824172	contig_829_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_168927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACCCGATCGTACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112551	110595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_110600_112600
824174	scaffold_9205_pilon	-	476	3	Intergenic	novelGene_161098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	6.5	60	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	73	444	180663	179434	FALSE	45	CAAGAAAGAATTGCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTGTWNPKGPDLSNCTSHWVNQLAQKIRSGENAASLANELAKHTKGPVFAGDVSSSVRLMEQLVDILDAQLQELKPSEKDSAGRSYNKVGRNVLLVSVRQFLWQILILVAIGCRTLGAPPI	181282	179401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_179722_180579_180684_181230
824175	contig_19076_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_74225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGCATTAGGTGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141903	141139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_141100_141900
824179	contig_9708_pilon	-	1124	4	Intergenic	novelGene_67261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.4052795007307	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	299	1030	50111	49239	FALSE	25	AACACTAAGCTTGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66283	49144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_49778_49918_50118_51271_51377_66096
824181	contig_7919_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_28104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGCAGGAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374072	1374809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1374100_1374800
824183	contig_6446_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_149244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	481	858	565132	564755	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLHWLDRVHKCPCDLPVVLCVGQDTSGHMCLCFKRYTEGDQVVRVQEAVSWGRGAIEGTRGLNTTQVRQDQEDCRVMIIIFKIWEEQSYRKQILILLTPEFSTKWFIHSFNTHLGNTYFVPVTI	565612	564752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_564800_565600
824184	contig_9400_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_146600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATTCCTCAAAAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152293	153541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_+_152300_153500
824185	contig_149_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_173782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATAAAGAGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49093	48341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_48300_49100
824186	contig_9646_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_117428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGACAGCTTGACTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141912	143018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_141900_143000
824187	contig_11708_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_138977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAGAATATTACTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298422	299824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_298400_299800
824188	contig_2739_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_165828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29439	30147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_29400_30100
824189	contig_6277_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_80396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	302	361	209408	209349	NA	15	CGCTCCTCCCATAATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCQIAINYQPLQGSPQLQSTSLFKGTHPSWAARIQWLVDIKAQLLQPPWDNWGRLLRSRAPHGPVRAVGPTSFSLSSTGADYLIILLHAKLSVCFWGTQPMTLSLILFQGTRNEIHVIA	209709	208851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_208900_209700
824191	SIRV6	+	243	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	558	486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
824192	contig_2689_pilon	+	1700	12	Intergenic	novelGene_100815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	640	1272	55654	59867	TRUE	20	AGGCTGTGGAGGAAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSSILSSPSSDTYSYSSRTGLGLSSFKFCRAPNTPGLVCGLRPLEPRSFLLEKENENLLSLFPDRGDFSSFCSSSIFSKESGLLFLYFHLASDLLLVCSRISNLSTSFCLLATSLLGTLRTLFVALPFLGVSILVSASFVWASSRSRFGMVGEPVSLHFFPFFLLLSLILSVLGGFGGLGSFEGLGILEGLGITVLGVFFLDTFSRRD	46182	64195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_46277_48866_49139_53936_54101_55406_55478_55615_55795_57916_58036_58768_58888_59613_59981_60200_60290_61373_61461_63629_63748_64174
824193	contig_14219_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_54340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTTGCTCCGACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805501	806292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_805500_806300
824194	contig_3878_pilon	-	2040	6	Intergenic	novelGene_174786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	96.9276018479772	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	52	660	189045	123533	FALSE	60	ATATAAACTTCAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALFGSSGRDCERDGWHRMHNDHSHHGCYRPKDYKLVRAPHGRDFDDSLERCDEYLNTRPCSKPQHSARTLLVHSAPSTTPKHSPSPVLNRASLRERFHSDWCSPSNCDEIHDRVKNVLKSHQAHQRHLYDERDPDKEEELELKRGLFYRDSAYDSDPEYSSFQRSRGTAHLDDGEYWSNRAASYKGKPHRPIFENSMDKIYRNLYKKACSSVSHTPENF	189096	122152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_123714_128167_128260_156700_156801_160651_160837_179586_179628_189035
824195	contig_11017_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_128061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCATATTTGCTTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79728	77858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_77900_79700
824196	contig_14514_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_137452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGGTCCCAGCAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19175	19444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_19200_19400
824198	SIRV4	-	482	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	115	20	115	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5043	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824200	contig_7171_pilon	+	1066	8	Intergenic	novelGene_101394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	757	1062	1410317	1414821	FALSE	15	GTACTCCTGCCGGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPRPIIMPRKGSVWPVFSLLMSRRGVERGALLMRDAKGCTCREVPMTISRSTFRKSDCMQEKKCAGRFSPKNTMSEASPRSDISHTWESPRRRSSLSSS	1409310	1414825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1409975_1410083_1410151_1410291_1410363_1412334_1412384_1412462_1412540_1412677_1412740_1412986_1413044_1414806
824204	SIRV6	+	349	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	363	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1840
824207	contig_12817_pilon	+	869	3	Intergenic	novelGene_174768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	4.5	192	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTGTCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112437	137061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12817_pilon_+_112508_125035_125212_136438
824208	contig_7444_pilon	+	1368	7	Intergenic	novelGene_174923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	32.3595254737904	115	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	225	902	51658	59537	FALSE	30	ACAAAACTTGGTACCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRGGGRGGFNRGGGGGGFNRGGGGGSSNHFRGGGSGSFRGGGGGNFRGGGGGRGGFGRGGGRGGFNKFQDQGPPERVVLLGEFMHPCEDDIVCKCVTDENKVPYFNAPVYLENKEQIGKVDEIFGQLRDFYFSVKLSENMKASSFKKLQKFYIDPFKLLPLQRFLPRPPGEKGPPRGGGRGGRGGGRGGGGRGGGRGGFRGGRGGGGGFRGGRGGGGFRGRGH	51294	60003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_51507_51645_51899_53764_53920_54525_54586_56825_56968_58807_58874_59523
824209	contig_5854_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_68861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTGCCAAGAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341072	340169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_340200_341100
824210	contig_10323_pilon	+	1332	12	Intergenic	novelGene_123528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	109.809150742444	105	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	414	1232	137028	154457	FALSE	0	GTTTTTGTTTTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDAHVILNDITEKCRPPSSLIARVSYFAVFDGHGGIRASKFAAQNLHQNLIRKFPKGDVVSVEKTVKRCLLDTFKHTDEEFLKQASSQKPAWKDGSTATCVLAVDNTLYIANLGDSRAILCRYNEESQKHAALSLSKEHNPTQYEERMRIQKAGGNVRDGRVLGVLEVSRSIGDGQYKRCGVTSVPDIRRCQLTPNDRFILLACDGLFKVFTPEEAVNFILSCLEDEKIQTREGKPAVDARYEAACNRLASKAVQRGSADNVTVMVVRIGQ	120065	154557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_120161_130233_130323_130766_130824_135258_135369_136965_137093_139389_139497_139902_139997_140267_140356_142521_142644_152356_152477_153993_154076_154316
824211	SIRV6	+	209	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	88	486	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
824212	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
824214	contig_13904_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_165489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTAAACTAGCAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97354	96511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_96500_97400
824215	contig_10106_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_73855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAAAAACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60980	63425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_61000_63400
824216	contig_1276_pilon	-	1486	2	Intergenic	novelGene_159763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	819	1265	136421	135975	FALSE	50	AAAATATCAGATACCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIVSTWLGHDSQCLHVIMPMIKSVVSSQSVGREFPWGCGLHPNISRSSGLLLALAPVAASCSSWDLSYQLICQSWDSLIFTDREWEPCSLTCQSWVCQPPQLCESGEALQSSCQSWDSSIFTACEQEPCSPTCRSRARQPLRPRES	138100	135753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_136768_137628
824217	contig_18898_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_77636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAGAAATCTTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47270	48577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_47300_48600
824223	contig_11978_pilon	+	624	5	Intergenic	novelGene_63096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	7	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	176	541	1830113	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829124	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
824224	contig_3153_pilon	+	1059	2	Intergenic	novelGene_104699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	0	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448255	449406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448616_448707
824225	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824226	contig_8538_pilon	-	1302	3	Intergenic	novelGene_4603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACGTGCATGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692775	687052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_687835_687902_688349_692701
824227	contig_610_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_76788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGATTCCAACTCATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280349	279755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_279800_280300
824229	contig_12123_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_144595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTTATTTTCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82677	83982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_82700_84000
824230	contig_12635_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_60855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTCTGCCTTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592648	593140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_592600_593100
824231	contig_6102_pilon	+	272	2	Intergenic	novelGene_31801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360106_360956
824232	contig_9406_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_136152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGGGGTGCCCTCGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35265	33784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_33800_35300
824233	contig_8063_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_152420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	116	415	68712	68413	NA	20	ACCATCCTGTCAGGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFLSVQHLHVSTPGSPLSTCPEFSVAGNRTRPQPACGSLGGGATPQTPHTPSSEARPFLDEKMPAFGRRSLRFGKADSSHSAECSQNDSPRKNKCTL	68827	67058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_67100_68800
824235	contig_15599_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_176663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28419	27074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15599_pilon_-_27100_28400
824237	contig_2312_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_160757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534947	533969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_534000_534900
824238	contig_15570_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_137866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	854	1273	732962	733381	NA	20	AAGACGTTTCCTATTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISGACTITSVPENLSEAFCQYSYLTAICICQLCIWHLLVSVALELVGSQNGYTMKLLVSTSQWELLKGRNSTCRTSGEDKKRKKLVILTQASCSLLPKNNDLKSQSTLPKELRYLWTCILFLITDTKNKGFLFKICY	732108	734068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_732100_734100
824239	contig_8289_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_171173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTCACTGAGGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176406	176859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_176400_176900
824240	contig_4845_pilon	+	1299	10	Intergenic	novelGene_53610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	103.047993133728	1	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	263	838	159257	161971	TRUE	15	CCGACAGCGATGTGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHIDQFLIATFMQLRLIYNTHMADEKLEKDEIIKLYSCIIGNMISLFQIESLAREASTGVLKDLMHGLITLMLDSRIEDLEEGHQVIRSVNLLVVKVLEKSDQTNILSALLVLLQDSLLATASSPKFSELVMKCLWRMVRLLPDTINSINLDRILLDIHIFMKVFPKEKLKQCKSEFPIRTLKTLLHTS	152817	168036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_152945_153394_153516_159242_159398_160151_160340_160649_160726_161681_161846_161964_162082_162626_162711_162804_162965_167929
824242	contig_11832_pilon	-	903	2	Intergenic	novelGene_106949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	37	342	176398	176093	TRUE	35	GAAACTTCCAAGAGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGRGRVPPQVLMDLGPGRSPPRPALSHLAPRGPQARPNCRLPMLAHQPQLHLIIGARAERGPSGHADAVDNHLAQGRFEPAEGEAVEVANNRARDPAPTAQSSAPESEKAGF	176434	170764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_171308_176074
824244	contig_11708_pilon	+	1333	2	Intergenic	novelGene_138980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAGAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318973	323318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_320196_323207
824245	contig_9535_pilon	+	1546	7	Intergenic	novelGene_124505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	27.0847435530288	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	47	790	684856	708453	FALSE	10	TTATTGTGTTGTGTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAAAAAVGARRVLVYGGRGALGTRCVQAFRARNWWVASIDVVENEEASASIIVKMTDSFTEQADQVTAEVGKLLGEEKVDAILCVAGGWAGGNAKSKSLFKNCDLMWKQSIWTSTISSHLATKHLKEGGLLTLAGAKAALDGTPGMIGYGMAKGAVHQLCQSLAGKNSGMPSGSAAIAVLPVTLDTPMNRKSMPEADFSSWTPLEFLVETFHDWMTGKNRPSSGSLIQVVTTGGKTELTPAYF	684809	709209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_684970_691201_691295_692144_692242_693046_693188_700873_700983_703610_703695_708347
824246	contig_5485_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_37767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564960	566424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_565000_566400
824247	contig_7963_pilon	-	737	6	Intergenic	novelGene_58311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	48	497	48841	38897	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	48888	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40041_43690_43819_48741
824248	contig_17214_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_153474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGAAACCGCACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102775	104189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_102800_104200
824249	contig_14666_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_39516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	6	308	429343	429645	NA	75	AATGAAAACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMAGAAPGAIMDEDYFGSAAEWGDEADGGQVRGGAPRRGVLVSVAGGSARVVTEWFKHSPPRPGDRGPDHTPYPHPPGQRGSATPRTPPSPQGSSVSSLQL	429337	431029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_429300_431000
824251	contig_8663_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_58011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGTAAAGAGATAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291125	291695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_291100_291700
824252	contig_8663_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_58012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTAATCCTACCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291894	292882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_291900_292900
824254	contig_11050_pilon	+	756	2	Intergenic	novelGene_173573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	584	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	153	494	98338	98679	FALSE	20	TCTGTATACTTAGGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRSFRCSRHTSLGTSSLLPGARRTGIGPGQTAAGILVLKEQQPGKENFIMANMHQENEEMEQAPIQNGEEARPLGRGEGHQPAGNNRRGQARRLAPNFRWAIPNRQFNDRMGGDGDDMEMFMEEMREIRRKLRELQLRNCLRILMGELSNHHDHHDEFCLMP	97421	98941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11050_pilon_+_97527_98290
824256	contig_252_pilon	-	1094	2	Intergenic	novelGene_99918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	0	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	70	1017	165794	164049	FALSE	5	CTGCTTTTTTTTTCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFQTVLSLYQKHHNAIGYGLVTFLTASGERVFSTVVFSCPCSATWNLPYGLVSLLVPALGLFLLGYVLSARTWRLLTSCCAPDARTACRAGLRGALVCTHLSAASAVAPLTWVAVALLGGAFYECAASSAPFAQRLCWGRDPSCVAQLPLVPCKQANMSEVQDLLKDLRAESQVIGWILIAIVIIILLAFTSLMRCTSPVSYLQLKFWKIYMKQEENILKTQATAHATVLAKENVKSFFDGSHPKEYNTPSIKDWQQISSLYTFNPKDQYYSMLHKYVNRKEESHSITSAEGDVMVPVLDFVDSFDISTTAEL	165863	163971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_164472_165269
824257	contig_6503_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_145778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAAACCAAGGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330960	330380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_330400_331000
824258	contig_2890_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_60303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438143	438732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_438100_438700
824260	contig_401_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_42755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTGTTGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976610	976865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_976600_976900
824261	contig_5084_pilon	+	1069	11	Intergenic	novelGene_64600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_8	23.3846103238861	145	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	33	998	982509	1025529	FALSE	20	GTTTGTGCCTATTACGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTKELLQMDLYALLGIEEKAADKEVKKAYRQKALSCHPDKNPDNPRAAELFHQLSQALEVLTDAAARAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLDLEAREREAQAHGNEEEEETRSTRTLEQEIERLREEGSRQLEEQQRLIQEQIRQEREQRLRGKAENTEGKATPKLKLKWKCRKEDESKGGYSRDVLLRLLQKVYLLTSLLSPSSRPRAQYGEVLNLVLSKKKAGSAVVEFATVKAAELAVQNEVGLVDNPLKISWLEGQPQGTVDPSHPGLSQGSVLSERDYESLVMMRMRQAAERQQLIARMEQEDKEGPPT	982476	1025600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_982587_1014389_1014460_1014754_1014814_1015070_1015159_1017086_1017173_1017384_1017482_1018060_1018105_1018495_1018625_1019302_1019384_1019908_1020020_1025406
824263	SIRV6	-	428	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-269	384	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACGGTCCACAATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2089	1160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
824267	contig_13014_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_169376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAATGAACCAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581900	579904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_579900_581900
824268	contig_2703_pilon	-	1443	5	Intergenic	novelGene_101826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	21.5682057668226	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1404	38	1441	1182747	1174433	FALSE	35	GAGTCACAGTAGTATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQVQPPLWLQTLMSACSQASDFSVQSVAVSLVMDLVGLTQSVAMVTGENVNSVEPAQPLSPNQGKVAVVIRPPLTQGNLKYIAEKTEFFKHVALTLWDQLGDGTPQHHQKSVELFYQLHNLVPSSSICEDVISQQLTHKDKKIRMEAHAKFAVLWHLTRDLHINKSSSFARSFDRSLFIMLDSLNSLDGSTSSVGQAWLNQVLQRHDIARVLEPLLLLLLHPKTQRVSVQRVQAERYWNKAPCYPGEENDKHFVENFVCSNVSQVQLITSKGNGEKPLTMDEIENFSLTVNPLSDRLSLLSTSSETIPMVVSDFDLPDQQIEILQSSDSGCSHSSAGDNLSYEVEAENVSAQEESQMPKASSPDDDVQQVVFDLICKVISGLEAESASISSQLESEVMTSQCSGLDMGEETIKNEDQSTQQNQSGLLSDKSSQFLSVSAEDGCQYVTNGISRNSSSPCISGTTLTLHDPSVASTETKSRQ	1182784	1174430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1175089_1176612_1176873_1178421_1178523_1181179_1181333_1182513
824270	contig_11258_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_67762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	228	581	157211	156858	NA	35	GTGCTAGACCACCAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISPRVCGILFQQPQETGTLSILVKNKDLGRELRNFISCPHSRDPHSTENSYVCLEVSMSAPHSQAPLTTCRPLFWKPPARPLRLPAHATPGQHTADCQGMFAKEDSLPWCPGASV	157438	156756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_156800_157400
824272	contig_9915_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_174164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACATAAAACACAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329807	328987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_329000_329800
824273	contig_16303_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_34116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGGGTCATTTAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34798	35500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_34800_35500
824274	contig_8330_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_71941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAACAAACAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354978	1354091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1354100_1355000
824275	contig_7898_pilon	+	1495	2	Intergenic	novelGene_47588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497111	499920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_498460_499773
824279	contig_13740_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_34740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276589	274612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_274600_276600
824280	contig_12603_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_105800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGGACAGAGTAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594728	596015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_594700_596000
824282	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824283	contig_12249_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_121009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113805	112105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_-_112100_113800
824284	contig_11742_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_166540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATAACTGTGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103085	101533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_101500_103100
824285	contig_4131_pilon	+	648	3	Intergenic	novelGene_127876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	684.5	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	240601	241064	TRUE	30	TATTAAAATTTACTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IILFLCVGCFSEFFFIFLLRVWLQCLDVASKAVKLARKRSLVLPGRVCSFPWGVYTACSVRVITRSGSGLVHLTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240598	248842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_240819_240898_241199_248714
824289	contig_13093_pilon	-	1477	3	Intergenic	novelGene_105226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.5	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	425	1321	59519	57732	FALSE	40	TAAAAGGCTTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHSGEKPYVCRECGRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCKKCGRGFNRKSVIPPLVPENTQGESCVGQGLWAELHSSVCPQLT	60053	57575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_57833_58723_59592_59701
824290	contig_11284_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_174902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTTCCAAGGCTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27626	26690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11284_pilon_-_26700_27600
824292	contig_9646_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_117441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1200	1553	193907	193554	NA	55	TAAAACAATATTAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSITMTVRMAQGQAAFRSVVHRGCYESEPTQRHVTTTESLTEFLHMTLSFGHKDKEAELYLVMLSGWGRKQELDEKRARQVPCSSLELRTYRRQCHTEQNFTLTATTATCTTLTT	195106	193480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_193500_195100
824294	contig_2069_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_23448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTACACTTCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347738	1347976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1347700_1348000
824295	contig_9673_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_119159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGAGGAGAGTCCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60155	61322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_60200_61300
824296	contig_6509_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_145666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGATGAGTTGGGCGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263898	262392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_262400_263900
824297	contig_8461_pilon	+	1396	6	Intergenic	novelGene_163919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	1.35646599662505	110	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	61	1323	241645	255345	FALSE	20	TTATATTTTCAGCCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSQITVSQKLPVFSSGTNKMNIPALLQHSHQHLRKGLLRTPFRRYHFILPSSIHLRSGISCSQPFNSLEFHCTQWSLLSNGVKRKLCIQTTLKEHTEGLSDKERRFVDKLYTGLIQGQRACLAEAITLIESTHNRKKELAQVLLQKVLVYHREQEQLNKGKPLAFRVGLSGPPGAGKSTFIEYFGKMLTERGRKVSVLAVDPSSCTSGGSLLGDKTRMTELSRDMNAYIRPSPTRGTLGGVTRTTNEAILLCEGGGYDIILIETVGVGQSEFAVADMVDMFVLLLPPAGGDELQGIKRGIIEMADLVAITKCDGDLIVPARRIQAEYMSALKLLRKRSKAWRPKVIRISSRSGEGVTEMWDKMQEFQELMLASGELTTRRQKQQKVWMWNLIQESVLEHFRTHPTVREQIPLLERRVLTGALSPGLAADLLLKAFKDGD	241584	255418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_242090_244733_244857_249194_249366_252446_252533_253854_254005_255057
824298	contig_11937_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_171584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	227	684	97	780	193379	192696	NA	30	TGAAGAAAACTTCTTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQIQAQPLSSQAISQQHLQDAGTREWSPQNASMSESLSIPASLNDAALAQMNNEVQLLTEKALMELGGGKPLPHPRAWFVSLDGRSNAHVRHSYIDLQRAGRNGSNDASLDSGVDMNEPKSARKGRGDPLSLQQNHPPVQEHQQKEPRAPDSTAYTQLVYLDDMDQSGSECGTTVCTPEDSALRCLMDGSSRRSGQLPSLQEETTKRTAEVPLEPSASPEHRSAHEEEEDEDDDDDQGEDKKSPWQKREERPLMAFNIK	193475	191470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_191500_193500
824299	contig_18168_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_122063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAATAGTCTATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23128	22276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_22300_23100
824300	contig_1009_pilon	-	2866	1	Intergenic	novelGene_121787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTCAGGCTTAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356440	353574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_353600_356400
824301	contig_5428_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_160409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAATAGAAATGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153481	152883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_152900_153500
824302	contig_5428_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_160408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	152725	152393	NA	20	GTGTAACTTTCCTCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPKSVIHFIYIFSCITLPVIEVDSFYVFCFCFLLCFFAAGFTVVFSVKNVIPLHFPYHLAVALLNVGTLGTHILSQTRDWENTWLFLKFTEDVENNLIISYYIFRILCI	152726	151479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_151500_152700
824303	contig_1679_pilon	+	1197	8	Intergenic	novelGene_173493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	181.878183049501	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	5	868	128771	147510	FALSE	25	AGCCGGCAAGGATGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMKMASRGFQLLLLPLLLLGPAPAAGHGGKYSREKNEPAPPAKREPEAFRMEKLNQLWEKAQRLHLSPVKLAELHADLKIQERDELSWKKLKIEGLDEDGEKEARLIRNLHVILAKYRLDGRKDAQVVNTNYLQDGTEEEGLEDPRLEKLWHKAKTSGKFSSEELEKLWRELKHHTEKVREYSVLLETLSRTEEIHENVISPSDLSHIKEEVLQSRHAELKEKLRSINQGFARLRKVSHLGYGTEHEFEEPRVIDLWDMAKSANFTQKELESFREELKHFEAKREVAC	128766	147839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1679_pilon_+_128957_133892_134038_136698_136824_140447_140569_141738_141898_143026_143110_144921_144949_147492
824304	contig_8681_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_157212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCACTCACAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257698	259068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_257700_259100
824306	contig_17427_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_30271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGGGGTAGAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37106	35545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_35500_37100
824308	contig_10982_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_87891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	47	367	193660	193980	NA	75	AAATAAAAAAAAAATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTGYNSGSGTTQDIVLQSGQLLDCAHWQASLWPSAPWPGLCPTWASVTKFFSSTSKCQEEPYSASKPWPEGTQLFLAPWVNEPSCAKCPEAPHSTRKPFA	193613	194650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_193600_194600
824309	contig_9058_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_149376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTTCAGTTCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356872	357672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_356900_357700
824310	contig_13876_pilon	+	795	4	Intergenic	novelGene_174245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	189.378515735609	59	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	139	564	44405	109755	FALSE	5	TTGCTTTCACCCGTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASAVMHALRKNKTLRYGVPMLMLIVGGSFGLREFSQIRYDAVKIKIDPELEKKLKMNKVSLESEYEVQQSANFLPKIRKIRGWGLQTTELVKTKSGLPDMHRTISPVLWVTPELSFQQTELNFSAPRLGEDFQKQRVQA	44266	109986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_44474_61740_61813_65260_65329_109538
824312	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_97342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
824313	contig_10863_pilon	-	2029	15	Intergenic	novelGene_59336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	210.259618431255	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	474	1559	103134	89018	FALSE	15	AGTTTGTTTTAAGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDEPSSYLDVKQRLKAAITIRSLINPDRYIIVVEHDLSVLDYLSDFICCLYGVPSAYGVVTMPFSVREGINIFLDGYVPTENLRFRDASLVFKVAETANEEEVKKMCMYKYPGMKKKMGEFELAIVAGEFTDSEIMVMLGENGTGKTTFIRMLAGRLKPDEGGEVPVLNVSYKPQKISPKSTGSVRQLLHEKIRDAYTHPQFVTDVMKPLQIENIIDQEVQTLSGGELQRVALALCLGKPADVYLIDEPSAYLDSEQRLMAARVVKRFILHAKKTAFVVEHDFIMATYLADRVIVFDGIPSKNTVANSPQTLLAGMNKFLSQLEITFRRDPNNYRPRINKLNSIKDVEQKKSGNYFFLDD	107852	88547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_89066_90223_90336_92156_92280_92408_92552_92624_92736_94860_94920_95018_95079_96699_96922_98844_98967_103048_103139_105476_105574_105833_105897_106072_106181_106639_106753_107764
824314	contig_6576_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_42351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTGTGATTGTGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731439	730369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_730400_731400
824315	contig_6740_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_142698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTCTCAGGCCCTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642543	642842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_642500_642800
824316	contig_6740_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_142699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGCTGCTCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642842	643154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_642800_643200
824317	contig_9363_pilon	-	991	3	Intergenic	novelGene_6520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	10	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTCTTTGTCCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557270	553621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_554463_555229_555290_557180
824319	contig_9363_pilon	+	1165	6	Intergenic	novelGene_6843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_5	86.7640478539355	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	14	1012	1645884	1647514	FALSE	5	TGTGTTGGGGCCTTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPIMPKRKVTFQGVGDDDENEISVSKKKLVDPVAGAGGPGSRFKGKHSLDSDEEDDDEEGSSKYDILASEDVEGQEAATLPSEGGVRITPFNLQEEMEEGHFDADGNYFLNRDAQIRDNWLDNIDWVKIRERPPDQRQTSDSEEDSLGQTPMSAQALLEGLLELLLPRETVAGALRRLGARGGKGDSKGPGRPSSPQRLDRLSGLADQMVARGNLGVYQETRERLAMRLKGLGCRTQGSHDPSPPPSLDMFAEEVAEGELETPTPAQKGEAESPGDGLVDVMWEYKWENTGDAELYGPFTSAQMQTWVNEGYFPDGVYCRKLDPPWWSVLQLQTH	1645870	1647667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1645959_1646176_1646313_1646456_1646615_1646715_1647146_1647227_1647335_1647421
824320	contig_10023_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_123470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	224	532	124185	123877	NA	35	AGAACTGTCTGAAACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGDAEVLNGDCGSSAFGGAGLEPGEGPAVSLPCAQICRKMANLVSSSRFRITATLQDRVELPHRVSTERAGGAELPTFWLAAKCLTTAPPGPPDLQSIPE	124408	123618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_123600_124400
824321	contig_11428_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_138487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42592	43854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_42600_43900
824322	contig_3862_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_137431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCGAAGGCATCTAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624150	625572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_624200_625600
824325	contig_2487_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_148454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGCAAAAAAATGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120828	119920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_119900_120800
824326	contig_8588_pilon	-	2547	5	Intergenic	novelGene_146505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTGGACCACAAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362099	348964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_349179_352500_352681_357469_357680_359203_359319_360271
824327	contig_6375_pilon	+	891	4	Intergenic	novelGene_72938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	111.631337694912	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	39	812	20957	30292	FALSE	15	CTGCTGGCAGTGATGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRARPPEPLPRVHWGALSKQSPLSSSATRWFSRPDLHLCICPQGPQLSPTSNLPVCPLPGAGSRCSSEVLCSWLGLALRTSAAPACSFTFIKPTLSPV	20918	30371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_20997_22327_22701_22862_22937_30005
824331	contig_21248_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_176108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	768	1076	4538	4846	NA	15	CTGGTCAGAGTACCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTRSSCSITKQGKDSVNLELRGNKMVIGTLVTQLSYTSFYTHLNFHATKLLYFLTYPYEKGYQKKTFFHKKFQSLYPSPLYYLLLKICHSSLDILLSYSVQ	3770	5063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21248_pilon_+_3800_5100
824332	contig_4364_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_3676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
824335	contig_10958_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_5387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1175	1543	870076	870444	NA	35	GACACACTAGCATTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSSVLVGGVPSIPDLNSSLALSIMILSYATQFSLNRKVGTNNFNKEVCTWLKLITTEHKKPTPCVSLGTVVERTPVRNWKPPLTNSSISHVILNKSLTSLGYSFPISKKGDTNFAYHTEC	868901	871133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_868900_871100
824336	contig_366_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_51566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	4	15	319	333	656181	656195	NA	35	TCATGTATATTTTCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDGVAVSWKELHGNWLLCVWCSGTTTPSHHEEEFPIQSSCPGTLGSPRTKSPSCSSVLPTAHPTIRPWGLWGPLCGAGGLRCAGQAVWASKRRTPQGKEEGAEGTSMGWH	655862	657633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_655900_657600
824337	contig_10940_pilon	-	2358	1	Intergenic	novelGene_49190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCATAGGGGGATCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316755	314397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_314400_316800
824338	contig_6871_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_21598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	897	1202	364940	364635	NA	50	TTTATATAGTTAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFSQSPQDRLLFALPSVTTDSAAGLLLGLSLSFVLTALDLCYSSFRSFLASFLSASSLLPFLISAASCCLSEKPLWGWLQIYTNPSSVSRHGPSTRAMN	365836	364168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_364200_365800
824341	contig_3986_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_52705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGGTTGCTCATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34945	35470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_34900_35500
824342	contig_15970_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_144053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATATGTACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177551	178468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_177600_178500
824345	contig_15867_pilon	-	1938	13	Intergenic	novelGene_170906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.4976702158774	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	152	1456	302613	275788	FALSE	80	TTACAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGLRAADFPRWKRHISEELRRRDRLQRQAFEEIILQYNKLLEKSDLHSVLAHKLQAEKHDMPNRHEISPGHDGAWNDSQLQEMAQLRIKHQEELTELHKKRGELAQLVIDLNNQMQQKDKEIQTNEAKIAECLQTISDLEAECQELCGKLQDLERVNQTLKDEYDALQITFTALEEKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQEANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVLPDETSEQAEETSPVRAISRAATKRLSQPAGGLLDSITNIFGRRSVSSPPVPPDNMDSHPGSSKDVRVPATALYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGDKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRFPLCTPALSKIPLQNICSVTPRVSTKVPGYSSS	302764	275305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_275890_276046_276119_277272_277344_279096_279203_281340_281444_282310_282368_282977_283065_286507_286574_292128_292381_293237_293312_294393_294500_298961_299056_302498
824349	contig_18039_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_171241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACAAAATTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100853	101704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_100900_101700
824351	contig_6726_pilon	-	1544	4	Intergenic	novelGene_86213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_3	564.130205616477	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	11	319	76688	49974	FALSE	10	GGGTCCCTGATTGCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVKMAKVSELYDVTWEEMRDKMRKWREENCRNSEQIVEVGEELINEYASKLGDDIWIIYEQVMIAALDYGRDDLALFCLQELRRQFPGSHRVKRLTGMRFEAMER	76698	48748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_50064_52417_52483_53014_53129_76648
824355	contig_2093_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_153008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGATTAGTGTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1427134	1428446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1427100_1428400
824356	contig_6494_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_108585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATTAGCAGGGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135523	135986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_+_135500_136000
824357	contig_987_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_72327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAAAGTAGCTTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088227	1086772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1086800_1088200
824358	contig_8447_pilon	+	1384	9	Intergenic	novelGene_69438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	88.4794291064313	98	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1047	338	1384	207855	236234	FALSE	45	GATAGGACCATCAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQNEDESPKKNTLWQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASG	112847	236234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_113011_122455_122618_207842_207906_211259_211486_219795_219983_220881_220973_231202_231341_233610_233730_235999
824359	contig_12201_pilon	-	860	2	Intergenic	novelGene_159985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATTTATGTACCTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139212	137050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_137158_138459
824360	contig_12201_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_159984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAAAAAGAAAAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137099	136706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_136700_137100
824365	contig_10734_pilon	-	684	2	Intergenic	novelGene_51061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	1122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAGGGAAGCAATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437538	435219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_435652_437286
824367	contig_6451_pilon	+	657	5	Intergenic	novelGene_173693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	86.7939370002306	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	13	453	12389	243826	TRUE	5	CTCTCCATGTGCGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCALPSLLFPLASPEEPIYLLASARCRTYHGNSRRNSLRLFGSVE	12376	277974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231_153334_243695_243857_277800
824368	contig_7230_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_52567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	771	1160	280282	279893	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVKQTPKFSEDHKSQTRKLHKSCHKLPTQGCGPRCSGFIGSSTNSSSSCSSAYINTLHSMSCTKCLRLESVGAVFSDYLAAAFQMHSPSTLNVHVTSISAVSVVVWLEKQTDTEEVVHGILFLDLAAQ	281052	278347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_278300_281100
824369	contig_11816_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_98544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACCTCAGATACAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082278	1081342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1081300_1082300
824370	contig_4952_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_145545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATCCACTAAAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549806	549585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_549600_549800
824372	contig_6674_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_148000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGAGTTCCTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134713	133550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_133600_134700
824375	contig_3960_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_138046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699825	701082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_699800_701100
824376	contig_16113_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_140552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	107	412	107636	107941	NA	45	AAATAAAAGTTCGTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGLVLEAKIHFHKVDNNFPCLKYEGLLARSGNPGGVVVKCYGCQPKGWQFKSTRCSLETLWGSSTLSYRVTMSRNRLAANGFGFFFLVYLCFGELTFAS	107529	108319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_107500_108300
824379	contig_14666_pilon	-	1277	6	Intergenic	novelGene_39543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	961.517633743656	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	251	862	458202	449808	FALSE	30	ATAAGCACTGAGCCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	459079	449392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_458986
824380	contig_15188_pilon	-	1333	2	Intergenic	novelGene_163080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	738	1280	166655	165767	FALSE	15	TTCCTGTGGCCACAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLDNKIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNPPRAWRSRAMLLVRIVTMGNVHKRLGPLKEFTRPVPLSVDRAHRHQLSRPGLTHGLVLVLARLRSCSSPKGSGHWQPRACWAPFFGRRVKEAWGLQEAASPPNSPHSSSRRTVRERRRINLSGTDSGGEKIPSAGFF	167392	165713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_166182_166527
824381	contig_11285_pilon	-	2179	20	Intergenic	novelGene_5742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	174.597249250907	8	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	24	896	1229333	1207787	TRUE	35	CTTAGACAAACTTTGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGREAKDLDEMDDDDDDDDIGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIQRLLFQLPV	1230701	1192611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1192991_1193339_1193448_1193643_1193798_1194290_1194386_1194548_1194668_1195524_1195613_1195813_1195943_1196182_1196270_1196721_1196792_1207732_1207817_1209737_1209879_1212121_1212205_1213179_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228_1229338_1230682
824382	contig_16122_pilon	-	1306	10	Intergenic	novelGene_134556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	114.436245661013	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	51	1280	291639	280613	FALSE	10	CTGAGTGCTTGGCATGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGPRRPQEQLPARYSTMGFSSELCSPQGHGAVQRLQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMFLQDSGAQSRGMAPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKSYSEQWQQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQARRKYQEASKDKDRDRAKDKYVRSLWKLFAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLMLPSLLQSLQDLHQEMACILKEILQEYLEISSLVQDEVMAIHQEMAAAAARIQPEAEYEGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGELLEPGELQLNELTVESVQHTLTAVTGDLAEATETVLSRQKVVTQLQYELQNEEQNTHPRERVQLLSKKQALQARLPPRQLQPTLLDSSSQSWTPATSFRDASRDAAPVCSASLLLPGLPR	292137	280586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280760_286205_286240_286371_286495_286657_286778_286852_286991_288662_288847_288978_289076_291084_291259_291426_291649_292096
824383	contig_6489_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_128949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGTAGGAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319560	320625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_319600_320600
824384	contig_7457_pilon	+	933	2	Intergenic	novelGene_31547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	0	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAATAAACCTCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782461	783601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_782537_782743
824385	contig_16098_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_45802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCTCTAAATAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97818	97568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_97600_97800
824389	contig_10914_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_176667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8947	10288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10914_pilon_+_8900_10300
824390	SIRV5	-	227	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACCCATAAACTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10866
824391	contig_5918_pilon	-	1476	2	Intergenic	novelGene_99493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAAAAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211573	209147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_210310_211259
824392	contig_12964_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_131717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTAGGCAGCTAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589368	591448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_589400_591400
824393	contig_10937_pilon	+	1400	5	Intergenic	novelGene_67340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.8890665368072	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAATTTGCAGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180617	185955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_181397_181497_181654_181938_182017_184579_184669_185657
824394	contig_6047_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_24234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTCAAGAGTATATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230120	229733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_229700_230100
824395	contig_3612_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_87847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAACCACCAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994797	993444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_993400_994800
824398	SIRV6	+	342	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	28	337	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCGAAGACGCTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824399	contig_10500_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_41207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAGCAGATGAAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508932	1507348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1507300_1508900
824401	contig_14744_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_66096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCATGCATGTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431769	1430534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1430500_1431800
824402	contig_6364_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_51737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAATGAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474041	475193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_474000_475200
824403	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
824405	SIRV6	+	320	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	412	51	412	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10649	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
824407	contig_7294_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_172599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCTGCTATAACAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173999	175208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_+_174000_175200
824408	contig_6710_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_89514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
824410	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	1	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
824411	contig_12528_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_81281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256901	256087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_256100_256900
824412	contig_15548_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_173480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGTTTGAACCCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245967	244659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_244700_246000
824413	SIRV6	+	414	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	41	4	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
824414	contig_14338_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_174841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTACACATTAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123586	121654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_121700_123600
824415	contig_18925_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_176669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGCTCTCCAGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18925_pilon_+_0_500
824417	contig_3602_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_60571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAATCACTTTAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533249	534192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_533200_534200
824418	contig_9345_pilon	-	1492	12	Intergenic	novelGene_24327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	53.1957246775241	3	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	1074	1490	9508	3277	FALSE	55	GGAAGGAAAAATCCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVICVQDVSSIYRVPLLLEEQGVVDYFLRRLNLPIERQPQKLLTKWKEMADRYDCLLETCSIALVGKYTKLFDSYASVTKALEHSALAINHKLEIKYIDSTDLEPSTLQEDPAHYHEAWQKLCSAHGVLVPGGFGVRG	31172	3274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_3314_4159_4249_5417_5551_7492_7645_9502_9715_10174_10256_10775_10860_13603_13721_14502_14604_24376_24548_27097_27277_31038
824419	contig_11815_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_50898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTTAGCAGCCAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129116	128094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_128100_129100
824420	contig_10367_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_169466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152734	154451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_+_152700_154500
824423	contig_7599_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_73764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	425	868	26161	26604	NA	25	TGTAAGAAAGTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLENLRLAVRSQLGFTSIRLPTAGRSSNIWSRIFNFARSRHSGSLALVSAEGDEVVPSQSTSREPERNNTHRSLFSVEPDDTDTENERRDTGGASGGVAAPLPQKVPPTTGVEATVGAYGSSSTQSTRGGNTDHGRDVTSMEPTSVSPARHQLTSALSRMTQRLRWVRFTLGRSSSVNQNQSPLRQLDNGVNGREEDDDVEMLIPVSDAASDFDVNDCSRPLLDLASDQGQVFRQPFSATNPGVRPSNPGDGPCERCGIVHTAQIPDACLEATLKNETSDDEALLLC	25736	27660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_+_25700_27700
824424	contig_11447_pilon	-	1815	1	Intergenic	novelGene_168109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGTAAGAAGGACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564354	562539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_562500_564400
824425	contig_9479_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_176674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGGAGGACAGGATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28246	29486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_+_28200_29500
824426	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824427	contig_10857_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_160921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGATATACAGAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466832	467078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_466800_467100
824428	contig_16541_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_126743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTCTTTGTTTCATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389204	387727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_387700_389200
824429	contig_13547_pilon	-	2045	4	Intergenic	novelGene_104894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	90.5182608955539	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	36	350	223705	185467	FALSE	30	TTCTTTATACTCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNAIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSQDPSDTSNDTPCSTSSECSLNFWQFPVNVLLQLLLNDLQQTFIV	223740	183771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_185603_196798_196883_221449_221507_223667
824430	contig_15407_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_123086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATTTGTGATTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467786	466534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_466500_467800
824432	contig_9389_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_84069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	212	568	999642	999998	NA	15	GTGCACCCTGACCTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARPRHGGGQDSRLPGALGLGFCRHQVPNYGPSLNLSPGLASPKVQNPVMHPGSTLLCPRTPVPRASPQQWTPPRWASGSRAGLVFSSSGLHKPTHLRLKEATVVPRTGGKMLNKRR	999430	1000309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_999400_1000300
824435	contig_14047_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_176575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATACGACAGGGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5821	6710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_5800_6700
824436	contig_9468_pilon	-	1493	3	Intergenic	novelGene_59448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	8.5	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	333	761	134728	132836	FALSE	60	CAGGAGAATTAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKCTEEEQIFDLIERNKATLSEKQVGCAFNILWQFQKQKTSSKNVDYVKDHPQFLTLRNLTTDKIELMNDDTLVNVLYITQQLAVEAHDRLVEALVTEAWKRLERRVLWVHHLRSRVIFFRAGTVKSCRKRMESCLPIKHH	136970	132103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_133017_134480_134993_136902
824440	contig_1154_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_87059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTACTTTTCTAGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141855	143065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_141900_143100
824443	contig_3787_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_102348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGCCCAGAAATAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13680	14570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_13700_14600
824444	contig_12142_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_147785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTTGTTGTTAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5745	3607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_3600_5700
824446	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
824447	contig_4065_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_133403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTAGTTTTTCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593022	591848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_591800_593000
824448	SIRV6	+	503	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	353	0	180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
824449	contig_11978_pilon	+	742	4	Intergenic	novelGene_62984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	13.9522996909709	951	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	143	523	1495402	1499771	FALSE	40	AAAGCATACCCATCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFPAAGAGPDPRPAERGGVFRAEAGPGRPEAEGRGKVTWRGAVRSAHMSSMWATLQRAACGAGLNQRRDFFSWLTQWFSKAPAKAVVAQKTPIKVELVAGTMYRWCVCGRSKKQPFCDGSHFFQRTGLVPLKFKAQETRTAVLCTCKATQRPPYCDGTHKSERVQKAEVGSPL	1495259	1499990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1495450_1495809_1495843_1496425_1496546_1499591
824451	contig_6654_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_85688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42302	40781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_40800_42300
824452	contig_14516_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_153952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413395	414025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_413400_414000
824453	contig_9505_pilon	+	1023	9	Intergenic	novelGene_121850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	140.518459641429	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	64	678	530721	605581	FALSE	40	TCTTGAACAAGAGGCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSEMMMGRFAKDS	530657	605926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597992_604972_604993_605567
824454	contig_1925_pilon	-	778	3	Intergenic	novelGene_162223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAATGTAATATAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566865	563860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_564407_566244_566349_566737
824455	contig_6873_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_129842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCACAGTTACAGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780532	781199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_780500_781200
824456	contig_4678_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_126013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATGTGTGACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272091	273034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_272100_273000
824458	contig_12270_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_113743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14456	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14500
824459	contig_6163_pilon	+	906	3	Intergenic	novelGene_103822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	36	713	171191	173264	FALSE	30	GGTCGCTATTAGTCAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AREVSLDYERSMNKINFDQIVSSKPDTFFYVTLPKKEEEKVPEKGLVSVPEYPFQEQKEDFTFVSLLTRPEVITALSKVRAECNKVTAMSLFHSTLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQMFLKDTWISTLKVAVRSSLRDMSKGWYNLYETHWEVYLMSKLRKLMELIKYMLQDTLRFLVQDSLTSFSHFISDACCSVLDCTDDMVWGEDFVNSPYRWGPAGWGSCWHQNPSLPGPRG	171155	173457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_171291_172017_172230_172898
824461	contig_299_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_129492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACAATGCACATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585356	1586937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1585400_1586900
824462	contig_15105_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_150999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGACACTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815353	816756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_815400_816800
824463	SIRV6	+	421	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	346	0	180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
824464	contig_10642_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_78690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGACCCATTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216907	217546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_216900_217500
824465	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9284	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824466	contig_4364_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_3677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACATCAGCTAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
824467	contig_5217_pilon	-	361	4	Intergenic	novelGene_135787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_3	1146.01522192722	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	22	360	560372	558723	FALSE	15	AGTCCCACTATGCGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWY	560393	558721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558851_559273_559374_559858_559966_560368
824469	contig_5479_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_133582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	260	394	188816	188950	NA	55	GGAAAAAAAAAAATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLHVFFLLPEPSFEYCLVGELLLTIWTSAQKSLLGPLFCSPLFAKSGLGALPLCSSTTVLLAQTIITCPIVCLPYKGRATSVLFIMCLQQSRLMTKNSCWCPTNQAPPLLSFENMGGFLYLCKPQFSRL	188556	189433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_188600_189400
824471	contig_9415_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_109814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTGCACTGGCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782498	1781701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1781700_1782500
824472	contig_7412_pilon	+	1714	5	Intergenic	novelGene_76302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.20156211871642	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	405	788	337096	338217	FALSE	15	AGGAGCTCTGTCCTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCDPGPGPACLPAKTFRSYLPRCHRTYSCVHCRAHLAKHDELISKSFQGSHGRAYLFNSVVNVGCGPAEQRLLLTGLHSVADIFCESCKTTLGWKYEQAFETSQKYKEGKYIIEMSHMVKDNGWD	334101	339143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_334320_336909_337237_337408_337453_337801_337911_338127
824473	contig_12635_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_60850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGACAAAACATTAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562333	563457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_562300_563500
824474	contig_10642_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_78656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	1721	2032	149062	148751	NA	50	AAAAAAAAAAGTGTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTHSLGPRISFPPSPGGVAQAQVSAVTAGWEEERGPPERLPDYQLGPRWTPRLLQEDQNPAPGRLENLVARPSSPKGETQVSMHLIHTPRADPREGKHQFNE	150782	148749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_148700_150800
824479	contig_15120_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_108013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202640	200615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_200600_202600
824481	contig_504_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_54451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAGAGAGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253653	252776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_252800_253700
824485	contig_614_pilon	-	899	2	Intergenic	novelGene_132641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCCAGTGCAGTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927663	923762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_923996_926997
824486	contig_8276_pilon	+	2572	2	Intergenic	novelGene_174493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	21	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2448	125	2572	481261	485615	FALSE	60	GAGCAAGAGAAAATACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNVYEHLTLSNKEVQTHFAELQEKFSSLQSEHKILHDQRCQMSSKMSALQSYVDTLKAENSVLSMNLRNFQDDLVKEVTLGPEEGSILSLSFSCVTDSPILKSFGESSFCKDLLEQTGEISLLNNLEENISANQPDAAEVSCSSLEEEARAERGIPSRPVRGTEEPEALCQKCLRSLKKLGGDMESQRIMKNKEIQELERLLSSEREELECLRKQHLSENEQWQQKLTSVTVEMESKLAAEKKQTAHLSLELEVARLQLQGLDLSSRSLLGAGIEDAIRGGNESCNIKESEEYTPKAKGRTPKHDIRQICEDVQQDLSLEIEKIAETDAVSQTGQQFGMPSSDTGSETPLGDEAQGWSECVSELSFSDPHALVPMDFLETQVTIQNLQVQVKETSNENLRLLHVIVERERKLETLLNEVKELDSEVGLQKVRLTTKTEACIELEKTVEELKEEISDLSEKLRFFSSDNPEVYRKVKTLEDLNSNLETTDKLPDEVTEDDVAMVNDSWKEKFLKVENELERIKSENASMEHHILSMEANLETVQTEKLYLEKDNESKQKVITCLEEQLAEVTTERNQLRGELGTMSRENKELSQMSERMKEKLQQLECHHDECLRHIQVVEAEVKEKRELLQTLSSDANGRLKEKAHLQEQLQNLQKDSQALSLVKGELENQIGQLNKERDLLVRDLESLQNKLSESEEGKAAHSQALEAALVEKGEIAVRLSSTQEEVRQLRNGIEKLKVRIEADEKKQLHVLEKLKESERHSDALKDKVESLERELQVSEENQELVILDAENSKAEVETLKEKVEEMAETLKGLELDLVAVRSEKEHLMEQLREKQSQVLELEPLLSSLKSLIEEK	481136	485615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_481966_483872
824487	contig_14357_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_121693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGTCTGTGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629168	630136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_629200_630100
824488	contig_14357_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_121694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAAAAAAACCTGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630636	631472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_630600_631500
824493	contig_11978_pilon	+	1254	5	Intergenic	novelGene_63048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGCGTCCGGAACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796556	1802643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1797340_1798937_1799093_1799631_1799714_1800599_1800756_1802565
824494	SIRV6	+	324	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	530	19	364	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824495	contig_13292_pilon	+	1730	3	Intergenic	novelGene_142921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	340	junction_1	76	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTGGCACTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66992	243115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_67134_148532_148665_241658
824496	contig_12270_pilon	-	376	2	Intergenic	novelGene_113206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	15	CTGCTGGTACCACAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
824497	SIRV4	-	490	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	24	103	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	224	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGGTGGCGGTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824500	contig_4659_pilon	+	1179	3	Intergenic	novelGene_118259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAATAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884300	904533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_884812_897839_897943_903968
824504	contig_13055_pilon	-	798	7	Intergenic	novelGene_104949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_3	6.57436097443867	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	10	798	64901	55167	FALSE	40	AAGAAAATGAATCGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHMLIQNEYCNGGSLADAISENYRSMSYFKEAELKDLLLQVGRGLKYIHSMSLVHMDIKPSNIFISRTSIPNAASEEGDEDDWASNKVMFKIGDLGHVTRISSPQVEEGDSRFLANEVLQENYTHLPKADIFALALTVVCAAGAEPLPRNGDQWHEIRQGRLPRIPQVLSQEFTELLKVMIHPDPERRPSAMALVKHSVLLSASRKSAEQLRIELNAEKFKNSLLQKELKKAQMAKAAAEERALFTDRMATRSTTQSNRTSRLIG	64910	55166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_55282_56559_56706_56797_56969_57882_57969_58057_58154_60532_60680_64873
824506	contig_20561_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_166371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGCTTTAGTTTAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80178	81122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_80200_81100
824507	contig_13461_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_146605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCCTTCCCTAGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47322	49386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_47300_49400
824509	contig_13021_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_8107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCAACTTAAATAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119206	117786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_117800_119200
824510	contig_5389_pilon	-	773	8	Intergenic	novelGene_142988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	49.0276889697473	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	84	773	15088	4677	FALSE	15	GTGAGCTTCCATGCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTLRDQINSDHRTRAMEDRYMEVSGNLRDLYDDKDGLRKEELNAISGPNEFAEFYNRLKQIKEFHRKHPNEICVPMSVEFEELLKARENPSEEAQNLVEFTDEEGYGRYLDLHDCYLKYINLKASEKLDYITYLSIFDQLFDIPKERKNAEYKRYLEMLLEYLQDYTDRVKPLQDQNELFGKIQTEFEKKWENGTFPGWP	15171	4676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_4816_5512_5596_6493_6586_6996_7070_8644_8751_8855_8909_14657_14706_14992
824511	contig_8650_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_162635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATCCACCAGCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375808	376735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_375800_376700
824512	contig_11832_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_106957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTATACCAGTTAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392606	391987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_392000_392600
824518	contig_20614_pilon	-	1259	6	Intergenic	novelGene_107618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.24337600663307	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	77	619	555049	543776	FALSE	25	GCACAGGCTCAGGCAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLRPLDKLPKLNTATILLVSTEDALLQQLADSMLREDCASQLNVHLAKSLPLPSNVTRPRIDLIVFVVNLHSKYSLQNVEESLRHVDASFFLGKVCFLATGAGQESRCSIHHNTVVTLAHTYRSPLLFCDLKMEDFRVTMAQRLVRMLQICAGHTPGISALSLLSLLQSPESPSLEDL	555125	543135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_543917_549276_549369_550676_550757_553091_553185_554408_554489_554992
824519	contig_1785_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_175094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1431	1748	354727	354410	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNVHDIMLRESAISKNEDKIKTTILFKNTSMHTNKKGQMKAHLCINNCAFLDVIICDFYFLKFFSAIPKMSNRRITNFYFKMFKNHKTTKILNCSLFGKKRRFQ	356157	353823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_-_353800_356200
824525	contig_8145_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_118651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737659	738594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_737700_738600
824527	contig_19352_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_122396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGCCTTCTCCGGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214590	216174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_214600_216200
824528	contig_5005_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_84330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCCTATAGGGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535739	536353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_535700_536400
824529	contig_10103_pilon	-	1007	4	Intergenic	novelGene_86151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	29.8105126870818	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	235	909	475881	460298	FALSE	50	ACTTAAAATGATGTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGTGRSRLRSGRRRSLAFSRRFTVQCGRQAGELWSQSAVLLRLLLLRSAFFAALRASLSAGSGRSGFVRLSYDEAFAMANDPLEGFHEVNLASPTSPDLLGVYESGTQEKTTSPSVIYRPHPSALCSAPVQANALDVSDLPTQPVYSSPRRLNCAEISSISVHVTDPAPCSTSGATAGLTKLTTRKDNCNAEREFLQGATITEACDGSDDIFGLSTDSLSRLRSPSVLEVREKGYERLKEELAKAQRELKLKDEECERLSKVRDQLGQELEELTASLFEVGLSTPRQEQYLDSLCINRIVY	484878	460199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_460463_474368_474628_475630_475907_484669
824530	contig_10235_pilon	+	1063	4	Intergenic	novelGene_46626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGGGGGCCAGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608688	610418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_609314_609537_609738_609955_610055_610279
824533	contig_7513_pilon	-	1492	8	Intergenic	novelGene_88933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	73.796465818811	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	109	1263	87692	36503	FALSE	45	CAAAAATATGCCCTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLSAEPGSGCRGSPPRLPPGRWLWLRAGLPAVDFRMSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGDKIPLLCVPFEKKDFVGLDTDSRHYKKRCQGRMRKHVGDLCLQAGMLQDSLVHYHMSVELLRSVNDFLWLGAALEGLCSASVISHYPGGTGGKTGARRVQGSSLPAEAANRHRPGAQEVLIDPGALTTNGINPDTSAEIGRAKNCLSPEDIIDKYKEAISYYSKYKNAGVVELEACVKAVRVLAIQKRSMEASEFLQNAVYINLRQILLIGK	91725	36273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_36524_36741_36868_43663_43786_57076_57104_66270_66400_71522_71669_87108_87703_91627
824534	contig_20610_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_67638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACTTGGTTTAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33338	31135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_31100_33300
824535	contig_10311_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_50389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCTGTCACCAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50798	48605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_48600_50800
824537	contig_6028_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_156600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTCCACTGGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351386	349625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_349600_351400
824538	contig_9415_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_109864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGGCTGCTCCTTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2011807	2010779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2010800_2011800
824539	contig_14223_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_156972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27505	29281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_+_27500_29300
824541	contig_9886_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_147085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCGGTTGTGGGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229722	228982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_-_229000_229700
824542	contig_13744_pilon	-	1366	5	Intergenic	novelGene_77172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	15.6744218394172	38	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	507	962	524247	512480	FALSE	40	ACTGAAGTAGAAATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVLSYVSVKRLTPAPAIIFYGIIATIYIIPGDINSLVNYFSFAAWLFYGMTILGLVVMRFTRKELERPIKVPIVIPILMTLISVFLVLAPIISEPTWEYLYCVLFILSGLVFYFLFVYHKFGWAQRISKPITMYLQMLMEVVPPEEEPK	532071	512075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_512545_514588_514764_523043_523194_524181_524532_531849
824546	contig_10855_pilon	+	1820	13	Intergenic	novelGene_124276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_6	115.547128432034	68	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	93	1616	19140	26018	FALSE	20	CAAGGACACTGGGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRPEPGVLPPAHPAAPGSALPCLSFPLGTMAGRGSVVSLLALPGHDSAKEPPQVSSRFLRAWHPLPISARMPARRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACESKSWYRAKHHASGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESVRHPGDYVLCVSFGREVIHYRVLHRDGHLTIDEVVCFCNLMDMVEHYSKEKGAICTKLVTPKRKQGTKSAEEELAKAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHKNLVRLLGVILHQGLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFSSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKAVSEAVEKGYRMEAPEGCPGPIHTLMGSCWEAEPSRRPPFRKLAEKLARELRSAGTPASTGGQEADGSTSPCTQEP	19047	26222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_19212_19385_19446_19838_19953_20062_20179_20271_20492_21208_21303_23470_23537_24258_24359_24431_24517_24787_24862_24975_25172_25594_25682_25778
824547	contig_6375_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_73061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGCCTTGGCAGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676571	675552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_675600_676600
824548	contig_7457_pilon	-	487	4	Intergenic	novelGene_31724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	1176842	1174926	FALSE	15	TTGTGGCTCACTGACGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
824551	contig_12079_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_67489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	130	687	638707	638150	NA	35	TTAAACAAACTGTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPVSGPVPALDWVRPAYLQGERVTWPRGAATCRTGLASKRRRGRRWGLDSLCYLLTLLWVVMSFFLQSFSVFVNHLPPPPPQELRSFKKIRISTFSRLQSVLKVYSNATLKFLKKESCLNRSKSPRRRTPTPEFLPASESERNPDFPCSSKGAWEMRHASLAGSFAPVHFTPSCALWTGIGWG	638836	636717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_636700_638800
824552	contig_5019_pilon	-	1682	14	Intergenic	novelGene_109236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	458.053819736445	162	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	83	1534	527677	404842	FALSE	25	TAATTATTTACTCTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGTFRPRPGGSWGPGLRAIEKEKGKNMSGHKCSYPWDLHDRYAQDKSVVNKMQQKYWETKQAFIKATGKKEDEHVVASDADLDAKLELFHSVQRTCLDLSKAIVLYQKRICFLSQEENELGKFLRSQGFQDKTRAGKMMQATGKALCFSSQQRLALRNPLCRFHQEVETFRHRAISDTWLTVNRMEQCRTEYRGALLWMKDVSQELDPDLYKQMEKFRKVQTQVRLAKKNFDKLKMDVCQKVDLLGASRCNLLSHMLATYQTTLLHFWEKTSHTMAAIHESFKGYQPYEFTTLKSLQDPMKKLVEKEERKKITQQESTEAAAEELNQLISLADENQSKESSSFKTEDGKGILSALDKSSAHNACSGPVDELLDMKPEEGACLGPMAGAMEPEGADKDDLLLLNEIFNASSLEEGEFSKEWAAVFGDSRLKEPAPAMAPGEPDPKPQAGSGFLPSQLLDQNMKALQASLQEPAKAASDLTAWFSLFADLDPLSNPDAVGKTDKEHELLNA	546070	404693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_404964_416367_416638_426878_426921_427019_427083_429674_429728_432232_432331_444197_444297_444642_444769_505172_505372_509192_509317_517865_517939_521461_521628_527660_527704_546014
824555	contig_5881_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_129038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGGCTCCAAGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326814	327075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_326800_327100
824556	contig_7207_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_72039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323567	322398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_322400_323600
824557	contig_14643_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_99143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTACTAAGTAAAAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158734	160547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_158700_160500
824558	SIRV4	-	528	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	86	3	-86	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAAGGATTACGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824560	SIRV4	+	573	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCATTAACATCTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3661	5138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
824561	contig_1836_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_71054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACTTAGTTTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866307	865507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_865500_866300
824563	contig_11815_pilon	-	833	5	Intergenic	novelGene_50902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	106.519951182865	982	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCATTTTTCTTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156958	153842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153979_154794_154850_155177_155255_155551_155640_156481
824564	contig_6589_pilon	+	1089	3	Intergenic	novelGene_26313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	8	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	52	708	2353549	2354298	TRUE	10	CCCACTTTGTGGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQPRSQRVSGPAPPTAEMPLLLLLLLSLLWGIECVGSQGSQAGAGASTNPRSPRWYRDLVDGYQLQVQKSVTVQEGLCVFIPCIFSYPPDGWKDSDPVLGYWFQEQAYNFNHEQVAPVATNNPYRKVDSQTRDRFQLLGEPWNRSCSLVIRDAQRRDTATYFFRVERGNTVKFSFKKYTLALEVTGLTQKPDVYVPETLEPGRPVTLLCVFPGDFEGCPAPKFSWTGVAVSPPRS	2353497	2371607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2354054_2354146_2354433_2371360
824566	contig_18108_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_33528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294093	292460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_292500_294100
824567	contig_14618_pilon	-	284	4	Intergenic	novelGene_136861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACGCAGTACCTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350930	1327336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1327380_1344835_1344943_1348517_1348598_1350876
824568	contig_15062_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_162309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286055	287338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_286100_287300
824569	contig_5686_pilon	+	1695	3	Intergenic	novelGene_45196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAAGAGTGGTGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29265	35079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_29673_31067_31498_34221
824570	contig_14925_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_55061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	677	979	11421	11723	NA	10	ATTATGCCTCTGGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNQSSVLYKPSRSRKALQAKLQPPDLKEFMGQGGQSGLCKVRELINDRAGVRIHVYHLLVCFALVCLNSVGTLVFMDPTPVKCSVKNTCFTSGGCSLA	10744	12118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_10700_12100
824571	contig_13571_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_128134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373972	375163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_374000_375200
824572	contig_10197_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_115185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCATGAGCCAGTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483762	484314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_483800_484300
824573	contig_10197_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_115186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTTTGAAAATGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484414	485540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_484400_485500
824574	contig_9720_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_116794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414059	415476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_414100_415500
824575	contig_1618_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_141785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199928	198951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_199000_199900
824576	contig_4364_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_40	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	462	596	1057	431498	431037	NA	5	GGGGGGGCATGGTGGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVCVCVCVCVSVCGYLRFTCGRKKVVLCVHVCVCGCLRFTCGRKNVVLCVRVCVCLCVWVSAVHLWTEECGAVCVCVCVCGCLRFTRGWKNVVLCVCVCVYGCLRFTCGRKNVVLCVRVCGCGCLWFTCGQKNVVLCVRVCVCGCLRFTCGRKNVVLCVCLCVWVSAVHLWTEECGAVCACLCVSVCVGVCGSPVDGRMWCCVCVCVCLSVCVGVCGSPMDGTMWCCVCVSVGVGVCGSPVDGRMWCCVCVCVCVCLSVCVGVCGSPMDGTMWCCVCVSVGVGVCGSPVDGRMWCCVCVCLSVCLCGCLRFTCGRNNVLCVGVCVCLCVWVSAVHLWTEECALCVCLCVSVC	432093	431034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_431000_432100
824579	contig_7025_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_104366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCATTAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37176	38334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_37200_38300
824581	contig_4202_pilon	-	1111	2	Intergenic	novelGene_147067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTGGGATGTGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37146	16570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_16626_36090
824582	contig_9481_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_149620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTGCAGTGGCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44760	42122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_42100_44800
824583	contig_6137_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_59133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAGTAAGATAAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909352	910829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_909400_910800
824586	contig_11416_pilon	-	457	4	Intergenic	novelGene_145343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_2	95.3671268776033	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGTAGCCCCTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124638	122842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_123079_123169_123228_123308_123404_124570
824587	contig_8312_pilon	+	1522	2	Intergenic	novelGene_152902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGTCTCTGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278637	280276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_279846_279962
824591	scaffold_4438_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_174541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAAGGGAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403630	404745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_403600_404700
824595	contig_4929_pilon	+	1150	3	Intergenic	novelGene_176677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTGATGTCACTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51393	54237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4929_pilon_+_51627_52780_52841_53380
824597	contig_13937_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_167365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	572	943	106392	106763	NA	30	TAATGTAGAAGACTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSFSFTSFCTSPLGQIEFLLCLSLLLCPGRSFLGFSDAAVTSEAFPADLAPPHLWLSPCFCRFTLLRPPLCQSSRLAETFSAGTTSCSLSCSLGSSLWLSFSVSFVLCARCDSSFRSCNNF	105820	107356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_105800_107400
824598	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	101	1	-86	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	72	311	2458	3109	TRUE	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2386	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
824599	SIRV6	+	328	6	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3149_10707
824600	contig_19974_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_130466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTCTTATAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147166	146730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_146700_147200
824601	contig_9696_pilon	-	245	4	Intergenic	novelGene_68795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	26.3354429534716	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATATTAAGGACCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323971	322216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_322250_322337_322415_322785_322840_323890
824602	contig_6076_pilon	-	986	3	Intergenic	novelGene_81742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55841	54742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_55039_55101_55545_55594
824603	contig_6871_pilon	+	786	5	Intergenic	novelGene_21666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	11.146748404804	659	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTGCCAACTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795175	796545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396_795495_795646_795698_795945_796023_796104
824605	contig_8149_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_169953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAACTTTGTGCAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522761	523464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_522800_523500
824606	contig_8149_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_169954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATTAAAAAAAAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523414	524448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_523400_524400
824608	contig_9345_pilon	+	371	4	Intergenic	novelGene_24336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_1	737.148711063258	52	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117940	120179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_117988_118097_118154_118235_118324_119999
824609	scaffold_19766_pilon	-	665	2	Intergenic	novelGene_34388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGCCTAGGGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735443	734275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_734622_735124
824610	contig_4742_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_130965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35521	37952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_35500_38000
824612	contig_4659_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_118251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863511	863797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_863500_863800
824613	contig_8015_pilon	-	2073	13	Intergenic	novelGene_176679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	4.39933707127184	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	717	2024	23355	7444	FALSE	40	CCAAGTTTTTTAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAHTRKELCALQGLYQAASRSEYLADYLENYGRKGSAPQMPTQPPPSRVPEVLSPTYRPSGRYTLWEKGKSQTPGSSRSSSPGRDTMNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNTRELRDYCLQRLYMRDLSHSSSVHTALMEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTVRPKSIPENLDHLPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCNYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRARKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPVTGEWHTFNDSSVTPMFSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM	32602	7394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8015_pilon_-_7532_7797_7919_8120_8229_8452_8532_8670_8752_8833_8938_9141_9207_9572_9684_9781_9894_10321_10446_10923_10975_23091_23903_32433
824615	scaffold_12510_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_151422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAAGGGGGAATCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664340	665130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_664300_665100
824616	contig_1335_pilon	-	246	4	Intergenic	novelGene_166511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	151.847145365185	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGTGTATGAAGATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517452	382301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_382368_424212_424281_442932_442996_517403
824617	contig_5690_pilon	-	887	10	Intergenic	novelGene_119675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	21.299162448032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	217	681	271518	235744	TRUE	80	AAAAAAAAAAATGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFYLLSTLGGYLVTSFLLLKYPTLLHQRKKQRFLSKHISHRGGYCHDLGVLPLIDLACGKIEGAGENLENTMAAFQHAVTIGTDMLELDCHITKDEQVVVSHDENLKRSTGVNVNISDLKYCELPPYLGKLDVTFQRACQCEGKDNRIPLLKEVFEAFPNTPVNIDIKVNNSMLIKKVSELVKQYEREHITVWGNASYKIVEKCYKEIKRTTHHVKMSKVSHLAF	281969	233852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_234004_234406_234459_235740_235801_245763_245854_246370_246490_252192_252239_253436_253573_271501_271545_277048_277109_281839
824621	contig_7619_pilon	-	774	6	Intergenic	novelGene_162149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_2	38.4915575159021	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	186	671	30763	23773	FALSE	30	ATGTTCTGTCAAAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGLCTSPVPVVLFALFPRAGIDEGSPLFRLRLPLAFPAARVSDDSQVTLKSASCFLNTSLKMEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	32283	23669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_32143
824622	contig_2161_pilon	+	1478	7	Intergenic	novelGene_114924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	25.6672077865037	140	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	442	1158	832462	859116	FALSE	40	TTCCCAAAATATCAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFDIAIWWLIDRPIFKCEQQRTSEELQNIYRAAISAGIIGFAYGGIPAFVHAKQRYIEQSQAEIYHNRFDAVQSAHRAATRGFIRYGWRWSWRTTVFVTIFNTVNTGLNVYRNKNAMSHFVIAGAVTGSLFRINLGLRGLVAGGIIGALLGTPVGSLLMILQKYCGESVQERKQKDRQALHAMKLDEWKARLQMTELLPEEIESSLQKNRSEDDAKKIEALLNLPRNPSSTDKQDKD	832020	859436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_832515_834735_834902_839290_839380_839886_839955_847906_847986_850901_851013_858965
824623	contig_9575_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_169722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAGTCACGGTCTCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489349	490676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_489300_490700
824625	contig_8241_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_157487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGGACCAGTGAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210587	211132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_210600_211100
824626	contig_20493_pilon	-	1665	13	Intergenic	novelGene_86403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	76.2049046977949	1	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	473	1600	49056	37388	FALSE	10	TGCCTGAGCCTCCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	55240	37322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49101_49197_49252_50426_50565_54457_54665_55211
824628	contig_12948_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_126220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302162	301328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_301300_302200
824629	contig_4087_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_156074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCCTCTGCTTAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103636	104403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_103600_104400
824631	contig_15857_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_152075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105077	103149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_103100_105100
824632	contig_2204_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_71688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGCCCTATGTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51136	50597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_50600_51100
824633	contig_3825_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_78050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	40	459	2590400	2589981	NA	15	ATCTGGGTGGAGTGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVIPIPRRVRSFHGPHTTCLHAACGPVRASHLVRTKYNNFDVYLKTRWLYGFIRFLLYFSCSLFTAALWGTLAALFCLQYVGVRALLRFQLKLSVVLLLLGRRRVDFRLLNELLIHGIHVTVLLVGGLGWCFMVFVDM	2590439	2588528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2588500_2590400
824637	contig_11986_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_69128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136636	138546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_136600_138500
824638	contig_3604_pilon	+	942	5	Intergenic	novelGene_139990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_4	898.788211983224	6833	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGCCTGTGTCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45378	51565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47925_48032_48132_51168
824639	contig_10734_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_51153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTCCCCCTCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918684	917999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_918000_918700
824642	SIRV6	+	234	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-399	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1886	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
824643	contig_15114_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_121227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	70	717	1687560	1688207	NA	35	AACAAACGTTAACGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLGGPGPGPGGPEERDGRQQPQQQPPPPQPQQQQPPPSQQPPPTQQQPQQFRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVENDRERYGSRNDDRDNSSRERREWGRRSPDRDRHRDLEERNRRSSGHRDRERDSRESRREKEETRAKEKPEGTDRAGGNKAVEPPVSQVGNVDTVSELDKGESEATVVKPSEESPAEATSSVEPEKDSGSAAEVPR	1687490	1688577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1687500_1688600
824644	contig_3584_pilon	-	1026	3	Intergenic	novelGene_108191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	25.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTCTCTACTGATAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541823	534344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_535031_536549_536702_541635
824645	contig_17803_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_175029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115420	116484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_+_115400_116500
824646	contig_12761_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_164044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	442	1329	107	1435	46598	45270	NA	10	TTCTCTGGCCACATTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPLERPHSPAPQLPVVAPDPSPAGLPDPSTPPKSRAHYPEECTKVSEAPQSLLSPPQSLPSRVLEPTDNATESGISLPLSVEDTAPQKSKLCPPPPSAPQMPSPFPPPSPSPAYAAPPASSSSAPPAPELESSEQKFYNFVVLHARADEHVALRVRERLEQLGVPDGATFCEDFQVPGCGELNCLQDAIDHSAFTILLLTPNFDCRLSLHQVTQALMSSFVRRGWQDSVIPFQPLETSQLSSDVSRLLSSLVCLDEHSQLFERKVKNTFKRQKLQERKANWKKEQEVRAVREHSQRLDGERQQVAEMNVACSAYWQSYLAWQAQMEKLHATLRTQMSLGTQMPPGAQMPFCGQVPLGFQPPLPTWPGYPQPPLSPWLAGTPPPAFPQPSAFLPAFPGPPQSPGLQPLIIHHAQMVQLGLNNQMWGQSGAQAPEDKTQEAE	46704	44890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_44900_46700
824647	contig_3277_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_74742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAGCAGTATTTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283044	284867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_283000_284900
824648	contig_7619_pilon	-	779	3	Intergenic	novelGene_162164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	3.5	249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	57	425	439978	438814	FALSE	35	AAAATACTTCACCATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKPLVVSKQRREVLCGIPTQVVCTAFSSHILVVVTQFGKMGTLVSLEPSEMASDISRPMLTTKVLLGQDEPLIHVFAKNLVTFVSQEAGNRAVLLAVAVKDRSMEGVKALREVIRTCQVW	441500	438459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_438967_439762_440013_441478
824649	contig_7035_pilon	-	1639	9	Intergenic	novelGene_83544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	21.5334042826489	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	792	846	1637	775044	773698	FALSE	5	CAGCTTGTCTGGTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCQLRCLPFRALHFVFSPGFINHISGTPHALIVRRYLSLLDTAVELELPGYRGPRLPRRQQVPIFPQPLITDRARCKYSHKDIVAEGLRQLLGEEKYRQDLTVPPGYCTDFLLCVSSNGAVLPVRTQDPFLPYPPRSCPQGQAAWNPTTQDPTQRVVLMLRERWHFCRDGRVLLGSRALRERHLGLMGYQLLPLPFEELESQRGLPQLKSYLRQKLQALGLRWGPEGGGEGKHSGLRWPPHGGQTVCTLAPILVLIKGPFLP	778120	773695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_773905_773980_774096_774171_774308_774390_774483_774702_774863_774962_775177_775985_776166_776835_777260_778011
824652	contig_20614_pilon	+	636	7	Intergenic	novelGene_107545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1270.1618991294	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	64	543	152671	155100	FALSE	25	GATAGTTTGTCTTCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGMKSVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152049	155193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152102_152659_152696_154013_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
824654	contig_10642_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_78710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTTTAAACAAAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863007	863363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_863000_863400
824655	contig_12964_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_131658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGGATGTTAATTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131688	129762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_129800_131700
824659	SIRV2	-	487	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-49	-33	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	25	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGACGACGTCGACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4781	3698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4477_4687
824664	contig_14225_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_52754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCTATGACAGTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367970	368242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_368000_368200
824665	contig_13108_pilon	-	2119	6	Intergenic	novelGene_135870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	3.18747549010185	6	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	7	861	87487	70475	FALSE	40	CACAGCAGAGCATGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEIETNGTFGIQRVSVSFEQTNLIIEPDASLQQHFIIRFRSLEQNTAASLLSPRSGNPGYIVGKPLLALTGDVSHSMTLLQSQGDGTCSAKRHRVQFGVNAISGCKLRLRKADCSHLQQEIYQILHGRPRPEHVAIFGNADPAQKGQWTRILSRNCNVLAVNCTSCCFIPVSLEIQVLWAYIGLQSNPQAHVSGARFLYQCQSVQDSQLRTEVSLTTLVTFVDITQKPEPPRGQPRMDWKLPFDFFFPFKVAFSRGVDSQKGSVFPILILCLLLLGVLSLDTK	87493	69216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_70712_79018_79157_84161_84316_84653_84749_86361_86470_87364
824666	contig_5918_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_99583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1934051	1932673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1932700_1934100
824667	contig_10453_pilon	-	2019	8	Intergenic	novelGene_162043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	7.38172039015075	2	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	8	1015	241902	222789	FALSE	35	TTGGGAGAAAACAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAMATFVSELEAAKKNLSEALGDNVKQYWANLKLWFKQKISKEEFDLEAHRLLTQDNVHSHNDFLLAILTRCQILVSTPEGAGSLPWTGGSAAKPGKPKGKKKLSSVRQKFDHRFQPQNPLSGAQQFVAKDPQDDDDLKLCSHTMMLPTRGQLEGRMIVTAYEHGLDNVTEEAVSAVVYAVENHLKDILTSVVSRRKAYRLRDGHFKYAFGSNVTPQPYLKNSVIAYNNLIESPPAFSGPCAGQNPASHLPPDDAEQQAALLLACSGDTLPASLPPVNMYDLFEALQVHREVIPTHTVYALNIERIIMKLWHPNHEELQQDKIHRQRLAAKEGLLLC	241909	221784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_-_222942_223372_223536_228922_229075_230734_230945_232346_232445_236247_236314_236568_236661_241828
824668	contig_4136_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_161253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180389	181059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_180400_181100
824669	contig_5253_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_61564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACACACCCAGAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200732	201272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_200700_201300
824670	contig_4364_pilon	-	650	5	Intergenic	novelGene_74	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	18.6413518823072	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	63	650	718282	711471	FALSE	10	GTGCTGCAGGGCATCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYLARQSELEVIPLVQTFGHMEFVLKHNTFAHLREVALFPNTLNPHEAESLVLVGSMVDQVMELHRGARWLHIGCDEVYYLGEGEASRQWLQQEHNSKAKLCLSHVRAVASHVLARHPATTPLVWDDMLRDMPEDLLEESGLPHLVEPVLWDYGADLDVHGKVLLMEKFQKCGFPRLWAASAFKGATGAHQALTPVEHHLQNHLQWLRAARAGPAG	718344	711470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_711632_712066_712139_713580_713765_715092_715258_718276
824674	contig_8598_pilon	-	1943	9	Intergenic	novelGene_22890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	67	junction_3	59.2347026665957	15	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	55	1452	147528	122305	FALSE	30	TGACTTCACCACTGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQYGGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKRHHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA	147582	121813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_122414_127738_127939_128205_128308_142250_142386_142529_142846_144294_144455_145483_145669_147143_147278_147471
824676	contig_10437_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_38452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955143	953061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_953100_955100
824678	contig_8978_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_49416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTAAAAATGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361439	362845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_361400_362800
824679	contig_11566_pilon	-	2210	13	Intergenic	novelGene_166700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	240.935488714764	2	119	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	659	1780	203295	186029	FALSE	50	ATGGAGAGAATAATATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEEKNERYLLLFPNILLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHKNSFEISGSMIERILVSCNNQQDLHEWVDHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPITPSSKHADSKPVPLTPAYHTLPHLSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEVRSSDPSRSHCREGDRTRVNGTWNLGVLNRLSCTSPPPFFISMNLEILAVQYFYL	255247	185598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_186422_189026_189167_189368_189448_191619_191707_194821_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203334_223960_224061_224290_224386_234704_234794_245832_246035_255113
824680	contig_15039_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_110192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAAAAAAACAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369294	371000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_369300_371000
824682	contig_4782_pilon	-	1922	14	Intergenic	novelGene_73607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAAGATTGGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273127	134610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_134783_136247_136311_189650_189695_233392_233445_233541_233608_243963_244242_249344_249486_250934_251060_257041_257178_267533_267649_271122_271198_271530_271664_272302_272410_272712
824687	contig_7933_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_164696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAGCTAATCTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186074	185670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_185700_186100
824688	contig_12278_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_152598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTGAGATCTTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200100	200356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_200100_200400
824689	contig_6589_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_25845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932271	931092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_931100_932300
824690	contig_15882_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_144803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCCCCTCCAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47600	46417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_46400_47600
824693	SIRV6	+	422	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	183	70	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAAGCACTAACGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
824694	SIRV6	+	194	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	508	-1	-338	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGGTAGTCGAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468
824696	contig_91_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_127123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687676	688583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_687700_688600
824698	contig_12080_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_128368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCATCTGTTCAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119401	120727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_119400_120700
824700	SIRV6	+	449	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	6	4	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
824701	contig_9582_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_106848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGCTTTAAACATAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572882	573996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_572900_574000
824702	contig_20951_pilon	+	177	2	Intergenic	novelGene_43090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTCCCGCCAGATAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27188	27577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_27293_27504
824704	contig_16870_pilon	+	1982	11	Intergenic	novelGene_155536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_9	2.93428015022424	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	41	1462	336090	343765	FALSE	40	AATAAAAGCCGACTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPKHWTKERHQFLMELKQEALTFSRDWGADYILFADTDNILTNNQTLQLLMEQGLPVVAPMLDSQTYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRQGCFRVPMVHSTFLVSLRAEGTAQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSAHVCNQHRYGYMNVPVKSRQTLEDERVNFIHLILEALVDGPPMQASAHVSRPPKKPSKMGFDEVFVISLARRPDRRERMLNSLWEMEIAGRVVDAVDGRTLNSSIIRSLGVDLLPGYQDPYSGRTLTKGEVGCFLSHYSIWEEVVARGLAQVLVFEDDVRFQSNFKGQLEQLMEEVEAEKLRWDLIYLGRKQVNPEEEAVVEGLPHLVVAGYSYWTLAYALSLAGAGKLLASQPLHRMLPVDEFLPIMFDQHPNEKYKAHFWPRDLQAFSVRPLLTAPTHYAGDEGWLSDTETSSLWDDDSGRLISWSGSHKTLRDPRLYLASSSGHSFHPQPRDEL	336049	344628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_336150_336719_336855_337021_337227_339094_339215_339539_339617_339704_339812_340724_340858_342597_342726_342906_343111_343512_343766_344108
824706	contig_990_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_76002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTATTGAACTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210695	212170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_210700_212200
824707	contig_8597_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_158707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCCTGAACTTTTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69369	70666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_69400_70700
824708	contig_10980_pilon	-	2579	1	Intergenic	novelGene_162566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269917	267338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_267300_269900
824709	contig_12148_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_140338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGACTTTTTAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93707	94110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_93700_94100
824710	contig_12790_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_35276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	269	619	384204	384554	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSGAPSCYLHAPSTPPHSKLKEAVMSQGLWDLASSRPGLGWGSELGSHHRQPPSASHKAKREAPPSSAPMDILPEWILMPGIEALCAEEALSPSPSQADKGLDTDRIIYINIFS	383935	386153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_383900_386200
824711	SIRV6	+	359	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	14	4	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACACGAACTTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
824712	contig_9414_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_131092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTGTAGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556691	554805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_554800_556700
824714	contig_15022_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_171806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	1477	1800	74359	74036	NA	30	GCATTCATGTGAAATGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESASRKGNATSTIKTLSPRSLGDANSLHSAGNQKVASLNPPSGTVEETGLAICFHKNYRPRKPYGAVLLCNACNLLNHKTKTKPTTKPKCFCPLTQPPLGIYPAVV	75835	74033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_-_74000_75800
824715	contig_15063_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_14465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	22	384	36299	36661	NA	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36277	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
824720	contig_15897_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_49589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCGCACCACCCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877335	876955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_877000_877300
824722	contig_500_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_30945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1445303	1444929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1444900_1445300
824729	contig_8210_pilon	-	1461	6	Intergenic	novelGene_30260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	8.75442745129572	41	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	37	924	357750	222034	FALSE	25	TAACATGCTTCCATCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMSENMTLQRANSDTDLVTSESRSSLTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDENSPANFWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITVKNPAVMMGAEGMEGGASGSQHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKKSSFPICAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFLGKLTIPVQRLLERQAIG	357786	221496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_222181_225086_225257_230874_230951_235955_236051_269331_269440_357458
824730	contig_8145_pilon	-	999	4	Intergenic	novelGene_118649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_3	104.029910228848	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	76	408	735820	733896	FALSE	60	AATTTGAAGAAAAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELVRFQLIIFFSFYMSVCCAWYTIS	756986	733304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_734024_734339_734407_735682_735830_756920
824732	contig_3822_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_133323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292057	293209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_292100_293200
824733	contig_7247_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_176687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGGGATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81717	84223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_81700_84200
824734	contig_9653_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_48254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTTTGAAGCAATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876589	874765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_874800_876600
824736	contig_9177_pilon	+	1743	10	Intergenic	novelGene_32640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	56.2138772902208	7	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	262	1623	50312	56110	FALSE	35	GATACCTCGAAAAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAARSLSRRTRPSRIGRRVPLAGVRGTLRPGSGPWEGDPRRPDRRAPSGPAIRRFRPEGAQSGCRREVPPLPRRRRQGFRRSDSGAAMIEVVAELSRGPVFLAGEALECMVTVTNPLPPTATSACSEALAWASAQIHCQFHASESRVALPPPDSSQPDVQPESQTVFLPHRGERGQCILSTPPKILFCDLRLEPGESKSYSYSEVLPIEGPPSFRGQSVKYVYKLTIGCQRVNSPITLLRVPLRVLVLTGLQDVRFPQDEAVAPSSPFLEEDEGGKKDSWLAELAGERLMAATSCRSLHLYNISDGRGKVGTFGIFKSVYRLGEDVVGTLNLGEGTVACLQFSVSLQTEERVQPEYQRRRGTGGVPSVSHVTHARHQESCLHTTRTSFSLPIPLSSTPGFCTAIVSLKWRLHFEFVTSREPGLVLLPPMEQPEPATWTGPEQVPVDTFSWDLPIKVLSSWFRLRATLCTAERNTAWSYTILTIIAMFELIVAATTSVHLVEDLPLFSEPLPSMMPFSRDWSPQKRLLTVTGARAERLSFE	49628	56230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_49871_50292_50428_50800_50938_51231_51316_51415_51566_51829_51977_52188_52317_52532_52723_53230_53383_55852
824737	contig_7272_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_25302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397513	397013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_397000_397500
824738	contig_3557_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_173613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCCTGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197315	195417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_-_195400_197300
824741	contig_10541_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_144649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATAAGCCATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270402	268987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_269000_270400
824743	SIRV6	+	451	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	34	0	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	486	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
824744	contig_3233_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_56513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111363	112535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_111400_112500
824745	contig_5642_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_153025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAGGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71722	70988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_71000_71700
824746	contig_7898_pilon	+	418	3	Intergenic	novelGene_47571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.5	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGAATTCTTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483965	487531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484076_484409_484454_487267
824747	contig_10183_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_169509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAATACAGTCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131470	132639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_131500_132600
824748	contig_5145_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_131463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	380.376421748539	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	9	1127	956111	951288	FALSE	30	GGTATGCAAGACATCGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVERKSSASAGGASKKRRTITIENKVEIIKRSERGETPSVIGKALGYSRSTIGTILKDKVRIMEHVKGCALMKATVITKQRSGLLIEMERLLIMWLDDQNQRNMPISLTLVQRKARSLFNDLKAARAAREGDCDEEFVASRGWFNRFKVRANLHNIKVRGEAANANVSAASDFPEMLKNDGELLNSHAEELTNEGLKELEQQMIAFEEEDQDQKTPVPKKFLTKELAEAFRLIEAGMAKLEEQDPNTERFTKVYRVVTEGLSCYKAIYDEKKKSSVQTSRMPTSGN	956119	951116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_952140_952957_953012_955790_955930_956037
824751	contig_8587_pilon	-	989	4	Intergenic	novelGene_159136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	4.49691252107735	125	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	84	560	453328	444201	FALSE	35	GCTGTAGGTTTAGAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTRRGAGTRVCAGGSARGGAGVGVPGAMKLTRKMVLSRAKASELDSVRKLNCWGSRLTDISICREMPSLEVITLSVNGVSTLEPVRQCQHLSELYLRKNRIPSLAELFYLKDLPRLRVLWLAENPCCGSDPHLYRMTVLRNLPGLQKLDNQSGCLPSVPGLAWVGDHGAVMLFQSGCLAGMPGRA	453411	443771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_444535_448813_448861_450296_450316_453251
824752	contig_10930_pilon	+	504	6	Intergenic	novelGene_37099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_5	5111.4698316629	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	80	478	339608	342083	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339420	342109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
824754	contig_6862_pilon	-	957	5	Intergenic	novelGene_63769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	8.69985632065266	157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	133	633	799087	781481	FALSE	15	CATTCGTCATGTGTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSELTELLDQVEGAIHDFSEELVQQLARRDELEFEKEVKNSFITVLIEVQNKQKEQRELMKKRRKEKGLSLQSSRIEKGNQMPLKRFSMEGISSILQSSIRQTFGSSGTDKQYLNTVIPYEKKAAPPSVEDLQMLTNILFAMKEDNEKVPTLLTDYILKVLCPT	799219	781156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_781498_783449_783516_795785_795862_797538_797620_798826
824756	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	152	23	-35	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGAGAGTTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
824757	contig_5718_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_110338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAAACAAACCAAACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574180	575522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_574200_575500
824758	contig_6929_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_139369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCCAGTACAAACGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87861	88945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_87900_88900
824760	contig_12970_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_50505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAAAACTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20863	21412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_20900_21400
824761	contig_7933_pilon	-	443	2	Intergenic	novelGene_164695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAATCTAAGAGAGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197972	185664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186027_197891
824764	contig_14338_pilon	+	2624	1	Intergenic	novelGene_174834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAAACCTCAGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19316	21940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_19300_21900
824765	contig_12050_pilon	+	1215	7	Intergenic	novelGene_62650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	198.429668480632	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	146	739	359783	363488	FALSE	5	TGCTTGGAGCCCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAMFEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKVGAEHPRACLPGT	359637	363964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362686_362766_362817_362918_363056_363456
824766	contig_2450_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_160324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATATGCTTAGTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807084	809365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_807100_809400
824768	contig_12402_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_133375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612709	613145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_612700_613100
824769	contig_9036_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_155436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23703	22326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_22300_23700
824771	contig_15777_pilon	-	1689	2	Intergenic	novelGene_75739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCAGGGATGGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174603	170623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_171704_173994
824772	contig_4678_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_126016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289943	289227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_289200_289900
824773	contig_11518_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_109136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGCAATGAAATATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428191	427259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_427300_428200
824774	contig_5590_pilon	-	663	4	Intergenic	novelGene_163028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAGAGCACAAGCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359466	352338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_352702_353454_353504_358766_358981_359429
824775	contig_3270_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_104520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	329	990	251	1240	435229	434240	NA	45	AATGTTTGAACAGGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVYTERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVCTERQEGILHVFSITLLTEVCIERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLHVFSITPLTEVCTERQEGILHVFSITPLTEVCIERQEGTLHVFSITPLTEVYTELQEGTLKVFSMMLRSETSRGKSVRCSKPVSAKQSPGLLFLNKRERNLRTQKRPHWELFDEVTWLKYRYERWKTKDQVKGCCEYILSRKTSTLNRLKAKNAEGN	435479	433098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_433100_435500
824776	contig_9272_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_125931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCTAGAAAAAAATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376692	378049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_376700_378000
824778	contig_2444_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_83801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCGCACCTTACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289151	288547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_288500_289200
824779	contig_16211_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_150047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCCACAGGGTTTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64292	64615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_64300_64600
824781	contig_12884_pilon	-	908	5	Intergenic	novelGene_105003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	521.523249721429	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	412	852	900381	899626	FALSE	10	CACTCTGACTCCTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQVEPPAQKVATPAEDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915294	899569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900588_906202_906349_915235
824784	contig_13542_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_131520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAATTAGAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463481	464201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_463500_464200
824785	contig_6929_pilon	+	597	3	Intergenic	novelGene_139377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4374.5	44	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101622	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101775_130892_130971_131948
824786	contig_19737_pilon	-	950	2	Intergenic	novelGene_158985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	96	395	88454	82625	FALSE	25	TCAGGAAGGTACCCTGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGTRRCRRSAGCCPPLPRGRRGSGALALASAMIRQELSTSYQELSEELDQVVENSEQADEQEEETVTIQGPGVLPGRWVQCWSAVLCQCCSRRPSSGVSPAGCLEKRCPCRGSWCRISGIALVLKPYISN	88549	82069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_82889_88418
824787	contig_19737_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_158984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	246	741	1	741	81521	80781	NA	25	GTGCAGTAAATACTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEASCRPQVVRLSGTQKRRPDDCLQLTALNLTPGSAVTESGHTQAHTGGKRSWEEPFTSKEHLGLQTRKDPPLETVPSAGLVASRTETVNFCSLRPPACVFVTAALGNEQASSSAHCFWEPQRHLSLGVTVYRFLLFSPFLHLSAVLASCLESQSLPPQGLFGVLLLCLEFSSPITRQISAHAFLCKASDLPPGWVTAHPPLLCRRWPVRFFAAVAGGLCVSSWPSLVARAFVRGRHRWPVRLFL	81521	80708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_80700_81500
824790	contig_12437_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_169068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTTGCCTCCTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30713	31910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30700_31900
824792	contig_3727_pilon	-	746	4	Intergenic	novelGene_146750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	92.0036231170635	697	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	16	636	320175	317185	FALSE	5	CTGTCTCTGTCTTATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALRLAARAVRPASWLLGTWQTQIRDTHQRASLLSFWELLPMRAEPLRKKKKVDPKKDQAAKDRLKRRIRRLEKASQELIPIEDFITPVKLLDKARQRPQVELSFEEAERRALLLKKWSLYKQQEHEMERDAIRSLLEAQQEALQELHLTSPELHAEAIKRDPSLLPFEREGPHYTPPVPNYQPPEGRYNNITKVYTQVEFKR	320190	317074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_317510_318461_318621_319550_319635_320122
824794	contig_7635_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_171372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTTTGTTGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137967	136720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_136700_138000
824797	contig_10708_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_174355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGTACTAAGGTGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470787	469990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_-_470000_470800
824802	contig_15744_pilon	+	526	3	Intergenic	novelGene_83585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149609_152556_152712_153326
824806	contig_16411_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_77388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAATCCAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382017	381033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_381000_382000
824807	contig_2043_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_169902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTGGAAGGGTCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681439	682243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_681400_682200
824808	contig_8045_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_35328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGGGTGGGAAGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80462	81078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_80500_81100
824809	contig_7452_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_109169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAGGTCTGCAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424676	425145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_424700_425100
824812	contig_1274_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_137789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGATTAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106836	107603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_106800_107600
824815	contig_4852_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_153959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCATATCATAAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23589	24341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_23600_24300
824816	contig_7379_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_150019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAGGAAAAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513623	515363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_513600_515400
824817	contig_10235_pilon	+	447	4	Intergenic	novelGene_46315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_3	1171.28201367372	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGTGTCTCAGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89927	91872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91651
824818	contig_13456_pilon	-	1997	1	Intergenic	novelGene_153285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301625	299628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_299600_301600
824821	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824822	contig_4754_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_35877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAACAGGAGCGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9183	7827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_7800_9200
824823	contig_4754_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_35876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATGACTCTCACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7371	7017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_7000_7400
824825	contig_6446_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_149257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTTTAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676407	676648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_676400_676600
824826	contig_13607_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_170229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATATGTCTCCTGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484627	486702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_484600_486700
824827	contig_3155_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_26337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGCATCTTGAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110562	111298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_110600_111300
824830	contig_17680_pilon	+	1044	8	Intergenic	novelGene_150128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCGCCCCGCTGCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9942	28791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17680_pilon_+_10290_18022_18118_18773_18850_19891_19995_20302_20352_23413_23490_24125_24276_28643
824831	contig_5452_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_101020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1486	1935	459673	460122	NA	45	AATCTGAATGCATTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSHISSSNLLLRPSRDFYNLPMHNRAAALSTVKCLLWGEGPLPCFPCLLLRRKGALGAQTGHCQLVSSRVTASLTKISSANTRIKQTCSPSFGKPGSLAAALSNWPLFLNTHLGHKMALFTCQARGKLAALPPNLLPCQNVSISLQKL	458187	460413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_458200_460400
824832	contig_12485_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_147277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATGACAGGGATGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77434	78471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_77400_78500
824833	contig_12485_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_147278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTAATATAGTTAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78880	79535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_78900_79500
824834	contig_3397_pilon	+	2336	14	Intergenic	novelGene_154589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	291.350314770998	2	96	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	375	2093	184618	206594	FALSE	10	TCTCTTGCTTGTCATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQAKIESDRVIGSVGKKVVQETGIKVRSRSHGISMAYRKDFQQLLQGISEDVPHRLLDLNMKEYTGFQVALLNKDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	172429	206837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_172507_178078_178205_180412_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_190928_191145_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
824835	contig_14923_pilon	+	1151	2	Intergenic	novelGene_157772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	177	713	846407	846943	FALSE	25	TTAACTGTATATTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAGVAGELVVKELDLASLRSVRAFCQELLQEEPRLDVLINNAGIFQCPYTKTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLGLLKSSAPSRIVVVSSKLYKHGDINFEDLNCEQSYNKSFCYSRSKLANILFTRELARRLEGTNVTVNVLHPGIVRTNLGRHINIPLLVKPLFNLVSWAFFKTPLEGAQTSIYLACSPEVEGVSGKYFGDCKEEELLPKAMDESVARKLWDISEVMVGILK	841772	847381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_841868_846325
824836	contig_7070_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_104055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216388	214341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_214300_216400
824837	contig_6494_pilon	-	375	4	Intergenic	novelGene_108542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1210.95196711788	11	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	43	297	3457	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	5578	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2746_3313_3486_5564
824840	contig_16714_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_161563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCACATTTGGAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710220	710685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_710200_710700
824841	contig_16625_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_171121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATAAGCTTTTCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92500	94137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_92500_94100
824842	contig_14322_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_115668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCACCTCAGGTCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619210	620099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_619200_620100
824843	contig_15273_pilon	-	884	6	Intergenic	novelGene_140414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	180.807079507413	791	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	338	766	53386	10095	FALSE	25	CCTTTTCATGTATTACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAAVKWAISNTTVLKHLFPIQNGVLYCVCHKSTYSSLPDDYNCKVELALTSDGRTIVCYHPSVDIPYEHTKPIPHPDPVHNNEDTHDQVLKTRLEVKDEPLEQGPMIEQLSKMFFTTKHRWYPHGQYHRRRTKLNPPKDR	55097	9976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_10141_27929_28094_35310_35396_48755_48820_53316_53480_54853
824845	contig_11978_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_62972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAACCGTCCTCACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463743	1463963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1463700_1464000
824847	contig_7057_pilon	-	2251	14	Intergenic	novelGene_123284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	19.1246301739391	31	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	200	1843	825057	812202	FALSE	25	CTTCCAGAGTAATGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTDPAPMAPPPRGEEEEEEEEEETVPEAPSPTQERRQKPMVHPSAPAPLPKDYAFTFFDPNDPACQEILFDPQTTIPELFAIVRQWVPQVQHKIDVIGNEILRRGCHVNDRDGLTDMTLLHYACKAGAHGVGDPAAAVRLSQQLLALGADVTLRSRWTNMNALHYAAYFDVPDLVRVLLKGARPRVVNSTCSDFNHGSALHIAASNLCLGAAKCLLEHGANPALRNRKGQVPAEVVPDPMDMSLDKAEAALVAKELRTLLEEAVPLSCSLPKVTLPNYDNVPGNLMLSALGLRLGDRVLLDGQKTGTLRFCGTTEFASGQWVGVELDEPEGKNDGSVGGVRYFICPPKQGLFASVSKISKAVDAPPSSVTSTPRTPRMDFSRVTGKGRREHKGRKKSPSSPSLGSLQQREGAKAEVGDQVLVAGQKQGIVRFYGKTDFAPGYWYGIELDQPTGKHDGSVFGVRYFTCPPRHGVFAPASRIQRIGGSADPPGDSVGTKKVHQVTMTQPKRTFTTVRTPKDITSENSISRLLFCCWFPWMLRAEMQS	825526	811793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_812257_812652_812726_813530_813596_813793_813918_813985_814130_814722_814852_815004_815141_817969_818207_819112_819232_819530_819693_819889_819984_820064_820205_824891_825117_825386
824848	contig_9320_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_176701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAATGAAAGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714281	716207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9320_pilon_+_714300_716200
824849	contig_1948_pilon	+	726	2	Intergenic	novelGene_31163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAAGAAAATACTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468416	471587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468603_471047
824850	contig_8552_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_80072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTCTATATTTTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444408	444863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_444400_444900
824851	contig_1516_pilon	+	1167	9	Intergenic	novelGene_50029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_7	34.0163104260294	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	47	1165	575641	607764	FALSE	30	GTAATCTCTGTTACTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITRKNPRTPLSDLQGMNTLNEKNQHDTFDITWNGRTGIRQSRLSSSNSLLDKDGIFANSTSSKLLERAHGILTRNKNFKPKPVLPKHLLEVNSLKHLTRLTLQDRITKSLLHLHKKKKPPSISAQFQASLSKLMETLDQAEPYFVKCIRSNAEKLPLRFNDALVLRQLRYTGMLETVRIRQSGYSCKYSFQDFVSHFHVLLPRNITPSKLNIQDFFRKINLNSDNYQVGKTMVFLKEQERQHLQGLLHQEVLRRITLLQRWFRVLLCRQHFLHLRQASIIIQRFWRSYLNQKQVKDAAVQRNAFVRASAATLLQASWRAHLERRRYLELRAAAIIIQQRWQEHYRQRHMAAVYIQARWKGYRESKRYQEQRNKIILLQAACRGFRARQ	575594	607766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_575670_588367_588512_589825_589866_596024_596148_601660_601742_604008_604120_605011_605135_606462_606613_607446
824854	contig_10940_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_49298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037594	1039307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_1037600_1039300
824856	contig_9940_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_125353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAAGAGACATGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230856	229108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_229100_230900
824857	contig_5350_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_99369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	245	574	231615	231286	NA	15	AGTCTGTACGCGAGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPCTYILHSRKALHDLRTSQDSDSYLRNLLSEALVTATVSVHKHALVERRNGLPVHHYPSPPLSPHSHSMRILISGTHLHSRGLTECACSPILYFRRAGGTSAHFGPR	231859	230995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_231000_231900
824858	contig_5350_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_99368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCAGTAACAATCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230403	230003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_230000_230400
824860	SIRV6	+	386	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	400	514	227	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824863	contig_20199_pilon	-	347	3	Intergenic	novelGene_82570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	14	346	43987	40649	FALSE	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSLCCHYPPPTKPSCLPGFPSPGLTGRSGPSTQLTGGLNKSWLKS	44000	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40778_41954_42078_43906
824864	contig_13823_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_145248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137083	135595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_135600_137100
824865	contig_11281_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_125449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1320	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATGAATAAACTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811487	808760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_808838_810970
824866	contig_11386_pilon	+	803	2	Intergenic	novelGene_82793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27551	32452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_27893_31990
824867	contig_3122_pilon	+	1674	2	Intergenic	novelGene_64395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	79	1290	330003	331214	TRUE	35	TGCTAGAATAAAGGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSTSPAAMLLRRLRRLSWGSTAVQLFILTVVTFGLLAPLACHRLLHSYFYLRHWHLNQMSQEFLQQSLKEGEAALHYFEELPSANGSVPIVWQATPRPWLVITIVTVDRQPGFHYVLQVVSRFHQLLQQCGPQCEGHQLFLCNVERSVSHIDAKLLSKYVPVANRYEGTEDDYGDDPSTNSFEKEKQDYAYCLESSLQTYNPDYVLMVEDDAVPEEQIFPVLEHLLRARLSEPHLRDALYLKLYHPERLQHYLNPEPMRILEWVGVGMLLGPLLTWIYTRFASRPGFSWPVMLFFSLYSMGLVELIGRHYFLELRRLSPSLYSVVPASQCCTPAMLFPAPAARRTLTYLSQVYCHQGFGKDMALYSLLRAKGERAYVVEPNLVKHIGLFSSLRYNFHPRLL	329924	332367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_331218_331986
824869	contig_11551_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_168487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAAAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838991	839916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_839000_839900
824870	contig_4783_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_108431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTCCCAGCTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454954	453273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_453300_455000
824871	contig_3817_pilon	-	2189	11	Intergenic	novelGene_78338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	53.5346616688665	165	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	44	556	514660	491066	TRUE	5	CGTTGCTTGTGTTTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEVLLVSAPGKVILHGEHAVVHGKVALAVALNLRTFLQLQPHSNGKVGLSLPNIGVKRDWDVASLQLLDMSFLDEYREEKPEQGVVTVPTPEQVEKLKEVAGFPEDCAISEQVAVLAFLYLYLSICQKQRFGPAKPGHRGVVRAAHRGGLGLQCSLLSVFGSRPADCM	515635	468956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_470032_471989_472144_475299_475417_475814_475906_482218_482265_482891_483000_491023_491180_492932_493082_513601_513774_514582_514675_515606
824873	contig_11258_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_67868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386790	385232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_385200_386800
824875	contig_546_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_117252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGAGAGTGCCAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717661	718433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_717700_718400
824876	contig_15236_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_141553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTGTGAGTCCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321696	322614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_321700_322600
824877	SIRV5	+	226	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	291	151	177	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8492	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
824878	contig_9053_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_87942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATCTACACATATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199791	201666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_199800_201700
824879	contig_10904_pilon	+	669	5	Intergenic	novelGene_22656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1203.02711939507	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	287	598	533790	535124	FALSE	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVTGVCPRAQRGKRRQHAGGAELGLSQNLRDPAETIREGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530609	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_530638_530882_530973_531246_531362_533736_533924_534946
824880	contig_17859_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_155714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	276	602	26212	25886	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLRCGLTREGKLRFLPDTVRGVKFIIHHTFGVRGVRSQPSWAGLIQLETKVGFILSSPDSTVFLWIPTITLRGGIIAELPVDALSPFWEEAGLATGDPRKWDPLGS	26487	24570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_24600_26500
824881	contig_10003_pilon	-	2475	1	Intergenic	novelGene_88280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTGGGAGAGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839357	836882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_836900_839400
824882	contig_9955_pilon	-	840	2	Intergenic	novelGene_21270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45775	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45042_45092
824886	contig_12750_pilon	+	2397	14	Intergenic	novelGene_172622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	19.0045151906892	8	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	1023	2396	101120	122775	FALSE	25	TGGATTTGCTGACTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRCAAAKCLLELQNEAVFMWSTDLDSVATLCFKSFEGSSYGVRISVSKLLGTLLAKAINSVHPGAAASRQSIRKVSLEEVLELLGTGFLRGSSGFLRASGDMLKGTSSVSRDVRVGVTQAYVVFVSTLGGAWLERNFAAFLSHILSLVSQSNSKATQTQIDAVCCRRCVSFILRATIGGLLGEKAQIAAAKDICQAIWKQKKVVDAVMSDGNLEAQLGSTDVAASQNMLICALQELGNLIHSLSTTAAPLLQDSSTGILDSVISVILHPSISVRLAAAWCLHCIAVALPSYLTPLLDRCLERLSVLKSSPEAVTGFSFAVAALLGAVKHCPLGIPHGKGKIIMTLAEDLLCSAAQNSRLSAQRTQAGWLLIASLMTLGPAVVSHHLARVLLLWKCVFPASPKDLETEKSRGDSFTWQVTLEGRAGALCAIKSFVSHCGDLLTEEVIQRLLPPLPCA	63058	122776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_63158_63453_63755_92992_93171_94747_94960_95815_95925_100996_101147_101831_102007_109923_110085_111274_111531_112550_112707_114104_114356_117924_118037_121567_121721_122692
824887	SIRV6	+	210	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	522	51	522	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
824888	contig_13161_pilon	-	1174	6	Intergenic	novelGene_173925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35426	24717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13161_pilon_-_25388_26769_26925_27319_27405_33700_33761_34597_34729_35353
824889	contig_1719_pilon	+	1407	8	Intergenic	novelGene_87306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.3013524696732	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	251	649	415052	424054	TRUE	65	GTAAAAGAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVWCYPSTTAARRTLLLRKCCLTDENKLLHPFVFGQHRRTWFYITTVEVPDSSVLKKVTHFSIVLTAKDFNPEKYAAFTRIFRMYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLERP	408943	426728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_409116_411266_411341_415047_415200_416229_416342_417989_418091_421977_422007_424045_424141_426056
824890	contig_9400_pilon	-	854	10	Intergenic	novelGene_146592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	546.735158310981	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	199	657	135537	121571	FALSE	45	TTAGTTAATAAAAGGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE	163310	121373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539_158626_163221
824892	contig_14426_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_170621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACCTAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108642	109429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_108600_109400
824894	contig_4857_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_48668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAACTTTGGGCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040354	1038027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1038000_1040400
824895	contig_7815_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_134397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	387	61	447	760403	760789	NA	40	AAGTGAAGCAAAATTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKTVKQGHTTLPKVNTKIVAMPKSLNQSKKGETLNNKDAKQKTLPGQITLRTQSSQRPLKSEPSVQKSMLRDVRDNNKGSVSEQKSHKPLINLTPQINGTEAPQSSCKPYSKKPLNNQEKEKSVVECQNTSKWDKLVKHELESKQICSD	760342	760791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_760300_760800
824896	contig_7815_pilon	+	985	2	Intergenic	novelGene_134398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	164	592	763883	764311	FALSE	25	GTTTATGTATTGTTAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKNSSTKSITDSCRSQVLPQEAQVKQSHPTATEKANIGLSAGDIDDCDTLAQTCMYDRRPSKTLSPIYEMDVIEAFEQKMESDSHFMDVDFEDDQHFAKQDWTLLKQLLSEEDSNLNITNSVPEDLNLAQYLINQTLFLARDSSKPQGKAHVDTLNRWSEITSPLDSSASITMASFSSEDCSPQGEWTILELETQH	762429	764704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_762555_763844
824897	contig_9609_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_22958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	521	916	229519	229124	NA	70	AAAAAAAAAACCCACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDTKMAFDKLQHPFLLNRSGEEDITCVCLKIHIPEDTKLGNFFNQCFSGFINCYSFHAPGHVFLNSKADRTIFPLEFALNNVVRSSFIMTMHPWQLAELNPFLPENTIILNEIPCCISAWTRGKISS	230039	228953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_229000_230000
824899	SIRV4	-	365	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1158	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4000	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
824901	contig_9297_pilon	+	2231	2	Intergenic	novelGene_69813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303478	306296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_304886_305472
824902	contig_5981_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_35528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCGCAGTTCTCCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279060	278062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_278100_279100
824905	contig_4769_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_117970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATTACCGAGCAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408841	407990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_408000_408800
824907	SIRV6	+	217	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	749	0	-406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470
824911	contig_5594_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_150123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATTTCAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189931	189423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_189400_189900
824912	contig_6873_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_129823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGATTGCCATTTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442434	441834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_441800_442400
824913	contig_11449_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_170554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAGGCCTTGGATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151961	150522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_150500_152000
824914	contig_6589_pilon	+	878	5	Intergenic	novelGene_25681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	44.0986110892395	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	124	690	73445	77654	FALSE	5	GCCTGCCTGTGTCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACPVSAELPAPNSAPGATAQGDAGAPGSGEPRGRRGAEDVMSQAPGARPSPPCVYHERQRLELCAVHALNNVLQQQLFSQEAADEICKRLAPDSRLNPHRSLLGTGNYDVNVIMAALQGLGLAAVWWDRRRPLSQLALPQVLGLILNLPSPVSLGLLSLPLRRRHWVALRQVDGVYYNLDSKLRAPEALGDEDGVRAFLAAALAQGLCEVLLVVTKEVEEKGCWLQTD	72659	77842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_72769_73430_73591_75657_75784_77247_77443_77554
824915	SIRV4	-	508	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	89	20	89	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	359	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGCGGTATTACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5069	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
824916	contig_13778_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_70850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAGTTGTCAGATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256397	256768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_256400_256800
824920	SIRV6	+	362	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	11	4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
824921	contig_11978_pilon	+	497	5	Intergenic	novelGene_63085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5467.21837409116	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	4	375	1829081	1831181	TRUE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKCKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRRITACT	1829077	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830129_1830663_1830781_1831161_1831239_1831900
824924	contig_5566_pilon	+	459	2	Intergenic	novelGene_153643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTCCTCTCTAGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22713	23863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_22749_23439
824929	contig_5059_pilon	-	845	2	Intergenic	novelGene_140756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATAAGGTAGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475240	474222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_474471_474643
824932	contig_6673_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_164029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154433	153595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_153600_154400
824936	contig_6710_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_89392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653746	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
824937	contig_7344_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_168918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	172	390	6287	6069	NA	15	GGACACACGGGGCTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFFKGIDQNIERAVRSEIFLHESYCIETSNQPLLPATQKSPTNGADCGIQWWNAVFIMLLIGIVLPVFYLVYFKIQATGETPSSWNTTAVPSDSIAMTAIPGKAPKLVMPVPAIPNSDSHFGQTTHAGN	6458	5375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7344_pilon_-_5400_6500
824938	contig_7344_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_168917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTCCGCCCTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5022	4268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7344_pilon_-_4300_5000
824939	contig_12151_pilon	+	175	2	Intergenic	novelGene_54964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGGTGACCCCATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301860	309366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_301913_309243
824940	contig_12750_pilon	-	1684	4	Intergenic	novelGene_172626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCATTCTGAAGTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113667	101856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_102005_109921_110083_111272_111529_112548
824942	contig_7815_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_134394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATACCTGCTATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600864	599404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_599400_600900
824943	contig_7815_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_134393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAATAGGAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599206	598947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_598900_599200
824944	contig_10702_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_176702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATAGGTGCACACGTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3114	2545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10702_pilon_-_2500_3100
824945	contig_5766_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_175051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACCAAGGTCAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851750	853398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_851800_853400
824946	contig_2867_pilon	+	1151	4	Intergenic	novelGene_135156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	68.5338521381141	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	808	1149	492222	495300	FALSE	25	TATCTTAATCCTTGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKDLLVLFGGWTRPSPYPLHQPERFFDEIHTYSPSKNWWNCIVTTHGPPPMAGHSSCVIDDKMIVFGGSLGSRQMSNDVWVLDLEQWAWSKPNISGPSPHPRGGQSQIVIDDT	491414	495302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_492338_493154_493266_494692_494790_495282
824948	contig_2867_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_135158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	7	366	497351	497710	NA	5	TTCCCTTTCTGTGGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETMPIPRPGPAQGDGHSLPPIARRLGHHPPQSLNVGKPLYQSMNCKPMQMYVLDIKDTKEKGQVKWKVFNSSSVVGPPETSLHTVVQGRGELIIFGGLMDKKQNVKYYPKTNALYFVRAKR	497344	497726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_497300_497700
824949	contig_7164_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_172145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTATTACCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504401	503684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_503700_504400
824952	contig_10235_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_46516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	185	559	298587	298961	TRUE	20	GCCTCACTTCCAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	298402	299998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_298963_299023
824956	contig_2893_pilon	+	1453	1	Intergenic	novelGene_176704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135258	136711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2893_pilon_+_135300_136700
824957	contig_4125_pilon	+	1315	2	Intergenic	novelGene_25196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAAACTGCTTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384567	1385994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1385084_1385195
824958	contig_10968_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_84286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	943	1470	164662	164135	NA	20	ACTATGGTCTGTGAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRFPPPPKQKKDTRWAAEIQNPDQSCSLMDFPPPSKRSHQSCHPSRLKMSHPRGRQRGPYHHWEEMGAEHILWTQDPCSGNLLDPGDEGAVTRKTARDGDTAVSRGRSSSSRGLRIRRPVGNGTVVFPAHRAKELSAFRLRLPGGVRCPQALISGAEEFCNTCPSRAEARLRS	165604	164011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_164000_165600
824959	SIRV6	+	356	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	517	0	351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
824960	contig_18420_pilon	+	1861	9	Intergenic	novelGene_109344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	58.906573274975	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	86	1063	92356	97617	FALSE	20	AACCTGTTGCCACTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVSSGLLVHVWIKWDSKETSLF	92270	98415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407
824962	contig_4538_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_153079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAACCCATTGCCAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105981	105162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_105200_106000
824963	contig_4442_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_127928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131105	132809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_131100_132800
824964	contig_4392_pilon	+	2398	9	Intergenic	novelGene_117305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	171	junction_1	97.14928911217	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	172	1290	307347	464534	FALSE	15	ACTCTGACACTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGALCACAANSCHPVRNKSPKFPKSPGDRGHRLPSRRPPLGHACVPVRAPETAPAIMEVAEAESPLNPSCKIMTFRPSMEEFRDFNKCLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDDLLIPAPIQQIVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCEAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVKKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPESTPEVKAWLQRRRKVRKVPKR	273699	465642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_307329_307491_308176_308353_313024_313140_343418_343613_368063_368114_378934_379039_384173_384312_464336
824965	contig_1406_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_25452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAATGTGATTACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495832	494721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_494700_495800
824967	contig_4202_pilon	+	676	4	Intergenic	novelGene_147070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	105.69873330472	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTATTGTCTCTTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29064	40628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_29308_29851_29871_31725_31833_40321
824969	contig_5602_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_132994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGAAAATTATGCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56067	55108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_55100_56100
824970	contig_3469_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_34231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACAGTCACTGATTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626551	627315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_626600_627300
824972	contig_8606_pilon	-	1206	4	Intergenic	novelGene_159405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_2	76.524505878836	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	164	628	155240	120063	FALSE	35	AAGTTTATTGGTTATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGELDLTGAKQNTGVWLVKVPKYLSQQWAKAPGRGEVGKLRIAKTQGRTEVSFTLNEDLANIHDIGGKPASVSAPREHPFVLQSVGGQTLTVFTESSSGKWEWIYLILCRFTVSTCSHVSFSKVIIKAVLPNILSISVIHIMLSLFSVAFL	155403	119484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_120369_121436_121456_142027_142102_155174
824973	contig_15084_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_116707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGAGCATCCTTCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241943	243595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_241900_243600
824974	contig_10734_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_51399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2041958	2040634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2040600_2042000
824975	contig_8354_pilon	+	1361	5	Intergenic	novelGene_24098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGCCAACCCGAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188808	203475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_189721_190260_190435_195736_195863_197992_198079_203412
824976	contig_6635_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_127012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAACTTAATATATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353333	354719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_353300_354700
824977	contig_5684_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_80983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	414	761	32269	31922	NA	55	TAGAATATAAATAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRHQEILKHCPGFWKVVFNRHKYQNSVEISIKRFLKAIQSHRISRKAQGSGLQTVQPDIVFTWCDGPPRWAPSLTTTGTATPHPLLGTACDHQDLCIATPESWVYLIEKESTAP	32682	30408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_30400_32700
824978	contig_15664_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_171509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATAAAAAAGTAACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76406	74468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_74500_76400
824979	contig_5059_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_140753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGATTGACACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433240	434308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_433200_434300
824983	contig_21007_pilon	+	357	2	Intergenic	novelGene_161532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258	900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
824984	SIRV1	-	224	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3878	2	3604	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6762	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
824985	SIRV2	-	694	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	252	2	252	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTTGTTATCCTATATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4480	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
824986	contig_6208_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_52982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACATGAAACCACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354709	356140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_354700_356100
824987	contig_10581_pilon	-	1309	9	Intergenic	novelGene_41412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	94.8614120704515	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	596	1222	619681	609845	FALSE	45	TAGAACCAAAATGAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTAEPLMGSSLLEEASVPSKNLVSVNSQPSLGGESLNLPNTSSILGVDEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	628851	609757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_614126_614265_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620102_620394_627357_627551_628816
824991	contig_9414_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_131091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATGGAAAAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545524	545892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_545500_545900
824993	contig_9871_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_75637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACATGTTACAAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352405	351497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_351500_352400
824994	contig_13015_pilon	+	1005	10	Intergenic	novelGene_165561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	52.2812904711937	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	42	941	396085	427294	FALSE	45	TAATTGTGTAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGALEAAAVAVVEVGSARQFEELLPLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMTELAKEHPQVSFVKLEAEAVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQSIDRLDGAHAPELTKKVQRHASGSAFPPSTKEHPKEDLNLRLKKLTNAAPCMLFMKGTPQEPRCGFSKQMVEILNKHNIQFSSFDIFSDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVSGELIGGLDIIKELEASEELDTICPKAPKLEERLKALTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTDVEYETFDILEEKASCRFVYFTRFC	396043	427358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411107_411310_416546_416720_416945_417008_419014_419073_421035_421089_423128_423157_427246
824995	contig_9011_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_159299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAATGCAAGTCAGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431364	432514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_431400_432500
824997	contig_10437_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_38479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1173	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	407	820	1205322	1204909	NA	20	CATATGAGGTGTATTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGRLVRRLVSMAGRVCLSRGSAGSATVGPVEAAIRAKLEQALNPEVLELRNESGGHAVPPGSETHFRVAVVSARFEGLSPLQRHRLVHDALSEELAGPVHALAIQARTPAQWRENPQLDASPPCLGGSKKTRETP	1205728	1204625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1204600_1205700
824998	contig_11978_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_62836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAGAAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475209	476362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_475200_476400
825002	contig_7428_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_77699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTTCCATTGCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254316	253218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_253200_254300
825004	contig_8050_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_114869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420444	420126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_420100_420400
825005	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825006	contig_709_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_57666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAAACCCTGAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3914950	3915403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3915000_3915400
825007	contig_9668_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_58236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAATGCCCTATAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579114	579645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_579100_579600
825008	contig_9668_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_58234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	213	470	577946	577689	NA	75	AGTAAAAAAAAAAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTCLHTHAHTHILPYFIFLLSTYHHGIPGWCKQLTCLAANQKVGGSSLPRGASEEKPGDLLSQKAAIENTMEHSSTLTHMGSPRVGVDWMAAGFITIQHMIYFTYLSYLLPVSHPHPYKAPPGQGRNFYLFADASPPLRTGARDVPNEQVRQDPR	578158	577458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_577500_578200
825010	contig_11689_pilon	+	1746	2	Intergenic	novelGene_175849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	0	138	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAAATAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2414	5676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11689_pilon_+_2612_4127
825013	contig_10235_pilon	-	1002	10	Intergenic	novelGene_46361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	118.190158559192	5	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	182	634	132372	131467	TRUE	15	CTGGCTCTTTGGTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTTMMGLRLQVVLEHMPVGPDAILRYVRRVGDPPQALPEEPMEVQGAERTSPEPQRENASPAPGTTAEEAMSRGPPPAPEEGSRDEQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	138797	130278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131535_131619_131765_131864_131925_132030_132178_132339_132373_137543_137591_138212_138288_138738
825015	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
825017	scaffold_19766_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_34455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTAAAAAAAGATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884308	882949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_882900_884300
825018	contig_6842_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_130771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTTAAGGAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343681	1343980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1343700_1344000
825020	contig_3018_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_78803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501667	500243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_500200_501700
825023	contig_10143_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_163328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAATAATAAGCAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63100	64195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_63100_64200
825024	contig_5013_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_110080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTTAACTTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30987	31213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_31000_31200
825025	contig_5217_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_135800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTCACACAGGTGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690053	691058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_690100_691100
825026	contig_2504_pilon	+	2083	1	Intergenic	novelGene_166853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGATGTGAAACAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395867	397950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_395900_398000
825027	contig_6048_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_73308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2043070	2044200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2043100_2044200
825028	contig_4857_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_48663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAGAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012052	1012807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1012100_1012800
825030	contig_6446_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_149256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACTCTAATTATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658176	657063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_657100_658200
825031	contig_8571_pilon	+	633	4	Intergenic	novelGene_169185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	41.0636362518253	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTAGTCTCTGCCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471124	514517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_471242_482036_482183_513706_513782_514222
825033	contig_3068_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_137644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265301	265040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_265000_265300
825034	contig_8873_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_162903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCACATTCATTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384821	385829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_+_384800_385800
825035	contig_11986_pilon	+	1050	3	Intergenic	novelGene_69140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	699	1049	278977	279327	FALSE	20	GAATCAAGCCCTCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKPDMWELRLARIQWLVAQTGQRWGKVPDRCGPKPLLSVGLCPYPLGGTEGDDCPLTDTDHPKWQRWGQERLLPRVGSSSLLHLMSFAVRFHQCLPPSPRPENPGPPIKMVIGCR	270459	279328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_270666_277602_277901_278782
825038	SIRV6	+	376	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3023	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825040	SIRV6	+	416	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	357	527	184	63	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTGGATGCAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
825042	contig_10765_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_122991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1118	1480	558165	558527	NA	5	CGTGGCGGCGGGGGAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSHLWKNSIPQGYSGPNSHGDEELQDLESTTQGFQRTRSKPTRWAEETATDGLSSPQLRRRHLVAATNKTPKKRGRCLMPLACFKIPRPARCGGGFPTPDLCTRARPTLHSVCKRDHP	557047	558588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_557000_558600
825044	SIRV6	+	497	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	357	2	184	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
825046	contig_6164_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_121313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGTTTGTGTTTAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793099	791339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_791300_793100
825047	contig_6710_pilon	-	838	3	Intergenic	novelGene_98255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	72	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCCTCCTTAGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659339	653510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152_658365_659084
825049	contig_5758_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_119060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTTTGACCTTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60360	59035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_59000_60400
825050	contig_13876_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_174244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_3	102.306728354819	2186	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	159	479	44405	69402	FALSE	25	CTAAAGAGTGTCGTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASAVMHALRKNKTLRYGVPMLMLIVGGSFGLREFSQIRYDAVKIKIDPELEKKLKMNKVSLESEYEKIKDSTFDDWKNVRGPRPWEDPDLLQGRNPEIVKIKTT	44246	69648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_44474_61740_61813_65260_65324_69285
825051	contig_10037_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_148962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTGCTCTGTGATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365069	364055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_364100_365100
825053	contig_16098_pilon	+	1079	4	Intergenic	novelGene_45919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	28.7556757682529	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	116	346	335192	335508	TRUE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNK	334171	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_334237_335141_335272_335357_336034_336814
825056	contig_15105_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_150982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAACACATGGTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640646	641916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_640600_641900
825057	contig_15105_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_150983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642066	642634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_642100_642600
825062	contig_16231_pilon	-	763	2	Intergenic	novelGene_176710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAATTTCAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62104	55439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_55551_61452
825063	contig_12301_pilon	-	1366	3	Intergenic	novelGene_110030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	397	junction_2	11	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	86	505	136698	129013	FALSE	45	TCTTAAAATTGTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTFSSFGGRSPPAARIRLAQRCCGRRGTMAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENVSIYHKKIKGMRFLVFSLPVIELLFKHTCFVFLNALSDT	136783	128151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_129265_130605_130737_136661
825065	contig_9373_pilon	-	834	4	Intergenic	novelGene_162732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	138	junction_2	59.1739432145227	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	220	834	310052	305606	FALSE	35	CCACCAACAGAATTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSLTTYGVSELKPAGITTGAPFLLPGFAVPQPTGKGHSVRNIQAFAVLQNAFLKAKTSFLAQIILDAITNIYMADNANYFILESQHTLSQFAEKISKLPEVQNKYFEMLEFVVFSLNYIPCKELISVSILLKSSSSYHCSIIAMKTLLKFTRHDYIFKDVFREVGLLEVMVNLLHKYAALLKDPTQALNEQGDSRNNSSVEDQKHLALLVMETLTLLLQGSNTNAGVFREFGGARCAHNIVKYPQCRQHALMIIQQLVLSPNGDDDMGTLLGLMHSA	312032	305605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_305761_308699_308802_309694_310163_311923
825066	contig_9836_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_176162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	10	360	39287	39637	NA	30	AAATAGCATCCTTCCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNLMPILCPSNLETLHHDCAPNVYIAFTIWQSLCSSFSFYSSYRSFLTFLYFDPMLSISWADNFYLKLIQSVATGGNLTDCWVCQPLTTTVESLRVPWAVPIPNVTHLKKVPPQSLMTL	39277	40072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_39300_40100
825067	contig_2596_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_53480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGAAAAAATAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679408	678475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_678500_679400
825069	contig_16999_pilon	+	1483	12	Intergenic	novelGene_85003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	189.63649437806	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	62	1138	195656	211544	TRUE	65	AGTCAGAAATAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAENVCYTLINVPMDSEPPSEISLKNDLEKGDVKSKTEALKKVIIMILNGEKLPGLLMTIIRFVLPLQDHTIKKLLLVFWEIVPKTTPDGRLLHEMILVCDAYRKDLQHPNEFIRGSTLRFLCKLKEAELLEPLMPAIRACLEHRHSYVRRNAVLAIYTIYRNFEHLIPDAPELIHDFLVNEKDASCKRNAFMMLIHADQDRALDYLSTCIDQVQTFGDILQLVIVELIYKVCHANPSERARFIRCIYNLLQSSSPAVKYEAAGTLVTLSSAPTAIKAAAQCYIDLIIKESDNNVKLIVLDRLIELKEHPAHERVLQDLVMDILRVLSTPDLEVRKKTLQLALDLVSSRNVEELLS	195594	219653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_195747_199226_199457_199865_200036_201658_201774_202990_203084_204894_205033_209995_210116_211343_211452_211532_211673_212127_212248_213398_213483_219640
825070	contig_4924_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_84763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAAAAACACCAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221217	220662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_220700_221200
825071	contig_8683_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_150279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCTGGGAGAGAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743651	744728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_743700_744700
825072	contig_5899_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_146957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	292.091690322672	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	220	711	53130	12694	FALSE	20	TGAGTCTGATGTCTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEIDHWNNEKEKIVLITDKTLFICKYDFIMLSCVQLQRIPLHAICRICLGKFSFPGMSLEK	84492	12693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_43099_43192_52908_53140_84282
825073	contig_15732_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_88899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248530	248985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_248500_249000
825078	contig_15531_pilon	-	1286	2	Intergenic	novelGene_176724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	280	1071	288275	286785	FALSE	15	TCTTTGTGTATTACCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRKDIEKDNAGQVTLVPEEPEDMWHTYNLVQVGDSLRASTIRKVQTESSTGSVGSNRVRTTLTVCVEAIDFDSQACQLRVKGTNIQENEYVKMGAYHTIELEPNRQFTLAKKQWDSVVLERIEQACDPAWSADVAAVVMQEGLAHICLVTPSMTLTRAKVEVNIPRKRKGNCSQHDRALERFYEQVVQAIQRHIHFDVATRSRYVRLVDSVKENAGTVRIFSSLHVSGEQLSQLTGVAAILRFPVPELSDQEDDSSSEED	288554	286569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15531_pilon_-_286980_287678
825080	contig_1301_pilon	-	1721	4	Intergenic	novelGene_47363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_3	422.131364493198	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	270	1166	618221	551789	FALSE	25	TGTATTATTATTACACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLTQRSSGLVQRRTEASRNAADKERAAGGSGSNGEDDAQSRRDEQDDDDKGDSKETRLTLMEEVLLLGLKDREGYTSFWNDCISSGLRGCMLIELALRGRLQLEACGMRRKSLLTRKVICKSDAPTGDVLLDEALKHVKETQPPETVQNWIELLSGETWNPLKLHYQLRNVRERLAKNLVEKGVLTTEKQNFLLFDMTTHPLTNNNIKQRLIKKVQEAVLDKWVNDPHRMDKRLLALIYLAHASDVLENAFAPLLDEQYDLATKRVRQLLDLDPEVECLKANTNEVLWAVVAAFTK	618490	551233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_552214_558856_558972_567267_567400_617996
825086	SIRV6	+	368	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825087	contig_9609_pilon	-	1188	2	Intergenic	novelGene_23097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCCTTCACTCCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509880	485683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_486855_509863
825088	contig_21389_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_176729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCCGAAGGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19646	20158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21389_pilon_+_19600_20200
825089	contig_18111_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_176731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTATTGTAAATTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24293	25451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18111_pilon_+_24300_25500
825090	contig_3241_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_146405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	506	826	841604	841924	NA	45	TAGACTATAATATAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVETPASVTLWNSGVAAGLNCQENELVQFFEQYGVEWFWNLANSQQNFIIPAWNNPFFSSSGIGCVDVDRELQRPWVAQPSYQLFASIFMCVNVYWFANEQTAL	841098	843236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_841100_843200
825091	contig_3964_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_174197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACAGAAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15303	13454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_13500_15300
825092	contig_50_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_122217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	81	356	63682	63407	NA	25	CTCTGAAGGTTTTAGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLAPNNRKPTPLRLLYKGSFSPRNKMSENRQPRGGGGLSGLTTDPSSFHLLCLLILLLCHFLVSKWLLQPQAFWPHLRQKVGANVMPVSFIREVKNFPEIFWWTCASVSLARTQPK	63762	61604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_61600_63800
825093	contig_8898_pilon	-	459	3	Intergenic	novelGene_137235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	41	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGCTTTCTGCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285422	281873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_285082_285249_285321
825095	contig_7370_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_173665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37238	36045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7370_pilon_-_36000_37200
825096	contig_13982_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_163483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAATAAAGAGGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369870	368281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_368300_369900
825097	contig_12939_pilon	-	885	4	Intergenic	novelGene_166192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	14.7044966667419	193	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	13	504	37370	25241	FALSE	20	TGTTCCTCTATTCAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGKMADEEKLPPGWEKRMSRSSGRVYYFNHITNASQWERPSGNSSGGGKNGQGEPTRVRCSHLLVKHSQSRRPSSWRQEKITRTKEEALELINGYIQKIKSGEEDFESLASQFSDCSSAKARGDLGAFSRGQMQKPFEDASFALRTGEMSGPVFTDSGIHIILRTE	37382	24859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_25351_26301_26413_34331_34545_37312
825099	contig_7457_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_31387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448015	446723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_446700_448000
825101	contig_20719_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_140570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTTCAGCAACCAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40038	39023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_39000_40000
825102	contig_10523_pilon	-	1206	9	Intergenic	novelGene_120930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	475.127071818687	4	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	211	1134	39240	12805	FALSE	5	TTGCCAGGTTGTGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSKEDRGK	95348	12732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12824_15079_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162_39255_95152
825104	contig_4782_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_73629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCTTGAACGCCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275788	276989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_275800_277000
825105	contig_4782_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_73632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACTGGTGGCTTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277615	277994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_277600_278000
825106	scaffold_880_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_121436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGGAAGAGCATTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414185	414873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_414200_414900
825107	contig_8907_pilon	+	275	2	Intergenic	novelGene_85833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAGTAAGCTGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445556	448762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_445745_448675
825108	contig_8907_pilon	+	785	2	Intergenic	novelGene_85835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	209	313	451393	454533	FALSE	25	GTATCAGTGTATTTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPNLPGELSQQASPPASQTVSVIHPSSKKTRSTPSSKVSNVKSPRCQDYPGNIPVQNFVPVGDHTHSKSMSRVPVSGTNRLFSKDRAPTTVCLNEERGAQAFS	451184	455005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_451394_454429
825109	contig_5602_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_133044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCTAGTCTTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673551	672284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_672300_673600
825110	contig_12931_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_166770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATATTATTTGGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109870	110793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_109900_110800
825114	contig_6795_pilon	+	1602	8	Intergenic	novelGene_27775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	235	600	488822	489187	TRUE	20	AGCCGGAAGGCGGCGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTSVFLTQVPRHHPANPDDSSWPCQHGTEWGWTDPHPHGHTDQNKGTPWGSQGCWYAEHHASPDDHTVGLPGQAVHFLHRNLVNFVIHLVLKVEGGVGEGKVQSSQRCPAAVMDLRALL	488587	504863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_489511_490848_490940_491062_491134_491497_491590_493268_493331_493596_493687_499670_499832_504751
825120	contig_10377_pilon	+	155	1	Intergenic	novelGene_115400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223244	223399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_223200_223400
825122	contig_10196_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_132188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGTTATGCATTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100204	1098318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1098300_1100200
825124	contig_18859_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_150559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATACAAGATTTAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195946	198479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_195900_198500
825125	contig_13004_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_112664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTGTGGGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606275	604424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_604400_606300
825128	contig_1925_pilon	-	1277	5	Intergenic	novelGene_162208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	54.924379832639	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	609	1277	161343	149719	FALSE	15	GATGTTTTGAAGGCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSEEFTFLKEFSNMVTVEESQYVMKIANSLFVQNGFHVNDEFLQMLKKYFNAEVNHVDFSQNIAVANYINKWVENNTNNLLKGLVSPRDFDAVTHLALINAVYFKGNWKSQFRPENTRTFSFTKDDESEVQIPMMYQQGEFYYGEFSDGSNEAGGIYQVLEIPYEGDEISMILVLSRQEVPLATLEPLVKAQLIEEWANSVKKQKVEVYLPRFTVEQEIDLK	161951	149718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_149750_155727_155933_157393_157589_159046_159278_161336
825130	contig_3233_pilon	-	752	6	Intergenic	novelGene_56562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	87	563	747951	745312	TRUE	0	CGCCGTTTGCTTCCCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLGRGGARTRPLGKGVGVEGNGIDVVVHGEEVPDVLSPKAGPTQGRGVPQLHQGEAGERVLSLHLSAMCQRQNETFLQQLPALPHRAHTQDGEANLPLEQDRVNLRQHGYNVSAQHLPSFPEDVPGEGVSLLSYLLQFSGKTQQTCIYQSPYTGG	748037	738720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_738773_743703_743816_745286_745381_746327_746423_746935_747014_747716
825132	contig_1516_pilon	-	2524	2	Intergenic	novelGene_50023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	75	713	423352	422714	FALSE	75	CTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVVLSYMDSLLRQSDVSLLDPPGWLNDHIIGFAFEYFANSQFHDSCHQVCFISPEVTQFIKCTSNPAEIAMFLEPLDLPHKKVVFLAINDNSNRAAGGTHWSLLVYLQDKNSFSHYDSHSGSNSVHAKQVAEKLEAFLVSKGDRLAFVEEKAPAQQNSYDCGMYVICNTEALCQNFFRQQPEVLLQLLTPTYITKKRGEWKDLIARLAKN	438841	420902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_423389_438803
825134	contig_10546_pilon	+	1352	3	Intergenic	novelGene_176322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.5	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	8	406	477275	621231	FALSE	50	TACTTGCACTAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVMDSLLEALQSGAAFRDRRKRTPKPKDIRQSLSPISQRPVLKVCNHENQQVQLTEGSHSHYNINCNSTRTAVAKELNYNLDTHPSTGRIKAVEKKEACNVESNRKKEMELLGTVSKNESIPEVEALLARLRAL	477267	622177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10546_pilon_+_477351_477835_477896_620968
825135	contig_678_pilon	+	845	4	Intergenic	novelGene_167777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	20376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_16579_17500_17634_19595_19781_19987
825137	SIRV5	+	304	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-31	932	-31	-55	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCGGGACTAGGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8284	10934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
825139	contig_11281_pilon	-	1419	1	Intergenic	novelGene_125506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAAGAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950200	948781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_948800_950200
825140	contig_7202_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_17281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
825144	contig_14357_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_121700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTATTTTGAAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707721	708179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_707700_708200
825146	contig_5479_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_133581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGTATCCCCAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188162	187551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_187600_188200
825147	contig_366_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_51627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTCACCTCAGTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367697	1369775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1367700_1369800
825150	contig_6137_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_59304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	513	917	1612068	1612472	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVSHYRPLPPRLVHAFPPLWTVPPSPGLEHPSRAGSFQIGWLLSSGSPTALTIMSSTGSHSILPQCSMKSRPWAEARETKVKASGLASPTLQQKWLYEGFGSSMALGHDARSPRAPASLSQVTLKTSWKGPC	1611555	1613368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1611600_1613400
825152	contig_7979_pilon	+	1257	3	Intergenic	novelGene_125547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	26	301	1077470	1078319	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGYGKKECMGTAIRVTKQSMYKFFYGKKENCQPLMKNIKGIYFQINFNSSCSFLVYCVVVMKHTSSCNSVYFLLSSVTSSPACIFLYKSSSVSSNSFCI	1077444	1081158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1077742_1078315_1078484_1080366
825153	contig_2043_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_169894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	451	498	637840	637793	NA	55	CTTATCTTCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDVGDGGEGRGSAEKRPPFPPGRREGAVDRTPAVRYPPRHGPGGERDPGFIHPPQAARCGERPHFGETSPAPWTRPLLFSPSCALAAWPPGRLCPAPRPTRARSARRPRPRPGLESSTCHCEAVPLRGHSGARLATLPFLLHSLPKLTLIMYLQPCFRNDFRLLL	638290	635463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_635500_638300
825154	contig_9389_pilon	+	804	3	Intergenic	novelGene_83996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	7.5	430	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	20	439	388899	391951	FALSE	10	GCTGGTGACCGACTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRFCRAMGPQVGPQVAPPPPLSLLLQALLLSALLYGAQGATLSTQPTAKTTPSSPPPPAVTNDSQPGSPHNGTHPLSSPGSPLLRSFYVLTGISGLAALYFLIRAFRLKKPQRQRYGLLANSEDSAEMGSPDSDEETVFETRTLR	388879	392316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_389201_390982_391100_391950
825155	contig_10663_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_176733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCATTATAAAAAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5084	4343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10663_pilon_-_4300_5100
825158	contig_7321_pilon	-	1283	5	Intergenic	novelGene_53143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_4	134.887684760322	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	68	676	208319	183958	FALSE	20	GCTATTGTGGGCAGATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLR	208386	183350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
825161	contig_1275_pilon	+	684	2	Intergenic	novelGene_108846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	78	539	747507	747968	FALSE	20	TAATTGTGTCTGTCGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746553	748113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747506
825163	contig_12503_pilon	+	1461	2	Intergenic	novelGene_143812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	807	1346	40156	40695	FALSE	45	AAGAAGAGTTGACACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKWDLINIKNFCSSKEISKPLGWSRSNAQRSIYTNEHTHQKRRKDKDQNTNPTARTEREQQKKPTVTRRNEIIKIRAEINETENRKTIERINKILSWVFKRINKIDKSLARLTKEKQEKMQITQVRNEMGNIKTEPTEIKRIIIEYCEKLYSNKFENVEEMDKFLETHCLPKLIQTEV	38924	40810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_39006_39430
825164	scaffold_17907_pilon	-	1990	15	Intergenic	novelGene_150760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTCAGAATCCTAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81651	34302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_-_34366_41631_41768_46175_46388_53574_53668_55149_55354_56647_56784_57279_57379_58383_58476_67566_67685_72984_73089_76861_76963_77414_77467_79542_79658_80186_80277_81276
825166	contig_7004_pilon	+	1820	12	Intergenic	novelGene_126482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	28.0954688855841	26	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	194	508	405049	405558	TRUE	10	CACACCTCTGTGGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSWLLRKPKIHLRTSDPDFLAAVDSWFQVLLPKIYPWLYHNGGNIISIQVENEYGSYKACDFSYMRHLAGLFRTILGDKILLFTTDGPEGLRCGTLQGLYTTVDFGPADNMTKIFTQLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNM	403295	408333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_403349_404817_404913_405003_405179_405266_405326_405432_405705_405918_406038_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
825167	contig_6364_pilon	+	1543	3	Intergenic	novelGene_51734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAATAGCTTCTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458704	473800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_458773_466202_466373_472495
825168	contig_11989_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_68457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCACAGTATATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96123	95259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_95300_96100
825169	contig_5551_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_134290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTTAGCATATCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814562	815894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_814600_815900
825170	contig_15956_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_176734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	344	787	18488	18045	NA	40	CATTTCTAGGTAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVYLLPPQPCILLPTVLLVSDCSQYCPFIFLDNNRCLQLSSSIGPLSACRMNQAAFLHFVQSKLTGFLLRWLIKSIDHKPNLFSKGCVAISLVPCAEHAFLIFAIEFSKSSSSGYYCTVHFSIYLFPPTLYSKKQGENTTPSRSC	18831	16765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15956_pilon_-_16800_18800
825171	SIRV6	+	391	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	275	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGAAGCAATCGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578	2521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2035_2474
825174	contig_567_pilon	+	586	6	Intergenic	novelGene_33988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	247.619385347755	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	14	481	442621	458710	FALSE	20	ACAGATGCTGTCTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVSKMAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNQLPSSEVVGVRCPRTLYRCRVLTACFSFPLHLSLAQNTAGVSVGQQRVGIPKVWALEKVNSSIKFNCFVIHLMTYPRVT	442607	458815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_452651_454333_454404_455775_455862_458626
825175	contig_19778_pilon	+	1418	7	Intergenic	novelGene_143749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.0091437029	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	185	943	5827	16019	TRUE	30	TTATTCACATACATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAESLSKRSLARKKSPPVQKSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	5642	18624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9532_9638_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920_16025_18154
825176	contig_2867_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_135183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGAAAGGAGGTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789215	788559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_788600_789200
825177	contig_2867_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_135182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATATTTAGTAATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788609	788057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_788100_788600
825178	contig_12327_pilon	+	971	8	Intergenic	novelGene_140649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	43.74508718772	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	63	659	209738	214860	FALSE	30	GCTTGTTGAGAAAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPLAGLAAAALGRAPSDGMSGPRPVVLSGPSGAGKSTLLKKLLQEYGSVFGFSVSHTTRDPRPGEENGRDYHFVTREAMQRDIAAGDFIEHAEFSGNLYGTSKAAVRAVQAMNRICVLDVDLQGVRNIKKTDLRPLYICVQAPSLEVLEQRLRARNTETEESLAKRLAAAKADMESSKEPGLFDLVIVNENLDKAYSTLKEALFEEIKKAQGTSRT	189213	215172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_189274_209735_209850_210256_210299_210406_210504_211767_211907_212064_212150_213308_213395_214824
825179	contig_5585_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_143073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATCACCAAGGCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400826	400161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_400200_400800
825180	contig_5585_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_143072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAATAAATTTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400005	398795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_398800_4e+05
825181	scaffold_13609_pilon	-	1100	2	Intergenic	novelGene_124415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637080	634408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_634603_636174
825182	contig_10042_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_79190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTAAATACTTTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907688	906335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_906300_907700
825185	contig_16831_pilon	+	566	6	Intergenic	novelGene_134785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_5	82.390290690105	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	100	564	20751	133887	FALSE	45	CATGAACAAGAAAGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLYNSSGRDLRRALFSLKQIFQDDKDLVHEFVMAEGLTCLIKVGAEADQNYQNYILRALGQIMLYVDGMNGVINHNETIQWLYTLIGSKFRLVVKTALKLLLVFVEYSESNAPLLIQAVSAVDTKRGIKPWSNIMEILEEKDGVDTELLVYTMTLVNKTLSGLPDQDTFYDVVDCLEELGLAAVSQR	10850	133889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_10920_20720_20827_96149_96245_116899_117012_126176_126272_133800
825186	contig_14209_pilon	+	1777	12	Intergenic	novelGene_88339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	206.94024370047	1	110	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	999	1427	38057	40625	FALSE	15	GAGCGCCTCCTTGTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	32342	40975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_35209_35350_35511_35664_35769_35816_37100_37197_37300_37421_37712_37812_37909_38078_40142_40344_40418
825187	contig_12270_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_113868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	31	360	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14439	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
825188	contig_3380_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_60119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCCAGCCATCAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441837	443389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_441800_443400
825189	contig_12031_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_137571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	3	740	362427	361690	NA	80	AGATACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLRQAALLRARLSSAGFGFPRRRPGRGAQAVGSGIQSCGEEPGPFSHHDHAALRRVGTCTGDPQDPATKAARKGLFRQHPAPNHLVSASCPTQSEPRTLRELAALGLALLRYVTLALPLPAPPQLAGRKSVHRKQTLLTDSHSCTFTAPLIVSFHFPSPEDPTACPEPPGTVPGCTHFSPGANLDTPGKQRFPRLQETSLPEVRAGDSITLGWGKTGKHLLPSCVTTFGCTRGSKWRPSVSCPF	362429	360230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_360200_362400
825190	contig_17074_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_145188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCCTTAAAAGAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625043	624722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_624700_625000
825191	contig_10734_pilon	+	704	5	Intergenic	novelGene_51356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	16.0312195418814	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGGAGCAGGGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1780365	1784929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1780679_1781473_1781580_1783470_1783581_1784314_1784402_1784841
825193	contig_1309_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_73964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133857	133119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_133100_133900
825197	contig_5649_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_82407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACAGTGATGATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272297	1270629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1270600_1272300
825201	contig_3789_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_79828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGAAGCTCAACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232924	233397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_232900_233400
825204	contig_401_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_42753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTGTACTGATGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974548	975094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_974500_975100
825205	contig_401_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_42754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975898	976435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_975900_976400
825206	contig_3270_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_104509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394986	396196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_395000_396200
825207	contig_20675_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_161690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAACAATAAAAATCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62003	61003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20675_pilon_-_61000_62000
825208	contig_1090_pilon	-	345	2	Intergenic	novelGene_131151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTCTTAGTTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541783	538943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_539111_541605
825209	contig_5794_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_69741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTACCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445996	447931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_446000_447900
825210	contig_10733_pilon	-	835	7	Intergenic	novelGene_109961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	68.7687348210572	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	86	562	298577	296615	FALSE	5	TCGGTGCAGCTTGTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAALLRGLCGLLGHHACRGFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGGVKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFTATNPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLCNLFCGVCVGIVGSGAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQTSRVKMGD	299656	296341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_296642_297291_297483_297867_297920_298037_298108_298312_298391_298518_298603_299596
825213	contig_13722_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_174628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTCCAGCTTATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3211	1804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_-_1800_3200
825214	contig_12107_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_176735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGAGTTGGTTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10872	9912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_9900_10900
825217	SIRV6	+	420	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	344	3	178	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
825218	contig_8156_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_98916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATTACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152555	154463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_152600_154500
825219	contig_18799_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_171421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATAGGCTTTTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36949	37405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_36900_37400
825220	contig_3878_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_174791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATTATCTTCATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195559	196600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_195600_196600
825223	contig_12841_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_55901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTGAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912579	910928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_910900_912600
825224	contig_5765_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_141427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGAGTAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937522	936471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_936500_937500
825225	contig_6873_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_129819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGCCTAATAACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426191	426501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_426200_426500
825226	contig_4845_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_53704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGCAGCCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951408	950609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_950600_951400
825227	contig_4845_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_53703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTAAGGATCCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950481	949875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_949900_950500
825228	contig_6163_pilon	+	820	3	Intergenic	novelGene_103852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	48.5	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGTAATGAGTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498917	500987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_498972_499595_499655_500280
825230	contig_7119_pilon	-	1197	2	Intergenic	novelGene_40874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117470	108014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_108648_116906
825234	contig_5499_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_56970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31408	33106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_31400_33100
825236	contig_10581_pilon	+	1671	2	Intergenic	novelGene_41372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTAGGAAAGGAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465800	468078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_465866_466472
825237	contig_16831_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_134803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGTGTGTCTTCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507353	506181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_506200_507400
825238	contig_11978_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_62872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647033	645081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_645100_647000
825239	contig_6410_pilon	+	996	7	Intergenic	novelGene_108620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	121.006083409977	7	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	132	629	300693	313081	TRUE	15	AATTGCTGTTGTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299800	314656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310261_310369_312966_313134_314341
825240	contig_16103_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_118750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCAGCATTTTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369751	370488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_369800_370500
825242	contig_2550_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_135667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCAGACTGATAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207329	1209269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1207300_1209300
825244	contig_7357_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_36775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	48	356	116481	116173	NA	10	CAGGGTGCTGGCTCTAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGAVKFSHKWGYARNMYLPVQNILEESQKVIPCRRKRRCANWGRAKGYEVFKFYQRGWWAKHVSEDLKKHTDLSVEKNTLTQRVLYLISEFRDHPLPAQKELSDISRGFQRRNTNDS	116528	115461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_115500_116500
825245	contig_13904_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_165507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGACTTGTCACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212857	212394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_212400_212900
825246	contig_11677_pilon	-	437	5	Intergenic	novelGene_85937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	14096.7023515253	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598063	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597456_597553_598027
825248	contig_16666_pilon	-	1217	7	Intergenic	novelGene_61718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	292.07057746754	140	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	428	730	30779	24486	FALSE	5	TTTCTGCCTCTTGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47967	23998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_47871
825249	contig_15897_pilon	-	395	2	Intergenic	novelGene_49557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	176	346	679518	679348	FALSE	15	AGTAGGCCTGGCGAGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FACLEPGPPKEAVALSGGKVGSPAPCLSQDGAGKALERPKVRARVLSRAWVQLPASSSMSGAQTPGCPPAPSPLASSPTWTLILPAIRTVLGRGEYCENKPMHLLGSTRLLTKM	680081	679298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_679619_680006
825255	contig_14575_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_101895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAACCCTGAATCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34504	32235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_32200_34500
825256	SIRV6	+	434	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	2	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
825258	contig_8019_pilon	+	2234	5	Intergenic	novelGene_126977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_1	12.7549010188241	40	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	116	661	97837	195468	FALSE	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGDRESRFDPGGAKTRLFYIRALSVYSGKLWIVTSPCMLYLKKSKRIQDANMQLKRQQDECKKVQEELSHLQQELKIKQRLSQIFSQKLVEYKYFWNKTLLFLTSTKRELSSIKNEVYDNFQNWTSLKEEVFLQIKSISETALTEIATLNNSLTVSQRNKVCLEEEMKNLKLLSDAAILRSQQIHTSDQQEVNLHTRCYDLQKEVLGKRKLLFAIGSN	91584	197041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_170553_170730_195244
825260	contig_13607_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_170200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAATGCATATTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302834	304038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_302800_304000
825261	contig_9809_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_176763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCTAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112666	111969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_112000_112700
825262	contig_7056_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_43752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGATCCAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209158	1207683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1207700_1209200
825265	contig_11422_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_99027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACCTTAATATCATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742	132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_100_700
825266	contig_1443_pilon	+	689	3	Intergenic	novelGene_28196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2587.5	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	56	520	344128	344592	TRUE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343693	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122_344678_344814
825267	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12458	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
825270	contig_11373_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_176770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTTTGCCATGTGTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5996	7126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11373_pilon_+_6000_7100
825271	SIRV4	+	339	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1432	632	977	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
825273	contig_7057_pilon	+	939	8	Intergenic	novelGene_123254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	50.1882171715348	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	186	896	542770	570531	FALSE	5	GGCCTCTGCTTGCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVKVKVEKSDMEMAKARNQLDAVLQCLLEKSHMDRERLDEEAGKTPSDTHNKPSARFPHQRRKKRREMDDGLAEGGPQRSNAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEGSEVTNSKSRDVYKLPPPTAPGPPGDPCRSRIPSPLQPETQGTPDDEPSEPEPSRSTLIYHNMQRWKRIRQRWKEASHRNQLRYSESMKILREMYERQ	542584	570574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568785_568872_568952_569120_570061_570203_570293_570368_570449
825274	contig_2854_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_120809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72964	74372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_73000_74400
825275	scaffold_19766_pilon	+	963	4	Intergenic	novelGene_34308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.6488650063981	146	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	94	882	556963	558015	FALSE	20	TGAACACTTTTTGGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGCGEAELESAEEAVAAPGPPPEPRVSEPRAPVPEPGLDLSLSPQPESPEPPNCTPGRRKGRANRRGGARKGRQVRFRLAPTSPSRSEPLPAAAVPSEKLAAPQELEAPALQSTLALGLELQAARAAAGSQFDAAKAVEEQLRKSFQTRCGLEESVAEGLNVPRSKRLFRDLVSLQVPEEKVLNAALREKLAFLPPQARVPPPKEPPGAGPDMTILCDPETLFYESPHLTLEGLPPLRLQLRPRPSEDTFLMHRTLRRWEA	556869	558096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_557188_557268_557522_557599_557737_557841
825276	contig_4812_pilon	-	528	3	Intergenic	novelGene_103650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGTTGGAAGCTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80330	78715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79039_79102_79238_80260
825278	SIRV2	-	455	4	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1177	5	14	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4718	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687
825279	contig_5229_pilon	+	2108	11	Intergenic	novelGene_117676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.9728114616671	74	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	201	1169	191372	194367	FALSE	10	GCTACGGGTGTCCGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNSECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLIPSEIRKLKERIREEIDKFGIRVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQKMKQQMQDQ	186298	195306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_186403_191275_191382_191486_191574_191825_191950_192046_192182_192345_192464_192600_192703_193488_193586_193669_193806_194067_194171_194310
825280	contig_6873_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_129811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGCATAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185126	183723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_183700_185100
825282	contig_9982_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_55769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCGTATACTGTACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347209	346667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_346700_347200
825283	contig_10042_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_79117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGATTCCTAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38933	38454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_38500_38900
825286	contig_12464_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_68687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225759	225350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_225400_225800
825287	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	17	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
825288	contig_3334_pilon	-	1448	6	Intergenic	novelGene_137676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	188.396815259707	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	8	649	778618	756719	TRUE	5	TCTTTATTTTTTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHARIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQIAMQNQINTNPESPDTVTIHAATPQFIIGPGGVVNLTGLVSSENSSKATGIEMHTG	778625	733446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_733625_738712_738899_756283_756890_761716_761912_763122_763291_778510
825289	SIRV6	+	441	5	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	6	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2522	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10730
825290	contig_7057_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_123238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	92	433	538860	538519	NA	20	GTGGCTATATGTACCGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKRSVVRIHQLLLGNPMGQFYSTPINWTATGLIIPQSPHQGLWVHICNIKITKFLFFLPRIQTPHTIPCKNSNLQHMPISLVSNGHKGPCLSAAPLSVIQQLPSNAETEKVH	538951	538517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_538500_539000
825291	contig_7562_pilon	-	1819	8	Intergenic	novelGene_140878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	1282	1818	118999	117773	FALSE	45	AAGATAAAGCGAACAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNAGCLLFPFQGGTVTRSSFTGISLRGATRRVLGLCCGAEPRGFPAFSTASPARVRGCWAGAAFSGLMFSWSSRRAVCCSASSAEPASWAEGPGAELPNITAPRGRRRDQPAAPSSVHSARLTGAQTQPRNALAAAARRSPGQPAHLPAHLAGAVLDGGCKRSGQALPGVEDPGPRTP	124801	117771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_118220_118909_119154_120236_120358_120559_120786_121937_122145_122580_122692_124010_124149_124477
825292	contig_16860_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_155345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGGTTTGGGAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122035	123989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_122000_124000
825293	contig_10311_pilon	-	958	10	Intergenic	novelGene_50478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1049.24639622922	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	188	847	69004	66744	FALSE	10	ATTTGTTTTTCTTTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	70238	66632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67860_67907_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224
825294	contig_2332_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_58709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGAATCACAGAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789404	787279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_787300_789400
825295	contig_14575_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_101935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACCAGGCAACACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455990	455235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_455200_456000
825296	contig_6175_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_16340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648683	1650065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1648700_1650100
825298	contig_9833_pilon	-	2001	1	Intergenic	novelGene_68477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAACGAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84399	82398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_82400_84400
825299	SIRV4	-	370	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	0	1151	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
825301	contig_6325_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_143378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTGTGCATGTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564803	563301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_563300_564800
825302	contig_2710_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_161788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCAAAAAATGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034013	1034314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1034000_1034300
825304	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	0	1214	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
825309	contig_12622_pilon	-	1225	7	Intergenic	novelGene_5886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	23.1330691627568	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	75	335	1469326	1468486	TRUE	50	TTAAAGCACACGCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPCKQEQYQIEGQCCDLCLPGTKLMKDCTDGVDTVCEPCQAGEFLDTLNREMRCHQHKYCDPRLRIQTEGTSETDTTCTCKEGQHCTSDTCESCAPHSSCHPGFGVEQHF	1469740	1461960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1462606_1463320_1463350_1463458_1463613_1468423_1468496_1468836_1468973_1469211_1469338_1469677
825310	contig_6364_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_51772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.906570627444	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAAATCACCAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931352	902430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_902962_903030_903076_904266_904358_906457_906561_929810_929894_930955_931129_931214
825311	contig_2100_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_50610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCACACACACACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740575	741571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_740600_741600
825313	contig_5217_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_135808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCACACTTTATTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017020	1016565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_1016600_1017000
825315	contig_4125_pilon	+	1318	5	Intergenic	novelGene_25060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	881	1276	367705	371380	FALSE	20	CCGGGAAAAGGCGGGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISFLRLLRGSESSSNSSRALPRKTSWWNSLLRCPSISIFTPFRWSGGRISFSSLLVALSRTAEWLAGRVDTFARRSMPRSQRQHRALLQGEASQVAITRQDITVGQDCTRTAHRCGQSPRSKEQSHERP	355518	371422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_356173_359825_359902_360789_360932_367696_368065_371344
825316	contig_8606_pilon	+	1257	4	Intergenic	novelGene_159404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTGGGTAAAGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119484	155388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_120371_123693_123777_142027_142100_155172
825317	contig_5419_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_15470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCATGTCCTGTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66206	68237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_66200_68200
825318	contig_16896_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_174908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGCAGCCATTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80418	82159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_+_80400_82200
825319	contig_8050_pilon	-	1085	3	Intergenic	novelGene_114854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGCTCACTTCTGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382215	376197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_377054_380919_381124_382190
825320	SIRV5	+	314	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	138	216	24	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGGTGAGTCCGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8339	10926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
825321	SIRV6	+	436	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	95	0	-92	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2380	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
825322	contig_12299_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_29729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATTTTTGTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73003	71260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_71300_73000
825323	contig_10109_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_131329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAAAAAGCTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169976	169011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_169000_170000
825324	contig_5718_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_110379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTATGTCAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175726	1174182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1174200_1175700
825327	contig_12638_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_33293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACAAATACTGGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130643	1130935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1130600_1130900
825329	contig_6975_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_74276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACAAAATATGCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169337	167763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_167800_169300
825331	contig_935_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_45574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGCTTAGCACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608911	610882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_608900_610900
825334	contig_9363_pilon	+	1176	9	Intergenic	novelGene_6810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	184.5541925831	1	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	211	963	1622283	1625756	FALSE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPPVGRPLPWL	1622072	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624637_1625726
825335	contig_10182_pilon	-	2852	14	Intergenic	novelGene_134619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	18.8459968596287	88	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	169	2367	314276	308870	FALSE	50	TTTTGTACAGAGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAAHKSKSLKDLVSTCGSGGSTDVPMEGVKPEVVDALTPPTSDAGSPSQSSPLSLGSRGSGGGSGSDSEPDSLVLEDSQGKPAPPPPRSRGLLDRSRLALCALVFLCLSCNPLAFLLGGWGLPGPPGPPDATSVYHGPGRNVLATEGRDGPGCAQWLLLPLIWLINGLLVLGSLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALQALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQHLWVGRWLASQAGGLQKDGSLQADARASARDAALAYHRLHQLYTMGKYTGGHLAAINLALGALNLAECAGDAMSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRTLHFLTRFFLSSARQTCLAQSGSVPLVMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHSAPRESLYSLAGNPVDPLARVTQLFREHLLEQALNCVVQPNPGPGSTGGDQEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPGAPACSFSISPGTDPVSKWWASLATVAIHWLRRDEEAAEQLCPLVEHLPRALQESERTLPRAALHAFKAARALLGRSKAESMPASLAFCEKASGHLQDSLATMPAGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQQQQPPAPAQASPGAGSGPQASALELRGFQQDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGLGGRGGVVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVTMLAEAARTLEKLGDRRLLHYCQQMLLRLGGGTTVTSS	314774	308384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_309100_309423_309536_309621_309823_310199_310366_310510_310644_310768_310870_311092_311202_312184_312354_312530_312698_312786_313049_313364_313544_313679_313888_314114_314333_314662
825336	contig_383_pilon	-	2614	2	Intergenic	novelGene_126103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCATCTGGAGGAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126705	123212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_125331_126209
825338	contig_4429_pilon	-	1629	5	Intergenic	novelGene_50806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192077	174748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_174937_182069_182220_182827_182910_183985_184711_191593
825339	contig_10642_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_78689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTTAAATTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217546	216878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_216900_217500
825341	contig_3382_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_124203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAAAAAAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395106	1394615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1394600_1395100
825342	contig_16071_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_165993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAGCAAGTATCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43868	45486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_43900_45500
825343	contig_9957_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_173836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCAGGCATTAAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245281	243957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_244000_245300
825345	contig_4103_pilon	+	1378	2	Intergenic	novelGene_51892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	61	318	53913	54452	FALSE	20	TGTTACAATGTCTGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKTAATAADLDSRQLELADGMAERAALEELVRLQGERVRALKQQKAKAEKIEEEVAKLLKLKAQLGPDEGKQKFVLKTPKVNFIPLTASSPILQDACACFFEPTH	53852	55512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284
825346	contig_5917_pilon	+	1666	16	Intergenic	novelGene_122136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_14	208.976192158075	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	2	1519	57778	152700	FALSE	0	TGGCCGTGTGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPTWLSSAKVSPLIERVSDHKDLKKLLRTRNNVLVLYSKSEAAAENHLRLLSTVAQAVKGQGTICWVDCGDTESRKLCKKMKVDLSLKDKKVELFHYQDGAFHTEYNRAVTFKSMVAFLKDPKGPPLWEEDPGAKDVVHIDSEKDFRRLLKKEEKPLLMMFYAPWCSMCKRIMPHFQKAATELRGHSVLAGMNVYPSEFEDIKEEYNIRGYPTICYFEKGKFLFQYDNYGSTAEDIVEWLKNPQPPQPQVPETPWSDEGGSVYHLTDEDFDQFVKEHSSVLVMFHAPWCGHCKKMKPEFENAAEVLHGEADSSGVLAAVDATVNKALAERFHISEFPTLKYFKNGEKFAVPVLRTKKNFIEWMRNPEAPPPPEPTWEEQQTNVLHLVGDNFRETLKKKKHTLVMFYAPWCPHCKKVIPHFTATAHVFKEDRKITCAAVDCVKDKNQDLCQQEAIKAYPTFHYYHYGKFVEKYDSDRTELGFANFIRTLREGDHEKLAKKKEEL	57776	152847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_57905_61819_61908_74931_75016_75283_75330_82569_82663_86078_86140_94862_94931_103443_103536_103625_103698_111152_111290_131420_131492_132040_132202_136280_136412_142124_142196_152049_152185_152619
825347	SIRV6	+	474	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	382	0	209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
825348	contig_10324_pilon	-	1232	4	Intergenic	novelGene_7795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCAAGAGGAAATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131616	128788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_129524_130121_130232_130661_130760_131327
825350	SIRV1	-	242	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3862	0	3588	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
825352	contig_14575_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_101931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421949	421481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_421500_421900
825353	contig_2550_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_135664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTATTCCAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180189	1181804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1180200_1181800
825357	contig_15867_pilon	-	622	3	Intergenic	novelGene_170886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67690	63292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_63518_65547_65623_67368
825358	scaffold_880_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_121465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTCAATTTCGTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458912	458328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_458300_458900
825360	contig_13899_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_165573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGTGTTACTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35318	36693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13899_pilon_+_35300_36700
825361	contig_5484_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_151102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCCCAAGCCGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287215	287527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_287200_287500
825362	contig_14744_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_65953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	336587	336931	NA	75	TTAGAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSKPCAIVKSAQLLTDRSVVQTYQPLPQEKNVSGCFRKNLQPWKPYGVVLLCPVGSLRIGIQLDSNGFVLFWLLLTSCVTLGKLLNISGLRFLICKLGCSHWHPLYRTVLRIE	336586	337382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_336600_337400
825366	contig_3004_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_127512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAGGAAGGAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307468	309063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_307500_309100
825367	contig_15668_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_169627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGACAGTAGAACTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74145	74852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_+_74100_74900
825368	contig_8581_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_22858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCTGAGGTGATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381487	383741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_381500_383700
825369	contig_14467_pilon	+	881	3	Intergenic	novelGene_138255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	95	388	318578	319242	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEDLHPLVTLAFSLEAAPAPLPVVPWCLICPYLCLKD	306533	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_318766_319136
825370	SIRV6	+	197	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	453	1	222	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2815_3106_3165_10724
825371	contig_6477_pilon	-	578	7	Intergenic	novelGene_154171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4187.8868444864	19	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	82	537	773121	769365	FALSE	10	AGTGGGCTTGTTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773202	769323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769624_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
825372	contig_8616_pilon	-	1853	9	Intergenic	novelGene_72448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_8	26.2246901792948	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	66	1076	263983	258868	FALSE	40	TGACATATCACATGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEREERRFVEIPRESIRLMAESTGLELSDEVAALLAEDVCYRLREATQNSSQFMKHTKRRKLTVEDFNRALRWSNVEAVCGYGSQEALPLRPTREGELYFPEDREVNLVELALATNIPKGCAETAVRVHVSYLDGKGNLAPQGSVPSAVSSLTDDLLKYYQQVTRAVLGDDPQLMKIALQDLQTNSKIAALLPYFVYVVSGVKSVSHDLEQLHRLLQVARSLVRNPHLCLGPYVRSLVGSVLYCVLEPLAASINPLNDHWTLRDGAALLLSHIFWTHGDLVSGLYQQILLSLQKVLADPVRPLCSHYGAVVGLHALGWKVRSLAFFRQNHKGSLS	267589	258090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_259052_259424_259646_259786_259862_261582_261678_262321_262373_262500_262652_263282_263370_263836_263997_267537
825373	contig_9185_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_166910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAACCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483748	485799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_483700_485800
825374	contig_3818_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_99294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	111	341	934763	934993	NA	55	AAAAAAATATATACATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGPPLRGRENSRGCLEFGPAWKRCPRKRPRPSSSPMLRTFCEGRKCVSDPCGLSLALVFTSVSLALYFLRSEGNLFPFQLLLFREFGNEIWAGESCCGLRQRQCTKLEPLG	934652	936178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_934700_936200
825375	contig_12019_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_87716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	480	851	317741	317370	NA	20	TGTTCTTAATGTTCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYESKFRGATGCWWWAGLEGSPLSYCGPGHWAGRLQECARPSPPAACWPRGRHPAAGTLLDCPGQWQRAAGKGPAQPHTLGRSRGGDLRTALGPARPVPPQSPGSGCCCSACGLGVDGETEK	318220	317212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_317200_318200
825376	contig_709_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_57621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1541	1903	2495340	2494978	NA	20	CCCAGCAGCCCCACATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGWATSVASTRTPKSRVVPHELGADLEKGSDSCEALPAPPLPLDWSRTGFKGAGPTLRRPCGGDSRHGVSAQLFSEGLVPEGHLAPPNSLQMGEGNKTHPLGTQPVTCHSDLGQSCPL	2496880	2494843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2494800_2496900
825378	contig_11378_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_112235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATATGGAAGAACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325127	323417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_323400_325100
825379	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	469	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
825380	contig_8020_pilon	-	923	8	Intergenic	novelGene_114373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	146.815586115816	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	567	869	105876	104794	FALSE	25	TACCTAAACAGGGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107288	104739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105897_106021_106083_106365_106507_106616_106715_106803_106892_107130
825383	contig_6163_pilon	+	1207	6	Intergenic	novelGene_103823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	27.2514219812471	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	45	1160	227975	231085	FALSE	15	GCTGAGCCTCAGCCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGGRVTDDWDRRCVMNILEDFYNPAVLSPEHSYSTSGVYHQIQPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALLGSIIQLQPKSSSVGGQGREEIVQDVAQNILLKVPEPINLQWVMANYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNRLLQVITQTLRDLLKALKGLVVMSSQLELMAASLYNNAVPELWIAKAYPSLKPLSSWVMDLLQRLDFLQTWIQGGIPAVFWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKSVISIDTISFDFKVMAQSLSEISRRPKEGCYIYGLFLEGARWDPVTFQLAESRPKELYTEMAIIWLLPVPNRKAQDQNFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPTKQSQRHWIKRGVALICALDY	227930	231132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_228080_228720_228892_229024_229156_229558_229911_230218_230454_230963
825384	scaffold_16539_pilon	+	942	8	Intergenic	novelGene_68409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.8630767334798	446	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	569	862	916152	918774	FALSE	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPETRGVGVAADLGAAQRRAQHEARFQSPRGGFRGRGGFGDRGGFGGDRGGRGGRGGFGGGRGRGGGFRGLVTKNLVPGESVYGEKRVSISEGDDKIEYRAWNPFRSKLAAAILGGVDQIHIKPGAKVLYLGAASGTTVSHVSDIVGQDGLVYAVEFSHRSGRDLINLAKKRTNIIPVIEDARHPHKYRMLIAMVDVIFADVAQPDQTRIVALNAHTFLRNGGHFVISIKANCIDSTASAEAVFASEVKKMQQENMKPQEQLTLEPYERDHAVVVGVYRPPPKVKN	908247	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913737_914106_914169_915193_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
825385	contig_1244_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_37947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATAGCCAGTAGAGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832023	833169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_832000_833200
825386	contig_4896_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_164322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATGACATATACAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118938	117528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4896_pilon_-_117500_118900
825388	contig_14694_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_152465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAGGTTCTGGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80904	79881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_79900_80900
825389	contig_10011_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_68031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGATGCTCCCCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112125	112775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_112100_112800
825390	scaffold_13505_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_111415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330602	331045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_330600_331000
825391	contig_7593_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_127282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCAGGTCCCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67810	66974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_67000_67800
825392	contig_13945_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_173458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTGTGAAAATTGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105011	105404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_105000_105400
825393	SIRV6	+	387	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	370	543	197	47	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
825394	contig_10176_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_72700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAAGCTCGTCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233700	232907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_232900_233700
825396	contig_16782_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_176776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACACCAGTAAGGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70156	70414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_+_70200_70400
825397	contig_5571_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_75521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAACATGCGAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172091	173749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_172100_173700
825399	contig_12638_pilon	+	1455	5	Intergenic	novelGene_33278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_1	197.947594074795	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	140	766	858295	861300	FALSE	10	ACACCCTCGGCCCCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGPRAQQHSWCHPVLSLPQHILYCIVDSECKSRDVLQSYFDLLGELMKFNVDAFKRFNKYINTDAKFQVFLKQINSSLVDSNMLVRCVTLSLDRFENQVDMKVAEVLSECRLLAYISQVPTQMSFLFRLINIIHVQTLTQENVSCLNTSLVILMLARRKERLPLYLRLLQRMEHSKKYPGFLLNNFHHLLRFWQQHYLHKDKDSTCLENSSCISFSYWKETVSILLNPDRQSPSALVSYIEEPYMDIDRDFAEE	858155	861989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_858355_858997_859107_859709_859823_860780_860988_861162
825400	contig_12837_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_57280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAGAAAAATCAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52650	54757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_52600_54800
825401	contig_7070_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_104029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTGTTTATAACACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39846	40401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_39800_40400
825404	contig_6047_pilon	+	945	6	Intergenic	novelGene_24200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	614.15424772609	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	360	944	107251	114746	FALSE	35	ATGTATGGAGCAGCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPI	105127	114747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107152_107293_107809_107927_109178_109511_114652
825405	contig_11978_pilon	+	593	6	Intergenic	novelGene_63079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4747.14935935241	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	255	563	1830693	1831883	FALSE	25	TGGCCTTGGCAATTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827935	1831913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830103_1830663_1830785_1831161_1831262_1831766
825407	contig_15703_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_176777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGGAAAGGAGCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31424	32053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15703_pilon_+_31400_32100
825410	contig_2854_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_120824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTTATGTTTGCTGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229848	228331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_228300_229800
825414	scaffold_19766_pilon	-	1012	4	Intergenic	novelGene_34311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	45.8572664785952	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCCCCCACACTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564301	559215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_559807_559931_560059_560244_560464_564226
825419	contig_10002_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_157655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317307	315637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_315600_317300
825420	contig_10104_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_160135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGGAATTCTGAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432982	433640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_433000_433600
825421	contig_10011_pilon	+	1339	5	Intergenic	novelGene_68117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.2509433895096	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	289	372	332213	333199	TRUE	25	TGGTCATAATTGCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQCLVSRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSGSVVPAVTAAQAHAVKCQIKLM	330864	334218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_331039_332098_332233_332989_333045_333190_333327_333378
825422	contig_12277_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_139712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGCCAGGGTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393061	394158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_393100_394200
825423	contig_3787_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_102386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAATTTTTTTCTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432360	430895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_430900_432400
825424	contig_5264_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_165061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGCCTGTGAGCACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276154	274196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_-_274200_276200
825425	contig_7945_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_161610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAATCCAGGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480609	480973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_480600_481000
825427	contig_10733_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_109977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498235	498916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_+_498200_498900
825428	contig_16882_pilon	-	515	6	Intergenic	novelGene_148202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2065.13608268317	342	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189481	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187040_188683_188756_189058_189143_189464
825429	SIRV4	-	296	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1227	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3931	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
825430	contig_5954_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_28458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTCCTGCAGTGAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128654	127528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_127500_128700
825431	SIRV6	+	735	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	48	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10285	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
825432	SIRV6	+	362	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
825434	contig_7323_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_173214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63504	64747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_+_63500_64700
825435	contig_5457_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_139004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAAGAGCCTTCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208958	207114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_207100_209000
825436	contig_2161_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_114900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716956	717805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_717000_717800
825438	contig_4531_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_47856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGGCTTGTTTCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151478	152564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_151500_152600
825439	contig_14744_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_65946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230152	228035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_228000_230200
825440	scaffold_9100_pilon	-	1217	9	Intergenic	novelGene_83224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.6939360247965	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	6	1205	416503	156764	FALSE	30	TCCCACCAAACATTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMERERCASGAASAALFAWGANSYGQLGLGHKEDVLLPQQLNDFCEPGCVRRITGGGGHSAVVTDGGGLFVCGLNKDGQLGLGHTENVLYFTPCTSLLGCPIQQVACGWDFTIILTEGGQVLSCGSNLFGQLGVPHGPRRCVVPQVIELLREKVVCIAAGLRHALAATDAGELYVWGSNKHGQLATQAVFLPVPQKIEVHCFQNEKVTAIWSGWTHLVAQTETGKVFTWGRADYGQLGRKLEAQEGWKQEEQDSSLPCLTPQNSVPSSLLCLTGATEVSCGSEHNLAVIGGSCYSWGWNEHGMCGDGTEANIWAPMPVQALRSSLGLHVGCGAGHSLALCQLPALPALGQGLKVMDPFPDATEDAESQDSGQREKLEGKTIRNFNQSEGSRSGGLVTESI	416508	156751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_157099_250418_250456_345462_345630_384406_384566_403873_403935_406879_406975_410235_410392_412574_412711_416449
825441	contig_12125_pilon	+	1658	2	Intergenic	novelGene_76191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTGAAGGAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56156	65583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996
825443	contig_7976_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_169419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843822	842730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_842700_843800
825444	contig_13894_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_62075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGAGAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415617	414752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_414800_415600
825445	contig_17449_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_173767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10479	11975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17449_pilon_+_10500_12000
825447	contig_14353_pilon	-	1266	9	Intergenic	novelGene_82150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	182.674189131908	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	548	775	407973	406900	TRUE	20	TAGCCTTCAGCATTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGKLLLNLVDHTEVVRDLTFAPDGSLILVSASRDKTLRVWDLKDDGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVCGGSNIGVIEVMLAPLAHRRTMVLAGQKEWHLWLPGWGRPLP	415421	402954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_406851_407028_407873_407979_409840_409973_414146_414413_415277
825449	SIRV6	+	219	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-387	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1898	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
825450	contig_6557_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_33010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	214	348	574262	574396	NA	30	TGCTGGACTGTCCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHFPEVAPSARYGGRWDSGSYLRECCSLFVARLSSVLDLLSSLVLCALPGSPGRAWVGACEAVRSCSAYEYMYVFMRRPLRALNRVSSLSCEETISSLMGEIQDVGSWRRPLTQL	574048	575733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_574000_575700
825451	contig_11642_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_172915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTGACTCCATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228092	229763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_228100_229800
825452	contig_1813_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_105492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124037	125450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_124000_125400
825453	contig_12250_pilon	-	864	2	Intergenic	novelGene_80627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGCAGCGCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354969	353566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_353764_354302
825455	contig_10082_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_63887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374027	375539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_374000_375500
825456	contig_11216_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_173599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCCTTCTGAACCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145383	146612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_+_145400_146600
825458	contig_12728_pilon	-	1718	13	Intergenic	novelGene_155811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	54.6495781217832	6	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1042	1392	192197	189833	FALSE	5	TGTTCACTTCTGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIIPQKGGKVVPCRHDWHQTGGEVTISIYAKNSLPELSRVEANSTLLNVLIVFEGEKEFHQNVKLWGVIDVKRSYVTMTATKIEITMRKAEPMQWASLELPAAKKPEEQKEDITD	214157	189506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_189980_190221_190285_190726_190847_192176_192360_192797_192898_194279_194333_198663_198734_199405_199504_201483_201642_202943_203001_209323_209374_213612_213731_213982
825461	SIRV5	+	343	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	33	7586	13	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
825462	contig_990_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_76104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCGGCGTTCCCAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382754	1380649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1380600_1382800
825465	contig_10609_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_123911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCTAAAGGCAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251933	253281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_251900_253300
825466	SIRV6	+	471	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
825468	contig_3948_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_53240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026697	1027442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1026700_1027400
825469	contig_11720_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_44030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414902	416822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_414900_416800
825470	contig_4812_pilon	-	549	5	Intergenic	novelGene_103681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_4	5262.92734606892	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	114	548	82626	80303	FALSE	10	TTGCTCTGCTGGACTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGM	82739	80301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
825471	contig_8453_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_125137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTCCCTGTTGAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235326	233582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_233600_235300
825472	contig_3382_pilon	+	1008	2	Intergenic	novelGene_124113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709045	710250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_709730_709926
825473	contig_252_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_99925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTAGACAGTATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248605	246686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_246700_248600
825474	SIRV6	-	483	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCATCAGCACATATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11262	10477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11028_11118_11215
825476	contig_7138_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_120979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGAAATATCAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118585	116962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_117000_118600
825478	contig_2730_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_135387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347793	349414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_347800_349400
825479	contig_15518_pilon	+	825	2	Intergenic	novelGene_127582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	508	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	585	698	15096	15209	FALSE	10	GTCACTCTGCTCAGCGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGR	11046	15336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886
825480	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825484	contig_8045_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_35418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTGGCAATCAACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220599	221309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_220600_221300
825485	contig_4364_pilon	-	1634	13	Intergenic	novelGene_130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	168.119666375538	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	26	982	1097596	1093063	TRUE	20	AACACTCCCTGGCTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQSAPDVNYVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQHAPDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVGSGTARPRPSSPSSSAPQAWPSWLPASISRPPSASCWPPLTTVTSPSCFPPAMWPSMGACAPWPPLTARSCSATSSPAVPSSCSWSWSPRYGTSSSSSMSPSMPRVSRCWMR	1097621	1091836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653_1092792_1092879_1092961_1093060_1093167_1093329_1093425_1093639_1093726_1094116_1094178_1094488_1094627_1094707_1094873_1095550_1095733_1095987_1096081_1097563
825486	contig_9011_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_159319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	692	1093	524005	524406	NA	20	TTGAATCTACCAGCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGGSNPPNSSGSSQLPTNCATQGLQPSAELHKLECSFPNFVLTKTLFLFQLDTELVHLLSCLPVVWPQLSSGQWNVGRRGMYIFSKPGPQKPTPLSAMLFSLFPVCWPDILKPFWNPCVEEGRDFVIPSP	523313	524455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_523300_524500
825487	contig_17432_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_159001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	590	892	7812	7510	NA	45	CTATAAGACAGAGCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTHTHTHTHTHSHIRMNIVVRQGCILSLYLFNLYAEQIIREARLYEEEQGITIGGTLINNLRYAADKTMPAESEEDLKHLPTKKNKPELVAVESTPTHSH	8401	7508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_7500_8400
825488	contig_15825_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_160214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213983	215327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_214000_215300
825491	SIRV6	-	372	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-129	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1949	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
825492	contig_9771_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_156927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCTGTTCACAAAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457532	455733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_455700_457500
825493	contig_7171_pilon	-	815	8	Intergenic	novelGene_101185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	416.639177324496	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	146	730	49603	37493	FALSE	5	CCTGTGTCTCTGGTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSESIRSGGRCPNGHPDTKLPHQLTVPSLLPPVIEPTEWCVYEAQPEREDRWNQSWD	50453	37407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37663_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_50308
825494	contig_6589_pilon	-	531	5	Intergenic	novelGene_25855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1426.76215607227	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	155	529	957293	955185	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMVRGCCREDVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWM	957846	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_957227_957360_957758
825495	contig_14516_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_153924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGATGGTGCGGGACCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256076	254956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_255000_256100
825496	contig_3426_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_57950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAACAACATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372413	372800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_372400_372800
825497	contig_14341_pilon	-	691	5	Intergenic	novelGene_111845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGACCGCGCGCCGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551788	547739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_547803_548745_548860_549934_550155_550358_550491_551626
825499	contig_13412_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_80016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGCTAATGTTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412704	413581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_412700_413600
825500	contig_13412_pilon	+	1399	2	Intergenic	novelGene_80017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTGCTAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413990	415483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_415126_415219
825501	contig_14559_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_83724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAGCAGTGCTTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273446	274503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_273400_274500
825502	contig_1406_pilon	-	815	5	Intergenic	novelGene_25523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	81.1233628494283	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGTAGCTCGCCGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058875	1751288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1751389_1829371_1829712_2008288_2008459_2012379_2012515_2058805
825503	contig_13787_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_40634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTTGTTGCAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205372	204227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_204200_205400
825506	contig_5346_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_161866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGCTTGGAAAATGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477807	475597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_475600_477800
825507	contig_2969_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_157080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTACACAATTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967518	966354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_966400_967500
825508	contig_6451_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_173703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGCTATAGTGTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154710	155899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_154700_155900
825509	SIRV6	+	456	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
825510	contig_12079_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_67393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAGGAAAAAGAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470697	468794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_468800_470700
825511	contig_9415_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_109847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTTTACCAAGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1967351	1966708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1966700_1967400
825512	contig_9468_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_59514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTAATTTTAAAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445882	443394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_443400_445900
825516	contig_6364_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_51797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAAAGTCTCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405198	1405487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1405200_1405500
825517	contig_14838_pilon	+	537	3	Intergenic	novelGene_151924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	159	junction_1	34.5	2558	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	84	455	236178	253647	FALSE	30	TTAAGTTGTATGTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPLAVTGGDVSLHNFSARLWEQLVHFHVMRLTDSLFLWVGATPHLRNLAVAMCNRYDSIPVATSLLGDTSDTTSTGLAQRLARKTNKQVFVSYNLQNTDSSFALLVENRIKEEMDAFPEKF	236094	253729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_236352_248326_248403_253525
825519	contig_2703_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_101745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533872	535323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_533900_535300
825520	contig_6048_pilon	-	948	7	Intergenic	novelGene_73278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.3058255532927	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	36	638	2006298	1978762	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQVNSPGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLPV	2049037	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978772_1985011_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
825521	contig_6233_pilon	-	1253	8	Intergenic	novelGene_74784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	345.561004980691	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	116	949	149777	143464	TRUE	30	GCCACAAAGCTTTGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAMLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	199943	136683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136984_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148121_148189_149521_149787_199837
825522	contig_935_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_45589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATTTAAAAGGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632928	631407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_631400_632900
825526	contig_6589_pilon	-	1125	5	Intergenic	novelGene_25697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	159.095883039128	255	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	281	733	183824	179178	FALSE	75	AAAAAGAAACAGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLLFRGPEQWRRARGYREGGSGAEKENRASQPWPLGADPQSRDARQQRFAHFTELAIISVQEIVDFAKQVPGFLQLGREDQIALLKASTIEIMLLETARRYNHETECITFLKDFTYSKDDFHRAGLQVEFINPIFEFSRAMRRLGLDDAEYALLIAINIFSADRPNVQEPSRVEALQQPYVEALLSYTRIKRPQDQLRFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE	188178	178785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_179325_179690_179900_183727_183828_184901_185086_188085
825528	contig_19957_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_57725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATTAAAAAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250869	252906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_250900_252900
825531	contig_11702_pilon	-	855	7	Intergenic	novelGene_142015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	87.9117297192031	6	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	86	748	535701	531292	FALSE	15	TGGGGAATCTGTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRNARPEDLMNMQHCNLLCLPENYQMKYYFYHGLSWPQLSYIAEDENGKIVGYVLAKMEEDPDDVPHGHITSLAVKRSHRRLGLAQKLMDQASRAMIENFNAKYVSLHVRKRISEVEPKYYADGEDAYAMKRDLTQMADELRRQLELKEKGRHVVLGPIENKVEAKGNSLPSSGEACREEKGLAAEDSGGDSKDLSEVSETTESTDVKDSSEASDSAC	535786	531184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_531529_532311_532397_533818_533935_534024_534071_534740_534800_535082_535182_535680
825533	contig_1516_pilon	-	842	7	Intergenic	novelGene_50011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	157	348	363070	362192	TRUE	25	AGGCAGATCCCACTTCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLFIDIQVGSIATGLEEHYKRRWPNGGVEGRGRDRAWRRGSRAHHGTGTTRMVLVKPEPGRHPVSTMTTSPVLKKPRALPTFMPRFTRRSTSSAQASWTGSLHSTGKMPRYRWA	363728	347274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_347394_347975_348066_352895_353030_353505_353596_362130_362298_362984_363176_363677
825534	contig_11574_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_64035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCCAACTATTTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286547	283976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_284000_286500
825536	contig_16578_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_148630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATATTTCTTTTTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120385	119736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_119700_120400
825537	contig_2940_pilon	+	955	7	Intergenic	novelGene_81865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.6178938227879	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	260	955	183390	205802	FALSE	55	AAGACAACAGACAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWPTNFGISSMDLSVMDDHSHSFDIKPFTTVDFSSISAPHYEDIPFTRADPVMADYKYDLKLQDYQSAIKVEPASPPYYSEKTQLYNKPHEEPSNSLMAIECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRRTIRLKLIYDRCDLNCRIHKKSRNKCQYCRFQKCLAVGMSHNAIRFGRMPQAEKEKLLAEISSDIDQLNPESADLRALAKHLYDSYIKSFPLTKAKARAILTG	84379	205802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_84443_93501_93601_110944_111019_183366_183595_184992_185163_193334_193474_205620
825538	contig_2940_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_81868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	7.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	37	717	217515	235123	FALSE	25	CATTATGACATTGCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTTDKSPFVIYDMNSLMMGEDKIKLKHITPLQEQSKEVAIRIFQGCQFRSVESVQEITEYAKSIPGFVNLDLNDQVTLLKYGVHEIIYTMLASLMNKDGVLISEGQGFMTREFLKSLRKPFGDFMEPKFEFAVKFNALELDDSDLAIFIAVIILSGDRPGLLNVKPIEDIQENLLQALELQLKLNHPESSQLFAKLLQKMTDLRQIVTEHVQLLQVIKKTETDMSLHPLLQEIYKDLY	205802	235317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_205821_217496_217948_234875
825540	contig_7428_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_77714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	469	954	373285	373770	NA	25	AAATTATGTGGTATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYIRSLHELIRNHFSLFSAENEALDISVRGQFRESPIPPTSPPHKKHLLDCPLLASQLLDTWEAFQFEKSQASEFLLSKRHAIVPKLQQLMAAALAELDGLLEKALSGPFMDPAQEQRSTERQLISLERQFQNTASHLSELHHAYVTFTGTEHPAPSPAP	372816	374785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_372800_374800
825542	contig_7408_pilon	-	940	5	Intergenic	novelGene_168753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	185.03563845919	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAATATATAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48349	36734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48129
825543	contig_13292_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_142953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334042	335925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_334000_335900
825549	contig_10734_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_51205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	408	788	1132849	1132469	NA	85	AAACAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTESGKVFMASILLRMTSTYRLLLLVLLLLLLLCRCLDLEQERDLTRRFLSLLLDRDFFLSLLLDRDFFRSLLLLRWRLKLKCTEFVVTQSCLFSIIHEFTFVLYTIKTANKPVVYDAVTIVCN	1133256	1131999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1132000_1133300
825550	SIRV2	-	288	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4585	34	3410	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
825553	contig_10042_pilon	+	2373	1	Intergenic	novelGene_79145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGGGAAAATTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98910	101283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_98900_101300
825555	contig_19016_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_173335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAGCAAAGGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16541	15611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_15600_16500
825557	contig_3397_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_154585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTAAAAATCCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155419	154939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_154900_155400
825558	contig_7410_pilon	-	2133	8	Intergenic	novelGene_106105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.4101421902563	5	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	77	1105	497091	427503	TRUE	50	TCAAATAAATCCAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVTRAVFGELPSGAGTVEKFRLQSDLLRVDIISWGCTITALEVKDRQGRASDVVLGFAELEGYLQKQPYFGAVIGRVANRIATGTFTLDGKEYKLAINKEPNSLHGGIRGFDKVLWTPRVLSNGVEFSRVSPDGEEGYPGELKVWVTYTLDGGELVVNYRAQASQTTPVNLTNHSYFNLAGQGSPNIYDHEVTIEADAFLPVDETLIPTGEIAPVQGTAFDLRKPVELGKHLQESHINGFDHNFCLKRTKEKQFCARVRHAGSGRVLEVYTTQPGVQFYTGNFLDGTIKGKSGAVYPKHSGLCLETQNWPNAVNQPNFPPVLLRPGEEYDHTTWFKFSVA	497167	426361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_426399_426511_427581_428206_428382_430015_430158_471678_471761_479082_479290_483870_484026_496901
825559	contig_14219_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_54323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAAAGCCCTGCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722884	725228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_722900_725200
825560	contig_4845_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_53679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTATTTAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793247	795037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_793200_795000
825561	contig_6079_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_160105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGCCCTGGGGCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470652	468849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_468800_470700
825564	contig_9668_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_58153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGAAGCAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368972	370725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_369000_370700
825566	contig_5019_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_109219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCAGTCCCATAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296568	294452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_294500_296600
825567	contig_5331_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_112824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	2.5	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	152	490	751763	740492	FALSE	35	AAATCCCTAAGTTAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDLAGPPRPPLLPPICSIKGPGGPPGPPRLPPPKPPRSMPRPPRKPPLSPPRPPLNIPPGPPRSMRPPLPPRMPPGPPLPRSPPKAKFWFPQPLYKMTSQEKSATELRRCS	751914	739891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_740573_740981_741224_751747
825568	contig_11115_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_102776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAGCGATTACAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31682	32588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_31700_32600
825569	contig_12756_pilon	+	1210	9	Intergenic	novelGene_153205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	103.793590240438	3	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	40	777	47123	66492	FALSE	30	AACAAAGTTGTTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPPPPANWRTGDMRSGWALRFLRCDGRGGYRISPHRRRFSLVLRRDFLTTTTKEGYDVRQVDITPLEQRRLTFDTHALVQDLETHGFDKAQAETIVSALSSLSNVSLDTIYKEMVTQAQQEVTVQQLMAHLDSIRKDMVILEKSEFAKIELDQVKQQLINETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKKLMEATTEFTKKDNQTKSVISETSNKIDTEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFYRFWK	47083	66925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_47223_49215_49336_50950_51055_58624_58706_60062_60099_60185_60258_60480_60535_61922_62038_66436
825570	contig_7342_pilon	-	345	4	Intergenic	novelGene_71201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5266	junction_3	3402.61197056353	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	34	345	666818	665417	FALSE	20	GACTGAGTGCGTTCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTHIRAKRKREELSNVLAAMRKAAAKK	667028	665416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665709_666725_666821_666997
825571	contig_6102_pilon	+	491	4	Intergenic	novelGene_32188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGACTTGTCGAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894889	896323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895469_895591_895808_895940_896211
825572	contig_1275_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_108729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGACAACACCCCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331200	331683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_331200_331700
825573	contig_10609_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_123933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCCTATTCCTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380786	378696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_378700_380800
825574	contig_11816_pilon	-	1397	2	Intergenic	novelGene_98562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232146	1199715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1200892_1231925
825576	contig_18869_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_56385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73590	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
825577	SIRV4	-	592	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	17	8	17	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5141	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
825578	contig_17560_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_167573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGAGAGACTGAGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16265	16505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_16300_16500
825579	contig_17560_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_167574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAAGGATCCCACTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16505	16877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_16500_16900
825580	SIRV6	+	316	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	369	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1853
825582	contig_19342_pilon	+	799	6	Intergenic	novelGene_41094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.61109401705356	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	107	376	5208	6183	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHGVPDPPPAALGGPCPDPDPGRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3257	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_5170_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
825585	contig_14684_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_99654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCGAACCCGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255745	255531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_255500_255700
825586	contig_14744_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_66097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTGGAGAAAAATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439446	1437926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1437900_1439400
825587	contig_7521_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_160557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAGGCCATGTCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341451	342245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_341500_342200
825588	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	27	353	14409	13860	FALSE	20	AGTATGGTTATGCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYC	14435	13858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
825590	contig_3397_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_154583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAACTCTTGAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145808	147049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_145800_147000
825591	contig_2768_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_57499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTATGATAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727212	728206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_727200_728200
825592	contig_15866_pilon	-	958	10	Intergenic	novelGene_63626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGCGAGGAGGAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624446	458871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_459066_519221_519275_581432_581480_601014_601094_608107_608230_613653_613758_619603_619743_620760_620840_623213_623331_624422
825593	contig_9649_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_160688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	134	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTCCCGACCCTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26719	24595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_-_24600_26700
825594	contig_7816_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_66465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTGGGGAAGAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127145	127482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_127100_127500
825595	contig_13481_pilon	+	1532	11	Intergenic	novelGene_119296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	45.7794713818323	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1452	81	1532	190886	221986	FALSE	35	GTGAGTAAACGAATACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASREPLLSWCTEELRKTFSLDVSEEIMQYVLSIESAEEIREYVTDLLQGNEGKKGQFIEELIIRWQNNDQESISDPLQQYFKKDEILDGQRSGDQIKKSRRKGRNRQEVPSSFAEPDTAVEVKTPFDLAKAQENSSSLKKKTKFVNLYTREGQDRLAVLLPGRHPCDCLGQKHKLINNCLICGRIVCEQEGSGPCLFCGSLVCTREEQDILQRDSNKSQKLLKKLMSGTENSGKVDISPRDLLPHQKSRIKSGLEKAVKHKDKLLEFDKTSVRRTQVIDDESDYFASDSNQWLSKIERETLQKRQEELRELRHASRLSKKITIDFAGRKILEEENPLAEYHSKLDETIQAIANGTFNQPLTKSGRSSAEPLGILVNPNMDQPPPQWVDQTGAASQKRSLHLAGSELELSSHQHRMRIQDREFQEGFDGGWCLSMHQPWASLLVRGIKRVEGRTWYTPHRGRLWIAATAKKPSPQEVSELQATYRLLRGKGCLLGCVDLTDCLSQKQFKEQ	190805	221986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_190891_196375_196546_197209_197347_205538_205752_207198_207278_210021_210152_211669_211886_214285_214413_217712_217901_220528_220654_221924
825597	contig_14618_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_136842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTTTACATAATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197347	1195561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1195600_1197300
825602	contig_16330_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_176779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAACTTTTTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101815	103314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16330_pilon_+_101800_103300
825604	contig_10531_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_114542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500703	500112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_500100_500700
825605	contig_7050_pilon	-	573	5	Intergenic	novelGene_153613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_4	162.724268319142	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	231	410	637898	585724	FALSE	15	TTGCTTTTCATTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHCHGCRWWRRPRRRGTTLCRVLAALRQTARRRHRPGTGRYAFQIWKPLEQVITETAKKISNPSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGGSPYLATKINEAKDLLESSTKH	677200	585560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_631905_631977_637860_637938_651778_651853_677083
825606	contig_13349_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_161142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTTTCTTCATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412017	412469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_412000_412500
825610	contig_1847_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_171728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGCCACCAGCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73228	74313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_+_73200_74300
825611	contig_7935_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_171797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGAGAACATTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8796	9189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_+_8800_9200
825612	contig_10882_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_172745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATATTCCTTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7692	9543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_7700_9500
825614	contig_9873_pilon	+	1113	2	Intergenic	novelGene_176780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	25	780	273421	288269	FALSE	40	CCAGAAATGAAGTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDWEFPHFMGDVDVNLPGLHTSHVQFKIPFFQKIFKEEYHIHITGKWFNYGIIFLVLILDLNMWKNQIFYKPHEYGQYIGPGQKIYTVKDSESLKDLNRTKLSWEWRSNHTNPQTNKTYAEGDMFLHSRYIGASLDVKCLAFVPSLIAFVWFGFFIWFFGRFLKNEQGMENQDKTYTRMKRKSPSEHSKDMGMTRENTQVSVEDPLNDPPLVCIRSDFNEIIYKSSHLTSENLSSHLNESTSATEADPDPTTSKSTPTN	273396	288602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9873_pilon_+_273530_287622
825615	contig_2332_pilon	-	567	5	Intergenic	novelGene_58629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	1141.54128265254	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTCAAGTTTGTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67998	64468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_64652_64900_64970_65214_65352_67106_67225_67938
825616	contig_5696_pilon	+	1011	9	Intergenic	novelGene_117497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_8	64.5347532342071	538	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	108	812	270879	295872	FALSE	30	CGAATCTGAAAATTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVAGRATRFEAPSAKRFCLAAPVPVLRGSGSCQPAMEKQPTDSEGEGEEGGQPQEANKEDHMTLLLRLRAQTKQQLLEYKSMVDANEEKTPEQIMQEEQIKAKIEGLENEVEEAKTAFEMKNLALDRMQLSAALKNNLEKIDTKTSLLMDDMKHVLELNKLIMTSQQESWDLEEKLLDIRKKRLQLKQASESKLLEIQTEKNKQKDDLDNMENSDKIKAIRQNLQREIQITTVIQNVFQNLLLGSKANWAENPALKKTVLQLEKNLTMI	270771	296071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_270974_273594_273651_277202_277252_277624_277700_279528_279586_289658_289723_289969_290022_291302_291467_295779
825617	contig_19865_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_170158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61969	61431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_61400_62000
825619	contig_1925_pilon	+	1090	8	Intergenic	novelGene_162217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	425.732885499721	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	73	705	254564	284492	FALSE	35	AGTTTACATCTGTTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGKAINVFISANRLIHQTNLILQTFKTVA	225116	284877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225172_254546_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713_279797_284410
825620	contig_9909_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_42467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAACTCTTTGCCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560825	561586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_560800_561600
825624	contig_14871_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_63688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAGAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173782	172722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_172700_173800
825626	scaffold_13505_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_111407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTCTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295488	294452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_294500_295500
825627	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	6	337	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
825630	contig_9633_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_139607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACTCACCCCCAGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501782	502316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_501800_502300
825631	contig_7045_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_77424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCCAAAAATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184169	185270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_184200_185300
825632	contig_10241_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_142842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACTCAATGGCAATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130059	128569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_128600_130100
825633	contig_10241_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_142841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAAAAAGCAATGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127312	126971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_127000_127300
825634	contig_15731_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_171975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGAATTCAACCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65436	64193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_-_64200_65400
825635	contig_13224_pilon	-	1075	4	Intergenic	novelGene_104124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_3	52.2897908030069	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	80	562	387941	384754	FALSE	50	AACATGATAAATGAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLRPGWYRRGVSARLQEQLSRVTFKMDSTLTATEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPSHPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALELLTQEFGIPVERLYVTYFGGDEATRLEPDLECKQIWQNLG	390276	384240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_384904_385250_385440_387797_387963_390218
825637	contig_17781_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_163681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTCTGACTTCTTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416168	416626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_+_416200_416600
825640	contig_91_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_127086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTAATTGTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207380	207666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_207400_207700
825641	contig_8972_pilon	+	3027	7	Intergenic	novelGene_167627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1969	2307	277376	277858	TRUE	15	AACGTCTCCTCGGCGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLTKSSAPMKSPAMMFVQREPGPGHCSRTQASRHGSLGNVIVCRDSERCVSRYTRFSVRLMPATNSWSGRPTLFLNSRYWMRSLVFTLFPHQYGMPGHSSLCLLTEPSSS	275407	293035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_277584_277727_277908_279539_279698_281472_281601_282742_282881_285441_285587_292933
825642	contig_16510_pilon	-	973	3	Intergenic	novelGene_139072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.5	487	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGAATGTGGGGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235744	234469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_234668_234893_235412_235487
825643	contig_8195_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_170048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGTTGGCACCCCGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108720	109497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_108700_109500
825644	contig_10049_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_176783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21218	20992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10049_pilon_-_21000_21200
825645	contig_5324_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_102058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGTGGAACAAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403020	401756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_401800_403000
825646	contig_4114_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_15616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCACCTGCCAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374695	375476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_374700_375500
825648	contig_13215_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_145885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTGATATTTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105986	106596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_106000_106600
825649	SIRV4	-	196	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1327	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3831	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
825650	contig_7867_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_162745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227387	226272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_226300_227400
825651	contig_5317_pilon	+	675	5	Intergenic	novelGene_76505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5577.68945778626	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	112	522	35282	43326	TRUE	45	CACAAAGCATTAATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33677	43539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197_43375_43434
825652	contig_21388_pilon	-	723	5	Intergenic	novelGene_136639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	21	671	28487	21603	FALSE	10	TCGGGGGTGAAGGTGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPFSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28507	21550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
825653	contig_546_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_117199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAGGAAGAAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97906	97353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_97400_97900
825654	contig_6589_pilon	-	464	6	Intergenic	novelGene_25869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1283.38739280079	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	36	464	959104	955183	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVHARAARCTGISARHREPRTATPNRTSAPRAGSSSVPEADGPAAATKTNPRSYSVIKKILDA	959139	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956769_956815_957251_957360_957758_957846_959101
825655	contig_14322_pilon	+	1210	4	Intergenic	novelGene_115633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.0116263352131	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	249	410	251171	251471	FALSE	5	CACCTGTCTCCCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPGGPAVRTADAAAESGVDRAAPESDPESDPQCQQRRPAGVTTDCPSENHIRPSADWALPHVLPFSPVRLPKREKEKNWTCMFRRIFMFLLAPPFCTPPRPPGPQILFRRKEPASCDHKPATIFPQAPESPVFL	247996	252271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_248011_249115_249238_251058_251322_251460
825658	contig_8620_pilon	+	698	5	Intergenic	novelGene_173870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	99.0025252203195	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	130	555	57797	60703	FALSE	20	AATTTTTGCTGTGATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFACAKLACTPALIRAGSRVAYRPISASVLSRPEARTGEGSTVFNGAQNGVAQLIRREFQTSAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	57480	60846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57537_57723_57836_59040_59119_59712_59907_60588
825659	contig_8461_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_163934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGGTAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441477	442950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_441500_443000
825661	contig_11507_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_103354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78554	79624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_78600_79600
825662	contig_4364_pilon	-	902	5	Intergenic	novelGene_42	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_1	11.3219918742243	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	18	824	499956	487973	FALSE	20	GGTCTCCAGGGGTCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLLRAELRTRTLRAFGSSGAGYISEGRAYDTDAGPVFVKVNRRTQARQMFEGEKASLEALQATGLVRVPRPVKVIDLPGGGAAFVMEYLKMRSLSSQASKLGEQIADLHLYNQKLGEKLKEKESTVGQRAGCAEPQYVTKFGFQTVTCCGFIPQVKIPDLFCGLEIIPALLHGDLWSGNVAEDDMGPIIYDPASFYGHSEFELAIALMFGGFPRSFFTAYHRKIPKAPGFDRRLQLYQLFNYLNHWNHFGREYRSPSLGTMRKLLK	499973	487894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_488312_494113_494197_494602_494695_495979_496132_499815
825663	SIRV6	+	358	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825664	contig_7410_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_106052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93130	91558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_91600_93100
825665	contig_10864_pilon	+	1072	2	Intergenic	novelGene_107083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901785	904468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_902056_903666
825666	contig_16442_pilon	-	677	2	Intergenic	novelGene_172292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	99	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATTATCAAGAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4807	3837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16442_pilon_-_4442_4734
825667	contig_13740_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_34603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	405	1218	44	1261	149567	150784	NA	45	TCAGAAAGAGCAAACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGDIPLLPGSSNDGMNFSAHYNVNFSQAISHNVSLHEAMLLCPSNRFRRDPVARTSQPQEPFLQLNSPTNPEQTLSGTNLTGFLSPADNQMRNVTSQDLLCDLDVNVFDEINLMSLAMEEGFDPMEVSQLFEEPDSDSGLSLNSSHCSTSITKSNSSHSVYDEEGATGYSSDLESFSHHDLEGAVGGCSPEPSKLCHMDHRNDSGFDEEVAFQHIFHNHTYHLQPTVPESTSESFSWPGKSEKISRFLSGTDRNLSCDERRAKALHIPFSVEEIVRMPVDSFNRMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDVILNLEDDICNLQAKKETLKREGAQCNKAINIMKQKLHDLYHDVFSRLRDDHGRPVNPNQYALQCSHDGSVLIVPKELGTSGHKKENQKGTSKSERRN	149523	151149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_149500_151100
825668	contig_2646_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_69672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2207134	2205164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2205200_2207100
825669	contig_12886_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_135515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTGAAGATAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635355	634177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_634200_635400
825671	contig_12008_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_25009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60497	59628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_59600_60500
825672	contig_5797_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_56923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTAGGGTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205090	203695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_203700_205100
825673	contig_12644_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_44591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATAAAGAAGAATTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2132689	2135245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2132700_2135200
825675	contig_4751_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_173723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAACCAAGATAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176087	174700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_174700_176100
825677	contig_9609_pilon	-	2013	15	Intergenic	novelGene_22943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_13	3.10365156891435	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	106	1515	118509	99307	FALSE	15	CTTCTGGCTCTGGAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIRALCTICSDFFDHSRDVAAIHCGHTFHLQCLIQWFETAPSRTCPQCRIQVGKRTIINKLFFDLAQEEESALDAEFLKNELDNARAQLSRKEKEKRDSQAIIDSLRDTLEERNATVESLQQALDKAEMLCSTLKKQMKYLEQQQDETKQAREEARRLRSKMKTMERVELLLQSQRPEVEEMIRDMGVGQSAVEQLAVYCVSLKKEYENLKEARKASGELAEKLRKDLFSSRSKLQTVYSELDQAKLELKSSQKDLQNADKEITSLKKKLTMLQETLNLPAVASETVNRLVLESPAPVEMLNLKLRRPAFSDDIDLNATFDVDTPSTQPSNSQPGLIKKLCLEKAHSPIQDVLKKMSKGPKQDCQLSLGGQRCVGEPDEELAGAFPVFIRNAILGHKQPKRTRVESYRSTNAVRTGFDGLGGRTKFIQPTDSAVIRPLPVKPKTKAKQRMGMKTVPPPSQAKLDNFLR	118614	98808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_99427_99644_99696_99804_99955_100242_100292_100872_101029_106656_106746_107197_107288_107894_107983_109096_109211_109720_109816_111047_111176_111737_111778_113845_113930_114465_114524_118411
825678	contig_11594_pilon	-	1149	5	Intergenic	novelGene_80887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	29.978117018919	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	134	808	91216	75839	FALSE	25	GAATTGTCTTCTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPMPEYLNVHYIGESASRLLFLSMHWALSIPSFQALGQENSISLVKAYWNELFTLGLAQCWQVMNVATILATFVNCLHSSLQQDKMSTEKRKLLMDHIFKLQEFCNSMVKLCIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLENMEQIEKFQEKAYVEFQDYITKTYPDDTYRLSRLLLRLPALRLMNATITEELFFKGLIGNVRIDSVIPHILKMEPADYNSQIIGHGI	91349	75497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_76014_76865_76972_79697_79836_80587_80728_91100
825680	contig_19815_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_154700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAGTGCTCAGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74947	73199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_73200_74900
825683	contig_960_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_108260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614191	613476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_613500_614200
825686	contig_2646_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_69590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAATAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439735	1440082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1439700_1440100
825688	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	1	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
825689	contig_14744_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_66110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCCCTCTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539625	1541191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1539600_1541200
825690	contig_19132_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_170007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGGGGATGGCCCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469419	469959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_469400_470000
825691	contig_14530_pilon	+	1544	8	Intergenic	novelGene_108441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	10.0569805181703	6	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	38	916	9663	35214	FALSE	30	ATGGAAGGTTGCATGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYELFSHPAERGYRAGLCSKAALFLLLAAVFTYIPPLLVAFRSHGFWLKRSSYEEQPTVRFQHQVLLVALLGPERGGFLAWSTFPAFNRLQGDHLRVPLVSTREEDKNQDGKIDMLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNVTTILMDPNPIWLVGRAAEAPFVINAVIRYPVEVIAYQPGFWEMIKFAWVQYVTCPSEWAVLENTYGAVRG	9625	35842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10058_23780_23910_24255_24400_26701_26784_33247_33353_34037_34092_35158
825692	contig_6415_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_175841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59060	58211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_-_58200_59100
825693	contig_12512_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_24189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	235	576	599702	599361	NA	25	CTAGGAGTTAGCGTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERGKFSYCSVVIRPIFFGKVIF	599936	598037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_598000_599900
825696	contig_1244_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_37909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	725	1051	255872	256198	NA	40	TTAAAAACATGTATACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCSFLSARIPQTQRSQEASGRGGDTLGFWTVRSQEKQRSSPSSSHYLTGPWTAVAAFSRWAKMGGKVCLLPDPVMLRLTHVNPRPEPKIIQTAGQPQLSRRTAEITV	255147	256448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_255100_256400
825698	contig_10437_pilon	+	648	2	Intergenic	novelGene_38237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTATAGGATGGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335718	354016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_336254_353903
825699	contig_14288_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_153811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAACCTTGACCTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215877	217663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_215900_217700
825700	SIRV6	+	328	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	578	221	12	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTTTACGCTAGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	1962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
825701	contig_18272_pilon	-	828	2	Intergenic	novelGene_7008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAATCTGCTCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165721	164803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_165490_165579
825702	contig_3787_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_102354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCAACCCTTATCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94323	94967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_94300_95000
825704	contig_5050_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_110292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614227	614473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_614200_614500
825705	contig_753_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_112942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735345	733578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_733600_735300
825706	contig_2646_pilon	-	2092	19	Intergenic	novelGene_69594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.582364049246	1	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	67	1050	1508494	1476606	TRUE	40	AAAGAGTTTATGACCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEPDQENVEQSRAAKTAEEELNKPFSLEASLSKFSYIDLDKELEFKNDLIDDKEFDIPQVDTPPTLESILNETDDEDESFVLEDPMLLNIDTIDSHSYDTSSVASSDSGDRTNLKRKKKLPDNFSLHGSVMRHSLLKGISAQIVSAADKVDAGLPTAIAVSSLIAVGTSHGLALIFDQNQALRLCLGGTSVGEQYGAISALSINNDCSRLLCGFAKGQITMWDLASGKLLRSITDAHPPGTAILHIKFTDDPTLAICNDSGGSVFELTFKVMGVRTCESRCLFSGSKGEVCCIEPLHSKPELKDHPITQFSLLAMASLTKSWSLD	1508560	1451896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1452235_1461397_1461488_1462692_1462740_1463164_1463256_1465150_1465226_1467346_1467518_1471527_1471609_1474912_1475021_1476564_1476625_1476728_1476879_1478147_1478216_1481740_1481828_1482718_1482844_1492432_1492488_1493624_1493658_1498154_1498249_1500041_1500173_1506882_1506952_1508341
825708	contig_5317_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_76636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897088	897507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_897100_897500
825709	contig_10569_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_44095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTCCAAATTGAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413790	413198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_413200_413800
825711	contig_13577_pilon	-	748	4	Intergenic	novelGene_176117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.5235448453256	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	172	534	27310	22455	FALSE	25	TTTGTATGACTATATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWGFDCKKLGVDCSSLCPLNKKAKLNKNVAILPLPKKGEDVKPGTVCRVAGWGKFHNNSPQPSDTLREVNITVIDRKICNDEKHYNYNPVIGLNMICAGSLKGGKDTCNVRRFWKPFDM	31119	22240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13577_pilon_-_22484_24986_25264_27253_27393_31030
825713	contig_8020_pilon	+	2001	13	Intergenic	novelGene_114345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	292	648	14181	15636	TRUE	30	GACAACGAGATCACCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKYLQIIAEMLEILVQALLHHLKSRLLHGHFSIEAKEFRIVVQSSLMGILTGPGASSSGPGGKPGQQRLQRLCTQVCSAAWWNWLKKLMKSPGLERLGGTGGQLWTCCPVRSILIP	13807	20065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_14048_14129_14236_14321_14499_15247_15342_15605_15934_16234_16434_17128_17282_17492_17529_17668_17805_17927_18052_18156_18241_18394_18536_19882
825714	contig_5514_pilon	-	1215	4	Intergenic	novelGene_75272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATAAGTAAATAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76636	45919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_-_46166_47227_48089_68337_68413_76603
825716	SIRV4	-	482	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	90	45	90	-45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	28	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGACAAAAAACTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5068	3682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
825717	contig_16098_pilon	-	1110	6	Intergenic	novelGene_45921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	62.0625490936362	324	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	568	1110	344080	342395	FALSE	5	GGGTACCGTCTGGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAPPWARLPLTLRWLRPDFRQDLCPLPPPHVPLAFGPPPPRARRRGAVPSADRERDRVAEARCTLCACALQDEEGPLCCPHPGCPLRAHVICLAEEFLQEEPGQLLPLEGQCPGCKNSLLWGDLIWLRQTGTEEDEEDSELEERNTGPTCWRTDPSAPEPPLLFCATVFYLCTIKSLS	345225	342394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_342503_342582_342671_342825_342954_343861_344189_344267_344320_344818
825718	contig_6576_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_42239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGATTTTCAAACTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256656	256076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_256100_256700
825719	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	11	10	11	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3034	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
825720	contig_11631_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_104190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGACACCTTCAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111001	111300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_111000_111300
825721	contig_9180_pilon	-	1032	2	Intergenic	novelGene_109106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	303	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	78	356	240370	240092	FALSE	10	TGGATCTTATCCTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSVLPESGQRAGLGPSRVGWGTDAMWPVLWTVVRTYAPYVTFPVAFVVGAVGYHLEWFIRGKDPQPVEEEKSISERREDRKLDELLGKDHTQVVSLKDKLEFAPKAVLNRNRPEKS	244189	239415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_240376_244117
825723	contig_10064_pilon	+	766	3	Intergenic	novelGene_122731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	138.5	66	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	118	408	395972	404366	FALSE	20	TATTCAGAGGGTGCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPPQSRAPKSSFCFPPTSPGAQHAALPPQPLGASLRALRRAPYASPKDAHFQKKNTSPLVQCAAKGGALLLCAVSTPA	395854	404724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403014_404134
825727	contig_6102_pilon	+	355	2	Intergenic	novelGene_31813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAATCGTCTTGTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360164	361216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360226_360922
825729	contig_11849_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_171743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAGATTGCAGGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88223	89563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_88200_89600
825730	contig_9146_pilon	+	1576	4	Intergenic	novelGene_79515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	7.78888096369861	129	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACAGTGATACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359592	373199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_359763_360662_360930_371930_372044_372173
825731	SIRV4	-	223	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	391	3	-391	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGGTTTTTCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
825732	contig_9771_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_156930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560857	561382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_560900_561400
825733	scaffold_19766_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_34357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCCCCTCCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673268	672658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_672700_673300
825734	contig_253_pilon	-	1362	5	Intergenic	novelGene_129783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	17.5552698640608	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	24	530	1103445	1091034	FALSE	45	TAACAAACATTTTTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQSILLGMSAKLMWTLEETSCFPDTSGVSPFQMIFEVDEKHRTLMTDCLAIKNFLRKIIMVHPKMRFHFSIKVNGTLSKEIFGVEDEPILNLPNGIALVVNYQHYISRPKFGATELLCSRIHPVPGQPVTLSIPDDVAAMGLLGELILMPAAALCPCPKAFSNQMNRISSVSISF	1103468	1090201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_1091242_1093381_1093454_1093822_1093879_1097363_1097448_1103358
825735	contig_987_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_72245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAACGCTATCATCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247670	246849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_246800_247700
825737	contig_19730_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_142486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTCAAATCCACCAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111176	113159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_111200_113200
825738	contig_10904_pilon	+	1078	3	Intergenic	novelGene_22645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	4	98	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	3	764	519778	526209	FALSE	35	AAATGTCAAGTCTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGTEYLRPGLPAKFTPQALASFKRQQEQGFQEQSALAAEARETRCQEFLEKIAEGQAVKKQKLQQDSGSGGSQEAAGSQEAAGSQAVGENEANASQASREHEEAGSSSSQPGPSDGVAPLPRSALLVQLATARPRPIKARPLDWRVQSKDWPHAGRPAHELRYSIYRDLWERGFFLSAAGKFGGDFLVYPGDPLRFHAHYIAQCWAAEDPIPLQDLVSAGRLGTSVRKTLLLCSPQPDGKVVYTSLQWAGLQ	519775	526523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_520094_520253_520512_526021
825739	contig_6410_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_108638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATCCCCTCCTATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343631	344790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_343600_344800
825742	contig_13565_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_162388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCATCCAAATATTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171441	170100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_170100_171400
825743	contig_11396_pilon	-	478	5	Intergenic	novelGene_71393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_4	618.407784152173	5763	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	87	332	1555280	1554410	FALSE	10	GTCTGTGTTAGTTGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTPIQLPGEPPLPFSSHVRRGVFRRGLDMQNDAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIQMNVAEVDKVTGRFNGQFKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKADGIVSK	1555591	1554263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554470_1554871_1554944_1555079_1555144_1555230_1555294_1555518
825744	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_96653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653836	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
825745	contig_7171_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_101425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTGTGAGTATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1548388	1547957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1548000_1548400
825748	scaffold_12124_pilon	-	1476	5	Intergenic	novelGene_22174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	109.335207046953	231	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	533	1225	1260126	1229338	FALSE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1292854	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1292351
825754	contig_672_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_174851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGGGTCCATCATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168110	166372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_672_pilon_-_166400_168100
825755	contig_4131_pilon	+	2001	6	Intergenic	novelGene_127870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	8.52291030106501	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	416	1294	204305	209649	FALSE	30	GACTGGTGTCCTTATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVGAGNREGICFLRSPVAPGDGGDRDLPTPLVSVMRLGVLSESHTLQVILGCEVQEDNSTWGFWKYGYDGQDHLEFCPETLDWRAAEPGAQATKLEWEVNKIRAKQNRAYLERDCPEQLRQLLELGRGVLDQQVPPSLVKVTHHVTSEVTTLRCQALNFLPQNITMRWLKDKQPLDAKEVEPMDMLPNGDGTYQGWMAVAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLTATWEPSSPGTLVIGIISGIAVCVIIFFIGILFKILKKRHVSRRTMGDYVLAEVNLTQMKGKQQKTTY	198404	210356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_198477_203961_204711_205538_205818_205954_206069_207966_208000_209602
825756	contig_5917_pilon	+	2280	1	Intergenic	novelGene_122156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAAAAGAGATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635942	638222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_635900_638200
825757	contig_5316_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_61249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAAGCTGATTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486287	487188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_486300_487200
825759	SIRV6	+	361	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	602	164	-12	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGTAGCCTGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
825763	contig_9440_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_59031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGCGTGTATATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273359	272187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_272200_273400
825765	contig_11602_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_166597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACACGAAAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187961	188408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_188000_188400
825766	contig_366_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_51622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAGACTTATATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340470	1339902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1339900_1340500
825768	contig_6433_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_162756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	82.4715439139801	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	56	316	153355	140518	FALSE	60	CGAAAAGAAAACTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTFKDVAIDFTLEEWRLMDPTQRNLHKDVMLENYRNLVSLGLAVSKPDMISHLEDGKGPWVVVREISRAPYPGHRTSRCQPSPGKCRVPLFGDPAFKSSWRPN	153410	140120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_140536_142078_142156_152492_152589_153285
825769	contig_7915_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_42958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCTTAGAACAGTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66354	66888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_66400_66900
825771	contig_15327_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_70529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGAAAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480495	480990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_480500_481000
825772	contig_4803_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_150697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCTTCCCACCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8990	7725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_7700_9000
825773	contig_13188_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_176787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCAGCCAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158369	159688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13188_pilon_+_158400_159700
825774	contig_5770_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_74157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACACAAAAAAAGATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199921	199077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_199100_199900
825776	contig_5918_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_99565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAGTAACAACTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1723490	1723261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1723300_1723500
825778	contig_15134_pilon	+	1911	10	Intergenic	novelGene_140236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	562	990	380606	382704	TRUE	25	CCGCAGGAGGCTATCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEAAVLFGVLLIEAAQVGQLLDHLGIEQAAARRWVAAADVGLQRVGQAVLDGLDQCGVLHSRTVWGDDADGHEQDMLLLMQVQLLQSHLELDEGLDQLQAVSSFGYITDTVLVVLTAAGPGHVVHGEGLIGPQHDDLDGT	380044	447086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_380805_382264_382380_382589_382742_391121_391294_396569_396685_396948_397136_411633_411762_426591_426740_429904_429985_447032
825779	contig_5816_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_158234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAGGAAAAGCACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24842	23258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_23300_24800
825782	contig_4364_pilon	-	1669	3	Intergenic	novelGene_1	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	3.5	179	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	460	573	101404	101291	FALSE	15	CAAGCTTGTGTAGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKTGALRLLVPDGERGPRRVRCFGLDQGSLFVEASPQQDISRRTTGFQYELVHRRSGSDLLLLSAPCSPCSDTEVLLAVCTSDFVVRGSIQDVTNEPEQQESAIHLNVSRLYRQKSKVFQPDPEGVGRWRGHIKTLLKCGVRPGHGDFLFTGQMHFGEAWLGCAPRFTDFQRMYWDAKQKGLNPCEIGTE	110879	100194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_101611_103261_103322_110686
825783	contig_9656_pilon	-	1307	7	Intergenic	novelGene_121896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_6	156.893541400955	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	266	1096	97308	81749	FALSE	50	TTAATAAAAACACAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPSMFNVLWCSFIVCVFSFQLL	101202	81537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_101023
825784	contig_2455_pilon	+	842	11	Intergenic	novelGene_119207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	57.4525891496632	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	168	740	1357912	1465455	TRUE	30	AATCGGCCAGTATGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLSRELLDLVASHFNLKEKEYFGITFIDDTGQQNWLQLDHRVLDHDLPKKPGAAILYFAVRFYIESISFLKDKTTVELFFLNAKSCVHKGQIEVDSETTFKLAALVLQEAKGDYTSDENARKDLKTLPAFPTKTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKGLTRGQAVVQ	1330030	1470362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1330198_1357911_1357978_1362024_1362120_1369917_1370011_1389771_1389857_1433372_1433430_1434187_1434211_1463417_1463502_1465385_1465456_1468606_1468665_1470318
825786	contig_7513_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_88989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGGAATGGTAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420626	419526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_419500_420600
825787	contig_6445_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_77103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACCCACCTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155843	1154810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1154800_1155800
825788	contig_6048_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_73346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	8	337	2931174	2931503	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFMNVTKRASQRRQHLSKVGDRPRGSLANGVPGLGNSMCKALKASRCLACWRRCRWPAWVAREEGGQRGQRGQITHLEGQGRRLDLLSTHGQAFFLVCLRNLSNMGHPASI	2931166	2932203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2931200_2932200
825789	contig_13097_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_107722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTGTTTTGTTTTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192028	190199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_190200_192000
825791	contig_7322_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_164912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTAAAAAAAAGAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210427	211699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_210400_211700
825792	contig_9415_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_109717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAAAACACTAGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444228	445131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_444200_445100
825795	contig_10980_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_162559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCATTGCTTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179997	181668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_180000_181700
825796	contig_2750_pilon	-	681	4	Intergenic	novelGene_164482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	72.1710930128308	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTTATTGCCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158274	146215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_146679_147221_147336_148578_148630_158221
825799	contig_1274_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_137777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATGAGCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56721	55000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_55000_56700
825800	contig_3223_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_151828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAGGGAAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964949	965262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_964900_965300
825802	contig_4336_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_152360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTGACTTTAGGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355682	354884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_354900_355700
825805	contig_12638_pilon	+	498	2	Intergenic	novelGene_33314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTAGAATTGTCCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298305	1303666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1298672_1303534
825806	contig_16123_pilon	+	1406	2	Intergenic	novelGene_164283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	147	1097	201097	223492	FALSE	40	TAAAACATGACCTTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCFFSKRRKAEKESRPQGEEEGPKQYSWDQREKVDPKDYMFSGLKDETIGRLPGKVAGQQFVIQDCENCNIYIFDHSATITIDDCTNCIFFLGPVKGSVFFRNCRDCKCTLACQQFRVRDCRKLEVFLCCATQPIIESSTSIKFGCFQWYYPELAFQFKDAGLSIFNNAWSNIHDFTPVSGEFNWSLLPEDAVIQDYVPVPTTEELKAVRVSTEANRSIIPVSRGQRQKNSDESCLVVLFAGDYTIANARKLIDEVRRKRRDTDIHLDRDISLSRELPFFSNWVFRNTGNPQDIVPSPPPHHTHSTNAHIDFSAG	200950	223801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_+_201199_222643
825807	contig_20610_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_67642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAAACAAGTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49573	48317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_48300_49600
825808	contig_12119_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_88674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGTTAAAAAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351868	351301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_351300_351900
825809	contig_10658_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_130092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCCATAATGACAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372555	371080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_371100_372600
825811	contig_5469_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_176244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAATAGGATCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66835	65462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5469_pilon_-_65500_66800
825812	contig_11318_pilon	-	1133	10	Intergenic	novelGene_48142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	596.509683466359	2	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	367	1131	42716	14974	FALSE	75	AAAGCAAGAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKVMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEE	58251	14971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_31123_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42784_49722_49844_52071_52142_58143
825813	contig_2114_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_104283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705843	704834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_704800_705800
825814	contig_15293_pilon	-	1124	3	Intergenic	novelGene_146519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTATGTGCTTTTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91685	74588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_75377_85889_86038_91497
825818	contig_9389_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_84144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACTTTAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1819584	1820537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1819600_1820500
825819	contig_7171_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_101218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTAGTTAAAAGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489477	488923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_488900_489500
825820	contig_14142_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_120577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	256.762319838579	2128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGAACTCTGGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526704	527833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526804_527102_527210_527419_527503_527608
825821	contig_13004_pilon	+	947	2	Intergenic	novelGene_112744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	72	524	948461	952167	FALSE	35	TACTCAAAGGATGTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	948389	952590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_948698_951951
825822	contig_9429_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_155099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGCCCCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63381	62431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_62400_63400
825824	contig_11564_pilon	+	1603	2	Intergenic	novelGene_158587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGACCAAGAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163579	167798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_164880_167495
825826	contig_665_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_158216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTGTATGCTATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303158	305321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_303200_305300
825827	contig_5084_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_64597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948960	949488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_949000_949500
825828	contig_8312_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_152875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTCCTTCTTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226537	227270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_226500_227300
825831	contig_6440_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_161679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCTAACTGCAAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132686	134863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_132700_134900
825832	contig_5947_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_101539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGACTTCAGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551271	552455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_551300_552500
825834	contig_5059_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_140764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCGAAGACAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549751	548847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_548800_549800
825835	contig_8317_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_19543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16788	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_16800
825837	contig_3700_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_138097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	100	342	368916	369158	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVQVWLDLGAQKLCSFLYLCFLSLLFVSASICMSPSFFPVIQSLYTAGNRAPGSSRPTSLYLTNIRGQSSPLDLVEEHREVFLWPTLGKFPSLNQSLWLEGCSPTLGPAWVT	368816	371118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_368800_371100
825840	contig_17897_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_153397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGGTGTTTAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16992	17541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_17000_17500
825845	contig_9389_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_84066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCTGGGTCTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991877	990732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_990700_991900
825846	contig_9682_pilon	-	894	4	Intergenic	novelGene_125321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.8423039781937	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAAGTCTTGCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604239	579429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_580019_595229_595276_603710_603857_604126
825847	contig_2646_pilon	-	799	4	Intergenic	novelGene_69612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.4251842554055	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	120	458	2013948	2008302	FALSE	55	TTTAAAAAAAAAACTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGLTSLSTSCMGKCIGSRAMKLPLKRQRASLPTSPMEACSCGCREMPITCTDLRWIPECTC	2014067	2007960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2008400_2011714_2011799_2012507_2012592_2013875
825850	contig_9053_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_87943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATCCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265990	264483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_264500_266000
825851	contig_13206_pilon	+	1750	2	Intergenic	novelGene_161905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCCTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196121	200509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_197032_199669
825852	contig_4852_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_153980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACATGTTCAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408171	406887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_406900_408200
825853	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	49	221	-49	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTTGCTAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
825855	contig_4952_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_145544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTGGAACAGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539380	539826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_539400_539800
825857	contig_3584_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_108127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCAAAGGCCTACAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248152	247189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_247200_248200
825859	contig_20614_pilon	+	1353	2	Intergenic	novelGene_107598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419514	420961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_420494_420587
825860	contig_12603_pilon	+	1895	13	Intergenic	novelGene_105798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	27.9467499601176	111	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	33	1670	591344	612387	FALSE	25	TAACATTCAGTTCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKRPAEPGPARIGKKGKKEVMAEFSNAVTEEALKKQVAETWSRRTPFSHEAIVVDVNPFLHCVIPDFIQSQDFLEGLQKELLNLDFHEKYNDLYKFQQSDDLQKRREPHITALRKVLFEDFRAWLSDISNIDLDSTIDMSCAKYEFTDALLCHDDELEGRRIAFILYLVPPWDRSLGGTLDLYSVDEHFQPKQIVKSLIPSWNTLVFFEVSPVSFHQVSEVLSEEKLRLSISGWFHGPSLTRPPNYCEPLIPRSPHIPQDHEILYEWINPIYLDMDYQIQIQEEFEERSEILLKEFLKPEKFADICDALEKGNVEWSSRGPPNKRFYEKAEENKLPDVLKDCMELFRSEALFLLLSNFTGLKLHFLAPSEEDEIEAEREGEAASAAESTEEGTSHSSSESENNLAAVSNTSQESDDQTDSEPEGSEIKKESNVPTCHGELRRWKTGHYTLIHDNSTTEFALDLLLYCGCEGWEPGYGGFTSYIAKGEDEELLTVNPENNSLALVYRDRETLKFVKYINHRSLEQQKTFPHRTGFWDFSFIYYE	591311	612612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_591498_593642_593789_597127_597175_600061_600163_604192_604310_604916_605009_605206_605336_605529_605644_607291_607372_607592_607907_610992_611116_611671_611731_612225
825862	contig_11815_pilon	-	1715	2	Intergenic	novelGene_50885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACAGTTTCCTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59725	57482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_58988_59515
825863	contig_13547_pilon	+	1323	2	Intergenic	novelGene_104855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18336	21731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_19367_21438
825864	contig_10324_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_7780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80023	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_80000_80800
825866	contig_5765_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_141370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATCACAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514819	514121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_514100_514800
825867	contig_11447_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_168102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAACAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512630	513135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_512600_513100
825868	contig_11447_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_168101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACAGATCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511043	512485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_511000_512500
825869	contig_10003_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_88169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCATCATCTTATTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415391	414239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_414200_415400
825872	contig_829_pilon	+	2571	2	Intergenic	novelGene_168932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	96	443	292241	292588	TRUE	30	AAGGCTGACCCCACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMKHDRRAFSSIVRGVTMRWGLIPRKLTTLTALSPGPESSSESSCLPFLPSHTLEASKAPFIQQVQSHVIRLKASLPLYHNTIVNGSTILLSPHTSFCLPSTTNASRCPADSTS	292145	301095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_+_293733_300111
825874	contig_12864_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_76375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGAACTACCCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193057	193656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_193100_193700
825875	contig_9440_pilon	+	1489	6	Intergenic	novelGene_59035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGCCATTTCAATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289605	322951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_290495_295320_295437_297210_297327_308713_308838_312895_313081_322892
825876	contig_2932_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_47955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTTTTCAGTGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225592	223564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_223600_225600
825878	contig_10494_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_102137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTCTCTAGCCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352875	351818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_351800_352900
825881	contig_348_pilon	+	763	2	Intergenic	novelGene_67575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	0	452	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	254	601	157037	157980	FALSE	25	ATAAAGTGCCTGTGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKEEQPVAELGTPYNVPPMTSTVITIQNETPVPDHIIWSLFNTMYLNWCCLGFLAFAYSVKSRDRKMAGDLTGAQSYASTAKCLNIGALVFGLLLTITCIIIIATRSVIRFQIA	156783	158142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_157223_157818
825882	contig_1551_pilon	-	402	2	Intergenic	novelGene_173417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATAATAATTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388986	388496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_-_388871_388958
825883	contig_15325_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_157159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67178	64939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_64900_67200
825884	SIRV5	+	389	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2191_10858
825885	contig_6102_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_31756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271484	273113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_271500_273100
825886	SIRV4	+	506	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTTTATCTGGACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	5045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
825891	contig_4103_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_52012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGTACCATAGGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429068	430162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_429100_430200
825892	contig_6195_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_71027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAGAATAAGAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95413	94844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_-_94800_95400
825893	contig_3184_pilon	+	339	2	Intergenic	novelGene_169793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCATAATCGCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62820	71871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_62880_71591
825894	contig_11642_pilon	-	1332	2	Intergenic	novelGene_172911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGCCACGCTGGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173432	171815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_171953_172237
825895	contig_13224_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_104079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATATTTATACAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169564	170807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_169600_170800
825899	contig_13607_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_170211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACTTACTAATAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331260	330661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_330700_331300
825900	contig_1939_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_144861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGAAACCAATGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219351	217003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_217000_219400
825905	contig_10023_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_123462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGAATTGGAGCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43727	44136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_43700_44100
825906	contig_16716_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_169284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164361	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_164400_166100
825908	contig_6589_pilon	-	1263	3	Intergenic	novelGene_25879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	92.5	125	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	610	981	972987	970660	FALSE	15	TAGAGCCAGCTGTTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFEPDPADLALSSIPGHETFDPRRHRFSEEELKPQPIMKKARKIQVPEEQKDEKYWSRRYKNNEAAKRSRDARRLKENQISVRAAFLEKENALLRQEVVAVRQELSHYRAVLSRYQAQHGAL	974315	970377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_970876_972831_973044_973762
825909	contig_13958_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_129548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_5	12.1885191881541	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	122	703	274959	291662	FALSE	40	ACAGAGTATGAACATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFYKYVMESRDPSTNVILLEDTAAVLGVTIAATCMGLTSITGNPLYDSLGSLGVGTLLGVVSAFLIYTNTEALLGRSIQPEQVQRLTELLENDPSVRAIHDVKATDLGLGKVRFKAEVDFDGRVVTRSYLEKQDFDQMLQEIQEVKTPEELEIFMLKHGENIIDTLGAEVDRLEKELKKRNPEVRHVDLEIL	274837	292160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_274978_275439_275548_278315_278482_283884_284015_286080_286195_291617
825910	contig_13542_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_131471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATGTTGGCAGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210443	211629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_210400_211600
825912	contig_5515_pilon	-	730	5	Intergenic	novelGene_52306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32.3525501313266	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	53	451	37495	33289	FALSE	15	GCCTATTTATGCACTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGPAGSGLSSRLDAGAMEEYAREPCPWRIVDDCGGAFTMGVIGGGVFQAIKGFRNAPVGIQHRLRGSVSAVRIRAPPDWRWPTGHGGLGNDGGYPVGSHRGCWHSPHPLHCPAVPQCTPIPGGPQPAAPQGGCPGPRLSQLSAVSLRK	37547	33009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33386_33476_33588_34833_34899_36599_36700_37469
825913	contig_7996_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_165148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	44	526	191523	192005	NA	10	TGCCCTGGGCTCTTACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGTVTRKGSTFRPMDTDANEAGVSVDAGSHYDCPHRAGRHEYALPLTNQEPEYATPIVERQLMRANTFSAQSGYRVPGPAPMHKHSLSSGSFFPSEGAGTKSGDYQMPQTPKPADGAYDKPKANSFFPAESRDSDYQKPQMSLLMSDGYSAPRDCPKPINQTAGRDGSFVNTM	191479	193559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_191500_193600
825915	contig_5145_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_131358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTGCCGACTGGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109468	110474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_109500_110500
825917	contig_3584_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_108133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGACAGGGAGAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302386	301732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_301700_302400
825919	contig_2066_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_176532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116758	115059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2066_pilon_-_115100_116800
825920	contig_4364_pilon	+	2541	2	Intergenic	novelGene_76	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744604	747343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_746286_746483
825921	contig_5039_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_64800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTTGGCCAAGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184408	181990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_182000_184400
825922	contig_5451_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_167181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTGCTCCCAGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616871	618746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_616900_618700
825923	contig_12327_pilon	-	602	4	Intergenic	novelGene_140648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	24.9042611258038	1179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	151	528	187696	183921	FALSE	25	AAGCCCCCTACCACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVGSLSGLLRRGLVQRAASWSCRLHTSHGLADCHRASFTRLYRQAYARLYPVLLVKQDGATIHIRYREPRRMLAMPVDLDCLSPEERRARFRKREAKFREKKEEPELKDNFDMERYKRFWTKK	189071	183846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_184071_184605_184808_187670_187752_188976
825924	contig_678_pilon	-	435	2	Intergenic	novelGene_167820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGTGAATCGCTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130502	129791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_130118_130393
825926	contig_9481_pilon	+	1259	9	Intergenic	novelGene_149664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	88	312	367347	372996	TRUE	25	TAGGAAGCACCTGCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSSAPSAGAFALLEAAVLFLLLVFGFRPMTALPGTDMLLCWTAGPTLKKREASSGPAVAAAAAAAICGAPPAAVASAASAPSVTLSFFFFPGPFCSLLFLLA	360009	379795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_360044_367293_367417_370848_370942_371035_371085_372983_373143_374656_374822_376666_376768_378275_378375_379359
825927	contig_7078_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_130141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226212	225104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_225100_226200
825928	contig_17198_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_62359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCATCCCAATCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730144	732192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_730100_732200
825929	contig_10937_pilon	+	807	6	Intergenic	novelGene_67337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.7632851082144	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTGTGATGCACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180603	185982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181497_181654_181931_182017_183833_183891_184579_184669_185657
825930	contig_6102_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_32010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAACAGAAAACACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469307	470362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_469300_470400
825931	contig_6102_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_32011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATCAGGCTTTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470830	471413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_470800_471400
825933	contig_8476_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_121338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACTGGAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128970	129695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_129000_129700
825934	contig_16411_pilon	-	886	2	Intergenic	novelGene_77361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	434	823	299088	298699	FALSE	10	GTATCTGGTTTGGCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFVFDRGCTRFAFLNWRAVLKSVIGSICIYITALPGTQESRRSTSWKGALFPGKLAKERFCRIQANHLQSNPSVHLPTPPTMCTCVSGIQGNVNFVFIWEIVHRNILFSLVHLLIVYNDICTSMQNT	301098	298635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_299183_300759
825935	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	98	0	-89	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
825939	contig_5676_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_159094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTGCATAAAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433546	432382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_-_432400_433500
825940	contig_12411_pilon	+	621	5	Intergenic	novelGene_145682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	446	junction_1	303.419161392289	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	181	621	415501	468134	FALSE	25	TAAGGTTACTGCACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVASSRAVGKPAKPSKAAARERTEGVSAAVGGGPSSFRCCYGCCHAARLGRSSLPRDVIMLTEASLSIWGWGSLGVVLFLVTFGPFVIFYLAFYILCFVGGGFVVILLFGKTNSEKYLEQCEHSFLPPASTGVPKCLEEMKREARTIKIDRRLTGANIIDEPLQQVIQFSLRDYVQYWYYTLSDDESFLLEIRQTLQNALIQFATR	415320	468134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_415513_461314_461428_465238_465342_466838_466929_468011
825941	contig_11026_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_167695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGGGGAGGAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342193	343594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_342200_343600
825943	contig_7173_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_37554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTCTTCAACATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716115	717194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_716100_717200
825944	contig_3068_pilon	-	1461	7	Intergenic	novelGene_137638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	573	junction_3	128.740048159071	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	64	936	267422	252916	FALSE	35	AGTGATCAATTTACATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGDTDDPPRITQNPVINGNVAMSDGHNNTEEDMEDDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQCNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELCRVVSSKQQLYGPDIECLKQCQKLVPSKTSDLLHVTVV	267485	252390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_253079_253805_253937_254871_254981_257505_257595_258489_258629_261251_261451_267379
825945	contig_9180_pilon	+	1336	2	Intergenic	novelGene_109101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	140	961	109926	110747	FALSE	35	AAAGTCCATTCATTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWGFFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVMVYLVTVEHVWSDDHKDFDCNTRQPGCSNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVMCPSLLVVMHVAYREARERKHREAVGEGSARLYLDPSKKRGGLWWTYVFSLVFKAGVDAAFLYVFHSFYPKYTLPPVVKCHVAPCPNVVDCFISKPSEKNIFTLFMVVTAAICILLNLVELAYLVSKRCREYLVARRARAPHKRHPSDFATSSCKQNNLLLDDIIFLGSDTHPPLLPDHPQDHMKKTVL	107316	111122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_107432_109901
825946	contig_14732_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_169705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTATCATTTACTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62765	61295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_61300_62800
825948	contig_11171_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_48612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCAAGAAGCCTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237855	239300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_237900_239300
825952	contig_17829_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_157042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAAGAACTGGAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68575	67425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_67400_68600
825953	contig_776_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_139948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTCTGCACAAGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968794	969122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_968800_969100
825956	contig_6361_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_23933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGGGGAAAGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289431	290203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_289400_290200
825958	contig_19977_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_175617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTTTTTGGAAAAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32423	33204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19977_pilon_+_32400_33200
825961	contig_2367_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_65332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAACAAAATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230544	229995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_230000_230500
825963	contig_1867_pilon	-	1703	2	Intergenic	novelGene_54498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	142	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGCCCTTCATCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23478	14352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_14402_21824
825964	contig_3241_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_146412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885358	883629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_883600_885400
825970	contig_16686_pilon	-	700	4	Intergenic	novelGene_162107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	89.5333581533845	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	68	655	245967	205433	FALSE	30	AGGACAGCGATGCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPGQTQEQDCLQSQYVGDDEEMAVKQENGVPAAGVEESLPSCSSDNGLSASAEGCALGVPRRGPALLQIDRHQIQAVEQSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDDAIHEARRVAQLADTEKEYQSVLDDLTSCTTSLRQINKIIEQLSPQAPTNRDINRKLDSVKRQKYNKEQQLKKITAKQKRLQAILGGAEVKVEIDSASLEEDAGDGIN	246034	205387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_205450_241441_241551_243877_243999_245626
825972	contig_13645_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_146167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	250	753	554	1306	271019	271771	NA	25	CCCAGCCTCGTGCACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGEFLFSSAGESVGSRSKWSQAGWVGRRGVPSSPGERGRHALAGLLCGPPARPAWAVPLLELLPPRARSLRKLQVVTGAERWPLRYHGEQSARKGICARGCTWVCVRVCVHACECAHIATALTQTPWQTRGLCPLWPGGAASWAPVAALHEPTEGDVVCPAPPFLWLWTSLGAHAAGVHSAPLPLCLVCCAHTCPEPVHACAHVCSVLRRARAQGVCTRGRLLSSDSSSSPSALADGFTSTELGLSR	270465	271841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_270500_271800
825973	contig_10371_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_175467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGGCCGTCCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109379	108287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_108300_109400
825974	SIRV6	-	367	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-9457	-172	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGACCGTAGCGTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11277	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_2779_2828_3105_3164_10723_10818_11031_11109_11205
825975	contig_7843_pilon	+	1751	3	Intergenic	novelGene_152003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCGCCCCACCGCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113274	122809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_114594_115081_115291_122586
825977	contig_7895_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_154463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTTCTAATGGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863505	861840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_861800_863500
825978	contig_7291_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_106306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTTTTATTCTAAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177780	176483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_176500_177800
825979	SIRV4	-	423	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	53	-138	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	25	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATTAAAATAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5105	3775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
825980	SIRV4	-	502	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	112	3	112	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	30	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5046	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
825981	contig_9833_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_68557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAGGCAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250665	249382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_249400_250700
825982	contig_11448_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_66449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGGTGAAATAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702175	703698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_702200_703700
825983	contig_8276_pilon	-	656	3	Intergenic	novelGene_174483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATGTAGCTGGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164462	156788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_156877_161604_161714_164003
825984	contig_4783_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_108376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCCTTTTTATTTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177920	177144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_177100_177900
825986	contig_5918_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_99639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAGAGTCCACATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2263277	2262212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2262200_2263300
825989	contig_16220_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_163629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCGTGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130169	129584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_129600_130200
825990	contig_4812_pilon	-	375	4	Intergenic	novelGene_103676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3455.89477077452	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82740	79075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79086_81589_81739_82268_82343_82598
825991	SIRV6	+	259	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-441	-17	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
825994	contig_6881_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_164847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109307	110522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_+_109300_110500
825996	contig_15353_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_151957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGGCCCTTTAGCCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170496	170090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_170100_170500
825997	contig_11815_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_50937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAGTAGGGAAAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304577	303804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_303800_304600
825998	contig_11815_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_50936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTTAAAAAAAGTAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303512	303873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_303500_303900
825999	contig_9091_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_32448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCCTCCCCTCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202125	203574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_202100_203600
826000	contig_5881_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_129050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAGTCCCATCATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474614	472204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_472200_474600
826002	contig_6842_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_130700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388935	387013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_387000_388900
826004	contig_6397_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_146239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTAAGCATAAAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326907	325894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_325900_326900
826005	contig_9272_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_125927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAATTCAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333358	333695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_333400_333700
826010	contig_11375_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_152661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTCCAAGAAGGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182147	182717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_182100_182700
826011	contig_8676_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_142208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATATGTTGTGGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356841	356019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_356000_356800
826012	contig_8900_pilon	-	2591	1	Intergenic	novelGene_171616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1651	1983	180522	180190	NA	75	AAATTTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLVTVANACTHVVHTSLKMHIVYITLGISLTSEERRLLFHLKVKNNQLYFFYKESNCIVGIFYFESAANLMVSLIVYVRAFVLCYLGKSTDLGSDGRGWDTWYCHLEL	182172	179581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_179600_182200
826013	contig_9535_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_124478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289828	291567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_289800_291600
826015	contig_12951_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_68236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	594	932	807414	807076	NA	40	AAGATTGGATTTATAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIKHIGTSIFLNAENCKTVPVKEQSKKLNLLSLLFYLPSAFHMDSLRISGLGVLAVCQRTVVELTKDTSNWRPPESGRFTPSLTGNQTTDHQPPPSKVNFLYLVVTGRAAS	808007	806674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_806700_808000
826016	contig_4845_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_53648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTATAGAGAAATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388759	389460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_388800_389500
826017	contig_4845_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_53649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTAAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390916	391685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_390900_391700
826018	contig_1369_pilon	-	1482	2	Intergenic	novelGene_176793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	765	1319	1105076	1104522	FALSE	45	TAAAATACCAGTTCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPESVDPGSPDPQPTSTGSRPPRPCPTLCDAAFQAVGPAHHWGLVTPRRVPRPRTVGSPRADHSQGSGRGPATRRGGGGGDMSYCQLPVVIDNGSGVIKAGLAGSREPQFVCPNIFGRAKDQTWAAEGSEGLFVGDQAQDRRSLLSIRYRLPRLGRSGGSAIHGKPDPGEVWRGGRVRVKGA	1105945	1104358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_1105406_1105510
826019	contig_6658_pilon	+	839	4	Intergenic	novelGene_168404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	512.793872384953	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	182	526	156287	162318	FALSE	20	AACATTGGACTCTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRKEENFVSHVNAKRPRQEEVEDFDRDGDEFNGTSTLTAAEVGIIESIQLKNFMCHSMLGPFKFGSNVNFVVGNNGSGKSAVLTALIVGLGGKAVATNRGSSLKGFVKDGQK	145606	162631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_145783_156281_156404_159899_160018_162208
826020	scaffold_13505_pilon	-	1390	3	Intergenic	novelGene_111681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	38.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	112	477	955559	953099	FALSE	15	GCAGGACCTAGGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRELGAGQVPSLGDRPRLPYTDAVLHEVQRLLALIPMGVPRALTQTTCFRGYTLPEGTEVFPLIGSVLHDPEFFERPEEFNPGRFLDEDGQFKKHEAFLPFSLDLLPGEPVPAERPEPTASHQRLCQHPPGLPAAGPVPLTPLLSRGPEEGGSLGRW	955670	952185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_953263_953506_953649_955499
826021	contig_5514_pilon	+	582	3	Intergenic	novelGene_75274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	104.5	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAATTGGACCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61065	68863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_+_61139_65276_65429_68506
826022	contig_8195_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_170059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACAATTAGTTATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428030	430481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_428000_430500
826024	contig_9305_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_148190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGCTCAAAAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161269	161933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_161300_161900
826025	contig_17875_pilon	+	1207	4	Intergenic	novelGene_143175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	51.0446427703785	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	79	801	39073	73954	FALSE	35	AGGAATGGAAGAGGTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELATRSQIPKEVADIFNAPSDDEDFVGFRDDVPMETLSSEESCDSFDSLESGKKQDVRFHSKHFTEELRKIFIEDTDSETEDFEGFSQSDLNVKSDPEIMLVESDLSDDRKASLLSEEDEEEEKATPRRSRPRRSSIGLRVAFPFPTKKLANESDKKNSSSEPLHSSSCLQDNKKTVLGRQKSCRQWKQREDSASESEDDSRDEGQESSDALLKRTMNIKENKAMVRLRAGSVEASGGL	38994	74360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_39097_65210_65352_70946_71085_73534
826026	contig_6557_pilon	+	387	4	Intergenic	novelGene_32985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5617.45333758991	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAACGAAGCGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434248	440072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435306_436630_436691_439949
826027	contig_16220_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_163627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAGAGAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77024	78708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_77000_78700
826030	contig_16098_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_45925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAGCCAGAACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342945	343287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_342900_343300
826031	contig_7904_pilon	+	1585	11	Intergenic	novelGene_160016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	261.125812588491	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	93	1469	361442	507988	FALSE	70	TTGTAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLFQKLFSKRSGLCAPGRDARDPDCAFSWPLPEFDPSQIRLIVYQDCERRGRNVLFDSSAKRKTEDITVSKLCSDAQVKVFGKCCQLKPGGDSSSSLDSSVTSSSDIKDQCPKYQGSRCSSDANMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHQIRSPPQLMLSKVFTARTGSSICGSLNTLQDSLEFINQDNNTLKADNNTVINGLLGNIVHSNPMDMPGRELNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPNSSLTRSCASSYQRRWRRSQTTSLENGVFPRWSIEESFNLSDESCGPNPGIVRKKKIAIGVIFSLSKDEDENSKFNEFFFSHFPLFESHMNKLKSAIEQAMKMSRRSTDASQRSLAYNRIVDALNEFRTAICNLYTMPRIGEPVWLTMMSGTPEKNQLCYRFMKEFTFLMENAAKNQYGLLYFFIYFLVTFILYCIYKTKRDSLTLMSKAAAC	361349	508104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_361534_442515_442643_458570_458706_464767_464869_465302_465378_469399_469492_477700_477773_478378_478515_479041_479244_482720_482807_507729
826032	SIRV4	-	206	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1317	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3841	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
826034	contig_7318_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_152207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGCGGTTCATAGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125217	126040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_125200_126000
826035	SIRV6	-	268	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	85	-77	85	77	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1500_1700
826036	SIRV6	+	436	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	328	3	162	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
826037	contig_12427_pilon	+	1286	9	Intergenic	novelGene_40505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	273.638419040529	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	31	975	411330	419950	FALSE	30	TTTGTCTATCTGGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	411299	420261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_411362_412480_412585_413035_413162_414092_414224_414538_414711_415809_415872_417622_417711_417961_418061_419819
826042	contig_5374_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_166395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACTGAAATGACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395140	396039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5374_pilon_+_395100_396000
826043	contig_6375_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_72973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAGAAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241657	242490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241700_242500
826044	contig_10003_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_88277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAACGGCAGTATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825644	827633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_825600_827600
826045	contig_3233_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_56598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCGAAATTTGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925843	926189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_925800_926200
826046	contig_3233_pilon	+	1419	1	Intergenic	novelGene_56599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTTGAAAATGAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926443	927862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_926400_927900
826047	contig_3161_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_84495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTCAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19620	18909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_18900_19600
826048	contig_10377_pilon	+	946	6	Intergenic	novelGene_115372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	516.447712745443	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	546	944	227522	245209	FALSE	30	TGCAGCCAGAATAGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKI	208766	245211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_208967_219445_219615_220809_220952_227487_227752_240234_240355_245160
826051	contig_16525_pilon	+	812	2	Intergenic	novelGene_133821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGGAATCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156813	159342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156989_158705
826052	contig_4496_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_66618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATAAATATTAGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587817	586115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_586100_587800
826053	contig_9455_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_161833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCAGCATTGGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259555	261486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_259600_261500
826054	contig_9363_pilon	-	508	3	Intergenic	novelGene_6633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	635	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGAGTTCAGCGCCGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873778	872664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_872727_873002_873091_873420
826055	SIRV6	+	366	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	507	0	341	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826056	contig_5145_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_131387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGAACATCCTGGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620074	620996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_620100_621000
826057	contig_6677_pilon	-	984	4	Intergenic	novelGene_114176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	66.4880941723153	230	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	277	852	473323	441509	FALSE	25	GCCACTGAGATATGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVLIPHTPIAVDFWSLRRAGSARLFFLSHIHSDHTVGLSSTWARPLYCSPVTAHLLHRRLQVSKQWIRALEVGESHVLPLDEIGKETMTVTLIDANHCPGSVMFLFEGYFGTILYTGDFRYTPSMLKEPALRLGKQIHTLYLDNTNCNPALILPSQQEATHQIIKLIRKYPQHNIKIDAKDPVEKSREW	473599	441376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_441547_471606_471790_472260_472427_473134
826058	contig_3975_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_54683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTCTAATATACATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049044	1048181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1048200_1049000
826059	SIRV4	-	377	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1146	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
826060	contig_6795_pilon	+	1757	2	Intergenic	novelGene_27761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAACCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380034	385481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_381083_384772
826061	contig_8571_pilon	+	1851	2	Intergenic	novelGene_169170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	799	1143	380409	380753	FALSE	70	AAAAAAATTAAAAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGAGPSQRSGRSAKGSFSTEDEARCNDDSESSFHVLLQITPLSNRKAGFMLKAGSLRPLLVCPSPCCLPGHQHSSLKSVSGQEERDSWVPFVLMEEEEVAVHGSSEIRKGNLK	378781	381461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_379138_379966
826063	contig_13015_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_165570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCTCTTCAAATTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425192	427333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_425200_427300
826064	contig_3627_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_78463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAAAATAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318022	319517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_318000_319500
826065	contig_10857_pilon	+	1025	9	Intergenic	novelGene_160869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1481.84310383218	247	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	91	630	21903	62184	TRUE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAKRLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSCKDIVAGDMSKRSLWEQRGGSKTSSTVKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVDEDVAP	21812	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21919_58780_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61962_62094_62198_66447_66479_66547
826067	contig_12299_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_29761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTCTTTAAATATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654005	652306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_652300_654000
826069	contig_7457_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_31472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATTCCACAGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514574	513810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_513800_514600
826070	SIRV6	+	470	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	13	2	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
826071	contig_11378_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_112248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTCAGTATGTCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352155	352890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_352200_352900
826073	contig_5286_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_157396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGAAATTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687299	688665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_687300_688700
826074	contig_19778_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_143739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGTAATTTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885	3506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_1900_3500
826075	contig_9799_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_145561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942032	940347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_940300_942000
826076	SIRV4	-	329	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-138	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATTAAAATAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3800_4100
826077	SIRV6	+	442	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	521	164	69	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826080	contig_5502_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_155013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACAAGGAGAGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505036	505565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_505000_505600
826081	contig_5502_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_155014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCCTGAAGGTGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506193	506949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_506200_506900
826083	contig_11052_pilon	+	674	4	Intergenic	novelGene_115448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2271.10961622043	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	114	545	102902	107529	TRUE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102788	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445_107559_107698
826084	contig_15459_pilon	-	1104	4	Intergenic	novelGene_106380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	163.242832069963	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	99	596	20238	19063	FALSE	30	TGGGGAGTTTATTTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSALRAHVETAQKTGVFQLKDRGLTEFPSELQKLTSNLRTIDLSNNKIESLPPMLIGKFTLLKSLSLNNNKLTVLPDELCNLKKLEMLSLNNNHLTELPSTFGQLSALKTLSLSGNRLRALPPQLCSLRHLDVMDLSKNQIRSIPDIVGELQVIELNLNQNQV	20586	18554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_19338_19909_20049_20154_20261_20510
826085	contig_3575_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_141133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCTATCAGGCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832959	833867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_833000_833900
826086	contig_10104_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_160148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576636	575058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_575100_576600
826087	contig_8628_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_164425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACACTGCCCAGTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436878	437757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_436900_437800
826091	contig_6137_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_59140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTATTCAAATTATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933993	934648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_934000_934600
826092	contig_8615_pilon	-	1655	14	Intergenic	novelGene_165209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATAATTTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107490	25712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_25818_26959_26999_27200_27233_29227_29363_43082_43235_52422_52545_55001_55096_60415_60523_89001_89076_94891_95061_95390_95545_100244_100374_106273_106493_107366
826096	contig_13945_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_173464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	120	443	150740	150417	NA	80	CCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKENILQTTSVTEGALFLPGLRRDLILRHHVYREDLKLRLFAWILLLLSKAIWGVWLHFTPRSATGSACHQDSKINTKMMLAELKKPKGSALCFSFLFIKLYKNNP	150859	150415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_150400_150900
826097	contig_9972_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_162791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214814	214492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_214500_214800
826099	SIRV6	+	444	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	342	514	169	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826100	contig_14882_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_115039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATTAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504858	504328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_504300_504900
826102	contig_7815_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_134366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCATGTCATGGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192053	190394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_190400_192100
826108	scaffold_19766_pilon	+	718	2	Intergenic	novelGene_34306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	101	619	556963	557562	FALSE	35	GAAAAGGTTCTGAACGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGCGEAELESAEEAVAAPGPPPEPRVSEPRAPVPEPGLDLSLSPQPESPEPPNCTPGRRKGRANRRGGARKGRQVRFRLAPTSPSRSEPLPAAAVPSEKLAAPQELEAPALQSTLALGLELQAARAAAGSQFDAAKAVEEQLRKSFQTRCGLEESVAEGEDGLQTASREWG	556862	557661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_557188_557268
826110	contig_18113_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_137513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGAAAACAGGATTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31307	31866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_31300_31900
826112	contig_8900_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_171621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAGACTAAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215887	217343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_215900_217300
826113	contig_5302_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_81556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_1	0	320	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGTTGTGGTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667297	1666047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1666246_1666920
826115	contig_9243_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_60332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGCTGTAGGAGCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53837	52912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_52900_53800
826116	contig_20875_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_153103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63402	64339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_63400_64300
826117	contig_13498_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_176528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACTGAAAAGTTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266804	267568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_+_266800_267600
826119	contig_10106_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_73899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACCTCAGAGGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173547	174365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_173500_174400
826120	contig_18081_pilon	-	1084	2	Intergenic	novelGene_23802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	348	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATATTGACTTGGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137571	133714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_134317_137089
826121	contig_14577_pilon	-	1219	5	Intergenic	novelGene_164649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	686	junction_2	86.9798827315834	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	242	706	127106	78621	FALSE	50	AGTACGGTAGCCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPGFTPTPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPCM	127347	78107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
826122	contig_14682_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_139122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	426	908	131190	130708	NA	45	AAAAAATTTTTGGACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISIDAEKVFDKVQHRFLIKTLNKIGIEEKFLNIIKGIYAKPTANIILTKDVKDLYKENYKTLLQETQRDLRKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYSAIQIQVPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKAPLKKRKKKFGGLTLPNLRTYYIHLQ	131615	130247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_130200_131600
826123	contig_14405_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_85614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135068	133588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_133600_135100
826126	contig_10642_pilon	-	1271	2	Intergenic	novelGene_78741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACAGCACCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276524	1275154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1275932_1276030
826128	contig_7357_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_36918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGGAAGCAAAGCAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530582	530869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_530600_530900
826129	contig_12671_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_19234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATATATGTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208243	207415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_207400_208200
826130	contig_12671_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_19232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207415	206572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_206600_207400
826131	contig_3942_pilon	+	321	4	Intergenic	novelGene_128771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	33	320	793521	795173	FALSE	30	GCAAGTACGCACCCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGRAVDAEMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMIC	792282	795174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
826132	contig_91_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_127142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTGGTTTTGTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1199835	1198524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1198500_1199800
826133	contig_9888_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_162264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGCCATTTTAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57753	59397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_57800_59400
826134	contig_11832_pilon	+	894	6	Intergenic	novelGene_106968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_5	26.3893918080732	708	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	104	661	463912	466401	FALSE	10	TTGGTGTCTTCGGCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAVAGAVRSPGPLWSRLAWQWQQQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAKWTETEIEMLRAAVKRFGDDLNHISCVIKERTVAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPEAGGPPIKKQKADVTLSALNDSDANSDLVDIEGLGETPPAKKLNFDQDSLTLDSGTSHDLC	463808	466634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_464826_464929_465610_465802_466007_466113_466357
826135	contig_4305_pilon	-	449	4	Intergenic	novelGene_136672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	681.361545404168	184	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGCGCCTGGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514704	512958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513155_513209_513298_513934_514044_514648
826136	contig_11292_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_109433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAATATATTTCATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266900	265048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_265000_266900
826138	contig_18113_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_137529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131709	132815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_131700_132800
826139	contig_7229_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_39849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTATCTTTGGCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237318	1235980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1236000_1237300
826140	contig_15066_pilon	+	1948	5	Intergenic	novelGene_149558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	54.3162038437886	148	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2	484	114986	115468	TRUE	45	GCAACACGTTATAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGWSLRGLRALGGIRWGKGPLLTPDLRALLTSGTSDPRARVTYGTPNLRARLSAGVPEPRPCLTSGTPDPQARLTAEIPDPRTREASGTPGTRPRVWLAVALGAGGAVLLLWGGGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGR	114984	118066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_116056_116270_116631_116789_116860_117518_117615_117715
826141	contig_6164_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_121286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568978	570213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_569000_570200
826145	contig_14621_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_105845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCTCATCTCTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127560	127000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_127000_127600
826148	contig_1516_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_49978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1413	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	368	763	363302	363697	FALSE	10	AGCACCTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLHPSKGRVRGAGLEAPSIFNARGHHLPLLCVLHSVPVENGCPENAQPGPGAWRQQEQGLRAGGSGSSGSRLALALTCFPGHSASPTPTLLSVHWALVFPALPLAVAADKHSTLHLPFSPLLQPPPGLLL	335194	363729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347324_363104
826151	contig_10000_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_139355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAACACTCCAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358639	358942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_358600_358900
826154	contig_10749_pilon	-	1126	6	Intergenic	novelGene_133426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	12.2212928939618	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	321	842	113906	112517	FALSE	10	CCCAGGTCTGTTTCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCRVERFIEIGSGTSKKLAKRNAAAKMLLRVHTVPLDARDGNEVEPDDDHFSTGVGSRLDGLRNRGPGCTWDSLRNSVGEKILSLRSCSLGSLGALGPACCSVLSELSEEQAFHVSYLDIEELSLSGLCQCLVELSTQPATVCHGSATTREAARGEAARRALQYLKIMAGSK	116949	112232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_112675_112829_113032_113426_113555_113872_113991_114870_114967_116809
826155	contig_18039_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_171253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATTCCCAGCTAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197633	198459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_197600_198500
826156	contig_9931_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_134810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAACAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293216	295266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_293200_295300
826157	contig_343_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_163909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378148	380517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_+_378100_380500
826158	contig_8330_pilon	-	1451	5	Intergenic	novelGene_71839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0.82915619758885	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTACTTGTGCTTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888980	886727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_887964_888082_888150_888380_888429_888807_888849_888921
826159	contig_17270_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_67226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88933	87628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_-_87600_88900
826160	contig_17493_pilon	+	1010	6	Intergenic	novelGene_122184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.234387623979	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	421	837	118558	146724	FALSE	20	TTCTTTGTGTATGAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADEDAFAEECRRRGQNALPSQPAGVRSLKSHRPATLPKHGSHYICEDDDEQDRPRVTSSWDPSVFSAGVQRETNVEHTKSDTSLNSQGKRGQKASLCCCVLT	49974	146897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50055_104373_104472_116052_116185_118447_118590_119116_119188_146410
826161	contig_7272_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_25410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808778	808256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_808300_808800
826162	contig_9815_pilon	-	483	3	Intergenic	novelGene_164243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1233	junction_2	1105	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAAACAAATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77226	73937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_73989_75764_75981_77010
826163	contig_17840_pilon	-	1860	2	Intergenic	novelGene_154293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17778	12302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_12454_16069
826164	contig_15044_pilon	-	1066	11	Intergenic	novelGene_174969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	9.84073168011404	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	88	1056	139340	114629	FALSE	10	ACGGCCTCTCCTGCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGRNTGCGSWAARWVDGDLQVCRQEEKRMKEDLPPSSHVPVSDSKSILKSELLSLLKTYNCYHEGRSFQLRHREEEGALIIEGLLNISWGLRRPIRLQIQDDRERLHLPVTAWTSGQPTCDQKEPPPQDSSRNPAEELAADPLQRAESSSHSSEPLKGDTEVPQLPRTRSDASCVIQRRPKGRTPSEAQRVRQHRFSINGHFYNHKTSVFTPAFGSMTNVRVSSTMTTLQVLTLLLNKFRVENDPEEFALYIVHESGERTKLKDHEYPLISRILHGPCEKIARLFLMETDLGEEVPYDVAQYIKFEMPVLDSFVEKLKEEEEREIIKLTMKFQALRLTMLQRLEQLVEAK	149346	114618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_-_114690_115868_115967_116795_116918_117568_117621_117873_117976_122149_122308_123061_123157_124805_124949_138322_138399_139278_139376_149294
826167	contig_18642_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_176797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17998	16288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18642_pilon_-_16300_18000
826168	contig_4364_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_3430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
826172	contig_10042_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_79219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAACTATATTAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086397	1087091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1086400_1087100
826173	contig_6418_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_81181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	2	547	1153317	1153862	NA	45	AAAGCTAAATGACTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLGCSLASIEMKRDGTIKENCDIIIQAMTTIQKELQKVDEALKDKLEPTLYRKLQDIKERESEKIAIVQKVISVILGEATSAASAVAVKLITSNVTTGIINKLVTVLAQIGASLLGSIGVAVLGLGIDMIFCAILGAVEKTQLQAAIRSYEKHLVEFKSASENYHHAITEVTNTVKHQMK	1153315	1155061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1153300_1155100
826175	contig_5260_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_144384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393449	391905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_391900_393400
826176	contig_715_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_167550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTGGGAGCTATGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95852	96397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_95900_96400
826177	contig_715_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_167549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAAGAGGTCTCAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92904	93628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_92900_93600
826178	contig_3866_pilon	-	586	9	Intergenic	novelGene_112431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	57.5825494399128	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	64	585	257355	242036	FALSE	45	CAGATGATGATAATATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTKGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDE	257418	242034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_242060_242535_242601_243133_243202_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253751_253854_257352
826179	contig_9903_pilon	-	1232	3	Intergenic	novelGene_172015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	87	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	625	936	97842	97531	FALSE	15	GCGGGGTGCTTAACCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTINNASVALIQSRLIFSGCPKDVLSPDTTAWLVLSLESFLIEQFLIPSFFLCCLTPSYSPRYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEVSQHHYSRS	106326	97234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_98328_101465_101531_106252
826181	contig_19825_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_59687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTGGTCCCTATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34273	33978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_34000_34300
826183	contig_17603_pilon	-	1301	6	Intergenic	novelGene_152773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	47.136397825884	83	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTGCGAATGTGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47131	28060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_28466_28893_29014_29505_29578_30571_30807_42451_42697_46907
826184	contig_9727_pilon	-	643	4	Intergenic	novelGene_86298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_2	81.8290901819151	2069	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	135	512	256641	253928	FALSE	5	TCTTGTGTCTTGGCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQARKLQLPGRFGGLLGYGKRQVEASRRQSRVSECKSLGLGAAGMLRPKALTQVLSQANTGGVQSTLLLNNEGSLLAYSGYGDTDARVTAAIASNIWAAYDRNGNQAFNEDNLKFILMDCMEGRVAITRVANLLLCMYAKETVGFGMLKAKAQALVQYLEEPLTQVAAS	256775	253796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_253985_254217_254308_256107_256271_256573
826185	contig_7593_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_127373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAACCTTATAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746271	746634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_746300_746600
826187	contig_11396_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_71349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	450	350	799	505694	505245	NA	10	GTGCGCCAACGTGGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLILGAQIPDAEGIVQVAGTLGVHSEGQEAAAVLTLARCTAELQAVPLQHLGDGSRVRRGLLQAVLQVKYTQAPVPGGSLGQHLQDDAQRVVEALPPQHDSNPEEPRVPRCAQQPLMPHVLHAAPEQAVDRHQLWVLQFSHEDLGHRVVDGDHDAGIPRVHPAHEDQLSSAALQHAQHAALWPAHGHLIVASLVQDLHQHLIPCEGHAAVQAAFDLEGAGPCTIQRHSRRPLEGLPQEGAAAVCLRLSSEQPSELGRGQVHVLVGL	506043	505244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_505200_506000
826188	contig_1725_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_24295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209694	208025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_208000_209700
826189	contig_9505_pilon	+	1057	9	Intergenic	novelGene_121847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	140.300069048451	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	73	732	530721	605601	FALSE	40	TCTTGAACAAGAGGCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAKCDPRTVWDVARAPPAATLVTMSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSEMMMGRFADVSHLHLSEGQLTGTVSL	530648	605926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530722_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597992_604972_604993_605542
826191	contig_10569_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_44069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGTATGAGGGATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248429	247967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_248000_248400
826192	scaffold_880_pilon	+	971	2	Intergenic	novelGene_121512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCTTCCTAGATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564906	566225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_565054_565401
826193	contig_9706_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_21007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508654	507283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_507300_508700
826194	contig_10236_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_169108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.76969600708473	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	140	523	63290	68783	FALSE	25	TCTCTCTGTCACCAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQPRSRRLTGTREGSLREVSAGFRLWLLVQRREKGAVIDLSFIWPKMPLFGNTFSPKKTPPRKSASLSNLHSLDRSTREVELGLDYGTPTMNLAGQSLKFENGQWIADTGISAGVDRREAQRLRRRNQQLEEENNLLRLKVDILLDMLSETTAESHLMEKELDELRSVSRRRK	54801	69395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_54899_63247_63368_67176_67283_67366_67486_68702
826195	contig_8476_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_121336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAAGCCTCCACTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117419	115193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_115200_117400
826196	contig_2733_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_128550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTCTCACCCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533977	535477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_534000_535500
826197	contig_15970_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_144052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176369	177441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_176400_177400
826198	contig_20844_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_78617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTGTTACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208088	209456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_208100_209500
826200	contig_13744_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_77169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAAGGCGGTGGGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390324	392095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_390300_392100
826201	contig_8615_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_165218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAGAGTATTTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107442	107035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_107000_107400
826202	contig_8712_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_58852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTCCCTCCAGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710433	711009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_710400_711000
826204	contig_7548_pilon	+	948	7	Intergenic	novelGene_117617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.960515969978	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	453	692	200810	211815	FALSE	15	TTGCCTTGATCTGAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLVEGPEAEVARGGALLETVAISSRFLGLRLRLSEQAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIK	192695	212071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192809_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_211812
826205	contig_16098_pilon	-	1321	7	Intergenic	novelGene_46167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41.1298755975102	88	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	213	965	509333	501718	FALSE	0	GTTTTTTTCGTCCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGPTDGEVDYKKKYRNLKRKLKFLIYEHECFQEELRKAQRKLLKVSRDKSFLLDRLLQYENVDEDSSDSDATASSDNSETEGTPKLSDTPAPKRKRSPPLGGAPSPSSLSLPPSTGFPLQASGAPSPYLSSLASPPYPPFPSDYLALQLPEPSPLREPSPLRPTRQKRPRLPRKLKMSVGPPDCPVGGPLTFPGRGAGAGMGAALAPLPPPKMPPHTILSTVPRQMFSDAGSGDDALDGDDDLVIDIPE	509545	501361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_501940_505886_506022_506409_506522_506618_506698_508768_508822_509026_509098_509252
826206	contig_8687_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_169678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCATTCCTCTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326179	325697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_325700_326200
826207	contig_8687_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_169677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTCTCTGCCTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325697	325400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_325400_325700
826208	contig_12841_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_55876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	119	436	465793	466110	NA	25	GACGCCACCATTTTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHSGKSTKFQNSKSLWHLSHDLFLSYPCSHPQLSVTETLLWIGVDKKGSLCPKLSINGHSIPQKAAGCQYFSCHSGSVMQKLIASQMQLRDQLGSLLPPSPRP	465674	467322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_465700_467300
826209	SIRV5	+	416	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2085_2157_2270_2316_3298_3405_3483
826210	contig_9074_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_156615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTGAAGCTTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53967	55576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_54000_55600
826212	contig_2093_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_152934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCAAGGGATGCGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956617	957102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_956600_957100
826213	SIRV4	-	460	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	67	90	67	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAACCAAGGATTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5091	3727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
826215	contig_15882_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_144814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCATTGATTGGATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353177	355031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_353200_355000
826217	contig_11816_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_98582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341224	1342018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1341200_1342000
826218	contig_10734_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_51235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTCCACCTTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210577	1213046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1210600_1213000
826219	contig_6825_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_155124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51030	51675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_51000_51700
826220	SIRV6	+	204	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9672	561	522	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10759	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
826221	contig_13760_pilon	-	1326	5	Intergenic	novelGene_61341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	11.0312057364551	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	224	1075	333942	326481	FALSE	15	TGTCTCAACTGGCCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPGRLLLIILCSLVFLAVYILICGWACLPLCLATCLEPHLPTSSRPTMLGPLHFSGYSSVPDGKPLVREPCRSCAVVSSSGQMLGSGLGTKIDGAECVLRMNQAPTMGFEADVGRRSTLRVISHTSVPLLLRNYSHYFQQARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRHCCPCSLSSSSCPSEFHPISYLPSNLQQLLITWRVKSGFTTLLLPGPQALHDQALPGPGTLFLLRSLCFSHIGHLGFLR	334613	326229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_326722_327791_328205_330568_330755_333930_334018_334465
826223	contig_10892_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_116761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAAGATAGAGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181512	179963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_180000_181500
826224	SIRV6	+	360	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	496	17	330	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826225	contig_18895_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_176803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTACCTGGCTTGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63945	65222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18895_pilon_+_63900_65200
826227	contig_12923_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_30141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	799	1134	187556	187221	NA	85	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQVYNSVTLVRFLMMFNHYLDPFPLVPFCNPVFGPWKENNAVQTLALHFLALVFQSGQSEIALQFFSFVTLMFLKFASCCRVDSDSWRPRACQSRTVLRRVFNGWFYGSR	188354	186867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_186900_188400
826231	contig_5779_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_106413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45178	44619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_44600_45200
826233	contig_8050_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_114881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAATAGTTCACTTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453498	452574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_452600_453500
826236	contig_14516_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_153891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAACTGTCCAATTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44293	42667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_42700_44300
826237	contig_11978_pilon	+	628	5	Intergenic	novelGene_63094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4482.20963225729	5	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	219	545	1830693	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829103	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830680_1830785_1831161_1831273_1831759
826238	contig_5041_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_27032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATCAACCTAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329555	327605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_327600_329600
826239	contig_5039_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_64867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGGAAAGCAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366829	366034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_366000_366800
826240	contig_5039_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_64866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365579	365013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_365000_365600
826241	SIRV2	-	305	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4568	34	3393	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
826243	contig_15093_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_143293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGCCAGCGTAAACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52166	51541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_51500_52200
826246	contig_4114_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_15649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACCCTTCCCCACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591866	594201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_591900_594200
826247	contig_14326_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_120743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATATCCCAACATTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488566	487815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_487800_488600
826249	contig_2817_pilon	+	1006	8	Intergenic	novelGene_104335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	70.7176045397236	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	304	768	265498	268666	FALSE	25	TTTTAGTGTGTCAGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCTSSVQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMCRPTLCQLLIDKGADINSRDKQNRTALMLGCEYGCKDAVEVLIKNGADVSFLDALGNDSFYYARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQVACNFLKLYVLCTLSEMHSKIG	191577	268904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_191667_253093_253183_261105_261171_261967_262026_265495_265567_265666_265774_266805_266988_268559
826250	contig_9580_pilon	-	2145	3	Intergenic	novelGene_167729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	12.5	14	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1051	1377	759676	759350	TRUE	15	TTTGACTTAATTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQILFMQIEYDKLRKARYSFSFKIFIKSQRKQENSHRLQLLVLYLLSPPAPVLIFWAVFLHLLIFKYFGSKMNKDTYFTLRLLILHYSRHEIFKVRSLREQLSILMS	760726	752090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_752302_752886_752946_758851
826251	contig_1686_pilon	-	1814	10	Intergenic	novelGene_165591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.0308167140377	68	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	3	899	295257	277995	TRUE	10	TTGATTTGTCAGTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVDSVFQVPISKAVQLTTNDAVKTTLLLELDISKTDFSCQPGDAFHVVCPNSEEEVQSLLQRLQLTHQREHRILLEIKENTRKKGAALPPHIPESCSLQSILTWCLEIRAVPKKAFLRALADHTSDVAERRRLQELCSKQGAADYTRFVRDARVGLGDLLHAFPTCRPPLSLLLEHLPKLQPRPYSCASSSLFHPGKLRFVFNVVEFLSYTPAAVLRNGLCTGWLAAQATSLLQPDLHLSSSHKLLPSTRRPRGPRHHGGPGHWCCPLHQLPAAQRETSGATSRSKLWGNVVVLWLQA	295259	275674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_-_276386_277673_277857_277973_278067_279395_279515_285022_285163_286291_286335_287545_287727_292128_292218_293186_293341_295158
826252	contig_6885_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_83679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAATGAATGGGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228231	226142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_226100_228200
826255	contig_7049_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_171438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATGGATTTCAGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113698	111887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_111900_113700
826256	contig_8303_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_154908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCGTGGAAACCCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22453	23309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_22500_23300
826257	SIRV5	-	348	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATCTCTCTCAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
826258	contig_7657_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_30032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTAGAAGAGGACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202419	200742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_200700_202400
826259	contig_14925_pilon	-	685	2	Intergenic	novelGene_55327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112878	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112580_112674
826260	contig_15691_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_60764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1005	1562	30898	31455	NA	50	ATCATGTAGAAACGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFTTGWYHIIFTHLHNTTVSCLPSLSRFSDEETVAERSNMPHSDSQSAVKPGFKPQSVRLRCPPSTVLLTESDGNAQRTWRAGQLWATAWPPCSRTLRGEVARLHPETAGAVSDGGQTCGWQGVCTTRQEEHCPRSQETLVRAGYSGCVPAGWAMSALSLGLLVCKTTGRTRSHSSTLPALKF	29893	31465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_29900_31500
826262	contig_10500_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_41187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353662	1354894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1353700_1354900
826263	contig_12970_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_50535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTATAGCGTTGCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265181	264617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_264600_265200
826264	contig_12970_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_50534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264518	263902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_263900_264500
826265	contig_11416_pilon	-	423	5	Intergenic	novelGene_145332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	435.175252053699	153	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGGCTGTGTGTGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123930	122793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_123840
826267	contig_8823_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_53061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGTGCTCATCCTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61058	59603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_59600_61100
826268	contig_13645_pilon	+	915	3	Intergenic	novelGene_146172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	133.5	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATTATCATGTGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547998	582437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_548132_550122_550239_581771
826270	contig_6589_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_25975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTAAGAATCCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300124	1299587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1299600_1300100
826271	contig_6217_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_109643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609166	610568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_609200_610600
826272	contig_11428_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_138493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGGGGGGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95295	94219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_94200_95300
826273	contig_5967_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_44393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCAGTTCTACTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391981	393202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_392000_393200
826274	scaffold_4805_pilon	+	1989	10	Intergenic	novelGene_161024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACCGCGCTGCCCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468992	533691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_469755_474528_474713_495374_495406_512475_512603_515127_515359_521928_522182_524314_524417_526883_526949_529420_529484_533520
826276	contig_10667_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_137318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACCCAGCAGACCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90495	89313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_89300_90500
826279	contig_12888_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_155027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATCCTCAATTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171082	172578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12888_pilon_+_171100_172600
826280	contig_4659_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_118206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAATAAAAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373674	375811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_373700_375800
826284	contig_2940_pilon	-	674	11	Intergenic	novelGene_81925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	98.0844534062356	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	198	530	603124	595880	FALSE	20	CTAAGTGGTGTTAACGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSGESGLRQRGSDPASGEVEASPLRRVNIKKDDEFFHFVLLCFAIGALLVCYHYYADWFISFGVSLLTFASLETIGIYFGLLYRIHDVLQGFIPLLQKFKLLGFRRTD	636636	595735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_595900_596704_596768_597258_597334_597738_597811_602034_602083_602447_602481_603102_603139_605244_605299_613707_613760_614516_614549_636591
826285	contig_7898_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_47576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1709	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	131	352	484224	487351	FALSE	25	CTGAGAATTGAATTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGSQPSLGEAGRNRDLGLRPWGETAGASHKSGLSGCVLPAARMWKTLTYFVALPGVGLSMLNVFLKSHHGEEERPEFIAYPHLRIRSKPFPWGDGNHTLFHNPHVNPLPTGYEDD	484093	487527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484362_487267
826286	SIRV6	+	294	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1667_1736_2780_2829_3106_3165_10724
826287	contig_9389_pilon	+	849	8	Intergenic	novelGene_83981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	1184.86055323496	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	86	595	383398	386638	TRUE	0	GCTTCTTTGTGTCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYG	381996	387004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_386633_386771_386882
826288	SIRV6	+	273	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	31	-2938	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTGAAGAAACCAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	7850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3171_7805
826289	SIRV6	+	159	2	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	5295	44	-1188	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTAGGTAGTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7811	10771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7924_10724
826290	contig_14621_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_105846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAGTCTCAGTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131936	133253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_131900_133300
826291	contig_9373_pilon	-	2374	1	Intergenic	novelGene_162733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAACAGTCTTTTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318071	315697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_315700_318100
826292	contig_11050_pilon	+	1004	3	Intergenic	novelGene_173571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_2	4.5	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	243	557	62547	62861	FALSE	60	TGTTAAAAAATAATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPCQKIEGKPENEGESKIEEEPKPEENPEKKEEPEEEEKTEGTFRERLIQSLQEFKEDIHNRHLSKEDMFREVDEMDEIRRVRNKLIVMRWKVNRNHPYPYLL	61532	63308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11050_pilon_+_61638_62095_62165_62478
826293	contig_9177_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_32771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCTACTTTAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353941	1354644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1353900_1354600
826295	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826297	contig_6241_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_156449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACGAGAATCTGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591743	591976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_591700_592000
826299	contig_5832_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_134118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTGTTTACAAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60432	59938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_59900_60400
826303	contig_12031_pilon	-	981	2	Intergenic	novelGene_137554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGTCTGTGAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96991	81137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_81996_96868
826304	contig_7622_pilon	-	1206	8	Intergenic	novelGene_132414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	250.59007912346	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	275	799	280732	269279	FALSE	25	TAGGAAATGTTATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD	295616	268871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_274472_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_288428_288539_292279_292359_295549
826305	contig_12852_pilon	+	961	2	Intergenic	novelGene_141450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541817	542833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_541980_542034
826306	contig_7050_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_153622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACCTGAACAGAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656873	656216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_656200_656900
826308	contig_5201_pilon	-	1236	6	Intergenic	novelGene_82161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	10.5261578935526	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	62	586	164256	150768	TRUE	35	ATACATATTTGGCCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRGPHGAAVAVPAPQRASGMSAAEADRWAWLLVLSFVFACNVLRILLPSFSSFMSRVLQKDAEQESQMRAEIQGMKQELSTVNMMDEFARYARLERKINKMTDKLKTHVKARTAQLAKIKWVISVAFYILQAALMISLIWKYYSVPVAVVPSKWITPLDRLVAFPTRVAGGVGITCWILVCNKVVAIMLHPFS	164317	150028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_150676_150764_150842_152593_152709_154054_154123_154807_154974_164154
826311	contig_6076_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_81745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTAGCAACCCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70366	71330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_70400_71300
826315	contig_2093_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_153016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAGATGAAGAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470480	1470041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1470000_1470500
826316	contig_13904_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_165502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145263	146984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_145300_147000
826319	contig_9900_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_159503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGCCATGCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46971	46050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_46000_47000
826320	contig_6557_pilon	+	448	3	Intergenic	novelGene_32975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11115	junction_1	733.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	46	378	435138	436795	FALSE	35	ATTAAGATGTGTTGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFPFAAIAEAAAAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVGVFENT	434239	436865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434280_435132_435306_436630
826321	contig_11284_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_174901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	731	1066	17410	17745	NA	30	AAAAAATGTGCCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSPDPHCEIGKWTDGCMTLGNWGAPEKYPILLQSCCRQPLTGLPATELSLFILSMTRLVLKNTTVELSSSHLLPLPSSSPNNTPTEYLLPGLAFRSLSFGLMLLCSVTC	16679	18370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11284_pilon_+_16700_18400
826322	contig_10437_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_38214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCGTTTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234502	236377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_234500_236400
826323	contig_8900_pilon	+	1174	6	Intergenic	novelGene_171623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	5.74804314527997	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228379	361312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_228572_296436_296546_356147_356227_358225_358309_360180_360276_360696
826325	SIRV6	+	216	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	513	54	513	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10750	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
826326	contig_10980_pilon	+	1528	4	Intergenic	novelGene_162563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	16.1107279647928	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	19	468	256077	300057	FALSE	55	GTTTCACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLHYQQALTGAQLPQHAAFIPTVPMMHSATSATVSAATAPATSVPFAAAATANQIILK	256058	301117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_256263_264401_264556_273422_273518_300042
826327	contig_6374_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_158438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88536	88201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_88200_88500
826328	contig_1516_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_49990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1468.37944261693	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	85	534	347241	363190	FALSE	20	CAGCTGAAGCACCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIPGAPPPSPVPSPPLHPSIRPATLVVLVQGL	335197	363722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353008_363096
826330	contig_13366_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_99771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTGTAACATCACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45122	46737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_45100_46700
826331	contig_9233_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_78265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACAGTCTCCCCTTCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774357	775462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_774400_775500
826333	contig_13904_pilon	-	787	6	Intergenic	novelGene_165484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_5	53.7140577502761	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	69	302	67349	59484	FALSE	40	TAACATTTTCTAGATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLFAVFYTLGNIAALASTCFLMGPMKQLKKMFETTRLLATVFMLLCFVFTLCAVFWWHKKGLALLFCILQFLSMTWYSLSYIPYARDAVIKCCSSLIS	68802	58998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_59524_61361_61392_63518_63578_65030_65067_67280_67363_68747
826334	contig_16776_pilon	-	1031	5	Intergenic	novelGene_130502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	158.061696814883	5	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCCTGTCTGTTGTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57747	34678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_41422_41562_42698_42804_43076_43228_57706
826335	contig_9937_pilon	+	1832	3	Intergenic	novelGene_129220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14	3	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	150	797	237766	251284	FALSE	35	ATAGAAAATTAGCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASETEKIHALLQPCSTESLISSLGLGILCLVADRLLQFPIIQQNDWLRALSDNAVHCMIGMWSWAIVIGVKKKTDLGEIVLAGFLASVIDIDHFFLAGSVSLKAALTLPRRPFLHCSTVIPIVALTLKFVMHLFKLKGSWCFLPWMLFISWTSHHIRDGIRHGLWICPFGKTSPLPFWLYVIITSSLPHICSFVMYLTGTRQMMSSKRGIHIDV	218051	252319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_218128_237692_238078_250948
826337	contig_253_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_129687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGAAGCTGTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419078	418701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418700_419100
826338	contig_1918_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_168335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGCCAGACGAAGCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60403	60052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_-_60100_60400
826339	contig_11551_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_168464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATAATCCCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364184	364657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_364200_364700
826340	contig_11338_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_6322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACACTCCCAAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247736	247105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_247100_247700
826341	contig_4083_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_152322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACTTATGGCAGCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47054	45737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_45700_47100
826343	contig_20550_pilon	-	1371	2	Intergenic	novelGene_142623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21937	19942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_20611_21234
826344	contig_5916_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_158027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGGAAGAACTTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266144	266519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_266100_266500
826346	contig_10581_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_41388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTCCCAGCCCGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583975	583567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_583600_584000
826347	contig_5854_pilon	-	1012	6	Intergenic	novelGene_68863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	25.2792404949199	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	13	327	387800	385760	TRUE	50	GTGGAAAATCAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEGMGAEHCATCRPGRSAACTLGAGSRSPGNHSGGTPASVLEPGLRKACGGEFQLRGPLERRFSTTLTPFPSPQQHLRDSEAASNLNIQNHKMILQERVSISDSFES	387812	355206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_355520_357508_357605_357900_358028_385189_385249_385669_385899_387624
826348	contig_15720_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_41928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4736	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	104	373	283894	282589	FALSE	35	ATCTCACAACGCAAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRQGRGGSGCAAGLSELSGAILVAAATPAPVAAMTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLW	283997	282587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_282750_283785
826353	contig_10003_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_88284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	182	580	861957	861559	NA	15	GGACTTTCACTGATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCYPYVLNRIIASKAWQEKPCSECGPECDRYFSPINLPFTPPCKPRDVFTEGSLRYSYFEPSWSPRSCLSDSNILNNLPQGTQVQEPSTDVSRSPTPCYPPLLVKVPRIPNELLKRKKNTLPRKWSSFQRW	862138	861209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_861200_862100
826355	SIRV2	-	589	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	96	1	96	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAATTGACGTGGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5799	3666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
826356	contig_2894_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_86545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGTTGTGCCATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290393	289693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_289700_290400
826357	contig_12756_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_153208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGAAAAAAGCTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141738	144222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_141700_144200
826358	contig_299_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_129441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920445	922050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_920400_922000
826359	contig_12528_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_81298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTTCGGTACTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347042	345416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_345400_347000
826361	contig_4868_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_136752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGGAAACAATATACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37631	37905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_37600_37900
826364	contig_8617_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_73409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62450	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62400
826365	contig_15952_pilon	+	1103	6	Intergenic	novelGene_154029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	63.3258241162324	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	70	873	62239	64447	FALSE	5	GGCCTGGGCTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWARAWRLPHGGRGASRPSFPRVPVANSSSSGGGGGVELRPLPLSFTLLDGEAGRPALVFLHGVCGCKNNFNSVAKALARRTGRKVLTVDARNHGDSPHSPDMSYEAMSRDLQDLLPQLGLVPCILVGHSMGGKTAMLLALQRPDLVERLIAVDSSPAETTFLSNLPSYVAAMRAVEIPDEVPRSHARKLADEQLSPVVQDVVTRQFLLTNLVEVDGRFVWRVNLDAVAQHLQELLAFPPRQESYLGPTLFLLGGNSQFVQCRLC	62169	64677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62364_62533_62670_63344_63519_63695_63867_63969_64152_64431
826366	contig_4151_pilon	+	1473	2	Intergenic	novelGene_65244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546599	551094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_547460_550481
826367	contig_9345_pilon	+	1219	10	Intergenic	novelGene_24473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	123.641057546072	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	42	929	619385	631313	FALSE	40	GATCATTACAACTTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVKDGVGVGVSCMAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMVSTDTYFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVEQSDAHSGAAEENLAEGFP	618579	631603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625797_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631005_631257
826369	contig_5499_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_56969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCAACTATTATGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30026	28623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_28600_30000
826371	contig_15188_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_163082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	738	1040	166655	166353	NA	5	GGTGTTGATTGTTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLDNKIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGLAACVLTLPRSLLLEPARGTPDWNPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED	167392	165726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_165700_167400
826373	contig_5765_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_141393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	79	324	678534	678289	NA	25	TCTAGTTGAAATCGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKSYSRFLFTGPRIYSRPKWELLVAQMVKHSTTSQKAGSSNPHRGTSEDSPGDLLPKGHSLENPMEHGSTLCALSCHELELTLWQLTATTLLQIKGSWFTNIYGARA	678612	678015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_678000_678600
826374	contig_5765_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_141392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTAACTCTGTCAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677505	676824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_676800_677500
826375	contig_10734_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_50963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAATGGAAAATCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28303	28597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_28300_28600
826376	contig_934_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_129013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGGAAAAAACAGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140782	142892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_+_140800_142900
826377	contig_20276_pilon	+	1021	2	Intergenic	novelGene_117049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTGATGCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5913	6986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20276_pilon_+_6098_6149
826378	contig_3132_pilon	-	1407	10	Intergenic	novelGene_127424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	135.965500344575	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	299	1114	229252	219987	TRUE	20	CCTGCTTTTTCTCAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKVTLLK	229550	210768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220005_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227247_228876_228929_229210
826381	contig_2069_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_23360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949689	950499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_949700_950500
826382	contig_987_pilon	+	1009	9	Intergenic	novelGene_72304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_8	407.237568871046	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	17	841	956443	967663	TRUE	50	TAAAAAATTCACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVRNMATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD	956426	968491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_967656_967694_968353
826383	contig_5278_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_139778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	873	216	1088	315238	316110	NA	20	CTAGGGGTTCAGAGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDPDRCDIWGNTPLHYAASNGHAHCVSFLVNFGANIFALDNDLQTPLDAAASREQNQCVALLDKAATSQNIMNPKKVTRLKEQAQKNARRQIKECERLQEKHQNRMARVYSKEESGTLSSSKGSSRSSFSNASTSGTFGSFSKGIKDTFKIKFKKNRDTAEQVGKEGRSGQRNVMEVFREEKEYSLSGDFKDKLQFSGEEDNCEQHESILNRPGLGNIVFRRNTVLSLEDFSDSKREFGLKMSSELLQRQGAAEADKAEADEEEKENDHDDDLPWDKDEVEWEEDVVDATPLEVFLQSHHLEEFLPIFMREQIDLEALLLCSDEDLQSIQMQLGPRKKVLNAINRRNQVLQQPGQLVDTSL	315022	316223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_315000_316200
826384	contig_5429_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_127829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATGAAGAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611539	611212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_611200_611500
826385	contig_11028_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_163963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGGACACCAGAACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920730	921459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_920700_921500
826386	contig_10307_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_170293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	2051	2365	621074	621388	NA	60	TAGAAATAAGAAAAAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQGGPVLLPEALVSGLAALPAVAALFACFEEHTRCRRQGIPRICLFSSKEENVNLGLCPNHMTFGLGDSLGQFSSAAEQKLPGFKPVGNQMSGCVRVKESFIK	619023	621389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_619000_621400
826387	contig_2487_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_148451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTGCCTAGAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104412	102921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_102900_104400
826388	contig_91_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_127129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTGAGCCATGGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770260	771374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_770300_771400
826389	contig_1435_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_115527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTATTTTGACACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602983	604531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_603000_604500
826397	contig_3942_pilon	+	1379	2	Intergenic	novelGene_128852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACATACCATAAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408729	1412703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1408777_1411371
826398	contig_10912_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_176806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAATATGTGTCGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937296	938861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10912_pilon_+_937300_938900
826400	contig_13744_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_77197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTTGGAAAATATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954901	953607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_953600_954900
826401	contig_5005_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_84339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAAAAGCTAGCCATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654882	654644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_654600_654900
826402	contig_19476_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_116804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGGAAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132250	131864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_131900_132200
826403	contig_19185_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_163645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114563	116512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_114600_116500
826405	contig_10197_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_115332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAATGTAAGATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656005	1657798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1656000_1657800
826406	contig_9799_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_145559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAGCAAGCAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936136	938168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_936100_938200
826407	contig_9582_pilon	+	1887	5	Intergenic	novelGene_106838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGGTCTGCCACTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417238	424099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_417441_418010_418222_420109_420327_420724_420790_422907
826408	contig_2332_pilon	+	1390	7	Intergenic	novelGene_58713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	33.0777703131406	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	50	703	808593	842357	TRUE	50	TTTTTTTAAAAAAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTALLKLFVAIVITIILILPEYFKTPKGNVLELSCLEVCLQHNFTYSLSVLNFSFMTLLQPVREGQIIRGIFLNQSSFQNFTKLCQDIMSEFKMCSSCLVCESKGNMDFISQEQTSKVLVMRESMNVKASDFHLPCQHFNFTVASIVDPLEEYNITCNLNTHTRKSAIMVEDSAKENSINHSCRITEGLNSCIHVSLHLEMDIKSVICSMKITWS	808543	861176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_808681_829351_829622_833045_833307_839941_839970_842350_842435_857439_857546_860672
826409	contig_8552_pilon	+	1104	2	Intergenic	novelGene_80064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354711	375012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_374255
826410	contig_8487_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_111920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGGTAGTTCTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282934	283617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_282900_283600
826412	SIRV6	+	346	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	24	337	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826414	contig_2646_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_69647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATGACATTGGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161616	2160675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2160700_2161600
826415	contig_11304_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_156722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTCAAACGAGGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447109	446343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_446300_447100
826416	contig_10642_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_78649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACATGTTACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106211	107884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_106200_107900
826417	contig_401_pilon	-	545	5	Intergenic	novelGene_42779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	939	junction_1	362.476550965714	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	63	488	1083727	1079678	FALSE	10	TTGCCCTGTACCTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCLLCTWSSSSATAPHPLKMYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSFQTTAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	1086606	1079620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
826418	contig_2646_pilon	-	801	5	Intergenic	novelGene_69613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	26.6587227751068	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	24	494	2014129	2008282	FALSE	15	CCTTCCTTTTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKLIYPEMEAAEVGTLRHAFAHALSCSLAAVLLAVAPCLVSYPREGVCVPPVSIARSAPIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF	2014152	2007974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2008400_2011714_2011799_2012331_2012426_2012507_2012527_2013973
826419	contig_17344_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_169596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCCAAAAATTAGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98906	100520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_98900_100500
826420	contig_20889_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_127656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80535	81080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_80500_81100
826421	contig_17989_pilon	-	1155	5	Intergenic	novelGene_150816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_1	340.078943041171	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	3	647	205841	201145	FALSE	70	TGAAATAAAAATTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVGGLSWDTSKKDLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDSTSVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKKAMAMKKDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKSNKRRGFVFITYKEEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVYQQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGSGGQGSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY	205843	200636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_201216_202346_202465_204529_204662_204856_205016_205676
826423	contig_15236_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_141675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGATATTCTCTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763191	762897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_762900_763200
826424	contig_11281_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_125435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACGTGCTAGTGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550578	549917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_549900_550600
826425	contig_9468_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_59493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	91	339	319950	320198	NA	90	AAAAAAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319859	320243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319900_320200
826426	contig_8019_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_126994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGAGCTAAACGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207645	206988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_207000_207600
826428	contig_8260_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_163273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTTCCCTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562759	563617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_562800_563600
826430	contig_709_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_57616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCTCACGCACACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424481	2422153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2422200_2424500
826431	contig_817_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_132451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGGTGTCACGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553169	554331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_553200_554300
826432	SIRV6	+	428	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-83	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	83	252	69	320	2458	3120	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVSYL	2389	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2816_3106_3165_10724
826433	contig_9543_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_175317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAGGAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371435	369980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9543_pilon_-_370000_371400
826434	contig_12079_pilon	+	1910	2	Intergenic	novelGene_67360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTTGGTAGGTGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182216	184349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_183913_184135
826436	contig_1335_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_166513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGATTGATTTGGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411632	409729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_409700_411600
826439	SIRV4	-	215	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1308	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3850	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
826442	contig_5698_pilon	+	2207	15	Intergenic	novelGene_55051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.9043139656644	1	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	51	1412	42626	47577	TRUE	40	AAATCTTGTTCTATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLESVPMTWDPVDQNPRLLTLEVPGVTESRPSVLRGDHLFALLSSETNQEDPVTYKGFVHKSLLSRFVDGLTFKVNFTFNRQPLRVQHRALELTGRWLLWPMLFPVASRGVPLLPSDVKLKLYDRSLESNPEQLQAMKHIVMGTTRPAPYVIFGPPGTGKTVTLVEAIKQVVKHLPKAHILACAPSNSGADLLCQRLRVHLPSSIYRLLAPSRDIRLVPEDIKPCCNWDAKKGDYVFPAKKKLQEYRVLITTLITASRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHSMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGGQLVLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGHSLLERLLSYNSLYKKGSSGYNPQFITKLLRNYRSHPTILDIPNRLYYEGELQACADVVDRERFCRWEGLPRQGFPIIFHGVMGKDEREGNSPSFFNPRRGCHSDFLLEAAPGPLL	42575	50401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_42716_43499_43617_44100_44280_44398_44547_44980_45140_45364_45469_45636_45735_45831_46049_47110_47229_47445_47640_47896_47972_48928_49055_49135_49225_49872_49995_50080
826445	contig_15114_pilon	+	1094	5	Intergenic	novelGene_121201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	27.7702628723604	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	344	1075	785166	795526	FALSE	30	CTTGTGCAGATACATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVKRGDESQFLLQAPGSSELEELTVQVTRIYNGRLKVQRLCSEMEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQAELSVIKESEAQLWWAAKELRRTKKLSDYVGKNEKTKIIVKIQQVSTLTFRCVFVTHLRTDDNLQ	784822	795545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_789237_789406_791308_791377_793688_793848_795328
826446	SIRV5	+	386	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1994_2034_2119_2157_3271_3405_3483
826447	contig_2854_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_120886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGGGTGAACTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121711	1122391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1121700_1122400
826449	contig_15182_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_136456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACGTATCTGTATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504768	505936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_504800_505900
826451	contig_9705_pilon	+	1236	6	Intergenic	novelGene_41718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTCTAGAGCGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156088	237823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_156678_156966_157065_162930_163096_166745_166827_170662_170804_237661
826452	contig_7078_pilon	+	815	6	Intergenic	novelGene_130195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	192.737541750433	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAAGATTAAATTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951241	982386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951312_951436_951557_963633_963733_965325_965478_975279_975387_982119
826453	contig_12622_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_6019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	119	751	1656595	1657227	NA	40	GGTATGAATGCTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATETGQATAPSGKRRRGRCLPASDRRTPARLAAGPLLPGTLTCPERTRGDAATRSARPPVLPPPPRPPQRRCRHFVSRPGTPRCACAGSASEGLRRGRSAILSVAGSAGSSVPACCRPPSFPPHSPLLPAGLRSGETPLSALGCGLRKEGARTPPQFPPACTPEGTEDLGGRSAGKLGLSVRTRGLGAAAEPVGGSDSAADPEAESW	1656476	1657774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1656500_1657800
826454	contig_7165_pilon	+	1075	4	Intergenic	novelGene_116902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	34.5671648951558	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	127	798	1198317	1220946	FALSE	10	GATGTTTCCTCTTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRLLLRVWPRGLAVGPGAPCRPLSARSGPSQYLQSSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLDDGHFRKTEQFCKSFENGSGKELHEQLVAQDKKNKHTSYISGQGFDRHLFALRYLAAAKGIPLPELYLDPAYGKINHNILSTSTLSSPAVNLGGFAPVVPDGFGIGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAHEFLHCVEKALDDMFDALEGKSIKT	1198190	1221223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1210507_1210589_1211668_1211776_1220614
826455	contig_1274_pilon	-	1530	2	Intergenic	novelGene_137801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACTTCTAAAAATAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438373	429313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_430813_438342
826456	contig_15365_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_111131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60620	59864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_59900_60600
826457	contig_5316_pilon	-	989	3	Intergenic	novelGene_61209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTGCGAGCAGAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474718	396004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_396132_453775_453969_474049
826458	contig_12701_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_169557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGATAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37062	35822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_35800_37100
826459	contig_6048_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_73366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATGAGGCCAGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3081609	3082256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3081600_3082300
826460	contig_10801_pilon	+	1269	2	Intergenic	novelGene_74065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	389	691	369506	369856	FALSE	35	TTACTGTAAAAGACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVKEPLSIFKDQTVDCSSLIPLVCLLSSLDATKAPPSLWFSLVRWKLSISPRVLPSFHSSAVWQCNLVLTLRFSFGVGGEEHRCPSCIMILRARKRWNV	369117	370434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_369784_369831
826462	contig_12626_pilon	+	929	6	Intergenic	novelGene_80426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_1	229.022269659525	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	22	855	107206	155805	FALSE	65	TGAAAAAGAGGGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQVRNNRK	107184	155879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637
826464	contig_5770_pilon	+	584	6	Intergenic	novelGene_74169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCGCAGTACAATTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261893	264953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_261983_262764_262957_263609_263675_263925_264064_264768_264808_264892
826465	contig_7366_pilon	+	681	4	Intergenic	novelGene_164970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	98.3881203307707	982	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	17	421	51814	60801	FALSE	25	TTTATGTTTCTATATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATMKKAAAEDVNVTFEDQQKINKFARNTSRITELKEEIDVKKKQLQNLEDACDDIMLADDDCLVIPYQVGDVFISHSQEETQEMLEEAKKNLQEEIDALESRVESIQRVLADLKVQLYAKFGSNINLEADES	51797	61061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7366_pilon_+_51838_57495_57604_58651_58793_60669
826466	contig_6557_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_32971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACCTTCTCCAATGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393553	395010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_393600_395000
826467	contig_12886_pilon	+	2645	17	Intergenic	novelGene_135498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_12	78.0354236468926	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	828	2484	162	2645	576054	582449	FALSE	20	GTATGTTGCCAAGTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYEEHIPGQTRDWNEELQTTRELPRKNLPERLLRERAIFKVHSDFTAAATRGAMAVIDGNVMAINPSEETKMQMFIWNNIFFSLGFDVRDHYKDFGGDVAAYVAPTNDLNGVRTYNAVDVEGLYTLGTVVVDYRGYRVTAQSIIPGILERDQEQSVIYGSIDFGKTVVSHPRYLELLERTSRPLKILRHRVLNDREEEVELCSSVECKGIIGNDGRHYILDLLRTFPPDLNFLPVPGEELPEECTRAGFPRAHRHKLCCLRQELVDAFVEHRYLLFMKLAALQLMQQKASKMETLTSLENSSPLSSEPKTEVSPGPEVGSEEESGSASGLAKVKELAETIASDDGAADPRSREVIRNACKAVGSVSSTAFDIRFNPDIFSPGVRFPESCQAEVRDQKQLLKDAAAFLLSCQIPGLVKDCIDHAVLPMDGATLAEVMRQRGINMRYLGKVLDLVLRSPARDQLDHIYKIGIGELITRSAKHIFKTYLQGVELSGLSAAISHFLNCFLSSYPNPVAHLPADELVSKKRSKRRKNRPPGAADNTAWAVVTPQELWKNIRQEAQNYFDFSLECETVDQAVETYGLQKITLLREISLKIGVQILLKEYSFDSRHKPAFTEEDVLNIFPVVKHVSPKASDAFHFFQSGQAKVQQGFLKEGCELINEALNLFNNVYGAMHVEICACLRLLARLHYIMGDYAEALSNQQKAVLMSERVMGIEHPNTIQEYMHLALYCFASSQLSTALSLLYRARYLMLLVFGEDHPEMALLDNNIGLVLHGVMEYDLSLRFLENALAVSTKYHGPKSLKVALSHHLVARVYESKAEFRSALQHEKEGYTIYKTQLGEDHEKTKESSEYLKCLTQQAVALQRTMNEIYRNGSSANIPPLK	574866	582449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_574896_575081_575175_576014_576710_577230_577455_577586_577692_577888_577990_578743_578897_578987_579051_579181_579427_579741_579827_580002_580157_580235_580376_581091_581173_581250_581377_581464_581587_581863_581958_582314
826469	contig_12802_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_114260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCATAACGACCCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247646	246807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_246800_247600
826470	SIRV6	+	515	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	167	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
826471	contig_15361_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_167875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCACTTTAAGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501508	503437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_501500_503400
826472	contig_3978_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_173861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	357	659	17260	16958	NA	55	AAAAAAAAAATCACCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQAWCLFNQGGCSLRSNSNSGNKSNYFHILSDVLCTRLCTSTVGIFPCLISVPFPELGMTAAILQAGKLELRRVQLLCLVIQQVSWDSSPDWILLHSLG	17616	16533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3978_pilon_-_16500_17600
826474	SIRV4	-	358	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1160	3	1160	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3998	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
826476	contig_11427_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_79005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1005	1343	622337	622675	NA	25	CAGGCAGAACGCTGCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEGPAPALQTSFLCKALPPLWLQLLRAQPTKDRLSRSIRIYSFKKAGAYTGLAPVGNCSEQTKSRLPFCKDMSDPRQRSPATLVALAQGQTWEEGQEAPGSFQHGSTSQT	621332	623478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_621300_623500
826477	contig_10627_pilon	-	1266	12	Intergenic	novelGene_59948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	64.7616098912194	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	12	653	172150	168986	TRUE	15	GCCCTATAGGAGTCGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKVRTSRHWEDTVGPGCGSSYGLHLHSCLWL	172161	167848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_167950_168059_168147_168257_168363_168440_168544_168647_168839_168959_169076_169387_169619_169698_169756_169934_170033_170341_170412_171485_171558_172126
826478	SIRV6	+	485	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845
826479	contig_12010_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_160933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATATATTTCAAACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31550	32980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_31600_33000
826482	contig_7009_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_23670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	299	667	536537	536169	NA	45	TGAGTAAAATTTTCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVELVHRANDRDHLRAPRGRLHQGAQGLGPQVADRVVDGLVHHMRRHHLVLLLVVRAAVVGHLRQALLSCGKRRWSVWFGHLWRQLKSTLCAMQPNFWGVLIHQQVCNKNTTKSGVYLSS	536835	535345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_535300_536800
826484	contig_3153_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_104688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTCTTACAATGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311020	309558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_309600_311000
826486	contig_5021_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_167103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGGGCCGGGATGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402370	402794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_402400_402800
826487	contig_7188_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_108523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACGGAAAAAGAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69718	70054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_69700_70100
826488	contig_9389_pilon	-	869	9	Intergenic	novelGene_83957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.424276375821	140	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	33	665	215498	207870	TRUE	10	CCGCGTCTGTGTGTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ	215530	206830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_206952_207146_207215_207854_207936_208221_208301_208414_208474_208771_208853_209776_209893_213629_213805_215441
826489	SIRV6	+	349	2	ISM	SIRV6A	SIRV611	454	3	164	28	164	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCGATCAGCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640
826490	contig_10067_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_176807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCTTTAAGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10067_pilon_+_0_1200
826492	contig_5344_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_125330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGCAGCCCTTAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40916	41598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_+_40900_41600
826493	contig_8160_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_136398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAAAATTCTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17361	16007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_-_16000_17400
826494	contig_6102_pilon	+	468	5	Intergenic	novelGene_31954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2298	junction_1	260.182147735005	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	42	467	413086	414954	FALSE	10	GTGAGGGGCCAGGTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYE	413044	414955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877
826495	contig_6710_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_98311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1	303	657518	653622	FALSE	25	TCACGCATAAGACCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRSQFRRRDQSGHRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCE	657518	653620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657475
826498	contig_20612_pilon	+	809	3	Intergenic	novelGene_174676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	71	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	152	670	35730	36877	FALSE	40	AAGAGAAACCCCGTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEESGIETTPPGTPPPNPAGLAATAMSSTPLPLAATSSFSSPNVSSLQSLPPHAYSTPQPSLPPVKPSAPLSFVPPSPVPSVPPLVTSVPPPVSLSTATVFSSPPISHFPPSTSAPNTLLSAPPSSPPTSGFSVGSTYDITRGHAGRAPQTPLLPSFSAPAVTGNSVLLIL	31110	37016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20612_pilon_+_31240_35707_35833_36461
826499	contig_2646_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_69492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99276	98494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_98500_99300
826500	contig_7635_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_171376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	272	748	163705	163229	NA	30	AGTTGAGCTATCAGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKTRPTGEWVFACMYCFQSIVGIHIPENKRQSVTYLSFPEILRCQNLKQVNLRETEGQRAMRWSRLQRPFPVLVGICHAVPPLVSLSYYGGFHVAVAQDQAMFLSVVHRVVTSMLGDLTASDNDSDAVQTAQNSGLLQVRGLGLQVCPCPLGDREFG	163976	161760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_161800_164000
826501	contig_11115_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_102849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCACCATACTTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170100	168383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_168400_170100
826502	contig_9706_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_20787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATTATCCCCGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365	1182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_1200_1400
826504	contig_8617_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_73444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACAAACATAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62580	62044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62600
826505	contig_1699_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_72832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGTTTTTGTTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105408	106919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_105400_106900
826508	contig_6403_pilon	-	2082	3	Intergenic	novelGene_139902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	651	968	1135307	1134990	TRUE	15	CCCCCAAATCTCCTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPSEEVPRPLTPSSCPTSMKENLGMLLEMIQLTSGSALCWEALLTALDWTTGLLWPKRGFGLAGQGALYCQGWVRLSLAFLPAKLSHTHEIVDTPSRGHLHTQT	1136951	1133140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1133957_1134691_1135760_1136753
826512	contig_2903_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_148989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238128	237106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_237100_238100
826513	contig_14341_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_111869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACGATAAGCACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607757	606471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_606500_607800
826515	contig_4824_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_176032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTGCTGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752150	752501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_+_752200_752500
826516	contig_18804_pilon	-	564	3	Intergenic	novelGene_163790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	33.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	216	563	9601	7490	FALSE	40	ACTTGGAAAGCAGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFDFCSTNVINKIILQSEGLREAFSELDMTSEVLQITMSPDKPYFR	11967	7488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_7750_9513_9623_11773
826517	contig_12724_pilon	-	1592	7	Intergenic	novelGene_146868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	47	junction_6	41.9589746723577	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	68	1159	541481	440995	FALSE	30	TAAGTACTTTGATTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQVFVGKVLKKLFPDVPSGQEKLAPATLASEKPPEKVRPKKANLRGVQPLTDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPIISKNKKRKLKKKEQIKKKKVAGLLTKASGINFMYQPEERNSEQEELRNTDEEDGKDGNEEDIQDTNQEDVKDTNEEDIQDTNQEDVKGISEEDVKSTNEKADGILNFLKSTHEIYLYDGVSKDSDSAVFMETTEELFEQLESHSLSPSDVFILDHMKTLLLLQDTERLKSALEMFPEHCRMPPDHVRVISTFFNYWITHILPQRNSE	541548	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_441069_445761_445957_448443_448537_448584_449011_497701_497837_522974_523122_541459
826518	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
826519	contig_9571_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_136255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACCCTATATGGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307793	308752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_307800_308800
826520	contig_11816_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_98476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTCTACTCTGTCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455792	455405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_455400_455800
826522	contig_7695_pilon	-	848	2	Intergenic	novelGene_41554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	78	434	397040	373971	FALSE	15	GGGTATGTGTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGRPDVSLLSGGEVLAFREGGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKGGMCGG	397117	373556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_396703
826523	contig_4114_pilon	-	1683	6	Intergenic	novelGene_15626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	17.749366185867	62	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	167	709	474272	465318	FALSE	5	TCTCACTTGTTCGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYREPARWSYTFQTFSFMSRLKTQLEPVSEKPLQAKELVQVFERSVYSDRYIFAKNLFENGSLSDIEWHIYQSWHSFLLQEFASRLRLHGFIYLQATPQVCLKRLHQRARAEEKGVELAYLEQLHGQHEAWLVHKTTKLHCEALQNIPVLVLDVNEDFSEEGAIQEELMRKVNTFVKNL	500161	464343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_465345_465805_465906_466486_466603_469550_469699_474120_474309_500031
826524	contig_7157_pilon	+	1413	4	Intergenic	novelGene_131286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_3	146.978456471235	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	964	1413	864571	869397	FALSE	10	ATTTATGTGTGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATTVAAVQSDIPVVSSSSSPCQSAATQVQNLTLRSQKLGVLSSSQNGPPKSIGQTQSLTICHNKTTVTSSKISQRDPSPESNKKGESSSLESRSTAVTRTSSIHQLIAPASYSPIQPHSLIKHQQIPLHSPPPKVSHHQLILQQQQQQIQPITLQNPTQDPPPSQHCIPLQNHGLPQAPSNAQSQHCSPIQSHPPPLTVSPSQSQSAQQSVVVSPPPPHSPSQSPTIIIHPQALIQPHPLVSSALQPGPNLQQSTANQVQATAQLNLPSHLPLPASPVVHIGPVQQSALVSPGQQIVSPASHQQYSTLQSSPIPIATSPQMSTSPPAQIPPLPLQSMQSLQVQPEILSQGQVLVQNALVSEEELPAAEALVQLPFQTLPPPQTVAVNLQVQPPAPVDPPVVYQVEDVCEEEMPEEADECVRMDRTPPPPTLSPAAITVGREDLTSEHPLLGEQIPRCEAILYSINVSNGK	853033	869397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_853118_858596_858844_863938_864811_869187
826525	contig_4328_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_176809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCATGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325814	328144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4328_pilon_+_325800_328100
826527	contig_12411_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_145684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420862	419815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_419800_420900
826530	contig_7548_pilon	+	1016	7	Intergenic	novelGene_117624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.960515969978	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTTTTAAATTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192764	212059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192951_198385_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_211812
826531	contig_10236_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_169121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTAATCTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128527	130573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_128500_130600
826532	contig_15172_pilon	+	1186	8	Intergenic	novelGene_158737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.27301076447	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	30	344	215528	226241	TRUE	35	AAGGGGGACTGTAGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLNSLEAVKRKIQALQQQADEAEDRAQGLQRELDGERERREKGSSQPTYPACGGGAGQGSGAPGHSPAEAGGRHEGDRKPGHERRGEDGDPGDAAQGGQAHR	215498	237615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220404_220495_224966_225056_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
826533	SIRV6	+	424	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1628_1736_1845
826538	contig_11052_pilon	+	752	3	Intergenic	novelGene_115455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2262.5	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	98	457	102902	107503	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLWAQPP	102804	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106454_107484
826539	contig_9389_pilon	+	487	4	Intergenic	novelGene_84029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	60	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	19	456	584401	586236	FALSE	20	GGCCCGAGTCCAACCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584382	586267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
826542	contig_19076_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_74228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAGAAAAGAATAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151994	153517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_152000_153500
826543	contig_11980_pilon	-	2374	12	Intergenic	novelGene_176810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2.18938083250769	14	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	46	1515	50839	28611	FALSE	5	CTGATGTGTGTCGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPQILALCHITVGQQMNLYWLHKVGLVVILIFTVVAMSAVAQLWEDEWEVLLISLQGTAPFLHMGTLAAITVLSWIVAGQFARAERSSSQMAILCTFFTVVFALYLAPLSISSPCIMEKKDLGPKPALIGHRGAPMLAPEHTLMSFRKAIEQKLYGLQADVTISLDGVPFLLHDATLRRTTNVEEEFPGLARRPASMLNWTILQRLNAGQWFLKTDPFWTAGSLSPADHREAQNQSICSLAELLELAKGNASLLLNLRDPPREHPYRASFLNITLEAVLRSGFPQHQVLWLPNRQRPLVRKVAPGFQQTSGSKEAVASLRRGHIQRLNLRYTQVSHQELRDYASWNLSVNLYTVNAPWLFSLLWCAGVPSVTSDNVHTLSQVLSPLWIMQPPDEYCLMWVTADLISFTLIVGIFVFQKWRLGGIRSYNPEQIMLSAAVHRTSRDVSIMKEKLIFSEISNGMEVSDELSVCSDNSYDTYANSASTPVAPRGGRSHTKTLTDRSGH	50884	27751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11980_pilon_-_28760_31235_31349_34195_34282_36745_36894_37209_37368_38121_38341_38828_38980_40086_40170_45480_45627_46026_46121_46409_46509_50815
826545	contig_7411_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_137012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	177	509	320284	319952	NA	80	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPSVEVHVSSLRVGTLSCSLLYSQRALLALNGHLYWSGYSTNLKRLERTRFTSCPNFMSIMGQLIHIVHTQGLMLMEYHHLKMLLAMVEAKRALEGGLAVAVHCSSLKATHTMSAPISCARVSHMHPHKHKRPGRHILPFSRGGRELGISDGRALMTTTKLNKCLFT	320460	318820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_318800_320500
826546	contig_3822_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_133331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAGCTATGAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306435	305247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_305200_306400
826547	contig_7057_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_123360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	41	376	943389	943724	NA	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLFVA	943348	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_943300_943700
826548	contig_9995_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_47725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAACATTTTGACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485855	487151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_485900_487200
826550	SIRV6	+	457	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	21	7	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACGCTATTTCGGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
826553	contig_11566_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_166699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTTTCTTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184945	187120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_184900_187100
826555	contig_7207_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_72089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATAAAACAAAACGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690221	690609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_690200_690600
826556	contig_1150_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_61470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTGTGTTCTATTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457602	459581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_457600_459600
826557	contig_19769_pilon	+	494	4	Intergenic	novelGene_102301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1783.8991625712	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	14	460	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISGTKTVQEKEN	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_87954_89288
826558	contig_4654_pilon	+	1199	8	Intergenic	novelGene_103060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	200.428418694576	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	78	1133	444670	473174	FALSE	30	AGCCCCAACAACTCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKSPDSVEGLRAAGNQSFRNGQYTEASALYGRALRVLQARVSTRAGSSDPEEESVLYSNRAACHLKNGNCSDCIKDCTSALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPKETTTTKNKVPSAGDVERAKVLKEEGNEFVKKGNHKKAIEKYSESLSFSHLESATYTNRALCYLALKQYKEAVKDCTDALKLDGKNVKAFYRRAQAYKALKVTMSRKGAPDTDVTVFMVMTEFHFLSKEGKKSYANDRDPCWDQITQGLVSRMERLSLAKAIQQKSVAITES	444592	473240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_444797_449177_449293_450644_450798_453119_453290_456226_456375_457717_457845_460182_460336_473111
826559	contig_2892_pilon	+	452	2	Intergenic	novelGene_119045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695263	697655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_695474_697413
826560	contig_4364_pilon	+	931	3	Intergenic	novelGene_191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	60	314	1268714	1270459	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREREAARSNPPASQTRSSMAEQEPTVLLLLLPVLWARRPRPHFPFCTQVPASFLAGGWYGVSQVLSAPLSPCGCPGCLPPLPQPPGPGRPPVAVSHRVTMMP	1267046	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268734_1270224
826561	contig_10437_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_38327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	97	435	437924	438262	NA	35	ACGAGGCAAAGGAGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAAIPHCVSTLPPFPFHPGFTVSLHPVFLSPPAFLSLFLGKCCPLDLINLTDLRSTFLMCVIVCLIGLSILRLKGELQEWLQVLVRRVCGGHSLLGSFSLCQTCKSGLFL	437827	438926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_437800_438900
826562	contig_7333_pilon	-	1152	5	Intergenic	novelGene_142797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	19.5512147960172	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	626	997	329079	328040	FALSE	5	GCATGGTGCTCTCTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSADVSEDRTVWGKDLDWGLGHLAQVSKRAEVGKALRVRLGLTNNQMEPPSNCIMALERSGLIHGQISKSLETLMAGHTLEIQLDLYPIKAGPRQLQVLISSNKVKEIKGYRDIFVTAARAS	331028	327884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_328200_328431_328566_329001_329151_330356_330852_330969
826563	contig_10013_pilon	-	1360	11	Intergenic	novelGene_125070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	64.2346479713246	109	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	31	1296	462946	452428	FALSE	5	CGGTCTGAGCCTCCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLACIWRYRKMVVMARISRPERPDLVFEEEDLPYEEEIMRNPFSVKCWLRYIEFKQGAPKPRLNQLYERALKLLPCSYKLWYRYLKARRAQVKHRCVTDPAYEDVNNCHERAFVFMHKMPRLWLDYCQFLMDQGRVTHTRRTFDRALRALPITQHSRIWPLYLRFLRSHPLPETAVRGYRRFLKLSPESAEEYIEYLKSSDRLDEAAQRLATVVNDERFVSKAGKSNYQLWHELCDLISQNPDKVQSLNVDAIIRGGLTRFTDQLGKLWCSLADYYIRSGHFEKARDVYEEAIRTVMTVRDFTQVFDSYAQFEESMIAAKMETTSELGREEEDDVDLELRLARFEQLISQRAEQLAAEAERDQPPRAQSKILFVRSDASREELAELAQQANPEEIELGEDEDEDEMDLEPNEVRLEQQSVPAAVFGSLKDD	462976	452363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_452490_452571_452682_452808_452886_456723_456774_457212_457358_458530_458696_458782_458918_460673_460872_461173_461298_461568_461718_462895
826564	contig_6434_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_61827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAGGAAGATTGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691809	690671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_690700_691800
826566	contig_14953_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_137298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGACAGTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420493	419382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_419400_420500
826568	contig_13740_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_34763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693722	695026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_693700_695000
826569	contig_9290_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_77508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCAGATTATCTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30869	30047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_30000_30900
826573	contig_6375_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_72969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217862	218475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_217900_218500
826574	contig_15613_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_147204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGACTCATAGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117870	116103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_116100_117900
826575	contig_10082_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_63843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAACCGTTATGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67693	66729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_66700_67700
826576	contig_9049_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_83162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCAAGTCTTGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118308	117476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_117500_118300
826578	contig_665_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_158198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTTTTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135290	133253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_133300_135300
826579	contig_9297_pilon	-	2049	10	Intergenic	novelGene_69885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	8.88194172964949	164	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	1118	2029	927198	914923	FALSE	30	TTTTAAGCATCAATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGTHQWNLATWEGLLPRYEHASFIPSCTPDSIWVFGGAHQSGNRNCLQVLNPETRTWTTPEVTSPSPSPRTFHTSSAAIGNQLYVFGGGERGAQPVQDVKLHVFDANTLTWSQPETLGKPPSPRHGHVMVAAGTKLFIHGGLAGDKFYDDLHCIDISDMKWQKLSPTGAAPTGCAAHSAVAVGKHVYIFGGLAPTGALDTMYQYHTEKQHWTLLKFDTFLPPGRLDHSMCIIPWPVTSSEEEDSNSVPLNCEVQKEDFADKGVIQVDDSQESQADILLCFVFGGMNTEGEIYDDCIVTVVD	938998	914902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_915210_915483_915634_917329_917480_920216_920379_924278_924432_927188_927348_930417_930483_933831_934296_936099_936400_938859
826581	contig_5814_pilon	-	1520	4	Intergenic	novelGene_143044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	88	402	149864	149550	TRUE	10	CGGTGCCACGACCGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPYLGRLFHLNKSWSPSATHTDLHVPRVYRSYSWTSLVFSSPAGIDAVCLEPSLLADRFSILLASLMSDLRMPSLRRAWMVGMGFMAGLSSRAKRTSLCPARK	149951	138153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_138176_144692_144769_145154_145255_148629
826582	contig_5059_pilon	+	1394	2	Intergenic	novelGene_140763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTAGCCTGGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548187	554205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_548286_552909
826583	contig_11104_pilon	-	2055	17	Intergenic	novelGene_112449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	23.0134980772155	24	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	26	2029	207211	129464	FALSE	25	AGAAGCCGTATGCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGWTEPQMPIVVICSLTCGWKCGRCDLRENLWLNLTDGSVLCGKWFFDSSGGNGHALEHYRDTGYPLAVKLGTITPDGADVYSFQEEEPVLDPHLAKHLAHFGIDMLHMHGTENGLRDNDIKPRISEWEVIQESGTKLKPMYGPGYTGLKNLGNSCYLSSVMQAIFSIPEFQRAYVGNLPRIFDYSPLDPTQDFNTQMTKLGHGLLSGQYSKPPVKSELIEQVIKEEHKPQQNGISPRMFKAFVSKSHPEFSSNRQQDAQEFFLHLVNLVERNRIGSENPSDVFRFLVEERIQCCQTRKVRYTERVDYLMQLPVAMEAATNKDELIAYELMRREAEANKRPLPELVRAKIPFSACLQAFSEPENVDDFWSSALQAKSAGVKTSRFASFPEYLVVQIKKFTFGLDWVPKKFDVSVDMPDLLDINHLRARGLQPGEEELPDISPPIVIPEDSKDRLMSQLIDPSDIDESSVMQLAEMGFPLEACRKAVYFTGNMGAEVAFNWIIVHMEEPDFAEPLTIPGYGRAASAGASAFGATGLDNQPPEEIVAIITSMGFQRNQAVQALRATNHNLERALDWIFSHPEFEEDGDFVIEMENNANANIISEAKPEGPRVKDGSGMYELFAFISHMGTSTMSGHYVCHIKKEGRWVIYNDHKVCASERPPKDLGYMYFYRRIPS	207236	129437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_129558_133450_133536_147454_147609_149387_149555_151974_152119_153229_153257_154629_154753_155729_155819_162701_162877_165798_165953_167256_167383_186523_186618_186948_187021_194651_194840_195774_195870_206102_206288_207179
826584	contig_299_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_129512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAGTGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690200	1691311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1690200_1691300
826585	scaffold_13505_pilon	-	480	3	Intergenic	novelGene_111463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	7	2309	junction_1	459	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	226	441	541982	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVWGVSAYSTFARLHPQYLRFSLWQGSCVPVTEALSLSLPHLWRGCQRRVLTSPCPAPASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	542207	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848
826586	contig_3081_pilon	+	1328	3	Intergenic	novelGene_133915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	14	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCCAACAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158617	164956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158642_158754_158811_163708
826587	SIRV6	+	438	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-91	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2381	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2815_3106_3165_10724
826590	contig_8453_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_125099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGTCATAAGTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18046	16780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_16800_18000
826591	contig_2596_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_53449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTTAACAACCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32910	34754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_32900_34800
826592	contig_8814_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_167752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201948	200523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_200500_201900
826594	contig_7333_pilon	-	1389	2	Intergenic	novelGene_142764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAGAAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165821	163083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_163864_165212
826596	contig_8322_pilon	+	907	6	Intergenic	novelGene_143258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	36	junction_1	31.7830143315577	381	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	6	539	308431	310443	TRUE	20	TATCATCTGAGTGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAVGTGAALAFLSQESRARAGGIGGLRVPAPVTMDSFFFGCELSGHTRSFTFKVEEEDDAEHVLALTMLCLTEGAKDECNVVEVVARNHDHQEIAVPVANLKLSCQPMLSLDDFQLQPPVTFRLKSGSGPVRITGRHQIVTISNDVSEEEESEEEDSEEEEAELCPVLPAKKQGGRP	308425	310904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_308549_308892_308979_309209_309330_309814_309909_310327_310453_310545
826597	contig_11989_pilon	-	1287	3	Intergenic	novelGene_68452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1144	junction_1	68	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76607	70435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_71370_74969_75075_76359
826599	contig_18404_pilon	-	1050	3	Intergenic	novelGene_173053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	23	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	495	1004	14257	5939	FALSE	35	TGAACAAATTCTGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKTNFFATRNVCTELLPVIKPHGRVVNISSLEGLKALDNCSEDLQERFRCEMLTEEDLVDLMKKFVEDTKNEVHEREGWPSSAYGVSKLGVMVLSRIQARNLDEKRKGDRILLNTCCPSWVMTYMAEDYSSRAAEEVVETPVYLALLPPDATEPHGQMVWDKVVQIW	16262	5892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18404_pilon_-_6376_14184_14293_15803
826603	contig_7887_pilon	-	1105	8	Intergenic	novelGene_124896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_3	54.5134321586367	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	25	978	346236	341708	FALSE	20	TCAGACGTTCTCTCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPMELFCWSGGWGLPSVDLDSLTVLTYARFTGAPLKVHKISNPWRSPSGTLPALRTSHGEVISTPHKIITHLQKEKYNADYDLSARQRADTLAFMSLVEEKLLPVVIHTFWVDAKNYVEVTRKWYAEAMPFPLNFFLPGRMQRQYMERLQLLCGEHRLENEEELEKELYREARECLTLLSQRLGSQKFFFGDAPASLDAFVFSYLALLLQAKLPSGKLQAHLQGQHSLSAYCSHILSLYFPWEGAEVPPPRPTPAGPDADEEPYRRRNQILSVLVGLAAMVGYALLSGIVSIQRATPARAPGTRALSMAEEDEEE	346260	341580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_341923_342017_342173_342612_342690_342814_342998_343143_343237_344727_344808_344939_345010_346155
826604	contig_10618_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_170044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAACCCAGAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168714	169917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_+_168700_169900
826605	contig_7158_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_163735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTTACTAAACTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168680	1169991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1168700_1170000
826606	contig_10982_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_87865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCGGCAAAAGCAACCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88735	89740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_88700_89700
826608	contig_3818_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_99253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	906	1223	474978	474661	NA	25	GCTCAAGTCAGTTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQKAAMTRRSSTVWGFMQKSVAGRTKSTNSGYSSLHPGRGLSLLLPSLQQRWNNLPSSSQEARPLVPQASRPLLFPTKFTEVEESTLQLPRSPTTLTINWAC	475883	474186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_474200_475900
826609	contig_2438_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_112001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAACCATGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195853	196109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_195900_196100
826611	contig_5836_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_106283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCATTGTTGTGAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108299	107293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_107300_108300
826612	contig_9995_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_47784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTTTTTCTTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753783	752912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_752900_753800
826613	contig_15449_pilon	-	1236	3	Intergenic	novelGene_33612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCAGATTCAGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55613	51204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_51324_51857_51930_54568
826614	contig_10494_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_102141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	440	943	386139	386642	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGEGADLHQICAGLTESADPHVQASLGVHRPHWVCRPHWMCADLTGCVQTLTRCVQASPGAQASLGVHRPHWVCAGLTSVQTLTRVCRPSPGVQTLTRCVDPYWVCRPSPGVQILNGYAGFTGCVQAPPDVCRTLFMCTGLTKYAGFARCVQASPADLGLVLAHEE	385699	388091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_385700_388100
826615	contig_7070_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_104048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142583	141884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_141900_142600
826617	contig_12090_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_80491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGATTGAACTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133930	133016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_133000_133900
826619	contig_3832_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_161430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCAAGTTAGTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73778	75342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_73800_75300
826620	contig_3529_pilon	+	1618	5	Intergenic	novelGene_105376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	8.0156097709407	54	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	642	1220	745173	751006	FALSE	20	CTCCAGGGTATGACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMDEKVKESFVLDTASAICNYDAHYKDYPKYWCRGYFRDYCNIIAFTPNSTGRVALRDTGNQLIVTVSCLTKEDTGWYWCGIQRDFARDDMDFTELVVTDNRGALTDDFSSEKDLLGNKNRSCRASKVVQKADRSRMSILIICTLITALGIISIVSHYLTKRRRSQRNRRGKVLTRSSKNSQASSVIPTPL	744531	751404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_745516_747999_748067_748785_748890_749371_749434_751003
826621	contig_11507_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_103358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATAGTGAGATGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88176	87214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_87200_88200
826622	contig_12638_pilon	+	1006	10	Intergenic	novelGene_33188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	197.706728811348	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	98	778	269821	274237	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKSDPLCVLLQDVGGGNWTEIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALTGVLLQGPRLGPIQATSTPG	269302	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_269367_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271246_274173
826624	contig_9609_pilon	-	1176	6	Intergenic	novelGene_23079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTCAGGTAACTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456260	453023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_453141_453643_453775_453860_454031_454436_454633_455281_455388_455804
826625	contig_1443_pilon	+	1060	2	Intergenic	novelGene_28396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	132	545	1176594	1177007	FALSE	10	TATTACGCTTTCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSADYSRLDTGDAVPVSWSSAADVGNFPSLRFLDNGRKRVLLMMMCFQECCPGNSVCLLIGTVGQDIQQPTELTAMEGNFVQVNCTYQTSGFNGLFWYQQSDGGAPTFLSYNVLDGLEKRGHFSSFLSLSSASSYLLLTELQMNDSARYLCAVRDTVTMKPLQLHQIQKVTTVVRSDIS	1175892	1177522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_1176008_1176577
826626	contig_6076_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_81765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTCATGACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410898	409269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_409300_410900
826627	contig_4103_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_52008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	129	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	131	493	271588	271950	NA	55	CTGAATTAGTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGKTESGHLGGQSKQKSEYGAAKRLGFGEWGQGNREKEKHREGLPNIYIKFSSDTRATPELSMPKMRLQDVKQRIAAERLETSGIQAQPELRYFGEYPRLSVEMVEGHAKRVRTTPEE	271457	273614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_271500_273600
826628	contig_14338_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_174831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	527	901	16428	16054	NA	45	AATTCTGAATCGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGAIFISAGSQTTVPKVRFLGPCLEFSFLHPVKSRACSLWLWMSMEGEVRSELHPVHPQFCPRCGAIPYMPSAAAAVEVPPEICLDKESCSLGHPPSFQVMGCQQQHVITEWNDASPPKTLVS	16954	15202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_15200_17000
826629	contig_12019_pilon	+	572	2	Intergenic	novelGene_87754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	272	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	33	419	635765	636236	FALSE	60	TTAAAAACTAAAACTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVRGQGMGWKTS	635732	636389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_635969_636053
826631	contig_13607_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_170195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287776	289288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_287800_289300
826632	contig_2453_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_147768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	366	1911	2276	61857	62222	NA	20	AGGCCCAGAGTGGTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDLSNKGFEPLFSRYLDYTRVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKVLKFACKVIGELPELGISRAWSVPGWDRMCVCKTACSSYMNIVKPLFMCQTLCQTLYLNHLIFNKLTIGIIADQKT	59946	62223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2453_pilon_+_59900_62200
826637	contig_8075_pilon	+	1253	10	Intergenic	novelGene_42504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	354.95063123945	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	103	906	719960	793320	TRUE	45	ATTAAAATTTGACAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQV	719857	795107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780633_780756_781906_781963_782969_783123_785918_786070_793318_793386_794825
826638	contig_4519_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_123720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACACCAAATGTGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686327	687860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_686300_687900
826640	contig_15236_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_141561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCTCCACTAAATTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344762	344260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_344300_344800
826641	contig_9014_pilon	-	854	4	Intergenic	novelGene_106815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	40.8982477212248	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTTTATTTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155565	152465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_152663_152746_153048_154044_154076_155240
826642	contig_5084_pilon	+	874	4	Intergenic	novelGene_64498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13.9124245031395	100	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	316716	318549	TRUE	25	TTTTAATCTGGGAATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPLQRRFSVTLRLALFGEHVGALRALGLPLSQLPVALECYTGPPEDNLALLQLYFRALLTGALCPRWCPVLYAVAVAHVNSFIFSQDPKCSPSATSPCSASRTR	316715	319206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_316815_318245_318423_318507_318600_318700
826644	contig_9468_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_59486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAGTTTCTATAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272632	273618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_272600_273600
826645	contig_12837_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_57363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAATCAACTAGTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275066	274116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_274100_275100
826646	SIRV6	+	380	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	399	94	233	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826647	contig_19352_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_122390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTAAGACAGTATACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177259	178396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_177300_178400
826648	contig_10746_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_176817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACACAGCAAGGTGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176188	177910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_+_176200_177900
826650	contig_3956_pilon	+	2052	2	Intergenic	novelGene_15290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGTACACATATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410208	1424734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1410281_1422754
826654	contig_9919_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_138003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAGTTGAAATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884832	885383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_884800_885400
826655	contig_6048_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_73152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTCTGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060540	1060973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1060500_1061000
826656	contig_6589_pilon	-	843	7	Intergenic	novelGene_25889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	193.739014025455	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	42	695	1178015	1158634	FALSE	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTELALPHLRRSRGNIINISSLVGAIGQLQAVPYVATKGAVTAMTKALALDESQYGVRVNCISPGNIWTPLWKEFAASTPDPKATIQEGTLAQPLGRMGQPAEVGAAAVFLASEANFCTGIELFVTGGAELGYGRKASPGTSVEAPADPS	1178056	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160581_1160878_1160984_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
826659	contig_8317_pilon	-	1782	3	Intergenic	novelGene_20751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	51	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	89	673	325572	324071	FALSE	35	CACACCAAGTGAAGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEGDPMQLGDPVQQGDPVQPGDPVQQGGAVQRRSRREGFPLREGMPFVHLPHWGRFKHFLKPLVLHVEACLLEKIFGPSKVLLPGFEREFKVLLQVGEPDSDGKVEILISGRHWYRKRAKRLIHILAGRSRRKQCGGTAMLGLESMKSLETEDPQSSAFLSVEVMSSLDKAMQSLEIGRETLGEPVAKTVGSF	325660	322961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_324244_324976_325157_325340
826660	contig_6589_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_25953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGAGCTTTGGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296029	1295304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1295300_1296000
826665	contig_14275_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_162874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGGATGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426052	428078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_426100_428100
826666	contig_2236_pilon	-	1185	8	Intergenic	novelGene_98683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGCGCCGAAGTACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58299	41189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_-_41221_43192_43241_49200_49321_50576_50662_52492_52604_53479_53550_54642_54783_57719
826667	contig_10095_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_57226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTAAAGAAGCAAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174406	173748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_173700_174400
826668	contig_10095_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_57225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAACAATAAGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173246	172097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_172100_173200
826669	contig_7408_pilon	-	1537	7	Intergenic	novelGene_168743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.29770701702	1	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	488	1417	26987	12597	FALSE	40	CATTGATTTGGACGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNRLSGNGFFNFPSQKLGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	47268	12476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24292_24445_26364_26456_26932_27154_36880_36938_38375_38596_47224
826670	contig_14973_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_171225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCCCCTTGGAGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194118	195898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_194100_195900
826671	contig_5684_pilon	-	602	3	Intergenic	novelGene_81015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3156	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGTGAACTCGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361516	351253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351565_351605_351696_361315
826676	contig_19848_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_173814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAGAAAGTCTCCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26068	27035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_26100_27000
826677	SIRV6	+	378	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	585	164	5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTTATAGTTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
826680	contig_8447_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_69450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAGAGTAAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168584	170131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_168600_170100
826681	contig_12644_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_44533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACAACCACCCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1437971	1438872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1438000_1438900
826682	contig_12644_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_44534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCATTACTTTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439673	1440530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1439700_1440500
826683	contig_11056_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_130370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTCAGGTAGGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306626	305387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_305400_306600
826684	contig_3602_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_60556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAACTGAATAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462008	462752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_462000_462800
826685	contig_11061_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_173340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCAATATCCCCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17090	16176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_-_16200_17100
826687	contig_6710_pilon	-	431	2	Intergenic	novelGene_98221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	20	TCTGGCCCCTTCCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
826688	contig_6031_pilon	-	1054	4	Intergenic	novelGene_56741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.94392028877595	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	65	349	207906	207622	TRUE	35	TTATGCCTAAAACATGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSLLSPVQGEAEPLQGGARSMSPMDAEQVRSQEQFWGAPEVIHDRGGPSAGSRAGQPRASRLRNPGVTNKLFFLLGRSSHSTPLVRTDSPSYQAQDPTGEFATLRERCSARQFF	207970	205667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_205995_206317_206442_206951_207077_207492
826689	contig_2074_pilon	-	1352	3	Intergenic	novelGene_155332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	103	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	350	1258	138653	131296	FALSE	15	CTTGGGCTTTGTGAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAWLWLLGAAVLASVHCQPFPAHGDKSLEVPQAPSDQLSEPAPAYHKITPTITNFALRLYKQLAADIPRNIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSTQILEGLGFNLTETPEADLHHSFQSLLHTLDLPSPKLELKVGNSLFLDKQLKPQQWFLDSIKELYGALAFSANFTDSAGTARNINEYVRKRTYGQVSDCLQEFSQDTLMVLLNYIFFKGVAQGGGGHEREGDRSWGCLRPPFPASVSERNSSSSCSFQQAFSAAHLGRDHPELTLPGKSRQPSRRVTIVGGQGHLISVPRSGPPSP	145208	131201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2074_pilon_-_131562_138010_138657_144862
826691	contig_4125_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_25165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTGAAAAAAGAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916327	915613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_915600_916300
826692	contig_299_pilon	+	2481	4	Intergenic	novelGene_129518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	138.710730178551	4	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1256	1624	1715628	1728427	FALSE	5	GCCCCTCCCCGCCTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIGGFFNPCSTYEKFSPFADTFKNRVSKNTFFVLVRVVDELCLVELTEEILKLLMELVFRLVCNGELSLARVLRKNILDKVAQKKLLKCANSDQPLAARGVAARPGTLHDFHSHEIAEQLC	1714372	1729284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1715756_1716566_1716753_1717716_1717763_1728418
826694	contig_14559_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_83723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTAAAAAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272991	271641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_271600_273000
826695	contig_20614_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_107512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTCTTTAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3396	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_2500_3400
826697	contig_10082_pilon	+	2275	2	Intergenic	novelGene_63841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTCCGTGGGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53043	57162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_53740_55583
826698	contig_7378_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_120269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGGGGGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508449	510757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_508400_510800
826701	contig_17108_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_109540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGATTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159316	160020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_159300_160000
826704	contig_10197_pilon	-	957	2	Intergenic	novelGene_115328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642631	1641084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1641660_1642249
826706	contig_10494_pilon	-	614	5	Intergenic	novelGene_102160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_2	977.673098484355	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	47	553	912923	903512	FALSE	0	TGGCGGGGCGTGGGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQIEWAMWANEQALASGLILITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERWLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLAAIRGEQWTPIEQKPQERPQVGGTIKQPPSNPPPRPPAEARKKPSEEKEEDTAAGGSPGGAQTNPLPVTDEVV	912969	903450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_903734_906373_906456_907637_907713_908356_908427_912865
826707	contig_10753_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_105156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATTATTAAGAAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401742	402187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_401700_402200
826708	contig_1452_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_115117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAGAAAAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22744	24370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_22700_24400
826710	contig_6612_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_148155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTATTGAGTTTTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15810	13873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_14827_14875
826712	contig_7707_pilon	-	536	4	Intergenic	novelGene_72203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCGCCTCGGGGCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710936	688674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_688754_700558_700623_709517_709646_710671
826713	contig_10042_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_79214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGGTAGTATTTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065464	1066159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1065500_1066200
826715	contig_5278_pilon	+	1253	4	Intergenic	novelGene_139773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.6118725934355	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTCAGTGTTTTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191785	208760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_191845_194694_194887_201964_202104_207897
826716	contig_15371_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_151447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGACTGGGCTGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154417	154023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_154000_154400
826723	contig_2161_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_114922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828227	828843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_828200_828800
826726	contig_8050_pilon	-	910	8	Intergenic	novelGene_114873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	600	908	438618	436364	FALSE	30	ATTGATGACCAGGAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLENEKIFVPHPPHIMFFSVEFMDSLKHISGVLTFPIFSIFKGATPLHLTALSSKIAKFPSAVPTKRKFFCLLCLENELQYKQVTESVIFSSVCLLFPSS	454903	436361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_436446_437188_437261_438463_438650_442581_442739_443737_443945_445953_446024_446850_446927_454845
826727	contig_4531_pilon	+	1481	4	Intergenic	novelGene_47866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_1	306.937561511567	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	171	746	179122	180503	FALSE	30	ATGCTTATGACAACTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAALGLERAHMGMFTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFSKVKQLSLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQVKFWFLHIFSKLRL	178951	181238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_179260_179392_179543_179789_179922_180347
826728	contig_2332_pilon	-	1696	14	Intergenic	novelGene_58695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	10.9754971851638	36	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	288	1277	587806	561299	TRUE	25	TTGTTGACTAGATATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLYEKGLYYDKAASVYIRCKNWAKVGELLSHVSSPKIHLQYAKAKEADGRYKEAVVAYENAKQWNSVIRIYLDHLNNPEKAVSIVRETQSLDGAKMVARFFLQLGDYGSAIQFLVMSKCNNEAFTLAQQHNKMEIYADIIGSEDTTNEDYQSIALYFEGEKRHFQAGRFFLLCGQYSRALKHFLKCPSSEDNMAIEMAIETVGQAKDELLTSQLIDHLMGESDGMPKDAKYLFRLYMALKQYREAGRTAIIIAREEQSSGNYRNAHDVLFSMYAELKSQKIKIPSEMATNLMILHSYILVKIHVKNGDHMKGARMLIRVANNISKFPSHIVPILTSTVIECHRAGLKNSAFSFAAMLMRPEYRNKIDAKYKKKIEAMVRRPDTSEIEEATTPCPFCEFLLPECELLCPGCKNNIPYCIVTHVEH	590196	545446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_545756_561188_561314_562643_562768_564939_565091_567034_567117_570248_570374_572112_572210_573802_573881_582824_582894_585090_585204_587346_587472_587795_587943_589397_589482_590129
826730	contig_9646_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_117473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAAGTACAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387007	388353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_387000_388400
826731	contig_17521_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_176820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	558	968	5871	6281	NA	15	GGACTCTGGAGTGTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMQCEHLLSKIFIHDLSERGTLEEILRYPWMMVGHEGEEQKLYVEPLPDYNDAQWIEVMVHMCCTWEEIQYSLLIPKYNDVMATYLLLGHKTSETEGHTSTLGHQPSMDLHPMRYNIPSVLTQAEELHRACHSHL	5313	6595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17521_pilon_+_5300_6600
826732	contig_6557_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_32999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCCAGTAGCTGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495703	494376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_494400_495700
826733	contig_14357_pilon	+	2010	2	Intergenic	novelGene_121646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTAACAAAAAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56492	58625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_57358_57480
826735	contig_13460_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_162191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291760	290715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_290700_291800
826736	contig_12270_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_113842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
826737	contig_3956_pilon	+	1162	4	Intergenic	novelGene_15288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	23.6267268622258	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	116	691	1314987	1315967	TRUE	5	CACCGGTGTTCCTGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAIKRRNVRNEESGRKPERRRLKTTRLKEYTIKSHSSMPPNNTYINFERFSKVLEEVAAAEEGLRELEHSKRLFREDIEALTAIYEEKEAWYKEENESIGQDLRRLRQELHKAEALKRQAQEEAKGALLGASGLKRRFSRLENRYEALAKQVASEMHFVQELVRTLELEKLQAGECGLR	1314147	1317320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1314256_1314979_1315026_1315430_1315983_1316864
826738	contig_12837_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_57380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	230	313	376618	376701	NA	40	TATATTTTTAGTAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILTLQVVFSQGPWEDLQVQENSLFRKVGFHPGWVILPRLRQRLTFFFRVKGDGRGYGPAGDINRVKSNENSQICQVMCYLVVVHKSFRRSRTQSESIIKYTQT	376388	376952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_376400_377000
826739	contig_15777_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_75748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAGCCCATAGATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213032	213605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_213000_213600
826742	contig_12450_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_162326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383431	383709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_383400_383700
826744	SIRV6	+	336	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	22	19	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
826745	contig_10399_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_114473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	16	300	86478	86194	NA	20	TCAAACTGCATTTTGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGVWAMICSFSICLEPLRKGVDKKASREEAKASGWLPCFTSSSLGSRWPRVLATSFPEVPEARWRPLITSPMWPCLGAPDPDSPLPRTQEGGCLAGTLS	86493	85333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_85300_86500
826746	contig_5499_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_56987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAAGAGAAAAAAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778151	780383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_778200_780400
826749	contig_7412_pilon	-	750	4	Intergenic	novelGene_76281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_3	87.2327665247157	1333	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTGAGTAATAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270950	268954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_269135_270160_270292_270432_270579_270657
826750	contig_6589_pilon	+	927	4	Intergenic	novelGene_25826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.0752955856608	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGGTTTGCGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819993	825382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_820421_824102_824183_824588_824744_825117
826752	contig_2940_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_81976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091756	1093247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1091800_1093200
826754	contig_12046_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_83483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACAGCAGCTGGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399915	398314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_398300_399900
826755	contig_12046_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_83482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATAAAAATGATATAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398363	398068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_398100_398400
826756	contig_5429_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_127828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCACTTGAGAAGGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610203	729689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_610305_647165_647333_729551
826757	contig_11316_pilon	+	280	2	Intergenic	novelGene_122693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAACCACCTTCTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139822	140503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140039_140439
826758	contig_13051_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_140117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGGGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335349	335808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_335300_335800
826759	contig_7744_pilon	+	2105	10	Intergenic	novelGene_62461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	24.6260927563518	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	177	1556	418838	422630	TRUE	20	AATCTGCAACCTCTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGGASAPTSSIASSPDYEFNVWTRPDCAETEFENGNRSWFYFSVRGGTPGKLIKINIMNMNKQSKLYSQGMAPFVRTMPTRPRWERIRDRPTFEMTETQFVLSFVHRFVEGRGATTFFAFCYPFSYSDCQDLLNQLDQRFLENHPTHSSPLDTIYYHREVLCYSLDGLRVDLLTVSSCHGLREDREPRLEQLFPDTSTPRPFRFIGKRIFFLSSRVHPGETPSSFVFNGFLDFILRPDDPRAQTLRRLFVFKLIPMLNPDGVVRGHYRTDSRGVNLNRQYLKPDAVLHPAIYGAKAVLLYHHVHSRLNSQSLSEHQHSPHLSPDAPLSDLEKANNLQNEAHLDGENPETWKQTEIAEQKPSSMWIIPQQSTEVEEPAPETIPPKESGVAYYVDLHGHASKRGCFMYGNSFSDESTQVENMLYPKLISLNSAHFDFQGCNFSEKNMYARDRRDGQSKEGSGRVAIYKASGIIHSYTLECNYNTGRSVNSIPAACHDNGRASPPSPAGFPLQIYCGII	418416	425421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_418532_418776_418949_419275_419440_420012_420191_420460_420640_421065_421511_421988_422159_422497_422635_423281_423485_425079
826760	contig_10235_pilon	-	787	4	Intergenic	novelGene_46623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.3536555146996	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGAAGGCTAGTGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609675	608526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_608795_608878_608941_608994_609314_609537
826763	contig_9471_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_21748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGATTTTGATTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303439	305014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_303400_305000
826767	contig_5947_pilon	+	1538	8	Intergenic	novelGene_101471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_6	48.6847417743245	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	21	1055	71645	91302	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNTYIFMMQAQGILIRDNMRTIGAQVYEQVVRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFANRTCPERLPSMKGPIDINMSEIAMDDIHEIFSKDPAIKLGGHWRPSDCVPRWKVAILIPFRNRHEHLPVLLRHLIPMLQRQRLRFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCLIFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFAAKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFPNAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPHHHRGEVQFLGRYALLRKSKERQGLDGLNNLNYFANITYDALYKNITVNLTPELALVTEY	71624	91785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_71763_80151_80266_81258_81384_82212_82330_83053_83242_84286_84410_90148_90251_91154
826769	contig_10437_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_38466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	32	322	1118941	1119231	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFHPARGRGHMHMNGKIVKGWRRKLECFLKGLRVYLNVLWIWGALVAQWLKSSAANQKVGSLNPPATPWKLWGSSALSYRAAMIWNQLDGSGLWVMDMECLSYLVV	1118909	1119525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1118900_1119500
826770	contig_17796_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_33847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCCATGGTTGGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191743	193334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_191700_193300
826772	SIRV6	+	310	5	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	14	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGTCGAAGTTGTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	10749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_3075_3165_10724
826774	SIRV4	-	503	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	104	10	104	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5054	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
826775	contig_9332_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_60724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTGTATCGAGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168476	168727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_168500_168700
826776	contig_19769_pilon	+	789	6	Intergenic	novelGene_102270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1773.96020248482	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	34	561	87249	88883	TRUE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVPPLFQVWWLVVAALTSPS	86996	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88009_88823_88937_89180
826779	contig_4151_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_65302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAATAATGCGATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799736	799436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_799400_799700
826782	contig_1996_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_131870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACCAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105184	103870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_103900_105200
826783	contig_20175_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_142464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGCCCCTCTTTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122035	121041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_-_121000_122000
826784	contig_20175_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_142463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTCTTGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119770	119380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_-_119400_119800
826787	contig_3679_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_112115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCAAAAACAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658409	656915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_656900_658400
826789	SIRV6	+	459	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	24	2	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	161	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
826790	contig_665_pilon	-	2465	1	Intergenic	novelGene_158209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTTAGGAGTGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249833	247368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_247400_249800
826791	contig_18967_pilon	-	725	2	Intergenic	novelGene_165314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	99	494	35397	35002	FALSE	25	AATATGGGCCTCATGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRGVGASSFPPAPARDAHPCAKAAVAGKARAMQTPLTIPVPVLRLPRGPDGSSRGFAPDGRRALLKPEVPEIQESPVVQESLESQEQRARAILRERYLRSLLAMAGRQVSFTLHEGVHVTAHFGATDLDVANFYVSQLQTPIGVQAEALLRCSDIIAYTFKP	39801	34770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_35406_39711
826792	contig_8322_pilon	+	1297	9	Intergenic	novelGene_143262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	82.1522024963421	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	91	969	409542	484065	TRUE	10	GATCTGGTTCCTGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVKERVKVSQNWRLGRCREGILLKWRCSQMPWMQLEGDSLYISQANFILAYQFRPDGASLSRRPLGVFAGHDEDVCHFVLANSHIISAGGDGKIGVHKIHSTFTVKYSAHEQEVNCVDCKGGIIVSGSRDRTAKVWPLASGRLGQCLHTIQTEDRVWSIAISPLLSSFVTGTACCGHFSPLRIWDLNSGQLMTHLGSDFPPGAGVLDVMYETPSTLLSCGYDTYVRYWDLRTSVRKCVMEWEEPHDSTLYCLQTDGNHLLATGSSYYGVVRLWDRRQRACLHAFPLTSTPLSSPVYCLRFTTKHLYAALSYNLHVLDFQNP	407136	484687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_407223_409537_409724_410199_410333_415561_415657_466372_466439_482911_483053_483599_483742_483945_484069_484362
826793	contig_6494_pilon	-	660	6	Intergenic	novelGene_108563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1003.29836040931	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	27	632	8286	2133	FALSE	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGEQLGMLRGLLGNWIWSLDVAL	8312	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_3274_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
826794	SIRV6	-	337	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-5360	-171	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAGACGAACCTTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7907	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2826_3101_3164_7808
826795	contig_7171_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_101213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATACTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198122	198628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_198100_198600
826796	contig_1244_pilon	+	1199	8	Intergenic	novelGene_37923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	55.9916174484163	269	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	242	907	304789	307713	FALSE	5	GTTCTGGATTGTGTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLCCDSPAAPGPAAIREGWFRETCPLWPGQALSLQVEQLLHHQRSQYQDILVFRSKSYGNVLVLDGVIQCTERDEFSYQEMIANLPLCSHPNPRKVLIIGGGDGGVLREVVKHPSVEAVVQCEIDEDVIQVSKKFLPGMAVGYSSSKLTLHVGDGFEFMKQNQDAFDVIITDSSDPMGPAESLFKESYYQLMKTALKEDGILCCQGECQWLHLDLIKEMRQFCKSLFPVVAYAYCTIPTYPSGQIGFMLCSKNPSTNFREPLQQLTETQVEQRQLKYYNSDVHRAAFVLPEFARKALNDMS	304023	308005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_304189_304712_304834_305313_305407_306314_306469_307040_307125_307235_307382_307471_307595_307692
826798	contig_12050_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_62630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAATAAAATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346621	347473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_346600_347500
826800	contig_5815_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_141185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	902	1201	186424	186723	NA	65	TAAAAAAAAAAACTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVRVYFVFFIVLFYFTLHLNVEARLCSFLLATGPMTPNCVNASDIYWVRAWLQTKRSAVRIYQALLGNPMRQFYSVLQGRYESESTQWQRVFNGLLGP	185522	186999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_185500_187000
826804	contig_2646_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_69499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGTGAAATAAGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271158	269405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_269400_271200
826805	contig_11269_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_145816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTGAAACCTGTCCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304204	306382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_304200_306400
826806	contig_15042_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_115441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTACATACATACAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57715	59357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_+_57700_59400
826807	contig_6885_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_83689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGAGGAAAGCCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258374	260224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_258400_260200
826810	contig_3077_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_26842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649388	648654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_648700_649400
826811	SIRV6	+	309	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	57	11	-25	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGAACTTTGAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3080	11259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
826812	contig_3975_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_54700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	777	1145	1137262	1137630	NA	10	CGCATCCCCCGGCGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGRSTQREEAQNPGIATPHPQTISLAPPLRQDPWRLQACTKPRAHHWAFTTTCHLWGSGGPPGLGRGFPTANRQAHLPQGSRGHASAKCKILAYNGARPPMKESGPPPTHSSERSTLQG	1136485	1137854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1136500_1137900
826813	contig_614_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_132656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTCAGAAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079770	1078285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1078300_1079800
826815	contig_8636_pilon	-	941	6	Intergenic	novelGene_141939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	37.2214991637897	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACGGCCAGTGTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469094	458322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_458698_459739_459942_461427_461492_461996_462084_468602_468734_469012
826816	contig_6589_pilon	+	1140	6	Intergenic	novelGene_26180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	42.4499705535822	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	13	774	1901836	1912550	TRUE	20	TGAATTGATTGTGTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLRMRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNCDSSGTVWQPALGRVTRAPMATAPSMPGHHYKSKVVTNTTTAASCSTRGWRSPSRWSWNHQPGPRYLWLGSSSASCCSRRQ	1901823	1913573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901909_1903195_1903448_1903648_1903839_1911443_1911619_1912478_1912596_1913252
826818	SIRV6	+	297	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	-236	-6	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3163_7805_7924_10727
826819	contig_13004_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_112656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGGATTGCTCAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538240	537490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_537500_538200
826820	contig_567_pilon	+	518	5	Intergenic	novelGene_33994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	174.75608000868	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGATGCTGTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443142	458814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_443237_444625_444705_452579_452651_455775_455862_458626
826821	contig_7870_pilon	+	2629	1	Intergenic	novelGene_108959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346773	349402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_346800_349400
826824	contig_5013_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_110087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCTGAATTTGAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174679	173833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_173800_174700
826825	contig_8284_pilon	+	2327	2	Intergenic	novelGene_125687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371111	374916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_372197_373674
826826	contig_16503_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_162069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	204	320	97292	97176	NA	35	CAGTATTTCAGCCTACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSFPCACCVPGLVPGTKDTETGQSFSGGLVETLHAPPNSDQRGTSSGKQAQGKEGEEEDGVQERRGMLAKSAADVETYFPLRKLRVMLERPSHPQEELGPHSRK	97495	96867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_96900_97500
826827	contig_16503_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_162068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	507	377	883	96337	95831	NA	25	AGAGCTAACTCCTGACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHWQSRRRSPERRRNLSKVTQKSSVTLGTNSENQSTGLSPALSCLSMSAQSESAVDRKTMVLGNPGGESGTRQPPRQVNWLLWLAASSQGGMGARKEGSSTYPLAHVYLLGFPPNSSDPGLEEGKLVGRAAPAEIKQAPWPPQPLPCPILQRGGEAKRLGLFPPFPFL	96713	95828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_95800_96700
826828	contig_6673_pilon	-	868	5	Intergenic	novelGene_164004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.67467578644874	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	443	817	7932	5486	FALSE	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160249	5434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_7923_8133_11111_11199_56429_56515_160179
826829	contig_1435_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_115480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGCTGCCATGATAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353273	354036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_353300_354000
826831	contig_5732_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_119587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259147	257384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_257400_259100
826832	SIRV6	+	411	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	353	3	187	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
826833	SIRV7	+	290	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAATGCGATAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56033	78964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70989_78843
826834	contig_13097_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_107732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCTCCGATTTATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242548	244077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_242500_244100
826835	contig_4202_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_147077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAGCAGTGTTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228221	229803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_228200_229800
826837	contig_13760_pilon	-	828	3	Intergenic	novelGene_61351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTGTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355726	352847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_355293_355384_355695
826838	contig_1406_pilon	-	1499	2	Intergenic	novelGene_25560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCATTACCTAGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2141411	2138925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2139992_2140978
826839	contig_7272_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_25309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451871	452645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_451900_452600
826840	contig_9571_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_136258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTATAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320430	318648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_318600_320400
826841	contig_3252_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_61485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCCAGATTAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221336	219143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_219100_221300
826842	contig_11564_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_158572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGCAATAGAAGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67716	67269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_67300_67700
826843	contig_4783_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_108401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACACTGGCTTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272780	274030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_272800_274000
826844	contig_11056_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_130352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	25	327	34605	34907	NA	35	CAAAAATGTACTAGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEECAEEYMDKRMVPGKAEALEAQSIMEDEGLKMGIGCNSVFRSLGPLTYPCSSLPHTHASLSCRSPSHYHLHSSQRRLEVYSLENWTKDALQSGTPDTVKTGFKKQD	34580	35968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_34600_36000
826845	contig_14725_pilon	+	1265	8	Intergenic	novelGene_173605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAGTGGGACAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430833	460308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14725_pilon_+_430972_433951_434155_436381_436542_440332_440388_448417_448507_449808_449980_456934_457093_460017
826846	contig_10864_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_107113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCCTTCCAAACCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113311	1111299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1111300_1113300
826847	contig_3727_pilon	-	404	5	Intergenic	novelGene_146734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAAGAACACAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307455	300431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_300503_301350_301437_302615_302661_303621_303705_307336
826848	contig_7919_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_28128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCTTTTTTGGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488323	1486617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1486600_1488300
826850	contig_9303_pilon	+	3145	10	Intergenic	novelGene_176821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	310	726	24374	25851	TRUE	35	TTGATTTGCGCAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVLLNRLRQQETNSVVFSGKLKLKAFSKMCWQLMSTGEPESTPATQAVMKQAMVPAIRALTAPEVMSRFLEGAMDAGKHGSKCERLLIRIPCLWDVRSAEKLKVQKLSDQLHIQRGFLVWKIHIQKHRGLHSPKKT	24064	42397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9303_pilon_+_24389_25208_25326_25566_26419_31649_31847_32244_32414_33971_34102_35430_35559_37644_37726_39343_39429_41335
826854	contig_5039_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_64968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAGCACACATGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661884	1673150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1662352_1663443_1663560_1670573_1670761_1670976_1671124_1673047
826855	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_93537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
826856	scaffold_4805_pilon	+	1431	5	Intergenic	novelGene_161037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	758	1363	546275	550619	FALSE	15	GCACAGGGAGCTCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSRFLRNGKKEDALACQINLDKTVQPSIRSNTLGCIKCSASAGSDLRQSQPLRSQRSSQSPGREHRMFRRRLQREAGRVRRTPGRHAQLYLPVPVSQSYNSLMPNLGVMVNSLVFFVNINRLYYWQSIFVKSYSCKAIPYNEGNVKDVFYCTGKRMWINHKVKEGHGRIRIFLKIGLQQSQDSFYFFFCCFLMRFFHSF	545517	551404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_546648_548099_548146_549366_549463_550528_550620_551336
826857	contig_804_pilon	-	1450	8	Intergenic	novelGene_138789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_3	59.0603288932562	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	114	935	204639	171754	TRUE	20	ACATTCTATCTAGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMALQPGALQLIPKRPALEKTNGATPIFNPSVFHCQQAMANLQLPQPAFIPAGPILCMAPTSSIVPMMHGATPTTVSAATTPATSVPYVATTTGNQIPQLSIDELNSSMFVSQM	204752	169029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_171736_171811_172738_172834_175918_175955_178352_178504_183049_183287_184285_184478_204585
826858	contig_16098_pilon	+	1389	10	Intergenic	novelGene_45820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.5221474988286	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	19	1215	150572	153863	FALSE	10	CTAGCTTGTGTGTCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLLRATPRFCGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTASRHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVVVYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEEAPVIVGSALCALEQRDPELGVKSVQKLLDAVDTYIPVPTRDLEKPFLLPVESIYSIPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEFLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLDRAEAGDNLGALIRGLKREDLRRGLVMAKPGSIQPHQKVEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRVILPPGKELAMPGEDLKLTLILRQPMILEKGQRFTLRDGNRTIGTGLVIDIPALTEEDKKIKWS	150553	154037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_150615_150875_150909_151339_151507_151764_151870_151959_152125_152269_152403_152490_152596_152725_152878_152983_153104_153689
826862	contig_4857_pilon	+	1348	4	Intergenic	novelGene_48848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	133	junction_3	56.1090208631573	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	43	381	1331453	1410064	FALSE	45	AACCTCTGTAAATCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDWKQLLPLSCAKISAKGSYPGQKGVF	1331410	1411031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1409988
826863	contig_11709_pilon	-	2149	2	Intergenic	novelGene_168217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCAACACTTTAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55117	52405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_54254_54816
826864	contig_11978_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_62988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	359	397	1501570	1501532	FALSE	60	TACATAGGAAAAACCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLTLPTAPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPATLPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATHPTSPTPPSTASGASTAANGGTSNCLQTQSSTSRGRKMTVNGAPAPPLT	1502516	1501384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1501910_1502497
826866	contig_9283_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_164397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACTTGAAGACGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10433	8928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_-_8900_10400
826867	contig_6076_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_81752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	946	1338	177632	178024	NA	25	TGAAGACTCTTAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKDATLLTAETTLIDEEPKHMKLGFTLLPICNPLKAACDIRHGLFQRWKSEREERWILYMQQSLKRSWTERKGSLGIHSPTRIQFVQSPLVLRFNSGSVSLYVCDLLLSSFIFSVISEFLMFDIGVTM	176686	178738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_176700_178700
826868	SIRV6	+	475	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
826871	contig_821_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_149395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154848	155302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_154800_155300
826872	contig_14814_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_137693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	595	975	92748	93128	NA	10	ACCTGTCCTCCCCACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFNICYSNTVALHISKLTMTKFLTPAFLPPSLPTNRTTIHPFVQPTKCTSILLDASIAVFQLLPKANPPQVLSIQPLASVFLITSQCHSLDPATMSEILQETYNDLSASMLAPLTHAPRSCQCRL	92153	93382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_92200_93400
826873	contig_14814_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_137694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	191	373	93684	93866	NA	20	GTGGCGCAGTGGTTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQVSHHRTDRISDNGCKTTPHSNAHLQGDLATVPLEVGSSSHHPQFGGGCPYGCAAQVNAVEVMGWALGSRSSSKKPKLAIGVKVTCRGRERCSGDPRLSQSSQLKQETAECRSPSRLHAGQR	93493	94058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_93500_94100
826875	SIRV4	-	502	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	115	0	115	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	794	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5043	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
826876	contig_9415_pilon	-	2340	14	Intergenic	novelGene_109901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	296.22197018672	1	108	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	583	2076	2127967	2102226	TRUE	35	ACATCACATTGGTGAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGSPVSPEEQDTAYWMKTPLFSDGVEMDTPQLDKCMSCLLEVALSGNEEQKPFDYKLRPEIAVYVDLALGCSKEPARSLWISMQDYAVSKDWDSATLSNESLLDTVSRFVLAALLKHTDLLGQACGESRYQPGKSLSEVYRCVYKVRSRLLACKNLELIQTRSSSRDRWISENQDSADIDPQEHSFTRTIDEEAEMEEQAERDREEGHPEPEDEEEEREHEVMTAGKIFQCFLSAREVARSRDRDRMNSGAGSGVRTDDPPPQSQQERRLSTELPEGQDVYTAACNSVIHRCALLILGVSPVIHELQKRREEGQMQQPSTSASEGGGLMARSESLTAESRLVHASPNYRLVKSRSESDLSQPESDEEGYALSGRRNVDLDLASTHRKRGPMHSQLESLSDSWARLKHSRDWLCSSYSFESDFDLTKSLGVHTLTENVVSFVSGDVGNAPGFKEPEESMSTSPQASIIAMEQQQLRASLRGTSPDPCPVVGDGGKG	2133722	2101321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2101432_2102071_2102288_2104065_2104327_2111369_2111422_2116865_2116987_2117464_2117778_2120428_2120601_2122307_2122429_2122516_2122632_2125823_2125998_2127864_2128078_2130477_2130683_2133326_2133460_2133588
826877	contig_756_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_134780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGCCCAGCCAGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195472	196694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_195500_196700
826878	contig_9460_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_155321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGGTTGGTGGAGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489546	488849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_488800_489500
826881	contig_9871_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_75639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAACTTGGCTCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355371	353864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_353900_355400
826884	contig_9415_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_109941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGCACTATCCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2466593	2465681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2465700_2466600
826886	contig_709_pilon	+	1223	11	Intergenic	novelGene_57537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	50.2712641575682	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	213	1010	1506140	1526933	TRUE	25	CACATGTGCACGACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEAWKKSLKEKWNAKPAYVVGSATASLVRKIGLETEGEKCGNAEKLAEYICSRESPSLPLLFPCGTLKGEILPKMLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1498430	1527236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1498617_1506113_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511942_1512018_1515791_1515867_1520268_1520350_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795_1527085_1527174
826888	contig_4125_pilon	-	1049	5	Intergenic	novelGene_25053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	12.8135670287395	294	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	149	679	333386	331722	FALSE	10	CCTGCATGGATGTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARAAWCGVVLLCALGLGQGPAEEQSCGPGRFSRGTESNARCCRTCTPSMEVCPEQDCTCVQPEFHCGDPRCDSCKHHPCPPGQEARPQGTFTFGFECVDCAPGTFSEGHDGHCKPSADCSRLGFHTVFPGNRTHNAMCSLEPPAVPCQPLILALLTMATCVLILATAQLGLHFWKLRRACMWHQGTQLPLDAPMAEDTCSCQFPEEELGGRLVEEKVPLEDQPV	334336	331351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_331844_331907_332108_332320_332409_333265_333389_334190
826891	contig_5939_pilon	-	1339	3	Intergenic	novelGene_176252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	3.5	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	71	520	407859	403570	FALSE	20	TACTAGTTTTTCTGCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAHPAQKPSVRNSLINDAKARLKKHDVGTRFSHLLSNKCSVLLPLLIKEGKFHLLFTLRSEKLRRSPGEVCFPGGKCEPADMDEVATALREAQEEVGLRPHQVEVVCRLVPHIFDVRVGMELGFAISHGPPCGSAILKVPHLAKRGP	407929	402750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_-_403828_406453_406608_407821
826892	contig_10371_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_175491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	846861	847265	NA	25	CTTGGCTAGCAGTCACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRNESRIRISGPWELRQRSGPKYLIKTRAGADGPSVAALFSGPAAQEGGPLTTPSCHTSLPSEAQRTVTLCPCALAADGGAQDSDSAGLAPLATSCCPVFVRPFLQPSLPSSQHWSAGVHPHCAIVPQREPGRL	846860	847432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_846900_847400
826894	contig_7173_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_37555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAACAAGACACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723285	723614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_723300_723600
826895	SIRV4	-	507	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	112	-2	112	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	252	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5046	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
826898	contig_6434_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_61918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933400	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_933400_933800
826899	contig_8289_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_171169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTACTCCCAACTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162124	161810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_161800_162100
826900	contig_8289_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_171168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCTATGTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162098	161706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_161700_162100
826902	contig_12078_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_74087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGATGGGTTGGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161973	161743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_161700_162000
826903	contig_12697_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_122838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAAACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341816	342123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_341800_342100
826904	contig_12270_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_113832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	4	333	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14412	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
826906	contig_6496_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_103532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	3	665	1021162	1021824	NA	35	AAAGCAGTCATGACGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHRDRAAPRGAGRGGLVLAHSDRDGWLPGGLAGQGCSEHRRRSPRGGGTADKHGHLHTGQLPSSSSDPEPKRKFRTAGSVGLSLLALTKAGVETQHIEGVTLPGLTGEAFRSRWPPADAYQAALGVRRAADNTQGAQGALQAACPDFCSPSWFFGEWPVPASLAIVFLLFVLSCFSTNVFPFGLSKDCTLVVKKTVSRGLGQVCSCDLAYSCFNILLSLG	1021159	1022493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1021200_1022500
826907	contig_11294_pilon	-	703	2	Intergenic	novelGene_50040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161701	147943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_148270_161324
826908	contig_160_pilon	+	1206	7	Intergenic	novelGene_156323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	67.1854812358213	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	21	485	207052	212615	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLLLRMAVPGFILGVFIHLLHISSVANYPNGKVAKSCHGMIPEHGHSPQSHPIHHISVNQTTFQPGDQLKVTLSGPPFKGFLLEARDAEDLSGPLIGSFTLIDSELSQILTCEDIQGSAVSHRNPSKKNDIEVYWHAPSSAPNHIQFLAAGGFEPLAFS	192866	216271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_192887_207051_207248_209616_209754_210984_211080_212578_212667_212797_212946_215749
826909	scaffold_19766_pilon	-	1060	4	Intergenic	novelGene_34310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	40.8982477212248	235	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	242	517	560340	559754	FALSE	15	CCCCACACTTGTCTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGEVVGFRAGRRPPRLIPQEQGSCAKETFFTPAPRPPPTGNYVLDRDELVEAQTPEYDVVLCLSLTKWVHLNWGDEGLKRMFRRIYRHLRPGGILVLEPQPWSSYGKRKTLTETIYKNYYRIQLKPEQFSSYLTSPEVGFTSYELVATPHNTSKGFQRPVYLFHKARSPSH	564408	559210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_559807_559931_560059_560244_560464_564290
826912	contig_17062_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_176826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATACTCTTCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17993	16798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17062_pilon_-_16800_18000
826914	contig_9189_pilon	-	1127	7	Intergenic	novelGene_165122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTGGGATGGGAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601640	379396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_379452_427695_427762_446720_446966_545331_545613_564291_564523_583028_583110_601472
826916	contig_4103_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_51969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGAGAAGAGGGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173656	171514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_171500_173700
826918	contig_10235_pilon	-	925	6	Intergenic	novelGene_46463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	554.165318294099	3	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	5	397	222843	219464	TRUE	25	TTTAGTGGTGTTATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPSWQLRTLSPTQLGWMYLPSFLPTSRIQTQHSMTIWRRGS	222847	217918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218281_219297_219485_220089_220187_220354_220481_220677_220788_222804
826920	contig_8259_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_148886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTCTTTCTCAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257160	258373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_257200_258400
826921	contig_8505_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_173184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTTATCTTTGGCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11322	13593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_+_11300_13600
826922	contig_15293_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_146529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1086	1397	112653	112964	NA	15	TACCTGTCCCCACTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSVHRKTCTRMFIAAVFTIIKHWKQLSYRGMDKLRYIHTMEYYPVIKRKELSINTTWTNLKCTLLNQRRQTSKAVRLHSYDTLEQAENRSGQSGAGGSGSS	111567	113333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_111600_113300
826925	contig_9931_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_134846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTTTTGGTTAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370986	370560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_370600_371000
826926	contig_11337_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_107189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAACCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190202	191829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_190200_191800
826928	contig_15410_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_130632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150618	152311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_150600_152300
826930	contig_14142_pilon	-	1130	12	Intergenic	novelGene_120602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	172.190313700369	2	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	187	783	592056	585568	TRUE	30	TCCTTCATAAGTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSIHCSSKSRPWSRSLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSSRSTTQPFLATRG	592533	584545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585687_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591415_592007_592067_592149_592204_592411
826932	contig_6489_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_128953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGCTCTCTGGAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354685	354982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_354700_355000
826933	contig_6489_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_128954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTCCTTTCTTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356042	356475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_356000_356500
826935	SIRV5	+	281	4	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-2	-270	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTAAGTGCTGTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2070_2270_2316_3298
826936	contig_9839_pilon	-	648	5	Intergenic	novelGene_88509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATACCGTCCTGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58088	45352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45422_49447_49613_54063_54121_57650_57848_57928
826937	contig_11375_pilon	-	1896	13	Intergenic	novelGene_152646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	18.723685237925	25	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	164	997	29341	26966	TRUE	30	ACCCAATGGCTCAAGCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTPSRGGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFSKAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVLHFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSAEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQLSFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKV	30099	24589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_24891_25372_25452_25611_25660_26296_26428_26625_27056_27263_27333_27493_27606_27820_27910_28003_28101_28362_28495_28839_28945_29201_29345_29939
826938	contig_5965_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_154651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATCGTCTGTAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42587	41525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_41500_42600
826939	contig_6048_pilon	-	1224	11	Intergenic	novelGene_73328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.7510655613615	80	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	43	969	2727399	2589914	TRUE	10	GCTTCTCTGACTGGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGQGLCLPYWPAGMFQFSAPSGQAPEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGAPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYMEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGAPQVREAGPATL	2727441	2588102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2588241_2589796_2590009_2590685_2590768_2612162_2612285_2620452_2620514_2631321_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2727363
826940	contig_6272_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_160467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTATTTGAAACTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616686	616941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_616700_616900
826941	contig_348_pilon	-	568	3	Intergenic	novelGene_67581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	81	422	168193	167144	FALSE	25	TGCAACAGTGCTGTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKEELETSTVISIHSETSVPDHVVWSLFNTIFLNCCCCLGFAALAYSVKSRDRKMVGDLMGAQSYASTAKYLNIFTLVFSLLLIIVFIILVAPAAMMGLQAFSQMLKDYAGY	168273	166997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_167336_167989_168118_168171
826943	contig_10399_pilon	+	969	2	Intergenic	novelGene_114488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	192	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	50	559	332919	334054	FALSE	25	TTAACTTGGCTTGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAHLSPSRVTHGISFMVSFPEMPKPPDYSELSDSLTLAVGTGRFSGPLHRAWRMMNFRQRMGWIGVGLYLLASAAAFYYVFEISETYNRLALEHIQQHPEEPLEGTTWTHSLKVRLLSLPFWLWTIIFLIPYLQMFLFLYSCTRADPKTVGYCIIPICLAVICNRHQAFVKASNQISRLQLIDT	332869	334464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_333017_333642
826945	contig_15070_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_164899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATAAATTTTTATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493380	493918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_493400_493900
826946	contig_3068_pilon	+	1287	9	Intergenic	novelGene_137600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.29061969939522	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	499	1191	19171	29930	FALSE	15	GACTTGCTTGAGATTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPLEDVGKQVWRGALLLVDYILFRQDLLRGCTVLELGAGTGLASIVTATVARTVYCTDVGADLLAMCQRNIALNSHLTAAGGGIVKVRELDWLKDDLCIDPEVPFSWSEEEVSDLFNHTTVLLAAEVFYDDDLTDALFKTLYRLSHRLKNACTVILSVEKRLNFTLRHLDVTCEAYDHFRASLHMLEKLASSKVRFSVERVEATFPQRLAYERIQQLELWKITAEPVT	14244	30026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_14626_19053_19204_19292_19438_22002_22075_23887_23942_25785_25867_26109_26213_27967_28137_29894
826947	contig_11422_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_99024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGTTCAACCTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108	685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_100_700
826948	contig_7471_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_161286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGAGTCTGATATGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36539	34335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_34300_36500
826949	contig_10589_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_129370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAGAAAAAAAGAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28619	30659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_28600_30700
826950	contig_7179_pilon	+	2835	1	Intergenic	novelGene_78073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425716	428551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_425700_428600
826952	contig_12884_pilon	+	1443	2	Intergenic	novelGene_104979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGTAATTCCCTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622462	624669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_622670_623433
826960	SIRV6	+	448	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	16	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	18	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1645_1736_1847
826961	contig_9114_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_155179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49763	48855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_48900_49800
826962	contig_5718_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_110444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTTTGCATTGGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1617853	1619576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617900_1619600
826963	contig_1154_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_87141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGGAACATGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820849	819637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_819600_820800
826964	contig_6304_pilon	+	1522	2	Intergenic	novelGene_122245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	468	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70263	74769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345
826969	contig_12970_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_50512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64279	62297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_62300_64300
826970	contig_9484_pilon	-	962	8	Intergenic	novelGene_105608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	10.8345629862049	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	201	332	85865	84338	TRUE	0	CTCTCTCTTGCTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAWLKKIFGDHPIPQYEVNPRTTEILYHLSERNKARDRDVSLVIEDLKQKASEYESEAKHLQDLLMESVNFSPASLSSTGSRYLNALVDIAVVLETKDTSLTSTKMKK	87775	79592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_79846_80846_80895_81139_81212_82034_82101_82473_82598_84270_84357_85752_85889_87598
826971	contig_5916_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_158018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATAAAGGATTATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206865	207844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_206900_207800
826972	contig_7446_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_101953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTATAGGTGGTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201378	199223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_199200_201400
826973	contig_348_pilon	+	900	4	Intergenic	novelGene_67578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	431	751	242496	243470	FALSE	20	ACAGTGCTGTGACATCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTVINIRSETSVPDHVVWSLFNTLFLNCCCLGFVAFAYSVKSRDRKMVGDVTGAQSYASTAKCLNICALVFSILLIIGFIILSATGTVMNLQAFSQTLKDHGGY	160127	243619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_160384_167985_168126_242461_242625_243278
826975	contig_6101_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_114280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCCACACACACACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213671	212907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_212900_213700
826979	SIRV3	-	352	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	267	-2	267	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
826980	contig_2100_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_50633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAATAATGCTTCCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921949	923099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_921900_923100
826982	contig_2799_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_85492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGAATTTGGGAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542968	544536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_543000_544500
826983	contig_2799_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_85491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTGTGGATCTAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540985	541408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_541000_541400
826985	contig_10627_pilon	+	681	7	Intergenic	novelGene_59959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	82.2511398097315	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	74	679	173411	175031	FALSE	35	CAAGACCAGCGAAGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQKARALLDLCAAPGGWLQVAAKFMPVSSLIVGVDLVPIKPLPNVVTLQEDITTERCRQALRKELKTWKVDVVLNDGAPNVGASWVHDAYSQAHLTLMALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFL	173026	175033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174348_174431_174627_174709_174826_174941
826987	contig_5429_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_127817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAATGGCACAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496241	497614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_496200_497600
826988	SIRV6	+	357	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	1	19	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
826991	SIRV6	+	434	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	44	7	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
826993	contig_7254_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_145858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCATACAATAAGCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262538	261499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_261500_262500
826994	contig_5779_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_106410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTGAACAAATCCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634	1420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_1400_1600
826995	contig_15629_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_122461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGACTGTTGCTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123156	123701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_123200_123700
826996	contig_9706_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_20850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2320	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2300_2700
827000	contig_1435_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_115500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAATGCTTTGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520516	518584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_518600_520500
827002	contig_9333_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_120326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGAATTGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223928	222657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_222700_223900
827003	contig_5799_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_50261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221852	222580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_221900_222600
827007	contig_10003_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_88249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTCACTTTGGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709766	711386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_709800_711400
827009	contig_11851_pilon	-	2040	4	Intergenic	novelGene_146559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	25.9358182185692	97	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	121	762	337437	259999	FALSE	30	AATGATTATGAATTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYFCFLLTALGVTAGAHRLWSHRSYKAKLPLRIFLAIANSMAFQNDIFEWSRDHRVHHKYSETDADPHNARRGFFFSHIGWLFVRKHRDVIEKGRKLDVTDLLADPVVQFQRKYYKISVVLMCFVVPTLVPWYIWGESLWNSYFLASILRYTISLNITWLVNSAAHMYGNRPYDKHISPRQNPLVTLGAIGEGFHNYHHTFPYDYSASEFGLNFNPTTWFIDTMCWLGLATDRKRASQQVIKARKARTGDGSI	337557	258720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_260190_265553_265787_311716_311923_337425
827010	contig_10000_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_139320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTTGAGATGTAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194245	193663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_193700_194200
827012	contig_5375_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_169217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGATTCAGTTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88159	87442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_87400_88200
827013	contig_5744_pilon	+	500	3	Intergenic	novelGene_149325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_2	214.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	158	388	294152	297257	FALSE	55	CATGTAATGAATAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFFNGLRAELVTYPGITVSNICPGPVQSNIVKNAVTEEVTKSVGNPGDQSYKMATSRCVRLMLISMANDLKEVWISDHPFLLAAYLGQYMPTLTFWIIGKLGKKRIENFKSGLDADSSYFKPLKKKHD	293278	297369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_293403_294118_294335_297209
827015	contig_14220_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_159875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371620	372981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_371600_373000
827016	contig_987_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_72270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485113	483900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_483900_485100
827018	contig_10861_pilon	+	1330	2	Intergenic	novelGene_39248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	363	680	800201	800665	FALSE	15	TGCACGTCTTTCCATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSDLRLHGRCSGAQYSSKPIRTVCKECVLISDLETRIPAFRKGDVRAMREIKHQDHEWKVDSPSPILRASAAYPSLANCSFWGQKPREASPRQSQNSTDNGST	799838	801315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_800333_800479
827019	contig_14621_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_105868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAGTCCAGTAGACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400310	402088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_400300_402100
827020	contig_10003_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_88208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACCCTACAGGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521162	522917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_521200_522900
827021	contig_5039_pilon	-	1298	3	Intergenic	novelGene_64944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	31.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAGAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495395	1479034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1480116_1481900_1482029_1495306
827023	contig_11253_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_126853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTGGTGAATTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308819	308026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_308000_308800
827025	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7460	2	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
827027	contig_1335_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_166512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCAGTCTAATTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386944	386108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_386100_386900
827031	contig_4364_pilon	-	1850	12	Intergenic	novelGene_60	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	18.277023466004	54	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	113	1471	698614	679252	FALSE	10	CGTGTCCCTGTGTGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCEHCTRKECSKKTKNEDQEDASVDVTSPARGKEEKGEFHKLADAKIFLSDCLACDSCVTAEEGARVSQQNAKDFFRVLNLNKKCDTSKHKVLAVSVCPQSLPYFAAKFNLSVTDASRRLCGFLKSLGVHYVFDTTIAANFSILESQKEFVRRYQQHSEDERALPMLTSACPGWVRYAERVLGSPITPHLCTAKSPQQIMGLLVKDYFARQQNLSPDKIFHVIVGPCYDKKLEALREDVHAASHTLQGVDCVLTSGELLQIMEQSDLSVKEAAVDTLFGDLKEAAVWRPDGASSDGYLAHVFRHAAKELFGEDVENVTCRALRNKDFQEVTLEKDGEVVLRFAAAYGFWNIQNTIRKLRRGESPYHFVEVLACPGGCLRGRGQAQAEDGRVDKALLRQMEGIYAEIPVRPPETRLLLLQWTDLSAQLYGVPPSTDKVTPSPLQGTAGVSAP	698726	678872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_679368_680424_680539_681344_681503_681783_681922_684372_684437_686502_686633_688577_688697_689716_689852_692005_692139_692863_693008_696529_696611_698587
827032	contig_18637_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_81854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAGCAACACAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176861	176257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_176300_176900
827033	contig_14030_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_62251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTACAATATTAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391206	393337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_391200_393300
827034	contig_5338_pilon	-	1646	8	Intergenic	novelGene_114583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	16.4825201164068	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	19	714	391497	389507	TRUE	25	GGAAAGGGCTTTCTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDLSRAMESPDSGARCPLQEQRARWERKRACTARELLETERRYQEQLGLVATYFLGILRAKGTLRLPERQALFGPWELIYGASQDLLPYLEGGHWGQGLEGFCPHLELYTQYAANAESSWTTLQEQLKKNKRFRRFVQLQEGRPEFGGLQLQDLLPLPLQRLQQYENLVVALAENTGPNSPDHQQLTRMFLFLHSSCRRLPLLYSFSSSHLQQCLVCPYLPLTRVQRPYCSAPFSRS	391515	387540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387928_388106_388196_388459_388690_389280_389730_390314_390434_390691_390813_391079_391175_391359
827035	contig_17743_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_176424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAGAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50611	50981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_+_50600_51000
827038	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	254	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827039	contig_7816_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_66466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAAAAAGTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129661	127417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_127400_129700
827040	contig_8017_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_65382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTGCCCAGAGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503047	1501737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1501700_1503000
827043	SIRV4	-	427	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1094	0	1094	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4064	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4100
827044	contig_3424_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_55558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	62	502	932487	932927	NA	5	CGTCTCGTTCGGGTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWGALHPRRQGAGASSRNGFMWTRGRHSDATLSGECSDSYNFRAICKEEAEAHSTEVVLALSCLRTHLHCTQCCRQGQHLLPNSEETEALGPGGSLKFLLLQEALLDYPTRRHLWLSGRPGVLLHLPLPLCSHYFHAPSAQQRSQLLRTVGMSSSSLSSSTRLSMH	932425	933622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_932400_933600
827046	contig_6418_pilon	-	925	9	Intergenic	novelGene_81112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	466.925850644404	3	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	378	680	81742	68463	FALSE	30	TAGAAGCAACTACTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	117997	68217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72399_81731_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
827048	SIRV6	+	340	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	1	1248	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
827049	contig_5799_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_50271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGTAAATCAGTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270363	270663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_270400_270700
827050	SIRV6	+	341	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	231	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3157_7798_7924_10724
827052	contig_8122_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_40175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGTGAGAGAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30089	31459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_30100_31500
827053	contig_5429_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_127810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAAAAGCGGATTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440028	440829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_440000_440800
827054	contig_17470_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_110540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGATAAGTGAAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278854	279350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_278900_279400
827056	contig_10304_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_166497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAACAATGTGTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154385	153632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_-_153600_154400
827058	contig_1146_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_84788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108808	109835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_108800_109800
827059	contig_5222_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_58993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTGTAGGTGAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181340	182287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_181300_182300
827060	contig_14984_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_174156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28430	29463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_+_28400_29500
827064	contig_8954_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_130280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCTAAAAAAAAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130751	132092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_130800_132100
827065	contig_8286_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_139817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	954	1295	291987	291646	NA	20	TAAATTCTTCCATTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPQHSCRTSHLPLHLFVPTSQETPAGPITQASHAAEGKAPALCKHLGYQCISHFQPHMEHSTANMLWQSGIYQRRGAKGGSDVSSSPFAMVRDSCSGRGPTHSGPLHCQEP	292940	291349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_291300_292900
827067	contig_1759_pilon	-	1561	4	Intergenic	novelGene_171332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	12.8322510366134	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	843	1433	56906	50228	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAGTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPSKYCTSYSISDINTVSFHMYF	93159	50099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_50681_56768_56915_64867_64939_92396
827069	contig_19850_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_170862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGTACAATACTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42951	41056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_41100_43000
827072	contig_5039_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_65023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1778052	1774771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1775344_1776931
827073	contig_9646_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_117443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATACTGTAGGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207186	208999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_207200_209000
827074	contig_8820_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_79314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTGCCCGGCTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255902	254893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_254900_255900
827076	contig_9785_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_157908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAACCTCAATCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556647	557905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_556600_557900
827077	contig_15500_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_128979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACATTGGGTCACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188905	190516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_188900_190500
827078	contig_2892_pilon	-	1753	3	Intergenic	novelGene_118994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_1	152	111	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAACTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130476	88519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_90117_100483_100568_130404
827079	contig_11396_pilon	-	856	2	Intergenic	novelGene_71356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	625	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCCTGTGATGTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545077	544097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_544564_544687
827080	contig_14575_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_101934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTGGCCATTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447071	448730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_447100_448700
827081	contig_7933_pilon	-	515	3	Intergenic	novelGene_164691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3716	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTAAGAGAGAACGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197934	185660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189500_189556_197891
827084	contig_7182_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_117122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTTGGTTGTCGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605746	605335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_605300_605700
827085	contig_1918_pilon	+	1380	12	Intergenic	novelGene_168333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	650	1009	54546	56757	TRUE	15	CCAGCAGGATGCCTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKRLSFLTAPLQEVLVLPSAPGSYLYQWLLRKCPLPGRCRGGAQNRRVAPGLPQSGGSGWLLHHPAHGCPPAEEGVSFLQTFHHSGPVPLHSAVIRLHQPQQQCQGYLPNVLVTVE	52631	58143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_52982_53067_53168_54267_54355_54433_54554_55465_55558_55808_55928_56464_56576_56727_56786_56952_57058_57363_57447_57868_57954_58073
827086	contig_16930_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_139169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACATTCTCAACTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248738	246920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_246900_248700
827090	contig_295_pilon	+	795	7	Intergenic	novelGene_176829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	2.80871659105879	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	183	794	133839	149732	FALSE	50	ATCAGGTACAATATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGYVLGIYRIPHGKGCSSRTAPKPVVYLQHGLIASASNWICNLPNNSLAFLLADTGYDVWMGNSRGNTWSRKHLKLSPKSSEYWAFSLDEMAKYDLPATIDFIIKKTGQERLFYVGHSQGTTIAFIAFSTNPELAKRIKIFFALAPVITVKYTQSPLKRLAILSRQVLKALFGDKIFYSHSWFNQFIATKFCNQKLFHRICSNFLFTLSGFDPSNLNVSRMDVYLSQSPAGTSVQNMLHWAQAVNSGQFQAFDWGNPNQNKMHF	131980	149733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_295_pilon_+_132044_133719_133919_135406_135517_136752_136890_144105_144253_146295_146368_149666
827092	contig_10434_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_82018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTAATGACCAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99492	100831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_99500_100800
827094	contig_2444_pilon	+	1302	6	Intergenic	novelGene_83776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.956909041987	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	157	933	240924	243030	FALSE	20	AGCAGCCTTTCTGTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	238990	243399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_239058_240834_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877
827096	contig_11815_pilon	-	629	5	Intergenic	novelGene_50904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.864594488158	864	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATATCATTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156958	153846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153979_154794_154850_155177_155255_155551_155640_156681
827098	contig_11396_pilon	-	1236	10	Intergenic	novelGene_71250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.78845167894716	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	251	1069	95866	91839	FALSE	10	TCCTGATGTCCTTGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLRELKAMPVTLHLLQSTRVGMSVNALRKQSSDEEVTTLAKSLIKSWKKLLDASDAKAGEQRSASLASPPSKDTSEAKVHSRKRPELPKTPSTPRMTTFPPTPVTCDAVRNKCREMLAAALQTDDDHVAIGADCEHLSAQIEECIFRDVGSTDVKYKNRVRSRISNLKDAKNPGLRRSVLRGAIAPQRIAEMTSEEMASDELKEIRKAMTREAIREHQMARAGGTHTDLFTCGRCKRKSCTYTQVQTRSSDEPMTTFVVCNECGNRWKFC	102145	91671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_91848_91989_92062_92651_92799_92863_93019_93441_93499_93675_93807_94686_94775_95624_95731_95812_95876_101904
827101	contig_6412_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_149958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAAAAAAAAAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234735	233320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_233300_234700
827102	contig_5779_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_106517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGCAATAACACGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276968	277891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_277000_277900
827103	contig_5153_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_74337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAGGGCACAAGAGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635165	636626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_635200_636600
827104	contig_9571_pilon	+	990	2	Intergenic	novelGene_136243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTACTTGTACTCCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203659	207675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_204045_207070
827105	contig_14868_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_150441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAGTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119672	118448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_118400_119700
827106	contig_14814_pilon	-	759	5	Intergenic	novelGene_137681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	52.16799785309	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	178	759	10313	7231	FALSE	10	TGAGTGCGGGTGGGCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFLKTQFIVHLLIGFVFVVSGLAINFLQLCTLVLWPVNKQLYRRFNCRLAYSLWSQLVMLLEWWSCTECTLFTDQATVDHFGKEHVIIILNHNFEIDFLCGWTMCERFGVLGSSKVLAKKELLYVPLIGWTWYFLEFVFCKRKWEEDRQTVIEGLKRLSDYPEPLWFLLYCEGTRFTETKHRVSMEVAAAKGLAPLKYHLLPRTKGFTTAVHCLRGTVTAVYDVTLNFRGNTNPSLLGILYGKKYEADMCVR	16411	7230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_7335_7589_7744_9295_9458_10151_10322_16242
827107	SIRV4	-	208	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	406	3	-406	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCGGCGGCAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
827112	contig_10403_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_175808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107076	108643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_107100_108600
827113	contig_13542_pilon	-	1176	8	Intergenic	novelGene_131545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_7	15.160367234796	278	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	254	973	571554	566165	FALSE	35	CTTAGAAAAAGGAGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSKRDKKVSLTKTAKKGLELKQNLIEELRKCVDTYKYLFIFSVANMRNSKLKDIRNAWKHSRMFFGKNKVMMVALGRSPSDEYKDNLHQVSKKLRGEVGLLFTNRTKEEVNEWFTKFTEMDYARAGNKATFTVSLDPGPLEQFPHSMEPQLRQLGLPTALKKGVVTLLSDYEVCKEGDVLTPEQARVLKLFGYEMAEFKVTIKYVWDAQSGRFEQMGDDLPESASESAEDSEEDDDD	571807	565961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_566315_566455_566533_566915_567068_567426_567495_567761_567844_568508_568613_569512_569572_571526
827114	contig_7359_pilon	-	820	2	Intergenic	novelGene_139871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGGAAGAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386411	383484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_384263_386369
827115	contig_14450_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_48998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091782	1092594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1091800_1092600
827116	contig_9389_pilon	-	1659	7	Intergenic	novelGene_84086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.5035119910514	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	358	993	1256305	1242138	FALSE	40	TTAATGAGTGAGTGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVLEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQNLNEGEKLSSEHIMVRFMKNNTWSSVLGEISELHGNKHQQKNQRRHLRSRVVENLCESNEGNQCGKTFSRIPNLTVLKRNSPEVNLFACSECGKAFVDHSSYKHHTRSHTGCNARQCKECGEACSCPSHLTTPMRTHNGKKPHKSYAGLANKSPEVGELRELPSW	1264826	1241471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1242203_1245375_1245666_1246244_1246396_1247296_1247424_1256302_1256532_1256678_1256715_1264731
827118	contig_5454_pilon	+	2617	2	Intergenic	novelGene_145503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1768	2241	565570	566043	TRUE	5	CGGAGGTCCCCGTGCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSWAHLQPGPGSAGAQIDTVTGSLLPSRGPTSPPGPGEMKVTLLSQALSAGASKEAYEARSPRTQELPKGVLTGAHFGKCWPAGCPTPQAPPGASGVWQQQGPGIPAEVHRAQLWTSSTGQHPSRHYGRLSPANMRGGRPGSLGGFGPPVRHRSS	563802	566866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_+_566393_566839
827119	SIRV6	+	254	4	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	164	615	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACCGGTTATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	3155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_2780_2829_3106
827121	contig_7398_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_166155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1752	2078	108541	108867	NA	25	AAACCTTTCCTTTCCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYLARTQKICYLGKIMNVWLCAECFPQTFVWKAGPCRLCGPWRHTAPHTCEVEGGPHTTPRPPAPSVSSAASQPVPGVPLSLSQGCPLKVSPPARRVGQTDCRPRNG	106789	109494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_106800_109500
827122	contig_4228_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_151178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACAGGAGTGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593526	594545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_593500_594500
827124	contig_5988_pilon	-	1118	8	Intergenic	novelGene_15905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.13546137889432	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	151	702	602139	599333	FALSE	5	TGTTGTTGATGTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACFGFPIAWPWQLLGERLSCTLATPAYTLSSSCSGFLSLQFSKPPGPAPAMPLVRYRKVVILGYRSVGKTSLAHQFVEGEFLEGYDPTVENTYSKIVTLGKDEFHLHLVDTAGQDEYSILPYSFIIGVHGYVLVYSVTSQHSFQVIESLYQKLHEGHGKTRLPVVLVGNKADLSPAREVQAVEGKKLAESWGATFMESSARENQLTQGIFTKVIQEIARVENSYGQERHCRLM	602289	598916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_599423_599578_599661_600270_600319_600522_600580_600667_600751_601011_601080_601409_601482_602087
827125	contig_13496_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_107638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297906	296123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_296100_297900
827128	contig_5916_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_158072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	140	448	783134	783442	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEISLMTAAASCPLGIKIIINDNHCHLLSISRQPQGHLRHLLCVGTQLPLLPGAGSPRLPDQQRSTNKVHEYKICTDEGEQVPLVFLFPTAAVASRSWMSQR	782994	784976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_783000_785000
827129	contig_8600_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_125744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCATTTTACTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122308	120519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_120500_122300
827130	contig_6915_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_162399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCACCCCGTCCTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160818	160184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_160200_160800
827131	SIRV5	+	360	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	875	-30	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
827134	contig_9121_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_134421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	7514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_7500_8300
827135	contig_8600_pilon	+	1658	11	Intergenic	novelGene_125732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	156.772733598671	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	98	1519	102400	119760	TRUE	55	ATACTAAACTGTAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSFYIPGGHFTTAWFAIGMGGAFFFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNKMEEGNPRCWYAALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQEHQPHSGLLQSSFITLYTMYLTWSAMSNEPDHSCNPSLLSIITHITVPTQAPGNSSTLAPTSAPPLKSGPFLDTESFIGLVVFVLCLLYSSIRTSSNSQVSKLTLSGSDSVILSDTATSGANDEADGKPRRAVDNEKEGVQYSYSFFHLMLCLASLYIMMTLTRWYSPDAEFQSLISKWPAVWVKISSSWVCILLYAWTLVAPLVLTNRDFS	102302	122247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109465_110132_110271_114212_114383_115526_115618_116405_116587_118721_118950_119621_119819_122166
827136	contig_18096_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_58059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTGATTTAACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119591	120804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_119600_120800
827137	contig_13148_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_162935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAACTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214047	215640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_214000_215600
827138	contig_7022_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_142156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAGAAGGGAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256321	255720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_255700_256300
827140	contig_13901_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_146668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGCAGAACCAGAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274862	274512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_274500_274900
827143	contig_9471_pilon	+	766	6	Intergenic	novelGene_21839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	732.376296721842	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACTAAAGGACATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413958	417444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414144_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417247
827145	contig_5643_pilon	-	1000	4	Intergenic	novelGene_38912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	72.9672681564976	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCTGTGTTTAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324223	322619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_323273_323382_323445_323709_323888_324116
827150	contig_17968_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_154540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATTAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37954	36773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_36800_38000
827153	contig_2755_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_158304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273531	272819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_-_272800_273500
827156	contig_6842_pilon	-	1177	4	Intergenic	novelGene_130714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	313.059454772128	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACCAGGACTATCGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434024	428924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429699_431763_431865_432547_432644_433818
827157	contig_9406_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_136181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTACATTTCTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430768	430149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_430100_430800
827161	contig_21232_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_165980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGATACATATTTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15647	14803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_14800_15600
827164	contig_15991_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_70863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTTCAAATTTACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82363	80611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_80600_82400
827165	contig_8278_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_165305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGAAACAAAGTGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252742	254149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_252700_254100
827166	scaffold_6394_pilon	-	1025	6	Intergenic	novelGene_110955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_5	76.1855629368189	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	654	1025	132415	128092	FALSE	10	ATCTCCTGAGGCGTTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGSSGVPGTPPCPRPVVWGPSSPAPPSCSLEYCRLTAAGCEPLATALRARPGLRGLVLSNNDLGEDGVRALCGGLLGARCPLETLRLASCGVTAANCKDLCSLVAAKDSLQELDLGENKLGDAGVATLCPGLLSPSSRLKTLWLWECDISAEGCREISRVLHAKESLKELSLAGNELGDQGARLLCKALREPGCRLESLWVKTCGLTHACCPDFSAMLAQNKSLLELQLSNNRLGDTGVQQLCQGLGQPGATLQMLCLGDCEVTDSGCTALASLLLSSRSLRELDLSNNCMGDPGVLQLVESLRQPGCALRQLLLYDIYLSEAVDNHLKALEDSKPSLRI	134149	128091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128171_128360_128532_132293_132465_132715_132887_133027_133199_133887
827167	contig_5145_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_131357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAACCACTAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70029	70759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_70000_70800
827168	contig_10196_pilon	-	719	8	Intergenic	novelGene_132236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.910345097551	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	141	635	1442405	1433156	FALSE	5	GGTTTTGGTTGCGTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFCCVALSRRP	1448654	1433071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433187_1433620_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
827169	contig_5799_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_50291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355541	356663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_355500_356700
827173	contig_6557_pilon	-	1637	9	Intergenic	novelGene_33007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	41.4199151978852	65	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	435	1058	562259	552155	FALSE	25	GGCATTTTGTATGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFLRPKDPTQPSCFQEQQGLRHVVFTAETHNFPTGVAPFSGATTGTGGRIRDVQCTGRGAHVVAGTAGYCFGNLHIPGYSLPWEDRSFPYPGNFAQPLDVAIEASNGASDYGNKFGEPVLAGFSRSLGLRLPDGQRREWIKPIMFSGGIGVMEAKHMSKEAPEPGMKVVKIGGPVYRIGVGGGAASSVQVQGDNASDLDFGAVQRGDPEMEQKMNRVIRACVEAPNGNPICSLHDQGAGGNGNVLKELSDPAGAIIYTSRFQLGDPTLNALEIWGAEYQESNALLLRPPHQDFLCRVSAPGRLPGLMFVLKVSVTLAQPPTPHHLQKSLCISESVLDRQGPKCQKWQLIL	563449	551575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_552312_557521_557632_558018_558081_558365_558523_558626_558701_562195_562325_562477_562610_563076_563206_563341
827177	SIRV4	+	232	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCGATACCGCCGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
827179	contig_1154_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_87058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	163	462	135075	135374	NA	30	ATAGCCACAAGTGCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCCQTCCRVKGTWGGSWWLERWDRDKDSTVICREKELKGTWAVPTCRRESGGDRGVDREAAPGKSPHPLAPGWGMLSKCQEAVRAQNSASQLSGAVPC	134912	137166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_134900_137200
827180	contig_6885_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_83657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176278	174526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_174500_176300
827183	SIRV2	+	529	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-243	1405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTTCGCATCCATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3790	5862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4338_4479_4686_4800_5750
827184	contig_7157_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_131294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAATCAAAGAATGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888498	888142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_888100_888500
827187	contig_6635_pilon	-	1025	3	Intergenic	novelGene_127010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_2	59	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	263	823	377299	347559	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANYIHVPPGSPEVPKLNVTVQDQEEQRCREGALSLLQHLRPHWDPQEVTLQLFTDGITNKLIGCYVGNTMEDVVLVRIYGNKTELLVDRDEEVKSFRVLQAHGCAPQLYCTFNNGLCYEFIQGEALDPKHVCNPAIFRLIARQLAKIHAIHAHNGWIPKSNLWLKMGKYFSLVPTGFADEDINKR	377561	347356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_347704_361649_361910_377143
827188	contig_7379_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_150016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1	528	460613	461140	NA	70	AAAAAATGAGGAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVCLFSFSLLSLSAPYSQAVLRSLGAISLVCAAVPVRSLSAFLFSFFLFVFLHLSVSDLYNYLLFLSTEFPVLSCPRATQAWPSGICPALIPGPPFQSSYVPQTTNPSVSPSAGPACYTIAERLSLPIGEGGEKYHVHRRGNNNECTACLLRHNQIKPEKQDETNLQSVNEENNY	460612	461316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_460600_461300
827189	contig_10642_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_78673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATTAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179794	182038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_179800_182000
827193	contig_8291_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_99951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAACCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435259	433487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_433500_435300
827195	contig_18473_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_169636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGCAAAGAGAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25968	27459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_26000_27500
827196	contig_8050_pilon	-	985	2	Intergenic	novelGene_114845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTATGCCTTAGAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354317	350459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_350904_353776
827197	contig_8978_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_49494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTGCAGCTTTAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784581	1784032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1784000_1784600
827198	contig_11328_pilon	+	681	5	Intergenic	novelGene_88392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_3	2360.94864408356	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	40	642	643683	647995	FALSE	40	TAAATCATCTTTACACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643643	648034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_647064_647223_647899
827200	contig_8594_pilon	-	1967	6	Intergenic	novelGene_140013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	123	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCTGCTCTTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188201	125692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_126283_136958_137038_145283_145368_180565_180659_184907_185106_187278
827201	contig_5935_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_102680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775134	776040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_775100_776000
827203	contig_17493_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_122199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATTTCATACAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127128	125552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_125600_127100
827205	contig_7548_pilon	+	1116	7	Intergenic	novelGene_117627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	49	junction_6	131.951274677014	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	246	1061	193023	212793	FALSE	25	TTCAATTTCCTTATTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKYFLLGSWWSHRAPHPPVKMAGHSYHH	192777	212848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_212712
827206	SIRV7	-	253	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	0	146667	0	-91633	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACGAAGTAAGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147923	147670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
827207	contig_9239_pilon	+	1779	10	Intergenic	novelGene_137184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTCCCAGAGGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204563	279064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_205200_212054_212245_218403_218533_218860_218978_234929_235055_235498_235649_235788_235879_238798_238937_240385_240519_278993
827210	contig_6871_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_21669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTACTCTTGTTCAGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841802	842581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_841800_842600
827211	contig_7914_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_165032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAGAAGAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179009	179322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_179000_179300
827212	contig_10549_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_110599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATTAGGTCACTTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136234	137680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_136200_137700
827213	contig_10196_pilon	+	888	6	Intergenic	novelGene_132261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	212.358753057179	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	63	677	1998931	2000193	FALSE	0	TGTCTGGGCTGCCTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVGKGSSCGLPLINSFNLKEMAPGLGSETRLDRSKGDTRSDTVLLDSSATLITNEDNEETEGSDVPADYLLGDVEGDDEELYLLDPDHTHPEEPEYVLPQEAFPLRHEIVDTPPGPEHLQDKADSPHVSGSEADAVSLAPVDSSFSLISVSHTLYDNRLPPDFFSALVRDMLRFYAEQGDVQMAVSVLIVLGERVRKDIDEQAQEHWYTSYIDLLQPHHEVAGG	1998778	2000404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1998825_1998914_1999037_1999121_1999227_1999326_1999668_1999794_1999832_2000167
827214	contig_19185_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_163664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164398	164999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_164400_165000
827215	contig_1264_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_161297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAAAGTACAGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27888	28660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_27900_28700
827216	contig_6496_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_103542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCCAGTCCATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163374	1163982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1163400_1164000
827217	contig_2854_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_120901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTACAGAGTGGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247928	1248826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1247900_1248800
827219	SIRV2	-	343	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4494	70	3319	-35	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGATTTGCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413	1070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
827220	contig_3151_pilon	+	1374	2	Intergenic	novelGene_139177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	37	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTGAAAAAGAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39903	43357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_40028_42107
827221	contig_14727_pilon	-	1606	10	Intergenic	novelGene_56678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	111.430097669645	12	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	15	1250	414836	371686	TRUE	55	TTAGAGGAAGAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVIGASVAPRTGAEPISPGPIPHPAQDKTTEAGGGNQSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYLDPEFPPDESSLFYSQKFPVQFVWKRPPEICKNPQFIIGGANRTDICQGDLGDCWFLAAIACLTLNERLLFRVIPHDQSFTNNYAGIFHFQTIVPVQYETKMASGLVKGHAYSVTGLEETLFKDEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDNDEKARLQYQVTENGEFWMSYDDFIYHFTKLEICNLTADALESDKLQTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSQVVCSFLVALMQKNRRKERKLGANLFTIGFAIYEVPTDAWEQEAPAEGLLPVQCLQGQEQNLHQHAGSVPALPPASQRVRHRALHL	414850	370453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_370750_371625_371843_372979_373152_376104_376266_377287_377366_378996_379083_380192_380277_388019_388139_390301_390372_414527
827222	contig_9415_pilon	+	2073	3	Intergenic	novelGene_109886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	877	1860	2059646	2060629	FALSE	80	AAAAAGAAAAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVYTVVITALLSVLYTVVITALLFCLQLSSLSSCLFCIQLSSLSSCLFCIQLSSLRSCLFCIQLSSLCSCLFCIQLSAMHSCLFCIQLSSLCSCFVYTCHHCACFVYSCHHCAPVCFVYSCPHCTPLFVLYTVVITVLLSVLYTVVSNAAPVLYSCHHHTPVCFVYSCHHCAPVLYTVVITALLFILYTVVITVLFVLYTVVITELLSVLYTVVITALLFCIQLSSLRSCLFCIQLSSLRCLFCIQLSSLRSCLFCIQLSSLRSCFVLYTVVITVLLCVALNPPLLLLTPGFVHLCYLSRWPCKHLNWQSLFKVKFLKETSIKQY	2056816	2060842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2056951_2058478_2058586_2059010
827223	contig_11056_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_130361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAAAGGTGATATTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294789	292873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_292900_294800
827224	contig_8106_pilon	-	980	4	Intergenic	novelGene_139730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	17.1464281994822	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTCACCTGTCTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85312	64164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_64508_66863_67018_69911_70066_84983
827225	contig_5779_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_106529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCCTGAACTGAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336728	336278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_336300_336700
827228	contig_9670_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_169936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAAAGGAAGCTTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81226	81664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_+_81200_81700
827229	contig_8006_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_173936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCACCCTCACAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468041	467321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_467300_468000
827230	contig_2799_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_85477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAGATTGAAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460547	460890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_460500_460900
827231	contig_11752_pilon	+	825	4	Intergenic	novelGene_37670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	852.845824284788	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	42	509	92915	96579	TRUE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGT	92873	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_93060_94223_94410_96442_96584_105597
827233	contig_16632_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_154145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGGGTTTCCAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153512	154007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_153500_154000
827234	contig_5620_pilon	-	781	4	Intergenic	novelGene_161347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.52447456836295	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGTGTGCTGGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382766	348374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_348846_365394_365548_381096_381206_382718
827235	contig_10324_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_7776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGACTCCAGGCCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79626	80760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79600_80800
827236	contig_6612_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_148168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAATTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41873	41345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_41300_41900
827237	contig_12270_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_113721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
827239	contig_6364_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_51743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520716	522045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_520700_522000
827240	contig_21203_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_84494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGCTGTTGGGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113261	112905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_-_112900_113300
827243	SIRV4	-	482	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	112	23	112	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	127	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGTGGCGGTATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5046	3660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
827247	contig_6654_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_85736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	965	1324	431615	431256	NA	55	GAAGAAAGGGAGAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCARSSYHKRITFVILWIGRQISTCPMTQCYWRGGDKERNQKLRMTFILGMLPDEVMMKISALAQRKWMLVMPWAVFRDLSACKNFMLLGFSLALQVTNLFYASFPGRGRGQQPLCPD	432579	431177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_431200_432600
827248	SIRV6	+	356	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	17	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
827249	contig_4782_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_73620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAGACACAGACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191139	189835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_189800_191100
827250	contig_1443_pilon	+	1990	11	Intergenic	novelGene_28263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	22.364257197591	75	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	121	1452	638395	644713	TRUE	20	TCACACTTTGCCTCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRGLEVTSTEVVDRTCSPREHVLLGRARGPDGPWGVGTPRMERKRSISAQQRLVSELIACEQEYVAILSEPVPTPGPELTPELRGTWAAALSARERLRSFHRTHFLRELQGCATHPLRIGACFLRHGDQFSLYAQYVKHRHKLENGLAALSPPTKGSMEGGPHLPRALQQPLEQLAQYIRLLEELLREAGPELSSERQALGAAVQLLQEQEARGRDLLAVEAVRGCEIDLKEQGQLLHRDPFTVICGRKKCLRHVFLFEHLLLFSKLKGAEGGSETFVYKLAFKTADMGLTENIGDSGLCFELWFRRRRAREAYTLQAASPEIKLKWTSSIAQLLWRQAAHNKELRVQQMVSMGIGNKPFLDIKALGERTLNALLTGRAARTRASVAVSSFEHAGPSLPGLSPGACSLPARVEEEAWDLDVKQISLAPETLDSSGDVSPGPRNSPSQQPPDPGSSTPTLASGGILGLSRQSHARALSDPTTPL	638274	645392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_638418_638546_638782_639108_639196_640068_640285_640996_641168_641977_642156_643169_643275_643501_643646_644145_644277_644671_644719_644859
827251	contig_2646_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_69704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCCAGTCTGATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2519199	2517987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2518000_2519200
827252	contig_14536_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_69320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	23	400	249781	250158	NA	65	AAAAAAAAAAGTTCAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGMGFKKRAPRALKEIWKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKRIRNVPYRIRVWLSRKRNKDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	249758	250197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_249800_250200
827253	contig_5643_pilon	+	879	8	Intergenic	novelGene_38968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	646.61359625138	8	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	379	822	551324	552849	FALSE	20	CTGGCACAAAGCCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVIFEQTKVIADNVTDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLREWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPCPPVRGQGCYPLP	549605	552906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_549779_551004_551130_551243_551333_551401_551535_551805_551892_552142_552231_552357_552441_552804
827254	contig_299_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_129474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	230	640	1308357	1308767	NA	45	TAATGGTGATGGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQIKSYHSLPFLAYPGRCVEVQDIHAELSLNNDMSWHAPGSLNILWMWKTWHLSYQGIQRLGHLLLIRDTYLVELAVVCSTLPGSFGFCRCQTGKLNRYGGDHIPVSFRSLRVTLVSAIALGCDIVFDLLSWLGM	1308127	1310181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1308100_1310200
827255	contig_12528_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_81289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACATATAAGAAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323303	323845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_323300_323800
827258	contig_8017_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_65356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924356	925039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_924400_925000
827261	SIRV2	+	336	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-70	257	-70	-257	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGGGTTAATGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	1374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
827264	contig_2646_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_69678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCGAGTGCCTTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2220810	2219494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2219500_2220800
827265	contig_3818_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_99223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	105	380	271681	271406	NA	40	GACACCAATGTGAACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASECGAKPTGPGLAVSCLLDPALRPGPREAYRGTMLRCPLNFNNSPDPLKGQATLPFSPLVIPAFPAHFLATTAPSPMAAGLVHFPTASFDSALRHRLCPASSAWHMPPATTYAAPHFFHLNTKL	271785	271040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_271000_271800
827266	SIRV6	+	198	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	529	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10766	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11033_11109_11205
827267	contig_3153_pilon	+	776	8	Intergenic	novelGene_104697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	65.9214127052904	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	184	336	448387	448730	TRUE	30	CTTATTTTGATTTAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGCSRGLQLGLWSHLVGSAPAGILPHPGLRGSSAQARQLCDIRHLRPERYLGLTAELPDLMREPGRRLSHPAPLLLVRPDCFPGTVACRVHHGARTDAGRTDAGCRKSSL	448031	456601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_448084_448154_448252_448352_448445_448543_448616_448707_448756_454168_454312_454952_454978_456354
827268	contig_7171_pilon	-	979	10	Intergenic	novelGene_101199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	429.871154971514	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	148	690	49603	37971	TRUE	20	AAAGCACTGTGGTCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTKFEFCTLLFSCSIRDSLYKGRDFFSFLILAVFPVPRPVPGTQ	50438	37426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_37963_38099_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_49818_50365
827269	contig_7744_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_62442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGACTAAAAAATCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24560	23060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_23100_24600
827270	contig_8576_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_88723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGCAACCCCAAAAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543116	534799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_535259_539656_539892_542754
827271	contig_9807_pilon	+	901	3	Intergenic	novelGene_32927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	14.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACCACGTGTGGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156407	159003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_156770_157171_157384_158676
827272	contig_5684_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_81079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTAACATCTACTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463653	462342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_462300_463700
827274	contig_4538_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_153067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGCCTCATCCATAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22437	23581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_22400_23600
827276	contig_4392_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_117326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	427	735	501503	501811	NA	30	CAAATGCCTCATTAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLGPKLPLDSQRGNSFRAAVDLTLARERKGGNSHFTLTKWNRTFEDISYPDTTALVWRPSRWGTAYRVRSHKSFFSALFSPFCSINTPSAFLMERRKEKSA	501076	501858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_501100_501900
827278	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_2976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533309	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
827279	contig_2636_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_52060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGGATCGAATTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62622	59546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_62471
827280	contig_11846_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_105970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCTGTCAGCAAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295652	296376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_295700_296400
827283	contig_2799_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_85485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGGCCTTCAGGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508939	511112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_508900_511100
827284	contig_5236_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_100928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGCTCAAGAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923295	922992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_923000_923300
827285	contig_13048_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_138947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTGATAATGTGCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550273	548625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_548600_550300
827287	contig_10556_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_176832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACCTATGCTGTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157778	159259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10556_pilon_+_157800_159300
827288	contig_20293_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_153535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCAGCCTCAGTAGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114909	113362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_113400_114900
827289	contig_14322_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_115662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	5	1160	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	243	389	533975	534121	FALSE	0	GCCCCTGTGCGTTTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGSVHAAASRLTLRSHGGRLRLGFRELRGRETGPRAHHGAGEGADCRGQRAGAAAEDDGQVLPEVHREAGGLLGQLGAEMHRHVHGPLHGRLEHRVPRLQLAAAAGASQHVTGTPPGGPPSSLCPFP	533431	534408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_533603_533689_533759_533972
827290	contig_14924_pilon	-	2008	8	Intergenic	novelGene_104146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	87	344	54770	54513	TRUE	30	AATAAACGCCGCGCCGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRVGKKSGLLLGHPTHNSEGGWAQTASMAGKMAPRVTQCMAQLPKGEACSPVGPSSSHWWGAVQAPKPRMGQRKKGEPRSLLLSLTASASVVSSVLTASRVRVQAHKAHCGH	54856	43923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_44197_44364_44486_45048_45123_45617_45751_45838_45920_46743_46832_47110_47183_53690
827291	contig_5059_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_140770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTAAGAAAATAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609442	608763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_608800_609400
827294	contig_5766_pilon	+	2056	3	Intergenic	novelGene_175054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	7	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGTCACCAGATTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107972	1173713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_1108086_1136689_1136760_1171840
827298	SIRV7	+	388	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTTTCACTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56111_70889_70988_78837_78955_114676
827302	contig_7411_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_137037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATGAAGGGTAGTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438561	437263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_437300_438600
827304	contig_5461_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_156830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798969	798038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_798000_799000
827307	contig_13780_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_149023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	0	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCATGTGAGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469683	468637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482
827308	contig_17790_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_128487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTGGATTGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93070	93665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_93100_93700
827311	SIRV4	-	246	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	368	3	-368	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGGTGCAAGCGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
827312	contig_12765_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_106543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGTACCTATTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9883	10373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_9900_10400
827314	contig_4114_pilon	+	1170	6	Intergenic	novelGene_15586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	425.408791634588	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	216	731	222996	249670	FALSE	65	AGAAAAAAAAGAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRRARWAQRLLLACTGLTPGSEQRRLGFPLSSRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRQAVMLPEGEDLNEWIAVNTVDFFNQINMLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDSVMQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLGSKDR	218150	250109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_218245_222874_223042_232345_232440_234095_234230_247835_248000_249592
827315	contig_6048_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_73131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAATTTCTGTTTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964739	965883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_964700_965900
827316	contig_6291_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_164786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTAAGGAACGTGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356683	356179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_356200_356700
827317	contig_8461_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_163917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTGGATATGTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225151	223912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_223900_225200
827319	contig_2924_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_140271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAGACAAACCAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189844	190934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_189800_190900
827320	contig_4857_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_48670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTAAAGAAAGAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055024	1053305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1053300_1055000
827321	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	3	340	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827324	contig_9132_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_121360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	183	junction_2	26.5	7854	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	136	483	36660	36033	FALSE	10	CATGCTGCCTCGGCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMFVVNTNVPRASVPEGFLSELTQQLAQATGKPAQYIAVHVVPEQLMAFGGSSEPCALCSLHSIGKISGSQNRAYSKLLCGLLAERLRVSPDRIYINYYDMNPANVGWNSSTFN	36795	35937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_36100_36225_36399_36552
827326	contig_10734_pilon	+	1078	5	Intergenic	novelGene_51363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17.4785582929485	38	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGAGTTGCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781488	1787987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1781700_1781738_1783470_1783581_1784314_1784402_1787234
827327	contig_5954_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_28782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTGGTATTAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391612	1390885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390900_1391600
827328	contig_8676_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_142193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACAAACCAGCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52580	53172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_52600_53200
827329	contig_8676_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_142194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGTAAAATCTAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53242	54605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_53200_54600
827331	SIRV4	-	240	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1281	0	1281	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3877	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
827334	contig_12046_pilon	-	1615	10	Intergenic	novelGene_83478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	87.3584922765927	75	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	572	1501	440574	372157	FALSE	25	TGGTTTTCTTTAACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKCCYRLFLKIQLEIKIALLVSFDQKSELVYITLGEGRCR	459455	372042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_372276_391727_391822_404547_404629_404711_404858_408214_408357_410629_410807_417122_417223_440503_440614_442835_442912_458999
827336	contig_7157_pilon	-	295	3	Intergenic	novelGene_131303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_1	11.5	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTCTCAGTACCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913046	909518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_909610_910242_910413_913012
827337	contig_10331_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_54157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTATTCCTATGAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477303	478518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_477300_478500
827338	contig_10857_pilon	-	1925	2	Intergenic	novelGene_160906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAACATTGTCTGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449468	445627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_446259_448174
827339	contig_3523_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_171485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97101	98689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_97100_98700
827340	contig_12080_pilon	+	1437	14	Intergenic	novelGene_128366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTCGCCGCCCGCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109603	164152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_109682_110383_110454_111359_111471_112071_112203_112892_113013_113191_113300_114210_114318_115730_115871_116524_116587_117709_117810_118006_118140_118502_118606_120727_120885_164135
827341	contig_15182_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_136460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCAGCTTCGCCCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534255	533777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_533800_534300
827343	contig_14326_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_120763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	82	588	610148	609642	NA	30	CTTACATCTCTAGCACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNNVQLYEYTIFCSSIHQLMDIWIVSTLAILNNGVVSISVQISLWTHVFLSLTYIPRSGIVRSYVNSTLKGTVLSHAYSRKATGVGKVIKKMKPGKGRLSRIKLRRTLSLWWAGEEELSTGGKETQGAGRYGQACTFTITFPAYTFSTLYVVQRPKTGLCMLLGNRS	610229	609457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_609500_610200
827344	contig_14314_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_176843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAACCTGTCATCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155201	154184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_154200_155200
827345	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	14	44	14	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827346	contig_5399_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_176846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGGAGGAAAAAGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215250	215962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5399_pilon_+_215200_216000
827348	contig_1699_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_72835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAATGGCATTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115325	117354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_115300_117400
827354	contig_17500_pilon	-	839	4	Intergenic	novelGene_157924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACACACAGAAATATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296298	253175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_253248_272678_273142_277217_277383_296159
827356	contig_17066_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_130956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251989	250939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_250900_252000
827357	contig_7457_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_31533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAAAGTTCAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733849	731476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_731500_733800
827358	contig_12622_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_5849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTAACTGTTGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945929	945462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_945500_945900
827359	contig_5424_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_172808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCCTATCCTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101047	98581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_98600_101000
827360	contig_15118_pilon	-	806	4	Intergenic	novelGene_74539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	101	619	56632	55053	TRUE	40	TACCTATGGAGGCAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVRSIVLDGGIFHVECGKMISQGHLTHHSSFLRSFYSENLNLNFVSNLFLLRHIYRVCLLKEQSFCSEKISSPMCYCHGLCPQVHPSQYFPDSNHKFARLLLDCTDLGIPSLLSLVHLLFLIGQSLLAWWLDNLMTLDCYSFPTSHPSRGSSEQGLVAATPPRKSPQPHH	56732	53237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_53410_55037_55165_55738_55835_56321
827367	contig_4392_pilon	+	1621	3	Intergenic	novelGene_117291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	0.5	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	290	691	74856	87318	FALSE	30	TAGGATTATATTACTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHGRSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAPSADQTLTNMNRYSSLLELVNKLKSFRIRASHKSLIIGL	74566	88248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_74961_79382_79488_87126
827368	contig_12102_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_151057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTAACAATAAATTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44466	43603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_43600_44500
827369	contig_5526_pilon	+	690	3	Intergenic	novelGene_111694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAAAATCATGTATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229258	247932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_229317_236407_236627_247519
827371	contig_14814_pilon	+	1260	2	Intergenic	novelGene_137736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGCCAATTCCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362630	364360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_362825_363294
827372	contig_11744_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_176854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123244	121778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_-_121800_123200
827373	contig_17549_pilon	+	868	4	Intergenic	novelGene_162603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGACATATGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296165	448875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_+_296610_374901_375027_436355_436506_448726
827374	contig_9239_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_137204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCGTTATATATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257668	258829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_257700_258800
827375	contig_5965_pilon	-	1448	3	Intergenic	novelGene_154654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	33.5	246	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	287	601	62963	51642	FALSE	30	AAAGTCTTTGACTATATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQLLTDESLESVTFRDVTVDFTQEEWQQLKPAQKDLYRDVMLENYRNLVSLGKGGSFAEFHHRPTTGGPQINKKRKKRWTDLTDVESLNYSKLKIKLIDDKM	65280	50794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_51924_62930_63019_65049
827376	contig_10196_pilon	+	1333	3	Intergenic	novelGene_132263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	24.5	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1031	1333	2002986	2003288	FALSE	25	CTGCTCCTTCAATAAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARYLSCRETSSWAGAGRPRSRLPMCMQTHTHGGTGRCSHMLGLDAGLLGPDVAFILVTFVVPLTLFQLPGDQQGAGQMGLAMRDRIPPNLRANAQASHL	2001805	2003288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2001877_2001953_2002089_2002161
827377	contig_15120_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_108039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	237	711	10	720	713636	714346	NA	20	TGGGGGAGGGCAGAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVMEGVLREVTGTCRLNSGLVDARSKNSAQGDRLPPVSDPFDNNNQIAYVDQSDSVDSSPVKEVKPSSHPGSLSKKPESTTKRSPSSKGTCEPDKSLRKGRPVLASQESSLSSTSPSSPVPVKVPIKPSRSRSKADSSSRASGRHSSPALPKKESSSKSQDALSSSPQKQKSASSLAYTTSAPAKKASGPATRGPFPPGKSRTSDRSLSREGSRQSLGSDRASISSTSKPSSPWMGQAR	713626	714347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_713600_714300
827379	contig_14536_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_69291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTTTAGGCCTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86660	85423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_85400_86700
827380	contig_7629_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_153602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCTTTGCCATAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414828	414631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_414600_414800
827382	SIRV6	+	333	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	11	2916	11	-2889	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGAGAAAGTCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2527	7899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
827383	contig_10733_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_109974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAATGTGTATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428996	427413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_427400_429000
827386	contig_14202_pilon	-	506	4	Intergenic	novelGene_157138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2189.77203278231	36	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACGATTACCTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88607	86158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87510_87958_88214_88577
827387	contig_12010_pilon	+	1339	5	Intergenic	novelGene_160950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	275.747620116657	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	188	508	200924	209386	TRUE	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRRFRGKGPGASHSSRRTFRSYPERRCTRSRGRCRSQPAEERGRGRQGRFQSGTALLKTSTMTKREAEELIEIEIDGTEKPECTEESIVEQTYTPAECVSQAIDINEPIGNLKKLLEPRLQCSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVISYQGKLL	195203	211412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_195366_200898_201001_205109_205255_209287_209545_210739
827388	contig_9389_pilon	-	1427	7	Intergenic	novelGene_84014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.6332495807108	63	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	704	1027	546335	545216	TRUE	30	CCAATCTGTACCGTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIAASRIQEAPIEEHWVIECNDGVFQRLQDWAPRQPHKVIPLKGLWEEVAPTLPDGHFDGILYDTYPLSEDTWHTHQFNFIKEHALSPAEAGGHPYLLQSHVLGGS	552181	543454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_543817_545177_545291_545510_545579_545962_546027_546218_546365_550336_550479_551649
827389	contig_9127_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_103004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACTTGTGATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100140	100649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_100100_100600
827390	contig_14467_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_138234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208865	209254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_208900_209300
827391	contig_16071_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_165992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33814	34838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_33800_34800
827392	contig_405_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_135275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAGGCTTATCTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16820	18511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_16800_18500
827393	contig_17274_pilon	+	1274	3	Intergenic	novelGene_26499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	177.5	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77084	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_77168_77893_78720_79944
827394	contig_19006_pilon	-	1261	8	Intergenic	novelGene_145586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGGCCTGATTGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83822	58710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_58754_59856_60066_67910_68043_69353_69468_76101_76215_79838_79936_80453_80534_83349
827395	contig_6552_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_163588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90665	89266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_89300_90700
827396	contig_9593_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_59706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCGTAACAATTGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148659	148065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_148100_148700
827398	contig_2450_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_160307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509467	508862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_508900_509500
827399	contig_9373_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_162731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	142	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGTAACATCAGCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294883	297201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_294900_297200
827403	contig_14353_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_82121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAAGCAAAACTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139238	140081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_139200_140100
827405	contig_14924_pilon	-	1571	8	Intergenic	novelGene_104164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	14.4405890546369	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	25	951	206743	57069	FALSE	30	GTGGTGAGTCTAAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDAVCQLLENKEDISQYGIARFFTEYFNSVCQGTHILFREFSFIQATPHNRASFLRAFWRCFRTVGKNGDLLTMKEYHCLLQLLCPDFPLELTQKAARIVLMDDAMDCLMSFSDFLFAFQIQFYYSEFLESVAAIYQDLLSGKNPNTVIVPTSSSGQHRQRPALGEASMLEGVEASLFYQCLENLCDRHKYSCPPPALVKEVLSNVQRLTFYGFLVALSKHHGINQALGALPDKGDLMHDPAMDEELERLLVQVPGLVNSVSASPEASCLPSRTPPRVASPWRPLHHSRKVDAESDGSTEETDESET	206767	56448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_57244_57468_57533_60520_60631_61256_61453_63179_63266_79036_79122_163115_163247_206663
827406	contig_14209_pilon	-	1087	5	Intergenic	novelGene_88360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	260	337	40683	40606	TRUE	25	GGAAATAGTCACTGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALLCLPGRLSAGGKPGQRSKQAGPGRAVGEGSTGLQSPPAGSLSGEQPQAWRLICAWRGGAYTQVTLPQGSQPGERGEAHQSRPPMDTQGQKTCQAQGGHRPGGLSSPGP	40985	37940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_38076_38555_38781_40140_40342_40416_40862_40904
827407	contig_5452_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_101036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATTTAGCAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627535	629477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_627500_629500
827408	contig_13547_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_104859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAATGAATGAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37512	36488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_36500_37500
827410	contig_9903_pilon	-	1659	6	Intergenic	novelGene_172010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	69.1415938491441	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGAAATTCTCTTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101511	81409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98239_98311_101467
827411	contig_7904_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_160019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCACTTTCTCCCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373366	371440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_371400_373400
827412	contig_18859_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_150555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTCGGAAAATAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174462	176304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_174500_176300
827413	SIRV6	+	433	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	249	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
827414	contig_3172_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_173679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCACCCACAACAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25434	24607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_24600_25400
827415	SIRV6	+	415	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	352	0	186	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
827416	scaffold_8345_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_107022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAATATTTTGACACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595789	594060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_594100_595800
827417	contig_1982_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_151339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTTGTGAATTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410902	412194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_410900_412200
827418	contig_1982_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_151340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412194	413002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_412200_413000
827419	contig_10864_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_107118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACTTTGCTCAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126341	1124923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1124900_1126300
827421	contig_10734_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_51454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	376	387	2221797	2221808	NA	40	AAATTTTATGTTATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPRLKRVSPGPWNSWVGSAIHKPIPIPEPDDRGLWTGGLQIILSSKLGPAWLRLAQESCSHQPVKKQPAVPPKVKQLPHDPAIPSPGIRSRGLKAGTQTDTCAPVCTAALFTTAKGGNSPAVHQQMNG	2221421	2222329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2221400_2222300
827422	contig_18189_pilon	-	2521	8	Intergenic	novelGene_170760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1652	2239	72054	68431	TRUE	0	GCTGGGCCGCGCTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGPSNGRLSPCQYLQVGGGQSQCMLAGETCSWRHPGLHGHLVKSIMMSARPSCTSVKVSGVTLLHTCRASATVCRTCSRTSCHGNRRILQGEVSLLPVPARQHKPLLSVASAQLIGWVRHATAGWSGATCGLGGLLGGRGRCQATGQSCMPGFRSPFHGVVAVGVQILSSSHHHLTSSCPRHVFPRQEMENHS	75837	65268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_65407_68286_68517_70755_70981_71777_72143_72270_72508_72627_72843_73809_74075_74991
827425	contig_4678_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_126009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGTAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220059	221705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_220100_221700
827429	contig_9424_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_143792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5241	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	24	299	278733	277512	FALSE	15	CCTTATGGTCTGAGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	278756	277474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586
827430	contig_11751_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_150283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGTACTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83293	82277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_82300_83300
827432	SIRV4	+	558	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	625	22	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTAGGTCATTAACATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3671	5133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
827433	contig_12756_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_153215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCTAACCAAGAGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161086	160276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_160300_161100
827436	contig_5031_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_133205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATACTAAACCCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78546	77370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_77400_78500
827438	contig_15093_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_143289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11638	12888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_11600_12900
827439	contig_13525_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_145089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTGAGAGGGATTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77553	78300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_77600_78300
827440	SIRV6	+	388	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	19	78	19	-78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTGGTCTGCGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827443	contig_14142_pilon	+	828	4	Intergenic	novelGene_120425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	15.5205956357638	725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	114	551	22531	23846	FALSE	15	GCCTGAGTTTGTCATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVHNLYLFDRNGVCLHYSEWHRKKQAGIPKEEEYKLMYGMLFSIRSFVSKMSPLDMKDGFLAFQTSRYKLHYYETPTGIKVVMNTDSGVGPIRDVLHHIYSALYVELVVKNPLCPLGQTVQSELFRSRLDSYVRSLPFFSARAG	22417	24123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22630_22780_22852_23285_23425_23717
827444	contig_253_pilon	-	1743	15	Intergenic	novelGene_129723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.0263219389799	52	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	75	1502	559713	554448	FALSE	10	CTGACCTGGCTATTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVFDLDLETEEGSEGEGEPELSPADVCPLAELRSAGLEPVGHYEEVELTETSVNLGPERIGPHCFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVQGTNLGKIYAMKVLRKAKIVCNAKDTAHTRAERNILESVKHPFIVELAYAFQTGGKLYLILECLSGGELFTHLEREGIFLEDTACFYLAEITLALGHLHSQGIIYRDLKPENIMLNSQGHIKLTDFGLCKESIHEGAVTHTFCGTIEYMAPEILVRSGHNRAVDWWSLGALIHPLPQRTGRKPWTRSSRGSWCCPPYLTPDARDLVKKFLKRNPSQRIGGGPGDGADVQRHPFFRHINWDDLLARRVDPPFRPCLQSEEDVSQFDTRFTRQTPVDSPDDSALSESANQAFLGFTYVAPSVLDSIKEGFSFQPKLRSPRRLNSSPRTPISPLKFSPFEGFRPSPGPSEPMEPILPPLLPPPPPSSTAPLPIRPPSGTKKSKRGRGRPGR	559787	554206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_554629_554893_555007_555094_555203_555281_555360_555500_555564_556025_556135_556280_556350_556430_556522_556649_556751_556828_556887_557968_558117_558771_558841_559123_559245_559332_559374_559635
827445	contig_6361_pilon	-	649	4	Intergenic	novelGene_23989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	24	362	420979	415399	TRUE	10	CTGTGCTTCTTTACTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	421002	410932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
827446	contig_16098_pilon	+	2336	1	Intergenic	novelGene_46195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	549	854	696186	696491	NA	45	GGAGTGAATATGAAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHILKVSSWLLRLEAGRPARSYATILQRDHGSLDEGEVLKVERSGWTWKCWGAELIALPCCMLECWDNRRIKNGSEAFGLNLVDMDSGRNLRGSLEVPDF	695637	697973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_695600_698000
827447	contig_16831_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_134788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCCAAACCCGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332790	331894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_331900_332800
827449	contig_19957_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_57714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCACTGTGTGGTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208095	207176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_207200_208100
827450	SIRV6	+	234	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	567	486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
827452	contig_4336_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_152371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGAGGCACCCAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396289	396957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_396300_397000
827453	contig_3068_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_137601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCATCGTGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14721	15898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_14700_15900
827456	contig_6283_pilon	+	1665	13	Intergenic	novelGene_100204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_12	89.7592458871075	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1605	60	1664	576611	588253	FALSE	15	ACGCTGCCAGCCGGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLFSSPGGSSPSPAPRTPAMPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEMYQKMQSPHTKLEVLHYRLSVSSALHSPAQPGFQALHTYQESFTPTEEHVLVVRLLLKHLHAFSNSLKPEQVSPSAHSHATSPLEEFKRAAIPRFVQQKLYLFLQHCFGHWPLDASFRAVLEMWLSYLQPWRYAPEKQAQSSDSQPRCISERWAPFVQENLLMYTKLFVGFLNRALRTDLVSPKNALMVFRVAKVFAQPNLMEMIQKGEQLFLEPELVLPHRQHRIFMTPTFTGSFLSSWPPAVTDTAFKVKSHVYSLEGQDCKYTPMFGPEVRSLVLRLAQLITQAKQTAKSISDQSAESTAGRSFLSWLGFWPVDTNSSYPTNDLDEVGQDSVRKTDEYLEKALEYLCQIFRLSEAQLAQLTLALGTTQDENGKKQVPDCIVGENGLVLTPLGRYQIINGLRRFEIEYQGDSELQPIRSYEIAGLVRMLFRLSSAINCRFAGQMAALCSRADFLGSFCRYHLTEPALANRHLLSPVRQA	573625	588254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_573675_576600_576734_577535_577608_580719_580807_583268_583415_584154_584246_584746_584848_585567_585732_586395_586602_586978_587213_587530_587663_587830_587960_588133
827457	contig_6028_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_156612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATATATATTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461435	460031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_460000_461400
827459	contig_16211_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_150068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATCAAGGAAAAGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81373	79973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80000_81400
827461	contig_4924_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_84742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACTCTACAGCACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151984	150734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_150700_152000
827465	contig_11304_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_156690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAATATCTCATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297254	297846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_297300_297800
827468	contig_10599_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_49891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTTTATGTATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232028	231464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_231500_232000
827469	contig_5954_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_28735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	52	399	1186699	1184787	FALSE	30	CCTTACTTTAGAAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLGLGLIALYIPHRADMSALKPLLLRGLTAPARRVLVPRAQINSKPPREQLGTMVRSGWGGCGRRRAGFGWGFSTLGLGGPGRLHHWAHLLLRVLPRASGLGHGTHGELQEAGVKGAALSLCLRPDHPRPI	1186750	1184618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1184936_1186500
827470	contig_7051_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_64326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305941	306731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_305900_306700
827471	contig_12148_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_140342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGCAATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124531	123663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_123700_124500
827473	contig_12697_pilon	+	2023	11	Intergenic	novelGene_122824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_5	9.53362470417207	36	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	77	1408	215749	231237	FALSE	20	TAGTGGCGTTACATGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLRSLTLLLPRAVGLRRRTLCALALCSTPVAHPVVACGRAAELLGRSRAAPLCGPRRLRVAGEVHRFRTSDVAQATLASVAPVFTVTKFDKEGNVTSFERKKIELYQELGLQARDLRFQHVMSITTRSNRIIMRMEYLKAVIAPECLLILDYRNLNLEQWLFRELPSQLAGEGQLVTYPLPFEFRAIEALLQYWINTLQGKLSILQPVILETLETLVDPKHSSVDRSKLHVLLQNGKSLSELETDIKIFKESILEILDEEEMLEELCLTKWSDPQVFEKSSTGIDHAEEMELLLENYYRLADDLSNAARELRVLIDDSQSIIFINLDSHRNVMMRLNLQLTMGTFSLSLFGLMGVAFGMNLESSLEEDHRVFWLITGIMFMGSGLIWRRLLSFLGRQLEAPLPPMMTSLPKKTLQADRRMEVKTSLRPDGLGSSRNILTNR	215672	231852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_215939_217053_217128_219954_219992_221451_221565_222791_222966_225344_225476_227333_227451_228271_228425_228684_228803_230455_230570_231126
827474	contig_7467_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_69483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGCAAATGTAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89489	90944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_89500_90900
827475	contig_5643_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_38989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	561	85	645	617238	617798	NA	5	CCCCCAGCTTCCTCCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPEKGPTLPPSPHPLPPASSSSAPAPPMRYPYSSSNSSAAASSSNSSSSSASQYPASQALPSYPHSFPPPTSLSVSNQPPKYTQPSLPSQAVWSQGPPPPPPYGRLLANSNAHPGPFPPSTGGQSTAHPPATTHHHHHQQQQQQQQQQQQQHHGSSGPPPPGAYPHTLEGSSSHHAHPYAMSPSLGSLRPYPTGPAHLPPPHSQVSYSQAGPNG	617153	617798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_617200_617800
827476	contig_4364_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_92	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGCAAGTCCGTAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892752	893080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_892800_893100
827477	contig_5791_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_35805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACCCAGGGACTCCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204156	203624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_203600_204200
827478	contig_5247_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_81829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCAGGATTTATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356348	357152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_356300_357200
827480	contig_9363_pilon	+	785	6	Intergenic	novelGene_6831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	316.167930062491	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	83	445	1622549	1625624	FALSE	10	CTGGGGCCACGCGAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAPGEQSDTL	1622466	1625964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623430_1625407_1625435_1625537
827481	contig_7962_pilon	+	1506	4	Intergenic	novelGene_149294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	119.049009515689	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	948	1364	196933	198716	TRUE	60	TGCGACAGAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSAKAEEYGKISFEETQPLVNSETESSFSINENTTASGSGPSENAPICERVGTPKKRRMEFEDDLIKESSSCGEDKKRTLDAEIFPEKKGSGDDGSTSKKRKIEADDVPTNGSSTRDGSQQKRKIELEDVSEKRKV	193787	204417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_194694_196891_197348_198714_198841_204399
827483	contig_10814_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_176859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAAACCATTGGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223120	221380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10814_pilon_-_221400_223100
827484	contig_14838_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_151929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTTACAGATAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256597	258436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_256600_258400
827485	contig_9955_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_21338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAAGGTCAGCAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81937	80533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_80500_81900
827486	contig_6071_pilon	-	652	3	Intergenic	novelGene_176860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	5	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	150	650	44953	9943	FALSE	35	AAAATTGTATGATTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHTRGDCLSFRGRIPVGPERLVGNALFSFQCREVERSTGPAGLGCTSWNMARCGEGSAAPVVILGSPGVCNKGLQRKGPYERRRLKVMVSEQLSRDLLRLLREEIHTDVTFCIGCTLFKAHKAVLLARVPDFYYHTIGKTSNNLTNHEPIVVENFEASEFRTFLQVVYSSNRNIKNYEEEILMKKILKSGLPPKIPDLNLGKCIDNDGRSSVEFLG	45102	9940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6071_pilon_-_10097_28338_28537_44804
827487	contig_3397_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_154597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTAGTTAAGTAGAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208823	209701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_208800_209700
827488	contig_8848_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_140474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCAATAATTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356495	356961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_356500_357000
827489	contig_7308_pilon	-	853	5	Intergenic	novelGene_159588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	8.73212459828649	130	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGCCTTGGCCGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183283	166945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_167256_176548_176664_180753_180909_182565_182744_183188
827490	contig_5196_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_38679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127024	128571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_127000_128600
827494	contig_13680_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_149597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388815	387880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_387900_388800
827497	contig_1339_pilon	+	1112	2	Intergenic	novelGene_163158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	224	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	119	637	678845	679363	FALSE	15	ATTTTCTGGTTCGGATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGSLGPAASGPRQGKSGAAGTSARSSGPRRPPHRLPLQMLLLPPRPPHPRSSSPEAMDPPPPKAPPFPKAEGPSSTPSSAAGSRPPRLGRHLLIDANGVPYTYTVQLEEESRGPPQREAPPGEPGPRKGYSCPECARVFASPLRLQSHRVSHSDLKPFTCGACGKAFKRSSHLSRHRATHRARAGPPHTCPLCPRRFQDAAELAQHVRLH	677501	679838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_677608_678832
827499	contig_240_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_173790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCACTTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265549	264199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_264200_265500
827502	contig_4315_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_46862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAAAAAAACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793189	793744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_793200_793700
827503	contig_12884_pilon	+	1066	9	Intergenic	novelGene_104989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	241	813	899943	906267	TRUE	15	CGGAGGAAGCTCGCGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERTQASSRAMSVSSSQGLTSRRMEDLATSAGFLAFFSVYCRSRSSRRRAASLSSSSSLPNRSMSLSSSSSAGVATFWAGGSTWRMGDTCWVCGAVARWVGELLSSVLSLASSLEKACCRSCTTLRRLWFSTSRLAMRMMSSLWSPPGPLETHSGQGFLDVLSGSRDVPEDHAGAVLLPTEPATGPFICS	899567	915260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_899661_899795_899993_900174_900394_900647_900751_901040_901122_905755_905843_906234_906355_906534_906675_915234
827504	contig_15629_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_122436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTCTTTATTCTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69503	70456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_69500_70500
827505	contig_15629_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_122437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTCAGCAATGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70456	72089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_70500_72100
827510	contig_6842_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_130792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACTATATAGTACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417376	1418131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1417400_1418100
827512	contig_13744_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_77189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCCAGCTCTGCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736571	737026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_736600_737000
827513	contig_5954_pilon	-	1689	10	Intergenic	novelGene_28483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	821	1333	322686	320163	TRUE	10	CGCGCACCTCGAGCTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTVSAVAWMACTRRLLSSRAAEAVDEPKEAAPRCNPRMRRPSFRYCSMGSHSRSRKPWTKLDDRVHGAHAPQQARELVFANVLQPLMEGVAQHLVHAQEPVPAAEPLQLQLGAVELGQADEEAGKCAHLVHGDMLAVVIQPNGHLGREAELPEVDGLLLQGGGPAATA	323591	319403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_319486_319690_319791_319890_319987_320084_320213_320337_320413_320606_320690_320973_321095_321235_321392_322658_322812_322896
827514	contig_3601_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_132937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	206	580	421820	421446	NA	70	TAAAAAAAGAAGAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMAQDQAAFCSFLHGVIMNRAMVASNYNMPILYRRKPRLKRLSNLPQVSQPASEIILIRTQIPRHLGDHGLLEFVVLTAVILSAFQPRGLIFQYFIQQYSVVVHMVFVASFSADRQACLPYLS	422025	420717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_420700_422000
827515	contig_299_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_129496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAAGTAACTTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601590	1602293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1601600_1602300
827516	contig_18895_pilon	+	2323	2	Intergenic	novelGene_176802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	120	2252	59110	61242	FALSE	45	ATAGTACCCAAAGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACRVINNRRHVGLQQLLSFAETGRTFLGPVKSSKFIIDEESHESVLISSPVRLLESLDLTSAVGQLLNEAVQAHNDTYGTGTNTLLFFVGAWSSAVEECLHLGVPIPVIVSVMSEGLNSCSEEVVSLQVPIHNLFDHVDNTNTFSGFETPSVNLCPFLQIPSDTGLIQKDHELKDVSQSMTIYSLSGRPVKSCKLFRLQAKVEANKDASQTLQTLINSRLADTSCRKSILTHSRHFNSTDNNHWVSKPDGLEQPSAATSKTYSCNDLVELAVGLSHGDHSSMKLVEAAVRLQYQNACMQQGSCSLPFMFDVSRIFTCCLPGLPETSTCVCPGYITLASISSTALIKELKDQPVRVVLVQGDLTENYRHLGFNKSTNIKTVLESMKVNQDSTEELWAHHVLQILTQFNVHLVLARGNVSDHLNEKCVYSKRLVIGSVNGSVMQAFAEATGAVQVAYITQVNEDCVGNGVYVTFWRSVSVDVVDKKNRMAILLKTEGINLVTAVFTGPVTAQMQTKEDRFWTCASRLYYALKEQKVFIGGGAVEFLCLSHLQIIEEQSLKKGNQAYSGWLHNSSSWLASSLALYRPTVLKCLANGWHKYLSTLMYNTASYSSEFEASTFIQHHLRNAIDSGSPSSYILSEYSELNSGVFNSGISNKLEQIPRVYDIVTPKIEAWRRALDLVLLVLQTDSEIVTGHGHMQINSKESEGFLFL	56125	61313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18895_pilon_+_56229_59093
827517	contig_11416_pilon	-	496	5	Intergenic	novelGene_145335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_4	435.175252053699	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	301	357	123185	123038	TRUE	0	CGTGGCTGTGTGTGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLVDGDQVGRRVRQRAVPWVRDFPTGWQGGRDPTTNWARLREGREVPLQRGSAAERVTSLGKDWHRPCLKCEKCGKTLTSGGHAEHEGKPYCNHPCYAAMFGPKGFGRGGAESHTFK	125737	122793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_125574
827519	SIRV6	+	231	3	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	493	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10730	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10814_11034_11109_11205
827521	contig_11316_pilon	+	516	2	Intergenic	novelGene_122699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139888	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139996_140117
827522	contig_4769_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_117990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATACCACTAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859452	861243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_859500_861200
827525	contig_1666_pilon	-	2124	2	Intergenic	novelGene_160588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATTTGTTTGTTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727818	724373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_724393_725713
827528	contig_11656_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_53993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTAAGCAATTCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454127	453169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_453200_454100
827529	contig_1964_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_130935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAATTGTATAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705476	703910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_703900_705500
827531	contig_5499_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_57027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATTTCTACTTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384525	1383326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1383300_1384500
827532	contig_4180_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_8419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTGGACATATTTAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892789	894407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_892800_894400
827534	contig_15666_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_70105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCTATTTTCCACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22461	24033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_22500_24000
827535	contig_4736_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_168630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTCTCCCAGCAGGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263895	264799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_263900_264800
827537	contig_12709_pilon	-	1797	7	Intergenic	novelGene_147420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.4255352650655	1	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	230	700	88840	73780	FALSE	30	TAAAGTACCAGTTATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEKKLRALELRISRGFNLASFNPHGISTFIDDDDTVYLFVVNHPESKNTVEIFKYEEEENSLLHIKTVKHELFPRYIYVADMLAHEIHVLEKHTNMNLTQSKVLKLDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQKLFVYDPNNPPSSDSPHPEYSN	110639	72682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_73809_74445_74573_75355_75438_87708_87836_88734_88901_102690_102766_110545
827538	contig_7697_pilon	-	427	2	Intergenic	novelGene_128291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTATTTTCTGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393196	387844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_388209_393133
827539	contig_5247_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_81790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAACAAACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98364	99537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_98400_99500
827540	contig_12638_pilon	+	1545	12	Intergenic	novelGene_33299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	91.3677520556486	1	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	672	1286	1256219	1283566	FALSE	40	ATGAAAAAGTCTACCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVGSLVVIVCLSFFLLSSWDFIPAVYGFILSVPDLTPNIGLFWYFFAEMFEHFSLFFVCVFQINVFFYTIPLAIKLKEHPFFFMFIQIAVISIFKSYPTVGDVALYMAFFPVWNHLYRFLRNIFVLTCIIIVCSLLFPVLWHLWIYAGSANSNFFYAITLTFNVGQILLISDYFYAFLRREYYLTHGLYLTAKDGTEAMLVLK	1176666	1283825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1176714_1190109_1190175_1202078_1202241_1205821_1205882_1207256_1207320_1223709_1223820_1242583_1242682_1256152_1256308_1257964_1258109_1260881_1261007_1267724_1267868_1283452
827541	contig_8133_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_98677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	32	391	391898	366604	FALSE	25	GTTTTTTTACCTATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLRRGFVAVMSAAIAALAASYGSGSGSESDSDSEGGRCSLPAADSLMHLTKSPSAKPSLTVAVDSAPEVAVKEDLETGVHLDPAVKEVQYNPTYETMFAPEVRKHIIFKALPFAKVFKLYIGKQFVNF	391929	366494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_366775_391709
827542	contig_8133_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_98676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATAATCCCTCTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365828	364955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_365000_365800
827543	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	4	1243	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
827544	contig_1262_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_133549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCCTGCTAGATCGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198788	196743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_196700_198800
827545	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	0	374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827547	contig_11449_pilon	-	1620	10	Intergenic	novelGene_170547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1317	1619	74844	38276	FALSE	25	GAAGGCCGGTGAGCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDSLLLYLISGVGDALCDALVCADGCCQFCVVLHNQFIQVTVTFLIGFFKATFLIFSVFNIITGRQSPDHRDEQPRGVFAFADSASVFPTSCFCRHLEG	241906	38274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_38368_59400_59590_74822_75015_98468_98657_105620_105727_127558_127803_140411_140463_145446_145623_236345_236491_241670
827548	contig_20716_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_176139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAACCTTTCGGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133577	132564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_-_132600_133600
827549	contig_8712_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_58866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835734	837330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_835700_837300
827550	contig_15327_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_70815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424177	1422703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1422700_1424200
827551	contig_9429_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_155098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATTAGGCATGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57156	57485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_57200_57500
827553	contig_7066_pilon	-	1340	2	Intergenic	novelGene_42168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCAGTTGTGAGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879510	877910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_878639_878898
827554	contig_3241_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_146429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGCTTATTCAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033166	1033772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_1033200_1033800
827555	contig_4232_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_63434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	601	1197	513506	512910	NA	55	TAAAAGATACAAGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLMTDPTSENDLFLDVEKSLEKFNVDWSKLVSVTTDGAPAMVSDNIGLVAKLKSKIKTFCKDTELKCIHCIIHQELFCTKRLKLEHVMDVVINTVNWIPSRGSNHRQFSALLDELDAQYGNLLYYTKVKWLSRGTVLKRFFELIKDIDLFMPSKGKSLPQLTSEDWIRDLAFLVDITDHLNTEYFSAKTFTSRYTNV	514106	512448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_512400_514100
827557	contig_20614_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_107537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGTTTTTTCAGGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85636	83285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_83300_85600
827559	contig_8866_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_77914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAAGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175408	1175792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1175400_1175800
827560	SIRV4	-	226	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1297	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3861	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
827561	contig_16930_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_139140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGTTAGCTCTCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28640	28080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_28100_28600
827564	contig_1516_pilon	+	865	5	Intergenic	novelGene_50010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1449.19063618283	153	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	40	618	347304	363486	FALSE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISPLCTSFSSRRKWMSGERSARAWGLETARAGA	347264	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353671_363387
827565	SIRV6	-	393	6	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-8998	393	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTCGCCCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10818	1151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1542_1647_1735_2779_2828_3105_3164_10723
827567	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_113378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	2	340	14409	13848	FALSE	15	CTGCTTATAGCTGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14410	13846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
827569	contig_13101_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_172772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	190	534	9443	9099	NA	35	TGAAACCTTACCTGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFEFVFPISVWKYCICLPQCTSSGYGTEGAHTARKSLSVPSLLVMKASSSSIVLSTTMGTILSAQAPISTAPKRGRHLYCHCCAQAVQGFQSNPVLPTVARGLPSIACIHCF	9632	8699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_8700_9600
827570	contig_11855_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_66886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTAAGCCAAGGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621976	622774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_622000_622800
827571	contig_5084_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_64572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAACTATAGCAAAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684604	683838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_683800_684600
827572	contig_5918_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_99482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTCCCAGTAAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167734	168698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_167700_168700
827573	contig_7594_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_55409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456653	458267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_456700_458300
827574	contig_12586_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_121803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATATCCCTGTAGCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45699	47504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_45700_47500
827575	SIRV4	-	178	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1340	3	1340	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3818	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
827578	contig_253_pilon	-	1216	10	Intergenic	novelGene_129666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	116.716920393629	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	728	1138	391060	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	395642	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390206_390353_390436_390689_390780_391054_391122_391810_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
827579	contig_6589_pilon	+	1066	3	Intergenic	novelGene_25929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	242	955	1208834	1211526	FALSE	10	CCTCTCGGTGTGTTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQVPPLATPWRDVHPFFLLSPLVGLVRQAWSHLRGPGPPESWLVEAVTEEAALDGEAKASLAFHHAAWGEHPQGEAEDSRTAEEDGEADRRACPDLKDSSSFLDASNDDDEEYGEEEATSVAREQGGEFTDGRPAPLPSSFLIRTLRDPPGEKESEKEKEAPEEGVANNTEMTKVFFYPLSPLECYPGVEEKEDEDREAVKKEAPRISIPPLSLGSKPSAWVCSPLRASPCLLV	1207850	1211637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1208083_1208824_1209513_1211491
827581	contig_15165_pilon	+	416	2	Intergenic	novelGene_145310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAGCTCCCTCGCTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1859	3118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_2186_3028
827583	contig_2027_pilon	+	737	5	Intergenic	novelGene_39962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	787.537141981253	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	90	641	661438	664407	FALSE	10	AGCAGGCGGTGTCCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTPLVSGILLLLWLITPSRACTCAAPHPQMAFCSSDLVIRAKFMGTAEVNQTTLYQRYEIKMTKTFPFIHQQMFKGFEALGDAPDIRFVYTPAMESVCGYFHRSQDRSEEFLIAGQLQKGHLHITTCSFIAPWSSLSSAQRRGFTKAYAAGCGECTVFPCSSIPCKLESDTHCLWTDQLLSGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRLQIA	661348	664503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_661463_662681_662762_662920_663072_663312_663438_664236
827584	contig_18072_pilon	-	1904	6	Intergenic	novelGene_173569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_4	30.1330383466387	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	271	927	245169	233874	FALSE	20	ACTAGCCTTAGCCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDGDYDYLIKLLALGDSGVGKTTFLYRYTDNKFNPKFITTVGIDFREKRVVYNSQGPDGSSGKAFKVHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLMFDLTSQQSFLNVRNWMSQLQANAYCENPDIVLIGNKADLPDQREVNERQARDLADKYGIPYFETSAATGQNVEKAVETLLDLIMKRMEQCVEKTQVPGTANGGNSGKLDGEKSAEKKCAC	292514	232896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18072_pilon_-_234064_235901_236026_238758_238863_242990_243077_245016_245189_292263
827585	contig_12841_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_55867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380033	381658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_380000_381700
827586	contig_4923_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_109322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1037	1336	106534	106235	NA	20	CCAGACTTCGCGCAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTGEPISAQEALSHGLLSKVVPEEQLEEETMRIAKKIASLSRPVMSLGKATFYKQLPQDLQTAYCLTSQTMVDSLAQQDGQEGIKAFIQKRKPIWSH	107570	105636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_105600_107600
827587	contig_11720_pilon	+	756	2	Intergenic	novelGene_44018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	604	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCCTCTGTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276732	282543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_276806_281860
827588	contig_13496_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_107655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTCCTGACAGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403397	402371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_402400_403400
827589	contig_13496_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_107654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402371	401466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_401500_402400
827590	SIRV4	-	372	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1151	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
827591	contig_13917_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_175614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAAAATAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188285	186790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13917_pilon_-_186800_188300
827592	contig_5222_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_58973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCTAGGATGTAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29630	28128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_28100_29600
827594	contig_9434_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_150505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1254	1562	353824	353516	NA	45	CTAAATGTCAATAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELGRTSSKPCITVTKNQRIILAKFIEHLLYPRHCAKNIIRVFSQQLYEVTPLITMRELSSETLSNFPKVTQPSRRRGKLFISVCLILKPTHHPASHGKTM	355077	352868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_352900_355100
827595	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
827598	contig_9708_pilon	-	1030	2	Intergenic	novelGene_67260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	61	933	50111	49239	FALSE	20	ACTAAGCTTGTCTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGLFPGCWSTSWLLVLGQIMDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66157	49141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50115_66100
827599	contig_10003_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_88160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTACAGATTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398186	396788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_396800_398200
827600	contig_10904_pilon	-	895	7	Intergenic	novelGene_22610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	341.738081967267	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	40	393	515110	510240	TRUE	5	CTCTGTGTGTGTATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWPGSAEPRTRTMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEAGESGQ	516000	499129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499408_507447_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
827604	contig_10962_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_103891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAATTAGGCCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279027	279479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_279000_279500
827606	contig_12270_pilon	-	351	2	Intergenic	novelGene_114005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	27	350	14409	13863	FALSE	15	GTCAGTATGGTTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14435	13861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
827607	contig_10475_pilon	-	897	2	Intergenic	novelGene_148731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATTTGTTGGAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89671	86702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_86954_89025
827610	SIRV6	+	332	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	541	0	375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827612	contig_7749_pilon	-	908	5	Intergenic	novelGene_170870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	488.468205208896	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	142	780	43942	23997	FALSE	15	GTATTGTTTCTGGGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGKAKEEGSWKKFIWNSEKKEFLGRTGGSWFKILLFYVIFYGCLAGIFIGTIQVMLLTISDFRPTYQDRVAPPGLTQIPQIQKTEISFRPLDPKSYEAYVLNIVRFLDKYKDSAQKDEMIFEDCGNVPSDIKERGEYNNERGERKVCRFKLEWLGNCSGLNDESFGYKEGKPCVIIKLNRVLGFKPKNESSPSMAVPLLVLQKNKKGKLT	44083	23868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_24069_25444_25630_27369_27526_39130_39260_43845
827613	contig_987_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_72335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231194	1230612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1230600_1231200
827614	contig_4315_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_46871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCCCCAGAGTTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867486	866648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_866600_867500
827615	contig_11551_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_168457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGCCTCATCATGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332245	330247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_330200_332200
827617	contig_7426_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_27515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCCCAGTAATACACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984555	984853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_984600_984900
827618	contig_7426_pilon	+	592	2	Intergenic	novelGene_27516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAAAGGAGGGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984853	988108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_985205_987867
827621	contig_14915_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_174306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	723	1190	66490	66023	NA	40	ATTCTAATACATTTCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTKPAGLQPLKPGTDLSLVGSAGLTNLWYLSTDRGCGGSAEWQKWFLRLDVLCWPLFLLSVTLQTCFRCAGPSCTWGRLPARTLPRPVTLPAAPAVGTVVLRPHCLVKDLLLLLSLSFRPSLAGDPEPSDDGILLAREKDLTSLSELEQFQDIF	67212	65997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14915_pilon_-_66000_67200
827624	contig_9332_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_60733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	49	441	556092	556484	NA	0	TTGTGTTTTTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFCLKIFKFNLVAYVQSCGFSSASFKILIFMFRASLHLEFTFWVQCGKGLFFSLMSTKLSYPLNRIVHFFITDLQYQFSQVSIYAWNCFWAICSISLSVLVPIPQCLNYCSIRMSLGISCSGFHSFVH	556043	557152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_556000_557200
827626	contig_5935_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_102676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	664577	664242	NA	30	ACTAAAATTCTGTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWQYQSEVHLLNKRLSSHTLGESFSRTCFLSLYNRIFQVFKFWFHFVQFIFKSLSFLAHCTVSGKEKPYCSFKIWLRNFLSQTAKFDFLTLTSSTCHQTLKRSSGKFFATA	664577	662472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_662500_664600
827627	scaffold_13505_pilon	+	738	5	Intergenic	novelGene_111421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.636178131932	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	1	738	455604	458422	FALSE	20	AGACATTCTCCCAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGADGVYRARGSLHRFYTSPRRHGGREEPAEGCGGRGAERHERRRATIRPWGGFVDQRRFSRPRNLGELCQRLVRNVEHYQSNYVFVFLGLILYCVVTSPHAVGGSGGLLWCLLHPLSAHTAVQACALWPRGEPSPSVRSGRRCLLPLLLAGGCRLGRLLGPGSHPRGHRLPRCLPPDRGCGRGGAADGACVRCPQEPAGLPGLPPCPCSPPCCTALLLRPKSPSPLQAQEGISALEIKLLQLSFC	455603	458422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_455727_456074_456239_456548_456648_457989_458092_458172
827628	contig_4103_pilon	+	833	4	Intergenic	novelGene_51970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.09817126073	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	292	615	174424	175646	FALSE	25	GGCCCTGGGTAGGAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNKERGWNDPPQFSYGLQTQAVGSKRTPLTKRVAAAQDGPPPKGPPPPSDKAPRPSPVGSCPASSVKPPSFPVIKSETLLEDVLRPLEQALEDCRGHMRKQVCDDISRRLALLQEQWAGGKLSMPVKKRMALLVQELSSQRWDTADDIHRSLMVDHVTEVSQWMVGIKRLIAEKKSLSSEEEAAEKSAATTEENQTVPGFFGAP	171514	175864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_171628_174245_174430_175196_175306_175437
827630	contig_2332_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_58699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTACTTTTCAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588709	588264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_588300_588700
827631	contig_2332_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_58698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATAACAGTATTTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588112	586530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_586500_588100
827634	contig_16261_pilon	-	378	2	Intergenic	novelGene_155298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	23	376	46215	45639	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGGCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAEDAAVYYCLYGYGYSYG	46237	45636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
827636	contig_10238_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_170104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419365	420688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_419400_420700
827637	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
827639	contig_17194_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_155373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTAGTAATCAGGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247060	247742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_247100_247700
827641	contig_9668_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_58155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGTTTAATCTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381786	380142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_380100_381800
827643	contig_21065_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_176863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTAGGTATGCTGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5072	5801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21065_pilon_+_5100_5800
827645	contig_3193_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_126314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1004	1375	96996	97367	NA	15	CGCAGAGCTTCTCCCGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSVHMGTSSLNSGSVYMGTSCLDSGSVHMGTSCLDSGSVHMGTSCLDSGSVHMDTSCLDSGSVHMDTSCLDSGSVHMATSCLDSESELMDSICLSKVVTALDFLKNHGDFCPGKRYDATPL	95992	97620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_96000_97600
827646	contig_12464_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_68709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAATGGCTATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353339	351912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_351900_353300
827649	contig_10861_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_39413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGCATTCTGACCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1964719	1962611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1962600_1964700
827653	contig_1406_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_25636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTAAAATATTGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2646974	2645893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2645900_2647000
827656	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827657	contig_7273_pilon	-	1144	4	Intergenic	novelGene_176866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	3.55902608401044	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	168	410	43053	34028	FALSE	45	TTAATAAAGTGTATTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTDRVIGGLLAGQTYHVSVVCYLKSQVRATYHGSFSTKKTQPPPPQPARSAINLMVSTEPLVGTETDICKLPKDEGTCRKFILKWYYDSETKSCARFWYGGCGGNENRFNSQKECEKVCVPVLVNPGAITAIGT	44031	33293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7273_pilon_-_34069_34835_35001_43016_43104_43914
827658	contig_11269_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_145826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGAGTCTGCTTTCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335682	336533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_335700_336500
827659	contig_152_pilon	+	1018	8	Intergenic	novelGene_162647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	146.494688905609	36	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2	406	722961	724852	TRUE	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGRWLIDRGGKVRHELRGTTQTVLWPWRSRSSPALVDVDGRVCGKPEKLRIVEQSVRQVCNQVVSAPAGHFPTHDLWDKRCRRSSKLVDECEVQDCKASPARCPHVVRRRSIASSAECARQPRHEPVLCPDKC	722959	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_723565_723823_724555_724613_724850_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729514_731414
827660	SIRV4	+	347	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	635	966	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2800
827661	contig_7321_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_53127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCACCCACTTAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134177	134827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_134200_134800
827662	contig_7321_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_53128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGCACCACCCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134827	135251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_134800_135300
827663	contig_5210_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_65451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTAGACATTGTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613375	614388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_613400_614400
827664	contig_7078_pilon	-	1313	13	Intergenic	novelGene_130178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	363.557528307267	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	96	1313	795828	772547	FALSE	25	GTTACTGGGAACTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEREKEKNKTLRNTIQWLENELNRWRNGETVPVDEQFDKEKANLEAFAVDKDITVTNDKPAATIG	796283	772546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_772660_773113_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776425_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795836_796195
827666	SIRV6	+	323	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	550	0	384	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827667	contig_2332_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_58627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTATTGAAATAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5066	6194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_5100_6200
827668	contig_10734_pilon	-	1038	5	Intergenic	novelGene_51114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	196.748570515773	366	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	113	880	739047	737389	FALSE	0	CCCTGTTGTGTTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKVGITILPVTHLSCTFHVPSPAHVLLLQQATRGDGLAFQMRAGLLP	739503	737230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737597_738019_738138_738215_738501_738890_739059_739402
827669	contig_5201_pilon	-	1713	4	Intergenic	novelGene_82167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACAAGTCTTCCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206051	202755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_203575_203833_203960_205219_205439_205502
827670	contig_12353_pilon	-	1282	8	Intergenic	novelGene_165775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_7	86.8312931458916	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	64	1281	146414	121340	FALSE	40	TAGAAGAGATGGAATCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRPKRTFRQRRADSSDSDGGKESSTEPGAPEGQAAPGPAEEKPPVVAARPPFRGRRRVWASSRRAARAAPSAGGDPGDQGDTESDSENALLECRTIDLSTDEEDGTHHSSESKDDQSSSSNNSSSPEEKTFSSIARIPDATFIQAARRKRELARTQEDYISLDVKQTSTICGVKKNSDEDPESEPDDHEERIPFTLKLQTLRQRMAEETTTRNEETSEESQEDENQDIWEQQQMRKAVKMMEGRDIDLSHSSESQKVKKFDTSISFQPVNLEVIKRQLNTRLTLLQDTHRSHLREYEKYIQDVKSSKSTIQNLENSSNQALNYRFYKSMKIYVENLIDCLNEKIISIQEIESSMHALRLKRAMTFMKRRQDELKHESTYLQQLSRKAETSTNGSLAIDEKTQWI	146477	121338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_121399_122720_122845_125210_125398_127464_127581_132775_132874_134049_134275_136191_136342_146155
827673	contig_12019_pilon	+	1211	4	Intergenic	novelGene_87739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	208.135105693927	20	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	4	510	623205	642506	FALSE	40	TTTCATGCATAAAAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEGGTWFIFRSSPRPQTTEAIWDVNP	623201	643207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_642431
827675	contig_11338_pilon	+	810	7	Intergenic	novelGene_6246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	87.5	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	88	744	81743	84021	FALSE	10	TCTATGCATCCTCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILAAVTSAGHPFLVNLFGCFQTPEHVCFVMEYSAGGDLMLHIHSDVFSEPRAVFYSACVVLGLQFLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTKGYVKIADFGLCKEGMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSVPTLSDRTDVSNFDEEFTGEAPTLSPPRDARPLTATEQAAFQDFDFVAGDC	81655	84087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_81814_82107_82171_82275_82353_82552_82696_82974_83083_83183_83223_83865
827676	contig_5921_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_142239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTCTCCCTAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101777	102488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_101800_102500
827677	contig_18283_pilon	+	1132	6	Intergenic	novelGene_170695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	95.0292586522698	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	199	1131	18845	110906	FALSE	40	CAATAGAGTTGAGGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLSTAAPNIAHVHVDLTCTCRCCVQRFTGMWCHRLFHLQSRLQNLLKGGVTSWALQQPNFKRLFPLAIHGHHTASKSLNCAWQQHEDHFELQYANTVMRFDYVWLRDHCRSASCYNSKTHQRSLDTASVDLCIKPKTIRLDETTVFFTWPDGHVTRYDLEWLVKNSYEGQKQKIIQPRILWNAEIYQQAQVSPVDFQSFLETNEGLKKFLQNFLLYGIAFVENVPPTQEHTEKLAKRISLIRETIYGRMWYFTSDFSRGDTAYTKLALDRHTDTTYFQEPCGYNNYDRAVINTIPYDVVHRWYTAHRAL	18646	110907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_18937_53895_54078_73948_74126_84641_84922_92554_92675_110824
827678	contig_3081_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_133981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACGGGGGATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224440	1226767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1224400_1226800
827681	contig_8153_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_34802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACCTATTACTGATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138137	137032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_137000_138100
827683	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	101	20	-86	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGAGTTAGGTAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2386	10768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
827685	contig_11978_pilon	+	675	5	Intergenic	novelGene_63087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	4482.20963225729	15	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	261	587	1830693	1831883	FALSE	20	TCTCAGCTTTTTAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829077	1831971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830127_1830668_1830785_1831161_1831273_1831759
827686	contig_9195_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_155675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTCACCCAGAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107340	109312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_107300_109300
827689	contig_3426_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_57907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	63	422	143723	143364	NA	40	ACTTCCATACATAGAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTLSKVENLGDLEKQGGPIMFWLSQVSLYISIHVLLKEKDFTFPKAGSTGKRSLTTVALWHYFSYPLNWGLLFYLFGSEQWRKSIPDDSIVQSNFERMDENGTELKAGGKEVQTMWPVSCWPGGLWSLIIAYHNSPHF	143785	141917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_141900_143800
827690	contig_8594_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_140040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393918	394801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_393900_394800
827691	contig_10734_pilon	+	1537	10	Intergenic	novelGene_51224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	217.131296684748	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	301	1398	1243306	1333513	FALSE	30	CTTCAACAAAGAGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198704	1333652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1240226_1240306_1243189_1243385_1247255_1247552_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
827694	contig_2078_pilon	-	1094	2	Intergenic	novelGene_100196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATACAGTATATACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558116	556337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_557314_557998
827695	contig_3270_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_104510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCCCACCTCACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399402	400332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_399400_400300
827696	contig_15518_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_127621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTAAAAAAGAGCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16675	16178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_16200_16700
827698	contig_3193_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_126312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACCTTTAAGATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84763	85245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_84800_85200
827700	contig_9389_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_84132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATGCTATCAGCCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612534	1611876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1611900_1612500
827702	contig_11378_pilon	+	801	4	Intergenic	novelGene_112329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_3	32.8362942827327	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	71	742	1234052	1235221	FALSE	25	ACCACTGTCTCCAGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKNREKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSITRVDIAGRDVSRYLRLLLRKEGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSINPQKDEALETEKVQYTLPDGSTLDVGPARFRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVLAFAVHKSDVDLRRTLFANIVLSGGSTLFKGTAVWGRGRGGRLWRPSGSWAPETTPRLSEPETWPFLVGFWCSRSLFFLRVEFFF	1233981	1235280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1234072_1234310_1234528_1234659_1234753_1234879
827704	contig_1275_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_108799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAACCTATTGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508068	506472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_506500_508100
827705	contig_4364_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_1037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
827706	contig_15354_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_65731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTCAGTCGAGGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572537	573168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_572500_573200
827707	contig_14519_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_66832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAGAATCTTAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357778	356396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_356400_357800
827708	contig_5799_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_50267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTAAGCAAAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248557	250250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_248600_250200
827711	contig_8452_pilon	+	651	4	Intergenic	novelGene_48110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACAGCCCAGCCCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962768	991166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_963082_968669_968776_981611_981740_991062
827712	contig_6233_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_74816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCATAACAGAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242488	240845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_240800_242500
827713	contig_10148_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_172874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330209	331972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_330200_332000
827714	contig_833_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_176485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTGGATTCCAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589760	590385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_+_589800_590400
827715	contig_4232_pilon	-	728	7	Intergenic	novelGene_63485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	442.209509169579	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	13	459	620488	614837	TRUE	15	CACGGAGATCTCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620500	607754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_607832_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
827716	contig_8885_pilon	+	984	4	Intergenic	novelGene_115590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.7907545067406	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCCTGACTGTAGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351171	352682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_351375_351420_351632_351974_352109_352246
827717	contig_6102_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_32015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGAGCACAATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485701	485485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_485500_485700
827718	contig_9185_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_166874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTATATGTAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28792	30888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_28800_30900
827719	contig_6418_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_81166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519572	517693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_517700_519600
827720	contig_14698_pilon	+	1860	9	Intergenic	novelGene_168129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_5	36.8781778291715	105	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	56	1462	64977	183440	FALSE	75	CCAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSAEHPGASKPPISSSSMTSRILLRQQLMREQMQEQERREQQQKLQAAQFMQQRVPVSQTPAINVSVPSTLPSATQVPMEVLKVQTHLENPTKYHIQQAQRQQVKQYLSTTLANKHANQVLSLPCPNQPGDHVMPPVPGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFEEQNRVESECPSMNTHSRAPCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMDPALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKELENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRVIKQEPVLENCNQDLLQHHTDLTCTTTLDLTDGTITFNNSLGTGTESNQVYCVPAKMGAKLEDILMDDTLSPVGVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEEAEHAC	64921	183838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_65175_153405_153634_154692_154777_157092_157189_166046_166165_168183_168241_175145_175222_178570_178719_183038
827721	contig_12119_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_88647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTAAGAGGGGGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137113	137463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_137100_137500
827722	contig_12119_pilon	+	221	1	Intergenic	novelGene_88645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCTAGGAGGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128861	129082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_128900_129100
827723	contig_3386_pilon	+	1447	4	Intergenic	novelGene_34483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	20.4613456709637	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1	528	122000	138941	FALSE	60	TATACCTATTAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIPPDSWQPPNVYLETRSCALLSPYSMGIIVLELYWKHAPKTCKNFAELARRGYYNGTKFHRIIKDFMIQGGDPTGTGRGGASIFGKQFEDELHPDLKFTGAGILAMANAGPDTNGSQFFVTLAPTQWLDGKHTIFGRVCQGIGMVNRIGMVETNSQDRPVDDVKIIKAYPSG	121999	139860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_122056_124643_124826_138079_138149_138720
827725	contig_5020_pilon	+	814	2	Intergenic	novelGene_27955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	101	junction_1	0	749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTGCTTGATCACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198473	201811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_198644_201167
827726	contig_2480_pilon	-	1060	7	Intergenic	novelGene_63510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	28.0678740832924	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	413	1012	128902	123268	FALSE	25	CATATGGATACTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKNVRCPTCDLRKPARSKHCRVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQYLFLLFPRIIFFLGFVLVLSFLLGGYLCFALYLAATNQTTNEWYRAGRAPRQHCRHEAQPLSAEPQVFQNIHSHGVWSNLREVFLPATRYEKKKK	138387	123219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123556_127197_127443_128835_128962_135239_135314_136226_136352_137755_137895_138372
827728	contig_2487_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_148485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAAAAGAGTGTAGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214321	212917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_212900_214300
827729	contig_10600_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_169868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCACCCCCTTTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162060	161360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_161400_162100
827730	contig_10600_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_169867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1059	1388	160302	159973	NA	20	CACCCAGCATTTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSPFPAPTLLLSSSAGLPAVLPSTVAHAFLLPRISSLSHSLRSLGGTSSLQSSANIKVGCSLHGRKTWHSVFVKITASKTLWEQFYSVTWVTISLVFFVFLPLPVTW	161360	159891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_159900_161400
827731	scaffold_6394_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_111070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557985	559166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_558000_559200
827732	contig_3825_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_77993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTCCCATAACTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749848	750679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_749800_750700
827733	contig_15422_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_173107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATGAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47293	46432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_46400_47300
827734	contig_5836_pilon	+	2028	2	Intergenic	novelGene_106293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGCTGTTGCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253686	257382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_253756_255423
827735	contig_13823_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_145266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTCTTCAGAGCAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270208	269095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_269100_270200
827736	contig_17311_pilon	-	370	3	Intergenic	novelGene_57860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	2351.5	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	29	370	123675	121543	FALSE	35	GCAGGCAAAAAGGTATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVG	123703	121542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344_123555_123642
827737	contig_4315_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_46769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263281	262544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_262500_263300
827739	contig_11281_pilon	+	809	2	Intergenic	novelGene_125485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAACACACAATGCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894401	900726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_895115_900630
827740	contig_15185_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_99436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTTAAGGCTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397411	396118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_396100_397400
827741	contig_14142_pilon	-	1880	9	Intergenic	novelGene_120469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	24.1993672437938	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	301	1347	259646	247231	TRUE	20	GATACTAGAGTCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMQWGLSIRVSLSVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLDELTAAHSLCFSLDGSQLFSGFNRTVRVFYTARPGRDCEVRSTFAKKQGQSGIISCIAFSPTQPLYACGSYGRSLGLYACDNGSPLALLGGAPWGHHPPLLSP	259946	246245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248104_248210_248334_258456_258569_259008_259108_259245
827743	contig_7467_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_69475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_3	54.8229473446618	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	196	435	72454	70791	FALSE	60	TATTTAAAAACAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFKTLKRDEEEAAVRNEQVRQRAKECSQALNLILDLDHGRPIKNALDLEFDVKQLKDSIDRNKVAMIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIR	74628	70278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_70966_72389_72482_73580_73695_74574
827744	contig_7019_pilon	-	1237	4	Intergenic	novelGene_149454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.2046505340853	18	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	108	725	507011	506394	TRUE	80	GCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQPDPETLNENSELLFSFGVIADIQYADLEDGYNFQGNRRRYYRHSLHHLQDAIEDWKKESNIPCCVLQLGDIIDGYNAQYQASEKSLELVMNTFEMLKVPVHHTWGNHEFYNFSRDYLTNSKLNTKFLEDQIVHHPETIPSENYYAYHFVPFPKFRFILLDSYDLSVLGMDQSSPKYQQCMKILKEHNPNAELNSPQGELFL	519446	503322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_503546_505060_505279_506322_507037_519364
827745	contig_120_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_165244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13524	15402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_+_13500_15400
827748	SIRV2	-	540	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	100	46	100	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCTACTGCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5795	3711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
827750	contig_15828_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_173242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25435	24022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15828_pilon_-_24000_25400
827751	contig_348_pilon	+	1113	6	Intergenic	novelGene_67600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.28952211790544	6	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	382	684	342267	345268	FALSE	15	ACTGTATCTCTTCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314468	345697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_320084_320269_320421_320458_342200_342306_342779_342990_345214
827752	contig_16076_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_173865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGCAAGAAAAACAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151778	153977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16076_pilon_+_151800_154000
827754	contig_20819_pilon	+	441	5	Intergenic	novelGene_55672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTAGTGTTGAGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65398	69667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_65517_65650_65741_65858_65960_66045_66135_69624
827755	contig_2987_pilon	-	751	5	Intergenic	novelGene_125871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	35.0169601764631	1747	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	239	661	606175	603389	FALSE	15	ATGTCTCCTGCGTCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLEKGEYPRWDTWSSSYRSDRLVSFRPVKMDSQEHKICLFEGANFKGNALEIQGDDVPSLWVYGFCDRVGSVRVSSGTWVGYQYPGYRGYQYLLEPGNFKHWNEWGAFQPQMQAVRRLRDRQWHREGSFPAPATELPK	610789	603298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_603573_604792_604936_606079_606213_610478_610617_610726
827756	contig_4754_pilon	+	1011	5	Intergenic	novelGene_35899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	104.282069407928	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTATGGTTTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114784	129219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114975_119671_119871_121506_121634_121913_122010_128820
827757	contig_6102_pilon	+	1204	10	Intergenic	novelGene_31775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	264.213204219529	53	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	149	1003	350018	355818	TRUE	50	AAATCAGGAGTCAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRYCA	349869	357619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355840_357439
827758	contig_1213_pilon	+	1162	5	Intergenic	novelGene_76470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGGGCACGCATTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70794	78004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_71474_71551_71720_73624_73743_75371_75473_77908
827759	contig_5031_pilon	+	1384	4	Intergenic	novelGene_133211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCCAACTCATAGCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87419	93957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_88305_90740_90851_92326_92422_93663
827760	contig_4732_pilon	+	1223	6	Intergenic	novelGene_75424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	331.368918276896	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	43	780	596758	609046	FALSE	20	AGAAACCTGCGCCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRIVSQKQIADRAAHDEWGEWQGAQGWPEARRTARPSTLLAFSMADSQKRLLPSLSGHLAQPAPRPDPENLPG	596715	609489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607378_607825_607907_608495_608551_608874
827761	contig_9706_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_20966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCATTGCTCCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319160	318403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_318400_319200
827762	contig_6497_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_35628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGAGAATGAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714661	712358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_712400_714700
827764	contig_8866_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_77901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGACGTCTGAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115152	1116533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1115200_1116500
827765	contig_11678_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_160853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.68117106477861	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	61	1455	288184	285454	FALSE	20	GCTTAAGACTGCTCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDFRELRAQLTRPAAGGPAMAPPRPLLMLALLAWAVLADQESCKGRCTEGFNADTKCQCDELCSYYQSCCADYMDECKPQVTRGDVFTLPEDEYGVSDYREQTEHNASIHPQPENPIQSPDLQQRPVPNLEEEGPEPERVTLRTEVVALGPGTSDLESPVEEELCSEKPFDAFTNLKNGSLFAFRGQYCYELDEKAVRPGYPKLIRDVWGIEGPIDAAFTRINCLGKTYLFKGSQYWRFEDGVLDPDYPRNISEGFKGIPDNVDAALALPAHSYSGRERAYFFKGKQYWEYTFQQQPSQEECEGSSLSAVFARFALMHRDSWEDIFELLFWGRSLGGASEPKFISQHWPGVPEQVDAAMAGHIYVSGSAPRSSWAKKTKSARRNRKRYRSRHGRRRSRYSRPPIRSAWQSWFSSEESGLGTYSDYDMDWLVSASCEPIQSVYFFSGDKYYRVNLRTRRVDTVNPPYPRSIDTYWLGCPAPGHQ	288244	285381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_285567_285748_286082_286560_286714_286873_287031_287297_287438_287516_287832_287906_288027_288120
827766	contig_8866_pilon	-	1513	2	Intergenic	novelGene_77886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTATTTAATTCTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011749	1009081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1009687_1010841
827769	contig_15691_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_60780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTACTTTCATACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113427	114873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_113400_114900
827770	contig_2114_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_104271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGATCAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561161	559999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_560000_561200
827771	contig_10235_pilon	+	1174	5	Intergenic	novelGene_46600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.2651016552186	882	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	260	712	596627	598482	FALSE	15	GTATTGGTGGGAACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDCSGSCGQCVWPPVLFFSLQWLETRPERQECPVCKAGISREKVVPLYGRGSQKPQDPRLKTPPRPQGQRPAPESRGGFQPFGDTGGFHFSFGVGAFPFGFFTTVFNTHEPFRRGTGVDLGQGRTASSWQDSLFLFLAIFFFIWLLSI	596367	598944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_596681_597608_597737_598026_598082_598160_598279_598384
827772	contig_14516_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_153882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAGAAAAATATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32042	33130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32000_33100
827773	contig_13067_pilon	-	1107	4	Intergenic	novelGene_141336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	440.713814926043	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTGGTAGTAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74950	35560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_36413_52559_52644_53605_53720_74893
827775	contig_13206_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_161895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCTATTCAAAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106873	107390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_106900_107400
827776	contig_11855_pilon	-	755	6	Intergenic	novelGene_67050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	49	753	2007337	1995568	FALSE	5	CCTGCTCGCCTTCCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVLVRTGSQEGQVRTWGRRLFKYPHPLTAFWGLPFEDIAVIGPRGGSKGKDWRWAALFQEGRVTWRGGLSLGMDASSSTAPRCSSWLAQPDGWGDARGMEGELARLPGSRGRREGSQLLLWGGAGARCPSGISRILSSSSSPCSFTNTSSSSWLSPSRLLCRQGLSRRTVDPEGKLGGDPQSSPHSMVPLEWGAPLLLFPAAAQLCPLQLLLQLGDLVVCAAPGRRALVCTGA	2007385	1995565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1995615_1997476_1997592_2000912_2001045_2002252_2002453_2004011_2004165_2007279
827777	contig_9909_pilon	-	1600	15	Intergenic	novelGene_42469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	9.14732033918978	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	23	1468	640444	580096	FALSE	55	AAGATTAAAGATTAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTEVATFMKDTLAVMDSSDAQRKKIAVIGGGLVGSLNACFLAKRNFQVDVYEAREDLRVAKLARGRSINLALSYRGRQALKAIGLEDQIVSQGIPMRARMIHSLSGKKTAIPYGTKSQYILSISRENLNKDLLTAVEKYPNAKVHFGHRLLKCTPEEGVITVLGSNKVPTDVTCDLIVGCDGAYSTVRSHLMKKPRFDYSQQYIPHGYMELTIPPKNGDHAMEPNYLHIWPRNTFMMIALPNTNKSFTCTLFMPFEEFEKLLTGSDVLDFFQKYFMDSIPLIGEQALMQEFFLLPAQPMISVKCSSFHLKSRCMLMGDAAHAIVPFFGQGMNAGFEDCLVFDELMDKFNNDLSVCLPEFSRFRIPDDHAISDLSMYNYIEMRAHVNSRWFIFQKNIERCLHAIMPSTFIPLYTMVTFSRIRYHEAVLRWRWQKKVINNGLFFFGTLIAIGSTYLLTHYMLPRPLDYLRRPWNWITYFQNTGHVSLKLP	640466	579963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_580261_581712_581773_581862_581965_583148_583232_585519_585578_587424_587573_597565_597688_599382_599455_603437_603604_605370_605459_609350_609400_614123_614214_615734_615833_616136_616207_640369
827778	contig_2987_pilon	-	716	3	Intergenic	novelGene_125873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	34	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATGTCTCCTGCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610789	603300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_603573_606079_606213_610478
827779	contig_7396_pilon	-	1374	4	Intergenic	novelGene_79520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	42.5754232705521	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	170	772	207649	194786	FALSE	30	TCTTAAAGCTGGAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAREAWTLRCLRGPVTPRLEKRLWQVRGIPITSASYYATVTLEQVQHIFRSDTDVPMPLIEERHRILNETGKILLEKFEGSFLNCVRKSEQSAQKLMHLVVESFPSYRDVTQFEGKRISFYKRAQILVADTWSVLEGQGDGCFKDISSITMFADYRLPQVLLHLGALRYSDELQKKLLKGEMLSYGDKQEVEIRGCSVWCVELIRDCLLELIEKKGEKISGEINSILLDYYLWDYARDHRADMNGIPFHHTRCIYY	208695	194183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_195019_201889_202086_207475_207736_208612
827780	contig_1339_pilon	-	1020	4	Intergenic	novelGene_163148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	22.4548930574657	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	201	869	442014	437156	FALSE	15	GCTGTTTTTAGGTTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSNVENLPPHIIRLVYKEVTTLTADPPDGIKVFPNEEDLTDLQVTIEGPEGTPYAGGLFRMKLLLGKDFPASPPKGYFLTKIFHPNVGANGEICVNVLKRDWTAELGIRHVLLTIKCLLIHPNPESALNEEAGRLLLENYEEYAARARLLTEIHGGAGGPSGGRAEAGRALPGASSASTDPLAPGGPGGAEGPMAKKHAGERDKKLAAKKKTDKKRALRRL	442214	437004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_437483_439699_439891_441266_441415_442011
827782	contig_2310_pilon	-	1585	2	Intergenic	novelGene_71616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGTCGCCCGGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110958	106729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_108058_110701
827783	contig_14472_pilon	-	851	6	Intergenic	novelGene_111163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	13.3656275572829	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	843	9	851	139744	117502	FALSE	40	AAACGGCGAACTGAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEMEKQRQEEQRKRTEEERKRRIEQDMLEKRKIQRELAKRAEQIEDINNTGTESASEEGDDSLLVTVVPVKSHKISGKIQKNFEDLEKEREEKERLKYEEDKRIRYEEQRRSLKEAKCLSLVMDDEIEREAKKESFSPGKLKLTFEELERQRQENRKRQAEEEARQRLEEEKRAFEEARRQMVNEEEENQDAEKFFKEYRPGKLKLSFEEIERQRREDEKRKAEEEARRRIEEEKKAFAEARRTMVRDDDSPEMYKTISQESLTPGKLEINFEELLKQKMEEE	139752	117501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_117616_122006_122196_130319_130497_130592_130791_131996_132039_139621
827784	contig_20951_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_43121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221903	222871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_221900_222900
827785	SIRV6	+	300	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	472	101	306	69	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827786	contig_2027_pilon	+	1903	15	Intergenic	novelGene_39908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	266.243836759172	1	126	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	1265	1903	132640	135964	FALSE	25	TTTAAGGTAAAGCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDY	126033	135964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_126109_126258_126436_126592_126688_126785_126867_127247_127379_128871_129033_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132423_132489_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868
827787	contig_8617_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_73407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62372	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62400
827790	contig_8696_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_153341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAGTGTGTGTATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037571	1038962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_1037600_1039000
827791	contig_7179_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_78190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	354	668	1251016	1251330	NA	15	CGGTGGGTGCCCGACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGWASIVLWTLRALDHLLQIQSITLPGVAKALPPKFAICKVLGDRPQAGASRRQKGVHLPRGKHVPPLKDQLSEEVRAQHVQILCFKEKPGIQIIVQNFPKF	1250662	1251781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1250700_1251800
827792	contig_1372_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_140511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	599	931	449792	450124	NA	25	GACGTTACAGGTTCTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCKILSFILSWTYLNKYTMAVVMECKTVVSILAALSWITCPTENLLPFCEATPYRGPCDEGPRPANNLASTIGSGPPPQVEPSNEITALDFSLTATSLETWNSLLRCV	449193	451459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_449200_451500
827793	contig_5797_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_56903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAGATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26424	25087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_25100_26400
827796	contig_8538_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_5105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTGCCTAAAATGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846104	846396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_846100_846400
827799	contig_11677_pilon	+	410	3	Intergenic	novelGene_85954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCGGCCTACATACGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595827	597874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_595929_597211_597396_597749
827800	SIRV6	+	462	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	24	-1	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827802	SIRV2	+	236	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-15	302	-15	-302	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGCAGTAATGCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	1329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
827803	contig_7179_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_78116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTTCAGCATTAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725385	724744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_724700_725400
827805	contig_5590_pilon	+	925	7	Intergenic	novelGene_163063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	32.7180717986593	411	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	70	696	526219	530513	FALSE	15	GGGCGAGCCTGTGCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTPADKLRAAVETLGVPCFLGGMARGLLGRNNPLHIRQNRSAALKKADVVILAGTVCDFRLSYGRVLSRSSKIIVANRNREEMLLNSDLFWKPQEAVQGFALGAKLCRPDTEVWCLFGDGAFGYSLIEFDTFVRHKIPVIALVGNDAGWTQISREQVPSLGSNVACGLAYTDYHKAAMGLGARGLLLSRENEDQVVQVLREAQQQCQDGHPVVVNILIGKTDFRDGSIAV	526029	530742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_526056_526175_526313_527811_527947_529513_529555_529635_529708_529851_529958_530334
827806	contig_14519_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_66836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTCTATATAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378044	377444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_377400_378000
827807	contig_14516_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_153899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129646	128030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_128000_129600
827809	contig_960_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_108256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590395	591277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_590400_591300
827812	contig_1090_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_131163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	5.35412613473634	99	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	257	730	912205	909758	FALSE	35	ATAATAATGTGACTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKNLLFVAKVLYLLVPDSEDKQDETKEDREEQGALGDGVAKEEVEGRQVCTDEKVESDKEENDEAKEEPSKPATLLWLILKVSRMAKLEAAYSPRNPLKRTCIFKFLGAVAMDLGADKVKLYLPMIIAPLFRELNSTYSEQDPLLKNLSQEIIELLKKLVGLESFSLAFASVQKQANQKRALRKKRKALEFVTNPDIAAKKKLKKHKNKSEAKKRKIEFLRPGYKAKRQKSHSLKELAMVE	912461	909541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_909914_910233_910380_911739_911867_912160
827813	contig_665_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_158225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	22	390	355496	355864	NA	50	TGAAGCTGGAACAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLKSKTSCANLKKFEEVINQETFWVASEILREPNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFSSMFAIIR	355474	356207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_355500_356200
827814	contig_665_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_158228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368919	369863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_368900_369900
827815	contig_5039_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_64852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATTTTATTATTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332156	331714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_331700_332200
827816	contig_3068_pilon	+	1018	9	Intergenic	novelGene_137607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	41.6171163705512	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	10	942	162547	188872	FALSE	15	GCCCCACCGACTCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGADGTGQMAAADTALCLFDVDGTLTAPRQKITKEMDDFLQELRQKIKIGVVGGSDFEKVQEQLGNDVVEKYDYVFPENGLVAYKDGKLLCKQNIQGHLGEALIQDLINYCLSYIAKIKLPKKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRSCSQEERIEFYELDKKENIRQKFVADLRKEFAGKGLTFSIGGQISFDVFPDGWDKRYCLRHVENDGYNPIYFFGDKTLPGGNDHEIFTDPRTVGYTVTHPRLHRPSPHLGFSLQTSPAPQGSPNRQPRWLLLAQAREMQPLNCPTHPAPRQTQDCTFWVISWTLVHV	162537	188948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_162640_167639_167752_169390_169468_170507_170600_175262_175363_175530_175607_178805_178922_187344_187400_188660
827819	contig_6063_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_27600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCCTTTAACAATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62073	61514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_61500_62100
827820	contig_11978_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_62823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTAGGGCAGCCGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432706	432984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_432700_433000
827821	contig_11978_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_62824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTGCATTGGAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432934	435111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_432900_435100
827822	contig_20234_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_174326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTCTTTTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212983	213378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_+_213000_213400
827824	contig_12250_pilon	+	494	3	Intergenic	novelGene_80597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	826.5	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322751	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_328630_328687_332096
827825	SIRV6	+	432	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	24	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845
827826	contig_7171_pilon	+	1090	6	Intergenic	novelGene_101239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	415.864208606608	73	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	347	892	734335	764772	FALSE	25	AAGAGATTTCAGCTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLCGPRWCRALLALLGSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECSR	733988	764970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760684_764760
827827	contig_7840_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_68999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTGGTCACTCCATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273764	274340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_273800_274300
827828	contig_5816_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_158273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGAGTCCTCTCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419304	421644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_419300_421600
827829	contig_17601_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_172458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGCTTGGTGATCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8572	7080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17601_pilon_-_7100_8600
827832	contig_13097_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_107684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGAACGGCTCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133705	134180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_133700_134200
827833	contig_7106_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_148317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAAGATGGGGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537050	538513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_537000_538500
827834	contig_4125_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_25206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	259	438	1512573	1512752	NA	25	TCTCCAAAAGTGGATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDTGAELHLHDQSLPIAGRCGGGWCSVPSCLSVGLAGTFSLLRGHGESTGEALNQVFLSCFCEHPLVSDTFSDFAVVFISSLRNIYMTTWFLRANLLRHKFSVALPEEGRLNAFFLLSSWNIPLFKEHTLLPDPFQGWGRHQCIS	1512314	1513941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1512300_1513900
827835	contig_4469_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_21881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCTGCCACAGTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210433	212118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_210400_212100
827836	contig_10531_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_114512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCCTTCACTGGCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368121	369031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_368100_369000
827838	SIRV4	+	513	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	29	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAAAGGTTTATATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3672	5089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
827839	contig_12671_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_19210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197126	196144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_196100_197100
827841	contig_18850_pilon	-	1167	5	Intergenic	novelGene_142441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	181439	181095	TRUE	55	AGGCTGGGAAAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181441	177033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_177041_178212_178294_178939_179156_180536_180983_181024
827842	contig_10197_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_115223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCCAACAAGAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912302	910524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910500_912300
827843	contig_8544_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_55913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTATAAAGAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27407	28907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_27400_28900
827844	contig_6677_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_114214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAGCAGACACTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589001	590752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_589000_590800
827846	contig_5643_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_39137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	279	350	648218	648289	NA	15	CCTCCTGCTGGGCTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDVLGCPDFAQFDIARVLAQCFSKVSKPGLRVHTRLALNPWPHPPYSLPPLLQSSGLSDPRLCSDGSCLTLLWSPPVGPPARSCQELGTAAEMEARPAVLLIWPYSEEPGLRHPH	647939	648539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_647900_648500
827847	contig_2310_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_71619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134545	132883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_132900_134500
827848	contig_14526_pilon	-	2271	1	Intergenic	novelGene_111216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	307	789	362211	361729	NA	45	CCCAGCAGAAAGAGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIACSVLGYRQLTVSRSWAWPDSLSLPVVLLHSRTTMEIIMTSFCNSCSLFRGFSLSSALAHNLTNAESDSRGHLIEMELCCSLVLHPSRPMLLIMLPKESRAVDKWNWTVCPARRGTAHFLIGFPAIWSSCWPRGRAGAPGPRTLAGQRCCLQAGEGW	362517	360246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_360200_362500
827850	contig_9036_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_155434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAGAAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9321	10841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_9300_10800
827851	contig_17500_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_157926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTTTATTACAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265343	266148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_265300_266100
827852	contig_14275_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_162868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAGGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339758	338234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_338200_339800
827854	contig_3382_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_124088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACTGGGAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536410	538097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_536400_538100
827856	contig_6439_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_154245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375500	377333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_375500_377300
827857	contig_312_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_128295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCTTACAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12779	11495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_11500_12800
827858	contig_5711_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_80274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79803	80841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_79800_80800
827859	contig_17743_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_176422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGAATTATTGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34574	32769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_-_32800_34600
827860	contig_7898_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_47647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGGCTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787996	789578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_788000_789600
827861	contig_3960_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_138048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATTAGTGCATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711026	710447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_710400_711000
827862	contig_4884_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_63805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267857	266526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_266500_267900
827865	contig_14220_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_159868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATGATGATGAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333783	332031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_332000_333800
827866	contig_8341_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_160244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTATGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61025	58936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8341_pilon_-_58900_61000
827867	contig_8453_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_125122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGTGATGAAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192614	190469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_190500_192600
827868	contig_3081_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_133957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709270	707908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_707900_709300
827869	contig_9239_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_137154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	22	390	26099	26467	NA	80	ATAAGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKHQRDVSGTYNLDLSKGFLATKRSRYKDEQSRRQRLYPYSFVEILNIQEGNQISSPLQKQQQQKPKPVAMSIPTHRDPTGQSRTAPIGFPRWTKLPSFWLAAKLLTTTSPEGPTLESTS	26077	27513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_26100_27500
827870	contig_5899_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_146977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAACCTTTCAGTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147404	149345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_147400_149300
827871	contig_10297_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_112553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGAACTATACCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618003	616191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_616200_618000
827872	contig_16103_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_118770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATGAACAGAAGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475341	474712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_474700_475300
827873	contig_16103_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_118769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGTTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474461	474059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_474100_474500
827874	contig_2703_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_101686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTTTAAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268588	270015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_268600_270000
827875	contig_9272_pilon	+	1951	4	Intergenic	novelGene_125978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	26.5497436689865	327	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	101	1354	662667	666113	FALSE	25	AAACATGTTTTCTTTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRCPDCDSTELVEDSHYSQSQLVCSDCGCVVTEGVLTTTFADEGNLREVAYSRSTGENEQVSRSQQRGLCRVRDLCRVLQLPLTFEDTAVAYYQQAYRLSGIRAARLQKKEVLVGCCVLITCRQHNWPLTIGTICTLIYADLDVFSGTYMQIVKLLGLDVPSLCLADLVKTYCSSFKLFQASPSVPAKYVEDKEKMLSRTLQLVELANETWLVTGRHPLPVITAAAFLAWQSLQPSGRLTCSLARFCKLANVDLPYPASSRLQELLTVLLRMAEQLAWLQILKLNKRSVVKHIGDLLQHRHTLVRKAFRDAAGEREAYERELQGQRQGEEEVGNSSLDLPVRKRPPSPALLLPPCMLKPPKQLRPTPAVCTVTGDENISDSEIEQYLRTPEEVRDFQRAQAASQAAKSVPNPL	662566	666710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_662821_663505_663566_664233_664556_665395
827876	contig_9633_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_139600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	439362	439048	NA	40	ATATATTCATGTAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLYYGLRVLPPHLVNLNFDQSLTEDQKLVDEGLEVNLDNYSRPPRPAWKKDVASALRVGIASGVAGGVLLSVALCSGLRVIHGDSSLSRFKDWRPKDWLFRKPG	439364	438800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_438800_439400
827877	contig_16185_pilon	-	1392	7	Intergenic	novelGene_144755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.874061138208	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	230	826	111398	98932	FALSE	25	ATTAGTACCCATATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLVKVFRIPNKTSLRSLGGTNVCSELLT	134353	98365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_99013_104048_104214_105305_105468_110481_110660_111387_111499_127364_127464_134323
827878	contig_14925_pilon	-	164	1	Intergenic	novelGene_55237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAATAAGAAGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57995	57831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_57800_58000
827880	contig_4083_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_152316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACTTCCCATTAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28812	26635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_26600_28800
827882	contig_10074_pilon	+	653	3	Intergenic	novelGene_57207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	13	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTGTGGAGTGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609758	613836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_609842_611370_611431_613326
827883	contig_11615_pilon	+	993	4	Intergenic	novelGene_151249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	125.071535086481	189	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	3	425	32066	32488	TRUE	25	ATTATAGTTGCTTCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLPPRLRSGNQTKDTGPPRPGRSLLAAQQPLLPPRRLCFVAGAAVWPQGVVPLGLAKWSRAGLCAAREDAPARPWAPGRSLEHREGSRTPTPPPPRRSPGAERFQPCQLLGLLLRTWGAFPPLAAIRISFSILSARLFL	32063	36647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_32500_33435_33562_33986_34086_36315
827884	contig_11493_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_143668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGGTTAGCAGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141427	142218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_141400_142200
827887	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
827888	contig_18487_pilon	+	1522	11	Intergenic	novelGene_172673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	43.0238306058398	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	20	1237	202380	211152	FALSE	15	CGAAACTGTCTGTCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSVKVMRDPSGKSKGFGFVSYEKHEDANKAVEEMNGKEISGKVIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKNLDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGSKPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRTLPASAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRPPYYTPNQLAQMRPNPRWQQGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGNAPASRGLPTTTQRVGVPPAVQNLAPRAAVAAAAPRAVAPYKYASSVRSPHPVMQPLQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKDSKAK	202360	211437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_202452_203123_203262_204011_204108_206117_206391_206751_206840_207019_207140_207774_207903_209065_209160_209271_209403_210008_210069_211134
827889	contig_7411_pilon	+	1947	2	Intergenic	novelGene_137023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	1499	1945	348085	350506	FALSE	60	TAACATAGAAACTAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKTQQEPGENKACLQDKASGGGKKCSNSISVRAFLDEDEDMSLEEIKNWQNAARSASQPPAGAFGDTGCDILPVGQDTYLTDSLDASGTCDGRNGFCSPLSQARPRRGKRPMPHCREGSLLSPVSNLTVEFDKLNLQTLGSSFCKTS	346586	350508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_348149_350123
827890	contig_9646_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_117430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGTAGCCAATTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170815	169962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_170000_170800
827894	contig_9982_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_55778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629932	627821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_627800_629900
827896	contig_17046_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_176868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCTACAGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2216	1664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17046_pilon_-_1700_2200
827898	contig_13097_pilon	-	1908	9	Intergenic	novelGene_107723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTTTAAAAAGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227094	190541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_191692_195149_195202_195749_195856_196262_196390_196697_196756_205969_206082_215270_215379_225263_225360_226995
827899	contig_11396_pilon	+	845	6	Intergenic	novelGene_71434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	567.232227575267	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAGAGAGCGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782226	1789881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782422_1787247_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
827901	contig_10371_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_175480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTGGCACAGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734556	735650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_734600_735600
827903	contig_20822_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_170637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGTATTTGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33077	31316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_-_31300_33100
827906	contig_4059_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_140604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1023	junction_2	459	308	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	282	656	422646	411018	FALSE	65	TTGTAAATTAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGGWYLFVSA	436572	410979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_411209_422462_422662_436306
827907	contig_4496_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_66679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGCTATCCATGTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882490	883312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_882500_883300
827908	contig_7956_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_176869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	17.3925271309261	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	37	657	7121	30098	FALSE	75	ATAAAAAAATTTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIAGGRILSVIKMQLIKGQDSRDPFCKVVEEVTQNLDLRIKNIIGSQQGDVAVHTTDISPARPKSHAINHGTAYCGRDTVKTLLVLLDEEAADAPSKNKAELLYDDENIIHYNGTSILTLFRSPTQVNNSLMKPLRERIQKSMQEKKIKVKQTLIRSQFACTYKDECMISKNKWNNVNSVLKPLCVLRMENDPSEGVNSSVGTPAAGTSSGNVHLDRSK	7084	30099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7956_pilon_+_7271_10647_10827_14728_14811_29407_29544_30024
827909	contig_10857_pilon	-	1176	8	Intergenic	novelGene_160924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	786	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	464	775	532806	531452	TRUE	5	TTCCGGCTGCGTCCCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQHRTMLRIISKIMMTATTMAAIPIRYSFPEKSSSIFWWQSSLKRLLRTVLPEGHRLFLASEVASVDNALEPQQFNVSWKVFTTALALLASSSSTACCRAWS	533269	511755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_511844_527516_527633_530196_530295_531018_531093_531426_531533_531930_532032_532602_532691_532764
827910	contig_20507_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_164202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	107	469	46163	46525	NA	55	AGAAAAATTATTAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASSIVQMKDGERKKGRPGRAWIQGQRREFVGGLGYQRGLGLRTRPGPPCTYLLELRRQASKLMALPAVPPRARRSMLSALAFAKYLLRESCVRIYCVSA	46056	47665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_46100_47700
827911	contig_7342_pilon	+	1089	12	Intergenic	novelGene_71092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	291	479	26051	26507	TRUE	40	GTGAAAGAGAGAGCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDEQLEVGVSVGWQLPRDLDEGARLLVYGFHVLATSADDQPALVSGDGEGHLPARGAPVALASSSAPTPWGHAWATWRAGRTTPEALEEVIDNAGCMLTPVGGPHYVRDLLRTRPVILFELDPHSGVALDLLDHLSAPPYDHPDRVPGHRHVDAPTDA	25588	30210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_25692_25771_25920_26011_26113_26297_26398_26480_26583_26961_27060_27216_27392_27696_27756_28473_28546_28821_28871_29803_29845_30169
827912	contig_2332_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_58632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATATCTCAAGTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65307	64472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_64500_65300
827913	contig_6199_pilon	+	815	3	Intergenic	novelGene_126393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	15	177	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	31	696	538669	540510	FALSE	15	GTTACGTTTCACTGTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSSRSRAGEMWSAGRGWAAELALLGLLLALVVRGGSVAQTGAGLVTCGSVVKLLNTHHRVRLHSHDIKYGSGSGQQSVTGVEASDDANSYWRIRGSREGGCPRGAPVRCGQAVRLTHVLTGKNLHTHHFPSPLSNNQEVSAFGEDGEGDDLDLWTVQCSGQHWEREASVRFQHVGTSVFLSVTGEQYGSPIRGQHEVHGMTSANTHNTWKAMEGIFIKPSIEPSTGHDEL	538638	540629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_538856_539227_539425_540228
827914	contig_10740_pilon	-	1929	6	Intergenic	novelGene_152249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	2.78567765543682	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	210	1733	143293	131865	FALSE	10	TTTACTTGGCGTTCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKEQCAAIGESQTSPHPREEDKAPSTPTLCLPLSSPFCPREKGYSVLLFLKGLGKAERIDSKRHPDPAEMELPQNLYETPADRLDNFVRHSLQPQGDWKEEVQDAWQRIERFLREECFRDELILDQEVRVLKVVKGGSSGKGTTLNYSSDVDMVLFLSCFSSFQNQAQLRKDVITLIQEKLDHCCRSLAYHISLVSPREGARAPRSLSLQVQSKKSSEAIRVDVLPAFDALGPFCPDTKPSPEIYEDLITSAGQPGEFSSSFTELQRHFVKSCPTKLKSLLRLVKHWYLQFLKPKYRKVPLPSKYALELLTIYAWEMGTEKSVNFHMDEGFVAVMKLLRDHEDICIYWTKYYDFQNEVVRNCIKQKLKEYRPVILDPADPTNNLGKGKRWDLVAKEAAYCLRQPCCNTEDPSQGWHIQRARDVQVTVRKSGKEAWTLSVNPYSPIWKMKKEIKNMCALYGHQRLSFQEPDGERQPLSSQKTLADYGIFSKVSIRVLEIFPPEIQVFVKESSGQNKPYAINPDDSIWDLKEKIEVAGGPYMKDQMILKFQGRNLHNRLSLRDLQIKDCDTITLIRRS	143502	131668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_132342_134147_134290_134763_135006_135969_136146_137175_137465_143095
827915	contig_19182_pilon	+	1420	11	Intergenic	novelGene_165577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	98.9151656724084	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	553	741	9761	12218	TRUE	20	CCCTTCCAAACATTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSRELWTILLGRSALRELNQIEAELNKHWQRLLEGLSYYRPPSPSSAEKVKANKDVASPLKELGLRISKFLGLDEEQSVQLLQCYLQEDYRGTRDSLKTILQDERQSQALILKIADYYYEERTCILRCVLHLLTYFQDERHPYRVEYADCVDKLEKELVSKYRQQFEELYKTEAPTWETHGNLMTERQVSCWFVQCLREQSMLLEIIFLYYAYFEMAPSDLLVLAKMFKEQGFGSRQTNRHQPGG	3360	17661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19182_pilon_+_3418_4378_4453_7518_7604_8064_8146_8606_8652_9414_9508_9643_9764_12032_12249_13237_13353_13994_14196_17328
827917	SIRV6	+	313	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	379	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	16	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1761_3092_3157_10724_10819_11031
827919	contig_12227_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_127397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAGTCCTGCAGCGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115896	114835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_-_114800_115900
827920	contig_9113_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_68620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCAAAAAGATCTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659440	659697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_659400_659700
827921	contig_9679_pilon	-	2749	1	Intergenic	novelGene_173406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1432	1737	24073	23768	NA	70	AAGAGAAAAAAAGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSSGLLGSTIVSRTSAVWPSCAGSFLFNVCLSHISRHQGSRSNGISCPGFFCQHPGEDQHTQPYVHWSPHPTIYALEPPPNRICTRAPTQPYMRWSPTK	25504	22755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_22800_25500
827923	contig_13051_pilon	+	1679	5	Intergenic	novelGene_140133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	47.0850294679742	5	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	127	708	411192	453563	FALSE	25	TGAAGCTTTTCCCCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMNDVTEEKKSLKRTFQQIQEEEDDDYPGSYSPQDPSAGPLLTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGGLAPLPSAGDLFSTD	411065	454534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_411208_419906_420020_422064_422192_427709_427886_453413
827924	contig_12638_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_33274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	184	651	854829	854362	NA	35	AACAACACGGCAGATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSFSSWLLSSRYLFLKQIGCRSKGLEQGLRCQHCATAGSPLLISVEKKNLRIYQCLPPISCTPEWYSAPWALRLSESLFGPNTHPSAAHIHKQGPFQHLQAFIFPTEHFYLISQRHLQLNKSKSNSLFYSSSLVLVQHSRQDALSYTGQRPL	855012	852566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_852600_855000
827925	contig_12638_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_33273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849585	849258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_849300_849600
827926	contig_15323_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_148542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTTTTATTTCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194264	195020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_194300_195000
827927	contig_17171_pilon	-	1292	6	Intergenic	novelGene_147384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	62.3198202821542	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	25	621	350839	334259	FALSE	15	TGCAGATGGCTCCTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRCPGRAKMQLRLWLLLTVQLAALPGSSAFHQTPESKMVQIHETVTLSCDMKTSTTTRVYWLRQRQDPSPKSHPEFLPLAIWDPVKKAVFGEGVEQEKLNVSYNRTWSTLSLTRVETSDSGTYFCMTIGNPQLIFGKGTRLSVVDALPTTAQPTKKTKLKKKVCRIPKLPSQKGSSCSSLTLGLLVAGVLVLLRRARLRFMKQFCR	350863	333587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_334272_337314_337344_338815_338875_343889_343980_347342_347706_350796
827929	contig_1244_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_38084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAAGAAAAAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564378	1564001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1564000_1564400
827931	contig_2152_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_176873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTTAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35184	34096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2152_pilon_-_34100_35200
827932	contig_16411_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_77332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAGCAGAGAACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174318	173168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_173200_174300
827933	contig_8538_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_5111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967336	969271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_967300_969300
827936	contig_10428_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_162595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAACATCTTCAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120593	121081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_+_120600_121100
827937	contig_8195_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_170065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGCACCCTCCCACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471076	472040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_471100_472000
827938	contig_10446_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_162441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCAACTACATTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184237	182860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_182900_184200
827939	contig_10003_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_88158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCAGTGGTAATGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384714	383679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_383700_384700
827942	contig_10196_pilon	-	866	3	Intergenic	novelGene_132208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	210.5	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	94	363	1260668	1256120	FALSE	20	CCACTGTCCTTTTGAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGPAPRGGDSRRGHRRLPLLSPESPCWEEAMAAAFQLASFVLVIGLVTFYRIGSYTSLSWSCYLNIGACLLATLAAAVLIWNILHRREDCMAPRVIVIRRSLAARFRRGMDNDYVESPC	1264898	1255616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1256365_1260643_1260713_1264849
827943	contig_6445_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_77005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGATCATCAAAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509579	510368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_509600_510400
827945	contig_11948_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_174390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTGCATTGACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180836	180469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_180500_180800
827946	contig_10324_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_7737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAGGCCTGGTGATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62992	62058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_62100_63000
827947	contig_10549_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_110609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCATACCTCTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180047	181769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_180000_181800
827949	SIRV6	+	365	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1731_1845
827950	contig_6915_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_162400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCATGGGTCGGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161799	161258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_161300_161800
827951	contig_10143_pilon	+	1938	14	Intergenic	novelGene_163324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGGGCGGAGACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16203	65559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_16272_16359_16484_24998_25106_25556_25702_27764_28135_34718_34954_45355_45461_46050_46126_48620_48793_50671_50894_52172_52268_54969_55041_55362_55470_65517
827952	contig_835_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_152122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTAGGTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37682	39610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_37700_39600
827955	contig_7171_pilon	-	616	7	Intergenic	novelGene_101319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCTGGCTGGAGCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086207	1077089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1077169_1078495_1078591_1079821_1079948_1081133_1081207_1084209_1084277_1084388_1084462_1086104
827957	contig_18735_pilon	+	1575	6	Intergenic	novelGene_132680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65126	81713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_65875_67032_67197_71407_71578_77767_77841_78099_78209_81402
827959	contig_563_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_169761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAGAAATGGACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583805	585347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_583800_585300
827961	contig_9988_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_113062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGTCAAAAAGGAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135304	133549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_133500_135300
827962	contig_9297_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_69838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGCTAGGGAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667260	666099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_666100_667300
827963	SIRV4	-	506	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	111	0	111	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	519	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5047	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
827964	contig_9801_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_167570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCTCCCCTTTACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107023	109090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_107000_109100
827965	contig_1443_pilon	-	1511	8	Intergenic	novelGene_28378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	37.5640948844744	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	110	598	1041523	1039483	TRUE	50	AATGTTATTATTATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRSLGRERDESSINTLMSL	1041632	1036653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1038263_1038441_1038481_1039300_1039518_1040132_1040329_1041265
827966	contig_11316_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_122703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140217	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140200_140500
827968	contig_4852_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_153978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAACTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96495	98370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_96500_98400
827972	contig_4659_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_118219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGAAAGGTCGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712111	712563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_712100_712600
827974	contig_8729_pilon	-	1329	3	Intergenic	novelGene_40073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.5	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGGAACCAACTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58176	50294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_51441_57879_58006_58119
827975	contig_8729_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_40072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGTGAATGGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50080	49480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_49500_50100
827976	contig_12427_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_40427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAGCCCTGGAGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225355	225946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_225400_225900
827977	contig_8461_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_163925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGAAAACCCAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393116	390494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_390500_393100
827979	contig_14546_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_157418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGGGGAGGAGGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79035	77830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_77800_79000
827980	contig_3382_pilon	+	1656	11	Intergenic	novelGene_124036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCGTCTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176717	273420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_176943_181451_181619_183912_184038_189055_189153_224728_225049_229634_229761_231315_231466_234088_234182_254700_254817_272862_272957_273277
827981	contig_10734_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_51336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATGGTAGAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1621731	1620169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1620200_1621700
827982	contig_7056_pilon	+	1852	17	Intergenic	novelGene_43594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_16	185.560205442196	1	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	111	1793	661004	728973	FALSE	20	TACCTTGAGCCCCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANFLGTRLGRPPYAPRPHCVLLRSCPCFCPTAAKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNKALKGHTWLKDDEATHCKQCEKEFSISRRKGQFDFIF	660893	729032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_661164_662947_663066_667151_667254_668909_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542_714592_716858_716937_728949
827983	contig_9972_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_162801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACAATGCTATGGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330752	333030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_330800_333000
827985	SIRV6	+	471	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	3	11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
827986	contig_1717_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_146120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	643	975	211769	212101	NA	30	CTGGGAAGTATGGAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIDVQGLIRVSLIRKSVGLKDGRSRYSLVTRNTSFTCGEVKEDLFRVSDEQSSCFLAPPSPVNWNMDGGDGVTEAGPSLKSHSTLLLCLEPFLAILRVMLTKGNGNHFK	211126	212753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_211100_212800
827987	contig_15244_pilon	-	1297	4	Intergenic	novelGene_118076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0.942809041582063	86	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	112	1008	798035	790219	FALSE	20	CGTTCTCTAATTATTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQALSFLKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFTGLGNCLVKIFKSDGLRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYSGTVDCWRKIAKDEGPRAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKFV	798146	789929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_790377_795156_795298_795839_796327_797924
827990	contig_6048_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_73305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACTCCCATTTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2016431	2017512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2016400_2017500
827991	contig_14513_pilon	-	551	3	Intergenic	novelGene_70403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGACTGTATTCGTTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19221	14700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_14881_18729_19059_19179
827992	contig_10183_pilon	-	1130	4	Intergenic	novelGene_169510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	12.7540843131393	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	73	795	152596	146275	FALSE	15	TTCTTAGTGTTTTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMTSVRLPAGVLRKPDAWTGLWGVLRGTPSYKLCASWNRYVYFSSTKLNASNYKTLFHNIFSLRLPGLLVSPEYVFPFSIRLKSNISSKKSTKKTLQKVEAEDDSDEESDHSEINEQEQELEDDPSVVKDYKDLEKVAQSLRYDVILKTGLDVGRNKVEDAFYKGELRLNGEKLWKKSRTVKVGDTLDLLIGEDKEAETDTVMRILLKKVFEEKTESEKYRVVLRRWKKLELPKKSMSK	160076	145939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_146455_149991_150065_152126_152609_160016
827993	contig_14215_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_59349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGACAGAGTAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23675	22759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_22800_23700
827994	contig_9363_pilon	-	1040	5	Intergenic	novelGene_6702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	65.773759965506	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	114	755	1298867	1288377	FALSE	10	GAGCGGGTGCCCTGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDVGPEDELPDWAAAKEFYQNWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVAVWTVLAAGRVALSTHRIRPLTKSALLRDPYALRPVRRLIDNCAFRLYGHWVKKGEQQNRAALFQHRPPGPFPITGPEEEGDSAAVPEDEAMLVMG	1299306	1288091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1288894_1288965_1289120_1298799_1298886_1299211
827996	contig_6654_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_85729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401340	402076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_401300_402100
827997	contig_9406_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_136184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTATGTATTTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433798	434421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_433800_434400
827998	contig_6628_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_170612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCCTCCTCTTATGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223396	223803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6628_pilon_+_223400_223800
828001	contig_3960_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_138050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTTCATCTAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719288	718177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_718200_719300
828002	contig_4754_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_35922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCATCACAAGGGGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254240	255518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_254200_255500
828003	contig_10238_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_170103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTACATGCGAATGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417378	415670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_415700_417400
828005	contig_21394_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_128435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCAGTAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12348	12552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21394_pilon_+_12300_12600
828006	contig_19228_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_174411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23011	21060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_21100_23000
828008	contig_7919_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_28059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGACTGACCTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031551	1031286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1031300_1031600
828009	contig_6710_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_98052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	10	CCCTTCTCCTCTTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
828011	contig_5419_pilon	+	1120	4	Intergenic	novelGene_15558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	42.0819306696935	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	245	439	550934	551831	FALSE	30	GGTCACTATAAGTCGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREVWWHQVKVWSAAVVSVSLLSACFIVSCLVNHDIFVNSKIGKKLSKQQEYEPFHSTVTCHIERKGLKGKGWSCCPENWVMSNTSCYFISSELNNWTESEKNCAGMGAHLLVINAEEEQLLITQKLDRKVAYYVGLSDSEGTHQ	540051	552512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_540147_541812_541927_550898_551051_551753
828012	contig_12344_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_164868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTTATTATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117374	116257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_-_116300_117400
828013	SIRV6	+	322	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	371	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1856
828014	contig_7321_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_53146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208367	207208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_207200_208400
828016	contig_5964_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_80364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACGATGATGACAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105466	104412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_104400_105500
828017	contig_2069_pilon	-	546	3	Intergenic	novelGene_23499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1088	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509820	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508792_1509057_1509111_1509754
828019	contig_4486_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_38629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTGCAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701859	702708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_701900_702700
828020	contig_7695_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_41693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAGTCCAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149485	1148004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1148000_1149500
828022	contig_12964_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_131742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTCTAGCAATAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684286	685055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_684300_685100
828023	contig_3975_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_54689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068007	1069432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1068000_1069400
828025	contig_34_pilon	+	1050	3	Intergenic	novelGene_40024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTACCTCTCAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214113	216143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_214151_214480_214639_215288
828030	scaffold_15568_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_122589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	476	892	219580	219164	NA	30	TCCTGTTTGCAAGATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPASHAATPPPWTCCFLLTLLTFFGAFWSRVWGGDGYGLWSTGVRGVWTLPSLSFRLALRPPKRESTRPRKRVCIQPLIMNNLQDNFHFYLELCKYYFILTCMYFEIAGKLNRHFSILNSLKHAEKYKKKYNKYPCAY	220055	219161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_219200_220100
828031	contig_9146_pilon	-	449	3	Intergenic	novelGene_79499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4271	junction_1	231.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	73	417	143366	142549	FALSE	25	TGACATGCTGACAATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	143542	142516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479
828032	contig_5935_pilon	+	790	7	Intergenic	novelGene_102718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	24.3013488423082	205	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	116	586	1064952	1069960	TRUE	80	AAGAAAAAAGAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFTCNACGESVKKVQVEKHVTICRNCECLSCIDCGKDFWGDDYKNHVKCISEDQKYGGKGYEGKTHKGDIKQQAWIQKINELIKKPNVSPKVRELLEQISGFDNIPRKRAKFQNWMKNSLKIHNESILEQVWSIFSEASRNRASLCLHLWEGIN	1057522	1075443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1057577_1064890_1065074_1067042_1067158_1069514_1069623_1069731_1069816_1069918_1070000_1075278
828033	contig_2888_pilon	-	644	5	Intergenic	novelGene_151494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	51.3152024257919	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	110	430	228880	222375	TRUE	45	AATGTACACATGTATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNALTNWLTDARMLASQNIVIILCGNKKDLDADREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFVQCARKILNKIESGELDPERMGSGIQYGDAALRQLRSPRRAQAQSAQECGC	230803	221590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_221783_222352_222491_226218_226315_228771_228927_230740
828034	contig_2888_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_151493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTTAACTTTACATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221441	221200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_221200_221400
828035	contig_4364_pilon	+	459	4	Intergenic	novelGene_726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	52	459	1530895	1531663	FALSE	10	CAGGCTGTGCTGTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAI	1530473	1531663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
828037	contig_9305_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_148194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAATTGTAAGAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183489	183761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_183500_183800
828040	contig_15327_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_70757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCCGTGAGTCGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090186	1089533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1089500_1090200
828041	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	217	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
828042	contig_3469_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_34238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGTTTCACGAGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642046	642398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_642000_642400
828043	contig_4900_pilon	-	770	7	Intergenic	novelGene_159059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	20	CCCCTACCCAGAGCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1178642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1178686_1181577_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
828044	contig_11416_pilon	+	1381	12	Intergenic	novelGene_145378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	198.732512614942	9	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	271	1245	790698	797619	FALSE	5	CAGGTTTGGGCTGGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFRSGSPSDNSGAEEMEVSLAKPKHRVTMNEFEYLKLLGKGTFGKVILVKEKATGRYYAMKILKKEVIVAKDEVAHTLTENRVLQNSRHPFLTALKYSFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFSEERARFYGAEIVSALDYLHSEKNVVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGIKDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLSGLLKKDPKQRLGGGAEDAKEIMQHRFFASIVWQDVYEKKLSPPFKPQVTSETDTRGLTPF	775634	797755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_775712_787314_787444_790633_790782_791233_791366_791564_791631_792446_792516_792876_793003_793085_793215_793534_793750_794117_794206_796409_796457_797600
828045	contig_6233_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_74806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	284.504283799032	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	236	1006	149777	144379	TRUE	45	AGGTTAACACAAACTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAMLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPGMARRKVTVPVPVPVAVAVVVVIAGRQPPKRTQLLRQARPREKHRLEMTVMRRGC	250175	143183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_143509_144358_144544_144763_144880_145615_145783_148121_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
828046	contig_7904_pilon	-	1553	2	Intergenic	novelGene_160036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	751	1137	547201	546815	FALSE	60	CAACTTTTAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCAMSYVSLQPSRSQSFSFWQNGGECFYPSLKLHSKRTSNRCCLCLYNLEFLIKWIIQFLFTGAQKTLWSKAKINTNVTGLTITVFFQRPGLCHTIKLIMPGCSSPLEKKSLPGEPLSLRNKILDSV	551191	546398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_547435_550674
828047	contig_5018_pilon	+	471	5	Intergenic	novelGene_47197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	297.349436690235	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	23	427	1591791	1593158	FALSE	5	CCTGTCTCCTGTGTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDPRRPNKVLRYKPPPSECNPALDDPTPDYMNLLGMIFSMCGLMLKLKWCAWVAVYCSFISFANSRSSEDTKQMMSSFMLSISAVVMSYLQNPQPPFARVQGEHPRPTPVPFSLILPTAGGSAVCVSGHFFSG	1591768	1593202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1591826_1591943_1592050_1592607_1592706_1592804_1592850_1593037
828048	contig_10626_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_138201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATAGAGTATGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131876	132806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_131900_132800
828049	contig_6189_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_164953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATGAATTTCTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152898	152229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_152200_152900
828051	contig_11413_pilon	+	1824	11	Intergenic	novelGene_103144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	8.41961994391671	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	70	1167	120944	137753	FALSE	60	TTTTAATGAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLGCSPALKRSHSDSLDRDVFQMIDQDENKENEAFEFKKPIRPASRGCLHSHGLEESKDLFTQRQNSAPARMLSSNESESSEPGNFIPLFLPRSPVTVTLSDEDDGFMDVLDGENLKNDEETPSCMASLWTAPLVMKRTTNLGNRCKLFDSPSMCSSTRSTLKRPERSQEESPFGNSKRRKSMTGASPEEAATPEKPQEILHQCLSLASSPKGTIENILDSDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLRYISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTDGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFLKCQSHCEPPPATGPCTTRTLKKT	120874	138410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_120974_122992_123113_125769_125905_126410_126486_127860_128032_132929_133029_134974_135038_135123_135223_136093_136225_137370_137483_137690
828054	contig_6739_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_155873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTTACACTGTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60755	61744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6739_pilon_+_60800_61700
828055	SIRV6	+	432	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	99	0	-88	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	74	313	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2384	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
828056	contig_10980_pilon	+	1704	2	Intergenic	novelGene_162556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAAGTCGTGGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117248	120722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_117315_119084
828057	contig_12128_pilon	-	1602	5	Intergenic	novelGene_131974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.9390392736865	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	115	540	303817	194868	TRUE	55	TATGTAAAATTACCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDKKSPTRPKRQPKPSSDEGYWDCSVCTFRNSAEAFKCMMCDVRKGTSTRKPRPVSQLVAQQVTQQFVPPTQSKKEKKDKVEKEKSEKETTSKKNSHKKTRPRLKNVDRSSAQHLEVTVGDLTVIITDFKEKTKSPPASSAASADQHSQSGSSSDNTERGMSRSSSPRGEASSLNGESH	304349	193759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_194149_194194_195106_195873_196027_303782_303909_304326
828062	contig_14322_pilon	-	396	2	Intergenic	novelGene_115843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATATTTCTTGAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671906	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
828063	contig_2114_pilon	+	1920	4	Intergenic	novelGene_104228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	77.6587978846498	1	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	71	691	136332	137672	TRUE	35	TAAATCAGTAAGTCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEVGYTLNSFLWPELDTVVLNSGI	136261	139815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_138492_139405
828068	contig_4857_pilon	-	1274	4	Intergenic	novelGene_48847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCAAGAACATCCTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411072	1331401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331542_1405436_1405553_1407010_1407077_1410120
828070	contig_15838_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_174344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTAACGTTTGCCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286121	287740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_286100_287700
828071	contig_12642_pilon	+	888	3	Intergenic	novelGene_176401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	85	522	30976	31413	TRUE	55	AAAAAAATAAACTATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARTRTSCEASEQPVAEPSRPSPSKSFAMVDELVLLLHALLMRHRALSIENSQLMEQLRLLVCERASLLRQVRPPSCPVPFPETFSGESARLPEFIVQTTSYMLVNENRFCNDAMKVAFLISLLTGEAEEWVVPYIEMDSPILGDYRAFLDEMKQCFGWDDDEDEDEEGDEYY	30891	32206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12642_pilon_+_31414_31695_31936_32080
828073	contig_18342_pilon	-	857	6	Intergenic	novelGene_154564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGGTTGCCCTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63479	36067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_-_36202_36933_37095_38316_38445_54737_54795_56448_56610_63263
828075	contig_2069_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_23343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668529	668754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_668500_668800
828076	contig_10196_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_132257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCTAAAGTGTTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1958991	1959586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1959000_1959600
828077	contig_5217_pilon	+	612	5	Intergenic	novelGene_135781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTGTGAAGGCAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557723	559966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_557801_558301_558434_558654_558849_559271_559374_559859
828079	SIRV6	+	431	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	100	0	-87	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	73	312	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2385	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
828080	contig_9335_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_147428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCAGAGTATTCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85757	86325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_85800_86300
828081	contig_11396_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_71426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	138	521	1755292	1755675	NA	70	AAAAAAAAAACCACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKFKMKMETVFLFLQLEWMPNIPTHTCINSERIRGLPSPRLKEHVKSFLRSWKTLSPLILFVMARNMSSTVICNMLSPKILLVQQQTPMVMSCCAPIRICQYFWKSQSSVFKLTTCWMWDRRKNGL	1755154	1756099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1755200_1756100
828083	contig_821_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_149423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGTAGATTTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423351	424743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_423400_424700
828084	contig_1154_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_87093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAGCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338331	334351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_334927_337306
828086	contig_11337_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_107181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAACAACAAGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169486	167723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_167700_169500
828088	contig_5906_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_174814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACGCGGAGTCATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333884	334843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_+_333900_334800
828089	SIRV4	-	520	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	7	90	7	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	549	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAACCAAGGATTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5151	3727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
828090	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
828091	contig_13937_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_167363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAATAACAATTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102875	100938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_100900_102900
828092	contig_4429_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_50814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAATAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186199	187145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_186200_187100
828095	contig_6589_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_25822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	111	506	816846	816451	NA	10	GACCCCAGCCCCTGTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTYLSFTPDLNVPSSGKPSLIHSPTTFLYESTSQPFFVHVTVHVPYQTQAPLGTLGDTRSGYINVSRKRKRISQTGDIAQAKVWRLEHLTNIQRTNGQPISESRDEGKICPPRVDPQPPHYWNLEMLEAPA	816956	816448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_816400_817000
828097	contig_6589_pilon	-	849	7	Intergenic	novelGene_25917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	220.988247550759	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	170	628	1178015	1158723	FALSE	30	CCACCTGCAGCCAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYLSPQETFGPHCGRNLQPQLQTRRPQSKRARWPSPWAAWVSQLRWGQLLCSWPPRPTSARA	1178509	1158501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
828098	contig_12078_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_74077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCCTGGAAGAGGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61530	62049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_61500_62000
828099	contig_12078_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_74078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCATTGGAGGAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62498	63095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_62500_63100
828101	contig_13241_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_158913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195743	196894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_+_195700_196900
828103	contig_8538_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_4906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGTTGTAATCAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843131	842783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842800_843100
828106	contig_6509_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_145660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTATGCCCTTTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213355	214671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_213400_214700
828107	contig_16846_pilon	+	934	4	Intergenic	novelGene_82995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATGCTGTGGGAGGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575410	599130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_575708_576520_576680_577457_577549_598743
828108	contig_9575_pilon	+	1820	9	Intergenic	novelGene_169728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_8	3.82222121285516	54	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	37	1443	721915	748637	FALSE	60	ATATTGTGTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFALKATYHAHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNIREYLCAECGKGMKTKHALRHHMKLHKGIKEYECKECHRKFAQKVNMLKHYKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTMETHKLIHTVGKQWTCSVCDKKYVTEYMLQKHVQLTHDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDDLDHLPETTTIDASSIGIVQPELTLEQEELAEGKHVKAATRTHKRKQKPEESGAPVPESATFSEYPEKEAEFAGSSAGDETSSAVQSIQQVVVTLGDPNVTTPSSSVGLTNITVTPITTAAGTQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSILTVTFDTVSGSAMLHNRQNDIQIHPPPEASNPQSVAHFINLTTLVNSITPLGNQLNEQHPLAWRAVPQSDVLQPPQPQPPQQQAAQPQVPAEQQQQMYSY	721878	749014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_721959_722822_722903_723245_723366_730047_730180_734675_734760_735355_735532_741388_741470_746488_746699_748157
828110	contig_17603_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_152794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGGAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68222	68965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_68200_69000
828111	contig_12250_pilon	-	1658	15	Intergenic	novelGene_80732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	139.402002737934	1	43	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	54	1655	416521	409037	FALSE	25	TGACCTCCAGCCCCATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRNSSSAGSGSGDPSEGLPRRGAGRRLSEEEEEEDEDVDLAQVLAYLLRRGQVRLVQGGGAGNLQLIQALSDSEEEHDSAWDGRLGDRYNPPVDATPDTRELECNEIKTQVELATGRLGLRQAAQEHSFPRMLHQRERGLCHRGSFSLGEQSRVMSHFLPNDLAFTDTYSQKAFCGIYSKDGQIFMSACQDQTIRLYDCRYGRFHKFRSIKARDVGWSVLDVAFTPDGNHFLYSSWSDYIHICNIYGEGDTHTALDLRPDERRFAVFSIAVSSDGREVLGGANDGCLYVFDREQNRRTLQLESHEDDVNAVAFADVSSQILFSGGDDAICKVWDRRTMREDDPKPVGALAGGDARYLISNSKDQTIKLWDIRRFSSREGMEASRQAATQQNWDYRWQQVPKKAWRKLKLPGDSSLMTYRGHGVLHTLIRCRFSPTHSTGQQFIYSGCSTGKVVVYDLLSGRIMKKLTNHKACVRDVSWHPFEEKIVSSSWDGNLRLWQYHQAEYFQDDMPESRECLSAPAPHLSTAFSSPQ	417215	409033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_409166_409263_409371_410568_410722_411491_411646_412121_412275_412371_412430_412787_412857_413209_413265_413474_413622_413855_413957_414264_414330_414605_414734_414989_415118_416366_416547_417187
828112	contig_7521_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_160559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTAAAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344659	343106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_343100_344700
828113	contig_11328_pilon	+	1427	11	Intergenic	novelGene_88465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_8	183.422354144744	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	524	1252	874166	885362	FALSE	65	CTTAAAAAAAAAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPYDDQSNLQEKVQKVRSLWASVNETLMFLEKEREVVSSVLSLVNQYSLDGTNVAINIPRLLLDKIEKQMGQLHIGNVYEAGKLNLLTVIQLLNEVLKIMKYEHCQADQARLTIDLHYLEKETRFQRERLSDLKQMRYKIKEDLITIRRSIVEKQGEWYKKWKEFLGLSPFSLIKGCTPAVDLLPPMSPLSFDPASEEVYARSILFKYPASLPDTSKQCNQENDCRREKDTWGTVNELANR	864327	885537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_864423_866368_866448_867431_867565_870446_870596_873783_873850_874164_874214_876287_876459_877906_878101_878735_878863_879546_879650_885276
828114	contig_15114_pilon	-	1123	4	Intergenic	novelGene_121238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	863	junction_1	48.7259912389909	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	734	1120	1695069	1691054	FALSE	25	ATGGTCTTGAGTCCTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1695802	1691050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990
828116	contig_9345_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_24328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGCGAACCTCCTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14018	13364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_13400_14000
828119	contig_9609_pilon	-	1425	9	Intergenic	novelGene_23152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTCCCCAAGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757905	749274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_749497_749929_750019_750280_750367_754605_754740_755051_755131_756021_756160_756919_757017_757190_757306_757440
828120	contig_11416_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_145351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGGATTTTTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190101	189183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_189200_190100
828121	contig_9099_pilon	+	788	8	Intergenic	novelGene_149920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_5	97.4572643128615	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	702	85	786	405363	414479	FALSE	20	ACTGTTCTCCAATTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQYTEHQQLEGWKWNRPGDRLLDLDIPMSVGIIDTRTNPSQLNAVEFLWDPAKRTSAFIQVHCISTEFTPRKHGGEKGVPFRIQVDTFKQNENGEYTDHLHSASCQIKVFKPKGADRKQKTDREKMEKRAAHEKEKYQPSYDTTILTEMRLEPIIEDAVEHEQKKSSKRTLPADYGDSLAKRGSCSPWPDTPTAYVNNSPSAAPTFTPPPPSTCSVPDSNSSSPNHQGDGVSQASAEQLQPSATIQETQQWLLKNRFSSYT	405036	414481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_405113_405354_405462_406702_406856_406942_407054_407473_407582_412907_413012_414117_414173_414407
828122	contig_6477_pilon	-	542	6	Intergenic	novelGene_154166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5475.53133860085	7	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGCTTGTTTTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773154	769322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769369_769548_769666_770018_770106_770616_770713_772352_772479_773084
828123	contig_12464_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_68668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCTGACCTGGTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148121	149181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_148100_149200
828124	contig_6589_pilon	+	723	4	Intergenic	novelGene_26028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	870.318077231282	79	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725375	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1726974_1731406
828126	contig_6434_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_61878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTTCACGGCTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873645	872207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_872200_873600
828128	contig_12842_pilon	+	1493	9	Intergenic	novelGene_168342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	21.5450110234365	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	234	1256	143989	164996	FALSE	20	TCTATACCTGGGTGCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRELSQLRGSNSFGVNSETETCRCWRPEEERARGEDQPLHLPTASPGKGGSCSLSRSPRPAALPAPGPSEPAWRAENMEPERTQIKLDPRYTAGLLEVLKTNYSISPACFSHPPTAAQLLRALGPAEAALTAVLTTLTMGSVIIFLEDAVYLYKNTRCPIKRRTLLWSSSAPTVVSVFCCFGLWIPRSLMLVEMAIASFYAACFYLLMMVMVEGFGGKEAVLRTLKDTPMRIHTGPCCCCCLCCPPFKLTRKKLQLLMLGPFQYAFLRITLIVVGLFLIPDGIFDPADISEKSAALWISTFLSVSTLLALWALSILFRQARLHLGEQNMGAKFGLFQVLFVLTALQPAIFSILANNGQIACSPPFSSKIRSQVMNCHLLLLESFLITVLTRIYYRRKDDKLGYEPFSSPDMEWNLEA	143755	165233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_144027_144688_144784_159997_160153_161043_161118_161569_161729_162310_162423_162683_162831_164233_164340_164859
828130	contig_366_pilon	+	1175	4	Intergenic	novelGene_51624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	42	junction_1	49.2769948578667	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	445	1173	1350559	1356075	FALSE	35	ACCAGACCTCCCCACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASYDGTEVTVVMEEIEEAYCYTSPGPPKKKKKYKIHGEKAKKPRSAYLLYYYDIYLKVQQELPHLPQSEINKKISESWRLLSVAERSYYLEKAKLEKEGLDPNSKLSTLTAVVPDIPGFRKILPRSDYIIIPKSSLQEDRSCPQLELCVAQNQMSSKGTPLVSNTAPETVPSHAGMAEQCLAVEALAEEVGALAQPGAVQEIATSEILSQDVLLEEASLEVRESHQPYQTSLVIEETLVNG	1347002	1356077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1347445_1350556_1350696_1352328_1352504_1355658
828131	contig_4364_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_3015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
828132	contig_3956_pilon	+	893	6	Intergenic	novelGene_14920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1581.24591382871	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	81	755	1281682	1284761	TRUE	25	GCCCCGATGGCAAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPNRPCPWYRGLWVWPPRLGLHPEAVC	1281601	1285110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284253_1284684_1284870_1285080
828133	contig_408_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_84921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGTATTTATTAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143270	143020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_143000_143300
828134	contig_14215_pilon	+	1860	5	Intergenic	novelGene_59354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_4	32.6065560892284	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAAGCGGTATGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40274	47684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_40868_41400_41456_43126_43223_45741_46584_47410
828135	contig_12993_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_136748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTAAATTGTGAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185555	185911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_185600_185900
828136	contig_15610_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_154280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCATAGCCTATTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646162	645665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_645700_646200
828137	contig_10912_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_176805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATCCCTTTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876488	877183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10912_pilon_+_876500_877200
828139	contig_5083_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_151674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565673	564884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_564900_565700
828141	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
828142	contig_835_pilon	-	1508	1	Intergenic	novelGene_152147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAGTGAAGCTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187970	186462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_186500_188000
828143	contig_12884_pilon	-	683	7	Intergenic	novelGene_105000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	540.722793017724	58	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	81	668	906341	899583	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQGAPSWCQWATASISCRSSAWWRMTRWAPTCWRRRSPSSRSTCRVSTLLLSTRSEPSACVCVCEPAAN	915308	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899920_900647_900749_901038_901133_905761_905834_906224_906349_915235
828144	contig_15909_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_176421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTGTGTTGGTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24577	25191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15909_pilon_+_24600_25200
828147	contig_5967_pilon	+	1943	3	Intergenic	novelGene_44424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCTTGGGAGCTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537100	576844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_537380_539178_539323_575324
828148	contig_9578_pilon	-	1115	6	Intergenic	novelGene_67991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	168.849045007664	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	87	575	1276296	1198499	FALSE	15	GTGAGTATGGTCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPREWSADLARFYTVTEPQRHRRGYTVYKVTARVVSRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEVLPSC	1276382	1197958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1198516_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583_1251620_1276191
828149	contig_14184_pilon	-	1570	7	Intergenic	novelGene_66597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	462.720367920939	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	305	1246	105839	90129	FALSE	20	CTTTACTTCTCAGCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEAEPIELVESAGDEIVDLTCESLEPVVVDLTHNDSVVVKRRRPRRNARRLRQDHADSCVVSSDDDESPRDGDVYVTPHTPRGTREEGTAGLRPSGTVSCPICMDGYSENVATSSAASASVIPLKMLVPAQLVGKRSTTNGTTQFIYEAYSAAQERRRDRQHGWILPTACCRICGLSASDFPSSERLFQNQCLMMSTALLFPTPLRSFCCLQFDAVRLNRGAFPDQGLHLGCSGVAWFQAGREGVRPTGHPASLWAQVPCSGASQGLWAGPHNELENHGSSLILEPACLPRSGPRHPASCWHCHRGTVPGQ	126300	89804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_90738_91298_91348_91951_92112_103417_103502_105799_105915_109168_109327_126229
828151	contig_15631_pilon	-	1189	11	Intergenic	novelGene_151536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	8.94483090952535	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	610	1095	362889	361423	FALSE	50	AATTATATATTTTAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYGRQELHRKERLVLTSEHWLVLVPFWAVWPFQTLLLPRRHVRRLPELTPAERDDLASVMKKLLTKYDNLFETSFPYSMGWHGAPTGSEAEADWDHWQLHAHYYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAQAQRDLTPEQAAERLRALPEVHYRLGQKDRVTATIA	364587	361328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_361504_361771_361927_362246_362331_362432_362566_362856_362955_363136_363194_363342_363473_363595_363615_363731_363808_364034_364205_364495
828152	contig_10196_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_132239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGTTTTGGTTGCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434234	1433074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433100_1434200
828154	contig_11476_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_170511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAGAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318971	316780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_316800_319000
828155	contig_6436_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_134914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTACGGAACATTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718934	719772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_718900_719800
828156	contig_14023_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_165366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGCGCACCTTAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139878	138117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_138100_139900
828158	contig_6102_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_32009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCCGGGAAAGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462657	463082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_462700_463100
828162	scaffold_13505_pilon	-	886	4	Intergenic	novelGene_111420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1474	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	7	549	458417	456223	TRUE	15	AGCGGAGCGGACGTGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVTALFPKLRCLPGLVMGKGTLASAAEPCSMGVNKGRAAGPGGPQVLEDTSHRLHLQLLPVRSLDLVEGSVGADDHEGGSCRKQAAEGHASSPGPHCPPHHPDPVLTQDPEDGRACTRQPEEGEGDTSGQSVLMGWAHLSAKEHKLGLQCALIEDVTGTKEDRQSHQQHGGTSPRSTG	458423	455586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_455724_456022_456239_456548_456647_457988
828163	SIRV5	+	421	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-91	875	23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8224	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
828165	contig_6589_pilon	+	407	5	Intergenic	novelGene_26132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_1	2660.67965941035	30	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	29	382	1879501	1880585	FALSE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1879278	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
828168	contig_3956_pilon	-	1401	8	Intergenic	novelGene_14784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	121.529202000077	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	71	1036	1053710	1034062	FALSE	20	GCCATCTAGTGCTGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERKVLNKYYPPDFDPSKIPKLKLPKDRQYVVRLMAPFNMRCKTCGEYIYKGKKFNARKETVQNEVYLGLPIFRFYIKCTRCLAEITFKTDPENTDYTMEHGATRNFQAEKLLEEEEKRVQKEREDEELNNPMKVLENRTKDSKLEMEVLENLQELKDLNQRQAHVDFEAMLRQHRLSEEERQQQEQEEDERETVALVEEARKRRLLEDSDSEDDAAPAPPRPATRPKPTAILDEAPKAKRKGESWERSIGTLGSRSQLSGLVVVRKTDLDRGTQHSQQVLTPGAPHNQKPADPAPQTPGASSLSQLGAYSDSEDSSGSS	1053780	1033696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1034175_1036632_1036778_1038284_1038406_1044829_1045012_1045171_1045307_1046593_1046739_1048931_1049033_1053686
828169	contig_16883_pilon	+	1464	13	Intergenic	novelGene_161751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	119.990364196464	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	64	759	518332	577280	TRUE	20	TTTTTAAAATTCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYQEEELLDKVYSSVLQQCYSMYKLFNGTFLKAMEDGGVKLLKERLEKFFHRYLQTLHLQSCDLLDIFGGISFFPLDKMTYLKIQSFINRMEESLNIVKYTAFLYNDQLIWSGLEQDDMRILYKYLTTSLFPRHIEPELAGRDSPVRAEMPGNLQHYGRFLTGPLNLNDPEAKCRFPKIFVNTDDTYEELHLIVYKAMSAAVCFMIDAAIQPTLDFCRRLDSIVGPQLTVLASDICEQFNINKRISGYKVLQ	517881	580442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_517906_518292_518341_519492_519577_526114_526291_529884_529967_532608_532671_532957_533070_556651_556686_557588_557707_577261_577350_578279_578439_578743_578872_580093
828171	contig_6182_pilon	-	1264	6	Intergenic	novelGene_171659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	6.48074069840786	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	14	649	300205	289619	FALSE	25	CAGATGATTAGTTCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAAMEQSAEGRTASALFAGFRVLGLFSNDIPHVVRFSALKRRFYVTTCVGKSFHTYDVQKLSLVAVSNSVPQDICCMAADGRLVFAAYGNVFSAFARNKEIVHTFTGHKAEIHLLQPFGDHIISADTDSVLIIWHIYSEEEYLQLTFDKSVFRISAILHPSTYLNKILLGSEQGSLQLWNVKSNKLLYTFPGWKVGVTALQQVCIFLLCQKKQS	300218	289003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_289713_291670_291804_293562_293681_295424_295526_297792_297821_300043
828172	contig_10904_pilon	-	1190	7	Intergenic	novelGene_22606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	21.1633855724666	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	582	965	489299	488436	FALSE	20	CTGGTGGTGCAATGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNCFFPLVLVLGLAISAVPVLCSIFLIPPSKLCGPFQGQPSIWAQIPESIYSLPQATQNFLFFLGTQAFAVPLLVISSILMAYTVSLANSYGRLISELKRQIETEAQNKVFLAQRAVALSSANGAL	492081	488210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_488505_488603_488683_488965_489122_489219_489351_490474_490573_490979_491113_491782
828176	contig_7594_pilon	-	1507	4	Intergenic	novelGene_55402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	81.1418511004032	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1476	32	1507	392041	383013	FALSE	50	AAGTTAAAATATCATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPSYFLQSDMSPPNQEHICSLFLKECRVSDEFITQFSEWVNRVSSYKYLNFGNITEALRTFQKESEKRNKKKPTQNEQEESVPDREISLPLENTIAFKNVMRALQFPKIMEFLPVLLPRHFKQLINSDSTMLLEAIEEILGTCPWILGFSKVTYRELKLLQCEASWTAFCQCKSLLQLMSDLEKNALIIYSKLKQICREHGHTCIEEAELTSKLSDRMSFDDAWQSLKFLKDSGVVTYEKGCVFPYDLYQAERDIASSICHLMMRPPWDLHVDVKKVLASLQARKPENSECADVLNESKLDETRLENSVHILDTQDNSDHDGENELNAEISEVQLDRDQVTALEMICANAVTVISGKGGCGKTTIVSHLFKHIEQLEEREVKKACEDFEQDQDVSEEWVTFTEQSQLEAGKAIEVLLTAPTGKAAGLLRQKTGLHAYTLCQVNYSFYLWEKNKMMKDKPWKFSSIRVLVVDEGSLVSVRIFKSVLNLLCEHSKLSKLIVLG	392072	383012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_383193_386858_387725_388183_388358_391785
828178	contig_2917_pilon	+	1534	1	Intergenic	novelGene_147576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79905	81439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_79900_81400
828181	contig_7909_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_155938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAGAAACAATTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975557	976784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_975600_976800
828182	contig_5643_pilon	+	602	4	Intergenic	novelGene_39060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	357.760627608275	148	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	122	454	631341	641450	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSESG	631219	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_641443
828184	contig_3233_pilon	+	867	7	Intergenic	novelGene_56560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	357.828481569344	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	254	658	743801	747836	FALSE	20	AATGGGATTGTGTTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVSLVPRGDWPPHPVCGLCVEELGAAEGRFRFGADTWQRDAGSELFLQLHLDEAEALLGPGWGQPWG	738716	748045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740817_740917_743705_743819_745289_745378_746325_746428_746936_747016_747718
828185	contig_7019_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_149459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGTTATCTACTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521982	521126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_521100_522000
828187	contig_7605_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_172953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCCTATTGTTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264188	265456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_+_264200_265500
828189	contig_14451_pilon	+	1936	4	Intergenic	novelGene_176874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.94392028877595	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGTAAGGTAACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194769	226012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14451_pilon_+_194822_196105_196170_218374_218453_224270
828190	contig_10135_pilon	+	1071	6	Intergenic	novelGene_106580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	46.9067159370596	45	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	34	765	25077	27660	FALSE	10	GTCCTGTGTTTGGACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGRSLDRILRMVSAVSSCRTCSRSHRPRLGFIIRPRHQLLPLLLCPGLRIPRLSVLCAQPRPRAMAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKGSVVAAYRKTHLCDVDIPGQAPMHESDSTMPGPSIEPPVSTPAGKTRPLPCPNRPQLSTTVAPTPACVPAPQA	25043	27966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25130_25663_25763_26029_26285_26387_26492_26718_26853_27573
828191	contig_15613_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_147224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAATTGCTCAGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265162	264327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_264300_265200
828196	contig_5222_pilon	-	1641	2	Intergenic	novelGene_58987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGCCAGGGCATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171268	169406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_170075_170295
828197	contig_14516_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_153897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCTAACCAAAAGATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80025	80923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_80000_80900
828199	scaffold_19766_pilon	+	1036	3	Intergenic	novelGene_34307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_2	3.5	161	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	97	336	556963	557202	TRUE	40	TTGTTAACAAATGAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSGIWERRGRVCVPPSLAPDRATLHPRSKAKMMGCGEAELESAEEAVAAPGPPPEPRVSEPRAPVPEPGLDLSLSPQPESPEPPNCTPGRRKGRANRRGGARKGRQVSWE	556866	558085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_557522_557599_557737_557841
828200	contig_5686_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_45381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGCAATAATATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156895	157298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_156900_157300
828201	contig_8801_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_66291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493367	492897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_492900_493400
828202	contig_7056_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_43740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGCTATTATATTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102576	1103653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1102600_1103700
828203	contig_9415_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_109888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	374	685	2060469	2060158	NA	40	AAAGAGTGTAGCATATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVYRTKQERSDDNCIQNKQERSDDNCIQNKQRSDDNCIQNKQERSDDNCIQNRSAVMTTVYKTDRSSVMTTVYKTNSTVMTTVYKINRSAVMTTVYKTGAQ	2060842	2058757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2058800_2060800
828204	contig_2114_pilon	-	1339	2	Intergenic	novelGene_104251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	63	314	286102	285851	TRUE	30	CCAAGAGTCAGCTGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLPPFFLEACTRGRCAITNMTNSRGNVVKHNHPEPGKSTRKSLTWFTRPHPGEYLTGSDPPKEERDLLRTPGFQHSPREDAPHGFQPAPCHDQHLRLNTTSC	286164	267768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_268776_285832
828205	contig_1008_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_121571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655086	656554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_655100_656600
828207	contig_14618_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_136816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAATTAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648007	648916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_648000_648900
828208	contig_15098_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_176878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13254	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15098_pilon_-_12700_13300
828209	contig_2487_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_148456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCAGTTTCCATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128447	127199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_127200_128400
828210	contig_8978_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_49306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCCAGACTGTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110193	109830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_109800_110200
828211	contig_17768_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_140402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACACAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74845	72895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_72900_74800
828216	contig_4364_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_3327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATGTGCGAACATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533200
828217	contig_11258_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_67763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGACCTTGTCTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179202	179789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_179200_179800
828219	contig_5341_pilon	-	1087	3	Intergenic	novelGene_168032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	705	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	184	468	338764	338480	FALSE	30	TATTACATAAGGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRVVRAEGNSSRKLRRCGVSLDWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340869	337860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339319_340800
828220	SIRV5	-	426	2	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	133	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2273	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986
828223	contig_13806_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_173661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAATTGATTCTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115091	113822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_113800_115100
828224	contig_11115_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_102780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATGAATTAATACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39980	39430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_39400_40000
828225	contig_20356_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_159540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCACCATCAAAACAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95934	95114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_95100_95900
828226	contig_20356_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_159541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAACACAGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96466	96010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_96000_96500
828229	contig_8174_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_160058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATATTGCTCAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285636	286686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_285600_286700
828230	contig_9481_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_149679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAGAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451357	449610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_449600_451400
828231	contig_4364_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_3431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAACTGGGTCCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
828233	contig_3077_pilon	+	829	5	Intergenic	novelGene_26901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCCATTGTAAAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1543619	1553199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1544090_1547624_1547738_1548637_1548767_1552946_1553011_1553146
828234	contig_5253_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_61577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAAAAAAAAAAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272486	271229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_271200_272500
828236	contig_12532_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_111152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATACATAATTCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106524	106865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_+_106500_106900
828237	contig_5598_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_148293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAATACTAGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779166	778737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_778700_779200
828238	contig_10877_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_166211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	432	1649	2080	43629	43198	NA	30	AATGAATCCATTATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKALPVLTHTLPSFFFFFKIRYNHSALPVQTLNCAPAFLLPPGMLFPQTSVGLPSSGLSSSVREVKPSTSLKMATNLHLFPSPTLCGTFLVLFFLIATNYHVWNNVFYLLFPLSSLECKIHDADILFGSVHVQNRCLINNML	45277	43197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_-_43200_45300
828239	contig_18794_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_54636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAAAAAAGATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120616	119067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_119100_120600
828240	SIRV1	-	241	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3861	2	3587	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCTGGAAGTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	6451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
828241	contig_6589_pilon	+	1611	3	Intergenic	novelGene_25690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	221	514	108576	109444	FALSE	80	ACAGAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARQAGPDVSGAAVSSLRFPGTALPVTSPTRSFLGDVDKPCPPLCDVTEPAAPPSRCLLGLFLSLPAGGGGVAMKPGKSKSDLCGAERSLAPAYLTDRPGRLQRHLLSGEFDQLRDFPIFESNFVQVTRLGEVANKVTMGVAASSPALELPDLLLLAGPAKENGRLQLFG	108355	110541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_108616_108810_108930_109309
828242	scaffold_880_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_121455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCAAATCCTATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451922	451442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_451400_451900
828246	contig_21007_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_161545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611	900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_900
828247	contig_12119_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_88632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	1730	2125	75346	74951	NA	20	AAGCCATATCCTCCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKISEFSSQFDILISQEQLKGRSKGRENKRKALCKKGNGKWKMEVEKRNAILYVRKNQIINTGHTSAWSVLRVPISLVSPPISLAPSTPITLTHSPWHMLTGCFLCLNTLCSLLHYSTLLYPSDYSTNDDS	77075	74948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_74900_77100
828248	contig_8617_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_73436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62489	62036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
828251	contig_6684_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_168595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGAGGCTCCTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133505	131874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_131900_133500
828253	contig_6102_pilon	-	1217	3	Intergenic	novelGene_32237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	15	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	23	394	927104	920710	FALSE	75	AAAAGAGGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLIPCSMETFDPADLPELLKLYYRRLFPYAQYYRWLNYGGVIKNYFQHREFSFTLKDDIYIRYQSFNNQSDLEKEMQKMNPYKIDIGAVYSHRPSQHNTVKLGAFQAQEKELVFDIDMTDYDDVRRCCR	927126	919886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_920821_926066_926225_927001
828254	contig_5286_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_157390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657375	658578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_657400_658600
828256	SIRV6	+	211	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	519	53	519	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
828257	contig_4951_pilon	+	2152	8	Intergenic	novelGene_122123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.32364170012044	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	894	1289	105328	109217	FALSE	5	CTCCACCTTGTCTTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQAPIDGRIADCRLLWDYVYQLLSDTRYEPYIKWEDKDAKIFRVVDPNGLARLWGNHKNRMNMTYEKMSRALRHYYKLNIIKKEPGQRLLFRFLKTPGKIVQDKGSCLEQLENQGQDRMDFKDEMLQVSP	95086	110080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_95354_97446_97583_101072_101238_103070_103198_105129_105362_107238_107382_108885_108987_109099
828258	contig_15744_pilon	+	379	2	Intergenic	novelGene_83600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149517	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_153326
828260	contig_10197_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_115327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCCACAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625648	1627045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1625600_1627000
828261	contig_5549_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_81625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	1	25	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	9	701	387826	374443	FALSE	50	TAAAAATTGTAGCATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDMNIKVIFSTLLGVKGTQKDSEAFLVQILSKSQRPSENTEGKVLWTGWFCCIFGESLLETVSEDFTCLPLFLANGAEANTAIIGTWFQKTFDCYFSPLSINAFNLSWMAAMWTACKMDHYMATTEFLWSVPCSPQSLDISYAIHPEDAKALWDSIHKTPGEVTQEEVDLFMDCLYSHFHRHFKIHLSATRLVRVSTSVASAHTDGKIKILCHKYLIGVLAYLTELAIFQIE	387834	373501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_374515_376658_377202_387748
828262	contig_10541_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_144646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACTTAACACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263689	264956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_263700_265000
828263	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	355	581	182	9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTTTACGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485	1959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828264	contig_14855_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_146022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1890	2402	517095	516583	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSRHWRKKDKNGIISTLKKVTLKICREYSPRRSTEFAELELGMMFAFKILTLWATVTGMRAPESNATPPIQRPWARHSIHSCHPISNTVTMMPSGMFLLHWGWFGLCVGLSCKRTYFYFDRSWPSFPKVISSECVYVSYFISLTSCLSPRLKYSTAYLTFPVGSLLDV	518984	516469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_516500_519000
828265	contig_20165_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_54483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGTATTGTATGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87857	88516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_87900_88500
828266	contig_10861_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_39198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATACTGAGATTGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349279	348727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_348700_349300
828267	contig_9051_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_170816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGGGAAACGGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050711	1052553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1050700_1052600
828268	contig_11978_pilon	-	455	3	Intergenic	novelGene_63023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	3899	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	75	320	1595939	1591984	FALSE	10	AGTGCTTGCCTTCCGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1596013	1591848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890
828271	contig_12000_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_43173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTGCATTTGGTAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417224	419052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417200_419100
828272	contig_7599_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_73759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTCCAGAATGTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8527	9977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_+_8500_10000
828273	contig_5260_pilon	+	772	5	Intergenic	novelGene_144343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_1	82.2648162946955	1093	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCGAAATGACTTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63224	90814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_63505_70367_70468_84015_84087_90024_90107_90575
828274	contig_5718_pilon	+	1318	4	Intergenic	novelGene_110378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	83	junction_1	15.5777619273972	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	225	815	1173669	1269948	FALSE	15	AGGTCTGTGTGTTGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEQSSEAESRPNDLNSSVTPSPAKHRAKMDDIVVVAQGSQASRNVSNDPDVIKLQEIPTFQPLLKGLLSGQTSPTNTKLEKLDSQQVLQLCLRYQDHLHQCAEAVAFDQNALVKRIREMDLSVETLFSFMQERQKRYAKYAEQIQKVNEMSAILRRIQMGIDQTVPLMERLNSMLPESERLEPFSMKPDRELKL	1173444	1270451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1173727_1176500_1176645_1235074_1235233_1269717
828275	contig_15108_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_131183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCATATGGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109649	110477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_109600_110500
828278	contig_9895_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_144704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370354	370982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_370400_371000
828280	contig_7728_pilon	-	1111	7	Intergenic	novelGene_64699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	509.3340150519	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACCTCATCCCTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752204	713387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716182_726429_726569_729251_729337_730500_730541_735945_736058_752041
828281	contig_13412_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_80011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366141	364675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_364700_366100
828283	contig_17066_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_130955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGCCGACAGTTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246838	246052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_246100_246800
828284	contig_13828_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_158285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATTTCAGAGAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129991	131365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_130000_131400
828285	contig_18934_pilon	+	731	7	Intergenic	novelGene_175889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	12.5664898307629	63	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	122	730	198567	205004	FALSE	35	TTTATAAAGCTTGGGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSSLLTSAAGRTSLADSSIFDSKVTETSTTYVEEEMPQIETRMILVQEAGKQEELKKAIKEIKVPFVKMESVEEFEGLDSPEFENVFIVTDFRNPVFNHLYKADCRIIGPPVVLSCAQKGEPLPFSCRPLYCTSMINLVLCFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFNSKVTHLVANYTQGEKFRVAVSLGTPIMKPEW	196583	205005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_+_196684_198545_198673_199292_199373_200812_200996_202854_202945_203913_204022_204962
828286	contig_16418_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_176879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCCTTTGGATCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12369	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16418_pilon_-_11200_12400
828287	contig_9195_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_155667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTAGGTATGGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12946	11926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_11900_12900
828288	contig_9195_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_155665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	145	465	11626	11306	NA	25	GGTGCATGGTATTTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNPSLGCSFALYPSCTKQQEALVRISTPLGLGSCCIHLIISISFFRVMHFIVAVAFAQKLPLLIAPGPAFRGTSGPSLPSGRPRAKSLQRTWLGLQPDRYAENP	11770	10852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_10900_11800
828289	contig_13014_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_169360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGCCACCTAGTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434563	435498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_434600_435500
828290	contig_13014_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_169361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTATTTGTTCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435448	436946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_435400_436900
828292	contig_6412_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_149980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597905	596177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_596200_597900
828293	contig_2463_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_43015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	710	1135	433937	434362	NA	20	CCTTTGAGTAGTCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISAVNSVLPRNNVLGGVLKTKKQLKTLNHFDLPNGILVDDLGEEPLPPLRRGRKRHCKTKHLEQNGSLKKLRQTSGEVGLAPTDPVLREMEQKLQQEEEDRQLALQLQRMFDNERRTVSRRKGSMDQYLLRSSSMAGAK	433227	435744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_433200_435700
828294	contig_12270_pilon	-	370	2	Intergenic	novelGene_113332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	27	368	14409	13845	FALSE	25	TTATAGCTGCTGGTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYA	14435	13842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
828296	contig_9437_pilon	+	955	11	Intergenic	novelGene_141745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	138.956971757447	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	32	955	524155	557972	FALSE	55	GTGAAGAAAGACAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDPGTDQRQNEEIEAMAAIYGDEWCVVDDCAKIFCIRVNDTAKNPKWTLCLQVLLPNEYPSTAPPIYQLNAPWLRGQERMDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPEPETTKKTEEEDVECEEDLALACDSESPVKALETDISENKTETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQVKMVLSKLYENKKIANATHNIYAYRIYCEDKQTFLQDCEDDGETAAGGRLLHLMEILNVRNVLVIVSRWYGGILIGPDRFKHINNCARNILLEKNYITLPEESSKAVGKNKK	524123	557972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_524191_525312_525442_526424_526478_527753_527817_535608_535695_538464_538588_549658_549757_551903_551978_554779_554871_557035_557171_557936
828298	contig_15122_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_162692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACTCCAGGCATACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115385	114904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_-_114900_115400
828299	contig_1637_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_142393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAAAAAATACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699478	698116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_698100_699500
828300	contig_5826_pilon	+	1369	5	Intergenic	novelGene_71520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	530.837310293841	123	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	218	640	174975	188141	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEQKTSKLKTAIESRQKKLIKEQFHGLRSQSCGDEEFPHYDPLSCPDIIQQPLQQQLKQCCYKLYGSEETRIQRTPLTLKCVCWYTPLLDALHLDSLTGNPRLGLTLFSYVANRIHASCERPKYAEIKDDALDVTRGQK	174757	188870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_175006_182808_182871_184633_184715_185354_185452_187989
828301	contig_1337_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_84224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAACATAATGTTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86060	86725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_86100_86700
828303	contig_8069_pilon	+	656	2	Intergenic	novelGene_136775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATTTTCTAAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411135	411935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_411583_411726
828304	contig_2480_pilon	+	2084	5	Intergenic	novelGene_63498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	70.8695985596081	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1488	595	2082	5500	17912	FALSE	30	TGGAAAATTATTCTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKALGSVSFEDVAVDFTQEEWQQLDTVQKTIYKDVMLENYSHLISLGHPIIKPDVITKLEQGEEPWIVEGEFLLQSYPEEAYKVDDLLERVQENEEELSGQTVFINNKTQVEERGNILDKTFNVETSPDPSRKISYKCDSCEKNLKSISGYITSDGSYARMNPDECSGCGKSLLHIKLEKTHPGDQSYEFNQTGEADTLNDESIYQKIHILEKPFDYIECQKAFQTETVFVNHMEEKPCKWNESEIAFLQMSNLGVHQSSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPFVCNQCGKSFCQKGTLTVHLRTHTGEKPYECSVCGKTFYQKLHLIQHERTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHYCAKTFSQKSALNDHHKIHTGVKLYKCNECGKCFCRKSTLTTHQRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNE	4073	17914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_4618_5449_5515_12252_12380_12649_12746_16662
828305	scaffold_14128_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_169525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACTTGCTATGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277671	278169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_277700_278200
828307	contig_16103_pilon	-	565	3	Intergenic	novelGene_118722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	518.5	379	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	102	443	211758	207292	FALSE	10	TGAGGCTGCTGGTCTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLSEQVLTAAMAHPLEKALDVMVSTFHKYSAKDGDKFKLNRSELQELLTRELPSFLGKRTDEAAFQKLMSNLDSNKDNEVDFQEYCVFLSCIAMMCNEFFEGCPDKQPRKK	211859	207169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208627_208784_211737
828308	contig_5023_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_7144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCAATCACACTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339938	338763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_338800_339900
828310	contig_5569_pilon	+	2019	10	Intergenic	novelGene_86709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	25.6779676900521	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	225	1385	23963	27840	FALSE	70	TCAAAATAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLEKVLGITVSGGRGLACDPRSGLVAYPAGCVVVLFNPRKHKQLHILNSSRKTITALAFSPDGKYLVTGESGHMPAVRVWDVAERNQVAELQEHKYGVACVAFSPSAKYIVSVGYQHDMIVNVWAWKKNSVVASNKVSSRVTAVSFSEDCSYFVTAGNRHIKFWYLDDSKTSKVNATVPLLGRSGLLGELRNNLFTDVACGRGKKADSTFCITSSGLLCEFSDRRLLDKWVELRTTVAHCISVSQDYIFCGCADGTVRVFNPSNLHFLSTLPRPHALGTDVASVTEASHLFSGVANARYPDTIALTFDPTNHWLSCVYNDHSIYVWDVRDPKKVGKVYSALYHSSCVWSVEVYPEVKDSNQACLPPSSFVTCSSDNTIRLWNTESSGVHGSALHRNILSNDLIKIIYVDGNTQALLDTELPGGDKADGSLMDPRVGIRSVCISPSGQHLASGDRMGTLR	9677	28474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_9772_22914_22978_23193_23252_23953_24125_24497_24636_24865_25049_25595_25757_26537_26728_27285_27433_27660
828311	contig_1948_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_31187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGCTATCGTTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552054	551472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_551500_552100
828315	contig_7066_pilon	-	1411	2	Intergenic	novelGene_42205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	178	1119	1046298	1045357	FALSE	55	GGAGAAGTGCAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDSNHHHHHNASASATPKLPEVVYRELEQDTPDAPPRPTSYYRYIEKSAEELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEIFEYLMDRLEKESYFESHNKGDPNALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSRAVDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQAGLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIHTPPGSARRLPALSHSEGEEDEEEEEEEGKSWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRYAGHRWTGR	1050267	1045064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1046348_1050139
828316	contig_19957_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_57743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATCCCTATTTTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376145	377446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_376100_377400
828317	contig_4114_pilon	-	1413	4	Intergenic	novelGene_15625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	21.4527905462721	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCACTTGTTCGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500155	464343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_465345_465805_465906_474120_474309_500031
828319	contig_11281_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_125490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTTTTTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910198	911287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_910200_911300
828321	contig_7933_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_164675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGCACTGGTCCAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	186019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_185700_186000
828323	contig_10861_pilon	-	991	6	Intergenic	novelGene_39458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	396.827116008974	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2638370	2617910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2620867_2621063_2638306
828325	contig_13295_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_31242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	331	636	102032	102337	NA	65	TGAAAAAAAAAAAGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVKVETLKRPNTHILTAFWFLRMWTKDCDCDKLHSYIPDLTLKSQLMGANKKSSNRSLLYLAKGPEKGQLSKTENFWTIIALHQPNNTEKNCGPSPTSKG	101701	103053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_101700_103100
828326	contig_9839_pilon	-	1090	7	Intergenic	novelGene_88546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	57.3655432777861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	102	662	122755	111956	FALSE	25	ATTGATAAGAGTTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTIYMAYIFEEGAGIPGVVYSVLDISGLEGKLFSSFKAGYPFWGAISFAISGFLSIICERKNAIYLVRGRLGANTISSIAAGTGIVILIINLKESLTSLYYQCLQVADNDFCSVNYFSTEIVAMLLCLTILGFCSAVSLTIYGVRELLEGDKVPEDRLYEELNIYSPIYSELEDREEMPPPTDS	124678	111527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_112055_115463_115563_116318_116478_118304_118362_122018_122108_122697_122822_124643
828327	contig_6946_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_59751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATACAATAAAGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83991	83387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_83400_84000
828330	contig_1516_pilon	+	930	7	Intergenic	novelGene_49988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1213.71523293838	11	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	843	87	929	347241	363726	FALSE	15	GAAGCACCTGTTTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFICRCRQTLHPPPSIFPTTAATSRPVAIEPTCMSINNS	335195	363727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353693_354793_354963_363617
828331	contig_5770_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_74158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAATACCATTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216308	215128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_215100_216300
828332	SIRV6	+	423	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGTGGCTTGGTCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847
828333	contig_13607_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_170213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCATCCTTCCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340529	339450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_339400_340500
828334	contig_11056_pilon	+	1716	6	Intergenic	novelGene_130349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	11.3947356265953	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	321	1325	16819	31061	FALSE	50	CAATAACATAAAGTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQLLITLPTEASTWVKLHHPKKAKEGMPLWEDVTKIFEGALLSEDADETQGESIENKVIPGPPTAEYQELLTFKDVSVEFTQEEWRQLAPAHQNLYREVMLENYGNLVSVGYQLSKPGVISQLEKGEEPWMSEREISGGPVSDLENETETKESTLKNDISWKELHHGLMMERSTKGSTLYSTLGKVSKCDKFKSHQENQGMGEVQVLLIRKKTLTQERGQESNRFEKSIHGSSKATPGPLRKRDPKYDTSGKRSRYDLDLINHTRSYAKVKSFECSICEKIFKQLIHLTKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNDT	16498	31452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_16943_19172_19259_22389_22517_22777_22874_29901_30340_30927
828335	contig_10988_pilon	+	502	6	Intergenic	novelGene_104745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	4.63033476111609	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	64	501	457824	475807	FALSE	30	GACTAAACTTTGGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGNKLLPAWIRIVLSEGTPTMLCLAALHGMVALVGSEGDVIQLKSEAIQTSEFQGRLNEVIRTLTQVISVSGMIGLQSNAIWLLGHLHLSTLSSNQSRSSVPTDYSYLPESSFMRAAIGFFVTGGKKGPESVPPSLLKVVMKPIATVGENYQFPPVNWASLLSPLM	457289	475808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_457341_457811_457890_458756_458829_460334_460438_462348_462430_475691
828337	contig_10627_pilon	-	1440	3	Intergenic	novelGene_59961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	78.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	182523	180958	TRUE	15	TTTTGTGACTTTGTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTGSAQQGHNSPDSPPRQCCQEHTRLWQYWEHQQCSSDLPFCWSPRSQQHSSRE	182525	179708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_180767_180889_181231_182484
828338	contig_817_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_132481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACCAGGATGCCAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728715	727998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_728000_728700
828341	SIRV5	-	374	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCGTAAGCACTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
828343	contig_14513_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_70402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	187	408	18880	12942	FALSE	25	TGCTCGGAATTATTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMFPWLKQKNQNGWMLQNRLIYSFN	19066	12858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_13013_18729
828344	contig_9609_pilon	+	493	2	Intergenic	novelGene_23072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATACCAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450203	456267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450277_455847
828345	contig_11551_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_168486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835134	836934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_835100_836900
828346	SIRV4	-	261	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1262	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3896	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
828347	contig_11056_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_130378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTAGTCTGCGGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355122	357452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_355100_357500
828348	contig_15105_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_150987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATTAATAAATGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678795	680155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_678800_680200
828350	contig_15529_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_176880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATCTAGTATATTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8957	9715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15529_pilon_+_9000_9700
828351	contig_9036_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_155453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTCAGAGAGGTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131296	129247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_129200_131300
828352	contig_9678_pilon	-	1947	3	Intergenic	novelGene_146351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	114	1883	129840	128071	TRUE	40	TACTTTGGAGAAACCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSVHENRKSRASTGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDNEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEQYDPTTNKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS	133068	123481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_123520_128044_129854_132968
828353	SIRV2	-	471	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	100	-118	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGAAATGGTTGGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5795	3783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3963_4095_4338_4480_4687_4801_5751
828356	contig_4012_pilon	-	1315	5	Intergenic	novelGene_176882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	52.0258349284276	130	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	621	1016	613341	612179	FALSE	20	GAACGCTGCTGTATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKGPVGPASELKSAAASCSVDLGREHSTPGPPRGSQNPASAPQTEADHLEEELDLLLNLDAPVKEGGDILPDQTSQDLKSEKDRTVAQEEEAPVKPSVTEEKNVGSEQPSTSKNVTEKELEDWLDSMIS	673906	611879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_-_612295_613061_613408_614469_614566_620786_620858_673519
828357	contig_10626_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_138196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72537	73952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_72500_74000
828358	SIRV6	+	347	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	372	581	199	9	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTTTACGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	1959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828360	contig_6837_pilon	+	1662	7	Intergenic	novelGene_149797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.8110118769502	207	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	106	960	4733	7884	FALSE	20	TATTCTTTTCCATTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADGERSPLLSEPIDGGAGGNGLVGPGGSGAGPGGGLTPSAPPYGAGKHAPPQAFPPFPEGHPAVLPGEDPPPYSPLTSPDSGSAPMITCRVCQSLINVEGKMHQHVVKCGVCNEATPIKNAPPGKKYVRCPCNCLLICKVTSQRIACPRPYCKRIINLGPVHPGPLSPEPQPVGVRVICGHCKNTFLWTEFTDRTLARCPHCRKVSSIGRRYPRKRCICCFLLGLLLAVTATGLAFGTWKHARQYGGIYAAWAFVILLAVLCLGRALYWACMKVSHPAQNFS	4627	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_4896_5206_5398_5765_5873_6298_6405_6579_6633_6736_6828_7740
828361	contig_19744_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_120419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATATTTAGCTTGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282791	283168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_282800_283200
828362	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
828363	contig_3789_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_79858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAACCCCCACAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454471	453430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_453400_454500
828366	contig_10629_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_52963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAACAGTGGGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563416	564054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_563400_564100
828368	contig_12437_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_169070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36634	38067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_36600_38100
828370	contig_7230_pilon	+	436	4	Intergenic	novelGene_52517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	17.9133717900592	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	17	349	4010	8648	FALSE	30	TGTCATCCTCATACCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTDPENGHLFNCIQRAHQNTLEVYPSFLFFLAVGGVYHPRIVSGLGLAWIVGRVLYAYGYYTGEPRKRNRGGVSFIALIALMGTTVCSAFQHLGWVKTGLGSGSQHCH	3993	8735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_4075_5588_5647_7543_7617_8511
828371	SIRV6	+	461	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	14	10	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
828374	contig_6795_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_27722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCAGCAAATGCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270386	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_270400_271100
828376	contig_12250_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_80537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	3.65513337649941	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	99	737	238945	245880	FALSE	30	CCAACAAGACTTTTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGSWRSVSNVSSEVGRRVWNSGPPPQRPFRVCNHKRTNRKGLTAATRQELLDKALETLLLSGMLTLVLEEDGTTVESEDFFQLLEDDTCLMVLESGQSWSPIRSRMLSYGLGRKKPKHSKDIARITFDVYKQNPRDLFGSLNIKATFYGLYSMSCDFQGLGPKKVLRELLHWISMLLQGVGHMLLGISSTLRHIVEGAEQWQQQGRLHAY	234132	246334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_234171_238884_238965_241065_241211_242037_242188_245376_245568_245747
828380	SIRV6	+	342	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	4	1243	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
828381	contig_9186_pilon	-	2152	5	Intergenic	novelGene_85363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	22.8951414059839	138	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	194	811	643909	638458	FALSE	35	CACTTCCACCATCCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGILEKSMFCKDMTVKYDSRLRERKYGVAEGRALAELRALAKAAGEEVPTFTPPGGETLDQVKMRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	645808	637116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_638890_640124_640236_643834_643913_645289_645412_645740
828382	contig_1836_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_71083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCTCTGTTTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997396	998541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_997400_998500
828383	contig_16846_pilon	-	701	4	Intergenic	novelGene_82988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3759.16217024781	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	42	560	555239	551492	TRUE	45	AAATCTCAAATAGAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555280	550888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550982_551443_551665_552661_552824_555055
828384	contig_13625_pilon	-	1549	9	Intergenic	novelGene_150157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	139.287472516375	1	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	122	868	43415	29843	TRUE	25	AAGTTTTCTTTGCTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYALGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43536	23728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_23966_27051_27253_28833_29017_29782_29983_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
828386	contig_15047_pilon	-	1211	5	Intergenic	novelGene_52289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.68954408012983	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	285	776	84499	79792	FALSE	35	TAAAATAATTTGTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHGGTLVQESTWPIILRVLVAAIIIVIIIIIIALVLCWFKKESSDVESPA	93348	79356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82700_82842_82958_83229_84423_84686_93250
828388	contig_5718_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_110355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCTATGTGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683629	683015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_683000_683600
828389	contig_12173_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_172960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	39	347	74902	75210	NA	55	TGGCAGAAAACAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRESFSVIAVLMRSMCGVRVGGCRGGVCDGQREEGDRAVLEFSVLLDPGSLDDPQEHVATREGTEPGLLRPRKASKLYLQSFQKQEFICLLPLTDCQPCEEGIPWLESAGSIV	74863	75688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_74900_75700
828390	contig_3584_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_108159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAATCAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447997	446738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_446700_448000
828391	contig_2703_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_101846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTGCTCTCCCCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338414	1337750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1337800_1338400
828392	contig_6446_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_149253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	820	1128	630500	630808	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLINLLKTPSGQDSALCCISSLQFPPSSHWNFCPNLCHFVYKTILPKPSFLRLSLYSFLWPSFSYIPIIIACAVSKRQRGTAWAEITFSSSVHTAIQLRQI	629680	631127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_629700_631100
828393	contig_8310_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_75547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACAGAGTAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185508	183665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_183700_185500
828394	contig_8587_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_159146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACAGATTAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507624	508247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_507600_508200
828395	contig_10751_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_174817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGAGCCCCCGTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208866	209462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_+_208900_209500
828396	contig_10751_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_174818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	210710	211066	NA	50	AAACAAAAATCCAGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVCVCVCVRCSVCVCLSRGHIRVHLRERVHVPTCVGCVHPRLGRLEVGAPVSCPLSPQGQSVYLLRASPSSSPSCSAPSTRTLQQESPQGCGGPSASLGRSTPSGPLPPSSRQLNQVP	210707	211313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_+_210700_211300
828397	contig_6958_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_69952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGACCCCCCGTGACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170483	171482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_170500_171500
828399	contig_19957_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_57720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231472	230774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_230800_231500
828400	contig_10986_pilon	-	1229	8	Intergenic	novelGene_71499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.3203640693666	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	25	990	149386	141925	FALSE	25	TCTAATCTTTTAGACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPAAAATMHRPRPACCTLLLVLGLCSAHRARGRNVLLILADDGGFESGAYNNSAIATPHLDALAHRSLIFRNAFTSVSSCSPSRASLLTGLPQHQQGMYGLHQDVHHFNSFDKVRSLPLLLSRAGVHTGIIGKKHVGPEAVYPFDFAYTEENSSVLQVGRNITRMKLLVRKFLKSQDHRPFFLYVAFHDPHRCGHSQPQYGAFCEKFGNGESGMGHIPDWTPQTYDPQDVQVPYFIPDTPAARADLAAQYTTIGRMDQGIGLVLQELQGAGVLNDTLVIFTSDNGVPFPSGRTNLYWPGTAEPLLVSSPKHPRRWGQVSEAYVSLLVQ	149410	141685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_141933_142325_142530_143579_143662_144669_144827_145833_145985_146233_146340_147138_147300_149289
828401	contig_9705_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_41756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTCAGCTTTTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471653	473176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_471700_473200
828402	contig_10324_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_7821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAACTAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236510	237875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_236500_237900
828403	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828404	SIRV4	-	200	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	414	3	-414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAAACTATCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
828407	contig_15185_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_99467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCTGCCTCTAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454768	455542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_454800_455500
828408	contig_15120_pilon	-	2153	10	Intergenic	novelGene_107985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_3	94.3882185575569	53	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	40	1854	82431	70435	FALSE	5	CTTTTTCTTCTTGGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQTLLSPLSNSESMSAAVTAGKLARAPAETGKTGAPGIAVPGATAAAPPAKEIPEVLVDPRSRRRYLRGRFLGKGGFAKCFEISDAETKEVFAGKIVPKSLLLKPHQKEKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDSDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPLAASLIQKMLQTDPTARPTISELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGMENPVPERPREKEEPVVQETSEAVDCHLGEMLQQLHSVNAAKPSERGLVRQEEAEDPACIPIFWISKWVDYSDKYGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGESLQYIERDGTESYLTVSSHPNSLMKKITLLKYFRNYMSEHLLKAGANITPREGDELARLPYLRTWFRTRSAIILHLSNGCVQINFFQDHTKLILCPLMAAVTYINEKRDFRTYRLSLLEEHGCSKELASRLRYARTMVDKLLSSRSASNRLKASS	82470	70135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_70642_71245_71429_71524_71680_71880_71959_73505_73662_76907_77128_79122_79217_80223_80369_81116_81286_82023
828410	SIRV6	+	355	2	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	3	8025	3	223	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGACGTATCGTTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	2763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
828411	contig_3147_pilon	-	1664	3	Intergenic	novelGene_142270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTATTATGGCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81705	66913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_68406_75868_75957_81621
828412	contig_15410_pilon	-	956	6	Intergenic	novelGene_130581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	99.6124490211941	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	132	800	57724	54277	FALSE	25	CCCAAGCAATTCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	57855	54120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_57516_57564_57669
828414	contig_3424_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_55494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGCGATCTCCTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156481	155702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_155700_156500
828415	contig_13700_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_68280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAATTTTCTTGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111059	110644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_110600_111100
828416	contig_10642_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_78756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTTTATAGTTCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457984	1457657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1457700_1458000
828417	contig_10642_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_78755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGCCAAGTGGACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456822	1453955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1454269_1455373
828418	contig_16804_pilon	+	2310	2	Intergenic	novelGene_167286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13453	16761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_14992_15989
828419	contig_11448_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_66364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	390	752	249182	248820	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNVATCHVLTPSFKKQNVHFPFLKKCKNLCHSKTIPFVQGNNFSLKDRSCYVEPALTASIVSYSEDTVTPGSLLSWGPLSTSQICGRSDSSYLLLSVKIVTWSQVGSALVAFWKWGLS	249571	247484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_247500_249600
828420	SIRV6	+	448	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	515	164	75	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTAACGTGGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828421	contig_2419_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_137127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTTTCCAAGTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125772	125158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_125200_125800
828422	contig_14333_pilon	-	871	5	Intergenic	novelGene_49149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	165.161095600629	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	595	648	441061	441008	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIWWKKITSLESYMGTFGRYSETQICFAKN	446905	440784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441090_441682_441821_443131_443248_445731_445820_446681
828424	contig_6412_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_149960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCTGAGGTTCCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236882	238034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_236900_238000
828426	contig_9682_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_125312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGTGAACCAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484754	483773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_483800_484800
828427	contig_3727_pilon	-	2269	13	Intergenic	novelGene_146758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	814	1128	397750	395097	TRUE	5	AGCTGCTGCTGCCTCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSRAACLPELEVRPWMMANGPEHSMASWDGRLLLKSAHWASESCLSETRFHVERDGLKQYAFPSDRFITGIPCCVSKICDTVISLPAKMECRDSSFTTTTCL	424632	374439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_374525_375505_375581_383820_384026_386043_386192_389794_389997_390381_390499_391944_392080_394257_394423_395087_395147_395486_395595_396941_397066_397717_397880_423948
828428	SIRV4	-	408	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	103	106	103	-106	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAAAAACTAACCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5055	3743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
828429	contig_2069_pilon	-	670	3	Intergenic	novelGene_23480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509860	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509079_1509776
828430	contig_10148_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_172871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTGTTTACAGCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319467	318199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_318200_319500
828432	contig_8843_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_156638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10595	10241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_10200_10600
828435	contig_9345_pilon	-	2022	9	Intergenic	novelGene_24717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.47985272676876	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	20	1213	1010659	1006576	FALSE	15	CTTGCTTGCTACAGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAWVGSRLQAPPSTLSRSLICAQDVLRRTPLYDLHLAYGGKMVAFAGWSLPVQYRDSHIDSHLHTRRHCSLFDVSHMLQTKIFGCDRVKLMESLVVGDIAELRPNQGTLSLFTNEAGGIIDDLIVINTSEEHLYVVSNAGCWDKDLALMQDKVKELQNTGSDVGLEVVDNALLALQGPTAAQVLQAGVTDDLRKLPFMTSAVMEVFGVSSCRVTRCGYTGEDGVEISVPAAEAVHLAMALLENPEVKLAGLAARDSLRLEAGLCLYGNDIDEHTTPVEGSLSWTLGKRRRAAMDFPGAEVIVPQLKGKVQRRRVGLMCEGPPMRAHSPILSTEGAMIGTVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPSQYSRPGTLVLVEVRRKQQAAVVSKMPFVRTSYYTLK	1010678	1005766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1006755_1006861_1007018_1007409_1007591_1007672_1007819_1008148_1008228_1008667_1008800_1009704_1009786_1010316_1010485_1010587
828436	contig_1516_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_50005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCATTTTCAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342657	344349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_342700_344300
828438	contig_11986_pilon	-	1708	3	Intergenic	novelGene_69170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1593	junction_1	288.5	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	9	1136	517888	516761	TRUE	15	GGCACTGCTGCCGGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRSCSGLPWGQGRQDSKAAPWSVYLPPWSAHCAVHLPPWSVHLPPWSAHPVSTACPPCPLSLSILSPQPVHTVPTICPPCPQSVHPVPSACPPCPHSLSALSPQSAHPVPTVCPPCPHNLPTLSPQSVHPVPTICPPCPLSLSTLSPQSAHPVPSVCPPCPHNLPTLSPQSVHPVPTVCPPCPLSLSTLSPQSAHPVPTICPPCPLSLSTLSPQSAHPVHSVCPPCPHNPPTLSPQSVHPVPTICPPCPLSLSTLSPQSAHPVPSVCPPCPHNLPTLSPQSVHPVPTICPPCPLSLSTLSPQSVHPVPSVCPPSPQSAHPVPTVCPPCPLSLSALSPQFFHSVPSVCPPCSVSLSALSWAEWLSQGCGQQLLSG	517896	514773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_514921_515235_515332_516431
828439	contig_15631_pilon	+	829	7	Intergenic	novelGene_151539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	106.236240939187	2396	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	40	600	386533	393584	FALSE	35	CTGAAGGAGTATGCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVTDLQRLQTNVEELERWVYGPGGARGSRKVADGLVKVQVALGNIASKRERVKILYKKIEDLIKYLDPEYIDRIAIPDASKLQFILAEEQFILSQVALLEQVEALVPMLDSPHIKAVPEHAARLQRLAQIHIQQQDQCVEITEESKALLEEYNKTTMLLSKQFVQWDELLCQLEAAKQVKPVEE	386493	393813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_386629_388588_388674_389347_389435_391521_391606_392557_392617_393240_393301_393494
828440	contig_21377_pilon	+	553	4	Intergenic	novelGene_174774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_2	40.2850951207626	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	141	551	66919	77347	FALSE	15	ACTCAGGCCTCACTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLVQLSRSAKFYAKISLYCALCVGVSIVASVICLLRHGGRTVENMRIISWLLRSFKYIYGLRFEIQGREKLEVDRPCVIISNHQSILDMMGLMETLPKRCVQIAKRELLFWGPVGLVMYLGGVFFINRQRSSTAVTVMAEVGERMVRENLKVWIYPEGTRNSNGDLLPFKKGAFYLAVQAQ	66778	77349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21377_pilon_+_66924_76323_76458_76792_76969_77251
828441	contig_10734_pilon	-	543	5	Intergenic	novelGene_51373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	30.768287245149	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	114	542	1841941	1820841	FALSE	10	CTGTGGCATGTCGATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQLERCEREWHELEGEFQELQETHKIYKQKLEELTALQTLCSGSINKQKKRLKDLKFTLQRYKRHANQEEAELVQQLGANIKERQNVFFDMEAYLPKKNGLYLNLVLGNVNVTLLSNQAKFAYKDEYEKFKLYLTIILLLG	1842054	1820839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1820905_1821523_1821584_1822328_1822446_1824378_1824498_1841872
828442	contig_10734_pilon	-	1209	8	Intergenic	novelGene_51371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	1.66598625567009	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	226	639	1806816	1802839	FALSE	0	TGTCTTTGCCTCCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYEKFKLYLTIILLLGAVACRFVLHYRVTDEIFNFLLVWYYCTLTIRESILISNGSRIKGWWVSHHYVSTFLSGVMLTWPNGLIYQKFRNQFLAFSIFQSCVQFLQYYYQRGCLYRLRALGERNHLDLTVEGFQSWMWRGLTFLLPFLFCGHFWQLYNAITLFELSSHEECQEWQVFVLALTFLVLFLGNFLTTLKVVHAKLQKNRNKTEKP	1820888	1802268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1802953_1803262_1803332_1803663_1803729_1804533_1804627_1806096_1806159_1806805_1806872_1813766_1813857_1820808
828443	contig_12939_pilon	-	429	5	Intergenic	novelGene_166193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	485.181151736132	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTGAGCCATTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46778	42096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_42176_45740_45889_46031_46116_46311_46379_46727
828444	contig_11292_pilon	-	1452	12	Intergenic	novelGene_109418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	301.648610634163	1	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	870	1415	164507	161842	FALSE	55	TGGTTAAAATAAGTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167689	161804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164765_164807_165245_165384_165649_165710_165803_165909_166349_166476_167109_167194_167413
828446	contig_13494_pilon	+	1325	5	Intergenic	novelGene_167505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	17.1464281994822	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	16	570	17153	23139	FALSE	25	AAGTGCTTGGCTACTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFTAKMKPDETPMFDPSLLKEVDWSQNTATFSPAISPTHPGEGLVLRPLCTADLNRGFFKVLGQLTETGVVNPEQFMKSFEHMKKSGDYYVTVVEDVTLGRIVATATLIIEHKFIHSCAKRGRVEDVVVSDECRGKQLGKLLLSTLTLLSKKLNCYKITLECLPQNVGFYKKFGYTVSEENYMCRRFLK	17137	23894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_17307_18514_18578_20427_20556_21977_22040_22991
828449	contig_14846_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_85380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGATAACCTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198894	199693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_198900_199700
828450	contig_12297_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_161377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAAGGGAAGGAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714028	715232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_+_714000_715200
828451	contig_19402_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_80867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAATGAATGTGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176000	174396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_174400_176000
828453	contig_10734_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_51057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGGTAGCCAGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427358	426896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_426900_427400
828454	contig_7898_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_47555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTGGAAAGATGTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323763	324335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_323800_324300
828458	contig_17603_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_152797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATTCCTGAATAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75332	73659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_73700_75300
828461	contig_10148_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_172869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTGAGGCTGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301077	301777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_301100_301800
828463	contig_11505_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_140928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGGAAATGAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147970	147303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_147300_148000
828464	contig_10958_pilon	+	797	4	Intergenic	novelGene_5357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	397	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCTCAGGGAGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796057	802642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_796282_797033_797264_802038_802219_802479
828465	contig_5686_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_45195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACGAGCGCCTATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29265	30705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_29300_30700
828466	contig_12299_pilon	+	2286	3	Intergenic	novelGene_29754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCACCGTCTCCCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532254	538215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_533887_536008_536367_537919
828467	contig_8276_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_174486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCTGGCTTTCTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164544	164991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_164500_165000
828468	contig_7898_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_47632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCATTTAGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709874	710258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_709900_710300
828470	contig_6707_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_167034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	41	322	104741	104460	NA	25	CCTGCAGCGAGCACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSELVKRLERGGMSDLRFTGIIFGLLILILLALCEVRRQTPPPYHFYSWCQKWDEERLMLEMMDWYSSLEKLDIWGIFNLRFIGTSFVLMLLKEIIHSGGVNVGK	104781	102653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_102700_104800
828473	contig_10306_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_175735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCCCCTGTATAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24938	26045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10306_pilon_+_24900_26000
828475	contig_4754_pilon	+	697	5	Intergenic	novelGene_35918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	48.9508682251909	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	303	695	247348	252594	FALSE	55	TAATAGAGATGAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLWSSPGRSGSSWTLLRRTCTGCQVGKPDVLFRLEREPPWSLEDEIHSQNFSEIQEVSDHLLGNIQNESRVNRMEQCHEDNAFETIIHWHKSHFALRQNHSMFDLRGKTVKSILTLINQSRKYGIKNSAK	219013	252596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_219085_230755_230968_247328_247415_247724_247818_252361
828476	contig_5569_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_86754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGGCAACCCTAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482127	483746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_482100_483700
828477	contig_7599_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_73760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAGCCTCTAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11094	10508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_-_10500_11100
828481	contig_748_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_176131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTCTACTCTGTCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6932	6337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_748_pilon_-_6300_6900
828482	contig_2380_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_117881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCCACAGGCATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25576	26099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_25600_26100
828483	contig_6513_pilon	-	1625	1	Intergenic	novelGene_117786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATTTTCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256009	254384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_254400_256000
828484	scaffold_12124_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_22011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATCTTTACAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793299	792693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_792700_793300
828488	contig_3818_pilon	-	1988	5	Intergenic	novelGene_99288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.9180788932265	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	98	1387	906945	900532	FALSE	10	TTTTCATGGCGTCCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLARALGQCALQSLSPENASSFAPKNPEEERMAAVPLTARWQKSLKFKDVAVTFSEDEWNQLVPTQRALYREVMLDNYRDFVSLGLLVPNPDVIFQLERGEEPWTLDFPEAEEKESPESTSLGQKARLKSQDSIQRQDVSKNAKPQNTLMEKIRKNGPLGPAVGPSKPEGSLEIKKENPSEETLNTFSPKEDSRQGSTPSQKTDSVGRNFACSICGKTCYDPLSLSHHQRTHTREKPYECEGGEAFSYRSSLNNHLVFYMEESPYKHTEYGKTVYDQLTLTKHQQTHPGEKPFKCNECGKAFSIRFSLARHQRIHTGERPFECTECGKSFREKAVLARHKLTHIGERPYKCKECGKALANRSSLIRHWRAHTGESSFECDECGKVFFDRSSLTQHQKIHREKPYKCTECEKGFIQKRLLILHQRVHTGEKPYKCSLCGKAFSCKPSIVLHQRRHASQATE	912088	899930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_901548_902664_902779_905990_906118_906912_906964_912009
828490	contig_20028_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_170649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCTAGGAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43801	43246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_-_43200_43800
828491	contig_20055_pilon	+	1933	1	Intergenic	novelGene_175062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAAGTATAGAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53579	55512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_+_53600_55500
828492	SIRV6	+	349	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	507	17	341	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828494	contig_10581_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_41446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTGAAACAGCTTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794369	793080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_793100_794400
828496	contig_6674_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_147986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATTTGAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58203	59743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_58200_59700
828498	contig_9951_pilon	+	1805	10	Intergenic	novelGene_176327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2.34652356466032	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	59	1450	176950	201830	FALSE	35	TAAATTTATATGTCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKAKPAGTGKEERPVPRKQAKVEAAGGPSTLNFDSPGGLFESLISPIKTETFFKEFWEQKPLLIQRDDPALATYYRSLFRLTDLKSLCSRGVYYGRDVNVCRCVSGKKKVLNKDGKAHFLQLRKDFDQKRATIQFHQPQRFKDELWRIQEKLECYFGSLVGSNVYITPAGSQGLPPHYDDVEVFILQLEGEKHWRLYHPTVPLAREYSLETEDRIGKPTHEFMLKPGDLLYFPRGTIHQADTPPGLAHSTHVTISTYQNSSWGDFLLDTISGLVFDTAKEDMELRAGLPRQLLLQVETTTVTTRLSGFLRMLADRLEGTKELLSSDMKKDFVMNRLPPYHVGDGPELSTPGGMLPRLDSTVRFQFKEHIILTVGLAQDRSDETQEKMVYVYHSLRNRRETHMMGNEETEAYGLRFPLSHMDALKQIWNSSAISVKDLKLPTDEEKESLVLSLWTECLIQVV	170998	202185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9951_pilon_+_171015_176907_177382_182314_182435_183949_184079_189181_189286_192682_192786_193608_193778_199471_199561_201077_201165_201671
828500	contig_4803_pilon	-	178	1	Intergenic	novelGene_150735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAAAAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97470	97292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_97300_97500
828501	contig_817_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_132439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGTGTAAATCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381497	380813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_380800_381500
828503	contig_4180_pilon	+	2058	14	Intergenic	novelGene_8427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	81.2241401723992	1	116	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	381	1910	1078119	1155294	FALSE	20	CCACACTTAGTCCCTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKASLAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDITEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDSQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRSITIANQTNCPLYITKVMSKSAAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSIKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG	1072495	1155442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1072734_1076123_1076213_1078065_1078243_1125305_1125471_1127668_1127731_1128287_1128369_1128940_1129010_1136507_1136629_1144951_1145109_1145581_1145724_1147773_1147945_1152735_1152916_1153722_1153889_1155202
828504	SIRV6	+	425	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-84	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2388	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10727
828505	contig_12935_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_165723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATATTTCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167803	167365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_167400_167800
828506	contig_12935_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_165722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164794	164544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_164500_164800
828508	contig_6102_pilon	+	957	7	Intergenic	novelGene_32396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	20.9397283225505	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	22	789	1782772	1790246	TRUE	20	ATGAGTACCTGGCCCGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSAPPATVSPATAGPGQGFGFASKTKKKHFVQQKVKVFRAADPLVGVFLWGVAHSINELSQVPPPVMLLPDDFKASSKIKVNNHLFHRENLPSHFKFKEYCPQVFRNLRDRFGIDDQDYLVSLTRSPPSESEGSDGRFLISYDRTLVIKEVSSEDIADMHSNLSNYHQYIVKCHGNTLLPQFLGMYRVSVDNEDCYMLVMRNMFSHRLPVHRKYDLKGSLVSREASDKEKVILILGNRVRDGGWQMKGIVLG	1782750	1793466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1782946_1785536_1785635_1786298_1786396_1786744_1786889_1789812_1789960_1790138_1790330_1793381
828509	contig_12201_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_159982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCAAGGAACGGAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129240	139127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_130979_132872_132973_138878
828510	contig_8177_pilon	+	1003	3	Intergenic	novelGene_86508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	17	185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	163	384	101483	103559	FALSE	15	CCCGATATGTGTACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSHFLLVQDWEEPGKEPLHQPGALGEVTWRISTDDLQQTCDRARHEHLLCPCGYMTQDKPPACPTTWDFPASTTGCRRSEARRQHQSSFTLKTLTKTHSRVFAEQGRIVVHLLRESHTLRYLNLSPA	100246	104178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_100396_101469_101545_103399
828511	contig_2114_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_104217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGACTGCTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130728	129984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_130000_130700
828513	SIRV6	+	422	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	332	13	166	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
828514	contig_10331_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_54178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAAGAAAGAAATTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579561	581036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_579600_581000
828516	contig_3571_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_88715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	1270	1650	98265	98645	NA	45	AAGATTAGTCCAAAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKGSFLNSVERVLHRCRETSSQITRAGLAAASPHLEGSTWLSSLAKEQHSMPLQQEWMRSIGGRLALETRMLVGNRQSRDPSPTDVCTFLSTQPISPASRTFVMVVRVEASSVGQSGCPPQKISRS	96995	98646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_+_97000_98600
828517	contig_5050_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_110297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646922	645446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_645400_646900
828518	contig_9363_pilon	+	1148	10	Intergenic	novelGene_6827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	188.623735463613	3	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	26	895	1622283	1625712	FALSE	10	TGGGGCCACGCGAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAATANRAMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAATRLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLPSQPSA	1622257	1625965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622740_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1624997_1625690
828519	contig_8106_pilon	-	1140	5	Intergenic	novelGene_139731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	94.748021087514	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	819	1139	65275	64206	FALSE	30	ATGAAGGAGCTTAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCPPDSKVLPGARRVLGFSPVIIERHISRYLLTFLAEDLGGSLIRPWTLDFACRSAQRLPPASRLAYCHHPACSLPTLRGDQSVSFSKGFFLTIYHFCETHLDLA	85451	64204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_64508_65256_65329_66863_67018_69922_70066_84983
828521	contig_20199_pilon	-	581	4	Intergenic	novelGene_82545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	414.835978296108	59	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	157	579	43987	40649	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHCCHYPPPTKPSCLPGFPSPGLTGRSGPSTQLTGGLNKSWLKS	44143	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40770_41171_41250_41934_42078_43906
828522	contig_8447_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_69448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGCTTCATGATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158538	157848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_157800_158500
828523	scaffold_9100_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_83228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTACTCCCCTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327119	326487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_326500_327100
828524	contig_8606_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_159386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTTATGGTTACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12112	11477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_11500_12100
828525	contig_1008_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_121637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACATGAAAAAATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1379801	1380697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1379800_1380700
828527	contig_2201_pilon	+	609	4	Intergenic	novelGene_168760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_3	60.4777277644883	8443	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGGTGATCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46910	55173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_47053_48088_48207_53411_53475_54887
828528	scaffold_13609_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_124406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523683	522715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_522700_523700
828529	contig_12490_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_169051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGATAAGCATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259619	261670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_+_259600_261700
828531	contig_3975_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_54933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2328311	2329411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2328300_2329400
828533	contig_14341_pilon	-	930	6	Intergenic	novelGene_111890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_5	731.639966103547	464	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	212	880	729247	727088	FALSE	45	GAATAAAGAGTGGATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	730672	727037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_729079_729350_730563
828534	contig_4989_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_160792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208797	210367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_208800_210400
828535	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828536	SIRV6	+	232	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	65	486	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
828537	contig_8269_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_106234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1546	1932	303812	303426	NA	25	AGAAGGGCAGAGTTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCLSAGAGAEPSHYSFVSHSLLSKQPRGPDWRPGRGRGWSEGRTKNLESDLPHPWVALGALIRKSSGILAVHRHRTWCPLHRLACQQPLSSMATREKGPCGPSLAGSPWQEGRRSRCLGSTVSIFLD	305357	303320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_303300_305400
828538	contig_3866_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_112383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTATTTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128109	126561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_126600_128100
828539	contig_13780_pilon	+	385	4	Intergenic	novelGene_149009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	104.295520304352	9150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGCCTGTACCGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288612	295597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294733_294758_295430
828540	contig_8122_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_40194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTTCTAAACTTACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92803	94259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_92800_94300
828541	contig_1719_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_87393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACCACCAGGGTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934866	933036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_933000_934900
828542	contig_9484_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_105673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152179	151271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_151300_152200
828543	contig_6589_pilon	-	1122	3	Intergenic	novelGene_25878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	92	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	272	838	976252	970660	FALSE	15	GAGCCAGCTGTTGTGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPSSDRTPAPLLLGGPAGAPPGGGALLGLRSLLQGTNKPKEPASCLSSRDTPSPVDPDTVEVLMTFEPDPADLALSSIPGHETFDPRRHRFSEEELKPQPIMKKARKIQVPEEQKDEKYWSRRYKNNEAAKRSRDARRLKENQISVRAAFLEKENALLRQEVVAVRQELSHYRAVLSRYQAQHGAL	976523	970375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_970876_972831_973044_976113
828544	contig_9437_pilon	-	925	2	Intergenic	novelGene_141706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	232	621	48476	48087	FALSE	25	TCATCCAGAATGGCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKKDRRRIDTSELWCWQRILNIPWTAKRTNKSVLEEVQPECSSEARMVRLCLTYFGHVIRRNQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRLSMRWIDTVAATMDSSITMIMRMVQDWAVFHSVVTQGCYGNQLDST	76879	47782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_48622_76793
828545	contig_8907_pilon	-	489	4	Intergenic	novelGene_85798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3694.1143277742	15	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179534	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178749_179400
828546	contig_8452_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_47985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCAGTGAGTGCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100031	98384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_98400_1e+05
828547	contig_7201_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_152496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTCAGTTTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71116	70129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_70100_71100
828548	contig_10014_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_174558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGCACCCTTTCATGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4477	2995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_-_3000_4500
828549	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
828552	SIRV6	+	327	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	527	19	361	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828553	contig_7057_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_123189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAGAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401093	399726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_399700_401100
828554	contig_9132_pilon	-	1589	10	Intergenic	novelGene_121373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	102.932676067754	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	149	817	137052	105911	TRUE	10	TTTCCTTTCTCCAACTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMMALSKTFGQKPVKFQLEDDGEFYMIGSEVGNYLRMFRGSLYKRYPSLWRRLATVEERKKIVASSHGKKTKPNTKDHGYTTLATSVTLLKASEVEEILDGNDEKYKAVSISTEPPTYLREQKAKRNSQWVPTLPNSSHHLDAVPCSTTINRNRMGRDKKRTFPLCFDDHDPAVIHENASQPEVLVPIRLDMEIDGQKLRDAFTWNMNEADDPRDVLGDPL	137244	97376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97702_98063_98196_104762_104954_105786_105952_125469_125598_127955_128094_131337_131468_133154_133294_136959_137160_137203
828556	contig_7976_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_169405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723992	722157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_722200_724000
828557	contig_14157_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_171784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAATGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305022	303333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_-_303300_305000
828558	scaffold_12124_pilon	+	1182	8	Intergenic	novelGene_22089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	210.139992211218	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	151	486	867290	877161	TRUE	25	TAACTCCCCCAGTCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCDKEKGPNDGATPSARFHKPRSENQGYVSLGNTSSGSVAHFPAGAEPTMSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPDGKPGGQLRKI	860040	881049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879168_880764
828561	contig_7275_pilon	+	651	3	Intergenic	novelGene_111251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCTCAAATTACCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408496	420792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_408563_414260_414498_420444
828562	contig_10792_pilon	-	1968	11	Intergenic	novelGene_161003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	40.597536871096	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	101	943	128480	112656	TRUE	30	CAAGTAGGATTTATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSLAYRDDMFAEWTEMAHERVPRKLKCTFTSPKTPEHEGRYYECDVLPFMEIGSVAHKYYLLNIRLPVNEKKKINVGIGEIKDIRLVGIHQNGGFTKVWFAMKTFLTPSIFIIMVWYWRRITMMSRPPVLLEKVIFALGISMTFINIPVEWFSIGFDWTWMLLFGDIRQGIFYAMLLSFWIIFCGEHMMDQHERNHIAGYWKQVGPIAVGSFCLFIFDMCERGVQLTNPFYSIWTTDVGTELACGWDLPLPLLPVSVLHGISGVSEHQREAVQPAGHE	151647	91528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_92323_102219_102355_111249_111324_112633_112764_114739_114804_115152_115251_116733_116903_120172_120310_121596_121759_128375_128501_151567
828563	contig_11378_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_112294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	565130	565528	NA	40	TTTAACGTTACTACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRSLPIRLEASPTGLHLALQLAETLLHLHLSGIVLGQEPCKPGLQGVQGGLQVLHLLLDVLGVRPGLGQVLIDQVVLHQDLPSLLLQGLLGFRVFGQGLHQVILGEAEEVRVTDAPDVGCPAVPRLASLDV	565127	566650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_565100_566600
828564	contig_13481_pilon	-	1136	6	Intergenic	novelGene_119525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	637.881807233911	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	258	824	1462670	1445460	TRUE	5	TTTCTCACTGGCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKVAKPKEPITDVSVIIKSLGEEVPQDYVCIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCEIIQSTPYGRPANISGNTSSQRIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFCKVDKNLNNSMV	1501682	1444420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1444569_1445295_1445466_1459726_1459977_1462359_1462721_1473241_1473321_1501554
828566	contig_5302_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_81544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGATTTCGTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634424	1633798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1633800_1634400
828567	contig_12427_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_40440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271710	272167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_271700_272200
828568	contig_15596_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_139539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	179371	178997	NA	40	ATGTTAAGGGAACCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAVLGTRTSAAGNQARSSPSLPSPALCRTGARETTSPRPPQGAATRAPSPELPGPRVARSQASRRQRHCSPALPTIFSGFPALVEGVDPLRPSGLAVPATAECPVQGRASSAGLATNELPSGR	179371	177347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_177300_179400
828569	contig_1301_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_47365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571464	572133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_571500_572100
828570	contig_5918_pilon	-	1543	3	Intergenic	novelGene_99521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582671	579926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_581317_582155_582266_582628
828571	contig_7457_pilon	-	320	4	Intergenic	novelGene_31291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2921.50079392234	368	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	35	313	160764	157861	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLSALVVAVEMGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKVQDRQKQVVLPEAAVLDLFHFSH	161042	157853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_159142_159269_160683_160767_161010
828572	SIRV6	+	461	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	216	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	30	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1732_1845_2027_2470
828573	contig_5918_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_99627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCTCCTCAAATCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2232330	2231566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2231600_2232300
828574	contig_11702_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_142002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.171040447259	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	461	1180	509434	506168	FALSE	10	CGCCAGCCAGCTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRSKPEQKATGVGVWGAEQAHPAKRPLYPQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSASPLSILSPGSQALLLPGPAQQAQGTCP	509894	506003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506255_508408_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277
828575	contig_8978_pilon	-	1652	7	Intergenic	novelGene_49366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	45.8257569495584	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	77	718	314311	313670	TRUE	70	AAAAAAAAAATACTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPDPSPSSGALDLLDTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDVEDQTLEPGPGGQTPEVVPPDPGAEANSSSPEGLLEPLAPDSPITLQSPRIEEEETTSITTGRRGSPGQEEELPQGQPQIPNGPPQPFSGRDSGGWNQRFSDQTWGP	315303	310474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_310792_311139_311318_311547_311843_312286_312360_312668_312713_313642_314331_315246
828577	contig_16854_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_176887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTCCACTAACTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13977	12817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16854_pilon_-_12800_14000
828578	contig_10196_pilon	+	695	5	Intergenic	novelGene_132145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	498.035390308761	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	12	404	1034566	1050210	TRUE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWRSTGSGSPQCRPPLQRSSPTTPSCE	1034554	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1050131_1050212_1050506
828579	contig_5549_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_81678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGATTTTTTTATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557722	556118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_556100_557700
828580	contig_18272_pilon	+	1627	3	Intergenic	novelGene_7065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1119	junction_1	951	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	9	473	509637	514392	FALSE	45	AGGGAAAGTCCCCAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGRSDCISKSS	509628	515546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_509743_512634_512713_514111
828582	contig_17964_pilon	-	894	7	Intergenic	novelGene_33918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	202.229242857374	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	792	103	894	468932	397897	FALSE	55	AGTGATGAAAACGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEAVPLRNSSLQMSLSYAAVQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDAD	473120	397896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_397915_411236_411416_412391_412501_413439_413494_431364_431434_468569_468944_473029
828583	contig_12635_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_60839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAGCATTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482942	481680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_481700_482900
828585	scaffold_19766_pilon	-	1420	7	Intergenic	novelGene_34257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.15815883368028	113	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	158	997	180569	171835	FALSE	25	AACTGCAGGCTGGCTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESSPLLAYRLLGEEGVAFPANGAGGPGGTSARRLSTFLGVVVPTVLSMFSVVVFMRIGFVVGHAGLLQALAMLLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVRGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANICGCAICVLGLVEAVLDVFGADATGPNGLRVLPQGYGWSLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVSFSLASVLVSFVAVGPRDIPLTGPCCGKTTGSFVLSAYGPHWCWLASMPRYLTLLEILSHDLGPTLLIHGVTPVTCTDL	181494	171411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_171927_177031_177115_178808_179026_179457_179590_180016_180152_180388_180611_181378
828586	contig_5602_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_132992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAAATTTATTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41234	43438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_41200_43400
828587	contig_17829_pilon	-	1140	4	Intergenic	novelGene_157021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	15.9234278833282	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	47	403	17075	7910	FALSE	45	ATCAAAACAGTTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEYCGCCRGWSRSVFMERAEGSSTELAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSVDAGATNIDLRLKDYGVDLIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTHVETFGFRGEALSSLCALR	17121	7172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_8017_8201_8289_12725_12866_17052
828589	contig_1090_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_131146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTATATAGTTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499893	499641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_499600_499900
828590	contig_17440_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_7650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	3995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
828592	contig_4232_pilon	+	550	3	Intergenic	novelGene_63217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	191	421	148279	149550	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARRSRSVRRRAPPRGSERVCSREARARQEHAVSEPGRGRRGKSAQAASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKGCQFLTAIVTLCLSV	146651	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146794_148230_148463_149503
828593	contig_11056_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_130379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	88	582	359061	359555	NA	10	TTCGTGCCCTCAGCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERQPSHYRALDLKSGNLGFSLGSATERKYHPHLSGPQFPHKSSKESTVDKMFSRIITSSEFFEGGKIWNTPIKSTENPVEGILNGFFACCLSTLKLKCVHLRRSGIIASLLPSLLSLPHFSTQYLCQVTCSFYSSNQKIVSLPSGMVVRAVTSMSARGCERL	358973	360672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_359000_360700
828594	contig_14483_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_133759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAAATGATACATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96400	95254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_95300_96400
828595	contig_3426_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_57987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTATCTAATTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672663	675217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_672700_675200
828596	contig_13014_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_169381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAATTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640189	638569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_638600_640200
828598	contig_7056_pilon	+	1614	4	Intergenic	novelGene_43591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	287	junction_2	58.5396351960694	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	209	835	661004	669156	FALSE	60	CCCCCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVKNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVKLNFGSRWDTFIRPWLLGSICRHLLNLRNGQVAKDPLIE	660795	669935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_661164_662947_663066_667151_667254_668909
828599	contig_10371_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_175469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACTTACTTTTAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113589	115479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_113600_115500
828600	contig_7224_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_172968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54719	52740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7224_pilon_-_52700_54700
828601	contig_12079_pilon	+	1134	2	Intergenic	novelGene_67493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAAAAAAAAAAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823725	825251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_823816_824207
828603	contig_5696_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_117604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACCGTACACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840145	838977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_839000_840100
828606	contig_15114_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_121217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATTTCACTCAGGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980159	981002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_980200_981000
828607	contig_9995_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_47770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	340	693	720328	719975	NA	60	AAAAAAAAGGTACCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPRRFSNHRSPGGAVVKSSAANQKVGSSNLPAAPYKPRGALLLCPIGSLESESTLRQSVWFGFGFLIIISLDSSFSVSNREEFSMSTQTSPVFEFQRRDQHNCSKVCLSVCSAEL	720667	719388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_719400_720700
828608	contig_17964_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_33930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAATAAGTCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611314	613115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_611300_613100
828609	contig_990_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_76172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTAAAGCACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1934706	1934111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1934100_1934700
828610	contig_7051_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_64340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGGTATGATATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321854	322884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321900_322900
828611	contig_4884_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_63832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCTAGTGAATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590344	592353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_590300_592400
828612	SIRV6	+	385	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	521	221	69	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828614	contig_12050_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_62665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10	95	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	44	604	443313	442114	FALSE	5	TCTCCATGTGTTCTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALPELKQISRVEAMRLGPGWSHSCHAMLYAANPGQLFGRIPMRFSVLMQMRFDGLLGFPGGFVDRRFWSLEDGLNRVLGLGLGCLRLTEADYLSSHLTEGPQRVVAHLYARQLTLEQLHAVEISAVHSRDHGLEVGPPPGPALPRVGSGPAEGTDGCWGWCVSPCTPRRTAWGASPISSATPSSAPPSASSSSPSRCST	443356	441466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_442247_442811_443138_443211
828615	SIRV4	-	504	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	106	7	106	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	225	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAGAACATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5052	3644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
828616	contig_10240_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_176228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCCCTGTGTTTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515544	516955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10240_pilon_+_515500_517000
828618	contig_6795_pilon	+	956	8	Intergenic	novelGene_27781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	25.298221281347	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	70	825	564870	579327	FALSE	35	GAAATATGCCCTATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGIERKRFYQNVSITQGEGGFEINLDHRKLKTPQAKLFTVPSEALATAVAMEWDSQQDTIKFYTMHLTTLCNTSLDNPTQRNKDQLIQAAMKFLDTDTICYRVEEPETLVELQKNEWDPIIEWAEKRYGMEIGASTSIMGPSIPAKTYETLASHLASYNMWALQGIEFVVAQLKSLVLTLGLMDLRLTVEQAVLLSRLEEEYQVQKWGNIEWAHDYELQELQARAAAGTLFVHLCSESTTVKHKLLRE	564800	579458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_564889_571150_571196_571486_571633_573048_573147_574677_574759_576812_576926_577480_577597_579189
828619	contig_5280_pilon	+	1011	2	Intergenic	novelGene_52627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1650	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	39336	41172	FALSE	30	TATAACAGCTGGCGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCESEYGFKEYLWVFEGSNISSLVHTGTQCACVII	39335	41778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_39451_40882
828621	contig_2730_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_135381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTCACGAAACCATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323302	323903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_323300_323900
828622	contig_709_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_57634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAAAACACCCTTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2692436	2690825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2690800_2692400
828623	contig_15732_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_88903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAACAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272486	271423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_271400_272500
828624	contig_10437_pilon	-	880	7	Intergenic	novelGene_38106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.597329924046	449	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	111	587	71164	69238	TRUE	5	GCTTTCCTTGAGTCTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKREGDDWSQLSVLKKRRVGDLLASYIPEDEALMLRDGRFACAICPHRPVLDTLAMLTAHRAGKKHLSSLQGFYGKKQPGKGMEQNPRQQNELRREETKAEAPLLAQTRFITHSALHRAPHYNSCCRRKYRLQSSSLQTRSPWSLCRPFPFSTPRG	71274	68788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_68944_69099_69317_70027_70117_70233_70332_70430_70520_70784_70856_71113
828625	contig_5917_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_122150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGACAAAGGACTAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272473	272134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_272100_272500
828626	contig_5791_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_35875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTATTATCTGTGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112105	1113148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1112100_1113100
828627	contig_10324_pilon	-	1807	4	Intergenic	novelGene_7833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	18.6607133363712	1	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	249	473	269976	269045	FALSE	15	CAAGACCCCCGTCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALGLLLPPVGVGWAGPPPIQDGEFTFLLPAGRKQCFYQSAPANASLETEYQVIGGAGLDVDFSLESPQGTLLVSESRKADGMRWSPQKLETTSCALTTPSALSLRSWCSLNSSSTACRTTRRLRAGLKPWAGLMPWSQRRCWMSRWRTSRSLSRP	271092	267710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_269064_269626_269829_269972_270067_270934
828628	contig_10642_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_78715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGAGTATGGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914583	913304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_913300_914600
828630	contig_14326_pilon	-	1454	6	Intergenic	novelGene_120658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCGGCCTCGGGTGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100287	54880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_54984_96067_96204_96882_96992_97584_97776_99062_99169_99478
828632	contig_12279_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_50135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAAATCATAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81308	82780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_81300_82800
828633	contig_990_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_76090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATTGAGTACAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183455	1185228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1183500_1185200
828634	contig_4857_pilon	+	182	1	Intergenic	novelGene_48691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATGACCAGATAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133504	1133686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1133500_1133700
828635	contig_1893_pilon	-	1682	2	Intergenic	novelGene_172351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	266	742	268801	268325	FALSE	30	CAAACAGGAGGTCTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIDDTSSEIFDELYKVTKEHTHNKKEAHKIMKDLIKVAIKIGILYRNNQFSQEEVVVVEKFRKKLNQTAMTVVSFYEVEYTFDRNVLSKLLHECKDLVHELVQRHLTPRTHGRINHVFNHFADVEFLSTLYSLDGDCRPNLKRICEGINKLLDEKVL	299675	267384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_-_268888_299496
828636	contig_6066_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_149279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGAAATGTTTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40722	39199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6066_pilon_-_39200_40700
828637	contig_7379_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_150039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	126	326	569807	569607	NA	55	GAAAAAAATCATTATCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGLARKRVEGVLSGRFGVCFIRPGSVAARRIERSGPSVWVMALVARLWHFLPLGRGTVLGLRLLMGASGSRGRCGLWRLRGFEVPPSPWLPLPRPPLLSLGPPLLL	569932	568601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_568600_569900
828638	contig_5039_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_64832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280538	281465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_280500_281500
828639	contig_4083_pilon	-	416	4	Intergenic	novelGene_152340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	290	301	322313	322302	FALSE	45	AAGAAAAATGGTATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARRAAVSSSSLSSSKSSSSSSSSVRGSSASRLAAGIWSNLGFFETEEEVVCSGVGRSLFFFSCSSSLSLFQLSSEVTVANFFRGILSGLSIFYLCMRR	325692	322186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_322328_323219_323331_324443_324539_325623
828640	contig_8594_pilon	+	876	2	Intergenic	novelGene_140039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCCTATGGCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387983	392068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_388673_391881
828641	contig_7839_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_45685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGTCATTTGAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136107	137892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_136100_137900
828643	contig_2773_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_174281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTTGAATGCCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212489	211096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_211100_212500
828644	contig_10765_pilon	-	2019	7	Intergenic	novelGene_122918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.28964257620968	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1317	702	2018	178846	174338	FALSE	75	TGAAAAAGAAAACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKRAEAELLYSRVRVRSMYVFNKLFCFQGQTPKRISESLGAEVDPDMSWSSSLATPPTLSSTVLIVRDEEASETVFPKDSTTISKNFFSNHDESLKKNDQFIPSVMDNENQNQGEAISHELGKMLGNVFGEVSSCEDHLGRLVPHAVEEEVCETVAGISEEDSFSLCLTKYQRGDLQKIKTGRTRKKVFNRTKAGECEDAEKQLEDHEHLFAFEMEPDDSDPLDCNVPDEEPTGNISDTVSKEAVAASASEWSQLTLSGLNGIQMEKIPLLPTSCDQNNSEKDLIGTEKECANFITSENSLPRISSLPETEKIVNEERAVAQSSEGQSLVSHDDSILAVKQTVSGTSPVASPSQGITKSVFRVRESPDETFGAVFSDNVNDSNFKEKPEASEGGLEIDADCSQRGGSLCPSWVDSGSCPATTKHASVTLKNAGLLST	187466	174336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_175291_176141_176254_176586_176637_178644_179285_184494_184623_186391_186498_187437
828645	contig_13982_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_163500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATAAACTTTATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549282	550850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_549300_550800
828646	contig_8453_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_125128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203217	205263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_203200_205300
828648	contig_11702_pilon	+	520	5	Intergenic	novelGene_141996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1081	junction_3	140.78707327024	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	106	438	383406	384186	FALSE	15	CACAGGACTCCTTGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	382674	384268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
828649	contig_11629_pilon	+	1313	4	Intergenic	novelGene_161207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	881	1279	505017	506505	FALSE	20	GGATGCGTTTGCAGGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGTSGPRENSDCSWPVLYCRLGGSGGWPQTYGERRPEGRLEIPRVHSDSSPRLSGSRQPLADHRMSSGHSSGWGENQQMMMSKLLPPRQDFISTGTPLHRPTEAHPSSSPSLSFSIFNSCLDARPSKPSL	500758	506539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_500992_504369_505314_505898_505957_506461
828650	contig_3382_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_124072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAACAAATGACTTAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324859	323524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_323500_324900
828652	contig_11337_pilon	+	2050	2	Intergenic	novelGene_107191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	53	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCCTGTTAAAATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203966	208200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_205243_207426
828653	contig_14202_pilon	-	401	4	Intergenic	novelGene_157126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1856.69455394975	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	29	373	88580	59823	FALSE	15	TTACGCAGGTATGTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSDLVCGAMAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSCMKTVAGGAWTYKAGHQQVLKTPGQIKECHKEQNLLFGTHLTGGPWRGTGCCRIF	88608	59794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_59953_87403_87487_88084_88214_88577
828654	contig_1009_pilon	+	1298	10	Intergenic	novelGene_121753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	40.1730823214983	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	112	1005	260614	272516	FALSE	10	GTAGGTGCCATCCCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPISSKSQSGTLDSLPLGSRSAEDHRKGELRLKAFQGMALTVDVVGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVTERGKAEAADLRPGDIIVAINGESVEGMLHAEAHSKIRQSPSPLRLQLDRSRAASFGETNGERSLELLATRFQGSVRTHTDSQSSLRSSYSSPASLSPRPGSPFSPRPATSPHTLTGEGVISRSFQSLALTPGPAADHLSYGGRPGSRQAGLSRAGDSAVLVLPHSPGPQSSSPRLSVDSEGGRHLLEEDSEVFKMLQENREGRVAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQASLSVASWHGRGDGGWWRLRELSLGA	260307	272809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_260417_260611_260707_261459_261612_263744_263815_263909_264062_264225_264302_268833_268917_269119_269266_270765_270815_272443
828655	contig_6479_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_160599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTACTGCAGATCCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61937	62624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_61900_62600
828656	contig_6479_pilon	+	732	2	Intergenic	novelGene_160600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	798	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTGGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62627	69859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_62689_69188
828657	contig_8322_pilon	+	1561	4	Intergenic	novelGene_143272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	13.490737563232	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	79	936	504817	506667	FALSE	55	TTTTCATAATAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSALIGHPVALINPQTERPGYSHTSMDPRGILKAFPKRKQIHANPSSKALAKMPKREDGEEAGEWLSSLRAHVVPTGIGRARAELFEKQIAQHGGQICPAQAPGVTHIVVDESMDCERALRLLKLPRLPMGAQLVKSAWLSSCLQERRLVDTAGFSIFIPNRYLYQPQPSKANQDSSSPPGPHEGLLGTPLSLPPPPTRPVSPFQKAEETPSTQAQVRSLPASIGNQIIERRRTWWSFTKSQASERRACFIVKSFSSFQHLSLLHSPIPYPLPTVVDSGAGHWGKPSPHLRGPKSDAEDPVSFLGSSQSH	503915	507292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_503944_504766_504932_505731_506027_506219
828658	contig_15031_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_138426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172618	171461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_171500_172600
828659	contig_9185_pilon	-	1599	5	Intergenic	novelGene_166922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1205	1576	886131	884881	FALSE	10	ATTCCGGGACGGCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTALSRFWEWLRHWNIPEPGEASGRFLAKLRWARRMTVATKRRLRGGHMLSGLRNADGWTLQVRARLGDRPRGHIFIIAPRPRQDFPGTLVSCLLSLSVSLYISFSVTRGVRPAGFAALSD	893219	884857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_885117_885995_886140_889088_889204_889807_890198_892528
828660	contig_17198_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_62372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTCTCCCATACAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888014	888570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_888000_888600
828662	contig_9571_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_136241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2083	2394	184206	184517	NA	65	AGGGAGAGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAGFQMQEPPWRKGHQSILQSALVRLPSLLGDVVSRGPGATAPTTANQSTESCCIQKGWSLNQHVNHFSWMQDTSIFSISEAECTRQTGLSGVQMGKQVQYK	182123	184596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_182100_184600
828664	SIRV6	+	362	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	511	0	345	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828665	contig_12078_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_74127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAACCAGCACAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590751	592699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_590800_592700
828666	contig_12057_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_131636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAATTAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104440	103220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_103200_104400
828669	contig_9739_pilon	-	1468	10	Intergenic	novelGene_165086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	506	868	163266	151452	TRUE	5	CCAGCCCTTTGCCCTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFLPISRGKLIREVLLADAVDGTGEAVIGDGCVSGLDGPQGLAECSNGGRGVEDDLCPIDTVHEPVEGVVPPVADVHSDPPELGLEHWVAQVALHVVTGLVEVTHSGDVVLPCLPQDGA	165990	131174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_131322_137635_137804_141063_141155_149066_149160_151350_151513_154344_154515_159896_159979_162074_162118_163259_163415_165633
828671	contig_846_pilon	-	1495	4	Intergenic	novelGene_136099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.203830762666	52	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	181	561	214365	212487	TRUE	25	CGTGTTAAATATGGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	214545	211430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212260_212381_212690_213134_213244_214296
828672	contig_6278_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_119801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312017	310282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_310300_312000
828673	contig_3584_pilon	-	1207	6	Intergenic	novelGene_108166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGGAAAAAGAGCACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498888	484970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_485181_487763_487965_490198_490282_495886_496075_497539_497694_498517
828674	contig_821_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_149429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAAAAGCTTTATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482124	483673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_482100_483700
828675	contig_16882_pilon	+	1725	9	Intergenic	novelGene_148243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	51.5242661277189	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	150	1313	445854	615444	FALSE	10	GCTTGGACTCCTGGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDAPVIYGLEFQARALTPQTAETDAIRFLVGTQSLKYDNQIHIIDFDDENNIINKNVLLHQVGEIWHISASPADKGVLATCYNKTSDSKVLTCAAVWRMPKELESGSPESPDDSSSTTQTLELLCHLDNTAHGNMACVVWEPMGDGKKIISLADNHILLWDLQESSSKAVLASSASLEGKGQLKFTSGRWSPHHNCTQVATANDTTLRGWDTRTMSQIYCIENAHGQLVRDLDFNPNKQYYLASCGDDCRVKFWDTRNVTEPVKTLEEHSHWVWNVRYNHSHDQLILTGSSDSRVILSNMVSISSEPFGHLVDDDDLSDQEEHHQEEKNKEPLQDSVIATYEEHEDSVYAVDWSSADPWLFASLSYDGRLVVNRVPRALKYHILL	445704	615856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_445896_459574_459659_478552_478686_555368_555526_585050_585151_606970_607108_609865_610034_611534_611703_615269
828676	contig_9389_pilon	+	532	4	Intergenic	novelGene_83860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	817.471440207886	2981	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	23	451	9677	12342	FALSE	15	TCCAGTCTGCCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDTAVRLVALALLGAAVCAAQPRGRILGGREAEPHARPYGVVRHTGRRPDRLQYVSVPVLDRATCNLRTYHDGAITERMMCAESKSRDSCKGDSGGPLVCGGVAEGVVTSGLRVCGNRKKPGIYTRTASYVAWIDGVMAEG	9654	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9735_10655_10718_11405_11562_12189
828677	contig_9049_pilon	+	781	7	Intergenic	novelGene_83152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1839.90782528787	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTATTTTGAATCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89359	111580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95970_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558
828678	contig_12746_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_152186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGACCAAGAAAATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526981	528113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_527000_528100
828679	contig_2278_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_118123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	339	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	214	297	999587	999670	TRUE	35	TAAGTTGTAAAGTTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWFIPALSQKKSDSNHCPNPNSEIVLCVSFSRATPAYHPQKASRRSHVTCAVTFVGKCHDNEAKVARSYAGMGSVASEPVLFVFNDISVTASSIISSF	999373	1015385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1000068_1015229
828680	contig_10299_pilon	+	1129	10	Intergenic	novelGene_79718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	129.115318347974	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	211	576	335800	336895	TRUE	60	TAAAGATGAAAAGGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGDAPESIQFVLDEDSYLVPELDGVRIFSRSSHEFLHEVPVASEEIFKIASMAPGALLLEAQKEYEKESQKADEYLREIQELGQLTQAVQQCIEAAGHEHWPDMQKSLLRVDLEGGWGA	320548	337970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_320612_333955_334045_335741_335832_335938_336034_336187_336265_336733_337083_337220_337257_337431_337541_337704_337840_337884
828681	scaffold_15027_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_163551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTTGAATGGGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48756	24379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_24855_48686
828683	contig_6102_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_32057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATGAAACAAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586832	587432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_586800_587400
828684	SIRV6	+	363	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	336	68	170	-68	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCTATAATCTACGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473	2052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
828687	contig_4093_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_27647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCATACTTAGGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57839	59461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_57800_59500
828689	contig_15070_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_164894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGGCATGCTAAGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440890	439943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_439900_440900
828690	contig_12964_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_131688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAATTGCCTGATTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513169	514950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_513200_515000
828692	contig_9434_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_150499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTTTAAGGAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323628	324100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_323600_324100
828695	contig_6048_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_73229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAGAGGAAGCCATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764608	1765762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1764600_1765800
828697	contig_1725_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_24324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTATACACCTCCTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256307	256953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_256300_257000
828698	contig_1725_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_24325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCCCCCAAATTCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257207	257747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_257200_257700
828699	contig_2596_pilon	-	1231	3	Intergenic	novelGene_53483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	22.5	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	119	469	722501	694804	FALSE	70	CTGAAAAGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQVRVFNDISIYSVK	722619	694041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_695036_696168_696243_722456
828700	contig_5951_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_153241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATATGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163935	164402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_163900_164400
828702	contig_5286_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_157345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCATAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520485	521690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_520824_520871
828703	contig_10437_pilon	-	656	3	Intergenic	novelGene_38118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.5	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAACAGGGCTCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82788	79705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80214_80677_80788_82750
828704	contig_17074_pilon	+	1362	8	Intergenic	novelGene_145167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	650.563805714799	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1041	320	1360	610974	636796	FALSE	55	AAAAGAAAGAAGTAGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRQVSARRAWCTLEMMMMMMFK	563468	636798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_578712_578754_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631
828705	contig_6101_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_114290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341559	343353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_341600_343400
828707	contig_2043_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_169921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754379	753551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_753600_754400
828709	contig_3787_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_102358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAGGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139024	140252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_139000_140300
828718	contig_10324_pilon	+	1372	2	Intergenic	novelGene_7886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCAAACCCTGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569006	570457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_569503_569581
828719	contig_14925_pilon	+	365	3	Intergenic	novelGene_55057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	293	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTATGCCTCTGGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3187	12118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_3212_3279_3364_11861
828720	SIRV6	+	350	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	523	0	357	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1660	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828721	contig_16103_pilon	-	1267	11	Intergenic	novelGene_118783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.0334677889847	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	68	1261	573772	563123	FALSE	35	AATCATATCAAACCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGGGGRGLYWEGGGEGQVRKMATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLAYTRSSHYGGSLPNVNQIGCGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMASPLRRYSRHIDSSPYSPAYISPPPESSWRRTMPWGSFPAEKGQLCRLPSALNRTSSDSALHTSVMNPNPQDTYPGPTPPSVPPSRRGVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLPTSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPASVPALPLVMNSGGSLPDLTSLHFPPPLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISGGLGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSNSQPQLQGSHSHPSLPASSWARHALPATSLGHPWRREPEWILFFIKYIIC	573839	563116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_563176_566887_567062_567516_567762_567884_567935_568053_568119_568417_568522_568688_568758_569387_569448_570207_570327_570408_570511_573619
828722	contig_4385_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_141496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCTAGAAACCTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296748	295715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_295700_296700
828723	contig_6440_pilon	+	1136	4	Intergenic	novelGene_161663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.9133717900592	91	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGAGGGCGGGCGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29944	43512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_30687_30799_30957_42227_42374_43421
828724	contig_15327_pilon	+	1058	3	Intergenic	novelGene_70423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	208	810	36170	54329	FALSE	5	CTTCAGCCTCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRAVRNWLVGFSSLSRCSPAAAETPARSTRLSAGIPAALAASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEKSGLLAGDRLVEVNGENVEKETHQQVVNRIRASLNAVRLLVVDPDVDEQLQKLGVTVREELLRAQVGSGPAELQAATEAQGDGGESEPREAEKSQAERRELRPRLCAMKKGPNGYGFNLHSDKSKPGQFIRAVDPDSPAESHDLGTLFLFT	35962	54577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36611_48133_48260_54293
828725	SIRV6	+	455	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	7	221	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGTAGTATCTGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
828726	contig_5602_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_132987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCATGGGTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7402	7935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_7400_7900
828727	contig_11845_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_148149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCCCCTTTTTCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85209	85946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_+_85200_85900
828728	contig_11845_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_148150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGTGGTGGTGTCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85952	87054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_+_86000_87100
828730	contig_5009_pilon	-	531	3	Intergenic	novelGene_119255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	394	junction_2	72.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTGTACTATTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44621	43179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43540_43812_43900_44537
828731	SIRV6	+	425	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	342	0	176	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
828732	contig_6673_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_164021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAAAAAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108874	107684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_107700_108900
828733	contig_15407_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_123093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_3	108.996432153636	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	106	495	520361	526565	FALSE	35	GTAAAAGTCTTATTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQLVLVELSGIIDSDFLSKCENKCKILGIDTERPIMQVDNYVFAGEYEDTLGTCVIFEEDVEEHGGVEWLQIKDNDSSNRPNMICSFLHENEDEEVVAPAPDKPLELKEQEIQMKDNSDLSYEQGKPLHLEIEDSGPLIEIPSFDTEGFDFMETQDADLEATPR	519554	527428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_519636_520336_520401_520497_520546_526263
828734	contig_5057_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_151504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGATGCTGCTTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367016	365093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_365100_367000
828735	SIRV6	-	576	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACTAGAACTATTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11288	10404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
828737	contig_8268_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_147003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144113	141866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_141900_144100
828738	contig_10982_pilon	+	1561	2	Intergenic	novelGene_87898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	56	790	286264	301739	FALSE	15	CTCTTGTTTTGATTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVFILQLAVCILAFPMYLLNFLGIWSWICRTLFPHFLAWVSVIYNEKMASKKRELFSNLQEFAGPSGKLSLLEVGCGTGTNFKFYPPGCRVTCVDPNPNFEKFLIKSIAENRHLEFERFLVAAGENMHNVADGSVDVVVCTLVLCSVKSQEQTLQEVYRVLRPGGVFCFLEHVAAKPLTWNYFWQQILDPVWFLLFDGCSLTRDTWKTLERASFSKLKLQHLQAPLSWELVRPHIFGYAVK	286208	302510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_286762_301502
828740	contig_7898_pilon	-	1712	10	Intergenic	novelGene_47645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	126.433801543889	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	299	988	797053	777655	TRUE	50	ACATACATATACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQYLTRPCSPQNKISFGCCGRFTAAELLSFSLSVMLVLIWVLTGHWLLMDALAMGLCVAMIAFVRLPSLKVSCLLLSGLLIYDVFWVFFSAYIFNSNVMVKVATQPADNPLDVLSRKLHLGPNVGRDVPRLSLPGKLVFPSSTGSHFSMLGIGDIVMPGLLLCFVLRYDNYKKQASGDSCGASGPANISGRMQKVSYFHCTLIGYFQPSLPFSTWCHLPYCHFSRWPI	824925	776213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_776936_777652_777724_778762_778959_779697_779862_780332_780440_795944_796058_797012_797092_797868_797989_806387_806477_824874
828741	contig_6418_pilon	-	852	9	Intergenic	novelGene_81113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	285.17100133078	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	9	716	106563	68355	FALSE	30	TTAGAAGCAACTACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKGGCSAPPS	106571	68218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68372_73013_73117_75091_75152_77007_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515
828742	contig_5196_pilon	+	1228	3	Intergenic	novelGene_38703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	120	junction_1	19	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	407	1030	330945	335098	FALSE	50	CCTCCCTGCAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANTGLSHSKPLRIVLEMVHTALGLHFLCFTTHRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKINSHGFWKKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKVIYIQVIYILWGNL	330538	335296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_331233_331341_331480_334900
828743	contig_1267_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_74463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAATTAAAAAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28475	27506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1267_pilon_-_27500_28500
828744	contig_5711_pilon	+	801	4	Intergenic	novelGene_80259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	83.6434230661456	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	23	622	52529	77396	FALSE	10	CTTTGTATCTTGGTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTVPSSRFRLIATLHQQNETLPGPAPSSRLLLLLLLK	52506	77575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_77288
828745	contig_6137_pilon	-	1220	2	Intergenic	novelGene_59257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATGAGAGTAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320598	1319340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1320415_1320452
828746	contig_10183_pilon	+	1100	5	Intergenic	novelGene_169512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGCCCCGCCCCTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146176	160081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_146451_149987_150065_151382_151585_152126_152607_160014
828747	contig_2069_pilon	+	1421	3	Intergenic	novelGene_23416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAGCTAGATAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252411	1255109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1253191_1254291_1254374_1254549
828748	contig_19719_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_176890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGTGACTCTACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42235	40943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19719_pilon_-_40900_42200
828749	contig_16322_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_87561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAACAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153222	155417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_153200_155400
828752	contig_7630_pilon	+	1362	8	Intergenic	novelGene_133630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.89968330431206	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	504	1118	272213	284291	FALSE	10	GTTTCTGTGGTTTATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCVVLCTDASLHLVTANGTKGPTISVLVERPVKHLNETICAVAPVPALPGMLLIFSWNGSVRLMDVAKSEILCAFAPPRSYHLAVPWKPVFVVSLHHPCFLLRGDHPDEIECTSNAKKIRNSIFYFNFEAYPLLEEISGNCTIPQSDLTDNKAFSETLPLEKRCEHFLQKRFEKVKKNTMRDQEHWARLQKYSLILQREGFMK	256678	284535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_256803_260714_260800_266229_266402_272090_272305_274019_274084_275980_276138_276492_276695_284191
828753	contig_14516_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_153890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCGGCGGCGGCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35877	35563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_35600_35900
828755	SIRV6	+	495	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	9	514	2	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
828756	contig_16999_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_85004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATGATATCAAACAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195631	197385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_195600_197400
828757	contig_10135_pilon	+	2086	2	Intergenic	novelGene_106592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTAAACCCACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40148	46260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_41043_45068
828758	contig_6427_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_162579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1909	2208	1050331	1050032	NA	40	TACAGCAAGGGCACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLGTSLTWTLGIQPPLSGVAQNVLSGTNAAPPATSPLELGQTYIAKGTVLQTAQDSDTSPKLGGPQDTLTSDPLATNLGVSSTLQDASYKLEGLKIH	1052239	1049806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1049800_1052200
828759	SIRV6	+	415	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	441	0	268	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
828760	contig_9363_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_6716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATTTCACCAAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316314	1318335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1316300_1318300
828761	contig_709_pilon	-	1228	2	Intergenic	novelGene_57602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_1	0	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2338120	2333767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2334393_2337517
828762	contig_12046_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_83475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAAAAAGTTAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368121	367633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_367600_368100
828763	contig_9995_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_47801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAGAAAAAAATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812634	811138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_811100_812600
828764	contig_9091_pilon	-	800	2	Intergenic	novelGene_32411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAGGAAAAATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4579	2305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_2417_3890
828765	contig_12951_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_68251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCTTTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843785	842855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_842900_843800
828767	contig_7629_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_153560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAAACACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242478	240438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_240400_242500
828768	contig_11448_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_66363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAACCACACAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246225	246770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_246200_246800
828770	contig_19311_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_144083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACATCCTGTTATTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145731	146372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_145700_146400
828771	contig_10163_pilon	+	1385	6	Intergenic	novelGene_82610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	67.1970237436153	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATTTCTGCGTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6493	25124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6679_11212_11431_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602
828772	contig_7359_pilon	+	958	8	Intergenic	novelGene_139863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	33.2154377680387	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	84	632	325382	334476	TRUE	25	TATTTCTTCAATTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRGSGCTMLPYVVPSGNVVVLTPSDFSMSRAERSELPNQDDRGKGLKNEVKVLGTLQVLAGMMIMSLGITLGCTVTSHHFSPIVSTLMKSMYPFIGAKCFIVSGLLSLILEKRFNKHLAWSTLAINITSLLAAAVGFIILHSLVEADPSPRRTPDGALPAAEWNHCLHQAPSRASWSWT	325298	335483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_325402_326900_327052_328428_328564_329401_329459_331463_331525_333487_333536_334399_334484_335164
828777	contig_6576_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_42379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATATTAATGACCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274629	1275866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1274600_1275900
828778	contig_4496_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_66702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGACTTATTAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979499	978422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_978400_979500
828779	contig_4496_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_66701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCCTCCTCTTCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978422	977853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_977900_978400
828781	contig_6674_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_148021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTACAGAAAAAGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255351	253181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_253200_255400
828783	SIRV2	-	542	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	106	38	106	-38	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	35	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGCACGACGACGTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5789	3703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
828784	contig_6556_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_168491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	316	717	306274	306675	NA	25	ACTTTTCTCATCCTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSETQLSWVACIPSTRCSYYDGKSMKSDLLPLPLLKDVGGGSLTPPETALVSVFSRTGGMGKVMETLDVSSPDLMGEGQSKFSIVLVGSRHLNCLQFGEILGLSAHLEEEKSEATESQCGFEHKGKMHRK	305958	307177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_306000_307200
828787	contig_11832_pilon	-	787	3	Intergenic	novelGene_106910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	35.5	665	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	66	419	74306	72712	FALSE	20	GATTAGACTTTTCATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLKRRVSENGKILWRPPRVIMATCSLANERLRALEDIEREIGAILQNAGNVILELSKEKTNERLLDRQAAAFTASVQHVEAELSAQIRYLTQVATGQPHEGSSYSSRKDCQMALKRVDYARLKLTDVARTCEQMLEN	74371	72343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_72850_73874_74006_74221
828789	contig_593_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_102002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACCAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342600	341739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_341700_342600
828790	contig_14563_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_135042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	113812	113513	NA	30	ATCCCATTTAGAGGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSIGEKEKCVQTWLHVNFCFSGPEAEATICGFKETADLFRRGESGAPRLPTRRSQLACSFLVQVGRKLCLTFSLLLLHSLLLHAKNYFFLPYITETLVA	113813	113041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_113000_113800
828793	contig_3077_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_26845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAGCAGTGTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695059	697199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_695100_697200
828794	contig_14326_pilon	+	1212	8	Intergenic	novelGene_120702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	74.2648322298142	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	440	994	231946	248940	FALSE	20	GTTCATGTGTCAGTATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVEAVKSLQCPQSELDAETVKSILAEYKIHNADVTLRSDATADDLIDVVEGNRVYIPCIYVLNKIDQISIEELDIIYKVPHCVPISAHHRWNFDDLLEKIWDYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPDSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKK	221828	249158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_221931_222862_222987_223790_223967_231908_231979_241172_241304_242428_242597_242864_242988_248840
828795	contig_8663_pilon	-	834	5	Intergenic	novelGene_57996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	224.036129898729	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	71	433	71195	53470	FALSE	20	GTTACTTTTTTTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEKLAKLQAQVRIGGKVNMIKDDGTVIHFNNPKVQASLSANTFAITGHAEAKPITEMLPGILSQLGADSLTSLRKLAEQFPRQVLDSKTPKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN	74400	53068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_53517_54084_54145_54985_55188_71141_71209_74343
828796	contig_12566_pilon	-	1621	2	Intergenic	novelGene_85993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCCAAATACTAAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21537	18801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_19685_20799
828797	contig_5500_pilon	-	787	5	Intergenic	novelGene_159647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	104.48534586247	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	22	309	648597	636997	TRUE	30	GGAAGACGGTACATAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRGQPRKMAAAVTFCRLLSRSRLAALSLPQAARCFGVRTSPTGEKITHTGQVYDEKDYRQMRFVGRQKEACTRQRDPGPEGQKPAWPWSARTGCYCRSHPRL	648618	633236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_-_633503_634475_634599_636907_637099_647064_647119_648465
828798	SIRV6	+	446	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	214	-24	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCGTCTTGAAGCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517	2516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470
828799	SIRV5	+	414	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2196_3298_3405_3483
828800	contig_6159_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_128244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	48	488	143090	142650	NA	45	ACGACATCAAAATTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVWWKRFSGCLWEEMWLGHWSPKKPAVEGSGSRPLLSSGCSLLGPTGDLDLRAFFCSRLSVSILDKVVDTDHKSAHTKGFWGQRSLFLALRPSPSLCPQPHGSPSRGHLPIDTNAKYHSRTLPLIVSFHSISIRERFRTSILFNSCIAPQCVTVPQFTYR	143137	142209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_142200_143100
828801	contig_665_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_158212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAAAAAATAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275734	276647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_275700_276600
828802	contig_7357_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_36919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	147	572	534292	533867	NA	75	ATCCTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAPSMFSQNGYVFVAVLRSFSPHLCSPEWLRICSSCVEVFLAPSIFSQNGYHTCPSVDLFLAPSMFSQNGYIFVPVLRCFLPHPCSPEWLHFCPSVEMFLAPFTFTCSVSHDPLAHHLLLFLLLFLVKETQEVASSSEK	534438	532751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_532800_534400
828804	contig_11396_pilon	-	2294	24	Intergenic	novelGene_71306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	112.077511660626	7	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	195	2180	418545	390350	TRUE	10	GGACTATGGGGCTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVILNGVTVDFPFEPYRCQQEYMAKVLECLQKKVNGILESPTGTGKTLCLLCTTLAWREHLRDTISARKIAERAQGGLFLNQALSSWGSAAAGDTPASYVDIPKIIYASRTHSQLTQVIGELRSTSYRPRVCVLGSREQLCIHPEVKKQESNHMQIHLCRRKVASRSCHFYSNVEEKSLEQELVTPILDIEDLVKSGSCHKVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDPKSRRTHGIDLKGTVVIFDEAHNVEKMCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQRELYLEPDVGLAGSGLNMELEDIAKLKMILLHLEEAIEAIELPGDSGVTKPGSYIFELFAEAQITFQTKSCILDSLDQVIQHLAGRAGVFTNTVGLQKLLDIIQMVFSTDSPEGGPGSGGGQGASKFYKVHIHPDTSQRQRAQRSDAWSVAATRKQGKVLSYWCFSPGHSMQELVCQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHVIDKHQIWVGIIPKGPDGAQLSSAFDRRFSDECLSSLGKAVGNLARVVPHGLLVFFPSYPVMEKSLEFWRAHDFARRIEELKPMFAEPRSKGSFSEVIDAYYAKVASPGSSGATFLAVCRGKASEGLDFADMNGRGVIVTGLPYPPTHGPPHRPQDAVLG	419484	390140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_390224_390318_390467_390800_390879_391178_391257_391438_391525_391630_391672_392383_392498_392641_392775_394321_394404_394497_394573_398189_398246_398965_399064_406565_406642_406763_406803_408427_408582_409494_409561_411108_411194_412139_412216_415825_415887_416095_416178_416823_416918_417223_417417_418443_418702_419446
828805	SIRV6	+	322	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	48	337	-48	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGCACCAGCGGTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828806	contig_9440_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_59069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1319	1795	774319	774795	NA	40	AATTATCTCAGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNIRGQEIEGNEFSEASTLPAMKIMLKAYINLPQCERKLTKVIGECGLLGPRCAWKKPGCSQGPNLRPAALGSTEGWLRSALGLASRAVLPLLTGRTPLLIPALEGGICGCRCCLAPSPVPPAAGEHKRVRVCGRYGILGFLRFTSCFVLLPPFHVK	773000	775382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_773000_775400
828807	contig_16724_pilon	-	1022	9	Intergenic	novelGene_105319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	749.430439984259	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	153	869	569099	541872	TRUE	30	ATTTCAGCAGTTTATCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	571184	541305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541710_541741_541869_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072
828808	contig_12671_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_19202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGCAGAAAGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141487	140245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_140200_141500
828809	contig_13037_pilon	+	183	1	Intergenic	novelGene_155154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGAGAACTTCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80823	81006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_80800_81000
828811	contig_6674_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_148031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGACTACTGAAAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349507	347553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_347600_349500
828813	contig_7864_pilon	-	1439	4	Intergenic	novelGene_164860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	38.9643711898732	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	392	748	90160	89804	FALSE	30	TGGCAGCAGTGAAGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWKPAPLPVTTCCRRCTRSRWEASLSCPSTWTTAWGRGLDELSYSPALSSDRTLVGGMESLCLMCHVVLSVCCVGAWRCVACWAWVLNVSLLDWPWSCLRGAAARGGGRSCELLCC	116223	89112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_-_90166_92051_92174_92423_92472_116007
828815	contig_14029_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_151932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGTGTATTTTAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74078	74573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_+_74100_74600
828816	SIRV7	-	217	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69067	2	35848	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAAGAGATCGACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78890	56033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
828817	contig_2251_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_128474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTGCCTCCATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82565	83096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_+_82600_83100
828818	contig_9656_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_121908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAGTGATTGCCATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223439	224128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_223400_224100
828821	SIRV6	+	453	3	FSM	SIRV6A	SIRV611	454	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3000	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTGGTGTTTATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304	1950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1382_1468_1535_1640
828823	contig_8587_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_159116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTAGGTATTAATTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163005	164148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_163000_164100
828824	SIRV6	+	335	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	25	17	25	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3048	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
828825	contig_8138_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_52497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGGTGTGGCTGCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449830	451127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_449800_451100
828826	contig_4232_pilon	+	1013	5	Intergenic	novelGene_63186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1981.19854822781	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	82	582	146362	149200	TRUE	80	AAAAAAAAGACAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146280	149674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087_149485_149527
828827	contig_5669_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_86098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279767	278403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_278400_279800
828828	contig_10774_pilon	-	1049	4	Intergenic	novelGene_158678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.7241609446432	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	303	545	56149	24503	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRSLPARPPEEESSAERIDSSALCGRPAPNSSVCSELDFPRRRPRRRRQQQRQRRWRLLGQYSGPPPFRTGSERGAGTEGGGGGQRLGGSQVRERGLLKMTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYRGSGWQTNGRRRTFFV	61035	23998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_24553_42378_42461_56038_56161_60744
828829	contig_4519_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_123709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCCAGTATTATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639747	640257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_639700_640300
828832	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	0	374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
828834	contig_4845_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_53669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCTAAAATGGACACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757210	756220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_756200_757200
828837	contig_6954_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_64455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGTCATATAGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754488	755804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_754500_755800
828838	contig_4640_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_147968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCAAATTAAGAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395363	395994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_395400_396000
828839	contig_15545_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_120130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29897	31074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_29900_31100
828840	contig_8651_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_168159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTTTAGTTCTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105915	107589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_105900_107600
828841	contig_5331_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_112817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACACACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712095	713667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_712100_713700
828842	contig_14556_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_138514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAACAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82834	81835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_81800_82800
828846	contig_17727_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_172591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGGCTATTTGTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67198	65700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_-_65700_67200
828847	contig_11285_pilon	-	1139	3	Intergenic	novelGene_5495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	6	557	340985	327872	FALSE	30	TCCTTAGGATTAAAGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMARPCELSVEDLNDLLSDGSGCYSLPSQPCNEVTPRIYVGNASVAQDIPMLQKLGITHVLNAAEGRSFMHVNTSASFYKDSGIIYLGIKANDTQEFNLSAFFEKAADFIDQALAQKNGRVLVHCREGYSRSPTLVIAYLMMRQKMDVRSALSIVRQNREIGPNDGFLAQLCHLNDRLVKEGKL	340990	327289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_328072_335167_335395_340860
828848	contig_13966_pilon	+	855	6	Intergenic	novelGene_158158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	67.5532382643497	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	281	853	520012	526149	FALSE	75	AGAAAAAGAGAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHPNKKYEEVPDVELNPMDKSILSNLILGYTPVTNITRNIMQKVSTDHLPDVIITEEYTNEKELIASSLSKPTNFVGVVFKDFMSYELRFFPDKIPVSSIYMDSRAGCSKSCEAAQYWSSGFTALQASIDATIIELKTNVSLWKELESTIAIIMGEAAVVEIDTFPRGVILIYLVIAFSPFGYFLAIHIV	482836	526151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_482999_518831_518949_520010_520169_522514_522677_524119_524209_525984
828853	contig_12951_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_68205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCTTCTCTGCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759963	758598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_758600_760000
828857	contig_7260_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_169143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCCATTCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366520	365906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_-_365900_366500
828861	contig_8140_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_86451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACCTTGTTATATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829192	828374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_828400_829200
828862	contig_7919_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_28122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTATCTTTGGCTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443697	1444843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1443700_1444800
828863	contig_9468_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_59518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCATAAATACACTCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472449	471701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_471700_472400
828864	contig_7622_pilon	+	778	7	Intergenic	novelGene_132410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	115.951139134838	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	123	485	252116	274490	FALSE	40	CCTATAAAAATACATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTVVAVGLTIAAAGFAGRYVLRAMKHVEPQVKQVFQSLPKSAFSGGYYRGGFEPKMTKREAALILGVSPTANKGKIRDAHRRIMLLNHPDKGGSPYIAAKINEAKDLLEVLTYRARFH	251993	274783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252974_253027_253105_253180_254141_254222_255063_255135_256374_256429_274461
828865	contig_10988_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_104739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGACTTTGGTTAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308115	306925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_306900_308100
828866	contig_11126_pilon	+	2782	20	Intergenic	novelGene_138122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	37.9337518456305	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	602	1801	306653	348401	FALSE	65	AAAAAAAAAAAACTCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASGAFTALFGLGYFYDIHSFGFYVLTQIINGLVQTTGWPSVVTCLGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFLFLIEHPKDIRCSSTLSTHSKAYETGTNRFRTQKQILNEKNKPLDPEAQCLLLSDGSSGVHPNHVIILPAEGGNAMAAISFTGALRIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDHLDAQKAGVLSTLFDVGGIFGGILAGLISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYVFSAISKMGLEATVVMLLLSGALVSGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAHALATVTAIIDGTGSVGAALGPLLAGLISPSGWNNVFYMLMFADACALLCLIRLIHKELGCTGTPAGDQVPFKEH	276550	349382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_276580_282536_282765_291867_291950_301079_301213_301930_302010_306602_306740_308270_308348_309523_309691_310610_310649_314832_314911_319742_319875_322781_322873_324636_324700_325160_325247_326767_326817_328208_328283_336634_336714_344168_344267_347901_347967_348385
828867	contig_7171_pilon	+	774	8	Intergenic	novelGene_101312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_7	119.877147998461	1321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	81	737	1077108	1088749	FALSE	0	GCTCCGCTGTGTCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTDSQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDSVSSIMASSQ	1077027	1088786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086110_1086237_1088717
828868	contig_7963_pilon	+	984	6	Intergenic	novelGene_58421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	276.794942150322	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	42	497	89963	92154	TRUE	20	TTTGTAATGTATCTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSGVLTVGLHILMTLPSPQEAGAIQADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDGEQLFSVDLKTKEAVWRLPEFGNFAHFDPQGGLVSIALIKAHLDALVERSNRTRATNVPPKVTVLSKYRVELGQPNILICIVDNIFPPCNQHHLAAQC	89921	93182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_90045_91241_91491_91933_92055_92150_92217_92314_92451_92893
828869	contig_3942_pilon	-	510	3	Intergenic	novelGene_128774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTGTCCTATGACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795471	793354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_793623_793793_793885_795320
828870	contig_6710_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_93538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
828871	contig_3269_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_117037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAGCCAGAAGGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204013	205434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_204000_205400
828873	contig_11427_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_79002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTGGGTATGTGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601706	603460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_601700_603500
828874	contig_11427_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_79003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603510	603701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_603500_603700
828878	contig_1982_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_151344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATATGACCCCTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700421	701552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_700400_701600
828879	contig_1008_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_121585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTCCAGCTTTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695652	694229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_694200_695700
828880	contig_366_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_51648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGCTCACCTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419810	1420682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1419800_1420700
828881	contig_4989_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_160785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96015	94249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_94200_96000
828882	SIRV6	+	425	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-84	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2388	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10727
828884	contig_18799_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_171422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAACAACACTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44240	43396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_-_43400_44200
828886	contig_6418_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_81179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132528	1133045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1132500_1133000
828888	SIRV2	+	579	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-368	1323	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATGACTCGGCATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3665	5780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3965_4102_4340_4479_4686_4800_5750
828889	SIRV6	+	364	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856
828891	contig_6063_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_27601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66318	67162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_+_66300_67200
828893	contig_4469_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_21965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAATATGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781912	782665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_781900_782700
828894	contig_3409_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_172304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAGGAAGAAAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36722	37579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_36700_37600
828896	contig_5429_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_127812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453648	455121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_453600_455100
828897	contig_6674_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_148014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACATTTCTACTCTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209712	208963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_209000_209700
828898	contig_10011_pilon	+	1524	4	Intergenic	novelGene_68029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	31.5911379978626	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	410	1402	89374	94789	FALSE	50	TTTACAGAGAAAATAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESDDDFKELCASFFQRVKKNGTKELSGERKKQKASDGTQIRSKPKRPKRTTTKSKTLHGPAEEKTQSGSQATRTKTQGAAKSQGREPAPTVNGKGRVLAPTPAPEQPPPQDSAQSTQSEGAPSSDAQLPSSGLTAVPPSPSKPRTAELVLQRMQQFKRADPARLKHASGACSLEAEIAENIPKDPQEEPMVGNGCGPGSPATESDGAVALALQQELAQERAPTREEGLEDEGWFFCQICQKNLSAMNVTRREQHVNRCLDEAEKALRPSAPQIPECPICGKLFLTSKSRSSHLKQCAVRMEVGPQLLLQAVRLQTAQLDAGCSRTASR	88964	94911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_89735_91366_91592_93459_93650_94572
828900	contig_7361_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_163389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502815	501554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_501600_502800
828901	contig_5684_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_80987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1578	1892	42851	43165	NA	25	GAAGGGGCTGCCAAGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRTAFCNLGATIHIGAMPYFLLPGSKTSVQVTFDCSISSVSEPGSYQILSIQLFTVSISICTFHFICQDPYFPRFWYSNSSKLPVMIPGPGRMRQVCRYKKK	41273	43307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_41300_43300
828902	contig_8320_pilon	-	1320	2	Intergenic	novelGene_152277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1	426	563548	558045	FALSE	30	AAGGCGGACACTATTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPGLLLRRLLVLGLCVSRWFDLRCCTRRGAGVLFWDGSWSVFSFELDVATASQEREGGRVLLLARCSGPGTVGRAEAAAHAESCPAPLSRPWGADGRKRSGKSFSHRVFLCGLGFRECHVPGLPQHPSIQKLIVILLVSS	563548	557150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_558078_563155
828903	contig_9875_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_154413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGATTTCCCAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142225	143453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_142200_143500
828904	contig_13900_pilon	+	2185	7	Intergenic	novelGene_115093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	33.8694388629172	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	138	512	23488	33995	FALSE	75	AAAAGTAAATACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRITIGGHRSDVRTLSFSSDNIAVLSAAADSIKIWNRSTLQCIRTMTCEYALCSFFVPGDRQVVIGTKTGKLQLYDLASGNLLETVPGETQGENYFTGKKTIETVKAAERIMEAIELYREETAKMKEHKAICKAAGKEVPRPINPILMAYGNISPSAYVLEIFKGIKSR	20489	35668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_+_20602_23462_23557_26304_26356_32035_32102_32603_32697_33190_33239_33947
828906	contig_13700_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_68278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104980	103915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_103900_105000
828907	contig_5815_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_141192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAACCACCAACCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213042	211937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_211900_213000
828908	contig_11363_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_160490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAGGTCCTAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161240	161022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_161000_161200
828909	contig_14176_pilon	-	907	6	Intergenic	novelGene_74849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	2.13541565040626	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	102	779	281119	277708	FALSE	10	TTCCCTGACTCACGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRPLILPLLLLGTVSALHLRNDAPEPKSLETAADLSQDLEGSGEQEGELALAEKVIQSEGEEVESFWYEDALEDEEAMDSDPAALDKDLQCPREEDTVQVLGSPGCKSCHNLLVQTPRTFRTAQNICRRCYRGNLVSIHNYSSNYRIHLITRRINQDRVWIGGIIKGWFLCRRFRWTDASRWNFAYWARGQPRNGRGRCVALRTRGGRWQRTPCKRHLPFVCSF	281553	277579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_277767_278565_278678_279491_279624_280337_280652_281058_281197_281529
828910	contig_12756_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_153207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAATAAAGGAATTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62837	65048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_62800_65000
828911	contig_16098_pilon	-	1709	8	Intergenic	novelGene_45920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.49927106111883	38	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	631	1041	339547	338554	TRUE	30	AATAAAGCCATCTCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLQGDLRQPLEYVKDVPLIKYFAEALGPLQDFQAWPDDLLVSTYPKSGTTWVSEILDMIYQGGNPDKCSRDPIFIRVPFLEFKAPGVPSGLESLKDIPAPRILKTHLPLALLPQSLLDQKVKGLKGGRRTWRAG	341796	337122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_337354_337479_337661_338203_338299_338392_338593_339006_339105_339187_339314_339399_339585_341203
828913	scaffold_12124_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_22304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2233.04321498712	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCATTGGTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473590	1508442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473692_1506547_1506687_1508010_1508120_1508220
828914	contig_10446_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_162456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCTTGGGGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473517	472967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_473000_473500
828916	contig_11933_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_107264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGCAGCCGTCCATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148576	149829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_148600_149800
828920	contig_9258_pilon	+	487	2	Intergenic	novelGene_104618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12580	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	158	376	99364	99582	FALSE	20	GGGGTCTGGGGCTGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGQGHGHSHSHDHDHGHKH	97254	99693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_97376_99327
828923	contig_6076_pilon	+	975	4	Intergenic	novelGene_81754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.43650214343336	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206290	306980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_206355_213206_213366_214127_214250_306350
828924	SIRV6	+	492	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	39	0	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2324	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
828926	contig_19848_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_173825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGTTCCTCCTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173648	173143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_173100_173600
828927	contig_7057_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_123404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACATTCCTTACATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309649	1308957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1309000_1309600
828930	contig_8864_pilon	-	1373	10	Intergenic	novelGene_135982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	31.0928517845946	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	91	1371	156918	129341	FALSE	70	AATGAGAGAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQEHPSIPDAKLQRSQDADDQQESFVPEVPQLDLAALCDGKSWEEPVPTFSTWQRESINSDEARLSPQAGRLIRQLLDEDSDPLLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEERKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRKQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQELVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTIPIIGSPSSKRRSPLLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDDTNTKLDFTVTLKTDFSARSFLDQLEDDADGFISPMDDMMPSKCSQDTGLSNLHAASIPELLEHLQ	157008	129338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_129366_129947_130145_136023_136108_137851_137948_145581_145666_146305_146527_147385_147468_148398_148538_149075_149290_156779
828931	contig_11448_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_66366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1194	1544	253020	252670	NA	35	GATTGTTCCAGTACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSLAVTSQCVAMGGLVMYEGEGRNGVSRAHQDWMAAERAARSQEALLLWRPAREELLFREIFNSGASSSFSVLPTNEINFLKGKKGKLCFVFQTARRRGAGESVLAGLFHSIDL	254213	252543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_252500_254200
828932	contig_11720_pilon	+	1682	11	Intergenic	novelGene_43884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	10	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCCCAAACGCCTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107788	113320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_108268_108868_109000_109192_109301_109508_109597_109756_109883_109999_110080_110363_110494_110770_110891_111444_111564_112531_112683_113170
828934	contig_3825_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_78028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGCTTCGAGACTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1839663	1838875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1838900_1839700
828938	contig_10749_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_133467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTGACCTTGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156955	156287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_156300_157000
828939	contig_12550_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_175277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGGAAAATCTTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41642	39578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_-_39600_41600
828942	contig_7707_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_72165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGCAAAAGAAATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271654	270866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_270900_271700
828943	contig_15092_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_57762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTAAAATATTTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258074	258969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_258100_259000
828945	contig_1107_pilon	+	703	5	Intergenic	novelGene_126574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.5509673943818	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGATGCTTGTGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579626	589208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_579664_580183_580359_582057_582213_588337_588469_589003
828947	contig_12690_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_176891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	59	1903	57312	74303	FALSE	35	TTCGTGGCTTTATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTETAPHSEGLLYTGPPPAAMATTSTHSEDHPPGEAVPTILLTKPTGAMSHPTGEALPTILLTKPTGATSHPPEEAVPTVLLTKPTGATSHPPEEDVPTVLLTKPTGATSHPPEEDVPTVLLTKPTGATSHPPEEAVPSVLLTKPTGVTSHPPGEALPTILLTKPIGATSHPPGEAVPTILLTKPMGATSRPTTAGPRSTTRRPPRPPGSSRKGARSSSRLVPPASSGHSGRKESQRGRNQSSTHLGQKRPLGKIFQIYKGNFTGSVEPEPFALTPRNPLQGYSSSPQPQTVATTTAPNGTSWASSTTPLVPAENKSGLSRTDQEGGPAFTSQGGELNATAASGAPASPQLAPVPSQRHRGDPQDSPSHSNSLLTVIPGTNRPLSASSGVFTAVPGPTQAAFDASVSAPSKGIPQGAYTTPQAPTHPPGVSESTVSQAKEEAAATSSMTGRVPSPLSTVVSTATGNFLNRLVPAGTWKPGTVGNISHVAEGDKPQHRATICLSKMDIIWVILAISVPISSCSVLLTVCCMRRKKKTANPENNLSYWNNAITMDYFNKHAVELPREIQSLETSEDQLSEPRSPANGDYRDTGMVLVNPFCQETLFVGNDQVSEI	57253	74487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12690_pilon_+_58879_68124_68280_74180
828948	contig_11294_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_50045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGAAGGCTGTCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221641	221060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_221100_221600
828949	contig_2027_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_39930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATAAATATTGACATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176027	175643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_175600_176000
828956	contig_9505_pilon	+	868	8	Intergenic	novelGene_121818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	56.8273432317182	230	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	117	812	404142	447457	FALSE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKVTFQFSYGTKETSYGLSFFKPQPGNFERNFSVNLYKVTGQFPWSSLRETDRGLSAEYSSLGATRLSLRVRALA	404025	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419280_419515_419604_447409
828957	contig_14744_pilon	+	2191	14	Intergenic	novelGene_65961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	69.1646692993608	5	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	782	1657	677932	685369	FALSE	20	TGGCTTTGGAAGTCATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVFLTFTALYFGRVTLAWALGYLGLYVFYVITVVLCTWIYRWQQRKSLVYSMPGTPELLSDAEDERVSSNTNSYDYGDEYRPLIPYQETTAQILARALNPLDYRKWRNKSIYWRALKVFKLPVEFVLLLTVPVVDPDKDDHNWKRPLNCLHLVTSPLFCVLTLQSGAYGLYEIGNLLPVWAVVVIAGTGLATVTFFATSNYEIPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILQSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFLDLTLARQGYPRMAFSACFGGIIFSIL	670366	685903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_670474_672313_672509_676640_676802_676890_676944_677450_677509_677640_677747_677830_677999_679115_679224_680114_680175_680454_680586_681605_681748_682728_682851_684300_684455_685277
828958	contig_7057_pilon	+	838	10	Intergenic	novelGene_123325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	807.817376379245	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	119	589	938907	943233	TRUE	5	CGTGGCATCTGCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSRSHVPGQLVPEGRRRRWRREEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	936966	943717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937033_938702_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943305_943539
828959	contig_17074_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_145189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAGCTTGCAAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625091	625575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_625100_625600
828960	contig_17074_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_145191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAGTAGTTGAACCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626673	626985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_626700_627000
828961	contig_9189_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_165120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAATCGACCCCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363243	362349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_362300_363200
828962	contig_9189_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_165125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398636	398088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_398100_398600
828963	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
828964	contig_8248_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_125022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAGGTAACCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110671	109522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_109500_110700
828965	contig_14243_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_57427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1159	1488	578450	578121	NA	45	GTGGATATTTAATGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSSLVLQPHLLNYQLDSFPNLLFSLYSISMLILPYHQVTQMRNRRVVLIFVIIFLFHPPLLGVHSACSQFLVILQCKCLWHPFIFRTSALSSDPIITSLNFPDLLSG	579608	577584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_577600_579600
828966	contig_16412_pilon	-	2465	11	Intergenic	novelGene_176892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGCAGTCCCAGCGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193394	97662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16412_pilon_-_97723_118161_118430_153674_153812_157081_157211_157857_157989_160365_160416_168048_168188_180603_180772_184539_184714_189400_189588_192372
828967	contig_5964_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_80363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGTCATTGTCATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103323	104388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_103300_104400
828968	contig_5964_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_80365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	3	344	109160	109501	NA	35	CAGCAGGGACCAAATCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPPPSWDPVRRAGPEQGGGRAGTLRSHPALRLLGVARLTVALWASVSPSERRTRPRAPPLATAKVKGGAESRRACCLGGRRGATLQWFTTRTYGLSLDERTGEQHSLSLKTSR	109157	109502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_109200_109500
828971	contig_5643_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_38889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGCAGCTTCCCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243939	242773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_242800_243900
828973	contig_15474_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_136233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	311	457	68215	68361	NA	15	TGCCAAGAGCTTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECGRRFSDRSDLSKHQRTHTGEKPYRCELCGKRFTCVSNLNVHRRNHAGHKPHKCPECGKAFSVGSKLALHRKTHLGERPAECAECGKCFSHSRSLSQHQRAHMRARAAAARAATAEAAADVSSAGAPLVFTGEAGQEKQGLFVSQLGQKC	67904	69299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_+_67900_69300
828974	contig_5229_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_117700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGAAGATGGATCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562569	564202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_562600_564200
828975	contig_7272_pilon	-	975	3	Intergenic	novelGene_25372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCATATAATTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633219	616989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_617703_620497_620568_633027
828976	contig_4678_pilon	+	856	4	Intergenic	novelGene_126029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	127.002187207763	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	287	763	341435	343851	FALSE	15	CTAGCTCTATCTACTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRWAERLFPANVAHSVYILEDSIVDPQNQTMTTFTWNINHARLMVVEERCVYCVNSDNSGWTEIRREAWVSSSLFGVSRAVQEFGLARFKSNVTKTMKGFEYILAKLQGEAPSKTLVETAKEAKEKAKETALAATEKAKDLANKAATKKQQQQQQFV	341148	343944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_341570_343168_343283_343385_343465_343702
828977	contig_20951_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_43120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCACCTCGGAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220906	218802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_218800_220900
828978	contig_6664_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_176066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTAAAAAAAAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12570	12343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_12300_12600
828979	contig_6664_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_176065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGCAAATATTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10943	10632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_10600_10900
828980	scaffold_880_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_121527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590553	589157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_589200_590600
828981	contig_3103_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_146204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATTCATAGCAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115644	116714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_115600_116700
828983	contig_3103_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_146205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117863	118357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_117900_118400
828984	contig_11642_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_172921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAACTCTTAATAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272644	272245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_272200_272600
828985	contig_13547_pilon	-	1496	10	Intergenic	novelGene_104870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	354.073055166673	1	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	4	1494	163431	75804	FALSE	60	ACAGGAGAAAGGAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNLLRLHRWSVIWKNWIFSQDCEHVFQVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTIMEVNGQNFENITFVKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKAGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDIEQT	163434	75801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_75929_84852_84962_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206
828986	SIRV6	+	233	3	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	9636	568	486	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11034_11109_11205
828987	SIRV6	+	340	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	222	17	222	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
828988	contig_13494_pilon	+	1116	4	Intergenic	novelGene_167515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGTGTCTCCGCGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51189	84267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_51916_55521_55575_58441_58475_83963
828990	contig_13823_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_145239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCTGCATAGACTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57142	57894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_57100_57900
828991	contig_13823_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_145240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAGGATGCAGAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58618	59228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_58600_59200
828992	contig_15498_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_42720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAGAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037528	1039033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1037500_1039000
828993	contig_8866_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_77909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTGAAGGAAGAATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155331	1154094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1154100_1155300
828994	contig_10609_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_123903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAATATGAGTCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173577	174986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_173600_175000
828996	contig_1143_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_86638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAGCTTTCATAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344576	1343621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1343600_1344600
828997	contig_12638_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_33216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492819	492195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_492200_492800
828998	scaffold_19766_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_34299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTCCCTCCTTCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524517	523393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_523400_524500
829005	contig_12148_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_140327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_2	274.161752742184	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	20	514	57850	74287	FALSE	45	GCAACAGTAGAAAGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDEGAKNNGESPAAAVAERGEDITSKKDRGVLKIVKRLGTSEETPMIGDKVYVHYKGKLSNGKKFDSSHDRNEPFVFSLGKGQVIKAWDIGVATMKKGEICHLLCKPEYAYGSAGSVPKIPSNATLFFEIELLDFKGEDLFEDGGIIRRIKQKGEGYSNPNEG	57830	74287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_57955_61794_61940_73099_73243_74185
829006	SIRV6	+	481	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	201	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	28	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
829008	contig_5765_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_141399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCTTTTAGCCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707040	707788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_707000_707800
829009	SIRV6	+	449	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	96	0	-91	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2381	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
829011	contig_253_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_129658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACTGTGTGCCAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368982	369343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_369000_369300
829012	contig_4426_pilon	-	1107	5	Intergenic	novelGene_15451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1022	junction_4	462.595125352613	12	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	82	822	904546	868769	FALSE	35	TAACCAAAACCCTTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTGWFHIICIQLFL	904627	868483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
829013	contig_9995_pilon	+	508	2	Intergenic	novelGene_47755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTTTCAAATTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663729	664313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_663870_663945
829014	contig_6842_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_130851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGATTGTTTATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2132774	2133778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_2132800_2133800
829015	contig_16204_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_154488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAATGATCTTGCAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200219	200691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_200200_200700
829016	contig_15063_pilon	+	978	3	Intergenic	novelGene_14411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_2	1639.5	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	19	840	35271	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35252	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_35380_35839_36158_36266
829018	scaffold_7386_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_136601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	86	361	343079	342804	NA	25	GGATTGCCACCACTGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAANLVTFVLCFLPLHAALLAKLVAQWMDAACPTMQMVTTCVQVASRIANTNCCLDAVGYYFVVREFQEEVGAVLAPPWPFRGWFQGSAQGQPAEESQAGGGSPQPLKGAALCAPGLP	343164	342671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_342700_343200
829019	contig_6589_pilon	-	1087	6	Intergenic	novelGene_26207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	153.45044802802	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	579	1004	2030570	2028014	FALSE	25	CAATCATTGCATGTATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPSGLAVASEHPPQLLLSPSVDIIAPSPNQTPLENPLRQLLVIEEDLIAFIEGSKRSPRYTLWFCIGESWPRDQPWTKKLVMVKVVPTCLRALLDMARVGGASSLETTMDLHISNSHPLSLTSDQYKAYLQDLTEDMDF	2033637	2027930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2028182_2028657_2028774_2030428_2030623_2031545_2031718_2032516_2032690_2033456
829020	contig_5727_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_7936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATTACCGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168815	166729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_166700_168800
829021	contig_11096_pilon	+	1891	2	Intergenic	novelGene_143468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGACAGCAGATTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201657	203894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_202048_202393
829022	contig_13026_pilon	-	973	10	Intergenic	novelGene_146298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.03243068509	113	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	621	920	14211	6164	FALSE	10	TCTCCTGGACCAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITSSPLCQAWDPKANQEEEFHQTTSSSESPGAKMSTSQLPSTWFSADPNPYDSALFPGATFHVWREFP	28113	6110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6366_12671_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
829023	contig_15658_pilon	+	553	4	Intergenic	novelGene_157874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	8.65383665716478	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	240	551	103844	141848	FALSE	25	TGACTACATCTATACCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGESINPSSQPLVQAGDDEKSQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIIAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKL	103604	141850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15658_pilon_+_103858_119980_120101_130089_130197_141777
829026	contig_5947_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_101509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTGGAGAGGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417886	417066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_417100_417900
829027	contig_10861_pilon	+	766	4	Intergenic	novelGene_39374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.695516805508	47	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685835	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1685988_1686172_1686206_1686323_1686409_1686956
829028	contig_5019_pilon	+	985	3	Intergenic	novelGene_109187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.5	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGCCACACATGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105661	172523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105737_171495_171668_171785
829029	contig_7919_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_28108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGGACTGATCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392926	1391245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1391200_1392900
829031	SIRV5	+	351	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	168	149	54	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCGCCAAAAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8369	10993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
829032	SIRV2	+	270	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	317	-64	-317	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGCAATCGCAAGATACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
829033	contig_1154_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_87044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	144	491	58156	58503	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKQITNFIWKGKRSHISKELLKNNNKVRSLTLPDFRTYYTATIVKTACYWYKRYVDQWNRIENPDTNLSTYEQLKFDKGPKPVKWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTP	58012	59068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_58000_59100
829034	contig_5935_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_102729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	269	807	73	879	1152733	1153539	NA	35	CGGTAATTTGCATAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAISHGIYYLYPFNIEYQILASTMLYVLWKNVGRKVDGHQHPKMQFKFNGGMMGSVLGLTVLAATIGVVVVYMIRIGRSKTKSESALIMFYLYAIVLLMLMGAAGLVGIWIYRTNEKSLDESKNPARKLDADLLVGTASGSWLISWGSILAILCAKACPPYTWYNLPYSILVIVEKYIQNLFIIESIHREPEKLSEDIRTLRVVTVCNGNTTSLPSSCLKSGGVAEEVAPQDGEMPHAVNGNMCLREGHGKEEEESSWEGAPGPAHCPRFLQCNTKRRVLKNIAAFLFLCNI	1152660	1153540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1152700_1153500
829037	contig_1331_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_37860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAATAAAGAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249769	250257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_249800_250300
829038	contig_17386_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_157950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCAGTACTCATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491904	491350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_491400_491900
829039	contig_6674_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_148011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCTTACAACTGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195838	194391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_194400_195800
829040	SIRV6	+	427	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	10	48	10	-48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGCACCAGCGGTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147	2072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
829041	contig_11602_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_166591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACATAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129436	130749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_129400_130700
829045	contig_17440_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_7646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3515	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
829046	contig_12644_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_44537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTCATACTTTGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452434	1453524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1452400_1453500
829047	contig_7182_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_117121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443550	444206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_443600_444200
829048	contig_1516_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_50027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTAACTGTGTCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516876	516377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_516400_516900
829050	contig_2770_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_107425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAACACCTGATTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276614	277385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_276600_277400
829051	contig_7410_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_106103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCCTGACTGAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424099	424899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_424100_424900
829052	contig_6489_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_128950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTTCACCCCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337258	338299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_337300_338300
829053	contig_10005_pilon	+	1150	2	Intergenic	novelGene_148917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	826	1149	138050	138373	FALSE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLIIFCTSDTKKIKIQSEKGKVVFIKTKASLQSKEMYTMFLNIVHNVADYERNLIVWMSSLLQLIKWNSKYFVSKNGVAVTQGRGGALPHIFFAARNQSCLFCQMK	134915	138374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_135122_137430
829054	contig_9580_pilon	+	1469	2	Intergenic	novelGene_167741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATTAGTGGCAATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848158	854426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_849420_854218
829055	contig_7426_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_27563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCATCAACAGATGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207742	1208500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1207700_1208500
829056	contig_5797_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_56917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATGAATGCAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186695	184139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_184100_186700
829058	contig_9955_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_21374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGGAGAGCCTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563067	564425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_563100_564400
829062	contig_11978_pilon	+	695	6	Intergenic	novelGene_63067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_5	2755.83806490875	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	27	617	1827946	1831883	FALSE	5	CCTGCCTGCCTCTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827919	1831961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
829064	contig_8558_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_123158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCACTGCAAGTGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422121	422901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_422100_422900
829067	contig_4103_pilon	-	1197	2	Intergenic	novelGene_51940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	576	890	95561	94975	FALSE	15	CTGCTTTGCCACAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDYICPCLQVLTVLCNVAEKGPAYCQRLWPGPLLLSLLDTLAFSDTEVVGQSLELLQLLFLYQPEAAQAFLQQSGLQALERHEEEAQLQHRVRALRETALHG	96136	94667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360
829068	contig_10436_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_108464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62246	62943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_62200_62900
829070	contig_2215_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_163878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTATCCCTTTCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403357	401902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_401900_403400
829072	contig_6069_pilon	+	816	4	Intergenic	novelGene_8031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	140.485665540019	492	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	71	607	191950	193647	FALSE	0	GTTGTGTGTCGCCGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVGYQHGRTVFDIWVRSGVLDKMLKDRQETKTKACDVSGPSLHLSTPCRPPPRWASLRPLHPHSQAAPEGHSGRPAGTLAGPAPPSGLPPPVTLPHPGAGPPRQVLTCPNASFTDLAEIVSRIEPAKAATVDDESDYQTEYEEELLGVPRDTFTDFQGTPVQEDSDSEYEPSLRQRLHPGLASPASSRDLSPPSFSDQDG	191879	193856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_192196_192360_192446_193297_193402_193545
829074	contig_6862_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_63767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTCAGAGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580481	579847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_579800_580500
829075	SIRV6	+	261	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	166	-220	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGTATAGTGGACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1500_1700
829078	contig_4952_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_145529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGACAGCGATAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416722	416007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_416000_416700
829080	contig_7009_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_23592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATACTTTATTGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382196	383034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_382200_383000
829081	contig_15219_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_40848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTGTTGCGGAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64287	62513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_62531_63849
829085	contig_4659_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_118212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCATTACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506042	506993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_506000_507000
829086	contig_11823_pilon	+	667	3	Intergenic	novelGene_171032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	3.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGTGTGGCAGGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88104	89624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_88453_88743_88881_89442
829088	contig_4686_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_118540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501415	501948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_501400_501900
829089	contig_4426_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_15444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTTTACAATTCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844909	845876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_844900_845900
829090	contig_4305_pilon	-	791	3	Intergenic	novelGene_136662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_1	2.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	14	400	507008	506622	TRUE	20	CTTTTTGAAGTTTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEIGMATEGDVELELETETSGPERPPEKPRKHDSGAADLERVTDYAEEKEIQSSNLETVRSAGSVTGGLRAEGAQRLSLEARAPGLGPDPVAGVGKRVEPRETQLPPGARGLAKRSLMEIGLKVDLVCTVLN	507021	505767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_505919_506055_506108_506433
829091	contig_10857_pilon	+	787	6	Intergenic	novelGene_160876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1811.41200172683	25	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	80	787	21903	66895	FALSE	5	CCATGCGCTGCCTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAASDPGPGEQEELLRLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEPPCTPLTPTIIAVTSFCSWTLQLSPFHPSPQLCFSPREEERDALNCWHRAGSPECPRRQRTEALPEQNKAWQPAGPQGSTGDLRLCSGPCIPPCPLLHPSAPANLLCVIKLPCV	21823	66895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21954_58782_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61463_66553
829093	contig_18592_pilon	-	634	2	Intergenic	novelGene_114775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2399	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAACATGAGGGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13104	1377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1645_12737
829097	contig_16714_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_161573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	1636	1965	872013	871684	NA	20	TCGAAGGGGATCCTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTDYGSQKFRDLQKVPRPVFSRTFLLGLYPGGGTASVICGCFSHCGNLEAKEMREKYTHDANFINHRVFMDPRRCNLFNSKSGKIPLSPTQVNGNRCSMVEHWQECIVS	873648	871681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_871700_873600
829101	contig_7976_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_169420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTACCACAATAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862779	864262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_862800_864300
829102	contig_12019_pilon	+	2291	15	Intergenic	novelGene_87713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	30.2871461925649	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	259	1467	317600	395056	TRUE	30	AGCGCATTTTTGTAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLLTAETKKLASVDGRPKDHRQSSSSRSQDSAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLLSATGQGNPEESPQQGACHEASMQLEEMGVHTPGASQPSALDHSRRVGYPPGLPTTNSQSHPGTLTHTTSPHPGGAEEEGDRSGARSRAPPTSKPRAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQEQQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNGFDDVRFLGPNVMEEQDLREIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSMPSWLDSLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVHLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQKPPRFSQLRCQDLLSQTSSPLSQNDSCTGRSADLLLPPVDTGRRRHDSLHDPGAHSRAERLRIQEEHHEAKLTLRPPQPGCPLRPCAELATSARETHLRVLWL	288639	401428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_288698_317399_317990_358508_358576_363961_364069_390144_390244_391583_391737_391898_392007_393339_393505_394936_395064_395391_395464_395635_395723_396410_396549_398336_398508_399527_399626_401177
829103	contig_2438_pilon	-	721	2	Intergenic	novelGene_112087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_1	0	613	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	66	518	464007	462434	FALSE	25	AAGACCCAGCTCATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVEPPNFSWVLPGRLAGLALPRLPAHYQFLWDGGVRHLVSLTQRGPPYSDTCPDLTLHRLRIPDFCPPAPDQIDRFVKLVDEANARGEAVAVHCALGFGRTGTMLACYLVKERGLAAGDAIAEIRRLRPGSIETYEQEKAVFQFYQRTK	464072	462230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_462620_463740
829105	contig_17964_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_33908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAGGTGAGAAGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382758	384221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_382800_384200
829106	contig_3380_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_60126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGGCAAAACGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454616	453766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_453800_454600
829107	contig_3380_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_60123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCTGAGGCCTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453631	453068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_453100_453600
829108	contig_14546_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_157440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGTATGGAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511068	509987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_510000_511100
829109	contig_2799_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_85482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACTATAATGCAAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499507	498056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_498100_499500
829111	contig_8866_pilon	+	279	2	Intergenic	novelGene_77846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTCTAAGCTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639975	641109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_640045_640899
829113	contig_10414_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_146937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	110	523	68663	68250	NA	20	CGCCACTGGGACTCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERRGCCLLTWSRVMGMRERRGCCLLTWPRVMGMRERRGCCLLTWPQVNRDETEKGLLSADLAPGDGDEREKGLLPADLVPGDGDEREKGLVPTDFVTANRLSRLASPFTSSRKLNTCKQGKPLAFDGAMNGRQCG	68772	67969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_68000_68800
829114	contig_2444_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_83751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTGGGTGAATCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188048	187026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_187000_188000
829115	contig_7410_pilon	+	1014	7	Intergenic	novelGene_106085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.34292020148	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	356	832	407113	411958	FALSE	10	GGGTTTTTTTTGGCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLRTVDRRGCVVVFVLLETWALRAERAKHAGQSSCRVTGGTEETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRSRSRSHSRSRGRRYSRSRSRSRGRRSRSASLRRSRSVSLRRSRSASLRRSRSGSVKGSRYFQSRSRSRSRSRSLSRPRSSQILMFFFVVARHQEVHAEVQVLKEWTEVLKFSF	405245	412140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406604_406784_407069_407247_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411855
829117	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
829118	contig_13481_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_119410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCCTGGCTGCAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644001	643635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_643600_644000
829119	contig_14814_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_137686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	259	687	51516	51088	NA	60	CCAAAAGAGAAAAATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGVSMGSERRERRVCRCSGAFHPGDRHREGSADPCPCPHCPSHPPLCGSFAVSCLLAQHAQPAGPGDVGGGAQCSACCFNTIPVCVHLGQRDRCSGQEAHLEGRSPPSAGQLAGSPAPPDDRAHWDIISSHRVCGSDPSC	51774	49660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_49700_51800
829120	contig_10324_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_7819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTTCTCTACTATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233360	234936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_233400_234900
829122	contig_1143_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_86632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286879	1285583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1285600_1286900
829123	contig_6496_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_103506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673186	674762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_673200_674800
829127	contig_6479_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_160613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAGAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598317	596753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_596800_598300
829128	contig_11171_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_48523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26441	24688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_24700_26400
829129	contig_7657_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_30014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTGTGAAACAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134367	133624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_133600_134400
829130	contig_1594_pilon	+	1301	8	Intergenic	novelGene_138795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	11.8528391501094	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	230	1240	191727	256701	FALSE	15	CAGTGTTTGTTACTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIGCSVSRPVCGPLDLPRSLPVPRPFSLLSSLVFGRVSDFHFPTLRRLPQYQFALYLFPAVFCPVLRGPLSLNLGPMVLQSLPSSGVAFRKILSHFPEELSLAFAYGSGVYRQAGPNANQKNPMLDLVFTVDDPVRWHSKNLKKNWSHYSFLKVLGPRIITTIQNNFGAGVYYNPLIKCDGRLIKYGVISTSILVEDLLTWNNLYIAGRLQKPVKIVAMNENATLRAALDKNLKSAVNAAFLLLPESFSEEELFIEIARLSYSGDFRMVVGEDKTKVLNIVKPNIVHFRELYGTILQENPQVVHKIQQGRLELDKSPEGQFTQLMALPKTLQQQINHIMDPPGKNRDVEETLFQLANDPDCSEVVRLGLSAIVRPSSVRQSTKGIFTAGMKKSVIYSSLKLHKMWRGWLRKT	191497	256762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_191862_194310_194494_199775_199869_208914_209066_233142_233289_238756_238923_240170_240234_256627
829131	contig_401_pilon	+	1372	10	Intergenic	novelGene_42902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_7	171.699349639615	26	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	35	1036	1929703	1943914	FALSE	35	ATCCCCAGAATACGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSAYEHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKKTCSDPKSKPPFLLEKSMESSLKYINKKFPNIDIRNSTQHLGPVHREKSEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANR	1929668	1944250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853
829132	contig_8312_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_152884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGAATAGCACACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267700	269639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_267700_269600
829133	contig_3604_pilon	+	619	6	Intergenic	novelGene_139992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	833.13994022613	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGCCTGTGTCTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45390	51565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_+_45487_47477_47503_47611_47666_47849_47925_48032_48091_51254
829135	contig_9871_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_75715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGCTGTGGGGCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586264	587225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_586300_587200
829138	contig_6589_pilon	+	1217	10	Intergenic	novelGene_26224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	207.085060354972	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	15	677	2048791	2056424	TRUE	10	GACTTGGCTCAGCTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVKMAAAEAANCIMEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHCTALTCLASRMWPSRSRWWTWWTPSSWSLTPAS	2048776	2060057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055191_2056137_2056226_2056323_2056427_2057347_2057499_2058203_2058313_2059779
829141	contig_11136_pilon	-	1693	14	Intergenic	novelGene_169019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	13.567713154275	5	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	271	903	135067	132314	TRUE	45	AAACCATTAACAGTGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESPEGEHPSVTLFRQYLRIRTVHPEPDYGAAVAFLEERACQLGLGCQKVEVAPGRVVIVLTWPGTNPTLPSILLNSHMDVVPVFKEHWSHDPFEAFKDAEGYIYGRGAQDMKCVSIQYLEAVRRLKAEGRRFPRTIHMTFVPDEEIGGHKGMELFVQRPEFQALRAGFALDEGLASPTDAFSVFYSERNVWGTDHMFWEARPWLAFH	135754	130477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_130902_131044_131125_131743_131813_131909_132055_132156_132207_132291_132366_132712_132768_132867_132958_133047_133125_133433_133529_133812_133918_134004_134070_134973_135086_135502
829142	contig_12625_pilon	-	810	3	Intergenic	novelGene_140489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	32	463	58369	44461	FALSE	20	CTATCGCTGGCATACCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADDYHPEENRMKMSRGIPLNDQDRIPWLYKLHGILLREIASGERVVLACSALKKMYRDILIRGKDGTPRKHDKLGKEEEPPEVKLFVVHLSGSFEVISGRLLKRKGHFMPPKLLQSQFNTLEPPSAPENFIQISVDKELSEIITTIMEALKVQ	58400	44113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_-_44813_47303_47348_58333
829143	contig_7612_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_170358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGGTGGTGCCAGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58691	58393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_58400_58700
829144	SIRV6	+	352	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3048	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
829145	contig_15276_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_176895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGCACATAAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43727	41766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15276_pilon_-_41800_43700
829146	contig_6823_pilon	-	1837	2	Intergenic	novelGene_131230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAAAAGAAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295208	292982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_293443_293831
829148	contig_6954_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_64466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATACAGTATGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877466	875869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_875900_877500
829149	contig_5539_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_104757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	958	1338	92392	92012	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVRWAVKSIRFLVFILTYQHHLIFDHFLLPRNIFFHLASRKNYFLNVVDVRGPISLAIIPMSPLGVSSHLPNFQRLGMPQNPVCRPFVFPHHTHSHGNLIQSHGSKATYMLMTSKHYLQPGCLL	93349	91877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_91900_93300
829150	contig_15410_pilon	-	1884	9	Intergenic	novelGene_130631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	116.874866310084	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	71	1384	158709	149128	FALSE	5	CAGGCCTGGCTTCTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPDVREDSISLTWSGLTLPGRAMFARGSRRRRSGRAPPEAEDPDRGQPCNSCREQCPGFLLHGWRKICQHCKCPREEHAVHSVPVDLERIMCRLISDFQRHSISDDDSGCASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDKVPYVNSSGEKYRIKQLLHQLPPHDSEVHYCTALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGTVRIFPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGLGACWHPQCFVCTTCRELLVDLIYFYHAGKVYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAEGRHWHMGHFCCFECEASLGGQRYVMRQSRPHCCACYEARHAEYCDGCGEHIASGQNPLLQGPAAAAGTQAQSPHRSRPPQPLSLLSRGHRRRPPKAPAPSQRLLQVLRSPSAFCEGLPTATPCLSWGSEVPPSHPASQTRAWKTVPSAATAPRASASATLWCLREARGGP	158779	148627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_149332_149929_150085_151037_151225_151304_151509_153192_153331_153861_153976_156059_156244_157198_157285_158667
829152	contig_3424_pilon	+	2273	3	Intergenic	novelGene_55519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_1	72.5	19	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	243	560	237586	241470	FALSE	65	TTCAAAACCAAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENFDIEAPNYLSKESEILLYAKQDSQCVDCFQAFLPVHYRYHRPHSKDGETFIVVNNPDLLMYCDQEFPILKCWAQSEVAAPCALRNKDICQWKNMKYKSVS	235083	243183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_235320_237579_237794_241360
829153	contig_6277_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_80395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAACCCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173429	172246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_172200_173400
829154	contig_9389_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_83971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	22	360	335616	335278	NA	50	TTTAAACTTAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCCRICWMDSLRAGSYSSIPEKRCHGSGRALRPRAPTDDCCFLSVHPTVHPSVCPTLCLGHGGATGSGLQLQGRTQTCPPESPVPARWGRVTLTHYEANLVGKAVCWLNTAAPPGVQGG	335637	333652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_333700_335600
829155	contig_16883_pilon	-	1600	3	Intergenic	novelGene_161713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTCCATGTGTGAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21362	9913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_11097_15569_15760_21135
829156	contig_2476_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_157646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAATCTTGGCACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499466	499865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_499500_499900
829157	contig_2476_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_157647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499815	500702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_499800_500700
829159	contig_4364_pilon	+	287	3	Intergenic	novelGene_572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15276.5	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACCAACTGGGACGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530453	1531198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531009_1531096
829161	contig_11719_pilon	+	350	4	Intergenic	novelGene_154751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3152	junction_3	1646.94835647293	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	14380	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	14379	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14504_16247_16326_19126_19183_19997
829164	contig_10005_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_148921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	180670	180368	NA	10	CCAGTCCTGCGCCATGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGRLCPSDAAYAATPVPAPVPSPTSLPLPLPPPPGGSEGRLPGWPRRHRCRISRLSAAAPGRGSPAAESLGASVLALLPSPRVLEKRQRPGNGASRFQR	180670	180011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_180000_180700
829166	contig_6434_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_61857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTAAAAGTAAGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809218	807543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_807500_809200
829167	contig_2940_pilon	+	1967	9	Intergenic	novelGene_82009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.7399438934734	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	1373	1966	1349613	1365682	FALSE	65	AACTGAAAAAGAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKKCMEFISLPLANKLTSASKDSLSTHTSPSHSPTSVHGSRRGSISSMSSVSSVLDEKDDDRIRCCMHCKDTLLKREQQIDEKEHTPDVVKLYEKLRLYMEKVDQKAPEYVRMATSLNAGETTYSLEHANDLRVQVQKAYELIDALSKKILTLGLNQDPPPHPNTLRLQRMVRYSATLFVQEKLLGLMSLPTKEQFE	1338517	1365683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1338596_1345715_1345857_1348347_1349382_1349493_1349656_1352031_1352274_1353882_1353954_1362242_1362330_1363275_1363379_1365634
829168	contig_8447_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_69453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTCAAGTTTTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198066	197097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_197100_198100
829170	contig_5718_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_110380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCAGGCAGAACAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179615	1179312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1179300_1179600
829173	contig_7078_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_130137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATGAGAAAGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166822	168961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_166800_169000
829176	contig_500_pilon	-	827	5	Intergenic	novelGene_31093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	330.454611104158	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	37	405	1510494	1500493	FALSE	20	TAATGCTTGCCTCACGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRGAASAAAGAAMPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRRERQRCRRAFHM	1510530	1500070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500524_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
829177	contig_9438_pilon	+	2325	14	Intergenic	novelGene_154263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_13	27.6972217862109	24	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2274	51	2324	58808	205444	FALSE	35	TTGAACAGCTAAAGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKNRKRLNQSAENGSPSLSAASSPAGASAPAGPGSAAAAGTLAVTNFIEKDDKVPKTFRNSLVQFGLNTMKSANICIGRPVLLTSLDGKQEVYTAWPVSGFPGGKVGLSEMAQKNVGVKPGDAIQVQPIVGAVLQAEEMDVALSNKNIEINEEELTGCLLRKLDGKIVLPGNFLYCTFYGKPCKLQVLRVKGTDGMILGWPQNDSDTGNQEVTSKQSSMEASSLDMALQLSRLGLEEPWEPASSSTPCKPVDDRIINKADDILLDVAQNPGEHSGLGLQEVTGLKCSVESAREGNEQLINEERLLKAASMGAKCNTDNFYFISSTTRVKFAKIRTNSKEQDNQFKVTYDMIGGLNSQLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPPPRGVLLYGPPGTGKTMIARAIANEVGAYVSVINGPEIISKFYGETEARLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLTLMDGIGSEGSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAEDRLDILQKLLRKVPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKALCNEAGLYALRRVLKKQPNLPDSKVARLVKITLHDFLKGMNDIRPSAMREVAIDVPNVSWSDIGGLENIKLKLKQAVEWPLKHPESFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAVKGPELMNKYVGESERAVREIFRKAKAVAPSILFFDELDALAVERGSSSGAGNVADRVLAQLLTEMDG	58757	205445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_58968_65252_65375_69522_69681_72845_72905_73592_74238_75165_75296_76343_76401_77717_77842_80567_80824_107750_107906_150641_150852_172893_172948_174899_174980_205380
829179	contig_8864_pilon	+	1717	2	Intergenic	novelGene_135998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692574	696514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_694168_696390
829180	contig_15020_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_87400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGCTTAAGAAACTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87003	87595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_87000_87600
829181	contig_9739_pilon	+	556	3	Intergenic	novelGene_165096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	97.5	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTCACAGGGGCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204589	225149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_204672_206141_206286_224819
829183	contig_5669_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_86087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTGAGGGTCTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199046	197414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_197400_199000
829184	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	20	36	20	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
829185	contig_16907_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_87491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTAGCCTGAGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578925	578086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_578100_578900
829186	contig_15135_pilon	-	1346	3	Intergenic	novelGene_119876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1226	junction_2	25.5	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	123	350	85374	81326	FALSE	45	AAAAAAAATACTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKVRLCEVTSLLTPLM	88185	80329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_81518_85338_85411_88099
829187	contig_16091_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_112343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAGAACATGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6938	7535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_6900_7500
829188	contig_16091_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_112344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGACTTTTAAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7485	9078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_7500_9100
829189	contig_4125_pilon	-	1505	13	Intergenic	novelGene_25073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.4513458484077	2	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	80	1012	458229	455455	TRUE	5	GCTTTGCTACCTCTGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDRCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKAPIYFSTGLTEKANHYYKLFITWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLIGQAEPEHVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQEFRVNCYMPANGETVTLPTSPSIPVGISLGLLKREMAQGAGAG	460410	454773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_455047_455161_455292_455364_455472_455778_455887_456022_456186_456291_456382_456557_456642_456965_457156_457241_457307_457544_457684_458069_458105_458187_458287_460388
829192	contig_3964_pilon	-	1071	2	Intergenic	novelGene_174200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	68	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	47	385	78653	25886	FALSE	55	GGAAAAGAGAGAAATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRGWYALGGESLMAEEESDQEAERLGEELVAIVESPPGPERLRAAGDGGGSAGGGSCGGSGVGISSRDYCRRFCQVVEDYAGRWQVPLPQLQVLQTALCCFTSASASFPDECEHVQYVLSSLAL	78699	25199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_26036_78464
829193	contig_14333_pilon	+	1108	6	Intergenic	novelGene_49156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	73.3686581586443	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	98	574	447369	494185	FALSE	30	TCAACCCAACTCTGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGASSSFGTLCFQWLLLFGLLGPVLDGARPGFQQTSRLSSYEIITPWRLTRERREAPRPYSKQVSYVIQAEGKKRIIHLEMNKDLLPKDFVVYTYNKEGALISDHPNIQNHCHYWGYVEGVSNSSVALSDCFGLSNFAVLVAQWLRDRLLPKRPAV	447271	494719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_447466_470473_470572_483946_484006_487545_487625_493959_494037_494118
829195	SIRV6	+	158	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	787	51	787	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11024	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
829196	contig_10451_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_138323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCAGGCCAGGCCACGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314354	315981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_314400_316000
829200	contig_6842_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_130656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAGGAAATTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249418	251242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249400_251200
829201	contig_2798_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_119998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGATCTTTTAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79652	81312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_79700_81300
829202	contig_9995_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_47792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGTAACTTATGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776077	777434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_776100_777400
829205	contig_15838_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_174337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACCATCTAGTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209968	210252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_210000_210300
829206	contig_5954_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_28564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	165.5	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTTTCTTTTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862009	862886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862119_862204_862307_862602
829207	contig_9468_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_59494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	77	325	319950	320198	NA	90	AAAAAAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319873	320243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319900_320200
829208	contig_17833_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_174608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210508	209701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_209700_210500
829210	contig_5643_pilon	-	852	3	Intergenic	novelGene_39177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	9.5	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	64	588	784100	776516	FALSE	10	TCCGTCTGATCTTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSQWGNYLWRNPHPESCPGKMWWLLLCGVLQAFPTQGLVLLAQRLPQKLTSPGYPEPYLKGQVSTTDIEAPEGFVVRLVFQDFDLAPSQDCEQDSVTITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGECPSWGYREGNHFPQPWPLGNLRELERQLRLGA	784163	776251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_776810_783328_783558_784098
829212	contig_6479_pilon	-	2253	8	Intergenic	novelGene_160609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTGTGATCCTAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220695	135716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_136106_178394_178507_195652_195742_205869_205961_209017_209155_212867_212986_217963_218056_219470
829213	contig_4156_pilon	-	1079	2	Intergenic	novelGene_88089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTAGATGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243232	240601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_241257_242808
829214	contig_17768_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_140398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	179	532	66171	65818	NA	35	GGCCACATAAGAGCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSLWLSPVIDYSSEKEQAWKTKLDKARLCDWRAHGLITSPSSSAGSALPLQNRLQVYTPTLARLPFTIWVPALPSGPGKSPRLGASCQCAGSLAAHSAPPRQRLRGPLRLTLGYC	66349	65737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_65700_66300
829216	contig_12227_pilon	-	2107	15	Intergenic	novelGene_127393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	31.2237644973785	12	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	41	1441	105717	66609	FALSE	45	TTGACGTGTAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRWGFLIGFLGVLCLLSSGHGGQQPPETAAQRCFCQVSGYLDDCTCDVETIDRFNNYKLFPRLQKLLESDYFRYYKVNLKRPCPFWNDINQCGRRDCAVKPCQSDEVPDGIKSASYKYSEEANNLIEECEQAERLGAVDESLSEETQKAVLQWTKHDDSSDNFCEADDIQSPDAEYVDLLLNPERYTGYKGPDAWKIWNVIYEENCFKPQTIKRPLNPLASGQGEENTFYSWLEGLCVEKRAFYRLISGLHASINVHLSARYLLQDTWLEKKWGHNITEFQQRFDAILTEGEGPRRLKNLYFLYLIELRALSKVLPFFERPDFQLFTGNKVQDAENKMLLLDILHEVKSFPLHFDENSFFAGDKKEANKLKEDFRLHFRNISRIMDCVGCFKCRLWGKLQTQGLGTALKILFSEKLIANMPESGPSYEFHLTRQEIVSLFNAFGRISTSVGELENFRNLLQNIH	105757	65942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_-_66670_68247_68382_68468_68556_73123_73194_73661_73909_76756_76850_76982_77012_81585_81637_83991_84113_89221_89296_89382_89460_92291_92331_98295_98380_99129_99250_105603
829217	contig_2069_pilon	-	712	3	Intergenic	novelGene_23529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	470	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGCATTGTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509820	1508370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509147_1509754
829218	SIRV6	+	293	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	162	19	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
829222	contig_8914_pilon	-	666	4	Intergenic	novelGene_112871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4224	junction_1	1483.93628195044	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	141	629	267367	264566	FALSE	5	TTTGTGATGCTGTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	267507	264528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319
829223	contig_10372_pilon	+	1545	3	Intergenic	novelGene_112507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2.5	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	245	436	18729	19385	FALSE	5	CTCCCTCTCATGCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESTEALASPQDTLSVPPLVEARDPSAEDTAVLPTVLGSRQCFLYPGPGGSYGFRLSCVASGPSVFISQVTTGGSAARAGLRMGDMILEVNGCPMGRQNDPERLQQLFEAEPPLCLKLAARSQQGLEAWIPSKSGEDWAQASDVL	18353	20494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_18559_18689_18891_19355
829224	scaffold_13505_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_111388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACACCTGTGTGGCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132509	131840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_131800_132500
829225	contig_16103_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_118774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCCCTGCCACAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501592	500141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_500100_501600
829226	contig_14795_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_176897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTTTTGTGTTGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67235	67718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14795_pilon_+_67200_67700
829229	SIRV4	-	412	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	202	3	-202	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTCAACAACTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
829231	contig_3233_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_56516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCTAACTGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146556	147515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_146600_147500
829232	contig_10549_pilon	+	1634	1	Intergenic	novelGene_110605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTCATCAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154824	156458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_154800_156500
829233	contig_12391_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_103590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	10649	10347	NA	20	CAAGTTTGAACTCCTTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SADQCLPEESGSYGARLVIDSGALLLQVKLQKKEGSGEIWLQRALPLVWSRWQNIPGGGEETPRFGIVQVRWVPIESTALGCFVGALLLLREADRTFGLL	10649	10205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_10200_10600
829236	contig_8156_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_98907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	24	392	100845	101213	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEVYTCMCFLIDMVNVSLELKDPKGKEGTGSLARYGFIGIILLLIMVIVMPIIQAFFCISVEQKLQSGSPEAACGLQVPRWLYTVLFKSLNSLLHQSKWVRLCCCNKPVAVASIPTHRDPIGQSRIAP	100821	103339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_100800_103300
829237	contig_13894_pilon	+	442	5	Intergenic	novelGene_62167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2371.83773686144	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525761	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_525799_526477_526575_526851_526939_527459_527580_528072
829239	contig_2924_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_140260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	187	537	73607	73257	NA	40	TCTCAAAGAAGATCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTKELIFSPSLPPYLSFSIPFCVGHLAGTSIGKDWSGFYQSTSHLLHHLLSSRWKHTIALPFITCLTWTNLDTPRQNSGLVKISTTYAGALWLIQRNPQAKDLHSLYSSGIGAV	73793	72092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_72100_73800
829240	contig_4900_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_159048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504482	506129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_504500_506100
829242	contig_14142_pilon	+	1215	3	Intergenic	novelGene_120510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5.5	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	199	600	345676	348484	FALSE	35	TAAAAATGGCTACCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKATSTRVRRPRRTSPMMRGSKMDRSLGQEKPSRKTRLQVSTNPKIGRKDHKASPDSCGCRDCRTQDWQAQEQESCSQTVKVPRLADKLIAPVPRTGGQTNRRQPQDPESKKPECLFIFRCMPRPLGNSLFN	345373	349099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_345464_345567_345789_348195
829244	SIRV6	+	372	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	293	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAGCAATCGGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596	2523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2026_2470
829246	contig_5302_pilon	+	1192	3	Intergenic	novelGene_81486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_2	81	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGTGCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319361	328724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_319962_320055_320109_328185
829247	contig_14744_pilon	+	1627	4	Intergenic	novelGene_66026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0.471404520791032	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGCCAGGTCACTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970160	980423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_970205_977395_977576_978768_978851_979102
829248	contig_15021_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_26993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	645	1016	404743	405114	NA	15	TGCTGCCACACTCCTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELELHARRCNSQRERAELLNRGTARRCDGFYRAVSLMWPHRRPTPTHGGFLLPGWCPVVCAQHRLLLHPDTISKTQCQTTVPRPPAALGSFVAEERGTEGKSHSTSHLAGKCKQRQQHEAL	404098	405116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_404100_405100
829250	contig_15114_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_121158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	315	614	151712	151413	NA	35	CACCCAGCAAACATTTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGHTFSEDRVQRSRDHIDGLHWSWGGPAVHQETAWMSWTGLGPKSGLATTSWDTWTQSSASLSQSPLLRGCHRLITVDGAFSGSLSTSNNHSHKLLL	152026	151079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_151100_152000
829251	contig_5684_pilon	+	483	2	Intergenic	novelGene_81027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGTAGTGCCTAGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351257	361363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_351692_361314
829252	contig_19721_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_99148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTATGTGCCTATTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18830	17966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_18000_18800
829253	contig_19721_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_99147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGTCTATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17508	16838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_16800_17500
829254	contig_10437_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_38344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATACACACATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506423	505494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_505500_506400
829255	contig_10437_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_38342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGGAAACCCCGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491264	490816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_490800_491300
829257	contig_6132_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_163618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	105	527	175723	175301	NA	15	CCTATCTCACTATTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPSLSFSRLFLNLPLRFFTRGFSWHSWWMMMLSSRSRMSISRSASSCSRRRNSSSWFFCCNAARVSSSSQVRSSCGQDGRHQREEWGTKHRGVLGVRPESPNSKCSWQPGELARPHRASVLLPPYFKFPAETASPVPS	175827	174813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_-_174800_175800
829258	contig_7057_pilon	-	974	5	Intergenic	novelGene_123293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	33.0340733183179	64	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	331	927	898135	897025	FALSE	5	GTTTGTTTCGTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEVSGKTGILFGAWSFPWTGIPVLGGAPSTQASWADLYQCGEPCRLMFCEEALLDRELCGLSSVSLDFPDCEPFPPGRHAPLLRVHGPTLRSPLD	898465	896977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_897359_897464_897540_897628_897703_897944_898000_898076
829259	contig_16776_pilon	+	820	3	Intergenic	novelGene_130503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCATGCTCCCTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34679	57930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35251_41389_41530_57821
829260	contig_1262_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_133546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137766	137265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_137300_137800
829262	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
829263	contig_7866_pilon	+	506	3	Intergenic	novelGene_171199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACCAACACTGAAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415938	418645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_416183_417897_418022_418507
829264	contig_7866_pilon	+	517	2	Intergenic	novelGene_171203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	77	388	422453	422914	FALSE	20	CCCAGCCCTTTGAATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDISAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPNYLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF	422376	423043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_422508_422657
829266	contig_6397_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_146232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	28.6094390018399	134	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	76	687	281230	272223	FALSE	10	CCCTTTGGCCTACTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRQPDKALTLSFHGWSGTGKNFVARMLAENLYRDGLRSNCVQVFIAMFHFPHPKYVDMYKEQLTSQIQEKLHPGLLEALEPHLERRAPKANRAKTPRTIFLFLSNLGGNIINEVVLNLLKAGQAREEITMEHLEPHLQAEIVESTDSGFGHSCLVKENLIDFFVPFLPLEYRHVRLCARDAFLSQELPYTEEALDEIAKMMSYVPKEEQLFSSQGCKSISQRINYFLP	281305	271552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_272474_273211_273337_279118_279223_279270_279298_281125
829267	contig_11708_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_138966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACCCCAATGAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250331	252389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_250300_252400
829268	contig_5799_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_50255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	348	665	195307	195624	NA	10	GTGTGTGTGCATGTGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLLQRPSITFSFKTLNRGWKSSQQCTAMLLSAPSPQDSEACAGKLGWNACFGAHSGTAVSAIEPGHPGMECTVLPDREHSGCLRNSSLSGLLMQRKAPFPFSLL	194959	196779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_195000_196800
829269	SIRV6	+	394	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	12	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1856
829270	contig_19974_pilon	-	1997	2	Intergenic	novelGene_130488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	511	junction_1	0	39	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGAACTTGGGTTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346522	343623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_344869_345770
829271	contig_4845_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_53659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTTCTGCTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507357	506926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_506900_507400
829273	contig_10569_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_44067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCCGACCTTTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243798	245141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_243800_245100
829274	contig_19352_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_122399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	136	300	269569	269733	NA	35	CAAGAGTAGTGTTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCFRLRGGKAAAIPNKTQELVCDSSAWIPPVPKLSSRSFLGRSCPMFEPFFPRQEGGLKAASWGLFVITVLLSVKGGDGACAGLSPHPSEELLMLTGYA	269433	271182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_269400_271200
829279	contig_1244_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_38056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTCAGTGTTCATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040500	1040120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1040100_1040500
829280	contig_1244_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_38055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAAAATTTGCATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040120	1038334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1038300_1040100
829282	contig_7707_pilon	-	912	8	Intergenic	novelGene_72139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_7	47.1406925910002	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	14	844	165221	116934	FALSE	25	AAATTACTTGTATTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRREDMMAKKPPKPAPRRIFQERLKLTALPLYFEGFLLVKRPEYQYIDKLDIIDLTCLSDQNSTEKNCAKFTLVLPKEEVQLKTENTESGEEWRGFILTVTELSVPQHVSLLPGQVIRLHEVLEREKKRRIETERLPSTSVEKEKETTEDYVDLLNPMPACFYTVSRKEATEMLEEKPSWGNMILRPGSDSRNYSITIRQETEIKHYKVTSIGKNYTIELEKPVTLPNLFSVIDYFVKETRGSLRPFIYSTDDKVGQKPKREERRERLKKNPHNA	165234	116865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_116996_122192_122290_132319_132381_138299_138429_140066_140240_144963_145021_147676_147791_165083
829283	contig_15543_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_164361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTGGTTAATACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199764	201437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_199800_201400
829284	contig_7962_pilon	-	2255	11	Intergenic	novelGene_149318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	18.7232475815495	160	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	95	2017	464292	453973	TRUE	45	AAAATAAAGGTTTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQQRHPLLEVKGNKAPSRLPLPGSRLKRGPDQMDNALEPEKKRIRGLGTVTKIATSHPRAPPLTSVPQTQGQTTAQKVPKKTGPWCSTAITTVSKSKKPVAAVPAQKPDTSAVPPMVGGKKPSKRPAWDLKGQLGDLNIELKRYRERTQTLDQENQQLRAQLKEAQQEAKALGEERRTLKEELAKVQAQAKQGQQELGNLSARVLELEERLGMQEGLVQELQKEQLELQEERRGLAARLEEQERRLQASEVALSSSQAEVASLRQETAAQVTLLAERGERLHGLEMERRRLHNQLQELKGNIRVFCRVRPVLPGEPTPPPGLLLFPAGPGGPSDPPTRLSLSRSDERRGTLNGAPAPTTRHDFSFDRVFPPGSGQEEVFEEIAMLVQSALDGYPVCIFAYGQTGSGKTFTMEGGPGGDPQLEGLIPRALRHLFSVAQELGDQGWTYRFVASYVEIYNETVRDLLATGARKGQGGECKIRRAGPGSEELTVTNARYVSVSCEKEVEALLYLARQNRAVACTAQNERSSRSHSVFQLQITGEHTGRGLQCGAPLNLVDLAGSERLDPGLALGAEERERLRETQAINSSLSTLGLVIMALSNKESHVPYRNSKLTYLLQNSLGGSAKMLMFVNISPPRRERL	464386	452763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_452971_453941_454019_454164_454239_454334_454626_455303_456084_456833_457235_457439_457491_457611_457666_459738_459839_459974_460089_464280
829285	contig_6027_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_74432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	534	857	241896	242219	NA	70	CACGATAAAAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLIIIVVIILQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPLGEGTFCALGLARDGGGGLVSSWEIEEPAWLVGEPDGINFLAPDSPRPGPPALAKLQVTTSLPV	241362	243174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_241400_243200
829286	contig_15114_pilon	-	989	4	Intergenic	novelGene_121194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTAGAATACCTGACACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758915	748662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_749195_753186_753266_754479_754644_758701
829287	contig_11427_pilon	+	1337	2	Intergenic	novelGene_78971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	149	junction_1	0	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	273	1310	93223	94260	FALSE	25	TAATCATCAACTTTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNYTAAPDYEYDVLIEGDLKYDDLEQCDKYDGRALSPQLAPMLCSVFVVCLLGNLLVVLILVKYKGLRQVENVYFLNLAFSNLLFSLTLPFRASAALSGRIRGDPMHTILIGIYTIGLYSEVCFNVLLTVHRFLLQSSSSKACIVFRSILTSVLAWTMSVLISLPECVIYRPQMEGLEDKYSFYILHLLPANKTFWKYVLTLKMNVLGLLFPLFIFIFCYVQMRDRLTFRNSKNGLYKLVFTIMAIFLLMWAPYNIAIFLSSFKERFSLDDCKSSYGLDQGVQITEIIAATHCLVNPPLHVLFDQSFRRHLSHVLHLSKNTPVQPGKESGQDALRENHESSTGV	92302	94287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_92516_93163
829288	contig_5586_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_143514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCATTTGGAAAGATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252702	253261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_252700_253300
829291	contig_4388_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_161969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGAAGCTTCTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739761	738186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_738200_739800
829293	contig_6048_pilon	+	2033	14	Intergenic	novelGene_73208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	16.2458916062751	214	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	91	1899	1512212	1518811	FALSE	5	GCTTGTGGAGTGCTGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLSTRLLIQRGRPKSDRLGKIRSLDLSGLKLRSEHLDPKLLGRLRQLQELDLSNNQLDTLPANLGLSHLRILRCANNQLGDVTFLCQFPQLEELSLEGNPFLTVSDNLKVSFLLPKLRKVNGKEASSTSSQVENLNRELTSRVRMISEELVASGGTQVPKADNPERPVEAAAPHEPRTRLAALKRPDDAPLNLSPNKRVCTSPSAQVEGSPMGSDGSQAGLKLEPLHFLQCHSKNNSPRDLETQLWACAFEPTGEEGHSGATSQTVATCGGEAVCVIDCQTGIVLHKYKVPGEEFFSVAWTAVTVVTQAGHKKRWSVLAAAGLRGLVRLLHVRAGFCCGAIRAHKKAIATLCFSPTHETHLFTASYDKRIILWDIGIPNHDYEFQASQLLMLDTTSIPLRLCPVASCPDAYLLAGCESGCCCWDVRLDQPQKRRVCEVEFTFSEGSEASGQRVDGLAFVNEDVVASKGSGLGTICLWSWRQTWAGRGSQATVAVVVLARLQWSPTELAYFSLSTCPGEGIVLCGDEEGNVWIYNVWHLLSQKSPLPAAPQAPAQILKWPQPWALDQTVTKTMVNTVVANPTFTYLTALTDSNIVAIWKRQ	1512121	1518945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1512292_1512857_1513093_1513184_1513302_1514154_1514260_1514475_1514599_1514675_1514791_1515001_1515112_1515303_1515512_1516020_1516094_1516190_1516332_1517975_1518068_1518207_1518364_1518450_1518564_1518670
829296	contig_5832_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_134128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATAGGATTTCCAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180366	179590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_179600_180400
829297	contig_5988_pilon	-	1570	11	Intergenic	novelGene_15889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	89.9124018142103	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	522	953	530935	529953	FALSE	20	TTTTCATGGTATTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPIYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDETDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP	549429	529335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_530061_530221_530369_530603_530642_530796_530963_531071_531195_531641_531695_531805_531852_531991_532051_532177_532231_532430_532541_549379
829298	contig_10367_pilon	-	1292	6	Intergenic	novelGene_169460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	164.018779412603	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	72	1211	157654	131866	FALSE	80	AAGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRGGSPAHTKDEAAAAAPAAPAMLCYVTRPDAVLMEVEVEAKANGEDCLNQVCRRLGIIEVDYFGLQFTGSKGESLWLNLRNRISQQMDGLAPYRLKLRVKFFVEPHLILQEQTRHIFFLHIKEALLAGPLQCSPEQAVELHALLAQTEFGDYNQNTAKHNYEELCAKELSSAALNRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQSCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	157725	131784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133633_134055_134895_135061_137635_137822_156347_156539_157567
829299	contig_1008_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_121638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386706	1388099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1386700_1388100
829301	SIRV6	+	468	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	10	7	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
829303	contig_15551_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_176334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACACTTACTCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142311	143402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15551_pilon_+_142300_143400
829304	contig_11328_pilon	+	573	4	Intergenic	novelGene_88426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1629.17402385381	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644824	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645007_645268_645376_647077_647223_647899
829306	contig_14219_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_54382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTTTCAAAATAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066889	1065056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1065100_1066900
829307	contig_19990_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_30766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCTTCTACAGATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72591	72992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_72600_73000
829308	contig_8357_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_39673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTACTATGTTTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69067	68403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_68400_69100
829309	contig_14683_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_166057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCCAAAATAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174462	176232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_174500_176200
829312	contig_5075_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_174085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAATGACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605650	603898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_603900_605600
829313	contig_7189_pilon	-	1494	13	Intergenic	novelGene_117643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	74.8021000150842	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	932	1492	502025	277744	FALSE	70	AAAAGAAAGAAGATAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRSEELRKEARQLKRELLAAKQKKVENAAKQAEKRSEEEEAAPDGAVAEYRREKQKYEALRKQQAKKGTSREEQTLALLNQFKSKLTQAIAETPENDISETEVEDDEGWMSHVLQFEDKSRKVKDASMQDSDTFEIYDPRNPVNKRRREESKKLMRE	537357	277741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_277889_305602_305707_311080_311191_396531_396636_501927_502086_505132_505170_506191_506238_520890_520956_523229_523381_526773_526917_529072_529158_532684_532782_537110
829316	contig_12871_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_140378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGCAAAGGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36476	37185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_36500_37200
829318	contig_11136_pilon	-	819	4	Intergenic	novelGene_169024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	22.8958996814325	98	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	55	354	146932	144262	TRUE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAALFGCWFRVGGARSAMAGRVIPVGPTVVQTSMSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLPLHRAHR	146986	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137522_137734_137837_144255_144478_146848
829319	contig_11356_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_175258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGCAACACCAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10413	10842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_10400_10800
829321	contig_990_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_76111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAGGTGAAGATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443364	1445240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1443400_1445200
829323	contig_9931_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_134849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498014	499288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_498000_499300
829324	contig_6102_pilon	-	1388	8	Intergenic	novelGene_32407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_7	89.750220282829	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	112	1329	1824110	1819190	FALSE	35	AACACTGACTTAGAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLGRRALCALVLLLACTSLGLLYASTRSSPGLQAPSALWAPPQGPPRPQLPALTPEPRYAHIPVKIKEQVVGLLAQNNCSCESSGRGLSLLFQRQVQAFDFTKAFDPQELRAASAAREQEFQAFLSRSRSPTDQLLIAPANSPLQYPLQGVEVQPLRSILVPGLSLQAASGRELYQVNLTASLGTWDVAGEVTGVTLTGEGQPDLTLTSPGLDQLNRQLQLVTYNSRSYQANTADTVRFSTEGHEAAFTIRIRHPPNPRLYPPGALPQGAQYDISALVTIATKTFLRYDRLRVLIASIRRFYPTVTVVIADDSEKPELVSGPHIEHYVMPFGKVRNQRGRAAQGAVGGACGQSAASICLRITGVPARHADSWNVSSVGTRIVPILFAAASLEYCLTPSGHSRNS	1824821	1819130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1819597_1819737_1819837_1821722_1821904_1822045_1822087_1822948_1823056_1823180_1823346_1823892_1824112_1824711
829325	contig_5153_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_74386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATATACCGATAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984943	983793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_983800_984900
829326	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
829327	contig_1339_pilon	-	941	3	Intergenic	novelGene_163108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	254	634	255467	255087	FALSE	15	TGTGTCATTATTTTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRSSGLTCNHVPSPSPPKATSAQAEDPPSPLGALVKCLPVLSLAVSLWAVSPSSGYTALLQGALLCSAVGDICLIWPDAFLYGMAAFATAHLLYLAAFSFSPLQPATLLPVALACGPYYGLLLPRLPPDMALPLVAYALLLATVLWRGLVRGGSAGLGALLFTISDSVLAWDAFAQPLPHARLVVMTTYYAAQALIALSAVSGLRHKTN	257405	254779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_255470_256675_256848_257326
829328	contig_10300_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_152930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCTGTTGAGTAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144559	142451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_-_142500_144600
829329	contig_6445_pilon	+	1821	9	Intergenic	novelGene_77118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	79.3795274299362	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	170	721	1404526	1406432	TRUE	15	TCTGTTGGTGAAGAGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWNSSLQTNKEPVGILTSNHRNSWAKAYNTLIKDKVNRESVRSIQKSIFTVCLDAPMPRVSEDVYRSHVAGQMLHGGGSKLNSGNRWFDKTLQFIVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPVIALVDHVIAFTKKPEFVRSPMVPLPMPKKLRFNITPEIKSDIEKAKQNLSIMIQDLDITMLVFHHFGKDFPKSEKMSPDGSMGRHVPHMKAPPCACSTWAAQTPSAQLPWTHSPSSRPWMTPM	1403737	1409412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1403839_1404457_1404637_1405235_1405337_1405677_1405798_1406075_1406162_1406298_1406435_1406654_1406722_1407680_1407802_1408502
829330	contig_6005_pilon	-	383	5	Intergenic	novelGene_158901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2971.40560173128	59	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGGTTACTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369022	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366920_366967_367290_367391_367472_367547_368999
829331	contig_10511_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_126912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTATAACACAGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616308	618302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_+_616300_618300
829332	contig_3916_pilon	-	1045	4	Intergenic	novelGene_141858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	47.3380279362046	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86481	40644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_41365_50126_50177_62072_62139_86272
829336	contig_13481_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_119290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGGCAATTGTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186356	184981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_185000_186400
829339	contig_5954_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_28519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCGGAACCAGGTGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444095	443056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_443100_444100
829342	contig_7004_pilon	+	1521	10	Intergenic	novelGene_126485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	29.1615339399078	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	151	1365	405275	408168	FALSE	20	CCAGCTCCACACACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIFTQLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKFQEIPLGPLPAPSPKMMLGPLTLHLDGSLLAFLDFLCPQGPIRSILPMTFEAVKQDHGFMLYRTHLVNTFTEPTSFWVPNNGLHDRAYVMVNGVFQGVLERNIKHRLFLTGKMGDKLDVLVENMGRLSFGSNSSDFKGLLEPPLMGHVVLTQWLMFPLKIDNLVKWWFPIQLPKRSQPSTPSGPTFYSATFPILGLVGDTFLYLPGWSKGQVWINGFNLGRYWTKRGPQQTLYVPKPLLFPRGTFNKITLLELENVPPRPQIQFLDRPILNSTLYRTYLYSLSAGEQMELSGH	405124	408324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_405326_405432_405555_405663_405705_405918_406038_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
829343	contig_2739_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_165827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCTGTCCTTCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21441	22732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_21400_22700
829344	contig_10196_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_132338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	34	858	2446981	2452511	TRUE	5	CCGGGGCCGGGGGTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIESLLEQTLRSGLHLLSCPVHHADKGAAPHVEAQGLLGPLPCTADAHPGRSHHSWLGSRGATLHPHSPICGQVPLVEALVDGQCLAQLGGAVAELAILEGSARGAFPKGATEPLHGLQAPQGLQCSQQDTCPVPLAGDIQAEVHAIDDEHVQGARLHEHASVPGCLPAAPRVCRLILWAQVRLGLHNAAAELRVVSKPSHQDLSQKRPRQTNSWLIEKLRSQSGRMVLWAQEIDAALGACSSGRTQAGVWPRTGLLGGRRPGHVRQAPAPLCL	2446947	2456131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2447384_2449559_2449768_2452297_2452550_2456001
829345	contig_11702_pilon	-	978	5	Intergenic	novelGene_142000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	227.418529368211	117	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	70	882	509270	506100	FALSE	10	CGCCAGCCAGCTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPLPSTLAPSTQPLGPRSLALSAGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGVCPLYWRGPGLPPKHPVPRVPGPASPWPCPASSGHLPLTLCRGGQTGFLDLTPLPAPALA	509339	506003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506265_508312_508566_508678_508785_508880_509016_509116
829348	contig_4213_pilon	+	1689	5	Intergenic	novelGene_124828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	386	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTCTTCTTCAGTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176503	185340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_177638_178898_178998_179365_179570_181350_181468_185205
829351	contig_9053_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_87928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTTTCTTTGTTCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108665	107053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_107100_108700
829357	contig_2770_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_107417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTATTAGACATGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190974	191821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_191000_191800
829358	contig_5236_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_100974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	637	969	1040715	1040383	NA	5	CTGGCTCCTTCTAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQALCPVRQEAKHLVVSLVSAPPPTASTLWLPVAFPGESLTSSWPSWGSPWLLDGLPGGVPDFLMAFLESLTSSWPSWGSPPLPHSLLGAHRDSSLIGSLVPGSHTTCCR	1041351	1040380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1040400_1041400
829359	contig_12919_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_75915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACTACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809798	810286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_809800_810300
829360	contig_8576_pilon	+	419	2	Intergenic	novelGene_88807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAAAACAAGGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910630	917066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_910690_916706
829361	contig_14300_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_133115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCCCTGGCTCCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277621	278283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_277600_278300
829363	contig_8671_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_126293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959468	960481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_959500_960500
829364	contig_11656_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_53994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACGTCCTTTGTACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461512	460870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_460900_461500
829365	contig_15991_pilon	-	592	5	Intergenic	novelGene_70927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3638.99484748193	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	77	577	105108	100425	FALSE	45	ATGAGGTTGACGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCHRVGGNHHRVVLSCPCTV	106358	100409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100484_102080_102271_103583_103703_104975_105142_106315
829366	contig_4759_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_106343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	21	440	613098	612679	NA	65	AATAAAATAAAGAAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKRANICAQKCLKASDTSQRRKPPWCCLIGFLVVLFLSEGPVWQSWTRAELPEALLELWAAHGYSTPNAVVRVALDLISIACGSRGVGGLDQSLCKSLIPQHAPSPPFSLGVWELWSGLCSFPCQIPVLSVPSQQRG	613118	611860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_611900_613100
829367	contig_13702_pilon	+	1012	2	Intergenic	novelGene_102616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168907	194840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_168982_193902
829368	contig_15531_pilon	-	1224	3	Intergenic	novelGene_176725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	274	1095	288275	286705	FALSE	35	AAGAAATCTTTGTGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRKDIEKDNAGQVTLVPEEPEDMWHTYNLVQVGDSLRASTIRKVQTESSTGSVGSNRVRTTLTVCVEAIDFDSQACQLRVKGTNIQENEYVKMGAYHTIELEPNRQFTLAKKQWDSVVLERIEQACDPAWSADVAAVVMQEGLAHICLVTPSMTLTRAKVEVNIPRKRKGNCSQHDRALERFYEQVVQAIQRHIHFDVVKCILVASPGFVREQFCDYMFQQAVKTDNKVLLENRSKFLQVHASSGHKYSLKEALCDPAVASRLSDTKAYL	288548	286575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15531_pilon_-_286716_287131_287217_287549
829369	contig_20716_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_176137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGTTGTAGCTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127307	126777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_-_126800_127300
829370	contig_14483_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_133779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAGGAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201818	200852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_200900_201800
829371	contig_8801_pilon	-	1145	6	Intergenic	novelGene_66244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	45.0493063209635	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2	424	199005	193594	TRUE	5	CTCCTCAGCTTCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	199006	180722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_181615_181706_183962_184124_193584_193615_194487_194715_198830
829372	contig_5894_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_83054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCTTATTGAGCAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555008	554324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_554300_555000
829373	contig_5894_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_83053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGCGATCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554323	553070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_553100_554300
829374	contig_7593_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_127372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACATCATAGGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745210	744067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_744100_745200
829375	scaffold_12124_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_22198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGAGGAAACAACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346534	1345971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1346000_1346500
829376	scaffold_12124_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_22197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGCCGCTGAGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345322	1345014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1345000_1345300
829377	contig_8934_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_167251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCATTCTCTTATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791609	789911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_789900_791600
829380	contig_5799_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_50327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTTTACATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678561	678190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_678200_678600
829381	contig_10324_pilon	-	685	5	Intergenic	novelGene_7888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	1845.93694028263	248	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	4	597	583482	578583	FALSE	20	CATGGGTCTTACTGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAAFRDMEELSQGLLSLLGANRADAQQRRLLGHHEQVVDRLLEAQDSAERLLREILTTEKEVAQNLVDTKEKAHQGVAELQQLEAELQKASEEDTHLKANLFQLTSELEGLKEMEVDLQRQEREVDEDTTVTIPSAVYVAQLYHRISKIEWDYECEPGMIKGIHHGPSVAQPIHLDSTQLSKKFISDHLWSLVDTEW	583485	578494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_578690_578762_578840_578937_579043_579209_579355_583322
829383	contig_9883_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_87578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	77	643	63833	63267	NA	20	GATGGCTTTTTGCAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYRVTRCRHEVEQGCALLRATPLADMTPQLLLEVSQGLSRNLKFLTDACALASDKSRDRFSREQFKLGVKCMSTSASALLACVREVKAAPSELARSRCALFSGPLVQAVSALVGFATEPQFLGRAAAVSAEGKAVQTAILGGAMSVVSACVLLTQCLRDLAQHPDGGAKMLDHRERLRNSACAVSEGCTLLSQALRERSSPRTLPPVNSNSVN	63909	62628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_62600_63900
829384	contig_16098_pilon	+	888	9	Intergenic	novelGene_45914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	56.951185237886	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	88	663	321962	336013	TRUE	10	TTACCTGCATCCGTCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQNSSCWPCTPRPPASTVP	294779	337019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335460_335958_336034_336814
829385	contig_10467_pilon	-	1276	6	Intergenic	novelGene_175403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	2.71293199325011	210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	76	870	87398	29470	FALSE	40	AATATCCATATTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNGAAGHSHFGSRERILKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSCEGDLEVGKGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQSRIEQQQQQMRNSARTLNFVKHSSPKDKMSPASPMDDIERELKAEASIMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSENEECSSSPSDPGNYNSGHHTMSAMLQCKIPDMEASHNRFYDNSGLMMNTLRNDLQLSDSGSDSDY	87473	29063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_29517_58991_59253_62533_62680_64976_65114_77613_77709_87289
829386	contig_12119_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_88687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAATGCCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400470	402793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_400500_402800
829387	contig_10951_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_61624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145312	146402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_145300_146400
829388	contig_7004_pilon	-	753	3	Intergenic	novelGene_126436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	4	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3	470	59178	57497	FALSE	15	TGTCACATGTGTCAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLDKDSSLEAPRFFYLRVFLVEGSSPCPVSLLLTLSTLYLLDEHPAGPQAEPPPPAASGKASEKTAPLGPGPSVGVREQQPLSSLSSVLLYRTAPRDFRLVFYDEVSRLESFWALRVVCPEQLTALLAWIREPWEELFSIGLRTVTHEALDPDR	59180	57213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_57647_58331_58580_59108
829389	contig_8880_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_165761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGGGAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84402	84054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_84100_84400
829391	contig_5021_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_167097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTCATCATTCTGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301606	300662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_-_300700_301600
829393	contig_10734_pilon	-	1683	10	Intergenic	novelGene_51446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.3458488736833	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	108	965	2226326	2216993	FALSE	10	CTTAATCCGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMIITMNQTQGICPEIPDKTTVCQSDASCTTGSAGTHSNGVATGRCVPFNRTVKTCEVAAWCPLEDDTIVPTPAFLMAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPSFDTSYLKSCIYNAKTDPFCPIFRLGRIVASAGHSFQDMAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQDLISETDQ	2226433	2216274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920_2218017_2218269_2218336_2218461_2218550_2222650_2222788_2222878_2223021_2223122_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
829394	contig_6069_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_8038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	760	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATATGAAAAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319993	321398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_320000_321400
829395	contig_9185_pilon	+	1463	6	Intergenic	novelGene_166923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_4	7.1386273190299	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	213	830	885101	892686	FALSE	20	AAGGATGCCTCAGTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPPRSLLFVATVILLAHLSLARNLPEASPGSGMFQCLSHSQNLLRAVSDMLQKARGTLEFYSCTSEEIDHEDITKDKTSTVKACLPLELTTNGNCLASNETSSITTLCLSSIYEDLKMYQVEFKAMNAKLLMDPKRQIFLDQSMLTAMDELMQALNFNSETVPQTPSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTINRMMSYLNSS	884888	893319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_885117_885995_886142_889090_889205_889808_889851_890055_890200_892530
829398	contig_3832_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_161441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGTCACCAAAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118258	119140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_118300_119100
829399	contig_14546_pilon	-	1300	10	Intergenic	novelGene_157436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.628539361054709	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAGCAACTGCGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534201	498496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_498556_514545_514633_525339_525408_526577_526781_528372_528476_528723_528835_529060_529190_529581_529690_533730_534035_534073
829400	SIRV5	+	355	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	880	-30	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
829401	contig_2033_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_71550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCCAGGTCTTGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414504	414817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_414500_414800
829402	contig_12250_pilon	-	580	7	Intergenic	novelGene_80681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCAAGAATGTGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394994	392659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_392692_392910_393020_393216_393314_393881_393959_394330_394381_394686_394775_394867
829403	contig_11883_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_163777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	900	1220	107105	107425	NA	65	AAAAAAAAAAAATTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPARGWNGEAGWKGRQAGRGGRLEGEAGWKGRLAGRGGRLEGEAGWKGRLAGRGGWLEGEAGWKGRQAGREAGWKGRQAGRGGWLEGEAGWKGRQAGGPAHRRP	106205	107649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_106200_107600
829404	contig_4876_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_137923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654244	653000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_653000_654200
829406	contig_4364_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGAGAGTCCGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451076	1453054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1451100_1453100
829407	contig_6340_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_176635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCAAAAAAAGAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87207	87916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_+_87200_87900
829409	contig_11316_pilon	-	144	1	Intergenic	novelGene_122664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGGTATATTTATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139141	138997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139000_139100
829410	contig_4803_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_150733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAACCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93247	91481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_91500_93200
829411	contig_10225_pilon	-	1318	4	Intergenic	novelGene_86845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCCCCTGTGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40074	34910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_35785_37034_37142_38520_38662_39878
829412	contig_14209_pilon	+	907	8	Intergenic	novelGene_88347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	275.455837417447	1	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	322	654	35624	37768	TRUE	40	ATAAAGCTTGAATTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGQKRRSPQAPAGRLDIGVEHVGDCERLAKQCQLWDLLSDLEAKCEKVFEFVASKPGTCVKVLTIEPPPADSRLQEDLALLADCALPPRAPWRSGGASLPLPRWLQQLP	32365	40993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_35209_35355_35503_35664_37100_37218_37300_37421_37712_37812_37909_38028_40901
829413	SIRV6	+	440	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	346	514	173	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
829414	contig_18618_pilon	-	1240	11	Intergenic	novelGene_148303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	31.553763642393	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	741	498	1238	53660	39802	FALSE	35	CAACACACACTATGGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIWKIGPALSCGNTVIVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGQMIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVFADADLDNAVEFAHQGVFYHQGQCCIAASRLFVEESIHDEFLRRSIERAKKYVLGNPLTPGVNQGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFIQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKRA	83452	39799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18618_pilon_-_39865_42383_42549_46779_46965_49046_49150_51861_51976_53549_53679_56094_56157_58763_58894_63478_63612_69219_69325_83403
829415	contig_5780_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_29798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	107	499	112782	113174	NA	30	CCAAATTTACACTGGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMHHVHIPDGSWLDLLEPGSACRSQGPEDWCLWAQQGEREAASSRFGLCSPRSHGRTRVLLISFGAVVWFMRSDLMLDIPGNPVKELFPLQAFTESSFLLWLAPLNLVWPSFQTCQRTYLTRDGRAPGS	112675	113507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_112700_113500
829419	contig_361_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_166617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGCAATTTCACTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007398	1006897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1006900_1007400
829420	contig_11937_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_171578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	537	950	34429	34016	NA	20	CATGTTTCTACTTGTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGLADLHTRTKSRSFLSSALVTSLTPMASCFLTCTGVHPDTCWLSSGFFSFRSSLISTSVLHFSLLCFWKEGCFFLFFLSSIFRSPMYLNLFSSVCNMKCISSRSRVLQQIVYGLFNDVFTTKGLVFRIDPLPGA	34965	33710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_33700_35000
829422	contig_14814_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_137733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGGTATATATCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347843	345964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_346000_347800
829426	contig_6163_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_103853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACGTTAACCTTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500596	498930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_498900_500600
829430	SIRV6	+	432	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	332	3	166	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
829431	contig_5718_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_110343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592730	591390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_591400_592700
829432	contig_7513_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_89023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGCCCCCTCCCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682117	683149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_682100_683100
829435	contig_15084_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_116694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196596	196090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_196100_196600
829436	contig_665_pilon	+	1457	3	Intergenic	novelGene_158204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	328	junction_1	5.5	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	30	353	191199	233612	FALSE	40	TACTCATCACAAAGACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSVFIKESMFLPRSSFGKRSAGSFRRGCECIVLEPSEMIVVDYMDENEEYFQRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVDPYPVGKPPLPRGYHTVSYKSIIFLFIFSVLLGVF	191169	234716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_191219_231485_231562_233384
829437	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
829438	contig_3942_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_128850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	226	681	158	838	1384496	1383816	NA	15	TTAACACCTGCCCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVQVWARDTELEQGFQPGMRGLSSQQLCGPLLRRRAPPTSLPHRVSQSWSQALCRPQTAGQPYTLSGCPEGTPAGIGNQAMQPHPVPSTPSTQGGQSGSLTGLLTGISAHLCCEAATSSIRLCQECGDFLSLCSSLGAWPCLSLAGTLSLHHLGLPQEPLACLPPKPCPLPSPTRTEPLEGAPGPCIPWPGPATWLLSPASAQSRCSSCSSAYLLSLSLLIRCLC	1384653	1383789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1383800_1384700
829439	SIRV6	+	449	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	514	164	76	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
829440	contig_8650_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_162612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9564	9012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_9000_9600
829441	contig_6415_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_175840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	147	596	44141	44590	NA	35	ACTCCAATGCCAAATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVTIVICVARSSLSNSLQGRLLGHLKDDLVFPKRRWVGQNVCARLLTQRLVVQTYPEVLLKKDLVIRFDKDHSQENPMEQFCSVTHGSTMSRNQLNSNEFFFFAFLIALLYLISTKLRGKHCFTHFTAKKMEFQNTNAICAAPLTII	43994	44648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_44000_44600
829442	contig_7070_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_104062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241217	243181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_241200_243200
829445	contig_5278_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_139769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCGTCACTACAGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188664	189930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_188700_189900
829447	contig_3774_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_142053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTCTAAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198454	196612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_196600_198500
829450	contig_4305_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_136718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTCCCGTCTAGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818196	816708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_816700_818200
829451	contig_5797_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_56919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAGGAAGAAACTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191048	192920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_191000_192900
829452	contig_5899_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_146972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGGAAAAAAAAAAATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84487	83449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_83400_84500
829454	contig_11552_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_171666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21769	22307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_21800_22300
829455	contig_5083_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_151628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105543	104108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_104100_105500
829456	contig_7619_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_162154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTATTTTGTTGGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31578	30675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_30700_31600
829457	contig_5918_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_99622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGTGTCAGAGGAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2210857	2212022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2210900_2212000
829458	contig_8866_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_77880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997011	996128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_996100_997000
829460	contig_12885_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_176899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16950	17221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_+_17000_17200
829461	contig_13146_pilon	-	2169	8	Intergenic	novelGene_170038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	9.98161575403624	1	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	78	812	60217	49525	FALSE	50	AAAAAATAAAACTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSEMVSLAAVLLSSFPANGQDPDFAYLSTQLTQVQMEIVNKHNELRTGVSPEASDMLKMEWDNEAAANAQNWADKCIYKHSDPQKRRTNVSCGENLFMSSAPTSWSSGIQNWYDEERDFVYGVGPKSPNAVVGHYTQVVWSTSFRVGCGIGYCPDQSTFKYYYVCHYCPAGNYINRLYTPYKKGPRCSSCPDYCDNGLCTNGCGYEDVYSNCETLKKMFTCANEWVRNSCKASCNCEGKIH	70659	48167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13146_pilon_-_49653_51568_51658_53118_53217_53686_53833_55850_55939_56648_56766_60148_60220_70584
829462	contig_5988_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_15863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTCTTACTAATTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283829	282872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_282900_283800
829463	contig_4531_pilon	+	1096	2	Intergenic	novelGene_47895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	116	424	328636	330172	FALSE	5	TTGTGTCCGTTTTCTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEKEFTESCGCADCCILFLLSNPCFLSPGGKFIFFNVLSAFLPQCIFFLGLLYPVSSAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQQRLNSEEKTK	328520	330844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_328912_330139
829464	contig_5302_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_81516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATGGATAGATTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392298	1391766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1391800_1392300
829465	contig_7894_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_170785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAAATAAACAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216306	215595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_215600_216300
829466	contig_4228_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_151176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGTGCAAAACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518368	519195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_518400_519200
829467	contig_5954_pilon	-	416	4	Intergenic	novelGene_28558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	9.56846672960488	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	20	415	827282	826029	FALSE	20	TCAAGGAGGCTGAGGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSDPPAMGDEDEDEGCAVELRITEANLTGHEEKVSVENFELLKVLGTGAYGKVFLVRKAGGHDAGKLYAMKVLRKAALVQRAKTQEHTRTERSVLELVRQAPFLVTLHYAFQTDAKLHLILDYVSGGEMFTHLYQRQH	827301	826027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_826079_826168_826388_827063_827136_827227
829468	contig_5954_pilon	-	1099	9	Intergenic	novelGene_28557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_5	16.7663166795811	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	627	1097	819678	818420	FALSE	5	GCCCGAGGTGGGTGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVLEAPGAGDRPGRAAVARSAMMQDSPFFQQYELDLREPALGQGSFSVCRRCRQRQSGQEFAVKILSRRLEANTQREVTALRLCQSHPNVVKLHEVHQDQLHTYLVLELLRGGELLEHIRKKRHFSESEASQILRSLVSAVSFMHEEAGVVHRDL	825290	818417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_818585_819099_819194_819315_819450_819600_819730_821761_821927_824464_824617_824718_824823_824899_824981_825217
829469	contig_5954_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_28556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGCTGCGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816510	816141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_816100_816500
829470	SIRV6	-	370	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
829471	SIRV3	-	399	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	220	-2	220	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
829472	contig_7513_pilon	-	1561	2	Intergenic	novelGene_88960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	0	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	885	1496	154535	151971	FALSE	75	CAAAATGAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGYHGVDHRVETCPSSNTPWTWHSRDHDEPCLSPQVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVSVLGPRRRHGAFQCGGAGALLQHVCWWSPDQESLPSERGFVGTQPGPRGQRKASLG	155419	151905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_152280_154232
829473	contig_8616_pilon	+	1228	11	Intergenic	novelGene_72398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_2	20.5922315449298	281	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	30	1187	207076	213351	FALSE	10	CCTTGACCTTGAGCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARWNHVWVGTETGILKGVNLQRKQAANFTATGQPRREEAVSVLCWGSSGETQILLGCVDATVRRFSTEEGIFQGQRHCPGGEGTFRGLAEADGNLITCVDSGILRVWCDNDKEVSSDPLLELKVGPGVCKMRQDPAHPHVVATGGKENALKVWDLQGSEEPVFKAKNVRNDWLDLRVPIWEQDIQFLPESQKLVTCTGYHQVRVYDPASPQRRPVLEATYGEYPLTAMTLTPGGNSVIVGNTHGQLAEIDFRQGRLLGCLKGLAGSVRALQCHPSKPLLASCGLDRVLRVHRIRNPRGLEHKVYLKSRLNCLLLSGRDNWEDEPQQPQEPNKVSPEDTEMDELWASLEAAAKRKLPDFKQSQGALQARHKKKKRPGSTSP	207046	213392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_207140_207220_207328_207415_207538_209039_209116_209234_209382_209537_209640_211720_211822_211911_211968_212282_212429_212563_212621_213171
829474	SIRV5	+	314	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-18	909	-18	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
829475	contig_10575_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_141811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_1	30.6412938514171	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTGAAGCAGATCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293737	378886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_293810_300842_301046_301772_301899_378716
829476	contig_16846_pilon	-	674	5	Intergenic	novelGene_82979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3317.45135608648	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	62	580	555239	551492	TRUE	10	GCACTACTTCGGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558711	550867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550961_551490_551665_552661_552824_555055_555278_558688
829479	contig_5145_pilon	+	1829	7	Intergenic	novelGene_131395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	22.2217361057942	88	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	70	807	651321	654253	FALSE	20	CTTACTTTTTAAACCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHINHDDPSLVPNVPYFDLPAGLMAPLVKLEDHEYKPLDPKDIRLPPPMPPSERLLAAVEAFYSPPSHDRPRNSEGWEQNGLYEFFRAKMRARRRKGQEKRNSGPSRSRSRSKSRGRSSSRSNSRSSKSSGSYSRSRSRSCSRSYSRSRSRSRSRSRSSRSRSRSRSRSRSKSYSPGRRRRSRSRSPTPPLGEENKGHQMLVKMGWSGSGGLGVKEQGIQDPIKGGDVRDKWDQYKGVGVALDDPYENYRRNKSYSFIARMKARDECK	651251	655275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_651339_651914_652049_652581_652669_652929_653074_653156_653274_653802_653847_654059
829480	contig_5968_pilon	-	1150	3	Intergenic	novelGene_112175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	17	376	609966	609607	TRUE	25	AAGTGCTGACTGGGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYRVSMSRNRLSSNVFTIDRERQCTVKARRLNWAFGGRFGSNSATDHVKLTTLSLNELIYRVAIVFSALINSQTEDSMEGDYKYSLKFYANSTIFLRLLFVHLFNKYVFGIPYESELCWASGIW	609982	603272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_603571_603972_604028_609185
829481	contig_11396_pilon	-	1632	2	Intergenic	novelGene_71368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTCAAACTCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821894	815997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_816495_820759
829482	contig_16882_pilon	+	1505	8	Intergenic	novelGene_148216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_4	69.7520389578363	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	53	835	202217	213521	FALSE	35	CACGAGACAACTGTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLFSLAHRVALATVRNECRTQVDRFPAARFKKFATEDEAWAFVRNSVSPDVSEGQKNQRVQEPQLKANKRPRESPNDEEDENTEPCVKHLKQNTESVPSVSKDTFSYMGEFVVVYTDGCCSSNGRKRARAGIGVYWGPGHPLNVGVRLPGRQTNQRAEIHAACKAIEQAKAQNIDKLVLYTDSMFTINAITNWVQGWKKNGWRTSTGKEVINKEDFVELDTLTQGMDIQWMHVPGHSGFIGNEEADRLAREGAKQPGD	202164	214191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_202267_203443_203560_206620_206786_208805_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
829483	contig_4845_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_53656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474693	473477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_473500_474700
829486	contig_10163_pilon	+	1518	1	Intergenic	novelGene_82654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAAGTTTCTGTGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189347	190865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_189300_190900
829487	contig_13806_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_173660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGAAAAAAATAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108046	110006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_108000_110000
829488	contig_7410_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_106056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACCCAGGGACTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122701	122285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_122300_122700
829489	contig_5669_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_86039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGTGGGGATGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20383	21481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_20400_21500
829490	SIRV6	+	483	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	503	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
829491	contig_13718_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_142883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	260	574	92287	91973	NA	55	AAGAGATAAAAGATGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTGTGQNASKQVKFPLTREVILLILSRWTIRLTKTIKFSEIRNPLSEGAVYRVFHSITPRTITRGRVTGKGQGFLKFLCLWVEENKSTSTYFLPDAGYILPH	92546	90976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_91000_92500
829492	contig_10196_pilon	+	377	3	Intergenic	novelGene_132096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	14019	junction_2	45	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	96	335	908085	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	907989	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_908152_908260_908353_908475
829494	contig_4531_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_47915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCACTGTTTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410797	410355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_410400_410800
829495	contig_3942_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_128669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	18	410	245896	246288	NA	30	TAAAATATGCTTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTVFIRGRVLAGRSKVSDWSGPEKGVPGVVPSSALGSVQKKGGLTKWILGSDPLLLKVFPQSWAAKVWFHQVGEKFQGYPEDGVDGSVHVRQDRSGLNWFCGLQTPACFSYGQEVGQLLEKKISGDTS	245878	247537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_245900_247500
829496	contig_5649_pilon	+	1919	3	Intergenic	novelGene_82321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	21	1	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	136	606	297275	304015	FALSE	30	ATCTGCTTTGCACATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIQPGSGGNLHNPNNPDQPLPPFYTSHSLTPPSHASGNGEVQAAAMSEAYFPVESGALGPEENFLSLDDILMSHEKLPVRTETAIPRLGAFFPERSGGAETDNTIPQGSKLEIPLWLAKGLFDNRRRILSVELPKIYQEGWRTVFSADANVVDLHKMGPHFYGFGSQLLHFDSPSFRHLLDVFVASWTPLRTLTMKTRRHW	297139	305328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_297461_300529_300730_303930
829497	contig_5602_pilon	-	1348	3	Intergenic	novelGene_133031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	226	18	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	127	783	559969	558252	FALSE	35	AAAAATTGGCCTAGCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDLLAAAETESDSESNHSNQDNASGRRSVVTAATAGSEAGASSVPAFFSEDDSQSNDSSDSDSSSSQSDDIEQETFMLDEPLERTTNSSHANGAAQAPRSMQWAVRNTQHQRAASTAPSSTSTPAASSAGLIYIDPSNLRRSGTISTSAAAAAAALEASNASSYLTSASSLARAYSIVIRQISDLMGLIPKYNHLVYSQIPAAVKLTYQDAVNLQV	560095	557686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_558527_559107_559366_559845
829498	contig_15952_pilon	-	1026	12	Intergenic	novelGene_154048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.010437887898	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	28	828	105377	93502	FALSE	55	GTTCTAAAAGCAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGRRPEHGGPPELFYDENEARKYVRNSRMIDIQTKMAGRALELLYLPEGQPCYLLDVGCGSGLSGDYLSDEGHYWVGIDISPAMLDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKKFYLCLLSGPSSFLPKGLSDQKDGDEERESAFTKERVPHRAARRGMVRKSREVRPDTQYTGRKRKPYF	105404	93303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93753_93799_97043_97103_97395_97442_97625_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102732_102816_102901_102998_105197_105236_105329
829500	contig_3122_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_64402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCCAGCAACTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428839	429091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_428800_429100
829501	contig_9297_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_69842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTTTGTGGTTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679643	678616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_678600_679600
829502	contig_20672_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_176906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGGATCTATCAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1921	2679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20672_pilon_+_1900_2700
829503	contig_10323_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_123540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATAAGTAAATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249385	249046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_249000_249400
829504	contig_5860_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_147956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTATCCTGTTAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144919	143916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_-_143900_144900
829507	contig_13800_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_153723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGTTTACTTCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100163	100479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_100200_100500
829508	contig_13800_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_153724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGTGAAATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101277	101773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_101300_101800
829509	contig_14814_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_137687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTCCACCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54647	52933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_52900_54600
829510	contig_10976_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_155600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAGACCAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210944	212545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_210900_212500
829511	contig_6838_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_171792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117919	115626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_-_115600_117900
829512	contig_6189_pilon	+	803	4	Intergenic	novelGene_164931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	198	554	30285	33167	FALSE	75	GGAAAGAAAAAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVAQVRVPSSAGQDFTAGSVGVSVWSTLPPCGDPRFAFGSPGLSADILARDGHTRGHVCPEAPLKLCRPEERSTECDNSSSILNSESTLATLGSAWKWGQGSITGHVAFRYCFLFF	25814	33416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_25882_29146_29221_30228_30417_32942
829513	contig_11378_pilon	+	1495	8	Intergenic	novelGene_112326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	76.211574459741	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	75	881	1228994	1237172	FALSE	40	CAATAATTTAACACAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPACLSACRFLLQPACWAGPAWPAMEAYDIIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDLFIGPKAEEHRGLLTIRYPMEHGVVRDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPSKNREKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSITRVDIAGRDVSRYLRLLLRKEGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSIRPPVTRTYPVNVSLHGWILQLEHRNRGAKLWGVLGAPLSRAK	1228919	1237786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1229042_1231108_1231174_1232361_1232438_1233475_1233602_1233946_1234072_1234310_1234528_1234659_1234679_1237041
829514	contig_15350_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_164266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273470	274998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_273500_275000
829516	contig_2924_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_140267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133139	130702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_130700_133100
829517	contig_3942_pilon	+	391	5	Intergenic	novelGene_128769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	35	391	793521	795377	FALSE	45	AACCTGCGCCCCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTN	792280	795377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
829518	contig_16860_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_155347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGAAAAGATCTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139706	138185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_138200_139700
829519	contig_8822_pilon	-	1285	6	Intergenic	novelGene_117919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	143.899965253644	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAACCAGCTCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104580	45087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_45933_57093_57174_61525_61653_77031_77173_103708_103778_104557
829520	contig_17936_pilon	+	1831	2	Intergenic	novelGene_29970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2521	junction_1	0	50	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGAGTCAAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109420	114885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_111167_114800
829521	contig_11476_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_170503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACAAGCAAGTACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46226	46990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_+_46200_47000
829522	contig_8317_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_19475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
829523	contig_11816_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_98574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTTTACTGAAGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293102	1292561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1292600_1293100
829524	contig_7411_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_137026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTATTGGCATAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357165	355621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_355600_357200
829525	contig_3077_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_26854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCATAGTTAATCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952118	953482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_952100_953500
829527	contig_12079_pilon	+	1351	2	Intergenic	novelGene_67384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	103	363	425988	426248	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTTRTNLCSHSHRRVQTQHEPTCVLTVTDVFRHNMNRPVFSQSQTCSDTTRTHLCSHSHRRVQTQHQHTCVLTIAGVFKHKTSKPVFSQLQTCSNTKPISLCSKTILSNSRFLRNHGQAP	425836	427236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_425847_425895
829528	contig_348_pilon	+	1295	9	Intergenic	novelGene_67608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.9680564420461	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	259	1065	320222	345268	TRUE	30	TTTTAATTCGACAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGAVGSACDCSFRRGLWSLKLGTLFSSWVTVPLSQPRCAGERRPVSLSTCTSRDSGGGGGSTREQLSLQDVAELIRTRACQRLVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	314480	345643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314501_319690_319792_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214_345419_345563
829529	contig_15952_pilon	-	990	11	Intergenic	novelGene_154041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	40.3083117979406	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	26	760	105377	93502	FALSE	5	CTCTCTGGCTCTCGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRGRRPEHGGPPELFYDENEARKYVRNSRMIDIQTKMAGRALELLYLPEDAALDRDTEGDVLLGDMGQGIPFKPGSFDGCISISAVQWLCNANKKSDNPAKRLYCFFSSLYSVLARGARAVLQLYPENSEQLELITTQAMKAGFTGGVVVDYPNSAKAKKFYLCLLSGPSSFLPKGLSDQKDGDEERESAFTKERVPHRAARRGMVRKSRDWVLEKKERRRRQGKEVRPDTQYTGRKRKPYF	105402	93271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93557_93708_93799_97043_97103_97395_97442_97625_97712_98337_98389_99262_99360_102536_102634_102929_102998_105197_105236_105329
829530	contig_12697_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_122828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTATTTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233312	232977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_-_233000_233300
829531	contig_8415_pilon	+	746	5	Intergenic	novelGene_141682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	31.751968442917	227	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	363	746	25584	73103	FALSE	35	CAAGTAGGTGTGAACCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRERLFELWMLYCTKKDPDYLKLWLDSFVSSYEQFLDVDFEKLPTRVDDVPPGISLLPDNILQVLRIQLLQCVQKTADGLEEQQQALSILLVKFFIILCRNLSNVEEIGTCSYINHIITMTTLYIQ	24363	73103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_24504_25361_25635_58957_59050_64568_64731_73024
829532	contig_9439_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_176915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAACTTGCACTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170894	169992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_170000_170900
829533	contig_12550_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_175278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTTTCCACAATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42370	44264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_+_42400_44300
829534	contig_19941_pilon	-	1937	9	Intergenic	novelGene_139756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	60.8399539776289	123	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	23	466	40346	21654	TRUE	65	TGAAAAAAAAAAAAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGDFEAKMAAGTGKHKLLSTGPTEPWSIREKLCLASSVMRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQEKYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAM	40368	16828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_17453_17844_18064_18602_18740_21162_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_40327
829535	contig_1964_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_130938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAGAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775485	774217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_774200_775500
829536	contig_987_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_72256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCCATTAAGTCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395406	396778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_395400_396800
829537	contig_16098_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_45807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGGCATTCCTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141425	142194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_141400_142200
829538	contig_6980_pilon	-	1389	8	Intergenic	novelGene_36081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	49.2391083988974	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	718	1110	382289	376597	TRUE	30	AATTGAATTCTGCTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSSCLLLPGDATVLSSSWDNNVYFYSIAFGRHQDTLMGHDDAVSKICWHDNRLYSASWDSTVKVWSGIPAETPCTRRHHFHLLAELEHDVGVDTISLNAASTLLVSGTKEGTIAATSSAQEKTAVLTS	383006	375153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_375271_376299_376410_376544_376648_377150_377214_378717_378802_380128_380253_380644_380713_382286
829539	contig_10753_pilon	+	1748	1	Intergenic	novelGene_105125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAAGTGTGAGACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21001	22749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_21000_22700
829540	contig_10753_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_105126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCTAAGAAAGTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22698	23349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_22700_23300
829541	contig_14684_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_99668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	134	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317940	320161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_317900_320200
829543	contig_9482_pilon	-	1971	3	Intergenic	novelGene_44273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	95.5	116	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	850	1206	944129	943773	FALSE	40	GAGTATGCTGAAGAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEPRAHPVDTSSVSTRTRWQDDPSSLKHAAPQGIGHPRPSQCEEVLPHHSCICRRPYAYSPALGEHGTCVSLPACTRLADAAWLRLRRWFGSSAHFTFECALHLGPPCGLGQSAAG	952943	943007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_944819_945895_946030_952917
829544	contig_4751_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_173724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCTGAAAGGCTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229876	228342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_228300_229900
829545	contig_8954_pilon	+	1793	2	Intergenic	novelGene_130302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTGTCTTTTTTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186842	188702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_187185_187251
829547	contig_501_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_134907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCCTAATACAAACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808589	792229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_792698_793437_793720_794082_794256_794347_794478_808424
829548	contig_6375_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_72942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCAATTTGGGGAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26304	25607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_25600_26300
829551	contig_3269_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_117017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103140	104170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_103100_104200
829553	contig_2093_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_152974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAAAAACCCTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324747	1323408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1323400_1324700
829554	contig_8671_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_126262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTACCTTATGTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502992	504361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_503000_504400
829555	contig_13753_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_136513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	103	351	206709	206957	NA	15	ACAAGGTCTCTGTCCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFNSGKYTGNKTLSISTIFTCTIVLYFVNYHETFMEPDNGIHRLTPHWMSLFMFRMHQLSYPHLNGNSLLSSTGCSHSNNNTNNCNHTHNKATAYSVLTVYLDRNPGGIAVKSYGC	206606	208478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_206600_208500
829556	contig_8269_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_106230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTCAGTGAAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285200	284034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_284000_285200
829557	contig_8576_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_88817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAAAGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969213	968393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_968400_969200
829558	contig_14300_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_133113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATCGGAGAAGGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272449	272110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_272100_272400
829559	contig_12148_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_140320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTCTAGTCTTGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35411	34713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_34700_35400
829561	contig_9332_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_60709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACTGCCCCATAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76572	77122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_76600_77100
829563	contig_12086_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_74713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCAAGGCTTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77152	75953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_76000_77200
829564	contig_10182_pilon	-	1763	10	Intergenic	novelGene_134627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	76.7407049906967	10	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	49	1197	429480	354999	FALSE	45	ACCCTTCATCAACAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNGNRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDNVLVRIISAKNSPPTIVQDKVLALIQAWADAFRSSPDLTGVVHIYEELKRKGVEFPMADLDALSPIHTPQRSVPEVDPAATMPRPQSQTSAGSFSSPPAPFSAPQAPPLSVTGPITANSEQIARLRSELDIVRGNTKVMSEMLTEMVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNVFLRYERFERYRSGLSVQKATNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSSLQAWTWGQRVSVAPSVHSSSVTPVTASTCFPRQEGIPWLNNARRMWGPIQWLSKDIGGVGE	429528	354432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_355173_356975_357099_357542_357592_360179_360314_372403_372521_375511_375662_377063_377199_399763_399914_404440_404520_429442
829568	contig_8464_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_125401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGATCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892688	890663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_890987_891107_891174_891317_891399_891692_891820_891976_892100_892517
829569	contig_20951_pilon	-	361	2	Intergenic	novelGene_43088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	27684	27149	FALSE	45	AAAAACCTAACTTGCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	27684	27111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
829570	contig_13366_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_99790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152316	153410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_152300_153400
829571	contig_5145_pilon	+	1120	4	Intergenic	novelGene_131355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	12.7627931460511	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	151	399	36706	52613	FALSE	60	TACTCTGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVHVQRTQPALQPGLPGVGGTRPPLLRLRNRAWGRIRLRGAGLRAEGGKMADSSGRGGGKPSAAGSNTPSGAKPKGKRVQGGRMVEPRYLQYEKKTTKKVPAADALKASGKMPEVGKKPNLLQKSRGTSGV	36555	53334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514
829572	contig_9633_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_139609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCAAATTCGTTTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524835	523696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_523700_524800
829573	contig_3862_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_137429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGGAGCCCTGGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622943	621633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_621600_622900
829575	contig_5718_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_110321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGAATCATTCAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500224	502011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_500200_502000
829576	contig_7066_pilon	-	1320	7	Intergenic	novelGene_42198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	37.6519145152895	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	61	996	1035034	1028778	FALSE	35	TGCAATGGAGGAGAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRTLSSAPALWASIPCPRSELRLDLVLASGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLYCTVYRGNKGQVGKPTQEELQAIRSYFQLDVSLAQLYYHWGSVDPHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICSSNNNITRITGMVERLCQAFGPRLVQLDDITYHGFPSLQALAGPEVEAHLRKLGLGYRARYVSASARAILEEQGGPSWLQQLREAPYEHAHKALCTLPGVGTKVADCICLMALDKPQAVPVDVHMWHIAQYDYSWHPTMSQAKGPSPPGQQGTGKLLPESMGTLCWLGPSGAVQC	1035094	1028453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1028795_1029107_1029158_1029306_1029459_1031364_1031547_1033225_1033406_1034370_1034619_1034927
829581	contig_2933_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_111334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATTAACTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672664	671518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_671500_672700
829582	contig_5954_pilon	+	1056	3	Intergenic	novelGene_28573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	10	393	889079	899520	FALSE	5	GCCGAGTGTCCTCTGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQSMFQIPEFEQSDREDSSPADRCLGPSPKRGRPSGPRNRHHASPGPLGDASHQQGQPTSSSHHGGADTVETRSRHSSYPVGSEEGEGLEDEPSPFRGRSLSAPPNLWAAQRYGRELRRMSDEFEGSFKC	889069	900183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_889266_897858_898050_899514
829583	contig_6102_pilon	+	1230	6	Intergenic	novelGene_32249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCCCTGGAAATTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300853	1303635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1301333_1301418_1301781_1301868_1301999_1302085_1302157_1303251_1303338_1303533
829584	contig_8050_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_114867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATTCTAGTTTCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414684	415362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_414700_415400
829585	contig_6795_pilon	-	1899	9	Intergenic	novelGene_27690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_8	94.8959133735484	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	200	1015	129029	74533	FALSE	20	GCGGCTTCGAGTTGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPRECTTRLHLIYAAFSLGLMLASFRFSF	134299	73648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
829586	contig_8242_pilon	+	652	3	Intergenic	novelGene_80201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	2	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	153	650	188841	195945	FALSE	15	CAGGTGGGCCTGTTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINNQVEFHLALVKLFRSFSYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGYNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNVVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAVL	188688	195947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_189106_193940_194133_195904
829588	contig_6496_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_103517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGAGTTGGGTTGTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860302	858559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_858600_860300
829589	contig_6361_pilon	-	697	5	Intergenic	novelGene_24005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4808.59152975172	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	75	413	420979	415399	TRUE	15	AGACTGTGCTTCTTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436355	410935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_420987_436288
829590	contig_13412_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_80008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	800	1099	359773	359474	NA	25	AGTTTGAATCTACCAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFCRTSCVCPIWPDNASVGKSHLPLCAWCPISEGSLKSHFHILHVIGPDTAYQSTCSLLSEQILPCSWPPDEETDCDPLFIEYWGSEGPSWHALEAR	360572	359387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_359400_360600
829592	contig_1274_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_137812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATTCTAAAGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481615	482505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_481600_482500
829593	SIRV4	-	266	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1257	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3901	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
829595	contig_57_pilon	+	2221	9	Intergenic	novelGene_44920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	39.9231683988132	2	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	198	1061	299117	319950	FALSE	40	GGTAACCATATTGCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSCGISSLISCWNFLYSTMGAGSFPPITQEEALHILGFQPPFEDIRFGPFTGNTTLMRWFRQINDHFHVKGCSYVLYKPHGKNKTAGETGALSKLTHGLKDESLAYIYHCQNHYFCPIGFEATPVKANKAFRGPLSSHEVEYWILIGESSRKHPAIHCKKWADIVTDLNTQNPEYLDIRHLERGLQYRKTRKVGGNLHCIIAFQRLNWQRFGLWNFPFGTIRQEPQRPPPAQGIARSESEDSISKKQRGRLGRSLSTSFHQDSPWKKMSGVHERRNSGCQGYSDYD	294639	321110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_294713_298992_299120_304987_305056_305333_305439_305657_305753_315061_315189_315684_315769_318640_318738_319665
829596	contig_10339_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_125279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACACTGCAGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363420	362889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_362900_363400
829597	contig_8330_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_71853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTGGTCCTAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895507	894864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_894900_895500
829599	contig_14683_pilon	+	1211	3	Intergenic	novelGene_166030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2	168	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	112	414	20207	52703	FALSE	40	AAAATGGACTTGGAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLREEIQPGDIIIIDQFIDRIWPSFQFYCRDTKIAWLPRRKEDFLIPVTSGIPAKFEKTWKIHAAFVPLSA	16530	53500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_16620_20184_20353_52546
829602	contig_13780_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_149060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTCTTAGCTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608500	609904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_608500_609900
829605	contig_19098_pilon	-	1677	11	Intergenic	novelGene_65820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1121	1447	394038	358105	TRUE	40	CTGGGAGCAAGAAAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGPIKRMRKPMSPEKPTSICTQEATMMAPCNSRILFCHSSVNSGELVFTRLALIIHSGHFQAGSESMAREGAMKAIVPPWRMGSLTPKNTCRRVQMPETNKMVLMR	410374	355805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_355945_358013_358171_382753_382915_393938_394120_395030_395154_395415_395577_402619_402790_403122_403235_403354_403452_404276_404451_410172
829606	contig_10958_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_5382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTTCATTATTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842461	840320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840300_842500
829607	contig_7171_pilon	-	1418	18	Intergenic	novelGene_101305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	113.882231404894	1	68	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	282	1298	1074341	1057742	FALSE	5	CTGCTGTTATCTTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFCGAGSLQDIYQVTGPLSELQISYVCREVLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMAPEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELEPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEKGKWSAAFHNFVKVTLTKNPKKRPGATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLRNPVKGPPVGETDDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCSRRHIEFRRLGGMESRPPTHTVRCLRHQSESDDDYDDAFWKHGVQVWAPGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRPVVVETRPVDDPTAPSNLYIQE	1075783	1057621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057812_1060196_1060253_1060944_1060993_1068335_1068373_1068564_1068635_1069148_1069228_1069470_1069588_1070322_1070405_1070513_1070577_1070994_1071127_1072146_1072220_1072312_1072356_1072519_1072568_1072663_1072720_1074298_1074364_1075208_1075300_1075439_1075482_1075657
829608	contig_6227_pilon	+	1614	5	Intergenic	novelGene_49675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	362	junction_1	636.536134088239	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	317	679	848641	861222	FALSE	70	AAAACTATTAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSSGQDSSLLEDRNDHDKHKDRKRKKRKKGEKQVPGEEKGRKRRRVKEDKRKQDRDRVENEAENDLQCQAPVRLDLPPEKPLTSSLAKQEEVEQTPLQEALNQLMRQLQRKDPSAFFSFPVTDFIAPGYSMIIKHPMDFSTMKEKIKNNDYQSIEELKDNFRLMCTNAMIYNKPETIYYKAAKKLLHSGMKILSQVKKTLCHNNYYKICIPVFFGHRDTDPIQY	827484	862157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_827630_847470_847601_848599_848658_856400_856546_861021
829611	SIRV7	+	227	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCGTTCAAATCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	78909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70989_78843
829612	contig_4732_pilon	+	1238	10	Intergenic	novelGene_75360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	25.4689353265241	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	87	755	132389	133733	TRUE	30	GCCGAGGGCTGAGGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLANDGGSRSPSSESSPQHPTPPVRPRHMLGLPSALYTPRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQVWKMRFRKTGHIIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAEKLKKRMQGPIPERILGKMTVAIVKALFYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPGSH	132302	135086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_132436_132559_132627_132748_132863_132938_133059_133253_133362_133437_133618_133700_133783_133894_134039_134680_134727_134842
829613	contig_4732_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_75361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	11	36	275	310	136392	136427	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDTGVRGCVRGTEVGGLERAEARPRGGDGGGGYAPRVPLSVPQLTRSWPAPDPPWGLGQEGTGVGAQVEVPQHPQCSLQLPEPGGVSFLLVMHANQVDNKAK	136117	136427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_136100_136400
829614	contig_15752_pilon	+	1034	5	Intergenic	novelGene_148772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACTTCTTTTGTTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327827	334588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_328080_330869_330956_332465_332535_333156_333268_334072
829616	SIRV4	-	616	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	405	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
829617	contig_9484_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_105700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCCTAGAATGTGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299532	298038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_298000_299500
829618	contig_4232_pilon	-	1133	9	Intergenic	novelGene_63488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	384.527307222777	48	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3	449	620488	614837	TRUE	20	TACACGGAGATCTCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620490	607756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_607969_611644_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
829619	contig_19942_pilon	-	1078	2	Intergenic	novelGene_176916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	174	581	22633	20745	FALSE	25	TTTCACCAGACATATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIVYCQDRVYRDALQKVREKEAEKEKNNKGNFTFCQQSSSEESSVEEIFQHLLAYHQEISNRLSSHIPLVIQFFILRMYSQQLQKGMLQLLQDKDGYSWLLKERSDTSEKRKVLKERLSRLAQARRRLAKFPG	22806	20247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19942_pilon_-_20976_22456
829620	SIRV6	-	368	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1736_1847
829621	contig_18108_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_33529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCAGGACGAATAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301905	302134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_301900_302100
829622	contig_6871_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_21654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGTAACTGCTTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760275	759852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_759900_760300
829623	contig_4689_pilon	+	1162	5	Intergenic	novelGene_165405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGGAAGTCCGGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084206	1091710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1085003_1085500_1085603_1086632_1086742_1087114_1087251_1091691
829624	contig_6488_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_44750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCCACAGCCTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165354	165061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_165100_165400
829625	contig_3132_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_127458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAAGGAGCTTGTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419282	419718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_419300_419700
829627	contig_6533_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_114633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGTAATATGTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81426	80826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_80800_81400
829628	contig_4962_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_107376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCCACATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119784	121089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_119800_121100
829629	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	421	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
829630	contig_8900_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_171613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTTCATCTAACCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167870	169312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_167900_169300
829633	contig_14142_pilon	+	473	4	Intergenic	novelGene_120574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	209.088498009814	6137	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	46	387	526719	527752	FALSE	20	GAACTCTGGAGTCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGAQFRDAYGKELFDKTNKHHFLHSLALLAVPHCRKPLWAGLLLTSGTTLFCTSFYYQALSGDPSVQPLAPVGGSLLLLGWLALAL	526673	527838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526804_527102_527135_527421_527503_527608
829634	contig_8330_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_71930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTTGTTTCTCTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310497	1309975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1310000_1310500
829636	contig_5727_pilon	-	2392	4	Intergenic	novelGene_7977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	315	junction_1	334.187904562023	58	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	160	669	228154	224900	FALSE	55	TTCAAGAGAAAATAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSIEIPLRDTDEVIELDFDQLPEGDEVISILKQEHTQLHIWIALALEYYKQGKTEEFVKLLEAARIDGNLDYRDHEKDQMTCLDTLAAYYVQQARKEKNKDNKKDLITQATLLYTMADKIIMYDQNHLLGRACFCLLEGDKMDQADAQFHFVLNQSPNNIPALLGK	228313	223176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_225026_225530_225771_226761_226861_228109
829638	contig_15236_pilon	-	1481	4	Intergenic	novelGene_141633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	381.264562563408	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAGTTTATATGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646162	636619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_637297_637797_637864_644160_644300_645563
829639	contig_6726_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_86244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCCATTCATTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316400	316718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_316400_316700
829641	contig_2783_pilon	-	1724	8	Intergenic	novelGene_119652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAGAGAAAAGGAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769481	736842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_737085_738327_738466_756017_756174_756672_756766_762013_762085_764254_764415_767184_767593_769025
829642	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	660	966	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
829643	contig_1008_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_121537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGACTCTACAATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264934	263048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_263000_264900
829644	contig_15021_pilon	+	785	3	Intergenic	novelGene_26922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	9	434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	295	594	78749	90404	FALSE	25	TGGCTGAGGATTTTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRECGFIRLQPDTNKVAFVSAQNTGIVEVEEGEVNGQELSIASHSIARISFAKEPHVEQITRKFRLNSEGKLEQTVSMATTTQPMTQHLHITYKKVTP	78454	90595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_78825_79743_79848_90284
829645	contig_15707_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_173239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTTCCTTAGTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70409	71950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15707_pilon_+_70400_72000
829649	contig_2739_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_165839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAACTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238679	239166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_238700_239200
829650	contig_4891_pilon	+	1218	7	Intergenic	novelGene_124563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.415568635495	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	345	689	707907	754769	TRUE	45	TGTCAATACAAAAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFG	700928	756958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701142_707775_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754770_755876_756027_756579
829651	contig_15970_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_144058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGATTAAGGTGATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187652	189298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_187700_189300
829653	contig_7707_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_72169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285372	283527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_283500_285400
829655	contig_11689_pilon	+	1739	2	Intergenic	novelGene_175847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTTTGTAAATGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2068	4047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11689_pilon_+_2177_2416
829656	contig_10331_pilon	+	625	6	Intergenic	novelGene_54200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	228.016139779622	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAAATTCTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628004	639306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_628202_631089_631137_631637_631710_633179_633262_637502_637646_639222
829657	contig_11744_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_176853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116902	114007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_-_114000_116900
829658	contig_11933_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_107269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGGATTCATTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193012	194622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_193000_194600
829659	contig_7004_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_126519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	10.740577265678	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	57	755	477623	591884	FALSE	15	CCCTGCTTTTGAGATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLHRRLLRGGWELSQTLTMEELEQGLLMQPWAWLQLAENSLLAKAYITKHGYALLVSDLQQMWHEQVDTSVVSQRAKELNKRLTAPPEAFLCHLDDLLRPLLKDTARPSEATFSCDRVAEALILRVRSELSGLPFYWNFHCILASPSLKLPEACSIGNGRPFVMNLQSLYVAVTKQEVQVGQKHQGTDSQTSSSASLQGTDSHLLNQPEEPVSSAPSLSVPEIEPTSTSGSMPRPQLSKVKRKKPRGLFS	474950	592330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_475007_477622_477800_478464_478678_590520_590639_591212_591329_591809
829661	contig_5039_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_64818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAACTGCTTGTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231969	232425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_232000_232400
829662	contig_9484_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_105696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263435	262110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_262100_263400
829664	contig_5916_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_158058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCACCCAAGAGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480178	478427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_478400_480200
829666	contig_11396_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_71392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	650	1039	1553035	1553424	NA	30	ATAAAACTTGGTTTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAEWPSSPSPSGAGSERPVLLAAPSDHTRSMECCACLHGLAGLQETSPELGQTHSCPFPCYWRGSWMTPPVHHILFVWTGAPAEVTCQLSPAASQLRPPEEVQDGCPTRLLHWVSSASRLSTGPQNQ	1552385	1554095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1552400_1554100
829668	contig_15867_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_170875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATAAGACATGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11742	9623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_9600_11700
829671	contig_8628_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_164420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGATCCCATGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413183	412318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_412300_413200
829673	contig_4301_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_65075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	300	521	101692	101471	NA	30	ACAGCCAAGCGTGTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDSQGFYQEAREQAWQLQLPHPAHPPAEQLVPEALGITLQQLGRPREPSHSEHVILVKRRKGEGFCNFPGHRKLEPNILVKGALSLREGRERGDRERKRMKAEGRKVYERPFGIRGVTGSPEHRYNVSTPCVVLLCRLPLPWPDTDTWEEPRETGLEVGRAVAFRGLPAILT	101991	101015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_101000_102000
829674	contig_6241_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_156429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAATCTGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278479	279728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_278500_279700
829675	contig_8710_pilon	-	1149	8	Intergenic	novelGene_73520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAAACAGATTCAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418627	378272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_378343_386207_386343_398316_398470_401126_401266_401942_402029_403626_403710_416876_416960_418227
829679	contig_17_pilon	+	903	10	Intergenic	novelGene_173984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTTGCAGGAGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095455	1115792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_1095494_1097761_1097840_1102282_1102462_1102791_1102858_1103637_1103664_1108526_1108636_1111272_1111412_1112063_1112217_1114541_1114573_1115708
829680	contig_1321_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_176542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAGATACTTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65530	64883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1321_pilon_-_64900_65500
829681	contig_5935_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_102706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977367	975978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_976000_977400
829682	SIRV6	+	337	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	505	31	339	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
829684	contig_1982_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_151334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTCACTAATGCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341820	342546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_341800_342500
829685	SIRV6	+	266	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	222	2892	222	-2865	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATGTGCCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	7923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805
829687	contig_10583_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_167907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTTGGGCTGAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116315	114622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_114600_116300
829688	contig_4686_pilon	+	939	2	Intergenic	novelGene_118524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATCTTCCAGATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452631	455739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_453430_455598
829689	contig_11396_pilon	-	889	6	Intergenic	novelGene_71288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	630.424301562051	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	101	418	249053	243741	TRUE	15	GATCACTGTGCCATCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVYAASDSRRCSSGSSRSRPRPRRLLRPGRRLNMDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSA	249153	232099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_232395_232978_233028_238731_238824_243705_243894_245696_245843_249034
829691	contig_5727_pilon	+	1280	1	Intergenic	novelGene_7999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACAATATAAAAACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011759	1013039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_1011800_1013000
829696	contig_8045_pilon	-	853	5	Intergenic	novelGene_35456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	131.763044894993	70	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	75	434	481505	477260	FALSE	5	CATTTGCCTTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLARNGSSLAGGLGGTAGAAASGMGSNTSSSWGKSAIAPMNQIQETISDNCVVIFSKTSCSYCTMAKKLFQDININYKVVELDMLEYGNQFQDALFKMTGERTVPRIFVNGTFIGGAMDTHRLHKEGKLLPLVHQCYLKKSE	485392	476840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_477268_478679_478792_480120_480298_481442_481507_485319
829699	contig_2730_pilon	+	777	3	Intergenic	novelGene_135390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	353.5	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCCACAGTTTGGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372197	391217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_372328_379343_379459_390685
829700	contig_19098_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_65804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTCGTTGTTGCGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254966	256191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_255000_256200
829701	contig_8020_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_114436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAATCATAATATGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295555	294994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_295000_295600
829703	contig_21025_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_76490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTCATCTAAGACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39656	41594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_+_39700_41600
829705	contig_14788_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_176917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACATATTGCACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90623	89635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14788_pilon_-_89600_90600
829706	contig_8600_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_125738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATGAGTCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109442	110387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_109400_110400
829707	contig_9305_pilon	-	1056	3	Intergenic	novelGene_148186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	8	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	86	622	54808	52453	FALSE	20	TTACTGCATTGTGTAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRCFQNEYFDGLLHTCKPCHLRCSNTPPLSCQRYCNASMTNSAKGANVILWTCLGLCLIVSLAVFVLMFLLKKMSGELLKDKCKNTGPALQDVANVDLDNSKPSVEIVLPRSLGYTIEECTCEDCVKSKPKVDSDHFFPLPTMEEGAAILVTTKTSDHSNSLPGAASVIHHHHQLP	54893	52018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_-_52725_54203_54351_54690
829708	contig_2646_pilon	+	1410	9	Intergenic	novelGene_69643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	25.330009376232	241	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	17	1333	2124486	2130275	FALSE	15	GTCCACGTCTGTGCAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRTVKMAAGLRKRGRVGAAARAAGLCEQWLQRAWQERRLLLVEPRYTLPVAACLCLAEVGIIFWVIHRVAYTEIDWKAYMTEVEGVINGTYDYTQLQGDTGPLVYPAGFVYIFMGLYYVTGRGTDIRVAQHIFAVLYLATLLLVFSIYHQTCKVPPFVFFFMCCASYRVHSIFVLRLFNDPVAMALLFLSINLLLAQRWGWGCCCFSLAVSVKMNGLLFAPGLLFLLLTQFGLRGALPKLGICALLQVVLGLPFLLENPTGYLSRSFDLGRQFLFRWTVNWRFLPEAVFLHRAFHLLLLAAHLTLLLLFALHRWHRTGESILSLLKDPSKRKVPPQPLTPNHIVSALFTSNFIGICFSRSLHYQFYVWYFHTLPYLLWAMPARWLTHLLRLLVLGLIELSWNTYPSTSGSSAALHVCHAVILLQLWLGPQPYPKGIQHSKKAP	2124469	2130352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2124682_2126068_2126169_2126655_2126804_2126915_2127077_2127581_2127703_2128171_2128378_2128534_2128614_2129810_2129954_2130112
829712	SIRV6	+	389	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	378	0	212	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
829713	contig_14322_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_115723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTGTTTGTGATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671643	671334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671600
829714	contig_13905_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_130437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATGCCATCCAGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229550	228480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_228500_229600
829715	contig_5669_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_86106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394461	396548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_394500_396500
829717	contig_16722_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_118268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGAACACAATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46035	46317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_46000_46300
829719	contig_1996_pilon	-	1111	7	Intergenic	novelGene_131954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	40.0974507363692	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	62	718	527304	524419	TRUE	0	TCTTTGGGCCCCTGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREGAEPHGKRGLGGRSSSAMGLLSDPVRRRALARLVLRLNAPLCVLSYVAGIAWFLALAFPPLTQGTYMSENAMGSTMVEEQFVGGDRARNFARDFAAHRRKSGALPVAWLERAMRSVGLEVYTQTFSRKLPFPDETHERYMVSGTNVYGILRAPRAASTESLVLTVPCGSDSANSQAVGLLLALAAHFRGQIYWAKDIMFLVTDHDLLGTEAWLEAYHDVNVTACSWAASPSSTFH	527365	523815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_524148_524357_524460_526031_526134_526208_526357_526590_526703_526786_526967_527230
829720	contig_3942_pilon	-	2173	8	Intergenic	novelGene_128887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3.92272291935599	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	356	1768	1601666	1590626	FALSE	15	GTGGACAGTGCCTGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQALDALREAVACSQPREVSVPLARFRDQCQQHRPCRFLAAQKGAYPVLLAIWQLAAAGDPALLLQVLDALTVLTDGQPDLLDAQGLQLLVATLSQGAGVANLTCAALRLVRHVCLKHEQNRQALVKAGVLPLLTGAIAQHSRCADVVREACGALRIMTFDDDIRVPFGHAHSHAKMIVQENRGLKVLVKAAQAFPDDPGVLGELCSTLSRLAVRNEFCQEIVDIGGLGILVGLLADYTNHQDLMKQVLSALRAIAGNDDVKDAIVHAGGADSVVATMTRHLASPQVCEQSCAALCVLALRKPENSRVIVEGGGALAALEAMKAHPQEVGVQKQACMLIRNLVARSQAFSQPILDLGAEALISKARAAHRDCEDVAKAALRDLGCRVELCELWTGQKGNLAL	1628120	1590220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1590839_1591718_1591857_1592275_1592408_1593160_1593307_1595408_1595983_1600394_1600478_1601539_1601707_1627805
829721	contig_15629_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_122439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGCACAGGGACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77304	76177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_76200_77300
829724	contig_9121_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_134424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCATTGAGTCCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31422	30522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_30500_31400
829725	contig_10962_pilon	+	1337	6	Intergenic	novelGene_103887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	249.682198003782	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	116	1177	311769	353157	FALSE	15	CTGTATAGGTTTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRPSNNPGGSLRRSQRNSAGAQPQDDSTGGRSCSSSSAVIVPQPEDPDRANTSERQKTGQVPKKDSSRGVKRSASPDYNRTNSPSSAKKPKALQHTESPSETNKPHSKSKKRHLDQEQQLKSAQSPSTSKAHTRKSGATGSSRSQKRKRTESSCIKSGSVSESTGAEERSAKPTKLASKSAASAKAGCSTITDSSAASTSSSSSAVASASSTVPPGARVKQGKDQNKARRSRSASSPSPRRSSREKEQRSSKSETSKPGPSGLQAKLASLRKSTKKRSESPPAELPSLRRSTRQKTTGSCASTSRRGSGLGKRGAAEARRQEKMADPESNQETVNSSAARTDETPQGAAGR	274041	353317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_274108_311719_311867_331779_332433_332519_332580_349883_349990_353012
829726	contig_9321_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_174716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGAGCTGCTTATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29203	29847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_29200_29800
829728	contig_9460_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_155314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGCTACATGGGAATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383827	381984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_382000_383800
829729	contig_4816_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_115596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4974	6198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_5000_6200
829730	contig_563_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_169772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAGGGGATTGAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711423	710055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_710100_711400
829731	contig_1107_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_126585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	63	374	780694	780383	NA	35	CCAAGCCTTGCTTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGYRPSILPTPPYVRASTGEMCDEGDASEGSFLPFPKGVEPVLPPPPGVRGDGSQEAPAGAWDKMSIFAMLDSSGPPCDPPSWRSLSLGGTGLGGTPVGTGGSWAKRSSQSVGPRGDTLSAGY	780756	778852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_778900_780800
829732	contig_18113_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_137540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGACCCTATAGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187035	185570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_185600_187000
829733	contig_7019_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_149484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCAAGACGGATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1857477	1859423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1857500_1859400
829735	contig_14698_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_168138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169649	169076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_-_169100_169600
829736	contig_15720_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_41933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCTATAATTACACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288868	288525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_288500_288900
829737	contig_709_pilon	-	1370	2	Intergenic	novelGene_57676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3991073	3988599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3989352_3990455
829738	contig_11396_pilon	-	1178	5	Intergenic	novelGene_71294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	99.5740930162058	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	215	955	357291	355056	FALSE	15	GTGCTTCTCAGTGGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVPVDELRPFQDPDLSSLQAGSACLAKHQDGLWHPARITDVDSGFYTVKFDSLLLKEVVVEGDSVLPPLRMEPAESSDSDSGDGGDGDDSSYARVVDTGPTADGMCSAAFAGWEVHTRGIGSRLLTKMGYKPGGGLGRYAQGRVEPIHTVVLPRGKSLDQCTEALQKRVKGGKGTTHRPPKCRGKGAVHAGRRPPRDVFDFLNEKLQAQAPGALEVGAGPPRARGGKEAYHASKSAKRALSLRIVQTEEQIGRTQKDIRGIQEALARNAGQHSVVAAQLKEKLAGAQRQLGQLRAQEAGLQREQRKADTHKKMTEF	357848	354832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_355195_355361_355771_356399_356520_357218_357384_357726
829739	contig_7202_pilon	-	412	2	Intergenic	novelGene_18588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGAATCGTCCTTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30088	28512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
829740	contig_361_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_166622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGCTGCCGGCCGTGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020030	1021205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_1020000_1021200
829742	contig_1867_pilon	-	979	2	Intergenic	novelGene_54624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584971	583244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_583994_584741
829744	contig_10793_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_83449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGTGGACCTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190091	190400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_190100_190400
829745	contig_5816_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_158275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431375	431897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_431400_431900
829746	contig_9440_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_59038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299025	300606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_299000_300600
829748	contig_10196_pilon	+	937	5	Intergenic	novelGene_132051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	111.915984113084	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	118	870	643457	648579	FALSE	25	AGAGCAGATACTGCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSKSKPPKRDEKERKRRSPSPKSPHLSVTAAQWNLLPVHWCGLRPHTPASPLSLSETGEQAENQLCRPSGASPHLSPTVVWQVNSAKCTLLFWHLLYSQYYKICFEFCNFVAF	643339	648646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_643528_643749_643906_644528_644721_644998_645056_648302
829749	contig_13608_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_52396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGAAACTAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470353	469522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_469500_470400
829750	contig_2332_pilon	+	691	8	Intergenic	novelGene_58667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_5	1468.3099961854	1	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	22	600	331257	334269	TRUE	10	CATTTGCGTCTTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
829751	contig_2215_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_163876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAAGCATGCTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332631	332301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_332300_332600
829752	contig_15629_pilon	+	1289	2	Intergenic	novelGene_122449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGAATGGTCCTAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97356	99012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_97711_98077
829753	contig_13409_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_128439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTTTGTGCATATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17999	16939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_16900_18000
829754	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
829755	contig_9633_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_139647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTGCTTTCTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165171	1164164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1164200_1165200
829758	contig_16999_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_85009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224154	225197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_224200_225200
829759	contig_142_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_176919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGTTATTGGGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16427	17758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_142_pilon_+_16400_17800
829760	contig_11989_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_68463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAATGAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152236	150792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_150800_152200
829761	contig_776_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_139953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTAAGTTAGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095622	1093967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_1094000_1095600
829763	contig_8452_pilon	+	925	2	Intergenic	novelGene_48054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	19	924	432928	433884	FALSE	35	TGAAGATGTTGAAACGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTCKTPMDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKV	432909	433885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_433051_433101
829765	contig_12837_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_57406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAATATCTTCCCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465251	463889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_463900_465300
829769	contig_9415_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_109931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2329730	2330741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2329700_2330700
829770	contig_9415_pilon	+	2010	2	Intergenic	novelGene_109885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCACAGCAGGGGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2052562	2055934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2053605_2054966
829772	contig_1105_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_176921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTACTCTCCTGCTCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393540	394714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1105_pilon_+_393500_394700
829773	contig_1105_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_176922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGAGAAGCATTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394996	395402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1105_pilon_+_395000_395400
829774	contig_3948_pilon	-	833	2	Intergenic	novelGene_53404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGGTAAGTGCTCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1852837	1848385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1848929_1852547
829775	contig_7457_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_31473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAAAAAAAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515248	516938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_515200_516900
829776	contig_16303_pilon	-	1170	6	Intergenic	novelGene_34117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.309389316759	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	37	720	47976	37661	TRUE	15	TTCCACACCCTGCTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTASQNTRDSSPQP	48012	35706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35804_37184_37302_37424_37701_38587_38856_40433_40731_47897
829777	contig_14744_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_65917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGTGGCAACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101899	99618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_99600_101900
829779	contig_3767_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_111144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	98	373	461061	460786	NA	75	TAACAGAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGDTKQQKQFKIIVAASKVSGDSASGGVQCPMAIVLASGMLLMGRVAVLLLFTLSLPAVQACFFNFLTDFVLVNNLQQILFLLKSSRVSFCCLQPRILIGPVFNPIAEQRNQMHSVLVCDVN	461158	460617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_-_460600_461200
829781	contig_13496_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_107643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATATATGGAGTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333201	332799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_332800_333200
829783	contig_4426_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_15383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCACCAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370311	369622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_369600_370300
829785	contig_6735_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_15833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATAAAAGTATTCTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673901	674544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_673900_674500
829786	contig_2770_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_107424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275085	273627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_273600_275100
829787	contig_8075_pilon	-	766	3	Intergenic	novelGene_42479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	21.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	27	596	620458	606190	FALSE	25	CTGAATCAGCCTAGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGPRPGVMAGPLQGGRVRALDLLRALPRVSLANLKPNPGSRKPGADVFTAKVNIEVQLASELAIAAIEKNGGVVTTAFYDPRSLEILCKPVSFFLRGKPIPKRMLPPEALVPYYTDARNRGYLADPAKFPEARLELARKYGYILPDITKDELFKMLSARKDPRQIFFGLAPGWVVNMADKKILKPTDEDLIKYYSS	620484	606019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_606528_612911_613036_620350
829788	contig_14467_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_138237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTCTTCAGTTCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247598	248116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_247600_248100
829790	contig_10627_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_60055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAATGATTAATACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192487	1193575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1192500_1193600
829791	contig_10016_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_117851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCGAGTCTAGCGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286118	285280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_285300_286100
829793	contig_8552_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_80079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAAAAAAATTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480143	481292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_480100_481300
829794	contig_753_pilon	-	950	5	Intergenic	novelGene_112996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	51.3857957027037	702	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	25	489	1259080	1254281	FALSE	30	AATACTAAGGTTTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSCRTIVCVVCLEKPKYRCPACRVPYCSVTCFRKHKEQCNPETHPVKKKSSSLPIKTTKPVEDKDDESSIADFLNSDEEEDRVSLQNLKNLGDSAPLRSLLLNPHLRQLMVSLDQGDDKAKLMRAYMQEPLFVEFADCCLRIVEPSQNEDS	1259104	1253819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1254463_1255944_1256026_1257046_1257131_1258843_1258876_1258994
829796	SIRV6	-	407	3	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	47	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAACAACTTCGCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1542_1647_1735_1844
829797	contig_12019_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_87784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1243	junction_3	791.041876261933	12627	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	646	1047	765864	767304	FALSE	10	CCTCTGTGTCTGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMKKVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY	764786	767337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_765260_765343_765425_765772_765922_766639_766813_767133
829798	contig_3241_pilon	-	2229	1	Intergenic	novelGene_146413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACAGCTGGGAATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887600	885371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_885400_887600
829799	contig_16716_pilon	+	1807	6	Intergenic	novelGene_169279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	29.0489242485845	22	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	656	1009	166845	170709	FALSE	45	GCTAGAACCAGGATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELQENRECQLEKQTGEETLEQEDFITKREDFQEEEFQNDVEKAIVGHNQKDLTFRVSCRCSGAVGKTFTAQEVGRIIGIALMKQFGWKADLRNPNLEIFIHLNDIYSVVGIPVFR	155440	171507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_155588_156576_156755_164327_164464_166650_167064_168148_168227_170652
829800	contig_333_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_170916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTAAAGACTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25982	28050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_+_26000_28000
829801	contig_5018_pilon	-	870	5	Intergenic	novelGene_47157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTGGGGCCCCGTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500470	1498133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1498310_1498396_1498554_1499163_1499291_1499457_1499581_1500183
829803	contig_5041_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_27044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	168	476	461339	461031	NA	40	CCACTCTGTACAAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALVQGQQPLFQATGQHKLSVKQLILIYCSLSKPWSFSSSMPRIKATFETYNHNSLVWRPTGICLSWQLSIILFIPFLFPSNWENYGYFLHMAFIANLTSV	461506	460058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_460100_461500
829804	contig_2703_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_101854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACAATAAAATTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1412703	1412044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1412000_1412700
829805	contig_16098_pilon	+	1222	6	Intergenic	novelGene_45804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	33.2649966180669	113	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	277	393	109829	110161	TRUE	10	CAATCGGTCGCCTTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEQPPSVAPRGLEQEDGKQEELPSSVLELQQLVRCTRQEAWARQQAWEHEAERLRIEIVTLREALEEEAAARASLEGQLRVQREETGEAGFPMQPEDGAGAGPAGTEQGWAAGSTEATISLGPDGGGPTH	107596	111402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_107678_109405_109594_109821_109878_109971_110026_110147_110265_110676
829806	contig_14467_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_138245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGACAGAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294144	293840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_293800_294100
829809	contig_8866_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_77873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATAATGTTTTTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913074	912480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_912500_913100
829810	SIRV6	+	409	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	358	0	192	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
829811	contig_3942_pilon	-	620	5	Intergenic	novelGene_128835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	190.174262191286	251	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	283	564	1277064	1276273	FALSE	5	GCTTGAGTCCCTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCEDGLVEGEAGHAPARGLWPHRLQAEPAPSGTVGLQHARHGHWDLALWLLEHDEVEPRAQPPSRHPGLGPVPLKHHPRKQDVHGCPTPHQPRLMVSGFHRRLQIEDLEARIALMPLIQAEKDRRVLQMLRENLEEEAIIMKDVPDWKVGESVFHTTRWVPPMVGELYGLRMNDELLNANYGFMWYT	1283420	1276216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1276393_1276599_1276670_1276972_1277164_1278040_1278120_1283316
829813	SIRV6	+	437	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1540_1645_1736_1845
829814	contig_11396_pilon	-	1928	2	Intergenic	novelGene_71364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCTGCCTTTTAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805888	802166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_804019_805812
829815	contig_2463_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_43007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATTACAGCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394579	392750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_392800_394600
829816	contig_6576_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_42425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAGTAAGAGTAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299381	1299987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1299400_1300000
829819	contig_10734_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_51346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGGCAGCTCTTTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1703104	1703597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1703100_1703600
829821	contig_9434_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_150515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATTTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425446	423663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_423700_425400
829824	contig_1725_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_24317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTATTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242271	240731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_240700_242300
829826	contig_12964_pilon	+	2102	1	Intergenic	novelGene_131693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1567	1884	554218	554535	NA	45	TGGTGACAGACAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKWLCGFLYSLLYRWPLGPLATTHRGTRAGVVGVGKVCGAEVWGAHSGADWFTGNAACDPGSSALPPLPPRQWQEEEIQALVHLCKAAEEAACLRPGAHIGSEK	552651	554753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_552700_554800
829827	contig_20756_pilon	+	831	2	Intergenic	novelGene_176926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCTCTCACTTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11860	12889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_+_12562_12759
829829	contig_20756_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_176928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTGCAGGCGGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14032	14505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_+_14000_14500
829830	contig_10399_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_114502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAAAGGTTGGAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439015	440593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_439000_440600
829831	contig_15301_pilon	-	184	1	Intergenic	novelGene_176930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111217	111033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15301_pilon_-_111000_111200
829832	contig_6175_pilon	+	980	9	Intergenic	novelGene_16288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36.2655139216308	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGGAGACGGGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389900	1403455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154_1396213_1397562_1397662_1397764_1397851_1399127_1399292_1399417_1399611_1400927_1400981_1401374_1401479_1403348
829833	contig_14142_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_120563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	433229	432882	NA	35	ATTTTGACCAAAAGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433231	432453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432500_433200
829836	scaffold_880_pilon	+	645	3	Intergenic	novelGene_121414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_1	49	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	88	423	352652	420368	FALSE	10	TTCTTCCTGGTCCATCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLPSSERRAFALKINRYSSAEIRKQFTLPPNLGQCPRQSISTAGFPSLQLPQFYDPVEPVDFEGLLMTHLNSLDVELAQELEDFTDDDPDVVFTPKECRTLQPSLPEEG	352564	420590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_352705_406896_407000_420188
829837	contig_13878_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_165746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTTCACAAAAGCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511628	513211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_511600_513200
829839	contig_11356_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_175270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATTAAAGCACTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407972	409273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_408000_409300
829841	contig_3472_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_166935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTATTTTATGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293751	291947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_291900_293800
829842	contig_7165_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_116812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCAATCTACCAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77100	78934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_77100_78900
829843	contig_5954_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_28468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	45.2859396118775	69	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	75	512	176578	169233	TRUE	15	AGCTCCCTGACTATCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVRRGVGGVEEAEAGSGLRSGLAAMSRQAKDDFVRHYTVSDPRTHPKGYTEYKVTAQFISKKDPEDVKEVVVWKRYSDFRKLHGDLAYTHRNLFRRLEEFPSFPRAQVFGRFEASVIEERRKGAEDLLRFTVHIPALNNSPQLKEFFQGGEVTQLSEVSKDLHILPPPP	176652	166860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_167117_167405_167664_168702_168847_169127_169299_169396_169513_172981_173103_173324_173361_176479
829844	contig_4315_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_46744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGAGAAGAAGCGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188326	189353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_188300_189400
829845	contig_18364_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_102544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTTTGAAGAAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16475	18531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16500_18500
829847	contig_91_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_127128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGACAGAGCTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754966	753836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_753800_755000
829848	contig_826_pilon	-	1691	5	Intergenic	novelGene_154934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	626.519951797227	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	368	823	16013	12819	FALSE	30	CCTCTGGAAAATGGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGQQKGEDKSSDLAEDVEPKEAEEDDAEPKEAEEDDAEPKEESPPKEGVSGQASSENREGPPLGSMSSEKDDLFKDNPGSASAESSHFFAYLVTAATLVAVLYVAYHNKRKIIAFVLEGKRSKVTRRPKASDYQRLDQKVWVEAMQLHF	16554	11950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_12852_13256_13341_15627_15952_15998_16347_16520
829849	contig_7272_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_25424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	988	1395	942162	941755	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQWAGIKLLPSDGIRGLRGAGRHPKLFTCISSFNSPHNNLHLTEKETQRSYILCFRTATSEPVFILAPESAFVIPSPPGLSTGLECSGLEFKSQKWDVVVVLGVSSDSWRPCGAEYRGISYSGVWTTGTPLLPA	943149	940769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_940800_943100
829850	contig_5031_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_133210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTCAATGGCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85526	86513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_85500_86500
829852	contig_10904_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_22448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135388	135671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_135400_135700
829853	contig_13707_pilon	-	666	2	Intergenic	novelGene_43581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_1	0	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275549	274743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_275274_275413
829856	contig_8322_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_143284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566183	564877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_564900_566200
829857	contig_5899_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_146995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	90	222	311	560574	560485	NA	25	GTAAGTGGGGACGGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKSPSGSLGEHPRAACPILPEPARLCSRHLRAPDHRPLRSNCRAPPPQRPHLRPPRPLAAPPSRAPHTPRSSAMARENGESSSSWKKQAEDIKKIFEFKETLG	560795	560482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_560500_560800
829858	contig_8762_pilon	-	1406	7	Intergenic	novelGene_145288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	16.8027775481714	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	113	856	146704	72893	FALSE	15	CTTCCCAGCTCTATTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGGELFDRIVEKGFYTEKDASTLIRQVLDAVYYLHRMGIVHRDLKPENLLYYSQDEESKIMISDFGLSKMEGKGDVMSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDSKLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRNLMEKDPNKRYTCEQAARHPWIAGDTALNKNIHESVSAQIRKNFAKSKWRQAFNATAVVRHMRKLHLGSSLDSSNASVSSGLSLASQKDCAYVAKNRTLQLAFKYILGWGGGNSHLLSTYLLFVRHF	146816	72342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_73127_74713_74802_82015_82095_83365_83479_110423_110500_142802_142930_146677
829859	contig_19986_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_159226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTTATCATTTTTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27762	26988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_27000_27800
829860	contig_12080_pilon	-	1937	11	Intergenic	novelGene_128411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	506	844	496997	493579	TRUE	40	GCTATGCAGACAAAAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDSTAVGTGVGSEMPTSAEKPKVPCAPGVWEAQSSRQQGVQTAESGAGEGLESCNCQVAGNISRPLPDFSAHQGPSHSKFPSGTCSVSPHCWLQGRSISQLSAHPGMAPW	497502	485621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_485736_485831_485956_487382_487524_488468_488666_488920_489009_489107_489206_492134_492283_493301_493458_493551_493646_496095_496183_496812
829861	contig_14801_pilon	-	2056	3	Intergenic	novelGene_166529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.5	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	66	1820	132576	121699	FALSE	20	TCAGCAGTCACTGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQHRDTFIEERYGKYNISDPLMALQRDFETLKEKNDGEKQPVCTNPLSILKVVMKQCKNMQERMLSQLAAAESRHRKVILDLEEERQRHAQDTAEGDDVTYMLEKERERLTQQLEFEKSQVKKFEKEQKKLSSQLEEERSRHKQLSSMLALECKKATSKAAEEGQKAGELSLKLEKEKSRVSKLEEELAAEKKRGLQTEAQVEKQLSEFDIEREQLRAKLNREENRTKTLKEEMESLKKIVKDLEASCQHSSPNEQLKQPVTMSKGTATEPPVLVSVFCQTESFQAERTHGSNVGKVTNTGLPGSTTPTYTYAKTNGHCDPEIQPTRELLGSSAENQVLPREKSVGFTQEKPVENGGCPVGIESPIPMPSHLPSSGSSLSPSSTASSSLTSSPCSSPVLTKRLLGASASSPGYQSSYQVGINQRFHAARHKFQSQADQDQQASGLQSPPSRDLSPTLTDNSAAKQLARNTVTQVLSRFTSQQGPIKPVSPNSSPFGTDYRNLANTASPRGDTSHSPTPGKVSSPLSPLSPGIKSPTIPRAERGNPPPIPPKKPGLTPSPSTTTPLTKTHSQASSVATTEDLASSCSSNAVIANGKDVEILLPTSS	132641	121462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_-_123178_125093_125202_132408
829862	contig_3077_pilon	+	1012	7	Intergenic	novelGene_26865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	74.6205214550409	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	105	923	1337784	1342802	FALSE	30	AAAATGCCTTCTATTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQVPPSGARTVPQGRWATPSISGHQARVSGTDSPC	1336608	1342891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589
829863	contig_6102_pilon	+	939	6	Intergenic	novelGene_31947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	13.9656722000769	380	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	30	677	409986	412472	FALSE	5	GGCCGGACTGTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKDVPMKKPAGPSPSKPAAKPAAAAQPAAADPPAKAKDEPVATATVVPEKPEEPPIDLSKVVIEFNKDQLEEFKEAFELYDRVGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDELKSRRVDFETFLPMLQAVAKIPNRGTYQDYLEGLRVFDKEANGKVMGAELRHALTTLGEKMTEEEVESVLAGHEDVNGCINYEAFLKHILSV	409956	412734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_410181_410902_410931_411151_411296_411526_411701_412205_412284_412443
829864	contig_12299_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_29734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAGCTGGAACTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97917	99669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_97900_99700
829865	contig_7157_pilon	-	1962	2	Intergenic	novelGene_131318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	26	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAGAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019691	1004634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_1005612_1018706
829867	contig_9070_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_171950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGTGATGTGGATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127859	126609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_-_126600_127900
829868	contig_2414_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_158489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAAAACTAGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304937	306629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_304900_306600
829869	contig_14208_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_129092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTCACCAACACTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190631	188641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_188600_190600
829870	contig_3942_pilon	+	807	5	Intergenic	novelGene_128742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	312.457497109607	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	31	468	785181	790644	FALSE	20	GGGAAGGTTGCCTATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRVFCSRVLSMVNADDVNAIILAQKNMLDRFEKTNEMLLNFNNLSSARLQQMNERFLHHTRTLIEMKRDLDSIFRRIRTLKGKLARQHPEAFSHIPEASLLEDEDEDPIPPSTTTTIATSEQSTGSCDTSPDLISLPLSPGFEDCPEERLKVLRN	785150	790983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_785231_786164_786318_789060_789108_790165_790315_790605
829876	contig_6557_pilon	+	421	3	Intergenic	novelGene_32990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6391.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435145	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_435310_436686_436772_439911
829878	contig_8978_pilon	-	2022	6	Intergenic	novelGene_49367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	49.2341345003647	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	99	740	314311	313670	TRUE	70	AAAAAAAAAATACTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPDPSPSSGALDLLDTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDVEDQTLEPGPGGQTPEVVPPDPGAEANSSSPEGLLEPLAPDSPITLQSPRIEEEETTSITTGRRGSPGQEEELPQGQPQIPNGPPQPFSGRDSGGWNQRFSDQTWGP	315325	310474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_311318_311547_311843_312286_312360_312668_312713_313642_314331_315246
829879	contig_12624_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_60988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGACTCTTAAACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94634	93427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_93400_94600
829880	contig_2940_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_81965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAGAAAAAATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040315	1038561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1038600_1040300
829881	contig_500_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_31109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATAATAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554469	1555520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1554500_1555500
829883	contig_7202_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_16759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27873	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
829884	contig_10589_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_129371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTTTCATGTTCCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33133	31918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_-_31900_33100
829885	contig_15293_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_146536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	201	380	129433	129254	NA	20	CTGCTACACCTGTCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLSGNWASQIAAGGAWPGCEQKLELKTVTPCPALTSTDLDSHTRRVAVPVLLGHCSLWEGRLSPGMLVAWSLGNVPLHGEGSARPGAPPPLPRPGPGGLTTGSVRSPGRAVCLQSNSLCSTALE	129633	128288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_128300_129600
829887	contig_16970_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_157597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCCCAGCAACCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64814	66132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_64800_66100
829889	contig_2834_pilon	+	860	6	Intergenic	novelGene_27971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_5	2596.39154212149	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	186	677	274763	290627	FALSE	30	ATGACAAATGCCCTGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQA	238623	290810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290621
829890	contig_10159_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_30800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCCAGCCTGATTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349229	348202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_348200_349200
829893	contig_11396_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_71262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCCTTTACTAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137125	137433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_137100_137400
829894	contig_6494_pilon	-	604	5	Intergenic	novelGene_108573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1200.06611797017	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	221	583	3457	2133	FALSE	40	TAAAAGACACATGGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEGLLGNWIWSLDVAL	6492	2111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2670_2829_3297_3486_5564_5660_6395
829895	contig_3382_pilon	-	647	7	Intergenic	novelGene_124146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	34.1125587821651	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	127	645	896585	883945	FALSE	35	TACCCCTCAGGTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSAVIFTEATSFSHGVTAPKSRLQNRLLFHLAHKFNDEKKLMNFHQNLQDITEDQLSLASIHYMRSHYQEAIDIYKRILLDNREYLALNVYVALCYYKLDYYDVSQEVLAVYLQQIPDSTIALNLKACNHFRLYNGKAAEAELKSLMDNASSSFEFAKELIKHNLVVFRGGEGALQVLPPLVDVIPEARLNLVIYYLRQDDVQEAYNLIKDLEP	903487	883942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_883989_886994_887098_891134_891210_892972_893145_896460_896607_902362_902413_903432
829897	contig_16204_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_154521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	103	480	379209	379586	NA	40	TGAGATATATCAGGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPMGCPNKKQTKPIAIKFITTAHGGPMCYRVELFHSVFLAIIFTEAGHQAFLLWYFWVFKLPTFCLVAESTLFARPRDLYGFMGCPTEFGAKGRIILNIGVEGEEEGSRGWDANASQRGSQEFI	379106	380081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_379100_380100
829898	contig_7398_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_166161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134018	134774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_134000_134800
829899	contig_1759_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_171343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACAGAGGAGAACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82656	83110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_82700_83100
829900	contig_1759_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_171342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCTCCCAGATTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82242	82692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_82200_82700
829901	contig_5551_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_134278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGACAGATACATTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768026	766202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_766200_768000
829902	contig_5640_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_27249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTATTAACTGGGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60257	61919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_60300_61900
829905	contig_7165_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_116862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	157	465	394317	394009	NA	40	GAAATTATTGAGATTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVACTLRKGTWSLALEGSEQTIFSNYCVCLFSPVWGMPERLKEGAYLGLPCFGACTGLRALSWQESEVVTTYSHLGLKNVIHAYSRPLNIGRRTQGILFGN	394473	393174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_393200_394500
829906	contig_5765_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_141426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGACTGTTGTGATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935139	935895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_935100_935900
829907	contig_9683_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_151293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATATGCGCTTGGTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557271	556364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_556400_557300
829908	contig_14023_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_165373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGGCAGAGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224719	224020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_224000_224700
829909	contig_8069_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_136770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACACAAAAAAGTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261399	261890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_261400_261900
829910	contig_1154_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_87234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGTGTTTGTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658216	1659324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1658200_1659300
829912	SIRV6	+	402	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	561	164	29	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTGTATCGTGCCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
829913	contig_13014_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_169342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTAGGTTCTTTAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378829	380286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_378800_380300
829914	contig_960_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_108221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324723	323506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_323500_324700
829915	contig_4228_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_151174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATTTGCTTTTCATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481817	481156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_-_481200_481800
829916	SIRV6	+	346	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10402	2	1252	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
829917	contig_9924_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_175926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	906	299	1204	128110	129015	NA	70	AGGAAAAAGGAAACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDD	127811	129017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_127800_129000
829918	contig_6634_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_171148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAATTACCTAAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301278	301827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_301300_301800
829919	contig_7697_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_128276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1215	1514	139405	139106	NA	5	ACCGTGCCTGTTCCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHATSSRKPSPLTQLHCPTGHFCGFQLLMMHVGGGCHLGGSHLPKSTGSPGGQGGAGLGRARPKLDVSTSGPVTKFADRWSCLVYPPSPGEKSLWPLP	140619	138862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_138900_140600
829920	contig_10616_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_175610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	47.377913278939	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	69	369	437	1018080	1018012	FALSE	45	GGGGTAAAAGAAGAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAYDQQIWEKSVEQREIKGLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSAFAKAKPESPWTSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCSASSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTVHCQIVSTRTPKPPLST	1033395	1018010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_-_1018161_1025243_1025403_1025980_1026051_1033336
829921	contig_15327_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_70414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAACAAAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25640	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25600_27600
829923	contig_16103_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_118786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTGCTTTTTAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569402	570617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_569400_570600
829926	contig_12767_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_175749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTGTGCAGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6280	7449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12767_pilon_+_6300_7400
829927	contig_19518_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_170735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAATATGAAGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61708	60300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_60300_61700
829928	contig_9099_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_149904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313978	315287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_314000_315300
829929	contig_8291_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_99947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAAATATGCCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252746	251926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_251900_252700
829931	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
829932	contig_9633_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_139633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCGTGTGTTTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081181	1080183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1080200_1081200
829933	contig_13894_pilon	-	1089	4	Intergenic	novelGene_62042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	240.680055029263	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	274	1011	287445	286290	FALSE	10	TACTTCTGCAGGTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288313	286211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286475_286774_287102_287219_287538_288132
829934	contig_14643_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_99137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108910	109508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_108900_109500
829935	contig_3601_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_132916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATGTGTATATACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284825	286115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_284800_286100
829938	contig_9727_pilon	-	1932	12	Intergenic	novelGene_86285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_10	275.13395685534	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	139	1458	163331	141234	FALSE	50	AATAATTGGCAGGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPALGLDLRSLLGLLLFQLMLLLLPPPTAGSGGQGPVPRVRYSAGDGRRVLSRFQQKDLQDFDILLLSDDGNTLYVGAREAILALNIQDPGVPRLLNMIPWPASDQKKTQCALKRQNYETECFNFIRVLVSFNATHLYACGTFAFSPACTFIELKNSNLMPILEDNVVEGKGQSPFNPAHKHTAVLVDGMLYSGTMNNFLGSEPILIRTLGQPVLKTDTFLSWLHPDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEIDFFEKVYTSRVAQVCKNDVGGEKLLQRKWTTFMKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTSE	169674	140759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156455_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417_159579_163192_163361_165639_165728_169653
829939	contig_15185_pilon	+	908	5	Intergenic	novelGene_99416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	16.6339261751398	463	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	78	380	228773	230224	TRUE	15	GCTAATGGCTGTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGKVGTRGKKQIFEENRETLKFYLRIILGANAIYCLVTLVFFYSSASFWAWMALGFSLAVYGASYHSMSSMARAAFSEDGALMDGGMDLNMEQGMAE	228695	230856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_228779_229390_229487_229942_230003_230083_230471_230574
829941	contig_1639_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_74929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAGAAAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403464	404248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_403500_404200
829942	scaffold_12124_pilon	+	1062	4	Intergenic	novelGene_22181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCCTGTCTTTGCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229088	1292650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1229544_1253573_1253780_1260053_1260156_1292351
829945	contig_5640_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_27246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTATTTTTTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39956	39117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_39100_40000
829946	contig_5640_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_27245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAGGAAAAATAGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39167	38257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_38300_39200
829947	contig_6837_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_149837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	113	421	91617	91925	NA	5	GTGCAGCCCTGCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPRGRMVDTSRLETYPGSNSVLVMAESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKVSLREG	91504	92581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_91500_92600
829949	SIRV4	+	281	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGGGCCAATAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
829950	contig_14483_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_133745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATCTAAGTCTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36111	37365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_36100_37400
829951	contig_10196_pilon	+	681	5	Intergenic	novelGene_132041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	64.4452286829677	219	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	171	608	643457	648579	FALSE	15	GATACTGCTGGTTTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSPHLSPTVVWQVNSAKCTLLFWHLLYSQYYKICFEFCNFVAF	639736	648652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644613_648452
829952	contig_3942_pilon	+	290	3	Intergenic	novelGene_128664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2887	junction_1	82	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGGGCCCAAATGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179142	180120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_179177_179714_179825_179974
829953	contig_6546_pilon	+	527	4	Intergenic	novelGene_140974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4615.59099381891	24	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAGCTGTTGATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597576	599694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598433_599246_599365_599577
829954	contig_5649_pilon	-	1835	7	Intergenic	novelGene_82338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	17.5380538639079	113	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	66	869	574091	562342	FALSE	10	TTTAGTTTGGATTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGTRGAGLLFDRPCFLGGGYMNAVALVGYSSSGSEDEAEAGARAPARPGAGGGRRDQTPLPSQRLPVPDSVLNMFPSTEEGPEDDGAKHGGRVRTFPHERGNWATHVYVPYEAGEEFLDLLEMLLPHAQTCIPRLVRMEEFHLSLSQSVVLRHHWILPFVQALKDRMASFQRFFFTANRVKIYTNQEKTRTFVGLEVTSGHAQFLNLVSEVDRVMEEFDLTTFYKDPSFHVSLAWCVGDARPQLEGQCLRDLQEIVDEFEDSELLLRVHAEQIRCKSGNKFFSLPLK	574156	561375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_562447_563694_563779_564659_564766_568260_568315_570424_570609_572453_572621_573987
829955	contig_7894_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_170796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTACAAGATAACTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310246	309379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_309400_310200
829956	contig_19132_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_169993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTGAGTTTGATAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334555	335353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_334600_335400
829957	contig_19132_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_169994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAATAAACCAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335752	336083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_335800_336100
829958	contig_11631_pilon	+	785	6	Intergenic	novelGene_104211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_5	460.91977609992	367	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	90	629	261647	283438	FALSE	0	TTTCCTTTTGTTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	261557	283594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390_281540_283353
829960	contig_10324_pilon	-	1602	2	Intergenic	novelGene_7755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCATTTTTGTGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73665	71975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_73233_73320
829961	contig_4732_pilon	-	583	4	Intergenic	novelGene_75396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	230.090320429947	172	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	523907	516745	FALSE	5	TCGCTTCTGTTTTCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTEDGVCHSLHPAVEELDIWGRIFLSPSVHPRPSLHLCIPEPSLPPDLRTSPRGTCSLTSFSSYSKTCRRSCSCATRRSPSELSLLPSSLWAPATNSPTITTALATAAGKPPLPQSSCPPRRRWCQASQQRAQWQPLRRKQ	523909	516592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_516777_519120_519271_523305_523489_523843
829962	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
829963	contig_5210_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_65443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_2	21	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	7	336	565764	606926	FALSE	55	TCTTAAAAGGAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKMAAPEEQDLTQEQTEKLLQFQDLTGIESMDQCRHTLEQHNWNIEAAVQDRLNEQEGVPSVFNPPPSRPLQVNTADHRIYSYVVSRPQPRASYFAAEISPIFLIRLCYTV	565757	608050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565827_591290_591360_606728
829964	contig_6595_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_122548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGAAAGGTGAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649494	647846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_647800_649500
829967	contig_6086_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_171466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101099	102641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_+_101100_102600
829968	contig_3948_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_53167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTGCAGGAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236646	235648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_235600_236600
829969	contig_4418_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_98366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTCAAAATTAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756474	757311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_756500_757300
829970	contig_10074_pilon	+	1068	9	Intergenic	novelGene_57180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	55	441	559614	561999	TRUE	10	CTCTGCCTGGGTTGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAGGRRRHHGGRGRAVMWQSPGDGHRRGIVGLCLTRGPGCFCRNCTRRKQVWLFLMNRPSVVDPRGPGLGPSGNYRSPATACGKAELSSVSWPYYRTCLFSSGRYLKSIDSLTSWSDGLLSCIFTVTGSVIALQYGGVLKTMAT	559559	586283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_559726_560821_560883_561015_561091_561860_562073_562180_562289_563789_563906_577116_577198_583722_583871_586182
829971	contig_10734_pilon	-	923	6	Intergenic	novelGene_51117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	187.293352791817	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	81	767	739047	737389	FALSE	0	CTCCCTGTTGTGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKQATRGDGLAFQMRAGLLP	739506	737232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737446_737526_737597_738019_738138_738215_738501_738890_739059_739437
829973	contig_3956_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_14706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCCAGAGACTCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35250	34247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_34200_35200
829974	contig_10658_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_130076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	738	1244	187148	186642	NA	40	ATAAACCCATGTTAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLSSYFLKCPFSASSHGNFRTILLPKLAFSGCVGLFLKPAWSDLEPASLQRQVVVCSPLGACTLQFTSFATLSADPFSSPPGATFVADSIWFHRPLRRGGEGHLAWPTNLPHLEQFANCSLREPVPSPEQAAPVTAIVCGDQFAFSQMTCLLVERCEKLETKMVSTE	187885	185804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_185800_187900
829976	contig_15277_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_175421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCTAAACCTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198682	198437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_198400_198700
829978	contig_12654_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_129314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACATCAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789405	788989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_789000_789400
829979	contig_15866_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_63622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTAGAACATACATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437743	437309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_437300_437700
829980	contig_18081_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_23815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTAATTTGCGCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166550	166952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_166600_167000
829981	contig_11078_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_171999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGTAAATTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247432	246725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_-_246700_247400
829983	contig_4783_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_108381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGGTAACATGCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215035	215702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_215000_215700
829984	contig_7815_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_134399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAGGTTCACAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765779	766323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_765800_766300
829985	contig_3787_pilon	+	904	2	Intergenic	novelGene_102404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	64	321	526794	528882	FALSE	65	GAAAATAAAAATGAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLVEFADEDGCKRFSSYYCSLMISLIQKCWVLWEGCQTRLEAGFLGKNMFFPFCGKTHRRADFKTLPRCESELLTTVRGSVNSCFEIFMWSLKKIKDNCWEVDMES	526730	529465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_526942_528772
829986	contig_16525_pilon	-	398	3	Intergenic	novelGene_133848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	47	337	181436	178157	FALSE	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYDVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181482	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178588_178686_181388
829987	contig_8330_pilon	-	1163	2	Intergenic	novelGene_71936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	613	junction_1	0	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345214	1322638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1323522_1344934
829990	contig_10962_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_103928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATAGAGAAAATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763363	763967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_763400_764000
829993	contig_14357_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_121702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCATCATGGCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723795	725356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_723800_725400
829995	contig_6710_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_89165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
829996	contig_5083_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_151644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTCATGTTGCAAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248078	249500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_248100_249500
829998	contig_15114_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_121207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTTACAGGCAAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806862	805866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_805900_806900
829999	scaffold_8345_pilon	+	1506	8	Intergenic	novelGene_106999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.13546137889432	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	117	1088	518091	539401	FALSE	0	TGCTGGCCTTTCTTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTNNFKTPSKLSEKKKSVPCSTPCINIPASPFMQKLGFGTGVNVYLMKRSPRGLSHSPWAVKKINSKCNDHYQNMYQKRLTDEAKILKNLHHPNIVGYRAFTEASDGSLCLAMEYGGEKSLNDLIEERSKDSNNPFPAAIILKVALNMARGLKYLHQEKKLLHGDIKSSNVVIKGDFETIKICDVGVSLPLDENMTVTDPEACYIGTEPWKPKEALEENGIITDKADIFAFGLTLWEMMTLSIPHTNLSDDGDDEDKTFDESDFDDEAYYAALGTRPPVNTEELGESYQKVIELFSVCTNEDPKDRPSAAHIVEALEMNVQ	485144	539819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_485241_518070_518149_522857_522952_534210_534354_535020_535191_536690_536821_538520_538698_539201
830000	contig_7272_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_25399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACTTTTCTTACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770786	771516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_770800_771500
830001	contig_8520_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_85458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTAAAAAATTAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312901	311897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_311900_312900
830002	contig_4364_pilon	+	1151	7	Intergenic	novelGene_165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	864.625111440405	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	131	745	1268714	1270037	TRUE	25	CTCCAAAGGAGCCAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1266975	1271066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1270278_1270900
830003	contig_8059_pilon	+	1296	10	Intergenic	novelGene_111117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	93.1223806492176	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	173	460	266127	279478	TRUE	60	GTTTGTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGADLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKVRNFTFL	254903	342005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_255005_266055_266137_275614_275704_278459_278541_279370_279483_283690_283736_292994_293069_336424_336500_338661_338891_341596
830004	contig_10437_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_38373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATGAAATCTCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569072	570504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_569100_570500
830006	contig_6914_pilon	-	1031	7	Intergenic	novelGene_151745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.62476052848859	217	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	75	995	156681	152948	FALSE	10	GTTACTGTTACTGGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRERQAAGLKARVVCRAQWNLACPMALRVLTRTLGSLSLAPPAASTPAQNLLPAAQVIRNAFLQPLFASKLLPCRPVLTFVALNAKFVSWKSHTKYTVTPVKMKKSGGRDHTGRIQVHGIGGGHKQRYRMIDFLRFRPEQEAMRGPFEEKVIVVRYDPCRSAHIALVAGGSRKRWIIATENMKAGDVILNSDHIGQMAVAAQEGDAHPLGALPVGTLINNVESEPGRGAQYIRAAGTCGVLLRKMNGTAIIQLPSKRQMQVLETCMATVGRVSNVDHDKRVIGKAGRNRWLGKRPSSGLWHRKGGWAGRKIRPLPPMKSYVKLPSAAAQS	156755	152911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_153161_153529_153604_153901_154013_154088_154205_154316_154459_155067_155237_156585
830008	contig_2969_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_157079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGTTTTCTGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966109	966454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_966100_966500
830009	contig_2450_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_160318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	127	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	285	858	106	963	781953	781096	NA	60	ATTTAGTAAAAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTENKHSFQDTQFQNPTWCDYCKKKVWTKAASQCMFCAYVCHKKCQEKCLAETPLCGAADKRMDRTLKNLRLEGQETLLGLPPRVDADASKSVNKTTGLTRHIINTSSRLLNLRQVSKTRLAEPGTDLVEPSPKHTPNTSDNEGSDTEVCGPNSPSKRGNNTGTKLVRKEGGLDDSVFIAVKEIGRDLYRGLPTEERIQKLEFMLDKLQNEIDQELEHNNSLVREEKETTETRKKSLLSAALAKSGERLQALTLLMIHYRAGIEDIESLESLSLDQHSKKVIKYTDDAEEDLDNEITQLIDSQPFSSMSDDLFGPSESV	782058	780120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_780100_782100
830010	contig_12841_pilon	-	1535	13	Intergenic	novelGene_55892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_1	67.1966434346902	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	124	1059	931768	892602	FALSE	0	GTTTTGTTTTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVNQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIESGAEAKKLPGVGTKMAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFEDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEIKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHRVVEQLEKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLARENDEKEYPHRRIDIRLIPRDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRTHALEKGFTINEYTIRPLGVTGEYSCLH	931891	892125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_914691_914765_914862_914918_916588_916641_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
830011	contig_5018_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_46994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACCAGATTTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793458	793801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_793500_793800
830012	contig_6871_pilon	+	740	4	Intergenic	novelGene_21664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	4.92160768674447	728	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	34	381	795206	796188	FALSE	15	GTTGTGCCAACTAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAAAREKPAAMNGEPGEISLAPPPGEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASAVKEQYPGIEIESRLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYEKDLIEAIRRASNGEPLEKITNSRPPCVIL	795172	796547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396_795495_795945_796023_796104
830013	contig_5321_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_153861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCAGACCAAGGAGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3106	4103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_3100_4100
830016	contig_5526_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_111702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATTTAAAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326739	327960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_326700_328000
830017	contig_4531_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_47930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCACAATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632729	631460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_631500_632700
830018	contig_7976_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_169425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910266	911974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_910300_912000
830019	contig_10341_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_47255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGCCTGGTGATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208814	209903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_208800_209900
830020	contig_3942_pilon	-	683	2	Intergenic	novelGene_128729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCAGTATGGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644913	643982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_644150_644397
830023	contig_14814_pilon	+	643	3	Intergenic	novelGene_137703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	664	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAACTTCCGCCTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279160	283806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_282889_282925_283559
830024	SIRV6	+	434	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	333	0	167	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
830025	contig_5484_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_151105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGCCATGGAGTTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295934	294635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_294600_295900
830026	contig_5484_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_151104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294635	294345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_294300_294600
830028	contig_15043_pilon	+	2192	19	Intergenic	novelGene_175497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	137.119124563234	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2151	41	2191	92512	234222	FALSE	50	AAAGAAAAGACCGATTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVEPRRRPAAFDAMFRRSWNRFCAGEEKRVGTRTVFVGNHPISETEAYIAQRFCDNRIVSSKYTLWNFLPKNLFEQFRRIANFYFLIIFLVQVTVDTPTSPVTSGLPLFFVITVTAIKQGYEDWLRHRADNEVNKSTVNIIENAKRVKKECEKIKVGDVVEVQADETFPCDLILLSSCTSDGTCYVTTASLDGESNCKTHYAVRDTIALCTAESIDTLRAAIECEQPQPDLYKFVGRINIYSNSLEAVARSLGPENLLLKGATLKSTKKIYGVAVYTGMETKMALNYQGKSQKRSAVEKSINTFLIVYLFILLTKAAVCTTLKYVWQSYPYNDEPWYNQKTQKERETLKVLKMFTDFLSFMVLFNFIIPVSMYVTVEMQKFLGSFFISWDKDFYDEEIKEGALVNTSDLNEELGQVDYVFTDKTGTLTENSMEFIECCIDGYKYNGVTEEVDGLSRTDGPLTHFDKADKNKEELFLRALCLCHTVEIKTNDAVDGATESTELTYVSSSPDEIALVKGAKKYGFTFLGTRNDCMRVENQRKEIEEYELLHTLNFDPVRRRMSVIVKNQKGDIYLFCKGADSAIFPRIQIPEPESTKLRNAIDSTKQHVERSAMNGYRTLGVAFKNIAPDDYERINRQLIEAKMALQDREEKMEEVLDDIETNMNLIGATAVEDKLQDQAAETIEALHAAGLKVWVLTGDKMETAKSTCYACRLFQTSTELLELTTKTIKEC	92471	234223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_92539_190897_191018_197545_197636_199992_200074_203137_203246_207898_208028_209782_209887_212260_212312_213289_213355_213688_213771_215708_215860_217413_217612_224059_224222_224900_225053_225840_225913_227907_227982_229799_229931_230387_230570_234050
830031	contig_10196_pilon	-	2051	19	Intergenic	novelGene_132065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	75.8066294048772	5	24	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	917	1957	726449	721660	FALSE	20	TGGCTAGGAGTGGGAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGAHLKECEHIKCPHSKYGCTFIGNQDTYETHLETCRFEGLKEFLQQTDDRFHEMQVALAQKDQEIAFLRSMLGKLSEKIDQLEKSLELKFDVLDENQSKLSEDLMEFRRDASMLNDELSHINARLNMGILGSYDPQQIFKCKGTFVGHQGPVWCLCVYSTGDLLFSGSSDKTIKVWDTCTTYKCQKTLEGHDGIVLALCIQGCRLYSGSADCTIIVWDIQNLQKVNTIRAHDNPVCTLVSSHNMLFSGSLKAIKVWDIVGTELKLKKELTGLNHWVRALVAAQSYLYSGSYQTIKIWDIRTLDCIHVLQTSGGSVYSIAVTSHHIVCGTYENLIHVRPPAPSP	741254	721565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_721678_722378_722508_722691_722815_722894_723012_723113_723154_724788_724872_725003_725132_725235_725285_725381_725456_725537_725756_726387_726523_726603_726790_727376_727411_727910_728004_728384_728502_730700_730793_732461_732550_733360_733479_741139
830033	contig_10405_pilon	-	797	6	Intergenic	novelGene_165862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	24.4899979583503	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	327	797	290652	281138	FALSE	25	ACTGATGTGGACTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVFGLLSTSCRSVLASSQPFPAEPVQKKEEDSNMKREREQLKEHFSAWDRPHGLVGLHNIGQTCCLNSLIQLFIMNVDFAKILKRITVPRGVEEQKRSVPFQLLLLLEKMQDSRQKAVQPLELAYCLQKYRVPLFVQHDAAQLYLIVWNLIKDQI	297507	281137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_281203_283893_284040_289014_289112_290489_290756_296314_296346_297315
830035	contig_14528_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_111286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.8767264973791	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	243	587	250227	247022	FALSE	10	GTCTTCTTGTACTCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQFRSYVWDPLLILSQIVLMQTVYYGSLGLWLALVDGLVRSSPSLDQMFDAEILGFSTPPGRLSMMSFILNALTCALGLLYFIRRGKQCLDFTVTVHFFHLLGCWFSPKSNV	250676	246081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_247042_247167_247263_248485_248554_250065_250305_250511
830036	contig_2773_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_174282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTTGAATGCCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212489	211096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_211100_212500
830038	contig_4574_pilon	+	455	2	Intergenic	novelGene_174918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	18	455	32211	32790	FALSE	25	CTGCACTTGAGGCCAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGPEDGGIRVLCSSGGWFPKPKVQWGDMAGVKLPSFSESQTQDGDGLFHVEASLVVTDSSLGNVTCSVQNPVSGQEKVSAIFLPEPFFPRMSPWKAALSGTLPVLGLLLIGISYIGWTEHKAKQREIEKTEEEARKRDETEKRRK	32193	32790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4574_pilon_+_32467_32608
830039	contig_3789_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_79880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546445	547469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_546400_547500
830040	contig_14687_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_107915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAATAATAGGGTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455619	456040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_455600_456000
830041	contig_1270_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_170863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22065	22521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1270_pilon_+_22100_22500
830042	contig_11929_pilon	+	186	2	Intergenic	novelGene_171228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGATACATATGTGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6914	36857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_7027_36783
830045	contig_12125_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_76205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	74	346	121190	120918	NA	30	AAAGTTACTTGTTATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFLTPPAGAARRTQRWSWYPAASTMSHQTGIQGNDARRGPRGRGSREAWQSLAGCGVGRALVELGVRGVGLAGRTGPLRLSTLPFPGSAGLCPSQPGPTAVTLDRAEIQRNEGN	121263	119093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_119100_121300
830046	contig_13954_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_130050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36543	38351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_36500_38400
830047	contig_15108_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_131195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	114	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTGACAACAGCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172971	170945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_170900_173000
830048	contig_6164_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_121300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGAAACTTTCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698193	697355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_697400_698200
830049	contig_6102_pilon	+	512	4	Intergenic	novelGene_31976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1545.32614321019	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413057	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414570_414788_414877_414956_416018
830050	contig_10982_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_87894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCACCTTCTCTTACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201303	200501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_200500_201300
830051	contig_10982_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_87893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGATGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200097	199905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_199900_200100
830053	contig_2757_pilon	+	1925	12	Intergenic	novelGene_164572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	13.7642488154837	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	508	1383	72694	78810	FALSE	25	CAAGAGTGAGGGAGTCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWFRAMDRLSETESYNLSCELEPPSESASNTLKAKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSSSCHSKSCDQLKCSPYLSSGDTAEVLSVHSAGSSSSDVEEINMSFVPESPDCQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSSSTTPVASTRTHKRSVSGVCSYNSSLPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPTVIRKAMDKHNLDEDEPDDYELVQIISEDRKLKIPDNANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGAKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF	68557	79352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_68607_68968_69073_69586_69672_71052_71123_71595_71683_72254_72288_72614_72738_72921_73018_73317_73520_73719_73963_75322_75438_78634
830054	contig_13519_pilon	+	2386	17	Intergenic	novelGene_124644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	5.14174095030078	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2307	79	2385	133891	158873	FALSE	65	TGGAAGAAAAAATGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRSAGTRAPDPPLKFPVAYNLSPDSMNGKEDDLSLLTALLEENESALDCNSEGGISLTQEVGEPDQFDELFDADGDGESYSEEADDGEVGRTEDQKENLATLFGDMEDLTDEEEVPTSQSTTNRTLPSPAPAPAPGQEKTNQELQDELRKLQEQMKSLQEQLKVATIKEPASPVLLHKSPVGKFPRPPLKEKKVQRIQESTYFSAALDVSPLPKTKRVAQAPKVSPAGPKSSTSGMTSAPSQPLRTLPGNKPSGMPGDQSIRSSAGSSGELAQTVSVEAFSGLRLRRPRVSSTEMNKKMVGRKLIRLSQIKEKMASETLEEIDWVTFGVIVKKVTPQSSNSGKTFSIWRLNDLRDLTQYVSLFLFREVHKELWKTEQGTVIGLLNANPMKPKDGSEEVCLSIDHPQKVLIMGEALDLGTCKAKKKNGQPCTQMVNLNDCEYCQYHVQVQYRKLSAKRADLQSTFSGGRIPKKFARKGMSLKERLCQDGFYYGGVSSASYAASVAAAVAPKKKIQTTLTDMVVKGTNLIIQEKQQKLGIPQKNLSCSEEFRELMDLPTFGARNLKHLANAKTSGIMGNAKPAIQSISASALLKQQKQRMLEMRKKKSEEIQKRFLQSSSKGESPALPSSSRQPPCQSPRTGAEFPRLEGVPATKTPKLGRGVSEGDDVLFFDESPPPRPRLNALAEAKKLAAITKLRAKGQILTKTDPNSIKRKQMDQEDVLKMKNCVEKNNTISPQAEDELEPARKKWRKQLAYMESEEFQKILKAKSKYTGILKETEAELQEHYFEPLVKKEQ	132499	158874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_132523_133835_133898_139146_139501_140471_140577_140716_140858_142521_142697_143387_143554_145238_145407_146860_146978_148990_149191_151128_151230_152099_152208_152684_152803_154558_154788_156048_156194_156831_156951_158819
830058	contig_4364_pilon	-	873	5	Intergenic	novelGene_214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	40.9542427594505	134	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	328	627	1353682	1351496	FALSE	5	GCGTGTGCCATTCGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGVMPAAAPAAAEVAEEEDIPKQKERTHFTVRLTEAKPVDKVKLIKEIKNYVQGINLVQAKKLVESLPQEIKANIAKAEAEKIKAALEAVGGTVVLE	1354826	1351249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1351613_1351721_1351860_1353637_1353713_1353795_1353984_1354717
830060	contig_10000_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_139345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326946	326361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_326400_326900
830061	contig_953_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_130021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGAGCCTCCGAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583726	583327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_583300_583700
830063	contig_6227_pilon	-	2070	2	Intergenic	novelGene_49704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	0	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	33	305	1136676	1135450	FALSE	20	GATGATGGAGACCCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKDDIRYLLTMDKLWRKRKPPVPLDWAEVQSQGEETNASDQQNEPQLGLKDQQVLDVKSYASLFSKSIETLRVHLAEKGDGAELIWDKVRFHNVWQLLIY	1136708	1133684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1135656_1136609
830064	contig_9132_pilon	+	419	3	Intergenic	novelGene_121359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTGTTCACAACGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35937	36635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_36102_36227_36398_36550
830066	contig_11978_pilon	+	1382	4	Intergenic	novelGene_63136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	605	928	1987839	1989309	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRLMPIFDAHAHIKQGGNGTPRKGVGWCSGTTHWVVACGHAIPWAASRGQVLFHHVFNCFCNEGQGWGVGLNGFSFPPNSPHRHRDGHTSLNNFGNEVICADECI	1987234	1991494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1988113_1989259_1989366_1989475_1989571_1991191
830068	SIRV6	+	347	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	526	0	360	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830069	SIRV6	+	333	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	540	0	374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830072	contig_9121_pilon	+	824	7	Intergenic	novelGene_134467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	459	junction_6	174.861611948802	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	96	824	227863	292357	FALSE	30	GTGAGTAGAAATCCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRGKVFKREPSEFWKKRRTVRRINQGEVYRLSCQEKPRLLEPLNYETVIEELEKTYGNDPLRELLFFPNDDFSTATVSWDIRTLYSTVPEDAANKAESLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYSGDVRQLPRAEYKPEKLPSHSFEVDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGPGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQ	227767	292357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_227968_246462_246583_261230_261321_277383_277467_291496_291570_291842_291966_292222
830073	contig_5331_pilon	-	1345	4	Intergenic	novelGene_112825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6.59966329107444	83	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATCCCTAAGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751997	739894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_740573_740981_741224_745363_745539_751747
830075	contig_9706_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_21004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCTACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493105	494883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_493100_494900
830076	contig_15172_pilon	+	1394	7	Intergenic	novelGene_158773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_4	8.69386757049665	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	96	935	279714	287400	FALSE	15	GATCTGGTCTGGCACCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETRNLPPPLPPRLDWFVHTQAGQLAQAGVPTWFHGAISREAAENLLEPQPLGSFLIRVSHSHVGYTLSYKAHGCCRHFMVKLLDDGSVMIPGERAAHTSLDALVTFHQQEPLWPYGELLTQPCGQEDPANIDYEDLFLYSDALAQETASPAHDPSEHQGLSPCLAAASEKTVGSGKTGNPSGLFTTASPAPPRGPDTSKASLKPVLLRWPKERKPSAEMDGASPENTASSCPTKTPFQVTCRKLWKSLKTLPPNGQEGPAAAEIPPGGCELAIALGY	275991	287859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_276068_279694_279839_282065_282156_283386_283553_284225_284361_285285_285373_287163
830078	contig_13097_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_107734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATTCTTTAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246798	247964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_246800_248000
830081	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10493	1	1256	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
830083	SIRV6	+	327	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	546	0	380	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830084	contig_4301_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_65137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585380	586718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_585400_586700
830085	contig_1996_pilon	+	679	3	Intergenic	novelGene_131902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	172	339	254898	255065	TRUE	5	CTCTCCTGCGTGTTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAPQTLATHHRAGQRPWEGRGPALGCRGTRLQLRPDQVVGVAVVSLTFSPQLFITVMDKLRLEIRAMDEVTFLLGLGLGLLQGRACGPFCFLRGGRLGVGPSGLVVSADPA	250401	255579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_250451_254775_255147_255320
830086	contig_859_pilon	+	803	6	Intergenic	novelGene_132821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	279.113167012952	346	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	167	619	94720	130974	FALSE	20	CAGCTTTTCTCTTAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGARGLRATYHRVLDKVELMLPEKLRPLYNHPAGPRTVFFWAPIMKWIKGVRFKEYQVQRRGDFPVMLLLGLVCAGLADMARPAEKLSTAQSAVLMATGFIWSRYSLVIIPKNWSLFAVNFFVGAAGASQLFRIWRYNRELKAKANK	94553	131158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_94829_111900_111942_116102_116172_118678_118764_119225_119338_130937
830087	contig_12424_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_174274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180188	180538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_180200_180500
830093	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
830095	contig_7171_pilon	-	717	6	Intergenic	novelGene_101389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	914.886965695763	44	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	192	608	1372066	1363476	FALSE	40	GTTTGGAAAATAACTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVCSLFDPGRPAGLAAELENYDDPHKTPASPVVHIRGLIDGVVEADLVEALQEFGPISYVVVMPKKRQALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQKISRPGDSDDSRSVNSVLLFTILNPIYSITTDVLYTICNPCGPVQRIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKGN	1377112	1363366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363485_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690_1372810_1377053
830098	contig_8286_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_139783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	11	424	33701	33288	NA	40	ATGTGCAGTGCATGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKEMEDRSTLAAAGSFSFLPSYLTDQSRNSTALRRPHRRHLISYFYISQGSSRHKARKTRLTYTQAPLWWLWGLLCQSPYSDGSYSLTAATDPRTLGNLILKDSGCPWSSFPKSADWRLVLIGNCRTTVLHSLNTYPDFN	33711	32255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_32300_33700
830099	contig_14528_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_111289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCAGCATTGCTCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247381	246363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_246400_247400
830100	contig_15825_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_160200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGCGACCCTACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66856	65626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_65600_66900
830104	contig_11396_pilon	-	477	5	Intergenic	novelGene_71399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_4	618.59816318835	26143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555591	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554413_1554470_1554871_1554944_1555079_1555294_1555518
830106	contig_7146_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_162056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATCACATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182185	180704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_180700_182200
830110	contig_3825_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_77970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	626	925	27258	26959	NA	10	TTATACTGTGTTTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSQESGCRTGVLRLRLHSGRLARAPHTTQACQQCHPTSRPATSCLANLQWGQLPWGSTVTADSRARGLVTSHLTFPEQALKSTGADLAVVPVHLLPG	27883	26802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_26800_27900
830111	contig_10246_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_46884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTGATGAAGCATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88671	87429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_87400_88700
830112	contig_4065_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_133408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAAAATTTTTTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829542	830982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_829500_831000
830116	contig_9895_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_144697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	778	1113	320526	320861	NA	25	CATACTTGGCTTCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKRLPLWLHTFIVSQSLVRSFTKTTQTSKASAFFTSGSEWMRNAFKVQVNFRSILDFTFIRALLGTFLVFVDRLLFSQRCVENLRPLRLLMHLYSYPVIYMWKAYLFTL	319748	321249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_319700_321200
830117	contig_15866_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_63658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAAAAAAAAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572437	573276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_572400_573300
830118	contig_3960_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_138033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCACAACCATAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566186	565508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_565500_566200
830119	contig_5649_pilon	+	1599	4	Intergenic	novelGene_82477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650999	1655920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1651785_1652259_1652376_1654462_1654584_1655343
830120	contig_16884_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_161820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAGGATGCTAGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48829	46726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_46700_48800
830121	contig_8898_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_137249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311497	312528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_311500_312500
830124	contig_1107_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_126527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAAAGTAAGTATTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34394	33834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_33800_34400
830125	SIRV6	+	353	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	17	337	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830126	contig_7720_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_155737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATGTGGAACAGAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213197	213625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_213200_213600
830127	contig_7720_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_155738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAGAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213655	214075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_213700_214100
830128	contig_3529_pilon	+	1479	2	Intergenic	novelGene_105335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	114	1013	497057	509782	FALSE	10	CCAGCCTTATGTTTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKESREMDCYLRRLKQELMSMKEVGDGLQDQMNSMMGALQELKLLQVQTALEQLEISGGGPATGCPESPWTQPKPPRWEGGRGPARPLASSPSNQPSLDSSAKFPRHSNVCGREVSPLPRTQLPEHQSCTQQGPERVEPDDWTSTLMSRGRNRQPLVLGDNVFADLVGNWLDLPELEKGGEKGEIGEAGEPKVEKGQPRELGRRFALTANIFRKFLRSVRPDRDRLLKEKPGWVTPMASEPRAGRSQKVKKRSHSKGSGHFTFPGVKEPKRGESPSPSCPKALEPSPSGFDINTAVWV	496943	510248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_497114_508939
830129	contig_15731_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_171973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAGAGGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28295	29691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_28300_29700
830130	contig_11448_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_66408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATTTTCTGAAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515481	516382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_515500_516400
830133	contig_7629_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_153567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACGAGAACTATGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274182	275031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_274200_275000
830134	contig_13481_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_119493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGGCCCGAGAAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1371824	1372598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1371800_1372600
830136	contig_16595_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_150144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACCTAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389860	390606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_389900_390600
830139	contig_8907_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_85824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTATATTATCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371104	369919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_369900_371100
830140	contig_14855_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_146015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTTAAAAAAGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443138	441525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_441500_443100
830142	contig_252_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_99921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	551	892	213043	213384	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPSDASCRQRGAGPWPTSGQGAGLRPGLPRILSSRGSGTSMEGKPYLETIRKDPGKPEELRMFKVEGGRYCMIEASMETPNRQSIQEGKVSYHYVENNKEIPPTSKTTVWF	212492	214778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_212500_214800
830143	contig_8140_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_86459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878679	876804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_876800_878700
830144	contig_16846_pilon	-	621	5	Intergenic	novelGene_82982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3692.9805289901	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	96	497	555122	551492	TRUE	10	GCACTACTTCGGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQRPDLRAGSATHRAPSPHQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558750	550867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550983_551482_551665_552661_552824_555055_555156_558688
830145	contig_10904_pilon	-	1664	3	Intergenic	novelGene_22794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAACCTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848165	845230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_846733_847149_847253_848106
830146	scaffold_12510_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_151391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314444	315945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_314400_315900
830147	contig_504_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_54408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAAGAGAAGTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47267	48018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_47300_48000
830148	contig_16632_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_154149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAATCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217388	215667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_215700_217400
830149	contig_16411_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_77319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTTTTTTTTAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136476	135916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_135900_136500
830150	contig_11507_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_103367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126081	124803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_124800_126100
830151	contig_19744_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_120394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTAATACGATTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198083	197032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_197000_198100
830153	contig_2114_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_104297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789942	788075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_788100_789900
830154	contig_9527_pilon	+	1964	7	Intergenic	novelGene_134094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	1.95078331845327	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	28	921	683985	688465	FALSE	15	AGCTGTTACCCCCACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GENIAADGNMDLSKLEVSLTLTNKFEGLETDADDTNARSLLLSTKQMLADIIQFHPGDSLREILSLSASREQEMAHKQLMGRRQVCEAQTPEPLRRHLSLTAHSLLPLAEKQRRVLRNLRRLESLGLVRAANDYQGLVDELAKDIRNQRRHRQRRKAELVRLQATFQGLSAKTMFYEEQGDYYSQYIRACLDHLAPSSKSAGKGKKQPSLHYTAAQLLEKGVLVEIEDLPASHFKNVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFNKAKVNVNLLIFLLNKKFLRK	683957	689508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_684086_685030_685119_685978_686192_686638_686806_687100_687203_687642_687752_688351
830155	contig_14182_pilon	-	858	6	Intergenic	novelGene_76175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	516.036045252655	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	102	812	69537	17172	FALSE	30	GATCAGGTGAACGTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIAFNTPTALQKEEARQDVEALVSRTVRAQILTGKELRVATQEKESSSGRCMLTLLGLSFILAGLIVGGACIYKYFMPKSTIYRGEMCFFDSEDPANALPGGEPYFLPVTEEADIREDDNIAIIDVPVPSFSDSDPAAIIHDFEKSGKYLPHTYVIREDLVALEEIRDVSNLGIFIYQLCNNRKAFRLRRRDLLLGFNKRAVDKCWKIRHFPNEFVVETKICQEWISSFASTIS	69638	17125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_17206_59086_59172_59320_59472_65076_65275_65549_65682_69426
830158	contig_13519_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_124614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAACCACTACACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53502	52850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_52800_53500
830159	contig_12923_pilon	-	941	7	Intergenic	novelGene_30133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	150.595945791674	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	49	813	176103	162687	FALSE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLKHLIVTPSGCGEQNMIGMTPTVIAVHYLDHTEQWEKFGLDKRQEALELIKKGYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQEAKDICEGQVNSLGGSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGAVAGS	176151	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162704_170337_170482_172032_172190_172858_172958_174586_174747_175257_175334_175991
830160	contig_11602_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_166589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAAAGCATTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122308	123910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_122300_123900
830162	contig_4364_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_3016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
830163	contig_3942_pilon	-	1019	5	Intergenic	novelGene_128836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_4	95.0486717424289	5218	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	529	963	1283410	1276273	FALSE	5	GCTTGAGTCCCTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKVKQDMPPPGGYGPIDYKRNLPRRGLSGYSMLAMGIGTLLFGYWSMMKWNRERRRLQIEDLEARIALMPLIQAEKDRRVLQMLRENLEEEAIIMKDVPDWKVGESVFHTTRWVPPMVGELYGLRMNDELLNANYGFMWYT	1283938	1276216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1276393_1276599_1276670_1276972_1277045_1278040_1278120_1283316
830164	contig_15084_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_116685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAATTTGCTCAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168413	168964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_168400_169000
830165	contig_5988_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_16029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGGCATCTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804702	803321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_803300_804700
830167	contig_3825_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_78038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	25.0299820215677	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	614	772	2307162	2307004	FALSE	20	GCAGTTATTTCAGAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKQQQILEEQGLGKLKSKPKKPRPKSVHREESCSDSGTKCSSTPDNLSRAQSGSSLSLASAATTEPESVHSGGTPSQRVESLEALPTLSRNPSRSTDRDWETASAASSLASVAEYTGPKLFKEPSSKSNKPIIHNAISHCCLAGKVNEPHKNSILEELEKCDANHYIILFRDAGCQFRALYCYYPDTEEIYKLTGTGPKSVTKKMIDKLYKYSSDRKQFNLIPAKTMSVSVDALTIHNHLWQPKRPAVPKKMQTRK	2314598	2305997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2307307_2311449_2311569_2312489_2312606_2313998_2314102_2314467
830168	contig_12123_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_144580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTAGCCTCGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44858	45472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_44900_45500
830170	contig_16148_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_50384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCCCAAACAGCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119631	120498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_119600_120500
830173	contig_6048_pilon	+	1937	6	Intergenic	novelGene_73177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	108.422137960843	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1482	455	1936	1275218	1284480	FALSE	15	TGTCACTCCACGACCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSPSQSESAGSASEGEEIDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNRLFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEPAQPSSASSSGNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALNPALKQEPLSQTDITILTPKLLSTSPMSSVSSYSPIAISLKKPSSAPDPSVSALPNPSAIKKEPQDATGPELPGATEAAQGVLRHVKNELGRSGVWKDHWWSTIQPERRNTTVSSEEMKVEEASSGKEKASSSQARAERNQLQGPSSSEYWKEWPNAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPIVPMSKPSKPSVPPLTPEQYEIYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVIQSV	1274763	1284481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1275519_1276690_1276757_1278059_1278162_1280997_1281831_1283686_1283853_1284466
830175	SIRV4	+	234	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	635	1079	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCTTTATATGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
830176	contig_253_pilon	-	1492	15	Intergenic	novelGene_129742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	144.486582245479	16	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	8	1492	691426	672152	FALSE	10	CTCCTTGGCTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLEAVLADVSYLMAMEKSKATPAARASKKILLPEPSIRSVMQKYLEDRGEVAFEKIFSQKLGYLLFRDFCLNHLEEAKPLVEFYEEIKKYEKLETEEERLARSREVFDVYIMKELLACSHPFSKSATEHVQSHLVKKQVPPDLFQPYIEEICQNLRGDVFQKFIESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMSYAFHTPDKLSFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEADMRFYAAEIILGLEHMHNCFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKKPHASVGTHGYMAPEVLQKGVAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTMVSWDQPSPHGLCAQPHVRQCHHPKSATSPHAPLCCRATLCGAASAGLGRCALPHLLTPRGVSLPIFECDFKEWKMRLCVFIKNGA	691433	672151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_672404_675604_675678_675840_675949_676028_676124_676434_676566_676655_676735_676819_676920_677382_677475_677729_677782_678838_678901_679039_679115_679237_679340_679435_679510_680641_680719_691313
830178	contig_1372_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_140508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410126	410990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_410100_411000
830180	contig_10074_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_57185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGAAAATATGGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568099	567641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_567600_568100
830181	contig_10074_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_57184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTGCTCACTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567391	566349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_566300_567400
830182	contig_13496_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_107658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAATAAGGAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442412	444220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_442400_444200
830184	scaffold_19766_pilon	-	1156	2	Intergenic	novelGene_34399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATGGTTGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826293	825044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190
830186	contig_9014_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_106817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	883	1251	155704	156072	NA	35	TCTTACTAGTAGATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPTLQTLPSLSPSPAHVFSTDKACPWWARKGFFVFQADEEGSPRVLLEELVGEMLDLGEPGTSGFGYCSGSSEGNQPLRQTEPSPAGYTPPPGSELPSVGERLLRWGTGLWGLGPSQAYI	154821	156228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_154800_156200
830189	contig_2894_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_86542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCATGTGAGGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237356	238085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_237400_238100
830191	contig_7619_pilon	-	881	5	Intergenic	novelGene_162151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	45.8830033890546	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	142	657	31424	25197	FALSE	55	TCACCTAAAGCACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLKSASCFLNTSLKMEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVRTYCQLLEG	31565	24972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_31421
830193	contig_9463_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_83818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	3	467	44624	44160	NA	65	AAGATAGTATAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEAAERQAARGRAPVPDDGARQKCCRAFSCRWWRSLACASARTRKVRIGTPDCPALSAPPRWSVARSDSDPGHLLPEARLAGRLGTGASVTSSLPAGSPFLQAYISRGRCPDSPVVDLEETAIDWHGEGGGGSGSGWRREKPPPAPTHRPPLF	44626	43585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_43600_44600
830194	contig_7333_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_142795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236609	235191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_235200_236600
830196	SIRV6	+	453	3	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	3	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	23	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2610_2740_2815_3106
830198	contig_10103_pilon	+	651	4	Intergenic	novelGene_86177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAGTAGAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684077	694513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_684352_685337_685524_686762_686861_694420
830199	contig_9696_pilon	-	1024	8	Intergenic	novelGene_68828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	57.6601584939811	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	36	647	577481	547819	TRUE	30	ACTAAAAGAGTCCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAFFRADVCSKMEFCSGRRAVLQLLRAVAPADRPALLQWMRTTRDFDEFIQDNNDVMLKSIAEDLRNCLPLEAMLSSEHLALQKIQQQPEPTVHFDAFLYDEDFIDSLCEEGRMSRNYCMVCGSHQTAPLGFISHSFSLTELKFIYHHVLPDLSGKVLVDVGSRLGAVLYGVKSGLRTYSAFEKYFLLLAAALPATIQGLSLQFSIATIWSRNE	577516	534157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_534276_537075_537167_544243_544351_547757_547869_549910_550115_552616_552756_564332_564455_577384
830202	contig_2219_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_67197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTCTGGTGAGCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201644	201297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_201300_201600
830204	contig_2219_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_67196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201050	200867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_200900_201000
830205	contig_9206_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_137499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	852	1202	335205	334855	NA	30	TGTAATAAACTGCGCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVRKKQFPGGWNWGRKNTGCHRADPDPLSRHGGRGQGVSGDFEEEAGGRREDGASGKRWGLRVPGPGREPGLPMERWGQGYSKRVTGVGGGKAVNPPPGEDFTRRRRAGVREGF	336056	334547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_334500_336100
830206	contig_10703_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_176931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAGGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46321	45539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10703_pilon_-_45500_46300
830210	contig_7202_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_17138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27890	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
830211	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
830212	contig_19899_pilon	+	1085	5	Intergenic	novelGene_102536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTGCGCCTCCGGTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407514	430004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_408026_419443_419692_419731_419904_420537_420582_429894
830213	contig_2114_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_104277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCTCCCAGCATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601335	600242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_600200_601300
830214	contig_11978_pilon	+	549	5	Intergenic	novelGene_62993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	394.302152542945	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	119	475	1517714	1527267	FALSE	10	TTACCTACTGCTTCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPDMDPEHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD	1517264	1527341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683_1517830_1523680_1523778_1526094_1526190_1527218
830216	contig_10324_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_7830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	705	1079	266011	266385	NA	35	TAAAGGGAAGACGATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGPPCCPASGLTAVSPSPSLFSLQQKTPCCTQPAHHYPPSRAIPARLGCGGMSLGALHTLHAGASVVWAPPPSLALPAPVRDQVPCGQPVSPPSLAPVRGWPDPIPSWGELGCCTLGGWVSG	265306	266915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_265300_266900
830218	contig_6031_pilon	-	968	4	Intergenic	novelGene_56743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	388	702	207063	205940	FALSE	50	GTAAAATTATGCCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSPGGSLAFNSELMTAGAKRSMRPDAPSPSSFASRRCGNCNPEQMRHSTDFREDLGDERHPGRPASQVHPGSLDTRFLRFLLGDTQSKQMKILVASSFQRPLS	207863	205673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_205995_206261_206410_206951_207080_207492
830220	SIRV2	-	307	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	61	3364	-26	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGTTATCTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
830222	contig_5766_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_175050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCAGGAGCCATGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826958	825944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_-_825900_827000
830223	contig_14516_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_153916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGATGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215446	214867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_214900_215400
830224	contig_9900_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_159514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAGAGAGAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230562	230139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_230100_230600
830225	contig_7057_pilon	+	563	4	Intergenic	novelGene_123276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11628	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGTGAAGGAGGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705643	707670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_705874_706663_706712_706884_707046_707546
830226	contig_15063_pilon	+	723	2	Intergenic	novelGene_14454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	8	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	91	579	36064	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	35973	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
830227	contig_9389_pilon	+	751	7	Intergenic	novelGene_83982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1248.11551281656	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	83	571	383398	385338	FALSE	20	AACCTTGCTCTGACCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRTELSDSL	381999	385518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384340_385312
830228	SIRV2	+	334	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	263	-74	-263	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATCACTGGGTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1400
830229	contig_18892_pilon	-	646	2	Intergenic	novelGene_176932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	135	371	2554	2318	FALSE	20	TCACCTTCAGCTGCCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSDPTPFHIQAEVTLKTNFFSTRDVCTELLPLIKPQGRVVNVSSMASIQALKSCSPELQQRFRSETITEEELVAAHEEVRGRYKEWGAPEGGLAQHRIWCVEDRCHSPVQNPRQEPECTEGR	7754	2042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18892_pilon_-_2578_7643
830231	contig_11370_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_98784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	92	370	301451	301173	NA	20	GAATCTGTGTGACTTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPRHFLFLLPVSTPLLLTLPRSIPPWTGEGMFVGEDTTGDSCPPSTWQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTANGENLGFWACELQSLYPSQANIPHSLK	301542	300907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_300900_301500
830232	contig_6726_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_86218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTAACTAATTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76707	75848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_75800_76700
830234	contig_16632_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_154129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAAAAGATTTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83301	81373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_81400_83300
830235	contig_7945_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_161599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACATGAATGCTCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386912	385151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_385200_386900
830236	contig_4847_pilon	+	705	7	Intergenic	novelGene_156153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	76.8779696806713	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTATTTTTACCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79699	87010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_79786_82205_82369_85444_85532_85605_85681_86203_86257_86676_86823_86915
830237	contig_9375_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_136056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205234	206707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_205200_206700
830238	contig_3866_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_112406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTTCAGAACTATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182757	182253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_182300_182800
830239	contig_6710_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_90339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653820	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
830240	contig_5999_pilon	-	1645	2	Intergenic	novelGene_45661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTGTTTGTTCTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282245	279970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_281081_281710
830242	contig_3386_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_34599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACCTACAGTTACTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532340	533354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_532300_533400
830243	contig_612_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_155628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGTCCTAGGAGGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224707	235814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_225054_233410_233468_235731
830245	contig_13026_pilon	+	648	2	Intergenic	novelGene_146307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTTAAAAGCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24145	24832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_+_24657_24695
830246	contig_12038_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_165821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTCTACCCAGAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433978	433049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_-_433000_434000
830248	contig_15752_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_148779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTCATCACCCTCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341847	342093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_341800_342100
830249	contig_18970_pilon	-	733	2	Intergenic	novelGene_157819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	244	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	150	581	38902	31496	FALSE	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISDITAASLAGARHSTGGASYPAPQGRFRCLLETQRGQPKASPSVTLFPLPSEEFQANKSTLVCLMNDFYPGAVTVTWKEDGTTITQGVKTTKPSKPSIKKYAASSCLTLLTQWRSHNSYSCQVTHEGSTMEKKVVPAECV	39051	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31813_38787
830250	contig_5939_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_176248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	378	713	10816	11151	NA	10	TTGCTGCCTCCTGGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGFPQSEWSKREQGGRCSTFYDLSRELYAFISIIFYSLTVYHLEQHTLKGRGIRLHLLKGGLSQNLQAYVKPQSSGGVVVKSLDANQKVSSSTHQSLLGKPMGQFYSVL	10438	11354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_+_10400_11400
830251	contig_17274_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_26562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTTTAAAATACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205481	206865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_205500_206900
830255	contig_5549_pilon	-	505	10	Intergenic	novelGene_81642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	242.926600711683	211	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTTATTTCAATTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442938_443620_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
830257	contig_6446_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_149252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618354	620605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_618400_620600
830258	contig_5020_pilon	+	879	4	Intergenic	novelGene_27865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1199.62688643872	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118466	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_125692
830259	contig_13000_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_176934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATTTCCCCATAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82639	83052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13000_pilon_+_82600_83100
830263	SIRV6	+	361	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	6	340	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830264	contig_9696_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_68822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAGAGAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424393	423691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_423700_424400
830266	contig_15236_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_141558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATGGGGAACCTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336390	337659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_336400_337700
830267	contig_2480_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_63571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	485	802	518265	518582	NA	15	GTGCAGGGCCTGGTGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSAPRDSWSGGLIPAALRAQSVAIWTQAWPQRQLRGRGGHRSALKVVCVVSKDSRLQASLTAPGHWRESPSTGQALGQMHKTGLETKTFVSKHVHKGHRRPQV	517780	518687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_517800_518700
830268	contig_6488_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_44768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215225	214104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_214100_215200
830269	contig_4364_pilon	+	1307	8	Intergenic	novelGene_3	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	16.8389732587282	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	129	605	144301	262680	FALSE	75	AGAAAAAAGAAAAAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVAAAPPGGPRAHVSIILPVHNAERWLDDCLRSVLHQDFEGIMELSIFNDASKDKSGTIIEKWKVKLEASGILVVIGGHDSPSPRGVGYSKNQAIAQSSGAYLCFLDSDDVMTPQRVRLQLEAAAQHPTSIIGCQVRRDPPDSTERYTRWINQMSADQLLTQVFTSNGPTVIMPTWFCSRAWFSHVGWFDEGGQYSWTPQ	140279	263382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_140324_144216_144334_144434_144535_157577_157643_180872_180939_207801_207898_256295_256392_262659
830270	scaffold_6394_pilon	-	1733	2	Intergenic	novelGene_110978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	292	621	385289	384960	TRUE	45	CTAACAATAGAAGAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVASGWDHPGDSSYIELQGTTRSPGAHLSATTQAPGPLTLTVPCPPRNRPAGEWAGCPGRSRLAGTRRSGTRHPSSPVSRARAGHLFLLECCPLGPGRNLAESMVSG	385580	383109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_383220_383957
830273	contig_3942_pilon	+	1732	7	Intergenic	novelGene_128870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.006171781426	86	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	251	613	1492877	1499848	TRUE	20	GCTGAAATTGCTTTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEMQVKGKKVTDKFTESVYVLANEPSVALYRLQEHVRRSLPELAQHKADMQRWEEQSQGAIYTVEYACSAVKNLVDSSVYFRSVEGLLRQAISIRDHMNASAAQGHSPEEPPPLSSA	1492263	1503239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1492350_1492712_1492914_1495128_1495242_1495613_1495679_1498449_1498564_1499814_1499888_1502159
830274	contig_9195_pilon	-	1196	13	Intergenic	novelGene_155691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.5621274392019	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	972	224	1195	823352	712675	FALSE	20	CCCAACCAGCTCTGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGDTVWAPSILPHDFLGVLSQHPQPHFGRRMESKVSEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGETVKKMREESGARINISEGNCPERIVTITGPTDAIFKAFAMIAYKFEEDIINSMSNSPATSKPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGSKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAVTISGTPDAIIQCVKQICVVMLESPPKGATIPYRPKPASTPVIFAGGQAYTIQGQYAIPHPDLTKLHQLAMQQTPFPPLGQTNPAFPGEKLPLHSSEEAQNLMGQSSGLASLGCLELGRHGYDALEGSGCWTHQEAQCLSSINVVTP	899658	712673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_712794_724678_724739_725276_725353_749734_749777_753331_753407_757399_757529_758193_758326_764841_764959_765335_765369_768133_768158_770862_771018_823342_823479_899561
830275	contig_6479_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_160601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGCCTAGGGCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64219	63609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_63600_64200
830277	contig_15821_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_25032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	328	795	205860	205393	NA	15	TCATAGTCTCTCATCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAFLPPPFFTPTWPPLLPEASLLAGKHWLHPSVTWIPPARTGRLPKCHLLAAAVAFFRSLDFFLTCHHFPLLSLKYLAPCAIFISSSKPVKCPLNVRLLPCTCCHAGGIPALFFSLFVCLFSFPILKLGARSSWAVLHGLGPTPSVCAGMQRDH	206187	205046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_205000_206200
830278	contig_14526_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_111217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	227	322	362693	362788	NA	20	AACTCCCCCCGGGCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVVSKRAPVPTAKEPITPLTLEQTGNLTCKIKKRFLTSVRTKQCGCPYKFSACSFTSPKPTRPTAVESIPTHSDPMDPIGRSGTAPWGFQGCNLYRSRLPHLSPAE	362466	364462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_362500_364500
830279	contig_665_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_158192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94937	96054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_94900_96100
830280	contig_7411_pilon	+	614	2	Intergenic	novelGene_137020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341244	342781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_341507_342429
830282	contig_13680_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_149603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACATAACTAGAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418257	419672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_418300_419700
830284	contig_6217_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_109582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAAGAAAAAACTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181520	180257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_180300_181500
830287	contig_5523_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_169099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAATCAAGACAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402544	401413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_401400_402500
830288	contig_6102_pilon	+	305	3	Intergenic	novelGene_31814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGGACCTATGACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360230	361118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
830289	contig_9049_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_83155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	267	575	102009	101701	NA	70	AAGTCCAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFCCICRVLSRYNILTFTQLHLLPKGNLRTREVKWLAQASGTLKTYKPKSPGFLSCKLSMMSGCPFNDEDREGNLVKERGWSWTMKLIHLKIITRAFVAC	102275	99963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_1e+05_102300
830291	contig_2940_pilon	+	3067	21	Intergenic	novelGene_81949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	33.9604181364129	53	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	878	2779	802872	837339	FALSE	45	TTACAAATAAAAGGGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVEVPQSAPMYQYLDRKMFKEAYQIACLGVTDADWRDLAMEALEGLEFETAKKAFTRVQDLRYLELINSIEERKKRGETNNDLFLADVFAYQGKFHEAAKLYKRSGHETLALDMYTDLRMFEYAKDFLGSEDPKETKMLITKQADWARNINEPKAAVEMYVSAGEHAKAIEISGDHGWVDTLIDIARKLDKAEREPLLMCAHYFKKLDNPGYAAETYLKIGDLKSLIQLHVETQRWDEAFALGEKHPEFKDDIYVPYAQWLAENDRFEEAQKAFHKAGRQGEAVRVLEQLTHNAVVESRFNDAAYYYWMLSMQCLDIAQDPAQKDVMLDKFHHFQHLAELYHGYHAIQRYTEEPFSFHLPETLFNISRFLLHSMTKNTPLGISKVNTLFTLAKQSKALGAYKLARHAYDKLQGLQIPARFQKSIELGSLTIRSKPFHDSEELVPLCYRCSTNNPLFNNLGNVCINCRQPFVFSASSYEVLHLVEFYLEDGITDEEAVALIDLEAPRHNKRESKWQEITSNNSQTLRLDETVDSMGDDDPFTAKLSFEQGGSEFVPVVVNRSVLRSMSRRDVLIKRWPPPLQWQYFRSLLPDASITMCPSCFQMFHSEDYELLVLQHTCCPYCRRRIDDPSP	795175	837627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_795233_795388_795528_796637_796841_798627_798766_800070_800236_802696_802896_807581_807723_811021_811076_814144_814307_818552_818720_821182_821355_822809_822913_824932_825074_826227_826323_829871_829973_832406_832573_833630_833743_834300_834430_836166_836247_836644_836810_837249
830295	contig_8461_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_163935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACATTACTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484779	484072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_484100_484800
830296	contig_9293_pilon	-	2331	1	Intergenic	novelGene_175193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAGAGAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81835	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_79500_81800
830298	contig_8712_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_58753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152406	151215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_151200_152400
830299	contig_7963_pilon	-	1052	5	Intergenic	novelGene_58340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	48893	43622	TRUE	20	AATCCAATGTTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESFPDGNTLHLPNLFQLHDGPACLRGPLDSSCDSVTDGAEQSHGPGQGYSRVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48894	38333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38568_39276_39399_39945_40227_43546_43809_48741
830300	contig_17470_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_110471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72655	70726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_70700_72700
830301	contig_4232_pilon	-	448	3	Intergenic	novelGene_63194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGCGGCCTCTCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148861	146283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_146364_148229_148536_148799
830302	contig_11145_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_160511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	10	324	34707	34393	NA	90	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCIMYRFEMTTSSPTVNKWISFFNVWIKRSPRAAAAFGDPAIQGDGREKAWYSVAVRGCSHLNHQVHSGGGYTSTLQNVIDGVRELDVCLRENPPKLSPQPSATTYF	34716	33571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_33600_34700
830304	contig_12327_pilon	-	675	4	Intergenic	novelGene_140645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.2174099134244	510	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	214	591	187696	183921	FALSE	10	CCACCTCAGTCTGGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSRALLPGYPVLWLCCDPVSGFGPVPSCPARQVGVWTAGPRGPFRGDSDSRRSHTRAKDCLHVPRGLQGGMAAVGSLSGLLRRGLVQRAASWSCRLHTSHGLADCHRASFTRLYRQAYARLYPVLLVKQDGATIHIRYREPRRMLAMPVDLDCLSPEERRARFRKREAKFREKKEEPELKDNFDMERYKRFWTKK	189033	183836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_184071_184605_184808_187670_187752_188875
830307	contig_10475_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_148742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241040	242056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_241000_242100
830310	contig_8972_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_167620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGTAAAGATACCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194377	193178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_-_193200_194400
830311	contig_12964_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_131740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGATGCATTTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661607	663040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_661600_663000
830312	contig_12468_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_164877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAAGAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46558	45855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_45900_46600
830313	contig_987_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_72307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAACCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988479	989524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_988500_989500
830314	contig_2043_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_169897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTTTTTCTGGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640891	640054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_640100_640900
830315	contig_6847_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_143882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108607	107527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_107500_108600
830316	contig_11823_pilon	-	1198	4	Intergenic	novelGene_171023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	5.79271573232759	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	255	935	49356	41304	FALSE	5	GTCTGCGCCTGCTGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELTEVITAAEFHPHQCNVFVYSSSKGTVRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVNFSHSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECSWNGSDSAIMTGSYNNLFRMFDRNTRRDITLEASRENSKPRAILKPRKVCTGGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPVENIIAVAATNNLYIFQDKIN	49610	41040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_41584_46515_46608_46680_46851_49217
830318	contig_13664_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_144197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTATAAGTAAGGTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27976	26433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_-_26400_28000
830319	contig_7840_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_69053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGATCAGAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430241	428783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_428800_430200
830320	contig_13697_pilon	+	775	4	Intergenic	novelGene_165933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	27.8128667266709	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	254615	257976	TRUE	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKYRSCDRVLLKASLCWAPWGPQVGGLRALTYAASIPDVDECAEETPPCSEGQYCENVPGSYTCEECDSTCVGCTGKGPGKCIACVPGYAKEESGQCSARC	254612	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_254811_257483_257583_257965_258191_259883
830321	contig_12312_pilon	-	605	3	Intergenic	novelGene_64021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	74	896	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	9	320	564031	563107	FALSE	0	CTTGGTCTTTTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMATPSLRGRLARLGNPRKPILKPNKPLILANRVGERRREKGEATCITEMSVMMACWKQNEFRDEACRKEIQDFFDCASMAEVTEASWDCFLGRRKGRYKQPAR	564039	562821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_563123_563619_563792_563907
830322	contig_6137_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_59194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGAAAATTAAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295124	1296554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1295100_1296600
830324	contig_8330_pilon	-	1188	9	Intergenic	novelGene_71765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGCAGGCGGTCATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658507	649105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_649298_651524_651595_653905_654027_656163_656257_656346_656467_656693_656777_657148_657222_657410_657506_658166
830327	contig_5690_pilon	-	212	2	Intergenic	novelGene_119696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATACCAAGATATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784423	782450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_782516_784276
830330	contig_9482_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_44278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149637	1151360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1149600_1151400
830331	contig_7292_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_175365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATTCCATAATTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159652	157940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_157900_159700
830332	contig_6076_pilon	+	1254	2	Intergenic	novelGene_81750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	152	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	148	540	177632	178024	FALSE	25	TGAAGACTCTTAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKDATLLTAETTLIDEEPKHMKLGFTLLPICNPLKAACDIRHGLFQRWKSEREERWILYMQQSLKRSWTERKGSLGIHSPTRIQFVQSPLVLRFNSGSVSLYVCDLLLSSFIFSVISEFLMFDIGVTM	176682	178738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_176791_177592
830334	contig_12935_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_165726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191804	190248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_190200_191800
830335	SIRV4	-	307	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	0	1214	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
830336	contig_9706_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_21061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAGAAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742578	743975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_742600_744000
830337	contig_5765_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_141383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATAATGTCCCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616144	617760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_616100_617800
830339	contig_8554_pilon	+	1571	9	Intergenic	novelGene_160269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	14.7394029729837	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	127	696	13006	24297	TRUE	15	GCAAGGGTTTCTCTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATNRPDAVDPALRRPGRFDREVIIGTPTLKQRKAILQVITSKMPVSSLVDLGRLAEMTVGYVGADLTALCREAALRALLRSDQNQDSSVIDETDFLEAFKKIQPSSFRSVIGLMDIKPVGWEQIGGLDDVKLKLKQSVEWPLKFPREFVRMGLKHPKGVLLYGPPGCAKTTLVRALATSCHCSFVSVSGADLFSPFVGDSEKVLSQAYQGDIAGSVPDHRSKANIAIKQVT	11868	32680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_11932_12942_13129_18286_18446_23563_23774_24219_24395_26797_27023_28372_28508_29283_29410_32388
830340	contig_5039_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_64924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	369	536	1167924	1168091	NA	35	AAGATGGAGTCCAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISIHGCFCFRVTQGSHWVALLSTGHQQIHVFWLKALNAVFRFPVGNDVVGGLAVLIASQNAFLLHFVWFIFQGTALLHRHALLRPKGSGANLFLRGRWREKANDYSHESCDPKQCCGHIHVMDVLDEAWSVIRLVTLWGTVGKGQCQTDCSKNKACHSTIKSSLLIAALPENCQEE	1167555	1168305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1167600_1168300
830341	contig_6870_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_103952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAATACTCCAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260714	1259616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1259600_1260700
830342	scaffold_8345_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_106991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGATGAACCCCTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108076	108489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_108100_108500
830343	scaffold_8345_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_106992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTCTCAGCAAACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108637	109209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_108600_109200
830344	contig_6102_pilon	+	319	4	Intergenic	novelGene_31793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7954	junction_1	2053.07785207153	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTTGCCCTGGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864
830347	contig_5153_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_74341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTGGTTTGAAGCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672004	672934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_672000_672900
830349	contig_5799_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_50292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAATTTAGAGAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361917	361436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_361400_361900
830350	contig_13496_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_107630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAACAGTTGCCCTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244256	242787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_242800_244300
830352	contig_18618_pilon	-	1080	5	Intergenic	novelGene_148301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_3	24.3246274380513	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	213	539	42404	31249	FALSE	20	TCTTTTTAAGTTTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IERAKKYVLGNPLTPGVNQGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFIQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTHYGLSAGIFTKDLDKAITVSSALQAGTVWVNCYSVVSAHCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTMKISQKNS	46847	30707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18618_pilon_-_31322_36504_36580_39706_39865_42383_42549_46779
830354	contig_16122_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_134568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCTAGCAAAAGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565134	565905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_565100_565900
830357	contig_8729_pilon	+	1579	9	Intergenic	novelGene_40069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	30.3397429125561	93	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	8	940	45249	56380	FALSE	20	AAATGGCGCTGATTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLPLLSLLLVLFVSWVEPGNGQITGIVQLPGGRFQMGTNSPDGRDGEGPVREVTVKPFAIDIFPVTNKDFREFVRANKYRTEAESFGWSFVFEDFVSDELRKKATHQMKSLLWWLPVEKAFWRQPAGPGSGIREKLELPVLHVSWNDARTYCAWRGKRLPTEEEWEFAARGGLKGQVYPWGNQFQPNRTNLWQGKFPKGDRAEDGFHGVSPVNAFPPQNNYACDQPACWAAGLYDLMGNVWEWTASPYHPANQDMRVLRGASWIDTADGSANHRARVTTRMGNTPDSASDNLGFRCASSAGHLHGEL	45241	57019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_45313_46870_47028_49689_49805_50230_50276_51117_51269_52546_52603_54672_54758_54902_55078_56295
830358	contig_7887_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_124853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAATAGAATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77282	77636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_77300_77600
830361	contig_10196_pilon	-	460	3	Intergenic	novelGene_132321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24890	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGTGTGGCCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2389808	2388935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2389152_2389265_2389431_2389729
830362	contig_6446_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_149273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCCCCCCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832070	830616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_830600_832100
830363	contig_17144_pilon	-	683	6	Intergenic	novelGene_29528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	181	615	179764	166152	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTSQATCTL	183262	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166176_174950_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
830364	contig_10074_pilon	-	2027	8	Intergenic	novelGene_57220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	30.839280544296	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	228	986	725187	710958	FALSE	65	CATAAAAAAGGAATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEMSANTVLDSQRQQKHYGITSPISLACPKEIDHIYTEKLIDAMKPFGVFEDEEELNHRLVVLGKLNNLVKEWISHVSESKNLPPSVVATVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVERSDFFQSFFEKLKHQDGIRNLRAVEDAFVPVIKFEFDGIEIDLVFARLAIQTISDNLDLRDDSRLRSLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNKETFRLTLRAVKLWAKREYPKSCILRVHDRVTVFSCQ	725414	709916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_711113_713762_713875_715712_715767_716823_716934_717177_717260_720397_720465_722180_722343_725170
830366	contig_5419_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_15560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	643	1026	553637	554020	NA	80	ATTAAAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSILFLFLLKFLQNFYYNKKYVFIMQLIIHCCSLVINTDYDKNCSIHGFTCNRFSQCDLRLCPDHLEAIESFHFFSHAFPDYTFIRIGYFSSLSSTTVCRIHRFKAQGTTDTQFLSLVHLHEKF	552994	554152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_553000_554200
830367	contig_5485_pilon	-	720	7	Intergenic	novelGene_37778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	152.593869106491	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	314	640	650889	638722	FALSE	25	TAATTGAGTGTGGTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCLYAKCIPCITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVTQHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF	653202	638641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870_645944_650867_651017_651981_652054_653088
830368	contig_4125_pilon	+	1600	3	Intergenic	novelGene_25077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	86	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	37	681	472476	473510	FALSE	25	ATTTACTGGACCAGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGYGGCAVLLKMDDSETDFNLKVVMVNFKQCLNEKEEILMDHYLSGWWGLVKFLNSLGAIFAFISKDVVAKLQIMERLRSSPHGEHYASLQSMVAYEVGHQLVDLQRRSRHPDSGCRTVLRLHRALRWLQLFLEGLRTSPENAHTSTLCTDSYNASLAAYHPWVVRRAVTVAFYALPTRKVFLEAMKVGPPEQAIAMLDEALPFLERVYDIVQKLYAEHALLDLP	470167	474429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_470193_472464_472598_472987
830369	contig_7657_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_30054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGAGGAAAACTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377141	375962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_376000_377100
830371	contig_18251_pilon	-	1109	6	Intergenic	novelGene_50153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGTGATCTAACTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55317	35603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_35798_44812_44902_48575_48792_50694_50799_53919_54024_54915
830372	contig_14973_pilon	+	1323	3	Intergenic	novelGene_171220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	12	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	182	328	171380	173114	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELEGRPGRGAARELALATPGPWQERGTGDEARSAGLGAVRTRRFLLCLYLVGFLDLFGVSMVVPLLSLHVKSLGASPTVAGIVGSTYGILQLFSSTFVVSHLPSGNTS	167677	174109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_167841_171361_171450_173037
830374	contig_18222_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_176936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTACAGGCCCCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944	2603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18222_pilon_+_900_2600
830379	contig_18108_pilon	-	2577	1	Intergenic	novelGene_33442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTGTTATCCAGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53894	51317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_51300_53900
830380	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
830381	SIRV6	+	235	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-400	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
830382	contig_7744_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_62582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAGGAAAACAATCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900307	900981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_900300_901000
830383	contig_10801_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_74043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCCCCCCCCCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273520	274011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_273500_274000
830384	contig_1715_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_127194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260238	261826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_260200_261800
830385	contig_18156_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_101455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTTTTGCACAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208970	210613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_209000_210600
830389	contig_2450_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_160323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTGCTGTTGAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804256	804056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_804100_804300
830390	SIRV6	+	452	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	31	2	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	163	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
830391	contig_19680_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_132014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	490	1473	212	1684	176645	178117	NA	15	TTGGGTTATTGTGTATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATNIFPLLEDHTSENKTDEKKIEEKKAQIVTEKNTDIKTSNPFLVGTQDSETDYVTTDSSSKVTEEVVANMPEGLTPDLVQEACESKLSEATGTKIAYETKVDLVQTSEAMQESLYPVTQLCPSFEESEATPSPVLPDIIMEAPLSSVVPGAGTSAVQPSSPLEAPQSVNYESTKLEPENPPPYEEAMNVSLTKVSGIKEEMKEPESTKAAVQEAEAPYISIACDLIKGTKLSAEPTPNFPNYSEIATVAQPVPDHSELVEDSSPDSEPVDLFSDDSIPEVPQKQDEAVTLVKENLTGTSPDSVVERADKEELSPSPPEGGKPYLESFQPSLDSTKDTLPPDELSILTKKEKIPLQMEELNTTVYSDDGVFVSKEAVARESETFSDSSPIEIIDEFPTFVSSKTDVSPPVAREYTDLERSHKSEIADVQDGAGPLPCSELPHDLSLKSIQPKGEDKIHVSDEFSKDRSDISKVPSQPPDVSPLATQPEIGSIVKPKVLVKEAEKKLPSDTEKEKRSPSAIFSAELSKTSGNQSIHCLVISNHLLACCGPFRYALCSMLHL	176433	178689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_176400_178700
830393	contig_7962_pilon	+	769	6	Intergenic	novelGene_149313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.903201886272	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTCTCTTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444928	446283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_444999_445095_445425_445586_445647_445751_445798_445922_445973_446069
830394	contig_8394_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_27324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCAGCCCAGCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101665	102284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_101700_102300
830395	contig_2798_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_120005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGGAGATGGCTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105117	106609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_105100_106600
830396	contig_12427_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_40588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAAAAAGAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576840	574173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_574200_576800
830397	contig_5696_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_117514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356011	357197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_356000_357200
830398	contig_11292_pilon	+	1311	6	Intergenic	novelGene_109447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	287.398399438828	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	36	329	329340	330879	TRUE	20	CTAGACTAACCGTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPQLPGLHPGNMAAARGWWRGLVGAAALARGVVRPSALLLPVRRESATADTRPTVRPRNDVAHKQLSAFGEYVAEILPKYVQQVQVIFATIVWSGSRKSPRVAQMICT	329304	334160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_329398_329507_329574_330709_331369_332049_332176_332265_332386_333913
830399	contig_2480_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_63565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCGATTCAGACTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378287	377089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_377100_378300
830401	SIRV6	-	459	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	384	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACGGTCCACAATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1535_1640_1735_1844
830404	contig_6272_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_160448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154850	153690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_153700_154800
830405	contig_10017_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_156992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGCTCAGTCCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317919	316087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_316100_317900
830406	contig_10196_pilon	-	1002	8	Intergenic	novelGene_132165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGACACAACGCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050794	1038291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1038471_1039043_1039104_1043815_1043909_1044828_1044938_1046367_1046460_1046982_1047079_1050128_1050213_1050505
830407	contig_3975_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_54690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	38	670	1074978	1075610	NA	25	AACTGCAACAGTGCCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARFLETAEQHFMVGQRVVYYVFTERPAAVPHVALGEGRQLRVEYVAREQRWQDVSMERMRTLHEALGGRLGREAHFVLCMDVDQHFSGPFGPEALAESVAQLHAWHYRWPRWLLPFERDVRSAAVLAPGEGDFYYHAAVFGGSMAALRSLTAHCVQAMRRDRGRGIEARWHDESHAQQVFLAAQAREGAVTRVLLEPGNRRAGGDPPAAPALGAKGVRLGA	1074940	1075924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1074900_1075900
830408	contig_12115_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_114471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTCTTTCTGTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49982	48368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12115_pilon_-_48400_50000
830409	contig_11186_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_98864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCCAAGGGTACCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110320	111800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_110300_111800
830411	contig_1694_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_144946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAATAAAGATATATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646225	648150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_646200_648200
830413	contig_11378_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_112231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	301	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	84	317	314904	316446	FALSE	45	GTTTTAAAAGAAGAGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDDIIVKQNYFNTIKNFALQLSSEEWMILEFSQLGFIGKMFQAPDLTLIIEFIFMFYKEKPIDWLLDHILWVKVCNPEKDAVSSFFCGGGGGFLSVFFNTSDF	314820	317469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_314938_316246
830415	contig_13592_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_33750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTGTATAAAATTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354542	355234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_354500_355200
830416	contig_12454_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_171737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	47	355	111136	111551	FALSE	20	TATGAAGTGGATGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCTLTSSRGLGTLQYMHAAVCFAVFFLLPGSGIGLPGEVWCLALANMFSPADPGPGTSTGRSPGHLSLCGYAPAPGLVLPPDLPHFLFLPAPPCKTVFSCGHLWRQILALTPPVNLN	111089	111566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12454_pilon_+_111177_111283
830417	contig_3077_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_26856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTAAGATAGACTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017809	1017346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1017300_1017800
830419	contig_16046_pilon	+	974	6	Intergenic	novelGene_145509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	2.57681974534503	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	28	699	75265	94300	FALSE	60	TTTTAATTAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEEAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRHMDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTAPGTKENYGLLRRKLEQLQKKDV	75237	94575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_75348_75458_75601_83186_83302_84725_84839_92705_92776_94151
830420	SIRV6	+	468	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	16	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1183_1468_1535_1640_1736_1845
830421	contig_5451_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_167179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAGGGAGGGCCTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615826	614422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_614400_615800
830424	contig_3721_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_123807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTTCTGTTTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94372	95692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_94400_95700
830426	contig_8138_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_52498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATGGTTGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459631	458484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_458500_459600
830429	contig_1213_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_76481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAAGGCAGTGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101801	99532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_99500_101800
830430	contig_6199_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_126418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714009	715283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_714000_715300
830431	contig_10437_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_38434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAATAAACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858201	860067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_858200_860100
830434	contig_5341_pilon	-	1237	2	Intergenic	novelGene_168025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1410	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	45	569	339444	338480	FALSE	30	TACAAAATCTCAGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	339488	337811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290
830436	contig_8102_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_85328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACAGGAAAATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76426	77326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_76400_77300
830437	contig_10800_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_152623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	528	860	469366	469698	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTIIQKNENNKRWQGREETGTLLHCLWECKMAELLWPIAGWFLKKLKTELPYDPAIPLPGTSTPKSTESRDQTDRFTAASFTIAKGWKHPNCPSPGKWRDKRWYIHTTE	468838	470081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_468800_470100
830439	contig_5019_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_109232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCCCGGAATCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362331	364710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_362300_364700
830440	contig_7189_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_117649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420290	419412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_419400_420300
830442	contig_1925_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_162219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATCTTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262880	264981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_262900_265000
830443	contig_2924_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_140264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	372	830	116578	116120	NA	60	AAAAAAAAAACGGTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPRHVLMLYNSEEEMDTSEADGTPKKEFLGLSLQTPLGCGWIVAMELYSISLTSTVWSLEMSLLDCHRDVYNQHISMAENSKSICLLLQRQRSFERQLQLCQCSFSPTSCQNTGEKNVKSGGNHLFRPLTHKCMRGAGVNQLNLVGGEGN	116949	115358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_115400_116900
830445	contig_6871_pilon	+	1201	2	Intergenic	novelGene_21667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCAGCCTGGGCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795193	796496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396
830447	contig_6557_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_33028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCGAAACTCAGACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636609	637268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_636600_637300
830448	contig_5586_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_143623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	1089	1625	875709	875173	NA	30	ATAAATACTGATGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLVLLKQHIALHPPESISSRRKKDTREKRDCILDPCTGDKPWLQWLLTVVAIRITWECYKTANGQHFYFNASSIGLEWSLNTDIFKSTPGRCHVQPGFRTTAFINGRELGPLLVTRVLRLICSWAKPCCFCRCLNFCALCLEESGRGRDLWAPITSSVSLSIKGDKRSCCLKFCQI	876797	874995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_875000_876800
830449	contig_8049_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_166867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAGGCAAGACAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247915	245942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_-_245900_247900
830452	contig_9945_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_104814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAGACTAGAAGCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83139	81184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_81200_83100
830453	contig_13780_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_149041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATCAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567579	566253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_566300_567600
830454	contig_7271_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_159956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGATATTCCTTTAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521831	521425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_-_521400_521800
830455	contig_8594_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_140034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331980	333361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_332000_333400
830457	contig_20996_pilon	-	1190	5	Intergenic	novelGene_175574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	11.9242400177118	100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	144	554	60258	23510	FALSE	10	TATCCTGCATTGTGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLRRELSCLGENPKKVREETSEVGKRRQEMTEFERQNQGQHKKSQEVSSTSNQDNEDNNGLEEVCYTIIHHSRYQTSSLSSNDDGYENIDSNTNRVREFRDGSATEYALLRTACVSRRSSCTHEPDYELVLPY	60401	22873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20996_pilon_-_23753_24637_24667_38850_38901_47490_47551_60229
830459	SIRV6	+	398	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	385	517	212	73	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCACTAACGTGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830460	contig_15043_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_175499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAATCAACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96338	96003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_96000_96300
830461	contig_15043_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_175498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTTTTGTCACCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94546	93944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_93900_94500
830462	contig_2768_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_57488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTGTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662001	661320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_661300_662000
830464	contig_2380_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_117883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATACATAGTGTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30522	29943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_29900_30500
830465	contig_7357_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_36946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	22	69	285	353	998545	998613	NA	35	ACACGTGATTATAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISRAVTVEDTCNRESIRVSKSALEPVFQAAGSWASSPSPGLAPSGFSSVLGPPTQARPPGGEAQAVPRAHSSSLPELQVPVTCSHAASLNLDEMRTLPPHGMARFRSQIQVLFPQ	998260	1000211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_998300_1000200
830466	contig_1836_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_71077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983057	981784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_981800_983100
830467	contig_4125_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_25075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACCCAAAAAACTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458374	458617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_458400_458600
830470	contig_7870_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_109035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAATTTAAATATCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598492	596891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_596900_598500
830473	contig_3424_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_55550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319425	317959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_318000_319400
830475	contig_17993_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_61939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGAACAATTTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92067	91199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_91200_92100
830477	contig_5467_pilon	-	630	4	Intergenic	novelGene_111954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_3	440.40082752975	2869	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	55	546	89258	88200	FALSE	5	CTGTCTCTTGCTAGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTVKALQGRECTLQVSEDEMVSSLKLLVSEQLNVPVRQQRLLFKGKALADGKRLSDYSIGPNSKLNLVVKPLEKVLLEQGTARRQAETQSRPLAPPSETWQVIAKVLGRHFSAADANRVQEQLQREYERSLSRLTMDDIERLASRFLNPEVIEATEKGLSK	89312	88115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_88311_88417_88645_88878_88985_89210
830478	SIRV4	-	375	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1146	0	1146	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAAAAATAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4012	3637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
830479	contig_9901_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_126950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGTTCCAGGAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314398	316080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_314400_316100
830482	contig_1230_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_28823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTGAAAAGGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396482	395120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_395100_396500
830483	contig_12864_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_76351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACTGCAAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98139	99721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_98100_99700
830484	contig_16907_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_87432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAATGACAGTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366372	367240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_366400_367200
830485	contig_8263_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_83075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGATTCGTGCAGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77708	79212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_77700_79200
830487	contig_8576_pilon	+	1303	2	Intergenic	novelGene_88809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATATCATCAGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919408	922063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_920007_921358
830488	contig_4336_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_152373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTCTAGGGGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397622	398992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_397600_399000
830490	contig_5936_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_53583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATTTCCAGATAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377713	378829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_377700_378800
830492	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
830493	contig_10235_pilon	-	1170	6	Intergenic	novelGene_46598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	44.0844643837259	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	583	939	588881	588231	FALSE	30	GTTAAATACAGTGGTTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLPGRCVPIAKRELLWAGSAGLACWLAGVIFIDRKRTGDAINVMSEVAQTLLTQDVRVWVFPEGTRNHNGSMLPFKRGAFHLAVQAQVPIVPIVMSSYQDFYCKKERRFTSGEGSC	595808	587999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_588321_588449_588546_588710_588887_589221_589357_589564_589774_595575
830494	contig_3380_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_60133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAACTACTAAGTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506672	507710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_506700_507700
830496	contig_9332_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_60721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150969	149745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_149700_151000
830497	contig_10286_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_98424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAACCATTCTCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433115	432045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_432000_433100
830498	contig_11061_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_173339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATACCTATAGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16218	14363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_-_14400_16200
830499	contig_3789_pilon	-	299	2	Intergenic	novelGene_79895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGGATGTAAGCAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691285	599278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_599324_691031
830500	contig_2100_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_50646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTTTTGAAATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051778	1050638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1050600_1051800
830501	contig_10750_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_172603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGAGCCAGGGCTGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42331	41627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_41600_42300
830502	contig_6896_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_174230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATGATGTTTTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723340	722579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_722600_723300
830504	contig_9995_pilon	+	710	2	Intergenic	novelGene_47724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_1	0	304	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACTACGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485852	503408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_486036_502881
830506	contig_7057_pilon	+	927	8	Intergenic	novelGene_123320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1025.59702871358	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTCTTCGTGGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936040	943708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937209_938661_938752_938903_938962_939052_939135_941208_941288_941405_941492_943522
830507	contig_8357_pilon	+	1685	3	Intergenic	novelGene_39728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	54	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	16	474	577688	586714	FALSE	20	AAACTTTCCTGTTGTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWSGWMIASGSQDKTVRFWDLRVPSCVRVVGTTFHGTGSAVASVAVDPSGRLLATGQEDSSCMLYDIRGGRMVQSYHPHSSDVRSVRFSPGAHYLLTGSYDMKIKVTDLQGDLTKQLPIMVVGEHKDKVIQCRWHTQDLSFLSSSADRTVTLWTYNG	577672	587925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_577785_584940_585160_586571
830508	contig_2703_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_101743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGATAGGTGCTCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531869	532411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_531900_532400
830509	SIRV6	+	367	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	3	337	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830510	contig_9400_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_146572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTATTTTTATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115308	114470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_114500_115300
830511	contig_13004_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_112661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCTAACTCCACAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575151	574363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_574400_575200
830513	contig_5153_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_74328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTGACAATGCCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575146	575689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_575100_575700
830515	contig_7410_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_106110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCCTCTTAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455541	457426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_455500_457400
830516	contig_5590_pilon	-	1058	7	Intergenic	novelGene_163062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	168	344	530575	530399	TRUE	25	GGGCGAGAGGGGGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGQRWFIQSKKPSKRPKICPALLGSSLGPDSSSPSLSSGRLRSHWGHRVGLKQARMRPAGHSPGVGRSQGSQSTRPYTAMEPSRKSVFPIRMLTTTGWPSWHCCWASRSTWTT	530742	525954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_526054_526169_526310_527808_527948_529460_529552_529632_529706_529849_529957_530333
830517	contig_15353_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_151974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401420	400588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_400600_401400
830518	contig_7870_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_108979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCCTCAATGAGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398529	399577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_398500_399600
830519	contig_9400_pilon	-	792	2	Intergenic	novelGene_146595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1697	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTGCATACTTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135561	131916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_132600_135452
830520	contig_11427_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_79004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAAATATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610231	609874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_609900_610200
830521	SIRV5	+	360	4	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-1	-63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2207_2316_3298_3405_3483
830522	contig_7945_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_161612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494431	492957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_493000_494400
830525	contig_19908_pilon	-	639	4	Intergenic	novelGene_167617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	19.9555060627944	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTAAATGTCATGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75023	59082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_-_59470_61002_61056_61477_61573_74919
830526	contig_12046_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_83492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	345	313	657	643741	643397	NA	40	GGATGTAGAGCCACGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDTLLCVPFSHLTTGPNSMLQTVHSESEMIQVSPQQSAGSALPQWWLPVSQEGSAFFCSYKSTEWVSWRFSSIFSPRLSNPMMVTDGTLLSAGSAVRVGVEQYRINPTMMTVKD	644053	643395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_643400_644100
830528	contig_5286_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_157397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGGGAAAAGGAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693103	694730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_693100_694700
830529	contig_5832_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_134161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGGCAGGAAGGAGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454835	455778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_454800_455800
830530	contig_13097_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_107677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATTTATTTTCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71877	70932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_70900_71900
830531	contig_12120_pilon	+	572	3	Intergenic	novelGene_21447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_2	3	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	38	418	273980	293038	FALSE	20	TACAGTCTGTCTGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLESRCRRETEMADEIAKAQAARPGGDTIFGKIIRKEIPAKIIFEDDQCLAFHDISPQAPTHFLVIPKKHISQISVAEDDDESLLGHLMIVGKKCAADLGLHKGYRMVVNEGSDGGQSVYHVHLHVLGGRQMNWPPG	273942	293192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_274091_276213_276319_292873
830532	contig_8594_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_140042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCTCAGATTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421535	419588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_419600_421500
830535	contig_14441_pilon	-	2050	15	Intergenic	novelGene_100809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	30.6054550293084	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	10	1935	273405	243638	FALSE	10	GCCTGCTTCTCAGTGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRLQQEGGHLLGQNKGDSRRKSWMKPEGQERDRKTADRQTAGRQTTDSQQGPSRKQFPLGSAQEVKTTQGAEPSLGMGSPQEGPLEEGLPTARSFPRTWTQWVLMVLLLLGLLVGFSVLCVYIFQNSGPYVLSCETPVCLDLLDRYLASGNTSVAPCSDFFSFVCGNANRTRNSFQALEEENKGRLRRILEAPSPWPPGSAEEKAFQFYRSCMDMDAIEAAGAGPLRQVIEELGGWRISGNWTSFDFNRTLRLLMSQYGHFPFFRANLQPLRTPLQTPIIQIDQPEFAVPLKQEQEQKIYAQMVREYLTYLNQLGTLLGGDPDKVQEHAALSISITSRLSQFLRPLEEQPEQMVTIAQLQEMAPAINWLSCLQATFTPMPLSPSLTLMVRDLEYLTNMSQLVGSLQLGPSFLQLYLSCVRALQARKVRSFLQPFHSRRVFPWGVDAYYSVSDHVVVLSPGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLHIFYKLLLPGGCPDCDADALQGALLCVERHYAALSLPGETSFNRSGTILENAADIGGLAITLQAYHKRLLLQQKGNHPAPPGPQPGAALLSKLRPGDVWGAPTPGPTGPAQPSPTSNPWADQQHPGLRHAFQLSRRGPHEPQQPLRALVT	273414	243522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_243805_244896_244994_245256_245427_246413_246482_246576_246688_246847_246937_258725_258864_259069_259244_259334_259398_269465_269613_269898_270024_271745_271929_272200_272343_272576_272639_273215
830536	contig_3575_pilon	-	1487	2	Intergenic	novelGene_141124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778022	768650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_769567_777451
830537	contig_7119_pilon	-	2343	3	Intergenic	novelGene_41026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7	8	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	115	900	235956	224975	FALSE	45	CTGAGACGTTTCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLMPMASVMAVTEPKWVSVWGRFLWVTLLSMVLGSLLALLLPLGTMEEQCLAVLKGFYLLRSRLDRAQHAVTKCTSPSTGLSVKSRDTGLLVVKTKASPGGNKHWPPFHIFTVQLQGLQGRLLIFKFHVAVPSEVPTVAEDGADLGDVATGLEERPELHVWLLHAVGQVADEDRDAVLTAVMGHLGHVPLQGGSLCLLLGRGGRHAQVPSSQPVLLPCLCLVLRRLEGRCSQLSCVWKVALQVFKRKTATINDFFSSVSC	238763	223531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_225460_235655_236015_238707
830539	contig_19744_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_120359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTCTTTGCACCATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89914	89468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_89500_89900
830540	contig_4496_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_66693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957110	958126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_957100_958100
830541	contig_12915_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_148347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	344	697	90420	90773	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAKNSEYTIYCQKNKSVLEETARMLLRSKNSETSSHVFWTSYQEGQPLEKDIMLGKTEGQRKRRKPSMRQTDTVAATISSNIKMILRMGQNQAVFYSAVHRVHLGDHIVIIWEQH	90076	91058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_90100_91100
830542	contig_17964_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_33928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	182	493	470520	470831	NA	65	TTTCACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEKILPMLKYQNQKVIAVFHHQSLQSANQPNAFSSDLQKNSSLITTTGQSVPFYSTREPPSNSICSRAGQKSQNPSSATKLANSLSLFLHLESGRNPFSGLR	470338	471922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_470300_471900
830543	contig_13894_pilon	-	1064	4	Intergenic	novelGene_62217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	8.33999733546454	191	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	76	624	816016	813511	FALSE	35	TTCAAAATGAATGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPDTFIYNFKNNPLGTGKYQTYLCYEVQLMNGNSGVLQNWIKGFLCNQSDPDPQLCCHAELCFLDWISSWQLYPGQHYSITWFLSWSPCPDCAQEVAAFLQRNSHVRLYIFAARIHDCCEGYEEGLRSLDNAGTNIGIMTYREFEYCWRAFVDNQLWPFKPWRGLKRNHEFMSNQLQRILQ	826243	813070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_813630_814066_814350_815869_816021_826172
830544	contig_5480_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_107211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	116	430	18176	18490	TRUE	70	CTCTTAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGPTAASVRRGFGGVRHRLPASLCSGVCPFPVPSGRDMSVPEPAPPGGVMTRLPDSLGAGEPTPGTCCRRPAECERRGLGLLGGPPRQEAAFGSEFLASAWNWGPMPALLPSGVGGNRSLDGKRCLGGSWGRLMVGLFGVC	18060	20656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_19137_20546
830546	contig_12622_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_5761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACATTTAATAATGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81596	82274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_81600_82300
830547	contig_14814_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_137761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTGTAGATCCTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423434	419580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_419626_420517_420773_421784
830548	contig_13760_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_61355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	40	354	359380	359066	NA	10	TGTTTTGGTATGGCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGACWGRMELWLALRVPSCPADAWHFKRKLVALSPNGVTPRRWGSVILPFCVCDLSPARGGAFRMFLGLVQSSGASGTKLLALALLGRLPQTRNPSPAQGKV	359419	358388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_358400_359400
830549	contig_2450_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_160298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCCAGTTAATAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204031	205528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_204000_205500
830550	contig_9727_pilon	-	838	5	Intergenic	novelGene_86257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	420	602	53752	52910	TRUE	25	TCCCATAGGCCCCCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSISSRSDRDSWLFISESVSASKAVPPPSRLLSEPLSEPSLARAESRLESDSKPSLRSLSSPALGGWRAAQARETGDLTALSDLARLRCCRRRLRPWLLLFLQWFPGLGLICTVTLERRHGVLALLQLSLQADVDVIDEMGEEGQGEGDGCTVLPGPCSFQAVHTHQADDDHLKDEQVREKSVTTLVLLLLLAGQAEAG	54334	52131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_52219_52324_52391_52826_53038_53697_53836_53998
830552	contig_5758_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_119117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTACCCTAGCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398316	400110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_398300_400100
830554	SIRV6	+	465	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	389	2	216	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	34	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
830555	contig_7342_pilon	+	1809	7	Intergenic	novelGene_71186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	4.22952584681651	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1072	1731	543379	544918	FALSE	20	TTTAACACTGAGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGLSLSLCLSLSPSLSVSLCLPPCVAASPQLHGRSREQRYTKLADWQYIEQCVKAASPMPLFGNGDILSYEDANRAMQTGVAGVMIARGALLKPWLFTEIKEQRHWDISSSERLDILRDFTHYGLEHWGSDTQGVEKTRRFLLEWLSFLCRYVPVGLLERLPQKINERPPYYLGRDYLETLMASQNSADWIHISEMLLGPVPPNFVFLPKHKANSYK	541768	544996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_541922_542196_542314_542577_543572_543755_543832_544326_544516_544593_544723_544845
830556	contig_20332_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_156180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGGAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636541	638151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_636500_638200
830557	contig_6445_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_76875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAACCTTATGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36209	37110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_36200_37100
830561	contig_4131_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_127895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	83	475	303994	303602	NA	40	GACTTTGAAAAAGGGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARSKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	304076	302981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_303000_304100
830563	SIRV4	+	372	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCCGAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
830564	contig_8276_pilon	+	1775	4	Intergenic	novelGene_174494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.49691252107735	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	35	982	498238	508028	FALSE	25	TATGAATATTGGTGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEHAQGKIKLLMKSCKQLEGEKEMLQKELSQLEAAQAKQNAGTVVDANVDELMTEMKELRETLEEKTKEAEEYLDKYCSLLISHENLEKAKEILETQVARLSQQSKCNLQSSPLLNSIVPEPSPALSVTERKLSSGHNRASAKRQRSSGIWESGGGSAPSTPETFSKKSRKASRSGVHSAGDMEDIDFEPEGLPEVVKKGFADIPTGKPSPYVLRRTTMTARTSPRLAAQKSAPSPLSLHKENLAETCKPTAGGSRSHKVKVAQRSPADSGAAVREPSLRSVSGSTLPERRSADSPREGLRAKRGHRVPSPGAGPDLKSSENCRVQ	498203	508821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_498329_499672_500147_502092_502272_507824
830566	contig_4580_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_173384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137950	139186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_+_138000_139200
830569	contig_9437_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_141729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233737	235645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_233700_235600
830570	contig_9939_pilon	-	2017	9	Intergenic	novelGene_158602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	20.9344214154583	15	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	133	648	351505	330840	TRUE	40	TATTTCTAAAATAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRHLTQKLYDWSDSQSLKITGKAILLELFWSGSETSALLTKPVNMLLEWTIYSHKEKYKSNDVFKHELAYLLTGILGAAVDYWIFLGLKMGRNVMRHMSDDLGSYVSLSCDDFSSQELEIFICSFSSSWLQMFVAEAVFKKLCLQSSISISSEPLSLQKMVYSYLPALGNTGVPGAGKMQIPKKIGQRPCLESQRALLMLNGAKQKRVEGLPQLP	352236	323456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_324416_327154_327338_327749_327843_329797_329932_330839_331008_331997_332144_342174_342323_351451_351618_352216
830571	contig_4797_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_6902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAACAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344959	345276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_345000_345300
830572	contig_10855_pilon	-	257	2	Intergenic	novelGene_124301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCTACTCTGCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297501	296481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_296622_297384
830573	contig_5419_pilon	-	1129	10	Intergenic	novelGene_15463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_2	59.0055448325634	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	5	832	79704	70320	TRUE	45	AATTAATATGTATAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAESEYESVLCVKPDVSVYRIPPRASNRGYRASDWKLDQPDWTGRLRITSKGKIAYIKLEDKVSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSRYFVIRIQDGTGRSAFIGIGFTDRGDAFDFNVSLQDHFKWVKQESEISKESQEMDTRPKLDLGFKEGQTIKLSIGSITTKKGGASKPRTAGPGGLSLLPPPPGGKITIPPPSSSVAISNHVTPPPIPKSNHGGSDADILLDLDSPAPVITPAPAPVSASNDLWGDFSTASSSVSNQAPQPSNWVQF	79708	18000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_18108_21616_21734_70246_70369_70693_70797_72459_72644_72723_72833_73654_73737_74407_74513_74670_74772_79609
830574	contig_2069_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_23389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGACCAGCAGCATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103044	1102747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1102700_1103000
830575	contig_6210_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_171883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTGATTATTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74380	75271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_74400_75300
830576	contig_6210_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_171884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGTAGTAAGGCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75682	76809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_75700_76800
830577	contig_5981_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_35538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATTAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306253	307708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_306300_307700
830578	contig_5918_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_99605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCTGCTAACCTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2091027	2092039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2091000_2092000
830579	contig_5918_pilon	+	402	2	Intergenic	novelGene_99604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	6	338	2091026	2092012	FALSE	35	CCCAGCAATGCTGCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMCLTHCYGVDPAGQGRTARRDSQGCDLQGPPHLPPEERLVGSNRRPFMVKHSAAYQKIGSLNTPAILREKDVAVCFCKDYSLGSPMGQSSSVLQGHYESEWTQRQWGVGR	2091020	2092076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2091168_2091821
830580	SIRV6	+	329	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	544	0	378	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830582	contig_11702_pilon	-	2335	2	Intergenic	novelGene_141944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGTATTATTTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35335	31347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_33565_35217
830583	contig_10775_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_157940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCTCTCAGCAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54803	53739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_53700_54800
830584	contig_4659_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_118178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAAGGCTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113475	111523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_111500_113500
830585	contig_3601_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_132969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCCAGGCCTTTCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145956	1144239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1144200_1146000
830586	contig_9121_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_134439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAACTACGCTGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81427	80748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_80700_81400
830587	contig_8743_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_149486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGAACTTTCTATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75298	76640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8743_pilon_+_75300_76600
830591	contig_17198_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_62349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAAAACAGTTGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678806	679639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_678800_679600
830592	contig_13112_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_98832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265495	267149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_265500_267100
830593	contig_9901_pilon	-	1651	11	Intergenic	novelGene_126933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	166.258864425329	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	326	799	207348	185991	TRUE	55	CTGTGACAAGAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAADGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249478	171115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_207324_207492_245846_245927_249376
830594	contig_165_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_117063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTCTGTTTTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54691	54333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_54300_54700
830595	scaffold_12124_pilon	-	1187	5	Intergenic	novelGene_22173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	109.335207046953	8	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	211	936	1264879	1229338	FALSE	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1265089	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1264875
830600	SIRV6	+	436	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	1	164	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACAAGTCAAGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
830602	contig_15991_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_70938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATAGGACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118474	118817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_118500_118800
830603	contig_6403_pilon	+	974	2	Intergenic	novelGene_139892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCAGGCCTTCCTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092991	1094144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_1093037_1093215
830604	contig_9389_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_84141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	454	798	1769778	1769434	NA	70	ACTAGCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKKVPGFGFIGDEMKNEFPQLSNQMKRKRKSSRWPLLRPPRGPPRDWPVSPDSCEMRCASGAVLITHLGFEALTAARALVVQWLRARLLTKRSAVRIYQLLLGNPVGQFYSIL	1770231	1768519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1768500_1770200
830609	contig_6871_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_21677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCATCTGTTTAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954941	954033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_954000_954900
830610	contig_6871_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_21676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGGGGCATCTGAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953936	953080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_953100_953900
830611	contig_11338_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_6325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTTTCAGAAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256603	257116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_256600_257100
830612	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
830613	contig_9389_pilon	-	1242	4	Intergenic	novelGene_84073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	110	junction_3	63.4209919681348	137	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	93	1016	1021548	1017297	FALSE	0	CGGGCTCCTCTCCCCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGLSVSELCCLFCCPPCPGRIAAKLAFLPPEPTYSLVPEPEPGAGAAPLGTLRALASPPGRWKLHLTERADFQYSQRELDAIEVFLTKSARGSRVTCMYVRCVPGARYTVLFSHGNAVDLGQMSSFYVGLGSRIGCNVFSYDYSGYGASSGRPSERNLYADVDAAWQALRTRYGISPDSIILYGQSIGTVPTVDLASRYECAAVVLHSPLTSGMRVAFPDTKKTYCFDAFPNIEKVSKITSPVLIIHGTEDEVIDFSHGLALYERCPKAVEPLWVEGAGHNDIELYSQYLERLRRFITQELPSQRA	1021640	1017070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1017523_1017607_1017788_1019855_1020051_1021225
830614	SIRV6	+	273	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-438	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1847	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1800_2100
830615	contig_5260_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_144392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTTTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428303	426631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_426600_428300
830619	contig_5620_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_161369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAAATTTTCATTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455422	456648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_455400_456600
830625	contig_16625_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_171105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7044	6757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_6800_7000
830627	contig_10526_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_142573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237039	237371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_237000_237400
830628	contig_15327_pilon	+	1297	8	Intergenic	novelGene_70592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.2738074562926	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	89	1297	872167	880755	FALSE	20	CTGGGACCCACGTCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYIPVEGELLFHTGETWKELQVKLLELQEMDSLLRGRQTRRFLIHLSNPKFGARLGQPHSATVIIGDGDEVDRSVTNWTLSSLPLVHSDPAAPQNPNAKAAGPRKIHFNWLPPPGKPTGYKVKYWIQGDSEAEAQVLDSKVPSVELTNLYPYCNYEMKVCAYGPQGESPYSSLVTCRTHQEVPSEPGRLAFNVVSSTVTQLSWAEPAETNGEITAYEVCYGPVNEDNLPIGPMKKVLVDSPKRRMLLIENLRESQPYRYTVKARNGAGWGPEREAFINLATQPKRPMSIPIIPDIPIVDAQSGEDYNSFLMYSDDVLRSPSGSQRPSVSDDTEHLVNGRMDFTFPGSANSLHRMTVANAAYGTHLSPHLPHRVLSTSSTLTRDYNSLTRTEHSHSQSATLPRDYSTLTSLSSHDSHMAAGVPNTPTRLVFSA	872078	880755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_872285_873171_873330_873680_873862_873982_874121_877153_877337_877421_877554_879515_879759_880699
830629	contig_6767_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_174618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTCTTAGGTCACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32249	30882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_-_30900_32200
830630	scaffold_19766_pilon	-	1090	6	Intergenic	novelGene_34274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	30.779213765137	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	227	892	381041	379177	FALSE	35	GTGAGAAATGTTGGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRPEPACAAPPLGPVVPVLVFPPDLVFRADQRSGPRQLLTLYNPTGAALRFRVLCTAPAKYTVFDAEGYVKPQSCIDIVIRHVAPIPSHYDVQDRFRIELFEEGAEGRVVGRKDIPSVLRAPAYPLELQARQDSAPHPGPPAWTPPPAARHFQENAHPQLATSSFLLFLLTGIVSVAFLLLPLQDELGSQLPQVLHVSLGQKLVAAYVLGLLTMVFLRT	381267	378978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_379209_379327_379493_380094_380325_380552_380629_380813_380947_381011
830631	contig_2476_pilon	-	825	4	Intergenic	novelGene_157625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_1	20.3360653902262	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	31	693	135419	119126	FALSE	35	AATAAAGCTTGCCGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKHQDLEIEVKDEQHQCSLGNLKIPLSQLLTSHDMTMNQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLYLEKQERSPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKIPVKSQISVSPATEGSKTTPSTPVIDGSSKTDMEEKDQPSNASPQWPRDLSRSSSSLQASNFTYSPSHISVKEPTPSIASDVSLPVATQELRQRLQQLEK	135449	118993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_119519_121505_121656_134494_134582_135386
830632	contig_1847_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_171729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCTAAAACACAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74626	74212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_74200_74600
830633	contig_15327_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_70740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	0	63	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTATTAAAATTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002572	999868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1001270_1002519
830634	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
830636	contig_3130_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_103567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTCGATTCTGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76953	77736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_77000_77700
830637	contig_1143_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_86583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGTTGCCGTCGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124377	124661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_124400_124700
830640	contig_6375_pilon	-	882	7	Intergenic	novelGene_73036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	131.761674582896	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	17	880	497798	482136	FALSE	70	AGAGAAAGAAAGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEEASAESEDEMIHPEGVASLLPPDFQSSRERPELELSRHSPRKSSSVSEEKGESDDERPRKGERRSPRVRQARAAKLSECSQTAEEEEEEEEEEEEEEEEEEENEVQKSREAPILKQFEEEEEEEEMSRAKPEEVMDERPKTIRSQEEEGLEKGGRVTRSQEETRRSHLARHQQEKEMKTASPL	497814	482133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_482424_482495_482547_483232_483322_489768_489889_490309_490422_496143_496210_497660
830642	contig_4385_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_141511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	373	801	429653	429225	NA	45	TTCAATTTTCAATAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHADSPNPVCEGFMGCLDWAPGWGGIPPGLLSQTLGCFPRALSLPPKPPNSHTSGEKMGLRSQDGHGGSWGDGVPSSGGATTTRVSAPPTPQTHTGTRWDLPRVAWELVALRLQGVVSWTPRSALPGKERGQGAEPRGQAS	430025	428835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_428800_430000
830643	contig_17311_pilon	-	387	4	Intergenic	novelGene_57862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	2091.86461214763	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	40	387	126865	121573	FALSE	25	GTCAGGGGGACTGCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKK	126904	121572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344_123555_123642_123709_126862
830644	contig_14176_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_74867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAAGTGAATCCGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493952	493467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_493500_494000
830645	contig_13048_pilon	+	2284	1	Intergenic	novelGene_138905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAACTTAGAATGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217008	219292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_217000_219300
830646	contig_8538_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_4697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
830647	contig_7091_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_131788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCTGGGTGCTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420738	419981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_420000_420700
830648	contig_6364_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_51789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCATAGATGCCTAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294765	1296416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1294800_1296400
830650	contig_7416_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_134327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCCCTTCACCCTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853483	854392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_853500_854400
830651	contig_8978_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_49315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATAACTAGTTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187273	187554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_187300_187600
830653	contig_6441_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_172887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGTATTTGCTTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298157	297748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_297700_298200
830655	contig_14405_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_85675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTCTTACAATTGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889760	889204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_889200_889800
830656	contig_8880_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_165762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTTGGGACTGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88748	86762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_86800_88700
830659	contig_12935_pilon	+	933	6	Intergenic	novelGene_165719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_1	68.8284824763702	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	111	818	161610	251258	FALSE	50	GAGAATGGCAAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPLDRRSSFVPCHPDWRPSERTPGRANPIPASTAAMSSNSFAYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMMAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAAADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTVSNIFSVITVKYCFIYIVSFYHLIFYIITYFKMD	161499	251373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_161738_199297_199374_221271_221347_244806_244903_245525_245687_251086
830660	contig_1084_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_152394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAGAATAATGATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562012	560171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_560200_562000
830661	contig_15350_pilon	+	1211	3	Intergenic	novelGene_164256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTGATCTAGATTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235440	237825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_235515_236554_236642_236775
830662	contig_5057_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_151524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAATAATAGTGGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518146	517450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_517400_518100
830663	contig_10636_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_172281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTTCCCAGGAACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136894	137378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_136900_137400
830665	contig_19007_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_168448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAAAAAGATATGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65930	66491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_65900_66500
830666	contig_10299_pilon	-	890	10	Intergenic	novelGene_79799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_9	48.0788960658788	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	196	888	820243	787241	FALSE	40	AACTGAGCAAATGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANYLLFGLYNQNSSDFEKTGFSEEVLDDIIILIKSDSVHLYCNPVNYRYLLPYVAHWRNLHFHCMTENEYEDEEAAEEFKIASFVDMVRDCSRIGIPYSSQGHLQIFDMFVVEKWPIVQAFALEGIGGDGFFTMKYELQDVSLNLWNVYSKMDPMSLDNLLSEDLVTFEHQWTSFFANFDTEIPFLLELSESQAGEPFRSYFSHGMISSHITENSPNRQPFVLFGNHSTRENLNAGNFNFPSEGHLVRSTGPGGSFAKHMVAQCVSPKGPLACSRTYFFGATHIPYLGDDNKLPK	823454	787238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_787264_788904_788987_794008_794145_795684_795741_799160_799260_812168_812247_818203_818311_819185_819283_820228_820354_823369
830669	contig_3956_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_14724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGCCTGCTTCTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247209	247784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_247200_247800
830670	contig_11175_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_61179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAATTCCAATGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297133	298563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_297100_298600
830671	contig_6914_pilon	-	1159	8	Intergenic	novelGene_151765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.9256661561245	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	154	753	400568	398401	FALSE	20	TTGGAGGATGGGGAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPGQWRDTPGSLSWGKTCGAQKRLPSLILSDPLPSACAQHNGRPYCHKPCYGALFGPRGVNIGGVGSYVYSPPTSMPASSTPLSPSSFSPPRRRTGLPQGKKSPPHMKTFTGETSLCPGCGEPVYFAEKVMSLGRNWHRPCLRCQRCRKTLTAGSHAEHDGVPYCHIPCYGYLFGPKGVNIGDVGCYIYDPAEIKSK	401061	397994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_398463_398638_398697_398797_398893_399014_399087_399881_400014_400110_400284_400560_400656_400995
830672	contig_10037_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_148955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGGAAGTTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237877	238100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_237900_238100
830673	contig_3132_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_127444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCACTCTGAGTTTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301908	299783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_299800_301900
830677	contig_12078_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_74095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTATATATCTATACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208000	206069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_206100_208000
830678	contig_6589_pilon	-	416	5	Intergenic	novelGene_25862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1378.16263554052	88	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	33	416	959104	955183	FALSE	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMVHARAARCTGISARHREPRTATPNRTSAPRAGSSSVPEADGPAAATKTNPRSYSVIKKILDA	959136	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_957251_957360_957758_957846_959101
830680	contig_15084_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_116705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGCTACAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240184	241737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_240200_241700
830681	contig_614_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_132666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCTTTCAGAACAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175839	1176915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_1175800_1176900
830683	contig_12301_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_110010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGACACTCACTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62958	64148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_63000_64100
830684	contig_3942_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_128792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACTGCATGTGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799418	798121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_798100_799400
830685	contig_8712_pilon	-	1049	9	Intergenic	novelGene_58850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	55	junction_1	39.589889807879	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	45	1049	761974	683027	FALSE	25	AAGCCACCCTCACCATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYNHLLAERLIRIMNNAAQPDGKIRLATLELSCLLLKQQVLTSNGCIIKDVHLACLEGAREESVHLVRHFYKGEEIFLDMFEDEYRSMTMKPMNVEYLMMDASILLPPTGTPLTGIDFVKRLPCGDVEKTRRAIRVFFMLRALSLQLQGEPETQLPLTREEDLIKTDDVLDLNNSDLIACTVITKDGSMVQRFLAVDIYQMSLVEPDVSRLGWGVVKFAGLLQDMQVTGVEDDSRALNITIHKPASSPHSKPFPILQATFVFSDHIRCIIAKQRLAKGRIQARRMKMQRIAALLDLPIQPATEVLGFGLGSTAPTQHLPFRFYDQCRRGSSDPTVQRSVFASVDKVPG	762018	683026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_683197_684969_685175_689968_690121_742208_742330_751881_752011_754561_754613_757489_757535_758276_758387_761952
830686	contig_8712_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_58846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAAAGTGTAATATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635860	635259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_635300_635900
830688	contig_13224_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_104092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTATGAGGAAAAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238710	239621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_238700_239600
830689	contig_8045_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_35319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTGAAAAAAGAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48206	47578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_47600_48200
830691	contig_3424_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_55594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAAATCTACACACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184157	1185059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1184200_1185100
830692	contig_11056_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_130377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354387	353023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_353000_354400
830693	contig_14953_pilon	+	1995	1	Intergenic	novelGene_137281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTAAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159011	161006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_159000_161000
830694	SIRV6	+	339	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	31	337	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830695	scaffold_17541_pilon	-	2125	1	Intergenic	novelGene_175242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	323	649	366545	366219	NA	65	TTGAAAATAAGAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVLSAVCPVVSGSRELAPPEAQAWPGFPAPVPGPASLLRSLARPRCSGPWPCWEALLSALAPRDPLGGRALGNAVSEELWRAETAQGSSPWVPGRQMLAGGSGVLG	366867	364742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_364700_366900
830696	contig_12279_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_50134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGCTTGATCAACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80160	79878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_79900_80200
830697	SIRV6	+	345	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10480	1	1243	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11480	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
830699	contig_14684_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_99660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGTTCTGTAAATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295959	297143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_296000_297100
830700	contig_2215_pilon	+	584	2	Intergenic	novelGene_163832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	378	junction_1	0	1224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTTGTGGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64620	69614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_64804_69213
830701	contig_7292_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_175361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTTGCTGTGAGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129774	128710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_128700_129800
830703	contig_6272_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_160468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	588	944	617724	618080	NA	30	GAATATGACTTGCCTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDYSSKHELPRDKQLKKQESPRDQLNPKGKEDERPIEENLVKRAAAGAGVTKSSSSEHVPCRVTNVPKPQPVRIVKQHSLVRTRYETVSQSVQVTEHGKVSDHIQWFNQLSLNEPNRTNVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYHRQAVNHKSASHGDAASPLVKAVSCDSALSWVENASSIPCNKSGVKEQKSMSHEQPNVDAVSKSSMELTSKSSSKTKRHRDLVNASLGSTRICKQEVVSHDLIKVPLDDVTNYDILKSVVNNNTAFSPGVDNRGLRKPSERERAWYKGSPKAPIGKTQLLSTSKPVDL	617136	619021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_617100_619000
830704	contig_11416_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_145386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTTGGCGGGCAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912961	914354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_913000_914400
830706	contig_7078_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_130133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCTCCCTGTGGCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119449	117347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_117300_119400
830707	SIRV6	+	423	2	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	52	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTATTGTCGGCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
830708	contig_10549_pilon	-	788	6	Intergenic	novelGene_110647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	33.432917910347	159	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	113	748	529487	524895	FALSE	35	CTATGTCTAATGTATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSEIAGSSGSKMENHELDDTIKENLKTLNIVTRKINQLPEAEKYLLEHGSTYVGLNAALCGLIANSLFRRVLNVTQGRLAASLPMAVIPFLTAQISYKGFVSLPLSTGNLSCETCTVTRSGLVGLIFSGLYPVILAIPVNGGLAARYNTALLPEKGNILTYWIRISKPVFRKMLFPILLQTVFAAYLGSRQYKLLIKALQLPEPGLETP	531179	524854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_525088_525720_525836_527209_527404_528335_528439_529456_529516_531095
830710	contig_9216_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_163508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTGAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567225	569124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_567200_569100
830712	contig_16722_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_118308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	757	1119	190544	190906	NA	15	AGCTGTTCTCTACCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTMRYRKYHRVQTTEYISMVSWILIIFFGFYSNTIIFNSVAQIVPTLTTESSFSEFLCPFATPHPFIYLLSTSLLSSTKDAPGSSCIFLAPAVRSTISPSSPGSFLLENDIYKPLSGR	189787	191345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_189800_191300
830713	SIRV6	+	371	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	456	29	283	-29	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAAGGTTCGTCTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586	2511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
830714	contig_4732_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_75442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTAGATTAGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638242	640142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_638200_640100
830715	contig_18869_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_56374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCATTTTTCTACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73753	73371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73800
830716	contig_10196_pilon	+	889	8	Intergenic	novelGene_132240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGGCGGGGCGGGGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433075	1448676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1433227_1433515_1433680_1436109_1436189_1436281_1436386_1440632_1440710_1442139_1442226_1442339_1442415_1448523
830717	contig_7695_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_41531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCCCTGTACTCGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357828	359388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_357800_359400
830718	contig_11631_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_104180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCATGAAGCAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64427	63631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_63600_64400
830720	contig_414_pilon	-	1337	2	Intergenic	novelGene_115110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	444	1220	373842	373066	FALSE	15	GGACTTCAGTGCTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384109	372948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_383938
830721	SIRV6	+	357	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	516	0	350	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830722	contig_9945_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_104812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70986	69721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_69700_71000
830723	contig_10811_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_165796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1100	1450	345906	345556	NA	50	CTACAGAAGTAACTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIPGPVCDVAGLLVTSPTCFCACGFSAWEAGGVGPEVLAACLGRLGAEESPWFRGLLPMAPRLAMLALLGCPWAWPPRPCCTGLLAPTFPIPGLMLELLPPRRSSDSCLCLEAAS	347005	344927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_344900_347000
830725	contig_3700_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_138061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102502	101022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_101000_102500
830726	contig_10064_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_122716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGATAAGTTTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272718	272017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_272000_272700
830727	contig_15825_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_160204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGAAGTGCCAGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124551	126654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_124600_126700
830728	contig_1551_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_173425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAGAACATGTTACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404679	403725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_-_403700_404700
830729	contig_10235_pilon	+	505	4	Intergenic	novelGene_46311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_1	1121.49701540198	1419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	127	426	89989	91792	FALSE	10	CCACCTGTGTCTCAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCMRELCIYAAPALGGLLLLVMIILSTCLCWLHRRVKRLERSWPQALSSEQELHYASLQRLPGTGGAEGLDLSEGDGKDAKEDPSADYACIAKKKPT	89862	91871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90005_90395_90492_90833_90857_91627
830730	contig_2069_pilon	+	764	3	Intergenic	novelGene_23528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	195	521	1508564	1509023	TRUE	20	GAGTCACCGCTCTCAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERWLQLEEKGPGLGGRGSKVRRLSMTGNWSQGPSWPGEGWGRRGECGDGVQWGTMGGLGSGQLQELLQCVLFHSLHEELIVLVLVPVDNLGRGGLGVACQGSHLIP	1508369	1509914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508817_1508949_1509107_1509754
830731	contig_9440_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_59037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCATGAAAAGCAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298594	298871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_298600_298900
830732	contig_5394_pilon	-	818	5	Intergenic	novelGene_172741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	8.347903928532	153	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	9	491	40812	18584	FALSE	20	TAAATTGTCCTTGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASMAAEHKTKLSKNLLRMKFMQRGLDSETKQQLEEEEKKIISEEHWYLDLPELKEKESFIIEEQSFSLCEDLLYGRMSFRGFNPEVEKLMLQMNSKHKAEEIEDETVELDVSDEEMAKRYETLVGTIGKKFAKKRDRANYEEDENGNIKPTKAKKVFLKPQD	40820	18256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5394_pilon_-_18717_19497_19593_23670_23762_31035_31149_40761
830733	contig_2755_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_158302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCCACCCTGATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261399	260205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_-_260200_261400
830737	contig_11427_pilon	-	640	8	Intergenic	novelGene_78997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	84.013118509151	195	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	23	523	655701	597239	TRUE	25	GCTACTCTCAGAAGGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPAAGVGRLEEEALRRKERLKALREKTGRKDKEDGEPNTKQLREEEEEGEKHRELRLRNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAVEEKVKEQLEAAKPEPVIEEVDLANLAPRKPDWDLKRDVAKKLEKLEKRTQRAIAELIRERLKGQDDSLASAVDATAEQEACDSD	655723	595613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_595730_597237_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_655605
830738	contig_4892_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_162853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTCTGAAATATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20679	19279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4892_pilon_-_19300_20700
830741	contig_14208_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_129082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTAGATTATAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120521	120190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_120200_120500
830743	contig_1719_pilon	-	1365	14	Intergenic	novelGene_87311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_6	344.229712074011	124	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	86	1033	453350	430131	FALSE	20	ATACCCTGTTGGGCCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASPTSRRSREEEKTLGRRLPGCSAALMEPNVRFWTAERQSFVQRFLLWTELLDPTNLVISIEKIEKSRQLLSTEAARGNVEDKKIQEAWKKSLSTVNPDSSKLIPAPFRPAAFLPFTGPVVFFSMMPSKGIKSMILPQLSFYTYTTAFNIINGNSSYHHHPRESLLLGAGVIASSTFFGIIPHLAQMKYSLDNYLVRFLLRRVLPVLFIAQVSGMNVLASRSLEPTRGIKVMDKEGKVIGHSRRAGQKAVKETAISRTVLFGTSACVPEVLAYFFKRTQCFLQHPRSLWAVKLSCTILVMGLMVPVSFGMFPQIGQIQCSKLEEEIRSSTEETELFYNRGV	453435	429798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_430209_431935_432054_434372_434459_441949_442066_443599_443691_444483_444550_444701_444759_444843_444898_445617_445644_446954_447010_447306_447334_448474_448544_451558_451625_453311
830744	contig_7915_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_42982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATTGGTTGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140916	140151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_140200_140900
830745	contig_1867_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_54540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATCCTTCAAAAACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343489	343297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_343300_343500
830748	contig_817_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_132485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745152	744708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_744700_745200
830749	contig_16103_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_118947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGTCCTGCTCCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969019	967954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_968000_969000
830750	contig_10246_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_46919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATATGTGTATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188629	189508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_188600_189500
830751	contig_13019_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_176938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCGTGGAATACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24996	24722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13019_pilon_-_24700_25000
830752	contig_4900_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_159045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCAGCACTTACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253253	251756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_251800_253300
830753	contig_4900_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_159044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTACTGTGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251791	251364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_251400_251800
830754	contig_5033_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_29082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTGGTTAAGAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660747	659523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_659500_660700
830755	contig_11096_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_143479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266028	266734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_266000_266700
830756	contig_5495_pilon	+	1246	3	Intergenic	novelGene_157664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	199	588	41787	60565	FALSE	10	CCTCAGCCTTTTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQVLRRGLQSFCHRLGLCVSRHPVFFLTVPAVLTITFGLSALNRFQPESDLERLVAPSHSLAKIERSLASSLFPLDQSKSQLYSDLHTPGRYGRVILLSPPGDNILLQAEGILQTHRAVLEMKPRSV	41273	61223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_41435_41749_42162_60550
830757	contig_19849_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_175460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTGCTGAGTTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3937	4597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19849_pilon_+_3900_4600
830759	contig_4531_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_47861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGTGTTATCTATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172687	173461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_172700_173500
830760	contig_4531_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_47862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAGAAAGCCCATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173514	174359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_173500_174400
830761	contig_13498_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_176527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATACTTCTACGAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202835	204335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_+_202800_204300
830762	contig_11171_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_48609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231947	232512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_231900_232500
830763	contig_10864_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_107137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587677	1590226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1587700_1590200
830764	contig_2201_pilon	+	576	4	Intergenic	novelGene_168761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_3	60.4777277644883	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	106	369	47044	54961	FALSE	15	TTTAAGCCTTTGGTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRVLAAPRSTLSVLIPGLCLLVSPRALCSSCHPAGMSQAEFDKAAEDVKHLKTKPADDEMLFIYSRYKQATVGDINTERPGMLDFKGKAKWDAWNELKGTSKEDAMKAYIDKVEELKKKYGI	46938	55168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_47053_48088_48207_53411_53475_54887
830765	contig_19352_pilon	+	1219	2	Intergenic	novelGene_122406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACTAAAAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301808	339436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_301884_338292
830767	contig_14033_pilon	-	753	3	Intergenic	novelGene_167432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	37.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	297	725	284801	278231	FALSE	20	TTCCCATTGTTTACACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARWRHIVLCGWRWSQAGFLTRAGERVEPFLRPWWSGTGGAERGLRRLGTSGRPSLSRDLTLQPPRRPKSTNPFTRAQEENWRRRNKTVLTYVAAAAVGMLGASYAAVPLYRLYCQTTGLGGSAVAGHTSDQIESMVPIKDRIIKVTFNADVHASLQWNFRPQQTEVYVVPGETALAFYKAKNPTDKPVIGISTYNVVPFEAGQYFNKIQVQQNANFIEYDKGTMKLCNTKFAALFWYRYL	285097	278202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_278453_279983_280140_284750
830768	contig_299_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_129498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	435	821	1611294	1610908	NA	40	TTTTTTAAATAACATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSYTHICIHIYLRNIHIYFLVVKQYTLFQSFCGSGVQAQLSCNQGVGQGLVLIWGLNQGKVCFQAHSGCWKNFFAAVRRTGPDFLLVVDWKSPSDPCYTSLLFKASKGECLLCHIVLVRSKPQVPVH	1611728	1610027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1610000_1611700
830769	contig_11512_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_43394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598620	599671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_598600_599700
830773	contig_614_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_132631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	27	305	593714	593992	NA	5	CCCAGCCTTTGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCSHGVTMVAIDWTATPTPTPSGRVILALTKPILCLVESAPQKRNKIHFLRANSGRGVLSALSQTAHKTDAVIITMPILQIRTLRHREIKIIYQRLHSW	593687	594799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_593700_594800
830774	contig_7359_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_139864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	986	1417	331245	331676	NA	80	TAAAAAAAAAAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHSRVHSVSQHSPEGLGSSARGWTVDEIHHAGSVLPRKEPGRGRHPLLWSCRNALTRGMWCSQGGVSECPLQAWSTLAINITSLLAAAVGFIILTFNLAAMPAARERCLQNASPPLEGFYYSRSEATNCLVVSSILLVSIFR	330259	332686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_330300_332700
830777	contig_345_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_176940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGGGACAGATGGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77909	75795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_345_pilon_-_75800_77900
830780	contig_15543_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_164363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCCTTTCTTTGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209166	208181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_208200_209200
830781	contig_15543_pilon	-	911	2	Intergenic	novelGene_164362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGTCACCGAGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207997	206069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_206630_207646
830782	contig_16724_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_105326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTATTCCTGGAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558053	560450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_558144_559618
830783	SIRV3	-	448	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	8	23	8	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGAAATGCTTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1974	1023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
830784	contig_7247_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_176690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAACTCAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126549	124896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_124900_126500
830787	contig_16535_pilon	+	734	5	Intergenic	novelGene_167707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	30.6063718856058	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAAACAGCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257710	259042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_257744_257830_258102_258215_258320_258562_258645_258798
830790	contig_15498_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_42704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCTACAGGTGTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894504	895618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_894500_895600
830792	contig_12479_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_56850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGAGAAGTCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221748	220798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_220800_221700
830793	contig_9415_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_109802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCAATTCCCGCTGATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715396	1713984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1714000_1715400
830794	contig_12943_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_140350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATGAAAGAACAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15655	17312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_15700_17300
830795	SIRV6	+	236	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	61	486	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
830797	contig_18545_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_161881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGCGCCTTTCTCGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243557	242441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_242400_243600
830798	contig_13958_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_129550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCATAGAAACCTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293010	293902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_293000_293900
830799	scaffold_16539_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_68371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGAGGGGCACGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503392	504215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_503400_504200
830800	contig_4385_pilon	-	1317	7	Intergenic	novelGene_141510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.29152869605896	126	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	60	524	433791	430435	TRUE	25	GCTTCTTTCACTTAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGARLRPVALLPLPAADTMVVLKGVPALLSPELLYALARMGHGDEIVLADANFPTSSLCQCGPTEIRADGLGIPQLLEAVLKLLPLDTYVESPAAVMELVPSDQARGLQTPVWRRYEYLLHKAGCTKSLEKVERFAFYERARKAFAVVATGETALYGNIILKKGVLAPDDLL	433850	428800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_429327_430167_430502_430799_430874_431807_431907_432041_432113_432697_432767_433706
830801	contig_4754_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_35975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTTTTGTGGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459298	459615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_459300_459600
830802	contig_11227_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_163201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291442	292564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_291400_292600
830803	contig_8729_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_40172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCAATGTTTATGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935420	936114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_935400_936100
830804	contig_9931_pilon	+	722	3	Intergenic	novelGene_134816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	839.5	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	191	721	364058	365636	FALSE	60	AAAAAGAAGTCATAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKADTTNTPLIGKWKKQKTHKKMYNGCIEIICNCINGATVIKLNS	297127	365637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_364048_364464_365511
830805	contig_4769_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_118034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAAGGGGGGGGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401350	1402765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1401400_1402800
830807	contig_14882_pilon	-	1352	12	Intergenic	novelGene_115021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	375.059862990491	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1044	1352	310118	298152	FALSE	60	AAAGGAAAGAAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEK	363616	298151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_311857_311927_316351_316501_316882_316984_317224_317321_321328_321410_321539_321739_363416
830808	contig_15888_pilon	-	1086	5	Intergenic	novelGene_84413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1533.73099010224	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	148	378	253598	252516	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGWWRRGRRTDAAIWRRRCSWYWRPRSWASRASLGLTRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDVSPPGRAALTT	259773	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251812_251854_252301_252468_252551_253402_253632_259659
830809	contig_3679_pilon	-	498	3	Intergenic	novelGene_112113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTTGAAAGACAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655169	642515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_642670_644729_644982_655077
830810	contig_14563_pilon	-	659	5	Intergenic	novelGene_135066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_4	160.825215684606	572	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTTTCTCAGTTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175261	161674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_162039_166787_166855_172198_172279_172812_172877_175177
830811	contig_12503_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_143818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTCCGCCTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75809	77251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_75800_77300
830812	contig_18794_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_54633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTATTTGGGATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90915	91724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_90900_91700
830813	contig_13607_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_170189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATAGTCAGAAGACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243799	245625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_243800_245600
830814	contig_12837_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_57364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280042	278090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_278100_280000
830815	contig_5894_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_83045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAACAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453397	453197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_453200_453400
830817	contig_6807_pilon	-	973	4	Intergenic	novelGene_84580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	4.18993502999218	44	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACTAATTGTTGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607372	499860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_500427_503219_503333_546933_547041_607185
830818	contig_665_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_158206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGGGTTGCCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211440	212530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_211400_212500
830819	contig_12709_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_147415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTATTTGCTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56541	55547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_55500_56500
830820	contig_6546_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_140992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTAGTTATTAGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612410	612695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_612400_612700
830821	contig_13158_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_107295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACAAGTTGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168188	166728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_166700_168200
830822	contig_3382_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_124116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGAAAATGAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727573	728737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_727600_728700
830823	contig_6842_pilon	+	1499	2	Intergenic	novelGene_130751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCACCTGGCAGTCGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302658	1306462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1303966_1306270
830824	contig_10603_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_173376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTAATACTAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82658	80756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_-_80800_82700
830826	contig_5690_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_119741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTACTCCATTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068036	1069208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1068000_1069200
830833	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
830834	SIRV5	+	353	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	875	-23	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
830835	contig_6589_pilon	-	1134	5	Intergenic	novelGene_25710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_4	3.8405728739343	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	918	215	1132	445987	432836	FALSE	20	CGCACAGCCTGTTCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEFVTLKDVAMDFTLEDWEQLGLDQGDLFWDTALDNYQNLFLLNPLRPNLISHPGDGEELEALGRESSKAADPDTAEPKSSPLKQDFLEEGLSQEIMETFAKDPVCYSSLGEACIGESWLDNLLGDPESLLRSDFVTNKESPTKCSSPELKRGFSPRSFLFTGENSMVYDLPEESLTPAKPQEFQNDFGRYSDQSQQDDTVQGGEKLYKCSECGETFSQSYHLIQHWIIHTKEKPTTMCQDYEKDYNQSSCLFVHQITHSVYKSYVCNVCGKTFSQNTHLLWHQKIHTGEELCRSQDSDHAFSH	450958	432833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_433528_437483_437574_439625_439753_445978_446167_450923
830837	contig_3818_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_99328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAACAAAAACCCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343125	1342351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1342400_1343100
830838	contig_10196_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_132056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGACCTCTGGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660741	662137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_660700_662100
830839	contig_7173_pilon	-	1763	8	Intergenic	novelGene_37543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517043	500336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_501030_501104_501204_504621_504722_508109_508221_508303_508451_512279_512387_512491_512613_516658
830841	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830843	contig_6361_pilon	+	571	4	Intergenic	novelGene_24008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCACTCCCAGGTTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410939	420933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411212_415389_415502_419464_419591_420872
830844	contig_3818_pilon	-	963	3	Intergenic	novelGene_99281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	20.5	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	253	771	701547	699578	FALSE	25	ACAACCCCGGGCTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFGARRLLTALLQPQPQRWPLQPSRDMRLVQFQAPHLAGPRLGLESGNDRGVIDLNAFDSTLPKTMIEFLEQGEATLSVARRALTASLPTLLRSEVTFLPPVTRPDKVVCVGMNYVDHCKEQNVPVPKEPIIFSKFASSIVGPYDEVVLPPESQVSASPLPRDHWRPPQG	703670	699385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_699846_701296_701574_703444
830845	contig_5758_pilon	-	716	3	Intergenic	novelGene_119074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	559.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACCTAACTGAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95778	92577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_93084_93307_93404_95664
830846	contig_9440_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_59044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCCATTGCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407990	406371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_406400_408000
830847	contig_8571_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_169191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAGAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532212	532802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_532200_532800
830848	contig_13901_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_146652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACTTGATTATTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225561	224496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_224500_225600
830851	SIRV6	+	309	5	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	1684	14	-215	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGAGTTTTATTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2808	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
830854	contig_7368_pilon	+	986	6	Intergenic	novelGene_158808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	29.2301214503122	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	78	815	179319	189682	FALSE	75	AAAACAAAAGAAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKQYQWEKRALLEKKQRKKRLEPLMVQPNPEARLRRSKPRGSEEQTPLVEPHTPHNDVILHGIDGPAAFLKPDTQDLETKLHVLSVGSSAMEEDTEESFDGESMLDTASKPDLQEILQKHGISGSLNFDEEETDGEEEEGKKLRSHSPNSETGRPSSASSQKSTTDTGASGTATQQADNQLGEVENLEEFAYSPAPRGITVKCRITRDKKGMDRGLFPTYYMHLEKDENRKIFLLAGRKRKKSKTSNYLISTDPTDLSREGESYIGKLR	178326	189853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_178356_179270_179431_180356_180534_186954_187089_187465_187664_189565
830855	contig_5586_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_143583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCAATCTAGTCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418566	419042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_418600_419000
830858	contig_3322_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_176945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTTCTTGCATGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4567	5658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3322_pilon_+_4600_5700
830859	contig_16633_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_165069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACAGGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64706	62897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_62900_64700
830860	contig_4732_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_75384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	7.1336448530109	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236114	247266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_236143_237033_237161_238215_238297_246146
830861	contig_7229_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_39865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474715	1473287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1473300_1474700
830867	contig_10402_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_175142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAGCTGTTTCCTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274438	274220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10402_pilon_-_274200_274400
830868	contig_7207_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_72041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414921	412976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_413000_414900
830869	contig_14133_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_119976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGTGTTCTTCTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243545	241922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_241900_243500
830870	contig_11590_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_125574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAAAGCTATTTTTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397494	398067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_397500_398100
830873	contig_9389_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_84085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTTCTCTGACCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220143	1219403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1219400_1220100
830874	contig_3956_pilon	+	1393	7	Intergenic	novelGene_14699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_4	103.411260938492	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	87	1247	12062	53831	FALSE	55	CACGACTGAGAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETEENRLRCSRTPEPDIRLRKGHQLDDKRRIDNDNHQGDLEPILEAAVLSSHHKKSSEEHECNDEASQEDERFMGMSPLLQAHHAMERMEEFVCKVWEGRWRVIPHDVLPDWLKDNDFLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGCVFFLCLGIFYMFRPNISFVAPLQEKVVFGLFFLGAILCLSFSWLFHTVYCHSEGVSRLFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCNPQPCFIYLIVICVLGIAAIIVSQWDMFATPQYRGVRAGVFLGLGLSGIIPTLHYVISEGFLKAATIGQIGWLMLMASLYITGAALYAARIPERFFPGKCDIWFHSHQLFHIFVVAGAFVHFHGVSNLQEFRFMIGGGCSEEDAL	11975	53977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_12233_35907_36028_40474_40647_43054_43242_43500_43689_49374_49569_53702
830875	contig_17386_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_157947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCCCAGGTGTGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428289	429444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_+_428300_429400
830878	contig_6969_pilon	+	987	2	Intergenic	novelGene_176946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTCAAAGGTCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335064	344916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6969_pilon_+_335418_344282
830881	contig_5988_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_16116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTTGTTTGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224979	1226936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1225138_1226552
830882	contig_14219_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_54274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTCTGTTTATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153995	154294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_154000_154300
830884	contig_10674_pilon	-	1722	5	Intergenic	novelGene_6420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	61.7170964968379	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	710	1720	113201	100381	FALSE	20	TGATGATATTTTGCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVKHALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISQEALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPTDEPISSHPFHIEDE	134119	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_100527_104232_104398_110297_110443_112646_113835_134043
830885	contig_13004_pilon	+	1263	4	Intergenic	novelGene_112743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	84.9012498272094	191	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	86	724	941382	952167	FALSE	15	GAGTGTTGCCTGAGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTCVSQMPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	941296	952706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_941396_943755_943911_948443_948698_951951
830886	contig_7457_pilon	-	1009	3	Intergenic	novelGene_31364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_2	33.5	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	21	320	321514	320293	FALSE	30	TCTCTGGCCACAGGAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMTVMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGGFSSPDSLFTLLAGFF	321534	319603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_320400_321116_321263_321467
830887	contig_19098_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_65834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCACAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398748	397923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_397900_398700
830891	contig_10938_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_171766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACACACACTTTAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176396	175787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_-_175800_176400
830892	contig_9895_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_144710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTAATCTTATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444512	443037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_443000_444500
830893	contig_6163_pilon	+	452	5	Intergenic	novelGene_103869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	304.543100397957	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	128	451	521450	522982	FALSE	30	GAATTTAACTCTCCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSAGPPGFTQAQTPAATISESLRLSPRCPPSALRRPSSQAVMLEALGSLPTQMDYKGQKLAEQMFQGIILFSAIVGFIYGYVAEQFGWTVYIVMAGFAFSCLLTLPPWPIYRRHPLKWLPVQDSGTENTSMLSFFQVCINMKNKCLIND	521322	522983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521486_521834_521895_521976_522064_522566_522640_522914
830894	contig_12139_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_146476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155428	156090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_155400_156100
830897	contig_9363_pilon	-	1808	7	Intergenic	novelGene_6667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	0.897527467855751	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	66	1229	1048791	1046348	FALSE	30	AAACTCCTTTTCTAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDETALPVTSLGTVAQWLQPSMAGTAQAQKQVYLVTGGCGFLGEHVVRMLLQQQEPRLRELRVFDLHLSPWLEELKTGPVQVTAIQGDVTQAHEVAAAVAGAHVVIHTAGLVDVFGRSSPKTIHEVNVQGTKNVIEACVQTGTRFLVYTSSMEVVGPNIKGHPFYRGNEDTPYEAVHSHPYPRSKALAEQLVLEANGRKVRGGLPLVTCALRPTGIYGEGHQIMRDFYRQGLRLGCRLFRAIPASVEHGRVYVGNVAWMHVLVAQELEQREKLMGGQVYFCYDKSPYKSYEDFNMEFLGPCGLRLVGTRPLVPYWLLVILAALNALLQWLLRPLLLYAPLLNPYTLAMANTTFTVSTNKAQRHFGYEPLFSWEDSRNRTIRWVQAMEGSPSDGGAGAWRPSMAHPSRS	1049219	1045768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1046815_1047289_1047453_1047656_1047757_1047832_1047942_1048244_1048401_1048622_1048798_1049160
830898	SIRV6	+	405	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	0	613	0	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATCAGCCTCACGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130	1927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
830900	contig_7347_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_172498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGAGGAAGGGGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232689	232440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_232400_232700
830901	contig_10477_pilon	+	1485	5	Intergenic	novelGene_112495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287826	305331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_288094_288652_288831_292432_292571_303863_303987_304552
830903	contig_11825_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_155418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACTGTATTTCCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111158	110303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_110300_111200
830904	contig_2924_pilon	-	1132	11	Intergenic	novelGene_140244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGGCTCTCTGATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304778	17811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_17944_66032_66157_125501_125606_135677_135810_147478_147683_185697_185775_199571_199667_221845_221956_236286_236343_239715_239751_304715
830905	contig_7035_pilon	-	411	2	Intergenic	novelGene_83546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCGCTGTGCCTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779895	778474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_778782_779791
830907	contig_10904_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_22503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAGAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319798	320393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_319800_320400
830908	contig_7272_pilon	+	1909	2	Intergenic	novelGene_25413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGATTCCAGGAGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868073	871230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_869842_871089
830909	SIRV6	+	417	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	333	17	167	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
830910	contig_17103_pilon	+	1724	3	Intergenic	novelGene_176952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	3	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	354	956	286261	286863	FALSE	5	CTTTAGCCTTGCTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFEGSAIPEHPEFSTFNPEAVHGHRKAVAVCSVAPNLPPPPPSNSPSDSDSIQKPNWDFDYDAKVVDLDPCLSKKPLEEKPSLPYSARESLSEVQSLSSFQSESCDDNGYHWDTSDWMPSVPLPDIQEFPNYEVIDEQTPLYSADPNAIDTDYYPGGYDIESGFPPPPDDFPVPDELPPLPPEFSDQFESIHPPRDVPPTGSLGSSTRNWQRFHLNQYLPSFYPVDMSEPPKPGTSENSTCREPCTPYAPGYQRNFDAPAVENMPMSVYAATASCSDVSACCEVESEVMLSDYESGDDRHLEEVAIPALDPQQHTQV	278606	287631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17103_pilon_+_278796_279707_279846_286234
830911	contig_2940_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_81959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTCTCTCAAGGCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004280	1005150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1004300_1005200
830912	contig_9185_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_166880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTCTTAACCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93124	94067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_93100_94100
830913	contig_7182_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_117114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTAGAAAGAATTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169636	167667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_167700_169600
830914	contig_3161_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_84537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522381	523811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_522400_523800
830915	contig_11986_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_69224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAGAAAAAATCAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767725	766762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_766800_767700
830916	contig_9482_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_44329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTCCTTAGGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244084	1243121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1243100_1244100
830919	SIRV5	+	356	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-30	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8453_8586_10858
830922	contig_10437_pilon	+	461	2	Intergenic	novelGene_38498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGTCCCGATTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252187	1252739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1252283_1252373
830923	contig_8571_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_169184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	14.6692706021806	411	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	131	508	482050	514280	FALSE	10	CATGGCCTCTAGTCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARWEQKTRRLSKAFGSPYLACYALGGAILLLNLVRSHCFTQAMLSQPKMESLDNAGAYRVGLVLLGVGALFVLTSFSALGFTGTFLGDYFGILKEARVTTFPFSVLDNPMYWGSTANYLGWAIMHASPTGLLLTAIVAIVYVVAVLYEEPFTAEIYRQKAAKSHKRS	471124	514512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_471242_482036_482183_510795_510908_513706_513782_514222
830924	contig_6496_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_103521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTTTTTATTACTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890376	889153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_889200_890400
830925	contig_5229_pilon	-	1474	4	Intergenic	novelGene_117723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	19.3964487013015	409	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	28	558	896733	890906	FALSE	5	CCTGTGCTTGGTTTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGGRGAGEMERYSAAFEEAADGARQQERHYQLLSALQSLVKELPSSFQQRLSYTTLSDLALALLDGTVFEIVQGLLEIQHLTEKSLYNQRLRLQNDHRVLRQALRQKHEEAQQACRPHNLPVLQAAQQRELEAVEHRIREEQRTMDEKIVLELDRKVADQQSTLEKAGVTGFYVTTNPQVSALA	896760	889989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_891065_891999_892101_896378_896540_896623
830926	contig_7202_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_18105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27839	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27800
830928	contig_6710_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_96369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
830929	contig_6286_pilon	-	1519	10	Intergenic	novelGene_165668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	7.52772652709081	19	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	234	1139	441856	431010	FALSE	30	ATCTATGTCATTAGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSSWCCWACSWLWSAGAWTTSVPRACRPTSGPTTRCSPASPCSSWPGSPSRWSSSSSVLSSATSSPPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTVKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLSKFLSVFCGVYETVPSQLDLLVSACAVGVGCCFAAPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAITITALFRTNFRMDFPFDLQELPAFAVIGICCGFLGAMFVYLHRQVMLGVRKNKILSQFLAKHRLLYPGIVTLAIASSTFPPGIGQFMAGELMPREAISTLFDNNTWVKHTGDPGSLGLSAVWIHPKVNVVIIILLFFVMKVHPLPLTSDLHPLPTQRPRVHMEKERA	443324	430629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_431244_431449_431535_431844_431947_432172_432258_432894_433021_439749_439829_440136_440215_441739_441874_442016_442147_443238
830932	SIRV6	+	478	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
830933	contig_6451_pilon	+	580	5	Intergenic	novelGene_173688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	99.2329960245079	618	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	97	474	12389	277868	FALSE	5	CTCTCCATGTGCGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCGLIMVILLLLVAIVVVAVWPTS	7993	277974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_8080_12378_12504_29747_29841_153231_153334_277800
830935	contig_12638_pilon	-	1242	12	Intergenic	novelGene_33207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	308.358651331919	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	69	800	333468	321452	TRUE	15	ATAGTACTTGCTGGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPRLWRTSASRPAGVTIVSGLLMLLLFLSELQYYLTTEVHPELYVDKSRGDKLKINIDVLFPHMPCAYLSIDAMDVAGEQQLDVEHNLFKQRLDKDGIPVSSEAERHELGKVEVKVFDPDSLDPDRCESCYGAETEDIKCCNTCEDVREAYRRRGWAFKNPDTIEQCRREGFSQKIQEQKNEGCQVYGFLEVNKVAGNFHFAPGKSFQQSHVHVHDLQSFGLDNDPLHPAPVIWRRLPGHR	333536	319815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_320033_320362_320511_321266_321325_321432_321506_322595_322628_325995_326054_326191_326358_327062_327157_332668_332789_333007_333096_333202_333274_333419
830936	contig_5640_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_27298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAACACCTCTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299064	1299379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1299100_1299400
830938	contig_3135_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_176600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79966	81757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3135_pilon_+_80000_81800
830939	SIRV6	-	275	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-91	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1546_1647_1735_1844
830940	contig_9036_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_155451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGACACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128119	127369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_127400_128100
830941	contig_5485_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_37722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCAGTCCAATCCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224733	223609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_223600_224700
830942	contig_1734_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_164371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCCACATGGTCACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512473	511617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_511600_512500
830944	contig_14599_pilon	+	1000	6	Intergenic	novelGene_167900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	39.0251201151258	218	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	248	745	141561	145928	FALSE	0	TCCCCGTTTGTGCGCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVAGARVAAGRWPVLGPRLAARFFPQRPPQQTPEPGLALQRSLHATAVRAVPLIPIVVEQTGRGERAYDIYSRLLRERIVCVMGPIDDSLASLVIAQLLFLQSESNKKPIHMYINSPGGVVTSGLAIYDTMQYILNPICTWCVGQAASMGSLLLAAGSPGMRHSLPNSRIMIHQPSGGRPGPSHRHRHPGRGDLETEEAAIQHLRQTHQTEPAGDRVGHGEGPLHEPHGGPGVWHLGQGPGPPAPGW	141216	146183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_141401_141497_141570_142212_142310_143698_143888_144141_144248_145831
830945	contig_5338_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_114589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	20.8379994774504	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTCTATAATTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391411	387587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387928_388106_388196_388459_388690_389280_389410_389658_389730_390310_391175_391359
830946	contig_8447_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_69440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCGGCCGGGTAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114232	113661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_113700_114200
830949	contig_10437_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_38494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAATCAGGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242783	1241237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1241200_1242800
830951	contig_12570_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_79344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185614	187064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_185600_187100
830952	contig_5260_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_144435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCGATCGATCAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762600	761159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_761200_762600
830953	contig_3825_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_77982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGATGCGGCAGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445100	446245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_445100_446200
830957	contig_6497_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_35545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTGTAATAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8115	8473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_8100_8500
830958	contig_5145_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_131418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACTCTATGAATTCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832441	831498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_831500_832400
830961	contig_11328_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_88382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGGGTGAGTGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640307	639857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_639900_640300
830963	contig_11413_pilon	+	1126	7	Intergenic	novelGene_103116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	11.1766124861993	217	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	139	699	43720	47264	FALSE	15	GTACCAGCAGCTTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILRSPQALQLTLALIKPDAVAHPLILEAVHQQILSNKFLIVRMRELLWRKEDCQRFYQEHEGRFFYQRLVEFMASGPIRAYILARKDAIQLWRTLMGPTRVFRARHVAPDSIRGSFGLTDTRNTTHGSDSVISASREIAVFFPDFSEQRWYEEEEPQLRCGPVCYNPEGGIHCAAGTGGSGPA	41038	47691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_41095_41522_41598_43712_43810_45379_45483_46205_46246_46667_46829_47097
830965	contig_10426_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_144660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTGACTCATGGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45115	45565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_+_45100_45600
830966	contig_12250_pilon	+	693	4	Intergenic	novelGene_80530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2.82842712474619	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	298	456	210259	210417	TRUE	35	GTAAACCAGAGGGCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEIAPLQRLPPTPPPRSHPIRVSHDFQKPLTPSSLTSSSKLWSSGGSAPLVPNKELENLKFVGQGGFGAVFRAHHRAWGYDVAVKLLNSKAISREVKAMANLRNQYVLLLLGVTEKLEWENVCGPTLVTRFMENGSLSELLQHQCPRPWQ	209645	211105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_209774_209988_210130_210230_210547_210997
830967	contig_12250_pilon	+	1260	6	Intergenic	novelGene_80532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.37045990927054	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	647	1120	212134	213289	FALSE	15	TTCTTGTAGCCACGACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPGRIMGSQCSWNDSIVSESLNNLHLEECPGTVPEKSTSLTEKIRTQGGQVQDTRIAGASSDSTAQPPQTPKISPFRSQTPNSTSVWVPDPGTQGNQGAERHDKNWPHWDSELNPIPAVYSPTWVARGADWKQQLHEHTRETHPAHGGPSTSQRG	211056	213429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_211144_211248_211296_211511_211669_211778_212431_212576_212638_213173
830968	contig_9653_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_48257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGTTGCCGTCTAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906559	905546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_905500_906600
830970	contig_15413_pilon	+	1853	3	Intergenic	novelGene_176956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	0.5	23	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	128	367	91138	92077	FALSE	55	TAATAATGCACATTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHACVLQLPFNQQVGKNPSFFLRVISDTALCCYSIVKTKNAGMLLGAPGAMGPFPSEAARWLCHHAFLLKLARHRVTYKCLLGTLKTTKMQLGRKIPKATMALLEAATTPSLCSEFKTILD	89633	93563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15413_pilon_+_89759_91135_91274_91973
830971	SIRV6	+	335	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	514	24	348	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
830972	contig_19957_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_57751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTCAAGATAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410109	410697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_410100_410700
830974	contig_854_pilon	+	1065	7	Intergenic	novelGene_36433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	6.36832439151427	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	355	915	1181048	1199666	FALSE	10	GCCGCAGCAGCTCTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAAKCILAGDPTVGKTALAQIFRSDGAHFQKNYTLTAGVDLVVKTVPVPDTGDSVELFIFDSAGKELFSEMLDKLWESPNVLCLVYDVTNEQSFNNCSKWLEKVRSQAPGSSLPGVLVGNKTDLASRRAVESSQAQAWALGQGLECFETSVKEMENYEAPFHCLAKQFLHLYREKVEVFHALV	1180693	1199816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1181082_1188870_1188951_1189323_1189384_1190682_1190743_1193271_1193390_1194251_1194362_1199567
830975	contig_15084_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_116675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTAGCATGTGGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140100	141157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_140100_141200
830976	contig_15084_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_116676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTAAATTTAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141862	142140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_141900_142100
830977	contig_6228_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_164504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCAGAAAAAAAATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240554	239830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_239800_240600
830978	contig_5021_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_167106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTGCTTTCCTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464628	465013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_464600_465000
830979	contig_5021_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_167107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAAATGTCTTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465073	466116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_465100_466100
830980	contig_6929_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_139424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGTGTATCTTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131947	132317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_131900_132300
830982	SIRV6	+	373	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
830986	contig_5698_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_55034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTAAGAGATCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8091	6943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_6900_8100
830987	contig_20739_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_83184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTACAGAACTCAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161064	162327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_161100_162300
830989	contig_7843_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_152061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAAAATGTGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711253	709806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_709800_711300
830990	SIRV6	+	405	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	362	0	196	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
830991	contig_19680_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_132005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAATAAAGATTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100044	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_1e+05_100400
830992	contig_14855_pilon	+	472	4	Intergenic	novelGene_146021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_3	4.18993502999218	3370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	7	417	514617	530150	FALSE	20	CCTCAAGGTTTGAGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKMAGNRYRRFLKLCEEWPVDETKRGRDLGAYLRQRVAQAFREGENTQIAEPEACDQMYESLARLHSNYYKHKYPRPRDTSFSGLSLEEYRFILSSDTLQEFKVMNKGMWKKLQEKFAPKSPEEKHKAWAQALFRPRT	514610	530205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_514755_526144_526220_527126_527197_530022
830993	contig_11096_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_143467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAGTAGGATTAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199158	200520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_199200_200500
830994	contig_7411_pilon	+	2373	1	Intergenic	novelGene_137022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	139	492	346725	347078	NA	50	ACATCAAGCTAAAGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLFFSCVVESELTLAGQPRGVCAPFFWPQGVASILREVQLCPPEPMPGRSKGEGPLPSTAPFRKSLRLLGDMQSGCSRVGTVGSQVIHAGFCNQEEEGGHWETSGHLHSAGLFARCSSRFRFLHRQKSSANSGKLHLGRKQVSSTMSGNLIRREGLKEWEGT	346586	348959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_346600_349000
830996	contig_17178_pilon	-	965	2	Intergenic	novelGene_176338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTGAGTTGTCTACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94038	86516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17178_pilon_-_87295_93851
830997	contig_14322_pilon	+	1264	7	Intergenic	novelGene_115631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	90.2139432435782	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	55	306	247120	249230	TRUE	15	CGTGACCTTGACACCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSVGTFDIAGLLNNPSFMSMASNLMNNPQVQQLMSGMISGSPNPLGTPGTSPPQNDLASLIQAGQQFAQQMQQQNPELIEQLRSQIRSRTPSASNDDQQE	247065	252260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_247129_247603_247642_247920_248011_249115_249238_251058_251219_251365_251980_252083
830998	contig_20420_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_172481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACTTTATTGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43164	44579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_+_43200_44600
831000	contig_6270_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_99863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGGACAGTCAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012035	1014065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1012000_1014100
831001	contig_9668_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_58202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCTGTTATAGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515622	514433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_514400_515600
831002	contig_10848_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_133528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTCAAAAACCAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45142	43030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_43000_45100
831003	contig_15034_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_143640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	346	648	50729	50427	NA	30	AGTGTTGCATAGGGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLWDQIGLHSNYKCTAYCFVNLTLDNALSFLPPWLSHLYPGNLNMQFILALFLPTSLPSPHFLENWTLSLPAPSVHIESLESFPCHLPEPCSCPTSNA	51074	49982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_50000_51100
831004	contig_5485_pilon	+	571	3	Intergenic	novelGene_37729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	6.5	719	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	81	380	295690	316783	FALSE	10	TTCTGTTTAGGGTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLREPFGVVVTRLVLAAFEEDEEGLSMAEGHTLISVDYEIFGKVQGVFFRKYTQAEGKKLGLVGWVQNTDRGTVQGQLQGPTSKVRHMQKWLETRGSPKSHIDRASFNNEKIILKLDYSDFQIVK	295218	316974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_295291_295681_295774_316567
831005	contig_9578_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_67998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253188	1251270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1251300_1253200
831006	contig_13300_pilon	-	983	5	Intergenic	novelGene_125807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	27.4260368992678	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	250719	248617	TRUE	45	GAATCTGAAGCAATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250721	244134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247016_247267_247440_248525_248782_250575
831007	contig_7171_pilon	-	905	9	Intergenic	novelGene_101404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.7142793184607	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	102	575	1412687	1409727	TRUE	40	TGCTTCTTAGAGACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSEVIPKCEKCQSVVKPDIVFFGENLPAHFFSCMQSDFLKVDLLIVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKTGQTDPFLGMMMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGDCDQGCLALADLLGWKKELEDLVQKEHAAIDAKSVSGGPNPGISTSPRKSPPPAKEEARTTAPVGTAGPQPGWPLSNSQLL	1413037	1409344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1409474_1409525_1409789_1409836_1409973_1410081_1410149_1410289_1410361_1412332_1412385_1412463_1412541_1412678_1412735_1412983
831008	contig_10904_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_22504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGCTGGTGGTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325892	326097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_325900_326100
831009	contig_7004_pilon	+	2237	18	Intergenic	novelGene_126496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	8.60755281121899	99	64	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	889	2097	428471	431866	FALSE	45	TAAATAAAAGTGTAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTQENATQARAVDSLINFETVKYYNAERYEAECYREAIIKYQDLEWKSNASLVVLNQTQNLVIGLGLLAGSLLCAYFVSEQKLQVGDFVLFGTYIIQLYMPLNWFGTYYRMIQTNFIDMENMFDLLKEEAEVKDLPGAGPLRFQRGQIEFENVHFSYADGRETLQDVSFTVMPGQTLALVGPSGAGKSTILRLLFRFYDISSGCIRIDGQDISQVTQISLRSHIGVVPQDTVLFNDTIANNIRYGRITASSDEVEVAAKAAGIHDSILTFPEGYETQVGERGLKLSGGEKQRVAIARTILKAPDIILLDEATSALDTSNERAIQASLAKVCANRTTIVVAHRLSTVVNADQILVIKDGCIVERGRHEALLSRGGVYADMWQLQQQGQEEVSEDTKPQTMAR	425370	432006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_425613_425858_426046_426250_426353_426555_426740_427871_427998_428423_428534_428750_428817_428987_429114_429283_429361_429449_429514_429614_429701_429916_429975_430157_430263_430672_430848_430975_431089_431323_431419_431499_431569_431754
831010	contig_5467_pilon	+	993	5	Intergenic	novelGene_111927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	103.325638154332	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	25	741	8246	15593	FALSE	5	GTTGGGCCTCCGGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARVRAGSRRVPALWRMRWLPLLLSVTAAAVAAEQQVPLVLWSSDRDLWAPAADAHEGHITSDMQLSTYLDPALELGPRNVLLFLQDKLSIEDFTAYGGVFGNKQDSAFSNLENALALAPSSLVLPAVDWYAVSTLTTYLQEKLGASPLHVDLATLRELKLNASLPALLLIRLPYTASRCEGEGTLILGTLPPPFSLFPSLEHHPLLFTLLLCSKCPLPKLCGAPCSSPELDSP	8221	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_8395_8664_8792_11139_11215_11427_11622_15421
831013	contig_2036_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_131811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCTACAATCTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498276	499198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_498300_499200
831014	contig_990_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_76041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCCAGCAATTCTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857608	858362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_857600_858400
831016	contig_10600_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_169856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAACTGCTGGTGATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79218	77913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_77900_79200
831018	contig_9199_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_65656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	181	369	176325	176513	NA	65	AAAAAGAAAACAAACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSTIRAYSFPYRLLAFLLLHRLSLDHKHTPYFLEFLHQIGQSLIPWIKERVDDSLFIELRMEGHIMLSAARNFVILMEPPVRLTIGLLDSLFSDGKTLIPWTFDLFRSPVSCCISILPIASF	176144	177722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_176100_177700
831021	contig_8322_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_143275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTAAGTGTCTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535583	534366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_534400_535600
831022	contig_10800_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_152631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCTTTAATTTCTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536829	537533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_536800_537500
831024	contig_5935_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_102754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATGAGGTCATGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328691	1329954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1328700_1330000
831025	contig_6227_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_49655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAATGAAATGTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440520	440111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_440100_440500
831027	contig_9633_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_139619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTATAAGGCAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028234	1028688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1028200_1028700
831028	contig_5718_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_110422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCCTTGTAATCTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462585	1461073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1461100_1462600
831029	contig_15152_pilon	-	1921	9	Intergenic	novelGene_126952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.46410161513775	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	296	1540	43958	24699	FALSE	10	TGTTCTGCTCTGACCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPYKWVVEAANLLSPAVGSSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEGSISTSPVQPQAQQEAQVPSQRVIPVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTDVGGSGIGTPPSVLKRQKKRRVALSPVTENSASLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWTKQDTLELESPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPHLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDVRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDMKLMMSTLPKAMSLPTSVPSSSSSLTLSSIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAGAAQKPRSHFPTPAPMTSAWKMVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSQTLILS	50773	24317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_24828_25361_25512_26959_27065_28790_28905_29385_29486_34222_34363_39499_39908_43859_44152_50671
831030	contig_7333_pilon	+	1355	7	Intergenic	novelGene_142773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	83.2205904008537	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	276	911	185614	198318	FALSE	65	AAAAAAAACAATGTACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKPLLSSRLRLSLFNTCSRQISDIHLSRFHDRGRAVDLEKFCSETIDIIQPALVLATGDLTDAKTKDKLGSRQHEVEWQTYQGILKKTRVMEKTKWLDIKGNHDAFNIPGLESVENYYRKYSAVRKDGSFHYVHSTPFGNYSFICVDATLSPGPKRPYNFFGILNEKQMEELLSLAKESSWSNHTIWFGHFTTSTILSSSPGIRSIMSSATAYLCGHLHTLGGLMPVLHTRHFQGTLELEVGDWKDNRRYRIFAFDHDLFSFADLTFGKWPVVLITNPKSLLYSYAKHEPLERLLHSTHIR	184213	198762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_184391_185515_185654_188321_188368_191252_191395_194653_194779_194925_195049_198158
831031	contig_10238_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_170093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGGGGCTCTTGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81497	80523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_80500_81500
831033	contig_10299_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_79785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.4875425414005	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTCATCTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672477	679350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_672512_672601_672738_673298_673373_674236_674269_675516_675633_677664_677742_678885
831034	contig_16211_pilon	-	1074	9	Intergenic	novelGene_150055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	296.141435803908	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	206	1072	91808	73423	FALSE	40	GTAAGTCGAAAGCATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRERRRRRSRSSSRSPRTSKTIKRKSSRSPSPR	121104	73420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73517_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
831035	contig_9375_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_136081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGAACCTAAATTACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631757	632292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_631800_632300
831037	contig_678_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_167849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532213	530456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_530500_532200
831038	contig_4087_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_156079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAGAAAAATCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122939	123768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_122900_123800
831042	contig_6069_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_8061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	5	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	23	706	500328	498920	FALSE	15	GTCTAACATGTGCGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGLESEMDVCCLSGAVLVVRPGPEVESGASTLAAAALRLHSLAPSTGSGEGPSGFQDHLVCFLPGTLALGAHHGLPAEHMDLAKALMETCYQMNRQMKTGLSPEIAHFNMVPQEGHQDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLHRCTGDSKYRDWGWEILQSFNTYTRVPTGGYSSINNVQDPQNPGPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDADLLSLDTYVFNTEAHPLPIWTPS	500350	498276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_499124_499780_499913_499980
831043	contig_6059_pilon	-	1640	9	Intergenic	novelGene_44808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.89983551919633	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	61	855	502472	459713	FALSE	20	TCATCATGCTATTTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFELPYVSLQSSEVENCKVGLRKWYMDPSLDSMLMDCRTAVDLIYLQAIQDIEKEWAKPTQAQREKLTALQKEDNQTKFLELSREVQHYGYLQLDPCTCEYPEPGCLAVVSVGNNEISCHITLPDDQTQDVIFQMNRVKCWQVTFLGTLLDMDGPQQTLNQNLELRFQYSEDSCWQWFVIYTRQAFLLSSCLKKMISEKMVKLAAENPEMQIEVPEQGKSKRNHIQQSQWKNYSNFLLRKSKISIKVAEDDCIFGTIKEEDL	503730	458927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_459815_463759_463817_468807_468886_472632_472747_476778_476983_490411_490505_499346_499417_502395_502484_503681
831044	contig_10583_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_167911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTAGGGTAAATATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122009	121736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_121700_122000
831046	contig_14326_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_120708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	324	440	255738	255622	NA	15	GTAGTCATTCGCCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIYCILGRPKCLGEVCQYQNILSGSLQRPSCQPTLCPLLIETLLPLQIPNCQRCSGLRVLPHCPKPTVTPKNKIIDLKQLGEKHPPWLPQFQEHLFSALSIKFPSSPMYQSFGLLTSFTQGWSKGCSPREYTHSIFQVCSKLVSF	256061	254427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_254400_256100
831050	contig_839_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_171536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTGAAAATTAAGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451786	451487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_-_451500_451800
831051	contig_4364_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACGTCATGCAGGTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272347	1271656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1271700_1272300
831054	contig_3155_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_26426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCCTCTCCCTTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264835	265476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_264800_265500
831056	contig_8848_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_140471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAATCTTAACAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329609	328582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_328600_329600
831057	contig_9575_pilon	+	578	3	Intergenic	novelGene_169729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	1	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	25	336	721915	723433	FALSE	50	CCATCTACTTGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKATYHAHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNIREYLCAECGKGTRGLAPRTAARPPQRGKPSHS	721890	723675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_721959_722822_722903_723245
831060	contig_500_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_31120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713979	1715305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1714000_1715300
831061	contig_2342_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_132745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACATCAGAGATTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39075	40451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_39100_40500
831064	SIRV6	+	179	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	544	60	544	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10781	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
831066	contig_4151_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_65278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGCCAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648516	649953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_648500_650000
831067	contig_11493_pilon	-	1676	2	Intergenic	novelGene_143670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	785	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTATTATTTTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148042	142877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_143413_146901
831068	contig_10734_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_51351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCTGCATCCGCTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754343	1755010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1754300_1755000
831070	contig_13021_pilon	+	1536	8	Intergenic	novelGene_8224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	11.0564414690796	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	73	1233	184341	197393	TRUE	15	TTCCTAATTTGGTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSAAVRTFRKTCRCLFSGFGGRVGGGLLERLTKTSSSLGRQLRWYAELPRGSEPGEVPESGEGSEGLLEICQRRHFFSGTQQQLSRDSLLSGCHPGFGPLGIELRKNLAAEWWSSVVVFREQVFPVDALYHEPGPSLPGDSAFRLVSAESLREILQDKELSKEHLVAFLENLLKTPGKLRENLLHGALEHYVNCLDLVNKRLPYGLAQIGVCFHPVSDSKQTPHGAKRIGEKTEASLVWFTSARTASQWLDFWLRHRLLWWRKFAVSASNFSSSECQDEEGRKGNQLYYNFPWGKEPIETLWNLGDHELLHAYPGNVSKLHGRDGRKNVVPCVLSVSGDLDRGMLAYLYDSLQLTENSFSRKKHLHRKPLLRLLWMWEEAQQWN	184268	204058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_184903_191415_191543_191659_191766_193517_193692_194921_195063_197342_197399_202155_202257_203861
831071	contig_17440_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_7652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
831074	contig_16231_pilon	+	1517	2	Intergenic	novelGene_176715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89307	101650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_89359_100184
831075	contig_9561_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_100857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209488	210753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_209500_210800
831076	contig_4686_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_118587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGTTAAAGGAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816069	816536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_816100_816500
831077	contig_17436_pilon	-	617	6	Intergenic	novelGene_164173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	27.6738143377453	193	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAAATCTTCCTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67533	45038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_45136_47203_47306_61778_61825_63635_63785_66757_66854_67406
831078	contig_4640_pilon	-	1103	2	Intergenic	novelGene_147974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474566	473112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_473347_473697
831079	contig_7327_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_172116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGTAAGAAGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103467	102316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_102300_103500
831080	contig_709_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_57592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATCTCCTACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2242784	2243971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2242800_2244000
831088	contig_2069_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_23225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGGCGAAAGAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213281	213791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_213300_213800
831089	contig_11815_pilon	+	1479	2	Intergenic	novelGene_50893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAGAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126018	128017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_126130_126649
831090	contig_10299_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_79739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGCCCAGGGCTTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401681	402074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_401700_402100
831091	contig_10299_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_79740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAAGTTAGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402726	403804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_402700_403800
831097	contig_16766_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_153362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	98	316	138358	138140	NA	35	ATGTTCAAGGTTAATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNSAVLNIAIQVFESLISNFWSVYLGVELLGHMVILCFNFLRHRNTVPQLLHHFTFPPAMDEDSYLSTSFPALFSIFLIIAILVSMKLYLFVVLICISLIPDRV	138455	137931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_137900_138500
831099	contig_8866_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_77866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGGACAGAGCGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794645	794021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_794000_794600
831101	contig_2867_pilon	-	1775	13	Intergenic	novelGene_135169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	18.0483532643717	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	93	1166	692128	686589	TRUE	15	CCAGAGCCGCTGTTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLFSIEVLSSHYSVWDYWRCFFAATCGALMFRLLPVFNSEQETITTLFKTSFRVDVPFDLPEIFFFVVLGAICGIVSCAYLFCQRTFLGFIRTNWFLSKLLATSKPMYSTLATLILASITYPPGVGRFLASRLSMKEHLDSLFDNNSWALITRNSSPPWPPEPDSQNLWFEWYHPRFTIFGTLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPVFVFGAAIGRLWGEALSLAFPEGIMAGGVTYPIIPGGYALAGAAAFSGAVTHTISTAILAFELTGQILHALPVLMAVLAANAIAQSCQASFYDGTIIVKKLPYLPWIRGRGISSHGVIVEHFMNCTITTLAKDMPLEEVVKVVTSTDVAEYPPGGEHRVSNPGGRRAKGPVDAGPPD	692220	684697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_685111_685475_685563_686330_686412_686560_686650_687396_687532_688635_688850_689255_689367_689540_689611_689925_690100_690373_690459_691216_691319_691438_691524_692091
831104	contig_4876_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_137922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATATACATGTAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651790	651123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_651100_651800
831106	contig_9107_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_176292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138548	140356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9107_pilon_+_138500_140400
831107	contig_12019_pilon	+	1034	2	Intergenic	novelGene_87706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202887	205970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_202979_205027
831110	contig_14720_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_164982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACATTGCTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158218	160499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_158200_160500
831111	contig_5964_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_80345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTTTCTTCTTAGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5853	4950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_5000_5900
831112	contig_3243_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_147536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTAATAAAAGAAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32358	33229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_32400_33200
831113	contig_10751_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_174823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	447	863	251447	251031	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTAAHDPFFNFLPDKEAILSAPKGNKDCACNLICTFSRSSPNLLLILGSFLEVACIDFNKLDLVDVPPQGCSPACPSSTCLASWSQGSVPSPMVVKLLSLLPPQEELIDKERPLHLHTEQAAPPGALASLVAAGGAR	251893	249151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_-_249200_251900
831114	contig_8801_pilon	-	1361	6	Intergenic	novelGene_66281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	96.1195089458951	158	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	539	943	455284	445841	FALSE	15	TGGCCTTGGAGATCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGDSTKVDKLVRDIYGGDYERFGLPGWAVASSFGNMMSKEKREAVSKEDLARATLITITNNIGSIARMCALNENINQVVFVGNFLRINTIAMRLLAYALDYWSKGQLKALFSEHEGYFGAVGALLELLKIP	460542	445422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_445892_449288_449415_451005_451130_455180_455358_456383_456638_460331
831115	contig_5039_pilon	-	733	5	Intergenic	novelGene_64909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	46.0461724793712	780	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	834462	829376	TRUE	5	GGGTGTCTCTGGTCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPCVRVFSPGGPPAGLRLPGASPGGDRRVTAATATRRATDFSWQSRRHGAEGPALGAACLGFVGQVPKRSRERTSLLVGCIWPREPRRTTEWCPENSKT	834462	821218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_821388_822353_822533_829290_829391_833802_833898_834272
831116	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
831117	contig_13982_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_163499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAACACAGCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544422	544866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_544400_544900
831118	contig_6446_pilon	-	1623	5	Intergenic	novelGene_149241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	26.8001865665148	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	23	385	621224	504681	FALSE	15	TGCCCCATCCCCTTCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLAQPYMIGSLLLWDCDDRSYSYYVEVSTNQQQWTMVADRTKVSCKSWQSVTFERQPATFIRIVGTHNTANEVFHCVHFECPEQQSGQKEENGEDPGTGDTSLAEAPRHSSQGSSLPL	621246	503442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_504725_510179_510277_530676_530756_591664_591773_621189
831119	contig_18895_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_176799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAGTCTGCTTCCGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7850	11546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18895_pilon_+_9167_11332
831120	contig_18970_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_157821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCATTCTTTTGGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36056	35697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_35700_36100
831122	contig_2854_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_120893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAGACAACTGATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149774	1148741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1148700_1149800
831124	contig_10323_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_123634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAATGCAGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504667	505858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_504700_505900
831125	contig_2773_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_174283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAGAAAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227142	225606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2773_pilon_-_225600_227100
831126	contig_7066_pilon	+	952	2	Intergenic	novelGene_42132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGAACAAATGAACCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706835	718045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_707662_717919
831127	contig_9415_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_109735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAACCATTTCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543158	542088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_542100_543200
831129	SIRV5	+	319	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	916	-30	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGTCGGAGACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
831130	scaffold_6394_pilon	+	170	2	Intergenic	novelGene_111038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	16449	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACCGGCTCAACAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442088	442476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368
831133	SIRV6	+	447	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	36	2	-36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	534	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
831135	contig_11364_pilon	-	1218	8	Intergenic	novelGene_65149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.9306722459038	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	11	598	67704	61299	TRUE	5	TTTGTGGTTTGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNNKSPLTPEKEAGYTEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	67714	60417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_60906_61166_61515_63980_64062_64315_64454_65141_65189_66590_66616_67011_67048_67659
831136	contig_7234_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_145950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTAGCTCTTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475690	476069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_475700_476100
831137	contig_8538_pilon	-	1492	4	Intergenic	novelGene_4609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.3553390593274	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	206	676	694671	688312	FALSE	30	TGCATAGATGTTCTCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPLPSRSRPRFTPSRGWPHPPGPCGACSGVSHVLLYIRTGCATHRWRAPGGGGRLISSPPPLALRPMSYTLLSCLPCPSICPGSRQEHPHGGSASLPPAGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPVWQLPSMARKWKWL	694876	687495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688345_692689_692905_693724_693778_694501
831139	contig_7839_pilon	-	918	6	Intergenic	novelGene_45700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	10.4307238483242	427	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	22	609	249636	228735	FALSE	10	CCCACTGGGTGTGTGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSALVFKMAAFKALVSGCGRLLRGLLAVSPETRARPPVRAFREVVEIQEGKTTIIEGHITGTPKESPHPPNPSGQCPICRWNLKHKYNYEDVLLLSQFIRPHGGMLPRRITGLCREEHHKIEECVKMAHRAGLFPNHRPRLPEGFVPKNKPQLNRYLTRWSRRSVKPIYNKGHRWNKVRMAVGSPLLKDNVSYSRTPLVLYH	249657	228425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_228880_231906_231977_232135_232260_234883_234992_237435_237468_249527
831144	contig_13481_pilon	-	1157	2	Intergenic	novelGene_119384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	462	1016	526775	526221	FALSE	15	TCATCCAGAGTGGCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHHSWLLPMPLPHVSACSGEDPALPQWPHPTHFQAEQLQQIPNKHTVFSFPFQIRVLHFLLRWANSCQKVLSVRTAFPHHSMPLPPCHWSLLILSKFPNQPKSESIFVPCVTKYLCIIKDFSCVCNQLLKRPCSLCQMSLMFSLRHEEEKGFRSLAMSLFFFFLVRCYFKKNEMKEKLCNFVL	527524	526079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527173_527460
831146	contig_11285_pilon	-	951	7	Intergenic	novelGene_5669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	355.081876317123	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	420	761	786133	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	787625	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533
831147	contig_5428_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_160426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTGATTTATTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246236	245348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_245300_246200
831148	contig_12635_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_60871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTCATTACCTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657650	659202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_657600_659200
831149	contig_3602_pilon	-	903	5	Intergenic	novelGene_60552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	107.058395280333	338	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	209	637	401350	390133	FALSE	5	CCTGGCCTTGCCGTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRFILIQNRAGKTRLAKWYMQFDDDEKQKLIEEVHAVVTVRDAKHTNFVEFRNFKIIYRRYAGLYFCICVDVNDNNLAYLEAIHNFVEVLNEYFHNVCELDLVFNFYKVYTVVDEMFLAGEIRETSQTKVLKQLLMLQSLE	401558	389866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_390235_390436_390497_391239_391354_397430_397581_401347
831151	contig_14882_pilon	-	902	4	Intergenic	novelGene_114996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	17.1075032271418	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	373	768	251664	250841	FALSE	25	TATAATCCCCTTGATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSSDYYNKDNEEESLLANVASIRHELKITEWSLQNLGEELSSVSTSETSDYACNSSRFERLILEDLAQPSHPGLLTYSPYKKVCKLSSGNTDSHKKPRDKVIVFKPVYLKCFFFKYLICVFHSLLLWC	254096	250706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_251103_251530_251667_253004_253176_253897
831152	contig_5718_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_110448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCAATTGCAGTAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620085	1620437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1620100_1620400
831153	contig_5718_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_110449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620487	1621403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1620500_1621400
831154	contig_11986_pilon	+	1072	10	Intergenic	novelGene_69081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	149.405819048095	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	123	905	12992	22021	FALSE	10	GGTCTGTCTATGGGGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCSWDYKVTQRWASRLQQNNLRTQLKELLAEWQLRLVPRSMWGQLKRVAVLGLVWLLCLVTTMGCAMAVYTFSELMIQKVATSQEAALLTLPLVVSLINLVAPYLYRGLAALEQHESPVLEVYVAICRNLILKMVILGILCYHWLGRRVRALKGQCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLAVIYLNIQVVKGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYEKKERSSAPAQIRDAQETL	11874	22188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_11955_12949_13106_13593_13743_13861_13944_14176_14275_15956_16053_16436_16494_18573_18653_21266_21335_21981
831155	contig_8712_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_58873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGATTACGAGTCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885609	885881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_885600_885900
831156	contig_19608_pilon	+	1734	9	Intergenic	novelGene_176958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	21.1586270821148	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	233	1273	28542	36574	FALSE	10	AGCCCCGAGTGCCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGIPNQALREIKALQEIEDNQYVVQLKAVFPHGAGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAHVKSYLQMLLKGVAFCHANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGNRLYTHHVATRWYRAPELLYGARQYDQGVDLWAVGCIMGELLNGSPLFPGENDIEQLCCVLRILGTPSPQVWPEITELPDYNKISFKDQAPVPLEEVLPDASPQALDLLGQFLLYPPRQRITASQALLHQYFFTAPLPAHPSELPIPQRPGGPAPKAHPGPPHVHDFHVDWPLEDSLLNPELIRPFIPEG	27999	37035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19608_pilon_+_28195_28504_28617_29182_29297_31975_32165_32439_32562_32740_32804_33561_33686_34494_34651_36376
831158	contig_6654_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_85724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTACAAGACTTGCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335376	335066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_335100_335400
831159	contig_14341_pilon	+	1751	2	Intergenic	novelGene_111865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	984	1301	567755	568072	FALSE	35	ACACATACTACTTATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVNVGKLSALYPPSFGTGKFTLEKGPMSALNVGNSLPKTLTSFGTRELTLEQSLINALNVGKPTAESPVSVGTRRFIPKKACKNGTNVGKPLAPESSQHRETS	561655	568522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_562060_567175
831160	contig_9345_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_24697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACCACAAGTTTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952642	950781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_950800_952600
831161	contig_10627_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_60034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627139	627969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_627100_628000
831164	contig_12802_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_114256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAGCAATTTTGCGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178194	180522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_178200_180500
831165	contig_5711_pilon	-	1003	7	Intergenic	novelGene_80284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	168	602	206361	199360	TRUE	15	TCTTGCAGCATTGTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLQGHPSFIQFVFYIKIYITSKSIYRQFLSIKHDFDPFAGACQVIGSSGHEGHDILVKFFHLKFGQIWLECYACVIFTIKMFNFGFRSLHHIIHPCLFKTMFVFLARRFYCKLCTENITKFCTVTIATTCNFSLIIVVITGC	206528	187685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_187824_188727_188821_190151_190217_199254_199401_202163_202262_202931_203147_206280
831168	contig_5461_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_156824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCCTTTCCCTTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291957	290411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_290400_292000
831169	contig_19954_pilon	+	864	5	Intergenic	novelGene_173746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	62.8067472490018	319	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	31	450	7322	76962	FALSE	35	TTTATGATATCCTCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDQTLRIWDMKTTGVRIVIPAHQAEILSCDWCKYNENLLVTGAVDCSLRGWDLRNVRQPVFELLGHTYAVRRVKFSPFHVSVLASCSYDFTVRFWNFSKPDPLLETEEHHTEFTCGLDLSLHSPTQVADCAWDETIKIYDPACLIVPP	7291	77376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_+_7403_9465_9580_11183_11240_39912_40013_76893
831170	contig_5084_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_64559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGATATGGCGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533284	533688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_533300_533700
831171	contig_7513_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_89041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCTCGCCGCAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913075	902039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_902566_905068_905163_907384_907516_908213_908290_912502
831172	contig_13558_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_123000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTTATATTTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1721	2584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_1700_2600
831173	contig_15628_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_147687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29164	30412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_29200_30400
831174	contig_15067_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_154338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTATTCTTCTGAACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132359	131510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_131500_132400
831175	contig_3602_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_60595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGTGGGCCCGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786476	785994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_786000_786500
831176	contig_3602_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_60594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	579	929	782670	782320	NA	20	GGAACAGTGGACGCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVGQPRPSAQPSSLSQRRVMVMPASPSLGVARRGPDCESCALPATHPPPPIEPIHRFRESTRDHWHSFGGWDMVVEPAPALVPRARRWGGGRGVREGGSRKREESGSGEGWPSL	783248	782210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_782200_783200
831177	contig_151_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_132572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCTTCCATTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224623	223582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_223600_224600
831178	contig_12379_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_148938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTAGCCAGATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201384	200239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_200200_201400
831179	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831180	contig_20890_pilon	-	1200	4	Intergenic	novelGene_147041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	892.592105424794	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTTTGTGTCTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45633	21135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_21903_29614_29772_42577_42695_45474
831182	contig_1274_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_137778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATCATGTAATTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61288	60795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_60800_61300
831184	contig_7057_pilon	+	2209	6	Intergenic	novelGene_123407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	12.57616793781	5	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	115	1524	1335339	1350538	FALSE	25	TCCCTAATAAAGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARESVVFSDVSIAFSQEEWAHLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFVSKPDVISLLEQGKEPWKIVRKGRRRYPDLETRYETKKLFSENDIYEINLSQWKIMERMKNHGLTSLVLKNDWEYKSKFEGQEGPQEGYFSQVNITPEKVSSNQKHTSLTPRQRNHFVEKPYECKECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMVFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYKCKECGEAFVCGPDLRVHQKIHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTRHQKLNIADKLYECKECGEAFLCGSGLRVHHKIHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSHCSHNLLSIRVFILVRNLINVRNVGKPLDCAKNLLYIRAFTLVRNPLNARNVGRPLDSIHPLFNI	1328729	1351223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1328766_1335260_1335348_1336564_1336692_1337746_1337840_1349275_1350260_1350341
831186	contig_5260_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_144365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231810	231243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_231200_231800
831187	contig_12393_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_147118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGGCAACCAATGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12308	12515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12393_pilon_+_12300_12500
831189	contig_10135_pilon	+	860	2	Intergenic	novelGene_106687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	277	801	319750	320274	TRUE	10	CACGTGCTGCCGCCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGRRAGFIVLTCYSVVSNLTWAAPHLCCGGGQVQIGGKPPSGPCPPCLLGNPGLTKTDGRESERKRARARAREDRGEREEVHGTWRSETARTWGQAVRSGVSSGTQLGWGWGWRKGSSQRDSRRWSIIAVRDVADKSVLLRGVWPRAGGWRDRRIARPERGLSRGQGQRCVW	319473	320846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_320280_320792
831191	contig_1339_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_163155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	470	889	642083	641664	NA	5	TTTCTTTATGTTGGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVPDDGHPTTPSSDLIEIQVVKVTDTNLVPEPPEPGSLHCALCPAAFRLVSELLFHEHGHLAGAEGGQQGGDPSRCHVCGHSCPGPASLRAHYSLHTGERPYRCPLCPRAFKALAPLLRHQHRHGVEPGTSQRHPEAAAVQEQRPGVPQERAEVVMAAAAAGAAMGKPFACRFCAKPFRRSSDMRDHERVHTGERPYHCGICGKGFTQSSVLSGHARIHTGERPFRCSLCDRTFNNSSNFRKHQRTHFHGPGPGLGHSGGQLGSVAGTGSECGAGNTLEEGRGETMNVKVEVDQ	642552	640571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_640600_642600
831192	contig_9579_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_150588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	183	332	796434	796583	NA	55	TACAGAAAAAAAATGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCFIGKRHRVESASGRGRRSSTWISARRAGPFRKEENSEREGSPVPFLGEASSPFSCSCAMDSVPTTVPSVTASPGDPELLGPLSVLYAALIAKLLEVTGPIPREGPQL	796251	798095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_796300_798100
831193	contig_6102_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_32181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCTTATTTTCAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863980	866053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_864000_866100
831194	contig_12622_pilon	+	1061	9	Intergenic	novelGene_6054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAAGAGGCGCCTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687997	1691505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1688072_1688149_1688249_1688819_1688920_1689512_1689596_1689926_1690065_1690295_1690545_1690813_1690930_1691096_1691276_1691482
831196	contig_11702_pilon	-	506	5	Intergenic	novelGene_141982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.6898628384834	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	264	470	374527	372939	FALSE	15	TGGCCCCTGCCCCCAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNAALPTPERPW	375034	372902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_372972_374008_374078_374165_374269_374525_374660_374903
831197	contig_16622_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_48510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTCCTTTAATGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166392	164831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_164800_166400
831200	contig_9988_pilon	-	1580	2	Intergenic	novelGene_113059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGCTTTGAATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119821	116981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_118437_119696
831201	contig_366_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_51629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATGATGAAAAATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1383722	1382335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1382300_1383700
831204	contig_401_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_42852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGGGAAGAATCTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717145	1717894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1717100_1717900
831205	contig_8683_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_150265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTAAAAAGAAATAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701662	701269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_701300_701700
831206	contig_5317_pilon	-	1424	3	Intergenic	novelGene_76615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAATTTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764949	761514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_761973_762131_762583_764434
831207	contig_2646_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_69557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATATTACAAATGGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859567	857713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_857700_859600
831208	contig_14698_pilon	+	855	8	Intergenic	novelGene_168128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	45.002947749258	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	56	853	64977	175219	FALSE	25	GTGAGTACAATTGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSAEHPGASKPPISSSSMTSRILLRQQLMREQMQEQERREQQQKLQAAQFMQQRVPVSQTPAINVSVPSTLPSATQVPMEVLKVQTHLENPTKYHIQQAQRQQPGDHVMPPVPGSSAPNSPMAMLTLNSNCEKEGFYKFEEQNRVESECPSMNTHSRAPCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMDPALQMANTLPVSGNLIDLYGNQGLPPPGLTISNSCPANLPNIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSND	64921	175221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_65175_153405_153466_153540_153634_154692_154777_157092_157189_166046_166165_168165_168241_175145
831211	contig_567_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_34016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCTTCCCAGCCTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646931	647409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_646900_647400
831212	contig_5947_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_101598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCCCTGCAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920746	919636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_919600_920700
831214	contig_11989_pilon	+	2259	1	Intergenic	novelGene_68426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAATGAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31997	34256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_32000_34300
831215	contig_10135_pilon	+	1090	2	Intergenic	novelGene_106683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	141	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGGTTGTTCGGGGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315007	316732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_315415_316049
831217	contig_2078_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_100160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397841	398405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_397800_398400
831218	contig_14559_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_83728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290169	289543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_289500_290200
831220	contig_4686_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_118539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	120	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCTAGAACAAAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497814	495804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_495800_497800
831221	contig_3975_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_54936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2338857	2337654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2337700_2338900
831222	scaffold_17541_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_175240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTAGCTACCTGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322393	321891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_321900_322400
831223	contig_6497_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_35569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATATGATCAAAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172969	174190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_173000_174200
831224	contig_5779_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_106411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTAGTTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36667	37618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_36700_37600
831225	scaffold_12124_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_22416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	121	414	1509112	1509405	NA	10	CTGGAAGGCTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508991	1509472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1509000_1509500
831226	contig_383_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_126143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAGAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346576	346160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_346200_346600
831228	contig_91_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_127108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTCATGAAAAAACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380578	378844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_378800_380600
831234	contig_10756_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_170661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTACAACAATTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58302	58758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_58300_58800
831235	contig_13699_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_158317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	865	1203	53642	53980	NA	80	AACGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTRFMETADSTTAAVLQGKMAEVSQRFEELCLQQQEKESSLKKLLPQAEMFEHLSEKLQQFMENKIRILASGNQPDQDIAHFFQQIQVSVYLSKEGQRENQDLLSTYYVRQ	52777	54342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_52800_54300
831237	contig_11551_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_168477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTTTTTAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515768	514319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_514300_515800
831238	contig_19311_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_144089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186710	188270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_186700_188300
831239	contig_14638_pilon	-	928	5	Intergenic	novelGene_71586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_2	56.9056236236806	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	42	455	277550	254501	FALSE	15	CCGCTCTGAGCGGGCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLNPPEGIVAGPMNEENFFEWEALIMGPEDTCFEFGVFPAILSFPLDYPLSPPKMRFTCEMFHPNIYPDGRVCISILHAPGDDPMGYESSAERWSPVQSVEKILLSVVSMLAEPNDESGANVDASKMWRDDREQFYKIAKQIVQKSLGL	277696	254027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_254614_258223_258365_262339_262459_277509_277556_277660
831241	contig_14326_pilon	-	385	3	Intergenic	novelGene_120714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCGGATCCCCTCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440975	439928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_439964_440545_440659_440738
831243	contig_11277_pilon	+	630	4	Intergenic	novelGene_80301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_1	125.698934849195	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	145	489	250372	256069	FALSE	20	CTTTGGCATATGTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAV	248193	256210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953
831245	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
831246	contig_5889_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_133702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAACACACAGCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317868	318609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_317900_318600
831247	contig_5889_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_133697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAGAGTAGAGGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297395	298226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_297400_298200
831248	contig_15236_pilon	-	1358	7	Intergenic	novelGene_141538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	9.15453742990631	29	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGTTGCGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114048	99517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_99873_99974_100125_106355_106611_110951_111177_111381_111509_111610_111686_113877
831249	contig_15653_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_176959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAGAGCAATAAATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11727	13214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15653_pilon_+_11700_13200
831251	contig_16595_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_150136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCCCATGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44831	43553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_-_43600_44800
831254	contig_16686_pilon	-	1866	8	Intergenic	novelGene_162102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	96.4599948799755	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	100	1761	246051	180652	FALSE	50	ATGAAGGACACAAAATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNERIPHPGQTQEQDCLQSQYVGDDEEMAVKQENGVPAAGVEESLPSCSSDNGLSASAEGCALGVPRRGPALLQIDRHQIQAVEQSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDDAIHEARRVAQLADTEKEYQSVLDDLTSCTTSLRQINKIIEQLSPQAPTNRDINRKLDSVKRQKYNKEQQLKKITAKQKRLQAILGGAEVKVEIDSASLEEDAEPGPSSLGSMLMPAQETAWEELIRTGQMTPFGTQIPQKQERKPRRLMLNEASGFEKYLADQAKLSFERKKQARKKRLTRKAPASATSESNPTLNENQQNKRSKVPSKMDKRLEKHIKKLQRRALQFQGKVGLQKRAKALEAGIKREDGASESEESEYLPEEEEDKMAEADLSEGCAAYELKPPLKGRKRQKKVTVQEMDEDFFPSSGEESEAGGSGSRKAVRWRDDGDEDCYKQRLRRWNKLRLRDQEKCLKLEDNSEDSDAEFDEGFKVPGFLFRKLFKYQQTGVRWLWELHCQQAGGILGDEMGLGKTIQIIAFLAGLSYSKIRTRGSNYRRN	251058	180546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_180662_200073_200233_205320_205450_224725_225435_241441_241551_243877_243999_245626_246064_250971
831255	contig_9389_pilon	+	714	6	Intergenic	novelGene_83985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1287.88129887812	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	78	533	383398	385338	FALSE	15	ACCTTGCTCTGACCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGALPTCPTCTELSDSL	382004	385519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384069_385291
831256	contig_2365_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_103750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217462	216387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_216400_217500
831258	contig_3818_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_99266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTAATAATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541074	542574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_541100_542600
831259	contig_2114_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_104299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTTGGAAACAGATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819816	821516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_819800_821500
831260	contig_9091_pilon	-	887	4	Intergenic	novelGene_32451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	114.737381296013	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	77	655	235987	232739	FALSE	25	CACACAGTTGTTTTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEADLVSKMLRAVLQSHKNGIALPRLQGEYRSLTGDWIPFKQLGYPTLEAYLRSVPAVVRIETSRSGEITCYAVACTETARIAQLVARQRSSKRKAGRQVNCQMRVKKTMPFFLEGKPKATLRQPGFSSDFSIKKPPPALLRDKGNSLGVKSGAEMPPYTIHTTLGSEVFKNVPTQRHVTLSTNSRYLVLG	245438	232506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_232969_233912_234055_235780_235994_245368
831265	contig_1037_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_84613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509848	510594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_509800_510600
831266	contig_10093_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_147513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118082	117039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_117000_118100
831267	contig_14698_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_168136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTTCAAGTTGTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114596	113065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_-_113100_114600
831270	contig_12250_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_80533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGAGAGCTGCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221341	222116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_221300_222100
831272	contig_10011_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_68058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTTGTTTTTATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226520	227993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_226500_228000
831274	contig_10235_pilon	-	943	5	Intergenic	novelGene_46301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	270.955254608579	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTAGTGCTGCCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89022	83487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84102_84567_84640_84830_84877_85564_85743_88989
831275	contig_9036_pilon	-	1605	13	Intergenic	novelGene_155473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	30.026261653574	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	2	1216	251818	245088	FALSE	70	AAAACAAACAAAAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKQARVSQELKKAAKRTVSISENPDVLCDGVREGAETVALATPPESLESEACEKWKRPFRSASATSLTLSRCVDVVKGLLDFKKRRGHSIGGAPEQRYQSIPVCVAARLPTRAQDVLDAHLSEVNAVRFGPNSSLLATGGADRLIRLWNVVGGRLEANQTLEGAGGSITSVDFDPSGSQVLAATYNQAAQLWKVGEAQSKETLSGHTDKVTAAKFKLTRHQAVTGSRDRTVKEWDLGRAYCSRTINVLSYCNDVVCGDHVIISGHNDQKIRFWDSRGPRCTQVIPVQGRVTSLSLSHDQLHLLSCSRDDTLKVIDLRVSNIRQVFRADGFKCGSDWTKAVFSPDRSYALAGSWDGALYIWDVDTGKLESSLRGPHCAAVNAVAWCYSGSHVVSVDQGRKVVLWH	251819	244698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_245176_245504_245607_245754_245803_246219_246370_247197_247304_247641_247763_247879_247952_248247_248319_248975_249082_249511_249621_250221_250285_251314_251429_251753
831276	contig_854_pilon	-	687	2	Intergenic	novelGene_36414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	115	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGGTTGAGGAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067485	1064601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166
831277	contig_11855_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_67092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCACTTTATAAGTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2392164	2391589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2391600_2392200
831278	contig_3700_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_138082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTAATAAGAAACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258294	258707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_258300_258700
831279	contig_17470_pilon	-	637	6	Intergenic	novelGene_110524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.438080851674	65	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	55	588	277215	269642	FALSE	15	CAAACTCTTGTTGGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRFSLACTQTLGTSQVAMAKQLQARRLDGLDKNPWVEFIKLASENETVNLGQGFPDFAPPDFAMEAFQHAVSGDFMLNQYTKAFGYPPLTKVLADFFGKLLGQEMEPLKNVLVTVGAYGALFTAFQALVDEGDEVIIIEPYFDCYEPMTLMAEGRVQQYIRPQVLALSPALHWPEKAQASPCLSLSNLDLRSCL	302403	269592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_269770_273892_273948_274028_274179_275808_275957_277162_277222_302355
831280	contig_299_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_129463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAAATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036127	1035011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1035000_1036100
831283	SIRV6	+	345	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	367	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845
831284	contig_5423_pilon	+	1563	3	Intergenic	novelGene_85255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	257	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAATTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534759	543236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535231_541109_541167_542201
831285	contig_10857_pilon	+	565	4	Intergenic	novelGene_160903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	74.9577658863087	1644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	190	504	113585	118376	FALSE	20	TGAGCCAGAGCTCCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAVPAGRPPAACVPHQLLHPAGAARHGAARGHRAVPDPPGVRRSAQAGDGEGAWHCITRLTGMTRVDLRNYLERIYQVPVAAVRTRVQHGSGRRRDHRQVRVKKPDYKVAYVQLAHGQTFRFPNLFPEKEQSPERSAHLDLQDQLVEQQRQSSDPRRGSVPAWFSL	112638	118437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_112827_113583_113667_114298_114373_118217
831286	SIRV6	+	390	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	394	516	221	74	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTAACGTGGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1524	2024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831287	contig_5696_pilon	-	1241	2	Intergenic	novelGene_117598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGTAAGAATGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767785	764840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_766008_767711
831288	contig_9435_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_156950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTGGTGTTAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179431	178150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_178200_179400
831291	contig_14720_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_164984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCCCGTTGTAGAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189709	188966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_189000_189700
831292	contig_10197_pilon	+	955	5	Intergenic	novelGene_115303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	134.507202409388	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	28	438	1315291	1340726	FALSE	35	TTTCTTTGGAAATATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQLSEGAIAAIMQQGDMSIKPVLQVINIRPITTGNSPPRYRLLMSDGVNTLSSFMLATQLNSLVEEEQLSSNCICQINRFIVNMLKDGRRVVILMELEVLKSAEAVGLKIGNPVPYNEGKTLFIGCSTQLNTSL	1315263	1341243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1315324_1325302_1325354_1326427_1326507_1327173_1327283_1340587
831295	contig_7004_pilon	+	2046	2	Intergenic	novelGene_126439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTTACTTACAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77543	80431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_78519_79360
831296	contig_2310_pilon	+	1991	13	Intergenic	novelGene_71627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	33.3162456201509	52	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	169	1422	299755	318733	FALSE	10	GCAGCTGTTTGCCTCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFADLDYDIEEDKLGIPTVPGKVTLQKDAQNLIGISIGGGAQYCPCLYIVQVFDNTPAALDGTVAAGDEITGVNGRSIKGKTKVEVAKMIQEVKGEVTIHYNKLQADPKQGMSLDIVLKKVKHRLVENMSSGTADALGLSRAILCNDGLVKRLEELERTAELYKGMTEHTKNLLRAFFELSQTHRAFGDVFSVIGVREPQPAASEAFVKFADAHRSIEKFGIRLLKTIKPMLTDLNTYLNKAIPDTRLTIKKYLDVKFEYLSYCLKVKEMDDEEYSCVALGEPLYRVSTGNYEYRLILRCRQEARSRFSQMRKDVLEKMELLDQKHVQDIVFQLQRFVSTMSKYYNDCYAVLRDADVFPIEVDLAHTTLAYGLTQEDFIDGEDEEDDEEEDTAAREPSQDARGAARPLDKDGSWCGS	299442	319302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_299554_299697_299796_301525_301638_307480_307610_310321_310389_311610_311701_313903_313958_314446_314510_315866_316001_316332_316426_317238_317290_317888_318034_318458
831297	SIRV5	+	232	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	285	151	171	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8486	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
831298	contig_20844_pilon	+	1031	8	Intergenic	novelGene_78586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	37.5570314620964	141	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	98	1030	183893	188358	FALSE	30	GATATAAATGCCCTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPALRPDRRARPGSWAARRAVWTLAGIWAAATMSQEGVELEKSVRRLREKFHGKVSSRKAGALMRKFGSDHTGVGRSIVYEVKQKDGQELSNGLPTQDPPEDMKQDQDIQAVATSLLPLTEANLRMFQRAQDDLIPAVDRQFACPSCDHVWWRRVPQRKEVSRCRKCRKRYEPVPADKMWGLAEFHCPKCRHNFRGWAQMGSPSPCYGCGFPVYPTRILPPSWDRDTQRRSTHTHSCSAADCYNRREPHVPGTSCAHPKSRRQNHLPKVLHPSNLHISSGSTVATCLSQGGSPGRPGQPHPGGPEGGGGGRGRARGRDPCQVQMQTRHGLWILCVVIKYELKP	183795	188359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_183914_184378_184503_184684_184735_186136_186176_186355_186506_187097_187202_187350_187506_188068
831299	contig_8059_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_111116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267665	254820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_255004_266054
831300	scaffold_13505_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_111659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGAGGGAGAGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849485	850431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_849500_850400
831301	contig_8576_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_88797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	568.438870943921	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	222	773	909976	913464	FALSE	45	CGAAAGAAAAAGGAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLQLPEQQPHHQQQERQRRRDGSSGGWTKQVTCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYSAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIK	893620	913914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893685_893761_893804_909860_910082_910555_910783_913245
831302	contig_15354_pilon	-	2229	1	Intergenic	novelGene_65739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAACCAGCTTTGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596836	594607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_594600_596800
831304	contig_10148_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_172863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTGACTAATTTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256456	256731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_256500_256700
831305	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
831306	contig_5480_pilon	-	2325	1	Intergenic	novelGene_107222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGATGCATAATAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59680	57355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_-_57400_59700
831308	contig_11719_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_154757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGGAAACATATATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34533	35757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_34500_35800
831309	SIRV5	+	386	5	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1140_1985_2034_2119_2163_3280_3405_3483
831311	contig_9653_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_48336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTGAGTGACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061594	1060303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1060300_1061600
831312	contig_14225_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_52744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTTCAAAATTTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247589	246553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_246600_247600
831313	contig_14017_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_165685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCAGGGAGGCGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31059	29862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_29900_31100
831314	contig_11285_pilon	-	1743	17	Intergenic	novelGene_5745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	158.543960780599	1	87	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	601	1257	1209875	1200229	TRUE	10	CCTGGGCACTGGGGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGGGHE	1220426	1197034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1197061_1197747_1197889_1198296_1198409_1199301_1199496_1200215_1200345_1201906_1202043_1203419_1203481_1203896_1203952_1207736_1207862_1209711_1209879_1212121_1212205_1213179_1213269_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258
831317	contig_6589_pilon	+	1112	11	Intergenic	novelGene_25984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	47.4695691996462	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	143	916	1331842	1336011	TRUE	15	CTGTTCATGCATGTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAFRRSIGVRIKEETEIIEGEVVEIQIDRPATGTGSKVGKLTLKTTEMETIYDLGTKMIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDMAPVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIISTSPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLRYAIQLITAASLVCRKRKGHRGAGG	1330467	1336309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1330504_1330641_1330709_1331802_1331910_1331996_1332091_1332495_1332620_1333015_1333111_1333194_1333314_1334933_1335054_1335429_1335561_1335988_1336104_1336205
831319	contig_2100_pilon	+	681	3	Intergenic	novelGene_50586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCTTGTAATACCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516637	564551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_516959_517125_517235_564300
831321	contig_4429_pilon	-	658	2	Intergenic	novelGene_50780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATAGTGTTCTATTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130463	116955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_117280_130129
831322	contig_2550_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_135707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTACACTAATAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1732009	1732581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1732000_1732600
831324	contig_2161_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_114921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGTTTATGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824264	825873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_824300_825900
831325	contig_18116_pilon	-	1840	11	Intergenic	novelGene_175445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	29.2726835121073	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	70	1566	63876	44211	FALSE	15	CGCACTGCTGTGTAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVLPKRRRAQVGSPAGATASSAEPSARFPGVAIYLAEPRMGRSRRAFLTRLALSKGFRVLDEYSSEVTHVVMEQTSAVEAVCWQERKAVAALSDWTLSKLVNMSWFTESMAAGQPVPVECWHLLEVTKPSKGVPSPAWVPAYACQRLTPLTHHNTSLSEALETLAEAAGFEGSEGRLLSFRKAASVLKALPSPIIALRQLQGLPHFGEHSSRVIQEMLENGVCEEVERVQHSERYQTMKLFTQIFGVGVKTADRWYQEGLRTLDDLLKQPQKLTQQQKAGLQHHQDLSTPVQQQDAEALRQMVEAAVVQALPGATVMLTGGFRRGKLQGHDVDLLITHPQEGQEVGLLPRVVGCLKNQGLILYHLYQHNHYGDPAYPARQNSTMDTFEKSFCIFCLPQPPGAAVEGPQRPCRAWKAVRVDLVVTPVSQFPFALLGWTGSKHFERELRWFSRKEKGLWLNSHGLFDPEQKKFFHVTSEEDIFRHLGLEYIPPEQRNA	63945	43936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_-_44298_44642_44727_44807_45054_45175_45279_45472_45606_47184_47306_57979_58052_60165_60337_60491_60591_61443_61628_63679
831326	contig_10196_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_132219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360029	1359098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1359100_1360000
831327	contig_17108_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_109496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTATTTGATTTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7386	8387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_7400_8400
831329	contig_9527_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_134032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGCCCCCACCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208768	208181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_208200_208800
831331	contig_8122_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_40195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCTGTGTATACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116963	115873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_116390_116905
831333	contig_12884_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_104971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGCCTTCCCATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497758	498898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_497800_498900
831334	contig_13952_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_133247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTATAACATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32528	34114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_32500_34100
831335	contig_4486_pilon	+	1380	2	Intergenic	novelGene_38622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	603	1379	575209	575985	FALSE	10	TGCTGAGGCTGGCCACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTLGCHRSIPRDPSDLSHSRKFSAACNFSNILVNQERLNINTATEEELMTLPGVTRVVARSIVEYREYIGGFKKVEDLALVSGVGATKLEQVKFEICVSSKGSSAQHSPSSLRRDLLAEQQPHHLATAVPLIPRVNINTATPAQLMSVRGLTEKMALGIVDYRREHGPFRSVEDLVRMDGISAAFLDKIRHQVFAERSRPPSTHTNGGLTFTAKPHPSPTSLSLQSEDLDLPPGGPTQIISTRPSVEAFGGTRDGRP	574149	575986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_574567_575023
831336	contig_4742_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_130975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	110	418	189946	190254	NA	40	CACCAATATTCACTATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFSYLFLHLIGCFERNTTRMLLRSADGETSVPYFGNQERPIARKRYHVWKGLAKMKEILNEMDWHKSHNNGLKHTSDYGDSTGPGLTFGSVTHKITMSWS	189836	190604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_189800_190600
831337	contig_10890_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_166791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTCCATCAAATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149839	151136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_149800_151100
831339	contig_5145_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_131347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	426	178	603	10651	10226	NA	10	GCCTGCGGCGTTGAGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVEVKESGGEEWVLDANDSPVHRVLLWPRRAQDEHPRCDGYYFLLQERNADGTIKYLHMQLVAQTAAARRLAQRGFLPWQQADFDDLCDLPELTEANLLRNLKRRFLQQKIYTYAGSILVAINPFKFLPIYNPKYVKMYENQQLGRLEPHIFAIADAAYHAMLRKHLNQCIVISGESGSGKTQSTNFLIHCLTALSQKGY	10828	10225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_10200_10800
831342	contig_6578_pilon	+	1539	4	Intergenic	novelGene_162233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCAGCATCCAAGGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108827	113337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_109887_111109_111377_112681_112841_113283
831343	contig_8900_pilon	-	1337	6	Intergenic	novelGene_171615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	35.8184310097469	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	87	752	226128	170247	FALSE	30	AGCCATTTTTAAAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPLLPALTYYFNCPHPYLSAHCDARPQTPHQAAGQPFKFTIPESLDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASEKTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTICAQVIPFLSQEHQQQVAQAVERAKQVTMAELNAIIGQQQLQAQHLSHGHGPPVPLTPHPSGLQPPGIPPLGGSAGLLALSSALSGQSHLAIKDDKKHHDAEHHRGERPGKPD	226214	169661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_170478_184178_184254_185870_185934_224238_224284_224394_224459_225940
831344	contig_10642_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_78644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACATCTCCTTTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42399	40892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_40900_42400
831345	contig_4832_pilon	-	1503	3	Intergenic	novelGene_163424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	27	317	510030	507045	TRUE	15	CCTATTCCTTATGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIYNLSTIMNAARYLLYSSSHPSPDLFRKTLLLGHGLFMVLSMYDSSRKMVSSTWISLASNLLTLRFRVSSCWRSGAVIISSISCSCSSSAPVACMDAIMASTL	510056	505101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_505330_506086_507177_509871
831347	contig_4769_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_117993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864181	863057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_863100_864200
831348	contig_2278_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_118097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATCACTCTTTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690713	688620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_688600_690700
831349	contig_16535_pilon	-	1028	3	Intergenic	novelGene_167697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTACTTATGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79605	77608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_78386_78964_79123_79512
831354	contig_9185_pilon	-	1802	2	Intergenic	novelGene_166920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGAAAGTTTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826182	824126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_825093_825346
831355	contig_5481_pilon	+	2374	5	Intergenic	novelGene_144568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.29980158417708	37	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	98	1936	135438	155236	FALSE	55	ACACAGGAAAATGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGSRVAGPDSEAGGAGGFCSSPKEKLKKEGEMAVGLCKAMSQGLVTFRDVAIGFSQEEWEWLNSSQRDLYRDVMLENYRNLVWLGLSISKPNMISLLEQGKEPWMLEREMSDSQCADWESWCEIKEVSPKWYIDEEEISQRMVLERLTSHDFECSDFREVWKYEGELEQHQGNQEKCIRQVTTLKEIPARKRDGEYSNSGRSIPLKSILLTQERIPTEKQVHKFDIYEKIFPQNSVIIEHARLHAEKESLTDSEFDEEFNQSVHLAKDTEIPSGEKPYESNDFSNLLSFHSLLTQHQTTNFGKLHHGYNECGDAFSCYSFFTQPQRIHSGERLYACNNCGKAFSHDFFLSEHQRTHIGEKPYECKECSKAFRQSAHLAQHQRIHTGERPFSCNECGKAFSRYAFLVEHQRIHTGEKPYECKECNKAFRQSAHLNQHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPFKCNECGKTFGYRSHLNQHQRIHTGEKPYECIKCGKFFRTDSQLNRHHRIHTGERPFECSKCGKAFSDALVLIHHKRSHAGEKPYECNKCGKAFSCGSYLNQHQRIHTGEKPYECNECGKAFHQILSLRLHQRIHAGENPRKCNECGNTFSCASALRRHQKIHNRETLLL	132491	155674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_+_132545_135393_135471_139882_140010_142419_142516_153653
831356	SIRV6	+	433	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	4	164	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	370	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGTCACAAGTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
831357	contig_2125_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_147740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGGTTTATGCAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670020	671118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_670000_671100
831358	contig_5047_pilon	-	1559	12	Intergenic	novelGene_157976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	73.4720951132508	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	99	1205	1132158	703648	FALSE	10	CGTGCCGCGCTGACCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSYGQPWAQAPPVPGGDPWLVKSVSESHTPRPTESGSEAGPLQRSQSLPHSSTVALSGGVSDHSALGSSALSEREASRLDKFKQLLAGPNTDLEELRKLSWSGIPKPVRPITWKLLSGYLPANVDRRPATLQRKQKEYFAFVEQYYDSRNDEVHQDTYRQIHIDIPRMSPEALTLQPKVTEIFERILFIWAIRHPASGYVQGINDLVTPFFVVFICEHIDGEDVDTVDVSRVPADVLCDIEADTYWCMSRLLDGIQDNYTFAQPGIQMKVRMLEELVSRIDEPVHRHLEQHESEPEGFSHFHLYVCAAFLVRWRKEILEERDFQELLLFLQSLPTATWGDEDISLLLAEAYRLKFAFADAPNHYKK	1132256	703293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_703777_751773_751870_811858_811891_862509_862586_895330_895441_959374_959490_989613_989677_994731_994861_1006798_1006870_1091793_1091974_1095665_1095751_1132137
831359	contig_9333_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_120311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTCAAGTAAATTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63578	65617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_63600_65600
831361	contig_2093_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_152957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATCATTAGTCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038965	1039970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1039000_1040000
831362	contig_10864_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_107128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATTCTTGGGCCTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226365	1227178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1226400_1227200
831363	contig_5092_pilon	+	1182	3	Intergenic	novelGene_62316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTCAGCCTGGACCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446934	451555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_447986_449407_449497_451513
831364	contig_6937_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_175016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241354	240124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6937_pilon_-_240100_241400
831366	contig_2215_pilon	-	1437	2	Intergenic	novelGene_163875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGTGAATGTTTACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329398	327653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_328787_329094
831367	contig_13145_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_116654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTTTTAGAATCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221594	222104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_221600_222100
831368	contig_13145_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_116649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200108	200632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_200100_200600
831369	contig_5649_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_82431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCTTGATGCAACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446127	1447564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1446100_1447600
831370	contig_7066_pilon	-	2157	10	Intergenic	novelGene_42166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	11.4987922071069	49	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	439	1701	879072	871784	FALSE	25	GGAGAAGCTTCAGCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRPLRGLVPALLGSLSLFLSIPGPVWPQPSTPPQASLPPEPHPCHTCRGLVDSFNKGLERTTRDNFGGGNTAWEEEKLSKYKDSETRLVEVLEGVCSKSDFECHRLLELSEELVETWWFHKQQEAPDLFQWLCSDSLKLCCPSGTFGPSCLPCPGGAEKPCSGYGKCEGEGTRGGSGRCDCQASYGGEACGQCGLGYFEAERNSSHLVCLACFGPCARCSGPEESNCLQCRKGWALHHLKCVDIDECGTERASCGANQFCVNTEGSYECRDCAKACLGCMGAGPGRCKKCSPGYQQVGSKCLDVDECETEVCPGANEQCENTEGGYRCVCAEGYKQMEGICVKEQIPESAGFFSEMTEDELVVLQQMFFGVIICALATLAAKGDLVFTAIFIGAVAAMTGYWLSERSDRVLEGFIKGR	879510	871327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_871999_872789_872925_873107_873204_873376_873461_874423_874520_874608_874786_875456_875549_875908_876020_878555_878639_878898
831371	contig_7870_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_108930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCTTAATAACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276971	278230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_277000_278200
831372	contig_17840_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_154304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCTAATAAACAATTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90218	92323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_90200_92300
831374	contig_7165_pilon	-	1967	12	Intergenic	novelGene_116822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.42916167561589	25	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	192	1826	208121	191297	FALSE	15	TTCCAGAGTGTTTGGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNSRTSQQNACASLGSPERTKRKVASEVTSPCKRPQPDELQTSPPSLKASCTKDDKKSSTECHMTLRTRVPALKATGISEDKTLSPIRGGRKSSEVPDVVLKPENIKKREVKEPEAQNEATSTPHRVHRKSSVLTLNRIRQQLRYLGSSKNNQEEEEYLPAAEISDSSSEEEEASTPPLPRTPSHVSRNRRSSMKSSSQTPSKTPKKTPERRTPCRATPQIRSRSLAAQEPASVLEEARLRLHVSAVPESLPCREQEFQDIYNFVEGKLLDRTGGCVYISGVPGTGKTATVHEVIRCLQQAAQANDVPHFEYIEVNGMKLTEPHQIYVQILQKLTGQKATANHAAELLAKRFCARGSPPETTVLLVDELDLLWTQKQDVMYSLFDWPTHKEARLVVLTIANTMDLPERIMMNRVASRLGLTRMSFQPYTHSQLQQILMSRLKHVKAFEDDAIQLVARKVAALSGDARRCLDICRRATEICEIHQKPGSPGLVTVAHLMEAVDEMFSSSYITAIKNSSVLEQGFLRAILAEFRRSGLEEATFQQVYSQHVAMCRMEGLPYPTMSETMAVCSRLGSCRLLLVEPSRNDLLLRVRLNVSQDDVLYALKEE	208312	191155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_191492_193028_193117_193661_193829_196531_196652_197362_197513_197785_197894_198176_198349_198774_198877_199450_199549_206191_206385_207001_207107_207984
831375	contig_7806_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_157529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193912	191615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_191600_193900
831376	SIRV6	+	350	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	506	0	333	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
831380	contig_14209_pilon	-	976	7	Intergenic	novelGene_88366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	12.0554275466834	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	74	868	142085	52977	FALSE	55	TAATGTAATTTAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRALVFISHGAGEHCGRYEELAQMLMGLGLLVFAHDHVGHGQSEGERMVVSDFHVFVRDVLQHVDVMQKDYPRLPVFLLGHSMGGAIVILTAADRPGHFAGMVLISPLVLASPESATTFKVLAAKVLNLILPNMSLGPIDSSVLSRNKTEVDLYNADPLICRAGLKVCFGTQLLNAVSRVERALPKLTLPFLLLQGSADRLCDSRGAYLLMEQAKSQDKTLKIYEGAYHVLHKELPEVTNSVFHEINMWVSQRTPVAGAGSPP	142158	52868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_53103_54078_54295_69935_70026_83413_83525_84975_85113_131363_131471_142077
831381	contig_3123_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_162980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACACACTGACTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199067	200703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_199100_200700
831382	contig_9673_pilon	+	880	6	Intergenic	novelGene_119168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	140.515337241171	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143212	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_143356_149481_149547_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
831383	SIRV6	+	350	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	28	-1	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
831384	contig_14341_pilon	-	729	5	Intergenic	novelGene_111886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	262.363774176238	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	164	652	729247	727088	FALSE	15	GACTCTGTGATGACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRRRRQRRPTEGAVVGGRSVYPNEGSVTRKRKRIPVPAPASHLTQARQRAPTTMDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	730684	727010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_729079_729290_730563
831386	contig_7898_pilon	+	1419	2	Intergenic	novelGene_47585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTGTTCTTTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491536	493047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_491640_491731
831387	contig_2924_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_140251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	374	709	36827	36492	NA	35	AATGTGGTTCTCCAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPKKYVSNLIPRTCDCDLIWRKGLCGCNKVKDLEMKRPSWIIQVGPKFNDKCPCRRHTEKTDTEVTRRLRQRVELSSHKPRKPRNANSHPKLEEADSSSPRGSRGEPPC	37200	35853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_35900_37200
831388	contig_4364_pilon	+	1631	2	Intergenic	novelGene_211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACACGTGGTTAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337337	1339079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1337393_1337503
831389	contig_12885_pilon	+	2415	1	Intergenic	novelGene_176904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	179	637	213885	214343	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRRFEDVSSEVSTLHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLFQTSEGKYLLSDLGPQERMQISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRKTGGTKFLKNMDKGHPIFYCGDCASQFRTPSTYISHLESHLGFQMKDMNRMAVEQQSKVEQEISRVSSAQRSPETIAGEEDTDSKFKCKLCCRTFVSKHAVKLHLSKTHSKSPEHHSQFVTDVDEE	213706	216121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_+_213700_216100
831390	contig_18364_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_102570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCTAGTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127191	125273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_125300_127200
831393	contig_2798_pilon	-	989	4	Intergenic	novelGene_120030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	757.604264918184	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	373	936	116665	115914	FALSE	30	TTTATAACGAAATCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGLHHRVDGAEDTPLLAISPGVLGPAEKPLFYRGHLYLLPSLSVL	193515	115860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116048_116235_116680_170381_170519_193294
831395	SIRV6	+	297	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	342	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACGCAATAGAGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1750_1870
831396	contig_2854_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_120867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1232	1567	964614	964949	NA	40	AAAAGGTACCCCACCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGECRNGGEGGGKFAVLDSVIRKSFSNNDMGADPAGRIVVNDMDLTKSVQDSGNSKCKGPETGACLVCFRSRKEAGVVSMEQTGGEWLEMSPDHGEPHEPLEDFGFHSV	963382	965545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_963400_965500
831397	contig_6433_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_162767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCCCCCGAGCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301913	304164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_301900_304200
831398	contig_10627_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_60040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685601	686870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_685600_686900
831400	contig_2940_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_81904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTCATCTTCTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461866	462456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_461900_462500
831401	contig_16882_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_148235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415785	416395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_415800_416400
831402	contig_7202_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_17983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
831403	contig_7342_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_71219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	590	1009	695287	695706	NA	35	TTGCTTAACCGAATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVKKVLFLRELSVWPHATCFLCKWLLQLGTFFFSWLRFTSFPQNVEYFLIFYGFNRNRMAQGLMTREIKQSQMRNWHGCHTNMKRRANYTEIGKPEGTKSYLLRLPARQPTTALSLYATGKRQASQRFNPQNLLADS	694697	695767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_694700_695800
831404	contig_9919_pilon	-	658	2	Intergenic	novelGene_137980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	228	560	639757	619944	FALSE	40	GCCATGACACCAAGTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRLYVIPLCVVNFYHCDEVILMRLTRLDSVLMQSRFGDIKERSEQRQIGASYHSAPGTAFLVVCTLSAHFPFISCKIEGGAGHTPGKLPLHWVRDVTSVRVLQSHPNPL	639984	619845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_620115_639595
831405	contig_18799_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_171425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAATAACGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67205	68294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_67200_68300
831406	contig_11309_pilon	+	870	7	Intergenic	novelGene_149875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAAACCCCTTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56223	64487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_+_56391_56926_57017_60169_60348_61240_61440_62840_62932_64249_64330_64422
831411	contig_5136_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_126642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCACATCAGCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306286	304762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_304800_306300
831412	contig_12802_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_114257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183333	181126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_181100_183300
831413	contig_9653_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_48339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1573	1887	1080645	1080331	NA	35	TATCAAGGAGTTATCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTKGPSPQVAHITCERDTNERTNVIYCNERYGGGKPERAVEFEALNFKVDAHRGLSFPVFIFTRKPKPRHPSNGKLQHVAKNASRQELHFINLTRLSLSSEA	1082217	1080311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1080300_1082200
831414	contig_7171_pilon	+	458	7	Intergenic	novelGene_101202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGGGACCAGAAGGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37645	49582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_37711_40627_40702_40779_40815_44867_44956_46837_46895_47590_47692_49544
831415	contig_953_pilon	+	1377	11	Intergenic	novelGene_130009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_6	19.5471225503909	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1353	23	1375	329287	336600	FALSE	15	TTCCCCTGGACAACTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSRSSDAARPVGQVDRHIQLLVHGVGQAGPEITDELVRVLRRRLDEATLDVITVMLVRNCKLTPADVEFIQPPGSLPSEVLHLALPPSCRAWLPALAWYLRQNLLIFLHSPKYTDSNSRNHFQHPLPPQGGLPDLDIYLYNKPGGQGTGGKGVACITLAFVDEGGTPISLASWPPTSPGPPDPLQEEEFEQLTQVTCCPVMLDGSSAQSGAPRLRLDVWEKGNISIVQLEEKLQGAARQALADAVMELRLLPASLCTEDNPPGSLRSGSLETKSTAGRASTFPPAPVPGEPVTPPSKAGRRSFWDMLSKTECGDLGSPKTTDDIVLDRPEDTRGRRRHKTENVRTPGGNERAPGPDSGAQRQRRRMTQLEEGEVGTLHPVFAHVSRRWMEFMVQIGCISVSRSSTHMVSRFLLPSILSEFTTLVTSMAGDTSVRVFELHLGSESEIFSP	329264	336602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_329378_330096_330216_330310_330476_330745_330831_330990_331156_331269_331438_335282_335417_335813_335981_336068_336167_336256_336390_336572
831416	contig_5881_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_129048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGCCACAATTTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423825	422275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_422300_423800
831417	contig_3894_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_174752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAGAGAATGTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369273	371325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3894_pilon_+_369300_371300
831418	contig_10013_pilon	+	1168	3	Intergenic	novelGene_125076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	470	junction_1	15	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGCTTGTGGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463305	464920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_464300_464467_464501_464779
831419	contig_2703_pilon	-	151	2	Intergenic	novelGene_101675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	412	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCTGTAAGTTCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180981	172076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_172146_180899
831420	contig_9982_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_55761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGCCTCAACTGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341523	339715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339700_341500
831422	contig_9437_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_141725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	313	939	1577	2515	221244	222182	NA	35	AGGCAGAAGGAACAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVERWSQGTTLEKKPERVKEPEKASVISPEPTRKEKSTDTEEDNISKPLFSNKTTQFPSVHAELSEHVDIPEIVYGSSSKPSTPKVTTPPSSPSPAAVPPEFAYVPADPAQFAAQMLGKISSVRSDQSDVLMVDVATSMPALSEEVLSSEASEDTVVSPPLVCSGEVVAMQVLSQTSVHVDTGPKPKDDEAEPSTASPLPLQDEQEPPAYDQPPEVPFQADIQVTSTLHISSIYNDVPVTEGVFVEQMPEQIVIPFTDQVACLKENEQSPPVSPKPVATKTASGMSAELVNSAKLAVQLEEDEKHVSSVHL	219667	222183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_219700_222200
831423	contig_11978_pilon	+	1718	3	Intergenic	novelGene_63139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAAATACTGTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1994250	2000725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1994928_1999304_1999390_1999769
831424	contig_10740_pilon	-	887	3	Intergenic	novelGene_152248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1	669	115983	111537	FALSE	25	GGAACTCAGCAGGATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQLQKERPIILDPADPTQNVAEGYRWDIVAQRACQCLKQDCCYDNQGIPVTSWNVKRARDIQVTVEQCGYLDLILWVDPYEPIKKIKKKIQQNRGYSGLQRLSFQEPSGQRQLLSSHCSLAYYGIFSNIRIYLLETFSPEIQVFVKNPDGGSDAYAINPSNCILSLKEQIEDNFGLPRKQQQLEFQGQVLQDWLDFVGYGIQDSDTLFLSKKRAREAPFPPS	115983	111318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_112038_114209_114358_115963
831425	contig_16882_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_148236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCAGTGCAGAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420494	420831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_420500_420800
831426	contig_11855_pilon	+	1220	9	Intergenic	novelGene_67064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	69.173694422085	143	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	362	1039	2012783	2016987	FALSE	25	CAAGACAGAGTTGGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSNSALQFVNYPTQVLGKSCKPIPVMLLGVTLLKKKYPLAKYLCVLLIVAGVALFMYKPKKVVGMEEHTIGYGELLLLLSLTLDGLTGVSQDHMRAHYQTSSNHMMLNVNLWSTLLLGAGILFTGELWEFVSFAERYPAIIYNILLFGLTSALGQSFIFMTVVYFGPLTCSIITTTRKFFTILASVILFANPISPMQWVGTVLVFLGLGLDAKFGKGAKKTSH	2011138	2017168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2011338_2012006_2012111_2012724_2012831_2013138_2013170_2013750_2013909_2014831_2014959_2015950_2016058_2016240_2016395_2016934
831427	contig_5280_pilon	-	1320	3	Intergenic	novelGene_52662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329435	323868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_324722_327090_327274_329151
831429	contig_2770_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_107496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGGAGAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818998	831551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_819161_830373
831430	contig_10023_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_123484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAATAAGAAACTAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177966	178455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_178000_178500
831431	contig_16724_pilon	-	990	3	Intergenic	novelGene_105269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	449	junction_2	22	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGATATCATGTATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335203	331660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_331931_332507_332600_334575
831432	contig_1594_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_138808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	6	121	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	432	1004	424044	493544	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLNYQYLDKMNNNIGILCYEGEAALRGEPRMQTLPVASALTSHRTGPPPISPSKRKFSMEQADDDLDCENDHVSKMSRIFSPHLNKTANGDCRKDHRERSRSPIERAVAPTVSLHGSHLYASIPSLTLEQPLALTKNSMDASRPVGISPTLAPAERQQVCLCPAGLGASFDKIMAGSESEALGLKEEG	423612	494000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_424111_461911_462102_493228
831433	contig_16156_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_137078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGACTCGAAATTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153737	155332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_153700_155300
831434	contig_6102_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_32302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516920	1515978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1516000_1516900
831435	contig_10196_pilon	+	1438	11	Intergenic	novelGene_132297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_8	228.708548156819	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	284	1240	2352501	2374406	FALSE	10	GCCTCGTAGCCCACCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRTKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKSSRSRSRDRHRRHRSRSRSRSRGHRRASRDRSSKYKFSRERVSREESWERGRSERGTADCRLEGSNGKAASRRSEEKEAGEI	2346731	2374604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497_2352597_2364367_2364479_2365373_2365518_2368749_2368927_2372227_2372317_2372946_2372977_2373412_2373581_2374264
831436	contig_16633_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_165074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTAAATTTCAAGGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85570	86477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_85600_86500
831437	contig_9673_pilon	-	814	2	Intergenic	novelGene_119171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACAAGTTCCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146305	145335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_145443_145598
831438	contig_8616_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_72622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	56	171	128	298	483734	483904	NA	45	ACTTCACCTAAATCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHALLRTVLVIPQSSAGPFSQRLDRSPGPTITHIRNVLRSSIMFTRLMGTPAQKQREGRKGQENCTNGNRESGVEKGRALAHCGIGNQCHKTICVLTI	483606	483927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_483600_483900
831439	contig_11126_pilon	+	504	3	Intergenic	novelGene_138141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	157	1035	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTATAATTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734276	747000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_734390_735748_735867_746727
831443	contig_9909_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_42476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGATTACAGCCTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684118	683557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_683600_684100
831444	contig_20951_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_43118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGGCGACACCCAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215539	214723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_214700_215500
831446	contig_8453_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_125110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCCAGAGGCACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72576	73102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_72600_73100
831447	contig_10627_pilon	-	2853	1	Intergenic	novelGene_59996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1935	2246	293265	292954	NA	15	AGTTTACTTTCATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSVLGLQWLIFEMTAILVFVNYKLQSVNRSILVPPRLPGSLCRVVPSPAPSASVNEPRKCQQEKQYLRFALLAELLGMPARLLSPFWKLAFQSGRRIAPS	295199	292346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_292300_295200
831448	contig_14151_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_171835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGACTCGGTGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101988	101736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_-_101700_102000
831449	contig_1091_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_168775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACCCACAAATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655582	654967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_655000_655600
831451	contig_3721_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_123812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTCCGTTGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108228	106624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_106600_108200
831452	contig_4974_pilon	-	2309	2	Intergenic	novelGene_161403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72372	69587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_69779_70254
831453	contig_15867_pilon	-	1476	7	Intergenic	novelGene_170907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	80.4694559030526	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	178	801	292187	275987	FALSE	60	GGCATTTTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTISDLEAECQELCGKLQDLERVNQTLKDEYDALQITFTALEEKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQEANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVLPDETSEQAEETSPVRAISRAATRRSVSSPPVPPDNMDSHPGSSKDVRVPATALYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGDKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRVSPHSEIHLISNPHLVIET	292364	275311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_276119_277272_277344_279096_279203_281340_281444_282977_283065_286507_286574_292128
831454	contig_8980_pilon	+	1105	5	Intergenic	novelGene_74015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	4.74341649025257	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	33	404	661625	665621	TRUE	35	CATGTCAAAATCTGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDISRPIPGTMDFLFSLAFIFYLWGFFTIQGQKKAEGTEEVKIEVLHRPENCSKTSKKGDLLNAHYDGYLAKDGSKFYCSRTQNEGHPKWFVLGVGQVIKGLDIAMMDMCPGEKRKVIIPPSFAYGKEGYGST	661592	668576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_661834_662892_663045_665610_665726_667072_667207_668113
831455	contig_9527_pilon	+	686	6	Intergenic	novelGene_134067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	47.7300743766443	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	59	595	486523	487885	FALSE	10	CTCCTCTGTGTGCAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484577	487976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486481_486706_486786_486883_487092_487145_487577_487647_487748
831456	contig_19098_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_65801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCAGGTGAAGGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209520	208378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_208400_209500
831458	contig_3241_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_146401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGGAGTTGATTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827874	826823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_826800_827900
831459	contig_9185_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_166890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATGTGCAGGACCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232250	233226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_232200_233200
831460	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
831463	contig_11413_pilon	+	978	6	Intergenic	novelGene_103117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	13.9341307586803	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	243	578	46238	47264	FALSE	20	ATCCTCGAGGTTGGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGPIRAYILARKDAIQLWRTLMGPTRVFRARHVAPDSIRGSFGLTDTRNTTHGSDSVISASREIAVFFPDFSEQRWYEEEEPQLRCGPVCYNPEGGIHCAAGTGGSGPA	41056	47664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_41095_41522_41598_43712_43810_46205_46246_46667_46829_47097
831466	contig_2933_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_111320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACTGGACAGTCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430363	430890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_430400_430900
831467	contig_10813_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_87027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88761	89759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_88800_89800
831468	contig_11117_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_148578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTATGTAGAATTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41111	40396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_40400_41100
831474	contig_9481_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_149637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATCCAAATACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116172	116580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_116200_116600
831476	SIRV6	+	277	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-1	209	-1	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACGTTTCTAGACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
831477	contig_14679_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_174193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284557	285816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_284600_285800
831478	contig_2854_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_120883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTAGTTCAATAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111502	1112332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1111500_1112300
831479	contig_12019_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_87701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188365	189766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_188400_189800
831481	contig_5023_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_7146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	361	828	346981	347448	NA	20	GTTTGGTTTTCATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPDECPPWVSILSLPVRSCDLEHGIVSPGSIPALKCSDFITWPSQHLLVIFVKQHVSRRKWSKQLLLKIAFYKEVCFCSMLFGHFCIWEAHKQHSLGSVNFNLTMFYKKTVNTVSFHLFEAIYFSCGFICVIISPEQERYTMCQELRVKHDSLL	346620	347772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_346600_347800
831482	contig_10898_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_172766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAATAAAATTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127727	126783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_126800_127700
831483	SIRV5	+	236	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	281	151	167	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8482	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
831484	contig_12173_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_172962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102643	103095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_102600_103100
831485	contig_10466_pilon	+	2071	5	Intergenic	novelGene_173633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.866025403784439	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	115	996	350825	361140	FALSE	55	AAAATCTTTGAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGGARSRRAVSSARSGIAARTHARTSTRLTRQCQDPTMTLNNVTLRQGTVGIQPQQQRWSIPADGRHLMVQKEPHHRTRHSANPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLIVDGESATIILLDMWENKGENEWLQDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRRESIPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL	349399	362215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_349505_350815_351147_358282_358360_359154_359360_360862
831487	contig_1107_pilon	+	1429	9	Intergenic	novelGene_126546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGGACGGAAGCCGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169085	209667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_169114_171903_172125_173594_173725_173845_174019_175653_175803_178789_178920_181370_181548_193461_193647_209431
831488	contig_2067_pilon	+	915	3	Intergenic	novelGene_158922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_1	110.5	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAAGCTTAATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590033	594926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_590224_593355_593454_594299
831489	contig_10986_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_71450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	334	396	67223	67161	NA	25	TGAACAATTTCCCCAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFCSRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRYGVGSTAFLSCDVFTKRFSATFTKINVLYFWRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNGEHTARGGAAVPGGTS	67556	66355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_66400_67600
831490	contig_19186_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_176051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACGACAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134874	136515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_134900_136500
831491	contig_10569_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_44053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACGTCAAAGAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52270	51367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_51400_52300
831492	contig_5935_pilon	+	847	5	Intergenic	novelGene_102726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.2955236252754	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTGTGCCTTTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105424	1116419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1105458_1107351_1107494_1111358_1111518_1114681_1114777_1116001
831494	contig_10902_pilon	-	1291	4	Intergenic	novelGene_65675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	22.6421435969889	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	365	832	159633	158691	FALSE	40	CCATAACTTTTAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNSKRNNNSRVSDIDLNSVNTEEKKKESRNNFVELLPPEVTLNIFHQLDIQSLCRASMACRSWNDMIKNSDSLWKPHCLTVRAVCQREIDGDLESGYSWRVILLRNYQKSKVKHEWLSGRYSNICSPISLPEKIMYPMDADTWGEILEAELER	164774	158231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_158853_159327_159670_161967_162198_164676
831496	contig_15787_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_143996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAGATGTACTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105122	105833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_105100_105800
831497	contig_500_pilon	+	1084	2	Intergenic	novelGene_31087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	714	junction_1	0	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498198	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1498974_1499277
831498	contig_6163_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_103845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438612	439971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_438600_440000
831502	contig_12312_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_64023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTGAATGAACAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566154	566993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_566200_567000
831503	contig_4538_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_153068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTAATCCTACCAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44784	43694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_43700_44800
831504	contig_5590_pilon	+	1306	10	Intergenic	novelGene_162986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	83.5602835541762	42	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	48	1148	174610	185134	FALSE	25	CAGTAAAATCTGTGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSLGLVRKSRRPLTMDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSQLEPERDLPSSESHRLKSLERRLAEMESTHAQLRDAVQSLQLLPRTPGFRNQPLTLEAPCANGDTT	174424	185292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174459_174596_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177920_184816_184871_184990
831505	contig_14740_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_174689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337097	338309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_337100_338300
831506	contig_2414_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_158499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACTTGTCACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378923	379320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_378900_379300
831508	contig_10182_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_134634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTTGGAAATGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404997	402992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_403000_405000
831510	contig_12078_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_74129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACGAAAAAGATAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640317	639449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_639400_640300
831511	contig_7580_pilon	+	606	5	Intergenic	novelGene_108605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	325.264892049542	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	73	606	104065	109554	FALSE	65	CAAGAAGAAGAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPV	96570	109554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_104052_104173_106952_107190_108184_108248_109428
831513	contig_504_pilon	+	724	3	Intergenic	novelGene_54432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	147	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	141	452	222784	225918	FALSE	10	TATTTTTCTTACTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPVEPPPSRYRSVEPGWEGSAEGAQHAAASHLQSRARRRPSPEKTMASGSPAASEEERSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKVAYSHMVQNAARSTWCNSENLFPTLMPSLNAMSVPEIIYAFTIS	220106	226190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_220239_222775_222961_225783
831514	contig_7119_pilon	-	1095	4	Intergenic	novelGene_40997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	424.543938309753	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	15	407	196804	188651	FALSE	10	TCCTGAAGGTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196818	187962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_194906_195021_196690
831515	contig_9389_pilon	+	819	7	Intergenic	novelGene_83961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	180	junction_6	162.893028975733	1120	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGGCACCTCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227565	230109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_227659_228779_228875_228961_229107_229304_229457_229561_229587_229719_229780_229860
831517	contig_7057_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_123366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACCACATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012165	1010254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1010300_1012200
831518	contig_6494_pilon	-	444	3	Intergenic	novelGene_108541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1265	junction_1	785	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	13	366	3457	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	3469	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297
831519	contig_11702_pilon	-	1332	11	Intergenic	novelGene_142017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	8.02745289615579	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	54	1316	542727	536131	FALSE	5	CCTGTGCGTGCACGCGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEWETLKAWKERVGQELDRVMAFWMEHSHDQEHGGFFTCLGRDGQVYDDLKYVWLQGRQVWMYCRLYRKVERFRRPELLDSARAGGDFLLRHARVTPPGKKCAFVLTRDGRPVKVQRTIFSECFYTMAMNELWRVTGDARYQSEAVEMMEQLVRWVREDPSGLGQPRLSGAPGAEPMAVPMMLLCLVEQLGEADAELAARYAELGDWCASRILQHVQRDGQAVLENVAEDGRELAGCLGRHQNPGHALEAGWFLLHHAIRKGDLELRAHIIDKFLLLPFRSGWDPDHGGLFYFQDVDGLCPTQLEWAMKLWWPHSEAMIAFLMGYSESGDPALLRLFCQVAEYTFRQFRDPEYGEWFGYLNREGKVALTIKGGPFKGCFHVPRCLAMCEEMLDALLSRLAPAPRPQAPAAVPARPGAE	543061	536114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_536259_536359_536448_538966_539099_540234_540411_540700_540783_541246_541472_541822_541996_542100_542177_542357_542434_542620_542731_543011
831521	contig_12654_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_129286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTATATTATCTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732260	733608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_732300_733600
831522	contig_16870_pilon	-	1265	6	Intergenic	novelGene_155483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	4.31740662898458	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	117	677	81718	78374	FALSE	25	GGGTGCTATAATGGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEGDCLQQLNDSSVIISALKTHLVSGQSLEEIITYYPPMKAINDQGKEVTEFCNKYWLMLDEKEAQRLYGGKEARTEEMKWRQWADDWLVHLISPNVYRTPTEALASFDYIVQEGKFGAVEGAVAKYVGAAAMYFISKRLKSRHHLQDDVREDLYEAANKWVAAVGKDRPFMGGQKPNLADLAVYGVLRVMEGLEAFSDLMRHTHIQPWYLRVEKAIAETLLVH	83530	77785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_78503_79286_79405_81047_81249_81605_81756_82125_82185_83510
831523	contig_177_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_41780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGGAAGTCTGGGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335283	334248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_334200_335300
831524	contig_15543_pilon	+	1110	3	Intergenic	novelGene_164355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	3	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	116	529	143864	168576	FALSE	40	TTTAAAAGACTCACGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTVQEAAGAPESLRVCPQLEEERLSVIDRDNRLLLEKMSYIMRTKGQTDNRNDDQRRSLNRRKREQELCRVRKENKTILERITKSEPWYQAQRWHEDWERIEKYRDAIRKYPRRWYNTPSGKELIQKFSKGISKTGPKKVTWKKDEDSEHKLAKEDNKAEERGDGGTDRAIVAC	143748	169157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_143926_156810_157004_168417
831525	contig_6504_pilon	+	1552	2	Intergenic	novelGene_158784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAAGCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241029	258334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_241166_256918
831526	SIRV6	+	327	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	356	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1856
831528	contig_16310_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_70059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGACATTTGGAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131561	131045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_131000_131600
831530	contig_13958_pilon	+	864	2	Intergenic	novelGene_129538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	0	373	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	69	350	187410	195765	FALSE	20	ACATTTGCCTATTTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISGSPRPPGAVLALVLAGVQSMELVGAGGGAEAGGVFRVVAFAPPGCYQAWPPPLRPTDAAGPPGAGSVCAAGRRPAAPATNRVVAGADKPKISNSRQQAADTHARNCRQRMMS	187341	196279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_187596_195669
831532	contig_8712_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_58879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGCTGCCATTTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918582	920158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_918600_920200
831533	contig_1274_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_137762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3761	4370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3800_4400
831534	contig_9785_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_157900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1	420	491388	490969	NA	45	CATTAAAATATTCTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRCVGLPRLWTDHTEARLSSSTHENASFLLSCCFCPTPWFLFQILAVGTSLLAGPVPSSQSRQPRPQSHLWLLHHSEPFGGLTQQLCPCLCPRFSSLEHVPQLLLGPTPGDRSSARISDSVASALAPVLQSSLSPFHV	491388	489016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_489000_491400
831535	contig_12644_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_44503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTTCCAAACCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059155	1058618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1058600_1059200
831538	contig_10838_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_129159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32796	32062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_32100_32800
831543	contig_12619_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_73563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTATAGATGTATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794661	796623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_794700_796600
831545	contig_7091_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_131782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTGATTGTCCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361357	362431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_361400_362400
831546	contig_5400_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_162813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAACTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126098	126925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_126100_126900
831547	contig_7342_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_71140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGCCTTGACGCTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273917	273489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_273500_273900
831549	contig_11602_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_166593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGGGCTGGCAACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166917	167915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_166900_167900
831550	contig_11602_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_166594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168116	168836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_168100_168800
831551	contig_4900_pilon	+	1132	8	Intergenic	novelGene_159051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	15.172477768402	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	437	1132	694144	730300	FALSE	45	TATGAGGAGATGGAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSNQGVVSRPQRPGRGPVGSKASLGHLDSLEWKENQEQTPSQLAMLKKAQEFFQACDAEGKGFIARRDIQRLHKELPLSLEELEDVFDALDADGNGFLTPEEFTTGFSHFFFSQSNPSQEDAGEQVAQLQEEKVYQSRGEEDLGDMDKDEEAQFQMLMDRLGAQKVLEDESDVKQLWLQLKKDEPHLLSNFEDFLTRIFSQLQEAHEEKNELESALKKKIAGYDEEIQHL	608251	730300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_608301_623403_623675_654966_655048_694108_694360_704307_704420_705568_705753_710349_710497_730263
831555	contig_10341_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_47252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAATTTAAAAGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168619	167017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_167000_168600
831557	contig_16156_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_137082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261705	260329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_260300_261700
831558	contig_11851_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_146558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGATAAAATTTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53715	54980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_53700_55000
831559	SIRV4	-	395	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	202	20	-202	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTCAACAACTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
831560	contig_8617_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_73465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62716	62987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_62700_63000
831561	contig_8354_pilon	-	1207	9	Intergenic	novelGene_24105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	81.1602388796386	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	80	1009	259087	221213	TRUE	45	GTTTTCAAATAAATATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIFILSSFKLSKKEEKSLEHVEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKMPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAKAKKKEKEKEKKEEEKMEVDEAEKKEEKEKKKEPEPNFQLLDNPARVMPAQLKVLTMTETCRYQPFKPLSIGGIIILKDTSEDIEELVEPVAAHGPKIEEEEQEPEPPEPFEYIDD	259166	219087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_219277_221203_221360_230251_230399_231375_231463_232863_232957_240651_240822_247565_247669_256652_256770_259021
831565	contig_8550_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_72361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCTGAATTGCTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96247	94753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_-_94800_96200
831566	contig_6217_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_109687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTGGCACAGTGGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893609	893010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_893000_893600
831567	contig_5936_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_53547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTAAATTTTTCCCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75859	76456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_75900_76500
831568	contig_2550_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_135636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATTTTACAGCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453577	453171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_453200_453600
831571	contig_19769_pilon	+	309	2	Intergenic	novelGene_102333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3673	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88841	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_88958_89163
831573	contig_2093_pilon	+	1654	8	Intergenic	novelGene_152971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	57.2809046787525	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	109	1284	1297984	1307014	FALSE	70	ATGAAAAAAAAAATCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLAQQLQRLALPQSDPSLLSRDEVASLLFDPKEAATIDRDTAFAIGCTGLEELLGLNPSFEQFEAPLFSQLAKTLERSVQTKAVNKQLDENISLFLIHLSPYFLLKPAQKCLEWLIHRFHIHLYNQDSLIACVLPYHETRIFVRVIQLLKINNSKHKWFWLLPVKQSGVPLAKGTLITHCYKDLGFMDFICSLVTKAVKVFAEYPRSSAQLRVLLTFYASTIVSALVAAEDLSDNIVAKLFPYIQKGLKSSLPDYRAATYMIICQISVKVTMEDTFVNSLASQLIRTLTKIPSLIKDGLGCLIVLLQRQKPDSLGKKPFPHLCNVPDLITILHGISERYDISPLLRYMLPHLVVSIINHVTGMWFCILCPETYFLGFDSLKIGTSFLIS	1297538	1307384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1297619_1297955_1298126_1298980_1299198_1302658_1302801_1303663_1303766_1304723_1304865_1306432_1306645_1306794
831574	contig_14202_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_157146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142322	143476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_142300_143500
831577	contig_3560_pilon	-	807	7	Intergenic	novelGene_149505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	37.8832270126093	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTGTATATTTTGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208943	197979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_198211_199031_199080_199798_199862_203206_203305_206569_206703_207915_207965_208758
831578	contig_9505_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_121840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAGAATGCTGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516660	517327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_516700_517300
831579	contig_500_pilon	-	1602	9	Intergenic	novelGene_30913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	426	818	993161	988069	TRUE	10	GGGGTCACAGGTGTGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLGFLQHLPITASKFTKYAVGHMRNAIRRIAQSAPQGLHELCADWLDVVIEEIRLQVVHTQLQSPQALANQGLGPVERRHQGIHQHGQIRQERAQPYRHRETQLHKEVLHVLLVQATLQHVQPLQEVW	1010233	983541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_983693_983787_983885_984398_984594_985634_985827_987919_988086_990425_990683_993042_993244_1003256_1003411_1010044
831580	contig_10042_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_79229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179204	1177759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1177800_1179200
831581	contig_266_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_166296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTTCATCAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547441	547819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_547400_547800
831582	contig_11601_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_141040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	90	527	142395	142832	NA	35	TTTCACAAAATCTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPSSALPTPRVGSLEENELFPLMTLVYPDHVFPPLKESLHWILPSPTSPPGRRSRSMYICTYSVPQPSFLHLASTTQARSAPPLPANPASGPPACSHPKGPGAHGQKAGVGFALFCSSDSSSLLHHFPLASVGVRGLGGKTDI	142305	143050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_142300_143000
831585	contig_10482_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_152855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTACTCACCAACGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220944	219386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_219400_220900
831587	contig_9297_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_69839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGGATCTTGGCCCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668770	667307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_667300_668800
831588	scaffold_13505_pilon	+	1109	4	Intergenic	novelGene_111556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	229.498487044154	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCCACTTCTCCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608562	613607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608768_608977_609105_609537_610099_613391
831589	contig_9375_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_136071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTCTACTCTGTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460865	459294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_459300_460900
831590	contig_11337_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_107194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216458	214368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_214400_216500
831591	contig_18251_pilon	+	1117	6	Intergenic	novelGene_50147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1161.46142424103	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	119	421	35708	48605	TRUE	40	TCAAGAATAGTGTGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMSIHPMH	35589	55318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_48585_48794_53919_54027_54917
831593	contig_253_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_129721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	721	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	61	678	552099	553905	FALSE	35	CTTTAGAAATAAAGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLSTLPGLEVGAQHQDSRPMALPCALGLGTLLALPGALGSGGSTKDGSDSSVTIVLLLLLLLLLATGLALAWRRLSRDSGGYYHPARLGAMLWGRTRRLLWASPAGRWLRARVEQGSPDNDPELQEDDEDAEDYVMDGGLGMAEPQEEEKLCGEGPNPRQAPDQAEEAHDGDDEGGLCLSTHGPAGSGGSAEALLSDLHAFAGSAAWDDSTRAAGGQGPHVTAL	552038	554072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_552102_553290
831594	contig_610_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_76847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	854	1153	363283	362984	NA	40	TAGTGTATGCATAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAGGALADRVLGCAGVRHIWITGHPGDGKSGALKGLKRVGVHPGPAVQNAFLCPLHGAHQGEVTGGALRHGVLHSDSGLLQLLCRDNGKGKTTQTPS	364136	362482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_362500_364100
831595	contig_11335_pilon	-	1473	9	Intergenic	novelGene_104934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_4	100.830302984767	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	121	1020	459255	418179	FALSE	25	CACATATTGTTTTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLNPPVRLRSLREGDVYEIGEDGELAAILLAVSLPLEFEMLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVLRAAKRGIPYRVIHNASIMNAVGCCGLQVVPDLRRGSFPVTVLYKFGETVSIVFWTDTWRPESFFDRVKKNRQNGMHTLCLLDIKVKEQSLENLIKGRKIYEPPQYMSVNQAAQQLLEIVQNQRMRGEEPAITEETLCVGLARVGAEDQKIAAGTLQQMCTVDLGGPLHSLIITGGSMHPLEIEMLSLFSVLEDTSESQSIDGL	459610	417725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_418403_420501_420606_422034_422075_427382_427504_436535_436578_442122_442232_451414_451540_459120_459279_459513
831597	contig_10446_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_162458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACTGTGCCACCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476683	477987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_476700_478000
831598	contig_6199_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_126381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	632	1147	394129	393614	NA	50	CGGAGAAACAGGAAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVLPVSALGPPGLRPGRPRIRQSEGSEGCRLMVSGWRLLWWHRVSVHVSAGALSHVHLEGVDVLLSRRGIHSMSTEWGQVPHLREPRAGGPTRRPSRPCKSLSRDVQGGVCDQSEMHSREWRRTPSGSVEVRTRSCPHSLILGRGPTLSPHSTPWLSQPLPSVGWGATA	394760	392783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_392800_394800
831599	contig_5321_pilon	+	1050	3	Intergenic	novelGene_153873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	55	179	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCAAACTGGAATATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52127	60371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_52261_58488_58737_59702
831600	contig_4125_pilon	+	1400	9	Intergenic	novelGene_25216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	58.0452409763281	7	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	246	1112	1702282	1711502	FALSE	25	GAGATGCTTTGAGATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVPRSLLQPRPDQAPLGPAL	1702036	1711790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115_1711209_1711442
831603	contig_987_pilon	+	912	4	Intergenic	novelGene_72347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	463.68979094026	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	472	912	1289789	1300169	FALSE	20	GCCTGTGGGCTGTACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTEGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCN	1286876	1300169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1287010_1289450_1289988_1295465_1295612_1300073
831604	contig_14451_pilon	+	1461	5	Intergenic	novelGene_176875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.64005494464026	20	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194781	225489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14451_pilon_+_194822_196105_196170_218374_218453_222535_222596_224270
831606	contig_14300_pilon	+	1144	8	Intergenic	novelGene_133106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_7	119.305644186241	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	229	915	243795	257048	FALSE	15	AGCTGTCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLCSGLMFPMSCLILVWAAGSGSIKVLPKPTCFSDYTTTSICEWKMADPTNCSAELLLSYELLSYQQNLDPSENRTCVPENKEVMVCVCSMQTELLYAVDVYALRLWAGQQLLWEDHFRPSNHIKPRAPGNLMVHKNASDMLLLTWTHPYAPGDLLYSELTYLVNISNENDPSDFKVQEVTYKEPFLHLPARSLKSGAFYRASVKALAQGYNSTWSEWSHSNAWYN	218508	257277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_218602_243465_243580_243773_243865_246863_247018_248954_249107_250299_250452_255402_255560_257046
831607	contig_11292_pilon	-	1330	2	Intergenic	novelGene_109393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	812	1201	51809	51329	FALSE	40	AAGGAGTACTCCTAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGEGARKMARKKANRYITTFLTETIRPTSQATVLTRPPSVSSRTEWAPRMTVLGLLLAVVLELERWGWFSWESSLSGPGSSASFWFCSSSISTSLASPSAACVRGSTLGVSPLMSHFIISLTKSPRDE	52620	51199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_51394_51484
831608	contig_5988_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_15885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCCATGTCAAATGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481546	479443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_479400_481500
831609	contig_3233_pilon	-	1035	2	Intergenic	novelGene_56593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	169	333	768198	768034	FALSE	60	CTTGCAAAAAAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGNLESGSSASLVLCVAHVLVLKAETILTTATSATLEGVAEYGLEKGLLASPGSVIMNGSSVANTSPSVKSKEDQGISGHDEKENPFAEYMWMENEEDFNRQVKKDVEGK	796096	767331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_768210_795939
831610	contig_6589_pilon	+	588	3	Intergenic	novelGene_26040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	369.5	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAATAGCTTTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1725405	1731815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725536_1730102_1730152_1731406
831611	contig_9274_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_151159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATGGTGCTAAAATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528323	529354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_528300_529400
831614	contig_5105_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_168916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCGGAACTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501951	503028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_502000_503000
831615	contig_1735_pilon	+	2208	2	Intergenic	novelGene_106878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACATACAACATTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114529	117108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_114967_115337
831618	contig_8156_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_98908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAGTACATCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113800	114278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_113800_114300
831620	contig_12599_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_176962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTCCTAGGACTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23187	22793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_-_22800_23200
831621	contig_10948_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_124963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCACACACACCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59292	60174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_59300_60200
831622	contig_1813_pilon	-	576	4	Intergenic	novelGene_105508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_3	566.665882352398	5620	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTGCCTCCTGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423120	415698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415914_417583_417746_418496_418533_422957
831623	contig_9177_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_32707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510508	509377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_509400_510500
831624	contig_1813_pilon	-	716	5	Intergenic	novelGene_105507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	551.534393759809	5319	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	99	419	423014	417666	TRUE	5	GACCTGCCTCCTGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEDERKMLTGSGDPKEEEEEEEEEEEELVIGLRLSVHTGNLGRQECETFPYYLASELNGRPHSAISAGSVALPAGLLHGSPNNSERAMRAAGEMCKGPGAARAL	423112	415698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415914_417583_417746_417856_418005_418496_418533_422957
831625	SIRV6	+	368	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	505	0	339	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831626	contig_8102_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_85326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACAATGAAAGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51345	50901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_50900_51300
831627	contig_8102_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_85327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60367	60033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_60000_60400
831628	contig_19769_pilon	+	564	4	Intergenic	novelGene_102302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1783.8991625712	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	14	547	87249	89339	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHPQGCPCRPQSGSYCCSPDRTTPGNQDCAGERELGLGTQ	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_87954_89218
831630	contig_8017_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_65340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAACCACTGTGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128313	129049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_128300_129000
831631	contig_12479_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_56896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTTTATTTTCTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605772	607190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_605800_607200
831632	contig_11677_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_85961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639975	641344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_640116_640883
831633	contig_11427_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_79026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	828779	829108	NA	10	CTCCATCAGGGCTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEILSFLSFHGLHSSFSSYCYQLLLLYLLCWLFLLHTLECPSTQSLLCRLLSSIYPIFHLSDLIKIHDFKYHLYTGDFHNSKPNLSELIYPAAQWTSPSGCLTFISNI	828778	829964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_828800_830000
831634	contig_11427_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_79027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTAGATCCTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829964	830307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_830000_830300
831635	contig_17427_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_30267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAGAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17916	15991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_16000_17900
831636	contig_1443_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_28217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAATGAGTGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344691	344893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344700_344900
831637	contig_18538_pilon	+	1234	2	Intergenic	novelGene_163888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9305	15661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_+_9446_14567
831638	contig_5423_pilon	+	1269	3	Intergenic	novelGene_85256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	307.5	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534773	543245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_534942_541109_541167_542201
831639	contig_6938_pilon	-	1892	1	Intergenic	novelGene_69063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	115	336	139876	139655	NA	45	GGGCATCAAGAAGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWLQKDVSGRAIGKIVHRFILAWQLTFLFLKLRLLVRQMFLAMKFLFPLIFIAVEALGYHFSFYSKIFTTCSSFLFFLWGLQWVNDFNDFVIFTSYEKKILPCMLQEDQNE	139990	138098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138100_140000
831640	contig_5590_pilon	+	1564	11	Intergenic	novelGene_163061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.006817477606	13	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	545	1516	523307	530694	FALSE	15	GGGCGAGCCTGTGCATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFRPLCKFCASVRRVRDIVPTLRAAMAAAQSGTPGPVFVELPVDVLYPYFMVQKEMLPIKPPKGLLGWAVTWYLENHLANLFAGAWEPQPEGPLPLDIPQAAPQQVQRCVEILSRAKRPLIVLGSQALLPPTPADKLRAAVETLGVPCFLGGMARGLLGRNNPLHIRQNRSAALKKADVVILAGTVCDFRLSYGRVLSRSSKIIVANRNREEMLLNSDLFWKPQEAVQGDVASFMLKLGEGLRGHTWGPDWVEELREADRQKALWIGTLGSFPPLDCVLLASSLPASGPPCDPSDSSTSLRTGRGWRSQGPGRIPEVLGKS	521362	530742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_521546_522770_522973_523064_523193_523275_523416_523492_523605_525724_525825_525957_526056_526175_526313_527811_527947_529036_529137_530513
831641	contig_12414_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_59639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTATTCTTTGCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754083	753496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_753500_754100
831642	contig_1225_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_44213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAACCGGCAGCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328027	328488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_328000_328500
831644	contig_12270_pilon	+	373	2	Intergenic	novelGene_113272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	9	365	373	14431	14439	FALSE	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSITILTVINCGIFSLEAADGESEVCPRPTATEPVRDPRCPVRCTVDEQLRSLSWFLLIPACIAAARTLTGLAVDGDPFSWRRSQRGWRLGHHNVPTRGPEQQGHEEQSLWHHLAAPACLMLI	13837	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14129_14357
831645	contig_8248_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_125023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATACAACAACTGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110952	109780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_109800_111000
831646	contig_4055_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_158177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944814	944232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_944200_944800
831647	contig_2444_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_83755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCAATGAATGTGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214437	215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_214400_215700
831649	contig_4732_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_75480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCACCGAGAGACCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718905	719793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_718900_719800
831651	contig_10734_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_51252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCTGAAGCAGGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272608	1273513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1272600_1273500
831653	contig_12019_pilon	+	1102	3	Intergenic	novelGene_87730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	35	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	39	320	618180	620414	FALSE	10	CACCTGAGTTTCTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEEGDDIPAQVAMVTEEDGAPQVTLITQDGAQQVTIITSGAVVAEDSSVASLHHQQVALLATATGTHIAVQLEEQQTLEEALSVATAAMQQGAVTLETTASESGC	618141	621196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_618243_619648_619763_620309
831654	contig_3397_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_154571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTCCCAACTGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120874	119819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_119800_120900
831655	SIRV6	+	404	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	356	7	190	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTGGTCACAAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	2113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
831656	contig_11448_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_66430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTAACCGCTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603492	604242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_603500_604200
831658	contig_11538_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_152284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTTACTAATTTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134618	136532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_134600_136500
831659	contig_20614_pilon	-	637	4	Intergenic	novelGene_107557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	134.725234788769	2844	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	72	545	164868	160619	FALSE	10	TTTCTATGTCGTGTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRDPGPRETRGRFQLPEPEGSGVPSPQPDATMLSRLLKEHQAKQNERKELQEKRRREAITAATCLTEALVDHLNVGVAQAYMNQRKLDHEVKTLQVQAAQFAKQTGQWIGMVENFNQALKEIGDVENWARSIELDMRTIATALEYVYKGQLQPAPS	164939	160526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_160730_160918_161052_163291_163365_164711
831660	contig_12624_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_60984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGCAAAGGATACTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73497	75279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_73500_75300
831663	contig_15105_pilon	+	1108	5	Intergenic	novelGene_151044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.11803398874989	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	78	623	924699	929352	FALSE	30	AATGAGTCCCTCAACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDSGYTIQDLKSFHLVGLGATLCAMNITELPLIKISEFRVVVARIGTLLCSTHVLAEFKRKAEVVFGDPTKWTSSILQELGTIAAGLTKEELQMLDKDLMPYFQPSAVKCLPDEIFKELSPEQIASLGPENAAAVTDAQRRQLSLLQRQSLQQALDGAKTRSWLDAPQSASPTRIPSSRSPLGVPVCWGLWLGCPLLASVPKALW	924621	929837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_924743_924961_925099_925583_925682_927643_927840_929281
831664	contig_14443_pilon	-	567	3	Intergenic	novelGene_126678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1757	junction_1	181.5	179	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39501	37481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_37863_38988_39045_39371
831666	contig_2757_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_164569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	74	319	45563	45318	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSVAGAGKGAGKGAGLRTVVRRAMAHRLAVTTETQAKNTQPFLPLATAGMTPAGPASRAIVGLEGVENKGPREAFCQAARPPQLSRAPKCLDLVSPARLSYLLL	45636	44832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_44800_45600
831667	contig_17171_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_147358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTGACTGTTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185316	184419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_184400_185300
831670	contig_18113_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_137530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	235	336	140722	140823	NA	10	TTTTTTTCACACTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLDQANEKSSSQSHPVIQWRDPTYHRNDLYGKSHCAHFLARSRLPEVWPQREHNSGPTTAEAGSSVNFPPAKEDLSGMFSGHCVSIFSKPRYGFGSWLALDPSYGTGSCG	140487	142348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_140500_142300
831671	contig_20879_pilon	-	1431	10	Intergenic	novelGene_168600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	12.9881237299577	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1188	244	1431	177287	165742	FALSE	20	CTCTACGTCGCCATCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYLNLVGKHVIADAQNITISQYACHDQVAVTILWSPGALGIEFLKGFRVILEELKSEGRQCQQLILKDPKQLNSSFKRTGMESQPFLNMKFETDYFVKIVPFPSIKNESNYHPFFFRTRACDLLLQPDNLACKPFWKPRNLNITQHGSDMQVTFDHAPHNFGFRFFYLHYKLKHEGLFKRKTCRQERNTDATSCLLQNVSPGDYIIELVDDMNTTRKVMHYALKPAHSPWAGPIRAVAITVPLVLISAFATLFTVMCRKKQQENIYSHLDEESSESSAYAAALPRERLRPRPKVFLCYSSKDGQSHVNVVQCFAYFLQDFCGCEVTLDLWEDLSLCREGQREWVIQKIHESQFTIVVCSKGMKYFVDKKNYKHKGGGRGAGKGELFLVAVTAIAEKLRQAKPSAGALGKFIAVYFDYSCEGDVPSILDLSTKYKLMDNLPQLCFHLHSRDHRLQEPGPYPGQVSRRNYFRSKAGRS	186269	165741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_-_166198_168837_169023_170271_170383_171289_171345_172602_172669_173928_174081_174180_174226_177169_177291_177820_177940_186148
831674	contig_11003_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_105436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTCCGGTCTAATCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61162	60367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_60400_61200
831675	contig_9519_pilon	+	1406	10	Intergenic	novelGene_172078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	12.4186240067981	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	455	1162	473122	483403	FALSE	35	AAATTCTTTCTTTTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNEVEASTTNGQPDQQATPKAPSKKEKKKGPGKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDDVPDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVNKISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEKKKTEEANKAVENGSEVLMNLDVQPTKLKLGIDQMDLFGDMSTPPDLNSPTADYSEV	437876	483647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9519_pilon_+_438232_473022_473213_475450_475591_476384_476484_478398_478531_479133_479215_479623_479651_479881_479936_480346_480410_483382
831676	contig_10753_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_105160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAAGTTAATGTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419420	418464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_418500_419400
831678	contig_9481_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_149675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCTAACCTGGTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401231	400079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_400100_401200
831679	contig_10627_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_60027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCCATTGTGGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522246	520029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_520000_522200
831680	contig_11413_pilon	+	406	4	Intergenic	novelGene_103140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1157.74992502219	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3	395	87483	90735	FALSE	15	GCCTGGCACCACCTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87480	90746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87570_88139_88248_88420_88508_90624
831681	contig_8628_pilon	+	1061	3	Intergenic	novelGene_164403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATTTAAATTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297497	299780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_298274_298523_298665_299636
831682	contig_7914_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_165016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38553	39931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_38600_39900
831683	contig_6028_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_156594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	165.112650938685	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1114	1458	332055	323647	FALSE	40	GTGTCCAATCAAAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKSHPLES	336928	323570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_323668_323753_323830_326490_326709_332025_332108_335867
831684	contig_593_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_101999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGCCACAACACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319045	317483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_317500_319000
831686	contig_7816_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_66570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGGAAGTCCTAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522380	523785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_522400_523800
831687	contig_3942_pilon	+	963	7	Intergenic	novelGene_128684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	362.784447786224	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	59	793	426591	429999	FALSE	30	GTTATGAGTCATTTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426532	430169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
831688	contig_12046_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_83455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTGACACCTCACCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147787	149227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_147800_149200
831689	contig_9706_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_20856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGCATCCCCCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2355	2714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2400_2700
831690	contig_2940_pilon	-	1356	4	Intergenic	novelGene_81901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_2	118.704113941627	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	117	530	454239	453111	FALSE	35	GATACAGTTACTATACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFLHEGLTVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSILWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	454355	452284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236
831691	contig_10511_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_126905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAATTAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592473	591527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_591500_592500
831693	scaffold_880_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_121427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405737	405289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_405300_405700
831694	contig_10642_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_78711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATGGTTTGTTCACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876569	875678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_875700_876600
831695	contig_4232_pilon	-	1178	9	Intergenic	novelGene_63487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	384.527307222777	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	5	451	620488	614837	TRUE	20	ACACGGAGATCTCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAVVENVVKLLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	620492	607755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_608024_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_620456
831697	contig_8464_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_125398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885344	886252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_885300_886300
831698	contig_11378_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_112262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAATAAAGGAATGGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385114	386565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_385100_386600
831699	SIRV6	+	325	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	548	0	382	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831700	contig_6418_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_81145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGGGAGGAAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229516	227805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_227800_229500
831701	contig_19179_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_142356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7356	5880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_5900_7400
831702	contig_709_pilon	+	2078	3	Intergenic	novelGene_57664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	7	33	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCACCTGTCAAATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3911243	3923747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3911317_3914783_3914933_3921891
831703	contig_5954_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_28734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_1	0	13220	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGAAATTCATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186790	1184613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1184936_1186585
831704	contig_6175_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_16350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAATAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1694388	1692940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1692900_1694400
831705	contig_15893_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_128513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTCTCATCAGGACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85360	84445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_84400_85400
831706	contig_15897_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_49544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAACTAAACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650478	649769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_649800_650500
831707	contig_91_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_127154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGATTTTTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364903	1364338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1364300_1364900
831708	contig_10734_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_51428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGGGAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142002	2143632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2142000_2143600
831709	contig_11378_pilon	-	789	4	Intergenic	novelGene_112323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	25.9015229067499	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCGGGACGGCGGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179452	1174942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1175527_1176177_1176245_1179105_1179172_1179380
831714	contig_14744_pilon	-	1758	5	Intergenic	novelGene_65974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	6.25999201277446	36	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	5	670	847956	845110	FALSE	5	TCCTCACCCGGTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YMQKVKNPPDEDCTICMERLVTASGYEGVLRHKGVRPELVGRLGRCGHMYHLLCLVAMYSNGNKDGSLQCPTCKAIYGEKTGTQPPGKMEFHLIPHSLPGFADTQTIRIVYDIPTGIQGPEHPNPGKKFTARGFPRHCYLPNNEKGRKVLRLLITAWERRLIFTIGTSNTTGESDTVVWNEIHHKTEFGSNLTGHGYPDASYLDNVLAELTAQGVSEAPAKA	847960	844021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_845335_846446_846537_846637_846800_846892_847052_847926
831715	contig_20561_pilon	+	406	3	Intergenic	novelGene_166362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	260	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	4	363	38415	45760	FALSE	35	GGCAAAGAGAGAGGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMEQIRRLESEMDILKNEHFAIPVVCDSVQPSLDQSSHKVSEDSGQNSVVNSSDKEKNKDIRLSISDEVDSTIPKENSSNSFPRREGEGMPSSSRASKNAVQFDKPNRYLGLQTVKRMLC	38411	45803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_38441_39298_39593_45720
831716	contig_14219_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_54304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAACCAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647897	646036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_646000_647900
831719	contig_7898_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_47652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAGCATTTATCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849600	850042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_849600_850000
831722	contig_9752_pilon	-	1452	10	Intergenic	novelGene_122039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228797	198755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_199054_200020_200129_217240_217392_217656_217808_218674_218788_219178_219254_219967_220094_222352_222460_228053_228136_228556
831724	contig_4531_pilon	+	1517	7	Intergenic	novelGene_47941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	260.753661953619	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	319	1299	729029	738189	FALSE	55	AGCATAACAATAATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECTSLQFVSPFAFEAMQKVDVVRLASLSDPELRLLLPCLVRMALCAPADQSQSWAQDKKLILRLLSGVEAVNSIVALLSVDFHALEQDASKEQQLRHKLGGGSGESILVSQLQHGLTLEFEHSDSPRRLRLVLSELLAIMNKVSESNGEFFLKSSELFESPVYLEEAADVLCILQAELPSLLPIVDVAEALLHVRNGAWFLCLLVANVPDSFNEVCRGLIKNGERQDEESLGGRRRTDALRFLCKMNPSQALKVRGMVVEECHLPGLGVALTLDHTKNEAFEDGVSDLVCFVSGLLLGTNAKVRTWFGTFIRNGQQVRDKLISV	727767	738407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_728072_729014_729322_729945_730085_732799_732903_733741_733856_737433_737565_737988
831725	contig_2890_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_60272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGCTGATCTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294085	292906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_292900_294100
831726	contig_5815_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_141190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGCAGATCGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207251	208109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_207300_208100
831727	contig_9406_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_136174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCAAGTCTGCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97891	98354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_97900_98400
831728	contig_19957_pilon	-	1810	1	Intergenic	novelGene_57727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAGAAAAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258023	256213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_256200_258000
831729	contig_253_pilon	-	808	5	Intergenic	novelGene_129709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	65.3184506858514	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	25	570	513615	507538	FALSE	10	TCTCTGGTCTGTTAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPG	513639	507299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507543_508254_508328_508835_509025_510269_510450_513516
831730	contig_16846_pilon	+	889	6	Intergenic	novelGene_82914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	148.032428879621	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	435	683	476331	477023	TRUE	45	TATTCAAGTATCTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAMPPPVTVQRMALNWKELDSSFLFSEASATGEASLLSEGLREALSSYIRLTDDISLDDAKAQSRGRKGNQGYSIQHPNSAQPD	464052	477756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_464156_465206_465311_475327_475478_476253_476387_476830_477113_477639
831732	contig_6503_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_145745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAGTCAGTTGGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32451	33652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_32500_33700
831735	contig_11754_pilon	-	387	3	Intergenic	novelGene_176970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	52	387	36697	15078	FALSE	10	TGTACTTAGCTTTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSNSSCNGTGLAQVVKHLTTSQKAGSSNSPRGTSEVRPGDMLPKGHSLENPMEQFYCEHMGSPRVGIDSTATNNSPRCDGWSFQSHLVTKRESSGETLSTGEEITLQQTSL	36748	15077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_-_15181_35957_36172_36678
831736	contig_9955_pilon	+	1395	2	Intergenic	novelGene_21319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTCGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50075	60771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_50151_59451
831738	contig_4496_pilon	-	1993	2	Intergenic	novelGene_66699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATTTGAAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972101	968556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_968878_970429
831741	contig_9290_pilon	-	1009	7	Intergenic	novelGene_77554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	290.397667958191	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	48	677	483241	479939	TRUE	5	TTCCTCTCCTGTCTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQPAV	483288	478699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478970_479876_479950_479993_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136
831742	contig_8357_pilon	-	413	2	Intergenic	novelGene_39778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGATAGGAAAGGGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891855	884097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884331_891675
831743	contig_16103_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_118951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAACCCAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996586	997708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_996600_997700
831746	contig_641_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_170134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGATTGCCAGGTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14319	13654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_13700_14300
831747	contig_5059_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_140719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAAGAGGGATTCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230228	231911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_230200_231900
831748	contig_7272_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_25301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCTGAAAAAGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395513	396588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_395500_396600
831749	contig_6071_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_176861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGATATTATTTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26491	27521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6071_pilon_+_26500_27500
831750	contig_2940_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_81994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATATACCACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141547	1142339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1141500_1142300
831752	contig_13496_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_107631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTCCTAGGCACCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268198	267959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_268000_268200
831753	contig_6266_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_170987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTTGATCTTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388356	390042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_388400_390000
831754	contig_7057_pilon	+	863	8	Intergenic	novelGene_123306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	957.26930934416	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	188	859	936984	943696	FALSE	10	ACCCCATTGCTGCTCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNHTPRAFSVLEESLLSLHPVTPVPVTPPAAVLPGPRPTCPVPLFLLCFQPARPRKK	935974	943700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941088_943527
831755	contig_5093_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_135097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCGCTATACAGAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626042	627107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_626000_627100
831757	contig_5526_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_111690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198522	199877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_198500_199900
831759	contig_12128_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_131971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185639	187518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_185600_187500
831760	contig_9363_pilon	+	2012	2	Intergenic	novelGene_6509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	925	1431	513288	513918	FALSE	35	TGCACTGTAAGAGAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESREVIDLDPPAQASQEQEDLRIVKVEEEDCTWMQEYSPPTFETFYQRFKHFQYHEASGPREALSQLRVLCCEWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPEEFQTWVREHHPESGEEAVAVVENIQRELEERRQQVHCGESLPFQQREEISSMLTWRRQSVILCICV	512363	514499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_513696_513819
831762	scaffold_19766_pilon	-	1236	7	Intergenic	novelGene_34279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	48.9137563018376	101	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	220	1164	386168	383370	FALSE	20	TAAGGCTGGCGTCAGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNFAGGRLEKAQGTLTTPNWPESDYPPGISCSWHIIAPPDQVISLTFGKFDLEPDTYCRYDSVSVFNGAVSDDAKRLGKFCGDTVPSPISSEGNELLVQFVSDLSVTADGFSASYRVLPRGAAESGPARSPGEDGQPGPSPKPGAGPKVKPPTKPRLSPAEKPKASPEAEATPLGPDVPSTPCPKQCRRTGTLQSNFCASSLVVTATVKSMVRGPGEGITVTLSLIGAYKTGDLDLPSPPTDTPLKLYVPCRQCPPMKKGASYLLMGQVEENRGPVIPPESFVVLYRPNQHHILTNLSKRRCPSQPVMAAGS	386387	383297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_383531_383650_383822_383952_384031_384276_384546_384855_384993_385465_385592_386165
831763	contig_10115_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_171934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGAAAAAGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19146	18425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_-_18400_19100
831764	contig_13215_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_145878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27257	26180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_26200_27300
831765	contig_7720_pilon	-	2146	4	Intergenic	novelGene_155741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	3.68178700572909	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	94	324	241136	240906	TRUE	30	TAGGGACAGAAGTCTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLPPDAEDPGKEVLPYRLEAAEAPDRPASPMRPRQPLPKQPSDHSYALLDLDALKKKLFLTLKENEKLRKRLRAQRLEMQRMCRRLSAHREGRRKPQAHVRPEQQS	241611	233089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_234501_234741_234936_240688_241191_241572
831768	contig_7285_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_143397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAACAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241959	241693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_241700_242000
831769	contig_7285_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_143396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGTTAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241593	240778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_240800_241600
831770	contig_11978_pilon	-	1304	6	Intergenic	novelGene_63050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	6.87022561492707	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	49	588	1802644	1797292	FALSE	50	TAATAAATACCATTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRGHRALALPGSGRAMGQLIAKLMGIFGNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLTNEVVHTCPTIGSNVEEIILRKTHFLMWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGLPAGLQWMLSQTTAN	1802692	1796575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599_1800748_1801968_1802030_1802598
831777	contig_19680_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_132006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTAGATTAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101971	101570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_101600_102000
831778	SIRV4	-	436	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	161	20	-161	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGTAGCAGTTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
831780	contig_9440_pilon	-	1080	3	Intergenic	novelGene_59110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	824	junction_1	146	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTGTGACTCAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706431	1699908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375
831781	contig_8149_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_169956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAACGTCAATATCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681310	679801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_679800_681300
831782	contig_8017_pilon	-	661	4	Intergenic	novelGene_65379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	268.283846368398	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	15	473	1511273	1496306	FALSE	30	AGGGAAACTCAGAGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKILWKKNEVADYEATAFSIFYNNTLFLFLVIVASFFILKNFNPTLNYILSISASSGLIALLSTGSK	1511287	1496117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1496373_1497435_1497568_1509748_1509876_1511140
831783	scaffold_16539_pilon	+	624	4	Intergenic	novelGene_68421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	10.4243305140746	396	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	75	485	996013	999071	FALSE	30	CAGGATCTGGCTCAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCNSKRFTQKTGHHREEPLGEDSTMQQVPYTRHLSLSIGSSVTIRGRPVVSFNKDPQMQVDFHTGTIQESDIAFHFRVYFGHCAVMNSLQAGGWKNEVRSSHVPFVDGQLFDLRILVLQNEYQVVINGQHCYSFAHRLQPGSVRMMQVWRDVSLTSVDIS	995938	999210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_996022_997366_997444_997946_998158_998957
831784	contig_11163_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_153063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACCTGAATAATGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240198	238002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_238000_240200
831785	SIRV4	-	448	2	NNC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	15	-151	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	31	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAAACATTGAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5143	3788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_4104_5010
831790	contig_2550_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_135633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACAAAAACTCTAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433303	432050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_432000_433300
831791	contig_9934_pilon	+	946	2	Intergenic	novelGene_176979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAATAAATTATGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6112	7398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9934_pilon_+_6214_6553
831793	contig_7138_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_120971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGATCTCAGCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82958	80975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_81000_83000
831794	contig_6503_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_145776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTACCCAGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222859	225059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_222900_225100
831795	contig_5620_pilon	-	646	5	Intergenic	novelGene_161338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	106.373163908948	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	179	646	275802	179621	FALSE	30	GTAAGTAAACCTGGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREEDNKYCADCEAKVTRWIVLPPAKLGPSGRAGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTPEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAVEFFIRDKYEKKKYYDKNAIAITN	275980	179620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_179697_189281_189368_214183_214318_224902_224957_275684
831796	contig_6607_pilon	-	1521	5	Intergenic	novelGene_164217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.9912781852319	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	47	649	443113	288135	FALSE	15	TCTGTCCTACAGGGTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCSSFRSDTTHCSWMEHGDFSGNPSEKSVKEKTVKYMEMLEDKLHSCKNPLLEKVWEADLEACRLFIQNMQLKEARGSLSVEDEKLMGDLEGTAFTAAMAVPSRPLSEDGRRKTPLQADDEWKSQQSPSLHCAGSEQKEESYILSEELGEKCEAIGKKLLYLEDQLHTAIHSHDEDIIHSLRRELQTVKETLQAMILQLQPGREAGETETQLPA	443159	287262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_-_288243_296296_296417_322481_322762_379311_379373_443079
831797	contig_3095_pilon	-	670	3	Intergenic	novelGene_75213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1831.5	105	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	46	483	255481	246561	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEDILTGIASCSSVMSASSLLRVLAACVCLVPLGDLSPSVVLAQLPGHLL	255526	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246706_253609_253806_255384
831798	contig_13481_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_119312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGACTAAGAAGTAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250271	251599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_250300_251600
831799	contig_10861_pilon	+	1792	5	Intergenic	novelGene_39440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41.5112936440193	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	708	1073	2469355	2478785	FALSE	60	TAGGAAAAAAATACATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKHSDSEVACLAREVYTEWRTFMEKHSDRPSIEVRSDPKTEMFRKNAQKLLSEALELKMDHLLVENIERETFHLCSRLINGPYRRTVRALVFTLKHQAEIRAQVKNGLLPVSTFVKNHKK	2432919	2479504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2433325_2433921_2434067_2451187_2451328_2469337_2469532_2478596
831800	contig_7189_pilon	-	1414	14	Intergenic	novelGene_117644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	66.4594016750521	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	141	1412	537152	277762	FALSE	50	GAAGCTCATGAGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIYIQEPPTNGKVLLKTTAGDIDIELWSKEAPKACRNFIQLCLEAYYDNTIFHRVVPGFIIQGGDPTGTGTGGDSIYGAPFKHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKENFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDDGEDQSAEHDEYIDGDEKNLMRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRSEELRKEARQLKRELLAAKQKKVENAAKQAEKRSEEEEAAPDGAVAEYRREKQKYEALRKQQAKKGTSREEQTLALLNQFKSKLTQAIAETPENDISETEVEDDEGWMSHVLQFEDKSRKVKDASMQDSDTFEIYDPRNPVNKRRREES	537292	277759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_277889_305602_305707_311080_311191_396531_396636_501927_502086_505132_505164_506157_506238_520885_520956_523274_523334_524020_524120_526777_526856_529072_529186_532684_532782_537110
831801	contig_3825_pilon	+	469	4	Intergenic	novelGene_77943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3031	junction_3	427.32995318476	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	2	469	12984	14446	FALSE	25	GCACATGACGTGGACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVI	12982	14446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390
831802	contig_14467_pilon	+	1925	3	Intergenic	novelGene_138221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACAAGGTAAAGACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94565	97747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_94875_95356_95639_96413
831805	contig_5338_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_114575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_4	110.674071037439	1672	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	117	659	381792	380867	FALSE	15	GTGTTTAGATTTTTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDVTSAANCTDLLGPGIPSFGKAWGLWALLGAVTLLLFISLAAHLSQWTTGRSRSHPGQGRSGGSVEEAPLYGNLHYLQTGRLSQEPGPEQQEPAPGGPTRAAEEVMRYTSLQLRPPQSRVPSPGAPIKYSEVVLDSEPKAQALGPEPELYASVCSQTRRARASFPDQAYANSQPAPS	381908	380307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_381101_381180_381243_381346_381406_381493_381630_381740
831806	contig_4305_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_136645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTACCGTTCACGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17321	15709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_15700_17300
831808	contig_16391_pilon	-	1240	14	Intergenic	novelGene_176983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	37.834582346073	41	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	851	1045	34532	33412	FALSE	40	ACTTTGCAAGCAATTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTVSSGVSSSSPARVSGTTTFSRGVSSSLQSPKPGTTGTGSGTSVSSEGFKTGTSGTTVIPRSSTTGTTVVSSGIPESSNPGTTKKATTAKTTTAKTTTAKTTTAKTTTAKTTTAPGISTTGCPTTLPPTPVCHGPLGEKKSPGDIWTANCHECTCTAAKTVHCKLKECPSLPTCRTGESLRKFKSNDACCEVGYCEPRTCLFNNTDYEIGASFNDPKNPCISFSCNDTGFIAVVRKCPKQTWCVKKDRIYDSKKCCYSCRNNCRTSPVNVTVKYNGCNKRIEMTRCIGDCKNTLKYNYNVFQLESSCLCCREDNYEYREIALDCPDGTTKAYKYRHTTTCSCLGKC	46485	33216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16391_pilon_-_33569_34494_34604_35480_35521_36463_36575_38088_38127_38461_38625_38713_38746_40635_40666_42539_42660_43153_43199_43780_43823_45238_45293_45893_45948_46435
831809	contig_1996_pilon	+	841	10	Intergenic	novelGene_131897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	172.584565065261	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	98	700	251625	255438	FALSE	5	CTCTCCTGCGTGTTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEEVKLYKNAREREKYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249894	255579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251583_251662_252200_252230_252340_252379_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255113_255349
831810	contig_8650_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_162616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAAGTGTTTTGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97718	97362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_97400_97700
831812	contig_12120_pilon	-	643	5	Intergenic	novelGene_21442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	65.4064217030713	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTACTTTTTAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270419	242280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_242376_251077_251149_254532_254606_269897_270106_270223
831813	contig_6192_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_170325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	853	1197	118162	118506	NA	25	AGCTAGGCAAAGGGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKLPVDDVIEPAGLRDGGVLPADAELGWGLEVKVVGLHGWLAGRWGSVGSRGKAAQLTLLRALRFGILVQAVEHNELVFLPVAGFGVGGALGWRGARGLKDAGILAAAGLCG	117309	119244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_117300_119200
831814	SIRV6	+	364	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	6	337	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831816	contig_7119_pilon	+	1713	6	Intergenic	novelGene_41042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	680	1141	511718	512179	TRUE	15	ACTGCAGCAGCGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLSLVEGESRGGKAAVAGSARESRQWVLLPSAEVHALVHGHVQHGGRHRQGQGEVVRPAEAASEYRTSIPAGRLLGQLQSVDGEAVGAAAHIAPLPLALHVALGLANVGCLDLVAAVALSAELQPGIQVAPFRTVVLATEDSHLFVVEKGHASQSPTLGVVQIAADVLGSLLLLLPDNPSLEGSAPGSTVVAQFGSLISILALEPGSIPAGDARSFARVPEAPAQMQVAQEGQLSALRRGSCSRVGLVLRNGRLAHEARVKEDKAPGRQVEHQEGKEAHRFPAEVPLEFEPELGHSGIIPDWPTGLGWGPGKGWRGTWFPKPLLRMEPLGVFSLIPSVKVTATTRGRGDSSLWLRPRERREPTTLPEVKVSFWVKKGV	477195	580956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_477283_479212_479336_494854_495039_497991_498108_511548_512472_580676
831817	contig_6710_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_89126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653659	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
831819	contig_10058_pilon	+	1541	5	Intergenic	novelGene_67670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	461.550647275031	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	175	597	31601	46303	FALSE	30	GTAAATAGTGTGGAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQRQELRPVAQATLHPQFGALPPWGRAKPRGWLGIPWGAGRGLGGQRWLGQSPGAPAMKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRQEFEADRKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVAVQMEPERLVKILEVLRELPGP	31426	47247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38857_39003_39874_39944_46294
831820	contig_9833_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_68484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	178761	178426	NA	30	TCATGGGTGGCCAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEGLLPESGIWLQSSLGIAWPLVRWSAERKTSPRAQRSVTRSWESGGREPTIIKSKNNLSPTEKHTSSQLRLHGRRAQACCLREPSHSTLALNSADEVLQVTWNQSYNVKE	178762	178380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_178400_178800
831821	contig_2062_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_139058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1422009	1422428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1422000_1422400
831825	contig_11709_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_168232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313462	312836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_312800_313500
831826	contig_11338_pilon	+	741	6	Intergenic	novelGene_6179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	637.217513883603	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	446	715	6086	13590	FALSE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNTSMGCGAGGSRAGVSRAYFCACYLPKEPSRGDSFAGKPPRGPAVSRP	745	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_13443
831827	contig_6589_pilon	-	491	4	Intergenic	novelGene_25902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	133.359164164547	376	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178537	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158674_1177210_1177250_1177927_1178079_1178424
831829	contig_14682_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_139136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAACACCAAGCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174134	172863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_172900_174100
831830	contig_5916_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_158069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749431	748009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_748000_749400
831831	contig_11702_pilon	+	706	6	Intergenic	novelGene_141989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	500.887053136733	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	357	689	383406	384186	FALSE	0	CGGGGGCTCCGGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATSRGLTQPAGARLAPAAADASRFLVCPRARGARSLFPPAEKRRWRRWHLSGPWHSSCCPASPAAQARGLLCCTLTAEACAEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	380972	384203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382626_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
831834	contig_11978_pilon	+	674	5	Intergenic	novelGene_63081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	8	592	1829081	1831883	FALSE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829073	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
831836	contig_1288_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_147912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAAAAAATATGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28395	29127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_28400_29100
831839	contig_8330_pilon	-	1725	2	Intergenic	novelGene_71906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	1212	1724	1213469	1212957	FALSE	10	CCGAGACTGTGTTCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASHRDACSPAKRCSAESSGAGARVEPGAGPGAGVKAEAGTGDGAGAGAGPGAGAGAGAGAGAGEGAGEATAKAGGLGSARLKQATGKGWVRICNPTGTDVGVSTGGAGAGAEVGTDGTTAAGKGAGRRILNFRNMKATELWKLVLGVASAVTGAPGSPGASVTRFFRPGG	1219931	1212955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1213962_1219212
831840	contig_6589_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_26069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.0377492776186	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	178	705	1757916	1763824	FALSE	20	TCCAGCAGCACTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFFSAPMDFRGLPRNYHQEENQERRLGNNTLSSHRQIDKMTDNNTGEVLISEKVVASIEPAEGSFEGDWKVPKMKEKEALVPVQKAVDDFHVEPRPRVAFWIMKLPRRRSHQDTQEGNHWLSEKRHRLQAIRDGLREGTHEDLLHEGPQGSLHPRLPARKAHFLYILRPSQQL	1756572	1763897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1756732_1757897_1758039_1758165_1758259_1763512
831843	contig_12923_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_30124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCCCCATTACCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80675	81062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_80700_81100
831844	contig_7840_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_69051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAAGGGGAGTAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421112	421702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_421100_421700
831845	contig_9177_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_32713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAGGAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577026	578355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_577000_578400
831848	contig_5083_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_151634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGCATAATGAATAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136108	138093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_136100_138100
831849	contig_12292_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_167009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAAGTTGAATCCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304436	305170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_304400_305200
831852	contig_11855_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_67025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCATTAAGCCTTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1905891	1904836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1904800_1905900
831854	contig_6254_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_176985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCGCATTGACAACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138528	137535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6254_pilon_-_137500_138500
831856	contig_15867_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_170891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGAGCTTGCCGCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81273	82967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_81300_83000
831857	contig_9297_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_69818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCATGCGTGGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412291	413937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_412300_413900
831861	contig_6871_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_21643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACTACTCAGATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690157	689505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_689500_690200
831862	contig_15531_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_176727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGGCCTTTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292208	291885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15531_pilon_-_291900_292200
831864	contig_11816_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_98506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGTTAGCAACAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948787	948028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_948000_948800
831867	contig_8914_pilon	+	569	4	Intergenic	novelGene_112864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	154	567	264675	268963	FALSE	35	AAGACGGAAGTGCAACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPTFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHDTFFLAPFLPPFVRRLFLPTAILLLKQP	264521	268965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264687_264838_264950_265588_265797_268880
831868	contig_14450_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_49063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAGAGGGGCTCTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471476	1472967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1471500_1473000
831869	contig_9387_pilon	-	1320	7	Intergenic	novelGene_176986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	24.1275545567488	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	82	1206	136783	128484	FALSE	25	CAATTTGTGAATGTCTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGRRAAAAAAGAAAAAASAKGSRSSLMDHLCEANGTFAIRLLKMLGEEDKSRNVFISPLSISSALAMVFMGAKGNTATQMSQALFLNKDGDVHPGFQLLLTEVNKPGSQYLLRTANRLFGEETCNFLSAFKESCQKFYHAELEELSFAKDTEESRKHINNWVAERTEGKISEVLGAGTIDSLTKLVLVNAIYFKGKWKEQFDKNYTRRMPFKINQDKKTVQMMFKQAKFRIRYVDEVHTQVLELPYVGKELSMVILLPDDDTDLTVVEKELTYEKFKAWTNPEEMTTSEVQVFLPRLKLEESYDLESFLRRLGMSDAFEEVKADFSGMSTEKNVYISKVAHKCFAEVNEEGTEAAAASAVVMNTRSISTESRFCADHPFLLFIRHHKTNSILFCGRFSSP	139576	128369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9387_pilon_-_128889_129367_129521_130615_130759_132170_132289_134579_134718_136615_136794_139505
831872	contig_10581_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_41350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	362.990616269898	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	32	454	74587	87245	FALSE	40	TGAATAAAAACTTGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQAAAFLLLALSAASLAEPVFFKDCGSVVGVIKEVNVSPCPTQPCQLLKGQSYSVNVTFTSNTFSRNSTASVHGIVMGLPVPFPIPEPDGCKSGIDCPIQKDKTYYYVNKLPVKHEYPSIKLVVEWELLDDKGQRLFC	74555	87882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_74669_82742_82851_85033_85207_87087_87146_87243
831873	contig_3700_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_138079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACTTGGGAACTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223443	224299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_223400_224300
831875	contig_6710_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_89603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653773	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
831876	contig_12292_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_167023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438516	439943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_438500_439900
831877	contig_3077_pilon	-	867	2	Intergenic	novelGene_26880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	53	454	1342841	1342050	FALSE	60	AAAAAAAAAACAGTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGRPTSSHLDHSAWAVSATDSGLMSRDARGGPPSLGNSPGPRGWYLDGELPHSVFWALLHVLDADLEGSINFLFCGPVVDTFLLAFSELSEHDNEGHFFLPHHLPEVRHRVGHGALGCNVDLLLPVIALGR	1342893	1341636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1342198_1342587
831879	contig_12324_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_166643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCTCTGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48271	50055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_48300_50100
831880	SIRV6	+	406	3	FSM	SIRV6A	SIRV611	454	3	20	28	20	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCGATCAGCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1382_1468_1535_1640
831881	SIRV6	+	457	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	22	6	22	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	181	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
831882	contig_8020_pilon	-	1662	7	Intergenic	novelGene_114468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.21455025366432	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	316	1044	444810	435556	FALSE	80	TTAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEPGATNSKLLYKASVVKKAAARKRRHPDEAFDHEISAFFPANLDFLCLQEVFDTRAAVKLKDQLHGYFEYILYDVGVYGCYRSHGCCSFKFLNSGLFFASRYPIMEVAYHCYPNGRCSDALASKGALFLKVQVGSTPQDQRIVGYLSCTHLQATTEDSAIRCEQLDLLQDWLTDFRKSTSSSSAANPEELVAFDVICGDFNFDNCSSDDKLEQQHSLFTRYKDPCRLGPGEEKSWAIGTLLDTNNLYDEDVCTPENLQKVLESEEGRREYLAFPTSKSSGAGQKGRKDLLKGNGRRIDYILHGEEGLGPDWKAEVEEFSFITQLSGLTDHLPVAMRLMVSTGEEEA	445125	434937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_435658_435894_436058_437888_437953_438242_438333_439782_439939_440045_440122_444732
831883	contig_11978_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_62839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477179	478293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_477200_478300
831884	contig_3727_pilon	+	422	4	Intergenic	novelGene_146747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	314.271998257702	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGCTTTTAGTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300439	307457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_302506_302663_303623_303706_307336
831886	contig_12107_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_176736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTATGGAAAATTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26006	24916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_24900_26000
831887	contig_9053_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_87962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348259	349613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_348300_349600
831889	contig_2251_pilon	-	887	7	Intergenic	novelGene_128466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	126.577271085908	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	79	573	138003	56508	FALSE	15	TAAAGTTGTTGCCTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD	145219	56193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_56568_66235_66359_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988_138042_145179
831890	contig_8552_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_80081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTGACCAAACCAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487502	486153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_486200_487500
831891	contig_16261_pilon	-	371	2	Intergenic	novelGene_155297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	16	369	46215	45639	FALSE	25	CACAGTGCTTCAGGCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGKPATINCKSSESVDSNYISWYQQKAGQAPKLLIYGASDPASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSFQAEDAAVYYCLYGYGYSYG	46230	45636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16261_pilon_-_45944_46166
831892	contig_7695_pilon	-	166	1	Intergenic	novelGene_41650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATAAACATTTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805618	805452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_805500_805600
831893	contig_13481_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_119281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166845	165329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_165300_166800
831894	contig_9797_pilon	+	564	3	Intergenic	novelGene_65579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.5	144	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	428	544	192010	192126	FALSE	5	CTCTGGAGTTCTGCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESPCPAIRTGRAAQELQDKHPEPLRVATTLGPPHGGGQYGSGVPPGGGYGGPAPGGPYGPPAGGGPYGPGGLTSGTPGGPYGGAAPGEPLWSATSKLLQCPAAWALWAGTCCPCLGNLDSVLPGYLWPGYCSPSLHFHLPAMLCLALVPRGQLPPPTANVFIFFLFAVFSFGAKSLVKL	172533	192146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183982_191917
831895	contig_3382_pilon	+	1199	2	Intergenic	novelGene_124021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	525	junction_1	0	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	2	568	163525	167869	FALSE	50	AAAAAAAAATTGTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGIDLTATAFRLVAILKKKCAHCADICQPHVLEGPVEAEGPGCVFVWVGTCSFSASLVFSCRVSCAESADKLLVYWLCFDSMKFGVFPARRLSTASSVTKPPYFILTTEWVWYWTDQTGTWQEYGKQGTQHPVATVSSPELEKAYLAYCTPGSDAQVATLKFKAGKYKYELDFKGIFLTPSLHPRNP	163523	168500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_163909_167686
831897	contig_10904_pilon	-	248	3	Intergenic	novelGene_22572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	4	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGGTGGGGGCCGGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419266	413697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_413829_417965_417999_419182
831898	contig_8587_pilon	-	924	3	Intergenic	novelGene_159129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	25.5	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	179	766	325655	319457	FALSE	40	AAAACTCTTGTATTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETRGVHKAEPGSPVRVSAARGLPRPEVPHDRRSLPVRSLPWPEVSRGPRSPRPRGQPTMRLRSPGLFLLLLSGLQADIQKKEEVQGIVGSSVELNCVYPEGSSFDLNDFYIYWQTAMPETVVTYYLPGNTSPRYKDNRYQHRAQLSLDSMEQGNFSLRLYNITPQDEQTFHCLVFQKSLELKKVLQVNVTLHVAGETTEAKRTDFIPALHTGESLGGASGKHIQLLTGRLAVQVHPEAPRKKGLAIYFQKISH	325833	319298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_319990_323141_323183_325641
831899	contig_15353_pilon	+	2124	4	Intergenic	novelGene_151994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	272.193966787575	6	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTGTACATCTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540834	544850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_542421_542934_543283_543791_543881_544749
831900	contig_13074_pilon	+	1020	3	Intergenic	novelGene_153427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_2	739	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	247	405	451016	451174	FALSE	25	CTGTTTGCAGTTAGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403753	451789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002
831902	contig_16578_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_148638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTGTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137861	136494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_136500_137900
831903	contig_15327_pilon	-	707	5	Intergenic	novelGene_70633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	4	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	124	522	901528	898755	FALSE	20	GCTGTTTAAGTTAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRLSPSVCSLLGFVRIC	902151	898569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_898803_900963_901033_901126_901281_901400_901536_902035
831904	contig_2733_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_128580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	258	596	749631	749969	NA	70	GTTAAAAGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLSMHGFETSCIRHLENVGSVSYIHLSNVDTFHCTLFTEITFINITTYIEKSLSIGKLPHSLWKIQVFQNNDPYLKTQILSLATKLSIVFLEVAGLFCSFVRKRLPNTQV	749373	750977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_749400_751000
831905	contig_4891_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_124509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAACAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26102	27530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_26100_27500
831907	contig_5499_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_56980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTACAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229905	231070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_229900_231100
831908	contig_17769_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_124258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAACGAGGTCAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95011	94618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_94600_95000
831910	contig_15888_pilon	+	338	4	Intergenic	novelGene_84434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	75	264	338	254028	254235	FALSE	30	GAGGAAGACGCAGTGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSLLVNKGQGQGVGAIAHVRAGVRAHVQVCDVQFRPRLRGAHQEPALGAVHDDLLLGVGLLEPDPVGDGREGVRLALEHNVLALIGMLRLFHGYDSREALHVNAGPARDLG	251599	254235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_251637_253552_253678_253926_254065_254197
831912	contig_10765_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_122912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACACAAAGATTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160669	159489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_159500_160700
831914	contig_12010_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_160939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTGTGTCCAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98569	99125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_98600_99100
831915	contig_7376_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_108104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCACAGCAGCTGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335979	337007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_336000_337000
831916	contig_7411_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_137014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAAATTGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329105	330921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_329100_330900
831918	contig_10197_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_115271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	97	336	1139091	1138852	NA	75	ATTAAAAAAAAAGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNQKVGSSKPPGGVSEDRPGHLLPKDHSLENPMESSSTLQRMGLPYVRIGFGFLFVPHAGRGMGVIKVGGPATDMQADPSSGLLTAAVTLPVGWGAIHLTLKQSRKVVLGP	1139187	1138637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1138600_1139200
831920	contig_5936_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_53577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCTACCATCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309818	309321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_309300_309800
831921	SIRV6	+	352	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	521	0	355	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
831923	contig_16185_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_144727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTATTTCCGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57165	58675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_57200_58700
831924	contig_12050_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_62777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATCAGTACATACTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933146	931774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_931800_933100
831925	contig_10627_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_59963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATGTTAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193739	193111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_193100_193700
831929	contig_5628_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_157566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTGAGTGGCGGGTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100545	101215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_100500_101200
831930	contig_4686_pilon	+	1298	2	Intergenic	novelGene_118507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAGTACTTATTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397655	413411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_398633_413090
831931	contig_10855_pilon	+	1968	11	Intergenic	novelGene_124280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_7	23.7463681433604	33	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	120	1856	39910	47308	FALSE	35	TGTTTCCTATGTAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLTIPPTPPGPPAMDLEEPRDTLAPSQDLAPVCPWDPVLGAPSGLNPMDFDGSGVQDLVQRFEALPGDLGGLFSEGAPCPLHIATGHGLPPQDIADAHGLLSAEAERGDLLSLLCRDECLPSQPCPQGSPEPAPRLLQPPDDPDEDTSLPEWAEGASAGQDGSRSSDSSPEPWLETVPLVRPEEPPATAQCPKTLASYPARQEVPGPCDHEDLLDGVIFGAKYLGSTQLVSERNPPPSTRMAQAQEAMDRVKAPAGETQPMTEVDLFISTKRIKVLTADTQEAMMDHALQTISYIADIGSMLVLMARRRVARRPTPHDHSRRLCKMICHVFHSEDAQLIAQAIGQAFAVAYSQFLQESGIDPSQVDARQSQGAEGPGHLHNGDLAHFSNSENCREVRIEKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLQHGGPAERSGALSIGDRLTAINGASLVGLPLPACQAAVREVRPQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAERGGVRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAHSEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL	38955	47420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_39038_39872_40486_40561_40602_44312_44459_44573_44661_44749_44912_45468_45649_45744_45958_46810_46931_47013_47155_47236
831932	contig_4364_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	8	172	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3	389	1244247	1238195	FALSE	5	CGGAGGCCTCCGCGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAGPGSGCGSLGSGDWSACTWGAGLEGGWSWVPDVGGGAPASLVSCNAELPWEVTEALPPFPTYSLPSTLSDESSLGTLSFGCVTSLKAPGYEGEDQVLERRGHLALGGQRRELWHLPDGFQRLLSRL	1244249	1237625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1238199_1243254_1243381_1243990
831933	SIRV5	+	335	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-30	900	-30	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8285	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
831934	contig_6266_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_170998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTGTGAGGGAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784510	782631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_782600_784500
831935	contig_5649_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_82396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATAACTGAAAAGTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169836	1169394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1169400_1169800
831937	contig_11026_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_167683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTAGACACGTAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270387	269228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_269200_270400
831938	contig_6503_pilon	-	1317	8	Intergenic	novelGene_145756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_6	111.884415576878	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	52	999	134980	118803	FALSE	15	TCCTCTGTAGTTCAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRADIEVACYGYEGIDAVKEALRAGLNCSTETMPIKINLIAPPRYVMTTTTLERTEGLSVLNQAMAVIKEKIEEKRGVFNVQMEPKVVTDTDETELARQLERLERENAEVDGDDDAEEMEAKAED	139797	118484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
831939	contig_9727_pilon	-	1015	5	Intergenic	novelGene_86321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	273	344	314385	314314	TRUE	60	TTTGGAGAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIFIRKPHLVSASLTQNRDWVASKSPTAFIFHPLLRTEDEGWGGVRQSLKCPLLDPREFTLPAICPTVPQWGTRGPSGLKAVTKGVPVCMASGWNQGGSQTPRPLGLFLHSG	314657	309190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_309345_309986_310088_310904_311013_312911_312996_314089
831940	contig_6958_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_69958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCGCCCAGTCCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191436	191128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_191100_191400
831941	contig_10258_pilon	+	773	5	Intergenic	novelGene_155056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	13.4721935853075	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	128	772	116998	140363	FALSE	30	TTTGGCTGTTAAAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAGSLGSWSENILEHFLRNNQITTKDGAEITWYHAANHKAQMNEALKSTAHMIEADVFLPDDGSEHGQPIMAHPPETSSDNTLQEWLAEVVKSDKGIKLDFKSLAAVEPSMMLLESVKRHLKRPVWINADILPGPNGNGRVMDAKLFIDTVTSFFPDVTFSLGWTTGWHPQKVNEGYSWTMVKEMEFICHELNQPVTFPVRAALVRQSCSQL	116870	140364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_117023_123574_123701_129385_129552_133953_134172_140253
831943	contig_709_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_57617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTTCAACAAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2427434	2426044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2426000_2427400
831944	contig_7171_pilon	-	1116	9	Intergenic	novelGene_101387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	808.911836589749	106	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	60	1115	1374715	1363363	FALSE	40	GAAAATAACTAGAGCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRLEQRQQPDEQRRRAGAMVKMAAAGGGGGGGRYYGGGSEGGRAPKRLKTDNAGDQHGGGGGGGGGAGAAGGGGGENYDDPHKTPASPVVHIRGLIDGVVEADLVEALQEFGPISYVVVMPKKRQALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQKISRPGDSDDSRSVNSVLLFTILNPIYSITTDVLYTICNPCGPVQRIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKPTRLNVFKNDQDTWDYTNPNLSGQGDPGSNPNKRQRQPPLLGDHPAEYGGPHGGYHSHYHDEGYGPPPPHYEGGGELMSPKINLHFKKIIVHVIFPPVHTFVTPMYSWHISIKLF	1374774	1363361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363492_1367051_1367123_1367233_1367306_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690_1372810_1374544
831945	contig_4684_pilon	-	649	4	Intergenic	novelGene_175433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGCATGTAATTTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237393	234460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_-_234526_235078_235164_235500_235601_236994
831946	contig_4684_pilon	-	813	7	Intergenic	novelGene_175432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGGAATGGATACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228041	208793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_-_208888_212043_212193_214406_214543_215886_216016_226523_226617_227693_227853_227988
831947	contig_5947_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_101590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTATGCTTTAATAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881662	882477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_881700_882500
831948	contig_3233_pilon	+	1038	10	Intergenic	novelGene_56554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.44969797643	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	181	930	740857	747909	FALSE	45	GAAAATAAACGCACTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738712	748017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738768_740577_740664_740817_740917_741759_741848_742802_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
831949	contig_5640_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_27259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166010	167001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_166000_167000
831951	contig_10324_pilon	+	981	2	Intergenic	novelGene_7901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	470	748	790889	791167	FALSE	25	CTTCTTTTCCCACTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETLRRVLIAGCAAGPAEENVAEAGPPLLLLGGPGSGKTALLFAAALEVAGEGRGPVLFLARKPLQSLPLRTEAALDPLRLQKIRFQYPPSTRELFQLLCSAHEAQLPAPALLLLDSLEEYLSEHQGPHEAAHLAALLLDTAAHFSHRAGPGRGCGLMVALQAQEEADSGDALQLALLHRYFPACCWLQRDAPGPGQHCLRACLEPGGLGPRTEWLVAFQPDGEMMITPLSTEVGDRSFDKGTSSGGQP	789880	791400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_790125_790663
831953	contig_1624_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_138373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGTATACAATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98399	97779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_97800_98400
831955	contig_1624_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_138372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTCTTTGTGGGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97076	96340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_96300_97100
831956	contig_987_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_72303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCACACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955053	954567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_954600_955100
831958	contig_10494_pilon	-	645	4	Intergenic	novelGene_102192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	28.9942523039768	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	227	364	1056716	1056579	FALSE	15	GTACCAGCTGCTGTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGDGRVRATAGGTADPQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1059306	1056297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057258_1059254
831960	contig_12622_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_5830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACACAGATAAAGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429833	429182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_429200_429800
831961	contig_12128_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_131967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	61	327	140540	140806	NA	60	AAAAAAAAAATTGCATTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVKFIRQETKQKIYNTELTMLLALCLPSTLRNIDFQEKTSILYHGRSSQPPFPPSSPNTSYLHPTFQSTYTSQCLTAAWIFSQALSLFSGSPLPRLLLLIRQTHTHL	140479	142133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_140500_142100
831962	contig_5727_pilon	+	1528	4	Intergenic	novelGene_7983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	44.6392950959876	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	125	613	461775	480384	FALSE	25	ACATTGTAGGCAGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGLSGCLGWRRCRRERDALKLGNYVNEATSFLDFARHHVIMGQQISDQTQLVIGKLPEKVARHVTLVRESGSLTYEEFLGRVAELNDVTAEVAAGQEKHLLFEVQPGSDSSALWKVVVRVVCTKINKSSGIVEASRIMNLYQFIQLYKDITSQAAGVLAQSSTSEDPDESSSSVTSCQASLWMGRYNMHNDCVSLLFQFASY	454016	481299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_454086_461719_461918_466848_466958_480147
831963	contig_16098_pilon	-	600	2	Intergenic	novelGene_46249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATTTAGAAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827019	826323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_826751_826846
831964	contig_6870_pilon	-	1471	6	Intergenic	novelGene_103940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATGAAAGGATAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187959	1178531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1179086_1182793_1182935_1185739_1185938_1186568_1186721_1187407_1187575_1187700
831966	contig_6842_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_130677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338519	337151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_337200_338500
831969	contig_5217_pilon	-	637	6	Intergenic	novelGene_135778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3443.44208024471	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1	597	560395	557689	FALSE	15	TTATTCTATATCTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPASAEGWAQAPQDRGQEKALPQEAEIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	560395	557648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559892_559947_560368
831970	contig_5988_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_16157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1110	1460	1977773	1978123	NA	35	GATTTTTTCCATTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCEEWWALVVTAVQLTLTSQLKLSCVVDHSAFLCYCLCVYIYEAEKRLSSLRVQKTKTKPTAIESILTHSNRIGWSRAVPQGFQGFKSFFTEGDCHIFLPQRSWWVRTADLLVSS	1976663	1978208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1976700_1978200
831971	contig_8310_pilon	-	772	3	Intergenic	novelGene_75537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	5.5	272	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	327	641	177912	169903	FALSE	35	GGTTAAGTATCTTGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHETYKSRKDLDADTSPSMSLSLCLCASSFSQRELQTPGGRETSARMHPVLVTDVFQLTPSAGRSFLFSRKSQHSASGSTSWSCSDGSRGSDPTTKKSGSRQ	191763	169771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_170093_177787_177959_191483
831972	contig_5201_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_82195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTCAGCAGTGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409114	410430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_409100_410400
831973	contig_3948_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_53261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333730	1334845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1333700_1334800
831974	contig_10196_pilon	+	1508	2	Intergenic	novelGene_132039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	190	318	600599	600727	TRUE	25	GCAGGCAGGCAGGCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLKIQSENVPNATIYPGQSIRELPLFFNFPPPRDTWELAYIPSRSDAARTVTETVKKALVINMRGEVTGWGGGPGRRAWSCGAGPPLPPRGVHFLCDDVSMAVG	600409	601981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_601898_601961
831978	SIRV1	-	182	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3922	0	3648	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
831979	contig_8204_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_177000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGTTGTATTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28313	26601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_-_26600_28300
831980	contig_1009_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_121738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184584	186245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_184600_186200
831981	contig_11052_pilon	+	695	3	Intergenic	novelGene_115464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2262.5	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	102902	107503	FALSE	35	CTCTTACTGTATTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKPSALSRYILFLGWAQPP	102868	107763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107449
831984	contig_6673_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_164016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74874	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_73400_74900
831985	contig_7171_pilon	+	1114	10	Intergenic	novelGene_101341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	58.0206434101553	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	12	776	1301684	1314924	TRUE	20	AGAACCTGCTGACCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQPPGDDVARKSWYLRNIITRYQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGCSLVNELAFTARKLMADEALSIGCSQTRRPCLTQPSP	1301672	1315444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314451_1314541_1314607_1314874_1315023_1315204
831988	contig_5732_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_119574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGCATTTGACATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100198	99243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_99200_100200
831990	contig_5428_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_160419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTCCTTTTGAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177283	177881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_177300_177900
831991	contig_5428_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_160420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGCTTAATAGCGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178936	179934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_178900_179900
831992	contig_13526_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_165203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAAATTAGTAATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177136	177887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_+_177100_177900
831993	contig_1337_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_84238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGCTGCTAACCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420080	420474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_420100_420500
831995	SIRV6	+	302	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	337	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATCTACGCAATAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856
831997	contig_3469_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_34242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTATTTTGCCAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660053	658705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_658700_660100
831998	SIRV4	-	367	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	3	1151	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
831999	contig_5894_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_83042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425279	426473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_425300_426500
832001	contig_4908_pilon	+	1397	6	Intergenic	novelGene_117379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_5	28.9067466173556	27	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	202	1131	228376	247054	FALSE	60	AACAATATAAGAAGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGIALPIRDAIYHCREQPASDWPEAVCLLIGRQDLSKQACEGNLPKGKSVLSSDVPSGTEAEEEDDGMNDMNQEVMSLIWSEDLRVQDVRRLLQSAHPVRVNVVQYPELSDHEFIEEKENRLLQLCQRTMALPVGRGMFTLFSYHPVPTEPLPIPKLNLTGRAPPRNTTVDLNSGNIDVPPNMTSWASFHNGVAAGLKIAPASQIDSAWIVYNKPKHAELANEYAGFLMALGLNGHLTKLATLNIHDYLTKGHEMTSIGLLLGVSAAKLGTMDMSITRLLSIHIPALLPPTSTELDVPHNVQVAAVVGIGLVYQGTAHRHTAEVLLAEIGRPPGPEMEYCTDRESYSLAAGLALGMVCLGVSTAVPSDSSVTTAAC	214597	247320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_214745_228321_228537_231261_231381_234635_234908_244497_244733_246911
832002	contig_5649_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_82425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	419	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	109	489	1420787	1420407	NA	15	GCCTCTAGTCTGAGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQMLSGWSNLLIYCFLKKKQVCIYRQLLICNFFLETKYVFIDCVSRAAEPWKFFLLGLGGGRCPSTDQPGSPKAKAPGLTEAQPQGFWMILFLPPASASPSVHWMSPLNAGFPGLWAQVQVEPA	1420895	1420169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1420200_1420900
832004	contig_8616_pilon	+	642	4	Intergenic	novelGene_72521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	37.4195433192633	416	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	52	423	347998	349283	FALSE	30	GATGTGTGTGATTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPGGKINRPRTELKKKLFKRRRVLNRERRLRHRVVGAVIDEGLITRHHLKKRASSARANITLSGKKRRKLLQQIRLAQKERAAMEVEAPPKPSRTNEPQPKRQKQTKAPQDVDMENLEDEI	347946	349502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_348037_348207_348333_348990_349089_349173
832007	contig_12622_pilon	-	1009	4	Intergenic	novelGene_6017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.9938250421547	375	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	65	412	1657353	1656758	TRUE	25	TCCTACGATGTTGTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSFFYPRALITCAASLQEKSPMRVKPEPKWLENHPGDLQGKGLEKESNLPEVAEQVPDPQGAAENGGERKGADSKQGLRSLPSLPHSRWRSGRDEVPQRRNQRMRSAESRAGTQNGGSGAGEGEAEAAKQAVEQNV	1657417	1654369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1654834_1656176_1656281_1656728_1656997_1657244
832008	contig_3942_pilon	+	326	4	Intergenic	novelGene_128772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	32	325	793521	795179	FALSE	25	ACGCACCCACTCACACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGRAVDAEMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRK	792283	795180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
832009	contig_8241_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_157488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228193	227915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_227900_228200
832010	contig_12605_pilon	+	366	3	Intergenic	novelGene_64209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1966.5	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3877	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4307_4831
832011	contig_15323_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_148529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCACATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129545	128243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_128200_129500
832012	contig_10627_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_59998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGTGAAGAGACAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304063	303070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_303100_304100
832014	contig_8773_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_74531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGCAAATGAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56880	56276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_56300_56900
832015	contig_6361_pilon	+	557	6	Intergenic	novelGene_24010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	232	555	415471	436325	FALSE	45	CACCAGAAGAGAAAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQTVITDGSRDAIFGPVVGPHCDTCSTQTAFIHVTSNLTCKALNAKCSTKTDFAIGEAITQASVPVGGLDWRTTPRLRHNDHLGRLHFQCRLLKALQEMSPGLGQN	410949	436327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411033_411144_411212_415389_415503_419464_419589_420868_421002_436290
832016	SIRV2	+	394	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	17	112	17	-112	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTGGACGACCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	1519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1500
832017	contig_3825_pilon	-	881	2	Intergenic	novelGene_77977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	424	849	140747	140322	FALSE	25	AACGAGGGGCATCTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCGLGALRPGELAHSFRPHQVLPACGEHLRPAGAFLLLCCCLPGEPGVHRLLCARDQGPVAGADRVLLPHTEVVLPALGQVPAWEGQHQPAGHSTARSLQLGPGGHSRVQEDWPERAGPRQTPVLAGQAGLLSTLAPAQAAMLVDTRARPWGGSGHGCRTLTGVQEQGPLGDLGPHCLLMEPMAHSQSLMGSAVRTEGAQVGGGAATPSRCPGPHSRHQQASRRWGGWQGSVLGRAWWTPQGMFLTPRGQGMGPRHGLHQPASGTRALSYSHLRIVFTQLTK	142119	140289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_141092_142040
832018	contig_854_pilon	+	695	5	Intergenic	novelGene_36471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.5412687787881	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	251	445	1517484	1526706	TRUE	25	AAGGGTTTGCACTGTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHGRWAPLTSGALQSPQCHPGGLAATLSPARTVHTTRVCTTTFNIQDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG	1513677	1527486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513685_1514629_1514830_1517440_1517565_1526592_1526767_1527296
832022	contig_15939_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_160254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACACATTTTTATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60303	59971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_60000_60300
832024	contig_593_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_102017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395359	396758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_395400_396800
832028	SIRV6	+	471	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	12	2	12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTCACAAGTCAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
832029	contig_5959_pilon	-	1717	4	Intergenic	novelGene_150189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_3	134.514765814844	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	589	1698	216308	211902	FALSE	15	TTCAGCACTCAGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218727	211882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218222
832031	contig_10861_pilon	-	1355	1	Intergenic	novelGene_39290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGAACTCTAGCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356306	1354951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355000_1356300
832032	SIRV2	-	332	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4541	34	3366	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
832034	contig_401_pilon	-	739	5	Intergenic	novelGene_42777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	682.840162483139	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTCTTGAGTCTCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086599	1079532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1081766_1082304_1082383_1086068_1086252_1086575
832035	contig_5586_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_143585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATGAAACATCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424491	425564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_424500_425600
832038	contig_19378_pilon	-	848	3	Intergenic	novelGene_73781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	313	junction_2	36.5	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	18369	18070	TRUE	20	GCTTTTTTCAGAATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRSRSRSRSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	18370	16001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16440_16937_17040_18062
832039	contig_6410_pilon	-	1143	5	Intergenic	novelGene_108659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	18.5388106414624	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	228	575	524059	518668	FALSE	70	AAGAATTAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTGILRRVDEATFSKIPIGFIPLGQTSSLSQTLFAESGNKVQRITDATLAIVKGETVPLDVLQIKGEKEQPVFAMTGLRWGSFRDASVKVSKYWYLGPLKTKAAHFFSTLKVSETCSVETRPVVLCSCHCGMCVFGIRLHSLLWIYMTRSTAEMGQICLYANAESIPVSISNRPLSANSFPPQPNLVNF	538833	518099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_518963_524006_524087_530041_530112_537091_537187_538798
832040	contig_4857_pilon	+	1596	3	Intergenic	novelGene_48723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATCCTGTAAATAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178668	1213522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1178959_1181941_1183162_1213436
832043	contig_10734_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_50989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATAATCCATGTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304612	303025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_303000_304600
832044	contig_15752_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_148783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGAATAGTGCTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353287	354205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_353300_354200
832045	contig_8617_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_73443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACAAACATAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62466	62044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62500
832047	contig_13048_pilon	-	737	2	Intergenic	novelGene_138920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	405369	405055	TRUE	35	GGGGAGCAGGGAAGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSAADGPSSGPGTRVWQGSLTLGGLGFSGGSTGPRLPSGDQQGRPSLQDTSGGVDIAGWTRLVELTLGPVPGSVLPGLGPSLEVTAFCELSVPADEDDGAELER	405369	403986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_404237_404882
832048	contig_13048_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_138919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	304	624	403632	403312	NA	20	GCACGTCTCAGGCCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRQGRECRGRRTGPSGAKTRRPQEHARPGRRCSRCFLRRPRSCDASWGDEKARAGTHGPARGRSIDGPTDRPRQEVHSSRGGRPIVRWRRWFSARGPEGGGTRK	403935	403271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_403300_403900
832049	contig_14041_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_144030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACACAGAGTGATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26785	27452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_+_26800_27500
832050	contig_10864_pilon	+	1287	2	Intergenic	novelGene_107064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACTCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826718	828111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_827162_827267
832052	contig_8616_pilon	+	964	2	Intergenic	novelGene_72541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	63	344	410601	412303	FALSE	30	AGTGAATTACTTAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKRVLVEAEVLVFCRYLKVAMAAVDSDVESLPRGAFRCCLCRITTANRPSLDAHLGGRKHRHLVELRAARKAQGLRSVFVSGFPRDVDSTQLSEYFQAFGPVASVVMDKDKVQ	410538	412923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103
832054	contig_6441_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_172895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAACTTTATAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339011	340706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_339000_340700
832056	contig_5770_pilon	-	512	4	Intergenic	novelGene_74171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2618.28837220043	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	34	474	264028	261935	FALSE	15	GAATGTTGGTTGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264061	261896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926
832057	contig_8303_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_154921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTACAACAGATGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29810	30195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_29800_30200
832058	contig_3270_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_104497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	185	487	346938	347240	NA	60	AATCATGTAAAACAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKENKVGGFTLPILKHIIHGPNNMLSASVLPPSLLCSAWFFKVCKRSFKVQQLVSIHLEQQRKKESQEEKEMEFVTTCLHEQLPPFAMRAEELGGAWLP	346753	347774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_346800_347800
832059	contig_8594_pilon	+	1846	15	Intergenic	novelGene_140033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	8	340	331837	335716	TRUE	35	ACTGTAGGAAGTCAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMGLAVIPREERKPDLHACAATAQPQGLQQVALLLICSTGSPDVLHRLGQDNRGAEGQKFPLTGVALLLADLGAGPVPLHHDELSCEIEHNALCVPSLLWHFQGDSVLCAH	331829	359801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_332008_332395_332512_335670_335811_336715_336877_337679_337769_338814_338927_339218_339258_344793_344998_350434_350588_352325_352375_353403_353552_355995_356084_358812_358903_359253_359391_359659
832060	contig_10734_pilon	-	593	3	Intergenic	novelGene_51059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAGGGAAGCAATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437067	435219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_435652_436053_436128_436980
832061	contig_10779_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_165524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAATACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85169	83644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_83600_85200
832063	contig_15063_pilon	+	619	2	Intergenic	novelGene_14462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	70	480	36142	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36072	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
832065	contig_10490_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_169885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	360	353	712	31223	31582	NA	10	CTGTGTCGCCGACCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLYFGYLQIKARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDDWPHSDLSCQVCGILLYENIYISVGFLCCISIDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVSISVVIWTKELLTSIYFLMHREVIVDKDQHRVCFEHYPIQAWQRSINYYRFLVGFLFPICLLLVSYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLVLSTVVIFLACFLPYHMLLLVRSLWESSCEFAKGIFNAYHFSLLLTSL	30870	31584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_30900_31600
832066	scaffold_19766_pilon	-	955	7	Intergenic	novelGene_34317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	452.575101195616	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	178	768	621659	596588	FALSE	30	CCTAGAGAATTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSEKNLQPVASTTTQGPTTTTTAELGVDERSSVPGLLSLGAKVGVAVACAAFIIAMLGLMIFLRCKRRKGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKAHLDSSQGQDTDPKLDHKVRRPNEWDGPLHLNQD	622175	596400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596631_596911_596973_597196_597247_598328_598360_605098_605300_621454_621815_622153
832067	contig_10855_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_124331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCGCAAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517702	517177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_517200_517700
832068	contig_8980_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_73996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91089	92248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_91100_92200
832069	contig_7057_pilon	+	494	3	Intergenic	novelGene_123318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936019	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936217_941401_941523_943539
832070	SIRV6	+	413	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1847
832071	contig_3233_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_56534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTTGTAGTTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708328	709664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_708300_709700
832072	contig_16525_pilon	-	430	5	Intergenic	novelGene_133874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	1648.25868342927	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	55	429	181436	178220	FALSE	25	GTGAGTCCAAGAAGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRR	181490	178218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181250_181388
832073	contig_6375_pilon	+	843	4	Intergenic	novelGene_72926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.274551494344	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	15	575	16563	30099	FALSE	35	AAAACTGCTGGCAGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLEQQPQGWLSSWLPTWRPTSMSQLKNVEARILQCLQNKFLARYVSLPNQNKIWTVTVSPEIKDRTPLVMVHGFGGGVGLWILNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPPAQGPLGSLEQAESPVLISYKMVLTA	16548	30367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16586_20907_20997_22327_22694_30016
832074	contig_3241_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_146384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAGTAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728958	730644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_729000_730600
832075	contig_14871_pilon	-	1162	3	Intergenic	novelGene_63733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	276.5	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	107	436	289605	288466	FALSE	25	ATACTGCCAGATGCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	299873	287739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_289607_299768
832076	contig_14882_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_115037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGGAAAGCGCAGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352233	353416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_352200_353400
832079	contig_9571_pilon	+	1082	6	Intergenic	novelGene_136314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.6469776873856	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAACGTCTTGCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592830	682639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_600426_600593_601528_601830_602258_602382_617948_618059_682381
832081	contig_5643_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_38727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCATCCCCGTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138713	137474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_137500_138700
832082	contig_17198_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_62439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCGCTCCCTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296534	1297924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1296500_1297900
832083	contig_7080_pilon	+	868	7	Intergenic	novelGene_100116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	118.539374611702	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	3	602	527296	540726	TRUE	40	ACTAACAGAATGGTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	527293	542210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540891_542108
832084	contig_5084_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_64529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGTAAAATATAAAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477439	476739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_476700_477400
832085	contig_8712_pilon	+	1328	3	Intergenic	novelGene_58732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	173	95	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCAAAAAAAAATAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63474	75629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_63591_73583_73686_74519
832086	contig_4884_pilon	-	1586	1	Intergenic	novelGene_63814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCATAAAGGTACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564892	563306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_563300_564900
832088	SIRV5	+	367	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	43	7473	-5	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTAGAGGTCGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051	3518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
832089	contig_14225_pilon	+	2016	3	Intergenic	novelGene_52736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCAGAATATATACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154681	160421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_154822_155301_155512_158755
832090	contig_3469_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_34229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAGCAGTGAGTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620060	619320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_619300_620100
832091	contig_14954_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_165177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78839	79716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_78800_79700
832092	contig_10953_pilon	-	520	5	Intergenic	novelGene_42550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATAGGAGAAGGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426298	419995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_420028_422504_422665_423208_423364_425212_425305_426217
832093	contig_11145_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_160527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAAAAAAAAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165546	167798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_165500_167800
832094	contig_13224_pilon	+	1657	9	Intergenic	novelGene_104068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	36.7438345168274	9	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	116	1243	70006	95287	FALSE	30	AAGAATTTGCCATGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHEAMDYDVQVQSDHHAAEEPPPADVVSSQAGLPLLQPAPQVSIDLTEEVELSGEESVENIDPGTSEEDRRGSGANPTVHVSSLESVNTFISGLQRLHGMLEFLRPPASNHSVGPVRVRRRRGSAPHRARPGGSQRTDSARSRASLDAFFQVSRTQPHLSADPYPETRNPVSEDLQVSSSSNSDSDSSAEDEEEPGAVILEVSGNNLAEPPGGTSAEQEVICIDGGEVLPKQSSQKSNPLLSSEPADEEDGDTCTICLEQWTNAGDHRLSALRCGHLFGYRCISKWLRGQARKCPQCNKKAKHSDIVVLYTRTLRALDTSEQERMKSSLLKEQMIRKQAELESAQCRLQLQVLTEECTKLHGRVQELQKLIVQQ	63659	95701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_63773_70003_70431_72492_72675_75130_75223_79458_79651_79762_79855_82086_82202_82704_82730_95282
832095	contig_17127_pilon	+	2172	3	Intergenic	novelGene_168289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATTAATAAATGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3532	41482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_3804_39221_40886_41245
832096	contig_6848_pilon	-	805	5	Intergenic	novelGene_174870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAGTCCCTGGACGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45013	43234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6848_pilon_-_43382_43581_43704_44104_44242_44330_44525_44808
832097	contig_6848_pilon	-	1629	13	Intergenic	novelGene_174869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATGGGGAAAGCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39905	9377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6848_pilon_-_9455_13971_14054_15671_15825_17948_18025_26240_26453_31331_31431_33702_33837_34657_34719_34999_35087_35548_35757_36819_36961_38829_38960_39736
832098	contig_14676_pilon	-	761	2	Intergenic	novelGene_175165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	18	680	56785	43825	FALSE	25	TGTGAAGTGCATACGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTSRMAAGCPQVPGPTAASEGPVVGPAGVLPCLELPTYATACALVSSRYSCLVAGPHRRHIALSPRYLNRKRTGIREQLDAELLRYSESLKAKCSEVSEEVTETITEEAVEKPPKRKKKRKEDQYTCGSILVEDGTAELLDVTTKEETDLQTNNNVDGLWVEESKKKKKKRKHQEDQDQDPVFQGSDSSGYQSDHKKKKKKRKHSEEAEFTPILEHSPKKKRKK	56802	43743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14676_pilon_-_44234_56531
832099	contig_10769_pilon	+	1544	13	Intergenic	novelGene_177006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	30.2612467614201	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	23	1174	692783	753776	TRUE	25	CACCACCCCGAAAGGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQSLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFSCLGELGSIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYITKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKANRPQGKWMKTSLWL	692760	758866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10769_pilon_+_692822_725468_725558_726951_727137_731239_731405_736248_736311_737232_737314_741922_741992_745428_745550_749459_749617_751873_752013_753731_753908_755173_755354_758807
832100	contig_10769_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_177007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763296	763703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10769_pilon_+_763300_763700
832102	contig_6589_pilon	-	561	6	Intergenic	novelGene_25854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1277.55400668621	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957805	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956114_956706_956815_957251_957360_957758
832103	contig_2596_pilon	-	2685	18	Intergenic	novelGene_53457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.79495001104821	20	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	25	921	589239	566461	TRUE	30	GAAAAAGACTTGGGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTRGCFFTREQYMELVYRGLTDKVGRVKIFPPAILKPFPLWTGKQVVSTLLINIIPKDHIPLNLSGKAKISGKAWVKESPRPVPGFNPDSMCESQVIIREGELLCGVLDKAHYGSSAYGLVHCCYEIYGGETSGKVLTCLARLFTAYLQLYRGFTLDVEDILVKPKADVKRHRIIEESTHCGPQAVRAALNLPEAASCDEIRGKWQDAHLGKDQRDFNMIDLKFKEEVNHYSNEINKACMPFGLHRQFPENNLQMMVQSGAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGRRPPADGIWQVAALL	589263	539570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_539825_544876_544932_548734_548843_550197_550326_557424_557583_558014_558151_558785_558954_559559_559776_560672_560895_561801_561968_564516_564600_566390_566545_567781_567881_569899_570059_570175_570259_573210_573395_574465_574616_589101
832104	contig_4486_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_38596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAATTACATGATGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340859	342125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_340900_342100
832105	contig_8019_pilon	+	1467	1	Intergenic	novelGene_126997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGATATCGAGTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279844	281311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_279800_281300
832107	contig_5649_pilon	+	992	8	Intergenic	novelGene_82267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	188.439022779578	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	370	750	25982	35580	FALSE	50	TACAATAAAATCACTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHHGPAALQSHPLRGRRRLPPRPRRRGFFKSQAEAQIAAKNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENNEVLKSGRYVTVQTISGTGALRIGANFLQRFFKFSRDVFLPKPSWGNHTPIFRDAGMQLHGYRYYDPKTCGFDFTGAIEDISKIPEQSVILLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIAAVVKKKNLFAFFDMAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCFSHR	12771	35822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_23146_23276_25342_25403_25897_26060_26789_26895_28299_28451_28928_28961_35565
832109	contig_4232_pilon	+	740	4	Intergenic	novelGene_63234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	96.6517229828602	509	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	49	726	265429	266578	FALSE	5	GCGCCTGTGAGTCTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGDEEATEKHRVHLRPATLRDAAPVALHLLPCEVLANRPAPVERFFVPAIRQRPAGLEVSFRGRILRGEEVVVPPGLAGYVMVMDEKAEVLIGLERKQELKGSEDDEEEQQEGPEPLERDFDRFIRATASFARFHLWGLETIPGPDAKVRGALTWPTLAAAVGLPQMWPLPLDLSNPTAGDSCCRFTHRCLQTETQSLRLKATDACTPINQPCTLELLIPSPQ	265380	266592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_265601_265782_265980_266057_266178_266389
832110	SIRV2	-	477	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	107	-99	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	31	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGTAATGCTAGTCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5788	3764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3828_3963_4087_4338_4480_4687_4801_5751
832112	contig_4301_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_65078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGTACTTGAATTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275273	277222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_275300_277200
832113	contig_6896_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_174231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGGTGTGTAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722584	723340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_722600_723300
832114	contig_11855_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_66907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	70.9805607191152	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	76	1032	775934	868069	FALSE	80	ATTAAAAGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRARPVRARAAPSAGDAPGCPPATMELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGLFSLPAGDGLLTPDTQKGGETPGSEQWKFQDLSQPRSNTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTAASDVATIPTDTPLKEDSEGFVKATDTSDKSEISKHIEVQVAQETRNASTGK	775858	868238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_776237_825590_825712_842967_843039_848822_848918_854369_854521_867853
832116	contig_5947_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_101459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGAGTTTTTCTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24513	24136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_24100_24500
832119	contig_11105_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_159827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	500	805	409605	409910	NA	40	CCTGATAGAATTAAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWAGGVPTEVTEPVPGWETPLVICCGWLGTTPGSGASILLPPQGTQDKGLALLADPCLGRVLPSWVSSPLPPPARWRAGWAKCLEETSASLWFVHFTQVY	409105	409964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_409100_410000
832120	contig_11267_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_175382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGTGAAAACCCAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111069	109783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_-_109800_111100
832122	contig_3426_pilon	-	2125	2	Intergenic	novelGene_57989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	0	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	313	528	713338	713123	FALSE	15	TTTATTTGTTTTCAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLLTDLKTLCCEFLEGCIAAENCIGIRDFALHYCLHHVHYLATEYLETHFRDVSSTEEFLELSPQKLKEVISLEKLNVGNERYVFEAVIRWIAHDTEIRKVHMKDVMSALWVSGLDSSYLREQMLNEPLVREIVKECSNIPLSQPQQGEAMLANFKPRGYSECIVTVGGEERV	716040	711525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_713345_715734
832123	contig_11363_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_160493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCTTGAACAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172696	171033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_171000_172700
832124	contig_3832_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_161447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300926	298768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_298800_300900
832125	contig_3241_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_146420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATACCAATTCAACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939132	938865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_938900_939100
832126	contig_1406_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_25673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGAAAGGAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3038390	3039435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3038400_3039400
832129	contig_5018_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_46955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCGCCCGTGAGCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306872	307225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_306900_307200
832130	contig_1379_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_134581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGATGTTAGAATTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388892	390718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_388900_390700
832132	contig_17337_pilon	+	1275	2	Intergenic	novelGene_144725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCAGATAAGTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30709	32703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_31772_32490
832133	contig_5485_pilon	+	2198	4	Intergenic	novelGene_37766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTGATGCATCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561544	589407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_562465_586395_587368_588162_588345_589283
832134	contig_10801_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_74067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGGAGTGGAAGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370593	369689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_369700_370600
832135	SIRV6	+	467	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	378	11	205	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCGGTAGTATCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508	2529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
832137	contig_2798_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_120069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAAGAATTATCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188869	189458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_188900_189500
832138	contig_14840_pilon	-	2220	1	Intergenic	novelGene_66238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	10	315	25147	24842	NA	40	CGACAGATTCACCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSQMGFLLYRVVREVVSDNVTFEQRLKEVRQQVTHLTERKAFQAEKIASASSQETLDNSRTLPLSTGFSIPLPGSHPSKITGHYLKAGKAEAVPTESYPLFQHL	25156	22936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_22900_25200
832139	contig_5690_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_119671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	3	308	180164	155302	FALSE	25	AGCTCACTTGGCCAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRGPVRRARLLRTSPRPLFEGPSSEDITSVWSLPHTHPLPNHGLYLCLPVFPVRPILWECPVGHPRVYPTLSGANGEDDKIQDFPGISALLPPDLQLHSLQ	180166	155301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_155579_180135
832143	contig_3818_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_99274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAAAAAACAGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570191	570597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_570200_570600
832145	contig_7342_pilon	-	1028	8	Intergenic	novelGene_71146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	136	456	327269	321114	TRUE	30	TGGACAGAGGGAGACACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCWGKSLMAFVNQPSKLLAKLRMACVKLLGTGRSTSGMSVSTSAWYRMWSQVRIHFRMGSYLQREMSLSFAMMAPSSSSSLAGMEAGPSLEVAFELQKASQSFST	328730	311898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_312078_313216_313344_317861_317971_320666_320787_321076_321189_325193_325356_327185_327284_328609
832146	contig_16124_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_175390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATTCTGGCTATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234702	233467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_-_233500_234700
832147	contig_10106_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_73851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	752	1084	38668	38336	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGKVRPQTRIQAKTNKAKTARGVHLGKEPSVLLRFSKSPTAILWEGKGCRERRSGVPETGLPQLCHLCLSLQLPHPLPHRVPAWLPLEAAAEKAATTTAKFPSFKKYD	39419	38312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_38300_39400
832148	contig_8693_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_150862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTACAAGTAAGCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063348	1061819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1061800_1063300
832150	SIRV6	+	475	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	2	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1021	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845
832152	contig_14322_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_116402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAATTAGCAGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671660	671366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
832153	contig_15063_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_14466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	14	376	36299	36661	NA	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36285	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
832155	contig_21343_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_170233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGACTTAACCACTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43519	42460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21343_pilon_-_42500_43500
832156	contig_14300_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_133139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACATCCCTCAGTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419255	417964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_418000_419300
832157	contig_8149_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_169959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771228	770469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_770500_771200
832158	contig_826_pilon	-	444	3	Intergenic	novelGene_154953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	42	1461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGCGTGGTCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547771	546772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_547039_547303_547419_547708
832160	contig_12635_pilon	+	1454	7	Intergenic	novelGene_60794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	77.5542820653165	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	133	411	118817	142155	TRUE	30	GTGGATTTGAAAGTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFGCSAVRRSRRAAPPEPGRRASPLLAASTPAAGVHLTVHTHTMTKKDKKSFNQSLAEWKLFIYNPTTREFLGRTAKSWGLILLFYLVFYGFLAALFSFTMWAMLQTLNDEVPKYHRTYGFSKTSDCVGIFIQFV	118684	154712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_118926_137419_137528_142093_142206_143686_143872_146769_146821_151190_151282_154046
832161	contig_6823_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_131197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGCAGTAATCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	2383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_2400_2600
832162	contig_11248_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_142541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAAAGCTCTCCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169605	170334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_169600_170300
832163	contig_11248_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_142542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAAACTTATATAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170284	170620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_170300_170600
832164	contig_2414_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_158503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCATGATCATCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404706	404133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_404100_404700
832165	SIRV6	+	268	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	164	-215	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1500_1700
832167	contig_6871_pilon	-	2092	12	Intergenic	novelGene_21622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	98.5930780598837	123	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	112	1707	576389	562788	FALSE	25	GTTCATTATGCATCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEGSARRRGADKTKPPPGGGEREPPLPPAPQDVEMKEEASAGGGPAADTDGKAAAEHSQRELDTVTLEDIKEHVKQLEKAVSGKEPRFVLRALRMLPSTSRRLNHYVLYKAVHGFFTSNNATRDFLLSFLEEPMDTEADLQFRPRTGKAASAPLLPEVEAYLQLLVVILLMNSKRYKEAQKISDDLMQKISTQNRRALDLVAAKCYYYHARVYEFLDKLDVVRSFLHARLRTATLRHDADGQATLLNLLLRNYLHYSLYDQAEKLVSKSVFPEQANNNEWARYLYYTGRIKAIQLEYSEARRTMTNALRKAPQHTAVGFKQTVHKLLIVVELLLGEIPDRLQFRQPSLKRSLMPYFLLTQAVRTGNLAKFNQVLDQFGEKFQADGTYTLIIRLRHNVIKTGVRMISLSYSRISLADIAQKLQLDSPEDAEFIVAKAIRDGVIEASINHEKGYVQSKEMIDIYSTREPQLAFHQRISFCLDIHNMSVKAMRFPPKSYNKDLESAEERREREQQDLEFAKEMAEDDDDSFP	576500	562402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_562866_563048_563100_564414_564571_564855_564960_565098_565219_565323_565439_569297_569402_569561_569753_570683_570821_572194_572333_573701_573893_576178
832169	contig_9848_pilon	-	776	13	Intergenic	novelGene_79973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	553.800373931498	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	85	663	110549	104073	TRUE	25	AGGCGCTAGGGATGGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRIPTRTCSSAGQEPPSQMTTPRTTRIRHPSNSGGSPGGLWSLSWVKHLLPWQEAPTRTTVSQTM	113904	99245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99348_104061_104148_104467_104537_104841_104889_105864_105909_106409_106441_106511_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
832172	contig_12625_pilon	+	1280	8	Intergenic	novelGene_140482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	492.813993970404	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1	942	16025	32535	FALSE	60	AAAAAATAGCTAACTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALSTGGSSGTNGSSSAPSENTSPSAGTTETGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGERKRCLQFSFFNHGF	16024	32873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_16073_16678_16914_23321_23465_27153_27238_28478_28595_28844_29011_30470_30574_32488
832173	contig_8671_pilon	-	1108	4	Intergenic	novelGene_126261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	519	839	500717	500397	FALSE	15	TTTCCCTGGTTTCTATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCIFTINLRHIITFSLRSGPFKIIKNPSMRRWDPSVRNSISSKAISINFSAEIKISVIPIPLPFPGSSAVIKISVNFLSKSSVPRTTSRIKSIVSRPKSTSFFM	645997	500127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_500879_602109_602202_642992_643077_645816
832175	contig_14980_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_78234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAATAATAAATGCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546180	547552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_546200_547600
832176	contig_14970_pilon	+	695	2	Intergenic	novelGene_45100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCTAATGGAAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234075	234812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_234572_234613
832178	contig_8710_pilon	-	233	2	Intergenic	novelGene_73549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTATGTTTGATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520859	518642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_518757_520740
832179	contig_5361_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_167205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAGAGAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353282	354656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_353300_354700
832182	contig_16382_pilon	+	2280	4	Intergenic	novelGene_160242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.44948974278318	14	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	831	1280	304992	312934	FALSE	45	AAATAAAGTCTGTTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSCSFQDRCVSILCCKFCKQVLSSRGMKAVLLADTEIDLFSTDIPPTNAVDFIGRCYFTEICKCKLKDIACLKCGNVVGYHVIVPCSSCLLSCNNGHFWMFHSQAVYGTSRLDSTGVNVLLWGNLPETEENTDEDMLDTSAEECIR	304161	313934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_305144_306745_306824_309503_309629_312839
832183	contig_120_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_165252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCTGAAATGTGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101854	100213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_100200_101900
832187	contig_1154_pilon	+	1585	6	Intergenic	novelGene_87189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.16619037896906	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	65	775	1040757	1049158	FALSE	20	CTAGTGTGGCTATGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFVVQGSNGEFPFLTSSERLEMVSRARQAVPKDKLLIAGSGCESTQATVEMTVSMAQVGADAVMVVTPCYYRGRMSSAALIHHYTKVADLSPIPVVLYSVPANTGLDLPVDAVVTLSQHPNIVGIKDSAGDVTRIGLIVHKTRKQDFQVLAGSAGFLLASYALGAVGGVCALANVLGAQVCQLEQLCLTGQWEDAQKLQHRLIEPNTAVTQRFGIPGLKKTMDWLGYYGGPCRAPLQELSPAEEEALRMDFTNNGWL	1040692	1049968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1040824_1041032_1041161_1041771_1041907_1042175_1042273_1043607_1043742_1049008
832191	contig_13664_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_144200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTAATTAATATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73447	74401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_73400_74400
832192	contig_14450_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_48950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562024	560663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_560700_562000
832194	contig_6674_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_148002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTTTGTAACTTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143446	145463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_143400_145500
832195	contig_2890_pilon	-	1877	9	Intergenic	novelGene_60269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	39.3777776798031	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	19	1140	283193	272595	TRUE	25	TGAAAATATGTGTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPWFKMGSQVSVDVGSMHVVIVGGGFGGIAAASQLQALNVPFTLVDMKDSFHHNVAALRASVESGFAKKTFISYSETFKDNFRQAMVVGIDLKNQMVQLKGGEALPFSHLILATGSTGPFPGKFNQVSSQEAAIQAYEDLVKQVQSSLFIVVVGGGSAGVEMAAEIKTEYPQKEVTLIHSQAVLADKELLPCVRQEVKEILLRKGVQLLLSERVSNLEELPVNVCRDYIKVQTDKGTEVATNLVILCSGIKINSSAYRSAFESRLVSNGALRVNEYLQVEGYSNIYAIGDCADVKEPKMAYHAGLHANIVTTNIVNSMKQRPLKAYKPGALTFLLSMGRNDGVGQISGFYVGRLMVRLVKSRDLFVSTSWKTMKQSPP	283211	269340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_270066_272582_272747_273015_273217_274910_275064_277231_277341_279914_280008_280774_280895_282546_282663_283015
832197	contig_7171_pilon	+	1006	4	Intergenic	novelGene_101237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.2728627625936	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCTTTTCCTGTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733964	764954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734155_760560_760703_762706_762746_764319
832198	contig_11498_pilon	-	1734	11	Intergenic	novelGene_65527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.13906606301184	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	246	1193	256860	250986	FALSE	5	ATTTGCTGCCGTCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEDEGPEPDCQKQFQAAVSVIQSLPKNGSYRPSYEEMLRFYSYYKQATMGPCLVPRPGFWDPIGRYKWDAWNSLGRMSREEAMSAYIAEMKVVAQKVIDTVPLGEVAEDMFGYFKPLYQVIPDMPRPPETFLRRVTGQKERVLNRNVGADLEPPCPRKEPAPPSPEFQLPRDLDSEVFCDSLEQLEPELEVWAEQRGAPGGEPDTRTSPSPPQRARGVWGQPAGTPGTGHVADGDSSGAAGEHAGCPGETAEPGKHAPPAQAEAPTQYPALALQALRLHAALLPPVALRCPVALQTVSDPEEVTLHGGVSAAN	257372	250444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_251141_254076_254217_254948_255029_255118_255190_255503_255591_255800_255922_256175_256261_256332_256454_256772_256903_257075_257202_257295
832200	contig_3077_pilon	+	679	3	Intergenic	novelGene_26858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	31	453	1062918	1140153	FALSE	20	CCACTAGCACCGCCCGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTCSRRRSFMAGSSARSEGTSPSLFTIPTLAPWLMKYLCYVQIATGSCCMEGGPALVVLLVYVGSVLHQKLHHVQIFINTGLVQGCQAVHVDGVDVGSPSQKLFHLVSVPARASGQKDSTVLEADPGAPPTSLRLPSSASPLRGLLLGQ	1062887	1140379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1063004_1072481_1072611_1139945
832205	contig_5317_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_76601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTCTGCAGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661907	660397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_660400_661900
832208	contig_7870_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_108910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGATGGGTAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214305	213213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_213200_214300
832212	contig_12644_pilon	-	1463	14	Intergenic	novelGene_44595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_13	7.56666623222027	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	23	1432	2674981	2653574	FALSE	35	AATAGTTGCAGTCTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSDWAEMWSKMNQAAEELYARLLQGFDEEKKGICKDPFIYEADVQVQLISKGQRNPLRNILNENDIIFIMEKVPLEKEETGYVEEIQSEETAISDFSTGENVGPLPLPVGRARQLIGLYTMAHNPNMTHLKINRPVTALPPLWIRCDSSDPEGTCWLGAELITANDSIAGIVLYVVGCKADKHYSVHLEDLKNSHKKRHHLSTVTTRGFAQYELFKSTALDDTASASQTTITLDISWSPVDEILEIPPLSSTATLNIKVESGESRSPLNNLHRQLKFLLVLADGLRTGVTEWPEPLEVQSAVELVQEFLNDLNKLDGFGDSTKKETETVKHDTAAVEHSIESVFTARGDLDFAEQLWCKMSSSVISYQDLVKCFTLIIQSLQRGDIQPWLHSGSSSLLSKLIHQSYHGTMDTVPLSGTIPVQMLLEIGLDKLKKDYISFFIGQELASLNHLVSFFVLKLVFLFFSHSACFLCTKS	2675003	2653542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2653678_2654156_2654314_2657188_2657269_2657745_2657852_2658473_2658524_2659052_2659147_2663347_2663420_2664737_2664894_2665141_2665213_2665745_2665946_2666385_2666505_2669244_2669341_2670324_2670377_2674928
832213	contig_8628_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_164424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGGCAAGAAATGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435951	436368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_436000_436400
832214	contig_9389_pilon	+	1132	4	Intergenic	novelGene_83938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1131.3735015458	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	175	486	164432	167739	FALSE	40	TAGGGAAAAAAAGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGYGMNPVDLFEANDLSSPPTTRRGQTTEVPHVASPHIIASSGFWGFVLFFYMLERCQRRVCGRLGGEWPGVWVPPSLGFLPELSHQARGRGKGHISLHWGS	163660	168385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_163742_164232_164300_164405_164482_167477
832215	contig_9848_pilon	-	1430	5	Intergenic	novelGene_79960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	504.143518752349	1	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	186	524	105976	104044	TRUE	20	TTAAGAGCAGTCGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPHPPPRACHATPAVSVFLARDPVAVDYYNWGQFRKPLEGEGESEHPHARPNTDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	106432	98502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104562_105835_106035_106305
832216	contig_6424_pilon	-	1425	3	Intergenic	novelGene_109274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	12	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	136	453	95900	94515	FALSE	20	CGACCCAGACAGTGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTTRPDIEVKDWFAARPDCGSKYQLCVQLLSSAHTPLGTFQPDPAMIQQKSDARWREVSHTFSNYPPGVRYIWFQHGSVDTHYWAGWYGPRVTNSSITIGPPLP	96035	93542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_94659_95619_95756_95862
832217	contig_8773_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_74519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAAGAAAAAAAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33954	33283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_33300_34000
832221	contig_10235_pilon	+	619	4	Intergenic	novelGene_46323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	1400.7676466852	3145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	407	547	91662	91802	FALSE	5	CCTGTGTCTCAGGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYGLLKANDVILHERTVHICGTGTGRAPPPGHDHSVHLSVLAPSESKEAGEELVPTLVSAPLFLFLCAHFCVSPPVPTPLCQPPVPSPAYLLLCASPSVPVTQCPPPCAHPSVPTPLYLPLCASPRPCRQSRSSTMHLCRGYQGQAVLRGSTSARETGRMPRKTPVLTMPALPRKNPPKHP	89962	91874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90005_90395_90492_90833_90857_91416
832222	contig_9389_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_84122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATAAGCTTGTCATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1428682	1428208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1428200_1428700
832224	contig_12490_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_169053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTTTTCACCTTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269969	268920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_-_268900_270000
832226	contig_2069_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_23349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	79	381	899791	900093	NA	50	ACTACAAAGGTAATAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSRCTANPCRAQQPQPLLREGTAYRMKRETRTPSERVWAMSLGAVPTLAPPPLADWFLDHVHFTGPWCPHSPCITSWPEPCLACSFLPMAFWWPGSWKKSYLLGLNPDSTPIQDFEPVHSGLNPC	899712	900523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_899700_900500
832227	contig_14142_pilon	-	1207	10	Intergenic	novelGene_120544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_9	28.8058636006244	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	453	1070	360989	356909	FALSE	5	TTTCTGTATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVEEDGLRWTPESPLDPDSGLLPCTLPNGFGGPPGPEGERSLAPPDASILISNVCSIGDHVAQELFQGSDLGTAEEAEHPGEKAGQHSPLREEHVTCVQSILDEFLQTYGSLIPLSTDEVVEKLEDIFQQEFSTPSRKGLVLQLIQSYQRMPGNAMVRGFRVAYKRHVLTMDDLGTLYGQNWLNDQVMNMYGDLVMDTVPEKVHFFNSFFYDKLRTKGYDGVKRWTKNVDIFNKELLLIPIHLEVHWSLISVDVRRRTITYFDSQRTLNRRCPKHIAKYLQAEAVKKDRLDFHQGWKGYFKMNVARQNNDSDCGAFVLQYCKHLALSQPFSFTQQDMPKLRRQIYKELCHCKLTV	362671	356771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_357020_357628_357680_357796_357881_358048_358187_360188_360267_360704_360753_360881_361030_361393_361506_361603_361844_362611
832228	contig_5954_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_28452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACCACACAAAAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112287	113023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_112300_113000
832229	contig_15146_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_116943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATTTGGGAGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251341	250396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_250400_251300
832230	contig_7019_pilon	-	1271	4	Intergenic	novelGene_149451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	5.79271573232759	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	108	1115	507011	501185	FALSE	15	GCTTCAGTGTGCATTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQPDPETLNENSELLFSFGVIADIQYADLEDGYNFQGNRRRYYRHSLHHLQDAIEDWKKESNIPCCVLQLGDIIDGYNAQYQASEKSLELVMNTFEMLKVPVHHTWGNHEFYNFSRDYLTNSKLNTKFLEDQIVHHPETIPSENYYAYHFVPFPKFRFILLDSYDLSVLGMDQSSPKYQQCMKILKEHNPNAELNSPQGLSEPQFVQFNGGFSQEQLNWLNEVLTFSDTNQEKVVIVSHLPIYPESSNSVCLAWNYRDALAVIWSHECVVCFFAGHTHDGGYSEDPFGVHHVSLEGVIETAPDSQAFGTVHVYPDKMMLKGRGRVPNRIMNYK	519446	501028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_501475_505161_505279_506410_507037_519364
832231	contig_9185_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_166881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACCAACCCAAAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164511	163765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_163800_164500
832232	contig_11756_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_106031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCGAATAAGTTGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96844	94822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_-_94800_96800
832233	contig_10734_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_51046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407122	407932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_407100_407900
832236	contig_4232_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_63162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAAAGAACTTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48484	48068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_48100_48500
832238	contig_5505_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_177009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383794	383618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5505_pilon_-_383600_383800
832239	contig_7843_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_152042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAAGAAAGAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433081	433471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_433100_433500
832242	SIRV6	+	430	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	97	4	-90	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	76	315	2458	3109	TRUE	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2382	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
832243	contig_2733_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_128590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890646	891592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_890600_891600
832244	contig_14322_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_115640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370811	369721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_369700_370800
832245	contig_12790_pilon	-	886	2	Intergenic	novelGene_35190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	477	878	143107	141301	FALSE	55	AAAATTTAAATGCCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLLTFLEVGCEEDLQCSSALVLFFQVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDRENIESLAHALVEIIKSRSQQRNFQLLVITHDEDFVELLGRSEYMEKFYRIKKNMDQCSEIVKCSVSSLGSYVH	143583	141292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_141488_142892
832246	contig_10011_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_68076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAGAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284844	286193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_284800_286200
832247	contig_16826_pilon	-	1144	3	Intergenic	novelGene_176311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	15.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	53	1072	9790	6576	FALSE	25	TGTCCCCTGGGTAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLARAPALGGSFAGLEPMGLIWALEPEKPFWRFLKRDVQTPFAVELEVLDGHEPEPQRVLGRAVHERDFLRPGVRREPVRAGRVRATLFLPPGPGPFPGIIDIFGIGGGLLEYRASLLASHGFATLAVAYYEYEDLPKTYDNIHLEYFEEALHYMLQHPQVKGPGIGLLGISLGADICLSMASFLKNISATVSINGSGFSGEKTIQYKQTNIPSLGHELRRIKVTFSGLMDIVDIRNDIVGGCEHPSMIPIEKAQGPILFIVGQDDHNWRSEFCAQLASERLQAHGKEKPQIISYPGTGHYIEPPYFPMCPASLHRLVDKPVVWGGEPRAHSKAQVDAWKQILIFFCKHLGASPKL	9842	6503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16826_pilon_-_7167_7949_8153_9564
832248	contig_9053_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_87916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACGAAAAAACAAAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35821	35232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_35200_35800
832250	contig_7707_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_72207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGAAAGAGTATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709012	707617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_707600_709000
832252	contig_3627_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_78409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATTAAATTTCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4206	4904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_4200_4900
832253	contig_7308_pilon	+	2012	5	Intergenic	novelGene_159635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.02493781056044	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1854	157	2010	764122	785113	FALSE	30	GCCCAGTAGTGTTAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSGQGYCSYCHVLYNNLEQHMFSAHHRNLVTGKRHRMGSSSLMERFLQDVLRHHPYQCQESRSTHNERRLKNAVSPEVAYFDDFIPEETVKNTTGVRGDIPTKSSEPIEELYSRPSKSQEYIKDISIRPSVIQKLEKGQQPTLEFVHKIGSSMKEFNRVDVHQATNNGQNLTCPPVISNAPASCLSESSYDRPVISNTTRLPLVTHLDSVNKCDPNIVDRCLEKLGNSSSNPILSSHLETSSVSYLKPKESARKSLSIKSGKLILQKDVKSQGNTLSTGFKFHEIMGTQGSLRLECLSKLAVNSAVNLNKFNIPPNKGIFENAIPNNHKELFSNMDHTQEEKHLFFNKSPFLEQKSSVYSERKFDYGSLQSVSDQPQEAVQDLYPWKEERADPEDKNYESRGFEMSYDCNSSFLSLTNQSKVTAKEINFPMEVHADLQYKTNKSCASERSSDCDGSLRLFTGQSQVTVKEISLQKAVHISLVDQSYDSSSSEIDFHCDTSLQPIIDQAQQSVKYVSIPTELHTGLVDKNYGSSSSEISADSAFPLQAVVDRLPVAVKEIKLQKKVHTGLVDKNYESSCSETSFDCEFSCQSVVDHPQLAVKGRNLKDRHVDLEDENC	757007	785115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_757042_763125_763203_764076_764182_776805_776934_783447
832254	contig_11324_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_177011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGAGCCAGCCGCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167909	168698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11324_pilon_+_167900_168700
832255	contig_1694_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_144952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATGTCTTTTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773713	774161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_773700_774200
832257	contig_20819_pilon	+	877	5	Intergenic	novelGene_55611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24.0767003553228	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	78	683	22116	25305	FALSE	0	TTCCTGTCTTTTCCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDAESNEEQLEELPLEEESPMSQLFELEIEALPVETTPSPEERDISSSKKQTEDSLITVLENGAAMVTSTSFNGGVSPHTWGDSCPPCKKFRKEEKDPGSGPLGDSYVERQRAVHEKNGKSICTLPSPPSPLASMTPVADSSTRVDSPSHGLVTSSLCSPSPVRPSQTPQSQAPRPGTYKMSVATQCDPEEIIVLSDSD	21144	25499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_21173_22066_22121_24335_24654_24809_25033_25245
832258	contig_8330_pilon	+	1303	3	Intergenic	novelGene_71748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTCCTCCCGCCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523812	527595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_524851_526013_526229_527545
832260	contig_13074_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_153446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538947	540099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_538900_540100
832261	contig_6017_pilon	-	602	3	Intergenic	novelGene_152557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	21	2390	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	197	517	467484	467164	FALSE	5	CCTTTTGTATGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF	468315	467078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_467516_468013_468123_468259
832262	contig_7753_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_41456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAACCCAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512069	510987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_511000_512100
832263	contig_13992_pilon	-	1533	13	Intergenic	novelGene_147654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_11	168.014053644992	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	124	1371	665577	655415	FALSE	40	AAATAAAGTTTCCCTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNLDWDKLDGPNFNPFGNGSQCGGGEARPPERPEARPARPMAEPLSAEPEAAEASPPSQQVGSALPGGSPEVQVTAPEVPAEAPGAAGEGGTSCSSDTSVPTSSPGSEPTAPPAELPPSLDLAKESFKDPAEVLGTGAEVDYLEQFGASSFKESALRKQSLYLKFDPLLRDSPNRLVPVAAETSREAAQAAAVPSPLSVSTQVASNPSSGSVPEARLVEFDFLGSLDVPVPSPAPCVLGPGGPPLQVSPIVDVLQYSQKDLDAAVRALQLENLELKGRCEELYAKNQEMGKIMDEFEGIAHQVTEEAKKEKELAEAKIQKILKERDQLTADLNSMEKSFSDLFKRLEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYILRIEKESQRYQALKAHAEEKLSLANEEITQVRSKAQAEALAFQASLRKEQMRVHSLEKTIEQKTKENDELTRICDDLISKMEKI	665700	655252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656275_658801_658963_659896_659941_660024_660102_660361_660467_660821_660955_662112_662217_663349_663403_664196_664327_664510_664602_665521
832264	contig_11978_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_62833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1526	1864	465458	465120	NA	75	GAAAATCTAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFYVFGKDTQSLKIFYKHTDMVVKSEHTAFTFYFILMLLPSAVSITQEHHSARGVSNAPGRQPFCFYFFLKQLGSSICPKANSCGRWNMELAMLLNASSITIFPSAHLFR	466983	464901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_464900_467000
832266	contig_10864_pilon	+	1260	6	Intergenic	novelGene_107078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2	514	894707	903722	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAVRLAFIFSSRLARWLLVSSISSTLSSAVRTSLCSFLFSAFSSSSTFSAFSAAVLYRSTCPSSRPILCSKVVISCSAFESLNLYSLICLLASLCISISCKSVPFCSPARSPTALSLLGPFCRSSSSCSFSFLICDSSSSFSPASFRSLTSVAPLLLTPRPGRLPETRR	894705	904468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_894801_895371_895481_896060_896140_896983_897106_902002_902056_903666
832268	contig_10596_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_173585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATAATGTTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786217	788340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_+_786200_788300
832269	contig_7070_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_104046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCTTAACAATATCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129191	128642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_128600_129200
832270	contig_4604_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_19121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATGGAGCAGATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26695	26448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_26400_26700
832272	contig_10074_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_57089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	663	995	112715	112383	NA	45	GTACTATCATTATTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTILKSNSFGFMLIQMVHMGSSSLGTGKPHTTFLSLYGASVCSNSHCEQLPSLAQCSCSPHQLAKALTLVQLLKYSFSSYILTEKNLTDSNPANRESQASISNPFSNG	113377	111107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_111100_113400
832273	contig_401_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_42783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTACCAAGGTTAAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086602	1085435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1085400_1086600
832274	contig_2846_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_177014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAACATTTAAAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018885	1019568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2846_pilon_+_1018900_1019600
832275	contig_7635_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_171363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATTTAGTGAGCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72876	74784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_72900_74800
832276	contig_7593_pilon	-	738	3	Intergenic	novelGene_127275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_2	777.5	211	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	126	512	43266	27967	FALSE	70	GAAGAAAAAAAAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVSF	43391	27740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_28195_33772_33884_43218
832279	contig_11719_pilon	+	650	7	Intergenic	novelGene_154730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3344.15398701808	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	110	520	13921	16836	TRUE	15	GTGAGTATCCCTGATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPLL	12996	19182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13481_13554_13920_14071_14331_14504_16247_16326_16825_16911_19126
832280	contig_17432_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_159014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117840	117312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_117300_117800
832281	SIRV4	-	395	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	54	168	54	-168	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAAGTCAACTGTAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5104	3805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
832283	contig_3956_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_14710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGTTTAACTAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65465	66467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_65500_66500
832284	contig_7753_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_41473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936429	935115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_935100_936400
832285	contig_10300_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_152925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGCCAAAACAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74430	75206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_74400_75200
832287	contig_4974_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_161417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAGAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121045	122204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_121000_122200
832288	contig_8712_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_58887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAGAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019027	1017928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1017900_1019000
832290	contig_13547_pilon	+	1104	3	Intergenic	novelGene_104878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88733	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_89177_91160_91268_93754
832293	contig_6842_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_130650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	205	525	206822	206502	NA	60	AAGACTATAAAGTAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGCTHAGAVRFPQMLKSRQGEEVPHKYLWRENGRSGLDFGWSGVVSRTYFIAADEEPRLFHVIEGTEKEGSIDSLFKCCPCIVGNFGLTEIGAFIHSYVIWPLKT	207026	205133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_205100_207000
832295	contig_2933_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_111316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAGAAAAAAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401299	400200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_400200_401300
832296	contig_3727_pilon	+	1618	3	Intergenic	novelGene_146749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	1.5	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	329	685	313113	313469	FALSE	25	AAGAATCACTCCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEQPCLPPLQLPPAYLKWSCHATLRTVTGLLYWVPISSTWPGTWSRTSPAPPAPPLTCNQGAPLRDTLEDSWTHSRASGKPSSVAAICEQPGQAGSPFSPGTTAWQMAEMRSRILG	310173	314402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_310213_310379_310548_312991
832298	contig_12257_pilon	+	1513	1	Intergenic	novelGene_152118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	790	1242	646116	646568	NA	30	ACACACGTTCAGCAACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCFLIWAGKSSVSSPSPAPSPSPTQARSALPITQQFGSPCPSSSDPLEFGGSKVFLSCLLHVPTHRISRPSLLVSFLVPCLLPTPSSPPLLLPSVTNSGSSCPCLLFSAQASPLAWFTPSNSLLPPHTHMAAQLPAVVLFPIKPSPAHE	645326	646839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_645300_646800
832299	contig_383_pilon	+	426	3	Intergenic	novelGene_126142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGAACATGGTCCCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266050	441062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_266195_397805_397897_440871
832301	contig_9863_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_153998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45429	46450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_45400_46400
832302	contig_6589_pilon	+	565	7	Intergenic	novelGene_26124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_3	2410.86360736839	6	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	116	544	1879232	1880585	FALSE	5	CTCACTGGCCTGGCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878522	1880606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
832303	contig_14559_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_83712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCAGCATAATTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227223	224790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_224800_227200
832304	contig_9706_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_20904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACCCGAAGGCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97037	96184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_96200_97000
832307	contig_14882_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_114989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACATCTGTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149914	148576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_148600_149900
832309	contig_5495_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_157674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGATATCCTTCCGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590021	591941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_590000_591900
832310	contig_14202_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_157136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2321.64180412627	52506	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	222	428	88144	86210	FALSE	15	CCTTGATTTGTTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPSLRRHGEYWLRRGSQSARICPSLGFCARAPLCSPAPAHVLPELRASLAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSCMKTVAGGAWTYNTTSAVTVKSAIRRLKELKDQ	88604	86147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084_88214_88452
832311	contig_13004_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_112633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCCCCTTAACTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251161	251743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_251200_251700
832312	contig_6929_pilon	+	626	8	Intergenic	novelGene_139364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	559.481574900426	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	23	403	77555	90402	TRUE	0	TGTTTTGGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRVEAMAVANSSPVNPVVFFDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRQFCTGEFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMVSDVAPTINPSCLW	77532	96489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_78374_78399_78660_78706_79893_79937_85387_85493_90369_90447_96310
832313	contig_8415_pilon	+	781	6	Intergenic	novelGene_141685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	32.7902424510707	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	47	781	73083	101228	FALSE	15	GTAGTTTTTCTATTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEEIGTCSYINHIITMTTLYIQQLKSKKKEKEMADQTSIEEFVIHALAFCESLYDPYRNWRHRISGRILSTVEKSRQKYKPASLTVEFIPFFYQCFQESEHLKESLKCCLLHLFGAIVAGGQRNALQAISPATMEVLMRVLADCDSWEDGDPEEVGRKVELTLKCLTEVVHILLTSSSDQRQVETSTILENYFKLLNSDHSALPNQRRSRQWESRFIALQIKMLNTITAMLDCTDRPVLQAIFLNSNCFEHLIRLLQNCK	73036	101228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_73107_73677_73806_92157_92241_95106_95193_99269_99577_101121
832314	contig_6589_pilon	-	513	5	Intergenic	novelGene_26157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGAGCCACAGCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887907	1885104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1885136_1885926_1886041_1886254_1886332_1886649_1886766_1887732
832315	contig_20487_pilon	-	859	8	Intergenic	novelGene_154385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	115.827281689909	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	725	757	8677	8405	FALSE	25	ATTACACAGTGTGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPLLLLLLPTGALRGWEAEERPRTREEECHFYAGGQVYPGEPSRVSVADHSLHLSKAKISKPAPYWEGTAVINGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRIEEFRSINTEVVACSIDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIKPEDAMKAWWPREEL	22122	8302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8409_8648_8696_12726_12762_13744_13876_15072_15196_17370_17488_18175_18294_21940
832316	contig_16220_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_163631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCCCACGTACCACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159592	159135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_159100_159600
832318	contig_12257_pilon	+	947	6	Intergenic	novelGene_152108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	31.6947945252844	14	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	156	509	151413	162361	FALSE	25	TTTTATTGTGTTATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIPPGMEVCPYFPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLTASSILSLKTLRHLFRGTGRSFPWSAASLPAV	148868	162799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149449_149522_151405_151453_156678_156787_157405_157514_162263
832319	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	33	32	33	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
832320	contig_665_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_158197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACGCAGCAGCAGCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125871	127086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_125900_127100
832321	scaffold_4805_pilon	+	2294	1	Intergenic	novelGene_161034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	235	708	1482	2189	544314	545021	NA	65	CTGGCAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDLRFAKAEAYYYQRYQEMMMEEWKYNMVPQWEIKIKEEEKRPQSQKTEDVKKWDYLVPEMELHQTEKHIYRAERARGLRDHRDRLLPQRIPTEILSPKILSLEKVEKNENIQKTPKAKTEKHKVLQAKKQIKGHRERMIRGRELTEQRNDKKDAQKLSNRVPPCQKSLVEKEMKEFEWVTAYPIVQPYEKALIEVTIMMEKAKKEDKIEKPLRRELLSMPPFLRSQLEKNKV	542832	545126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_542800_545100
832322	contig_4232_pilon	+	1830	2	Intergenic	novelGene_63238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTTGACCAGACTGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268117	270966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_269291_270309
832324	contig_5317_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_76618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGTTAAAGCAGCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857688	856341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_856300_857700
832325	contig_5121_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_170744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCTGGGTTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436727	435809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_435800_436700
832326	contig_7229_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_39864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGATGCAATACTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469540	1471347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1469500_1471300
832327	contig_19402_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_80832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGAGAAAGAAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124638	126135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_124600_126100
832331	contig_6102_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_32245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATCTATGACTTCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299685	1300515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1299700_1300500
832332	contig_5640_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_27279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	448	771	1058413	1058090	NA	25	CAAATGGGGTGGATGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAILLGEEDRQKQRQDSTTYSLNKKCKTETDQLVQEMTKKYLFGCKTKKKNKDAMESIFTHGNPMCVRVELYPIGISMVDFLEVDCQVFLLRHRWVIGTSNLLVCS	1058860	1057973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1058000_1058900
832333	contig_3243_pilon	+	997	6	Intergenic	novelGene_147531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	310.843754963808	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	70	567	20577	33350	TRUE	20	TTCAATGGAGTTTGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPGSSSQPPPVTAGSLSWKRCAGCGGKIADRFLLYAMDSYWHSRCLKCSCCQAQLGDIGTSCYTKSGMILCRNDYIRLFGNSGACSACGQSIPASELVMRAQGNVYHLKCFTCSTCRNRLVPGDRFHYINGSLFCEHDRPTALINGHLNSLQSNPLLPDQKVC	20319	34143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_20386_20573_20813_28044_28142_28539_28696_33341_33597_33959
832336	contig_11594_pilon	-	702	4	Intergenic	novelGene_80879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	286	junction_1	44.0176732183285	462	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	171	608	56794	24954	FALSE	20	AAGCAGTGTCTTGTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLQVVKRGLQQISGHGGLRGYLRVLFRTNDVRVGTLVGEDKYGNKYYEDNKQFFGRHRWVIYTTEMNGKNTFWDVDGSMVPPEWHRWLHCMTDDPPTTKPPTARKFIWANHKFNMSGTPGQYVPYSTTRKKIQEWVPPSTPYK	56964	24859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_25135_51461_51550_55728_55812_56708
832338	contig_2032_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_175554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACCATTTAACATAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40821	42869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2032_pilon_+_40800_42900
832339	contig_5916_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_158023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGCAGACATTACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249696	248815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_248800_249700
832341	contig_10811_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_165801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATTAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362945	364789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_362900_364800
832346	contig_987_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_72316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	444	767	998376	998699	NA	40	TGATAAGCCCTAACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPPVSVRLLSLVFLLEFEHCTPPFPHSIRDSLCVPCQGINTKILKGRFLGRRLDSTWIENNYFLSQRGNEFYTSTLSISFLSSVIKYDLLSILDIFIKVVLCY	997932	999276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_997900_999300
832347	contig_12644_pilon	-	1411	2	Intergenic	novelGene_44436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	144	1238	223562	192548	FALSE	15	GTAGATTGTAGTTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLALLVALLLWSSSVLAYPSITVTPDEEQNLNHYVQVLQNMLLSVPTKEEPGQGLKSKPPNNVYSTRSKVSKFKEIVTHEEAVNENDVLINPISEETTTFPTRGFTLEIGRRKRTKSTAFWWIKPNNVSVVLHAKEPYIEKEEEPEVDTKPTWTSRTFSRVSDFPRSPTFATRTPPIATSKESTDFGESTEDVPQLSGGFDAEKLEAPTFIKHPQILNNDDILKKISDIHSQVQQAPLGDNLIKESREDIQASKDHLRRSIALAAAAEHKLTKMYESQILPLGQTGNEIDSIETVINMLYNSRSKLSEYFDIKYVPPEMREKASTVFTTLKKILCVGREETQRLIRKLIKNNIKILNLLDTA	223705	192374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_193579_223498
832352	contig_12642_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_176402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	85	522	30976	31413	NA	30	TAAACTATTGTCTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARTRTSCEASEQPVAEPSRPSPSKSFAMVDELVLLLHALLMRHRALSIENSQLMEQLRLLVCERASLLRQVRPPSCPVPFPETFSGESARLPEFIVQTTSYMLVNENRFCNDAMKVAFLISLLTGEAEEWVVPYIEMDSPILGDYRAFLDEMKQCFGWDDDEDEDEEGDEYY	30891	32213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12642_pilon_+_30900_32200
832353	contig_7275_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_111252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGACTGATTCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411624	412090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_411600_412100
832354	contig_16647_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_170308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCACCTAAATCGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311455	310058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_310100_311500
832355	contig_1090_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_131127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAACCCTGTGGGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426438	425065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_425100_426400
832356	contig_11845_pilon	-	412	2	Intergenic	novelGene_148146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGGACTCAGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58390	54655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_-_54719_58041
832357	contig_2168_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_147266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267676	268824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_+_267700_268800
832358	scaffold_6394_pilon	+	636	5	Intergenic	novelGene_111036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5071.80061713786	26	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGTATCTGTTGAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441829	444580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442145_442426_442494_443338_443388_444267_444367_444474
832359	contig_13612_pilon	-	541	3	Intergenic	novelGene_157278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	77.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTCCTGTACGACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38504	34874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_35126_36275_36418_38356
832360	contig_15405_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_112098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	504	581	69053	69130	NA	30	CTCTGATTTCAAAAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTASGSPGSGGRRPLSLPPSSFAVSSQFGGGSLIPCLPGPGEWAEPIRPRRPGDLGAGGVGGPHPGHRPPPPPPSSSRLVWPALGWSASPHLLFSFSLARSFSPRPWPALPLAGPLGALAVALACSGPPALTARPVGSAAPLPIPGDRPPERGAAKEYLRKWGFKRKMRGISSPKLNCEGLEESWVAFSTSL	68549	70529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_68500_70500
832361	contig_13760_pilon	-	805	7	Intergenic	novelGene_61331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.8283123417944	429	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	89	634	293766	287136	FALSE	10	CATTTGGTTTTACTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKLKTTKIVFVVGGPGSGKGTQCEKIVQKYGYTHLSTGDLLRAEVNSGSARGKMLSEIMEKGQLVPLETVLDMLRDAMVAKVDTSKGFLIDGYPREVQQGEEFERRIGQPTLLLYVDAGPETMTKRLLRRGETSGRVDDNEETIKKRLETYYKATEPVIAFYEKRGIVRKVCTHLDAMK	297000	286964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_287166_287498_287691_290963_291081_291799_291964_292137_292174_293759_293799_296944
832362	contig_10235_pilon	+	1649	8	Intergenic	novelGene_46589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32.6690267091392	2	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTAGCTTGGTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566822	582337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566979_567165_567360_568225_568322_568415_568518_569254_569385_569503_569589_581262_581318_581506
832363	contig_4402_pilon	+	985	7	Intergenic	novelGene_140813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383341	392280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_383445_385642_385854_386143_386226_386694_386822_387274_387415_388089_388232_392100
832365	contig_9720_pilon	+	865	4	Intergenic	novelGene_116792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.881158828371	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	30	338	391837	392457	TRUE	25	AAGTGTGTTTATTGAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391807	393847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392089_392400_392465_393259_393365_393432
832368	contig_3861_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_57903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGACTCATTTATTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174035	172103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_172100_174000
832369	contig_16907_pilon	-	902	5	Intergenic	novelGene_87455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	21.8746428542274	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	301	675	467716	449131	FALSE	20	AGGGAAGCTTTGTACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGCKLNRLNLVVGEYASACLKVAQDCGTDVLDLWTLMQKDNQDFSSYLSDGLHLSPKGNEFLFSHLWPLLEKKTSSLPLLLPYWRDVAEA	474506	448903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_459295_459418_467610_467773_471189_471339_474411
832370	contig_12414_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_59673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCACCCATATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882779	881058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_881100_882800
832371	contig_34_pilon	+	2043	1	Intergenic	novelGene_39969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGCAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203713	205756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_203700_205800
832372	contig_2367_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_65309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTTTAGTTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148361	147118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_147100_148400
832373	contig_1331_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_37875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAGAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340250	341935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_340200_341900
832374	contig_5549_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_81659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAAAGCACATTTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454832	455843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_454800_455800
832375	contig_3018_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_78763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304070	303285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_303300_304100
832376	contig_18039_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_171252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAGTGCGGGGGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197718	196316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_-_196300_197700
832378	contig_11163_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_153057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1353	1670	93089	92772	NA	45	AAAAAACAGTTCCAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSGCIELGRILHLWLLKGKVIGVVFPQIMMGTFGTGCVFCLILTHNMSPVFHSHVRRKQGLPNDMQCHFINSCPSSLENLCSPYFPFICLYQHRTSVQHRTP	94441	92381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_92400_94400
832379	contig_11094_pilon	+	346	2	Intergenic	novelGene_177019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTAGTAGTCTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326169	327556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_+_326240_327280
832381	contig_5921_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_142259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAGGGAAGAAGCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459305	458899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_458900_459300
832382	contig_9333_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_120310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCTGATTCTTACAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9997	10238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_10000_10200
832383	SIRV2	-	329	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	35	3368	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
832384	SIRV6	+	480	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	22	29	22	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTTCAACAAGAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2307	10759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
832385	contig_4469_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_21916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGCAATCACTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471317	469301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_469300_471300
832386	contig_12278_pilon	+	1643	9	Intergenic	novelGene_152607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	43.7628552541993	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	140	973	246858	250366	TRUE	5	CTAGGCTGGGCTCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHILEHRVRVLSLARPGLWLYTHPLIKLLFLPRRSRCKFFSLTETPEDYTLMVDEEGFKELPPSEYLQVAEATWLVLNVSSHSGAATAVQAAGVTKIARSVITPLAEHHVSVLMLSTYQTDFILVREQDLSVVIHTLSQEFDIYREVGGEPVPVARDESSNGFPRAQHGPSPTVHPVQSPQNRFCVLTLDPETLPAIATTLIDVLFYSHSAPKEAAPVSPEPNSIPFFAFSLIEGYISIVMDAETQKKFPSDLLLTSSSGGAMEDGAHRWTAAGL	246718	251182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_246971_247586_247658_248744_248939_249022_249156_249361_249486_249924_250039_250197_250282_250365_250461_250606
832388	contig_15105_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_150951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCCCTCTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405925	404197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_404200_405900
832389	contig_9335_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_147449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAACCCGAAGACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410427	409864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_409900_410400
832390	contig_10642_pilon	+	1268	4	Intergenic	novelGene_78671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATAGCATGAACTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177350	222213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_178084_181157_181371_185224_185325_221991
832391	contig_10196_pilon	+	817	5	Intergenic	novelGene_132045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	64.4452286829677	415	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	156	749	643457	648579	FALSE	20	GAGCAGATACTGCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSSVTAAQWNLLPVHWCGLRPHTPASPLSLSETGEQAENQLCRPSGASPHLSPTVVWQVNSAKCTLLFWHLLYSQYYKICFEFCNFVAF	639751	648647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644631_648314
832392	contig_10235_pilon	-	1135	11	Intergenic	novelGene_46500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	45.849318424596	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	379	1134	269862	264835	FALSE	25	CTGTGCATCCCAAAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPFRYVLDPSARRIWGNVTRWFITCVQQPEFRAVLGEVVLYSGARPLSQQPGPEVPAPPKTAAQLKKEAKKREKLEKFQQKQKIQQQQPPSGEKKPKSEKKEKWDPGVITYDVPTPPGEKKDVSGTMPDSYSPQYVEAAWYPWWEQQGFFKPEYGRSSVSAPNPQGIFMMCIPPPNVTGSLHLGHALTNAIQDSLTRWHRMRGETTLWNPGCDHAGIATQVVVEKKLWREQGLSRHQLGRQAFLQEVWKWKEEKGDRIYHQLRKLGSSLDWDRACFTMDPKLSTAVTEAFVRLHEEGVIYRSTRLVNWSCTLNSAISDIEVDKKELPGRTLLSVPGYKEKVEFGVLVSFAYKVQGSDNDEEVVVATTRIETMLGDVAV	270917	264833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_264900_264991_265101_265182_265303_265744_265827_266076_266242_269511_269640_269775_269877_270128_270214_270303_270429_270668_270808_270902
832393	SIRV6	+	420	3	FSM	SIRV6A	SIRV611	454	3	6	28	6	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCGATCAGCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1382_1468_1535_1640
832394	SIRV6	+	473	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	986	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
832396	contig_12151_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_54985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994428	995650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_994400_995600
832399	contig_16098_pilon	-	950	11	Intergenic	novelGene_45785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	356.532803539871	1	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTAGCTCTCTTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36343	31094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31303_31490_31587_31679_31743_32117_32173_34565_34661_34734_34799_34991_35073_35215_35304_35567_35617_35907_36011_36295
832401	contig_21386_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_177029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCAACACAAAATGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50742	49420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_49400_50700
832402	contig_848_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_83332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGTAATAAGAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520165	518343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_518300_520200
832403	contig_9888_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_162255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGGTATCATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25027	25275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_25000_25300
832404	contig_17494_pilon	-	1364	5	Intergenic	novelGene_177035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.04152298679729	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	150	893	232806	195911	FALSE	40	GTTAAAAAAAATGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDSGLISALQGLSVTDTHLVEVDGDTLSLYGSGALESLDRNWSVQTAGMVTTVSFSFIEFDEIVQVLPKLKIKFPNSLHLKFKETNLVMLQQFNALAQLRRVDQLTVDPQGNPVVNFTLWKYYVLFRLSHFSMQKINGTEVTQNDMIMAERLFGILAHVASSELPQYRMISILGDTRKKQFQYLLETKGKKPGITSEENNDSKRLTGENTNRATLNYTTRDFYNEKLEEIKEKKKFCKMYIEDLVKEATEINMKNEALQKLWPQMFIELVRDAVIEIRNKNSYMKLCLQQITDQK	232955	195439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17494_pilon_-_196115_217025_217180_227443_227554_231274_231461_232716
832405	contig_6079_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_160087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTCTGTCAGGTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413705	412990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_413000_413700
832406	contig_9333_pilon	-	968	11	Intergenic	novelGene_120315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	157.218605769165	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	83	760	142532	96170	FALSE	25	TTTGATGACTATTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTQPKPKHVTGEGGVGESEQTAEDSAKMAAFSEMGVMPEIAQAVEEMDWLLPTDIQAESIPLILGGGDVLMAAETGSGKTGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGKKGKTTIKTGASVLNKWQMNPYDRGSAFAIGSDGLCCQSREVKEWHGCRATRGLMKGKHYYEVSCHDQGLCRVGWSTMQASLDLGTDKFGFGFGGTGKKSHNKQFDNYGEEFTMHDTIGCYLDIDKGHIKFSKNGKLSVGFNIFPASWLPS	142614	95961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_96202_128767_128862_131045_131123_131655_131740_131961_132046_133811_133860_136925_137023_137591_137622_138606_138671_139421_139474_142516
832407	contig_15323_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_148539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTTTTTAAGACTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172837	171750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_171800_172800
832408	contig_14333_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_49082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGAGGCACCCTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259089	258097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_258100_259100
832410	contig_5105_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_168908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGCAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154171	152036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_-_152000_154200
832411	contig_6616_pilon	-	530	3	Intergenic	novelGene_141768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	45	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAAAGGTAGCCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363105	361799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_362108_362327_362398_362953
832413	contig_11413_pilon	+	627	4	Intergenic	novelGene_103125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1157.74992502219	31	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	193	501	87619	90735	FALSE	5	CTCAGTGTCCTCCCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVSWRLSNSQIGIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87426	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88177_88248_88420_88508_90624
832416	contig_10404_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_138738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAACTATATGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1621831	1622544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1621800_1622500
832419	contig_6102_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_32409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCACCCCCCAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1828011	1828338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1828000_1828300
832420	contig_6272_pilon	+	1706	12	Intergenic	novelGene_160442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_4	88.6487170878536	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	159	1190	133604	167328	FALSE	65	GAAAAAACAAAAACCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFAIRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWETFKKKPDHFPFFFKCILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQPARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSIPLSEPVTVDKVHYCERFIELTIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCSLSCLVRREEDGHLFSQLLDVLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQVTEMH	133445	167844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_133679_136037_136095_139069_139111_146394_146431_150176_150298_152348_152490_153855_153925_154949_155051_162090_162168_164423_164489_165672_165790_167196
832422	scaffold_13505_pilon	-	474	5	Intergenic	novelGene_111488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2207.45928614776	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATCTTGGTCTGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547767	540194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547503_547734
832423	contig_3409_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_172315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218210	217108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_217100_218200
832424	contig_11538_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_152293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_1	349.12640977159	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	352	984	217573	190864	FALSE	55	GAAGAAATTCTAAAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLYHVAYVLVCMLGLFVHEFFYSFLLFDLVYREETLLNVIKSVTRNGRSIILTAVLALILVYLFSIIGFLFLKDDFTMEVDRLKNRTPVTGSNGVPTMTLTSMMGTCEKENCSPTIPASNTGDEEYEDGIERMCDTLLMCIVTVLNQGLRNGGGVGDVLRRPSKDEPLFAARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKK	217924	190863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_190996_192713_192845_210651_210745_213828_214025_217492
832425	contig_3832_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_161445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTCGAACCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288970	289998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_289000_290000
832428	contig_15476_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_174657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTCTTGTGCAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85640	85241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15476_pilon_-_85200_85600
832429	contig_9653_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_48252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGGAGGAGGTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853571	852301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_852300_853600
832431	contig_5575_pilon	-	1982	6	Intergenic	novelGene_122054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.96386945839634	34	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	618	752	84438	84304	FALSE	25	AGTCTTGTTTTTATCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLEQGNLGSYSHLPGQLHRKALRNLRRWSQRILYVKTASPKEIEASAASAEPDQTLETRLSGKLTSRGVCVCIHTAFEGNLLDSYFVDLVIQKPLWIHRHSVPVFIPLEEIAAKYLQIDVQHFLFSLCEHLNAYAGRKYQADRLESDFAAFLAGPLQRNSLCNLLSFTYKREPGGQSFPFCARLLYKDLTVTLPTDVTVTYQGMDALPTSWEEQRVSHENLFRTTSLHKVFTSFAGEGGKLDMSLLP	93084	83073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_-_84441_85104_85277_86607_86868_87637_87687_92356_92474_93067
832432	contig_16535_pilon	+	978	8	Intergenic	novelGene_167706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_5	51.5763749111896	282	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	125	802	257176	258873	FALSE	5	CAGCTTCTTCCTTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPFPSCPSPLTTLIGSWVQSRPLKTQELREPVLSAAIATKMAQFHGMEMPFTKEPHWLFGTMERYLKQIQDLPPTGLPQLNLLEVYSLKDEMDNLRKLLDSTPSPVVFCHNDIQEGNILLLSEPENADNLMLVDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWVYDYTHEEWPFYTARPADYPTRGQQLHFIRHYLAEIRKDKTPSPEEQRKLEEDLLVEVNRYALASHFFWGLWSILQSSMSTIEFGYLEYAQSRFQFYFQQKRQLTTLHPKS	257051	259049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_257247_257442_257539_257684_257744_257830_257913_257992_258102_258215_258320_258562_258645_258798
832433	contig_7020_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_57048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATAAGGTTTTCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49077	50058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_49100_50100
832435	contig_9706_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_20781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660	910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_700_900
832436	contig_14556_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_138529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGAAAATTAAAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157204	158367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_157200_158400
832437	scaffold_16539_pilon	+	2359	3	Intergenic	novelGene_68378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	37.5	19	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1268	1711	612051	614236	FALSE	15	TTAAATTGTCCGTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLFTKTRFLASLRVGRAGPVFPASLASGTLCLQDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKVSPCSPLGSVTWGGRVEAREGPALIC	610783	614884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_612222_613174_613244_614032
832438	contig_19098_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_65813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATGAAAGATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310888	310026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_310000_310900
832439	contig_9272_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_125993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAGTTCTTACAGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813255	812873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_812900_813300
832440	contig_2940_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_81978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGTCTGCAGAAGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096602	1096947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1096600_1096900
832443	contig_1454_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_177036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	146	523	75160	75537	NA	25	CAGTTAAGCAATGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLEYVFGYKLVELEPKSNTYILINTLEPVEEDAEVRGDQGTPTTGLLMIVLGLIFMKGNTVKETEVWDFLRRLGVYPTKKHLIFGDPKKLITEDFVRQRYLEYRRIPHTDPVDYELQWGPRTNLETSKMKVLKFVAKVHNQDPKDWPAQYCEALADEAARARPQPSVPAPSS	75014	76178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1454_pilon_+_75000_76200
832444	contig_7119_pilon	-	702	5	Intergenic	novelGene_41009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	100.886074361133	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCCGTGGTTTCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196772	188480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_193612_193724_194906_195021_196239_196379_196690
832445	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	15	1248	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
832446	contig_19352_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_122409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGCCCATCCTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309117	310539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_309100_310500
832447	contig_18620_pilon	-	837	7	Intergenic	novelGene_168576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	87.150572127911	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	135	545	50261	44563	FALSE	25	TTGAAATGCAAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCWTACQIEESTITLQQAEYEFLSFVRQQTPPGLCPLAGNSVHADKKFLDKYMPQFMKHLHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEYEFAPKKAASHRALDDISESIRELQFYRNNIFKKKTDEKKRKIIENGENEKTVS	54247	44270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_44693_46638_46693_48072_48182_49498_49589_50233_50290_53171_53256_54225
832448	contig_13292_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_142939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTGGACAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210550	210311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_210300_210600
832450	contig_7056_pilon	+	1291	12	Intergenic	novelGene_43597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_9	192.517767775057	10	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	68	1291	668860	714564	FALSE	60	ATAAAAGAAGTAAATAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVREFLSSSPVMSISFSEFYEPEALMMEEEGTVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLNGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQAKIDGLEKTNSKLQEELSAAAGRICSLQEEQHQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKRVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFHKVQNAESNLQQKNEAITSFEEKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGGRVSALQQQLAQLHAQCSSLEKELKSEKEQRQVLQRELQHEKDTSCLLQTELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKVCDEQEQALQEMGLHLSQSKLKMED	668792	714564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_669034_685552_685615_688006_688073_690725_690796_693341_693444_694619_694737_695349_695518_703904_704003_705627_705748_706415_706546_708736_708832_714542
832452	contig_504_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_54418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTTTCACAATCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143044	142625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_142600_143000
832455	contig_5690_pilon	+	1333	10	Intergenic	novelGene_119704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	38.1413873908484	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	175	1170	930555	939107	FALSE	5	TAGGTGGCTTCTCGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLSAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVEHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRMVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAGPLGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQRQMKETH	930380	939270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_930565_930991_931079_931573_931698_937441_937577_937689_937808_937894_937997_938193_938291_938381_938545_938702_938803_939047
832462	contig_7057_pilon	-	343	3	Intergenic	novelGene_123274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	1598.5	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTCTGTTATGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707617	705643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_705875_706664_706709_707549
832465	contig_10011_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_68112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTCCCATGGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328897	328239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_328200_328900
832466	contig_5039_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_64925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171473	1173242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1171500_1173200
832469	contig_6446_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_149165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCACCCTCTTAGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96424	95369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_95400_96400
832470	SIRV4	-	262	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTCTGCGAAAACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
832472	SIRV4	+	560	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	443	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCATTAACATCTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3674	5138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
832473	contig_2438_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_111987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCCTCCCAGCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121466	122157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_121500_122200
832474	contig_2438_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_111988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122469	123149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_122500_123100
832475	contig_5286_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_157369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTTAGCCTCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569578	571270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_569600_571300
832476	contig_16503_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_162072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111216	110961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_111000_111200
832477	contig_5461_pilon	-	2009	2	Intergenic	novelGene_156827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATTGCAGATTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327958	324973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_325058_326033
832478	contig_12689_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_145038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	12	392	66288	66668	NA	15	CTTTAGCCCCAGGGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVNMPDPSRSAPAPKKGSKKAITKVQKKDGKKRRRGRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIASEASRLAHYNKRSTITSREVQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	66276	66892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_66300_66900
832480	contig_1337_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_84233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCCTAAAATCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156044	154111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_154100_156000
832482	contig_9505_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_121814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAGTGATGAAAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403867	402714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_402700_403900
832483	contig_11908_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_133244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCGAGTTTTGCTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822819	823910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_822800_823900
832484	contig_21374_pilon	+	834	6	Intergenic	novelGene_177038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	2.71293199325011	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	121	834	12334	17553	FALSE	45	ACCACAAAGACAGGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTLTALLCLGLCLSQMISSQKYTLMKPIIWAKPNSIIPKGNPVTIWCKGIHEAIEYHLLFKGQLSALERQKSHGLMNKVRFPIPAMTLHTAGRYNCIYLSGELWSKPSDPLDLVVTGMYDIPTLSVQPGPEVVSGENVTFHCHLETATNTFFLLKEGRSSRPQQRYGKNQADFFMGPMTPAHRGTYRCFGSYNDFAWSLPSEPVKLLVTGSIGDTSFAPTEPNSYDGEDSWDVYPS	12213	17553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21374_pilon_+_12368_12450_12487_12674_12960_15531_15811_16497_16549_17524
832485	SIRV6	+	420	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	21	44	21	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
832486	contig_13092_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_177042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	517	849	51254	50922	NA	30	TTGCACATGAATACCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFANGFKDHTPPCFSPVNSSHKILTVLYGPSYWGTVSDDEQPFTMLGENPSRPEGVALKDSFDCQKSAPQDEVEKWKKHGCSQCSPSGIWMEFKENLVLPKFLQVHVLEA	51770	50921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13092_pilon_-_50900_51800
832487	contig_13092_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_177041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGTACTAAGAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50722	49484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13092_pilon_-_49500_50700
832488	contig_12142_pilon	+	705	6	Intergenic	novelGene_147835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	11.6516093309036	7	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	12	365	203622	207732	TRUE	25	ATAGTATCTGGACCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDKMAAKRFASRLRGSRRFLSGFAAGAVVGAAGAGLAVLQFLRSHGPEAASAVREPDGSAGKSVLEQFGFPLTGTEPKCYTNHALSYDQAKRVPRWVLEHISKSKIMGHKVEKSFVPLRN	203610	214889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_203785_205910_206061_207691_207807_209783_209924_212889_212967_214840
832490	contig_9242_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_155076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGTAATTAAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712739	711847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_711800_712700
832491	contig_9242_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_155075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTTGGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711746	711143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_711100_711700
832492	contig_12528_pilon	-	834	7	Intergenic	novelGene_81300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	196	834	491100	473058	FALSE	25	CAAGTGGCGTCTCATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATSLRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDLVATWRFYESIVSFPFFR	492399	473057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_473154_475031_475128_476799_476911_478205_478362_487312_487486_491093_491221_492324
832493	contig_4232_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_63467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	163	351	571849	571661	NA	20	CCCCCGGTAACGACTGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTGASAVAGPESDLGPESGPGPGLSRRALRPCEVRARRRPPCPGSRPVSGCAMSRLGIPRTEFQSQLLTVTAWTPDQPGLDTESAEDPQFASSVSSVSVVQSQRPSPGIRFLFQ	572011	571631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_571600_572000
832494	contig_19012_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_159495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCTAACATAAAAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110116	109050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_109000_110100
832496	contig_4364_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_94	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	290	313	910522	910499	NA	0	TCTCCTGCCTTCGGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDPGPVLQRQHDFNERRGPGTAGEGGCCRQPIPPCVWASQPLPTWSEGAAWAPPCSDWGPTGHGPSTLEGWQHTWDRRRGLRTRRTWCEWRDGVLMSPAWFC	910811	910258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_910300_910800
832499	contig_1666_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_160592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGGAACAGGAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752326	751728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_751700_752300
832500	contig_12837_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_57397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTCAAGTTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424924	423161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_423200_424900
832501	contig_1723_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_165529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAGTATAAAAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32691	33775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_32700_33800
832502	SIRV6	+	464	4	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	7	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	412	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845
832504	contig_10855_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_124277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAACCAGCCACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21868	23862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_21900_23900
832506	contig_17436_pilon	-	471	5	Intergenic	novelGene_164174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	12.794041581924	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	56	469	67481	45041	FALSE	35	CACCAAAATCTTCCTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFAKGGTRPRTSEVDPSEHKKWVKVFKACDEDNKGYLSREDFKVAVVTLFGYKPSKIEADSVMSSINQNTSGILLGDFLNVVRKKKEAQLYWSEIRHIFTAFDRHYRGFLTLEDFKKAFKQVAPKLPERIIVEVFR	67536	45038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_45136_47203_47306_61778_61825_66757_66854_67406
832507	contig_7321_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_53126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAACTTTTCTGTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124769	126056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_124800_126100
832508	contig_14220_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_159883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAGTTCCATAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409593	411175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_409600_411200
832509	contig_12327_pilon	+	701	7	Intergenic	novelGene_140670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	51.3043749488179	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	49	585	1124059	1137535	FALSE	15	TGTTTTATGGAAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLRAFTCDDLFRFNNINLDPLTETYGIPFYLQYLAHWPEYFIVAEAPGGELMGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISERKGGFFVDLFVRVSNQVAVNMYKQLGYSVYRTVIEYYSASNGEPDEDAYDMRKALSRDTEKKSIIPLPHPVRPEDIE	1124010	1137651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1131157_1131801_1131938_1136332_1136479_1136945_1137030_1137533
832510	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
832512	contig_10437_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_38131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTCGACAGTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141714	144043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_141700_144000
832513	SIRV5	-	286	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
832514	contig_13021_pilon	-	931	5	Intergenic	novelGene_8275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	287.36594700834	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	42	617	270418	249850	FALSE	15	TCTCTTTCAAGCCCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHIILRLDSPNQNMMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYERSSMVTA	270459	249535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249873_251082_251152_252257_252369_265837_266120_270327
832517	contig_9272_pilon	+	360	3	Intergenic	novelGene_125989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGGGTGACTGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768090	787970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_768204_769006_769233_787949
832518	contig_7376_pilon	+	1079	8	Intergenic	novelGene_108102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGAAAGCCGAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328918	347612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_329018_329379_329517_331460_331618_334287_334463_334548_334626_339087_339224_341576_341687_347424
832520	contig_5854_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_68860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	445	807	339683	339321	NA	40	TACATCTACATATCTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCSNHEFFLPLPAWLILLNMSWSSIPAYRCLIWKPRKSAKGLQANKGRKEGSTKAIILVCSIHNVSQTYETPPLHIRQKEIFVECTIIKLKFKYIFHFIAVRYLSRCFIIDYTQGKLLL	340127	339169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_339200_340100
832521	contig_11258_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_67861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359808	359103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_359100_359800
832522	contig_18391_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_174094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTAGAAGTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52411	51738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_51700_52400
832523	contig_6823_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_131256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGCATTCCTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492703	493173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_492700_493200
832524	contig_12031_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_137553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGTCTCTATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55552	56876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_55600_56900
832525	scaffold_12124_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_22194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294793	1295831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1294800_1295800
832527	contig_18055_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_117827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72859	73341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_72900_73300
832528	contig_6316_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_134722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCCTAGTCGTTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154642	155634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_154600_155600
832529	contig_15631_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_151550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTGGGCAGTGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546099	544781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_544800_546100
832530	contig_15631_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_151549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAATAAAGCTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543397	543119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_543100_543400
832533	contig_9233_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_78253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATCCAAACCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668004	669612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_668000_669600
832534	contig_6557_pilon	+	1235	9	Intergenic	novelGene_33017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	5.58457697592217	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	72	1106	612815	617221	FALSE	20	CTGGTGCGTGTAGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKENAYPWPYGRQTAQSGLNTLPQRVFRKEPTTSSALVPMSCSNAQPTAAPGEKKTENSSGTPSFLMRPFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFYDRRRVYLILEYAPRGELYKDLQKSRTFDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLRGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPPSVPTGAQDLISKLLKHNPSERLPLAQVSAHPWVRAHSRRVLPPSALQSVA	612422	617350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_612469_612789_612863_614312_614416_614524_614580_614819_615012_615336_615476_615585_615735_616691_616867_617047
832537	contig_665_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_158191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCCAGTCGGCATGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94509	93707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_93700_94500
832538	contig_2377_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_67936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATCTCAGATCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847656	847364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_847400_847700
832539	contig_2377_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_67935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAAGTATCCCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847208	846018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_846000_847200
832540	contig_8060_pilon	+	732	5	Intergenic	novelGene_104833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_3	28.0579756931964	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	39	500	201395	215146	TRUE	15	GTGAGCTGTAGTTTTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGSHALHSRTEMTPSPASNAENGHPEYIAYVLVPVFFIMGLFGVLICHLLKKKGYRCTTEAEQEVEEEKIEKIELNDSINENSDTVGQIVHYIMKNEANADVLKAMVADNSMGDPESPVTPSTPGSPPVSPGPLSPGGTPGEARLWTPSAHSGWCCGEGRVSSV	201356	219595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_201582_203636_203709_212184_212243_215001_215240_219456
832541	contig_2078_pilon	+	829	3	Intergenic	novelGene_100137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAAAAAATAGTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266428	286599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285651_285766_285919
832544	contig_5050_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_110255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATATTTTTTCCAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275100	273773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_273800_275100
832545	contig_7146_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_162050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119675	118533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_118500_119700
832547	contig_15442_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_119142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	6	392	12251	12637	NA	50	ATAAAAACCAAGTCCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMRPLALRTGLVMAVLAGLCYALLYPGLSGAFTYLVGVYVALISFMGWRAMAGLRLVGAAWRWTELAASSGALLFMVSDMTIAFDKFRFPVPYSRALIMSTYYAAQMLIALSAVESREPVEDYELRKAN	12245	13624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_12200_13600
832548	contig_9995_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_47809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTCGGACTCACAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861403	862069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_861400_862100
832549	contig_15264_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_158872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAGAATAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101844	103894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_101800_103900
832550	contig_5485_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_37757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473069	471124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_471100_473100
832551	contig_9901_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_126942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219545	220060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_219500_220100
832552	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
832553	contig_3307_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_86897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGGCTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181299	179893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_179900_181300
832554	contig_6870_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_104002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1532251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1532300_1533100
832556	contig_10196_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_132055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	50	junction_1	24.5598758140183	202	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	56	745	658470	661808	FALSE	15	GTACCCCTCCCAGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAVLKFRNPPVNALSLEMLMELVISLEKLENDKAVRGIVITAENPGIFLAGLDLTEMCGRNPAHYAKYWEAVQELWLRLYQSSKVLVAAINGACPAGGCLASLTCDYRVMADNPKYTIGLNETQLGIIAPFWFKDTLVNTVGHRAAEQALQLGTLFPPAKALQVGIVDQVVPEEQLQSAALSVMAQWLAIPDHARQLTKTMMRKPTVDQLVKQREADIQSFVGLISQDSIQRALQTYLQKLRQKKG	658414	662129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_658545_659137_659285_660008_660131_660215_660395_661641
832557	contig_11933_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_107235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACTCTTAAGGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4246	4793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_4200_4800
832558	contig_10953_pilon	-	498	5	Intergenic	novelGene_42616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	91.4422632047129	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	171	326	496	497791	496882	FALSE	30	CTCAGAGACTGAGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRELLPLIYQHLLQAGYVRAAREVKEQSGQKSFPTQPVTLLDIYTHWQQTSEVGQKRKAEGDAALQAKKTRVSDPISSSESSEDEEEAEAETTNAKKTPRLVSTNNSVMGTDLPSSMKEQAKAKTKKASKMMNSLPHPASGKTVAHLLSGKSPKKLAVPLANTTL	506431	496879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_497011_497749_497824_500261_500408_503629_503686_506340
832559	contig_8697_pilon	+	1877	5	Intergenic	novelGene_83222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	15.1554445662277	35	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	163	816	131346	148913	FALSE	20	TACTATTCTCTGGATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCQKIACVLPALMNGMQSHPHKLFYQVGEKVTFSCPSGMSLGGPSVFLCGSSLKWSPEMKNVQCVHKGATLTQAVPVCQPWEKLQDSRCVCKMPYECGSSLDICAQDERSKRILPLTVCKMHVLACRGRNYTLASRESCTLPAATEKACGACSLWENCDAHSSKCVCREASECEEEGFSVCVEVNGQEQTMRECEAGALRCRGQSVSITSIMPCAA	131183	149974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_131359_134312_134505_139107_139199_145448_145634_148740
832560	contig_14822_pilon	-	673	4	Intergenic	novelGene_145423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	14	400	190302	186548	TRUE	15	CTTAAATTCTTCTGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHGLMLHYRYMIHVSWPTAQSSGHFHQGKERLPSPTPAEKAYTYSHIRSQPSIRLCILCMKRSTKGFCSQGCPLQAGTKMAQRSLLLGEILFAFLDIRLDGITARLPSAVWSPDIWLTFPVFVRELEGLNKS	190315	185678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_185737_186101_186234_186464_186627_189994
832562	contig_20819_pilon	-	877	2	Intergenic	novelGene_55709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACCTGCTTCTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181360	175087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_175779_181174
832563	contig_7119_pilon	-	972	4	Intergenic	novelGene_41040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	43.5430821141545	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	109	816	469254	446870	FALSE	40	GGAGGCTCAAGGAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEQLCAQKCSAEEFESCGTPSYFIVYQTQVQDNRCMDRRFLPAKSKQLIALASFPGAGNTWARHLIELATGFYTGSYYFDGSLYNKGFKGERDHWRSGRTICIKTHESGQKEIEAFDAAILLIRNPYKALMAEFNRKYGGHIGFAAHAHWKGKEWPEFVRNYAPWWATHTLDWLKFGKKVLVVHFEDLKQDLFVQLGRMIRLLGVAAHEDRLLCVESQKDGNFKRSGLRKLEYDPYTADMQKTISAYIKMVDAALKGRNLTGVPDDYYPR	477205	446713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_447223_455536_455738_469100_469266_477108
832564	contig_16860_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_155340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAATGAAGGGAAAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99071	100080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_99100_100100
832568	contig_15244_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_118060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACAAAAAACACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615269	616288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_615300_616300
832569	contig_10489_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_165627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTTCAAACAGACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83415	82544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_82500_83400
832571	scaffold_6394_pilon	-	2100	13	Intergenic	novelGene_111064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_12	36.5797264736751	4	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	173	1354	518212	501668	FALSE	45	TGAAGCAAATAAACCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLLDVLGLALACGFVHATLSKSDAKKAASKTLLEKTQLADRPVQERGLVVMDVRAEDVVLEYRSYCSARVQERHFDGAVLGYVTPWNSHGYDVAKTFGSKFTQVSPVWLQLKRRGREMFEVTGLHDVDQGWMRAVRKNAKGLRIVPRLLFEDWTYDDFRSVLDSEDEIEELGKTMVQVAKDQHFDGFVVEVWSQLLSQKQAGLVHMLTHVAEALHQARLLAVLVIPPSVTPGTHQLGMFTHKEFEQLAPVLDGFSLMTYDYSTAQQPGPNAPLSWVRACVQVLDPKSKWRSKILLGLNFYGMDYSASKDAREPIVGSRYIQMLKEHRPQLVWDSQAAEHVLEYKKSRGGRHIVFYPTLKSVQVRLDLARELGVGASIWELGQGLDYFYDLL	523719	500921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_501767_502099_502143_502334_502416_510408_510565_510748_510851_511977_512071_513471_513534_513800_513908_514609_514655_515506_515640_517036_517187_518101_518255_523589
832573	contig_3270_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_104505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACACAACAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374952	375328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_375000_375300
832575	contig_4125_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_25170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGCTTCTGTAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934243	933459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_933500_934200
832577	contig_9727_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_86364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCGCGAACCACCACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562455	563912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_562500_563900
832578	contig_15353_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_151966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTAATTTGCATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272295	274632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_272300_274600
832579	contig_6191_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_107833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTGACATAACTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113800	112716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_112700_113800
832580	contig_19769_pilon	+	441	5	Intergenic	novelGene_102255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1802.28831974798	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	36	374	87249	87965	TRUE	20	AAAGCTTGTTCTCCTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGHHRVLSGGEAWRPRQAGASLRELRHGHFPQP	86994	89337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87570_87867_87969_89273
832584	contig_12250_pilon	+	1426	3	Intergenic	novelGene_80529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	502	924	210457	210879	FALSE	25	TATCTACTTAGTCCACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYLHSLNPVLLHQDLKPSNVLLDLELHAKVSPFTPQPCLRPKPCPRASGAHLTQALPQPCPVGYPQPLPLDTELTRGQGLPRSLSPSLPGDKNFDPQTSIPQAHPTRPSKNHGQPGPEDSGLDPLPLRRGLRTPTQGPH	209639	211381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_209774_209988_210130_210230
832586	contig_9415_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_109874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	456	788	2027512	2027180	NA	75	TACCAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPLLPTQAGQTVTSMEPHLTGGRGAFLPCSGDVHNYPQSRPRSLSPQPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQPVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY	2027967	2026823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2026800_2028000
832590	contig_9440_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_59122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGGTTTCAACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1965385	1963288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1963300_1965400
832591	contig_12993_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_136747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTGATAGCCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179357	178663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_178700_179400
832593	contig_9727_pilon	+	830	8	Intergenic	novelGene_86250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	133.935409349249	22	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	115	768	4844	21321	FALSE	10	GACTGTTGTTACGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISTPVDINNRDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACSIALDAVKTVQFEESGRKEIDIRIKLRGSPQALSVPAQFAKGTDM	4729	21383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_4872_7376_7439_8182_8234_8327_8391_8706_8804_12793_12912_14765_14930_21250
832596	contig_10246_pilon	+	1244	7	Intergenic	novelGene_46898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_5	198.483136703236	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	71	679	144696	175125	TRUE	5	GTGCCACTTTTTTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGLIWSQRFFTGECNCEVAGYPCL	140729	176783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_175054_175202_176294
832597	SIRV6	+	389	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	257	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1882_2027_2470
832598	contig_4769_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_118007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCCTTAAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992669	991952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_992000_992700
832599	contig_4769_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_118006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCTTCATAAGAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991903	991132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_991100_991900
832600	contig_5620_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_161328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAAGCATGACTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100417	100899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_100400_100900
832601	contig_1213_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_76480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTAGCTGCTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83348	81368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_81400_83300
832602	contig_6795_pilon	-	892	6	Intergenic	novelGene_27779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	10.1862652625975	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	59	679	564070	529490	FALSE	25	TTAAACAGACTTGGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRRRFLSPPPALAPGDPAMPVRTECPPPAGASAACAASLIPPPPINTQQPGVATSLLYSGSKFRGHQKSKGNSYDVEVVLQHVDMENSYLCGYLKIKGLTEEYPTLTTFFEGEIISKKHPFLTRKWDADEDVDRKHWGKFLAFYQYAKSFNSDDFDYEELKNGDYVFMRWKEQFLVPDHTIKDISGASFAGFYYICFQKSAASIEGYYYHRSSECVLQLYPLNQ	564128	529276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_529521_542652_542784_544414_544517_547301_547410_558015_558076_563881
832603	contig_665_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_158205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTCTCAAAGAGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192986	193359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_193000_193400
832604	contig_12250_pilon	+	625	4	Intergenic	novelGene_80587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	801.796455190191	3977	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322731	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322837_328373_328449_328603_328687_332096
832605	contig_1435_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_115504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTGGCCCATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538721	537677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_537700_538700
832610	contig_10494_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_102150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTATAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841464	842761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_841500_842800
832611	contig_3132_pilon	-	971	8	Intergenic	novelGene_127430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	152.572899939401	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	196	969	229252	221678	FALSE	60	ACATGAAAAAGAACTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKVRLYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGIT	229447	221675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_221776_222117_222250_223790_223861_224854_224931_225837_225975_227106_227258_228860_228929_229210
832612	contig_18889_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_167117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGATTAAGATCCATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183507	182956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_183000_183500
832615	contig_7179_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_78147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATGTATCTACTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003158	1002257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1002300_1003200
832617	contig_385_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_177049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTCTGAATTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279036	279461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_279000_279500
832618	contig_385_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_177050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGAGTCCTCCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279410	280905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_279400_280900
832619	contig_5826_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_71524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAAGGGTTAGGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188850	187545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_-_187500_188800
832620	contig_253_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_129612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATAAAGTAGGAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72326	72896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_72300_72900
832621	contig_253_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_129613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATAGCTGCCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73095	73510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_73100_73500
832625	SIRV6	+	477	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	6	2	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
832628	scaffold_12124_pilon	-	1404	4	Intergenic	novelGene_22115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1077.96320283517	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	102	869	899419	894594	FALSE	20	GACTTGGAACAGTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGVVSYPFDTVRRRMMMQSGRKGGLLAEDPQG	899520	894058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894623_895139_895281_895908_896396_899308
832630	contig_5331_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_112797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	672	1091	510006	509587	NA	10	GTGGTTTTGCCACAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVPSTRSSAQCRPLGVLAHAPRKQQLRGMAVPPQTHAHTGSPQRVRPRARQPLLYTEHVPSTCRVCGEHPHAPSDTKATKLHSPWVFAPTRPSESFLQPVAGSPTYSYKGLQSYAPLPSGPGVSDFRQRTPRPLPLL	510677	508890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_508900_510700
832631	scaffold_13505_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_111392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAACTAGAAGAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184321	186323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_184300_186300
832632	contig_7410_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_106128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	398	724	658290	657964	NA	50	GAGAGAAAGAAAATTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLYLCFATFVLASSHCGFVFSLWSIKTYSCPTRFVNLYATVLVLYCCHNKLTTNLGLNIIIHFYRSEAPIPDSLASYSKCLAGLHSLLEALARNHFVAHSGCWQNCY	658687	656614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_656600_658700
832634	contig_16532_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_110052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCACAATTCTACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215397	215147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_215100_215400
832635	contig_17796_pilon	+	1010	3	Intergenic	novelGene_33771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATATTAGTCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13934	17665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_14011_15375_15512_16867
832638	contig_20493_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_86422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCACTCAGCAGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48290	49081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_+_48300_49100
832639	contig_9878_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_177051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAGAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4372	3938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9878_pilon_-_3900_4400
832641	contig_10016_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_117870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAACTACCAGGGCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423495	424196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_423500_424200
832642	contig_15327_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_70706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAACCAACGAGGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919784	918131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_918100_919800
832644	contig_12327_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_140694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAAAGAGCTCACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145764	1145293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1145300_1145800
832646	contig_8286_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_139791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	150	458	83790	83482	NA	30	TCGAGTCAATTCCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGSVLGTVHRLSLIFKLLRKQVASPSCGPEDLSKAPRPARGGNDIPVPGCPPSTLFPLHQVHDIRCLQVYVPPHTLDPGKNHHCMISLRGTQNETQGSQC	83939	83046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_83000_83900
832647	contig_8286_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_139790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCATTAAACCCCGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82947	82355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_82400_82900
832651	contig_9333_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_120329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATACCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351276	352642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_351300_352600
832653	contig_5571_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_75514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGTTAAGCCCCGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127352	126457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_126500_127400
832655	contig_16220_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_163625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGATGACGAAGGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54802	53492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_53500_54800
832656	contig_10753_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_105171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCAGACTCAGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456826	456506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_456500_456800
832659	contig_9177_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_32791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGCATAAAGTACCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481987	1482512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1482000_1482500
832660	contig_12644_pilon	-	1631	12	Intergenic	novelGene_44548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	77.1897950691017	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	520	1359	1654290	1529758	FALSE	80	CAAAAAGAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWLPLGPFHAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAFEYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLTEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRKIPEHVLGRIAVAVSIWLQPYEIWVT	1654809	1529485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1529862_1550127_1550210_1550302_1550372_1564675_1564716_1593651_1593717_1601003_1601053_1608763_1608832_1609758_1609800_1614602_1614673_1631094_1631163_1647252_1647302_1654155
832662	contig_11285_pilon	-	814	6	Intergenic	novelGene_5548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.541302717516	22	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	126	440	744458	741595	FALSE	25	TAAACTTTTGTCAAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQDPWGISPVQQMVASGAGAVVTSLFMTPLDVVKVRLQSQRPSVASELTPPSRFWSVSYTKWKCLLYCNGVLEPLYLCPNGCRLSPADHQGRPLLCHHDQHL	745447	741220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_741663_743662_743720_743995_744041_744159_744220_744373_744474_745337
832663	contig_3382_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_124130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCATGCTTCCCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782373	783969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_782400_784000
832664	contig_5848_pilon	+	1300	7	Intergenic	novelGene_163807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	24.5673676969177	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	3	1034	261633	357635	FALSE	10	CTTTGGCTCTTTTTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLDPNLRSAVSIARRVQDPLAELVKIEPKHIGVGMYQHDVSQILLKATLDSIVEECVSFVGVDINICSEVLLRHIAGLNANRAKNIIEWREKNGPFINREQLKKVKGLGPKSFQQCAGFIRINQDYIRTFCSYSSQHAESSTGVEVTNEKQGKKKSKTPVNVVLKPNPLDQTCIHPESYDIAMRFLSFIGGTLCEIGKPEMQQKINSLLEKEGIKKIAEGLQTTVHTLQVIIDGLSQPESFDFRTDFDKPDFKRSIVCLEDLQVGTVLTGKVQNATLFGIFVDIGVGRAGLIPIRNVTEAKLSKTKKRRSLGLGPGERVEVRVLHIDIPRSRITLDLIRVL	261630	357901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_+_261667_270160_270244_319557_319665_321756_321934_326711_326868_349903_350089_357345
832666	contig_5502_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_155002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGATGGACTAATCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448206	447124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_447100_448200
832667	contig_593_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_102033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGCTCAAAAATATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538806	537195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_537200_538800
832668	contig_7146_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_162054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCTTGACTCCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175934	177006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_175900_177000
832670	contig_6102_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_32390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGATTCAAGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1740655	1740061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1740100_1740700
832672	contig_6007_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_87914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCATAGAGAGGTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81328	80545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_-_80500_81300
832674	contig_9083_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_150135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTCAACACAGAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109021	1110155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_+_1109000_1110200
832675	contig_14682_pilon	-	1573	4	Intergenic	novelGene_139120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	111.87592333573	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	541	873	137297	119737	FALSE	10	TTGTCATATTTGTTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLK	142008	119036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_119809_122397_122529_137167_137317_141487
832677	contig_12038_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_165824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463115	464218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_+_463100_464200
832679	contig_835_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_152121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17203	15849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_15800_17200
832680	scaffold_6394_pilon	-	1181	9	Intergenic	novelGene_110953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.2082290101165	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	668	985	132415	128083	FALSE	10	GCAGGAGTCCTGTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQNKSLLELQLSNNRLGDTGVQQLCQGLGQPGATLQMLCLGDCEVTDSNNCMGDPGVLQLVESLRQPGCALRQLLLYDIYLSEAVDNHLKALEDSKPSLRIIS	145790	127886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128171_128360_128442_128504_128532_132293_132465_132715_132842_134575_134704_134926_135098_135995_136102_145703
832682	contig_21386_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_177032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74044	72796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_72800_74000
832684	contig_9482_pilon	+	2056	13	Intergenic	novelGene_44269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	4.93006648591635	29	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	82	1185	773923	793829	TRUE	5	TTTTTTCTTGTTCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAVGDLKQALPCVAESPTVHVEVRQRSSSTAKKEDIKLSVRNLLNRHNIVFGDYTWTEFDEPFLTRNVQSVSIVDTELKAKGSQPIDLSTCTVALHIFQLNEDGPSSENLEEETENIIAANHWVLPAVEFHGLWDSLVYDVEVKSQLLDYVLTTLLFSEKNVNSNLITWNRVVLLHGPPGTGKTSLCKALAQKLTIRLSNRYQYGQLIEINSHSLFSKWFSESGKLVTKMFQKIQDFIDDKDALVFVLIDEVESLTAARNACRAGTEPSDAIRVVNAVLTQIDQIKRHSNVVILTTSNITERIDVAFVDRADIKQYIGPPVSGCHLQDLPLVLGGAHEVSDHLPSPAAADPAGAGDDRLHREQRV	773841	796624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_774015_775545_775712_779879_780010_780675_780732_781733_781825_784686_784760_787534_787599_788388_788476_789042_789150_792108_792264_793746_793860_795235_795306_795853
832685	contig_15952_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_154054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208543	208280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_208300_208500
832686	contig_12644_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_44496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCACGAGGCAGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036287	1035847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1035800_1036300
832687	contig_16535_pilon	-	1440	5	Intergenic	novelGene_167723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	19.2093727122985	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	70	678	445836	443724	FALSE	20	GTGTCATTCTTACTGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAALQAPGVALDVGSSVWAVSMPGASAPEEKGWAKFTDFQPFCCSDSGPRCSSPVDTDGGDVQGGPNQCPEKTPSPTHPSAWNTCVPRKAPPIASGGSCSETLDREDIEQNTGSIREGVGSDFSQETPPRATEAVTRRADHTPSMPLDSAPWGPAAHSITADATSTALNEAGSPKAALVTSTALAVVAPPGPIVAVTTVAPLGTKDRKTDAPPSVGATANGPL	445905	442961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_443776_443862_444070_444692_444886_445589_445679_445768
832688	contig_9049_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_83165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACATAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138154	137118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_137100_138200
832689	scaffold_14128_pilon	+	185	3	Intergenic	novelGene_169519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	362.5	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGAGGGTTTTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118445	323673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_118471_316127_316218_323603
832690	contig_8412_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_118368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATAGATTAGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525170	523383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_523400_525200
832691	contig_7056_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_43736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGGAGTAGTAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080919	1080577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1080600_1080900
832692	contig_7056_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_43732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGCTTTTGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079901	1079464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1079500_1079900
832693	contig_13992_pilon	+	2289	4	Intergenic	novelGene_147656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.46337971105226	30	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	56	715	674660	680253	FALSE	20	CTCTGAAGTTACAGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPEFATGAPGARVIVTDTWVMKVTTYHVHVAQQQDVHLTVTESRQHELSPDSNLPVQFLTIRVAGTNPYVKAFDIRLNSAEYGELCEKLRAPIRSAAHVVIHQSLGDLFLETFASVVEVNPAYSVPSSQELEVCIGCMQARAAVKLVKTCQEADAGQCQQCYCRPMWCLTCMGKWFASRQDPQHPETWLASRVPCPTCRARFLHPGRVHHPLTATLA	674604	681827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_674675_678802_679021_679748_679909_679986
832696	contig_10958_pilon	+	1852	6	Intergenic	novelGene_5349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1172	1510	769326	769664	TRUE	30	TTAAGACCCCAGACGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQAERRQRGQSRGPEEGKHGPTTVRTAGPDGEGPVRCTVASRATGRFEAEKMAQSNSHLARLLQWQLGHEAGQAMRLGHQSGPCNHWMRSNSLNQGNNTGVLRKGTSFRGT	764744	770757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_764968_766458_766559_766694_766872_767187_767289_768755_769753_770503
832698	contig_12638_pilon	-	524	3	Intergenic	novelGene_33151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	492	junction_2	676.5	5429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGTGGTCTGTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204301	202787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_202980_203780_203912_204100
832699	contig_5765_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_141366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCTTCTGTTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427374	427075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_427100_427400
832700	contig_6710_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_98181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	653870	653562	NA	15	TCCCTATTTCAGCCTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653870	653466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
832701	contig_10734_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_51259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTACACCAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282808	1284990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1282800_1285000
832702	contig_10734_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_51168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGGCAGGCAGTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999862	999075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_999100_999900
832703	contig_5918_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_99581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924290	1922825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1922800_1924300
832704	contig_11855_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_67084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAATTTAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2325493	2323991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2324000_2325500
832705	contig_10352_pilon	+	764	2	Intergenic	novelGene_49606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	417	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGATATAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20729	22800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_21430_22736
832707	contig_2940_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_81911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAATACTCTAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508259	508580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_508300_508600
832708	contig_2940_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_81912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGTATTTATATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508830	509466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_508800_509500
832709	contig_3942_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_128844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364115	1365426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1364100_1365400
832710	contig_13215_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_145891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACTTTTGTTTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116936	117760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_116900_117800
832711	contig_5062_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_157867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAAACCCATTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977513	975983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_976000_977500
832714	contig_1706_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_155030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGCCGGCCTGCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15847	14225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_-_14200_15800
832715	contig_5782_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_162131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346195	348136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_346200_348100
832717	contig_1244_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_37946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821733	819437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_819400_821700
832718	contig_12010_pilon	+	596	4	Intergenic	novelGene_160943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	177	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCTGCGGCCCCCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183290	195435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_183420_184223_184348_189364_189539_195266
832719	contig_2069_pilon	-	1495	8	Intergenic	novelGene_23549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	9.19405309125948	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	119	1357	1549787	1523054	TRUE	55	AAAGAAATGTCAGAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQEKYPSERISQASSPGSSVFQKGSSLGTEWQTPVISEAFRSRFSRCSSVADSGDTAIGTSCSDIAEDFCSSSGSPSFQPIKNHVTIPTAHVMPSTLGTSPAKPNSMPAGPSCSKLPLSGSAESVGMTRNGDLSAMKRSPGLSRDLMYLCGAAGENAIEQSWFPAVGHEREKEVRKFDIPSMESTLNQSTIMETLYSDPHYRVHFHNPRTDTNKELYKVLPEAKKAPGSGAVCERNGPHPSSSGVLPLGLQPAPGLSKPLPSQVWLPNPDPWHPRERSCELSTCRQQLELIRLQMEQMQLQNGAICHHPTSFAPSLPTLEPAQWISILNSNEHLLKEKELLIDKQRKHISQLEQKVRESELQVHSALLGRPAPPWGCLLAEAAGIAAREHFLTCTVCTEDRSLKQRKDRA	1555752	1520245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1520281_1522950_1523137_1524547_1524667_1525316_1525451_1526270_1526966_1546890_1547044_1549732_1549806_1555652
832720	contig_13744_pilon	+	1187	5	Intergenic	novelGene_77175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.8516842425803	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	55	702	646062	648879	FALSE	0	CTTTCTTTCTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAESGEDGDLSRLGHRPPMERTPSDDTGPIHVPFGYVVASEKWRGSQLAQGMQGKIKLIFEDRLTPVDFYLSHRSCILYITEADLVAGNGYRKRLVRVRNSSNLQAIVLVEKTQMIEQYFPAVQKFTVLDLGMVLLPVASQMEASCLIIQLVQEQTKEPSKNPFVRKKCALLSEPSLLRTVQQIPGVGKVKAPLLLQKFPSIQQLSNASIQELEQVVGRAVAQQIHAFFTESR	645704	649364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_645752_646054_646168_646276_646417_646621_646775_648630
832721	contig_1443_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_28267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAAAAATACAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745866	745281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_745300_745900
832723	contig_9195_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_155697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGTCTCAGCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792876	792552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_792600_792900
832724	contig_5623_pilon	+	1469	2	Intergenic	novelGene_154871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273577	275105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_274926_274984
832725	contig_7004_pilon	-	1371	7	Intergenic	novelGene_126477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	93.814385298252	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	108	1025	400178	397565	FALSE	15	GTATAGTTCTTCGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHALCICSRGTVIIDNKRYLFIQKLGEGGFSYVDLVEGLHDGHFYALKRILCHEQQDREEAQREADMHRLFHHPNILRLVAYCMRERGSKHEAWLLLPFFKRGTLWNEIERLKDKGNFLTEDQILLLLLGICRGLEAIHAKGYAHRDLKPTNILLGDEGQPVLMDLGSMNQARIHVEGSRQALALQDWAAQRCTISYRAPELFSVQSHCVIDEQTDVWSLGCVLYAMMFGEGPYDMVFQKGDSVALAVQNQLSIPQSSRHSSALRQLLASMMTVDPQQRPHVPVLLSQVEALQPIPPGQDTTQI	400285	397218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_397704_397832_397955_398375_398472_398595_398717_398884_399019_399327_399548_400092
832726	contig_10801_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_74066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTTCACATTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369171	370589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_369200_370600
832728	contig_7078_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_130190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCAAAACTACAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789361	790953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_789400_791000
832729	contig_15354_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_65774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTACATGGGGGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689385	688773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_688800_689400
832731	contig_8445_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_177054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGGAAAACAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101979	102536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8445_pilon_+_102000_102500
832733	contig_11978_pilon	-	740	4	Intergenic	novelGene_62868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	16.1314048434171	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	393	503	601192	601082	FALSE	0	CTTCTGCCTCCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVITVRVQDPRVQNEGSWNSYVDYKIFLHTNSKAFTAKTSCVRRRYREFVWLRKQLQRNAGLVPVPELPGKSTFFGSSDEFIEKRRQGLQHFLEKVLQSVVLLSDSQLHLFLQSQLSVPEIEACVQGRSPMTVSDAILHYAMSNCGWVQEERQGSSHLAKGDQPKR	603360	600844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_601299_601508_601605_602843_602945_603271
832734	contig_20868_pilon	-	2782	19	Intergenic	novelGene_175397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	31.5802426905662	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	921	2763	20	2782	150621	90760	FALSE	5	TGCTTCGGATCCCTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRIYILFLLDIPCDIRHVSPRKIECTTRSPGKDARLTAPQAGNRGLLFEVGDAAEGLDLTEATPGYRWQIVPNASSPFGFWSKEGQPFRARLSGFFVAPETNNYTFWIQADSQAALHFSWPEDPRTKVEVASIRVGTADWFDSWEQNGNEGTWHRKTPKLELLGGVKYYLEAEHHGISPSRGMKIGVQIHNTWLNPDVVSTYLREKHQIRARAQRLPEVQMLNVSGRGNFFLAWDNVSSQPIPANATAQQIQTAIEELLAVKCKLEPLSANILLWLGFEQGPQGSSSDGEFTSTTEPFCGRFSLHQPRHLVLTPPAGQKGYQLDQYAHLCFAYKGYMNGVLKMILTFTTDFQSIEKNITCDWSPVETKPESWLFTCTDLWETCVHPSGYLQPPLANSSVLVHRIDLLPLAQEMGLFYVDEIIITDKNLTVSQADSGTARLGGNLVESLSVVGSPPVYNVTFWSAGCGTELPLITARSLQAEGTEEGSELVQETTRRLQRTSPPLGGHFRIQLSNTVIPGVPVHISAGQLHKLLQNSADDFTSRYLNVSDLTVKEDLSTCYEHVWTLSWSIQIGDLPIFIRVSDENLTGVNPAVTTRVLYDGGVFLGPIFGDMLVTANQRTQVVVRVNDIPAHCSGSCSFQYLQGSTPQVHSAWYSLDNDTNLLVHITGTGFSDDSQALRVAVNITSCEVIFSNLTYVICHMGMLSVGVHWISMLVRPSGLAINASGEGLFLHVEPRLDAVEPCRAAEIGGLWATIRGSGLEGISLVLFGSQSCAINVNTSNSQRIQCKVPPRGNDESIVNVTVIRGDHSAVLPAAFTYVSSFNPVILSLSRNRSNLAGGDTLFIGMTLLENYTELDVEVLIQDTWAQLHAQTAQGLEVVLPPMPTGLHRISVSINGVGIRSQGVDLHIQYLTEVFDIEP	150640	90759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20868_pilon_-_90809_91463_91660_96403_96540_102397_102529_112714_112991_113663_113770_115395_115519_116652_116838_120083_120212_122780_122920_134253_134430_135848_135977_137359_137503_138482_138574_138679_138770_139735_140015_141571_141687_147410_147553_150491
832735	contig_665_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_158194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111249	110246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_110200_111200
832736	contig_11493_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_143648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAAAAAAATCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81023	79950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_80000_81000
832737	contig_6823_pilon	-	606	3	Intergenic	novelGene_131218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	6.5	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGTTTCACTTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257623	248475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575
832738	contig_3942_pilon	+	677	5	Intergenic	novelGene_128787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.38484800354236	291	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	28	537	797066	799027	FALSE	10	GCTCCACCGTCTGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGANPGLPVMITAEEAASAPGAPGRAEPAWPWKGAPVHALVQRIHQLQAERAQAFRRLEEAHRQYVRSGPHYDFPRYRGSVHKVTQAFAAASREVLALEAELAGPRAQPLLAGHVRALQQLEQTRLATVALLQLMGAPELRGQEDASQMHQLKMKVIKTMEAISEVLQDLRFDAESVE	797038	799167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_797135_797228_797312_797619_797825_798333_798414_798954
832739	contig_5452_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_101037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	324	794	635502	635032	NA	10	GTGCCCCAGCAGGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYQHSCQLRVIVNFSDATKGIYDMSHLSHWFCFPLQLDWLKSWSVLTSHCQLLLSNLTDWKVCTVYSALLGGRPFMYSLWFWKKRNHHLQTDSRKTASPKKKTNSFLLWFFALSPLHIFDRTVSLCISKAVCIWRKAPHHFLNRLVFLPYHPPKM	635825	634301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_634300_635800
832740	contig_12622_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_5814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	53	361	357322	357014	NA	50	GAAAAACCTACGAATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLCSVVWDYDKAKEKSKMATLRPGTPEYNGDVFKRVHVCCLWEEEDSEWELSRKKKTNSELNYRNLETSDLTSTRRVKKGSFGLNPNINTFSSLILYLNNFIYTACVKEARDTNPQRNN	357374	355800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_355800_357400
832741	scaffold_12124_pilon	-	1079	6	Intergenic	novelGene_22182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	102.850182304165	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	233	523	1333065	1242319	TRUE	5	TGAGCGTGGGCTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPRARSHRPGGSLCRRGFGRDRAQPRAPFPARRGGGVRETSPPAQVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAIATRPTEPTPRASWPWSSSPTTSSACWPPRGAT	1368147	1229089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368007
832742	SIRV3	-	441	3	Genic_Genomic	SIRV3D	novel	161	1	NA	NA	-1941	594	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8622	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACCTCATAGAACAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6703	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV3_-_4080_4567_4784_6550
832743	contig_7359_pilon	+	1694	5	Intergenic	novelGene_139862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	27.267196408872	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	109	684	325382	331676	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRGSGCTMLPYVVPSGNVVVLTPSDFSMSRAERSELPNQDDRGKGLKNEVKVLGTLQVLAGMMIMSLGITLGCTVTSHHFSPIVSTLMKSMYPFIGAKCFIVSGLLSLILEKRFNKHLAWSTLAINITSLLAAAVGFIILTFNLAAMPAARERCLQNASPPLEGFYYSRSEATNCLVVSSILLVSIFR	325273	332686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_325402_326900_327052_328428_328564_329401_329459_331463
832745	contig_14744_pilon	+	708	3	Intergenic	novelGene_65908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	63	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	51	707	69238	238344	FALSE	40	GTAAGAGACACAGGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESDQGSPDVHNYPDMEAVPLLLNNVKGEPPEDSLSVDHFQTQTEPVDLSINKARISPTAVSSSPVSMTASASSPSSTSTSSSSSSRPASSPTVITSVSSASSSSTVLTPGPLVASASGVGGQQFLHIIHPVPPSSPMNLQSNKLSHVHRIPVVVQSVPVVYTAVRSPGNVNNTIVVPLLEDGRSHGK	69187	238345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_136799_136890_237798
832747	contig_3077_pilon	+	1891	1	Intergenic	novelGene_26850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATTTATCTAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728178	730069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_728200_730100
832748	contig_6079_pilon	-	1189	5	Intergenic	novelGene_160125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	111.451783296635	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	95	631	548810	529723	FALSE	45	GTCTTAAAAAATCAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKALTAKNGGREKKVIHPYSRKAAQITREAHKQEKKEKLKNEKALRLNIIGEKLQWFQNHLDPQKVAYSKKDACALTESYLDRFCSELEQIELHNSIKDRQGRRHFSRETAIKQTMERERQRYEGYGLGAFAVIFFPKICSTFYVRSVIHFTGLTFLSCLCSSVVFSFFDCLPFVSV	548904	529164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_530021_531161_531247_532395_532434_542333_542447_548807
832749	contig_20844_pilon	-	532	3	Intergenic	novelGene_78606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_1	63	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCACGTGCTCCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205676	204724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376
832751	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
832753	contig_12080_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_128362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACCATTATTTTTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98665	100034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_98700_1e+05
832754	contig_2069_pilon	-	563	3	Intergenic	novelGene_23530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	84	563	1509802	1508371	FALSE	10	CATTGGCATTGTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIDQFPVILNLLTLEPLPPSPGPFSSNCSHLSSIQRQHSLPTSLKQQLQCRLSQPALRLPPCLVLADRYLCWCHQPGLCQRPRNPCPGSTQRQLNVPF	1509885	1508370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508659_1508966_1509111_1509754
832755	contig_8420_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_69373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259672	260910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_259700_260900
832757	contig_6440_pilon	-	1387	5	Intergenic	novelGene_161664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	80.9706737035082	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	414	905	42364	30428	FALSE	60	AAAAAAAAGCTTTAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSLSRAVAGGDEQVAMQCAIWLAERRVPLSVQLKPEVAPSQDIRLWVSVEDAQMHTVTIWLTVRPDMTMASLKDMVFLDYGFPPALQRWVIGQRLTRDQETLHSHGVRQDGDSAFLYLLSACNTSLNPQELQRERQLRMLEGEAVFLSNTVLEGTPPPRLT	43906	29945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_30689_30801_30896_42227_42373_43159_43511_43852
832758	contig_10003_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_88234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAATAAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652217	650441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_650400_652200
832759	contig_1090_pilon	-	367	3	Intergenic	novelGene_131167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	932149	928455	FALSE	45	AAGAAAAGTAAGTTGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGDLDSCLDIMIEIFNHELFGAIAEEKEVKQILSKIMEARRSKSYDSYEILGKFVGKDQVTKLILPLKEILQNTTNLKLARKVHETLRRIIAGLIVNQEMTAESILLLSYGLVSENLPLLTE	932179	928453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_928614_930860_931029_932140
832760	contig_8712_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_58847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	294	885	1492	2376	650446	649562	NA	25	GGTTAGGTTCAATTGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCHLCVASCVISVWPHVSSLCGLVSSVWPRVSSLCGLVSSLCGLMCHLCVASCHLCVASCHLCGLVCHLWPRVISVWPRVICVASCVISVWPRVSSLASCHLCGLVCHLCVASCHLCVASCVISVWPRVICVASCVISVWPRVISVWPRVSSLCGLVSSVWPRVSSLCGLVSSLCGLVCHLCVASCLLCVALCVTWCGPTQKLSPFAGFHRKSALSMERVEGAFPDDLGVVRVSFLISLIPSLLSPHPMAPRLPPGDTGPLSLCQKLWRPASPLSLLGSAHIPALAKLSPAV	651937	649556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_649600_651900
832761	contig_8357_pilon	-	457	2	Intergenic	novelGene_39675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	77134	75758	FALSE	20	ACCTCAAGACTGTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTVGPRVKRAGPLDCQGTPHQPSTPVKASQLENRGAAGHPAKALPTNCLSEEEVAKKRKNLATYCRPVKTKHCQAGAPANAACSVRRKKPGPPLAFEEKCSTLKSKAH	77134	75630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_75773_76819
832762	contig_9436_pilon	+	1259	5	Intergenic	novelGene_60897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	5.44862367942584	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	19	513	393187	395444	TRUE	35	TGAAGAACACAGTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPGLRIMAGVETGNAAGAEAPQPQKRYYRQRAHSNPMADHTLRYPVKPEEMDWSELYPEFFAPLTQNQSHDDLKDKKEERPQAQVEFADIGCGYGGLLVELSPLFPNTLILGLEIRVKVSDYVQDRIRALRAAPGGGFQNIACLRSNAMKHLPNFFRKGQVGRGPAGLGW	393168	396511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_393300_394038_394203_395226_395620_395777_395880_396042
832763	contig_1275_pilon	+	380	3	Intergenic	novelGene_108852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATGGTAGCATAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746568	748101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747692_747783_747873
832764	contig_3825_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_78051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTCTCTCAATTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2594983	2596843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2595000_2596800
832765	contig_8149_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_169952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTAATTAAAAATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520090	520642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_520100_520600
832766	contig_7057_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_123255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAGAAAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542590	543512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542600_543500
832767	contig_7898_pilon	-	404	2	Intergenic	novelGene_47578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTGCGGGAAGGACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487531	484221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_484360_487265
832768	contig_4686_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_118596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCTAGAGGGATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861803	862828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_861800_862800
832769	contig_6479_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_160603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCGAAGTATTAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74347	75142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_74300_75100
832770	contig_8291_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_99945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAACGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219934	219511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_219500_219900
832772	contig_13019_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_176937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACACATATTGTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7765	6810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13019_pilon_-_6800_7800
832774	contig_5485_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_37770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	308	927	146	1072	608080	607154	NA	75	TCTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPNWGRYGGSSHYPPPPVPPPPVALPEASPGSGYSSSTTPSAPSSSGFMSFREQHLAQLQQLQQMHQKQMQCVLQPHHLPRPPLPPPPVMPGGGYGDWQPPPPPMPPPPGPALSYQKQQQYKHQMLHHHRDGPPGLVPMELDSPPASPPVPPGSYMPPSQSYMPPPQPPPSYYPPSSSQPYPPPAQPSPSQSPPSQSYLAPTSSYSSSSSSSQSYLSHSQSYLPPSQASPSRPSQGHPKSQLLAPPPPSGPSGNKTTVQQEPLESGTKNKSTEQQQAAPEPDPSTMTPQVRKHLLAPNLFTKRALSE	608225	606811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_606800_608200
832777	contig_15114_pilon	+	1151	6	Intergenic	novelGene_121205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	70.6127467246531	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	236	946	785166	821723	FALSE	30	GATTTAGCAATGAATGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVKRGDESQFLLQAPGSSELEELTVQVTRIYNGRLKVQRLCSEMEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQAELSVIKESEAQLWWAAKELRRTKKLSDYVGKNEKTKIIVKIQQVTLLGARNMSPDVS	784930	821928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_789237_789406_791308_791377_793688_793848_795328_795461_821678
832778	contig_10594_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_142310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTACATTTATCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227036	228724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_+_227000_228700
832781	contig_9871_pilon	-	1121	5	Intergenic	novelGene_75666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	21.0356839679626	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	143	625	435650	430437	FALSE	30	GGAAATTTTTCTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTQCDVNCCCDPDCSSTDFSVFSACSVPVVTGDSQFCSQKAATYSMNFTADPPQRVFKLVDKINPSIFCVHITNYKPALSFINPEVPDENNFDKFMKTSGGFAPNADSDVSSTTRLDSPNTSAKYEYGVPLQTLDSFLRFPSPLTSSLCTDDNPAAFLVNQAVKCTRRINLEQCNETEALKMASYSRPEILKVRIILNWFVRYDF	444816	429940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_430589_432207_432296_434308_434464_435562_435694_444717
832782	contig_9871_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_75664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCTGAGCCCTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429812	429373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_429400_429800
832784	contig_10616_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_175611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCCCCAGTGCCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021806	1021148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_-_1021100_1021800
832785	contig_7342_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_71144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGTTCTTGCAGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309660	308043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_308000_309700
832786	contig_1146_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_84833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAACTCTTACCTATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894706	894190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_894200_894700
832787	contig_15543_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_164364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATTTGTCTTGCCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217967	219339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_218000_219300
832788	contig_7171_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_101244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATGTACCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735572	736048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_735600_736000
832789	contig_5649_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_82420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	786	1187	1349597	1349998	NA	15	TATGCTGACTTTTCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKSALPTPTMMMDIGSLEACTTACRVSSMSLMTPSVMMRRMKYCCRERVKWALSRALRPLVPFPSLPHPSKTSLIPWKVVLLPHLQPNLSHLPGQPAPWVLCPCRPCIHRNTALVTAQSTHCLFLPPWVPS	1348811	1350688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1348800_1350700
832790	contig_10196_pilon	+	1444	7	Intergenic	novelGene_132260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	196.042016471526	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	132	1280	1998353	2000239	FALSE	0	CTGTCTGGGCTGCCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPYAGDRRHPIFFKRKLDPAEPFAGLASSALSVFETEAGGSCMSWFVDTARRYALAGRPLAELCDHNAKVARELGRNQVAQTWTMLRIIYCSPGLVPSTNLNHSVGKGSSCGLPLINSFNLKEMAPGLGSETRLDRSKGDTRSDTVLLDSSATLITNEDNEETEGSDVPADYLLGDVEGDDEELYLLDPDHTHPEEPEYVLPQEAFPLRHEIVDTPPGPEHLQDKADSPHVSGSEADAVSLAPVDSSFSLISVSHTLYDNRLPPDFFSALVRDMLRFYAEQGDVQMAVSVLIVLGERVRKDIDEQAQEHWYTSYIDLLQRFRLWNVSNEVVKLSTSRAISCLNQASTSLHVNCSHCKRPMSGRGWVCGRCHRCASMCAVCHHVVKGLFVWCQGCSHGGHLQHIMKWLEGSSHCPAGCGHLCEYS	1998221	2000403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1998461_1998705_1998825_1998914_1999037_1999121_1999227_1999326_1999668_1999794_1999980_2000070
832791	contig_5782_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_162128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCAGCACCGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332472	330955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_331000_332500
832792	contig_615_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_80052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	45	326	78902	58827	FALSE	30	GAGCCAGTGTATTAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGELILDRHNFAIMTKYISRPENLKLMMNLLRDKSPNIQFEAFHVFKVFVASPHKTQPIVEILLKNQPKLIEFLSTFQKERTDDEQFTDEKNYLIKQIRDLKKTSP	78946	58599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_59007_78800
832793	scaffold_14128_pilon	+	1228	2	Intergenic	novelGene_169527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	118	junction_1	0	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	453	752	318134	318433	FALSE	45	TAAAGAAATGTTGAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLPSCGIRDGLQSNKKYFRAISSSVCPSVMPISQPLTEVVLSSTLQRCSWSFSVCNLQSRRSEMTGMHSLGSLDSVGSLNSSGLKKISLFIIIISAC	316175	318909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_316218_317723
832794	contig_10609_pilon	+	957	5	Intergenic	novelGene_123965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	76.296707006266	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	37	873	574055	593201	FALSE	25	TTATTATAGAACTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKQDLINLLITQATPHVAPVMPLDRFITDFYMTVNNYWILNAQHINLTTLSVAGGFRDYQVRSGLTFLPQLSHHTSALSVVVIFFSIFLT	574018	593285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888_585065_589691_589864_593013
832795	contig_10609_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_123969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGAGGAACACAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593391	593901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_593400_593900
832798	SIRV6	+	409	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	350	541	177	49	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGCTATTGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480	1999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
832799	contig_5684_pilon	-	882	4	Intergenic	novelGene_81008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	188.681389295995	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACCAGTTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326550	312669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_313062_315407_315614_316151_316350_326464
832801	contig_14807_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_124744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283600	282514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_282500_283600
832802	contig_12324_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_166654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCATACATCTGCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165128	166192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_165100_166200
832803	contig_6375_pilon	-	947	3	Intergenic	novelGene_73023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	11	529	440438	435980	FALSE	30	GAGCTGCTGCAGAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALASVLQRPLLVNQRGVFGLEGRADLLDLGPGSSSDGLSLAAPKWGVPEEPGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAVDSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRPLLCGQ	440448	435561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_436002_439210_439510_440240
832805	contig_11483_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_172691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAGTATAAAGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115426	115981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_115400_116000
832806	contig_12886_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_135495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAACTTACAGCGACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465482	466347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_465500_466300
832807	contig_18420_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_109335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1431	1730	46034	45735	NA	30	TTGCTGAGTAGTATTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREVQGTLHPVLVSCVTTGQYHDQEMDTGAICRARSDLHTSLCVCGSVRSHLVCSVMLPPPQSRYRIFSSLQEWFLVPFYNHTHFPPIPTSSLIPDNH	47464	45587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_45600_47500
832808	contig_12078_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_74116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACATGAGTATTTCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410971	411916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_411000_411900
832809	contig_11105_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_159820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGAATGTTACACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274931	276743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_274900_276700
832811	contig_4364_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_93	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATCTTTATCATATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894587	893138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_893100_894600
832815	contig_6760_pilon	-	1100	5	Intergenic	novelGene_150796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGAAAAGACAGAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192505	188078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_188605_189357_189599_190671_190721_191625_191851_192446
832816	SIRV4	-	407	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1082	32	1082	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	22	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGTTTAGAAGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4076	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3700_4100
832817	contig_401_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_42765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029035	1030373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1029000_1030400
832818	contig_2863_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_174058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATGAAATAGAAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9878	8909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_-_8900_9900
832823	contig_6842_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_130665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAAGCTATCTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271531	270283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_270300_271500
832824	contig_8710_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_73501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATTGTGCCTGCGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180365	179808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_179800_180400
832825	contig_8286_pilon	-	1397	2	Intergenic	novelGene_139815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	796	1209	225402	224989	FALSE	30	TTTCAATAGTGTTGCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIEKNGNSRTLNRDHEESVRRRRGSRLNRTRGYCINNLRYADNTTLEEVQPECSLEANMVRLRLTYYGPVIRRNQFLEDIMLDKVKGQRKRGRPSTSWTDTVAATVGSNMAMIVRVMQDQAVFLSIVRWVAMSRN	226799	224800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_225787_226388
832826	contig_11719_pilon	+	490	5	Intergenic	novelGene_154736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4417	junction_4	1114.11071599729	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	35	490	13921	19182	FALSE	15	GTGAGTATCCCTGATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASAWDAPVATMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQF	12999	19182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14504_16247_16326_19126
832827	contig_9345_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_24736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093925	1093249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1093200_1093900
832830	contig_14326_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_120779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGTCAGTGAAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827224	828309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_827200_828300
832832	contig_11678_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_160825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAGGTTAAGAATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35531	36187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_35500_36200
832833	contig_11678_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_160826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGTAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36291	36598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_36300_36600
832836	contig_348_pilon	-	595	2	Intergenic	novelGene_67580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGCTGTGACATCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168368	166992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_167209_167989
832837	contig_20844_pilon	+	697	8	Intergenic	novelGene_78598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	326	625	206889	208346	TRUE	20	CTGCGGGGACAAGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVMETSSLTVVVATLGPGGSNSEFPNFFQFFLLATAFEAFRVSIRKVRTIFNFLPSSSILYSVTVLMFPLMTSLGGGSDLPAVAQALGWCRQRPEGSP	204723	208981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_204849_205183_205289_205377_205438_206853_206981_207877_207940_208088_208173_208284_208373_208935
832840	contig_12050_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_62728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGCTGTGTCCTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683358	684269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_683400_684300
832841	contig_12050_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_62727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTTTCCAAAAGAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682245	683273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_682200_683300
832843	contig_8412_pilon	-	1045	2	Intergenic	novelGene_118406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCACCTTCCACACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806246	805146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_805228_805282
832844	contig_13905_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_130416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAATATTTATGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90008	88041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_88000_90000
832846	contig_610_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_76696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTGTAAGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194648	194192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_194200_194600
832848	contig_4505_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_176043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAGAAAGGGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210707	209440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_-_209400_210700
832849	contig_9437_pilon	+	1515	14	Intergenic	novelGene_141709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	87.0450471691893	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	645	1445	153899	195809	FALSE	20	GCTCTTGTGAAGATCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFKGRIQRLECQINSALTSFHSALELAVDQREIQHVCLYEIGWCSMIELNFKDAFDSFERLKNESRWSQCYYAYLTAVCQGATGDVDGAQIVFKEVQKLFKRKNNQIEQFSVKKAERFRKQTPTRVLCVLASIEVLYLWKALPNCSFPNLQRMSQACHEVDDSSVVGLKYLLLGAIHKCLGNSEDAVQFFQRAVKDELCRQNNLYVQPYACYELGCLLLDKPETVARGRALLLQAKEDFSGYDFENRLHVRIHAALASLRELVPQ	76457	195879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_76484_130484_130534_140918_141048_142526_142642_151570_151760_153762_153932_175815_175910_179162_179271_184931_185042_186528_186653_190862_190961_192107_192213_194006_194046_195719
832850	contig_9580_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_167735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAATCCGGGGTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831376	831819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_831400_831800
832851	contig_11186_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_98883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGATGATTACAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282927	284160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_282900_284200
832852	contig_1996_pilon	+	791	8	Intergenic	novelGene_131905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	191.762076223509	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	157	489	252360	255079	TRUE	5	TCTCCTGCGTGTTCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSARSEHVLTQPWPPRYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLPAGHGEGQGGPAHHHKGRQGQPQPLRRRRRLALHHSDGQAAPGDPSYGRSSLTCGS	251553	255580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_251662_252200_252230_252340_252383_253913_254050_254174_254272_254882_254935_255054_255122_255320
832853	contig_9988_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_113056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATGCCTCTATCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105793	106916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_105800_106900
832854	SIRV6	+	363	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	337	600	164	-10	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCTGCTTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
832856	contig_7976_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_169413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTCTTTCAAACCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813193	814183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_813200_814200
832857	contig_6958_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_69973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671558	673268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_671600_673300
832858	contig_8269_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_106211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAACATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209595	208354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_208400_209600
832860	contig_12802_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_114245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATAAAAATCTCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82692	80312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_82040_82625
832861	contig_1009_pilon	+	1530	10	Intergenic	novelGene_121720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	88.8481851249647	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	284	1492	99747	189475	FALSE	80	AAAAAAAAAAATACATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSAQLSTTERVIKAVPFPPTQRLTLKEVFENGKPKIDVLKSHLVKEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECRIKYSEDVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITCLDDIKKLDRFKEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGSEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDEESLEGKFAFSSFELETKKFQFWFVF	99463	189513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_99796_142330_142529_143089_143215_169778_169891_179433_179580_181526_181667_183899_183978_184062_184158_188479_188606_189335
832862	contig_4364_pilon	+	1203	5	Intergenic	novelGene_219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.94172168845741	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	186	521	1374140	1375183	FALSE	30	ACTAACATGTTGAACCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLLGAAGVGKTLLVKRLQNLSALDGTGDLGDPPPTRPTVGTNLTDIVIQKKISVRELGGCMSPIWPSYYGNCHALLFVLDASDSTQLSASCVQLLGLLSAEQLAEASVLILFNKTDLPCYMSVEEMKSLMRLPDIIARAKQNITTAEISARVGTGLAGVLRWLRDTHRTSR	1373394	1375865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1373457_1373541_1373599_1374073_1374188_1374743_1374860_1375011
832863	contig_13753_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_136508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGAAATCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117004	115628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_115600_117000
832864	contig_15020_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_87397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGATGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42674	43830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_42700_43800
832866	contig_7622_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_132433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	181	375	287154	286960	NA	75	AGAAAAAAAGAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLRKLLRKSQFLIQKFQFGNLSSTVLYLTCKAVELTRQTVIKEFLIDHTLLDFFVKSESMDHFLIEILLSFYVAILIPTSLEFLFFYNLFSHVDVLSVVLYASVSLKDLIHIYGFISELCLYT	287334	286813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_286800_287300
832867	contig_709_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_57639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCTCTCCAGCCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2984751	2983770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2983800_2984800
832868	contig_8651_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_168188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4078.43730966762	2115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	386	487	189217	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGLGSGGGWLLGLSHGEDNDIGRHPRAVGLWGWSDGRGAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185074	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185193_185619_185757_186928_187011_189168
832869	contig_12540_pilon	+	1215	9	Intergenic	novelGene_148117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	11.2131340400443	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	79	900	1160355	1165026	FALSE	15	TCCAGAGTCCTGATCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGPGNDSVPLTGLAWSSASAPPPRGFSSISCTVEGAPASFGKSFAQKSGYFLCLSSLGSLENPQENVVAEIQVLVDKSPLPPGFSPVCDPQDSRAPVSKKKRMCVKLVPLGAADTAVFDVRLSGKTKTVPGYLRVGDMGGFAIWCKKAKAPRPVPKPRGLSRDMRGLSLDPPGQPSKGSFPERTLSRLGSRASTLRRSDSIYEASSLYGISAMDGVPFTLHPRFEGKSCGPLAFSAFADLTIKSLADIEEEYNYGFVVEKTAAARLPPSVS	1160276	1165341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1160445_1160572_1160672_1160786_1160884_1163114_1163242_1163904_1164025_1164104_1164212_1164366_1164429_1164725_1164783_1164963
832871	contig_7356_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_60433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCCCAAATTGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519590	520332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_519600_520300
832872	contig_489_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_165711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTTAAAGTGCCAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228170	227087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_489_pilon_-_227100_228200
832873	contig_14516_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_153925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTGCAATAAAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264296	262554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_262600_264300
832874	SIRV6	-	372	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-186	20	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTTACAGTTACGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006	1524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
832876	contig_13379_pilon	+	1426	4	Intergenic	novelGene_175873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	18.9912260443255	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	13	813	154277	172871	FALSE	40	GGTTATTGCTAATGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACSVGLLTRVPLCAQGRGQVHRPICRLLSCPGTVAADLKREEQPSGNVGTGSEDSVLQKRFSEVQKERREEAQRTVLISCPNKISEKKFLKYLSQHGPINNHFFYESFGLHAVVEFRQKGSVASLQDAACTPSLGTEAAVPFRSRFFSVKLKNPSTSEKSSVQRSSQSPPSSKKLFELLCYAESIDDQLNTLLKASQVTEENAKLRQLTCSLIEDIAAAYFPYCTVRPFGSSVNSFGKLGCDLDMFLDLDETERLNAQKVIVFP	154264	173484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_154434_168316_168490_168954_169183_172628
832877	SIRV5	+	480	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	30	158	30	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8231	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
832879	contig_2547_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_165465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAACAAGATAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434531	433270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_433300_434500
832880	contig_4782_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_73666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGACCCTATGTACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550516	551489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_550500_551500
832881	contig_9482_pilon	+	1346	4	Intergenic	novelGene_44222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGCACCCCAGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202852	211481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_203755_209669_209800_210409_210619_211376
832883	contig_19185_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_163654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	638	1024	143791	144177	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKPSITLVSFLSTQSSSKSFLQRQCPDLDVNEVGGYSEDLSRQLVRSLLLTFLLVFKESVHPWYVRKSARFSDLSSRLTIHGLQKVLKDSFPQKVGRYLGLYSCLPSGPETYSLLKKTADKLKVSE	143153	144369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_143200_144400
832884	contig_11160_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_168797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCAACATGTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91032	91759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_91000_91800
832885	contig_6048_pilon	-	1393	3	Intergenic	novelGene_73309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	9.5	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	122	871	2119438	2102483	FALSE	5	CTGTGGTGTTTGGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLVFTVISAVIYLSFEAVSSLTKLGEVEDARGFTPVAFAMLGVSSVRSRMRRALVFGMVLPSALVPWLLLGISWLIPQTSFLSNVCGLVIGLTYGLTYCYSIDLSERVALKLDQKFPFSLMRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2119559	2101960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104907_2119275
832886	contig_8140_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_86466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAATAGGATTTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909099	907530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_907500_909100
832887	contig_6325_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_143336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92695	92359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_92400_92700
832889	contig_302_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_145014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAATAAAATTTAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84175	84815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_84200_84800
832890	contig_1154_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_87237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	30	419	1848374	1848763	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLEGREEPMPSRGTACPPAESLQGQPLTISVARASAPLRKSHIYVGPQTATRSLLQASPLPLNNRLPKTLAGAWGKFTVCNSWGCPLLLKAWTSLLSFGAFPILQESSRIKDHISKYLPTILLACLELGASCSLPIS	1848344	1849571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1848300_1849600
832891	contig_11986_pilon	-	810	4	Intergenic	novelGene_69227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_2	554.386748278372	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATAGTATTTTTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794706	768088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_768537_768639_768818_792503_792597_794615
832892	contig_10642_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_78700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTTACTTATGTACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488681	489843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_488700_489800
832893	contig_2365_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_103765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATAAAAAAAAAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277682	277390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_277400_277700
832894	contig_7272_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_25374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAGTAAGTCCTAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623365	624834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_623400_624800
832895	contig_6102_pilon	+	643	5	Intergenic	novelGene_32290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	3.278719262151	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	19	330	1474121	1483026	TRUE	30	AGAAGTCCTGGTGGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPLSYKMSHLFHSPKGKEKLSIGRMSAGDRQRDWVILPYSECTHLVRRQWSVLNHQALHLAPQAAPLVAEKALVLWLLDPNHALEWAGGKARSPTKQFKHLPQAPPSPD	1474102	1484745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1474129_1476032_1476102_1478276_1478434_1482948_1483038_1484443
832896	contig_7912_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_129582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTTTTGGCTCTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379927	378705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_378700_379900
832898	contig_10638_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_164315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGCATTAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546472	545089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_545100_546500
832899	contig_3975_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_54708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAATCTGTGTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398541	1397266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1397300_1398500
832900	contig_5039_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_64812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAACCCGATGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219036	217439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_217400_219000
832901	contig_10300_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_152926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCTAGTTTGCACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76596	76925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_76600_76900
832903	contig_19362_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_157797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCATCAGTATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52320	51546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_51500_52300
832907	contig_10581_pilon	+	934	2	Intergenic	novelGene_41449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	851	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTTCTAGTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796721	799368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_796827_798539
832908	contig_10238_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_170108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	435349	435041	NA	25	TAAGTGTCTTGGGGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDCWKVCPGASQHCVDQRLTSLSSLTPSPRVPTQGEKVCLAEPRSVSPLDCPRWRGELWEAWLSCGRRKRWVYWSVGAAWRGGVNSKKEISAGGKGNGSWEA	435350	434320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_434300_435400
832909	SIRV6	+	429	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	345	526	172	64	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGATGCAAGCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475	2014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
832911	contig_9871_pilon	+	523	4	Intergenic	novelGene_75705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1396.95796484918	200	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCTACGTCTGTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572871	584410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_583572_583630_584117
832912	contig_1639_pilon	+	1228	2	Intergenic	novelGene_74910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	863	1165	314903	315717	FALSE	30	TCAGTATTTTATGAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTTIPLSTMVTSITTGTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGQNTGNNNP	314040	315780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_315025_315536
832913	contig_15629_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_122454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTGCAGGTTCTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105132	104900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_104900_105100
832914	contig_610_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_76773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGGAATATAGGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230767	229772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_229800_230800
832915	contig_9982_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_55782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAATTTTTTTCACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658341	660352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_658300_660400
832916	contig_7056_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_43742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCATATTCCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122349	1121251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1121300_1122300
832918	contig_9668_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_58138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGCATCCTCTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305139	303896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_303900_305100
832919	contig_7327_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_172119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTTTTTTCTTTTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105464	106776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_105500_106800
832920	contig_10239_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_175248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGTCTTATTGTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45916	47327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_45900_47300
832921	contig_9002_pilon	+	909	2	Intergenic	novelGene_116729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1351	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	702	207	908	518518	521931	FALSE	35	TAAGTTTAGAAGTTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFNADASQHADENTDISEKLYQKVKILCWVMTGPQNLEKKAKHVKATWAQHCNKMLFMSSEENKDFPTVGLKTKEGRDQLYWKTIKAFQYVHDHYLEDADWFMKADDDTYVALDNLRWLLSKYNPEKPIYFGRRFKPYVKQGYMSGGAGYVLSKEALKRFVDAFKTDKCTHSSSIEDLALGRCMEIVNVEAGDSRDNTGKETFHPFVPEHHLIKGYLPKTFWYWNYNYYPAVE	518311	521932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_+_518552_521263
832922	contig_15092_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_57818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTCACTTTTTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328126	327471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_327683_327928
832923	contig_16098_pilon	+	1284	12	Intergenic	novelGene_45911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_1	58.6682788408588	274	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	141	1193	305140	336931	FALSE	5	CCTGCATCCGTCGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLGLQEVRHCPHTICTTNQSGWRHWRPGNPESRALRSSVWPVQRSSPETDRHPLYTMALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294732	337022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_305117_305152_306428_306572_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
832924	contig_15673_pilon	-	1060	5	Intergenic	novelGene_169839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_4	45.5706868502111	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	40	561	162366	159835	FALSE	15	TGAATGTTTGCTGTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSFRKASMASTSQRKRMSSKPELTDEQRREIREAFDLFDADGTGTIDVKELKVAMRALGFEPKKEEIKKMTNEIDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEEEFLRIMKKTSLY	162405	159335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_159925_160343_160482_160693_160823_161080_161243_162363
832925	contig_11227_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_163170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGATTCCTTCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98246	97475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_97500_98200
832926	contig_7456_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_177056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAACCTGCTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170228	168852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7456_pilon_-_168900_170200
832929	contig_6513_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_117785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACTTTACATAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245303	245004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_245000_245300
832930	SIRV5	-	230	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATAAACTGCTCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10868
832931	contig_7031_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_132792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGAGGTAGATAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249585	250756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_249600_250800
832934	contig_710_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_162947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGTGCTATAGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283887	285733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_283900_285700
832935	contig_3320_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_133065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACAAACTTGTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161345	160290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_160300_161300
832936	contig_9345_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_24735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGCTGATTTCACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089662	1090308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1089700_1090300
832939	SIRV4	-	280	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1243	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3915	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
832940	contig_7720_pilon	+	1469	11	Intergenic	novelGene_155731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_6	74.7222189178025	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	16	1272	164847	231575	FALSE	25	ATTAGTAGTGGTACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALSEEELDNEDYYSLLNVRREASYEELKAAYRRLCMLYHPDKHRDPELKLQAERLFNLVHQAYEVLSDPQTRAIYDIYGKKGLEMEGWEVVERRRTPAEIREEFERLQREREERRLQQRTNPKGTISVGVDATDLFDRYEEEYEDVSGSGFPQIEINKMHISQSIEAPLTATDTAILSGNLSTQNGNGGGSINFALRRVTSAKGWGELEFGAGDLQGPLFGLKLFRNLTPRCFVTTNCALQFSSRGIRPGLTTVLARNLDKNTVGYLQWRWGIQSAMNTSIVRDTKTSHFTMALQLGIPHSFALISYQHKFQDDDQTRVKGSLKAGFFGTVVEYGAERKISRHSVLGAAVSVGVPQGVSLKVKLNRASQTYFFPIHLTDQLLPSAVFYATVGPLVVYFAMHRLIIKPYLRAQKEK	164831	231772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_164919_188254_188385_190684_190759_196990_197093_215025_215155_216144_216268_217282_217357_220310_220501_221166_221253_221648_221766_231415
832941	contig_15897_pilon	+	1015	3	Intergenic	novelGene_49555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTGGTAGGGATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679294	699147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_679605_682003_682546_698984
832943	contig_13900_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_115091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14437	15380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13900_pilon_+_14400_15400
832944	scaffold_16735_pilon	-	946	2	Intergenic	novelGene_160356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1482	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364174	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_364048_364090
832945	contig_12570_pilon	-	1452	5	Intergenic	novelGene_79360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	303.709873892832	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	206	682	228467	201257	FALSE	15	AGCTGTTCTTCTAGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLIAAYSGVLRGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQSNSPGPENIPSPSRGGASVLTAANRTAGCLDEEWSVPWVTSP	228672	200486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_201386_204946_205018_205425_205534_211349_211479_228427
832947	contig_5261_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_102470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTGTATTCATAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545373	543924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_543900_545400
832948	contig_8980_pilon	-	1849	10	Intergenic	novelGene_74021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	6.57905393026109	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	229	1272	743648	730921	FALSE	25	TGCTCATAGGTTTATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDDESYISDVSDNISEDNTSVADNISRQILNGELTGGAFRNGRRTCLPAPCPDTSNINLWNILRNNIGKDLSKVSMPVELNEPLNTLQHLCEEMEYSELLDKASETDDPYERMVLIAAFAVSGYCSTYFRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFRFFSEQVSHHPPISACHCESKNFVFWQDIRWKNKFWGKSMEILPVGTLNVMLPRYGDFYVWNKVTTCIHNILSGRRWIEHYGEVTIRNTKSSVCICKLTFVKVNYWNSNVNEVQGVVMDQEGKVVHRLFGKWHEGLYCGVAPSAKCIWRPGSMPTNYELYYGFTRFAIELNELDPVLKDLLPPTDARFRPDQRFLEEGNLEAAAAEKQRVEELQRSRRRYMEENNLEHIPKFFKKVINANQREVWVSKDTYWELRKDPGFSKVDSPVLW	744354	730343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_731030_732033_732157_734455_734583_736086_736232_738305_738451_739889_739969_741593_741658_741969_742108_743534_743789_744266
832950	contig_11986_pilon	-	992	2	Intergenic	novelGene_69187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGGCTCAGTCAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596855	594313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_594404_595953
832951	contig_11986_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_69186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTACTACACTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594313	593618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_593600_594300
832952	SIRV6	+	248	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	272	11	41	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTAGTGCCGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
832954	contig_12661_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_166721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCTTTTTGTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78153	79570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_78200_79600
832955	contig_6870_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_103999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATATTGCAGTGGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522873	1523076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1522900_1523100
832956	contig_12120_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_21435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTCAGCTTAAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147107	146684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_146700_147100
832957	contig_14516_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_153892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTCAGACCAAATTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44292	42750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_42800_44300
832958	contig_6199_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_126375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAAGGCCTGGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252082	251230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_251200_252100
832961	contig_10197_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_115235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946853	947296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_946900_947300
832962	SIRV7	-	255	1	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	146664	1	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
832963	contig_6227_pilon	+	1080	3	Intergenic	novelGene_49665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	71	junction_1	82	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	113	901	495153	498022	FALSE	10	CCTCCTTGGAATTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLERITEGDNVTLLPDPWTHAGPQASDTTSSLSPNSNMTTRELQEYWRNEKCHWKHVKLLFEIASARIEERQASKFVMYQIVVIQTGSFDSNKAILERRYSDFERLQKNLLKIFREEIEDVTFPKKHLMGNFTEEMICERKLAFKEYLSLLYAIRCVRRSREFIDFLTRPELREAFGCLRAGQYTNALDILVRVVPLQEKLTSHCPVMVVPALCAMLVCHRDLERPLEAFAAGERALQRLQARESHRYYAPLLDAMARLAYTLGKDFVSLQEKLEERQLLKPTTQGLTLKELTVREYLY	488693	498201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_488774_495120_495273_497353
832965	contig_13977_pilon	-	1695	2	Intergenic	novelGene_80956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	17	316	173044	172660	FALSE	35	ACAGATATCCAGGTGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVMLWDRWLQILHLVSKRNSMKRQVIAALLQTMDDQGNQRVQAHAAAALINFTEDCPKSLLIPYLDNLVKHLHSIMVLKLQEVNFTIFVFLSPLFRG	173060	171280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_-_172882_172966
832966	contig_11594_pilon	-	892	2	Intergenic	novelGene_80948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATAGTAGCAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598212	585286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_585889_597922
832970	contig_3894_pilon	+	2512	14	Intergenic	novelGene_174753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.37761513847695	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	251	1597	427873	484137	FALSE	40	AACGTTCTGAAAATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVIAESEETQVKQENLIQLGVTKNKIMTAQYECYQKIMQDPIQQTEGLYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDPDGNWFRHPASNRTWTNYTQCNLNTHEKVKTAMNLFYLTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFKSLSCQRITLHKNLFFSFVCNSIVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWMLCEGIHLHTLIVVAVFAEKQRLMWYYFLGWGFPLVPACIHAVARSLYYNDNCWISSDTHLLYIIHGPICAALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESHLYMKAVRATLILVPLLGIEFVLLPWRPEGRTAEEIYDYTMHILMHYQGLLVATIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSFSHSEALRSASYTVSTISDSQGYSHDCPSEHLNGKSIQDIENIVLKPEKLYA	426349	485052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3894_pilon_+_426423_426601_426689_427782_427876_430118_430261_434296_434408_434510_434624_436084_436177_466144_466272_470356_470511_471778_471840_471922_471990_479608_479828_479994_480037_483921
832971	contig_11885_pilon	-	1296	6	Intergenic	novelGene_159702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	13.7025545063685	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTGATTTTTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66920	32166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_-_32937_35061_35210_51739_51817_52789_52925_57073_57180_66860
832972	contig_7416_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_134315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACACCCTATTGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44433	43414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_43400_44400
832973	SIRV6	+	392	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	279	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTGCAGTCAAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582	2539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2016_2470
832974	contig_12943_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_140359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTAGGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42967	43611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_43000_43600
832975	contig_10581_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_41430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721647	723175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_721600_723200
832976	contig_10003_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_88233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTGACCCGATAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647985	647089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_647100_648000
832980	contig_15066_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_149568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACGTTGTTGTTGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289712	290380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_289700_290400
832982	contig_8920_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_146061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCTCCGGAACTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84270	85084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_84300_85100
832983	contig_12622_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_5850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACCAGCCGCTCCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947546	948390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_947500_948400
832984	contig_13014_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_169373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTTAATTAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559297	559903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_559300_559900
832989	contig_15120_pilon	+	794	2	Intergenic	novelGene_108011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	246	647	198465	198866	FALSE	30	AACACCCAGCACAGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQTPRYDNRCRNLTQKQVTQKLAEAPKPAIRFHLEEEAPAFQDLVYGWNQHEVASVEGDPVILKSDGFPTYHLACVVDDHHMGISHVLRGSEWLVSTSKHLLLYQALGWQPPHFAHLPLLLNRDGSKLSKRQGDIFVEHFSTAGFLPDALLDIITNCGSGFAGIYPPERAQSQESIAVKSMGFGSGRPGLQSQLCHLPAEWFGASSSFLSANVY	196567	199013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_196584_198235
832990	contig_11720_pilon	+	1489	9	Intergenic	novelGene_44041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.17586189819115	26	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	187	1446	496669	502649	FALSE	15	CCTGCCACACTCCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSDFIVALKDNPYFGAGFGLVGVGTALALARKGVQLGMVVFRRHYMITLEVPARDRSYAWLLSWLTRHSTRTQHLSVETSYLQHESGRISTKFEFVPSPGNHFIWYQGKWIRVVRSREMQMIDLHTGTPWESVTFTALGTDRKVFFNILEEARELALQQEEGKTVMYTAVGSEWRPFGYPRRRRPLSSVVLQQGLADRIVRDIREFIDNPKWYTDRGIPYRRGYLLYGPPGCGKSSFITALAGELEHSICLLSLTDSSLSDDRLNHLLSVAPQQSLVLLEDVDAAFLSRDLAAENPVKYQGLGRLTFSGLLNALDGVASTEARIVFMTTNHVERLDPALIRPGRVDLKEYVGYCSHWQLSQMFQRFYPGEAPSLAEAFAEHVLKATTQISPAQVQGYFMLYKNDPAGAIHNAETLKR	495364	502692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_495387_496275_496391_496619_496989_500679_500820_501026_501222_501464_501529_501777_501948_502155_502274_502396
832991	contig_8289_pilon	+	1521	1	Intergenic	novelGene_171170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAATAGTCATTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164119	165640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_164100_165600
832992	contig_20375_pilon	+	1431	8	Intergenic	novelGene_105826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	134.092414066584	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	401	1285	37030	52857	FALSE	20	CAGCTACACCTGTCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTLRWQPSELAAGRVAGHGLQSPAGSRRVPVRPVAAPAVPAAAARGLAEDGAGARKGHPGGHRRRPVQGNAVIIKPSEVSENTAKIVSKLLPQYLDQDLYVVINGGVKETTELLRQRFDHILYTGNTAVGKIVMEAAAKHLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDIACRRITWGKYMNCGQTCIAPDYILCEPSLQSQIVQKIKETVKEFYGENVKESPDYERIINLHHFKRIINLLEGQKIAYGGETDEATCYIAPTVLTDVDPEAKVMQEEIFGPILPIVPVKNADEAIKFINDHEKPLAFYIFSRNNKLIKRMIDETSSGGVTGNDVIMHFTLSSLPFGGVGSSGIGAYHGKHSFDTFSHQRSCLLKSLKREGINKLRYPPNSQSKVDWAKFLILKRFNKGKLCLLMLTVLGIVAAVLIKVSLQCS	31735	53003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_31942_34676_34763_36921_37131_38335_38454_40445_40588_44736_44904_46452_46553_52600
832993	contig_7333_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_142747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	321	644	49887	50210	NA	90	AAAAAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLAFKAGGQFLCCFLMQFNSNKNYPLYTIQGRPWRDTEKTSMQFFLLLSFLFSDLGADRFVCTHTCTHTCTHTRGYIRKDFREQVAFELVPEEEVDFNRTIMYER	49566	50470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_49600_50500
832995	contig_7707_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_72208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724238	723485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_723500_724200
832999	contig_1624_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_138383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGTCAAGAAAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219674	218758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_218800_219700
833002	contig_10252_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_162922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146400	147619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_146400_147600
833003	contig_16578_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_148644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTAAAAAAAAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164198	162783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_162800_164200
833004	contig_2414_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_158507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATCATATAATGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451123	450882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_450900_451100
833005	contig_2414_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_158506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTAGTTTTGGGATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445280	444430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_444400_445300
833007	contig_11851_pilon	+	1735	1	Intergenic	novelGene_146553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCAAACCTGTTGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32538	34273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_32500_34300
833008	contig_9955_pilon	-	1229	10	Intergenic	novelGene_21343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58.6079251372107	1	76	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	106	762	118470	107166	TRUE	20	CTTGTTTAAGTGGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAFVLIFCFFTSYNDSANNQTLTQNSQVFQDITIMAALGLGFLTSSFPKNSWSSVAFNLFILAIGVQWAVLLDGFLNKFSSGKISTSIQLATMSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKIRLISTVLCWREAWLWVPHVT	127897	86814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91277_96117_96204_105378_105470_107124_107227_108945_109106_109880_110029_113676_113815_118320_118491_127812
833009	contig_12079_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_67372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTCTCTCTCTGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331134	329166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_329200_331100
833010	contig_12257_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_152088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	113414	113734	NA	10	GGAAGCTGCTGGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQADIPLFSQPSWNVQSFLFSLCQEVSRAGGHALPKVTVQEALRSCVVQVAAAYEKLAEEKQTKVGDRIFFHEKQTNKSPRLSLGLGSSHRGFRGLWITQPRHWVL	113413	113953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_113400_114000
833011	contig_17212_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_88614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCACTCAGCTACTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104895	104113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_104100_104900
833012	contig_9373_pilon	+	1986	2	Intergenic	novelGene_162724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATGGAAATGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243455	247314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_244397_246269
833014	contig_12837_pilon	+	1074	7	Intergenic	novelGene_57320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2585.51265064913	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGCATCAGCAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129664	166562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159404_161387_161494_163874_163969_166003
833016	contig_15886_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_144335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCTATTTTAATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60597	59423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_-_59400_60600
833019	contig_4418_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_98364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCTGGGCTGTGACCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751951	751137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_751100_752000
833022	contig_6738_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_166139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59818	58486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_58500_59800
833024	contig_6674_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_147998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACATTAGAGTTAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131320	130004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_130000_131300
833025	contig_6674_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_147997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129904	128859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_128900_129900
833027	contig_5551_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_134250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498471	499012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_498500_499000
833029	contig_4151_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_65275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGGGTATAAAGACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639715	640988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_639700_641000
833030	contig_8914_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_112852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTTCACTTTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244852	246955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_244900_247000
833033	scaffold_4805_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_161028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATACCTGTAATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490264	491572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_490300_491600
833034	contig_8050_pilon	+	1448	2	Intergenic	novelGene_114878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGAGAGTGTGTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447019	448520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_447890_447942
833035	contig_12993_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_136725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAGGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74230	75129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_74200_75100
833036	contig_15118_pilon	+	2053	2	Intergenic	novelGene_74580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1717	2025	375682	376398	FALSE	15	GAGCTGAGGGATTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMLVADLRKVVPVHTALMEKKFLLHWFTGHICSPLALHEKMPRVLILLISETLQISMPGKISTFSLISHASDILRGPCSDSGAQESAQHCETGCGDLVFLL	373965	376426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_375876_376283
833037	SIRV6	+	357	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	516	0	350	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
833038	contig_20842_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_160972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTTGTAGTCTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116516	118027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_116500_118000
833039	contig_6361_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_23936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTATTTTTTTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326611	325055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_325100_326600
833042	scaffold_16539_pilon	+	1017	9	Intergenic	novelGene_68410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86.8870495240804	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	230	937	913956	918774	FALSE	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPETRGVGVAADLGAAQRRAQHEARFQSPRGGFRGRGGFGDRGGFGGDRGGRGGRGGFGGGRGRGGKRGNQSGKNVMVEPHRHEGVFICRGKEDALVTKNLVPGESVYGEKRVSISEGDDKIEYRAWNPFRSKLAAAILGGVDQIHIKPGAKVLYLGAASGTTVSHVSDIVGQDGLVYAVEFSHRSGRDLINLAKKRTNIIPVIEDARHPHKYRMLIAMVDVIFADVAQPDQTRIVALNAHTFLRNGGHFVISIKANCIDSTASAEAVFASEVKKMQQENMKPQEQLTLEPYERDHAVVVGVYRPPPKVKN	908247	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913710_913911_913981_914073_914169_915193_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
833043	contig_8330_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_71868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935423	936693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_935400_936700
833044	contig_5302_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_81552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATATCAAATAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657963	1659285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1658000_1659300
833045	contig_9807_pilon	+	842	5	Intergenic	novelGene_32866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	506.610488936027	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	105	626	109130	158783	FALSE	25	CGCTTAAACCACGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109025	158999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109660_154118_154270_156624_156770_158676
833046	contig_9633_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_139606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	292	738	499998	499552	NA	5	AGGTTTGCGTCTGTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLSTSTCQLSEGLELSFPEGGSSLGWQGCNVVTALNDTLYVGLLSAEKQRGGGGYSSTLGNRGALWPCLGGMACLVFLLTNHGNAKACVASERDSQPWKSPLPREYFFSLTFLKLDLLDQITYLSFKRKKGGVDLSFLGNVGVRKE	500289	498999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_499000_500300
833047	contig_8045_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_35423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACAGCAATACTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368957	369947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_369000_369900
833049	contig_12586_pilon	-	576	4	Intergenic	novelGene_121809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	69.4310209248479	1107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	71	457	70067	56396	FALSE	30	TGTGTCATATCTCTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYTPDEKLRVQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPQRLWPLEEFWNKFLQNPTPWRNALFKVYRHSVFAFTHVLIPAWIIHYYLKYHVNVKPYAIVERKPRIFPGDTILETGEVIPPMKDFPDQHH	70137	56276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_56465_63106_63152_65426_65520_69887
833050	contig_15613_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_147194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAAAAAAATACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58861	56832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_56800_58900
833052	contig_14868_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_150442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121786	120915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_120900_121800
833053	contig_19098_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_65791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89182	86998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_87000_89200
833054	contig_8375_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_141326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGAAACACTGGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287360	287963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_287400_288000
833055	contig_8375_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_141327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTTAAACACGATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288012	288568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_288000_288600
833057	SIRV6	+	414	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	117	0	-70	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2402	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
833058	contig_1910_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_168272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGTTCCCACCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12786	14468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_12800_14500
833060	contig_12767_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_175748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	712	1032	4606	4286	NA	15	CACTGAAGCCTTTGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSAHCSEGPHSSFLDFLFLSDVQKGSSDSGNAGLWNGKQRDLGAQESRGGRWQHLKLQGVRSCFRGREGSERGQPNSNFLPLTLQTWEMHLESWQLQSLGGCC	5317	4130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12767_pilon_-_4100_5300
833061	contig_9074_pilon	+	1597	3	Intergenic	novelGene_156624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCTACTCAGGATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61394	64387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_61609_62805_62886_63084
833063	contig_11030_pilon	-	340	2	Intergenic	novelGene_177057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTACTTCTCATGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51007	36085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11030_pilon_-_36284_50865
833064	contig_15104_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_163371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTTCTTCTCTTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930822	931921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_930800_931900
833065	contig_14727_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_56666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGAGAAAAAATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347887	349334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_347900_349300
833068	contig_9389_pilon	-	644	4	Intergenic	novelGene_83868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	192.940405306924	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	376	627	35948	35697	FALSE	0	CTCGGGCTGGGCGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGDGGGGLPRRAADAAPARLPACSGWLPGEEVLSLQAEAAFHQPGSAELRPCAQGQGAKEPPALGEHPVPPDLVGVKWGHASRARSGVVRAGLTLFLERTSSPVPFGQRVFACVTWGSSTCPLMPPLPSPAFVLWGSSTSSQKLPSSESPVPLLLSPLSPSLALACWVRVPPTPAQVTLPWAGRAGLGTPLPSVWLIVFWGKWRVQ	45804	35679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36074_39490_39535_40050_40206_45753
833069	contig_20028_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_170652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAATAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56124	57755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_56100_57800
833070	contig_9014_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_106821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGCCACCCACGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255984	256264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_256000_256300
833071	contig_3789_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_79814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCCACCCAGTGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91901	92797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_91900_92800
833072	contig_16578_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_148618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTACAAAACCATGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65078	63963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_64000_65100
833074	SIRV6	+	429	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	339	532	166	58	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCGGCCTGGATGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
833075	contig_4388_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_161941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAATATTTTTCAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47124	48391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_47100_48400
833076	contig_9696_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_68850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTAAAACAGACCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670303	672315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_670300_672300
833077	contig_19812_pilon	-	1110	7	Intergenic	novelGene_101008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.6871697861508	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	19	720	67090	49522	FALSE	15	GTAAACTTCGTGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKEYLEFRKERSQMLQSRRNQLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKAGRRDGGWERFGDKRQNVDQGTKKANLGLNHRIWNPELGR	67108	49131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_49645_54056_54198_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
833078	contig_7357_pilon	-	1740	2	Intergenic	novelGene_36909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	0	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTCCGGCATTTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427397	423891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_423974_425739
833079	contig_7357_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_36908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGGAAAAGACAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423941	423366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_423400_423900
833080	contig_8576_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_88756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713452	713113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_713100_713500
833083	contig_12391_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_103609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTAGCGTCTGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82050	80686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_80700_82000
833084	contig_15449_pilon	-	736	4	Intergenic	novelGene_33642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	79.289904079201	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	7	435	107058	104764	FALSE	10	GACCTCGACTCCTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAMRLSPLQLLLLLGAWVIPGGLGGRSPLTATAPQLDDEERYSTHMPTHLRCDACRAVAYQMWQHLSEAEAKLHTPESGRRRELSESGYTDVLDRSCSQSWQGPRAQQGTRAKHQCDGHRGPLAHQALHDMSALPGGVWRRPDL	107064	104462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_104821_104907_104978_105397_105523_106881
833085	contig_8656_pilon	-	899	3	Intergenic	novelGene_162354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1.5	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	458	898	601920	597125	FALSE	30	TCAATTGTTTACAGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSYDSNQQTSYNGIPPKKKNSFLVSEDHGQKILSILQNFREQNVFYDFKIIMKDEIIPCHRCVLAACSDFFRAMFEVNMKERDDGSVTITNLSSKAVKAFLDYAYTGKTKITDDNVEMFFQLSSFLQVPFLSKACSDFLIKSIDL	620962	597123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_-_597345_601699_601945_620529
833086	contig_11815_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_50901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCCTTCTTTACTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147010	146370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_146400_147000
833087	contig_15327_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_70554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGGCTCCAGCCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566456	566982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_566500_567000
833088	contig_15327_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_70555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTGGTGTTTAAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567181	568393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_567200_568400
833089	contig_709_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_57580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2205493	2207309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2205500_2207300
833091	contig_13800_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_153695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75148	77034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_75100_77000
833095	contig_9189_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_165114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282730	283044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_282700_283000
833096	contig_13707_pilon	-	984	2	Intergenic	novelGene_43580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1247	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAACACCCATTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274896	273795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_273839_273955
833098	contig_14577_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_164628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44599	45366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_44600_45400
833100	SIRV2	+	299	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	298	-74	-298	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATGCTAAACCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
833101	contig_10752_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_153049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCATTTCCCAAGAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257080	258324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_257100_258300
833102	contig_6838_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_171788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCATTTCATTTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30423	30792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_+_30400_30800
833103	contig_7066_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_42117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAGAGAGTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577757	578575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_577800_578600
833106	contig_10082_pilon	+	801	4	Intergenic	novelGene_63912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_2	237.501345025431	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	77	586	580253	584895	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGAQSPSRSATSSAELSGAAVAAAMAPPWVPAVGFTLVPSLGGFLSSHFIHGEGLRWYAGLQKPSWHPPYWTLGPIWGTLYSAMGYGSYLVWKELGGFSEEAVVPLGLYAGQLALNWAWPRIFFGAHQMGWALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	574371	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_574419_580223_580435_583586_583726_584706
833107	contig_6189_pilon	+	2449	1	Intergenic	novelGene_164943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCCTTTCAATAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91966	94415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_92000_94400
833108	contig_3575_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_141129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTAAGCTGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820185	819207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_819200_820200
833109	contig_7979_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_125551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	362	688	1107636	1107310	NA	15	GTACTTATTTCATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLQELVITLAYNLSFFCIHVKIIYIKLIICFFRSRDERKKDDRSRKRDYDRNPPRRDSYRDRYNRRRGRSRSYSRSRSRSWSKERLRDRDRDRSRTRSRSRTRSRGK	1107997	1107263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1107300_1108000
833110	contig_6677_pilon	-	1454	4	Intergenic	novelGene_114166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	475.903585006693	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	140	850	427708	418364	TRUE	20	CATATGTTTGTAACTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVPGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQANSSHQVANFNIPAYDQGLLLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATSTFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVDSNGSVQIIEEHPPLMLQNRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILKNHPSYARQGQIESP	439058	410471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_410961_418248_418373_427006_427711_438921
833111	contig_3602_pilon	-	1063	2	Intergenic	novelGene_60677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	99	482	1139393	1135289	FALSE	40	CAAAATAAAAGCTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSGKEAEAIALLAEAERKVKNSQSFFSGLFGHGCFLQIFERKNRLHHSPFQLQETLRWCRESGVSEQGQGREGRRPIYWSLAGREAGGQLGAPTSGSSRTGTLMTTPSLLVCVEHFTALHLLKVF	1139491	1134707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1135575_1139295
833112	contig_15135_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_119879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTCTACTTTTTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101280	102702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_101300_102700
833114	contig_2069_pilon	-	624	3	Intergenic	novelGene_23514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	117	623	1509802	1508368	FALSE	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAEQEGNRSRARRRRLLAVLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDQFPVILNLLTLEPLPPSPGPFSSNCSHLSSIQRQHSLPTSLKQQLQCRLSQPALRLPPCLVLADRYLCWCHQPGLCQRPRNPCPGSTQRQLNVPFH	1509918	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508659_1508942_1509111_1509754
833115	contig_11720_pilon	-	352	5	Intergenic	novelGene_44044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	6.96419413859206	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	8	352	510801	507538	FALSE	35	GAACTCATTGAGGTAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEMAASALATAVEEDWVLPSEVEVLESIYLDELQVVKGNGRSSPWEIYITLHPATAEDQDSQYVCFILVLQVPAQYPNEVPQISIRNPRGLSDEQIHTISQALSHVAKANLGTAMLY	510808	507537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_507596_507694_507763_507853_507957_508214_508290_510760
833116	contig_11720_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_44042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	504102	503788	NA	25	TCAACAGTGCTCATCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERWHLKGGECCAPKGTSDTQELPPPEGPFKEPTDLNQGVQGHPQEKGPGSRQGPPPRRTRDCARWERSKGRTPGSSYPRLPRGRGVYRPASRREHLGLEPEDGS	504104	503712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_503700_504100
833118	contig_11304_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_156727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCCCAGTAACCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468960	469700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_469000_469700
833119	contig_9482_pilon	+	1199	4	Intergenic	novelGene_44334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTAGCTCTGTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272922	1275879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1272955_1273768_1273868_1274112_1274796_1275494
833120	contig_9455_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_161837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286216	287061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_286200_287100
833121	contig_7357_pilon	-	1760	13	Intergenic	novelGene_36906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_4	30.8899255421569	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1524	236	1759	543060	417585	FALSE	40	AAAGCATGGAAGAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSLLSLLYKDLAELWLFLKRNTDEIMHQDIVPLCAADIKDQLKKRFAYLSGGRGQDGCPVITFPDYPTFSDIPDKEFQNVMTYLTSIPSSQDTGIGFILVIDRRQDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVPIIMLSSVPELHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCHRTAIESFALMVKQTAQMLQSFGTELAETELPNDVQSTSLVLSAHTEKKDKMKEDMKLALQEGHTILESIREPLAKNPEYSLNQDQLDNQTTVQRLLAQLNETEAAFDEFWAKHQQKLEQCLQLRHFEQNFREVKVALDLVSQKMTTLADVGNSLAHVEHLLKDLANFEEKSNVSVEKARALCLEGSQLIENKHYAVDSIHPKCNELQHLCDHFAAEIGKRRNLLNKSLELHGLLETSMKWCDEGIYLLASQPVDKCQSQDGAEAALQEIEKFLETGAENKIQELNKIYKEYESILNQDLTEHVQKVFQKQ	543295	417583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_417615_418470_418663_419405_419598_420230_420351_423858_423974_425739_425865_426973_427124_427713_427831_431176_431297_450606_450698_481817_481933_510787_510872_542987
833124	contig_9146_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_79513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTGTTATTATTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354277	353630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_353600_354300
833125	contig_6361_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_23859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	41	316	39089	38814	NA	10	CTTGATTCTTTCCCTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRRSCIRGDFSPAMRGPTADGAQVPFCNAKEEISARVETSEGDGGQKRPDMRGQRQNIVWRNVVLMSLLHLGAVYSLVLIPKAKPLTLLWGKSHWRRLRPGRAA	39129	36721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_36700_39100
833127	contig_11493_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_143688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGAGCACATTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190738	191033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_190700_191000
833128	contig_8850_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_172441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGTTGCAGCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368969	368716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_-_368700_369000
833129	contig_4301_pilon	-	1926	13	Intergenic	novelGene_65146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	53.8662824862538	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	839	1642	712315	700648	TRUE	25	GGAAGCGTTCTCCCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYWKAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDAFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVNVEFQGLVQPPEDQENERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLNYAREAADFSTQQQLPSLDFAINHYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAMDSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFLRPSQVRHLYDTGETKDIHLEMENLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVNVTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPRSDRL	718999	698376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_698473_700459_700657_702757_702907_706577_706675_707944_708072_709082_709199_709550_709809_712267_712369_713377_713534_714554_714657_715044_715162_716976_717185_718797
833130	contig_14686_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_88074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAAGTGCTCGGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82780	81993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_82000_82800
833131	contig_1154_pilon	+	2664	1	Intergenic	novelGene_87223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAGAAAACTGAATAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592316	1594980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1592300_1595000
833134	contig_2100_pilon	+	1435	12	Intergenic	novelGene_50593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.3229383033795	14	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	8	328	667982	669050	TRUE	25	ACAGAGCTTGCACTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGSLLPSSLTLRLSELSPSPSDGELGRLISWVLVFLELVLSTSSVSEATFSRWRLVLLRGDEASSLTFLADFFTVSDLLSLLEVLAALGEFRPLERMSSLMGEA	667974	836520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_668076_668331_668449_668940_669101_670290_670493_670927_671020_672051_672215_742540_742625_781492_781591_813557_813657_814881_815010_822283_822333_836378
833137	SIRV6	+	345	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	343	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856
833138	contig_675_pilon	+	1102	2	Intergenic	novelGene_136353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	166	768	211006	211608	FALSE	15	AGTGTCTACCTAGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSTRVVPPACQPVLTHLDTNSNSGGVLQLNHLGRKVQTRNEEIISTWDTYLQLEMGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	210391	211942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_210468_210916
833139	contig_2114_pilon	-	2245	3	Intergenic	novelGene_104235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.5	39	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153203	149139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_150518_151578_152077_152834
833140	contig_19957_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_57733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGGCAAGTTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293175	292836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_292800_293200
833141	contig_16594_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_53922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAACCCAGATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295348	296425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_295300_296400
833142	contig_15793_pilon	-	809	4	Intergenic	novelGene_177058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	68.3569065030496	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	428	808	12894	10257	FALSE	25	TATAATCTTCATCTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSEKELNKAKAFKQDLMIEDNLLKLEVKRTRAMLHSKAEEVLSLEKRKQQLYTAMEERTEEIKVHKTMLASQIRYVDQERQNISAEFHDRLSKIDKLKNRYEILTVVMLPPEGEEEKTQAYYVIK	14834	10255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15793_pilon_-_10381_11059_11269_12846_12985_14497
833143	contig_14142_pilon	-	1109	6	Intergenic	novelGene_120589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	127.014014974726	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588046	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586303_587490
833144	contig_4486_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_38630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACCAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717021	717949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_717000_717900
833145	contig_15952_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_154096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGTAATCAGAGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722794	723358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_722800_723400
833147	contig_6865_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_177060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88332	89634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6865_pilon_+_88300_89600
833148	contig_6885_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_83659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181369	182216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_181400_182200
833149	contig_5878_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_145739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCTTTTTTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386447	384704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_384700_386400
833150	contig_19098_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_65777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	295	786	37398	37889	NA	25	TCCTAGAGACTAGGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYNPREECSGLQARPHHKEQGGLWLSRRKTGRQVRRPLRPENSFLITAWPSPPAELWPLHVDWAPDAVPEQPPSVGSHPAGVHLGVYHHRVCEQPGHHHHLPAHPVQPGEQAGPLGSRWCWAAGRSQSSFCACPLLGHCPRLHDRCSNHGLKNEVFQIAIGK	37103	37933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_37100_37900
833151	contig_6208_pilon	-	738	7	Intergenic	novelGene_52970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	303.099222844416	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	43	525	351804	333652	FALSE	35	ATTAAGTAAATCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARRFAGGYPQQVNMRIEKCYFCSGPIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVRWTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRSEPVKYQRELWNKTIEAMKRVEEIKQKRQATFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEDKMYLIFEHLGVNI	351846	333438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_333688_334802_334832_336085_336172_338944_339009_344015_344089_345798_345913_351723
833152	contig_6102_pilon	+	1392	13	Intergenic	novelGene_32293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTCAACAGAATACAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479288	1510564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1479388_1487620_1487781_1489607_1489843_1494196_1494254_1494352_1494387_1500133_1500240_1500663_1500805_1501393_1501456_1502110_1502188_1503076_1503204_1503731_1503820_1505750_1505795_1510402
833154	contig_8683_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_150239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	293	610	297846	297529	NA	45	TGATATTAGTAAAATTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPGRNLRPQKSTGLQTMRWGTLDCLQGSPSLSPGNSVVGCCSYAVHFLTDIPKPFVLRLPIPTLKRLTYFLSIKAHTLMAAEDHSAYFKNSLSAPCGVELWEN	298138	297056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_297100_298100
833155	contig_16776_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_130526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATATATCCAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48061	47722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_47700_48100
833156	contig_5039_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_64811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTCATCCTACCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217501	216478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_216500_217500
833160	contig_5590_pilon	+	1167	10	Intergenic	novelGene_162987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	27.9435056170989	67	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	48	1142	174610	185268	FALSE	25	AGTAAAATCTGTGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSLGLVRKSRRPLTMDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSQDNVEREETWLTLRQRRHHLSCPSRPMWSGSREMAIRRRCLTLASTLCGLGWGVELQAPTSLAL	174424	185293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174459_174596_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177920_178717_178751_185109
833161	contig_5033_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_28893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	270	743	433811	434284	NA	25	TGGAGATCCCCTGCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRGWHSPEHGQDQKVTTWACWSQIPNQGPKSDKGWVGIFCRREGEKVEARPPRVRDGQASLSVLPSPVCQADSPWATHSWSSPPPLSPDSSHPSSSQIMASDRGIPPQKKDHILQVTILDINDNPPVIESPFGYNVSVNEVRAAPTRQRGWSVGVS	433541	434944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_433500_434900
833164	contig_6589_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_26307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	218	331	2293424	2293537	NA	5	TTGGTCTTGGTGTCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPEDAQQLDGQGLWPVGGAGLQFWLTYVSVAEVGPLHHSSASSFIPDPSSLCFYCCLLSCPFLNLAPSSILRMVECLALVNISIPQVSAEELRPTGNSGSRSELRNRAS	2293206	2293975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2293200_2294000
833165	contig_1090_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_131102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCTATAGAATTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235806	234309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_234300_235800
833166	contig_7338_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_156797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACTTCTGGAACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260704	259413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_259400_260700
833167	contig_7338_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_156796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGACTAGGAGGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259301	258617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_258600_259300
833168	contig_19974_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_130484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCTCAAGCGACGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298239	297945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_297900_298200
833169	contig_19974_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_130483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAGAAAGAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297945	297255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_297300_297900
833170	contig_13744_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_77166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1520	1840	330127	329807	NA	20	ATGGGTGTACCACAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGCCPFISAVVISLLSSQILSIMEAGHLAFERRQKSSEVNEWGCAGWLYMRPGASFLALVCLCAHVFSGLDAVTADPCSVPSALCGFHQPAVLHFQLLLRVSEL	331646	329213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_329200_331600
833172	contig_12935_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_165715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGGTCCCACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7942	10111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_7900_10100
833175	contig_5452_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_101034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGTCCTGGAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599988	599094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_599100_6e+05
833177	contig_9915_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_174177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793533	792309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_792300_793500
833180	contig_9415_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_109787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGTCAAACGCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667535	1667075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1667100_1667500
833181	contig_3942_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_128799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTCGAACACCGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941980	943332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_942000_943300
833184	contig_7839_pilon	+	182	1	Intergenic	novelGene_45707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTATTTTTGCTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355869	356051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_355900_356100
833185	contig_12697_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_122826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGGTAAGTGTGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216003	217120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_216000_217100
833186	contig_9225_pilon	-	2004	2	Intergenic	novelGene_160163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGTTCTATATACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47834	37661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_39535_47703
833187	contig_9888_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_162277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	51.6978400580398	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	227816	224885	TRUE	30	TGTGCTCCATAAGAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSPADSGKRRLRDHRETSSSSRAGVRASVVGWTGNPCRHPRSIEHTPPWTDGLGGPALDRRNFVCNVRTINRKRNSKAYLPTRTTASARTPSPPPNSACVSEHQPEPP	227816	220507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_221269_224841_224914_227391_227598_227721
833188	contig_5201_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_82198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATAACACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528378	527400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_527400_528400
833189	contig_2450_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_160316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769183	767781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_767800_769200
833190	contig_3584_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_108130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTGAATAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270422	271519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_270400_271500
833191	contig_3147_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_142278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	219	599	125027	124647	NA	30	TCAGAACCAACTACCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAFLKSLACHPMARWFEKQKRGYNITFNEIPTASKYFSAFTESKIPSNLNLSKHSTRMISAKYMIFMHECFPFRSPSLLHYSIFQNRDNHLLIKLMLIVKINTGKCYQEKKGKTTLIISLCPLL	125245	123329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_123300_125200
833192	contig_5711_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_80298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTCATTAAAAAAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243000	244221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_243000_244200
833193	contig_11656_pilon	+	1677	3	Intergenic	novelGene_54042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	0.5	3	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGGAAACTCTTATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530498	537201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_531337_535319_535411_536453
833194	contig_6445_pilon	-	399	2	Intergenic	novelGene_77114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGGGGTGGCAGAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358250	1357405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1357732_1358177
833195	contig_10093_pilon	+	730	8	Intergenic	novelGene_147498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	149.105633012031	38	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGAATTGTAGGTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73127	103683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90910_91006_93068_93140_101699_101815_102061_102148_102327_102420_102834_102925_103664
833197	contig_6724_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_167955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCTTGCCTCCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130609	129031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_129000_130600
833198	contig_1996_pilon	-	1037	6	Intergenic	novelGene_131952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	33.5678417536785	187	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	248	847	518033	516912	FALSE	35	TCTCAACATGCATACACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVVEVWPVPGPEGDAVGAGHAGGRGVQGWPWLCIPLSVPVIWSCIPPNYPWSHRGLFSSLDHTSIRRGFQVYKQVCSSCHSMDYVAYRHLVGVCYTEEEAKALAEEVEVQDGPNEDGEMFMRPGKLSDYFPKPYPNPEAARAANSGALPPDLSYIVRARHGGEDYVFSLLTGYCDPPTGVSLREGLYFNPYFPGQAIAMAPPIYNEVLEFDDGTPATMSQVAKDVSTFLRWASEPEHDHRKRMGLKMLMMMGLLLPLVYAMKRHKWSVLKSRKLAYRPPK	518376	516721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_517017_517092_517194_517467_517629_517714_517873_517958_518086_518181
833199	contig_10377_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_115344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	102855	103196	NA	25	TTAGTCCACACTTTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTELTDNTHDYGVYSGSNRLQFRFRNAQNTGLPSGQTLPFCAHRHASPWLSVSAQRHSGSLLHALGSPLSGLSCHCFSPSSGLHLAVSWAQELLSTGIPGPKDELSTPGCSPW	102852	103730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_102900_103700
833201	contig_15105_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_150969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCCAGCTTTAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584942	584162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_584200_584900
833202	contig_11285_pilon	+	1176	5	Intergenic	novelGene_5528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	16.1303285769385	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	121	441	737560	738825	TRUE	5	GGGCAGCCTGGTCTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTDEEERHSAESSTSEDNSPEHPYLPLVTDEDSWYSKWHKMEQKFRIVYAQKGYLEELVRLRESQLKDLEAENRRLQLQLEEAAAQNQREKRELEGVILELQEQLTGLIPGDHAPPDPRLQGAHHTPGQPMAITGNAQWGRGCQQP	737439	740681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_737596_737708_737867_738698_738838_738948_739056_740065
833203	contig_9646_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_117480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTCATGATCAGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433381	432369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_432400_433400
833205	contig_12019_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_87693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATGTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66930	68553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_66900_68600
833206	SIRV6	-	533	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAGCACATATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11322	10474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11043_11111_11206
833207	contig_5686_pilon	+	500	5	Intergenic	novelGene_45250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2724	junction_2	1259.79254244499	1	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	54	500	93843	175559	FALSE	15	GTAAGTTTTCATTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDK	93789	175559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535
833209	contig_8576_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_88773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGATAGCAGCAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772479	773220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_772500_773200
833210	contig_6374_pilon	+	831	6	Intergenic	novelGene_158427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	295.842525678781	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	300	755	41580	52593	FALSE	35	ATATACTGATAAGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEPGCTAPAVGPHHGDQTGGNSRQRLGRSLQVFEETGFDIKDYICKDDYIELRINDQLARLYIIPGVPKDTKFNPKTRREIRNIEWFSIEKLPCHRNDMTPKSKLGLAPNKFFMAIPFIRPLRDWLSRRFGDSSDSDNGFSSAGSTPAKPTVEKLSRTKFRHGQQLFPEGSPGDQWVKHRQPLQQKPYNNHSEMSDLLKAKNQNMRGNGRKQYQDSPNQKKRTNGVHSQSAKQQNPLMVRFKAPMLSRS	4835	52669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4934_41257_41411_41531_41645_41737_41846_44612_44749_52446
833211	contig_2710_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_161802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGCTAATATTATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146234	1145545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1145500_1146200
833212	contig_401_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_42948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTATATGGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2246310	2245372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2245400_2246300
833213	contig_567_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_33990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	263.337974642642	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	13	324	442621	458710	FALSE	15	CAGATGCTGTCTCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVSKMAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNVWALEKVNSSIKFNCFVIHLMTYPRVT	442608	458816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_452651_458626
833214	contig_12638_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_33072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGATTTAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122532	122802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_122500_122800
833215	contig_9183_pilon	+	509	4	Intergenic	novelGene_40274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	9.20144916122817	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	85	432	283999	287876	FALSE	25	ACTTACTGAGTCTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPSISRFCRGHHRPPPAAPRPRAAPDAMDPALAAQISEAVAEKLLLYRRDKSGWKICREGNGVSVSWRPSVEFPGNLYRGEGIVCGTPEKVWDCVKPVTGGLREKWDENVSSFEVIENITDVKGKHASMLGPLCLCTMTGGW	283914	287953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_284098_284746_284797_285605_285739_287810
833216	contig_5136_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_126655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCACTGTGTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355187	354309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_354300_355200
833217	contig_1996_pilon	+	2169	15	Intergenic	novelGene_131921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	45.6769937178668	111	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	397	1770	413425	415742	TRUE	5	CTGCCTGGGTGCTGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAPGRIHTSDSGLSDSEESVFSGLEDSGSDSSEDDSEDGAHSDGGHGGTRKTTEKQPQAGTPSPRTEAVVSTPAEDEYAEDSSDEEDIRNTVGNVPLEWYADFPHVGYDLDGRRIYKPLRTRDELDQFLDKMDDPDYWRTVQDRGTGRDVRLTDEQVALVQRLQRGQFGDVGFDPYEPAVDFFSGDTMIHPVTNRPADKRSFIPSLVEKEKVSRMVHAIKMGWIQPRRPRDQAPSYYDLWAQEDPNAVLGRHKMHVPAPKLALPGHAESYNPPPEYLPSEEERLAWEQQEPGERKLNFLPQKFPSLRAVPAYSRFIQERFERCLDLYLCPRQRKMRVNMDPEDLIPKLPRPRDLQPFPTCQALVYRGHGDLVRCLSVSPGGPVAGFRLRRQFGAALGGVHRPLHEDCACGGRGEERRLEPQPCRLPGGCGCGGCCAAAEPSPGGPAGGGRHRSAAECLQPAGGAGPAARPVAGGHRRGAPAWPAAAYLPQQASDSGGLARARRLPGRGAGNSGPHAGADPPAEPAPQPEPFPPQPRAGAARGLPPLPALPAGGLPAQCPPLPPAAPGAHQETHAQLQVGVQPRRAPGR	397412	416327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_397590_402565_402650_413289_413445_413534_413653_413725_413828_413977_414191_414267_414430_414523_414605_414728_414800_414883_415017_415092_415274_415369_415659_415738_415824_415917_416026_416117
833218	contig_9206_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_137489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189415	187910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_187900_189400
833222	contig_4531_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_47913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGGAAAATAAAGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398462	397046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_397000_398500
833223	contig_6544_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_142100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107163	105416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_105400_107200
833224	contig_755_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_119758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAATGTCCTTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78683	77222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_77200_78700
833226	contig_21203_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_84489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTCAAAAAGGAAACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89061	88136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_-_88100_89100
833227	contig_3077_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_26860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	3.1446603773522	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	103	696	1150086	1153273	FALSE	15	TGTTGAGTACGTGTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRATRLKRELNLLATEPPPGITCWQEKDQMDDLRAQILGGANTPYAKGVFKLEVIIPERYPFEPPKIRFLTPIYHPNIDSAGRICLDVLKLPPKGAWRPSLNIATVLTSIQLLMSEPNPDDPLMADISSEYKYNKPVFLENARQWTEKHARQKQKADEEEMPVDSPEASDPEPHNATQKRKARPLGGVEKKFYPDG	1146227	1153511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1146266_1150021_1150195_1150773_1150844_1151958_1152065_1152179_1152279_1152405_1152490_1153147
833228	contig_11978_pilon	-	857	2	Intergenic	novelGene_62970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAAACATCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456842	1455532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1455928_1456380
833231	contig_19687_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_170765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61550	62394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19687_pilon_+_61600_62400
833232	contig_5084_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_64575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAAAATAAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691953	690897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_690900_692000
833235	contig_10196_pilon	+	794	3	Intergenic	novelGene_132182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	0.5	180	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	174	428	1082779	1083033	FALSE	5	GTAGCGTGCGTTGTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVTRKSWLWQHDEPCYWRLTRVRPDYTAQNLDHGKAWGVLTFKGQTESEAREIEQVMYHDWRLVPRHEEAAFTAFTPASKDPPRSVPYPPLLRAMILADRQKSGDESTEEPMLNLERVRISPWDYPAKKKAKGKAKGTPV	1082313	1083399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1082406_1082615_1082659_1082740
833237	contig_8322_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_143269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTGAAAAAAAAAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463744	463218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_463200_463700
833238	contig_9363_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_6478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338450	339538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_338400_339500
833240	contig_8900_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_171628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTATCACCCCTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279612	281070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_279600_281100
833244	contig_10988_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_104731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTTGAACCAGAATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100641	101021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_100600_101000
833245	contig_10988_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_104732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTCCGGACTTCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101277	102107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_101300_102100
833247	contig_14362_pilon	-	809	5	Intergenic	novelGene_142513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_4	22.1852991866236	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	128	460	33047	27717	TRUE	10	TGTGCCTTGTTTTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAQGGRSCFWPRRWSELRYSGKEKTETILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNGEICGNYTYRGPKAFQRHFACGPS	33174	26325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_26634_27675_27732_30007_30119_30223_30389_33005
833249	contig_7864_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_164857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTGCCACATACCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66503	67743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7864_pilon_+_66500_67700
833250	SIRV5	+	373	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	22	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
833251	contig_821_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_149388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTCCATAACAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110490	109509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_109500_110500
833252	contig_9995_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_47761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCTAATTCACAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676858	676102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_676100_676900
833253	contig_6446_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_149275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAGAAAGTGATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847793	848254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_847800_848300
833254	contig_12620_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_98811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396594	395379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_395400_396600
833255	contig_9653_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_48345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	274	657	1101648	1102031	NA	25	CCCATTTAGACTCATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQYTFIKIIALETIWGSSTLSYSIALNQNQLDGNRFGLGYSKSWNNFAKYYISSPIIRKSILLLLKIICYYDSGVKKPNKKANSLQLRCHLQNTFTSQYKRRSRLILLILDLTSIFLLFINITVHV	1101374	1102511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1101400_1102500
833257	contig_13146_pilon	+	2086	8	Intergenic	novelGene_170039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	73	333	48272	48532	TRUE	40	ACAGAATGTGTAGAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLQKICKDSRESSYILLTQFQFTRMLSSYITMVHFSKPRSTLLLTKFQTFHISPIFLLMIFFCSRMQSRIPHYIQLSCLLSLLWSVTVFQNFLVFHDFHSFEQYWSGMSI	48199	70656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13146_pilon_+_49618_51559_51660_53122_53218_53681_53833_55850_55938_56647_56765_60147_60220_70610
833258	contig_8954_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_130262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATAGAAACAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74941	73099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_73100_74900
833260	contig_4223_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_117267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTATGTGCTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154747	153858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_153900_154700
833262	contig_1699_pilon	-	1000	2	Intergenic	novelGene_72837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAAGATTATGGCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124625	118792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_119521_124353
833263	contig_2043_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_169914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAGCTTCATTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697484	699520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_697500_699500
833265	contig_9345_pilon	-	1183	3	Intergenic	novelGene_24440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5	79	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTTGTAATTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382128	359218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_360040_360894_361223_382094
833266	contig_9833_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_68574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGTTTCTTACATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348879	351143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_348900_351100
833267	contig_6929_pilon	+	730	4	Intergenic	novelGene_139413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2867.55369997185	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	100	363	127755	130939	TRUE	5	CCTTTGTGTATCTTTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTLLHAETLWASTTVFQPSCAGRSDGGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127162	132317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127734_127787_130707_130958_131968
833268	contig_546_pilon	+	1526	6	Intergenic	novelGene_117185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	677.944717510211	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	98	1363	119834	153009	FALSE	25	TAGCCCAGCTTTCAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSDVLHPSSRAASIVAVQELHALLPFSFPCPLYIGSWEERRVR	61186	153172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_152884
833273	contig_10581_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_41436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGGCACTTTCCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731731	733502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_731700_733500
833276	contig_4531_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_47891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTAAGGCTTAGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323891	322549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_322500_323900
833278	contig_5153_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_74332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCATTTTAGAAGGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598799	599353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_598800_599400
833280	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
833281	contig_18869_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_56182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGAATTCTAAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	73643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_73600
833282	contig_19544_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_177062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16482	15174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19544_pilon_-_15200_16500
833283	contig_5247_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_81795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTCAGCGCATTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132986	133434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_133000_133400
833284	contig_8286_pilon	-	679	4	Intergenic	novelGene_139797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	10.2089285540757	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	110	613	154727	149181	FALSE	5	TTCCTTGTCTTCTTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPKKPKSPQPKNEVGTRKKCRRYRWELKSSNKEFWVMGHAEVKYLTVGCLVTALILFSGLSAHPVLTLIITMELSILIFLIIIYTFAINRYMPFILWPISDLLNDLAAFCFLTGAVIFAVRSRPTLHMHYFIAVICTGVAGLFALIDVCLQRRHFKAKRVKKTVLVPPPPKKTKEDEKQPEAGKPKEPEPEKAAEPDKKKENK	154836	149114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_149391_149857_149960_154410_154570_154694
833287	contig_9706_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_20955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGAGTCCTGTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294726	292550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_292600_294700
833288	contig_6630_pilon	-	830	2	Intergenic	novelGene_30712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	427	744	374404	372498	FALSE	30	TTGGTCATAACTACCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVSFC	374830	372411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_372710_374298
833289	contig_6189_pilon	-	1434	6	Intergenic	novelGene_164938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	99.4806513850809	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	36	1100	57585	44746	FALSE	25	TTTCTTAGCAGCAGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLNHQLQNELQMVKKECELLRQNQDEDKHLHNSFKHPVGKLAASHQGQETWGPSHKEATMELLRVKDRAIELERNNAALQAEKQLLKEQVQHLESQNVAFSSQILTLQKQSAFLQEHNTTLQTQTAKLQVENSTLSSQSASLTAQYTLLQNQQTAKETENENLQKQQEQLATAYEALLQDHERLGALHEHQSVEYEALIRQHSCLKTLHRNLEMEHKELGERHSDMLKHKAELDELEKVLKTEREALQQEQRTNAVAVDENQRLREELDRVSFLHHQLKAEYEELHAHTKELKTSLNNSQLELNRWQARFDELKEQHQSMDISLTKLHTHCEVRRGHGGLRSSPESCIQRLSGEVDQRRRWARGV	57620	44411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_45035_46870_47015_50944_51223_54739_54902_56573_56763_57582
833291	contig_17198_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_62433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGCTCGATAATATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246741	1246310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1246300_1246700
833292	SIRV6	+	380	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	476	0	303	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
833293	contig_8552_pilon	+	396	5	Intergenic	novelGene_80056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	8.74642784226795	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	63	395	217888	226537	FALSE	40	AAGAGCCCGTCACAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGDKGASEDLRPEERPMEDSHGDVIRPLRKQVELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMYPEELFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILEASNNIQFVIKRPELLTEGV	217825	226538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_217898_218080_218129_219034_219101_220203_220388_226512
833294	contig_8552_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_80057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGTTTGTGGTACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250804	251279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_250800_251300
833296	contig_7416_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_134347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAAAACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941977	943034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_942000_943000
833298	contig_1719_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_87329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAGCTACTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494552	493716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_493700_494600
833299	SIRV2	-	334	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	34	3364	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
833300	contig_5341_pilon	-	1031	2	Intergenic	novelGene_168009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340887	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338616_340667
833301	contig_7188_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_108518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30146	31572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_30100_31600
833302	contig_6202_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_139823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAGATTGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463985	464425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_464000_464400
833303	contig_15063_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_14467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	8	370	36299	36661	NA	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36291	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
833304	contig_11574_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_64100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	852	1178	461566	461240	NA	30	CAGAGGCAGAGTAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDNHTVLRIMVQPNCYTHFWGDIIQSITSGSFNLSGSLCLHLLNEGGVLNRLLSSTTTPPPPPPSFKLWFMWVTRGCSSLEVFWLNHLIMTQLHLWLVQVFHDLWTL	462417	461060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_461100_462400
833305	contig_3948_pilon	-	1812	3	Intergenic	novelGene_53189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5.5	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAATAAAATATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837619	834990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_835979_836262_836305_836837
833306	contig_6842_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_130826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACATGAGGTCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781619	1782001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1781600_1782000
833308	contig_3380_pilon	-	1346	3	Intergenic	novelGene_60087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.5	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGAAAAAAACTTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325069	249286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_250499_307841_307885_324978
833312	contig_10404_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_138719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATAAATGTTCTGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271192	1270990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1271000_1271200
833313	contig_9363_pilon	-	423	3	Intergenic	novelGene_6528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	839	junction_1	607	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCAGTGTCTGTCCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604988	604105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_604386_604674_604754_604924
833314	contig_9843_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_114314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCCTCAGACTGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38001	38753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_38000_38800
833315	contig_10196_pilon	+	1459	6	Intergenic	novelGene_132180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	25.3881862290318	113	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	15	1049	1074579	1078325	FALSE	30	GACCCATGCCACCTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRPRSSRAWHFVLSAARRDADARVVALAGTSNWGYDSDGQHSDSDSDPEFSSLPPSIPSAVPVTGESFCDCDSQSEASVCGSRHSAHGGKDCRCGEEDEHFDWVWDELNKSSATLLSCDNRKVSFHVEYSCGTAAIRGTKELGEGQHFWEIKMTSPVYGTDMMVGIGTSDVDLDKYHHTFCSLLGRDEDSWGLSYTGLLHHKGDKTSFSSRFGQGSIIGVHLDTWHGRLTFFKNRKCIGVAATRLQNKKFYPMVCSTAAKSSMKVIRSCASSTSLQYLCCYRLRQLRPDSGDTLEGLPLPPGLKQVLHTKLGWVLSMSCGRRRPPAPSPETRSCQRKRCRRT	1074564	1078735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1074705_1076974_1077153_1077310_1077499_1077574_1077678_1077758_1077885_1078011
833316	contig_4531_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_47897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGCTTTTTCAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334571	334799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_334600_334800
833317	SIRV6	+	411	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-79	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	77	234	65	298	2458	3109	TRUE	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGELGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2393	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_2752_2815_3106_3160_10721
833318	contig_1406_pilon	+	956	7	Intergenic	novelGene_25651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	29.0311135776008	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	175	882	2778873	2796764	FALSE	25	TAAAATTTTGCCATGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGVVGLFLLFALPVLCLELRRGIPDLDEEEEENEKRQKLVRKKQQEAQGEKASRYLENVLKPHQEMKLKKLEERFYQMTGETWKLSNGHKLGGDEDLLLDNASQTSFETANREAAKRRNLPKPVTKVSPPAEQPPQKKVLDLPEEPPEAAEEVVTVALRCPSGRVLRRRFLKSCSSQVLLDWMMKIGYHTSLYSLSTSFPRRPLEVEGSWTLEDVGITVDTVLNVEEKEQSN	2778698	2796838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2778961_2786024_2786099_2789060_2789184_2791275_2791414_2792853_2792896_2795116_2795192_2796596
833319	contig_5316_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_61227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTATCCCACTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446383	445820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_445800_446400
833320	contig_8843_pilon	+	980	7	Intergenic	novelGene_156645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_6	365.78974683401	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	13	873	49851	89956	FALSE	50	ATACAAAAGTTAAAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYDPPDPRRIYTIMSAEEVANGKKSHWAELEISGRVRSLSTSLWSLTHLTALHLNDNYLSRIPPDIAKLHNLVYLDLSSNKLRSLPAELGNMVSLRELLLNNNLLRVLPYELGRLFQLQTLGLKGNPLSQDILNLYQDPDGTRKLLNFMLDNLAVHPEQLPPRPWITLKERDQILPSASFTVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWEYRKKGIMEEIVNCDADIISLQEVETEQYFTLFLPALKERGYDGFFSPKSRAKIMSEQERKHVDGCAIFFKTEK	49838	90063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_49963_53127_53315_54647_54734_66012_66103_83970_84040_87806_87965_89797
833321	contig_12173_pilon	-	1308	6	Intergenic	novelGene_172965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	8.12403840463596	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	16	612	215303	205242	FALSE	25	TTAAAATTTTCGTGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVTAEQFAALQILLKASSKDVVRQLCQESFSSSSLGSKKLLDITCSSLSVTQEEADQLLQSLHHLTRLAVFRDLSSAEAILALFPENFHQNLKNLLTKIILEHISTWRTEAQANQISLPRLVDLDWRVDIKTSSDSISRMAVPTCLLQMKIQDDPSLCGDKPSVSAVTMELSKEMLDTMLDGLGRIRDQLSAVANK	215318	204545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_-_205383_206946_207051_207868_207904_209487_209628_211945_212072_215252
833322	contig_7004_pilon	-	1506	13	Intergenic	novelGene_126437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_5	7.38805341976717	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	921	586	1506	67351	64504	FALSE	35	GAGGAGCAGGATGAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKLAGLLRQSGDVVLSGCSTLSLLTATLQQLNHVFELHLGPWSPGQTGFVALPSHPADSPVILQLQFLFDVLQKTLSLKLVHVPGPGPPGPIKIFPFKSLRQLELRGVPLHCLRGLRSIYSQLETLICSRSIQALEELLSACGGDLCSALPWLALLSANFSYNSLTALDSSLRLLSVVRFLNLSHNHVRDCEAFLMDLSELYHLDVSYNCLRLVPRMGPSGVALGTLILRGNELRSLLGVEQLRNLRHLDVAYNLLEGHGELSPLWLLAELRKLYLEGNPLWFHPAHRAATAQYLSPRARDAVPGFLLDGEVLSVTDFQTSTSSGLGPAAPPMPWPVGSTTETSGGPDLSDSPSSGGIVARPPLRKVKSRVRVRRASISEPSDTDPEPQTLDPSPAGWFVKQHRDLELMNSFRERFGCDWLQYRNHLETSENPHLATSKTSDLSSLPPDALGPEPLPPEEADSPEESAQEASEEIRVGPEPQEEEEMEEPEEEEGKEDQEEE	71252	64503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_64821_65388_65474_65669_65817_65983_66026_66281_66378_66501_66606_66852_66980_67348_67421_67575_67684_68063_68160_68435_68511_68697_68904_71221
833324	contig_19098_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_65809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGTTACACAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275539	274315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_274300_275500
833325	contig_10437_pilon	-	715	2	Intergenic	novelGene_38421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCCTTCGGAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811488	805898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_806061_810935
833326	contig_9955_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_21360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTACTGGTAGGTCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204871	205391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_204900_205400
833329	contig_13928_pilon	+	1492	2	Intergenic	novelGene_177065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	873	1373	311244	311744	FALSE	45	AAGAACAGAGCTCAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYLVDEGGKLVVKGLDLLPLLGPHPLDGGVNLQVEGSQEVLVDGDLLDASRGANREARATKAPSKASCTTKPKATTSSTAKTKSAPGSASEGIATSSTCTKSVPEATAASADGDPLGAPQVVETPAAIATCSTTPTKADPAKAATTTRRSGHGGKTGSRDRGGDG	303011	311863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13928_pilon_+_303112_310471
833331	contig_20263_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_175832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGCCCCCTCACACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34491	33795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20263_pilon_-_33800_34500
833333	contig_7416_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_134340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913537	914142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_913500_914100
833335	contig_12503_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_143822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCGCGCCGCTCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113619	112518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_112500_113600
833336	contig_7416_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_134325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448755	449885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_448800_449900
833337	contig_5125_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_43498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977887	978886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_977900_978900
833338	contig_7730_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_156256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTCTTTGTAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11287	13066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_11300_13100
833339	contig_6215_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_21171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_4	9.04654630231891	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	96	692	161679	198976	FALSE	45	ACCTGAATGAAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCGRSRGAAATAAATSSFGCRIWNPCASLTMKQSSNVPAFLSKLWTLVEEAHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIIKQERDGPVEFQHPYFKQGQDDLLENIKRKVSSTKPEENKIRQEDLTKIMSSAQKVQIKQETIESRLSELKSENESLWKEVSELRAKHAQQQQVIRKIVQFIVTLVQNNQLVSLKRKR	161583	199259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_161772_190232_190342_190495_190624_191275_191401_196036_196113_198910
833341	contig_8576_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_88739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659604	657806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_657800_659600
833342	SIRV6	+	372	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	385	10	219	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGCTTGGTCACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
833343	contig_5352_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_177069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGTTGGCAATCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175662	175164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_175200_175700
833347	contig_10753_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_105127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCGACTCAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43273	41538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_41500_43300
833349	contig_3948_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_53154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCAATAAAAAGGCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92474	91004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_91000_92500
833352	contig_10930_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_37083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339254	337146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_337100_339300
833354	contig_19934_pilon	-	660	2	Intergenic	novelGene_166632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	538	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGTGTTTATACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259259	236741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_237240_259097
833355	contig_8550_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_72364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGCAGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146263	145941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_-_145900_146300
833356	contig_11602_pilon	-	2073	1	Intergenic	novelGene_166584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	235	393	58303	58145	NA	45	GTTTCAGAAGCAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSNQKILSHSIIKSPFPKPFQACSLPLGVSEAKAAVPSATLPATAARSDNCDKPDGTNTEVQPECPSSHTPWRHKGAMDSTWARSEPRPGPDGKHSPSSLPGPPTLLIHFLLSGPMGFSSTCYQHSLHS	58537	56464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_56500_58500
833357	contig_8505_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_173188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAATGAGATGGGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81451	81258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_81300_81500
833358	contig_5260_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_144419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGGGCCAAGCACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523249	522140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_522100_523200
833360	contig_5399_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_176845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAGGAAAAAGACATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215245	215964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5399_pilon_+_215200_216000
833361	contig_7292_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_175362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134915	135378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_+_134900_135400
833362	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
833363	contig_953_pilon	+	1517	10	Intergenic	novelGene_129994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	5.31245915016974	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	91	1464	246254	249823	FALSE	10	TGTCTCCTTTTCTCTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQLDAPIPNAPPARWQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTPGKSSSKAQTTPSKAGGDRYIPHRSASQMEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLYSQKATPGSSHKTCRYIPSLPDRILDAPEIRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYVSSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLCWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRTWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTARVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQGIR	246163	249876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_246309_246421_246571_246656_246754_246896_247026_247123_247321_247437_247533_247667_247897_248058_248185_249113_249232_249644
833365	SIRV6	+	358	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
833367	contig_12948_pilon	-	1061	2	Intergenic	novelGene_126181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182861	181607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_182615_182807
833368	contig_5093_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_135077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAGAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507476	505429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_505400_507500
833369	contig_8196_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_168766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTCCCCTAGCACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427111	425559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_-_425600_427100
833370	contig_8258_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_130443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACAACTGTTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22824	22357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_-_22400_22800
833371	contig_13700_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_68259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	185	379	11960	11766	NA	65	ATCCAAAGCCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRSSCSPSPTHLATDAHTSLSSPDLLPDLQTQSQCLLERPPPVVSGGSKAKGANCLLFPDMLLPKFFSSVKGTTINLLFKLEIWSHPFLHSLSQSPSPQVSPTKAFLFPSLQENQSDLSIKNCC	12144	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_11100_12100
833372	contig_4782_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_73667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTCTGAGACAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553997	552227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_552200_554000
833373	contig_7695_pilon	-	655	3	Intergenic	novelGene_41533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	184.5	691	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	78	512	380076	360143	FALSE	35	CAAGGCTCAATTTCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQAVQSFEL	381082	359999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_360166_379664_380089_381017
833376	contig_7342_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_71153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACAATTTCCTGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365077	365919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_365100_365900
833377	contig_12993_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_136749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264942	264016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_264000_264900
833379	contig_6048_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_73132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACTAGTAAAGAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969934	969002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_969000_969900
833382	contig_8616_pilon	-	2073	6	Intergenic	novelGene_72623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.38230690505755	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	335	877	620970	605442	FALSE	25	TAACAGTGTGGTTAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPQIPGEQLVTERSIKRLEKEKREKGAQKPGCNKNLGTVGAVALDCKGNVAYATSTGGIINKMVGRVGDSPCVGSGGYADNNIGAISTTGHGESILKVNLARLTLFHIEQGKTLEEAANLSLGYMKSRLKGLGGVILVDKTGGWVVKWTSTSMPWAAAKDGKLHSGIDVGETTTVDLA	632741	604245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_605648_606803_606915_609713_609833_620863_621022_629476_629678_632659
833383	contig_10777_pilon	+	510	2	Intergenic	novelGene_101179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	597	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	190	510	461726	462159	FALSE	10	GGTGTGTATTACTGTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWSLALHLAVLAPASLKASILEMKSMSITKQSGESVEIICDLKQDIYYIHWYRYQEGKTLQRILHFYFPSSKVVLDSGFSSEKYHAYKNTQRICKLVLENLQESDS	461536	462159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_461769_461881
833386	contig_12257_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_152084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	374	724	7454	7104	NA	30	GACCTAATTGAATTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPQVPVYLASILITILLISFHLSSPSLLGRLECFLKANPSHCVISPVRSVSIFSGMTCSSKQNHHAVITPSKMNNNSLIQSNTQCIFKLPPASSETIWLELGSKQDFHTELVFMS	7827	6079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_6100_7800
833387	contig_4125_pilon	+	652	2	Intergenic	novelGene_25037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	255	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	61	549	117238	118175	FALSE	0	CTGTCGGTCTCCTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREAANFSVTAEHLAPEPTAMGWDLKVKMLNGQEISVPLTASMLLSELKQQVSKKLAVPVFQQRLAHPDGTVLLDGVPLIHQRLSSGNTVLLMVESCKPLNILVRNDKGRSIAYDVQLTDTVAQLKQQVCQKEKVQADLFWLTFEGRPLEDKQLLGEYGLTAGCTVYMNLRLRGGQTGPKGC	117177	118278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_117241_117689
833388	contig_11302_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_177079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTGATTCCAGTGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280765	279638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11302_pilon_-_279600_280800
833389	contig_9366_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_166223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGCTTCATGATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176411	177361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_176400_177400
833390	contig_18869_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_56333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACTAAAATTTGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73566	73358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
833391	contig_5041_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_27043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	891	1232	438717	438376	NA	25	GCCATTAAAAGTTTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEIPPGLESGCQTQPPPLGLSPTGRGCGLLGATAHFAADVGLPENGIVTRPGAANVYSHSSAPAPLWPPIRPVGTNITPTSACMHTWPTRRGQVMRIKLSIFAYPQHREGN	439607	437835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_437800_439600
833392	contig_9363_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_6794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596549	1597949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1596500_1597900
833395	contig_14516_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_153938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGGAAACAAACAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322682	322203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_322200_322700
833397	contig_7138_pilon	+	1442	10	Intergenic	novelGene_120981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	157	465	140422	141385	TRUE	35	TACTCGTAAAATATCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKKCKIIFRFFGQPSASVVHTFSTSDQASSSPYFAVMYIRLFKTIAVACGDPQPSPRNQRLLVTISSRSFNESSSSSSCRRAVGKGFKSTSSMLFIHGKR	137166	162042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_137284_140382_140526_141180_141443_151594_151762_152873_152971_153284_153441_155782_155895_156464_156629_157875_158047_161989
833398	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
833400	contig_12540_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_148062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGTATAAAGTTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215425	214182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_214200_215400
833401	contig_6076_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_81767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCAATGTATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414010	414246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_414000_414200
833402	contig_11630_pilon	+	1487	2	Intergenic	novelGene_147182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGGTGCTATATTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132653	155265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_133585_154709
833404	contig_11364_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_65187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTGCATATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246933	245087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_245100_246900
833405	contig_7019_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_149478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTGGATGCAGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345195	1344709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1344700_1345200
833406	contig_5018_pilon	+	2011	17	Intergenic	novelGene_47007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	33.7395817253267	41	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	94	1269	1246147	1250401	TRUE	10	CTGTCATTCGTTTGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQPQEPLNPDAMENGTGTSGEECPPEAQETTVTEGAAKIAFPSANEVFYNPVQEFNRDLTCAVITEFARIQLQTKGIQIKVPGEKDVQKLVVDLSEQEEDKAELKEGENLAPGDQPRTASVREICEEGLRVLEGLAASGLRSIRFAQEVPGLRSVVANDASSQAVHLIRRNVLLNDVAHLVQPSQADARMLMYQHQSVSERFDVIDLDPYGSPAPFLDAAVQAVSEGGLLCVTCTDMAVLAGNSGETCYSKYGSMALKSRACHEMALRIILHSLDLRANCYQRFIVPLLSISADFYIRVFVRVFTGQAKVKASAQAGPGVPVCGLRVLPPSAPWQSISSLRKTGQVLYGLRSPPWRQTASTVGRDTSLAAPCGQSPSMTWTLWAASWRL	1245791	1253058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1245866_1246127_1246332_1246425_1246482_1246723_1246867_1247032_1247221_1248283_1248400_1248476_1248590_1249480_1249628_1250009_1250097_1250177_1250249_1250331_1250467_1250556_1250643_1250925_1251035_1251128_1251206_1252372_1252493_1252573_1252704_1252903
833407	contig_7230_pilon	-	256	2	Intergenic	novelGene_52563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1465	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAAAAAATGTGAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177627	176944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_177012_177438
833408	contig_12654_pilon	+	2917	2	Intergenic	novelGene_129265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAACACTACTCTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111335	114682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_113686_114115
833409	contig_9437_pilon	+	1698	10	Intergenic	novelGene_141744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	139.996119875684	116	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	54	881	524155	558005	FALSE	35	ATTGGAACTATGCTAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDPGTDQRQVLLPNEYPSTAPPIYQLNAPWLRGQERMDLSNSLEEIYIQNIGESILYLWVEKVREFLIQKSQMAEPEPETTKKTEEEDVECEEDLALACDSESPVKALETDISENKTETEELPPIDHGIPITDRRSTFQAHLAPVVCLQQVKMVLSKLYENKKIANATHNIYAYRIYCEDKQTFLQDCEDDGETAAGGRLLHLMEILNVRNVLVIVSRWYGGILIGPDRFKHINNCARNILLEKNYITLPEESSKAVGKNKKVKKDKKRSEH	524101	558822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_524191_526424_526478_527753_527817_535608_535695_538464_538588_549658_549757_551903_551978_554779_554871_557035_557171_557936
833410	contig_15354_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_65759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	639090	639407	NA	40	CAGTGTCTAAATAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVRKSPGWEFRDVGSSAASATTSLRAVKNPRSVAVFSFRIWPPFSVPFLPQVVVIKTRKTAGGAPRPNVHPRLAGTKDPTEESGISPQVSGTVLPSFEPDLNTV	639088	640125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639100_640100
833412	contig_5033_pilon	+	1149	2	Intergenic	novelGene_28965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	167	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGGCATTTGAGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458851	460313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_459573_459885
833415	contig_5727_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_7978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	228497	228162	NA	55	AGCAGAAAAGAAGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLQRSCKFSVNLQSIRERKPGETPEPQVEPPYDAPSRGESFRGRGRGRRKWPSAVCCSLFEPLKRRRSPSSGCAAGRQSQLHPGPPLATGRARSESYRLPSCGAGHRLAF	228497	226927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_226900_228500
833419	contig_16535_pilon	+	1794	9	Intergenic	novelGene_167699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3.17952433549423	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	98	586	80801	95406	TRUE	35	AACCATGAGTATATGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDRAKPCELDQEKYDADENVKIICLGDSAVGKSKLMERFLMDGFQPQQLSTYALTLYKHTAMVDGKTVLVDFWDTAGQERFQSMHASYYHKAHACIMVFDVQRKVTYKNLSTWYTELREFRPEIPCVVVANKIDADIKVTQKKLQFCQEVLPASVLCLSC	79683	97065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_79747_80766_80908_89797_89828_91099_91180_91771_91852_95017_95130_95326_95426_95720_95805_95960
833420	contig_16724_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_105325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGACAGAGTAGAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557306	558131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_557300_558100
833422	contig_12050_pilon	-	1066	5	Intergenic	novelGene_62694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	80	junction_1	107.858703867606	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	105	851	619215	615698	FALSE	5	GCCTCTGCCTGCCAGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAELETSEGLDESEKKSSGALERENHTRIADLSELLKEGTKEAHDRAENTQFVKDFLKGNIKKELFKLATTALYFTYSALEEEMDRNKDHPAFAPLYFPMELHRKEALTKDMEYFFGENWEKQVQCSAATQKYVDRIHYVGQYEPELLVAHAYTRYMGDLSGGQVLKKVAQRALKLPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFKQLYRARMNALDLNLKTKERIVAEANKAFEYNMQVPWRAAAAPSKQPWPC	659668	615482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_615749_616873_617366_617771_617890_619129_619256_659604
833423	contig_11902_pilon	-	587	4	Intergenic	novelGene_176151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	20.9920619917784	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	114	472	585	10352	10239	FALSE	20	TGAGAAGGGGGGCTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARAPCLLLADVPFLPPKGPPPAFQLPPGRPLSPLHREKHRESVSASGNKARASQSCPCFPGLRSRRDEDSLSGDRSDLKAPSTPGKRKKRRHRTVFTAHQLEELEKAFSEAHYPDVYARETLAVKTKLPEDRVQVWFQNRRAKWRKREKCWGGSSVMAEYGLYGAMVRHSLPLPESIVNSAKGGLAGSCMPWLL	14801	10236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_10419_11454_11579_12057_12137_14599
833424	contig_12250_pilon	-	1102	7	Intergenic	novelGene_80630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	5.71547606649408	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	103	459	367597	366932	TRUE	10	TACTGGGCCCTACCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRPLLFWDKETQISRQKFQEQLQTKAHCWECPMVQPPKRTTMSPAELFRTPTHPDWLPPELLAFWTRCAQLPPRVLRRRPPREPEEEAAEREAAAEVERRKTEALSDIEVLREAQEPSGPLMLSLGKAEGRVSPGEEGQWRPSLSTVPGN	368039	365942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_366088_366227_366335_366407_366528_366660_367058_367260_367428_367533_367601_367940
833425	contig_12410_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_167259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAGTGTAGTACATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23194	24850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_23200_24800
833432	contig_8541_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_105584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTTGTGATACTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548581	548032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548000_548600
833433	contig_4388_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_161948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305685	306418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_305700_306400
833434	contig_16921_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_177081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGGTATAACAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240906	242034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16921_pilon_+_240900_242000
833435	contig_9727_pilon	-	1599	9	Intergenic	novelGene_86284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_4	286.376063943899	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	661	1125	156166	141234	FALSE	50	AATAATTGGCAGGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQLLCAQPGQLPFNIIRHAVLLPDSSSAGSHVYAVFTSQWQMGESKSSAVCAFSLMDIENVFKGKYKELNKQTSHWTTYLGPEPDPQPGSCSVDPSSDKALTFIKDHFLMDERVMGTPLLVKSGVEYTKIAVETAQDLEGNSHVVMYLGTSE	159581	140759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_141423_154841_154993_156041_156215_156329_156396_156838_156953_157778_157885_158121_158221_158486_158550_159417
833436	contig_3818_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_99209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCATCCAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113923	115162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_113900_115200
833438	contig_12247_pilon	-	1971	2	Intergenic	novelGene_177082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	504	1229	216834	216109	FALSE	35	GGAGAAATGTCTTGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQSLFAFLEHRKMKKSLETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVVMVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEKGPGETEESHKESSLHVTQLVLSNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVGLQIPASANIHLNKAAFVSLQSYAIAHPCPF	228914	215366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12247_pilon_-_216835_228411
833439	contig_4962_pilon	+	1063	4	Intergenic	novelGene_107390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0.471404520791032	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	48	851	368140	382425	FALSE	35	CAACATCCCAGCTGATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKFWTFQELAGHGVPMPDTFSYGGHDDFSKMIDEAEPLGYPVVVKSTRGHRGKAVFLARDKHHLSDICHLIRHDVPYLFQKYVKESHGKDIRVVVVGGQVIGSMLRCSTDGRMQSNCSLGGVGVMCPLTEQGKQLAIQVSNILGMDFCGIDLLIMDDGSFVVCEANANVGFLAFDQACNLDVGGIIADYTMSLLPNRQTGKMALLPGLSSPREKKEPDGCASAQGVPESVYTINNGSTSSESEPELGEIQDPSASTMGAPSPMLPEPSYNINNRIASELKLK	368092	382637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_368162_372179_372267_378255_378460_381934
833441	contig_17311_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_57868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAATTCAAGAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185068	185556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_185100_185600
833442	contig_17370_pilon	+	1630	2	Intergenic	novelGene_177084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	6275	6589	TRUE	20	AATAGTGTTTGAGTTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSNSRLSPFLHPSGPFLPSEISGVHTPFHPGRLFSASSSPALVQCRSPSRGAPSVAATANVGAAETITNSTTLPEKWGQEGHSEESNPGFSLRSLFYSQYGKQ	6273	8476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17370_pilon_+_6617_7189
833443	contig_5039_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_65027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACAAATAATAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782961	1782758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1782800_1783000
833444	contig_5039_pilon	-	1597	2	Intergenic	novelGene_65026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTTCTGATCTCTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782708	1776696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1776997_1781411
833446	SIRV6	+	374	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	499	0	333	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
833447	contig_253_pilon	-	708	7	Intergenic	novelGene_129676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	857.238865324142	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	29	361	421711	419186	TRUE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAAASTAIMPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKRQARTTT	421739	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420252_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
833448	contig_8263_pilon	+	1133	2	Intergenic	novelGene_83098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATAGAAAACTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140321	142190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_141043_141778
833449	contig_12701_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_169560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	154	462	50984	51292	NA	45	AACGCACCCCCCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHNLCDPETKSTRWCPTTTTDCFDWDPNRGSPTEWEKNCTIIKFTKKIRLTCLTETGGTHEITALRHPSDLELIPFPETTFQPNHRKAHKINSNTQEETAP	50830	51710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_50800_51700
833450	contig_12701_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_169561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTCACCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51660	51906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_51700_51900
833451	contig_6361_pilon	-	1070	3	Intergenic	novelGene_24037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	105	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681293	676683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_677644_678989_679076_681269
833452	contig_15691_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_60765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34092	33151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_33200_34100
833454	contig_10044_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_156393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATATTTTACTCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153821	154922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_153800_154900
833457	contig_8671_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_126236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATAAACCATTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84906	84328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_84300_84900
833458	contig_3956_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_14731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374273	375722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_374300_375700
833459	scaffold_13505_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_111384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCTTGAACTCGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69125	68370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_68400_69100
833462	contig_4845_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_53650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGGGAGGAGGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432446	431875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_431900_432400
833463	contig_4845_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_53651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433009	432756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_432800_433000
833468	contig_8864_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_135987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	77	544	241977	241510	NA	30	TTCATGTTTTAGTAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSQFFRYCSFFPCPLLSSSLHSQPIPKCPLTISLSLFGHSTPPPLTTCKYNHITLLLGTVQWLKPTRDLLLFPLPTSLAPYPTPNSVPAFLSYLRLPYTTFCSDLRYYLQDQVTCQIFIFILAVKSTVIPHVAFFGHITVLSGSSVKKIFRTER	242053	240791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_240800_242100
833469	contig_5084_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_64628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTATTGATTTAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280238	1279036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1279000_1280200
833472	contig_7943_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_173144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGTCAGTAACTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180400	179154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_179200_180400
833473	contig_14647_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_167381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGTGTGTTTTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147858	146176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_146200_147900
833474	contig_9982_pilon	+	1852	2	Intergenic	novelGene_55781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAACCAGAATATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655738	659367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_656799_658575
833475	contig_7229_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_39794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTTTTCTGCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874013	875134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_874000_875100
833476	contig_2988_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_136539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42861	43299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_42900_43300
833478	contig_12624_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_61013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCACAGAGTGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820994	822626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_821000_822600
833481	contig_14546_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_157439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATCATACCCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504818	506630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_504800_506600
833482	contig_11816_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_98495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTGACTCAAACAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549732	548249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_548200_549700
833483	contig_15325_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_157154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCCACGTGTGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8214	8029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_8000_8200
833484	contig_20602_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_133733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24100	22802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_22800_24100
833486	contig_15084_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_116699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAACTCCGACACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225479	224983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_225000_225500
833487	contig_8691_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_72686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39694	38133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_-_38100_39700
833488	contig_14621_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_105852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCAGTACCCTTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391426	390903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_390900_391400
833489	contig_8710_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_73516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCTCTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366079	364123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_364100_366100
833490	contig_10642_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_78677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGCACAAAATGTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193382	194527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_193400_194500
833493	contig_10861_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_39444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGAATCCTCGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2468212	2468000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2468000_2468200
833495	contig_1694_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_144921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTCTTCCCTCTACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423984	425363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_424000_425400
833496	contig_2219_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_67191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAACAAAAATAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169393	169603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_169400_169600
833497	contig_2414_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_158511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486420	487388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_486400_487400
833498	contig_10095_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_57222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	692	1093	97033	96632	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRKSWWPPETVTELKAGTLNLCNNASCPTFPKVSKICREACIRKRLSFQLIKYLEVQYTEISSISNKCDTCSQWQPGAMVRDAHSQVNLLGFTRDLILIRLGPIISSLCVSVSSLIRNKGLVLTHGIDIRMI	97724	95782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_95800_97700
833499	contig_8864_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_136008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTACAGACGGACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741701	740382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_740400_741700
833500	scaffold_6394_pilon	-	1693	10	Intergenic	novelGene_110947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	47.8121323515277	182	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	275	1507	52282	47895	FALSE	15	CTGCCTGGACCTCAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVCDWNPDFTSPAGDQVLRPALGSAVTLNCTAWVVSGLHCPLPSVQWLKDGLPLDNGSHYSFQEDLWVGANLSKVLVSRVLRVNLTTAEDYGVFTCSVHNVSSSSFMLWRAGPPGHVAAVLASLLVLLALLLAALLYVKCRLNVLLWYQDAYGEVEMNDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFLDDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLGRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFITFEGQRREPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWKPGSVTPSSDFWKELQLALPRKVRYRAMEGDPQTQLQDDKDPMLIVRGSVPEARTLDPELDPDPEGDLGVRGPVFGEPSVSPHASGFALGEGRGTEVDVSDLGSRNYSARTDFYCLVSEDDV	54234	47708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_48059_48316_48507_48872_49024_49087_49191_49965_50110_50343_50485_50576_50711_51187_51387_52275_52425_54102
833501	contig_14338_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_174840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGACACTTTGTGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108314	109102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_108300_109100
833503	contig_14142_pilon	-	412	2	Intergenic	novelGene_120538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAGGAACCGTGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350215	349388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349718_350132
833508	contig_20246_pilon	+	1296	7	Intergenic	novelGene_174891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	20.2649122047609	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	11	1033	13719	16405	FALSE	25	GAGAGTGCTCAGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGMFSFSLGQTVLCVGRNTTRCESHGYNACDYQCWENSVGEELFKLSIFNFLLTVAFAFLVTLPRRLMVERFSGKFWAWLDREEFLVPKNVLDIVAGQTVTWMGLFYCPLLPLLNSVFIFLTFYIKKYTLLRNSRASPRLFRASSSTFFFQLVLLLGLLLAAVPLGYVVSSVHSSWDCGLFTNYSAPWQVVPELVALRLPVPSQLALHYLGSHAFSFPFLILLSLVLTVCVSQSHANARAIQGLRKQLVWQVKEKWHLVEDLSRLLQEPGSNGFPGLESPHSRASRPQSFCPGFPCPGSPRPRSPQPVPSLGHPAGPRSPCPGRGDAPASACSFVFPGAAEL	13708	16668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20246_pilon_+_13812_14165_14264_14456_14641_14781_14913_14999_15159_15620_15700_16126
833509	SIRV6	+	305	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	25	47	25	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGTATATGCGGTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3048	11223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
833510	contig_10196_pilon	-	669	5	Intergenic	novelGene_132343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	108.010126840033	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	147	653	2475895	2473818	FALSE	45	GTTTGAAAGTCAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAEGPAADAALEGAEAEARPEASEDNEDDDEALPHSEVVDVFQEGLAMVVQDPLLCDLPIQVTLEEVNSQIALEYGQAMTVRVCKMDGEVMPVVVVQNATVLELKKAIQRYVQLRQEREGGIQHISWSYVWRTYYLTFAGEKLTDDRKKLRELQPHPNVLCLLLPPPSGTNSVNPRAVGSSFLSRLLGLSLTPSQCPNLTTCGPHGAVDIVLYTE	2476041	2473801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474011_2474605_2474681_2475090_2475197_2475338_2475430_2475853
833511	contig_10616_pilon	-	2236	10	Intergenic	novelGene_175608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	235.509586709541	1	117	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTAAAACTATTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000250	976051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_-_977046_977683_977810_978134_978223_980031_980188_984482_984562_986713_986846_987074_987348_988902_989022_995177_995374_1000177
833512	contig_6276_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_174122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGATAACAAAGTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156523	155939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_155900_156500
833513	contig_6710_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_97729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAATATTTGTGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653693	653397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
833516	contig_15236_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_141562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATTCTTCATATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412114	410746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_410700_412100
833517	contig_15543_pilon	-	1678	13	Intergenic	novelGene_164358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTATCTGTTGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216114	188713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_188867_189931_190021_190555_190692_191521_191601_192834_192886_194044_194117_194562_194690_202040_202195_203537_203607_206574_206630_207646_207785_209402_209493_215649
833520	contig_15105_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_150950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTTGTTGATGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390920	391900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_390900_391900
833521	contig_3018_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_78956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGAGTTTTCTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443929	1443348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_1443300_1443900
833524	contig_9578_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_67960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020400	1018500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1018500_1020400
833528	contig_1372_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_140521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCATTTCTGAATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453546	454465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_453500_454500
833531	contig_8069_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_136767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAGAGGTATAGAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90070	88552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_-_88600_90100
833533	contig_16643_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_158143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGCAATGGTAATATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318701	319334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_318700_319300
833535	SIRV4	+	551	3	Antisense	novelGene_SIRV4A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCTAAGTGAGGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8702	15121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_8947_13623_13829_15019
833536	contig_6069_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_8011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGGTTCTTTTAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81835	82436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_81800_82400
833538	contig_10733_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_109955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCCTGGGTGTGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34931	62364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_+_35034_61837
833540	contig_366_pilon	+	775	3	Intergenic	novelGene_51613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	2	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	9	344	1163645	1168078	FALSE	65	AAGAAAAAAAAAGTATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDMSSRELKRRFEEFGEIVECQVLTRSKRGEKYGFITYRCSEHAALSVRNGAALRKRNEPSFQLSYGGLQHFCWPRYTDYDSNSEEALPTSVKNKYEAMDFDSLLKEAQQSLH	1163636	1168509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1163725_1166991_1167147_1167977
833541	contig_5586_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_143613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCGGTTAATTTTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773275	771745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_771700_773300
833543	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
833544	contig_11721_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_177088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113563	115139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11721_pilon_+_113600_115100
833545	contig_6842_pilon	+	1012	7	Intergenic	novelGene_130755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	336.918099180729	935	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	46	639	1306076	1368955	TRUE	10	CATGGAGTCCCTGTCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAHSASEEVRELVGKTGFSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVKYAPSPALAPGAPPTPSTWWRPKFLVGLCPPPPLRWSRSCSQETPTLRRSLLAPLQMGP	1306030	1377406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306134_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368988_1374425_1374474_1377113
833546	contig_12626_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_80444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGAAAAAGAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154312	155877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_154300_155900
833547	contig_1836_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_71038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTGTATATTTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626049	627799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_626000_627800
833548	contig_15369_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_177090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTTGATTCAAAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13675	15452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15369_pilon_+_13700_15500
833549	scaffold_880_pilon	-	1310	16	Intergenic	novelGene_121400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_12	275.563471212472	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	486	1253	299574	271774	FALSE	15	GCTGGGTGTCATCCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGAVASMFWVDAELGSDIYLDGIVTVVDSKYGLKHLAEEKAGGLINEATRQVALADLIIINKTDLVPEEDLSQLRTAIRSINGLGKILETQRSRVDLSNVLDLHAFDGLSGISLQKKLQYVSATQPHLDQNIITVTFEAPGNAKEESLNVFIQNLLWEKNVRNKDGHCMEVIRLKGLVSIKDRAQQVIVQGVHELYDLEETPVSWDDDAQRTNRLVFIGKNLDKDVLKQLFMATVTETGKQRTTHSKEGQVCP	311043	271716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_272251_272382_275217_275284_275386_275456_277107_277160_281388_281446_286467_286513_289339_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_299564_299632_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
833550	contig_14450_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_49031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAGCTTCTCATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252506	1253296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1252500_1253300
833551	contig_286_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_177091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAAGGTCTAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22331	20547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_286_pilon_-_20500_22300
833552	contig_504_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_54458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTTTGAGTAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494248	494021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_494000_494200
833553	contig_990_pilon	+	503	5	Intergenic	novelGene_76091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.433012701892219	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	145	501	1282067	1327755	FALSE	35	AACCAAATCTCCAGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETTMMPEEIELEMAKIQRLREVLVRRESELRFMMDDIQLCKDIMDLKQELQNLVAIPEKEKTKLQKQREDELIQKIHKLVQKRDFLVDDAEVERLREQEEDKEMADFLRIKLKPLDK	1188527	1327757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1188652_1282046_1282171_1323563_1323638_1326197_1326313_1327691
833554	contig_9683_pilon	+	788	2	Intergenic	novelGene_151303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGTGCCTCATTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934121	936803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_934722_936615
833558	contig_9185_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_166908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAGAAGAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448749	450879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_448700_450900
833559	contig_12520_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_161085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578461	579827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_578500_579800
833560	contig_11016_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_163292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTCTAAGCTATAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131138	133375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_131100_133400
833561	contig_18869_pilon	-	1622	2	Intergenic	novelGene_56446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1013	1351	120066	119728	FALSE	75	CAAGAAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFSPEKFYRKQTNHSPHSLTSKTKSLKRLTFLRILFPCMSTSLLPRIQIQPKLFKTKRIPLHSCVSTIPPTAGAAKSSVKLLSTLISASPSGNRTCRTICLLMNNNDVLL	122514	119456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_120203_121638
833562	contig_1339_pilon	-	1048	6	Intergenic	novelGene_163149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_3	2.72763633939717	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	104	721	477136	474015	FALSE	20	TGTGGACTGAACCATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRPGLGRVLPGSSVLFLCDMQEKFRHNIAYFPEIVSVAARMLKVARLLEVPVMLTEQYPKGLGPTVPELGAEGLQPLPKTCFSMVPALQQELDARPQLRSVLLCGIEAQACILNTALDLLDRGLQVHVVVDACSSRSQVDRLVALSRMRQSGAFLSTSEGLILQLVGDAAHPQFKEIQKVIKDPAPDSGLLGLFQGQNPIFR	484701	473687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_474096_476003_476122_476286_476358_476701_476912_476998_477140_484601
833564	contig_5095_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_74939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133526	132847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_132800_133500
833565	contig_6589_pilon	-	1229	3	Intergenic	novelGene_25687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	376	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGTACATGGTGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108263	100523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_101576_107073_107107_108119
833566	contig_8597_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_158702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAAACTAAAGAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29381	30236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_29400_30200
833567	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
833568	contig_9468_pilon	+	1119	9	Intergenic	novelGene_59446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.17944947177034	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	192	812	59736	69708	FALSE	40	CATTCAATGTATTGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNCILNITTRTANSKLRGQTEALYILTKCNSTRFEFIFTNVVPGSPRLFTSVIAVHRAYETSKMYRDFKLRSALIQNKQLRLLPQEHVYDKISGVWNLSSDQGNLGTFFITNVRIVWHANMNDSFNVSIPYLQIRSIKIRDSKFGLALVIESSQQSGGYVLGFKIDPVEKLQESVKEINSLHKVYSASPIFGVDYEMEEKPQPLEALTVEQIQDDVEIDSDDHRDAFVAYFADGNKQQDREPVFSEELGLAIEKLKDGFTLQGLWEVMS	56946	70015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_56991_57120_57249_59716_59853_63217_63314_66151_66215_67812_67948_68371_68456_69435_69460_69606
833569	contig_6589_pilon	+	1190	5	Intergenic	novelGene_26315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	57.1095438608995	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1	627	2353579	2354298	TRUE	10	CCCACTTTGTGGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLWGIECVGSQGSQAGAGASTNPRSPRWYRDLVDGYQLQVQKSVTVQEGLCVFIPCIFSYPPDGWKDSDPVLGYWFQEQAYNFNHEQVAPVATNNPYRKVDSQTRDRFQLLGEPWNRSCSLVIRDAQRRDTATYFFRVERGNTVKFSFKKYTLALEVTGLTQKPDVYVPETLEPGRPVTLLCVFPGDFEGCPAPKFSWTGVAVSPPRS	2353578	2371607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2354054_2354146_2354433_2354880_2354981_2355976_2356059_2371360
833572	contig_9450_pilon	-	701	4	Intergenic	novelGene_174434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_1	330.964583536601	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	105	368	83101	33128	FALSE	30	GTCCACTTTAATTCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFLDPLRVDGVTLNSSTRVSEIRLAIDEAIFLRTMAKNKLRGQKSRNIFHIASQKHFKSKNKAKPVTTNLKKINIVNEEKVNRVNKAFVDIQKELAHFSKGLSLEPLQKQLETSRMNETML	86319	32794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_-_33161_71483_71601_82987_83105_86218
833573	contig_10753_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_105137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGTGCTTGGCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112966	114239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_113000_114200
833576	contig_6710_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_89347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
833579	contig_6433_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_162754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	42	junction_2	1	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	528	7	534	57702	51388	FALSE	30	GGACAACCTTCAATCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESMTFKDVAVDITQEDWELMRPVQKELYKTVTLQNYWNMVSLGLTVYRPSVIPILEEPWLVIKEILEGPSSEWQTKAQEYTPVEDTSELKKDVTQTIKLEESYDYDDRLERQETEAFRKIPTNESDFRLKSFLSQEDDPTEECLSKYDVYRNNFEKHSSLIVQFGTQSDNKTSMYNES	57708	51386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_51708_57015_57103_57581
833580	contig_13044_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_99982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGAGTTGATTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51466	52998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_51500_53000
833581	contig_11160_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_168853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	457	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCAATAACAGAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819528	820677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_819633_819808
833583	contig_9629_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_171601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGTGGCTGCAAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63360	62636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_-_62600_63400
833584	contig_5316_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_61225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAAATCTTAAGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430041	428713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_428700_430000
833585	contig_8354_pilon	-	1516	5	Intergenic	novelGene_24153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_4	284.140260258908	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	143	823	578686	550857	FALSE	30	TCGGAATTTAGTATACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKVTFIKTVHSSKQTCKSDFWACCFSYPPYPRSLHTAAL	618460	550163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_551140_555802_555922_558330_558496_578572_578731_618362
833587	contig_5753_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_174319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177926	179742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_177900_179700
833589	contig_2704_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_75313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257168	256048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_256000_257200
833590	contig_4305_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_136693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATCTAGAACAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535081	534137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_534100_535100
833591	contig_14357_pilon	+	896	8	Intergenic	novelGene_121715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	50.3457433905889	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	29	895	902563	931438	FALSE	30	GTGAGTAATTTGAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKGRIYVKMETKVQLFCQAEENIDIVDAGSHSFATDLPSRNIYSKKYIKFSKTTEKKISPLISPDIRGLSPEHKKTYETSVFLHEEKYSDKIRKKKSLQLHSKRTEIISSSVKLSKEKITKKESSLCKLPNQYRVHRTSSPIRKSSITGKKETLSKLYQTLYDEVPCGHLYSQELNALQKACKLFSKIQNGKIYVNDLPVILCTLKISVNDSEMRQALKTIGIDGNGLLDFSTFLKALNDVSYWVSQDPAFQDALKIFCRIKDGQVATDELAPVLSSMNIFVDPETVQETINYTFVD	902534	931439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_902593_906773_906947_914904_914996_918248_918377_919172_919256_920498_920643_929681_929757_931295
833592	contig_9011_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_159300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTGTTCTAGAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435588	436252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_435600_436300
833594	contig_5479_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_133567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99559	97338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_97300_99600
833595	contig_4315_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_46810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGTTACGAGGACAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328192	327131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327100_328200
833597	contig_2867_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_135165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	585	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	394	807	550083	550496	NA	25	TGCTCAGAGTCTATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGVAWDTSSRTSLEGSPCPKLLLLGTSCTQEGAGPPKGPHCPQTPQCPLFKTKSSFFFWYGDHDRYLFTAGKDLGSLPSMPLNLPDSWSFRRGLAGEGPGVNGCWDLCISWVSLATSLGQNLSGPGCCDLFVNKLP	549689	550502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_549700_550500
833598	contig_10437_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_38101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	58917	58588	NA	50	TTATTTCAAACTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFNCFSPKATLTKQKQLYTDPRFSHSLCPLSYLHSPLQYGWVHKSAPQVTSDLHATKTNGHFSVVLIRVSAAFNSYSLFLEIFSFVSILNTNSPEFANCLVIPPWLYTQ	58917	57890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_57900_58900
833599	contig_1567_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_176416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTACTGAAGGGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377596	377894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1567_pilon_+_377600_377900
833601	contig_10404_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_138647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTCACTCCTAACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748623	748091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_748100_748600
833602	contig_6374_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_158441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	311	616	273492	273187	NA	20	AGGGTTGAGAGTATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGCRVALLKPQTLEAQSSHGAIRLLSTPRVNSTCSGSIPWPPGEVSKVVVRQSNLVWGMLKALIDMGLVSLETSYCHMGITEIEGSEIRGQWEKGMLSH	273802	272697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_272700_273800
833603	contig_10734_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_51284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTCTCAGGTTCATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342884	1341577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1341600_1342900
833605	contig_14530_pilon	+	1576	6	Intergenic	novelGene_108439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	10.5527247666183	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	483	893	14025	26836	FALSE	45	ATATATATATATATATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREEDKNQDGKIDMLHFKLELPLQSTEHVLGVQLILTFSYQLHRMSTFVMQSMAFLQSSFAVPGSQLYVNGDLKLQQKEPLSSGGLDVRYNVSVINGTSPFAYDYDLTHIVAAYQERNGESWVEFIQPLLRNFPG	9608	27519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_9802_9887_10058_13905_14028_23780_23910_24255_24400_26701
833606	contig_14300_pilon	-	1574	12	Intergenic	novelGene_133155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATCAGGGCGACTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636219	607718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_607842_608612_608821_610952_611032_619107_619286_624917_625083_628308_628466_630121_630189_631725_631837_632753_632891_634826_634932_635868_636027_636133
833607	contig_2201_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_168759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAAACAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23133	24745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_23100_24700
833609	contig_665_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_158219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339656	342024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_339700_342000
833613	contig_3948_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_53157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAATAAGAAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99468	98921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_98900_99500
833615	contig_11378_pilon	-	500	3	Intergenic	novelGene_112211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	97	468	208695	191335	FALSE	40	AGGGAATGTCCTGAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLTGGRRAIGRQHHATRTSPLTDSRRDIAHQHHNDMHVPTDGQQKGRWPRIKPGSPNRKVGMVDAPPACSTVSSAHLPQQPHCITAQEDMLSLPRPSTMSSTDEETRAPVKDATASADGEV	208791	191302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_191417_200923_201031_208512
833616	contig_11929_pilon	+	1029	2	Intergenic	novelGene_171229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATTGCATAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36730	46491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_36907_45638
833617	contig_4392_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_117316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTAATTTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322888	324981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_322900_325000
833619	contig_1239_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_150406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583306	582839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_582800_583300
833620	contig_10494_pilon	+	1616	2	Intergenic	novelGene_102208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGCATAAGTCAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083279	1086687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083310_1085101
833621	contig_5999_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_45621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGGAATATTACTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125953	126811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_126000_126800
833623	contig_9656_pilon	+	1190	2	Intergenic	novelGene_121905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACATCTTGGTTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174599	192360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_175196_191766
833624	contig_11396_pilon	+	818	7	Intergenic	novelGene_71441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	464	junction_3	401.664626550836	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	141	677	1786240	1789745	FALSE	25	GAGAGCGTGTTATTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782403	1789886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
833625	contig_19769_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_102249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	399	339	737	59806	60204	NA	5	CTCGGCGTGCAGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLLVLDEGRQPAAGFPAVPAPVRLLATVQTVVLTEGVTSAEGLATLCALKGLLLGVDFLVQSEVGLAAEGLAALLTSKWFLACVEPLVEQEQGVVLKRLLAHGALVALVPRGGPLYRAEWGALARAAFCRAV	59467	60204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_59500_60200
833626	contig_10600_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_169854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTATAATCATAGCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70884	71434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_70900_71400
833628	contig_13300_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_125774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	975	1358	53536	53919	NA	50	AATAATAAATTTCTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQKVIHIELVKKRLTTGTVESTHCIVGQLVGQLASRSPSGFPRDGSTDEEILSFLAVVSFQTCHTSSWGRNGARSCALGCAEVVLDKRAQVLISAGFSPCILGKCPGPPLHPAPRDVFLLFFSCCT	52561	54241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_52600_54200
833633	contig_18173_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_160760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTTGTTATGTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18754	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_17400_18800
833634	contig_13800_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_153731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAACACAATACTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134740	133552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_133600_134700
833636	contig_19744_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_120387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTATATGTAATATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174950	174124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_174100_175000
833638	contig_5640_pilon	-	1129	5	Intergenic	novelGene_27268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	10.158124826955	211	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	450	1058	920135	912628	FALSE	15	CTTTTCCTAATGTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLIFVDKENGEVGTRVAPKDGLKLGSGSTVKALDGRSQVSTPHVGKIFDAPSALPKATRKALGTVNRATEKSVKTNGPLKQKQPTFSAKKMTEKTGKAKSSVPALDDTCPEIEKFFPFNPLDFESFDLPEEHQIAHLPLNGVPLMILDEERELGKLLDMGPPSPVKMPSLTWGSNLLQSPSSNLSTLDVELPPPCYHLDI	920584	912556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_912708_913439_913599_918104_918199_919513_919699_920044
833639	contig_2854_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_120863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919750	921321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_919800_921300
833640	contig_7730_pilon	-	1088	4	Intergenic	novelGene_156250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	678.518156639075	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	77	520	43591	2264	FALSE	15	ACTTATTGTGTTGCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRQQRRPWNAEGAEGVRGGGCNSEMAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKQKKKLSVTINDSYVPVKKL	43667	1695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2325_4051_4177_7798_7895_43429
833641	scaffold_13505_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_111399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCGGCTATGAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211825	212305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_211800_212300
833642	contig_5280_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_52643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	197	526	201376	201047	NA	55	AAACCCCAAAGCCAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPATPGIIQSQSPVLVVSARGGNLRPGDCRGLPKLAGGKQASSTTLTFSLSTPCFASQHSGPPCPRRVPTSALPLPVTEDPWRDESQENPKEVRCAHATAELQRHDAF	201572	199758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_199800_201600
833643	contig_12540_pilon	-	1193	2	Intergenic	novelGene_148049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	238	795	111833	111276	FALSE	0	TTGTTTTTGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELVENRTRQVDSHVELFEAHQEISDATGNSGKASQDKSKNETITQAEKPNNKRSRRQRNNENRENASNNHDHDDITSGTPKEKKAKTSKKKKRSKAKAEREASPADLPIDPNEPTYCLCNQVSYGEMIGCDNDECPIEWFHFSCVGLNHKPKGKWYCPKCRGENEKTMDKALEKSKKERAYTR	115127	110877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_111980_115036
833644	contig_10962_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_103925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCAACAGCTTTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626298	626000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_626000_626300
833645	contig_19563_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_177092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAATCATATTCTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20846	22035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19563_pilon_+_20800_22000
833647	contig_3948_pilon	+	1141	3	Intergenic	novelGene_53357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	28	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	191	322	1696499	1696859	FALSE	30	GTACAATGATCAGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APHRARPNKLERERTCQLLDTRRFLDELCAHLRDGHPEPEYQIRLCFGEEYPGPPGQPEERLVMAHVEPVFARELLWHSKHLGGPEGPQPGIPDTVIHLLTHLSQP	1695771	1697678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1695852_1696388_1696508_1696736
833648	contig_8900_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_171632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACAAAGTCAATTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364132	365878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_364100_365900
833649	contig_504_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_54394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCAGAGCAGAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6093	6564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_6100_6600
833651	contig_8571_pilon	+	723	5	Intergenic	novelGene_169181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	39.6831198370289	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCATGGCCTCTAGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461201	514510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_461300_471125_471242_482036_482183_513706_513782_514222
833652	contig_9074_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_156632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATCAAGATCACAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151372	152466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_151400_152500
833653	contig_6445_pilon	+	1439	9	Intergenic	novelGene_77133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	181.508952947231	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	423	800	1487442	1488667	TRUE	15	TGCAAGCTGCCTGGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFIHTASINFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKATTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFIESQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGRFPGTFVGTTEPASPPLSSTSPTTSAATMPVVPSVAGLVPPGEAALCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS	1481346	1489360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1481427_1481644_1481738_1483951_1484015_1485815_1485840_1486472_1486563_1487369_1487471_1487987_1488229_1488559_1488840_1488893
833656	contig_7345_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_159195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTTATTTTCACAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318167	318724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_318200_318700
833660	contig_6427_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_162583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	29	574	1085473	1086018	NA	20	TAAGGTGTATGTGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAQTGQRAVMQLGTAAQTGQRAMTQPGMAAQMGQRAVTQLGTTAQTGQRAVTQPGTAAQMGQRAVTQPGMAAQTGQRAVTQPGMAAQTGQRLWTAAQMGRQVVTQLRTACPGEEAVSRGQRGHAWGQLYRGVADTTSRPVTGDSGGETRSGSVEEQPEWAHGFHRRPSCFPVARSASFLRPRWVSRACCW	1085444	1086443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_+_1085400_1086400
833661	contig_1982_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_151313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAAATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118082	116385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_116400_118100
833662	contig_11248_pilon	-	530	4	Intergenic	novelGene_142553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	258.511551428988	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	142	528	294216	285292	FALSE	65	AATAGAAGAAAGAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAGEVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQK	302105	285289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_285439_290108_290226_294093_294235_301982
833663	contig_13201_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_130884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGAATCTTGGCCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197715	196663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_196700_197700
833664	contig_10904_pilon	+	500	4	Intergenic	novelGene_22589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	142.8573492062	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	16	453	444436	454228	FALSE	25	AAGATCCGTCCTCGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHETSPRTEVAASLGSTGGLHRFLYFVLSC	444420	454275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_444557_445256_445415_448343_448420_454145
833666	contig_15105_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_150932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGCCATTGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230152	231126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_230200_231100
833667	contig_3095_pilon	-	968	6	Intergenic	novelGene_75236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1206.16274192167	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGTACTCTGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255543	246374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248723_253732_253806_255384
833668	contig_14516_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_153893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTCATATAATAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45424	45900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_45400_45900
833669	contig_13188_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_176784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAGAAGATGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105829	107240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13188_pilon_+_105800_107200
833670	contig_14225_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_52746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGACTCATATGCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255456	256708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_255500_256700
833671	contig_9468_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_59538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACTATAATGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648972	649470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_649000_649500
833672	contig_10003_pilon	-	1392	2	Intergenic	novelGene_88282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGTACTGTTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857604	855814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_857171_857568
833673	contig_299_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_129476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCGGTGGTTCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363956	1362657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1362700_1364000
833675	SIRV4	-	362	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1151	8	1151	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
833676	contig_10734_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_51386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAATTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1894896	1894057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1894100_1894900
833677	contig_10575_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_141819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCCAACAAATGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358452	357825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_357800_358500
833678	contig_3602_pilon	+	959	2	Intergenic	novelGene_60631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	17	730	971037	972129	FALSE	15	CCCACTTCTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPRTREGRSHRDRHWAPHEKETPERWDWNCPETRRLLEDAFFRDEDYIRQGSEECQKFWAFFERLQRFQNLKTTRKEEEKDPGPPKHSVPALADLPPTYDPRYRINLSVLGPNTRGSRELGRRLPPERVSEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERVALPIAQYGKRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQV	971020	972358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_971745_972123
833680	contig_9333_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_120331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGAGGAGCCATACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360184	359226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_359200_360200
833681	contig_9333_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_120330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359028	358716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_358700_359000
833682	scaffold_19766_pilon	+	1816	14	Intergenic	novelGene_34314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2.49496534465029	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	101	1657	583340	595656	FALSE	15	GCTTTAACTTGGCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASLTNAEFEEIVQIVLRKSLQECLGSGLGLAEMSCAQPIACTQSDKEPELTSMTVDNDNADGERLIVPHTPEISASQENEVVPEINASKPGQPDPASSEKKFNKLSLNKRKMEAQNEKLEKLQGKHEHRQKDQPKKTARNHSQIRDQQKGEGGGFGQCLVWVQCSSPNCEKWRRLHGNIDPSVLPENWSCDQNTDLEYNRCDIPEETWTGHESDVAYASYIPGSIIWAKQYGYPWWPGMVESDPDLGEYFLFASHLDSLPSKYHVTFFGETVSRAWIPVNMLKNFQELSLELAGAKKCRNKDCSQKLGAALIMAQAAEQISIQERVNLFGFRSRYNGLDSAREGKDLMLSGPNSPDSYLEKEEEVESEMEEEEEKRDPTLDVPKPAKIQRKNSKPRGGNTGRAAGRDGTLQKKTKRSLGVESTAPPVLIMARKEGQGNSDPHQPSTKKKFKAPQSKSLVTSLSKEREARMVPKGLAPPTPSQVHLTVEKERPGHQEPMHREAESVLSEDEASSDLDLEQLLEDVGNEPELREESQSRDEEQGFTMALFEE	581259	595815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_581337_583316_583429_583762_583921_584130_584254_584978_585096_585834_585956_586521_586598_587040_587146_588049_588134_588731_588799_589206_589299_594136_594198_594654_594799_595336
833683	contig_10196_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_132220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1515	1823	1367701	1367393	NA	30	AGCCGTCATCAAGTCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNPREPTTPLMSAKALSGWLLLRWRRGHHCHGNQSGCAGEGGHWSTKRALTWGMSRGMASGLVFLVYVSRRTGNCPLCDGEFDVPAWLSYGAKCSGQTLL	1369215	1367067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1367100_1369200
833684	contig_9706_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_21003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488808	487718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_487700_488800
833685	contig_2940_pilon	+	547	7	Intergenic	novelGene_81948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	18.0500846412297	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	210	337	546	790584	795061	FALSE	10	ACTTTGACCCCTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTSDGTLLQPLKGHKDTVYCVAYAKDGKRFASGSADKSVIIWTSKLEGILKYTHNDSIQCVSYNPVTHQLASCSSSDFGLWSPEQKSVSKHKSSSKITCCSWTNDGQYLALGMFNGIISIRNKNGEEKVKIERPGGSLSPIWSICWNPSREEHNDILAIADWGQKLSFYQLSGKQIGKDRSL	777217	795062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_777297_783231_783311_787197_787275_789520_789588_790549_790697_794042_794119_795040
833686	contig_5954_pilon	-	592	6	Intergenic	novelGene_28580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.8748652690263	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	10	354	929131	927201	TRUE	35	ACATCTTAAAAGCCCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVMRLRKGGSTVEVDSGGAARRDMRLSWVLAVLSICLNALATAAGAEGKRKLQIGVKKRVDHCPIKSRKGDVLHMHYTGKLEDGTEFDSSLPQNQPFVFSLGTGQVIKGWDQGLLG	929140	926531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_926656_926741_926778_927044_927092_927169_927318_927656_927826_929072
833687	contig_12255_pilon	+	1105	7	Intergenic	novelGene_177093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.40947204913349	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	702	402	1103	25240	57390	FALSE	30	AGATTCCAGTGCATTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDPNKLFLVNQLLYGKEGNDALVRCPLTDPEVSNYSLKGCKGKPLPKDLVFVPDPKTGITIRSVKRAYHQLCVHCSADQGGKSVLSEKFILKVRAAIKAVPSVSVSKASYLLREGEEFAVTCTIKDETSSVLSMWIRENSQHIKAEVQSTSRHKGDFYYERQEMLTISSARVNDSGVFICYANNTFGSANVTTTLKVVDKGFIHISPIMNTTIFVNDGENLDLIVEYEAYPKPEHQQWIYMNRTSTDKWEDYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGIYTFLVSNSDANSSVTFNVYVNTKPEILTSDRLANGKLQCVAAGFPEPTIEWYFCPGTEQRCSASIVPGDVQIQNSSVSPFGRLVVQSS	23386	57392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12255_pilon_+_23675_25126_25264_29548_29721_33570_33761_36231_36348_54740_54856_57305
833689	contig_709_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_57554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTATTTATGTACCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1541254	1540666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1540700_1541300
833693	contig_5832_pilon	-	983	4	Intergenic	novelGene_134136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	254	673	229619	229200	TRUE	20	ATGCCTGTATGAATCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSTGYFSFMVGTGLASSMDRKESSRSRPRVKGGLRVGVDGDEGSSAVAEDTSVVEGPLLGSSFCWTSRPSLLSTTAGGAASVGDAEAWKCSSTTELVLWRLSSGWRGSVSAVVTNFSQPSFELTPMGKNFSNRRLF	229872	224192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_224321_226087_226162_228424_228520_229186
833695	contig_16204_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_154499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGTTGTAAATCCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271508	272044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_271500_272000
833697	contig_3986_pilon	-	1025	2	Intergenic	novelGene_52698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	318	662	41485	35282	FALSE	25	GCCCAGCTTACATGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	41802	34918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_41346
833698	contig_11396_pilon	-	937	5	Intergenic	novelGene_71293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	14.7732867026942	178	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	13	540	353506	352401	TRUE	30	AGAACGAATGCCGCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVEMGPQLPLAPPALWVLTGFALLLGLWALCAACHRKQAPRPRAGLQGAVMPVDVSLLRRTHLCALSKSDTRLHELHRGARGSQAPRPASMDLLHPHWLEGYRGTPRPPAALPTFPHQEPARPPPVVTTSASSGPKATYSTVGLAALPRVSLAASPEMWSGARLTSHWARPGGGTHGG	353518	351914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_352227_352315_352685_352966_353055_353127_353186_353408
833700	contig_4388_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_161960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGATGAGAATATATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448256	450485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_448300_450500
833701	contig_15039_pilon	+	799	2	Intergenic	novelGene_110173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	176	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAATCTGTGTCCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331878	344097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_332378_343797
833702	contig_6433_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_162758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAAGAAGGGGTAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176358	177681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_176400_177700
833705	contig_7025_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_104403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAACCCACCAGCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101950	103486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_102000_103500
833707	contig_9274_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_151160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530094	531383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_530100_531400
833708	contig_17142_pilon	+	1622	11	Intergenic	novelGene_177094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	12.2539789456323	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1548	73	1620	38863	90729	FALSE	40	GACAACAAAAGGATTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTDKYLGPQDLKELGDDSLPVEGYMGFSLGARSASLRSFSSDRSYTLNRSSYARDSMMIEELLVPSKEQHLTFTREFDSDSLRHYSWAADTLDNVNLVSSPVHSGFLVSFMVDARGGSMRGSRHHGMRIIIPPRKCTAPTRITCRLVKRHKLANPPPMVEGEGLASRLVEMGPAGAQFLGPVIVEIPHFGSMRGKERELIVLRSENGETWKEHQFDSKNQDFTELLNGMDEELDSPEELGKKRICRIITKDFPQYFAVVSRIKQESNQIGPEGGILSSTTVPLVQASFPEGALTKRIRVGLQAQPVPDEIVKKILGNKATFSPIVTVEPRRRKFHKPITMTIPVPPPSGEGVSNGYKGDTTPNLRLLCSITGGTSPAQWEDITGTTPLTFIKDCVSFTTNVSARFWLADCHQVLETVGLATQLYRELICVPYMAKFVVFAKMNDPVESSLRCFCMTDDKVDKTLEQQENFEEVARSKDIEVLEGKPIYVDCYGNLAPLTKGGQQLVFNFYSFKENRLPFSVKIRDTSQEPCGRLSFLKEP	38790	90731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17142_pilon_+_38895_43611_43715_59665_59773_64448_64674_67448_67604_84004_84217_85721_85930_87420_87518_88123_88353_89042_89169_90675
833712	contig_9389_pilon	-	468	4	Intergenic	novelGene_83942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	167414	165919	TRUE	10	CCTGCACCTGGGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRTVLGVIDLPAQAKDLAALVGALRVTHLQGHGGVVTLVGAQLGVIDVPPGPWGCHAHLAGTLVGAHLEADGGVVHGWQDVVLGVVEVASHPVGRHARLAGTFVGAHLQGAR	167414	164513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_164538_165813_165927_166064_166228_167246
833714	contig_1154_pilon	-	397	3	Intergenic	novelGene_87228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	65	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATTTAACAAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633133	1625906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1626014_1628432_1628653_1633063
833716	SIRV5	+	291	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	878	36	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
833720	contig_4350_pilon	+	332	2	Intergenic	novelGene_136366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	228	104	331	31883	32257	FALSE	55	GTAAATACACCAAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSIVSAVVLQDLLAYVSSKHSCLRDLPQRQPQKMNSIEFVELKHLQPEILVHAVLRVVDITILTEALYSYRGQKQKKVVLTVEQTQGQHYVLVLWGAGAAWYPQLQRKK	31779	32258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_31977_32123
833721	contig_4486_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_38631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAGAGAAGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734145	735138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_734100_735100
833722	contig_15120_pilon	-	1355	1	Intergenic	novelGene_108031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAAATAGTGTTCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349828	348473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_348500_349800
833723	contig_6589_pilon	-	591	4	Intergenic	novelGene_25897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	127.454567068688	339	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178507	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158783_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
833724	contig_10021_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_168664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTAGAATTGATAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032521	1031731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_-_1031700_1032500
833725	contig_3426_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_57963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTAAGACTCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440935	442270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_440900_442300
833727	contig_10583_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_167908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116847	116351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_116400_116800
833729	contig_5095_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_74952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTTGCTTATGTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248488	249042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_248500_249000
833730	contig_2987_pilon	+	1479	3	Intergenic	novelGene_125875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGAAGACCCTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604836	614605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_605192_612712_612881_613649
833731	contig_10082_pilon	+	1257	6	Intergenic	novelGene_63904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	20.2049498885793	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	665	1255	532638	534984	FALSE	35	TAAGGAATGTGGGAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METFRNLASVESQNLDGEKLYIERIIAQIMNNDSWSSMLGEIFESLGSEDQPKNEGQHLRRRTEEILHGSNESSPCENTFSQISNLNVLKRNDSEVKPFEGGDCGKAFMEHSSLKLHIRSFTRRNTCQSKERGEACSLPSNQSTSMRTLAREKPYKKHYQCNKCWKDFCSVSSFQRHVRDSKHECKEKFQNGNKPYE	508109	534986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_508353_511273_511521_525894_525973_532541_532669_534075_534224_534572
833734	contig_12128_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_131996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515868	514919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_514900_515900
833735	SIRV4	-	221	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	6	390	6	-390	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGTTTTTCGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5152	4027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
833736	contig_12300_pilon	+	588	6	Intergenic	novelGene_176512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	49.7891554457394	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	84	587	375833	406774	FALSE	30	TCTCTTCCAGATGCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDYVFVQLTSGGRPHYYVSYRRNAFAHMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTHGVYFTLALENVQSSRGPEGNVMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASRDTAPSIIVASGNIGSELSDSDISMF	373842	406775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_+_373866_375772_375863_386405_386586_396368_396516_406382_406486_406730
833737	contig_12300_pilon	+	1054	9	Intergenic	novelGene_176513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	14.6878989307525	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	7	1053	452395	503195	FALSE	45	TGGAGGACGCCAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNSLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWKGNNTEPLITLEGSISVKFLSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDIPEWRRDISRVIKRSLVEATGVPGQSILVAVLPGLPTAAELFVLPYQDPTGESRRLAEDLEQISELLIHKLNQNSVHFELKPGVQVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGLAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHTESRPNTPQTELRRPGQLLDEKVESQLIGSISIVAENQSTKEIPTYVNV	452388	503196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_+_452507_460222_460357_462546_462671_468028_468142_472842_472975_486142_486243_500945_501052_501172_501334_503130
833738	contig_4845_pilon	-	1946	9	Intergenic	novelGene_53706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	7.35590748990225	31	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	623	1465	963040	961049	FALSE	20	TTGATCAGCTGCTCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLQMLEALCSHWPGPMSLALYLTDAETQQFLRFVEASTVLSARSNVAYHVVYREGPLYPVNHLRNVALAQALTSYVFLSDIDFLPAYSLYGYLRASIKQLDLGSQRKVALVVPAFESLHYRLSFPTSKAELLALLDAGSLYTFRYDVWPRGHAPTDYARWREARAPYRVQWAADYEPYVVVPRECPRYDSRFVGFGWNKVAHIVELDAQEYEFLVLPEAFTIHMPHAPSLDISRFRSSPAYRDCLQALKDEFHQDLSRRYGAAALKYLTALQQSRSSA	964408	960567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_961259_961496_961693_961778_961929_962324_962604_963032_963194_963318_963475_963558_963685_963753_963872_964339
833741	contig_3523_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_171491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTGAGAGGGTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409370	408368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_408400_409400
833742	contig_19769_pilon	+	502	4	Intergenic	novelGene_102303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1846.02010341768	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	14	391	87249	87965	TRUE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKGHHRVLSGGEAWRPRQAGASLRELRHGHFPQP	87235	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87867_87996_89275
833743	contig_5023_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_7389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	965	1315	644560	644910	NA	70	CAGAGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPKCSHPICEYPWICRGSGGVQSQSLYHVGNSCHLLFNWATCRMMTTEPRFGKLQSMSPAWPVVCCCRYSFTETQPSLFLCFLWLLTYYRQSWVVSTKPKKLKILTVWSYKSTS	643595	645292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_643600_645300
833745	contig_4125_pilon	+	842	7	Intergenic	novelGene_25229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	7.99478997014097	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	104	712	1728400	1731655	FALSE	10	GGTCGAGTGCTTCTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRGTRRFSGRPGTRRREPTGEVAQLGAGQEAAAMSALDLARVGACVLKNAVTGEAVELRSLWQEQACVVAGLRRFGCMVCRWIARDLSSLKGLLDQHGVRLVGVGPEVLGLQEFLDGGYFAGELYLDESKQFYKELGFKRYNSLSILPAALGKPVRDVAAKAKAVGIQGNLSGDLLQSGGLLVVSKGGEKVLLHFVQKSPGDYVPQETVLGALGISAEGCHASEPPQCVEDVCGR	1728296	1731785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1728463_1728655_1728861_1729720_1729773_1730423_1730488_1730582_1730659_1731036_1731159_1731628
833746	contig_1008_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_121569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCCTGACTACACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629021	626826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_626800_629000
833747	contig_10813_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_87025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAGAAAGAAATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67871	66601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_-_66600_67900
833749	contig_5918_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_99608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2093624	2094997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2093600_2095000
833750	contig_11994_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_129357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATTAATGACGTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110547	111190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_110500_111200
833752	contig_16578_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_148610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	203	658	20570	21025	NA	45	TATATAATTGTAAGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSEPLVVMVEWDDFLGPSMEKLHMMIRWWFSSPCAYHHYPTSFHPLPTLTSHLSVSLSVCLSLSFLLSPFPFLLPSFSLFPLSFALSPTPTSFLCSPFFQSAAFVPFLEKLHLAPVLFLSLGTLCWLQASADSQQGSPLPSPLRTQVAG	20367	21770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_20400_21800
833756	contig_4305_pilon	-	360	4	Intergenic	novelGene_136685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	681.361545404168	377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAATTCCTTGAGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514718	512967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513051_513199_513298_513934_514044_514648
833758	contig_5954_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_28453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAGTTGCATCATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113064	114408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_113100_114400
833760	contig_5967_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_44415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTGAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458291	456729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_456700_458300
833761	contig_3068_pilon	+	1194	10	Intergenic	novelGene_137599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	7.43531778858738	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1104	90	1193	12509	26490	FALSE	25	GCCAGAACGCTTCACCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSCVRVRWPCRLRPAIGAPVQGLRGAWAMVQPAPSPAMDEVTFKSDTVLSDVHLYTPNQRHLMVRLNGTGQPVFLSHFKLLWSQDSLADSGVEGGDHRDTQTDNTPPAGTGPPESPPGSDHSHKGFSLQTGAHTAGQDGSGAQLDEDGDLDVVRRPRAASDPDPARPSRDKVHPVILRQEEDDIIGDEAQESSLYSVIRIEHTMATPLEDVGKQVWRGALLLVDYILFRQDLLRGCTVLELGAGTGLASIVTATVARTVYCTDVGADLLAMCQRNIALNSHLTAAGGGIVKVRELDWLKDDLCIDPEVPFSWSEEEVSDLFNHTTVLLAAEVFYDDDLTDALFKTLYRLSHRLKNACTVILSVEKSRRLCPHFTDEGGRLRLQRLGQATSNANVYQ	10019	26491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_10074_12473_12642_14241_14626_19162_19204_19292_19438_22002_22075_23887_23942_25785_25867_26109_26213_26399
833762	contig_12427_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_40510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTTTTTCCATGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422805	423057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_422800_423100
833764	contig_7378_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_120305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCAAGAAACTGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688734	689102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_688700_689100
833765	contig_9424_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_143766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTCAAGACCACCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7507	6711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_6700_7500
833767	contig_8284_pilon	+	2037	4	Intergenic	novelGene_125686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACACAGCCCTTGTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371066	374693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_371744_372799_373045_373146_373363_373794
833769	contig_9415_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_109826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACGAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924579	1923021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1923000_1924600
833770	contig_11855_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_67065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAGACTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2018339	2017103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2017100_2018300
833772	contig_10958_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_5335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCGACCCCCTATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540257	540604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_540300_540600
833773	contig_9976_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_147907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	234	539	61392	61697	NA	65	AATAAAGAGAGAAATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPWQGQAAYVSLPPISLMLNTIQAALVGWKHHLMCRRPRIRGPWSLPPQLAHRLKVSHRRDKLRIPEAAIPDPCQRKCTPIPSCNSVVRGFRKRGKDSP	61158	62997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_61200_63000
833777	SIRV6	-	236	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTTTCTAAACAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11600_11800
833778	contig_4742_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_130985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198235	196722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_196700_198200
833780	contig_8671_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_126282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGTATGAAGGGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647767	649229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_647800_649200
833781	SIRV6	+	349	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	347	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1856
833782	contig_12622_pilon	-	653	2	Intergenic	novelGene_6016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	0	302	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATAATTGATGTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656829	1654281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1654834_1656728
833783	contig_7057_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_123440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAATTGTTTTAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672565	1671850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1671800_1672600
833784	contig_9527_pilon	-	1215	8	Intergenic	novelGene_134029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAAATTTATGGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274304	147201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_147868_217963_218052_218927_219030_222714_222765_223465_223526_224772_224830_270376_270524_274259
833785	contig_10377_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_115343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAGAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97956	99223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_98000_99200
833787	contig_11986_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_69151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	612	1148	505958	505422	NA	30	TGCAAACCCAGAAGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNARIHTGPSCPSFADAERAESRGGKRPEARRTWKIFCCLKCAWASYTSEPHEGKTREAGSLCARLQSQTWGGTAPSPSVLARGPEGPPELYTVSQSHFPPISCSWPGLMRADTRGCGLCLQAPRLLLPAGEETGCRQAWGVQVCARVHVRRSHPHSMFHSHLERQDPPTKRFREFTC	506569	505108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_505100_506600
833789	contig_8412_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_118369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	1290	1760	534545	534075	NA	15	CTGGGCTCTGGAACTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEGKKARHCRGSCRRKGHGCPRTGALVSRNREPAQHSCCVWQHSCERAVTKESLTAPPQTLSLPPCSTEPAGLTEPCGGGEGPVRREPSHLCWRFCPQQNNSHCLFQNPVVPAQGWEGEGVRGYSRKKLLQCQALQVYASLLCSPPCVLGNQPRS	535834	533518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_533500_535800
833791	contig_10658_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_130075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAATAAAGAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184523	184307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_184300_184500
833792	contig_5899_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_146974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTAGAAAGGAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136944	135970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_136000_136900
833793	contig_7207_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_72101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGGCACCTCCTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752303	753060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_752300_753100
833795	scaffold_13505_pilon	+	754	5	Intergenic	novelGene_111396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	19.8368344248774	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	119	754	202527	218746	FALSE	15	GCATTGGAGCAGGGCGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIEKVPERSKTSGCGCLPGVVGGQSPARVPSLFPPPPPGMALPGPTPAPGWEEDECLDYYGMLSLHRMFEVVGGQLTECELELLAFLLDEAPGAAGGLARARSGLELLLELERRGQCDESDLRLLRQLLRVLARHDLLPHLARKRRRPVSPERYSCGTSSSSKRAEGSCCRRRHQSNSSSHSQQGQWETGSPPTKRQRRSRGRPSGGARRRRRGAPAAPQQQQEPARPTSEGKVTCDIRLRVRAEYCEHGP	201793	218746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_201873_202487_202855_204649_204773_208672_208814_218702
833796	contig_6710_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_89117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653642	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
833798	contig_753_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_112934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAAGGTCATGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654999	653929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_653900_655000
833799	contig_15613_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_147218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACGTAAGCAACAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214916	214577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_214600_214900
833801	contig_14744_pilon	+	706	3	Intergenic	novelGene_65912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	63	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	49	705	69238	238344	FALSE	40	GTAAGAGACACAGGTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESDQGSPDVHNYPDMEAVPLLLNNVKGEPPEDSLSVDHFQTQTEPVDLSINKARISPTAVSSSPVSMTASASSPSSTSTSSSSSSRPASSPTVITSVSSASSSSTVLTPGPLVASASGVGGQQFLHIIHPVPPSSPMNLQSNKLSHVHRIPVVVQSVPVVYTAVRSPGNVNNTIVVPLLEDGRSHGK	69189	238345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69259_136799_136890_237798
833803	contig_7362_pilon	+	824	8	Intergenic	novelGene_147539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.91372543633873	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	35	673	289270	307539	FALSE	15	TTTTTCATCTCTCATAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGHLVGRPVMKPPISLQTSEFDSSDEEPIEDEQTPIQISWLPLSQVNCSQFLGLCALPGCKFKDIRRNIQKDTEELKNYGIQDIFVFCTRGELSKYRVPNLLDLYRQYGIITHHHPIPDGGTPNIASCCEIMEELAICLKNNRKTLIHCYGGLGRSCLVAACLLLYLSDTVSPQQAIDSLRDLRGSGAIQTIKQYNYLHEFRDKLAAHLSSREALSRSVSR	289235	307690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_289279_291461_291545_296630_296687_297171_297217_299956_300180_303954_303987_305607_305712_307452
833804	contig_3081_pilon	+	213	2	Intergenic	novelGene_133951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACGTGTCCGCCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562409	573269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_562579_573225
833806	contig_14202_pilon	-	622	4	Intergenic	novelGene_157139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2189.77203278231	432	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTAACGATTACCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88616	86160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_87826_88214_88577
833807	contig_1274_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_137788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTAAAAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96294	95209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_95200_96300
833811	contig_14326_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_120766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAATTCTAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679055	679685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_679100_679700
833812	scaffold_16539_pilon	+	503	3	Intergenic	novelGene_68333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	335	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	25	390	415666	433538	FALSE	15	GGACCGGACTCTGTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIKKIAIFGATGKTGLTTLAQAVQAAFLLWDPAKVPPRLQNVTDDHIRMHKVLQESGLKYVAVMPPHIGDEPLTGAYSVTVDGRGPSRVISKHDLGHFMLHCLTTDEYNGHNTYPSHQYE	415641	433651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_415745_429264_429394_433380
833813	contig_7356_pilon	-	1595	15	Intergenic	novelGene_60414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	392.801431114646	1	96	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1539	55	1593	492080	476139	FALSE	40	GAAAACTAAGCCAGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKKRRKKSPGSPLTEQKMKMVLLMKMKDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTP	492134	476136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483372_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811_491970_492052
833815	contig_3601_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_132874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCATAGAGGAAGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146304	145817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_145800_146300
833816	contig_5602_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_132991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCTTTTGCTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38456	40378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_38500_40400
833817	contig_12046_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_83503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGCAAGATAGGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955099	955834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_955100_955800
833818	contig_8640_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_117732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAATATCTAATTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33906	35165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_33900_35200
833821	contig_16635_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_153147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_2	165.180709123876	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	161	433	87592	94700	FALSE	25	TCTTTAACTGCTCAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGAVAAKVRRHDMRVHPYQRVVTADRAATGN	86099	95045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_86141_87472_87773_90607_90683_94683
833822	contig_6062_pilon	-	707	6	Intergenic	novelGene_5319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	351.458333234539	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTAAAATGCCAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828595	821310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_821364_822118_822504_822639_822725_823326_823372_824526_824643_828572
833823	SIRV4	-	309	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1214	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
833826	contig_5238_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_176259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	409	903	67798	68292	NA	30	CAACCCTACAGATCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVCLLFVFLVSCAFSQEIYLLSLVSRTHTSLNSWGARLKFEFVTVTLVEFKYLSMVPISAIGRSRYVVCESAVVKFPVMYHCLNKYLRLRLGQFARSPPHSLGALMAQWLGAWLLTKSFSSSNPPATSWKPYGTVLLCPVGLLSVGIGNRLHGSGFGLVFWGL	67389	68814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_+_67400_68800
833828	contig_8375_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_141323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274932	276512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_274900_276500
833829	contig_9297_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_69835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCCATACAGAGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638927	639394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_638900_639400
833831	contig_8377_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_34967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAATATACTTGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68100	68882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_68900
833832	contig_14923_pilon	-	624	4	Intergenic	novelGene_157767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_1	34.554305086342	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	80	385	591127	541924	FALSE	35	CGTATTTACATATTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVLRRLVTLITQLAKELSTRGALKTQMENTSVAARKLMEENEKLKRLLKTYGKGEQHMLEAENKKLVEDQEKLKTELKKTSDALSKAQNDVMTMKMQSERLSKEYDRLLKEHSELQDRIEKGNKKGL	591206	541684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_541960_547844_547946_581685_581795_591067
833833	contig_15245_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_145221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67040	67337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_67000_67300
833834	contig_17796_pilon	+	1214	5	Intergenic	novelGene_33799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	969	junction_2	58.182901268328	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	139	825	53527	75761	FALSE	45	AACTCTGGACAAAATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKGNNL	53388	76150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549
833835	contig_14720_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_164988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGGGCAATGGTGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204760	205265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_204800_205300
833836	contig_14720_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_164989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAACTAAAATTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205764	206808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_205800_206800
833838	contig_2940_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_81914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTTATTGTCATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531093	530468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_530500_531100
833839	contig_3270_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_104498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	6	311	349268	349573	NA	20	GCCTAGCACTGCCTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMVTQMFNFLENCQTVFQSGCTMLHFYQQGTDVPISPRPCNIRYGLLSDYSNPSGCEAVTHCGFDLHFFFGETSIQVLCPFLNWVIVMSYLYILDISPLSDI	349262	349840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_349300_349800
833840	SIRV6	-	318	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTTAGCCGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	11493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
833841	contig_6929_pilon	-	652	3	Intergenic	novelGene_139436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	37	295	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCACTTGTTTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242696	236479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_236901_241957_242114_242621
833842	contig_7254_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_145849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAATCAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223588	224303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_223600_224300
833843	contig_14698_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_168131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAGAAAGGGGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76740	78057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_76700_78100
833844	contig_7887_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_124877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	643	1143	229679	229179	NA	10	ACTGCGGTTATGTTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFFQIQVGRHEALAEDRHQLSSFLAGEPLHSFPLFCPLAQDDYLDLFGDPSVTGKVGTDIQDNKCSWLVVQCLQRASPEQRQILQVPRRGSWVPGLMRKGIEQWFSTGGGSVPRGTLGHVCRHVLVSQLNGREESACSWHLSSAQMPVMPLNILQCTDSPHNKE	230321	228661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_228700_230300
833845	contig_12145_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_172321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGATTTGTCTGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121484	123602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_+_121500_123600
833846	contig_15866_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_63660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGGCTACGTAGTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575726	577636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_575700_577600
833847	contig_9527_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_134037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGCAGCACCCGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279885	280983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_279900_281000
833848	contig_1076_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_101139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTAAAAATTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945844	946637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945800_946600
833849	contig_1076_pilon	+	166	1	Intergenic	novelGene_101141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACTATGTTTTAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947590	947756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_947600_947800
833850	contig_8322_pilon	+	1448	2	Intergenic	novelGene_143248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1454	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	872	1447	294578	295153	FALSE	45	ATACTGGTAACTGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKVSMVNLPTFLARMIPLLVIWRSFINE	292586	295154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_292713_293832
833851	contig_14219_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_54296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	401	1203	746	1948	626766	625564	NA	50	CTATGAAAACTGAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPDLTGQAMGKPLNPISSSSPAHQAMCSGNPGQDMTLSSNINFPINGPKEQMGMPMGRFGGSGGMNHVSSMQATTPQGSNYALKMNSPSQSSPGMNPGQPNSMLSPRHRMSPGVAGSPRIPPSQFSPAGSLHSPVGVCSSTGNSHSYTNSSLNALQALSEGHGVSLGSSLASPDLKMGNLQNSPVNMNPPPLSKMGSLDSKDCFGLYGEPSEGTTGQAESNCHPGEPKETNDSSMPQPGSSERPDGQNRLHDSKGQTKLLQLLTTKSDQTEPSPLSSSLSDANKDSTSSLPGSGSTHGTSLKEKHKILHRLLQDSSSPVDLTKLIAEATGKELSQESSSTAPGSEVTVKQEPVSPKKKENALLRYLLDKDDTKDIGLPEVTPKLERLDSKTDPASNTKLI	627511	625562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_625600_627500
833852	contig_10103_pilon	+	1575	1	Intergenic	novelGene_86164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTCAACTTTACAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645326	646901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_645300_646900
833854	contig_7345_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_159186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCGGTAGAGTGGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267106	267361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_267100_267400
833855	contig_7345_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_159187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGCCCTAAATTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267808	268665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_267800_268700
833856	contig_18544_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_152755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGATAATCAGTAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73749	72676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_72700_73700
833858	contig_1146_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_84791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCTTGAGAATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145223	146049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_145200_146000
833860	contig_15760_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_131060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTAAAAAAAAACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424977	426273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_425000_426300
833861	contig_2438_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_112082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGGACTGACCTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343802	345153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_343800_345200
833864	contig_18869_pilon	-	1015	2	Intergenic	novelGene_56469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAATTGAAATCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205393	195508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_196491_205360
833866	contig_11986_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_69141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	406	753	278977	279324	FALSE	30	AGGAGAATCAAGCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKPDMWELRLARIQWLVAQTGQRWGKVPDRCGPKPLLSVGLCPYPLGGTEGDDCPLTDTDHPKWQRWGQERLLPRVGSSSLLHLMSFAVRFHQCLPPSPRPENPGPPIKMVIGC	278316	279324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_278528_278782
833867	contig_9919_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_137948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAACATACATGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534078	533381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_533400_534100
833869	contig_8801_pilon	-	1552	2	Intergenic	novelGene_66310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	583858	583061	FALSE	35	TAAGTATGCTATAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHAQLLGYTQRLLLEDDALDWQAGGADLLEPGYEQPLELVVGRQLVSLAAGGGHTVLALRRQDGALVLQDGAQRGRRDVKAPSDLALAQVGVLFYLLDDPQVHG	583859	581824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_583075_583557
833871	contig_3151_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_139175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	435	216	650	39684	40118	NA	20	GGGCGAAGCGAGTCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLIGSITIHPRLPNSNFGAILFGQIPPGKKNLENFRALELMLGRKPRAFLLSSPLGALSCRVRSAGCRARPPEVGGAGFCPRWLGACPAARGGRNRRERVSGPSTRSRRVSARCVGVADDLRVPRCPFWGVGESGAFSRRPFL	39468	40120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_39500_40100
833873	contig_602_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_134932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGAAAGACCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230561	230083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_230100_230600
833874	contig_2161_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_114897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGGATTCTCCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629885	630407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_629900_630400
833875	contig_2161_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_114898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630357	631189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_630400_631200
833877	contig_13740_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_34775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATTTTTCTGGCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774462	773306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_773300_774500
833878	contig_13718_pilon	-	451	2	Intergenic	novelGene_142887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATCTTTGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129778	125202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_125588_129712
833879	contig_13718_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_142886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTCACTTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119126	118462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_118500_119100
833880	contig_14133_pilon	-	648	5	Intergenic	novelGene_119943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1808.14566614529	18	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209450	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208482_208728_209012_209131_209421
833881	contig_12021_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_172207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATTGCATTCCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290682	291942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_290700_291900
833882	contig_12746_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_152194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGAAAGAAAGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596897	596270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_596300_596900
833883	contig_1406_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_25671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGAGAGCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3035603	3036455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3035600_3036500
833884	contig_1339_pilon	-	1106	2	Intergenic	novelGene_163090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGACCCCCTAATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16005	14652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_15696_15942
833886	contig_4388_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_161944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTAAGTAAACTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218179	217435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_217400_218200
833887	contig_11396_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_71447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAGAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1845321	1846546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1845300_1846500
833890	contig_3223_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_151836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACATTTGTCTTTGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003335	1004142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_1003300_1004100
833892	contig_3426_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_57936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAGAATTAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327022	327882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_327000_327900
833893	contig_7095_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_166466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTGTGCAGACACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487810	488219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_+_487800_488200
833895	contig_3818_pilon	+	1201	9	Intergenic	novelGene_99301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	164.574403766199	2	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	451	1041	976286	990624	FALSE	25	ATTGAGTACATGCTACGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNGTVQSIAQRSKEEQEKVEASIVQQREEWERRKKAKNKAVNFLHYIERYGDHTIFHDVSLTFKRTHIKMKKQPRGYGLRCHRAIITMCRLIGIKDMYAKVSGSVNMLNLTRGFFHGLSHQETHQQLADKKGLHVVEFREECGPLPIVVASPQSALRKDPEPEDEVPDTRLDWDDVKTAQGMKRSVWSGLKRAAT	961588	990784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_968211_968350_973411_973538_976245_976394_986661_986720_987008_987072_987473_987611_990399
833896	contig_2244_pilon	-	2150	4	Intergenic	novelGene_177097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	51	344	87714	84336	FALSE	5	CTTGGATTGCTCTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRLSALEGQQFLIIHATADEKIHFQHTAELITQLIKGKANYSLQIYPDESHYFHSAFLKQHLYRSIISFFVECFRIQDKLPTVTTKEDEEED	88798	82529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2244_pilon_-_84483_87460_87535_87641_87715_88748
833897	contig_6270_pilon	+	1587	6	Intergenic	novelGene_99885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	470	junction_1	222.638181810758	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	146	1174	1115563	1127604	FALSE	80	ACCAAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVPAVGEAAAGPSLRSRWSGGRGCDRGPCRPAPGVASAPVSVPSVYAMAGSGCAWGAEPPRFLEAFGRLWQVQSRLGSGSSASVYRVRCCGTPGSPPGALKQFLPPGTTGAAASAAEYGFRKERAALEQLQGHRNIVTLYGVFTIHFSPNVPSRCLLLELLDVSVSELLLCSSHQGCSMWMIQHCARDVLEALAFLHHEGYVHADLKPRNILWSAENECFKLIDFGLSFKEGNQDVKYIQTDGYRAPEAELQNCLAQAGLQSDTECTSAVDLWSLGIILLEMFSGMKLKHTVRSQEWKANSSAIIDHIFASKAVVNAAIPAYHLRDLIKSMLHDDPSRRISAEMALCSPFFSIPFAPHIEDLVMLPTPVLRLLNVLDDDYLENEEEYEG	1115417	1128017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1115831_1117193_1117487_1118141_1118334_1120997_1121093_1127280_1127358_1127500
833898	contig_6833_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_175134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTTTTTATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243261	244031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_243300_244000
833899	SIRV5	+	348	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	880	-23	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
833900	contig_6192_pilon	+	1077	2	Intergenic	novelGene_170349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACAATTTTTTAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898033	902964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_898498_902351
833901	contig_19012_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_159481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAGCCATGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54234	53308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_53300_54200
833902	contig_2455_pilon	-	1600	1	Intergenic	novelGene_119219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387002	1385402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1385400_1387000
833903	contig_9181_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_177101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGAAACTATCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629504	630566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_+_629500_630600
833904	SIRV5	+	366	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	167	135	53	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8368	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
833905	contig_6589_pilon	+	1289	10	Intergenic	novelGene_26235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	184.852961252858	65	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	364	1176	2195981	2199918	FALSE	10	CACACGCCCCGGCTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLIPQQLLTTLGPLFRNSRMVQFHFTNKDLESLKGLYRIMGNGFAGCVHFPHTAPCEVRVLMLLYSSKKKIFMGLIPYDQSGFVNGIRQVITNHKQVQQQKLEQQRGDGGTAGTRRAGPHPGGPGEAHTESAPAPPAAAPATGCCWGHWCGRAAAASRCRPSPPGSSPRPSWSSPWPTPTWPNPSAAEPRGQPPAAEPPPEPPLRPRVGCPHPRPPCTTSSLQGLLLCCPLHTRAWGSPSLGPRSCTRRPPSLGLRSCPRGLPCQVRCC	2183927	2200031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2184123_2195212_2195264_2195790_2195877_2195949_2196008_2196124_2196233_2198045_2198236_2198620_2198693_2198814_2199035_2199326_2199508_2199903
833906	contig_1275_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_108738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGTTGATACTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354171	352912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_352900_354200
833907	contig_9436_pilon	-	701	2	Intergenic	novelGene_60925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATCAGTCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458986	441227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_441844_458901
833908	SIRV2	+	311	1	FSM	SIRV2C	SIRV206	424	1	112	1	112	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGAACACACTTCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4145	4456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_4100_4500
833909	contig_5815_pilon	-	910	2	Intergenic	novelGene_141212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTTCTGCGCACGCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565169	561927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_561984_564315
833911	contig_5084_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_64471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTTCAGCCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58039	56618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_56600_58000
833912	contig_9651_pilon	+	1078	7	Intergenic	novelGene_162850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	19.6270788000207	37	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCAGTCAGTTCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52549	87798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_52693_72856_72995_73882_74061_76650_76822_84624_84768_85685_85814_87621
833913	contig_11632_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_177106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGGCCTGGTAATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3408	3060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11632_pilon_-_3100_3400
833914	contig_13490_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_129124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAATTCTGACTCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60225	61261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_+_60200_61300
833915	contig_776_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_139915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAAACAGAGTAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788062	786383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_786400_788100
833916	contig_9505_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_121877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCAGGTGGACCATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677613	676032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_676000_677600
833917	contig_12078_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_74124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAAAAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533206	534115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_533200_534100
833918	contig_15130_pilon	+	716	3	Intergenic	novelGene_177109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	181	507	218019	222171	TRUE	45	TAATTTAAAACTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWEMATGVGWTAAGVFQRPGPLLVKVDAGVMDLEEWFRCSWLDVLDSTEELWFIHRSLSDFRSSAGAVRCRSSWYSWSSRSSSWERVTRWITTLEWSLSVCTCGLSS	217838	222479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_+_218288_222113_222302_222400
833919	contig_13894_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_62172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693891	694796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_693900_694800
833920	contig_13894_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_62173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCCCATTCTGGCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694794	695018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_694800_695000
833921	contig_5799_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_50310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAAATAGTTTCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584066	582952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_583000_584100
833922	contig_3948_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_53158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAAGTCTTACTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124648	125977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_124600_126000
833924	contig_5935_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_102697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844985	845208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_845000_845200
833925	contig_5317_pilon	+	786	4	Intergenic	novelGene_76523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAATTTCTTATTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33694	43665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33730_35258_35410_36681_36851_43234
833926	contig_2114_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_104259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	830	1165	460773	461108	NA	60	AATTAAAGAAACTAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSAPVPGRSQGLTEFQPSTQPLAWRVSHLPKGQDSPQVNFSHPLCEPPLLSGSASGWRALVLETFPGQSLFPSQPAGAAQGKANIMKGPACPPKVQFRRQHTSKTELITP	459943	461293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_459900_461300
833927	contig_13074_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_153431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTAAATTAGAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425805	423758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_423800_425800
833928	contig_18150_pilon	-	741	5	Intergenic	novelGene_175821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.2780291578087	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTTTATTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23969	11009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18150_pilon_-_11161_18599_18666_18839_18911_21173_21452_23794
833929	contig_3942_pilon	+	136	1	Intergenic	novelGene_128666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGGGGCCCAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179982	180118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_180000_180100
833930	SIRV4	-	527	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	87	3	-87	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	984	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCAAGGATTACGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
833931	contig_3410_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_58936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCACTGCCCCTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47481	48846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_47500_48800
833932	contig_1699_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_72817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGACTAGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67198	69219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_67200_69200
833934	contig_14060_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_156054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCAGAAAACTAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60706	59632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_59600_60700
833935	contig_10940_pilon	-	840	5	Intergenic	novelGene_49226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	940.428725369445	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	79	378	917000	875664	TRUE	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTELR	917078	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874205_875370_875675_893176_893306_916664_916748_916923
833936	contig_10904_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_22575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	40	junction_1	236.282787260426	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGACTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423295	426363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_423412_423523_423599_425434_425513_426221
833937	contig_9202_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_168949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279883	281072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_279900_281100
833939	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
833940	contig_11292_pilon	-	1528	6	Intergenic	novelGene_109397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	565.574539738132	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	137	937	124274	107762	FALSE	45	GTTATTAAGGGAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSSGGRPEPCARPASIQPPTGRPIPRGSIVAPTETGDPTGSELGWMLQACKMEGFPLVPPPTEDLVPYDADLYQRPTHDYYQYLSSDGDSHSDHYWDFHPHHVHSEFESFTENHFTELQSVQPPQLQQLYRHMELEQMHVLDTPMAPPHASLGHQVSYLPRMCVPYPSLSPAQPSSDEEEGERHSPPLEVSDGEADGLEPGPGLLHGETGSKKKIRLYQFLLDLLRSGDMKDSIWWVDKDKGTFQFSSKHKEALAHRWGIQKGNRKKMTYQKMARALRNYGKTGEVKKVKKKLTYQFSGEVLGPARPPRRP	124410	107170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_107791_107856_108136_109382_109546_110339_110528_120962_121060_124229
833941	SIRV4	+	299	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTGAAAGCTGGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	3944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
833942	contig_7816_pilon	+	1787	3	Intergenic	novelGene_66471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_2	75.5	2	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1231	1593	146640	148859	FALSE	25	GCAGACCTTTGTTTTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKNDSGFLSTLHEVYLQVLTKNKENLSL	145409	149053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_146703_148224_148444_148778
833943	contig_16917_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_161923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCCAGATTTTTTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61957	61528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_61500_62000
833944	contig_15741_pilon	-	641	2	Intergenic	novelGene_159674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAGAGGTATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50343	49608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288
833945	contig_9548_pilon	+	861	2	Intergenic	novelGene_141077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCTAACAAGAAACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247911	252833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_248035_252095
833947	contig_7201_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_152494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGCAAAAGAGAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66463	67493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_66500_67500
833948	contig_7521_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_160555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATAGTTTATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324234	325678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_324200_325700
833949	contig_17880_pilon	-	1128	7	Intergenic	novelGene_167326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.410894641155	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	24	893	46189	28098	FALSE	65	ATACATAAAAAGGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKYLPDSVGKTGLLMKLSDPAQSDPEVRRAAVHCMANLCLSVPGQPYLDEPYQSICFQTFLTTLQSPKLSDMDDITFCMLLQNALKGIQSLLNSGKMKLTLAEELGALLAVLKKAMFHGLPGLNIEIPTVLYPTLLPQYDGRPPAKPQQSESCASRPTVPSKTLRQMTFA	46212	27862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_28134_35770_35909_37047_37150_39669_39785_40628_40745_41000_41145_45970
833950	contig_8712_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_58889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAGGGAGAAAATACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190826	1191889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1190800_1191900
833951	contig_10446_pilon	+	1236	3	Intergenic	novelGene_162518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	8.5	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTTATCCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201462	1224225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1201524_1213901_1214003_1223151
833952	contig_8980_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_74014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATATGTGCCCTGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661572	662973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_661600_663000
833953	contig_17768_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_140410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAGAAAGAGATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143841	142662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_142700_143800
833954	contig_15384_pilon	+	1512	9	Intergenic	novelGene_85133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	8.86002257333467	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	108	911	115715	117787	FALSE	5	CGCCTGTGCAGGGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRFAPEKYACKDLRENFCRNPDGSEAPWCFTSRPGMRVAFCYQIRRCADDVRPEECYYGAGEQYRGSVNKTRKGIPCQRWSAETPHKPQFTPTSAPHAKLEENYCRNPDRDRHGPWCYTTDPGTPFDYCAVRRCDNDQPPSILEPPDQVLFEECGLRVDRPDHWHSKLRVIGGQPGNSPWTVSLRNRQGHHFCGGSLVKEQWVLTARQCFSSCHVPLLGYEVWLGMMFQNPQPGEPDLQRVPVAKMVCGPSDSQLVLLKLERPVTLNQRVALICLPPERYVVPPGTKCEIAGWGDTKGRNTV	115457	118388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_115492_115641_115773_115874_115978_116604_116742_116829_116866_116944_117066_117217_117296_117437_117585_117663
833955	contig_9415_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_109905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	531	956	2104321	2103896	NA	20	GTGGCCACAGACATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSQLESLSDSWARLKHSRDWLCSSYSFESDFDLTKSLGVHTLTENVVSFVSGDVGNAPGFKEPEESMSTSPQASIIAMEQQQLRAEVSLLYLLLVRDSGNLNGTAGYTVLRKPSPFLFSLPAPFFHLSLPVSLTLFIKTA	2104851	2103786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2103800_2104900
833956	SIRV4	+	299	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	683	966	-51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTATGTTAATTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
833957	contig_5918_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_99623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTGCTTTAAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2223157	2223654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2223200_2223700
833958	contig_5918_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_99624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAATAATAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2224809	2225338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2224800_2225300
833959	contig_8696_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_153337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAATGGCGGAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986301	984916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_-_984900_986300
833961	contig_4891_pilon	-	546	4	Intergenic	novelGene_124559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGCCAAAATGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756923	700894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_701142_707765_707922_708890_708960_756849
833962	contig_7720_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_155733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176518	178361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_176500_178400
833965	contig_610_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_76649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCAAACCTGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13488	13165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_13200_13500
833966	contig_4388_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_161975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAACAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832454	833098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_832500_833100
833967	contig_19701_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_147889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACTGAAAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82103	82409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_82100_82400
833968	contig_20375_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_105827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	31743	32111	NA	30	CCAACTAGTTTTATTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRWQPSELAAGRVAGHGLQSPAGSRRVPVRPVAAPAVPAAAARGLAEDGAGARKGHPGGHRRRPVQGSDADLPPPHFGTAFSLSVCILFYFRLSKQKFLPTFPILLPRILHTLRSAYVFCCV	31742	33333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_31700_33300
833969	contig_12079_pilon	-	1408	2	Intergenic	novelGene_67409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	76	300	493226	493002	TRUE	35	CACTATTTATTATACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAANKEPCFHTLVHGPSAAYSVLTDMGELGSTETDEKELPVDTSAGEQAEQVHTSRPLLLEADWEANTSREKRGMDSIAFAVSKLSACPLSPQVPPKIR	493301	491535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_492461_492818
833972	contig_6058_pilon	-	1092	2	Intergenic	novelGene_172424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	152	junction_1	0	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401601	397271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_398065_401302
833975	contig_6277_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_80406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636596	637278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_636600_637300
833976	contig_5880_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_151125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTAGAAATGACCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199690	200239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_+_199700_200200
833977	contig_11341_pilon	+	628	8	Intergenic	novelGene_162229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.82946406783796	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	53	628	841369	868089	FALSE	25	GTAAGTTCTTAGAGGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPFPVQPPARQGFWSTMAEEQEKDLQKFLKNVDEITNLIQGMNSNDPVVRQKAVQETEKRLLLTEKDQDEDECRTTLNKTMISPPEASTKDKDAINSEAFLVSLEKDAKERARRRQENKVFADALKEKGNEAFAKGDYETAVLCYSEGLKKLKDMKVLYTNRAQAYIKLGDYQKALVDCEWALKCDEKCPKAYFHMGKANLALKNYST	829954	868089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11341_pilon_+_829992_841353_841427_852808_852973_853527_853550_854162_854241_855130_855253_861180_861241_868017
833979	contig_9195_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_155703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACCAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110585	1108353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_1108400_1110600
833981	contig_10324_pilon	-	1253	8	Intergenic	novelGene_7893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	18.7910095741641	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	87	1061	617782	614614	FALSE	10	GCAACCCGTGTGGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSLCLPRLALPTPPGSALPQRVFGTYFRVGFYGARFGDLDEQEFVYKEPSITKLAEISHRLEEFYTERSGEDVVEIVKDSNPVDKSKLEPQKAYIQITYVEPYFDTYELKDRVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTPDGRAHGELPEQHKRKTLLSTAHAFPYIKTRIRVCHREETVLTPVEVAIEDMQKKTRELAFATEQDPPDAKMLQMVLQGSVGPTVNQGPLEVAQVFLAEIPEDRKLFRHHNKLRLCFKDFCKKCEDALRKNKALIGPDQKEYHRELERNYCRLREALQPLLTQRLPQLLAPAAPALRNSLNRTSFRKADL	617868	614421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_614657_615018_615181_615415_615523_615603_615748_616073_616311_616819_616910_617025_617158_617722
833982	contig_3900_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_84181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215394	213906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_213900_215400
833983	contig_7275_pilon	+	755	4	Intergenic	novelGene_111250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.44948974278318	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	99	524	412973	420570	FALSE	20	ATTACCATCTGTGCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRNPDEQARQFLILQSQTPVEEREHLIFHEAKMRENAERNAERSPVPFLPRGQIPHHPVDDFAQAKLFNTRSSCPGKATAHSPLYLVLPQPVVTQREPAGKSSSALGRQTSDTVREKRAGLASFSRVMSLRMVFSPPFFTLLASRRLTSRDAFGFSQWEASTGGGSWREWEES	408490	420801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_408563_412946_413036_414260_414498_420444
833984	contig_10479_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_147103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTTTGGGGAACACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71985	73728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_72000_73700
833985	contig_302_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_145006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27151	27598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_27200_27600
833986	contig_4091_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_173041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACATCATACCAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33968	34768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_34000_34800
833987	contig_7057_pilon	+	973	6	Intergenic	novelGene_123296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	84.1308504652128	503	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	86	820	898785	905717	FALSE	20	GGGAAGTGTTTGGGGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTGISAPTVTVFISSTLNTFRSEKRYSRSLTIAELKCKLELVVGSPASCMELELYGADDKFYSKLDQEDALLGSYPVDDGCRIHVIDHSGARLGEYEDVSKVEKYKISQEAYEQRQDSVRSFLKRSKLGRYNEEERAQQEAEATQRLAEERTQAAAITVGSRCEVRAPGQPFRRGTVMYVGLTDFKPGYWIGIRYDEPLGKNDGSVNGKRYFECQAKYGAFVKPSVVTTGDFPEEDYGLDEM	898699	905870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_898899_899284_899429_900750_900848_901239_901432_905387_905461_905602
833988	contig_11512_pilon	+	1415	9	Intergenic	novelGene_43264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.629013170439	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	749	1333	452382	471553	FALSE	30	CTTGTTCTCTAAAACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLPGALHGRLRLLLLGPGERHQVPLGKAGPRKCLHVPRSWRLWPHPELLADVQYAFGLPFYPTYEGQFTREEKSLSLKIMQYFSNFIRSGNPNYPHEFSRRAPDFATPWPDFLPSAGGESYKEFSSLLPNRQGLKKADCSFWSKYIQSLKASADGANDQQPALREEEELLAGSGLREDLLDLPDPGSKTYSK	357635	471635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_357769_358498_358693_434437_434581_435571_435740_452271_452457_455964_456030_468856_468992_470015_470207_471434
833991	contig_678_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_167854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566781	567628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_566800_567600
833993	contig_14618_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_136799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377092	375947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_375900_377100
833994	contig_14142_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_120428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	149	325	22793	22969	NA	10	CTCTGCAGCCTGAGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSSVLASPNAYSPSPGPPLQTPARAHPHLVSLNNRELTLPLSFQEYKLMYGMLFSIRSFVSKMSPLDMYAQSEGMSREGGLALGILEWGKLSVGEGALFSREGKGT	22644	24116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_22600_24100
833995	contig_3817_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_78355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAAATAGCAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591940	593101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_591900_593100
833996	contig_14846_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_85381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATCATAAGCAAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199600	200338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_199600_200300
833998	contig_3818_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_99229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTCCCCCACCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404477	403259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_403300_404500
834001	contig_9189_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_165126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTGATTCATTCAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423564	421910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_421900_423600
834003	contig_11363_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_160506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATTTCAGTACACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229120	228618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_228600_229100
834004	contig_11855_pilon	-	831	9	Intergenic	novelGene_67155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	307.602726743441	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	369	830	2718660	2713523	FALSE	55	TGCAGAGAGAAAAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKT	2731331	2713521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718745_2719882_2719986_2723728_2723865_2731286
834005	contig_9406_pilon	-	1150	8	Intergenic	novelGene_136163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	705.479718101847	18	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	65	1132	62401	51322	FALSE	15	CGAGGTCCTGGAGGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFSWAGSEHSGDLTEDAHHIRARHPGPGHSGEAAAGGCSPSTGGLCRRQGR	63150	51303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_51387_57753_57838_57899_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329_62420_63104
834006	contig_12312_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_64010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATCTGAGTGTAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515968	517348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_516000_517300
834007	contig_21388_pilon	-	870	5	Intergenic	novelGene_136632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	15	665	28487	21603	FALSE	15	ATAACCTGCGTGTGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28501	21397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
834013	contig_1624_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_138368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCTAGTAAGCACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52132	53035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_52100_53000
834015	contig_17602_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_174499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83870	84518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_+_83900_84500
834016	contig_4232_pilon	-	2419	18	Intergenic	novelGene_63494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.7672808462731	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	276	2069	681480	650851	FALSE	10	CTTCTGGGGTTAATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSAQQLAEELEIFGLDCEQAVIEKLVELCILHGQNEEEMAGELVAFISTHGVNLTSETLNSFEHEFLSKRSSKARHSASKDSGHAGARDIVSIQELIEVEEEEETLLNSYTTPSKGSQKRAITTPETPLTKRTVSARSPHQLLSPSSFSPSATPSQKYNSRNNRGEVVTFFGLAQGVSWSGRGGAGNITLKVLGCPEPLTKSYKSMFQKLSDIREVLTCKMEELGSELKEHYKIEAFTPIQVPAQEPVTLLGQIGCDSNGKLNNKSVILEGDREHSSGAQIPVDLSELKEYSLFPGQVVIMEGINTTGRKLVATKLYEGVPLPFHQPTEEDGDFEQKMVLVACGPYTTSDSITYDPLLDLVTIINHDRPDVCILFGPFLDAKHEQVENCLLTSPFEDVFKQCLRTIIEGTRSSGSRLVFVPSLRDVHHEPVYPQPPFSYADLSREDKERVQFVSEPCSLSINGAIFGLTSTDLLFHMGAEEISSSSGTSDRFSRILKHILTQRSYYPLYPPQEDLAIDYENFYAYAQLPVTPDVFISPSELRYFVKDILGCICVNPGRLTKGQVGGTFGRLYLRRQPVGEEGRRSPCVAVQVVRI	681755	650500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_651001_651748_651876_652140_652201_653424_653532_653817_653927_657074_657149_657882_657922_658542_658668_661064_661108_662046_662110_662656_662813_664112_664202_664814_665009_667072_667180_672369_672428_674125_674218_674969_675092_681401
834017	contig_5779_pilon	+	1037	4	Intergenic	novelGene_106536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGCTCCTCTCGAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348261	358741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_348603_349140_349632_357794_357867_358608
834018	contig_7707_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_72206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTTTTTCCAGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705095	706302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_705100_706300
834019	contig_3861_pilon	+	944	9	Intergenic	novelGene_57884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	373.970252827681	539	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	453	944	152855	176822	FALSE	50	AATTAAATATATTAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKEEAKEEPVNFSVDQPEE	141730	176822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_147877_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166853_176769
834020	contig_1406_pilon	-	1275	7	Intergenic	novelGene_25630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	303.06911569622	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	94	714	2692029	2615744	TRUE	40	GTAGAAGGATTTTAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLLRERELFKKRALSTPVVEKRSVSSESSSSSLSKKKKAKLEHGGSSGSKQNSDHNNGSFNLKALSGSSGYKFGVLAKIVNYMKTRHQQGDTHPLTLEEILDETQHLDIGLKQKQWLMTEALVNNPKIEVIDGKYAFKPKYNLKDKKALLRLLDKHDQRGLGGILLEDIEEGLPNSHKAVKSFRNFGGASLWIQWMMRKLKSI	2700470	2613720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2614235_2615696_2615813_2644012_2644196_2645903_2646012_2660128_2660221_2691860_2692034_2700381
834023	contig_13004_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_112585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGTGGGTTTGAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15795	16513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_15800_16500
834024	contig_9460_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_155317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACATTGGTGGAACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430296	431391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_430300_431400
834026	contig_15039_pilon	-	526	3	Intergenic	novelGene_110112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	37	245	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	87	299	169493	163266	FALSE	20	ATCCATTTGTGGTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRFSLTARAEPSPAHCPPPAALLALASMSFIPVAEDSDFPIHNLPYGVFSTKTNPRPRIGVAIGDQILDLSVIKHLFTGPVLSKHQDVFDQAISFEI	169579	163038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_163287_163620_163732_169412
834028	contig_7753_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_41493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	74	439	1193191	1193556	NA	50	AATACTTTGAAACATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGINSGFPPESLEFLVINVRLLNGYKSCSSAEWLLLFYQLLPTKSSAVVLIVHAILLPSTLLLPSFAARNPIWSPGFRKAALPLNTQPIEPENPGKVPSKGFLLFCLQGVCLYLSGVKS	1193117	1193966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1193100_1194000
834030	contig_10734_pilon	+	804	5	Intergenic	novelGene_51180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	477.08823869385	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	242	634	1131100	1132821	FALSE	40	AAATAACTCTGAAGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKINPLRNTSLRNIMTKNILLIREESDLIHLKMVRTGTNAKKGSHQEAEVTPDLDPVKGAIVVEAGSGRSLGPEAERERNHDPEAGRGNGGSDLVPAQDQDTGIGVEAEVGQGVEVGRCLSSGVKLTP	1123685	1132991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1128560_1128605_1129370_1129449_1131089_1131281_1132609
834031	contig_5586_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_143608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAATGTTCTACCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682884	681410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_681400_682900
834033	contig_15264_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_158859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTGGATTTTGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9379	9853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_9400_9900
834035	contig_16362_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_161169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGATGCCATTTCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321800	322469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_321800_322500
834036	contig_9406_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_136176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAATCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133710	134035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_133700_134000
834038	contig_8978_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_49440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	7	384	1074589	1074966	NA	50	AAGAATAAAAGGCTGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHMTKQSSPSRLALAAGGECVHIHGPRQTAPVLSPPTGSVTACCAGRRVGGAGFLRTPQPALGTDSASLNGQTSVPSGPHPLGLHTERLQVPGTQPHKWTTAVRYLPPSSPAAALATSRFLATIASR	1074582	1076850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1074600_1076800
834041	contig_12624_pilon	-	1016	4	Intergenic	novelGene_61034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1250	junction_1	1066.77874411187	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	80	655	868089	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMSSLCFLFFPQEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	868168	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898
834042	contig_12566_pilon	+	905	6	Intergenic	novelGene_86019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	71.5329294800653	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	27	656	128423	342884	TRUE	45	CCCCCTTCCAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAAAAAVMKAVVQRVTRATVTVGGEQISAIGRGLCVLLGVSLEDTHKELEHMVRKILNLRVFEDESGKHWSKSVMDKQYEVLCVSQFTLQCVLKGNKPDFHLAMPTEQAEGFYNSFLEQLRKAYRPELIKDGKFGAYMQVHIQNDGPVTIELESPATSAATSDPKQLSKLEKQQQRKEKTRAKGPSESSKERNVPRKEDRSASSGAEGDVSSEREP	128396	346589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_128466_139078_139170_142368_142605_195781_195889_342731_342907_346362
834043	contig_1719_pilon	-	1614	2	Intergenic	novelGene_87373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAGATAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771415	765509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_766173_770464
834044	contig_7229_pilon	-	576	3	Intergenic	novelGene_39819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1980.5	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	11	574	877522	875666	FALSE	35	TTACCGCTAATATGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKVYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLH	877532	875663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876858_877380
834046	contig_8412_pilon	-	928	8	Intergenic	novelGene_118399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	18.3358687176979	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	308	928	732306	727615	FALSE	30	GAGATACAACGCTGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAARALCGPGSTPLAQEDRVWSRAAQVQTGKTAPSRTLLVLPGAHLLPGGVCWSRYPLAWVFQQAPRDLSSAARPGNCILKPVFFYKISVQTSGSPSTLTRMEQPKGVDWTVIILTCQYKDSVQVFQRELEVRQKREQIPAGTLLLAVEDPEMRVGSGGATLNALLVAAEHLSAREGFTVVTSDVLQLAWILILHMGRDFPFDDCGRAFTCLPVENPQAPVEAVVCNLDCLLDIMTHRLGPGSPPGVWVCSTDMLLSVPPNPGIRWDGFRGARVIALPGSVAYARNHGIYLSDSQGFVLDIYYQGTEA	738859	727614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_727654_728068_728167_728590_728664_729002_729129_730863_730915_731730_731883_732224_732330_738575
834047	contig_11396_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_71379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTATGAAAAAGTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062463	1064514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1062500_1064500
834049	contig_10774_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_158683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAAAAAGAGATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30856	31733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_30900_31700
834050	contig_6589_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_25945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAAAACACAGCAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251982	1251300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1251300_1252000
834052	contig_7171_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_101423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAGACATCAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471851	1473316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1471900_1473300
834054	contig_7839_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_45672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATAGATGTTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70987	72651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_71000_72700
834055	contig_14925_pilon	-	698	3	Intergenic	novelGene_55063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	1887	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27400	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27347
834056	contig_12624_pilon	+	904	5	Intergenic	novelGene_60994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	389.891331014169	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	63	590	122804	130728	FALSE	30	ACTGAATAGTGGCCATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPCPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQLVLVDDWIRLQISHEAAACITALRAAMEALVVEVTKQPDIISQLDPANERMLNMIRQISRPSAAGITLMIGSVRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYGSGGYGSGGYGGGGGGYGGGY	122741	131042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_122843_123005_123122_127215_127417_130346_130505_130714
834057	contig_6654_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_85716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241546	240101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_240100_241500
834058	contig_11512_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_43258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTCTGTGGCACCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44078	43525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_43555_43778
834059	contig_14744_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_65949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295214	294698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_294700_295200
834060	contig_16098_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_46242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCACCACCCATCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815582	814863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_814900_815600
834062	contig_16208_pilon	+	1600	2	Intergenic	novelGene_177114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACATGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1890	11047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16208_pilon_+_2621_10177
834063	contig_13366_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_99778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAGTGTCTACATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65724	66692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_65700_66700
834064	contig_13666_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_177115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACCCGTGGGATGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2951	3598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13666_pilon_+_3000_3600
834065	contig_13744_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_77193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGAAAAAAGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751517	752527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_751500_752500
834068	scaffold_4805_pilon	-	1289	6	Intergenic	novelGene_161022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.426310729134	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	245	742	515282	459722	FALSE	40	CGAGTGAGACATGGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEFTRFLCSSPLEAENPPDGPDCGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPHCVSSVYLYYDPDYSFLSLGVYSALREIAFTKQLHEKASQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKSAALGRPVI	522109	459174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_459752_469654_469755_474528_474711_495372_495406_515129_515354_521936
834070	contig_14744_pilon	-	1001	7	Intergenic	novelGene_66109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCAGGCATGCTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1543405	1534536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1534636_1536776_1536882_1538319_1538482_1538594_1538755_1539455_1539527_1541547_1541712_1543165
834071	contig_14744_pilon	-	1048	4	Intergenic	novelGene_66108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533589	1530782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1531330_1532147_1532331_1532863_1533031_1533438
834073	contig_7815_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_134363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCTTTGGATAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180000	179032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_179000_180000
834074	contig_12694_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_171993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACAGTCGTGAATGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383063	382054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_382100_383100
834075	contig_4402_pilon	+	754	3	Intergenic	novelGene_140851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGACTTTTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595185	596818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_595574_595648_595931_596734
834077	contig_835_pilon	+	1199	5	Intergenic	novelGene_152127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	118.822346383161	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	135	1010	70975	321937	FALSE	20	ATTGTTGCACTTACTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKSTEILEYSSDSGKEDDSENVLFIDSESPHKCSVDFGTDARQYMERLVEPWTKSTETILYTPQKQKNKFPRTPEDSTKKKKLIRGGLAERLNELQNRERSAISFWRHQCVSYPKTLEGRKSGVLVVKILELHEECTMQVAICEQLEDLQASSPSPGVAPGPGACLKILFTKDTASNLKGRPQDIVHIYPPWQKLIIPDESCPVVLNTYFCQKSIAKEDSERMAVVHCRDSPLLRRSITLAQMFRLKCVKPEIQVTCGGMTTMGTDLTHEQEEAKQHFPAHTSPSDSLLDVVGSQGATAGSVVRVRVVVQRVYLFPGRDGASCVPCTHTDAPHAW	70840	322126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_88205_88307_164341_164562_320242_320430_321691
834078	contig_5041_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_27018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	454	753	243369	243070	NA	25	CTCCTGACAACACTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMRTKEDGLVLSWSQQFYWGGKILKIYYYYFFNHMWDIKYQLWGRGRDLCKQELPCCCCCCVPWSQFRLRENFADSLVLVISADGCQVPCLRHFLCTV	243822	242400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_242400_243800
834081	contig_18545_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_161886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTCCACTCAACTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305550	303790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_303800_305600
834082	contig_13707_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_43525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTAGATTGAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140475	138543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_138500_140500
834083	contig_6084_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_127033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	4.89897948556636	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	526	693	305099	305266	FALSE	15	ATATGCTTATCCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFQRQESVRSEHKSIQLYDTPYEPDGQSVDSDSESAVSLRLRESKLPQDDDRPADEYDQPWEWNRVTIPALAAQFNGTEKRQASPSPSRDRRRQLRAPGGGFKPIKHGSPEFCGILGERVDPAVPLEKQIWYHGAISRGDAESLLRLCKECSYLVRNSQTSKHDYSLSLKSNQGFMHMKLAKTKEKYVLGQNSPPFDSVPEVIHYYTTRKLPIKGAEHLSLLYPVAVRTL	257563	305877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_257781_273073_273246_279743_279864_305082
834084	contig_6059_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_44793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGGTTCTCTAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382496	381974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_382000_382500
834087	contig_6361_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_23857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACCACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30717	29529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_29500_30700
834088	contig_10299_pilon	+	953	6	Intergenic	novelGene_79786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	7.88923316932641	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTCATCTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672477	679350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_672667_673298_673373_674236_674269_675516_675633_677664_677742_678885
834089	contig_1127_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_98859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGACAAGCCATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344415	345582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_+_344400_345600
834090	contig_14577_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_164655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGAAATATTTAGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98288	97387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_97400_98300
834091	contig_14577_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_164654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97111	96808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_96800_97100
834092	contig_12644_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_44556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677402	1679189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1677400_1679200
834094	contig_11375_pilon	-	1685	14	Intergenic	novelGene_152647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.3352452288415	1	42	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	726	1406	27828	24878	FALSE	25	TGGACGTGAACCCAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSAEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQLSFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTANQPGFIIVETNYRLYAYTESELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDRLRFTEGERPV	30083	24598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_24891_25368_25452_25611_25660_26296_26428_26625_26759_26971_27056_27263_27333_27493_27606_27820_27910_28003_28101_28366_28495_28839_28945_29201_29345_29912
834095	contig_14727_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_56679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAACAGAGAGCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370460	371028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_370500_371000
834099	contig_10003_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_88215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATACGTTCTCTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548604	547441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_547400_548600
834101	contig_14209_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_88349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	216.472990360358	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	421	849	38057	40625	FALSE	25	GCCTCCTTGTGGCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDHTELSPEMAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	34089	40979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_34106_35209_35348_35503_35664_35769_35784_37964_38078_40142_40344_40418
834102	contig_19179_pilon	-	1180	2	Intergenic	novelGene_142362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAACAAAAAAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13104	11883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_12639_12679
834104	contig_13421_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_166799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	159	554	39456	39061	NA	25	TATCTGACTCTGACTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRNGSSGGSTGQKREEEFAEGDVGDVLPAAGPGSRSDGAEPGLREGKRSYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPNGAEDESAEAFPLEFKRELARERREPARGPQGPAEGAATRADLDYGIMAEAEAASAEKKDEGPYKMEHFRWGSPPKDKRYGGFMTSEKSQTPLVTLFKNAIIKNAHKKGQ	39614	38885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_38900_39600
834106	contig_177_pilon	-	807	2	Intergenic	novelGene_41796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGTGTTCAGCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413133	403091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_403136_412370
834107	contig_14519_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_66847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGTAGATAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417071	418560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_417100_418600
834108	contig_14519_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_66848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACAGCTCGCCTGCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418512	419147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_418500_419100
834109	contig_9053_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_87922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACTCATTGTACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84206	81752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_81800_84200
834110	contig_2867_pilon	-	942	4	Intergenic	novelGene_135202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACTAATTATCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903816	895066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_895750_896210_896311_896508_896582_903730
834111	contig_14882_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_114982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTAGCAGAAACATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39556	40812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_39600_40800
834113	contig_5047_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_158003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGAACAATTACAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271091	1270414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1270400_1271100
834114	contig_7887_pilon	+	704	2	Intergenic	novelGene_124904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	0	721	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	392085	392504	FALSE	10	CATTCTTTGAGGTCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKPREERETQGREGRVGCELNGEGENSESHRGAELRLGDPESGDHDEASAVAVGAGAAGLHLGSPDHGPHPGPGAALDLPGGPVATARLLAGDRRLLCPGHRGLSRGHFQ	392082	392873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_392213_392299
834115	contig_3111_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_129970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAGTGAAAAAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54729	56510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_54700_56500
834117	contig_10319_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_147237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41357	42842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_41400_42800
834119	contig_3602_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_60588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAACCGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676711	677121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_676700_677100
834120	contig_4640_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_147964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127604	128895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_127600_128900
834121	contig_6589_pilon	+	1126	7	Intergenic	novelGene_26215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	313	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	199	960	2034734	2042124	FALSE	20	TTGTCTGTTATTTTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQGRGGSGTRSGTRSGHPSPVSPTPKRPGSRRVQTEPDSGTTPPGSLSGELEQIEGPPASSLTGAPMAGSEELGLQEDTLRVLAAFIRRGQATGSSVTTPPRSLTQEQPTDFLSRLRRCLPCPLGQGTVPPESPRPCSLRLHPCYGSEPGPATPDFYALVAQRLEQLVQEQLRSPPSPELQGPAPTEKEALLRRLVVLLEEEAEVINQKLASDPALRRKLARLSIGSFARLAELFSSRETSPSRARPSLPCPGPPPPSPEPLARLALAMELSRRVAWLGGTLAGLSVEHVHSFAPWIQANGGWEGILAVSPVDLNLPLD	2033900	2042290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2034069_2034703_2034841_2035049_2035193_2036074_2036162_2036551_2036644_2037385_2037668_2042073
834122	SIRV6	+	439	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	32	14	32	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCGGTGGCTTGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169	2106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
834123	contig_15866_pilon	-	1136	11	Intergenic	novelGene_63612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATTTAGCTGGCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389909	368564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_368628_371353_371403_374371_374535_376728_376865_378938_379051_381973_382090_382345_382429_386494_386613_386774_386841_388058_388168_389788
834125	contig_10000_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_139341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTGTCGGGAGAAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312679	311821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_311800_312700
834127	contig_1715_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_127171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCAGCCAATTCAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237670	236992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_237000_237700
834128	scaffold_16539_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_68417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAATTTTCCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940439	939082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_939100_940400
834129	contig_11363_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_160495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGAAGAAAAAAATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175082	176154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_175100_176200
834130	contig_7455_pilon	-	1357	2	Intergenic	novelGene_168650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTGCAAATAGAACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67875	61311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_62455_67661
834131	contig_563_pilon	-	1412	12	Intergenic	novelGene_169751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	82.3081289981345	31	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	11	1408	148760	120846	FALSE	15	GCCTGTCTCTGGATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGERTECAEPPRDEPPADGALKRAEELKTQANDYFKAKDYENAIKFYSQAIDLNPTHAIYYGNRSLAYLRTECYGYALADATRAIELDKKYIKGYYRRAASNMALGKFRAALRDYETVVKVKPHDKDAKMKYQECNKIVKQKAFERAIAGDEHKRSVVDSLDIESMTIEDEYSGPKLEDGKVTITFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPGHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGITLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSVSKRGVSCQFGPDVTKTFLEENHLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSTPSPSYFMSVIKYVKIKSLL	148770	120841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_120909_122795_122961_123071_123113_124010_124099_124224_124368_126603_126710_127487_127587_127956_128023_132665_132788_133533_133682_140853_141096_148645
834132	contig_7870_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_108987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433854	434770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_433900_434800
834133	contig_12532_pilon	+	2231	11	Intergenic	novelGene_111146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGATTGGATAACAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21595	41281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_+_21833_28096_28264_29334_29518_31371_31522_31666_31859_32326_32525_33075_33224_34225_34436_35602_35699_37394_37545_40781
834134	contig_8174_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_160046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTAACTTCAGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220988	221314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_221000_221300
834136	contig_15327_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_70801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGCCAGAGCCGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260250	1261318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1260200_1261300
834137	contig_13481_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_119341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1552	1902	357146	356796	NA	70	AAAAGAAAGAAAAAACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELMSHCREYRQNQNKLYSMLLLLLVSIEVIPTHGDPMCAEWGFQGRDLSEADRPGLSSEAPLGRFEPPTFQLVVECLAVCTTQRLHTVCQTGINTIDTIKRVRGKRKSVQVCKFK	358697	356585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_356600_358700
834138	contig_3365_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_177116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAGAGCTGTAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42187	40955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3365_pilon_-_41000_42200
834139	contig_4974_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_161404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAAAATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74687	76066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_74700_76100
834140	contig_9633_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_139596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAGAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97421	99018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_97400_99000
834142	contig_9679_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_173408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGACATTTAGTACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29531	31463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_29500_31500
834149	contig_3942_pilon	+	2245	7	Intergenic	novelGene_128678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_6	30.7503387515216	41	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	319	1080	418835	421150	FALSE	20	TCTGGAACTGTTGGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGGNNKLIKVFHRDGHYGFSEPLTFCSVVDLITHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYLERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQELRAQASDNREIDKRMNSLKPDLMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQYSLMEDEDDLPHHEERTWYVGKINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNLYGSLKELVLHYQHASLVQHNDALAVTLAHPVRAPGPGPPPAAR	417235	422315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_417419_417504_417631_418825_418969_419243_419421_420185_420258_420497_420669_420942
834153	contig_10339_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_125259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278786	277233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_277200_278800
834154	contig_9389_pilon	-	1973	3	Intergenic	novelGene_84048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	257	565	621586	618814	FALSE	5	TGGCGTCCACGCTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKAKKRVVLPTRPAPPTVEQILEDVRGAPAADPVFTALAPEDSAGLAGGAEDTEARREQLYQQSQAYVATNPQHRHPAHLRHRPSQRAGSGLLARTLWPI	621842	617405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_618903_619272_619363_621456
834155	SIRV2	-	294	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	35	3403	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
834157	contig_14357_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_121714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATTGGCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879701	880902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_879700_880900
834158	contig_6217_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_109678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTGTGGACTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844004	844696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_844153_844266
834160	contig_9678_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_146349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACCCATTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120946	122714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_120900_122700
834161	contig_6707_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_167044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTACCAAAAAAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196723	196263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_196300_196700
834162	contig_9177_pilon	-	686	3	Intergenic	novelGene_32694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	630	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACACAAAACACAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461269	444196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_444316_452973_453084_460812
834163	contig_6513_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_117763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGATAAGGTATGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154985	156295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_155000_156300
834164	contig_10263_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_135850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAGCACAGGGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882785	883138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_882800_883100
834165	contig_9903_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_172019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	309	620	152314	152625	NA	70	CATAAAAAAAATGCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKFSNIGYQATKDSDPSVMGNNVSPMIALAYCLKQFPRHSTGKGKLRWSLVDSLSCGYGAESLERPRRLQFIELSTREERATQKENPGDLHRASLKCSAEH	152005	153481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_+_152000_153500
834166	contig_6589_pilon	+	552	5	Intergenic	novelGene_26152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	22	498	1885124	1887829	FALSE	30	TTGAGCCCAAATACTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885102	1887883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
834167	contig_4604_pilon	-	1221	3	Intergenic	novelGene_19159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367745	364832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_365454_367055_367196_367285
834169	contig_8291_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_99964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCACCTTTAGCCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749103	748246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_748200_749100
834170	contig_15777_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_75745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAGCAGCCTAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207340	206973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_207000_207300
834172	contig_5815_pilon	+	466	5	Intergenic	novelGene_141228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16663.8406643697	423	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	57	434	1041346	1046025	FALSE	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1040934	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040991_1041345_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
834173	contig_7158_pilon	+	1542	11	Intergenic	novelGene_163725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	344	886	1030187	1048427	TRUE	15	CGAGCCCGGCTGCGCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGHNLARCWRFQRQHTAVRNSRAEVLALHTPVGRRQPLLPRLAVVPVEEEQGEGAHDKEKEDPHTEAGVVLNGLSDVFIALLDVLGRPDHQLVDVVNLGFLLQNLFCEYLLESGNFNHFSFNLPHFIKQAVHLANKSLILLFKLFVSPLGIVPLHLCCLPRSPIQAVCRARSFLLDILQ	1029843	1168548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1030408_1031684_1031769_1034355_1034423_1035837_1035900_1044189_1044281_1048409_1048526_1059357_1059424_1059589_1059671_1062223_1062338_1080130_1080197_1168317
834174	contig_5797_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_56909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACAGGTCAGAGCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81149	80028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_80000_81100
834175	contig_5797_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_56908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTATTAAAGAAGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79923	79370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_79400_79900
834176	contig_11823_pilon	+	1117	3	Intergenic	novelGene_171034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATACTAGATTCGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90305	92195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_90609_91198_91346_91528
834177	contig_2380_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_117891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCAGAATGTAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148083	149427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_148100_149400
834178	contig_6807_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_84576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1350	1691	164317	164658	NA	30	ATACGTAGAAGAGCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHRIIKITAKFNERRKPVEKISEIKSELFENINKINKPLLKHIKKKERKQITKIRNGKTDITTNLTEIRIVREYYEQLYANKSENLNEKDKFLETQKQPALTQEKIGNLEQT	162967	165441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_163000_165400
834179	contig_12886_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_135463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAGAAAAAAAAGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267192	268664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_267200_268700
834180	contig_10627_pilon	-	1057	5	Intergenic	novelGene_59908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTGGGGAGGAGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37618	29073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_29337_30028_30300_31515_31836_34666_34722_37470
834181	contig_1406_pilon	-	1116	2	Intergenic	novelGene_25512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	36	350	1522301	1511136	FALSE	15	GAAACTTTGGGGTTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGKNGRGGSQFMMKQMPHLTRARHRGQPRTLPLYSATDDPTQQQLISFRTSRQNGKKKPTNISQKAWKGTSPGRFLADLHHWPILDDGNHNGRFCHCPLSPVIIPVELKSPLHGP	1522336	1510369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1511313_1522163
834182	contig_8588_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_146516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTATCCTTGACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543647	544437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_543600_544400
834183	contig_11047_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_173954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAAGTTTTGGTGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93031	92390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_-_92400_93000
834185	contig_14047_pilon	-	2128	7	Intergenic	novelGene_176588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	47.6969600708473	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	256	1380	79287	64021	FALSE	25	GAACCCAGCAGGGGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEKRPAPRPPYEGLFADGHLVLWTLCSVLLPVFITFWCSLQRSRRQLHRRDIFRKSKHGWQDTDLFSQPTYCCVCAQHILQGAFCDCCGLRVDEGCLKKADKRFQCKEIMLKNDSRALDAMPHHWIRGNVPLCSHCVVCKQQCGSQPKLCDYRCIWCQKTVHDECMKNSLKNEKCDFGEFRNLIIPPTYLTSINQMRKDKKTDYEIPASKLGKQWTPLIILANSRSGTNMGEGLLGEFRILLNPVQVFDVTKTPPIEALQLCTLLPCYSARVLVCGGDGTVGWVLDAVDEMKIKGQEKYIPQVAVLPLGTGNDLSNTLGWGTGYAGEIPVTQVLRNVMDADGIKLDRWKVQVTNKGYYNLRKPKVCFKCFQT	79812	63272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_-_64100_64442_64601_64909_65054_68843_68964_71563_71724_78823_79310_79579
834186	contig_14528_pilon	-	1366	5	Intergenic	novelGene_111281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	57.7256442146816	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	421	903	212001	210110	FALSE	20	CCATTCCACTTCATTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNPRATLERQQLRLRERQKFFEDILQPETEFVFPLSHLHLESQRPPIGSISSMEVNVDTLEQVELIDLGDQDGADVFLPCEEAPPTPQTSGVDDHPEELSLLVAVSDRTTSRTSSSSSDSSTNLHSPNLSDGGADTPLAQSDEDDDGGDGGAEPGACS	250409	209646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_210316_211529_211668_211862_212010_248485_248554_250065
834189	contig_12139_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_146486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	358	771	326444	326857	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRGPGVGNWFPWRPSGVPHQQGRWGARAAGLKGSGVRNTPGQCGDESWETGHYRRGSGTVCKPGTEPGWKENETKWRACVGAPSPSPDTGHRAGVSRWGRTPPRREEGGVPTDSGWRRGSGGEPGHSSQTEETLM	326086	327405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_326100_327400
834190	contig_12638_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_33330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTTATACTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316680	1314981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1315000_1316700
834191	contig_11448_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_66396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443547	442102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_442100_443500
834192	contig_11752_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_37677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATCAACTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110094	109307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_109300_110100
834194	contig_5041_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_27042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACTCAGCAGGTAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427439	428085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_427400_428100
834195	contig_15459_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_106386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26718	25570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_-_25600_26700
834197	contig_12008_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_25008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTGATTCCAGAGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58740	59436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_58700_59400
834198	contig_5894_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_83039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400221	401600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_400200_401600
834199	contig_1090_pilon	-	1105	9	Intergenic	novelGene_131152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	116.265254375501	95	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	189	983	555646	539066	FALSE	20	TTAATTCTTAGTTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISYCPTATEEAPYWTYLLCALGLFIYQSLDAIDGKQARRTNSCSPLGELFDHGCDSLSTVFMAVGASIAVRLGTHPDWLFFCSFIGMFMFYCAHWQTYVSGVLRFGKVDVTEIQVALIIIFVLSTFGGATMWDYTIPVLEIKWKIFPVLGVVGGAIFSCSHYFHVILHGGVGKNGSTIAGTSVLSPGLHIGLIIILAIMIYKKSATNVFEKHPCLYTLMFGCVFAKVAQKLVVAHMTKSELYLQDTVFIGPGLLFLDQYFSNFVDEYVVLWIAMVIASFDMMTYFSALCLQISRHLHLNIFKTSCHPAPEQVQVLSSKSHQNNMD	582011	538943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_539111_541694_541806_543724_543851_544297_544457_545673_545806_547699_547785_555509_555652_555931_556080_581976
834200	contig_13558_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_123029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAGAAATCAGTACTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518396	517907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_517900_518400
834202	contig_776_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_139942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAACTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932030	931126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_931100_932000
834204	contig_14243_pilon	+	454	2	Intergenic	novelGene_57423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGCTGTAAGCACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555778	557315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_556018_557100
834205	contig_16869_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_137583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTTAGCAATAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35221	33197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_33200_35200
834206	contig_8476_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_121328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTCATCTTTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76339	76852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_76300_76900
834207	contig_8476_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_121329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	244	546	77357	77659	NA	5	CTGGCCCTCGCCCTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHKDLKNFIPQLLPSSMYEIELFQKKKGYISSSYKSTSVERVKLLKIAIANKYLQNFANQSYYLFFSPLLPPLPTALSIVDYSNTPVFVSSMLSKMTKN	77113	78027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_77100_78000
834208	contig_2114_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_104276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGACCCTCTACTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598626	599485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_598600_599500
834209	contig_14443_pilon	-	651	4	Intergenic	novelGene_126661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	925.756027375584	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGAGCTGGAGTAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39507	24884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_25171_37689_37863_38988_39045_39371
834211	contig_4364_pilon	-	1501	3	Intergenic	novelGene_121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	501	809	1057434	1057126	TRUE	25	GGGTGCAGCTGCAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKRLSPALAGLGRPFTEQAALWVSRLARLAREDRPTSSSSPGGCACIEAVVWAQDSGSQGRGVGVPPAGPSPARRSLGVVLGWGGWWMPSDGVLAGLWGS	1057934	1056235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1056440_1056552_1056653_1056737
834212	contig_9435_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_156967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTGACATGCATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480124	479291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_479300_480100
834214	contig_5765_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_141355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGGCAGGAACCAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351833	353213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_351800_353200
834215	contig_7272_pilon	-	582	3	Intergenic	novelGene_25421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_2	47.5	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGCGGTAAGTTGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010732	915826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_915910_924066_924211_1010377
834216	contig_15152_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_126953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATACATCCTTTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80480	78841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_78800_80500
834218	contig_7045_pilon	+	1199	8	Intergenic	novelGene_77450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	335.31003016094	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	408	1163	356528	365689	FALSE	20	AAGCTTGTATTGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCKKNEQISLRRNTGRMLIRNEDAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEVLDMGVSSNDVIIH	323271	365725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_356323_356601_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364288_365644
834220	contig_4093_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_27651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATAAAATGAAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70589	70315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_70300_70600
834222	contig_7593_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_127362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGGAACAAATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699999	699302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_699300_7e+05
834225	contig_5917_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_122137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTCTGCGTTCTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85515	86052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_85500_86100
834227	contig_8138_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_52480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATAGGAAAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280879	281648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280900_281600
834228	contig_8552_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_80112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTTTTTGAAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572453	570886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_570900_572500
834229	contig_7171_pilon	+	1120	6	Intergenic	novelGene_101243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	415.864208606608	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	489	668	760687	764509	FALSE	35	TCCTGTTAAAAGAGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLLLSGAEAADREGDIHGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQAVHDGPAPLPGSLCGLPGQSGPEEPGGHPPHRLELRGRQGAPGEEHVHPVNTRCLPC	734383	764961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_734441_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760692_764334
834230	contig_3942_pilon	+	435	4	Intergenic	novelGene_128782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5604.51603619795	13	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	238	399	795165	795466	FALSE	25	TGAAGCAGTAACTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKRSPAPPCCQLPQEEVRPHQQPAPQKEGQIRAPLSRFPCFLLMASSQAP	793562	795502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795318
834231	contig_14326_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_120656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGCAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44017	42758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_42800_44000
834232	contig_10734_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_51047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAGAACAACAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407714	408439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_407700_408400
834233	contig_16122_pilon	-	681	5	Intergenic	novelGene_134493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	186.183377346099	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGATCCTGTGTGTGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110657	104299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_104996_105132_110328_110368_110497
834236	contig_8122_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_40213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGGACCATAGCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367054	369186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_367100_369200
834237	contig_15063_pilon	+	663	2	Intergenic	novelGene_14457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5984	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	33	521	36064	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36031	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36158_36266
834238	contig_8581_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_22851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336511	337542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_336500_337500
834240	contig_2365_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_103748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGACTGGCTAATGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209849	207579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_207600_209800
834242	contig_10235_pilon	+	930	5	Intergenic	novelGene_46603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.2651016552186	596	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	13	465	596627	598482	FALSE	20	TTGGTGGGAACTCTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDCSGSCGQCVWPPVLFFSLQWLETRPERQECPVCKAGISREKVVPLYGRGSQKPQDPRLKTPPRPQGQRPAPESRGGFQPFGDTGGFHFSFGVGAFPFGFFTTVFNTHEPFRRGTGVDLGQGRTASSWQDSLFLFLAIFFFIWLLSI	596614	598947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_596681_597608_597737_598026_598082_598160_598279_598384
834243	contig_20693_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_60261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23815	24840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_23800_24800
834245	contig_870_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_176024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAATAAAACAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16498	14623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_870_pilon_-_14600_16500
834250	contig_5916_pilon	+	2069	2	Intergenic	novelGene_158056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475368	478025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_476213_476800
834251	contig_10523_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_120962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACATTATTACATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80731	81074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_80700_81100
834252	contig_10523_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_120963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTGGTGACTATCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81421	82706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_81400_82700
834255	contig_10148_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_172859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	175	582	244005	244412	NA	65	TTAAGAAAGAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQNQVIVKARQGIEPSKVSQLMFNTDGSRAQDPFGCPKQFAYFPSHCAEYALSHFSFSCFFFFLKGRQENPLFTLKSPRAWDFGIVWALNQTIKYLGEGLFVQFNVLEMTLCWKKTKQKSSISIIVLCESTVT	243830	244728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_243800_244700
834256	SIRV6	+	260	3	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	228	2892	228	-2865	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATGTGCCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2744	7923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805
834257	contig_6270_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_99810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATGGGTAATTTTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29336	30546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_29300_30500
834258	contig_9653_pilon	+	1105	2	Intergenic	novelGene_48343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGGACAAACGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098053	1099910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1098572_1099323
834259	contig_11449_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_170552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTGTCATCTTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124151	125942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_+_124200_125900
834260	contig_6958_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_70023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815604	814055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_814100_815600
834261	contig_11832_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_106984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGTATGAATAGACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505465	506257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_505500_506300
834262	contig_9439_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_176909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTCACCTAAGTATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161557	160612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_160600_161600
834263	contig_1154_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_87180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGAGCAGAATGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953360	954632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_953400_954600
834264	contig_6451_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_173704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCCCACTGCTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171534	171187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_-_171200_171500
834267	SIRV5	-	293	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8393_8469_8590_10863
834268	contig_9415_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_109838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1934613	1933138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1933100_1934600
834271	contig_9858_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_140532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTCTGACTCATAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220620	220247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_220200_220600
834272	contig_2278_pilon	+	1263	3	Intergenic	novelGene_118147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_2	128.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	38	421	1458359	1469653	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAQTSRPESPGMTSPSPRIQIISTDSAVASPQRIQIVTDQQTGQKIQIVTAVDASGSPKQQFILTSPDGAGTGKVILASPETSSAKQLIFTTSDNLVPGRIQIVTDSASVERLLGKADVQRPQVVEYCVVCGDKASGE	1458321	1470495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1458431_1467703_1467905_1469542
834274	contig_12008_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_25005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAGCTGCTTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48066	46752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_46800_48100
834275	contig_5832_pilon	-	1480	6	Intergenic	novelGene_134182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_1	15.9699718221417	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAGAATAAGGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592856	583494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_584440_585683_585763_590111_590192_591301_591407_591676_591829_592737
834276	contig_14687_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_107944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547648	546291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_546300_547600
834277	contig_7051_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_64375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCACAACAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368219	369186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_368200_369200
834278	contig_10095_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_57234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTAATCAGGCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200759	202147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_200800_202100
834279	contig_15365_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_111138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188585	189471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_+_188600_189500
834280	contig_16896_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_174912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGGGGAAAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101368	103188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_+_101400_103200
834281	contig_15114_pilon	+	1913	5	Intergenic	novelGene_121218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	5.35607132140714	60	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	182	1345	1046788	1051759	FALSE	20	ATGTCTATTTTTGTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILEILQNAAQVAKSAYEILRDYSLLTWLVHILESRFLETQLLSNIISLVHTLWVTNLGDRMVEPKSQPPCKRGSQEPPKLLALHLIDEFLYVLVALMKHLRPTLDPAQITSFFSALDSVLRYRATVMLAFKEKDRFIVNERVLSTKDVLILLHKWSLFERDTKLQEDLKTATEKHQVRELVKMIKEKNKPVGPARARGPRGRKRRPGEAEETVAPELKAASLDTCRDLLRSILTHWEPVFPGPKPSTEATDGAAPESDAPGPVHAVASLAASWVLRTVAEHPPTRAEAAGLLSWLKSHILPQPVVVADLLRDNVVRSGLFKLYSRLCNAEGLVGPAQGVACLFNTVMMQLVAAHVPVGSPFHLAVEGLCLTSLTEEDEAARAAAAFLVSLYIKDLWLGAPRPDALLTHIRMIHDATEEAPSGGERSRAPEDAILLLCKDVAASTTDA	1045170	1052327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1045276_1046711_1046910_1048199_1048442_1049652_1050253_1051559
834282	contig_3068_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_137641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGCAGAGAAAGAGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257653	257074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_257100_257700
834283	contig_14522_pilon	-	1236	8	Intergenic	novelGene_147317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	333.85515617723	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	130	936	146829	66449	FALSE	15	CCCTTGCCCCTCCACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	232041	66148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66521_78937_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_206230_206293_232023
834284	contig_14508_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_79054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	496	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAAATAAATATGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73289	72854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_72900_73300
834285	contig_4228_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_151175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511820	513127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_511800_513100
834286	contig_9303_pilon	+	2503	11	Intergenic	novelGene_176822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	310	627	24374	31651	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVLLNRLRQQETNSVVFSGKLKLKAFSKMCWQLMSTGEPESTPATQAVMKQAMVPAIRALTAPEVMSRFLEGAMDVSPPITIPREPILEKPQRAYVAMVSERI	24064	42426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9303_pilon_+_24389_25208_25326_25566_25667_26334_26419_31649_31847_32244_32414_33971_34101_35430_35559_37644_37726_39343_39425_41333
834287	contig_11338_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_6410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGACACACTAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316831	317326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_316800_317300
834288	contig_366_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_51564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCATTATGCTAAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648260	647667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_647700_648300
834289	contig_2703_pilon	-	1250	2	Intergenic	novelGene_101813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	142	1020	1110006	1108100	FALSE	30	ACTAGTGAAGCTGATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSCCKTLQQNCCHVKGTFGKFRWTPLTLTNPVPLGVSQASGNVDPGNMSASVKECLQLQLLEMEMLFSMFPNRGEIKLEDVNALTHVKRYLEGKREALPPKIEFVITLQIEEPKVKIDLQVTMPHSYPYAALQLFGRASELDRQQQLLLNKSLTSYIETFDQGELCVCAAIQWIQDNSASYVLNKKLVHEPSAQVKQVKNTFLRMWIYSHHIYQQDLRKKILDVGKRLDVTGFFMTGKPGIICVEGFKEHCEEFWHTIRYPNWKHISCKHAESIETEGNGEDLRLFHSFEELLLEAHGDYGLRNDYHMNLGQFLEFLRKHKSEHVFQILFGIESKNLES	1110147	1107869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1108778_1109805
834290	contig_1076_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_101085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGCCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49847	48444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_48400_49800
834291	contig_10467_pilon	+	1002	8	Intergenic	novelGene_175406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	6.67006715995929	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	679	1002	120264	144843	FALSE	55	GTATTACATTATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLQNILHINSGGLLRIEGKNLHSILDEVVFKLLSTPSPTIRSTATKLLLLMAESHKEILILLRLSACYKGLRGLLNKQETGTEFSQELRQLLGLLSPKVYQDIEEQ	87616	144843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_+_87804_88200_88291_103109_103222_107379_107510_115016_115111_120198_120299_140920_141100_144733
834292	contig_7898_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_47556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1523	1894	326138	326509	NA	20	GGCTCTCAAAGGTTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHLCWPAQLRDKRGNGKSRGSQVRARGHSHFQLRQRNVPGSRGSRKAWPGLSEPLQSLNKPRAAPTHQLPLKGHRGGRTAQSPARPLSNGYDYSSDKTTAPLFYCCCEPQSQQCPDGETSL	324615	326673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_324600_326700
834294	contig_14645_pilon	+	399	2	Intergenic	novelGene_177117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	70	399	3793	4302	FALSE	25	GATACACGGTGCTTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFLGVSLVILWLQLARVNSQVEQNPEALTIQEGENATMNCSYKASINNLQWYRQDSGRGLVQLILIHSNEKEKTNGRLRATLDTSTKSSFLFITASQAADTAAYFCAI	3723	4302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14645_pilon_+_3845_4024
834295	scaffold_16735_pilon	+	1241	2	Intergenic	novelGene_160362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAAACAGCATAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364380	366928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_+_364680_365986
834296	contig_8375_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_141282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72735	73796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_72700_73800
834297	contig_11483_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_172689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTCTTGGAGCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73028	73760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_73000_73800
834298	contig_11483_pilon	+	521	2	Intergenic	novelGene_172690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAGAAAATAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73760	77607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_73786_77111
834299	contig_9858_pilon	-	1451	5	Intergenic	novelGene_140534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2	490	249693	242218	TRUE	70	AAAAAAAAAAAGTCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPRCSTECWSLGNEGLFGHLADHVIEDTPVVEISELHICVKPHDSLEGLPGVQLDLDFHSWFEVFWDDDSVSLQPRESQSICILPRQVFEGDHPHSDQVTAVNAFVTLGQDSFDSQKERALGRPVSGASRAVLFASQNDQGKAGLLVSLSSIEHIKNFSRR	249694	239641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_240470_242084_242236_246860_246983_248358_248544_249529
834300	contig_4782_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_73677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAACAAATGATCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617551	616774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_616800_617600
834302	contig_14786_pilon	+	1130	5	Intergenic	novelGene_174708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.2396172239067	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	96	389	60355	66036	TRUE	0	TTGCTTGGGTTTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRALRRPQFLPLLLLLSGVCPQVDGCNETRMLEKLPRCGKAFAEMMQQVDVWKWCNLSEFIVYYEIFTTCTEVETNLVGCYWPNPPGRELHHPHPQAVLFQLHRGQGALGRPPRMRFSFHSSLCPSC	35571	67086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_35629_60316_60450_65837_66092_66283_66461_66577
834303	contig_4469_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_21884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAACCCCATGTTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248033	246192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_246200_248000
834305	contig_5084_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_64685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTTCATGAGAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1810078	1811472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1810100_1811500
834308	contig_15897_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_49525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGGATTTCAGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299577	300188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_299600_300200
834309	contig_9839_pilon	-	946	3	Intergenic	novelGene_88582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGAAGTTGTATCCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336516	331248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_331424_331782_331848_335810
834310	contig_4519_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_123654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGGAAACTCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44429	45102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_44400_45100
834311	contig_2770_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_107498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGTTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822032	822757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_822000_822800
834313	contig_11372_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_176657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAAGCTTGACTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291253	291645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_+_291300_291600
834315	contig_27_pilon	-	2076	11	Intergenic	novelGene_175812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCAGCTCCTGGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140418	68329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_27_pilon_-_68671_76389_76468_94364_94875_99518_99665_100651_100747_106732_106877_122820_122971_123815_124007_129328_129452_130256_130488_140351
834320	contig_7870_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_108982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411409	412636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_411400_412600
834321	contig_17680_pilon	-	1193	9	Intergenic	novelGene_150127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_8	127.655787177864	418	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	55	822	28724	10232	FALSE	10	GTGGTTGTCTCTTTAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSAGSNGPRHREAGGGRMVKLTAELIEQAAQYTNAVRDRELDLRGYKIPVIENLGATLDQFDAIDFSDNEIRKLDGFPLLRRLKTLLVNNNRVCRIGEGLDQSLPCLTELILTNNSLVELGDLDPLASLKSLTYLSILRNPVTNKKHYRLYVIYKVPQVRVLDFQKVKLKERQEAEKMFKGKRGAQLAKDIARRSKTFNPGAGLPTDKKKGGPSPGDVEAIKNAIANASTLAEVERLKGLLQSGQIPGRERRSGPTDDGEEEMEEDTVTNGS	28778	9860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17680_pilon_-_10291_18023_18118_18773_18850_19240_19321_19891_19995_20302_20350_23410_23490_24125_24274_28642
834322	contig_12638_pilon	-	483	3	Intergenic	novelGene_33323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	455.5	156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325626	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1310601_1310678_1325582
834323	contig_13904_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_165508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	72	371	218105	217806	NA	30	TAGTGTGCAAAACCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTRPLPLLLWNLPLSPVCQVGSMSPKGTTGQAQRPHQASVTLLITLLSGPGNRAVSDLVSAWTAELSLRGGMQHSSSDWFPELRLECWCVTSQYKCTHPAHWRGPVPPCRPPCMESRKVRL	218176	216775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_216800_218200
834324	contig_8616_pilon	+	827	6	Intergenic	novelGene_72588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1179.18843277909	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	447	752	435878	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426886	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427047_427756_427821_427982_428115_435787_435900_435993_436119_436357
834325	contig_11364_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_65172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTTCATGTATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126773	127769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_126800_127800
834326	contig_10196_pilon	-	1115	5	Intergenic	novelGene_132345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	107.836392280157	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	138	332	2475895	2475701	TRUE	45	TAGTTTGAAAGTCAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGPAADAALEGAEAEARPEASEDNEDDDEALPHSEVVDVFQEGLAMVVQDPLLCDLPIQVRGRGGRAGVSPSRAGACADPEVLWALQPLGWRKHRAGPRRARSPACFCC	2476032	2473803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474169_2474605_2474681_2475090_2475197_2475338_2475430_2475554
834327	contig_4232_pilon	+	1439	2	Intergenic	novelGene_63167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	69	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	102	860	92129	92887	FALSE	35	GGTATTTCAATAAAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGEGRGGGAEPRQERSRARGWARAERSEGRRMEPGEEPEEEDSPGGREDGFTAEHLAAEAMAADMDPWLVFDARSTPASELDAWLAKYPPSQVTRYGDPGSPNSEPVGWIAVYGQGYAHNSGDVQGLQAAWEALQTSGRPITPSTLRQLAVTHQVLSGKWLMHLTPGFKLDHAWAGIARAVVVEGQLQVAKVSPRAKEGGRQVICVYTDDFTDRLGVLEADTAIRAAGIKCLLTYKPDVYTYLGIYRANRWHLCPTLYESRFQLGGDARGSRVLDRANNVELT	91321	93466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_91422_92127
834328	contig_5945_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_104533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTACAACTCATAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7655	8631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_7700_8600
834329	contig_2215_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_163857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTCTACTTTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209065	208212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_208200_209100
834330	contig_6083_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_177118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGTGGGGGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4710	3986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6083_pilon_-_4000_4700
834331	contig_2710_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_161773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCTCAGCTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936917	938222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_936900_938200
834332	contig_5210_pilon	+	878	7	Intergenic	novelGene_65447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	88.0714671918967	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	338	877	613119	616724	FALSE	70	GTGAAAGGAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITRTLMSFAALCAPEVISLINTRMLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRVTDLVLTPCNLQPAGILPSWSFLK	591289	616725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_591360_606728_606864_608380_608458_613063_613150_613250_613338_614670_614849_616480
834333	contig_3975_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_54679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	613	912	1044788	1044489	NA	25	AATGAATCTATTCTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNAVLAHLGSAQEMVDAALGVMKDIANDPDTSSPGQTSSALSTISYIKRLQVHHLPRFSLPTSFKVNTNTGYLGNTKHNISSVVIQDIWLRVSFCFF	1045400	1044400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1044400_1045400
834334	contig_19098_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_65776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	31	297	33907	33641	NA	60	AAAGGCAAGATATAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIQPRTQGECMRWVPANTGLGVTFMRDLKTGIRSLQNVHSLHPRNITRNAHRCITYEKMKQPKHPMTLHDIEYIFVYSYTLKRDAPINNHVYKEELMT	33937	33433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_33400_33900
834335	contig_11512_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_43250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	1	333	4023	4578	FALSE	20	GCTGGTACCACAGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYS	4022	4578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
834337	contig_13571_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_128136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCCTTGGTAAGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414593	415258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_414600_415300
834338	contig_12050_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_62595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285611	286999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_285600_287000
834339	contig_15039_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_110201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	58	300	423496	423738	NA	55	CCGAATTTCAATAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILCSSSKDHQDSSIEPQLPMVKMSSIVHPWTGLPSSVSLSKSPGPVSKDYFPKYTFCMQALFLVSAFRGSQGKTTCLFSLEHVHTCQPLSCGLETLQKL	423438	424028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_423400_424000
834342	contig_20614_pilon	+	722	7	Intergenic	novelGene_107548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088.01385050416	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	169	636	153826	155100	FALSE	30	CTGAAAAGATAGTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAYAVGVGAQLVLSQTVNQGATPGALLPVVIIAVGAFLFLVALVGCCGACKENYCLMITFAVFLSLIMLVEVATAIAGYVFRDKVISEFKKDFQKQMQTYPKDNQTALLLDGMQRDFKCCGADNYTDWENILVPKDRVPDSCCINVTQSCGLHFNVTNINTKGCVEKIGGWLRSSVLVVAAAALGIAFVEVLGIIFACCLVKSIRSGYEVM	152075	155186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_152084_153665_153835_154009_154085_154185_154282_154394_154533_154771_154856_155034
834345	contig_6175_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_16359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736938	1737651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1736900_1737700
834346	contig_5041_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_27028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	473	775	293079	292777	NA	15	CTCTCTGGCTTTGCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLFKLSKQHQLRFKQRSRMKSKENWRGLSRQTESVHTWEDARGLCRTLLPSAYPCAALHPSQPEQLCTDLFSLLNKAKIKRKTTSFDSPPSIKIQFLQ	293551	292744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_292700_293600
834348	contig_6805_pilon	-	1496	7	Intergenic	novelGene_163897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	39.6806697972143	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	552	1451	446270	432794	FALSE	60	TTTTAATAAAAATAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRKLCKSSESRGVNESYKFEFIELKKWLKDRKFEDPNLTPARFPGTGRGLMSKTSLQVGQMIVSLPESCLLTTDTVIRSYLGTYVTKWKPPPSPLLALCSFLVSEKHAGDQSPWKPYLETLPKTYTCPVCLEPKVVNLLPRPLRAKAQEQRAHVQEFFTSSRDFFSSLQPLFSEAVESIFTYSAFLWAWCTVNTRAVYLRHRQLGCFSAEPDTCALAPYLDLLNHSPGVQVKAAFNEETRCYEIIAASSCRKHEEVFICYGPHDNHRLLLEYGFVSTRNPHACVYVSRGWNQLWFYQ	448161	432748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_432998_434586_435017_436785_436875_440054_440093_442598_442695_446227_446383_447722
834349	contig_10377_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_115349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATTGTTAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120068	119868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_119900_120100
834350	contig_5832_pilon	-	1172	4	Intergenic	novelGene_134172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTAACAAAGACAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570680	565661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_565750_568816_568936_569378_569456_569792
834351	contig_5331_pilon	-	1561	10	Intergenic	novelGene_112844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_9	146.946702356104	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1386	175	1560	813351	798080	FALSE	80	TCCAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYTPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKCVPCPSHEKKIQLCLGTEMGGEEKEGGTSSLLLCHRQY	835937	798078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_798311_799347_799444_799920_800042_802651_802874_804438_804630_805851_806098_806907_807044_809720_809827_813314_813378_835789
834352	contig_5153_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_74321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAACTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461948	462323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_461900_462300
834353	contig_11855_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_67076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2076386	2075231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2075200_2076400
834357	contig_7810_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_144219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGTATCTGCCCTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344930	344555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_344600_344900
834359	contig_8907_pilon	-	300	3	Intergenic	novelGene_85797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1059.5	1339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178693	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588
834361	contig_15361_pilon	-	674	3	Intergenic	novelGene_167877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	651	junction_1	185.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	10	570	514053	504687	FALSE	35	AATGGTATCCCTTATAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAQMLLDQYRKKSKLFRTKVVLAPLGDDFRYSERTEWDQQFKNYQLLFDYMNSQPQLNVKIQFGTLSDYFDALDKADKNSGKSSQSVFPVLSGDFFTYADRDDHYWSGYFTSRPFYKRMDRVMESHLRTAEILYYFALRKAQKYKISKFLSSSHYTALSEARRNLGLFQHHDAITGTAKDWVVVDYGTR	514062	504582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_504874_508495_508699_513882
834362	contig_10732_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_114721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCCAAAAAAAAAAAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149866	148730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_148700_149900
834363	contig_16156_pilon	-	932	9	Intergenic	novelGene_137086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	48.9590070875625	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	119	823	655076	637307	FALSE	15	CGCTTGGTGTTATGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQTRERALDMQADEDTGDGLQSSHRMLSFSDALLSIIATVMILPVTHTKIYPEEQFDTTIRKLLATKIAVYLMTFLLVTVAWTAHIRLFQVVGKIDDILALLNLACMMTITFLPYTFALMVTFPDVPLGIFLFCVCVITIGLTQAVIVGYAFHYPHLLNQQIAHSAHKAAFRQHILGIVLRGPALCFVAALFSLFFFPVCGPSGCTVPGSHGPDHSVHFGEPRSRGEAVMH	658563	637197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_637406_644612_644778_645765_645850_646616_646653_647079_647132_649034_649133_654711_654751_654944_655108_658476
834364	contig_17518_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_117366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCAAGAAACTTAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153296	154259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_153300_154300
834365	contig_9014_pilon	-	1217	8	Intergenic	novelGene_106738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.157940944203	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	12	437	46682	44513	TRUE	20	AGAAGAGGGTGGGGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKAMPPPGKVPRKENLGLQCEWGSCSFVCSAMEEFCEHVTQHLQQHLHGSEEEEEEEEDDLLEEEFSCLWQECGFCSLDSSADLIRHVYFHCYHTKLKQWGLQALQSQADLSPCILDFQSRNVIPDIPDHFLCLWEHCELLRQS	46693	42095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_42279_42835_42957_43054_43194_43466_43559_44086_44240_44420_44531_44785_45016_46504
834366	contig_18391_pilon	-	965	8	Intergenic	novelGene_174099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.26778683805536	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	10	849	204585	186571	TRUE	40	AAGGTATTTGCGATGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPTFRAVGISPDQDLDVIEITENSQELRVQNSSGPCLSGSLVSLHCLACGESLKAPRVVGGEKASVDSWPWQVSVQYDRKHICGGSILDPHWILTAAHCFRKHLDVSNWKVRVGSDKMGNFPSLPVAKIFIIELNTMYAKEKDIALMKLQFPLTFSDTVRPICLPFSDEELAPATPLWIIGWGFTEQDGGKISDALLQASVQVIDSTRCNAEDAYQGDVTEKMLCAGTLEGGVDTCQGIRQPRTVVSEIEETNETSPSSAVLHRGEELRQRVQQLP	204594	183699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_183775_186529_186691_198487_198631_198855_198955_199784_199952_201030_201191_203446_203488_204475
834368	contig_6497_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_35595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTCATATGCATGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361555	360988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_361000_361600
834369	contig_3942_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_128854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTTAAAAAAAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414661	1415392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1414700_1415400
834370	contig_8269_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_106249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	720	1091	345066	345437	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGLTGAGGGKVIHCQESCRSMRKCCTAGGGRWVEDRREYKPAPRAVGSQGGLSRVCHAQIRAQSDRGVGRGQSTCLILVLIAHPHDGCRARPPLLLTFSLKWPAFLILYLNIFKRKPYTIS	344346	345833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_344300_345800
834371	contig_15888_pilon	-	1061	9	Intergenic	novelGene_84395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.303987350164	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	31	888	49714	37821	FALSE	5	CCTTGCGGTGCCTGTCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPCGSPVCAMDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGSLALAASAAAVDAVQAPECAAAAGGPGGPGPHQGLQQLAPAPLQEARLQELPEHLPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	49744	37647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38538_38666_42462_42548_42626_42774_42847_43021_43145_43222_46483_46515_49706
834372	contig_6871_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_21523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAGAGCGCCCTCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53735	52523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_52500_53700
834374	contig_11068_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_130543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGCAATAAAACTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133950	132613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_132600_134000
834375	contig_10732_pilon	+	916	8	Intergenic	novelGene_114748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	22.2499713368309	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	417	905	562816	570665	FALSE	10	GAGCCCTTCCAGGGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALPACLLRDVAQEALGVAVIGIDEGQFFPDIVEFSETMANAGKTVIVAALDGTFQRKAFGSILNLVPLAESVVKLTAVCMECFREAAYTKRLGSEKEVEVIGGADKYHSVCRLCYFKKSSSQPPGLDNKENCPVLGRPGEAVGVRKLFAPQQVLQCNSVH	558644	570676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_558741_558871_558904_560027_560139_560602_560773_562808_562903_569793_569884_570270_570391_570473
834376	contig_12139_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_146485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAGACGAGGATAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325055	325879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_325100_325900
834378	contig_11512_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_43325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGGAGGAAGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415756	417104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_415800_417100
834381	contig_15185_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_99420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATCTAAGAGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231406	230979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_231000_231400
834386	contig_13806_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_173663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	262	579	122567	122250	NA	25	TGTTAGGGGGAACACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHLTTAPPGLLSLAALKMASSSWIVRVGLEVEGEAGEDSVSGMRCEDPTGHAGFEEGRGRASERDLHMEEGATGQGVEAAPRGWKRQGNRFPGASRRNAALPTP	122828	121769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_121800_122800
834387	contig_13806_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_173662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121613	121345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_121300_121600
834389	contig_9177_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_32829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAATTGGGTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1784623	1781498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1781899_1784542
834390	contig_11677_pilon	-	297	4	Intergenic	novelGene_85928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8611.14638128978	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATATGCTTCTTGTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597300	594882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595224_595714_595830_597234
834391	contig_10000_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_139321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTTTTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194970	196425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_195000_196400
834392	contig_3602_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_60589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATTTGCTCTGTAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682448	681231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_681200_682400
834393	contig_13547_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_104873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80954	79572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_79600_81000
834394	contig_2704_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_75295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCAAAGGATGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52821	52467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_52500_52800
834396	contig_3942_pilon	+	691	6	Intergenic	novelGene_128699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	528.337770748978	3	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	233	517	428548	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPASPPRWSWPGFCRSWRCCCYYRAPRRRARPRRGRSTSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426569	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426687_428261_428323_428493_428587_429453_429583_429798_429853_429936
834397	SIRV6	-	258	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-91	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1515_1631_1736_1847
834398	contig_5816_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_158236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAAGCAAGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50313	48827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_48800_50300
834399	contig_3475_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_177125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACCAGAACATCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526294	526638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3475_pilon_+_526300_526600
834401	contig_1428_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_158395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTATATAATTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93193	94283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_93200_94300
834402	contig_4469_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_21877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCGATTTACATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191658	190057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_190100_191700
834404	SIRV4	-	455	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTACTTAAGAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3600_4100
834405	contig_5551_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_134220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAAACATTTAAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113545	114460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_113500_114500
834408	contig_16228_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_147940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGAAATTAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47774	48808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47800_48800
834409	contig_19377_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_174105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCTGCTTTCATCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7610	9346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19377_pilon_+_7600_9300
834410	SIRV6	-	322	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-287	-131	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGGGCTGGTTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2107	1675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
834411	contig_17500_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_157925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAATTCTTTTGCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258138	257672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_257700_258100
834412	contig_13780_pilon	+	1487	12	Intergenic	novelGene_149090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCAACTTCACTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676159	727460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_676618_684610_684750_685234_685351_685722_685834_686093_686212_686409_686641_688701_688754_694780_694860_699204_699266_702164_702213_713180_713235_727440
834415	contig_10940_pilon	-	802	5	Intergenic	novelGene_49268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1110.34251472237	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	355	576	893258	875564	TRUE	25	TGTATTGGGGTTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVLAVAVPAASPPPARPRRLPRSLTPRLGRSGSLACFWGGSFAAALRRWPQGSTKRLAGQRTTWCATTARPSSGERSPRDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917146	874111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874200_875425_875675_893147_893306_916664_916733_916907
834417	contig_6397_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_146226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAGAAGAGATTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243109	243824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_243100_243800
834418	contig_5999_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_45642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTCCCAGCGTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238067	237559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_237600_238100
834419	contig_6102_pilon	-	1067	9	Intergenic	novelGene_32328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	106.604115774205	7	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	35	958	1691438	1682503	FALSE	15	TCCATTCTTCAGTTCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEEEVSGGEKMGRGTGRLTTSFFPFPGRQSPSPSCQSPPCTVTWWNFAAVPGPHPQALHAPPLQRLDSWEQHLDPSSGRCFYINSLTGCKSWKPPRRTCSRETNPGSMEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQGSRCLCGQTCRLDTSEPPPALQPPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELRLSS	1691472	1682393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1682517_1689183_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1690853_1690968_1691159
834420	contig_11115_pilon	-	1694	3	Intergenic	novelGene_102868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	44	87	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	24	572	213706	212895	FALSE	10	GCCTACGCCTTGTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPTSAQMPASKAQFSFNASAKDNGRSFSCSAALEVAGQVLYKNQTQQLQVLYGPRLNEEDCPGNWTWQEGSEKTLKCQAWGNPPPKLDCHRKGDKVSLPIGDLRPVKREFAGTYLCQAVSVRGEVTRQVVVNVLYHQNNLAIIITVAAVAILGLAGIAGYLYNRQRKIRKYKLQKAQEEASMKMNTPP	213729	211772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_213059_213138_213388_213570
834421	contig_11448_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_66410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	971	1288	524120	523803	NA	75	AAAAAAAAAATCCCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPKSKLCHLKEDYAKSNLKVMNERANMICFKESWLEKDLILALTRILLNVGRVGYTFPKIPAFSSSSLMLSKEQGATSFSFITRPYFLSSAPSFFLFFIILRL	525090	523096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_523100_525100
834422	contig_10642_pilon	+	1016	2	Intergenic	novelGene_78672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTGGGAGGCAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177988	182078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_178084_181157
834423	contig_16204_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_154507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGTTAGTACACATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280075	279402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_279400_280100
834425	contig_10126_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_105773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCTGCCTGGAACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191261	193054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_191300_193100
834427	contig_12841_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_55884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTACTTCATTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842560	844024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_842600_844000
834429	contig_3426_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_57967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGAACTGCCCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517274	518235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_517300_518200
834430	SIRV5	+	349	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	27	7586	7	-193	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
834431	contig_11978_pilon	+	1256	9	Intergenic	novelGene_62926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	45.2299679416203	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	44	1036	871474	884325	FALSE	10	CCAGACTTTGGCCTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEEPRGRLEAEDIMPERQEGHLLKKRKWPLKGWHKRYFVLEDGILHYATTRQDITKGKLHGSIDVRLSVMSINKKAQRIDLDTEDNIYHLKIKSQELFQSWVAQLRAHRLAQRMDMPRGPLPSTTHWKVAGGQLSTAGNTSALPGIGPREKVSSWLRDNDGLDRCSHELSECQGKLQELHRLLQSLESLHRIPSAPVIPTHQASATTERPKKGKRTSRMWCTQSFAKDDTIGRVGRLHGSVPNLSRYLESRDPSGPRGLPPPDYAHLQRSFWALAQKVGPWKSLPSYWIPLPNCKTPAAFISPSSSGILQPQLRGSPPSGRSLSKSGEWTSRKGNWLRPTRRE	871430	884545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_871540_871725_871780_872331_872446_872795_872907_873020_873139_873821_873926_874287_874381_874465_874599_884125
834432	contig_19579_pilon	-	847	6	Intergenic	novelGene_59401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	562.77647427731	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	88	678	13090	7943	FALSE	35	CCATTAAATATTTTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13177	7773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12900
834433	contig_5451_pilon	-	1739	3	Intergenic	novelGene_167165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_2	4.5	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	78	581	376008	309127	FALSE	15	GTACAACTTGGGTCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVHCFHYLIPLAKEGNYAIVANVESMDYDPLVVKLNKDISAIEEAMSASLQQHKFQYIFEGLGHLISCILINGAQYFRRISESGIKKMCRNIFVLQQNLTNITMSREADLDFARQYYEMLYNTADELLNLVVDQGVKYTELEYIHALTLLHRSQTGVGDQTTQNMRLQRLKEIICEQAAIKQATKDKKITTV	376085	307968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_309365_372162_372323_375902
834434	contig_16525_pilon	-	350	3	Intergenic	novelGene_133844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3625	junction_2	351	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178683	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588
834435	contig_18642_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_176798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATGGAGTTGTTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21523	19887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18642_pilon_-_19900_21500
834436	contig_10864_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_107117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACAGCGGGCAGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123496	1122671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1122700_1123500
834437	contig_10531_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_114527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTATGGTCACCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451150	449398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_449400_451200
834438	contig_16714_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_161558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATGTTCAAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578677	579967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_578700_580000
834439	contig_12142_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_147833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGATAATAATAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197474	198901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_197500_198900
834440	contig_804_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_138782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28135	29622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_+_28100_29600
834442	contig_5084_pilon	+	824	5	Intergenic	novelGene_64672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	716	junction_1	1277.19037343694	7680	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	28	360	1751485	1755688	FALSE	25	GTAATCTCATGGTTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLESEQFLTELTRLFQKCRLSGSVFITLKKYDGRTKPIPRKGTVDSFEPSDNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMAYSNLLRANMDGLKKRDKKSKSKKSKAAQ	1751457	1756152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751509_1751646_1751720_1752165_1752279_1754409_1754443_1755598
834443	contig_14450_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_49061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465076	1466417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1465100_1466400
834444	contig_5732_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_119589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGCTTATAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271819	270696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_270700_271800
834446	contig_13592_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_33683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGTAATAGATGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58669	60236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_58700_60200
834447	contig_5765_pilon	+	1381	2	Intergenic	novelGene_141419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACACGTATAAGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918222	919759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_919307_919462
834448	contig_7909_pilon	+	1796	7	Intergenic	novelGene_155887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1097	1402	218978	223089	TRUE	20	ACCCAGGCCTCCAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWLMAAADSAYTKADSRVPLQVKQVVGGELDGGAVPAHVCEGPAASLRDLAGGMHDGVHELQVAAAQLHLCRHQALQLLAVLRLVQHQGHRRLGQRPGKS	209682	233068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_210541_215653_215867_218952_219036_220622_220856_223074_223232_230555_230738_232998
834450	contig_5887_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_175120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9428	10851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5887_pilon_+_9400_10900
834452	contig_14968_pilon	-	662	2	Intergenic	novelGene_177126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCCTAATGGGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52806	51969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14968_pilon_-_52496_52670
834453	contig_11601_pilon	-	881	3	Intergenic	novelGene_141037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGTGAACAAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105405	103258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_-_103755_104165_104243_105097
834455	contig_9527_pilon	+	1202	6	Intergenic	novelGene_134069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	49.8742418488743	191	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	78	728	486523	487885	FALSE	40	TGAAATCTTACATAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTDGPKDTSVEDALERTYVPRLKTLEEEVMEAMGIQETRKHKKVYWY	484663	488359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484732_486513_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487748
834456	contig_16578_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_148659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAATCTTTTCCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200181	202161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_200200_202200
834457	contig_3382_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_124009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGTCTCAGTAGCGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117105	117877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_117100_117900
834458	contig_2596_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_53447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26854	27489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_26900_27500
834459	contig_17311_pilon	-	264	4	Intergenic	novelGene_57831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	6498.06837965458	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123392	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344
834460	contig_7398_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_166167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAATATCAGCAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171003	170625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_170600_171000
834461	SIRV6	+	428	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	339	0	173	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
834463	contig_5718_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_110313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGTTTGTTTCTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447056	447998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_447100_448000
834464	contig_4732_pilon	-	181	2	Intergenic	novelGene_75410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAACCCGCCGGGGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525119	524534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_524668_525071
834465	SIRV6	+	302	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	547	24	381	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
834467	contig_6182_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_171654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTAATTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150871	149270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_149300_150900
834468	contig_14450_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_49033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263719	1265247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1263700_1265200
834469	contig_7914_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_165033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTGTTTCTCTGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182799	183728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_182800_183700
834470	contig_8652_pilon	+	1314	9	Intergenic	novelGene_168785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.9142803193777	157	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	171	1064	663643	673875	FALSE	45	TGCCAGGAATCAAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRHPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQFMDSSLVKSYLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLVYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM	660280	674125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_+_660355_661521_661593_663617_663680_668244_668402_669271_669396_670555_670727_671699_671864_671986_672129_673776
834471	contig_12622_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_5818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGTTGGGAGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389911	388681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_388700_389900
834472	contig_5815_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_141201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTAAATGTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387839	386762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_386800_387800
834473	contig_11855_pilon	+	1100	2	Intergenic	novelGene_66939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	387	1100	1003891	1004604	FALSE	30	CAGCAGCAGCAGCCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQP	1001609	1004604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1001853_1003747
834474	contig_3815_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_177129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGCATATAAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180327	178333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3815_pilon_-_178300_180300
834476	contig_10042_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_79189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTCCAAATTTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900852	902677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_900900_902700
834477	contig_3269_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_117013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGATTAGGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68334	68806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_68300_68800
834478	contig_6048_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_73129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGTCTCTTGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952759	951116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_951100_952800
834479	contig_14923_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_157763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCTAAATTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538534	537400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_537400_538500
834482	contig_10711_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_118420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCCTCTTGCTTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383770	381786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_381800_383800
834483	contig_5041_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_27125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGTGATAAAGCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764830	766770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_764800_766800
834484	SIRV2	-	398	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	106	-321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATCTACATACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5789	3986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4340_4480_4687_4801_5751
834485	SIRV6	+	319	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	554	0	388	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1691	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
834486	contig_12644_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_44532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAACAGAAGGAAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432776	1431895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1431900_1432800
834487	contig_9535_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_124504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCGTCACAGAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635497	634297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_634300_635500
834489	contig_8954_pilon	+	1672	5	Intergenic	novelGene_130318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTTTCTTTACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654503	665075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_655079_655436_655723_658639_658799_662530_662615_664507
834490	contig_6654_pilon	-	1031	3	Intergenic	novelGene_85695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAGAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102086	98280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_99256_99423_99459_102065
834493	contig_12884_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_104981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCTACCTCACTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866061	866399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_866100_866400
834494	contig_10196_pilon	+	965	4	Intergenic	novelGene_132184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.49691252107735	143	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	1083823	1084451	TRUE	35	TGACAGAGTGAAGACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICLVLSIFANLFPAGCTGVHERTFVAVKPDGVQRRLVGEIVRRFERKGFKLVALKLVQVRAGPARPRDRGGAVADPSFSTGFGGATARTLFRAARAALLRPPGALHGIRAGGGHGVAGAGRGARFAGAHRGHRPS	1083822	1085125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1083866_1084014_1084315_1084386_1084500_1084616
834496	contig_11378_pilon	+	743	6	Intergenic	novelGene_112307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_3	242.801153209782	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	364	741	1077725	1079604	FALSE	40	AAGCCTTCCAGAGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRPTPQNDAVTVHFKPITLKASESKYTKVASISFDASKARKTSQCSGKITVKAKEKSYSKLEIPYQAEVLDGYLGFDHAATLFHIRDSPADPVERPIYLTNTFNFAILIHDVLLPEEAKTMFKVHNFSKPVLILPNESGYIFTLFFMPSTSSMHIDNNILLITNASKFHLPVRVYTGFLDYFVLPPKIEERFIDFGILSAAEASDILFAIINSNPIELAIKSWHIIGDGLSIELVAAERGNRTTII	1073344	1079606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1073454_1076699_1076809_1077579_1077734_1077823_1077995_1079315_1079427_1079517
834497	contig_5389_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_143035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTCTTTTTCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470902	470431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_470400_470900
834498	contig_15442_pilon	+	1211	2	Intergenic	novelGene_119148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260059	262907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_260816_262452
834501	contig_8259_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_148890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTCAAAGAAAAACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289520	287548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_287500_289500
834502	contig_10235_pilon	+	492	5	Intergenic	novelGene_46306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1374.84969633048	139	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	87	413	88925	91792	FALSE	10	CCACCTGTGTCTCAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKLWGPRHSLMPHFSPSPTCEEQLSTPGELCIYAAPALGGLLLLVMIILSTCLCWLHRRVKRLERSWRLPGTGGAEGLDLSEGDGKDAKEDPSADYACIAKKKPT	88473	91871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_88536_88900_89016_90395_90492_90833_90857_91675
834504	contig_7119_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_41036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	572	880	406713	407021	NA	25	ATATTTTTCACAAGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSMNVNGIIGSVAEFLPSKQETQVQFLTNAPYVQPPLSLPHLHHVLSGTGSSGAIRPKDVPSYNGNHTRNGLRLQPLGTSSGRHRDTEKVPCADVNRLIRA	406141	407773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_406100_407800
834505	contig_18538_pilon	+	1294	2	Intergenic	novelGene_163884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9245	15661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_+_9446_14567
834506	contig_10013_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_125041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	5	307	188695	161752	FALSE	10	CCAGGGCCCGGCGTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRANCDKVHKVLGKMQVLNKWYSLPLLSSALAHLSSQTPACSSLVVEKKSEFSRLQCPGQEPLLLLVAEAAAPESKGWTHGLESEPMELCPRCCGCPLGN	188699	161691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_161797_188437
834507	contig_14679_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_174189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221737	220457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_220500_221700
834508	contig_8060_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_104831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175318	176508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_175300_176500
834509	contig_16548_pilon	-	2365	1	Intergenic	novelGene_167094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33090	30725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_-_30700_33100
834510	contig_12125_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_76215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216318	218436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_216300_218400
834511	contig_13300_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_125835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGGCAGGGGATGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159750	1161681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1159800_1161700
834512	contig_12074_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_53780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTATCTTTTACTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59207	60827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_59200_60800
834514	contig_14123_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_177132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCCCTCCGCCTCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220484	219603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14123_pilon_-_219600_220500
834515	contig_5429_pilon	+	1127	2	Intergenic	novelGene_127822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGGAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597273	598790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_598213_598602
834516	contig_16685_pilon	+	1404	9	Intergenic	novelGene_115058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_7	111.48815800344	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	106	1167	589300	597722	FALSE	25	GGTTTCAGCGAAGTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDKPSSRFHDFVDLCCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELSDLEDLKYVYDALRPQDTEANATTYFTRLIESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFAPRTHTLKSSGRITDVFLCRHEKVFHPSKGYIYMVKVMRENVHEAAYIQRTFEEFQELHNKLRLLFPSSLLPSFPSRFVIGRSWGEAVAERRREELNGYIWHLIHAVPEVAECDLVYTFFHPLPRDEKAIGASPAPKSSDGSWARPIGKVGGEVKLSISYKNNKLFIMVMHIRDLQLLQDGNDPDPYVKTYLLPDPQKTTKRKTKVARKTCNPTYNEMLVYDGIPRGDLQQRELQLSVLSEQGLWENVLLGEVHIRLRELDLAQEKTGWFALGSRSHGTL	588825	597959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_588931_589299_589410_590386_590589_590971_591097_591960_592079_594187_594270_594717_594825_596890_597020_597533
834517	contig_4732_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_75508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATGACCATATTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102452	1101648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1101600_1102500
834519	contig_15105_pilon	-	1127	5	Intergenic	novelGene_150935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGGTTGAATCTACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283501	272604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_272730_280536_280726_282261_282397_282604_282794_283012
834520	contig_15105_pilon	-	867	5	Intergenic	novelGene_150934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAATTTGTTGACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272653	262727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_262874_264574_264879_265893_266155_267663_267742_272575
834521	contig_17880_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_167328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGTTATCTAGAAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29475	30417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_+_29500_30400
834522	contig_9440_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_59045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTCACTTGTCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410908	409688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_409700_410900
834523	contig_2733_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_128585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	307	642	835052	834717	NA	50	CAACATCCACCCAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSLPYYEAPFPAFISALTATNYTILQLNTGPLSFHLHAKSNQITLVTSGHVTSTCSFGWMPLTKAICFPQSAFKHSQHLRCSVLWFLLSNQCKTASKTLHIFQICLNQR	835358	834226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_834200_835400
834524	contig_3817_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_78354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576241	577834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_576200_577800
834525	contig_19850_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_170861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTACTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40280	41026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_+_40300_41000
834526	contig_12046_pilon	-	1847	7	Intergenic	novelGene_83474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_3	55.0739401976006	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	99	875	345717	329082	FALSE	45	AAATGGTTAGTATTAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLTVLLHGGPRGRSPLLQRLMQEIRYMKRSYVVKPTLNEVVIVSAIRTPIGSFLSSLSSLPATKLGTIAIQGALEKAGIPKEEVKEVYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCTTINKVCASGMKAIMMASQNLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGATPYGGVQLEDLIVKDGLTDVYNKIHMGNCAENTAKKLNISRDEQDTYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTISVKGRGIMSQSRSNFYST	345815	328109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_329280_329920_330065_331755_331857_332089_332186_332477_332596_338465_338514_345645
834530	contig_11677_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_85913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	16	591	575633	575058	NA	30	TGCTTAGTGACAGAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPHLAMMCALVSRQRQELQELRRELEELSVGSDGVLIWKIGSYGRRLQEAKAKPNLECFSPAFYTHKYGYKLQVSAFLNGNGSGEGTHLSLYIRVLPGAFDNLLEWPFARRVTFSLLDQSDPGLAKPQHVTETFHPDPNWKNFQKPGTWRGSLDESSLGFGYPKFISHQDIRKRNYVRDDAVFIRASVELPRKILS	575648	574618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_574600_575600
834533	contig_15067_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_154347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAGTCAGGATCGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246250	245141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_245100_246200
834534	contig_17158_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_141139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAACTTAAAACTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73249	71996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_72000_73200
834535	SIRV4	+	335	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCACAAACTGCACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_4000
834537	contig_13301_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_153130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGAGTCAGAGCAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175048	175586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_175000_175600
834540	contig_20939_pilon	-	844	2	Intergenic	novelGene_172448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTGGCAGTCTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144273	139040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_139867_144255
834541	contig_2776_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_175038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCTTGTCCTCAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8274	8879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2776_pilon_+_8300_8900
834542	contig_6488_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_44777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGGATCATTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269944	271836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_269900_271800
834543	contig_10990_pilon	+	595	4	Intergenic	novelGene_7523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.445906426088	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGTTTTTATTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783849	790119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_784099_785394_785458_786477_786557_789915
834544	contig_5643_pilon	+	494	6	Intergenic	novelGene_38791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1928.17627824844	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	69	494	233973	238195	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKGRERPSQLLGSPCPNSIQHTENLPSSTQLPSVPPEEGVRGLESPTLSCTINKVYCTQP	233606	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236440_238020
834545	SIRV6	+	452	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	31	2	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	423	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
834547	contig_16775_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_107746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGGAGGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83799	84716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_83800_84700
834549	contig_4604_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_19120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAGGGGATGATGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24279	26318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_24300_26300
834551	contig_10985_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_175546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177977	176357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_176400_178000
834552	contig_12626_pilon	+	928	6	Intergenic	novelGene_80423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_1	229.022269659525	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	23	856	107206	155805	FALSE	60	ACTGAAAAAGAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQVRNNRK	107183	155877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637
834553	contig_16411_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_77373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGGAGGGAAAACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318170	317635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_317600_318200
834554	contig_7870_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_109085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATGTAAATAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790992	790348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_790300_791000
834555	contig_17130_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_176544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGAAGAATAAACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6128	7396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_+_6100_7400
834556	contig_4213_pilon	-	708	5	Intergenic	novelGene_124824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	142.037627057058	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	55	516	165961	156991	FALSE	25	TAAACGCTATTTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDIVYADIKISPLEQSSTLQKPESHHHGIFLKAGCAMIIILLLIVILLSIFVIQFNYARHNEVNNESVKKNSTAKNSSKIIISTASSNSSIVHQLCPSKDWISHGGKCYWIAKNTQSWSKSQDDCAMKNSHLFVIQDVIDMWILAAYQISF	166015	156798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_157024_157247_157418_159434_159534_162609_162697_165888
834557	contig_13707_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_43516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113937	112171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_112200_113900
834558	contig_14666_pilon	+	1657	12	Intergenic	novelGene_39483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	47.5415433816303	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	331	1566	60267	77022	FALSE	5	GATGGGTTTTGGTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVGLQFQASAGDADPQSRPLLLLGQLPHLHRVPWSHVRGKLQPRVTEELWQAALSTLNPNPTDSCPLYLNCATVAALPSRVSRHNSPSAAHFVTRLVRTCLPPGTHRRILMVCERSDVFASACALARAFPLFTHRSGAARRTEKKTVTVEFFLVGQDNGPVEVSTLQCLVNATEGVRLAARIVDTPCNEMNTDTFLEEIKKVGKDLGITPAIIRDEELKTRGFGGIYGVGKAALHPPALAVLSHTPEGATQTIAWVGKGIVYDTGGLSMKGKTTMPGMKRDCGGAAAILGAFRAAVKQGFKDTLHAVFCLAENAVGPSATRPDDIHLLYSGKTVEINNTDAEGRLVLADGVVYACKDLGADIILDMATLTGAQGIATGKYHAAVLTNSAEWEAACVTAGRKCGDLVHPLVYCPELHFSEFTSAVADMKNSVADRDNSPSSCAGLFIASHIGFDWPGVWVHLDIAAPVHAGERATGFGVALLLALFGRASEDPLLNLVSPLGCEADTQAEDMERDSKRRRLV	58714	77113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_58859_59608_59795_60266_60438_62131_62222_62576_62659_65535_65679_69922_70001_74559_74661_75380_75505_75696_75874_76242_76354_76863
834561	contig_3754_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_146825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGCTTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162302	164474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_162300_164500
834562	contig_6208_pilon	+	1740	2	Intergenic	novelGene_52985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	39	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTTATAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374132	375930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_374700_374757
834563	SIRV5	+	409	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7462	1	-69	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTCTTTTGTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
834564	contig_19730_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_142500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTCTGTGTCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174515	173590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_173600_174500
834565	contig_15384_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_85107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1568	1900	17998	18330	NA	60	AAAAAAATGTTGAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALQDGIWGAGFLPRCFYRSRGMLNLQQTLLSRSAHPWTEHVDPSGRQQLGYSILCLVPCTHTVTMHLQVASECGTLANRSTSRRAKSRTWHLQMSTGVWVVRVSGLDT	16430	18638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_16400_18600
834568	contig_2364_pilon	+	1287	11	Intergenic	novelGene_170826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	6.58862656401165	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	405	1286	125989	187065	FALSE	35	TTTCAGGAACAATTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIKQDGQSLGIRIVGYVGNSHTGEASGIYVKSIIPGSAAYHNGQIQVNDKIVAVDGVNIQGFDNKDVVEVLRNAGQVVHLTLVRRKTSLFDPPLEQPSDRGASVEPPKIPALFLTGAVETETNLDDEDEEIEERMDNQKNDNIQVLEKLERVPDSPENELKFRWENLLGPDYEVMVATLDTHIADDAELQKYSKLLPIHTLRLGVEVDSFDGHHYISSIVPGGPVATLNLLQPEDELLEVNGVQLYGKSRREAVSFLKEVPPPFTLVCCRRLFDDEASVDEPRATEPSLLELEVDHNIDVNTEEDDDGELALWSPEVNIVELVKDHKGLGFSILDYQDPLDSTKSVIVIRSLVADGVAERDGGLLPGDRLVSVNEYCLDNATLAEAVEVLKAVPPGTVRLGICKPLVEDEKEESHCILHSSNNEDKPE	116804	187066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_+_116874_120012_120105_122551_122694_125887_126035_128544_128622_131159_131217_145587_145723_156661_156824_160568_160701_182340_182551_187002
834569	contig_18208_pilon	+	778	2	Intergenic	novelGene_176175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAAGGTCCATGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142732	146395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_143178_146062
834570	contig_14341_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_111774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTTTTAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307649	305941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_305900_307600
834571	contig_7396_pilon	-	816	6	Intergenic	novelGene_79593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2319.55068062761	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	21	350	248917	247733	TRUE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVSLDLTTSVGGWVIIIPMQGVVAHMVILVDLLLLHK	248937	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246001_246260_246476_247186_247357_247718_247802_248510_248608_248753
834572	contig_5020_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_27964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGTCATCTCATCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915695	913612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_913600_915700
834573	contig_19743_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_173164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCTTTTGGAATAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292779	292325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_292300_292800
834575	contig_2414_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_158513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTACTTTACCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511901	510812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_510800_511900
834576	contig_16883_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_161750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTTCAATTATAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518800	517856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_517900_518800
834577	contig_16883_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_161749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAGAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517332	516757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_516800_517300
834578	contig_5136_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_126641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAGCCGTAGATGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304021	304636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_304000_304600
834579	contig_8182_pilon	-	1835	12	Intergenic	novelGene_173260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	35.0428309358705	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	533	1153	344519	288174	TRUE	55	AAATAAAATTATATTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICNHEKCNSADQRAQAAFGEYRQDCPVASLCP	417491	254675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_254902_260075_260145_272882_273131_280197_280330_288166_288265_293604_293787_332473_332654_344351_344544_360798_360856_377443_377624_416836_416916_417299
834581	SIRV5	+	364	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	169	135	55	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8370	11007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858
834584	contig_15689_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_164160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	321	452	174683	174552	NA	40	TAAGAAAACATCAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQNQASIQFCGVAQHPILQLDWGQRGVPPAGASSISLGQSAPAQCSGFGETEGAHGCGGRGKASGYSPCQAQPRWSTVRPVQHPQKVEPRTLDPDTVLYTHSLLIDMVSFQRPGHYVKIGLMLKWKITTSDHKREDDYIITQLPHSITT	175003	172757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_172800_175000
834586	contig_13044_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_99998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACCTTTAGCAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203836	202569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_202600_203800
834587	contig_6439_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_154242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCCCTAGCTTTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372023	370251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_370300_372000
834588	contig_17382_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_165192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAGTAGAGCGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61474	62220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_+_61500_62200
834589	contig_4845_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_53716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATTGCTAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033969	1032770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1032800_1034000
834591	contig_10016_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_117859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTCCCGTAAGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341462	342129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_341500_342100
834592	contig_1836_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_71058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTATCAGGGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886616	886367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_886400_886600
834593	contig_1836_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_71057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAACTACGACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885805	884891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_884900_885800
834594	contig_10756_pilon	-	1778	9	Intergenic	novelGene_170671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.5566048824937	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	630	1694	261672	140945	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQPIFSTRAHVFQIDPNTKKNWVPTSKHAVTVSYFYDSTRNVYRIISLDGSKAIINSTITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVYGLGFSSEHHLSKFAEKFQEFKEAARLAKEKSQEKMELTSTPSQESAGGDLQSPLTPESINGTDDERTPDVTQNSEPRAEPTQNALPFSHSSAISKHWEAELATLKGNNAKLTAALLESTANVKQWKQQLAAYQEEAERLHKRVTELECVSSQANAVHTHKTELNQTIQELEETLKVKEEEIERLKQEIDNARELQEQRDSLTQKLQEVEIRNKDLEGQLSDLEQRLEKSQNEQEAFRNNLKTLLEILDGKIFELTELRDNLAKLLECS	262301	140860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_141134_149802_149884_150515_150627_154298_154456_194825_194966_204673_204767_208635_208768_214417_214575_261667
834595	contig_4426_pilon	-	1175	2	Intergenic	novelGene_15381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGGTCAGAATGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341578	334748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_334839_340493
834597	contig_16210_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_147682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAGCCAAGCAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74103	74337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_+_74100_74300
834599	contig_5253_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_61561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTGAAAAAATCTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193292	192499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_192500_193300
834602	contig_7056_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_43737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGAATAACAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088562	1090185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1088600_1090200
834603	contig_3130_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_103555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGGAGATTATAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32330	33170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_32300_33200
834604	contig_6576_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_42300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAATAATGCCTAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455701	457253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_455700_457300
834605	contig_10311_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_50494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239681	238285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_238300_239700
834606	contig_6364_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_51697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGACTTTGCTCAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333350	333702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_333400_333700
834610	contig_7182_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_117102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAGAAAAAAAGAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104690	103672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_103700_104700
834611	contig_19155_pilon	+	963	8	Intergenic	novelGene_173364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	75.8150273187772	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	199	963	480493	601738	FALSE	50	GTAATAAAAGTACACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDDDFGGFEAAETFDSGNGETQTISPAIPWAAFPTVSGVHLSPASPEIVLDNDHSLPSVGCLSSDPIVSSPENTHADNSIVGQTVPKAQIQQSTHTHLDISLFPLGLTDEKSNGTIALVDDSENPGANVSNIQLQQKISSLEIKLKVSEEEKQRIKKDVEALMDKHSILEKGFLKEKEQEAISFQDRYKELQEKHKQELEDMRKAGHEALSIIVDEYKALLQSSVKQQVEAIEKQYISAIEKQAHKCEELLNAQ	378483	601738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_378668_480478_480523_483087_483167_527704_527866_529045_529250_530637_530743_570474_570553_601630
834612	contig_12852_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_141455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTACAGGACAAAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566558	565835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_565800_566600
834613	contig_2161_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_114930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTTAGTGAGCTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842506	842871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_842500_842900
834614	contig_5910_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_168425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTAGCATAGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165815	164760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_164800_165800
834615	contig_5575_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_122059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGAGGTTAGAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206518	207930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_+_206500_207900
834618	contig_20951_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_43106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTAGGTGGGGAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127144	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_127100_127700
834619	contig_19132_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_170000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAAGTTATGTATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386574	385828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_385800_386600
834620	contig_2757_pilon	+	2228	7	Intergenic	novelGene_164566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	867	1499	19880	20512	FALSE	10	CCAGGGTTGTGTCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFMHGYHVYYYIFTDDPAAMPHVPLGPGRLLSVIPIQGYSRWEEISMRRMETISQHIANRAHREVDYLFCLDVDVVFRNPWGPETLGDLVAVIHPGYYAVSRQQFPYERRQVSAAFVEDNEGDFYYGRAVFGGRVTRVYEFTRGCHMGILADKANGIMAAWQEESHLNRRFISHKPSKVLSPEYLWDDRKPQPPILKLIRLSTLDKGTK	13444	21241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_13573_14460_14654_15196_15263_17397_17542_17622_17659_18710_18846_19715
834621	contig_7066_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_42180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	465	257	721	957368	956904	NA	50	AAATGGAGCAAGTGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGKAEHWGQAGLEGRGRQQLLGWLEAQGKGLFPLELPSWTDFLMSLPPLPFFHTEAVAPQSLRGFHPGSALWPLSLEVGACPITHRKVKAKGEFKDRLYKKPKAEACLKKGLSHLGPLRLIGEQQMLEGMGDARLEKPLLRSPPPPSWTQSQI	957624	956903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_956900_957600
834622	contig_17005_pilon	-	1394	4	Intergenic	novelGene_129901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	30.169889330626	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	142	1044	21134	18884	FALSE	40	TGCATGCAATAAAAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPGRVGIAGSFSEETLQRCNDGNLQKPVSRNLDDGEKLSTENIIVRFMKSDTWPSMVGGICKLHGIEDQDNNQKTCVSMLPIFNRRHMVENLCENNEDSPCGQTFSQIPNLSVLKRTPMEAYPSECLECGKSLMDHSSLKHHISSHSGCSASQHKECGEDCSCPSYLSTPMRTLTGEKRHECKECGKAFSQSSHLTSHIRSHSGERPYECKECGKAFGHSSNLTIHMRTHSGERPYECKECGKAFHKSSNLTIHMRIHSGERPYVCKECGKTFNRSSHLTTHIRSHSGERPYECKECGSTFHHSSSFTRHIRIHSGERPYECKECGKAFRWSSHFTKHMRTHSGERP	22289	18533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_-_19002_19423_20117_21042_21194_22207
834623	contig_4769_pilon	+	2142	20	Intergenic	novelGene_118016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	442	771	1102760	1127776	TRUE	40	AGAAACCGACGGGGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKFRIWSPGVLSCMEDWSRPTSVKPTLSVHCTRATSSGLDAWYTRQESSYCFSASACSVTPLDSYTGVTLWQRAMAFTASCTRLLMVRRTLVVSVGPFWAGGSWDCWV	1088266	1213781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1088303_1091795_1091968_1093375_1093461_1094774_1094867_1102703_1102865_1116421_1116637_1127766_1127879_1129135_1129280_1130772_1130936_1132354_1132426_1139414_1139494_1141095_1141177_1146645_1146744_1148730_1148784_1150091_1150151_1162701_1162811_1167692_1167796_1173194_1173313_1176361_1176500_1213728
834625	contig_6440_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_161678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	54	683	132110	131481	NA	20	TTGCTAATACTGCTGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPTRDFVVGALILRSIGMDPSDIYAVIQIPGSREFDVSFRSAEKLALFLRVYEEKREQEDCWENFVVLGRSKSSLKTLFILFRNETVDVEDIVTWLKRHCDVLAVPVKVTDRFGIWTGEYKCEIELRQGEGGIRHLPGAFFLGAERGYSWYKGQPKTCFKCGSRTHMSGSCTQDRCFRCGEEGHLSPYCRKGIVCNLCGKRGHAFAQCPKAVHNSVAAQLTGVAGH	132163	130007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_130000_132200
834627	contig_1406_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_25530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGGCCAGTTTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2135491	2135279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2135300_2135500
834629	contig_5018_pilon	-	881	6	Intergenic	novelGene_47033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	215.167469660263	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	411	773	1394371	1392342	FALSE	80	AAAATCAAAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1395508	1392233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394422_1394879_1395016_1395148_1395205_1395340
834631	contig_10774_pilon	+	1831	1	Intergenic	novelGene_158685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54824	56655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_54800_56700
834633	contig_3469_pilon	-	896	8	Intergenic	novelGene_34147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	27.1315766032789	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	118	894	301073	263275	FALSE	5	GGTTCCCTTCTTTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPFWNNIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFIAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDVSQVTISFVYIVTAIVGVEAWYEPFLFNFLYRDLFTTMIIGCALCVTLPMSLLNIFRSYKNNTLKHNSAYEA	301190	263272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_263321_264890_264940_270057_270167_271140_271404_275070_275146_277132_277242_277670_277740_301016
834634	contig_9424_pilon	-	722	3	Intergenic	novelGene_143781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2620.5	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAAACACCTGTTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280144	277217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_280020
834635	contig_4339_pilon	+	1068	2	Intergenic	novelGene_146090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTTCCCTTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074198	1076424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1074919_1076076
834636	SIRV4	-	550	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	57	10	57	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTTAAGAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5101	3647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
834638	contig_10013_pilon	-	1347	10	Intergenic	novelGene_125069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	65.0879746531143	16	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	4	1023	461684	452897	TRUE	5	CGGTCTGAGCCTCCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMRNPFSVKCWLRYIEFKQGAPKPRLNQLYERALKLLPCSYKLWYRYLKARRAQVKHRCVTDPAYEDVNNCHERAFVFMHKMPRLWLDYCQFLMDQGRVTHTRRTFDRALRALPITQHSRIWPLYLRFLRSHPLPETAVRGYRRFLKLSPESAEEYIEYLKSSDRLDEAAQRLATVVNDERFVSKAGKSNYQLWHELCDLISQNPDKVQSLNVDAIIRGGLTRFTDQLGKLWCSLADYYIRSGHFEKARDVYEEAIRTVMTVRDFTQVFDSYAQFEESMIAAKMETTSELGREEEDDVDLELRLARFEQLISRRPLLLNSVLLRQKQCRTWPPDRVAWTT	461687	452363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_452490_452571_452682_452808_452943_456682_456774_457212_457358_458530_458696_458782_458918_460673_460872_461173_461298_461568
834639	contig_17198_pilon	+	299	2	Intergenic	novelGene_62364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGGAACTCAATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802961	803788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_803214_803741
834641	contig_7513_pilon	+	1592	2	Intergenic	novelGene_88965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAAAGGTTGGCAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204900	211976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_205284_210767
834642	contig_13044_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_99975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	324	515	24338	24147	NA	20	TAAACAGGGTGTGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSETVPPLIFFFNYEHFQTYRTVERIVFCTLYHLGHKFKHPILLLNDSFKFLTWSTLIYIVDLTVTSSPCILYFLSSLVNYNNSPFNFLSPEKPLALGRLCVCVVVGMERAGQLAILFMESFDTPLPSLVSRELRVPKAVSWHHTLVHLINGKCPLQAYLVCYELTKGPG	24661	23499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_23500_24700
834646	contig_960_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_108250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCTATTGCAGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527822	529441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_527800_529400
834648	contig_13481_pilon	+	1563	3	Intergenic	novelGene_119431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGAATGCCTGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917845	931858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_917940_919681_919984_930691
834649	contig_2332_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_58654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGCTCCCGCCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293149	292141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_292100_293100
834650	contig_17602_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_174498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTCATACTTATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82285	81841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_-_81800_82300
834652	contig_16220_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_163628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTCTGGCTTTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110528	109926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_109900_110500
834654	contig_7733_pilon	+	929	8	Intergenic	novelGene_147131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	53.7849079810555	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	56	643	88179	106149	TRUE	40	TATTATTAGCAACAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AESSGLCLAFGPGRKSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKAHPQKSSSFWNSAWKGSSSPAGKGMSARRL	86745	107454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_91178_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_106056_106176_107194
834656	contig_2689_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_100832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATCTGGTACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192397	191326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_191300_192400
834657	contig_7066_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_42120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAACCTGAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595638	596579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_595600_596600
834659	scaffold_13505_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_111647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGCTTTCATTGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807410	809112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_807400_809100
834660	contig_4952_pilon	-	1380	9	Intergenic	novelGene_145532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	151	junction_5	55.6606627251239	357	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	140	1159	496802	488749	FALSE	30	ACGCACATATCTGGACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKWGEGDPRWIVEERADATNVNNWHWTERDASNWSTDKLKTLFLAVRVQNEEGKCEVTEVSKLDGEASINNRKGKLIFFYEWSIKLNWTGTSKSGVQYKGHVEIPNLSDENSVEEVEISVSLAKDEPDTNLVALMKEEGVKLLREAVGIYISTLKTEFTQGMILPTMNGESVESTRQPALKAEKWKANESAPLKTQARSVGVRIPTCKITLKETFLTSPEELYRVFTTQELVQAFTHAPAMLEADKGGKFHMVDGNVSGEFTDLVPEKHIVMKWRFKSWPEGHFATITLTFIDKSGETELHVEGRGIPAPEEERTRQGWQRYYFEGIKQTFGYGARLF	496941	488527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_488922_489123_489176_489682_489785_490458_490591_491384_491474_492946_493065_493469_493553_495193_495385_496722
834661	contig_6451_pilon	+	737	6	Intergenic	novelGene_173687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	79.4491032045045	270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	97	537	12389	243826	TRUE	15	TGAACTCTCCATGTGCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCALPSLLFPLASPEEPIYLLASARCRTYHGNSRRNSLRLFGSVE	7993	277970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_8080_12378_12504_29747_29841_153231_153334_243695_243857_277800
834662	contig_4114_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_15621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTTTCACAGAATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398888	399139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_398900_399100
834663	contig_10159_pilon	-	881	2	Intergenic	novelGene_30852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGACTTCAATTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747640	745751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_745873_746880
834664	contig_10159_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_30851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAAAGACCAGTGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718613	718114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_718100_718600
834666	contig_1331_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_37865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314002	315432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_314000_315400
834669	contig_12689_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_145035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAAACCAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49715	50279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_49700_50300
834670	contig_12689_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_145036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50433	51023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_50400_51000
834672	contig_1337_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_84266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGGGGAAGGAGATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627879	628678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_627900_628700
834673	contig_15866_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_63664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTTTGACATAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592260	593163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_592300_593200
834674	contig_5499_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_57038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAGACATATCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1589617	1590463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1589600_1590500
834675	contig_7119_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_40862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31833	33739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_31800_33700
834677	contig_12157_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_135926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGACTCCGTGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254191	255081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_254200_255100
834678	contig_15087_pilon	+	1249	2	Intergenic	novelGene_37219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAATAAAACAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119451	122104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_120603_122006
834679	contig_2867_pilon	+	2147	9	Intergenic	novelGene_135220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCATAGGCATTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153332	1170860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1154501_1155042_1155217_1155895_1155998_1156102_1156178_1157208_1157285_1157421_1157604_1158558_1158742_1160555_1160690_1170807
834681	contig_5588_pilon	-	2216	2	Intergenic	novelGene_172832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	13	1239	389145	384144	FALSE	35	AAAAGGGGACAACTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDEGQLTDIVVEVDHGKTFSCHRNVLAAISPYFRSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLNYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLEPQNSIGVFVFADHYGHQELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLELTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQNEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIETIPPQFAQAIPKSCGEKGPSSTNGCTQRLGMTASEMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIATGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDIFIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHTTNRWISKPPLLRARIGCRLVYCCGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWRTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGR	389157	383166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_385267_389041
834682	contig_91_pilon	-	1402	4	Intergenic	novelGene_127087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCCCAATCTCAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215808	208738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_208839_209707_209867_212754_212843_214753
834683	contig_2033_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_71552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCTTCCAAAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433939	432122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_432100_433900
834684	contig_5153_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_74320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCACTTCGTCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437675	437416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_437400_437700
834685	contig_2969_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_157062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCACCACAGAGTACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794994	796845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_795000_796800
834687	contig_10898_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_172764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAATAAATATTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124649	122863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_122900_124600
834688	contig_12021_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_172181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGCCTGTCCCATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14636	12613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_12600_14600
834689	contig_6496_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_103549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGAGTTCTTTCCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220859	1221188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1220900_1221200
834690	contig_20356_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_159533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCACAGCTGAAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66100	65486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_65500_66100
834692	contig_3942_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_128823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCCAGCAGCTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179637	1180169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1179600_1180200
834694	contig_4686_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_118481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAACAAAAAACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57275	57986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_57300_58000
834695	contig_12864_pilon	+	713	4	Intergenic	novelGene_76353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTTTTCGGCCAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103112	106814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_103442_103881_103946_105652_105889_106730
834697	contig_11292_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_109462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	18.9091394715771	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	371	1132	431545	429068	FALSE	50	CAAAAATGCACCAGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVPEIVGEEKGTVVYQLDSVPTEGSYFTSSRVGGKRGIIKELAVTLQGPDDNTLLFESRFESGNLQKAVRIDTYEYELTLRTDLYTNKHTQWFYFRVQNTRKDVTYRFTIVNLLKPKSLYTTGMKPLMYSQLDANTHNIGWRREGNEIKYYKNNTDDKQQPFYCLTWTIQFPHDQDTCFFAHFYPYTYTDLQCYLLSVANNPVQSQFCKLRTLCRSLAGNTVYLLTITNPSQSPQEAAAKKAVVFSARVHPGESNGSWIMKGFLDFILSNSPDAQLLRDLFVFKVVPMLNPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRHYKTILKDSFPCIWYTKNMIKRLLEEREVLLYCDFHGHSRKNNIFLYGCTNNDRKYWLHERVFPLML	440683	429065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_429204_430919_431703_434291_434446_440624
834698	contig_19469_pilon	-	1242	10	Intergenic	novelGene_135002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	42.5205832509386	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	627	1178	153553	144902	FALSE	45	TTTGAAAAAAATGTGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKGNY	158454	144837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488_155616_156187_156320_157184_157244_157377_157515_158418
834699	SIRV4	-	357	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1156	8	1156	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
834700	contig_10609_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_123902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCAACTCCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160830	159034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_159000_160800
834701	contig_13101_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_172789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245260	246588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_245300_246600
834702	contig_7379_pilon	-	1009	11	Intergenic	novelGene_150026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	100.927746432782	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	143	955	553324	536814	FALSE	50	AACTATAAATACATTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGRFGVCFIRPGSVAARRIESSEVGKNQCRRKETSKREPAAFLEQVMGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQIQTEAAQLLTSFSVKN	569895	536759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_536865_537340_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695_549784_553209_553328_561385_561459_569829
834703	contig_19559_pilon	-	1600	5	Intergenic	novelGene_163428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	18.952242611364	56	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	122	817	46231	43631	FALSE	15	GCTACTGACATCTGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDVLCVVRDVVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLVNNSTLEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKEKVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSYDLKRKMILQQF	47398	42847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_43742_44227_44384_44592_44776_45985_46238_47283
834705	contig_776_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_139941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATAGTGACCCTACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906169	907028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_906200_907000
834706	contig_16098_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_45856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCATACAGCCTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213321	210988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_211000_213300
834707	contig_18081_pilon	+	1637	3	Intergenic	novelGene_23767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_1	43	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	1058	1636	52798	58611	FALSE	25	AGTGTATCCTTTTAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYNAEQYCWLDGEITSSCCLGNFLLSVVDQTRCNVWILDGDLYHKGLLKFSLEAVSLKDTLVMLVVDMSKPWTALDSLQKWASVIREHIDKLKIPPEEMKEMEQKLIRDFQEYVEPGEDFPASPQRRSAASQEDKDDSAVLPLGADTLTHNLGVPVLVVCTKCDAISVLEKEHDYRDEHFDFIQSHVRKFCL	51740	58612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_53117_53944_54115_58521
834708	contig_3787_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_102361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCCCACATAAATGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355802	355305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_355300_355800
834709	contig_6374_pilon	+	1243	7	Intergenic	novelGene_158425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	208	junction_3	230.536150455122	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	177	986	4881	41849	FALSE	65	AGAAAAAAGAAAAATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTQVSGSRPHPLPLCSSLEPLLQLLPLLAFGRAGVSVLYPRSPAARSRDALLLLWVHIMETKRVEIPGSVLDDLCSRFILHIPSEERDNAIRVCFQIELAHWFYLDFYMQNTPGLPQCGIRDFAKAVFSHCPFLLPQGEDVEKVLDEWKEYKMGVPTYGAIILDETLENVLLVQGYLAKSGWGFPKGKVNKEEAPHDCAAREVFEETGFDIKDYICKDDYIELRINDQLARLYIIPGVPKDTKFNPKTRREIRNIEWFSIEKLPCHRNDMTPKSKLGLAPNKFFMAIPFIRPLRDWLSRRFGDSSDSDNGFSSAGSTPAKPTVEKLR	4704	42106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4934_17854_18007_25247_25376_25800_25900_41257_41411_41531_41645_41737
834710	contig_16625_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_171117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCCAGCTGAGATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69316	75152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_70291_74787
834711	contig_15236_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_141628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAGAGGCTGCTCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620267	621061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_620300_621100
834712	contig_10451_pilon	+	912	6	Intergenic	novelGene_138300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	180.01777689995	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	156	911	103898	151954	FALSE	20	CCCCAAAGCCGGCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQGLDWLLVPLQQLVSWGAAGAMVFGGVVPYIPQYQDIRRTQNADGFSTYVCLVLLLANILRILFWFGRHFESPLLWQSIIMILTMLLMLRLCTEVRVTNELNLKRRSFADSKDEEIRVPLRRSYLDFDLHHFWRWSSFSDYVQCVLAFSGVAGYVTYLCIDSTLFVETLGFLAVFTEAMLGVPQLCRNHRHRSTEGMSIKMVLMWTSGDTFKTAYFLLNHVPLQFSICGLLQVFVDLAILLQAYTYARR	103406	151955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_103439_103774_104101_111508_111643_120458_120507_140302_140520_151800
834715	contig_4114_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_15648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583056	582302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_582300_583100
834716	contig_854_pilon	+	755	5	Intergenic	novelGene_36467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	47.1506892844633	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	60	560	1514567	1526706	TRUE	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRLLLRRFLALAISRNPPQGRWAPLTSGALQSPQCHPGGLAATLSPARTVHTTRVCTTTFNIQDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG	1513634	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514830_1517440_1517565_1526592_1526768_1527368
834717	contig_11994_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_129361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389216	390317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_389200_390300
834719	contig_10968_pilon	+	1265	2	Intergenic	novelGene_84295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	557	junction_1	0	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166046	167518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362
834720	contig_5280_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_52660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTTAGATCATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323264	320724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_320700_323300
834721	contig_7840_pilon	+	1296	3	Intergenic	novelGene_68953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGGAAGTTTCTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84781	97556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_85690_87228_87455_97394
834723	contig_15120_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_108022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTACAAATTATGTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238825	238016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_238000_238800
834724	contig_15120_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_108021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCCTGGGAAAAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237402	237014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_237000_237400
834725	contig_5981_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_35517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAACTAGTAAGTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148125	148566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_148100_148600
834726	contig_8866_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_77864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTATATCAGTGGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785977	784799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_784800_786000
834728	contig_12644_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_44437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGAAAAAAAAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223687	222355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_222400_223700
834729	contig_12622_pilon	-	771	6	Intergenic	novelGene_6060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	5.23067873224881	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	45	584	1750843	1747753	FALSE	5	TGTTTTGTTTTCCTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQNRDPAAASVVAARKGAEPSGGAARGSVGKRLQQELMTLMMSGDKGISAFPESDNLFKWVGTIHGAAGTVYEDLRYKLSLEFPSGYPYNAPTVKFLTPCYHPNVDTQGNICLDILKDKWSALYDVRTILLSIQSLLGEPNIDSPLNTHAAELWKNPTAFKKYLQETYSKQVSSQEP	1750887	1747565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1747812_1748420_1748481_1748587_1748793_1749476_1749564_1750283_1750312_1750742
834730	contig_2486_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_177133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCGTACTTTGCAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115802	113874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2486_pilon_-_113900_115800
834731	contig_12327_pilon	+	1645	2	Intergenic	novelGene_140672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	0	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAGCAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124025	1129901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342
834732	contig_5954_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_28554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAATCCCAAAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608273	608510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_608300_608500
834734	contig_2716_pilon	+	2246	14	Intergenic	novelGene_173553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	22.2066677976358	13	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	38	619	525840	535745	TRUE	45	TACCAAATAAATGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WENGINGILADEMGLGKTVQCIATIALMIQRGVPGPFLVCGPLSTLPNWMAEFKRFTPEIPTMLYHGTQQERRKLVKNIYKLKGTLQIHPVVITSFEIAMRDRNALQHCYWKYLIVDEGHRIKNMKCRLIRELKRFNADNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNFLLPDVFDDLKSFESWFDITSLSETAEDIIAKEREQNVLHMLHQ	525802	545622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_525981_526591_526736_528980_529178_530897_530995_535742_535915_537171_537312_537394_537534_538822_538907_538984_539105_540059_540169_540542_540694_541767_541865_541946_542024_545081
834736	contig_10600_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_169865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140212	141398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_140200_141400
834737	contig_7020_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_57065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATTGGTGCCCTGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93621	92348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_92300_93600
834739	contig_17976_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_32536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	174	476	53318	53016	NA	25	CATTTTACATTCCCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTCKLLRTRHYSKNEEVVEEKHEKQYQLTGMTHDTAALNLQTNKSYPMKCLVTRKQPQQRFFFFVVMYKFLCGGTSSFLLYMYRGVKLPSHMVTLCLVF	53491	52982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_53000_53500
834742	contig_6546_pilon	+	344	2	Intergenic	novelGene_140981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCTGCTGCCCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597580	599347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_599197
834744	contig_6885_pilon	-	1041	6	Intergenic	novelGene_83644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	231.465418583425	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	414	1040	165388	128492	FALSE	60	AGAAAGAAAAAGAGAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNLKGRPRKKKSCPQRRDSFSGVKDSNNNSDGKAVAKVKCEARSALTKPKNNHNNCKKVSNEEKPKVTIGEECRADEQAFLVALYKYMKERKTPIERIPYLGFKQINLWTMFQAAQKLGGYETITARRQWKHIYDELGGNPGSTSAATCTRRHYERLILPYERFIKGEEDKPLPPVKPRKQENSSQENDNKTKVSGTKRIKHENPKS	165801	128490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_128646_144722_144821_154941_154995_156958_157164_163851_163965_165384
834745	contig_19934_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_166640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAACCTCCCCAGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340265	341772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_+_340300_341800
834747	contig_5643_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_38960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGTAGCACTGTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530454	530893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_530500_530900
834748	contig_3789_pilon	+	1134	2	Intergenic	novelGene_79894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598405	690878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_599322_690660
834750	contig_17198_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_62421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTTCTTTTAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144509	1145002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1144500_1145000
834751	contig_17144_pilon	-	888	2	Intergenic	novelGene_29150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	163	528	101676	101311	FALSE	5	CTGTCCTCTTTTCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSHSVKERTISENSLIILLQGLQGQVTTVDLRDESVARGRIDNVDAFMNIRLANVTYTDRWGHQVELDDLFVTGRNVRYVHIPDDVNITTTIEQQLQIIHRVRNFGGQGRQEFSSKNYK	105794	100950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_101701_105656
834752	contig_15360_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_171266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGCAGAGTGCTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228776	227880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_227900_228800
834754	contig_1964_pilon	-	1083	2	Intergenic	novelGene_130926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAAAAAAAATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579171	574113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_575149_579123
834755	contig_7321_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_53141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTTATTTTTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171687	169925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_169900_171700
834759	contig_3241_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_146422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGCTAACCAAAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947292	946751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_946800_947300
834760	contig_6424_pilon	-	778	2	Intergenic	novelGene_109256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1187	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	59	646	7848	5841	FALSE	15	GGGAATCCTGTTGCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAALPTTCTGSAGASSSFMSVSSDPRQSAVPTRLLTHQMRPTTPLQAQRARVRWPTGTEARPAPADPTGAVSPSSCLRGHSRDAHDLPFSDLRWNMSSHSPSQRLPAATAWRGQKPPCTPTPCTYLPQIFQAFPPLHHLTSPQAGNHNLCPHCLPLSCSVQASDQTMPEPGRIRYLWASDAPCPLLTPYLSGLSAEALIALGQAQPRGIAAWE	7906	5708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842
834763	contig_9389_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_83999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498633	500007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_498600_5e+05
834764	contig_6677_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_114228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAGCAGAGTCCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740002	739228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_739200_740000
834766	contig_10106_pilon	-	2192	1	Intergenic	novelGene_73882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	549	887	134909	134571	NA	25	CCTGGCATAAGCTGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPAPLLCERSLSLVQPLLPWAGVPQPQALFPNCCTNLGLQAPEAPIPGMVKKYPLAFQLAESGGCPCLQSPTSSMPLTPTPDLKQPRPPGEPKSGPNKPSNHGAVGAHPT	135457	133265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_133300_135500
834767	contig_1545_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_149740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122098	123259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_+_122100_123300
834768	contig_14890_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_122511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTCTGTTTGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367040	366268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_366300_367000
834770	contig_4678_pilon	-	1031	8	Intergenic	novelGene_126044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	97.6135654674354	170	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	91	759	551815	545168	FALSE	0	GTCTCTGTCTCTGTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGDGRPIPTRLFGAGGQAAPQRGQAGAGTMDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGALTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPAQSKLQKAPAPAADPPRYTFAPSASLNKTARPFGASPPADSAPQQNGQPIRPLVPNASKQRLMEDTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSREKYVLELQSPRYTRLRDWHHQRSAHVLNVQS	552855	544895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_545265_545466_545504_545644_545782_546411_546531_547042_547074_547151_547304_551719_551827_552776
834772	contig_11720_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_44043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	646	1029	505527	505910	NA	40	AATAAATGTATCTTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVVKVSDQRCQKKAGMGGVYLLGCSMLPFLLLLPSLSLQLLLHVLDVPCKAVAVEVVVTGCFGKGLLLLEGGQMHCSVPELFTSPPLPFQADPQVPREKPTWKPYRQMTHWPWGMLLSVRISFPF	504881	506176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_504900_506200
834773	contig_15185_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_99464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	886	1194	435252	434944	NA	20	GGGTAAGGGTACTGTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGERPGSLGGWELLGTDRFQARACAGLVWLASCEAELRSKQLHLPPPGRSQGLGQAVPRRMQGPCQWSRKERGQGASCRPPPRQCLLMPALEVGEKALRP	436137	434699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_434700_436100
834774	contig_10863_pilon	-	1469	8	Intergenic	novelGene_59330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGTCAAGAGCCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78338	69092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_69446_71428_71542_71849_71906_72595_72679_73643_73784_74389_74652_76162_76204_77917
834775	contig_5451_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_167191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGAATTTAACTAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763754	765828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_763800_765800
834777	contig_14896_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_177134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTTGAATAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8293	6914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14896_pilon_-_6900_8300
834778	contig_15325_pilon	+	795	7	Intergenic	novelGene_157168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1004.21987410903	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	128	559	94114	96067	TRUE	30	ATTGAAATATTGTTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSGWNHGGCRKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSSAWRI	93227	96607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94020_94117_94399_94567_95094_95233_95674_95777_96045_96245_96548
834779	contig_7376_pilon	+	1021	6	Intergenic	novelGene_108087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.2144252725313	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAGAAGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80077	113114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_93590_93697_102779_102959_104743_104851_112441_112496_112599
834782	contig_9098_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_75863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	5	397	377028	376636	NA	45	GGTAAGAAGAAGAGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRHKTKGYSLQEPKGKKRRAVLETQVGGMIVRMMPILSNTCLSSLQAYAHCDPVPFFHFLGFRYTPWSLSRQPLCVTKLFSTAPSWAGQGQEERRGIMVHGRHTFLGFIIRVDVNIWGLVALISQLMSVD	377032	375716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_375700_377000
834783	contig_3103_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_146187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTTTCCTGATTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61868	61213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_61200_61900
834784	contig_1213_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_76467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTTTAGTTACACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65718	64834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_64800_65700
834785	contig_10196_pilon	+	778	5	Intergenic	novelGene_132042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	64.4452286829677	293	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	170	715	643457	648579	FALSE	30	AGGCAGAGCAGATACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSNPHLSPTVVWQVNSAKCTLLFWHLLYSQYYKICFEFCNFVAF	639737	648642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644721_648452
834786	contig_2312_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_160732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGGTACAGCTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195671	195335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_195300_195700
834788	contig_567_pilon	+	510	5	Intergenic	novelGene_33991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_4	159.547015014384	6014	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	7	333	442621	458639	FALSE	15	CAGATGCTGTCTCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNHAFHFHCISRWLKTRQVCPLDNREWEFQKYGH	442614	458816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_452651_455775_455862_458626
834789	contig_3975_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_54675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	491	1473	267	1739	886623	885151	NA	20	TTTGGCAGACAGCATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLDHTNTDAAAVVGLGLQRLDALSAKKTDTAELPVRVIAHFGLQELHLGLTQIRRIAPEALASCHSLKSLDLKSNHPIHLPPGFLAAMPRLQTLKLTINQLQISMLCMNGTGAESGLRALDLSNNGLYTMPSDTFSCLPHLRELLLQGNQLFDLDSQVFQGLRRLETLDLSGNPLVALDKGWLASLPALTTLNLLDTRMALSSTWDFWGPERLNNLRLGLVSGPPRMLSLPMGLASLELHAVSGTKPWKLVTNVFPVLQTLTLKGWGLQLGVQNVSKIFPALHQLSLSGNSLEALCSQDTSRFFLWQLPGLKQLQVRGDGHSLRPCCITGLPSLWELKLHNLQSQARPRPLRLEELVGQLPMLQVLQLEQTGLETLSAAAFQGLCNLQILVLGWEKGLVLDASLQEHSPQMPQYMYFLTSSLACQCANAWVGPWLERSPRTYVHITTRQLCQTEAGDHSKRLLFPFLWSHCPKTLGLELFLGSSALLLLLISLPFLQEARNWILYLRTLFRAWLQGLRGQRSEGKRFVYDVFVSHCRQDQGWVVQELLPTLEGCPPAGWGLRVCLPERDFEPGKDVAD	886889	885148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_885100_886900
834791	contig_8580_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_156092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTTTTCTCTAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261015	262917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_261000_262900
834792	contig_6434_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_61913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATATTCCTTAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927953	927428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_927400_928000
834793	contig_3818_pilon	-	1815	12	Intergenic	novelGene_99322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	8.19594739606156	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	101	1693	1289602	1270637	FALSE	20	CACGTGACTTAGTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAFPVFEDGNKENYGLPQPKNKPAGARTFGERSMSRLSAKPNEAPPHTEEFLDDSAVWGTRCNKTLAPIPKSAGDFTSAAQLASTPFHKLPADSVHALEDKENIVAKQCTRVTLYASEENTVEPSKPRKFSPIQEKSPEQALCVDVPSAPLLSRSQPTAGGVLTSEAEQSLEACKLTDTDVAMEEDPPGARPSGLHAERTKSSSAGNAAAPNFVVENPWDDTLIQELLSGLSKPVSSYPNTFEWQYKLPPIKPKTEFQLGSSVIYIDHLLGEGAFAQVYEATQEDVNDPKNKQKFILKVQKPANPWEFYIGSQLMERLKPDMQHMFIKFYSAHFFQNGSVLVGDLFSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQALVMSFAIRMLHMVEQVHNCEIIHGDIKPDNFILGNRFLEQDGEDDDLSAGLAMIDLGQSIDMKLFPKGTTFTAKCETSGFQCVEMLSKKQWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGVWKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHIMLNIPDCHQLPSLDFLRQKLKKIFQQHYSNKIRTLRNRLIVLLLEYKRSRK	1290611	1270514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1270833_1273452_1273560_1275306_1275482_1275580_1275739_1275905_1276068_1276354_1276471_1279973_1280118_1281783_1282026_1283005_1283094_1287468_1287647_1289575_1289658_1290566
834794	contig_9363_pilon	+	1256	7	Intergenic	novelGene_6807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.137935894445	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	656	1246	1623705	1625958	FALSE	10	GGCCACGCGAGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLAGPCPGFEDSPLGPFLPKSGVGSPASRSAWTLPLPALQFAVRPLPEQASPAPSRPCSPSSGVTPLHPRCIFNKR	1622057	1625968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622985_1623110_1623401_1623738_1624342_1624445_1624573_1624674_1624905_1625037_1625733
834795	contig_6434_pilon	+	902	4	Intergenic	novelGene_61846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7.58653778449403	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTACACGTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764020	772826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_764453_764753_765008_769304_769360_772665
834796	contig_5799_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_50238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTCAATGGCAATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152546	153362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_152500_153400
834797	contig_12540_pilon	+	1457	13	Intergenic	novelGene_148051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_6	32.2722791262099	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	84	1328	147480	205311	FALSE	20	CACTGGTGTCTGTTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKVLPPTVYLRVTENIPQIISFIEGIIANGHAYSTQKGNVYFDLKSRGDKYGKLVGVAPDPVGEPVDSDKRHLSDFALWKAAKPQEIFWTSPWGNGRPGWHIECSAMSSLMFGGQLDLHSGGIDLAFPHHENEIAQCEAFHRCKQWGNYFLHSGHLHIKGKEEKMSKSLKNYITIKDFLKKFSPDVFRLFCMRSNYRSAIDYSDSSMQDTQRLLLGVTSFVEDARAYMRGQLACASVREDQLWERLADTKVAVKAAFADDFDTPRAVDAIMSLIHHGNRQLKAVTKETAGPRSPAVFGATVSYIEQFLETVGISLANQQFVSGESSSATLHGVVEELVHFRQKVRQYALATKEASRDIRHQQLLERQPLLEACDALRRGLAIHGINIKDRSSTTSTWELLDQRTKEHIPGS	131421	205440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_131448_147422_147495_147612_147719_149470_149555_156702_156833_164740_164875_169307_169376_183881_183949_194798_194938_198028_198153_200104_200204_204049_204257_205239
834798	contig_7057_pilon	+	1705	3	Intergenic	novelGene_123421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTAAAAAACAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1526607	1539030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1526650_1537062_1537190_1537494
834800	contig_1694_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_144955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814320	812652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_812700_814300
834801	contig_8133_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_98674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCCCACCCCTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344326	345119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_344300_345100
834802	contig_4125_pilon	+	2886	1	Intergenic	novelGene_25272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGGTATTGCCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3369803	3372689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_3369800_3372700
834803	contig_10857_pilon	-	529	2	Intergenic	novelGene_160878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGTGCTTCTCGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66884	21829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21931_66456
834804	contig_20614_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_107615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTCAAGGTAAAAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501629	503808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_501600_503800
834806	contig_12128_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_131981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	387	689	299899	300201	NA	45	TCAGATTCTAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLCFHKKMAPKKPLGSQSNPSTAKCEGVEDSGKKEFKASKAWLASYVKRYNLKNFKVTGEQASADAQVASVFPEELKKLIEEKGFNCNEITIYKAFTLY	299512	300851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_299500_300900
834810	contig_16846_pilon	-	539	4	Intergenic	novelGene_82991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1486.80985857491	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	14	445	555167	551492	TRUE	20	TGGAATTTGGGCCAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555180	550910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_550961_551447_551665_552676_552824_555055
834811	contig_14353_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_82132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAATGGAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282231	281885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_281900_282200
834814	contig_2364_pilon	+	2333	4	Intergenic	novelGene_170829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.68331255192114	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	34	318	445785	469855	FALSE	5	TGCATGGTGGTTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLGDIPIFIAMIQASGVAARTQKLKVGDRIVSINGQPLDGLSHADVVNLLKNAYGRIILQVVADTNISAIATQLESMSTGYHLGSPTAEHHLEDTEEQQQMTAD	445751	471870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_+_445830_446565_446671_462179_462287_469827
834815	contig_6102_pilon	-	1242	3	Intergenic	novelGene_32294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_1	263	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	871	1242	1489722	1479293	FALSE	20	CCACTTATCTCCCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCHQVTSSQSIRGLLPCTAQQQQQQQQLPALPPTPQQQQPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSAEAADPSSALFQP	1490592	1479292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1479386_1487616_1487784_1489610
834816	contig_8475_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_171096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAGAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20008	17948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_17900_20000
834817	contig_10434_pilon	+	498	4	Intergenic	novelGene_82014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_2	73.7849728753912	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	125	496	79135	99544	FALSE	40	AACTAAAGATTATGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLAPPAPGPETEPGEVRRHPGRGAERSRAPLIFPIPRGDNMRACSPALCILLLLLCLAQVFSQSCVWYGECGIATGDKRYNCKYSGPPKPLPKDGYDLVQELCPGFFFDNVTLCCDVQQLRTLKDNLQLPLQFLSRCPSCFYNLMNLFCELTCSPQQSQFLNVT	79010	99546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_79192_95675_95799_97607_97715_99459
834818	SIRV6	+	399	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	368	0	202	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
834820	contig_18299_pilon	+	1402	3	Intergenic	novelGene_135345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_1	14	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	26	649	47477	55662	FALSE	30	AGAACATCAGGCTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPGAALRMGGAVSAGEDNDELIDNLKEAQYIRTELVEQAFRAIDRADYYLEEFKENAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALDLQPGLSFLNLGSGTGYLSSMVGLILGPFGVNHGVELHSDVIEYARQKLDFFIKTSDSFDKFEFCEPSFVTGNCLEISPDCTQYDRVYCGAGVQKEHEDYMKNLLKVGGILVMPLEEKVRVPPSLTLGSAV	47451	56415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_47784_54382_54486_55448
834821	contig_8063_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_152455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAACCGAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138199	1137433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_1137400_1138200
834822	contig_10958_pilon	-	1272	7	Intergenic	novelGene_5346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_6	2.74873708374511	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTGGCCAACACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770853	764723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_764969_766459_766872_767187_767288_767837_767881_768066_768121_768756_768822_770500
834823	contig_2455_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_119226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418816	1417567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1417600_1418800
834824	contig_2027_pilon	+	1125	10	Intergenic	novelGene_39921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	61.2713051885315	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	124	360	148013	148747	TRUE	0	CGCCTGGTCTGTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNVINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFDFAQDLLNSSCLFSPPPRPGPGQINPNEDVLQ	147788	151077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_147864_147964_148028_148274_148399_148649_148823_148930_149029_149113_149220_149304_149348_149494_149586_150639_150718_150803
834825	contig_8594_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_140068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTGTGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520971	520119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_520100_521000
834827	contig_16389_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_177135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTTGGTACATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15984	15542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16389_pilon_-_15500_16000
834828	contig_821_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_149407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215559	216706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_215600_216700
834830	contig_13697_pilon	+	721	4	Intergenic	novelGene_165931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.7124606795322	115	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	520	534	259935	259949	FALSE	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVEACCQPRFHRKYRSCDRVLLKASLCWAPWGPQVGGLRALTYAASIPDVDECAEETPPCSEGQYCENVPGSYTCEECDSTCVGCTGKGPGKCIACVPGYAKEESGQCSDVDECSRPETPCARENENCYNTPGSFICVCPEGHEETDGACVPKAGAKWKRKSQRSPLPTKIYKMILN	254581	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_254811_257483_257583_258050_258191_259883
834832	contig_6919_pilon	+	1125	5	Intergenic	novelGene_163980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.06917857360853	77	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	472	999	45277	48263	FALSE	40	TGATTCAGCAACAGATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIAIHHPWIRRPFFPFHSPSRLFDQFFGEHLLESDLFPSSTSLSPFYFRLPSFLRAPSWIDTGLSEMRLEKDRFSVNLDVKHFSPEDLKVKVLGDVIEVHGKHEERQDEHGFISREFHRKYRIPADVDPLAITSSLSSDGVLTVNGPRKQASGPERTIPITREEKPAVTAAPKK	39153	48389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_39239_40438_40627_45078_45478_46600_46724_48059
834835	contig_3679_pilon	+	1499	3	Intergenic	novelGene_112117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	3.5	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	72	383	1025707	1032358	FALSE	60	TTGAGGGAAAAAAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPEIRSTAAPLWYSVNQQKSKSMEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHVRHLFFSE	1025635	1033474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211
834836	contig_14618_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_136859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGTTAAGAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281954	1280697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1280700_1282000
834837	contig_14441_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_100369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCTGAATTCCATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25615	24062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_24100_25600
834839	contig_854_pilon	+	1170	6	Intergenic	novelGene_36118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	221.812172794912	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	167	853	286499	325607	FALSE	55	ATAATGTTTACAAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRLLRGLAGALLTLLCMGLLSLRYHSGLFPQGVRVTPKPSPPSPGPPELQMHDIFIAIKTTRAFHHSRLELLLDTWVSRTREQTFVFTDSSDEGLQERLGRHLVVTNCSAEHSHPALSCKMAAEFDAFLASGLRWFCHVDDDNYVNPRALLQLLATFAPARDVYVGRPSLNRPIHASEPQPRNHTRLVQFWFATGGAGFCINRKLALKMVPWASWPSSEAVCGRHG	286332	325924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_286754_295356_295406_295734_295838_296314_296469_299517_299604_325567
834842	contig_12292_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_167004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282568	281548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_281500_282600
834843	contig_5881_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_129034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCATTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259984	258749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_258700_260000
834844	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	36	337	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
834846	contig_11448_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_66436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCATCCTGTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647109	648150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_647100_648200
834847	contig_10323_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_123573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTCTTTAAAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454413	456033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_454400_456000
834848	contig_10159_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_30837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATTCTTTTTCAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576364	577402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_576400_577400
834851	contig_6726_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_86220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104445	103538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_103500_104400
834852	contig_5880_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_151118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155814	157204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_+_155800_157200
834853	contig_16103_pilon	+	192	2	Intergenic	novelGene_118942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGAAGTGTGTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918882	919853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_918940_919718
834855	contig_12802_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_114254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTAATGATGTTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153708	153110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_153100_153700
834856	contig_12802_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_114253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACATCCTGAATCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153162	151904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_151900_153200
834860	contig_13778_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_70861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTAAAAAATTAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314770	315692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_314800_315700
834861	contig_13019_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_176939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGGCTAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80295	79181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13019_pilon_-_79200_80300
834862	contig_14526_pilon	-	1509	5	Intergenic	novelGene_111202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	41.1787263037603	43	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	38	643	164729	163049	FALSE	35	TTTAAAACTGTTCTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCAAQTANNTVRMAKGDPKKPKGKMSAYAFFVQTCREEHKKKNPEVPVNFAEFSKKCSERWKTMSGKEKSKFDEMAKADKVRYDREMKDYGPAKGGKKKKDPNAPKRPPSGFFLFCSEFRPKIKSTNPGISIGDVAKKLGEMWNNLSDNEKQPYNNKAAKLKEKYEKDVADYKSKGKFDGAKGPAKVARKKVEEEDEEDEEEEEEEEEEEEDE	166600	162182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_163190_163467_163643_164171_164312_164579_164735_166568
834863	contig_5799_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_50330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGAGTTATCCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695685	696033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_695700_696000
834864	contig_5799_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_50331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCAGACACCTATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696289	697501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_696300_697500
834865	contig_5260_pilon	+	657	4	Intergenic	novelGene_144344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	82.9471049658891	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTACTTTGTTTTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63253	90799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_63505_70367_70468_90024_90107_90575
834867	contig_7733_pilon	-	817	5	Intergenic	novelGene_147140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	208	672	107241	91148	FALSE	55	TAACAACAATAATAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSNPSLMCSWYWILPSETHFSKSFRAFWRTSPCQRVTMNPSMRSSRKMMISGGGPVMPTVPKARDSGNVSGHSVGSFSSSFPSEMECVVQPEKATTIVPVGKAEFLLSTTLNLLPHHRVTLLQSFGYYSHIRVHGKEQSFKQDLYKRKHSTVN	107448	91002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_91223_92133_92189_93202_93370_106054_106174_107192
834868	contig_15866_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_63594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAAACACAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246537	244758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_244800_246500
834870	contig_7942_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_155327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGGTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49634	49963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_+_49600_50000
834871	contig_3004_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_127476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	117	500	253222	252839	NA	60	GAATGAAGGAAAAAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPGTQVPAFWLPVEASLSPPPFWPRAGVSPPHAATASMSGVRAVRISIESACEKQVQEVGLDGTETYLQPLSMSQNLARLAQRIDFSQGSGSEEEEAAGAEGDAQDWAGAGSSADQDDEEGKTHVFAELGLGRSQYPPSNVTLPLAYWVRCCEWEYLESNTHAE	253338	251795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_251800_253300
834873	contig_7078_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_130187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCACCAGTTAACTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780131	779799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_779800_780100
834874	contig_12672_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_141479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGACAAATTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91863	92508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_91900_92500
834875	contig_12841_pilon	+	887	2	Intergenic	novelGene_55857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGTTGCTAAGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313353	317706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_313520_316985
834876	contig_6546_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_140993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGCCCACCTACCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614883	615637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_614900_615600
834877	contig_6546_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_140994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAATATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615836	616099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_615800_616100
834878	contig_5047_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_157979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATAACAACCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833589	831883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_831900_833600
834880	contig_7887_pilon	+	1128	3	Intergenic	novelGene_124874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	385	786	219693	221586	TRUE	20	CCCAGTGCAACAGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGLCRQGKCFWDDWFTRISAHGPFHSQVTGGGHMQERAPGLQNKGGIPHRHQPLHSIPPTAEPVFIHRGNDAQHLPTLEAQLVRSCSCVVTESPDCPVGLHHTGGRGLKLLRRRGTLRRCPPASPEPTHSL	219308	222470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_219987_221478_221609_222150
834881	contig_12635_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_60827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAATGAAATAAGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225722	225427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_225400_225700
834882	contig_18799_pilon	+	318	2	Intergenic	novelGene_171410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTGAAATAAGGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6456	8370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_6604_8199
834883	contig_9471_pilon	-	758	4	Intergenic	novelGene_21707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	98.3564944474944	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	152	604	103082	81188	FALSE	75	AGGAAAAAAAAAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQGQGLDTSLEENCSMDFRRKLLKINEYLGAKDVEALKFLCRDLLSHKKLEKSGSALEIFEQLLAEEHLSEEDPFFLAELLYIIRQKSLLRHLQYFKEQVQNLLPVRRRVSLFRNLLYELSEDIDSERLRSMIFLLPNVFPKTEMSPR	105620	81033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_81200_100470_100565_102735_103090_105476
834884	contig_1719_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_87264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347497	349450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_347500_349400
834885	contig_6871_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_21623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCTAAACCTCTCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566979	569096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_567000_569100
834886	contig_4364_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_2777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533008	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
834887	contig_14954_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_165185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGTAAACATTAAGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198463	198900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_198500_198900
834888	contig_15185_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_99474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGACCTGTTGTGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505812	501144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_501652_505778
834890	contig_12528_pilon	-	1503	6	Intergenic	novelGene_81358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTTTTTAAAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023270	1010011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1010737_1011281_1011409_1016758_1016845_1020322_1020576_1022688_1022870_1023139
834891	contig_6871_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_21572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCCGCAGAACCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128865	128646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_128600_128900
834892	contig_7457_pilon	-	1701	4	Intergenic	novelGene_31392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATTAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462712	458345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_459733_460794_460877_462069_462206_462616
834893	contig_6375_pilon	+	806	4	Intergenic	novelGene_73079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	62.9832429213429	174	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	194	517	749083	751419	FALSE	15	ATCCTACTGGTGAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMLGARDRLDWPPEEGTAAGLQAFAVDKNFLSSLRGILLETELDFLRCVSAIVIFLVISIAAVTSRDGAAIAAFVFGIILVSVFAYDIFKIYQTEMAPRATEGDQQ	748889	751708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_749215_750937_751031_751230_751316_751405
834895	contig_6084_pilon	-	1822	1	Intergenic	novelGene_127036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTCTTGATGGCTCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290469	288647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_288600_290500
834896	contig_6589_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_25811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	681	1142	691501	691040	NA	40	ACAAAATGCCCATCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKGMGMVSRLSASLKREKRRFTIKPWELNHLKDRDGNILKSPHNPSCYDYAHCLSLSPSPQALYDPINPDRETLDQPSLTDTQRLSNEQEVLEALKPLLIQANFSQLSEDTLAYALVVHHPQDGVQVPGPKFPAGLGVGVGRLRSRGCWEL	692181	690870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_690900_692200
834897	contig_3602_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_60564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCCATCAAGAGGAGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510559	509721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_509700_510600
834899	contig_6048_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_73356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAATGGTGCGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3004903	3003718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3003700_3004900
834901	contig_12528_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_81352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTTAAACCAGAAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988939	988320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_988300_988900
834904	contig_9753_pilon	-	752	6	Intergenic	novelGene_41329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_5	307.993116806204	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTTTATGGGGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93363	69995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_85817_85932_86172_86247_93261
834907	contig_12644_pilon	+	191	1	Intergenic	novelGene_44563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTGGTTCAAGGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992014	1992205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1992000_1992200
834908	SIRV4	+	481	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	25	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTATCTGGACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3661	5046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4102_5005
834909	contig_7272_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_25287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTCGTAACTTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317665	317415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_317400_317700
834910	contig_7272_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_25286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGAAATAAGTTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316391	315761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_315800_316400
834913	contig_16575_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_146495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGAATTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12194	10858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_10900_12200
834914	contig_7605_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_172955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315621	314579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_-_314600_315600
834916	contig_9900_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_159515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238882	239496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_238900_239500
834917	contig_6079_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_160095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAATGTATAACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424596	423958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_424000_424600
834918	contig_5947_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_101561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCGGTCCAGCAGTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676503	675672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_675700_676500
834919	contig_16897_pilon	-	728	5	Intergenic	novelGene_174460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	59.1100668245266	1002	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	23	589	156559	154704	FALSE	20	TTTCCCAGCATGCTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARRNSAMVGGGGGMAGGPLENANPLIYERSGERPVTAGEEDEQVPDSIDAREIFDLIRSINDPEHPLTLEELNVVEQVRVQVSDPESTVAVAFTPTIPHCSMATLIGLSIKVKLLRSLPQRFKVSVSPYPTGWISRCVLRPLLSLSQMDVHITPGTHASEHAVNKQLADKERVAAALENTHLLEVVNQCLSARS	156581	154564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_154802_155273_155367_155779_155931_156176_156255_156412
834920	contig_11115_pilon	-	968	3	Intergenic	novelGene_102866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	5.5	573	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	36	836	211368	210323	FALSE	30	GCATAACCATTCCCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALDPQFQLFAMGSLLLLSPLFLLGATYSGGRSVRERRAEWAQSPGVSPVSPSGTSAPFWVRLSPELVSVPPGSSVLLNCSSSCPLPENYQLRTQLQQGKTLSGSGWVSYQLLDVRAWSSDVHCFVTCAGEMRSATTRVTAYQLPHSMLLEPLVLEGSQYTLRCHMTRVFPVGFLVVSFQHGGRVIYSESLKHFTNVNPANVTLTYMLPSRSPDLWQPVTCHAHFNLDGLVVHSSSAPLMLTALAWSTESKALTFTSIASLVILLAVGAAYLMQAQV	211403	210190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_210424_210562_210869_210974
834921	contig_10496_pilon	-	1618	10	Intergenic	novelGene_59429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	134.881841294932	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	52	1419	64679	44321	FALSE	35	TTCAATAAATAGTGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THKAHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAVSDARFSPTVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVNLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKLCLQKWKNQSSALYGMARGPE	64730	44121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_44387_47753_48041_50488_50736_52476_52557_52660_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56317_64508_64573_64672
834922	contig_15039_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_110176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTCGACATCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348929	337723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_338356_348784
834924	contig_7457_pilon	+	973	7	Intergenic	novelGene_31306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	56.2840020688729	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	108	878	183157	189512	FALSE	25	TTTTACTGTACTTTAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183049	189607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404
834925	contig_18794_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_54638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135838	137608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_135800_137600
834926	contig_7004_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_126456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGAATCTTTCCTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290270	289462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_289500_290300
834927	contig_4114_pilon	-	1556	5	Intergenic	novelGene_15627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	16.2076370887307	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATCTCACTTGTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500186	464347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_465345_465805_465906_466486_466603_474120_474309_500031
834928	contig_9017_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_130338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTGAGTATCTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241705	242185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_241700_242200
834930	contig_5400_pilon	-	1229	1	Intergenic	novelGene_162819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAATCCTGAACACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258871	257642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_257600_258900
834931	contig_2027_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_39932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTTTTGTGCATGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183961	184424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_184000_184400
834932	contig_14326_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_120768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTAGAAATTGTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696968	696573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_696600_697000
834933	contig_4686_pilon	-	1307	6	Intergenic	novelGene_118544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	270.395562093759	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	50	1105	532011	506884	FALSE	45	GCAGTGTGGGAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMDIAYYQALSAERLQTEAARIHPSAPSSQEFYEPGLESSTTAKLDDLQRSWETLKNVISEKQRTLYEALERQQKYQDSLQSISTKMEAIEMKLNESLELGKSPESQMAEHQSFLQALMDEILMLQDEINVLQSSLAEELVSESPESDPAEQLALQSTLTVLAERMSTIKMKASGKQQLLEEKLNDQLEEQRQEQALQRYRCEADELNHWLLSTKATLDITLGTPEEPMDMEAQLVDCQNMLVEIEQKVVALSELSVHNENLLLEGKAHTKDEAEQLAVKLRTLKGSLLELQRALHDKQLNIQVRVLGH	532060	506681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_507097_509797_509972_511588_511796_521407_521570_521780_521949_531879
834935	contig_10299_pilon	-	1473	2	Intergenic	novelGene_79754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGGCTTCTTCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581325	579640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_579914_580125
834936	SIRV6	+	312	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	12	2936	12	-2909	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGACTAAATCCATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2528	7879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
834937	contig_13699_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_158331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGACATTAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100200	100590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_100200_100600
834938	contig_8330_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_71755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581590	580772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_580800_581600
834939	contig_4350_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_136378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTGTTGCCATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242642	241512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_241500_242600
834941	contig_8773_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_74532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCCCAGCAGCAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62336	61452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_61500_62300
834943	contig_11396_pilon	+	696	7	Intergenic	novelGene_71440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	519.144809598761	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	55	507	1782334	1788470	TRUE	70	AGAAAGAAGAAAACGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPGRSGQSPEQAVLCPAMSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKCHWSRGQVSA	1782279	1789701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787324_1787846_1787958_1788437_1788557_1789210_1789265_1789652
834944	contig_9345_pilon	-	1293	10	Intergenic	novelGene_24485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	45.4633212628259	84	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	42	1169	661607	659427	FALSE	20	GTAAAGCTGTGTCCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVRLVPAARDPHMRTFLQQLRVEWPAASERAATEALRSRALAEHTSAHDGEVLPPGILGRVCLKELVEKQGRLAGYDPNLDSCLVTEDLLSLLAELQEAVQNWPEDSSPGVAGTPDPGTDSCIVVHVVSCEEEFQQQKLDLLWCKLDDQAPLRQKHLVCGPVKVAGGPGTLTVPEYYELRLAQVCKASALKHGGDLAQDPAWTEIFGILSVATIKFEMLSTAPQSQLLLTLADSSVSTKGTKSGTFVMYNCARLATLFESYNHSMEQGLYPTFPRVSSLDFSLLQDEGEWLLLFNSILPFPDMLSQTAALAYTAPGLHITAHTEMVCKFLVQLSMDFSSYYNRVHVLGEPRPHLFGQMFARLQLLRAVREVLHAGLAMLGLPPLNHI	661648	659302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_659547_659647_659717_659814_659929_660003_660187_660275_660359_660462_660525_660631_660703_661019_661149_661229_661310_661390
834945	contig_3132_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_127447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341642	343058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_341600_343100
834946	scaffold_12510_pilon	-	797	2	Intergenic	novelGene_151404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGGGTGAAAAGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589074	585741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_585821_588356
834947	contig_252_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_99924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATCAAATAACTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225551	226285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_225600_226300
834949	SIRV5	-	490	2	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	69	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2337	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986
834950	SIRV4	-	183	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1335	3	1335	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3823	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3800
834951	contig_8452_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_48028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363606	365135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_363600_365100
834952	contig_8317_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_20253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
834953	contig_11525_pilon	+	1709	3	Intergenic	novelGene_171066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1549	4666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_1943_2008_2127_3468
834954	contig_16525_pilon	-	547	5	Intergenic	novelGene_133864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1532.80092885541	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTCGAGGACTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181485	178101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178483_178593_178686_181150_181253_181388
834955	contig_7157_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_131282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834179	833864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_833900_834200
834957	SIRV6	+	555	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	19	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
834958	contig_10235_pilon	+	389	4	Intergenic	novelGene_46322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	1290.60201284345	468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGTGTCTCAGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89962	91873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91675
834959	contig_15067_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_154324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83481	84155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_83500_84200
834961	contig_6217_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_109673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795206	794315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_794300_795200
834962	contig_5047_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_157992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAACAAAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024224	1022506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1022500_1024200
834966	contig_6833_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_175135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAACTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253396	253141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_253100_253400
834968	contig_641_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_170133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGATTCTGTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5274	5879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_5300_5900
834969	contig_2114_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_104290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759595	759180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_759200_759600
834970	contig_7157_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_131272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAATCTCCTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627078	628389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_627100_628400
834971	contig_5317_pilon	-	660	3	Intergenic	novelGene_76547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTACCTACCAGCATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43630	35264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682_36879_43309
834972	contig_14397_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_134650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTAGAAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93681	92677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_92700_93700
834973	contig_835_pilon	-	1827	1	Intergenic	novelGene_152161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244266	242439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_242400_244300
834975	contig_8934_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_167255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	251	574	827923	827600	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKMIHHEAVNNCYVYHYKNSKGHQVFLPAFNLRIPKVTEEETWRRTACLVEGHRKRGRPSLSWTDTVAATMGLSITTIVGMWQDPAVFCSVVLRVTMSRNQPDST	828173	826604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_826600_828200
834976	contig_2799_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_85463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389771	388018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_388000_389800
834978	contig_7229_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_39857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413848	1411807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1411800_1413800
834979	contig_12270_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_113982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTGCCTGCCTGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13860	14416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
834980	contig_7587_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_163709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGAGAGTGATGTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111923	112907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_111900_112900
834981	contig_7587_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_163710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAAGTATTTAAGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113214	113647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_113200_113600
834982	contig_4068_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_161712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTTACATATGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113742	112642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_112600_113700
834984	contig_17440_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_7615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCAACATGAACCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	3335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_3300
834985	contig_10938_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_171769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGATTTGGTCATTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238914	239733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_238900_239700
834989	contig_6159_pilon	-	841	4	Intergenic	novelGene_128269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	121.031676294541	1931	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	109	666	314676	312482	FALSE	15	CATGACTGCTTTACTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLELDTNLPADRVPAGLEKRLCAATAAILSKPEERVNVMVRPGLAMVVNGSAEPCAQLLVSSIGVVGTAEENRGHSAHFFEFLTKELALGQDRLSGGILDMSSHCDLWAYGPTKSQVEAPRMVTGHRVVEKALAWVSGDLSSGPSTAGGPQTDPAMSHLRIIIRFYPLEPWQIGKKGTVMTFL	314784	312306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312555_313460_313662_314132_314309_314568
834990	contig_10323_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_123633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTAGCAGTTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503175	504263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_503200_504300
834991	contig_4083_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_152324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_1	291	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	118	354	56967	58698	FALSE	45	ATAAATAAGCTGCTAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAFIPEKEVVQANTVNERTNFLVEEYSTSGRLDNITQVMSLHTQYLESFLRSQFYMLRMDGPLPLPYRHYIAIMAAARHQCSYLINMHVDEFLKTGGMAEWLNGLEYIPQRLKNLNE	54608	58698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_54636_56876_57075_58569
834993	contig_89_pilon	-	731	1	Intergenic	novelGene_176385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTGAGGCAGGGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148054	147323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_-_147300_148100
834994	contig_7806_pilon	+	699	2	Intergenic	novelGene_157549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	557	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCTGTTTCCGATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281200	284916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_281642_284658
834995	contig_7057_pilon	+	766	8	Intergenic	novelGene_123313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	957.26930934416	30	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	146	766	936984	943712	FALSE	5	CTCTTCGTGGCATCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNVLGGLISGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAMRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLL	936016	943712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_943613
834996	contig_20058_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_109291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58633	57571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_57600_58600
834998	SIRV6	+	462	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
834999	contig_5945_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_104550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGAAAAGGAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208956	207614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_207600_209000
835000	contig_5799_pilon	+	1447	2	Intergenic	novelGene_50345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	17	397	763538	763918	TRUE	20	GGGGGAAGGCCCTCTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQERLNSNSDFLGFARPLSLPSLSSQTHLLHFKSLGTHLLQSKRVPSSSLSRTCNNKLACIFLRAHVVIPPPPSPSPWSHENNQMCAGSCCAWKPPPAASVHFQPKTNTGQSQRAVPRGRRGQPA	763521	771360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_764364_770755
835001	contig_7816_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_66574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTACAGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608985	610672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_609000_610700
835002	contig_709_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_57563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2075912	2074700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2074700_2075900
835004	contig_11883_pilon	-	1130	4	Intergenic	novelGene_163770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	143.250363583017	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATGTTGGAATCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144816	62162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_63003_67301_67356_140649_140790_144720
835006	contig_3602_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_60554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGATCCTGGTTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438718	436930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_436900_438700
835007	contig_12654_pilon	+	1988	2	Intergenic	novelGene_129266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAACACTACTCTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112296	114682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_113692_114089
835008	contig_11285_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_5521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGGGAGAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660578	659559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_659600_660600
835009	contig_2646_pilon	+	896	9	Intergenic	novelGene_69496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_3	10.2827221590394	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	279	896	227098	332828	FALSE	20	GTGAGTGTTCCCAATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVNPKSGGRQGERLNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLEVIPREEVENGDQVPYNIMNNYFSIGVDASIAHRFHLMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATCKKLHDHVELECDGVGVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGETKKNRTVIRESRKVITDPKELKFCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSSVTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPPCM	214607	332828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_214651_219023_219110_222860_222951_227038_227200_239572_239638_278421_278513_305043_305222_329909_330031_332767
835012	contig_11802_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_177138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAGAAAAGGAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11802_pilon_+_10700_11100
835014	contig_6403_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_139890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAAGCGGGAGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092745	1092203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1092200_1092700
835017	SIRV6	+	357	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	104	7630	-83	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCGGTTATTGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2389	3158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106
835018	contig_5690_pilon	-	1160	11	Intergenic	novelGene_119676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	24.0923224285248	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	383	1156	267052	233881	FALSE	35	AGAGGTACTCGAAGGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIAVTIGTDMLELDCHITKDEQVVVSHDENLKRSTGVNVNISDLKYCELPPYLGKLDVTFQRACQCEGKDNRIPLLKEVFEAFPNTPVNIDIKVNNSMLIKKVSELVKQYEREHITVWGNASYKIVEKCYKENSDIPILFSLQRVLLILGLFFTGLLPFVPIREQFFEIPMPSIILKLKEPHTMSRCQKFLIWLSDILLMRKALFDHLTARGIQVYIWVLNEEQEYKRAFDLGATGVMTDYPTKLKDFLLNFSA	282110	233876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_234004_234406_234459_235740_235801_238496_238631_245763_245854_246370_246490_252192_252239_253436_253573_267038_267121_271501_271545_281839
835019	contig_2100_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_50597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGAAGTCTTCTCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677820	678662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_677800_678700
835021	contig_13074_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_153412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143491	144572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_143500_144600
835022	contig_4891_pilon	+	529	4	Intergenic	novelGene_124573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	615.478314447841	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACTTTTCTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702920	756986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_703063_707771_707925_708893_708969_756827
835023	contig_9903_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_172021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165242	166406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_+_165200_166400
835024	contig_12340_pilon	-	1559	2	Intergenic	novelGene_122116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTAATGCTGAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145013	143187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_143242_143508
835025	contig_5860_pilon	-	1831	3	Intergenic	novelGene_147954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	104	166	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	108	533	139339	135795	FALSE	15	GAAGCACGGCTTGTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQPLGVNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED	139446	134496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_-_136011_136833_136953_139248
835026	contig_16411_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_77398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAACAGAGGAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415263	415955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_415300_416000
835027	contig_20055_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_175061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	3	488	49038	48553	NA	40	AGAAACTTGGAATTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEDIESWGDEGIDSWGDEGIESWGGEGIESRGGEGIDSRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESRGGEGIESWGGVGIESWGGEGIDSWGGEGIDSWGGEGIESWGGEGIESWGGEGIESWGGEGIGEVKA	49040	48302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_48300_49000
835028	contig_9274_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_151164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607298	607969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_607300_608000
835031	contig_5623_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_154876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281993	282736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_282000_282700
835033	contig_1339_pilon	-	842	6	Intergenic	novelGene_163106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	52.1022072469104	117	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	304	780	164607	162104	FALSE	20	AACTGGGAGTGACTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVIKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADVMMQALLGTRAKETFDLRAHLKQVKKEDTEKENRGVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG	166384	162041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_162188_162910_163088_163842_163933_164481_164614_165174_165217_166129
835035	contig_4857_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_48667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAGCAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033172	1031440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1031400_1033200
835036	contig_13593_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_156111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAAGGCTCTCCCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16470	16873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_16500_16900
835037	contig_14472_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_111185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACAACTTGGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394932	396300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_394900_396300
835038	contig_16260_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_177142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTTGAGTCTCCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4270	4933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16260_pilon_+_4300_4900
835039	contig_7180_pilon	+	963	7	Intergenic	novelGene_169040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	29.3015926757119	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	139	675	34705	254181	FALSE	35	AGAAATACATTTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGSYLAEFLLDKGYEVHGIVRRSSSFNTGRIEHLYKNPQAHTEGNMKLHYGDLTDSTCLVKIINEVKPTEIYNLGAQSHVKISFDLAEYTADVDGVGTLRLLDAVKTCGLISSVRFYQASTSELYGKVQEIPQKETTPFYPRSPYGAAKLYAYWIVVNFREAYNLFAVNGILFNHESPRRGANFVTRKISRSVAKIYLGQLECFSLGNLDAKRDWGHAKDYVK	22185	254469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_22234_32790_32879_34702_34813_191894_192088_192887_192993_242049_242178_254178
835042	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
835043	contig_8628_pilon	-	597	5	Intergenic	novelGene_164415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTCTTGACCAGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397230	384794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_384856_388160_388286_395393_395486_396163_396359_397106
835045	contig_13457_pilon	+	1285	8	Intergenic	novelGene_118328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_4	104.850914567849	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	231	1013	55746	57730	FALSE	25	CGAGGACAATTCCCGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	55353	58002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
835046	contig_12977_pilon	+	1103	10	Intergenic	novelGene_122802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	858.401227088281	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	120	380	48712	52378	TRUE	40	TCTCCCACAGGGAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKIGCTSRTLSCWRRCGLSGSRNTGPPVRPSSCRSLTG	47258	58765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_47366_48699_48763_49441_49541_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57233_57378_58495
835047	contig_8050_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_114826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCTGTGTATCACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298633	299292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_298600_299300
835048	contig_1009_pilon	+	1819	9	Intergenic	novelGene_121748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.31695671910659	25	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	310	1059	246661	254742	FALSE	20	AGGGACCTTCCCTCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWASSLLITWRCCLQMRSPSPSSRRPTRCWNMEKPWPSTTSRGIWTWSCPSARGERICLIRKVNENWYEGRISGTGRQGIFPATYVHVCREPRVRICDDGPQLPGSPRLTAAARLASNPSFSSAPRRPADPTDWGGQTSPHRTGFSFPTQEPRPQTQSLRISGSALSHPQGTSHPLAPGASSSSTTQIHWTPYRAMYQYQPQNEDELELWKGDWVDVMQQCDDGWFVGVSRRTQKFGTFPGNYVAPV	245800	255502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_245933_246127_246181_246318_246366_246583_246699_248847_248974_250305_250619_251520_251625_252185_252293_254680
835049	contig_6589_pilon	-	640	6	Intergenic	novelGene_25856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1543.10925083093	6	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCTCTTTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957846	955182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956119_956711_956815_957251_957398_957758
835050	contig_16211_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_150073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTAGGTCCGACAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100483	99790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_99800_100500
835052	contig_6215_pilon	-	1498	4	Intergenic	novelGene_21244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590723	581809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_582962_584024_584168_588150_588249_590618
835053	contig_6550_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_110659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGTATAAATGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58743	59526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_+_58700_59500
835055	contig_7695_pilon	-	867	3	Intergenic	novelGene_41561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	228.5	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	65	832	380076	373606	FALSE	20	GGTTTTTCAACTTAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQAAVVHENTPFVVPCLRDVLGSVRSVPQEPWTLIYLLSSDPLCLAFPLSCPFTCSSIRSFLFVFCSPAGLTVYRNWWGLCCLLPASCFQWVLDMGNNLGESVTASGSSFWPKGLWQVDV	381069	373570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373962_379664_380089_381017
835056	contig_2703_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_101752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTCTACATCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562637	564636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_562600_564600
835058	contig_5988_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_16061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGCAGTGAACAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148803	1147143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1147100_1148800
835060	contig_16204_pilon	+	1744	6	Intergenic	novelGene_154530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	73.4857809375392	1	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	333	812	459331	461481	FALSE	35	GTGAGACAATAAATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGAVIGCDSGCHAILDTGTSLVTGPPEPIFNIQRIINARQSYGGEYIMDCEAINTLPDIIITINGVDYPLPASAYIRQEHTGICYSNFLATPGNLSREIWILGDVFLRLRLQRESGLLQGATRPTLNTCMGGMPAQGSRFELCSVLYKAPFSVENILF	454758	462413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_454992_457373_457453_459310_459469_459559_459659_461195_461288_461330
835061	contig_4012_pilon	-	930	4	Intergenic	novelGene_176881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_3	44.9691252107735	146	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	236	631	613341	612179	FALSE	20	GAACGCTGCTGTATGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSFSQFRFAEEKEWDGEASCPKQNSAFYVDCQSLVQALQELPLSLRLNVAAELVQAAVPLELPQVKTKRSNDSKGLGMQLKGPVGPASELKSAAASCSVDLGREHSTPGPPRGSQNPASAPQTEADHLEEELDLLLNLDAPVKEGGDILPDQTSQDLKSEKDRTVAQEEEAPVKPSVTEEKNVGSEQPSTSKNVTEKELEDWLDSMIS	620859	611879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_-_612295_613061_613408_614469_614566_620786
835063	contig_3789_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_79881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTCGATCCATAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551848	550389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_550400_551800
835064	contig_11281_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_125452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	88	435	813645	813298	NA	50	AAGGCCAAAGAAACAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPISINEPPAIYDGNWHHPNSLPHIQSSGMLLGQLLILRIKSVYFCSSSLCSHVGEGHHHLWLLRQPPSWCPLMPSDHTTLFVLRPDQPKPSWSSLALPRSPAPLSASVFSLACSLLRAPTLSLTSGPLHLPFLLPETLSISLS	813732	812366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_812400_813700
835065	contig_8020_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_114421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAATAAATGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229030	230504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_229000_230500
835067	contig_5050_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_110250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249739	248852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_248900_249700
835068	contig_3942_pilon	-	724	7	Intergenic	novelGene_128804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.092794765062	235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	51	683	1060159	1050150	FALSE	5	TGATGCTGTGCTCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVVRPSYRKPGPSAPFSYQ	1060209	1050108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050186_1053126_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
835069	contig_3382_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_124038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTTGTAATATAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187323	187766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_187300_187800
835070	contig_3382_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_124039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTCCTCTGGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187816	188200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_187800_188200
835071	contig_5445_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_135434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGGATTGTTCCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142859	141912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_141900_142900
835072	contig_2770_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_107420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCACCATTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239355	238284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_238300_239400
835074	contig_13004_pilon	-	782	4	Intergenic	novelGene_112631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_2	127.14908135291	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	103	429	242710	239281	FALSE	30	CTTATAGATTACCATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTEAWKEGPYCQKHELNTSEIKEEEDPLVHLSEDMIARTYNIFAIMFRYAVEILTWEKEGELPADLELTDKSDTYYCMLFNDEVHTYEQVIYTLQKAVNCTQKEAIGFATTVDRDGRRSVRYGDFQYCEQAKSVIVVSNFKT	248902	238927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_239365_239992_240132_242606_242738_248827
835075	contig_4845_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_53696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGCAGAGATGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913478	912846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_912800_913500
835078	contig_5832_pilon	-	1383	5	Intergenic	novelGene_134181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	46.5617869072913	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	296	544	590172	584331	FALSE	55	GAGAATAAGGATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPARETKSSWPGGLSSFQGGTWPGIPAFGVVSPPSLGGSQGTHSLPLSVFPLQEEETQAIQQTTGQIQIPCKREAAAGHPWPRLLQRRNKCSLESRNMMKSWLLIFILFPLKLVEKCESTVDLIVPPVVRLENGSSTSVSIALRHPLNATLVVTFKITFRSKNITILELPDEVSSNSDR	592861	583491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_584440_585683_585763_590111_590192_591676_591829_592737
835079	contig_8580_pilon	+	948	8	Intergenic	novelGene_156086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	63.9598088087913	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	62	853	253010	273102	FALSE	5	TTTTTTGTGTGTGGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVWSRARGPFERGTRQPAAMSLWVDKYRPCSLGRLDYHKEQAAQLRNLVQCGDFPHLLVYGPSGAGKKTRIMCILRELYGVGVEKLRIEHQTITTPSKKKIEISTIASNYHLEVNPSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQTGGEVPSQPPEGAPDVRGVPRAARYPFTADQDIPETDWEVYLREAANAIVSQQSPQRLLEVRGRLYELLTHCIPPEIIMKGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	252948	273197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262176_262244_267596_267666_267737_267839_271126_271197_272910
835081	contig_8453_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_125144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCAATAGTTATTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286142	287624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_286100_287600
835082	contig_9706_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_20919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCAAGCTGAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140392	142191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_140400_142200
835083	contig_2867_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_135274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562247	1563580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1562200_1563600
835084	contig_10737_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_133889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_6	5.8022983951764	90	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	411	905	268447	189346	FALSE	10	CGTTGTCCATGGATTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDREWESTETAVAELHKKIKEAFEVFDHESNNTVDVREIGTIIRSLGCCPSEGELHDLIAEVEEEEPTGYIRLEKFLPVMTEVLLERRYRPIPEDVLLRAFEVLDPTKRGFLTKEELIKYMTEEGEPFSQEEMEEMLSAAIDSESNSIHYKDYITMMVVDDN	268857	189104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_-_189462_195596_195664_195774_195818_196430_196511_219903_219977_244701_244787_268416
835085	contig_7022_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_142160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGGAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300301	299028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_299000_300300
835086	contig_18794_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_54669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGATGTACTTGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352433	354048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_352400_354000
835087	contig_513_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_80180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTATACCTCTGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588838	589761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_588800_589800
835088	contig_10627_pilon	+	518	3	Intergenic	novelGene_59921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	220	363	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	67	498	105394	109684	FALSE	30	ACGCACAGACTTGTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLVLSPVLSNCLVVLLLLLSAGKTVPTTKADPPPTPTPGPQLSRKGLDWKGHKAVIWSRSSQDKLDQTSGVLLGSRSCLGWGRQRLVWNLQMDSEQTSSLRSLARAMTPNSAPDGPPRAVSLSPSASHPGPPRPQTHYTME	105327	109704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_106064_106095_109349
835090	contig_14322_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_116191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6339	junction_1	0	34	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671900	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817
835091	contig_10159_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_30810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417132	417742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_417100_417700
835092	scaffold_15568_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_122566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTACAACAAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4463	3408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_3400_4500
835093	contig_6048_pilon	-	678	5	Intergenic	novelGene_73101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	35.7027659992892	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	327	434	219882	219453	FALSE	15	AGCTTTGGCTTGGGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVDDLLKFERKFQSEKVAGSVSKSTQFEYAWCLVRSKYNDDIRKGIVLLEELLPKGSKEEQRDYVFYLAVGNYRLKEYEKALKYVRGLLQTEPQNTQAKELEHLIDKAMKKDGLVGMAIVGGMALGVAGLAGLIGLAVSKSKS	223265	219208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_219551_219872_219979_220412_220490_222244_222378_223245
835094	contig_7909_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_155885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAAACTCAGCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156782	158179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_156800_158200
835095	contig_665_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_158196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAATAACCTGACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124882	124241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_124200_124900
835096	contig_7593_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_127374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACATACACATATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752423	753411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_752400_753400
835101	contig_3960_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_138037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAGCAAAGATCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608048	606114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_606100_608000
835102	contig_13440_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_170517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147847	146004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_-_146000_147800
835103	contig_5551_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_134237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCTTTAATTTTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395692	397175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_395700_397200
835105	SIRV6	+	514	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	14	3	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
835106	SIRV4	-	330	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1188	3	1188	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3970	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_4000
835107	contig_8322_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_143276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCAAGGGACACCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535849	536265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_535800_536300
835108	contig_5671_pilon	+	466	3	Intergenic	novelGene_79431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3025.5	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368840	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370443_531429
835110	contig_14895_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_106694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83220	82215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_82200_83200
835112	SIRV4	+	233	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1538	632	1083	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2538	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
835113	contig_12543_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_168362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATAATAAAAAAAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176157	177827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_176200_177800
835115	contig_91_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_127106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTACTTAAGCAGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353014	354088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_353000_354100
835116	contig_12046_pilon	-	1043	5	Intergenic	novelGene_83463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	23.2916293977042	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	149	655	241250	235993	FALSE	55	AAGTTGAAAGAAGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLALNDLLICCRHLEHDRATERRKEVEKFKRLIRDPETVQHLDRHSDSKPGKFLNWDAVFRFLQKYIQKETECLKTAKPNVSASTQSSRQKKMQEISSLVKYFIKCANKRAPRLKCQELLNYIMDTVKDSSNGAIYGADYSNILLKDILSVRKYWCEISQQQWLGMF	246844	235604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_236169_239280_239427_240980_241094_241178_241281_246726
835117	contig_6842_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_130770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340324	1341078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1340300_1341100
835119	contig_14219_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_54334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACAAGAAAAATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789832	787858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_787900_789800
835121	SIRV6	+	367	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	9	1	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
835124	contig_1618_pilon	+	1050	4	Intergenic	novelGene_141773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.1809358517739	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	489	932	238960	239403	FALSE	70	AAAAAAAAGGGCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIYNHSYIYMPAFSMKTGTEPSLRVYYTLSDVGANQTVLFANPNFLRNIGKFWKSRGIHAKRLSTGLFLVSAALGLCEEVAIYGFWPFSVNMQEQPISHHYYDNVLPFSGFHAMPEEFLQLWYLHKVGALRMQLDPCENTSLQPTS	79919	239521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_80162_194002_194113_202112_202206_238916
835125	contig_5947_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_101617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTAGCAGCCGAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994854	994303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_994300_994900
835129	contig_18081_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_23788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTCTAAACTCTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92438	92014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_92000_92400
835130	contig_9389_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_84150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATGCATAAAGATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844116	1846383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1844100_1846400
835131	contig_10500_pilon	-	1317	8	Intergenic	novelGene_41166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_5	74.6187589261137	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	96	1175	1290675	1272002	FALSE	50	GAATTAGAAGAAATAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSKADVERYIASVQGSAPSPREKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLYELEENIDKAVECYKRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPTIYKLKEQLLDCKGEDGWNKLFDLIQSELYARPDDVHVNIRLVELYRSNNRLKDAVAHCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKDYLESLQCLDSDKSNWRITSRDLLLAYANLMFLTLSTRDVQECRELLESFDSALRSVESSVGGNDELSATFFEMRGHFYMHAGSLLLKMGQHSDVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLMKGEAGQNLLEMMAYDRLSQSGNSNV	1290770	1271859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1272107_1275639_1275833_1278008_1278155_1278499_1278731_1282879_1283033_1283520_1283633_1284886_1284955_1290603
835132	contig_3942_pilon	-	822	5	Intergenic	novelGene_128827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCAGCCGGTGGGTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191921	1190324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1190393_1190636_1190823_1190929_1191071_1191168_1191364_1191689
835133	contig_14953_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_137283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTAATGGCTGCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191739	190260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_190300_191700
835134	contig_20842_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_160968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTAATTGATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58446	59163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_58400_59200
835135	contig_14341_pilon	+	557	4	Intergenic	novelGene_111862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3063	junction_3	1348.60158023866	8	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	117	506	550058	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	549941	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_550151_550355_550485_551481_551581_551668
835137	contig_18544_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_152764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCCCAGGAGTATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213274	212333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_212300_213300
835138	contig_10867_pilon	+	457	5	Intergenic	novelGene_159451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	308	358	87759	88615	TRUE	10	GAGGCGGAGCCGCGGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYTADVFILHLLCHELIGNRFQQLRLLSIGSHKVCFSGWSRLALQLNPGTFLFGFLLFLIIFLHTFQEAISALRVLNVLDTHINSLGKNLALNLFVHNNANSMLGNILKEDKSTYHAF	86776	91460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_86901_87085_87236_87725_87774_88579_88688_91433
835139	contig_15323_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_148538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCGGTGTCCTAGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166985	167892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_167000_167900
835140	contig_13481_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_119442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGGCTGAGGAGTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034548	1035424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1034500_1035400
835141	contig_4388_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_161940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAGAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12015	12772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_12000_12800
835142	contig_12644_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_44459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	227	1636	928383	926974	NA	40	ACAATAGAATTATGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLSHADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIMKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEFEQCIKLWLHALHLRQKGNRNTHKDLLRFAQVFSQMIHLNETVKAPDIECVLRCSVLEIEQSMNRVKNIPDADVHNAMDNYECNLYTFLYLVCISTKTQCSEEDQCKINKQIYNLIHLDPRTREGFSLLHLAVNSNTPVDDFHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNAVDNEGNSALHIIVQYNRPISDFLTLHSIIISLVEAGAHTDMTNKQNKTPLDKSTTGVSEILLKTQMKMSLKCLAARAVRANDINYQDQIPRTLEEFVGFH	928609	926913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_926900_928600
835143	SIRV4	+	322	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1421	660	966	-28	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAGTCAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2400_2700
835144	contig_10437_pilon	+	630	3	Intergenic	novelGene_38510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTCTGGTAATGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344541	1384785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1344892_1383313_1383550_1384741
835147	contig_7058_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_136016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAAGGCAGTCATTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70080	68650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_68600_70100
835148	contig_14397_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_134646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAGAATAAATGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74781	73655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_73700_74800
835149	contig_13945_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_173457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96479	95516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_95500_96500
835151	contig_7758_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_163546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAGAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190540	191754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_190500_191800
835153	contig_7342_pilon	-	1162	4	Intergenic	novelGene_71133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.49443825784929	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	91	393	94017	92364	FALSE	10	ACCTGCTTTTCAGGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAAAAAAAATAAAASSLCAAAASAISATSMREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYVPRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGSSMLWRA	94107	91594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_92390_93133_93245_93352_93462_93960
835154	contig_10074_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_57086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGGTTGCCCTGTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105794	104807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_104800_105800
835155	contig_6898_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_35741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTCTCCAGCTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110789	111901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_110800_111900
835157	contig_13460_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_162199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGCCCAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390980	392159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_391000_392200
835158	contig_16870_pilon	-	1116	4	Intergenic	novelGene_155529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	719	1114	260077	247033	FALSE	15	CGCAGCAGTGTCGCCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGISRRVWSMSCTSRYRWITYASSSSSTKRVGARVSGETLVAVRVVERHSGRTGGQQQLLQWGGGDVVRIEQASAMAPGPEGHICGTTKRLRSEKRGAPRTPPYLRLEAGATNPQLAGASPEAGGAGAVP	261942	247030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_247303_259951_260079_260707_260807_261324
835159	contig_4832_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_163399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAAAAATTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268880	269647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_268900_269600
835161	contig_5018_pilon	+	504	6	Intergenic	novelGene_46967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCAGGCAGGCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412640	413830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_412776_413074_413158_413248_413350_413451_413506_413623_413684_413759
835162	contig_2480_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_63568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTATCACAGCTTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445650	443414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_443400_445600
835163	contig_10444_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_139459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748769	749281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_748800_749300
835165	contig_7202_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_17485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTCTTGGCGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27917	27622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
835166	contig_9940_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_125347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAAGGATACAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149860	148224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_148200_149900
835167	contig_11986_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_69085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTCTGTCTATGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21720	22185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_21700_22200
835168	contig_7720_pilon	+	444	4	Intergenic	novelGene_155763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	2887.32821518826	814	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	15	401	699791	707424	FALSE	30	CTTGGGAACCAAACAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAAMAPVKKLVAKGGQKKKQVLKFTLDCTHPVEDGIMDAANFEQFLQERIKVNGKAGNLGGGVVTIERSKSKITVTSEVPFSKRYLKYLTKKYLKKNNLRDWLRVVANSKESYELRYFQINQDEEEEEDED	699776	707467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_699803_701856_701962_705016_705142_707279
835170	contig_3081_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_133973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCTCTAAAATTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200124	1201164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1200100_1201200
835171	contig_3081_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_133974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCACTGGCAAGACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201215	1201819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1201200_1201800
835172	contig_5286_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_157341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATCAGCCCACCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514103	513177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_513200_514100
835173	contig_20609_pilon	+	910	9	Intergenic	novelGene_118473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.8896354552003	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	780	129	908	52568	59323	FALSE	5	TGCCTGCTACTGCCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACANHVSAMASFLKGAHVTINARAEEDVEPESIIQKVAKASGANYSFHKESSRFQDTGPQAPVGSVYQKTNAMSEIRMVGKDSFWAKAEKDEENRRLEEKQRAEEERQRLEEERQERERREAARREQCYQEQDHESSLRRKPEQQQEVVSGTGADQQSACQQPMHPRDIFRQKGLGVESEGRYKSVTTTAHASVGPALPVCQPCAPLGQLQLLLQSSCFRKSNKKMA	43707	59325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_52546_52634_53372_53448_54340_54488_55225_55304_55672_55825_56053_56103_56493_56544_59160
835174	SIRV6	+	228	4	ISM	SIRV6A	SIRV602	574	8	552	492	373	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_2780_2829_3106_3165_10724
835175	contig_15897_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_49574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	175	570	824127	823732	NA	20	GAACTGCCCCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKSMFFTVKSDLVKNRNWRRHLYWIVPFNQINHMDYEGHRTYKQRQMIESVNHGGPTPGVMALRTGPNALRSWLKLLPHQILSSCQERANDAPAVQCGHTTLHRRVCCKFIRVTYTLLIHIQHNKFKCY	824301	823645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_823600_824300
835176	contig_4136_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_161252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162464	161700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_161700_162500
835177	contig_12644_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_44516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAATGGCTGATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134379	1134739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1134400_1134700
835178	contig_9575_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_169716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTATCTGCAGTGGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56506	55966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_56000_56500
835179	contig_9724_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_172581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAACAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20466	19824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_19800_20500
835180	contig_12886_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_135496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	482	880	466838	467236	NA	80	ATCCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEMGNKCWQGCGETGTLMSCWGECKNGKAPMNNSLEVPRQVKYRTTIRSSNSTPSRIPKRLESRNSETCTPMFTAALFTRAKRWKQPKYSSRDEWISKTWYIHTLDDYSAIKREEVLIHGAARMNLETLC	466356	467925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_466400_467900
835181	contig_3817_pilon	+	1363	6	Intergenic	novelGene_78336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	31.1448230047949	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	13	816	254926	263052	FALSE	15	TGGTGGAGATGGTGGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNQDQTNCSVPTYPSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSAKYPEVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDEVVVPLDTMRSPSCDSHQQSYPRKWRTDNAPL	254913	263599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_254938_255191_255259_258575_258893_260678_260807_262233_262356_262894
835183	contig_12021_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_172201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166687	164798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_164800_166700
835186	contig_8616_pilon	+	631	11	Intergenic	novelGene_72378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_10	50.9961763272503	315	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTACCTTGAGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195756	199031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_195813_196156_196212_196479_196640_196862_196914_197236_197268_197609_197657_197845_197881_198085_198124_198540_198588_198825_198858_198952
835187	contig_10489_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_165640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCACAAGTATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615562	614952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_615000_615600
835189	contig_5018_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_46995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTCACACTCATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200413	1200042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1200000_1200400
835190	contig_15273_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_140433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAGTAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114668	115309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_114700_115300
835192	contig_13760_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_61365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACCTATTCACCTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409219	410568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_409200_410600
835193	contig_14133_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_119958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1731.35387775001	7	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	412	585	207422	206601	FALSE	25	TTTCTCAAGTAGTATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAIGSHGAQPEWHDPEAPLPQGLAAARSHVVQPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209132	206562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208683_209034
835194	contig_11106_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_167455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156133	157625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_156100_157600
835196	contig_11982_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_100264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129543	130482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_129500_130500
835198	contig_8291_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_99950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTGGAAGGTACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422866	424152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_422900_424200
835202	SIRV5	+	411	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	12	7460	1	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
835205	contig_2027_pilon	+	1153	2	Intergenic	novelGene_39955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGCTTGTTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647266	649420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_647505_648505
835207	contig_11052_pilon	-	649	3	Intergenic	novelGene_115463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCAGCGTAAGAGCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107704	102852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_-_103134_106344_106452_107443
835208	contig_11572_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_100074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAGGATAATCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360558	359744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_359700_360600
835210	contig_6163_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_103840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTTTATTCTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426987	426305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_426300_427000
835211	contig_4783_pilon	+	1168	2	Intergenic	novelGene_108379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTCCAGGTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198455	211547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_198683_210606
835212	contig_2854_pilon	-	1570	7	Intergenic	novelGene_120833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	74.4975763960741	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	686	1372	274434	257841	FALSE	10	TCTTCCGTGACTTGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	276400	257642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368_274468_275541_275702_275862_276294_276339
835215	contig_8145_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_118671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAACTTAAGCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906749	906325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_906300_906700
835216	contig_10446_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_162449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258543	259170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_258500_259200
835218	contig_16666_pilon	-	1180	7	Intergenic	novelGene_61725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	286.196562212446	9	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	432	734	30779	24486	FALSE	25	GTGCCCAGTAAGTGCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKKTVVSEFYDEMIFQDPTAMMQQLLTTSRQLTLGAYKHETEFAELEVKTREKLEAAKKKTSFEIAELKERLKASRETINCLKNEIRKLEEDDQTKEI	47784	24039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_24656_30557_30646_30734_30828_42432_42529_42637_42705_44969_45090_47684
835219	SIRV5	+	396	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	-1	7488	-1	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
835220	contig_8357_pilon	+	1456	5	Intergenic	novelGene_39784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	2.58602010819715	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	22	1005	933517	963352	FALSE	50	AAAGAAAATCGGATTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDTSLLWMLKFHKCLELLVGVDTNEDKLRRKEYKLSPLVGDYLKPRERTLTVTLYHGSAVERDSRLLGFDLITCIELIEHLDSEDLATFPEVVFGFLSPAMIVITTPNSEFNPLFPAVTLRDSDHKFEWNRMQFQTWALDVANLYDYSVEFTGVGDPPAGAEKVGYCTQIGIFRKNMAKAAELCVPEEHGEHVYKVVFTATYPSLQQKKYRQYAVVNEVISQVYDMRRNLLESLKLQDDKDFAGVPEDTGTSEAPCQCFQPVLTQLNANMEKTPKPFCVGNVFYVPLERLFSLPKVQHLCINVEMLKTLIADAVMLNSDGSAVMVDIHDEGSDD	933495	963803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_933591_934557_934693_956977_957158_962025_962204_962935
835221	contig_8544_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_55938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186507	188099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_186500_188100
835222	scaffold_19766_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_34300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCGGGGGTTGGGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530830	531064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_530800_531100
835223	contig_9113_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_68600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGCTCCTGCCTGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363655	362605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_362600_363700
835224	contig_11885_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_159707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233070	233282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_+_233100_233300
835225	contig_15631_pilon	+	693	5	Intergenic	novelGene_151538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	58.997351635476	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATGCCAACATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386491	393818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_386629_388588_388674_389347_389435_393240_393301_393494
835226	contig_1856_pilon	-	1110	3	Intergenic	novelGene_84883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_2	89.5	216	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	495	944	260083	259331	FALSE	20	TTTCATTTTTCTTAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLTFLFVILHVYKALCEEILWDTTIKFAENMTLECTYSLMDSLTQMEWFKINTTKKESMAIFNPTYGGIIREPYANRVYFLNSTMASNHMALSFYNASETDVGFYSCSLYTFPSGPWKKVIRVVQSGKGKFHFPFPPPTTFDSTKPK	271563	259164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_259735_260037_260191_271176
835227	contig_11702_pilon	+	967	8	Intergenic	novelGene_141949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	7.54848275064166	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	321	965	282557	284031	FALSE	25	CAGTGCCAAGGGCACCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIVYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFIIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYKPLVYNNTYVYPWWGEAMGWGFALSSMLCVPLHLLGCL	282062	284033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_282200_282279_282384_282477_282603_283113_283227_283312_283451_283527_283631_283709_283811_283887
835228	contig_14338_pilon	+	663	5	Intergenic	novelGene_174835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	27.9866039383131	293	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTGTGTTTGGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30838	42645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_31031_37749_37819_39581_39640_42116_42221_42405
835229	contig_1090_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_131135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTTTTCCACAACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462779	464333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_462800_464300
835230	contig_10855_pilon	+	935	6	Intergenic	novelGene_124374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	21.1527775953892	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	227	556	780603	789532	FALSE	10	ACTCTTTGTTCTCACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDGDSTWVPAQDLGRPHEGNVEEKGMVAGFLTTWSQESVAFEDVAVDFTPEEWVLLDRSQRTLYREVMLETYRNLASLDWRTQLKTKESTSKQDIFGESMFKGMKM	772728	789911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_772824_780471_780634_781331_781418_782042_782170_785798_785882_789529
835231	contig_11427_pilon	-	737	7	Intergenic	novelGene_79000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	87.1424440531453	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGTATAGCAGAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640310	596975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_640241
835232	contig_18231_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_105882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGGATTCTGACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237281	237040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_237000_237300
835233	contig_10904_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_22780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAGAATTTAAAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752224	752526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_752200_752500
835234	contig_5005_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_84305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGGTGTGCGTGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344937	344591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_344600_344900
835235	contig_15021_pilon	+	1099	8	Intergenic	novelGene_26986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCTCCTCTCTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389113	426138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_389542_415994_416114_417093_417210_419337_419500_420184_420316_420895_420970_421597_421649_426120
835236	contig_11978_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_62908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAGAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790335	788161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_788200_790300
835237	contig_252_pilon	-	729	5	Intergenic	novelGene_99914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	367.495833309713	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACGAATGAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68228	41858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_67926
835239	contig_13224_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_104080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCCAGTTTGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170934	170256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_170300_170900
835240	contig_3818_pilon	-	1356	8	Intergenic	novelGene_99279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	18	junction_2	44.4255855680173	131	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	235	1185	701547	695411	FALSE	15	TAGCTGGGCTTTTATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFGARRLLTALLQPQPQRWPLQPSRDMRLVQFQAPHLAGPRLGLESGNDRGVIDLNAFDSTLPKTMIEFLEQGEATLSVARRALTASLPTLLRSEVTFLPPVTRPDKVVCVGMNYVDHCKEQNVPVPKEPIIFSKFASSIVGPYDEVVLPPESQEVDWEVELAVIIGKKGKHIKATDAMAHVAGFTVAHDVSARDWQMRRNGKQWLLGKTFDTFCPLGPALVTKDSVPDPHNLKICCRVNGEVVQSSSTSQMVFKTEELIAWVSQFVTLYPGDVFLTGTPPGVGVFRKPPVFLKKGDEVQCEIEELGIIINKVV	703652	695239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_695474_695589_695678_695800_695910_697488_697652_697925_697986_699628_699846_701296_701574_703444
835241	contig_9366_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_166243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTTCTTAATAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852695	851363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_851400_852700
835242	contig_13894_pilon	-	716	4	Intergenic	novelGene_62061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	679.409711113666	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	271	693	287445	286246	FALSE	25	TGTAGTGAAAGTACTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLVRVVRSGCLYIGLC	288310	286222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286290_286969_287123_287219_287538_288132
835243	contig_13894_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_62024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.8609095887935	191	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	242	421	280119	280646	FALSE	5	GCCGTGTGTGTGACTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QACRLLCCGGAWSCWRSQRPPQAAPNQAKPSRASVKRARKAKATQTRKLRNSAKGKVPKSALAEFQKRECQDHLKTNLKFMTCARITVAEAVTRQILLQNRGRKACDRPVAKMKKNKKAESTVFTEEDFQKFQQEYFGS	277469	281033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_277528_277690_277821_280065_280164_280511
835245	contig_8617_pilon	+	174	1	Intergenic	novelGene_73489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTCTTATAGGATTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63405	63579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63400_63600
835248	contig_4442_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_127952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTTAAGGTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319476	318656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_318700_319500
835249	contig_5495_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_157668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCCAGTTAGGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527342	529594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_527300_529600
835252	contig_10434_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_82020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAGAAAGAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101717	102049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_101700_102000
835256	contig_401_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_42782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086602	1085040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1085000_1086600
835257	contig_8270_pilon	-	1157	6	Intergenic	novelGene_143801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_4	57.1860122757305	558	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	585	989	409509	380364	FALSE	25	TGTTTTCAAATTTTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRVQPDVVKDKETERNLQRIATRGVVQLFNAVQKHQKNVDEKVKEAGGSIRKRAKLISTVSKKDFISVLRGTDGSTNEKSSAGKKSKAKQTEVKSEESPGWNIFRDDFMMGASMRDWDKESDGSADSQPGATS	429504	380195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_380496_406158_406361_409438_409537_410968_411098_412730_413006_429351
835258	contig_9363_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_6696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATGATGTGTGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282993	1282318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1282300_1283000
835259	contig_6896_pilon	+	1401	5	Intergenic	novelGene_174228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	11.0453610171873	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	6	545	645658	650557	FALSE	50	AACAAAACAGAGTATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAGVGEDSLALFGAGVRAALEAWPALQIAVENGFGGVHSQEKAEWLGGAVEEYFIRNADLELDEVEDFLGELMTNEFDTVVEDGSLPQVSQQLQTMFHHFRRGDGAALREMASHITQRKCRVTATALMTARETDDEEEDADSTEEMEVCPEPEPSGPDSQTIEEEDIVEDGWTIVRRKK	645652	651413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_645739_645880_645972_649374_649467_650009_650187_650458
835261	contig_17440_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_7614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTAAGAAGAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3325	3054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3100_3300
835264	contig_9771_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_156929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGTATATTTTCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544782	543508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_543500_544800
835269	contig_14785_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_158417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAACTAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137323	138537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_+_137300_138500
835270	contig_12852_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_141444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCCTTCCTTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475930	475051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_475100_475900
835273	contig_14068_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_165967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAAGTAACTGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85609	86946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_85600_86900
835275	contig_14725_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_173602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCGTGTGGAGACTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415903	417679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14725_pilon_+_415900_417700
835276	contig_12993_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_136746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGAATACAGTATAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178016	176570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_176600_178000
835277	contig_546_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_117248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAGGAGGAAGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462333	463262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_462300_463300
835278	contig_546_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_117249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTGAAACATTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463438	464272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_463400_464300
835279	contig_10126_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_105776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	404962	404594	NA	25	TCTAGCTTTTACATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSYFLHLLIADLFCPAFLFYLVISEQAGCGTEEASQCGWGKSSQRGTGASCATIAACWEAADWPTGKRQRLSRRRQGGVWESVYRWLLSAVSCWELHESAFLYSLSTNLRQGSKLVDPCCVS	404962	404385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_404400_405000
835280	contig_6740_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_142738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTCCTGTTCCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783899	783144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_783100_783900
835281	contig_13097_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_107669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAACATCTCAGCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15344	14571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_14600_15300
835284	contig_16535_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_167700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86568	87557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_86600_87600
835286	contig_11564_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_158548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCGCAGGGAAGGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40808	39850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_39800_40800
835287	contig_15273_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_140425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	32.5	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAGGCTACAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55075	52506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_53179_53316_53480_54853
835290	contig_6397_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_146267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGATAAGCCAAGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492452	491648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_491600_492500
835291	contig_6397_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_146266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCAGAATAATTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491610	490854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_490900_491600
835294	contig_4442_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_127954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTTTCCTTTCTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374243	375983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_374200_376000
835297	contig_10793_pilon	+	464	6	Intergenic	novelGene_83396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1633.94528672168	392	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130872	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151479_165323_165377_166401_166473_167141
835298	contig_8696_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_153328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAATTTTTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671951	673913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_672000_673900
835299	contig_5286_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_157398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTAAGAGACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711489	713609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_711500_713600
835300	contig_5253_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_61581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAATGAAAATACTCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289848	290626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_289800_290600
835301	scaffold_880_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_121526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAAGTCTCCGGTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583707	584481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_583700_584500
835302	contig_2878_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_176499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTAAATGTTAGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240959	242144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_+_241000_242100
835303	contig_2940_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_82000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGATATGTAGAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176059	1175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1175600_1176100
835304	contig_299_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_129509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCATGACAATATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667336	1667767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1667300_1667800
835305	contig_253_pilon	+	1168	10	Intergenic	novelGene_129716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	119.469609752108	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	718	1125	548329	551581	FALSE	15	GCTAGGTCTGACCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAIFLADGKVFTTGFSRMSERQLALWDPGNLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDSSVVYVCGKGDSSIRYFEITDEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIPPAPPWRNRK	546202	551624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_546248_546957_547161_547537_547661_547750_547882_548030_548213_548295_548416_548970_549076_549151_549298_549601_549639_551548
835306	contig_5947_pilon	-	1695	14	Intergenic	novelGene_101513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	84.6157342650119	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	398	1693	435457	425796	FALSE	60	CAAAGAAGAGAGGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAAVTRVLVLVPTRELGIQVHSVTKQLAQFCSITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHLSSIEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVNSNTDVAPFLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLGLMGLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNTIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEEERKMLKEIVKSAKAPVKARILPQDVILKFRDKIEKMEKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINTAKRLLEKGKEALNQEPERSWFQ	438611	425793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_425871_426094_426202_427926_428105_428212_428295_429134_429289_430088_430231_430358_430459_431274_431426_432222_432397_434531_434638_435430_435518_435927_436123_436374_436433_438527
835307	contig_3269_pilon	-	2582	1	Intergenic	novelGene_117002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAATGGTCACTCTCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45184	42602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_42600_45200
835310	contig_8059_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_111095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAATTTGGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143754	142972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_143000_143800
835311	contig_5999_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_45598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGAATGGTTTAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12933	13672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_12900_13700
835312	contig_5999_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_45599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGCTACCAGCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14070	14947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_14100_14900
835313	contig_13004_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_112642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAAATTCTGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288198	286244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_286200_288200
835314	contig_14333_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_49113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCAGGGTCCTATCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358109	356741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_356700_358100
835315	contig_6137_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_59183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCCAAGCAGATCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273827	1273463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1273500_1273800
835316	contig_10196_pilon	+	1205	14	Intergenic	novelGene_132216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	31.275829562026	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1062	142	1203	1319731	1329143	FALSE	25	GCACATCCAGTTGCAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGIPQIKCFLNGVKIPHVVRLKTLVIKVSGVILSVVGGLAVGKEGPMIHSGSVIAAGVSQGRSTSLKRDFKIFEYFRRDTEKRDFVSAGAAAGVSAAFGAPVGGVLFSLEEGASFWNQFLTWRIFFASMISTFTLNFVLSIYHGNIWDLSSPGLINFGRFDTEKMVYTIHEIPIFIAMGVVGGILGAVFNALNYWLTMFRIRYIHRPCLQVIEAVLVAAVTATVAFVMIYSSRDCQPLQGNSVSHPLQLFCADGEYSSMAAAFFNTPEKSVVSLFHDPPGSYNPLTLGLFTLVYFFLACWTYGLTVSAGVFIPSLLIGAAWGRLFGISLSYLTGTAIWADPGKYALMGAAAQLGGIVRMTLSLTVIMMEATSSVTYGFPIMLVLMTAKIVGDVFIEGLYD	1319114	1329145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1319184_1319565_1319629_1319721_1319806_1320316_1320411_1320744_1320810_1321330_1321448_1322222_1322278_1323309_1323371_1326575_1326715_1327154_1327249_1327572_1327743_1328106_1328159_1328489_1328618_1329131
835320	contig_18822_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_111746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGGGGGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452305	452824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_452300_452800
835323	contig_15036_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_107155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATTACTAACGAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171490	169383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_169400_171500
835327	contig_7521_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_160546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280313	279531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_279500_280300
835328	contig_9883_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_87593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGCTAGTAATGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85242	86067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_85200_86100
835330	contig_4604_pilon	+	1043	6	Intergenic	novelGene_19188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	121.36556348487	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	282	629	540825	548080	FALSE	45	TACCAGACAAGACTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNENLVHMIEHAQKELQKLRKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	526615	548494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_540751_540914_545202_545254_545868_545950_547953
835332	scaffold_880_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_121525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAGTTATCTTGGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580658	581665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_580700_581700
835333	contig_12090_pilon	+	1480	5	Intergenic	novelGene_80482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGCCTACCTCCCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58098	67683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_59072_59838_59951_60901_60990_64357_64413_67431
835334	contig_2125_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_147721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445139	443403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_443400_445100
835335	contig_15720_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_41977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	338	1017	245	1261	455505	456521	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCGGIGHEEVDAANVGVVETTSEKAGYKHPKFPKVTIWDLPGIGTTKFQPRKYLKEMEFNTYDFFFIICATRFKENDLELAKAIKKMKKNFYFVRAKVDSDLYNKKMSHPNTFCKDKVLEEIRDDCLKHLQEAKLEDPRVFLISNLNKFAYDFPNLETTLLKELPAHKRYIFMQCLPSVTDAAIDRKRDFLKQKIWLEALKAGTTATIPFMGFISDNDMEKLEKTLTVYRSYFGLDDASLENMAKKWDLSVEELKAKIKSPHLLLVETDDEKLGEKLLKFVEKVCSISGGLLATGLYFRKTFYLQNYFLDTVVNDAKVLLSKELIKDLVGLDRPNCF	455260	456711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_455300_456700
835337	contig_10196_pilon	+	1351	9	Intergenic	novelGene_132354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	64.4374696896146	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1302	49	1350	2487371	2494792	FALSE	10	CACCCCCGCCTTAGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLARTAVLHTSSSGGTMGWGRCFQGGWTSEGEALIQEVGAWLLVCTCVCWGAFLPVGGGVTVPGPGLGTVSCLNNNILRIDCYLSAPALDPGTDPWLLLTSACSVELPPEEVLVPSDSFTITLHRFIAGQEQVSLVDPQYLPRRHVKLDPPSALQSNVSSDYCILTWSISPALEPMAGFLAYELAFKRQEEAWEQARHKDRIIGVTRLTLEAMELDPGSTYEARLRVKMAQEDDVTKEEHYEGPWSEWSPSVRFPAPRRPDPLTPPWGRPDSTLVAVSVFLLLTGLTYLLFKLSPRVKRAFHQHVPSPAAFFQPLYEVHHGNFQTWMGAHRMGLQLSQEGVGTQLGGSGPSCREAVALLTCSPVWSWPPAHLEEEEDLSALGSEDVLPAGGLELGGQLPAYLPQEDWALVPPIRPVPPDSESCSSDYCALGYYGGVPPLGPPQETCRALC	2487322	2494793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2487399_2490023_2490126_2490355_2490480_2490611_2490746_2490883_2491030_2491481_2491681_2492071_2492178_2493484_2493570_2494414
835338	contig_10765_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_122871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACTCCAGGGATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25265	24673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_24700_25300
835339	contig_8693_pilon	+	924	4	Intergenic	novelGene_150857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	16.0485374896143	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	223	603	1056400	1069118	FALSE	55	ACAGAGCAGGAGAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTRRLRGVNNPCSRGEDGPSFNNPSMAETLPNLQEDFRMQNKSVFILGASGETGKVLVKEILEQSLFSKVTLIGRRKLTFEEEAYKNVNQEVVDFEKLDDYASAFQGHDVGFCCLGTTKKKAGA	1056177	1069439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1056427_1056608_1056852_1061608_1061717_1069115
835340	contig_7744_pilon	+	1284	8	Intergenic	novelGene_62468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7.73542078324622	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	361	1122	452324	460938	FALSE	15	TAGAGCCAGCCTCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKQILCVGLVVLDIISVVDKYPEEDTDRRCLSQRWQRGGNASNSCTVLSLLGAPCAFMGSLAPGHVAENLPDVSAKDFEKVDLTRFKWIHIEGRNASEQVKMLQRIEQHNARQPPEQKIQVSVEVEKPQEELFQLFGYGDTVFVSKDVAKHFGFWSSAEALRGLYGRVRKGATLICAWAEEGADALGPDGQLIHSDAFPPPRVVDTLGAGDTFNASVIFSLSQGKSIQEALRFGCQVAGKKCGLQGYDGIV	451787	461100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_452005_452180_452416_453715_453833_458201_458275_458966_459114_460376_460466_460608_460767_460852
835341	contig_9727_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_86258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	691	1005	62482	62168	NA	55	AAAAAAAGGCAGCAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERRRAEDQNLGGSPDSRPCRQTDAMPWTLLCGLSHHGPVTRTQVTGRNHADRVTVAQQGVGQFCRPAGLEMSHPRGGKERIPPPPRKNSQEPACPLDLGSLY	63172	61693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_61700_63200
835343	contig_15825_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_160206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAGAAAATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142762	143569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_142800_143600
835345	contig_11378_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_112225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTCAGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291997	293735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_292000_293700
835346	contig_11416_pilon	-	420	5	Intergenic	novelGene_145336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	429.657639871561	150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCCGTGGCTGTGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123692	122797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_123601
835347	contig_14219_pilon	-	1287	6	Intergenic	novelGene_54391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	71.6446787975213	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	329	550	1116288	1114030	TRUE	50	AAGACATTATGATGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRILIDTGEPAIPEYISCLKQALTEYNTAIQEIIVTHWHHDHSGGIRDICKNISDDIAYCIKKLPRNPHKEEIIGNGEQQYVYLKDGDLIETEGATLRVIYTPGHTDDHMALLLEEENALFSGDCILGEGTTVFEDLYDYMNSLKELLKIKANVIYPEISENSNFWQYFVRTLKNHLQSQSL	1133848	1107277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1107919_1108569_1108652_1114015_1114107_1116143_1116323_1122717_1122845_1133681
835349	contig_177_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_41777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285883	286504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_285900_286500
835351	contig_12157_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_135913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTTCAGAATATCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178430	177794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_177800_178400
835352	contig_18850_pilon	-	584	4	Intergenic	novelGene_142447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	200.884709887703	82	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193182	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_190905_191759_191866_192915_193051_193161
835353	contig_11579_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_171943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGCAGAAAGAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91130	90432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_-_90400_91100
835356	contig_5574_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_155856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCTAAATACCTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168218	167020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_167000_168200
835361	contig_5075_pilon	+	1501	1	Intergenic	novelGene_174084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTGGTTGGTCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600403	601904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_600400_601900
835364	SIRV6	+	302	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	46	2912	46	-2885	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAGTCGAAGACGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2562	7903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
835366	contig_11396_pilon	-	1269	10	Intergenic	novelGene_71404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	91.3041315847451	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	372	1139	1647812	1644244	FALSE	5	ACTCTGGTGGTCTGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSELGRRLSAECRRNQDDDFRCPVSKPGARFPRLVQQVFGGVSGRKNVTERNNGHPGQAEGAGVHSADRRLPHSLLLEGQDVGQRGGRDIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGTLGASGSGSHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGPGLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649968	1644113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1644896_1645249_1645372_1645524_1645586_1646269_1646357_1646708_1646833_1647806_1647916_1648612_1648831_1649918
835367	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	127	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
835369	contig_12019_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_87709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTCAAAGATCCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236949	237476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_236900_237500
835372	contig_5918_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_99506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAGTCTAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287013	288052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_287000_288100
835373	contig_3817_pilon	+	986	4	Intergenic	novelGene_78325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	758.860110077389	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCAAACTCCTTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178690	199384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_193004_193445_197949_198009_199026
835374	contig_5018_pilon	+	847	6	Intergenic	novelGene_47150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	459.389856222359	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	243	641	1498479	1500271	FALSE	30	GGAGCACAGGCCTAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTSASWAARCWGSLWTLSSPTWLEEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497686	1500477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499181_1499288_1499456_1499588_1500185
835375	contig_11538_pilon	-	2051	2	Intergenic	novelGene_152287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGAAAGAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149362	143370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_144459_148399
835377	contig_12886_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_135519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATTTTATGTGGTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654970	653998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_654000_655000
835378	contig_12278_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_152611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTGGTTTATAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263668	263324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_263300_263700
835379	contig_12278_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_152610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAAATGGTGCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262245	261837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_261800_262200
835380	contig_12733_pilon	+	1195	8	Intergenic	novelGene_129599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_7	217.967793913857	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	81	941	374496	420357	FALSE	15	TTTTGTTGTTTGGAATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPSAGRRLCGSAAGPAGRGRAHGRLMGFASTSASACSAVSAARKEMVPWVRTMGEKLKQRLRLDVGREICRQYPLFCFLLLCLSAASLLLNRYLHVLMIFWSFVAGVVTFYCSLGPDSLLPNIFFTIKYKPKQLGLQELFPQGHSCAVCGKVKCKRHRPALLLENYQPWLDLKISSKVDASLSEVLELVLENFVYPWYRDVTDDESFVDELRITLRFFASVLIRRIHKVDIPSIITKKLLKAAMKHIELIVKARQKVKNTEFLQQAALEEYGPELHVALRSRRDELHYLRKLTELLFPYILPPKATDCRYK	374415	420611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_374696_403393_403515_404909_404987_405070_405150_410213_410258_412078_412167_418596_418682_420190
835381	contig_9415_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_109945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGCATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477324	2476707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2476700_2477300
835382	contig_6595_pilon	+	2166	2	Intergenic	novelGene_122530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTATAAAATATTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346786	349847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_347653_348547
835383	contig_1639_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_74919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	21	329	340209	339901	NA	50	GGTGAATGAAAAATGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPAAAMRLSAPLNIGATSPSPGSALRRGLTFFPAEAGDQGGCGERKGAIPLRDGRWQGLGAWSPAPTASAPELAAGTCRPRRHSCHFLECVPSDSRAPCSPSPLFIS	340229	338472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_338500_340200
835384	contig_14890_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_122525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAAGAGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366282	367080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_+_366300_367100
835385	contig_8027_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_158841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGTTTACAACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284020	283762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_283800_284000
835386	contig_8045_pilon	+	952	9	Intergenic	novelGene_35431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAAGGGGCAGGGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379957	434857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_380047_388108_388199_390871_390986_392305_392396_401354_401528_402003_402178_413303_413407_414823_414889_434803
835387	contig_9132_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_121369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTTCTCCAACTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98287	97376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_97400_98300
835388	contig_2867_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_135238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274512	1275263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1274500_1275300
835389	contig_14536_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_69325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTACTCCCACCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305884	304659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_304700_305900
835393	contig_11335_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_104920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGCCAATGAAGTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343388	345116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_343400_345100
835395	contig_10003_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_88263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTACTTGGTGAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766268	766830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_766300_766800
835396	contig_14219_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_54333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAGTATTAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785181	783626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_783600_785200
835397	contig_13800_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_153696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTTAGAAAAGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77034	75148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_75100_77000
835398	contig_7622_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_132431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCATACCCCAGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280355	279565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_279600_280400
835399	contig_16378_pilon	-	299	3	Intergenic	novelGene_163374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	1000	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCATTAGAGTTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17335	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16378_pilon_-_16838_16969_17114_17222
835403	contig_9345_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_24464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAATCGTATTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581711	580395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_580400_581700
835405	contig_3155_pilon	-	1825	12	Intergenic	novelGene_26436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_11	666.795767114131	217	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	38	1660	332640	295308	FALSE	40	ACCTAGCATTAATAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESKAGGAAGLFAKQVQKKFSRAQEKVLQKLGKTVETKDERFEQSASNFFQQQAEGHKLYKDLKNFLSAVKVMHESSKRVSETLQEIYSSEWDGQEELKAIIGNNDLLWEDYEEKLTDQVVRTMENYIAQFSEIKERIAKRGRKLVDYDSARHHLEAVQNAKKKDEAKAAKAEEEFSKAQIVFEDLNQELLEELPILYNSRIGCYVTIFQNISNLKDVFYREMSKLNHNLYEVMSKLEKQHSNKVFVVKGLSSSSRRSLVISAPLRTSTASSPLTSPISPSALSLKSERESISAAEEERAPDPAQEEDNSEMEEEPLKDKEIEGGGAKASSSEEEEPLPAYNGPTQTQPSPTTEGGESQEEVFSCSPAPSSGRALIPSEQPSSSFPEVVLQTHTTSEGSEQPKRASLSRTSAPPSRPPPPRASPSPRLSSGSIPSSPTTSEGGSPTSSRAFFGAGTPSPRTSIEVSPDPELPEKPERNPEAREKETTHHLNPEELCTSPTLMISQGQGLELQVSTVAGESSVIAPEPQEEVSTSQNAQL	332677	295142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295338_295600_295676_299936_300694_306112_306196_307222_307299_308408_308495_309008_309117_310332_310429_310991_311087_311678_311734_321619_321701_332559
835406	contig_20890_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_147038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAGATAGCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18528	19881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_18500_19900
835407	contig_11413_pilon	+	625	4	Intergenic	novelGene_103132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2127.97415397838	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	17	505	87465	90735	FALSE	20	AACCTACTCAGTGTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRRF	87448	90855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88513_90641
835409	contig_15899_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_128905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGACTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13733	14343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_13700_14300
835410	contig_405_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_135334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTTGAAAAAAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618050	616099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_616100_618000
835411	contig_10855_pilon	-	1198	8	Intergenic	novelGene_124325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	70.5274588297324	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	61	1017	401138	339006	TRUE	55	AAAATAAATAAAATTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPGTERASPAPASPPRRSAMDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGLTHTSCR	401198	338194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_338242_338871_339032_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
835413	contig_9414_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_131083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTATTTCAGTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394858	393967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_394000_394900
835414	contig_253_pilon	-	1164	8	Intergenic	novelGene_129668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.365941687501	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	474	1028	393089	389945	FALSE	10	CTCTCCTGTTGCAGCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTRPDPTLPA	395564	389808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390796_390857_391020_391234_391669_391860_393023_393209_394069_394241_394312_394396_395464
835415	contig_6217_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_109577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140595	141758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_140600_141800
835416	contig_11370_pilon	+	806	3	Intergenic	novelGene_98725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	140	562	145831	148303	FALSE	10	AGTGCTGTGTGGTTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145691	148547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
835418	contig_10424_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_56791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTTACCACCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230361	232369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_230400_232400
835420	contig_5620_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_161334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAGAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163505	162400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_162400_163500
835422	contig_9468_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_59537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATTAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633907	635308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_633900_635300
835423	contig_1154_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_87220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACATGGAATGTTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582744	1583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1582700_1583600
835424	contig_7887_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_124910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTGTGTCCACCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516513	515673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_515700_516500
835426	contig_9436_pilon	+	1320	8	Intergenic	novelGene_60910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_5	101.898308651922	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	135	680	420868	429997	TRUE	15	GTGCATAGTCCAGGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAQRQLAVAAVRAEVRRHEVTKQALSRLRKLTERVGDPELRDSIQASLDSIQEAVVNSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQHKKDMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGRPGPGTGGDTR	420733	431376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_421028_427395_427455_428096_428185_428349_428436_428568_428718_429993_430129_430451_430562_430977
835427	contig_12474_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_172213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGAGCAGACTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102569	102956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12474_pilon_+_102600_103000
835429	contig_12279_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_50138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96912	95718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_95700_96900
835430	contig_2733_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_128600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTGGGAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001229	1002860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_1001200_1002900
835431	contig_2093_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_152962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089712	1090914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1089700_1090900
835433	contig_5423_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_85166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80389	81521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_80400_81500
835434	contig_2770_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_107408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTTTCCTCCCCCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159062	160360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_159100_160400
835435	contig_4496_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_66684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912737	911078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_911100_912700
835436	contig_10235_pilon	+	493	6	Intergenic	novelGene_46333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_1	269.78613752378	148	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	84	491	109120	111193	FALSE	35	CCCAGCCAAGAAAGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGQASWQKKAKPASFVCLLTSASICGAMSQIRDLQGGKAFGRLKAQQEEQLEEINKQFLDDPKYSSDEDLSSKLEAFKKKYMEFDLNGNGDIDIMSLKRMLEKLGVPKTHLELKKLIQEVSRSSGETFSYPDFLRMMLGKRSAILKMILMYEEKAREQEKPMG	109036	111195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_109145_109331_109394_109485_109553_109932_109975_110144_110308_111144
835438	contig_4783_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_108420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	495	79	573	409843	410337	NA	35	GGTGGCACAATCTACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEGTCQRLHKEQAQDLNPCCRRPEPTLLASTVGHTGLRKLAKDKGEESPGMCTAWSTAHFTVYVSSALWCWQCYSAPRVQSTFFQGSVPTDDQKEKQPRQQQSTDSEDCSFPSTPVILSGVSHILTSVVSRNHFHFSGREENRGKLLDRGRFIHRTLLEYVEY	409764	410338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_409800_410300
835440	contig_3077_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_26896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGTGAAAAGGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509295	1510545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1509300_1510500
835441	contig_10837_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_160657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84947	84723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_-_84700_84900
835442	contig_6102_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_31992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	261	572	420307	419996	NA	35	CACCAACAGCAGCAGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPCGEPGELKPRRIHEDEWVEDRGAQDLMWGTTGMRGWVCQRRQSRDQVFSFGSSEHRVTVLIWHWQLEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQM	420567	419995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_420000_420600
835444	contig_3533_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_176537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAAATTCTCATCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412088	411179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_411200_412100
835445	contig_5649_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_82433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462473	1463354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1462500_1463400
835446	contig_345_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_176942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104604	103453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_345_pilon_-_103500_104600
835447	contig_15323_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_148505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCCTCAATATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35357	34305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_34300_35400
835449	SIRV4	+	482	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	31	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGACGTGTTTAACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3669	5055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_4104_5007
835450	scaffold_16539_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_68388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTTCTGCAATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650095	650665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_650100_650700
835451	contig_17373_pilon	+	770	5	Intergenic	novelGene_177143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_1	97.476599756044	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	318	548	40691	41018	FALSE	35	ATATGCTGATAAGGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKEHASQVLVRRRRANVLFEERKGGNLERECIEELCNKEEAREIFENDPETDYFYPKYLVCLGSFRAGLFTASRQSTNAYPDLRSCVTAIPDQCNPLPCNEDGYMSCRDGQATFTCICKSGWQGEMCEFDINECKNPANTNGGCSQICDNTPGSYHCSCKSGFVMLSNKKDCKGKSKTVE	23861	41240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17373_pilon_+_24020_27863_27889_38031_38119_40643_40767_40863
835452	contig_5502_pilon	+	1700	7	Intergenic	novelGene_155015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105.140646543359	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	38	1003	527127	538556	FALSE	30	ATGATTGTATTCCAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKIGDLETHRKEMKSHSEMKLVCGFILEPRLLIQQQKGQIFPTELAVHLKETQPGLLVASILGLQKNNKMGIEEADSFFKVRFYENLVSLFSKVLCGKDEDMIPQLLVDFWEAQLVACLPDVVLQELFFKLTSHYIWRLSKGQPPDSTPLRTSEDLINACSHYGLIYPWVNILISYDSSADKNYTEDLSKLQSLICGPSFDIASIIPFLELLSEDTAAGLSVHVLCRTRLKEYEQCIDTLLERCPEAVIPYANHELKEENRTLWWKKLLPELCQRIKCGGEKYQLYLSSLKETLSVVAVELELRDFLNVLPEDGTAAFFLPYLLYCCRKKSLT	527089	539253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_527145_528390_528595_528910_529121_530137_530246_532858_533066_534043_534135_538428
835453	contig_4852_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_153965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48707	50680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_48700_50700
835454	contig_7887_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_124889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCATCCCTGGAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292700	293462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_292700_293500
835455	contig_6062_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_5243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTTTAGTAAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538767	539525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_538800_539500
835457	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
835458	contig_15422_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_173109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGGAAAAATGATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76692	75234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_75200_76700
835459	contig_5121_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_170750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCCTGGTGGCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456587	457549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_+_456600_457500
835460	contig_17144_pilon	+	1045	4	Intergenic	novelGene_29119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	134.821692946235	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	699	1043	9746	11709	FALSE	55	TACTGATAAAGAGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPTALVLHQRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQT	5055	11711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9215_9778_9857_10116_11654
835461	contig_19061_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_173510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	57	171	131	301	40256	40426	NA	45	ACCCTAGGAGAAACTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPIILSWAYLERKKKILLISYVQYSDFRSKSFPDNRGRHKCIPMLAGWLAGPSCGPTLFCAKCPQLQEETAEEAHRPQIPPLHSHSPLQPVSENTSPGGT	40125	40426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_40100_40400
835462	contig_755_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_119791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	917	1249	605087	604755	NA	25	CACCACCAATTGTCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPQGRWFYIPLWFPPLKSKTFRKVNSPNITNDYEFSDDEKDSMIKTLVTTLNSYIPSPSDSSSNQTNLPTHPPTLTLTFNQIQQYPAPQPSPEVLISESKTCKAQGIT	606003	604696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_604700_606000
835463	contig_17436_pilon	-	1363	5	Intergenic	novelGene_164171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	12.794041581924	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	16	429	67481	45041	FALSE	55	AACTCAAAGTAAGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCGVMFFAKGGTRPRTSEVDPSEHKKWVKVFKACDEDNKGYLSREDFKVAVVTLFGYKPSKIEADSVMSSINQNTSGILLGDFLNVVRKKKEAQLYWSEIRHIFTAFDRHYRGFLTLEDFKKAFKQVAPKLPERIIVEVFR	67496	44106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_45136_47203_47306_61778_61825_66757_66854_67406
835464	contig_6340_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_176638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCGCTTTGCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118430	119219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_+_118400_119200
835465	contig_3602_pilon	+	639	6	Intergenic	novelGene_60483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	904.082164407638	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	148	597	161745	171071	FALSE	40	AAATACAGTGACTACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGRAAAAARAAGSECGGANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREAVSGVFWFFSFCFFLNRAILC	161597	171113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169244_171004
835466	contig_6272_pilon	-	1229	6	Intergenic	novelGene_160452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAAGAAGTTCAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167844	153709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_153923_154944_155051_162090_162165_164419_164487_165670_165789_167193
835467	contig_14980_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_78230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCAGTGCTCCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440753	442290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_440800_442300
835468	contig_2710_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_161807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATGACATACTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176242	1177348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1176200_1177300
835469	contig_11145_pilon	-	860	7	Intergenic	novelGene_160522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	68.0269554416973	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	813	46	858	284014	73379	FALSE	30	CAGGTGAGCAGTATGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGRGGRVELWGLCMPLGCRAGSRRSLTMAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGQAVPAGSHVRLNLQTGAREVKLQYGDKIQNNLKESKKGKRLDINTNAYTSQDLKSALAKLKKGAEMESSEEDKARQAEVKQLFRPIEELKKDFAELNVVIETDVQIMVRLINKFNSSSSSLEEKIAALFDLEYYVHQMDNAQDLLSFGGLQVVINALNSTEPLVKEYAAFVLGAAF	284059	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_73496_83180_83373_100831_100932_114511_114633_209147_209284_215605_215721_283982
835472	contig_9070_pilon	+	1036	5	Intergenic	novelGene_171957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.4790199457749	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATAGTTTGTTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248991	281805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_249179_252450_252585_263850_263933_280724_280837_281284
835473	contig_10122_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_177147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCGTCTCTCATACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43430	41242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10122_pilon_-_41200_43400
835474	contig_7230_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_52570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	537	968	310294	310725	NA	35	CAGATATGTATCAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFVKPFLEPQCRKQTKTESLWLKLAKRWWWWWGGLEPHPQPLVQEFSGYSLKLFKSKLLVSWIRKLRLRGKVSWFRSYCWALGLQGIGLRLNKQTKNPSSCMSSWRLSRCRQWQDQHNLGWVSAVGLIVFGRRTWVTTLGW	309757	310794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_309800_310800
835476	contig_1637_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_142396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGAATTGTGTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775712	774714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_774700_775700
835477	contig_1694_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_144927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTATACCTGGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457336	456236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_456200_457300
835478	contig_21196_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_174874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGAACATATACTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13396	11214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21196_pilon_-_11200_13400
835479	SIRV4	+	424	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	26	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGCTATGTCGCGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3674	4098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4100
835480	contig_15888_pilon	-	1266	8	Intergenic	novelGene_84448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1425.81332321348	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	520	873	253673	252475	TRUE	45	CAATAAAGACTGACTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDGEARGFRKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259791	251616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251718_252014_252301_252468_252539_253383_253680_253928_254066_254198_254282_254523_254685_259659
835481	contig_4364_pilon	+	818	7	Intergenic	novelGene_71	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	41.4678590396627	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTAGTGTGATTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703021	709034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_703151_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707398_708753
835482	contig_8242_pilon	+	1490	13	Intergenic	novelGene_80204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_9	38.6630745457902	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	25	1404	203963	221541	FALSE	15	TTCCACAGCTGTACTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTPITIFMEYRLDYRTAADVTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLKVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLTVKAQNQGEGAYEAELIVSIPPQADFIGVVRNSEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPMVSYKADLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKAMLNLQWPYKYNNNTLLYILQYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKVSTSQTAENDTVAVQGGRNHLITKRDLTLSEGDIHTLGCGIAECLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSMKSSASFNVIEFPYKNLPIEDIFNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPQENGEGNSET	203938	221627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_204056_206170_206239_207333_207482_208008_208102_209840_209921_210462_210544_211056_211163_211754_211914_213235_213347_220158_220273_220371_220480_221073_221197_221445
835483	scaffold_19766_pilon	-	1424	4	Intergenic	novelGene_34447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCAGGCACGCTCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860705	855856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_856022_856105_856231_856717_857447_860300
835484	contig_3754_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_146837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTGAATTGCCCCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300531	301428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_300500_301400
835488	contig_8801_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_66239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCTCAATAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176073	175129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_175100_176100
835491	contig_12603_pilon	+	547	3	Intergenic	novelGene_105816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	132	junction_2	22	975	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGCTCTGGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710541	711609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_710779_711094_711161_711365
835492	contig_7887_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_124922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAAGGACTCCTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572929	574328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_572900_574300
835494	contig_16362_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_161164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTAGCACATCTCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148644	147508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_147500_148600
835496	contig_5936_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_53542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCCTTAAGAAATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50228	49661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_49700_50200
835497	contig_7992_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_115539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGCACCAAAGTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593618	592090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_592100_593600
835498	contig_14755_pilon	-	1480	11	Intergenic	novelGene_129380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	57.0162257607429	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	710	1255	225859	128904	FALSE	35	TCCCCCAAAATTAAGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNRLAFLPLDLGRSRELQYVYVDNNVHLKGLPSYLYNKVIGCSGCGAPIQVSEVKLLSFSSGQLTVFLPAEVKSIGTEKDHVLPLQELAMRSLYRSYHQFLKDLNFLSPISLPRSFLELLHCPLGHCHRCSEPMFTIVYPKLFPLRETPMAGLHQGRTTVSFVAYCCSTRCLQTFDLLS	364360	128678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_128977_147818_147979_149447_149624_186864_186968_225825_225938_225992_226033_232058_232203_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130
835499	contig_10235_pilon	-	713	2	Intergenic	novelGene_46383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	158	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTGTGTGTATCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172910	168600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_169084_172680
835500	contig_5959_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_150174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	281	598	96535	96218	NA	20	ACCCATAGGACTTCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKWLWKEAIGRSCKNIEEHDHESLSHLEQIVTKSLDFKDATSEGSEGSEVTFHLNTLEKEEQTEPKAKKNKEIINIRVEIDEIETRKTIEKNQQTQSWFFENIK	96815	95999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_96000_96800
835505	contig_602_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_134937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234494	235907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_234500_235900
835506	contig_5229_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_117679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1414	1830	312716	312300	NA	15	GCTGAACCCCCCGACTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTYACLWTVCGILCGGGLSGASPGGSFLWGCSTGSAFEDFSRSVALQPCAPCQLACSYVTGAAQKTLASEGPTTAPSELLHSQPAWCSCSIIGGLAQPQVQTAYVSHTRAGATGSLPPAGGCLCACKESDGFSPNL	314129	312288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_312300_314100
835507	contig_1472_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_86141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736479	737356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_736500_737400
835508	contig_16492_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_100294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCAAGGGCAATAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148015	146741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_146700_148000
835510	contig_7412_pilon	+	1582	4	Intergenic	novelGene_76303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.16024689946929	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAGCAACTGTGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334109	339128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_334320_336909_337237_337408_337453_338127
835511	contig_2550_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_135644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAACACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515777	517346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_515800_517300
835514	contig_3155_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_26324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTTTAAATTAAGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44670	46139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_44700_46100
835515	contig_11104_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_112457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCATGATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314561	316557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_314600_316600
835516	contig_9305_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_148189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACTCCTAGCAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153342	154616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_153300_154600
835517	contig_14314_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_176842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACACCCAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155631	154159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_154200_155600
835518	contig_6375_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_73068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACGAAATTACACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695757	696484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_695800_696500
835519	contig_6182_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_171650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGTCACCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79183	77198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_77200_79200
835520	contig_1521_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_145449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	641	961	168097	167777	NA	45	AAGAATAAATTTCTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSQATWLQGLTNQNWQFRPQATGSQGYGSWQIRSDDRPLAHGAVEVGESQNQQVIQQASGSGPKNWRSVNHEPDVGSRCTERGPHQVISIYTLDAGHTSGKAIT	168737	167046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_167000_168700
835522	contig_7428_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_77734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCCTCATCCCACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433170	434288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_433200_434300
835523	contig_14744_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_66037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	163	330	1305495	1305662	NA	60	AAAAAAACCATGAGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTLEYIEKQCLTIAIPIINLTNVFLARFSLNKESAKFFCKAPDNKHSQLFRAYMVSVIYSSLLLYFYNLLKIIFSSWAIQKQALAQIWPAGCSLLIPGLNAQSRLLES	1305332	1306831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1305300_1306800
835524	contig_10011_pilon	+	1790	3	Intergenic	novelGene_68028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_2	46	23	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	478	1107	89374	91635	FALSE	10	TCTGGATTTGTCTATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESDDDFKELCASFFQRVKKNGTKELSGERKKQKASDGTQIRSKPKRPKRTTTKSKTLHGPAEEKTQSGSQATRTKTQGAAKSQGREPAPTVNGKGRVLAPTPAPEQPPPQDSAQSTQSEGAPSSDAQLPSSGLTAVPPSPSKPRTAELVLQRMQQFKRADPARLKHASGACSLEAEIAENIPKDPQEEPMVGNGMTGMFHLANRDKL	85904	92318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_85975_88966_89735_91366
835526	contig_504_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_54428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCATCCCAACTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202748	201286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_201300_202700
835527	contig_10734_pilon	-	807	2	Intergenic	novelGene_51375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGTCAGGAAAGTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1859072	1858138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1858886_1859012
835528	contig_631_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_177148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGCAGTGCTGGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21508	22021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_631_pilon_+_21500_22000
835529	contig_631_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_177149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCTCTTGTTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22082	23034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_631_pilon_+_22100_23000
835530	contig_7444_pilon	+	1614	2	Intergenic	novelGene_174921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	474	junction_1	0	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	72	365	51658	51951	FALSE	35	CAGAAGTAAACATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGRVGVRARSAPEVHVAPVGESMSFRGGGRGGFNRGGGGGGFNRGGGGGSSNHFRGGGSGSFRGGGGGNFRGGGGGRGGFGRGGGRGGFNKFQDQGPPERVVCMSALKGGFLGGWGLCR	51242	53200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_51302_51645
835531	contig_14514_pilon	+	1364	4	Intergenic	novelGene_137472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.471404520791032	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTGCTTGAACTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48881	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_49952_50199_50291_53757_53868_55302
835533	contig_4364_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_2964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGAACGGCGACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
835534	contig_5988_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_16129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGACCCAGCTCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1541792	1543265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1541800_1543300
835537	contig_312_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_128312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTTTCAATGACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423098	421775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_421800_423100
835539	contig_12837_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_57388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTCTGTCAGTATGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392708	393802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_392700_393800
835541	contig_20550_pilon	-	1118	5	Intergenic	novelGene_142624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29283	19942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_20611_21234_21398_24121_24274_24355_24434_29226
835544	contig_3307_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_86885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTAACATCCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123197	122382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_122400_123200
835545	contig_10904_pilon	+	631	4	Intergenic	novelGene_22661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1930	junction_1	569.461929270859	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	249	560	533790	535124	FALSE	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530932	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531005_531238_531362_533736_533924_534946
835546	contig_6062_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_5293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCCTCAGGCTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766963	765620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_765600_767000
835547	contig_11978_pilon	-	1083	7	Intergenic	novelGene_62914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.77169096878911	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	106	960	860171	856840	FALSE	15	CTATGTCTCTCAGGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELAPSPEEGGICITEALITKRNLTFLEDDDLSEKMFHTLAELQTVRLDREGITVIRNLESLQNIHSLYLQSNKIQKIENLACIPSLRFLSLAGNHIKQVENLLNLPHLQFLDLSENLIETLKLDEFPQSLLILNLTGNSCTKQNGYRELVIGALPLLLDLDGQPVPERWASDEEENASGDEDEEFPELSGPFCSEQGFLKDLEQEMTRHKEHRQQAALTEHLLRMETQLALTDLPLLPEEPMARDSNLPVPPEQEKTPTEPASSPQTYSATKMPCPLVSLGQQGTAQAQEGARAAVAPKASLTGVRSTTKTMTKKIKN	860276	856716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_857208_857483_857633_857945_858016_858224_858335_858565_858613_859617_859727_860169
835548	contig_6674_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_148030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGAAAATGTCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347334	346877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_346900_347300
835549	contig_5718_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_110353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTGAAACACTAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677914	676651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_676700_677900
835550	contig_10467_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_175408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	898	1227	102621	102292	NA	55	CCTAAAATTAAAAAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNICFPSGSLEFWYLLGKWCLCDQLPVKILGVEFLVSVPGRQYFTHCHKSLLEALKLSCVTISGKGFLETCTWLPLDFSPYAFSFADFALYPSAILNYICEYNYMLFS	103518	102172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_102200_103500
835551	contig_10811_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_165794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATTACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327925	326781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_326800_327900
835552	contig_16122_pilon	-	772	6	Intergenic	novelGene_134491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	109.590875532592	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	55	534	110548	104536	FALSE	20	GATCCTGTGTGTGACAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFGKDQSLANILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFVSSFKIVL	110602	104297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104918_105232_105407_108757_108867_110332_110368_110497
835553	contig_12050_pilon	+	806	8	Intergenic	novelGene_62633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	190.462380451749	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	244	621	359783	363762	FALSE	30	TAAAGATCTTCAGACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGDGRSVAGSDGDRDGGYGGGARGAGGGVPLAAARRGACRAQAAPGHPQGGLSPLHSAGHRGGSQAGELHPEQLWDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLGWISSPFPC	357431	363947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_357511_357599_357672_358746_358824_359767_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362656_363729
835554	contig_5812_pilon	-	1245	6	Intergenic	novelGene_167497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.07245829914744	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	277	858	221761	203013	FALSE	35	CAGATTTTGGAGTCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYFMTGQLLWASLAFSVLLPGFLVQGLSYLWFRADGHQGHCSLVIVHLLQLGVWKRHWDTASAALSKKWEAPCLGQLLLQEADLSALRLLEALLQTGPYLLLQTYVFLASDFTDIVPGVSALLSWSSLSWALVSYARFMGFLKPGHLSMPWAALFCQQLWRMGMLGTRVLSLVLFYKAYNVWVLVVGEHLQ	224498	202625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_203027_203802_204013_206091_206277_221588_221773_222527_222716_224421
835555	contig_6576_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_42359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTTTGAAGGATAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789554	788593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_788600_789600
835557	contig_10196_pilon	-	1201	6	Intergenic	novelGene_132270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	33.7366269801828	87	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	597	737	2011524	2011138	FALSE	10	CCTCTCGGCCCCCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLGHLGYLGYPVLSEHDSQAHAITVTRERRLDQEKGQTQRRVLLGEVVGARGVGKSAFLQAFLGRSLGLQEPTTAPSVYAINTVHVSGQEKYLILREVDADGPLDVTSDTACDVACLLFDSSNPASFAFCTRVYKQRYLDGQTPCLFVSSKADLPPGVWPPGPSPAEFCRRHLLPAPARFSCAGSAAPSTAIFSQLATMATFPHLVHAELHTTSFWLRVTLGVAGAALAVVLSFSLYRALVRSR	2012528	2010673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2011265_2011510_2011714_2011801_2011925_2012030_2012109_2012204_2012336_2012453
835559	contig_8848_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_140459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	14	460	80089	79643	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTLMAVLPCRSVLLGLSTSFLSFFTLATDTLSFPVCLVAGLFLRRVKRNGGREADNEGVPRAILVGEGEARNGKELVRGRRAGRRRVGHVTSKCSRTGKAWRVCRTVEAGAREGEKMAVAVLSAGRPKNPVGDRRRKFYNARCASTRLSVE	80102	78805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_78800_80100
835560	contig_253_pilon	+	525	6	Intergenic	novelGene_129692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	418883	420772	TRUE	30	GACAAACCTCCGGCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVQAAGGQHLVDQEQVQQVVVGKGYLVTHNEALAPLVLGQQGLKGLQLRRQCSHVVVLACLIVGVDEGDVLRAQVLHTVVHHVHQSCLPRVLPPRERPR	418882	421735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_418960_419104_419210_420223_420319_420749_420847_420952_421073_421704
835561	contig_15613_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_147232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACTGTAGCTAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472300	473809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_472300_473800
835562	contig_7202_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_18072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGCAGGTTGGTCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27628	27864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27600_27900
835563	contig_17796_pilon	+	967	6	Intergenic	novelGene_33805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	969	junction_2	54.50357786421	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	116	967	53527	96504	FALSE	45	AAAGGTACAAAGATTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCV	53411	96504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325
835564	contig_15087_pilon	+	1426	3	Intergenic	novelGene_37163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	845	1222	69033	72624	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPGSPRNLSGPCASHTGRTGPRALPIHSPLCSWCCHHSLVENSAPQQGRLQIQRKCPTGWRFWDRLWLVTGVCTVSGRCWDICVLSCELSQVIKRGQGGRGLLEQLTVLDQLLCLLPESGRFHL	68188	72828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_69207_71087_71173_72505
835566	contig_12485_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_147281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGTTCAAACTCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113285	112124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_112100_113300
835567	contig_12622_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_5835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	78	380	446928	447230	NA	70	TAGAAAGCGAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCVPRVSDTKPCPSRPDDSHPATIFASVPVVASLPCAACHHTACLNPAPLQAELRPHPLQKSPLTALPPACFLWYLLLRSISGPFVWGYLSQSRLEAV	446850	448551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_446800_448600
835568	contig_7843_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_152027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.10554159678513	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	527	1090	232704	238820	FALSE	20	ATCTTATTGCCTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPYSKTVDGFETHLGVNHLGHFLLTHLLLERLKESAPARVVTLSSMVHYAGKIRFHDLQGEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKKLQGTGVTAYAVHPGIVRSELVRHSFLLCLLWRLFSPFLKSAWEGAQTSLHCALAEDLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTAEHLWNVSCELLGIRWE	229411	239453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_229620_231020_231139_231692_231849_232659_232765_233630_233841_235538_235729_238717
835569	contig_16109_pilon	-	1565	10	Intergenic	novelGene_80319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	22.8716223978779	112	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	39	854	195285	160368	FALSE	35	TCATCTAAAGACTCTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALSRLRKSYSTMSMNQQDLDPVNTADVDDVADAEKELIEECEEIWKDMEECQNKLSLVGTETLTNSNAQLSLLIMQAKCLAAELNQWQKETPKIIPLNEDVLLTLGKEEFQKLRHDLEMVLSTIQSKNEKLKEDLEREQQWLDEQEQILESLNTVYNELKNQVVPFSESRIFNELKTKMVNIKEYKETLLFTLGGFLEDHFPLPDGKVKKKKKNLQEPTAQLITLHEMLEILINKLFDVPHDPYVKISDSFWPPYIELLLRNGIALRHPEDPNRVRLEAFHQ	205366	159656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_160527_163563_163618_166307_166435_166783_166883_167193_167277_177939_177987_187335_187409_192821_192879_195168_195308_205350
835571	contig_3386_pilon	-	1780	6	Intergenic	novelGene_34485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	10.4804580052591	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	66	1061	281037	269774	FALSE	25	AGACATGGACCTTCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNLEEESWAEEGKQEDQGGQDMGSEQSVEAQGLEAEHSEHSLQDVLPATPPHGLPQPQAEAEATAPGKPSALGSPFPMGAQPDDGAGPQEPTQTLPITAELEAQSRPPPTAAQAEGEQGAPQSREPRAESRPEDPGTDSREAGRSPFPGDLPANEPPADPDYIFHVIFLGDSNVGKTSFLYLLHQNSFATALTATVGVDFRVKSLLVDNKHFALQLWDTAGQERYHSITRQLLRKADGVVLMYDVTNYESFAHVRYWLDCLQQDAGSDKVVILLLGNKMDCEEERQVPTEVGRQLAKELGVSFGECSAALGHNILEPVVNLARSLKMQEDLLRCSLVEVVPKKSPKRTGCCS	281102	269054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_269865_271679_271757_273806_273912_275006_275122_276209_276292_280511
835576	contig_2125_pilon	-	1359	3	Intergenic	novelGene_147738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	783	1115	659160	658828	TRUE	5	TCTGCTGTTCCTTTGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVQLHFRFTQILHIHTNTSDSHNYCLVGNEYTYSTNRNLHDCIKATFWRIQISRYALFTNKFVKYFPSISKTKHIFVAKGAGAVLFTCARIPEFSWGCTNVRHHSFLHK	659942	651175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_651239_657752_657924_658817
835577	contig_13004_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_112624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAGAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197372	197887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_197400_197900
835578	contig_5954_pilon	-	1041	6	Intergenic	novelGene_28586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4.88262224629348	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	116	1003	941853	939622	FALSE	0	TTCTGTTGGGGTCTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRRSLADVGRGCRRRRDGGRTPGFWGYGHLRSCSVQTMDPEVSLLLQCPRGGLPEEQVQVELSPAHDRRPLPGGDKVIATVWENRLQAQPWLFDAPKFRLHSATLAPAGSPGPQLLLHLGLTSYRDFLGTNWASSAAWLRQQGAADWGDRQAYLADPLGVGAALATADDFLVFLRRSWQVAEAPGLVDVPGGHPEPQALCPGDNPRHEDLPGELVVHELFSSILQEICDEVNLPLLTLSQPLLLGIACNETSAGRASAEFYVQCSLTSEQVRKHYLSGGPEAHESTGIIFVETQSVRRLQKAEIWAELCPSAKGAVLLYSRVQGSALGSAAL	942226	939583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_939739_940040_940135_940249_940348_940824_940924_941373_941872_942129
835579	contig_9656_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_121901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTAAAAAGAGAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101227	99940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_99900_101200
835580	contig_7179_pilon	-	1331	7	Intergenic	novelGene_78071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.414294693321	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	74	670	547098	414095	FALSE	0	GCTGCTTGGGTCTCGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSFVEVAVDGLPSETKKTGKRIGSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENTQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGSVPNGSAVTDGSQPPSRESSGTAVPPENRHQPPTIQELRTAQREAAVRY	570903	413433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_414150_501956_502021_503927_504066_540603_540726_541039_541188_547028_547114_570845
835581	contig_15185_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_99473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	56	313	472420	472163	NA	55	AGAAAACATTGAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSAGRSGFYGPAASSAAMSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEGEPRGQTAGSWKARMKVWPRRRKREFSKGLRGRGVGPEGPRW	472475	471239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_471200_472500
835582	contig_7843_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_152058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCAGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549608	548236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_548200_549600
835585	contig_15327_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_70563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTTTCAGAAGCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583884	582995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_583000_583900
835586	contig_13292_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_142957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCCACCAATAAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377213	375390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_375400_377200
835587	contig_4211_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_80251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGGAAGTGGAGTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245844	1247076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1245800_1247100
835589	contig_10054_pilon	-	1591	3	Intergenic	novelGene_171216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	60	521	157241	156323	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQPVSQSRCLLPGPPRAPTMRPPFYRCHNITSVEKGNSATMGGVLFSAGVLGNLLALGLLARSGLGLHLPRQSPSVFFVLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLSGLLPASGSLLCQAFAFFMSFFGLASMLQLLAMALQCWLSLGHPFFYRRHITRERLAGRMEPV	157357	155252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_156358_156814_157273_157329
835590	contig_16303_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_34026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCGTAAAGATTATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28610	29235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_28600_29200
835592	contig_20614_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_107597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCACATCTCCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417236	416411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_416400_417200
835593	contig_10163_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_82673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCTTTACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460518	462214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_460500_462200
835595	contig_9119_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_169734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTCAAATGTGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10877	10227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_10200_10900
835596	contig_7815_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_134381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGAAAAAGATGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456929	455673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_455700_456900
835597	contig_15029_pilon	+	1800	13	Intergenic	novelGene_128213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1071	1487	239249	240373	TRUE	5	TGGCCAGTTGGGTCGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGDVCDRSWYRLSRSANTCRGSAPSAHRFTIQAASKAARKPRATPVPRGQKGCTRQSPTSPSSRRAPCFSCTRAELSARIMLVKSKAETSGRPWASWANSSFPSLPWVAKSAAARAKRCRASGTTLALPRSRSVSE	233520	242544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_233780_234225_234301_234398_234503_234711_234814_234938_235050_235335_235446_235591_235820_239167_239294_239477_239599_240122_240375_241285_241387_242007_242171_242496
835598	contig_6364_pilon	+	1786	14	Intergenic	novelGene_51837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	8.19799369307613	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	322	1566	1610422	1623606	FALSE	25	CACAGCTGCTTTTTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLPDKVLISSTNRPPKVSVLNLNETLLPCPQDVRNMAVIWIPEETEKHRRSPAEKKPDVTSQDGREKRKNSPVENKSALGSLEKQGMGTQLGWQEVLVPPPSPVQLFEQLSPDSMLSCDQIDMLPKDLLKDLLTDEGKTIPSANMKIELAMMKKNRPLEKSRPDSAISSKMFLSVYRLTLQRPGLRYPEHLRKLHYNLMTKARFSEVARSPGPRKQQQQKKKKVKIPTKIQEVKKKTKSDPGSQNTLHERKVIIICDPVPETNMGTLEKAAEGESHSGHSTLPDQENDTKQQQQMEIEGPTLKQDATEEPAMDHLENYLDSFTSHRSTELVKTESTKEDIGAQVEIELESQTSSKEKTSKNVSASTTGTTWNPELKLLRILQATDNEDEENQPSRAQSEKSLEAQAEGITPF	1604666	1623826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1604826_1606549_1606701_1610410_1610476_1612112_1612217_1614688_1614756_1615501_1615675_1617050_1617202_1617545_1617637_1617850_1617910_1618132_1618221_1621157_1621209_1621540_1621621_1623049_1623117_1623346
835599	contig_13481_pilon	+	1335	5	Intergenic	novelGene_119432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	813	1187	931862	933418	FALSE	75	CTAAAAAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAWHTANLIYFIQKDNSLLRFFYVIIGILEQFGNHRFNIFTYISSLSQSRTVTDSKRDIKAFSQCLRQQVIYLTQLVQVAKYYFSQALCHHEKNPILHLLAFPEVLVDLPVAALMLLKHYHAD	919370	933566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_919984_930691_930854_931824_931914_932721_932881_933254
835601	contig_6233_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_74766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	126	446	118350	118030	NA	40	ACTCATACTATTAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWQFTRKKTIRNLARPSAHRLLMALTSTKQPYQGEKLLQAQNSTPMEENQVSDDNSDPLTSTTHLFSYCLLHQLLHLCPQLALAPLLLFLRVGFLLSGHPLPHLT	118475	117811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_117800_118500
835602	contig_11375_pilon	-	1437	10	Intergenic	novelGene_152643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	7.498147919468	33	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	579	1193	13721	11913	FALSE	25	AAACATGCCTGCTTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVLDPRDIIIGAELQVLQEKLRDGNLDPAELAIAATAQRKDFPHGIPECGTDALRFTLCSHGALGGDLNLSISEVLSSRHFCNKIWNALRFILNVLGEKFTPEPAEELSPASPVDAWILSRLALTAQQCERGFLTRELSLVTHTLHHFWLHNLCDTYLEAVKPVLARSPHPSGPPQILFFCADVGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPSRPGCSPAPSICVAPYPSAHSLEHWRQPELEQRFSQVQEAAQGLRALRAMYQLTKARPRVLLQSSELGEQGLFEAFLEPLGTLGHCGAVGLLSPGAAAPSGWAQAPLSDTVQIFMELQGLVDPQTHLPLLAARRHKLQKQLEDLLARTPSHGAAETQRQQRLSSLQMELLKLDKAASHLRQLMEEFQPREC	15674	11668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_12006_12115_12245_12398_12575_12721_12834_13616_13824_14668_14822_14961_15090_15214_15294_15416_15486_15627
835603	contig_8942_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_143196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGAATACCATTACAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338378	336594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_336600_338400
835605	contig_9415_pilon	+	1113	5	Intergenic	novelGene_109798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	77.428596138636	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	46	543	1712832	1759460	FALSE	65	AAAAAAAAAAACCCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAVFFGCAFIAFGPAFALYIFTIATEPLRIIFLIAGAFFWLVSLLLSSLVWFVAGTTVGHKDGPVQKYLLIFGVLVSVLIQEAFRLAYYKLLKKANEGLKAINPEETAPSMRLLAYAFMTLVIILLHIFWGIVFFDGCEKKRWHTLLVVLLTHLLVSALLQTL	1712786	1760030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1712945_1714635_1714807_1720758_1720830_1733129_1733258_1759445
835607	contig_5566_pilon	+	729	7	Intergenic	novelGene_153658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	220.380542093292	2057	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	123	323	176750	177187	TRUE	45	TACTGATTCAGATTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGVRLQSLQRSARANSGRAPEGTGGDGFERGKEEEEQGIMAAMVAVGCALGRRKLTHLVTAAICLTDSGTPSGDERSGSQEVAGTYLRPTGKLSEERTFPESPSS	176627	181846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_176850_177086_177201_177661_177718_179689_179774_180773_180832_181571_181632_181711
835608	contig_18283_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_170701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTCTAGAATTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57688	56876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_-_56900_57700
835611	contig_11815_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_50919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGATTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212559	211006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_211000_212600
835612	contig_13760_pilon	+	1318	4	Intergenic	novelGene_61322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	20.757863302587	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	34	765	203073	204617	FALSE	0	GTGGCTGTGTCCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDKYELFEKLDLPKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKSMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF	203039	205170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_203118_203240_203413_203569_203719_204251
835613	contig_2069_pilon	+	2160	7	Intergenic	novelGene_23217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCCCTCCCATTTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158015	177955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_159474_161141_161204_167075_167221_168776_169001_170552_170704_175753_175814_177895
835614	contig_8418_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_166066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTAGTTTTGTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134499	1132626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1132600_1134500
835615	contig_7129_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_169300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATTTGCTTGTATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897209	896342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_896300_897200
835616	contig_6048_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_73298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAATACTATTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2007106	2007860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2007100_2007900
835617	contig_6048_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_73299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	160	477	2008836	2009153	NA	35	CCCTCCCAGCAAGACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQASRPFSQLCTPPLGHAGSLSAVLAGPPLNCANLLLAVHTAHPLSAVQGSSQPYTPPLNCAGLSAFSFPTVGLSTANWPLLTASVTACSTLLAAFLAAAFCRHQ	2008676	2009342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2008700_2009300
835619	SIRV6	-	209	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTGACACTCATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10818	7808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7923_10723
835620	contig_5765_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_141405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGGGATCATACCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820075	819794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_819800_820100
835622	contig_20819_pilon	+	1149	2	Intergenic	novelGene_55661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	0	218	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	290	610	51287	51734	FALSE	5	TTCATCCCCCCCGTCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTGHHGEIYCSFGLCCCQVTSQDKAPSVISRVLEKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPPSANVFYAMDGASHDFLLRQRRRPSAATVVLTSGPSASGTPPE	50997	52273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_51462_51588
835623	contig_15185_pilon	+	1033	5	Intergenic	novelGene_99409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	49.180788932265	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	156	311	209119	209372	FALSE	35	AAAGACCATGCCTAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKRTPQAPELASSRAPAPSHQPQPLTSEPSTSQVLELPKELSEIFDPTPECMSSELLEELMSSEVFAPLLRLSPPPGDHDYIYNLDESEGVCDLFDVPVLNL	207018	210094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_207042_207141_207221_208882_208931_209113_209159_209256
835624	contig_15354_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_65702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCCCTGCCCCAGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117832	118766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_117800_118800
835625	contig_9995_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_47686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAGGTGTCAGGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273816	274544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_273800_274500
835626	contig_15299_pilon	+	424	2	Intergenic	novelGene_175456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2448	junction_1	0	4454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTGCTTGTGGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165439	185005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15299_pilon_+_165664_184805
835627	contig_14060_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_156053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAGAAAAAGATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56207	55107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_55100_56200
835628	contig_6443_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_175147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACAGTTCTACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433522	432022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_432000_433500
835630	contig_10003_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_88303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGGCTAGGGGTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955039	954650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_954600_955000
835631	scaffold_12124_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_21981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACTTTGGCATGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702392	701915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_701900_702400
835632	contig_8133_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_98673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGTTAAGTACTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342678	341508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_-_341500_342700
835633	contig_15905_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_154710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGCAAAGTGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136329	137666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_136300_137700
835634	contig_16071_pilon	+	1153	6	Intergenic	novelGene_165995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	8.89044430835715	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	188	637	58466	65352	FALSE	45	AAAATTATTTTACAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESERRVPLPVPPKRTVKRNIPKLDAQRLISERGLPALRHVFDKAKFKGKGHEAEDLKKLIRHMEHWAHRLFPKLQFEDFIDRVEHLGNKKEVQTCLKRIRLDLPILHEDFVNNNDEVGENNGDDVTATELDPFLTNSSESERFASESSRTLTEEQQQRIERNKQLALERRQAKLLSNSQSLGNDSLMDTPRAETVGEVNTSEDQKEEETNG	54640	65868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_54722_54935_55012_58435_58559_58940_59005_63438_63646_65266
835635	contig_14483_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_133744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGTACAGACATAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37355	36111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_36100_37400
835636	contig_6277_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_80417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAAGCAGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791531	792268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_791500_792300
835638	contig_16882_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_148260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAACGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631101	630386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_630400_631100
835639	contig_6871_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_21624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAACCAAAAAGTGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569116	570971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_569100_571000
835641	contig_14925_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_55384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGTCTCTCATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159905	161468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_159900_161500
835643	contig_2770_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_107409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGGTAAATATTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166967	168088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_167000_168100
835644	contig_2770_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_107416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188305	188760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_188300_188800
835645	contig_7815_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_134388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAAAAGGATCGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540740	539774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_539800_540700
835646	contig_10746_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_176812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTGCCTTCAGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15749	14559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_14600_15700
835648	contig_7513_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_88991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGGCCAAGAAATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456185	454093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_454100_456200
835649	contig_6576_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_42321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	45	557	599349	600882	FALSE	70	ATACAGAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGERTAGSDLTCKMNFPSLLLAGVRWRCCPAPLRSSLFQALHSSCCREKSTAPTKIIPNVAFCGENTKESGNALDKFFSSEQQASILRVLNTASNKELEAFKLLRGRKATNIVEHREKFGPFQNLESLMNVPLFQYKTTIQVCNSILFPETKKKKRKLQENRLLGKLIKPDIGRERLKVYHFS	599304	601044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_599380_600400
835650	contig_8418_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_166067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAACACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169761	1170874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1169800_1170900
835651	contig_9727_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_86326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGCAGGAGAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360994	360257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_360300_361000
835652	contig_4131_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_127894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTTTCTAGTTTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301301	302463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_301300_302500
835654	contig_10861_pilon	+	686	1	Intergenic	novelGene_39411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1945748	1946434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1945700_1946400
835656	contig_9177_pilon	-	1123	8	Intergenic	novelGene_32741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	117.345295463205	58	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	165	1121	1248987	1087231	FALSE	15	CCCCGCCGGACAGGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEKNYPTPRTGRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRVSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLAERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVPASSHSIVSTGSVTQVSSVSTDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQQQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLTSPTPADIGSTVPGPQSYPIVTGRDLASTTLPGYPPHV	1249151	1087228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1087278_1129550_1129681_1182914_1183091_1218232_1218362_1222137_1222203_1229995_1230194_1235399_1235566_1248941
835659	contig_14357_pilon	+	1271	8	Intergenic	novelGene_121711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	103	junction_3	222.373834901905	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	606	1271	862581	877901	FALSE	25	ATCACCTACCAGGGCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCVGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLTIQVTFDCDCACQARAELYSPRCNNGNGTFECGVCLCGPGWLGPQCECSEESYHPSQQDECSPREGHPVCSQRGECLCGQCVCHNSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTHTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCTQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKGCVECKKFDRGELHEENTCNRYCRDEIELVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPDCPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTFTN	859356	877901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_859407_860724_860860_862160_862591_868359_868583_869422_869524_871954_872075_876349_876517_877856
835662	contig_2365_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_103752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTCTCCCATATACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235376	233456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_233500_235400
835664	contig_19709_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_108663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCATGGCTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70025	70597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19709_pilon_+_70000_70600
835665	contig_12000_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_43197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599346	599098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_599100_599300
835666	contig_1275_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_108737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATGAGAAAATTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352693	351765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_351800_352700
835667	contig_6031_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_56728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_1	96.5776889348674	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	71	658	149114	162025	FALSE	45	GTAAGCCAGCAAAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVE	149043	162025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_149190_157218_157314_157966_158049_158985_159142_161846
835668	contig_9468_pilon	+	739	8	Intergenic	novelGene_59467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	157.691380324263	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	73	738	172913	200512	FALSE	55	TAGAAAAAATTCCCGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEVKLCFSVDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPLRKKKRKGINPLPPPPHHPVTQIAQVILSPLLILLILKVLLKRNQKKGKRN	172513	200513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_177186_177296_189671_189702_189792_189922_200358
835672	contig_17198_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_62374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCACAATAATAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904086	903650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_903600_904100
835673	contig_2476_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_157640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448778	446750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_446800_448800
835674	contig_3602_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_60628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954119	954513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_954100_954500
835676	contig_3942_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_128802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTTGCGTGGTACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019861	1021109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1019900_1021100
835678	contig_17108_pilon	-	953	3	Intergenic	novelGene_109517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	343	157	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103853	48461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_48884_53229_53320_103412
835679	contig_14687_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_107891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCAGCCTTGAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410988	409286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_409300_411000
835680	contig_6919_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_163971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	14	316	17945	18247	NA	70	AGGGAGAAAAACAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTHSMVVEKSTVPNLERDTNIELGLHRTTYSSPPSLKLSTNVRPPHSFLGTLGFQPGLPLKENEQFCHTFRGIPENFLGENPHGGCRPPLLGGDDFWICGSVLS	17931	19306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_17900_19300
835681	contig_2894_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_86535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	420	111	530	157912	158331	NA	10	GCCATCCTTGAGCCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQSARAVAQREWAQSEGQPHPSRPGNPQEGIRPAFLCWNRRKQCSSSPMPFLYQVGTGRRVDRRGSHAKPYAQSPGADTLFLQPSTSWEYSQAQSRLLQNPFFSFPPRTWEEGILDHKEGLEVKAQSLPCLRKQPKGRC	157801	158332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_157800_158300
835682	contig_205_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_144323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCATGAAGTGATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300956	302288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_301000_302300
835683	contig_5640_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_27254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103038	104610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_103000_104600
835685	contig_3602_pilon	+	671	2	Intergenic	novelGene_60525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170376	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170863_170947
835686	contig_17311_pilon	-	423	4	Intergenic	novelGene_57846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	6498.06837965458	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	71	325	123485	119271	TRUE	10	CTTATATGTGTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	123555	118800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344
835687	contig_10143_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_163335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAACTTCCTTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139881	140192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_139900_140200
835693	contig_10734_pilon	+	856	5	Intergenic	novelGene_51193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	191	junction_1	453.204355120292	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	137	652	1127664	1132787	FALSE	40	AAATAACTCTGAAGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFLLEPQSIIIQGHDRGQEKENESQKMKEENTGAGAEAKRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSR	1123734	1132991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131067_1131281_1132609
835694	SIRV6	+	241	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	491	51	491	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10728	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
835696	contig_18156_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_101450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTGGAACACAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35576	33750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_-_33800_35600
835697	contig_504_pilon	+	1227	2	Intergenic	novelGene_54431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	143	343	222784	222984	FALSE	75	ATTAAAAAAAAAACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSFPVEPPPSRYRSVEPGWEGSAEGAQHAAASHLQSRARRRPSPEKTMASGSPAASEEERSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKVKINVGR	220104	223868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_220239_222775
835699	SIRV6	+	332	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10489	5	1252	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11489	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
835700	contig_14077_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_174867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTGTATCTTTTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52400	53524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_+_52400_53500
835701	contig_9516_pilon	-	1312	11	Intergenic	novelGene_106200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	14.3878420897645	6	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	92	1312	1211942	1161273	FALSE	50	CCAATAAAGTAAGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLYLSNCKEAVEPAASKAAASSLKADKKQCSTGLEKKPVPEVGAAHLLDLPLGVKLPVIPGSTNVFYTTNLSEKLYQPSYDFNLTDPYCRLLETSYQSLHDPHLKSYHRRKDILRRLKKGGYITSNNKVICTIKELNKYRQYLTSLKLDFERNYVREQKMIEKQVNKLYESKRALERPNIAQFQEWLFHKGPPITPEQDQLLKYRYLDMVRKELDKTEHTAEKQSTSRMMEEESRHRDHIRRKLSLRKQIEEEWKTKEMLLLTKIGEEVRRESRIEEHRRKSREETDRKKQALLEKKIAYHLQKIQKNSSKREVPEERRAENKGQDGAEANTKTAPASAAPTKKNILRHSIHEIPKQEANDISYAPDANRTSVIYAKANEKRTKKLSFSYEPVLPTIKEVVSAHSP	1212033	1161272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1161314_1162973_1163035_1164843_1164972_1205245_1205367_1205781_1205893_1206594_1206737_1207806_1207947_1208318_1208409_1209328_1209491_1211350_1211477_1211843
835702	contig_6410_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_108650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCGTGAGTTATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419293	418872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_418900_419300
835703	contig_16103_pilon	+	1212	8	Intergenic	novelGene_118800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGAGAGAGGCGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595884	599951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_596428_596618_596673_596760_596830_596942_597031_597154_597232_597458_597529_598370_598428_599697
835704	contig_17875_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_143181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGGGTCTTTTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66311	65594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_-_65600_66300
835705	contig_13760_pilon	+	1112	2	Intergenic	novelGene_61267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	80	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGTAATACTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17194	21781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_17325_20799
835706	contig_9527_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_134020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATCAATAAATGTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44109	43268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_43300_44100
835709	contig_3956_pilon	-	1960	13	Intergenic	novelGene_14738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_6	8.39766832718067	24	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	49	1812	506765	477929	FALSE	40	TTGAAATAAAATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPLVTMKILLRTKCFQHLAIPGPVRALYKDYRTMTPQNFSNYESMKQDFRLEIPEYFNFAKDVLDQWTKIEKAGKKSSNPAFWWIHGNGQEVRWSFEELGSLSRKFANILTEACALQRGDRVIAVLPKIPEWWLVNVACLRTGTVLITGTTQLTQKDILYRLQSSKAKCIITNDALAPAVDAIAPKCENLRSKLIVSQNPRDGWGNLNEMMKHVSDNHTCVKTKHNDPMAIYFTSGTSGAPKMTEHTHSSFGIGLSVNGRFWLDLTPSDVLWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFAHYLPRFESTSILQTLSKFPITVFCSAPTAYRMLVQNDMTSYKFKSLKHCVSAGEPINPEVTKQWRNRTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPVFDVKILDANGNVLPPGQEGDIGIQVLPNRPLGLFTRYVDDPAKTASTLRGNFYITGDRGYMDEDGYFWFVARSDDVILSSGYRIGPFEVESALTEHPAVEESAVVSSPDPIRGEVVKAFIVLKPDYKSRDKEQLKKEIQEHVKKMTAPYKYPRKVEFVQELPKTVNGKIKRNELRKKEWKTI	506813	477780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_478012_479003_479128_480197_480298_480389_480518_482372_482475_488287_488369_489647_489772_491257_491338_491597_491755_491847_491992_495183_495392_505497_505709_506543
835710	contig_8729_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_40085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGACAGCACCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160910	161638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_160900_161600
835711	contig_9955_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_21364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCATTTGAGTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294500	295439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_294500_295400
835713	contig_10609_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_123960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTCTTCCTGGTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515661	517591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_515700_517600
835714	SIRV6	+	508	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	164	-9	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	32	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGGTAGTATCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2025_2470
835716	contig_2577_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_172067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTTCCGGAGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180143	181197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_180100_181200
835717	contig_1406_pilon	+	557	2	Intergenic	novelGene_25678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9257	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	97	396	3357131	3357484	FALSE	50	AAAGAATGGACAGTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNDRTGEASRRIALRRRGRYALYVPQALPSSFFQLFNFVRCREVGSSLNDCAAPLHVKESRTTDYEGGACHPHPPVWLAGKEESLHVGDGRSWVGRQ	3357034	3357645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3357136_3357189
835718	contig_7457_pilon	+	1319	12	Intergenic	novelGene_31314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_10	54.7398052699472	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	236	754	186386	189512	TRUE	20	GTGGTTGTCGTATACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183173	195103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189537_189996_190064_190243_190336_190768_190824_192098_192194_194871
835720	contig_6076_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_81773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCTGGTCCCACAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457268	457798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_457300_457800
835721	contig_1443_pilon	+	847	2	Intergenic	novelGene_28192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	82	546	344128	344592	FALSE	25	TCTAATGAGTGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343667	344893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
835722	contig_5039_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_64836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296750	297858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_296800_297900
835723	contig_754_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_161114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTATCAAAAATAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505324	504363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_754_pilon_-_504400_505300
835724	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	15	1248	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
835725	contig_19892_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_158951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTCAGACTGGATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26252	26587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_26300_26600
835726	contig_5403_pilon	-	672	2	Intergenic	novelGene_87980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTGAACCTTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433602	431930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_432248_433247
835727	contig_15327_pilon	-	679	7	Intergenic	novelGene_70454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1123.79871665506	119	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	121	606	293006	289810	FALSE	0	GCTGTGTGTCTGCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVKSCAEFLAVSKTRIGEYEKQLEKLRNIIPFDQMTIDDLNEAFPETRLDKTKYPYWPHQPIENF	294812	289736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_290158_291454_291527_292481_292579_292884_293021_294428_294484_294761
835728	contig_8202_pilon	+	785	3	Intergenic	novelGene_177150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_1	18.5	150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATATGATTTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81900	144447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8202_pilon_+_82027_120158_120294_143923
835729	contig_4131_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_127888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	59	718	269996	270655	NA	35	GAACCGGACAGATGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPVSLFPAGIAFPTPTLNMSETAPAAPAAPAPAEKVPVKKKPRKSGGAAKRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEAKPKAKKVGAAKAKKSAGAAKKSKKAAGTATPKKSAKKTPKKAKKPAAATGAKKAKSPKKAKAAKPKKTPKSPAKAKAVKPKASKPKTAKPKAAKPKKAAAKKK	269937	270866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_269900_270900
835731	contig_9481_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_149688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGACTTTGTTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475583	477061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_475600_477100
835733	contig_7078_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_130165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAGTCTGATTGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594129	594354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_594100_594400
835736	contig_2419_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_137133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTTCAGTGAAATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152182	152965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_152200_153000
835737	contig_6241_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_156447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAAGAGAAGAGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560024	560706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_560000_560700
835738	contig_4339_pilon	-	510	4	Intergenic	novelGene_146089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATGGCCAAATCATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072193	1064716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1064884_1068673_1068746_1069966_1070121_1072076
835739	contig_9571_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_136335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATTAAAGGTAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781252	782133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_781300_782100
835740	contig_16633_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_165068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60306	58982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_59000_60300
835741	contig_405_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_135286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131355	132490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_131400_132500
835742	contig_3818_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_99257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCATTAAAAAATAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496536	495045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_495000_496500
835743	SIRV3	+	666	1	NIC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	3619	-4	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGGTACCTAACAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7622	8288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_+_7600_8300
835745	contig_5549_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_81696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	214	525	772160	771849	NA	30	GCTTCTGTAAAGATTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESEINCMKSHKVITLHTLKITFHTHKDINFFSENTHSGNLNLRGSYKKNIKCKHVKTHYLSLSPNHPPKKSFYPGLKKAKTHNCIFLPSNYFLLSNLRAKF	772373	771676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_771700_772400
835747	contig_4684_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_175436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517251	518940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_+_517300_518900
835748	contig_4769_pilon	-	825	8	Intergenic	novelGene_117964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	81.7714585205096	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	361	765	421215	407585	FALSE	35	GTTGATGATTTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFHTTKQKEGNFDIVSGTRYRGNGGVYGWDLKRKIISRGANFITQILLRPGASDLTGSFRLYRKEVLQKLIEKCVSKGYVFQMEMIVRARQLNYTIGEVPISFVDRVYGESKLGGNEIISFLKGLLTLFATT	437513	407524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_417932_421195_421273_423624_423659_433960_434061_437344
835749	contig_1154_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_87057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGCAAACCAGATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117282	118625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_117300_118600
835750	contig_7898_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_47615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570282	567975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_568000_570300
835754	contig_10042_pilon	+	1090	10	Intergenic	novelGene_79212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	93.7502592589008	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	118	1032	1060566	1082966	FALSE	25	GAGTACTTATGGTATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHKMEPSSYAAEPVSDSGLPALSPPSLRCVPPPAAAVIVPTYSTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKVNGLTSSICVTVARLVSIFSCLLSLLCPPASA	1060016	1083024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1060080_1060511_1060696_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808
835755	contig_8616_pilon	+	909	9	Intergenic	novelGene_72392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_8	56.2183244147315	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTGTACCTTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196163	199030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479_196640_196862_196914_197236_197657_197845_197881_198085_198124_198540_198588_198825_198858_198952
835757	contig_11160_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_168860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAACAATCCCAAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000309	1001375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_1000300_1001400
835758	contig_13044_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_100005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGGTAATAGGGAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237507	238199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_237500_238200
835759	contig_14925_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_55385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	334	678	168988	169332	NA	20	CTTCCATGCAGTGATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSFCGVPSVVLGSLAGRQCFGLSGACQAQEAAGPVVLRLQGQTNLGSRGSRRRSGQIHFMAPLDDWRTLLLGPFSGCFFLISTLSISVTCLCACGLAADNEEISLNQQMFCP	168654	169995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_168700_170000
835760	SIRV6	+	466	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	17	2	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
835761	contig_10958_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_5336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543853	542292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_542300_543900
835762	contig_5050_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_110247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	261	380	80596	80715	NA	25	GATTTGGTAGGAGACGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLHRSRLHIFLLQSDWWVKTTNPSVSSQALNRCATRAPLSSKQVLQKDTRKTGVVTVSRQGSPTLLCASRRLSVQCAWCHGGLRGDMRQECVRRQPCSRTGQSHEKEREVTASLLTGEGGLTYVV	80335	82403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_80300_82400
835764	contig_11846_pilon	-	1485	12	Intergenic	novelGene_105941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105.852228199864	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	570	1442	254938	248626	FALSE	35	TATTGCTGAGGCATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGLAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGECRRCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263887	248582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251383_251471_252081_252173_253141_253246_253410_253492_253969_254061_254613_254655_254824_254997_257458_257538_259908_260113_263659
835766	contig_5415_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_146150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACTAGATGGCTAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325431	325074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_325100_325400
835767	contig_3602_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_60655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATGAGTCTCTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106520	1106033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1106000_1106500
835768	SIRV6	+	245	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	272	14	41	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
835769	contig_13015_pilon	-	887	4	Intergenic	novelGene_165542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	12.9185482500507	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	18	344	371542	338781	FALSE	10	TTCTCTGGGTTTTCCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVALHRWRRRRPEELQVLGDAKRVCRRPEAAVHEWGCSQLSRCARQSWSPEEVTPLPSGPPPAHGPESSRGKPASKIPLNGGTSLAQPCPRCMAGESGHFNHTEDR	371559	338237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_338811_351800_351864_351964_352130_371473
835771	contig_4797_pilon	+	437	5	Intergenic	novelGene_6906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_4	1790.90680592263	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	45	437	368372	370986	FALSE	30	AAGAGAGTCCTTCCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKT	368327	370986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368844_369855_370026_370914
835773	contig_14353_pilon	+	1733	6	Intergenic	novelGene_82146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	128	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTGACCACTTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401869	409925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_403009_403498_403605_404586_404701_405458_405644_407875_407967_409827
835774	contig_14621_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_105851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTCACGCTGGGACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388488	387438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_387400_388500
835775	contig_14621_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_105850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAGAAACCCAGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386031	385604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_385600_386000
835776	contig_4751_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_173729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCTATGAAAGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328311	326940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_326900_328300
835777	contig_6375_pilon	+	443	4	Intergenic	novelGene_72979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	290.349597707469	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCACTGTTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241665	244542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241803_241940_242009_243940_244006_244369
835778	contig_6958_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_70027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGTCAGAGAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836330	837654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_836300_837700
835781	contig_6533_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_114663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAAAATGAGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321341	322888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_321300_322900
835782	contig_4857_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_48859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAAGAAAATCCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341576	1341284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1341300_1341600
835783	contig_990_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_76014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGGTACCCTGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530455	530824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_530500_530800
835784	contig_4876_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_137907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCACTCCTTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484774	485127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_484800_485100
835785	contig_17493_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_122186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGCCCCTGCATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49983	50634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_50000_50600
835786	contig_15084_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_116666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	71	511	15125	15565	NA	35	ATGCAGCAGCTTACAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDKVTNDLHDAKVNFQFSSYLTYMQHLTVFHSPPPWTIPLSFWNITFFSSAPTSLAIPSHLLGWFLIFLNGGVTPGLSPSLFLHLHKWFSIGGDFSLPNPKDIWQYLETFLVVTTGMGRVLLYAVGRGQGCCSTSYNAQDSPHNKELLLLVAFESYPGPNANSSEVEKH	15054	15907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_15100_15900
835788	contig_8538_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_4618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCTGTCCAGAATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730423	728710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_728700_730400
835789	contig_4659_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_118208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTTTTACTGCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423806	424978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_423800_425000
835791	contig_11816_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_98542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACCATTATTTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068165	1068840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1068200_1068800
835792	contig_6325_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_143339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGAGTATCAGATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110976	111816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_111000_111800
835793	contig_8677_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_174034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTGAAGATGAGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122638	122139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_-_122100_122600
835794	contig_19892_pilon	+	1470	3	Intergenic	novelGene_158949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	8.5	87	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	417	899	7948	18968	TRUE	15	TCTTAATGCTTTCTGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQACALEAGACSAFSANALRVERGPEPGRRPETCHSLLLNTVSSPSFHFRSQVWCREKESSPGSRGPRVPILHIHKSQGRISTALAGVWTKHYSSASKLPSALLPLPSLFLTWLHGLRDDIPLDFQKLEKEMAVKSREAGKVESVSRQFSDGLQSCPLDD	7531	24966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_+_8344_18881_19045_24471
835795	contig_6361_pilon	-	740	4	Intergenic	novelGene_24027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	277.558802578641	193	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTATTATTTTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594664	551038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_551475_556742_556858_572329_572455_594600
835797	contig_14846_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_85386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237259	238412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_237300_238400
835798	contig_7327_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_172123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATCACTTTCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125744	124639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_124600_125700
835799	contig_8475_pilon	-	962	2	Intergenic	novelGene_171104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAATTAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104218	96305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_97199_104149
835800	contig_12540_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_148055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACGCATGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189592	188359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_188400_189600
835801	contig_10135_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_106665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACCATATATTTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119863	120185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_119900_120200
835802	contig_16148_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_50349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCTTCTGCTCACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58021	57239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_57200_58000
835804	contig_8606_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_159390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGAGATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27353	29477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_27400_29500
835805	contig_91_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_127126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACATTAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726659	724787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_724800_726700
835806	contig_16205_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_156870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACCCAGGGATTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82670	82043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_82000_82700
835809	contig_299_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_129504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649871	1648402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1648400_1649900
835810	contig_6451_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_173697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTACCTCCAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61833	61126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_-_61100_61800
835812	contig_9363_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_6531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATATTAAATAGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611294	611821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_611300_611800
835820	contig_9121_pilon	+	1534	1	Intergenic	novelGene_134457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTTTACTTTACTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166392	167926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_166400_167900
835822	contig_11642_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_172914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACAGATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200308	199888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_199900_200300
835823	scaffold_12124_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_22082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCCAAGAAAACCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859624	858121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_858100_859600
835825	contig_14868_pilon	-	1362	7	Intergenic	novelGene_150444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	67	junction_6	114.057977459809	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	223	870	154533	123454	FALSE	55	TCAGAAAAAAGAAATAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVRGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSELELSKSACTKSIDSKVADAATEVQHKATEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEQSALKSDGKPEEKNHETGMSGKRSQ	185249	122961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_123606_124638_124802_124892_124949_130555_130638_139495_139586_154428_154575_185068
835826	contig_19744_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_120373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTATAGTCAAGGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137277	137000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_137000_137300
835828	contig_9415_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_109946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTTTTTTTTAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481233	2480637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2480600_2481200
835829	contig_10096_pilon	-	1061	4	Intergenic	novelGene_177155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33.9411254969543	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGAAAGTCAGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83533	67556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10096_pilon_-_67738_68828_68901_71137_71756_83343
835831	contig_1939_pilon	+	1257	10	Intergenic	novelGene_144857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	300.976845834352	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	60	1046	194349	455047	TRUE	30	GCACTACTTCAAAGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDALKEEKEKLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYTLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRVKIHYQQRPGGLRGCI	194289	469087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_194379_371026_371183_376345_376468_393212_393443_411106_411235_421380_421483_430156_430324_436180_436222_455036_455168_468996
835832	contig_8650_pilon	-	1376	6	Intergenic	novelGene_162611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAGAAAAATGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270207	3328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_3417_9659_9794_15861_15937_95746_95787_230365_230403_269205
835833	contig_13780_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_149101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	360	740	762505	762885	NA	25	ATATCCTACTTTGCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKECNNKSGSREREERGQTVGTPGTPVPARRRFVTSQEDWKHPGIPGWGRTQWTDADWNTGSAEKPSLPPRLCRCPVFLPRVWPAVGGIHGCKIPRRESVWTGVTRTVIESLPGGYITLVKLLSSG	762145	763978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_762100_764000
835834	contig_10861_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_39470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAAAAAGAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2808943	2810473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2808900_2810500
835838	contig_1986_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_64154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTTACGGCTGACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391689	392679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_391700_392700
835839	SIRV6	+	517	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	339	0	166	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
835840	contig_5083_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_151669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGGCCACCACTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499609	500233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_499600_500200
835841	contig_1339_pilon	+	364	4	Intergenic	novelGene_163134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4815	junction_1	2683.83759237071	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	40	363	431340	433796	FALSE	10	TGAGTGGGGCCCAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGQRKPATSYVRTTINKNARATLSSIRHMIRKNKYRPDLRM	430921	433797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433677
835847	contig_15867_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_170877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATACATATAGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19233	19627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_19200_19600
835848	contig_15867_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_170878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAGGAAGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20496	21530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_20500_21500
835850	contig_12638_pilon	+	797	2	Intergenic	novelGene_33395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGGATTTTGAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515794	1539676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515854_1538938
835851	contig_10023_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_123505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAATCGTCAGAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426886	426358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_426400_426900
835852	contig_9706_pilon	+	1126	7	Intergenic	novelGene_20895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	833.788025952773	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	335	751	231608	313514	FALSE	70	TAATTTAAACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTE	91200	313889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340
835855	contig_6556_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_168497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCACCACCTGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323590	322506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_322500_323600
835856	contig_12724_pilon	+	941	5	Intergenic	novelGene_146850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	28.8476602170783	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	74	481	104653	135285	FALSE	80	AAAGAAAAAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGRELGTSGNNSATRPPPVRRTMPFLGQDWRSPGWSWIKTEDGWKRCESCSQELERENQYNINHNIILNSEDEEIFNNEECEYTSKKRKKDHFGNDTNTQCFYREKWIYVHKESTRERHGYCTLGEAFNRLDFSSAIQDIRRFNYVVKVSILFPKLF	97126	135745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_97193_104645_104784_131760_131865_133210_133261_135162
835858	contig_14341_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_111801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428144	427592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_427600_428100
835859	contig_15327_pilon	-	1176	3	Intergenic	novelGene_70738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	35	junction_1	1.5	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	416	850	982871	982437	FALSE	10	CTGACTTGACTCCCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSFTKSSQAVQAVRELLAAACTSQWEQLRGLGSDEDGLQKLGLEAEADSQDPDSTDHTESEASRDYFLKFAYVVDLDSDTADKFLQLFGTKGVKRVLCPINYPESPTRFTHCEQVLGDGALDRGTYYWEVEIIDGWVSMGVMAEDFSPQEPYDRGRLGRNAHSCCLQWNGRSFSIWFHGLEAPLPQPFSPTVGICLEYANRALAFYAVRDGKMNLLRRLKASRPRRSGTPALPIDPFQSRLDSHFAGLFTRRLKPAFFLESVDAHLQIGPLKKSCISVLKRR	983999	982110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_983078_983336_983412_983865
835860	contig_9389_pilon	+	368	4	Intergenic	novelGene_84027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6542.81454897067	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	19	366	584401	586197	FALSE	10	CGCCACCCACTCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGI	584382	586199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585705_585890_586122
835861	contig_10023_pilon	-	1648	1	Intergenic	novelGene_123473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAAACTGTTCTTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130561	128913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_128900_130600
835862	contig_7412_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_76272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTAATAGTATTAACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241893	242436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_241900_242400
835864	contig_19735_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_167890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCCAGCCACAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152040	152798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_+_152000_152800
835865	SIRV3	-	359	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	218	40	218	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAGCTACAACGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1764	1040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
835866	contig_17440_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_7653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
835867	contig_2770_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_107492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATTAAAATAGAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747149	746466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_746500_747100
835868	contig_6364_pilon	-	709	3	Intergenic	novelGene_51809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAATGGATATCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489274	1474549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1474912_1481681_1481810_1489055
835869	contig_18081_pilon	-	1065	4	Intergenic	novelGene_23799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	110.745955531869	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	24	455	205697	134303	FALSE	35	CAGAAGGATTTCTCGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHGAGLVRTTCSSSSNAPGPWAGTGQSSASPSEGMLDPDYPCTRTALLKVAQMVALLIAFTCVRTAVWTDYSAYSFFEVVTICDLIMILAFYLVHLFRLYRVLTCINWSLSIFGFVATTLCLMNIWLSYKISCVTQSTDAAV	205720	133692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_134317_137089_137172_146060_146235_205535
835870	contig_13265_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_146002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67476	66024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_-_66000_67500
835872	contig_7300_pilon	-	1354	12	Intergenic	novelGene_170454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	57.561609106897	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	43	1161	504153	440577	FALSE	50	TTAAAGACTAATTTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVKAAQAGKPGPAKRRLAEQFAAGEIITDMTKKEWKLGLPIGQGGFGCIYLADTNSSKSVGSDAPCVAKVEPSDNGPLFTELKFYQRAAKPEQIQKWIRTHKLKYLGVPKYWGSGLHDKNGKSYRFMIMDRFGSDLQKIHEANAKKFSRKTVLQLSLRILDILEYIHEHEYVHGDIKASNLLLSCKNPDQVYLVDYGLAYRYCPEGVHKEYKEDPKRCHDGTIEFTSIDAHHGVAPSRRGDLEILGYCMVQWLSGHLPWENNLKDPNYVRDSKIRYLETVKLLDYTEKPLYQNLRDILLQGLKAIGSKDDGRLDLSVVENGGLKAKTVTKKRKKEVEESTESSVEDMECSSPKTEAFPPSRLRTRKRVQK	551189	440383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_-_440609_445428_445520_464275_464442_468514_468636_469429_469563_474926_475020_475152_475262_481496_481585_483014_483085_500494_500551_503993_504159_551152
835875	contig_15062_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_162305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251927	250208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_250200_251900
835876	scaffold_6394_pilon	-	894	6	Intergenic	novelGene_110952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	85.2136139358025	120	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	108	695	136081	128083	FALSE	5	GGAGTCCTGTCCTTCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDIQCECLSDTQWKELLPQMQQVEVIRLDDCGLTEVRCEDISSALQANPSLTELSLHNSGLGDAGLRRLLQALQGPARKIRKLSLQNCSLTAAGCTALPGALRSLPSLLELHLSDNTGCTALASLLLSSRSLRELDLSNNCMGDPGVLQLVESLRQPGCALRQLLLYDIYLSEAVDNHLKALEDSKPSLRIIS	145790	127883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_128171_128360_128505_134604_134704_134926_135098_135995_136102_145703
835877	SIRV5	+	425	3	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2053_2173
835878	contig_17814_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_168524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAAGGGTTTACCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110670	111845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_+_110700_111800
835879	contig_11372_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_176659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	135	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTATTTTATTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671559	664418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_-_664734_671393
835880	contig_7428_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_77710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCTACTGTGTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322087	322984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_322100_323000
835881	contig_9440_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_59084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACGAAAACTTGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649562	1650969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1649600_1651000
835884	contig_14882_pilon	-	1217	10	Intergenic	novelGene_115024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	141.007836223889	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	675	1217	316929	303713	FALSE	25	TAAGTTGACTTATTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGSVDSVFLQRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTM	363666	303712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316893_316984_317235_317321_321323_321410_321539_321739_363416
835885	contig_500_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_30931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGCAGAGGACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124455	1122701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1122700_1124500
835886	contig_500_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_30930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGACACTTAGGAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122701	1122386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1122400_1122700
835887	contig_5057_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_151526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTTTTTTGGAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522373	521180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_521200_522400
835888	contig_14219_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_54328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAGTATAAACAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749272	748705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_748700_749300
835889	contig_6014_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_176281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGAGGCTTTTTGGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239461	238483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_238500_239500
835890	contig_6014_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_176280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAACCCCCGTAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238427	237836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_237800_238400
835893	contig_5480_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_107213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19503	20664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_19500_20700
835896	contig_17549_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_162607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421500	420412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_-_420400_421500
835897	contig_6954_pilon	+	1424	10	Intergenic	novelGene_64424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_9	43.9750209679973	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1275	150	1424	151276	158951	FALSE	25	TCTCTGGGCAGAGTAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIRWLAAAAGNQCVRINNHEHTDIQEYIGCYTSDASGKLVFKEGVLIDAMRKGYWIILDELNLAPTDVLEALNRLLDDNRELLITETQEVVKAHPRFMLFATQNPPGLYGGRKVLSRAFRNRFVELHFDELPSSELETILHKRCSLPPSYCSKLVKVMLDLQSYRRGSSVFAGKQGFITLRDLFRWAERYRLAEQTEKEYDWLQHLANDGFMLLAGRVRKQEEVKVIQEVLEKHFKKKLCPQSLFSKENVLKLLGKLSTQMSRLESKFSHIVWTANMRRLAMLVGRALEFGEPVLLVGDTGCGKTTICQVFAALANQKLYSVNCHLHMETSDFLGGLRPVRQKPKDKEEIDTSRLFEWHDGPLVLAMKEDGFFLLDEISLADDSVLERLNSVLEVEKSLVLAEKGSLEDKDNEVELLTAGKKFRILATMNPGGDFGKKELSPALRNRFTEIWCPQSTSREDLIQIISRNLCPGL	149944	158951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_150077_151258_151468_151645_151793_152546_152689_154043_154179_154260_154400_154991_155131_155446_155578_156629_156775_158846
835899	contig_2027_pilon	+	946	7	Intergenic	novelGene_39946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	115.472098602024	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	117	656	639551	642265	FALSE	20	CTCAGATGTCACCTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARRQAQDGGSGGRSGVTGAPWNLPSPTSARLDKVLGSMELPRAPLPMGLSHPGQWVPSKSTCPTSSARDGMSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMHNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRRHFYHSVQDLSGVSRQHEAPSNRPLNEPLTPPV	638043	642555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_638101_639491_639643_639821_639915_640833_640937_641024_641180_641290_641383_642260
835900	contig_7775_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_37480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCAATATTCTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142911	142014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_142000_142900
835902	contig_11126_pilon	+	1616	8	Intergenic	novelGene_138132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	28.9573930498741	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAATAGATATTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444513	547042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_444621_482897_482969_486391_486470_495717_495762_527147_527259_539040_539096_539954_540026_545963
835904	scaffold_19766_pilon	+	1234	8	Intergenic	novelGene_34430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	139.667389149496	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	83	448	844727	845974	TRUE	15	TCTGACCCAGGGATGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRKQEFYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRL	844644	847974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844741_845104_845163_845497_845663_845845_846225_846509_846648_846978_847129_847510_847667_847882
835906	contig_2940_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_81958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGTGAAAAGAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001823	1000970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1001000_1001800
835908	contig_4364_pilon	+	1052	6	Intergenic	novelGene_173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	830.773711668827	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	110	673	1268714	1270694	FALSE	15	GGAGCCAGTGTCCCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKNPEVSGVLLLLPAQGCGDGSTAWGKPDCQTQAAPGPAPGGLGGLTSATS	1266996	1271073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1270545
835909	contig_10857_pilon	+	532	5	Intergenic	novelGene_160900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	24.0663146326977	1627	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	16	471	110363	118376	FALSE	20	TGAGCCAGAGCTCCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAAAMARNVLYPLYQLGGPQLRVFRTNFFIQLVQPGMAQPEDTVQFRIPLEMTRVDLRNYLERIYQVPVAAVRTRVQHGSGRRRDHRQVRVKKPDYKVAYVQLAHGQTFRFPNLFPEKEQSPERSAHLDLQDQLVEQQRQSSDPRRGSVPAWFSL	110347	118437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_110380_112638_112762_113583_113667_114298_114373_118217
835911	contig_3135_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_176599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATAAGGGCCGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46964	46528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3135_pilon_-_46500_47000
835913	contig_15893_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_128494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11303	10059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_10100_11300
835914	contig_17814_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_168525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	1294	1605	120134	120445	NA	75	TAAGTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAPWTPTYQGLVEEGRAGARKLTQNSQSWEENQQSQGGAISKRKEKAVSYTQEGSSTVGTEESIGFDSEVSDGLCVTSMVSVELTKYLKSDFSGSKRKCEVRR	118840	120445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_+_118800_120400
835915	contig_15273_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_140411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	86.5075462347393	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGTATTTCCTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55063	9964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_10141_27929_28094_53316_53480_54853
835917	contig_10135_pilon	-	438	3	Intergenic	novelGene_106662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCCGTACAAAAATAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120160	118810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_118837_119157_119205_119795
835918	contig_3560_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_149495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	795	1100	190496	190801	NA	20	GGGTTTTCAATCCCGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTQRSIYPSVFCGDETIGADCPIGKVSTVLTLLTRSSVVNNFAFFHHNKDSASRYGWHLCPSQPHSTFLQNQSLFSNVQSPPGPDDPASKVGTGLPVLTS	189701	191279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_+_189700_191300
835919	contig_9144_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_151137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATCTTGAAAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615313	616956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615300_617000
835920	contig_11594_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_80950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGAGGGGGAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598356	599282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_598400_599300
835921	contig_7410_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_106113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAAAAAAAATTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494761	493344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_493300_494800
835923	contig_11285_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_5523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCCTCTCGGCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666947	666619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_666600_666900
835924	contig_15039_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_110198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTCCGGCTTTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395932	395060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_395100_395900
835925	contig_10377_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_115354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAACAACGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180256	178624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_178600_180300
835926	contig_5649_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_82444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCAACACCTGAGAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501042	1501348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1501000_1501300
835929	contig_11677_pilon	-	404	4	Intergenic	novelGene_85951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	163	375	595842	594927	FALSE	35	AAATTTTTTCACCACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597325	594897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
835930	contig_10371_pilon	-	1261	9	Intergenic	novelGene_175476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_8	31.9951168149141	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	930	331	1260	790710	694854	FALSE	15	GCTCGGTAACCCAGCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTVDAVTALPLQVAPAAVPMDLRLDPPFPLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLALKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSASYNHPVLGMYDTKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGPSSPNNSSSNVSSENGIAPTVPSIPAETTLAHRLVARE	861074	694852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_694887_699032_699146_705483_705616_708503_708626_712292_712414_722469_722621_736888_737134_790697_790770_860803
835931	contig_11422_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_99030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCGAACGCTTCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_900
835932	contig_401_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_42733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112897	113962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_112900_114000
835934	contig_165_pilon	-	930	7	Intergenic	novelGene_117083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	307	339	484727	484695	TRUE	5	GCAGCTGCTTCCCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSAWRLAWLVWERHSSRLTSSRRFCRASSLSLCDACSCRTCFSKAAALASRAFRCCSSCRAASDFSTSSLLTLLSSCRSLASSAFCLLSTWLVAWFKASLRMEFSCCRRAS	491005	458699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_458823_477588_477738_478480_478604_483682_483836_484651_484773_486949_487098_490892
835935	contig_11413_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_103185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTAAGAATCAGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501445	501959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_501400_502000
835936	contig_6726_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_86245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTACTTTTACATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324706	325112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_324700_325100
835937	contig_6726_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_86246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACCTTCAAGCAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325214	326183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_325200_326200
835940	contig_16362_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_161172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	969	1373	344022	343618	NA	45	CGAAAAAACATGCTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPCVGVGHIPKLSWRGRTTWRSEAGLVSAQRGVALAGVVGIAHLFTHWVLGFLKAVGGNADPKWDLFLPSACLLSEALITTHLVLLFCVSKVSMKWYNCKPALWLRDMAGLALPSMQTLSPKLGERRTKVLIY	344990	342475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_342500_345000
835941	contig_709_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_57671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAATAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3939735	3939116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3939100_3939700
835943	contig_13403_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_158100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAGTACCTTAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105340	105808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_105300_105800
835946	contig_10299_pilon	-	1659	4	Intergenic	novelGene_79762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.8267435801184	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	244	1446	592066	579859	FALSE	0	TCTGCTGTGGGCTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLSLLSCASLPVPLPDLRAYWSQPHPGQDHPAEGP	593450	579645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_579964_584797_584887_591057_592259_593399
835947	contig_14288_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_153835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGACCCCATGTACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440106	438908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_438900_440100
835949	contig_14694_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_152462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGCAATGATATTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32003	32274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_32000_32300
835950	contig_11413_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_103230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGGTTTGAACTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907986	909233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_908000_909200
835952	contig_10711_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_118456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAGGAAATCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863780	863100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_863100_863800
835953	contig_4131_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_127890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	35	346	294921	294610	NA	15	TTCAATTCCTCACCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG	294955	293721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_293700_295000
835955	contig_19825_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_59696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTCAACAACTTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81756	80113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_80100_81800
835957	contig_12078_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_74091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAACAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183229	184078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_183200_184100
835958	contig_10976_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_155608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCAATGTGGGTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245707	245167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_245200_245700
835959	contig_8241_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_157482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127815	126302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_126300_127800
835961	contig_12624_pilon	-	2132	15	Intergenic	novelGene_61006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGAAGCGTCCGTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850596	759714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_759782_822900_823023_824693_824825_832954_833128_834319_834392_835163_835314_835984_836121_840053_840219_840544_840701_842126_842199_843401_843462_846472_846593_847461_847751_849706_849852_850322
835962	contig_11338_pilon	+	1182	13	Intergenic	novelGene_6259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_8	94.0606704325576	856	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	97	981	119137	150508	FALSE	5	CCCAGGCTCTGTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHYEVEILDAKTREKLCFLDKVEPHATIAEIKNLFTKTHPQWYPARQSLRLDPKGKSLKDEDVLQKLPVGTTATLYFRDLGAQISWVTVFLTEYAGPLFIYLLFYFRVPFIYGHKYDFTSSRHTVVHLACICHSFHYIKRLLETLFVHRFSHGTMPLRNIFKNCTYYWGFAAWMAYYINHPLYTPPHLRSSAGEAGARHLCNLPARQLFHPCGPAEPAAGRVQDKEDPIPHQEPLHVALPAGVLPQLHLRGRLLDWLHHHDTVPPSGSLLPGWLHPNDHLGQGQAPKLPEGVP	119040	150709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_119152_147568_147620_148324_148377_148784_148830_148916_149021_149100_149217_149301_149408_149503_149578_149664_149709_149804_149863_149940_150030_150264_150311_150423
835963	contig_7356_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_60370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401723	402988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_401700_403000
835965	contig_14450_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_49008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAACAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139439	1138325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1138300_1139400
835966	contig_6020_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_155571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACTAATTTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302359	301357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_301400_302400
835967	contig_6489_pilon	+	903	4	Intergenic	novelGene_128917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	323.823340041381	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	20	316	100350	203736	TRUE	90	AAACAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAAAMAQQQMTSSQKALMLELKSLQEEPVEGFRITLVDESDLYNWEVAIFGPPNTLYEGGYFKAHIKFPIDYPYSPPTFRFLTKMWHPNIYEDYPVKCNLTA	100330	208761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_100527_166604_166692_203703_203839_208276
835969	contig_1867_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_54544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAACAAATCTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375346	374835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_374800_375300
835970	SIRV6	+	527	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	28	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
835972	contig_3095_pilon	-	769	3	Intergenic	novelGene_75248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1831.5	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	66	437	255481	246709	FALSE	20	TTATCTGTACTCTGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRA	255546	246376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246714_253535_253806_255384
835974	SIRV6	+	345	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	509	19	343	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
835975	contig_3817_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_78402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAGAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267498	1268909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1267500_1268900
835976	contig_9233_pilon	+	828	3	Intergenic	novelGene_78237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_2	35	252	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	145	375	582395	674723	FALSE	20	GCCACGCTTGTTCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGARGWGCAGSLAVRAPSRRPARLSSVHSLLAREPAVAASQSCGTRRTMSSPPQGKLETKAGHPPAVKAGGMRIVQKHPHSGDNKDDKDKDNQEWESPSPPKPAVFISGVMARVRAHFSLSESV	582250	675176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_582450_603080_603178_674644
835978	contig_3721_pilon	-	1846	2	Intergenic	novelGene_123843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTGTTTTAAAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525836	520555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_521096_524530
835979	contig_9575_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_169727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATACCAGTTAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699824	700531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_699800_700500
835981	contig_8493_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_177159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTGTTCCCAGCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32909	31737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8493_pilon_-_31700_32900
835984	contig_8594_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_140008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAAGGAGCAGGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83151	84543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_83200_84500
835985	contig_7707_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_72137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110607	109371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_109400_110600
835986	contig_13026_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_146306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTACATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23177	24058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_+_23200_24100
835987	contig_7179_pilon	+	1793	5	Intergenic	novelGene_78152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTCCCTGTTGCTTCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038552	1041443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1039724_1039916_1040059_1040747_1040887_1040984_1041072_1041189
835989	contig_7843_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_152060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGGTAGAATCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590963	591409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_591000_591400
835990	contig_16650_pilon	-	1732	7	Intergenic	novelGene_61949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_6	53.5404831256997	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	54	1139	203207	191207	FALSE	5	TGGGGTGTGCAGGGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGGLLNVVVDGLFIIGWMYLPPHDPHVDDPMRFKPLFRIHLMERKSATVECMYGHKGPHHGHIQIVKKDEFSTKCNQTDHHRMSGGRQEEFRTWLREEWGRTLEDIFHEHMQELILMKFIYTSQYDNCLTYRRIYLPPSHPDDLIKPGLFKGTYGSHGLEIVMLSFHGRRARGTKITGDPNIPAGQQTVEVDLRHRIQLPEAENLHNFNELSRVVLEVREQVRQEQQRQQEGAQEDSQDPAPPAGEPPAKEAAAGPAEGPAEGHQEPEGGSGAAAQQPTESGQPFVLPVGVSSRNEDYPRTCRMCFYGTGLIAGHGFTSPERTPGVFILFDDDRFGFIWLELKSFSLYSRVKATFQNADAPSPQAFDEMLKNIQSLTS	204711	190613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_191430_192532_192916_193453_193608_194299_194410_201648_201724_203066_203235_204685
835991	contig_15165_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_145326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATATTGCGTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245770	247188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_245800_247200
835993	contig_5344_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_125335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAACCAAACCAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56006	55332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_55300_56000
835995	contig_16970_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_157612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTAAAAAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172610	173623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_172600_173600
835999	contig_1435_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_115531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCTGCTTTATGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615805	616072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_615800_616100
836000	contig_1435_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_115532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATAGGTTTACTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616644	617390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_616600_617400
836001	contig_16525_pilon	-	501	5	Intergenic	novelGene_133849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_3	1642.11667901523	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	51	440	181436	178157	FALSE	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181486	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181201_181253_181388
836002	contig_4971_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_174757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575252	577290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4971_pilon_+_575300_577300
836003	contig_4884_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_63796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTACAAGCCCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225412	226862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_225400_226900
836004	contig_4745_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_175176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAACTCTGACCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217102	216374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_-_216400_217100
836005	contig_12402_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_133374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTATTTTGTTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605352	604079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_604100_605400
836006	contig_3320_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_133064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	43	432	159683	159294	NA	35	CATGCAGTCAGTTGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRSKKAPISLSTRVAYQVQDALIKHTRIFWVTFQSIFILKRFPWLDFNFSLLPHFHSSDPWPTEYQEYVYLRPLTTSATTFFSQLWGRERKEPCSMAVKISVTIIHKMAALHWFGGSRMVSPAILE	159725	158546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_158500_159700
836007	contig_10437_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_38350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	90	404	530066	530380	NA	50	TTTACCAGAAAAGATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAGCLRCHLGEGAGMLAYGPGLFLTPGHSFCSVADTEDPSVSDCGSQNEGFKVFDQNGLLTANQPGQKLASLVQDKPEMKPILPFPFPLLFLLVSHICEGET	529976	530497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_530000_530500
836008	contig_7457_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_31350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCAGATAATCGGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294667	294233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_294200_294700
836010	contig_4426_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_15351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	467	787	14992	15312	NA	30	ACTGCTCTGGAAAACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNERVRRGIKKLNIGMVMSPRDREDRTGCYSPKMPVSSTWMSYFKISYHSKASLPVISFFTLKNYKTQKAQAIKEKSGELKNKKPNPCCQVELLHGVTAEGLVWI	14525	15799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_14500_15800
836011	contig_1719_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_87295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTACTGGAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392061	392381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_392100_392400
836013	contig_14219_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_54277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTGCACAGAACCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233116	233364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_233100_233400
836014	contig_10042_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_79140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATCAGTTGATTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87953	87195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_87200_88000
836015	contig_14924_pilon	+	1281	2	Intergenic	novelGene_104143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	227	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAACACGCGACTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14445	21477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_15015_20765
836016	contig_9706_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_20969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCAAATATCAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328769	327871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_327900_328800
836017	contig_7697_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_128293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	153	425	403500	403228	NA	35	TTTACTGCTAATGCAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNIPKSIDVIHHINQLKKKNHIIIATIQRKHLTKSSPRVTLRTKVHLTQAMVFSVTSHTCKTWTTNKEDRRRTDAFELWCWQRLLNILWTARRANKSVLEEVQPECSLEARRARLRLMFFGHGIGGTSSWRRTSCLVEGQ	403652	402909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_402900_403700
836018	contig_10617_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_172357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTGCAGCCGCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89525	87349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10617_pilon_-_87300_89500
836019	contig_12297_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_161378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTATGTGACCCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718094	718815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_+_718100_718800
836021	contig_12429_pilon	-	1232	9	Intergenic	novelGene_136202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_7	26.8514431641951	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1224	9	1232	73979	47950	FALSE	25	CCTGTAGAAGTGGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMKSSEENPKMVSAVLNGMLDQSFRDRAIQKHQGLKLVAAVLQNWGRCESWWAQDSASESKMAVLALLAKILQIDSSVSFNTNHSSFPEVFRTYASLLADSKLGLHLKGQAVIILPFFTNLTGGNLEDLKHVLEKLVVSNFPMKSDEFPQGTLRYNNYVDCMKKFLDALELSQSPILFQLMTEILCREQQHVMEELFQSTFKRIANRSSCVTQLDLLESVYRMFRRDDLLSNTTRQAFVDRSLLTLLWHCSPSALREFFSKIVVDAIDVLKSRFIKLNESTFDTQITKKMGYYKMLDVMYSRLPKHDVHSKESKINQVFHGSGITEGSELTKSLIKLCYDAFTENMAGESQLLERRRLYHCAAYNCAISLICCVFSELKFYQGFLFSEKPEKNLLIFENLIDLNRCYTF	73987	47949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_48001_49106_49276_51106_51286_52302_52511_62794_62923_66114_66283_67448_67554_67969_68156_73949
836023	contig_6217_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_109696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTGCCATAACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008927	1007674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1007700_1008900
836024	contig_13224_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_104126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAACTGAGATAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390241	389559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_389600_390200
836025	contig_16842_pilon	+	547	4	Intergenic	novelGene_177161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	6.94422221866655	261	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTCAATATTTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51109	62982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16842_pilon_+_51376_54829_54958_60470_60568_62926
836026	contig_2892_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_119008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATAAAATAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231496	231941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_231500_231900
836028	contig_13403_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_158083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTAGCAGCCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26365	26816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_26400_26800
836029	contig_16122_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_134529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTTTCAAATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163921	162978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_163000_163900
836031	contig_19954_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_173748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68064	69266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_+_68100_69300
836033	contig_14814_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_137734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAACAAAATCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349780	349027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_349000_349800
836037	contig_4900_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_159058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	25	363	1179339	1179001	NA	35	ACTGATAATGTGTCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFFIFVKINSRSLVHWGRMTSLANNVSGELQGLPLALEPLPQPPPSPTKPHLVCLFVEPCPGFPKLPSCLTLCLAVGHLAESTLAWSLCGQGWATAKPLTCLSVSGPHATQ	1179363	1178040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1178000_1179400
836038	contig_10163_pilon	+	993	4	Intergenic	novelGene_82658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.44948974278318	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	203	565	226271	238676	FALSE	45	TTGAAAAGAGATGAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRPGYKPQEPNGCSSYFLGLKIPESMDLGIPAMTKCCNQLDVCYDTCGANKYRCDAKFRWCLHSICSDLKRSLGFVSKVEACDSLADTVFNTVWTLGCRPFMNSQRAACICAEEEKDEL	208625	239104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_208817_226259_226349_235440_235607_238557
836039	contig_14720_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_164992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCCTTATAAACTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218901	217650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_217600_218900
836040	contig_12050_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_62688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGGGCTGACTAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541558	542066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_541600_542100
836041	contig_11978_pilon	+	560	4	Intergenic	novelGene_63103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4280.08990040578	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	114	359	1830113	1831276	FALSE	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLA	1829999	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830123_1830663_1830785_1831161_1831277_1831766
836042	contig_8942_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_143210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	248	448	517673	517873	NA	35	TGGGAAATTTTCAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAASPPLLAAHRPRTLPPKGSQVTCLPACLGDPRPLLQSHNKSHVLPSRKGRIGTVKGGSFRPREVFFPAGILVRPGEGSRMAIRAPGAELRDSLPGSSRDVRVDPPTRASQLTVRYKFKNSTRRTSIRIRIEGSSRMDREGNSSLK	517425	518470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_517400_518500
836043	contig_6496_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_103502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1306	1719	600854	600441	NA	30	TTATCTGAATATGGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRDQRTINVLPKTAKRLDGILLCCIPDDHAEEEDTLMIQAHPLHSWQAGKLRGHPQHRLGCQEQKEKSTKNLFIKIWLPSGKGGSFKSNSNIKNGQSTYEPNSVQVKRAKNKNVSSHFPQIVASVMTYRSSVTLNI	602159	600412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_600400_602200
836044	contig_10324_pilon	+	1180	6	Intergenic	novelGene_7841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	88.092224401476	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	77	625	283476	295997	FALSE	15	GGCCTCTCTGGAGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTVLLFAAGSLAIPAPSILLVPPHPSSQKDPIHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSENGFRRGFDHLGCSV	283399	296552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_283507_284893_285203_287181_287272_288007_288036_288830_288875_295950
836045	contig_9305_pilon	+	947	2	Intergenic	novelGene_148191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTTGTCCTTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162434	163494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_162913_163025
836046	contig_678_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_167852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCAAGTATACTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563476	564809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_563500_564800
836047	contig_610_pilon	-	543	3	Intergenic	novelGene_76699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.5	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	57	416	252557	200317	FALSE	35	AAGGTAATAAATTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVVLH	252613	200189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_200328_220517_220785_252475
836049	contig_5260_pilon	+	730	5	Intergenic	novelGene_144345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_1	82.2648162946955	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTTTGTAAAAACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63274	90822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_63505_70367_70468_84015_84087_90024_90107_90575
836050	contig_9011_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_159336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGCAAATAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651047	649664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_649700_651000
836051	contig_4845_pilon	+	1482	9	Intergenic	novelGene_53641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	63.1525929792277	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	514	1278	355239	492256	FALSE	0	CCCTCGCCCGGCTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVPEKNAVRILWGRERGTRALGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVNHNIYITEVKTGKCVHSLVGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPTAQLLLIATANEIHFWDWSRREPFVVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSHYRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSVI	307798	492460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_307982_308330_308540_355117_355374_355736_355796_356325_356510_357872_358046_358990_359058_359620_359756_492244
836052	contig_10056_pilon	+	695	7	Intergenic	novelGene_170927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	29.4938788376315	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	152	694	43823	67428	FALSE	20	ACGATGTCCCCTGAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSAREFRGANLGLQSRAERIRREARGASTKDLRTGEEQNEVGRETSDAIMQRSIMSFFQPKKEGKAKKPEKETSNSSRETEPPLKVALKEQNGVVPESESPVKRPARKAARVLGSEEEEEDSAPTSLKGQKPAPDSPRSSPPSPAASPESIPSLSDACPMEISPSGIPKRRTARKQVPKRKIQDALEEQSEDKERETKRKKEEEEAETPAESITEPEVAKKEGSRRRGQA	35732	67429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_+_35827_43765_43840_48679_48770_53129_53266_57494_57622_61871_61968_67351
836053	contig_9799_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_145567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCACTATTTCTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011500	1012893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1011500_1012900
836055	contig_15122_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_162706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGAAGGAAGACAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482222	483567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_482200_483600
836056	contig_14528_pilon	-	199	1	Intergenic	novelGene_111294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286927	286728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_286700_286900
836061	contig_9955_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_21337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGGAAATCCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81937	80501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_80500_81900
836062	contig_3787_pilon	+	940	10	Intergenic	novelGene_102421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	24.0231369956363	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	174	863	579750	598214	FALSE	30	CTGGAAGCTGTTTAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSTVGCHPTRCGEFEKNNPDLYLKELLNLAENNKGKVVAIGECGLDFDRLQFCPKETQLKYFEKQFELSEQTKLPMFLHCRNSHAEFLDIMKRNRDRCVGGVVHSFDGTKEAAAALIDLDFYIGFNGCSLKTEANLEVLKSIPSEKLMIETDAPWCGVKSTHAGSKYIKTSFPTKKKWENGHCLKDRNEPCHIIQILEIMSAVRDEDPLELANTLYNNTIKIFFPDM	575108	598291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_575139_578143_578285_579747_579892_579991_580035_586976_587063_587149_587191_589373_589451_592630_592702_594285_594413_598111
836063	contig_1986_pilon	+	1322	2	Intergenic	novelGene_64149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATTGCTTTGAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383162	402884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_384458_402857
836065	contig_2414_pilon	-	2159	2	Intergenic	novelGene_158490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310845	304945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_306421_310161
836066	contig_5602_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_133045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACGAAAAAACACGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685878	685007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_685000_685900
836067	contig_8461_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_163936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGATTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516029	516852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_516000_516900
836068	contig_14300_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_133157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATTTGGAATAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623156	622167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_622200_623200
836069	contig_8650_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_162630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	338	349	302217	302206	NA	40	AAAAAAACTCTCTGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFTWSSKWGQGETGCHPRITAAGSFILYCKEACSWLSLNTQPGLQCLAQLSELLGKRHDQINNWRDGTLKRQLLFIGLCLQVETQRYKLQVNEISWVRSFTSNTVNNCCGDMCH	302554	301820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_301800_302600
836070	SIRV6	+	350	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	17	340	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCGGTGGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
836071	contig_12622_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_6007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620169	1618933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1618900_1620200
836072	contig_8520_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_85447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGCCCACAAACCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243964	243447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_243400_244000
836073	contig_7119_pilon	-	542	3	Intergenic	novelGene_41012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_2	2.5	127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	39	440	196804	193550	FALSE	25	GGGATTATGGATCATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAGRLRRAASALLLRSPRLPARELSAPARLYHKKVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVRSLADLTELNHRLQTFGCH	196842	193447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_193724_194906_195021_196690
836074	contig_14450_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_48918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTTGTACGGCCTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13087	14859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_13100_14900
836075	contig_11846_pilon	-	174	3	Intergenic	novelGene_105987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	120	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGATTTTTCCATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356764	348260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_348324_352209_352232_356675
836076	contig_11656_pilon	-	1180	3	Intergenic	novelGene_53991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	235.5	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	160	411	374546	372983	FALSE	45	TAAATAAATATATTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACLPEAGLQLPDWTECELSGYGKHEATSPFYSERLKEGHVRLYPSSRCTSEHMFNKTITNNMLCAGDTRSGGNEANVHDACQVGDSGGPLVCMKDNRMTLVGIISWGLGCGQKDVPGVYTKVTNYIDWIQDNMRP	375843	372213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_373142_374453_374624_375761
836077	contig_5586_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_143547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGACTCGTAGTAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345892	344870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_344900_345900
836079	contig_10431_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_117411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTTCTCCTGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325474	326135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_325500_326100
836080	contig_12270_pilon	-	283	2	Intergenic	novelGene_114103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTCACCATCAGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14416	13910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
836082	contig_7164_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_172143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAAGACACTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480850	481668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_+_480800_481700
836083	contig_10104_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_160138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAGGACTCACCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454914	457055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_454900_457100
836084	contig_5445_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_135430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	103	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCTCCTGTTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124827	131347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_124922_126545_126733_130833
836086	contig_9543_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_175316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGACAAACGTTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367630	366873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9543_pilon_-_366900_367600
836087	contig_2793_pilon	+	2545	1	Intergenic	novelGene_142872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87869	90414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_87900_90400
836088	contig_11986_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_69129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCAAAGCTTTAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143382	144070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_143400_144100
836089	contig_10626_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_138202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTCGGCCCAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141930	141609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_141600_141900
836090	contig_10235_pilon	+	548	5	Intergenic	novelGene_46305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1372.74551538149	2978	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	92	466	88925	91792	FALSE	5	CCTGTGTCTCAGGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKLWGPRHSLMPHFSPSPTCEEQLSTPGELCIYAAPALGGLLLLVMIILSTCLCWLHRRVKRLERSWPQALSSEQELHYASLQRLPGTGGAEGLDLSEGDGKDAKEDPSADYACIAKKKPT	88426	91874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_88494_88900_89016_90395_90492_90833_90857_91627
836091	contig_3975_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_54865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCCTATGTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2074057	2074936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2074100_2074900
836092	contig_6027_pilon	+	1210	3	Intergenic	novelGene_74434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	75	425	260294	261318	FALSE	45	AAATTCAATAAAATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKLVNSLYPDGSKPVKVPENPPSMVFKQMEQVAQFLKAAEDYGVIKTDMFQTVDLFEGKDMAAVQRTLVALGSLAVTKNDGHYRGDPNWFMKKAQEHKREFTESQLQEGKHVIGLQMGSNRGASQAGMTGYGRPRQIIS	260219	262103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_260397_260704_260808_261173
836093	contig_16686_pilon	-	1479	2	Intergenic	novelGene_162110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	100	528	246051	245623	FALSE	30	CAACCAGTGACTTTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNERIPHPGQTQEQDCLQSQYVGDDEEMAVKQENGVPAAGVEESLPSCSSDNGLSASAEGCALGVPRRGPALLQIDRHQIQAVEQSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDDAIHEARRVAQLADTEKEYQSVLDDLT	251058	244671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_246064_250971
836094	contig_5999_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_45645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGGGTGTCCCAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250260	250006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_250000_250300
836095	contig_6735_pilon	-	887	8	Intergenic	novelGene_15728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	921.894699374443	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	86	598	564868	547295	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKITPVASVAVMGWRRINGTK	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542196_547217_547355_551180_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
836096	contig_695_pilon	+	466	2	Intergenic	novelGene_177167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	33	464	69751	70650	FALSE	20	CAGTCAATGTTTGTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYSPRAPTPLMNQTNTRTVEKVNEQQDIKRNYTDRDHKASYSNGPLSTIACSQVIETTKIEKRRQDLSESKTIRNVDFHSTGNMNKELINNSQLNQRGEKKISPKPGEILTNNGEEGTIRNCEEKKQKSDSEIHMPITIQVQNWKNRQNLLKAT	69718	70652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_70040_70507
836097	contig_5316_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_61247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAACCTAAGTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483272	481884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_481900_483300
836099	contig_6674_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_148020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248251	249547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_248300_249500
836100	SIRV2	-	562	5	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	112	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	40	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGGTAATTGACGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5783	3670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5758
836101	contig_9816_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_177173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATTGTAATCCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92284	93801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9816_pilon_+_92300_93800
836103	contig_2312_pilon	+	1164	3	Intergenic	novelGene_160753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.5	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTGTGTAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497295	567862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_497453_506414_506590_567030
836104	contig_11601_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_141042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTGTTCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240695	241872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_240700_241900
836106	contig_3948_pilon	+	2106	1	Intergenic	novelGene_53160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1653	1997	139080	139424	NA	25	CTGAGAGATCTGGTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFREQLTSFQIFHLGPSFLEEGGEEKEGTDSCLALLCVGYRVQQPRDSLSSDHLPLQGHQRPEEGLAVRCVLTFSTWQNKKVRSVQVQNSELYALTTESLDTGNPAARVQFID	137427	139533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_137400_139500
836108	contig_5945_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_104587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTTATTTCTAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293581	292986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_293000_293600
836109	contig_3900_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_84172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180316	181250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_180300_181200
836110	contig_17979_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_177174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34441	33625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17979_pilon_-_33600_34400
836111	contig_7457_pilon	-	622	3	Intergenic	novelGene_31365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_2	75	356	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	43	402	326893	326392	FALSE	10	TCCCCTTCCCCATTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLTTPGSLKSEGTMVEQYETNVQSCWLEYKKLMDPLEKDWCDWAMISRPYSFLRDCLEFYADYFDLGFPNPWAERVIFKTHQMHFANCSLLQSTFCDPPEDVLLAMIIAPICLIPFLVTLVVWQSKDSEARA	327362	326171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_326648_326789_326899_327325
836112	contig_5302_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_81540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACTCTACAAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612890	1614019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1612900_1614000
836113	contig_12951_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_68180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357917	358567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_357900_358600
836114	contig_7171_pilon	-	1308	10	Intergenic	novelGene_101360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.496903994999953	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	267	1238	1349975	1339060	FALSE	30	AATATCTGAGGATGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYVPAPGYQPTYSPTLPYNKPIPGGLSVGMSIYIQGVANEHMRRFFVNFVVGHNPGADIAFHFNPRFDGWDKVVLNSQHDGQWGREERKLSMPFSRGAAFELVFMVLAEHYKVVVNGTPFYEFKHRIPLQMVTHLQVDGDLELQSINFIGGQPTFGERPIPTPQYPGPVHSHPPWNNLPTMEGPPIFNPPVPFIGKLRGGLIARRTIIIKGFVPVSARSFAINFKVGASGDVAMHINPRLNEGVVVRNSHLNGSWGSEERNISYNPFGPGQFFDLSIRCGTDRFKVYGNGQHLFDFYHRLTAFQRVDVLEIKGDVTLSYVQI	1350241	1338989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1339207_1339287_1339454_1339619_1339709_1340006_1340037_1340214_1340254_1340376_1340404_1343542_1343678_1344985_1345191_1349561_1349651_1349930
836115	contig_7945_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_161587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237213	235694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_235700_237200
836116	contig_3818_pilon	+	1657	2	Intergenic	novelGene_99296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGGTTGTGTTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961425	965416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987
836117	contig_10733_pilon	+	2199	11	Intergenic	novelGene_109959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	3.104834939252	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	5	1693	258836	273614	FALSE	10	CTATTTGTCTGTGTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMLIFCGIPLFFMELSFGQFASQGCLGVWRISPMFKGVGYGMMVVSTYIGIYYNVVICIAFYYFFSSMTHVLPWAYCNNPWNTPDCAGVLDATNLTNGSRPASLPSNLSHLLNHTFQRTSPSEEYWRLYVLKLSDDIGNLGEVRLPLLGCLGVSWVVVFLCLIRGVKSSGKVVYFTATFPYVVLTILFVRGVTLEGAFAGIMYYLTPQWDKILEAKVWGDAASQIFYSLGCAWGGLITMASYNKFHNNCYRDSVIISITNCATSVYAGFVIFSILGFMANHLGVDVSRVADHGPGLAFVAYPEALTLLPISPLWSLLFFFMLILLGLGTQFCLLETLVTAIVDEVGNEWILQKKTYVTLGVAVAGFLLGIPLTSQAGIYWLLLMDNYAASFSLVVISCIMCVSIMYIYGHRNYFQDIQMMLGFTPPVFFQICWRFVSPAIIFFILIFTVIQYQPITYNHYQYPGWAVVIGFLMALSSVICIPLYALFQLCRTDGDTLLQRLKNATKPSRDWGPALLEHRTGRYAPTIAPSPEDGLEVQPLHPDKAQIPIMGSNGSSHLQDSRI	258831	274120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_+_258942_259328_259600_268197_268331_268485_268621_268713_268818_269216_269455_269543_269679_269786_269887_269966_270068_273139_273311_273419
836118	contig_4678_pilon	+	1003	6	Intergenic	novelGene_126072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.2849747786569	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	27	698	723236	732428	FALSE	10	CTCTGATCATCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPSRRKAAQLPWEDGRKKIQHHIYVLNQVDHFRFNRAALINVGFLESSNSTDYIAMHDVDLLPLNEELDYGFPEAGPFHVASPELHPLYHYKTYVGGILLLSKQHYQLCNGMSNRFWGWGREDDEFYRRIKGAGLQLFRPSGITTGYKTFQHLHDPAWRKRDQKRIAAQKQEQFKVDREGGLSTVRYHVDSRTALSVGGAPCTVLNIMLDCDQAATPWCTFG	723209	732733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_723286_727280_727332_730123_730350_731372_731457_731707_731813_732272
836119	contig_15610_pilon	-	2018	2	Intergenic	novelGene_154288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAAGCCTCCCGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761375	752548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_752658_759466
836121	contig_7056_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_43727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAATACTGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000025	999622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_999600_1e+06
836122	contig_15029_pilon	+	1648	13	Intergenic	novelGene_128221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	76.3100401141437	28	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	206	1648	426951	499801	FALSE	30	GTATGGAAAATATTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAAAPIISSVQKLVLYETRARYFLVGSNHAETKYRVLKIDRTEPKDLVIIDDRHVYTQQEVRELLGRLDLGNRTKMGQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGHAIYKIEDTNMIYIPNDSVRVTHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTVLRMPLEMLKSETTQAPQARQESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLEIIKNTVHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIYGRPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSVPLYWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAHVAALHFDQMLQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERILSEELVAAVTYLNQFLPPEHTIVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYCSILRPDEKWNELGGCVIPTGRRQ	426745	499801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_427017_443677_443777_446121_446246_458994_459152_468922_468974_471258_471417_473952_474082_477357_477459_478701_478865_479292_479391_484413_484548_488664_488782_499755
836123	contig_8330_pilon	-	684	3	Intergenic	novelGene_71987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	347	junction_2	367.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	353	667	2056084	2052166	FALSE	5	GGTGTGTTTCTGTCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQGIRTRTKCICSLLCIKECHKVNY	2056547	2052148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2052370_2055973_2056187_2056297
836124	contig_8920_pilon	+	1087	4	Intergenic	novelGene_146066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAAACAGACTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90790	94820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_91014_91999_92619_93782_93948_94740
836125	contig_34_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_40048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAATGGAAAAGAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240524	239815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_239800_240500
836127	contig_7887_pilon	+	580	5	Intergenic	novelGene_124903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	55.6798886493139	3593	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	76	387	375247	378325	FALSE	15	GTTGTGTGAGCTGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGTGTSLALSSLLSLLLFAGMQMYSRQLASTEWLTIQGGLLGSGLFVFSLTAFNNLENLVFGKGFQAKIFPEILLCLLLALFASGLIHRVCVTTWGCQLAA	375171	378518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_375251_375570_375726_375862_375927_378067_378135_378303
836130	contig_1939_pilon	-	585	4	Intergenic	novelGene_144892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_3	176.643394693628	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTGTACCTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017230	982060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_982175_983139_983248_986938_987022_1016950
836132	contig_11016_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_163288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGTTGCTGAAACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37569	35574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_35600_37600
836133	contig_9202_pilon	-	1783	7	Intergenic	novelGene_168944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	10.7664602663395	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1143	1721	268833	262775	FALSE	70	GAAAAAAGAAAAGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAQAVQATAQMKEGRRTSSLKASYEAFKNNDFQLGKEFSMPRETTGYSSSSALMTTLTQNASSSAADSRSGRKSKNNNKSSSQQSSSSSSSSSLSSCSSTSTAVQEISQQTTVVPESDSNSQVDWTYDPNEPRYCICNQVSYGEMVGCDNQDCPIEWFHYGCVGLTEAPKGKWYCPQCTAAMKRRGSRHK	272144	262712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_262892_265227_265267_267566_267760_267991_268186_268797_268956_269241_270218_272100
836135	contig_4364_pilon	+	2312	10	Intergenic	novelGene_48	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_6	48.5732233302604	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	83	1117	583085	599744	FALSE	35	TAAAAGTGACTAATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPARPDPTAASRAACGAEERRTDGGTMNLLPCNPHGNGLLYAGFNQDHGCFACGMENGFRVYNTDPLKEKEKQEFLEGGVGHVEMLFRCNYLALVGGGKKPKYPPNKVMIWDDLKKKTVIEIEFSTEVKAVKLRRDRIVVVLDSMIKVFTFTHNPHQLHVFETCYNPKGLCVLCPNSNNSLLAFPGTHTGHVQLVDLASTEKPPVDIPAHEGVLSCVALNLQGTRIATASEKGTLIRIFDTSSGHLIQELRRGSQAANIYCINFNQDASLICVSSDHGTVHIFAAEDPKRNKQSSLASASFLPKYFSSKWSFSKFQVPSGSPCICAFGTEPNAVIAICADGSYYKFLFNPKGECIRDVYAQFLEMTDDKL	583002	600939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_583152_588635_588711_591549_591652_592467_592556_593930_594026_596828_597020_597709_597796_598672_598775_599207_599330_599637
836136	contig_11286_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_156667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTAATTATATGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180641	182069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11286_pilon_+_180600_182100
836137	contig_4678_pilon	-	1163	9	Intergenic	novelGene_126062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	67.2131637032509	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	101	928	574824	571931	FALSE	10	CTGGCCTAGCCTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMDSALQCHHAQEDSEFCQERPSEACDNQCGPRRGCQPRRHPGGGICEGRGQDGVPARGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	574924	571695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_572958_573178_573226_573495_573616_573851_573974_574789
836138	contig_5954_pilon	+	626	5	Intergenic	novelGene_28530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	319.855729196774	807	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	184	606	465084	467077	FALSE	25	TGAATGAGGGTCACGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVCVVGGAESSASHPICA	463837	467097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463952_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893
836139	contig_12528_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_81365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTTAGTAACAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047085	1045428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1045400_1047100
836140	contig_8412_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_118400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTGGGTCTGGGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772729	771075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_771100_772700
836141	contig_10958_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_5345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGATGTTTTTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621925	622208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_621900_622200
836142	contig_8452_pilon	-	862	5	Intergenic	novelGene_48103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_4	889.024887165708	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	72	557	991128	962919	FALSE	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCTVWAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQSTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991199	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
836143	contig_16310_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_70066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGAGAATTTCTAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224851	225869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_224900_225900
836150	contig_9272_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_125992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACACCGTGGTATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805849	804333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_804300_805800
836151	contig_12021_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_172205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279671	278365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_278400_279700
836153	contig_5918_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_99526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATAAGAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625761	627243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_625800_627200
836154	contig_11677_pilon	-	417	4	Intergenic	novelGene_85944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	168	380	595842	594927	FALSE	20	TCACCACATATGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597330	594889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
836156	contig_20398_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_155203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTAATAAACAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138108	139562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_138100_139600
836157	contig_5878_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_145725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATGGTGTATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243787	243479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_243500_243800
836158	contig_15952_pilon	+	1103	7	Intergenic	novelGene_154079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	5.07991688470939	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	4	1032	534671	538675	FALSE	30	TATGTAACTGAAACTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMALYVAAAAVLEGVENRQGSIKGLVYGRRFQNVKQLYALVCETQRYSVVLDAVIASAGLLRAEKKLRPHLAKVLVYELLLGRGFRGSGGRWKPLVARHQARLKAELARLKVHRSVSRNEDLLELASRPGPALQVPRFVRVNTLKTCSDDAIDYFKRQGFSYQGRASSLEDLRTLKGKHFLLDPLLPELLVFPAQTDLHEHPLYQAGHLILQDKASCLPAMLLAPPPGSHVIDACAAPGNKTSHVAALLKNQGKIFAFDLDAKRLASMATLLARAGVSCCELAEKDFLAVSPSDQRYRQVQYILLDPSCSGSGKKAWLRDSDPEEPSADGVVVCFGLRFGLTL	534667	538746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_534764_534916_535040_535482_535658_535745_535855_537602_537742_537826_537943_538401
836159	contig_7996_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_165156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGATAAACATTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232513	231203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_231200_232500
836161	contig_5041_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_27034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346352	345155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_345200_346400
836162	contig_3130_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_103581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTATCTGGGTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160449	161170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_160400_161200
836164	contig_12429_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_136222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAAGGGGGGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373660	372806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_372800_373700
836165	contig_5120_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_169623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGTGGTCATTATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350684	351687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_+_350700_351700
836167	contig_3964_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_174204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAGGTAGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71087	71556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_71100_71600
836171	contig_299_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_129516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCCTCGGCTCTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710223	1710934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1710200_1710900
836172	contig_299_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_129517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAGGAAAATTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711333	1712401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1711300_1712400
836174	contig_89_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_176386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAAAGCCTGGTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148117	149189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_+_148100_149200
836175	contig_89_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_176384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147025	147377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_+_147000_147400
836176	contig_7362_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_147555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAGTATATACAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409329	408620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_408600_409300
836177	contig_10238_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_170110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436471	437583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_436500_437600
836179	contig_1910_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_168273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAACTCCCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14546	14922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_14500_14900
836180	contig_8954_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_130258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAAAAGAAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56178	58477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_56200_58500
836181	contig_2438_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_112003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	48	914	265641	269085	FALSE	15	CTCTGGAGGAACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGADQVVPPRAQAAGMGALAWLVLLLLLLKAKGHSGDTVDPEEVVAVLQESIRLPLEIPSDEEVENIIWSSHRRLATVVPGKKGNPATITVISPRYRGRVSFLGSSYSLQISNLSWEDAGPYQAQVNLRMSQMSIMQDYNLRVYRRLLEPQVTVNFEISGKDVCNISLTCSIEKAGMDVIYSWISLGDSTDIAHEGPILSTSWRLGDNPLSYTCRASNPISKVSSRPICAGLFCADPGFSSEMASSTVCLLTKGLLLLLLLVILAVGLWVVWVQKRYQMPKVKKLKRNRMKLRKKGKPGPSLA	265593	269243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_265687_266262_266605_268182_268456_268879
836183	contig_10626_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_138211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTGAAAGAAAGAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296464	294796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_294800_296500
836184	contig_10861_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_39429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGAGAAAAGCAGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2424331	2423153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2423200_2424300
836186	contig_15888_pilon	-	700	6	Intergenic	novelGene_84451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1159.22087627855	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	282	635	253673	252475	TRUE	10	CGCCCCTACCTCGACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDGEARGFRKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	254582	251658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251718_252468_252539_253383_253680_253928_254066_254198_254282_254527
836190	contig_14118_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_177175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101451	103768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14118_pilon_+_102780_102893
836192	contig_9121_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_134469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTAGCATTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236366	235838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_235800_236400
836195	contig_8865_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_164465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTCTTGCTTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425699	427104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_425700_427100
836196	contig_7078_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_130149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAACATTACAAGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533653	532651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_532700_533700
836197	contig_7078_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_130148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATCAGAAACTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532651	531988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_532000_532700
836198	contig_4952_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_145522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAATAAAATCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357467	357211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_357200_357500
836199	contig_17976_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_32528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGGAGAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46509	48882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_46732_48339
836200	contig_9571_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_136319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	144	371	629829	630056	NA	30	CTTGCACATCAGAAATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVFLELNKVPRACREQEGEPFILSPKKRFSCLSYIFCSCPCFISPWMKISASSLITTSSLSKLLQPLCTSVSSSIKMGLILPTSGCYGDYKYIYQNQKTEPTAVELILTHSDPVGQSRTVP	629685	630236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_629700_630200
836201	contig_4816_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_115605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACTTTGCCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597795	598594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_597800_598600
836202	contig_15752_pilon	-	1152	2	Intergenic	novelGene_148796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	265	378	435755	435642	FALSE	30	AAGAGTGTCCATGACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCIPVSAAGNRGAGGAGLGVSWAAAVNHVQRQPVLRISSPSKDVLCTSKILYTPITNFKKPWWHQWLSTQLLTERLTVRTHQLLHRRKMWQSVSVKITALETLWGSCTLSYRVAMSGNQLYGNGL	440913	434867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_435930_440823
836203	contig_17299_pilon	-	1058	4	Intergenic	novelGene_177178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	95	622	32119	27133	FALSE	20	TTTATGAGGTATTTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVAVEEVAVNFTQEEWALLDLSQRQLYRDVMMEIFRSLASVASQNLIDGDKLSTENTILRFMKNDTWSSIVGEIFELLVTEDQDNNQKTHVRRRMLENLCESNEDNHCGQTFSQIPDLSLLKTPMEAYPSECLECGKSLVNHSSLKQHIKSHSGCSAYQCKEYGEARSCPFYLSTAVRTLTGEKSYEYLFNPCHTEHSPACPVKC	32213	26696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17299_pilon_-_27189_28507_28795_30793_30945_32085
836204	contig_9501_pilon	+	1748	1	Intergenic	novelGene_164279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTAGAATGAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412363	414111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9501_pilon_+_412400_414100
836205	contig_16103_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_118946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	58	372	962285	962599	NA	30	ACTGAGAGTTTGGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLGVCVDDSALIAKGTDIMGAESRVAQGLTCSATNRKVGGLNPPAAPREKDVAVSFRKDLQPWKPFGAVLVCPVESEPTTRQWVNGSRRPSRCMRWYSRQQAPALTSRVPQPWAFHLSGEAS	962227	963865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_962200_963900
836206	contig_12951_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_68214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTATGGAGAGTCTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787633	786951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_787000_787600
836209	contig_17470_pilon	-	1022	4	Intergenic	novelGene_110489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	136.407070523814	592	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	254	688	165344	164687	FALSE	10	CACTCATGTGGCGCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTAPGWRTVWGERNHPLFVAYLALQLVVLLWALYLAWSGLRFFQPWGLWLRSSGLLFATFLLLSLFSSVAGLLLASHLYLVASNTTTWEFISSHRIAYLRQRSSNPFDRGLIRNLAHFFCGWPSGSWETLWAEEEEDSSQAV	167829	164352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_165006_165228_165397_165582_165662_167707
836210	contig_16594_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_53816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	382	732	115812	116162	NA	30	CAAGAGTTTGCACACACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHNQP	115430	116163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115400_116200
836212	contig_12622_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_5894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533698	1535169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1533700_1535200
836213	contig_6885_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_83650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAATTTATGTACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147493	145670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_145700_147500
836214	contig_4604_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_19185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGCTCACCTTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388209	387522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_387500_388200
836215	contig_4604_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_19184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGGCTGATGGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387463	386336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_386744_387385
836216	contig_9900_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_159509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTCAGAGTAAACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130891	132054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_130900_132100
836217	contig_12277_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_139696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCTTGAGTGTTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275204	276852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_275200_276900
836218	contig_6031_pilon	-	704	4	Intergenic	novelGene_56740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	8.04155872120988	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACGTCTTCCCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207995	205655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_205995_206317_206442_206951_207080_207882
836220	contig_10302_pilon	-	1019	4	Intergenic	novelGene_175200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	3.39934634239519	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	369	386	16017	16000	FALSE	20	ATGTTGTATTACGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSSSPTPTKPSNQAGNLRHLDILIGLSVVFLLPAIFIFFLIHCWSPAKKIATILNREPEVDRVVNTEDHEAEDPQEVTYSELSHWIPQQKIITPTSEDSEDPSTDSIVYVELSLTLSPDQGMTPSP	19769	15366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_-_16180_16276_16330_16790_16896_19721
836222	contig_13041_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_127715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAATTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20856	18788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_18800_20900
836223	contig_7753_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_41466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGATTTTAACTTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559391	558432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_558400_559400
836224	contig_18108_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_33462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCCCAGCCCCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116397	115363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_115400_116400
836226	contig_3155_pilon	+	1040	3	Intergenic	novelGene_26353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAATTTTTATGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213435	215741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_213657_214400_214569_215090
836227	contig_7919_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_28033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCAGCCTCTGTCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172285	172661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_172300_172700
836228	scaffold_13505_pilon	+	1127	2	Intergenic	novelGene_111383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGAGGCCTAGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20048	31570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_20087_30481
836229	contig_14814_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_137719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCCTTCAGAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286192	285283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_285300_286200
836231	contig_13041_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_127733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCTCAGATAGTCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273478	274841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_273500_274800
836233	contig_14275_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_162869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340803	341356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_340800_341400
836234	contig_5331_pilon	+	1007	7	Intergenic	novelGene_112812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	583	junction_1	282.98257700588	186	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	21	842	711291	729639	FALSE	75	GGGAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEGEKMASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSELLREKAK	711270	729804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398
836237	contig_116_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_154905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCATTGTTTCTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313392	313091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_313100_313400
836238	contig_12802_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_114242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	48190	47828	NA	80	CTTAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGSKAVIFIEADCHIFLPRSSWWVRTANLSVSSQALNHCATRAPSSSPTQDKTKSAELHPSAWRQGYSEKRRGLRPPGDGHGQRLLCFQETPPRGKEDWTLPSLQGCLKLKISFSRPQF	48191	47625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_47600_48200
836239	contig_16907_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_87437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	201	323	392429	392551	NA	70	AAAACAAAATGTTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQIAPCTSGGLEPGSRAFPVGGAGRKRGLRGRAGRILSFPSNVSSVPIPRLAKAAPRGGAGGRAWNMRQCLLFVTSLIPFVLAPRPPDDPDYGSHQQLGKNPGKLV	392228	393876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_392200_393900
836241	contig_10618_pilon	+	1812	9	Intergenic	novelGene_170041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	76.5588009310491	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	156	1655	76979	205347	FALSE	35	ATACAGTTTTGTTTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRKLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQSQCNKCNAAHPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIMVFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFAINCSATFGLEDDVVKKGAICTSRYSNPFPCTGGEVIFRALSPPYDVENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNNLNAKPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCVPVDGFRPIKAPGAFHVVHGKCMCKHNTAGTHCQHCAPLYNDRPWEAGDGKTGAPKECRSCKCNGHADTCHFDITVWEASGNRSGGVCNDCQHNTEGQHCQRCKPGFYRDFRRPFSAPDACKLCSCHPVGSAVLPFSSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGPHCERCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPLTGDCISSSTDIDWYHEVPDFHSVLNNSEPTWEWEDEQGFSALRHSGKCECKEQVLGNSKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGSHAEVNVNVKKVLKSTKLKILRGKQTLYPESWTNRGCTCPVLNPGDASSNKGV	76823	205504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_+_77285_127361_127641_158703_158831_160726_160916_182731_182946_183308_183425_194542_194612_199777_199953_205322
836242	contig_5964_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_80350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACACACACACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13327	14428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_13300_14400
836243	contig_16716_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_169285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTATCCTATAGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175633	174698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_-_174700_175600
836245	contig_14720_pilon	+	892	7	Intergenic	novelGene_164975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	397.393346977805	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	107	877	120703	232158	FALSE	10	TTTCCCCAGGTCTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDERYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEKIKQKFRKYSSLK	120596	232173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_120769_157060_157259_175396_175511_195878_196040_196956_197072_199814_199887_232113
836246	contig_6102_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_32314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGTAAAGACAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580106	1580804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1580100_1580800
836247	contig_6102_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_32315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTAGGCATAGTCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580955	1581456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1581000_1581500
836251	contig_8017_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_65389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAAATTTTTGCCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644729	1646568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1644700_1646600
836252	contig_2867_pilon	+	441	3	Intergenic	novelGene_135270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	2.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGAAGCAACACAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534983	1544835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1535237_1541791_1541916_1544771
836254	contig_6589_pilon	-	1099	7	Intergenic	novelGene_26241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_6	43.9143737541847	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	88	720	2229483	2228348	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHCLLSILLSLPSGQRGRTSLHRGQPLRGRRSRSPCQLGPWAEEERLLLCRPPGEAPAPILALWEPLGSPSYLCPHPQFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYQGPTGSLP	2229570	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229304_2229388
836255	contig_4891_pilon	-	690	6	Intergenic	novelGene_124599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	449.76411595413	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	50	376	964296	940000	TRUE	10	TATGCTGGCTTTTCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964345	937420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937536_938372_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
836256	contig_7593_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_127292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAGAAAAGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169121	170690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_169100_170700
836257	contig_14219_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_54313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673523	674728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_673500_674700
836258	contig_5649_pilon	-	1205	4	Intergenic	novelGene_82339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	4.98887651569859	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGGGCTGAGGGGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568367	561538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_562447_563694_563779_564659_564766_568260
836259	contig_8286_pilon	-	523	3	Intergenic	novelGene_139802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	114	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	172	468	189870	179734	FALSE	25	ACATATTGTCAGCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAEQCFEEKDCKESGVQLLGLPALCRPRSRGGRIPPQSLPKVSHHPFCLSVKGHVKMLRLVLTVTSMIFFILAQAPEPYIVITGFEVTVIFFFIVLYLLRLDRLLKWLFWPLLVFGLVSVVCCIADGALIYRKLLFNPSGPYQKKPSHEQKLIL	190041	179678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_179860_184959_185119_189858
836260	contig_12709_pilon	-	1100	9	Intergenic	novelGene_147402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_8	531.244397029277	1	56	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	29	1012	57442	29115	FALSE	25	CCAACAACTGTGTGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	58950	29026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
836261	contig_13831_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_160998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATCAGATACATCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139216	140326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_139200_140300
836262	contig_4156_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_88087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACACACACAGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227393	227785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_227400_227800
836263	contig_4156_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_88088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAACCCTAAGGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227785	229216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_227800_229200
836264	contig_13201_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_130892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTCTGATTGGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482349	483418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_482300_483400
836265	SIRV6	+	423	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	7665	3	583	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGAATGGTCGGTCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	3123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106
836266	contig_5815_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_141193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCCTGACTGGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215154	215468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_215200_215500
836267	contig_5018_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_46977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATTAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563484	564406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_563500_564400
836268	contig_10734_pilon	+	1322	4	Intergenic	novelGene_51090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	175.569549371942	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	93	1148	545373	559796	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLSTNGVSSFSGKTRPSVIQGTVEVLTSLMQELQNSGKTDPELWKTCETRWLQLFSLVEKQCQEQIVAQQEQFHNQIQRIQEEIKNLVKLQTSNASWAPYDSSSSKQISSESPMGFFYENSERNESVLSLPKSKEPEMQQESSPSQPDCNVDSSSVSSGYGTFCISELNACKSKDPKEFMEDTEVSKEQYVAPVVQTDSLLGGVKNKSFYIQTAEEFSASLKDDISVFPGEFEHNFLGENKISEVYSGKTNSKSITSWAQKLKQNQPKRAHIEEGRSKSMQGSEQAKKSLSEKVSDESLLSVCFGCDHHVEFIRIHQHTCFLALSSVLLICSIQCSALNRKVSSLNPSAAPPLYGRKDLVICSHKHYGLGNPMGQFYSVI	545280	559970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_545430_555001_555092_557793_558315_559408
836271	contig_5684_pilon	-	634	2	Intergenic	novelGene_81021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361507	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_361313
836272	contig_10446_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_162461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATCCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526110	527555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_526100_527600
836273	contig_17274_pilon	+	707	6	Intergenic	novelGene_26454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	261.830937820572	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	108	707	7027	42687	FALSE	70	AGAAAACAGAAGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEDKVTTWTLESFNLEFKTWLLQSSVGERDTVDTGNNSTL	6919	42687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_36255_36337_42655
836274	contig_5988_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_15854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAATAAAAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260597	259607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_259600_260600
836275	contig_15821_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_25027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGACACAGGGTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163131	162357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_162400_163100
836282	contig_5988_pilon	+	663	8	Intergenic	novelGene_16078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1851.93965608924	1	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	81	662	1218380	1224888	FALSE	5	TTTGTACTTTGTGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQAPHFLFAHITGGVFCDNEKHQKN	1209863	1224889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1224819
836283	contig_10238_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_170096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTCCAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99348	98426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_98400_99300
836284	contig_5451_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_167198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874798	876039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_874800_876000
836285	contig_12250_pilon	+	521	8	Intergenic	novelGene_80677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	130.904545375629	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	25	519	391631	394174	FALSE	10	GTGAGGGCAGCTGGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSCNWRNMAKPCGVRLSGEAREQVDVFRQNLFREAEEFLCTFLPQKIIYLNQLLKEDSFNVADLTSLRAPLDIPIPDPPPKDDEMETDKQEKKEAPKCGFLPGNEKVLALLALVKPEVWTLKEKCILVITWIQHLIPKIEDGNDFGVAIQEKVLERVNAVKTKVEAFQTTIS	391606	394176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_391679_391982_392016_392628_392692_392910_392998_393101_393133_393218_393317_393885_393955_394108
836288	contig_15706_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_172042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106302	105193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_-_105200_106300
836289	contig_14563_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_135060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAGCCCAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160105	161645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_160100_161600
836290	contig_11492_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_152261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCATGTGTTCTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413161	411009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_411000_413200
836292	contig_14516_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_153951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAATGGGCAGGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408271	408727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_408300_408700
836294	contig_4469_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_21970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAAGGGCCCACCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913862	912900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_912900_913900
836295	contig_12948_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_126218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACAAATGAAGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285530	283953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_284000_285500
836302	contig_5121_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_170748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGGAGAAAAGACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443381	442930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_442900_443400
836303	contig_15327_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_70826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	57	171	195	365	1569164	1569334	NA	30	AGGAGTGAAACTGCATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKDERCGAGQLQPPHSQAGVSRGHRADSCGQRAASAFVLGQAWGRTREGSGHPGALSHGQGVPAMPGACCSFQGPAEQGQVAPGGSPPGRWEKMTAQPNFQEDKNAIAASCPLWPPSSFSR	1568969	1569335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1569000_1569300
836305	contig_8848_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_140466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTGTGTTGTTTCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98782	100020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_98800_1e+05
836306	contig_3463_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_62023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTTCACTAACATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635848	636533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_635800_636500
836307	contig_4769_pilon	-	2231	2	Intergenic	novelGene_118009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCATTCTTCATTACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007334	1002938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1005046_1007210
836308	contig_17436_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_164182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGAGAGAGAGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162976	163331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_+_163000_163300
836309	contig_8354_pilon	+	1525	14	Intergenic	novelGene_24111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGTAAAACAAACAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231433	307426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_231455_232856_232957_240651_240820_247563_247665_256648_256769_259836_259952_296383_296454_297455_297549_299401_299599_300178_300291_302312_302448_305538_305603_306055_306154_307295
836310	contig_5467_pilon	-	945	2	Intergenic	novelGene_111964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAAAAAAGAAAAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123245	120412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_121210_123097
836312	contig_5918_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_99580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGGAAAGAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1857194	1857749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1857200_1857700
836313	contig_20614_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_107587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCGCGCAAGGCAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292137	302075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_292461_293200_293371_295571_295693_301973
836314	contig_14093_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_174216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGATTTGTGCGTGTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140442	139103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14093_pilon_-_139100_140400
836315	contig_14522_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_147345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCAAGTTGGAAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222708	221904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_221900_222700
836316	contig_11702_pilon	+	529	5	Intergenic	novelGene_141993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_2	449.924993748958	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	8	454	381109	384186	FALSE	25	GTCAGGACACAGGACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAPLGALALLLLSGLSCCSAEACAEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	381101	384261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_381176_382657_382777_383590_383681_383828_383895_384081
836317	contig_3763_pilon	-	388	3	Intergenic	novelGene_177180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_2	6.5	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	21	367	387	70987	70967	FALSE	10	TAGGTCCCTACTCCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLEGLSAFHSLEELILDNNLLGDDLVLPGLPSLHTLTLNKNQITDLESLLDHLAEVTPALEYLSLLGNVACPNELVSLEKDEEDYKRYRCFVLHKLPNLKFLDAQKVTRQEREEALVRGAFMKVVKPK	93952	70965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3763_pilon_-_71085_82587_82726_93821
836318	contig_990_pilon	+	1142	9	Intergenic	novelGene_76067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	105.807534585208	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	370	987	1082680	1091532	FALSE	15	GGCATTTGTTTAGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIAVNIKTAEIYRASFPDRGPEEELRAARALTGGPMISIYDAKTEQLRIGPYSWMPFPHVDFWLQQDDKQILENLSTSPLAEPPHFVEHIRSTLMFLKKNPSPTNTLFPGNKALLYKKNEDGLWEKISSPRS	1067234	1091687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082312_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464_1086519_1087593_1087692_1090825_1090940_1091352
836319	contig_14755_pilon	-	1055	6	Intergenic	novelGene_129389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	39.5605864466138	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	117	515	364298	288920	FALSE	25	ATATTCTCTATCAGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELCKTISVARLEKHKNLFLNYRNLHHFPLELLKDEGLQYLERLYMKRNSLTTLPENLAQKLPNLVELYLHSNNIVVVPEAIGSLVKLQCLDLSDNALEIVCPEIGRLRALRHLRLANNQLQFLPPGKMK	368715	288379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_288934_321120_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
836320	contig_15066_pilon	-	1311	11	Intergenic	novelGene_149543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	166.482101140032	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	56	1165	114591	111830	FALSE	10	AAGGTCTCTTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPPAPGPERLFDSHRLPSDGFLLLALLLYAPVGFCLLVLRLFLGLHVFLVSCALPDSVLRRFVVRTMCAVLGLVARQEDSGLRDHRVRVLISNHVTPFDHNIVNLLTSCSTPLLNSPPSFVCWSRGFMEMDGRGELVESLKRFCASTRLPPTPLLLFPEEAATNGREGLLRFSSWPFSIQDVVQPLTLRVQRPLVSVTVSDASWVSELLWSLFVPFTVYQVRWLHPVHRQLGEGNEEFALRVQQLVAKELGQRGTRLTAADKAEHLKRQRHPRLHPQSARTGCVDLTITNLLEGAVAFMPEDITEGTQSLPTASAPKFPSSGPVTPQPTALTFAKSSWARQESLQERKQALYEYARRFTERQAQEAD	114646	111683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111864_111967_112087_112275_112392_112743_112847_112954_113022_113269_113344_113438_113512_113709_113895_114094_114246_114324_114463_114541
836322	contig_11566_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_166697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCCAGCGCCAACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184391	184090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_184100_184400
836325	SIRV6	+	413	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	31	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845
836326	contig_614_pilon	-	1765	10	Intergenic	novelGene_132597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTCACGCCTCTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374324	177541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_177591_197751_197804_274185_274247_309688_309799_314031_314081_317610_317855_331659_331795_354811_354874_361670_361779_373429
836327	SIRV4	-	402	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1121	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4037	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_4000
836329	contig_13366_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_99795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCATGGCCAAATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169562	170645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_169600_170600
836332	contig_10003_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_88289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890855	891543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_890900_891500
836333	contig_8681_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_157195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTTTCATATTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105909	106468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_105900_106500
836336	contig_7045_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_77463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTGGGAGGAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377806	378235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_377800_378200
836338	contig_753_pilon	-	1406	6	Intergenic	novelGene_112957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_5	71.6251352529264	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	129	818	1177782	1169508	FALSE	20	ACATTGACTTCGGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRSAVAVAAVTGERPGLSDLGRSSPIQVPGSRNEVGGRLGTMARAGMERWRDRLALVTGASGGIGAAVARALVQQGLKVVGCARTVSNIEELAAECKSAGYPGTLIPYRCDLSNEEDILSMFSAVRSQHSGVDICINNAGLARPDPLLSGSTSGWKDMFNVNVLALSICTREAYQSMKERKVDDGHIININSMSGHRVVPQSVIHFYSATKYAVTALTEGLRHELREAQTHIRATCLKPEDVAEAVIYVLSTPPHVQIGDIQMRPTEQVT	1177910	1168919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1169550_1169672_1169739_1170711_1170842_1171527_1171623_1174580_1174791_1177635
836339	contig_3410_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_58947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235707	235009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_235000_235700
836340	contig_4364_pilon	-	1094	5	Intergenic	novelGene_216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	5.76085931090146	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	20	544	1360549	1357319	FALSE	10	GTGCTGTTTGCGCCTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEGSPMHTVYMNQPTQASGPYPSMPVTGADPSMVSTYMYPAGATGGQAAPPGQAGPTTSPAYSSYQPTPTQGYQSVASQAPQSLPSLPQPLQTGTMGYMGSQSVSVGYQPYSMQNLMTTLPSQDVPLPAQQPYLAGQQPMYQQMAPTGGPPQQPPPVAQQPPVQGPPVPGSEPQLISFD	1360568	1356768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1357430_1357829_1357917_1358170_1358291_1358364_1358499_1360476
836341	contig_6076_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_81743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAACTGCCCCACAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58677	58019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_58000_58700
836342	contig_5649_pilon	-	1342	7	Intergenic	novelGene_82373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	54.5081543339058	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2	421	1062041	1057321	TRUE	30	CCCATCAGTTATGGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1062042	1055611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971
836343	contig_12728_pilon	-	984	9	Intergenic	novelGene_155812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	49.9168057872296	182	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	574	945	199490	192747	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLELKISASLKQALDKLKLSSGNEEDKKEEESDEIKIGTSCKNGGCSKTYQGLQSLEEICIYHSGVPIFHEGMKYWSCCRRKTSDFNTFLAQEGCTTGKHMWTKKDAVSSLFKITYLIILI	214159	192707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_192898_194279_194351_198684_198744_199399_199504_201483_201642_202943_203001_209323_209374_213612_213731_213982
836344	contig_11293_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_134679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGATAAGGAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121635	122129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_121600_122100
836345	contig_5033_pilon	-	875	3	Intergenic	novelGene_28934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.5	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	452	586	464569	449723	FALSE	35	CCACAGGAGAGAAGTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLAVFLAASRAGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGDHMMHCPNWYTFECEKEVLSKVHLGDRCQQGHMVTL	477148	449433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_449836_464547_464986_477113
836346	contig_16525_pilon	-	488	6	Intergenic	novelGene_133789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	2087.63560038624	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCCAGTTCCGGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97638	91478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
836347	contig_6740_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_142728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTATTTTCTAGCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748928	750630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_748900_750600
836348	contig_21416_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_172821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	441	1591	2031	128114	128554	NA	30	ACAACTCCAAGTCCCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVGALVFSRRESNSGNFTSVLYIPLSNHPLFFVSAQTQNNPKQPSTEKSELCPKNVPKREYSVKEILKLDSSSSKGRDLYHSNVSSLTSEKDMDDFRKDGSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYRMERPTYITHSPIQSS	126523	128554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_+_126500_128600
836349	contig_15663_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_177181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTCTAAGGAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20421	19837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15663_pilon_-_19800_20400
836350	contig_8149_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_169951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGATTAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518199	519212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_518200_519200
836351	contig_12964_pilon	+	1488	9	Intergenic	novelGene_131687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_3	40.085650487425	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	551	1486	455463	471340	FALSE	15	CCAGCAGGCCTCCTCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKSPFLPGSIREENGVRWHVCPYCTKEFKKPSDLVRHIRIHTHEKPFKCPQCFRAFAVKSTLTAHIKTHTGIKAFQCQYCMKSFSTSGSLKVHIRLHTGVRPFACPHCDKKFRTSGHRKTHIASHFKHTELRKMRHQRKPAKVRVGKASTLVPDIPLQEPILITDLGLIQPIPRNQFFQSYFNNNFVNEADRPYKCFYCHRAYKKSCHLKQHIRSHTGEKPFKCSQCGRGFVSAGVLKAHIRTHTGLKSFKCLICNGAFTTGGSLRRHMGIHNNLRPYMCPYCQKTFKTSLNCKKHMKTHRYELAQQLQQ	449270	471342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_449309_451337_451482_453857_454062_455298_455491_461331_461605_462940_463145_466710_466853_467512_467774_471312
836353	SIRV6	+	533	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	211	-199	-20	19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACAGGAAAATTTAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2496	10987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
836354	contig_6005_pilon	-	244	2	Intergenic	novelGene_158898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6290	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGGTTACTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366966	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862
836355	contig_10857_pilon	-	875	7	Intergenic	novelGene_160870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	317	760	66582	58794	TRUE	5	CTCGGGCGGGCAGGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVRGTTLTVDEVLEPPLCSQRLLLLMSPATISLQEGPLDVDWVCTSPVSHRLFVLATAMLGSSMEVWRASLGVRPAVSTAWVYCSRRSSILEIGWAGSDFFTLLLFSMERFKDSVLSMSLVVGLRGGGLCSAVPSKAKGLGVLGC	66898	21818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21920_58779_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61967_66564
836356	contig_4364_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_54	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATTATAATATTCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621834	619479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_619500_621800
836357	contig_13015_pilon	-	921	5	Intergenic	novelGene_165552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	25.1445819213603	68	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTCCTCTCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371585	367981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_368494_369169_369274_369354_369486_371173_371236_371473
836358	contig_6058_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_172426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTTGCTGTATAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407143	406296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_406300_407100
836359	contig_6862_pilon	-	176	1	Intergenic	novelGene_63757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATGTAGAACAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132285	132109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_132100_132300
836362	contig_13992_pilon	-	699	4	Intergenic	novelGene_147652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	201.38244434133	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	150	515	658873	655415	FALSE	25	AAGCTCTGAAGTTGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRSRLFVTPAYAFVLLFSQEEAKKEKELAEAKIQKILKERDQLTADLNSMEKSFSDLFKRLEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYILRIEKESQRYQALKAHAEEKLSLANEEITQVRSKAQAEALAFQASLRKEQMRVHSLEKTIEQKTKENDELTRICDDLISKMEKI	659022	655230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656275_658801
836364	SIRV5	-	270	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10964	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
836365	contig_17704_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_177184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294943	293991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17704_pilon_-_294000_294900
836366	contig_10259_pilon	-	2104	1	Intergenic	novelGene_177191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	496	918	48824	48402	NA	15	TTACTGTCCTTACTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIKLQNIFITQRVPCFPLQAASRPTPAPDTGFCPSRSSFSRCHAGGITQPAALCAWLPSLSHADMGVSQEGALCRSSVLSVPASRAWASHSLSTLHPLTDAGVSRLAIMCKAAERFTYRSLNGPMSSFLLGIRLRVVMC	49319	47215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_47200_49300
836367	contig_19745_pilon	-	1564	3	Intergenic	novelGene_177196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	202	1452	46635	35559	FALSE	95	AAAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLWLRGFLLASCWIIVRSSPTPGSEGHSADPDCPACALATLPKDVPNSQPEMVEAVKRHILNMLHLKKRPDVTQPVPKAALLNAIRKLHVGKVGENGYVEIEDDIGRRAEMNELLEQTSEIITFAESGTTRKMLHFEISKEGSDLSVVERAEIWLFLKVPKANRTRTKITIRLFQQQKHPQGSLDAGEEAEEVGLKGERSELLISEKVVDARKSTWHIFPASSSIQRLLDQGKSSLDVRIGCQQCQETGASLVLLGKKKKDGSDGGAGGEDEKEQSHRPFLMLQARQSEDHPHRRRRRGLECDGKVNICCKKQFFVSFKDIGWNDWIIAPSGYHANYCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPMSMLYYDDGQNIIKKDIQNMIVEECGCS	49318	35446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19745_pilon_-_36422_46247_46762_49243
836368	contig_19745_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_177195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50166	34872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19745_pilon_-_35409_50137
836369	scaffold_13505_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_111644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	32	382	788346	788696	NA	15	TTGGGAAGGGGGGGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWEEGRSEHMDTWREEELPGRRGVSKGRGQWGTGHLREESGSRCFPSAPHEVELLLQPVSQMSKLRSQLAAQGHQLVSSEAQVLLRQSCSRALTVQVQTDRTQGGGRTHTLRAVVPHLNRRGCYS	788314	788731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_788300_788700
836370	contig_11417_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_103309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGCACCAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550071	548496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_548500_550100
836371	contig_4156_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_88083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCATCAATGAGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198030	200091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_198000_200100
836372	contig_2069_pilon	-	612	3	Intergenic	novelGene_23552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	9.5	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	69	473	1601277	1600543	FALSE	10	GGGGATTGCCTCTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRRTGAHRAHSLARQMKAKRRRPDLDEIHRELRSQGPARPRPDPEAEPDPDLPGGGLHRCLACGRYFIDSANLRTHFRSKDHKKRLKQLSVEPYSQEEAERAAGMGSYVSPQRLPVPTEVSTDIPEMDTSP	1601345	1600403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1600685_1600777_1600841_1601077
836373	contig_9706_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_20913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAACTCATGGCCGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117558	118313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_117600_118300
836375	contig_11630_pilon	+	1601	3	Intergenic	novelGene_147176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCTCTTGGTGTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77650	145911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77682_131895_132058_144503
836376	contig_5500_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_159649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	530	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	68	400	655939	656271	FALSE	20	GATTTGTTGACCTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRLIRTVAVSVVHPLLQLSHHTVKSRGLSTLLLGSLRSALPVGTSLLKPSSVVESLLSNRLMPCLQPALGFKTKGVIKKRCKDCYRVKRRGRWFIYCKTNPKHKQRQM	654569	656399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_+_654624_655925
836378	contig_19228_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_174416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGACGAACGTTATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259205	259838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_+_259200_259800
836379	contig_8278_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_165295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAGCTGAGTAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205596	206306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_205600_206300
836380	contig_12427_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_40585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGTTCTTTAAGACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565115	566525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_565100_566500
836381	contig_6557_pilon	+	1548	9	Intergenic	novelGene_33043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	4.48434777866302	91	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	247	1476	736383	742223	FALSE	25	TTTAAACATTCAGTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPFLAEGTCLQAELEKGNIYLADYRILEGIPTIELNGRKQHCCVPLCLLYSDPEGKMMPIAIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRHAEFYSHEAISHLLETHLIAEAFCLAMLRQLPMCHPLYKLLIPHTRYTIQINSIGRALLLNEGGLVARGTSLGLEGIAEVMVRALSEITYDSLYVPNDFVERGVQDLPQYYYRDDSLAVWDALERYVTEIITYYYPNDAAVEGDPELQCWVQDIFKEGLLGRESSGFPTCLRTVPELIRYVTIMIYTCSAKHAAVNTGQLEFTSWMPNFPPSMRNPPMQVKGLTTEKTYLDTLPDVKTTGIILLVLWTLGQEPDDKRPLGHFPDIHFVEEVPRRSIEALRQRLAQISHNIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI	736136	742295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_736434_736612_736757_738071_738276_738527_738615_738935_739106_739541_739664_741172_741274_741632_741804_742043
836384	contig_9683_pilon	+	686	4	Intergenic	novelGene_151285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	17.4547032821147	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	23	394	487041	487890	FALSE	15	GTGACGTCTGAGGTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARGTASRFLTSVLHNGLGRYVQQLQRLSFSLSRDSPSSRGAREFVEREVVDFARRNPGVVIYVNPRPCCVPRVVAEYLNGAVREESIHCKSAEDIATLVQKLADQSGLDVIRIRKPFHTGQ	487018	488182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_487172_487259_487367_487465_487591_487881
836386	contig_6842_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_130818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCCTTTTGTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758586	1759405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1758600_1759400
836389	contig_16897_pilon	+	1509	7	Intergenic	novelGene_174457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.21735578260835	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	71	865	84157	92752	FALSE	40	CATGCAACAAATACTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGHHGWGYGQEDGPSQWHRLYPIAQGDRQSPINIVSSQAVYSPSLQPLELSYEACTSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLDGPYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVIGVFLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPTNRQYWTYPGSLTTPPLSESVTWIVLREPIYVSERQMEKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA	84086	93396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_+_84197_87191_87390_90315_90435_91206_91303_91407_91471_91986_92143_92629
836391	contig_13074_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_153458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTATTTGTAAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646908	647613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_646900_647600
836392	contig_16930_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_139142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAACAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32236	32824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_32200_32800
836394	contig_16917_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_161919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTCTTTGTCCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12018	13517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_12000_13500
836396	contig_1618_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_141790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243446	244397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_243400_244400
836397	contig_17413_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_177197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTAACCAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16619	15872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17413_pilon_-_15900_16600
836398	contig_16831_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_134802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAATGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484131	485383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_484100_485400
836402	contig_10734_pilon	+	1487	10	Intergenic	novelGene_51389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	86.9048010436963	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	200	1156	1936334	1996123	FALSE	10	TTTATGTATTTTGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEKDSGRRLRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQLYQGDFVHAMEGKDFNYEYVQREALRVPLIFREKDGLGIKMPDPDFTVRDVKLLVGSRRLVDVMDVNTQKGTEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVKRPTVIDLVDWVDNMWPQHLKEKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGTSVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFFIPSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTR	1936134	1996454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1936367_1937425_1937571_1940528_1940608_1942143_1942191_1972220_1972400_1972675_1972783_1989705_1989800_1990794_1990949_1995537_1995654_1996120
836403	contig_7342_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_71152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAGGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355910	354703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_354700_355900
836406	contig_15471_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_175209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113650	112065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_112100_113600
836408	contig_2703_pilon	-	1771	2	Intergenic	novelGene_101830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACATGAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232959	1229924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1231636_1232899
836409	SIRV6	+	424	3	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	45	623	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	21	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2330	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2815_3106
836410	contig_11978_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_62817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAATAGAGTATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410284	411935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_410300_411900
836411	contig_18145_pilon	+	1105	10	Intergenic	novelGene_37305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	35.0273261932297	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	12	1082	57127	60118	FALSE	15	GCTGGGGACCAGGAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWEMLARAARGTGGILLRGFLRAPGRAPRRASSGLPRNTVVLFVPQQEAWVVERMGRFHRILEPGLNILIPVLDRIRYVQSLKEIVINVPEQSAVTLDNVTLQIDGVLYLRIMDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHNGDAAASLTVAEQYVSAFSKLAKDSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTKAPVPAAQDLVSSGSSRDVPGTDTSLDEELDRVKLS	57115	60141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_57553_57963_58064_58193_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59211_59432_59562_59980
836412	contig_6589_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_26237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGTCTGATTTTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2187148	2187899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2187100_2187900
836413	contig_5988_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_16149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTAAATAAAATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1922927	1924617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1922900_1924600
836414	contig_15897_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_49545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	207	536	651826	651497	NA	55	AGTTTAAAATATAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFGIFQRPIQTINLKSLLKQEVIILMPQGACMALARLTSLFKAAFPYAQYFEALPSVEGALCTPIQTNAAADTSGSGLSSTLTCTFWVTSLFTSCISEVLSPLESSI	652032	650679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_650700_652000
836416	contig_15825_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_160196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACAGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45492	44979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_45000_45500
836417	contig_6767_pilon	+	1992	4	Intergenic	novelGene_174614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	62.9338276816742	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	560	1105	16201	17881	FALSE	55	AATAAATTACGCTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKRDVGAYMLMYKGASRTETITSFRKRESRVPGDLLKRAFVKMSTGPEAFLALRSHFASSHALLCISHWILGIGDRHLNNFMVNMETGGMVGIDFGHAFGSATQFLPVPELMPFRLTRQFINLMLPMKETGLIYSVMVHALRAFRSHPDLLTNTMDVFVKDPSFDWKVCFVLHTFFILV	15641	18768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_16245_16690_16763_16836_17039_17653
836419	contig_6954_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_64459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAGTCACAAAATAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772078	770975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_771000_772100
836420	SIRV6	+	409	2	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	340	551	167	39	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCGCTTGGTATGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	1989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
836422	contig_1090_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_131154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAATCCCAGTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549888	549210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_549200_549900
836423	contig_5586_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_143510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239969	240761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_240000_240800
836424	scaffold_13505_pilon	-	358	4	Intergenic	novelGene_111496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6464.03080300691	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	168	305	541982	541845	TRUE	15	GCCTCATTCGTAATCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	547750	540204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541844_542033_547363_547465_547734
836426	contig_987_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_72331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAACTACTGCCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145716	1147367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1145700_1147400
836427	contig_14450_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_49065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCTGGCAGTTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479735	1481098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1479700_1481100
836428	contig_7629_pilon	+	1740	9	Intergenic	novelGene_153544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	38.8522843601248	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	9	1118	6859	42114	FALSE	20	ATGTCAGGTGGTGGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPTDETAGDLPVKDTGLTHFGMGELQETSIPRTMKSRQAVSRVSREELEDRFLRLHDENIVLKQHARKQEDKIKRMATKLIRLVNDKKRYEQVGGGPKRLGRDVEMEEMIERLQEKVHELERQNEVLKNRVISAKQQLQIQGHRQTPYNYVQSRINTGRRKANENAGVQECPRKGIRFQDVDVAETLQPMLTKYGSSLLEEARGEIRNFRENVIQTQRDQIEELEHLAEILKTQLRRKENEIELSLLQLREQQATDQRSNIRDNVEMIKLHKQLVEKSNALSVMEGKFIQLQEKQRALRISHDALMANGDELNKQLKEQRLKCCNLEKQLNSMTFSEKRIEELQDRINDLEKERELLKENYDQLYNS	6850	42736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_6944_8610_8756_11900_12200_15763_15867_17462_17610_29283_29390_31388_31536_32866_32941_42110
836429	contig_5732_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_119599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCAGCCGCCCATCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326081	327609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_326208_326848_327050_327586
836430	contig_5732_pilon	+	721	5	Intergenic	novelGene_119597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	309	719	309004	312205	FALSE	15	CAGCCGCAGGCTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLSPLVSLPYPRSQLEVIGCQQGLAAQLSATVAALPSLAGGGDRALRAWVRFRGLPGPLRAKLLWGSSRLSSQSRRRCSFTSSRCFSLYCRCTSASRMRKSSSMASILSREDFMAYIRSSFFCIQLYFLLGFSSR	307063	312207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_307288_308919_309091_310831_310963_311176_311315_312150
836431	contig_6266_pilon	+	1377	6	Intergenic	novelGene_170991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	10.6131993291373	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	119	1048	490808	502821	FALSE	45	ATAAATATATGTACAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCFLSDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKESSPRVIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIVECDRLFEVPHEMVAQSQSSYMEAEIHSWTLEDLRKHLEDSGATFHAYLEHLVQGLQKEAKEKFKGWVICSSIDNTDLAFKKVGDRHPLKLWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVEALDKHTEVYQYVLNSMAPHPSRDFVVLRTWRTDLPKGMCALVSMSVEHEEAQPMGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRVDLKGRSPEWYNKGFGYLCTAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI	490689	503150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_490888_492058_492174_493923_494146_495465_495684_500729_500907_502703
836434	contig_13911_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_177201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13343	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13911_pilon_+_13300_13900
836435	contig_18342_pilon	+	450	4	Intergenic	novelGene_154561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	210.254343329428	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTACTGAGTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26177	60757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_+_26310_54740_54798_56452_56612_60655
836436	contig_11429_pilon	-	1771	2	Intergenic	novelGene_60440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	425	841	33598	33182	TRUE	15	GTGCGGCCCACCTGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQRKSINGFPRPNSWGGGRPSGGRGGRDFPGSCGEPTSCIKGDPAAISPAGEASWVDGGDEEDGESGREEEESSGSGEFSKGSERDLELMRAAGRGSWTRGSLLVPVLSLSCWRSSRLACLRRRPPLPGPWLVVAK	34022	31955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_-_32132_32427
836437	contig_12424_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_174272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCATCAATCAGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143701	144986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_143700_145000
836438	contig_9833_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_68520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAACAAGATATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230639	229853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_229900_230600
836439	contig_3334_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_137665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAAATAATTATCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255201	252990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_253000_255200
836441	contig_14397_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_134642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	935	1249	60929	60615	NA	40	ATATATTGCAAATAAGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPETAVFARTWNLREKRQLPNNPKEPRNILRRPYLAVQKPKEIKVLHIHTSRMQHLIQNPVKTVIFGTRPFLPFQTVVQVPTCWQQVLSVEKQLPNKPERQKM	61863	60089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_60100_61900
836442	contig_5018_pilon	+	1122	8	Intergenic	novelGene_47168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.90763000177031	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	443	817	1526380	1527161	FALSE	5	CTTCCTGGACTCTGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERYRRYVDKARTVIQTLEPKQQPPGGAPPELHALRTQLRERDVRIRHLEMDFEKSRSQREQEEKLLISAWYNMGMALQQRAGEERAPAHAQSFLARQRLATNTRRGPLGRLASLNLHPTDKY	1516965	1527466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1517112_1517619_1517706_1517777_1517851_1519270_1519326_1526297_1526422_1526681_1526793_1526859_1526932_1527011
836444	contig_14353_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_82155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420590	419654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_419700_420600
836445	contig_12886_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_135545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTTTAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900071	899674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_899700_900100
836446	contig_11285_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_5615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTGCCGCACGACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765505	763577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_763600_765500
836447	contig_1009_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_121736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAACAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179096	178015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_178000_179100
836448	contig_5480_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_107234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCTAATAAATCTCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476392	478212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_476400_478200
836449	contig_15423_pilon	+	1626	16	Intergenic	novelGene_171587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	15.1475703955746	26	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1602	25	1626	249583	272617	FALSE	30	GATGAATTCGAGGCTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGAGSGTMAEEGAVAVCVRVRPLNSREEALGEDTQVYWKTDKNTIYQVDGSKSFNFDRVFHSNETTKNVYEEIAVPIIESAIQGYNGTIFAYGQTASGKTYTMMGSQDYLGVIPRAIHDIFKKIKEFPDREFLLRVSYMEIYNETITDLLCDTRKMKPLIIREDFNRNVYVSDLTEEVVYTSEMALKWITKGEKNRHYGITKMNQRSSRSHTIFRMILESREKGEPSNCEGSVKVSHLNLVDLAGSERAAQTGAEGVRLKEGCNINRSLFILGQVIKKLSDGQVGGFINYRDSKLTRILQNSLGGNAKTRIICTITPVSFDETLTTLQFASTAKYMKNTPYVNEVSSDEALLKRYRKEIMDLKKQLEEVSLETRAQAMEKDQLAQLLEEKDLLQKVQIEKIQNLTQMLVTSSSLTSQQELKAKKKRRVTWCLGKINKMKDSNYVNEFNTTTNITTKTHKTTVTLLGEIDDSLCSEADVFSNTLDTITETEWNPATKLLSQETLESELNSLRANYDSLVLDYEQLRRDNEEMELRLKEKNDL	249558	272617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_249639_251253_251346_254545_254636_254913_255033_255754_255875_256293_256376_256535_256604_256690_256757_260061_260114_263009_263098_263823_263954_264849_264970_265855_266015_270083_270232_270887_270977_272494
836450	contig_4125_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_25187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321746	1320349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1320300_1321700
836451	contig_7730_pilon	-	938	4	Intergenic	novelGene_156252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	678.518156639075	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2	388	43561	2264	FALSE	30	AATGCATTTCTGATATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQKKKLSVTINDSYVPVKKL	43562	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2325_4078_4177_7798_7895_43429
836452	contig_14405_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_85635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTAGGCTACCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410619	410207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_410200_410600
836455	contig_5039_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_65065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGGTGAATCTATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1842169	1843130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1842200_1843100
836456	contig_7195_pilon	-	1523	2	Intergenic	novelGene_177202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAATTTTCCTTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576745	575171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7195_pilon_-_575708_575758
836457	contig_14300_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_133146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	483	794	480345	480034	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLKTQIYMAPLIKTFCGCESKLTEAFWGAVWQNPLKQDKTNPAQHQYTLSWLLNSLESTLKKDSHRCPRRNENHLKALQLGNGEITCSLSIPSGFLEWHKW	480827	479429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_479400_480800
836458	contig_4896_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_164323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTACTGGGGAGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177712	176964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4896_pilon_-_177000_177700
836459	contig_10135_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_106597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATTTTAAACTGAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67338	68515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_67300_68500
836461	SIRV5	+	428	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-2	-47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAACATAACTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	3551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
836462	contig_1594_pilon	+	1901	1	Intergenic	novelGene_138811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTTAATATTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435400	437301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_435400_437300
836463	contig_11986_pilon	-	924	2	Intergenic	novelGene_69242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	158	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATTGGTTGATGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798309	796490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_797248_798142
836466	contig_16798_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_172267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAAGGTCTCAATATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228737	230797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_+_228700_230800
836470	contig_10016_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_117838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	672	226	897	161064	160393	NA	45	CCTAATTTTAAGTAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NENSHISCVSVTEEYILSDHPKPDSILQSQEFSAAGQNVENLCRVFKISEDISIKCEKQDDLSLAVEGKPKSSALMSNSQKEDVFIENIKETNSQCENLERKSTENSSEVTCKERKHRRRSMCYPDGQSLPLEKSGNHKNANRVSSSGEIDLENSELYKDLSDAIEQTFKRTNNETKVRRSTRLQKDLENEGLIWISLPFPSTSCTSQKTKRRTICTFDSRGFERLSSRKETMSSRQIPGMPSSSGKEHSEDPAANSANLLGKRRMSFCTSTLSNTKNTTQLEDYRRRSFLNQKEKTL	161289	160214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_160200_161300
836471	contig_3789_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_79904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	108	533	648592	649017	NA	15	TCACCAGCCCCGGAGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKAIAATTNDKSSHHQLCLLTEEAQTPKDLRTVSRASPSTDGVQGLHTLLGTSISAPDRAPPLPAAWKVGQQIRSPGTASQERPAELRAQARTSGPEEPARPSFRIYWNISHPSLLPRCGWLGGFLQPELHTPLISNAL	648484	650003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_648500_650000
836472	contig_10159_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_30828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACTCAAGGCACTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526581	527277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_526600_527300
836474	contig_6102_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_32259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACCCACTAGGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388206	1387719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1387700_1388200
836476	contig_5643_pilon	+	732	5	Intergenic	novelGene_39122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAAGTGCGCTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646192	651410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_646374_649400_649530_650490_650570_650869_650958_651155
836477	contig_8284_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_125681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAGCAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344934	344435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_344400_344900
836478	contig_3270_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_104517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTACTCCAGTATCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423947	424556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_423900_424600
836479	contig_11978_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_63104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2800.99676702578	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	101	469	1830113	1831883	FALSE	10	ACCTGCCTGCCTCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIAGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1830012	1831960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1830123_1830660_1830785_1831161_1831273_1831759
836480	contig_19604_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_77259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGTAAAGGAAATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283587	284090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_283600_284100
836481	contig_8312_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_152871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGATTCCATTCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218759	219646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_218800_219600
836482	contig_9480_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_177207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACAGTGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335411	336450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9480_pilon_+_335400_336400
836483	SIRV4	-	599	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	-2	20	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
836485	contig_953_pilon	+	2146	12	Intergenic	novelGene_129992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.024009587849	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	318	1748	201589	209454	FALSE	20	CCAATGTCTATGTTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPDRLRVSWSLPSVPGPLVGDGFLLRLWDGARGQERRENVSSPQARTALLAGLTPGTHYQLDVRLYHCTLLGPASPPARVLLPPSGPPAPRHLRAQALSDSEIQLMWQRPEGSSGPISKYIVEVQVAGGSGDPMWIDVDRPEETSTIIHGLNASTCYLFRVRASVQGPGDWSNVVEESTLGNGLQSEGPVQESRAAEESLDQQLILAIMGSVSATCLTILAALLALVCIRRSCLHRRRTFTYQSGSGEETILQFSSGTLTLTRRPKPQPEPLSYPVLEWEDITFEDLIGEGNFGQVIRAMIKKDGLKMNAAIKMLKEYASENDHRDFAGELEVLCKLGHHPNIINLLGACENRGYLYIAIEYAPYGNLLDFLRKSRVLETDPAFAREHGTASTLSSRQLLRFASDAANGMQYLSEKQFIHRDLAARNVLVGENLASKIADFGLSRGEEVYVKKTMGRLPVRWMAIESLNYSVYTTKSDVWSFGVLLWEIVSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRMEQPRNCDDEVYELMRQCWRDRPYERPPFAQIALQLGRMLEARKAYVNMSLFENFTYAGIDATAEEA	200798	209852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_201057_201529_201821_202189_202381_204814_205026_205193_205305_205521_205713_206652_206767_206881_206953_208037_208079_208164_208262_208387_208488_209382
836487	contig_17198_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_62346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCATTGCTGAAGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635470	636772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_635500_636800
836488	contig_12122_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_174997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGTGTCTTGTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96204	95798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12122_pilon_-_95800_96200
836490	contig_14101_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_122768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCTGTCTGAGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279646	280427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_279600_280400
836491	contig_7318_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_152217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACAAAAACATACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237592	239458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_237600_239500
836492	SIRV6	+	437	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	167	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1635_1736_1847
836493	contig_13365_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_168076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCAGACATATGAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5012	4276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_-_4300_5000
836496	scaffold_880_pilon	+	1350	9	Intergenic	novelGene_121528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.707106781186548	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	157	1350	830969	848695	FALSE	10	GCGGTTCTTCTCTACGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPEQEVGAAEGKPIGGQDAFPAQESALSPVNLTDDQIAAGLYAYTNNESTLKSIMKKKDGNRDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSGSDGSSSSESDDEDDVIECPPEDEEEEEDEEDEDSRAMAEAHRAINVEGFKSARVEAEMQVQEWEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNNIHDPKTLTSKDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAVPAMVGDYIAAFEAISPDVLRHVINMADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFACGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCSGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDI	830485	848695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_830577_830903_831102_832972_833082_834413_834663_836436_836525_844317_844538_846295_846439_847866_848068_848644
836497	scaffold_880_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_121529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCTGATGCCCTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850651	851413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_850700_851400
836498	contig_11417_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_103345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTGGGTGAGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683302	682849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_682800_683300
836500	SIRV6	+	326	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	15	1248	-13	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
836501	contig_10312_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_159019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTTATGAGAACAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77914	78629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_77900_78600
836504	contig_9258_pilon	+	513	3	Intergenic	novelGene_104604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3170	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	114	497	97238	99715	FALSE	5	AGTGCTTGGCTTGCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDEYPGQGLPIIAEPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELANFLKTPKGQTTATVQASEGRVALARAMATATATTTTMATSTNQEARIPFPGTSLGSALWGKGNGFTPRVVMPHSLSCGLGSGAEQ	96707	99731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97376_99469
836505	contig_7333_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_142767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGCAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170261	170851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_170300_170900
836506	contig_8415_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_141692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAGGATAGTTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231921	233020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_231900_233000
836507	contig_11422_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_99017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCGAAGACTGATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416	23	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_400
836508	contig_6418_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_81233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	534	839	1414392	1414697	NA	10	GTGTTGCTAGCTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFTASHIRQSMCSELQATDSLSFTLGLRHLCELLRRLSPVCVLTTELPSIHSFQSGRVETGELYHVCPCCWSLWRTPHTPAGSAPYVRQSSWEGWTCVL	1413858	1415258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1413900_1415300
836509	SIRV5	+	416	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGTAGAGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
836510	contig_5059_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_140757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAATTGACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494041	494405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_494000_494400
836511	SIRV5	+	401	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7488	2	-95	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCGACAATTCCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
836512	contig_15114_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_121172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTACATAGCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648866	650552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_648900_650600
836514	contig_7426_pilon	-	511	5	Intergenic	novelGene_27454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	19.266226926931	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	9	509	415241	407566	FALSE	25	CTTCACCAACGCCATGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARQEALHHSHPHAVIRCPSSSSSSVSCSGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPDGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKVLSVRKCQLVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVN	415249	407563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_407611_409722_409903_411112_411191_413690_413798_415150
836515	contig_7426_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_27452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTGTACTTGGATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330219	329905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_329900_330200
836516	contig_13437_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_131644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73580	74532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13437_pilon_+_73600_74500
836517	contig_854_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_36127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATTTAAAACAATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407348	408323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_407300_408300
836518	contig_990_pilon	+	1227	7	Intergenic	novelGene_75998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.5601973046327	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	27	914	205094	216635	TRUE	45	TCTGAGAAAATGGAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGPGRASMEPGLPVRRTGMAPLLEYERQLVLELLDADGLVVCARGLGADRLLCHFLRLHCHPACLVLVLNTQPAEEEYFISQLKLEGVDHLPRRVTNEIASNGRYEVYTQGGVIFATSRILVVDFLTDRIPSDLITGILVYRAHRIIESCQEAFILRLFRQKNKRGFIKAFTDNAVAFDTGFCHVERVMRNLFVRKLYLWPRFHVAVNSFLEQHKPEVVEIHVSMTPAMLTIQTAILDILNACLKELKCHNPSLEVEDLSLENAIGKPFDKFMSTAPCSRWIPHFYPARTESEPNLAGIECI	205067	219200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_205301_206724_206906_213464_213661_214559_214768_216539_216670_216943_217125_219102
836520	contig_5935_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_102755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCATGTGCAGCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335940	1338108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1335900_1338100
836521	contig_16113_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_140546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAATTTAAAATAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21830	22581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_21800_22600
836524	contig_12969_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_61650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11771	12935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_11800_12900
836525	contig_7201_pilon	-	1161	3	Intergenic	novelGene_152509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	379	junction_2	306.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255782	237552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_238545_239711_239821_255722
836528	contig_500_pilon	+	562	7	Intergenic	novelGene_30911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	220.816980526609	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	81	458	956249	969415	TRUE	45	TTTACAAAGAGCTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFVATQGATVVDQTTLMKKYLQFVAALTDVNTPDETKLKMMQEVSENFENVTSSPQYSTFLEHIIPRFLTFLQDGEVQFLQEKPAQQLRKLVLEIIHRIPTNEHLRPHTKNVLSVMFRFFRDGK	953977	971088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_953998_956188_956349_956760_956811_966887_966999_968026_968133_969404_969489_971057
836529	contig_5434_pilon	+	1050	6	Intergenic	novelGene_74661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTCCTTAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262202	276986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_262893_273748_273820_275488_275544_276013_276123_276267_276334_276927
836530	contig_11396_pilon	-	2150	23	Intergenic	novelGene_71305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	54.59749411499	3	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	811	2031	408575	390350	TRUE	5	ATGGGGCTGTCTTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEESASFDLTPHDLASGLDVIDQVLEEQTKAAQQRELYLEPDVGLAGSGLNMELEDIAKLKMILLHLEEAIEAIELPGDSGVTKPGSYIFELFAEAQITFQTKSCILDSLDQVIQHLAGRAGVFTNTVGLQKLLDIIQMVFSTDSPEGGPGSGGGQGASKFYKVHIHPDTSQRQRAQRSDAWSVAATRKQGKVLSYWCFSPGHSMQELVCQGVRSLILTSGTLAPVSSFALEMQIPFPVCLENPHVIDKHQIWVGIIPKGPDGAQLSSAFDRRFSDECLSSLGKAVGNLARVVPHGLLVFFPSYPVMEKSLEFWRAHDFARRIEELKPMFAEPRSKGSFSEVIDAYYAKVASPGSSGATFLAVCRGKASEGLDFADMNGRGVIVTGLPYPPTHGPPHRPQDAVLG	418615	390135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_390224_390318_390467_390800_390879_391178_391257_391438_391525_391630_391672_392383_392498_392641_392775_394321_394404_394497_394573_398189_398246_398965_399064_406565_406642_406763_406803_408427_408582_409494_409561_411133_411194_412139_412216_415825_415887_416095_416178_416823_416918_417223_417417_418443
836531	contig_8674_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_102889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCCAGGAGAAATATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106255	106710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_106300_106700
836534	contig_19405_pilon	+	1573	6	Intergenic	novelGene_176206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	37.4934660974416	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTAAAGAAATCCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69398	80386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_+_69526_69653_69795_76124_76300_78147_78345_79192_79326_79586
836536	contig_3004_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_127534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGACCTAGCCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511467	510273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_510300_511500
836537	contig_8864_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_135974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTGTGCTTCAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93924	92075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_92100_93900
836538	contig_8452_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_48066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTGAATCCATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502541	503202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_502500_503200
836539	contig_12889_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_177209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTGAAAAAAAGAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304570	303382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12889_pilon_-_303400_304600
836540	contig_1154_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_87132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGATATTAAAATGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480709	481410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_480700_481400
836542	contig_14275_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_162882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	30	410	482196	482576	NA	30	TTCTGGGGCCATAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLGYKSRHMLSSGYFLMDCILLRQYSPLGYKSRHMLSSGYFLMDYILLRQYSTFGYKSRHMLSSGYFLMDCILLRQYSILVYKPGHMLSSGYFLMDCILLRQYSILVYKSGYMLSSGYFLMDCILLRHTVYNSR	482166	482988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_482200_483000
836544	contig_5590_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_163020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGCACTATCTTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307151	306411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_306400_307200
836545	contig_5590_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_163025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	549	1061	345765	346277	NA	55	TTTTAACATCCAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGEAGAQRPREGRAMRLRCQCQPAEQSRVGDLRESGLGVGGQCCCEMEAGSEPPLPGEERVSPPLIPVTCCPPSAAPQREEEEAGPFGGGIDLPSALIWQRAGDGAGPGATRCSLVPRAPPLQGGVRAAENVHLLHLLSAAFQALTCVWPLFLLDFSLEWPISQSLPD	345216	347625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_345200_347600
836546	SIRV6	-	470	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	395	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTGTCGCCCCCATCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1182_1466_1542_1647_1735_1844
836548	contig_11483_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_172687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16559	17700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_16600_17700
836550	contig_14694_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_152477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATTTTTACTGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132894	132131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_132100_132900
836551	contig_5084_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_64484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTAAAAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77492	79636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_77500_79600
836555	contig_5302_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_81372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38666	39868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_38700_39900
836559	contig_9038_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_143332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTGAAATGATGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437637	438933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_437600_438900
836560	contig_4413_pilon	+	1250	8	Intergenic	novelGene_116980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	77.3966723959059	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	269	1009	126062	152361	FALSE	45	GTGTATGTTTAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVDIRDNLLGISWVDSTWIPILNSGSVLDYFSERSNPFYDRTCNNEVVKMQRLTLEHLNQMVGVEYILLHAQEPILFIIRKQQRQSPTQVIPLADYYIIAGVIYQAPDLGSVINSRVLTAVHGIQSAFDEAMSYCRYHPSKGYWWHFKDHEEQDKVKPKAKRKEEPSSIFQRQRVDALLLDLRQKFPPRFVQQKSGEKPVPVDQTKKEAEPIPEAVKPEEKETTKNVQQTVSTKAPPEKRMRLQ	125793	152602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_129424_129585_131813_131906_139202_139286_139572_139682_142574_142691_151580_151609_152230
836561	contig_11932_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_85418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	261	786	3	788	304501	305286	NA	25	CCTGAATTTTGTTAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRGAGLPAPAFPACSLHAGPASPGLRGSPFPGAAGAEAEPETVVAPDAAVLGGSGAAGPGAEAVTRLRSALAASAPVPSASPGAPEPATASSSSRASRRRASSASRRLLCRRNCSTASRVCRSWGAPTSGAAVGTGAAPAGAAAETATTGFGVPPSPPADAAAATFPPPPLGPLLVVPPPPSPAPSPACGGSSVGCPSGSSLTATSVCSSASAAILRLSHFAPSSVIEFSPHGGRGRRISRQLWRAIYGSRRGEKKGEKE	304498	305772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_304500_305800
836562	contig_12603_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_105779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATTTTTGCTTTCAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518257	516860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_516900_518300
836563	contig_14142_pilon	+	680	2	Intergenic	novelGene_120447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	83	397	94812	95313	FALSE	5	GTCGCCTGTGTCTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPTMLLREENGCCSRRQSSSSAGDSDGEREDSPAARARQQLEALLNKTMRIRMTDGRTLVGCFLCTDRDCNVILGSAQEFLKPSGQWPGNAHLPGECGGA	94729	95596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_94893_95079
836564	contig_14219_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_54359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTTCATCTTCAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871611	871910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_871600_871900
836565	contig_14219_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_54360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTGTGTATAAGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872702	873830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_872700_873800
836566	SIRV2	-	317	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4555	35	3380	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
836568	contig_9272_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_125885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATTTAACCTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223278	221990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_222000_223300
836569	contig_17144_pilon	-	514	5	Intergenic	novelGene_29446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	773.229711987324	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	148	483	167257	166106	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPHPLAFCTCFL	183205	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_166551_166843_167248_167299_181790_181850_183158
836570	SIRV5	-	292	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
836571	contig_7158_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_163724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026995	1026472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_-_1026500_1027000
836574	contig_4732_pilon	+	1875	2	Intergenic	novelGene_75488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_1	0	83	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTGTACCATGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747984	750690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_748095_748925
836575	contig_8691_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_72687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATTTATTTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57436	39645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_-_39816_57033
836576	contig_12113_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_134740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTCATAATTTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212549	213009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_212500_213000
836578	contig_11259_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_144536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTCATCAAAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140634	139495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_139500_140600
836580	contig_15034_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_143638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGGGCAGATTAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42973	43502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_43000_43500
836583	contig_15036_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_107158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTATTACTTGTAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190479	189206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_189200_190500
836585	contig_12619_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_73573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTATACTTTGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852676	852106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_852100_852700
836586	contig_12884_pilon	-	521	4	Intergenic	novelGene_104997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	459.985748571506	1588	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	248	463	899974	899626	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPQRPLPAAPASFLRGRRVLVWRDDEDNDIDLFGSDEEEDKEAARLREERLRQYTEKKAKKPALVAKSSILLDVKPWDDETDMARLEACVRSIQLDGLTWGGSKLVPVGYGIHKLQIQCVVEDDKVGTDLLEEEVTKFQEHVQSVDIAAFNKI	915305	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899993_900174_900334_915235
836587	contig_7207_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_72047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521687	523002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_521700_523000
836589	contig_9679_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_173412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACATTTTTACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57076	56106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_56100_57100
836591	contig_500_pilon	-	509	3	Intergenic	novelGene_30927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	27	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	6	353	1114000	1108893	FALSE	60	AGATTTAACAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKAIQLSDLESVDPELHKSLVWIL	1114005	1108736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1109076_1109968_1110084_1113950
836592	contig_4531_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_47844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACTATACTTGGAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107001	107761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_107000_107800
836593	SIRV5	-	297	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAACGTGTACCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	8359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8404_8457_8590_10863
836594	contig_3426_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_57966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486680	487495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_486700_487500
836597	contig_12229_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_169392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTTATTTAGAAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87510	86411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_-_86400_87500
836598	contig_9848_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_79988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGGTGGTAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129015	130117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_129000_130100
836600	contig_5715_pilon	+	757	5	Intergenic	novelGene_127981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCGGCAAGGTGAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630591	659562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_+_630826_631704_631783_635159_635300_645325_645415_659346
836602	contig_6047_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_24247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTGCACAGAAATATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290468	288982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_289000_290500
836603	contig_7207_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_72061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648092	648484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_648100_648500
836604	contig_6842_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_130742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCCTGGAAATTACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259354	1260089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1259400_1260100
836606	contig_4418_pilon	+	2274	1	Intergenic	novelGene_98373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATTTTACTAAATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782810	785084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_782800_785100
836607	contig_2646_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_69725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCATGTTTGCTTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2623477	2625431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2623500_2625400
836609	contig_15067_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_154348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247270	246587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_246600_247300
836610	contig_6902_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_135589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTCCAAAAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449123	447915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_447900_449100
836612	contig_10500_pilon	+	247	2	Intergenic	novelGene_41139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTCTGATAAGACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54441	58162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_54590_58063
836613	contig_3130_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_103577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAATAAGAAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152532	150754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_150800_152500
836614	SIRV4	+	299	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTGAAAGCTGGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3645	3944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
836615	contig_12624_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_60974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCTACCAGTATTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46374	43945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_44831_45928
836616	contig_4730_pilon	+	428	4	Intergenic	novelGene_71708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	274.981615547092	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTCTTATTTTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135803	141666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_135858_137082_137173_140626_140712_141467
836619	contig_10104_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_160149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGAGCAAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583809	582891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_582900_583800
836620	SIRV5	+	431	6	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	2	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTTCTTTTGTAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
836621	contig_854_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_36566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTGGAGACTTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678847	1677317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1677300_1678800
836623	contig_16071_pilon	-	2083	2	Intergenic	novelGene_166007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3	446	97562	95326	FALSE	50	TCAACTGGATGACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKREKVLFLRTFRGRTLRIVREHYLRPSVPCNSPLCPQPAACRNDGKLLTMDVTHYVIPDWKVVQDYLEILEFPELKGIIFMQTACQAVQHQRGWRYLFCIIFLFMVWVPPPTPLEKIPCWGEEKGRNSLFCQKGLFELIWYSLW	97564	93688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_95631_97423
836624	contig_14209_pilon	-	879	3	Intergenic	novelGene_88368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	4.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	577	879	85083	69942	FALSE	25	ACAGAGGTGAGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSDFHVFVRDVLQHVDVMQKDYPRLPVFLLGHSMGGAIVILTAADRPGHFAGMVLISPLVLASPESATTFKVLAAKVLNLILPNMSLGPIDSSVLSRNK	85659	69941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_70026_83413_83525_84975
836626	contig_10727_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_159654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCCTGAGCATGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94555	92530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_-_92500_94600
836627	contig_12885_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_176901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTTTGACTTATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167314	168653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_+_167300_168700
836628	contig_6364_pilon	-	1818	9	Intergenic	novelGene_51821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_8	5.3253521010352	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	230	1033	1589829	1586979	FALSE	45	TAAGTGCTTCAAAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEDSPAIEAIRLLRKTFPSLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSENGVFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVIAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1590058	1586193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1588844_1588934_1589040_1589125_1589244_1589381_1589757
836629	contig_8674_pilon	+	897	3	Intergenic	novelGene_102924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	732	114	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATATTTGTGTTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427658	476864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_476127
836630	contig_12425_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_46656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181363	182389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_181400_182400
836631	contig_6919_pilon	-	687	3	Intergenic	novelGene_163978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	58	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATACCTGGTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33041	31887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_32382_32627_32793_33013
836634	contig_2046_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_151554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATAACTACTGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11001	10686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_-_10700_11000
836636	SIRV6	+	518	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	3	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10726
836637	contig_10642_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_78739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275920	1275146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1275100_1275900
836639	contig_9706_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_20845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTTAGGGAGAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2724	2281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_2300_2700
836640	contig_5947_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_101622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1014	1412	1067148	1067546	NA	30	CACACAGAGCATCACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQLRGPPPIHVEHHMRGLSPPPISKKHHLQGPPSIDTQHHLLGLHLIDMKHHLWGCPLPDPGNFTCQACPQLTQSIIFGVCPGSTWRITSGDHPRSTGSVTCMARPQLTQSITCGACPRSKGSITYRASS	1066134	1068112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_1066100_1068100
836642	contig_18185_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_177212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTTCATTTGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18364	16985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18185_pilon_-_17000_18400
836644	contig_13984_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_130238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTCTTCTCCCTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15804	14860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_-_14900_15800
836645	contig_10235_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_46319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	228.5	78	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTCAGGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89942	91874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90005_90395_90496_91633
836646	contig_1090_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_131097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAAGAAAGAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148275	149757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_148300_149800
836648	contig_10438_pilon	-	1126	3	Intergenic	novelGene_161684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	318	662	124865	123346	FALSE	20	TTTTGTATTTGATTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVRNVEKPLVVPHPLPRIEELTVEERPYECKQCGKAFGCASSLTQHLRTHSGERPYECKECGKAFSHVSNLTTHKRTHSGERPYECKKCGKAFSQSSHFTKHLRTHSGEDLSM	125267	122881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_-_123615_124789_124993_125077
836649	contig_14814_pilon	-	1417	11	Intergenic	novelGene_137724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_10	12.537942414926	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	32	970	353552	299396	FALSE	15	TCTTTATTGTCATTCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQECRVLSIQSHVVRGYVGNRAATFPLQVLGFEIDAVNSVQFSNHTGYTHWKGQVLNSSELHELYEGLKLNNVNKYDYVLTGYTRDASFLAMVVDIVQELKQQNSSLVYVCDPVMGDKWNGEGSMYVPEDLLPIYREKVVPVADIITPNQFEAELLSGKKIHSQEEALAVMDVLHSMGPDTVVITSSDLPSPRGSDYLIALGSQRIRQPDGSTVTERIRVEMHKVDAVFVGTGDLFAAMLLAWTHKHPNNLKVACEKTVSAMHHVLQRTIQCAKAQAGKGQKPSSAQLELRMVQSKRDIENPEIVVQATVL	353583	298948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_299509_299748_299816_303284_303422_304748_304861_317259_317306_318435_318522_321377_321425_322612_322697_323636_323742_334367_334423_353465
836651	contig_14045_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_177213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCTGAAACCCAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26659	27675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14045_pilon_+_26700_27700
836652	contig_9345_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_24443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	235	429	381794	381600	NA	35	TTACATGCTTTTTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPFGGGVSGPRGSPRIIGRVSLRVFVGPDFPGSFGRGGIYPGYWGGGICPSFEGQNLLWSLRLSGGFWGDRIFLVIEMVSPSFWGAGSRVSLRGVLSGSLGGGLSPSPQVLLPEARRCAAILGIKCQLDSSAGVLVGNPHN	382028	380368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_380400_382000
836653	contig_12250_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_80743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGTATTCATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449726	450058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_449700_450100
836654	contig_11574_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_64098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457299	457055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_457100_457300
836655	contig_7887_pilon	+	1349	2	Intergenic	novelGene_124917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTGCCGAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548917	550794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_549713_550240
836659	contig_253_pilon	+	548	3	Intergenic	novelGene_129722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	61	546	552099	554098	FALSE	10	TCCCAAGGTGCTGTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLSTLPGLEVGAQHQDSRPMALPCALGLGTLLALPGALGSGGSTKDGSDSSVTIVLLLLLLLLLATGLALAWRRLSRDSGAAPRPCSATYTPLLAAQPGMTALEQPGARAPTSPHCSDQPQSPSHPYSLCLCFPSCHSWTCPALDPSTTPCKDCNSPTCSRPCRPIHRNREQPLEIKLSSL	552038	554100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_552102_553290_553467_553791
836660	contig_5454_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_145496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAAACCAAGTATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47741	49060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_+_47700_49100
836661	contig_16578_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_148673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	273944	273624	NA	30	AGCTGACTCGATGACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCLQSTPLRISPCLLQNDCVCSSEGEAGLAGAPAPLGSHSPGPNISGGHLCICLHFTHSYFWQQLFDFPLENYPSYLPLAPRLCGLARTDHTPPVPKVGHDSSLTK	273945	272947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_272900_273900
836663	contig_5062_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_157828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGCCTCGTTTCCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608225	607705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_607700_608200
836665	contig_17344_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_169592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGCCTGGTACTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73083	72623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_72600_73100
836667	contig_11321_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_86644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCTCCCGGAAACCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8206	8526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_8200_8500
836668	contig_10159_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_30888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	625	984	993540	993181	NA	75	ACAGATGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWQQWLTWDLGPLPRAQLHAASSASPGAHHHPWSSHPEGVAGGPGACSPSPGAGDGCPASTEHGHCGQDCAIGMQTPHLGKERKKAKVECTCHLSTRMERKTQLYLLVSVFIKSTCF	994164	992907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_992900_994200
836669	contig_11417_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_103270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGAAAGGTTGGAGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287651	288583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_287700_288600
836670	contig_15929_pilon	+	1652	3	Intergenic	novelGene_172470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	57	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1066	1413	88094	88441	FALSE	40	AATTTGTACACTTAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQASERRVDSEHRINTGRAVGAEPLANWIPDGAECSGRSMGGHWASALAAAQLSALEQVLLSSLPPWALSPSSWLLSCLAALRSAPLWPGIFCSSTDQPSAQQAQYPPTPGLC	83865	88680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_84057_84400_84489_87307
836672	contig_9482_pilon	+	1006	6	Intergenic	novelGene_44239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	338	junction_1	51.2343634682817	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	42	605	263283	289957	FALSE	55	GCAATGTAAACAATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSPSRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGYRLSDQFHDILIRKFDRQGRGQIAFDDFIQGCIVLQRLTDIFRRYDTDQDGWIQVSYEQYLSMVFSIV	263241	290358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_278052_278098_285421_285581_288833_288944_289858
836676	contig_7895_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_154444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTCAAAAACAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684799	684208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_684200_684800
836677	contig_7895_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_154443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTTGATCTAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683994	683038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_683000_684000
836682	contig_3068_pilon	-	1598	7	Intergenic	novelGene_137612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	17	358	188903	188562	TRUE	25	CCAGGCCCCATGACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHYSIICKIKHGQESKKSPRKCNPVSVGARGEWDSSEAAFLEPELRAASVADGLGSLGEPGWFVVKTLGEGWGGGGGGGGERPGFLQEKPQRLGSSTNLPRACARTLKGDR	188919	168897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_169465_170503_170598_175260_175363_175530_175605_178803_178922_187344_187440_188371
836683	contig_299_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_129459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGGAGGGAGAAATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985115	985741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_985100_985700
836684	contig_16924_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_177216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTTGGCAGGGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6028	4990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16924_pilon_-_5000_6000
836685	contig_16907_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_87462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTATTACTAGAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471338	469958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_470000_471300
836686	contig_11935_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_175653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGTGTCTAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51059	16378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11935_pilon_-_16756_50981
836687	contig_9982_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_55722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGAAGCAGTGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278184	278926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_278200_278900
836688	contig_4114_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_15576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCTTGATTACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169913	173782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_169958_172613
836689	contig_4114_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_15578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATCCCCAAAACGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173936	174415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_173900_174400
836690	contig_3612_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_87831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAAAGCCACCCGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956672	956325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_956300_956700
836693	contig_12970_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_50507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAACATTACATATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25698	25164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_25200_25700
836696	contig_4797_pilon	+	424	4	Intergenic	novelGene_6919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2294	junction_3	2365.21725570119	790	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3	380	368771	371710	FALSE	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA	368768	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368844_369855_370026_370914_371016_371676
836699	contig_4151_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_65262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATACAAGTGCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603636	602031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_602000_603600
836701	contig_1008_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_121561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTAGAACTGTGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565208	565518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_565200_565500
836702	contig_11742_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_166546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGAAAAACCTCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132279	131158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_131200_132300
836704	contig_9679_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_173414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGCGTGGAGCAGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61971	61631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_61600_62000
836705	contig_4103_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_51871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAGAAAGTAAGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36960	36605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_36600_37000
836707	SIRV6	+	343	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	231	5	231	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGAAAGTAAGACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	10810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
836708	contig_1694_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_144970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATGAAAAAGGAAGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580523	1579776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1579800_1580500
836709	contig_7171_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_101222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATTTTTGATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525184	527109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_525200_527100
836710	contig_3386_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_34587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGTACTGTTTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516120	515337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_515300_516100
836711	contig_5084_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_64514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366461	365341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_365300_366500
836712	contig_15327_pilon	-	654	5	Intergenic	novelGene_70508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	67	543	446027	443446	TRUE	35	ATCTTACAAATGCTGCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRWSSSWLASGTFQGAFFDNCPSKVSCKSQSQHFHLGGLYVVITWTPWPSGSPCPGLPAVKSSRHLISSYVCSAEKITCLCSKRGRASVSRVIQKDRGAICEVINDRRREAPSTKRFSPYNRWNSRYFPRNVSRSLSIMAGPRLSMRSKSEKQPRSQ	446093	443252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_443349_443430_443533_444965_445118_445423_445533_445898
836714	contig_9318_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_172353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCAACTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113482	112576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9318_pilon_-_112600_113500
836715	contig_19743_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_173152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCGATATAAGTAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162724	165069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_+_162700_165100
836716	contig_10765_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_122904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGGAAAATAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107516	108227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_107500_108200
836718	SIRV4	-	397	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	98	122	98	-122	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTAGCGTTAAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	3759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
836719	contig_6496_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_103529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATCCCAAAGGGGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948691	947549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_947500_948700
836720	contig_13905_pilon	-	1522	1	Intergenic	novelGene_130428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCGTCAGCTCCAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223812	222290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_222300_223800
836721	contig_9981_pilon	-	2678	8	Intergenic	novelGene_121073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.29047354790892	8	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	821	1165	422994	418249	FALSE	15	AGTCTAATTCTGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHYFTGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPAERLTCEQLLQHPYFDSIREIEGLAKEHGKPSRKTLRQSRKHLPGVKMVHCFTEASRVTVSNDLYLHLAQRI	485367	416735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_418489_419891_419949_422946_423030_425365_425567_426365_426457_432898_432972_484802_485091_485235
836722	contig_5769_pilon	+	1080	2	Intergenic	novelGene_138772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	784	1080	274418	276114	FALSE	10	GCTCTCCTCCCAGACCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSSVSSSCSSSSDSSPGAGSSRCPLFSDHSLMAMFSAVICTDCASQLLKKVPSMGNGVDRPSCPRTDSCPAFTFSFFSGLPFGPSWPFLFESFFLPF	273634	276114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_274604_276003
836723	contig_12079_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_67364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTAACTTCCTTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285446	284933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_284900_285400
836724	contig_7327_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_172125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGCAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134173	133547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_133500_134200
836725	SIRV6	+	372	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	407	94	241	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
836726	contig_15132_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_176090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCACGGCTTGTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58119	59492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15132_pilon_+_58100_59500
836728	contig_12964_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_131731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCGACAGGCTGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625097	625849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_625100_625800
836729	contig_7810_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_144224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATAATAGAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383254	381446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_381400_383300
836732	contig_9258_pilon	+	424	3	Intergenic	novelGene_104612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3170	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	73	423	97238	99728	FALSE	5	CCAGTGCTTGGCTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPLRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQPRSRPRREEWPWPGPWPQPQPRPRPWPQALIRRPEYPSLGPAWALHYGEREMASLPELSCHTALVVVWGLGLNNKAFLP	96748	99729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97352_99491
836734	contig_6048_pilon	-	821	3	Intergenic	novelGene_73355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	35.5	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	236	442	3000505	2998603	FALSE	20	GAAACCCTGTGGGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSPAEQRALERKLKKERKKEEKRRLWEAGGCPAPQTPATPEPAPSGATLALDYLCSWAQKHQDWKFQKTRQTWLLVHMYDSDKVPDEHFPTLLAYLEGLKGQARELTVQKAEARMQALDAAGAGGSDPLLLGQVQRIRQVLQLLS	3001975	2998223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2998792_3000487_3000570_3001804
836735	contig_16625_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_171112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43770	42512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_42500_43800
836737	contig_16098_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_46223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	457	780	765295	764972	NA	65	TCATTAACAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLACSVPELHGTFLGQLLGGCSPCLSAHWPSPNLPLPSSMPHTYLLGSAFSILVMNISLLIFRPLSSNLSRKIPEAPNVFHLCSFLLVLRTGVRKSHQAGSWRRV	765751	764912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_764900_765800
836739	contig_8182_pilon	-	1580	11	Intergenic	novelGene_173262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.3120098463002	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	162	1295	377569	272895	TRUE	75	AAAATAAAGAAATAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDGMEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGREDSLAQGFQRRAENGAGR	416916	254693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_254902_260075_260145_272886_272951_273045_273131_280197_280330_288166_288297_293553_293787_332473_332654_344351_344544_377443_377624_416809
836741	contig_7254_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_145841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTACTATTTACTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205383	204998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_205000_205400
836742	contig_4832_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_163423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAAGGTAACCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504891	506183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_504900_506200
836743	contig_19640_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_134879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGCTTTTAGCCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117075	116614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_116600_117100
836744	contig_8284_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_125664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCTGTTTACTGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205517	204699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_204700_205500
836745	contig_16724_pilon	-	721	7	Intergenic	novelGene_105320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	816.37316154372	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	272	601	560992	541872	TRUE	30	AACATTTCAGCAGTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENAVRQNGQLVRNDSIPVLRGGSAAATSNPHHDNVRYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	568163	541308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541869_542004_543916_544002_547919_547980_560939_561029_567595_567766_568098
836747	contig_16884_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_161815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTTAGAAGGTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39813	38549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_38500_39800
836748	contig_11607_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_177219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGGGAAATTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24492	23419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11607_pilon_-_23400_24500
836751	contig_10399_pilon	+	866	2	Intergenic	novelGene_114487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	186	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	68	463	333659	334054	FALSE	30	TATACAATTAACTTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRPPVRRAGGPPGTGRHRAWRMMNFRQRMGWIGVGLYLLASAAAFYYVFEISETYNRLALEHIQQHPEEPLEGTTWTHSLKVRLLSLPFWLWTIIFLIPYLQMFLFLYSCTRADPKTVGYCIIPICLAVICNRHQAFVKASNQISRLQLIDT	332510	334457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_332562_333642
836752	contig_9471_pilon	+	577	6	Intergenic	novelGene_21745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_3	160.890521784224	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATGATCAAAACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259453	278393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_259496_260221_260324_261048_261105_271741_271922_275967_276049_278277
836754	contig_7963_pilon	-	603	4	Intergenic	novelGene_58325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1815.85021408705	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	64	387	48838	38544	FALSE	5	ATGTTGTTGTCTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNQSDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKGKEPSGYRVPDLN	48901	38327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38568_39276_39399_43737_43819_48741
836757	contig_6501_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_150569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230028	231228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_230000_231200
836759	contig_16484_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_177220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATCTTAAAAAGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10604	9290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16484_pilon_-_9300_10600
836760	contig_19469_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_134983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGCCCCTGATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24241	24942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_24200_24900
836761	contig_19469_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_134984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCGTTGCCTAGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25201	26130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_25200_26100
836764	contig_10811_pilon	-	608	5	Intergenic	novelGene_165789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	137	442	201986	197622	TRUE	20	CGGATTGGTCCAAGCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCRGSQPAIHSSRRLVHDMTSSRKNTILTETVRESTSSSRAAPKTARAAGGGGEAAAPYFRKQVTQRTRNTVADRNTSRRELKVALAKVFTGEFLTTSSW	204265	192848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_192922_197528_197633_200564_200774_201900_202063_204205
836765	contig_593_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_102014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAGCAGCCGGAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383755	383352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_383400_383800
836766	SIRV6	+	411	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	171	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	20	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1645_1736_1845
836767	contig_15327_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_70469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAAAAAAAAAATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358968	360477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_359000_360500
836768	contig_10855_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_124332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACATTGAACATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529435	530359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_529400_530400
836770	contig_5945_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_104589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTTTTGAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314161	313086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_313100_314200
836772	contig_8377_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_35171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGACAGGACTCGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391079	391979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_391100_392000
836774	contig_15707_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_173240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	180	536	91965	92321	NA	10	AGCCTTCCTTGTGCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHGRQGHTPGREPPSPPSPAGWRCAPPPQRLILPLALDGQGDQHHQQHRTGGSAVTTPSPAQTHTPLLPCVLCFRKDFAISSPLTRTLHRITLLLQDSETPRPHQLLPDASPAHHPI	91785	92903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15707_pilon_+_91800_92900
836775	contig_2342_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_132761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATGAAAACTATTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317913	319566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_317900_319600
836776	contig_11832_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_106959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAATCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397413	398312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_397400_398300
836778	contig_11615_pilon	-	735	3	Intergenic	novelGene_151253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	9.5	584	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	214	555	74686	42181	FALSE	10	TTTTTTTCTCTGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTAGTTGIPPKAKMKFMVLVVTVGLTLLLGGQAMPANRLSCYRKILKDGNCHNLPEGVADLTQIDANVQNHFWNGKGCEMICYCNFSELLCCPKDIFFGPKISFVIPCNNQ	74899	42000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_42236_44517_44774_74655
836779	contig_6710_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_93728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
836782	contig_6616_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_141760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAAACAAAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342012	342966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_342000_343000
836783	contig_6616_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_141761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACTGAGAGCTGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343618	344024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_343600_344000
836784	contig_7919_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_28040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGGCGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274101	275361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_274100_275400
836785	contig_202_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_127076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	46	327	379336	379055	NA	55	AAACTAAAAACTATGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFQDIKVLFPLFIDCMFVCFVLIFCFEMLGWVGQAFFAVCSSVGMTALTSLSGWAGQQWAGQACFTVHWFGEVTDGGLGGHCLPPDVGPAVWEHSQPLNRWAGVLDRE	379381	378332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_-_378300_379400
836787	contig_1987_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_177222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCGTTTTGGAGACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91282	89808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1987_pilon_-_89800_91300
836788	contig_20223_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_177229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1191	1490	44621	44322	NA	15	TTTCTCATCCTTACTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGQLLLISSFPDGLGWARVTTPWSCLQDCLEFCRFSVVCLLQVLQVWHSFKYLSTGGAGVAAGVGNAVGGCVVSGHLAPVLTHEFGHEQIGGSPVSG	45811	43963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_-_44000_45800
836790	contig_5429_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_127796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATAATAAATAAAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251460	250855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_250900_251500
836791	contig_6589_pilon	+	648	6	Intergenic	novelGene_25792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1974.4345013193	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	141	644	669670	672840	FALSE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCTSVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGSGVSTLRCLLPALPLHPEAPVPDCLPENKTI	668536	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669548_669748_670000_670104_671046_671188_672584_672672_672745
836792	contig_17171_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_147390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCAAACACTGTTGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376751	377512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_376800_377500
836793	contig_5445_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_135442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCGACCTTTTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179352	178326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_178300_179400
836794	contig_5935_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_102693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813160	814378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_813200_814400
836795	contig_7291_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_106315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGATTAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212276	210748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_210700_212300
836797	contig_6286_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_165656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAACTGTCATTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222053	220716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_220700_222100
836799	contig_3964_pilon	+	1113	3	Intergenic	novelGene_174207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	559	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	516	1019	82044	82547	FALSE	40	AATCATGTGATGCAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERFVVTAPPARNRSKTALYVTPLDRVTEFGGELHEDGGKLFCTSCNVVLNHVRKSAISDHLKSKTHTKRKAEFEEQNVRKKQRPLTASLQCNSTAQTEKVSVIQDFVKMCLEANIPLEKADHPAVRAFLSRHVKNGGSIPKSDQLRRAYLPDGYENENQLLNSQDC	79300	82641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_79593_79760_79965_82024
836802	contig_2438_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_112088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATATAAGACCCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463521	462237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_462200_463500
836803	contig_5236_pilon	+	1599	11	Intergenic	novelGene_100918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	11.8663389467856	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	273	1382	468003	505606	FALSE	10	TTCTTATTTCTGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNRPSKIQEMALPMMLAHPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVNALELFPQCLCLAPTYELALQTGRVVERMGKFCVDVQVMYAIRGNRIPRGTDITKQIIIGTPGTVLDWCFKRKLIDLAKIRVFVLDEADVMIDTQGFSDQSIRIQRALPSECQMLLFSATFEDSVWQFAERIIPDPNVIKLRKEELTLNNIRQYYVLCENRKEKYQALCNIYGGITIGQAIIFCQTRRNAKWLTVEMMQDGHQVSLLSGELTVDQRASIIQRFRDGKEKVLITTNVCARGIDVKQVTIVVNFDLPVNQAEEPDYETYLHRIGRTGRFGKKGLAFNMIEVDKLPLLMKIQDHFNSSIKQLDPEDMDEIEKIEY	455669	505823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_455730_457986_458032_458481_458618_467971_468065_468177_468281_469967_470083_471149_471328_496585_496824_498179_498343_500424_500614_505544
836804	contig_9290_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_77527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGAGCTGTTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278911	278150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_278200_278900
836806	contig_13992_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_147640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGAAGGCCCTACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498992	498185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_498200_499000
836807	contig_8576_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_88752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTTTACTGAAACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703025	702095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_702100_703000
836808	contig_9468_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_59516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTACAATGAGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462890	461817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_461800_462900
836810	contig_13015_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_165539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83472	84053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_83500_84100
836811	contig_13015_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_165540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGTGACACTTCCTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84194	84546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_84200_84500
836812	contig_11026_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_167654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCTTATGCCCTTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112349	113523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_112300_113500
836813	contig_18850_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_142425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAATAGAAATAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172731	173590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_172700_173600
836814	contig_15021_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_26931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCATGTAGTTACGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176948	176145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_176100_176900
836816	scaffold_17542_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_139245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTATCCTTGACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477407	478585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_477400_478600
836817	contig_6175_pilon	-	1073	3	Intergenic	novelGene_16373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	10.5	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	111	701	1862256	1852920	FALSE	25	CAGCCACACCTATTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRCTGGPWVRNEVIDVDGTKRRTLLEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVIGTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATKCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLETTNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSSNHIYWTDVSLKVRCAGPHVYAGSF	1862366	1852547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1853252_1856471_1856689_1862214
836822	contig_2414_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_158508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464137	465542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_464100_465500
836824	contig_5253_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_61604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTAACCTCTGGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380622	381257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_380600_381300
836825	contig_2988_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_136545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77728	78916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_77700_78900
836826	contig_3424_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_55531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTTTCTGTGGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251028	251986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_251000_252000
836827	contig_17500_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_157918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTACTGGTCAGGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234352	232878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_232900_234400
836828	contig_5954_pilon	-	1183	6	Intergenic	novelGene_28450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_5	28.9178145785604	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	262	1110	110233	107815	FALSE	5	CTTACGGCTCTTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAAFLGCLTDVRQALAAPRLTGKEGPGLAELLANVASSVLSHIKASLAAVHLFTAKEVSFSNKPYFRGEFCSQGVREGLIVGFIHSMCQTAQSFCDSPGEKGGATPPALLLLLSRLCLDYETATISYILTLTDEQFLVQDQSPVTPVSVLCAEARETARRLLTHYVKVQGLVISQMLRKSVETRDWLSTLEPRNVRAVMKRVVEDTTAIDVQVGLLYEEGVRKAQSSDSSKRTFSVYSSSRQQGRYAPSYTPSAPMDTNLLSNIQKLFSERIDVFSPVEFNKVSVLTGIIKISLKTLLECVRLRTFGRFGLQQVQVDCHFLQLYLWRFVADEELVHLLLDEVVASAALRCPDPVPMEPSVVEVICERG	110907	107741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_108076_108922_109011_109102_109225_109668_109888_110074_110291_110703
836829	contig_1867_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_54558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAACACATAATTCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444951	443833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_443800_445000
836830	contig_8866_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_77905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAATAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142015	1141001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1141000_1142000
836832	contig_7070_pilon	-	1374	1	Intergenic	novelGene_104056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTCCAACTCATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222556	221182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_221200_222600
836834	contig_5375_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_169213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	83	466	73423	73806	NA	30	ATCTTAGCAACTTGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIESRLRNPDLAGGDFLYLTQQHIDVIHYGEGSKEGRRTVVIQKDKIHRTFIHKAERGFKKNQVVFTQQGIKYATKGFIYKNKMRNVRERERKRRGGIAKNKLCFWSLQPSQKVSPTFLLCVFSQE	73340	74909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_73300_74900
836835	contig_5586_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_143529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1116	1421	295563	295868	NA	20	AGGAGCATTTTGTTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRAARCQGRPSWDGHFGRVAIFNLICRDSITQEGTWRWNFIASSTCLLQNYGLVSLEWQSLVSLWWRPEQLASMGHQGTMFQEITGCLYLCKGPESLRDS	294447	296040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_294400_296000
836836	SIRV6	+	347	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	511	15	345	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCGGTGGCTTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	2105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
836838	contig_5566_pilon	-	370	3	Intergenic	novelGene_153646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	10	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATGGATGATGTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142175	131262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_131481_140998_141134_142158
836839	contig_18111_pilon	+	929	2	Intergenic	novelGene_176730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGGAAAAGCTATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24191	25444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18111_pilon_+_24697_25020
836841	contig_6823_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_131249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCATTTTTATCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449835	448842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_448800_449800
836843	contig_12967_pilon	+	1460	12	Intergenic	novelGene_169798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_11	47.0972266734526	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	34	1371	150665	158335	FALSE	25	AGATTTGCACTACAGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITLKTPLISSPMDTVTEADMAIAMALMGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKFEQGFITDPVVLSPSHAVGDVLEAKIRHGFSGIPITETGTMGSQLVGIVTSRDIDFLAEKDHTILLSEVMTPRNELVVAPAGVTLKEANEILQRSKKGKLPIVNDHDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDSHKQLLCGAAVGTREDDKYRLDLLTQAGADVVVLDSSQGNSVYQIAMVHYIKQKYPQLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDGLRVGMGCGSICITQEVMACGRPQGTAVYKVAEYARRFGVPVIADGGIQTVGHVVKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGVRLKKYRGMGSLDAMEKSSSSQKRYFSEGDKVKIAQGVSGSIQDKGSIQKFVPYLITGIQHGCQDIGARSLSVLRSMMYSGELKFEKRTMSAQIEGGVHGLHSYEKRLY	150631	158424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_150707_150867_150943_151218_151426_151576_151665_152867_153068_153895_153987_154198_154295_156128_156273_156377_156523_156826_156971_157083_157168_158313
836844	contig_2646_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_69641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCCAGACGGCGGCGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2079239	2078985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2079000_2079200
836846	contig_6740_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_142736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	136	318	762606	762788	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSDLRRRLGEDKAGGGPGDYSSLALGPGLRGWLVLQCPGGAWLMRDLAAWLLDQRLAPGPAPRESQERLGLAGDPWALSRSEVRLFSSHLFTNAGIPSVHGSR	762470	762893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_762500_762900
836848	contig_8020_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_114377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	854	1195	113316	113657	NA	5	CACGTGGGTCTTCGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSFFIWMLLSSIWATVKMRIRHFLQTCLSRAGGCLVTPTPPRAQHFTHGHPPAYLVLAQQEGQQHEHATVVHDPPHINVALQVALMVAGVEGDILGHEQGQVGGRGAAHSV	112462	113784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_112500_113800
836852	contig_3825_pilon	+	1183	6	Intergenic	novelGene_77967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	6.78232998312527	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	51	806	21374	25530	FALSE	25	GAGATTTATACCTATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEPARSKCVPRGRQSMGEPSTDVRAFLRQHPGLRLEPGGAKVTCTLTGHELPCRLSELQVYTRGKKYQRLVRAVPAFDYAEFEPHIVPSTKNPRQLFCKLTLRHINKRPEHVLRHTRGRRFQRALQKYEECQKQGVEYVPACLLHRRRRREDQDGGRPPGGRVDFWEPASSHEGGSQSDDSMTDLYPPELFTRKDLGGAESRDGTDSNEDEDAPGPPRGETGSRGEGADAGRALVRKRRKKQLGSLKLKRHHSRPKSFSLEKESGS	21323	25907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_21452_21530_21686_22505_22610_23827_24008_24240_24399_25449
836853	contig_15185_pilon	-	592	3	Intergenic	novelGene_99412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATCTCCCTTTGGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228566	219484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_219939_225088_225191_228530
836855	contig_1275_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_108809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAGAAAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596952	597843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_597000_597800
836856	contig_3948_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_53429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTTGTCTGTCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2101152	2101412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_2101200_2101400
836858	contig_11994_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_129359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131250	130338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_130300_131200
836862	contig_15182_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_136470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCAGAATAAAAACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625408	626642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_625400_626600
836863	contig_11855_pilon	+	991	2	Intergenic	novelGene_66934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	261	989	1003891	1004619	FALSE	15	CCAGCCACCGCTGCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIQVALNFIISYLYNKLPRRRVNIFGEELERLLKKKYEGHWYPEKPYKGSGFRCIHIGEKVDPVIEQASKESGLDIDDVRGNLPQDLSVWIDPFEVSYQIGEKGPVKVLYVDDNNENGCELDKEIKNSFNPEAQVFMPISDPASSVSSSPSPPFGHSAAVSPTFMPRSTQPLTFTTATFAATKFGSTKMKNSGRSNKVARTSPINLGLNVNDLLKQKAISSSMHSLYGLGLGSQPQQQQP	1000240	1004621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1000358_1003747
836864	contig_16411_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_77368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307646	307372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_307400_307600
836865	contig_8589_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_107360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTATTCCCAAAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162857	162336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_162300_162900
836866	contig_10904_pilon	-	1161	2	Intergenic	novelGene_22507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	624	junction_1	0	137	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATATTTGGCTGTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337010	333178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_334103_336773
836867	contig_3862_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_137400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	180	329	445344	445195	NA	20	GTATAATTATTTCCGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNYYSRTEVHRKLHNQTYPSSVLLVLPKSTEGGRRPPKKNLGTRPRSYKRKALSVTQEQMLTQETLCCSTEELGCDTQGDNSAAVSHSHYHQTGLGFHHPLPRLLEKT	445523	443558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_443600_445500
836868	contig_610_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_76782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAGAGAGGAAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252664	251949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_251900_252700
836869	SIRV6	+	365	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	508	0	342	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
836870	contig_2783_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_119658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765030	764583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_764600_765000
836871	contig_13074_pilon	+	1013	2	Intergenic	novelGene_153410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	146	652	135484	139443	FALSE	40	CTTTTCAAAACAGGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPWGNELASAAARGDLEQLTSLLQNNVNVNAQNGFGRTALQVMKLGNPEIARRLLLRGANPDLKDRTGFAVIHDAARAGFLDTLQTLLEFQADVNIEDNEGNLALHLAAKEGHLPVVEFLVKHTASNVGHRNHKGDTACDLARLYRRNEVVSLMEGNGAGGAANQQ	135338	139804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_135613_139065
836872	scaffold_19766_pilon	+	1471	6	Intergenic	novelGene_34383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	48.0849248725627	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	237	866	731644	733165	FALSE	30	GAAGAAAGACTGCTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLPGASGCFPCLLSALEEHNFLFQLRGGEQPPPGAKEGLEVPLIAVVQWSTPKLPFTQSIYTHYGLPSIRLDRPCFVMTASCESPVRTYERFTVTYTLLNNLQDFLAVRLVWTPEHAQAGKQLCEEERRAMQAALDSIICHTPLNNLGFSRKGSALTFSVAFQALRTGLFELSQHMKLKLQFTASVSHPPPEARPLSRKSSPSSPAVRDLVERHQASLGRSQSFSHQQPSRSHLMRSGSVMERRAITPPVASPVGRPLYLPPDKAVLSLDKIAKRECKVLVVEPVK	731181	733770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_731298_731431_731515_731606_731771_732313_732469_732702_732897_733011
836875	contig_8291_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_99935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATGGATGGATACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9653	9155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_9200_9700
836876	contig_9931_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_134836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAGCCATACCAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339005	338094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_338100_339000
836877	contig_10074_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_57198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAACCTGTTTGTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590810	590596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_590600_590800
836878	contig_6870_pilon	+	931	2	Intergenic	novelGene_103982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTGTGGTATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467721	1470520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1468539_1470406
836880	contig_15720_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_41858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATCTCTAGGGTAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233705	232951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_233000_233700
836882	contig_12654_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_129288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746546	745787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_745800_746500
836883	contig_11396_pilon	-	1017	4	Intergenic	novelGene_71411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_3	81.6999932000541	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	254	901	1645175	1644244	FALSE	10	TCTTTTACCCGCTCACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLASLLGSGGPPASSSSSSSRSQSAAVIPSSTTSSARTTPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQGKGTRAVSLRLGDGAYRPARSRALSRAWAQHVPGQCSDGDQPHPCLSPPLPVSSPGLESGAICLGGCPGPGAAADGCVCVLVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1645581	1644127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1645372_1645524
836884	contig_6418_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_81150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGCCACCAAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247187	247828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_247200_247800
836885	contig_5997_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_168614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACCTTCTTTCTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325520	324792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_324800_325500
836886	contig_11317_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_164083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCATCAGATTCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112941	115284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_+_112900_115300
836887	contig_16883_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_161766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618826	617416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_617400_618800
836889	contig_14814_pilon	+	2097	3	Intergenic	novelGene_137760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.5	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1446	1856	422783	423193	FALSE	30	ATACACCAGGGTCTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLKSREPDSPSVPRDVLWEAGPCRLCLWFPCWLAGCQPLGLTVEASVGGERLGYFLLLLSCCAALLWWQLQPSTAVSPTSWLPPQSLLSWAPVKLFSLHSFSCCLSLGASPSLVGSLPRSHLCSPFIKISLHLG	419408	423434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_419630_420520_420760_421797
836891	SIRV6	+	437	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
836892	contig_17964_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_33934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTACCACCCTCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654162	655194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_654200_655200
836893	contig_9389_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_83959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGGACTGACCGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210162	210971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_210200_211000
836900	contig_7630_pilon	+	1199	7	Intergenic	novelGene_133629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.86744175568088	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	194	961	260769	284291	FALSE	20	GCTAAAGTTTCTGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKPPKPVTGFPLGVVALPDGCFCQSIHFLNYFLVHKRRNVYPEGQVKSKMKCVVLCTDASLHLVTANGTKGPTISVLVERPVKHLNETICAVAPVPALPGMLLIFSWNGSVRLMDVAKSEILCAFAPPRSYHLAVPWKPVFVVSLHHPCFLLRGDHPDEIECTSNAKKIRNSIFYFNFEAYPLLEEISGNCTIPQSDLTDNKAFSETLPLEKRCEHFLQKRFEKVKKNTMRDQEHWARLQKYSLILQREGFMK	256663	284529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_256803_260714_260800_272090_272305_274019_274084_275980_276138_276492_276695_284191
836901	contig_16187_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_101083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATACTTTTTTTGCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126705	128448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_126700_128400
836903	contig_6076_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_81775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGGTTAGCAGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504327	503283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_503300_504300
836904	contig_10765_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_122911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTTCTCCCTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159454	158540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_158500_159500
836905	contig_6854_pilon	-	1271	2	Intergenic	novelGene_169495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAGAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485274	478693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_-_479848_485157
836907	contig_1379_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_134573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAGCCATATCTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359940	358921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_358900_359900
836908	contig_13780_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_149016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATACAATTAATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410753	412050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_410800_412000
836909	contig_7285_pilon	-	1594	1	Intergenic	novelGene_143422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTGAATATTACAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366073	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_364500_366100
836910	contig_10958_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_5360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTGAAATCTGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802556	801614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_801600_802600
836911	contig_20170_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_166658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78123	77296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20170_pilon_-_77300_78100
836912	scaffold_880_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_121402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATCTGAGCCATGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287210	288173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_287200_288200
836913	contig_15966_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_176503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCAAAAAAGCATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45846	45516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15966_pilon_-_45500_45800
836915	contig_18859_pilon	-	1739	4	Intergenic	novelGene_150548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	12.2836838484589	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	95	667	168580	118427	FALSE	65	GAAATTAAAAAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPRATTDTTPAAGAAGEEGEHVKPFTPEKAKEIIMSLQQPAIFCNMVFDWPARHWNAKHLSEVLHGKQIRFRMGMKNTNTVPQFETTCSYVEATLEEFLNWNCDQSRGSGPFRNYDHSQFWAYADYKYFVSLFENKTDVFRDVIWSDFGFPGRNGRESTLWIGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQVQGR	168674	117354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_118568_131869_132052_148363_148550_168516
836916	contig_4364_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_4598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAGAAAAAAGAAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2189611	2189352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2189400_2189600
836917	contig_3948_pilon	+	1664	7	Intergenic	novelGene_53172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_1	44.3223670647476	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	128	1141	328722	336800	FALSE	25	CATGGGCAGATGGGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALFVGDAILSVNGEDLSSATHDEAVQALKKTGKEVVLEVKYMKEVSPYFKNSAGGTSVSWDSPPASPLQRQPSSPGPPLRDLSDAKHVSLKMAYVSKRCTPNDPEPRYLEICSADGQDTVFLRAKDEASARSWAAAIQAQVNALMPWVKDELQALLAATSTAGSQDIKQIGWLTEQLPSGSTAPTLALLTDKELLLYSSLPQTREALSRPARTAPLITTRLVHSGPSKGSVPYDAELSFVLRTGTRHGVDTHLFSVESPQDLAAWTRQLVDGCHRAAEGVQEVSTACTWNGRPCSLSVHIDKGFTLWAAEPGAARAVLLRQPFEKLQMSSDDGASLLFLDFGGAEGEIQLDLHSCPKTMVFIIHSFLSAKVTRLGLLA	316869	337323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_316989_328713_328919_333109_333318_333420_333552_335510_335708_336419_336608_336707
836919	contig_10017_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_156994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTCCCACCATCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341814	342367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_341800_342400
836920	contig_10017_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_156995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGATAAACTGCTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342367	344024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_342400_344000
836922	contig_253_pilon	-	1090	7	Intergenic	novelGene_129662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	99.006172647074	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	62	1012	393089	389884	FALSE	10	TCCTGTTGCAGCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSNYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIERHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAF	393150	389805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059_390206_390353_390436_390689_390857_391020_391234_391669_391860_393023
836923	contig_14814_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_137683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCCAGCAATGGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28669	27304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_27300_28700
836925	contig_12128_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_131969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTCTGTGTCTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154527	155618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_154500_155600
836926	contig_12514_pilon	+	1050	5	Intergenic	novelGene_177232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.54835134966506	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	161	667	301334	327435	FALSE	25	TTAGGTAATCTTTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRCGESEQGTRGEATARRARGGAAAASTRAPSGLRALVTKAARRTGDLCNSEMQSQQYQQQRRKFAAAFLAFIFILAAVDNAEAGKKEKPEKKMKKSDCGEWQWSVCVPTSGDCGLGTREGTRTGAECKQTMKTQRCKIPCNWKKQFGAECKYQFQAWGECDLNTALKTRTGSLKRALHNADCQKTVTISKPCGKLTKPKPQAESKKKKKEGKRQEKMLD	195213	327818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12514_pilon_+_195373_301332_301449_302356_302531_305282_305445_327379
836927	contig_11978_pilon	+	296	4	Intergenic	novelGene_62802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_3	59.4866931898779	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGACAGGACAGCTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299667	379931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907
836929	contig_6220_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_177234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAGGAAAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60328	60051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6220_pilon_-_60100_60300
836930	contig_16951_pilon	+	996	2	Intergenic	novelGene_98638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	85808	86262	FALSE	30	AACTGCAAGCAGTGAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKRSLQTSTRVSVQGCSEGKEEICWFLPPETFLRCPQQKVFPASQSTEHVLGPGVHLRGACVRAAWWQRHSHPRSLSTLQGLLAVLFWQWHLVKHRIKITAKKTL	85805	86938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_86165
836932	scaffold_13505_pilon	-	234	2	Intergenic	novelGene_111633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGGCTCTGTGCCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760764	746364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_746488_760653
836933	contig_19098_pilon	+	1601	9	Intergenic	novelGene_65847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	89.9791642548429	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	541	1137	464512	477552	FALSE	45	TTTTTTTAAAAAAAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQLQFSLDPEPIAINCTAFNHNGNLLVTGAADGVIRLFDMQQHECAMSWRAHCGEVCSVEFSYDENTVYSIGEDGKFIQWDIHKSGLKVSESSLPADATGPFVLSGYSGYKQVQAPRGRLFAFDSEGRYMLTCSATGGVIYKLGGEEKVLESCLSLGGHRAPVVTVDWSTAMDCGTCLTASMDGKIKLTTLLAHKL	445603	478016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_445767_447666_447751_461722_461764_464097_464193_464354_464524_468886_468996_470207_470321_472101_472300_477387
836934	contig_14093_pilon	-	773	3	Intergenic	novelGene_174215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	2.5	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCACTTGCCTGCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140438	127396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14093_pilon_-_127893_138772_138922_140310
836935	contig_405_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_135326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGACGCTCATATGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586563	585206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_585200_586600
836936	contig_12128_pilon	+	703	5	Intergenic	novelGene_131991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	101.87983117379	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	77	601	434447	483076	FALSE	50	AAATTTTAAACTTATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQGAGDYIYGVSRRPRVVAYKRDEMWSEGRYDYERLPRERAAPRSHPSDGYHRVVNIVPKKPPLLDRPGEGSYNRYYSHVDYREYDEGRSFSHDRRSGPPHRGDESGCRWTRDDHSGGRQPEYRDVRDGFRRKSFYSSHYARDRSPHKRDNPFFRESPVGRKDSPHSRSGSSVSSRSYSPERSKTYSFHQSQHRSMYF	411746	483178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_411803_434426_434519_449493_449659_461896_461959_482850
836939	contig_11846_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_105929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188657	189935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_188700_189900
836945	contig_5222_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_59010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTTAATAATAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320891	322337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_320900_322300
836946	contig_14514_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_137475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGAAAGGTGGGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72441	71870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_71900_72400
836948	contig_4678_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_125998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTCCCTTTTTCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75041	76064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_75000_76100
836949	contig_8167_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_155652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	3	518	131898	132413	NA	5	TTGCAGGTGTTTTCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLSATDCYIVHEIYNGENAQDQFEYELEQALEAQYKYIVIEPTRIGDETARWITVGNCLHKTAVLAGTACLCTPLALPLEYSHYISLPAGVLSLACCTLYGISWQFDPCCKYQVEYDAYKLSRLPLHTLTSSTPVVLVRKDDLHRKRLHNTIALAALVYCVKKVYELYAV	131895	132790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_131900_132800
836952	contig_3787_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_102433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCGACACACAGCCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626089	627443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_626100_627400
836953	contig_5039_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_64952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACTGGGAACCCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628509	1627498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1627500_1628500
836954	contig_13753_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_136516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	501	824	227718	227395	NA	70	GCTTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRLSFDEHGFCSLLPVVFIDLRISKASCVPCRKVVMPVVHMRRSRLSKELCSQVPLTFCCVTGRSHRHHMLDAVFIHSFRVVSFGRLSFRQSINSKYLRYGMILF	228218	226588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_226600_228200
836955	contig_7182_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_117127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACAAATAAGTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862500	863022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_862500_863000
836956	contig_14208_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_129086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148686	147049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_147000_148700
836959	contig_10861_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_39211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCTGGCTAACTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459888	457957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_458000_459900
836961	contig_14341_pilon	+	535	5	Intergenic	novelGene_111824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	2394.76213589158	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	80	484	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQNPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547736	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_550355_550485_551481_551581_551668
836962	contig_16724_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_105274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAACGGAAAAAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372577	370837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_370800_372600
836963	contig_11978_pilon	+	601	5	Intergenic	novelGene_62994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	111.558280732539	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	118	423	1517714	1526137	TRUE	5	CCTACTGCTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQIKPYTLMSMVANLLYEKRIQNTYLKPSPKPC	1517265	1527344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683_1517869_1520333_1520442_1526094_1526190_1527218
836964	contig_8149_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_169944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCCTTGTTACTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485684	484335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_484300_485700
836965	contig_5247_pilon	+	1014	7	Intergenic	novelGene_81810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274.316980071514	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	155	397	155964	158101	TRUE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVAHCLLCQHRGGAVG	155809	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_155967_156364_156459_157776_157879_158057_158153_158462_158565_160638_160735_161186
836969	contig_7704_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_154628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGCCCAAGTCCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364239	365023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_364200_365000
836970	contig_15135_pilon	-	1805	2	Intergenic	novelGene_119886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1137	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGATTCTATGGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114978	112987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_113524_113709
836972	contig_10940_pilon	-	798	5	Intergenic	novelGene_49250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1110.34251472237	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	248	469	893258	875564	TRUE	30	CAAGAACAGTTTGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWGGSFAAALRRWPQGSTKRLAGQRTTWCATTARPSSERVTFKYDGATIVPGDQGAEYQDFIQQCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE	917036	874038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874229_875424_875675_893147_893306_916664_916752_916923
836973	contig_10864_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_107125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAGAAAGATGACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185261	1183573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1183600_1185300
836974	contig_835_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_152138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAAATAAGCTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92226	91722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_91700_92200
836975	contig_10494_pilon	+	648	6	Intergenic	novelGene_102207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	91.2249965744039	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	172	501	1085154	1087047	FALSE	15	AGACTTGGAGTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTSLDVVDEKISALGKALVDQRELYLGLLYPTEDHKVYGYVTNSKVKFVMVVDASNTALRDNEIRSMFRKLHNSYTDVMCNPFYNPGDRIHSRAFDNMVTSMMIQVC	1083265	1087194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1083306_1084069_1084144_1085096_1085270_1086225_1086314_1086606_1086687_1087001
836976	contig_6062_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_5301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAATAAATAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781844	781466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_781500_781800
836977	contig_7308_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_159584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTCTCCTTGTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96563	97567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_96600_97600
836978	contig_4754_pilon	+	933	5	Intergenic	novelGene_35893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	88.1291665681686	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTATGGTTTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114674	129219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114787_119671_119871_121506_121634_121913_122010_128820
836979	contig_12520_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_161076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACTTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513752	515203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_513800_515200
836983	SIRV6	+	341	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	371	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845
836985	contig_3426_pilon	-	1270	13	Intergenic	novelGene_57947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	266.776266539752	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	64	1215	443332	368098	FALSE	65	AAAGGAAGCAAACAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARSVPGVQGRGTRLGPSPFHMAEEEHLRKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPIPFPKEALAHEKFTQELKYVIQRFAEDPRQEVHSCLLSVRAGKDGWFQLYSPLGV	443395	368042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_368111_385114_385177_388422_388472_388767_388795_390086_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_443308
836986	contig_10436_pilon	-	915	5	Intergenic	novelGene_108473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.4919347844333	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	407	520	97741	96622	FALSE	15	TGTGTTTATAGCCCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLELVGPSRTRSSVEYPPPTLKPETQPPEKRRRTIEDFNKFCSFVLAYAGYIPPSKEESDWPASGSSSPLRGESAADSDGWDSAPSDLRTIQTFVKKAKSSKRRAAQSGPTQPGPPRSTFSRLQAPDSATLLEKMKLKDSLFDLDGPKVASPLSPTSLTHASRPPVPNLWT	99471	96226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_96638_97643_97973_98574_98668_98822_98855_99421
836987	contig_1309_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_73962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGTTTTACAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109938	111600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_109900_111600
836988	contig_7050_pilon	-	1479	2	Intergenic	novelGene_153618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588565	585684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_586450_587851
836989	contig_3018_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_78764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAAAAGAACTCCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307878	306744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_306700_307900
836990	SIRV6	+	296	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	354	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCGAAGACGCTATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	2092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1874
836991	contig_15491_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_75986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCATGATGGTTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86147	86877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_86100_86900
836993	contig_2854_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_120865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCAGTTTATAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944902	942843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_942800_944900
836994	contig_10446_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_162499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTGAAAATCAGTCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956161	958310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_956200_958300
836996	contig_12050_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_62765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	768	1280	806675	806163	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSPTSSLTWLRISLPNAALRGAGGPETDCFSQLGNREADGPAGDSKGSPQPGPPSMADSTFPQFSDHTSRDSLPSPRNLITLSCSHLSVGTWLLPESNPSRLPSTPQASNQSGMGGPAVPAVQNCMVTGKAGLAFHFGSCPSRPQELPGQKASARGGSGTSAGVQIPVV	807442	805227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_805200_807400
836997	contig_9753_pilon	-	707	6	Intergenic	novelGene_41331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	363.151208176429	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCAGACAGTTTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93370	70001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73285_85840_85932_86172_86225_93230
836998	contig_8357_pilon	+	1238	3	Intergenic	novelGene_39682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	611	junction_2	262	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAATGGGAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143506	146493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_143550_144117_144221_145401
836999	contig_12977_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_122822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACATAAGCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240294	239821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_239800_240300
837000	contig_10596_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_173589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTCCAGGCCCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801976	801084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_801100_802000
837002	contig_6228_pilon	-	420	2	Intergenic	novelGene_164513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACAATTTGTCCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368647	350022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_350157_368361
837004	contig_10377_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_115357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGAAACGAGATTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182285	181521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_181500_182300
837005	contig_8693_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_150869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	80	388	1085054	1085362	NA	30	ACTCTGCATTGCAACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSYVKSNSVSNNLTLVFKPNPLPLSRILTYRDPIGQSRTVLMPWGFQGCKSLWKQTATYFYRVAGRFKPPTFQLAAKPLTAALPGFLPCFYLDQIKTQVS	1084974	1085570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1085000_1085600
837006	contig_6175_pilon	-	797	3	Intergenic	novelGene_16370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	4	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	115	594	1819672	1808591	FALSE	0	CTGCTGTTCTTTCGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLVPGGQPELGRWAVSGAAQRLTHLVPFPAGISCSKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPPILNPPPSPATDPSLYNVDMFYSSNIPASTRPYRPYIIRGMVPPTTPCSTDVCDSDYSASRWKASKYYLDLNSDSDPHPPPPTPHSQYLSAEDSCPPSPATERSYFHLFPPPPSPCTDSS	1819786	1808387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1808853_1811503_1811602_1819552
837009	contig_17440_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_7674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3701	3995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3700_4000
837010	contig_19098_pilon	+	1454	2	Intergenic	novelGene_65851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	7	417	445644	446054	TRUE	40	ATTTTTGGGAAAAGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVERTDELVREYLLFRGFTHTLRQLDAEIKADKEKGFRVRGRRARRGRRRSPGTLERAVPSLALRGGSGAVTAPGDVASRVWPSLTMRSRGPERGLTCLKLLSGSGASPGREPKGPASRCRAPIPTSLWPQRR	445637	450977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_446896_450781
837011	contig_7411_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_137059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTAGTCTGCTTCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016991	1018436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_1017000_1018400
837012	contig_14618_pilon	-	561	4	Intergenic	novelGene_136855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351056	1279745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327382_1348516_1348598_1350876
837013	contig_15360_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_171267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCTTATACTAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229832	229504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_229500_229800
837014	contig_14953_pilon	-	2194	5	Intergenic	novelGene_137299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTGGGTCACCTTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459328	421111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_422032_423960_424062_451463_451564_455025_455221_458450
837015	contig_14744_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_66023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGACGCATGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970126	979200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_970205_977395_977576_979102
837019	contig_10324_pilon	-	1384	5	Intergenic	novelGene_7924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	21.6376408140999	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	89	1063	929627	927701	FALSE	25	GAATCGTTGCTAAGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWTALLTLVLQASLVLPLAESAAPALRFVAVGDWGGVPNAPFYTAREVASAKEIARTVQTLGADFILSLGDNFYFSGVQDVNDKRFQETFEDVFSARSLHNVPWYVLAGNHDHLGNVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKVPRTNVSLAIFMLDTVTLCGNSDDFLSQQPERPRDLMLARTQLSWLKKQLAAAKEDYVLIAGHYPVWSIAEHGPTRCLVKQLQPLLATYGVIAYLCGHDHNLQDEKGVGYVLSGAGNFMDPSKRHQRKVPNGYLRFHYGVEDSLGGFAYIEISPKEMSVTFIEASGKSLFKTSLPRRPRP	930004	927379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_927935_928538_928885_929014_929143_929360_929628_929916
837022	contig_6241_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_156417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192541	193832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_192500_193800
837023	contig_14289_pilon	+	1425	3	Intergenic	novelGene_110562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1	456	51422	58680	FALSE	30	AGTCAAGGCTGTGCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RADSLINQAACRPRSPAAADHSQGHSWPGSTVVSGSVPPQVHSLLADALPGDDADPQRVPSVHVPLGSGDKDIPHQAQGPVQRQWDVLHVLHVLKSNLVVEQRLQHGTGRAPSLEGVSLVGPHRVEAVHGPLPFLVEPANDVVDVVGEEAP	51421	59649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_51711_51943_52052_58621
837024	scaffold_7386_pilon	-	1071	9	Intergenic	novelGene_136596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	64.5924724716433	1	51	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	643	1071	305687	298896	FALSE	20	TTTGAGAAGCGTTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMS	309017	298895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305688_306773_306842_307269_307374_308174_308285_308577_308785_308864
837026	contig_9377_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_176302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGGGAGCTCCCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317398	317931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_+_317400_317900
837028	contig_12761_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_164068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362825	363647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_362800_363600
837032	contig_5725_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_167144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCCACAGAGATGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234513	233334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_233300_234500
837034	scaffold_16539_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_68385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACCTACGACAGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643584	642920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_642900_643600
837036	contig_8538_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_5112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGCTAATCAAAAGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969269	970152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_969300_970200
837037	contig_5039_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_64786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCATATATCGCACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149868	149030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_149000_149900
837038	contig_11590_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_125592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTCTTAGGCTGGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698246	699286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_698200_699300
837039	contig_9995_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_47668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAAATGCATGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182559	181249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_181200_182600
837040	contig_10549_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_110631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408623	409137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_408600_409100
837041	contig_10163_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_82620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAGGAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59906	61093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_59900_61100
837042	contig_15185_pilon	+	784	6	Intergenic	novelGene_99414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_4	18.6826122370508	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	105	407	228773	230224	TRUE	20	GGCTTAGAGGTGGCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGKVGTRGKKQIFEENRETLKFYLRIILGANAIYCLVTLVFFYSSASFWAWMALGFSLAVYGASYHSMSSMARAAFSEDGALMDGGMDLNMEQGMAE	228668	230844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_228779_229390_229487_229942_230003_230083_230247_230385_230471_230574
837043	contig_5799_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_50329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAATGTTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691840	691064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_691100_691800
837044	contig_12148_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_140341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGAGATTATCCCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116332	117777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_116300_117800
837045	contig_9027_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_156366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGAACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182408	180826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_180800_182400
837046	contig_9582_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_106849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTACCCAGCACCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606462	608131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_606500_608100
837048	contig_3334_pilon	-	825	6	Intergenic	novelGene_137666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	27	junction_2	37.1429670328045	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	254	823	371237	342199	FALSE	70	CAAGAACAACAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIETAELDGETNLKVRHALSVTKELGADISRLAEFDGIVDCEAPNNKLDKFTGVLSWKDGKYSLNNEKIILRGCVLRNTSWCFGMVIFAGPDTKLMQNSGKTKFKRTSIDRLMNTLVLWIFGFLVSLGVILAIGNSIWEQQVGDQFRTFVFWNEGEKSSVFSGFLTFWSYVIILNTVVPISLYVSVEIIRLGHSYFINWDRKMYYSGKATPAEARTTTLNEELGQIEYVFSDKTGTLTQNIMTFKKCSINGKLYGKESSSFFLTILLTILKQAN	391315	342196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_342467_350063_350261_358129_358219_371221_371381_383330_383414_391288
837049	contig_7357_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_36940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCCTTTACGTCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936466	937477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_936500_937500
837050	contig_9594_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_73921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAGGAAGCCAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148933	150539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_148900_150500
837052	contig_7720_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_155791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAACTGATAAACAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832747	834377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_832700_834400
837053	contig_19378_pilon	-	1208	3	Intergenic	novelGene_73783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	193	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGTTAGCTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17894	16011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16440_16937_17502_17678
837054	contig_4136_pilon	+	1745	1	Intergenic	novelGene_161246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTAATGAAAATGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135084	136829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_135100_136800
837055	contig_6102_pilon	+	341	4	Intergenic	novelGene_31788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7954	junction_1	2053.07785207153	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACAGTCTGGACTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360095	361129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864
837056	contig_7291_pilon	-	886	10	Intergenic	novelGene_106305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	359.473208534824	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	114	830	206279	173638	FALSE	25	GGAAGATTCCTGTAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEADIMDINEIFKDLGMMIHEQGDVIGKHRSQCRKCRGARSASKPAAVQGGRLSAQIQKNSVHHHFCPCHWSCDYRSHHMGSE	213253	173581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176464_178175_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180692_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
837057	contig_6589_pilon	+	561	4	Intergenic	novelGene_25780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	2053.57752876941	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	119	469	669670	672754	FALSE	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668305	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668405_669650_669748_670000_670104_672584
837059	contig_8286_pilon	-	636	4	Intergenic	novelGene_139799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	122.698365469508	2636	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	162	380	189870	182885	TRUE	25	CATATTGTCAGCAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCFEEKDCKESGVQLLGLPALCRPRSRGGRIPPQSLPKVSHHPFCLSVKGHVKMLRLVLTVTSMIFFILAQAPEPYIVITGFEVTVIFFFIVLYLLRLDRLLKWLFWPLLLAFLFWVFRILSTHW	190031	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_179860_182810_182933_184959_185119_189858
837060	contig_6760_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_150782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGATTTCGTTCGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130785	131727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_130800_131700
837061	contig_12603_pilon	-	432	3	Intergenic	novelGene_105817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	393	junction_2	0.5	2025	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCGGCACTGCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718081	716438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_716658_717243_717310_717934
837062	contig_7512_pilon	-	1058	6	Intergenic	novelGene_153191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.582986550977	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	147	530	129044	106241	FALSE	15	CTTCGAGAGTGCCTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVLQKLGKADETKDEQFEQCVQNFNKQLTEGTRLQKDLRTYLASVKAMHEASKKLNECLQEVYEPDWPGRDEASKIAENNDLLWIDYHQKLVDQALLTMDTYLGQFPDIKSRIAKRGRKLVDYDSARHHYESLQTAKKKDEGWLMGVKESDWNQHKELEKCRGVFPENFTERVQ	134564	105712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_106349_126720_126808_128472_128569_128951_129047_129306_129362_134475
837063	contig_8177_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_86503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGCCAGAGAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52687	51690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_51700_52700
837064	contig_3817_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_78295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	394	786	112193	112585	NA	70	AATGAACAAAAGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVSRVSSSRDSEHDGATTGNPEGKARATHPTQNSLAQTPPEAACSTQSESRSPYTDPRDGPSGNSDSLRLLSLCCSRFGTNVLTSFKLSLTSQLFKGLPHSLIKMQSSCVPTSAPQLYFTLLCLLFFL	111799	112782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_111800_112800
837065	contig_11709_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_168238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	85	312	620359	620586	NA	10	CCTCCTCTGTGATTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DELHLPGKASLGTPCTSLTLGQPTPPSSMPNLSSEAALTDVLPLKEEHVGHQFLTPEEAPSPPQMLAAGSPLAHSRTMHTLGLASQDSLHEDSVRGLVKLSSV	620274	621462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_620300_621500
837067	contig_366_pilon	-	1094	6	Intergenic	novelGene_51639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	302.908170903328	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	139	927	1440886	1406207	FALSE	0	GCTGGCTCTCTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWALLVLLMATAWHGQGIPVIEPQGPELVVEPGTPVTLRCVGNGTVEWDSPISPGWTLGHEAPSSILTTTNATFRNTGTYHCTESGELSRGDANIHLFVKDPFRPWNILAEEVTVLEDQDALLPCLLTNPELEADVSLVRERGRPVRHDTSYSFLKWRGFTIHKTKYLDSSVYHCSTLVGGRKVLSIGIQLKVQRVSGPPALKLEPAELVRIQGEAAQIVCSASSVNPAFDVFLQRGDTKLTVYAATDFHDKHYHVAAKS	1441024	1406039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406229_1432953_1432995_1433665_1433800_1435697_1435983_1436405_1436664_1440837
837068	contig_11631_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_104177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCGAAATGTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57056	57766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_57100_57800
837070	contig_4012_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_176884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATGTAACAAGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641678	643075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_+_641700_643100
837071	contig_5059_pilon	+	1674	4	Intergenic	novelGene_140707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAAAATTTACTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167139	187948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_167213_171564_171697_185165_185194_186507
837072	contig_7894_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_170792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACGCTATATTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238372	238143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_238100_238400
837073	contig_8671_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_126263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTGAATATTCTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510868	511651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_510900_511700
837075	contig_5928_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_40385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCCCAGCCCGTAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299692	299438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_299400_299700
837077	contig_9099_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_149909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCTGGTTAAGAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321273	320374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_320400_321300
837078	contig_18231_pilon	+	429	3	Intergenic	novelGene_105889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTAAAATCGGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258591	277078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_258763_272879_272982_276922
837081	contig_15491_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_75992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCTTTGGTTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177252	178927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_177300_178900
837082	contig_15293_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_146542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCCGCTGGGGGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140388	141630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_140400_141600
837084	contig_8063_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_152441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTACATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704425	705585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_704400_705600
837086	contig_9415_pilon	-	1181	4	Intergenic	novelGene_109771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	226.256491619578	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	14	334	1599184	1597383	TRUE	20	AGTCATCTATTTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVTMPLARDLLHPSLEDEKKKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGTRQLLSLPAKQQITNGACQRFYFYEQVLND	1599197	1596480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1597059_1597113_1597589_1598231_1598341_1599178
837087	contig_11386_pilon	+	1113	5	Intergenic	novelGene_82839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	57.1505686760858	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGTTTTGTGCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231227	245133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_231363_231608_231685_232027_232173_233457_233517_244435
837088	contig_7806_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_157555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	156	563	296122	295715	NA	35	CATCCCAACACCAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPDAPSETVTLEQAGHSISSPPCLPRNLWREVTRYLRLGDIDAATEQKRRLEEKQRVEERKRENLCTPWQPKYFVQEVTQLSAPGKPVLRCGRVGTEGQGGALGKTGASWLWLQLWPRFWDSCSAATSSCGKS	296277	295071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_295100_296300
837089	contig_10569_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_44070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGAAACCTAAATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262212	260769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_260800_262200
837090	contig_10801_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_74048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTGTGTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307468	308362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_307500_308400
837091	contig_9424_pilon	-	341	3	Intergenic	novelGene_143793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2620.5	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTATGGTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280141	277476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278702_280079
837094	contig_10861_pilon	-	515	6	Intergenic	novelGene_39357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1542.39406119189	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	14	466	1585418	1581171	FALSE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNISRYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1585431	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584609_1584677_1585412
837095	contig_15070_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_164889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCCTTTGTTTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386937	388517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_386900_388500
837098	contig_5515_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_52312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCGTCTTGCTGGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51610	49913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_50218_51530
837099	contig_7815_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_134349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCGACTAAAGTGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42969	41856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_41900_43000
837100	contig_14133_pilon	-	651	5	Intergenic	novelGene_119950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1813.84736127382	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209108	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207403_207465_208214_208389_208585_208728_209032
837102	contig_8354_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_24116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACATATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251751	251109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_251100_251800
837104	contig_2646_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_69585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGATGACTAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420176	1420921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1420200_1420900
837105	contig_14846_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_85377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGGGACAACTGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193476	192200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_192200_193500
837107	contig_11986_pilon	-	837	7	Intergenic	novelGene_69158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1128.38208905002	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	313	687	518553	507353	FALSE	10	TCTTGCGTGTGTTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	547581	507202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507413_516431_516550_517890_518029_518494_518588_519123_519181_523616_523809_547552
837108	contig_16516_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_173251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	923	1498	19882	19307	NA	75	CCCCAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTDPRPKYPGVMFDGKTSLRALSHPKSKKQCVEEWGPPPRPACTDAWALGPSSAQTLQRPEPETRAAHLTVRLFTVESRPALALTVPGPGAVGHHLLVCVDRRMRVSPQRWDPARHTSGNEAARPPSVCHSTPSALTPLPPQTQDREEATDPFPKCGVSREKQWGAPSIWDVHREAGEGPYDTGCPQKCW	20804	18956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_-_19000_20800
837111	contig_14980_pilon	-	2596	4	Intergenic	novelGene_78231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.63299316185545	6	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	205	1812	502610	489529	FALSE	35	CAAGTACCATCACATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAELREAVALASWGPVTVKKEEEEEENLLGQVSSQQLHSDNIKAWAHGEGAQTGLDASEQEEKGQNMFWDMAVILKATQEVPAGSPLGSYSLPGANGVPAQVIVAKSEILETHGDITSLDAEIKNPQSLILKTEMCDEAEKPFIIPGRIQKADPEEPELGEACEKGNLLKRQRIKREKKDFRQVTVKDCHFPESLKEEGDQKWQNSGERYNLSSSPLKNQKIQPGQKPFTCNVCGKGFSQSANLVVHQRIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIHSLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNECGKTFTRSSNLIVHQRIHTGEKPFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAFSCFSHLIVHQRIHTAEKPYDCSECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNECGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECGKAFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECAKCGAAFISNSHLMRHHRTHLVE	504875	488744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_490776_501046_501216_502418_502734_504794
837112	contig_14341_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_111782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	576	364	939	327850	328425	NA	25	TCTTCCAGCACCTAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSSGDILQDEVPEVQNTALKQVRFAQEKAQPQEENCKSPQSRANTGLCTSPVSPQKIPLRKRLRKRSSQVKSTKHNSHIKIHQSSFEGGKARESSGCGTPCSRSAQQITFTRIHKESPHCRCSECGKTLRNPKYFSVHKKIHIGDRPFVCQDCGKSFIQSSSLTQHQRIHTGEKPFKCRECGRAFNDRSA	327486	328426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_327500_328400
837113	contig_12528_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_81360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019286	1020878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1019300_1020900
837114	contig_16411_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_77340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGGACGACCAGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206292	205607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_205600_206300
837115	contig_8161_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_156777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAATCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412380	413991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_412400_414000
837116	contig_14300_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_133128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	22	414	386369	386761	NA	60	TCAATCCCATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSTMTAFFFKKIKTYKRDIKWERGAFTISKIRVGFTYRIQPSGPPSFGLERLYLIFILKLFRGPKLQQPHVAQPMKALHDRKKCNAWKTQKWQVPITPHSQLTPRLCLGRGMQLTSPLFYLVVPGGLA	386347	387830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_386300_387800
837117	contig_10235_pilon	-	715	2	Intergenic	novelGene_46369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	37	junction_1	0	414	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTGATCTATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152632	149941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_150567_152542
837118	SIRV6	+	208	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	385	2	-215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGTGGACGCCGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	1735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640
837119	contig_4125_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_25168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929850	930958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_929800_931000
837120	contig_11883_pilon	-	1145	4	Intergenic	novelGene_163771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.3397624273	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATGTTGGAATCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147930	62162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_63003_67301_67356_140649_140790_147819
837121	contig_5779_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_106511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTATTATTCATAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241508	239771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_239800_241500
837122	contig_5482_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_144514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCCAAGCCAAAGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734753	733552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_733600_734800
837123	contig_13112_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_98830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGTACCAAATGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260413	261025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_260400_261000
837124	contig_16882_pilon	-	1036	2	Intergenic	novelGene_148238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	706	1035	435293	434964	FALSE	65	GAATAGAAAATATAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANGTNQSMTEKSPPAEVGMESIIDQVTQEEQGQLLFHEETIDLGGDEFGSEENETVSEDSNNFIDKLNEQMMESVLISDSPNNSEDDVGELGCLQDVVEPVESEVDN	443454	434962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_435300_442755
837125	contig_6674_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_148019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAACCAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241919	242766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_241900_242800
837128	contig_8248_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_125014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTCCAAATCCAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54309	53191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_53200_54300
837129	contig_3956_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_14737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTATGGTGGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470701	469879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_469900_470700
837132	contig_13153_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_107278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15841	17067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13153_pilon_+_15800_17100
837133	contig_11493_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_143681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCACCCGGTCACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176827	176477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_176500_176800
837135	contig_10159_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_30803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATGTTAGAAGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374338	373719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_373700_374300
837136	contig_8289_pilon	+	1677	5	Intergenic	novelGene_171165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_1	261.863991415391	14	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	156	1043	137586	182930	FALSE	65	GTTTAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGQLWLLYLSAGLLSRLGAAFNLDTREENVIQKLGEPGSLFGFSLAMHWQLQPEDKRLLLVGAPKAKALPLQRANRTGGLYSCDITSQGPCTRIEFDNNADPSLESKEDQWMGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMDGGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNSFFDMNIFEDGPYEVGGESNHDESLVPVPANSYLGRSERCVILPSQGPQEPGLLRSRTSWSQGSLAAFAGI	137430	183564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_137768_175619_175745_177783_177864_179839_180096_182685
837139	contig_13905_pilon	+	1227	4	Intergenic	novelGene_130431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.589562023308	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	485	796	228815	229126	FALSE	30	GATTCAATGACTTTTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRHSSTSKTSVSNHVYLWPPRMSLYLVFCDCPAAEIISLILTLWSLYYEINRRFECAFSNYVHPPLAIPTTPHLENQHSEPVFSTLTTHRSHWKCSIILFRV	223109	229557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_223177_226255_226376_228438_228574_228652
837141	contig_3942_pilon	-	791	8	Intergenic	novelGene_128812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.044684556338	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	25	777	1060159	1050140	FALSE	20	CCCCAGGGCACCCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAWCSNCCFRAVGLRGAVCASHQCPPLTSRPDPGSLVPAPPSLINKWT	1060183	1050125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050283_1052823_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
837142	contig_12277_pilon	-	1120	6	Intergenic	novelGene_139670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.4173830931541	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	534	974	84655	70289	FALSE	15	ACCATGGCTCTGGCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRYFCDYCDRSFQDSLHNRKKHLNGLQHLKAKKVWYDMFRDAATILVDEQNKRPCWKFLLIGQCDFGSKCRFSHMSGRDLQELSLQVEEERRAKEWPVDAVELPEVRLEDWLEKRAPWLCLALTQSAFLLVTTKTRTGEAPQSL	99256	70142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_70378_76333_76415_78338_78420_79707_79771_84528_84684_98751
837143	contig_9011_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_159333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTGTTCACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633335	633029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_633000_633300
837144	contig_9121_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_134423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24238	25648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_24200_25600
837145	contig_7340_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_159897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138022	140125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_138000_140100
837146	contig_13697_pilon	+	722	5	Intergenic	novelGene_165930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.3052556957184	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254408	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_254555_254726_254811_257483_257583_258050_258191_259883
837147	contig_14133_pilon	-	553	5	Intergenic	novelGene_119961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1975.12827115102	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	353	526	207422	206601	FALSE	25	CAGTGAAGCCTTTTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWHDPEAPLPQGLAAALAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209103	206573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208238_208389_208585_208696_209053
837148	contig_9437_pilon	+	1499	10	Intergenic	novelGene_141707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	95.0486555064313	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	70	747	76431	153767	TRUE	30	GTGATAGAAGCAGAGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGDSAAAAAPLQDAELALAGINMLLNNGFRESDQLFKQYRNHSPLMSFGASFVSFLNAMMTFEEEKMQLACDDLKTTEKLCESEEAGVIETIKNKIKKNVDVRKSAPSMIDRLQRQIIIADCQVYLAVLSFVKQELSAYIKGGWILRKAWKIYNKCYLDINALQELYQKKLTEEPLTSDAANDNHIVAEGVSEESLNRLKGAVSFGYGLFHLCISMVPPNLLKIINLLGFPGDRLQGLSSLMYASEN	76361	186804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_76484_130484_130534_140918_141048_142526_142642_151570_151898_153762_153932_175815_175910_179162_179271_184931_185042_186528
837150	contig_7521_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_160549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACGAGGCATCAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302970	302311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_302300_303000
837151	contig_2414_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_158505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1148	1519	430287	429916	NA	10	TTGTTTGTTGGATTTTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIHNTRIYINKVISFHSRKQLLFRQVQIVQIYRLVRVMCGKCVKLFFMLLIHYSHFLGFTHTSSSVRFKQHISENGSHNFKLIITSSREDDGLNFWGTVEPAQLKTVLRSCFLVSVSINNFN	431434	429762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_429800_431400
837152	contig_5467_pilon	-	545	4	Intergenic	novelGene_111955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	427.88653740085	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	46	465	89258	88200	FALSE	15	GTAACTGTCTCTTGCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCASAAVDTAAAAAAMQLTVKALQGRECTLQVSEDEMVSSLKLLVSEQLNVPVRQQRLLFKGKALADGKRLSDYSIGPNSKLNLVVKPLEKVLLEQGTARRQAETQSRPLAPPSETWQEYERSLSRLTMDDIERLASRFLNPEVIEATEKGLSK	89303	88119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_88311_88489_88645_88878_88985_89210
837153	contig_19378_pilon	-	1101	3	Intergenic	novelGene_73769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAAGGTGGGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15712	14374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_15034_15118_15204_15355
837156	contig_5400_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_162820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAGAAAAAAAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257862	258869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_257900_258900
837157	contig_14984_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_174160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTCATTTGGAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92771	92340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_-_92300_92800
837158	SIRV6	+	274	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	86	2900	86	-2873	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGAATGGTGGCATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2602	7915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
837160	contig_2550_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_135673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCTTTTGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258455	1258933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1258500_1258900
837161	contig_7057_pilon	+	839	2	Intergenic	novelGene_123195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	460	780	416065	416614	FALSE	0	GCTTGTCGTGTGTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWGRKARVFARLLVAGPIQLWQFLLELLRDGARSSCIRWTGNSREFQLCDPKEVARLWGERKRKPGMNYEKLSRGLRYYYRRDIVLKSGGRKYTYRFGSRVPGLA	415605	416673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_416227_416455
837162	contig_2219_pilon	+	668	2	Intergenic	novelGene_67212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	0	365	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTACAGGGCTACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384821	385674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_385247_385431
837166	contig_15897_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_49534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	574	972	577622	577224	NA	75	TATAATAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMISEFCMAIATNYRTQQRSKECRGEESGQLVSGLMKRLDSGVMSDLRLIGLSLGLILMVILIIPSPKFRQVLTLLPPYFTSQLCLPAKINYFKAYHKNLFTVTLLLPHLWYHSNISYIIFICSSFIIVLY	578195	576095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_576100_578200
837167	contig_20641_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_52772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTTCTTAGTGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_1500_1800
837168	contig_8900_pilon	-	2070	2	Intergenic	novelGene_171620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCTTGGAAAATGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208532	206356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_206752_206857
837169	contig_16643_pilon	+	722	3	Intergenic	novelGene_158140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	95	544	306589	318119	FALSE	15	GAGCAACTGCCTTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVREAGSGERILFVFHKNGRLSCKAKVQPPRLNGAKTGVFSTRSPHRPNAIGLTLAKLEKVEDVGQTAFKYFQSAEEAKHAIEAVLSADPRSVYRRKLCQDRLFYFTVDIAHVTCWFGDGFAEVLRIQHASEPVQMTDPAESLVSLGS	306494	318297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306621_314690_314849_317859
837170	contig_8045_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_35476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGATAAAAATGTAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599918	598833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_598800_599900
837171	contig_18420_pilon	+	1295	2	Intergenic	novelGene_109376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	422	751	118186	119878	FALSE	45	AAGAGATATATTGTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAAGSLETQDTQKAYLSCALPDTCLCTSSSSQRDCNLGLHLELTEPHSPLAYSCSSGEGINPADSLEEPSTRPCHQLLSSLLMIWTMSPVTNFSPASLQGIRLSFLGS	117764	120422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_118344_119706
837172	contig_5586_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_143500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCACCTGCCACCCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198983	198478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_198500_199000
837173	contig_3975_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_54909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTACTGATCCCATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142345	2142003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2142000_2142300
837174	contig_5727_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_7968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179595	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_179600_180100
837176	contig_15066_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_149560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	60.1112302319625	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	580	1179	115927	117881	FALSE	10	GAGTCTGAGGTTCCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPFALQNTITSGIVSSAQRPARDLGLPQTNVEYIQTDAAIDFGNSGGPLVNLDGEVIGVNTMKVTAGISFAIPSDRLREFLRRGEKKNSLFGVSGSRRRYIGVMMLTLTPSILAELQLREPSFPDVQHGVLIHKVILGSPAHRAGLRPGDVILAIGEQLVQSAEDVYEAVRTQSQLAVRIRRGPETLTLYVTPEVTE	115347	117893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_116056_116270_116304_116524_116631_116789_116860_117518_117615_117715
837177	contig_500_pilon	-	516	4	Intergenic	novelGene_31113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	298.06636099291	18	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCGTGGTGTCTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566549	1559331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1559492_1560220_1560338_1562150_1562367_1566526
837179	scaffold_12124_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_22167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAACCGAAGCTTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037544	1038572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1037500_1038600
837180	contig_11574_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_64054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGGTATTGGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442486	442824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_442500_442800
837181	contig_13004_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_112719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGCTGCTAACCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883096	882139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_882100_883100
837188	contig_12836_pilon	-	1172	6	Intergenic	novelGene_170414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_3	16.9587735405601	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	122	1171	89237	44631	FALSE	45	AGGTAGACTAAAATGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEGLKKSIHNLGTILTTNAVASETVATGEGLRQTIIGQPMSVTITTKDKDGELCKTGNAYITAELSTPDGSVADGEILDNKNGTYEFLYTVQKEGDFTLSLRLYDQHIRGSPFKLKVIRSADVSPTTEGVKRRVKSPGSGHVKQKAVKRPASMYSTGKRKENPIEDDLIFRVGTKGRNKGEFTNLQGVAASASGKILIADSNNQCVQIFSNDGQFKSRFGIRGRSPGQLQRPTGVAVHPSGDIIIADYDNKWVSIFSSDGKFKTKIGSGKLMGPKGVSVDRNGHIIVVDNKACCVFIFQPNGKIVTRFGSRGNGDRQFAGPHFAAVNSNNEIIVTDFHNHSVKVFNQEGEFILKFGSNGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRI	89358	44629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_44769_48605_48677_49778_49948_71223_71392_71642_71747_88837
837189	contig_1239_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_150421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAACCTCCGGCAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682155	684350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_682200_684400
837190	contig_10331_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_54169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531651	533047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_531700_533000
837191	contig_16706_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_177237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTAACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30394	29090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16706_pilon_-_29100_30400
837193	contig_11056_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_130381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGGACCAACGGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365444	364848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_364800_365400
837196	contig_9501_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_164281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACGATACAGCCTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422762	421780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9501_pilon_-_421800_422800
837197	contig_14744_pilon	+	1864	15	Intergenic	novelGene_65962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	65.2130339419841	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	180	1838	672386	687195	FALSE	35	TGTGCACATAGGGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGRWLMVETVFGAGPGDPSAEAPVCPLLPTAGVNKTPTVDCRDVCGLNISDRCDFIRTNPDCRNNGGYLNYLEGIFCLFPHSLLPLAITLYAIWLLYLFLILGVTAANFFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPRTAGLAFGALFGAGVLVTTVVAGGIAILRPFTAASRPFLRDIIFYMVAVFLTFTALYFGRVTLAWALGYLGLYVFYVITVVLCTWIYRWQQRKSLVYSMPGTPELLSDAEDERVSSNTNSYDYGDEYRPLIPYQETTAQILARALNPLDYRKWRNKSIYWRALKVFKLPVEFVLLLTVPVVDPDKDDHNWKRPLNCLHLVTSPLFCVLTLQSGAYGLYEIGNLLPVWAVVVIAGTGLATVTFFATSNYEIPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILQSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFLDLTLARQGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLHISRGHVEVKVSGQTLLEGALLQCYLLILFWPSGLGDHSDLCNLHFLEKRTCPH	670366	687221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_670474_672313_672509_676648_676802_676890_676944_677450_677509_677640_677747_677830_677999_679115_679224_680114_680175_680454_680586_681605_681748_682728_682851_684300_684455_685277_685359_686995
837198	contig_5899_pilon	-	474	4	Intergenic	novelGene_146954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	541.768913426708	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	109	474	53004	12694	FALSE	20	TGAGTCTGATGTCTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEIDHWNNEKEKIVLITDKTLFICKYDFIMLSCVQLQRIPLHAICRICLGKFSFPGMSLEK	84482	12693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_43099_43192_52908_53037_84406
837199	contig_14023_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_165355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATTCAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67568	68982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_67600_69000
837201	contig_17127_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_168296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGCCTCTTCTTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32052	32451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_32100_32500
837202	contig_3832_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_161446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293333	294073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_293300_294100
837203	contig_13894_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_62083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478205	478867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_478200_478900
837204	contig_4496_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_66716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1339431	1337944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_1337900_1339400
837206	contig_11505_pilon	-	1093	6	Intergenic	novelGene_140923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	137.786211211427	133	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	190	846	198190	81396	FALSE	80	AAAGAAAGGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPFLPLMFLNPSWYRWINNRLVATWLTLPVALLETVFGVKVIITGDAFIPGERSVIIMNHRTRMDWMFLWNCLMRYSYLRLEKICLKASLKSVPGFGWAMQAAAYIFIHRKWKDDKSHFEDMINYFCHIREPLQLLIFPEGTDLTENSKARSNDFAEQNGLQKYEYVLHPRTTGFTFVVDRLREGISDILEHIHLLGIAGNNVSNNMDICWNTSFC	345827	81148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_81494_102473_102591_107828_107976_150340_150540_198094_198265_345712
837207	contig_5428_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_160401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTTTACCTACTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32879	31519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_31500_32900
837208	contig_12270_pilon	+	306	2	Intergenic	novelGene_114087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATGCTGATCAGCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13898	14427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
837209	contig_20894_pilon	+	1799	3	Intergenic	novelGene_177238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1	74	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCACATAAGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420	5474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20894_pilon_+_574_2997_3102_3932
837210	contig_11702_pilon	+	511	5	Intergenic	novelGene_141995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1081	junction_3	140.78707327024	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	110	442	383406	384186	FALSE	35	CGAGTAGTCAGGACACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEIFLTCKNRVQNMALYADVSGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDVSIIPPLFTVSVDHRGTWSGPWVSTEVLAAVVGLVIYYLAFSAKSHIQA	382670	384255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_382777_383402_383478_383590_383681_383828_383895_384081
837218	contig_14925_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_55242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGGAAAAAAATATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73141	72626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_72600_73100
837219	contig_10040_pilon	-	618	2	Intergenic	novelGene_176491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	0	411	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	8	346	89981	88813	FALSE	40	GAAAATGGGATAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMGAFMSQPLDRGEVVAPPEVTAPAKLAPLSASEAPASPARGQRFNSCWSCRVLSGSGLIGAGLYVCSAARRRMKLGYTPNPGSATQMVVGVSIAAWGLIILADPKRKAYRTD	89988	88540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10040_pilon_-_88878_89707
837220	contig_6062_pilon	-	1394	3	Intergenic	novelGene_5262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGATCCCGCCCGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688325	652608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_652698_661999_662941_687961
837221	contig_19098_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_65871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGAAGAGAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499018	497764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_497800_499000
837222	contig_12884_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_105006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCGTAAGCTCAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919984	920238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_920000_920200
837224	contig_6424_pilon	-	879	6	Intergenic	novelGene_109251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	452.377983549156	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	412	735	7848	5841	FALSE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSSDPRQSAVPTRLLTHQMRPTTPLQAQRARVRWPTGTEARPAPADPTGAVSPSSDQTMPEPGRIRYLWASDAPCPLLTPYLSGLSAEALIALGQAQPRGIAAWE	21097	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_5995_6258_6423_7842_8039_9178_9280_12062_12098_21012
837225	contig_14923_pilon	+	936	6	Intergenic	novelGene_157766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	229	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGAAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541683	592957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_541958_544856_545018_547843_547946_581685_581795_591067_591204_592803
837226	scaffold_17542_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_139222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2	403	290557	290156	NA	35	CAATAGTTTAAACTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPIEEVKRKRKTRKSEEKKQSILLSIQLPIPRIILSVSSPHSSASVPPHSVTLPPEASWSLSALLQKSLPFPPAARKHPFPSQLFSLTPHFQPAFQHRRVLFHLSQQHSFTAVSPVPRIKTLCILRKLFFVH	290558	288847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_288800_290600
837227	contig_12540_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_148077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTGATTTTATCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918289	917716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_917700_918300
837229	contig_9181_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_177104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTAGGTGTCACTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687491	689097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_+_687500_689100
837230	contig_12485_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_147292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTACCAATAGGGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336689	337999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_336700_338000
837233	contig_11590_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_125577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTTTTTCCAGCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420586	419179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_419200_420600
837235	contig_2010_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_176270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	376	1149	186491	185718	NA	10	TACATTCCTTGTTCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIIRKVVESAEHWLDKAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQVGHQVLEAYARYHRPEFEAFFNKTFVLGLLQQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIISCPSVLDLFGLLQVEMLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQCVSTQEKELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPSTLLPSLQEVFASISSTGKVVVFQVNISWKLSIVSFTYIPAMIAFLP	186866	185150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_-_185200_186900
837236	contig_19941_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_139764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86783	85690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_85700_86800
837238	contig_9852_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_138478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCACTAATATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355897	356506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_355900_356500
837239	contig_1594_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_138832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCCTGCCCCCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612972	614075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_613000_614100
837240	contig_7357_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_36848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACCAGAGTGAAGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164217	165648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_164200_165600
837241	contig_6958_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_69907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGGATCAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19928	19510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_19500_19900
837242	contig_11677_pilon	-	291	3	Intergenic	novelGene_85930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	7750.5	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595877	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714
837243	contig_10765_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_122915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATCTCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166909	165621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_165600_166900
837244	contig_2332_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_58706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	757757	757440	NA	40	GAAGTATGAAACTGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKYVSHNFCQFNFLENVILNKHLTLFTLDILATVPGKTHKFPNQKIVVLKRKWVKAFFFLGSCHFSLYSCSVLSLPLLYPNSFLTCLNSKIHFKSHLLLVAFPKH	757758	756202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_756200_757800
837245	contig_11615_pilon	+	1023	3	Intergenic	novelGene_151251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_2	34.5	160	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAGTTGCTTCAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32970	36648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_33562_33986_34086_36315
837246	contig_1154_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_87068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGGTAGGGTGGGTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191258	190673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_190700_191300
837248	contig_14441_pilon	+	614	4	Intergenic	novelGene_100723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	58	438	116720	117610	FALSE	10	TTGGCGCTGCCTACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARWPSAGYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116662	117786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116743_116792_116957_117220_117344_117539
837250	contig_12951_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_68252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	176	736	848366	847806	NA	15	TCCTGCACAGGGTTCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPWVSPSRLCCPVLAGFIFLGGQPLLMAEMALWPGPASDRFNHLCEEIGALYVMAPARFLGESLPGFGWATRPIQGQTTVTRGKERDWPASVGVNFWPEKQSGEQGSPVRELPLGREGRWDLGRRDANLEHRGSLPRNWPPPNLSRMVQECLLEEAAQQKQVLETLSVLDFEKVCKATSIDESK	848541	847114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_847100_848500
837251	contig_7635_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_171377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165711	164136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_164100_165700
837255	contig_8900_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_171617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGCCTGGCTGTCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202457	201759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_201800_202500
837256	SIRV1	-	457	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3898	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACATTGTTCCGACTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6468	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1362_6337
837257	contig_612_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_155626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144585	145137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_144600_145100
837258	contig_2770_pilon	-	1053	4	Intergenic	novelGene_107504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAGGGAAAATAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846795	831485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_831709_834920_835070_845071_845521_846563
837259	contig_1288_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_147914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117484	118176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_117500_118200
837260	contig_7272_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_25304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTCCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415418	416757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_415400_416800
837261	contig_3132_pilon	+	793	6	Intergenic	novelGene_127455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	37.7962961148311	154	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	16	564	378817	418495	FALSE	50	AATTGAAATAGTATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGGRMGLLSILRKLKSAPDQEVRILLLGLDNAGKTTLLKQLASEDISHITPTQGFNIKSVQSQGFKLNVWDIGGQRKIRPYWRNYFENTDILIYVIDSADRKRFEETGQELAELLEEEKLSCVPVLVFANKQDLLTAAPASEIAEGLNLHTIRDRVWQIQSCSALTGEGVQDGMNWVCKNVNAKKK	378801	418724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_378820_388406_388551_392135_392253_406104_406156_409852_410039_418447
837262	contig_15471_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_175220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACAACCATTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292877	291497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_291500_292900
837263	contig_9363_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_6663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	110	526	1013803	1014219	NA	25	GTGGACAGAATTTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGNLLLLQLSDFTLQLDNSLPNCPDLGRVTARAKGDMGVLQDRTALHVLQPCPLANLGRDPSPLPSGRTRRPGSPAGPGPAAQPARSAPCLHRPSCHLPARAGVIGTTFLLLLSPHETYWLPGLSFLAISHPSLPRGPDPPSLPAPNPAVPTSHLPQLVGPVPHGGPSSLSPRA	1013693	1015459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1013700_1015500
837265	contig_414_pilon	-	1283	2	Intergenic	novelGene_115109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	150	1163	374079	373066	FALSE	15	CTTCAGTGCTGCTTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSWMLWNFVERWLIALASWSWALCRISLLPLIVTFHLYGGIILLLLIFVSIAGILYKFQDVLLYFPEQPSSSRLYVPMPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	376657	372945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374115_376543
837268	SIRV6	+	377	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
837271	contig_10011_pilon	-	1581	2	Intergenic	novelGene_68068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	281	952	242740	241091	FALSE	40	TCAGGAAAAGGATGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKMEITLSLQPHSPDSPKQERHIIAKLEERQEPALHNNRRDPELSRQRFRQLCYQELSGPKEALCRLGQLCREWLQPELHTKEQILELLVLEQFLTILPPEIQTWVRKRCPVNSKEIVNLVEEFHRASKRPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGAQLGEQELPDFLEESSQAEPQDQLSHHHGEKYHLLQEPTLKLAGTGKHSVPLPSFLSAFVSIKASHGPQKA	243020	240461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_241355_242332
837274	contig_12623_pilon	-	1177	8	Intergenic	novelGene_138167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	177.046978661205	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	11	1132	177710	51811	FALSE	55	TAATAAGAATAAAGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGSPTPPLPSVMSPSRVAASRLAQQGSDLIVPAGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	177720	51765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_141648_141745_147430_147540_177617
837277	contig_10002_pilon	+	1065	2	Intergenic	novelGene_157652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGGAGGCACGAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298836	307517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_299002_306617
837278	contig_12837_pilon	+	666	3	Intergenic	novelGene_57279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCGCGCCTGCGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48822	60632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_49189_51014_51230_60547
837280	contig_10331_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_54176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGTCCCTCTTACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569489	568993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_569000_569500
837281	contig_11258_pilon	+	1262	10	Intergenic	novelGene_67758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	18.684515276322	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1134	129	1262	147240	173804	FALSE	45	AAGAGTAAGATTGACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDSGDSKDQQLMVALRIRPISVAELEEGATLIAHKVDKQMVILMDPMEDPDDILRAHRSREKSYLFDVAFDFTATQEMLYQATTKSLIEGVISGYNATVFAYGPTGCGKTYTMLGTDHEPGIYVRTLNDLFRAIEETSNDMEYEVSMSYLEIYNEMIRDLLNPALGYLELREDSKGVIQVAGITEVSTINAKEIMQLLMKGNRQRTQEPTAANQTSSRSHAVLQVAVRQRSRIKDILQEVRQGRLFMIDLAGSERASQTQNRGQRMKEGAHINRSLLALGNCINALSDQGSNKYINYRDSKLTRLLKDSLGGNSRTVMIAHISPASSAFEESRNTLTYAGRAKNIKTRVKQNLLNVSYHIAQYTSIIADLRGEIQRL	147111	173804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_147279_148901_148983_161457_161569_162094_162183_162449_162587_166702_166829_167216_167412_169341_169489_171476_171600_173717
837282	contig_11816_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_98481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCACACTGCACGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468154	467174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_467200_468200
837284	contig_498_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_148561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGGGCCCAGGCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773317	773865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_773300_773900
837287	contig_9370_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_177239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGAAATGTTTGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15950	17387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_+_16000_17400
837288	contig_10948_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_124980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174586	173322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_173300_174600
837289	contig_116_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_154887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTGAAGCCAGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48241	47030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_47000_48200
837290	contig_116_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_154886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGTGAAAAACACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46831	46430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_46400_46800
837291	SIRV5	+	294	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	36	875	36	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
837292	contig_6975_pilon	-	859	2	Intergenic	novelGene_74244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAATGAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43919	42977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_43253_43335
837293	contig_10968_pilon	-	906	7	Intergenic	novelGene_84304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	13.4866188827626	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	27	815	183325	181387	FALSE	20	ACATTATCTCCCGAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPPPARAMTQPVPRFSVPTALALGSAALGAAFATGLFLGRRYPPWQSRPEKRLLPPEDSPLWQYLLSRSMREHPALRNLRLLTLEQPQGDSMMTCEQAQLLANLARLIKAKKALDLGTFTGYSALALALALPPAGRVVTCEVDPGPPELGRPLWRQAEEEHKIDLQLQPALETLNELLAAGEAGTFDVAVVDADKENCAAYYERCLQLLRPGGVLAIPSVLWHGEVLRPQQRDMVAQCVRNLNERILRDARVHISLLPLGDGLTLAFKI	183351	181295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_181540_181758_181893_182219_182275_182350_182470_182559_182666_182915_183044_183231
837294	contig_1694_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_144964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGGAATAATGAGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555527	1557373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1555500_1557400
837296	contig_11396_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_71295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363655	364850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_363700_364800
837297	contig_7342_pilon	+	1590	15	Intergenic	novelGene_71154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	97.3050117215061	1	74	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	135	1382	381744	420979	FALSE	10	GCCTTACTGGGGCTAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLPLLRLSLCFRRIKDTSPLQSKKICRIRERSLGGRLRPPHHGMGHPESAGEHALEPPAPASAPASAPPRPAPEAQLLPFPRELAGRSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSVSKNNVFMPSTFCESSAGNSDSEPEEKSSGFRLKPPTLIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKASSQTVPSTGTNGVSIPTDCTGPVTSTLPNNPARRSPSESADEARALEEKEPQKNESSSTSEEENCERKEQAAQQAFVFGQNLRDRVKLINENTDVADVENAGHPSSETPTATNYFLQYISSSLENSTNSADSSSNKFVFGQNMSARVLSPPKLNEVSSDANRENTAAESRSESSSQEATPEKESLAESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQIQCKLFVFDSLSPLPPPAEILAWGSPRATARRRHLSPEV	374953	421187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_375012_381667_381873_389060_389098_389178_389266_391607_391680_401006_401073_401988_402082_403298_403427_409403_409524_411476_411581_412888_412968_414068_414172_414733_414844_416559_416588_420887
837298	contig_4392_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_117290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGATAACAGGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65576	66417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_65600_66400
837299	contig_12733_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_129597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATTGGGTTGTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370505	371400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_370500_371400
837300	SIRV6	+	350	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	223	6	223	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2739	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
837301	contig_6397_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_146279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCTTTTAAAGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556892	555757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_555800_556900
837302	contig_11512_pilon	+	362	2	Intergenic	novelGene_43218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	4011	4569	FALSE	20	GCTTATAGTGCTGGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRQGSKMVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYA	3984	4569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
837303	contig_6589_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_25946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGACACATTGTGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255310	1254899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1254900_1255300
837304	contig_5399_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_176849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTACAATCCCCACAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307054	306156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5399_pilon_-_306200_307100
837307	contig_7308_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_159607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAATTCGATCTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516784	516302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_516300_516800
837310	contig_12935_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_165724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172549	171500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_171500_172500
837312	contig_20742_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_150656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105331	105800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_105300_105800
837314	contig_15327_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_70598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAACAGGAACCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896034	897744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_896000_897700
837317	contig_9363_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_6683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGGAATAAGATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266638	1268667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1266600_1268700
837318	contig_4364_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_2965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533307	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
837319	contig_15405_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_112099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGCTTGTATCAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71282	70586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_70600_71300
837320	contig_6445_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_77102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	159	461	1149344	1149042	NA	40	AGAAAATAAATTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYPSEFVQLINVNSGNSHPGDTAAALNLVRKVFKEEDRAVFPKNMVANPELCTCGYNPIWEYGFLCYVNEAIISVGCVLSQSLLRYNKSRLGTETSKHK	1149502	1148860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1148900_1149500
837321	contig_11335_pilon	-	786	2	Intergenic	novelGene_104927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGCAGTGAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411189	408049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_408746_411099
837322	contig_10581_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_41368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCGCACCAGCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408661	408204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_408200_408700
837323	contig_11259_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_144532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTCTTTCCATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133819	132422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_132400_133800
837325	SIRV6	-	261	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTACATGAGAGCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_1900_2100
837327	contig_10467_pilon	+	1247	7	Intergenic	novelGene_175405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	8.37987005998436	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	290	880	103122	120302	FALSE	20	CAACTGCTCCTTGGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPTGTDPRILSLAAEVAKSPEQNVPVILLKLKEIINSTSLGSSELKKIKQDIYCYDLIQYCLLVLSQDYSRIQGGWSTVSQLTQVLSHCCVGLEPGEDAEEFYSELLPSAAESFLILGRRLQTCFINAAKGEEKDELLHFFQIVTDSLFWLVGDHVQLIQNVLQSDHFLHLLQTDDVQIGSTVMTMLQNILHINR	87616	120669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_+_87804_88200_88291_103109_103222_103449_103613_107379_107510_115016_115111_120198
837330	contig_9839_pilon	+	921	5	Intergenic	novelGene_88587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	101.786541350023	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	304	693	335852	336288	FALSE	20	TAACTTCTCACTGGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLARASAPLLRVPLSGSWAASPASAGLKTLLPVPTYEDVSIPEKPKLRFVERAPLVPKVKRERKNLSDIRGPSTEATEFTEGNFAILALGGGYLHWGHFEMMRLTINRSMDPKNMFAIWRVPAPFKPITRKGVGQRMGGGKGAIDHYVTPVKAGRLIVEMGGRCEFKEVQGFLNQVARRLPFAAKAVSRETLEKMQKDQEERERNNQNPWTFERIATANMLGIRKVLHA	331375	336516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331425_331783_331850_334831_334981_335812_336227_336273
837331	contig_9990_pilon	+	474	5	Intergenic	novelGene_177246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_4	199.556383009915	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	11	472	51425	82521	FALSE	35	GTAAGTTACTGATACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVSELGTVFASFLICQVLFHFVSSWFSAKVSCFNDLSLEKKIDWNSRVVSTCHSLVVGVFSLYIFFFDEAAIADPLWGDSLLGNVNIAITTGYLISDLLLLILYWRAIGDIVYAVHHCTVLYACCLVLKEGILAYIGNFRLIAELSTPFVNQ	51414	82523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9990_pilon_+_51571_66132_66223_71071_71131_74149_74245_82449
837332	contig_10437_pilon	+	1666	1	Intergenic	novelGene_38161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGGTCCCTCCTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160242	161908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_160200_161900
837333	contig_20398_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_155206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	214	546	163233	162901	NA	70	CCAGAGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHRRTEFQAFYSMTRDGLQSSVTLLISCALILSNIIIFYIYCTKKTGLREVKGFSPCHTVSGKVRGNTVPTSKVGLSPHQCSVFDGLPLLHLRRHHLFSTTPSGVALVA	163446	162616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_162600_163400
837334	contig_17382_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_165191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTGTAACAGCACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61147	59101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_-_59100_61100
837335	contig_16632_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_154146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191701	191259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_191300_191700
837336	contig_15689_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_164152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCAAGGCTGTGAATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41833	39974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_40000_41800
837337	contig_10500_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_41194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAAATGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385795	1383613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1383600_1385800
837338	contig_4388_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_161963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAGACAAAGTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559640	560821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_559600_560800
837339	contig_13258_pilon	+	1060	4	Intergenic	novelGene_146922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	62.0537401505072	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	167	634	30484	32609	FALSE	65	AAAAAAAAATCTCATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQPKRQPELVEGNLPVFVFPTELIFYADDQSTHKQVLTLYNPYEFALKFKVLCTTPNKYVVVDAAGAVKPQCCVDIVIRHRDVRSCHYGVIDKFRLQVSEQSQRKALGRKEVVATLLPSAKEQQKEEEEKRIKEHLTESLFFEQSCQPGSLGLF	15675	33035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_+_15741_30382_30638_30749_30826_32371
837341	contig_8284_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_125674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAATAAGAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256811	257508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_256800_257500
837342	contig_715_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_167547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAACCTGAGCACCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55486	55809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_55500_55800
837343	contig_10855_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_124291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATGAAGCTTGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212300	211274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_211300_212300
837344	contig_7411_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_137038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGACCCTGGGCTCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488186	486340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_486300_488200
837346	contig_10444_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_139452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659176	660550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_659200_660600
837347	contig_1337_pilon	-	2001	8	Intergenic	novelGene_84250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_5	42.6643281672076	30	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	132	1046	450056	439310	FALSE	90	AAAAAAGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKKRNTPHRGGSGGGGTGAAAATAVAAGSQHRNVQPFSDEDASIETMSHCSGYSDPSSFAEDGPEVLDEEGTQEDLEYKLKGLIDLTLDKSAKTRQAALEGIKNAMSSKMLYEFILERRMTLTDSIERCLKKGKSDEQCAAAALACVLCIQLGPGIESEEILKTLGPILKKIICDGTTSIQARQTCATCFGVCCFIATDDITELYSTLECLENIFTKSYLKEKDPNGICSTPTTVLHISSLLAWTLLLTICPINEVKKKLEMHLHKLPSLLSCDDVNMRIAAGISLALLFELARGMDNVSI	450187	438354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_439431_439518_439698_439779_439831_442539_442698_444397_444523_445308_445394_445524_445630_449965
837348	contig_1009_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_121757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGCTTGGAAGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272803	274847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_272800_274800
837349	contig_19640_pilon	+	1719	1	Intergenic	novelGene_134851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGTGAAAATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18112	19831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_18100_19800
837350	contig_8616_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_72606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453443	454245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_453400_454200
837351	contig_3212_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_174745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCCACCTCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62571	62162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3212_pilon_-_62200_62600
837353	contig_12312_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_64012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAATAAAAACCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531885	532282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_531900_532300
837354	contig_7659_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_177247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTCAAAAACACCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33430	32482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7659_pilon_-_32500_33400
837355	contig_12622_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_5833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	407	730	437541	437218	NA	20	TTTCATCATTATCCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFLYFWFCFGPSRVIFFVSLNESNYQLLKTRRVCIKIWISVFLENSKSLTTRLNWSEPPPLEGPFCPPYYHSFRIGIHLTPLAPAAGPTYPSGGPRLSEVIRRPC	437947	436773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_436800_437900
837356	contig_3818_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_99255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATGCACGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481485	479617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_479600_481500
837357	contig_9527_pilon	-	1128	8	Intergenic	novelGene_134095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGACAGCCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741409	728115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_728302_729008_729206_730747_730887_731904_732116_732352_732409_734187_734279_736153_736235_741242
837358	contig_1009_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_121721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	280	666	99747	100133	NA	30	ATTTTATGATGTTTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSAQLSTTERVIKGANRAGPSSLTRGKRLSAGRRLRGGRERRRCSRSPQREAGGPGLRPSLEEDLDGVWKRRRRGFPVGAALRGPRAFSVTPRPVAADGSFISCGFGFQVGWGFLLPKRTWNPSF	99467	100363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_99500_100400
837359	contig_5372_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_149714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGTACATTATGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166822	166066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_166100_166800
837360	contig_5372_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_149716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGGTACGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173999	173443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_173400_174000
837361	contig_14694_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_152484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248386	246826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_246800_248400
837363	contig_2550_pilon	-	1062	2	Intergenic	novelGene_135711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	52	441	1801470	1779815	FALSE	60	GTAAAAACAAATTAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKASVGKISVSSDSVSTLNSEDFVLVSRQGDETPSTNNGSDDEKTGLKIVGNGSEQQLQKELADVLMDPPMDEQPGDKELVERSHLDGEGDAPLSNQLSASSTVNPVPLVGLQKPEMSLPVKPGQGG	1801521	1779193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1780055_1801320
837364	contig_7810_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_144221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGATACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372613	372267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_372300_372600
837366	contig_11709_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_168236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTAAAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614325	613484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_613500_614300
837367	contig_12733_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_129596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGATCAAAAAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346536	347572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_346500_347600
837368	contig_16757_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_175583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACATGAATCATATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134321	132784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16757_pilon_-_132800_134300
837369	contig_2888_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_151495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273866	272321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_272300_273900
837370	contig_9931_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_134848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGATCTTTCCCCCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463509	461548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_461500_463500
837371	contig_7909_pilon	+	1596	9	Intergenic	novelGene_155950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	1.65359456941537	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	345	1013	1250454	1259931	FALSE	10	CCTACAGTCTCTTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSRKYPPHLVEVEAIQHKTTQIFHKVYFPDDTDEAFEVESSTKAKDFCQNIATRLLLKTSEGFSLFVKIADKVISVPENDFFFDFVRHLTDWIKKARPVKDGIVPSLTYQVFFMKKLWTTTVPGKDPMADSIFHYYQELPKYLRGYHKCTREEVLQLGALIYRVKFEEDKSYFPSIPKLLRELVPQDLIRQISPDDWKRSIVAYFNKHAGKSKEEAKLAFLKLIFKWPTFGSAFFEVKQTTEPNFPEILLIAINKYGVSLIDPRTKDILTTHPFTKISNWSSGNTYFHITIGNLVRGSKLLCETSLGYKMDDLLTSYISQMLTAMSKQRGSRTSK	1247728	1260514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_1247836_1249003_1249118_1250156_1250245_1250418_1250526_1252043_1252230_1252713_1252831_1258042_1258127_1259085_1259206_1259841
837372	contig_10658_pilon	+	1894	2	Intergenic	novelGene_130080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229040	231030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_229572_229667
837373	contig_5018_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_46993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	566	883	652658	652341	NA	55	AGAAAAGGTGTAAACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFENHCFGGSLTHFSRWQPAFKKRENLTVRVVFHDTCVSVVLQSVTQLQCKIFLTESHGQNKFESPCSRRIIIAWNFPQQQQIFHPSPQPEIRHQAQSLSSRSHP	653223	652273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_652300_653200
837374	contig_4421_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_177249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	255	752	51586	54997	FALSE	45	CAAAAGAGAACTATGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTTGPPAISTTTTVEIRKSSVTTTEITSKVEKSPTTATGNSSCPSTETEEEKAKRLLYCSLCKVAVNSASQLEAHNSGTKHKTMLEARNGSGTIKAFPRAGVKGKGPVNKGNTGLQNKTFHCEICDVHVNSETQLKQHISSRRHKDRAAGKPPKPKYSPYNKLQKGAHPLGVKLVFSKEPSKPLAPRILPNPLAAAAAAAAVAVNSPFSLRTAPAATLFQTSALPPALLRPAPGPIRTAHTPVLFAPY	29478	55053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4421_pilon_+_29716_51568_51748_52805_52908_54763
837376	contig_13112_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_98829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGTATATGAAATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255712	256113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_255700_256100
837378	contig_6445_pilon	+	1853	2	Intergenic	novelGene_77096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACTCATTCATTCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095868	1098762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1095936_1096976
837379	contig_12619_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_73559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTTGCTTCCCTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743982	744495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_744000_744500
837383	contig_15076_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_177255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTATATATATGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123888	124568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15076_pilon_+_123900_124600
837384	SIRV5	+	470	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	6	76	-5	-76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTGGCGGCGTTTCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
837386	contig_7744_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_62477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGAAACCCTAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487620	487045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_487000_487600
837390	contig_11338_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_6326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAAACATTTCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260206	259455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_259500_260200
837391	contig_17440_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_7651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	3995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3600_4000
837392	contig_9527_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_134039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCCATGAACTAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287341	286172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_286200_287300
837393	contig_18364_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_102558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTCCAAAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97802	98873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_97800_98900
837394	contig_9706_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_20810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATCCCCTAATCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2100
837395	contig_16846_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_82883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATAAAGAAGAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246499	247045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_246500_247000
837396	contig_4982_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_172235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTCTCCTCTGTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56712	55454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_55500_56700
837397	contig_4071_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_151867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37712	38376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_37700_38400
837401	contig_14895_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_106701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCTTTGAAAGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267012	268074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_267000_268100
837402	contig_4923_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_109324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCAGGGAGCAGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117253	115799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_115800_117300
837403	contig_177_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_41779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAGGGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318353	317438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_317400_318400
837404	contig_5686_pilon	+	682	4	Intergenic	novelGene_45355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	1928.26179642588	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	236	601	170242	172616	FALSE	70	TCCCTAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLVGTIPSLGC	129783	172697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_129993_170215_170343_171643_171800_172507
837406	contig_11110_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_177262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468229	469216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_+_468200_469200
837407	contig_11924_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_128026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGGTACAAAAGGCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55641	54786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_54800_55600
837408	contig_3948_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_53260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAAAAAACCTAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319101	1319821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1319100_1319800
837409	contig_3575_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_141119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	218	559	705263	705604	NA	25	GTAGATGGTCCCTAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTGNVGGLDPLLQCARCVIVFRTRHDVESTESGLHGLHGLGPLVATSSSLCLIHTELFNFFSGPHSVALPCLCANSSSNLRCPLLTPHPYYLPLKLRNLSGSLPSASLKLS	705045	706037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_705000_706000
837410	contig_3575_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_141120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATTAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706137	706884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_706100_706900
837412	contig_6048_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_73175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCCGGCTCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232828	1232269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1232300_1232800
837413	contig_3789_pilon	+	1864	12	Intergenic	novelGene_79827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	25.4409054363536	1	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1779	84	1862	223044	232673	FALSE	10	TCCTGTGGCTTGCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWNPKPLDVFLEELAENCVGYCGADIKSICAEAALCALRRRYPQIYTTSEKLQLNLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSAIVKPLLQSTVHKILEALQRVFPHAEIGTHKALDSGISCPLLESDLAYSDDDVPSVYENGLSQKSFNKTKENFNFLHLNRNACHQPMSFRPRILIVGEPGFGQGSHLAPAVIHALEKFTVYTLDIPVLFGVSATSPEETCAQMIREAKRTAPSIVYVPHIHLWWEIVGPTLKATFTTLLQNIPSFAPVLLLATSDKPHSALPEEVQELFIRGYGEIFNVQLPGEEERTKFFEDLILKQAAKPPISKKKAVLQALEVLPVAPPPEPRPLTVEEVKRLEEQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLSDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFERLCEEIQESRKKRGCSSSKYAPSYYHVMPKQNSAPAGDKRSDPEQNEKLKMSS	219414	232675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_219470_223015_223176_223913_224005_224830_225146_225495_225629_225979_226167_227021_227208_228612_228749_229576_229774_230367_230528_232303_232427_232554
837415	contig_2798_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_120000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAGAATAAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91984	91186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_91200_92000
837416	contig_8561_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_161641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCCCAGCAGTGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150921	148771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_148800_150900
837417	contig_854_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_36126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCTATGGGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321052	321728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_321100_321700
837420	contig_7887_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_124953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTAAAAAGGTAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873495	875647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_873500_875600
837422	contig_17198_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_62328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAGAAGAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438006	439241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_438000_439200
837423	contig_6631_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_174293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9946	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_9900_11300
837424	contig_16757_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_175581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	119546	119244	NA	30	GAGAAGAGAGTGGTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHLPWSENTFLEEIREQYKDSWYHKWVSKVGERIFGLKFEQSKRLHEEGSILAGSQRADSLGRQRSWGKWDILQGRINKENFCKVISARSVLIDTFFFFN	119546	117604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16757_pilon_-_117600_119500
837425	contig_14338_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_174832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	527	901	16428	16054	NA	45	AATAAAGATGGAGGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGAIFISAGSQTTVPKVRFLGPCLEFSFLHPVKSRACSLWLWMSMEGEVRSELHPVHPQFCPRCGAIPYMPSAAAAVEVPPEICLDKESCSLGHPPSFQVMGCQQQHVITEWNDASPPKTLVS	16954	15246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_15200_17000
837426	contig_8885_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_115591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.5	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	68	337	351242	351558	TRUE	15	TGCCTGACTGTAGGCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDPLAGLVLSDNDRSLLERWTRMAQPPAPAPPTVQPASPTPGPVAQQTGPPPQPAGSTPGPASQPACPCSSPVHHLQSPGPPAACATPRAAWPQCPESPALLPIWPTPSRP	351174	352684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_351375_351421_352109_352246
837427	contig_6842_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_130678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCAGAATAACAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345085	343418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_343400_345100
837428	contig_16846_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_82899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAAAACCATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421905	420952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_421000_421900
837430	contig_10404_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_138729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGTAAGGAATTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566884	1566102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1566100_1566900
837431	contig_5954_pilon	-	1004	2	Intergenic	novelGene_28752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	58	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	263	421	1321141	1320983	FALSE	15	GAGAGTTCGGTCTGGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPPSSPDSPTETFAAPAEVRHFTDGSFPPGFVLQLFSHTQLRASENKDSPIEGNVGEGGFSQLQSPSPAPPPGLRGTLDLQVIRVRMEEPPAVSLLQDWSKHPPGTKGVGAGDTRDWPAVLSESSTPVRGEPEAGSGV	1330483	1320399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1321195_1330274
837432	contig_5954_pilon	-	866	6	Intergenic	novelGene_28404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.521861300698	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	102	761	41040	16110	FALSE	10	CATCTGGCTCTGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGALFLVGPCPELPSPSQLQGPQGPPKHPLPRMAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVHSAQGNEFWSALLEKAYANEEGGLAAPPRSFFYIGDSKGTL	41676	16004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16180_38313_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_41576
837433	contig_7695_pilon	-	736	7	Intergenic	novelGene_41624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	60	734	687243	680317	FALSE	0	GTTGCTGGTGGCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREAEQSRLGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGCPLGCPPFLDSPLVSCQAFCKEKPLGERRKRTKIKSIHFHWPSGEPRVFAR	687302	680314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680471_681638_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
837434	scaffold_4805_pilon	+	1955	4	Intergenic	novelGene_161042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.816496580927726	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	901	1536	793100	797049	FALSE	80	AAAAAGGAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPLETDPGWSPGSGFIPKKSRGPGCTPLVSPSRMEGSAGPETRLESTGLIVLLLSLLPEDEQREKSVSHHTVQQLVVEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKKCAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAYQASLRKEQLRVDALERTLEQKNKEIEELTKICDELIAKMGKS	792199	797468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_793442_793691_793799_794524_794646_796983
837435	contig_14556_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_138536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACCCTGGTGGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184617	183159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_183200_184600
837437	contig_8182_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_173263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGAGTGTAGCCAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401213	399779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_399800_401200
837440	contig_11328_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_88430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATCTGTTCCTAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647252	646712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_646700_647300
837441	contig_17474_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_176650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGAAAATTTCTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15622	14867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17474_pilon_-_14900_15600
837444	contig_9919_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_138001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858374	859651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_858400_859700
837446	contig_6048_pilon	-	1343	11	Intergenic	novelGene_73329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47.2901681113527	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	22	1092	2733108	2589914	TRUE	25	AACAAGCTTCTCTGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKEDFLMMACPSPWLSEEDESLKGCELYVHKHSIQQVLKECIVHLCIAKPDRPMKFLREYFEKLEKEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGAPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYMEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGAPQVREAGPATL	2733129	2588107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2588247_2589801_2590009_2590685_2590768_2612162_2612285_2620452_2620514_2631321_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2732928
837447	contig_10554_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_166963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATGTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26861	27135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_+_26900_27100
837448	contig_6304_pilon	+	1372	4	Intergenic	novelGene_122243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	85.9702791020762	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	32	466	70293	128899	FALSE	65	AAAGAAGAAAAGAGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGKFFSSKTLTPELLSN	70261	129805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695
837449	contig_10296_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_168875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAGATTAGCTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190473	190108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_190100_190500
837450	contig_10196_pilon	-	1365	10	Intergenic	novelGene_132084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.1723824005672	41	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	68	835	897484	895834	TRUE	0	CCTCCTGCCTCCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVFRKGWLFASCAKDQSVRIWRMNKAGEVACVALGSGHTHSVGTVCCSRLKESFLVTGSQDCTVKVWPLPEGLLSRTTAPSGGPVLLQAQATQRCHDKDINSVAIAPNDKLLATGSQDRTAKLWALPQCQLLGVFSGHRRGLWSVQFSPMDQVLATASADGTIKLWALQDFSCLKTFEGHDASVLKVAFVSRGTQLLSRLRLGRALEALDHQEQRVCAHAGRPRGQGLGAALQSARPPRPHWWQRLPRHPLEGCDGGGAGRRAGQAGGAGGQAARTG	897651	895085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_895221_895298_895608_895747_895852_896068_896128_896195_896353_896437_896513_896579_896811_896897_897046_897404_897509_897608
837452	contig_10196_pilon	-	789	4	Intergenic	novelGene_132034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	574.137614165803	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	170	571	409216	404095	TRUE	35	AGGATGAATTAGACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLNDKISLYKSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK	409385	403824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_404038_404089_404300_404421_404606_409203
837453	contig_16775_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_107804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAACCATGAAGATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221590	222388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_221600_222400
837454	contig_14814_pilon	-	1379	12	Intergenic	novelGene_137748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.0201074974278	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	637	1203	406622	401490	TRUE	45	GAAAACGAAGGCAGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSAANPKSTPGNSEERPGKLHLKIQPSNTLRSSSALTYGVALLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTVVQTIARGVFGVMVAQSPFVPEEMVEEQRTRVGDSKLSEEEISENEMSWRETISRKKTALDKHHANDGISGDSERDSGGACEDPEPLLQFDYKAVADRLLEITNRKNIPPFNRKCLSKLIKK	419207	398412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_398442_399029_399159_401471_401592_402158_402251_404264_404447_405639_405705_406496_406695_406814_406945_407717_407780_408374_408451_411513_411597_418994
837455	contig_16870_pilon	+	2249	17	Intergenic	novelGene_155538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_2	58.8262470649794	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	369	2201	368019	395222	FALSE	30	TTCTGAAAGGAGTGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDTVNVRRSVRVKTKVPWMPPGKSSARHVGCKWENPPHCLEITPPSSEKLVSVMRLSDLSTEDDDSGHCKMNHYDKKIDSLMNAVGCLKSEVKMQKGERQMAKRFLEERKEELEEVAQELAETEHENTVLRHNIERIKEEKDFTMLQKKHLQQEKECLMSKLVEAEMDGAAAAKQVMALKDTIGKLKTEKQMTCTDINTLTRQKELLLQKLSTFEETNRTLRDLLREQHSKEDSERLMEQQGALLKRLAEADSEKARLLLLLQDKDKEVEELLQEIQCEKAQAKTASELSKSMESMRGHLQAQLRCKEAENSRLCMQIKNLERSGNQHKAEVEAIMEQLKELKQKGDRDKETLKKAIRAQKERAEKSEEYAEHLHVQLADKDLYVAEALSTLESWRSRYNQVVKDKGDLELEIIVLNDRVTDLVNQQQTLEEKMREDRDSLVERLHRQTAEYSAFKLENERLKASFAPMEDKLNQAHLEVQQLKASVKNYEGMIDNYKSQVMKTRLEADEVAAQLERCDKENKILKDEMNKEIEAARRQFQSQLADLQQLPDILKITEAKLAECQDQLQGYERKNIDLTAIISDLRSRVRDWQKGSHELARAGTRIPR	363535	395270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_363639_366640_366732_367563_367720_368000_368127_373398_373570_374562_374724_375607_375738_376276_376409_379903_379976_381128_381201_381324_381442_382288_382475_382992_383103_384936_385073_393643_393755_393929_394035_395000
837456	contig_5136_pilon	+	1358	3	Intergenic	novelGene_126658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	284	1084	415421	431178	FALSE	20	GTTCAGCAGTCACATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLEYSQEAGAGPPRSLEQANRTRFPFFSEVKGDHRLVLSAVETVVLALIFVVSLLGNVCALVLVARRRHRGTTACLVLNLFCADLLFTSAIPPVMAVRWTEAWLLGPIACHLLFYVMSLSGSVTILTLAAVSLERLVCIVSLQSGVRRPGWRTRIALLAVIWGYSALAALPLCVFFTVVPQRLPGADQEIPVCTLVWPSIAGEISWDVSFATLNFLVPGLVIVISYSKILQITKASRKRLTVSLAYSDSHQIRVSHQDFRLFRTLFLLMVSFFIMWSPIIITILLILIQNFKQDLVIWPSLFFWVVAFTFANSALNPILYNMALFRNEWRKIICCFLFLEKEAIFTDRSVRRNDLSIISS	415137	431452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_415703_420931_421061_430788
837458	contig_5899_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_146992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAGAAAAAAGAATTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529853	528433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_528400_529900
837459	contig_8386_pilon	+	1532	1	Intergenic	novelGene_82222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGACAATTCTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33860	35392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_33900_35400
837460	contig_11136_pilon	-	1255	4	Intergenic	novelGene_169023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	15.8394724940223	133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	38	742	146932	137678	FALSE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAALFGCWFRVGGARSAMAGRVIPVGPTVVQTSMSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLPLHRAHRVEVVLLHGKAFNSHTWEQLGTLQLLSQRGYRAVALDLPGFGNSAPSAEASTEAGRAELLQRVLQDLEVHNAVLVSPSLSGHYALPFLMRAHHQLRGFVPIAPASTQNYTQEQFWAVKVRGRRSPKVLAPCPWLGS	146969	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137971_143996_144113_144265_144478_146848
837461	contig_9784_pilon	+	972	8	Intergenic	novelGene_165703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	86.6873340087871	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	239	745	244094	262045	FALSE	20	CTCTGGGAACGTCTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVVYELNSYIEQRLDAGGDNQLLLYELSSIIKIATKADGFALYFLGECNNSLCVFTPPGVKDGKPRLIPAGPITQGTTVSAYVAKSRKTLLVEDILGDERFPRGTGLESGTRIQSVLCLPIVTAIGDLIGILELYRHWGKEAFCLSHQEVRSSQLLVRVFSCTYLI	104192	262272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_104243_104683_104746_147658_147741_218175_218205_244078_244200_245510_245561_257546_257688_261835
837462	contig_10023_pilon	+	1419	5	Intergenic	novelGene_123454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	7.34846922834953	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	322	933	4453	10056	FALSE	5	GATGTTCTGCCTTCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERCAHRLTEAIQYVVEFAKRLTGFMELCQNDQIVLLKTGAMEVVLVRMCRAYNADNHTVFFEGKYGGVELFRALGCGELISAIFDFSHSLSALCFSEDEIALYTALVLINANRPGLQEKRKVEQLQYNLELAFHHHLCKTRRQGILAELPPKGKLRSLCSQHVEKLQTFQHLHPIVVQAAFPPLYKELFSTEIEPPEGLSQ	4131	10542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_4574_4721_4830_4986_5098_6522_6633_9894
837463	contig_6496_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_103512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	356	745	791882	792271	NA	30	CATTTACCGCCACATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGSLAHTFLLNSRLVFPSVHWVALLRYLIDMSNLACLKPNNSFPPPTFPTQLPAQLASLVDFSVSVDGNLSLCLHRPGTLESSWTSHCLSYPIQSIRFKIDPKSDPKSDHFSPPPFQHSCSNVPPSHV	791526	792727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_791500_792700
837465	contig_7004_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_126458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGGTGCGGTGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354329	353657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_353700_354300
837470	contig_7894_pilon	+	1714	2	Intergenic	novelGene_170773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGATACTCATCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86323	98800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_86632_97394
837471	contig_2733_pilon	-	619	4	Intergenic	novelGene_128589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	269	619	888135	874595	FALSE	10	TTCCCAGTTGGGGATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAEELFHRVLQGGPRQQHFVFQVHHLEPLQQLAVPILQPVSFINDHTAPWNIPQLRTISQNHLKCSDDGMKLIGPLHHSTLWIFEVHFIQLNGPTTSLTPMIHNHVQLCPGTKLP	889577	874594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_874698_875885_876064_888065_888209_889382
837472	contig_11498_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_65517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTCCCAGGGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183963	185155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_184000_185200
837477	contig_5095_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_74935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCTTCCCAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105780	105306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_105300_105800
837478	contig_5095_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_74934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAATTTTTAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104861	104288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_104300_104900
837480	contig_9706_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_20980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGATACCTGCAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371573	371979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_371600_372000
837481	contig_5815_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_141176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115035	116573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_115000_116600
837482	contig_990_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_76032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACACTGCGAGCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809696	809965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_809700_810000
837483	contig_5415_pilon	+	1056	2	Intergenic	novelGene_146153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	34	312	345619	349449	FALSE	65	GAAAAAAAACTACAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNKRKAFSVYTMDDTKEKNDDYKDDLLLRMGINDNKAGMDGLDKEKINKIIMEATKGSRFYGNELKKEKQVNQRIKNMMQQKAQVTSQQLRKAQLQVFIQFVK	345585	350193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_345754_349305
837485	contig_8896_pilon	+	772	4	Intergenic	novelGene_171574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.82842712474619	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	248	592	58106	68144	FALSE	30	AAGCATTGAAGTTGTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEETIVSQQQEREEKITGNKTSVAVASSDVKPKSISRAKKWSEEIENLYRFQQAGYRDEVEYKQVKQVSVVDRWPETGYVKKLQRRDNTFYYYNKQRECEDKEVHKVKIYAY	42390	68324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_+_42571_58038_58155_58562_58730_68015
837487	contig_11473_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_159256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTATATTATGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133884	134522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_+_133900_134500
837488	contig_9186_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_85358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATTGGCATAACACGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498924	498229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_498200_498900
837489	contig_7308_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_159601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTTCCAATCAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492040	493916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_492000_493900
837490	contig_6375_pilon	+	475	5	Intergenic	novelGene_72976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	266.62426746266	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACCCTGTTCTCCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241662	244531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241699_241806_241865_241940_242095_243940_244006_244369
837492	contig_10129_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_128173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTAACAGAAATACCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635542	636849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_635500_636800
837493	contig_16525_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_133833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAGTAGGCGAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158414	157939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_157900_158400
837495	contig_13519_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_124638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGAAAGAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57288	58469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57300_58500
837496	contig_6446_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_149247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAGAATAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585210	582994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_583000_585200
837497	contig_2093_pilon	-	1255	11	Intergenic	novelGene_152980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	298.2422002333	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	186	704	1384563	1367583	TRUE	40	ATACAGAAGTTTTATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVAVNGKHTLLYAHRISLEKIDTLGIYGKVNIHSVGFRFSSVRFTRYPSIICGADTDK	1386691	1346727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1346855_1357880_1358016_1364609_1364776_1365572_1365662_1366409_1366437_1367575_1367633_1368500_1368625_1370810_1371022_1372530_1372620_1384518_1384668_1386610
837498	contig_6503_pilon	+	1623	4	Intergenic	novelGene_145742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.05480466765633	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	362	865	23663	24166	FALSE	25	CCTAGCCAGCACAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAEPLTALSRWYLYAIHGYFCEVMFTAAWEFVVNFNWKFPGVTSVWALFIYGTSILIVERMYLRLRGRCPLLVRCLIYTFWTYLWEFTTGFILRQFNACPWDYSQFDFDFMGLITLEYAVPWFCGALIMEQFIIRNTLRLRFDKDAEPGEPGSPLALANGHVKTD	13955	24924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_14138_17827_17902_18680_18765_23641
837499	contig_10711_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_118451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACAAATCCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841874	843989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_841900_844000
837500	contig_6005_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_158894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCAGTTATATTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313094	312105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_312100_313100
837501	contig_9436_pilon	+	1620	2	Intergenic	novelGene_60913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	9	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACAGTGTTGTGAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420763	423736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_421028_422380
837502	contig_12802_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_114247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGTTATAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101005	99166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_99200_101000
837503	contig_7914_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_165017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTCTTCTCTTAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71346	71694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_71300_71700
837505	contig_3130_pilon	-	1003	2	Intergenic	novelGene_103584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGTTTTGTTTTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174735	173672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_173920_173979
837506	contig_5515_pilon	-	651	4	Intergenic	novelGene_52305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32.2628096868343	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATTTATGCACTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37532	33008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33386_33476_33588_36599_36700_37469
837507	contig_635_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_152459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGAAGCCGCCTCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75106	73092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_635_pilon_-_73100_75100
837508	contig_5620_pilon	-	693	5	Intergenic	novelGene_161335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	83.2436183740231	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	208	693	275802	167286	FALSE	30	AAATTGGAGGTATGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREEDNKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTPEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAVEFFIRDKYEKKKYYDKNAIAITNISSSDAPLQPLVSSPSLQAAVEKN	276009	167285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_167358_179620_179697_189281_189368_214183_214318_275684
837509	contig_15323_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_148500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGCCAAGAGGCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15709	16770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_15700_16800
837510	contig_16204_pilon	+	1209	3	Intergenic	novelGene_154500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	2	481	276149	288644	FALSE	25	CTGGAGTGTGGAGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEHGEWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAIQALPGLHFAPGQGLIHRDQVNCSGAEDYLWDCPGLPGDRYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGTDPCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWSSIKHALSASHRTCWDRPPLLQTAAPRLQGLPLRGDELSV	276147	289372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_276405_277638_277741_288522
837511	contig_7197_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_177264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTTTAAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7317	10434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7197_pilon_+_7435_10193
837512	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_113839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	16	345	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14424	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
837514	contig_13048_pilon	-	1306	2	Intergenic	novelGene_138921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAATAAGCTTGACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408957	406941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_407356_408065
837515	contig_16103_pilon	-	1546	3	Intergenic	novelGene_118924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAGACTGAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786302	781700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_782376_784334_784418_785514
837516	contig_6050_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_123129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGGTTCTCTTACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407950	409286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_408000_409300
837517	contig_15486_pilon	+	1518	1	Intergenic	novelGene_157318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	58	525	105328	105795	NA	35	GTAAGATATAATTTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVLSVQPLARLLSPSLQQFVFSPPVLGLWSILLSSHKNSGLHCLHFLRFEVSQLSSAAKKEIPQVDGFNKQKFILSQFRRLKSAYSGCQLYGKAFSLLVLGEGPCHQSSPGLGASQRRDPGSKGHAVLLVLLYWWHEVPLFSPRFSLLYLKRD	105270	106788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_105300_106800
837518	contig_9883_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_87582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_2	26	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGGCTCTGGGTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65853	71758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_66069_67998_68098_71274
837519	contig_4059_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_140592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAACAAACAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393236	395307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_393200_395300
837520	contig_13377_pilon	-	633	4	Intergenic	novelGene_162528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.9470120998333	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	74	565	10902	3799	FALSE	25	TCTTCATCATAAAGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQFLFTVSVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRALALTSLLSLQRAGAIKADHVSTYAIFIQTHSPSGEYMFEFDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGQAFFFDAQAGPTYIASLKTLLNYMIQLSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVQLGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIEGVGANPDS	10975	3730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13377_pilon_-_3819_4183_4328_4646_4893_10820
837521	contig_15146_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_116952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCTCTTGTCAGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505421	504575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_504600_505400
837523	contig_9335_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_147434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGGTTTCCTAGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132591	131920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_131900_132600
837524	contig_14666_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_39482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAACCAACCCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56570	55657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_55700_56600
837525	contig_9008_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_58618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAGTGCTAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99714	100771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_99700_100800
837526	contig_6477_pilon	+	1153	5	Intergenic	novelGene_154151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.20156211871642	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	53	697	734913	738509	FALSE	40	AAAAGCAGGCCACAACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLRQPGVYKPFIIGISLMAFQQLSGINAVMFYAETIFEKAKFKNSSLASIIMSIIQVLFTATAALVMDRAGRRLLLTLSGVIMVFSTSAFGAYFKLTQGGPNNSSHVDLFMPISTQPVDPSAGLAWLAVGSMCFFIAGFALGWGPIPWLLMSEIFPLHVKGVATGICVLTNWLMAFLVTKEFSYLMEVLRPYGAFWLTSTFCIFSVLFAVFCVPETKGKTLEQITAHFEGR	734860	738965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_734991_735122_735232_736152_736327_736769_736916_738371
837528	contig_11678_pilon	-	1847	5	Intergenic	novelGene_160857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	4.08503365959205	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	74	1450	329391	316576	FALSE	30	AGTTCATGATGTGCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVPSSEKRASPSARVTFAPQHTLMEERTCSPREPRVCPAAVLCRGPVEPLIFLANFALVLQGPLTTQYLWHRFSTDLGYNGTRDSHSCSNHSVNPTMQEVETLTSHWTLYMNLGGFLVGLFSSTLLGAWSDCVGRRPLLVLASLSLLVQAVVSIFVVQLQLHVGYFVLGRILCALLGDFNGLLAAGFASVADVSSSSSRTFRMALLEACIGVSGVLASLLGGYWLRAQGYANPFWLALALLIAMTLYAAFCFRETVKEPTQARLFTLRHHRSILRLYVTPSPEKSRKHLALYSLAIFVVITVHFGVQDIMTIYELSAPLCWDSRLIGYGSAAHHLQYLTSLLGLRLLQCCLADTWVAEIGLAFNILGMVVFAFATITALVFTGYGLFFLSLVTTPVIRAKLSKLVSKSELGALFSAVACVNSLGMLMASGIFNSLYPATLNFMKGFPFLLGAGLLFIPAILIGVLEKINPHSEFQQFPESR	329464	316178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_316634_317107_317265_318983_319068_327930_328784_329166
837529	scaffold_6394_pilon	+	1343	8	Intergenic	novelGene_111059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	91.3202483302692	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	165	605	464827	468063	FALSE	30	CTAGTAATGGAGATGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFNDKNETCGTICLKYLLFTFNCCFWLAGLAVMAVGIWTLALKSDYISLLSSKDWRDSEWIHSGEAGGRVVPDSCCKTVVDGCGQRDHASNIYKVEGGCITKLETFIQEHLQIIGAVGIGIACVQVFGMIFTCSLYKSLKLDHY	462281	468801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_462323_463520_463560_463962_464029_464808_464911_464995_465070_467046_467183_467308_467396_468003
837533	contig_6724_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_167969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTATGAGTCAGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288622	286903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_286900_288600
837534	contig_4678_pilon	-	919	7	Intergenic	novelGene_126045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.329192466708	147	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	93	647	551815	545168	FALSE	0	GTCTCTGTCTCTGTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGDGRPIPTRLFGAGGQAAPQRGQAGAGTMDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGALTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPAQSKLQKVGQPIRPLVPNASKQRLMEDTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSREKYVLELQSPRYTRLRDWHHQRSAHVLNVQS	552857	544895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_545265_545466_545504_545644_545782_547037_547074_547151_547304_551719_551827_552776
837535	SIRV6	-	307	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-265	-123	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTTCGACTGTCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2085	1667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1756_1866
837536	contig_9538_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_176460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCGGCGCGGCGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28896	29387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_28900_29400
837537	contig_14546_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_157430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTTGTTGGAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470746	468992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_469000_470700
837539	contig_15084_pilon	+	907	3	Intergenic	novelGene_116670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATAAGAAATGGTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18899	87639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_18976_69616_69787_86978
837540	contig_11370_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_98705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAGACACCAAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124647	124277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_124300_124600
837541	contig_11370_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_98706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAGAACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125834	124679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_124700_125800
837542	contig_15112_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_124775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTGGCTATTTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74206	73033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_73000_74200
837543	contig_10000_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_139334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287080	287733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_287100_287700
837544	contig_5361_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_167209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437457	438785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_437500_438800
837545	SIRV6	+	433	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	99	-1	-88	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAAAAGTAATAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2384	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
837546	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
837547	contig_7775_pilon	+	2215	1	Intergenic	novelGene_37506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	152	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATATCTAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308224	310439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_308200_310400
837548	contig_7171_pilon	-	1344	9	Intergenic	novelGene_101367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	21.5855854680849	1	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	421	822	1356706	1353923	FALSE	20	GAACCTGCTGACCTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLLQPQGEDMVCISWYIHNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGDACDIRYCAKDAFFQVKVLVNELAFTARKLMADEARSSGLVRWEDKRGEEASPSHPILDSLSSTVGCSQTRRSCFTQPSP	1360959	1353400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1354041_1354227_1354300_1356223_1356275_1356465_1356519_1356598_1356724_1357398_1357446_1360023_1360113_1360257_1360465_1360899
837549	contig_3103_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_146203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAGGTTACTAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98270	97570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_97600_98300
837551	contig_8814_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_167755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGATCATATGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283409	284266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_+_283400_284300
837552	contig_7887_pilon	+	591	2	Intergenic	novelGene_124905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	87	302	392371	392586	FALSE	5	TTCTTTGAGGTCTTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQGREGRVGCELNGEGENSESHRGAALTMGPTLGLELPLTCREVLWPLPAYLLVTVGCFALGTVGYRVATFNDCEGAALELQTQIQEARADLARKGLRF	392106	392875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_392185_392362
837555	contig_5954_pilon	+	593	5	Intergenic	novelGene_28527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	322.335520071866	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	151	573	465084	467077	FALSE	25	TGAATGAGGGTCACGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVCVVGGAESSASHPICA	463498	467097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463580_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893
837556	contig_3825_pilon	+	784	7	Intergenic	novelGene_77935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1564.28535333764	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12214	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12239_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14516_15231_15302_15498
837561	contig_9197_pilon	+	1268	3	Intergenic	novelGene_154357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_1	14	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTGTGTTGAGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52417	93171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92373
837562	contig_6496_pilon	+	1063	6	Intergenic	novelGene_103483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	79.0113915837457	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	199	732	452626	457591	FALSE	40	AAATATATTTTTTTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTELFNYIDENQDRYVKKLAEWVAIQSVSAWPEKRSEIRRMMEVAAADITKLGGSVELVDIGKQKLPDGSEIPLPPVLLGKLGTDPKKKTVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLEERDGKLYGRGSTDDKGPVAGWMNALEAFQKTNQVRRPHRTLPDSPTCAGKDILSQNSL	450245	457922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_450279_451306_451439_452592_452686_453536_453681_455572_455736_457424
837563	contig_4350_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_136365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGTATGTAAAGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29532	30986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_29500_31000
837564	SIRV6	+	467	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	15	3	15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
837566	contig_6876_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_147015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCTGAAAAACAACCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72007	74023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_72000_74000
837568	contig_9011_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_159323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551720	552926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_551700_552900
837569	contig_10734_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_51042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	55	459	397040	397444	NA	60	AAAAAAAAACCAAACTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPPLREEEEEGDGDEVGPEGALDKSPSQLTAEDVYDISYVMGRELMALGSDPRVTQLQFKIVRVLEMLEALVNEGSLEAEELRMERDSLRKELQALRREGPSAGGEVSVGAGGMPGEWGASTEPEATCLSFL	396985	397674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_397000_397700
837570	contig_14855_pilon	-	1183	2	Intergenic	novelGene_146025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	221	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGATAATGTTTCCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532832	531170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_531994_532472
837571	contig_500_pilon	-	1379	2	Intergenic	novelGene_30924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGTGCGTCTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098237	1096130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1096786_1097513
837572	contig_11498_pilon	+	994	3	Intergenic	novelGene_65542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	31.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTGAGTACCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312588	314568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_313017_313099_313275_314177
837573	contig_7707_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_72155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCTTTTATTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218332	217382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_217400_218300
837574	contig_9516_pilon	-	1944	3	Intergenic	novelGene_106149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	7.5	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	299	736	627217	617326	FALSE	50	CTAAAAAATAAAGTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVMVVRKKVTRKWEKLPGRNTFCCDGRVMMARQKGIFYLTLFLILGTCTLFFAFECRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIGELLNQLASCHVVGGLNQYGKGFSSYRLTNTSSLSF	629764	616117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_617597_627050_627353_629601
837575	SIRV6	+	313	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	162	-1	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
837577	contig_12344_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_164865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAATCCAAAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65292	66495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_+_65300_66500
837578	contig_9306_pilon	-	988	2	Intergenic	novelGene_171479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAATTCAGAATCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77593	75894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_-_76117_76827
837581	contig_16067_pilon	-	2190	2	Intergenic	novelGene_169851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAATCCCTTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84276	80649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_-_80736_82172
837582	contig_13004_pilon	+	1445	2	Intergenic	novelGene_112723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCCTGGAAGGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906703	908407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_907267_907525
837583	contig_6847_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_143844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	569	907	61850	62188	NA	55	TAATATATATAGAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTSHIFLIYSSHNHPMRQMHHPHFTDGNTGLGKLDNLGIQIQVLFQSQISTTCIFFTLLQHLKDTVFLQKITCSFEPIFFQLLKLLGVATYEGSICLLAGGSIVKCLAAK	61281	62457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_61300_62500
837584	contig_6743_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_33552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAAATTTCCTTTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212139	210612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_210600_212100
837585	SIRV6	+	391	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	162	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATAGAGGCACCAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465	2067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845
837586	contig_12810_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_145697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCATGTTACAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271646	272585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_271600_272600
837588	contig_7720_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_155803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	592	978	869238	869624	NA	75	CCACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLWGTRQKGPVVPGCPRGPEGGVWRSAEPSVQAAASRACPDPAQWGRGRRKVQMLLEAGKHGQDPHALCHRETLGLSSKLLSPEPGGPCHPLAPDLPLMSMGIMCPRQKHPDQTTPPMVKTIGKGV	868646	869805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_868600_869800
837589	contig_990_pilon	+	372	2	Intergenic	novelGene_76078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097098	1098108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1097167_1097804
837590	contig_20819_pilon	-	1332	6	Intergenic	novelGene_55695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	42.6642707660637	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCACATCCAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120210	118078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_118266_118455_118531_118722_118766_118970_119058_119170_119257_119356
837592	contig_20199_pilon	-	469	2	Intergenic	novelGene_82578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41207	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40785_40873
837593	contig_4392_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_117327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAAAAGGTGCTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521114	522782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_521100_522800
837594	contig_10793_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_83419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATACAGGTTCACAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134517	135293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_134500_135300
837595	contig_9222_pilon	+	619	2	Intergenic	novelGene_177269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAAGAATGTGACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21129	44132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9222_pilon_+_21244_43627
837598	contig_9527_pilon	+	767	6	Intergenic	novelGene_134066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	47.7300743766443	27	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	72	422	486523	487532	TRUE	10	CTCTGTGTGCAACTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSENPLR	484564	487979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486481_486706_486786_486883_487092_487148_487515_487647_487748
837599	contig_2487_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_148482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATCACTACGCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201798	200989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_201000_201800
837600	contig_6557_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_32960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCACGAAAAGAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372077	373216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_372100_373200
837601	contig_6332_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_177270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAAACTTTTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162384	161707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6332_pilon_-_161700_162400
837603	contig_1715_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_127197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAACTACTGCTCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312774	313740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_312800_313700
837605	contig_8866_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_77812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTGAGGGCCTCACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520908	521910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_520900_521900
837606	contig_6513_pilon	+	762	2	Intergenic	novelGene_117790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	22	636	708493	709245	FALSE	20	CCTCCAACCTTTTGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEILSAMATDTQPAPFTFLRCSLPSFFFFLFYGCKLLPTLLPPKFFPSCHLWSSSLSPSFSEGLTRREEGRKRFSQNPTPATEPSAPLDSTALSVCCPGASCTSLLGRHRGKEEGTEGRASPVLWGAPILVSPPCLPFSPRTRASIPGMGTVPVHPSPEDPRHFLTTWSPWPRSFSSRVAVLQRSWGLGGKAALLSPPNWVDEMAANRFR	708471	709371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_709084_709221
837608	contig_9423_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_99191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTGTTTTATCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111691	112244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_111700_112200
837610	contig_9594_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_73925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGTAAAGGAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204527	203878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_203900_204500
837611	contig_5968_pilon	-	337	3	Intergenic	novelGene_112200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_2	133.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	14	337	732362	638318	FALSE	35	CATGTAAACATTGATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGKMASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLR	732375	638317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_638353_700585_700743_732230
837612	contig_7179_pilon	-	1665	3	Intergenic	novelGene_78172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_1	24.5	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	977	1387	1060393	1058069	FALSE	70	TTTTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGADISIIVRDSLMQPVRKVQSATHFKKVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEEFGQES	1061369	1057790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1058171_1058816_1058958_1060225
837613	contig_12031_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_137579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	436711	437106	NA	25	TCATGGGGTGAGTATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSGLGSSLSAAAAPPPSLLPRARSALRRCRRPPRVETLRYPDGLPWNFQAPELLSFLVLSLGAAPWGTGGPVGSDPGRRCGSGCLLCKLPTPGGGEQLQIQLLLPPGPSGSRVPLQCVLAHVGVCLHEGQ	436710	438034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_436700_438000
837615	contig_14816_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_172453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTAGCATTTTGGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93227	95641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_+_93200_95600
837616	SIRV6	+	372	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
837617	contig_5105_pilon	+	728	5	Intergenic	novelGene_168915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28.7869327994491	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	210	557	497861	502857	FALSE	30	AATACCGGAACTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWFQGNRIQLARYSFGILLRNLSASKTTLPVLTLFTKDPCPLCDEAKEVLKPYNNRFILQEVDITLPENAAWYERYKFDIPVLHLNGQFLMMHRVNISKLEKQLLKLEQQGAGG	492342	503028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_492459_493396_493483_497853_497975_501949_502007_502680
837618	contig_5331_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_112783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATATCCACAGTCACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247960	248664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_248000_248700
837620	contig_7398_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_166186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTTATTAGATAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349085	348003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_348000_349100
837621	contig_10583_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_167915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTACTCGTTACCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165632	166174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_165600_166200
837622	contig_11505_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_140924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGTTGAAGTTCTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98754	100523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_98800_100500
837623	contig_16361_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_177271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCATGGTGACACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24847	23168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16361_pilon_-_23200_24800
837624	contig_1380_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_138886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCGGATCAAAGTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142727	141576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_141600_142700
837626	contig_10753_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_105168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCCATTGACATATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444350	445341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_444400_445300
837627	contig_8312_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_152909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGACTCCACTAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520442	1519846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1519800_1520400
837628	contig_14275_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_162861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAGGAAGGAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295525	294505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_294500_295500
837629	contig_14275_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_162860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCAGTACACGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294405	293774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_293800_294400
837630	contig_5452_pilon	-	819	2	Intergenic	novelGene_101035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608203	606449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_606717_607651
837631	contig_6217_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_109642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATCAGTTCTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610563	609166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_609200_610600
837632	contig_8020_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_114467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGTTGTGCCACGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428041	427087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_427100_428000
837635	contig_10377_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_115396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGGAATCTGGGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214350	214939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_214400_214900
837637	contig_9482_pilon	-	798	2	Intergenic	novelGene_44280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGGACTGGAAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176171	1150600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1151253_1176025
837639	contig_10011_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_68034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGAGGAGTCATGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129539	128087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_128100_129500
837640	contig_9415_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_109748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTACTAAGGATTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598761	597948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_597900_598800
837641	contig_4604_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_19118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGATGGCCATTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20196	20667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_20200_20700
837642	contig_10642_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_78658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	185	610	158802	159227	NA	25	ACATTTGCCTACTTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEAQKAYHPWPNVPHSWALQPVGPSAGRATDAPAHQEDGRELRGGVKGRAGASQIRDPSPTARGRHLGSLLHSRREGGLGGLVEASLIFGGPWFSPIHHFLVVYVGPAGAFGSWVSPSPARPLVPSIFSSTDAFELALP	158617	160256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_158600_160300
837643	contig_5945_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_104547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199443	200720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_199400_200700
837645	contig_17454_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_177273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACGCTTACTGGCCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16155	14757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17454_pilon_-_14800_16200
837646	contig_7411_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_137062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	414	713	1026558	1026259	NA	75	CAAAAAAAAAAAACCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTFIRCRQKRWRARLSARVLGGGWNKWVLEEQLIGPATVSGSAVGLHLRGGSTPASTADELSRVGLPQTPRACQLPGLSHLLGTVASTLRAQSCNLEN	1026971	1025570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_1025600_1027000
837647	contig_2917_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_147578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGTTTCATGTTGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85011	85305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_85000_85300
837648	contig_18613_pilon	+	675	4	Intergenic	novelGene_80228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_1	1299.05837692794	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	116	415	28443	31105	FALSE	5	TATGGTCTTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	27957	31365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_28067_28436_28639_30137_30195_31058
837649	contig_6327_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_147491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACATCTTTCTTCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72811	73610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_72800_73600
837651	contig_11413_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_103198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604012	603518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_603500_604000
837652	contig_6434_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_61921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGTTTTAAAGGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937263	936559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_936600_937300
837653	contig_5361_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_167210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444383	443186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_443200_444400
837654	contig_11720_pilon	-	647	2	Intergenic	novelGene_44029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAGAGAATTAGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409570	404009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_404515_409428
837656	contig_16391_pilon	-	1376	16	Intergenic	novelGene_176981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_11	49.2353080172711	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	975	1169	34532	33412	FALSE	30	ATTAATGAGCATATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTTGIVPGPTVATGSSSTVASASPGQSETTRVGIATTTTRVVPGKTSEPQTYKTEATTSTGGSRTTGSALPGGTTTVSSGVSSSSPARVSGTTGTGSGTSVSSEGFKTGTSGTTVIPRSSTTGTTKKATTAKTTTAKTTTAKTTTAKTTTAKTTTAPGISTTGCPTTLPPTPVCHGPLGEKKSPGDIWTANCHECTCTAAKTVHCKLKECPSLPTCRTGESLRKFKSNDACCEVGYCEPRTCLFNNTDYEIGASFNDPKNPCISFSCNDTGFIAVVRKCPKQTWCVKKDRIYDSKKCCYSCRNNCRTSPVNVTVKYNGCNKRIEMTRCIGDCKNTLKYNYNVFQLESSCLCCREDNYEYREIALDCPDGTTKAYKYRHTTTCSCLGKC	47994	33204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16391_pilon_-_33569_34494_34604_35480_35521_36463_36575_38088_38127_38461_38625_38713_38746_40635_40666_42539_42660_43780_43823_45238_45293_46435_46490_47027_47082_47204_47259_47742_47797_47937
837658	contig_15021_pilon	+	766	5	Intergenic	novelGene_26918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	34.5135842821345	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	56	553	67699	90404	FALSE	20	TCACTGTGTAGACTGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTLKNLGGVSRSLGNLGMEPPTMNPVVEPLSWMLGTWLSDPPGAGTFPTLQPFQYLEEVHISHVGQPMLNFSFNAFHPDTRKPMHRECGFIRLQPDTNKVAFVSAQNTGIVEVEEGEVNGQELSIASHSIARISFAKEPHVEQITRKFRLNSEGKLEQTVSMATTTQPMTQHLHITYKKVTP	67643	90617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_67703_74899_75060_78714_78825_79743_79848_90284
837659	contig_4392_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_117282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGAAAAAAAAGATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33060	24757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_24989_25218_25314_32808
837660	contig_7571_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_106400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAAAGGATAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127301	126552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_126600_127300
837663	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
837664	scaffold_9100_pilon	-	1810	7	Intergenic	novelGene_83236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	51.2491192336241	5	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	773	1111	536524	533389	FALSE	50	AATAAAGACTTCAGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCWIPETMEEWKLLLHLVQNKSTRPALQESPNGNLSDGPSPINVENVALLLAKAMGPDQAWSLLQECGLALELSERFTRTCNILRIAEKRQRALIQSMLEKCDRFFWAQQA	540597	532689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_533450_533795_534067_536517_536629_537271_537430_538582_538697_539475_539596_540321
837665	contig_8682_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_165278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118697	117606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_117600_118700
837666	contig_1624_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_138386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTATGCTCATCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427509	428192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_427500_428200
837667	contig_1624_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_138387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTAGAATAGGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428192	428919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_428200_428900
837668	contig_14288_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_153813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCACTGAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222040	219776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_219800_222000
837669	contig_8138_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_52492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAATCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321501	322839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_321500_322800
837670	contig_10011_pilon	-	871	6	Intergenic	novelGene_68044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.596806948121	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	117	629	194838	184849	FALSE	15	CATCCTATCTTTCCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTPSASCHPPPHLCHLPRTHTAAATLMLLC	212616	184606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_184936_188278_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_212506
837674	contig_8063_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_152454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAATTAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962442	963214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_962400_963200
837675	contig_10494_pilon	+	736	4	Intergenic	novelGene_102183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGACTGGGTGCGCGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056294	1059306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1056724_1056877_1056955_1057166_1057272_1059181
837676	contig_1262_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_133554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281552	281818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_281600_281800
837677	contig_11742_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_166537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAAAAGGGTTCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77556	75258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_75300_77600
837680	contig_9389_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_83998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATGGTCATCAGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412876	412504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_412500_412900
837681	contig_10561_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_175932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTTCTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111904	112214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10561_pilon_+_111900_112200
837683	contig_15087_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_37162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGACTTCCAGATCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42370	42830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_42400_42800
837684	contig_12157_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_135901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTCATCTCAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129177	127458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_127500_129200
837685	contig_8687_pilon	-	1021	2	Intergenic	novelGene_169654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGCATGAAGGAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28544	27456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_28231_28297
837686	contig_5732_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_119577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCTCTTGGTGAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108307	107591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_107600_108300
837687	contig_4654_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_103056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAATGATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431814	430428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_430400_431800
837689	contig_8744_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_173641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1539	1880	92867	93208	NA	60	GAAAGGAGCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSENFCIELLLGSNLVHTKRLKCYEFRISTPSHRLGSLCLSLLFSPGSKTAGNLEQSVYSFSGFSALSLLPFFNWSREIGRQLQQTHFFFFSFLIFSTCPFSFLYKEVFIK	91328	93230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_+_91300_93200
837690	contig_3382_pilon	+	1099	2	Intergenic	novelGene_124151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	482	883	931459	936245	FALSE	5	TGTGACCTTTTGTGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRGHLSYFPFLSTRNRAAKNMHVNKCLLESLRGTDG	930977	936461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_936139
837691	contig_5728_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_126713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATAACGGTTTTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374100	373580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_373600_374100
837692	contig_5728_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_126712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTTATCACAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373442	373098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_373100_373400
837695	contig_9389_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_84043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCGCGCTGTAGAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586264	585685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_585888_586120
837696	contig_13145_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_116650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCATGGATACTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204800	206120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_204800_206100
837697	contig_18208_pilon	-	259	2	Intergenic	novelGene_176195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4759	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAAATGCTTGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154784	154379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713
837698	contig_7182_pilon	-	977	2	Intergenic	novelGene_117120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGAGAAGAATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323015	321501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_322129_322665
837700	contig_5588_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_172841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036560	1040802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_+_1036722_1038848
837701	contig_12622_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_5765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90534	91526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_90500_91500
837702	contig_7378_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_120264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCACCACAATCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460116	460360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_460100_460400
837703	contig_7378_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_120265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460887	461911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_460900_461900
837704	contig_11720_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_44039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCCTGGAAGGATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492315	491194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_491200_492300
837705	contig_8377_pilon	+	861	3	Intergenic	novelGene_34899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3519	junction_2	797	125	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAATTAAATTGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68043	125376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720
837707	contig_3832_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_161484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCATTATACACATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476731	475674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_475700_476700
837709	contig_8972_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_167628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATACTTTACTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349396	347613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_-_347600_349400
837710	contig_7376_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_108066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	315	junction_2	79.8670770718448	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	13	666	53088	64314	FALSE	30	GAACTCATATAGTCTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGGENGGGGKKGLKRKATSEDPEETVVSGDGTAEGGAQSPKAAAFPPGFSISEIKNKQRRHLMFTRWKQQQRKEKLAAKKKLKKEREALGVKAPPKPVPKTIDNQRVYDETIVDPHDEEVAYDEATDEFAPYFNRQTSPKILITTSDRPHGRTVRLCEQLSTVIPNSHVYYRRGLALKKIIPQCIARDFTDLIVINEDRKTPSILCFLRKLLCPF	53075	64524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_53313_54868_54926_57516_57598_63239_63336_64119
837711	contig_10734_pilon	-	602	3	Intergenic	novelGene_51060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	11	515	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAGGGAAGCAATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437382	435219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_435652_436053_436128_437286
837712	contig_18869_pilon	+	1108	8	Intergenic	novelGene_56429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	6.5121550400237	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	128	856	110457	113479	FALSE	35	GAGATAGTAGAATGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQLLEIEKGQKDGFAKPSSSEQQSIQVEKLFQTLMTQEQNNLEEAADGFLQVLSVRKGKALVARLLPFLPRDRTVSLLLAITHHLPFLVQRDVADQALQILFKPLGKFISHLTFHELLQGLQGLTLPPASEKPVTVVLQNQFGISLLYALLSHGEQLLSLDSSLEKPNSDHTAWTNMVVLIAWEIAQMPTASLAEPLTFPSNLLPLFCRHVDKQLVQQLEARMELSDGRNKITAPCSSLI	110010	114065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_110084_110307_110362_110456_110591_110733_110894_111620_111756_112386_112485_113277_113480_113813
837714	contig_12301_pilon	+	1535	10	Intergenic	novelGene_110008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_3	112.06347407707	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	836	1489	54345	60865	FALSE	20	AGAGGCACCCCCTTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRHLQRIIQQETLQLINSNEPGVIMFKTDALKCRVALSPKTNQTLQLKVTPENAGQWKPDELQVLEKFFETRVAGPPFKANTLIAFTKLLGAPTHILRDCVHIMKLELFPDQATQLKWNVQFCLTIPPSAPPIAPPGTPAVVLKSKMLFFLQLTQKTSVPPQEPVSIIVPIIYDMASGTTQQADIPRQQNSSVAAPMMVSNILKRFAEMNPPRQGT	39697	60911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_39762_42625_42773_46777_46890_50931_51064_53025_53209_54147_54384_56686_56867_56954_57063_60150_60277_60664
837716	contig_8063_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_152452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAGAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945535	944889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_944900_945500
837717	contig_14973_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_171223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATATGATTAAAAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179572	180630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_179600_180600
837718	contig_5744_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_149354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAACTGGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769941	768830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_768800_769900
837720	SIRV6	+	365	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	11	1	11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3034	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
837721	contig_14635_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_84371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGGACAGATCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591134	591465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_591100_591500
837722	SIRV3	+	359	2	Antisense	novelGene_SIRV3B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACAGGAGCTACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020	1744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_+_1168_1532
837725	contig_4519_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_123722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699833	698721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_698700_699800
837726	contig_15905_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_154715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAATAAGCATCCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291729	292329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_291700_292300
837727	contig_15905_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_154716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCGGAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292576	293425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_292600_293400
837729	contig_14621_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_105847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGTTTGGCCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235762	234427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_234400_235800
837730	contig_10011_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_68022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTGCCCACGGCTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32554	39312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_32743_34860_35737_35936_36034_38217_38376_38451_38563_38731_38853_39129_39205_39293
837732	contig_3601_pilon	-	1053	2	Intergenic	novelGene_132943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	85	1053	427480	426416	FALSE	35	TATTTAAAGCAGGGGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNEGSVGKNKSSACRRKREFIPDEKKDAMYWEENATLKAELLSLKLKFGLISSTAYAQEIQKLSNSTAVYFQDYPTSKSNVSSFVDEHERSMVASSCISVIKHSPQSLSDGSEVSSVEHTQESPVQSSCRSPENKFQIIKQEPMELESYTRETRDDREVTTPIYQNYIGNSFPGYSHSPPLLQVNRSSSNSPRTSETDDGVVGKSSDGEDEQQVPKGPIHSPVELKHGHATVVKVPEVNSSALPHKLRIKGKAMQIKVEALDGEFDAAQKLSSAIDMTSKRHFELEKHNTPNMVHSALTPFSVQVTNIQDWSLKSEHWHQKELIGKTQNSFKSGVVEIKDSVYRVSDPENL	427564	426415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_427373_427468
837733	contig_11396_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_71312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACGAGGCCCGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439116	441129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_439100_441100
837734	contig_13744_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_77163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGTGTTGTGGTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312341	311070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_311100_312300
837736	contig_16846_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_82884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTCTCCTGGATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340315	341294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_340300_341300
837739	contig_3942_pilon	-	784	6	Intergenic	novelGene_128807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.42135623731	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	49	576	1054846	1050329	FALSE	15	GGGCACCCCACTTGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEALDKVPGPGLPTTASFEGE	1054894	1050120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050344_1052665_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811
837740	contig_8801_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_66313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGATTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605665	606949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_605700_606900
837741	contig_13760_pilon	-	1050	3	Intergenic	novelGene_61303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	310	618	170928	161870	FALSE	5	CTCTTTCTTCTGTCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	171237	161437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161976_169072_169199_170851
837742	contig_537_pilon	+	993	2	Intergenic	novelGene_167590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	66	812	548731	549477	FALSE	25	CATTATCACTTATGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APARLRADCWPLSAGARRWDVMTEAHHKYDHSEATGSSSWDFQNSFRREKLEQKSPDSKTLPEDSSGVRQKVYDCQECGKSFRQKGSLTLHERIHTGQKPFECTHCGKSFRAKGNLVTHQRIHTGEKPYECKECGKSFSQRGSLAVHERLHTGQKPYECIICQRSFRNQSNLAVHRRVHSGEKPYRCDQCGKAFSQKGSLIVHIRVHTGLKPYACSQCRKSFHTRGNCILHGKIHTGETPYLCGQCGKSFTQRGSLAVHQRSCSQRLTL	544519	549658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_+_544580_548725
837743	contig_8520_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_85438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAATGGGAAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77723	79038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_77700_79000
837744	contig_253_pilon	-	602	6	Intergenic	novelGene_129677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	851.714130445186	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	31	378	421711	418918	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVVAAASTAIMPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYPLPTTTCWTCS	421741	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_420252_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
837748	contig_10196_pilon	+	1230	2	Intergenic	novelGene_132329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	224	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTGTTAACGCCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2397503	2400442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2397808_2399516
837750	contig_5451_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_167173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	82	387	462193	461888	NA	35	ATGCAGTAATCGCTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKVHFPLSLSFYTIELLHFPSPPSSYLPLWHCHTCFFFLKCPLLIPPLPPVPTQFSAQDSAQQGCGELGTLIHCWWECRMVQPLWRTVWHPSHGLARSSRA	462274	461887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_461900_462300
837752	contig_14450_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_48938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513837	515027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_513800_515000
837753	contig_12842_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_168351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201815	200913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_200900_201800
837755	contig_2069_pilon	+	364	2	Intergenic	novelGene_23544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTAGCTGGTACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508548	1509042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941
837756	contig_2342_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_132770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCAAGGCAGCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519720	519181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_519200_519700
837757	contig_7035_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_83532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1166	1579	720820	720407	NA	10	TGGCCCGAGGTGTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDTNKKCPNLRTNSKNEDGCLVATRWLNTSAARRLLVGEGLIVCTDPESPLRPSDTHKQTRGASCWPEPSLSIIKADIPESDIPPSQVRRKLLAGLAQPGTPSPRGPRARRPQRPALEKGGPLLPDGGECLEPEQ	721985	719934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_719900_722000
837758	contig_5981_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_35514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACGGGGAACAGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72632	71929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_71900_72600
837762	contig_9706_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_20992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGTGTACTAGTAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436974	438199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_437000_438200
837764	contig_14725_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_173603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTCTCTTACCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420002	419470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14725_pilon_-_419500_420000
837765	contig_13721_pilon	+	923	2	Intergenic	novelGene_169486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	267	578	70896	71372	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCSIYFYHNKKQNRRVTLLVCWVLGQQAAKREPLLQREQGSKQALLRPSWVKIFQRLGWRRSRGQQRPSDDHTTRSTMRHFFSFRLSRFSKINTNYFIIIEK	70629	71717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_+_71136_71300
837766	contig_12970_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_50521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAACACCTAGAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138195	137006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_137000_138200
837767	contig_12019_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_87707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACTCTGAAGATACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219593	220239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_219600_220200
837768	contig_12019_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_87708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTTACATATATATTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220239	220815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_220200_220800
837769	contig_5917_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_122149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATTACTAGCATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265628	266070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_265600_266100
837770	contig_4364_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_3190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAAGGCTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533314	1533027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
837771	contig_12019_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_87704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	57	374	196750	197067	NA	70	AATCAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSVVSLFLNSLIEVQFSLFLLSYKNQRQETVKQSCGFRNLICIPSASACSLVKGGYGPSGSCFLGQKNPFGMFFPPLVCSPQTSVNFGLQKGSQGYFCPSLL	196693	197410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_196700_197400
837772	contig_4385_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_141491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCCAGCCCCATCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13953	14922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_14000_14900
837774	contig_4674_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_174152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGTAAACCTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363606	364426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_363600_364400
837777	contig_15365_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_111127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGAGAAAGTAGCATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29917	29268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_29300_29900
837778	contig_5894_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_83005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226013	227895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_226000_227900
837780	contig_12724_pilon	-	399	3	Intergenic	novelGene_146860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGTAAACAAATGACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245481	189702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_189818_244987_245194_245403
837781	contig_9014_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_106816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153453	153100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_153100_153500
837782	contig_10196_pilon	+	1350	3	Intergenic	novelGene_132246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	11	490	1771365	1777758	FALSE	55	ACAATAGAAAGGATAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAMAAPAESLRKRRRGDAGSGSPPEPACEPVGYPTRLRAGSFWLTRIVLLRALAFVYFVAFLVAFHQNKQLIGDQGLLPSRLYLKSVQQHFKGRIGWDALSYAPTVLWFLDWSRMDTNLDFLALAGLGISSFVLVAGCANMVLMAALWVLYMSLVNVGQIW	1771354	1801911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1771531_1777444_1777759_1801051
837785	contig_12157_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_135931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGCTCAACCATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357302	358167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_357300_358200
837787	contig_8535_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_177278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAAGTGTCTGGTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53608	54138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8535_pilon_+_53600_54100
837789	contig_10023_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_123497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGACTAACCTCATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231426	231048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_231000_231400
837790	contig_9848_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_79987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCCCATTGGGAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129500	128998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_129000_129500
837791	contig_2924_pilon	+	1457	11	Intergenic	novelGene_140289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_10	21.4112120161377	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	412	1215	441741	448272	TRUE	60	AAAGAAACTGAGAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFAGGGGGGSGVSSSSSSEHSSISPDSEAQSDVFFEKARSPASESLPKHHLSHLPSVPDESTALSPEDRDPGLFLLRKDGERRAILYKILWEEQSQVVSNLQECVAQSSEELHLSVGHIKQIIGILRDFIRSPEHRVMASTISKLKVELDFDSSSINQIHLVLFGFQDAVNKILRNHLIRPHWMFAMDNIIRQAVQAAVTILIPELQAQFEPASEMEGVDKDADMEDYHPLADSNGSKVPATYGGSRPSSAAFQEIQLHHPYQHLSLQLGKLREETTRLLEYLIQREREYQNFLRQTLEQKTQELYHLRLHLKSNGITQKPAPHCGYPGQRTDQELEDWLKLQGADAETIEKIAEEGYTLSDILNDITKEDLRYLRLRGGLLCRIWNAVSQYRARALEPSKTKQ	439564	455329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_439732_440467_440622_441650_441837_442485_442592_443720_443941_445984_446098_447274_447385_447463_447541_448190_448289_449482_449523_455143
837792	contig_6031_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_56773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAACAAACCACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421084	422034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_421100_422000
837794	contig_5479_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_133572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATAGTGGTGATGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121886	122390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_121900_122400
837795	scaffold_7386_pilon	-	947	4	Intergenic	novelGene_136606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	21	junction_2	40.1026460750687	80	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	385	396	381992	381981	FALSE	15	GGCCGTTCACAGATTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPCLPFSVPTGGGTRCVRITLRQHCQDGACHPIGFHVFQVPGGGGSQDEPSPLCQEPLSSCVPHRHALEVSQLCRLPAGTYGVVPSTYLPNTEAAFTVTIATRIDRRSLQSRERLGQLLQEASFTALMKT	383366	381429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_382011_382084_382131_382237_382438_383246
837796	contig_6302_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_171691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAAAAAGTCAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93711	93911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_93700_93900
837797	contig_4492_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_166111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAGCAAAGAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129448	130650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_+_129400_130600
837798	contig_5018_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_47127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGAGTTCAGATCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449358	1449584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1449400_1449600
837801	contig_6451_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_173709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAAAAAAAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244636	243058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_-_243100_244600
837802	SIRV1	+	266	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCACTATCCTAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6449	6802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV1_+_6472_6558
837803	contig_7380_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_157516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	104.616860495811	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	74	373	139473	144097	FALSE	20	CTAATGGACTGACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDDLLSEAGCPGLDAGGHL	138633	144806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_144041
837804	contig_2069_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_23172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1.11803398874989	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	187	939	32221	27030	FALSE	25	CACAGTTAGTGAACGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSNSIYNQVAELWRPWLSNESITLFKEGAFYSEKLPGPSRAGRIVVLNTNLYYSNNEQTAGMADPGKQFQWLEDVLTNASWAGEMVYITGHVPPGFFEKARNKAWFRKDFNERYLEVVRKHHRVIAGQFFGHHHTDSFRMFYDDTGAPISVMFLTPGVTPWKTTLPGVVDGANNPGIRVIEYDQATLNLQDMVTYFVNLSQANAQGTPSWQLEYRLTEAYEVPDASARCMHSALGRIARDQGVLQRYYVYNSVSYDAQNCGKACRTEHVCALREVAFDAYATCLRASGAMPVPQLALLLAALLGMRALLLP	36908	26760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_27396_30399_30534_30615_30797_32149_32323_36823
837808	contig_7619_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_162144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGACAGAGGAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17621	18501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_17600_18500
837809	contig_3285_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_153388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	29	421	189885	190277	NA	55	TGTACTTAATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CESAARLLFMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQVRSRGHSGLGEGHLGKNNSNQSYKTGCYLDKNQQGQASVLNGNEETIFTSLFLGFKMYSYGILSKKCNYLVSGKLNLVYKKQMYRNIIYIYIYIFSLIEPSNLISNKIVS	189856	191009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_189900_191000
837812	contig_6919_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_163976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29323	28246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_28200_29300
837813	contig_14142_pilon	-	1254	14	Intergenic	novelGene_120612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	126.079246235695	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	179	1120	598441	585056	TRUE	5	CAGGCCTTCGGGGGGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLSPWKQPTLISSRCCDWQR	598619	584632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585499_589390_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
837814	contig_5765_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_141357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACCTAACAACAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362310	361226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_361200_362300
837815	contig_11986_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_69144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAGAACCCCCAGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287414	288080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_287400_288100
837816	contig_3386_pilon	-	975	5	Intergenic	novelGene_34596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	87.6484455081777	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	47	724	531475	523419	FALSE	5	TTGTCTGGGTTCTTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYLWSSRQFRIQSPRMNVHRASDGDRLLRQDASCLVDDTSTATQEREASSLASSGLQNLTYPSGPRSDDLSLDYASQPAHLQFPHIMPLPEDIKGSCFQTGNKRNHEPFIAPERFGNSSVGFGSNSHLQAPEKVTLLVDGTRFVVNPQIFTAHPDTMLGRMFGPGREYNFTRPNEKGEYEIAEGISATVFRTVLDYYKTGIINCPDGISIPDLRDTCDYLCINFDFNTIRCQDLRLSSVG	531521	523167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_523439_523515_523637_523989_524093_528528_528803_531315
837817	contig_13464_pilon	+	765	3	Intergenic	novelGene_125234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	18	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAACTGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232930	243623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_233084_233717_233859_243152
837819	contig_7571_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_106392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTGTGTTTTGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77583	78055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_77600_78100
837822	contig_5815_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_141186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCAAACTGCCAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191722	192211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_191700_192200
837823	contig_3948_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_53241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTTGCGCTGCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039271	1040117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1039300_1040100
837824	contig_10861_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_39191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	582	935	341450	341097	NA	10	CACCTCGGGCACCGCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFGPVYQPLWSLNPLCREKVKASWCSMRSGPENLLTLKGGLLIAGGCTCWELLGGGRNGLLIPLPTTPPPAWRGSCLLKRNQTLKQESQSFKRGRRVRGLGIQMVKISRRKCLGSD	342031	340832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_340800_342000
837826	contig_10734_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_51324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1541842	1543218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1541800_1543200
837830	contig_9799_pilon	+	1129	1	Intergenic	novelGene_145568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGGAATAGAAGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037236	1038365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1037200_1038400
837831	contig_6199_pilon	-	917	3	Intergenic	novelGene_126328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	156	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	407	904	31305	30808	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTWAGRLGHQGQRPSSWGQVRTSNFPGSPRAEPEPSIVLPFSCLAPLWRGFSFKKIPWLPQMTGIGGRIGPASSLWNFCFGTLQHLRHDLKIKTHTFADLCDSQHDWANIHCGGQAQSQNAQCHIREVQPVDAQRRQKLILPLGSGKASPGSALDLDFEGHSR	32704	30794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_31352_31930_32068_32481
837832	contig_11422_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_98985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
837834	contig_4812_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_103689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTTTGGTTAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202844	202442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_202400_202800
837836	contig_10734_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_51350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGTGGCAGCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754148	1755260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1754100_1755300
837838	contig_3472_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_166946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971482	972689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_971500_972700
837839	contig_12079_pilon	-	1171	2	Intergenic	novelGene_67552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	972	199	1170	862393	861422	FALSE	15	GTCAGCCAGTCTTTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRC	862631	861420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862402_862441
837840	contig_4364_pilon	-	819	5	Intergenic	novelGene_215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	43.468379311863	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	285	584	1353682	1351496	FALSE	15	GTTGAGACTCAGCGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGVMPAAAPAAAEVAEEEDIPKQKERTHFTVRLTEAKPVDKVKLIKEIKNYVQGINLVQAKKLVESLPQEIKANIAKAEAEKIKAALEAVGGTVVLE	1355385	1351260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1351613_1351721_1351860_1353637_1353713_1353795_1353984_1355319
837841	contig_9027_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_156354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGACTTATAGCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77118	78862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_77100_78900
837842	contig_6048_pilon	-	1064	5	Intergenic	novelGene_73210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	31.7411404962078	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	31	534	1533524	1527849	FALSE	0	GGCTCTGGGGTCTCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKSFGSSHVMQIIYTDDAGQPQTAYLQCKSMNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGIFRGDKWSCCHQKDKTDVGCDKTRSRVTLQEWNDPLDHDLEAQLIYRHLLGMEATLREKHRELRGATEASTVLEGPGPAPEDGLAQLFQVLEDLKKAHSSSPAAGPPLEHRNLLELQT	1533554	1527318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1527971_1528163_1528229_1531326_1531448_1532999_1533136_1533464
837843	contig_2125_pilon	+	2186	9	Intergenic	novelGene_147713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	40.6724722631905	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	73	1314	304342	342094	FALSE	20	AGTGTGAGATGTCAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWRMIMSDSKRKAKSFEGNNNYDTPELRTFPPLSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEVPTAGPTTPNGNPVDECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLTTEKPTVLDSTIQSEFPTYGFNCEFGWGSHKTFCHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHTAGDGNFIYSQADENQKGKVARLVSPVVYSQNSAHCLTFWYHMSGSHVGTLRVKLRYQKPDEYDQLVWTAIGHQGDHWKEGRVLLHKSLKLYQVIFEGEIGKGNLGGIAVDDISINNHISQEDCAKPADLDKKHPENKIDEAGSTPGYTGAEEGDENISRKPGSVLKTLDPILITIIVMSALGVLLGAVCGVVLYCACWHNGMSERNLSALENYNFELVDGVKLKKDKLTTQSTYSEA	304269	342966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_304423_309409_309555_312802_312908_321081_321142_327059_327198_332302_332578_333289_333387_339269_339321_341804
837845	contig_7347_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_172502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	345	166	510	303990	303646	NA	60	GGCAAATAGCAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESFLKKQTENAISTKETFIPAPNNKGSSTSVVKTSTFKAEEEAADATDSNNRGYQMQKKVNSVYGEEAKQELCLVGDPWTELSPKQKYIKDLQEGTRVRKVEKEDAVLQSCYNRYTEERNFEDSKVAYLEKKGTSERPNYSGLRLAENGAKQPSFKNGLEPILLQKSIYQ	304155	303643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_303600_304200
837847	contig_12566_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_86012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53043	51837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_51800_53000
837848	contig_461_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_177279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	26	367	3010	3351	NA	35	TTCAAAAGAATTGAGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKVQLMKALLSRHRWPQARRWRNPIPFPETFDGDTDRLPEFIVQTGSYMFVDETVFSNDALKVTFLITRLTGPALQWVIPYIKKESPLLNDYRGFLAEMKRVFGWEEDEDF	2984	4176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_461_pilon_+_3000_4200
837849	contig_12603_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_105802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATCCACCAGCCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596765	596071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_596100_596800
837852	contig_2552_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_139010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAATTCTAACTCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117649	118497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_+_117600_118500
837853	contig_8885_pilon	-	1141	6	Intergenic	novelGene_115586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.1442284397967	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	28	465	331816	306667	FALSE	15	CAGTTCATTTCCCTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGPSVFLLMVNGQVESAQFPEYNDLYCKYCFVYGQDWAPTAGLEEGISQITSKSQDVQGALVWNFPIDVTFKSTNPYGWPQMVLSVYGPDVFGNDVVRGYGMVHVPFSPGRHKSTIPMFVPESTSKLQKFTRLQYPPWPPRS	331843	305990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_306701_313354_313418_314572_314670_327226_327339_330294_330364_331753
837854	contig_5696_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_117492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182724	182402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_182400_182700
837855	contig_1443_pilon	-	950	2	Intergenic	novelGene_28344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1786	junction_1	0	93	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACTTATATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809544	807935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_808741_809399
837856	contig_7022_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_142167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395233	393828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_393800_395200
837857	contig_7728_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_64749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTACAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892526	891121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_891100_892500
837858	contig_13558_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_123023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTTAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71142	70381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_70400_71100
837859	SIRV4	-	575	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	20	22	20	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTGGCGGTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5138	3659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
837862	contig_17797_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_177285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106191	107350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17797_pilon_+_106200_107400
837863	contig_6102_pilon	-	1351	5	Intergenic	novelGene_32339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_3	177.979458084353	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGGCTTTCTGATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688883	1685253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226
837864	contig_5231_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_65902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTCCATTGGGGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272981	275167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_273000_275200
837866	contig_6397_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_146255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTATAGGACACAGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455814	456511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_455800_456500
837868	contig_12479_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_56872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494704	495914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_494700_495900
837869	contig_19633_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_177286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAATGGATATAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4131	2325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19633_pilon_-_2300_4100
837870	contig_1008_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_121552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTCTAATCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528912	530176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_528900_530200
837871	contig_2125_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_147724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTTAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522065	520648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_520600_522100
837872	contig_3948_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_53185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCAGGGGACCAGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788271	787763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_787800_788300
837873	contig_6795_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_27698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCCTATGACAATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105733	106113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_105700_106100
837874	contig_13496_pilon	+	1960	2	Intergenic	novelGene_107665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	613	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTACTTTCCAACGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500754	506629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_502287_506201
837876	contig_6479_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_160594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGTGATGTGTTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_300_1000
837878	contig_8660_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_136481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTACCTAGCATGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55781	56693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_55800_56700
837879	contig_7979_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_125524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGAAATACATGCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364649	363722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_363700_364600
837880	contig_3018_pilon	+	530	2	Intergenic	novelGene_78915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTCAAATGACACGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625290	626013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_625370_625562
837881	contig_10765_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_122994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668512	670098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_668500_670100
837883	contig_1996_pilon	+	1647	14	Intergenic	novelGene_131907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	24.6622150682173	209	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	124	1560	279625	283048	FALSE	20	GTGTGCATTCATTGCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMGIDGPIDSFAPFHNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKVPLRCTAHYVAYHVESKVYAVATSTNASCTRIPRMTGEEKEFETIERDDRYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIELEEWEHVTCMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEPGQPLTKNKFKVLYEKEQKGPVTALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSLRASELTGMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFMVDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLPEAKESFGGMRLLRRADFHVGAHVNTFWRTPCRGAAEGPSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAGLNPRAFRMLHVDRRILQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERGELAKKIGTTPDIILDDLLETDRVTAHF	279424	283135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_279479_279555_279709_280528_280646_280737_280829_281037_281123_281198_281341_281418_281572_281823_282001_282079_282147_282224_282273_282345_282502_282583_282714_282787_282927_283000
837888	contig_1262_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_133544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGTCCCATAACAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132454	131376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_131400_132500
837889	contig_20693_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_60260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACCAACTCTTATAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19571	20795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_19600_20800
837890	contig_8017_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_65368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGGAGCAGCCTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015212	1016410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1015200_1016400
837891	contig_18933_pilon	+	666	2	Intergenic	novelGene_177288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCACACTTTTGGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8914	9642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18933_pilon_+_9103_9164
837893	contig_5372_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_149712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGTAAATATTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160709	162531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_160700_162500
837894	contig_8628_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_164426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGCTGTCAAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440013	441747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_440000_441700
837895	contig_6291_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_164787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGAAGTAGATCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359631	359210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_359200_359600
837896	contig_12689_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_145051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGATCAAAAGGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264990	263068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_263100_265000
837897	contig_7408_pilon	-	858	5	Intergenic	novelGene_168754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	195.75622595463	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAGTATAGTCTCACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48304	36821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_36938_38375_38596_47224_47360_47827_48040_48129
837898	contig_5649_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_82376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTTTTGTATAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061659	1060688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1060700_1061700
837899	contig_15047_pilon	-	1004	4	Intergenic	novelGene_52285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	18.8030730348939	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	211	561	84499	79792	FALSE	20	TTTGTCTGTGTATTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAFRAPILDSTVFVITSRWSPRRSVQPRFIAEGYIDGKLFLHYDSEKDRAEPQGPWGEANLGAETWDLETMDFTDIGMELRMTLSDIMKLQDQKRAVNVTLSEAVKGNVILTCWAAGFYAPKITLTWLQDGEPLSMDSQKSGSVLSGGNGTYKTWVSTRLPQGEEQRYSCHLEHSGKNITCPVSHA	96151	79348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_79797_82958_83229_84423_84686_96127
837900	contig_14176_pilon	-	906	2	Intergenic	novelGene_74831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAACCACGTCGTTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224179	223020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_223762
837902	contig_2646_pilon	-	969	3	Intergenic	novelGene_69642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	12	779	2123714	2116733	FALSE	5	TCCTAGGCTTCTGGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCCMGSPGAPPPLPALPERNCGYRELQYWDQRYRDAAHSAPYEWFGDFSSFRALLEPELRPEDRILVLGCGNSALSYELFLGGFPDVTSVDYSSVVVAAMRARYAHVPKLRWETMDVRALGFPSGSFDVVLEKGTLDALLAGERDPWTVSSEGVHTMDQVLSEVSRVLVPGGRFISLTCAAPHFRTRHYAQAHYGWSLRHRTYGRGFHFHLYLMHKGGELSAAQLALGAQILSPPSPLASPCFLQDSDHEDFLSAIQL	2123725	2116542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2117021_2117695_2117980_2123518
837903	contig_1938_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_114890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	112	456	302034	301690	NA	40	TGAAAACACAGTGTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKRYFCKLKRIQDVAVSVLQKVLVPRGAFIKLFLFYVLLAALLIFISFQIRINIHGQSEIKESIESQQESPYSCKNEANFLGKKKIVRLEINEKRLVRLSVSSDKINSDIIL	302145	300556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_-_300600_302100
837904	contig_9505_pilon	+	782	8	Intergenic	novelGene_121819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	64.8316501189261	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	117	611	404142	419536	TRUE	20	GACACGCTGTGGATGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVHARSLEPLPVGGPDFGALGEEAEFVEVEPEAKQEILENKDVVVQHVHFDGLGRTKDDIIMCEIGDVFKAKNLIDVMRKSHEAREKLLRLGIFRQVDVLIDTCQGEDALPNGLDVTFEVTELRRFTGSYNTMVGNNEGSMVLGLKLPNLLGRAEKFLCELI	404025	447513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_404163_408855_408967_410310_410413_417292_417381_418386_418494_419148_419194_419515_419604_447409
837905	contig_5585_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_143078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417266	417624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_417300_417600
837907	contig_8615_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_165215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83355	83708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_83400_83700
837908	contig_4486_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_38650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTGGCTCATAATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037807	1029795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1029926_1037295
837911	contig_7340_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_159894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAGAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132161	133216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_132200_133200
837912	contig_15327_pilon	-	1757	13	Intergenic	novelGene_70825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	67.301353791898	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	40	1716	1564121	1557980	FALSE	20	GTGACGACCAGCCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMPDDVFESPPLSASYFQAMPRSASPVSADGVQIPLRECSRAPVPAARRGKRIASKVKHFAFDQKKRHYGLGMVGSWLNRSYRRSISSTVQRQLESFDSHRPYFTYWLTFVHVIIMLLVICTYGIAPLGFAQHVTTQLVLRNKGVYESVKYIQQENFWIGPSSIDLIHLGAKFSPCIRRDEQIEQLVRRERDLERDSGCCVQNDHSGCIQTQHKDCSETLATFVKWQGDTGPPMDKSDQGQRRTSGAVCHQDPRTCEEPASSGAHIWPDDITKWPICTEQSRSNHTGFLHVDCQIKGRPCCIDTKGSCEITTREYCEFMHGYFHEEATLCSQVHCLDNVCGLLPFLNPEVPDQFYRLWLSLFLHAGVVHCLVSVVFQMTILRDLEKLAGWHRISIIFILSGITGNLASAIFLPYRAEVGPAGSQFGLLACLFVELFQSWQLLERPWKAFLNLSAIVFFLFVCGLLPWIDNIAHIFGFLSGLLLAFAFLPYITFGTSDKYRKRALILVSLPVFAGLFASLVIWLYVYPINWPWVEYLTCFPFTSRFCEKYELDQVLH	1564537	1557938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1558400_1560082_1560237_1560403_1560505_1560661_1560738_1561013_1561109_1561202_1561267_1561426_1561537_1561933_1562096_1562237_1562313_1562590_1562703_1563555_1563751_1564008_1564128_1564504
837913	contig_7898_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_47508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204556	203259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_203300_204600
837914	contig_9415_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_109784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAAAAACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654749	1653648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1653600_1654700
837915	contig_4388_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_161962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508667	509852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_508700_509900
837916	contig_14559_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_83719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGTGGCCACACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243937	242231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_242200_243900
837918	contig_5253_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_61586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325333	326484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_325300_326500
837920	contig_5346_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_161848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTTGCTTAGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108842	109287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_108800_109300
837921	contig_6677_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_114162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAGTGAAGGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398411	396762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_396800_398400
837922	contig_7318_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_152215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205573	206357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_205600_206400
837924	scaffold_880_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_121424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCGTCTTTCAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378315	378830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_378300_378800
837925	contig_12622_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_5888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATTCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511491	1512951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1511500_1513000
837926	contig_10196_pilon	-	511	3	Intergenic	novelGene_132325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36.5	380	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	24	449	2396440	2395724	FALSE	0	CTCGCGTGTGCTTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNRHASAMLSAQERAHVAQVWDLIAGHEAHFGAELLLRLFTVYPSTKTYFPHLGACQDQEHLLSHGQRMLAAVGVAVQHLDNLRAALSPLADLHGQVLRVDPSNFPLLIQCFHVVLASHLQDEFTVEMQAAWDKFLTGVAVVLTEKYR	2396463	2395661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2395853_2395954_2396160_2396348
837927	contig_14687_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_107883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGGAGATCATATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26469	24742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_24700_26500
837930	contig_13044_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_99986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTTTACATACTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	60554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_60000_60600
837933	contig_8570_pilon	+	1134	10	Intergenic	novelGene_120140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	992	junction_3	394.18946375231	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1059	76	1134	284365	361810	FALSE	10	TCCTCCCTTCTCCTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWRKTDKERQGVAIYNFQGQGVPQLSLQIGDVVRIQETCGDWYRGHLIKHKMLEGIFPKSFIHIKEVTVEKRRNTENIIPAEIPLAQEVTTTLWEWGSIWKHLYVASKKERFLQVQSMMYDLMEWRSQLLSGTLPKDELKELKQKVTSKIDYGNKILELDLIVRDDDGNILDPDNTSVISLFHAHEEATEKITERIKEELSKDQPDYGMYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAGNDTLYTINFYWSAHLAWLNFKDYFVP	284289	361810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594
837935	contig_11964_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_164720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATTACTGTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233570	235406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_233600_235400
837937	contig_9177_pilon	+	1064	5	Intergenic	novelGene_32691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	255.337521723698	1011	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	126	782	437240	460987	FALSE	20	CATGAAGCTTCTTTATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMDPFGAPAGAPGGPALGNGVAGIGEEDPAAAFLAQQESEIAGIENDEAFAILDGGALGPQPHGEPPGGPDAVDAIMNGEYYQESNGPTDNYAAISQVDRLQSEPESIRKWREEQTERLEALDANSRKQEAEWKEKAIKELEEWYARQDEQLQKTKANNRAAEEAFVNDVDESSPGTEWERVARLCDFNPKSSKQAKDVSRMRSVLISLKQAPLVH	437114	461269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_437457_442070_442109_444198_444317_452974_453087_460815
837939	contig_7457_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_31372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGTAAGGGTAGAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377032	377939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_377000_377900
837940	contig_15838_pilon	-	769	5	Intergenic	novelGene_174333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.15454401062709	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAGACCCAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271390	164918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_165015_174515_174667_178532_178747_188264_188509_271326
837942	contig_11448_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_66428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCATTCTGAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600365	598411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_598400_600400
837943	contig_14202_pilon	-	1645	3	Intergenic	novelGene_157151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	34	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	291	1181	154582	153692	FALSE	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLTEEQRKKIEENRQKALARRAEKLAQQHQSTGSGSSITVNPSQSKQGSSQNPPRDSSKPVTRDVIFKQWNPTNSSNGDKRSHNSHKFRLSTPEPAEGIWKSQEEKPIACPSHRPPSQTTVTGVSPPLAQSSPEVPNQQHLGYKLGRGHAQASHKTKLTPFANTTHELLAVTVSSQETPASSPGQPPGDPELLAERVRPSTSGQTISDLHYGSGYVTPRTEGKRQQNLELSLHKEVSSQKGMCIQNGDRFQVKIGYNAELLAVFKSLPSRSYGNKPFVLFFKCFFLFLESLLI	156245	153227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_154641_155111_155249_156150
837944	SIRV6	+	374	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	499	0	333	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
837946	contig_8004_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_174407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGCACACTTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139426	138353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8004_pilon_-_138400_139400
837949	contig_1443_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_28395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	1060194	1059856	NA	10	TCCTGTCAAGTGGTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEAIRKEPGENSSRKACEVCGQTFPTQVALEEHQKTHPKEGPLFTCIFCKQGFLERATLKKHMLLAHHQVQPFAHHSPQNIATLSLVPGCSPSITSPGLSPFPRKDDPTIP	1060196	1059346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1059300_1060200
837950	contig_5935_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_102691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813060	814382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_813100_814400
837953	contig_3472_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_166951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	478	981	983477	982974	NA	85	AAAAAAAAAAAAATAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSITLESELILPLRTTDVPAKISGITSTNSKDRSNCVGPTKTYGMQQMQCSAINAYIKKEERSQINGLILQLEELEKEEQVKPKATIKKGIIQIRAEINDIEKRKTIERNNETRNWFFEKINKFDKLLARLTKKKRRYKYLKLEMTVGTLQLVLHHNRNKKDYKGIL	983954	982757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_982800_984000
837954	contig_16650_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_61947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGTTGGTTTACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53625	52314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_52300_53600
837955	SIRV6	+	361	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	506	6	340	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
837957	contig_1009_pilon	-	1868	3	Intergenic	novelGene_121782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_2	10.5	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTACTATAATGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356441	317807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_319533_326889_326939_356347
837958	SIRV6	+	368	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	337	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847
837959	contig_9888_pilon	-	935	2	Intergenic	novelGene_162259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGATATCCAGTTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44042	37227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_37784_43663
837961	SIRV6	+	359	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	8	2893	8	-2866	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCATGTGCCATGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2524	7922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
837962	contig_7870_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_108881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTCTTCAGAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140451	139069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_139100_140500
837963	contig_14289_pilon	+	465	5	Intergenic	novelGene_110566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCGAGATGGCGGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51969	66607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_52012_58660_58761_61216_61292_64644_64754_66468
837964	contig_11386_pilon	+	881	5	Intergenic	novelGene_82815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	132.422382926754	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	42	842	137770	165654	FALSE	25	TTGATGGCTACTTCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNLLLLLLLTLAGQGSVGSLPEVLQVPVGGSILVQCHYRLQDVKARKVWCRFLLEGCQPLVSSAVDRRAPEGTRMFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKARIRLTSAMISLVPRPFLNLLEFLEVPCRDPDSNSPYSQPFKPVPSSQEALSVC	137728	165693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_137813_137981_138315_140637_140759_141029_141170_165490
837965	contig_5084_pilon	-	1127	7	Intergenic	novelGene_64645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	83.6528873115301	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2	574	1344218	1335495	TRUE	75	ATAAAAAGAAAAGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAWRQGWRVGRWGLRRPQLPPLAGLVSQRAHSVLPVDDAINGLSEEQKQLRQTMVKFLQEHLAPKAQEIDQSNEFKKLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKVSL	1344219	1334700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1334960_1335200_1335506_1335727_1335822_1337106_1337277_1340930_1340983_1341204_1341295_1344062
837966	contig_7580_pilon	+	1496	7	Intergenic	novelGene_108589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	4.6696419087073	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	236	1036	19129	28667	FALSE	15	GATCTATTTTGTTTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLPKTKGTFSTFTPKDIIVTQREKPGHTYQKEDNLKNDLQKEATVLGAIQILSCLMISSLGAILVSAQYPTHFNPQVSTILMSGYPFVASLCFVVTGSLSIISGKKSTKAFAIRSLTSNAMSFVAAGAGFILLADNLVALRTASQQCDLENLSSLPYSDYYYSVYETKDCLLGSASLTGLLVVMLIFTVLELLLAVYASLLWWKQVHSYNFGSAFFLPQSQKHMQYVKKSSSRSWMSNCWHQSNKENTNAVAKCNETFLKSQPL	12918	29127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_13141_19115_19276_20999_21135_22595_22653_25547_25749_27125_27228_28508
837967	contig_8900_pilon	+	909	3	Intergenic	novelGene_171624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	74	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228384	361309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_228572_296436_296546_360696
837968	contig_14405_pilon	-	1006	6	Intergenic	novelGene_85673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_5	88.0149987218088	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	329	928	995902	866517	FALSE	10	TCATGTTGACTTCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNEYQGGAFVEIFSAQGKNPAAKWKIFGSPSVIWKEFDKEVKSFVFVLEGSSQTNKIQLPKENKQILGLIQRFLVLQIYVPLGQDFSTELLITDLGNIKRRLYLSTVHKELSSTPLHAKIPLFMIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDGMFKLLSRFFNFLMCF	996230	866438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_866724_885904_886020_979091_979165_989814_989909_993288_993379_995881
837970	contig_1551_pilon	+	930	2	Intergenic	novelGene_173418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCCGGAATCCTAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389408	393406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_390286_393353
837971	contig_15866_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_63589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCACCTAGCAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222647	220895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_220900_222600
837972	contig_8656_pilon	-	1384	2	Intergenic	novelGene_162351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	147	1184	549866	548465	FALSE	30	TAGGAGAAACTATTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLKRKRKSNFSVQETQTLLKEITKRKEVIFSKQLNTTINVMKRMAWEEIAQCVNAVGEGEQRTGTEVKRRYLDWRALMKRKRMKANIKLVGSGFPLPTSDLDDSLTEEIDEKIGFRNDANFDWQNVTDFRDAGGSLTEVKVEEEERDPRSPEFEIEEEEEEMLSSVIPDSRRENELPDFPHIDEFFTLNSTPSRSYDEPHLLVNIEKQKLELEKRRLDIEAERLQVEKERLQIEKERLRHLDMEHERLQLEKERLQIEREKLRLQIVSSEKPSLESELGSGEKSVLQPQDIETEKLKLERERLQLEKDRLQFLKFESEKLQIEKERLQVEKERLRIQKEGHLQ	550012	548264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_-_549041_549404
837973	contig_19402_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_80830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	120	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTACTAGTGCAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117987	120029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_118000_120000
837974	contig_7171_pilon	-	734	10	Intergenic	novelGene_101200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_9	386.09424423591	1	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	140	625	49603	37539	FALSE	25	AGTAAAGCACTGTGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGPLCVLSIVGLVILTRGQMLEETTPMPQMELNTMDSDVLTQVPFEERGTDTVYPELQSTPPTSTQETGETTWSQTKAQTRQPARMDERLTDDSMDMMGSHEVMDNPFFYDEDSLRKHGLLVAAVLFITGIIILTSGKCRPLSKFCRNYCRAYRVVRV	50430	37429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37564_37662_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44956_46837_46895_47590_47690_49542_49604_49743_49818_50365
837975	contig_4519_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_123751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGCAAAAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303079	1304747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1303100_1304700
837976	contig_13888_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_151779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTAGCTACGTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251185	250472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_250500_251200
837978	contig_5643_pilon	-	551	3	Intergenic	novelGene_39121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.5	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	126	449	651279	646295	FALSE	15	GTCAAGCCCTCACGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNLKDLAGRLPAGPRGMGMALKLLLGAGAVAYGVRESVFTVEGGHRAIFFNRIGGVQQDTILAEGLHFRMVPSVSTLPATLGRLTLFQGNDFSSSPFCPGVLEHV	651404	646192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646407_650870_650956_651152
837980	contig_14450_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_49032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259583	1260627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1259600_1260600
837981	contig_2854_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_120902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTAAAAAAAAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264302	1263140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1263100_1264300
837982	contig_6028_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_156563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCAATGGCAGTGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231596	230905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_230900_231600
837983	contig_6028_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_156562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCTTTTCTGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230849	230595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_230600_230800
837984	contig_7702_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_177293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76055	77137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_+_76100_77100
837986	contig_4103_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_52025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCTTAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535318	536541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_535300_536500
837987	contig_1337_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_84231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	265	615	149610	149260	NA	30	TTGCAAAGTTGTTGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPPPNPQRYGTLPGPNCLVRFLAEAGPHHGLPPRSNQPLGREARCVRPCVGASGSTPPLGDPRPPLAPGTWHQGRGIGAERQARIRLSVFIKRPGRCLQLDRNWGRMGGTSPRGL	149874	148815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_148800_149900
837988	contig_7839_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_45706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCAGGGTTTGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241727	240203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_240200_241700
837989	contig_2487_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_148489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGGAAGCGAAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223232	224483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_223200_224500
837990	contig_12886_pilon	-	1359	8	Intergenic	novelGene_135540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	8.18410604994429	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	312	1331	889832	884850	FALSE	25	CTAGACACTTGGAAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAEYCVSFADVKKAHTNIQDLIHLTPVLTSSILNQVTGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGALNAIRGLIPATSEGKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPHTAPNCKKLAIKAYGASIVYSEHSDESRENVTKRIMEETEGIMIHPSQEPAVIAGQGTIALEVLNQVPLVDAMVVPVGGGGMVAGIAITVKALRPSVKVYAAEPLNADDCHQSKLKGELTPNPYPPETIADGVKCSIGVNTWPIIRDLVDDVFTVTEDEIKYATQLVWERMKLLIEPTAGVGMAAVLSQHFQTISPEVKNICVVLSGGNVDLSSLTWVKQAERSASSQSDAV	893031	884821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_885066_885395_885606_886078_886154_886290_886411_887831_887936_888080_888208_889664_889837_892724
837991	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	38	3364	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
837992	contig_10299_pilon	+	985	5	Intergenic	novelGene_79792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTAACTGAAAGGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718433	752561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_718495_720605_720750_733024_733056_745855_745982_751938
837993	contig_13828_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_158295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAAATGACAATCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306678	308417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_306700_308400
837994	contig_5200_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_140152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGTCTGAGACACCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165193	180458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_165849_166655_166739_175658_175762_177460_177599_180271
837995	contig_11924_pilon	-	1878	2	Intergenic	novelGene_128034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	153	1100	821666	820719	FALSE	20	ATTAAGCTGAGCCGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARAQSGSGSQPLLQAPRDGGRQRGEPDPRDALTQQVRVLSLDQIRALRNTNEYTEGPTVVPRPGLKPAPRPSAQHKHERLHGLPEHRQPPRLQHTQLQSSARAPLTRSISTVSSGSRSSMRTSTSSNSSEQRLLGSSFSLGPIADGIIRVQPKSELKPGELKPLSKEDLGLHAYRCEDCGKCKCKECTYPRPLPSDWICDKQCLCSAQNVIDYGTCVCCVKGLFYHCSNDDEDNCADNPCSCSQSHCCTRWSAMGVMSLFLPCLWCYLPAKGCLKLCQGCYDRVNRPGCRCKNSNTVCCKVPTVPPRNFEKPT	825036	819940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_821718_824935
837996	contig_10734_pilon	+	947	5	Intergenic	novelGene_51420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	97.1969649731925	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	49	729	2116886	2127653	FALSE	80	GGAAAAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVHESLYFNPMMTNGVVHANVFGIKDWVTPYKIAVLVLLNEMGRTGEGAVSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVSSLISFKCARLSLVLALSQLLKQSPGPRCF	2116837	2127871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2127562
837997	contig_8310_pilon	-	1119	3	Intergenic	novelGene_75543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	5.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAGGAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191715	174867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_175584_177787_177959_191483
837998	contig_12624_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_61150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTCAATTTTGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950431	949759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_949800_950400
837999	contig_8330_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_71940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATAGGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342456	1341186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1341200_1342500
838000	contig_11413_pilon	+	571	5	Intergenic	novelGene_103136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1859.16236179092	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	12	515	87465	90805	FALSE	5	CTCAGTGTCCTCCCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVARARRGLKKFFKKVKKVIKKLIPKKGVGIQVSRIPS	87453	90861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88508_90624_90728_90794
838001	contig_17427_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_30276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATTTTGGTTTATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86428	87430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_86400_87400
838002	contig_7521_pilon	+	1712	5	Intergenic	novelGene_160536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1151	1585	207487	383588	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIPLTHGGTTDKRPESPHTGGLVRHLQSDSAGQQTPSRLIVSFLKIKFIKDGKDVGGTSEEPSSAVPPPGLKTAAMSLSLLDPTFLICSLTCWLDEKALAEDRGVQDNVVYNVLILFHLRHPQTVPTYQGEADVSTVAGTVP	197291	383715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_198389_207433_207602_246576_246730_248014_248135_383541
838003	contig_17519_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_177300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38391	39864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17519_pilon_+_38400_39900
838004	contig_755_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_119794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGTAATTAAAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622470	620999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_621000_622500
838006	contig_11117_pilon	-	1310	3	Intergenic	novelGene_148575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATCAAGCAACTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57519	31267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_31402_52756_52850_56436
838007	contig_5598_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_148295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTATTGTCCTAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793791	793400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_793400_793800
838008	contig_5598_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_148294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAAAAAATTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792154	791762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_791800_792200
838010	contig_8177_pilon	+	547	3	Intergenic	novelGene_86510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	24.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAATAAAAAATTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100332	103699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_100396_101360_101545_103399
838011	contig_11512_pilon	-	1188	8	Intergenic	novelGene_43267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAAGCTGGATGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471635	358654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_358727_434439_434579_435569_435738_452269_452451_455932_456031_468853_468991_470014_470204_471431
838014	contig_6654_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_85737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCATCAGTCAATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432776	434625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_432800_434600
838015	contig_9828_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_172250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCGTGTTCTTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118129	119158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_118100_119200
838016	contig_6795_pilon	+	869	6	Intergenic	novelGene_27747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	347.683419219266	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	90	815	331921	333686	FALSE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGLGAQKPYDDNAEYMKYTRLFRCSNEKGFFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQESPPPTTVPCDHCKLWVRKRKGTLCPPPARTENAQVTVPAQPTQCPGRQQHLQGDLTGTLRGLGNGAPPTVSRCVKPFSYQG	331831	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_331990_332117_332185_332539_332671_332735_332843_332948_333055_333440
838018	contig_4105_pilon	-	696	3	Intergenic	novelGene_21485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_2	3.5	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	66	392	75553	75054	FALSE	30	TTTCTATAAATTTTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPPGSLVSWPRSLGAPGRMCVTSSQSLTQISLQVPLSPSSPKFYWARESEGRPQAQSPHQHCIPSWHPTALTSSWVPRRPSSQPHPLGMGSGHQPGTLLSFPTPAC	75760	74749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_75365_75537_75568_75709
838019	contig_6710_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_93414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653680	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
838020	contig_11476_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_170498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTTGACATAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8574	8202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_8200_8600
838021	contig_11304_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_156695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	830	1177	339883	340230	NA	30	ACTAGAAATGCAGCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGRRFFVILLSLPNVFQHHSAFPPDLSYGGISLRNVPNLVFLLCVLPVACGSPVKLALCFEATAPGLEHVILGPVSTQTPGQQAGPIHHAHAGTGSGWPLPGVCPLYAPAVTQ	339053	340425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_339100_340400
838022	SIRV4	+	304	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTTTGAAAGCTGGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	3944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3900
838024	contig_8019_pilon	+	2198	3	Intergenic	novelGene_127001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	6	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAATGTTCACTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382862	387945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_382891_384520_386044_387298
838025	contig_18081_pilon	-	1118	5	Intergenic	novelGene_23798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	142.913216673616	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAGGATTTCTCGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165964	133692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_134317_137089_137172_140916_141016_146060_146235_165825
838026	contig_299_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_129511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTATCAGGTTTGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1686567	1687651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1686600_1687700
838027	contig_5092_pilon	-	1239	4	Intergenic	novelGene_62252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.2659863237109	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTATCTTGTTTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240002	135280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_136164_147766_147896_162376_162552_239950
838028	contig_5361_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_167221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593163	591255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_591300_593200
838029	contig_7411_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_137006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAAAATTGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264573	265122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_264600_265100
838030	contig_11413_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_103176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTATTTCAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435777	436153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_435800_436200
838031	contig_10106_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_73850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATTAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32537	33767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_32500_33800
838032	contig_546_pilon	-	991	2	Intergenic	novelGene_117251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACGCCTGGAGCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766074	709801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_710288_765569
838034	contig_14341_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_111891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	259	567	728055	727747	NA	30	AGATGAGGAGGAGAGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSLPPLSTLQDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQVCLSPSPFLPQLTPKPRMSHPGCSGLEGRV	728313	727548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727500_728300
838035	contig_1964_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_130928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAAACAAAACACCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621218	619392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_619400_621200
838036	contig_3103_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_146182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGAATGCTTAACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41209	42017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_41508_41967
838037	contig_6710_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_94775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
838039	contig_13992_pilon	+	1133	2	Intergenic	novelGene_147614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTTAATGGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77115	79389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_77501_78641
838040	contig_8538_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_4698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
838041	contig_12622_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_6006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGCTATAAATAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614995	1615902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1615000_1615900
838042	contig_10163_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_82666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349842	349204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_349200_349800
838043	contig_8712_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_58747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	45	286	330	99207	99163	NA	80	CAACTACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TENNKWYLQSLPRSLLACEFVFHFPCLTGWLRHRFFHFSDSLARVHKTAPYLVLKKNELLSAGTTKHHLNTHNITHSLTAGTDLEKKRERAEHKPMMVDSENGLHSSSR	99492	98504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_98500_99500
838045	contig_12278_pilon	+	1431	8	Intergenic	novelGene_152609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	35.1504056933652	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	41	760	246858	250366	TRUE	5	TAGGCTGGGCTCTGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFGGGVGSARVGMELHILEHRVRVLSLARPGLWLYTHPLIKLLFLPRRSRCKFFSLTETPEDYTLMVDEEGFKELPPSEYLQVAEATWLVLNVSSHSGAATAVQAAGVTKIARSVITPLAEHHVSVLMLSTYQTDFILVREQDLSVVIHTLSQEFDIYREVGGEPVPVARDESSNGFPRAQHGPSPTVHPVQSPQNRFCVLTLDPETLPAIATTLIDVLFYSHRFPSDLLLTSSSGGAMEDGAHRWTAAGL	246817	251183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_246971_247586_247658_248744_248939_249022_249156_249361_249486_250197_250282_250365_250461_250606
838046	contig_17134_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_171595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACCAAAAAAGTGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14051	13547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17134_pilon_-_13500_14100
838047	contig_12050_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_62629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGCTACACACACACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346284	345895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_345900_346300
838048	contig_16622_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_48505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144902	145941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_144900_145900
838049	contig_9051_pilon	-	1873	6	Intergenic	novelGene_170804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	7.69415362466854	97	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	40	1041	1031045	995881	FALSE	25	AAAGCCACCCCTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLSQYVEERDFVMPLDLGAKGSCHIGGNVATNAGGLRVLRYGSLHGTVLGLEVVLADGTVLNCLTSLRKDNTGYDLKQLFIGSEGTLGVITAVSILCPPKPKAVNVAFLGCPGFTEVLQAFSSCNRLLGEILSAFEFMDAECMRLVGQHLHLACPVQESPFYVLVETSGSSREHDGAKLDAFLEQALSSGLVTDGTVATDQRKMKMLWALRERITEALSRDGYVYKYDISLPVERLYDLVTDLRARLGPSAKSVVGYGHLGDGNLHLNVTGEAFSTQLLGALEPYVYEWTARQCGSVSAEHGLGFRKRDVIGYSKPPAAVQLMWGLKALLDPKGILNPYKTLPSQ	1031084	995048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_996138_1003612_1003779_1011248_1011392_1014193_1014338_1029405_1029575_1030922
838051	contig_9363_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_6476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	538	894	326464	326108	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGYSRVSLHITFFFPQMFSIHSWLSPWMRNLQIQTADCIALSFSIVGFKVVGSWHSSFLYHSPNSFKFLLSISLQDLYNFSIPFYITNMISGCCLLNFSGKAILDYFHACRFLTAS	327001	325464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_325500_327000
838052	contig_13932_pilon	+	974	6	Intergenic	novelGene_168865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	53.1021656808835	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	23	565	27336	29990	FALSE	10	GGTTTGTACATGGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPGPAMGLTVSALFSRIFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVQESADELQKMLQEDELRDAVLLVFANKQDMPNAMPVSELTDKLGLQHLRSRTWYVQATCATQGTGLYDGLDWLSHELSKR	27313	30399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13932_pilon_+_27403_27919_28001_28322_28433_28868_28941_29654_29781_29903
838053	contig_4769_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_117995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGGAGAAATAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883097	884864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_883100_884900
838054	contig_2204_pilon	-	1166	2	Intergenic	novelGene_71675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGGGGATAAGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15759	14088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_14916_15420
838055	contig_9995_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_47831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	118	489	958045	957674	NA	15	TTGTCATAGGTGCCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSPICLFIITYLNSCHLIPIIVYFDAQIVPDLAVGAPYSWLLCPFDILHCSFSTFLNFMAQQQHVPDTSCTVPAPAWTQPFLLGDLFLFSGEYYLETKIRVLGVHTVRDESLLLEPLSELS	958162	957265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_957300_958200
838058	contig_11978_pilon	+	774	6	Intergenic	novelGene_62995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	324.220048732339	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	113	697	1517714	1527267	FALSE	5	CCTACTGCTTCTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPDMDPEHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD	1517270	1527344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1517353_1517683_1517869_1520333_1520442_1523599_1523778_1526094_1526190_1527218
838059	contig_6192_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_170333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACACGCGTACACATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137821	136896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_136900_137800
838060	contig_9609_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_23096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGCGGATGTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485149	484913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_484900_485100
838061	contig_7943_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_173151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCCTAAGCAAATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269891	269193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_269200_269900
838062	contig_12299_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_29756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAGAAAGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538761	539393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_538800_539400
838066	contig_7035_pilon	-	1153	6	Intergenic	novelGene_83531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.0591260281974	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	25	771	711944	709668	FALSE	20	CATATCTTTGTGACTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEVSLAQRAEDGKTELSLMRFFLAHPQWRPPGHSSKFLGHLRGRVQQDAATWGATSVRSPTTPGLLSDSTSSLPEVFLANLLVHPLLPPKDLSPTSPCPAAATASLLASISRISQDPSCVSPGGPGGQKLTQLPELASAEMSLHAIYLHQLHQQQHQELWGEASASSLSRPWSSPFHPLSPDEGKPSWSSDGSQLLQPQEIERSEVEGHMSLFRAPSPTDYRPRDALVEQDL	711968	709285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_709793_710221_710346_710545_710643_710809_710944_711134_711372_711914
838067	SIRV6	+	340	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	533	0	367	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
838069	contig_8712_pilon	+	2307	5	Intergenic	novelGene_58862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798126	831628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_799900_822388_822504_825910_825962_828070_828246_831435
838072	contig_5020_pilon	-	789	6	Intergenic	novelGene_27959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	35.0177098051829	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	226	567	223081	210147	FALSE	25	ATCTGCTATGAAATCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRTSRENPICSAGGFLLNTSRHYKTKPTHGIGRYKHLIIAQEPKKKRGKVEVRPINLGTDHEYGVVNIHLTAYDMALAESYAQYVHNLCNDLSIKVEESYALPTKTVEVLRLQDQGNKTFLDSVLTTHERVVQISGLSATFAEIFLEIIGNNLPEGVKLSVKEHTEEDFKGRFKARPELEELLAKLN	260446	209924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_210222_211256_211347_212688_212792_223007_223178_239656_239746_260406
838074	contig_513_pilon	+	1513	1	Intergenic	novelGene_80132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGCACAGTGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303179	304692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_303200_304700
838075	contig_8238_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_165242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	202	534	410615	410947	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGRGIEAKAICPWGRSRKPAWTKDPAAGYQWGRGRKLKVFLYTVGNKERIPTLTTPIQHCIRGTIHCNKAKEKKKDKHWKEEIKWSLLAGNMFVYIENSKESKKPTTP	410413	411605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_+_410400_411600
838076	contig_13597_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_175641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTAGCCCTTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56142	55740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13597_pilon_-_55700_56100
838079	contig_723_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_169431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCCCTCACTCCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8440	7643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_723_pilon_-_7600_8400
838080	contig_3161_pilon	+	1589	5	Intergenic	novelGene_84541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663054	712589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_663688_664234_664317_667717_667830_704054_704114_711886
838081	contig_15043_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_175509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGCAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262384	260760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_260800_262400
838083	contig_8330_pilon	+	832	4	Intergenic	novelGene_71753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	32.1489588564786	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	146	832	569816	598341	FALSE	30	AAGAGGGGTGAGTATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPRRGLSRCFLTASCSTAPGTGSDAVCLLGCDQVHSHANQWVKLEAVMEPLQQQKQQQQQQKQPHLASLQMDAREKQGQQMRETQFLYAQKLVTQPTLLSATPGRPSANPALGPLARVPPATAAPRVFEQSSVNSEPEEEEGGLEDEDGDDEDAEVAEKEAQSASKCFHVQKAVHQDFRAAPMSSLLPAPGLPSHGLQTKEDHTKDASKASPSVSTSGQPSWNLEEQLKQNGGLTWSDDADGGRGREISRDFAKLYELDGDPERKEFLDDLFVFMQ	566712	598341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_566781_569738_570365_598001_598074_598275
838084	contig_6589_pilon	+	892	6	Intergenic	novelGene_26182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.8834501440274	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	191	322	1911359	1911490	TRUE	15	TTGATTGTGTTCTCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQDEGQRTTALGAPCAAALSAWDAGCRQPSLPPVPPHRCILPRLLGHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGLSVLTCSAFSFFPPGAAAAIPPERSGSRHWGG	1901824	1913577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901909_1903195_1903242_1903875_1903925_1911347_1911619_1912478_1912596_1913252
838086	contig_14549_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_176220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATGGACTGACCACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16881	14836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14549_pilon_-_14800_16900
838087	contig_11986_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_69190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTTCTGGGGCAAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646268	648018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_646300_648000
838088	contig_4364_pilon	+	922	6	Intergenic	novelGene_164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.7689427594609	685	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	338	622	1247050	1248143	FALSE	10	GACCTGTCTCGTTCGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGHVSGRHHQTEPEPARRPWRGPGPRQSGPKQLPDKWQHDLFDSGFGGGAGVETGGKLLVSNLDFGVSDADIQELFAEFGTLKKAAVHYDRSGRSLGTADVHFERKADALKAMKQYNGVPLDGRPMNIQLVTSQIDTQRRPAQSINRGGMTRNRGSGAFGGGGTRRGTRGGSRGRGRGTGRSSKQQLSAEELDAQLDAYNARMDTS	1244655	1248443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1244744_1245354_1245487_1246932_1247081_1247657_1247722_1247822_1247998_1248128
838089	contig_9389_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_83963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACTTCCCACACTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232302	231321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_231300_232300
838092	contig_10711_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_118412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTAAAAAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191115	192158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_191100_192200
838095	contig_13014_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_169372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGCTATTATCCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549315	548822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_548800_549300
838096	contig_13014_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_169371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCAAACTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548871	547925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_547900_548900
838097	contig_8291_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_99965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACGAACCCGTTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764123	764508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_764100_764500
838098	contig_16948_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_166401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCTTCCCCAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185626	185303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_185300_185600
838101	contig_7119_pilon	-	648	5	Intergenic	novelGene_41010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	427.816549469513	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATCCCGTGGTTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196805	188481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_194906_195021_196293_196379_196690
838103	contig_5171_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_161230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100815	100382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_-_100400_100800
838104	contig_8710_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_73527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTGTTTGTCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416890	418627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_416900_418600
838105	contig_6496_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_103548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207473	1206032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1206000_1207500
838106	contig_4392_pilon	+	1341	8	Intergenic	novelGene_117307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	171	junction_1	101.119448461425	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	164	1099	307347	384326	FALSE	30	CCTCCCCATTAGAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAEAESPLNPSCKIMTFRPSMEEFRDFNKCLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDDLLIPAPIQQIVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCEAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLVSDA	273707	384568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_307329_307491_308176_308353_313024_313140_343418_343613_368063_368114_378934_379039_384173
838107	contig_10599_pilon	-	1513	3	Intergenic	novelGene_49895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	1	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGAGGAAGAGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247957	237690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_238377_245764_245868_247233
838108	SIRV6	+	435	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	7653	3	595	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	31	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTCGCTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	3135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106
838109	contig_12977_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_122808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGACCTCGCAATCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61499	60706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_60700_61500
838110	contig_7697_pilon	-	625	4	Intergenic	novelGene_128273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	148.739892280301	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTCTGGCTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120617	118848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_118940_119437_119537_119907_120272_120546
838111	contig_10746_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_176819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1006	1320	186362	186048	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGARLGMGKKRERREKQEPPYPTPQKKSAEGACCWSAEMINREMKGKRMPLGIPPAQLCRSGTWFPSRAVQLEGVKLIYSARYSGDRKRRQVERVEKLRNEEK	187367	186021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_186000_187400
838112	contig_6101_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_114282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACCTGTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223712	221371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_222015_223024
838113	contig_1786_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_142581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	337.429498809257	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	38	520	26683	39989	FALSE	10	CCTTCAGTTTTTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRFRPRWPQRIMATLRSRVLLWRPLICSRGVEQFSLCARTQPITLLQRLPQPCGAGSPYRRVASEAAASGNSEIKKPTFMDEEVQSILIKMTGLNLQKIFKPAVQELKPPTCKLMTQTQLEEATTQAVEAAKVQLKMPPVLEERAPINDVLAEDKILEGSETAKYVFTDIS	26645	40185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_26849_27764_27932_29190_29339_39987
838114	contig_12079_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_67499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAATTTTGATGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846707	846411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_846400_846700
838115	contig_16776_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_130491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGCGATCCGGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32811	33249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_32800_33200
838116	contig_1861_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_77672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTAGAACTGCTCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115216	113310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_113300_115200
838118	contig_5766_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_175055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACACTCAATAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116367	1117093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_1116400_1117100
838119	contig_10197_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_115179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411985	414277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_412000_414300
838121	contig_7020_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_57047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTGTTAATGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46039	46571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_46000_46600
838123	contig_5039_pilon	-	563	4	Intergenic	novelGene_64911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.6298437156548	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	300	323	833790	829376	TRUE	45	AGATAACTAAGGGGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRSRFLSGRAASRPSAPWRLPGWRPEGDGRHGHAESHRLLLAIQAPRSRGPGAGGSVFGFCGLVVPKRSRERTSLLVGCIWPREPRRTTEWCPEVSQVMPKNSKT	834462	822377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_822533_829290_829391_833781_833893_834265
838124	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	34	3403	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
838125	contig_11429_pilon	-	601	7	Intergenic	novelGene_60465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	70	390	48520	46570	TRUE	30	GCTAACGCCGAGGAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGLAQWVRQEVWEVPISIHLHYMCMPHLSCRNCLCNSLQSSGHNHPGFFSGPSISISISSRPTVIPAAPIALVPTTCSRVAAATPMGTKGTPSGSPGRLARVIHPDLAAIQGLLHSWLAWHLRHVLDW	50797	45440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_-_45473_46142_46264_46511_46617_47259_47364_47448_47540_48441_48528_50735
838126	SIRV6	+	463	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	11	11	11	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	175	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTGGCTTGGTCACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148	2109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
838127	contig_9579_pilon	-	965	3	Intergenic	novelGene_150598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_2	176	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	16	318	833304	827641	FALSE	35	TTTGAAAAGTGAGCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEPGMTLLTIRIEKIGLKDAGQCIDPYITVSVKGAAIFFEFKHYKPKKRFTSTKCFAFMEMDEIKPGPIVIELYKKPTDFKRKKLQLLTKKPLYLHLHQTLHKE	833319	826993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_827738_827881_828000_833216
838129	contig_13421_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_166807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTAGATGACCCCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183955	183385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_183400_184000
838131	contig_4876_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_137889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAACAAAGAGAAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269266	268532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_268500_269300
838132	contig_15400_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_175702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGGCAGTTCAAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12068	12407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_+_12100_12400
838133	contig_15400_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_175703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTAAGTTTTGGGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12357	12961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_+_12400_13000
838134	contig_11702_pilon	-	1176	10	Intergenic	novelGene_141981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.6725722897911	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	414	1094	376758	372981	FALSE	20	CCCTGCCCCCAACCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDDIIRHIRIINGRAVEA	380787	372898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373032_374050_374078_374165_374269_374525_374660_374903_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377021_377281_380672
838135	contig_15039_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_110158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAATAGATGGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238279	237884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_237900_238300
838137	contig_6497_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_35585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCAGGGGATCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322463	321489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_321500_322500
838139	contig_7720_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_155787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCAAGGACAGAGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811180	811890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_811200_811900
838140	contig_15918_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_132718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCAGAAGCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50521	51593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_50500_51600
838141	contig_6503_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_145788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCATAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784765	785839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_784800_785800
838142	contig_5725_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_167145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGTACAGAATTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244182	243412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_243400_244200
838143	contig_7695_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_41692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTAACAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140617	1141566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1140600_1141600
838144	contig_8354_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_24150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAATTAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546159	546925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_546200_546900
838145	contig_8248_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_125020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAATTAGTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103209	104524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_103200_104500
838149	contig_2703_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_101811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047633	1046148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1046100_1047600
838151	contig_8616_pilon	-	1355	9	Intergenic	novelGene_72446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.4064463633448	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	66	1025	263983	255213	FALSE	20	GCATGGACTCATTCGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEREERRFVEIPRESIRLMAESTGLELSDEVAALLAEDVCYRLREATQNSSQFMKHTKRRKLTVEDFNRALRWSNVEAVCGYGSQEALPLRPTREGELYFPEDREVNLVELALATNIPKGCAETAVRVHVSYLDGKGNLAPQGSVPSAVSSLTDDLLKYYQQVTRAVLGDDPQLMKIALQDLQTNSKIAALLPYFVYVVSGVKSVSHDLEQLHRLLQVARSLVRNPHLCLGPYVRSLVGSVLYCVLEPLAASINPLNDHWTLRDGAALLLSHIFWGWDGQAGGWPTRSRSLVRLSGPFRVGRARRAASPLFTAEMQRC	267589	254882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_255346_259424_259646_259786_259862_261582_261678_262321_262373_262500_262652_263282_263370_263836_263997_267537
838152	contig_7411_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_137046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAACAGATCTTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887261	888945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_887300_888900
838157	contig_12735_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_140776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAACTTTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159852	158550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_158600_159900
838159	contig_4152_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_177304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGATACTAGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267852	266749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4152_pilon_-_266700_267900
838160	contig_13421_pilon	-	2018	2	Intergenic	novelGene_166814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAAGTATTGATTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232902	229792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_231498_232589
838161	contig_4857_pilon	+	663	5	Intergenic	novelGene_48823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	103.100375848006	122	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTCACTTTTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331378	1434480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1425666_1425779_1434266
838162	contig_5961_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_144174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGGTTATCACTCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275636	274799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_274800_275600
838164	contig_10988_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_104737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAGTTGTTCCATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186376	185518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_185500_186400
838167	contig_9335_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_147442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACCCCCACTTTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349145	348817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_348800_349100
838168	contig_12866_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_174651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAAGGATGTGACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674079	673326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_673300_674100
838169	contig_10861_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_39240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGTGAGGATCATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618005	618306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_618000_618300
838170	SIRV6	+	322	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	222	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCGCTTGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	10783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3171_7814_7924_10724
838171	contig_5539_pilon	-	2220	1	Intergenic	novelGene_104768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTCCTTCCTGGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173004	170784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_170800_173000
838174	contig_9633_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_139588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATCCCAAAACATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16691	16054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_16100_16700
838177	contig_11281_pilon	-	1181	5	Intergenic	novelGene_125432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.33012701892219	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	86	598	487395	477138	FALSE	15	TAACTCTGTGTTGGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSYGTGFLQISVEELERNLVIKINKDAVMKIAVAGDLFQLDRGLYHLNLTVGGIPFKDKDLVQPINPRLDGCMRSWNWLNGEDSTIQDTVKVNTKMQCFSVTEKGSFYPGNGFAFFSLNYVRTSLDVGTEMTWEIEVIARIRPATDTGVLLALVAKNHTIPLSVALVDYHSTKKLKKQLVILAIENVALSLMEIKMFP	487480	476554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_477150_478515_478567_480763_480937_485834_486004_487287
838178	contig_8182_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_173265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTGGTTAAGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415055	414110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_414100_415100
838179	contig_3380_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_60084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAAGAAAGGCAAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106883	108030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_106900_108000
838180	contig_501_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_134883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAAATTGACTAACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21115	20364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_20400_21100
838181	contig_10837_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_160655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATCCCTTGCTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25389	26233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_+_25400_26200
838182	contig_10837_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_160656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26185	26985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_+_26200_27000
838183	contig_21203_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_84467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGGATCTTTAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15414	13663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_-_13700_15400
838184	contig_3241_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_146396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1382	1696	797961	797647	NA	55	AGGACACGGTCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNILQCTGQDPTTEDYQVLKSKVPRLRNLGLGSQSGKSANRCRQACSHTRPASPLTSQIPPGDARPPNLVMRTQEGRDCPFLAHGCIPGPRTGTWCLFILFF	799342	797380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_797400_799300
838185	contig_21417_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_177308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAACCAAGGTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587	1127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21417_pilon_-_1100_1600
838188	contig_11590_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_125594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACAGGACATTGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703131	702285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_702300_703100
838189	contig_9616_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_177312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	633	51	683	40418	39786	NA	55	AAAAAATTTACTAGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTTVGEKSLLFDSDRMNVSYLLEDQARELVDEVIFSAQENVTDDAFKDTEDTWNSELQASTSKILNSGSVKPRDRVREFLVSEQAVNQSTHEINESKILSRFFSVSNLVSDTESSKGREIVLYQKSPFPGNGVGYSDNINSQESDTVLLSEDMPHEELDDGVKTHLLLKEGCKEKIEMECVDNHKTGTEDTRTLVLNFRWPPFVNDDIHIPGTSKSSLSDSLVCIS	40468	39783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9616_pilon_-_39800_40500
838190	contig_9415_pilon	+	1024	4	Intergenic	novelGene_109726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	193	309	483487	484836	TRUE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTFFPLSSLRKGQASTLRSLTEASIICSSLDVDSESLHWNEAARAGASAFVRLATNTTSGSVIMALIVILGLTESSFSDLILAVPVCLSAICVSFAIFSGL	483294	489163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_483524_484756_485005_486222_486397_488790
838197	contig_14441_pilon	+	406	4	Intergenic	novelGene_100540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.107647738325	86	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	317	385	117707	117775	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEHAGTLLVHTPLDMQGRDPLPRGALASLNPRGPNQ	111195	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112113_112154_116578_116623_117670
838198	contig_776_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_139920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802880	803231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_802900_803200
838199	contig_6418_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_81121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACAGTGTCCACTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69163	70575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_69200_70600
838201	SIRV6	+	312	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1239	418	1	-238	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGCCTATAGAACGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	10550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10200_10600
838202	contig_8453_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_125105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGGGGCAGTTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57895	58648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_57900_58600
838205	contig_7229_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_39854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTCAGGATTACATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350495	1349628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1349600_1350500
838206	contig_9678_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_146362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTTCGAAGCACAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213283	213810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_213300_213800
838208	scaffold_13505_pilon	+	1413	4	Intergenic	novelGene_111554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	76.412622575651	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACAATTAGTGAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608522	635969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_635129
838209	contig_5981_pilon	-	350	3	Intergenic	novelGene_35513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	87	262	348	66427	66341	FALSE	20	CTGCTGGGCCCTAAACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPSFPEDAKKRAQRILQACGGNSLGSYSASQGVNCIREDVAAYITRRDGDVPADPDNIYLTTGASDGISTILKILVSGGGKSRTGVMIPIPQYPLYSAVISELDAIQVNYYLDED	73197	66338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_66479_68904_69039_73121
838210	contig_1107_pilon	+	913	6	Intergenic	novelGene_126577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	3.40587727318528	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	262	558	601997	608647	FALSE	35	AACAAGAGTATTCTCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVPSLKDPGKEYDGFTITITGDKVGNILFSVETQTTEERTQLYHAEIDALYKDLTAKGKVLILSSEFGEADAVCNLILSLVYYFYNLMPLSRGSSVIAYSVIVGALMASGKEVAGKIPKGKLVDFEAMTAPGSEAFSKIAKSWMNLKSISPSYKTLPSVSETFPMLRSMIEVLNTDSSPRCLEKL	598054	609002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_598123_600690_600827_601939_602020_604351_604431_604571_604652_608532
838211	contig_8606_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_159399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAGCAATATCTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103116	101413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_101400_103100
838212	SIRV2	-	261	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4566	80	3391	-45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTAATTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341	1080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
838213	contig_4971_pilon	-	1384	10	Intergenic	novelGene_174756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	9.37029717435912	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	320	1237	417763	362355	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGQNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELEGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVRKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALKLTCEAIGKPQPMMISWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGSAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTILTIIADTTATTEPAVHDSRAGEEGSIRAVDHAVIGGVVAVVVFAMLCLLIILGRYFARHKGTYFTHEAKGADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKKEYFI	427912	362207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4971_pilon_-_362474_364663_364796_384196_384230_395275_395357_400361_400535_403858_403959_415025_415185_417642_417781_425561_425715_427763
838214	contig_12689_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_145065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349471	349023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_349000_349500
838215	contig_821_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_149420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATAGAGCACAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329482	328750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_328800_329500
838216	contig_10609_pilon	+	1481	1	Intergenic	novelGene_123897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34918	36399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_34900_36400
838218	contig_12513_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_177314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTTCTGGACAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8089	7781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12513_pilon_-_7800_8100
838219	contig_5643_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_38748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGCCTCTACTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153853	153163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_153200_153900
838221	contig_13300_pilon	-	1516	2	Intergenic	novelGene_125751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2	541	18866	17756	FALSE	80	TAAGCAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVDKLKEALKPGRKDLADDGELGKLLAASAKKVLLQKIEFEPASKSFSYQLESLKSKYVLLNPKTEGASRHKNSDEPQARRQGGEHAYESHTDGVPAPQKVLFPTEWLSLKWERVYRVGAGLHNLGNTCFLNATIQCLTYTPPLANYLLSKEHARNCECPCLASGWLPALGAGWCAH	18867	16780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_18043_18613
838222	contig_253_pilon	+	1254	9	Intergenic	novelGene_129703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	70.0156232565275	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	260	1087	503559	505970	FALSE	25	CCCACAGCATGCCCACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLNGRFMYGPLDVVTLTGEKVDIYVMTQPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLAFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDAGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLPPSQTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLESGSHPHAPTGPPRAALAKSSYGVGAPVDFLRKQSHGCEQEAGA	502871	506137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_502945_503057_503169_503483_503601_503788_503938_504013_504164_504231_504416_504724_504854_505627_505772_505940
838223	contig_12622_pilon	+	889	6	Intergenic	novelGene_6014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAAAGGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647381	1650570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1647418_1647568_1647741_1648486_1648647_1649689_1649790_1650068_1650158_1650238
838224	contig_5832_pilon	+	1309	3	Intergenic	novelGene_134123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCACAACCAAGATGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135067	145840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_135940_139612_139755_145545
838225	contig_10990_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_7418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1017	1469	598829	598377	NA	20	AGCTGTCGGCCTAATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDLEKTAPFLSLSTQSPAPHGQLPEGMSPLIRPPDLCLYRKHSGAGKASSTEHPPQPSAQPPSPSSLLQSCLRVLPSHITLPRAHTSELNKKSDSPTSKGGCNTCLSQGGKCRLSSHPNLQRFLLSCPRNAAERVSGLVKRQGGFTGSG	599845	598227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_598200_599800
838226	contig_12142_pilon	+	1776	18	Intergenic	novelGene_147803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	67.1499381001294	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	175	1362	94411	128277	TRUE	40	GGATGTATGCAATAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCLGWDFSTQQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGHHFFLLRPALWISPRMQSGGLHGGQPSSPEAPLPSLASLAGMRLEEGDIVVSLGTSDTLFLWLQEPMPSLEGHIFCNPVDPQHYMALLCFKNGSLMRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRCLRQRFWPPEEHLTTETSCRCLRMCLAPRCTSQTLPTQPVWALHTELFTALQLEQRCPLQTW	87472	135850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88923_89007_94352_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100329_100403_104919_105002_106921_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_112307_112401_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
838227	contig_8063_pilon	+	2341	1	Intergenic	novelGene_152432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTCGAACCAGTGGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233139	235480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_233100_235500
838228	contig_9981_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_121026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGCTGACAACTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34980	33777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_33800_35000
838229	contig_11307_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_105253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATACAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101475	100775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_100800_101500
838230	contig_4180_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_8363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGGCTCATTACACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866471	868173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_866500_868200
838231	contig_16049_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_174934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCTGTCAAAGACGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90647	90217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16049_pilon_-_90200_90600
838232	contig_7207_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_72100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCGATGAAACCATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748986	749632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_749000_749600
838233	contig_7410_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_106108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTCAGACCTTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442367	442008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_442000_442400
838234	contig_9272_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_125944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGGAGTTGGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441565	440007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_440000_441600
838236	contig_20614_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_107599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATTACTTGCCTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419521	420927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_419500_420900
838237	contig_6958_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_69960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	275	532	195104	194847	NA	65	CTAAAGCGAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEAPHCHGVSLPGPQTLRCSLQVSASPSPQSGISFEASALPGCIPQACLVGSEAVPRDTHTRAVSLSPTVCSTPSRIQNLVVEKASLTLRRMAPPCWPMQTLCSLALFLPPSLIVLFPPFLTFLTSHAWSKSFPPCYQNSPFLSPIHRTPNSTLAKMIHSCELMANTEPAMHQMTS	195378	194138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_194100_195400
838238	contig_11896_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_87993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTCCAGTGTCCAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48322	46501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_46500_48300
838239	contig_15236_pilon	+	780	3	Intergenic	novelGene_141669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	12	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	728285	728647	TRUE	5	CGGTGAGTTTGCTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRGAGGLSAFAPHPLCAVEAGAAVGLSTESAPSGPLLSSSCCRSVGALCPVWATLSPPQANAQSEVGVTEDYRQGSPVWGSVKSSKRITQPSSKSHLELWECWPLSDFERGAATPLCLV	728284	769314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_728791_732963_733049_769125
838240	contig_10581_pilon	+	817	3	Intergenic	novelGene_41451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAATTGTCTTCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796728	799362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_796832_798515_798807_798939
838241	contig_7965_pilon	+	741	4	Intergenic	novelGene_174402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	6.23609564462324	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTCACATGGTCGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193975	203511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7965_pilon_+_194021_195831_195899_197525_197578_202934
838244	contig_8063_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_152445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGGAGAATGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814239	813907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_813900_814200
838246	contig_15327_pilon	-	499	4	Intergenic	novelGene_70435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.02768199119819	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTCTGGTGAAAGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57998	56995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_57020_57202_57472_57593_57689_57887
838249	contig_7753_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_41499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222246	1223087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1222200_1223100
838253	contig_8538_pilon	+	649	4	Intergenic	novelGene_4624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	156.360694123129	239	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	90	647	791763	798393	FALSE	15	AGCCGTCCTACGTCTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLRRRYNIKGRQQAGPGPSKGPPEPPPVQLELEDKGTLKGVDASNALVLLGKKKKKKTKAPPLSKKEKKPLTKKERKMLQKILEQKEKKSQRAEMLKKLSEVQVSDTEMKLFYTTSKLGTGDRMYHTKEKPDEVAPQGPEKINSLSGAHRKRRRQQSEEEESESSEADEADEALAAGQVEAGAG	791673	798395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_791869_795025_795199_796187_796301_798227
838254	contig_8538_pilon	+	690	4	Intergenic	novelGene_4626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	36.012343562852	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	77	598	798578	802565	FALSE	10	GGGTGCTCGTGTTTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEERLKLPILAEEQVIMEAVAENPIVIVCGETGSGKTTQVPQFLYEAGYSSDDSIIGVTEPRRVAAITMSQRVAKEMNLSQRVVSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKVGHSSPKPGGGPGAREGGHHPWSEQPLHQLLAKCYVPLCHCVTLGKLLNLSEPLFLHL	798501	802657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_798584_799502_799652_801311_801405_802291
838255	contig_3727_pilon	-	979	4	Intergenic	novelGene_146751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_3	106.37982264822	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	214	873	319913	317185	FALSE	25	AAAACTGTCTCTGTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPCPRALLWTRNFEKSPTMTLQAVTSSTSRLLGTWQTQIRDTHQRASLLSFWELLPMRAEPLRKKKKVDPKKDQAAKDRLKRRIRRLEKASQELIPIEDFITPVKLLDKARQRPQVELSFEEAERRALLLKKWSLYKQQEHEMERDAIRSLLEAQQEALQELHLTSPELHAEAIKRDPSLLPFEREGPHYTPPVPNYQPPEGRYNNITKVYTQVEFKR	320126	317078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_317510_318461_318621_319550_319635_319821
838256	contig_15146_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_116956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	182	496	544568	544882	NA	30	GAGACCTATCCGTGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVRIGKKVGGWKAHLHLIGISLGLILVIIPLRLDRLSHYQYHLFTPINKITPHSSIKQAPFTSHFTVVNTETQTSGDSLRLCFFQKELGRLEYNKKHACPMI	544386	545127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_544400_545100
838257	contig_15146_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_116957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGGGCAACACTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545280	545633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_545300_545600
838258	contig_16098_pilon	-	391	4	Intergenic	novelGene_45944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	920.022101183807	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	164	355	349190	348324	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATALSGTLRSLPRPRSCTFSPCSAPRSPSVAWATCPNVAWRFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALIGGDSPDQVEESRAFRRTKAIHLSPFHSHLRSSSHNGR	349492	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348441_349004_349062_349172_349231_349369
838259	contig_10042_pilon	-	810	8	Intergenic	novelGene_79166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	68.719780000123	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	31	513	737320	717079	TRUE	50	AGAGAATGATATAAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTLCTTVRNMFIQTQDTPNPNSLKFVPGKPVLETRTMDFPTPASAFRSPLARQLFRIEGVKSVFFGPDFITVTKESEELDWNLLKPDIYATIMDFFASGLPLVTEETSSGEAGSEEDDEVVAMIKELLDTRIRVHDSVKNIQAYIETGPRGNKTDPQADCAGRWRRCHL	741119	714564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_714726_716942_717118_720481_720555_721699_721761_725762_725878_729321_729389_737192_737329_741097
838260	contig_10733_pilon	-	1682	10	Intergenic	novelGene_109958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	47.9513642489276	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	291	1184	72159	64478	TRUE	35	GAAGCCGTAAGAGGCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGADVRDILELGGPEGDAASGTISKKDIINPDKKKSKKSSETLTFKRPEGMHREVYALLYSDKKDAPPLLPSDTGQGYRTVKAKLGSKKVRPWKWMPFTNPARKDGAMFFHWRRAAEEGKDYPFARFNKTVQVPVYSEQEYQLYLHDDAWTKAETDHLFDLSRRFDLRFIVIHDRYDHQQFKKRSVEDLKERYYHICAKLANVRAVPGTDLKIPVFDAGHERRRKEQLERLYNRTPGGRGGVPATGAAQDRGPEEGAGEAESGPAEADNSGRYHCRAATHRAQGPQKEATPEKGG	72449	63135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_63186_63401_63698_63836_63910_64235_64308_64470_64657_64838_65002_65134_65294_70918_71115_71378_71471_72054
838261	SIRV6	+	366	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	413	94	247	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAACGTGGTCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1550	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
838262	contig_9836_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_176161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	430	876	37412	37858	NA	55	GAAAAAACAAATCTAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACYQAQLLNNPEVTLNVTSTLNPASLLPTNPTGELVHDCLQIIEEIYSSQLDLSDQPISNPALTLHTDRSSFIKNGTRKAASAVVTQTNVLEACPLPPGTLAQKVELIVLVQALQIAASKTTNVYTDSRYAFSVLHAHRPFGKNEAF	36982	39271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_37000_39300
838264	SIRV6	+	526	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	13	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGTGCCGCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2298	10779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2737_2829_3106_3165_10724
838265	contig_5502_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_154983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	570	962	382449	382841	NA	25	TCCCCATACTGTGACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWKPRSWAHSNIGVSRAEWLCGVLAFLGQHGWWQVEWEIMEWLFWLVLFYFSDIHTTKHTTFHQSPHVHFTDIDYILHAVHHSRFFPIISSPLAYIRALSAKTSSSPPLLPLVTTSYFWFLYVSLFSYK	381879	384073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_381900_384100
838266	contig_8513_pilon	-	1349	10	Intergenic	novelGene_174916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	27.0764806145322	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	268	1185	129752	125753	FALSE	25	GGAAGTGAGTGTGTCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRHSEERGWQLLWLCTGLFPPSKALLPHAQKFVDTRRKKLLAPDCSRRLQRVLRAGPRKQPLHQVEVEAAEQNITRICHKVYFPNDTSKMLEVGANTRVRDVCQSIAAKLQLASWEGCSLFVKIADKVFSQKEGDFFFDSLRQVSDWVKKNKPQKEGAAVTLPYQVLFMRKLWLNVVPGKDVNADTILHYHQELPKYLRGFHKCSREDAVHLAGLIYKAQFDNDRSQLASVPKILRQLVPENLMRLMSSEEWKKNIPLAYDKHVDKTVEEAKVAFLKWICRWPTFGSAFFEVKQTSEPSYPDIVLIAINRHGVLLIHPKTKELLTTYPFTKIASWSSGSTYFHMVLGSLGRGSRLLCETSLGYKMDDLLTSYVQQLLSTVNKQRSSRAPALANL	131863	125588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8513_pilon_-_125855_126290_126411_126688_126773_127452_127570_127806_127993_128517_128625_129256_129345_129638_129753_130682_130789_131702
838267	contig_14405_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_85618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATAGTCACCTGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316464	318484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_316500_318500
838268	contig_5005_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_84336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAACCCTTTCTTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639157	641456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_639200_641500
838269	contig_15689_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_164159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCAGTCGCCATCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168787	170026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_168800_170000
838270	contig_4732_pilon	+	688	9	Intergenic	novelGene_75441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	657.66765923223	2	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	292	687	653080	657751	FALSE	20	AGCGTCCTCAGCAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESMKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPP	634994	657752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644372_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712
838272	contig_14744_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_65948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAGTTAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276092	276835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_276100_276800
838273	contig_9177_pilon	-	446	4	Intergenic	novelGene_32665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	18.7794213613377	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	229	360	112950	112716	FALSE	20	TCCTACAACTTTGGATCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAPGGATPTIFSRILDRSLPADIIYEDQQCLVFRDVAPQAPVHFLVIPKKPIPRISQAEEEDQQLLGHLLLVAKKMAKAEGLADGYRLVINDGKLGAQSVYHLHIHVLGGRQLLWPPG	113421	112629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_112808_112910_112984_113092_113198_113331
838275	contig_9482_pilon	-	1184	3	Intergenic	novelGene_44221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	103	885	209792	203095	FALSE	25	TTATTTTTCTATCTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNQLLKTLWITVLLTLLGSPRVGVSLTATGGYISMNNLNDPPNWNIRPNSRAEGGDGSRWNYALLVPMLGLAAFRWIWSRESQKEIEKEREVFHQRTAAFQRDLEAKYHAIISENRRAVAQLSLELEKEQNRTASYREALISQGRKLVEEKKLLEQERARVMQEKRQLQPLRSAYQSCLEREEDWQRRARLLLKEFEDALTERQNIYCSLVLPRSKRLEIEKSLLVRASVDPVAADLEMVTGLTDIFRHDTYCGDVWNTNKRQNGRLMWLYLKYWELIVELKKFKRVEKAILEK	210504	202795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_203757_209671_209803_210412
838276	contig_8520_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_85455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278919	280172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_278900_280200
838277	contig_3472_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_166955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATATTTCCCAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018859	1020182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_1018900_1020200
838279	contig_12292_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_167018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTTTTAATGAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363091	365013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_363100_365000
838280	contig_16541_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_126718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGCCGAGAATCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113933	115008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_113900_115000
838282	contig_3942_pilon	-	1593	12	Intergenic	novelGene_128673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	7.76195425677693	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	36	746	353952	345309	TRUE	25	CCCTCAGTACATCAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKVSKAAGQLLMEWKTPDGQDNADVQFRHRTPGSPWKLGHCGLQDDTGLESCLCPLEKDAAQEFQLRRQQSLKSQAPGGPWSNWSSPVCVPAETPPPKLEMNCSVELLRPDGRRLLTLQGQQPPQLELPEGCHRTTPGAEATYSIHLHMLSCPCQAKATKTLSLRKTLRLSGAAYNVTVISRNRFGPGLNQTCLIAPDNRTEPRTLNISVGAKGTTMRWAGQAQATTYCIEWQSHDQDRSRATCTLT	353987	338691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_338934_339735_339818_340224_340322_341264_341400_344126_344283_345173_345312_346011_346149_347823_348065_348891_348978_349677_349807_350240_350275_353871
838283	contig_3004_pilon	+	899	3	Intergenic	novelGene_127528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	39.5	346	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGATGTTTATCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469996	539089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_470059_514582_514662_538331
838286	contig_14225_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_52748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCCAAATTTAGGGCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273549	274598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_273500_274600
838288	contig_14563_pilon	-	604	5	Intergenic	novelGene_135064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	302.976484235988	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	91	390	172842	161885	FALSE	5	CTTTCTCAGTTTGGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNKYGSFEVCHFENRWSCIFEEKEVFGKVYILFSRNVNPETEFSEGPIQSSRRWKHLLPLRNQDGSLLWGIVKNGLIQECCDNMQPRQGSFNMDSMK	175233	161670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_162008_166787_166855_172198_172279_172812_172877_175177
838289	contig_1009_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_121746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGATAATGTTATTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218734	220096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_218700_220100
838290	contig_14142_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_120613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACACGGGGTAGGGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586010	585660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_585700_586000
838291	contig_14142_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_120606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTCCTTCATAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585562	584550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584600_585600
838292	contig_1863_pilon	-	497	3	Intergenic	novelGene_156523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_1	27.5	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGTAATAACTGACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56403	49232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_49540_51778_51906_56340
838293	contig_10324_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_7866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATTGGGGTCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485614	484415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_484400_485600
838295	contig_12139_pilon	-	1439	2	Intergenic	novelGene_146483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	493	894	298392	297991	FALSE	35	ATAGTTTTAAATGTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIKLRLGEKEILEKAVKSAAVNREYYRRQLEERAPLPKYEESALGLLESSVADSRLPLVLRNLEEEGGEQEAFKLKEAVGRAKVAEHRLINGVNSVPNGTRSENGNLNQEESPRGVDDAKESPSESIEEAKE	300524	297445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_298441_300080
838296	contig_6304_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_122261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTCAAGACCATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199055	196702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_196700_199100
838298	contig_5300_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_144238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAGATGGGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27107	26327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_26300_27100
838300	contig_4891_pilon	-	953	9	Intergenic	novelGene_124582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	82.5332319432603	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	70	948	903560	892463	FALSE	15	CAGAGGGGCAGCTCGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSDCRTEDVQQHLAYRVPQGAAMSALYPSLEDLKVDQVIQAQARASPRMPALPAQEVAVSQPPVLYPNLAELGSYMGLSLSSQEVQQNLPQIPEGDSTAASGPSLGMVVAPVSGDSLGARRAEIKSGVREIHLCKDERGRTGLRLRAIDKGIFVQLVQANTPASLVGLRFGDQILQIDGRDCAGWSTDKAHRVVKKASAEKIIMIVRDRPFQRTVIMHKDSTGQVGFFIKNGKIISVVKGSSAAHNGLLTNHYICEVNGQNVIGLKDKKIGEILAMAGKVITLTIIPTMIYEHMVKKLSPSLLQHTMDHSIPDV	911551	892457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_892518_892762_892855_896061_896234_896313_896490_897160_897320_899588_899690_902740_902811_903506_903580_911501
838301	contig_4891_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_124581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTAAAGCCCCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892212	891971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_892000_892200
838303	contig_17171_pilon	+	971	5	Intergenic	novelGene_147380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.44948974278318	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACATTCTTGCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318552	324390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_318671_320563_320761_322300_322371_323711_323849_323941
838304	contig_253_pilon	-	594	4	Intergenic	novelGene_129704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.9236648566763	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	20	487	513615	507405	FALSE	10	TCTGGTCTGTTAGGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIFTP	513634	507297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507417_508847_509025_510269_510450_513516
838306	contig_9945_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_104811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAAAAAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58485	60126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_58500_60100
838307	contig_233_pilon	+	784	2	Intergenic	novelGene_14680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95386	96279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_95640_95748
838308	contig_401_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_42734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1514	1834	114591	114271	NA	35	AACTTTCAACCTGAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPSISQLERQVCLMKCSVHRWKMLLEGGRQTSKLEPSKERPAVSVAPGIPVVCFQGCLIWKNFHKTFVHSFTEHQHKLSEWSGNNSRKCLCPCREYMVPPETGRV	116104	114012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_114000_116100
838309	contig_9333_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_120339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACTTGAAATCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457869	458202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_457900_458200
838310	contig_6069_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_8013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAATTACTATTAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84585	86538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_84600_86500
838311	contig_177_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_41774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATACAACCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182651	182989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_182700_183000
838313	contig_20356_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_159545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTCCCTAGTAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112562	113520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_112600_113500
838314	contig_1009_pilon	-	665	2	Intergenic	novelGene_121747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	240834	238791	FALSE	30	ACATATTTACACGCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGDEGHLWGRRDPEKRQGLSGAPDPGVSAPTLLPAVATRGRKSRREALAALPPRPRAPSPPLALTHSELPRGLAWRQVFAGARDELRLLRRHTRKPLKLPPVHLTSSSWDLSYQLICQSWDSSIFTACEWSPAV	240834	238533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_238902_240537
838315	contig_18391_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_174091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGCCATGGAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41020	42569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_+_41000_42600
838316	contig_6001_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_128055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752607	753843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_752600_753800
838319	contig_7843_pilon	-	355	3	Intergenic	novelGene_152013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	227	118	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTACTAAATGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197364	178250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178311_190884_190953_197137
838320	contig_10494_pilon	-	508	3	Intergenic	novelGene_102187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.5	184	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059345	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056567_1058717_1058827_1059218
838321	contig_18799_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_171427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGTACAATCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75206	76264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_75200_76300
838323	contig_2646_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_69712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCTGGTGGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2551879	2550613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2550600_2551900
838324	contig_6079_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_160098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGGGGATGAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429902	431110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_429900_431100
838327	SIRV3	+	384	3	FSM	SIRV3A	SIRV305	436	3	13	39	13	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGGATTTGGTGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4016	6679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_4081_4568_4780_6570
838328	contig_709_pilon	+	1140	3	Intergenic	novelGene_57527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	23	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	207	581	1479182	1480457	FALSE	25	CAGCTAGGTGTGGGATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APDCFSHVPCGAEEAALTRWKTFLHPDGDHFTLINIYKAYQDITLHATSEHCVESWCHSHFLHVSALRMADVVRAELLEIIKRIELPYAEPAFGSQENILNIKKALLSGYFMQIARDVDGSGNYLMLTHKQVAQLHPLSGYSLTKKMPEWVLFHKFSISENNCIRITSATSPELYVPCRERGSFGSHTCRAK	1477154	1481016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1477308_1479128_1479317_1480217
838330	contig_4442_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_127938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTATGGCATTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185077	183787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_183800_185100
838331	contig_2703_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_101823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAATGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156564	1157138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1156600_1157100
838332	contig_17560_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_167582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCACACCAGTCCTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94076	94622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_94100_94600
838333	contig_9995_pilon	-	1115	2	Intergenic	novelGene_47769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAATAGAAAAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719225	716471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_717029_718667
838334	contig_16525_pilon	-	336	3	Intergenic	novelGene_133800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1066	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGATCGCCAGTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93450	91485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365
838335	contig_13421_pilon	-	1264	2	Intergenic	novelGene_166813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231068	229761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_230124_230166
838336	contig_6847_pilon	-	1365	3	Intergenic	novelGene_143848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	182	886	73970	73025	TRUE	0	CTCGTTTGTTGGTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAPPPLKMARAQAAAAAAPAAASRPCLHRGRRNASQAGPLREKWRTVLPHGRGDQRVSSLGEKLKGKYSFLSEEKGGVLFSTAEEKCLGNEGWEESTLPLPFKSENRRLRPEENLLTTDPRARSENGLFGQRLGDGRADLTSPMDWGAAAGRNEPRPSPSRAPPPSRNARSECPRVVSPPEKREWRRPDLPLRRAKASEESVQWKSFCKEMKNQKAADAAFSCLTLTTKT	74151	72450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_72930_73024_73192_73432
838337	contig_16431_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_87604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACTACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91418	92306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_91400_92300
838338	contig_15123_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_110902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACCTGAAAATAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141399	142236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_141400_142200
838339	contig_8866_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_77790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTACCCACACCAGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370776	369385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_369400_370800
838340	contig_1009_pilon	+	1129	8	Intergenic	novelGene_121749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	32.6484052803033	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	101	721	260614	272389	FALSE	50	GAACAAAATAAAGTAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRWQLREQQRLLALPPSLPSWAWPPSPTGMALTVDVVGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVTERGKAEAADLRPGDIIVAINGESVEGMLHAEAHSKIRQSPSPLRLQLDRSRAASFGETNGERSLELLATRFQGSVRTHTDSQSSLRSSYSSPASLSPRPGSPFSPRPATSPHTLTGEGVISRSFQSLALTPGPAADHLSYGGRPGSRQAGLSRAGDSAVLVLPHSPGPHSSQA	259035	272797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_259134_260611_260707_261459_261612_263744_263815_263909_264062_264225_264302_268833_268896_272373
838341	contig_4385_pilon	-	1312	7	Intergenic	novelGene_141495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	11.9268604418766	52	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	120	842	299494	296180	FALSE	30	AGAAACCTTTGTAAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKEPVLSSIGQAHPEPLLLPTPPWPEVMMAEIVKHFHPQLVDLHNYVPTCNTDQKLSNWSTLNRKVFHKLHFCVSEADIRKVVANTPGAVEPILWALRAKVEEGTLGGSPPSEAGPGRCSPGADGPWAKLTGHRCTAGPSSPLVLCDGKSPLSQRPPEEMSCTCPGQDMGDLGVQKVLENKEQALAILQETVKLFQVKLMMQAFQRIPGSECNSPNETLDQIWRDFYSARQANNPVSA	300682	295709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_296318_297390_297473_297581_297667_297990_298061_298300_298452_299297_299516_300584
838342	contig_11448_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_66435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAACGAACAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647201	646689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_646700_647200
838343	contig_16882_pilon	-	474	4	Intergenic	novelGene_148199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4752	junction_1	326.104277800829	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	3	440	187624	181967	FALSE	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	187626	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480
838344	contig_4125_pilon	-	1301	6	Intergenic	novelGene_25262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3069598	3053787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3054378_3058550_3058739_3059284_3059364_3061732_3061902_3063926_3064032_3069428
838345	contig_12886_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_135446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAGAGAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226317	225650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_225600_226300
838346	contig_7895_pilon	-	1070	7	Intergenic	novelGene_154461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGATGGATTCTGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809988	798621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_798664_799880_800116_801908_802078_802890_803067_806523_806783_807903_807965_809860
838347	contig_3184_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_169786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTCGATTCAGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9062	10359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_9100_10400
838350	contig_15236_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_141597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCTGAGCTCCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491829	491235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_491200_491800
838352	contig_6981_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_177317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAGGAAGCCAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149794	150635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6981_pilon_+_149800_150600
838353	contig_19064_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_177318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91565	92388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19064_pilon_+_91600_92400
838354	contig_10263_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_135861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGTGGTTAAGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959384	960214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_959400_960200
838355	contig_9345_pilon	-	866	2	Intergenic	novelGene_24581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	215	652	945468	944755	FALSE	5	CTGTGTGTGTTTCCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945682	944540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
838356	contig_6101_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_114277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195418	194188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_194200_195400
838357	contig_11281_pilon	+	931	4	Intergenic	novelGene_125429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	641	junction_3	133.029654171124	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGATGATGATGACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230445	237867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_231025_231738_231906_233428_233508_237761
838359	contig_935_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_45556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCACCCTATACAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351536	352846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_351500_352800
838360	contig_9843_pilon	+	843	3	Intergenic	novelGene_114331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_1	48.5	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAGACTCATATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107559	111461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_108309_108429_108503_111440
838362	scaffold_17541_pilon	-	978	6	Intergenic	novelGene_175236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	129.309551078024	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	115	729	153441	123044	FALSE	30	AGTCATTAACTTGGCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTVSTQRGPVYIGELPQDFLRITPTQQQQQIQLDAQAAQQLQYGGALGTVGRLSITVVQAKLAKNYGMTRMDPYCRIRLGYAVYETPTAHNGAKNPRWNKVIQCTVPPGVDSFYLEIFDERAFSMDDRIAWTHVTIPESLKQGCVEDEWYSLSGRQGDDKEGMINLVLSYTPLPAAMMMPPQPVVLMPTVYQQGVGYVPITG	153555	122794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_123049_132843_132935_133644_133798_136000_136184_138379_138530_153408
838363	contig_8581_pilon	-	971	3	Intergenic	novelGene_22801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	102	464	65545	64470	FALSE	35	TGAGTCCCTGTAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRILANGEIVQDDDPRVRTTTSPRSSTPRQSFLNRAHGAPLGGPGPRQQQAGARLGAAQSPFNDLNRQLVNMGFPQWHLGNHAVEPVTSILLLFLLMMLGVRGLLLVGLVYLVSHLSQR	67291	63962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_64740_65452_65580_67224
838364	contig_348_pilon	+	978	2	Intergenic	novelGene_67577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	465	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	220	828	159967	161229	FALSE	20	CAGTGCTGTGACATCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTSLVCGQSQLFNARKLKLLRNRNYCGERRFWKSHPTPDPTDCWSSFGTMNLTSQSFLPHAVTGLPTSYELLKEENEVAVLGAPVSPSPRSSAPMTSTVISIHSETSVPDHVVWSLFNTVFLNCCCLGFVAFAYSVKSRDRKMVGDLMGAQSYASTAKCLNICALVFSILLIIGFIILSATGTVMSLQAFSQTLKDHGGY	159747	161379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_160384_161037
838365	contig_10437_pilon	-	1426	11	Intergenic	novelGene_38451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	31.360644126038	1	90	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	693	1232	1007972	951458	FALSE	50	TATGAAATAAATAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYALHYERHSSNSLPGLMVDLRNKGVSEKYRKLVSAVVEYGGKRVRGSDLFSPKDAVAITKQFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGKLKETQYPYLGPSTLRDRPQDIIVFVIGGATYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVFPRGSFGFWTARPKQGGLPGYSEIRKQEMK	1022333	951263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_951551_986406_986525_1006041_1006164_1007555_1007664_1007873_1008033_1017987_1018162_1018590_1018674_1019086_1019210_1021496_1021608_1022051_1022171_1022311
838366	contig_12409_pilon	-	856	7	Intergenic	novelGene_169438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18.022362651871	202	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	320	778	137103	117946	FALSE	25	GACTATTGACTTTAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTTTSSEEGKQNLVIMGRKTWFSIPEKNRPLKDRINLVLSRELKEPPQGAHFLAKSLDDALKLIEQPELENKVDMVWIVGGSSVYKEAMNHPGHLRLFVTRIMQEFESDTFFPEIDFKKYKLLPEYPGVLSDVQEEKGIKYKFEVYEKND	137997	117867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_-_118025_121294_121411_124718_124846_134609_134716_137072_137129_137472_137598_137828
838367	contig_8063_pilon	-	2026	10	Intergenic	novelGene_152422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.7029235261671	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	148	1344	106010	76245	TRUE	5	TCTGTGGTGTGACTGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGPSLSCRLLSACVQAAGHETLSWVLDIFSLWTYALQLFISQQKQPHAMDLAGLLKSQFLCHLIFCYVFIASGLIINSIQLCTLILWPINKQLFRKINCRLSYCISSQLVMLLEWWSGTECTLYTDPRDYPKYGKESAIVVLNHKFEIDFLCGWTLAERFGVLPASKVLAKKELAYVPIIGWMWYFLEMVFCKRKWEEDRKTVLKSLLNLRDYPEKFFFLIHCEGTRFTEKKHQISMQVAKAKGLPGLKYHLLPRTKGFAVTVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHSDLYVRKCCLHGRRSCWWGRFALGMKSRLLCVHSVRVIVSGGNWLWWPVSKRTARSGRLWAGGQTGRCPASRACCTGASAFPVWMWGTPSPHPLSGGFPWKMSPRTRTSAPPGCTSSTRRRTPSRRSTTGGASSRRPRWRRRGGPGRC	160761	72360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_72929_76130_76330_77093_77170_77293_77563_81245_81349_86001_86156_87828_87991_95615_95786_105832_106095_160698
838368	contig_8552_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_80061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCACAATTAAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353712	352265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_352300_353700
838369	contig_7758_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_163528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTGAAGACTGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110763	110238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_110200_110800
838370	contig_18999_pilon	-	849	4	Intergenic	novelGene_177319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	3.29983164553722	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGAATGCACATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11035	8392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18999_pilon_-_8812_9163_9197_9645_9766_10758
838371	contig_1516_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_49924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGAGTTGAATTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100707	100337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_100300_100700
838372	contig_16122_pilon	+	731	4	Intergenic	novelGene_134543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.0388511535855	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	3	518	234904	250596	FALSE	20	AAGTCCTCAGGCCATGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAQVLEAADFAARKHRWQRRKDPEETPYINHPIGVARILTREAGITDIVVLQAALLHDTVEDTNTTLDEVELHFGAQVRHLVEEVTDDKTLPKLERKRLQVEQAPNSSLGAKLVKLADKLYNLRDLNRSTPKGIWQKHWPLSLAIYLHAHRSLPAISGLLHPKARPWIPA	234901	250809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_235007_235301_235358_235465_235707_250480
838373	contig_817_pilon	+	1091	3	Intergenic	novelGene_132441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	7.5	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTAGAACCTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542463	644302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_542818_622221_622296_643639
838374	contig_6557_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_32941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTGATAGGTGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303980	305168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_304000_305200
838375	contig_15859_pilon	-	1394	7	Intergenic	novelGene_50209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACAAGCTTCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376401	362043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_362162_364773_364831_365927_366118_367452_367589_372608_372728_375488_375671_375809
838376	contig_7979_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_125552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116644	1117552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1116600_1117600
838378	contig_12277_pilon	-	1267	6	Intergenic	novelGene_139668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	15.1578362571971	201	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	518	1030	84655	70379	FALSE	10	CCATGGCTCTGGCTGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRYFCDYCDRSFQDSLHNRKKHLNGLQHLKAKKVWYDMFRDAATILVDEQNKRPCWKFLLIGQCDFGSKCRFSHMSGRDLQELSLQVEEERRAKEWPVDAVELPEVRLEDWLEKRAKRLSSAPSSRAEPARTAIFQYPMGWPPIQELPPSLRAPPPGGWPLQPSIQWG	99240	70141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_70509_76302_76415_78338_78420_79707_79771_84528_84684_98751
838381	contig_7760_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_138431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGTAAATTTATATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56002	57218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_56000_57200
838382	contig_7760_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_138432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTGGTTGGCAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59868	60429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_59900_60400
838384	contig_6576_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_42294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439251	440023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_439300_440000
838386	contig_2726_pilon	+	1130	4	Intergenic	novelGene_165894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	302.467996470517	23	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	173	472	176473	177160	FALSE	30	CAAGAGCCTTAGTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAPSFERGVYELTHNNRTVSLKTINAVQQMSLYPELIASVLYQATGGIEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINR	166719	177818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_166829_176409_176501_176771_176894_177010
838388	contig_4782_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_73640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCGGTCTTCAGCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404146	418403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_404706_412784_412883_414169_414398_418262
838389	contig_8330_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_71927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1542	junction_1	0	36	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGGTACTATGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286997	1284893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1286419_1286966
838390	contig_6163_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_103848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAAATGCAGCTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473288	474715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_473300_474700
838391	contig_160_pilon	+	1118	6	Intergenic	novelGene_156324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	51.6836531216593	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	21	842	207052	215995	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLLLRMAVPGFILGVFIHLLHISSVANYPNGKVAKSCHGMIPEHGHSPQSHPIHHISVNQTTFQPGDQLKVTLSGPPFKGFLLEARDAEDLSGPLIGSFTLIDSELSQILTCEDIQGSAVSHRNPSKKNDIEVYWHAPSSAPNHIQFLATVVEKYKIYWVKIPGSIISQPNALPFTTPKATTARLSTLPPDSHLTKPFSASACGNTKFCIRSPLNCDPEKERACVFLSFMRDDRSVMVEMSGPSKGYLSFALSHDRWMVCTSYYISGSERRITGVSSN	192866	216271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_192887_207051_207248_209616_209754_210984_211080_212797_212946_215749
838392	contig_17968_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_154544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGTTTTAGAATTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47653	47218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_47200_47700
838395	contig_9940_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_125360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCATATATTCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267483	268471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_267500_268500
838396	contig_9940_pilon	+	155	1	Intergenic	novelGene_125361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268706	268861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_268700_268900
838397	SIRV4	-	281	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1242	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3916	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3900
838398	contig_16884_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_161817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGAAATATCACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42620	43046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_42600_43000
838399	contig_6031_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_56722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48653	49253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_48700_49300
838400	contig_10864_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_107108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAGTTAATGAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031779	1031196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1031200_1031800
838401	contig_10864_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_107107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAGTATGTCCAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031092	1030790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1030800_1031100
838402	contig_3861_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_57900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCAAGCTTGACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156450	155071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_155100_156400
838403	contig_8304_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_153180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACATTTGTCAGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153066	151497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_151500_153100
838404	contig_9363_pilon	+	983	9	Intergenic	novelGene_6809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	184.5541925831	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	768	215	982	1622283	1625948	FALSE	20	AAACGCTGAGCTGCCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIEEGGIKVKLTLVDTPGFGDSVDCSDCWLPVVHFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPKEAQALKQKIRDQLKEEEINIYQFPDCDSDEDEDFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGETLFSIFGRHPSSPTLYLQ	1622068	1625949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623110_1623401_1623537_1623619_1623738_1624342_1624445_1624573_1624628_1625894
838405	contig_15327_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_70507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGAGACTTGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439171	441343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_439200_441300
838406	contig_4114_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_15628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTCAGAAGTAACTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469254	467245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_467200_469300
838407	contig_7057_pilon	-	1283	2	Intergenic	novelGene_123215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTCCCTTGAAATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535612	534247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534688
838410	contig_16103_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_118963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGAAGTCCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035119	1036315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1035100_1036300
838412	contig_378_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_175167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATGGTCTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230081	230451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_378_pilon_+_230100_230500
838413	contig_15859_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_50210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTCAGTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370935	371899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_+_370900_371900
838414	contig_5935_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_102769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATAACAGTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403215	1403558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1403200_1403600
838416	contig_4868_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_136762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACATTTATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175601	174355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_174400_175600
838418	contig_821_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_149392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCTCTGGGACAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142354	143050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_142400_143000
838419	contig_14954_pilon	-	1236	3	Intergenic	novelGene_165167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	6.5	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	73	1107	55664	54017	FALSE	10	GCCATGGTCCTTCTATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWPGCLPAPRRAALGTVPGQPGPAMARPQRTPACSPDSIVEVKSKFDAEFRRFALPRASVSGFQEFSRLLRAMHQIPGLDVLLGYTDAHGDLLPLTNDDSLHRALASGPPPLRLLVQKRAEANSSGLAFASNSLQRRKKGLLLRPVAPLRTRPPLLISLPQDFRQVSSVIDVDLLPETHRRVRLHKHGSDRPLGFYIRDGMSVRVAPQGLERVPGIFISRLVRGGLAERTGLLAVSDEILEVNGIEVAGKTLDQVTDMMVANSHNLIVTVKPANQRNNVVRGASGRLAGLPSAQPGLPEPDDDNSDLVIENCQPPCSNGLSQRSPCWNLHPGRSPPGARSSLPSLDDQEQASSGWGSSIQGDGSGFSL	55736	53887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_54766_54996_55220_55601
838420	SIRV6	+	475	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	344	37	171	-37	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGCCAACTAAGGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1474	2503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
838421	contig_16541_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_126750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAACTAGAAATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415835	414856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_414900_415800
838424	contig_2278_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_118081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTAACTGTAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628788	628392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_628400_628800
838425	contig_10324_pilon	-	1237	7	Intergenic	novelGene_7861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	332	904	450287	432735	TRUE	10	CAAGCGCTTGTCCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGDPTTHPSPSLPLEVKAVAGLPLWGSSRAPVRPAHLRERHYDEKGPVDPLVFHEVRDERNGLDGLPQTHLVGQDAVQVVVVQRHQPLQAFDLVLLQDAVDHQSRLLVHSLSNSMGHGVVGLQATSQGLGHTVFIINILLGILNDVPCIHLRDVVAVWIWNLLLLLHRQGRRLCRLRLLFLLLLLILLF	450618	427118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_427228_427315_427367_432382_432515_432693_432754_446753_446878_448140_448290_450006
838426	contig_9363_pilon	+	846	2	Intergenic	novelGene_6616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACATACCGGCCGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856519	857546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_857159_857339
838431	contig_3132_pilon	-	1518	10	Intergenic	novelGene_127422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	136.256656876682	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	299	1399	229252	210841	FALSE	25	CACCATATTCTTGATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKLYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229550	210721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223861_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228914_229210
838432	contig_6902_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_135600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCAGTAGCAGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488257	487222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_487200_488300
838434	contig_15471_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_175212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAGAATAGGAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176490	177041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_176500_177000
838435	contig_10324_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_7849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCCTAAGCAGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299466	300888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_299500_300900
838436	contig_10225_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_86842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCTGGAATACCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30207	28860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_28900_30200
838438	contig_4418_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_98362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	384	704	711001	710681	NA	45	AAAAAAAGCAGCTGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLAKLMLLLNLHSSHSLACGSWDVSLQKSLACCLTCRFWVHQSLQPCEPAEIFSLPDSQLGTCQPLHLCEPFSHNYVSYLLEVNFSLHIIYIHFTGFAPLENPD	711384	710567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_710600_711400
838439	contig_5018_pilon	-	1304	7	Intergenic	novelGene_47189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.7515430335097	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	769	1173	1588599	1586939	FALSE	15	AGGCCTCCCTGGGCCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLFSDYVGSPITCICFSRDGQCTLVSSLDSTLRLLDKDTGELLGEYTGHKNQEYKLDCCLSERDTHVVSCSEDGKVFFWDLVEGALVLALPVGSGVVQSLAFHPTEPCLLTALGGSVQCWREEAYKAEGGAG	1591421	1586807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1587089_1588169_1588285_1588368_1588478_1588568_1588637_1590294_1590592_1590906_1591013_1591093
838440	contig_5479_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_133614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCTTTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384139	385091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_384100_385100
838442	contig_5467_pilon	-	870	3	Intergenic	novelGene_111950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	37.5	293	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	355	387	72646	72614	FALSE	25	AACATTTTTTTTCCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGGPAGADLEAAAADEVPQVARAPHAPGPGGDAEPAAGRPGSGLHEFTLTVPFRSPLEAEIARGSLAPDAEPHGGVVHKEFTLNGSVLAVRWTAEDPRLLRISIINFLDQLSLVVRTMQRFGPPVFR	73472	72130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_72729_72961_73091_73329
838443	contig_9995_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_47741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCGCTGCCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563903	562698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_562700_563900
838444	contig_18967_pilon	-	865	9	Intergenic	novelGene_165317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	27.5315160316318	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2	502	53438	50419	TRUE	10	CTTCACCTGGCCTCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRYSRSRSCGRRHSGGGSRDGHRYSRSPARRGGYGPRRRSRSRSRSGDRYRRGARGPRHHSSSRSRSSWSLSPSRSRSLTRSHSRSHSHSRSRSRSHSRSQSHSPSPPREKLARPAASPAVGEKLKKTEPAAGKETGAAKVTQADTAGEAEAEDAEGPEQAVQGG	53439	46683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_46846_47023_47049_47391_47475_50241_50289_50372_50432_50692_50754_51076_51121_51464_51723_53313
838445	scaffold_16539_pilon	-	870	4	Intergenic	novelGene_68301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.716781150323	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGCACTTAACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98727	96909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97527_97821_97890_98114_98252_98679
838446	contig_10437_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_38244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAGCAAATTGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371871	372925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_371900_372900
838447	contig_5018_pilon	-	1131	2	Intergenic	novelGene_47001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAATCTGCTGCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214698	1213453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1213836_1213949
838448	SIRV1	-	442	3	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	2653	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7713	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_6478_6560_6814_7552
838449	contig_7066_pilon	+	979	2	Intergenic	novelGene_42116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	0	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	485	820	570082	570417	FALSE	25	CCTCATTGGGCAAATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHCKGRGSLQRKPKAEPGRTTTDDWPGRALSARSHELRGLNKEDRAAGVGPEVKVPAEKTQNCFMQGPAVQAAFGQEHLCPGQSAYKVSSQGSCPHILSQQLLLGFWEVA	567000	570576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_567066_569662
838450	contig_6946_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_59758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.08248290463863	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	74	637	113515	130381	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQRSAIAAGLSLGGWRRRWNCWSSMWCASPVAMMAFCAGLLVPNSVPAQGQEAPGRHGADCEVCKEFLNRFYNSLIAKGVNFSLDIIEKELISFCLDVKGKENRLCYYLGATEDAAAKILSEVTRPMSVHMPARKICEKLRKIDSQICELKYEKKLDLASVDLSKMRVAELKQILYSWGEECRACIEKTDYVNLIKELAPKHAATHPKTEL	113441	130878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_113630_125850_125979_127165_127308_130202
838453	contig_4689_pilon	-	2156	2	Intergenic	novelGene_165417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAACAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204100	1200200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1200931_1202674
838454	contig_9995_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_47799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCTCAGCTGTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810267	809351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_809400_810300
838455	contig_6691_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_60155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344091	343385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_343400_344100
838457	contig_7629_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_153590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGATTTTTTTTTTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357882	357157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_357200_357900
838461	contig_10196_pilon	-	894	5	Intergenic	novelGene_132346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_4	68.6221538571911	531	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	217	588	2475895	2474111	FALSE	45	TTAGTTTGAAAGTCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWPSRFALRSAVPARKRFALLLLTGGAEGPAADAALEGAEAEARPEASEDNEDDDEALPHSEVVDVFQEGLAMVVQDPLLCDLPIQVTLEEVNSQIALEYGQAMTVRVCKMDGEVMPVVVVQNATVLELKKAIQRYVQLRQEREGGIQHISWSYVWRTYYLTFAGEKLTDDRKKLRDYGIRNRDEVSFIKKLRQK	2476111	2473804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2474169_2474605_2474681_2475090_2475197_2475338_2475430_2475853
838465	contig_18272_pilon	-	1517	2	Intergenic	novelGene_7078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGCTGGGGGCGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529504	527905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_527950_528031
838466	contig_6048_pilon	-	1145	7	Intergenic	novelGene_73274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.271274542869	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	7	774	2006289	1978823	FALSE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEAAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS	2006295	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978886_1984400_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110
838467	contig_7254_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_145839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCAGCGTGTGTTCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172294	172531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_172300_172500
838468	contig_7644_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_64232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113073	114187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_113100_114200
838471	contig_5718_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_110331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	675	1037	557904	557542	NA	45	GAAGCTGATGAAAACAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSYEGSFSQIPHTHPSTHIEATHLWLASYSFPRVKIFLTTSPQDLDYQGPYTSAWSWHYGKEFSHLRDKNGYILVRMVERLKRSDLHPKIHNSSQGNVDDFHILQLTVSQKDETLFHQD	558578	557210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_557200_558600
838472	contig_12733_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_129602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACAAATGATGGCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378567	378003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_378000_378600
838473	scaffold_19766_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_34272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAATAAAAGCATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330107	332048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_330100_332000
838475	contig_8814_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_167749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTAATATAAACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67318	66872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_66900_67300
838477	contig_16205_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_156865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGCATCTACCTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77765	75707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_75700_77800
838478	contig_10756_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_170663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAACTAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64685	64441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_64400_64700
838479	contig_846_pilon	+	1457	3	Intergenic	novelGene_136111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	252	848	224710	225306	FALSE	15	CCTTGCCCTTGATTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRNLHRRLAWAKASKDPRIAVGQQSPLEKKILNLGGVHTTAARRLIIQKYQEEYETLCKEQAHSLDYWLAKAESYYNKRVVEMMKEQQTDSETEEKTTQSIEGQKRYYFVPERELKHIERHIHRTGKARELRNKTLRHLLRPVSETTLPKIVPEEHGMQNTERKKQVNEREQMQIKDHQERMIRGRELLEQRLKERLLKTNQSQPPTHKKHRKVKKEIKEFERVIAYPLFQPHHASLIKVNILREKSQDREEGNTVIKPHQRKFLTMPPFLRSQIGKIKN	220071	225915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_220097_224042_224119_224559
838481	contig_4469_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_21893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301044	300437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_300400_301000
838484	contig_5084_pilon	-	904	6	Intergenic	novelGene_64548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175.5505625169	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580127	524726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_525079_525167_525278_537729_537792_544656_544785_549014_549096_579956
838487	contig_10803_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_170120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGACCTTGCCCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74448	73645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_73600_74400
838488	contig_10864_pilon	+	1357	3	Intergenic	novelGene_107067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	11	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	832846	837301	FALSE	75	TTAATAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVAGVIRRLDETVVNRIAAGEVIQRPANAIKEMIENCLDAKSTSIQVVVKEGGLKLIQIQDNGTGIRKEDLDIVCERFTTSKLKSFEDLASISTYGFRGEVS	832845	838343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_832962_835127_835219_837193
838490	contig_6199_pilon	-	1053	5	Intergenic	novelGene_126362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	136.02757073476	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	165	806	185138	144334	FALSE	50	ATTTCAGCAAAAAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCSPAVGDPRRRLCCRVHSWGRFRGSRCTSGPAKIIACLGRTPPSSQAETSAGTMSAYSKNYNPFDDDAEDEGSRDACDLPDGPSAPADRQQSLRQEVLRRAEATAASTSRSLSLMYESERVGVASSEELIRQRGVLERTEKMVDKMDQDLKTSQKHINSIKSVFGGLVNYFRSKPAETPPEQNGILAPQPNSRLKEAITTSKEQESKYQASHPNLRKLDDSDSIPGVASAAVSSDAYPKNPHLRAYHQKIDSNLVLHASCGLTSGS	185302	144086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_144372_160176_160276_167517_167604_172211_172409_184916
838491	contig_7561_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_170572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAACAAAAAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19159	18205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7561_pilon_-_18200_19200
838493	contig_1442_pilon	-	467	4	Intergenic	novelGene_172168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	30.2691628926573	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	122	466	579548	552745	FALSE	70	TACAAAAAACAAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQKEALQRIISTLANKNDEIQNFIDTLNHTLKGVQENSSNILSELDEEFDSLYSILDEMKESMISSIKQEQAHKSQELQSQLSQCNNALENSEELLEFATRSLDIKEPEEFSK	579669	552743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_552847_555798_555931_558901_558998_579533
838494	contig_8006_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_173926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13045	14304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_13000_14300
838495	contig_13593_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_156136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180962	182420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_181000_182400
838496	contig_16622_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_48512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189859	191772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_189900_191800
838498	contig_1594_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_138825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	465	881	526870	527286	NA	85	AAAAAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRHSVRALMPSKRPWLWGACLTHGRHSPACEQKTGGQTLNLLFQNQQPAGATLIMSVFTLALVCLTPKYRCLCSVGICLLPQHRCVQLTVEGLHVKTLHLCTMCHGLSGSFFVYIEHPQLQVKLTDSPTEGYDHVK	526405	527777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_526400_527800
838499	contig_2114_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_104256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTTGAACAGAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446341	445365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_445400_446300
838500	contig_4364_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_3024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCTCAGATTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533317	1533022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533000_1533300
838501	contig_1348_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_174367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTTTTTAGTCAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284522	285117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_+_284500_285100
838502	contig_6710_pilon	-	623	2	Intergenic	novelGene_95981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	14	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2	424	658255	653562	FALSE	5	GCCTTGCACCTGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCPPSVRRVFVRPDNEELSLWWTFSSGTKLETKWADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	658256	653362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
838504	contig_8913_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_177322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGTAAGAGACTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54761	54394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8913_pilon_-_54400_54800
838505	contig_12301_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_110031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135205	134279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_134300_135200
838506	contig_10446_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_162500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960825	962064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_960800_962100
838507	contig_3832_pilon	-	1295	1	Intergenic	novelGene_161444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAGAACAATTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275555	274260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_274300_275600
838508	scaffold_12510_pilon	-	1407	4	Intergenic	novelGene_151401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	75.0658969765158	595	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	238	627	583153	580926	FALSE	20	ATTAGTTTCTATTTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQAPGPRAGPCILPIVRDGKKVSNTHYYLLPERPSYLERYQRFLREAQSPEEPAPLPVPLLLPPPSTPAPAAPTATVRPMPQAAPDPKANFSTNNSNPGARPPSLRAAARLLQRGCPGDGPEAGRPADKVRMLQAMVHGVTTEECQAALQSHGWSVQRAAQYLKVEQLFGLGLRPRGECHKVLEMFDWNLEQAGCHLLGSCGPAHHKR	583390	580145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_580933_582517_582646_582802_582899_582994
838509	SIRV6	+	363	2	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	13	274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2298	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2585_2737
838510	SIRV6	+	491	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2298	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2627_3065_3165_10724
838511	contig_10023_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_123510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACCCAGAAAAAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439384	438519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_438500_439400
838512	contig_10023_pilon	-	796	4	Intergenic	novelGene_123504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	402	701	436923	423717	FALSE	55	GCTACAAGACAAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWTGLNTGWVTIVPRPGAGFWVRMSGCPPCWTKGLPALLLAISVTRVFLALSLFCAPLLLTVVDVERCPATEAWAAMGTGAETGCWLTETVVVLSTEL	438264	423621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_423744_425959_426120_436810_436987_437926
838513	contig_5620_pilon	-	392	3	Intergenic	novelGene_161350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.5	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	76	387	382782	348702	FALSE	35	TACATCTGAATTAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASGLVGLLGSALATTWRAARPPLLCHSLRKTSSSKGGKSEPTKQSLKKPKLPEGRFDAPEGSHLEKEPLERAQNLPDMEIGNEKDAVLTFKSHTLTSVICF	382857	348696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_348797_365394_365548_382718
838514	contig_14720_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_164991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACATCTATTTAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216634	215542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_215500_216600
838515	contig_5791_pilon	+	1086	4	Intergenic	novelGene_35808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_3	70.6745278646337	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	318	662	325962	335278	FALSE	25	TCTTGAATTTTATACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKKKRKSPGVAAAVAEDGGLKKCKISSYCRSQPPARLISGEEHFSSKKCLAWFYEYAGPDEVVGPEGMEKFCEDIGVEPENIIMLVLAWKLEAESMGFFTKEEWLKGMSSLQ	325644	335702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_326048_328474_328567_334698_334770_335182
838516	contig_500_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_31114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGAACAAATAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562559	1561932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1561900_1562600
838517	contig_6276_pilon	+	2044	4	Intergenic	novelGene_174120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	16.3095064303001	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	52	957	128155	136490	FALSE	35	AAAAAATTTTTTTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIQQQLAQLDNESWPGMAEADRDRLQLVKEKEALLQELQLIPQQRRSEEDVARLEEEKRRLEEEIQRARATSVQGATERILLQEKRNCLLMQLEEATRLKSYLQSQLKSLSASTLTVSSGSSRGSLASSRGSLASSRGSLSSISFTDIYGLPQYEKPDADGGQLLRFDLIPFDSLGRDAPFSDSPGPSGFNKQRRSLDTPQSLASLSSRSSLSSLSPPSSPLDTPFLSVSRDSPLAQMADGFEVPGLGALDRLRAQASALGDEELQGTASLQPHGFPGDGEGSRDRGPQLACAPAGGSAVESVPTHSDPIGRSRTAP	128103	137577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_128343_131345_131436_132412_132979_136428
838518	contig_17968_pilon	-	967	2	Intergenic	novelGene_154541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTTGCTTATCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44324	36795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_36828_43389
838519	contig_15371_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_151446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTGGAGAATTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154091	152988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_153000_154100
838520	contig_11539_pilon	-	2607	4	Intergenic	novelGene_177323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.63299316185545	6	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	275	319	60790	60746	FALSE	30	TGTGAATGAATGAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGKVGVKVFLVNIHAQVYNDISHGGIFEDGGLERSHVFPSIHDAVLFAQANGRDAAPGHSFQGPPVDPELSLYDDDLQEDGPSYWDLEQEMFGSMFHAETLTAL	65791	58457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11539_pilon_-_60794_62119_62198_63833_63980_65744
838521	contig_9871_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_75716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCTGCCTTTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587309	587936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_587300_587900
838522	contig_13300_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_125838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176879	1175702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1175700_1176900
838526	contig_12411_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_145688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCAAACTAAATCAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441832	441105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_441100_441800
838527	contig_12626_pilon	+	812	5	Intergenic	novelGene_80429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	743	junction_4	156.884511663835	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGAAAAAGAGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118503	155877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637
838528	contig_8328_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_174042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71584	72395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_+_71600_72400
838529	contig_9696_pilon	+	459	4	Intergenic	novelGene_68768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGAAACCAGAAGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136220	141055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_136382_137979_138092_139913_140029_140984
838530	contig_12885_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_176903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	569	1015	212788	212342	NA	60	TAAGAGAAGAAGAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPPFEPSSKSSSLRYWYLIVGSRGFCRGSSYSSLFTTFSSLLASSGFSFLLPFFNSVVEAVWSAAELLDGLGATESLFGASLNDCIFSTATGSNTSCFPFLEAELVTFRKWPVTIMWVVSCCKVSWELPHSIHFKIWDLQASNCQV	213356	211275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_-_211300_213400
838531	contig_18108_pilon	-	1066	8	Intergenic	novelGene_33499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	476.128948406001	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	117	854	278305	266909	FALSE	20	GCCAAGTGTGCCTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYRKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGPGLAYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYDSFWEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKLGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSEEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTTITLVKQGFEPPSFVGWFLGWDDNYWSVDPLDRAIAALRT	282794	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269653_269897_270023_276346_276411_277875_278092_278281_278346_282718
838532	contig_10674_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_6429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAAAAGAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198549	200014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198500_2e+05
838533	contig_5092_pilon	-	856	6	Intergenic	novelGene_62273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	566.148531747632	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAATGATTGTTGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252780	232281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252629
838534	contig_709_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_57678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTATAATGTATTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3993673	3996059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3993700_3996100
838535	contig_6576_pilon	-	813	2	Intergenic	novelGene_42327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	27	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	810	2	811	612059	610828	FALSE	70	AGAACAAGGAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLARNHSEGEQPSKKSQKRKHKKKMVILDDSDLFDTDLDFSHEFISQSSTSFSSSEESKARDKQSTQETKKPNKCLESNIDSIPHPPKTPAEKKCSALVSHCLNSLTEFMDNMSFLDALLTNVKEQKGFGKNDFSWTNGKVKNGLCDEFSLESSDGWPSQCSGELKAVVEALSFTKCSSDISKALETSLNSCKRLGRDPTKDLTLYVSQQRNDIYFSQSVANLDNAWKRIAVIKNVFSSRSLLNLGNRQAGIIEYLPTLRNICRTEKL	612060	610825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_610961_611382
838536	contig_12050_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_62770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGATTCTGTGTCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879545	880351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_879500_880400
838537	contig_992_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_164300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATCATTTCAAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369905	370504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_+_369900_370500
838538	contig_8464_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_125383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAACTACTATCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806009	807484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_806000_807500
838539	contig_17198_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_62437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCCAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290285	1288935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1288900_1290300
838540	contig_4426_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_15391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCTATAGGAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476767	477322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_476800_477300
838541	contig_5236_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_100939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCATTATCATACCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988343	989228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_988300_989200
838542	contig_7110_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_176018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228713	230006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7110_pilon_+_228700_230000
838543	contig_19960_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_164194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTATGAAATTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59046	58087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_-_58100_59000
838544	contig_6102_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_32006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGGCACTTGGGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452372	453156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_452400_453200
838546	SIRV4	-	299	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	8	1214	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTTAAGAACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
838547	contig_11396_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_71383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGACTGCACATTAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090603	1089144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1089100_1090600
838548	contig_11448_pilon	-	2471	1	Intergenic	novelGene_66434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGGTGCCTCATGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644324	641853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_641900_644300
838550	contig_15327_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_70487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGATCTGGAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396113	397758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_396100_397800
838552	contig_14684_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_99672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATTAAAAATATAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336239	337335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_336200_337300
838553	contig_4847_pilon	+	876	6	Intergenic	novelGene_156166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	325.684264280607	35	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	92	439	101069	109628	FALSE	35	ATAAACAACATTTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKEPSPLVPLHWLGFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLLMVAKLGFTVFTRPHQS	99615	110065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99660_101021_101092_101400_101478_102278_102381_108569_108658_109570
838555	contig_10902_pilon	+	1096	7	Intergenic	novelGene_65687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	335.220698446064	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	316	666	189165	209479	TRUE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVSLRAVHLGKEAEGQTKDYKVRRPPKWITDKRVSRRHAILEVVGGQLRIKPIHTNPCFYQSSGKSQLLPLKINLWRWLNPGDCFSLLVDKYIFRVFSTHSETEMECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGGSATVVFCSHSKKHRGE	168111	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_168199_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_209426_209783_218452
838556	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
838558	contig_10898_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_172765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTAGAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126478	125255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_125300_126500
838559	contig_5260_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_144377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTGGGTTGGAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301873	299976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_3e+05_301900
838560	contig_3525_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_135143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCGGAATTCAAGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606128	607416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_606100_607400
838561	contig_10569_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_44063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGTCGTGTAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233299	233805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_233300_233800
838562	contig_2854_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_120903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287941	1286708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1286700_1287900
838563	contig_4151_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_65260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAGAGAATTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595385	598092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_595400_598100
838564	contig_9888_pilon	-	986	3	Intergenic	novelGene_162278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	56.5	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGCTCCATAAGAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228644	220508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_221269_224841_224925_228501
838565	contig_12050_pilon	+	762	5	Intergenic	novelGene_62654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	244.066589274321	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	130	558	359783	363762	FALSE	5	CTTGGAGCCCTCTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKQTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLGWISSPFPC	359653	363966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362033_362184_362571_362656_363729
838566	contig_7415_pilon	-	1233	9	Intergenic	novelGene_168676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.1304883272325	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	42	413	302651	261474	TRUE	40	AAGACTTAGTAAATACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGTEEAKYRCPRCMRYSCSLPCVKKHKAELTCNGVRDKTAFVSIQQFTEMNLLSDYRFLEDVARTADYISRDTFLKRPTGNKHMYYLKNRARRQGIYLKLLPNGFTKRKEKSTVLLACEAPVSSESSCVHRKKSTG	302692	234462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_235024_239427_239540_259273_259352_261404_261486_265596_265666_294744_294826_302270_302357_302441_302549_302634
838567	contig_16211_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_150104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACATTAAAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219637	218520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_218500_219600
838569	contig_16686_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_162100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGACTTGCCTGAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175799	175153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_175200_175800
838570	contig_2892_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_118982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAGAAAACCAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17016	16772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_16800_17000
838571	contig_16382_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_160236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCCTCAGTGCAGATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283391	284679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_283400_284700
838572	contig_5461_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_156836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATCAGCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812945	811927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_811900_812900
838573	contig_19146_pilon	+	1214	4	Intergenic	novelGene_172286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	43.1508980207828	23	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	264	794	17784	19024	FALSE	5	TCTGGGGCTCCCTTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFACLSFRQPYAGLVLNRVKTLETRWRPLLSGHCNRTLAVHIAHRDWEDNAWRELLLDRLGMTPAQVQALIRDGERFGRGVIAGAGSGTEGRNRRVSPVRAGLVDLGETVQCPNDLAPEEAVQLETRALLPDLKHKYLTALSNPRWLLEPIPGKGGKDVFQVDIPEHLIPSGQEA	16157	19444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19146_pilon_+_16209_17487_17646_17729_18037_18746
838574	contig_10914_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_176668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCCTCAAAGACATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18143	17546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10914_pilon_-_17500_18100
838575	contig_18214_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_166027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTGAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254210	255083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_+_254200_255100
838576	contig_7919_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_28034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTCCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174090	172632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_172600_174100
838579	contig_8682_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_165289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGCCAGAAGGCAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225100	224565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_224600_225100
838580	contig_10371_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_175488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804432	802299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_802300_804400
838584	contig_4125_pilon	+	788	8	Intergenic	novelGene_25271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_7	20.9450203521271	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	36	788	3332015	3353739	FALSE	20	TTGGAGCAGATGCAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVVPDEEVIEMYEGSHVPLEQMSDFYGKSSHGNTMKQFMDIFSLPEMTLLSCVNEYFLKNNIDYEPVHLYKDVKDSIRDVHTKGIMYRAIEADIEKYICYAEQTRAVLAKLADHGKKMFLITNSPSSFVDKGMRYIVGKDWRDLFDVVIVQAEKPNFFNDKRRPFRKVNEKGVLLWDKIHKLQKGQIYKQGNLYEFLKLTGWRGSKVLYFGDHIYSDLADLTLKHGWRTGAIIPELRSELKIMNTEQYIQTMTWLQTLTGL	3331979	3353739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_3332069_3332710_3332849_3336190_3336252_3336678_3336782_3336919_3337022_3342785_3342868_3343866_3343954_3353613
838586	contig_12746_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_152180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATGAATCCAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466596	466165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_466200_466600
838587	contig_5222_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_59008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAATTTCCAAAATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264491	266356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_264500_266400
838588	contig_16103_pilon	+	1089	7	Intergenic	novelGene_118937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	29.8928642544225	400	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	79	915	808369	810767	FALSE	5	TTCCTCAGTCTTGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFDLFRGFFGFSGPRSHRDPFFGGMTRDEDEDDEEEEEGGGATWGYGSPRFGDPQPPEEFGFSFSPEGGMRFHRNFGFDDLIRDFNSIFSEMEAWTLPSRPPELPGPESETAGERRRREETLRDSMLKYPDSHQPRIFGGVLESDAGTESQKPGPDWGSQRPFHRFDDMWPVTPHPRAREDNDLDSQVSQEGLGPVLQPQPRSYFKSVSVTKITKPDGTVEEHRTVVDSEGRTETTVTRQEADGSPRDDQESPRPSALDDTSSILDLFLGRWFRFR	808290	810941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_808422_808972_809233_809406_809595_810016_810069_810214_810322_810437_810529_810681
838589	contig_12810_pilon	+	1782	11	Intergenic	novelGene_145704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24.4272388943163	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	541	1590	519916	623125	FALSE	55	AGTAAAACAAAGTATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLGKSQEQENHAALVSFSEDEKYQLRKFVNKSYLLDKRAHRQVYYSLIDILLAYCYETRVTEGEKNVESAWNIRKLSPTLCWLETCTNVHEILVSFGRRVLCYPLYRHFKLVLKACRDTIKILQLGKSAVLKCLLDIHKIFQENDPAYILNDLYISDYCVWIQKAKSKKLAALAEALKKDSLTKAQLGFELEELETAALLVQEEETALKAACSASRQQTPCCSPEASDLEESDSTSSSTTQDSDSEQDERQENGSKTAGSLQGPLLEESSALLTDGVEVCRNMALLRSEGSQGKPLALSCAPGRSGPLIEELEDQLKTIVQISEAEGSVAGNHSSVQERDDRQTPIH	492519	623317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_492570_496557_496611_498294_498434_499170_499332_510384_510477_519870_519965_530618_530774_533251_533306_535654_535779_561661_561783_622578
838590	contig_5423_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_85198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTATTCTTTAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257177	257986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_257200_258000
838591	contig_5549_pilon	-	496	11	Intergenic	novelGene_81640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	796.595028857198	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTTATTTCAATTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445621	441959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442504_442535_442879_442936_443118_443145_443324_443363_443637_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
838592	contig_16632_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_154141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTGCCACCCAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111241	110383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_110400_111200
838595	contig_6471_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_172097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAACAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79707	81313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_79700_81300
838596	contig_4071_pilon	+	782	3	Intergenic	novelGene_151887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.5	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	56	565	338050	343402	FALSE	15	CCAAGTTCACTGGTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRRRRYLTKYSRPCLE	331780	343619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_331835_338048_338517_343359
838597	contig_8412_pilon	+	1256	5	Intergenic	novelGene_118402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	24.8130510014387	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	188	1159	795054	803271	FALSE	50	TGAAATCACTTCATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCSLRVWFLSMAFLLVFIMSLLFTYSHHSTATLPYMDTEALDGTHRVKLVPGYAGLQHLSKEGLVGKSCACHHCMGDTGTSNWFDSHFDSSISPVWTRDNMDLPPDVQRWWMMLQPQFKSHNTNEVLEKLFQIVPGENPYRFRDPHQCRRCAVVGNSGNLRGSGYGQDVDGHNFIMRMNQAPTVGFEQDVGSRTTHHFMYPESAKNLPANVSFVLVPFKALDLLWIASALSTGQIRFTYAPVKSFLRVDKEKVQIYNPAFFKYIHDRWTEHHGRYPSTGMLVLFFALHVCDEVGRRSWTHGTERMPSVSQISSITSKGNVFL	794866	803368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_795393_797426_797621_800907_801088_802741_802788_803058
838599	contig_11978_pilon	-	373	3	Intergenic	novelGene_62925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCTCCTAGTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871495	869751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_869888_871150_871307_871414
838600	contig_13044_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_99996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182528	183680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_182500_183700
838602	contig_6233_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_74814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	16	51	545	595	222505	222555	NA	30	CCAGAGATTCTGATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRKEGQAEWSKQRILLSEKQSHLPVPDVLSDHCQEPTGSPQAWPRGQRTAALQLSSSLPHRILEISFSWYLLKESPPFPHLLPSYVTAIQWLPLQPSVWQRASDCGRPSDLLHVRGCTNVHPFIKSAWTHLYAFASASPPVWGALPALTVFNSYSSFKTLLKVPSPQESPPSCLCNLSPFYMPLVNHTHYTVVCFFV	221960	223959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_222000_224000
838603	contig_7380_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_157524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGCATTTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211859	213345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_211900_213300
838605	contig_21386_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_177025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCCATATTGTGGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33565	34756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_+_33600_34800
838606	contig_7887_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_124914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1071	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	545345	544968	NA	35	CAAATGTCTGAAAGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHCCPHAAPDTARSPGPALLPWRGPARCWAPSACHEDRHRVGGPAADPEGGRLHPPLLLVYQGAAGLRHERAASSPQLASLKVGRAGQTQEVWLQLLWQSLPPSFPFFSLAPSPTPVKTPGASRA	545346	544688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_544700_545300
838607	contig_15744_pilon	+	1474	3	Intergenic	novelGene_83568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	42.5	245	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	242	592	44813	46137	FALSE	5	CGTGTGGGCTGTGCCACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELRDCLLLCGALTQDPNCLLAGSSFLGPGNFPDSFPPTTPSSTPALPEFTPGPPPISYQSDIPSSLLTPEKPASCLPGQMAPVGHLDPAHNPGPQGLHNPNLGAPPGPQLHHQNPPPPPRPPLGQAGAGPGSELAFNPTTGVMGPTSMSAAGEAPEPALDLLPELTNPDELLSYLGPPGLPTNSNDDLLSLFENN	44474	47019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_44716_44812_45056_46029
838608	contig_13244_pilon	+	1431	2	Intergenic	novelGene_86955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291784	293979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_292691_293454
838611	contig_7056_pilon	-	1043	7	Intergenic	novelGene_43726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	49.3110873266179	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	918	126	1043	999458	991256	FALSE	15	ATGCCCTTCGAGAGCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKMPSKQPGSSIGERKASVVVTTPESPSAAQDVLEQPASPSSTLSGCRSICTQVPTASQGLLKLFQRNSSTEVLGAKGAKEKMKEESWNIHFFEYGRGMCMYRTARTRELVLKGIPEGLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSV	1002989	991255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_991390_992984_993103_995075_995291_995816_995968_996481_996641_999317_999531_1002936
838612	contig_12540_pilon	+	824	5	Intergenic	novelGene_148124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	603.622139670175	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCATCTGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245894	1253124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1246027_1250202_1250311_1251168_1251271_1251605_1251747_1252783
838613	contig_10968_pilon	+	610	4	Intergenic	novelGene_84291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.361373010266	417	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTATGACTCCACGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166018	178389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_166156_166362_166412_167440_167497_178021
838615	contig_15423_pilon	+	1478	7	Intergenic	novelGene_171589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_5	236.327926595417	24	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1266	212	1477	287628	292768	FALSE	40	TAGAAACTGAGAAGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIENQEELRILGDELKKQQEIIAQEKSQIIKKEEELSRTCERLAEVEENLKEKSQQLQEKQQQLLSVREEMSEMQTEINEMENLKNELKSKGLALERTEMEKLELTQKLHENNEEMKSITKERNDLKKLQESFEIERDQLKGYIREIEATGLETKEELKIAHMNLKEYQETIDELRRNVSEKTAQIINIQKDLEKSSAELQGKIPALHVEQEPPANVKEVSETQETTDEPVQLEGQFKAKGSTPASVEMERLRLTAELQETNEEIKSITKERDDLKMIKDALQVERDQLKEDIRVTLAKIQEAEDKQEQSFNMNEKDNETKKMLSEMEQLKEQCKAKDSTLLGVETEKLKLSERLQESQDEMKSIAKERDDLKKLQEILQSESDQLKKNMGELIAKHLEMEEKLKVAHFHLKEQEETIDKLRVNVSEKETEISSFQKELETANHELQKKIQELQEKQEQILSVKEISETQRKVSELEQIMEHLRATESTPQS	285865	292769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_286026_287576_287868_288937_289097_290017_290306_291918_292210_292353_292513_292639
838616	contig_3700_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_138098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGAGTCCCTGGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371485	372177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_371500_372200
838618	contig_19730_pilon	-	1936	6	Intergenic	novelGene_142496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_5	123.625887256675	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	63	686	175963	152104	FALSE	30	TGCTCTATAACATATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSDNLREILQNVAKLQGVSNMRKLGHLNNFTKLLCDIGHSEEKLGFNYEDIIICLRLALLNEAKEVRAAGLRALRYLIQDSIILQKVLKLKVDYLIARCIDIQQSNEVERTQALRLVRKMITVNASLFPSSVANSLIAVGNDGLQERDRMVRACIAIICELALQNPEVVALRGGLNTILKNVIDCQLSRINEALITTILHLLNHPKTRQYVRADVELEVGTSYSFQF	176025	150853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_152304_155552_155680_159325_159390_163461_163594_164440_164506_175927
838619	contig_11525_pilon	+	1725	3	Intergenic	novelGene_171065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	4675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_1375_1618_2158_3497
838620	contig_16635_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_153156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTAGTAAACGTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112685	111094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_111100_112700
838621	contig_13593_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_156129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCAAGCCCTTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77322	78784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_77300_78800
838623	contig_8464_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_125399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAAACACCCGCCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886923	886385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_886400_886900
838624	contig_18113_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_137542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193888	195356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_193900_195400
838626	contig_14341_pilon	-	1826	7	Intergenic	novelGene_111749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_2	56.0637038456156	106	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	704	1126	115501	113541	FALSE	25	ACCCTCCAGTGTCTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAISPWASWAESTSCIPIACRGVASPSSDLLQPGVRIREPALYPRDSSWPVEGTPEEERRTAWLPTDQVQNYTTITMIFFQNIFIIPKRNPMSIKQSSPFPFLQPLVTTNLFLYGFTSSDTSYERNLTICGPLRLASFT	118513	112840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_113751_114863_114953_115377_115528_116275_116352_117568_117660_117822_117907_118087
838627	contig_6164_pilon	-	845	7	Intergenic	novelGene_121276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	109.378166620827	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	124	696	485859	475276	FALSE	25	CTAAGTTATCTGTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRMGKPAPPGAAYPGPAPPGAAYPGPTAPGAYQSGAGAYPAASPYGGLAEPLTLPYDLHLPGGIMPRMMITILGTVKPNANRIALDFMRGNDIAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKQDNVWGREERQNAFPFESGKPFRIQVLAEADHFKVAVNDAHLLQYNHRMRNLGEIRKLAISGDIILTSASHAMI	493183	475126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_475432_481538_481705_483551_483641_485555_485693_485834_485904_486668_486691_493126
838628	contig_3700_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_138073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAAGATGATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202587	202278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_202300_202600
838629	contig_9272_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_125910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGGCTTTCTACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295119	294837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_294800_295100
838630	contig_10588_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_177325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGTGAATAAATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120040	118976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10588_pilon_-_119000_120000
838631	SIRV4	-	445	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	82	90	82	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAACCAAGGATTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5076	3727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
838632	contig_10341_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_47249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGGCTTCTTAGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166788	164873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_164900_166800
838634	SIRV2	-	299	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4539	69	3364	-34	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATTTGCCAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368	1069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
838635	contig_9797_pilon	+	619	4	Intergenic	novelGene_65580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	274.122032841012	342	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	172535	188605	TRUE	5	GGAGTTCTGCGTTTTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESPCPAIRTGRAAQELQDKHPEPLRVATTLGPPHGGGQYGSGVPPGGGYGGPAPGGPYGPPAGGGPYGPGGLTSGTPGGPYGGAAPGEPLWSATSKLLQCPAAWALWAGTSSRWRPTQCGS	172533	192150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183989_188577_188676_191971
838636	contig_5753_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_174314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAATAAGCGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155379	154862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_-_154900_155400
838637	contig_10627_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_60038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCTGTAAACCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654482	654053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_654100_654500
838638	contig_15459_pilon	+	893	3	Intergenic	novelGene_106357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAATGAGTTTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8161	11510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9156_9268_10889
838639	contig_6795_pilon	-	1396	9	Intergenic	novelGene_27770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	39.560080889705	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	250	654	489424	483517	FALSE	40	ACTGAGGAAAAAGCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVYNKIDQISMEEVDRLARKPNSVVISCGMKLNLDYLLEMLWEYLALTCIYTKKRGQRPDFTDAIILRKGASVEHVVPPSHGTNCPGYPGVQVKILPCLSAIGSTGRWPASSNTPWCGVPAPSTAHSGWD	491137	482774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486052_486124_486600_486660_487526_487616_489014_489092_489409_489508_490848_490940_491062
838640	contig_3787_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_102402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	220	534	515688	516002	NA	40	TCAAAAACTCGGAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDRRVRRPFCPGNLHLRVSFRPIVKQKLIEPASCLAFLCPEWVDMTMADMGIWGHQCLKENAHWFAADLHNSAILHSSALWVASCVNASQSEITVVHLAGPPW	515468	516864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_515500_516900
838641	contig_11978_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_62830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATGGGAGCATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454919	456013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_454900_456000
838643	contig_10023_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_123494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	719	1111	219288	218896	NA	80	AAAAAACAAAATATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKNHSLGLFCQDSSTVPVFTLKQQWVLFSLPGVLTPRKCDTEVSLVSYVLIGYIRFLCPAQLSFVLLICQRPSWTSYLQCVETDYRPIKTGLPSSAVKRNCPSLIWTKSWYLIAKGPYPFNRVSLVIHF	220006	217761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_217800_220000
838644	contig_5253_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_61597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357728	356301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_356300_357700
838646	contig_6842_pilon	+	909	6	Intergenic	novelGene_130773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	113	junction_1	385.983212070162	787	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	217	537	1366898	1368955	TRUE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVKYAPSPALAPGAPPTPSTWWRPKFLVGLCPPPPLRWSRSCSQETPTLRRSLLAPLQMGP	1345522	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1345594_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368988_1374425_1374474_1377113
838647	contig_11026_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_167682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTCTTATATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262053	263697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_262100_263700
838648	contig_15613_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_147206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATATGTTAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126413	127196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_126400_127200
838650	contig_4426_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_15396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCAATAAATTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632342	631527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_631500_632300
838651	contig_18487_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_172669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATCTGTTCTGCCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195601	195947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_195600_195900
838652	contig_4924_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_84747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAACAAGAATTATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165730	166667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_165700_166700
838653	contig_20719_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_140569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAAGAAGTCAGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36954	36664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_36700_37000
838655	contig_500_pilon	-	860	5	Intergenic	novelGene_31089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	330.454611104158	892	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	150	575	1510494	1500353	FALSE	10	TGCTTGCCTCACGATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLSEVPGPRGGCGGSWWALGRAERVVPEEFPVPVSVRGAASAAAGAAMPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRRERRWGEKSFHSSGRLHSSERLCRGWLLTSL	1510643	1500067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500441_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
838657	contig_11815_pilon	+	802	6	Intergenic	novelGene_50891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_5	7.46726188103779	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	24	800	117769	121534	FALSE	30	GGAACGGAGTTGATGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIGLLEPMKKSMVPVQLQLDVPVVKVASGNDHLVMLTVDGDLYTLGCGEQGQLGRVPELFSNRGGRQGLERLLVPKCVMLKSRGSRGYVRFQDVFCGAYFTFAISHEGHVYGFGLSNYHQLGTPGTESCFVPQNLTSFKNSTKSWVGFSGGQHHTVCMDSEGKAYSLGRAEYGRLGLGEGAEEKSTPTLIPRLPAVSSVACGASVGYAVTKDGRAFAWGMGTNYQLGTGQDEDVWSPVEMTGKQLENRVVLSVSSGGQHTVLLVKD	117745	121536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_117833_117940_118064_118818_118975_119223_119344_119720_119874_121373
838658	contig_6069_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_8020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATACACCATATTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115303	113853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_113900_115300
838659	contig_10500_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_41185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGGAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338009	1339792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1338000_1339800
838660	contig_6674_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_148003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	799	1158	151211	151570	NA	25	TGCATTCTATCTTCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVPLKSPVEIITQFICGGIQFPKELGFLSSPGCLSEVWPSEVGCPKIMCCFLNGEALSLMVSVLSGRDAKAAVLTVFLIQFSAILSCTNQVIMQPVKKRGREVWVPVKFKQPLRLQY	150412	152024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_150400_152000
838663	contig_16716_pilon	+	176	1	Intergenic	novelGene_169289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTGTGTTGTAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192936	193112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_192900_193100
838664	SIRV3	-	312	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	307	-2	307	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
838665	contig_12019_pilon	-	587	6	Intergenic	novelGene_87785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	45	566	767163	764809	FALSE	20	GACTAGCAGGGTTCGCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVDIVYKFIVCHLHMANSHCQTQHLLHLELDGRFHFIYFGHHVFIVGKQGREFASLIQAWTQDSRDLLDQGLRSQKGIILLGQLFNKLLILVEFLQRLNVHVRDIHSLGFITVLLVPKDTHRELGAGGGLKPAGAREAFVLLRVVVLQANLQLHRFQKLPALALVPVQDFPHRLVESVARDFAAHGF	767207	764787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_764821_765182_765260_765343_765421_765768_765921_766638_766811_767131
838666	contig_11335_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_104906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATGAGTCACAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310081	309476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_309500_310100
838668	contig_19957_pilon	-	1432	2	Intergenic	novelGene_57753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423417	416925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_417023_422082
838669	contig_15070_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_164893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAATAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435716	434710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_434700_435700
838670	contig_91_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_127114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTACACCACCAGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431164	432640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_431200_432600
838671	contig_15859_pilon	-	1223	3	Intergenic	novelGene_50200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	47	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	134	775	344895	341031	FALSE	30	AGCTCTGAGAATCAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	346287	340582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346163
838673	contig_818_pilon	-	773	2	Intergenic	novelGene_167994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTGATGTGGTGGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672634	671774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_-_672491_672577
838674	contig_12837_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_57372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTCTAACCAGGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316366	317539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_316400_317500
838675	SIRV6	+	396	3	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	168	-31	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1856
838676	contig_19974_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_130476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACCAAAGTAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228037	228400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_228000_228400
838677	contig_12313_pilon	+	1138	2	Intergenic	novelGene_171843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGGGTGGAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70350	72490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_+_70730_71731
838678	contig_6159_pilon	-	822	2	Intergenic	novelGene_128267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	0	129	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACTGCTTTACTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314706	312306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312555_314132
838679	contig_6451_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_173700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGGAAAGGTACAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89911	91363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_89900_91400
838681	contig_16122_pilon	-	914	4	Intergenic	novelGene_134502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	150	449	126056	123248	FALSE	70	AAAAAAAAAAAGAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHGGKAGQALLIHEDPKRVTGRDQDVDSHVKLETINEERLRDVLLTDHMLSWLDLPGISGDEDAPSLTATVRLADISAVFPLTTIRLEVPVAICGEAPGAREDVVFSRIELLHAVEVPSQQIFAADFCHAREVVDFLKPLHVHDSFQ	126601	122782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_123277_125527_125665_125922_126079_126474
838684	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533037	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
838685	contig_5350_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_99354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTCTCTTCTCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178325	178723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_178300_178700
838686	contig_5350_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_99357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATAAAAAGCACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181858	183650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_181900_183600
838687	contig_614_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_132648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994129	995478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_994100_995500
838688	contig_5871_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_160185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAGAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417566	416609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_416600_417600
838692	contig_18919_pilon	+	674	3	Intergenic	novelGene_156027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTTTAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74954	167402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_75063_159887_160218_167166
838693	contig_4845_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_53699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTTGTATGGATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934539	933751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_933800_934500
838694	scaffold_19766_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_34352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTCAAATAATGTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617248	616783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_616800_617200
838696	contig_13464_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_125242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGGCCTGTAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294983	293148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_293100_295000
838697	SIRV6	+	432	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-85	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	71	310	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10721
838698	SIRV6	+	343	2	NNC	SIRV6A	novel	454	3	NA	NA	345	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1856
838702	contig_20614_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_107616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAATAGGCTGGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534076	533234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_533200_534100
838703	contig_10446_pilon	+	1467	10	Intergenic	novelGene_162432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	168.783885486737	27	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	448	1044	15381	32452	FALSE	30	AAATTCTTCACTGTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELEAKTADLVRQAEEVIRGQQEVRSRPVSQIKSYEDEDDYSSRGLLSSEETIHLHSETEPKTKNIGPVIKVQNKLHSANKGRKTNSRVKLKYSDVQTADDVAIPENFSDFSLAKTISKIEEQLDEKGLSEYIDDDIFSGVSKDIGTEAQMRFLKAKLRVMQEELDNVVCECNKKEDEIQDLKSQVRSFEEDCMWQRRTINTQQSQIEKYKALSEEANRKCDGLQQQLSSVERELENKRRLQKQAASNQSATEVRLNRALEEAEKYKLELSKLRQNNKDIANEEQKKIEALKSENKKLEKQKGELMIGFKKQLKLIDVLKRQKMHIEAAKMLSFTEEEFLKALEWGNP	5394	32875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_5446_7324_7402_9489_9539_10304_10388_12572_12752_15372_15456_15844_16019_20025_20161_31553_31689_32374
838705	SIRV5	+	169	1	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1172	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGTACGGCCAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2228	2397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_2200_2400
838706	contig_6270_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_99857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTGGTTAAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799688	799048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_799000_799700
838707	contig_8687_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_169656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGCCATTCACAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34380	34702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_34400_34700
838708	contig_3077_pilon	-	1923	11	Intergenic	novelGene_26905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	59.2284559987849	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	432	1250	1681168	1667200	FALSE	30	TGGACGGCTTCACAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRELLPNGLRESISKVRSSVAYAVSAIAHWDWPEAWPQLFNLLMEMLVSGDLNAVHGAMRVLTEFTREVTDTQMPLVAPVILPEMYKIFTMAEVYGIRTRSRAVEIFTTCAHMICNMEELEKGAAKVLIFPVVQQFTEAFVQALQIPDGPTSDSGFKMEVLKAVTALVKNFPKHMVSSMQQILPIVWNTLTESAAFYVRTEVNYTEEVEDPVDSDGEVLGFENLVFSIFEFVHALLENSKFKSTVKKALPELIYYIILYMQITEEQVNDI	1710481	1666526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1667367_1668185_1668245_1668577_1668679_1668783_1668904_1670202_1670290_1671180_1671270_1680972_1681175_1681899_1681987_1682200_1682263_1705944_1706055_1710315
838709	contig_5649_pilon	-	1211	9	Intergenic	novelGene_82324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	7.26291952316697	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	16	1149	383831	367916	FALSE	10	TTCTAGTCAGCGTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDDSESNLTDSQAGDENELPVIQLCGLVEELSYGNAALRIETEMFEKYYNRLEPIDHRHPRLSDIKISSSEFAQLRGKRKPKAQSGTDRAITLTVDQKCELAQKELEDTKEEIRHMRANAERDLQHHEAIIEEAEIRWAEVQRAVRDFEKDILKTISKKKGSILATQKVMKYLEDANRRRDNMKDKLNLKNVSLKVQRKKMLSQLRQKEEVGDALHEVDFQQLKIENAQFLETIEAKNQELIQLKLASGNTLQILNMYKSRLHRGLEMSISLDKEMVLRNELLEKLERETVQAEEDRAKAEFLNKKLRKQLAEFRAPPVMAYVREKIINGELEKSIKTWERKVEIAEMSLKGYRKAWNRMKTTCEQLQATGPPGK	383846	367853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_368003_369490_369647_373035_373144_373614_373771_377371_377453_378527_378684_379751_379914_381002_381130_383730
838710	contig_2069_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_23341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACACCTCAAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618247	619877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_618200_619900
838711	contig_6946_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_59799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAATTAAAAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460573	460861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_460600_460900
838712	contig_8027_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_158844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATAAGTAAGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310125	308274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_308300_310100
838714	contig_14666_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_39484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCCTCACGGTCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73094	72769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_72800_73100
838715	contig_18284_pilon	+	1116	9	Intergenic	novelGene_177327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.35710626448334	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	46	1116	470070	506693	FALSE	20	AAGTTCCTTAGCTACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPAQILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSESMG	470024	506693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18284_pilon_+_470192_472434_472547_474487_474625_475326_475366_479740_479807_480905_480972_483692_483852_505478_505723_506567
838717	contig_12265_pilon	+	1008	4	Intergenic	novelGene_149431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCTCCTTGTCGGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11449	19470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_11573_12476_12546_13331_13487_18809
838718	contig_8412_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_118367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAAATATTTGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523035	521907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_521900_523000
838719	contig_9345_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_24439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360257	359038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_359000_360300
838720	contig_5092_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_62283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361098	362232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_361100_362200
838721	contig_5770_pilon	-	452	4	Intergenic	novelGene_74194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6777.33398911401	8	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAGTAAATTCAGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264060	261942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263589_263676_263926
838722	contig_7308_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_159613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAAGTTTTAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541055	541707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_541100_541700
838724	contig_11285_pilon	-	614	2	Intergenic	novelGene_5655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCGGGCTGGGTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770194	769525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_769666_769720
838725	contig_12654_pilon	-	807	7	Intergenic	novelGene_129334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_1	76.7673252251387	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	179	805	827177	810591	FALSE	20	GTACGTATTCTCCTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEFLKSRWKRGGLLQQKRPLPPLRALSESSFCLRWCNFLPARAQSGGFRAVLESFASTMAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINY	827355	810588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
838726	contig_15185_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_99432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	389525	389848	NA	20	TTTTTTTTTTTTTATAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLIFSSLGPRPGPGGYLVHTTTLPHPSGARGSLQKDEGFDGRKENCTGLEIGCQIRGCGNLHTTQSRWTLHVEDKTPLRAILQPQSGCPTSPQCPAPINKTNQLPSS	389522	389915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_389500_389900
838727	contig_9177_pilon	+	1683	5	Intergenic	novelGene_32703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGACCCTGGCCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484826	510628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_485587_487895_488049_491913_492364_496462_496672_510517
838728	contig_11560_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_117911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGGACAGTACTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44575	43007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_43000_44600
838729	contig_6488_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_44724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAAGCAGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41462	42050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_41500_42000
838735	contig_5018_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_46928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCCATCTGTAGACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188308	190103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_188300_190100
838736	contig_8681_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_157211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCACATTAAGATATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250037	248897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_248900_250000
838737	contig_9901_pilon	-	723	3	Intergenic	novelGene_126951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	66	171	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	235	426	325692	325501	FALSE	25	CTCTAGAGACTGTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGNVADSDGLLASLWKEYGKADARWLYFDPNLVAVELLTVFLDGSLALFLVYAIVKEKYYRHFIQITLCVCELYGGWMTFSPEWFMGSPSLNTSNWLYFWVYLVFFNGVWVLVPGLLLCQSWIELKKMHHKETRSGKKFR	331376	325203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_325742_326713_326853_331330
838738	contig_2027_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_39931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCTCCCATATAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182767	183233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_182800_183200
838740	contig_8581_pilon	-	647	2	Intergenic	novelGene_22807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309143	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306845_309001
838741	contig_7720_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_155739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGCAACTTTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214955	215274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_215000_215300
838742	contig_16110_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_126798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAAAAAAAAAAAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100822	99503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_99500_100800
838743	contig_7428_pilon	-	650	3	Intergenic	novelGene_77735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	392	junction_2	104.5	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	92	304	436221	435695	FALSE	5	GGGCTGGTCCCTCCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSNGVYVLPSAANGDVKPVVSSTPLVDFLMQLEDYTPTIPDAVTGYYLNRAGFEASDPRIIRLISLAAQKFISDIANDALQHCKMKGTASGSSRSKSKV	436312	435348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_435816_435901_435967_436194
838745	SIRV6	+	435	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1517_1618_1736_1845
838746	contig_4492_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_166108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTTTTCCCTCTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17567	15677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_-_15700_17600
838747	contig_15093_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_143313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTCACTGAGTCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206326	205320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_205300_206300
838749	contig_5050_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_110291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGCCTTGGACCAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613428	614143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_613400_614100
838750	contig_5954_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_28470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAGTTAGCCGTGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174953	175708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_175000_175700
838751	contig_14691_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_146790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTTTAGTATGAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14934	14578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_14600_14900
838752	contig_3787_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_102392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAGCACTCAGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447433	446854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_446900_447400
838753	contig_3787_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_102391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTTTAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445393	444933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_444900_445400
838754	contig_3960_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_138051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGCAATACTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722925	722496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_722500_722900
838756	contig_19098_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_65775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGTGTACGTATATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32763	31837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_31800_32800
838757	contig_14030_pilon	-	1181	6	Intergenic	novelGene_62236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	596.021476123134	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	381	746	394370	337410	FALSE	5	GCTGTTTCTGTATCCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRIHKELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394750	336974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344350_344383_350784_350849_394346
838760	contig_10431_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_117398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221288	222010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_221300_222000
838762	contig_5791_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_35820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTCTGTATTATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759407	759180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_759200_759400
838763	contig_9727_pilon	+	1339	4	Intergenic	novelGene_86260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	12.657891697365	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	48	725	71373	73023	FALSE	45	ACTTTCTAAAATCTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASWLHGRLHQLFVPTAALNSFLCTGLSCYSRFPELESPGLSKVLRTAAFAYPFLFDNLPLFYRLGLCWGRGRDCGQEALSTSHGYHLLCALLTGFLFTSHLPERLAPGHFDYIGHSHQLFHICAVLGTHFQLEAVLADMGSRRAWLAAQEPALGLVGTLVTLGLVVAGNLLIIAAFTASLLRAPGSCPLLHGGPPEGGHQGQTPVSPPLPLPWREAEARLQQC	71325	73637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_71471_71837_71935_72156_72308_72691
838764	contig_7594_pilon	+	920	3	Intergenic	novelGene_55446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	273	3512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	66	449	561547	566248	FALSE	20	GTGTGTAGATCTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSLRSKWKRKMRAEKRKKNAPKELDRLKNILRVDGDVLMKDVQDIATVVVPKHCPEKMQCEMNDEKDDMKMETDTKRNKKSLLDQHGQYPVWMNQRQRKKLKAKREKGKGKNRGKAVKAAKGLAW	559123	566719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_559182_561539_561752_566069
838765	contig_9053_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_87937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTCCAAACAAAAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146540	146150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_146200_146500
838767	contig_4009_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_145455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCGGCTCGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264862	264399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4009_pilon_-_264400_264900
838768	contig_1516_pilon	+	1230	11	Intergenic	novelGene_49952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.8768548125971	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	623	952	325004	326248	FALSE	10	CACTGTGGTCTGATTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGQHRMPSKDELVQRYNRMNTIPQTRSIQSRFLQSRNLNCIALCEVITSKDLQKHGNIWVCPVSDHVCTRFFFVYEDGQVGDANINTQDPKIQKEIMRVIGTQVYTN	305752	326526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_305881_306838_306902_307282_307406_307828_307897_309115_309165_310249_310323_323569_323686_325001_325082_325478_325543_325725_325811_326145
838769	contig_11413_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_103114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCACCCAGCACCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1594	1031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_1000_1600
838770	contig_1301_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_47289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACTGTCTTCTGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243092	244185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_243100_244200
838771	contig_2770_pilon	-	1159	5	Intergenic	novelGene_107503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	483	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCGTGCAAAAGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846784	830371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_830488_831484_831709_834920_835070_845071_845521_846563
838772	contig_3900_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_84216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	327	356	709983	709954	NA	30	TTTTAGTCTGGGCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWVVHNGLPLTIFQSGNRILCSIILSHHQGPSIINYDDESGKTCAHIAAAAGSHDIIHELARVPECNLQALDVDDRYPWQLGKCWELPVISKLILKIFKERSHTTISSMPVIFTHVF	710309	709936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_709900_710300
838773	contig_10434_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_82047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAATATGCAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146344	147408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_146300_147400
838774	contig_3252_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_61512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGGGAGGGCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661198	662062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_661200_662100
838775	contig_9995_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_47688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTATTCCTGGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276781	277994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_276800_278000
838776	contig_5954_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_28732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCAAAATGGGGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172705	1173916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1172700_1173900
838777	contig_8317_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_20693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16495	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
838779	contig_11476_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_170506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATGTATCTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56898	57289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_+_56900_57300
838780	contig_8357_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_39686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195574	196689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_195600_196700
838781	contig_8898_pilon	-	563	3	Intergenic	novelGene_137236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	49	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGCTTTCTGCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286794	281873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_285321_285463_286564
838782	contig_14300_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_133116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAAAAAAAAAGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279149	278812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_278800_279100
838783	contig_19378_pilon	-	952	4	Intergenic	novelGene_73766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	19.6015872373189	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	53	952	9138	4950	FALSE	45	ACGGTAAGAGGGAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLNPAAVADNVERADALQLSVEEFVERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTREEGGNQQDEAITWFNIIHPRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHK	9190	4949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_5045_6637_6925_8101_8491_9009
838785	contig_4686_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_118590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCACTTGAATCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839542	838885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_838900_839500
838786	contig_5236_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_100912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAAAAATCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436961	437375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_437000_437400
838788	contig_521_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_174739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1128	1460	52462	52130	NA	80	AATTAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVLAIHHYHQWVKVLTISGAGCLTFSLPFWVINWAEDYDHFVAWCGQITETREAGQVYKDWGVPGTVELFSKGIPIPNHLKNTLRPNKTHPWGRWQSAAPSLYLLRIF	53589	52104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_52100_53600
838789	contig_9363_pilon	+	662	3	Intergenic	novelGene_6630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_1	465	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	45	662	872458	873683	FALSE	15	GGTGTCTTCCTCAGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	872413	873683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872729_873004_873095_873426
838790	contig_10755_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_174290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56334	54587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10755_pilon_-_54600_56300
838791	contig_9721_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_155990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370017	370566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_+_370000_370600
838792	contig_8317_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_20654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16472	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
838793	contig_3602_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_60537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTAGAACTGACCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255093	254596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_254600_255100
838794	contig_3602_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_60536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254448	254177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_254200_254400
838795	contig_12214_pilon	-	1849	4	Intergenic	novelGene_177330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	17.326921891156	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	42	659	107562	103811	FALSE	45	GTTAAAGATGGAAACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKHRNLDELPWSAMTNDEQVEYIEYLSRKVSTEMGLREQLDIIKIIDPSAQISPTDSEFIIELNCLTDEKLKQVRNYIKEHSPRQRPAREAWKRSNFSCASTSGVSGASASASSSSASMVSSASSSGSSVGNSASNSSANMSRAHSDSNLSASAAERIRDSKKRSKQRKLQQKALRKRQLKEQRQARKERLSGLFLNEEVLSLKVTEEDHEADVDVLM	107603	102620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12214_pilon_-_103982_105224_105492_107131_107294_107544
838796	contig_5018_pilon	+	1673	13	Intergenic	novelGene_47112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	35.101835976041	2	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	608	1399	1409960	1412829	FALSE	0	TCTCGTGCCTTTCCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDNFIESSFWNFDALFQPQQHPARDQHDTFFLRDPAEALQLPMDYVQRVKRTHSQGGYGSQGYKYTWKLAEARKNLLRTHTTSASARALYRLAQKKPFTPAKYFSIDRVFRNETLDATHLAEFHQIEGVVADHGLTLGHLMGVLREFFTKLGITQLRFKPAYNPYTEPSMEVFSYHQGLKKWVEVGNSGIFRPEMLLPMGLPENVSVIAWGLSLERPTMIKYGINNIRELVGHKVNLQMVYNSPLCRLDTEPVPSRMQKAV	1406458	1413103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1406518_1408384_1408523_1408602_1408702_1408782_1408900_1409548_1409642_1409738_1409830_1409949_1410066_1411130_1411216_1411306_1411407_1411491_1411661_1411759_1411838_1411966_1412082_1412690
838797	contig_2419_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_137122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1318	junction_1	0	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	212	574	116008	169857	FALSE	25	AAGCCAGTTCTGAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAKQKRNEQLKRWIGSETDLEPPVVKRQKTKVKFDDGAVFLAACSSGDTDEVLKLLHRGADINYANVDGLTALHQACIDDNVDMVKFLVENGANINQPDNEGWIPLHAAASCGYLDIAE	115796	169858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_116239_169725
838799	SIRV6	+	428	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	103	0	-84	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	70	309	2458	3109	TRUE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2388	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
838800	contig_5039_pilon	-	649	2	Intergenic	novelGene_64919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	99	junction_1	0	173	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATGATCGACTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191990	1121679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1122183_1191844
838801	SIRV7	+	390	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	22	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCGGTCTTTTAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56032	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78962_114683
838802	contig_6344_pilon	-	694	5	Intergenic	novelGene_157099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_4	84.617891134204	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	8	583	846988	837523	FALSE	30	AGACAGGATGAATGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERSARSLAKGSEPPGPVPEGLIRIYSMRFCPFAKRTLLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFTKNPLGLVPVLENSQGQLICESAITCEYLDEAYPGKKLWPDDPYKKACQKMDFELFSEVPRLLKSIFSRRDKEDCSGLKEQLCKEFSKLEEVLTKKKTTFFGGYSVSMIDYLIWPWFEWLQAMELSE	846995	837411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_837634_839176_839276_842311_842535_846648_846758_846954
838803	contig_5585_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_143081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	234	380	447576	447722	NA	60	AGACAATATCAAAACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCTDHTPFWQAEQHRSAREPATHGLTRYSPTPSAKSCHVNLFTFFSFSPSLLSLSYLAPHITSSPFPHAYLHCAPSTMHPSGTDVVPWTPPCTVHWPRPVSPSSCHKLSIPAPPTTTGTALLHHS	447342	447919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_447300_447900
838806	contig_15838_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_174343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAAGGTCAGTTCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271329	269759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_269800_271300
838808	contig_11413_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_103214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	695	1033	806775	806437	NA	25	TAAATCCACTTCTGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGFKTPVQSLETSTHTYAHTHNLGHLCISDCGQLSNQSNQRIQRTAPLALVINSKPFSILGISKRPLPRRHFPHVAQESPPVCNRHHFQLLVPKGAFWAPHPPSSVHPAN	807469	805760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_805800_807500
838811	contig_7173_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_37538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	225	678	22	699	243730	244407	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADEKDPLSYFAAYGSSSSGSSAEEDDSEPEETSRRAPDPANPAGGCGNKAEKRLPGPDELFRSVTRPAFLYNPLNKQIDWERHVVKAPEEVRSLTPFPGLGPGLRPLPAEPPPGDGLSVPPHAPTPCGMPHKPLSPPSLGSPGPLPQPGGLQTGPAAPAPLEEAQTSALGAPDPARRGLTVVTPPPPPAAASPRDPFPLTPKCLRCCLQDSVCCSLLKGSALA	243708	244524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_243700_244500
838812	contig_10197_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_115306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTAAAAAACCATAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354085	1353353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1353400_1354100
838813	contig_1893_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_172348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATGTAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132812	133616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_+_132800_133600
838817	contig_11364_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_65192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTTTTTTTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261584	262238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_261600_262200
838818	contig_6189_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_164954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGTTTTATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159307	159634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_159300_159600
838819	contig_5050_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_110293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAATCAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619257	618397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_618400_619300
838820	contig_5423_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_85160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGATTTCTATTTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32016	31709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_31700_32000
838821	SIRV1	+	464	3	FSM	SIRV1B	SIRV109	464	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13835	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTCGGCTAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10711	11643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_+_10792_10882_11058_11434
838822	scaffold_880_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_121472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTATGGGGCGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471455	472203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_471500_472200
838825	contig_6441_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_172880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTGCAATCCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230857	231388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_230900_231400
838826	contig_12790_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_35178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGTTTTTGTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17568	18090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_17600_18100
838827	contig_15570_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_137834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAAGGCACTGTGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464590	465787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_464600_465800
838828	contig_6497_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_35594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATGAAAGGGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358311	359297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_358300_359300
838830	contig_14556_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_138512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAAGAAGCCAGGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58705	59325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_58700_59300
838831	contig_5375_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_169205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTAAATGAAGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50958	49712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_49700_51000
838832	contig_7580_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_108606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATCTCCCTTCATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102921	103365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_102900_103400
838833	contig_15323_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_148540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATCTTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180864	181255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_180900_181300
838834	contig_4686_pilon	-	1186	2	Intergenic	novelGene_118501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_1	0	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	884	1186	385436	384893	FALSE	60	CTTAAAAAAAAAAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHDGNQRWDNLQKRVTSILRRLKHFIGQREEFETARDSILVWLTEMDLQLTNIEHFSECDVQAKIKQLKVTDILFFRLPVLRKSEKERICRFFCEEHGRI	386319	384892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_385124_385364
838836	contig_17875_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_143178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGAGTCAGAGGCTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41130	40083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_-_40100_41100
838839	contig_7057_pilon	+	979	6	Intergenic	novelGene_123208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	64.7715987142513	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	150	731	532697	533605	FALSE	20	TGTCAATGTTTGGAGACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGHFSPQNFPSAQGAPSYLSRYSPHEEPPLNPHGAARAEVYLRKCTFDMFNFLASQHRVLPEGAACDEEEDEVQLRSTRRATSLELPMAMRFRHLKKTSKEAVGVYRSAIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYSGIVIRSVLTDKREKFYDGKGIGCYMFRMDDFDVVDATMHGNAARFINHSCEPNCFSRVIHVEGQKHIVIFALRRILRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKRCRRFLN	526530	533853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_526611_532343_532397_532680_532789_532906_532991_533108_533239_533329
838840	contig_10286_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_98411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAGAGAAAATCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395232	394860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_394900_395200
838841	contig_7919_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_28068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGATCCTAACTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066971	1066386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1066400_1067000
838843	contig_8651_pilon	+	360	4	Intergenic	novelGene_168187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3720.20002449092	160	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCTTTGTGTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185070	189353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_186972_189227
838844	contig_5482_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_144440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATCAGAAACAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255394	254525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_254500_255400
838845	contig_1091_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_168778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCACAGAAGAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774561	773635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_773600_774600
838846	contig_10599_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_49906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACGTGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330605	329490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_329500_330600
838847	contig_9373_pilon	+	1312	3	Intergenic	novelGene_162709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	0.5	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	332	637	136308	138868	TRUE	80	AAAAACAGAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKNVAFPLTYLLVSWFLDLVACSNTIFMQLFLSSLPPPRPTRLGNSELVSFPDTQYCSFNVCVFNWPIWRLLCQWIQKSFQNQGFCKHHSWTWRDHGQI	135976	143727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_136564_138818_138923_143106
838849	contig_10857_pilon	+	1269	2	Intergenic	novelGene_160904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTACAGAAAATGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116595	118425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_117657_118217
838850	contig_8864_pilon	+	2341	1	Intergenic	novelGene_135981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGACATTTCTAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124270	126611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_124300_126600
838851	contig_4293_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_177333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGCATTATTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117833	116372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4293_pilon_-_116400_117800
838852	contig_9186_pilon	-	1811	4	Intergenic	novelGene_85364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	22.7303028283098	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	126	743	643909	638458	FALSE	10	GTTTTACATGTGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVDEPLSETGFKQAAAAGLFLNNVKFTHVFSSDLTRTKQTMHGILEKSMFCKDMTVKYDSRLRERKYGVAEGRALAELRALAKAAGEEVPTFTPPGGETLDQVKMRGKDFFEFLCQLILKEADQKEQFSQGVPGRLLETSLAEIFPLGKNCGSEFNSHDGTTGLVASVLVVSHGAYMRSLFSYFLTDLKCSLPATLSKSELMLVSPNTGMSLFIINFEEGKEVKPTIQCICMNLQDHLNGMTETR	645411	637389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_638890_640124_640236_643834_643913_645289
838853	contig_3767_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_111141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418086	417497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_-_417500_418100
838854	contig_709_pilon	+	637	5	Intergenic	novelGene_57549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	21.4053147605916	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	133	471	1520334	1526933	TRUE	15	TGTGCACGACTGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASSPRSCPSPSCLLEPGALPTGESPSLPLLFPCGTLKGEILPKMLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1520201	1527240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1520350_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795_1527034_1527174
838855	contig_10196_pilon	+	736	5	Intergenic	novelGene_132113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	205.222440293453	64	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	29	313	922274	924513	TRUE	20	GCCCAGTGTCTTTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARSGFGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922245	926564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701_925730_926203
838856	contig_8276_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_174485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACCGAGCAGCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164476	162326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_162300_164500
838857	contig_8464_pilon	+	869	5	Intergenic	novelGene_125385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	82.1112050818888	672	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	83	619	843520	847994	FALSE	20	CCTTCAAGGTAGTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDKAFVEFLNDEIKEEKKIQKHKSLPKMSGGWELEVNGTEAKLVRKVAGEKITVSFNINNSIPPTFDGGEEETSEGQKVEEKEPELTSTPNFVVEVTKSDGKKALVLDCHYPEDEVGQEEEEESDIFSIREVSFQSTDKSDWTDTEYTLNTDSLDWALYDHLMDFLADRGVDNTFADELVELSTALEHREYITFLEDLRSFVKIQ	843437	848244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_843591_845821_845919_847308_847405_847574_847698_847844
838858	contig_12939_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_166206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	127949	128272	NA	30	TTGAATTGTGTCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLKLRLAFEVGFRLGPPQVAPGRREESCPSLGAPARPLWLSASASEPRRLFPPVSRSGSSAAASASPPSFRASPRRAPRGWAQGIVSGRSRVGKWDRRVCGVLFSPL	127948	129739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_127900_129700
838859	contig_14618_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_136823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	334	junction_1	0	69	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	236	577	1084987	1084054	FALSE	55	TTTAAAAAAATCTACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKVLEICSGKDYSQENPMGQLSPVTRGHCESESTLWHPITATFLEQPCQSLPKTLTLTFLPGGGECRVHPCGSVCGTLTPQPPQPGIGPCAKRTGFASQSSQADTVGKGVF	1085222	1083299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1084064_1084655
838860	contig_9177_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_32781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAGTTTAAACATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409541	1410241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1409500_1410200
838862	contig_2733_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_128587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGATCAAAGTTAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853429	852480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_852500_853400
838865	contig_19362_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_157798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54928	55988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_54900_56000
838866	contig_14326_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_120780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATCTCCTACTGGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839182	837759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_837800_839200
838867	contig_10641_pilon	+	1174	13	Intergenic	novelGene_171401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	486.708559840714	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	93	1172	202579	259691	FALSE	50	AGTGAAGCAGTATAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRVFWREGYGRRRRKKERGGRLPCPLRLRKMVFESVVVDVLNRFLGDYVVNLDTSQLTLGIWGGAVSLKNLKIKENALHQLDVPFKVKAGHIGNLSLVIPWKNLYTQPVEAVLEEIYLLIVPSSIIKYDPLKEEKQILEAKQQELKRIEEAKQKVADQEQPKEEKQDTFVEKLVTQIIKNLQVKISSIHIRYEDDITNRDNPLSFGISLQNLSLQTTDQDWVPCLHNETEKLFRKLVRLDNLFAYWNVKSEMFYHYDYDESLNSLKNGIVNENIVPEDYDFVFRPISAKAKLQMNRRSDFDFSEPKINLDVELHDIAIEFNKPQYFSLMELLESVDMMTQNLPYRKFKPDVPLHYHAREWWAYAINGVLEVNIRPSLRMWSWKHIRDHRQ	202486	259693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_202679_229607_229652_230142_230186_234450_234547_234803_234906_235935_236046_236596_236657_243798_243859_244087_244169_244562_244621_258282_258411_258611_258719_259600
838869	contig_7398_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_166162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCAACGGGTAGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140498	139983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_140000_140500
838870	contig_3948_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_53164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGACAGAGTAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192173	192849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_192200_192800
838871	contig_3948_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_53163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190804	191487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_190800_191500
838872	contig_5988_pilon	-	1268	2	Intergenic	novelGene_16143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	35	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGCTTGCTGTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664621	1656221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1656843_1663974
838875	contig_5331_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_112758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTCATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58082	60477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_58100_60500
838876	contig_10196_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_132273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	300	338	2050129	2050091	NA	25	AATTAAGTGCAGTGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLVYRKHVACFCTFLRAVREAWVQLCRPWECAGDTGGDRRGVRARVWFTSRAPRPAQIQWDTSGCTLWKPLAGHFLTILYTDPSVGLGKVSGAPSSTRMTPYAHLSEAWR	2050428	2049401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2049400_2050400
838879	contig_7640_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_177336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	450	77	526	152819	152370	NA	55	TGTAAGAATAAAAAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAQAVIKPIHDLDLQPYLHSVPKTMAKFHQLFKVCGSIEELTSDHISMVIQKIYLKSDQELSEQESKQNLHLMLNIIRWLYSNQIPASPNTPVPIHHSKSPSKLIMKPIHECCYCDIKVDDLNDLLEDSVEPIILVHEDIPMKTAEWLKVPCLSTRLINPENMGFEQSGQREPL	152895	152367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7640_pilon_-_152400_152900
838880	contig_5463_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_144774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGAGCTCACAGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27242	26274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_26300_27200
838881	contig_16378_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_163375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	142	510	17168	16800	NA	25	ATCCACGGCATTAGAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLYISFVHWNFFALLAVGLGQWKLEQPDMSISKAASKSAHITCNVAVEDFENAYIGWFRLKPNQGVEYLIYIHSTTTPNYASLGGKSKKLEASKNSRSSTSILKINSVEKEDEAMYYCAWY	17309	16799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16378_pilon_-_16800_17300
838882	contig_10642_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_78761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAGGGTTACTAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1488498	1489750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1488500_1489800
838883	contig_11855_pilon	-	791	4	Intergenic	novelGene_67136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	41.7212975189731	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	352	690	2675276	2674178	FALSE	20	AATCCATATGCCTGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASFLSRSEIPSKQPSYSSSPLQLARREFQTSVVSRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	2677190	2674076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674293_2674641_2674821_2675231_2675310_2676872
838884	contig_19730_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_142483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGACCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105019	105287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_105000_105300
838885	contig_4364_pilon	-	1892	18	Intergenic	novelGene_218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_17	89.3989541906426	38	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1878	14	1891	1373089	1360481	FALSE	20	CAGGTAACGGGCTGGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDAMGRGSGTFERLLDKATSQLLLETDWESILQICDLIRQGDTQAKYAVNAIKKKVNDKNPHVALYALEVMESVVKNCGQTVHDEVANKQTMEELKELLKRQVEVNVRNKILYLIQAWAHAFRNEPKYKVVQDTYQIMKVEGHVFPEFKESDAMFAAERAPDWVDAEECHRCRVQFSVMTRKHHCRACGQIFCGKCSSKYSTIPKFGIEKEVRVCEPCYEQLNKKAEGKAASTTELPPEYLTSPLSQQSQLPPKRDETALQEEEELQLALALSQSEAEEKERMRQKSTYTTYPKAEPAPVASSAPPASSLYSSPVNSSAPLAEDMDPELARYLNRNYWEKKQEDARRSPTPSAPVPLAEPAALPREGHVALVSTVETPLPESDSQPIAPPGGHFSEQQYQNGDSEESHEQFLKGLQNAVTTFVNRMKSNHVRGRSITNDSAVLSLFQAINSMHPQLLELLNQLDERRLYYEGLQDKLAQIRDARGALSALREEHREKLRRAAEEAERQRQIQLAQKLEIMRQKKQEYLEVQRQLAIQRLQEQEKERQLRLEQQKQTVQMRAQMPAFPLPYAQLQAMPTAGGVIYQPSGPTSFPGTFSPAGSVEGSPMHTVYMNQPTQASGPYPSMPVTG	1373102	1360479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1360652_1360973_1361115_1361324_1361498_1361791_1362006_1363022_1363083_1363174_1363319_1363393_1363433_1364500_1364597_1364695_1364795_1364866_1364946_1365895_1366021_1366897_1366967_1367391_1367445_1368927_1369052_1370079_1370173_1370289_1370366_1371162_1371248_1373052
838886	contig_4686_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_118530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAGTAAGAGACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462836	463092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_462800_463100
838887	contig_5236_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_100920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGAAGTAGCAAGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575105	573705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_573700_575100
838888	contig_10627_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_60059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAAAAAAAGCTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244353	1245249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1244400_1245200
838889	contig_9995_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_47751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632832	631523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_631500_632800
838890	contig_16156_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_137095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	546	932	706099	705713	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLCAPIDTVTAVRQSYKTVRPGATQTRLNHRLTDGDTFTGRIQSGKGEEQTAVPHHVRVRHRECGDHEPDPGGSTTQLRRQSQHQAGQAGASRQDGRGTRVTVTQHAHWVGSPQAVQLRSHTVLHM	706644	705161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_705200_706600
838891	contig_6418_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_81173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGCAACCCCATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559035	560056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_559000_560100
838892	contig_10437_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_38401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743632	744557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_743600_744600
838896	contig_9515_pilon	-	1249	7	Intergenic	novelGene_73841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	41.4517792139252	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTCTGGATTGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108090	94951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_95482_95754_95874_95989_96085_98393_98463_105877_106138_107123_107276_108066
838897	contig_13607_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_170168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTGGGAGGTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133754	134159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_133800_134200
838898	contig_1406_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_25614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAAAAGATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2225983	2227236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2226000_2227200
838899	contig_3153_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_104715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	305	706	552686	553087	NA	35	TAGACTTTTCAAATGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHVLGFCSSPLPGAIFCFSYLLQHKKITLKCRLFLFMTLWVRNLARVSGNSLSLFHMLSFGACPLKLKAPKTVSLTCLGAMVLGCQLKYLISLHLGSLYLPMCSLILPGFFLNMGLFLSGRMAWSSLHGSSG	552381	553891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_552400_553900
838901	contig_3789_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_79891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	165	569	586647	586243	NA	65	TAAGATGTACAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGRGFESCVSSQDSTQGVHVCYASKQYGPWGRTGMVLWEHGGRAPRGAHTCSAMIARGNSPSGRTSVVLRERTVRPCRVHACGAVQTRPAVLAGSGEGCLRKVAVDALKAHGLPGLGTGFEERGGILSRRTL	586811	585952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_586000_586800
838902	contig_5467_pilon	+	1190	5	Intergenic	novelGene_111942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.713170009881	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	141	677	13537	15270	FALSE	15	GAGTGCCTGGCAGGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPRILLWAQNFSVTYNGQTEDLTSLTFGAQELNLTGSFWNSSAAGLALTYEQLFGTMVTFKFIFASHFYPVSAWHWFTMERLEIHSNGSVAYFNASQVTGPSIYSFHCHLHLRPAHDPQPQDHGPLRRPQGPCYLSDPNRVTTPRCWGAESRGCHFSTSGHAGLEGCWPASPFLS	13004	15783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_13048_13439_13680_14371_14420_14507_14652_15068
838905	contig_13004_pilon	+	1390	4	Intergenic	novelGene_112740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	101.114896144051	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	245	874	940370	952167	FALSE	30	TGAATTATGAACTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPRCLWLRARVSSRPWSSSPGNWRCLGQRSKEHFVWTVRPTTQLPPPLAAKVSQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	940125	952683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_940371_943755_943915_948443_948698_951951
838906	contig_12078_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_74131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCTATGTAACTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698459	697644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_697600_698500
838907	contig_9290_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_77521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAAATAAATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191151	189769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_189800_191200
838909	contig_18859_pilon	-	917	3	Intergenic	novelGene_150530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTATCGTTATTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46222	39472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_39988_42499_42737_46057
838911	contig_11855_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_66922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846861	845998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_846000_846900
838914	contig_7056_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_43743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACCAAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133086	1133880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1133100_1133900
838915	contig_3942_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_128718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1080	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCGGCTCTCCGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525796	525198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_525200_525800
838917	contig_10299_pilon	-	1487	7	Intergenic	novelGene_79679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	1.4142135623731	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1467	19	1485	319669	315055	FALSE	50	ACCAATAAAGGCATGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCLENEEPRRPLPSAMVHLQASEVQQLLHNKFVVILGDSIQRAVYKDLVLLLQKDSLLTAAQLKAKGELSFEQDQLVAGGQLGELHNGTQYREVRQFCSGSGHHLVRFYFLTRVYSEYLEDVLEELAYGPTPDLVIINSCLWDLSRYGRCSMESYRENLERVFVRMDQVLPDSCLLVWNMAMPLGERVTGGFLLPELQPLAGSLRRDVVEGNFYSATLAGDHCFDVLDLHFHFRHAVRHRHRDGVHWDQHAHRHLSHLLLTHVADAWGVELPKRDRPSEPWIEDWPEMDHPFQGIHRQPPDFREQLRPPLPSPLPPPMPFPYPLPQPSPPPLFPPLPQDAPFFPGQPFPPHEFFNYNPVEDFSMPPHLGCGPGVNFVPGPLPPPIPVPVPHGQHRGPVVHRGDATLYSQWPLPCAKDGGALQAKAQTLRQTDPHIQTGRTASCRFRDMAWVDWNLGWICQRPCRACLPPQVLGQGVCYAKCCSCSLL	319687	315052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_315411_315711_315982_317966_318214_318318_318470_318579_318819_318926_319007_319545
838918	contig_7057_pilon	+	648	8	Intergenic	novelGene_123308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	884.23925564549	3	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	178	648	936984	943662	FALSE	10	CTGCTTTCAGCCCGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVNSFLKGGGGGGGGGGGLGGGLGNDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMITCHACSSYPPGSRTPRSTSHVPSAFVPA	935984	943662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937065_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941442_943579
838920	contig_12970_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_50523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169274	169767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_169300_169800
838921	contig_9527_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_134057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449212	448310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_448300_449200
838923	contig_12429_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_136201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25805	24692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_24700_25800
838924	contig_13593_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_156134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	79	399	127569	127249	NA	30	AGTCAATGCAGTCAGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALTECYDELGNRYQLPVYCLAPPINMIEEKSDIETLDIPEPPPNSGYECQLRLRLSTGKDLKLVVRSTDTVFHMKRRLHAAEGVEPSSQRWFFSGRPLTDKMKLEELKIPKDYVVQVIVSQPLQNPTPVEN	127647	126606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_126600_127600
838925	scaffold_6394_pilon	-	1827	10	Intergenic	novelGene_110968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.86044221516	3	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	628	1629	250850	248837	TRUE	15	CAAGAGTCGGTGGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDNSGDPADPHKVYAVSPAPGWGGQGSDRTEEEAPTDGRLMRGEPPGPFLGEAGERPEPVLGWAGATGQRSEPCTSSPQPTPAADARDLLHQALQHTHLGDHLLEEAWRMDSAPQQPPGPALVSEELYLPWAEAAPSCPPQPPAQHQALMTDAAWTPALEPSQEAGPAPSPLTGAPLAEGGLAVLEVTILYKGRPVLQEVVGRASCVLLYRTPGPAAEAVDAQLVAFPSPAELPDQKQLRYTEELLRHVDPGLQLELRGGSLWARRLGVSGAPCLRAVPEPAGWLAHWSPSPQSWWSSGNGGARAPHTTPSTWALGRTCLRGGRRRRAWCW	251645	248561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_248758_248834_249031_249151_249419_249495_249577_249650_249750_250025_250255_250350_250407_250774_250983_251068_251231_251312
838926	contig_990_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_76158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATAACACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1874482	1876478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1874500_1876500
838929	contig_5350_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_99347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150619	150020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_150000_150600
838930	contig_13744_pilon	-	962	5	Intergenic	novelGene_77167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_4	41.4630859922413	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	120	677	375026	355145	FALSE	20	TCTTGTATTAGTGCTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYDEDLLKNPFYLALQKWRPDLCSKVAQAHGIVLVPCKGSLSSNVQSTCQFESYILIPVEEHFQTLNGKDVFIQGNRIKLGTGFAYLLSVPILFEETFYNEREESFSILCIAHPLEKRESSEEPSTSPDPLSLKTIEDVRDFLGRHAEKFDRSIASFHRTFRECERKSLRHHIVSSCVLLCQA	385575	354859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_355333_356183_356341_358131_358243_374924_375057_385486
838931	contig_13481_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_119338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGCTTTTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341474	340274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_340300_341500
838935	contig_10307_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_170265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387435	388450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387400_388400
838936	contig_10377_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_115363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTTTGTCAATAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196359	196815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_196400_196800
838937	contig_9955_pilon	-	945	6	Intergenic	novelGene_21388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	167.72525152761	564	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	109	558	667630	664178	TRUE	10	GGTGGCAGTGACTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGCVGAQSVARRLGPSRVFLTSGLHRIYCQSLLFTMASSDIQVKELEKRASGQAFELILSPRSKESVPEFPLSPPKKKDLSLEEIQKKLEAAEERRKSHEAEVLKQLAEKREHEKEVLQKAIEENNNFSKMAEEKLTHKMEANKENREAQMAAKLERLREKDKHIEEVRKNKESKDPADETEAD	669371	663735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_664095_664149_664250_664634_664827_666950_667124_667617_667686_669318
838938	contig_8059_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_111090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACACCAAAGATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103324	102109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_102100_103300
838939	contig_6031_pilon	+	2249	3	Intergenic	novelGene_56748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCCCGCTGTCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211269	220787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_211549_218058_218142_218900
838942	contig_2043_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_169898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCAATCTTTGAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643857	644809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_643900_644800
838944	contig_11126_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_138114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	752	1117	159459	159094	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCFHRGTPASGGCHSGACPKLVAGLECPHCVQTLTLQVTEQSSSSCPALTQEGKTKAPGQVTSGVTQLIIERIRARVRFLSSPVSTLPMSTFLTMTWRVPVSACSYRQHQGNGAAYRDHP	160210	158853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_158900_160200
838945	contig_6097_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_174443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAAAAAAGACAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158427	156947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_-_156900_158400
838946	contig_7720_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_155750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAAAAAAAAAAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316134	315075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_315100_316100
838947	contig_13305_pilon	+	1126	4	Intergenic	novelGene_146772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	10.3387082795139	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAACTAACTCCTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99390	120195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_99434_102557_102768_109683_109806_119444
838948	contig_7129_pilon	+	792	4	Intergenic	novelGene_169294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	51.6935413975694	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	335	790	874877	878797	FALSE	10	TGTGGGAGTCAGCCGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPGNWLWASMTFMARFSRSSSRSPVRTRGPLEEMPAVQHPFVNVFELERLLYTGKTACNHADEVWPGLYLGDQDIANNHRELRRLGITHVLNASHNKWRGTPEAYEGLGIRYLGVEAHDSPAFDMSIHFQTAADFIHRALSRPGGKILVHC	872704	878799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_872963_874800_875098_877618_877834_878777
838949	contig_7129_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_169295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGCCTCTTGAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879061	879652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_879100_879700
838951	contig_5997_pilon	+	1503	2	Intergenic	novelGene_168617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTAGTTACACTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328858	353257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_329039_351934
838952	contig_7513_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_89010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGGGACCCCAAAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664202	665483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_664200_665500
838953	contig_7513_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_89011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGGTTTCTGCAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665436	665791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_665400_665800
838954	contig_16686_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_162108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGTAATTAGTTATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219885	221994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_219900_222000
838955	contig_10235_pilon	-	880	3	Intergenic	novelGene_46406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	3.5	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	51	428	208771	206451	FALSE	20	ACTTCTTCCCAGTTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLSSAVAATILRILTMKGLLLLALSTLVCWVSADIHCHSCYKIPLIGCVDRQSCHLEPNQQCMTTKVYLGKMWLYSNLRCGTPQEPCHAAFNQTNHKLGLTYNTTCCRTDNCNNPAPRPTPALALIFLTSLAGLGLWLLH	208821	205998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_206666_207138_207250_208719
838959	contig_8624_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_112581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGTTGGTAACCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185548	1184953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1185000_1185500
838960	contig_6873_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_129813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203790	204821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_203800_204800
838961	contig_10864_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_107092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAACCCTTGCTCTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931996	932919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_932000_932900
838962	contig_10779_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_165515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCATAACCAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35689	36224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_35700_36200
838963	contig_990_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_76144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTAACCCCTATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1730817	1729425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1729400_1730800
838967	contig_6794_pilon	-	1292	4	Intergenic	novelGene_149003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	188.073271773412	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	24	644	20671	13983	FALSE	20	ATCATGTTTGATGTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAAAEADRTLFVGNLETKVTEELLFELFHQEVAMPRRMSICHIPSITVGIQVLLYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20694	13334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15945_18755_18827_20575
838968	contig_848_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_83351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGACGTCTAGTTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754008	754390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_754000_754400
838969	contig_1143_pilon	-	1431	13	Intergenic	novelGene_86605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_12	114.922044834265	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	188	1222	249983	224419	TRUE	40	ATAACTACCTAAAGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKDASWELEENAYQELLQHYERCDVRRCRCKEGREYNAPNSKWEIKRCQCCGSSGTHLACSSLRSWEQNWECLECRSIIYNSGDFQKAKKHALPNSNSMGINDCLLEESSPKLLKQSPGAQSKDLLSSERESLL	255727	214579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_214632_224261_224444_228833_228967_229069_229195_231297_231415_232073_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_254862_254932_255613
838970	contig_9363_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_6710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	54	473	1295786	1295367	NA	50	GAAATTAAGACTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTYIYIERERDLLQGNGSCSCGAGKSQICGSGDRLKWLQELMDPKSAGEAAGWRPQLAHRVAGVGKSKICRSGSRPETSAGLHPKNQKSGNKKSARLRKERFARTSIYILEAGHTPKETPLSTDWLLTSDHKTEAGFR	1295839	1294350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1294400_1295800
838972	contig_8616_pilon	+	1147	2	Intergenic	novelGene_72524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGAATGGGGTTCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352322	353657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_352903_353090
838974	contig_4202_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_147078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGAGGCTTAAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233757	235098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_233800_235100
838975	contig_12543_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_168380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAATTCAGAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351799	353431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_351800_353400
838976	SIRV2	-	297	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	67	3368	-32	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTGCCAGTTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1400
838977	contig_1813_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_105463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACATATACAATGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46164	47053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_46200_47100
838978	contig_17106_pilon	+	1640	1	Intergenic	novelGene_127667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	856	1188	62487	62819	NA	65	AGAGATGAAAGAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSVLPETLEAKVTWWENLGGGVSFSQRQFRVTAKSESEELMNLSIVFGVRGAVYTGHPLRGQAFGPIRPRQGRVEEATWDRVRLGFPRQQQILALVDGVGFLGLVYRTR	61631	63271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_61600_63300
838979	contig_5918_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_99619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCTATAGACTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2190203	2191713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2190200_2191700
838980	contig_11328_pilon	+	622	5	Intergenic	novelGene_88401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2808.61963426876	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	38	415	643683	645256	TRUE	40	TACATTAAATCATCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGGEGYSRTD	643645	648029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645227_645344_647909
838983	contig_16541_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_126733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTAACAAAAAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305174	305440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_305200_305400
838984	contig_11720_pilon	-	705	3	Intergenic	novelGene_43872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	206	334	106001	104773	TRUE	25	ACTTCCCATGCATGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVSLEKSVYIERRPHPTPKHFVHPLPSPGQASKLAKREARSWCEQSCSSQYSRAASGWQPDVLGAGTEMNEGFPVFRCSPPGCGGQVKLTQPRLSSEGQKWPPPTLQGFR	106206	100960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_101304_104744_104862_105961
838985	contig_10930_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_36955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	11	304	195530	194157	FALSE	20	TTCCTGGCTCTTGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFEMFSLSGTFGTQYVFPEVLLSEVQLAPGEFQVSSDGRLFSLKPTSGPVLTVTLFGRWYEKDWTSNVSSEFRAQALRMMKIAVTIIILAIITTFLKIIF	195540	193920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_194361_195440
838987	contig_7545_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_177340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81429	79956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7545_pilon_-_80000_81400
838989	contig_14341_pilon	-	760	5	Intergenic	novelGene_111883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	820.704118425148	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	321	683	727881	727088	FALSE	15	GACTCTGTGATGACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	729290	727010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_729108
838990	contig_8535_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_177276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1735	2061	10849	10523	NA	50	ATTATTAAACACTTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFCFLTKPALQYSRSSGFSGSRSLPAFCFEDPLKPLKYDSRAPESQCSDGGLAAAGCQVSPMLSFPSKSNLLLRFFIPLTELLVRLLCLMCTEQTFNSCVGCSRVF	12583	10428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8535_pilon_-_10400_12600
838992	contig_2890_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_60296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTATGTTACACTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369540	369033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_369000_369500
838993	contig_10658_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_130077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCCGAAATACCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193488	192245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_192200_193500
838994	contig_5260_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_144371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACTGACATGTTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281357	282124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_281400_282100
838995	contig_5816_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_158255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	150	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAACTTGGCAGGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333554	308670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_309199_330700_330822_333374
838996	contig_10857_pilon	-	954	6	Intergenic	novelGene_160874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	318	743	66582	58794	TRUE	5	CTCGGGCGGGCAGGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVRGVQGGWGGLQKWLPPGARRALARVSPGSLDVDWVCTSPVSHRLFVLATAMLGSSMEVWRASLGVRPAVSTAWVYCSRRSSILEIGWAGSDFFTLLLFSMERFKDSVLSMSLVVGLRGGGLCSAVPSKAKGLGVLGC	66899	21818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21931_58694_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61488_66485
838997	contig_16071_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_165996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAAAAAAAAGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59793	59048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_59000_59800
838998	contig_12427_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_40447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAGCAAGAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306242	305068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_305100_306200
839000	contig_6434_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_61872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGACTTTGATGGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849427	848610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_848600_849400
839002	contig_10674_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_6465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACTCATACTGACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374445	374981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_374400_375000
839003	contig_11631_pilon	-	624	4	Intergenic	novelGene_104195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_3	65.9966329107444	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	209	622	154973	147518	FALSE	40	GCGGAGGTTGAATAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAQSPPVPARKNQLRAEEEKKNVIMELSEMRKQLRSEERRLQGQLLHMDSDDGIHIRKRERNPMDIFDMARHRLQAPVRRPSPKGLDPATFQNIHDFNELKDRDSETRVDLKCMYPDPPRDHHTLEIQQQALLREQ	155181	147515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_147616_150473_150614_154174_154293_154915
839004	contig_6286_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_165666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCCTCTGGCTTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411576	412647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_411600_412600
839005	contig_6266_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_171001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACCCTTAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803745	805612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_803700_805600
839006	contig_10990_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_7421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATTATGAAGTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649066	648249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_648200_649100
839007	contig_4125_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_25244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACCAAAGTGACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2979671	2977804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2977800_2979700
839008	contig_5451_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_167174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGAGCCCAGGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475153	475930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_475200_475900
839010	contig_17214_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_153475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGTCAGTTCTTGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108202	107270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_-_107300_108200
839011	contig_5502_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_154999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGATGAAGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434184	435220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_434200_435200
839012	contig_10404_pilon	+	915	2	Intergenic	novelGene_138671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085387	1086748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085728_1086173
839014	contig_5954_pilon	+	669	3	Intergenic	novelGene_28565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	346	junction_2	64	1742	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTTTCTTTTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862011	862886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862307_862431_862522_862602
839015	contig_6266_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_171016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919793	918390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_918400_919800
839016	contig_6076_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_81764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGACTTACAGAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387901	388328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_387900_388300
839018	SIRV2	+	264	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-43	302	-43	-302	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGCAGTAATGCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065	1329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1100_1300
839019	contig_4531_pilon	+	1192	8	Intergenic	novelGene_47950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	34.0647642479044	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	72	1190	854345	879830	FALSE	25	CCAGGATGAAGTGGGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSRDHTCVHPEVVGNFNRKEKCMEFLDGKNGKSCYFYHGVHKIRDQQTLQTFQGMHKAWDIEELVSLGKKLKACPYYTARELIEDAEIVFCPYNYLLDPQIRESMDINLKEQVVILDEAHNIEDCARESASYSITEVQLWFARDELDSMVNNNIRKKDHDPLRAVCYSLINWLEVNSKHLVERDYESSCKIWSGNEMIIHLHKMGITSATFPILQGHFSAVLQKEEKVSSIHSKEEAREIPVISASTQIMLKGLFMVLDYLFRQNSRFADDYKVAIQQTYSWINQTDISDRNGFFALPKNKKRSRQKTAVNVLNFWCLNPAVAFSDIDDRVRTIVLTSGTLSPMKSFSSELGVTFSIQLEANHVINDSQVWVGTIGSGPTGRNLCATFQHTETFE	854273	879832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_854369_856972_857195_859916_860117_868728_868862_874425_874581_875900_876067_876183_876325_879752
839020	contig_7410_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_106061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	6	341	270469	270804	NA	75	ATTCAGAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSSSVRRKGKPGKGGGKGSSRGGRGGRSHSSKSHGGGGGGGSGGGGSGNRKASSRIWDEGDDFCIFSEPRRSSRSLYSLNVQIWKQYQSLMYRTTDGREKGKRNVKRFWAS	270463	271593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_270500_271600
839021	contig_2703_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_101757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGGTACCATAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577119	575610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_575600_577100
839023	contig_7895_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_154459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTTAGAAAAAAACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759457	760041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_759500_760000
839025	contig_19469_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_134988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGAGACGTTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71460	70878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_70900_71500
839026	SIRV6	+	413	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	24	164	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
839028	contig_11248_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_142560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373114	373860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_373100_373900
839029	contig_13004_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_112636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCAAATATTTTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258075	258429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_258100_258400
839030	contig_602_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_134959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGTGACCTCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512192	513320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_512200_513300
839031	contig_16594_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_53882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTGGGTGACCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194749	195848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_194700_195800
839033	contig_6735_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_15835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTCATAGTCCCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679326	680559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_679300_680600
839037	contig_5848_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_163806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGATCCATAAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224787	223099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_-_223100_224800
839038	contig_6418_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_81266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATTTTTTATAAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562893	1563779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1562900_1563800
839039	contig_5832_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_134116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTAACCACCACTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42880	44038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_42900_44000
839040	contig_16647_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_170306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300328	302307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_300300_302300
839041	contig_2480_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_63500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTAATTTGTGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19030	20324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_19000_20300
839042	contig_16010_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_165260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	39.5	2442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAACAGTCTCTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23275	25014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_+_23324_23682_23777_24757
839043	contig_6497_pilon	-	1461	3	Intergenic	novelGene_35575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	382	1227	201514	196700	FALSE	40	GATGCAAAATTTTGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELVERFALYGAIEQYNALDEYPAEDFTEVYLIKFLNLQSARTAKRKMDEQSFFGGLLHVCYAPEFETVEETRKKLQERKAYIARTTKNKEDHRMTKKKLVTEHKDAEDHRQDFHSETSGFCASALNTSTGSSNPYSCESPLCYFSSKCMCSSGEHVARASNSSQDGRNHGEAVEHCNYNKSLQKIQMKTFKNSVACPGAQKVITPSEAIDRFMPRTTQLQERKRRRENDCRLGTFLETSTSSNEVMIGPKLPDIPKVDMHDDSLNTTANLIRDKLKEVR	201895	196465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_197272_199566_199713_201386
839045	contig_11047_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_173953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCCTGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83877	84912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_83900_84900
839047	contig_7411_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_136960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATCCACACGTATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22983	22507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_22500_23000
839049	contig_2114_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_104291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765922	764986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_765000_765900
839050	contig_14300_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_133151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACTATAAAATGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527309	525676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_525700_527300
839051	contig_1172_pilon	+	1979	9	Intergenic	novelGene_162025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	43.1970412759948	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	2	1783	571315	647721	FALSE	20	CTGATTGTATGGTTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSSFISRRHLQLSFQEPHFYLRCLGKNGVFVDGAFQRRGAPALQLPPQCTFRFPSTAIKIQFTSLYHKEEAPASPLRPLYPQISPLKIHIPEPDLRSMVSPVPSPTGTISVPNSCPASPRGAGSSGYRFVQNVTSDLQLAAEFAAKAASEQQADASGGDSPKDESKPPYSYAQLIVQAISSAQDRQLTLSGIYAHITKHYPYYRTADKGWQNSIRHNLSLNRYFIKVPRSQEEPGKGSFWRIDPASEAKLVEQAFRKRRQRGVSCFRTPFGPLSSRSAPASPTHPGLMSPRSTGLQTPECLSREGSPIPHDPDFGSKLASVPEYRYSQSAPGSPVSTQPVIMAVPPRPSSLVAKPVAYMPASIVASQQPTGHAIHVVQQAPTVTMVRVVTTSASSTNGYILASQGVAGGTHDTPGTAVLDLGSEARGLEEKPTIAFATIPATSRVIQTVASQMAPGVPGHTVTILQPATPVTLGQHHLPVRAVTQNGKHAAPASGLASSAYALTSPLQLLAAQASSSTPVVVTRVCEVGPEEPPAVVTAAATPTTAAPTAAISPTGEPEIKRSRVEEPGGTAAAQAGVIAAAGPQGSGSGE	571313	647917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_571464_620567_620754_641440_641598_642592_642740_644186_644381_645164_645332_645443_645729_646577_646803_647449
839052	contig_15456_pilon	-	1048	6	Intergenic	novelGene_139494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	75.4676089458252	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGATTGTGGCTTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131121	101999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_102318_115593_115703_126116_126234_127751_127844_128943_129193_130958
839053	contig_15353_pilon	+	956	4	Intergenic	novelGene_151976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.854905783439	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	94	420	529420	529819	TRUE	20	GTGTACCAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVIRHFERSKVAFTFPERLLRFCLDRPLITDMSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLQVAQSPRSHHRLPTKYSSSNSNSSRYRRSSLRHSSSHRHRRISSRHRRISSHINNHISSRRRHRTRLSLSFLRDPARLLE	529326	537366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_529506_529578_529841_534462_534567_536955
839054	contig_1337_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_84235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTTTATTTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175475	174590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_174600_175500
839055	contig_12622_pilon	+	1074	2	Intergenic	novelGene_5851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	19	780	949138	952249	FALSE	25	CGTAATAACACTTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPSATSVETSEELAPGDEALAAARERSSRFLSGLELVKQGAEARVFRGRFQGRAAVVKHRFPKGYRHPALEARLSRRRTVQEARALLRCRRAGISAPVVFFVDYASNCLYMEEIEGSVTVRDYIQSTMETEKTPQSLSCLAKAVGQVLARMHDEDLIHGDLTTSNMLLKPPVEQLNIVLIDFGLSFISALPEDKGVDLYVLEKAFLSTHPNTETVFEAFLKSYSSSSKKARPVLKKLDEVRLRGRKRSMVG	949119	952543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_949421_951770
839056	contig_7056_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_43680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTAAGACTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819891	820631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_819900_820600
839059	contig_3334_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_137679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGGTGACCCCATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813775	813285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_813300_813800
839063	contig_7702_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_177292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	40.8197256237717	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	125	577	17387	253368	FALSE	30	AACCCCTAATCTGATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIQAVFFGICVLTDLSSLLTRGSGNQEQERQLRKLISLRDWMLAVLAFPVGIFVVSMFWIIYAYDREMIYPKLLDNFIPGWLNHGMHTTVLPFILIEMRTSHHQYPSRSSGLLAICTFSVGYILWVCWVHHVTGMWVYPFLEHIGPGARIIFFGSTTILMNFLYLLGEVLNNYIWDTQKSMEEEKEKPKLE	17262	254018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_+_17420_64605_64708_196377_196494_248094_248259_253330
839064	contig_7695_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_41678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGGTAGCTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026562	1025640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1025600_1026600
839065	contig_16884_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_161824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCAAAGGTCAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87671	88224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_87700_88200
839067	contig_8762_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_145291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAACCAGACTCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106939	106493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_106500_106900
839068	contig_15354_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_65741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCGTTAAGGCATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614494	615554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_614500_615600
839069	contig_10064_pilon	-	784	2	Intergenic	novelGene_122714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	270	659	268276	267887	TRUE	10	ACCCCCAGTGCTGGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICNKDSPNLGLRPLENVEVQVTVVASRATLELQRVTQITERETERTQVVEQMKLTWSPRDWRFSGVVWISKGLLLTGTGREGSTPFPYFSDSPLYTSLVSLTSPRLYTVRPPSPMGNTGRPEGSRAMG	268545	267183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_267252_267829
839071	contig_5910_pilon	-	870	7	Intergenic	novelGene_168418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_6	61.1212365349029	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	861	9	869	202081	109275	FALSE	30	TTGATGATGAGGCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKMAEKQKLDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPEDPSYDANV	202089	109273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_109348_128028_128254_129650_129739_135487_135633_136211_136306_160633_160776_201987
839073	contig_10599_pilon	+	1656	6	Intergenic	novelGene_49903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_5	59.502604984992	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	36	713	323361	332596	FALSE	25	TTGAACTATGCTTTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSEKKEKNAVMSFTVTDEPVCIDLTLSENKEEPVRLVVVCRDGQVHLFEHILNGFCKKPLSSNCTIQIATSGKGKKSTPKPIPILAAGFCSDKMSLLLVYGSWFQPTIERVAINSKEPHVCLVRDISSCWAPKVETAITKVRTPVMNSEAKVLVPGIPGHCAVVKPVTPQAEELESKRKLGENEVSIEERLGAMDIDSKKGKDDLPQTNSFPVLLTQGLESNDFEMLNVSIIVAF	323325	333539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_323427_326889_326955_329050_329223_330609_330697_331544_331677_332440
839074	contig_753_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_112953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	380	682	1165661	1165359	NA	25	TCAACAAGTGTGGCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKIILLEEVMKECLAHGNSSVHGPSSLSLSLVLLSVCRNSSSLHLQPEEGFPCRGRKRATSPRHSRILSHIQRAQSGSAPRTVFRIRNREAECGLIWTA	1166040	1164842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1164800_1166000
839075	contig_7457_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_31541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAAGTTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760809	761922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_760800_761900
839077	contig_19145_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_164140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAACTAGGACAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94978	93582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_93600_95000
839078	contig_9335_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_147430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	965	1300	91078	91413	NA	20	CTGCTGAGCCCAGCGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVHHYGILQNSFLALKMSCAPPLHPSPPREPWDGKCFHTHMLHVPDASLPVSLPGDIPPKRFPGQAGGGSMSRLLLLSQRRPSCPRGLGQPAPPTFVSCFLLPTMVPVR	90113	91538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_90100_91500
839079	contig_13457_pilon	+	1671	10	Intergenic	novelGene_118327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	265.704514242587	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	33	1403	54302	57730	FALSE	45	AAAACGAGGACAATTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQQQIKRSARMCGECEACRRTEDCGHCDFCRDMKKFGGPNKIRQKCRLRQCQLRARESYKYFPSSLSPVTPSEPLPRPRRPLPTQQQPQPSQKLGRIREDEGAVVSSAVKEPPEATATPEPLSDEDLPLDPDLYQDFCAGAFDDHGLPWMSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEAMRVTVMTRTCRSSVSPVGTPSTHVLPCATWNAAMPRLGCHSEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVSCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	54269	57998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_54440_54805_54833_54909_55156_55307_55416_55583_55763_56023_56228_56310_56443_56721_56824_57413_57502_57583
839080	contig_1898_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_177342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTTGTTCCCACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039640	1039322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1898_pilon_-_1039300_1039600
839081	contig_9389_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_84134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAAGAAATCATTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1630899	1631361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1630900_1631400
839082	contig_13753_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_136522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAGTATTTGAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352337	353268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_352300_353300
839083	contig_6283_pilon	-	506	3	Intergenic	novelGene_100199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	43	junction_1	75.5	103	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	35	400	564726	554036	FALSE	40	TGAAAAACTGAGGATCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRKKVLSAEEMELYELAQAAGGAIDPDVFKILVDLLKLNVAPLAVFQMLKSMCAGQRLASEPADPTALPLPAASVSETRGRNKGSTPLSGAPALAERSSREGASQRMPRQPSATRLPKGGGPGKSPTRGST	564760	553929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_554194_564351_564501_564667
839084	contig_12837_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_57278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_2	215.5	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	11	418	60580	49099	FALSE	30	CACTTCTCAACACTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTVSEWLRLLPFLGVLALLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPKVVNEINIEDLCLTKAAYCRCWRSKTFPVCDGSHNKHNELTGDNVGPLILKKKEV	60590	48822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_49189_51014_51230_60477
839085	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
839087	contig_13265_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_146007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGACAAATTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78236	78743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_78200_78700
839089	contig_9434_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_150493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGTAAACCAATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144967	144444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_144400_145000
839091	contig_1836_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_71033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	590	931	577106	576765	FALSE	10	TCTCTCTCTAGAGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMLSADGLQLSPPCAFPLSKGAASPKVIPSPIRWPSSNDWLVEEGGYKGPAPLLQFGTILKVIPDAEPPMGSAEASAAIVSQFNFSLCPVLLSALLYGYYPEEHSPINFLHA	578587	576762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_577667_578558
839093	contig_9720_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_116790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	614.5	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	18	422	391741	392457	TRUE	20	GTCAATGCCTGCATTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAFNMKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391723	393993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_392089_392400_392469_393259
839094	contig_9468_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_59473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAACTAATAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197883	196526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_196500_197900
839095	contig_9516_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_106190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAGAGGAAAATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963502	962526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_962500_963500
839096	contig_8317_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_20244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
839098	SIRV4	+	393	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	28	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTCGCGTCGTGTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3711	4104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3700_4100
839099	contig_6595_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_122564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGATACAAGGGAGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740035	742047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_740000_742000
839100	contig_5684_pilon	+	942	5	Intergenic	novelGene_80994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	18.886172190256	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTCAGAGTGTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135231	143887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_135275_135930_136056_136661_136800_137547_137926_143629
839102	contig_8696_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_153333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTGTTCATTTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952981	953954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_953000_954000
839103	contig_9706_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_20972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGCAGAATATGAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340740	341497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_340700_341500
839106	contig_7887_pilon	+	468	4	Intergenic	novelGene_124902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.3716067751046	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	93	467	375247	378517	FALSE	15	GTTGTGTGAGCTGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGTGTSLALSSLLSLLLFAGMQMYSRQLASTEWLTIQGGLLGSGLFVFSLTAFNNLENLVFGKGFQAKIFPETSSSPWLVCTTSTRSLPPCTRQQLQSSHQPRSRARARRETDPECPIKLIRC	375154	378518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_375251_375570_375726_375862_375927_378365
839107	contig_3900_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_84166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATATACCTAGCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61110	59918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_59900_61100
839108	contig_2476_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_157630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAATGATCAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170835	172063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_170800_172100
839109	contig_19405_pilon	+	1562	6	Intergenic	novelGene_176204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	30.0692533994444	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACGATCTAAAGAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50180	80382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_+_50301_69653_69795_76124_76300_78147_78345_79192_79326_79586
839110	contig_9242_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_155082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATGTAGATTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821089	819852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_819900_821100
839111	contig_11498_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_65501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	427	942	126972	127487	NA	65	TTGAAAAAAAAATAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKEYPPTWVDPFLLMTPDLLHSGSPPPPLIGTLFQIFHLTLGLLAKSYGMWVSSLHRQGLSNNLYFQSWKGLLSCNSVRITGGATDIYIAPTVCQAPYWALKQFIILQKSCYVGLRIPILQMRHLSLILSELPVVTYQRIEKLRFELRSFDAKAVLSCYIARWLFLRIK	126545	128171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_126500_128200
839113	contig_14745_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_147851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTATACTCTTCATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60363	58845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_-_58800_60400
839114	contig_15970_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_144054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179012	179311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_179000_179300
839116	contig_9177_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_32719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATATGGGCCCTTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612125	610877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_610900_612100
839117	contig_3004_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_127522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAATAATTTAGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366893	366185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_366200_366900
839118	contig_1813_pilon	+	893	2	Intergenic	novelGene_105469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	52	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	209	892	94152	97378	FALSE	30	GCTACAAGCACTTCTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCQTAPAGLWGLPEVISSRPLLLAVLQGASAASLRVSSKSDEHQSGIQGQPFVRWHESREETKQDRRHRMQRLTEDSGEGEMTCWEIQAPLVFAPHALVSGRSVPRTPRPSWAMALCLKQVFSKDKTFRPRKRFEPGTQRFELYKKAQASLKSGLDLRSVVRLPPGESIHDWIAVHVVDFFNRINLIYGTMAERCSETSCPVMAGGPRYEYRWQDERQYRRPAKLSAPRYMALLMDWIEGLINDEDVFPTRVGVPFPKNFQQVCTKILTRLFRVFVHVYIHHFDSILSMGAEAHVNT	93943	97379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_94702_97244
839119	contig_18919_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_156025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	139	471	73251	72919	NA	55	CAAAAAATTTATGCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSPRLLLTPYKARVLHAQNSRQFRGDQNKVCGNGLWGSRKLSSKADPHPHSAAPAILEFTCDVLASGAVTDLNDTLPAPTRACCMNWVRPGFGLSSGSRSGCVIGSCPS	73389	71342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_71300_73400
839120	contig_9548_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_141091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320671	321412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_320700_321400
839121	contig_7411_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_137051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGTTCTAGAAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983563	982118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_982100_983600
839124	contig_3818_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_99200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGCAGTGGTTAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72911	74277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_72900_74300
839125	contig_9871_pilon	+	769	5	Intergenic	novelGene_75688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	197.886804764744	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	533395	539165	TRUE	10	GGCCTGTCTTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGEDGGGGHRGLALGRGAAPLGAAGSLWERAWAIPDVLAGAACALLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDEVIPWCHTTKV	533394	540643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_533533_537743_537941_539137_539213_539747_539984_540520
839126	contig_2867_pilon	-	703	2	Intergenic	novelGene_135246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTGTGTGTGTTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285757	1285014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285549_1285588
839129	contig_12919_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_75875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGATTTTTAGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631799	633284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_631800_633300
839130	contig_4232_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_63244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	272	562	312904	313194	NA	20	GCAAGCCAGTGCCCTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDVFHERKSVLRLIATRFRTSHRGEREGGTRCKGQRVLWESTRPWVQTQVDGTWEENASGGGVLGTRTLTGVARNSDLASWVGATQNIRAMGSNRAGGTRSGPGDPAWQRLRRWSQAGTPRRPRGGRRILTGRKPRRRRALPGVPEGTAQFQSSSPDRVLFSWLSSRPAVTSRDPRKPSHGPSHTP	312632	313954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_312600_314000
839131	contig_1406_pilon	+	926	2	Intergenic	novelGene_25652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGTCGGAATCGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2778710	2780242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2779278_2779883
839132	contig_1406_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_25656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCTCACCTCAGAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2780325	2781054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2780300_2781100
839135	contig_15449_pilon	-	1366	10	Intergenic	novelGene_33640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	7.24185366080014	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	71	1366	99234	92562	FALSE	40	AAGGTCTGAAAAATTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNTSHIWHPRIREVQGAIIVSSMVEVVIGMMGLPGALLNYIGPLTVTPTVSLIGLSVFQAAGDRAGSHWGISSCTILLIVLFSQYLRNLTFLLPVYRWGMGLTLFRIQIFKMFPIMLAIMTVWLLCYVLTLTDVLPTDSAAYGFQARTDARGDIMGIAPWIRIPYPCQWGLPTVTAAAVLGMFSATLTGIIESIGDYYACARLAGAPPPPVHAINRGIFTEGICCIIAGLLGTGNGSTSSSPNIGVLGITKVGSRRVVQYGAAIMLILGTIGKFTALFASLPDPILGGMFCTLFGMITAVGLSNLQFVDMNSSRNLFVLGFSMFFGLTLPNYLESNPGAIDTGIPEVDQILTVLLTTEMFVGGFLAFILDNTVPGSPQERGLIQWKAGAHANSETSTSLKSYDLPIGMGMVKRITFLKYIPICPVFKGFSSRSKEELRVPEDTPENTETGSAST	99471	92561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_92801_96163_96260_96773_96918_97026_97157_97351_97458_97972_98121_98407_98565_98826_98948_99079_99262_99428
839137	contig_5954_pilon	+	810	7	Intergenic	novelGene_28725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	6.65206734782504	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGAGCGTTGACTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167368	1169581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1167712_1168282_1168405_1168524_1168556_1168758_1168833_1169064_1169147_1169257_1169292_1169457
839138	contig_11307_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_105258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAACAGTTTCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210061	210596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_210100_210600
839139	contig_6215_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_21178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198233	199278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_198200_199300
839141	contig_16231_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_176717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	135	169	303	123983	123849	FALSE	10	GGTGAATGCCGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALFRDPDFPQIRPGCLCICLLRKLVWKARQEREPRSSLGGGLTAKQIISVSAGWSYMATFYYHSDKLKWTPAYLAISVLRRLDWKEKQERRCCSSLGGGLM	153995	123848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_124022_153865
839142	contig_753_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_113004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATCCTCCCCTCTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285194	1283631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1283600_1285200
839143	contig_5815_pilon	+	943	6	Intergenic	novelGene_141210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	85.2	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGAGACGTTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561922	572113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564444_566543_566639_566892_567037_567812_568009_571794
839144	contig_3382_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_124189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACCATTAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986491	985211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_985200_986500
839148	contig_13421_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_166808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTTTTTTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186144	186448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_186100_186400
839150	contig_12080_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_128407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTCTGGGGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484307	483210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_483200_484300
839152	contig_7933_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_164703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5362	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGGAGCGTCAGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234487	233157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430
839154	contig_8286_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_139786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACACAGTTTCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54379	54712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_54400_54700
839156	contig_10732_pilon	-	1613	4	Intergenic	novelGene_114739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8.37987005998436	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	22	420	530345	525538	FALSE	20	GAACCTTTCTCTTTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVGGGGMGARLLPPAWQLYLKDHRISTFKNWPFLEGCSCTPERMAEAGFIHCPTENEPDLAQCFFCFKELEEHKKHSSGCAFLSVKKQFEELTLSEFLKLDKERAKNKIAKETNSKQKEFEETAKKVRSAIEQLAALE	530366	524344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_525628_528247_528366_529907_529988_530234
839157	contig_5947_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_101530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523168	521580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_521600_523200
839158	contig_3825_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_78023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTATGTTTAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466312	1466556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1466300_1466600
839159	contig_17340_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_177344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCATCATCTTTTAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56652	57970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17340_pilon_+_56700_58000
839160	contig_5947_pilon	-	638	5	Intergenic	novelGene_101485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	247.502525239643	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCACCCCTGTCTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393950	386006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_386292_392030_392116_392437_392503_393389_393497_393854
839161	contig_10158_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_150770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53515	54774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_53500_54800
839164	contig_5253_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_61553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTGGTCAGCGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154565	152666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_152700_154600
839165	contig_5253_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_61552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAATAGTGCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152716	152351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_152400_152700
839166	contig_5718_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_110335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGCAGTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563677	565506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_563700_565500
839169	contig_7091_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_131765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTCTTTGTGTGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349664	351534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_349700_351500
839170	contig_18438_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_171392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTCTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281602	283070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_281600_283100
839171	contig_6190_pilon	+	1356	7	Intergenic	novelGene_177346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.7950549357115	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	229	678	457554	497724	FALSE	25	ATGATATGTGAAGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILPPILAETPKRAVKFFTFEQYKKLLGYVSLSPALTFAIAGLGSGLTEAIVVNPFEVVKVGLQANRNTFAEQPSTMGYARHIIKKEGLGLQGLNKGFTATLGRHGVFNMVYFGFYYNVKNIVPVNQDPALEFLRKFGIGLLSGTIASVINIPFDVAKSRIQGPQPVPGQIKYRTCFKTIATVYQEEGFLALYKGLIPKIMRLGPGGAVMLLVYEYAYSWLQKNW	428878	498402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6190_pilon_+_428927_435233_435294_438828_438937_457541_457707_493510_493693_494574_494628_497662
839172	contig_2487_pilon	+	436	3	Intergenic	novelGene_148494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGAGAATATCTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366708	432310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_366911_413339_413508_432244
839173	contig_16385_pilon	+	1047	9	Intergenic	novelGene_86198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	259.179353923109	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	198	461	24785	27292	TRUE	25	AAAGTGATTGGGTTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGKI	20632	36827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27293_27588_27728_27908_28005_34231_34318_36562
839174	contig_6589_pilon	+	1668	2	Intergenic	novelGene_25729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATTGATATAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451901	453976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_452550_452956
839175	contig_10988_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_104725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCAGAGCCAACTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70277	72200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_70300_72200
839176	contig_9578_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_67973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	85	357	1071797	1071525	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYSSFPSLTGLCLTQLLAFPVFTVVFHQMDVPRYVYNTKPKPLLPSRFQRLVSLQDRVELPLSVCKGRLHGDMNPGGKGSRGYEEVLKWSISLCSMGGTLFFRPIRMSFAPRLGAQAV	1071881	1069938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1069900_1071900
839177	contig_8650_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_162621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGCCCGCAGACAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202859	204808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_202900_204800
839178	contig_10609_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_123907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGGACCTAAGGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235205	236048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_235200_236000
839179	contig_10609_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_123908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGGCCAACTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236206	236475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_236200_236500
839180	contig_8650_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_162613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATTGAAGCACTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17400	15993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_16000_17400
839182	contig_7839_pilon	+	1032	8	Intergenic	novelGene_45673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	41.419210765153	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	56	1030	83593	89075	FALSE	25	GGATAAGGTGCAGATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAAPAKKPYRKAPPEHRELRLEAPGSRLEQEEPLTDADRMKLLQQENEELRRRLASATRRTEALERELEIGQDCLELELGQSREELDKFKDKFRRLQNSYTASQRTNQELEDKLHTLIKKAEMDKKTLDWEIVELTNKLLDAKNTINKLEELNERYRLDCNLAVQLLKCNKSHFRNHKFADLPCELQDMVRKHLHSGQEAASPNPAPSLAPGAVVPTSIIARVLEKPESLLLNSAQSGSAGHPLAEDVFVHVDMSGDVPGDPASPLAPGSPAPQPNGECGSLGTAGGSPEEELPLPAFEKLSPYPTPSPPHPLYPGRKVIEFS	82817	89077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_82849_83568_83692_85407_85437_86096_86259_86465_86533_87594_87703_87807_87892_88649
839186	contig_18274_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_164038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTCTGTTGGATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50901	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_+_50900_51700
839188	contig_10013_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_125054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTACCCAGAGGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243790	242984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_243000_243800
839189	contig_9375_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_136051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAATTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175807	176118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_175800_176100
839191	contig_18859_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_150540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAAAAAAGGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83043	81618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_81600_83000
839192	contig_16714_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_161556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCTTCTTCAGAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564040	562804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_562800_564000
839193	contig_7810_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_144223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374930	376232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_374900_376200
839194	contig_15882_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_144818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGAAAGATTTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448357	449760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_448400_449800
839195	contig_9429_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_155087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTTGGAGGTTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7622	8980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_7600_9000
839197	contig_12923_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_30182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCATTAAAGCACTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335788	334447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_334400_335800
839198	contig_6589_pilon	+	1058	7	Intergenic	novelGene_26076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	57.4003968240251	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	15	770	1865919	1874896	FALSE	5	GCTCTGGCCAGGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVGPPLALLSLSRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQRGL	1865904	1875184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1874884
839199	SIRV1	-	220	1	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	3588	-109	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6778	6558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6600_6800
839202	contig_854_pilon	+	1943	1	Intergenic	novelGene_36545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	878	1192	1643713	1644027	NA	65	GACCAAATAAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQDAGVVIYQAVTCISCSNGNAHWVNPFGKRFGNPYQGHKNVRMSLCPSNSTSGNLSQGGTVRCRITSVQATSDRTIHLWSHKVMKDFRNLDRRTGPSGFNRM	1642835	1644778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1642800_1644800
839206	contig_3307_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_86888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCAGGTGAAAAATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131617	132571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_131600_132600
839210	contig_20742_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_150655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96817	97546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_96800_97500
839211	contig_20116_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_159083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAAAGGGTGGCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13124	12637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_12600_13100
839217	contig_5954_pilon	+	292	3	Intergenic	novelGene_28442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1926.5	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCATCTCATTGATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98099	99026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_98163_98637_98698_98857
839220	contig_846_pilon	-	1492	4	Intergenic	novelGene_136103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	128.203830762666	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	183	563	214365	212362	FALSE	30	AACGTGTTAAATATGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVIPRGGEAEAQEEGEKRRRRFLATTLNPIPILSDLRNTEKGKGVSSPFLPSALSSALAMAEAGAGLSETVTETTVTVTTEPENRSLTIKLRKRKPEKKVEWTSDTVDNEHMGRRSSKCCCIYEKPRAFGESSTESDEEEEEGCGHTHCVRGHRKGRRHTSQEPTPTTPPQPPDPSLPLLPSPLA	214547	211432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_212391_212515_212690_213134_213244_214296
839221	contig_10500_pilon	-	1114	2	Intergenic	novelGene_41182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1054	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGGTCCAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329052	1327158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1327802_1328581
839222	contig_16442_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_172295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATACATTTGCCTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4807	3993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16442_pilon_-_4442_4734
839223	SIRV6	+	394	3	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	31	602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGCTTTTGTCGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2316	3142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2760_2815_3106
839224	contig_11709_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_168205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGAAGAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18089	19308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_18100_19300
839225	contig_13571_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_128135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCATTTCAAATCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409942	409439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_409400_409900
839226	contig_3465_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_173392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTCTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744242	743508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_743500_744200
839227	contig_6929_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_139368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATACAGTTAAGGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80192	79016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_79000_80200
839228	contig_5551_pilon	+	1011	6	Intergenic	novelGene_134266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	148.735469878573	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	125	811	623518	635173	FALSE	15	TTCTGTTAGTACCCTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASALEEKDLEEVKVLLEKATRKRVRDALTAEKSKIETEIKNKMQQKSQGKADPLDNEKPAAVVAPMTMGYTVKISNYGWDQSDKFVKIYITLTGVHQVPAENIQVHFTERSFDLLVKNLNGKNYSMIVNNLLKPISVEGSSKKVKTDTVLILCRKKAENMRWDYLTQVEKECKEKEKPSYDTETDPSEGLMNVLKKIYEDGDDDMKRTINKAWVESREKQAKGDTEF	623393	635373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_623539_626689_626904_629801_629899_630168_630269_633422_633521_635016
839229	contig_9177_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_32700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGGGACGTAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480116	478678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_478700_480100
839230	contig_3081_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_133931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTAGAATAGAACCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203464	202668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_202700_203500
839231	contig_11378_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_112266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCGGCAGCGCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395147	394325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_394300_395100
839232	contig_6155_pilon	-	2122	19	Intergenic	novelGene_174107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	879	1190	337902	331400	TRUE	35	TTTGAAACTCTGTAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGGPGRPSAPGKPGRPGRPLSPGSPGGPVGPCRPGGPIRPAGPAGPGGPSISIPGSTTAGSPFCPFSPYAPWPFMLVSVISVSAGTPGPNSSVVGLVGLSS	356312	271038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6155_pilon_-_271077_276468_276686_282722_282882_322837_322971_328404_328522_329120_329214_331224_331482_332121_332185_334618_334660_335848_335912_337839_337915_339002_339087_341387_341441_353136_353191_354028_354083_354199_354255_354445_354500_355708_355762_355853
839233	contig_5964_pilon	-	2135	4	Intergenic	novelGene_80374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	14	550	400551	400015	TRUE	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSMDFLVFFQGRAMQEGLPTHLTFIRFLFTVNFLKLITGQAGLKGFLMLIICVITEVPSTMGFLVVDQGRAMEEGLLTHPTFIEFLFTVHFLELAKGWAGHEGFLVFLILTFHEILSRVDFPVLSKSGALIEGLPTLLTLKALPSGLAFLNLTNGHAMDEGFAVLIEILPRVHDLVLNKL	400564	394328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_395197_398118_398224_399260_399352_399493
839235	contig_3095_pilon	+	264	2	Intergenic	novelGene_75150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151940	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_151963_152011
839237	contig_6658_pilon	+	835	8	Intergenic	novelGene_168403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	123.57497930489	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTATGGAAACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145595	175361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_145783_155155_155246_156281_156404_162208_162315_169698_169836_170463_170526_174496_174578_175311
839238	contig_10557_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_171925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	240	723	2	724	79172	78450	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIRSCSASRLRISAPTTCSVLRPGKRPREKREGPGGRRREAAHTRLPVPPLRAAQGRRRRCCRRRCHLRRPPGPAAGLTAPKTPPSTWLSTRTATAVIIIIPREGKSETSQESHAHLRELLKCLLGREGRPARQEQPGAEGRCSGAGRRSWGTAPARKLREAEARRCRAPAPGAVCAREAAAPSVLTREQSGSAGPGTTPPPAARTLSVAREEEEYGFRGGTLLPSGLLPLDLRCCPQTR	79173	77732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_77700_79200
839239	contig_15114_pilon	-	1466	8	Intergenic	novelGene_121208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	6.22044030202207	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	245	1294	893259	849855	FALSE	15	GAGGAAGTCTTTGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAQHPGLRRQVEPPGQLLRLLYCTLLVCSKEIAALTDFSGYLTKLLQNHTAYACDGDRLNLQCPRHSTISVQSAFYGQGDQMCNSQQPAAQRKDSLTCVASTTLQKVLDECQNQRACHFLVNSRIFGPDLCPGSSKYLLVSFKCQPNEFKNKTVCEDQELKLHCHESKFLNIYSATYGRKTQEKDICSSDSERFSPVDCLSYSALQVLSRRCYGKQRCKIIVNNHHFGSPCLPGVKKYLTVTYACVPKNILTAIDPAVANLEPSLKKKNGINFDPSESSVLRKDGVIFSNSLAAFAYIRAHPERAALLFVSSVCIGLALTVCALAIRVSCTKDFHELQLGREHLVPGSDKAEEDSEDKDEEEGSSDSELPGELSGFCRTSYPIYSSIEAAELAERIERREQIIQEIWMNSGLDSSLPRNMSQFYGKPDAS	949674	849682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_850250_857644_857735_859343_859416_865423_865568_880581_880735_890097_890222_893187_893385_949555
839240	contig_10642_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_78684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTGAAGGTTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210692	211004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_210700_211000
839241	contig_10642_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_78685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATCTACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211704	212218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_211700_212200
839243	contig_3523_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_171496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGAAAAGAAGTTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498361	496898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_496900_498400
839244	contig_16541_pilon	+	757	4	Intergenic	novelGene_126756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	271.257565178682	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	85	429	441353	505113	FALSE	20	TTTAAGCTGCCAAGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLLSEREASDDYLAILLSFLKFWRFSVMFQFVLFSTLFPSVFTELGEPRWVCNSSDISIWYTYCDNMKYPISLNLTPCITLKGSRGLLHIYYIPRRDVEKLYFNLYLSVNSINLPKRKEVICRGSDDSYSFCRALKGDHSL	441268	505441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441465_459495_459586_464057_464187_505099
839245	contig_7760_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_138434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAAGAAGGAAGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134045	135625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_134000_135600
839247	contig_9200_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_173988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAAAAATAAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127101	128703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9200_pilon_+_127100_128700
839248	SIRV6	+	332	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	541	0	375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
839249	contig_3948_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_53266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCTAAAGCGGAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385630	1383463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1383500_1385600
839250	contig_12866_pilon	+	893	1	Intergenic	novelGene_174641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	8	421	637324	637737	NA	20	GGCTTAAATGTCTTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYMINTCGQDFPLKTNKEIVQYLKGFKGKNITPGVLPPEHAIKRTKYVHREHIGKYGSFVQNTNILKTSPPHQMTIYFGTAYVALTREFVNFVFHDKRAIDLLQWSKDTYSPDEHFWVTLNRIPGKYPFPSSFLLLSRD	637316	638209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_637300_638200
839252	contig_10299_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_79749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCTGCCAGCCCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504991	503500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_503500_505000
839253	contig_8161_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_156786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTAAACAAAAGTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601197	601955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_601200_602000
839254	contig_13301_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_153111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGAGTATTGTCTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138039	138435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_138000_138400
839256	contig_5916_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_158041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCTGTTAAAGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343222	342273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_342300_343200
839257	contig_3382_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_124131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTTAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782373	784511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_782400_784500
839262	contig_12000_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_43185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTGTTGGAGTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550689	551255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_550700_551300
839263	contig_12000_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_43186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTGTCCCATCTCGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551408	552431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_551400_552400
839264	contig_11363_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_160496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCAGGAGATAAGGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177110	178290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_177100_178300
839265	contig_10196_pilon	-	1196	3	Intergenic	novelGene_132082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_2	2.5	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	16	639	889928	887753	FALSE	10	GTGAGGACCGGGCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGERGRSTGGGLFSFLPGGARTEVLDDLATDARGRGAGRRDAAASAPTPAPAPIPEPQVSENASQKRPCRACVDFKTWLRTQRKQQESKFREDCPEDREELGRHSWAVLHTLAAYYPDRPTPAQQQDMTQFIHLFSKFYPCEECAEDIRKRIQRNQPDTRTRTGFTQWLCRLHNEVNRKLGKPDFDCSQVDERWRDGWKDGSCD	889943	887195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_887916_889062_889263_889667
839270	contig_14822_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_145409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146910	145572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_145600_146900
839273	contig_13904_pilon	+	296	4	Intergenic	novelGene_165509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAGAGAGGAACACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222630	235273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_222656_226975_227085_231142_231222_235190
839274	contig_7056_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_43745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGGCAAAGCCTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140403	1141003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1140400_1141000
839277	contig_9186_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_85356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGTAGGTTAGTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477594	476242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_476200_477600
839279	contig_4103_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_52035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGTATTCAGAATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679822	679610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_679600_679800
839281	contig_7733_pilon	-	939	2	Intergenic	novelGene_147125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	80	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	483	626	44366	44223	FALSE	25	TGACCTAGCTAGAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYSHYYHYYSRRLAPKVDVRVVILVSVCAISVFQFFSWWNSYNKAISYLATVPKYRIQATEIAKQQGLLKKAKEKGRNKKSKEEIRDEEENIIKNIIKSKIDIKGGYQKPQIRDLLLFQIILAPFHLCSYIVWYCRWIYNFNIKGKEYGEEERLYIIRKSMKMSKSQFDSLEDHQKETFLKRELWIKENYEVSGPSAVILVSHSLPS	47298	43909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_44745_47194
839282	contig_9481_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_149687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCCTTACTAGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473820	473473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_473500_473800
839285	contig_3825_pilon	-	520	3	Intergenic	novelGene_77979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	8	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	63	518	148520	146469	FALSE	30	AAGGCCAGGACCACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVRPPRRGSDPDGLTREAAMQEPLLGAEGPGYDTFPEEPAPEDRPRVGALQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTSPVIPALEHASDPELRLTKSQASWFGSVFTLGAATGGLSAMVLNDLLGRKLSIMFSAAPSAAGYALMAGAHGFWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIP	148582	146466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_146676_147823_147987_148434
839290	contig_13412_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_80006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350815	349300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_349300_350800
839291	contig_11378_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_112273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAGAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439772	441099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_439800_441100
839292	contig_2278_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_118154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAAAAAGAAACTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497709	1497293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1497300_1497700
839293	SIRV6	-	430	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-202	77	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2022	1467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1737_1861
839294	contig_10307_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_170295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	890	1201	629829	630140	NA	60	AAAGAAAAAAAAATGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVRKRSLTTLSSKEHSGCTSKTHLFILLAIDGIFSILHQHNNLKASVLQSSLFIFQLLCAYEVVKNTMAEVRCILVLKVSSLSFFLGIMERSQSLECFRRE	628939	630217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_628900_630200
839295	contig_2940_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_81886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGGAACTCTTTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425329	423708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_423700_425300
839296	contig_3787_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_102352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCATGAGCTTTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53804	52862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_52900_53800
839297	contig_4339_pilon	-	1228	5	Intergenic	novelGene_146104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_4	59.6678305286861	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	273	1028	1231218	1219223	FALSE	60	AGCATTAGATCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHSDWRVQVAVKHLHIHTPLLDSERNDVLREAEILHKARFSYVLPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNQLLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMNPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMMSLSQSRSSISAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASVKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEGKCTLTSSFQVTCWSATLRAI	1231490	1219022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1219338_1221086_1221245_1223050_1223207_1225856_1226011_1231045
839298	contig_9777_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_154428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAACAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28789	27810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_27800_28800
839300	contig_9683_pilon	+	610	5	Intergenic	novelGene_151297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	203.279979338842	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	38	448	932275	936638	FALSE	10	GGTATTTGTGCCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARAGVLGVRWLQRAARNMVPLGTRTASHITKDMLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPDRSQQERDPWYDWDHSDLRLNWGEPLHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMWAKAVSL	932237	936800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_932360_932589_932717_934040_934141_934565_934642_936615
839301	contig_8600_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_125748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGAGCTCTCGGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362779	301818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_302022_361453
839303	contig_9133_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_109316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGGTCTGTTCTACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881784	881525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_881500_881800
839304	contig_10240_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_176227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509458	510288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10240_pilon_+_509500_510300
839305	contig_5765_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_141372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528166	527871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_527900_528200
839306	contig_9216_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_163504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497955	497141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_497100_498000
839307	scaffold_19766_pilon	-	579	3	Intergenic	novelGene_34385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	120.5	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	76	327	735615	734524	FALSE	5	GGCCTAGGGGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQDKGDGCVPDSANRAVNGKTEKKMETLTIQWSFSRSSGDLENDEQAASAISELVSTACGFRLHHGINVPFKRLSVVFGEHTLLVTVSGQRVFVVKRQNRVREPIDI	735690	734271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_734622_735124_735243_735579
839308	contig_12969_pilon	+	847	5	Intergenic	novelGene_61702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	50.2910280268757	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599218	612204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_599389_605232_605433_608459_608636_608880_608977_611999
839309	contig_5574_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_155869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTTAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214323	213396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_213400_214300
839310	contig_4924_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_84760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTATGTTCCAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203171	204114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_203200_204100
839312	contig_17493_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_122201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAACTTGCTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148585	149848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_148600_149800
839313	contig_15123_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_110921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239459	241092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_239500_241100
839315	contig_8651_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_168160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGTTGAGTTTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119896	118176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_118200_119900
839316	contig_10404_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_138732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAGAAAATAATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1576130	1575669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1575700_1576100
839318	contig_7730_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_156280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	408	818	318386	318796	NA	40	TGGTGCCAAGAATATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKVKGQRKRERPSTRWTDTVAATVSSNSTDCEDGTGPAVFCSVIYTLDHYELESARWHLTTKPSAAAASVFCFHSFSFQAPRVVERVWTGQSQPQSVEKGRPNGNPEALTMAPSLVHLQAVNHSLGAIGCYRHG	317978	319341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_318000_319300
839319	contig_5083_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_151690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACCCAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216611	1215226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1215200_1216600
839320	contig_18869_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_56459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182675	183482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_182700_183500
839321	contig_3627_pilon	+	889	2	Intergenic	novelGene_78555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	214	846	719312	720753	FALSE	15	TTTTCCTCGTATGCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHSFTKLLSSFFWQFARQYSRNEPLTFAWLRRYIKWPLLPPKNIKDLMDLEAVHDVLDLYLWLSYRFMDMFPDASLIRDLQKQLDGIIQEGVHNITKLIKISETHKLLHLESMPAGSQSGLSGTLKSQSRRTRGTKTLGSKAAEPHSPEAGEKSLASRLVQQGLLTPDLLKQLEKEWLTQRTEHGKGRTESGSNSKGTRRKKKELDSD	719098	720796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_719509_720317
839322	contig_13780_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_149133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCACTGAAATGTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882591	883278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_882600_883300
839323	contig_7870_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_109096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAACGTTCCAAAACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839838	838879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_838900_839800
839324	contig_7870_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_109095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGGGAAAAATAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838727	838205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_838200_838700
839325	contig_2854_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_120870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAACAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987024	987385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_987000_987400
839326	contig_7057_pilon	+	758	8	Intergenic	novelGene_123314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	977.875226797199	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	273	758	937155	943715	FALSE	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	936016	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937014_937057_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_943511
839328	contig_3797_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_120091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCCCTGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346549	347497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_346500_347500
839329	contig_9434_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_150519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTCCTTTGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469932	467989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_468000_469900
839331	contig_13211_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_123149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296179	295343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_295300_296200
839333	contig_9871_pilon	-	1312	1	Intergenic	novelGene_75677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATGTTAAAAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497411	496099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_496100_497400
839334	contig_2894_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_86540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGAGCCATGCTCGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228693	229303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_228700_229300
839336	contig_5278_pilon	+	925	5	Intergenic	novelGene_139774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	52.2374386814668	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	70	564	194722	231951	FALSE	5	TGAGTGGTTGTGTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDCALCSLVEELIPRETKVGFRMAKEEPQSISKDLQELQKKLSLLIESIQTNSKVVAFMTSPVGQYLDRHPFLALTLLMFIAMSAVPVGFFLLLVVLTSLAAFVGVILLEGLVISVGGLSLLCILCGLAFVSLAMSGTITVSYMVVSSLISYWFSPSLSLFWL	191802	232312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_191845_194694_194887_200452_200622_201964_202104_231929
839337	contig_3825_pilon	-	1166	3	Intergenic	novelGene_77975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	1.5	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTGCAGTCTGCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81837	78418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_79433_81135_81211_81760
839338	contig_953_pilon	-	1640	11	Intergenic	novelGene_129991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	426	818	196483	195520	TRUE	50	GCAAAAAACAAGACTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRGADTATEPVTSAAVLALALEAAVSPKVTRGTGILALDSSPARSTRTAVGVREAEGESPAARCARALLLAALPKTALSAGLLTAGASESRGGTRTRHPGHGRHLHAGSLGTPWHSLAPSAQPHSPAR	200185	182015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_182114_189560_189711_192928_193246_193326_193439_195374_195531_195681_195815_195999_196141_196375_196503_197318_197465_197707_197856_200073
839339	contig_7446_pilon	-	1301	9	Intergenic	novelGene_101943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	76.3183095659226	1	79	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	429	1301	193592	156392	FALSE	50	AATGAGGACGAAGAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQSDKFTSEPLDSSSGEKNDLNLDRPCGVPEESILSEKGKEPETSDQLSTKSATNQNTTNPEPQSQTEAIESSVHEETSARYSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENE	260419	156391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_156439_163488_163595_165971_166061_166683_166841_168390_168530_185009_185342_193589_193708_206814_206875_260166
839340	contig_4364_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_95	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGCTTTGAGGGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927655	926734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_926700_927700
839346	contig_312_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_128325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAAACCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579087	578023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_578000_579100
839349	contig_934_pilon	-	677	4	Intergenic	novelGene_129009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_3	70.2107937254348	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGAGTATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57711	49284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_49645_52243_52327_54241_54354_57589
839350	contig_5317_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_76578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAGAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303445	304874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_303400_304900
839351	contig_678_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_167847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCCCAACTTGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493277	491317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_491300_493300
839353	contig_8045_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_35421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGCACGACGTCCAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249704	249197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_249200_249700
839354	contig_8045_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_35420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTAGTATTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248639	248146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_248100_248600
839357	contig_6375_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_73072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGGAACTAGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710960	709580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_709600_711000
839359	contig_8006_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_173930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343812	344691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_343800_344700
839360	contig_10196_pilon	+	1340	9	Intergenic	novelGene_132355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	61.6010348939042	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	515	1339	2490973	2494792	FALSE	10	CACCCCCGCCTTAGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCFQGGWTSEGEALIQEVGAWLLVCTCVCWGAFLPVGGGVTVPGPGLGTVSCLNNNILRIDCYLSAPALDPGTDPWLLLTSEHAPGSKHRCVFRASACSVELPPEEVLVPSDSFTITLHRFIAGQEQVSLVDPQYLPRRHVKLDPPSALQSNVSSDYCILTWSISPALEPMAGFLAYELAFKRQEEAWEQARHKDRIIGVTRLTLEAMELDPGSTYEARLRVKMAQEDDVTKEEHYEGPWSEWSPSVRFPAPRRPDPLTPPWGRPDSTLVAVSVFLLLTGLTYLLFKLSPRVKRAFHQHVPSPAAFFQPLYEVHHGNFQTWMGAHRMGLQLSQEGVGTQLGGSGPSCREAVALLTCSPVWSWPPAHLEEEEDLSALGSEDVLPAGGLELGGQLPAYLPQEDWALVPPIRPVPPDSESCSSDYCALGYYGGVPPLGPPQETCRALC	2487378	2494793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2487399_2490023_2490126_2490355_2490480_2490566_2490746_2490883_2491030_2491481_2491681_2492071_2492178_2493484_2493570_2494414
839361	contig_14868_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_150465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGAAGATGCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259943	258904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_258900_259900
839363	contig_12278_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_152582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	768	1352	112987	113571	NA	80	GTACAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTWPLASCPGSCLTWSIAGHEGPSAPAMRLPEMGLRRPRSGQSGSGLAARGKTQAGKCPVCCCHDPKCHFCLGCSEGGLLRERPAAVKGKWKAQGSLPPQPPWLFTGLGFLEVISLVLCLRWRTVAGYPSSLSQEVESLTITSNYRGSQWHPGVAEVFRVRERPAYLPLSGKIYADSGHLPRPGKSPKLPWPQ	112219	114365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_112200_114400
839366	contig_6137_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_59148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTACCCTCAGTTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103127	1103365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1103100_1103400
839367	contig_10016_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_117878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGCACATCTTGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491376	491725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_491400_491700
839370	contig_8843_pilon	+	1558	6	Intergenic	novelGene_156656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	249.533645026077	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	423	1010	110344	117048	FALSE	50	CTAGCCATAAGAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKGVIDYIFYSKTHMNVLGVLGPLDPQWLVENNITGCPHPHIPSDHFSLLTQLELHPPLLPLVNGVHLPNRR	87897	117596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_87965_89801_89953_107316_107473_110295_110516_112586_112790_116835
839371	contig_3103_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_146211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACTTGTCCAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150091	148476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_148500_150100
839373	contig_10479_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_147104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATGAAACTAAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75194	74623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_74600_75200
839374	contig_12278_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_152614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	306	629	270042	270365	NA	25	AGTAAAGCCCTTATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIWGSKAQPRTLCVTSGKPLYLSGPQSSLCEARGLGPSACQLLGLCVIERISNYFCKSEHMVQIDMGCRMNYLRKRRPPGTQKRPVLGPGCQLLPLVAFGGISSC	269736	270544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_269700_270500
839376	contig_8317_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_19456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACAAAGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16800
839377	contig_15760_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_131051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	546	854	14102	13794	NA	80	GAAAAAAATGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFFLKNYYSTMHLEIRFSDGFIKNICIYKRYGSMNTITIICSKSGCSADVSRVKGCVLIFRCNFYQVGRTFVNILEQGSETVACRQIQPAAWFCRVWELRMV	14647	13791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_13800_14600
839379	contig_9185_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_166909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	457	786	475820	476149	NA	50	ATGGATTAGCTAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFTSASRRLFHELPENCFSSLSRVKLQVPGLGSRWEVLVHADALSSDTASLWVLPEYRRRLSIFILLGTRTRCSLNVCSIVSNKMKNMSLCQYFRGAWWCSGYVLGC	475363	476275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_475400_476300
839380	contig_7379_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_150011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	243	569	392914	392588	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAHWIKAQKPKFCSPFLPRDCDIYFHLHSKSSVLSSALQTQLSLCQAQTQSLDWGKVIGSLSLSFQNSFPEALHFDVIQLMLYLNIRSNLLHFWSQINFTSQDSCIV	393156	391662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_391700_393200
839381	contig_10674_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_6456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAAACAGACCCAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313913	313563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_313600_313900
839386	contig_2757_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_164600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485746	484860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_484900_485700
839387	contig_12915_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_148346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGACTGAAAAATCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89858	88346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_88300_89900
839389	contig_1076_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_101150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAGAGGAAAGTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038459	1039799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_1038500_1039800
839390	contig_12970_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_50524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198387	199915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_198400_199900
839391	contig_11115_pilon	+	599	4	Intergenic	novelGene_102860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	780.594787468006	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	34	513	172456	173241	FALSE	15	CGGAGTCTGTGGCTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKEFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	172422	173327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_172595_172714_172768_172869_172964_173047
839392	contig_12697_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_122829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAACTATGGTATAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233797	234217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_233800_234200
839393	contig_14219_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_54324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACCTAGCTCAGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735142	733027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_733000_735100
839395	contig_10569_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_44096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGGTGCAGGGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429394	429090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_429100_429400
839396	contig_17637_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_177347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6757	5867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17637_pilon_-_5900_6800
839397	contig_5988_pilon	+	1412	3	Intergenic	novelGene_15861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	423	791	271065	271433	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFISSGFEEAILSPPATGILILRAVLSAFSKKGRSGFSEPSMGIFRMTEEWLSRWDRRFWAAYAYCDFTLASIFSNCLFWAANSSACFARYSFSDTLADGTLLLLCFWETNAFEPSCCKE	270642	273192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_271741_272715_272788_272950
839398	contig_15066_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_149566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAATAAAGCTATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175051	175858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_175100_175900
839400	contig_2596_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_53501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGATTCCATGTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013972	1015069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1014000_1015100
839402	contig_9646_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_117469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAGCACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363739	364497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_363700_364500
839403	contig_14727_pilon	-	640	6	Intergenic	novelGene_56643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	450.479122712696	188	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	94	432	264439	259834	FALSE	25	TAAAGCCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLSSEEIQRRAHQVTDESLESTRRILGLAIESQDAGVKTMTMLDEQGEQLKRIEEGMDQINKDMKEAEKTLTELNKCCGLCVCPCNSVKEFPCGVASTTFYLTRDKRKGK	279891	259625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_259907_261399_261518_262275_262325_263333_263376_264382_264455_279813
839404	contig_16098_pilon	-	1256	3	Intergenic	novelGene_46194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	38	junction_1	13	205	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	269	1222	699844	695369	FALSE	10	TCTTAAGGGGCTGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTRGHGDPAATTAAPLSEEGEVTSGLQALAVEDTGGPPASVSKAEEDREGDREEAEREEPGAQEAQEEAPSAAGEEPAEGESEDWCVPCSDEEVELPAAWMPPPSEIQRLYELLAAHGTLELQAEILPRRPPTPEAQSEEERSDEEPEAKEEEEEKPHMPTEFDFDDEPMTPKDSLIDRRRTPGSSARGQKREARLDKVLSDMKRHKKLEEQILRTGRDLFSLDSEDPSPSSPPAPVLREQSLPPAAAAEILMAAAPSSRGRVRTCWGRAPPSPALDSRGHGQRRGMPSSRQSTWQEGRGLCVCFSVERLFGDWG	700112	695334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_695767_699079_699163_699371
839405	contig_16103_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_118894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTCTGTGCAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743800	744820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_743800_744800
839406	contig_678_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_167775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTACTTCAGTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17096	15834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_15800_17100
839407	contig_10892_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_116740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGAAGAAAAAACTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112778	113974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_112800_114000
839408	contig_3193_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_126308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGAAGAAAAAATATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72418	72116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_72100_72400
839409	contig_9389_pilon	+	497	4	Intergenic	novelGene_83861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	817.471440207886	19	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTCTGCCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9658	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9735_10655_10706_11424_11562_12189
839415	contig_18967_pilon	+	1280	6	Intergenic	novelGene_165323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	279	677	81051	81449	TRUE	25	GAGAGCACAGGGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSDRTRRLANCPRAAWGAAGRRPLHHPPHPVRLLRQRPGGLRGLRPRGQEATPKGRLAVLVGEHVAAHEAGGDPIPRARGLVRVQRQRLGAPGDSPTAAPAPPLPGTALASGGAGGSRSSMVKSVGGVGS	80772	98207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_81567_86218_86298_86433_86500_88629_88846_97068_97174_98187
839416	contig_18506_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_67945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGAGGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9715	10108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_9700_10100
839417	contig_7229_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_39870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAACAAACAACAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514067	1514592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1514100_1514600
839420	contig_3818_pilon	+	1071	2	Intergenic	novelGene_99234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTTCTCCCCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411034	417410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_411573_416877
839421	contig_4364_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_37	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCAAACCTCATTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302919	304177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_302900_304200
839422	contig_16666_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_61810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGTTGCCATTTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230218	229474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_229500_230200
839423	contig_5092_pilon	-	1926	5	Intergenic	novelGene_62319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.78535710713571	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	317	631	470424	456565	FALSE	50	TGCTAAAGCATGACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSSNTSLSPVGSPISEIAFEKPSLPSAADWSEFLSASTSEKVENEFAQLTLSDHEQRELYEAARLVQTAFRKYKGRPLREQQEVAAAVIQRCYRKYKQYALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKKFQQSRRAAVLIQKYYRSYKKCGKRRQARRTAVIVQQKLRSSLLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHRVKELKKAKELEDIQQHPLAM	475074	455269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_456629_469211_469287_470248_470443_473955_474028_474848
839425	contig_11851_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_146546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTCAGAAGAGATTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16253	15857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_15900_16300
839426	contig_11304_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_156716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419509	418316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_418300_419500
839430	contig_7022_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_142166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGACGGCAGCAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393315	394324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_393300_394300
839431	contig_5153_pilon	+	1634	1	Intergenic	novelGene_74319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTCAGGAAAAAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435868	437502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_435900_437500
839432	contig_13295_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_31219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTGTTAAAAAACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65646	64698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_64700_65600
839433	contig_17912_pilon	-	211	2	Intergenic	novelGene_177349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGGGAGATAATAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112169	104061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17912_pilon_-_104168_112064
839434	contig_10980_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_162561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACAGAGTTTTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215599	215176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_215200_215600
839435	contig_7943_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_173128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAAATGCCATTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75093	76231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_75100_76200
839436	contig_9501_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_164277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGAAGTAACTCAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411080	409466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9501_pilon_-_409500_411100
839437	scaffold_13505_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_111412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321689	322165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_321700_322200
839438	SIRV4	+	211	1	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCGCCGTAACGCGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3635	3846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_+_3600_3800
839439	contig_9239_pilon	+	900	3	Intergenic	novelGene_137165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	84	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	108	431	100978	107765	FALSE	20	ACACATGTAGCTCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVGQSRRLRLRGWAERVLSGSLSDPEARRSGTASTMSRQSNRGTESKKMSSELFTLTYGALVTQLCKDYENDEDVNKQLDKMGYNIGVRLIEDFLARSNVGRCHDFRETADVIAKVIILGYLAILKDWRHCLPLSPSPLEKP	100870	108234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_101020_107248_107347_107581
839441	contig_11375_pilon	-	700	7	Intergenic	novelGene_152644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.75378527364305	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	161	700	23733	22472	FALSE	25	CTGAGGGAAGTGTGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPFPGGTVKQKQKRLRERQAALEAGITGKNKSPAGSSKAWTPKEIVLYEIPTELGEKKDVSRPLPPAYSPQYVEAAWYPWWVREGFFKPEYKAQLPQATGEIFSMCIPPPNVTGSLHIGHALTVAIQDALVRWHRMRGDQVLWVPGSDHAGIATQAVVEKQLWREQGVRRHELSREAF	24376	22471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_22541_22636_22704_22814_22937_23201_23303_23418_23501_23634_23863_24345
839442	contig_2817_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_104332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	308	927	128	1054	130446	131372	NA	15	CTGGAGTGCTGACTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDWRTTAYALKYSVILELNEDHRKVRRTTPVPLFPNENLPSKMLLVYDLYLSPKLWALATPQKNGRVQEKVMEHLLKLFGAFGIISSVRILKPGRELPPDIRRISSRYSQVGTQECAIVEFEEVEAAVKAHEYMISESQGKENMKAVLIGMKPPKKKPPKDKNHDEEPTVSSHLNKSLNKRVEELQYMGDESSANSSSDPESNPTSPMAGRRHVVTNKLSPSGHQNLFLSPNASPCSSPWSSPLAQRKGVSRKSPLAEEGRLNSSTSPEIFRKCMDYSSDSSITPSGSPWVRRRRQAEMGTQEKSPGASPLLSRKMQTADGLPVGVLRLPRGPDNTRGFHGGHERSRAYV	130318	131829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_130300_131800
839443	contig_17102_pilon	-	982	4	Intergenic	novelGene_141702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	61.0791835789139	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	37	432	30631	20431	FALSE	20	TGGTTAAGACTTGGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFAFIGLCSARIMAPSLWKGVVGIGLFALAHAAFSAAQHRSYMRLTEKEDESLPIDIVLQTLLAFAVTCYGIVHIAGEFKDMDATSELKNKTFDTLRNHPSFYVFNHRGRVLFRPSDTTNTSNQDALSSNTSLKLRKLESLRR	30667	19880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17102_pilon_-_20591_22373_22478_25604_25658_30552
839444	contig_5278_pilon	+	527	3	Intergenic	novelGene_139779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGTCTGCTGGCTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323832	325753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_324173_324886_324975_325654
839445	contig_14289_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_110571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAGAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66652	65952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_66000_66700
839448	contig_9668_pilon	+	1021	7	Intergenic	novelGene_58156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.34370962471642	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTATTTACTATACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417949	468252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_418435_420795_420926_422201_422331_425522_425587_427801_427891_466864_466963_468226
839449	contig_2341_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_84348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACATAAACAGGCGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39390	40302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_39400_40300
839451	contig_8259_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_148875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCTTTTAGTAAACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167212	166633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_166600_167200
839452	contig_8259_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_148872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAAAAAAAAACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164788	163998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_164000_164800
839455	contig_9195_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_155666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGCCATTGCCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12913	11895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_11900_12900
839456	SIRV6	+	332	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	344	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2011_2461
839458	contig_14048_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_146335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTCCTTCCGGTCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526451	524984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_525000_526500
839459	contig_8238_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_165241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTAATGCCAGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359031	361278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_+_359000_361300
839462	contig_10753_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_105150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	56	475	358268	357849	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTPGGQVPPVGQALCWVFMHMMSLCAPSSPARPGVLARLIDQGTVTWTTAQSDCRVMLPGFEPGCAVTEAAGPTCLLLQHCDAGDAPQGVASMSLGGFSGQGGGSSPLLWWRAGSQASVFSTGLAKALWPHQKAWWKQPGEKGLGCVTCGPLLQGHV	358323	357157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_357200_358300
839464	contig_7816_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_66571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACTTAAAAAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536696	537693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_536700_537700
839465	contig_11629_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_161203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATCATGCTGGCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498680	497798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_497800_498700
839467	contig_12841_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_55865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTATTCTAGCCTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369056	367813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_367800_369100
839468	contig_6505_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_175696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCTTGGTAATTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142810	142257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_-_142300_142800
839469	SIRV1	-	623	3	NNC	SIRV1A	novel	744	3	NA	NA	1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTGTGAGGCGCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11642	10650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_10792_10882_11140_11417
839470	contig_12340_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_122099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCCACAAGTCAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10257	9781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_9800_10300
839474	contig_14472_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_111189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCAAAGTAACCCTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429185	428522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_428500_429200
839477	contig_15456_pilon	+	831	3	Intergenic	novelGene_139509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	375.5	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTTCATTTATTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131502	143126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_131523_136433_136471_142352
839478	contig_7593_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_127343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAACTTACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615913	617422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_615900_617400
839480	contig_3449_pilon	+	844	3	Intergenic	novelGene_73724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	398	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTTAATAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493422	499171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_498816
839482	contig_5429_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_127807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAGCCAGTCACCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432177	432796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_432200_432800
839483	contig_5429_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_127809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGGAAGGGGTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438303	439251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_438300_439300
839484	contig_4136_pilon	+	986	1	Intergenic	novelGene_161238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37204	38190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_37200_38200
839487	contig_9724_pilon	+	1787	2	Intergenic	novelGene_172580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTCTCCCAGCTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17975	21576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_+_19320_21133
839489	contig_14755_pilon	-	1303	5	Intergenic	novelGene_129393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	19.9671605392454	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	106	507	364298	321104	FALSE	25	TTACTTTGTGAATCCACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELCKTISVARLEKHKNLFLNYRNLHHFPLELLKDEGLQYLERLYMKRNSLTTLPENLAQKLPNLVELYLHSNNIVVVPEAIGSLVKLQCLDLSDNALEIVCPEIGRLRALRHLRLANNQLQFLPPGNHSL	368704	320307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_321259_321858_321897_337676_337718_364130_364359_368659
839490	contig_10765_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_122944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGACAAATAAAAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288536	289614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_288500_289600
839491	contig_10765_pilon	+	183	1	Intergenic	novelGene_122945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTAAAAAAAAAAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289564	289747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_289600_289700
839492	contig_5586_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_143591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGAGGTTGCAGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515152	514466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_514500_515200
839493	contig_1472_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_86120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246564	244958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_245000_246600
839494	contig_7593_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_127317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACACGCACGCACACACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288208	289124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_288200_289100
839496	contig_3627_pilon	-	1842	6	Intergenic	novelGene_78431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACGAACAGCCAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261859	243203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_243283_243613_243702_247999_248087_252269_252420_255397_255738_260761
839499	contig_11978_pilon	-	468	2	Intergenic	novelGene_62955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059369	1057718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1058147_1059329
839500	contig_9098_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_75770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41799	42790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_41800_42800
839501	contig_5338_pilon	-	1579	9	Intergenic	novelGene_114572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	15.1492574075431	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	106	1236	368085	361543	TRUE	15	TTTGCACGTGTTAGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPITYADLRFVKAPLKKSISTRLGQDSDDYEDGELTYENVQVPSAPEWPVGVAPPGLGNKAAVLPEQPPAAWSAVTSAAAGRVLPCCVAYTHLLLLGLLLTCLLLGVAAICLGVRYLQVSQQLRQTDRVLEATNSSLHQQLYLKITQVENSEEEVQGSRRELAQSQKALQVEQGLRQAAEGQLKDCQSDREKTEETLRREEGQRSSLEQRLSNVQDTLKSFFKCSSPETCCPMGWIQKRTSCFYVSPIQRNWEDSRKHCKSLSSDLAIFKDLQAYSYYSLFDSKEILNQLLPPDGLFNSCWIGLRFNKNWEWTDGTLFNGFGPQKQRFRTQNLDCGKVQNYWQKLQQEQCSHMLPCICQMAAFKYPDGEHFSHF	368190	360896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_361235_361537_361709_362433_362556_363156_363312_365693_366030_366350_366441_366966_367039_367801_367910_368003
839504	contig_8907_pilon	-	1190	4	Intergenic	novelGene_85846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	124.099422507386	227	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTAGTCTTATATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657325	652922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_653713_655098_655227_655815_655943_657180
839505	contig_13048_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_138908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATTTAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284637	285021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_284600_285000
839506	contig_3449_pilon	+	697	3	Intergenic	novelGene_73734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_2	306	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATGGAAGGCTCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493438	506535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_506311
839507	contig_11816_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_98527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCATGAGTCACAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003907	1004538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1003900_1004500
839508	contig_6069_pilon	+	1190	8	Intergenic	novelGene_8087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	124.453089268895	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	191	1189	601955	605436	FALSE	5	CCTGCCGAGCCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQFDALFDELTAREHLQLYTRLRGISWKDEARVVKWALEKLELTKYASKPAGTYSGGTKRKLSAAIALIGHPAFIFLDEPTTGMDPKARRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDGYMITVRTKVSQSVKDVVRFFNRNFPEAVLKERHHTKVQYQLKSEYISLAQVFSKMEQVHYLFCFRKRLLHWLSCWPVSAPRGYWRGLERGRLGGGGGGEKEGAAALPVSWGPGPPLHSSCRRSPPGLAPLPAPGAGLVHSTQMFVLNKKRSE	601764	605437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_602011_602140_602283_602357_602493_602568_602673_602842_602936_603042_603146_603221_603303_605151
839509	SIRV4	-	467	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	115	35	115	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTACAGTTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5043	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
839511	contig_14986_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_59715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	491	568	105092	105015	NA	25	TTAAAGTCTGCTTTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATVTLTVAVANSIPDVLADLESIKTSSDPDDSGLTLYLVVSLAAVSCVFLAFVIVLLVLRLRRWHTSRLLQASGGVLPNPPVSHFVGVDGVRAFLQTYSHEVSLTTDSGKSHIIFPQPNYADTLISAESCEKSEPLLIPDQINANKEEPGVFQVSFFFPPLGMIGAFVSSIIFLSLSNSVNFVNSKS	105582	104951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_105000_105600
839512	contig_4392_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_117283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTCATTAACTCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32846	33226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_32800_33200
839513	contig_2550_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_135652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATGCATTGTAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890407	891254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_890400_891300
839516	contig_4847_pilon	+	804	6	Intergenic	novelGene_156164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.159053857675	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	6	422	99616	109628	FALSE	30	CAGACCTGATTTGAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAWLPELTSGEVPACVISQLDRVGREQCRRVPLHWLGFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLLMVAKLGFTVFTRPHQS	99610	110010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99652_101021_101078_101400_101478_102278_102381_108569_108658_109570
839517	contig_20402_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_72848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTTCTTAACCAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197310	198981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_197300_199000
839520	contig_6552_pilon	-	1057	3	Intergenic	novelGene_163606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	385	junction_2	110	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAAAGAATGATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152378	148003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_148133_149263_149305_151491
839521	contig_15130_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_177107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTATGTATTTAAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195865	195171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_-_195200_195900
839522	contig_16622_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_48408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7786	7453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_7500_7800
839523	contig_240_pilon	-	386	3	Intergenic	novelGene_173791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284135	266504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_266647_283715_283790_283965
839524	contig_11572_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_100077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCATACAACATTCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378977	379246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_379000_379200
839527	contig_7201_pilon	+	618	6	Intergenic	novelGene_152515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	119.719672568881	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	142	618	303913	320669	FALSE	45	GAAAATCATGAAGTGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAAGEDDHFLIRASAALEKLKLLCGEDKECSDPSNLLELYTQAILDMTYFEENKLVDEDFPEDSYSSSQKVKDLISFLSEPEILVKENNMHPKQCTLLGDELLECLSWRRGALLYMYCHSLTKRREWLSRKSSLLKKYLVDGISYLLQMLNYRCPVELNEGVSFQDIETAKLLSEGIFSDIHLLAMMYCGEMCYWGLKHCANRQS	295822	320669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_295845_299808_299916_303900_304054_306918_307051_307939_308055_320580
839528	contig_7201_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_152520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAATAGACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320619	320894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_320600_320900
839529	contig_1867_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_54551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTAAACCTTCACCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416802	416423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_416400_416800
839530	contig_401_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_42916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTATATGCCCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1940980	1939568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1939600_1941000
839531	contig_9305_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_148196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATAGTTGTGCGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192970	191603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_-_191600_193000
839533	contig_7031_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_132806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCTCTCCCAATTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356165	355147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_355100_356200
839534	contig_5936_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_53554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106099	107618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_106100_107600
839535	contig_12179_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_127999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATAGTGGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506880	506685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_506700_506900
839536	contig_12029_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_177351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAAGCGTGGTAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31240	30303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12029_pilon_-_30300_31200
839537	contig_5018_pilon	-	1111	6	Intergenic	novelGene_47017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_4	5.38887743412299	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	318	788	1279428	1266883	TRUE	40	AGAAAGGGATGCAGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKLDFCSALSSQSSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF	1280794	1262256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1262560_1266862_1266955_1274512_1274689_1276543_1276667_1279328_1279466_1280514
839538	contig_7182_pilon	-	1505	4	Intergenic	novelGene_117124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	8.17856276425687	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	122	646	693346	673663	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVIQQIQRHCQSVRDPAVKGKWQQVRQELLEEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSYQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRLSREVRPLRKEMPGVGARGPVGRAHPTSRSEKPSASKDKDYRARGRDDKARLFLCNSFT	722228	672803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_673865_691269_691431_693184_693361_722121
839539	contig_11171_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_48608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCTCGAGTCTGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228855	229382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_228900_229400
839540	contig_6163_pilon	-	1279	3	Intergenic	novelGene_103791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	269	1054	25312	21347	FALSE	25	GACGGCTAACCCTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGKGLLGAGWGLPPPVLSPLCRKAEQWFSRISGWGSRIGVEVGGGGFQVVVKFSLPLSLCASAAGRRDPEIKAAQSASRPSGEAQQPIMGPCRRALHPLSLLVQASALVVALALGTLPAFLPCELQPQGVVNCNWLFLKSVPHFPVAAPRGNVTSLLLRSNRIHHLRASDFARLPSLRCLDLKWNCPPVTLSPMNYPCHMTIEQGTFLAVPTLEELNLSYNNITTVPALPSSLVSLSLSRTNILALDSAAFAGLHALRFLYMDGNCYYRNPCRWALRVAPGALLGLGNLTHLSLKYNNLTAVPRSLPRSLESLLLSYNHIVSASAARASSSGPNSPGARVAFGPSWARP	25580	21121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_21432_23679_24378_25309
839541	contig_12179_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_127988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	268.043256770246	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	70	534	379546	390742	FALSE	35	AGAAAATGTGACTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQALNTFTEIATSEKDHIPALLGMATAYMILKQTPRARNQLKRIAKMSWNPIDAEEFEKSWLLLADIYIQSAKYDMAEELLKRCLRHNRSCCKAYEYMGYIMEKEQAYSDAALNYEMAWKYGNQTNPAVGYKLAFNYLKGKKYVDAIDVCHQVLEAHPAYPKIRKDILDKARASLRP	375693	391299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_375736_379518_379744_383701_383823_389229_389298_390664
839542	contig_5317_pilon	-	1983	2	Intergenic	novelGene_76566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACTGAGTTTCAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91447	87703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_89233_90993
839543	contig_14300_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_133138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCCAGAATAGCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416384	415330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_415300_416400
839544	contig_15146_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_116940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTATTTTTATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130266	129745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_129700_130300
839546	contig_10734_pilon	-	1701	10	Intergenic	novelGene_51330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.1052220150544	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	322	1305	1653499	1601237	FALSE	25	TAGTAATTTCTGCCTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLENEIAEPFKYSRSGVTHISFSHDSHYMATADENYTVALYQVVVKHGQRVWEYLARLRSHHRSIQSLLFGVNLDSNEPRLLSLGRDRLLIEYNLLKTCKDHLEVLDIHRTDQGCYPTCMVWYPPLTKELFLLICNSGYKVKLFNSTTKMCRKTLLGPTYGSPIEQIQLLPVKTTSELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHKTSAIICHPNGVAGMTLSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWEINLSALEAAVSLGGEDLTPFYGLVAGGREGQFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETREVSEHICLSEVPYVMRAIGFYPSEEKHYL	1659138	1600840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1601249_1616124_1616269_1616476_1616568_1623239_1623404_1624479_1624595_1642310_1642496_1643488_1643663_1653400_1653553_1655343_1655539_1659065
839547	contig_3797_pilon	-	717	2	Intergenic	novelGene_120097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441802	379143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_379744_441685
839548	contig_5947_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_101462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33621	32777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_32800_33600
839549	contig_2799_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_85565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTCAGCTTTCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730881	730475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_730500_730900
839552	contig_10331_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_54215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTCTCAGGCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190927	1192382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1190900_1192400
839553	contig_13176_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_159710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGCATAAAAGACATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74594	76098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13176_pilon_+_74600_76100
839554	contig_14034_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_72624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	406	1221	55	1275	70879	69659	NA	35	GTCCACTGCATACAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAQGDPGEAGALPGSDTGIRDTGSAAQLKVKPKKVRKIKALIIDLGSQYCKCGYGGEPRPTYFISSTVGKRCPEAAHAGDTRKETFVGHELLNTEVPLKLVNPLKHGIVVDWDCVQNIWEYIFHTAMKILPEEHAVLVSDPPLSPSSNREKYAELLFETFSIPAMHVTSQSLLSIYSYGKTSGLVVESGHGVSHVVPISEGDVLPGLTMRADYAGSDLTNYLMQLLNEAGHKFTDDHLHIIEHIKKKCCYAALMPDEELRLPLEELHVEYELPDGQLITIGQERFRCSEMLFKPSLVGCSQPGLPALTAACLGHCQEAGFKEEMAANVLLCGGCTMLDGFPERFQRELSLLCPGDSPAVAAAPERKTSVWTGGSILASLQAFQQLWVSKEEFQERGCAAVYNKC	70933	69613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_69600_70900
839555	contig_10431_pilon	-	892	3	Intergenic	novelGene_117395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	115	1794	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	457	777	224107	220630	FALSE	10	GTCCTGTTTTCTGCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFDVQKRLGLNIDHWMTIQSAEQPYRHSARCHAFEKEWIECAHGIGGIRAEKECKIEFDDLTECLLRQKTMKRVATIKQQRAKLIKEGKYTPPPHHLGKDEPRP	225995	220514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_220735_223891_224110_225541
839556	contig_8581_pilon	+	1884	1	Intergenic	novelGene_22860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGGACGTGGAGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388683	390567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_388700_390600
839558	contig_2069_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_23352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATATAACTTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939314	938336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_938300_939300
839559	contig_12125_pilon	+	831	5	Intergenic	novelGene_76238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_4	113.014379616047	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	271	831	512723	531223	FALSE	30	CTGCAGGAAATCATGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVLTVVVAGLPPGSASSSHPGPGSVSEMSLLHALGPVQTWLGQELEKCGIDAVIYTRYVLSLLLQDSYDYDLQEQENDIFLGWEKGAYKKWGKSKKKCSDLTLEEMKKQAAVQCLRSASDESSGIETLVEELCSRLRDLQSEQEEKIHKKLEGSPSPEAELSPSAKDQVEMYYEAFPPLSEKTVC	512452	531223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_512954_521168_521307_527453_527521_529005_529088_531180
839563	contig_18735_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_132685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTCATAAAGATAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81713	80225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_80200_81700
839564	contig_12078_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_74134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAGTTAGGGCTTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715789	715345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_715300_715800
839565	contig_12790_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_35271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	130	369	340184	339945	NA	25	TTTTGTCAGGACCAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCVLWPAEPSQGPQHHCPAEVQEASGPFLFSPALQTRRCKEDMWGHCLETQPRDSASFCCDLGSQGLREACLIPPCTAPPRAGSSWPSPSWEGGWGPGGQTVSVCVLFCPVQAACSLVRVF	340313	339432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_339400_340300
839566	contig_12624_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_61022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	762	1169	848978	848571	NA	20	CCCATTCTCAAGGCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLSVWTFGRQLQRMEAGQAGKTLDSNPNALILWLSSSFGFFLSLAPIVLHVFSQFLACFFSVSLPTINLKVKLLFSYFSLSQKIPLGNYTESTVYLKTVFNNVKFLMSTANKYICQNVLTNHMVTKVLTQWFK	849739	847980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_848000_849700
839567	contig_11748_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_177356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTCCAATAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248374	247309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11748_pilon_-_247300_248400
839570	contig_6340_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_176636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCTGCAAGAAAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91023	90201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_-_90200_91000
839571	contig_8354_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_24161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCGTAAGATTATCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572591	574433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_572600_574400
839572	contig_4114_pilon	-	734	2	Intergenic	novelGene_15634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGGCAGACGCATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500210	492451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_493007_500031
839577	contig_11126_pilon	-	691	7	Intergenic	novelGene_138154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	747.991013017908	150	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	50	691	1001201	987797	FALSE	10	TTCTTGGTGTGACTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGDGVGVDSSVGGGWEMAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIALLNIYRNPQNSSQSADGLRCAVSDVEMQEHYDEFFEEVFTEMEEKYGEVEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAEKAVIDLNNRWFNGQPIHAELSPVTDFREACCRQYEMGDRGDSEPCRFYRMSARKCCRRLTKPVHNGNFFKKKKTKKHKDGFLNKICSDTV	1001250	987796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_987957_989354_989489_990028_990128_990285_990336_993941_994009_997708_997797_1001157
839578	contig_10904_pilon	-	997	4	Intergenic	novelGene_22603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	20.5480466765633	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	111	902	487599	482506	FALSE	50	ATATTTTCCAAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNILPKKSWHVRNKDNVARVRRDEAQAREEEKERERRALLAQQEARTEFLRKKARHQNSRSALEAVEAGAPSPGPVDLFRELLEEGKGVTRSNKEYEEEKRQEKERQEKALGILTYLGQSAAEAQTQPPWYQLPPGRGASPPRLGPDEKIKRHLDPLREMQKHLGKKRQQSGDKGRPSRKEKKGSEKQRPKEPPSLDQLRAERLQREAAERARAEDLLARVRGRAPQEDPPEEETDERRRRYNSQFHPKLARRPCQQDAQPSH	487709	482410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_482723_483502_483766_485670_485851_487467
839582	contig_854_pilon	+	1184	9	Intergenic	novelGene_36183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	724	1068	488609	497535	TRUE	15	TGCGTCACCTCAGCTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVHEGLEDLQVDGVPLPQVDAYGCLVEALALVEELGDVLDIGGQQLVFNEILDALAGVHVKLLASDAQFLLLLGHPALLRTFEAVDLGKHLCDLVLQLLDVLQKLLPVPFDLL	476361	509263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_476788_483477_483629_486998_487109_488572_488654_491435_491558_493131_493199_495175_495241_497489_497571_509182
839583	contig_1146_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_84784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	591	956	92313	91948	NA	25	CCCCAGGCCATGGGATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTCCTHTNTDTRALQPPTLIPSRQSPFLKESLTSSQDSSAILLSFLFFFFLLFRAGSSMPGCSACFLDLVFFFTEVLGSSPIGMYSRISALAGFFLLPFLGLFSVDLKTSRWPRGKSPSW	92903	91690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_91700_92900
839585	contig_16578_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_148683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGCCTGCCTTCCCCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299282	300573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_299300_300600
839588	contig_13206_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_161918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATTAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250752	250189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_250200_250800
839589	contig_8242_pilon	+	369	4	Intergenic	novelGene_80194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	24.5673676969177	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	141	229	369	171428	178703	FALSE	40	AAAGTAAGTTCTCATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSNRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSKNIDADGQGFCQGGFSIDFT	145401	178703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_145505_163935_164028_171394_171510_178644
839590	contig_6589_pilon	+	1225	3	Intergenic	novelGene_25749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	46	351	520325	521441	FALSE	45	TATTTACCACAGTAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPPEAAPASGFWNPMKGTRKAPCRPGPSSMWPGAGHQPHKAASETGLSGLPDSSSLLVVMVISHLPVHLACPHTPVACPQTHWPHSVGRSSQCSCHFWRSPLDRSTRPCPSSVRL	520279	522315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_520439_520864_521020_521404
839591	contig_7992_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_115537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583607	584841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_583600_584800
839594	contig_5105_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_168912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTTCAACCTTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480920	480336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_-_480300_480900
839595	contig_18391_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_174101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.28521820013368	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	206	727	199902	196379	FALSE	80	AATGTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNFPSLPVAKIFIIELNTMYAKEKDIALMKLQFPLTFSDTVRPICLPFSDEELAPATPLWIIGWGFTEQDGGKISDALLQASVQVIDSTRCNAEDAYQGDVTEKMLCAGTLEGGVDTCQGDSGGPLMYQSDLWQVVGIVSWGHGCGDPSTPGVYIKVTAYLNWIYNVRKAEL	204590	195941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_196391_196826_196977_198487_198631_198855_198955_199784_199952_203446_203488_204475
839596	contig_6847_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_143842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTACCATTTTGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33404	32769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_32800_33400
839599	contig_5041_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_27024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCAGGACCCCAGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274723	273173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_273200_274700
839602	contig_5321_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_153874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCATGCCCATGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55005	57399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_55000_57400
839603	contig_12802_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_114261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256088	255388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_255400_256100
839605	contig_10197_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_115304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAGGGTCACTGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321161	1319502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1319500_1321200
839606	contig_5500_pilon	+	642	2	Intergenic	novelGene_159650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	159	515	654818	656271	FALSE	25	AGATTTGTTGACCTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGRGVGGGARCPESPPEQPARPRLQEGKVGCSGRPWASVSPGGPPPHPGGDRMSSRFSRNMATRLIRTVAVSVVHPLLQLSHHTVKSRGLSTLLLGSLRSALPVGTSLLKPSSVVESLLSNRLMPCLQPALGFKTKGVIKKRCKDCYRVKRRGRWFIYCKTNPKHKQRQM	654659	656398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_+_654829_655925
839607	contig_15762_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_177357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227140	226350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15762_pilon_-_226400_227100
839608	contig_12765_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_106572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCCTTATCAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225256	226676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_225300_226700
839609	contig_14890_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_122515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370205	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_366657_370130
839612	contig_11292_pilon	-	1344	8	Intergenic	novelGene_109488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	32.3274067083921	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	4	1167	534757	523172	FALSE	55	GGATCAAAAATATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMATAGAMERSFLEISGAERERPRHFREFTVYGVGTVNAVVGAVKYSESAGGFYYLESGKLFSVTRNRFIHWKTSGDTLELVEESLDVNLLNNAVHLKFQNCSILPGGVHVSETQNHVIILIVTNQTVHRLLLPHPSRMYRSELVTESQMQSIFTDIGRVDFRDPCNYQLIPTVPGLSPNSSTSAAWLSSDGEALFALPSASGGIFVLKLPPHDLPGMVSVVELKQSSVMQRLLIGWMPTAIRGDQGPSDRPLSLAVHCVEHDAFIFALCQDHKLRMWSFKDQMCLMVADMLEYVPVNKDLRLAAGTGHKLRLAYSPSLGLYLGVYMHAPKHGQFCIFQLVTTENNRYSLDHISSLFTSQVGLSSFTCQTSVRMKYWLAPQCCNGIEV	534760	522994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_523337_524780_524940_525744_525860_526402_526482_528348_528572_528859_529071_534273_534386_534657
839615	contig_16625_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_171120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGGTATCAGTTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92319	91818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_91800_92300
839616	contig_7695_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_41565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	151	540	382554	382165	NA	55	GTGCCCAATAAAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLFFITDPVPFTPCQRCISIHNEMDNTSVNILTFFFRSSSFSTVGKALDQFSSIGFLNHTRFPNPLFSGLTSLSTTPCQPLPPLKKVVCSASSVSTPDDDPFPHKQFTAFSLFCSFFKFFHPAPLPF	382704	381958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_382000_382700
839617	contig_8650_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_162626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGTGCAGCTATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277975	277576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_277600_278000
839618	contig_15118_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_74560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAGAACTGTGTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178179	179805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_178200_179800
839619	contig_1443_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_28339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTCCGAAGAAATAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790225	788759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_788800_790200
839620	contig_10437_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_38509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAGAGTCACTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331622	1330514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1330500_1331600
839622	contig_8676_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_142227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTATTAAAAGAACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694696	693849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_693800_694700
839627	contig_9981_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_121075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520110	520840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_520100_520800
839628	contig_9682_pilon	-	1009	4	Intergenic	novelGene_125323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	8.37987005998436	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCCTCTGTGATGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603982	579446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_580019_582184_582304_595229_595276_603710
839630	contig_6496_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_103513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGTCAGGAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817937	818735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_817900_818700
839631	contig_9058_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_149372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACATTTTGCTCTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267827	267213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_267200_267800
839632	contig_16703_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_72797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGCAATAAAGATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44186	44853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_44200_44900
839633	contig_1379_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_134574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTTAGAAACCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362475	362043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_362000_362500
839635	contig_8027_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_158843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTCAAGTAAGGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296263	296986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_296300_297000
839636	contig_10990_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_7436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCCCAGAATACTAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705257	704574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_704600_705300
839638	contig_12622_pilon	+	2068	2	Intergenic	novelGene_5755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTATGAATTGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68209	76768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_69873_76363
839639	contig_7368_pilon	+	855	6	Intergenic	novelGene_158806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	37.379138566853	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	48	509	170910	205328	FALSE	35	TAAAAATGTGAGTGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRRGPGGDSAFEDETMKLRQLKLDNQRALLEKKQRKKRLEPLMVQPNPEARLRRSKPRGSEEQTPLVEPHTPHNDVILHGIDGPAAFLKPDTQDLETKLHVLSVGSSAMEEDTEESFDGESMLDTASKPDLQEILQKHGISGSLNFDEEETEGEGTGRCKDPVCFVLA	106482	205674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_106511_170890_170943_179270_179431_180356_180534_186954_186992_205273
839641	contig_4486_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_38556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAATAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158250	156989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_157000_158200
839642	contig_8538_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_5097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842905	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
839643	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
839644	contig_6477_pilon	+	965	6	Intergenic	novelGene_154156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	30.9476978142155	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	533	928	754555	761236	FALSE	25	AGTTGCCATTGACTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPDSLFWRAIKPIHDRIPSYVEIHRDAINLKWESLSGSCINVHLYNAL	748119	761273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_749798_749923_754498_754588_757413_757541_758317_758414_761096
839645	contig_11294_pilon	+	1673	10	Intergenic	novelGene_50058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	136.970213937822	1	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	4	1014	251378	323765	FALSE	35	AATATATTTTACCTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIASFRNSHVPGDWTGGSLLYLCNY	251374	324424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319233_323693
839646	contig_4659_pilon	+	1260	2	Intergenic	novelGene_118260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTCATGACAATGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884307	920482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_884812_919726
839648	contig_10299_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_79795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	23	298	745745	745470	NA	60	TATAGAAATAAGGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSVFVFGMHQSYLVWSKWSIILPLVLGPQKTHLDWQPPTTSLCALKSCSSRAVGLEMDSPRRRDRLWLSFPKAFGVSHRYFFILLSHLISVNDTHSHY	745767	743633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_743600_745800
839649	contig_12540_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_148106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTCGTTTTATATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054217	1055249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1054315_1054627
839650	contig_821_pilon	+	1404	5	Intergenic	novelGene_149430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATCATCCAAGCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632595	712139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_633541_650291_650442_669319_669437_709140_709243_712049
839652	contig_6654_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_85772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	165	470	632613	632308	NA	30	CCCAAAGACCTTTTCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNTRNETLYFFQLPGSKHQSSRTPSLLISILCSVAKLYSCYGLNLRYTSPFFNPSLAPELTFLIISILSYFNRQLTLFPPQSIPFITTRLIFLKHFESIL	632777	630851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_630900_632800
839655	contig_10095_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_57235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTCTAGACTAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202107	204169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_202100_204200
839656	contig_6831_pilon	+	1324	2	Intergenic	novelGene_165143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	205	300	52881	52976	FALSE	30	TCAAGGGAATATTCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWPKNITVWQYRGNACWPGSGAVRTAWLERQPGQIGFIPRSCRGEPSGAGCRRIFRTTFQTWKQSARCMKEERLKEERRAQLRRKVAEILPDFQTLAPP	48315	54000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_+_48471_52831
839657	contig_5084_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_64518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGGTGTCTGGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377031	376185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_376200_377000
839658	contig_18438_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_171391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAACCCCAAGAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254016	252262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_252300_254000
839659	contig_15327_pilon	-	1200	3	Intergenic	novelGene_70744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	5.5	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	155	691	1012665	1010488	FALSE	70	AAAAGAATAAAGAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKTWTRVCKATSSGRNAETRGGEGPPAARSGAVWPPLRGVLGAAAAQTWAKMAAPWWRAALYGSRRWRAFSTSAACSRRTAPLGPMPNEDIDVSNLERLEKYRSFERYRRRAEQEARAPHWWRTYWEHFGEKSDPKDKIDIGLPPPKICRTQQLLERKQVLRELRANVEEERAARLRTGKPWGVEGVGCVLAPTPTLHPSWHLPSQHRSHWRRCGLSGRGPAAPTTSSV	1012819	1009978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1010778_1012304_1012485_1012598
839660	contig_10074_pilon	-	1650	15	Intergenic	novelGene_57216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	218.339898379773	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	13	450	725187	715767	TRUE	30	ACTTGTCTCCAGAAGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEMSANTVLDSQRQQKHYGITSPISLACPKEIDHIYTEKLIDAMKPFGVFEDEEELNHRLVVLGKLNNLVKEWISHVSESKNLPPSVVATVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVERSDFFQSFFEKLKHQDGIRNL	725199	699930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_700283_700699_700820_705608_705663_706064_706150_706745_706867_707709_707783_708422_708562_711022_711113_713762_713875_715712_715771_716827_716934_717177_717260_720397_720465_722180_722343_725170
839662	contig_6227_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_49685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGGTTTTCTGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876294	877394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_876300_877400
839664	contig_7356_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_60411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTAGTATGTCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470843	471477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_470800_471500
839665	contig_12528_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_81368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGTTAACACAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062713	1063482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1062700_1063500
839668	contig_6589_pilon	+	432	2	Intergenic	novelGene_26063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	739	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCTTTATATTCTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1730134	1731821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1730152_1731406
839669	contig_12638_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_33355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACACACACTGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406961	1407574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1407000_1407600
839672	contig_9919_pilon	-	3080	2	Intergenic	novelGene_137945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	223	1968	490486	488741	FALSE	20	TCCCTGAGAACAGGTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYYGCPSECTCSRASQVECTGARIMAMPTPLPWNAMSLQILNTHITELSESPFLNISALIALRIEKNELSRIMPGAFRNLGSLRYLSLANNKLQVLPVGLFQGLDNLESLLLSSNQLMQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNNLEYIPDGVFNHLVGLTKLNLGKNSLTHLSPRVFQHLGNLQVLRLYENRLSDIPMGTFDGLDNLQELALQQNQISRLSPGLFHNNRNLQKLYLSNNHISQLPPGIFMQLPQLNRLTLFGNSLKELTPGIFGPMHNLRELWIYDNHITSLPDNVFSNLSQLQVLVLSRNQISFISPGAFSGLMELRELSLHTNALQELDGNIFRILANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMTIQLQNNQLENLPLGIFDHLGNLCELQLYDNPWRCDADILPLRNWLVLNRPRLGTAALPVCFSPANVRGQSLVIVNVSIAVPSVQVPEVPSYPEMPQYPDTSSYHDTTSISYTTEYTSPMEDYTDLTTIGSTEDRGTWGMTRAQSGLAIAAIVIGIIALAFSMAACICCWCCKQRGHTVLMQMKAPNEC	491059	487628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_490492_490842
839673	contig_6031_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_56785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGCCTTAAAAGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581162	582962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_581200_583000
839674	SIRV6	+	370	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	0	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
839675	contig_3252_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_61516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGGGATATGTACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721770	722449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_721800_722400
839676	contig_19934_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_166641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342573	342181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_342200_342600
839679	contig_1225_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_44214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359772	358447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_358400_359800
839680	contig_10494_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_102213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1145	1462	1096965	1097282	NA	15	GCCAGTTCTGATCTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGCKEAPGQCPLCSPGWPQLAKLLLGYWAKLPTLPAAEPSLSLGGIWTRTGAWEAVAPQAGSLVQSSLAQGGKQLRLWELPDCPCESGALKTLARVEMGTGMDA	1095820	1097706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1095800_1097700
839681	contig_9706_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_20819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACCCCATATCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	2047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2000
839683	contig_17519_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_177301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTTTCCTTTCTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53193	54002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17519_pilon_+_53200_54000
839685	contig_15105_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_150998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAACTGCCCCATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812810	813681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_812800_813700
839687	contig_10023_pilon	-	696	6	Intergenic	novelGene_123518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	771	junction_4	256.751241477037	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	7	591	457819	456118	FALSE	10	TTGCAGAGTGGTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLQQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREFLEKQPVVSQAEARELVERCMRVLYYRDARSYNRFQVATVTEKGVEIEGPLSAETNWDIAHMISGFE	457825	456012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305_456395_456596_456714_457083_457166_457288_457436_457682
839690	contig_5586_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_143587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATCAGGACAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429952	430622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_430000_430600
839692	contig_7272_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_25313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488715	487480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_487500_488700
839694	contig_10183_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_169508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGTCTTGGTGGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66995	65993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_66000_67000
839695	contig_8548_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_170564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGCCATTTATACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478480	476365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_-_476400_478500
839696	contig_13148_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_162924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGTTAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26613	26047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_26000_26600
839697	contig_15888_pilon	-	960	4	Intergenic	novelGene_84441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1669.71481264183	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	306	470	252256	252092	FALSE	10	CCACATTTCGGCTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCGGGGGWWRRGRRTVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDGEARVPHQEEQRSPRERQGQAHPSEERQLSAGSLQGRGRGRGPVLPMGLASGVSVRKISSPPKETHLGEQIVDPSLILRFPVFPAKLGFSTYRIPFSPTL	259787	251601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252550_253390_253522_259738
839698	contig_4256_pilon	+	581	4	Intergenic	novelGene_176395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	4.49691252107735	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGGCAGCAATGACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392136	454195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4256_pilon_+_392327_395158_395230_448238_448375_454011
839699	contig_5018_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_46997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTTCTGTGTGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211096	1211339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1211100_1211300
839700	contig_7342_pilon	-	927	11	Intergenic	novelGene_71110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.417364850282	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTTTCTCCTGGCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86745	76097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76311_81075_81176_81295_81342_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83789_83834_83913_83979_86703
839701	contig_3233_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_56504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATTATCATAATCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67041	67968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_67000_68000
839702	contig_8538_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_4687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAAGATCAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843115	842741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
839703	contig_6496_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_103466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	368	754	148763	149149	NA	45	AAGAAAGAATACTTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFLRAVQHAEKLHRATGARLFGPRLVFNKACLNTEPGLKWGPPEQNKTLLPRGILGLTRRTIWTQGQGLRRAKEDGSKQVSVHRSPRGETDVSTSQKGKKSHPVNISSSTDVAKATSALLHKVRC	148395	149705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_148400_149700
839704	contig_7839_pilon	-	188	1	Intergenic	novelGene_45692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACCACTTTGTAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183159	182971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_183000_183200
839708	contig_10626_pilon	+	901	5	Intergenic	novelGene_138215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_1	43.3445498303997	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	150	899	315334	321208	FALSE	40	TAATTTTATCATTTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPCSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLCDEVQEVVYFPAAVHNNLQKHLKCTYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGGNKHGVCIGNEAVWGREEVSDEEALLGMDLVRLGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCSEGSMEFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYWAAEKVEEGVRNISNQLSVTTKIDREHPHMRNYAKQKGWWDGKKEFDFAATYSYLDTAKMTSSGRYCEGYKLLNKHK	312086	321210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_312220_315317_315493_318230_318413_318980_319181_320999
839709	contig_8310_pilon	-	699	3	Intergenic	novelGene_75538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTAAGTATCTTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191747	169772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_170037_177787_177959_191483
839710	contig_4496_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_66694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGTCAAAACAAACGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960108	958168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_958200_960100
839711	contig_16391_pilon	+	1396	16	Intergenic	novelGene_176982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAACTATCCCAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33211	47970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16391_pilon_+_33567_34492_34601_35477_35523_36465_36575_38088_38127_38461_38625_38713_38748_42519_42656_43776_43825_45240_45292_45892_45944_46431_46489_47026_47082_47204_47259_47742_47809_47944
839713	SIRV6	-	362	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-104	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTACTCTTTCAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844
839714	contig_16930_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_139162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATTAACACCACTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155733	156413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_155700_156400
839716	contig_1406_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_25488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGTGATATAGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334867	1333252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1333300_1334900
839717	contig_7707_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_72116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACCAAAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19283	18197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_18200_19300
839718	contig_7272_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_25386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATATAGATCAGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733300	735849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_733300_735800
839719	contig_9955_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_21350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCCTCCTCTTCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92981	93890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_93000_93900
839720	contig_21202_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_177361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGAGTCTTACTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10857	12141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21202_pilon_+_10900_12100
839721	contig_20883_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_173831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTTTAAAAGTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15982	17228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_+_16000_17200
839722	contig_6980_pilon	-	1300	7	Intergenic	novelGene_35990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGATCTCCCGAGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220510	202624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_202721_205895_205998_212661_212817_214512_214597_215403_215511_215847_215937_219843
839723	contig_2054_pilon	-	938	5	Intergenic	novelGene_51664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_3	693.770990673435	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	109	543	34719	24955	FALSE	15	CCTCAGTAGTTTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPPEEGGGLGCLSAPRSGRFFFYEFRAGSLRPRVEMACAAARSPADQDRFICIYPAYLNNKKTIAEGRRIPINKAVENPTATEIQDVCLAVGLNAFLEKNKLYSREWNRDVQYRGRVRVQLKQEDGSFCLIQFPSRKSVMLYAAEMIPKLKTRTQKTGGGDQSLQQGEGSKKGKGKKKK	34827	24559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_25089_30978_31091_31184_31257_34095_34172_34678
839724	contig_13653_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_175685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	414	902	74722	74234	NA	20	CTCCCCAGCTCTGTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYDSVPLRTASVSVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGELYVFNTPSGTSSVDTQMRHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLETIPDIPPPRPPKPHPAHDRSPVETCSITRTASDTDSSYCIPTAGVPPSRSNTISTVDLNKLRKGQL	75135	74129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_-_74100_75100
839725	contig_6654_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_85726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAGAAACCTCTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348171	349504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_348200_349500
839727	contig_7022_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_142165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCCAGGACGGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393315	394319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_393300_394300
839728	contig_5965_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_154655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTTAAGATAATGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115331	113796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_113800_115300
839729	contig_2236_pilon	-	1391	4	Intergenic	novelGene_98685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCCATCAGTCACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65763	60724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_-_61260_63779_63941_64980_65077_65164
839730	contig_12540_pilon	+	1250	2	Intergenic	novelGene_148069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	59	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	7	639	304675	347148	FALSE	10	TCTTGGTGTTGACGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYMERRFQDTVSTVGGAFYLKQWRSYNISIWDTAGREQFHGLGSMYCRGAGAIILTYDVNHLQSLVELEDRFLGLTDTANTDCLFAIVGNKLDLAEEGAAEDQENEQDSSREAGGSCVPAKVPKQVKLEDAVALYKKILKYRMLDEKDVPAAEKMCFETSAKTGYNVDYLFETLFDMVVPMILRQRAEGPPQTVVISDYEKQPKQMKSGCCA	304668	347759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_304772_346612
839733	contig_19459_pilon	-	542	4	Intergenic	novelGene_59883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4458.03596516074	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATAATTTTATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19116	6686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6950_15611_15702_16203_16265_18988
839734	contig_7457_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_31649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003474	1002981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1003000_1003500
839735	contig_13744_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_77155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTAGTAACATATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171973	169967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_170000_172000
839736	contig_5317_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_76647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTCCCAGCTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003407	1004752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_1003400_1004800
839737	contig_5967_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_44412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434763	436362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_434800_436400
839738	contig_1084_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_152393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTGTCTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544342	543204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_543200_544300
839739	contig_16103_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_118688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176398	177093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_176400_177100
839740	contig_13201_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_130873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGATATACATACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53995	56084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_54000_56100
839741	contig_11855_pilon	+	929	7	Intergenic	novelGene_67081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	174.381207575689	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	69	512	2279887	2286307	TRUE	50	TAATTACTCTACCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGGQSGSRCEWAERQDPAEEDMAAKVFESIGKFGLALAVAGGVVNSALYNVDAGHRAVIFDRFRGVQDIVVGEGTHFLIPWVQKPIIFDCRSRPRNVPVITGSKDLQNVNITLRILFRPVASQLPRIFTSIGEDYDERVLPSITTEILKSVVARFDAGELITQSSQKQ	2278574	2288071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2278603_2279846_2279975_2281322_2281485_2283589_2283733_2283903_2283936_2286288_2286364_2287710
839743	contig_7753_pilon	+	1358	4	Intergenic	novelGene_41507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCTTGGATTCGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232126	1234862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1232669_1233233_1233336_1233553_1233626_1234220
839744	contig_11300_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_168649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTCTTATTGTACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94176	95917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_+_94200_95900
839745	contig_5461_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_156841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACATTGGTTAACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834569	833337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_833300_834600
839747	contig_6710_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_96023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653757	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653800
839748	contig_4659_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_118215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCGAAGAGAAGCACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590541	591556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_590500_591600
839750	contig_9091_pilon	+	1789	1	Intergenic	novelGene_32433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATGAAAAAAATCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48578	50367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_48600_50400
839751	contig_15613_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_147216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAACCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207409	208485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_207400_208500
839752	contig_6496_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_103527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGCTATAAGATAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942853	943415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_942900_943400
839754	contig_7045_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_77460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTGCATGATTATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371528	372666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_371500_372700
839755	contig_14030_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_62240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACAGGTTAGAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346270	345724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_345700_346300
839756	SIRV6	+	416	3	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	18	596	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGTCGCTTTTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2303	3136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2616_2740_2815_3106
839757	contig_7019_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_149457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTCCTGTGTGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519429	518493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_518500_519400
839760	contig_2069_pilon	-	455	3	Intergenic	novelGene_23531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	73	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGCATTGTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509896	1508370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508601_1509027_1509111_1509754
839761	contig_2036_pilon	-	818	5	Intergenic	novelGene_131837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	302.635506839498	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	191	688	661225	631740	TRUE	15	GGTCTTCCTACCAGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLRK	661415	617139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631701_631872_636558_636731_647832_647936_661134
839762	contig_4469_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_21972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCTTACTCAACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919727	918393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_918400_919700
839763	contig_20006_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_157304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATATTTTAATATATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50041	49673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20006_pilon_-_49700_50000
839764	contig_12540_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_148110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACATTCGCTGTCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079036	1077911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1077900_1079000
839765	contig_4388_pilon	-	971	2	Intergenic	novelGene_161950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGAGTTGATGTACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335910	333729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_334013_335222
839766	contig_8561_pilon	-	1511	1	Intergenic	novelGene_161637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTATCACTATTGTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111453	109942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_109900_111500
839767	SIRV6	-	257	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAATTTTCCATGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11774	11517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11500_11800
839768	contig_11855_pilon	-	1254	10	Intergenic	novelGene_66991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6.48835614251397	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	43	1254	1294548	1282231	FALSE	45	AGTAACCCAAAGGACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGRRSCLRLGRGQMMKKVVSKQSPPKLFEKKRAKLPEQPTPPIQEETEPISNVLQGDDILALAIKKEDLKKQHIPRPGTKDKPAITQKVIIRKFKPKDSTRKICHLVAHPATPDAATKPLDYSGPGDSFDDSEQILPHHILGSLQDFKRIALARGNTQLAELIHTPPCLMALISAKEEPEQKKPKAEKTRLWAPPPQHNFLKNWQRHITLWKKQQEALSEHLKKPVSELLMHTGETYRQIQEERELIDRVLPTQHDGKCCEESSGFWNQLEYVGDEMTGLTMTKTKIQRGLMEPITHIRKPQSIREEMGLPAQKDAWYRYTWDRSLFLIYRRKELKSLLAELNFTQQDIDGLEVVGKGQPFSAVTVEDYPLFESTQESSSEDTVSSDVMASYPDVTLMPVLGPSLLFCGKPACWIRG	1294590	1282230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1282325_1282825_1282942_1283029_1283146_1284256_1284408_1285195_1285312_1285717_1285902_1286766_1286871_1287007_1287165_1287922_1288051_1294502
839769	contig_11855_pilon	-	508	2	Intergenic	novelGene_66989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAATCTTGTTTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280820	1279223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1279631_1280719
839770	SIRV6	+	417	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	331	19	165	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCTATTTCGGTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468	2101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
839771	contig_12622_pilon	-	780	4	Intergenic	novelGene_6048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	248.041663167031	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	42	419	1691275	1685486	FALSE	30	GGACAGCTTAAAACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRAALSLPSLLLLLLSWVPRSEAAPQQDEIQFLPGLAKQPSFRQYSGYLHGSGSKRLHYWFVEAQKDPKSSPVVLWLNGGPGCSSLGGFLTEHGPFLGAGHMVPTDKPQAAFTMFSRFLNKKPY	1691523	1685124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1690814_1690927_1691093_1691276_1691482
839772	contig_11171_pilon	+	734	7	Intergenic	novelGene_48527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1645.4343313815	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	41	580	31058	65800	FALSE	15	TTAACCTGCAGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSALALA	31017	65954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51822_65782
839773	contig_6102_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_32239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATACCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926916	926538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_926500_926900
839774	contig_8820_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_79302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172706	173382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_172700_173400
839778	contig_9335_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_147431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111541	112236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_111500_112200
839779	contig_5105_pilon	+	1486	2	Intergenic	novelGene_168907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAGTTTTGTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128662	138562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_128670_137083
839780	contig_6576_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_42291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTATTTCCTTAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346744	348803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_346700_348800
839781	contig_7179_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_78198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368788	1367254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1367300_1368800
839782	contig_11594_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_80946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATTCAATTTGAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580886	578713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_578700_580900
839783	contig_12485_pilon	-	1981	4	Intergenic	novelGene_147295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.18544972870135	8	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAACTGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758078	700982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_702706_706869_707050_757265_757308_758042
839784	contig_16109_pilon	-	887	9	Intergenic	novelGene_80342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	15.6359961307235	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	169	885	376408	333243	FALSE	40	GTAAGTATATTGAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIKHLVYAVIRFLREQSQMDAYTSDEHESLEVAIQCLETVFKISPEDTHLAVPQPLTEMFTNSFCKNDILPLSNSVPEDVGKADQLKDEGNNHMKEENYTAAVDCYTRAIELDPDNAVYYCNRAAAQSKLGHYTDAIKDCEKAIAIDSKYSKAYGRMGLALTAMNKFEEAVTSYQKALDLDPENDSYKSNLKIAEQKLREVSSPTGTGLSFDMASLINNPAFISMAASLMQNPQVQQ	377687	333240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_333279_335941_336005_336081_336221_338712_338818_357876_357977_361892_361963_368107_368212_376308_376444_377554
839785	contig_16109_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_80341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAGAAAAAAATACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330558	329866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_329900_330600
839786	contig_13004_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_112659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAGGAAAAAAAAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564830	563911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_563900_564800
839789	contig_13224_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_104086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAGAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211869	211374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_211400_211900
839790	contig_13224_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_104085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGCCACAAACGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211325	210710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_210700_211300
839792	contig_11594_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_80907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	678	2037	108	2144	267676	265640	NA	30	AGGTATATGTACATGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDFILPVCSCSSECVHKLGNRGNSCVKQLVLESLEMHENLENSKIDEFSLTIKTRNQCDSHGETIQSQSGVVLKASILEENLKDVLTQGMSPFSSPQKHRSTDSPEMNGGCNLNEQFRIEFTDLSPSLSSFEKVPDDHHLLQPVSDEFQIVETCQDGNRKSSSCFHSSKQEALENGKKNNFISSDGVSKKMEVKDIGPLEIHLVPYTKKFPTPKPRKTRTARLIRQEYIDAPSESTEEPENSDSNSSCLIEDNLKNNKISVLHQNVLCNQEQVDKVKQGSKNELNLDSDCDRQDLANSQKAVCPETSSFEKMAPPLETDSCLSSDSKTVDGCNMSLAMDNGTGIIRCSTLSVSLPKQLKLTCNEHLPTAYNPGVCAPQMQKESTVKDESSSRIIPKKPQRHSLPVAGVLKKAASEELVEKSCYPLNEEKNLEKNLESNHVQHLGAPNNGMSSSFDVPKRASEKPVWKLPHPILPFSGNPESLKSVRMSSNSEPSSSLTKPRAKSLSAVDAERSTKPCKDSQKKNSLKKLLNMKLSICFMKSDFQKCWSKSSQLGDMSTGNVCGGDRKRIESDWHGLLAGEEKRSKPVKAYSADNYSLESQKKRKKSRVQTSMANSPRAESLDDQILSRESSSQAACKSVRSACAPEYENIHHYKEIPEYENLPFIMVIGKTPEFECHNSSNMEDTDANVYEVEDPYEAPASQLQLGPRLQHCR	267783	265567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_265600_267800
839794	contig_6477_pilon	-	480	3	Intergenic	novelGene_154176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2783.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773200	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769624_772836
839795	contig_9629_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_171603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCCCAATATGTCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69351	71131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_+_69400_71100
839797	contig_12046_pilon	+	823	2	Intergenic	novelGene_83494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	128	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAACATGGCTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723620	729752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_723827_729135
839798	contig_5526_pilon	-	2123	6	Intergenic	novelGene_111685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_5	312.768668507573	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	267	1517	227612	173000	FALSE	55	AAATTTCAAAAATATTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPGLAATAAELREPGAALHRELGRGAPAPHRRNGPPPRASASTIGGYPRASSRPSLSERPSGSPPHLSSSLFFLLSPLPPSPLQLSVMATEPPSPLRLEAPGSPEMKIPPASEAVPEGTPQPAGGRLRFLNGCVPLSHQVAGHMYGKDKVGILQHPDGTVLKQLQPPPRGPRELEFYNMVYAADCSDSVLLELRKYLPTYYGIWSPPTAPNDLYLKLEDVTHKFKKPCIMDVKIGRKSYDPYASSEKIQQQVSKYPLMEEIGFLVLGMRVYHVHSDSYETQNQHYGRGLTKETIKDGVSRFFHNGFCLRKDAIAASIQNIEKILQWFESQKQLNFYASSLLFVYEGSSQPTTTKSNDRTLAEKFLSKGQLSDTEVLEYNNNFHVLSSTMNGKIEASVGKSLSKMYARHRKMYSKKHHSQTSLKVENMEQDNGWKSMSQERLNGNVLSKLEKVFYHLPTSCQEVAEVEVRMIDFAHVFPSNTKDEGYVYGLKHLITVLRSILDN	227878	172393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_173623_176019_176102_187723_187897_205925_206023_217615_217702_227422
839799	contig_15970_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_144066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227324	228724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_+_227300_228700
839800	contig_5799_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_50318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTTATAATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620443	619049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_619000_620400
839801	contig_12993_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_136744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATACTAGCAGATATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169744	170136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_169700_170100
839804	contig_16109_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_80331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAAGAAATCCATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270109	268826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_268800_270100
839806	contig_12145_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_172326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCATAAGGTTTCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188962	189343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_+_189000_189300
839807	contig_14443_pilon	-	736	3	Intergenic	novelGene_126671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1060	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGCAGTGTGGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39512	29095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29631_38984_39045_39371
839808	contig_3081_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_133949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATAGAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363969	364394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_364000_364400
839809	contig_11378_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_112281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTCTTTCCAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492500	492127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_492100_492500
839811	contig_9633_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_139648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTCAGCCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166495	1165304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1165300_1166500
839812	contig_13806_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_173651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAATTATCTAACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75643	65508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_67005_75539
839813	contig_6192_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_170334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAGAGGAAATAACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141681	141878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_141700_141900
839814	contig_11493_pilon	+	1544	2	Intergenic	novelGene_143712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTTCATGCTACAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271878	274077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_272906_273560
839815	contig_8019_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_126992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGATTGAATATTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190895	193119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_190900_193100
839816	contig_12638_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_33361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGAGGAACTATCATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1442483	1442970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1442500_1443000
839817	contig_7870_pilon	-	684	3	Intergenic	novelGene_109094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	156	junction_2	43.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAACAAAATCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854069	823628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_824168_847511_847613_854025
839818	contig_6364_pilon	-	1217	12	Intergenic	novelGene_51828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_11	7.10139085434084	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	143	1135	1591470	1586979	FALSE	15	GCTTTTAGAACTGTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRSVLHSGYFHPLLRTWQVATTTLNASNLIYPIFVTDVPDDVQPIASLPGVARYGVNRLEEMLKPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEDSPAIEAIRLLRKTFPSLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSENGVFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVIAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLRWLKEE	1593453	1586896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587041_1587684_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588522_1588844_1588934_1589040_1589125_1589244_1589381_1589757_1589855_1590376_1590428_1591357_1591545_1593385
839819	contig_11304_pilon	+	598	5	Intergenic	novelGene_156685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	181.484159088335	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGATGCTAAGTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273701	441292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_273886_351744_351860_357445_357630_433617_433676_441235
839820	contig_21226_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_177362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATGCAAAAAAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26560	26027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21226_pilon_-_26000_26600
839821	contig_9233_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_78263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGGTTAGCCGTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753629	754107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_753600_754100
839822	contig_10371_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_175492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGATTGTCCAGATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855904	854585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_854600_855900
839823	contig_6302_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_171690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAACCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90637	91804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_90600_91800
839824	contig_8820_pilon	-	733	6	Intergenic	novelGene_79271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACACGCTCTTCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104116	99414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_99498_100843_101105_101242_101400_102516_102576_103614_103685_104013
839826	contig_992_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_164295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	288600	288271	NA	25	ATTACTTAAGTTCATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKENCGLSSALRFSQFGRAFSVVFPLSWMQRVFADRQSEPGSPCFPRQCCSRQESGSGDVKEKRWRGGERARLLCPAEALPLQDPVVYLAVFCMNEKHLFLGGGGTRTT	288670	287259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_287300_288700
839827	contig_4079_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_167468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	161	469	76100	76408	NA	30	ACAGTGGCTGCAACAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSRSTQLVYIYSLVLTHHLSVSLSYCGSLRVAVMLEAMLPVFQTPAGSPRGAGFSRASRLKTECSLEASMARLCITYFGHVVMRDQPLEKDIMLGKAKDQ	75939	76439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_75900_76400
839832	contig_2768_pilon	+	222	1	Intergenic	novelGene_57474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544616	544838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_544600_544800
839833	contig_7728_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_64748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTGTATATTCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890283	888855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_888900_890300
839834	contig_19291_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_177363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCAGTCTCAGGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14395	15733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19291_pilon_+_14662_15154
839837	contig_10324_pilon	-	680	4	Intergenic	novelGene_7889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	4.32049379893857	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	245	319	579008	578934	TRUE	35	ACAAACATGGGTCTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHEQVVDRLLEAQDSAERLLREILTTEKEVAQNLVDTKEKAHQGVAELQQLEAELQKASEEDTHLKANLFQLTSELEGLKEMEVDLQRQEREVDEDTTVTIPSAV	583387	578499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_578690_578762_579043_579209_579355_583322
839840	contig_9646_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_117413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	261	383	50589	50711	FALSE	15	CTCTTCAGTTCTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASAAAAGSASPRSWDEAEAQEEEEAVGDGDADGDGEDDQCVVYFARAPKSIEVYSAYNNVKACLRNHQGPLPPVPLHLRNAPTRLMKDLGYGKGYKYNPMYSEPVDQEYLPEELRGVDFFKQRRC	23375	51173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_23498_50450
839841	contig_4232_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_63433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCAGAAATTATTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507196	508563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_507200_508600
839842	contig_12019_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_87768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAAATTAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684990	686220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_685000_686200
839843	contig_14528_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_111295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATATGGCAGTCTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290520	289713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_289700_290500
839844	contig_10523_pilon	-	497	2	Intergenic	novelGene_120915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTGTGTCTGCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14943	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13039_14758
839848	contig_2069_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_23294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGGCTACATGGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414659	413780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_413800_414700
839850	contig_4769_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_117986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGGCTACTTTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841728	841422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_841400_841700
839853	contig_2414_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_158486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACATAAACCTGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278464	278014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_278000_278500
839855	contig_6102_pilon	+	1681	4	Intergenic	novelGene_32372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	36.3715395452116	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	129	803	1723220	1724121	TRUE	25	CTTCAGCACCCCCTAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDGTCKCGLECPLNVPKVFNFDPLAPVTPGGAGVGPASEEDMTKLCNHRRKAVAMATLYRSMETTCSHSSPGEGASPQMFHTVSPGPPSACPPCRVPPLAPLNGGPGSLPLEPPSVSQAFSSLAGPGGLFPPPRLPDPVPSGGSSSPRFLPRGNAPSPAPPPPPAISLNAPSYNWGATLRSSLVPPDLGSPPAPHASSSPPSDPPFHCSDALTPPPLPYSNNLPRPPWSCYSTTSVFSHYAPAPGPGTPGRGPNSGGARGIPFPC	1722965	1725176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1723022_1723147_1723311_1723537_1724580_1724756
839857	contig_3975_pilon	-	928	5	Intergenic	novelGene_54898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	3.8405728739343	388	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	70	435	2116028	2113769	TRUE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGRLEEPAPKPRSRLRASSQHPMDDKKKKRSPKPCLTQPAQAPGTLRRVPVPTSHSGSLALGLPHLPSPKQRAKFKRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGESWGLSLDGM	2117403	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2112988_2113492_2113971_2115864_2116039_2117344
839859	contig_5093_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_135087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACGGAAGATTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569825	567951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_568000_569800
839860	contig_8594_pilon	+	1222	2	Intergenic	novelGene_140032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	86	469	331837	332608	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAGAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDQRIFKQNSQGVNVDVERQHNPLGQERMGLAVIPREERKPDLHACAATAQPQGLQQVALLLICSTGSPDVLHRLGQDNRGAEGQKFPLTGVALLLADLGAGPVPLHHDELSCEIEHNALCVPSLREKEIPFILIYRYVSSIYSSVHKVYRLNNQ	331751	333361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_332008_332395
839861	contig_3380_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_60088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTCAGAGTGGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326168	325770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_325800_326200
839862	contig_11281_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_125433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATCCAACTCATAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492646	492045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_492000_492600
839864	contig_10082_pilon	+	616	2	Intergenic	novelGene_63918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	580225	584895	FALSE	5	TGTGCGATGGCCTTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRSSSCSSHGPALGARCGLHSGAQPRGLPELPLHPWRGPPLVCWPAKALLAPALLDARPHLGHALLGDGALVDLLLVGGVAAATTVAWHQVSPLAARLLYPYLAWLAFAATLNYYVWRDNRGRRSGRRPPE	580222	585110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_580435_584706
839865	contig_3426_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_57958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTGTGACATGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426586	425593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_425600_426600
839866	contig_5445_pilon	+	302	3	Intergenic	novelGene_135414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2873	junction_1	46.5	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	240	61	300	51744	53237	FALSE	25	GTAAGTGCCAAGTCCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCQKAASPGSLGPSLLAPRKMKVSVAALSFFILAVSLGSQGRVIQELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGV	51683	53239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127
839868	SIRV6	+	418	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	47	7626	47	622	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTATTGTATGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2332	3162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106
839869	contig_15518_pilon	+	998	3	Intergenic	novelGene_127620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	347.5	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	561	998	14871	16107	FALSE	40	CTGAAGGACCAGAGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLVAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAP	14310	16107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_15202_15808_15856_16047
839870	contig_12142_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_147820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCTTCGGCTCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125886	125285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_125300_125900
839871	contig_5779_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_106499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTCTAAGTAACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204556	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_204600_205200
839873	contig_13901_pilon	-	337	3	Intergenic	novelGene_146674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	574	junction_2	56.5	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	72	335	308423	284026	FALSE	25	TTGGTGTCATTCGCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIKEETPVFYKLVPDPVNNSYIYLTAGKEVRRIHVANCSKHKSCTECLTAADPHC	308494	284023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_284104_290653_290789_308372
839874	contig_13901_pilon	-	658	5	Intergenic	novelGene_146651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_3	148.5	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	178	657	233425	222662	FALSE	35	TGGACAGGGAACTGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLPSKISGGGRFKGNKTSRTNESLQVFYIKSIEPQKISTLGKSNVIVTGANFTWASNITMILKGTSTCDKDVIQVSQVLNDTHMKFSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCFSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITIMGRNFDVIDNLIISHELKGNINVSEYCLATQCRFLAPNLKSSKLRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQYLEDPRFTGYRVESE	243542	222660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_222836_226689_226778_229695_229876_233387_233528_243467
839875	contig_854_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_36411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCCTTCTGTTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997662	996726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_996700_997700
839876	contig_5084_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_64679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTGTAGCATGGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767889	1766341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1766300_1767900
839877	contig_1008_pilon	+	1753	13	Intergenic	novelGene_121535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	93.7527407006797	3	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	336	1094	280354	329175	FALSE	25	CAGTGGTTGAATATGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNPIKTLKTNTIGTLNMLGLAKRVGARLLLASTSEVYGDPEVHPQSEDYWGHVNPIGPRACYDEGKRVAETMCYAYMKQEGVEVRVARIFNTFGPRMHMNDGRVVSNFILQALQGEPLTVYGSGSQTRAFQYVSDLVNGLVALMNSNVSSPVNLGNPEEHTILEFAQLIKNLVGSGSEIQFLSEAQDDPQKRKPDIRKAKLMLGWEPVVPLEEGLNKAIHYFRKELEYQANNQYIPKPKPARIKKGRTRHT	249875	329834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_249892_253727_253772_259224_259276_266009_266195_280314_280412_289286_289347_292120_292243_308208_308329_318553_318598_322911_322973_326154_326213_327713_327818_329043
839878	contig_7412_pilon	+	1057	2	Intergenic	novelGene_76289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCATTGTAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276009	279268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_276319_278520
839879	contig_2278_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_118136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACACTGCTACCATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071580	1070506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1070500_1071600
839880	contig_7416_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_134328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATGCTCACTCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856645	855827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_855800_856600
839881	contig_3825_pilon	+	868	8	Intergenic	novelGene_77927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	903.299620326297	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	20	820	12232	15603	FALSE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12212	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
839882	contig_4429_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_50777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGGGAAGAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109481	109739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_109500_109700
839883	contig_11160_pilon	+	457	2	Intergenic	novelGene_168854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGGGAACACATGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819563	820392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_819633_820004
839884	contig_9113_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_68614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCAAGTAGTCTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596093	594037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_594000_596100
839885	contig_14361_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_139254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTAATTACATAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12513	11601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_-_11600_12500
839886	contig_8020_pilon	+	1642	2	Intergenic	novelGene_114356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	62	1156	83692	103625	FALSE	10	TTGTTTCTCCTCACGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAACRAGPASRAGEDAPVSVMGCGTSKVLPEPPKDVQLDLVKKVEPFSGTKSDVYKHFITEVDSVGPLKTGSLAANQHAHPCPGAPTTGHTEPPSEPPRRARVAKYRAKFDPRVTAKYDIKALIGRGSFSRVVRVEHRATRQPYAIKMIETKYREGREVCESELRVLRRVRHANIIQLVEVFETQERVYMVMELATGGELFDRIIAKGSFTERDATRVLQMVLDGVRYLHALGITHRDLKPENLLYYHPGTDSKIIITDFGLASARKKGDDCLMKTTCGTPEYIAPEVLVRKPYTNSVDMWALGVIAYILLSGTMPFEDDNRTRLYRQILRGKYSYSGEVCSEMVTPTRTWWGWAQSFISLAPESTLLMMDDACEGPGIQKGKV	83630	104111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_84649_103487
839887	contig_9197_pilon	+	907	2	Intergenic	novelGene_154375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	348	junction_1	0	4	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80785	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80892_92373
839889	contig_2703_pilon	-	914	2	Intergenic	novelGene_101787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATTTCATAGACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610051	607548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_607730_609318
839890	contig_9705_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_41710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108748	109948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_108700_109900
839891	SIRV4	-	313	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAGTCAAAGTGGCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	2447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2800
839893	contig_11677_pilon	+	1255	11	Intergenic	novelGene_85966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	42.995464877124	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	33	1253	663597	668192	FALSE	40	AAAAAGGTCAGCGTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAWPGRAGAEMLVFFFALLALLLVALGALFLGRWFVVRLATKWCQRKLQVELKIGSFGFFEIQNVSLKFLQHQQTVEIDSLRISSKLLSHDLPHYVALCFGEVRIRTDLQRVSGLSAPFSQSTGVDQKELPLSPSLLKIFCQLFSIHIETINIMVLKVATSESLWHIQISGSSLLLDSDGKRLDCKMSLSKINSKVLKSGQLEDTCLAELSLTLNLCLEVGISSRQLKAITVGVWTHHAELHEGLFHSQLLSQGPNLVLTPVPCSEVTENLAEPTLPGLHLLQQLPEQVKVKMEGISVVLSMNSQKRHLNWTLKLLHFLYHRDEDQLPLRSFTANSDMAQMSIELLLEDGLLLSQSRQRIVCLNSLKASVQVTTIDLSASMVLNTCIIHYRHQEFSHWLNMLALETQGSSSPVFKQR	663564	668194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_663665_664506_664637_665114_665165_665455_665604_665801_665921_666152_666214_666406_666597_667193_667318_667496_667622_667876_667945_668054
839894	scaffold_16539_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_68386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCACAGTGGTTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645115	646175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_645100_646200
839895	contig_5217_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_135723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTCATAGTAAGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302559	301856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_301900_302600
839897	contig_12019_pilon	+	1643	2	Intergenic	novelGene_87776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAAGATAAATGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720578	722458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_722117_722353
839899	contig_18184_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_123847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAACGGAAGTGCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38711	37542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_37500_38700
839900	contig_10863_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_59329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGAAGTTTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70174	69030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_69000_70200
839901	contig_10863_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_59328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATGGTTCAGCAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68970	68154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_68200_69000
839902	contig_20742_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_150654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATAGTAAAACACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77983	77014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_77000_78000
839905	contig_4125_pilon	+	846	7	Intergenic	novelGene_25205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	208.611614143498	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	77	667	1510873	1518074	FALSE	20	TCGCATTGATTTATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGDSAGDSVHGKPSVVYRFFTRLGQIYQSWLDKSTPYTAVRWVVTLGLSFIYMIRVYLLQGWYIVTYALGIYHLNLFIAFLSPKVDPSLMEDSDDGPSLPTKQNEEFRPFIRRLPEFKFWHAATKGILVAMVCTFFEAFNVPVFWPILVMYFIMLFCITMKRQIKHMIKYRYIPFTHGKRKYKGKEDVGKTFAS	1505642	1518253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1505712_1510865_1510954_1512261_1512367_1513878_1513979_1515280_1515360_1517032_1517169_1517984
839906	contig_10444_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_139451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653729	655026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_653700_655000
839907	contig_8594_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_140066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCATAAATCAGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512784	513402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_512800_513400
839908	contig_8594_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_140067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAGGGTTTCCACTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513913	514198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_513900_514200
839909	contig_6589_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_26238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1197	1601	2196928	2196524	NA	45	TGGAAAAGCACCCAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLGHSLPLTAQLPCWEEAQAIHGGHVLVLWPWSQLSPQLPASTDGYPVSGPSGMSSPIKLCEDHSLSRHLHGNPTKVPPENGPAVYHRTVRDSKLFYISTPILCSKSPDAWICAICSCVKSAHQHFLCVQFS	2198124	2196513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2196500_2198100
839910	contig_8558_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_123169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGACAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576616	575450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_575400_576600
839911	contig_401_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_42899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCATGAAATAGATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1823072	1822781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1822800_1823100
839912	contig_6445_pilon	-	801	6	Intergenic	novelGene_77125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	15.8063278467834	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	173	799	1464561	1459517	FALSE	30	GGACAGCCTCCAGAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQRTEGMPMIQALAMTVAEIPVFLYTTFGQSAFSQLRLTPGLRKVLFATALGTLTLALAAHQLKRRRRRKKQVGPEMGGEQIGTVPLPILMARKVPSVKKGYSSRRVQSPSSKSNDTLSGVSSIEPSKHSGSSHSLASMVAVNSSSPMAACLGPWDAKGMEESVAANDGNAESLYMQGMELFEEALQKWEQALSVGQRGESSSTPTP	1467216	1459514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1459606_1459973_1460092_1461065_1461179_1463373_1463585_1464465_1464706_1467188
839913	contig_12464_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_68689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	495	204	698	242417	241923	NA	40	AAAGGCAGTAGAGGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLVSIGRSSPHCSRASRGCCWLRLVREADKRVNKGGSPIVGSGGE	242620	241920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_241900_242600
839914	contig_7933_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_164687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197996	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
839915	contig_9527_pilon	-	837	2	Intergenic	novelGene_134040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGAGTATCTAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287622	286275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_287051_287560
839916	contig_3789_pilon	+	257	3	Intergenic	novelGene_79813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	49.5	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGTCTTAAGAACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88812	91317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_88927_89776_89827_91224
839917	contig_8330_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_71877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACCTGTTAATGTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962067	960297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_960300_962100
839918	contig_5041_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_27115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAGCGGAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606327	606103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_606100_606300
839919	contig_7035_pilon	+	1390	8	Intergenic	novelGene_83539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	42.3749059357213	95	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	215	1237	757608	773440	FALSE	0	TCCCTGGCCTTTTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAPRRPASGADSFRTPEPESLSPGTAGFPEQEEDELHRTLGVERFEEILQEAGSRGGEEPGRSYGEEDFEYHRQSSHHIHHPLSTHLPPDARRRKTPQGPGRKPRRRPGASPTLIISKKERMLQKGSGFHLDLLLIVAMGGICALFGLPWLAAATVRSVTHANALTVMSKAVAPGDKPKIQEVKEQRVTGLLVALLVGLSIVIGDLLRQIPLAVLFGIFLYMGVTSLNGIQFYERLHLLLMPPKHHPDVTYVKKVRTLRMHLFTALQLLCLALLWAVMSTAASLAFPFILILTVPLRMVVLTRIFTEREMKCLDANEAEPVFDEREGVDEYNEMPMPV	755142	773593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_755294_757544_757659_759385_759552_759699_759827_772283_772538_772626_772797_773070_773245_773359
839920	contig_7229_pilon	-	666	3	Intergenic	novelGene_39848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	38	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	320	382	1212438	1212376	FALSE	40	AAAAGCTTTCTTACAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSPDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYMTNRAEHDRMARQWTKRYAT	1315336	1212091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1212474_1267646_1267795_1315200
839921	contig_10627_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_59985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	248	697	271593	272042	NA	45	TTAACAAAGAGAAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISHGQRQRVVHDFPKYSIKVLPWLSPEVLQQVGVLDPEDSPSPSAQGFQGSLQELIDGSILHFHVVSDWGRAPCWPGVPGSPLSEAIICPLQVDVLSPVWHFRLHLMLFQLPSGVLPIFWEEWTSWNCFLDLCTEQEHGAQLFFLLTT	271345	272871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_271300_272900
839922	SIRV6	+	452	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	2	31	2	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGCCGAAGACGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	2089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
839923	contig_5571_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_75515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	538	894	129144	128788	NA	25	TTTGTGAATACCAGTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESCKQSGLSSLVNGKSPVRSLMHRSARIGGDGNSKDDDPNEDWCAVCQNGGDLLCCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPRYQRNNYLFIYFGRFIFISLKNSRKLIRTDGFLDQCILFL	129681	128512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_128500_129700
839925	contig_7416_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_134323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGACTCCTACTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99867	101775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_99900_101800
839926	contig_7411_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_136988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	339	377	201082	201120	NA	45	GTAACATAAATAGTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKHQRIHSGEKPYGCSECGKAFREKSSLNDHQRIHSGEKPYGCSECGKAFSGKSLLIRHQKTHSGEKPYGCNECQKAFIWKSQLIIHQRTHTGEKPYGCNKCGKAFSQKSHLMIHQRTHIEQKP	200743	202913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_200700_202900
839928	contig_10182_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_134625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACAAAGCCCCAGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346649	345565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_345600_346600
839932	contig_13004_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_112653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTCTACAGCAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497138	495171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_495200_497100
839934	contig_15323_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_148508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAAACATCAGAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57283	56300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_56300_57300
839935	contig_3386_pilon	+	1550	11	Intergenic	novelGene_34472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_7	42.6967211855899	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	128	778	30307	40111	FALSE	15	AGTTTTGTGGGGAGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTIGTNVLGRKVLYLPSFFTYAKYIVQVDGKIGLFRGLSPRLMSNALSTVTRGSMKKVFPPDEIEQVSNKDDMKTSLKKVVKETSYEMMMQCVSRMLAHPLHVISMRCMVQFVGREAKYSGVLSSIGKIFKEEGLLGFFVGLIPHLLGDVVFLWGCNLLAHFINAYLVDDSFSQALAIRSYTKFVMGIAVSMLTYPFLLVGDLMAVNNCGLQAGLPPYSPVFKSWIHCWKYLSVQGQLFRGSSLLFRRVSSGSCFALE	26692	40883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_26758_30244_30352_30755_30834_31219_31278_31645_31698_33137_33198_35956_36051_38173_38222_38390_38459_38928_39005_40039
839936	contig_7993_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_170954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	35	412	16712	17089	NA	50	GGAATTAGTCAATAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKV	16677	17437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_16700_17400
839937	contig_7976_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_169421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTTAATACCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871311	871728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_871300_871700
839938	contig_4659_pilon	+	1377	3	Intergenic	novelGene_118176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCATTCTGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105714	110121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_106483_108451_108573_109633
839939	contig_12107_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_176738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATAAAATGGGGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38693	37900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_37900_38700
839941	contig_6496_pilon	+	1019	3	Intergenic	novelGene_103470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	3.5	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	253	732	148763	152360	FALSE	30	AATAGCAGTTGTTGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFLRAVQHAEKLHRATGARLFGPRLVFNKACLNTEPGLKWGPPEQNKTLLPRGILGLTRRTIWTQGQGLRRAKEDGSKQVSVHRSPRGETDVSTSQKVKEAGRDFTYLIVVLIGISITGGLFYVIFRELFSSSSPSKIYGKALEKCRSHPEVSSQV	148510	152647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_149064_152081_152145_152244
839943	contig_14060_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_156062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAAATCATGGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155661	157816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_155700_157800
839945	contig_12920_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_166329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGATTTAATGAGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78888	79836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_78900_79800
839946	contig_4422_pilon	+	1092	2	Intergenic	novelGene_155957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	31	528	139457	141695	FALSE	15	TTTGTCTCTTTATTTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVSALLNAVMAPNAPCLCVNVHSEERKLMTFTANKDDRVKKISEHIRSKTKVPVRDQILLLGSKTLQPQRKLSSYGIDKEKTIHLTLKVVKPSDEELPMVLVELRDEGQRHLLQVRRSSSVAQVKKMIEVKTAITPETQIVTCNGKKLEDGKIMADYGIKKGNFLFLTYHCIGG	139426	142259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_139484_141224
839947	contig_7342_pilon	+	803	2	Intergenic	novelGene_71137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	112	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	233667	266296	FALSE	15	CTTTTGGCAGTCCATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHRRRHRDCSRGDCYLPTGTNTQQPPPPPREPLPELLARTPDPRVLLQGSLPRCPVPGQLRLICTPEIDDHLKTRKIPSLPETAEAPPGGPSTCRPENENSAFETVSQPDYWPRTFLLH	233666	266736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_233794_266060
839949	contig_3469_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_34191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTTAAAAAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472264	470493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_470500_472300
839951	contig_3382_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_124074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	215	337	336728	336850	NA	60	CTTTCGTAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRDKVVLDDWSSNQVTARASAHSFSPQSRVLTDICSCSAGRNRSLGRHWVTKHGVSTLHEERQPLRLLVVMTFGGELVQLLYFWGSHSLPRESSPGRVLKQQSGVQPQIR	336513	337161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_336500_337200
839952	contig_5210_pilon	-	1540	14	Intergenic	novelGene_65485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	228.081476151207	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	183	1070	1162890	1107344	TRUE	15	TCCGGCCAGGTAGCCGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEEQFALALKMSEQEAREVNSQEEEEEELLRKAIAESLNVVASLLMPLLPALDLLPLDHLHSSTKRKPQTLGPLKACIWQLVPPSLFKGSHISQGNEAEEREEPWDHTENTEEEPVSGSSGSWDQSSQPVFENENVTCFDRCTGHLAEHTQCGKLQSSQGLFVEETSEEGNSVPASQSIAALTSKRSLVLMPESSAEEITVCPETQLSSSETPDFEREVSPSSRETPDEVRIIMADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAIIDSETKRGQEQEQE	1204062	1101211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141856_1141979_1147997_1148102_1152584_1152662_1154692_1154758_1161383_1161623_1161926_1162037_1162765_1162893_1173672_1173761_1203970
839954	contig_14519_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_66849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATTGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419060	419353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_419100_419400
839955	contig_5727_pilon	+	739	2	Intergenic	novelGene_7935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTTCCAGTATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131044	131826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_131215_131257
839956	contig_17108_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_109536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGACTCTAAGCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86654	85907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_85900_86700
839958	contig_12969_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_61700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCAAAGGTTGTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598940	599259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_598900_599300
839959	contig_12969_pilon	+	760	5	Intergenic	novelGene_61704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	49.7210971319017	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	315	689	605418	612136	FALSE	15	TTCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKDVMLENYNSLVSVGCQGTKRDSVFELEQGETPWIVEGAVHSQTSPDKIKQARLRNRDGRREMPSRVKIAQEDKLKRDKDLPPELTEEAFR	599259	612207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_599389_605232_605433_608508_608636_608880_608977_611999
839960	contig_9177_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_32751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACAGAGAGCATACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234017	1234687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1234000_1234700
839961	contig_4505_pilon	+	1362	3	Intergenic	novelGene_176035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	250	1155	84013	86722	FALSE	35	CTCCCCTGTTTTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGLPYRIASFWGLLPFWMLCVSSANKCAIRHEVADCSHLKLTQVPDDLPTNITVLNLTHNQLRRLPPANFTRYSRLIVLDGGFNSISKLESELCQKLPLLKVLNLQHNELSHLSDKTFFSCVNLMELHLTSNSIQKIQNNPFKNLQNLIKLDLAHNGLSSTKLGTGLQLENLQELLLSNNKIHALRREELDFLGNSSLKKLDLSSNQIKEVRSEVTFVCVFVWVLPLNIEFLTVSQRQESKDPRGRNSKPCPVHQGSFTLMLGPVVQSYRREYGKWLRAGALLPHRSGLRAPFHHRPVL	72501	86929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_+_72743_84004_84457_86260
839962	scaffold_16539_pilon	+	967	4	Intergenic	novelGene_68401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	512	811	795683	796068	FALSE	30	CCATAGCAACCCAGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPTTFQPLLPTGPTPHLPLPVPNPNLDIDILVKSIHLIQQLQQDPLHLPVSPSLGIESLGGDGIYLVYEDDGRCVLLGQAEHVPHHAGALTQVLLYKL	794786	796224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_795031_795185_795240_795469_795838_795923
839963	contig_5084_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_64470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCTGGGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49004	49598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_49000_49600
839964	contig_5485_pilon	-	535	5	Intergenic	novelGene_37777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	176.531866811633	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGAGTGTGGTTAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652053	638639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_650867_651017_651981
839966	contig_6048_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_73133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTAAGGGAGAGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970609	970119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_970100_970600
839968	contig_6442_pilon	-	1765	2	Intergenic	novelGene_166485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	140	1168	318184	300863	FALSE	65	AAACAAAACAAACCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIERDPSRDDLPLMANTSHMLVKHYILDLDVDFKRHVIEGTIVLFFESGNGLKNWGSSSEETSPSESNEVHEFRTLEPYHTPVTNTRTFSSKMGYNDTTTCSKGEKATSDKDDNHDNREQASGISSSQCCCDPGNHGSEDFLLVLDCCDLSVLKVEEVDVAAVPGIEKYTRSPQLTVVSEELRNQIVHEIVALPADRWREQLDCYARCSQAPGCGELLFATDTWSLQIRKTGAQTTADFPHAIRIWYRTKPEGRSVTWTSDQSGRPCVYTMGSPINNRALFPCQEPPVAMSTWQATVRAAASFVVLMSGENSAKPTQLREGTVHVFFAYLCIAHMLDPGTQ	318323	300265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_-_301095_317387
839970	contig_12278_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_152595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGAAAAAAGAAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192936	193409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_192900_193400
839971	contig_3721_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_123819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTATTGAGTAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166623	168684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_166600_168700
839972	contig_2414_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_158516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGAAGCGCAGCGTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523211	525392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_523200_525400
839974	contig_13292_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_142975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAATATAGTCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547876	548546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_547900_548500
839975	contig_13292_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_142976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACAAGAAAATTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548546	548791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_548500_548800
839976	contig_18895_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_176801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	136.897772078292	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	65	571	55766	50315	FALSE	40	ATAAAACTGGCAACTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRSGGRVRRRWSRPSASVGEMASNYHTSLDQWKKRAAKIELNETQKQEIKEAFDLFDVDGSGTIDVKELKIAMRALGFEPKKEEIKKMIAEIDKGRTGTISFEDFFAIMSVKMSEKDEKEEILKAFKLFDDDDTGSITLSNIKRVAKELGENLTDDELQEMLDEADRDGDGEINEEEFLRMMKKTSLY	55830	49881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18895_pilon_-_50405_50583_50722_51373_51503_52070_52218_55763
839977	contig_10494_pilon	-	1707	9	Intergenic	novelGene_102121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	35.6896343494858	1	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	397	1332	153617	144239	FALSE	15	TGGACTGGTCACGAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPTPRSGCQISVTAQGSIIIYGGYSKQRVKKDVDKGTLHSDMFLLKSEDGREGKWAWTRMHPSGAKPTPRSGFSVAMAPNHQTLLFGGVCDEEEEETLEGDFLNDLYFYDTARNRWFAGQLKEPKTEKRKRRRGRKGELRGSDEQAGEEPSPQEPLEVVRKVTTEDGTVITIKQVLPAPGVAGRPPSKDEDDDGAEEAGASLVAPCPRSSAMLAVKHGLLYVYGGMFEAGDRQFTLSDLYCLDLQKMDGWKALVEMDPDTQEWLEETDTEEEGDEVEDGDDDKEEEDTGEGSSEEGSVLMGPRAGEAILA	182012	143863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_144280_147661_147779_148662_149072_149922_150132_150988_151065_153533_153694_156981_157055_167871_168009_181902
839979	contig_8651_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_168157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTTTCTCATTAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17079	15893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_15900_17100
839980	contig_990_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_76013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATTGGTTTCAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472846	473717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_472800_473700
839982	contig_11253_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_126814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24536	25491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_24500_25500
839983	contig_4884_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_63801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCACACTGGTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259351	259892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_259400_259900
839986	contig_14953_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_137288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAGTTTACTCTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281372	281739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_281400_281700
839988	contig_10064_pilon	+	806	2	Intergenic	novelGene_122724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	372	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATTCAGAGGGTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395833	404722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395991_404073
839990	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_114050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	27	341	14409	13872	FALSE	20	GTTTATTACTGTCAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14435	13871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
839991	contig_12479_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_56865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTTCCTTGAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461180	461560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_461200_461600
839992	contig_12479_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_56866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTCAATTTTTGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461608	462317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_461600_462300
839993	SIRV6	+	412	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	442	2	269	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATCTGCAGTCAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1572	2538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
839994	contig_9239_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_137171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCACTTAACTGACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144280	145127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_144300_145100
839995	contig_1172_pilon	-	1416	3	Intergenic	novelGene_162033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCCACTGTCATGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633868	619081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_620286_633422_633489_633722
839997	contig_14666_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_39547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCCTCTTTTGTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451714	452491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_451700_452500
840000	contig_13014_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_169343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGGCATAAAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385684	385031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_385000_385700
840001	contig_6005_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_158897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTTGCATCTAATTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324778	324198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_324200_324800
840002	contig_762_pilon	-	1158	6	Intergenic	novelGene_135948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	39.540359128364	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	267	659	259754	256695	TRUE	45	GCGAAACTAGTTTATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGEEPRRRLVLIDTRYLSWIHDEM	266702	255284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_256905_257514_257668_259724_259833_263903_264056_266666
840004	contig_8453_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_125109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATGTATCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71435	72115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_71400_72100
840006	contig_13295_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_31217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAAAAAGAACCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58513	57362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_57400_58500
840007	contig_12837_pilon	+	599	3	Intergenic	novelGene_57287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAGTCTGTCGTCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60966	75788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_60982_64986_65093_75310
840008	contig_6795_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_27720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAGTACACTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259685	260982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_259700_261000
840009	contig_2757_pilon	+	1934	7	Intergenic	novelGene_164565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	0.942809041582063	7	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	174	1205	14583	20512	FALSE	10	CCAGGGTTGTGTCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCRRLCLGLGFCLLAGVGLCVLWVYIENWLPASYVPYYLPCPKIFNMKLQYKGEKPFQPVAQLHYPQPKLLEQRPTQLLTLTPWLAPIVSEGTFDPMLLQNIYQPLNLTIGLTVFAVGRYTGFIQHFLESAEMFFMHGYHVYYYIFTDDPAAMPHVPLGPGRLLSVIPIQGYSRWEEISMRRMETISQHIANRAHREVDYLFCLDVDVVFRNPWGPETLGDLVAVIHPGYYAVSRQQFPYERRQVSAAFVEDNEGDFYYGRAVFGGRVTRVYEFTRGCHMGILADKANGIMAAWQEESHLNRRFISHKPSKVLSPEYLWDDRKPQPPILKLIRLSTLDKGTK	13429	21241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_13573_14552_14654_15196_15263_17490_17542_17622_17659_18710_18846_19839
840010	contig_3942_pilon	+	397	4	Intergenic	novelGene_128649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1401.20051701706	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	92	346	179125	180067	FALSE	20	TGATGGGGGCCCAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRYSRSPPLRVKNFGIWLRYDSRSGTHNMYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHDSKIKFPLPHRVLRRQHKPRFTTKWPNTFF	176958	180118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_179040_179177_179714_179825_179974
840012	contig_20875_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_153098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGCCTGAGAGGGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54027	53135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_53100_54000
840013	contig_19402_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_80835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGAGAGGTTAAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138822	136965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_137000_138800
840014	contig_7704_pilon	-	708	8	Intergenic	novelGene_154602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	173.585243424359	42	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	320	652	220403	216744	FALSE	0	GGCTCCTGCTGGGTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQPPGPPQRKKFIIPLDEDEVPPAGRGNPVLKFVRNVPWEFGDVLPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHQRLQSLGKNFALRVLLVQVDVKDPQQALKELAKMCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	230275	216687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_230196
840015	contig_11017_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_128088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248455	247786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_247800_248500
840016	contig_1275_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_108772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAGACTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418335	419826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_418300_419800
840018	contig_12270_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_113672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	11	343	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14419	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
840019	contig_3815_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_177128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACACCTGGAATCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36021	37382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3815_pilon_+_36000_37400
840020	contig_6958_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_70012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCCCGGACCAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757365	758532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_757400_758500
840022	contig_7870_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_109081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGAAAAGAGTCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771170	770724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_770700_771200
840023	SIRV6	+	334	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	36	337	-36	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCGTTGAAGCCGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
840024	contig_2332_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_58636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGAAAAAGCAGATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160004	161580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_160000_161600
840025	contig_6556_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_168504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCAGGGGTCATAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334748	336568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_334700_336600
840026	contig_7379_pilon	+	945	10	Intergenic	novelGene_150028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACACCCCAAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536764	569868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_536865_537340_537477_540872_540961_542466_542521_544759_544853_547847_548008_549695_549788_551757_551825_553211_553326_569827
840027	contig_3602_pilon	-	194	3	Intergenic	novelGene_60582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	14	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGGGGTCGAGGAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675710	657585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_657623_674379_674442_675615
840028	contig_8354_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_24115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	49	447	241880	242278	NA	55	CTCAACTTCCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQVLFDRQNKKYHWLGFGQWAAVLQPLVYMVTVLVLDYATLRCKSFSSYNTDYDNWGLSVLNQDPNWNSSVTHISLLLVSASCRCPHICISQEASTDLTKSKSILIVVRTRVLLFNQIIQIFLILHYRPFI	241831	243869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_241800_243900
840029	contig_10609_pilon	-	1115	4	Intergenic	novelGene_123895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.88561808316413	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTATCAGAGTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12472	5085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_5891_11041_11195_11773_11835_12376
840030	contig_10734_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_51400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACAAAACAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2044563	2043737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2043700_2044600
840032	contig_9185_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_166876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGGCAGAGGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35715	35019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_35000_35700
840034	contig_15354_pilon	+	771	6	Intergenic	novelGene_65734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	118.856215655724	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	118	696	591728	600633	FALSE	25	TATGAATCAGTGTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTEPPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQVIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVLNGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRECVRVPRGGSPTGKRMR	590989	600708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_591056_591676_591782_598174_598394_599232_599337_599700_599874_600604
840035	contig_675_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_136345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTGAACCTTAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145929	146433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_145900_146400
840037	contig_10868_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_173895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTATTTTTTTATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460980	462702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_461000_462700
840039	contig_11986_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_69100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACGCTCAGGGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48566	49771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_48600_49800
840040	contig_4654_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_103107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAGGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509974	509462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_509500_510000
840041	contig_16647_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_170307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGTAAATGGTACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302307	300328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_300300_302300
840043	contig_13607_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_170201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311057	309776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_309800_311100
840044	contig_4565_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_174704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGGTCTGGAAACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244531	243914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_-_243900_244500
840045	contig_3727_pilon	-	1096	7	Intergenic	novelGene_146762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCACTCGTGGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546051	527456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_527683_536755_536782_537352_537470_537987_538106_538333_538457_538645_538779_545698
840046	contig_5959_pilon	-	1708	4	Intergenic	novelGene_150195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_3	134.514765814844	1	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1107	601	1707	216308	211905	FALSE	85	AAGAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218739	211903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218222
840047	contig_12672_pilon	+	653	4	Intergenic	novelGene_141487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_2	9.62635271879577	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	41	361	185964	188070	FALSE	20	AAGCCTTTAGCCTTGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKPKKENIVAFDEMIEPYRLHEDDKEQDIADKMKEDEPWLITDNELELYKTKTYRQIRLNELLKEHSSTANIIVMSLPVARKGAVSSALYMAWLEALSKDLPPILLVRGNHQSVLTFYS	184494	188362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_184516_185944_186081_186389_186458_187934
840048	contig_7744_pilon	+	1031	7	Intergenic	novelGene_62470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.58292879305582	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	239	865	455930	460938	FALSE	5	GCCAGCCTCCTCTGCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVPVSMVIINEAKGSRTILHAYRNLPDVSAKDFEKVDLTRFKWIHIEGRNASEQVKMLQRIEQHNARQPPEQKIQVSVEVEKPQEELFQLFGYGDTVFVSKDVAKHFGFWSSAEALRGLYGRVRKGATLICAWAEEGADALGPDGQLIHSDAFPPPRVVDTLGAGDTFNASVIFSLSQGKSIQEALRFGCQVAGKKCGLQGYDGIV	453741	461104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_453833_455782_456004_458201_458275_458966_459114_460376_460466_460608_460767_460852
840049	contig_10163_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_82655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGAAGGGGAAATCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192087	192641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_192100_192600
840050	contig_10163_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_82656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192941	193546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_192900_193500
840051	contig_11017_pilon	-	1230	9	Intergenic	novelGene_128067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	8.37779804005802	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	69	668	213402	167267	FALSE	5	GTTTGTTTTATTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFIIGIGGVTNGGKTTLAKNLQKHLQNCSVISQDDFFKPVSEIETDKNGFLQYDVLEALNMEKMMSAISCWMESARHSLLSTDWESAEEIPILIIEGFLLFNYKPLDTIWNRSYFLTVPYEECKRRRSTRVYEPPDPPGYFDGHVWPMYLKHKREIEDITWEIVYLDGTKSEEDLFSQVYEDLIHELAKQKCLQVTA	233363	166704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_167287_181076_181161_187633_187741_188368_188441_188518_188667_192927_192977_193270_193362_213373_213437_233329
840052	contig_6410_pilon	+	900	4	Intergenic	novelGene_108626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	33.1092467782374	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	122	658	300693	307207	FALSE	40	TACCTAATACTCCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLVRACGCQEHSLACTSCHAGRQWGDGAWRRTAEVPRSGPGVQTLLSRVGCVSQVQLSYRNLLLVALPIRHGMGWCPRDGPRHAGMTQ	299810	307449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809
840053	contig_8258_pilon	+	991	4	Intergenic	novelGene_130444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	36.3348623531481	46	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	300	635	25390	51135	FALSE	25	GTTTAAAATGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNKEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK	25090	51491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_+_25494_32383_32475_38822_38949_51120
840054	contig_6276_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_174118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGATGGAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105729	106731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_105700_106700
840056	contig_13901_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_146628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTTATAAAAAATCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74891	74012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_74000_74900
840058	contig_6443_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_175148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACAGTTCTACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433522	432022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_432000_433500
840059	contig_5643_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_38915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAACTTTAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346461	344735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_344700_346500
840061	contig_8228_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_81784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAGAAACAGTGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122162	121787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_-_121800_122200
840064	contig_13547_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_104858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33848	35460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_33800_35500
840065	contig_405_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_135285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGTACAATGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126693	125897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_125900_126700
840066	contig_405_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_135284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAGTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125797	125171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_125200_125800
840067	contig_10319_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_147239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATGTACTTGAGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56741	55621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_55600_56700
840069	contig_11978_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_62977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTGTGCGGGCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476141	1474294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1474300_1476100
840070	SIRV6	+	432	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	335	0	169	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
840071	contig_5039_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_64903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	627484	627885	NA	55	AAGAAAGGCAGTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRLQSLGQWELEGPRFQSLGQWELEGPRFQTRCSVCFPSCFYFLSKRHF	627481	628863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_627500_628900
840072	contig_8616_pilon	-	766	8	Intergenic	novelGene_72453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.7284976795578	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	70	612	274294	271216	FALSE	15	TGGAAGTGTTATCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTVDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGFLPCLVVIQEA	274363	271061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_271254_271486_271521_271722_271795_271904_271971_272093_272145_272904_273065_274039_274150_274282
840073	contig_14666_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_39662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1250	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492455	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488902_490422_490532_492333
840076	contig_15273_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_140447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184050	185194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_184000_185200
840078	contig_6871_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_21600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCCTCCCTACTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384310	386067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_384300_386100
840079	contig_14814_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_137728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1166	1507	328220	327879	NA	15	AGCAGGTTTTTCAGGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGLPGANTCPATIKDGPEPVGTGLSAFTHPSNPWVFQLLRRVYAGVLLQNTWGHRQPTALEAAPSLRVAGTIAVVGQLLQPPCFTSIPGGGTNGSVMTGSTVAHRRPHAL	329385	327290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_327300_329400
840080	contig_7230_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_52518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTAATAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9445	7759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_7800_9400
840081	contig_3817_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_78395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGGCCGCCGGGCTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196738	1198459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1196700_1198500
840082	SIRV5	+	433	6	ISM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	7456	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTGTAGAAAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	3535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
840085	contig_12464_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_68670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGTGCTGGTCTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150808	150254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_150300_150800
840086	contig_11292_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_109426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTCTCTCTCATGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223190	223583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_223200_223600
840089	contig_13664_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_144201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATAATCATTTTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87648	88136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_87600_88100
840090	contig_4079_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_167472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGTTAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119247	120299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_119200_120300
840091	contig_3529_pilon	-	910	4	Intergenic	novelGene_105340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	489.988662000346	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTTTGTGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550535	525452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_544822_544892_550497
840092	contig_7411_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_137036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	40	387	434788	435135	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITVKKTVWGSSAQSRGVSMNQNQLDGTQQRWVDCNDHICSCFVDAHFPVNCLIFGVSFSDVNMNSCSEEPDLDLRDVGAGCGRVWGQLTQKLHSRFLLSLDSGNLWGLDASVLL	434748	435509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_434700_435500
840093	contig_5816_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_158276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433041	434089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_433000_434100
840096	contig_7426_pilon	+	1117	9	Intergenic	novelGene_27525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.0964102531543	115	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	150	701	1028634	1032123	FALSE	25	CATTCAGAGTCACTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAYLFLLVLPAGLLAQGQYDVDPLPPFPDHVQYTHYSDQIEPPDYYDYQEVTPRPPEEQFQFQSQQQVQQEVIPAPTSEPGSPETEPTEPGPLDCREEQYPCTRLYSIHKPCKQCLNEVCFYSLRRVYVINREICVRTVCAHEELLRADLCRDKFSKCGVIASSGLCQSVAASCARSCGGC	1028002	1032539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1028114_1028595_1028671_1029855_1029946_1030151_1030179_1030265_1030353_1030536_1030582_1031433_1031522_1031736_1031811_1032019
840097	contig_5200_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_140165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACACCTCTTCAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349586	347541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_347500_349600
840098	contig_3334_pilon	-	1063	7	Intergenic	novelGene_137675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	178.296958907199	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	3	1049	778618	733461	FALSE	5	TCTTTATTTTTTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHYSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHARIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQIAMQNQINTNPESPDTVTIHAATPQFIIGPGGVVNLTDETGVSAVQFGNSSTSVLATLAALAEASAPLSNSSETPVVATEEVVTAESVDGAIQQVVSSGGQQVITIVTDGIQLGNLHSIPTSGIGQPIIVTMPDGQQVLTVPATDIAEETVISEEPPAKRQCIEIIENRVESAEIEVRSLLPGVFCRSHQK	778620	733446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_733625_738712_738899_756283_756398_756777_756890_761716_761912_763122_763291_778510
840099	contig_8820_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_79310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250654	249773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_249800_250700
840100	contig_11417_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_103335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTGTGTTTTTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588471	588850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_588500_588800
840101	contig_3942_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_128830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCTGAGCTTGTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201119	1200267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1200300_1201100
840103	contig_14954_pilon	-	888	8	Intergenic	novelGene_165172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_7	27.2501638265062	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	54	836	61697	59088	FALSE	20	GTGCAAAGCTCTGTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARRSRPRYTRDSKAYSMILLPAEEEEAALGDRPDKRRPLERRDTELAPSFEQRVQVMLQRIGVSRGSGGAEGKRKQSKDGEIKKAGSDGDIMDSSTEAPPISIKSRTHSVSADPSCRPGPGGQGPEPASWKTLGQQLNAELRGRGWGEQDGPGPPSPCPSPSPRRASPSPDSLGLPEDPCLGPRNEDGQLRPRPLSAGRRAVSVHEDQLQAPAERPLRLQRSPVLKRRPKLEATLSPSLGPGSGAKPLPPQPTEPSSPEQSLPSPATDQRGGGPKP	61750	59035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_59201_59288_59367_59686_59768_59894_60117_60234_60307_60456_60494_61436_61560_61640
840104	contig_5331_pilon	-	1034	3	Intergenic	novelGene_112826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.5	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAGGAAAATAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751882	739904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_740573_740981_741213_751747
840105	contig_5602_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_133037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	181	486	600642	600947	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKPTILDKVTLITGSNLYELCEQIKPLLSEVFSTACVAFRNRASAPSLTSLSFSHTAFFLFLDYVHLDPTPGLLSAVLWVSLSQVAHSILIHVCAQEDLL	600461	601957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_600500_602000
840106	contig_10023_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_123499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	333	1074	1406	260761	261093	NA	35	AGCTGGACTCCAATCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALENLSAQSYSLNVHSDLPKTTRPSKSSSLTLTRRDRQPHCPPVGRPAQRGLRVERVEKQSVAKNPAVFAGGTSFPQDTLQSLRSSVSAAFRAEANLVTSPSLTRAWLLG	259687	261094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_259700_261100
840108	contig_14682_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_139096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATAAAAATAATATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81815	81268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_81300_81800
840109	contig_7197_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_177265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	60	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGTTTTAAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7317	10434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7197_pilon_+_7435_10193
840111	contig_14142_pilon	-	1028	11	Intergenic	novelGene_120603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	144.792299519001	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	18	698	598441	585553	TRUE	30	TTTCCTTCATAAGTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQQPEMTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMACLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQRACS	598458	584547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585568_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592201_592411_592532_597758_597817_598388
840112	contig_8558_pilon	+	949	5	Intergenic	novelGene_123154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_3	42.3024821966749	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	314	673	435273	527687	FALSE	75	AAATTAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKRVFGQTTIHQQIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTAIDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAVSCKQFALIKQFILSGVSSVNK	390327	527963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_390448_426563_426618_435133_435277_507338_507479_527471
840113	contig_5502_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_154992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAAACGAAAGCCCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413830	413447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_413400_413800
840115	contig_5588_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_172835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGAATGTGCTGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942558	941284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_941300_942600
840116	contig_11227_pilon	+	625	2	Intergenic	novelGene_163221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	165	497	512456	526189	FALSE	40	CAACTACTAACCTAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTEVRFMVSIMSGASSKLALFLFGCYVAALGAHTGKHRVAEHRMAEHHVAEYYVAAVYEHQSILSPDPLALTSRKQALELMNQNLDIYEQQVMAAAQKARSAPPCNMS	512291	526317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_512476_525876
840117	contig_6654_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_85782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCACAAATGTTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996824	995552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_995600_996800
840119	contig_8322_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_143229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224006	224293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_224000_224300
840120	contig_10074_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_57219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAGCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706819	709010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_706800_709000
840122	contig_4689_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_165407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	37.5	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGAGGGGTAATATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091954	1085374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1086253_1086632_1086743_1091691
840124	contig_2854_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_120874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCACCGGCCTTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019234	1021064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1019200_1021100
840125	contig_4845_pilon	+	1666	3	Intergenic	novelGene_53618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	185	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	81	431	205637	206209	FALSE	25	CCCTGCAAGTAGGGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGKGSSGRARFLFSFCRVRLWGTGLAMDPLSELQDDMTLDDTSQALNQLKLTSIDEKNWPSDEMPDFPKSDDSKCSSPELVTHLQWDDPYYDIARHQIVEVAGEHSQHCTLFLTGEASPSCHGEGDWCGSRCPELLSTGAVL	202023	207444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_202055_205587_205770_205991
840126	contig_4884_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_63794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCAAGACAAGGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228141	219584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_219748_227774
840127	contig_14519_pilon	-	955	5	Intergenic	novelGene_66826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_3	170.197679185117	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACTTAAGAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287169	280507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_280995_282023_282140_282222_282309_283632_283842_287112
840129	contig_10437_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_38372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGTATGTAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565277	566049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_565300_566000
840130	contig_16029_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_163759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATATACAGCACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19094	19522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16029_pilon_+_19100_19500
840131	contig_11846_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_105999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCAACTCATAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408791	407961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_408000_408800
840133	contig_9070_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_171953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACTTTTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158966	159541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_159000_159500
840134	contig_12050_pilon	+	1003	9	Intergenic	novelGene_62637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	246.19882082374	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	150	728	359783	363452	FALSE	10	AGCTGGGCTGGATCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASLRFTLPGTEGAAKQENFILSSCGTDQVKGVLTLQGDALSQADVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAELMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYQLHVLQPSSTKNFRPAGGAVLHSPGAEWGSQRLEVSHVHKVECVIPWLNDALVFFTVSLQLCQQLKDKISVFSSYWSYRPF	358744	363727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_358824_359050_359106_359767_359849_360750_360838_362084_362184_362571_362686_362766_362811_362918_363046_363410
840137	contig_6710_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_98055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653741	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
840138	contig_10500_pilon	-	1168	8	Intergenic	novelGene_41165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	136.532421207625	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	60	713	1290675	1278024	TRUE	50	GAATTAGAAGAAATAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAAGPNAGLPRTGSQDGAMRRSKADVERYIASVQGSAPSPREKSMKGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVQERDPKAHRFLGLLYELEENIDKAVECYKRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPTIYKLKEQLLDCKGEDGWNKLFDLIQSELYARPDDVHVNIRLVELYRSNNRLKDAVAHCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKRCAGM	1290734	1271859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1272107_1275639_1275833_1278008_1278042_1278499_1278731_1282879_1283033_1283520_1283633_1284886_1284955_1290603
840140	contig_5499_pilon	+	1209	10	Intergenic	novelGene_57015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	248.566755819771	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	562	1209	818258	835507	FALSE	20	AAGGTAGGTGCTCCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLAN	803445	835507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818105_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345
840141	contig_3721_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_123813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACATACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118400	118034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_118000_118400
840142	contig_9682_pilon	-	1006	5	Intergenic	novelGene_125320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.8423695919137	470	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAAGTCTTGCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604232	579429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_580019_582184_582304_595229_595276_603710_603857_604126
840143	contig_2890_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_60271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGGATGGAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272050	271033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_271000_272000
840145	contig_16109_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_80318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGGGGGGCAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130047	129596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_129600_130000
840146	contig_6589_pilon	-	993	9	Intergenic	novelGene_26189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	103.661031130314	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	42	950	1950197	1936442	FALSE	5	CCGACGTGTGGCGCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHGKNCTAGAVYTYHEKKKDTAASGYGTQNIRLSRDAVKDFDCCCLSLQPCHDPVVTPDGYLYEREAILEYILHQKKEIARQMKAYEKQRGARREEQKELQRAAAQDQVRGFLEKEAAIVSRPLNPFTPKAASSGNGPDDAQPGPSAGPASKDKDKALPSFWIPSLTPEAKATKLEKPSRTVTCPMSGKPLRMSDLTPVRFTPLDSSVDRVGLITRSERYVCAVTRDSLSNATPCAVLRPSGAVVTVECVEKLIRKDMVDPVNGEKLTDHDIIVLQRGGTGFAGSGVKLQAEKSRPVMQA	1953415	1936398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1936514_1936951_1937061_1937166_1937355_1937504_1937624_1937714_1937878_1941840_1941923_1949540_1949647_1950127_1950199_1953375
840147	contig_960_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_108208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATACGTACTGATTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262831	258940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_259998_262767
840148	SIRV6	+	361	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	349	57	183	-57	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACGCAATAGAGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486	2063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
840149	contig_19974_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_130467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGGTGTCATGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149658	149223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_149200_149700
840150	contig_2069_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_23554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGGACTTAAGAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645098	1646862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1645100_1646900
840151	contig_5791_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_35815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGATAAGAGACAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355069	356899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_355100_356900
840153	contig_10732_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_114686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAAAGAGAAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80387	81838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_80400_81800
840155	contig_533_pilon	-	836	3	Intergenic	novelGene_174255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	82	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACAGTTGCATCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130905	127835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_-_128163_129542_129687_130540
840156	contig_7530_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_141840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	501	812	189754	189443	NA	60	CACTATAAAATATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGLFTAINLHDISHIRLLVGSQIAAEMREAIYNQLGLTGCAGVASNKLLAKLVSGIFKPNQQTVLLPESCQDLIHSLNHIKKMPGKTNIFEKYLIGFIVFV	190254	188247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_188200_190300
840158	contig_13865_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_122741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATCTTATATTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31748	32568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_31700_32600
840159	contig_7816_pilon	-	189	1	Intergenic	novelGene_66479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTCCAGGCTCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169869	169680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_169700_169900
840160	contig_7816_pilon	-	1869	2	Intergenic	novelGene_66478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCACGCATGTATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169730	166116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_167779_169523
840162	contig_5889_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_133668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACCCCTGCCTCCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5030	4037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_4000_5000
840163	contig_11978_pilon	-	400	3	Intergenic	novelGene_63027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	3899	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCCAGTGCTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595965	1591855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890
840169	contig_8683_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_150274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723276	722515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_722500_723300
840170	contig_17936_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_29889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTTGGTTGGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47774	46429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_46400_47800
840172	contig_10861_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_39196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAATGAAATATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345286	346892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_345300_346900
840173	contig_13412_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_80020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACTTGAATGTTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467402	466184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_466200_467400
840174	contig_5942_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_177364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAGGGAAGGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52623	51992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5942_pilon_-_52000_52600
840178	contig_6589_pilon	+	587	4	Intergenic	novelGene_25793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2195.08830498153	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	147	497	669670	672754	FALSE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGVAVFTGALIYAIHSKEILKHHPPGGSFGYCFALAWVAFPLALASGIIYIHLRKRE	668536	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668562_669548_669748_670000_670104_672584
840179	contig_9571_pilon	+	961	5	Intergenic	novelGene_136311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	24.1091269024824	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTACTGTGCCAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592821	602520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_596578_596678_600426_600593_601528_601830_602258
840180	SIRV5	+	384	5	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	-1	-193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCCCGCAGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	3405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2048_2126_2157_2270_2316_3298
840182	contig_8354_pilon	-	1171	6	Intergenic	novelGene_24097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_5	107.059983186997	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	59	670	198044	187880	FALSE	15	CATTGTTTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVTAARRRDFCCENYQWHFMMGDILAHESELLALVREYLDFAEFQDTLKTFSKECKIKGKPLSKAAGGAFRDSTSLIIQKDLIAAFDSGDQKTFFHLWKEHVPTSIRDGDALAQKLEFYLHIHFAIYLLKHSIGRPDKEELDERISYFKTYLETKGAALSQTTEFLPYYALPFVPNPMVHPSFKELFQDSWTPELRLKLEKFLALIFKASNTPRLLTLCVSF	203436	187378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_187985_189565_189722_190261_190433_195734_195861_197990_198079_203412
840183	contig_2450_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_160296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTCATGTGGCCCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180396	178114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_178100_180400
840184	contig_6228_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_164485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGCTAAGGTTTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152013	151443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_151400_152000
840185	contig_6914_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_151770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAAAGAGCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995217	995473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_995200_995500
840186	contig_3942_pilon	+	622	3	Intergenic	novelGene_128604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	14	237	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	304	519	67856	69366	FALSE	5	CTGTGGCCTCCATTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLASGDRANRSVSSLCEPGDKAARAPLSRKASIPKTTTRGPPGAAGSRLVRSAAPPGNPVYLDLAYLPSGSSARLVDAEFFRRVRALCYVISGQDQGKEEGMRALLDALLAGKQQWDRELQVTLIPTFESVAMHEWYQETHARQQALGLTVLGSNSTVAMQDETFPACKVEF	64020	69469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_64148_67679_67916_69210
840188	contig_405_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_135320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCTGAAGGAACAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485478	487316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_485500_487300
840189	contig_5889_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_133670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATGGGGTTTTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13671	13297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_13300_13700
840190	contig_1301_pilon	+	909	8	Intergenic	novelGene_47338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGTGCTCCCTGACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284708	322886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_284903_292185_292272_296659_296765_296921_296992_297694_297762_305263_305408_309751_309901_322792
840191	contig_9429_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_155107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTATGTTAAGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102850	101231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_101200_102800
840192	contig_2062_pilon	-	607	5	Intergenic	novelGene_139025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	179.694880283218	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTCCCCTCTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174311	1165198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1165425_1165606_1165654_1168065_1168095_1168937_1169119_1174187
840193	contig_15236_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_141629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGGCAAAGCCTGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629821	631428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_629800_631400
840195	contig_16098_pilon	+	1280	4	Intergenic	novelGene_46169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	22.196095752782	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	810	471	1280	510042	511287	FALSE	65	AAAAAAGAGAGTAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDSGMQEFTRSLFRGRPDLSTLTHSIVRQRFLAHVGRDHLEPEEKQALKRLVEEELLKMQVDEAGTRKKLDLTKKVKRPPISSSEPERKRFRLNSESELSSAASSPDCFGSSAKNRMAAAEVSPAEKSPRRASKKAMESRDEEEQQRDPTAKMGLEEVVKDSSEEEEEESSVKTSKVWKEESSEEEEEKEEEKKEEFKGRTRKKMMTKKDKQTLGKASVSRKQAKEESEDSEEPAQSMGRKGEGKKGTRSHQESEKESDNDKEEIPAM	509571	511287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_510107_510184_510306_510415_510528_510775
840197	SIRV3	-	622	4	NNC	SIRV3C	novel	796	3	NA	NA	49	-52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTAACTCTCGCTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9865	8849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_8976_9189_9299_9434_9761_9804
840198	contig_13558_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_123022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGGCCTGGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66537	67257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_66500_67300
840199	contig_854_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_36305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCCCCCCATCCCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555339	554038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_554000_555300
840200	contig_5201_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_82187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTACACCTGTGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333212	332551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_332600_333200
840205	contig_10196_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_132199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAGTTTTACTGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184908	1186857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1184900_1186900
840206	contig_7171_pilon	+	922	7	Intergenic	novelGene_101258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	75.5527777267138	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	37	912	869817	876869	FALSE	5	ACCCTGTCTCTCTTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVNGAPGASSSAASGAVLQAAAGMYEQLKGEWNRKSPNLSKCGEELGRLKLVLLELNFLPTTGTKLTKQQLILARDILEIGAQWSILRKDIPSFERYMAQLKCYYFDYKEQLPESAYMHQLLGLNLLFLLSQNRVAEFHTELERLPAKDIQTNVYIKHPVSLEQYLMEGSYNKVFLAKGNIPAESYTFFIDILLDTIRDEIAGCIEKAYEKILFTEAARILFFSTPKKMLCQPAAEARRHHHSLHRAGQTGHRVCPAVGDDRLSPLGTELGWGVRYLKQLWCRVVLQ	869780	876879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_869979_871007_871081_871200_871304_872377_872544_873459_873561_875805_875900_876692
840207	contig_7720_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_155758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTAGGGCGGAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517029	516748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_516700_517000
840208	contig_11413_pilon	-	1078	6	Intergenic	novelGene_103177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	36.6769682498431	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	175	558	453873	440163	FALSE	35	ACGAAAGCCAAATCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLDSFRKDRAQHRQRQCKLPPPRLPPMCVNPAPGGTISRASRDLLKEFPQPKNLLNSVIGRALGISHAKDKLVYVHTNGPKKKKVTLHIKWPKSVEVEGYGSKKIDAERQAAAAACQLFKVTLPW	458121	439642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_440292_440937_441069_448052_448149_453845_453901_455922_456021_458072
840209	contig_5255_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_171555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTGCTAACTGAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41599	41063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_-_41100_41600
840210	contig_16643_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_158126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTAAACCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235020	236011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_235000_236000
840211	contig_4103_pilon	-	1034	3	Intergenic	novelGene_52031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_1	72.5	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	62	343	577318	543271	FALSE	35	ATTTCCCATATAAACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHRTSVQLVRGEERYSLQSLMNQGNPPPYPGPGPSAPYPPYPPQPMGGPYPPPQGYPYQGYPQYGWQGGPQEPPKTTVYVMERERKTQDTGCQAALAACWTALCCCCLLDSLD	619497	542579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_543381_577146_577338_619455
840214	contig_13744_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_77180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGAGACCCCCTTGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689321	690155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_689300_690200
840216	contig_6576_pilon	+	1058	8	Intergenic	novelGene_42357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_2	29.2609651521041	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	99	731	788282	800240	FALSE	75	GAGAATAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIIQERIEDRLPELEQLERIGLFSHAEIKAIIKKASDLEYRIQRRALFKEDFINYVQYEINLLELIQRRRTRIGYSFKKDEIENSIVRRVQGVFRRASAKWKDDVQLWLSYVVFCKKWATKVQLSKVFSAMLAIHSNKPALWIMAAKWEMEDRLSSESARQLFLRALRFHPECPKLYQEYFRMELMHAEKLRKEKQEFEKAKMEVVRF	788183	800567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_788374_789599_789685_793050_793093_793335_793429_794418_794467_794961_795026_797138_797258_800150
840219	contig_11989_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_68428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44287	45594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_44300_45600
840220	contig_15354_pilon	-	1605	6	Intergenic	novelGene_65747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.8994381845148	24	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	595	1083	634123	631165	FALSE	20	TGGTGGACTCTATCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTSNYSLVLSLQFLLLSYDLFVNSFSELLRMAPVIQLVLFIIQDIAILFNIIIIFLMFFNTFVFQAGLVNLLFHKFKGTIILTAVYFALSISLHVWVMNLRWKTSNRFVWTDGLQTLFVFQRLAAVLYCYFYKRTAVRLGDPRFYQDSLWLRKEFLQVQR	638428	630642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_631278_631545_631622_632742_632915_633995_634264_637889_638048_638132
840221	contig_3751_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_158633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTACTCTATCTTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106086	108108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_106100_108100
840222	contig_8020_pilon	+	739	4	Intergenic	novelGene_114348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	133.987561611766	96	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	215	349	51582	53381	FALSE	35	ACAGTTTAAATTGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVGPRPRWVAAAAAAIVPALWIDASCLTWEGQQFQGKAAIVEKLSSLPFQKIQHSITAQDHQPTPDSCIISMVVGQLKADEDPIMGFHQMFLLKNINDAWVCTNDMFRLALHNFG	39921	53771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_39986_51342_51415_51503_51603_53267
840223	contig_3975_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_54934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCACAACAACCTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2331416	2331932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2331400_2331900
840224	contig_19892_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_158955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61734	60511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_-_60500_61700
840225	contig_5236_pilon	+	945	2	Intergenic	novelGene_100924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917894	918881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_918122_918163
840226	contig_5954_pilon	+	675	3	Intergenic	novelGene_28563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	331	junction_1	71.5	422	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	74	499	862074	862710	FALSE	15	GCGGTTTCTTTTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGVGPRGFPLRLQATEVRINPVEFNPEFVARMIPKVEWAALLEAADTLHLVEVPKGPTEGYERDEQFLRKMHHVLLEVRPGASPASQATPPAATGAQLCLPSPQVDVLEGTLQCPESGRLFPISRGIPNMLLNDEETET	862000	862886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862119_862204_862307_862431
840229	contig_5832_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_134189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700999	700575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_700600_701000
840230	contig_1694_pilon	-	1097	3	Intergenic	novelGene_144934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_2	23	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	46	651	502378	498540	FALSE	60	CACAAAAGAAAATTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGATGCAACGRAHEGPALELQPQDPASSLCPRPHYLLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNHEKHFYTFTNEHHRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSAENQLEVIFITNDRKNKEKAIEEGIPAFTCKSKYSSR	502423	498093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_498760_501382_501541_502150
840232	contig_8017_pilon	+	2313	22	Intergenic	novelGene_65341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_12	17.5779443332867	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	21	2141	317891	408121	FALSE	35	AAGTTAGTTATCTTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALYATYDDGICKSSGCIKSAARLIENMDTTVEPCTDFFKYACGGWLKHNIIPETSSRYSNFDILRDELEVILKDVLQEPEPEDIVAVQKAKTLYRSCINESAIDSRGGDPLLKLLPEIYDWPVATSNWERKYGPSWTAEKSIARLNSKYGKKVLINFFVGTDDKSSMNHIIHFDQPRLGLPSRDYYECTGIYKEACTAYVDFMIAVAKLIHQERGLPINENQISLEMNKVMELEKEIANATAKPEDRNDPMLLYNKMTLAQMQSNFSLEVDGKPFSWSNFTNEIMSTVNISIPNEEDVIVYAPEYLTKLKPILTKYSARDLQNLMSWRFIMDLVSSLSRNYKESRNAFRKAIYGTTSETAAWRRCANYVNGNMENAVGRLYVEAAFAGESKHLVEDLITQVREVFIQTLDDLTWMDAKTKKKAEEKALAIKERLGYPDDLISDDSKLNKEYVELNYKEEEYFENIIQNLKFGQSKQLKKLREKVDKEEWISGAAVVNAFYSSGRNQIVFPAGLLQPPFFSAQQPNSLNYGGIGMVIGHEITHGFDDNGRNFNKDGDLVDWWSQQSANNFKEQSKCMVYQYGNFSWDLAGGQHLNGINTLGENIADNGGLGQAYRAYQNYVKKNGEEKLLPGLDLNHKQLFFLNFAQVWCGTYRPEYAVNSIKTDVHSPGNFRIIGTLQNSAEFSEVFNCPKKTYMNPEKKCQMW	317870	408293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_317919_318623_318660_352154_352317_353445_353527_353625_353722_353829_353949_355614_355681_366697_366833_369490_369593_371497_371635_371743_371838_372971_373101_374572_374672_377597_377679_379192_379297_391143_391203_397203_397324_399100_399235_399354_399421_403496_403593_403946_404024_408021
840233	contig_13097_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_107738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCATAAATGTTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267578	266978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_267000_267600
840234	contig_2878_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_176495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGAAGTAGTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138467	137705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_137700_138500
840237	contig_6885_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_83706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312738	313755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_312700_313800
840239	contig_4876_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_137919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAATAACTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629295	628799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_628800_629300
840240	contig_1154_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_87047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAGTATGGAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76681	77997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_76700_78000
840241	contig_10367_pilon	-	1094	3	Intergenic	novelGene_169461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	137.5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	268	1014	135131	131866	FALSE	75	GAAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKWHPSSDEYLLQTHLLTSPFRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQSCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	135398	131785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133633_134055_134895
840242	scaffold_12510_pilon	+	1552	5	Intergenic	novelGene_151414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	25.0237387294545	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	243	632	625218	659240	TRUE	30	GTGGCAAAGTGTTAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRRWQKRICRPQPAVGQLSTVRGSQHSSAPPTPTSCASLRPGVTTSSSACALRSCASGSCAPRGAPLLPGTPSPPECKLHNNRDFCLGRDWHDHPEECLAQSRCQQYLLDERECITGGENWPVKAQ	624771	670150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_624862_625065_625453_633947_634084_659221_659433_669422
840243	contig_9218_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_157688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346673	345575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_345600_346700
840244	contig_9335_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_147446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398485	397783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_397800_398500
840245	contig_6451_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_173707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACCTGAGCACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176163	175658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_-_175700_176200
840247	contig_7695_pilon	-	800	7	Intergenic	novelGene_41621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	204	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	35	673	687243	680442	FALSE	0	GTTGCTGGTGGCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPALPSSLYLSPWAAPWGAPHS	687277	680314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680505_681583_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
840248	SIRV6	+	424	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	106	1	-81	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	79	240	67	306	2458	3109	TRUE	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTN	2391	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
840250	contig_15021_pilon	+	899	5	Intergenic	novelGene_26916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	4.96865172858795	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	13	651	7012	11465	FALSE	35	AACAATACCTACATGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRRGALIVLEGVDRAGKSTQSRKLVAALCADGYRAELLRFPERSTEIGKLLSSYLEKKTEVEDHSVHLLFSANRWEQVPLIRDKLDQGVTLVVDRYAFSGVAFTAAKENVSLDWCKQPDVGLPRPDLVLFLQLQLADAARRGGFGRERYEDGAFQERALHCFQQLMQDPSLDWKTVDASRSVEDVHKEIRALSKDAIQAAMQMPLGQLWM	6999	11713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_7142_8223_8333_9037_9129_10322_10521_11354
840251	contig_500_pilon	-	696	5	Intergenic	novelGene_31090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	330.454611104158	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	150	695	1510494	1500069	FALSE	10	TGCTTGCCTCACGATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLSEVPGPRGGCGGSWWALGRAERVVPEEFPVPVSVRGAASAAAGAAMPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLAADQFVTTSPSLCCLAAHSQDGLSAGSLCPGLLKVPACPWPAPTEASLPFPAPFPPTWPGPIFNPAHQSFQETSVYCAAPRQNMLYKFNLYIWQIKLDIIV	1510643	1500067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500373_1504425_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
840253	contig_9272_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_125925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	117.991525119392	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	16	498	322813	327365	FALSE	30	TTTTTCTCGTATGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGIRMWKRTTSLPSPCLCVVIAFLSPLSLILLAKCLKKADTADSRQACLAASLALALNGVFTNTIKLIVGSCICWPGLCFLLPGREATLLHTTRPWEILEVLCLPVTSTFRSCDCTVPYLRLQASLARQYYPPLTDAECHKPFQDKLVLPTVQKKPGDPYHFDV	322797	328380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322858_323324_323416_323879_323944_325357_325529_327253
840254	contig_12837_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_57284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCTAGTCTGTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60748	75784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_60982_75310
840255	contig_13215_pilon	+	745	5	Intergenic	novelGene_145895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	376.986322696195	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTGTGCTACTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156101	180817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_156158_169217_169301_173174_173218_174186_174269_180336
840256	contig_13048_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_138913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAACATAGGAAGCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322922	324021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_322900_324000
840258	contig_3832_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_161500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAAGAGTAGAGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508423	509256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_508400_509300
840260	contig_12627_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_177367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	56878	56570	NA	10	ATTTCCTGCTTGTGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVSPPVALSLRPRGLLRSPESGRAQSPLGCCETLGRPLRRSELRNARTRRQLGRGLARRSPLGEGRRIYSTGPRPARFTFLPNTPAHTRLPEHPHPPPASGT	56879	55680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12627_pilon_-_55700_56900
840261	contig_935_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_45571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTAGCTGCTTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604321	604970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_604300_605000
840262	contig_15063_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_14463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	34	396	36299	36661	NA	65	AATTAGAAATAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	36265	36775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_36300_36800
840263	contig_10951_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_61617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGCTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60773	60481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_60500_60800
840266	contig_5549_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_81613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTATGTAGCAGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323649	322008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_322000_323600
840268	contig_15327_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_70440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	406	717	87898	88209	NA	20	CCCACAGCTGCCCAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLSALPSVLRAPEKSVLLCFVLSSHSFREGAQHDRVVVTGAVSGDVLLAHYRPTKPGATFGGGPPCLLPAAGVVPSIRKIHIPGHSSAFCLCPMSSGLREG	87492	88614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_87500_88600
840269	contig_6217_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_109690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932216	933418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_932200_933400
840270	contig_6228_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_164515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTAACTTGACCTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497492	499512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_497500_499500
840271	contig_1335_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_166519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGTATTAAAGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506652	508759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_506700_508800
840272	contig_16804_pilon	+	2350	2	Intergenic	novelGene_167285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12144	16768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_12262_14535
840273	contig_9206_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_137491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGGGAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304855	303574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_303600_304900
840276	contig_7201_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_152499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97733	99024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_97700_99000
840277	contig_5095_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_74956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAGAAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300421	302100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_300400_302100
840278	contig_8710_pilon	-	1323	10	Intergenic	novelGene_73502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	9.93435242100316	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	11	1018	256738	180114	FALSE	5	CCCATTGTGCCTGCGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSGIHLLFSRGCHRIFSSPLNHIYSHKQSGSQQRRNFLFRRQRDISHSIVLPAAVSPAHPVPKHIKKPDYVTTGIVPDWGDSIEVKNEDQIQGLRQACQLARHVLLLAGKNLKVDMTTEEVDALVHQEIISHNAYPSPLGYGGFPKSVCTSVNNVLCHGIPNSRPLQDGDIINIDVTVYYCGYHGDTSETFLVGNVDDCGKKLVEVARRCRDEAIAACRAGAPFSVIGNTISHITHQNGLQVCPHFVGHGIGSYFHGHPEIWHHANDNDLRMEEGMAFTIEPIITEGSPEFKVLEDAWTAVSVDNQRSAQFEHTVLITSRGAQILTKLPDEA	256748	179808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_180193_180321_180401_181269_181318_182662_182761_189601_189766_193788_193832_194425_194575_195938_196089_198217_198376_256698
840279	contig_8656_pilon	+	1056	6	Intergenic	novelGene_162362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	118.998487385345	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTTCACAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633848	647318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_633934_634549_634712_638245_638283_639533_639985_644687_644760_647069
840280	contig_6634_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_171137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	254	631	144710	145087	NA	50	AGTCTTCAGACAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVRLDRAVVVWFVQCPEAPGQGKQGAEIQRELHTRSLFPQCQLVSAQRKGQLPLSALLRGNRILIYRGALQASRDPGARLVLLPTLCELRHSLPVGLNAYDNLSFVGIFLEGRNVCVLEQRGR	144456	145811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_144500_145800
840281	contig_253_pilon	+	1052	9	Intergenic	novelGene_129714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	118.614659717929	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	68	529	546960	548037	TRUE	25	CTCTTTCTAAAAGCTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRARDPEPSEAGAAAPGSPDMSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVESSGGGAFLVLPLGKTGRVDKASPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLASPLTEPVVVLEGHTKARGYRHLAPHGPQRAAQRRL	546182	551612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_546248_546957_547161_547537_547661_547750_547882_548030_548213_548295_548416_548970_549076_549151_549193_551530
840282	contig_4079_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_167469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99612	100693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_99600_100700
840283	contig_16934_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_132540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCTAAACTATAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257698	259156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_257700_259200
840284	contig_9185_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_166919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	159	488	767193	767522	NA	45	AGAGTTCTCCAGGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARAELPPGSPTSQRSAVHPRAGRVPDSGYVLSDPAAQRPPAEQGVHAHPLRPMLGSWLGFTPKPYHLKTRLKANSKQILLETRARFKTPLLKPLVNHQLVCRIISFS	767034	768141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_767000_768100
840285	contig_14970_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_45021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCATTTGTGAGAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164939	165217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_164900_165200
840286	contig_10930_pilon	-	1270	4	Intergenic	novelGene_36958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	6.18241233033047	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	224	985	246358	242240	FALSE	40	AGTTTCCATATCATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEIQFDFPKDSEVVTFETPFGKFGIFTCFDIFSHDPAVVVVDDFQVDSVLYPVAWYNTLPLLSAVPFQSAWARAMRVNLLAANTHNTSMHMTGSGIYAPEAVKVYHYDMETESGQLMLSELKSQPRREPTYPAAVDWSAYARSAKPFSSGQSDFPGMIYFDEFTFTELKENTGNYTVCQKDLCCHLTYKMSEKRKDEVYALGAFNGLHTVEGQYYLQICTLLKCQTTDLKTCGEPVGSAFTKFEEFSLSGTFGTSYVFPQIVLSGSQLAPERYYKVSRDGRLRSQSGASLPVVVMALYGRVFEKDPPRLGQGPGKSQRSPSPVHFQD	246581	241954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_242399_244000_244175_244960_245335_246303
840287	contig_14618_pilon	-	1137	6	Intergenic	novelGene_136810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	13.8188277360998	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	327	1022	567433	559577	FALSE	5	CCTCTCCGCTTCCTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVTCTGPATWCLGGDGTRDVVPTEPAEPGPSCGYRPSEEAAQKSLQNAATIPQSTGSPLGEQRQKAIYTLLAANGPRDALSIARALGMKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPEDSGRKNQFTKNIYQQSTVNMFIQTGPSGTISITNSKGIQIGSANMMQKHTASGKSDAGFARCDSDFPGDVGQAAPGIITTLSSQMDTLSFGREDPTPAENRAPTEGN	570003	559461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_559735_563700_563869_565414_565589_566228_566298_567306_567553_569796
840289	contig_6823_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_131202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGAAAATCCTGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62344	61708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_61700_62300
840290	contig_5375_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_169225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGACACATATGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111590	110794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_110800_111600
840292	contig_15323_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_148536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTGTTTGGAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159248	161441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_159200_161400
840293	contig_15691_pilon	-	722	5	Intergenic	novelGene_60770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	179.041894538681	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	15	617	187699	65935	FALSE	30	AAGCCATTTTGCTTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPAMPNKNKKEKESPKAGKSGKSSKEGQDSDQEIASRKNSLVAIQSATSNKIKVSVPQPIVKKDKRQNSTRFNTSNNRELQKLPSLKDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMGESVAERCNERGEKVCVCARTRARAQVGGIWQEFLTLRSKEKSSIPGSA	187713	65829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_66085_69380_69581_148364_148528_186770_186834_187672
840294	contig_9177_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_32776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCCTTTTCTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374888	1376154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1374900_1376200
840295	contig_5472_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_130043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCCCAAATTTTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456032	457360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_456000_457400
840296	contig_10324_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_7875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGGCAACCTTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519771	518915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_518900_519800
840298	contig_6589_pilon	-	488	3	Intergenic	novelGene_25895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	147.5	350	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178139	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158723_1177210_1177250_1177927
840299	contig_6612_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_148176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAAACACATAAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73575	74529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_73600_74500
840300	contig_11615_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_151255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44701	43667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_43700_44700
840301	contig_15146_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_116962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589598	591149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_589600_591100
840303	scaffold_12124_pilon	-	982	5	Intergenic	novelGene_22175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	115.233187493881	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTGGGCTTGTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368145	1229086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1323601_1323671_1333049_1333158_1368003
840304	contig_4125_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_25161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905583	906670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_905600_906700
840305	contig_15042_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_115424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAGATGTTTTCTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9916	10570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_+_9900_10600
840306	scaffold_4805_pilon	-	1037	11	Intergenic	novelGene_161038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	33.6429784650527	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	206	886	555930	546387	TRUE	25	GGAAATTCACTGCCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINSVQQNREDILNAGDKLTEVLEEADTLFNGVSRAREAALDAQFLVLASDLGKEKAKQLRSDLNSFDMLRYVETLLTHMGVNPLEAEELIRDEDSSDFELIVYDSWKISGKTAENTFNKTHTFHFLLGSIQGELPVPKPRVDRPKKVRTTEEQRAMPDQLKRMEESHQEATEKEVERILGLLQTYFQEDPDTPMSFFDFVIDPHSFPRTVENIFHVSFIIRDGFARIRLDEDRLPVIEPVNINEENEGVDHNTQIRHQGIIALTYRDWEEIVKTFEISEAVIASSQSQQRLST	560175	545539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_545680_546375_546462_546550_546646_548097_548147_549367_549463_550528_550620_551336_551437_553345_553498_555906_556038_559348_559427_560155
840307	contig_18391_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_174088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTAAAATCACTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14495	13915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_13900_14500
840309	contig_9440_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_59104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGTAGGCCTGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699118	1699544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1699100_1699500
840312	contig_15353_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_151970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAACAGAAGGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316017	316632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_316000_316600
840313	contig_15033_pilon	+	1505	7	Intergenic	novelGene_177369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	54.8191471010713	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	263	775	50400	65186	FALSE	50	TCTTACAAACTAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALSFPRYNVAEILIHIRNKILTGADGKNLSKNDLYPNPKPEVLHMIYMRALQIVYGIRLEHFYMMPVNSEVMYPHIMEGFLPVSNLFIHLDSFLPICRVNDFEIADILYPKAKRTSRFLSGIINFIHFRESCRETYMEFLWQYKSSLDKMQQLNAAHQEALMKLEKLE	42273	65916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15033_pilon_+_42516_50379_50523_53877_53953_55054_55132_55829_55892_61019_61118_65108
840314	contig_12644_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_44561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTGGCTAAAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1953364	1951988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1952000_1953400
840315	contig_12638_pilon	-	508	2	Intergenic	novelGene_33328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTAAAAATAACGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325617	1298328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298748_1325528
840316	contig_4232_pilon	-	1523	9	Intergenic	novelGene_63249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	63	junction_6	91.731861286033	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	494	1522	332991	327177	FALSE	15	GCTGGGAGAGGTGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERDYNTKRVDHSNTRLVTQLDRNPGADDNNLNSIFYEHLTRSLQHTLCGDLVLGRWGNYSPGDCFVLASDYLNALVHLIEVGNGLVTFQLRGLEFRGTYCQQREVEAITEGVEEDEGCCCCEPGHLPRVLSFNAAFGQRWLAWEVTASKYVLEGYSISDNNAASMLQVFDLRKILITYYVKSIIYYVSRSPKLEAWLSHEGIAAALRPVRAPGYADSDPTFSLSVDEDYDLRLSGLSLPSFCAVHLEWIQHCASRRGQPMDQDWNSPLVTLCFGLCVLGRRALGTASHSMSASLEPFLYGLHALFKGDFRITSPRDEWVFADMDLLHRVVAPGVRMALKLHQDHFTSPDEYEEPAALYDAIAANEERLVISHEGDPAWRSAILSNTPSLLALRHVMDDASDEYKIIMLNRRHLSFRVIKVNRECVRGLWAGQQQELVFLRNRNPERGSIQNAKQALRNMINSSCDQPLGYPIYVSPLTTSLADSHPQLRALWGGPVSLGAIARWLLR	335659	327175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_327441_327519_327751_327847_327996_328676_328781_328965_329197_332940_333195_334810_335027_335133_335193_335644
840318	contig_18484_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_177370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATAGCATTAACCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17679	16667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18484_pilon_-_16700_17700
840319	contig_8628_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_164423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTATAAGAAAGTAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431476	431782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_431500_431800
840320	contig_14563_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_135041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACAGGTTCAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112266	113009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_112300_113000
840321	contig_10803_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_170117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCTAATATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45081	44277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_44300_45100
840323	contig_6028_pilon	-	1094	9	Intergenic	novelGene_156614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.10653744329409	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	359	1093	478949	463882	FALSE	30	ATCTCAGTTACTTTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSRGNTWSRRHKTLSVTEEEFWAFSFDEMAKYDLPGIIDFIVNKTGQEKLYFVGHSLGTTIGFVAFSTMPELAQRIKMNFALGPVVSFKYPTGFFTSIFLLPTSIIKALVGTRGLFLEDKTGKPPSAKICNNKILWVICSEFMSLWAGSNKKNMNMSRMDVYMSHAPTGSSVQNILHIKQLYLADEFRAYDWGSEAENMRHYNQSCPPLYDLTAMEVPTAIWAGGHDVLVTPKDVARILPQIR	482239	463880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_463999_467314_467387_468281_468354_470205_470353_472660_472798_475307_475418_478869_479069_481363_481482_482118
840324	contig_9819_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_175590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTATTGTGTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25167	26346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9819_pilon_+_25200_26300
840325	contig_12277_pilon	+	478	2	Intergenic	novelGene_139674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	4366	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTCCCTCTGAATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99676	102382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_99898_102125
840328	contig_4486_pilon	+	971	7	Intergenic	novelGene_38638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	388.587506232509	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	197	763	1016066	1029872	FALSE	10	CTGGCTCTTGTCTCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQGRNFS	1014100	1030080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679
840329	SIRV5	+	290	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7671	1	-278	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCAAAAGCCTAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298
840332	contig_12250_pilon	+	1099	8	Intergenic	novelGene_80534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.49343407446785	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	25	1047	227162	231232	FALSE	15	AGTGTGTCTGGAGCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLFLHMSFELKLLLLLLWLAASCSLFLHSHAWLSDCLIARLYMGLLDSRPGVLKEPKLMGTISFFIFFFTLLVLARQNEYYCRLDFLWKKKLRQEREETETMENLTRLLLENVLPAHVAPQFIGQNRRNEDLYHQSYECVCVLFASVPDFKEFYSESNINHEGLECLRLLNEIIADFDELLSKPKFSGVEKIKTISSTYMAATGLNATSGQDAQQDAERSCSHLGTMVEFAVALGSKLDVINKHSFNNFRLRVGLNHGPVVAGVIGAQKPQYDIWGNTVNVASRMESTGVLGKIQVTEETAQALKSLGYTCYRRGVIKVKGKGQLCTYFLNTDLMRTGPPSATLG	227137	231284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_227293_227499_227585_228024_228184_229832_229980_230215_230324_230437_230553_230865_230991_231079
840333	contig_8921_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_161628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGATTTATAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89285	87562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_-_87600_89300
840334	contig_2438_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_111990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCAGGTGTGAATTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169190	168084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_168100_169200
840337	contig_720_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_155155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAAGCCAGCCTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24447	25254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_24400_25300
840338	contig_12299_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_29749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGTTTTTGGACACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355587	354356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_354400_355600
840339	contig_15327_pilon	+	1109	10	Intergenic	novelGene_70580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	138.356847622193	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	371	859	839153	843400	FALSE	5	CTTAGCGCTTGGCCTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMNYIIQRKKEFRNPSIYEKLIQFCAIDELGTNYPKDMFDPHGWSEDSYYEALAKAQKIEMDKLEKAKKERTKIEFVTGTKKGTTTNATATTTTTASTAVADAQKRKSKWDSAIPVTTIAQPTILTTTATLPAVVTVTTSASGSKTTVISAVGTIVKKAKQ	808418	843650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_808500_809869_809980_812492_812541_836724_836814_839110_839203_840064_840126_840599_840652_841633_841693_842872_842958_843218
840340	contig_11396_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_71309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGACTGTGTCTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433915	433228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_433200_433900
840341	contig_10106_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_73849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26840	26512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_26500_26800
840343	contig_9871_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_75671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGTCAATTCCAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445793	446701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_445800_446700
840344	contig_9945_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_104799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACTGCCCAGTAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16785	17674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_16800_17700
840345	contig_7342_pilon	+	1295	6	Intergenic	novelGene_71184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	2.13541565040626	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	106	543	541832	542895	TRUE	20	GTGAGTGAGCCCAGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDIGGKLYLAPLTTCGNLPFRRICKRFGADVTCGEMAVCTNLLQGQTSEWALLKRHHSEDLFGVQLEGAFPDTMTRCAELLNRTIEVDFVDINVGCPIDLVYKKGGGCALMSRSTKCRQIVLGMNQVLDVPLTMKIRTGVQERTNLAHRLLPELRDWGVSLVTVGPRAWASGPPGGKPPC	541555	543831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_541598_541768_541922_542196_542314_542577_542644_542730_543572_543755
840346	contig_2867_pilon	-	1436	1	Intergenic	novelGene_135263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGCAAAGGGACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292549	1291113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1291100_1292500
840347	contig_10323_pilon	+	1988	3	Intergenic	novelGene_123527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAAAGGGCTCGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110651	118577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_110970_115124_115221_117003
840350	SIRV6	-	407	5	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8249	-162	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTAGTTGGCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10796	2520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2623_2745_2826_3114_3161_7816_7923_10723
840352	contig_14275_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_162864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGTTTCTATTAACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317498	316869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_316900_317500
840353	contig_16119_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_164275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCAGTAATTTATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236728	237670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_+_236700_237700
840354	contig_5095_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_74945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184065	184309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_184100_184300
840355	contig_8617_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_73452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATCCCCCCACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62431	62054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62400
840356	contig_7840_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_69052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424313	423725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_423700_424300
840357	contig_9097_pilon	-	1220	2	Intergenic	novelGene_173579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	240	1220	213211	212231	FALSE	60	GAACATATAAGAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNREPRPPSYTISVVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYLEHTSVLSTIDFGGRVVNNDHFLYWGDITQNGEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAAATKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLSVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFVNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNVETCFTALVQMLDKTRGKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNHPDYEEYINLEGTKKARNAFSKHIEQLKQ	231540	212230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_213383_231472
840358	contig_8320_pilon	-	1014	2	Intergenic	novelGene_152276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	117	323	558021	557815	FALSE	80	AGAAAAAAAAAAAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIYAVALEEELECYFGTAPETHCHPVGFILIPSSCQVLMAPNRIPTTRLGRLLTQVQKLNEARFLMRKWAGLLSGKSITLWNTLQSLSWLDPNGQILRSGEQISQH	563489	557123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_558078_563429
840359	contig_17_pilon	+	915	8	Intergenic	novelGene_173983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	321	824	1102817	1112251	FALSE	50	GTATGTGTGAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGRFSSFSALLSSGLVPVLSLFLSDEPLKSIPPRPSLPAAEVAVVVPKVKPKAFCPSPDVAVLLLWKSEPPKPAKAPPKERPVDAGVVVAVVPPKLFRVNPAEAAGADVRADERVRPLAEVEAIGRANGVADAAGLLNPKLKPVVDADVVAGVPVQKKKKKSHFT	1095455	1112342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_1095494_1097761_1097840_1102282_1102462_1102791_1102858_1103637_1103662_1108523_1108636_1111272_1111412_1112063
840361	contig_9955_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_21365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTTGGTTTTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295578	295939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_295600_295900
840363	contig_953_pilon	+	1057	7	Intergenic	novelGene_130006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	44.8048236490472	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	984	72	1055	312565	315593	FALSE	25	GTCGGCAAAGTGATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFVQVGGVYSYDCSFGHVPNVELMKFIAMATFGSYLSTCPEPEPGNLGLTVYHRAFLLYSFLRSGEALNPEYYCGSQHRLFNEHLVSASSNPALALRRKKHTEKEVPADLVSTVSVRLREGYSVREVTLAKGGSQLEMKLVLLWKHNMRIEYVAMAPWPLEPEGPRGTRVEVTMEGGYDILHDVSCALRQPIRSLYRTHVIRRFWNTLQSINQTDQMLAHLQSFSSVPEHFTLPDSTKSGVPLFYIPPGSTTPVLSLQHSGSDSSHAQFAAYWKPVLSMDANSWQRWLHMHRLVLILEHDTPIPKHLHTPGSNGRYSTIQCRISHSSLTSLLRDWSSFVLVEGYSYVKLLS	306529	315595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_306544_312507_312719_312945_313117_313553_313789_313993_314124_315030_315174_315442
840366	contig_2009_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_165450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53843	55181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_53800_55200
840367	contig_6871_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_21525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAACCAGTTGAAGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56573	55112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_55100_56600
840368	contig_2450_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_160299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTGAGAGAATAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345650	345130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_345100_345600
840369	contig_12078_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_74097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAACAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209813	210260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_209800_210300
840370	contig_10158_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_150767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15514	16827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_15500_16800
840371	contig_5643_pilon	+	881	5	Intergenic	novelGene_39143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.1362613717347	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	117	386	655176	655922	TRUE	5	CCTAGTTGTTCTTTGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPDSGQEARLEAVGSLWCWKGPVGKTYELLNCDKHKSMLLKNGRDPGEVRPDIAHQSLLMLMDSPLNRAGLLQVYIHTQKNVLIEVNPQTRIPRTFDRFCGLMVQLLHKLSVRAADGPQKLLKVRY	651772	656804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_651844_655130_655233_655340_655483_655851_656145_656531
840372	contig_7707_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_72125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCAAACTTTGAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56397	55035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_55000_56400
840374	contig_10926_pilon	+	718	3	Intergenic	novelGene_137504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	12	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	344	553	99456	102286	FALSE	30	AACCATCAACCTTTTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVLSRALKLPGKKSPDLGEYDPLTQADSDESEDELVLNLQQKNGGVKNGKSPLGEAPEPDSDAEVAGAAKPHLSEVTTEGYPSEPLRDLEQKANSSIVSYVRTSVFLLTLVISMILVLVCAFLIPCPPRDLHSTWSRHLGPQGGGDLSPLELADVNGDDLRDVLLSFVPSRNESAVGKRHGF	81045	102451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_81081_99147_99547_102167
840375	contig_15422_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_173113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	301	642	112543	112202	NA	5	CTTAGGTCTGTCTCGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQMVIREGTLAGLHCGPTASSQTRLPLSTSVFSAGVTPSSLSLLECVFLSCRFFSWAVLRVWLVWGSTSSPDSWQPECGFLVHAYPTAVCHCCQGPGRASSLPSVSTYGPCC	112843	112009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_112000_112800
840378	contig_16011_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_177376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	176	565	24686	25075	NA	10	GTTCTACTCCGTCACCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVECVTARDTPFKCHCRNCKEALGLLLFGWIILKITCTRLCPAPRNVLSAAGRSCLHFPIWQPSCHPLLQGLASPSFLGQRTDYLRSVFLPRVSRNVLQYSFQGGWRMLHWGQEEEPPQAGPPPRGTQ	24510	25461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_+_24500_25500
840379	contig_16011_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_177377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	325	669	25935	26279	NA	35	AAACAACAGCACGTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLSLHRPCVTSAGMGCKLGLLAYPCESLSHNNPLEPGSEQTHVIRKSIQSARIIRSLQWRTIQLIDAPLIRKTIVWLHLGKEAPDQKLLRGLGSEHLFSGVIRVGVTSSPS	25610	26351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_+_25600_26400
840381	contig_13593_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_156124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCACCCACCCACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66464	64974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_65000_66500
840382	contig_6208_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_53047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCATTTGTATCGTTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532811	533600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_532800_533600
840383	contig_1813_pilon	-	1442	5	Intergenic	novelGene_105504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	12.9301005409857	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	138	821	364980	342138	FALSE	35	AATGTTAAGCCCGTGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAASLLPVLALGLQPGDTVLDLCAAPGGKTLALLQTGCCCNLAANDLSTSRTSRLQKVLHSYVPQDIRDGTRVRVTSWDGRKWGELEGDTYDRVLVDAPCTTDRHSLHEEENNIFQRSRKKERQTLPLLQVQLLAAGLLATKPGGYAVYSTCSLSHLQNEYVVQGTIELLANQYSIEVQVEDLTHFRKLFMGTFFFFPSCQVGELVIPNLMANFGPMYFCKLRRLT	392326	341516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_342415_343026_343152_362125_362287_364859_365015_392223
840384	contig_15327_pilon	+	1056	5	Intergenic	novelGene_70593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	632	739	882297	882404	FALSE	15	TGGCTCTGACCTATCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQTSVVVEDLLPNHSYVFRVRAQSQEGWGPEREGVITIESQVHPQSPLCPLPGSAFTLSTPSAPGPLVFTALSPDSLQLSWERPRRPLGDILGYLVTCEIAHGGGPATTFLVDGDSPESRLTVPGLSENVPYKFKVQAKTTQGFGPEREGIITIESQDGGPFPQPGSHPGLFQPSLPGEYSSVTTTTTHTNTTEPFLADGLTLGSQHLEMGGSLTQHVTQEFVSRTLTTSGTLSTQVDHQFYHT	881306	882721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_881468_881557_881714_881797_881963_882048_882166_882264
840385	contig_1090_pilon	+	1237	10	Intergenic	novelGene_131093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	16.2966329931548	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	103	1083	73167	116440	FALSE	10	TTTTCCTACTCTGTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDATRNAAYTVDCEDYVHVVEFNPFESGDLGNLIAYGGNNYVVIGTCTFQEEEADVEGIQYKTLRTFHHGVRVDGIAWSPETRLDTLPPVIKFCTSAADMRIRLFTSDLQDKNEYKVLEGHSDFINGLVFDPKEGQEIASVSDDHTCRIWDLEGVQTAHFALRSPGMSVCWHPEETYKLMVAEKNGTIRFYDLIAQQAILSLESEQMPLMSAHWCLKNTFKVGAVAGNDWLIWDITQSSYPQEKRPIHLDRAFLFRWSTINENLFATTGYPGKMTSQFQIHHLGHPQPILIGCVPVGSGLSWHRTLPLCAVGGDHKLLFWVTEM	71720	116594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_71758_73101_73323_79416_79542_85454_85528_87485_87581_107038_107130_111716_111899_112384_112436_115724_115819_116326
840387	contig_1719_pilon	-	676	5	Intergenic	novelGene_87368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_3	399.987812314325	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	48	593	803613	754873	FALSE	35	TTTGCAAGGACTGAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803660	754789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
840388	contig_6048_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_73225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	812	1195	1654532	1654149	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLLQHSRNRGRSPPGRLRLHPGQSRGEADRTRSLSKDERLNCPIAQVLNILVGFGRMRWISHTLAVVNGLPGKPHAEYQLNSSSRRPSAVVGFIRLGLPTWKLAIRWDDFHSAASASSDLVLKLI	1655343	1653973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1654000_1655300
840389	contig_6664_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_176070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	30832	30458	NA	55	AAATCGAACAACAACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSESVSACHKNDSPSIFNRTLLSYTYAALVKTYPEDIRNCSLVGRLKGYESYTVVQGSVAQDAGAKYSILRDVAGGINAGKNICQTLLDSLGISIPDASLDPRILHLWRQIHRQQISFIPSLPL	30833	29443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_29400_30800
840390	contig_5315_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_175356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATATCCTCTGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311578	309400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_-_309400_311600
840392	contig_753_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_112992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACAACTAAAAAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234327	1233292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1233300_1234300
840394	contig_6726_pilon	+	1042	10	Intergenic	novelGene_86226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	385.914786218697	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	13	1041	287836	324486	FALSE	20	GTCGCATCCATCAGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGKMAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVTTDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETF	287823	324487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301545_308113_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405
840395	contig_15666_pilon	+	300	3	Intergenic	novelGene_70104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCCTCAACATGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20782	25758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_20864_24369_24521_25690
840396	contig_15666_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_70106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGACTTCGATAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25758	27075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_25800_27100
840397	contig_6509_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_145612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	41	484	58860	58417	NA	35	ATCAAAATGGCAGCACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGWEQRSLQVSGFPLHWGWSGATIGTQAQLHATSSPKSGGSLRRPCAGLITPLLGTELAETHVHGSESHSDTCTAACVQRSKTGNKCPSKEWKVNCGTPIVQYHPAGCLCLAPLTSWLDHCAGGGWRPVHCRISSSIPGLHPLDAQ	58900	57968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_58000_58900
840398	contig_2371_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_176556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGAAGACGATAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258123	259059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_+_258100_259100
840400	contig_5882_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_159560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTGAATGGAAAATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15544	14543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5882_pilon_-_14500_15500
840402	contig_6175_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_16318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTCACCATACCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482297	1481919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1481900_1482300
840403	contig_9144_pilon	-	395	4	Intergenic	novelGene_151143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	35.4432253360529	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTACTACCACCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648302	643170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_-_643230_644026_644138_645183_645342_648235
840404	contig_4364_pilon	-	1019	10	Intergenic	novelGene_137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	24.5809320861155	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGGTTCTCCTGTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139106	1129984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1130072_1130149_1130323_1130391_1130462_1130660_1130713_1134316_1134370_1134859_1134923_1135480_1135548_1135968_1136051_1136219_1136360_1138874
840407	SIRV6	+	435	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	332	0	166	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
840408	contig_12078_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_74104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGCTTTTTTGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231872	229982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_230000_231900
840409	contig_12810_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_145706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557958	557415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_557400_558000
840411	contig_7285_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_143423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGCGAAATACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372054	372555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_372100_372600
840412	contig_1596_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_131589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCATCCTTTTCGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96574	97802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_96600_97800
840413	contig_11816_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_98462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAGAAAAAAACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410477	409981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_410000_410500
840414	contig_5084_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_64619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125584	1126013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1125600_1126000
840415	SIRV6	+	357	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	1	19	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
840418	contig_10428_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_162600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATCAGTTTGATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242963	241440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_241400_243000
840419	contig_9438_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_154260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTTGTTATTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22788	22566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_22600_22800
840420	contig_1091_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_168777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACAGGATTTTAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764767	764072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_764100_764800
840422	contig_11304_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_156708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383727	383475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_383500_383700
840423	contig_5918_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_99558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAACAGAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704222	1704655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1704200_1704700
840426	contig_16666_pilon	+	1654	2	Intergenic	novelGene_61805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	148	405	208958	209215	FALSE	70	AAATCAATAATAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRATAVRLSAHGIEARGARARTRVVSVCLASARIAGCLSPGPRALSATMTGLLKRKFDQLDEDSSSSSSSSGCHSPSCSPSSSASPAWESDEEVPWDQTPLPYRDFCGSRNSTRESYLLWLTTWEPHHTPPER	202443	210464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_202553_208919
840429	contig_9321_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_174718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCCTCACTGCCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33300	34098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_33300_34100
840430	contig_7088_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_159790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTCTGACATGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696668	698782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_696700_698800
840431	contig_13457_pilon	+	481	4	Intergenic	novelGene_118338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	54.6890198201512	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	177	479	60777	71289	FALSE	20	CAAGGTGGGGGTCAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCRPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCP	59234	71291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60802_70867_71059_71202
840432	contig_1369_pilon	-	561	3	Intergenic	novelGene_176788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	83	427	394002	388287	FALSE	60	AACTGAATGATTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTGKESLTSNLHEGNAEDDYEETSALEMSCKTSPVRYKEEEYKTGLSALDHIRHFTDSLKMRKMEDNQYTEAELSSFSTSHVPEELKQPLHRKSKSQAYAMMLSLSEKESLHSTSHSSSNVWHSMARAAAESSAIQSISHV	394084	388152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_388422_392513_392698_393976
840434	contig_11851_pilon	+	777	5	Intergenic	novelGene_146550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	64.0819787459782	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	219	704	21555	35451	FALSE	50	GTAACTTACTTAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLFPYIKENIKEYLQTHWEEEECQQDVSLLRKQAEEDSHLDGAVPIPAASGNGEDDLQQAIQAVVDNVCWQMSLDRKTTALKQLQGHMWKAAFTAGCMKAEFFEDVVPAVRKWREAGMKVYIYSSGSVEAQKLLFGHSTEGDILELFDGHFDTKIGHKVESESYRKIADSIGCSTNNILFLTDVTLEASAAEEADVHVAVVVRPGNAGLTDDEKTYYSLITSFSELYLPALT	20252	35524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_20357_21440_21644_27168_27302_28781_28906_35311
840435	contig_2069_pilon	+	965	6	Intergenic	novelGene_23184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	273.836885755006	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	63	485	70041	81061	TRUE	25	GCCTGGTAGCCTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQVKSE	69978	81601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81338_81397
840436	contig_11416_pilon	-	519	5	Intergenic	novelGene_145334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_3	97.7304967755715	27618	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGGCTGTGTGTGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124756	122793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_124570
840440	contig_5954_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_28744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTAAGCTTTCCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263721	1264511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1263700_1264500
840441	contig_4519_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_123723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCACCCTTTTGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701415	703275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_701400_703300
840442	contig_6102_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_31821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360960	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_361000_361200
840443	contig_10238_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_170106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGAAAATAAAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425738	424539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_424500_425700
840444	contig_12270_pilon	+	338	2	Intergenic	novelGene_114066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAGCTCACATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13874	14435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
840447	contig_11678_pilon	+	653	3	Intergenic	novelGene_160852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_1	13.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATCGCTTATGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278083	279460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_278438_278721_278812_279251
840449	contig_11071_pilon	+	996	2	Intergenic	novelGene_131048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	31	996	446856	457247	FALSE	35	AATTTAGAAGATTGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRYSKDTGLMSCGWCQKTPEDGGSGDLPPVGHDELSRGTRNYKKTLLLRHHVSSEHKANAQESEIPSEEGYCDFNSRPNENSYCYQLLRQLNEQRKKGILCDVSIVVSGKIFKAHKNILVAGSRFFKTLYCFSNKESPNQNNTTHLDIAAVQGFSVILDFLYSGNLVLTSQNAIEVMTVASYLQMSEVVQTCRNFIKDALNISIKSEAPESVVVDYNNRKPINRDGLSSSRDQKIASFWATRNLTNLASNVKVENDGCSVDEGQIDNYQMNDSSWVQDGSPELAENESQGQTKVFIWNDMGSQGIQETGKTRRKNQTTKRFIYNVPPNNET	446825	457247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_447012_456437
840451	contig_10235_pilon	+	1042	3	Intergenic	novelGene_46511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	121	696	298263	298961	FALSE	20	ATGTGTTAATTTTTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKRVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	296830	299307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_296891_298202_298515_298637
840453	contig_5878_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_145730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299102	300617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_299100_300600
840454	contig_11356_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_175272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTACCAAATTGACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434425	432269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_432300_434400
840455	contig_17796_pilon	-	1238	3	Intergenic	novelGene_33842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.5	127	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCATCGTGTCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148483	132754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_133794_147849_147995_148429
840456	contig_15691_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_60766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	87	389	51246	51548	NA	35	AAACTAGACTGGACTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAGRCRRCTPITWSKPSPSPFCGVRYFCMPDMFYVATPGYRGWKMFCYRDIHVFLLVPPSHLLPISLPLHPPLRADPVFPLKQLAHAASGPLHRRPDQPGFYSLAGLTKACGKAPAGTRVLGSIMGIH	51159	53467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_51200_53500
840457	contig_9505_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_121829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439310	437696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_437700_439300
840460	contig_9516_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_106137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGGAAAAGTGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347447	348947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_347400_348900
840462	contig_9274_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_151167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAACAAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633104	634063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_633100_634100
840463	contig_3942_pilon	+	473	6	Intergenic	novelGene_128768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5331.90579061558	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	38	451	793521	795483	FALSE	20	AGCAGTAACTGGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLLPADGLLPSPITLGLQ	792277	795505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313_795380_795428
840464	contig_1275_pilon	+	462	3	Intergenic	novelGene_108847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	600	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGTGTCTGTCGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746553	748113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747366_747821
840465	contig_299_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_129480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCAGAAGAGAAGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395468	1393355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1393400_1395500
840466	contig_1154_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_87076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTCTGGGGATGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220601	221243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_220600_221200
840467	contig_1244_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_38063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCATTAAACAGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178682	1179747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1178700_1179700
840469	contig_7035_pilon	-	730	3	Intergenic	novelGene_83526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGAATCTAATTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386461	385338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_385908_386022_386096_386373
840470	contig_6503_pilon	+	994	4	Intergenic	novelGene_145746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1.24721912892465	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	77	406	108929	113318	FALSE	35	GGTACATATAACTTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSLVDWLISNSFAVNRLEAVTLASMLMEENFIRPVGIRSMGAIRSGDLAEQFLDDSTALYTFAESYKKKINPKEEISLSTVELSGTVVKQGYLAKQGHKRKNWKVRRFVLRKDPAFLHYYDPSKCWEPWWCSG	108852	113906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_109043_109696_109799_111752_111837_113288
840471	contig_16209_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_177378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACAAAACAGCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2494	840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16209_pilon_-_800_2500
840472	contig_19735_pilon	-	1301	6	Intergenic	novelGene_167880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATAATGGAAAAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47388	6807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_6899_7859_7974_23837_23983_25310_25537_27417_27541_46786
840473	contig_9871_pilon	+	664	6	Intergenic	novelGene_75700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1811.39232636113	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	90	575	572939	584306	FALSE	35	TAAACACGTTTCTAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTPPEQPDRKRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLKKLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDGKLRPQAAFYSKMYTVLCVYFIKFYMEERRKHVFT	572849	584395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_579914_579992_581756_581826_582912_583051_584210
840474	contig_6595_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_122552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGTATGAACCCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690678	691996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_690700_692000
840475	contig_3382_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_124075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGTTAAGCGCGTAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341047	340099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_340100_341000
840476	contig_10246_pilon	+	1222	8	Intergenic	novelGene_46887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	204.846981218386	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	804	1130	176349	183855	FALSE	80	CATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQVKSSELRRFLKTHQGSQPVIGILEGLWEVFGRVDWVGFVFLRSIPEQLKLHGWGCRLSLLSLSSSWLQIRVDIVIRYS	140677	183947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_169672_169783_171155_171293_175049_175206_176299_176367_183546
840477	contig_15570_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_137853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTTTCATGGGGCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656291	656997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_656300_657000
840479	scaffold_14325_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_162656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAATAGGCAAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49400	50083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_+_49400_50100
840480	contig_9852_pilon	+	318	3	Intergenic	novelGene_138460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	713	junction_2	23.5	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTTATGTACAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32068	35574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_32184_33374_33434_35430
840481	contig_9440_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_59058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAACTAAAAAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499963	498839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_498800_5e+05
840482	contig_7171_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_101406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTGACTCATGGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1415487	1416662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1415500_1416700
840484	contig_5988_pilon	+	1047	2	Intergenic	novelGene_16133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAATTGTTCTTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560437	1587629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1560469_1586613
840485	contig_6199_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_126352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATTTTGTGTGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102814	101291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_101300_102800
840486	contig_3787_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_102423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGATGAATGACAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591907	591313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_591300_591900
840489	contig_12201_pilon	-	940	6	Intergenic	novelGene_159974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	301.546414337826	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	239	739	124452	110501	FALSE	25	TAATTTTTGTCTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQLLITVAFNQPVKLYSMKFQGPDNGQGPKYVKIFINLPRSMDFEEAERSEPTQALELTEDDIKEDGIVPLRYVKFQNVNSVTIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	139115	110299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329_124453_138877
840490	contig_7045_pilon	-	1431	6	Intergenic	novelGene_77452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCCCACGCGATGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364907	323302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_323478_358375_358501_361978_362088_362189_362286_363877_364007_364110
840491	contig_9594_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_73920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCAGGAAGCCAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148913	150539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_148900_150500
840493	contig_7070_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_104049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGATTCATGGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148468	149336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_148500_149300
840494	contig_12550_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_175276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAGGATATGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38450	39432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_+_38400_39400
840495	contig_6048_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_73199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491215	1490857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1490900_1491200
840496	contig_2380_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_117882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTTGCAAATGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26165	27140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_26200_27100
840498	contig_7457_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_31348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCATTTGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291263	290638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_290600_291300
840499	contig_14353_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_82129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	930	1343	229984	229571	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFPSAWGGREGAELRNGEIPGLGAACGLTCCCQVRPSAEVFQQVAGSSPYIPPPAEAPKSNKSNKRGSAWLAPLLEKLSSSASCIPGYWYARNPPDVQEGKSCLYSKNADKTSLESVPSFQLTLPLTKLPFVLIIC	230913	229293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_229300_230900
840501	contig_8452_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_47982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTATTTAAAATAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89156	88412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_88400_89200
840502	contig_13460_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_162178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGCTACCCCATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141258	139947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_139900_141300
840503	contig_7171_pilon	-	1333	7	Intergenic	novelGene_101252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	25.3355262208798	134	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	525	1112	790927	788002	FALSE	10	GTGACAGCCTCTCCTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPYLHPQSPAPFSLWVGRLGQRFGCLEAPGWCFVLCLPPTAMAFITYVLVAGLALGTQDRFSPDLLGLQASSALAWLTLEVLAILLSLYLVTINTDLTTIDLVAFLGYKYVGMIGGVLTGLLFGKMGYYLVLGWCCASIFVFMIRTLRLKILAEAAAEGVPVRGARNQLRMYLTMAVATAQPLLMYWLTFRLVR	795902	787780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_788158_789197_789292_789363_789520_790745_791017_791171_791277_791436_791676_795811
840505	contig_1785_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_175098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCTGGGGGACAAGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390310	389477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_-_389500_390300
840506	contig_1785_pilon	-	205	2	Intergenic	novelGene_175095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCTAAAAATAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384350	354934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_-_355029_384239
840508	contig_18039_pilon	+	1001	6	Intergenic	novelGene_171238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	22.8962879087419	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	255	671	79599	96163	FALSE	15	GACCGACGCCATTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPQELLTFRDVAIEFSQQEWECLEPAQRALYRDVMLENYRNLISLGISPSEMNIISILKKGTEPWTVKKKMKLAKNSDCSSFFIFYHLWLMHKSAYTLSSLTWLGSKEHAVTRSRRYTKWRMTTSAHKMEDDCIIT	75678	96493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_75707_78494_78650_79527_79614_83285_83413_84652_84749_95984
840509	contig_6451_pilon	+	496	4	Intergenic	novelGene_173694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_2	73.5859286065542	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	13	390	12389	277868	FALSE	5	CTCTCCATGTGCGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCGLIMVILLLLVAIVVVAVWPTS	12376	277974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231_153334_277800
840510	contig_11594_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_80888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCTAAAGCAACCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79079	79587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_79100_79600
840511	contig_10003_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_88192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAACACAGCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470622	470270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_470300_470600
840512	contig_12729_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_149932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGCAGTACCTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35639	34195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12729_pilon_-_34200_35600
840513	contig_15354_pilon	+	1072	4	Intergenic	novelGene_65754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	25.8370965001015	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGACCGTGAGTTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639009	642170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639096_639245_639699_640818_640895_641713
840515	contig_5718_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_110365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAGATATTTCCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718860	719303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_718900_719300
840516	contig_8576_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_88740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666728	665551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_665600_666700
840517	contig_14814_pilon	-	1211	12	Intergenic	novelGene_137747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	126.097561599431	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	341	1210	408418	398404	FALSE	45	GCAGTACTCAGAAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREWKGIDRLRLDKYHTLIRLVLRQSFEVLKRNSWEERQIKPFLDVLMKEILHPESQCPKGVKFHFIDIYLEELSKVGGKELLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTVVQTIARGVFGVMVAQSPFVPEEMVEEQRTRVGDSKLSEEEISENEMSWRETISRKKTALDKHHANDGISGDSERDSGGACEDPEPLLQFDYKAVADRLLEITNRKNIPPFNRKCLSKLIKKFQDLSEGSVSQPGFAEDNSADEDDHAVGQGRNKNKGSKPAEKTHLGKEKGSKFFRTEEEENE	419219	398402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402158_402251_404264_404447_405639_405705_406814_406945_407717_407780_408364_408451_411513_411597_418994
840521	contig_16535_pilon	+	1020	2	Intergenic	novelGene_167708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	176	982	348304	349110	FALSE	10	GCTCTGTGTGTGGTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPARAPKAWQGLSRLKLLAPASPGALGSETLHLRPRLLSWQGPAGTGGQGHPQGPGLRTRLLITALFGAGLGGAWLVARAEKERWRQQQRIEALRQAAVGQGDFSLLDHRGQARCKADFRGQWVLMYFGFTHCPDICPDELEKLVQVVRELEAHPSLPPVQPVFVTVDPERDDVAALAHYVQDFHPRLLGLTGSAEQVAQVSHNYRVYYSAGPKDEDQDYLVDHSVAIYLLNPDGLFTDYYGRGRSAEQIADSVQRHMAAFRSILG	347135	349148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_347300_348292
840523	contig_6375_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_73018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACCCCGTAAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403595	402935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_402900_403600
840526	contig_9363_pilon	-	396	3	Intergenic	novelGene_6646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	49	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	86	301	940473	939928	FALSE	25	AGTAAGTTCTACCAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWQQCGLHPDPAPLPASWLREVPHRFHQMTSITQNDIISTLQSLNMVKYWKGQHVICVTPKLVEEHLKSAQYKKPPITVDSVCLKWAPPKHKQVKLSKK	940994	939832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_939993_940322_940478_940913
840527	contig_10857_pilon	+	1100	2	Intergenic	novelGene_160927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	170	1084	537489	538403	FALSE	5	CGGGCCTGGCCGCCTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAGVGEAEGEAERGTESDTLPSDMVSLSDSDTDLSLPGSAEVEALSPEGLRGEAEGDSGPDEPPSPPAGLPGATVQPFHLKGMSSTFSKRSHDIFDCLEGVAHTSRGDSGGFKQPLSPPDQSPMEGPGRAIWSPVPPRVPSVPDYVTHPERWTKYSLEDVAEGSEQSNRAAALAFLGSRSPAASPDYAPSFNQDPSSHGEGRILFSKPARASEARPGRNRVLRKAGVPGAAEDTVKLAHLAASPETEESGPRGGLQEVGRPGGPSSGGPAPVETVGFRGSRKRSRDHFRSKDGSPEGPGGEA	537168	538419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_537314_537464
840528	contig_5954_pilon	-	820	6	Intergenic	novelGene_28406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.228920763909	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	86	730	41040	16103	FALSE	10	AGTCCCCCCATCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVHSAQGNELKLPTRRVVWPPPPALFFILVIQRELFRD	42834	16012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16191_38346_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_42750
840529	contig_12786_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_103459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATATAGAATGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753216	752035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_752000_753200
840530	contig_8636_pilon	+	1163	10	Intergenic	novelGene_141905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	55.5973176366905	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	8	964	271439	306962	FALSE	20	AAACTTGCTCCTTTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLMERQKRKADIEKGLQFIQSTLPLKQEEYEAFLLKLVQNLFAEGNDLFREKDHKQALVQYMEGLNVADYAASDQVALPRELLCKLHVNRAACYFTMGLYEKSLEDSEKALGLDSENIRALFRKARALNELGRHKEAYECSSRCSLALPHDESVTQLGQELAQKLGLRVRKAYKRPQELETFSPLSNGMATGMADQGTSNGLGSIDDIETDCYMDLRGSPAPLPSSPTMPLFPHVLDLLAPLDSGSRALPSTESLDDFSDGDVFGPELDTLLDSLSLVQSGLPGSGLPSELPQLIPVFPGGTPLLPPVVGGSVPVSVPLM	271431	307161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_271492_277831_277866_277987_278186_279156_279316_280602_280684_281532_281590_283052_283096_283710_283905_284180_284304_306947
840531	contig_13577_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_176115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACCAAAGGGCAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21902	20819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13577_pilon_-_20800_21900
840534	contig_8140_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_86461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGCATTTATTATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888903	890411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_888900_890400
840535	contig_5894_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_83070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACAGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876713	875345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_875300_876700
840537	contig_10044_pilon	+	852	6	Intergenic	novelGene_156379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	48.3056932462417	19	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	359	850	127559	135038	FALSE	35	CAGAGTTGAGAAAACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGPASLYNCESLTFSDVAVGFTWEEWQLLNPAQKDLYQDVMLENYNNLVSVGYQVSKPDVLSRLERGEQPWTILDKNHTRNFSEIWKVDDHLPGHWQNKSRVDSMKECCEHNALENIVHQHKNHFPLRENHGMVDLHDKAVTSNVTLINQTKSYEIKNSAEL	112279	135040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_112365_117085_117296_127495_127592_131338_131466_131718_131815_134802
840538	contig_6397_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_146225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTTCCCCTTCTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178821	177494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_177500_178800
840539	contig_8980_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_74012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTTTGCTCCGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648258	647893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_647900_648300
840540	scaffold_17541_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_175241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	336	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGAGCCTCCGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328411	327787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_327800_328400
840543	contig_9195_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_155680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCACCAGGGTTTCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291283	290472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_290500_291300
840547	contig_6691_pilon	+	1288	6	Intergenic	novelGene_60150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	14.560219778561	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	53	592	317592	330967	FALSE	75	GAGTAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKKRLFVASNGTSYPVAMLAQLSVFLCGSTSTPNGLWYNFIELPYHGDSISMFIALPTESSTPLSAIIPYINTKTIDSWMSIMVTKRVQVVLPKFTAVAETDLKDPLKAFGITEMFDPLKANFSKITRSENLHVSHILQKAKIEVSEDGTKASAATSAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHSPTGAILFMGQINKP	317539	331663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_317623_322967_323167_323976_324078_326610_326698_329120_329205_330929
840549	contig_9450_pilon	-	571	3	Intergenic	novelGene_174433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_1	396	216	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCACTTTAATTCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86306	32794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_-_33161_82987_83105_86218
840550	contig_11602_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_166587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGAGGATGTAATGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115781	114992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_115000_115800
840551	contig_11702_pilon	+	1240	11	Intergenic	novelGene_141984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	233	820	373459	375021	TRUE	25	AGACGACACTGCTCTCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGAAQALGLPGALRSGQSSLGQLGLHRPAVDDADVADDVLDGLGCGALAPDVWGVHVLIVHGCQDGLANGGGVGVEQMVQHHAARQQRRRGVGDVLVGNTLACVPSSRLEHRVHVAIVGPSHEAWAPDQPRADVVDDVAVEVRHHHDVKLLGPGHQLHGGVVHDHVLKGDLGVAGGHLPAALEEEPIAQFHVGLVHGRHFFAAALVGQLEGILSDAQGLGLRDDLEALHHSRPTSCSRLLYSPSVFSRTMRMSMSLCRVTTPGRLLQWMTLA	372913	380787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_373083_373301_373363_373456_373548_373929_374078_374165_374269_374528_374653_374897_375043_375133_375189_376303_376421_376698_376806_380667
840553	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
840554	contig_12624_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_60986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCGTTGCCTTCGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84757	85514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_84800_85500
840555	contig_4519_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_123692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAATAAAAGAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504090	505058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_504100_505100
840556	contig_990_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_76138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTAGTTCGAACGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1648121	1647219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1647200_1648100
840557	contig_14563_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_135022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTCCTAAATCATAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53944	52233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_52200_53900
840559	contig_14288_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_153828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400477	398724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_398700_400500
840563	contig_6414_pilon	-	1104	2	Intergenic	novelGene_157014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGAGTGAGGAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85567	73987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_74989_85464
840567	contig_10675_pilon	+	1375	5	Intergenic	novelGene_176287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.1118742080783	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	168	1004	118746	133151	FALSE	10	GGTCCTCCAGGCTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEFKKKLFWRAVAAEFLAMILFVFISIGSALGFNYPVSGNQTANASQDIVKVSLAFGLSIATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISILRAVMYIIVQCVGAIVGTAILLGVTSSLPNNSLGRNGLVPGVNSGQGLCIEIIGTLQLVLCVLAITDRRRRDLGGWAPLAIGFSVALGHLLAIDYTGCSINPARSFGSAVITHNFTDHWIFWVGPFTGGALAVLIYDFILAPRSSHLMDRLKGQSSSTACDSSHDWEENRETQMTRRPLTGTDTA	118578	133522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10675_pilon_+_119136_129058_129224_130190_130272_131537_131637_133049
840568	contig_11832_pilon	+	718	6	Intergenic	novelGene_106972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	35.8853730648018	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	99	485	463912	466401	FALSE	10	TTGGTGTCTTCGGCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAGAVRSPGPLWSRLAWQWQQQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAKWTETEIEMLRAAVKRFGDDLNHISCVIKGSDKGHRETQDVTLSALNDSDANSDLVDIEGLGETPPAKKLNFDQDSLTLDSGTSHDLC	463813	466634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_464826_464918_465610_465642_466007_466113_466357
840569	contig_14720_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_164999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCATCACAAGAAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243338	242201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_242200_243300
840570	contig_5766_pilon	+	1171	2	Intergenic	novelGene_175048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCTTAAACTCCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767450	775593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_767704_774675
840571	contig_7412_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_76277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGGGGTGGGGGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256199	256900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_256200_256900
840573	contig_6017_pilon	-	309	3	Intergenic	novelGene_152543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3344	57	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACTATCACTTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442550	440550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442195_442468
840574	contig_5988_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_16156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCGGCCCCTCTTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1974056	1973564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1973600_1974100
840575	contig_5988_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_16155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCCCATACCCAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1973003	1972722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1972700_1973000
840576	contig_11370_pilon	+	802	3	Intergenic	novelGene_98724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1310	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	140	526	145831	148269	FALSE	20	AAAGTGCTGTGTGGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEPRSGRQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRSDLGDGQRRCPWWFDQQEML	145691	148545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147620_148211
840578	contig_9650_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_177381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	335	766	346840	347271	NA	30	AATAAAGTTTGTCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGAFWSERKKDKKEAIPQSDLAVCPALCTQPHFRASHQLRSQENWPLDQGRCRDPTQPVGAQPDLKLSLLTPEPRFPNVHVRLLLWIELCPPKRNVEVLTCECDLVWKFVVVLVSCQRESAPNSWRPHAQEKETLPSPALSP	346505	347854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9650_pilon_+_346500_347900
840580	contig_9363_pilon	+	882	2	Intergenic	novelGene_6653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	130	402	979537	979809	TRUE	15	TCCCCGCCACCATAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVFPAFLRAKLLAPRVSGHHLTLEAWGGFLGAGRSVPAAALRSMSPHVAFEGHGIGEVLATGGTGEKASLVGPAVVDQAPWVTVAPPTLLTAVGPGDLVSLLSVPVGRWMEQFSVPYQFWEARKVALAVRAAE	979407	982102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_979914_981726
840581	contig_14846_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_85388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGGGGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248947	250432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_248900_250400
840582	contig_13966_pilon	-	803	2	Intergenic	novelGene_158151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	0	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	12	353	429996	427209	FALSE	65	TTGAAAAAAAAAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSRVPVPRLEGVSREQFVQHLYPQRKPLVLEGIDLGACTSKWTVDYLSQVGGRKEVKIHVAAVPQMDFISKNFVYRYFLLRFTLGVQITFEKPLKKFCFITQRSYVISSFG	430007	426758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_427473_429918
840583	contig_4364_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_4203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533072	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
840584	SIRV5	-	294	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10988	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
840586	contig_826_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_154938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGACCACTTGAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317907	317374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_317400_317900
840587	contig_1442_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_172155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTCCAAGGGCTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387225	386257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_386300_387200
840590	contig_5954_pilon	-	651	6	Intergenic	novelGene_28579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.8887510136314	1854	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	90	578	929131	926594	FALSE	10	GCCCGAGTGAGCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRKGGSTVEVDSGGAARRDMRLSWVLAVLSICLNALATAAGAEGKRKLQIGVKKRVDHCPIKSRKGDVLHMHYTGKLEDGTEFDSSLPQNQPFVFSLGTGQVIKGWDQGLLGMCEGEKRKLVIPSELGYGERGAPPKIPAGGATLVFEVELLKIERRSEL	929220	926520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_926659_926741_926778_927044_927092_927204_927318_927656_927826_929072
840591	contig_10980_pilon	-	2092	2	Intergenic	novelGene_162573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAGCTTAGATGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392237	372231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_372612_390525
840592	contig_8375_pilon	-	128	2	Intergenic	novelGene_141319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	0	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTTGGTGTCGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225193	224862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_224956_225158
840593	SIRV2	-	311	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	34	3387	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
840594	contig_6164_pilon	-	807	7	Intergenic	novelGene_121275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.332855777434	22	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	112	519	485859	475415	FALSE	25	CTAAGTTATCTGTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRMGKPAPPGAAYPGPTAPGAYQSGAGAYPAASPYGGLAEPLTLPYDLHLPGGIMPRMMITILGTVKPNANRIALDFMRGNDIAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKQDNVWGREERQNAFPFESGKPFRVNTSTG	493171	475126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_475432_481534_481705_483551_483641_485555_485663_485834_485904_486668_486691_493126
840597	contig_13048_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_138915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACTGGCAATGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327622	328969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_327600_329000
840598	contig_13823_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_145277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACATCAATCTTTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322271	323066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_322300_323100
840599	contig_17989_pilon	+	665	4	Intergenic	novelGene_150834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	182.078737546883	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	10	423	261854	265002	FALSE	20	AAATGTGAGTCTGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFINKGEKGLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDLGAAAGSKRPTCVIMVKPHEEYQEAYDECLEEVQALPPPL	261844	265244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262087_262158_264211_264270_264876
840600	contig_9706_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_21025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCTGCAGACTGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584949	584633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_584600_584900
840603	contig_10949_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_146690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATATTTTATATATGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49316	48771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_48800_49300
840604	contig_663_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_163747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAAGTTCCTAGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84837	83906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_83900_84800
840605	contig_11396_pilon	-	734	6	Intergenic	novelGene_71408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	108.788602344179	545	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	72	611	1648829	1644244	FALSE	5	CCCGCTCACTCTGGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPSAPAAASATSPSPAPSSVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649988	1644120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1644896_1645249_1645307_1648714_1648831_1649918
840606	contig_9188_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_175727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATATATTTTACCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17067	18821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_+_17100_18800
840607	contig_13780_pilon	-	841	5	Intergenic	novelGene_149042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	21.1719153597401	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	326	493	575218	571933	FALSE	20	ACTTGTCTTAGTGAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAERRDAAPGPVSRFCPPKTSCHDWIGPPDKYSNLRPVQFHIPEDESPLEQKLRELRQETQEWNQQFWANQNLTFSKEKEEFIHSRLKAKGLGLRTESGQKATLNAEEMADFYKGFLSKNFQKHMYYNRDWYRRNFAITFFTGRVVLERVWRRLRPKQKLSSS	603783	571584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_572039_575156_575248_580521_580586_581725_581924_603749
840608	contig_8594_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_140027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAACCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312758	311498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_311500_312800
840609	contig_8100_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_176008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCAATTTAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395905	394561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_-_394600_395900
840610	contig_12464_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_68740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGGTTATTTATTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425496	426495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_425500_426500
840613	contig_5286_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_157373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTAGAGCTGCACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576006	576453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_576000_576500
840614	contig_6445_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_77104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACAGAGCGGAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162690	1162010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1162000_1162700
840615	contig_9272_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_125988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767716	765577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_765600_767700
840616	contig_13481_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_119457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCACAGCCTTGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070681	1070288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1070300_1070700
840618	contig_12724_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_146854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134332	135741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_134300_135700
840620	contig_19604_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_77258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275479	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_275500_275800
840621	contig_4845_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_53644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGACACTTGGTGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319244	320220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_319200_320200
840623	contig_401_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_42748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTTGTTTGTTTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925592	924910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_924900_925600
840625	contig_5481_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_144569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATATCTGTATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237065	235729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_235700_237100
840626	contig_8864_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_135999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAACCCTGTAGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699367	699108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_699100_699400
840627	contig_9683_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_151272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGAGAAGGGGTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415220	416221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_415200_416200
840629	contig_6217_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_109679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGAAGTAGCTGCTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844686	844042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_844393_844459
840630	contig_3960_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_138021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTATCCTTACAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442820	441485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_441500_442800
840633	contig_7919_pilon	+	1063	4	Intergenic	novelGene_28047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	389	junction_1	435.450979509239	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	282	599	973941	974709	FALSE	15	CTGTGTGATTGCCACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAEMGRFNISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSRYADVDPENQNFLLESNVGKKKYETDFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFM	972449	975173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_972723_973932_974057_974362_974445_974589
840636	contig_5316_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_61242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACAGTTTCTGCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458637	459859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_458600_459900
840637	contig_1264_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_161318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATCTAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142160	141231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_141200_142200
840638	contig_500_pilon	-	541	6	Intergenic	novelGene_31092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	302.89047525467	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	17	541	1510494	1500071	FALSE	20	TAATGCTTGCCTCACGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGGRKGGHKGRARQYTSPEEIDAQLQAEKQKAREEEEQGEEGGDGAAGDPKKEKKSLDSDESEEDEDDYQQKRKGVEGLIDIENPNRVAQTTKKVTQLDLDGPKELSRREREEIEKQKAKERYMKMHLAPGQGPFLTLPINHFKKPPFTVRHPGKTCSTNSTCIFGRLNLTLS	1510510	1500070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1500203_1502096_1502152_1504329_1504452_1506281_1506393_1507659_1507752_1510481
840639	contig_8269_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_106235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGATAAGGTGTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311458	311744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_311500_311700
840642	contig_11145_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_160532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284052	283138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_283100_284100
840643	contig_14333_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_49164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGGCGATGACCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534395	534696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_534400_534700
840645	contig_5797_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_56928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCATGCAGTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221716	222746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_221700_222700
840646	contig_3956_pilon	+	1161	6	Intergenic	novelGene_14765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	24.6690088978054	196	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	394	759	873679	874886	FALSE	15	AGTTTCCTGGTGGTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKYQKIKLQNKVFQERIHCLEGTHEFFEAIGFQKVLLPVPDQEDPEEFYVLGEAARAQPQNLERHKEQLLGAEPLRARLDRQRRVFRPSPLAAQFDLPGDFFTLTAEEIRREQRLRADAVERLSVLRTKAMREKEEQREMRKYTYTLLRVRLPDGCLLQGTFYARERLSALYGFVREALQNDWLPFELLVSGGQRLLEDENLAFNECGLVPSALLTFSWDPAVLQDMKAAGAEPDRSVLKPELLSVIENLS	871955	875288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_872001_873137_873223_873328_873549_873635_873767_873864_874014_874757
840648	contig_8304_pilon	+	1349	7	Intergenic	novelGene_153173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	155.401362070393	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	912	1250	105349	112550	FALSE	45	ATAATACATATGTACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKCCSLLNCHTQVAILCQFLREIDYKTAFKSLQEQNSHDAMDSYYDYIWDVTILEYLTYLHHKRGETDKRQIAIKAIGQTELNASNPEEVLQLAAQRRKKKFLQAMAKLYF	102526	112649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_103322_104607_104712_105336_105388_106811_106886_106965_107031_107187_107232_112433
840651	contig_5602_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_133018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAATTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492551	492879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_492600_492900
840652	contig_16870_pilon	+	633	3	Intergenic	novelGene_155494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	9.5	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCACATTGCCTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104466	107909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104632_107350_107425_107515
840653	contig_5968_pilon	-	943	8	Intergenic	novelGene_112195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	618.76483284633	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	156	593	700606	631733	TRUE	15	CTTGTTTTCATAGTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLILMKMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLIWGRIYSC	732249	622525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622743_625838_625909_631669_631762_635205_635346_636586_636687_638184_638333_700585_700743_732230
840654	contig_14687_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_107882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	232	504	22392	22664	NA	30	GGAGTAAACACTTCCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAAPASSRRTGTTCTRSTQWTGQLPSWTSWPRPTTPTTAETATITGCWSPSGPRRPPARPVTCPERYGSWRRRRLMTSGARENPIQVPRSSREAAGARERRPEDVPHPDLAWLPATHHKGSLPNPCFGVGCTGTARSRFLGSLGKCGRLDSSHPARLCGRGRRGD	22160	23693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_22200_23700
840655	contig_11855_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_67078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	199	306	2171713	2171606	NA	55	GAAAGAAAAATCGTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHTRSEKSCFPPPVPSLGLRPDTSPGQRPEKQGRELSSVLGLPAPPGLAGQGLLRLELASSKDLHMKECPPPPPPPLPCVHGLTGLRGLICVALKKSGPV	2171911	2170965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2171000_2171900
840657	contig_3862_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_137422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAGGAAGGTGGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598199	598822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_598200_598800
840658	contig_14209_pilon	-	1058	7	Intergenic	novelGene_88365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	13.8252988715937	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	345	938	85026	52977	FALSE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKDYPRLPVFLLGHSMGGAIVILTAADRPGHFAGMVLISPLVLASPESATTFKVLAAKVLNLILPNMSLGPIDSSVLSRNKTEVDLYNADPLICRAGLKVCFGTQLLNAVSRVERALPKLTLPFLLLQGSADRLCDSRGAYLLMEQAKSQDKTLKIYEGAYHVLHKELPEVTNSVFHEINMWVSQRTPVAGAGSPP	169821	52856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_53103_54078_54295_69935_70026_83413_83525_84975_85113_168293_168439_169708
840659	contig_10182_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_134611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACATTACTGTTACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56499	55521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_55500_56500
840660	contig_13014_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_169347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATGACATGCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396348	395062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_395100_396300
840661	contig_15021_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_26970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATTCTTTAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278712	277983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_278000_278700
840665	contig_678_pilon	-	1191	9	Intergenic	novelGene_167823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	196.878730123393	24	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	70	1026	153915	145144	FALSE	50	ATATAAATATATATATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAVQSAGRGPGALPAACSAAMSQGSPGEWAPLDLTAGTPNPFVHELHLSRLQRVKFCLLGALLAPIRVLLAFIVLFLLWPFAWLQVVGLTDEQLQEPVTGWRKSVCHSGVLGLGRLLFFLLGFLRIRVRGQRASRLQAPVLVAAPHSTFFDPIVLLPCDLPKVVSRAENLSVPVIGALLRFNQAIFVSRHDPASRREVVEEVRRRATSGGKWPQVLFFPEGTCSNKKALLKFKPGAFIAGVPVQPVLIRYPNSVDTTSWAWRGPGVRAPARASPSRASPSVSSRTSPSVTPSMGRSSAPTCASHTPLVAPRSGQRPHPPGGPTALANGTAQAPKQKGD	153984	144978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_145321_145530_145574_150264_150300_150481_150541_150984_151046_151167_151281_151690_151912_152220_152364_153810
840667	contig_3601_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_132914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255138	254722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_254700_255100
840668	contig_9185_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_166883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGAAGTTCGCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177633	176340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_176300_177600
840669	contig_16382_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_160227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCTGCAATTTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172634	170610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_170600_172600
840670	contig_5728_pilon	+	735	3	Intergenic	novelGene_126707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	59	451	371873	408722	FALSE	30	TATACTATGGAACCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHQVAGSRQFSSPATTQRGMWGVAVPKLACMQRAAAASALGLFSRLQTPVPTMRTFSLSQPSQKVADPVWNLGRLNHVAIAVPNLEKASTFYKNVLGAQVDNINTAMMDLKKKKIRTTTEEAKIGAHGKPVIFLHPKDCDGVLVELEQA	371814	409006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_371937_392287_392464_408569
840672	scaffold_7386_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_136583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	728	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGGCTGAGACCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293606	294706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_293850_294407
840674	contig_4125_pilon	+	1838	8	Intergenic	novelGene_25036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_5	2.61080955464244	36	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	142	1239	66376	69141	FALSE	5	GACTCCTCGGCCTGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRPHPQVLELVSSDSLNVPSEEDVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAEGLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAISNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAPLHGLLYATGGYDGASCLNSAERYDPLTGAWTSIAAMSTRRRYVRVATLDGSLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNAWTPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERFSPKASAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL	66001	69740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_66140_66372_66587_67307_67453_67530_67699_67953_68043_68143_68218_68496_68679_68912
840675	contig_2455_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_119201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACCTGGGGAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828251	828751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_828300_828800
840677	contig_7179_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_78097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTAATTCATGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624740	623738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_623700_624700
840678	contig_12227_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_127402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTCCATCTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139452	140326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_139500_140300
840679	contig_8823_pilon	+	846	4	Intergenic	novelGene_53053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	33.4763598180368	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	278	673	85153	85815	FALSE	15	CCAATACCTGTGCGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSCNLIAGSETKGPFSIPSSKEALHGAQGSLSPSASNGSPRETWTLGLMPCKSRRAMPLQTGYPTMYALSQDAGAPSRTELLAKIPISWGIKNQLLIHTRQGTLWKAGRSSERKAVGASTMVRTPWTSRL	51757	85988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_85102_85376_85642
840680	contig_19647_pilon	-	1058	6	Intergenic	novelGene_144021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	154.166144143259	221	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	193	780	137920	101718	FALSE	30	GCAGTGAAGGCAACCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGGKKKSTKTSRSAKAGVIFPVGRMLRYIKKGHPKYRIGVGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKGRVTPRHILLAVANDEELNQLLKGVTIASGGVLPNIHPELLAKKRGSKGKLEAIITPPPAKKAKSPSQKKPVSKKAGGKKGARKSKKQGEVSKAASADSTTEGTPADGFTVLSTKSLFLGQK	146564	101439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_101721_102559_102668_112495_112694_113103_113211_137748_137954_146405
840681	SIRV2	-	445	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4408	54	3233	-19	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTAAGGAGACGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	1054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1500
840683	contig_177_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_41778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291476	291689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_291500_291700
840685	contig_9177_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_32793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTATAAGTGCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496922	1495235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1495200_1496900
840688	contig_14925_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_55244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAGTCAGGATTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86499	84802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_84800_86500
840689	contig_15952_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_154070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATCAAGAAATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308665	309938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_308700_309900
840691	contig_8021_pilon	+	920	2	Intergenic	novelGene_177383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAAACCTGAGCATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149738	150773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8021_pilon_+_150116_150230
840693	contig_6048_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_73107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAGGTAGGTTTCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267046	266497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_266500_267000
840694	contig_6048_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_73106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAATCAGACAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266497	265497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_265500_266500
840696	contig_6165_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_167405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAGAAAGTTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439346	439111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_439100_439300
840697	contig_5921_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_142238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACTAAATAAAAGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82324	81879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_81900_82300
840698	contig_6589_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_25990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTAGCCGCGGGGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375643	1373945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1373980_1374633
840701	contig_9381_pilon	-	860	6	Intergenic	novelGene_129365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_2	78.5722597358635	488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	50	784	74659	19597	FALSE	15	TCCCTTTTGTGTAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKISGLEIMDEDRLIEEVLDKFVNCHEQTYEEFLSTFTHLSKEDNGTKKGAFGTDSLENVFTSVKFAHKMEPNDHHLRNKTIFLRTLSQCSEEEQIMMDEGQKVGSSFQGDLNRAGKVKVDNFLDLEDLDMDEDIKPQMSKDLLLLPGEVEQYISTSAPSYIPSVDQILTPEVKPSTTTNRAGKPMEELLGDEVHPFSLDEEFDYDKVMLTPKFTSAEMDTIKQLSKQKKENPNGDLEEPHD	74708	19520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9381_pilon_-_19762_34777_34918_48899_48967_50275_50348_52639_52798_74526
840703	contig_15664_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_171497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	21587	21267	NA	40	AGTGAAAAGAGCTCACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRNVVKLRKDRRDPSARVGGSGFLFADEDDGRGRRAGLGWRAALFRHCARPAARFPGLLRRGQATPWLACRGIGSLAGQPSDSEAQPAREADLVITIWSLHCFCF	21588	19724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_19700_21600
840705	contig_12951_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_68250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAACAAAAAAAAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842466	842879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_842500_842900
840707	contig_11845_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_148147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGCCCTTTCAGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79030	79992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_+_79000_80000
840708	contig_14445_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_137381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351815	351071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_351100_351800
840709	contig_15327_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_70829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	1143	1442	1635000	1634701	NA	25	GCCATTTTAAGTTGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIYKYRERDLIQGNGSRSCGSCQVPKSMGQTSGWRLLLTHMVAGADELKIGWQTAGHGLTGLWELTDPKICRSGGSCWLYSYTKIKRLTSKIKKSSYCL	1636142	1634699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1634700_1636100
840712	contig_6206_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_168153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	257	562	138423	137985	FALSE	50	AGGACATCATACATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLETKNDQLLKNVALVIETMAEITDRILQDQQTRPGADCRTNNQLLICNFKLKLKKIRTSPGEPKDDLQYIPPEFRDRFRNRFNALNTNDRRPDELWNDI	138679	137983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_138190_138322
840714	contig_5696_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_117607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTCCCTATCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913532	913935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_913500_913900
840716	contig_5479_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_133621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432171	432708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_432200_432700
840717	contig_12078_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_74096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGGAAAACCAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208095	206144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_206100_208100
840718	contig_4392_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_117347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTAGAGCAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667380	669320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_667400_669300
840720	contig_10855_pilon	-	1273	2	Intergenic	novelGene_124364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATATGTGTCTGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695980	694625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_694658_694739
840721	contig_14665_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_171048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCAGCACCCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58413	56805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_56800_58400
840722	contig_8260_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_163251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGAAATACTAATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177162	176088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_176100_177200
840723	contig_1301_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_47297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAGTTCTTCCTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263965	262978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_263000_264000
840725	contig_16897_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_174456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATCCATTACCCAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74693	73919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_73900_74700
840727	contig_91_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_127105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	105	428	349803	350126	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHGGKITPKGESMNYPIMLTKPEVTEPEAVTVVRCRRMGSDSQRPRVQQNKTLPGWSCAILTLVSMFVPIVAATVSDHLVEGLPLFCWPSTLLYQARCPSPGIGPS	349698	351423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_349700_351400
840728	contig_8064_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_164553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGACATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28434	26396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_-_26400_28400
840729	contig_5959_pilon	-	893	3	Intergenic	novelGene_150183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4	105	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	142	708	181431	180596	FALSE	15	TGTCAGTTTACCTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRVLSNPVTQDPQEQELIVVKVEEGLSWGQKSKQDGSAQSCQEIFRQQFRKFCYKETPGPREALGRLQQLCYRWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELRVWVQQQSPKSGEEAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASPQGPAVPWKDLTFLGASQESTNVQLQPLKTQLKSWEPCLSHRSGEE	182842	180410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_180749_181017_181522_182791
840730	contig_2757_pilon	+	1978	7	Intergenic	novelGene_164567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	7	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	218	1249	14583	20512	FALSE	10	CCAGGGTTGTGTCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCRRLCLGLGFCLLAGVGLCVLWVYIENWLPASYVPYYLPCPKIFNMKLQYKGEKPFQPVAQLHYPQPKLLEQRPTQLLTLTPWLAPIVSEGTFDPMLLQNIYQPLNLTIGLTVFAVGRYTGFIQHFLESAEMFFMHGYHVYYYIFTDDPAAMPHVPLGPGRLLSVIPIQGYSRWEEISMRRMETISQHIANRAHREVDYLFCLDVDVVFRNPWGPETLGDLVAVIHPGYYAVSRQQFPYERRQVSAAFVEDNEGDFYYGRAVFGGRVTRVYEFTRGCHMGILADKANGIMAAWQEESHLNRRFISHKPSKVLSPEYLWDDRKPQPPILKLIRLSTLDKGTK	13477	21241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_13573_14460_14654_15196_15263_17490_17542_17622_17659_18710_18846_19839
840732	contig_3866_pilon	-	800	9	Intergenic	novelGene_112430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.092249953019	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	54	653	268685	242050	FALSE	30	CCACTGAAGTTTGGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKMNL	268738	241902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_242060_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253751_253854_257352_257477_265864_265948_268664
840733	contig_7165_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_116904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1198196	1199069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198200_1199100
840736	contig_7056_pilon	-	1273	8	Intergenic	novelGene_43720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.36808406515884	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	195	350	946475	941211	TRUE	15	ACAGATTTGCTTTGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPARVLRCCSCRLFQAHQVKKSLKWTCKACGEKQSFLRDYGEGSGADCRRHVQKLNLLQGQISEMLLRSLEEPVNASEEESAGHQQAENVSLQVLDKLCLLLPRWLPVCTKPSGA	960580	937944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_938605_940175_940249_940913_941072_941178_941280_944191_944268_946464_946554_952294_952355_960524
840738	contig_6217_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_109587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACCTCAACATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248026	247195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_247200_248000
840740	contig_4745_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_175174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGAAAACCCTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193073	194064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_+_193100_194100
840741	contig_14546_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_157416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACCTCAAGCCCAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70671	68900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_68900_70700
840743	contig_14289_pilon	-	1178	6	Intergenic	novelGene_110576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	42.9762725233355	146	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	410	790	91860	86504	FALSE	35	TAATTTGGTCAAACCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCRDPSCCAGLRVFRNQLPRKNDFYSYEPPSEEPPPETGESVCLQLKSGAHLCRVCGCLAPKTCSRCHRAHYCSKEHQTLDWRWHRQACARAGDLEDTVPDHNFLFPEYEIVIGAEDEAPPEVLEEEDDVEPIGSMGEAFEDELESMAKHESREDKIFQKFKKQIALEPEQILRYGRGAAPVWISGENVPQEKDIPNCPCGAKRIFEFQVMPQLLNLLKADSLGTSVDWGVLAIFTCADSCALGTGYAEEFVWKQDVTDTA	95374	86115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_86663_88710_88825_89970_90075_91856_91989_94388_94629_95333
840745	contig_14450_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_48994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCAGACCGTAACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074679	1075762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1074700_1075800
840754	contig_12735_pilon	+	1884	1	Intergenic	novelGene_140773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36120	38004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_+_36100_38000
840756	contig_9901_pilon	-	1120	7	Intergenic	novelGene_126931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	133.990878628195	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGGTGGTTTTATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198711	171083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_171336_172049_172174_178113_178343_184551_184683_185870_185998_197326_197519_198646
840757	contig_15939_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_160246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGCACTTTTGCTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8956	10817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_9000_10800
840760	contig_9297_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_69861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGACTAATCTTTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869721	869154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_869200_869700
840761	contig_4769_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_118011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062940	1061770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1061800_1062900
840762	contig_817_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_132496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACTTTATTTACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793896	795708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_793900_795700
840765	contig_13014_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_169344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	316	501	386667	386852	NA	20	GTAAGCCGCCATCATTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIRSQLRGPLLPAPSLTTSAPPTLHLPDVPEAVCISREPVSARREGLGLSDSLPPGQGVETALCSWGRKELTPGTLRRSAVEDPAEHSSTLTCRVTVSQQLVPSMLWLLVAVKLILTHSDPAYAGENCSDPVCAGENCSDPVCAGENCSDPVCAGENCSVGFSRL	386351	387143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_386400_387100
840768	contig_8888_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_167763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCTCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156777	157816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_+_156800_157800
840769	contig_13206_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_161894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAGGTCACCTCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104099	103339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_103300_104100
840770	contig_10196_pilon	-	1506	9	Intergenic	novelGene_132061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	9.83298021964857	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	119	994	694464	691805	FALSE	40	AAAGCGGACTGACGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSPGTVGSDPVILATAGYDHTVRFWQAHSGICTRTVQHQDSQVNALEITPDRSMIAAAGYQHIRMYDLNSNNPNPIISYNGVSKNIASVGFHEDGRWMYTGGEDCTARIWDLRSRNLQCQRIFQVNAPINCVCLHPNQAELIVGDQSGAIHIWDLKTDHNEQLIPEPEVSIMSTHIDPDASYMAAVNSTGNCYVWNLTGGIGDEVTQLIPKTKIPAHTRYALQCRFSPDSTLLATCSADQTCKIWRTSNFSLMTELSIRSSNPGGVVPWLDVGLRLLGRLPVHCHRVLR	695315	691292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_691818_691912_692078_692210_692336_692966_693120_693262_693339_693912_694076_694161_694214_694335_694538_695270
840772	contig_12580_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_172904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCGACCTCATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194801	195608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_194800_195600
840773	contig_11590_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_125614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGATAATAGTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945809	947006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_945800_947000
840774	contig_20951_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_43113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGGACCCTGCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170842	171534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_170800_171500
840776	contig_14647_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_167379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCATAATGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139862	138540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_138500_139900
840777	contig_5916_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_158037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGTGGCCAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327014	327419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_327000_327400
840778	contig_14322_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_116608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATGTATGTAAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675426	676324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_675400_676300
840780	scaffold_16539_pilon	+	646	4	Intergenic	novelGene_68332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	109.273357533603	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	41	532	415666	433538	FALSE	15	GACCGGACTCTGTGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIKKIAIFGATGKTGLTTLAQAVQAGYEVTVLVRDPSRLPPEGPQPAHVIVGDVRKAADVDKTVTGQDAVVILLGTGNDLSPTTVMSEGAQNIVVAMKAHGVDKVVACTSGDEPLTGAYSVTVDGRGPSRVISKHDLGHFMLHCLTTDEYNGHNTYPSHQYE	415625	433652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_415745_424683_424849_424983_425074_433380
840781	contig_5136_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_126653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	288	794	341261	341767	NA	20	CTATTTAATTCCACCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSWEGKVTLGGGNRVGESVTEAEKNRLGLGTLHSPTGYNQRTWKGVEAIRLQAKFALWSLECHAKPHLTNTSHLMKEGIRKQTLQLKFIIQQEKQSAQQLFQYMVQTRGAVETRWSYSSGTSCSSWHLAHDVDTDGTAIKGAFAEDQACAEPLTYTLPFNLPSKTMR	340973	342144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_341000_342100
840783	contig_709_pilon	+	1244	2	Intergenic	novelGene_57622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	905	1216	2506494	2507417	FALSE	35	AGCCTTACTTTTCAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPACTRRGRRNHSLCSSPSTSPGPPLSEEGGLAGHCHHSHLVPPGWPFLRAGRGGTGVEGRRAQGAGDGPQTCLPAISLPRLGPGGKKDEHYSVRGRGGAVC	2505589	2507445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2506783_2507394
840784	contig_7444_pilon	-	1168	2	Intergenic	novelGene_174924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGATTTTTTTGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67934	60825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_-_61953_67893
840787	contig_15350_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_164265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTCTGTCTGTCCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261455	260437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_260400_261500
840788	contig_11602_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_166599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225561	226914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_225600_226900
840789	contig_4364_pilon	+	712	5	Intergenic	novelGene_136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	24.7032386540712	433	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	33	539	1125140	1129116	FALSE	15	GCTCAGCCTCTAAGCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEARAEVTVMEEAGVGFRKELVSKLLNLHFRDKKTKVSTDALQLMAEMLKIFVVEAAVRGVRQAQAEDLPRVDVDQLEKVLPPAAPGLLEDSLALEDCLHLGRGGPAPGPDGVVFCGLWFPAGEGLRGLELISPALQTPGPEPPTRAAPQPGEQDVPGRPCPGEPGAQRGWESMLLW	1125107	1129289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1125170_1128087_1128140_1128329_1128384_1128646_1128737_1128835
840791	contig_6589_pilon	-	729	6	Intergenic	novelGene_25920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	215.067803262134	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	64	522	1178015	1158723	FALSE	35	GGTCCCCATAAAAACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYLSPQETFGPHCGRNLQPQLQTRRPQSKRARWPSPWAAWVSQLRWGQLLCSWPPRPTSARA	1178078	1158515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1176083_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927
840792	contig_5918_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_99632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAGGCAATCTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2235739	2236106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2235700_2236100
840793	contig_7378_pilon	+	768	4	Intergenic	novelGene_120231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	131	junction_1	48.9148920745683	1360	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	109	477	62113	80638	FALSE	45	AGACTGAAGAAAAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPEIVSLFWGQMKVEGSTKTYKDCKVWPGGSRAWDWRETGTEHSPGVQPADVEEVVKKGVQTLVIGRGMSEALKVPPSTVEYLEKQGIDVRVLQTQQAVKEYNALVAQGVRVGGVFHSTC	50625	80929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_50716_62094_62245_78598_78695_80497
840794	contig_3394_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_152712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTTCCTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529255	527272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_527300_529300
840795	contig_1146_pilon	+	407	4	Intergenic	novelGene_84857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_3	3810.38222054778	176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATCAGTGTAGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949779	957203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951113_951651_951732_957038
840796	contig_10732_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_114729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACATGACTTGAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417620	417864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_417600_417900
840797	contig_12355_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_172102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGTTACTTTGAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232728	233584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12355_pilon_+_232700_233600
840798	contig_1244_pilon	-	1187	11	Intergenic	novelGene_37934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	33.8232168783515	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	8	1153	870512	720117	FALSE	35	AAATGGATGAATATTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSEQAEQPSQPNSAPGSENVLPREPLIATAVKFLQNSRVRQSPLTTRRAFLKKKGLTDEEIDLAFQQSGTAADEPSSLGRATQVVPVQPPHLLPQPYSPVGSRWRDYGALAIIMAGITFGFHQLYKKYLLPLIVGGREDRKQLERMEASLSELSGSVAQTVTQVQTTLASVQELLIQQQQKVQELAHELAAAKATTSTNWILESQNINELKSEINSLKGLLLNRRQFPPSPSAPKIPSWQIPVKSPSPSSPAAANHHSSSDISPVSNESTSSSPVKESHSPEGSTYHLLGPAEEGAGVLDVKGQARSPEASAFRRLAQHLYQTDILSRVCLLSVFTLTPRMTRGLWLLTKPEGPGLWVRGVCCKATSPIAGEGTSYYCI	870519	720082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_720227_720962_721081_721557_721799_723587_723680_727655_727754_728925_729029_732208_732295_755798_755928_813306_813392_851591_851640_870476
840799	contig_9957_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_173842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413540	414843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_+_413500_414800
840800	contig_10323_pilon	-	1184	3	Intergenic	novelGene_123557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	163.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTCTGCTTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280495	268241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_279648
840801	contig_9189_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_165140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACAGAGGCAACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614145	613374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_613400_614100
840806	contig_16883_pilon	-	2013	2	Intergenic	novelGene_161720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	871	1242	160169	159798	TRUE	35	TGAAAATTCATTGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVATWARLLGMARGIGAVTSGLSSLDLSVFIRTRRHLVDGLGASRHANGSDVRPVPLPVSALGHRECSLCWISEPWFGCRDGGTPRRASEVEMAAWARSSSQPYGATSAWPLVQLLHYVVMD	161039	158886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_159605_159744
840807	contig_826_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_154949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGGGAAGCAGACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411329	411996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_411300_412000
840809	contig_20140_pilon	+	491	4	Intergenic	novelGene_170560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_3	517.117867501104	2578	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCTTCCACAAACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31223	33454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20140_pilon_+_31274_32031_32102_32436_32530_33176
840810	contig_14924_pilon	-	1318	6	Intergenic	novelGene_104165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.3046005777511	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	21	704	206743	57069	FALSE	30	TGGTAAGTGGTGAGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDAVCQLLENKEDISQYGIARFFTEYFNSVCQGTHILFREFSFIQATPHNRASFLRAFWRCFRTVGKNGDLLTMKEYHCLLQLLCPDFPLELTQKAARIVLMDDAMDCLMSFSDFLFAFQIQFYYSEFLESVAAIYQDLLSGKNPNTVIVPTSSSGQHRQRPALGEASMLEGVPGLVNSVSASPEASCLPSRTPPRVASPWRPLHHSRKVDAESDGSTEETDESET	206763	56454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_57234_61315_61453_63179_63266_79036_79122_163115_163247_206663
840811	contig_15732_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_88870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACTCCGTCCTATAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121642	120387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_120400_121600
840812	contig_4884_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_63770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTAAGTATATTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649	2381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_1600_2400
840814	contig_3825_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_78029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGAGCTCATTATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1857215	1856097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1856459_1857058
840816	contig_12622_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_6009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATAAACATTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636098	1636575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1636100_1636600
840817	contig_1996_pilon	+	937	7	Intergenic	novelGene_131916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	230.216323390753	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	23	664	369363	370754	FALSE	15	CAGAGTGACTCCCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRLLEMLFFTQLQVGLIQQDMDYSRIIERLLKLAVSGRGGSTGEWGAFRNRQLPSTQVPNHFIWLIFFYWLFHSCLNAVAELLRFGDREFYRDWWNSESVSYFWQNWNIPVHKWCQRHFYKPMLRRGASRWMARTGVFLASAFFHEYLVSIPLRMFRLWAFTGMMAQIPLAWITSRFLQGNYGNAAVWLTLIIGQPVAVLMYVHDYYVLHHEAATTGP	369340	371027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_369366_369454_369494_369702_369930_370031_370098_370269_370358_370452_370516_370598
840819	contig_4252_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_176360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATATCAGGAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317155	316811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_-_316800_317200
840821	contig_19899_pilon	-	817	4	Intergenic	novelGene_102523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.3732226286351	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCTCCCGACCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145556	143680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_144177_144433_144546_144638_144792_145500
840822	contig_16103_pilon	+	781	6	Intergenic	novelGene_118939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.7472011593269	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	173	628	809475	810767	FALSE	35	TAAAACCTTTATTTATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKYPDSHQPRIFGGVLESDAGTESQKPGPDWGSQRPFHRFDDMWPVTPHPRAREDNDLDSQVSQEGLGPVLQPQPRSYFKSVSVTKITKPDGTVEEHRTVVDSEGRTETTVTRQEADGSPRDDQESPRPSALDDTSSILDLFLGRWFRFR	809126	810920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_809235_809410_809595_810016_810069_810214_810322_810437_810529_810681
840825	contig_2636_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_52042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTCTTTTTTCCCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24659	25938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_24700_25900
840826	contig_990_pilon	+	1095	2	Intergenic	novelGene_76150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGGAGGTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1776022	1778703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1776534_1778119
840827	contig_11106_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_167460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	19	327	301284	300976	NA	45	AAACAGCTCCAAATTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKRATGMSYLNGRNTDVSGSLLVDESLEMTASFARNLPDMVKRSTQVRSCNGFRTVTAPEAAETASGPRQFCQPSALTFGDKRPGDSGKGPWPKGGSKRPSSRNKRPN	301302	299513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_299500_301300
840828	contig_7568_pilon	-	444	5	Intergenic	novelGene_174009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	133.631021847474	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	30	443	126630	116697	FALSE	35	AAGATAGAATGGACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLHQIAAAMRILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSHVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAATLCGSPMYMAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKHRSLIPSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQ	126659	116695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_116761_118390_118450_119295_119398_125890_125965_126515
840829	contig_7568_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_174008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTAGCAACAGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116505	115360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_115400_116500
840830	contig_7272_pilon	-	934	2	Intergenic	novelGene_25422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010753	923652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_924211_1010377
840831	contig_8140_pilon	+	1359	11	Intergenic	novelGene_86455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	29.1478987235787	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	427	1005	868629	895638	FALSE	65	GAAAAAGAATAAATTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAISEFLAGDYSGSWYLDGQTLLIIICIAIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMVFFALVVIIKKWSIPCPLPLNHIEEYFQISNATVDCKPKLFHFSKESAYAIPTMAFSFLCHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAVALSFLLYFISALFGYLTFYGKCIL	842279	895992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_842522_843683_843815_865395_865449_868628_868669_881391_881471_888214_888298_888758_888818_892629_892696_892905_892960_895088_895169_895520
840833	contig_4924_pilon	-	675	2	Intergenic	novelGene_84759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTAGCAGCTGCTGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252604	197527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_197997_252398
840834	contig_15867_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_170897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAACAGGGCAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132919	134066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_132900_134100
840836	contig_5039_pilon	-	681	3	Intergenic	novelGene_65050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_1	88	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	29	301	1829000	1819913	FALSE	10	CCACCTCGGTCTCTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRAERPGAMRLPPLLPLLLLLGGRAVSPHDSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYRSQCKMKMRGPSLKTYSEFQESRA	1829028	1819532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1819989_1822685_1822819_1828936
840838	contig_5302_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_81509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCACAACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359017	358078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_358100_359000
840839	contig_11427_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_79021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTGTACTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801007	799657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_799700_801000
840843	contig_11493_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_143702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACACAATGACATAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223956	225925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_224000_225900
840844	contig_6975_pilon	-	1718	10	Intergenic	novelGene_74297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGTGTAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468732	440063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_440626_441772_441857_448630_448785_457468_457633_464116_464187_464469_464588_465588_465724_466243_466435_467792_467959_468658
840847	contig_4857_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_48689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTAAGGTGCACCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128108	1126781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1126800_1128100
840848	contig_8964_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_168689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGCTCTTTCCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472879	471395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_471400_472900
840851	contig_14333_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_49141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACTGGACTATGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434692	433669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_433700_434700
840852	contig_18113_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_137539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185081	183874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_183900_185100
840853	contig_7202_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_18179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCAGCTGTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27904	27629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_27900
840856	contig_614_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_132649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020948	1019893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1019900_1020900
840860	contig_10235_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_46256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCACTCATTGGCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3477	3144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_3100_3500
840862	contig_10003_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_88248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGTACTTTTATAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705626	706927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_705600_706900
840863	contig_4857_pilon	-	850	7	Intergenic	novelGene_48784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3295.33147885847	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	142	405	1249503	1242201	TRUE	35	ACATAAGGACTATACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQGLLPSLEDLLFYTIAEGQEKIPVHKFITALKSTGLRTSDPRLKECMDMLRLTLQTTSDGVMLDKDLFKKCVQSNIVLLTQAFRRKFVIPDFMSFTSHIDELFESAKKQSGGKIIFLSWPSSVLICGVYQFVQ	1249999	1231044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1231280_1234301_1234361_1238553_1238695_1242190_1242264_1243122_1243253_1249432_1249555_1249909
840866	contig_9982_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_55723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAACACTGCTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279373	278945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_278900_279400
840867	contig_16098_pilon	+	815	8	Intergenic	novelGene_45909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	47.1060462343926	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	184	741	328217	336931	FALSE	20	ATATTCTTTCCCCATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294724	337005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335227_335727_335764_335870_336034_336814
840869	contig_14537_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_158646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAATACTAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19702	18652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_18700_19700
840871	contig_15697_pilon	+	900	2	Intergenic	novelGene_173306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54029	60520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_54894_60484
840873	contig_4232_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_63255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	362	718	390513	390157	NA	15	TAGCGTTGTTACGTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFHLPWVSWHWGRHLEDLHFSHMCTPPVCPTRSLVAGPKVSCPPFGISDWGECLAPTSFSPFAATGSCWLRGIPPLFSGFHCPGQGLQDLSLYPLTAGTPRLYAGFLSLGANFLARR	390874	390145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_390100_390900
840874	scaffold_13505_pilon	-	375	4	Intergenic	novelGene_111464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	1642.33620864372	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	121	336	541982	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	547433	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363
840875	contig_5041_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_27037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGACGTAAAAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374134	374926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_374100_374900
840877	contig_15613_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_147231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCCTTTTCTACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471788	469620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_469600_471800
840880	contig_2854_pilon	+	1198	2	Intergenic	novelGene_120815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGTTCAATCGCACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88615	90716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_89211_90113
840882	contig_17108_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_109519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_2	293	410	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87094	48469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_48884_53229_53320_87020
840883	contig_1008_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_121640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386787	1388099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1386800_1388100
840885	contig_7919_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_28093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGCTAAGTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295834	1295452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1295500_1295800
840886	contig_12735_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_140779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	177734	178069	NA	40	ATTAAAACCTTTGGGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKRQGTVLHPPRGHNHNKYLRTKRAAKYIQQTLRVLKTEIDNSTIIVGDFNIPLSVKERTTRKKLSGDAEDLNNTINQLDLVDIYRTLHPKAAQYTFFSNAHASFCRIDHI	177731	178282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_+_177700_178300
840887	contig_19769_pilon	-	386	3	Intergenic	novelGene_102295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGCGTCCACGGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89318	87235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_87385_87464_87580_89196
840889	contig_18272_pilon	-	172	1	Intergenic	novelGene_7002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATTAAAAAGGATACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143071	142899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_142900_143100
840892	contig_4686_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_118579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGCAATATTTAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759822	760209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_759800_760200
840893	contig_18518_pilon	+	1151	7	Intergenic	novelGene_176104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	42.1732537674452	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	338	961	110621	140510	FALSE	15	CTTCGGCTCCAAGCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KASPAADVSKLQYSSSSNHKYIPRRAVLYVPGNDEKKIKKIPSLNVDCAVLDCEDGVALNKKNEARLRIVKTLEDFDLGPTEKCVRINSVSSGLAEEDLETLLQSRVLPSSLMLPKVENPEEIQWFSDKFSFHLKGRKLEHPMNLIPFVETAMGLLNFKAVCEEALKTGPRVGLVLDAVVFGGEDFRASIGATSNKDTQDILYARQKIIVVAKAFGLQAIDLVYIDFRDGDGLLRQSREGAAMGFTGKQVIHPNQIAVVQEQFSPSPEKAKWAEELIAAFREHQQLGKGAFTFQGSMIDMPLLNQAQNIVTLATAIKKK	17603	140700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18518_pilon_+_17791_110470_110660_114732_114835_116616_116711_117948_118117_123136_123262_140414
840895	contig_12292_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_166991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180781	181705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_180800_181700
840896	contig_3081_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_133966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167225	1165846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1165800_1167200
840897	contig_7992_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_115541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTCTGAGGAAAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600511	600775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_600500_600800
840898	contig_9440_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_59061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513942	513044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_513000_513900
840899	contig_6589_pilon	-	1068	9	Intergenic	novelGene_26242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_7	47.1109063805824	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	3	689	2230551	2228348	TRUE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGEAGGPIPGFGGHTCWLVPEATDWHVGPSAGAGQRGRTSLHRGQPLRGRRSRSPCQLGPWAEEERLLLCRPPGEAPAPILALWEPLGSPSYLCPHPQFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYQGPTGSLP	2230553	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523
840901	contig_11615_pilon	-	636	3	Intergenic	novelGene_151254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	18	325	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	94	456	77067	42181	FALSE	10	TTTTTTTCTCTGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLVLGPHFRRGPSESSPKAKMKFMVLVVTVGLTLLLGGQAMPANRLSCYRKILKDGNCHNLPEGVADLTQIDANVQNHFWNGKGCEMICYCNFSELLCCPKDIFFGPKISFVIPCNNQ	77160	42000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_42236_44517_44774_77015
840902	contig_2550_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_135631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420678	419253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_419300_420700
840904	contig_7898_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_47506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTAAAAAAATACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187126	186925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_186900_187100
840905	SIRV7	+	215	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCCATTTCGCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56034	78890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841
840907	contig_7410_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_106077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTATATAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394644	395125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_394600_395100
840909	contig_11281_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_125420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATGCAAAGATTAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52284	50327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_50300_52300
840911	contig_9609_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_22962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGAGTTATTCCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240232	241648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_240200_241600
840912	contig_9609_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_22963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAGATCAGAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241799	242328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_241800_242300
840913	contig_6412_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_149941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129124	127900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_127900_129100
840914	contig_3015_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_163314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATAGAGGTTTTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169649	170244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_169600_170200
840915	contig_10003_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_88167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTTTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405884	404520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_404500_405900
840917	contig_9561_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_100861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTGTAATGTCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244547	244835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_244500_244800
840918	contig_7843_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_152048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATATTTTTAATTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479283	480795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_479300_480800
840920	contig_7138_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_121003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339739	338585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_338600_339700
840921	contig_10196_pilon	-	336	2	Intergenic	novelGene_132323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCAACCTGGTGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2393414	2388942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2389152_2393287
840922	contig_299_pilon	+	841	6	Intergenic	novelGene_129468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	370.095663308826	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	13	774	1207529	1419339	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGIMAEVISVGVNLEAFAQAISAIQALRSSVSRVFDCLKDGMRNKETLEGREKAFIAHFQDNLHSVNRDLNELERLSNLVGKPSENHPLHNSGLLSLDPVQDKTPLYSQLLQAYKWSNKLQYHAGLASGLLNQQSLKRSANQMGVSAKRRPKAQPTTLVLPPQYVDDVISRIDRMFPEMSIHLSRPNGTSAMLLVTLGKVLKVIVVMRSLFIDRTIVKGYNENVYTEDGKLDIWSKSNYQVFQKVSFTFYFLVKRN	1207516	1419406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1207732_1209950_1210096_1285142_1285274_1358276_1358371_1409477_1409586_1419258
840923	contig_4664_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_171607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCTACTTGGAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28111	27298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4664_pilon_-_27300_28100
840924	contig_5832_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_134106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTACTAAACTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5403	20516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
840926	scaffold_16539_pilon	+	749	3	Intergenic	novelGene_68339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	13.5	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	133	435	450108	450856	FALSE	0	GTCTGTGTTTTTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTASPVLGAGSSSRAGERCCRRCRFLIGCGWLTLRSDWQLVNWTMLSKGLKRKREEEEEKAALAVDAWWLDPGHPDVAQAAPAVASSSLFDLSVLKLHHSLRQSEPDLRHLVLVVNTLRRIQASTAARAGALTPRVGRVILWLN	448310	451170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_448440_450104_450349_450794
840928	contig_15130_pilon	-	433	4	Intergenic	novelGene_177113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	5.35412613473634	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	72	431	316172	308816	FALSE	75	AAAGAAAGAAAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIEEKPLVVQLNWNRDDREGRFVLKNENDAIPPKKVQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTL	365096	308813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_-_308885_311687_311804_315997_316194_365046
840929	contig_5918_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_99569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGGCTAATTCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1741038	1742410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1741000_1742400
840930	contig_13283_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_154019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGCATGTCCTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58347	58846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_58300_58800
840932	contig_12050_pilon	-	1163	7	Intergenic	novelGene_62748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.45190640586	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	972	191	1162	697920	686379	FALSE	35	GCTGAAAGATGAACCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAAPWIALQEARLGARLGRTRRDSFPNLRKCLPPDSPAEVENGPLETSLEAAATPHGLDGRRLSTELEPLPAEAPTTSATARPQQHLSLERGSVDGPQAVRYRTCKVSCPRLVAWLLVQGRVRQMDTCGRATTLGGDVVEFLAKELKAMF	698110	686377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687339_687453_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799
840933	contig_5261_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_102467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGAAGAGGCAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529030	530077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_529000_530100
840934	contig_2480_pilon	-	1358	8	Intergenic	novelGene_63512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	26.1682156480736	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	282	1310	136343	123268	FALSE	25	CATATGGATACTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPARHRRRWRGAASVCSKSISAGLAGTPAGPGPSVSLSEPSFSLPDPTCSTNRESCCLQLWVPPAVPGTHCCTRERLFEFSVTVGRRNTRAPRMDFLVLFLLYLALVLIGVTLICIYSRTQFLKGLVRGGAQIFSCIIPECLQRAVQRLLHYLFHTRNHTFIILHLVLQGMVYTEYTWEVLGYCQELEFSLYYLLLPYLLLFVNLFFFTLSCVTNPGTITKANELLFLQVYEFDDLMFPKNVRCPTCDLRKPARSKHCRVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQYLFLLFPRIIFFLGFVLVLSFLLGGYLCFALYLAATNQTTNEWYRAGRAPRQHCRHEAQPLSAEPQVFQNIHSHGVWSNLREVFLPATRYEKKKK	138423	123219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123556_127197_127443_128835_128962_130073_130253_135239_135314_136226_136352_137755_137895_138289
840937	contig_5361_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_167204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAAAGAGTCTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289660	290276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_289700_290300
840938	contig_7644_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_64264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAGATCTAGACTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211923	211271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_211300_211900
840939	contig_9363_pilon	+	681	2	Intergenic	novelGene_6650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	47	325	963791	965617	FALSE	15	TTGGCCGAGTCTGAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VADYPGQSPRAARESMGTTWASPGWARLALCLAGFGLSLYALHVKAAHARDKDYRALCDVGTAISCSRVFSSRLPTGTLDLHPAGAEFPVVSRWFCLPGLDPVLRAV	963744	965973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_963964_965511
840942	contig_2463_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_43019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504380	505341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_504400_505300
840944	SIRV5	+	614	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-251	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10882	11866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_10992_11311_11673_11722
840945	contig_3130_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_103569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCTGTCTGAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101188	100046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_1e+05_101200
840946	contig_17337_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_144719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATATCCCACATCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12949	12485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_-_12500_12900
840947	contig_9656_pilon	-	1578	4	Intergenic	novelGene_121897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38.4967531098403	160	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGACATGTTTAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101189	96139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_97333_98895_98958_100608_100766_101023
840949	contig_13780_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_149064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGAGGGACCAGGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653499	652576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_652600_653500
840953	contig_17727_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_172590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGAAAGAGTTAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53877	54844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_+_53900_54800
840954	contig_4125_pilon	-	1096	4	Intergenic	novelGene_25106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_3	154.353130479718	821	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	59	499	750308	748011	FALSE	25	TTCTAATTTCTCATTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSQVTGPAAAAATQGVLTQMGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGTDVFVFFYIIFKCGLFLVSESTVFSRT	751097	747413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_748225_749126_749243_750197_750322_751052
840955	contig_5918_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_99613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATATATGTGCACATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2130328	2129227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2129200_2130300
840959	contig_15371_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_151482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	646	972	238875	238549	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCVLELEGGGSARSDVLRDLQWEPKQLVCHSTTPSTEKPQGALHSGTMGMGIGQQAAQTLRSASVQVLPHVQLRLQTRLYKQPSKPPGEAEPTRHGALLCVRKPACS	239520	238317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_238300_239500
840960	contig_12270_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_113855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	27	356	14409	13857	FALSE	20	ATGGTTATGCTGCTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14435	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
840963	contig_14814_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_137695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	402	98	499	108462	108863	NA	10	GCTGGTTGTAGCCTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPENWQSFIYCSLGTEADINTSPDSSSQSWQFFLKTFAPLHFLPSAHHQFRLTRSPHTCVVTPQLRRHNNFLVAVLFTDLLFLKHHFHCTPAWLPSAPPGFQASASPPPGNNMPTPSSQPRSLPPVKPYTPLP	108364	108863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_108400_108900
840965	contig_6102_pilon	-	782	8	Intergenic	novelGene_32208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1828.26543198626	3	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	40	390	905250	896229	TRUE	15	AACCCAGTGGGTGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKLCPNWVFDKSQGLLESLSGNLRTSSLSSQSQMSTRAQLQIPT	906122	894891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896640_896706_896888_896975_905180_905253_906085
840966	contig_5279_pilon	-	873	7	Intergenic	novelGene_105566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	287.765963935974	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	234	698	339255	330226	TRUE	70	CAAGAAAAAGAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTEI	340107	322555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_322657_330151_330235_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339267_339885
840967	contig_9389_pilon	+	366	2	Intergenic	novelGene_84042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	14330	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	104	334	585773	586236	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	585669	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_585890_586122
840969	contig_12427_pilon	-	549	4	Intergenic	novelGene_40555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1290.07321067019	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTTAACAAGAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578190	504691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504823_520312_520440_522284_522346_577960
840970	contig_12786_pilon	-	1022	8	Intergenic	novelGene_103427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1418	junction_3	272.85048608185	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	36	971	614067	590909	FALSE	20	ATTGTCCAGAATCTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGAETKEVENHHDDCCVQLLNPNLATMKEDVLYHFSLSTSTHDFPAMFGDVKFVCVGGSPSRIKAFTSYVAQELGLERPGADHPNICAGTDRYAMYKVGPVLCVSHGMGIPSIAIMLHELIKLLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	615648	590857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_593426_600793_600909_602796_602956_604600_604719_614020_614079_615624
840972	contig_9436_pilon	+	394	2	Intergenic	novelGene_60882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAATTCTTTCAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235883	236744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_236196_236662
840974	contig_4874_pilon	-	1476	4	Intergenic	novelGene_78626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACACGAGGCTAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128165	122538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_122706_124794_124961_125175_125230_127076
840977	contig_15244_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_118059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAAGTATGAATACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607474	607912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_607500_607900
840978	contig_12951_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_68208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCATATTTTGCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765439	766416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_765400_766400
840979	contig_9375_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_136055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202552	203544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_202600_203500
840980	contig_6266_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_170982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGCAGCTAAGAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115120	114014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_114000_115100
840981	contig_14322_pilon	+	943	6	Intergenic	novelGene_116614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_5	38.1418405428999	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	72	518	710070	711813	FALSE	15	TATACCTCTTTTCACTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRRQGRRPRARRPEIGVLPAGGAMRYNEKELQALSRQPAEMAAELGMRGPKKGSVVKRRLVKLVVNFLFYFRTDEAEPIGALLLEHCRVTREEPSGFCISFVDTERKYHFECCSEEQCQEWIEALRRASYEFMRRSLIFYRNEIQKMTGKDPLEQFGISEEARFQLSSLKA	709998	712238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_710164_710286_710355_710605_710673_711395_711484_711598_711663_711747
840983	SIRV6	+	350	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	520	3	354	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
840984	contig_6557_pilon	-	838	5	Intergenic	novelGene_33002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.02493781056044	187	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	125	565	535294	534247	FALSE	20	TATAATCTCTGTGCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSRDYPLFGGAFSAILPPGAIDVSDLRPVPDNQEVFCHCGTDQSLIVELLELQAHVRGEEAARYHFEDVGGVQGARAVQVEAVRPLPLENLALGGCCQDAWVLSGKQQVVKENHQVAKEVTLHQALLRLTQYQTDLLLTFNQPP	535418	533973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_534251_534487_534574_534657_534815_535012_535130_535217
840985	contig_7593_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_127315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1499	1864	280862	280497	NA	60	AAGAGGAGATGAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENILNKTKQSNPPTIYIVIAFLENSVSIQTVQKTLCFGVSLGSDNYKQGFRPQVCHIQHVGKSCGPGDNLLYRTWPHTAGRMAGHFSPAHSPQFQECLPTIVTVKTPPWISSVGSATPH	282360	280408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_280400_282400
840986	contig_1009_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_121786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAGTCAGTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350835	352520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_350800_352500
840989	contig_8452_pilon	-	746	5	Intergenic	novelGene_48107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	644.11504213145	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	21	371	991230	968728	TRUE	20	ATATGTTTCAGGCTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTTEILMTKGRAQALTSPSCTVWAGLSRSRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLLPLLG	991250	962618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_962933_968666_968747_972872_972933_981637_981738_991058
840990	contig_7230_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_52568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATATAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281021	283048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_281000_283000
840991	contig_6375_pilon	-	1488	5	Intergenic	novelGene_72998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	18.5067555233217	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	407	859	319794	316401	FALSE	10	CACTCCGGACCCCTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAAHIQPRDLEAFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVLLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKILLAAMANNVQKGSGGPVHLYMGSRHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSRGYGFIMVNSWPGTLPP	320200	315771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_316434_318798_318865_319257_319396_319480_319634_319731
840992	contig_5770_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_74146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTTTGAGAAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72509	72983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_72500_73000
840993	contig_5429_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_127773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATATCCACACACCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71592	72662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_71600_72700
840994	contig_9875_pilon	+	1089	5	Intergenic	novelGene_154397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	47.673367827331	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCACAACTTTCAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10835	22026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_10946_11610_11746_19197_19288_19388_19468_21351
840995	contig_10176_pilon	+	1060	5	Intergenic	novelGene_72708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	235.99192253126	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTAGAAATTTCAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250740	275170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_251096_252448_252698_253015_253117_271483_271560_274891
840996	contig_6795_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_27777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAGAACTGCTCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501434	502012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_501400_502000
840998	contig_4364_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532888	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532900_1533300
841000	contig_4659_pilon	-	1821	4	Intergenic	novelGene_118217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19.4422220952236	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	167	448	688651	683831	TRUE	40	CACCTAAATTTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYLERLLTYAEIDICPTNWKRIVLGAILLASKVWDDQAVWNVDYCQILKDITVEDMNEMERHFLELLQFNINVPASVYAKYYFDLRSLADDNNLSFLFAPLSKERAQNLEAISRLCEDKYKDLCRAAMRRSFSADNFIGIQRSNAILS	688817	682310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_683288_683434_683948_685125_685289_688649
841001	contig_6674_pilon	-	715	2	Intergenic	novelGene_147981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTATGGAACATCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54282	46953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_47552_54165
841003	contig_10940_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_49289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGAAAAAAGCACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964378	963414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_963400_964400
841006	contig_13905_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_130409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGTGTCTGCGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43596	42489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_42500_43600
841007	contig_6017_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_152565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCCTGCAGTTCCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479677	480777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_479700_480800
841008	contig_5947_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_101540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAACTGTTGAGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558267	557440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_557400_558300
841009	contig_16510_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_139077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGAACGCCAGCGGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252621	253860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_252600_253900
841010	contig_8538_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_5085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842859	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842900_843100
841011	contig_1154_pilon	-	541	3	Intergenic	novelGene_87236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	127	300	1818490	1817149	FALSE	30	TACAGATAGTTTGCATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFDCIEAYAPGFKSSVVGRDILTPPDLERIFGLPGGNIFHCSMSLDQLYFARPLPLHSSYRCPLPGLYLCGSGAHPGGGVMGAAGHNAAHVVFGDLKSM	1820104	1816907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1817220_1818387_1818509_1819996
841015	contig_5145_pilon	-	2590	1	Intergenic	novelGene_131397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	2290	2589	652546	652247	NA	30	TCTAAGTGTCTCCATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTRDRQHLADLLWARTLPLPLSARWKLPTLTLRTSLAFPTHGCSTEESWGPITSLGGGQLQLTDTGLRPAWGRRLLAVLNSETLREISSGTCQVCANV	654835	652245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_652200_654800
841016	contig_9482_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_44246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATGTGCTCCAGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291238	292041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_291200_292000
841018	contig_5598_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_148291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATATTTGCTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756380	755822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_755800_756400
841020	contig_7898_pilon	+	560	3	Intergenic	novelGene_47574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAATTGAATTCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483970	487529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484034_484218_484454_487267
841021	contig_11370_pilon	-	581	5	Intergenic	novelGene_98786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_1	199.577522531973	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	5	580	302903	301254	FALSE	15	GTGAGAACTTGGGCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAATIVAARRAGPVPAWGLEALTPNWENQEVSTGTTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAASLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTAN	302907	301252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301398_301595_301726_301843_301976_302310_302379_302801
841022	contig_7457_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_31554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1080	1574	846486	846980	NA	50	AATAAACTCTTATTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKPPPSGLQLSRCCWPVTIRRPPSIRTSSSSGLKPWASTFNWKLPSAWSSCAAAGSSLSSRTGSLATWFSSARATLGRRNAATCFSLERPVPTRCIGVSNCYPRGVPSAGLAQNAAEARGRLQGTAREEKTFPHPAWLPPLCPTQLCSVQLGPLRFRKAAALR	845406	847628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_845400_847600
841024	contig_7164_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_172146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACCAAAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546913	548743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_+_546900_548700
841027	contig_14341_pilon	-	1745	2	Intergenic	novelGene_111805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	174	1532	463432	462074	FALSE	35	TAAAGCACAATTCATTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRREEVLPGSALTDICTSKAHSRNRNGNPAEDWGEQSFFQGGDFKPQSFPNMETPSGGRGCGDCEIARSTRMPSSSIKQDSVAMEEKAPVLVPRGGSFEQALEPAELQAACVSGKPCRCSVCGKSFKQRSALTVHERTHTGEKPYLCGACGKVFRCRSNLIEHQRIHTGVKPYKCSECGKVFIQNSTLTLHQRTHTGEKPYKCRECGKAFRGSSDLRKHERIHTGEKPYQCQECGKAFRWSSPLIRHQRMHSGEKPYQCIECGKAFGQSSTLIEHHKIHTGEKPYECLNCGKAFKGSSDLSQHQRIHTGERPYACGECGRTFMWKTALVTHQRTHSGERPYVCGQCGKAFVQSSQLNQHQRSHTGEKPYECPACGKAFSVSAYLVEHQRIHTGEKPYSCLECGKAFIQRSHLAQHQRIHTGEKPYTCGKCGKAFRYSSYLLQHQKLHTRE	470041	461860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_463553_469988
841028	contig_5797_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_56907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATGAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76164	77655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_76200_77700
841029	contig_5718_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_110323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525163	524648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_524600_525200
841032	contig_12257_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_152101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134569	134965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_134600_135000
841033	contig_7179_pilon	-	890	6	Intergenic	novelGene_78157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.3394320305905	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	57	599	1041245	1039605	TRUE	25	ATTTTCATATTGCGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFRQLWHEDSVFRPSGKMRPLTEEETRVMFEKISKYIGENLQLLVDRPDGTYCFRLHNDRVYYVSEKILKLAANISGDKLVSLGTCFGKFTKTHKFRLHITALDYLAPYAKYKVWIKPGAEQSFLYGNHVLKSGLGRITENTSQYQGVVVYSMSDIPLGFGVAAKSTQDCRKVDPMAIVVFHQADIGEYVRHEETLT	1041301	1038903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1039132_1039541_1039725_1039917_1040059_1040747_1040887_1040984_1041072_1041189
841034	contig_9668_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_58231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAGCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564245	565185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_564200_565200
841035	contig_5238_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_176258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAACGGTTGCGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67314	66613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_66600_67300
841037	contig_9029_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_155135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	56	370	732997	733311	FALSE	40	GTGTATAATCAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARDREAPGLAGSTGGEKMVAVTGTLVLLLPAGFLGCSAESREAPVIVPSYYTTSDAVSAPETVFIVEFSLTWKNGRQSIPLYANVRGKQFPVTRGQDVGRYQVSRSLEHRHPLRHLRGQVL	730270	734511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_730310_732980
841039	SIRV4	-	334	1	NIC	SIRV4B	novel	617	2	NA	NA	1054	-133	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGATTTAAGCTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4104	3770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV4_-_3800_4100
841040	contig_753_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_113035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446470	1447408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1446500_1447400
841041	contig_10531_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_114520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	25	366	390805	390464	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTSFAPGMEPEEGTALWRLQKLPADLGPQVRGARLAARRRGSRAAWRAGQAQCPLRGARSGSPGKEGGRGVLSCGQPPTSPVEMRRPRPLGPDFAGRGVPAAPASRCSRITRSHAGPGTW	390829	389584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_389600_390800
841042	contig_10437_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_38268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTCACAAGGGGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408257	406711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_406700_408300
841044	contig_678_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_167816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCTTTTACTTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130498	129746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_129700_130500
841045	contig_5917_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_122157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	696607	696242	NA	25	TATCACACAGCAGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDTLLQSGQPPLSCACRQASPWPSTSQSLAPRPLGPASDLLWQVLQSSLAPLTSAQRHPTPMASLLPEGTQLSHSVGREAYRTVSYQSTSSAASAATVSLPLLLAVSDVTAPSLCLSWV	696609	695914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_695900_696600
841046	contig_2924_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_140266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAACTCCCTCACCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123711	122616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_122600_123700
841048	contig_11328_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_88381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGTGATTTAGCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606497	605392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_605400_606500
841049	contig_17964_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_33925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAACTCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464286	465365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_464300_465400
841050	contig_266_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_166305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCACCCCTCACATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708106	707317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_707300_708100
841052	contig_19209_pilon	+	750	3	Intergenic	novelGene_169565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	5	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	113	457	44456	87938	FALSE	5	CCCAGCTTTCTCTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHGTLLHGLEDKNYAESVLPRLKVYKLKHKQGLVERVMDDYSVIGRSLFKKETNIQLFVGLKVHLSTGELGVIDSAFGQSGKFKVHIPGGLSPESKKILAPVLKKRGRAGRGEVAREEEGMERPEPSQPVTLSLTFKRYVFDTHKRMVQSS	18815	88231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19209_pilon_+_18925_44452_44610_87747
841053	contig_5230_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_173233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTCCAGGCACCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39492	39134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5230_pilon_-_39100_39500
841054	contig_4531_pilon	-	1023	2	Intergenic	novelGene_47851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAAAAAGGGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128782	126424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_127237_128571
841056	contig_10196_pilon	-	815	4	Intergenic	novelGene_132242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	286.320721491749	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAAAGGTTTTGGTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440664	1433078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440632
841057	SIRV3	-	365	3	NNC	SIRV3B	novel	479	3	NA	NA	7	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTTCTTGAAATGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1975	1026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_1087_1532_1765_1902
841058	contig_14023_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_165365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	18	353	129945	130280	NA	30	ACCTCTCTCCCCCAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFHGIRRIFCDCFQVGISFQVFHDLRECCPSDTWSITVNTYLGINCKGERLIVHGFRFLKPILFTSLGFFSRMLMIFSESAPPLSIFGSFILLSLHITFSQIGATSDKSV	129927	131290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_129900_131300
841059	contig_14033_pilon	+	331	4	Intergenic	novelGene_167434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.65685424949238	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCATTCCTGGAGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285261	315587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_+_285279_311406_311484_311960_312093_315482
841061	contig_11285_pilon	+	1616	13	Intergenic	novelGene_5746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	291	755	1201866	1209719	TRUE	40	CATGATGCTAAAATTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVMLRGGHGLFITRELAKELFADQPEQRADVKLQLLLGQVDAKFIQGPREAGVHITHNLSEDLIKGFQDKLHKAPLGAAGGGLFCELSRLGVEVDVTPESFSKFLVINVTKGVSVDLGKGAQCEADAILGAGKADVAQEWRQDQVLISGIHAY	1201575	1229330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_1202045_1203421_1203510_1203886_1203950_1207734_1207862_1209711_1209878_1212121_1212202_1213172_1213271_1214379_1214416_1215182_1215249_1215728_1215805_1219067_1219147_1220258_1220425_1229228
841062	contig_1154_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_87198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTCCCCATCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083335	1083966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1083300_1084000
841063	contig_14209_pilon	+	1011	8	Intergenic	novelGene_88313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	252.848264573754	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	113	607	32406	37182	TRUE	25	GAATTCACTTAGGGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPECGEGPTYYACLCGHEELVLYLLANGARCEANTFDGERCLYGALSDAIRRALRDYKQVTASCRRRDYYDDFLQRLLEQGSHSDVVFVVHGKPFRVHRCILGARSAYFANMLDTKWKGKSVVVLRHPLVTPPLLPRPPGHWCGACRRLRAPGQAVPTVGPAQ	32293	41002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32435_34049_34106_35209_35355_35503_35664_37077_37218_37300_37421_37712_37819_40859
841064	contig_18055_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_117796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTTTATAAAATACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31613	30175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_30200_31600
841065	contig_15570_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_137859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAAGGCCCTGCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694348	693070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_693100_694300
841066	contig_4686_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_118503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCCATAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391662	392151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_391700_392200
841067	contig_8561_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_161645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCATCCTCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213732	214746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_213700_214700
841069	contig_4678_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_126070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTCCTAATAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718355	718640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_718400_718600
841070	contig_835_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_152158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGAAGAAAAATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234424	235665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_234400_235700
841071	contig_9177_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_32752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTCTTTTGTAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235798	1234902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1234900_1235800
841072	contig_709_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_57609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTGTGGTACACAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2388242	2389433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2388200_2389400
841073	contig_11115_pilon	+	795	4	Intergenic	novelGene_102828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	593.606491429016	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2	394	165388	166343	TRUE	20	GCCTTCAAACTCCGGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTNPLLGLLGPTPAQVAPLWGHRESPCPSLGLATVQALTSAILTATSVPWATCPALSQPAHHQGNFSLKTGHHGALGATALGPPVSAQPPAAGLLSAAPRCPGAGIFTAGGAPGPGGAYWRVALGELQC	165386	173315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166358_172844_172964_173047
841074	contig_10990_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_7429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670572	671106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_670600_671100
841075	contig_6217_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_109707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106369	1105107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1105100_1106400
841077	contig_5485_pilon	+	947	2	Intergenic	novelGene_37721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	4	381	221624	222001	TRUE	50	CCAAGAAAGCAAGCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMGFIREITGYNSGSGTLGIQCFHQDSLFTAALAGTPLSLALGLCPPCSGKCYKALLDPANKSSETPSALSFLAPWARSPPCCLLPTIISLPPFLELSYGSRSFSAQGSRVQRMHSLLPAVLPWWW	221620	225754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_222048_225234
841078	contig_57_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_44874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCCGCCGACCCCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66108	66670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66100_66700
841079	contig_57_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_44876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	172	588	66895	67311	NA	15	AATTTCGTTTGTTTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVRQPSRARDAGGDAASEEPGRPKTGCAAEPNPTSAARRSRLREEGDGRAGRTPERRMDQRPPRGPGGAGARDGRGARSSGARAGCVPGPDKKPRAWRGWFGEPGSASAAEKPLLA	66723	67686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66700_67700
841080	contig_13901_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_146647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTTTGCTAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204189	203870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_203900_204200
841083	contig_9535_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_124484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366158	366742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_366200_366700
841084	contig_15787_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_143988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAGAGAGAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81421	82182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_81400_82200
841085	contig_5696_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_117517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAATACAATATATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415109	415713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_415100_415700
841086	contig_19640_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_134878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATATTCACAGAATAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115379	116496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_115400_116500
841087	contig_5482_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_144498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATTTGGTCAGGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570622	571257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_570600_571300
841088	contig_14499_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_174028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTCCTTCATAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126716	127512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_126700_127500
841089	contig_6902_pilon	+	1050	4	Intergenic	novelGene_135553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	22.905603390146	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	289	843	282413	284761	FALSE	70	TGTCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRVAVIGAGVSGLSSIKCCLDEDLEPICFERSNDIGGLWKFTETSKDGMTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGKSFPPGTMPTLLGSSRRKVIDL	278401	284968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_278655_282377_282545_283762_283952_284527
841092	contig_8377_pilon	+	630	2	Intergenic	novelGene_35090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTATTACCTACAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141672	142361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_141704_141762
841094	contig_12278_pilon	+	2024	3	Intergenic	novelGene_152606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_2	21	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	728	1651	241699	243610	FALSE	25	AGCTGGTGTTCAACTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRACLVWELEVVPLCRSWPLCPQEAIQGWSLSGGHALYVPQEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFMCVFARTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEKLKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQIEREHLIQLRRWQETRGELQCCSSPRLHGAKAILEAEPGLRLALQTSPSIRLPLDAPVPDSRAKPKLPKQVQKEQKEQRKRAKASGQLDQPPATGQAEVAAAAGDACPSQDMALKDPVPQNSAHHCSQDSLTSQESEDTYL	240971	243983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_242012_242098_242254_243154
841095	contig_16369_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_98691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTTAGAAAATTAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11613	10603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_10600_11600
841100	contig_12923_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_30062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	328	630	27957	28259	NA	15	CTGGCCACGTAGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPILKTSRGNEDSRCLPPNPTAPGYREEGRFLRPHPSPQASNTPEWGAFLLRKLSKILDKRADLTWSSRRQKLLGHLHQEAGRWPRTGAPARGLIFTQCLGRAVRILSSMRRPGQPFPRSSHWKAAGQLACPPASPRASGSTSPFLSYLLGRKAPTAILWSGFVTTRWKASPPGPTCGIPSCSHPTPAAGQLGPQGLRGHSHRKGPGAF	27629	28591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_27600_28600
841101	contig_8015_pilon	-	1745	4	Intergenic	novelGene_176680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	2.86744175568088	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	67	552	66637	64963	FALSE	55	GGGAAAAAACTGCACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTISAALLLTVFQVAWGQKVTSLTACLVNQSLRLDCRHENTTALPIQYEFSVTRETKKHVIEGTLGVPEHSYRTRTNLTSKYNIKVLYLNGFTSKDEGTYTCELRLSGQPPTISNKNISVFRDKLVKCEGISLLAQNTSWLLLLLLSLPLLQAMDFISL	68805	63769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8015_pilon_-_65076_65584_65921_66600_66662_68763
841105	contig_11017_pilon	+	662	3	Intergenic	novelGene_128084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	532	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTATTCTCTTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233730	295070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259292_294631
841106	contig_8357_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_39731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAAAAAATCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605170	605697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_605200_605700
841108	contig_17066_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_130940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAAAAAAGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12849	11661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_11700_12800
841109	contig_7151_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_40808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCATTTCAGCTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582439	584226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_582400_584200
841110	contig_854_pilon	+	1112	3	Intergenic	novelGene_36332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	17	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	45	938	794240	800873	FALSE	25	TTTCTGAGAAACTATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQQVLYRALVSAKWLAESVRAGKLGPGLRVLDASWYSPGTRDARKEYLERHVPGASFFDIEECRDTASPYEMMLPSEERFADYVGHLGISNSTHVVIYDGDHLGTFYAPRAWWMFRVFGHRTVSVLNGGFRNWLKEGHPVTSEPSRPEPAVFKATLNPSLLKTYEQVLENLKSKRFQLVDSRSQGRYLGTEPEPDIEGLGSGHIRGAINMPFMDFLTEEGFEKSPEELRAMFEDKKVDLAQPLIATCRKGVTACHIALAAYLCGKPDVAVYDGSWSEWFRRAPPETRVSQQKAEKA	793492	801047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_793516_794218_794835_800574
841111	contig_13607_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_170165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCCTAATCTGGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127305	128873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_127300_128900
841114	contig_5461_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_156814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTTTGTAAAGAGGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216283	216987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_216300_217000
841115	contig_10734_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_51108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTACAATCCCTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641839	641327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_641300_641800
841117	contig_12151_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_54979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	18	320	976043	976345	NA	40	ATGCTCAGTTAACAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRTTEQCWLELIITTRQWLQRNSWCQSTLYSAPNPVQAHTNALTVFLAKGTWQEINQTIRSTSHTYTLDYRFLIEEKTNKSPVSEWKDTFTATYQIPS	976025	977261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_976000_977300
841118	contig_9363_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_6795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGGACGGTGAAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599620	1600002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1599600_1600000
841119	contig_5210_pilon	-	1075	4	Intergenic	novelGene_65421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	25.0377492776186	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444179	439098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_439957_442673_442763_443013_443119_444156
841120	contig_9871_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_75710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACCTTCAGTGGGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574683	574442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_574400_574700
841121	contig_14687_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_107899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGTTGGCTTGTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416436	415341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_415300_416400
841123	contig_11448_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_66365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCAAATTAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250061	250816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_250100_250800
841125	contig_15613_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_147189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAACAAATAATCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44903	43343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_43300_44900
841126	contig_7123_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_170583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544084	543411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_543400_544100
841127	contig_7179_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_78125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779246	777758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_777800_779200
841128	contig_7333_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_142763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATAGGGTTGCTATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161898	162668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_161900_162700
841130	contig_5643_pilon	-	439	4	Intergenic	novelGene_39109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	238	348	640689	640480	FALSE	10	GCCCTGGGCAGGGGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRLWVIHWRPLQGSGLRHGHLWRVPAHFFLKESLLFSLSADRCFFIFSSFLFLPCRFSYISSLCLLEEVREALAWVFFMAGGYVMFPYSDSLPFWDCMTSSFFLVVSMNWAMAT	641466	640388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_640536_640634_640729_641099_641243_641411
841132	contig_253_pilon	+	625	3	Intergenic	novelGene_129720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	735	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	68	430	552099	553905	FALSE	10	TCCCAAGGTGCTGTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTSLSTLPGLEVGAQHQDSRPMALPCALGLGTLLALPGALGSGGSTKDGSDSSVTIVLLLLLLLLLATGLALAWRRLSPDQAEEAHDGDDEGGLCLSTHGPAGSGGSAEALLSDLHAFAGSAAWDDSTRAAGGQGPHVTAL	552031	554100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_552102_553290_553460_553714
841135	contig_14970_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_45146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAACTCACACTTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298211	296291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_296300_298200
841136	contig_6058_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_172417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAATACAATGAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388007	386667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_386700_388000
841137	contig_2069_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_23543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	470	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	198	332	1509011	1508747	FALSE	10	CTTGAGGCTGCCACCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAIAACRSVGPSVHPQHEWPARLQHVGHRFIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509859	1508497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509761
841138	contig_13697_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_165932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	27.8128667266709	283	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	254606	258099	TRUE	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFHRKYRSCDRVLLKASLCWAPWGPQVGGLRALTYAASIPDVDECAEETPPCSEGQYCENVPGSYTCEECDSTCVGCTGKGPGKCIACVPGYAKEESGQCSARQPGRLCCRRGRVLATGDAVCTGE	254605	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_254811_257483_257583_258022_258191_259883
841139	contig_10331_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_54085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAGTCTACTGTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104125	105032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_104100_105000
841140	SIRV7	+	285	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAAATGCGATAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	78963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78841
841142	contig_7398_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_166176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCTTCAATTCATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266195	267553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_266200_267600
841143	contig_3281_pilon	+	825	2	Intergenic	novelGene_128528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	30	410	139814	140194	TRUE	45	TGATGCAATTAAAGGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIASEASRLAHYNKRSTISSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	139784	190192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_140204_189786
841144	contig_10734_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_51533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCGCTATGTGCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2293428	2294686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2293400_2294700
841145	contig_15114_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_121147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCCTACCTCACAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134309	133292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_133300_134300
841148	contig_15422_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_173110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACAGCCATTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79794	78611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_78600_79800
841149	contig_13992_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_147644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGTGGGTGGGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546961	546636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_546600_547000
841150	contig_7066_pilon	+	1177	2	Intergenic	novelGene_42179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTACTGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946308	955420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_946481_954415
841151	contig_14405_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_85634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTACAAAAAAAATTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406742	408045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_406700_408000
841153	contig_11855_pilon	+	682	4	Intergenic	novelGene_67009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	26.3354429534716	1075	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	30	470	1396380	1402327	FALSE	10	GTCTGTGCTGTTTGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAVLALRTRTAALLSPTQATALAVRYASKKTGGSSKNLGGKSSGRRYGIKKMEGHYVHAGNILGTQRQFRWHPGAHVGLGKKKCLYALEEGVVRYTKEVYVPNPSNAEAVDLVTKLPRGAVLYKTFVHVVPTKPEGTFKLVAML	1396350	1402539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1396420_1398380_1398507_1398909_1398978_1402120
841154	contig_14556_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_138516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATATTATGAGTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90312	91463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_90300_91500
841155	contig_2689_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_100827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGCCAAAGGGACTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149619	150804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_149600_150800
841156	contig_8153_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_34790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10292	10972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_10300_11000
841157	contig_2768_pilon	+	1219	6	Intergenic	novelGene_57504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	96	junction_5	302.619629237761	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	110	1051	749589	772283	FALSE	70	AAAAAAAACAGAAGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKKNGNITGSPLHSCELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDHKVQCDEEEFRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDDAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPVSNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREENPTPLQQKGE	749479	772451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_749799_754345_754562_763844_764080_770255_770407_771088_771183_772247
841158	contig_5084_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_64482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTTCCAAACAGCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73378	71762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_71800_73400
841159	contig_12080_pilon	-	764	8	Intergenic	novelGene_128389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	13.0384048104053	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	195	764	190761	188345	FALSE	15	GCCCGCCAAGGGGGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQEVKLRFLEQLSILQTRQQREVDLLEDIRSYSKQRAAIEREYGQALQKLAGPFLKREGHRSGEMDSRTMFGAWRCLLDATMAGGQARLQASDRYRDLAGGTGRSAKEQVLRKGTENLQRAQAEVLQSVRELSRSRKLYGQRERVWALAQEKAADVQARLNRSDHGIFHTRTSLQKLSTKLSAQSVQYSQQLRAARNEYLLNLVATNAHLDHYYQGELPALLKVLVSELLEHLRDPLTLLSRTEMEAAEMALEH	191890	188344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_188438_188884_189014_189901_189966_190059_190197_190282_190419_190750_190819_191217_191264_191799
841161	contig_9706_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_20887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3497	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3500_4000
841162	contig_5918_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_99557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATCTATAGGCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697397	1699038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1697400_1699000
841163	contig_6364_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_51787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGACACACTTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224225	1225157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1224200_1225200
841164	contig_4364_pilon	+	1461	2	Intergenic	novelGene_4574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACCGAGCAGCTCCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1820382	1821885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1821359_1821400
841165	contig_1244_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_38080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACAAAGCCTCTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304411	1305174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1304400_1305200
841166	contig_17840_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_154300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCAGAACCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69308	68670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_68700_69300
841167	contig_3754_pilon	+	631	4	Intergenic	novelGene_146840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3.74165738677394	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATGCTGCATATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358407	422182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_358481_408103_408143_420785_420922_421799
841168	contig_11493_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_143678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCCCTGTAGGATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167090	165814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_165800_167100
841169	contig_2903_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_148979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAGCAAAACAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184102	182283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_182300_184100
841171	contig_1274_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_137779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAACTCCTGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67952	66690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_66700_68000
841172	contig_11071_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_131046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTATTGAATCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444900	443077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_443100_444900
841173	contig_12391_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_103607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAAGGAGGCTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57811	58830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_57800_58800
841174	scaffold_6394_pilon	+	1055	4	Intergenic	novelGene_111071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	104.47434560163	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	83	802	616840	618488	FALSE	25	TGTGACTGGAACTGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSPGLAVTRADGHLAGLGPTVHLVLGDSDPELRAVGTLMRVTPPDTRSARPLGCRQNLSLCYQDRSRAPSQWDACACLHPVLFCVALPAWSLAVDLSSGFSNSVFRYGGTFQNVSVKLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEITKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTVRTSKDTVSQRLCGLLSEQF	616757	618741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_617277_617400_617471_617597_617733_618410
841175	contig_14953_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_137301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCCAGCATCAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439341	440482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_439300_440500
841176	contig_11677_pilon	-	415	4	Intergenic	novelGene_85916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20123.1308421152	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	164	370	595842	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVAIGII	597326	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595172_595237_595714_595892_597212
841177	contig_5538_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_23705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103415	103736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_103400_103700
841178	contig_3789_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_79822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAGAAAAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169296	168122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_168100_169300
841179	contig_3426_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_57982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCCAGTGATGACTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609692	609238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_609200_609700
841180	contig_3787_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_102379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTCTACCCAGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412012	412934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_412000_412900
841182	contig_13226_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_175343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAATTTAATGAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179132	180321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_+_179100_180300
841183	contig_12728_pilon	-	840	8	Intergenic	novelGene_155813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_2	31.361616992881	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	96	809	214046	192747	FALSE	80	TTAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLCYNRGCGQRFDPETNSDGACTYHPGVPVFHDALKGWSCCKRRTTDFSDFLSIVGCTKGRHNSEKPPEPVKPEVKTTEKKELSELKPRFQEHIIQAPKPIEAIKRPSPDEPMTNLELKISASLKQALDKLKLSSGNEEDKKEEESDEIKIGTSCKNGGCSKTYQGLQSLEEICIYHSGVPIFHEGMKYWSCCRRKTSDFNTFLAQEGCTTGKHMWTKKDAVSSLFKITYLIILI	214141	192715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_-_192898_194279_194351_198684_198744_199399_199504_201483_201642_202943_203001_209323_209374_213982
841184	contig_2310_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_71628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	747	1076	311824	311495	NA	35	AATCCACGGGAACAAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTGPTGRGQGQARGATWAWWTATVLKWRGPRLGGKGGYSPLHRMARLKPRASAVPELMFSTSRCFTFFNTGARREGATGSTLQLGPQPILAPAHHDALGATTRGRRG	312570	310086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_310100_312600
841185	contig_4315_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_46857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGCAAAGAACTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625973	624630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_624600_626000
841186	contig_9345_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_24518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTCAGCCAATAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669841	670076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_669800_670100
841187	contig_14822_pilon	+	489	5	Intergenic	novelGene_145414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	519.068877895795	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	44	397	183396	190065	FALSE	25	TACTTGGCTGAGACCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FISCLVSLRSGDNKMSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINMCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	181675	190157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181708_183384_183502_185583_185738_186102_186111_189979
841188	contig_14516_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_153915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTATAAAATGTCAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214352	213959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_214000_214400
841189	contig_14516_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_153913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213526	212455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_212500_213500
841190	contig_3602_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_60591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGTTTGGTATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719849	717868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_717900_719800
841191	contig_6277_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_80393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGCAGAAGAGAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146386	145387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_145400_146400
841193	contig_366_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_51614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACAGATAGATCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167354	1165660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1165700_1167400
841194	contig_7091_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_131777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCAAATTGGGTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352641	353600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_352600_353600
841197	contig_4736_pilon	+	836	6	Intergenic	novelGene_168626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	58.0013792939444	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	114	452	248143	268880	TRUE	25	GGATAACCTTGCCCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVGGGGLRLDIPGVRPSLVAFGVFCAGSVCLISDSTMYHNSSQKRHWTFASEEHLASLRADANRKFKCKAVANGKILPNDPVFLETHEEMIICKYYEKRLLEFCSVFKPAMPRSVVLFIRESYAEREQNLLVTVTRYNEKYEKLGKKV	248029	272720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_248260_250224_250348_266104_266176_268852_268965_271628_271690_272481
841198	contig_10196_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_132181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	598	1026	1076479	1076051	NA	5	CGCTGTGTGTCAGGCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHCALPLTCCSTVPYSPRVNPRPIKSFESPQPRSTVRTLPSLLPTCSTWLRGPPAGSPDAPPQPSEATEALRPPLPGFLLGVSLQLICHLSPGGGKPRPSFLSHSRAQPSLLSHSRAQPSFLSHSRAQPCGHTQLNHLNK	1077076	1076033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1076000_1077100
841202	contig_3068_pilon	-	740	4	Intergenic	novelGene_137618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_3	98.1121806912883	218	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	55	498	197581	194051	FALSE	10	GAGAGGCGCCCGCTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSEASSWRSGVERIARSAMSSEPPPPPQAPTHQASAGLLDTPRGRERSPSPLRGNVVPSPLPTRRTRTFSATVRASQGPVYKGVCKCFCRSKGHGFITPADGGPDIFLHISDVEGEYVPVEGDEVTYKMCSIPPKNEKLQAVEVVITHLAPGTKHETWSGHVVSS	205919	193808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_194214_196518_196642_197423_197589_205872
841204	contig_9345_pilon	-	864	2	Intergenic	novelGene_24580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2318	junction_1	0	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	213	650	945468	944755	FALSE	5	CTGTGTGTGTTTCCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDLQRRLGPRGLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNCLKYVRPGGGFEPNFTLFEKCEVNGAQAHPLFAFLREALPAPSDDATALMTDPKFIIWSPVCRNDISWNFEKFLVGPDGVPVRRYSRRFPTIDIEADIEALLSKGPSSA	945680	944540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_945115_945390
841206	contig_7009_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_23590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGTGGACTCAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375285	376155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_375300_376200
841207	contig_12201_pilon	+	693	4	Intergenic	novelGene_159990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	138	junction_3	15.06283137026	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	227	691	208357	209580	FALSE	40	TTGATTATAAAAGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVGKAVENLIPPVQHSLLDRTDKEQLLICPPVTRFFYGCKEYFHKLLIQGDSSGRLSIWNISDTLEKQEDEEGLKMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGRLVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMFRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARYDQRYLISGGVDFSVIIWDIYSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSV	204663	209582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_204737_207967_208113_208348_208598_209356
841208	contig_8652_pilon	-	796	7	Intergenic	novelGene_168779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_6	16.303544263612	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	452	796	81301	76109	FALSE	20	GTGGATTTCACCGCAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQENHLEVVKFLLDNGASQSLATEDGFTPLAVALQQGHDQVVSLLLENDTKGKVRLPALHIAARKDDTKAAALLLQNDNNADVESKSGFTPLHIAAHYGNINVATLLLNRAAA	171299	76108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_-_76190_78101_78288_81223_81323_89857_89957_90798_90898_91281_91384_171169
841209	SIRV6	+	344	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	231	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2747	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3171_7809_7924_10724
841211	contig_20600_pilon	+	2102	6	Intergenic	novelGene_137117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	52.2440427225918	1	136	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	17	826	111355	117548	FALSE	10	TCCCGTCCTCCCTACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGAVMAKSKFEYVRDFEADDTCLAHCWVVVRLDGRNFHRFAEKHNFEKPNDSRALRLMTKCAQTVMKELEDIVIAYGQSDEYSFVFKRKSNWFKRRASKFMTHVASQFASSYVFYWRDYFEDQPLLYPPGFDGRVVVYPTNQTLKDYLSWRQADCHINNLYNTVFWALIQQSGLTPVQAQGRLQGTLAADKNEILFSEFNINYNNEPLMYRKGTVLIWQKVNEVMTKEVKLPAESKGQKMAVTRTRTKPVPFHCDIIGDAFWKEHPEILDEDS	111338	118824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_111459_112268_112446_113990_114161_114959_115049_116223_116332_117386
841212	contig_10095_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_57252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTTTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356487	355346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_355300_356500
841213	contig_9318_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_172354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACAAATGTATCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147342	146844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9318_pilon_-_146800_147300
841214	contig_18804_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_163802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGCCTCTGAGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69416	70743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_69400_70700
841215	contig_7963_pilon	-	417	2	Intergenic	novelGene_58352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3852	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGCGCCGAGGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	43561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_43819_48741
841217	contig_9415_pilon	-	1592	5	Intergenic	novelGene_109817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1167	1556	1836457	1802516	FALSE	45	GTAAAACAAAGACGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASGYQTATREGKCQHAGTFQVSAGSHLLLFHCPKAVYTAKPGISVTAKLCCSSCTFHFLPQMTKQRHQRLRKHTVLELTAPDQEFLYLWGSLGSCCPTDSMCCRQAGPYFRSASARRYWLLHLLRSG	1840523	1802479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1802575_1805896_1805970_1822085_1822197_1836310_1836458_1839357
841221	contig_6424_pilon	-	701	3	Intergenic	novelGene_109268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	32	108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	385	423	83153	83115	FALSE	20	CAGCCTGGGGTTGGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPSWWTSRLKATGRSCWTHSGLTLWSRTGPAAGPAPRFAARADCGCTYHLRVQLASADYIVLASFEPPPVIIQQWNDAKWNEVSYTFSDYPPGVRHILFQHGGKDTQFWAGWYGTRVTNSSIIISHKMTLKRGLANNSA	84398	82836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_83289_83394_83556_84310
841222	contig_11136_pilon	+	1032	12	Intergenic	novelGene_169032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	48.7411784771239	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	31	1020	159922	164313	FALSE	40	ATGACCAGGAAGCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSAAPAPPKRMSGSDAGLEEEPELSITLTLRMLMHGKEVGSIIGKKGETVKRIREQSSARITISEGSCPERITTITGSTAAVFHAVSMIAFKLDEDLCAAPANGGNISRPPVTLRLVIPASQCGSLIGKAGTKIKEIRETTGAQVQVAGDLLPNSTERAVTVSGVPDAIILCVRQICAVILESPPKGATIPYHPSLSLGTVLLSANQGFSVQGQYGAVTPAEVTKLQQLSGHTVPFASPSVVPGLDPSTQTSSQEFLVPNDLIGCVIGRQGSKISEIRQMSGAHIKIGNQAEGAGERHVTITGSPVSIALAQYLITACVGAGAEFSAADTLYSFFNPCF	159891	164325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_160003_160225_160250_160361_160395_160614_160732_160907_161040_161578_161708_161950_162026_162196_162242_162319_162384_162511_162565_162650_162821_164246
841223	contig_15570_pilon	-	1230	8	Intergenic	novelGene_137845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_7	30.8624334088932	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	32	1228	580903	555904	FALSE	20	ACTACTAGATTTTGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLLTRRANWMQKDLEEMTPLHLTTRHKSPKCLALLLKFMAPGEVDTQDKNKQTALHWSAYYNNPEHVKLLIKHDSNIGIPDVEGKIPLHWAANHKDPSAVHTVRCILDAAPTESLLNWQDYEGRTPLHFAVADGNVTVVDVLTSYESCNITSYDNLFRTPLHWAALLGHAQIVHLLLERNKSGTIPSDSQGATPLHYAAQSNFAETVKVFLKHPSVKDDSDLEGRTSFMWAAGKGSDDVLRTMLSLKSDIDINMADKYAGTALHAAALSGHVSTVKLLLENNAQVDATDVMKHTPLFRACEMGHKEVIQTLIKGGARVDLVDQDGHSLLHWAALGGNADVCQILIENKINPNVQDYAGRTPLQCAAYGGYINCMAVLMENNADPNIQDKEGRTALHWSCNNGYLDAIK	580934	555901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_555958_560158_560389_561469_561626_564417_564590_568516_568627_571601_571783_574380_574549_580777
841224	contig_1964_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_130937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTAGAAATGTTGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715577	716528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_715600_716500
841225	contig_13937_pilon	-	1183	3	Intergenic	novelGene_167351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_2	126	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	213	800	37830	35956	FALSE	40	AGATATGAGACTTACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYLKITKRLLFQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGRCGSRALGKPSGTGSYLGRQFLKIFTLRSSYLQGKLWYILQ	38042	35572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_36299_36824_36951_37711
841227	contig_7271_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_159957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAATAAAAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546135	544819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_-_544800_546100
841228	contig_14563_pilon	-	720	3	Intergenic	novelGene_135068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGTATTGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248340	235565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_236149_238903_239011_248310
841229	contig_6387_pilon	+	399	2	Intergenic	novelGene_165426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTGACTGATTTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74742	82939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_74984_82781
841230	contig_5316_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_61258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTCAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531504	532844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_531500_532800
841231	contig_14980_pilon	-	871	7	Intergenic	novelGene_78215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	11.0855260988773	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	19	738	240461	203038	FALSE	5	TGGTTTGGTCTGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVALSEAEKVYIVHGVQEDLRVDGRGCEDYRSIEVETDVVSNTSGSARVKLGHTDILVGVKAEMGTPKLEKPNEGYLEFFVDCSANATPEFEGRGGDDLGTEIANTLYRIFNNKSSVDLKSLCISPREHCWILYVDVLLLECGGNLFDAISIAVKAALFNTRIPKVRVLEDEEGSKDIELFDDPYDCIRLCVENVPCIVTLCKTGKRVGKVLHTSLQSVLHKEESLGPKRQKVGFLG	240479	202904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_203143_207925_208050_212379_212451_216619_216786_228506_228602_228877_228980_240404
841232	contig_8898_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_137265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGAGGTTCCCTGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392005	391624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_391600_392000
841234	SIRV2	+	642	5	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-333	1430	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	7	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACGTAGCGGATAAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3700	5887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_3828_3967_4095_4340_4479_4686_4800_5750
841235	contig_6069_pilon	+	416	2	Intergenic	novelGene_8036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAAATTTTTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319887	321376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_320088_321160
841236	contig_6069_pilon	+	89	1	Intergenic	novelGene_8039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTTGGTTCTTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321327	321416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_321300_321400
841237	contig_6269_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_170538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196493	194517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_194500_196500
841238	contig_12086_pilon	-	1151	2	Intergenic	novelGene_74709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGTTTCTTTGAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13205	10893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_11484_12644
841239	contig_5791_pilon	+	1564	2	Intergenic	novelGene_35849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAACAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056312	1058471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1056541_1057135
841240	contig_3832_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_161483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCATTAGCTATGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470158	468520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_468500_470200
841241	contig_2704_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_75297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTAATCTGTAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60428	59585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_59600_60400
841242	contig_14219_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_54326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCTTATTTGAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742009	741330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_741300_742000
841244	contig_6496_pilon	-	942	7	Intergenic	novelGene_103480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.1324755940392	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCCCACCAAGCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300537	247413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247790_249540_249576_250694_250719_263144_263179_264936_265066_296691_296745_300246
841245	contig_20614_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_107608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAATAGAAAATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471296	471658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_471300_471700
841246	contig_6808_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_173535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386921	386467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_-_386500_386900
841247	contig_16686_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_162106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCAGCAGTTCAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203264	204102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_203300_204100
841248	contig_13481_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_119262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23606	24958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_23600_25000
841249	contig_8581_pilon	-	1280	5	Intergenic	novelGene_22840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	134.450734471776	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	80	337	312629	308959	TRUE	40	AACTCAAAGACTCGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRPGGPRSCVARAWRPWWIRSVRTGDWTI	314621	306347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309044_309119_309147_312483_312640_314552
841250	contig_11594_pilon	-	2067	5	Intergenic	novelGene_80943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	8.7571399440685	14	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	5	1675	585362	572389	FALSE	45	GACAGGAAAATTAGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGKIFRIWFEQLPTGRKRQEQFQEKIVAKREVKRRQQELEYQIKAELEIMPPRKSLRLQGLAQSTTVEIISVQVPPQTPSSPAKDKVVSTSEFVRCRNVSDSSIKRRLIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQCFLKLDLNQWLAVTASDKTRASYKPLPVTDTVFQINEYQEKDTGSVCSRHPSLSSGLSGGASKSKKMELIQPREPSSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPSFRGYAQQDAQEFLCELLDKIQHELETTGTRLPTLIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVTCLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKDTAFQPCLVTEMLAKFTETEALEGKIYVCDQCNSKHRKFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFEEILNMEPYCCKESLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWVHCNDSKLSMCTMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLSGSQHPSEEADTSNNEIFS	585366	571996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_572589_573518_573725_579101_579211_582020_582217_584402
841251	contig_6870_pilon	-	875	3	Intergenic	novelGene_103963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	98	186	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	338	874	1405146	1404610	FALSE	40	ACGAAAACGTGGAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGKMNIAIDMEANCGDLVLSVGRITLGEKNRKKMKNCQLRREQNKKVLHCMNALLNFGGGVIKAEIENEDYSYQKDGLGLDLETSFRNLLSSFTRNFLDFRQQGRYFLIFVKSWSSAIPGLWIASLCTNLYYRDTTSVLVMSASDALKFLKERKESRGKWNSEPRFPPKRAKTDIQE	1407451	1404608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1405172_1407048_1407293_1407383
841252	contig_6726_pilon	-	1143	4	Intergenic	novelGene_86219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.77123616632825	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	340	708	192028	103970	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLWRQEFLRENFKKLQFLPRPRRYNCSKALFSTYCSVTFCLLALPKFLDCSRLLLSHLLFLGLELAAYLLILEFVELLSLRSRVQFPDLPTLGSAASVALRIGRSLYPDLWTWDVLAFTIA	287637	103534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_104227_104478_104577_192014_192168_287437
841253	contig_9389_pilon	-	887	9	Intergenic	novelGene_84065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	36.8610142969506	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	362	886	954875	950513	FALSE	5	TGTTCCCGCACCGCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLRGLVPSATPGLIKTSSRRLVSHEVVLGGRLAAKTSFSLSRPGSPRVEELKGVALYSRLKEYLLTEDQLKENGYPFPHPKRAGGAIIFTAEEKKPKDASCRICCRCGAEYLVSSSGRCMRAEECSYHWGRLRRNRVAGGWETQYTCCSAAVGSVGCQVAKQHVQDGRKENLEGFVKTFEKEHPEDTHPGVYALDCEMSYTTYGLELTRVTVVDTDMQVVYDTFVKPDNEIVDYNTRFSGVTEADLADTSITLRDVQAVLLSMLSADTILIGHSLESDLLALKIIHSTVVDTAV	956297	950511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_950546_950784_950924_951077_951194_952264_952376_953631_953706_954823_954938_955187_955326_955434_955549_956250
841255	contig_13744_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_77215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGATTTTTCAGAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123227	1121839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1121800_1123200
841256	contig_5261_pilon	+	1215	11	Intergenic	novelGene_102495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	38.4130186265021	2	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	228	971	814866	837097	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLLWGKASAELQTLLMNQLTVKGLKKLGQSIESSYSSIQKLVISHLQSGSESLLYHLSELKGMALWKQKYEPLGLDAAGIEDAITAVGSFILKANELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVADFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVEKVGQYLKDEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDHCLQKPAVSLEEMHVFM	814638	837341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_814895_816117_816161_816240_816318_818001_818103_818185_818238_825709_825766_828096_828144_829243_829301_829622_829680_835108_835203_836966
841257	contig_5302_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_81370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTATCATAAAATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24634	22845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_22800_24600
841258	contig_7412_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_76274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAATTCCCTGATTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252558	252118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_252100_252600
841259	contig_2009_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_165440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAGGTCCATGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26568	24397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_24400_26600
841260	contig_7513_pilon	-	1327	6	Intergenic	novelGene_88935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	41.1553155740543	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	66	1082	87692	43655	FALSE	65	AAAGAAAAAAAAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLPPGRWLWLRAGLPAVDFRMSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGDKIPLLCVPFEKKDFVGLDTDSRHYKKRCQGRMRKHVGDLCLQAGMLQDSLVHYHMSVELLRSVNDFLWLGAALEGLCSASVISHYPGGTGGKTGARRVQGSSLPAEAANRHRPGAQEVLIDPGALTTNGINPDTSAEIGRAKNCLSPEDIIDKYKEAISYYSKVI	91682	43409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_43786_57076_57104_66270_66400_71522_71669_87108_87703_91627
841262	contig_6496_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_103523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTAGGAGCTGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896816	898373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_896800_898400
841263	contig_302_pilon	-	201	3	Intergenic	novelGene_145010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	212.5	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTGCAAAGTAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58281	46999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_47056_54397_54442_58180
841266	contig_14023_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_165357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTCTTATTAATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82171	82711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_82200_82700
841267	contig_10500_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_41167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGAAAGAAAAATAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273948	1273007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1273000_1273900
841268	contig_1154_pilon	+	1312	9	Intergenic	novelGene_87169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	38.9358446678636	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	180	1154	918664	923168	FALSE	25	AAGAACACGTCGTCGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGQRSLLLGPARLCLRLLLLLGYRRRCPPLLRGLVQRWRYGKVCLRSLLYNSFGGVDTAVDAAFEPVYWLVDNVIRWFGVVFVVLVIVLTGSIVAIAYLCVLPLILQTYSVPRLCWHFFYSHWNLILIVFHYYQAITTPPGYPPQGRNDIATVSICKKCIYPKPARTHHCSICNRCVLKMDHHCPWLNNCVGHYNHRYFFSFCFFMTLGCIYCSYGSWDLFREAYAAIETYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGR	914576	923326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_914751_918658_918907_919076_919272_919418_919508_919901_919931_920589_920724_921741_921828_922770_922895_923093
841270	contig_1037_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_84608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCTGGAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377440	375633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_375600_377400
841271	contig_3980_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_172331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAGAGAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61194	60255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_60300_61200
841273	contig_7234_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_145949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGTGAAATGTGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468027	466491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_466500_468000
841274	contig_10000_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_139333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGTCCAGTTAGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280785	281433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_280800_281400
841275	contig_9833_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_68572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	339	1020	42	1061	345937	346956	NA	35	GGTGTTTTTCAATAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCCFECQLRGKGYMCRPAGDECDLPEYCEGTSEECPVNTYKQDGTPCERINYCYMGQCRNPDKQCIRIYGPHARSASEDCYQSMNSKGDRFGNCGRPSENDPVYVKCIDDDIFCGKLICTDVAYLPRIKPNHTLIQVPYTDDWCWSMDAYNGADIPDDGDVQTGTYCAPNKVCMNYSCVDHAVFNYDCKPAEMCNGKGVCNNLRHCHCEPGFAPPDCRAPGDGGSVDSGPGFFLYDTNPSEGGLRVKSNEDNAGKVVFILPVFLVGLLFGLVIFTSFSIRKKPPEATPEPPSEESLEGPPEAPSEEPPEAPLGEPPEAPAEEPPEEPHEMPEEPAPEGEAGEPLEEPETEYQ	345895	347471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_345900_347500
841276	contig_14314_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_176838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAAATTAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130162	129533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_129500_130200
841279	contig_1694_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_144924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTCCTGTAGGGTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446719	446135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_446100_446700
841280	contig_1694_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_144926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455671	455054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_455100_455700
841281	contig_6138_pilon	+	1080	2	Intergenic	novelGene_159690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTAAAAAAAAAAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574866	576039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_575528_575620
841282	contig_9363_pilon	-	1280	3	Intergenic	novelGene_6739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25.5	87	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	300	980	1497101	1493275	FALSE	15	GTATGGTCTGTGAGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALEPETLSSYATPTRGAPTPASLDPLPSLLLLTLPPAPRSGIVAKATSPPQVPRGTTPIAQGTQRLAEGACVLTAPPTTRRVRGVNGRQGRQGNLSDWLKGTRGWLHLHCPPEAPAGEPRVLCIRAVNLDGINSTAVNNYLDKQRSWLGAEMASSILLRREIGDGPHYHRRELGVECVLWIQGPSSENLLDPGDRVVTLEMAREGSKKQETSVRQLQWTSWPTE	1497400	1492974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1493469_1495986_1496117_1496744
841283	contig_6069_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_8005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTGTCACTTTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29296	27615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_27600_29300
841285	contig_4519_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_123706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAAAATCGGGAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610835	612526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_610800_612500
841286	contig_15599_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_176664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTCAACTCTGGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43051	42389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15599_pilon_-_42400_43100
841288	contig_10196_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_132247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAGGACCTAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788938	1789932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1788900_1789900
841290	contig_7909_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_155917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTACATCAAAAGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532322	532028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_532000_532300
841291	contig_7909_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_155916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCTCAAGGGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531775	531328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_531300_531800
841292	contig_4845_pilon	-	1090	5	Intergenic	novelGene_53664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	73.7122784887294	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	21	743	521287	519445	FALSE	5	TATGTGGTCTTTTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARLVGMKEEEKEDVAARASSATQPGTKRPGSPPHLGACPLLPVPRYLRRRQASPHLLPADVVYDHTFWGLHGCYRRLSQRRPSGHHLGPGGRRASGTMASPVLPTSVRQLSRRRQVALRRKSVGPQAWSALLVKAITKSGLPHLALPPPTPGALCGESERQIRSTVDWSESAAYGEHIWFETNVSGDFCYVGEQYCVAKMLQKSVSRRKCAACKIVVHTPCIEQLEKMNHLLSGGNHSTYLEWLL	521307	519097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_519502_519701_519780_520091_520188_520466_520576_520904
841294	contig_1699_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_72813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAGGAGCCAAATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46320	46579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_46300_46600
841295	contig_5062_pilon	-	1320	2	Intergenic	novelGene_157866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	39	638	813086	811159	FALSE	65	ATTTCTAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQGIKFDASQKKFAKERKLSTGSSGRYEDSDGCYLQKSKHPRKLELQQLSTRSSSSSSRVSRIRSSSSAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERRLSGAPISFILLLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPAGVTGEVGEEEEGRSTGASMLGTHIVT	813124	810476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_811677_813004
841296	contig_10054_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_171215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	111	311	156443	156243	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPRCGTRGCPEPGAGEREASPQPLEELDHLLLLALMTGLFTMCSLPLIVSRLAPRLRGFGGLRPRAPGGKDGACLDRAQEELRGGRENLLLRSADQFLPQS	156553	155247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_155200_156600
841297	contig_3787_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_102427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGGAAGGAGATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602967	601845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_601800_603000
841298	contig_12250_pilon	+	495	5	Intergenic	novelGene_80588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	712.74978077864	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	78	428	322810	332391	FALSE	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKVKTLTGKEIEIDIEPTDKVERIKERVEEKEGIPPQQQRLIYSGKQMNDEKTAADYKILGGSVLHLVLAHCLGPQNHCPLPWMPRLVYLLVGDCEDPRMQCSWHKGPLLAVGF	322732	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_328400_328449_328603_328687_332096_332162_332254
841299	contig_9216_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_163503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATTAATTGACATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493068	491672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_491700_493100
841300	contig_6496_pilon	+	1237	2	Intergenic	novelGene_103534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACTCCCAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131700	1133316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1132668_1133046
841303	contig_5758_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_119135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTGGGTAACTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632624	631886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_631900_632600
841304	contig_19957_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_57691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTCTTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98283	97515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_97500_98300
841305	contig_11130_pilon	-	421	5	Intergenic	novelGene_53103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	729	junction_4	827.675170281192	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTGTACAATTTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	56043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
841306	contig_13558_pilon	+	1727	11	Intergenic	novelGene_123021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	327	713	48526	72230	TRUE	20	CCTCTTTCTTACTAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQNNSTRFTNSTFSHSLFGSDNEGACVSKNLSRTFWKTGKLDPAREAEEMDSFSSKTSDSPHLSASTSACLFSKSFATAMALCLPDRLQLTAHSHNSVTTASSLAATYVVVFVLVWPENLMIKRLH	45678	122174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_45857_48377_48593_49959_50087_51234_51370_72172_72307_72607_72707_73549_73702_77919_78197_80094_80199_82834_83006_122039
841309	contig_15376_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_154687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAGAGCAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168406	167651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_167700_168400
841311	contig_12746_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_152189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563193	561922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_561900_563200
841312	contig_20447_pilon	+	397	2	Intergenic	novelGene_177384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	72	395	5481	5984	FALSE	40	AATAGATACACAGTGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFLGVSLVILWLLLARVNSQVEQNPEALTIQEGENATMNCSYKASINNLQWYRQDSGRGLVQLILIRSNEKEKTNGRLRATLDTSTTSSFLFITASQAADTAAYFC	5409	5986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20447_pilon_+_5533_5712
841313	contig_9375_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_136041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132992	133370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_133000_133400
841314	contig_848_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_83331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCCTCAGCCCTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515334	516729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_515300_516700
841315	contig_5718_pilon	-	1237	6	Intergenic	novelGene_110396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	41.1708634837794	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	361	1236	1326579	1282836	FALSE	50	ACTACGAGAAGAAGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHEMTGTEIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQQDKVLITELIQHSAKYKVDLDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLSVLLGKLEKSFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTLVPTCISQPCLPVANIGPTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLL	1326939	1282834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1282897_1285385_1285510_1288884_1289045_1301205_1301370_1322368_1322508_1326351
841316	contig_11448_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_66381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAATCTCAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356760	357956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_356800_358000
841317	contig_12964_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_131719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAAAAATAAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592740	591580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_591600_592700
841320	contig_9982_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_55793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATCCTCCCACTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904085	902200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_902200_904100
841321	contig_11047_pilon	+	977	2	Intergenic	novelGene_173955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTGCATATCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100447	112457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_100525_111557
841322	contig_14441_pilon	+	549	4	Intergenic	novelGene_100563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGCCCTGAATCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111196	126693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_121188_121432_125152_125190_126599
841324	contig_2450_pilon	-	2227	9	Intergenic	novelGene_160297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	64.7900455317019	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	75	1703	204344	181889	FALSE	20	TCGAGAGAGTGTTTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASRLFSFIHGSEDLTTETDLTAANGKKVQALEIFAYALQYFKEQALKELSDQAGSDFENSDVRWVITVPAIWKQPAKQFMRQAAYQAGLASPENSEQLIIALEPEAASIYCRKLRLHQMMELSSKAAVNGYSASDTVGAGFAQAKEHIRRNRQSRTFLVENVIGEIWSELEEGDKYVVVDSGGGTVDLTVHQIRLPEGHLKELYKATGGPYGSLGVDLEFEKLLCKIFGEDFIEQFKIKRPAAWVDLMIAFESRKRAAAPDRTNPLNITLPFSFIDYYKKFRGHSVEHALRKSNVDFVKWSSQGMLRMSPDAMNALFKPTIDSIIEHLRDLFQKPEVSTVKFLFLVGGFAEAPLLQQAVQTAFGDKCRIIIPQDVGLTILKGAVLFGLDPAVIKVRRSPLTYGVGVLNRYVEGKHPPDKLLVKDGTRWCTDVFDKFISADQSVALGELVKRSYTPAKPSQLVIVINIYSSELDNVSFITDPGVKKCGTLRLDLSGTSGTAVPARREIQTLMQFGDTEIKATAIDIATSKSVKVGIDFLNY	204418	181364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_182527_184336_184441_187894_188154_189060_189166_189752_189840_193551_193724_201524_201642_203805_203911_204302
841325	scaffold_12510_pilon	+	729	2	Intergenic	novelGene_151416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAAATGTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627910	629129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_627970_628459
841326	contig_593_pilon	+	1257	8	Intergenic	novelGene_102012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_6	113.207773584679	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	263	1009	383582	479108	FALSE	65	ATAAAAGAGAAAGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQVSVEI	383319	479356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016
841327	contig_6102_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_32296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATAGCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485979	1485140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1485100_1486000
841328	contig_10319_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_147252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAATTGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180352	178999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_179000_180400
841330	contig_3654_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_174993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATGTGAACAACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539359	537741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_537700_539400
841331	contig_8202_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_177152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94139	93517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8202_pilon_-_93500_94100
841332	SIRV6	+	405	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	32	164	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
841333	contig_4364_pilon	-	887	8	Intergenic	novelGene_68	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	511	885	705766	701294	FALSE	20	CGCGCGGAGCGAATGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPGKGQQLPVQAERLQNDLPGALVEDGFLPVFQVLYRHKQAARDVEELPAQTISAVVGGGQADGQDPNQKRPRPDARSPLQVEAGACVHLHLHVHPGTFWHHSEQDTGGLEGASGRAAADGPA	709030	701291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_701332_702988_703119_704289_704331_704793_704868_705674_705772_706889_707033_707343_707405_708729
841334	contig_15264_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_158873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAGAATAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101850	103894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_101800_103900
841336	contig_6014_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_176285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTATTAATTATGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327515	327863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_327500_327900
841339	SIRV6	+	399	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	333	35	167	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTTGAAGCCGAAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470	2085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
841341	contig_9582_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_106862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTTTCCTTGATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882648	882423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_882400_882600
841342	contig_20600_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_137119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGGAAACTGTAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137857	138155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_137900_138200
841343	contig_6266_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_170983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126946	126010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_126000_126900
841344	contig_5502_pilon	+	1240	6	Intergenic	novelGene_155016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	111.427824173319	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	25	723	528956	538556	TRUE	15	ACTGTGTTTTCTGTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLCGKDEDMIPQLLVDFWEAQLVACLPDVVLQELFFKLTSHYIWRLSKGQPPDSTPLRTSEDLINACSHYGLIYPWVNILISYDSSADKNYTEDLSKLQSLICGPSFDIASIIPFLELLSEDTAAGLSVHVLCRTRLKEYEQCIDTLLERCPEAVIPYANHELKEENRTLWWKKLLPELCQRIKCGGEKYQLYLSSLKETLSVVAVELELRDFLNVLPEDGTAAFFLPYLLYCCRKKSLT	528931	539268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_529121_530137_530246_532858_533066_534043_534135_538428_538620_538814
841345	contig_5947_pilon	-	511	4	Intergenic	novelGene_101488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	271.288694116721	101	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTTGTATTTGGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393948	391376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_391633_392030_392108_393412_393497_393854
841347	contig_11855_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_67086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAGTGGATTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2331991	2332583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2332000_2332600
841349	contig_9784_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_165705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTTGGGGTCAAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364372	363802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_-_363800_364400
841350	contig_7359_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_139859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCATTATTACATGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62010	62726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_62000_62700
841351	contig_10399_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_114508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAATAAATAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474197	473105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_473100_474200
841354	contig_7342_pilon	-	949	2	Intergenic	novelGene_71203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	94	321	669127	668807	FALSE	15	TCTGTTGTTCAAATTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APYSAAKFALDGFFGSLRRELDVQDVNVAVTMCILGLRDRASAAEGVRGVTRARAAPGPKAALAVVRGGRHARLWRLLPAALPPAVSASGLAAAPRGPGSSARSST	669220	668178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_668985_669077
841355	contig_6208_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_52987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374771	375949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_374800_375900
841356	contig_13607_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_170174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTGCTGCAAAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173663	174716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_173700_174700
841357	contig_6276_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_174123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAAACGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156705	157267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_156700_157300
841358	contig_6952_pilon	-	947	2	Intergenic	novelGene_173645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCATATTGTATCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35808	29982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_-_30524_35402
841360	contig_13992_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_147630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGGAAGAAGAACCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400680	401634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_400700_401600
841362	contig_5845_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_98894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146426	146797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_146400_146800
841365	contig_5832_pilon	+	946	2	Intergenic	novelGene_134177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGGGGTCTCTGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569792	570815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_570304_570380
841366	contig_348_pilon	+	803	5	Intergenic	novelGene_67615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	9.01041064547005	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	196	498	342267	345268	TRUE	30	AAAACTGTATCTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	321737	345694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_321810_342143_342306_342779_342990_345214_345312_345432
841367	SIRV2	-	256	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	670	22	670	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4062	3665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
841368	contig_6691_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_60156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGCAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350821	349777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_349800_350800
841369	contig_348_pilon	-	1882	4	Intergenic	novelGene_67621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_2	35.8143360495021	87	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1084	1416	347679	346839	FALSE	15	TTTGGGCGAGAACGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGRASAQYSEEEDTDTEEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMDGMTEEQKEHEAMKLVNMFDKLSRHQVIQPMSISPCGHLTSLQDAMGQTMEGQLSSDPDSDPDSDPD	348845	346372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_346972_347234_347355_347599_347957_348039
841372	contig_7056_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_43589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTAGGCGGGCTAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659371	660799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_659400_660800
841375	contig_7426_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_27455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGGAGGGAGCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573610	574117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_573600_574100
841376	contig_16578_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_148622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92736	93998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_92700_94000
841377	contig_9527_pilon	-	962	7	Intergenic	novelGene_134042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.29152869605896	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	225	815	302596	298512	FALSE	10	GGAGCTTTTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPMKTPKSLGKKKEKSGEMVKKEEKSGSGQSPTQGAPKKEDASKAGKGKASIPEQKPAKGKGTKSGSKEKRSILLESELVAETTEMVNPLLEPVAHRDGKVYMPGNKVLLHLNLLRNRITEVGLDGFLTAVRYQVQFSKSKAASKGPVGLLWLSLAKNYFPVQCPAYTMIQELLLPRDPMNKARPREEEAVAFPM	303391	298364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_298632_299958_300081_300417_300530_301745_301835_302238_302333_302542_302693_303263
841378	contig_4769_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_118041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAACTGGCTTAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1526991	1528076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1527000_1528100
841379	contig_11427_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_78983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	34	387	256838	259280	FALSE	40	TATTGACCAAAATGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQQPFQFVSFMGIQDSKQLNKTCCLNGGTCMLGSFCACPPYFYGRNCEHDVRKENCGSVPHDTWLPKKCSMCKCWHGWLRCFPQTFLPGCDGRVMDEYLEASRTPELTPSVCTTFMLAGLCLSTLFY	256804	260408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_256854_257310_257426_257513_257624_259167
841381	contig_6086_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_171465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTTAAGAACTACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94628	95078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_+_94600_95100
841383	contig_5569_pilon	+	2302	19	Intergenic	novelGene_86710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	37.523531711431	8	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	225	2186	23963	31181	FALSE	35	TCAAGAAAGAGCCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLEKVLGITVSGGRGLACDPRSGLVAYPAGCVVVLFNPRKHKQLHILNSSRKTITALAFSPDGKYLVTGESGHMPAVRVWDVAERNQVAELQEHKYGVACVAFSPSAKYIVSVGYQHDMIVNVWAWKKNSVVASNKVSSRVTAVSFSEDCSYFVTAGNRHIKFWYLDDSKTSKVNATVPLLGRSGLLGELRNNLFTDVACGRGKKADSTFCITSSGLLCEFSDRRLLDKWVELRTTVAHCISVSQDYIFCGCADGTVRVFNPSNLHFLSTLPRPHALGTDVASVTEASHLFSGVANARYPDTIALTFDPTNHWLSCVYNDHSIYVWDVRDPKKVGKVYSALYHSSCVWSVEVYPEVKDSNQACLPPSSFVTCSSDNTIRLWNTESSGVHGSALHRNILSNDLIKIIYVDGNTQALLDTELPGGDKADGSLMDPRVGIRSVCISPSGQHLASGDRMGTLRVHELQSLSEMLKVEAHESEILCLEYSKPDTGLKLLASASRDRLIHVLDAGREYSLQQTLDEHSSSITAVKFAASDGQVRMISCGADKSIYFRTAQKSGDGVQFTRTHHVVRKTTLYDMDVEPSWKYTAIGCQDRNIRIFNISSGKQKKLFKGSQGEDGTLIKVQTDPSGIYIATSCSDKNLSIFDFSSGECVATMFGHSEIVTGMKFSNDCKHLISVSGDSCIFVWRLSSEMTISMRQRLAELRQRQRGGQAAGTILSPKGFWTQRA	9677	31297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_9772_22914_22978_23193_23252_23953_24125_24497_24636_24865_25049_25595_25757_26537_26728_27285_27433_27660_27837_28587_28680_28985_29112_29477_29549_29651_29774_30037_30114_30226_30339_30514_30579_30844_30981_31175
841386	scaffold_13505_pilon	-	1891	3	Intergenic	novelGene_111403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTCTGAAAATCAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287713	283746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_285069_286100_286193_287236
841388	contig_13292_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_142932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCATATTAAAAGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110085	109401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_109400_110100
841389	contig_15327_pilon	-	1361	5	Intergenic	novelGene_70837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	2.04633819296811	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	37	552	1653943	1647610	FALSE	25	AAACCTGCCTGCCACTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKTSFYGFTVNTMKNSLISYRKLGFTSVPQRQDLRYIFIPSHIRDYVMLRSAILGVPVPEGTDKGDRPQTYFGPEASASKFKLLHPDFIRYLTERFLKSDLINTKFRDLYMPSTGALMLLTALHTCDQVSAYGFITRNYRKFSDHYFDRIKKPLIFYANHDLLLEAALWRDLHKAGIIWLYQR	1653979	1646800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1647778_1648633_1648734_1650193_1650278_1652049_1652154_1653883
841390	contig_10016_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_117844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGTTCTTGGTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251629	252931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_251600_252900
841391	contig_11708_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_138987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379637	379143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_379100_379600
841392	contig_17198_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_62327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTATCAATTGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422020	424053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_422000_424100
841393	contig_4924_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_84757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAAAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198296	197481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_197500_198300
841394	contig_9982_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_55792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGGAACAATTAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895977	894848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_894800_896000
841395	contig_9982_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_55791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGAGGTAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894848	893906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_893900_894800
841396	contig_10930_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_37082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCATCTTTTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294685	294096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_294100_294700
841397	contig_5145_pilon	+	1214	2	Intergenic	novelGene_131405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTTTATTATAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715823	717556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_715903_716421
841398	contig_20614_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_107538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGAATGTTCTACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86514	86219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_86200_86500
841400	contig_3627_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_78433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267226	265406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_265400_267200
841401	contig_12622_pilon	-	1184	6	Intergenic	novelGene_5887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	9.17387595294377	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	136	765	1469024	1462438	FALSE	65	GGCAAAGATGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGVPILPAHFCSDLGLRIQTEGTSETDTTCTCKEGQHCTSDTCESCAPHSSCHPGFGVEQIATGTSDTICTPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCKTKDLAELKAGTNTTDVLCGPWPRTRALVAIPITLGILFVIFVSAYINKVVKKPDNKAYPGEGVRKAPEEMIFLDDIPGHNPVAPVQETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ	1469159	1462018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1462606_1463320_1463350_1463458_1463543_1464886_1464949_1468407_1468502_1468831
841402	contig_7898_pilon	-	547	3	Intergenic	novelGene_47567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14012	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGATGGGAGGCGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487531	483935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_484071_484213_484360_487265
841404	contig_7229_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_39839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954660	954427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_954400_954700
841405	SIRV3	-	383	3	NNC	SIRV3B	novel	479	3	NA	NA	42	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1940	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_1191_1601_1755_1902
841406	contig_5649_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_82360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATATTAAATTTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025493	1026311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1025500_1026300
841407	contig_848_pilon	+	1403	3	Intergenic	novelGene_83353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	13	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	29	682	789617	792105	FALSE	35	GATAAGCCTAATTTAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGTIDPSSVMVLVNVIYFKGQWQNKFQEGETSKTPFQLGEGKSVTVDMMYQTGIFKLAFIKKPRIQVLELPFVNNRLSMIILLPVGKAKLEQIEKELNLKTFQEWTSSSNMMEKEVEVYIPRFKLEIKYELNSLLKSLGMTDIFDQTKADLSRMSPAKNLYLSKVIHKSYVDVNEEGTEAAAATGNIVVVKNVPMRAQFMANRPFLFFIKHTRTNMILFFGKLASP	789588	792826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_789710_790763_790920_791700
841409	contig_17897_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_153400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	521	826	37549	37854	NA	60	GTTTAATTAACAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCLTSAPLTLVLLHAVLEGFGAREQTAFPHASQFLSHSSCRSEGRRRGKHCHFFSPLLPSPQIIFSSSSLLWWPLWMALIYSPWRKHSSRKSHTCNNESA	37028	38311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_37000_38300
841415	contig_10064_pilon	+	662	4	Intergenic	novelGene_122727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.579052259116	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	126	407	395972	404366	TRUE	20	GTATTCAGAGGGTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIPGAQHAALPPQPLGASLRALRRAPYASPKDAHFQKKNTSPLVQCAAKGGALLLCAVSTPA	395846	404723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403054_404183_404493_404594
841417	contig_20602_pilon	-	1141	3	Intergenic	novelGene_133730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_2	80	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	521	1093	19906	16994	FALSE	45	ACCAAGCTTAAAGTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKLKLTGLALICFLLVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVNAFYNFRFKKTNRDVKTSFEFHSFTVNMGIRKKNR	20426	16945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_17275_19179_19325_19759
841419	contig_12079_pilon	-	1908	13	Intergenic	novelGene_67358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCCTCCCGTTGCCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361495	166131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_166223_282632_282762_291969_292132_317220_317402_319612_319758_327056_327217_341903_342132_343459_343691_348475_348621_349675_349822_351612_351706_355785_355929_361441
841420	contig_10319_pilon	+	726	2	Intergenic	novelGene_147258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTTGCAAATGGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368453	369642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_368880_369342
841421	contig_6870_pilon	-	494	3	Intergenic	novelGene_103945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	38	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	122	493	1221712	1214185	FALSE	25	AGAAGGAGGAGCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWGSLPSGDPATFSNLAVLSSVLFSDEISETGCWRFPDFIMWATCCNWFCLDGQPEETPPPQGARTQAYSNPGYSSFPSPTGSEPSCRGCGAHFANMARKQTCLDCKKNFCMTCSSQVGNGPRLCLLCQRFRATAFQREELMKMKVKDLRDYLSLHDISTEMCR	1259412	1214183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1214377_1221532_1221721_1259299
841425	contig_6286_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_165662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	152	451	360953	361252	NA	20	CAGGACGCACCTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHTTQSAHSGHTPTVRLLPGRESVRTQYRQSRSEPRPHQSPGPRAPSVGFGTPDPPLPGQPTACAGDDGAGVGRGWGTLLEPQELETGPQGYTCPRDT	360801	361664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_360800_361700
841427	contig_9423_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_99179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	999	1310	50096	50407	NA	30	GTTTTCACACTCACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYQGLQNPLLSVPYLDPSEFISSPLPHLILLQPHRSSSCSLNTPNLFFPKGAGTYCSLRPIHYSLFHFIQVFLQNSHQRPSLTNLRQTFFSLIISLLYCFRE	49097	50834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_49100_50800
841429	contig_18930_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_177385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAAAAAAACTACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10746	10068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18930_pilon_-_10100_10700
841430	contig_4059_pilon	-	674	4	Intergenic	novelGene_140598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1210.96077558276	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	4	522	422646	398089	TRUE	40	CAGGAAAATATATCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	422649	397840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_397864_397959_398262_411046_411209_422462
841431	contig_7229_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_39830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATGCCAAACACAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920013	920759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_920000_920800
841433	contig_13481_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_119514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAGAAAGATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413461	1413964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1413500_1414000
841436	contig_17074_pilon	-	1111	2	Intergenic	novelGene_145163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGATATTTTGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558034	552562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_553336_557696
841437	contig_5947_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_101505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGGAAAATAGATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409063	410313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_409100_410300
841438	contig_3942_pilon	-	406	5	Intergenic	novelGene_128702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	88	405	430075	426638	FALSE	30	GTAGCAGCAACAGCGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCAEVIQGPRAGSRKNGGSWVFTAVTGNRLPSGTWSQFGRHLASHPGTNGKRGSGAHPVHSWASIDDDPGHVFVGKSSRTRNPRQVVATSWSALGGDARAAAGPC	430162	426636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426698_428065_428097_429571_429605_429797_429849_429932
841441	contig_5936_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_53558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAGAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138321	139091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_138300_139100
841443	contig_11328_pilon	+	594	4	Intergenic	novelGene_88424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	934.795164728616	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	51	458	644854	647167	TRUE	35	TTTTCTAAGAGTGACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEETQDQSTQDSASCYSTCLATQASAYCSEEAAH	644803	647999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645017_645228_645376_647069_647194_647889
841444	contig_10372_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_112514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCCCTGCAATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37588	38701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_37600_38700
841445	contig_1244_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_38067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTAACTAGCATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240428	1241190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1240400_1241200
841447	contig_9297_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_69811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATCACCTGGGTCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297999	298263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_298000_298300
841448	contig_9713_pilon	-	1324	3	Intergenic	novelGene_170258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	138	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACTTGATTGACAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571610	550377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_551444_552922_552999_571428
841449	contig_9571_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_136317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626294	625973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_626000_626300
841453	contig_6674_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_148022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATGATATGACTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268795	268239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_268200_268800
841454	contig_7898_pilon	-	445	5	Intergenic	novelGene_47623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	120	302	598959	596133	TRUE	0	CCCCTGGCCCTCGGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHLVWTTEVLNSSFCFCFFLFFPPFSSDRESAVAGVSSFMKAASIAWLKEFWKLGTGTRSELSLSPSLSTGAGGTRLFSSFFGAVLGHTSAFAFPTLSI	599925	594321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_594363_596030_596135_598691_598750_598836_598997_599843
841455	contig_3575_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_141123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTCTAAAAAATATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763615	762676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_762700_763600
841457	contig_17212_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_88615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTCTTAAATATTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105458	104853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_104900_105500
841459	contig_12520_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_161067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412407	411914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_411900_412400
841461	contig_10494_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_102236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATACACTAAATCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276404	1274795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1274800_1276400
841462	contig_11309_pilon	+	1619	2	Intergenic	novelGene_149848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTATAATATAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9299	21823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_+_10581_21485
841466	contig_8580_pilon	+	869	6	Intergenic	novelGene_156088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	58.4930765133789	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	28	792	253010	273102	FALSE	25	TGAACTCTGCTTAACCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGTRQPAAMSLWVDKYRPCSLGRLDYHKEQAAQLRNLVQCGDFPHLLVYGPSGAGKKTRIMCILRELYGVGVEKLRIEHQTITTPSKKKIEISTIASNYHLEVNPSDAGNSDRVVIQEMLKTVAQSQQLETSSQRDFKVVLLTEVDKLTKDAQHALRRTMEKYMSTCRLILCCNSTSKVIAPIRSRCLAVRVPAPSIEDGLLSELLHNCDGQLKGEVAQMAAFYEHRLQLGSKAIYHLEAFVAKFMALYKKFMEDGLEGMMF	252982	273179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_253097_256854_256993_260718_260787_262176_262275_266363_266546_272910
841467	contig_7843_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_152062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTTGCCATCCTGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833480	834417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_833500_834400
841468	contig_9579_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_150584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793344	792726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_792700_793300
841469	contig_12923_pilon	-	939	8	Intergenic	novelGene_30066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	297.902874187175	2	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	50	829	93727	45443	FALSE	10	CTACTGATCTGTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPIVTAETKLPASLKGLYVGY	101217	45332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45506_68229_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
841470	contig_6902_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_135559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTGAGTTTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279763	279060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_279100_279800
841472	contig_2114_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_104272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATGCTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566297	565366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_565400_566300
841475	contig_15825_pilon	-	1522	1	Intergenic	novelGene_160198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGTCCCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61888	60366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_60400_61900
841476	contig_4151_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_65224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAACAAAAAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489958	491055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_490000_491100
841477	contig_12644_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_44465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTAATTTCTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003420	1002289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1002300_1003400
841478	contig_10437_pilon	-	681	2	Intergenic	novelGene_38416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAATAGCAATTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797336	795969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_796539_797224
841480	contig_11908_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_133235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGACCATGTCAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720264	721437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_720300_721400
841481	contig_610_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_76689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGGTGAAAATATACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68963	67502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_67500_69000
841482	contig_12424_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_174271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72351	73578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_72400_73600
841484	contig_10581_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_41376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTATAGTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530570	532157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_530600_532200
841485	contig_9706_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_21046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	724	1101	697979	698356	NA	50	TGAAAAATAGAAGTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWTMCLSFNRELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNSRRRQGILWGHFKLRMGEHKPDPWGATEHGCWSMGGPRSIERGPGMGVYVSSGFRMHTQGESKSRITKRPTELKSHVCHSVL	697255	698984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_697300_699000
841486	contig_4782_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_73680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACCAAATCAGTTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659441	658748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_658700_659400
841487	contig_4924_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_84632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACAGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44183	44792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_44200_44800
841488	contig_15720_pilon	+	401	2	Intergenic	novelGene_41929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAACTCGCAAACTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284063	284641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_284393_284569
841489	contig_5451_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_167177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGAAAACTAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550420	549902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_549900_550400
841492	contig_12532_pilon	-	806	2	Intergenic	novelGene_111148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	94	804	48761	44734	FALSE	50	AAAACTTCAATTTCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLTKLRLKKEIIAALVIQKYWRRFLAQRKLLMLKREKLEKTQNKSAAIIQGYWRRYSTRKRFLKLKYYSIILQSRIRMIIAVTSYKRYLWATVVIQRHWRAYFRRKQDQQRYKMLKSSSLVIQSRFRRWKRRKMQLQIKAVIILQRAFRRWQVRKRAKEKSAIVIQSWYRMHKELRKYTHIRSCVVIIQRRFRCFQAQKSYKRKKESVLTIQKYYKAYVKGKIERTQYLQKRAAAIQLQAAFRRMKARNLHRQIRAACVFQSYWRMRQ	48854	44731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_45388_48704
841493	contig_16846_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_82887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTAGAGAGGAGCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346040	347066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_346000_347100
841494	contig_1996_pilon	+	846	7	Intergenic	novelGene_131950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	39.6964174146176	328	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	82	783	514551	515732	FALSE	10	GCGAGTGGCCTTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSPPEAPTPIGLQPEADPPWSPGNSMEKEELAGRLARAIADGDEKGAAEGAAVLAQRQVALSIRLQEACFPPGPIRLQVTVEDAASSAHIALQVHPHCTVAALQEQVFSEFGFPPAVQRWVVGRCLCVPERSLASYGVRHDGDPAFLYLLSSPRETPGFRPQRPQKTDGELGRLFPQSQGLPRAPQPASTSPPSPLQPGWSCPSCTFINALSRPGCEMCSTQRPSTRDSLPAAATQQPPKVTRREDGPSLPGLSGDLC	514469	515795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_514561_514634_514777_514856_514948_515021_515176_515258_515378_515472_515602_515675
841495	contig_14661_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_47442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAATTTCTTGATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63358	63056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_63100_63400
841497	SIRV6	+	354	2	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	358	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845
841498	contig_5145_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_131411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGTTGCCCACTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786647	784671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_784700_786600
841499	contig_4364_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_4573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGGCTAGAACCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770122	1770660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1770100_1770700
841500	SIRV2	-	285	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	663	0	663	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
841501	contig_6418_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_81125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGTGGTCAGAGGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90706	91591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_90700_91600
841502	contig_17144_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_29157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGCACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155568	154644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_154600_155600
841503	contig_8594_pilon	+	320	3	Intergenic	novelGene_140031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCTGAGCCATCAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329070	331314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_329201_329283_329435_331275
841504	contig_4232_pilon	+	463	3	Intergenic	novelGene_63210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2674.5	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	75	302	146362	149518	FALSE	70	AAAGACAACAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPAAAAAALVFSASFCHIPFASANMASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFAANF	146287	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148441_149503
841505	contig_5827_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_129800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTTTACAACAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459714	459376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_459400_459700
841506	contig_4531_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_47868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185756	184702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_184700_185800
841507	contig_7549_pilon	+	878	6	Intergenic	novelGene_164539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	9.79795897113271	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	44	745	798541	830154	FALSE	30	CACTGATGTGGTAGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRELPPPAPEENGVKYDTNNNEEEEGEQFEFDSGDEIPEADRQAPSDPTASNAVANEEASNTAGENGPGTETMVSVEPAKIMAPTKVNPYSVIDITPFQEDQAPAPEASTEEDSLSLHVPSGYSVPVPCGYAVPSSLPLLLPAYSSPVIIRTVSVDEEETQEVAEDSHFNSLSSEDPPNSEDQVDKEDSALARWAADPANTAWMENPEEAIYDDVPRENSDSEPGLISVLN	798497	830287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_798578_818222_818379_819484_819773_824212_824277_827948_828026_830074
841511	contig_12622_pilon	+	933	4	Intergenic	novelGene_5793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.40870359029762	245	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGTTTCCTGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349087	358903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_350840_350905_358492_358564_358772
841513	contig_15084_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_116716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAGTGGCGAGGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258494	257011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_257000_258500
841514	contig_20875_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_153095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTGAGGCCAAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21859	23939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_21900_23900
841515	contig_8059_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_111118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAGTACCTTCGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284178	285867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_284200_285900
841516	contig_6102_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_31932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGTGGGTGACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390531	391457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_390500_391500
841518	contig_8503_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_177387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAGAAGAACAAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65563	65051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8503_pilon_-_65095_65257
841519	contig_16548_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_167090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13615	14685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_+_13600_14700
841522	contig_16622_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_48504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTACACATTTCTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140056	141320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_140100_141300
841523	contig_7410_pilon	+	1108	8	Intergenic	novelGene_106095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	256.184005937059	2	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	80	493	405351	407457	TRUE	20	CTAGAATTTTGATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405271	412177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407537_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411881
841524	contig_11448_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_66356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACAAAGTGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195986	194531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_194500_196000
841525	contig_12540_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_148086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACACCAGTGGTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947442	946419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_946400_947400
841527	contig_6975_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_74282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTAGGACTTTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400761	400148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_400100_400800
841528	contig_9177_pilon	-	1183	8	Intergenic	novelGene_32742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	117.345295463205	61	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	225	1181	1248987	1087231	FALSE	15	CCCCGCCGGACAGGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEKNYPTPRTGRTGHGGVNQLGGVFVNGRPLPDVVRQRIVELAHQGVRPCDISRQLRVSHGCVSKILGRYYETGSIKPGVIGGSKPKVATPKVVEKIAEYKRQNPTMFAWEIRDRLLAERVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPPNQPVPASSHSIVSTGSVTQVSSVSTDSAGSSYSISGILGITSPSADTNKRKRDEGIQESPVPNGHSLPGRDFLRKQMRGDLFTQQQLEVLDRVFERQHYSDIFTTTEPIKPEQTTEYSAMASLAGGLDDMKANLTSPTPADIGSTVPGPQSYPIVTGRDLASTTLPGYPPHV	1249211	1087228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1087278_1129550_1129681_1182914_1183091_1218232_1218362_1222137_1222203_1229995_1230194_1235399_1235566_1248941
841530	contig_6418_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_81176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGTGTAGTGTTAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582231	582683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_582200_582700
841531	contig_9146_pilon	-	1705	6	Intergenic	novelGene_79481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_4	15.0917195839308	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	221	1591	117035	108624	FALSE	25	ATTGTAATCTGTATACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTSWPQESVTFEDVAVYFTQSQWASLGPLQRALYREVMLENYANVASLGKGGVLDPERKDSSGSTVAFPFPKPVLISQLEREEAPLGPDPWETEVLRDICPGGESWIKNEEPAVKQEISEETELHRMPLEGLLRSVSQHCDFKSKGTKQTLSPNPNLILRGGMKFYQCKVCGKIFRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSNTALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFIVHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQKLHSVEKKPVKKLGPTLGNPQCPSSALSPIPLQGSCSAPAVAVPSLTFPHAVLIPTSGPLFMLLPTSGIPSSPVQIVRVFQGLTPAVKPSPIILTPTSHPS	117950	108509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_109685_111023_111132_111472_111524_111704_111832_117011_117098_117792
841532	contig_5071_pilon	-	1060	7	Intergenic	novelGene_171274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.6464241811619	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	117	734	307799	130091	FALSE	30	GCAACATGAATCCTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLAERRQKQKWAVDPRNTAWSNDDSKFGQRMLEKMGWSKGKGLGAQEQGATDHVKVQVKNNHLGFGATVNNEDNWIAHQDDFNQLLAELNTCHGQEATDSSDNKEKKSFNLEEKSKISKNRVHYRKFMKGKDLSSQSKTDLDCIFGRRQNKKTSEGARLRIHCAEPRPNEQLDQQLDEVPGPAPARAVPWEPRRSPPLASLSP	307915	129764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_130238_251079_251157_258097_258191_293754_293834_295391_295485_303075_303186_307780
841533	contig_12278_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_152613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	351	1056	282	1337	268592	267537	NA	20	AGGAGGCCCCATAGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRGRGLGTYTLVDQVWPGNRTGTQFPHSPHSECVGPVRGEPDPPSAHSYPTPPRSLGLRRHKGAGAHIGVQEHVGVLHDFCLLLQLAKEDLVLAGAATHGHRAQQQESEDQTWGREGDVTCLGEEAAGRTLRQLSEERGLRGRERAHPSIPGLCHQGLSPAGHGVYMTTCWGRHHRPSDSLPRTQKNSGCNLPSRPLKGSCGAHGSSCACQLRLQHLLTSLAYTDSAGGAGALPDPGLRDGCCPALSGPLCPSNRLSRRFKCTRGLQVGSPETVWPVSCVCGTTWKGFLETICPCPCFTEGLPCSPNPSPPSLSIPPGMLGAPQNIPEGSTVMARPPPHPPQGTGSHVV	268873	267090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_267100_268900
841534	contig_6471_pilon	+	499	2	Intergenic	novelGene_172098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	126	497	233863	251028	FALSE	30	AAGATCCTGTCTGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRFLSGKDESQFRHQGAVELLVFNVLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGLIMGLILRYATAPTDIESGTVYDCGKLAFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNVSPHQGNAILEK	233737	251030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_234032_250825
841535	contig_401_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_42807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGATGGGCTGCCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708564	1709308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1708600_1709300
841536	contig_8598_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_22887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTCTCTCCAGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82376	83402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_82400_83400
841537	contig_5794_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_69738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATGAAAATTTAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406407	405054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_405100_406400
841538	contig_7398_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_166180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAATTAATATATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304045	303114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_303100_304000
841539	contig_3307_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_86895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAAAGAATGATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157636	158239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_157600_158200
841540	contig_2646_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_69586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426581	1425215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1425200_1426600
841541	contig_5549_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_81628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTACGGAGCATAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399219	399657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_399200_399700
841543	contig_14023_pilon	+	196	1	Intergenic	novelGene_165367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156661	156857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_156700_156900
841545	contig_1624_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_138369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATGGAGTGAGGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71015	72029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_71000_72000
841546	contig_15613_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_147212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTAAAAGATGTAGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153381	151933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_151900_153400
841547	contig_8268_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_147012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCTGAAAGGCATTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344701	343180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_343200_344700
841548	contig_10444_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_139450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTAATGTGGCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630538	630297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_630300_630500
841549	contig_10444_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_139449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630247	629711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_629700_630200
841550	contig_7815_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_134364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGAAGACTACATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180312	181471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_180300_181500
841552	contig_2377_pilon	+	754	2	Intergenic	novelGene_67939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTTTCTCATGAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873242	877219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_873928_877150
841553	contig_7057_pilon	+	493	4	Intergenic	novelGene_123202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	850.542702566361	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTGTGTGTGTATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418050	425758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_418198_419809_419927_421272_421374_425630
841554	contig_9875_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_154409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85631	84217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_84200_85600
841555	contig_6375_pilon	+	475	4	Intergenic	novelGene_72978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_1	157.584545209512	9000	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCACTGTTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241663	244542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241699_241806_242009_243940_244006_244369
841557	contig_21013_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_38520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCAATACTTCCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58917	58113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_58100_58900
841561	contig_14953_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_137302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCATTCAGGATGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440482	439342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_439300_440500
841562	contig_10140_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_148416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGCCTGGAAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253182	254289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_253200_254300
841564	contig_15123_pilon	+	908	5	Intergenic	novelGene_110925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.73861278752583	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	444	776	307568	307900	FALSE	25	CGTTCAAATTTAAGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFADSSSGAPKSTGLAPMPAHCSPAVRNSTEPEAGPPTVTASPDSSLSSFDTVPITGERTSIIFLLPKLRLAQAKCHLGTLSPYLLDSSLMALEDAPPSPASEAGVARIK	292457	308032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_292490_299380_299459_300034_300171_306554_306704_307519
841566	contig_14744_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_66162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCCAGCAATTCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699488	1699240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1699200_1699500
841567	contig_11855_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_67072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTTGTGCCACTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2048646	2049544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2048600_2049500
841568	contig_11832_pilon	-	656	2	Intergenic	novelGene_106911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTAGACTTTTCATTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74371	72343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_72850_74221
841569	contig_8636_pilon	+	772	2	Intergenic	novelGene_141925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	55	429	384875	390788	FALSE	70	AAAAAAAAAAACACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAFLLVVLGIYSGSCSSLMWGGRDHRQSPLFEAIFFAFIEEISLRAPQIDNLWATISILLLDGAFLTVIGIGDSGASTDHAASLVRAVITLITYAHQGTGTHIGVTDHTLAITCEKKRMDLRSPASIYSPKCSALFQLWAVH	384820	391131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_384992_390530
841570	contig_16883_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_161738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGTCTGCTGTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308774	309444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_308800_309400
841571	contig_11642_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_172916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACTCAGCACCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250216	249552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_249600_250200
841573	contig_11816_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_98528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGAGTCACAATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003907	1004540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1003900_1004500
841574	contig_4742_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_130992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAAGAGGACATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202266	203951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_202300_204000
841576	contig_12352_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_57464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCATAAAAAAAAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244932	242953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_-_243000_244900
841579	contig_8964_pilon	-	760	4	Intergenic	novelGene_168709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	47.932823363073	108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCATCTGGAAAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549662	542956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543276_543392_543520_547370_547457_549434
841582	contig_19812_pilon	-	780	7	Intergenic	novelGene_101010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	21.6871697861508	50	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	16	663	67090	49263	FALSE	45	ATTAAATATTTACTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRSNMAPRLCSISAAARLLLGCPGPLARDAAAAAAARFYSKDNEGSWFRSLFVHKVDPRKDAHSTLLSKKETSNLYKIQFHNVKPECLDAYNSLTEAVLPKLHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWRFSGGYPALMDCMNKLKNNKEYLEFRKERSQMLQSRRNQLLLEFSFWNEPQPRAGPNIYELRTYKLKPHWHSFSPTPHSISSTLSLLDI	67105	49145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_49332_54056_54198_54358_54430_59827_59923_60121_60168_60346_60475_66992
841583	contig_6241_pilon	+	1719	2	Intergenic	novelGene_156440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	41	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353531	357714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_354749_357212
841584	contig_2069_pilon	+	1045	10	Intergenic	novelGene_23467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.44948974278318	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	334	729	1457746	1459343	TRUE	35	ACCAACTGGCTGACATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSVERPGEPKAVVFEAPGFQGQSWEVSRDIYNLKQPEDSQSPNLASVGSLRVLGGCWVGYEKEGFRGHQYLLEEGEYADWSHWGGYDKVLTSLRVIRTDFADPAVVLFDSMDFKGPSVEVTEALPDVEQAGHQPCTKAIHVLSGVWVAYQEVGFSGEQYVLEKGVYRNCEDWGASNSALVSLQPVLQVGEHNLHFASKIQLFSGPDFLGDHISFEDDQASLPPLLPAPVLPGPRRQLDPVR	1456652	1461576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1456686_1457000_1457138_1457288_1457416_1457709_1457850_1457947_1458075_1458333_1458367_1458503_1458618_1459325_1459456_1461002_1461143_1461512
841586	contig_8006_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_173937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAACTCTAAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509614	508334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_508300_509600
841587	contig_7202_pilon	+	602	4	Intergenic	novelGene_19108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	20.9496751499609	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	134	601	141518	144042	FALSE	30	AGAATACTCCAGCCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPELLAWRPGAERVWAGPGLARESAGFGSQQHVGDAGQSNIAAMGTTAPGPIHLLELCEQKLLEFVCNVDNKDMVWLEEIEEEAERMFTREFSKEPELMPKTPSQKNRRKKRRVSSVQDENRDPVRKRLSRRKTRSSQLSSRRLCSKDKVEKLATVVGENGSVLGRLTRAAAAAAAAATAASAASSCTPESPKALTKNS	138135	144043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_138258_141506_141658_142545_142660_143828
841588	contig_14441_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_100409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAGAAAAAAATTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70025	69199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_69200_70000
841589	contig_8942_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_143199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATGTAGGACTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354323	354693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_354300_354700
841590	contig_1127_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_98856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGTACTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29025	28370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_-_28400_29000
841593	contig_16578_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_148643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATCCACCAGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158929	158402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_158400_158900
841594	contig_16578_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_148645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATGGCTGAGAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165387	165124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_165100_165400
841597	contig_9272_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_125915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAAAATATATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311852	310645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_310600_311900
841598	contig_11071_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_131047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTTTCTTTCTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444900	443092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_443100_444900
841599	contig_3942_pilon	-	1243	9	Intergenic	novelGene_128869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	16.4145514711795	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	287	1117	1491123	1486376	FALSE	30	AGGGGGTCGTCCCAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTQPLDNLSLAQQPPAPEPGDPEDPRDETPDSSDTVVLSLFPCTPETGNPEADAGVLSPQGRTPPLGSAVWHGCTDAGSSLKHSTTLTNRQRGNEVSALPATLDSLSIHQLAAQGELSQLKEHLRKGDNLVNKPDERGFTPLIWASAFGEIETVRFLLEWGADPHILAKERESALSLASTGGYTDIVGLLLERDVDINIYDWNGGTPLLYAVRGNHVKCVEALLARGADLTTEADSGYTPMDLAVALGYRKVQQVIENHILKLFQSNLVSADPE	1492200	1486249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1486447_1487331_1487413_1488027_1488095_1488564_1488691_1489002_1489104_1489377_1489444_1489587_1489672_1490888_1491132_1491922
841600	contig_7004_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_126514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGGAAATATAAAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461067	460505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_460500_461100
841601	contig_10863_pilon	-	981	5	Intergenic	novelGene_59326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAATTAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71870	63694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_64190_64293_64481_69280_69446_71428_71542_71849
841604	contig_13074_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_153434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTTAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440685	441530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_440700_441500
841605	contig_7171_pilon	+	723	8	Intergenic	novelGene_101317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	187.221684597894	16	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	59	565	1077108	1086122	TRUE	10	TGTGTTGACTTCTTAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTVPARSAAPARVWKASVVMAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQHIDRWLLAEMLGDLTAS	1077049	1088771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084469_1086114_1086237_1088727
841606	contig_19352_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_122391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTGTTTACGGAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181082	181709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_181100_181700
841607	contig_9345_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_24469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGGACACTTCACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605712	604747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_604700_605700
841610	contig_14835_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_177388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10467	10209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14835_pilon_-_10200_10500
841616	contig_2312_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_160755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAGAAGAAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507311	507890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_507300_507900
841617	contig_10861_pilon	-	1511	3	Intergenic	novelGene_39253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTTGACAGCAGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926570	911614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_911678_923212_923401_925310
841618	contig_12427_pilon	-	2048	4	Intergenic	novelGene_40596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTCGTTGACCAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645152	624137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_624292_627549_627622_635036_635331_643624
841619	contig_5799_pilon	-	1009	2	Intergenic	novelGene_50314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGGAGGAGAAAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620448	612805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_612922_619555
841620	contig_8561_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_161639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	273	822	22	843	122302	123123	NA	65	TAAACAATAGGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLCVACWWLGLLTTAGAAAGQEDGFEGAEEGTQSEFIYLNRYKRAGESSDKCTYTFIVPQQRVTGAICVNSKEPEVLLENRVHKQELELLNNELLKQKRQIETLQQLVEVDGGIVSEVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNALELSQLENRILNQTADMLQLASKYKDLEHKYQHLATLAHNQSEIIAQLEEHCQRVPMARPVPQPPPATPPRVYQPPTYNRIINQISTNEIQSDQNLKVLPPPSAHHAYSHQPPILHRQAVG	122280	123521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_122300_123500
841621	contig_4816_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_115606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATATATAGTCTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610215	610922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_610200_610900
841622	contig_4816_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_115607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611123	611614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_611100_611600
841624	contig_14357_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_121661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478290	478745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_478300_478700
841625	contig_10003_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_88200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATACTTTTCTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494970	493032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_493000_495000
841626	contig_10437_pilon	-	935	8	Intergenic	novelGene_38378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.3946307395712	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	22	933	636504	630916	FALSE	30	GGAAGGTACGGAGACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFQTWLRLRLPELHACGLRTVHEAAVPTPPHWLLERLGLFEELWAAQVKRSASKAQEEQRTIKVSLPGGQKVDAVAWNTTPYQLAGQISSALADTAVVAEVNGEPYDLDRPLETDSSIRFLTFDSPEGKAVFWHSSAHVLGAAAEQLLGAVLCRGPSTECGFYHDFFLGKERTVQGSELPVLERICRELAAAAQPFRRLEASRGQLRQLFKDNPFKLRLIEEKVTGPTATVYGCGTSVDLCRGPHLRHTGQIGGLKLLTVMEVVRGPGDTAACVRDFLPLGRGTVGLGSMEGRGRVAGPPAH	636525	630913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_631041_632195_632279_632537_632603_632727_632846_633400_633526_634961_635086_635389_635587_636429
841627	contig_15286_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_124440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAGAAAAGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42217	40609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_-_40600_42200
841629	contig_8980_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_73997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAGTAAACGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99314	100326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_99300_100300
841630	contig_8617_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_73400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62333	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
841631	contig_5331_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_112789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341420	342378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_341400_342400
841632	contig_4769_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_118047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585595	1586388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1585600_1586400
841633	contig_10958_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_5485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCTAAAACTAGGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901323	901702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_901300_901700
841634	contig_9440_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_59105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGATCTGTTTCCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699121	1699554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1699100_1699600
841635	SIRV5	+	350	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	102	7431	54	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
841636	contig_2646_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_69718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	125	433	2599107	2598799	NA	35	CATACAATGAATATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQRPLLIISSVSFMFYYFCTQPSNTSANLSLFALPSSRFMLYSLVTSSSSCFIIKGALLSSRLRFPAVCVIFPHGCSRTSDLKQNSPSSPTYFVCFQTT	2599231	2597653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2597700_2599200
841637	contig_4732_pilon	+	1229	9	Intergenic	novelGene_75391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_8	24.4182308941496	104	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	549	950	482148	485241	FALSE	20	TTCGCCACCTGAGAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRRPVVPNPTLEKHFLTQGRRPQEHQLALLATQCGLTLRQTQRWFRGRRNQDQPHLTKKFCEASWRFLFYLCSFVGGLSVLYHESWLWTPSTCWDNYPDQPLKPALYWWYLLELSFYVSLLITLPLDVKRKDFKEQVAHHFVTILLITFSYSANLLRIGSLVLLLHDTSDVLLEACKIFNYMRWRIPCDLLFLVFSCVFFYTRLALFPTQILYTTYYESIIGRGTFFGYYFFNALLMMLQLLHVFWSCLILRMLCNFMIKGQMEKDIRSDVEESDLSEEEATQERPQLRNGSAPTGGPRSRVARRLANGHTAAM	479287	485520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_479365_479976_480096_480189_480248_480615_480667_481009_481103_481391_481521_482126_482234_484846_485004_485082
841639	contig_10863_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_59323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGTCATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43588	43970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_43600_44000
841641	contig_3424_pilon	+	2411	15	Intergenic	novelGene_55565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_2	261.57474445897	9	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2373	39	2411	1032884	1044114	FALSE	15	TACTGCGACGTCCCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCANAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHAGKCINTQGSFECQCLPGYTGPRCEIDVNECVSSPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGIYCELNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFHCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNGAKCLDGPNTYSCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGIATFACVCRPGYTGHRCETNINECHSQPCRHGGACQDRDNAYLCFCLKGTSGPNCEVNLDDCASNPCDSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSKCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGVNGFSCRCPEGYHGPTCLSEVNECSSNPCIHGACRDGLNGYKCDCDPGWSGANCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCSCLLPYTGATCEVLLAPCAPSPCRNSGECRESEDHESFSCVCPTGWQGQTCEIDVNECVKSPCRHSASCQNTNGGYRCHCREGYTGRNCETDVDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGAFCEEDINECASNPCHNGANCTDCVDSYTCSCPAGFSGIHCEDNTPDCTESSCFNGGTCVDGISSFTCLCPPGFTGSYCQHDINECDSRPCLHGGTCQDSYGTYKCTCPQGYTGLNCQNLVRWCDSSPCKNGGTCWQTDTLYHCKCGSGWTGL	1032845	1044114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1033080_1033345_1033502_1034109_1034296_1034536_1034651_1035592_1035707_1035946_1036181_1036453_1036565_1037090_1037284_1037785_1037932_1038174_1038289_1039736_1039857_1040213_1040367_1040967_1041197_1042388_1042591_1044009
841642	contig_9017_pilon	+	1064	3	Intergenic	novelGene_130336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTTTTATCCTTTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224621	234302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_224795_232790_233359_233979
841643	contig_15596_pilon	+	1092	5	Intergenic	novelGene_139529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	344.375158802141	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	327	785	126064	138496	FALSE	5	CCCAGCGTCTTCCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVPARGLLTALAVVFGMAVAFAPVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLVRVDHVAFVRYRLVSS	104504	138803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_104614_125846_126164_128203_128350_136550_136614_138346
841646	contig_10857_pilon	-	780	8	Intergenic	novelGene_160871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	303	665	61903	58794	TRUE	5	CTCGGGCGGGCAGGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHTGALLHTASSRGQRGAAGGREGCRVLSTTGGLQWSPGGRRAAKPCSARAGPQSSASTSTFSYFPCPVATNLYRFPDGVLLTVDEVLEPPLCSQRLLLLMSPATISLQEGPLDVDWVCTSPVSHRLFVLATAMLGSSMEVWRASLGVRPAVSTAWVYCSRRSSILEIGWAGSDFFTLLLFSMERFKDSVLSMSLVVGLRGGGLCSAVPSKAKGLGVLGC	66898	21818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21920_58779_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61960_62092_62167_66726
841647	contig_11590_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_125572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372080	373560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_372100_373600
841648	contig_13048_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_138922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTAGCTTCTCATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408965	409557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_409000_409600
841649	contig_10990_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_7414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	392	700	562117	561809	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGECLSRVTQQSGASSWMNPRHHVPALDPALNTCQHSLNQLVKLLRKPPGLFVTPAFLTAGSRNLQELAPLASFRSILTSLLRCVQLPTPSTETFHPHSRH	562508	561045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_561000_562500
841651	contig_4131_pilon	+	168	1	Intergenic	novelGene_127897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCATGAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377367	377535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_377400_377500
841652	contig_9527_pilon	+	681	6	Intergenic	novelGene_134068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	61.3364491962161	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	624	58	681	486523	487959	FALSE	30	ATAAAGAGCCGTGAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSALLAMASKVTLPPNYRYGMSRPGSMADKRKNPPGTRRRPVAVEPISDEDWHLFCGDMVQVLEGKDAGKQGRVVQVIRQRNWVVLEGLNTHYRYIGKTKDFRGTMIPSEAPLLHRQVTLVDPVDRKPTEIEWRFTEAGERVRVSTRSGRIIPKPEFPRADGIVPETWTGDPETQESLLVLSLGRAASPPLLSWPWRLGSPLLQTP	484578	487959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_484595_486481_486706_486786_486883_487092_487197_487515_487647_487849
841653	contig_16999_pilon	+	876	5	Intergenic	novelGene_84967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	63.381779716256	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACGGGGTTGGACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50640	83386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_56118_56155_73925_74018_81568_81688_82921
841654	contig_9434_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_150495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGTCAAAACGCTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160897	161242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_160900_161200
841656	contig_10801_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_74074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACAAAACTAGCTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477550	478043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_477600_478000
841657	contig_11978_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_62854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCAAAAACCAAAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569704	567947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_567900_569700
841660	contig_10800_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_152633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCCCCGGAGAGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576310	575664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_575700_576300
841662	contig_5889_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_133683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCAGTACTGACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100628	99337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_99300_100600
841663	contig_15471_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_175229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTGCTTATGAGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402005	402770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_402000_402800
841664	contig_1244_pilon	-	1258	2	Intergenic	novelGene_37925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTTGTGCAGTTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320778	317214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_318405_320710
841666	contig_16510_pilon	-	869	3	Intergenic	novelGene_139079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_2	29	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTCCATCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278049	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_277390_277488
841667	contig_9981_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_121068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	18.7132974111993	246	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	119	721	408875	413375	FALSE	35	TTGCTTTAAACAGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLFGKISWQFCGLKKLPWSCDSRSFWGWLNAVFNKVDYERIRDVGPDRAASEWLLRCGAMVRYHGQERWQKDYNNLPTGPLDKYKIQAIDATNSCIMNIGFDHMEGLQHVEKIKLCKCHYIEDTCLERLGQLENLQKSILEMEIISCGNVTEKGIIALHHLRNLNYLLLSDLPGVREKEKIVQAFQISLPSLKLKLDLK	401960	414163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_402074_408869_408982_410426_410636_411180_411353_413260
841668	contig_3846_pilon	-	484	4	Intergenic	novelGene_137141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	460.236412678914	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAAGTTGCTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160227	148811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_149077_152512_152588_153913_153985_160154
841669	contig_11104_pilon	+	741	7	Intergenic	novelGene_112471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	4.25897744639355	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	43	741	460023	476926	FALSE	30	GTAAGTCAGTAGTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYSLKSREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDVRDGMCRQSFAGHVSDINAVS	459980	476926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_460080_468349_468389_469503_469611_472278_472343_474535_474699_476550_476618_476724
841671	contig_9121_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_134452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATGAAGAATAACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144732	143903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_143900_144700
841672	contig_15327_pilon	+	666	4	Intergenic	novelGene_70478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2970	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	270	299	381604	381633	TRUE	10	GAGCCTCCGCCACCGCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCFFFNETNPKRCTVRLKLCSSQAWRKQTHRRTGSRRLGLTQDQAGLAAGRVPSGRHGGRRHRAGHRGSRHRLLLALSQAGWQLCVRSFMLCHTDLQI	372571	390949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_372840_381602_381718_382828_382973_390810
841675	contig_14970_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_45025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGTCAGTGTAACTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170332	169177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_169200_170300
841676	scaffold_880_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_121405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTTTCCTTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300742	299485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_299500_300700
841680	contig_3751_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_158630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAGATAGTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76561	76004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_76000_76600
841681	contig_9653_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_48173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATAATAATTGCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144573	142803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_142800_144600
841682	contig_16882_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_148246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGTGGAAGAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462975	462086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_462100_463000
841683	contig_2093_pilon	+	545	4	Intergenic	novelGene_152964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	221	544	1114584	1120081	FALSE	10	TTGATGGTTCTGGCGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLRGQDAEGGDDLLSSVGVGRLSRHEVNEGLEGDSALTVGVNQGHDTGKFSFALIITHGNQAGSEIFMIHQAILPPVKVVERGSELIHLLLGDALSVSCEDLGLDL	1114363	1120082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1114588_1115998_1116163_1117772_1117836_1119988
841685	contig_10252_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_162917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92972	93913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_93000_93900
841686	contig_253_pilon	-	1016	6	Intergenic	novelGene_129711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58.5334092634284	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	14	919	513615	507405	FALSE	5	TTTATCTCTCTCTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPGIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEEYYEVLDHCSAILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALEPVVSRELRTLEARIRQKDEEDKARFRGIFTP	513628	507307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507611_507918_507974_508150_508328_508835_509025_510269_510450_513516
841687	contig_20246_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_174890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACGTGCATGCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11519	12262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20246_pilon_+_11500_12300
841689	contig_6557_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_33040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAATAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662353	663628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_662400_663600
841690	contig_5918_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_99563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716370	1715095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1715100_1716400
841691	contig_3277_pilon	+	1080	2	Intergenic	novelGene_74716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2381	junction_1	0	115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGGAAAAAAGTAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188781	191968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986
841692	contig_9708_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_67279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCACATGGCAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779971	779137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_779100_780000
841693	contig_6048_pilon	-	764	4	Intergenic	novelGene_73317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCATGATGTTGATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2122061	2102008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102108_2119303_2119684_2120026_2120150_2121899
841694	contig_11518_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_109129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAAGAACTTAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86032	87380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_+_86000_87400
841695	contig_12931_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_166759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAATTCAAGTTTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58262	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_58300_60000
841696	contig_2646_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_69500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGGGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340542	341283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_340500_341300
841697	contig_6047_pilon	-	808	4	Intergenic	novelGene_24246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_1	276.986562048695	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	131	391	284838	281640	FALSE	25	CATTTTGAATGCAAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKDAKECVQECVSEFISFITSEASERCHQEKRKTINGEDILFAMSTLGFDSYVEPLKLYLQKFREAMKGEKGIGGTVTATDGLSEELTEEAFTNQLPAGLITADGQQQNVMVYTTSYQQISGVQQIQFS	284968	281222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_281673_282295_282376_283168_283251_284772
841698	contig_16525_pilon	+	746	2	Intergenic	novelGene_133832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTGGAATCATGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156910	159343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_157016_158702
841699	contig_10861_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_39464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCAAACCCACCAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2715032	2716047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2715000_2716000
841700	contig_19352_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_122419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAGATAAATAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349136	349431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_349100_349400
841701	contig_13300_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_125834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTTTTTTTTTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155313	1156419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1155300_1156400
841703	contig_9481_pilon	+	1200	3	Intergenic	novelGene_149670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAACCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379413	385187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_379459_380945_381037_384123
841706	contig_4857_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_48703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACTGAGGCTTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157233	1158633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1157200_1158600
841708	contig_19680_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_132010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACATAGATATCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161955	162565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_162000_162600
841709	contig_7151_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_40719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACAATTGTCACCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249513	250944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_249500_250900
841710	contig_14093_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_174214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGAGAAACTGCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127460	126444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14093_pilon_-_126400_127500
841711	contig_9363_pilon	+	659	4	Intergenic	novelGene_6837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	372.021803423163	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCTGGGGCCACGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624341	1625960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1624445_1624573_1624674_1625401_1625435_1625537
841713	contig_15327_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_70470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAACCAGAGAGCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366007	366965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_366000_367000
841714	contig_1009_pilon	-	1079	8	Intergenic	novelGene_121754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGCCCGCCCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272889	260586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_260714_261464_261611_263743_263813_263907_264059_264222_264300_268831_268915_269117_269198_272543
841716	contig_9389_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_84060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAGACCCAGGTTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757421	756513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_756500_757400
841717	contig_15474_pilon	+	184	2	Intergenic	novelGene_136229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCCACATTCGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57159	64247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_+_57219_64122
841719	contig_18272_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_7009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTCTTCACCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165156	165692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_165200_165700
841722	contig_5881_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_129058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCACTGTGGTAGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563270	562599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_562600_563300
841723	contig_6589_pilon	-	804	6	Intergenic	novelGene_25913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	233.591609438353	12	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGAGGGCATCATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178553	1158488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1158899_1158997_1160512_1160551_1177200_1177250_1177927_1178100_1178424
841724	contig_15146_pilon	+	1751	3	Intergenic	novelGene_116953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	1320	1751	510135	519474	FALSE	20	GCATGCTGGGAGACGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSRRCSSPYSCSSVPSTAHLPSSWFPNSTAVFSQSASFFSAVPVRPSRLCSRAAWDSILFSTAWTAATTVQSEISVVCRYELFSVACGGSVEELKGVERRFLLCSRWRCLRHGDCRPQHPSYLVSRATPDPSGSRRRCVDAS	508687	519474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_509932_510059_510454_519361
841726	contig_7275_pilon	+	770	2	Intergenic	novelGene_111256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	140	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGGACCTTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429517	430382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_429676_429770
841727	contig_5556_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_173273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94084	93525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_93500_94100
841728	contig_2069_pilon	+	1491	2	Intergenic	novelGene_23353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	361	954	939799	942098	FALSE	25	TCAAAGTTCCCAGTGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSGRQWLDSQGSWLPGRCLIRRLRLPTEASDLGSFPFKTRKELQSRKAKSEAFTLADLRQLPELNPPVLMPNGNVGTPLRVFLEFIRACRLPPRIITQLQLQFPKTGSSRRYGNVPFEYEDSETVEQEELVYTAEGEEIPQGACLVATPASPCGEPEEEDKEEEEESNSDDVSIMRHLSLLTAWRGQSIKNTKLQL	939438	942635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_939893_941598
841729	contig_14322_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_116172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTATATTTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671663	671357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
841731	contig_13348_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_162683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGGAGCCACACAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99447	100954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_99400_101000
841732	contig_16798_pilon	-	1423	8	Intergenic	novelGene_172264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	28.2683929648703	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	491	1330	241743	36019	FALSE	80	AGAAAAGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSESRAMGEQCSVCGVELPDNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHPYECEYCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKPEEIPPDWRIEKTYLYLCYV	246567	35925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_-_36249_38467_38636_44018_44190_102541_102629_139230_139329_241657_241749_242808_243016_246289
841734	contig_12120_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_21436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAGTGTCATGATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151187	152185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_151200_152200
841735	contig_12540_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_148050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGAACAAAGTTAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125880	125022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_125000_125900
841737	contig_5018_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_46998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	926	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCTGCCTGTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214294	1213447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1213400_1214300
841738	contig_11378_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_112268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406829	406327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_406300_406800
841739	contig_15003_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_137342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAATGTTTAAGCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246258	247927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_246300_247900
841740	contig_2455_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_119194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170427	172262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_170400_172300
841742	contig_16010_pilon	+	294	2	Intergenic	novelGene_165263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	789	junction_1	0	310	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAACAGTCTCTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24192	25014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_+_24230_24757
841743	contig_13787_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_40600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATTTTTGAAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128855	128054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_128100_128900
841745	contig_11396_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_71325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAAATGCGCGTGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464845	465402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_464800_465400
841747	contig_12312_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_64005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAGAGGATATATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488930	489748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_488900_489700
841750	contig_7428_pilon	-	1376	7	Intergenic	novelGene_77704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_3	2.5	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	99	590	296938	290670	TRUE	15	TCACCACGATGGTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAVRRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCVQVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKIGAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVFTFQPNGKLVGRFGGPWGH	297036	288385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_288946_289067_289209_290313_290385_290655_290826_291041_291210_296648_296753_296874
841752	contig_8020_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_114464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	443	748	407667	407362	NA	40	GCTAGAACCTCTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTKKARPGSQKTFSLHLSLLKKTVKDHYHPNLFTWYGLAFKLFHLLPHSPPSVHKTSTQCSHSTTKQVPYLKHLSLSLNTFLNSTPSPCVLSGPHTLISF	408109	407216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_407200_408100
841755	contig_12229_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_169384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	637	957	69300	69620	NA	40	TCTCTAAAGTCATGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAIKRVIHRQEEAAKSSCRNAVGIGREGALCPCVPSVLGPLPHLPAQPLSARGTVPLANPQPLSLSMLSQVLEIAHDSCRTQPRPTASGSFCLRGNFKFHKRFQ	68663	69648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_68700_69600
841756	contig_6302_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_171682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTTGTGACTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36018	34742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_34700_36000
841757	contig_19007_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_168445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTTGAACTACAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42742	42940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_42700_42900
841758	contig_19007_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_168446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATCTAGGTCTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42891	43925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_42900_43900
841760	contig_4125_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_25061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	197	601	356883	355996	FALSE	35	AGTTTATTGTGACAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHLPCGSGLTCPRPADQDGDKRLSLPEFISLPVGTVENQQAQDIDDNWVKDRKREFEELIDANHDGIVTPEELEEYMDPMNEYNALNEAKQMIAIADENQNQHLEPEEILKYSEFFTGSKLVDYARSVHEEF	357079	355576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_356173_356655
841761	contig_7914_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_165038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238371	237355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_237400_238400
841762	contig_2100_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_50644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	103	342	1009916	1009677	NA	80	GAAATTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAARRRRRTRPAGAAPAADRLQASVRETLAGGLMLRVCCGPGSWASVGAGAVGGGWTGRIQADSRKMNSGSTKNDDGFPGIRTKTSVCAVSHCISPGRTTFLIAKAVEITIK	1010018	1009099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1009100_1010000
841763	contig_5031_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_133194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGGCGAGGCCTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28959	30027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_29000_30000
841765	contig_10403_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_175803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACATACACTATCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90661	89367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_89400_90700
841766	contig_17993_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_61932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACTTTATCATTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55414	56707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_55400_56700
841767	contig_7744_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_62501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGAATCCAACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811519	812362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_811500_812400
841769	contig_4103_pilon	-	800	10	Intergenic	novelGene_51912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	485.893093967626	1	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	228	635	87793	77689	FALSE	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCQGNTMRMKTLGDFFGMSNSYAECYPATMDDMAVDSDEEVDYSKMDQGNKKGPLGRWDFDTQEEYSEYMNNKEALPKAAFQYGIKMSEGRKTRRFKETNDKAELDRQWKKISAIIEKRKKMEADGVEVKRPKY	91909	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80624_86856_86889_87789_87883_91263_91331_91838
841770	contig_17880_pilon	-	1030	3	Intergenic	novelGene_167336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_2	58.5	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	8	505	46189	40971	FALSE	55	AGAAAGCTTATAAATAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEDVNALLVQACRLVPLSQNHLVSKVSQLIHHLLNRLQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKVTNCVLSFL	46196	40445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_41142_43188_43297_45970
841772	contig_1154_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_87095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338331	337161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_337200_338300
841774	contig_5264_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_165063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTGAAAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292241	292746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_292200_292700
841775	contig_13245_pilon	-	375	3	Intergenic	novelGene_148810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	551	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	144	338	26010	25454	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26437	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356
841777	contig_7123_pilon	-	837	2	Intergenic	novelGene_170577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	6	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	153	530	434051	433674	FALSE	35	TGTATTACAAATGGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNPCQSPTTSNFDDVGVLQKKLVPFVTDLTIHLAQELEKQKEDPGKVEQLQAWLQAWLLPHTNEVSQQINDNLCELQQRLVPCTNHPSVKTVCCCFTSTLQLSHTMSVWPILTGNMGKGVLEM	437171	433366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_434141_437108
841780	contig_9871_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_75672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448595	449460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_448600_449500
841781	contig_1090_pilon	+	822	6	Intergenic	novelGene_131161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	69.0350635546894	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	178	489	887944	896243	TRUE	45	AATATGCAAAATGAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGFFSSIFSSLFGTREMRILILGLDGAGKTTILYRLQVGEVVTTIPTIGFNVETVTYKNLKFQVWDLGGQTSIRPYWRCYYSNTDAVIYVVDSCDRVFRKKS	887766	897727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_887948_891823_891962_893773_893856_895637_895706_896223_896410_897560
841782	contig_17769_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_124253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCACCACACCCAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73341	74433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_73300_74400
841784	contig_3832_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_161463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAACCAGAGGCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356286	356503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_356300_356500
841786	contig_6199_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_126356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGGCTTCTGTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110335	108419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_108400_110300
841787	contig_10940_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_49211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCCTGTCCACTCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837474	836349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_836300_837500
841790	contig_11120_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_161293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTCTCTTCTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56242	55163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11120_pilon_-_55200_56200
841791	contig_15897_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_49542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATTTTATGAACCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633379	633989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_633400_634000
841793	contig_7457_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_31569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTGTCTCCTCCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891112	891627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_891100_891600
841794	contig_8375_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_141294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACTGCACCCCCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135253	136772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_135300_136800
841796	contig_4845_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_53645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAGTATTCTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333839	333133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_333100_333800
841798	contig_10235_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_46495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGTTCAATAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247102	245802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_245800_247100
841803	contig_987_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_72300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGGTGGGCAGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945392	945948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945400_945900
841804	contig_4295_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_169977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCAATATGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67824	69036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_67800_69000
841805	contig_12119_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_88641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTCAAAGTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122324	122746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_122300_122700
841806	contig_4982_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_172229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTTTCCCAGAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26720	25887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_25900_26700
841808	contig_18364_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_102557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	298	junction_1	0	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	182	364	97417	229621	FALSE	50	TTAAGTGGTTAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVSLSARGGGGGGGAGGGLSNSGARLFSLPLEIPSASPAPGLTSLDPGPVCVCARRRGRMAVLKLTDQPPLVQAIFSGDPEEIRMLIHKTEDVNALVRDAVVDEIVLPAQALLTWSKGS	97235	230110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_97444_229465
841809	contig_9646_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_117458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATATTACAGTATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323592	324531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_323600_324500
841811	contig_15420_pilon	-	874	7	Intergenic	novelGene_175298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	83	junction_6	446.907397815501	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	88	459	165048	158915	FALSE	25	ATGAAGCCCTCCTCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDAAAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHLTSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINKYSRLSKKRENDKV	172180	158499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_158980_159531_159574_161301_161390_162233_162306_163325_163386_165003_165103_172147
841814	contig_3584_pilon	-	562	5	Intergenic	novelGene_108136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	9.01041064547005	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCCCTACCCCCAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318738	313028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_313057_313896_314064_315220_315326_316000_316147_318622
841816	contig_7730_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_156288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAAGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373184	372079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_372100_373200
841817	contig_21013_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_38516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCTAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29008	27682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_27700_29000
841818	contig_5964_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_80344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGATTAGGAGAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4992	3691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_3700_5000
841819	contig_15327_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_70824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2	436	1557777	1557343	NA	20	GGTAGAGCACCGCGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRHPERLILSGPDLRPNRHSHSPVSGPSVGGGVCSSRVLRLLCSPSSASAAAFCRHYCECALPRDVAVPSVGPGRPQAGQLSGHPGSHPISPHPPAPRPTHPPPPHGPVNPIKRSSAVLSCTRAPVLGNAGAALAVGCGAESF	1557778	1556992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1557000_1557800
841820	contig_7357_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_36942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAAGGTTTGAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973066	971886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_971900_973100
841821	contig_2125_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_147711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268499	270097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_268500_270100
841822	contig_10437_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_38441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGACACCTGGAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936237	936730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_936200_936700
841823	contig_9113_pilon	-	1429	2	Intergenic	novelGene_68619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCATAAACTACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659271	645344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_645761_658258
841824	contig_13097_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_107721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGGAGTGGGGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186192	186996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_186200_187000
841825	contig_7396_pilon	-	732	5	Intergenic	novelGene_79519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.78535710713571	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	702	29	730	128614	118077	FALSE	65	TCGAGAAGAAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGFRTRSQMLLGHLEEQDEVLHCQFSDNSDDEEAEGQEKSGVRQGRSRPWIQKPGPVCSLVELNDIQDQIHKSTLANEDVKLECLQESQELNLQKLRKSELLLTEAKQKMRELTINIKMKEDLIKELIKTGNDAQSVSKQYSLKVTKLEHEAEQAKVELTETQKQLRELENKDLSDVALKVKLQKEFRKKMDDAKLKVQVLQKKQQDSKKLASLSIQNEERANKLEQNVDHMKYQKAQLQRR	128642	118074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_118206_123440_123647_124978_125135_127485_127593_128510
841826	contig_11160_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_168857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGGAAATTATGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829024	828544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_828500_829000
841828	contig_12884_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_105027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACAATCTTTCCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294078	1293786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1293800_1294100
841831	contig_11551_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_168456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGTCCAGCTAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330241	332226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_330200_332200
841832	contig_4884_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_63774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCCTGTCGCCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61305	60927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_60900_61300
841833	contig_7861_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_77409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCATGTAGAAATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119732	118785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_118800_119700
841834	contig_10777_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_101168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	63	314	33050	34114	FALSE	35	AAGGTGAGAAGTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCKPGYSILSEPGCESGSPQMTADHNFKGGEVIHEGGVVSRALWEIGSWEINGYSVKTKKWRTYTAKSLKRYTVIYLQWILEICTHNLSPRCLTSKEPWWRNG	32987	34465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_33243_34055
841835	contig_11105_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_159822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAATGGTGGAGGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304257	305334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_304300_305300
841838	contig_5718_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_110431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGTTATCATTTATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1542683	1541962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1542000_1542700
841839	SIRV6	+	356	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2458	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3171_10732
841840	contig_10446_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_162481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	375	746	752184	752555	NA	30	CTTTGAGACAGATGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKIKELINTMDLASCEPQVSSKRQNDWRRKNEKFCVCFLICMVRDCHRWGNTLPLPLKLTKYLSDGVLFYVKKTPRTPPPPPFIIHTLLRCVFKVNFYLDFVESGHQNLVVRNHSFKIALS	751809	753860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_751800_753900
841842	contig_15866_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_63606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	325	627	337808	337506	NA	5	TTTTCTTCATCCTGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWDRAAGEGFFIGRERELKLTDSTLAHTAGSHLYPTSLSHNHPDRKLATCRFYSWAQETQRVYKQPCLYCQPRQQHRDHLLLSDQAEERILLSLGVQSAV	338132	337503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_337500_338100
841844	contig_10627_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_60061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTCAAGACTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256902	1257283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1256900_1257300
841847	contig_17161_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_177389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGTCCCTTTCATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73962	73203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17161_pilon_-_73200_74000
841848	contig_3818_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_99205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	104270	104569	NA	25	TGGGGGTCTTCTGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACLWLARAFGSPGPEAGISASALSPGSFQEVEVALGQESDRNARRGQTRQRGRTTSKEPCPHVLEVKQVVELGSNLEVGKRIRFCGQLAHLSSPAQRRH	104267	105121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_104300_105100
841849	contig_15095_pilon	-	1074	2	Intergenic	novelGene_177391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	204	515	128145	127834	FALSE	25	AGCACACAGCCCACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAEACPVPAALGWENTWSCPNSPAPSLSFLFLLFVPFSSPMDLFAFFLHPSLIPSRPLKPQLPLPFSQVPLLTTLRPCTEANQTTFPSVVPLLRGAAWSPGL	155336	127274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15095_pilon_-_128253_155240
841850	contig_6497_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_35601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAAAAAGTAAAATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494469	496223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_494500_496200
841852	contig_3956_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_14773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCAATGTGTTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936763	938682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_936800_938700
841853	contig_12340_pilon	+	1357	9	Intergenic	novelGene_122107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12.8452325786651	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	30	707	55691	68740	FALSE	25	GACTTTTGTGTGCAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWPLWQLLNIQENLKRSCSFQKVQGLLPEDQRSVTLKDLDIALPIIENYRDQLLAIGEVGLDFSPRFASTDEQKEEQRQVLIRQVQLARRLNLPLNVHSRSAGRPTINLLLEQGADKVLLHAFDGRPSVAMKGVRAGYFFSIPPSVVRSGQQKLVEQLPLTSVCLETDSPALGPEKQVRNEPRNIYISAEYIAQVKGISVEEVIEVTTQNALKLFPKLQQLLRK	53563	69390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_53589_55686_55761_55981_56026_59536_59600_61820_61931_62566_62623_64091_64205_65708_65787_68596
841856	contig_10064_pilon	+	536	2	Intergenic	novelGene_122732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCTCCTGGGGCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395868	404628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395965_404188
841857	contig_6881_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_164839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTGGACAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83472	81924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_81900_83500
841860	contig_10312_pilon	-	502	6	Intergenic	novelGene_159017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAGCAGGTTTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41699	31541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_31605_34709_34851_36040_36139_40209_40261_40457_40584_41676
841862	contig_12733_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_129598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	273	587	374039	373725	NA	65	ATGATTAGAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKALRVLPLRSPTSQSSPRAFPGEGDSTGDRPFPEIEEKFQHPVTACTAEKRKKAVAERWRNYSLLQPLKPCLRRPAGDSSLRDAYRGGMEGLVAPCSSSPAPTPAHYSVSLPGGYRSQLCAVLSDTQRGGERDAFESLFWKEVGGNGNSPGIRKSVTHGRSPQRESIFCLLTGKVELSSRRSASVWTRGLAG	374311	372451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_372500_374300
841864	contig_10196_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_132336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	225	139	363	2446748	2446972	NA	30	TTCCTGAATGATCGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSDLPLPDSASSLCAPCPWQGHLIIICHSSPRGRASACPAENLHTWMPGLSCPLCMSLQDRSGVLHSRADGGVQAGPGALPPPTPCRSCQSVSRAGFRLLLTLRDSSPDPHTTFLETSIYL	2446609	2446973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2446600_2447000
841867	contig_11304_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_156721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGAAGTGCAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441773	441325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_441300_441800
841869	contig_9799_pilon	+	1220	5	Intergenic	novelGene_145557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	66	1220	92622	125334	FALSE	45	TTAGAAATGATAGGGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLLCCALVFLDICIKWTTQEAFPPKYLHYDPETSRQLMCDKCPPGTYLQQHCTARWKTVCAPCPDHYYTDSWHTSDECLYCSPVCKELQYVKQECSRTHNRVCECQEGRYLEVEFCLKHRSCPPGFGVAQAGTAEQNTVCKRCPDGCFSNETSSKAPCRKHTNCSAFGLLLIQRGNTTHDNICSGNSESTQKCGIDITLCEEAFFRFAVPTKFTPNWLSVLVDNLPGTKVNAESIERIKRRHSSQEQTFQLLKLWKHQNKDQDMVKKIIQDIDLCEKSVQRHIGHANLTFEQLSSLMQSLPGKKVETEDIERTMKACKSNEQILKLLSLWRMKNGDQDTLKGLMHGLKHLKTYHLPKTVTQSLKKTIRFLHSFTMYRLYQKLF	92556	125334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_92652_115492_115863_120291_120484_122847_123073_124996
841870	contig_5947_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_101470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGCCAGATAAATGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70613	70181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_70200_70600
841872	contig_4732_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_75386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATATTTGTTGGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249367	250081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_249400_250100
841875	contig_10196_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_132079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCACAGAGACTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837233	837921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_837200_837900
841876	contig_14744_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_66163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAGGGATACAGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1700746	1700169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1700200_1700700
841878	contig_13680_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_149602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	779	1084	417045	417350	NA	30	ATACCATACCCCAGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSPVLSEGAAKCSCTNSQRQNKLHAIWFYLVLYPASGICTFSHWPHFPQMKKNTANIERNSKPRKFKLSMMTVNKISLITKPETHLLAFCTISDYTERII	416266	417350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_416300_417400
841882	contig_12540_pilon	+	1242	6	Intergenic	novelGene_148053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	13.2151428293454	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	33	686	156825	198266	FALSE	20	GGTTGTCTGAAGAGTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGWHIECSAMSSLMFGGQLDLHSGGIDLAFPHHENEIAQCEAFHRCKQWGNYFLHSGHLHIKGKEEKMSKSLKNYITIKDFLKKFSPDVFRLFCMRSNYRSAIDYSDSSMQDTQRLLLGVTSFVEDARAYMRGQLACASVREDQLWERLADTKVAVKAAFADDFDTPRAVDAIMSLIHHGNRQLKAVTKVTSQDTASPVVPLLSAGGLAVLLFPAGTGAEYASSLG	156792	198822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_156833_164740_164875_169307_169376_183881_183949_194798_194938_198028
841883	contig_14566_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_148846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATTCTGTGGGGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103833	102237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_102200_103800
841884	contig_12964_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_131657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCTTACAACAATGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128195	126994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_127000_128200
841885	contig_15191_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_177392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18464	17706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15191_pilon_-_17700_18500
841887	contig_10246_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_46915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAATGGAAATGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181634	181058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_181100_181600
841888	contig_8168_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_168243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	787	1158	173419	173790	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCTDSGPHPGTLRDGPPTCLFPGALSGLPLGPASSPRTWCFFSQPGWGVVGQLRGDFGPCPTPFPPLTSWVPWPSLQAHSLLSVELQAFSLKPGWGALQGPSRLIPQGLSPPPPGLPRYGCV	172632	174222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8168_pilon_+_172600_174200
841889	contig_13645_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_146171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAACCTTCAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523795	525747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_523800_525700
841892	contig_3472_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_166939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719084	720037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_719100_720000
841893	contig_2455_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_119221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACGGTAGTTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390942	1389820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1389800_1390900
841896	contig_2113_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_161145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAGTAATTCATATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203363	202398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_202400_203400
841899	contig_10549_pilon	-	873	5	Intergenic	novelGene_110650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	28	junction_3	54.7374414820423	428	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	12	710	552176	544365	FALSE	20	TGTTAAATTTCATCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGRGGGAQLADRGVVPVEAGEVPKDIKMATYTHGQPRSFLEDAKFRRPTVTEIIEKKLEYLRKENKNLNIYGSVFYGTTAGFSGILANFIFRYCFKVKHDALKTYASLTTLPFLSTIVTYKLFVTDALYSGNISQENCVVRSSLVGLVCGVLYPSALAFSKNGRLAAKYHTVTLPPKGRVLLHWLLLCQTEVKAMAFPLVFQMLIGILNGLQHYAVFESTLEKKTLHED	552187	544201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_544552_544938_545051_546324_546522_548134_548257_552095
841900	contig_12250_pilon	+	710	5	Intergenic	novelGene_80687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	27.2798002192098	275	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	119	658	396557	398534	FALSE	35	CAGAATGATTATATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVEISSRAYVKMCLHAARYPHVAVNRLLLAPAPRSGECLCRTVCPYSTATWPCPSCWRLPSTSPGPLALKIAGRIAEFFPDAVLTMVDNQKLVPQPHVPPVIVLENHGLCWAPRDKNLVMWRDWQELCQMVGALLEGRAHQHLVDFDSHLDDIWQNWTNQQLNTQITQWIGPTNGNA	396298	398586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_396405_396544_396751_397945_398016_398103_398199_398353
841901	contig_10904_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_22642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507902	508700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_507900_508700
841903	contig_2093_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_152958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAAGTTAGGATTGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048503	1046393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1046400_1048500
841904	contig_5935_pilon	-	1560	9	Intergenic	novelGene_102742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	186.292612574949	5	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	554	1090	1346624	1263639	FALSE	25	ACCCCGCAGAGGATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACYQLCGLNAIWFYTNSIFEAAGIAPEKIPYVTLSTGGIEILAAIFSGLVIERLGRRPLLIGGFGLMALFFGILTITLTLQDHASWIPYLSIMCILAIIASFCIGPGGIPFILTGELFRQSERPAAFIIAGTVNWLSNFTVGFLFPFIQSSWWVRQVTFRLAAEHKRLQRRLPRSRS	1418919	1263168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1263726_1273070_1273199_1300025_1300102_1303659_1303762_1332491_1332603_1346591_1346781_1358530_1358653_1392211_1392362_1418794
841905	contig_12841_pilon	-	1219	13	Intergenic	novelGene_55888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	84.0122345587567	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	273	1076	924052	891271	FALSE	15	CTGTCAGATGATGTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFEDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEIKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHRVVEQLEKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLARENDEKEYPHRRIDIRLIPRDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRTHALEKGFTINEYTIRPLGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE	931894	891127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_891366_892624_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_914691_914765_914862_914918_916588_916641_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931707
841906	contig_11720_pilon	+	1344	4	Intergenic	novelGene_44035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.18241233033047	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGCTTGGGTATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471651	473581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_472318_472673_472824_472901_473051_473202
841908	contig_6286_pilon	-	1305	8	Intergenic	novelGene_165669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8.24373602643058	20	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	274	930	439775	431010	FALSE	30	TTTAAATCTATGTCATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLCGSAWRVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAITITALFRTNFRMDFPFDLQELPAFAVIGICCGFLGAMFVYLHRQVMLGVRKNKILSQFLAKHRLLYPGIVTLAIASSTFPPGIGQFMAGELMPREAISTLFDNNTWVKHTGDPGSLGLSAVWIHPKVNVVIIILLFFVMKVHPLPLTSDLHPLPTQRPRVHMEKERA	441406	430634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_431244_431449_431535_431844_431947_432172_432258_432894_433021_439750_439829_440136_440215_441264
841910	contig_8822_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_117933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGCAATAACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94963	94617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_94600_95000
841912	contig_165_pilon	+	1384	14	Intergenic	novelGene_117085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	54.1903286203021	57	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	58	1209	496601	505512	FALSE	35	CCAGTTTGTAAAAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVEQQKVKNNELREKNWKAMEAVSAAERACEEKLCSLTQAKEESEQQLRLIETQTREALLSLLPELSDISHQNYTEWLQELQEKGSELRKQPPAPTEPSPDPASRLQEAEEAQSTLQAECDQYRTILAETEGMLKDLQKSVEEEEQVWKARVSTMEEELQKSRVTVKHLEEIVERLRGELESSDQVREHTSHLEAELEKHMAAASAECQSYAKEVAGLRQLLLESQSQLDTAKSEAQKQSDELALVRQQLSEMKSHVEDGEVAGFLAAPPETPPAEQEPIELKMQLERTEAILEGEQTQRQKLTAEFEEAQNAACRLQEELERLRTASPLGSSDAQEAAQLKERLEKEKKLTSDLGQAATKLQELLKTTQEQLAKEKDTAKKLQEQLDKAGNGSSSKEGSSV	496057	505687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_496088_496573_496667_498700_498794_498883_498968_499053_499144_499792_499886_500397_500470_501092_501189_501739_501824_502975_503084_503839_503924_504312_504412_504829_504974_505473
841913	contig_11538_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_152288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169788	169141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_169100_169800
841916	contig_16948_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_166408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTTTATTTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287585	287923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_287600_287900
841917	contig_12010_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_160952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGCCAGGTAAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197316	198310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_197300_198300
841918	contig_10867_pilon	-	463	5	Intergenic	novelGene_159458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2751.83914637102	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	112	453	88226	86811	FALSE	35	ATAAAGACATCTGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQEPELLEPIPYEFMA	88685	86800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86856_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603
841919	contig_6634_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_171141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209922	211218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_209900_211200
841920	contig_19628_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_166570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18510	20151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_18500_20200
841921	contig_5590_pilon	-	960	5	Intergenic	novelGene_163042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGCTTGTTCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369477	359491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
841922	contig_5959_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_150198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTGAGTCCCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325635	324498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_324500_325600
841923	contig_4501_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_168981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGTACTTTGCAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61671	62180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_+_61700_62200
841925	contig_5253_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_61555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCATTTATCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177596	178362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_177600_178400
841928	contig_776_pilon	-	1166	8	Intergenic	novelGene_139934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	121.639648477101	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	472	1077	888118	833127	FALSE	15	CAGTTTTAGCTATTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMKLKAISTLLTVINFINNNKKSGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRYYGPIPYGLIRGRIFFKIWPLSDFGFLRDNPNGHRFSDD	924460	833037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834687_834799_857382_857510_861796_861886_863749_863884_888042_888299_911670_911784_924282
841929	contig_7870_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_108923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGGTAGGGGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261295	259942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_259900_261300
841930	contig_7870_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_108924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATACTACCCAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262403	262156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_262200_262400
841931	contig_7744_pilon	+	1220	10	Intergenic	novelGene_62532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	110.962456113168	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	145	687	827185	829382	TRUE	10	GCCTGACTGCTGCCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSGDSGGSAYVLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEVRPA	825513	831114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829386_830494_830537_830626
841932	contig_12312_pilon	+	1035	5	Intergenic	novelGene_64017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	50.305939013202	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	272	358	544200	544522	TRUE	10	TGTTTCGTCTGCCTCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IITVLTNPADRAYSWYQHQRAHGDPVALNYTFYQVISASSQAPLALRSLQNRCLIPGHYSTHLQRWLTYYPSGQLLIVDGQDLRTNPAASMESIQKFLGLMRIRDSGARDLKVARLAV	543634	545296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_543687_543883_544055_544151_544225_544460_544564_544660
841933	contig_13547_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_104888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAGAAAGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111199	110980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_111000_111200
841934	contig_5083_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_151672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAGGAAGAGAGTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559646	559871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_559600_559900
841936	contig_5896_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_159246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAATAGGAAAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342254	343503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_342300_343500
841938	contig_6129_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_159967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	17.9304210770411	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	321	719	71114	68490	FALSE	60	AGGCAACATAAAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGAVKTIYLFSLDANGRKLELLQLSLHAS	74165	68342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_68573_68775_69064_71086_71199_73242_73293_73979
841940	contig_1964_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_130930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTAGGACTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662736	661046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_661000_662700
841941	contig_1037_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_84597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTATACAAGAGACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201156	202614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_201200_202600
841942	contig_5039_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_64844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTACGGGCAGACAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320721	321221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_320700_321200
841945	contig_12479_pilon	-	696	6	Intergenic	novelGene_56867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	42.0447380774337	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	77	667	486705	461645	FALSE	70	GATTTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMVGPCPLSLLYTGCRITRQEL	486781	461615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699
841948	contig_3424_pilon	-	672	2	Intergenic	novelGene_55562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	140	670	985275	984348	FALSE	20	CTGCAGCCCTAGCACAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRAPEPTCSSLPPSVSVLGKSLLCPAPQFPHPRNAGSQDRGSGHPRSQPRPLALVPAFLPSLCCLHRGAFRGTLGTLILRSALKGPPSPHLQMSQDLRVRGLGGHSGAGASAHLLCGCQLKPWGSSLWVCWGTQKSFQGWEPGLGAPVQCLVTSAACTFIPCRLRSVWWGWAPPL	985414	984345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_984869_985265
841949	contig_5586_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_143595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGAGGCAGCTCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564681	565537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_564700_565500
841950	contig_10753_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_105151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360447	361213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_360400_361200
841951	contig_7297_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_169698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAATGAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152772	151994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_152000_152800
841952	contig_6509_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_145663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTCTATAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233052	233800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_233100_233800
841954	contig_10904_pilon	+	600	4	Intergenic	novelGene_22663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1930	junction_1	569.461929270859	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	222	533	533790	535124	FALSE	25	AGAACTTTGGAATTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRRLVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530959	535191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531005_531238_531362_533736_533924_534946
841955	contig_9363_pilon	+	1381	2	Intergenic	novelGene_6791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTGGTTTCTTCCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1589435	1592449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1590335_1591967
841957	contig_9797_pilon	+	529	3	Intergenic	novelGene_65581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.5	358	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	386	502	192010	192126	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESPCPAIRTGRAAQELQDKHPEPLRVATTLGPPHGGGQYGSGVPPGGGYGGPAPGGPYGPPAGGGPYGPGGLTSGTPGGPYGGAAPGEPLWSATSKRCPCLGNLDSVLPGYLWPGYCSPSLHFHLPAMLCLALVPRGQLPPPTANVFIFFLFAVFSFGAKSLVKL	172533	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183940_191917
841958	contig_7131_pilon	+	693	5	Intergenic	novelGene_175333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	39.3541611522848	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	60	341	126497	128690	FALSE	20	AGAATCCTGGGGGTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGGARSLRWLRPDPGALLEMDSRIPYDDYPVVFLPAYENPPAWIPPHEVIPDSDAHRAGLQEGDQVLAVNKVDFQDIEHSKAVEILKTAREISMRVRFFPYNYHRQKERTVH	125905	129042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_+_125952_126483_126584_128104_128204_128436_128498_128655
841959	contig_4301_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_65076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207553	209721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_207600_209700
841960	contig_5928_pilon	+	606	2	Intergenic	novelGene_40346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	26	319	3045	5093	FALSE	20	TAAATTTGCATGGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNKSSLIKMSSAPEPPAFKSESPKEKDFRNPGLRGVRTTTLFRAVNPELFIKPNKPVMAFGLITLSLCVAYIGYLHATEENKKDLYEAIDSEGHSYMRRKTSKWD	3019	5380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_3180_4934
841962	contig_12078_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_74114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTCAAGTATGAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403939	402959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_403000_403900
841963	contig_14895_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_106697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGAGTGGGAGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126164	125575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_125600_126200
841964	contig_5445_pilon	+	785	3	Intergenic	novelGene_135427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	4	171	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATAGCAGTCCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70722	74994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_70818_73885_74001_74419
841965	contig_3942_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_128725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGGCTCAGGAAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634928	634196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_634200_634900
841966	contig_6829_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_123773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGGAAAATAGGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65140	66065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_65100_66100
841967	contig_11428_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_138500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGAGGTTTTTACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163846	164718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_163800_164700
841968	contig_14838_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_151900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	212	448	17597	17361	NA	80	AGGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVLLLLLLILLLLLLILHLLLVLLLILLHLLLVLLHLLLILLLLLILLHLLLILHLLLILHLLLLTLIHMLLVLLHLLLILHLLLVLLQLLLVLLHLLLLLLRLLLVLYLLLLILLHLLLTLLHLFLVLLHLLVTILHLLLVSSTCS	17808	17026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_17000_17800
841969	contig_6436_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_134917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCTGAAGCTTGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780125	781487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_780100_781500
841971	SIRV6	+	442	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	103	0	-84	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2388	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
841973	contig_13004_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_112601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	345	1038	11	1048	113622	114659	NA	35	ATGCTTTAAAACAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVKMESANSSVAAVGNGDMGSQRDMSLVPERLQRREQERQLEVERRKQRQQNQKVEEEKSDFFAAAFSRERAAVEELLEGEQSAERLEEAAARLQGLQKLLNDSVLFLAAYDLRQGQEALGRLQAALAERRQELQPKKRFAFKTRRKDPAPASKVDAAPGVPVAEGIQASAPPLKEERSFGSNWVCGFSSLESQVLEKRAEELHQRDVLLTELINCTIRLYGNPNTLRLTKARNCTVLCGPVSTSVFLEDCSDCVLVVACQQLRIHTTKDTRIFLQVISRAIVEDCNGIQFAPYTWSYPGIDKDFEDSGLDRSKNNWNDVDDFNWLARDVASPNWSILPEEERMIQWD	113611	114834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_113600_114800
841975	contig_5954_pilon	+	667	8	Intergenic	novelGene_28723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.45450977587103	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTGAGCGTTGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166493	1169579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1166579_1167594_1167712_1168282_1168405_1168524_1168556_1168758_1168833_1169064_1169147_1169257_1169292_1169457
841976	contig_6412_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_149948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201392	200934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_200900_201400
841977	contig_15760_pilon	-	558	4	Intergenic	novelGene_131054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	738.219931095515	2143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCTTTGGTGTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51884	30639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_30839_37859_37958_38233_38328_51717
841980	contig_1450_pilon	+	802	2	Intergenic	novelGene_27413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGTGTGAGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416694	418066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_416882_417451
841981	contig_4364_pilon	-	934	4	Intergenic	novelGene_160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	73.3590863871379	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	1244256	1238195	TRUE	5	CGGAGGCCTCCGCGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPRFAGPGSGCGSLGSGDWSACTWGAGLEGGWSWVPDVGGGAPASLVSCNAELPWEVTEALPPFPTYSLPSTLSDESSLGTLSFGCVTSLKAPGYEGEDQVLERRGHLALGGQRRELWHLPDGFQRLLSRL	1244256	1237625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1237843_1237873_1238199_1243254_1243381_1243990
841982	contig_5499_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_56973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62157	63073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_62200_63100
841983	contig_10940_pilon	+	269	2	Intergenic	novelGene_49168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAGACCAGATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98779	191361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_99017_191329
841984	contig_12802_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_114255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAACTAAACGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176152	176705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_176200_176700
841985	contig_15559_pilon	-	217	1	Intergenic	novelGene_141901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGGATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196741	196524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_196500_196700
841986	contig_13224_pilon	+	1441	1	Intergenic	novelGene_104125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385369	386810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_385400_386800
841987	contig_16204_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_154481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACAGCTGCGACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197516	197859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_197500_197900
841988	contig_438_pilon	+	478	2	Intergenic	novelGene_177394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114668	116560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_438_pilon_+_114785_116198
841989	contig_10323_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_123637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	22	564	519980	519438	NA	25	CACTGTTGCAGCTCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESLSAQEMHEQQDSLKLFVLLRNLLHTPPANTFFLCRQPGIPFHKCLSSVCSLKRSPRVVQRAWRWTVSPEAGLAVAPKRSQPWKPYGTVLCTRGRHESQPTQQQPTTTVILWKSTTWAPPAIQQWELQKDTDTIRQVEPPKVVGIGVQGIGVAAHSWAESPSSYKTFATGMRTSKDQVLVQVPRDS	520001	519264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_519300_520000
841991	contig_5551_pilon	-	1651	1	Intergenic	novelGene_134271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATAAGAGATCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649583	647932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_647900_649600
841992	contig_7919_pilon	+	765	4	Intergenic	novelGene_28041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	18.1536650722535	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348440	357463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_348754_351863_351939_356701_356835_357219
841993	contig_5961_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_144128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTTACAAAAAACACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143434	142569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_142600_143400
841994	contig_5961_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_144127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTTCAGCCCGGATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142305	141901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_141900_142300
841995	contig_4857_pilon	-	1313	1	Intergenic	novelGene_48894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTATAATGACTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449716	1448403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1448400_1449700
841996	contig_3320_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_133067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACCTGTTCAACATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170280	169421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_-_169400_170300
841997	contig_12841_pilon	-	1303	14	Intergenic	novelGene_55887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	76	junction_2	64.5605078325568	713	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	147	1154	931768	891271	FALSE	15	GATGATGTTGTCCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVNQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIESGAEAKKLPGVGTKMAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFEDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEIKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHRVVEQLEKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLARENDEKEYPHRRIDIRLIPRDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRTHALEKGFTINEYTIRPLGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE	931914	891121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_891366_892624_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_914691_914765_914862_914918_916588_916641_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
841999	contig_7580_pilon	-	1739	3	Intergenic	novelGene_108590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTCCCACTGGCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22392	12959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_-_13134_19103_19275_20998
842000	SIRV6	+	447	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-82	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	123	372	68	439	2458	10780	FALSE	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALIVSPERPVYVVVILVARLSMVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIEVRIIDERVEVEVVQQES	2390	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3171_10723
842001	contig_12543_pilon	-	845	5	Intergenic	novelGene_168370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	7.29297607290741	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGGAAAGAAAAAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246679	232286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_232756_236307_236435_241375_241452_244439_244512_246578
842003	contig_165_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_117077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	0	332	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	247	663	456823	457239	FALSE	55	GAAGAAGGAGAAAAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIYDTQTLGVVVFGGFMVVSAIGIFLVSTFSMKETSYEEALANQRKEMAKTHHLKVEKKKKEKTVEKKGKTKKKEEKPNGKIPEHEPAPNVTILLKETVRASSVTVTPTPVQSHMVITPVATVPAMPQEKPAPSPKDK	431344	457241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_431570_456801
842004	contig_3751_pilon	-	847	2	Intergenic	novelGene_158637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	45	395	171742	153354	FALSE	70	ACCCCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITYITRSSFCSKIIMSRSRQPPLVTGISPNEGIPWTKVTIRGENLGTGPPDLIGLTICGHNCLLTAEWMSASKIVCRVGQAKNDKGDIIVTTKSGGRGTSTVSFKLLKPEKIGILHDFILNKKIKMGFVF	171786	152901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_153587_171624
842005	contig_5451_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_167175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTGTCTTCTTCCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523052	521954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_522000_523100
842006	contig_7057_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_123180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCACTTAGGACCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229811	230684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_229800_230700
842008	contig_17470_pilon	-	709	4	Intergenic	novelGene_110488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.5764535535124	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	33	530	167807	164687	TRUE	5	CTCATGTGGCGCCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFRVGPRAEAMAPWAFISPGVVVRTGHTVLTWGITLVLFLHDTGRTQGGADGHGSSGHPPFGAADTAWCWSGLRFFQPWGLWLRSSGLLFATFLLLSLFSSVAGLLLASHLYLVASNTTTWEFISSHRIAYLRQRSSNPFDRGLIRNLAHFFCGWPSGSWETLWAEEEEDSSQAV	167839	164350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_164432_164588_165006_165582_165662_167707
842009	contig_11081_pilon	-	906	2	Intergenic	novelGene_167069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	128	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	318	905	6578	3555	FALSE	20	GTATGGCCCACAGCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPRGREEAAAAVRRPEQGPKRLCRLVQEGQLRALQEEVQRMGGPAVRCPGPAGDTLLHCAARHGHRDILAYLAEVWEMDIEATNRDYKRPLHEAASMGHRDCVRYLLGRGASVDCLKKADWTPLMMACTRKNLNVIQDLVEHGANPLLKNKDGWNSFHIASREGDPLILQYLLSVSPASWKTESKIRRTPLHTA	6895	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_3775_6210
842010	contig_14698_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_168137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGGAAAGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168344	168630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_168300_168600
842011	contig_14666_pilon	-	695	4	Intergenic	novelGene_39544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.4477166051	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	69	395	451985	449694	FALSE	30	CATAAGCACTGAGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIAGVKELG	452053	449393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449717_449812_449919_450765_450929_451950
842012	SIRV6	+	468	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	21	-45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2306	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10721
842013	contig_3956_pilon	+	1374	3	Intergenic	novelGene_14732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	11.5	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	255	1169	421984	424875	FALSE	25	GGGGGTCCCCCAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQCVTKCKNPSSTLGSKNGDRDSSNKSHSRRGAGHREEQAPACSKPGGDILVNGTKKAEAATEACQLPTSSGDAGREPKSNAEESSLQRLEELFRRYKDEREDAILEEGMERFCNDLCVDPTEFRVLLLAWKFQAATMCKFTRKEFFDGCKAISADSIDGICARFPSLLIEAKQEDKFKDLYRFTFQFGLDSEEGQRSLHREIAIALWKLVFTQNNPPVLDQWLHFLTENPSGIKGISRDTWNMFLNFTQVIGPDLSNYSEDEAWPSLFDTFVEWEMERRKREGEGRGAFSSGPEGLCPEEQT	374293	425080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_374443_421878_422415_424391
842014	contig_6576_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_42288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	187	489	339351	339049	NA	30	TTTTATGCTTAAGTAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGRPGFWPMAGSVCDLGVEPGGWVAEIEFGEASENGVPRVRGTSSCGSWRLRDSGFGFEVSVGPLGGGLDLYQRKRYLSTVLPLFRCFGDDSTKRRFF	339537	337736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_337700_339500
842017	contig_15066_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_149518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	174	503	28061	27732	NA	15	ACAGCAGCCTTTTCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATPNLLPGRCPPRPLPWGFPLGCPSPSSAISTVQRPLQQRPTPYLAPVTSMREEGADNRMQPEEETTCVQSGSGYGAVCCRLASLASPSSAGLGVGWGGEPEAQLKL	28234	27547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_27500_28200
842018	contig_3584_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_108122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTACTAATGAACCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221010	220708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_220700_221000
842020	contig_9073_pilon	+	1634	5	Intergenic	novelGene_177399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	8.40758586040012	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1485	148	1632	374504	398380	FALSE	25	CTCAGCTTTAATTCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRLLPAQAQEFVMFRDVAVFFSQEEWGHLDPAQRALYREVMLENYSNLVSLGIRFSKPKVISQLQQGEDPWMVDRGVPQGACQGWKSLLETTVSEGETQEVIMKKLLDGGPFNFKLGKTYMYEGKLEKQQGKNKPFRKVLVTFKKTYVKERSFKGIEFGKNLGIKSPVIRTPKIISRGQKPYSQQYSTLLKQLGINTWRKCYKCNVCGKVFLHSSSLSKHQRIHTGEKLYKCTECRKAFSQSSSLTQHLRVHTGEKPYICNECGKAFSFTTSLIGHQRMHTGERPYKCKECGKTFKGSSSLNNHQRIHTGEKPYKCNECGRAFSQCSSLIQHHRIHTGEKPYECSQCGKAFTSISRLSRHHRIHTGEKPFNCNECGKVFSYHSALIIHQRTHTGERPYACKECGKAFSQSSALIQHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSWISRLNIHHRIHTGEKPYNCKECGKAFSSHSAVNTHRKIHSGEKPYKCNDCDKAFNQ	373306	398382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_+_373404_374453_374537_385473_385601_386048_386145_397151
842021	contig_15146_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_116955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCGAGCAGATAGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521817	522198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_521800_522200
842023	contig_1725_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_24248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89344	90311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_89300_90300
842024	contig_8581_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_22853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTGATGGTAGAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347654	346238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_346200_347700
842027	contig_6589_pilon	-	1171	10	Intergenic	novelGene_26243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_9	46.6732799546849	3	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	653	1111	2228821	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHLTAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2230752	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737
842028	contig_5811_pilon	+	527	5	Intergenic	novelGene_177403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	30.9879008646923	594	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	32	484	51870	53961	FALSE	10	TTGCCTTGTGTAATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGQVKDREAFQRLNFLYQAAHCILAQDPENQALARFYCHTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVPGLTCTQRQRRCKGQRWTVQTCLTCQRSQRFLNDPRHLLWGDRPEAQLVSQADPKPPQPLPSTAHPIPEEKVQPQSPSHQ	51838	54004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5811_pilon_+_51927_52001_52103_52193_52277_53635_53762_53875
842029	contig_14704_pilon	-	525	5	Intergenic	novelGene_82700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	287.839690626571	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAATTTATTTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99280	77536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_99008_99126_99216
842031	contig_9415_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_109904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTGGCAGGCATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2103843	2103435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2103400_2103800
842032	contig_9415_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_109903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGATAAATACACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2103485	2103029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2103000_2103500
842034	contig_10324_pilon	+	852	5	Intergenic	novelGene_7825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	291.234763549958	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	293	850	261538	265396	FALSE	15	CCCATCGAGGCCGGCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDEEDLAHRHPAAFTEHWLCAGAALAQGHRAPCPGVTRCGGRQVRSRNVYKDLRQIELACDSQEDVDSWKASFLRAGVYPEKDQAENEDGAQENTFSMDPQLERQVETIRNLVDSYVAIINKSIRDLMPKTIMHLMINNTKAFIHHELLAYLYSSADQSSLMEESADQAQRRDDMLRMYHALKEALNIIGDISTSTVSTPMPPPVDDTWLQTTSSHSPTPQRRPVSSVHPPGRPPAVRGPTPGPPLIPIPVGAVGSFAAPPIPSRPGPQSVFANNDPFSAPPQ	258496	265398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_258638_260944_261057_261498_261664_263847_264081_265197
842035	contig_12750_pilon	+	1045	2	Intergenic	novelGene_172617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGAAAAAGAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14751	27998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_14980_27181
842036	contig_3386_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_34475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTTCTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75383	74925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_74900_75400
842037	contig_7895_pilon	+	1418	7	Intergenic	novelGene_154462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	7.51480021173033	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	63	1025	841349	849427	FALSE	25	AGATTCATCTATGCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLAFRLELVGSLIVFFASLLMVIYRDTLSGDTVGFVLSNALNITQTLNWLVRMTSEMETNIVAVERINEYIKVENEAPWVTDKRPPAGWPSLGEIQFSNYQVRYRPELDLVLKGITCDIRSAEKIGVVGRTGAGKSSLTNCLFRILEAAGGHITIDGLDIASIGLHDLREKLTIIPQDPILFSGTLRMNLDPFNSYSDEEIWKALELAHLKSFVAGLQLGLSHEVTEAGDNLSIGQRQLLCLGRALLRKSKILIMDEATAAVDLETDHLIQMTIKNEFSQCTVITIAHRLHTIMDSDKVMVLDNGKIIEYGSPEELLKNPGPFYYMAKESGIENANSTAF	841286	849820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_841415_843027_843130_843566_843711_844607_844767_845687_845855_848355_848551_849297
842038	contig_15327_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_70737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAAATTCTTCAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967252	965972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_966000_967300
842039	contig_3424_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_55589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	291	198	488	1167227	1166937	NA	35	GCGAAAGCCTTAGATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAQRPCTHSVKSVQEGTNPIAWEQWTLLETSKIRNARDPREETEQGRRRHFPVSSFLQSNSCQDGMVLAQGQTETNRRMENPETNPHIYGQQGYRGNSVEKNSLFNKWCRDNWTSTRGRMKLDPYLTQHTKSNSTYQRPTMKLKTIKLLEKVTRVNFRDFRR	1167424	1166936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1166900_1167400
842041	contig_10753_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_105132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69324	70188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_69300_70200
842042	contig_3241_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_146399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAATGAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819873	821105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_819900_821100
842045	contig_8600_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_125743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGTTGAGGCAGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117004	117975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_117000_118000
842046	contig_19243_pilon	+	609	3	Intergenic	novelGene_177405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	21.5	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	169	603	19168	20266	FALSE	65	TGAAAAAAATTAAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSIGEYDVLRGIFSSEIGTKQVTQDALLAEARNDYSEAAKQYNEALNKHDWLDGEPMEAEKDFWELASLDCYNHLTEWQSLAYCSTASVDSKHPPDLNKMWSESFYQETYLPYMIRSKLKLLLHGEDDQSLLTFVDNSVSKELQKVLLELHYSQELSLLYLLQDDFDRAKYCIENGIHIFMQVVQMYLKCATFYNTSLKS	18128	20272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19243_pilon_+_18261_19131_19321_19984
842047	contig_13547_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_104854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCTATTTGATTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18433	17811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_17800_18400
842048	SIRV2	-	269	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	676	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4056	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_3826_3969
842049	scaffold_6394_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_110971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAGTCTTTTTGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306139	304873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_304900_306100
842050	contig_18173_pilon	-	1178	2	Intergenic	novelGene_160769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72494	47280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_48366_72401
842052	contig_9127_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_103021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTACAGCAGTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220718	221391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_220700_221400
842054	contig_6364_pilon	+	374	3	Intergenic	novelGene_51790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_2	79.5	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGGTTATCTGTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360063	1368189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1360167_1367550_1367618_1367985
842056	contig_15897_pilon	+	735	4	Intergenic	novelGene_49524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	50.6249828532207	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	153	583	735	300609	312640	FALSE	50	GCAGTAATGAAAGAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEA	291740	312640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_291868_292435_292732_300449_300723_312601
842057	contig_16907_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_87430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCAGTGAGGAACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352174	351470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_351500_352200
842058	contig_6446_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_149185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACTAGAATGAGGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200423	201075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_200400_201100
842059	contig_14133_pilon	-	440	5	Intergenic	novelGene_119963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1987.16449998484	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGCCCATACGAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209450	207425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_207465_208259_208389_208602_208728_209012_209131_209421
842061	SIRV7	+	269	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
842062	contig_253_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_129657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGCTGACAGGGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364687	366750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_364700_366800
842063	contig_593_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_102037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	203	601	589343	588945	NA	35	TGCTAACCAAAAGGTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGFSRSPARPLRCVLTANTTASHGNSSKEVQKLRSKPDLLKGRENEVRNFCVEMGNVKTLSNADKHQRFYKNSKLVSKRPVYLACYKKSMLAQAGQCLRQILCLVHFQCVRKMSYTPSSFYKNPGEQTLA	589545	588502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_588500_589500
842064	contig_593_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_102036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588502	588238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_588200_588500
842066	contig_11498_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_65528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTTTATTATGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253529	252104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_252100_253500
842068	contig_5315_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_175353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAGATTAATTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143078	142779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_-_142800_143100
842069	contig_753_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_112927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATAACGTATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422960	422673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_422700_423000
842073	contig_7697_pilon	-	1120	4	Intergenic	novelGene_128290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	30.7064958744707	213	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	123	608	393059	388357	FALSE	25	TAAACTATTTTCTGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGAGSSWQTSRAPTQGTSWSPQAKPPPAKACSQPRPNYAMNFSVIGGREERGIRAPSFAQKPKVSENDFEDLLPNEGFSSKSDKKGPKTIAEMRKQEMAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGEGRWTPVGMADLVTPSQVKKHYRRAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF	393181	387844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_388459_388692_388870_391647_391797_393001
842076	contig_3241_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_146423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCACTAGAAAAGGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957481	956677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_956700_957500
842077	contig_10627_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_60058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAACTGTGTAAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220472	1218940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1218900_1220500
842078	contig_16790_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_171678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGTCCATGGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34787	33371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_-_33400_34800
842079	contig_10197_pilon	-	876	2	Intergenic	novelGene_115237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCATTATGTGGTCTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952411	950850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_951583_952267
842080	contig_18363_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_157716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACGTGAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277259	277982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_+_277300_278000
842081	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	102	0	-85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2387	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
842084	contig_1406_pilon	+	1569	2	Intergenic	novelGene_25477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	244	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	14	952	1242821	1272133	FALSE	60	GGGAAAAAAAAGAATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRRSQHHHHHHQQQLQPAPGASAPPPPPPPPPPLSPGLAPGTTPASPTASGLAPFASPRHGLALPEGDGSRDPPDRPRSPDPVDSTSCCSTTSTICTVAAAPVVPVVSASSAVGVAPNPSGGGGNNSSSSSSSPTSSSSSSPSSPGSSLAESPEAAGVSTTTALGPGAAGPGPGVAAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDAANVNAKDMAGRKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGADPNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIGKYNLMISNII	1242807	1272750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1243500_1271873
842085	scaffold_12510_pilon	+	1162	3	Intergenic	novelGene_151410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	2	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	473	862	625218	659240	FALSE	30	AACAGCAGGTGTTTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRRWQKRICRPQPAVGQLSTVRGSQHSSAPPTPTSCASLRPGVTTSSSACALRSCASGSCAPRGAPLLPGTPSPPECKLHNNRDFCLGRDWHDHPEECLAQSRCQQYLLDERECITGGENWPVKAQ	624745	659540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_625453_633947_634084_659221
842087	contig_6398_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_177410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCCCTGGCCCTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64633	62830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6398_pilon_-_62800_64600
842088	contig_8616_pilon	-	728	3	Intergenic	novelGene_72488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	2	663	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGCCGGCTCCTGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319747	318383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_318925_319198_319299_319660
842089	contig_10962_pilon	+	1485	2	Intergenic	novelGene_103884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGAAAATACAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273996	313093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_274108_311719
842092	contig_10446_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_162484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTAACCACCCACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758912	757828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_757800_758900
842093	contig_2078_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_100140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAAAACTGGATGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267786	268469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_267800_268500
842094	contig_1339_pilon	+	346	4	Intergenic	novelGene_163138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4815	junction_1	2683.83759237071	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	32	346	431340	433787	FALSE	10	CTGCGCATGGTGAGTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGQRKPATSYVRTTINKNARATLSSIRHMIRKNKYRPD	430929	433787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433677
842096	contig_4689_pilon	-	1188	4	Intergenic	novelGene_165406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	34.1011567089577	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	1091889	1086641	TRUE	20	CCTTTTACTTGTCACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLQEKDKDPLSLEGLRALGSNSLATTKVIDLVSGSRTRGDSAHGIQPLGKASGRPDFLVRCLFEAEGEDIARDTPEYTCEPIEDLKFLLKKTAQATDE	1091890	1084225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1085003_1085500_1085603_1086632_1086743_1091691
842098	contig_17459_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_175520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	831	1193	23501	23863	NA	50	AAAGGAAATAAATTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDIEYRIYKNGLEKSLNRHIATAYSKQPKQTEAGEESDFQTYHIIIVTMSRFQQKSMEHVKKQSVTHLQKKLTEIVPEEIQTLHLLEKGIKSSVKLKRNHEQRTKGYQENDVRTNREYQ	22670	23881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17459_pilon_+_22700_23900
842099	contig_12250_pilon	+	1141	5	Intergenic	novelGene_80518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	10.8627804912002	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	188	811	62743	64563	FALSE	10	GCTTCGACTCATCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASTISKAPQPPKTWILVTGVAYYQPSLTAEYDEDSPGGDFDFFSSLVTKWEAAARLPGDSTRQVVVRSGVVLGRAGGAIGHMLLPFRLGLGGPIGSGHQFFPWIHISDLVGILAHALEARHVQGVLNGVAPGPTTTNAEFAQALGAALGRPAFIPLPSTVVKAIFGRERAIMLLEGQKVVPRRTLATGYQYSFPKLGAALKEVVA	61713	64893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_61739_62039_62147_62687_62810_63712_63857_64150
842100	contig_5586_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_143520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269438	268593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_268600_269400
842101	contig_18544_pilon	-	1427	4	Intergenic	novelGene_152756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.6958174002346	144	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	140	1231	121262	111124	FALSE	20	GAACAGCATCCTTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMDVTFLGTGAAYPSPTRGASAVVLRCEGECWLFDCGEGTQTQLMKSQLKAGRITKIFITHLHGDHFFGLPGLLCTISLQSGSVVTKQPIEIYGPLGLRDFVWRTMELSHTELVFPYVVHELVPTADQCPTEEQKELTHVKRADSCPKEGQGRTILLDSEENAYLLVDDEQFVVKAFRLFHRIPSFGFSVMEKKRPGKLNAQKLKDLGVPPGPAYGKLKNGISVVLENGVTISPQDVLKKPIIGRKICILGDCSGVVGDGGVKLCSEADLLIHEATLDDTQMDKAKEHGHSTPQMAAAFAKLCQAKRLVLTHFSQRYKPVALAREGETDGVAELKKQAESVLHLQEVTLAEDFMVIGIPIKK	123048	110927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_111591_113106_113575_121105_121289_122935
842102	contig_14514_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_137466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCCAACACCTGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36321	35639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_35600_36300
842103	contig_12297_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_161381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTGATAAGGAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739370	738481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_738500_739400
842104	contig_12297_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_161380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGGATTGTCTGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738428	738129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_738100_738400
842105	contig_16884_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_161818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAAAAGTACATAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43178	44085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_43200_44100
842106	contig_10940_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_49278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTAACTCTTGTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884532	883888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_883900_884500
842107	contig_7035_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_83557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942410	941831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_941800_942400
842108	contig_5050_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_110251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACTTATGACGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265462	264961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_265000_265500
842109	contig_11989_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_68458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTTCACACAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105968	106542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_106000_106500
842110	contig_10658_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_130088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTGGGGCCAGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330516	330249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_330200_330500
842111	contig_10768_pilon	+	1085	6	Intergenic	novelGene_166446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	51.3770376724856	122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	293	892	140391	154799	FALSE	35	TTATCTATGAAGTGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFKIEHTWDGFPVTHEPVLVRLSPGDRGVMMEVSAPFFNDPPDPLGEPGKPFNELWDYEVVEAFFLNDRTEQYLEVELCPHGQHLVLLLSGRRNVWKQGLALSFQVSRGETKWEGKTCLPWCYFPPNVTKFNSFAIHGSKDKRHYEALYPVPQHELQQGQKPDFHLLEYFKPFNFNTLFGEEWKQPESDLWLIEKPDI	117331	154992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10768_pilon_+_117624_140390_140572_149046_149108_152415_152468_152609_152810_154693
842112	contig_5571_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_75532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGACGACCTCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245132	243896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_243900_245100
842115	contig_15371_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_151481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATTTTACCAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233830	233518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_233500_233800
842116	contig_7157_pilon	-	575	4	Intergenic	novelGene_131267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3807	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGGAAGCTATTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93104	88932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_88964_90914_91008_91104_91292_92840
842117	contig_8576_pilon	-	460	4	Intergenic	novelGene_88771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	78.5748051222528	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	47	364	763004	761002	TRUE	35	AGAATGAGAGATTGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALTRLAPFVRGGGRLFRSCRKRTAGSGGVRHAGGGVHIEPTYRQFPQLTRSQVLQAEFFSATMWFWILWRFWHDSDAVLGHFPYPDPSQWTDEELGIPPDDED	763050	759814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_759888_760978_761077_762178_762324_762906
842119	contig_14526_pilon	-	1245	2	Intergenic	novelGene_111226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	0	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGGATTTCAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456350	450710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_451881_456275
842122	contig_9698_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_82489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144288	142987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_143000_144300
842123	contig_13905_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_130417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTTAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95636	94920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_94900_95600
842126	contig_4469_pilon	-	1216	3	Intergenic	novelGene_21904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACATCTATCCTATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440290	432604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_433118_435296_435478_439768
842127	contig_3980_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_172334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184529	183751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_183800_184500
842128	contig_7171_pilon	-	847	4	Intergenic	novelGene_101414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	23.8932812499432	545	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	140	505	1452316	1451349	FALSE	15	GAGCTTTGTGGATCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQELGLPAYRKFDIEAWMPGRGRFGEVTSASNCTDFQSRRLHILFHTDDGELRFAHTVNATACAVPRLLIALLESYQQKDGSVLVPPALQPYLSTDRITAPAHVPLRYIGPNQPRTPSS	1452455	1451006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451621_1452054_1452148_1452232
842129	SIRV6	+	271	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	65	2924	65	-2897	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTGATCTTTGAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	7891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
842130	contig_4746_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_177411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCGAAGTAGGTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5247	6192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4746_pilon_+_5200_6200
842131	contig_16930_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_139144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGCAACAGAAAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38479	39952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_38500_40000
842132	contig_5372_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_149708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153941	154990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_153900_155000
842136	contig_10103_pilon	-	796	3	Intergenic	novelGene_86150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	26.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	24	698	475881	460298	FALSE	50	ACTTAAAATGATGTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYDEAFAMANDPLEGFHEVNLASPTSPDLLGVYESGTQEKTTSPSVIYRPHPSALCSAPVQANALDVSDLPTQPVYSSPRRLNCAEISSISVHVTDPAPCSTSGATAGLTKLTTRKDNCNAEREFLQGATITEACDGSDDIFGLSTDSLSRLRSPSVLEVREKGYERLKEELAKAQRELKLKDEECERLSKVRDQLGQELEELTASLFEVGLSTPRQEQYLDSLCINRIVY	475904	460199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_460463_474368_474628_475630
842137	contig_7612_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_170361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAGGGTGGAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128180	126414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_126400_128200
842141	contig_10286_pilon	-	1853	1	Intergenic	novelGene_98410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTTCATTTTACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394922	393069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_393100_394900
842142	contig_12427_pilon	+	242	3	Intergenic	novelGene_40418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	71	junction_2	95.5	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACCTACCTGCGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208709	210114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_208743_209618_209737_210023
842143	contig_10037_pilon	+	532	2	Intergenic	novelGene_148941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_1	0	408	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACTCAAGACTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115300	116787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_116488
842144	contig_2069_pilon	-	1113	6	Intergenic	novelGene_23417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	221.69835362492	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	359	661	1256627	1253082	FALSE	30	ACCACCTACTAGCTCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPEK	1257970	1252629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256856_1256978_1257784
842145	contig_8045_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_35337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATACAGAAGATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87858	87361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_87400_87900
842146	contig_8045_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_35336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGTAGAGAGGGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87112	86543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_86500_87100
842149	contig_9646_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_117452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGCATTTTCCTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272786	273178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_272800_273200
842150	contig_7146_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_162057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGGATTTTTGTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193740	194916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_193700_194900
842151	contig_4213_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_124821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	269	670	65495	65896	NA	45	AAAAGTCCTTTAATAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVQTGEVVPQLRGASQAVKKEGRWHMEQGVGEKVKEGGKREKKPKEAEESNNSYKKKALKEPASVGGVNPSVKEPVSPRKSDCGLLKVTEVKQEAEWWWVGKTVLLVTGCPVSCWGLFEAAFLYSLSTILSG	65226	66206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_65200_66200
842152	contig_10263_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_135822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGACATTTCGAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535204	533667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_533700_535200
842153	contig_9375_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_136029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCCCTTCAGATGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44754	45492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_44800_45500
842154	contig_11762_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_177412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGGTCCTTGTTCCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30521	30132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11762_pilon_-_30100_30500
842156	contig_6027_pilon	-	1397	6	Intergenic	novelGene_74442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.6311266587099	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	163	858	265846	262615	FALSE	25	ACCTTCCAAATCACTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVLVWVMGTSTHAWVRRCLSWPEEHLYRNSIEVPWKKGSGVEAGKSPWTCLSF	266008	262075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262770_263393_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709
842158	SIRV6	-	348	3	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-615	-44	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGCGCCACGACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3162	2402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2815_3106
842159	contig_3382_pilon	-	504	4	Intergenic	novelGene_124091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTACTGATGGTGATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576828	564285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_564322_572509_572760_575142_575303_576770
842161	contig_6710_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_96341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTTGCACCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653714	653364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
842163	contig_14133_pilon	-	2475	17	Intergenic	novelGene_119895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1130	1474	63498	61030	TRUE	20	CAACCGCTACCGACTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPSSAAWRMIRKAGTKLSGSKLSNAWATRRATQSLTSCCASGRQTTRVDMQESTCRQFTSCMSKTSCMQPSSSSGLSTEKSLRYRLVSRGEVLTKVHSLCIWMASDTFSTGL	67677	42141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_42230_43051_43161_52479_52574_54408_54553_54669_54764_55736_55812_57806_57919_58917_59002_59232_59268_60089_60155_60928_61048_62208_62287_62633_62775_63390_63525_65405_65517_66606_66705_66783
842164	contig_253_pilon	-	636	4	Intergenic	novelGene_129706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.9236648566763	62	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	25	507	513615	508821	TRUE	10	CTCTGGTCTGTTAGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGDLPDFQDGTKATFHYRTLHSDEEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDVKHVVFYPLVAKSLRNIAAGKDPLEGQRHCCGIAQMHEHSSLGHADLDALQQSPRPLIFDIEMLKVRAT	513639	507298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_507422_508814_509025_510269_510450_513516
842166	contig_2364_pilon	+	522	5	Intergenic	novelGene_170820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	597	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACCGGTGCGTTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7133	36984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_+_7206_17102_17199_20726_20836_35076_35151_36813
842168	contig_2338_pilon	+	1424	5	Intergenic	novelGene_177414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.1650635094611	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	94	1302	94962	100762	FALSE	15	TGCGCTGACCTGGCCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSISWGLLLLAGLCCLVPGSLAKRPKGDPAQETESSKEDHDKHQHPACYKVSPNLANFAFSLYREVAHQSNTTNIFLSPVSIAVAFALLSTGAKSDTHNQILEGLKFNLTKTSEAEIHVGFQHLLHTLNQPDSQLQLTTGNALFINESLKLVDKFLEDAKKLYYSEAFSINFRDNEAAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDENTVLALVNYIFFKGKWKKPFEVEQTQDGDFHVDDETTVTVPMMNRLGMYDLHYHEKLSSWVLLMDYVGNATAIFILPKPGKMQQLEDRLTKILLSQWLRERRTRSAILSFPKLSISGTYDLRNLLGKLGITKVFSDGADLSGITENGPLKLSKAMHKAVLTIDEKGTEAAGASFFGSHPHVNAPHDQIQQPLPCYHL	86603	100884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2338_pilon_+_86693_94957_95617_97365_97637_98813_98962_100627
842169	contig_5247_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_81811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTGGAAACCCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159221	160408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_159200_160400
842171	contig_16098_pilon	-	506	3	Intergenic	novelGene_45923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	66	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	3	500	343969	342409	FALSE	20	TGAGTTAAGGGTACCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPPPRARRRGAVPSADRERDRVAEARCTLCACALQDEEGPLCCPHPGCPLRAHVICLAEEFLQEEPGQLLPLEGQCPGCKNSLLWGDLIWLRQTGTEEDEEDSELEEVRGGSGPSLLSPAPSSRLPLTSSLVITGTLDRHAGELTPVPLNPHFFFVPLFFTCVQ	343971	342402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_342671_342825_342954_343861
842172	contig_13015_pilon	+	572	3	Intergenic	novelGene_165532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.5	311	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	269	388	64621	73551	FALSE	5	CCTGCCTTCTCTGTTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVATASLEETAEPLTQCAAWLEAYFQDPAAVEGLPLPALHHPIFQRDSFTRQVLWKLLKAVKVGEVVSYQQLAALAGNPRAARAVGGAMRNNPVSPHPHPVPQSDQQQWRCGQLLRRAGREAVAAGP	26407	73735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_26551_64495_64640_73450
842173	contig_12464_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_68674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGAACAGAATTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167114	168004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_167100_168000
842174	contig_15108_pilon	+	846	2	Intergenic	novelGene_131182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGCCCCTGTGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103198	109568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_103313_108836
842175	contig_14133_pilon	-	437	4	Intergenic	novelGene_119946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1879.92505760794	12	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	45	437	209116	206561	FALSE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVSVHVSAWPAPTPDSSGSAQRGPKRPQSRMWRRKSKSLSGTFNKSSEAF	209451	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206695_208572_208728_209012_209131_209421
842178	contig_7866_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_171201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415949	416946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_415900_416900
842181	contig_3529_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_105392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATTAAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790202	788593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_789822_790099
842183	contig_10940_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_49206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTTGGTGTCCATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789581	788679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_788700_789600
842184	contig_11396_pilon	-	933	4	Intergenic	novelGene_71412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.933106855846	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	177	824	1645175	1644244	FALSE	10	AGTCTTTTCTTTTACCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEERARTASLGRVSAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQGKGTRAVSLRLGDGAYRPARSRALSRAWAQHVPGQCSDGDQPHPCLSPPLPVSSPGLESGAICLGGCPGPGAAADGCVCVLVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649972	1644134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1645307_1649927
842185	contig_14822_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_145433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	134	451	279402	279085	NA	50	TCTGAAAGAAAACTAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAMPLVFQMVNRFQWSSRLRQTRKKGVVIYCQRLVNENPVDHNRILSNIVLEDESPSLGWKALKIHSGHNNELEHTNDYKDGMGLGDILFYRTWGHNELEPTP	279535	278569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_278600_279500
842186	contig_7357_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_36868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTTACAGGAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230020	231293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_230000_231300
842187	contig_11709_pilon	-	606	2	Intergenic	novelGene_168209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATCTGCAAGACCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42408	36591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_36670_41880
842188	contig_3469_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_34195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATACATATATATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513005	512512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_512500_513000
842190	contig_4519_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_123693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAATCTCCTATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509278	509889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_509300_509900
842191	contig_14635_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_84383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650156	649276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_649300_650200
842193	contig_6102_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_32034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542332	543206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_542300_543200
842195	contig_14768_pilon	+	799	2	Intergenic	novelGene_115073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	313	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTCTGATATATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174322	189295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_174424_188597
842196	contig_835_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_152175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATACCTCAAACTCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399558	399311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_399300_399600
842199	contig_3382_pilon	-	1771	3	Intergenic	novelGene_124205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	95.5	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGTGTGAAACCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417423	1403250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1403680_1406196_1407249_1417133
842200	contig_15236_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_141631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTTAATATATTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633647	631959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_632000_633600
842202	contig_15744_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_83564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	1026	1565	21221	21760	NA	70	AAAAAAAAAAACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSNPDLIIFVDGSYLTPESTISSLPGRICKCCDCSREIIELTAKVVLDYQIALDFLLAQQGGVCPIANASCCTWVNTSGEVKQDIKLMHQKATWLHIPPPSDAPFLDIFSWLPSGVGSWIKSILSTGLIILTVITIGTLKCCIKLLTNAITQKTHVIMKRIMYIDSTYISDGFEPTP	20195	22012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_20200_22000
842205	contig_10196_pilon	-	1194	5	Intergenic	novelGene_132176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.74165738677394	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	9	914	1072541	1069737	TRUE	10	TATGCGTGTGGTGTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVEEPGNLSGVRHIILVLSGKGGVGKSTISTELALALRHAGKKVGILDVDLCGPSVPRMLQAQGCAVHQCDSGWVPVFVDQEQSVALMSVGFLLETPDEAVVWRGPKKNGNKTQVLSGPMRAVTRSWHHPGSTGRACEKLRDEAGSTVLGLEGHCSRVTGLQGWGPHWGFCWTIRPRAPAGVRSQPRASEPSRSPRGLLPGLGCSGLSLVWYRHQLMAPGWGGGRNSVLGNCACVCPPGSGLALWGPGQAGALSALEAAGGGGLLGAPSPAPGVLGRLRSAHKAVCVGRGLGGSWTSWW	1072549	1068312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068426_1069460_1069533_1069641_1070508_1070597_1070717_1072525
842206	contig_2067_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_158935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCCTTATCAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647971	647003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_647000_648000
842208	contig_6277_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_80407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATATAATACCACCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693460	691456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_691500_693500
842209	contig_19973_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_173774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10787	9704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19973_pilon_-_9700_10800
842210	contig_1244_pilon	+	1869	16	Intergenic	novelGene_37900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_9	61.3317391097156	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1662	207	1868	165980	231288	FALSE	20	CCCAGCATGCCATCGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLDDYLHLLLPPIVKLFDAPEVPLPSRKAALETVDRLTESLDFTDYASRIIHPIVRTLDQSPELRSTAMDTLSSLVFQLGKKYQIFIPMVNKVLVRHRINHQRYDVLICRIVKGYTLADEEEDPLIYQHRMLRSGQGDALASGPVETGPMKKLHVSTINLQKAWGAARRVSKDDWLEWLRRLSLELLKDSSSPSLRSCWALAQAYNPMARDLFNAAFVSCWSELNEDQQDELIRSIELALTSQDIAEVTQTLLNLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGIVLLGERAAKCRAYAKALHYKELEFQKGPTPAILESLISINNKLQQPEAAAGVLDYAMKHFGELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKVDTNKDDPELMLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEKWTLVNDETQAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEEYTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLAQQCIDKARDLLDAELTAMAGESYSRAYGAMVSCHMLSELEEVIQYKLVPERREIIRQIWWERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVDPSRQLDHPLPTVHPQVTYAYMKNMWKSTRKIDAFQHMQHFVQTMQQQ	161953	231289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_162039_165858_166022_167117_167211_167896_168044_172977_173121_177071_177235_177371_177518_207479_207556_210839_210980_218828_218930_221769_221886_223612_223691_223901_224010_226754_226881_226975_227108_231237
842211	contig_2114_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_104295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCCCTTGAAAGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778338	777513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_777500_778300
842212	contig_4065_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_133407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821634	820969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_821000_821600
842213	SIRV6	-	483	4	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	400	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844
842215	contig_9940_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_125359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264090	263158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_263200_264100
842216	contig_3627_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_78425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGTGAATATAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176119	177113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_176100_177100
842217	contig_5095_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_74941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGAAAGCCAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153371	154123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_153400_154100
842218	contig_1406_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_25457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	552	860	540932	541240	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLIICWCYHSQIFTRQCSMLQFIKILIIPVAFELIPTHSNPTGQSRTSHGVPKAEIFMEADCHIFLPRSSWWVQTSDLSDSNPALYPLCHQCSFTDNKGH	540380	541247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_540400_541200
842219	contig_13301_pilon	+	503	4	Intergenic	novelGene_153110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	64.9324435257308	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTCCTGTGGCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134848	144594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_135086_135556_135665_144234_144299_144500
842221	contig_4519_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_123711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	623	1126	648805	648302	NA	30	CCACAAAGGCAGGCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKHTGLWNIFFYGAPGTANTERQQLKSEKKIQIFIPFGFILSQKGTLLSAVSMVHKQQKPRLGGSLSSSIALLLLGPIHWLWEHPRCPTASAVTWRSGHSLLTFKSTKALPGSLAALQPTQTSGLRKSYMSFGAINLPPASGDRGEISLPELPKTNQEGDKVSR	649427	647579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_647600_649400
842222	contig_12270_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_114082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2	304	14409	13884	FALSE	30	GAAGATGCCGCAGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQA	14410	13883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
842223	contig_7004_pilon	-	807	3	Intergenic	novelGene_126503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	118	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	343	480	433245	432489	FALSE	30	ATAAAGCATTCAGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYQPGRTCRHLQSTRSGFFYKHRPQPKSDLGFIYLSQQVGLPISPLPFFFLHTSHLNLLNVCHRATTHSPSPTAPPVIALQNGLVSWGEVGWTDANPQSKVNSNWSSLSSCRVRMRLCNEPWNCRWQRPSPRSLGPEPQLEAVYLQPVLGPWAWGGRIN	433867	432161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_432566_433184_433570_433849
842224	SIRV6	+	369	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	504	0	338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
842226	contig_14621_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_105876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAACAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453287	453668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_453300_453700
842227	contig_4315_pilon	-	1093	5	Intergenic	novelGene_46776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.833301429296	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	106	498	299202	297453	TRUE	30	ACTGTACTGTACCTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYGTLLQDLTNNITLEDLEQLKSACKEDIPSEKSEEITTGSAWFSFLESHNKLDKDNLSYIEHIFEISRRPDLLTMVVDYRTRVLKISEEDELDTKLTRIPSAKKYKDIIRQPSEEEIIKLAPPPKKA	306029	295505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_295585_296936_297518_297670_297827_299030_299205_305926
842229	contig_14522_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_147321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAAACTGCTCTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81777	80316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_80300_81800
842231	contig_18637_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_81849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149603	148083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_148389_149542
842232	contig_7171_pilon	+	1240	7	Intergenic	novelGene_101231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	404.227108882563	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	529	750	760687	764486	FALSE	5	TTTCAGCTGTGTGCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARRADDPRFPGRACRPPSPPAGANWFLLAVSGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKEECMQRCLGKQSYPVLSHSSKVVVLAGLFMMVLLLCLGASVVCLVRVARRSQEDTLRTVWSSEDDKEHLVKNTYTL	733688	764976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733758_755557_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760703_762706_762746_764319
842233	contig_1262_pilon	+	1018	2	Intergenic	novelGene_133542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	292	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGAATCTGAGAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126355	166353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_126721_165700
842234	contig_5084_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_64585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAGAACAATGAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788276	789476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_788300_789500
842235	contig_8461_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_163918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	207	299	226771	226679	NA	55	AATAAAAAGATGAATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGAGKAGVWQGVEVGQAPGSSWGSEAGRAAYGLRGSFSFSAGPDWIFHLEGSGITFIPSRPWSFAVLMKQSSAAARSPRRPGAWAHFFRSWDAENVG	226977	225914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_225900_227000
842236	contig_2892_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_118985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAATACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42424	42801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_42400_42800
842237	SIRV6	-	329	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-300	-139	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGTTCATTGGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120	1683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1727_1834
842238	contig_6710_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_98056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653743	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
842239	contig_2125_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_147742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGAAAAGGCAGAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678668	676866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_676900_678700
842241	contig_9177_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_32824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATCGAATTGTCACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706236	1705706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1705700_1706200
842242	contig_4730_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_71699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACTCTAACCATGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85812	84828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_84800_85800
842243	contig_9921_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_23737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATTTCTAAACAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188103	187663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_187700_188100
842244	contig_7843_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_152059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGGTGAGATGAATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570773	571424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_570800_571400
842245	contig_11594_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_80941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTATACTTCAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566717	568819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_566726_568183
842247	contig_2403_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_71016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCTTGTCTCACTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163620	164622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_163600_164600
842248	contig_4125_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_25230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTAAAGATTTTGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1786213	1787643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1786200_1787600
842250	contig_10182_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_134620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCCTGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320167	321289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_320200_321300
842251	contig_16831_pilon	+	1766	8	Intergenic	novelGene_134787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	6.46813224152673	17	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	79	1242	265977	307222	FALSE	40	ATAACCAGAAACTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKQKIQEAQLANPEVPLGSAEQFLLMLSSISELSARLHLWAFKMDYETTEKEVAEPLLDLKEGIDQLENNKTLGFILSTLLAIGNFLNGTNAKAFELSYLEKVPEVKDTVHKQSLLYHVCTMVVENFPDSSDLYSEIGAITRSAKVDFDQLQDNLCQMERRCKASWDHLKAIAKHEMKPVLKQRMSEFLKDCAERIIILKIVHRRIINRFHSFLLFMGHPPYAIREVNINKFCRIISEFALEYRTTRERVLQQKQKRANHRERNKTRGKMITDSGKFLGSSPAPSSQPQGLSYAEDAAEHENMKAVLKTSSPATEDATPVLGVRTRSRASRGSTSSWTMGMDDSPNVTDDAADEIMDRIVKSATQVPSQRVVPRERKRSRANRKSLRRTLKSGLTPEEARALGLVSTSELQL	265898	307746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_266055_267747_267868_268736_268899_273841_274033_276360_276554_282212_282388_290919_291082_307139
842254	contig_14679_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_174195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322038	322816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_322000_322800
842256	contig_9582_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_106831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTACACTTGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371749	370820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_370800_371700
842258	contig_5050_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_110254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	343	861	271741	271223	NA	75	AAATAAAAACCAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGFARATFGKAEFVSELGACRVDCSGVDSAGGIAGLRRTWWAGVARMHLAVVRMLVGGGSCVDRKCLRTCAMPYGRESPVGRASLSVALLPESPSALSVALPRCSSRPGSTPIPSPSWGTITLSDQPLGPQPLAPPVLPWMPLASLCPNPGGLSGGGAPRRPSRSPASFGC	272083	270632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_270600_272100
842259	contig_15084_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_116698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACAGTGCCTAGAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222957	222305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_222300_223000
842260	contig_10734_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_51250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAACTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256908	1258060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1256900_1258100
842261	contig_8702_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_157735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTCCCACTACTAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69470	69090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_-_69100_69500
842262	contig_9895_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_144709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACTCATGTAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441079	442630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_441100_442600
842263	contig_11498_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_65503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGATACCATCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148587	149337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_148600_149300
842264	SIRV4	-	322	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTGCCACAAGCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2743	2421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2400_2700
842265	contig_13074_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_153448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTATCCCTAGGTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546046	544818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_544800_546000
842267	contig_9099_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_149896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAACGTAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273338	274760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_273300_274800
842268	contig_13992_pilon	-	841	7	Intergenic	novelGene_147655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	205.340706036469	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	211	687	660046	655415	FALSE	45	TGAAGACTAAATAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRTRRWEEAKKEKELAEAKIQKILKERDQLTADLNSMEKSFSDLFKRLEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYILRIEKESQRYQALKAHAEEKLSLANEEITQVRSKAQAEALAFQASLRKEQMRVHSLEKTIEQKTKENDELTRICDDLISKMEKI	660871	655260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_655481_655816_655938_656167_656275_658801_658963_660024_660102_660361_660467_660821
842269	contig_5227_pilon	-	1368	13	Intergenic	novelGene_175908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	869	1366	8432	1561	FALSE	40	CTGCAAGACAGCAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAESLHTHVLHPKFICRFFDHFPQILLQGNVHGLKLLFYLFQWKTHVRQELLEPLLAMHRPELEPGGGVARVAEAVVERPVLVEGQAEVVLEGDPCAVNREGVLLVLIPVVVPGHVALQDANVSHVFHLGDLVLNPLVRQSHDGPHSMSFRSLDIIHAKSNITMA	23014	1558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5227_pilon_-_1620_3567_3619_4975_5096_7169_7301_7584_7683_8393_8555_12885_13026_13117_13204_14133_14252_15952_16074_19434_19507_21075_21147_22876
842271	contig_13348_pilon	-	841	9	Intergenic	novelGene_162684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	15.9667623518358	661	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	22	645	296331	187700	FALSE	10	CGGTGGCCATCTCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVLDLGEERRRGSATSGPKMGRRAQLESAQTENQLSGKNSSLTLTGEAPPPKPPRRQGGWADDSMKATKFGRKASEEIEDHRLRQHSLDGSDDGGDIPVIPDLEEVQEEDFVLQVAAPPSIQVNRVMTYRDLDNDLMKYSAFQTLDGEIDLKLLTKVLAPEHEVREADVSWDWDHLYTEVSSELLTEWDQLQMEKEDPVGQPRQP	296352	187503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_187820_187987_188051_188576_188653_188910_188984_214781_214829_215784_215818_263502_263568_292757_292851_296277
842272	contig_7593_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_127284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATAATTACAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72192	71316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_71300_72200
842273	contig_10549_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_110649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAATGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527241	528444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_527200_528400
842274	contig_10093_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_147514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	235	600	126440	126805	NA	10	TGATTTTTCTTGATGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTCIERTTGTRKRDTQVHTLEFLSEVEGHHQRLLQTPFWELTGILSCRPRESLPVQPKSIPDPYLKSDCHRFMSSSVSRNVVAMAFCYRLSLSDLSLIIHCGDRYPNFPPRHSLKFVLR	126205	127575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_126200_127600
842275	contig_498_pilon	-	1589	10	Intergenic	novelGene_148563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	6.76775214792936	54	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	86	1156	850675	779634	FALSE	10	TGGTGTCGTTCTGATTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEILHGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGDTATFDVSVEAWSCPSRQAEHRFTLFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTGISSCQAKDGQICSDRGRCICGQCQCTEPGAFGETCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPAGNQTCHNYCKDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTTQDCVMLFTYAELPSGKTNLTVLKEPECGTAPNAMTILLAVVGSILLIGIALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFSFNKFNKSYNGTVD	850760	779200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_779730_780708_780876_782247_782368_786470_786575_796565_796789_820805_820862_821167_821236_840436_840572_848526_848617_850663
842276	contig_5566_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_153677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	99	449	212904	212554	NA	60	TTGCTAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGESTSAVLSGFVLGALAFQHLNTDSDTVSRGCEAGSLVAAEEAWRTASFPPAAVGTSSRSSPGPRPPTFSPTPTLYPTVSTCALFLRVLDVPSAAKVFPKISPPSFNLYFCSPT	213002	211956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_212000_213000
842277	contig_14829_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_163818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107101	106338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_106300_107100
842280	contig_14333_pilon	+	1066	5	Intergenic	novelGene_49112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	232.028419595531	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	176	556	367143	398710	FALSE	65	CTTAGGGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYVDRQNRICGFLDIEENENSGKFLRRYFILDTQANCLLWYMDNPQNLAVGAGAVGSLQLTYISKVSVATPKQKPKTPFCFVINALSQRYFLQANDQKDLKDWVEALNQASKITVRMVPSPFWRE	353909	399220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_354062_367119_367284_387315_387373_397050_397100_398576
842281	contig_15596_pilon	-	753	3	Intergenic	novelGene_139555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	4.5	1150	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	95	334	225336	220490	FALSE	20	CTCACAGTGGTCGATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRCCLLAWTCGVELPFSALLTYPPRCAAGRMAHKQIYYSDKYFDEHYEYRHVMLPRELSKQVPKTHLMSEEEWRRLGVQQSLGWVHYMIHEPEPHILLFRRPLPKDQQK	225430	220070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_220543_221847_221976_225277
842282	contig_10058_pilon	+	684	4	Intergenic	novelGene_67706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	37.4165738677394	123	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAATCAAAGTCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54223	55520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_54474_54676_55030_55248_55330
842285	contig_5041_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_27048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTATTCAAAATAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503021	502762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_502800_503000
842286	contig_9937_pilon	-	1724	5	Intergenic	novelGene_129198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_4	27.3952550636055	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	282	776	59935	44127	FALSE	35	GTCTGTTAACAAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAFHSLVGLAAVLTCIAEYIVEYPHFATDAAANLTKIVAYLGTYIGGVTFSGSLIAYGKLQGILKSAPLLLPGRHLLNAGLLAASVGGVIPFMMDPSFTTGITCLGSVSALSAVMGVTLTAAIGGADMPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVAMNRSLANVILGGYGTTSTAGGKPMEISGTHTEISLDNAIDMIREANSIIITPGYGLCAAKAQYPIADLVKMLNEQGKKVR	61351	43178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_44213_45066_45227_57847_58028_59866_60028_61162
842288	contig_9653_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_48232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	95	424	621925	622254	NA	15	TGTAGGGGGGTGGGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLWESTQHQHLTTTATPLPCQWGHDEDVISGFSFFFGLSVPAFSASHRSPSVLTLLPTPPTLRLFSQEPHMCTEHPQGKVFALVAGCTEVSRTRSLLQQPQPSLRLL	621830	622291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_621800_622300
842289	contig_16930_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_139141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAGGAAGTTAGATCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32122	30141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_30100_32100
842290	contig_5758_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_119123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTGCATCGTGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540567	539245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_539200_540600
842291	contig_6434_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_61905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGACCCCAGCCACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915292	917107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_915300_917100
842295	contig_9940_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_125362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGGAAGATAGAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270078	270428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_270100_270400
842297	contig_13740_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_34741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288663	289526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_288700_289500
842298	contig_5765_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_141403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGAGGACTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740458	742430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_740500_742400
842299	contig_8461_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_163911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTTAACTTTAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81528	82106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_81500_82100
842300	contig_7630_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_133634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGTTGAGGCAAACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387427	386736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_386700_387400
842301	contig_348_pilon	-	1268	5	Intergenic	novelGene_67622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	60.0973169118223	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	470	802	347679	346839	FALSE	15	TTTGGGCGAGAACGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGRASAQYSEEEDTDTEEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMDGMTEEQKEHEAMKLVNMFDKLSRHQVIQPMSISPCGHLTSLQDAMGQTMEGQLSSDPDSDPDSDPD	349248	346372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_346972_347234_347355_347599_347952_348039_348136_349147
842303	SIRV6	+	506	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2310	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
842304	SIRV6	+	406	2	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	3	7974	3	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
842305	SIRV5	+	329	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-26	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGACGTCCTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8289	10966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8456_8586_10858
842306	contig_18272_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_6999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCCAAAAAAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133208	132267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_132300_133200
842307	contig_19564_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_29692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTCGGCATCGCGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127454	128365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_127500_128400
842309	contig_12278_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_152604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGGGCTCTCCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231687	232266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_231700_232300
842311	contig_5201_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_82163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATTGATTGGCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201082	202254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_201100_202300
842312	contig_6375_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_72944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGAACGTGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35614	36969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_35600_37000
842313	contig_1706_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_155034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAACCAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16578	16165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_-_16200_16600
842314	contig_4732_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_75489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTGAGTGGTGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752101	750632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_750600_752100
842317	scaffold_13505_pilon	-	1019	3	Intergenic	novelGene_111654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.5	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830507	825656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_825854_826341_826531_829874
842318	contig_5020_pilon	-	610	2	Intergenic	novelGene_27928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGGAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156271	136351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_136485_155794
842319	SIRV6	+	311	2	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	98	7974	-89	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2383	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
842323	contig_13004_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_112643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGGCAACAGTATACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411005	410395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_410400_411000
842324	contig_9633_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_139590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGAAGACAGCACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27247	26727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_26700_27200
842328	contig_8848_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_140467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGCATACTTTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327514	328530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_327500_328500
842329	contig_13697_pilon	-	1478	12	Intergenic	novelGene_165949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	6.01238391410416	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	177	1040	679453	671787	FALSE	5	CCCATCCTGGCCTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRVVYQDLQPVGSGAYGAVCSAVDSRTGARVAIKKLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMHHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGADLGKLMKHDKLSEDRVQFLVYQMLKGLKYIHGAGIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARQADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWRHYTQTVDVWSVGCIMAEMISGKTLFKGNDHLDQLKEILKVTGTPPAEFVQGLQSTDAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAAEALAHPYFEALHEAEDEPKAQKYDNSFDDVKRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPQQLGSRVSKETSL	679724	671348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_671867_673737_673912_673988_674068_674138_674219_674357_674430_674583_674699_675153_675202_675436_675467_675799_675912_677043_677103_679438_679569_679663
842331	contig_2069_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_23293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGATAGGCCTGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370318	371549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_370300_371500
842332	SIRV6	+	280	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10521	25	1284	-23	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
842333	contig_8628_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_164405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTGTGCAAGCATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363503	364309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_363500_364300
842334	contig_19098_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_65870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAGAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496452	497260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_496500_497300
842335	contig_10341_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_47259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAACTGCGAAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406417	406860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_406400_406900
842336	contig_3068_pilon	-	1398	2	Intergenic	novelGene_137640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	778	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACCACTGCACCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255611	253278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_253937_254871
842338	contig_18967_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_165324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATTAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92034	92319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_92000_92300
842341	contig_5954_pilon	+	726	5	Intergenic	novelGene_28526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	318.386851958431	832	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	284	706	465084	467077	FALSE	25	TGAATGAGGGTCACGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVCVVGGAESSASHPICA	463452	467097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463667_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893
842343	contig_16882_pilon	-	469	4	Intergenic	novelGene_148205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4752	junction_1	326.104277800829	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3	437	187621	181967	FALSE	20	TATTCTGTCTTAGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	187623	181934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480
842348	contig_7707_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_72187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587258	585657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_585700_587300
842349	contig_8671_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_126264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAGGTTGTTTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515448	514083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_514100_515400
842350	SIRV6	-	328	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGCTCCTGCTAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10808	2747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2877_7808_7923_10723
842352	contig_1331_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_37881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATAGGCGTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430490	431542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_430500_431500
842355	contig_10058_pilon	+	722	3	Intergenic	novelGene_67705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	46.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTCTTGGAAGCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54222	55528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_54474_54676_55084
842357	contig_15991_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_70939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGAAGTGATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119355	118850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_118800_119400
842359	contig_10642_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_78706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTAATATACCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853704	853240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_853200_853700
842363	contig_211_pilon	-	989	7	Intergenic	novelGene_129853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	98.0143130137408	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGAATTTATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87651	77452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_77844_80549_80600_81082_81181_82183_82284_86086_86238_87063_87175_87563
842364	SIRV7	+	289	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56041	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56111_70876_70987_78840
842367	contig_16525_pilon	-	319	3	Intergenic	novelGene_133846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2163.5	24	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181459	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178512_181431
842368	contig_7513_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_88948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGAGGTCTCCCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144063	143484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_143500_144100
842369	contig_6241_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_156419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTAATTGATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205513	204826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_204800_205500
842370	contig_5954_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_28456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	44	361	121104	120330	FALSE	35	TGGTCTATGAGAACTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAASGLGPGSGPGDSPEGPEPEAPERRRKAHGMLKLYYGLSEGETAGRPPGSDPLDPIDLNGAHFDPEMYLDKLRRECPLAQLMDSETDMVRQIRALDSDMQT	121147	120328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_120420_120876
842372	contig_5019_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_109172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGAAATTATACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44013	43498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_43500_44000
842374	contig_11356_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_175271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTTTCTTTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422466	421896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_421900_422500
842375	contig_19237_pilon	+	901	4	Intergenic	novelGene_162953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	72.7614061314253	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	64	474	23905	39457	FALSE	60	CAAAAATGAAGATGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQRRSPCYPGRAPVGSSRRKMAAAAELLLLEKSLGLSKGNKYSAQGERQIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVKQANKEYLLGSTPEEKAVVQQWLEYRVTQVDGHASKDDVRTLLKDLNLYLEDKVYLTGYHFTLADILLYYGLHRFIVQYILVVF	23841	39884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_23992_28458_28660_35765_35862_39430
842377	contig_11448_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_66380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352358	351040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_351000_352400
842379	contig_10861_pilon	-	803	3	Intergenic	novelGene_39204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	8	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTCATTTGAAGTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432339	376390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_376849_377941_378039_432091
842380	contig_8636_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_141911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCTGAGAAAAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363345	364302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_363300_364300
842381	contig_3612_pilon	+	1339	6	Intergenic	novelGene_87820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	102.803890976947	28	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	179	1126	955615	978135	FALSE	30	TGAATTAGCTAATGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEHYLEPRVKLCEALERYGLNTEDFFVLNHGESRYLNTDSENVK	932463	978348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_955598_955909_965350_965667_965903_965998_969734_969850_978006
842382	contig_7345_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_159183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCAAAAAAATTGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257235	256723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_256700_257200
842383	contig_10814_pilon	+	468	2	Intergenic	novelGene_176858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	226	468	204883	225571	FALSE	15	GTGAGGGTCTGGGTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSARNLHPTAQPPHLTQLGCWGNSVPSCFLTDPLQAQGTTGQQGLPQGTSTAAGHEHSQAPSLIGPSLPTSHTTTMRSAWMLLACCCVVLSAMEGLSRDFCLQNLNSSVKPGFPKTIKTNDPGVLKAARHTVERFNNCTNDIFLFKESHVNRALVQ	204657	225571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10814_pilon_+_204953_225398
842386	contig_1516_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_49919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGTAAATCTTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84797	86798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_84800_86800
842387	contig_8260_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_163250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAGGAAAAACACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171551	172351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_171600_172400
842390	contig_11933_pilon	-	1421	4	Intergenic	novelGene_107271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_3	68.0506347427332	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	164	568	269902	207760	FALSE	50	ATGAGCTTGATAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLSDTLKKLKITAVDRTEDSLEGCLDCLLQALAQNNMETSENIQGSGTLQLFANLLTPQSSCTAKVANIIAEVAKNEFMRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSRKYYHINNTLKFFV	270065	206906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_207930_214256_214380_245558_245667_269898
842391	contig_8273_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_113084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAACTACAGACTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109224	107662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_107700_109200
842392	contig_7898_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_47628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTAATTGTTGGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688152	686195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_686200_688200
842393	contig_12000_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_43200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCTGAGTGTAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618742	619117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_618700_619100
842394	contig_14546_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_157426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGGGTTAAACGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184338	183541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_183500_184300
842397	contig_10331_pilon	+	1458	12	Intergenic	novelGene_54108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAAAGGAAAGGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304625	333044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305224_309477_309600_311135_311285_312015_312173_312584_312689_318101_318166_318788_318878_320112_320200_321431_321525_325324_325414_332861
842398	contig_11702_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_142025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGGCTGTCTTAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599251	599837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_599300_599800
842400	contig_7083_pilon	-	1682	7	Intergenic	novelGene_125169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTCCTGAGGTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319190	277141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_277255_280249_280395_281729_281879_307328_307463_308751_308854_310781_310954_318323
842401	contig_3081_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_133935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACATATATAGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213580	214817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_213600_214800
842402	contig_3956_pilon	+	649	2	Intergenic	novelGene_15291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	170	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTCCTTCTGAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410215	1422291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1410281_1421707
842403	contig_2817_pilon	+	1704	5	Intergenic	novelGene_104343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	82.8624613440851	3	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	393	398	289958	289963	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITELERRIQESAEQIEAKDNKITELLTDVERLKQALNGISQLTYTCASPSTRQSQLVETLQRQVESLQQQLADTDRQHQEVIAIYRTHLLSAAQVKNCFSFGKEIILENCFLFLYCFSRKNFFFLFASKFM	284597	292645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_284663_287013_287167_289783_290403_291256_291428_291949
842404	contig_6556_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_168502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCCTGGTAGGGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332411	331411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_331400_332400
842405	contig_14755_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_129402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAACAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997594	998843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_997600_998800
842407	contig_11896_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_87987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGTGTGCCCATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12748	11856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_11900_12700
842408	contig_11016_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_163298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACAGAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189013	187844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_187800_189000
842411	contig_12128_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_131999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGTAAAATGAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556723	555889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_555900_556700
842412	contig_7171_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_101287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCCAGCAGTGAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050180	1050623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1050200_1050600
842413	contig_15422_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_173106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	79	423	32676	32332	NA	15	GATGCCGTGTATCAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVREGAGSLGQLWVFQGDGCSWVRSLWKLVSGCFVLSPQMSEGVCLEGRIKGGLRGIALASEIIVPTQREDTRAIILPCCQAKFLQTHGRAVCTSRNPILCPNKYSMKIGLLP	32754	31849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_31800_32800
842414	contig_299_pilon	+	1240	10	Intergenic	novelGene_129458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	189.285205150558	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	596	1240	991509	1008362	FALSE	35	CCACGACTACTTAGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIKLIKDKRRDVTFRNIGIITHYKAQKMMIQKDLDKEFDRKGPAEVDTVDAFQGRQKDCVIVTCVRANAMQGSIGFLASLQRLNVTITRAKYSLFILGHLRTLMENQHWNHLIQDAQKRGAIIKTCDKNYRHDAMKILKLKPVLQRSVTHPPAIAPEVARPQGDLPSNKLDSGLAKTSYSSSLCHSPFDSREATVPVTSKDPERPPVQDRLRD	981111	1008362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_981160_982238_982311_984211_984362_985542_985613_988256_988385_989175_989269_991474_991640_994862_994962_1003995_1004084_1008035
842415	contig_5779_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_106537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGACGTCACTCTGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352883	353402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_352900_353400
842417	contig_9875_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_154411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137702	138726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_137700_138700
842418	contig_14068_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_165956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCCTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15313	13849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_13800_15300
842419	contig_8273_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_113093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGATTTTCCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356921	355257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_355300_356900
842422	scaffold_17542_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_139228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCACTGCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338350	337595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_337600_338400
842423	contig_10023_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_123481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159789	160709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_159800_160700
842424	contig_4223_pilon	+	860	6	Intergenic	novelGene_117263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_2	3.54400902933387	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	44	625	138071	146912	FALSE	10	CGTTTGAGTGTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFTHRVGSSIGLEMPVWGGGNKCGSCGRTVYHAEEVQCDGRSFHRCCFLCMVCRKNLDSTTVAIHDEEIYCKSCYGKKYGPKGYGYGQGAGTLNMDHGERLGIKPESVQPHSPTTNPNTSKFAQKYRGAEKCSRCGDSVYAAEKIIGAGKPWHKNCFRCAKCGKSLESTTLTEKEGEIYCKGCYAKNFGPKGFGYGQGAGALVHTQ	120730	147147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_120773_138069_138183_141375_141545_145354_145485_146164_146259_146835
842426	contig_12837_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_57399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTCTGCCCTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444670	446146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_444700_446100
842427	contig_12689_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_145034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGAGATGATCTCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45742	46663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_45700_46700
842428	contig_6299_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_172929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTTAAGCTCAAGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431660	433066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_431700_433100
842429	contig_6497_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_35627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCGTTTAGACAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704010	702581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_702600_704000
842431	contig_20223_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_177226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAAAGAGTTCATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26919	26701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_-_26700_26900
842432	contig_12790_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_35296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTACCTTGTTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549677	550180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_549700_550200
842433	contig_10523_pilon	-	813	7	Intergenic	novelGene_120927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.382466606375	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	66	746	26656	12800	FALSE	5	TTGCCAGGTTGTGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIRRQREMT	39181	12732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_12824_15111_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_39162
842434	contig_16122_pilon	-	790	7	Intergenic	novelGene_134497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	177.615142622719	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	35	607	110548	104499	FALSE	35	TAAAGATTTAGACGTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSQLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNISLSSSMSSLVHQTLSAPLRLSCDRSYSMWSQHRV	110582	104315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_104878_104996_105116_105255_105407_108757_108867_110332_110368_110497
842436	contig_15365_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_111133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGGGGATAGAGGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80094	78824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_78800_80100
842437	contig_11115_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_102777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	34989	34687	NA	40	TTTAAAAGGAGTCCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPQVQGAHPRTAGRGAGRDHSACVVPPSSWVPHQSVSAQGCCSPPAPLSVTAHGTGLAFWRTQDLARITCIVGIFLSLLPPIKRRVKLVCRISNPGSASR	34991	34110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_34100_35000
842438	contig_14326_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_120750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	775	1074	541394	541095	NA	70	GAAAAAAAAAAATGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGGMSDLCLIGIRLGLFILFLLLLCEVRGGQTLPSCHFYTLSKRIFQNKNNRYKLNYTNLTKCKRCKYHKVEDWQPGKEKAVKYLHERYLKLITER	542168	541088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_541100_542200
842439	contig_91_pilon	-	1425	2	Intergenic	novelGene_127137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1081	1419	1139800	1139462	FALSE	40	AAAACCAAACCCACTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSILPSFLRFTVPTLGILSLQPFNKCGSLVAKTVVQSLASNAAQITHTGCVMPINPSLPLLSLFSYITFYIRPTRTGPNVSHTVMMNVSALWPKKSLETCLLLNIFLLKLG	1142672	1139455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1140418_1142209
842443	contig_11375_pilon	-	1716	5	Intergenic	novelGene_152649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.93700393700591	31	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	139	588	39287	37738	TRUE	5	GCTGTGAGTTGGGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESPEDLVSLDFPLNVRKGHPLLVAVKILRPDATKNARNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMITDYMENGDLNQFLSAHQLEDKVAEGSPGDEEAAQGPTISYPMLLHVAAQIASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRAVLPIRWMAWECILMGEVHDCE	39670	36494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_-_37495_37609_37762_38390_38626_39096_39316_39560
842445	contig_17157_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_171740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11281	10063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17157_pilon_-_10100_11300
842446	contig_15034_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_143637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	103	315	40004	40216	NA	20	CATGAGTTCCCTATGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNFLPAPKATKTNTPILLLVTELRLGVVVVELVVMGIKNKTKQNLSSLNARLPILLMNESLLNELGLKAALVWKRHPRPGYFIHSKFISFIQQIFVLIVGQVLC	39901	40876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_39900_40900
842448	contig_5083_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_151625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGTATTTCTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62112	60971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_61000_62100
842449	contig_8330_pilon	+	740	2	Intergenic	novelGene_71730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	205	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAGGACATGTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456900	460293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_457079_459731
842451	contig_6446_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_149184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGAAAAACCTCTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195352	194080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_194100_195400
842452	contig_1804_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_177415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200135	201151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_+_200100_201200
842453	contig_13021_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_8102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGGCTTAAGCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99537	98018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_98000_99500
842454	contig_10196_pilon	+	921	5	Intergenic	novelGene_132183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.90512483795333	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	21	530	1083820	1084734	FALSE	35	TGACAGAGTGAAGACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATVAIMICLVLSIFANLFPAGCTGVHERTFVAVKPDGVQRRLVGEIVRRFERKGFKLVALKLVQASEELLREHYSELRARPFYGRLVRYMGSGPVVAMVWQGLDVVRASRALIGATDPADASPGTIRGDFCIEIGKNVIHGSDSVESARREIALWFHADELLCWEDSAAHWLYE	1083799	1085125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1083866_1084014_1084146_1084212_1084315_1084386_1084500_1084616
842455	contig_9239_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_137206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTCTAGCCAATTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265927	265193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_265200_265900
842456	contig_13097_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_107729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATGAAAACAGCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224734	225336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_224700_225300
842457	contig_4797_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_6924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACCAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577569	579541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_577600_579500
842458	contig_11994_pilon	+	1064	8	Intergenic	novelGene_129354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.8614630019414	1	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	477	1064	100357	107249	FALSE	40	ATGGAAATGGATGTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARRDPLPIVPFGLAAFAATLFALGLAIGTTIAVGMLFFIQMKTILRNKTSIESWIEEKAKDRIQYYQLDEVFVFPYDLGSRWKNFKQVFTWSGVPEGDGLEWPIREGCHQYTLTIEQLKQKADKRVRSVRYKVIEDYSGACCPLNKGIKTFFTSPCTEEPRIRLKKGEFILATRGLRYWLYGDKLLDDSFIEG	95091	107249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_95436_97358_97451_100316_100486_102990_103045_104968_105137_106206_106249_106963_107110_107200
842459	contig_7513_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_88929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCTTAAGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12881	12545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_12500_12900
842460	contig_13097_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_107692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	313	942	94	1035	174003	173062	NA	60	AAAAAAAAGCATCAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGVLSFTQQVWEQVLAKMKRALVYLDAACAESLHWGCGSTRLLEAVGSPACHLREFEPDAAGGGAEQPKAVFVLSCLLKGRTVETLRDIIRRSHFQYCVVVTAVSHAVHLTANHVPAAAAAELEGQQPVFEQLEEKLCEWMGNLNYTAEVLHAPLLLAPVAPYLALTPSFASLFPLLPQDVHLLNSARPDKRRMGSLAEVDATALTPELLLQIRCLVSGLSSLCEHLGVREECFAVGSFSRIIASDLANYAPAKNRRKTASGRASVVFVDRTLDLTGKWHCCRVLHNHLQGAGTFTDSAYDLLDSYVMLG	174096	172915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_172900_174100
842461	contig_10324_pilon	-	1169	3	Intergenic	novelGene_7794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131616	128753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_129524_130121_130231_131326
842462	contig_6654_pilon	-	1612	4	Intergenic	novelGene_85719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_3	95.6114823415868	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	830	1138	469036	279279	FALSE	25	CCAGGATGCCTTTAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKEYRICMPLTVDEYKIGQLYMISKHSHEQSDRGEGVEVVQNEPFHDPHHGNGQFTEKRVYLNSKLPSWARAVVPKIFYVTEKAWNYYPYTITEYTVSFI	469865	278804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_279302_281038_281128_307583_307733_468988
842464	contig_7165_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_116881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721324	719970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_720000_721300
842465	contig_5039_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_64927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGTGTATGGATGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179379	1178092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1178100_1179400
842466	contig_6677_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_114233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTAAGTATATTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897333	899116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_897300_899100
842468	contig_4364_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_2977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
842469	contig_6453_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_177423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAAGTCTGTGAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24462	23062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6453_pilon_-_23100_24500
842471	contig_4339_pilon	-	1647	2	Intergenic	novelGene_146097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGTGTTTTTATTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131953	1130106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1131643_1131842
842472	contig_12728_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_155815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACAAGGTCCTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225398	226103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_+_225400_226100
842473	contig_7057_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_123188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGTAACAAAGATTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387180	386785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_386800_387200
842476	contig_5988_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_16168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGACATGATTTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2072516	2073650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_2072500_2073600
842477	contig_5260_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_144375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	519	911	298688	298296	NA	25	CTATATGGTGAAGTGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSSEELPDLTRRDPTPCRPDWLRYTVRQAVAFGTCCSRSGETEQHSLLRPPEPVKSSTGSAKDKCMRLACHMDQKTPHLGRTSLPFTCRLPALHWVPGQLQRLSHPLGRKYDRSCALCHFPSLGEETN	299206	298081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_298100_299200
842478	contig_4202_pilon	+	497	4	Intergenic	novelGene_147068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	54.4140504730983	857	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTATTGTCTCTTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28798	40628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_28863_29851_29871_31725_31833_40321
842479	contig_3326_pilon	-	896	4	Intergenic	novelGene_170602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.7826889938944	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	84	758	214350	212417	FALSE	25	GGACAAGGGATAGTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILWGGVLALLPLLLLSLLGVSWAESSCSGYPAIPGIPGIPGAPGSDGNPGTPGIKGEKGLPGLAGDHGEFGEKGDPGIPGNPGKVGPKGPIGPKGSPGPPGARGPKGESGDYRATQKIAFSVLRNIHTPLRRDQVIRFDQVITNENHNYEPRNGKFTCRVPGLYYFCDYVHNTFQVTTGSVVLKLDQGENVFLQATDKNSLVGIEGANSIFSGFLLFPDIEV	217537	212278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_-_212588_212668_212992_214169_214374_217477
842480	contig_5394_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_172742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGTGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40919	42407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5394_pilon_+_40900_42400
842481	contig_16098_pilon	+	682	2	Intergenic	novelGene_45927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTAATGTGTCAGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345415	346187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_345557_345646
842484	contig_2547_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_165459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	8	427	15916	15497	NA	25	CTTGGATCTATAGGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEKCVIIFFNCTSLLISEIVPCYELNCAPQKVCVVNPCLYVCGYNPIWEWVVFVMLKRQDQCRVCLESISFEIEKRLNELQVSKQREGETDAKIHADLQGTRKQKLNRQGPSPGANRDRQPFLRAGILNLDFWPPKL	15923	14987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_15000_15900
842485	contig_8598_pilon	+	1509	9	Intergenic	novelGene_22891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCTGTCTGTCAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127602	147729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_127938_128204_128306_142248_142383_142526_142845_144293_144455_145483_145668_147143_147278_147471_147599_147714
842488	contig_13863_pilon	-	943	9	Intergenic	novelGene_41999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCACACGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74800	64394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_64710_65651_65756_67573_67597_68690_68750_69377_69451_70288_70372_70467_70553_73200_73318_74716
842490	contig_4891_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_124609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047309	1046774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1046800_1047300
842494	contig_12810_pilon	-	1445	6	Intergenic	novelGene_145701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	7.34846922834953	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	67	1020	436609	345609	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPELWIHLAVVACGNRLEETLVMLKSAVLFSHRKMQFHIFTEEALKPEFDKQLRQWPDSYTKKFEHRIYPITFSVGNPQEWKKLFKPCAAQRLFLPVILKDVDSLLYVDTDVLFLRPVDDIWKLLRHFNSTQLAAMAPEHEIPKIGWYSRFARHPFYGAAGVNSGVMLMNLTRIRSTQFKNSLIPTGLAWEDMLYPLYQKYKNAITWGDQDLLNIIFYFNPECLYMFPCHWNYRPDHCMYGSNCKEAEREGVSVLHGNRGVYHNDKQPTFKALYEAIRDFPFQDNLFQSMYYPLQLKFLETVHTLCGRIPQVFLKQIEKTMKRVYEKHIIFHVGPNRMH	436675	345183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_345792_352138_352312_364605_364730_368082_368335_421866_421999_436519
842495	contig_152_pilon	+	635	5	Intergenic	novelGene_162642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	238.508254574134	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722943	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_724850_724951_726442_726498_729388_729514_731414
842496	SIRV6	+	471	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	15	-1	15	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	556	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAAGTCAAGCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1152	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
842498	contig_12021_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_172199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144334	145616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_144300_145600
842499	contig_9415_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_109791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATATAGAATATCACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674672	1674171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1674200_1674700
842500	contig_5954_pilon	+	886	4	Intergenic	novelGene_28464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	135	443	162161	162952	FALSE	30	TGAAACAAGTCCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRSFLQAAQQDLRALLEQHNIDLGPLVSAVEKFEEAAAALNQRMLALKEGSPDPLQVRMFNDQLMLLERAFLNPRAFPEERYYSHVLWAPRTGGVATFPGLANACSRANNTAPGSAAWAEVQQQLSIVVTALEGAAATLRPVADL	161952	163395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_162028_162101_162190_162292_162386_162765
842502	SIRV6	+	409	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	352	6	186	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGTCACAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489	2114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
842503	contig_1982_pilon	-	1089	8	Intergenic	novelGene_151321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	163	junction_7	240.621474265185	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	232	1089	242049	180483	FALSE	35	TCTACCCAGCAAGTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIIKKQILKHLSRFTKNLSPDKINLSTLKGEGELKNLELDEEVLQNMLDLPTWLAINKVFCNKASIRIPWTKLKTHPIALSLDKVIMEMSTCEEPRAPNGPSPIATASGQSEYGFAEKVVEGITVSVNSIVIRIGAKAFNASFELSQLRIYSVNAHWEHGDLRFTRIQDPQRGEVLTFKEINWQMIRIEADATQSSHLEILCAPVRLITNQSKIRVTLKRRLKDCNVIATKLVLILDDLLWVLTDSQLKAMVQYAKSLSEAIEKSTEQRKSMAPEPTQSSTVAP	242280	180482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_180501_185020_185192_186492_186634_187414_187605_194556_194649_196595_196635_198695_198859_242005
842504	contig_8616_pilon	+	1014	8	Intergenic	novelGene_72532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_7	32.163485444186	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	137	802	397975	399658	FALSE	0	GGCTTCCCTGTCCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHALAWSIDLKETGLCADFHPSGAVVAVGLNTGRWLVLDTETREIMSDVTDGNEQLSVVRYSPDGMYLAIGSHDNMIYIYSVSSDGAKSSRFGRCVGHSSFITHLDWSKDGNFIMSNSGDYEILYWDVAAGCKLLRNRYESRDREWATYTCVLGFHVYGVWPDGSDGTDINSLCRSHNERVVAVADDFCKVHLFQYPCARAKAPSRIYGGHGSHVTSVRFTHDDSHLISLGGKDASIFQWRVLGAGPAPATPSRTPSLSPASSLDV	396795	399870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_396830_397444_397513_397940_398030_398100_398199_398298_398387_398874_398974_399251_399383_399463
842505	SIRV3	-	223	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	392	2	392	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTTTATTTGTATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
842506	contig_17144_pilon	-	289	3	Intergenic	novelGene_29120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGAGGAGGGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11727	9207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_9330_10021_10113_11651
842507	contig_7202_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_18822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCCAGAACTACAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30113	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_29900_30100
842508	contig_10811_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_165777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAAACATACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5732	4170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_4200_5700
842509	contig_10627_pilon	-	880	4	Intergenic	novelGene_60016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_1	4.49691252107735	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	74	658	402038	380385	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTRVPPAASGCGPGPHCGPSAATMSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVMMLCLFSFPHMLSRPSR	402111	380162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_380561_380960_381073_381786_381946_401900
842510	contig_5485_pilon	+	1392	2	Intergenic	novelGene_37725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAATATGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257547	258983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_258560_258603
842511	contig_2552_pilon	-	1298	4	Intergenic	novelGene_139009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	20.9920619917784	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	47	547	99596	91662	FALSE	15	TATGTGTATGCAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHLIQAYTSPELLPMRPWRSNKSSFGKNTAKSDTDWTEGSENEDSDASPKPTGTSIKTLTEKVEKTVSNPRNVNKPFGGINVAEAFIKKEVQEELKCADVDDDDWDISSLEEEKSLGKRTEKDRKEPPVVKNEPNSTHVASAWGASNPNEPKGEGLQENESSTLKSSLVTVTDWSDSSDV	99642	90910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_-_91742_94036_94212_94949_95081_99481
842512	contig_9185_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_166899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTGAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297269	295991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_296000_297300
842514	contig_6048_pilon	-	1055	5	Intergenic	novelGene_73211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	34.7589916424513	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	4	525	1538190	1527849	FALSE	0	GGCTCTGGGGTCTCGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMSSSFKKLHFSLTTEALSFAKTPTSKSMNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGIFRGDKWSCCHQKDKTDVGCDKTRSRVTLQEWNDPLDHDLEAQLIYRHLLGMEATLREKHRELRGATEASTVLEGPGPAPEDGLAQLFQVLEDLKKAHSSSPAAGPPLEHRNLLELQT	1538193	1527318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1527971_1528163_1528229_1531326_1531448_1532999_1533136_1538112
842517	contig_5779_pilon	-	607	5	Intergenic	novelGene_106539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	34.6509379382435	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	6	491	495508	425395	FALSE	55	TAAATAAAGTATAAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMSVKEVLQSLVDDGMVDCERIGTSNYYWAFPSKALHARKRKLEVLESQLSEGSQKHTNLQKSIEKAKIGRHETEERTMLAKELSSLRDQREQLKTEVEKYKECDPQVVEEIRQANKVAKEAANRWTDNIFSIKSWAKRKFGFEENKIDKNFGIPEDFDYID	495513	425278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_425502_439814_439860_451774_451890_457335_457411_495364
842519	contig_8260_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_163234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATAGCCCAGCAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96946	96475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_96500_96900
842521	contig_6557_pilon	-	775	5	Intergenic	novelGene_33004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.60298815988049	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATATAATCTCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535405	533977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_534251_534487_534574_534657_534815_535012_535084_535217
842522	contig_13992_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_147616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATGAAGGTTTACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84750	84435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_84400_84800
842523	contig_12151_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_54984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGTTAGCTCCTACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991715	992717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_991700_992700
842525	contig_14915_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_174307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAGGAAAGAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105951	107337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14915_pilon_+_106000_107300
842528	contig_5145_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_131422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGTCTCCCTTGCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854431	854073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_854100_854400
842531	contig_12635_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_60846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAATATAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545949	545502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_545500_545900
842532	contig_4857_pilon	-	469	2	Intergenic	novelGene_48851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATACGATTTATTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334662	1331417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331550_1334325
842533	contig_19697_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_177424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	7.78888096369861	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	310	462	195065	194662	FALSE	0	CTGTGTGTGCGCGTGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHYSDERHSHGGPPERHSRDSRDGWGGYGPDKRLSEGRSLPSAPRGGRDWGEHSQRLEDHQDRAWQGSVDSSTAGRDHARWQGGGERGPSGPAGPGHVASRGGMSGRGGFAQGGHSQGHVAPADELEGGGLAGQDRGSSVPHPHPYPHFARRY	196711	194412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19697_pilon_-_194807_195057_195125_195272_195389_196577
842535	contig_3789_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_79867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCACCTGGAGTAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506415	506886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_506400_506900
842537	contig_11602_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_166592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATATTTTCCACAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155567	154426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_154400_155600
842540	contig_9177_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_32745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	566	1027	1135554	1135093	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKDCTMGSLMERELKPKMISRERAPTAWRSRKCGSTAVFCDCKWLCGGGAMYPSMEVHVHTHTCVTVCMLWVSAPHYLALNFPSNHGKWKWTATVTRKRAINNAFSFLLFLSPRSSFLTSFPFSLSFFFLSLPVSTFTIDLRWPTKQTVTCT	1136119	1135085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1135100_1136100
842542	contig_1037_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_84599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTTTTCTGTTTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218814	219939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_218800_219900
842543	contig_10904_pilon	+	610	4	Intergenic	novelGene_22590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	131.029258819039	1	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGTCCTCGGAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445353	454279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_445415_448343_448434_449228_449252_453843
842544	contig_15897_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_49559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATAAATGAATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692059	691515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_691500_692100
842546	contig_9571_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_136275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCAATGATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421563	421297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_421300_421600
842547	contig_13300_pilon	-	1173	2	Intergenic	novelGene_125787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	25	609	167148	157619	FALSE	25	GCACATGCGTCCCTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIKAPGTAMAIPQLLWIWLLAVGAWGWENRASHEVIAGLLEEIRFPMMLPMDLFELQFNMSLFRDHEPLFRKKVLQALEFHTVPLRLLAQYRGLNFSEDTYRPRLYMAPTWSASVSGNIQNSWLAEKSRRVASIPSTHTTLLTPRPPLTIDITPIDLSRHPSTPASSSTTCSSPGLSPTSPPSRAAGTTGSRVPPTRSLPWA	167172	157054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_158168_167112
842550	contig_18081_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_23764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCTTTAAATTATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39802	40247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_39800_40200
842551	contig_1861_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_77646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGACATAAAGAATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22027	23139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_+_22000_23100
842552	contig_10068_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_148714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACAGGGTTTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49663	49989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_49700_50000
842554	contig_6544_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_142111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTGCATTGAGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333032	334955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_333000_335000
842555	contig_14142_pilon	+	917	4	Intergenic	novelGene_120491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	18.1536650722535	117	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTTTTGTGCTGTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307860	309375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308467_308566_308669_309006
842556	contig_9708_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_67248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATACGTTGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19864	18900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_18900_19900
842557	contig_16411_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_77389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAACAGAAGAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382934	381944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_381900_382900
842558	contig_11293_pilon	+	1346	3	Intergenic	novelGene_134660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	29.5	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAAGATTTTCTGTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11610	14603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_11682_12758_12923_13492
842559	contig_5479_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_133585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGGATGCTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213793	214334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_213800_214300
842560	contig_16892_pilon	-	1135	8	Intergenic	novelGene_172713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	231.167489416798	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	67	1095	198210	187583	FALSE	0	CTGCGTTGGTGTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPPLLLLALGLLLGPAAALIRIPLYKFTSIRRTLSEVGVSVENLISKNPVSKYSQRGSAVAQGPVPEMLKNYMDAQYYGEIGIGTPAQCFTVVFDTGSSNLWVPSIHCKLLDIACWIHHKYDSAKSSTYVKNGTTFNIHYGSGSLSGYLSQDTVSVPCSSASALGGVKVERQTFGEATKQPGVTFIAAKFDGILGMAYPHISVNNVVPVFDNLMEQKVLEKNVFSFYLNRDPTVQPGGELMLGGIDSKYYKGPLNFIKVTRKAYWQIHMDRVDVGNGLTLCKGGCEAIVDTGTSLMVGPVEEITELQKALGAVPLIQGEVSTAGCWRWLSTAAALHCPPE	198276	187542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16892_pilon_-_187640_188660_188815_189216_189340_191166_191391_192986_193106_193558_193683_195550_195711_198142
842561	contig_11932_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_85436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTTAAAGTGCTCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504098	502806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_502800_504100
842562	contig_19459_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_59885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTATTAAGTTTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7122	6711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6700_7100
842563	contig_2799_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_85604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGCTGGAGGGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785829	785315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_785300_785800
842564	contig_6451_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_173699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGTATATGAAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89034	89468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_89000_89500
842566	contig_16948_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_166423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	501	1506	106	1611	416698	415193	NA	35	AAAGCCTTTGTCAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAFEKYGIIEEVVIKRPARGQGGAYAFLKFQNLDMAHRAKVAMSGRVIGRNPIKIGYGKANPTTRLWVGGLGPNTSLAALAREFDRFGSIRTIDHVKGDSFAYIQYESLDAAQAACAKMRGFPLGGPDRRLRVDFAKAEETRYPQQYQPSPLPVHYELLPDGYTRHRTLDPDLRVRDRTPPHLLYSDRERTFLEGDWTSPSKSSDRRNSLEGYSRQVRSRSGERWGGDGDRVMPKPWEERRKRRSLSSDRGRTTHSPYDERSRTKGGGQQLERGAERTPERSRKENHSSEGTKESSSNSLSNSRHGAEERSHHHHEAPDCSHGKKARDSERNHRTTEAEPKPLEEPKHETKKLKNLSEYAQTLQLGWNGLLVLKNSCFPTSMHILEGDQGVISGLLKDHTSGSKLTQLKIAQRLRLDQPKLDEVTRRIKQGSPNGYAVLLATQAAPGGPGTEGMHTVEPGLQRRLLRNLVSYLKQKQAAGVISLPVGGSKGRDSTGMLYAFPPCDFSQQYLQSALRTLGKLEEEHMVIVIVRDAA	416803	414892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_414900_416800
842567	contig_3081_pilon	+	1492	4	Intergenic	novelGene_133985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	1.69967317119759	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACCCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2953548	2988334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2953740_2977573_2977655_2979746_2979875_2987242
842570	contig_14497_pilon	-	1627	3	Intergenic	novelGene_177426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	2.5	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	2	481	19614	16083	FALSE	25	TTTTTCTAAGAACACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLHFNESVLELFLIFSASIQWSSWRKSLQESTDLPNFEDPQVFPASLHSACTSSSGFLTELFLLVLKEACHQRTKWTPRHIIFLKSRTPILIQKRLLGSEALTSPEAPSFLRAILLGWRLHISQALWSPNVETTKSGETSISAKTVSLLTPFLCYQGVS	19615	14936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14497_pilon_-_16173_16544_16737_19416
842572	contig_6375_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_73074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	71.8656153293539	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGAGTCTTTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744972	751714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_745211_750937_751031_751230_751316_751405
842573	contig_6266_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_171002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAAGATGTGGTAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805567	806209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_805600_806200
842574	contig_6266_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_171003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810220	809969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_810000_810200
842577	contig_10855_pilon	+	766	3	Intergenic	novelGene_124305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTGTGGTCTCTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303768	306668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_304035_306111_306143_306199
842580	contig_8089_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_177428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTTTGGGTCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3877	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8089_pilon_-_2500_3900
842581	contig_4732_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_75381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAGGCAAGCCACAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220195	221015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_220200_221000
842582	contig_15114_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_121214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAATTGACTTGTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967158	966323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_966300_967200
842583	contig_7171_pilon	-	787	6	Intergenic	novelGene_101198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	356.889002352272	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	394	714	40809	37493	FALSE	0	TGTGGTCCTTGCCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLWTIPSSMMRTPSGNMVCWLQPCCSSQASSSSPVANVDPCPNSVGIIAGESIRSGGRCPNGHPDTKLPHQLTVPSLLPPVIEPTEWCVYEAQPEREDRWNQSWD	50439	37419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37709_40626_40702_40779_40816_44868_44914_47474_47721_50343
842586	contig_11338_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_6323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGAGTTATAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253767	254676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_253800_254700
842589	contig_9481_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_149673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399078	398571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_398600_399100
842591	contig_17198_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_62348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAGAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673884	675160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_673900_675200
842592	contig_17198_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_62329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGGTTGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450242	449386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_449400_450200
842593	scaffold_17306_pilon	-	1128	2	Intergenic	novelGene_175324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	107	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	198	974	310209	309433	FALSE	25	TTATGTGGACATGACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLHKKAAAGQHARATVGHHPGSANMRKKKTFQKKQRGRPSSQPRRNIVGCRISHGWKEGNEPITQWKGTVLDQVPINPSLYLVKYDGIDCVYGLELHRDERILKLKILPDKVPFSRVRDVRLANTIIGKAVEHMFEGEHGSKDEWRGMVLAQAPIMKAWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPESSESPPAEREPEGVVDGLIGKHVEYTKEDGSKRTGKVIHQVKAKPSVYFIKFDDDFHIYVYDLVKKS	311120	309278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_310212_310925
842594	contig_15498_pilon	-	1306	4	Intergenic	novelGene_42618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.35702260395516	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	74	532	139303	126120	FALSE	50	AGAGGGAAGAAGGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STGRPLAPRQRCDRGTSDTVFSSGMKVITVLVVFVSCLMAPTQNSFWQFQRMVKHITGRSAFFSYYGYGCYCGLGGKGTPVDDTDRCCLAHDCCYEKLKQLGCQPVLNSYQFHIVNGTVACGCAVGPGVGCLCGLRACECDKQSVYCFKESLPTYEKNFKQFFSSRPRCGRRKLQC	139376	125345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_126290_135016_135121_136967_137113_139263
842597	contig_10609_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_123934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTCTTGCCTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381617	382417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_381600_382400
842598	SIRV4	-	644	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	22	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15100	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13833_15027
842599	contig_1308_pilon	+	428	2	Intergenic	novelGene_172681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCTATATTTTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8455	9612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1308_pilon_+_8626_9354
842600	contig_8615_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_165231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGATTGCAAGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460340	461048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_460300_461000
842605	contig_7815_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_134416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919170	920191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_919200_920200
842606	contig_16594_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_53925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	306375	306076	NA	15	TGGGTTCTGGTTTTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHKKKHVRGKFPFAQFAQRRAAAALHCLGSCRGCAWLEEEVRGGVHRLLLGPGRRGWLPTVDGFRSHTISGEKGSRRWQPQLRSELPFQGLCGQCQSAA	306376	305628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_305600_306400
842607	contig_13048_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_138923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCAGACCTTTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414350	413433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_413400_414400
842609	contig_5033_pilon	+	1734	13	Intergenic	novelGene_28975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	59.3258422237355	9	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	459	1550	521595	530454	FALSE	15	CTTGATACCTGCTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DADEGPNAIVYYFIAAGNEEKNFHLQPDGRLLVLRDLDREREAVFSFIVKASSNRSWTPPRGPSSALDLLADLTLQEVRVVLEDINDQPPRFTKAEYTAGVATDAKVGSELVQVLALDADIGNNSLVFYSILAIHYFRALANDSEDVGQVFTMGSVDGILRTFDLFMAYSPGYFVVDIVARDLAGHNDTAIIGIYILRDDQRVKIVINEIPDRVRGFEEEFIRLLSNITGAIVNTDDVQFHVDKKGRVNFAQTELLIHVVNRDTNRILDVDRVIQMIDENKEQLRNLFRNYNVLDVQPAISIRLPDDMSALQMAIIVLAILLFLAAMLFILMNWYYRTIHKRKLKAIVAGSAGNRGFIDIMDMPNTNKYSFDGANPVWLDPFCRNLELAAQAEHEDDLPENLSEIADLWNSPTRTHGTFGREPAAVKPDDDRYLRAAIQEYDNIAKLGQIIREGPIKGSLLKVVLEDYLRLKKLFAQRMVQKASSCHSSISERRHPLPAQHLDFGSSLPHPQLDI	520955	530638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_521004_521098_521351_521436_521599_523214_523472_523880_523979_526462_526584_526707_526788_526934_526976_527130_527192_527670_527801_528243_528367_528752_528858_530382
842610	contig_6674_pilon	-	851	8	Intergenic	novelGene_148026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAATAAATCCTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471190	324470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_324554_342130_342275_371979_372110_394452_394579_449884_449975_469261_469327_470320_470501_471157
842611	contig_9272_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_125952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAATAGAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459952	458982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_459000_460000
842612	contig_20667_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_174981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	0.942809041582063	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	65	379	7452	5904	FALSE	25	CTAAGATGAAGTGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRAILLFCLILLTLSGTKGIPLSRTTRCTCIEISDRPVNPRSLEKLEMIPASPSCPRAEIIATMKKNGEKRCLNPDSKNVKNILKAISKERSKRSPRNQREV	7516	5145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20667_pilon_-_5941_6388_6479_6700_6828_7391
842613	contig_11929_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_171230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAATGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37725	39828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_37700_39800
842614	contig_13992_pilon	+	909	2	Intergenic	novelGene_147627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	76	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	389	466	390114	390191	FALSE	15	GAACGCCTGGACTGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPTEGTDVCSTGDVQDSQQSHTAREGPDPGLHGGFPREPVPGAGRRDPDQAERAHGGPAQGGRPGQHHHAGGHGVRDELRHRPVDALQEVQAHDQRVLAGRRPQPPALSTAAPQPPLWASTRGGSEERQMDSWQGAVLHPASRTCGRAPAYLSF	389615	390634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_389727_389836
842615	contig_6266_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_171006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTAAAAATAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829683	830843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_829700_830800
842616	contig_2062_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_139060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAACAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426924	1427502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1426900_1427500
842617	contig_7379_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_150045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTTTTCTATGTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636347	636617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_636300_636600
842618	contig_6497_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_35586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGTTAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324593	323934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_323900_324600
842622	SIRV6	+	234	3	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	251	-2865	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATGTGCCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2767	7923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_7808
842624	contig_8354_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_24118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275008	273946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_273900_275000
842625	contig_15146_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_116951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGACTCCTACTAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493454	494757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_493500_494800
842626	contig_8628_pilon	-	536	4	Intergenic	novelGene_164416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAATAAAAAATATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397230	388160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_388286_395393_395486_396163_396359_397106
842630	contig_5827_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_129790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATGCAAGCCACCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235547	236838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_235500_236800
842631	contig_3269_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_117041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATCGAAGAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216689	217993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_216700_218000
842634	contig_7629_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_153559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTGGCAGTCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239855	238783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_238800_239900
842635	contig_7919_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_28053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACACTAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976504	975158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_975200_976500
842636	contig_20931_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_177430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	288	317	3061	3032	NA	75	AAGTTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKRKRRRNRGRGREGGREGKPLTHAIIWINPKTLCCVKEVRHKRVHNLQFYSYRGQEQRKRIFGNRNPSSNEEEHGEISAYTEYILYLNLRGSYMGAYICKIP	3348	2961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20931_pilon_-_3000_3300
842637	contig_11396_pilon	+	1090	4	Intergenic	novelGene_71348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	236.847817994781	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	37	1089	500884	504638	FALSE	5	CGCAGGTGGTGGCCGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPFGTGKTYTLAMASLEVTRQPHTKVLICTHTNSAADIYIREYFHGHVSSGHPEATPLRVMYTDRPPSQTDAATLRYCCLTEDGRAFRPPTRTELQRHCIVVTTTSQACELRVPAGFFSHILIDEAAQMLECEALTPLRYATPHTRIVLAGDHLQVTPKLFSVAGSQAASHTLLNRLFLHYQQETHAVSRQSRVVFHENYRSTQALVAFASRHFYLAQGNPIHASGRIPRHPQHYPLMFCHVAGTPERDMSQTSWLNPAEILQVVEKVREVYDTWPPCWGGREQQHICVVSHGAQVGALRQELRRKNLAEVSVGSFEILPGREFRVVVLSTIHTCDSLRGPGVTSMEFFMEARVLNTIMTRAQ	500847	504639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_500949_502672_503457_503731_503808_504510
842638	contig_2069_pilon	-	449	3	Intergenic	novelGene_23515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCATTGTGTCTGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509817	1508367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508682_1509038_1509111_1509754
842639	contig_12964_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_131686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCGTTGATCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420011	419346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_419300_420000
842640	SIRV6	+	437	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	16	32	16	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAGCCGAAGACGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153	2088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
842641	contig_6192_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_170330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAACGTCGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132935	132159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_132200_132900
842642	contig_10803_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_170118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAGGCACAGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65850	64158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_64200_65800
842644	contig_11719_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_154786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGATAAAAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166775	165952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_166000_166800
842648	contig_16126_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_141866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAAAAAGATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13971	15002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_14000_15000
842649	contig_678_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_167825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACATTCGGTGGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148314	149171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_148300_149200
842651	contig_13460_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_162174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGAGAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15941	16354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_15900_16400
842652	contig_5797_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_56925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGTATCTGTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211874	209728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_209700_211900
842654	contig_11719_pilon	+	245	4	Intergenic	novelGene_154752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3152	junction_3	1646.94835647293	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTGAGTGTCCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14480	20085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14504_16247_16326_19126_19183_19997
842655	contig_1225_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_44201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272159	271154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_271200_272200
842656	contig_12603_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_105784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAGAGTTGAACCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547128	547850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_547100_547800
842657	contig_8019_pilon	+	1047	7	Intergenic	novelGene_126993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.5860168026914	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	417	866	231796	242466	FALSE	25	AGACTTATTTTTGGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKTPPECLLLEQQRDLSCLCLCRSCPSLHSHPARGFQILLTGEEVSVFRSCSSTPAHRGLVLRC	195378	242647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_195431_215116_215199_216480_216648_231345_231424_231758_231963_240500_240595_242277
842659	contig_11396_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_71302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGAGCAGCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378643	379420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_378600_379400
842660	contig_756_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_134782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAATCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215263	216474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_215300_216500
842661	contig_10126_pilon	-	1158	3	Intergenic	novelGene_105711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	4	135	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGTCTGTGTTTGTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139621	130494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_131340_135887_135981_139401
842662	contig_10867_pilon	-	390	3	Intergenic	novelGene_159446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2670	junction_1	1970	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	27	356	87815	86811	FALSE	10	TGTTAGGTCTTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	87841	86776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726
842665	contig_10861_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_39450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2594353	2593575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2593600_2594400
842666	contig_9668_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_58157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCTAACTAATGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428858	427378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_427400_428900
842667	contig_9678_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_146357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTGCAATAATGTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211976	210420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_210400_212000
842668	contig_6375_pilon	+	725	5	Intergenic	novelGene_73082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	72.850875080537	478	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	140	433	750284	751419	FALSE	10	CTACTGGTGAGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQSRGTARVHHGLLSLVSAWSQGLWSLLEALTFIIFICFTASISTYMAAALLEFFITLAFLFLYATQYYQRFDRVNWPCLDFLRCVSAIVIFLVISIAAVTSRDGAAIAAFVFGIILVSVFAYDIFKIYQTEMAPRATEGDQQ	749710	751711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_749799_750232_750386_750937_751031_751230_751316_751405
842670	contig_11825_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_155425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAATCATTTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215892	214202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_214399_215809
842673	contig_6102_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_32099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGAAAAAGGAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811394	811136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_811100_811400
842675	contig_5013_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_110097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTCTGTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216365	216028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_216000_216400
842676	contig_12624_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_61017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTCTACATCATCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829740	827901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_827900_829700
842677	contig_14322_pilon	-	671	8	Intergenic	novelGene_116613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	66.8061466071034	39	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	141	671	704508	701716	FALSE	25	ACCATTGCCTTCAAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQHRPGGKTGSGGVASSSESNRDRRERLRQLALETIDINKDPYFMKNHLGSYECKLCLTLHNNEGSYLAHTQGKKHQTNLARRAAKEAKEAPAQPAPEKVKVEVKKFVKIGRPGYKVTKQRDTEVGQQSLLFQIDYPEIAEGIMPRHRFMSAYEQRIEPPDRRWQYLLMAAEPYE	709521	701715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_701842_701946_701997_702512_702623_703041_703089_703514_703587_704382_704546_705039_705112_709490
842679	contig_5041_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_27126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAACAATAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803197	803909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_803200_803900
842681	contig_3155_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_26442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGTTTACGTACATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326042	324936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_324900_326000
842683	contig_16098_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_45896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCACCTAAGGGATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252999	254216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_253000_254200
842684	contig_3700_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_138060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94186	93625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_93600_94200
842685	contig_17880_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_167334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTTCATTTCAGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37155	36609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_36600_37200
842686	contig_4924_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_84751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAGAAACTGCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184202	185524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_184200_185500
842687	contig_10299_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_79791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTGTGATTGAAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706408	704599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_704600_706400
842690	contig_4364_pilon	+	1002	7	Intergenic	novelGene_186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	925.525031175999	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	67	987	1268714	1271052	FALSE	25	TCCAAAGGAGCCAGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAPSPDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYRPRAVETAPRLGESQIAKLKLPPVPPQEGWVASPRPPPELTHRHQTAPRQTKPVAKPYLAHLAWPEPRAWPVSIYCLHLCCLLGPPWPAFCHLYPALGATTHGQAPFPPDPARTDRDQAQSWEPSPVPLCPLPPVVASCLLGLRHLRQQRARPCFPL	1267039	1271067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268894_1268990_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837_1269869_1270577
842691	contig_13244_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_86978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTGCTAATGATAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345506	346626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_345500_346600
842694	contig_20622_pilon	-	1920	3	Intergenic	novelGene_173850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	3	124	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	348	1592	11652	10408	FALSE	25	GATGACTGTTATCCATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQFISDFLSGKKLQQLSSEFLPYYSTLISKAGGILSQETINDIQEDLVKGKLKDMVGKIQKSLVEAENAPLDVAVIGECGTGKSSFINALRGLSHEEEGSASTGVVETTMKKTPYQHPKYPKVTFWDMPGSGAPNFSLETYLETVEFAKYDFFIIISSTRFNENDALLAQKIKNVGRKFYFVRTKVDNDLHNEEISKPKSFKKERVLQQIRDYCLANLSDIGVPEPHIFLVSNFDLTDFDFPKLEETLLKELPAHKRHTFVLLMPCLSDSAIEMKRDFFKEKIWLDALKTSALAFVPFMPFIYGFDLPEQEKCLAHYRSHFGLDDKSIKEIAQNFGISEQEIRSSIKSLDFQLLVKDDCTIAKAKTCVEAYCSVTGGLKSSILQFVKTYILHLKFLNTVADDAKIILHKTLGS	20082	10079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20622_pilon_-_11673_19358_19488_19884
842695	contig_4232_pilon	+	527	4	Intergenic	novelGene_63232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	172.28142351655	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	176	442	265860	266487	FALSE	40	CAATAAATGAGTTCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCALYAPALASARDSQRPQDGERRRGSHREAPRPLAPRHAARRCPRRAASTTLAGYVMVMDEKAEVLIGLERKQELKGSEDDEEEQQEGPEPLERDFDRFIRATASFARFHLWGLETIPGPDAKVRGALTWPTLAAAIHTQVPAD	265366	266572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_265526_265843_265980_266057_266178_266460
842696	contig_15752_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_148788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAATGAGGCTCACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369345	367799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_367800_369300
842698	contig_9609_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_23107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACACCACACAGAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510497	511095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_510500_511100
842699	contig_7882_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_175010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245122	244413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_-_244400_245100
842702	contig_17470_pilon	+	855	7	Intergenic	novelGene_110480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1162	junction_1	2323.96362206181	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	92	853	142219	146502	FALSE	45	TGAAGGGGAAGAAGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPAAKVSKKELNSNHDGADETSEKEQQEAIEHIDEVQNEIDRLNEQASEEILKVEQKYNKLRQPFFQKRSELIAKIPNFWVTTFVNHPQVSALLGEEDEEALHYLTRVEVTEFEDIKSGYRIDFYFDENPYFENKVLSKEFHLNESGDPSSKSTEIKWKSGKDLTKRSSQTQNKASRKRQHEEPESFFTWFTDHSDAGADELGEVIKDDIWPNPLQYYLVPDMDDEEGEGEEDDDDDEEEEGLEDIDEEGDE	142127	146504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_142292_143892_143951_144618_144762_145162_145267_145372_145487_146100_146272_146403
842705	contig_2100_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_50638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCCTATGAGAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949124	949775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_949100_949800
842706	contig_2114_pilon	-	1707	10	Intergenic	novelGene_104264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_1	186.853345807631	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	6	707	901431	499305	FALSE	25	GATGTAATCACCGGTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMFIGGLSWQTSPDSLRDYFSKFGEIRECMVMRDPTTKRSRGFGFVTFADPASVDKVLGQPHHELDSKTIDPKVAFPRRAQPKMVTRTKKIFVGGLSANTVVEDVKQYFEQFGKVEDAMLMFDKTTNRHRGFGFVTFENEDVVEKVCEIHFHEINNKMVECKKAQPKEVMFPPGTRGRARGLPYTMDAFMLGMGMLGYPNFVATYGRGYPGFAPSYGYQFPDYLPISQDIIFIN	901436	498304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_499346_503398_503474_512384_512500_532552_532636_608341_608391_737869_737963_896092_896135_900198_900284_900992_901075_901394
842707	contig_5236_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_100925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917894	918881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_917900_918900
842708	contig_3900_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_84180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTTTTTTTTTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212805	213893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_212800_213900
842709	contig_13015_pilon	-	903	4	Intergenic	novelGene_165550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	15.6418242755334	25	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	32	355	371542	351049	FALSE	25	CCCATCTGTCTGAGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVALHRWRRRRPEELQVLGDAKRVCRRPEAAVHEWGCSQLSRCARQSWSPEEVTPLPSGPPPAHGPESSRGKPASKIPLNGGTSLAQPCPRCMAGESVSISEVAP	371573	350500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_351076_351800_351864_351964_352130_371473
842710	SIRV6	+	443	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	4	21	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGTCCAATCTGTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141	1971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1741_1845
842712	contig_15859_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_50187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATGGCACGAGAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320450	319437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_319400_320400
842713	contig_15859_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_50186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCAAGAGAAACAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319280	318660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_318700_319300
842715	contig_8558_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_123157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGGTTTAAAGCCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399343	398488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_398500_399300
842716	contig_8611_pilon	+	442	4	Intergenic	novelGene_166562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	23.8932812499432	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	34	441	82644	101408	FALSE	50	GATGCTGTGCAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDVSASITLQVMVSIPGNISCLWIFKHSSLNCQPYFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRNTPLYTLRRPYFRKMENQDALLCISESIPEPVVEWVFCDSQSESCKEEGPAVVKKEEKVLHELFGTDI	82610	101409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_82733_86315_86432_98559_98690_101335
842717	contig_8611_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_166563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	3	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	162	234	395	102102	102360	FALSE	30	TAGGTAATGCAGGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKEEKVLHELFGTDIRCCAKNKLGRECTKLFTIDLNATPQTTLPQLFLKVGEPLWIRCKAVYINHRFELKWELGNKMLTEDSYFEMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVGRNDTGSYTCSSSEHPSKSTLVTV	101358	102361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_101464_101973_102114_102210
842718	contig_7391_pilon	+	1348	12	Intergenic	novelGene_112137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	67.2915207164363	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1284	64	1347	120156	207465	FALSE	10	TCTCCGCCGTGGTGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRFRRADAATSFLRAARSGNLDKVLDYLRNGVDINTCNPNGLNGLHLASREGHVKMVAELLHKKISLEMKTKKGNTALHIAALAGQNEVVRELVNYGANVNAQSLKGFTPLYMAAQENHLEVVKFLLENGANQSIATEDGFTPLAVALQQGHENVVAQLINYGTKGKVRLPALHIAARNDDTRTAAVLLQNDPNPDVLSKTGFTPLHIAAHYENLNVAQLLLNRGASVNFTPQNGITPLHIASRRGNVNMVQLLLYRQAEIEARTKDELTPLHCAARNGHVRISEILLDHGAPIQAKTKNGLSPIHMAAQGDHLDCVRLLLQYNAEIDDITLDHLTPLHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHNRVMELLLKTGASIDAVTESGLTPLHVAAFMGHLSIVKNLLQRGASPS	120092	207466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_120174_163221_163324_188850_188950_196274_196374_197224_197324_198396_198583_199715_199815_201041_201141_201435_201535_205169_205368_206823_206923_207378
842719	contig_6164_pilon	+	645	5	Intergenic	novelGene_121259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	9.67923034130297	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	6	644	191706	239130	FALSE	35	GTGTGAGGTACAGTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMASPSGKGARAPEAPGCGSRQLARDLEDSVDDAEGLYVAVERCPLCNTTRRRLTCAKCVQNGDFVYFDGRDHERFSDKKERLSRLKSKQEEFQKDVLKAMEGKWITDQLRWKIMSCKMRIEQLKQTICKGNEEMKKNSEGLLKTKEKNQKLYSRAQRHQEKKEKIQRHNRRLGDLVEKKTIDLRSHYERLANLRRSHILELTSVIFPIEEVKT	191700	239131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_191927_221300_221364_223152_223196_234356_234439_238900
842726	contig_16204_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_154489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAAATGGAAGAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200984	201873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_201000_201900
842728	contig_4336_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_152350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTAAAGTTAAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258465	257148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_257100_258500
842729	contig_2646_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_69601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGCTGTTATACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483555	1485522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1483600_1485500
842730	contig_6847_pilon	-	1625	5	Intergenic	novelGene_143888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2.44948974278318	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	117	488	186684	180965	FALSE	30	TTTTCAATATTTGTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWIPACTWCSVARSAVATWSRWGGKIKSWKKRWFVFDRIKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN	188512	179827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_181106_182008_182095_186304_186409_186643_186761_188472
842731	contig_9481_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_149680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGTCTGCGCCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451577	452312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_451600_452300
842733	contig_1594_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_138842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679418	679005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_679000_679400
842734	contig_11896_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_88015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTTCACTGAACATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147081	145749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_145700_147100
842735	contig_2311_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_169809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTCACACCCAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196371	195569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_195600_196400
842736	contig_12709_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_147407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAACTCTCAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39301	37903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_37900_39300
842740	contig_14142_pilon	+	1451	2	Intergenic	novelGene_120500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACGAAGTGTCAACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310067	311831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_310205_310517
842742	contig_593_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_102030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTACGTAAAGATAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524174	524802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_524200_524800
842744	contig_14362_pilon	-	885	6	Intergenic	novelGene_142514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	19.5816240388789	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	156	536	33047	27717	TRUE	10	TGTGCCTTGTTTTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPDVQRGDASAQGGRSCFWPRRWSELRYSGKEKTETILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTLRDQINSDHRTRAMEDEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNGEICGNYTYRGPKAFQRHFACGPS	33202	26325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_26634_27675_27732_30007_30119_30223_30389_32670_32719_33005
842746	contig_16685_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_115059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594211	593784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_593800_594200
842747	contig_17144_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_29146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTCAGCAGCCAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87578	86947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_86900_87600
842748	contig_5961_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_144187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAATATAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339982	338505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_338500_340000
842749	contig_4271_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_171864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425239	427088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_425200_427100
842750	contig_12920_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_166341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	435	812	191609	191986	NA	70	TAATAATGAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIFEGHNPIHNNQCLQFVYLQILKSKKSFQLFYFVYFHRVKPSFLEYLSYLLNFMSVIAGPCNNFKDYVAFIEGRHMHMKLLEVNWKQRGFHSLPRPSPTVSFSCQVSTQRSREYGFAARVDSH	191174	192277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_191200_192300
842751	contig_13941_pilon	+	1443	4	Intergenic	novelGene_174663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.90668171555645	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	22	816	100372	124593	FALSE	50	TGACCAAATTAAATTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEEDLYLMEPLRLRRNAPRCLRRTREERWCENSSLIRKYCSALQMPQRGKNELHELEKQIASVSAETKEIGRQIYQQDAAIENTKLQCRSLETQVISLHTENVKLKFDIEAAQEDFEEHMIRYNAYYAKIKAHKDSLEEIESKWSFMIELNEKRDLVKKLMTMKEELTRDLRNPEGNRIKQVQEDITKLSNTIITIKESIVEKTCVLEKEKKIHEKLRKEIEVQHKRYDAILKRLHCQVKKRQSNRRQWQWNIQQLEKTAAELRQRIGMQK	100350	125220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13941_pilon_+_100501_101012_101412_102184_102302_124443
842754	contig_10023_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_123480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTTCTACTTCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146514	147987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_146500_148000
842759	contig_9460_pilon	-	554	3	Intergenic	novelGene_155313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	38.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	236	553	368524	357706	FALSE	20	TGGACAGCCACCTTCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQSAALARNNSRVSPVPLSGATAGTEQKTEVVLHCEFCEFSSGYIQSIRRHYRDKHGGKKLFKCKDCSFYTGFKSAFTMHVEAGHSAVPEEGPKDLRCPLCLYHTKYKRNMIDHIVLHREERVVPIEVCRSKLSKYLQGVVFRCDKCTFTCSSDESLQQHIEKHNELKPYKCQLCYYETKHTEE	370906	357704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_357900_368400_368538_370684
842761	contig_12015_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_164290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTGACTCATGACGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4935	4012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12015_pilon_-_4000_4900
842764	contig_3942_pilon	+	908	5	Intergenic	novelGene_128667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	16.161296358894	80	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	29	700	232684	243238	FALSE	20	TGAGCACGTGTGGACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALREEACQGMPKKFQGENTKAAAARARKAEAKAAADARKQKELEDAYWRDEDKHVMRKEQRKEEKEKRRLEQLERKKETQRLLEEEDSKLKGGKAPRAAAPGKVTRAQIEETLRRDLQHREAPEPAEKARSHLEVPLEENVNRRVLEEGSVEARTVEDAIAVLSMAEEAADRHPERRMRAAFTAFEEVQMPRLKLENPNMRLSQLKQLLKKEWMRSPDNPMNQRTMPFNAPK	227201	243446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_227219_232672_232843_241983_242174_242838_242954_243030
842766	contig_1244_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_38046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972217	969960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_970000_972200
842767	contig_8704_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_156341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATGCTAATGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580505	579329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8704_pilon_-_579300_580500
842768	contig_2093_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_153006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAGAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1422033	1423130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1422000_1423100
842769	contig_2365_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_103767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGCCCTGGGGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293858	294306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_293900_294300
842771	contig_4071_pilon	-	1624	3	Intergenic	novelGene_151870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	360	1349	59623	57018	FALSE	15	ATTGTTGCCCAGGGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQEMAPLRTEQEASMSLQSVKAKLKCESPEPEAQQEQVSDVETENEYRNLILKQEVSEEMELYGDISSRFESEMAAEYEETHEPKGKIENPSGYPWEDKQPTCDENGVSWSENSDLTEQQRICPGEKAYECDSCGKAFSQYAHLIEHQKIHTGDRPYKCEVCGKTFRGRTVLVRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGQCSALNQHQRLHTGEKHYRCNECGKAFSQKAGLFHHLKIHTRDKPYQCTHCNKGFSRRSILIQHQRIHTGEKPYQCDDCGKAFRRRSYLSKHQRMHSRGGPYKYKEYGESFRQNSALIQHQTMHKGEKSVPM	64065	56742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_57890_59505_59644_63726
842772	contig_10838_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_129165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAGAAAAAGAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59991	59036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_59000_60000
842773	contig_12624_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_61003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCATGTTCATCACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529987	530768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_530000_530800
842774	contig_10923_pilon	+	1592	3	Intergenic	novelGene_66228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGCTAGGCCCCGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43728	51650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_45009_50241_50320_51416
842775	contig_7867_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_162744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGATGGTACCTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224098	225422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_+_224100_225400
842776	contig_2078_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_100153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	289	732	334486	334929	NA	75	AAATTAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGRREVLNQAGNVPFFFPLCRLLRDEVFLSISLSDEQMHLLISHVSPPTSHDSVACSQHHVSQLLIFPRLTSLASCPHPSGSALPNKLLACESLPQALLSGGLGLRQQGAWASVNRSQGGSWKLVPRWSSDGIQEQNFKGGWSLA	334197	335217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_334200_335200
842778	contig_18898_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_77637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAGTTTTTCTTTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50721	51460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_50700_51500
842779	contig_12965_pilon	-	1799	5	Intergenic	novelGene_65200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_4	251.472662530145	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	528	1799	313082	307997	FALSE	45	AGGGTAGGACTAGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSRSRSDDGGEEASFQDHNHHENERRWQQERLHREEAYYQFINELSDEDYRLMRDHNLLGTPGEITSEELQQRLDGVKEQIASQPDLRNRENGTNTRDSEVPRESSNEDSLLEWLNTFRRTGNATRSGQNGNQTWRAVSRTNPNSGEFRFSLEIHVNHENREFEIHGEDYASIPLTDISRDHTRNRHQRSNSPVARRTRSQTSVNFSGNSSNTPRTRLGSRGQNSIEVSYSTLGRLRNGVRGSVGVPRTRTPRANSSDHTDQAGDGELRQREGQRFGAAHVWENGARTNVTVRNTNQRLEPIRLRSSFSSRSRSPIQRQSGTADHNSQRESRPSQRTIRRSARRRGITHGFLQHDRESRGTTYTPFSNSRLVSRITVEEGEESSRSSTAVRRHPTITLDLQVRRIRPGENRDRDSIANRTRS	315886	307996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_308971_311954_312060_312889_313102_314850_315064_315591
842780	contig_10451_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_138322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGAGTGTCTGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302697	303297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_302700_303300
842783	contig_7866_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_171187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTGCCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146705	145631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_145600_146700
842784	SIRV2	-	290	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4583	34	3408	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
842785	contig_8687_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_169666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATCATTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259895	258892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_258900_259900
842786	contig_6217_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_109633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGCCCAGCATCTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483825	484952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_483800_485000
842788	contig_5317_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_76599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398901	400472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_398900_400500
842789	contig_21236_pilon	-	989	3	Intergenic	novelGene_177431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATATTCAAAGCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37506	16560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21236_pilon_-_17312_21200_21301_37368
842791	contig_11551_pilon	+	1220	1	Intergenic	novelGene_168484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644253	645473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_644300_645500
842792	contig_5551_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_134240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428238	429651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_428200_429700
842793	contig_19146_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_172284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.7609635064506	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	489	965	17784	19024	FALSE	5	TCTGGGGCTCCCTTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFACLSFRQPYAGLVLNRVKTLETRWRPLLSGHCNRTLAVHIAHRDWEDNAWRELLLDRLGMTPAQVQALIRDGERFGRGVIAGLVDLGETVQCPNDLAPEEAVQLETRALLPDLKHKYLTALSNPRWLLEPIPGKGGKDVFQVDIPEHLIPSGQEA	15317	19444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19146_pilon_+_15543_16157_16209_17487_17646_17729_18037_18800
842794	contig_2114_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_104253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAAAAATTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285604	284802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_284800_285600
842796	contig_5084_pilon	-	969	7	Intergenic	novelGene_64547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.070210289804	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	97	537	580023	525248	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLTPTLSFSFSFLPSFAVASAAAAPRGTPDSGMGSRASTLLRDEELEEIKKETGFSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQHDEIYLVNL	580119	524726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_525079_525167_525278_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579956
842797	contig_14167_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_105539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGTGTTATAAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59103	60358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_59100_60400
842798	contig_5260_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_144427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGTAAGAAGAAAGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572955	573940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_573000_573900
842799	contig_10864_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_107050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAAAAAGAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732140	731182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_731200_732100
842800	contig_12292_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_167026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTAGTTAAATGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456302	457048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_456300_457000
842801	contig_7056_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_43747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGTCCATACTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157917	1157208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1157200_1157900
842802	contig_7056_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_43746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTTCTGGTGCTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156967	1156451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1156500_1157000
842803	contig_2027_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_39900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121011	120263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_120300_121000
842804	contig_19721_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_99150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGGATTTTACTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135056	137266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_135100_137300
842805	contig_10446_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_162503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCATATTACAGAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966466	966975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_966500_967000
842807	contig_17311_pilon	+	1172	7	Intergenic	novelGene_57867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	21.5844594300828	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	167	1072	174344	184479	FALSE	5	CCGTTGGGTTAGTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTLWTGKQIFSVILRPSDDNPVRANLRTKGKQYCGKGEDLCVNDSYVTIQNSELMSGSMDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLSNRGFSIGIGDVTPGQGLLTAKYELLNAGYKKCDEYIEALNTGKLQQQPGCTAEETLEALILKELSVIRDHAGSACLRELDKSNSPLIMALCGSKGSFINISQMIACVGQQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLPAAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMAGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDLTVRSSTGDIIQFIYGGDGLDPAAMEGKDEPLEFKRVLDNIKVRLSIISGGRVFSRKVL	172285	184579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_172426_174317_174483_177643_177817_179172_179285_180604_180724_182329_182468_184254
842808	contig_12849_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_177432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATCTTCAGCAAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620665	618744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12849_pilon_-_618700_620700
842809	contig_709_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_57520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490242	488972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_489000_490200
842810	contig_10196_pilon	+	1904	17	Intergenic	novelGene_132064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1306	1662	726693	730731	TRUE	30	TGTAGGGGAGCAGACAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVDEELPDLLGHGDVVHHHRQLGAVHGALLCDGVPLTPHVVITGSLNTQQHSWQHSFTDGCSANTSGTGSSSSSGSENVERKDMLDSECRERMEMAESERRGVLMGGMLSSSSRGE	721565	733479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_721674_722368_722510_722693_722813_722892_723009_723110_723151_724785_724865_724998_725132_725235_725282_725376_725460_725539_725753_726384_726522_726602_726793_727894_728000_728380_728502_730700_730789_732453_732520_733360
842811	contig_19378_pilon	+	1086	5	Intergenic	novelGene_73768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10.7558123821495	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	301	885	13395	15535	FALSE	15	GACTTGGATTGTTCCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVWPCAVVLAQYLWFHRRSLPGKAILEIGAGVSLPGILAAKCGATVILSDNSELPHSLEICQQSCQMNNLPQVHVLGLTWGHVSPDLLALPPQDVILASDVFFEPEDFEDILTTVYFLMEKNPKVQLWSTYQVRSADWSLEALLYKWDMKCVHIPLESFDADQEDIAESALPGRHTIEMLIISFAKGSPDLPP	8625	15736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_8905_13373_13479_14797_15036_15120_15206_15357
842814	contig_7201_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_152497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81066	82002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_81100_82000
842816	contig_6434_pilon	+	1387	2	Intergenic	novelGene_61844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763962	765650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_764453_764753
842818	contig_10196_pilon	+	957	4	Intergenic	novelGene_132267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.32049379893857	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGCCTGTAAGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2005009	2006397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2005383_2005562_2005723_2005871_2006025_2006126
842821	contig_5935_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_102677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACTAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676810	676020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_676000_676800
842822	contig_6710_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_95990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653663	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
842823	contig_10058_pilon	+	626	4	Intergenic	novelGene_67707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	38.4967531098403	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGGAAGCATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54238	55531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_54474_54676_55084_55248_55330
842824	contig_5039_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_64850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTGCCCAGCAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328447	329117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_328400_329100
842825	contig_6132_pilon	-	2008	3	Intergenic	novelGene_163620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTAGGGCTAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187505	182911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_-_183916_185099_185903_187304
842826	contig_12841_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_55864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCCAGCAGGAAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359325	358224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_358200_359300
842827	contig_13409_pilon	-	1274	2	Intergenic	novelGene_128450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTAAGTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84179	82263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_83354_83995
842829	contig_3960_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_138041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGTTAATTCGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685398	686498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_685400_686500
842830	contig_16492_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_100289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAGATAAAAAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117381	116606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_116600_117400
842832	contig_4105_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_21510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCTGAAGAGAGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106446	107289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_106400_107300
842834	contig_5125_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_43493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTACCATTAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908828	908297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_908300_908800
842836	contig_10861_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_39467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	74	331	2742223	2742480	NA	80	AAAAAAAAAAAAGATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYLELGGATSTLGGQVTGWADGWGMRFHTPPHLCQLRSTVTCAPEEGNGADIPISHTHHTHSSDSSTKMLRAARAGESHLHSYKTIRNKEFYSSSNSTVNINLAGYRPS	2742149	2743410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2742100_2743400
842837	contig_16775_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_107802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTGTTTACGTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204523	205363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_204500_205400
842838	contig_12661_pilon	+	1657	1	Intergenic	novelGene_166722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCAGGTTAGCATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83508	85165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_83500_85200
842839	contig_11396_pilon	-	900	6	Intergenic	novelGene_71407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	99.3076029314976	465	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	70	777	1648829	1644244	FALSE	5	CCCGCTCACTCTGGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSGALFPSLVPGSRGSSNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGSSPSPAPSSGNGTSTATSPTQPIQLSDLQNILATMNVPAGAGGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTAEEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649986	1644120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644583_1644737_1644896_1645138_1645275_1648625_1648831_1649918
842840	contig_11078_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_172000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGCACACACGCACACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274698	275311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_+_274700_275300
842842	contig_7070_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_104050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACTCAATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173090	172555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_172600_173100
842843	contig_11375_pilon	+	1014	7	Intergenic	novelGene_152658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	252.918080720923	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	243	695	180735	182015	TRUE	30	CAGACCTACCATACTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFTCGPNEAMVVSGFCRSPPVMVAGGRVFVLPCIQQIQRISLNTLTLNVKSEKVYTRHGVPISVTGIAQVKIQGQNKEMLAAACQMFLGKTEAEIAHIALETLEEIYKDRQKFSEQVFKVASSDLVNMGISVVSYTLKDIHDEQVNQGS	180161	182543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_180366_180696_180778_181047_181124_181211_181303_181578_181684_181877_182180_182388
842844	contig_20596_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_157238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCACAGTTTGAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96723	96513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_96500_96700
842845	contig_7057_pilon	+	823	5	Intergenic	novelGene_123190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	173.90999827497	302	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	120	695	401608	410055	FALSE	10	CCATCCCTGGCTGGGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPAPGLPGAGGPVVPGPGAGIPELLSLRPRPRPPRPEPPPGLMALEVPEPLGEDKKKGKPEKLKRCIRTAAGSSWEDPSLLEWDADDFRIFCGDLGNEVNDDILARAFSRFPSFLKAKVIRDKRTGKTKGYGFVSFKDPSDYVRAMREMNGKYVGSRPIKLRKSMWKDRNLDVVRKKQKEKKKLGLR	401488	410183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_401678_406503_406584_406911_407030_409662_409858_409942
842846	SIRV5	-	292	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACCTTAGAGCGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10868
842847	contig_18299_pilon	+	1382	5	Intergenic	novelGene_135341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	111.873533509941	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	96	824	47477	60782	FALSE	70	GAAAATGCAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAESGSARPLPRRLVSRPAELRVLPGAALRMGGAVSAGEDNDELIDNLKEAQYIRTELVEQAFRAIDRADYYLEEFKENAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALDLQPGLSFLNLGSGTGYLSSMVGLILGPFGVNHGVELHSDVIEYARQKLDFFIKTSDSFDKFEFCEPSFVTGNCLEISPDCTQYDRVYCGAGVQKEHEDYMKNLLKVGGILVMPLEEKLTKITRTGPSAWETKKILAVSFAPLIQPCPSESGRSRPVQLRKYKDLC	43759	61340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_+_43832_47453_47784_54382_54486_55448_55621_60635
842848	contig_2940_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_81935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	19376	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTGGTATGTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720924	717653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771
842850	contig_50_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_122213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAGAAAAAAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56810	54677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_54700_56800
842851	contig_1244_pilon	-	767	6	Intergenic	novelGene_37961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	49.4182152652238	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	49	462	911358	900905	TRUE	10	GTGACGTTTCTTATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAVLASTSFCPDRPAGMEDEEAEEQQRFSYQQRLKAAVHYTVGCLCKEVASEKEMQFSKQTIAAISEVTFRQCENFAKDLEMFARHAKRSTINTDDVKLLARRSNSLLKYITEKNEEIAQFNLEQKAKKKKKFENGNKDSREPAEAGVVESEN	911406	893696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_893984_900886_901046_903292_903360_906509_906544_907474_907599_911310
842852	contig_14142_pilon	+	1108	4	Intergenic	novelGene_120496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	12.4988888395018	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTGCTGTTGGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307908	309378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308281_308382_308467_308566
842854	contig_5316_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_61263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACACACCAATGCACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554862	553717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_553700_554900
842855	contig_1009_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_121737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACGAATATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181648	182954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_181600_183000
842858	contig_593_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_102008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTTAAAAAAGCAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382523	381352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_381400_382500
842860	contig_15825_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_160201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83230	81745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_81700_83200
842861	contig_678_pilon	+	1030	3	Intergenic	novelGene_167778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAGGTTGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16450	20364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_16579_17500_17634_19595
842862	contig_11281_pilon	-	1493	1	Intergenic	novelGene_125426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAACCCTATGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222388	220895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_220900_222400
842863	contig_6326_pilon	-	1371	2	Intergenic	novelGene_168528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	109492	109157	TRUE	0	GTCCTGTCCTGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVLPGGADGTRGAEEDDVTKDIVLRASSEFRAVLLSLRQGSLVEFSTVLEGRLGSKWPVFELKAISCLNCAAQPSPAPRHVKLEQDWRGTVHGALKFAFDFFFFPFLSAS	109494	108008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_108768_108882
842864	contig_11590_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_125612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTTTTCAGTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926720	927991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_926700_928000
842865	contig_10296_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_168898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993383	991285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_991300_993400
842866	contig_5799_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_50308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACACTTTCAGAGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565663	565260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_565300_565700
842867	contig_16948_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_166413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTATAAAAAAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343058	342275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_342300_343100
842868	contig_16594_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_53924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	979	1404	304992	305417	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWHHLCPYGIVRYGTPSGYQQTLCSNPRGRNGVSAGVVFQRPLQRACRCKGTVTSLSMYSFLSEIPQTRAEWIIHLLSPVPLSASSQSKGNDNHLPGCVLLNFNRMQAHSTEREHRIPAATYSPGPRATEAHNYSPAAPL	304013	305539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_304000_305500
842869	contig_3147_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_142273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCGCCCACAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73098	73900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_73100_73900
842870	contig_7080_pilon	+	670	3	Intergenic	novelGene_100107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	85	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTTTTAGGCTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488492	542335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_488594_525760_525812_541817
842871	contig_9582_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_106833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382730	383087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_382700_383100
842872	contig_3948_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_53161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCTTGGTGGCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141811	143368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_141800_143400
842873	contig_14792_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_170494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCTTATTTTAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98262	99197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_98300_99200
842874	contig_3602_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_60617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904275	904079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_904100_904300
842875	contig_7580_pilon	+	1775	3	Intergenic	novelGene_108588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.5	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	236	565	19129	21182	FALSE	25	TATCTGCCTGTTCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLPKTKGTFSTFTPKDIIVTQREKPGHTYQKEDNLKNDLQKEATVLGAIQILSCLMISSLGAILVSAQYPTHFNPQVSTILMSGYPFVASLCVSRVGSPRRKLLYKC	12918	22392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_13141_19115_19276_20999
842876	contig_12848_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_177433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33267	32670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12848_pilon_-_32700_33300
842879	contig_14516_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_153902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTACTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173650	171839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_171800_173600
842880	contig_5450_pilon	-	808	3	Intergenic	novelGene_170920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATCCCTTTCTCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158793	151450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_-_151599_152389_152946_158689
842881	contig_5450_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_170918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTTCTCCAACTTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151450	150624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_-_150600_151400
842882	contig_8907_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_85851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGGGTTGGGTTTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741805	742742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_741800_742700
842883	contig_6630_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_30733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790383	791218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_790400_791200
842885	contig_11337_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_107200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260267	261718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_260300_261700
842887	contig_4659_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_118254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCAGCAATTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876031	874444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_874400_876000
842889	contig_1301_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_47386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTTAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704424	703789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_703800_704400
842890	SIRV6	+	341	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	19	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3162_10721_10819_11031_11109_11205
842891	contig_18794_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_54670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393549	395115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_393500_395100
842892	contig_2550_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_135706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAATAAAAATGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1724620	1723996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1724000_1724600
842893	contig_9389_pilon	+	613	3	Intergenic	novelGene_83858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	984	123	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	239	532	9586	12342	FALSE	15	TCCAGTCTGCCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKDGTLEGWVERVGWGLSPPLCPLPILRGCPFSGTVWARLTEGKGPLVYSWCKVLKEVAEEGRSGVPLSAAGPLPTEQMGPVKATRPYVSVPVLDRATCNLRTYHDGAITERMMCAESKSRDSCKGDSGGPLVCGGVAEGVVTSGLRVCGNRKKPGIYTRTASYVAWIDGVMAEG	9347	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9613_11447_11562_12189
842897	SIRV6	+	350	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10398	2	1248	-2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
842899	contig_5018_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_46927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	941	1366	131419	131844	FALSE	15	ACTGAACCTGCCTGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLWPPSGRLSGPAGKPRQGCAWAGSWKSVLEELSQECIYEPYSVKVFSQHLPLPPPCSWNSSCPGLVALPPGSPPWLLALLPTASPAVGQPGQAAWVRPQLPPPLLAVCPWAAQLTAQSLSFPIYRMKITIKTYFVKLL	129951	132513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_130016_130542
842900	contig_776_pilon	-	466	5	Intergenic	novelGene_139949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCAGGAAGTTCCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072874	1016468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_1016586_1022958_1023098_1036263_1036352_1040810_1040893_1072834
842901	contig_7164_pilon	+	1009	6	Intergenic	novelGene_172136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGTTTAAATCAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118934	126146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_+_119490_120048_120081_122087_122132_122674_122791_124142_124299_126040
842902	SIRV3	+	435	3	FSM	SIRV3A	SIRV305	436	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_4081_4568_4780_6570
842904	contig_5500_pilon	-	584	4	Intergenic	novelGene_159644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_3	63.4367576584918	1978	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	4	378	648597	633437	FALSE	15	CGGTACATAGTTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAAVTFCRLLSRSRLAALSLPQAARCFGVRTSPTGEKITHTGQVYDEKDYRQMRFVGRQKEVNENFAIDLIAEQPVSEVESRVISCDGGGGALGHPRVYINLDKETKTGTCGYCGLQFRQHHH	648600	633230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_-_633503_634475_634599_647064_647119_648465
842905	contig_7080_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_100104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCCACAGGCATCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466801	466182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_466200_466800
842906	contig_12292_pilon	+	918	2	Intergenic	novelGene_166998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242659	246083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_242792_245297
842908	contig_16650_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_61953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237672	239493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_237700_239500
842910	contig_5782_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_162127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACACCCATTAGGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314480	315895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_314500_315900
842914	SIRV6	+	358	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
842915	contig_11285_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_5525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGGATATCTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669138	670249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_669100_670200
842916	contig_2703_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_101848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCAGTCCTGCCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368221	1366527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1366500_1368200
842917	contig_6217_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_109691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934249	934880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_934200_934900
842918	contig_5039_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_64894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	1315	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTTTTGTTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585129	584517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_584888_584987
842919	contig_13004_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_112598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCGGAAAAGAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81294	81899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_81300_81900
842920	contig_10800_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_152632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTCAAATAAAGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574984	574159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_574200_575000
842921	contig_13014_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_169345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCACAAGGCTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389501	387560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_387600_389500
842922	contig_5968_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_112207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716817	715436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_715400_716800
842923	contig_7704_pilon	-	963	8	Intergenic	novelGene_154609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	174.823526180324	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	600	932	220403	216744	FALSE	40	CATAATAAAGCATTTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	236201	216712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_235842
842924	contig_20944_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_167531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAATGCTGCTCATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10946	12028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_10900_12000
842925	contig_2278_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_118137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACAGTATGTGTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071482	1072453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1071500_1072500
842927	contig_8712_pilon	+	843	4	Intergenic	novelGene_58755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	120.477752671972	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	108	422	174713	179587	FALSE	20	GCTTGAATGTCTGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLNHVFIQLARLLPPDTFTVARIDVAQNDLPWEFMVDRLPTVLFFPCNRKDLSVKYPEDLPITLPNLLKMSAERGYLAAGAHLPPGAGDPEAAGGNQCPPPSTGAGGGPAGQCPQRRAPAAEAAADLGEAAQPAPAAQ	171865	180008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_171936_174675_174757_179251_179312_179376
842928	contig_10766_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_151225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGTATAAGGGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199904	201265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_199900_201300
842930	contig_11924_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_128019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGACTAGCTTGTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16741	15436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_15400_16700
842933	contig_12638_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_33252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799354	800085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_799400_800100
842934	contig_7057_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_123253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	104	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540547	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540891_541177
842935	contig_9113_pilon	+	1554	4	Intergenic	novelGene_68618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.49443825784929	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	242	1471	645178	659354	FALSE	25	AACTTCTTACACTTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYGNLVSMGLRSSKPKLITQLEQGAEPWMEDGDFPSSTCPVQEYWFEAKISALKQNTSEESLLGEQTKSATMERSLDWEDRRSTEKRHYKCEECGKVFKYNCSFISHQRNHIGEKPHKCKDCGIAFMSSLSLLNHQKIHIDKQLYRCIECGKFLKKHSTYVNHQRIHSKEKPHKCNECGKTFSKNSILLSHQRTHTGQKPYKCSDCGKAFAQNVARTRHERIHSGEKPFKCNECGKAFRDNSTVLEHQKIHTGEKPYQCNECGKAFRKSSTLTSHQRMHTGEKPYHCSTCGKSFRYSSSFAGHQKTHSGDKPYKCSDCGKAFTKSSNLVGHQRIHTGEKPYYCKKCGKAFRQNSGLVEHQRLHTGEKPYECNECGKAFPQSSALKQHKKIHNKDLLNVVGVVNHSE	642574	659437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_642660_645021_645212_645663_645760_658254
842937	contig_1276_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_159765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCATATTACAAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149043	147388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_147400_149000
842938	contig_8027_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_158846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGAGAAGTAATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338388	339732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_338400_339700
842939	contig_5999_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_45605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGATATTTTGCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67663	66220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_66200_67700
842940	contig_13300_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_125836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTATTGCTGTAAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166565	1165468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1165500_1166600
842941	contig_14618_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_136797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	266	676	340752	341162	NA	65	TAAAAAAAAAAAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWKDRVSLQGFWCARGLGRHTPGPESLFRDVWPGFRGQGDVWPPSYAFSGGLKTSSRGRFQLSSVARNSAGLSHLRPQRFTFVWPCVSGSLSGLHSRTPHSGGVCGGKSRKDPVNPLLLVYNALQRVSQPPHYAG	340486	341539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_340500_341500
842942	contig_9415_pilon	+	567	7	Intergenic	novelGene_109779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_5	501.281275001038	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	16	474	1634159	1700432	TRUE	60	CAAAACTTAACAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSEKMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKVNLNCIREGFNVLS	1634143	1703250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1634283_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1698006_1700428_1700495_1703219
842944	contig_7753_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_41480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTGTGATGTTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010082	1009815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1009800_1010100
842945	contig_4364_pilon	-	564	3	Intergenic	novelGene_125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	38	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	19	339	1092764	1092058	FALSE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYVSADMRKMATAFNTTVAALEDELTQLILEGLINARIDSHSKILHARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMNTNM	1092782	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454_1092590_1092653
842947	contig_7031_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_132796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAAATAAATGATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322159	321720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_321700_322200
842948	contig_4852_pilon	-	924	4	Intergenic	novelGene_153981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3.09120616516523	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACATGTTCAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418356	406887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_407208_408253_408704_414050_414145_418296
842949	SIRV6	-	412	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAACGTCGTTACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10694	10238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10391_10434
842950	contig_15354_pilon	+	1046	3	Intergenic	novelGene_65755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.5	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGACCGTGAGTTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639010	642170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_639524_640818_640895_641713
842951	contig_7056_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_43712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACACAAAAAACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933757	931962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_932000_933800
842952	contig_1090_pilon	-	970	8	Intergenic	novelGene_131104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	108.938289964586	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	208	780	330824	304994	FALSE	10	GTAATTTGTGTCTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLRGRLCPGRRGASVRPPVAVPFLLVTWSSAAFIISYVVAVLNGHVNPFLPYISDTGTTPPESGIFGFMINFSAFLGAATMYTRYKIVEKQNETWYFSTPVFNLVSFVLGLVGCIGMGIVANFQELAVPVVHDGGALLAFVCGVVYTLLQSIISYKSCPQWNSLTTCHVRMAISAVSCAAVVPMIACASLISITKLEWNPKEKDYVYHVVSAICEWTVAFGFIFYFLTFIQDFQLFGLHHSMTAHQPGQLPQKLLQNC	366390	304803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_305069_308663_308757_315823_315883_321199_321378_327086_327230_330799_330868_366068_366170_366327
842953	contig_10451_pilon	-	670	3	Intergenic	novelGene_138293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGACCAGGTCGCGCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84156	60724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_60796_61217_61390_83729
842955	contig_10444_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_139465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCAGCTTGTTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842383	844071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_842400_844100
842956	contig_15063_pilon	-	637	2	Intergenic	novelGene_14458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTTTCATTGGGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36782	36035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_36155_36264
842957	contig_18735_pilon	-	1788	6	Intergenic	novelGene_132686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_4	291.499571183218	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACGGAACAGGAAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93231	84676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_84711_85317_85404_86459_86580_86748_86876_91588_91676_91897
842958	contig_1694_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_144936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGAAAACTGAGGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502434	502083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_502100_502400
842959	contig_5018_pilon	-	564	3	Intergenic	novelGene_46983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	81	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCCGCTGTGATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634683	631999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_632449_634465_634522_634624
842961	contig_4125_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_25266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTGGTATTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3076701	3075422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3075400_3076700
842962	contig_8697_pilon	-	433	4	Intergenic	novelGene_83200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3038.38454884609	503	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGGTGTTTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19209	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18369_18573_19181
842963	contig_7285_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_143421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCACTTTTTAGAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362967	361659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_361700_363000
842964	contig_8729_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_40148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATACCCGGTAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684853	685780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_684900_685800
842966	contig_3817_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_78376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865977	865285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_865300_866000
842968	contig_8064_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_164555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTTTATTGAGTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40780	39585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_-_39600_40800
842970	contig_8636_pilon	+	1195	9	Intergenic	novelGene_141928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	168.594743393737	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	501	1052	450918	456940	FALSE	10	ACTGCTACTGTGTGCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSAAVAKQALAHGLKCKSQFTITPGSEQIRATIERDGYAQILRDVGGIVLANACGPCIGQWDRKDIKKGEKNTIVTSYNRNFTGRNDANPETHAFVTSPEIVTALAIAGTLKFNPETDFLTGKDGTKFKLEAPEADEPGQPQCPAPDSVVRHSCPPLLSPLSDHGWFSNHPAFPVLVWFQS	392429	457083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_392473_429634_429772_436550_436758_449665_449741_450879_451038_451238_451313_451844_451957_452835_452947_456805
842971	contig_8554_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_160289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATCTGTGGCTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107682	108392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_107700_108400
842972	SIRV2	-	301	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4562	44	3387	-9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGGTGATTCGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	1044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
842973	contig_11719_pilon	+	957	4	Intergenic	novelGene_154777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	42.5754232705521	191	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGTTTTGTGGCTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158002	160582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_158045_159129_159559_159896_160003_160202
842974	contig_13496_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_107660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459303	458194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_458200_459300
842975	contig_3956_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_14777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAGAGGCTCAGATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966661	965879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_965900_966700
842976	contig_12644_pilon	-	1533	2	Intergenic	novelGene_44435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	392	1360	193516	192548	FALSE	15	GTAGATTGTAGTTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSVPTKEEPGQGLKSKPPNNVYSTRSKVSKFKEIVTHEEAVNENDVLINPISEETTTFPTRGFTLEIGRRKRTKSTAFWWIKPNNVSVVLHAKEPYIEKEEEPEVDTKPTWTSRTFSRVSDFPRSPTFATRTPPIATSKESTDFGESTEDVPQLSGGFDAEKLEAPTFIKHPQILNNDDILKKISDIHSQVQQAPLGDNLIKESREDIQASKDHLRRSIALAAAAEHKLTKMYESQILPLGQTGNEIDSIETVINMLYNSRSKLSEYFDIKYVPPEMREKASTVFTTLKKILCVGREETQRLIRKLIKNNIKILNLLDTA	223670	192374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_193579_223341
842977	contig_11978_pilon	+	460	3	Intergenic	novelGene_63092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2699.5	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829100	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829191_1831108_1831273_1831759
842978	contig_2834_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_28018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACAATAGGATGTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306921	306560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_306600_306900
842979	contig_8954_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_130264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGGTTAAGAGCTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78717	77702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_77700_78700
842980	contig_5696_pilon	-	1284	2	Intergenic	novelGene_117600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	185	331	786951	786805	TRUE	40	TAACACATTGGTGAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLPGSVRWSTWPVSVRRGGGSCRKASRPAVPGTQHGPEAARGRGGREAWRPAGDPFLSGEMGTLPSVSREGTLFFPGFRCLLEPAVGSGPKAGLLLAPQVQVCTVRPV	787135	783634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_783912_786128
842981	contig_7887_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_124847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGAGATGCTCCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43299	44372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_43300_44400
842982	contig_6302_pilon	+	1248	2	Intergenic	novelGene_171714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCTCCCCCCTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486361	493839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_486458_492687
842985	contig_10307_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_170282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452015	450566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_450600_452000
842986	contig_10238_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_170090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67431	66016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_66000_67400
842988	contig_4531_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_47875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACAGGAAACCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	210382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_210400_211400
842989	contig_776_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_139958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGACTTAATTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193565	1194634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1193600_1194600
842991	contig_9752_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_122014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAAGTCTCTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74252	74855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_74300_74900
842992	contig_1637_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_142391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAGAAAAAAAAAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651548	653499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_651500_653500
842993	contig_6412_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_149991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTATGAGAACTGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679199	678391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_678400_679200
842994	contig_1146_pilon	+	894	3	Intergenic	novelGene_84819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	124	junction_2	89	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	841497	841925	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRVSVRSRRHRLLLAVFFLGPGVAGRARVWKRRRLPFLRLPFAAPLPPPRPALRAQAEPGTAVRFPRPPPPPPPPPSSRLPSQPRAGAECRWRPVRAATRASSGGGAWPCRVGEGNEPQSPGVSAEQRRRRRRHQVPAELE	841494	865408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_861728_861787_865015
842997	contig_6446_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_149269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGATAAAAAAAAATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812327	811673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_811700_812300
842998	contig_16650_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_61948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAACTTGTTGTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190648	189630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_189600_190600
842999	contig_7342_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_71141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	276887	277183	NA	30	GCTCAACACCCTACAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGCFARDDQVRPVTFQFKDTRWEWPTPGTEQQNLPPKRPTGPCCLPAPPASCLEPFWSQFSRAGVRPFARERRASWLPRRKQEQRPNSYPKKKEFEF	276885	277917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_276900_277900
843000	contig_3601_pilon	+	493	2	Intergenic	novelGene_132929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTCTATGGGGCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362330	417042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_362737_416955
843001	contig_20641_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_52875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCCAAAGATAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46553	46948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_46600_46900
843002	contig_7411_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_136979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCTCCCTTCTCGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139461	138877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_138900_139500
843003	contig_3822_pilon	+	1321	2	Intergenic	novelGene_133281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	316	810	148325	195266	FALSE	80	GAAAACTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEKIRSLRRDHKPSKEEEGDLLEAGDEEAAAALGGTFTGGRIGTGGSGKGGKACHKIFSNHHHRLQLKAVPASSNPPGAPALPLHNSSLTTTSQSPAALTGTNSIAVVADGGGCPAHYPVHECVFKGDVRRLSSLIRTHNIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKG	148009	195777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_148773_195219
843004	contig_3916_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_141859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	285	395	45738	45628	NA	25	CTTTCATTAGCCGAACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSQEQTVCATRDLKDKQIPQNLLKFQNLRNSSHCFTRPIGTFPSLLCFTFNPQKQFFFAKPLLPPAVAHQPRPKPTHVPGAFPAASPEPSAPCMCSCKPGSSETSPEISSWTQGVCKDLKVPVLGDLSP	46022	44862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_44900_46000
843005	contig_5894_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_83060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTGTAACTCAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589301	588613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_588600_589300
843009	contig_2487_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_148455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATCCAAAGAAGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123282	121451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_121500_123300
843010	contig_7697_pilon	-	820	7	Intergenic	novelGene_128282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	91	423	244060	239738	TRUE	10	ACCCGGGTTCTGCACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQSCKRKIKTQRFLEVSPFTNKKELIIFSIMVQLYLVERREIKFFLAMNFFRCKTVAWAEQRIHFRFNPPEFAAIAFQTDAYLLITSVIIIILFLLLFRCLFVGTVLCFAYSPFRWESRCCLAEQVSPLMSPGTSMPSLW	244150	209803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_209901_219227_219346_221268_221369_225664_225720_239710_239833_241101_241182_243902
843011	contig_21007_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_161544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAATAAACATGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593	890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_900
843013	SIRV6	+	467	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
843014	contig_13145_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_116645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAATAAAAACGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170959	172647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_171000_172600
843015	scaffold_13505_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_111382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTAGGGTGAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14904	14638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_14600_14900
843016	contig_6028_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_156566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTCCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247884	248531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_247900_248500
843018	contig_9609_pilon	-	1329	7	Intergenic	novelGene_22944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	4.71404520791032	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	207	1007	151865	147515	FALSE	50	CAAATGAATATTTAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEVKDVLIPHERVVTHSDQVIGKGHFGVVYHGEYTDQAQNRIHCAIKSLSRITEVQEVEAFLREGLLMSGLHHPNVLALIGITLPPNGLPRVLLPYMHHGDLRQFIRSPQRNPTVKDLISFGLQVAHGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFTVKVADFGLTRGILDKEYYSVRRYRHARLPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELLTRGAPPYPHIDPFDLTDFLAQGRRLHQPEYCPDSLYAVMQRCWATDPGARPTFGVLVREVERVASTLRGNHYVQLSAAYVNVGPTALDWANASVEQPLVPPAPPVHRSGGRPRPLSEPL	152607	147192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_147771_150522_150660_151096_151263_151531_151642_151733_151916_152094_152176_152532
843021	contig_15323_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_148531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATTCAATTGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136403	137750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_136400_137800
843022	contig_11978_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_62983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGTCTTCCCAGGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490907	1490394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1490400_1490900
843023	contig_11978_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_62981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCAGATCTCCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489968	1489217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1489200_1490000
843024	contig_16525_pilon	+	785	4	Intergenic	novelGene_133819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	49.425589413672	398	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	132	734	146630	149786	FALSE	10	GCAGCCTGTCTCCGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPQQPASTASSTSGVSGPGSAGGPGAQQQPQPQAQLVGPAQSGLLQQQQQDFDPVQRYKMLIPQLKESLQTLMKVAAQNLVQNTNIDNGQKSSDGPIQRFDKCLEEFYALCDQLELCLRLAHECLSQSCDSAKHSPTLVPTATKPDAVQPDSLPYPQYLAVIKAQIACAKDIHTALLDCANKVTGKTPTPPPGPGGTL	146498	149837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_146846_147300_147360_147781_147867_149543
843025	contig_11719_pilon	+	508	6	Intergenic	novelGene_154737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2577.87171131536	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTCAGCCACCTCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12999	20020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14336_14504_16247_16326_19126_19183_19997
843026	contig_8674_pilon	-	917	2	Intergenic	novelGene_102901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201373	158146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_158431_200740
843027	contig_10434_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_82016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	715	1050	87495	87830	NA	65	AAAAAAAAAAAATTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIGSHQVGCNTEFLQSIPREVRPSQPAPKCPAIFVWSAYLTPEDIQAAESLDMTPPTNPSSPILGCPYWPDQPVCLLRGEARGSRIHRQPPLLWSWYWLCLQVLLLALPI	86780	88573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_86800_88600
843028	contig_12528_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_81353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGAAATTGACAGGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989811	990929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_989800_990900
843030	contig_2693_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_167602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTATTTTTCCTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301653	302230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_+_301700_302200
843031	contig_9177_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_32832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGAAAATTTTTACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783758	1783250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1783200_1783800
843033	contig_9389_pilon	+	751	7	Intergenic	novelGene_83962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_3	158.033488012299	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGGCACCTCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227565	230109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_227659_228779_228875_228961_229107_229372_229457_229561_229587_229719_229780_229860
843035	contig_10082_pilon	+	777	5	Intergenic	novelGene_63875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTCAGGGACTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212001	224187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_212201_214736_214928_218341_218463_221743_221862_224039
843036	contig_2332_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_58647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249820	248922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_248900_249800
843038	contig_14683_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_166036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35021	34281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_34300_35000
843039	contig_9582_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_106834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACAACAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383241	383647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_383200_383600
843041	scaffold_6394_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_110977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	521	859	373825	374163	NA	75	TAAACCAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALQMLLSSKLLRKHGAVSCFLQREAHLAPVLAGAGGALANAGCWIHFLGLPCQVTTNRVAGNNRNLFSHSPGGQMPKIPVLAGLCSAEASGERSFPVPSGVRWLPAILGL	373304	374232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_373300_374200
843042	contig_8063_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_152438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAAATTTCTCCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675475	676250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_675500_676200
843043	contig_3380_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_60122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGCTCTGTGATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453042	451941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_451900_453000
843045	contig_11802_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_177139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14454	15390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11802_pilon_+_14500_15400
843046	contig_14341_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_111809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATAATCGAGGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473290	472806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_472800_473300
843048	contig_8864_pilon	-	1128	4	Intergenic	novelGene_135970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80900	77372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_77509_77936_78128_79967_80132_80263
843049	contig_5400_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_162832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTCGTGTATCCGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273308	274543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_273300_274500
843050	contig_15104_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_163354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATAATTAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589777	588959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_589000_589800
843051	contig_10855_pilon	+	1491	8	Intergenic	novelGene_124292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_4	31.407135546963	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	315	902	237146	240671	FALSE	15	AGTGCCCCCAGTGGGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NITVYGAAWLLLHLQGSPHVGPTQEISDELGVQDVPVFRNLSLLVVGIGAVFSLLFHLGTREGRRPRWEEPDEHSPLLTHEAQPLLLWKHWLQEPAFYQVGLLYMSTRLIVNLSQTYMAMYLTYSLSLPKKFIAIIPLVMYLSGFFSSFLMKPINKWIGRNMTYFTGLLVILAFSAWVALANGLGVAVYVAAVLLGMGCATILVTSLAMTADLIGPHTHSGAFVYGAMSFSDKVANGLAVMAIQSLHPRGSDLCCTACVGFYHWVMVAVTGGVGVAATLVLCSLLLWPIRLRSWNPGTQ	236353	241260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_236473_236584_236765_237130_237224_237315_237409_238683_238855_238938_239034_240419_240551_240651
843053	contig_5899_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_146986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAGAATGTTTTGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341515	340572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_340600_341500
843054	contig_6434_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_61824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	347843	347496	NA	25	TTTATTGAGCGACTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPLLRAEPGAAPSARQRGTATPRLATLPASAGGQAPACFSLPLGVRVEGSFGWNVNPFFCKTTLAPGVFPRPPGRGLTAESCLPGRPGLALGASPPWLLLRTSERPSPCRLLSF	347845	346425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_346400_347800
843055	contig_10904_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_22639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGATACTGTACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503857	504977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_503900_505000
843056	contig_4232_pilon	-	746	7	Intergenic	novelGene_63164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.387961140811	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	59	637	90602	88928	FALSE	10	CATCGGTGTCTCTCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSKKKKYNARFPPARIKKIMQTDEEIGKVAAAVPVIISRALELFLESLLKKACQVTQSRNAKTMTTSHLKQCIELEQQFDFLKDLVASVPDMQGDGEDNHMDGDKGARRWTVPSRRGRKPGSSSRKNGGMGSKGKDKKLSGTDSEQEDESEDTDTEGEEETPQPPPQASHPPAHFQSPPTPFMPFTSTVPLPPAPPGPSAPDAEDEEDYDS	90896	88818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_89034_89375_89465_89719_89835_89927_90048_90362_90457_90547_90621_90856
843057	contig_10437_pilon	+	757	5	Intergenic	novelGene_38477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	60.0687106570467	189	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	13	576	1169851	1173883	FALSE	0	TTCTTCGTGGTGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLYGKPIRVNKAPALGGSHHPDHHLECLILDPLQWACPPRGPPFGSPMGHPGPMPPHGMRGPPPLMPPHGYTGPPRPPPYGYQRGPLPPPRPTPRPPVPPRGPLRGPLPQ	1169838	1174064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169885_1170349_1170479_1170741_1170844_1173385_1173497_1173695
843058	contig_5039_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_64921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138744	1139725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1138700_1139700
843059	contig_15123_pilon	-	817	6	Intergenic	novelGene_110911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	189.877434151613	49	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	164	799	250047	217220	FALSE	15	TAGTGCTGAGCTGCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLHATRAAALLTWVNSLRVANPVEAVLQLQDCSIFLKIIDSIRGTEEGQQIMKQPVPERWDFVCSFLQKSPIQGLPQHPQWNPPLSSHRHHHSQRRQCCRCHPSGQGQGGGPEVPVSGPTCVPNAALAWSFFYCPSQCLLSAPRPTVAKPQETVMPPTPRAPCLRGGVGWQPSQAAHPQLPRTCTGVGFGVMGKLLRARDGSFLNVITCK	255052	217201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_217513_217905_218041_238060_238141_244656_244743_250005_250076_254917
843061	contig_3787_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_102444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAAAATGTATATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732216	732947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_732200_732900
843063	SIRV6	+	295	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	-236	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7920_10727
843064	contig_4908_pilon	+	1724	10	Intergenic	novelGene_117378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	63.4918095233016	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	313	1587	125797	137867	FALSE	55	ACTAATTAAAGTGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAARDLQEFVPFGRDHCKHHPNALNLQLRQLQPASELWSSDGAAGLVGSLQEVTIHEKQKESWQLRKGISEIGEEVDYDEELYVAGNMVIWSKGSKSQALAVYKAFTVDSPVQQALWCDFITSQDKSEKAYSGDEVEKCICILQSSCINMHSIEGKDYIASLPFQVANVWPTKYGLLFERSSSSHEVPAVPPRKPLPTLFSMLHPLDEITPLVCKSGSLFGSSRVQYVVDHAMKIVFLNTDPSIVMTYDTVQGLHSVWALRRVKPEEENVVLKFSEQGGTPQNVATSSSLTAHLRSLSKGDSSVTSPFQNYSSIHSQSRSTSSPSLHSRSPSISNMAALSRAHSPALGVHSFSGVQRFNLSSHNQSPKRHSISHSPNSTSNDSFFAPETEPIVPELCIDHLWTETITNTRFGVYIFIFKEKCC	123529	138004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_123788_125742_125980_127010_127173_133236_133289_133483_133585_134216_134300_135393_135468_136341_136488_136708_136930_137614
843065	contig_12019_pilon	+	1215	6	Intergenic	novelGene_87744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	186.874717391091	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	5	529	623214	642146	TRUE	35	AATATGTTACATTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELLHRLPGPPACSP	623209	643220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635792_642104_642501_642888
843066	contig_3181_pilon	+	744	2	Intergenic	novelGene_136930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	269	334	300182	300247	FALSE	85	AACATACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTFERGLELHAKVTVFAEGCHGHLAKQLYKKFDLRASCDPQTYGIGLKELWIIDEKKWKPGRVDHTVGWPLDRHTYGGSFLYHLSEGEPMVALGLVVSSVPAWKVLPLES	298284	300657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_298433_300061
843067	contig_12119_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_88681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAATGTTACTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376476	378082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_376500_378100
843068	contig_17936_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_29966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	885	1193	93878	94186	NA	30	CAACCAAAGGTTCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPKPKCEEGKVCLPSLELPDSPFRAQGLSPIHATLLEFAGRNDCALPGNPSLGVLYLTKACALQVCSPSGSKDLVLSWRNVKDQRSGGWDFGVALGLSLAL	92993	94680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_93000_94700
843069	contig_6735_pilon	-	758	9	Intergenic	novelGene_15760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	903.050109351635	1	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	46	756	564868	541990	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGVVVRSWDSESQTHMWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKVLGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKCCLPTFLSCRDISESSLCPVLKLKIKWDYGS	568251	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542083_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552945_554239_554374_564157_564232_564784_564869_568206
843070	contig_7810_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_144232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCTGAAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651650	653045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_651600_653000
843071	contig_13014_pilon	-	690	2	Intergenic	novelGene_169327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAACTGCTCCGTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288319	286173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_286789_288244
843072	contig_14637_pilon	-	764	3	Intergenic	novelGene_114558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	494	junction_2	49	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	53	364	391450	377704	FALSE	80	CTAAAAAAAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGGAGRPAGSERSRVRMDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLAIWVRVFKIYLKLILSKLIPFREAEVDLCNIPEANEQFVLNSFW	391502	377303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_377892_389892_389949_391382
843073	contig_4315_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_46740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCCTTGAATTCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169942	170897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_169900_170900
843075	contig_12201_pilon	-	671	5	Intergenic	novelGene_159978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_3	273.917414561397	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	9	500	124443	110501	FALSE	40	GTAAATAAAAGTCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQLLITVAFNQPVKLYSMKFQGPDNGQGPKYVKIFINLPRSMDFEEAERSEPTQALELTEDDIKEDGIVPLRYVKFQNVNSVTIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	124451	110329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329
843077	contig_755_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_119756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAATAATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57213	56713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_56700_57200
843078	contig_11931_pilon	-	2144	3	Intergenic	novelGene_159905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	13	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	1815	2144	343973	325817	FALSE	20	TCGGCAACATCCAGCGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFYLCLCVDLLLICFQGVPENERRTTKAESAWLFRIWYNFDHNYLKPLLTHSGPPLTTTLPACCGPIARCLTSPQAYENQEQLKDDDSDLILNDGDISLTYGDSTVNTE	345787	325816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_-_325910_328938_329045_343842
843080	contig_10196_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_132217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	216	632	1333810	1334226	NA	15	GTCTCTACTGTCTTAACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSGRPQLLAAASCLHRNVRRTLWVDVFPGGRGPTGVGSGSRKAGERGADGSFPPHSEACTQPFLEWGTRWEEDAGGSPQAGWTQQARRRRIVHIGRLRFKDTARELNYLVSNFCIDDMLKYYFGYVRLNEINKIDFI	1333594	1334226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1333600_1334200
843081	contig_9578_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_67983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	867	1166	1148065	1147766	NA	80	AAATGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCIFNITFKKPPCISVTTLLFPWNWNHHQQQESIPAAGFWLSFLCYYGDCLASSRKTKSLKNSDLITKYSFNPSSNQVFHNLGIFEFHIVLGSSRFLE	1148931	1147489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1147500_1148900
843082	contig_11026_pilon	+	1222	5	Intergenic	novelGene_167677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	77.4705589240196	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	139	696	220673	222883	TRUE	10	ACGTGACGTGTGGGGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWPWQVSLHALGQGHVCGASLISPTWLVSAAHCHIDDKGFRYSDPAMWTAYLGLHDQSKRSDPGVQEHKLKRIIRHPSFNDFTYDYDLALLELEQPAEYSSVVRPICLPDATHVFPAGKAIWVTGWGHTQEGGSSALILQKGEIRVINQTTCESLLPQQLSARMMCVGYLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCARRNKPGVYTRLSMFRGWIKEQTGV	205480	224593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_205603_220656_220932_221998_222136_222721_222915_224098
843085	contig_5954_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_28733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGAAATTCATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186746	1184613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1184936_1186585
843086	contig_18620_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_168579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAAGAGGCTGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45956	45633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_45600_46000
843087	contig_20610_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_67651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	328	657	55091	54762	NA	60	GTAAAAAAAAAACCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYTHTMKYYSATKKNEVLIQATTRMNLENKLSERSQLQKTMYYMTPFICIIQNRQICKFLGGVNGLHLTANQKVGSSNSSSGIVEEKAWQSASIKITVKKILWSSSII	55418	54523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_54500_55400
843089	contig_2069_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_23393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	114	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGAGATGTCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115866	1117995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1115900_1118000
843090	contig_709_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_57619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCCACGGCAGCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2451913	2450412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2450400_2451900
843092	contig_12923_pilon	+	888	8	Intergenic	novelGene_30180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	201.458559064658	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	527	886	332961	349174	FALSE	20	TGGATGGGATAGTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLHGSLNKMGCKETTLNKVM	330851	349176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_330990_332130_332197_332638_332964_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344041_349122
843093	contig_16970_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_157599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCAAGTTTTGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70306	71727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_70300_71700
843095	contig_14357_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_121656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATAAGGAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464182	463677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_463700_464200
843096	contig_16666_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_61784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTACAATTCCACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107150	106490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_106500_107200
843097	contig_5988_pilon	-	1044	6	Intergenic	novelGene_16045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	16	junction_5	21.7016128432889	27	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	303	686	1043149	1042346	FALSE	20	GGTAGTTTCTTTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPDFDNQTLAVLRGRMVRYLMRSREITLGRATKDNQIDVDLSLEGPAWKISRKQGVIKLKNNGDFFIANEGRRPIYIDGRPVLCGSKWRLSNNSVVEIASLRFVFLINQDLIALIRAEAAKITPQ	1044026	1041987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1042433_1042547_1042676_1042844_1042933_1043068_1043152_1043345_1043587_1043967
843100	contig_15353_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_151968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277449	277846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_277400_277800
843102	contig_6191_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_107859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195624	196583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_195600_196600
843103	contig_17074_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_145174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	416	739	580498	580175	NA	55	ACAAAAAAAAAGTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEAGVEGHPCAHTAAAQGGVRRQGHACLLFHGQCHRLKNTSPWGRGGLWLLMTEDLGWGQQIVGATKWLFSQSWLHKTSCHQVDSDSWQPHACQSRTVLHRVFSG	580913	579638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_579600_580900
843104	contig_12079_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_67352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87369	88624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_87400_88600
843109	contig_5050_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_110249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTAAAAAAAAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138114	137650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_137600_138100
843111	contig_5056_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_171161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATTAAAGAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117968	116758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_-_116800_118000
843112	scaffold_13505_pilon	+	283	3	Intergenic	novelGene_111498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGCAGGACAGGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540214	542033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_540260_541299_541355_541850
843116	contig_8978_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_49435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGACATAAAACAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542326	541956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_542000_542300
843117	contig_14142_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_120640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTACAAAAATGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621896	622505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_621900_622500
843120	contig_10629_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_52893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACAGTGGCTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219236	218786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_218800_219200
843122	contig_7720_pilon	+	1881	10	Intergenic	novelGene_155804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.684934889218775	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	302	964	1019253	1031118	TRUE	35	TACTGATTTTACCAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQQSVRAQHLRDLQVIEAYRERTKAEGIASLLSLAITTQHTLYTSLGTAEFFEFALKNPHNTQHTVTVEIDNPELSVILDSREWRHFKDAAGLLTPVEEDMFHLRGGGLAPQLYLRPKETAHIPFKYQTFSLGQPAATQASAELRPEQGVDTEPPWKSSAAPTKHAKVTFRASSGKPLAVLCLAVEPQPHVVDQIFRFYHPELTFLKKSIRLPPWHMLPGAPVGPPGEDPPIHVRCSDPNVICETQNVGPGGAPRCVPEGGQWSKPRDKGLLCHHLRGSLAGSTCPDLAGPPSLPAACGRLLRHRPADPPVPGPSGDTDS	1018505	1034768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_1018734_1019179_1019370_1020209_1020294_1028268_1028426_1028972_1029059_1029647_1029735_1030986_1031159_1032066_1032247_1032573_1032718_1034215
843123	contig_5964_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_80370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTATCTATGGGGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380498	380950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_380500_381000
843124	contig_12817_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_174767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGTTGTCTATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112411	114357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12817_pilon_+_112400_114400
843125	contig_5434_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_74638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAATGTCAAAATATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8881	9788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_8900_9800
843126	contig_10479_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_147092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACTCTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13785	12822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_12800_13800
843127	contig_755_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_119793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAACAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622490	620975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_621000_622500
843129	contig_6975_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_74234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTGAACCCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24392	24759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_24400_24800
843130	contig_9945_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_104823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127940	129103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_127900_129100
843131	contig_11908_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_133230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	285	476	692735	692926	NA	50	ACTTACTCAATGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAASVELVIGWCIFGLLLLVGEALGVFPVFRLVGGREGPILQLSSPGPGDPSRPAPPRFWLGLWGGSSVPEGGGRRWEGPGGALICGWFWFLSLMMSDAAGFFSPNLALTPDLDTAGSGDGRRRRPSRVKRVWSPLWSPVTLGLWVCGGDAGSLRAQ	692450	693212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692400_693200
843132	contig_9363_pilon	-	1535	8	Intergenic	novelGene_6533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.48461497791618	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	13	1329	626817	623686	FALSE	25	AACTGCCTTTCACACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLTVSEDPALGNISSSCYQPRPDSYHLLRDPVTGDLPWPALLLGLTIVSSWYWCSDQVIVQRCLAGKNLTHIKAGCILCGYLKLMPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCKRVCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGMRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRLRPRASDPELLLVGRLWVVLIVAVSVAWLPVVQAAQGGQLFDYMQSVSSYLAPPVSAVFILALFVPRVNEKGAFWGLIGGLLMGLARLIPEFSFGSGSCVRPSKCPALICGVHYLYFAIVLFVCSGLLTLVVSLCTAPIPRKHLHRLVFSLRYSKEDREDLDADEELEGPTSLPVQNGRLEHAAEMEEPQPSAPGLFRHCLFWFCGISSGGAVSSPPPAQEEAAAAARRLEDISEDPTWARVVNLNALLMMAVAMFLWGFYA	626829	623479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_623913_623989_624123_624966_625183_625252_625422_625546_625698_625826_625935_626183_626320_626640
843133	contig_8594_pilon	+	121	1	Intergenic	novelGene_140015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAGAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125995	126116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_126000_126100
843135	contig_5686_pilon	+	836	2	Intergenic	novelGene_45348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTATAAAAGAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120093	123271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120279_122620
843137	contig_7411_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_137057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998731	997432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_997400_998700
843139	contig_9335_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_147467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674092	674526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_674100_674500
843141	contig_2310_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_71617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACTTTCACTTTATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120419	119943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_119900_120400
843142	contig_11929_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_171236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAAAGCTTTACTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92649	91710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_-_91700_92600
843143	contig_6726_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_86222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTAAAAAGAGCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247601	246933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_246900_247600
843144	contig_3975_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_54716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTTCTGAGAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472454	1473918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1472500_1473900
843145	contig_546_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_117255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	542	1180	738196	738834	NA	50	GCAATAAATGTACACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQSRGRKDLKKHDRSMCCLQATYHRHKVINRLKIKGWKIIYKAKSHQKTAGVAVLISDKINFNSKSIIRDKEGPYITIKGSNQQEDITVNFYAPSARATKFIKQTLTELKKEIDSFTIIVGDFNTPLSMLESTTRKKINKDREDLNNTLNQLDLRDICRTHHPTAAQYTFFSNAHETFTRIDHIFGHKARLSKFKKIKIMQNIFSDHNNLK	737654	739021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_737700_739000
843146	contig_8954_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_130252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATGGACACACACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28844	27451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_27500_28800
843148	contig_14142_pilon	+	762	2	Intergenic	novelGene_120513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAATGCTCTACTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345449	348618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_345789_348195
843149	contig_1239_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_150405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576495	575938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_575900_576500
843150	contig_10455_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_177437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAAATTATGAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195013	195257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10455_pilon_+_195000_195300
843151	contig_13428_pilon	+	1063	2	Intergenic	novelGene_143449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGCACAATCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82521	84328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_82839_83582
843152	contig_6102_pilon	+	260	4	Intergenic	novelGene_31790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7954	junction_1	2053.07785207153	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCGATCGCCGCGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360097	361050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864
843153	contig_7410_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_106074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTGTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374357	373494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_373500_374400
843154	contig_7066_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_42123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTCTTTGAAATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608364	609489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_608400_609500
843155	contig_614_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_132657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTGACATAATTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106872	1105609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1105600_1106900
843156	contig_4604_pilon	+	874	5	Intergenic	novelGene_19195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_4	61.7550605213856	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	23	451	535613	548080	FALSE	35	AGACTTCAGAAATGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPIELLSMKRYELPAPSSGQKNDITAWQECVNNSMAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNENLVHMIEHAQKELQKLRKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	535590	548503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_535621_540751_540914_545202_545254_545868_545950_547953
843157	contig_8683_pilon	+	932	3	Intergenic	novelGene_150256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	12.5	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	264	830	599012	606012	FALSE	15	AGGACGGCCGCCCTAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFLFKNSIKVSCLCLEENVENDPCKFALTSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWIHEINQILENQRNFLNALTSPIEYQRNHSGGGGGSSGGGGGGSGGPSSSSSNHSGGPSSCSGMPSSSRSRPSRIPQPVRHHSPVLVSSAASSQAEADKMSGTSAHGPSLPPPSSGLAPGGPPQPAEQAPSWRRM	598748	606114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_599045_602880_603059_605656
843158	contig_2757_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_164570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGGCTGAAAACCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47632	46193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_46200_47600
843163	contig_6272_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_160438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	3	413	117754	118164	NA	70	TTGGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADVLSLASRRLCPEICGCRIHASFRCVRRSGIRVRSGATPGEGRAWLDRAKVPSGPERGATTRAPLGFPPPRLLSAPQGQREAASKVRKERFFAAEGRISAPVFPWLRPQPVSRLPFLSEVAFCGVWTRPRGAYWL	117751	118575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_117800_118600
843164	contig_9363_pilon	+	677	5	Intergenic	novelGene_6800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	230.285013624422	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	266	676	1622283	1625952	FALSE	10	GCTGAGCTGCCCTGGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQLPAASARLTQTLTIERRGVEIGPFLPKSGVGSPASRSAWTLPLPALQFAVRPLPEQASPAPSRPCSPSSGVTPLHPRCIFNK	1622017	1625953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623031_1625767
843168	scaffold_15568_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_122579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGCTCATCACGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59281	58649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_58600_59300
843169	contig_11294_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_50065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCTTCATCGAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295394	294736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_294700_295400
843171	contig_7078_pilon	-	502	4	Intergenic	novelGene_130211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCTGAATATTTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982394	951535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951555_963631_963733_975279_975384_982116
843173	contig_9875_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_154414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAATAAGTAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241269	241079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_241100_241300
843174	contig_10437_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_38460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGAAACTTTCGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096173	1094776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1094800_1096200
843175	contig_5765_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_141387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640865	642153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_640900_642200
843176	contig_5316_pilon	+	589	2	Intergenic	novelGene_61203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_1	0	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATATGTAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395999	454143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453775
843178	contig_15613_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_147227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTCCTTTTGAGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286887	285935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_285900_286900
843179	contig_8452_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_48065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATAGATGGTTCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502471	502258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_502300_502500
843180	contig_16098_pilon	-	603	6	Intergenic	novelGene_45992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1881.45820043922	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	121	603	352350	348289	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFFKPQWQIRKNNNKMALFSG	354109	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348350_349346_349493_349604_349710_349955_350059_352282_352352_353990
843184	contig_593_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_102021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCAGTCTCAAGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437028	435804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_435800_437000
843185	contig_2684_pilon	+	1206	2	Intergenic	novelGene_172696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	232	480	140730	140978	FALSE	25	AAACCATGCCCCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRGGVEASDPESGASSLSGGSEEGSSSERKKQKQKGGTGRRRFGKPKARERQRVKDADGVLCRYKKILGTFQKLKSMSRAFEHHCVDRNTVALTTPIAELLIVAPEKLAEVGEFDPSKERLLEYSRRCFLALDEETLKKVQALKKSKLLLPITYRFKR	139271	141704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_139435_140661
843186	contig_8674_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_102881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18238	17163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_17200_18200
843187	contig_15327_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_70541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCCTTAAAAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520164	519275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_519300_520200
843188	contig_17796_pilon	+	691	5	Intergenic	novelGene_33834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_4	341.263369701467	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTAGTTTCTTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99241	120567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
843189	contig_6017_pilon	-	341	3	Intergenic	novelGene_152550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3344	23	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAATGGAATAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442543	440595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442277_442466
843191	contig_16098_pilon	+	902	2	Intergenic	novelGene_46179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGTGGCAGGACAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589408	684970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_589548_684207
843192	contig_6914_pilon	-	1525	3	Intergenic	novelGene_151762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	108.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTACATCTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327947	326062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_326313_326481_326593_326783
843193	contig_5056_pilon	-	1702	3	Intergenic	novelGene_171160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_1	15	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	301	669	116299	114174	FALSE	45	AGTGCAAATAAAATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVDDSARLGHAASVNIPQYASEDAELLLVGNKLDCDTDREITRQQGEKFAQQITGMRFCEASAKDNFNVDEIFLKLVDDILKKMPLDILRNELSNSILSLQPEPEIPPELPPPRPHVRCC	116599	113140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_-_114288_115282_115388_116149
843195	contig_10238_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_170099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	41.5173156646718	282	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	20	595	177786	183428	FALSE	35	AAGTTACAAAGATTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESNSAMVRSKNQEINKKLNTHNRNEPEYNVGQPGTEIFNMPAISGSGLVTCRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGGGGGKTKASGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLPAGSGPLAGPHHAWDEEPKPLLCSQYETLSDSE	177766	184325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_177856_178548_178603_181616_181704_182660_182844_183246
843196	contig_6028_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_156595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAACACACATCCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334168	334402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_334200_334400
843197	contig_6028_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_156596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTCGCAGTTTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334406	335471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_334400_335500
843198	contig_16156_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_137094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677475	676576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_676600_677500
843199	contig_9646_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_117425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGGTTAACTTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135156	135986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_135200_136000
843200	contig_12970_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_50539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGAAGAATCTTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419121	420109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_419100_420100
843202	contig_3825_pilon	-	1144	2	Intergenic	novelGene_78047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2498409	2496419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2497493_2498338
843203	contig_6131_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_177439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACAGCTCATCTAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238776	238432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6131_pilon_-_238400_238800
843204	contig_10489_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_165634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479288	480494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_479300_480500
843205	contig_15744_pilon	-	515	2	Intergenic	novelGene_83577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACCAGCGTGGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153581	149503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_149680_153242
843207	contig_13707_pilon	-	700	2	Intergenic	novelGene_43582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275487	274747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_275158_275197
843208	contig_19899_pilon	+	1165	2	Intergenic	novelGene_102501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	80	1141	97918	98979	FALSE	35	ACACATAACCCGAGTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDRKLSLDVRPSHCPRASAALLVVKMSAKNQIAARAALIEQLMANRNFEDLGNHLTELETIHVTKEHLQETDVVRVVYRVLKHCPAVAWKKKAKCLLSKWKALYKTTHFKPMNNPQLSPTSGNKEENSGLSHDPSQDEILDISSSNSWLSSQDTGKAIEMIGPANSAVHVAPKEGHCSGCDPTPTGKESSESLVAPTMPVRTRCIELLYEALTSSSTDPSKADLWQKFAREIEEHIFALYSRNLKKYKTCIRSKVSNLKNPRNSHLQQNLLSGTMSPREFAAMTVLEMANQELKELRAAYTESSIQEHRLPEGLDGTPTNKIKCRRCEKYNCKVTVIARGTLFLPSWVRNSNPDEQMMTYVICNECGEQWYHSKWVCL	88394	99003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_88466_97909
843209	contig_8795_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_146892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176838	178314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_+_176800_178300
843210	contig_9481_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_149638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCACGATAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119880	120925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_119900_120900
843211	contig_12098_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_160661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGACAGGGCCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92818	93263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_92800_93300
843212	contig_12098_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_160662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGAAAGTTTTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93712	94479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_93700_94500
843213	contig_10235_pilon	-	1030	7	Intergenic	novelGene_46612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	186.5731908811	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	331	561	604723	604239	TRUE	15	TCTTCCTCAGTTTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGGWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN	605557	603020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_603180_603864_604057_604120_604332_604460_604548_604672_604762_605139_605294_605419
843215	contig_5812_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_167488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAGAATGCCAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73977	72966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_73000_74000
843216	contig_1154_pilon	-	1046	7	Intergenic	novelGene_87143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.89806736219163	96	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	285	647	850655	846716	FALSE	25	CGCACTGTCCCTAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDDEKQERSRGKEQRKLARQRSRAWLKEGGGDEPLNFLDPKVAQRVLATQPGPGRGKKKDHGFKVSADGRLIIRETDDGDQVEEEDGTKGEEEEMADLMEDMGVRSKKHQKLKRRQEADDEELEMPPQYQAGGSGIHRPLAKKATPGAEYKAKKAKGDVKKKGRLDPYAYIPLNRTKLNRRKKVKLQGQFKGLVKAAQRGSQAGHKLRRKDHRP	852564	846316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_846819_847997_848081_848452_848521_850006_850080_850619_850670_852078_852205_852420
843218	contig_3269_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_117009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCGTATGTAATTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54959	53786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_53800_55000
843220	contig_1594_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_138841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGCGAAACACAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676400	675017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_675000_676400
843221	contig_3817_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_78351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAGAGCCACAGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562838	562571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_562600_562800
843222	contig_9997_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_169473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGATTTAAACAGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109872	108276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_-_108300_109900
843223	contig_16532_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_110046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCCATTTTCGTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192104	192497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_192100_192500
843226	contig_7294_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_172597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAGATAGAAATGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170082	171236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_+_170100_171200
843228	contig_5084_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_64660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGACTATTAGAACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499943	1501368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1499900_1501400
843229	contig_7457_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_31568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878200	873392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_873774_878092
843230	contig_5018_pilon	+	1385	11	Intergenic	novelGene_47169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	11.8338497539896	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	65	1078	1522522	1527161	FALSE	10	TCCTGGACTCTGGGCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEKWLFECRNLEEKYESVTKEKERLLTERDSLREANEELRCAQLQPRGLSPADPSLDPTSPAVENLAAEILPTELRETLLRLQLENKRLCQQEAADRERQEELQLHLEEANRARHRLETQHRLNQQQLSELRAQVEDLQKALQDPGVKSEDPTLLKRKLEEHLQKLHEADLELQRKREYIEELEPPADSSTARRIEELQHSLQKKDADLRAMEERYRRYVDKARTVIQTLEPKQQPPGGAPPELHALRTQLRERDVRIRHLEMDFEKSRSQREQEEKLLISAWYNMGMALQQRAGEERAPAHAQSFLARQRLATNTRRGPLGRLASLNLHPTDKY	1522457	1527468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1522597_1522704_1522793_1523363_1523434_1524180_1524319_1524402_1524491_1524688_1524724_1526151_1526235_1526317_1526422_1526681_1526793_1526859_1526932_1527011
843231	contig_19986_pilon	-	835	5	Intergenic	novelGene_159230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_2	44.5365018832867	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	167	835	56946	50621	FALSE	25	CCTGTGCAAGGTAATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTVTRALEETLRQHFIYQKLEIAYAIHKPFPFFEGLRDKYFITEKMYEESLEACQNLVPVSRVVHNILTKLERTFDLSFLVVLFSPINLREYPNLMTILRSFRRVGDACGGWSRAMPVLSPAPADPAEGSSNVQPAHQDLLPWPPLLHTLPNRPPCAPRVHQPEASTQQSSEILGEPLSPSGPAVALPEFIQEGRVTPVFHDNLTSKTNEKDSEEMPSRLPG	63410	50620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_50692_51440_51723_53920_54090_56799_56948_63245
843232	contig_18799_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_171417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTCTACCTCATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20032	20731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_20000_20700
843233	contig_10500_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_41160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	278	352	1252301	1252375	NA	35	AGCCTATTCATGCCATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSKRNNFARLQKNSSSSSSPVFTSILSGRGTTGSKCGPSSSSSPWALPPSASRFLFANSGAGVPNTDFPGPWKVNISSLRRKPEFLCWFGPMFSANEIPDRFLLPKLNVFRGPMV	1252023	1252915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1252000_1252900
843234	contig_10386_pilon	+	1132	2	Intergenic	novelGene_173536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	182	1132	88066	89016	FALSE	15	TCTTGTTATTTTGGTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSPLDDRVVVALSRPVRPQDLNLCLDSSYIGSATPGSDSHPPVIATTVVSLKAANLTYMPSSSGSARSLNCGCSSASCCTVATYDKDSQTQTQAIAAGTATTAIGTSTTCPTNQMVNNNENTGPLTPSGGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPSDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGNAPVPLPSTVLISLGFHLEVTVFFFPWLQKTKTDLLLLLVFPSMPF	85673	89016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_85812_88022
843236	contig_5145_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_131349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25349	24411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_24400_25300
843237	contig_9807_pilon	+	1552	2	Intergenic	novelGene_32853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	116	442	109130	109867	FALSE	55	AGAAAGCAAAAATTGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDVSNTPSSGPGFRFCAVPFGILILFPSPLPVSSPVAERGEGATPPPPGDHIPEPGSWFQFIQS	109014	110977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556
843238	contig_17880_pilon	-	1181	8	Intergenic	novelGene_167330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	72.2651015218216	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	10	612	46189	37131	TRUE	75	ATAAAATCAATAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEDVNALLVQACRLVPLSQNHLVSKVSQLIHHLLNRLQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKYLPDSVGKTGLLMKLSDPAQSDPEVRRAAVHCMANLCLSCYKMH	46198	31448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_31501_33341_33638_35770_35909_37047_37150_40628_40745_41000_41142_43188_43297_45970
843239	contig_5389_pilon	-	1147	11	Intergenic	novelGene_143004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	233.375748525848	96	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	128	967	254084	240038	FALSE	20	GCCTCATGCCTCCCAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPARKGRSRSTKTNSLRSRKLASFLKDFDREVQIRYKQIQSDRQNLLKEMDNLYNIEILRLPKALREMNWLDYFALGGNKQALEEAATADLDITEINKLTAEAIQTPLKAAKTRKAIQMDEVIAEEEEENKNKNLQITRVKRCPPSKKRTQSIQGKGRSKRSSRCNTVTPAMNRLELSMIKPTPGLTPRFDSRVFKTPGLRTPAARERIYNVSVNGSPLADSKEIFLTVPVGGGESMRLLASDLRRIDITQLDPEALGSIKKLSSRLAQICSSIQSHK	254367	239857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_240083_241195_241283_242075_242203_243548_243645_244513_244579_246253_246334_248993_249067_251240_251282_253715_253845_253987_254101_254256
843242	contig_10609_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_123947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462014	460767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_460800_462000
843243	contig_6102_pilon	+	588	5	Intergenic	novelGene_31966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1634.55643830368	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	42	431	413086	416047	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDGEHPLFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414239_414378_414645_414788_414877_414956_416018
843244	contig_1301_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_47432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGCAGATTTAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986250	986603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_986200_986600
843245	contig_17880_pilon	-	1296	4	Intergenic	novelGene_167318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	149	junction_1	57.3120115391762	18	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	104	538	15265	12708	FALSE	30	CTGGATAGGAAGATGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKAATSRALGVYVLFPCLRQDVIFVADTANAILMSLQDKSLNVRAKAAWSLGNLTDTLIINMETPDPSFQEEFSGLLLLEMLRSAIEASKDKDKVKSNAVRALGNLLHFLQPSHIENPRFTAIIEEAILALISTVVVEAAMKVRWNACYALGNVFKNPALPLGKKVSSFFLGEDLFG	16723	11949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_12960_14022_14120_15179_15305_16659
843246	contig_17198_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_62373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892940	893571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_892900_893600
843247	contig_3132_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_127443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGGGCAACATCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299340	299692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_299300_299700
843248	contig_9875_pilon	-	643	5	Intergenic	novelGene_154419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	12.9903810567666	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCTCTTACATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427090	349240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_349284_351852_352033_356118_356291_381793_381943_426991
843249	contig_10855_pilon	-	1092	7	Intergenic	novelGene_124282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.06718737290547	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	125	967	52004	47701	FALSE	10	CACTGGCTTCTAGTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLTAEMPDQFEIAESMLRTDTPSKIIKLDTVRVIAEKDKHALLDVTPSAVERLNYVQYYPIVVFCAPESRSTLKALRQWLAPASRRSSRRLYAQAQKLQKHSSHIFTATIPLHGTSDAWYQELKAIICEQQTRPIWTAEDQLDSSSDDNLDLPLRALADSSADLSCDSRANSDYETDGEGYTDGEGGPCTDVDEEPPARALARSSEPVLADEPQNPQDHGRSVAHRGIQVDSWHSKGQWRQDSMRTYEREALKKKFTRARDMESSDEDGYDWGPATDL	52128	47575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_47804_48202_48250_49735_50000_50784_50886_50960_51172_51607_51679_51958
843250	contig_14556_pilon	-	1717	3	Intergenic	novelGene_138521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	1406	1717	124077	120879	FALSE	30	TCTGCATCTTCAGGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHIQIFSIVGKSYKRQLISHKSFRNWKGFYISFIIFNVIKIAAVYVTAEFRYYRSCSFSYVIPIPLIILKERMLFDFFYPISPKSYLLSVKKAQMRFFACLEI	125482	120878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_120926_123065_123158_123904
843251	scaffold_12124_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_22189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246834	1246320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1246300_1246800
843252	contig_4364_pilon	-	441	2	Intergenic	novelGene_124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	3	440	1092593	1091834	FALSE	5	CTCCCTGGCTCCATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADPARPGRGPAQHHFREVPPDGQGVPAPRESHDPARRGAAQPDPRQVSSPGRESGGAHTRKQPVPDEHQHVRRLPVDHCCPQPLWRKPGATEASSKGWPCPHSPLGSLSPAAGYWPCGLRRVQPPSPIPAAVLSGVKTLIKEQTAN	1092595	1091832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1092133_1092454
843253	contig_14322_pilon	+	546	2	Intergenic	novelGene_115663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCTGTGCGTTTTGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533431	534409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_533541_533972
843254	contig_8775_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_166836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCCCACGGGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262683	261471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_261500_262700
843255	contig_15087_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_37232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAAACTAAATCGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144766	145653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_144800_145700
843259	contig_10019_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_86702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATAATAGTGACCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419599	418550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_418600_419600
843260	scaffold_16539_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_68412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAAACCTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912493	912217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_912200_912500
843261	contig_13823_pilon	-	1378	2	Intergenic	novelGene_145234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACATATATTCTTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42092	40486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_41028_41255
843263	contig_7455_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_168654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTAGCTTTGTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383877	383172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_383200_383900
843264	contig_7455_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_168653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377914	377509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_377500_377900
843266	contig_2817_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_104358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACCTCCTTCATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426326	427265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_426300_427300
843269	contig_5039_pilon	+	639	7	Intergenic	novelGene_64931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	330.529583480141	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	30	422	1361490	1368259	TRUE	35	AGCGTCAATAAAATGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRAVTGFCLQVRCFSTSVTRPFAKLVRPPVQAHGVEGRYATALYSAASKQKKLDQVEKELLRVAQLLKDPKVSLAILNPYVKRSIKVKSLKDITAKERFSPLTSNLINLLAENGRLNITPGVISAFSF	1361460	1368799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1361526_1362687_1362739_1363908_1364020_1365540_1365671_1366437_1366492_1368248_1368321_1368643
843270	contig_4891_pilon	-	1074	6	Intergenic	novelGene_124597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.76411595413	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	31	357	964296	940000	TRUE	10	CTCAGCTCTGTGTGATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPASVAAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964326	937407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937492_937938_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
843271	contig_5484_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_151107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAACAGTTCTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318344	316520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_316500_318300
843272	contig_4232_pilon	-	762	3	Intergenic	novelGene_63256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	47	junction_1	47.5	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	34	630	393786	392710	FALSE	10	CAGCTGTTCATCTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNEPGGDNGSMALNGAGEDMACGGLWLRGTGSSSLRQDPPAPCASLPPEVDDFSWEPPTEAETKVLQARRERQDRISRLMGDYLLRGYRMLGETCSDCGTILLQDKQRKIYCVACQELDSDVDKDNPALNAQAALSQAREHQLASASEPPSGSRPTPQPSVPRLEHCEGAAAGLKAAQGPPPCCSATKCRCLGLHTDGAPAEADLGLS	393819	392577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_392955_393315_393401_393519
843273	contig_4769_pilon	-	721	3	Intergenic	novelGene_118003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_2	3.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	167	721	985972	929490	FALSE	35	TACGAGAAGATCGTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKRRHSCAEALVTPLPGASPQRSRSPSPQPLPHVAPQEDGARAGYPPTAGSAVLMDALNSLAADSPCGIPHKMWKTSPDPSPVSAAPSKAGLPRHIYPAVEFLGPCEQEERRNSAPESILLVPPTWPKQLVPAIPICSIPVTASLPPLEWPLSSQSGSYELRIEVQPKPHHRAHYETEGSRGAVKAPTGGHPVVQLHGYMENKPLGLQIFIGTADERILKPHAFYQVHRITGKTVTTTS	986138	929489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_929622_982771_982944_985721
843274	scaffold_13505_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_111462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCAGCACCGAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539849	539158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_539200_539800
843275	contig_18545_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_161888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATAAAATAGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333716	332056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_332100_333700
843276	contig_9919_pilon	-	1460	10	Intergenic	novelGene_137986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	36.7695526217005	2	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	300	1175	817991	766672	FALSE	40	AGATAAATCTTCATCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYMQLLTVTVIVRLLYLRCTRKSGPDQSALCAACCLLTSLCDTVGAILARQLTIQVFTGAYLAAIDLVNFMFILFPVCGSKFKSHSGRGSRERKRRQRLKATIFALALPLSLGPGWALWASVPKASGPVQGPQRRLLGSLLQENIEIFGYLLGGIAAFGSWASQIPTLSRINPDWVPLTTLPNYKSLRTMGVISHYMEMTIEPVQQAGCSATRLPDDQQMSTGDVSLQEPPSYPPVQVIRARVSSSSSSEVSSINSDLEWDPEDVHLERSKDNMEMLRSQAHRGSMSQWT	826035	766386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_766768_785412_785572_791906_792012_803342_803430_803628_803796_807290_807385_809633_809761_817950_818050_823980_824186_825999
843277	contig_9233_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_78264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767660	768363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_767700_768400
843278	contig_753_pilon	+	750	2	Intergenic	novelGene_112923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGGACAATCTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404781	407390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_405353_407211
843279	contig_16703_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_72756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10849	9493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_9500_10800
843280	contig_12123_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_144616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTTCAAATTACAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166541	164920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_164900_166500
843282	contig_1380_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_138866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGGACCACAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19523	19826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_19500_19800
843283	contig_5018_pilon	-	541	3	Intergenic	novelGene_47196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCCAGGGAGCGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1593188	1591766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1591824_1592605_1592706_1592804
843284	contig_7078_pilon	+	1472	2	Intergenic	novelGene_130169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	315	683	669557	669925	FALSE	15	ACCCCGTCGCCCACGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTHVPSLSGSSGGTAQGHAFTSCSKALLWDPQLFQGFLKQTEKYWPQKPDCLFRREEYRKTTHSVIHPPIDQVRKTGYGQTNTSPRHCFPTFKYKAVGLKVRYFLTTFHYNILTLPRSHL	666061	670714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_666143_669323
843285	contig_4232_pilon	-	719	5	Intergenic	novelGene_63245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_1	43.5373402954292	221	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	117	497	315604	314834	FALSE	10	TGTGTGTATGGGGGTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDEPAASSGCEDKGDPAPELRASFLPRTLSLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTILESLSREGHPIPETGDSKGTSKSDAEPEPGSLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADKAALEEEVRNLRHNNRRLQAESESAATRLLMASKQLGAPATNLA	315798	314611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_314981_315073_315153_315361_315417_315504_315607_315684
843286	contig_2476_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_157637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420226	418212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_418200_420200
843288	contig_10106_pilon	-	2138	6	Intergenic	novelGene_73857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGCCAATGACGCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88371	73779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_73878_76250_76357_80839_80971_82043_82181_83211_83308_86801
843290	contig_5918_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_99519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572947	573571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_572900_573600
843291	contig_11678_pilon	+	606	4	Intergenic	novelGene_160850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	14.6590889515307	441	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	23	526	277059	279380	FALSE	25	GGAAATCGCTTATGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLVAGERLVRALGAGGELEPEQLPRKLRVELEAALRKKHKSDDSPGDPRPLVSFGLIRDLHQHLRQRDSTLYLHELLEGSEIYLPEVVKPPRNPELVARLEKIKIQLANEEYKRITRNITCQDSRHGGTLSDLGKEGEIPGNQATKASPWGGSQNSFPPQCSVF	277036	279460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_277270_278363_278438_278721_278812_279251
843292	contig_5375_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_169201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCACTAATTACTATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37076	36512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_36500_37100
843293	contig_20951_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_43126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGTCCCAAACACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250937	250150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_250200_250900
843295	contig_11003_pilon	-	855	8	Intergenic	novelGene_105414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.843334927993	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	831	23	853	27839	12797	FALSE	15	AGGGTGCTGTGATGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLEKKKYERGSATNYITRNKARKKLQLSLADFRRLCILKGIYPHEPKHKKKVNKGSTAARTFYLIKDIRFLLHEPIVNKFREYKVFVRKLRKAYGKGEWNTVERLKDNKPNYKLDHIIKERYPTFIDALRDLDDALSMCFLFSTFPRTGKCHVQTIQLCRRLTVEFLHYIIAARALRKVFLSIKGIYYQAEVLGQPIVWITPYAFSHDHPTDVDYRVMATFTEFYTTLLGFVNFRLYQSLNLHYPPLVPSPIWCSQESVTWGAGGQPFITITFPS	27861	12794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_12885_16655_16769_19509_19600_19680_19853_22094_22205_23380_23535_24812_24893_27815
843296	contig_11105_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_159819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTAAGATAAAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268300	269837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_268300_269800
843297	contig_2646_pilon	-	1133	3	Intergenic	novelGene_69724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_2	20.5	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	255	1133	2623501	2622623	FALSE	30	CTTGGGAATGAAATGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLILGRRLNREDLGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGREFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGREFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFEDVSQHEEFLELGKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHI	2627212	2622622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2623563_2625182_2625311_2627147
843299	contig_8576_pilon	-	556	4	Intergenic	novelGene_88769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	75	junction_3	64.3445586061652	3349	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	37	354	763004	761002	TRUE	15	GAGATTGCATTGCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPGSGVRTRAVMSALTRLAPFVRGGGRLFRSCRKRTAGSGGVRHAGGGVHIEPTYRQFPQLTRSQVLQAEFFSATMWFWILWRFWHDSDAVLGHFPYPDPSQWTDEELGIPPDDED	763040	759807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_759987_760978_761077_762178_762324_762906
843301	contig_11253_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_126819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCGCTCTGCACCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72608	73215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_72600_73200
843302	contig_13138_pilon	+	806	6	Intergenic	novelGene_143161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	7.81280999384984	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	726	79	804	240198	242006	FALSE	25	CCCAGCAACAGATGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFKKAAAALFGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEEIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQPPTTTVARSGTPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGCLENMPEADCIPKEQLSTSFQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKKTVHYYAELGQCSV	240119	242008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_+_240267_240355_240504_240859_240958_241330_241461_241597_241839_241966
843303	contig_10926_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_137503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCTGTCTCTCTGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10989	12203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_11000_12200
843304	contig_9934_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_176980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAATGTAGATACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19076	19370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9934_pilon_+_19100_19400
843306	contig_16532_pilon	+	704	5	Intergenic	novelGene_110036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	39.6571242023423	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	125	652	138093	168037	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGAGLWIFPPPHVARRCRAVQFPHSSRASLLGSPRVAGTMSFAETNPAASSLPNGDCSRFRARPGGNRVTVVLGAQWGDEGKGKVVDLLSQDADIVCRCQGGNNAGHTVVVDSVEYDFHLLPSGIINPNVTAFIGNGVVIHLPGLFEEAEKNVQKGKGLEGWEKRLIISDRAHIVFDFHQAADGIQEQQRQEQAGKKYVLSISRPLCLNFRPYI	137968	168089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_138276_148401_148505_149545_149615_151217_151269_167915
843307	contig_9578_pilon	+	1487	4	Intergenic	novelGene_68008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	60.9498883418903	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	291	851	1319262	1321498	TRUE	35	TTTAAAAATAGTGCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHAKDLSTSYITDVCRIHFGKRVGELCFDVCVNKILFICFIGYHCEYKMRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKMII	1318971	1327141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1319811_1321486_1321545_1324878_1325043_1326715
843308	contig_13300_pilon	-	834	2	Intergenic	novelGene_125806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCTGAAGCAATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247440	244134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913
843309	contig_1406_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_25635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCCATTCGATGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2643926	2644426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2643900_2644400
843310	contig_7707_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_72231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTTAGCGTATGTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990319	991473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_990300_991500
843312	contig_9202_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_168948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCCAAAAATGTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276938	278181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_276900_278200
843313	contig_3322_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_176944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAGCATGAGCCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2052	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3322_pilon_+_2100_2900
843314	contig_18484_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_177371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCATTTTGTGTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20282	20519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18484_pilon_+_20300_20500
843315	contig_357_pilon	+	234	4	Intergenic	novelGene_177441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	9.42809041582063	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTGGAAAACATGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166828	171514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_357_pilon_+_166872_168177_168283_169059_169114_171482
843316	contig_6546_pilon	+	327	2	Intergenic	novelGene_140977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597578	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597779_599568
843317	contig_12540_pilon	+	1793	3	Intergenic	novelGene_148121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	27	junction_2	23.5	47	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	16	453	1236430	1239928	FALSE	20	ATTCACACTGTCCCTACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DELGYMYFRDRSGDTFRWRGENVSTTEVEGVLSRLLGQADVAVYGVAVPGVEGKAGMAAIVDPQGQLSPNALYQELQKVLAPYARPIFLRLLPQMDTTGTFKIQKTRLQREGFDPRQTSDRLFFLDLKQGHYLPLDEDIYGRICSGAFAL	1236414	1241268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1236563_1236929_1237077_1239770
843318	scaffold_13609_pilon	+	594	4	Intergenic	novelGene_124425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	45.9008593480437	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	23	451	779035	781267	FALSE	20	GATAGTGGGCAGCGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEEALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGTPLLTSLPDKVRNFLASQVPFPSRLGDPAEYAHLVQAIIENPFLNGEVIRLDGAIRMQP	779012	781410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780322_781080
843319	contig_10914_pilon	+	582	3	Intergenic	novelGene_176665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	1.5	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTGGAGGCAAATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5438	34666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10914_pilon_+_5542_8338_8426_34274
843321	contig_6062_pilon	-	503	5	Intergenic	novelGene_5315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	308.179635115625	1145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828605	821139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_821364_822639_822725_823326_823372_824526_824643_828572
843323	contig_9429_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_155097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	354	725	55254	55625	NA	65	AAATAAAAAAAAACTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPKHLIGSTVINSDQYLDDSGLETGNLYLTNKGKLSLQSENSSSDQSKCKFNILEDDGPAKRANELKSSCQVDTCADTRANKVQAQTCNIACVVCETNTDGIIQRINNPKLKTSQEMLPNRKSLDHSKSFMSNSVSSAFIFTCAVEEGEIGLSYKTEDEICVKNSSSVLHNQLSDPPRLEATEKESLKAQILEADHREASKNEIENVRSDSKTVFDWETLILKCKEVPSQNVPTFTCVSS	54900	55626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_54900_55600
843324	contig_12603_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_105795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATTTGAAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591059	589733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_589700_591100
843325	contig_7004_pilon	-	1018	3	Intergenic	novelGene_126470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCGTGTTCCAGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395503	393923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_394049_394360_394511_394760
843329	contig_4180_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_8310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGACTCAGAGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738422	736659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_736700_738400
843330	SIRV2	-	261	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4612	34	3437	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
843332	contig_2550_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_135617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGATACATATAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101901	102386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_101900_102400
843333	contig_10317_pilon	-	1798	2	Intergenic	novelGene_177443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236927	188106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10317_pilon_-_189348_236370
843336	contig_6589_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_25881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCATGACGCGCACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019077	1017771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1017800_1019100
843338	contig_15853_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_177444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTTTCTTAAGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15381	15006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15853_pilon_-_15000_15400
843340	contig_5569_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_86727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGGGGCTTGTGACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177159	178166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_177200_178200
843341	contig_14326_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_120674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAACAACCAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107863	108624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_107900_108600
843343	contig_8291_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_99968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCTTCATGCAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771424	772123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_771400_772100
843344	contig_9609_pilon	+	983	5	Intergenic	novelGene_22983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	188.870822256907	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	162	632	311574	318014	FALSE	25	TGGGAGAGAGATTCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGENLIGSCYSGSLPHSHLSP	309943	318365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882
843346	contig_5018_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_47179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTGGCCTCCTGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1567844	1569071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1567800_1569100
843348	contig_15888_pilon	-	947	5	Intergenic	novelGene_84457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	4.96865172858795	46	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	550	813	272673	272017	FALSE	15	TCTGTCCGAGCCTGCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNSQHHGALPVPAAGAGPGVPRGRPHVQGRDHRGSRGCPPTPGRTWPHCRRLAATYAGGVLVHSQWVLTAAHCLNKTAKLLTLVLGLHTLDDPNDPGLRFHLKKTVLHPDYKKPPKLENDLALLKLEGKVKPTKTIRPLPLPGGKQKVLAGARCSIPGWGQTHHDGQPARRLRELDVHVLDARMCNNSRFWNGSINAHMVCFSAEVQHQGPCMGDSGGPLVCGKGFVAGILSFSSKACTDVFKPPVATAVAPYVSWIKKTIRRGRSLPRA	276867	271882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_272191_272583_272848_273336_273482_274492_274652_276796
843350	contig_15866_pilon	-	749	2	Intergenic	novelGene_63673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619626	613031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_613758_619603
843351	contig_10003_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_88236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGCCTTGAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656686	657392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_656700_657400
843352	contig_14338_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_174827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGCCTCTGGTTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11987	10480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_10500_12000
843354	contig_11977_pilon	-	1569	2	Intergenic	novelGene_171721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	127	516	72297	71076	FALSE	55	AGGAAAACCAAAAATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THVKTLTGKKIYKCKECGITCSCSSSLTTHIRTLGREGPYECMEFGKGFRQFSTLIEHKKIHSGKHPYERKEYGNTVSSSSSLSKFISTHSEQRPYKRKECGKAFHQSSSLSNHKRTHTGDKPYECKECGKGFSTSSELTGHVRTHSGEHRYECKECGKAFSFGPLPSLHI	72423	70022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11977_pilon_-_71105_71936
843358	contig_3975_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_54774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATGGCCAAACCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2014557	2015201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2014600_2015200
843359	contig_14720_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_164978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTATGTTAATATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122548	123220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_122500_123200
843360	contig_20378_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_159581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTATCTAAAAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133291	132478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_132500_133300
843361	contig_15036_pilon	+	2029	10	Intergenic	novelGene_107143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_3	93.0232945736353	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	206	1423	10373	83604	FALSE	30	AAAGTGTGTAACTCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSVQSGGSSGGPAVPTVQRGIVKMVLSGCAIIVRGQPRGGPPPERQINLSNIRAGNLARRAAAAQPDAKDTPDEPWAFPAREFLRKKLIGKEVCFTIENKTPQGREYGMIYLGKDTNGENIAESLVAEGLATRREGMRANNPEQNRLSECEEQAKAAKKGMWSEGSGSHTIRDLKYTIENPRHFVDSHHQKPVNAIIEHVRDGSVVRALLLPDHYLVTVMLSGIKCPTFRREADGTETPEPFAAEAKFFTESRLLQRDVQIILESCHNQNILGTILHPNGNITELLLKEGFARCVDWSIAVYTRGAEKLRAAERFAKERRLRIWRDYVPPTANLDQKDKQFVAKVMQVLNADAIVVKLNSGDYKTIHLSSIRPPRLEGENTQVRIGGNRASFQNCKEGAGELV	10167	84210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_10451_45988_46139_52672_52794_59893_59973_62278_62440_63998_64091_64868_65028_66511_66619_71034_71126_83424
843362	contig_6241_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_156425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATAGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240458	239861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_239900_240500
843363	contig_10003_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_88197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCAGCTGAAAAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480420	481360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_480400_481400
843364	contig_6711_pilon	+	1189	7	Intergenic	novelGene_169272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	15.8683822601913	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	73	1098	21142	53201	FALSE	20	TCAGTTTGGGCTCCACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPVRGLPLNDGDEGTDSTPLLQGSPRAEAAVVCCSARYNLALLAFFGFFVVYALRVNLSVALVDMVNSNTTLAENSTSSECPEHSVPIKVHNQTGKRYQWDAETQGWILGSFFYGYIITQIPGGYIASKVGGKLLLGFGILGTAVFTVFTPLAADLGVGFLIAVRTLEGLGEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVIALPLSGIICFYMDWVYVFYLFGIVGIFWFILWIWLVSDTPETHRAISPAEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWIPMLKSLPLWAIVVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQEVRRNNHLLIFLYSVYV	21069	53292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6711_pilon_+_21236_30456_30651_32606_32841_42728_42817_45142_45230_47862_47982_52991
843365	contig_13697_pilon	+	900	6	Intergenic	novelGene_165945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	141.507031627407	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	331	708	624246	627387	TRUE	20	GCCCCTGTTTGGTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMDERTLLREAKEVSLEKLHQAVRQNGVMSGLMQMLLLKVSAHITEQLGMAPGGEFREAFKEASKVPFCKFHLGDRPIPVTFKRAIAALSFWQKVKLAWGLCFLSDPIRTTWRSASRRTCWSR	623437	629185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_623708_624185_624327_626795_626907_626996_627137_627341_627440_629045
843366	contig_7019_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_149473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTCACACTGCCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312349	1313439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1312300_1313400
843368	contig_7327_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_172110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCCATAGGGTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73851	72702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_72700_73900
843371	contig_6227_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_49703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCCCCTTCTACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123426	1124581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1123400_1124600
843373	scaffold_17907_pilon	+	1018	4	Intergenic	novelGene_150755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	136.608930893994	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	51	404	19269	41778	FALSE	25	ACCAGCCTGACATTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGLVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTSDQDTLISGILRVLEKDSEVIVDWRPLDDALDSSSILYARKDSSSVVEWTQAPKERAHRGMEHLNNYEAEWDMVNTVSFKKKPHTNGGMN	19218	42392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_19299_33766_33866_34290_34366_41628
843374	contig_8594_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_140017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAATCGCTGTGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126284	126025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_126000_126300
843375	contig_11932_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_85414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGAAAAAAAATGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285590	287236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_285600_287200
843376	contig_8693_pilon	+	1501	2	Intergenic	novelGene_150863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAATGAAAACCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061819	1063377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1062282_1062338
843377	contig_7079_pilon	-	1400	2	Intergenic	novelGene_129232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	1029	1400	343153	342454	FALSE	30	GGGTGCAGGGTAAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDLGLQIENWFACSVEVEGHLEAVESDEVGLLGVILHEAHSPTMLLGPVLGSRGQRQVQLNNCGSQCPAFPSKHLEESLVLVVPKEGGGYVLLNWTSAAPGSASHRAPTHGASCPCPLWLGS	344181	342453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_-_342618_342945
843378	contig_15066_pilon	+	1020	3	Intergenic	novelGene_149521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	6	166	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	154	555	57293	59088	FALSE	30	GAGTACAACTGGCTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGWKLRTRSDGGAREDGPGRDHGGGGRGGRGGAAGGRGDSGVQGAVGGGMARASSANDSEEAWGALRAPQQQLRELCPGVNNQPYLCESGHCCGETGCCTYYYELWCLLSAFKPPAYEDVVHRPGTPPPPYTVAPGRSLTASSECTCCSSASSCPAHCEGTNVEGVSSHQRAPPLIRRVNLG	57139	59553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_57362_58281_58385_58858
843381	contig_10074_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_57137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGATTGATAAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393151	392341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_392300_393200
843383	contig_15596_pilon	-	1105	5	Intergenic	novelGene_139524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	524	826	128346	126004	TRUE	40	TGACTAGTGGGAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLGNIEGVQGKDSLPGAHVQGVLVFTEQQGRVVEDAWLVKTHQSYISVLPGDPRDRCECHGHPKHHGQGREQAPGRDAHPHGVGAGHRGGRLFSALEP	138803	104240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_104361_125844_126162_128201_128348_136548_136612_138344
843385	contig_15093_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_143292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCAACACAATTGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49668	50007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_49700_50000
843387	contig_11538_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_152286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAGAGGAAGTTATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141954	143123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_142000_143100
843390	contig_14525_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_149769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	22	306	164531	164247	NA	60	AAAGACAAAGATAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSSWGGMTNVEHFFMCFLAVPISFKKCLFKSFAHFLKLIAFVELWKSHFFLKGAVSPKMVRTSATDEILTRLLPLAYTVTTFSSSTQIINKLASFTTCFT	164552	162772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_162800_164600
843391	contig_5260_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_144378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAAGTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331022	329630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_329600_331000
843393	contig_6440_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_161662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	743	1138	24257	24652	NA	85	AATAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIRHVFCKNNLPALLCRPPPLSLSATSDHSLRLGSTLRPLNHSATLPGNTWAPQSLSTNSGPITMSLGTAGPHRKTQGARRATTHLSGPLQARARRPPTPSSIPSQKSHQIDKMGLLLVKGVGVPKVLPL	23514	25049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_23500_25000
843394	contig_18850_pilon	+	1066	6	Intergenic	novelGene_142399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	627	1004	19968	21188	FALSE	15	CCTCGCCATCTGGGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTWVGSHSQKPCSRAGRGDTSCPEGWRRQNQGPLKKKVSPRMLAMASKLPSHRSGTGDEGLSGGSTGGWGGGARGFLVGSSCGVWGPFPIELLQALTVILGQAVLAGVTHGALVEGPHDGVGC	19084	21250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_19405_19584_19840_19916_20069_20644_20730_20895_20983_21083
843395	contig_6048_pilon	-	599	3	Intergenic	novelGene_73352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.5	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGGCTCATGGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2975521	2968346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2968735_2973668_2973785_2975426
843396	contig_2214_pilon	-	885	3	Intergenic	novelGene_144249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	16	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	50	346	277156	265810	FALSE	75	TAGAAAAAGAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEFEVGSEVWEVGRFLMNSLAVKLRENLALPKKKKPIALKPLLRQTVNVDGFICRACTFLVQEIELALNNGKNLHCRRRCWPISCKHRSPRKGFCFWSFNRTVFFTKGLCDTCH	277205	265270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_265848_268393_268515_277018
843397	contig_5815_pilon	+	397	4	Intergenic	novelGene_141233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	11895.13684943	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	1041346	1046025	FALSE	30	AATTATAAAGCTGCCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1041344	1046043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
843398	contig_17493_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_122198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACAGTGTATCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124338	123497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_123500_124300
843399	contig_4339_pilon	+	564	3	Intergenic	novelGene_146100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTAGCTTCAAGTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205603	1207915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1205939_1206549_1206707_1207843
843401	contig_9575_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_169730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACTTGAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722418	723680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_722400_723700
843402	contig_19692_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_174877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTATGCGTGTGTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13484	14229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_13500_14200
843403	contig_6069_pilon	+	1209	6	Intergenic	novelGene_8014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	35.6067409348286	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	207	773	94402	98072	FALSE	30	GTAAAGGGGCGAGTCACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDADGNGAKIFAYAFDKNRGRGSGRLLHELLWERHRGGVAPGFQVVHLNAVTVDNRLDNLQLVPWGWRPKAEELSSKQREQSLYWLAIQQLPMDPIEEQFPVLNVTRYYNANGDVVEEEENSCTYYECHYPPCTMIEKQLREFNICGRCQVARYCGSQCQQKDWPAHKKHCREKKRPFQHELEPER	89629	98508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_89770_93413_93474_94395_94503_95445_95587_97641_97823_97928
843405	contig_9995_pilon	+	1019	5	Intergenic	novelGene_47781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACACTTGCCCACTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742108	840805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_742689_744296_744399_806837_806987_819342_819425_840699
843407	contig_4315_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_46861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAGTGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762629	761226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_761200_762600
843408	contig_14526_pilon	-	1535	3	Intergenic	novelGene_111211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	245	junction_1	54	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTATAGAGATCGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346568	339995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_340082_340404_340500_345214
843409	contig_11136_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_169014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	681	junction_1	1248.85734440194	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	43	411	126603	128146	FALSE	50	AAAGCCAAGGCTCAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPGAPGAAGDGADMAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKS	126142	128146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_126177_126594_126640_126975_127041_127879
843410	contig_6589_pilon	-	835	5	Intergenic	novelGene_25827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCACAAATGGGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825375	820002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_820422_824103_824182_824425_824497_824584_824725_825248
843411	contig_21259_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_177446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATCTTGGTTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4423	3526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21259_pilon_-_3500_4400
843413	contig_8006_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_173929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_5	103.08559550199	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	28	1221	343343	512075	FALSE	15	GAGTACCTAGTTCTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRSCGERRMGPRRAARPLLPAVLRPPLLLLLLPPLSCSGAGVGRPPHLVFLLADDLGWNDVGFHGSSILTPHLDALAAGGVLLDNYYIQPLCTPSRSQLLTGRYQIHTGLQHQIIWPCQPSCVPLDEKLLPQLLKEAGYTTHMVGKWHLGMYRKECLPTRRGFDTYFGYLLGSEDYYSHERCTLIDALNVTRCALDFRDGEEVAAGYKNMYSTNVFTERATALIANHPPEKPLFLYLALQSVHEPLQVPEEYLKPYDFIQDKNRRHYAAMVSLMDEAVGNVTAALKNHGLWDNTIFIFSTDNGGQTLAGGNNWPLRGRKWSLWEGGVRGVGFVVSPLLKQKGVKNRELIHISDWLPTLVKLAGGHTNGTKPLDGFDVWKTISEGSPSPRVELLHNIDPNFVDISPC	343315	512075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_343634_363267_363455_383425_383617_394066_394275_475705_475950_512002
843414	contig_14300_pilon	-	634	4	Intergenic	novelGene_133150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTGCACAGATTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551202	518719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_518834_525220_525351_546444_546712_551079
843415	contig_18967_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_165322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAAAGAGGGGATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78670	80136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_78700_80100
843417	contig_11832_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_106980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCAGTGTTTCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489686	490604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_489700_490600
843418	contig_10642_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_78749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGTGGGCTGTTCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347114	1345968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1346000_1347100
843419	contig_16870_pilon	+	683	5	Intergenic	novelGene_155524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	3.83242742918897	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	270	464	211744	214218	FALSE	25	TATCAGTCTGTACACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPLCSSPWTLLCCRPPPKRGPGTPGLRRANSRPNQPPLGFLSRTQPGLSKSYRGAFRSPRPSPKSGQASGASEDSQQLDIQKLKEKRDMLDKEISQLISEGYSVDELEDHISQLHEYNDIKDVGQMLLGKLAVIRGVTTKELYPEFDLDVND	209531	214437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_209620_209908_210003_211656_211779_212472_212568_214153
843421	contig_7993_pilon	+	1038	2	Intergenic	novelGene_170974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCAATCCAATTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393349	397255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_393542_396409
843423	contig_10777_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_101173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCATGTGTCTACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50138	51032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_50100_51000
843425	contig_6446_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_149243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	426	893	513201	512734	NA	40	AAGAAGGCACACTGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHPSSSSVPLQPSCPKLAPLLLDIGVDPQLITQQYPPSPGASAPCYQISPNTWYHITNINAPRGQDPEARPAHEALTGHLSRSRSSVLPLQNPHWLPSPTSPLLRGHTPTPSCSCRTPLSISSSKSHLHCAPCLEHSSNPKMPLFPSRFCLFVF	513626	512454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_512500_513600
843426	contig_3956_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_14790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148808	1149882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1148800_1149900
843427	contig_10953_pilon	+	2324	10	Intergenic	novelGene_42542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1748	2323	360813	394545	FALSE	15	AGAGTCGGGTTCGATCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRKSTAWGDTCRHSLRRRARVGILALRPRLLEAWPALATPRPRAEGDTRVQRPTNSQRLRKRGPQRAGCGGSGPRTFPQARGAVHRLVALLPSFVPLYVTMANPHVVLRRVEVTQGVRASWEGWTAGRRTLDWPRGATCRSFSGAHGAEAKAPDSSCPAPLHFGLVLSVAPHSSLTTAAPNPRAPRIAAA	342050	394546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_342117_343846_344034_344706_344832_347068_347260_347964_348116_349215_349311_352716_353209_360372_361269_372663_372764_394525
843429	contig_8864_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_135980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTGTAAACTTGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122972	121959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_122000_123000
843431	SIRV6	+	410	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	190	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1843
843432	contig_7919_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_28135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGCTCGGCACTTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568484	1569648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1568500_1569600
843433	contig_5999_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_45631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCTCAGTGTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168244	169046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_168200_169000
843434	contig_6048_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_73169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTCTGCAGGGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201267	1200847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1200800_1201300
843435	contig_2646_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_69708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAAGGTTTAGATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547322	2546677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2546700_2547300
843439	contig_3818_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_99211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	147293	147595	NA	30	ATTCACTTAATACGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSGPSHPKVWLLRLSEVSNTPACPNSTGSCSDSEATAQQRPSVLPPSSLSTGLTLIVHRVVQLYSPVLLNVPASGALYVLPGLHEVSFLRVDREGELRGA	147292	147743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_147300_147700
843440	contig_16103_pilon	-	951	3	Intergenic	novelGene_118727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	50	361	263475	262246	FALSE	10	CCCTATGCCTTTGTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSYTELEKAVVVLVENFYKYVSKHSLVKNKISKGSFRKMLQKELNHMLTDTGNRKAADKLIQNLDANHDGRISFDEYWTLIGGITSPIANLIRQQEQQSSS	264359	261655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_262405_263322_263502_264336
843442	contig_13456_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_153294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACCAAACCAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334119	335930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_334100_335900
843445	contig_17198_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_62339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	672	426	1097	570543	569872	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKSDIPVKDPSLIVNVILIVLTVQSVCHFWPVFCPLSLSSDTGSKLCFSLPTLLFGPLVFVDPRCSGSFHLVPSCHGASCCHSDFEACSFSTNCQPEMQAGSGTALTRPNGKDAWRWGAELYYSTLLSTARELRKHSSALTHMGPPCLGINSTPTGLSRTLRALAPSERGAMLFFSPEVCGVLSPDNKLIQKTELHAETCAPRLHDTASGPWGVDQPLLPLS	570968	569755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_569800_571000
843447	contig_3754_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_146834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTGCAGCATAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276098	276436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_276100_276400
843449	contig_18990_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_177449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTCAACAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102	460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18990_pilon_+_100_500
843450	contig_15471_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_175215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238171	237387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_237400_238200
843451	contig_12786_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_103381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTGAAAACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583000	582602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_582600_583000
843452	contig_4803_pilon	-	409	6	Intergenic	novelGene_150724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	219	junction_5	575.68790155778	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	97	408	66839	55804	FALSE	40	ACAAGGTGAGCACACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPD	93162	55802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
843455	contig_817_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_132438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80265	78244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_78200_80300
843456	contig_14516_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_153907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCCAACCATATATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206115	207228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_206100_207200
843457	contig_2219_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_67203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCACTATGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237687	236613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_236600_237700
843458	contig_990_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_76130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGAGAGAGAATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600782	1600347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1600300_1600800
843459	contig_7457_pilon	-	576	4	Intergenic	novelGene_31723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	133	474	1176842	1174926	FALSE	20	ATGTAACCATTTGGGGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176974	1174823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
843461	contig_10196_pilon	-	308	3	Intergenic	novelGene_132097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	43	306	908490	907995	FALSE	30	CCTAGAAGGGCACAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPLHRDSGVGLYEMVSEFLVGRLGEHGLFPEVRGEIAVGLGDGIKGGLRKVAQSGSAAPGRGVAVVNTGHHQQLLGHRGRDYASASGCGDEAHQHRAAAAS	908532	907992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_908151_908259_908350_908472
843462	contig_7704_pilon	+	1199	2	Intergenic	novelGene_154621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACTTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347174	348440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_347862_347928
843463	contig_2646_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_69615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACATCTGGTCATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2031742	2030863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2030900_2031700
843464	contig_11248_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_142559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTTAGAGGTTTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360048	359802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_359800_360000
843465	contig_11248_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_142558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358116	356992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_357000_358100
843466	contig_11498_pilon	+	1144	4	Intergenic	novelGene_65540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	77	junction_1	24.8506650928211	287	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTACCTGTGATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312555	314573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_313017_313099_313275_313845_313958_314177
843467	contig_10183_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_169503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGACAAGGACTAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44299	43891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_43900_44300
843469	contig_19098_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_65811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATCTTGGAGCTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299562	298052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_298100_299600
843472	contig_14618_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_136822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGACGCGCCCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082545	1081139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1081100_1082500
843473	contig_9335_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_147441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCCTTCACTGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347106	347900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_347100_347900
843474	contig_8065_pilon	+	668	5	Intergenic	novelGene_107334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	399	junction_2	41.1521566871045	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	10	663	143042	171091	FALSE	10	AAGCTTTTGGTTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIQMPNLDLKEKVEPEVLSTDIQASPEPGTRMNILPKRTRRLKSQSEPGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGAKDKEDEVSRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHVSIYLLSQFGEMPRFI	143032	171096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_143168_167447_167554_168762_168855_169620_169780_170920
843475	contig_13349_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_161141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	99	482	409447	409064	NA	20	CCCCATGTGGCAGTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFFPSVSLTSLVSFFSLFSSLEFSNYIRVMLLAVTSTVQHFSVVNAVLTDKFLSVHLTVNVPDGWVCFPWSLITQAPAVLWLCSPVGLGSPQLSAGIGEKRVEKTCLLLNSLRPEVMPISPFLLHW	409545	408440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_408400_409500
843477	contig_14353_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_82130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGTAAGATATTAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252627	251319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_251300_252600
843478	contig_15020_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_87396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCATGGCGACTCGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21625	21215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_-_21200_21600
843479	contig_3426_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_57927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCCAGGGGCCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205560	206853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_205600_206900
843481	contig_7342_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_71160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	66	443	406073	405696	NA	20	CCCCAGAGATGCTGCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIPQLVWSSIISVQCVISVLEMVSKFRWDILKIILWLWWTELYTQKLLKWCVLFGIFLLTRTHTNNNTKGNKLNSVCVCVCLEITRKINHEKERIQIIKRCYLGVSESKQGAYRVYFIDFCGISMLAECRHYCISYMLMLFLYNKS	406138	405612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_405600_406100
843482	contig_9912_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_177455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCTATGGGTTTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77827	76821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9912_pilon_-_76800_77800
843484	contig_10734_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_51388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAATAAGAAATAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1895266	1894072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1894100_1895300
843489	contig_13740_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_34781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGGATTCTTAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812478	811461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_811500_812500
843490	contig_5686_pilon	-	1133	2	Intergenic	novelGene_45358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131629	130014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_130877_131358
843491	contig_6635_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_127006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAAGCTGGCATAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342206	340592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_340600_342200
843492	contig_7979_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_125532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAATTAGAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038385	1037628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1037600_1038400
843493	contig_8317_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_20627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16463	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
843494	contig_6557_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_32943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTTGGTGTCTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340078	340678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_340100_340700
843495	contig_8312_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_152919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCCAGACTTCTAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1602235	1603005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1602200_1603000
843496	contig_5676_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_159091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTATTAAAAGGACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410440	411589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_410400_411600
843497	contig_1516_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_50032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTGAAAACAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600085	600949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_600100_600900
843498	contig_10774_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_158681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTTAACTTAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25376	24048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_-_24000_25400
843499	contig_16802_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_177458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAACAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16452	15781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16802_pilon_-_15800_16500
843500	contig_3975_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_54715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTATAAATGCAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470217	1471443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1470200_1471400
843501	contig_20997_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_177459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATCTCCACCAGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4373	2808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20997_pilon_-_2800_4400
843502	contig_12790_pilon	-	839	5	Intergenic	novelGene_35269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	10.3531396204243	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	217	303	395581	325056	TRUE	15	CTCAGCTTTCCATCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEENESDRGQVWQSCRFGRGAQSVPAAGLWPRTRSARARWQHALDFPALRLDFREARKWTPFSWRHECQSPAMGVAEFAAYCLSMWGNNIKVLECEMENC	406752	320661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_321099_324956_325086_349175_349229_395577_395682_406636
843504	contig_9995_pilon	+	823	2	Intergenic	novelGene_47810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCTGGAATTACAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864903	866417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_865648_866338
843505	contig_3426_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_57981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCACGCAGAGCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602707	604121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_602700_604100
843506	contig_8673_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_129938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404490	405496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_404500_405500
843507	contig_7704_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_154614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTCCTTTGGCAGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301097	301753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_301100_301800
843509	SIRV6	+	379	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-37	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2813_3106_3165_10724
843510	contig_12638_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_33218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTATTGTAAAGTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549084	550729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_549100_550700
843511	contig_4845_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_53697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916247	915046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_915000_916200
843513	contig_12292_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_166990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAAGAATTTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176906	175876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_175900_176900
843514	contig_5918_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_99621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2208359	2210295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2208400_2210300
843516	contig_9440_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_59117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTTCAAATGGATTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1808680	1809099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1808700_1809100
843517	contig_11548_pilon	+	883	2	Intergenic	novelGene_66786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAAAAGAGATCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119028	120292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_119111_119491
843518	contig_7452_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_109152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGCATTAAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147994	148623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_148000_148600
843519	contig_8268_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_147013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATATTGTAGTTCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374860	373522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_373500_374900
843520	contig_4364_pilon	+	738	3	Intergenic	novelGene_175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	104	691	1268714	1271017	FALSE	25	TCCTCCAAAGGAGCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRHGLGKARLPNSSCPRSRPRRAGWPHLGHLLNSPTATKQPLDRQSQWPSLTWPTWPGRSRVPGLSVFIVFICAVFWVRPGLPSATSTPLSGPPPMGRPPSPRTQPGQTGTKHRVGSRLLCPSAPFPRSWRPVCWAFGI	1267002	1271064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268888_1270603
843522	contig_15307_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_174782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	10.8012344973464	175	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAGAAGAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163328	155775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15307_pilon_-_155829_161809_161901_162608_162880_163032
843523	contig_13740_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_34745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321123	320349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_320300_321100
843524	contig_8554_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_160291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTATTAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114286	113477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_-_113500_114300
843527	contig_12543_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_168375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCTTCAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304437	305207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_304400_305200
843528	contig_6975_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_74290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTAGAAGCGAGGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408249	409373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_408200_409400
843530	contig_7630_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_133667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATTGTTAAATGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557356	556597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_556600_557400
843532	contig_253_pilon	-	1453	16	Intergenic	novelGene_129724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.7263297593655	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	81	1043	559713	555508	TRUE	10	CTGACCTGGCTATTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVFDLDLETEEGSEGEGEPELSPADVCPLAELRSAGLEPVGHYEEVELTETSVNLGPERIGPHCFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVQGTNLGKIYAMKVLRKAKIVCNAKDTAHTRAERNILESVKHPFIVELAYAFQTGGKLYLILECLSGGELFTHLEREGIFLEDTACFYLAEITLALGHLHSQGIIYRDLKPENIMLNSQGHIKLTDFGLCKESIHEGAVTHTFCGTIEYMAPEILVRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGSPPFTAENRKKTMDKIVKGKLVLPPLPHPGCPGPRQKVSEAESQPTDWGWPRGRR	559793	554206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_554267_554584_554629_554893_555007_555094_555203_555281_555360_555500_555564_556025_556135_556258_556350_556430_556522_556649_556751_556828_556887_557968_558117_558771_558841_559123_559245_559332_559374_559635
843533	contig_14546_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_157403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGCCATAAGATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19724	18630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_18600_19700
843534	contig_5765_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_141381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAGAAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583813	584627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_583800_584600
843536	contig_16883_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_161760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGTTAGAAACATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560219	559542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_559500_560200
843537	contig_21013_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_38524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATTGTCTAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70124	70715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_70100_70700
843538	contig_7933_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_164694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATCTAAGAGAGAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186006	185663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_185700_186000
843539	contig_18438_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_171388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCAGAGCATGACAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129645	130134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_129600_130100
843540	contig_11364_pilon	+	528	4	Intergenic	novelGene_65189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	5.43650214343336	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	9	527	255419	260416	FALSE	35	AAGGACACTCACACAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEARQKQLLAEEKMKQLTEETEALAREIERLQKEMKEDDVSFLMKHKSRKRRLFCTMEPEPVQAGMLINVCKYLDSLQYRVWKKMVMSVEPVPFSFDPNTAAGWLSVSDDLTSVTNHGYRVQVENPERFSSAPCLLGSCVFSQGSHAWEVDLGGLQSWRVGVVRVRQDANT	255410	260417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_255557_258626_258650_259462_259582_260177
843541	contig_11364_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_65191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGCGAGGGGGTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260774	261639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_260800_261600
843543	contig_5092_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_62256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAAGATACCACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162639	163664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_162600_163700
843545	contig_15426_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_174675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	389	712	74980	75303	NA	35	TAAACCTGTATCCATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIQRPSSQQQAMTEAGEEKTANESDVSNKSLERAGLRLRRALVFCLLVFLSHLPLKIVRERNLCSPLQMQLYIHIFIAYNYSSHWTKFSLWSRLVLTYAHTLHSC	74591	76018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15426_pilon_+_74600_76000
843546	contig_6199_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_126368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204047	203411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_203400_204000
843547	contig_12603_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_105796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATTTGAAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591081	589733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_589700_591100
843549	contig_10021_pilon	-	1671	9	Intergenic	novelGene_168665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	73.2256785560912	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	128	988	1048320	1036284	FALSE	35	TATGTTTAAACTACTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVGVQIDTITPEIRALYNVLAKVKRERDEYKRRWEEELAKRMNLQTMVDTLQEAAQEADAIQEEMNEKIERLKAELVVFKGLMSDPMTDLDTKIQEKAMKVDMDICRRIDITAKLCDVAQQRNSEDVSKIFQVVPKKKERKVASDDDISEQDGEVNRFSDDEVGSMNITDEMKRVFNQLRETFDFDDDCDSLTWEENEDTLLLWEDFTNCNPTIDLQGEEENLGNLIHETESFFKTRDKEYQETIGQIELELATAKSDMNRHLHEYMEMCSMKRGLDVQMETCRRLIKGSADRNSPSPSSVASSDSGSTDEIQDEFEREADVEPMVS	1085205	1035600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_-_1036390_1038068_1038200_1039199_1039290_1039450_1039572_1044200_1044341_1045662_1045804_1046995_1047092_1048284_1048346_1085103
843551	contig_9197_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_154363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAACCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61506	60037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_-_60000_61500
843552	contig_9609_pilon	-	1644	1	Intergenic	novelGene_23165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACCCCAGGAGTAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849379	847735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_847700_849400
843555	contig_9668_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_58204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTCCAACACGCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517351	517018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_517000_517400
843556	contig_4659_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_118204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAAAAACCCTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209144	208088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_208100_209100
843557	contig_15182_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_136471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTTACAAATAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627563	628768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_627600_628800
843558	contig_20507_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_164212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151263	149250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_-_149200_151300
843559	contig_12603_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_105823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGCCACAGCACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806774	807447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_806800_807400
843560	contig_1154_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_87079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTGGATGACTCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237099	238653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_237100_238700
843561	contig_1076_pilon	+	1065	6	Intergenic	novelGene_101124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	0.979795897113271	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	261	710	749833	753971	FALSE	30	CTGTGTTTTACTATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSCYSAVGAPYEEVVQYQRRASDKHRLIALVGPSGVGVNELRRQLIELNPNHFQSAVPHTTRSKKSYEINGREYHYVSKETFESLMYSHRMLEYGEYKGHLYGTSVDAVQAVLDQGKVCVMDLEPQGIQVARTQELKPYVIFIKPSNLSCMKLSRKNAKIITDYFVEMKFKDEDLQEMEDLAQKMEAQFGQYFDHVIVNDSLQDACVQLLSAVRKAQEEPQWVPATWISSDTES	746290	754326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_746390_747618_747700_749752_749847_750241_750351_751272_751408_753779
843562	contig_14142_pilon	-	634	3	Intergenic	novelGene_120475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	20	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	31	612	259553	258394	FALSE	30	GTTCACAAACAGGACCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMVRAGANSAPSSDTLHLTLST	259583	258371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_258569_259008_259108_259245
843563	contig_7025_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_104388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCCCTTTCACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54788	55642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_54800_55600
843564	contig_12278_pilon	-	1454	6	Intergenic	novelGene_152579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.68781778291716	16	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAATAAAGAGATATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105644	100826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_101017_101594_101691_103238_103331_103415_103525_104361_104471_104786
843565	contig_10297_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_112545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAGCGAAGGTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549989	551433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_550000_551400
843567	contig_10629_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_52950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTCTTTGGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440281	439179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_439200_440300
843570	contig_5145_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_131421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTAGCGAGGTGACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851039	850576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_850600_851000
843572	contig_6743_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_33558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275953	274799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_274800_276000
843574	contig_10196_pilon	-	420	3	Intergenic	novelGene_132324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5922	1105	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	39	419	2394072	2389318	FALSE	20	CTGAGCGACCTGCATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLISTQTQKQPTMVLSDEDKTNVKTFWGKIGTHTGEYGGEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSGQIKAHGKKVADALTRAVGHLEDDVPLLPHHQDLLSSLRPEPRLRPDQGPRQEGGGRADPRCRPPGGPAWHSV	2394110	2389316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2389471_2393637_2393771_2393977
843575	contig_3818_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_99321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCGGAGAGAGCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195889	1197074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1195900_1197100
843576	contig_11115_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_102871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215036	216060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_215000_216100
843578	contig_7022_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_142159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGAATCTTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292952	292113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_292100_293000
843579	contig_12884_pilon	-	1311	11	Intergenic	novelGene_105008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.5089459643811	62	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	64	1029	929861	926300	FALSE	20	TTCACAGCTCTGTGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPGGSMRILVTGGSGLVGRAIQKVVADGAGLPGEDWMFVSSKDADLTDAAQTRALFEKVRPTHVIHLAAMVGGLFRNIKYNLDFWRNNVHINDNVLHAAFEVGARKVVSCLSTCIFPDKTTYPIDETMIHNGPPHSSNFGYSYAKRMIDVQNRAYFQQYGRTFTAVIPTNVFGPHDNFNIEDGHVLPGLIHKVHLAKSSGSALTVWGTGKPRRQFIYSLDLARLFLWVLREYSEVEPVILSVGEEEEVSIKEAAEAVAEAMDFHGEVIFDTTKSDGQFKKTASNGKLRTYLPDCQFTPFKQAVKETCTWFTDNYEQARK	930847	926017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_926356_926624_926725_926870_926951_927082_927150_927536_927602_927736_927871_928100_928175_928455_928585_929363_929479_929715_929873_930795
843581	contig_9363_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_6507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTAATTATTTTCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482174	484099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_482252_483879
843586	SIRV6	+	319	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	29	-2885	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAGTCGAAGACGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	7903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2815_3092_3165_7805
843588	contig_14225_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_52767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAAGTAAGTTTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506604	507885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_506600_507900
843590	scaffold_12124_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_22146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGTCCCCCAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965241	965890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_965200_965900
843592	contig_6374_pilon	+	1115	2	Intergenic	novelGene_158424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGCGCCCTTTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4693	5871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_5129_5191
843593	contig_8900_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_171611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1040	1357	123626	123309	NA	30	ACTTCTGTGTAGTAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTQGLLSSLTLFLNSKLSLKVWSSVVIIRYEGWRGDKRKKGLLHSVESENGVQTSHLFSSLSCQLPCSLQSRTLKDSCQHCPQAARPAVLTRTVPHAYRLFSA	124665	122793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_122800_124700
843595	contig_13828_pilon	-	1772	7	Intergenic	novelGene_158284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.8227078139243	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	217	792	323602	115478	TRUE	15	ATAATTCCCTTTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELEDCVLYTLPAKKWHWRARTSALYFSQHVPISEHYRILFASSVLNLTELAALRPDLGKLKKILYFHENQLVYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSIGKFMKLIPDHRPRDLESIIRPKCQVIYFPIRFPDVKRSIHAQAQNNPFKEDAQP	327018	113070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_113739_115165_115529_246994_247173_250617_250786_323423_323628_325387_325510_326949
843596	contig_9363_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_6797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCAAGATTTGTTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615334	1616433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1615300_1616400
843599	contig_7866_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_171200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCAAGAGAAGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415946	417514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_415900_417500
843601	contig_15610_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_154285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687692	688528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_687700_688500
843602	contig_9375_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_136061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313637	312612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_312600_313600
843604	contig_10063_pilon	-	1120	4	Intergenic	novelGene_127763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	19.6015872373189	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	168	866	752750	746874	FALSE	30	TTGACACATCCAAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWKSTPLLLLVAWVAATSSTRDRTDLLNVCMDAKYHKTKPGPEDKLHGQCSPWRKNACCSVNTSQELHKDISRLYNFNWDHCGKMEPDCKRHFIQDNCLYECSPNVGPWIKQVNQRWRKERFLDVPLCKEDCQSWWEACRTSYTCKTNWHRGWDWTSGVNKCPVGTTCHTFEFYFPTPADLCEGLWSHSYKASNYSRGSGRCIQMWFDPAQGNPNEEVARFYAKAMSGVEE	752917	746619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_747098_747246_747383_747499_747689_752600
843605	contig_7457_pilon	+	322	3	Intergenic	novelGene_31279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCACCAGAGCATGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157840	159217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_157929_158042_158156_159096
843606	contig_10304_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_166491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGATACCATGGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61627	62462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_61600_62500
843607	contig_12464_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_68715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACAACAGTAAAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371401	372072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_371400_372100
843608	contig_11294_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_50038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAATGCACTGTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87594	86811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_86800_87600
843609	contig_7895_pilon	-	1152	2	Intergenic	novelGene_154438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	223	330	541757	525356	FALSE	25	TTTATTTATTACTTATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAAAGPRARGSTWGDGGHELRRETFCGQGFALGRPFCSGRGAGYLFALNPETTLTPQAEAGVSKPGRGAAEGRMRLVFQLPRSAEAQRSGERWGFPSDARRASGKAVD	541979	524533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_525402_541695
843610	contig_4315_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_46816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTGGCTACCACCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341043	342298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_341000_342300
843611	contig_6217_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_109589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCATTCCCCAGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260039	259608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_259600_260000
843613	contig_11978_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_62898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATATTGCAATATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761658	763108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_761700_763100
843614	contig_990_pilon	-	819	2	Intergenic	novelGene_76019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCATTCCTTGTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592652	570550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_571340_592622
843615	contig_3986_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_52713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCCTATCTTATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69980	67752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_67800_70000
843617	contig_9931_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_134847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATACTCCCTCTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371423	371056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_371100_371400
843618	contig_11258_pilon	-	557	3	Intergenic	novelGene_67856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	16.5	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	77	382	354760	352035	FALSE	50	GTATACCTACAACAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVSTTHSPSSQENSNQSQSPWSLLSSIHFLLLVFLKVPLFLSMLSAVLWVNRPQRDPREGPYENQ	354836	351859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353000_353152_354741
843619	contig_11564_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_158590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAGAAAATGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174046	173142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_173100_174000
843620	contig_12793_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_164119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTAAGCATTCACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208206	206929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_206900_208200
843623	contig_13412_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_80000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAAGTTCTGCCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247441	245748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_245700_247400
843625	contig_817_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_132465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGGCCCTGGTGTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637532	636600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_636600_637500
843626	contig_15118_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_74635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGATGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443671	443253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_443300_443700
843628	contig_2924_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_140284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCACCCATGGGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367366	365852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_365900_367400
843629	contig_9571_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_136302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCTATTTTTATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569557	568471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_568500_569600
843630	contig_9571_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_136304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAATAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577097	576707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_576700_577100
843631	contig_2054_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_51671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56205	57561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_56200_57600
843632	contig_2933_pilon	+	594	5	Intergenic	novelGene_111381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	66.027929696455	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	19	594	1088995	1099855	FALSE	10	TGTGTGTCCTGTGCACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGSLQMQYQQSMQLEERAEQIRSQSHLIQVEREKMQMELSHKRARVELERAATTSARNYEREADRNQELLTRIRQLQEREAEAAEKMKEQLERNRSCRQSLDAANKKLREKEDGLAEANETISMLKGRISELQWSTMNQEMQVKGLESEKQELREQLDAQHRKWQEANQKIQELQASQEVRVEHEQKIKVRPQFHPR	1088976	1099855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1089019_1092650_1092792_1095538_1095719_1098493_1098619_1099749
843633	contig_11028_pilon	-	877	4	Intergenic	novelGene_163956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	4.18993502999218	102	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGAACGGTGATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861527	830276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_-_830775_851735_851911_856977_857060_861405
843637	contig_7179_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_78077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508853	508040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_508000_508900
843638	contig_3233_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_56609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970688	969905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_969900_970700
843639	contig_13349_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_161121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCAGTTTTGAGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22515	23662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_22500_23700
843641	contig_19899_pilon	-	1064	4	Intergenic	novelGene_102522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.9489206049712	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTCTGTGCTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142117	139139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_139945_139986_140127_141577_141660_142080
843642	contig_6356_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_126430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66359	64106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_64100_66400
843643	contig_9305_pilon	+	840	7	Intergenic	novelGene_148187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	458.285573269186	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	509	838	163046	167288	FALSE	70	AGAAGCTAAAGAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRECRVGTGAAAAATLEIVSLAPSPSASLPSLDQRGLLLPGPSPPPPFPALYSPHTRPPRSWIRAVAAVAAAAVAAAGAAEAQREQLSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAQPPPSPSGAAANNHGAGSGAGGPSAPVEPSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPVVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRPPEENAQEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVDKRTLEKYE	148539	167290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_148791_148897_149093_162870_162913_163025_163068_163755_163984_165127_165162_167242
843644	contig_10437_pilon	-	857	3	Intergenic	novelGene_38224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	36.5	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	125	547	278736	277592	FALSE	30	AAAATTCACTCTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIPECVGLEAAAAAVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRQFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELETWVKQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLHYRESSSEDEASRPTEIIEIPDEDDDVLSIDSGKR	280297	277281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_277755_278476_278748_280184
843646	contig_12128_pilon	-	627	7	Intergenic	novelGene_131987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	129.911080700951	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	212	625	410049	394560	FALSE	45	AGAACGTGAACCTCCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGLAPSKSTVYVSNLPFSLTNNDLYRIFSKYGKVVKYDKETSSFLMISWVTIMKDKDTRKSKGVAFILFLDKESAQNCTRAINNKQLFGRMIKASIAIDNGRAAEFIRRRHYFDKSKCYECGENGHLSYACPKNML	411703	394557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_394602_396936_397045_397580_397693_404289_404329_404592_404622_409965_410052_411494
843647	contig_1154_pilon	-	662	2	Intergenic	novelGene_87219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAGAGGGAAGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581498	1580790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1581067_1581112
843650	contig_6842_pilon	+	927	8	Intergenic	novelGene_130767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	372.824738602853	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	171	713	1347077	1377191	FALSE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTTGCDPPLWIISWNGKLGRARFENCEVQWTFENLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1330091	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1330200_1347014_1347096_1365160_1365249_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
843651	contig_14322_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_115918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATTTCTTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671659	671355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671400_671700
843653	contig_15105_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_150961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCACGTTGCCGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547653	546880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_546900_547700
843655	contig_11378_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_112246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAATTTACATTGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347317	347074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_347100_347300
843661	contig_1544_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_167935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAATCCTTATTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60575	60839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_+_60600_60800
843662	contig_7548_pilon	+	1066	8	Intergenic	novelGene_117620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	143.62451044303	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	85	822	193023	211815	FALSE	20	TTATGTTTTAAATTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIK	192732	212059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192809_193014_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_211812
843663	contig_17386_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_157945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGATTAACCAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340046	339096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_339100_340000
843664	contig_9646_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_117468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGTCCCTATCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361345	362518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_361300_362500
843666	contig_7744_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_62584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908219	909300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_908200_909300
843667	contig_7870_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_108905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGGGAAACCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206273	206762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_206300_206800
843668	contig_1435_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_115494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTACTGTCTTGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496753	497984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_496800_498000
843669	contig_7657_pilon	-	867	4	Intergenic	novelGene_30003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	3.09120616516523	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAATTCCTGTCCATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91115	78948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_79594_80584_80698_85299_85348_91054
843671	contig_4336_pilon	-	2015	4	Intergenic	novelGene_152352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	7.25718035235908	43	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	131	1396	281820	269774	FALSE	25	AACAACTTTTGTTTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFTDIDIFRDLQEICRRQGVAVYILLDQALLSQFLDMCMDLKVHPEQEKLMTVRTITGNIYYARSGTKIVGKVHEKFTLIDGIRVATGSYSFTWTDGKLNSSNLVILSGQVVEHFDLEFRILYAQSTPISSKLLSNFRISSKFDHLVEHKPPSKELTLGNLLRLRLARLSSTPKKTDLEPEVPTEGRAETRRHDSESSTIGEEDYLNSHKDELESRRATDVATQTEPREEMPTVHGSDMGTQTRISTASNGTQTTVATRVASSQTTIWSKSATTQTDVDENILFSQGTQSKEGSPVSKMSVSTSSSLKSSSSLSSQGSVASSTGSQTSMRATDFHNPGYPKYLSTPHLDLCLRDSFRNLDKERQFHFAGIRSRLNHMLAMLSRRTFFTENYLGFNPGNFNRASVNLLATRDIALYPSCQ	285314	269154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_270762_273562_273688_281667_281836_285199
843674	contig_15204_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_177460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGCTGCTCCAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11429	10727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15204_pilon_-_10700_11400
843676	contig_7428_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_77673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACACAAAGAGGGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50457	51435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_50500_51400
843677	contig_13753_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_136517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAGGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257101	256437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_256400_257100
843678	contig_11106_pilon	+	1699	2	Intergenic	novelGene_167448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	34	408	127487	130704	FALSE	60	TTGTAAAAAAAAAAACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIQWREESLCPMAPMGSKPSCLAREGPAGLAARLAHCSDMMYSPGKGLQGTPATCTWWAISEKSRPRFTPWMVRRVPPSGGPDTVKICLSWPAPPAAPSHTDSCLRFCPCFLAPDFMSFPLSCAEQFSCAGFCSL	127453	131995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_127714_130556
843679	contig_6710_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_89127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653659	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
843680	contig_5715_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_127976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACTCGATGGCAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605071	606381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_+_605100_606400
843681	contig_9438_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_154266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	473	910	210609	211046	NA	20	TTGCCTAACACAGTGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASIFKDSNGSFSSYFIPLVLQTSFTRSTSPPPPPKKKEPVAVELILTHGNFMCYGLEQFHKVLFAVIFMEADHHAFLPWCHWVGSELPTLQLVVEHNCLCYPRTFRESLVPFKGSPDQARPAQENLPSSPLIQDFNYICKSSS	210136	211130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_210100_211100
843682	contig_10765_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_122990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAATAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515791	516124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_515800_516100
843684	contig_13542_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_131570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTAAATCCCAGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716547	717697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_716500_717700
843686	contig_11448_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_66354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	40.1271416873916	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	447	1037	186389	185799	FALSE	10	GAGACTGCGCTTGGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERIHSINLHNFSNSVLETLNEQRNRGHFCDVTVRIHGSMLRAHRCVLAAGSPFFQDKLLLGYSDIEIPSVVSVQSVQKLIDFMYSGVLRVSQSEALQILTAASILQIKTVIDECTRIVSQNVGDVFPGIQDSGQDTPRGTPESGTSGQSSDTESGYLQSHSQHSVDRIYSALYACSMQNGSGERSFYSGAVVSHH	436787	185798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_186410_216685_216874_225366_225468_349238_349276_436687
843689	contig_405_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_135328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTTAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599746	600619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_599700_600600
843690	contig_614_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_132617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	403	1209	201	1409	442659	443867	NA	65	ATGAATCAAAAACAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QISLTCNKSKASRQTFVINKLEKRNLIPNHKDKETISENIEITNEFQTADLSTKDNGNLHNCETQHMLGLKKHVTNMQPIQQSESKVNKKLRQKVNRKTEIISEMNQIYENNDKDVHDLEKVDFFFQTQENKETISGNVEVSSEFKTLTLSTRDNGNLCNWEIQNVLGLQKQITGMYPVQQNESNVNKKLRQKINRKTEIISEMNHTDNDKGVHCPEKGNFFLLTQKDKETILENLEDSNGFQIPDLSTKDTGNLCDHETQNILRVKKHVHDIQPACQNESKIDKLRQKVCRKTEIISEMNQIYENNPEKGNFFPVTQKDKETTPENLEDANGFQIADSSTRSNRNLCNYETQNMLGLKKHVTDMQPAQQNESKINKKLRQKVNRKTEIISEMKLINDYNNESVHDPVKGNFFSLTQKDKETISKDLETANEFQTTDPSTRDNGNAYDYETQNMFSLKKQVTDMQPAQQ	442458	443868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_442500_443900
843691	contig_15775_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_148379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAACTCTAGCCCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24327	23190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_23200_24300
843692	contig_17158_pilon	-	640	2	Intergenic	novelGene_141152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	173	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGTTTTGTGTCTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165620	163991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_164452_165440
843693	contig_7342_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_71210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAACCCTTTACTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681605	679927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_679900_681600
843696	contig_4364_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_39	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATATAATTGGTCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318038	318886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_318000_318900
843697	contig_6589_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_25755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGAGGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659254	660048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_659300_660000
843698	contig_6434_pilon	+	540	3	Intergenic	novelGene_61917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933201	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_933277_933316_933565_933617
843699	contig_8829_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_140951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCACATTTATGAACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85202	84180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_84200_85200
843700	contig_5196_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_38672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTTGTTGTAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29634	30064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_29600_30100
843701	contig_7630_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_133626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	212	649	35819	36256	NA	55	TGAAACTATGTATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQWLGSPPSDAQREPRAPELTALREERTAGSGAQGAPSSVNPVHICLSPFCLGERKSRSGTMCMPPEQGGRNTSLKKNQSFFFSDYKINTGDMKNMDRLRNCHRPKVTKEMTAKCYVVPWIGPWNRKRRWMEELVKSQQSLKL	35607	36425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_35600_36400
843702	contig_817_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_132491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAAAGGTCAGCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759401	759106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_759100_759400
843703	contig_6048_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_73180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCTCTTCCCCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292895	1294040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1292900_1294000
843705	SIRV6	+	411	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	329	27	163	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGAAGACGCTATTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466	2093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
843709	contig_848_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_83334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCGAATTGTGTCCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547683	546398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_546400_547700
843711	contig_10013_pilon	+	610	3	Intergenic	novelGene_125074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_1	17.5	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACTCAGTCCTTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463196	464907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_463280_464212_464300_464467
843712	contig_5125_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_43466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCAAGAAGTCTGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63910	65019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_63900_65000
843715	contig_6050_pilon	+	712	3	Intergenic	novelGene_123112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTCAGCATGATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322690	324496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_323209_323678_323794_324417
843717	contig_15887_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_177463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18467	17478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15887_pilon_-_17500_18500
843718	contig_2793_pilon	+	1944	14	Intergenic	novelGene_142874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	11.3100468506242	10	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1410	535	1944	291846	323476	FALSE	5	CTGTGTGAGGTGGCCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNSWKLHGDCQDLQKQDSDPCNLNPRLTKFAEEACAVLTSSKFEACHHAVSLQPYLQNCHYDVCSCSDGRDCLCNAVASYASACAQKGVSIAWREPSFCALSCPQGQVYLQCGIPCNLTCRSLSYPDEECNEVCIEGCFCPPGLYLDDRGDCVPKAQCPCYYDGEIFQPEDVFSDHHTMCYCEDGFMHCTMSGMPGSLLPDVVLSSPLSHRSKRSLSCRPPMVKLVCPADNPRAEGLECAKTCQNYDLECMSTGCVSGCLCPHGMVRHENRCVALERCPCFHQGKEYAPGEMVKIDCNTCVCQDRKWNCTDNVCDATCSMVGMAHYLTFDGLKYMFPGECQYVLLQDYCGGNPGTFRILVGNEGCSYPSVKCKKRVTILLDGGEIELFDGEVNVKRSMKDETHFEVVESGRYVILLLGKALSVVWDHHLFVSVILKQTYREQVCGLCGNFDGIQNNDFTSSNLQVEEDPVDFGNSWKVNPQCADTKKVPLDSSPASCHNNIMKQTMVDSSCGILTSDLFQDCNKLVDPEPYLDACIYDTCSCESIGDCACFCDTIAAYAHVCAQHGKVVTWRTATLCPQSCEERNLRENGYECEWRYNSCAPACPITCQHPEPLACPVQCVEGCYAYCPPGKILDELLQTCIDLEDCP	285910	323476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_285993_286658_286875_291609_291851_299208_299304_301264_301426_309761_309866_311055_311195_313958_314094_315931_316079_319298_319440_319636_319751_321374_321532_322353_322513_323423
843719	contig_21232_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_165983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	26.5	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTGTGTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27815	17095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_17254_17500_17705_27348
843720	contig_14516_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_153917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCACAGTTAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215613	216798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_215600_216800
843721	contig_12810_pilon	+	414	2	Intergenic	novelGene_145710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	244	321	630140	630217	TRUE	40	TGACAACTGAACGGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALNTLGAAVLPCELCPSEDRVRKALCLPCFKCSQWHAVLVDAVSRDAFPWSEHWGRSSRNRADLRPTSSHLTSANWPEALMAPVVWPAAQKPSENRSSTATQCVS	629896	630662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_630251_630602
843723	contig_12644_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_44529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408803	1410032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1408800_1410000
843727	contig_20719_pilon	-	814	3	Intergenic	novelGene_140576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	57.5	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAAAAATTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91819	71690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_72220_72337_72440_91636
843728	contig_6001_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_128057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAGAAAAATCCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763048	762015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_762000_763000
843729	contig_9389_pilon	-	1100	9	Intergenic	novelGene_84099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.4642247682282	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	149	508	1389625	1388407	TRUE	15	CTGACATTTCTCCTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALARGCLHCHSNFSDKFSFYRHHVNLKSWWVGDIPVSGALLTDWSQDTMKELHLAIPAEITEEKLDQVANAVYQRMDQLYQGKMYFPGYFPNELRAIFRDQVHLIQNAIIESRIDCQRHCGIFRYETISCANCTSSHVVCFGYNCESSAQWERAVQGLLGYISRWHK	1389773	1387496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1387764_1387893_1388149_1388336_1388426_1388516_1388565_1388648_1388725_1388805_1388833_1389242_1389315_1389406_1389488_1389588
843731	contig_10937_pilon	+	1433	9	Intergenic	novelGene_67307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	66.4745016904978	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	13	1014	39200	44011	TRUE	10	AGGCTTCCCGGGTGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYGKLNFHQTQVFQRLAADLLSHMPSLTPSEVARCAKSLALLKWLNLPLFEAFAQHILNTAQDITLQHLCNVVLAFARLNFHPEQEDRFFSVVHEKLMSELADLSPALQVDVVWALCVLQQVQEAELRAVLSSDFHTQFLGGKSPKDESTLQKLLHINATALLEHPDYTGPLLPALALVPRPTALDKKVTPLQKELQETLKGLLGSANKGCFAVTTQYGWVLDAEVLLDTEGQFLNLRDFVAPHLAQATGSRPLPPGAKR	39187	45569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_39254_40254_40427_40733_40892_41611_41723_42770_42916_43276_43523_43895_44012_44143_44249_45255
843732	contig_8505_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_173182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3737	2959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_3000_3700
843733	contig_7057_pilon	+	872	4	Intergenic	novelGene_123240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	61	junction_2	241.761590552897	2250	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539791	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540705_540891_541177
843734	contig_11428_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_138498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTATAAACTCTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145233	146391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_145200_146400
843735	contig_8278_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_165304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	543	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252503	252964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_252500_253000
843736	contig_15516_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_177468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAGAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37202	36269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_-_36300_37200
843737	contig_6958_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_70003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGACTGTGTTAATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734562	736101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_734600_736100
843739	contig_10934_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_177473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGAATGGTACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397852	398397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10934_pilon_+_397900_398400
843743	contig_5260_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_144381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTGTAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350872	349574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_349600_350900
843744	contig_15185_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_99428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTGACATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365863	366187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_365900_366200
843746	contig_10196_pilon	-	297	3	Intergenic	novelGene_132178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTATGCGTGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069530	1068316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068440_1068510_1068622_1069467
843747	contig_7548_pilon	+	1039	7	Intergenic	novelGene_117623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.960515969978	2	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	262	1023	193023	212793	FALSE	40	TGAAAAATGCACCTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKYFLLGSWWSHRAPHPPVKMAGHSYHH	192761	212809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193161_198425_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_212712
843748	contig_11396_pilon	+	727	2	Intergenic	novelGene_71326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGCTCAGACCATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470733	472221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_470912_471672
843749	contig_211_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_129893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTCAAAATAAAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399856	399221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_399200_399900
843750	contig_6589_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_25950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTAGACACCAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289790	1288547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1288500_1289800
843751	contig_5419_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_15484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCATCCCTGTATAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211973	213526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_212000_213500
843752	contig_253_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_129661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	20	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGCAGCATCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390427	389803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_389971_390059
843753	contig_5936_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_53568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191998	191002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_191000_192000
843755	contig_987_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_72328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTGTTGTCTACGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086849	1088123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1086800_1088100
843756	contig_10569_pilon	-	848	3	Intergenic	novelGene_44102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	4.5	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	226	585	466480	457217	FALSE	70	ATTTGAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSGYGNCSDHEENSFLYFAYGSNLLKERIHLQNPSAAFCCVACLQDFKLDFGNPQGKKSPTWHGGIATIFQSPGDEVWGVIWKMNKSNLSSLDKQEGVSSGIYVPIEVKVYTQEKKK	466705	456953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_457290_458218_458365_466339
843757	contig_13145_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_116639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCGGCGGTGACCAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116302	117144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_116300_117100
843758	contig_10904_pilon	+	1066	6	Intergenic	novelGene_22599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	31.9349338499393	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	159	785	479077	482153	FALSE	5	CGGCTGGCAGCGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLLVPLPVNPPSSPTPSFSEAKAAGALLNGPPQFSTAPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPHPSDSERIRQYLPRNPCPTPPYHHQMPPPHSDTVEFYQRLSTETLFFIFYYLEGTKAQYLAAKALKKQSWRFHTKYMMWFQRHEEPKTITDEFEQGTYIYFDYEKWGQRKKEGFTFEYRYLEDRDLQ	474028	482434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_474157_479046_479147_479241_479441_479820_479954_480609_480736_482054
843759	contig_4364_pilon	+	273	3	Intergenic	novelGene_435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAAATACCCGATTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
843760	contig_7070_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_104047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGGGTTTCTTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130663	129202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_129200_130700
843761	contig_7569_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_114604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGGGAATGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297625	298490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_297600_298500
843763	contig_6418_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_81194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316060	1315578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1315600_1316100
843764	contig_11416_pilon	-	301	4	Intergenic	novelGene_145338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	497.279487701724	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGCCCGTGGCTGTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124638	122798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_124570
843765	contig_13301_pilon	+	1148	3	Intergenic	novelGene_153113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.5	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	157218	158286	FALSE	25	TTTTTAAACAGGGCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPGLGASTQPELAGWAGTRTDSRIRNWLWPAGSGAGTDTVPATDAYIGDSLPPSIHFWSTLSPIAPRSPAKLSFQFPSSGSAQVHIPSISVDGLSTPVVLSPGPQKP	157217	159107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_157367_158022_158102_158187
843766	contig_2377_pilon	+	809	8	Intergenic	novelGene_67896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	753.692596893618	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	5	370	197521	217214	TRUE	25	GTAATTCTTTTGTACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEGERAKKAIKEGRETYKRGGG	197516	224487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_217152_217225_221864_221950_222879_222956_224219
843767	contig_7704_pilon	-	687	7	Intergenic	novelGene_154605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	156.824388692859	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGCTCCTGCTGGGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266660	216688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_220362_220440_222497_222598_223587_223692_266501
843770	contig_1076_pilon	-	741	2	Intergenic	novelGene_101157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATATGTGGTAACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149230	1148077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1148645_1149056
843771	contig_13004_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_112634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTACCCTGCAGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253677	252956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_253000_253700
843772	contig_6631_pilon	-	2184	2	Intergenic	novelGene_174301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCACACCATCCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076893	1073221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_1075081_1076568
843774	contig_21414_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_170480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAGTAATGTCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10625	11221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21414_pilon_+_10600_11200
843775	SIRV6	-	455	3	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-608	70	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTCACGACCTACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3155	2288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2815_3106
843776	contig_9006_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_177476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	672	14	685	144299	144970	NA	50	TAAGTTTAAAAATACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRNLMISTTEETIKAEFNKFKPGAVERVKKLRDYAFVHFFNREDAVAAMSVMNGKCIDGASIEVTLAKPVNKENTWRQHLNGQISPSSENLLVFANKEESHPKTLGKPPTLPARLNGQHSPSPPEVERCTYPFFPGTKLTPISMYSLKSNHFNSAVMHLDYYCNKNNWAPPEYYLYSTTSQDGKVLLVYKIVIPTIANGSQSYFMPDKLCTTLEDAKELAAQFTLLHL	144285	144972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9006_pilon_+_144300_145000
843777	contig_16231_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_176713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCTAGGTCAGTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85176	85502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_85200_85500
843778	contig_1939_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_144858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202055	201325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_201300_202100
843779	SIRV6	+	341	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	508	24	342	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGACGCTATTTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
843782	contig_9333_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_120325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGAAATCTCGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206259	206864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_206300_206900
843786	contig_6805_pilon	-	862	4	Intergenic	novelGene_163902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	48.5065860362167	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTACTTAGGGACGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448271	436812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_436875_442598_442695_446227_446383_447722
843787	contig_6805_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_163901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCAGCACAGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436803	436347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_-_436300_436800
843788	contig_12410_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_167278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126345	127289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_126300_127300
843789	contig_4730_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_71701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTAAATCTACCAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112652	111715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_111700_112700
843791	contig_5018_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_46960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCAGCCTGTGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318608	316394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_316657_318372
843792	contig_2940_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_81883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAACCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414332	415663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_414300_415700
843793	contig_13044_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_99990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95979	95528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_95500_96000
843795	contig_5954_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_28813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGAAATATCTATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516532	1517069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1516500_1517100
843797	contig_8616_pilon	+	420	2	Intergenic	novelGene_72499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCACTTCCTTGACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330516	331067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_330720_330850
843798	contig_6233_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_74815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238870	240093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_238900_240100
843799	contig_6434_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_61860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAACAGTCATTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815904	815312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_815300_815900
843800	contig_3754_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_146830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217090	215710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_215700_217100
843802	contig_10042_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_79158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677471	677966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_677500_678000
843804	SIRV7	-	243	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	25	91658	-7	-91652	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCGATTTCTTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147932	147689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
843805	contig_9054_pilon	+	1282	7	Intergenic	novelGene_160675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_4	36.6818150526328	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	31	1179	426380	479659	FALSE	25	TCTGTCTTCCTCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFYPAVEGTLCLTGHHLILSSRQDNTEELWLLHSNIDAIDKRFVGSLGTIIIKCKDFRIIQLDIPGMEECLNIASSIEALSTLDSITLMYPFFYRPMFEVVEDGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYINKEFAVCLSYPPIVIVPNSIDDEAVRKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDEKLINATLRAGKRGYIIDTRSLNVAQQARAKGGGFEQEAHYPQWRRIHKSIERYHILQESLIKLVEACNDQTHSMDRWLSKLETSNWLTHIKEILTTACLAAQCIDREAASVLIHGTEGTDSTLQVTSLAQIILEPRSRTIHGFEALIEREWLQVRKVFSSQRNC	426349	479762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_426562_441717_441827_461791_461918_470405_470580_473074_473293_474378_474541_479481
843809	contig_7057_pilon	+	858	7	Intergenic	novelGene_123183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	38.5173121249826	356	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	111	785	239166	240866	FALSE	5	GTTTCTGCCTCCACTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLFHFGNCFALAYFPYFITYKCSGLSEYNAFWKCVQAGVTYLFVQLCKMLFLATFFPTWEGGIYDFIGEFMKASVDVADLIGLNLVMSRNAGKGEYKIMVAALGWATAELIMSRCIPLWVGARGIEFDWKYIQMSIDSNISLVHYIIASAQVWMITRYDLYHTFRPAVLLLMFLSVYKAFVMETFVHLCALGSWTALLARAVVTGLLALGTLALYVAVVNVHS	239055	240939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_239243_239318_239389_239913_239974_240064_240202_240355_240441_240537_240660_240742
843810	contig_14341_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_111753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCTCTATGGATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114529	113629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_113600_114500
843811	contig_5779_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_106540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAAGGTAATTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481289	480338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_480300_481300
843812	contig_5669_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_86105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACTATTACAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390610	392159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_390600_392200
843813	contig_5084_pilon	+	1797	1	Intergenic	novelGene_64496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301196	302993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_301200_303000
843815	contig_8260_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_163263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAACAAAATAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315630	314897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_314900_315600
843816	contig_15122_pilon	+	2500	13	Intergenic	novelGene_162696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.35412613473634	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2430	71	2500	180777	201341	FALSE	60	TATATGATAAAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIYSARNRNDSDIRGIPSSQKNSSLNDLSHSSQLKLHSKSDMSECENDDPLFRSASKIKDINNTYVISACKNTGDLPLTPKPVGRLTLQRRVKRDKESSLLDSELGDTTEKTAAKRLTLQRRAKTESVEKCKPTQKTGGETEDKHASQETSRHVKTVNTDKNSFVVSSVPLAEDSKHIEMMTDEKCKETFSAPSDENGNVALKYLSHRAPTGSRSHIEAVRSGRLAIKPTKSKLDIKVSGTENLHPRSIGKDIVKNSANKLGPLEKGRTPVKCVTEHRLTPKCSVPQFKSPVASILKNRVPSLQVKQRPKSSLLVNKSERSQESTLPPEEETAGQNTYTETDPLKVENSQVTVAVRVRPFSKREKMEKASQVVFMNGEEITVQHPDMKQVYNFIYDVSFWSFDECHPKYASQTTVYETLAVPLLERAFEGYNTCLFAYGQTGSGKSYTMMGFSEEPGIIPRFCEDLFAQVAKKQTQEVSYHLEMSFFEVYNEKIHDLLVCKGDNGQRKQPLRVREHPISGPYVEALSTNVVSSYSDIQSWLELGNKQRATAATGMNDKSSRSHSVFTLVMTQTKTEFVEGEEHDHRITSRINLIDLAGSERCCMAHTGGDRLKEGVSINKSLLTLGKVISALSEQANRKRVFVPYRESVLTWLLKESLGGNSKTAMIATISPAASNIDETLSTLRYANQARLIVNIAKVNEDMNAKLIRELKAEIEKLKAAQRNNRNIDPERYRLCRQEITSLRMKLHQQEKDMAEMQRVWKEKFEQAEKRKLQETKELQKAGITFQMDNHLPNLVNLNEDPQLSEMLL	180706	201341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_181868_183486_183742_184614_184703_191823_191923_192920_192974_194018_194050_194505_194614_195452_195570_195899_196016_197156_197330_198384_198533_198785_198850_201254
843817	contig_9687_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_172732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTTTGAATTTATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113796	114890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_113800_114900
843818	contig_2438_pilon	-	642	3	Intergenic	novelGene_112085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	80.5	194	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	66	431	464007	462434	FALSE	15	GCTCATGTTTGCTTAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVEPPNFSWVLPGRLAGLALPRLPAHYQFLWDGGVRHLVSLTQIDRFVKLVDEANARGEAVAVHCALGFGRTGTMLACYLVKERGLAAGDAIAEIRRLRPGSIETYEQEKAVFQFYQRTK	464072	462222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_462620_463740_463789_463875
843819	contig_2770_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_107407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159136	158058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_158100_159100
843820	contig_5832_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_134119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAAGAGGTGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100930	100613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_100600_100900
843821	contig_10196_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_132077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTACCACAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831026	829347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_829300_831000
843824	contig_15486_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_157316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATACTACCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91231	91927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_91200_91900
843825	contig_15152_pilon	-	665	3	Intergenic	novelGene_126971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	93	482	206402	203263	FALSE	40	TGAGCTAAAATAAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRALFPTRTAATALRFAVRQLAFGPLPATAMPRVYIGRLSYNVREKDIQRFFSGYGRLLEVDLKNGYGFVEFEDSRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDRDGYSYGSRIHQKELHRDPVLDLAQSRGPDQVPEINPELSVVCTLLWNTFLLA	206494	203079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203397_205925_206075_206295
843826	contig_5539_pilon	+	648	3	Intergenic	novelGene_104791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	43.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	60	647	360176	379507	FALSE	35	AGAGCTAAAGAGCCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSFPVLLLETMSHYTDEPRFTIEQIDLLQRLRRTGMTKHEVLHALETLERLDQEHSDKFGRRSSYGGSSYGNSTNNVPASSSTATASTQTQHLGMSPSPSNSYDTSPQPCTTNQNGRENNERLSTSNGKMSPTRYHANSMGQRSYSFEASEEDLDVDDKVEELMRRDSSVIKEEIKAFLANRRISQAVVAQVTG	360116	379508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_360199_368870_369348_379419
843827	contig_12622_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_5817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGCACTACATACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386144	385184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_385200_386100
843830	contig_12694_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_171987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359573	360068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_359600_360100
843831	contig_3866_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_112423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATCCCCGGCCATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234703	235998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_234700_236000
843834	contig_13904_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_165488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	320	832	77669	77157	NA	65	CAGAAAGAAAGAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCFPLSPSECTRQTTNCRNHIFILKAWKSSEKLKENCNSRSVPYSLTGFLCCDCLAHQSRPDLFSKRLCSHILGESSRICFLSVYNRIFPIFKFWFHFAQFIFIYFLLRLSISSKEKPGCPLKILFRQLLSHIYKFITYKFYFSTKPSNIIQTSPLPLYSKDCLSSSAQ	77988	76506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_76500_78000
843835	contig_14687_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_107983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAAAGGTGGTCTTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861351	862335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_861400_862300
843838	contig_15273_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_140438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136662	135835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_135800_136700
843839	contig_9146_pilon	-	312	3	Intergenic	novelGene_79501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4271	junction_1	231.5	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	210	103	312	143366	142684	FALSE	45	GCCCAGAAAGAAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAP	143572	142683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479
843840	contig_3077_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_26882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTCTTTCTACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342322	1341669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1341700_1342300
843842	contig_1008_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_121627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAAAAACCCTGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165549	1165069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1165100_1165500
843843	contig_5145_pilon	+	1001	6	Intergenic	novelGene_131394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	59.9746613162592	38	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	51	677	638955	645780	TRUE	20	CTTACTTTTTAAACCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMPLPPDDQELRNVIDKLAQFVARNGPEFEKMTMEKQKDNPKFSFLFGGEFYSYYKCKLALEQQQLICKQQAPEMEPAAALPPLPQPPLAPAAPIPPAQGAPSVDELIQQSQWNLQQQEQHLLALRQEQVTAAVAHAVEQQMQKLLEETQLDMNEFDNLLQPIIDTCTKDAISAGKNWMFSNAKSPPHCELMAGHLRNRITADGGAL	638904	655275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_638980_639269_639444_644499_644685_645274_645413_645675_645808_654978
843844	contig_15236_pilon	+	659	3	Intergenic	novelGene_141573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	299.5	139	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	114	428	419232	452322	FALSE	10	GTGTTCTTGTCATTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVAVRRPSSFHLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTTRAPYFCRAACQIF	419118	452553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_425816_452275
843845	contig_11003_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_105449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	333	728	394226	393831	NA	30	ACTTTTACCAGTGAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEFQRIPFRKGPLVLRLWRPRLWVGWVLGEQTAASDGTGSSGKPAAAFSSPTSCFLSPPCPVVAPALGQSGEPVRPGNWAAGTPETALQGAQHPFPWEGCPYSVRPSYSCVLQQVFSGSKTKERVAEFSL	394558	393230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_393200_394600
843846	contig_4364_pilon	+	1166	9	Intergenic	novelGene_64	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	46.5026880943457	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	77	601	703017	707465	TRUE	25	TTTCAGACTCATATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGCRSIGCGPAAGSLSPPSILFRVMPERSGMYMQVEMHTGSRLHLKRAPGIRSWSLLVGILSIGLAAAYYSGDSLGWQLFYVTGCLFVAVQNLEDWEEAIFNKSTGKVILKTFSLYRKLLTLSRAGHEQVVVPLSDIRDVNVEEEKVRYFGKGYVVVLRFATGFSHPLTQSAVMGHRSDVEAIAKLITSFLELHRPES	701283	709024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_701336_702992_703120_704290_704333_704795_704870_705676_705774_706891_707037_707347_707408_707461_707653_708646
843847	contig_13937_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_167366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACGACTCTACAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110300	109403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_109400_110300
843848	contig_15888_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_84401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	52	junction_1	0	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAAGCAGGTGGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195294	196361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_195355_195546
843849	contig_5954_pilon	-	1021	7	Intergenic	novelGene_28583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.5662377970196	271	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	221	601	933127	931376	FALSE	0	CCTGCCTGCGTCGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVYARATCQPREVVVPLTVELMGTVAKQLVPSCVTVHRCGGCCPDDGLECVPTGQHQVRMQILMIRYPSSQLGEMSLEEHSQCECRPKKRETAGKPDSPRPLCPRCAQRRQHPDPWTCRCRCLRG	933838	930955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_931388_932065_932139_932472_932509_932700_932775_932941_933139_933456_933500_933672
843851	contig_12270_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_113576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14125	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14100
843854	contig_15039_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_110196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCCCAGTAATCAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389752	390375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_389800_390400
843855	contig_15088_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_177477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78288	79369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15088_pilon_+_78300_79400
843856	contig_16541_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_126760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCATAATTCTAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452197	451881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_451900_452200
843859	contig_615_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_80045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGAGGGTGGCTGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45234	44579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_44600_45200
843860	contig_615_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_80046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGCCAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47896	48688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_47900_48700
843861	contig_18438_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_171387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTAGAGATTACCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127048	126731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_126700_127000
843862	contig_9098_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_75768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTCTACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25110	26851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_25100_26900
843864	contig_8127_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_175068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTATAAAAGGCAGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256315	255597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8127_pilon_-_255600_256300
843865	contig_14890_pilon	-	727	8	Intergenic	novelGene_122517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1223.80550675642	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	131	706	370199	366291	FALSE	10	CTTTTGTCTGTTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHHIKVAVCY	371217	366269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_366322_367174_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_371106
843866	contig_6842_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_130649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATGATATAATGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203307	205153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_204727_204916
843867	scaffold_12124_pilon	-	810	3	Intergenic	novelGene_22116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1156	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1	669	896398	894594	FALSE	30	GGGCCGGCCAACCACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGEAAGQGALDDRSDGDGCGWGCLLPLRHRAAAHDDAVGAQRSRHHVHRDGGLLAEDPQG	896398	894452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894649_895139_895241_895885
843869	contig_8576_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_88765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTCACTAACAGAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750707	751462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_750700_751500
843870	contig_5727_pilon	+	1536	6	Intergenic	novelGene_7985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	54.9130221350091	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	108	650	461775	488779	FALSE	35	ACATGAATGGACAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLGWRRCRRERDALKLGNYVNEATSFLDFARHHVIMGQQISDQTQLVIGKLPEKVARHVTLVRESGSLTYEEFLGRVAELNDVTAEVAAGQEKHLLFEVQPGSDSSALWKVVVRVVCTKINKSSGIVEASRIMNLYQFIQLYKDITSQAAGVLAQSSTSEDPDESSSSVTSCQASLWMGRVKQLTDEEECCICMDGRADLILPCAHSFCQKCIDK	454033	489665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_454086_461719_461918_466848_466958_480147_480330_485112_485221_488778
843871	contig_7179_pilon	-	500	6	Intergenic	novelGene_78061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCTCCGGCATCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401680	392357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_392389_395389_395490_396248_396344_397036_397128_397718_397832_401610
843873	contig_3465_pilon	-	658	3	Intergenic	novelGene_173402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	0.5	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	316	654	802256	801321	FALSE	55	CAGAGAGAGACAGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDYLLNDCISCASICGQHPKQCAYFCENKFKEQSQVNFPPQLRRQKTGEAEAKPNNSGSYQGPESRGSEAVSAPQGLKLSGGQLALVYTTLGLCLCAVVCCFLVAMACFLKRRGGQCSCQLPHEPSHTQAESSQDHLMEVGSVGAGTPEPVETCSFCFPEQRAPTEESVGGHRGQGLAPTERWQPLPGTTSVQPSSSDEDSGLKIICAPSQERGPTT	807713	801316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_801572_802168_802355_807496
843874	contig_7066_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_42111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTAGCAGCCGAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552197	553815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_552200_553800
843875	contig_12079_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_67482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGGCAATGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609918	610845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_609900_610800
843876	contig_7870_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_109052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAAAGATATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646351	645965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_646000_646400
843878	contig_5945_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_104549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206992	206124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_206100_207000
843879	contig_11386_pilon	-	450	3	Intergenic	novelGene_82844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	502.5	178	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGCCAAGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250757	247183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_247310_247445_247600_250587
843880	contig_12090_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_80503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATCCCAAAGAATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251621	252987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_251600_253000
843883	contig_1545_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_149736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83659	84815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_+_83700_84800
843884	contig_10371_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_175471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGAGCCGGAGTGCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627010	626668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_626700_627000
843887	contig_7049_pilon	+	851	4	Intergenic	novelGene_171430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	54.6321028944216	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	103	609	90484	92345	FALSE	10	AGTGTCTGTCTTTGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLGLSRVDDAVAAKHPGLGEYAACQSNAFMKGVVTFVTGTGAAFGLQMLIHRKFPYPLQWTVLVAVDPAGVQKIWRESLRTQPSAPPPAPAWSSLPRTGPHRALWVPPVSPAHSHGQVPHTCEDSCDSSPVPAQDIRPERAVPGVVLASRNMVDIVNQDFCSLWCF	90381	92587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_90538_90815_90883_91084_91169_92043
843888	contig_333_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_170911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAGACGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10205	10706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_+_10200_10700
843889	contig_13112_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_98822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	10	33	274	306	221833	221801	NA	75	CCACCAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFVLLQPPSPRLQDRPKRPALLTCPPSAAPRSSPSHQLSNPGLVSRSTSLPSPLQALGTPRSHDASWARIWTVPPQGQNLSGHIVCILNPKMQFYFYSPEW	222106	220654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_220700_222100
843890	contig_14855_pilon	+	1516	7	Intergenic	novelGene_146045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.9858134617958	2	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	442	795	652860	654448	TRUE	10	TTGTTGTATCCTTTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQHLQPTIENAHEYFIKVASSLFDSGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQRGLTGFLDKVTHFVANFVLQNCIARWIAQRGGWVVALDLGNVPIRNVLIVLAVVLLGQYVVRRFWGPR	648677	655666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_648809_650807_650909_652287_652431_652793_652925_654023_654205_654340_655021_655517
843891	contig_18145_pilon	+	1445	9	Intergenic	novelGene_37301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	36.6296925321521	380	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	40	912	57127	59279	TRUE	35	GTAATAAACTCGTCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARAARGTGGILLRGFLRAPGRAPRRASSGLPRNTVVLFVPQQEAWVVERMGRFHRILEPGLNILIPVLDRIRYVQSLKEIVINVPEQSAVTLDNVTLQIDGVLYLRIMDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHVRYPWVGVGDRIDSERGSFIQS	57087	60231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_57553_57963_58064_58193_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59562_59980
843893	contig_11160_pilon	+	914	3	Intergenic	novelGene_168852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	3	662	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	180	320	819830	820083	FALSE	40	TTTCCAATAACAGAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRLGVCGQAQGRLLCRAGSTTKICVTSHQVVAHGQGSSKGPRQDVDVWLWQLEGSSVVTMRGQRLSLTPDDSLLVPAGTSYTWERAQGSVALSVTQDPARKKPLG	819474	820677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_819633_819808_819892_820004
843895	contig_13901_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_146635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAATTCCAACATTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147789	149371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_147800_149400
843896	contig_4151_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_65207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTAAGTTGCTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78351	77733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_77700_78400
843897	contig_10456_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_163454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	69.5462975290561	16	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	340	738	36382	42873	FALSE	40	AAATAGGATATATTTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIKSCINHPEISKDLYFHQALFTCLFMSPVEDQLFQEHLLKTDCRSGIDIICNTEKEGKTMLALQLCESFLISQLQNGDMYYIWELIFIWSKLQLKSNPSKQVFVDQCYQLLRTATNVRVIFPFMKIIKDE	12072	42875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_12155_33549_33721_36295_36499_37106_37247_42731
843899	contig_4812_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_103700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTCACCCTTTCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322704	323163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_322700_323200
843902	contig_1154_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_87225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTAAACGTAAGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606987	1606448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1606400_1607000
843904	contig_2577_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_172045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGGCCCCTGCCCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5577	5245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_5200_5600
843906	contig_1679_pilon	+	934	6	Intergenic	novelGene_173497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	150.142066057451	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	114	623	128918	147510	FALSE	20	CACGCTCCTGACACCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLLLLGPAPAAGHGGKYSREKNEPAPPAKREPEAFRMEKLNQLWEKAQRLHLSPVKLAELHADLKIQERDELSWKKLKIEGLDEDGEKEARLIRNLHVILAKYRLDGRKDAQVVNTNYLQDGTEEEGLEDPRLEKLWHKAKTSGKFSSEELEKLWRELKHHTEKVREYSVLLETLSRTEEIHENVISPSDQAVTMSSEPQREVAC	128804	147821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1679_pilon_+_128957_133892_134038_136698_136824_140447_140569_141738_141772_147463
843907	contig_5643_pilon	-	491	4	Intergenic	novelGene_39111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	189	302	490	640689	640403	FALSE	20	ATGTCACAGTCCAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSGGEREVGTRPFKLQWNRGAPRFRLWVIHWRPLQGSGLRHGHLWRVPAHFFLKESLLFSLSADRCFFIFSSFLFLPCRFSYISSLCLEEVREALAWVFFMAGGYVMFPYSDSLPFWDLHDLQLLLGCFNELGNGHVDELVLRLCLHHARALRPHHLDCLLDV	641533	640401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_640537_640634_640729_641102_641243_641411
843908	contig_2296_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_177478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	84	365	29856	29575	FALSE	25	TGGATCCTTTCATAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWNNIGIIDLIEKRKFNQNSNATYCIFMVNKPYAITCSVVAFYIPFFLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQRAGAPSEGRPQLADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNI	46098	29573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2296_pilon_-_29908_46066
843909	contig_10404_pilon	-	2004	2	Intergenic	novelGene_138700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	4	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGCAAAAGGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201807	1194342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1195790_1201250
843910	contig_8161_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_156772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCCTATTTACCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381319	380141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_380100_381300
843911	contig_8354_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_24079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATATTGAATCAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122245	121576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_121600_122200
843912	contig_8354_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_24078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTCTAAAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121327	120677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_120700_121300
843913	contig_8640_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_117733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTATAATTACAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35766	36954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_35800_37000
843914	contig_4103_pilon	+	1274	2	Intergenic	novelGene_51889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTACAATGTCTGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53837	55512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54403
843918	contig_12340_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_122089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAATGAAGTTTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1954	602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_600_2000
843919	contig_15354_pilon	-	1148	2	Intergenic	novelGene_65725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTCTTTTGTGAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568098	559866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_560491_567574
843920	contig_1275_pilon	+	818	2	Intergenic	novelGene_108780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCATAATCCTTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442830	443904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_442971_443226
843921	contig_5167_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_164104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGGTAAGCTCAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494644	495268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_+_494600_495300
843922	contig_14727_pilon	-	1158	5	Intergenic	novelGene_56645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_1	273.624286202815	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGAGAGTTAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279871	260580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_261518_262275_262325_263333_263376_264382_264455_279813
843923	contig_709_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_57561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	394	753	2047859	2048218	NA	60	CCTGTAAAATACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICWVFALCCKAAAASENTPLLCIFLLHSQSLPSGFCSPHGSRAQCGASAAAPVPLLLLPFFLLPTPCGCSVDVGHCWGLRGTRGRIFGGELPFSSASSLPPPCVKVLEISCCSSLHN	2047465	2048526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2047500_2048500
843924	contig_12837_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_57409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGGACAGAGTACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494458	493850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_493800_494500
843925	contig_3252_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_61506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAGGGAAAATATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558211	556750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_556800_558200
843927	contig_12869_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_75355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTCCAGGAACTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100731	99840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_99800_100700
843928	contig_8464_pilon	-	826	7	Intergenic	novelGene_125387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	29.1661904723031	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	141	716	855375	848418	FALSE	10	TGCTCTGAGTGTTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSRDRLLNKYRQGGGSMPRGAQNTLLVQEVMEEEWNALQSVDRYPEALAQLEEPVDLAVLEEIQQELIDQEQAIISEYEKSLQFDEQCLSIMLAEWEANPLICPVCTKYNLRITSGVVMCQCGLYIPSHSPELTEQKLRAFLEDHIQEHSIHCPHTPEFLVTKGTEEKSSLFMSCLACDTWAVILESQP	856630	848307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_848460_850667_850809_851973_852038_852195_852308_853577_853639_855219_855391_856505
843929	contig_17074_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_145180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGCACACACACGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596724	595105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_595100_596700
843930	contig_11356_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_175265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGTACTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234030	235300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_234000_235300
843931	contig_2867_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_135194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGAAAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858723	860361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_858700_860400
843932	contig_13901_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_146642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATGGGAAACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175045	173944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_173900_175000
843933	contig_6674_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_148010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTTTCCCTTTCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184063	183750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_183800_184100
843934	contig_6048_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_73203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	74	568	1501708	1501214	NA	25	GGTAGGGGATGAATGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKRKLKAAGFRGLPSFSQEVVRRMGLYPNLEDFRPVEQCNLDYCPERGSAIDPHLDDAWLWGERLVSLNLLSSTVLSMTHEAPGSLLLCPAPPGSLEPLVEGVVAFSRSVLCQDVEVAIPLPRRSLLVLSGAARHQWQHAIHRRHITARRVCATFRELSAEFCSGGRQQELGQKLLQIAFSFQGRPT	1501781	1500762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1500800_1501800
843936	contig_9863_pilon	+	899	4	Intergenic	novelGene_153986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	132.90180167661	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTGTGTCTGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5738	18747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5944_13883_13950_15250_15336_18204
843937	contig_10641_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_171404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAAAAAGAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215240	215548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_215200_215500
843938	contig_13015_pilon	-	865	4	Intergenic	novelGene_165556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	27.8128667266709	94	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTCCTCTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371592	367982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_368494_369169_369274_369354_369486_371473
843939	contig_5590_pilon	+	1085	4	Intergenic	novelGene_163047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.36357401145817	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	467	1084	384207	385388	FALSE	20	CCCCAGGTTACTCCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELVVTALLAPSRLTLKLLRALMWSLVFSAALVAAAVYSCIALTHVLCRPRRGCCGRPRCVFPACLSDPSLGEHDFLTLQSSGLRLHYVSAGRGNGPLMLFLHGFPENWFSWRYQLREFQSRFHVVAVDMRGYRPSDAPGDVDCYTTDLLMVDIQDVILGLGGWGRPADMPSSCALLSLVLPACRAATPTLGPALPTPQLNQFLW	383260	385389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_383335_383814_384450_384559_384646_385099
843941	contig_2100_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_50612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCATCCACTGTGACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747333	746908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_746900_747300
843942	contig_2100_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_50611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATGCCAGATTGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746695	745729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_745700_746700
843943	contig_50_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_122231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATTTAAGCTGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127250	126394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_126400_127200
843945	contig_14874_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_177481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79244	78505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14874_pilon_-_78500_79200
843946	contig_3612_pilon	+	342	2	Intergenic	novelGene_87832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACTAAGCCAGACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957015	958310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_957288_958240
843950	contig_7420_pilon	+	1502	2	Intergenic	novelGene_85860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226819	245765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_+_226974_244417
843952	contig_9727_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_86365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTATTCCTCATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567692	569001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_567700_569000
843953	contig_8291_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_99953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAACCTCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450769	450244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_450200_450800
843955	contig_6375_pilon	+	1464	4	Intergenic	novelGene_73081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	39.3813266522205	390	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	507	806	749890	750189	TRUE	55	CCCAAATTAAAAGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLNSAFQRDTTVMDYHMNGAPWSCAAWPCSAGAAGIPGQGVACVGRGGRLETTFNGNGGSCHQGWGDLPELCFLSKNGWRGANPGDLLRRRKQRCGL	749383	751689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_750386_750937_751031_751230_751316_751405
843957	contig_10074_pilon	+	1331	1	Intergenic	novelGene_57105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCCCAGCATAGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218822	220153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_218800_220200
843958	contig_6434_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_61892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACACTGCCCAAGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903249	902849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_902800_903200
843959	contig_11885_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_159706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAAGGGGTTTGGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63811	62396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_-_62400_63800
843961	contig_11386_pilon	+	607	3	Intergenic	novelGene_82792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTAAAGCCACTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27551	32444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_27893_31990_32183_32370
843962	contig_1406_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_25529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGACCCCTGGTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1975233	1974639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1974600_1975200
843963	contig_12485_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_147271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATGCCAATTGAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32404	32729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_32400_32700
843964	contig_11855_pilon	-	1684	8	Intergenic	novelGene_66986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2.47435829652697	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	62	1249	1169052	1150565	FALSE	55	AAATAAAACATGGCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALCGSGELGSKFWDSNLSLHTDNPDLTPCFQNSLLAWAPCIYLWAALPFYLLYLRNHHRGYIVLSHLSRLKTALGILLWCVSWADLFYSFHGLVHGWAPAPIFFVTPLVVGITMLVATLLIQHERLRGVQSSGVLITFWFLCVLCAIIPFRSKILLAMSEGRISDPFLFTTFYIYFALVLSALILSCFREKPPFFSPKNLDPNLCPEANAGFLSRLSFWWFTKMAILGYRRPLEEQDLWSLNEEDSSQMVVQRLLEAWKKQQKQAARHKTAAAFKKKVSSEDEVLLGAQARPREPSFLKAMVITFGPTFLISCFFNLIYDLLSFVNPQLLRSHHTSLLQPFPGQGAGWLSTGAEPRGRNHMQGKESQPRIQRGDSQLLHDFQQVTSPRFPSHT	1169113	1150129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1150947_1152175_1152308_1153069_1153132_1153394_1153521_1154522_1154661_1154863_1154990_1155518_1155696_1169007
843965	contig_366_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_51604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAGAAGAGATATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792274	791286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_791300_792300
843968	contig_20883_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_173835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAGGCACGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30664	30287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_-_30300_30700
843969	contig_10711_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_118455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCATCATGCGGCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861692	862056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_861700_862100
843970	contig_5013_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_110081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAGTATGTATTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76849	77559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_76800_77600
843971	contig_1836_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_71055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGAATCCAGTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870211	868335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_868300_870200
843974	contig_1274_pilon	-	903	4	Intergenic	novelGene_137819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	29.1318840219212	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	108	509	562540	539087	FALSE	75	AAAATATTAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAGILNGKVVSAQIKERLKNQVTQMKEQIPGFTPGLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTATESEVSHCASIVKRSAEVLSSLIFGTLETDMFSIYRSPGNSFFTDSASRKSLNIPTE	562647	538692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_539303_539728_539789_549397_549483_562499
843975	contig_14445_pilon	-	464	4	Intergenic	novelGene_137350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1073.89705693278	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	112	351	245160	244339	FALSE	35	TAAATATCTATTGTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSKWRAGLRVIAASGRWLKGIRKWYYNAAGFNKLGLMRDDTIYEDEDVKEAIRRLPENLYNDRMFRIKRALDLTMRQQILPKEQWTKYEEDKFYLEPYLKEVIRERKEREEWAKR	250652	244225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_244417_244998_245166_245995_246068_250618
843976	contig_5317_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_76570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCTTTCCCAGACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134399	134654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_134400_134700
843977	contig_14722_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_110205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGTAAACATGTCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36872	36498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_36500_36900
843978	contig_14722_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_110204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGGGAGGGGTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33367	32561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_32600_33400
843980	contig_11903_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_164736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCCTTTCTCTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129121	129781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_+_129100_129800
843981	contig_11903_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_164737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGCATTCACAATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130087	130538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_+_130100_130500
843982	contig_7576_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_177482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCTAAAATGGTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65408	64234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7576_pilon_-_64200_65400
843983	contig_13004_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_112619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTCCCTGAGGCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186282	186511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_186300_186500
843985	contig_2455_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_119220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAACATCAGAGATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388741	1389409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1388700_1389400
843987	contig_14481_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_153855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTTTGTTTTGTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193778	194050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_193800_194000
843989	contig_9189_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_165128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCCCCCAGAAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472000	471564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_471600_472000
843991	contig_6446_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_149186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCCAGCAGTAGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210045	211294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_210000_211300
843993	contig_6102_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_32308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCGTACTAACAGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552439	1551145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1551100_1552400
843994	contig_5467_pilon	-	864	3	Intergenic	novelGene_111949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	47	319	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	14	379	73894	72614	FALSE	15	CATTTTTTTTCCTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSALMGAPEALAGPAWRERHAFGILKRSLCAQAHGVESWRRAEQSTLTVPFRSPLEAEIARGSLAPDAEPHGGVVHKEFTLNGSVLAVRWTAEDPRLLRISIINFLDQLSLVVRTMQRFGPPVFR	73907	72128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_72729_72961_73091_73772
843995	contig_13721_pilon	-	718	6	Intergenic	novelGene_169484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	21.7678662252413	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	21	716	82555	29518	FALSE	20	GCGTGCCAAGGTCCAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATADPGAGNPQATDSSGGGTGGSLPSQGEQELSRRLQRLYPAVNQHETPLPRSWSPKDKYNYIGLSQGNLRVHYKGHGKNHKDAASVRATHPIPAACGIYYFEVKIVSKGRDGYMGIGLSAQGVNMNRLPGWDKHSYGYHGDDGHSFCSSGTGQPYGPTFTTGDVIGCCVNLINGTCFYTKNGHSLGIAFTDLPANLYPTVGLQTPGEIVDANFGQQPFLFDIEDYMRE	82575	29515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_-_29623_31535_31559_37456_37625_58399_58453_81419_81532_82320
843996	contig_6299_pilon	+	1190	4	Intergenic	novelGene_172938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	64.88108781113	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	325	1185	956551	961823	FALSE	20	TGGTTAGCAGCCGAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQLLPLALYLSNMRKAVKIRERTPEDIFKPTNGIIHHFKTMHRYTLEMFRTCQFCPQFREIIHKALIDRNIQASLESQRKLNWCREVRKLVALKTNGDGNCLMHAASQYMWGVQDTDLVLRKALFSTLKETDTRNFKFRWQLESLKSQEFVETGLCYDTRNWNDEWDNLVKMASTDTPGARGGFQYHSLEEIHIFVLCNILRRPIIVISGEMPADCLFVFKCFSVLMLWLLGKSHTTKATDNSKQKTKRKKPTAVKSIPTHSDPIGQGRTAHRISKQRLVGSNC	952569	961828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_952879_956535_956846_960604_960796_961448
843997	contig_14353_pilon	-	674	7	Intergenic	novelGene_82110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	509.289919615755	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	201	674	88616	79840	FALSE	40	TTGTGTAAGGGAATTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVPCKEAYPGDTPPNLYPTDLTFPSVTEINKNACQDGDME	104400	79839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_79945_83896_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_104333
843998	contig_6299_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_172931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCATATACATAATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436711	435909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_435900_436700
844000	contig_5515_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_52344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGAAAGTAAAATTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94236	94617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_94200_94600
844001	contig_5258_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_100247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATACATACGTCGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229551	230403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_229600_230400
844003	contig_4924_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_84778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCAGCTTAATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371559	372878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_371600_372900
844005	contig_8978_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_49305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTGAGAAAGAACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109154	109612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_109200_109600
844006	contig_6230_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_102098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130459	131311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_130500_131300
844009	contig_13697_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_165919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	163891	163493	NA	30	TGGCCGAAGAGCAGGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRGLPGPRRQEGQSCVPRGCPARARRARAGPFLARQVRGRAEALTEGDRWGQVPAGAFTRAPKPQRTTGFPAVSTGRWPPVSAPALCGSRYPHPPRTVRPTWSPAHLHLRPLLAGPTGSAPTLSAPGLCSV	163891	163442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_163400_163900
844010	contig_15132_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_176088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGCAAAAGAAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17138	16562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15132_pilon_-_16600_17100
844011	contig_710_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_162948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287928	288732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_287900_288700
844012	contig_4364_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGGGCGTGAGGTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359145	1360416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1359100_1360400
844014	contig_6593_pilon	-	286	2	Intergenic	novelGene_49834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCTCTGAACCACTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178270	1168725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1168888_1178146
844015	contig_6593_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_49833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACCCTGGTGGTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167028	1166739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1166700_1167000
844016	contig_11525_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_171089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACACACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83124	81718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_81700_83100
844017	contig_5690_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_119712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATGGAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979982	980879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_980000_980900
844019	contig_6050_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_123119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	278	634	360223	360579	NA	20	TCGCCGAACCAGCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPHPALQLSGQDGQELLQHQQLQDLLLAVHLGLQPLSAELPELAQGLSGPRCLLITKVPEPLAKNLPGMGFFPLKAGFLSPNMFIFLHLHDLKPHRLLCNLEGQLCSFSWLHGLLG	359945	361514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_359900_361500
844020	contig_7521_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_160567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTTTGTTAAGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383726	382415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_382400_383700
844022	contig_15105_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_150974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTGCAATAGGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620058	620295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_620100_620300
844023	contig_6076_pilon	+	1010	4	Intergenic	novelGene_81751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.98887651569859	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAGTAAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176682	306971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_176791_213206_213366_214127_214250_306350
844024	contig_15673_pilon	-	574	3	Intergenic	novelGene_169836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	39	299	160771	159608	FALSE	15	ATGTTTGCTGTCTCACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGFEPKKEEIKKMTNEIDKEGTGKMNFSEFLTVMTEKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGRISFKNLKRVAKELGENLTDEELQVLIVCIPRSRTRAH	160809	159332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_159649_160339_160482_160693
844028	contig_8866_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_77860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTATCTACATTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677240	676733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_676700_677200
844030	contig_14666_pilon	-	709	4	Intergenic	novelGene_39548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	1124.54445097658	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	226	567	458202	451947	FALSE	20	CGCCCCTCATAGGATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPIR	475122	451804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_452102_453686_453867_458195_458360_475054
844032	contig_10176_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_72739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAAAAATACATACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265098	265457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_265100_265500
844033	contig_6446_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_149271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTGCAGATTGAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826006	824888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_824900_826000
844037	contig_10494_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_102149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTTGCAAACGCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749992	749172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_749200_750000
844039	contig_7057_pilon	+	471	4	Intergenic	novelGene_123316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	609.054640862013	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	2	469	936021	943710	FALSE	5	CTCTTCGTGGCATCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRLCPSRSPRPESPAPPSGAERSGRPGGCRRTDCRTCERGVVTLFLTPSHQSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAPQGLLSSGGISPVPAPCHACSSYPPGSRTPRSTSHVPSAFVPALLSARQAQEEIKAPHC	936019	943712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_941005_941107_941208_941274_943532
844040	contig_14357_pilon	-	931	3	Intergenic	novelGene_121709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	70	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	196	342	810577	810333	TRUE	35	AAACTATATGTATGCACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLPRDLPSYYQHWGCCCWVPSSQLQLKATPCDRVRTAQQGFLDSNLYGAGLSLTERLGGFKPPTMNLPVSSRVLNWCTTRAPNTGWRIGSLGLALHSPSPLPRIALITPTNL	810772	809412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_809953_810283_810409_810506
844041	contig_17522_pilon	-	776	2	Intergenic	novelGene_160815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_1	0	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAGAAAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96468	93639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_94332_96384
844042	contig_1275_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_108802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	44	310	545138	544872	NA	65	TTTTTAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELLTIHPWRKYNRMCPDSSCNFVTLWKMIKLMCFSFLGCNIRKTPAHLGLVAVSLKGASPYEIALNNLKGLCFCKVVTASSALLWFVCTSLMARNTFYLVL	545181	544541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_544500_545200
844044	contig_2637_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_100018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGGTTCAGGAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12064	10538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_-_10500_12100
844045	contig_12740_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_159216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAACAACAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101919	103108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_101900_103100
844046	contig_5302_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_81506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAATATATATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348830	348548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_348500_348800
844047	contig_6375_pilon	+	996	2	Intergenic	novelGene_73073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	32	508	744990	747623	FALSE	20	CGTATCAGTGTGTAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVVAVLATVMGTHTFSLRLHKDRSHWPSCCSSKGQDFSEEWLKWNPVVVNSPETASLIRYAESCRASEDGPLNSRAISPWRYELDRDLDRLPQDLYHARCLCPHCVSLQTGSHMDPLGNSELLYHNQTVFYRRRCRGEQGAHDGYCLERRLYRVSLACVCVRPRVMA	744958	748111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_745211_747367
844048	contig_2062_pilon	+	1408	13	Intergenic	novelGene_139063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	114.959654758625	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	529	1227	1475169	1485745	FALSE	15	GCCAGGATGACTTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRTFTVTTGQQQAGVVAHPPAVPPRPQPSQAPGPIVHRPVDADGLITHTSTSPQQIPEQPNFADFSQFEVFTASSVNEEQDDEAEKHPEALPVEKSSDPASSLRGAKTESKIEEKTAASAPANVSKGTTPLAPPPKPVRRRLKSEDELRPEVDEHTQKTGVLAAVLASQPSIPRSVGKDKKAIQASIRRNKETNTVLARLNSELQQQLKDVLEERISLEVQLEQLRPFSHL	1442240	1485926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1442278_1457814_1457937_1461764_1461846_1467831_1467920_1471350_1471449_1473690_1473768_1475143_1475197_1476070_1476136_1478133_1478320_1479438_1479535_1481454_1481604_1482965_1483072_1485676
844049	contig_14445_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_137361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCAAATGGATGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296200	295144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_295100_296200
844051	contig_6279_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_164761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCAGCTCTGGCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43067	41818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_41800_43100
844052	contig_14868_pilon	-	604	5	Intergenic	novelGene_150464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCAGGGTAACAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252472	227099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_227158_230100_230240_239751_239905_248547_248683_252353
844053	contig_6109_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_160378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCACATAATTTACAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571048	572800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_571000_572800
844054	contig_2045_pilon	+	871	6	Intergenic	novelGene_177483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.612815249019	13	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	8	871	20494	32626	FALSE	30	GTAAGTTAACTGCTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEMKMLSGNAKRDKKELETAGKIATEAIENIRTVVSLTQERKFESMYVEKLYGPYRNSVRKAHIYGITFSISQAFMYFSYAGCFRFGAYLIVNGHMRFRDVILVFSAMVFGAVALGHASSFAPDYAKAKLSAAHLFMLFERQPLIDSYSEEGLRPDKFEGNVTLGDIVFSYPTRPNVPVLQKLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQLLERFYDPMAGTVLFDGQEAKKLNVQWLRAQLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQDEILSAAKAANIHPFIETLPH	20486	32626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2045_pilon_+_20554_24575_24677_26263_26405_28952_29110_30707_30906_32419
844056	contig_7513_pilon	-	1168	4	Intergenic	novelGene_89033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	5.43650214343336	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	52	984	709827	705051	FALSE	50	AAAAAATCATTTGAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRFRRANAVVLIKSSRSMNDLYDLQKRQRQRGRHRNQSGATTSSGDTESEEGEAETTVRLLWLSMLKMPPELMRLCLCHLLTWFSVIAEAVFYTDFMGQVIFEGDPKAPSNSTSWQAYNDGVKMGCWGLVIYAATGAICSALLQKYLDNYDLSIRVIYVLGTLGFSVGTAVMAMFANVYVAMIMISTMGIVSMSISYCPYALLGQYHEIKQYVHHSPGNSRRGFGIDCAILSCQVYISQILVASALGSVVDAVGTVRVIPMVASVGSFLGFLTATFMVIYPDVSEEAKEEQRGLSAQPASDGTAKPMVLKLSRKEGPQGPVETESVV	709878	704866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_705402_708167_708380_708522_708623_709557
844058	contig_19402_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_80873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGCTCATTTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232975	232191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_232200_233000
844059	contig_5777_pilon	-	1287	9	Intergenic	novelGene_173317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	254.472217294934	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	25	741	65170	40120	FALSE	30	TCTGAAAGTGAGTGGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAESPGDRGTASPRPLFAGLSDVSISQDIPVEGEITIPMRSHIQEFDSSTLNESVQNTIMRDLKAVGKKFMHVLYPRKSNTLLRDWDLWGPLILCVTLALMLQRGSADSEKDGGPQFAEVFVIVWFGAVTITLNTKLLGGNISFFQSLCVLGYCILPLTVAMLICRLVLLAKPGPVNFVVRFFVVIVMFAWSIVASTAFLADSQPPNRKALAVGIPHKFILINQVNNTRTTGSLE	65194	39573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_40165_40888_40914_44383_44439_46524_46683_47289_47416_53621_53665_56491_56571_57809_57939_65113
844060	contig_9471_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_21753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGCATATGAAAACGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345955	345078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_345100_346000
844061	contig_987_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_72351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	118	465	1291931	1291584	NA	15	GTTTTTTTTTTTTTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAKKPESFGKVTLSPPPTQTTTPASDTTIFPQPYTSTRKENFFKKSITTSKCTGFSLHPALKPCSNSCFSELKLYPILSNPPPPPPYPALDKAVGATFLPPALPSSCFLFDSAS	1292048	1290937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1290900_1292000
844062	contig_2917_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_147605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTCTGCATACTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178954	178350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_178400_179000
844063	contig_8617_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_73406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62340	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_62300
844064	SIRV6	+	258	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	272	1	41	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2557	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
844065	contig_3817_pilon	+	1424	4	Intergenic	novelGene_78380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	344	1057	899196	907417	FALSE	25	ACACTCTAAAGGCCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVGWAGSSPVNGSAWVHFGRVIELQPGHHAARFQHGSWALDVLHLATLLYGQGHDHLHHLHLSIAAPSLDMAPILHRVLYQLPSRGGSQDRWVVLLLKHTRLVADGNSVPVHLFFHVGGVAVPIVRQQQPAIVQPVGVDLDVTAVHDEHEHGQRLAGHLWRQARCYPLDVGSLLVPGLSKPHLAPLLVEGLAALCRSAGVDASTSLAPALTHPMGTAHAAGDTLELVSHTCPWGS	898852	907784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_899246_903332_903462_904806_904958_907033
844067	contig_3281_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_128533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACTAACTTCAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157361	158516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_157400_158500
844068	contig_8671_pilon	+	1231	2	Intergenic	novelGene_126284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGATGGTGAGTCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845079	847088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_845683_846460
844070	contig_8550_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_72366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAATACCCGGTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153339	153632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_153300_153600
844071	contig_2799_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_85552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTGAGACTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712444	713021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_712400_713000
844073	contig_10437_pilon	+	276	3	Intergenic	novelGene_38121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCCCGTGCCCCCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90518	94602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_90690_92824_92875_94547
844074	contig_10437_pilon	+	847	7	Intergenic	novelGene_38122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	3.74165738677394	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	423	524	100333	100434	TRUE	30	GTAAACAGAAGGGGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSTFYFDVLQALTGPVNLHGRSAFFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLEDIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAASFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPATHQPLLTLTSRALLTQVAVDGMAGPHSNTTVLFLGSNDGTVLKVLPPGGAAWGI	99070	101484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_99177_99453_99586_99901_100055_100301_100477_100771_100919_101214_101293_101428
844075	contig_10437_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_38123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGCCGCCGTCCAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102566	102796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_102600_102800
844078	contig_13460_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_162196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCCCCAAGGACAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326149	326742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_326100_326700
844079	contig_14744_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_66104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1503087	1504382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1503100_1504400
844081	contig_1406_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_25460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGAGCTTGGCTGCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575988	575388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_575400_576000
844082	contig_5770_pilon	-	506	5	Intergenic	novelGene_74176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	180	junction_2	6332.04917463533	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	16	471	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264947	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263926_264062_264766_264808_264892
844083	contig_10583_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_167928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACAAACAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304057	302688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_303117_303900
844085	contig_12672_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_141490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAGCAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239084	239336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_239100_239300
844086	contig_9481_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_149627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTACTTAAAAATGCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92606	92278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_92300_92600
844087	contig_16722_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_118300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTGGAAATGTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154307	155913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_154300_155900
844088	contig_12977_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_122814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGACAAACTAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76775	77164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_76800_77200
844089	contig_14635_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_84372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595670	597096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_595700_597100
844090	contig_2078_pilon	-	1770	7	Intergenic	novelGene_100162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_5	5.78551831923659	27	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTTAATATCAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431045	418577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_419795_419879_419912_423192_423262_423480_423564_429666_429695_430275_430339_430767
844091	contig_15029_pilon	-	672	6	Intergenic	novelGene_128176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1297.22756677462	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTTGTGTTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172415	146604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_146780_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
844092	contig_9389_pilon	+	634	5	Intergenic	novelGene_83907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	981.569502124022	1098	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	40	570	159587	168333	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLHPPLGPSFDCRCYWVALPDDPCLPALPPAKNCTGSPTQDPSGDQPPPGAPGP	159547	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164522_168174
844093	contig_16775_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_107741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAATATCAGAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49022	49330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_49000_49300
844094	contig_563_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_169767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGGCTGGGCTCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703828	704584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_703800_704600
844095	contig_7467_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_69460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGCCTCTTGTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63048	62120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_62100_63000
844096	contig_10404_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_138733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAGGCATAAACCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1577243	1576838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1576800_1577200
844097	contig_5361_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_167217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	630	983	567059	567412	NA	70	TGACCAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACKALRYLCLLTSFFSNTISCHTQTELLSSCHFVIVVVSCHQVDSNSWRPHMCGVERLYRGFKAAGLLCLLQIGQARSHLRAFAFSVRLPWNSPVALPSGLCSNVTSSEGPSLRTL	566429	568326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_566400_568300
844098	contig_14338_pilon	+	1412	10	Intergenic	novelGene_174837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_9	84.300315597728	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1410	1	1410	77725	106369	FALSE	30	CCTAAGGGATTATGGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNECVAQTWFRFLHMLSNPVDLSNPAIISSTPKFQEQFLNVSGMPQELNQYPCLKHLPQIFFRAMRGISCLVDAFLGISRPRSDSAPPTPVNRLSMPQSTAVNTTPPHNRRHRAVTVNKATMKTSTVSTAHASKVQHQASSTSPLSSPNQTSSEPRPLPAPRRPKVNSILNLFGSWLFDAAFVHCKLHNGINRDSSMTAITTQASMEFRRKGSQMSTDTMVSNPMFDASEFPDNYEAGRAEACGTLCRIFCSKKTGEEILPAYLSRFYMLLIQGLQINDYMCHPVLASIILNSPPLFCCDLKGIDVVVPYFISALETILPDRELSKFKSYVNPTDLRRSSINILLSLLPLPHHFGTVKSEVVLEGKFSNDDSSAYDKPITFLSLKLRLVNILIGALQTETDPNNTQMILGAMLNIVQDSALLEAIGCQMEMGGGENNLKSHSRTNSGISSASGGSTEPTTPDSERPAQA	77724	106371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_77778_85210_85390_86508_86658_86786_87004_90532_90735_93826_93995_94540_94656_95053_95202_95671_95737_106255
844099	contig_5315_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_175349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTGTTTAGTCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126633	128728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_126600_128700
844101	contig_7843_pilon	-	1351	8	Intergenic	novelGene_152006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGAGCCCGCGATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178247	147416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_147562_148472_148547_167924_168101_171647_171814_172656_172747_172922_173030_175315_175450_177788
844102	contig_2646_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_69543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGAGCCTGGGAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842349	843096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_842300_843100
844104	contig_10437_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_38402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCCATTGAAAACCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754285	754707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_754300_754700
844106	contig_1534_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_176128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTACAGTCTTTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29741	30947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_+_29700_30900
844107	contig_9415_pilon	-	997	3	Intergenic	novelGene_109917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_1	53.5	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	107	637	2160349	2158825	FALSE	70	GAGAAAAAAATGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSADRSQWREPTRTSDGLCSLYEAALCLFEEVCRMASDYSRTCASPDSIQTGDAPLVSETCEVYVWGSNSSHQLVEGTQEKILQPKLAPSFSDAQTIEAGQYCTFVISTDGSVRACGKGSYGRLGLGDSNNQSTLKKLTFEPHRSIRKVSSSKGSDGHTLAFTTEGEVFSWGDGDYGKLGHGNSSTQKYPKLIQGPLQGKVCAFFFQFKK	2165303	2158464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2159170_2160163_2160359_2165206
844108	contig_10235_pilon	-	664	2	Intergenic	novelGene_46298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	447	500	83700	83647	FALSE	25	AGTGCTGCCAATGTAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQKLPEEKAETDLSPRLPAAHLIGWETKKEEAFLRSGTQFLGAEGLALPQDGLYYLYCYVGYRGRAPPAGRGPLGRSVTLRSSLYRAGGAYGPGIPQLLLEGAETVTSVLDPARRHEYGPLWFTSVGFGGLVQLRRGERVYVNISHPDMVDYRRGKTFFGAVMVG	84639	83482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84075_84567
844109	contig_7179_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_78206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCATTAAAAACGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667622	1668741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1667600_1668700
844110	contig_15991_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_70937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACCAGGGCTCCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118391	117062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_117100_118400
844111	contig_15820_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_174593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACCTTCCCCCCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77531	76525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_-_76500_77500
844112	contig_11324_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_177010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	222	228	449	169050	26644	FALSE	30	GAGAACTATTCTGTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRAWRAAAAAGSRRRRRFRPRGSLASARRKKCRRVAADSPPSAPEVRPASRLWISPRSPRQLFAKLLETSPKVDMDTAAAALPAFVALLLFSPWPLLGSAQGQFSAGGCTFDDGPGACDYHQDLYDDFEWVHVSAQEPHYLPPEMPQG	169277	26643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11324_pilon_-_26769_168953
844113	contig_19957_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_57685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCATACGTATCTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77943	79121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_77900_79100
844114	contig_8065_pilon	+	428	4	Intergenic	novelGene_107350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	19.7540431867054	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	109	426	601095	601723	FALSE	15	ACCCCCACCCCCACCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISSVSSLLLFNTTENLYKKYVFLDPLAGAVTKTHVMLGAETEEKLFDAPLSISKREQLEQQVLESYFYVPDLGQVPEIDVPSYLPDLPGIADDLMYSADLGPGIAPSAPGTIPELPTFHTEVAEPFKPDLEGGMLTAPPPP	600726	601725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_600777_601036_601173_601385_601588_601685
844116	contig_13794_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_168550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCACCATTTCCTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49255	49797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_49300_49800
844117	contig_12250_pilon	+	1328	7	Intergenic	novelGene_80578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.595088904127	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	216	1280	311980	314315	FALSE	30	TGTTAAAACATTGTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKADMLSWMQPGVSITSSFALSQYGVDMGWTLPECSITDSVTMTQPMEPNPPQQPRLALGSSLPNTKHSPHFPQEPASRTHPEPLTGHHFNLAPIGRRRIQSRWASTRGGHKERPTVMLFPFRNLGSSAQVISKPENRRQHWTHTADPACAVGTRTASAGKPKCPSQHLGGRALKENPVGSSASEQKENCLDCALDPLKLSLSPPRTRKPASSPSLCSPIITIGDLVLDSDDEENGQREGKPYKQFSGNEVEVQDWVA	311764	314363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312877_312969_313132_313596_313684_313753_313856_313949_314261
844118	contig_10500_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_41210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGCCACTCCTTGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533845	1534159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1533800_1534200
844119	contig_14973_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_171226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATTAATACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195562	194119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_-_194100_195600
844120	contig_12761_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_164067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGGTTTTCAGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341823	340321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_340300_341800
844123	contig_2988_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_136555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAATTAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176032	175549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_175500_176000
844125	contig_1435_pilon	-	1257	6	Intergenic	novelGene_115475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGCCCGGGAACACTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358192	333054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_333103_338637_338755_345578_345720_348684_348816_350409_350592_357554
844126	contig_253_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_129780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACACATAAAAATGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061550	1060849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_1060800_1061600
844127	contig_6589_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_26322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATCAAAAGTAGGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2417775	2417268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2417300_2417800
844129	contig_19564_pilon	+	858	6	Intergenic	novelGene_29698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24.9046180456557	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	528	749	151310	151531	FALSE	15	TCCCCTTCCCCAGATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGYDPNRYRLHFERDSREEVERRKRAAREQVLQPVSAEVLELDIREVYQPGSGLVFPSLLPRQLQVLAGIYPIAQIQEPYTAVGYLASRIPVQALLRLRHPEAEDPSAEHPWCAWDICEAWAEKRGYKTARAARNDVYRAANSLLWLAVDGRLSLCFHPPGYSEQKGTWESHPETMELVVLQGRVGPAGDEEEEEEEEEELSSSCEEEGEEDRDADEEGEGDEDTPTSAPGSSLATRNPYALLGEDEC	142751	151640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_142774_143116_143254_150174_150213_150292_150456_150747_150889_151283
844130	contig_826_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_154943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGCAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333475	335027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_333500_335000
844132	contig_7919_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_28080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAACTGAAAGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089055	1089919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1089100_1089900
844133	contig_5797_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_56958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTGCCCCCAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383030	384237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_383000_384200
844135	contig_8027_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_158848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGCAGTAAATGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412032	411157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_411200_412000
844136	contig_6710_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_89101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653609	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
844137	contig_2043_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_169890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACAGACTACTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96263	98176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_96300_98200
844138	contig_13760_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_61327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTTCTGGGACCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240272	239241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_239200_240300
844139	contig_9290_pilon	+	1646	2	Intergenic	novelGene_77526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCATCTGGTAATGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247252	249327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_248869_249297
844141	contig_5936_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_53541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTACTGCTAACTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47992	48717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_48000_48700
844142	contig_10050_pilon	+	1470	1	Intergenic	novelGene_119642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	457	774	308203	308520	NA	30	GGTGTCCAGGTAACAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQPHVCYRKEFSKNQTHSARIDWPYGIYSRVLNILKLRLHIFIAVQLIINCCTCIQEHIVYPTEQVVTTYQHPPVWVNEGVWRTGGFEDVEEQVGWEGGSCG	307746	309216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_307700_309200
844143	contig_10446_pilon	-	1198	10	Intergenic	novelGene_162431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAGCAGAAAATGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32589	5381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_5444_7321_7400_9487_9537_10302_10386_12570_12750_15370_15454_15842_16016_20019_20159_31551_31687_32372
844145	contig_2596_pilon	+	1297	8	Intergenic	novelGene_53495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGTGCAAAGTGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780888	911861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_781240_782930_783050_785587_785705_788592_788670_811138_811213_896009_896093_903329_903420_911475
844146	contig_5718_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_110407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATTTGCTGAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369307	1370164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1369300_1370200
844147	contig_8829_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_140948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGACCCATCTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78837	78260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_78300_78800
844152	contig_7410_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_106071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTACTACTAAATTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339401	340816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_339400_340800
844154	contig_12886_pilon	-	1633	2	Intergenic	novelGene_135452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGAGGGTCTTGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231536	229810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_230633_230725
844155	contig_5302_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_81546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTTGGCTATGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1638888	1639302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1638900_1639300
844156	contig_5260_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_144382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	65	310	352534	352289	NA	65	GGAGCCCAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNVVRAKRFRKTPPAAHQISLMCREECFKKQVWFFSLPCRGIPRWTVRSLTAHAFHLGVGRSMWFTVCLLVEVEIGELKGLGRLPYSFSERMMAKRSGASAF	352598	351487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_351500_352600
844157	contig_7171_pilon	+	1390	12	Intergenic	novelGene_101283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_11	38.6217084505122	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	27	1262	1045755	1057396	FALSE	10	CTACGCCCTCTGGCGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYFLEESTGYMEPALRCLSLLHTLVAFLCIIGYNCLKVPLVIFKREKELARKLEFDGLYITEQPEDDDVKGQWDRLVLNTPSFPSNYWDKFVKRKVLDKHGDIYGRERIAELLGMDLATLEITAHNERKPEPPPGLLTWLMSIDVKYQIWKFGVIFTDNSFLYLGWYMVMSLLGHYNNFFFAAHLLDIAMGVKTLRTILSSVTHNGKQLVMTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFYNKSEDEDEPDMKCDDMMTCYLFHMYVGVRAGGGIGDEIEDPAGDEYELYRVVFDITFFFFVIVILLAIIQGLIIDAFGELRDQQEQVKEDMETKCFICGIGSDYFDSTPHGFETHTLEEHNLANYMFFLMYLINKDETEHTGQESYVWKMYQERCWDFFPAGDCFRKQYEDQLS	1045728	1057524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1045872_1047072_1047204_1049273_1049317_1051592_1051724_1051815_1051877_1052973_1053121_1053400_1053536_1055776_1055934_1056367_1056433_1056521_1056623_1056774_1056827_1057300
844158	contig_3956_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_14769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	42	395	919044	919397	NA	40	TATCTAGAGCAATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAGLKKQFYKASQVSGGRAGSYRLPGIGGPAQAREEAEVAALARVRRRVGAPRRNGGLGGGPGPVRHGGASVLEKGGQRRNRAELRVETGRRGSTVPRGCRQRNLLLPDSPGPGQI	919002	919399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_919000_919400
844159	contig_17158_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_141140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	366	12	377	106383	106748	NA	15	GCCCTGCAGTACGTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSMAKSSEGKNVEFIHSLLQRCKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYSLATSERDRALQKDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIELLKLLQVLIVLEHHLGQAQEEVESQPELSREWRRTLGFQQAIS	106371	106748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_106400_106700
844160	contig_2537_pilon	+	938	4	Intergenic	novelGene_33406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	24.9042611258038	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAACTACAACCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138526	158781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_139185_141607_141705_156611_156656_158642
844162	contig_10627_pilon	-	1305	7	Intergenic	novelGene_60033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_1	83.6215017537688	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	36	1295	756383	622841	FALSE	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHIRIMEGMSRSLPSSPLLTHQSISVRLQPVKKLTGDAEQELGPPPSVDEAANTLMTRLGFLLGEKVAEVQPGDQYSMEVQDENQTSAITQRISPCSTLTSSTASPPASSPCSTLPPVNTNATAKDCSYGAVTSPTSTLESRDSGIIATLTSYSENMERTKYVGENSKELGSGGNLKPWQSQKSSMDSCLYRVDENMMASTYSLNKIPERNLETVLSQSVQSIPLYLMPRPNSVAATSSAHLEDLAYLDEQRHTPLRTSLRMPRQSMGSARTQQDLRVRFAPYRPPDISLKPLLFEVPSITTESVFVGRDWVFHEIDAQLQSSNASVNQGVVIVGNIGFGKTAIISRLVALSCHGTRMRQIASDSPHASPKHVDANRELPLTQPPSAHSSITSGSCPGTPEMRRRQEEAMRRLASQVQ	756418	622830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_622984_626896_627179_656327_656454_669726_669991_687298_687486_694416_694566_756274
844163	contig_11702_pilon	-	653	7	Intergenic	novelGene_141983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.7935447508499	37	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	174	584	376758	372981	FALSE	30	AGAATAAACTGGCCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSTADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNNILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGESEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	380760	372911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373048_374925_375037_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
844165	contig_776_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_139907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCATACAGCTAGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474363	472911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_472900_474400
844166	contig_16110_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_126804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATTAATAAAGCTATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119088	119900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_119100_119900
844169	contig_9828_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_172249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGATGAGATTAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114693	116427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_114700_116400
844170	contig_12079_pilon	+	2159	1	Intergenic	novelGene_67362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAAAAACCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240926	243085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_240900_243100
844174	contig_5899_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_146987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATATGAAGCATTTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446011	445494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_445500_446000
844175	contig_14807_pilon	-	647	4	Intergenic	novelGene_124717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.105074707492	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	3	575	54494	45280	FALSE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLNTTGVPASLPVEFTIDAKDAGEGLLAVQITDPEGKAKKTHIQDNQDGTYTVAYVPDVTGRYTILIKYGGDEIPFSPYRVRAVPTGDASKCTVTGAGIGPTIQIGEETVITVDTKAAGKGKVTCTVCTPDGSEVDVDVVENEDGTFDIFYTAPTLRCSHPPPPPVASQLSLGKRRRGSHSVSCLSSLVL	54496	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45394_51543_51717_53836_54027_54398
844176	contig_10134_pilon	+	1581	2	Intergenic	novelGene_16171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12398	14076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_13684_13780
844178	contig_10140_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_148420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAATTCCTCAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272863	272599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_272600_272900
844179	contig_266_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_166300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAATTAACGTGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634100	632548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_632500_634100
844180	SIRV2	-	330	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4543	34	3368	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
844181	contig_3602_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_60584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTACCTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662167	663103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_662200_663100
844182	contig_6418_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_81221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCGCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364981	1365221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1365000_1365200
844183	contig_12050_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_62667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCTGTCCTGTACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446608	446058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446100_446600
844184	contig_593_pilon	-	1167	3	Intergenic	novelGene_102018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGGTGAGTGACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396758	395423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_395756_395858_396330_396394
844186	contig_13700_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_68279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATACATGTAATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109423	108293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_108300_109400
844189	contig_9721_pilon	-	445	2	Intergenic	novelGene_155991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGACCCAAGGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437439	403411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_403718_437300
844190	contig_11386_pilon	+	1217	4	Intergenic	novelGene_82787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	488	junction_3	309.683709613535	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	105	764	17940	31994	FALSE	25	TTAAAGCCACTCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTR	17835	32447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_21022_31990
844191	contig_19752_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_177484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59215	58192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19752_pilon_-_58592_59115
844193	contig_12410_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_167275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111240	110183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_110200_111200
844194	contig_16593_pilon	-	1143	3	Intergenic	novelGene_177485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.5	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	557	1039	10455	9413	FALSE	10	CCAGATGCCCGCCCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYVPWDPFPARLPYAPSRLPTPSALHRNYQGVPKGPIPLGPCPILKLLPATAVAVAAVPVVLSTVGFTGAGIAASSLAAKMMSTAAIANGGGVAAGSLVATLQSVGAAGLSMSSNILLGSVGSALGAWLGGSKKKPPPPPPDEPKTEEGDSDEDGDQDE	11139	9308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16593_pilon_-_9577_10136_10945_11072
844195	contig_3397_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_154586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTCACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157107	155767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_155800_157100
844196	contig_6205_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_160336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40488	39425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_-_39400_40500
844197	contig_11846_pilon	+	645	6	Intergenic	novelGene_105980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGTGAAGATGAGTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339660	477024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_339944_348261_348331_356655_356764_437088_437159_467818_467905_476995
844198	scaffold_13609_pilon	+	945	6	Intergenic	novelGene_124426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_5	44.2899537141325	998	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	17	802	779035	781267	FALSE	20	GATAGTGGGCAGCGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGRVDVAVNCAGIAVAIKTYNLKRSQAHTLEDFQRVLNVNLIGTFNVIRLVAGEMGQNERDQGGQRGVIINTASVAAFEGQVGQAAYSASKGGIVGMTLPIARDLAPIGIRVMTIAPGLFGTPLLTSLPDKVRNFLASQVPFPSRLGDPAEYAHLVQAIIENPFLNGEVIRLDGAIRMQP	779018	781410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780437_780559_780689_780768_780878_781076
844202	contig_4845_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_53663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTGGTCTTTTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519738	519097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_519100_519700
844203	contig_6270_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_99836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	189	422	197654	197421	NA	30	CTCACTATCCATAGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSWFLPLPLILLPPFLCHRALLCLLPLFAISYCLARSPALQLFFLCLGGSQHRDFKSKGRSMLQTLLDGSEVPLNLCGIGPYVIRHLVNFKAWSSHRDHELTNPLSKPQSLICIVINQFSQGHIILLGGFTYPICIAD	197842	196471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_196500_197800
844205	contig_9482_pilon	+	1815	13	Intergenic	novelGene_44270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4.93006648591635	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	45	1121	773923	793829	TRUE	10	ACGGGGCGCGTGTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAVGDLKQALPCVAESPTVHVEVRQRSSSTAKKEDIKLSVRNLLNRHNIVFGDYTWTEFDEPFLTRNVQSVSIVDTELKAKGSQPIDLSTCTVALHIFQLNEDGPSSENLEEETENIIAANHWVLPAVEFHGLWDSLVYDVEVKSQLLDYVLTTLLFSEKNVNSNLITWNRVVLLHGPPGTGKTSLCKALAQKLTIRLSNRYQYGQLIEINSHSLFSKWFSESGKLVTKMFQKIQDFIDDKDALVFVLIDEVESLTAARNACRAGTEPSDAIRVVNAVLTQIDQIKRHSNVVILTTSNITERIDVAFVDRADIKQYIGPPVSGCHLQDLPLVLGGAHEAADPAGAGDDRLHREQRV	773878	796322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_774015_775545_775712_779879_780010_780675_780732_781733_781825_784686_784760_787534_787599_788388_788476_789042_789150_792108_792264_793773_793860_795235_795306_795728
844206	contig_13494_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_167518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCAAAAGTTCAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81401	82391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_81400_82400
844207	contig_7843_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_152019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAAACTATAATTAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183371	184756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_183400_184800
844209	contig_11253_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_126844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237182	238232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_237200_238200
844211	contig_6489_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_128952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTAAAGGTTGGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353495	353294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_353300_353500
844212	contig_16113_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_140554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGACGTGGCAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141128	139943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_139900_141100
844214	contig_15123_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_110905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCCAGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190764	191105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_190800_191100
844216	contig_13828_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_158291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCTGGAAGAAAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246394	327012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_247175_250618_250785_323422_323628_325416_325510_326949
844217	contig_8373_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_176381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGAGCTAGTAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59682	57866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_57900_59700
844218	contig_2450_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_160308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	260	475	734334	734119	NA	50	CTTTAAAAATATGAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQDAATSLLGDPGQVAYPFCASVSTSLKWGYKLDQLQDCCEDERGVHRHHFAQCLAQRRSSGSVGRSFFSEYLWRACRVIDVAETVMTQTDEISALRMLTFWCNNIITVDIGSHTRAQPSQLAEDGARENPTSRSLPPPLEHQGLQQGLPAFCSHMP	734593	733908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_733900_734600
844219	contig_4783_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_108353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGCAAATTTCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108262	106319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_106300_108300
844220	contig_5623_pilon	-	1422	7	Intergenic	novelGene_154881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	48.5778298769671	180	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	202	1167	372557	339867	FALSE	25	AGTATAAATTTGGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGAQQKENTLLHLFAGGCGGTVGAIFTCPLEVIKTRLQSSRLALRTVYYPQVHLGTINGAGMVRPTSVTPGLLQVLKSILEKEGPKSLFRGLGPNLVGVAPSRAVYFACYSKAKEQFNGIFVPDSNIVHVFSAGSAAFVTNSLMNPIWMVKTRMQLERRVRGSKQMNTLQCARYVYQTEGIRGFYRGLTASYAGISETIICFAIYENLKKYLKEAPLASSTNGTEKNSTNFFGLMAAAAISKGCASCIAYPHEVIRTRLREEGTKYKSFIQTARLVFREEGYLAFYRGLFAQLIRQIPNTAIVLSTYELIVYLLEDHAQ	372758	339611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_340070_341498_341780_344636_344704_346714_346816_349055_349134_363791_363972_372501
844221	contig_2113_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_161152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCGGTAGGTATACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367252	367773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_367300_367800
844222	contig_15410_pilon	+	982	4	Intergenic	novelGene_130618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	873.24337959128	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	134	556	145617	148107	FALSE	25	TTAATCCTTTGATCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIILCLVIMICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGPMLSLFSSPCRPCRWPGVGELS	145483	148533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146817_146980_147081_147178_148038
844224	contig_3382_pilon	-	636	4	Intergenic	novelGene_124066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	465.159709729417	216	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACACAATATTTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344851	281936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_282220_306326_306380_309848_309943_344645
844225	contig_7457_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_31492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAGTTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618509	619775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_618500_619800
844226	contig_5247_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_81835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	282	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	84	470	416518	376173	FALSE	65	AAAAAAAAATGAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIGKYSIN	416601	376133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_376490_416448
844228	contig_8712_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_58844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGAAAAAGTTACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633989	633323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_633300_634000
844229	contig_7775_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_37505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTTGGAGCAGGGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306541	307169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_306500_307200
844232	contig_1008_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_121616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACACACACCTCTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100317	1099130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1099100_1100300
844235	contig_13823_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_145233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACAAAAAGAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38917	39826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_38900_39800
844236	contig_6608_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_162546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAACCCATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362299	364035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_362300_364000
844237	contig_2209_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_141007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATTAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123763	125134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_123800_125100
844238	contig_10948_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_124955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCTCTAATTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15493	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_13800_15500
844240	contig_6808_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_173531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190441	189175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_-_189200_190400
844242	contig_14640_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_168043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAACTTTGTTCTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283212	283833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_283200_283800
844243	contig_13460_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_162167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	7179	6796	NA	35	ATAGAATTCCATTGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSCGCRGAAARVRGSRTAGPGKCTPGARQVILSRCSGDSWGEGALSSTAPAWVWARCPVFLAVVTAVCLRGPGSPHGVCLLCLVTPFCKQVPFWVSARGWECSFCVHIPLLSARASSPFVGDTTVA	7181	5337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_5300_7200
844244	contig_6595_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_122543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGGTTTGATGTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601737	600769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_600800_601700
844245	contig_20241_pilon	+	1459	8	Intergenic	novelGene_159724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	5.22943006220661	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	203	1237	99491	138737	FALSE	30	ATCTAGAATTCTGTTACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPYVPLPMPVGNPVSSFTTNRNQRSPSFGSISTSSNSSKGQLEDTNMGNYKRPSVPDQMDSTSSVCNSPLIRTKFTGTDSSIEYSARPRESEEQNPETVSWEDRPSTPTILGYEVMEERAKFTVYKVLVKKTPEESWVVFRRYTDFSRLNDKLKEMFPGFRLALPPKRWFKDNYNADFLEERRLGLQAFLQNLVAHKDIANCLAVREFLCLDDPPGPFDSLEESRAFCETLEETNYRLQKELLEKQKEVESLKKLLSEKQLRINTLEDRIRMLSLEPEDSLCMSGTEGGQILKVESSVLESDQGVLDEPSRADSKPCLSCSELENSVSEIEVAEVAYNADED	97670	138959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_97772_99389_99866_107573_107661_113677_113827_127889_127960_137181_137319_137850_137971_138640
844246	contig_18081_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_23820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATACACAATTTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184528	185037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_184500_185000
844247	contig_10367_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_169462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	128	652	134026	133502	NA	55	AAAAAAAAAACCCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQVSRCTGLAQTPTWNLDFHPEGFFISHDSKGTAWETFRISILVQ	134153	132775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_132800_134200
844249	contig_4114_pilon	+	1203	5	Intergenic	novelGene_15571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	45.6364711606846	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	447	1106	42229	44248	FALSE	15	AAGCTGTTCCTGTCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVVAPTAGPPGQPLGSVAGPELVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKAALSALPPLHVAKVSLPSREGPGSDVAAGALYHKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLLEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVFRETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQEDTVYVGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLCQLHSRLIS	41782	44345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_42388_42499_42693_42957_43038_43574_43665_44110
844250	contig_5018_pilon	-	732	3	Intergenic	novelGene_47192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGTGGAAGTGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1593190	1591725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1592048_1592605_1592718_1592892
844254	contig_9290_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_77523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAGACCATATTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193554	194942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_193600_194900
844255	contig_14868_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_150436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGCCCCAGAGTCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106634	106329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_106300_106600
844256	contig_14868_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_150435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGATAGACAAAAGAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106180	105607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_105600_106200
844257	contig_8322_pilon	-	836	6	Intergenic	novelGene_143270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1.01980390271856	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	14	625	503788	485559	FALSE	10	TGGACTGCCCTCTTGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTGWLESLRAAEKTALLQDGRRKVHYLFPDGKEMAEEYDEKTSELLVRKWRVKSTLGALGQWQIEVGHPVPPGAGSLGPELIKESNANPIFIRKDTKMSFQWRIRNLPYPKDVYSVCVDQKERCLVIRTTNKKYYKKFSIPDLDRYQLPLDDSSLSFAHANCTLIISYQKPKEVLVAESELQKELKKVKTAHSSDGDCKTQ	503801	485347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_485664_486096_486200_492784_492919_493303_493429_499224_499306_503724
844259	contig_6589_pilon	+	379	4	Intergenic	novelGene_25791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_1	1681.8327965513	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	57	377	669670	671186	FALSE	35	TAAGCACTAACCCCGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLLVVSALHILILILLFVATLDKSWWTLPRKESLNLWYDCTWNSSTEAWTCSNVSENGWLKPVQVLMVLSLILCCLSFILFMFQLYTMRRGGLFYATGFCQLCT	668518	671188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_668556_669650_669748_670000_670104_671046
844260	contig_6854_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_169496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTATTTTTTGCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487797	487486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_-_487500_487800
844261	contig_5502_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_154997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429234	430440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_429200_430400
844262	contig_12520_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_161063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAATGAGAAGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382794	382474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_382500_382800
844264	contig_17005_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_129902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGACTCAGCAACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24676	24004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_-_24000_24700
844265	contig_10962_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_103877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCACACTATTAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160113	159357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_159400_160100
844266	contig_10235_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_46317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	228.5	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTCTCCCCACCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89928	91862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90005_90395_90492_91675
844267	contig_5286_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_157367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCAATGTAGTAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559729	561408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_559700_561400
844268	contig_16103_pilon	-	561	6	Intergenic	novelGene_118799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	183	junction_5	140.60213369647	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	200	559	590829	589344	FALSE	5	TTGCCTTGTCATCGTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGAGRHGLPQGRRLCWLLCAVALKFCHAEAPVREDKQSVSTSNLQCWLVEEFVVAEECAPCSYFQAKTIPECSSTGYVEKITCSSSKRSELKSCRSAVMEQQLFWKFEGAVVVVAMVF	591297	589341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_589420_589795_589876_590287_590371_590564_590603_590746_590849_591117
844269	contig_11551_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_168471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGTTTATCAAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443830	444973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_443800_445000
844271	contig_13547_pilon	-	979	9	Intergenic	novelGene_104883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	462.363763718568	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	36	830	223705	98998	TRUE	50	ATACTCATAAAGTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEEVCYFKRHCRNQSSRWKN	223740	98245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_98301_98903_99052_101109_101247_103067_103246_114702_114814_163206_163343_196798_196883_221449_221507_223667
844272	contig_9833_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_68573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCAAAAAAAATCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347770	348696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_347800_348700
844274	contig_12977_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_122800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	52	363	45017	45328	NA	40	AAAAAAAGTGCTTCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEGGAGPEPQSGGSSRMWRGARRPGAALCGPGKRGHPLASVPLSSLIDCGTSGVLVVREPLSLLPPSLRGYKRRRRILPHSWTQSASATRPFLCAFGDWVPMGPHWGSHRHGHPSHVCS	44965	46126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_45000_46100
844277	contig_10948_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_124984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATCAACATAGACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283853	282337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_282300_283900
844279	contig_6684_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_168587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGGTATTGCTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40640	39913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_39900_40600
844280	contig_10135_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_106591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGTCCAGATGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34700	35255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_34700_35300
844282	contig_9656_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_121907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220111	219685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_219700_220100
844285	contig_14768_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_115087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCCCCTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245484	246281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_245500_246300
844286	contig_20055_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_175060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTATCTGTCAGAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44037	43064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_43100_44000
844287	contig_14694_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_152485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258039	256836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_256800_258000
844288	contig_15326_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_157691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6840	5994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_6000_6800
844290	contig_15629_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_122475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAGAAATAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179508	179081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_179100_179500
844291	contig_6735_pilon	-	597	7	Intergenic	novelGene_15799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	802.514520463995	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	80	568	564868	542104	FALSE	10	GCCCACTTTCCTTTCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHAVLSGIPGLLTWEGT	568277	542074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542150_551190_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
844292	contig_1982_pilon	+	1170	2	Intergenic	novelGene_151330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATTCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334803	359949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_335016_358991
844293	contig_17074_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_145172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAACCAGTAAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577798	577372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_577400_577800
844294	contig_17074_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_145171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGCCTTCCAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576600	575588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_575600_576600
844295	contig_3472_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_166928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAGATCAATAGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212725	213968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_212700_214000
844296	contig_5023_pilon	+	1804	4	Intergenic	novelGene_7128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	320.146841308797	2	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGGGTTTGTCATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320205	360340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_320270_353197_353850_358605_358684_359330
844301	contig_11081_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_167081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAAAATATTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39059	39947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_39100_39900
844302	contig_11986_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_69149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	346	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGAAGAACTTAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304024	301819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_302190_303877
844303	contig_5620_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_161367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGAAATTCCTTTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448801	448160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_448200_448800
844304	contig_16322_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_87520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTATTAGTTATAAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49607	48546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_48500_49600
844305	contig_16185_pilon	-	1167	5	Intergenic	novelGene_144747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	49.4033146661234	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	15	515	104066	82379	FALSE	30	TCATAAGTGAACGTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPLEKKSSQSGDDT	104080	81726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048
844306	SIRV2	+	288	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	309	-74	-309	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAAGATACGCAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
844307	contig_18055_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_117837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTCATTAGAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104393	106602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_104400_106600
844310	contig_9127_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_103029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAAAATTTTTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262864	262355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_262400_262900
844313	contig_6048_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_73333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2790645	2789253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2789300_2790600
844315	contig_6434_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_61877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTGGCAAGATAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869970	868575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_868600_870000
844316	contig_10377_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_115342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATCTAGATCCAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91223	90565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_90600_91200
844317	contig_13481_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_119468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAATAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260727	1259006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1259000_1260700
844319	contig_6710_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_89113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653639	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653600
844320	contig_13945_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_173463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCTGGTATAGGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138938	137439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_137400_138900
844322	contig_1107_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_126542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGAAGTAGGTGGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157593	155812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_155800_157600
844323	contig_8801_pilon	+	1826	10	Intergenic	novelGene_66323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.1653431646335	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	140	1147	848245	899114	FALSE	50	TATATTATGAAAAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSEQQKEFQATARKFAREEIIPVAPEYDKTGEYPLPVIKRAWELGLMNSHIPESCGGLGLEILDSCLISEELAYGCTGIQTALEGNTLGQMPLIIAGNDDQQKKYLGRMIEEPLLCAYCVSEPGAGSDVAGLKTKAEKKGNEYVINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPNPKTPASKAFTGFIVEADTPGIHIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGEGAGFKIVMETFDKTRPQIAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKPLTEHQAISFLLAEMAMKVEVARLSYQRAAWEVDRGRRNTYYASIAKAFAADTANQLATDAVQIFGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIIAREHIGKYNN	847988	899793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_848086_848202_848273_848889_848991_850039_850121_854701_854833_855463_855573_880869_881011_881787_881884_897509_897759_899042
844324	contig_15867_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_170905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	732	1109	275980	275603	NA	80	ACAAAAAAAAAAAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGWRVRGLAWVFLQSDLTRHTLSFLPWKVSTLHSRFVQDSTSEYLQCDPPRFHKGPGILQFLRMRCSDRLRVELHFRDFSTSTCGVVLEGPATYSPRRRVFISCKVGCRHADGCTFCEGQPGM	276711	275303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_275300_276700
844325	contig_11370_pilon	-	922	6	Intergenic	novelGene_98783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_2	188.869902313736	5135	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	127	846	302903	300981	FALSE	10	TCTGTGTGACTTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATIVAARRAGPVPAWGLEALTPNWENQEVSTGTTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAASLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLHFTANALALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFTIATLPPP	303029	300904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_301124_301252_301398_301595_301726_301843_301976_302310_302379_302801
844326	contig_4271_pilon	+	1713	11	Intergenic	novelGene_171861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	37.2780096035183	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	305	1624	335405	427009	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDSDRPVSFGSTSSSASSRDSHGSFGSRMTLVSNSHLGLFNHDKEAGAIRLELVPARPFSSSELQRADSAEQQGTEGSGERQLWAQRRVEANGATKASAESTSSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLPLGTEERSALFGNIQDIYHFNSELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAVLTECMRNKMLAKFFRERQETLKHSLPLGSFLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTFRIQRAKNERTLFLFDKLLLITKKRDDTFTYKAHILCSNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHVAKIPAKAKQALLEMDAVRKF	309830	427098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_310019_335288_335813_373933_374035_390068_390139_404813_404861_410685_410837_418816_418949_419518_419702_419781_419878_420031_420119_426964
844327	contig_13592_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_33745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATACAATAAAGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317908	316900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_316900_317900
844328	contig_2933_pilon	-	1226	3	Intergenic	novelGene_111345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	360	junction_1	124.5	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	183	317	741824	741531	FALSE	10	CTCCCACGGCTCACCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHFLSTAERIRLPDDCTIGYIVEALLGVPLTRSGLFHSHLENLQQVPASELHEQVTLSYGMFENKRNAIHMKGAFSVETDPSRFRSIHCHLYPDTPWCPRTAVF	742522	740621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_741598_741756_741843_742358
844330	contig_7391_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_112151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGTTGTAATCCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385404	385869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_385400_385900
844331	contig_6397_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_146228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTCGGCTCTTCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260760	260137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_260100_260800
844332	contig_6397_pilon	-	690	4	Intergenic	novelGene_146227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	134	475	259084	256298	TRUE	45	CAAAAGCTGCATAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELKKPPFLSLVKHVSLASSKRLLGDLSLCFRGSAGDPLGACALLMNPGAELEAEFSMASCAPSMFSLFSTCFFSVRVLEGSIGNRGRYGTTDEEEAALPSSSATSSEMLES	259217	255201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_255350_256230_256319_258214_258388_258936
844333	contig_1154_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_87071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCATTTGCTCCACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202348	203479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_202300_203500
844334	contig_848_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_83346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTACTTTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567892	566731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_566700_567900
844335	contig_14970_pilon	-	639	3	Intergenic	novelGene_45152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	7	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCTGAAAAAAAATCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315750	311675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_312047_315339_315469_315611
844337	contig_9594_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_73919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTTGCTTATACCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148030	148965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_148000_149000
844340	contig_2550_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_135645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAGAGGAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542659	540524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_540500_542700
844341	contig_16870_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_155485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	667	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGAGGTATAGGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95568	96604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_95823_96093
844343	contig_1813_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_105493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125699	127132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_125700_127100
844345	contig_9363_pilon	-	771	3	Intergenic	novelGene_6627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCAAGCTGCCTGCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873774	872390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_872724_873002_873087_873420
844346	scaffold_13505_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_111666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTCTTCCTCCCAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869046	868060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_868100_869000
844347	contig_5965_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_154656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	384	1152	1	1152	120740	119589	NA	30	AAAGCCTTTAGCCATCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWFYLDNSEEKVHNRDLVKKGFPKNSVVVKHTGIYVGKKLFICNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGNKPYECVECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCTDCGKAFSDHIGLSQHRRIHTGEKPYKCDVCDKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECGECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCIECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHCRSHTGEKPYECSACG	120740	119588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_119600_120700
844349	contig_10432_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_171306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	267	804	72	875	91362	90559	NA	35	AAACTCTAAGCATCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLMVGGHMEHREDTWQEARGQAHMLRAHDTPHACCIGPLSALLRAKQQFYTMDPSKSICSRARPSQGVLICAKPSSQNRPATALLPGSQQTGTQQQLTTWQVLGTRAGRHVLRRQVPQSREDAGCASHTSPATLTFSIPASQRGPSCSHPVHPPHLFSRCHLPNRRVVDYTACCSCQWRLSETSSLSICKRGGSPCAPPRQHCAVMLCCPSARAPGEWQGRKGPPGELEVEGVHAGWPVEVAPGLLDQAGFRLHLKRPPDPQDTLP	91433	90507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_90500_91400
844350	contig_253_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_129624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGAAGTTTTTCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137314	138452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_137300_138500
844351	contig_5586_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_143524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGGTCTTAGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277046	275827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_275800_277000
844353	contig_6589_pilon	-	449	4	Intergenic	novelGene_25901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.454567068688	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178516	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158632_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
844355	contig_7379_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_150018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497873	496922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_496900_497900
844356	contig_11602_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_166586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCATCGTTTTCTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113649	114197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_113600_114200
844358	contig_15966_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_176504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTTTAGTTCCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45897	46783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15966_pilon_+_45900_46800
844359	contig_15966_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_176505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCAAAAAAAATGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46783	47163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15966_pilon_+_46800_47200
844361	contig_3015_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_163310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGATGGAGTTGGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143395	144045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_143400_144000
844363	contig_9937_pilon	+	1561	3	Intergenic	novelGene_129197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43178	58213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_44212_45065_45224_57843
844364	contig_935_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_45526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGATAACATCCAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52957	52035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_52000_53000
844365	contig_14041_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_144038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAAGCCTGGGAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107710	106295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_106300_107700
844366	contig_10017_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_157003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAATTAGTCTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388475	388165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_388200_388500
844367	contig_10482_pilon	+	1768	5	Intergenic	novelGene_152854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	120	junction_2	19.2532464794902	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	200	1141	218975	239470	FALSE	40	AAGGCTAATTTCCAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLVDRVRGNGRIVAGLLLNLLVSICIVFLNKWIYVHHGFPNMSLTLVHFVVTWLGLYICQKLNIFAPKSLPPSKLLLLALSFCGFVVFTNLSLQNNTIGTYQLAKAMTTPVIIAIQTLWYKKTFSTRIQLTLIPITSGVILNSYYDVKFNFLGMVFAALGVLVTSLYQVWVGAKQHELQVNSMQLLYYQAPMSSAMLLLAVPFFEPVFGEGGIFGPWSISALVMVLLSGVIAFMVNLSIYWIIGNTSPVTYNMFGHFKFCITLFGGYVLFKDPLSVNQGLGILCTLFGILAYTHFKLSEQEGTKSKLVQRP	218775	240097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_219377_220412_220524_225795_225955_234570_234654_239283
844368	contig_14341_pilon	-	1657	2	Intergenic	novelGene_111747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGTAAATAAACAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92562	85576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_86355_91683
844369	contig_4659_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_118163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGGAATTGACAGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75678	74987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_75000_75700
844371	scaffold_880_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_121401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTAAGTTGGCATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278937	277469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_277500_278900
844372	contig_13460_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_162188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271029	272059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_271000_272100
844373	contig_16882_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_148212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACCTACTGGACTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190174	190976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_190200_191000
844377	contig_15974_pilon	-	573	4	Intergenic	novelGene_164818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_3	148.602377728846	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	157	573	178338	175147	FALSE	20	GTAAGTTTTTTTTTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGAGWRQRPSSKGHLGFRGSASSTPQCRARRRICEAAAVALGGGGAGPVLLMVPPRRHRGVGRPGVLSSSPPFRLTSAKFSGITFEDLRKALKIRLQMVCVFIMNRMNSQSSGFTQRRRMALGIVILLLVDVIWVASSELTSYVFTQYNKPFFSTFAKTSMFVLYLLGFIIWKPWRQQCTRRFQGKHAAF	178494	175146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_175291_177106_177249_177384_177476_178298
844379	contig_8284_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_125684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATATCGTTTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361090	362561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_361100_362600
844380	contig_10241_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_142843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAGAAATTCTAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131520	131857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_131500_131900
844381	contig_3878_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_174799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1212	1565	579296	579649	NA	65	AAAGAGAAAAAGTCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWPGPSVLPLQGRKRSAGDAGNGSISKGALKSNRFHLPSLTIFALAQVGQLQGCIWTNQNKKNLLFLINPLGHHTGQTEDFQSIRQEKWADKDDSLRRTEYDVYSARPLPQWQRM	578084	580258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_578100_580300
844385	contig_12620_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_98808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGATAATTACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302602	301021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_301000_302600
844386	contig_18208_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_176171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACCAAAAATCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50632	51095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_50600_51100
844391	contig_7707_pilon	+	1161	11	Intergenic	novelGene_72112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	185.217196825781	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	38	1057	7375	60963	FALSE	30	AGTGGGAATTTGTATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESQPVTVPEGETASCSSWAAGSTNTNLPIVSTESVEIDDALYSRQRYVLGDTAMQKMAKSHVFLSGMGGLGLEIAKNIVLAGIKALTIHDTENCQPWDLGTNFFICEDDVANMRNRAEAVLQHIAELNPYVHVTSSSLPLNETTDLSFLDEYQCVVLTEIRLPLQKKINDFCRSQCPPIKFISADVHGIWSRLFCDFGDEFEVLDTTGEEPKEIFISSITQANPGIVTCLENHPHKLETGQFVTFREINGMTGLNGSTQQITVVSPFSFSIRDTTELEPYLHGGIAVQVKTPKIFYFESLEKQIKHAKCLIADFSKPEVNKHFAGLREAAEWGSGDW	7337	61067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_7446_14660_14724_35290_35386_35922_35952_38977_39073_39609_39722_42243_42325_53086_53210_54824_54949_59055_59160_60840
844393	contig_9321_pilon	-	666	2	Intergenic	novelGene_174721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTAGACTGTTACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38790	37635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_-_37671_38159
844394	contig_7521_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_160566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTTGCCTGGAGACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377461	376637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_376600_377500
844395	contig_6589_pilon	-	728	2	Intergenic	novelGene_25839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATCACGGGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918815	912550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_913192_918728
844396	contig_5964_pilon	+	1098	2	Intergenic	novelGene_80352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACAATTTCTACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22692	24912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_23448_24569
844397	contig_3948_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_53344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGACCAGCAACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499057	1500761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1499100_1500800
844399	contig_5551_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_134261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGGCAATTTAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604409	606195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_604400_606200
844401	contig_266_pilon	+	1681	2	Intergenic	novelGene_166291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGCCATCAAAGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130392	136382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_131137_135445
844402	contig_7657_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_30025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTAGTAGTTGCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178338	176967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_177000_178300
844403	contig_12948_pilon	+	1269	6	Intergenic	novelGene_126189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGGCGCCGTGACGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203077	209686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_203590_204892_204999_205869_205986_206247_206308_207563_207934_209581
844404	contig_6165_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_167426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548519	547970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_548000_548500
844405	contig_953_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_130008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGATGCATGTCATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322983	322397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_322400_323000
844406	contig_10058_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_67682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGACATTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48144	47335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_47300_48100
844408	contig_5084_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_64691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGACGCGGCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1839418	1838718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1838700_1839400
844409	contig_7513_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_88983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAACGCTGACAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308535	310139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_308500_310100
844410	contig_6129_pilon	+	1089	8	Intergenic	novelGene_159960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAGGAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989	40145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_+_2044_2688_2775_5034_5177_11727_11889_11978_12075_17218_17413_30499_30721_40010
844411	contig_3197_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_177487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAGCTTTGGATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2449	2689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3197_pilon_+_2400_2700
844412	contig_3197_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_177488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAATAAACAAATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2689	3190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3197_pilon_+_2700_3200
844413	contig_3825_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_77994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAAGTGTTGTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755642	756619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_755600_756600
844415	contig_3123_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_162976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154951	155235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_155000_155200
844418	contig_13937_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_167356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGCTAGGTAACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61791	61440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_61400_61800
844421	contig_9727_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_86355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541197	541582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_541200_541600
844423	contig_19352_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_122410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCACCCAGCAGTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314946	314297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_314300_314900
844424	contig_3068_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_137648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314789	315155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_314800_315200
844425	contig_2710_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_161800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	250	414	1108652	1108488	NA	40	CCTTCATTTAGAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPSPDSHSSKPQIIFGFYIRSFKVTSSVLHRGSPASFPPPQPPVEAEGHRPLEGLTRACEGCGGVECGRGSACATCLIYLEMLLMPPISLRPHPPPLFLHLPGLEAFSCLPLSAVGGGGESGACSEEDSVAASFL	1108901	1107716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1107700_1108900
844426	contig_6451_pilon	+	481	4	Intergenic	novelGene_173691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_2	73.5859286065542	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	13	390	12389	277868	FALSE	15	CCTCCATGCTCTGAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCGLIMVILLLLVAIVVVAVWPTS	12376	277959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231_153334_277800
844427	contig_2924_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_140274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239184	239596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_239200_239600
844429	contig_710_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_162939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	103	414	25651	25340	NA	80	TAAAAAAAGTAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRAGVGVGREGTGVVRVFLSEDTEGLPATHWCTGGQTRGQAHLGLIFSSAVCWWVTQDSDTSMSFSFPVTGRVAVFPGCLSSLLGGLESGEMTFAKVFGKL	25753	24505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_24500_25800
844431	contig_2377_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_67940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888712	887667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_887700_888700
844432	contig_12644_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_44528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTGACTCAGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375918	1374879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1374900_1375900
844433	contig_6496_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_103498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTTTTCCCCTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547051	547433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_547100_547400
844434	contig_10575_pilon	+	597	4	Intergenic	novelGene_141809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_1	30.6412938514171	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCAGATCCTATGCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293717	378892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_293810_300842_301046_301772_301899_378716
844435	contig_4769_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_117951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	24	404	314728	315108	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWEEGGPMTPAWEVGYPVSCQALPGFHLKPKAKGPFICLSWPFVGDLPQPRVFLPSLLFIHPTELRLLLLLPPGQAGGRVSTDVERALFLLSSEGPTIGPFREATAFLMACPGYRQVPGLFSFYPIMYPLALA	314704	315203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_314700_315200
844436	contig_6654_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_85745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487706	487074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_487100_487700
844437	contig_6418_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_81189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTATGATTTACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160008	1158813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1158800_1160000
844438	contig_9363_pilon	+	763	5	Intergenic	novelGene_6805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	230.285013624422	68	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	273	344	1622478	1622549	TRUE	10	GCCACGCGAGTCTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTSSGGDGATVGLEIKVLKELKLILGVIGKGIQEVGTFPIFLGLASFSISASFTARPLVCHGTQLPAPTRGSGERQQVLRQPTGPWTKSMWVLPPSPTSSTASLSRRGLTSH	1622023	1625969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1622286_1622467_1622559_1622655_1622743_1622985_1623066_1625726
844439	contig_10581_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_41423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	387	186	572	645728	645342	NA	15	TGAGGTTCCCCACCCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRTQTILTIVRFIREVTGYNSGSGRTQDTVLGSKQPLLSCACRQAYLWPSAPRPGLSPAWAMLQSCLAPPVNTQRHRTPSGSLGLKLLSSLAPWVSKTCSTDKCSEAPHSASKSPARRHSALSLHELGNALQHLLPVSFLCCLSCPRFSAAASCHLQCYISLCLLSRRFSAQESRVQKMLFTPSSSFLVV	645913	645340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_645300_645900
844441	contig_6439_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_154233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTCAAAAACAAAACACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220129	220998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_220100_221000
844443	contig_12842_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_168340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATATGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129737	130432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_129700_130400
844444	contig_1996_pilon	+	926	8	Intergenic	novelGene_131922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	35.426843275824	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	392	526	413425	415742	TRUE	5	TGCCTGGGTGCTGACCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGRIHTSDSGLSDSEESVFSGLEDSGSDSSEDDSEDGAHSDGGHGGTRKTTEKQPQAGTPSPRTEAVVSTPAEDEYAEDSSDEEDIRNTVGNVPLEWYADFPHVGYDLDGRRIYKPLRTRDELDQFLDKMDDPDYWRTVQDRGTGRDVRLTGAHQETHAQLQVGVQPRRAPGR	397417	416328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_397590_402565_402650_413289_413445_413534_413582_415594_415659_415738_415824_415917_416026_416117
844445	contig_13097_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_107739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGAATTATACATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270890	270029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_270000_270900
844446	SIRV5	-	221	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATAAACTGCTCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10980	8482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8590_10866
844447	contig_8330_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_71721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTCAATGAGAGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148884	149267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_148900_149300
844449	SIRV6	+	337	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	31	2892	31	-2865	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATGTGCCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2547	7923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
844450	contig_7744_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_62583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACCCTACTGGTTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907396	908193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_907400_908200
844451	contig_401_pilon	-	227	2	Intergenic	novelGene_42766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTTACGCATATTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043669	1035409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1035491_1043523
844453	contig_1618_pilon	-	1184	6	Intergenic	novelGene_141791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	344.904624497846	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	259	576	341041	317189	FALSE	30	TGAAAACTGCCTCCTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRE	353532	316580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_317196_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
844454	contig_6674_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_147995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGATCTCTGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109702	111017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_109700_111000
844455	contig_3942_pilon	+	492	4	Intergenic	novelGene_128656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1360.94485152371	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	71	490	178379	180116	FALSE	20	TGATGGGGGCCCAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREYKVVGRCLPNPKCKTPPLYRMRIFAPNHVVAKSRFWYFVSQLKKMKKSSGEIVYCGQVWQNFGIWLRYDSRSGTHNMYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASNCLTGSSVASTSHASPPSGPTPSSSCSPSPTLVCSINSLGT	178308	180118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178498_179075_179177_179714_179794_179995
844456	contig_13744_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_77185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCACCATTAACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718901	720313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_718900_720300
844458	contig_2646_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_69526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCTTCTTCTAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556943	555230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_555200_556900
844462	contig_8538_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_4600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGTGCATGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688292	687050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_687489_687582_687720_688173
844463	contig_13425_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_170838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGTTTACTAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58942	57675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_-_57700_58900
844464	contig_3163_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_168075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	583	903	1000570	1000250	NA	70	ACTCAAACAACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGCAHHCIIFLILVISFAASKAATVLSVNKCAYVAAYPNTVGRTGERWGIKSEKEVQEKRQAFLLHFKYVLVFVIPNENHQYRLPSSRFQLMVTPSVSEYNCAL	1001152	1000130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_1000100_1001200
844469	contig_3700_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_138057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	1124	1435	55626	55315	NA	25	GAACACCCGCTCCAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPKHKSESLMCSKPSLLTQSKSKSSIKACKVLHDLSPHIPTLSVQPPSFSHSGLLAVLQTCPERYVFLVSFALSLCLEDSSLCLEYLPQIPQSSLSLLHPIPD	56749	55312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_55300_56700
844470	contig_6233_pilon	-	812	5	Intergenic	novelGene_74818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1739	junction_1	414.452877297287	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	104	778	419607	369922	FALSE	10	CTGGTGGCCTGCAGCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGLQRPGAAGPGADAGAEPSRSGRRRPARRGTTMSVFGKLFGAGGGKAGKGGPTPQEAIQRLRDTEEMLSKKQEFLEKKIEQELTAAKKHGTKNKRAALQALKRKKRYEKQLAQIDGTLSTIEFQREALENANTNTEVLKNMGYAAKAMKAAHDNMDIDKVDELMQDIADQQELAEEISTAISKPVGFGEEFDEDELMAELEELEQEELDKNLLEISGPETVPLPNVPSIALPSKPTKKKEEEDDDMKELENWAGSM	419710	369887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_369987_371362_371490_372717_372833_374470_374649_419417
844471	contig_5988_pilon	+	1020	2	Intergenic	novelGene_16010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGGATCACTAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746802	748681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_747111_747969
844472	contig_9440_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_59030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAATTTTGTTGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271612	272187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_271600_272200
844475	contig_709_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_57620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	927	1250	2479781	2480104	NA	60	TAAAAAGGGGAAAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLGLGPGPAAGNGGPEGWRRFHRGTEEAKWSRGGGWNAALQTCRLQDSLSTSVLPSVGEMRPVGPRACAPPGPSVPVLCPMPRAPSRALWTLVLLRGQAELSRPC	2478854	2481087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2478900_2481100
844477	contig_6635_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_127017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAAAAAGAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397880	399076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_397900_399100
844478	contig_10003_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_88270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAGTTGAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791404	791004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_791000_791400
844479	contig_4492_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_166112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTTACTTTCTCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157594	156817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_-_156800_157600
844480	contig_5791_pilon	-	1863	12	Intergenic	novelGene_35807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_8	9.29764921857861	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1695	169	1863	308635	291734	FALSE	30	CCTCATGATGGGTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGTGDVRKLFIFTTTQNYFGLMSEPRDQPLLYNCPEINNFLDDGNQMLLRVQRSDAGISFANTIDFGDTKDKVLVFFKLRPEVITDQNLHNNILVSSMLESPINSLYQAVRQVFAPVLLKDQEWNRNFDPKLQNLLSELEAGLGIVLRRSDTNLSKMKFKEDDTRGILTPSDEFQFWIEQAHRGSKQISKERASYFKELFETIAREFYNLDSLSLLEVVDLVETTRDVVDDVWRQTDHDHYPESRMLHLLDIIGGSFGRFVQKKLGTLNLWGDPYYLVKENLKAGISICEQWVIACSHLTGQVWQRYVPHPWKNEKYFPETLDKLGKRLEEVLAVRTIHEKLLYFLPASEEKIICLTRVFEPFTGLNPVQYNPYTEPLWKAAVSQYEKIIAPAEQKIAGKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKELMLERETLLARLVDSVKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNNIVWVRQLELKVDDTIKIAEALLSDLSGFRSFHRSAEDVLDQFKLFEQEQFDDWSRDIQSGLSDSRSGLCIEANSRIMELD	308803	291733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_291768_293683_293860_295016_295142_295470_295583_295698_295813_295926_296062_298075_298309_299586_299732_300680_300800_303784_303921_304417_304589_308440
844481	contig_7179_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_78200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATCAGTCAGTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380990	1381656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1381000_1381700
844482	contig_13607_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_170188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241810	241333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_241300_241800
844483	contig_11476_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_170510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTATCTGGCCCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256043	254530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_254500_256000
844485	contig_12765_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_106556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTCTTACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87989	88391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_88000_88400
844486	contig_6691_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_60183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	139	468	448041	448370	NA	35	TTTAAATCTGAGTCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITHINKRTLVSSVLKSIKESKGALVAHCLQLSTANQKVSGWNPPASLWEKDVAVCLCKDYSLGNPMGPFYLVLYSLHKSELTRWHTTAKESKTFENYCYGVVTGCVS	447902	449208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_447900_449200
844488	contig_7275_pilon	-	903	7	Intergenic	novelGene_111253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	2.96741563579414	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	163	840	415159	413354	FALSE	15	GCAGTGACTGCGTATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLAPGPGRCPCRTAPAPTSAGGSLINENWVVTAAHCGVSTSHLVVAGEYDQGSDAENIQVLNIAKVFKNPKFSMLTIRNDITLLKLARPARFSLTVSEVCLPNAEDDFPAGSLCVTTGWGKTKYSAIKIPEKLQQATLPLLSNTDCKKYWGSKITDVMVCAGASGVSSCMGDSGGPLVCQKNGAWTLVGIVSWGSSTCSTSTPAVYARVTELVAWVQKTLDAN	416995	413290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_413516_413984_414119_414348_414530_414755_414835_414930_415012_415118_415223_416896
844489	contig_5302_pilon	-	345	3	Intergenic	novelGene_81555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.5	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTGGTGTTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667358	1666046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1666237_1666953_1667089_1667338
844490	contig_3960_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_138025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATTTGTGAATTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514021	515268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_514000_515300
844493	contig_20596_pilon	-	694	4	Intergenic	novelGene_157225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	49.0736408087093	372	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATTTTCTCCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41383	20486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_20856_24168_24241_33609_33726_41246
844494	SIRV6	+	326	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	44	337	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGCGGTCGTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
844495	contig_5419_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_15565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCGACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593818	595090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_593800_595100
844497	contig_13992_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_147641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGATATTCCTTGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503219	502075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_502100_503200
844499	contig_5084_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_64560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGTACTATCTTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533627	535582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_533600_535600
844500	contig_12150_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_6973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAGGCCACCTAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186745	187771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_186700_187800
844501	contig_8075_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_42516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842958	842502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_842500_843000
844505	contig_12566_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_86023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	543	899	205489	205845	NA	15	TTGGAGTCAGGTTTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAELCPGPGHVRLHGQIKNLGFVVSELRVTGMLRASGVCLQRWVETGWQCGDEEVQPGRGGRSTSGRLPQEEDEGSRAIWRHGGLLTTLAFRLPQWSLSVMLMFEFFCTVVEHEDEL	204946	206039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_204900_206000
844506	contig_5586_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_143615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGTAGCTACAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822313	821386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_821400_822300
844507	contig_3132_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_127438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	875	1186	278425	278736	NA	35	ACGGAGACAGCCAATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTWQVLDKCSVLKYSRLLAPRLEAHIQTPPKTHSPSQQVQQEAKQHSAKPTSRSSSSSWVRPGFPPHPTPLAENRKNWKTEFLENLCFRTLVLFQSECGHLG	277550	278738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_277600_278700
844508	contig_5799_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_50340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTAAGCCACATCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713757	713237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_713200_713800
844510	contig_20753_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_168259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTATCATCCCACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74974	74480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_74500_75000
844511	contig_6975_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_74302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506142	507080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_506100_507100
844512	contig_8354_pilon	+	798	8	Intergenic	novelGene_24082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	54	419	128376	141496	TRUE	35	CTACATCACTGCAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEWTELKGCCTELHSHMAVSRGFHGQGDLKELSARGPPPWRTCSSLCAPEAEVHKQSHRVLQRVVRQAVGVLENVNQPEDEAIPNHRRLQRAPEAELLQGPKDILPGDDVLVFLLQPFLQHSQHLCVLGKVEATFCK	128322	151736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_128388_132893_132971_134289_134429_140150_140274_141481_141575_148518_148617_150592_150700_151640
844513	contig_11752_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_37676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGATGTCCAGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105600	105905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_105600_105900
844514	contig_14882_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_115007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTTTAGCCTACTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292517	292172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_292200_292500
844515	contig_12278_pilon	+	483	3	Intergenic	novelGene_152612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	3.5	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	34	483	266686	269218	FALSE	20	CTCAATGGCTCCTCAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQAQARALAPSMQVQLIRRTLLGLVLGLLLLSTVAMGSCSGKYQVLLGQLQQQAKIMQNTDMLLDPYIRIQGLDKLNHKEYCKERPGAFPGKDALRGLSRWGFLQTLNATLGLVLHRLAAFQQKVCNLTKDKDQDWKTLCQAELYIRGIRNNIFCLTRLLN	266652	269218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_266720_268251_268386_268936
844516	contig_14405_pilon	-	672	2	Intergenic	novelGene_85623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	0	181	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351543	350118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_350320_351072
844517	contig_6446_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_149254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCAAGGTCATGGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632134	633313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_632100_633300
844519	contig_15882_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_144817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTTATTTTGTTGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373041	374628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_373000_374600
844521	contig_2487_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_148453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAGCATTATTCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105624	106291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_105600_106300
844524	contig_15628_pilon	-	1659	4	Intergenic	novelGene_147683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	1277	1657	48301	26857	FALSE	5	CGGGACCGGGCCTCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHFLDIPLLLHALHLHLVYLWGTLNISTQILQSRSSCPASTVFLLYHPEPCLLEVEQEACICHSFLVASLLALGVPAGRATPPLPLTRAGLAPPLLRGGGPCAGPPSGTGPPFPSAPLPSPPLRPP	49577	26854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_27023_29112_29254_47263_47315_48278
844527	contig_6589_pilon	-	654	5	Intergenic	novelGene_25924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_4	140.261140377512	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	208	519	1178015	1176049	FALSE	15	GCCTGGGCTTCAATCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVESGSQVVICDKDECGGRALEQELPGTVFLRCDVTQEEDTEALISETICRFGRLDCVVNNAGYRELWGPRANLS	1178547	1175913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1176151_1176854_1176938_1177210_1177250_1177927_1178100_1178424
844528	contig_9024_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_177491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCCTCCATACAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13294	13576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9024_pilon_+_13300_13600
844529	contig_4469_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_21923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTATCTAGGACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519072	520287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_519100_520300
844532	contig_5954_pilon	-	805	6	Intergenic	novelGene_28585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2.0591260281974	34	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	480	710	936720	934725	FALSE	0	GCGCTCCTGTCTGGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRLCRLWPRSPPTRLLGAAAGQRSGPSNYYELLGVHPGASSEEIKRAFFTKSKELHPDRDPGNPALHSRFVELSEAYRVLSHEQSRRSYDHQLLWSSPLKSSGTAAHPRPVHQARSSSWAPPNAQYWAQFHGVRPQGPEVRQQQHRHNQRVLGYCLLLMLAGMGLHYVAFRKLEQMHRSFMDEKDRIITAIYNDTRTRARANRARLQKERLQRQQPPLSGPPQDPGIVPRGADP	938712	934629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_934831_934920_935008_936682_936848_936930_937116_937620_937715_938639
844533	contig_5346_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_161845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61987	59797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_59800_62000
844534	contig_3269_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_117018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGAGAATAGACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103164	104153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_103200_104200
844535	contig_9345_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_24554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	399	725	732101	731775	NA	55	AAAAAAAAAACCTGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGWLPDWAHTTLWFCSVHGLVTGCTGLAGHPLVPTIAIFYILCGAGGATFTSCDVEPQGRHLEEPGKGGAGHLRRPPPDLRDSLLVVMVLQQTVQWHHVQRKQWQW	732499	731229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_731200_732500
844537	contig_3382_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_124213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCGGTGACAGGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481585	1480406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1480400_1481600
844540	contig_4782_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_73647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATGCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438609	438935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_438600_438900
844541	contig_8273_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_113073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACATAGGATTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54052	55327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_54100_55300
844542	contig_16934_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_132536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAATAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238759	238991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_238800_239000
844545	contig_8138_pilon	+	885	4	Intergenic	novelGene_52469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	492.813239360398	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	105	461	280295	306577	TRUE	20	GATCAAATCTTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKSVHWRRRGRVPNCRPTIPPQTTASTPTPRAAPSLPSMEAQTPARSQSRKSPKAGRNSGWRPAKLSGAGQQ	280190	307511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306364_306848_307357
844546	contig_14954_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_165168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGATTCCGGTGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56230	55923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_55900_56200
844547	contig_3252_pilon	-	586	5	Intergenic	novelGene_61500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	180.333545132346	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	30	584	330888	319219	FALSE	20	GTAGGTATTGTGAATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMDASGPKHLNMKLSRAQFEGIVTDLIRKTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGDVTDVSLLNLLTGTPLFQPRRARYFLQLLMDRLKWRLKCARVRERWLEITNFLDSLL	330917	319216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_319322_320216_320273_320324_320445_321511_321722_330822
844548	contig_953_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_129997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGGAAGAGGTGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258718	260309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_258700_260300
844549	contig_5718_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_110408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTGGTGGCATAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370921	1372096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1370900_1372100
844550	contig_7411_pilon	+	1810	9	Intergenic	novelGene_137004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	39.9341254442864	231	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGACCATCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251314	264547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_251698_252455_252574_256377_256459_256934_257006_257905_257994_260152_260261_261659_261733_263207_263342_263793
844551	contig_10011_pilon	-	1593	7	Intergenic	novelGene_68024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	30.3337912053355	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	384	689	38455	35690	FALSE	50	ACCACAGATAAAGCGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIALVQEVRDSHLTAVGKLLDDLNQKAPDTFHFVVSEPLGRNSYKERYLFLYRPDQVSVLGSYYYEDGCEPCGNDTFAREPAIVSFSSPFAQVREFAVIPLHAAPLDAVAEIDALYDVYLDVRKKWGMEDIMLLGDFNAGCSYVSPSDWASIRLRMSPAFHWLIPDTADTTVKSTHCPYDRIVVAGTSLQDAIVPNSAMPFDFQAAYGLSNKMAEAISDHYPVEVALK	39370	34785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_35738_35937_36035_38218_38374_38449_38563_38731_38848_39121_39206_39294
844552	contig_3721_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_123838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	27	632	360064	360669	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGLCLAAAGRGSGPPPALLLFLLMLMAVPGAGAAQRSALYSPSDPLTLLQGDTVRGAVLGSRSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKALANDIKGEKPGRPLAPPGPTPSTCPTEGSSLGARCHLPITSGFTPASSLPIPLPPVSYPLNSILGSGPLSFSSWPASGASLPSPRPGPPDLLLCFPCSLCLLVTSTQLLPHP	360037	361331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_360000_361300
844554	contig_18487_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_172677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216315	217653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_216300_217700
844555	contig_7019_pilon	-	828	2	Intergenic	novelGene_149482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	49	552	1700318	1682049	FALSE	60	AAAAGGAGAACAAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLLSWSSAPCPSLPPMPGSPVFNNGLFHQKKAGLETRPLARSIRGRSISMKVPTPSRAKQGAFKTIPLRWSFGPKEKPSGASVELVEYLESRRRPRPTSRSIVPLLTGAADGEERSATPRSNSALSAQDEDSGRASRGRIGRGAPPFGPPQPLSGPWKLRWSKRHKETTGKHKSGYQASQKV	1700366	1681772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1682504_1700269
844556	contig_10861_pilon	+	1070	4	Intergenic	novelGene_39437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	16.4991582276861	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTTCTTAAAATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2432401	2451420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2432592_2432824_2433325_2433921_2434067_2451185
844557	contig_1309_pilon	+	763	6	Intergenic	novelGene_73978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	281.093294121365	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	235	444	294293	309413	TRUE	15	GTACTCTTTGTAGTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRPRLLPTPDTRGRAYPRSLTPQILRVKLCGNLKYYLSPLYSTVVPPDEITVNYRYGLPLITLPLPSRRERCQFVVKPMLSTVGSFLQEIQNEDKGVNTVAVFTADGSKIPASTLMGILLMNDFKLVINKITYDVQCPKQGLYLLSC	209582	311296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_209652_293631_293708_294203_294375_300418_300524_309390_309508_311071
844558	contig_6163_pilon	+	977	6	Intergenic	novelGene_103856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	29.4781274846283	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	83	868	504849	507858	FALSE	40	TGAATATGTATCATACGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVPLDKQITIIDSPSIIVSPLNSATALAMRSPASIEVVKPVEAASAILSQADARQVVLKFTVPEYKNPLEFFTSLAQRRGLHQKGGSPNVEGAAKLLWSEWTGATLGYYCQPPTSWTCSSHFNESVVADMKLGFNMEELEKNNAHSMQAIRGSRLASSVLFQSSGLTNGIIEEADIPEELTKRKERQQEENVDSDQESVGGEEADEKSSDMSPVEETWQALPEESQAGEQFGSQEARSFVLDKTTKEEDDAYDFSTDYV	504766	507967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_505020_506718_506862_506943_507081_507166_507337_507598_507666_507760
844559	contig_1146_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_84793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACACAATGAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178621	177496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_177500_178600
844560	contig_6028_pilon	-	795	4	Intergenic	novelGene_156592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	175.336501872511	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	275	727	332055	323625	FALSE	70	CTGGAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKVLWDSFSPVGSNAAQVPIIDSLSLPFLLSLTLLRVKHKNSFH	353993	323556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_323830_326490_326709_332025_332108_353771
844561	contig_2054_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_51668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGCATACTAGTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46890	45717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_45700_46900
844565	contig_9706_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_20789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1415	1706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1400_1700
844566	contig_8548_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_170567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTGGAGGTTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483881	482522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_-_482500_483900
844567	contig_2219_pilon	+	1097	2	Intergenic	novelGene_67215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAATTGTTGTACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384867	386391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_385005_385431
844570	contig_8980_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_74019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.20156211871642	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	6	608	694479	700112	FALSE	40	AAAGAGCCATTATTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMPDPSKQPKNQLNPIGSLQELAIHHGWRLPEYTLSQEGGPAHKREYTTICRLESFMETGKGASKKQAKRNAAEKFLAKFSNISPDNHISLTNVVGHSLGCTWHSLRNSPGEKINLLKRSLLSIPNMDYIQLLSEIAKEQGFNITYLDIEELSANGQYQCLAELSTSPITVCHGSGISCGNAQSDAAHNALQYLKIIAERK	694473	700584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_694536_695591_695710_697013_697109_697946_698122_699954
844571	contig_9482_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_44277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCCAGCGCTCGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145853	1144900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1144900_1145900
844573	contig_8865_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_164455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTAAGTTTCTCTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389568	390314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_389600_390300
844574	contig_5628_pilon	-	1202	6	Intergenic	novelGene_157573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.125293234946	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	175	855	281815	278863	TRUE	0	GTCTTCCTTTTTGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKEPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGVRVADNLPVAIKHVEKDRISDWGELPSGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERSDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALPEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSPECQHLIKWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHSLSPEPNK	282181	278181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_278282_278615_279021_279775_279953_281469_281837_281925_281977_282079
844575	contig_9423_pilon	-	1058	2	Intergenic	novelGene_99181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAACCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74948	73307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_74088_74670
844576	contig_13300_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_125773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	210	557	49368	49715	NA	20	TCCTCTAATTGGGATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKSVTGSGERSQRRTGICHLDFCRKHPQGHVLPERPSAAQLFDKPNDYPSEGVTVGGAGAGEEPFLSSMPPTAAGGHRPRGSVSMLTLLPSTLSALQGSGPPPARQPCLWGGRTLPTALGPGEKEAPLQSQGPHPSWPPGACSQCRAGEAPGEGVCLPCTHSPSGTCGSGSSSGWCSGCPRAQ	49158	50188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_49200_50200
844577	contig_2487_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_148468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATGTCTATGCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154745	154360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_154400_154700
844578	contig_8453_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_125101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCCACTAAAACATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19592	20428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_19600_20400
844580	contig_3942_pilon	-	579	6	Intergenic	novelGene_128814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.94525329868	93	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	13	513	1060159	1053731	TRUE	25	GCACCCCAACCCCAGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDSNMAPPAPGPASGGPGEVDELFDVKNAFYIGSYQQCINEAQRVKPSSPERDVERDVFLYRAYLAQRKYGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLAR	1060171	1050134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050195_1053724_1053789_1054379_1054533_1054811_1054913_1056018_1056082_1060033
844582	contig_11413_pilon	+	538	4	Intergenic	novelGene_103130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2142.08532872889	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAACCTACTCAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87448	90851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88203_88470_88508_90624
844584	contig_15689_pilon	-	1263	6	Intergenic	novelGene_164153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_4	8.5463442476886	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	33	737	46217	43612	FALSE	20	CTTTGAGACAGCTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLAQDFFDRYMATQQNVVKTLLQLIGISSLFIAAKLEEIYPPKLHQFAYVTDGACTGDDILNMELGIMKALKWRLSPLTVVSWLNVYMQVAYLKDFYEVLLPQYPQQIFIQIAELLDLCVLDAGCLEFSYGVLAASALYHFSSSELMQKVSGYQWCDIERCVKWMVPFAMVIRETGSSKLKHFRGVPAEDAHNIQTHINSLDLLDKAQAKKAIMSEQNRVSPLPTGVLTPPQSGKKQGSEQERA	46249	43085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_43735_44542_44701_44780_44893_45000_45136_45364_45461_46136
844586	contig_12540_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_148065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTCGTTTTTTAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227828	227421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_227400_227800
844588	contig_8955_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_175089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTACCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287523	286445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_-_286400_287500
844589	contig_19098_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_65861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGATCTCATTTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485480	485677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_485500_485700
844590	contig_9593_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_59709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACACATTATGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207599	208290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_+_207600_208300
844591	contig_11100_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_175528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTCTTAATTATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141176	141981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_+_141200_142000
844592	contig_9029_pilon	-	780	2	Intergenic	novelGene_155141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTTCTTTCGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921173	915570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_916205_921027
844593	contig_13868_pilon	+	1350	1	Intergenic	novelGene_172660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106548	107898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_106500_107900
844594	contig_9389_pilon	-	970	7	Intergenic	novelGene_84013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.28010988928052	83	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	241	564	546335	545216	TRUE	20	TGTACCGTGTAAACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIAASRIQEAPIEEHWVIECNDGVFQRLQDWAPRQPHKVIPLKGLWEEVAPTLPDGHFDGILYDTYPLSEDTWHTHQFNFIKEHALSPAEAGGHPYLLQSHVLGGS	551261	543448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_543817_545177_545291_545510_545579_545962_546027_546218_546365_550336_550479_551192
844595	contig_5649_pilon	-	855	5	Intergenic	novelGene_82472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.29903810567666	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	107	559	1605224	1591421	FALSE	15	TTCAGTCTTTGATTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLPGLTLLIPYLLGRKKRWSKCKFRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVHVLPDINQKPRAEHTNRFEDMIAPFRLNDGFKDEATITEMRRDCPWKISDEEISKNRIKSLRQVRLNEILLDYSRDAALVVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ	1605330	1591124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1591563_1595737_1595806_1597799_1597936_1601813_1601901_1605204
844596	contig_567_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_34003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTTGTCATAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594314	592975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_593000_594300
844597	SIRV7	-	290	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91636	0	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
844600	SIRV2	+	323	1	FSM	SIRV2C	SIRV206	424	1	101	0	101	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAACACACTTCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4134	4457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_4100_4500
844601	contig_16103_pilon	+	901	5	Intergenic	novelGene_118741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	29.6395006705579	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	37	447	312192	313449	TRUE	30	AGATTACTCTGGTATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGSAAVSGAGTPVAGPAGRNLFAEGLFEFLRPAVQQLDSHVHAVRESQVELREQIDNLATELCRINEDQKVALDLDPYVKKLLNARRRVVLVNNILQNAQERLRRLNHSVAKETARRRAMLDSGVYPPGFPSK	312155	313986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_312335_312601_312649_312907_313027_313347_313769_313851
844602	contig_20241_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_159731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAAATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194865	193744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_193700_194900
844603	contig_1369_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_176794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACTGGTTCTTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108654	1107349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_1107300_1108700
844604	contig_9415_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_109722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACAAAGTGTAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454327	454700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_454300_454700
844605	contig_7171_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_101224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	10	312	674734	674432	NA	85	CAGAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLMVGVVLGVGGPLSRLRWLWTGLCAEGMSGLRAGSFREKRETALCTAGEREDRTESSWVQRSGHQVLPATPTTDGPHVSPEPSTQVPTTLSITHLSGHTDT	674743	673948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_673900_674700
844606	contig_1085_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_171469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTTGAGTATTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794355	792953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1085_pilon_-_793000_794400
844608	contig_12964_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_131689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCCCTAGTAAAGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515743	516913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_515700_516900
844609	contig_12964_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_131690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGTATTAGAAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517188	517429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_517200_517400
844611	contig_4689_pilon	-	1556	2	Intergenic	novelGene_165390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	106	369	128730	127560	FALSE	50	TTATGAATAATAAAACGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCHGSGGKKPFQPKGSAAECKQSQRNAANARERARMRVLSKAFSRLKTSLPWVPPDTKLSKLDTLRLASSYIAHLRQLLQEDRYENGYVHPVNLTWPFVVSGRPDSDTKEVSAANRLCGTTA	128835	126372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_127647_128553
844612	contig_5669_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_86103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCGCCCCTCCGCTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385985	385686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_385700_386000
844613	contig_9895_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_144703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGAGATTTGAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361617	362562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_361600_362600
844614	contig_7022_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_142153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAGTCCTAATTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219334	220481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_219300_220500
844615	contig_6885_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_83647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134840	133007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_133000_134800
844616	contig_6589_pilon	+	794	8	Intergenic	novelGene_26240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	77.7995855400534	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	7	648	2222119	2226054	TRUE	25	CTGTACGTTTCCCCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLMLVYSSKKKIFMGLIPYDQSGFVSAIRQVITTRKQAMGLGGVNSGPVQIVNNKFLAWSGVMEWQEPRPDPNSCSKRWLPSHIYVNQGEILRTEQWPRKLSMQLIPQQLLTTLVPLFRNSRLVQFHFTKDLETLKSLCRIMDNGFAGCVHFSSKASCEVRVLMLLYSSEKKIFIGLIPHDQSNFVNGIRRVIANQQQVLQRNLEQEQQQRGMGG	2222112	2226462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2222224_2223106_2223197_2223278_2223353_2223426_2223485_2224127_2224233_2225763_2225962_2226042_2226108_2226369
844617	contig_16650_pilon	+	732	4	Intergenic	novelGene_61968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1942	junction_1	436.799216523514	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	82	459	244670	254361	FALSE	40	GCCAATAAAATAGATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244588	254634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186
844618	contig_7840_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_69021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATATGCCTGAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323716	324381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_323700_324400
844619	contig_3846_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_137150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTACAGCACCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204651	204340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_204300_204700
844621	contig_6164_pilon	-	1540	11	Intergenic	novelGene_121296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	982	1311	621466	608595	FALSE	40	GTGGCTGTGAAAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCICGKASQYTIWNSFRKRVDLNSIVRYGSDQFSILQSTRICLFSHINGLRIIIIQVFPNPHITITSTSYNTTPRIIETDIGVSLRMSISHRLLCGRHLFLYLPENVL	634233	608365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_608703_617896_618009_621356_621509_622155_622267_622441_622493_623645_623742_626518_626613_627410_627518_627745_627887_631244_631458_634107
844622	contig_15888_pilon	-	512	5	Intergenic	novelGene_84450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	753.009088590569	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	39	389	259726	254020	TRUE	10	GCCCTGACCCTGACCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGEPPESHSREKVGACQ	259764	251640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251737_253992_254066_254194_254282_254527_254683_259663
844623	contig_4469_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_21898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCAACAAGATAACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407427	406524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_406500_407400
844624	contig_5041_pilon	+	977	2	Intergenic	novelGene_27045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAGGAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471074	484758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_471384_484090
844627	contig_10898_pilon	-	760	3	Intergenic	novelGene_172769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	274	759	219017	208976	FALSE	35	TTGCAATCAAGCTCATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKPVVSTISNGGYLQGNANGRLPALGSKESPGQEKVMLKKKITLLRGTSIIIGTIIGAGIFISPKGVLQNTGSVGMSLVIWTTCGVLSLFGALSYAELGTSIKKSGGHYTYILEVFGPLPAFVRVWVELLVIRPAATAVISLAFGRYILEPFFIQCEIPE	219290	208974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_-_209058_213459_213587_218740
844628	contig_1982_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_151323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233366	234220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_233400_234200
844629	contig_10197_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_115267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAATGCCTAGGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114681	1115647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1114700_1115600
844630	contig_5260_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_144354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	239	565	93805	94131	NA	35	ATTATACACAAGGTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDLRSSDIDRATALVLVWQLSWTWAGTLGPECVEAVVLTFTYCMKRSPWVARMVKHLTTSLKVDSSNPPRSTLEDRPADLLLKSHSLENPMEQFYFAHTGRHESEST	93566	94771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_93600_94800
844631	contig_12485_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_147282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAGTGGAGAGAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112127	113009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_112100_113000
844632	contig_1146_pilon	+	861	5	Intergenic	novelGene_84810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.1734949746879	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	70	426	470159	477872	TRUE	30	CAACAACTTGATTTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLRTGARRSLSAYGRKVGVRFCSSRMTLDNINWAAVDRIIRVDHAGEYGANRIYAGQMAVLGRTSVGPVIQKMWDQEKDHLKKFNELMVAFRVRPTILMPFWNVVGFALDNKEISG	470089	478769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_470199_474311_474491_475284_475400_477849_477919_478380
844633	contig_1575_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_45154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCTTGAGATTTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39156	41018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_39200_41000
844634	contig_4845_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_53692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAAACCATGAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873601	874564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_873600_874600
844635	contig_4845_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_53693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCTAGTGTATGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874636	875353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_874600_875400
844636	contig_7157_pilon	+	492	4	Intergenic	novelGene_131265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	13.1402688962847	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	23	391	88955	92988	FALSE	20	CATTGTAGACTCTTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSPHLEMAPQKDKKAKRSTWKFNLDLTHPVEDGIFDSGNFEQFLRGKVKVNGKTGNLGNVVHIERSKNKITVVSEKQFSKRYLKYLTKKYLKKNNLRDWLRVVASDKETYELRYFQISQDEDGSESED	88932	93089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_88964_90914_91008_91172_91295_92843
844641	contig_6664_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_176067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAGAAGTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16448	14562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_14600_16400
844643	contig_16622_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_48516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGACACAAAAAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214821	216061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_214800_216100
844644	contig_10324_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_7892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	20.2847780915203	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	84	968	617782	614614	FALSE	5	CCCGTGTGGTGTGGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSLCLPRLALPTPPGSALPQRVFGTYFRVGFYGARFGDLDEQEFVYKEPSITKLAEISHRLEAYIQITYVEPYFDTYELKDRVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTPDGRAHGELPEQHKRKTLLSTAHAFPYIKTRIRVCHREETVLTPVEVAIEDMQKKTRELAFATEQDPPDAKMLQMVLQGSVGPTVNQGPLEVAQVFLAEIPEDRKLFRHHNKLRLCFKDFCKKCEDALRKNKALIGPDQKEYHRELERNYCRLREALQPLLTQRLPQLLAPAAPALRNSLNRTSFRKADL	617865	614417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_614657_615018_615181_615415_615523_615603_615748_616073_616311_617025_617158_617722
844645	contig_11986_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_69142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	348	525	872	278977	279324	NA	30	AGGAGAATCAAGCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKPDMWELRLARIQWLVAQTGQRWGKVPDRCGPKPLLSVGLCPYPLGGTEGDDCPLTDTDHPKWQRWGQERLLPRVGSSSLLHLMSFAVRFHQCLPPSPRPENPGPPIKMVIGC	278452	279324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_278500_279300
844646	contig_6233_pilon	+	420	3	Intergenic	novelGene_74748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_1	233	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAGTATTAAATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112895	119753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651
844650	contig_5551_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_134245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGGCACCTCAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472083	471533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_471500_472100
844651	scaffold_880_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_121474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTATTATTACTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479364	478855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_478900_479400
844653	contig_4847_pilon	+	792	5	Intergenic	novelGene_156170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	369.977279707822	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	49	465	101069	109731	FALSE	40	TTTTACTATAAACAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASLCHLSAGQSGKRTMQKVPLHWLGFGYAALVASGGIIGYAKAGSVPSLAAGLLFGGLAGLGAYQLSQDPRNVWVFLATSGTLAGIMGMRFYHSGKFMPAGLIAGVSLDLLFSLDPISRSPIPAGTHEELKISELIVLNVRDRSTRLKCFHIF	101020	110058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_101077_101400_101478_102278_102381_108569_108658_109589
844654	contig_8934_pilon	-	710	4	Intergenic	novelGene_167241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1728.02494837957	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATCTTGATTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603929	595844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_596052_601775_601837_602571_602661_603576
844655	contig_10135_pilon	+	1047	5	Intergenic	novelGene_106579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	52.4046753639406	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	34	561	25077	27470	FALSE	15	TCATCCTTAAGTCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGRSLDRILRMVSAVSSCRTCSRSHRPRLGFIIRPRHQLLPLLLCPGLRIPRLSVLCAQPRPRAMAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKEPSAM	25043	27956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25130_25663_25763_26029_26285_26387_26492_27453
844656	contig_2215_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_163842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAATGAAATGGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123193	124414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_123200_124400
844657	contig_7066_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_42133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTCCCCGAGGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716804	717854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_716800_717900
844658	contig_7066_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_42134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAACCAGATCGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717857	718052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_717900_718100
844659	contig_16647_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_170305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAACCAAAATAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297538	295565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_295600_297500
844661	contig_17493_pilon	+	806	2	Intergenic	novelGene_122197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAATAAATGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118526	119859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_118590_119116
844662	contig_1406_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_25665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATATTTCCTTTCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2809949	2811164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2809900_2811200
844664	contig_3956_pilon	-	692	5	Intergenic	novelGene_14811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	63.4409173956367	101	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	38	634	1259540	1231611	FALSE	20	GCCAGCAAAGTGTCGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGVPALGTLVAKMAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKELYETRYAKKNAEPVPQPHRPLDPLTMHSAYDRAGTLPRTPLSGPNIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSRELQPGIRAVQVVLRAAVF	1259577	1231552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1231627_1240152_1240195_1240973_1241059_1253552_1253980_1259513
844667	contig_12540_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_148044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACGTTGTTGTTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108573	108830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_108600_108800
844669	contig_12078_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_74109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308262	307813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_307800_308300
844670	contig_5196_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_38704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAGAAAATCCAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331771	332124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_331800_332100
844671	contig_10037_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_148956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241791	241333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_241300_241800
844673	contig_13800_pilon	+	1027	10	Intergenic	novelGene_153750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTGGCCACCATCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175567	223086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_175885_193490_193574_197498_197576_199920_199993_212668_212759_216414_216521_219001_219068_219783_219857_221991_222056_223007
844674	contig_7057_pilon	+	872	8	Intergenic	novelGene_123256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	54.0132258935584	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	293	826	567112	570531	FALSE	5	CTCTGCTTGCCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLGRRPRTRTIRTAPLQPPANDAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEGSEVTNSKSRDVYKLPPPTAPGPPGDPCRSRIPSPLQPETQGTPDDEPSEPEPSRSTLIYHNMQRWKRIRQRWKEASHRNQLRYSESMKILREMYERQ	542598	570577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568676_568707_568952_569120_570061_570203_570293_570368_570449
844676	contig_12123_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_144600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTATATTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112078	110899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_110900_112100
844677	contig_11136_pilon	-	722	4	Intergenic	novelGene_169021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	22.8958996814325	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	10	363	146932	137737	TRUE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTMVAALFGCWFRVGGARSAMAGRVIPVGPTVVQTSMSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLTTSCVDLCPLRLPLPRTIPRNSSGQ	146941	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137522_137734_137818_144288_144478_146848
844679	contig_7179_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_78122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCACAGTTTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767542	767242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_767200_767500
844681	contig_6533_pilon	+	627	6	Intergenic	novelGene_114636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	40.3663225969372	335	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	100	531	113801	143489	FALSE	25	ATCTGTTTCAATTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVDLCLSSEGTEVILATSSDEKHPPENIIDGNPETFWTTTGMFPQEFIICFHKHVRIEKLVIQSYFVRTLRIEKSTSKEPVDFEQWIERDLVHTEGRLQNEEIAARDGYATYLRFIIISAFDHFASVHSISAEGIAVSNLS	103148	143585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_103233_113785_113899_125966_126074_127313_127383_141030_141075_143375
844683	contig_720_pilon	-	759	2	Intergenic	novelGene_155159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	639	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	16	459	77507	74425	FALSE	15	ACCTATTGTGTTTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRACGLIIFRRRLIPKVDNSSIEFLLLQASDGIHHWTPPKGHVDPGENDLETALRETWEEAGIEADQLTIIEGFRRELNYVAREKPKTVIYWLAEVKDYDVEIRLSHEHQTYRWLGLDEACQLAQFKEMKAALQEGHQFLCSTAA	77522	74124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_74742_77380
844686	contig_4301_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_65091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGTGTCTTAGTTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449785	449065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_449100_449800
844687	contig_4486_pilon	-	1080	5	Intergenic	novelGene_38632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGAAGTGAGTCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867670	844090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_844168_855649_855804_858098_858413_865587_865976_867523
844688	contig_12479_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_56870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTGGAATTCTATCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472262	473144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_472300_473100
844689	contig_5247_pilon	+	603	3	Intergenic	novelGene_81834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCGGCAGGCCGGGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376129	416541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_376488_409242_409395_416448
844690	contig_1331_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_37868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAGACAAAAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325391	324160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_324200_325400
844692	contig_2817_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_104341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGACAGACTCACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279556	280086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_279600_280100
844693	contig_804_pilon	-	785	4	Intergenic	novelGene_138792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	96.1491896308371	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	111	605	204639	169516	FALSE	55	TCTTAAAACACGAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMLKF	204749	169335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_183049_183287_184285_184478_204585
844694	contig_7411_pilon	-	792	3	Intergenic	novelGene_137031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_1	10.5	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	16	324	368534	364436	FALSE	20	TGTAAGGTAGCTTCTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFYLFMEHWIPSDVPLAGVKRLLLDRLIFAPAFLLFFFFIMNFLERKDMAAFSAKMRRGFWPALQMNWKVWTPLQFININYVPLQFRVLFANLVALFWYAYLASLGK	368549	363967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_364505_365158_365279_368414
844697	contig_6842_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_130839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844658	1843752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1843800_1844700
844698	contig_13863_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_42052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGACTGCCTGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321760	320007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_320000_321800
844699	contig_10618_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_170042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTCCCGCCTCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98705	99996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10618_pilon_+_98700_1e+05
844700	contig_11396_pilon	-	1054	4	Intergenic	novelGene_71304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	15.3260852434302	68	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	108	674	383851	382991	FALSE	0	TCTCTGGGCCCCCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVRPHHQQRFRQMWTDLTGQPAPGGGTEPPGATDASPARPPGLEPAHGAGVPARLGLPQSEKPDKVQSKTSSCWEQRPAESMAADAVPPGPSQALPGPPCGQSESPWGRSGEGACAEAPVHPQSRVEGPTCSGCGAEDEVTFRCPDCDFHRCQACWRQHLQASRTCPACHAAARKQSLSQVFWAVSP	384036	382610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_383072_383245_383563_383682_383860_383937
844701	contig_16362_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_161163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATAGAGCGCTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139499	141180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_139500_141200
844702	contig_9919_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_137983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGTTTTCTACAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762513	763621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_762500_763600
844703	contig_7376_pilon	+	1012	8	Intergenic	novelGene_108082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	33.0775218083156	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	542	1012	112633	147791	FALSE	45	TCAATACAGATTGAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLGNIYSASSTVALDGQQTNNGVTQADGTVHRPVSVTLSKEKPGTDPSLLENTLKELLNKNQEEARGKTTPKESQTGKNQIRNSKLPGSLEDSNTDYFNSKKSQYPGKNEDDTANISRREDSETGEKECVILPNLTNFPSLPCQPAISPGITDIS	79969	147791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_102779_102959_104743_104851_112441_112496_112599_112832_129280_129396_130280_130342_147695
844706	contig_9053_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_87948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTCACAGATGAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288140	287579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_287600_288100
844707	contig_8801_pilon	+	1426	6	Intergenic	novelGene_66320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	805	1221	810671	813999	FALSE	85	CAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASATDIFGQGDALLVSELPLAVLIQGTAPAAGLLVTVVHGVVLGAILIHGNGDLALRAAVVRRDTVVVAPVAVVSVGCAAVTVCVLVTSVMVKSYEGKEKSINRDSFSSEKLQAITVAVEHNLRLRLKKKGNTMGK	805415	814204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_805649_806204_806394_807612_807830_810505_810697_812345_812485_813747
844708	contig_12596_pilon	+	722	2	Intergenic	novelGene_172735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	49	720	39736	48466	FALSE	25	GCCACAGAAGTGCTGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDQESHGVTLQLRVDGMHCKSCVFSIEEDIGQLPGVQSIQVSLENRTAQVQFEPSRISPVSLQKAIEALPPGNFKVCLPDDSEWSGTQCLPGVRPSELYSSGSSQRNQGLGAPTSVVLTIAGMTCTSCVQSIEGIISQREGVQQISVSLTEGTGTILFNSAVTNPEELRAAVEDMGFEASIISENCSGNHFGSHSARNSMAQTTGGAPLSIQETAPHARVLPRRHHPGHSSESPQSSQTV	39687	48468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_+_40238_48296
844709	contig_7816_pilon	-	734	6	Intergenic	novelGene_66537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	317.106543609557	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	55	471	253065	245938	FALSE	20	TACCAGTCTAGCTGTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLALAWENPFLTHLFCTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEILCGLQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVNCV	253119	245674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_245953_250104_250135_250283_250423_251947_252011_252582_252675_252987
844710	contig_14814_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_137759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCACTCTGTGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416948	417301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_416900_417300
844711	contig_14322_pilon	-	667	3	Intergenic	novelGene_115661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAAGCTGGCTGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534398	533430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_533597_533683_533756_533969
844712	contig_2463_pilon	-	1145	5	Intergenic	novelGene_43001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTGCCATTCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240793	218960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_219288_221671_221760_237703_237756_239947_240051_240218
844715	contig_10197_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_115260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTTAGAATCTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094624	1093473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1093500_1094600
844717	contig_4364_pilon	+	713	3	Intergenic	novelGene_166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	174	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	128	331	1268714	1270694	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTPEVTDGQAGGWGSATFVISCRREREAARSNPPASQTRSSMAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYMLPAQGCGDGSTAWGKPDCQTQAAPGPAPGGLGGLTSATS	1266978	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268796_1270572
844718	contig_16541_pilon	+	477	4	Intergenic	novelGene_126759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	69.4278202323983	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	70	447	441353	474766	FALSE	10	TTTTTCGAAGGTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREASDDYLAILLSFLKFWRFSVMFQFVLFSTLFPSVFTELGEPRWVCNSSDISIWYTYCGRDVEKLYFNLYLSVNSINLPKRKEVICRGSDDSYSFCRALKGETVNTTIPFSFRGIKFSKGLYRCVAEAISGKTEEMLFCLNFTMIH	441283	474796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441465_464057_464187_473751_473805_474682
844719	contig_7097_pilon	+	1660	3	Intergenic	novelGene_174449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	22	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATATACTTTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289942	362044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7097_pilon_+_290021_295006_295132_360587
844721	contig_20365_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_85324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACGGACGCAGACTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36277	36778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_36300_36800
844722	contig_6557_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_32972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	107	463	427767	428123	NA	30	AAGAGCAGAGGCTGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVHTPGVPTAETSTTYNSLCEVCSLWGKKLARCLLSSSQMPVVVVLVAVESILTRLTTTPCVPEQNCAPKGFQGHDLLEADGQACLPRHLRVSLNHQLSFWLVVKSFTVCATQEFLQ	427660	428226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_427700_428200
844723	contig_14338_pilon	-	1126	7	Intergenic	novelGene_174829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5.69844033242625	90	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	194	508	21806	18348	TRUE	40	TTCTCAATAACCCTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLALHQPAPPSLLQDLICTSRHTPTLLVVRMSPGRLTPDRESGISASAIVPPSSCASQDLLRAGSDQLSFMTSRLWQTGPPCAERLQERWHCAGEHQAPGPK	23458	13794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_14142_14243_14346_16377_16461_18261_18351_19978_20184_21699_21859_23317
844724	contig_11908_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_133236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725236	724946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_724900_725200
844726	contig_1443_pilon	-	1527	4	Intergenic	novelGene_28360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.8017186960874	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	93	1073	946651	939139	FALSE	5	CTTTTCCACTCTTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLSLCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNYQTGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDVPVEKPPEETAAQIPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVNSSDTAPLVSRSVPPVKLMRMRMMMMIYLRAMIAQKGTSHSLMIL	946743	938684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_939224_945198_945788_945880_946090_946553
844728	contig_16125_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_155223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTTTAATAAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111672	110389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_110409_111341
844730	contig_4418_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_98374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTAAAAATAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786746	786401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_786400_786700
844731	contig_1244_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_38070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTTCTGTTCTAGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252040	1250635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1250600_1252000
844733	contig_9871_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_75656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACCCTAATCTTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400960	400521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_400500_401000
844735	contig_6070_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_177492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199062	198805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6070_pilon_-_198800_199100
844736	contig_13612_pilon	-	864	4	Intergenic	novelGene_157272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAGAAACTACCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57317	26000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_26084_55100_55304_56239_56380_56879
844738	contig_16714_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_161569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACAAACCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766861	768521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_766900_768500
844739	contig_14722_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_110223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTCCTTCCTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104078	102463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_102500_104100
844741	contig_7919_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_28084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCGGGAGGGACGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108907	1109217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1108900_1109200
844742	contig_9919_pilon	-	1104	2	Intergenic	novelGene_137951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	251	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1074	29	1102	535510	534437	FALSE	15	CCGCAACCTCAGCCGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGCSTVSDMLRTSLLCVMLGLQQAWPFPCPQGCRCVFRDAAQCSGGSVARIPALGLPTNLTHILLSGMDRGALPSQSFSGMTVLQRLILSDNHISAIAPDTFNDLIKLKTLRLSRNKITHLPGALLDNMVLLEQLFLDHNALRSIDDNMFQKLVNLQELFLNLNQLAFLPASLFTNLENLKVLDLSGNNLTHLPKGLLGTQAKLEKLLLHSNQLISLDSGLLDSLGALIELQLHRNHIQSIAPGAFDCLRNLSSLTLSRNHLGSLPSALFLHTHNLTFLTLFENPLEELPEVLFGEMAGLQEMWLNRTRLRTLPDAVFRNLSRLQALGVTLSPRLSALPEGAFRGLGELRLLALHNNRLQALPRAL	536813	534434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_535513_536787
844744	contig_8133_pilon	+	548	3	Intergenic	novelGene_98668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	27	446	257187	337455	FALSE	30	CATTAAAATTCTTTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDTHFEVSMANNGCEVHRFDPSVKSAHILESQHLWYHRLSIDWRDPHPAVAAQKPHSNTRKLGTILNEFGHHKIDVLKADLESAEWKVLENLILENVLEQIGQLIFEIHLHWPGFEGGGCAKESSAMQEDGRQSCTEICELIHLVQN	257160	337557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_257382_319739_319869_337359
844746	SIRV5	+	402	3	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	3	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1987_2147_2293
844747	contig_8576_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_88750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGAGTATGCAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698325	698827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_698300_698800
844748	contig_15003_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_137337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAACAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217533	218565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_217500_218600
844749	contig_14599_pilon	+	746	4	Intergenic	novelGene_167904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	4.49691252107735	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	30	731	147829	149795	FALSE	5	TGCCAGGCCTGGTTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGGLALRTLPGQGWVRGSSPAVLSRLRDAAVVRPGFLNAAEEETLSRELEPHLRRRRYEYDHWDAAIHGFRETEKSRWSEASRAILQRVREAAFDPGQALLPRVHVLDLEPRGYIKPHVDSVKFCGATIAGLSLLSPSVMRLVHTQEPADWLELLLEPGSLYILRGSARYDFSHEILRDEDSFFGERRIPRGRRISVICRSPPEETGPGEPGQPPQPADPSPHLSRTLCQ	147799	149810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_148033_149024_149199_149287_149413_149596
844751	contig_14882_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_115008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAATCCTTATCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292712	293694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_292700_293700
844752	contig_17198_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_62363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCAGTAGGTCTCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793946	794272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_793900_794300
844753	contig_9434_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_150507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCAGTAATACACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364065	364969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_364100_365000
844754	contig_19352_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_122393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192991	193780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_193000_193800
844755	contig_5033_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_29096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGATCCTCAGACTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754250	754989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_754200_755000
844756	contig_17102_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_141703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAAATTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30716	29940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17102_pilon_-_29900_30700
844757	contig_7095_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_166468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATGGCCTGCAAGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489440	490248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_+_489400_490200
844758	contig_13853_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_176559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTTACCCAGCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30224	30730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13853_pilon_+_30200_30700
844759	contig_12969_pilon	-	996	2	Intergenic	novelGene_61670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACTCCATAACTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340347	337411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_338202_340141
844761	contig_610_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_76748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGCATGGTTGCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213500	214109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_213500_214100
844762	contig_10109_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_131341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCTACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343426	342610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_342600_343400
844764	contig_16831_pilon	-	757	2	Intergenic	novelGene_134791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	0	190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGTAAAAGGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382106	379111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_379691_381928
844765	contig_6048_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_73127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAAATGCCCTTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946115	945457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_945500_946100
844766	contig_10629_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_52948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCCGTTTCTTAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416358	415797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_415800_416400
844767	contig_8907_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_85855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACTAGTGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772923	774183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_772900_774200
844768	contig_17989_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_150815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	176	484	201557	201249	NA	70	TGAAATAAAAATTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITATAPATTTVSRREGGPIHLLPRGGRTDSTEATGSRDFGVRQAWAPGLALPWEPPEVELWLLGLSFYLQSGESTPQLSGLLRLWRGCESSAWHRVNSAQ	201732	200636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_200600_201700
844769	contig_5261_pilon	-	1449	12	Intergenic	novelGene_102463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	11.8433298868991	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	30	1184	221634	98377	FALSE	30	CTTAAACCACTAAGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASACLEEETMNSDRTESDWQGLVSEYLVCKRKLESKKEALLILSKELDTCQQERDQYKLMANQLRERHQSLKTKYRELIDGDLSLPPEKRKQANLAQLLRDSQDRNKHLGEEIKELQQRLGEVQGDNKLLRMTIAKQRLGDEEIGVRHFAAHEREDLVQQLERAKEQIESLEHDLQASVDELQDVKEERSSYQDKVERLNQELNHILGGHENRIIDVDALCMENRYLQERLKQLHEEVNLLKCNIAKYKNALERRKNSKGQGKCNSSALTGVLSAKQVQDLLSEDHGCSLPATPQSISDLKSLATALLETIHEKNMVIQHQRQTNKILGNRVAELEKKLRTLEVSGLWSLPGSKDTILFSDPTLPTIQRSRSPLLKFTEQPTESTANPKSGGS	221663	98111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_98388_104677_104795_113714_113792_123963_124109_127934_128020_129531_129605_130757_130931_131968_132086_159983_160092_176043_176083_177737_177900_221586
844770	contig_12485_pilon	+	1513	6	Intergenic	novelGene_147288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	8.84533775499839	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	383	1342	202333	210647	FALSE	50	AAAACCAGACCCCGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLLLLLLCVCQAQSQPASRPNFVLLMADDLGIGDPGCYGNKTLRTPNIDRLAQGGVKLTQHLAASPLCTPSRAAFMTGRYPIRSGMASWSRIGVFLFTASSGGLPASEITFARLLKNQGYSTALIGKWHLGMSCDSKSDFCHHPLSHGFDYFYGLTVTNLRDCKPGSGSVFTQGFWLLVFIPLQIIGVALLTLAVLNCMGLLCVPHAIFLCLLLLAAAILGLLVCFLHYFRPLNCFLMRNHEVTQQPMSYDNLTQRLTAEAVQFIQRWVSIACWLAFSSLAAHEKCCCCCLHLWSGSPTRGDPCTWNEMLPGPASSL	142613	210818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_142869_165141_165265_202328_202470_206891_207014_207094_207218_210069
844771	contig_15882_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_144821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	254	637	580790	581173	NA	60	CCAGAAAGCATAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQGGKGRGLGLVSSGCSFLHLPSASPDSGWCGGVQAVGAERALRMELCWGAGLGWRHRAERGTALFPQLQGEVSKTAGSGFRSTEARGRAEEADLGIGQDWGKWWYPGLRGIEAQAANFLLVPGP	580536	581914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_580500_581900
844772	contig_18108_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_33454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACCCCTTTTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100736	101998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_100700_102000
844773	contig_8063_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_152427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGAAATTTCCAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126422	125506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_125500_126400
844774	contig_3409_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_172306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67437	67851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_67400_67900
844776	contig_500_pilon	-	1410	7	Intergenic	novelGene_31133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.26691175145591	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	252	1019	1798566	1783970	FALSE	30	CCCGTGCATCAGAACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSRLTYSADLVRLFGAGSAHLHKSPPSGLSVGASAPPAAAGKLQPREPWRRRRPRQEQQHPRSSRSWSTYRVIHKDICSQNFMLPFLSRVRAGREFIYWEFSTGETRKVLSRMVSHSELRNLFCSADAICFDVDSTVIREEGIDELAKFCGVEDAVSEMTRRAMGGAVPFKTALTERLALIQPSREQVQRLLAEHPPHLTPGIRELVSRLQERNVQVFLISGGFRSIVEHVASKLSIPAANVFANRLKFYFNGEYAGFDEMQPTAESGGKGKVIKLLKEKFHFKKIVMIGDGATDMEACPPADAFIGFGGNVIRQQVKDNAKWYITDFVELLRELEE	1803545	1783578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1784078_1787619_1787769_1789165_1789312_1789861_1789997_1790834_1790994_1798495_1798629_1803356
844779	contig_15185_pilon	+	872	4	Intergenic	novelGene_99404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.381533094402	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	110	736	187302	188191	FALSE	10	GGCTGTCTCCACGATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNAQERPSETIDRERKRLVETLQAESGLLLDALLARGMLTGAEYEALDAMPDAERRVRRLLLLVQGKGEAACNELLHCAQRVARAPDPVWDWQHVGPGYRDRSYDPPCPGHGTPETPGSGTTCPGLPRASDWDEAGGPEGSGAVQSQIREEPNLELEAEASEGAEPEPEPQMNPGPELEAEPEPELEQEPDPEPEPDCEAADESEGS	184821	188327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_184923_187293_187597_187769_188094_188183
844781	contig_4797_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_6950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGACCTAGAACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662591	664398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_662600_664400
844784	contig_9468_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_59517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466522	465828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_465800_466500
844785	contig_16930_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_139164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAAGAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194919	196238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_194900_196200
844786	contig_3627_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_78583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTCACCGAAATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316425	1317281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1316400_1317300
844788	contig_1932_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_167340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATAAAGCTGCTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119719	118574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1932_pilon_-_118600_119700
844789	SIRV5	+	253	4	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-1	-89	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGCCGTATCGCGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1137_1985_2034_2119_2157_2270
844790	contig_10765_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_122913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTAATTGTGGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161338	162746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_161300_162700
844791	contig_10140_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_148431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAATGATAACGCGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326812	327340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_326800_327300
844792	contig_6397_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_146253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGCCTGTTACAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453475	453155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_453200_453500
844793	contig_5954_pilon	-	587	5	Intergenic	novelGene_28729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.589899600302	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	15	356	1178000	1170683	FALSE	5	GAGCTGCGTGTGTGCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLKMAAEEPQQQKQEPLGSDSEGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSERLELSVLYKEYAEDDNIYQQKIKDLHKKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSHLEALLDDSKELQR	1178014	1170451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1170687_1171616_1171736_1176032_1176132_1176381_1176444_1177942
844794	contig_1244_pilon	-	1049	7	Intergenic	novelGene_37930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	206.14126763514	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	99	995	349752	344086	FALSE	20	CATCACGCTGCACAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDIKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSPDEPLRSRKVFVGRCTEDMTADELRQFFCQYGEVVDVFIPKPFRAFAFVTFADDQVAQSLCGEDLIIKGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPVHLISNVYGRSTSLKVVL	350840	344031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_344142_345083_345211_345598_345770_347073_347215_347810_347975_349514_349764_350753
844795	contig_9484_pilon	-	1202	3	Intergenic	novelGene_105692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239348	236379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_236601_237466_237573_238473
844796	scaffold_4805_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_161018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	270	590	392426	392746	NA	65	TGAAAAAAAAAAGCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISLPPTHSTIDSSVYLGSLTFTLVTKVKGSPRSRLQWVHLRLDHSQPWVTPEDRFLPLETHSALAFLTQLSWFSSDHWHDPFTFADFSLLYLTDKCWEVRSILF	392156	393465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_392200_393500
844798	contig_6825_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_155112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTTTTTTTTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19279	19938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_19300_19900
844801	contig_9981_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_121028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	476	817	39624	39965	NA	15	TCTTTTCTTCTCTACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGRLELSVSRRPQFLCTWASPQGCLNVLTAWQLAFPRVSYPREQVRSCNVFYDPALEFTHCHFCPILLVTHTSPDSLWEETTQRCEYQELRVTGTILDAGYHSRKPTASVET	39148	40659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_39100_40700
844803	contig_10176_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_72707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_4	84.0011160640143	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	466	1188	248464	254018	FALSE	40	TATATGCAGTAGTGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRIHQIGPGMVQQIQSVCMECQGHGERISPKDRCKSCNGRKIVREKKILEVHIDKGMKDGQKITFHGEGDQEPGLEPGDIIIVLDQKDHAVFTRRGEDLFMCMDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIVITSHPGQIVKHEDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVNFPENGFLSPDKLSLLEKLLPARKEVEETDEMDQVELVDFDPNQERRRHYNGEAYEDDDHHPRGGVQCQTS	247998	254053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_248636_250956_251072_252581_252698_253015_253117_253799
844804	scaffold_880_pilon	+	1114	7	Intergenic	novelGene_121495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_1	181.451018796319	11	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	121	984	539198	547638	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAATTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQTHWRQANEKLDKTKAELDQEALISGNLATEANLIILDMQENIIQATSALDCKDSLLGGVLRVLVNSLSCDQSTTYLTHCFATLRALIAKFGDLLFEEEVEQCADLCQRVLHHCSSSIDVTRSQACATLYLLMRFSFGAVSNFARVKMQVTMSLASLVGKAPDFNEEHLRRSLRTILAYAEEDTAMQTTLFPAQVEELLCNLNSILYDTVKMREFQDDPEMLMDLMYRIAKSYQTSPDLRLTWLQNMAEKHTKRKCYTEAAMCLVHAAALVAEYLSMLEDHSYLPVGSVSFQVRRELSFSFGAMVPKGRQFCHPRGTIGRVWRHF	536013	547768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_536058_539121_539219_541591_541727_542997_543151_544244_544404_546050_546152_547343
844805	contig_13145_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_116660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATTAAAAATAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307089	308692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_307100_308700
844806	contig_383_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_126151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387143	388267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_387100_388300
844807	contig_17158_pilon	-	878	2	Intergenic	novelGene_141153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTCACCCGTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165452	163999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_164452_165026
844808	contig_2646_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_69702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGCTTCCACAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2508293	2509447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2508300_2509400
844811	contig_3862_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_137426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAAGCACACTGCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607548	607268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_607300_607500
844812	contig_16125_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_155296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGGACAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271438	272236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_271400_272200
844813	contig_5779_pilon	-	1142	7	Intergenic	novelGene_106488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_4	221.240442354768	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	20	895	184786	168035	FALSE	30	GTGATTACGGAGCATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYFMGKSRAEIPNWQRSLSLDRSTWDVDSELANKLYERWKKLKNGDVCKRNVLGMTRFSHLKKSKESESFVFFLPRLIAEPGLVLNFSATALRSSVVKYFVVQNPSSLPISLQLLPVSSYPKPEAAMRLLHKWFGTDMQMINFTTGEFQLTQACPYQGVNSEESRFGILHLHLQPLEMRRVGVVFTPADYGKVTSLILIRNNLTVIDMIGVEGFGARELLKVGGRLPGMGGSLRFKVPESTLMDCRRRESIHGEGLALKPRAERSVVLVQIIKPGKRLHIFSLMLLRLEQ	184805	167787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_168309_171097_171226_177330_177404_178739_178850_181059_181202_183540_183659_184755
844814	contig_2684_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_172697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAAAGGGCTGGCGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142367	142814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_142400_142800
844817	contig_7356_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_60396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATTAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437200	438778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_437200_438800
844818	contig_20819_pilon	-	1417	2	Intergenic	novelGene_55693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	0	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCCAGCCGGGAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116078	114537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_114629_114752
844819	contig_5690_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_119754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAACAGCACCTAACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108565	1106813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_1106800_1108600
844820	contig_10494_pilon	+	1803	1	Intergenic	novelGene_102142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGCCAAAAGCTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399165	400968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_399200_401000
844821	contig_6870_pilon	-	1706	4	Intergenic	novelGene_103967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	5.35412613473634	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1587	118	1704	1428000	1420984	FALSE	30	TCCAATAGATTACCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSALFPAPQTALPLSGRRLAGQSTALASLSSDATSEAARMNMEKHNSSLVVELSHPDLVINVGKVTLGEKNRNKLQKAQREQEKMRVMQAVCALLNSGGGVIRMEMANEAEHPVEMGLDLEQSLRKLIQSSDLQAFFETKQQGRYFSIFVKSWSSDLFPEESSIKFRICSLFSSLYSRSGTSVFLMDSREAFDFLKIKKRNAESSSGKEPSSKNTRVIPQGLHKSDPVFLVFQRDRFEYGEILGFPESQYTEFKQFSTKHIHTYVENIIPVYIPAFANTGGGYLFIGVDDKSKRVLGCAKENIDPDYLRKRIEKAIYKFRYFHFCQSSCGINFTLKIFDVFAKGELYGYACVIRVEPFCCAVFSEVPRSWMVKGKHICNLTTEEWVSRMMGAEPELTLLCDDFESQLSLAGGPPLSKPVYSKKGLEHKKDLQQLLFSVPSKHLRYTPEHLWKELSSQHEGLEELIKKEMRPFSRGIFILSRSWAVDLNLKEKQGVICDALLIAQDSPPILYTILREQDAEGHNYSTRTAFTLKQKLVNMGGYTGKVCVMTKILYLNPESAQESLEGPC	1442107	1420981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1421376_1423139_1423269_1426934_1428002_1441991
844822	scaffold_880_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_121508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558566	558916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_558600_558900
844823	contig_5954_pilon	-	741	2	Intergenic	novelGene_28409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	0	235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTCATTTAACTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85996	84972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_85292_85574
844825	contig_19899_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_102538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGCCCTATACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417754	419063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_417800_419100
844827	contig_19402_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_80848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTTAGGCTTGGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162894	163187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_162900_163200
844828	contig_11413_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_103178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444015	445038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_444000_445000
844829	contig_9440_pilon	+	960	3	Intergenic	novelGene_59032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGCATTGGAAAGCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275479	285516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_276254_282014_282164_285479
844831	scaffold_17542_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_139247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAACAAAATGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496155	497123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_496200_497100
844833	contig_20614_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_107562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAGAACCTACAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220007	220870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_220000_220900
844834	contig_10431_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_117409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTAATTCGCTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259134	260522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_259100_260500
844835	contig_8286_pilon	-	2350	4	Intergenic	novelGene_139788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGCCGCGCAGGTAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111330	61799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_61825_98741_98920_105240_105339_109281
844837	contig_1544_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_167932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGCAGTCCTTGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50573	49112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_49100_50600
844838	contig_6576_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_42424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCATAAAGAAAGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299120	1298502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1298500_1299100
844839	contig_10482_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_152820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGAAACCCCTAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102299	100951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_101000_102300
844841	contig_9679_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_173411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGTTGAAGACTACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52184	50579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_50600_52200
844842	contig_8412_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_118379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCTCCTGTAACATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652368	654427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_652400_654400
844843	contig_8122_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_40200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGTAAGTTGGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237433	238738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_237400_238700
844845	contig_6076_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_81758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319597	318218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_318200_319600
844846	contig_15114_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_121170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331130	331888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_331100_331900
844847	contig_6445_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_76996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455467	456255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_455500_456300
844848	contig_4131_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_127851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	49	693	119761	119117	NA	30	TAGGTGAGTGTATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPPPPAASTPPEKAPAGKKAKKPSKAAVAAKKPAGPSVSELIVQVVSISKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKNLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAVSAEAKPSNAKVAAKAKVTGAKKPKKPLGATTKKSVKTPKKTKKPAAVRKSSKSPKKPKVVKVKKVSKSPAKAKAVKPKAAKAKVTKPKTAKPKKAAPKKK	119809	117597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_117600_119800
844849	contig_383_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_126150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	54	431	383094	382717	NA	25	GCCATAGAACTTCCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDLGFSLFSPLSLLPVPQYSSIGMTSKSVYSLDLFPCDSDLQSLLPTGHLQLDIGNSLSVSQRELLLTQLLSWWSEFWRPGSSVRGGKQFPRSQLCSKLTSSSKLSLRGLKFSKETRKKRSCQ	383147	382176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_382200_383100
844850	contig_1037_pilon	-	2344	18	Intergenic	novelGene_84592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	56.7824720749995	11	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2310	35	2344	367378	153436	FALSE	35	GACTTGAGCCCAGCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLKTCGSTASMKVKHVKKLPFTKGHFPKMAECAHFHYENVEFGSIQLSLSEEQNEVTRNGCESKELVYLVQIACQGKSWIVKRSYEDFRVLDKHLHLCIYDRRFSQLSELPRSDALKDSPESVTQMLMAYLARLSAIAGNKINCGPALTWMEIDNKGNHLLVHEESSINTPAVGAAHVIKRYTARAPDELTLEVGDIVSVIDMPPKVLSTWWRGKHGFQVGLFPGHCVELINQKVPQSVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGKISAVIQEGAASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERRRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAVALKGGRAEGTLRSTKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFNGEMLGTRCNSYDNLPRDDEIEEEVGLPHIPVLMSPQSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLEGGASFLDSLGYSKDKPSTSQKDAEGGGSQSQTPGSTASSEPVSPLQEKLSPFFTL	367412	153435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_153888_155886_155959_159037_159184_161268_161465_162061_162208_162482_162591_164244_164328_164782_164928_167770_167874_176041_176192_225060_225143_275470_275549_277300_277424_278491_278585_282834_282973_316864_316952_365906_365992_367355
844851	contig_14665_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_171043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCTTTACCTGGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43685	42121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_42100_43700
844852	contig_4538_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_153069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTGGACAAAATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45052	46665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_45100_46700
844856	contig_11978_pilon	+	467	5	Intergenic	novelGene_63069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4785.56655475608	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	27	386	1827946	1830788	TRUE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHM	1827919	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830790_1831885
844857	contig_15067_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_154325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACGGGATCCCACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88175	86065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_86100_88200
844858	contig_7357_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_36937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTTAGGAGGATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829488	831473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_829500_831500
844859	contig_3956_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_14715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAGAAAAAAGAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216431	217906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_216400_217900
844860	contig_5093_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_135092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598878	597801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_597800_598900
844861	contig_4732_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_75371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATCACTAAAAAGCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195265	195732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_195300_195700
844862	contig_4315_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_46830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGGGTGCTTCCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376267	377209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_376300_377200
844863	contig_7157_pilon	+	2033	4	Intergenic	novelGene_131279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	317.629763508816	28	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	9	524	806224	820419	FALSE	40	TTGGTTTCCCAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMAEAEFKDHSTTMDSEANPGTSSVSTTTSSTTTTTITTSSSRMQQPQISVYSGSDRHAVQVIQQALHRPPSSAAQYLQQMYAAQQQHLMLHTAALQQQHLSSSQLQSLAAVQASLSSGRPSTSPTGSVTQQSSMSQTSVSTLNFFLDLNFLIIFFQRKPLLIFMKLLSYVC	806215	821928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_806238_809724_809891_814471_814628_820239
844865	contig_6556_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_168495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAGAAAGATGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319207	320208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_319200_320200
844866	contig_10437_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_38220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACAAACCCCCTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256853	255522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_255500_256900
844867	contig_3900_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_84217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACTAACTGTTTACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736942	737953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_736900_738000
844868	contig_4580_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_173386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGACCAATTAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151065	150643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_-_150600_151100
844869	contig_4580_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_173385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCAATAGTTTCTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150593	149753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_-_149800_150600
844870	contig_7078_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_130192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACGTGGTGTTGGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950810	951042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_950800_951000
844871	contig_4782_pilon	-	687	4	Intergenic	novelGene_73630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	220.001515146298	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	371	664	278695	275812	FALSE	20	TTTCAGATTTGGATTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAWRLGALLWRGALSCGLRPTVGAGTRPPSGPPLGLAYLAPGPTRGLHGGTRPEERAEGVADEGRRESSAADHTSLKFDIDTLVSLLRQENARDICVIKVPPEVKYTDYFVIGSGTSTRHLHAMAYYIVKMYKYLKCKSDPHVKIEGKDTDDWLCVDFGNMVIHLMLPETRETYELEKLWTLRSYDDQLAQIASDTLPEDFILGLEDHTSSLTPVEFKCE	284075	275788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_276000_277391_277474_278671_278851_283860
844872	contig_5209_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_136428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	52	570	146702	147220	NA	85	AAATCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPGQRRALSLEDLTTAMSSQECFKCGPSGHWTRVCRKRGGARGHRGRGRGRGYPCGSTTLPDICYRCGESGHHAKNCDLLEDICYNCGKGGHIAKDCIEPKREREQCCCYTCGRPGHLARDCDLQKEQKCYCCGEYGHIQKDCTQVKCYRCGETGHVAINCSKTSEINCYRCGESGHLARECPIEATA	146650	147367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5209_pilon_+_146600_147400
844873	contig_3975_pilon	-	1385	2	Intergenic	novelGene_54713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTTTCTTCTTTACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409553	1405273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1406509_1409403
844876	contig_2168_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_147267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCTGTTTTTATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293402	292573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_-_292600_293400
844877	contig_13937_pilon	-	1039	5	Intergenic	novelGene_167346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	116.112822289358	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	386	751	37830	33542	TRUE	45	ATGAAAACACTTGTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYLKITKRLLFQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQH	38215	30854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36183_36299_36824_36951_37711
844880	contig_12871_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_140381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAATGAATAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50533	51092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_50500_51100
844881	contig_18081_pilon	-	821	2	Intergenic	novelGene_23773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCCCGCTTCCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105085	90615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_90852_104500
844883	contig_10904_pilon	-	921	5	Intergenic	novelGene_22795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAACCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849128	845231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_845696_846558_846733_847149_847253_848106_848216_849057
844884	contig_3533_pilon	-	957	4	Intergenic	novelGene_176540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTTGGCTTGAATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740423	558439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_558655_721486_721610_732296_732422_739929
844885	scaffold_16735_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_160363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGGCGGGCAGAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367528	368737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_+_367500_368700
844886	contig_7088_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_159806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTAGAATAGTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743035	743684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_743000_743700
844887	contig_12021_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_172210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTACAAAAAAAAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336376	335297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_335300_336400
844888	contig_5201_pilon	-	1255	5	Intergenic	novelGene_82162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	0.82915619758885	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	16	540	164256	150768	FALSE	30	GCTCGATTAAATTCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRASGMSAAEADRWAWLLVLSFVFACNVLRILLPSFSSFMSRVLQKDAEQESQMRAEIQGMKQELSTVNMMDEFARYARLERKINKMTDKLKTHVKARTAQLAKIKWVISVAFYILQAALMISLIWKYYSVPVAVVPSKWITPLDRLVAFPTRVAGGVGITCWILVCNKVVAIMLHPFS	164271	150052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_150842_152593_152709_154054_154123_154807_154974_164154
844889	contig_10667_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_137323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	512	961	212691	213140	NA	20	CCCTAGTTCCCTGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERETPGSARSLSCRRQAEGKEHSGAGHAPGGLAFGGYLWSSCSTNLLTRLPSFELSPSPSSSTRACSLLGVVLSSPAGFPSSSGLLHFLRPCLVSRPVAWLGQGLVNGSGIPAGVRSLPITLENRLHRALGLRHLRPCWQLIKAGNAR	212179	213297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_212200_213300
844890	contig_14807_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_124736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGATGTTTTACTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218158	216734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_216700_218200
844892	contig_5018_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_47016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGTGGGATGAGGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261146	1261751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1261100_1261800
844893	contig_1575_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_45173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85007	86353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_85000_86400
844894	contig_5696_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_117510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATCAAGGTCTGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335705	335461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_335500_335700
844895	contig_15020_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_87399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83303	84433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_83300_84400
844896	contig_7840_pilon	-	1001	5	Intergenic	novelGene_69045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	615	junction_1	59.0651123760888	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	48	881	427684	393023	FALSE	30	AATTTGGAGATCTTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYGKNPGLTYCLSQKCLTAVFFFLF	427731	392902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609
844900	contig_1406_pilon	+	1228	9	Intergenic	novelGene_25672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_2	149.287474357362	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1128	100	1227	3059942	3074176	FALSE	70	AAAACAATAAATCGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDKNLEITSQQRKLPDWMSVQNKRSAVEERKSSIQKSVFEDELPFLEFTGSIVYSYEASDCSFLSEDIRMSLSDGDVIGFDMEWPPVYSNVKLGRVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENEAIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKSFVELTNVANEKLKCMETWSLNGLVKHLLSKQLLKDKSIRCSNWNNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYRKLEKLGDGVQMLALNKEEKILPSVVKKQLTSISEEMLDLAEHLPDTFRKFENPQRISILLKDISENLYSLRKMIFGSTNTETELRPSSDFNLSLEDPTAGVKEQKETREHKIFAKVKDQTWDIPLDNLIKHDGENILENEVKQQDVFEDGI	3035616	3074177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3035704_3059929_3060038_3061751_3061865_3063583_3063730_3064218_3064368_3065113_3065264_3066842_3066913_3069652_3069768_3073887
844901	contig_4301_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_65143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTGCTCCGCAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686803	687747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_686800_687700
844902	contig_5084_pilon	-	595	6	Intergenic	novelGene_64562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	150.65112014187	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	102	539	580023	537130	FALSE	20	TGGTTTCCACTCACCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFLTPTLSFSFSFLPSFAVASAAAAPRGTPDSGMGSRASTLLRDEELEEIKKETGFSHSQITRLYSRFTSLDKGENGTLSREDFQRIPELAINPLGDRIINAFFPEGEDQVNFRGFMRTLAHFRPIEDNEKSKDVNGPEPLNSRSNKLHFAFRLYDLDKDDKISRDELLQLHVWRTLG	580124	537073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_537157_537729_537792_544656_544785_549014_549096_570213_570287_579956
844906	contig_12520_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_161090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATGTTTCAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609773	609449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_609400_609800
844907	contig_12520_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_161089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGGTCACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609242	608697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_608700_609200
844908	contig_1813_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_105509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAATACACAGGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415700	416534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_415918_416454
844910	contig_5125_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_43490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502596	503276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_502600_503300
844911	contig_9955_pilon	-	715	6	Intergenic	novelGene_21341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	66.1561788497492	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	166	465	107176	91278	TRUE	20	CTTGTTTAAGTGGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDLFSLARHAGGPSGWADLCWGSQVPAGGFSPYADGSLCLWPAGFAWRDHLHYVDGASGLPEPGYHELLPDFPQHGDTQLRHDYESGIWFPDRSVVF	109060	86814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_96119_96204_105378_105495_107088_107227_108945
844913	contig_3679_pilon	-	1289	7	Intergenic	novelGene_112127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	55.0325661161946	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	154	972	1069746	1054257	FALSE	40	TTTATACTTAACATATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDAGASNDCDSSPDAWNKEDFPWSDKVKDVLQNVFKLQKFRSLQLETINVTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSKLKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNTSLIGLTATATSHVLKDAQKILCVDKCFTFTASFHRPNLYYEVQQKPSNTEDFIEDIVKLINRRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHAGAYHANMEPEDKTKVHRKWSANEIQVKYLFSTEA	1070981	1053939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1054436_1055506_1055589_1056364_1056532_1060849_1061049_1065296_1065404_1069661_1069842_1070923
844914	contig_6501_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_150574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267172	265363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_-_265400_267200
844915	contig_8620_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_173880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGTTAGCAGCCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94475	95322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_94500_95300
844917	contig_5684_pilon	-	1193	4	Intergenic	novelGene_81010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	73.8933164922392	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	237	656	317651	315400	FALSE	25	TTATGCATTTCTAATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIGISCLLPASWHFSISPVGCLRILNTNLRQIIVISILAATVSLLYFSVVIIRNKYGRLSRDKKFQRYLARVTDIEATDTNNPNVNYGIVVDCGSSGSRIFVYCWPRHNGNPHDLLDIRQMRDKSRKPVVMKIKPGM	326607	314862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_315614_316151_316350_317643_317745_326464
844919	contig_4857_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_48913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCTAGTAATAGGATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733345	1734303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1733300_1734300
844922	contig_16620_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_155997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12596	13433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_12600_13400
844923	scaffold_6394_pilon	+	260	3	Intergenic	novelGene_111052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10205	junction_2	136.5	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTGTTGAGCATTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443336	444584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_443388_444267_444367_444474
844927	contig_15236_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_141608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588015	587269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_587300_588000
844928	contig_8452_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_48032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAATACCTCACGGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419411	418706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_418700_419400
844930	contig_15354_pilon	+	1139	6	Intergenic	novelGene_65772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	117.673106528212	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	288	647	681665	690579	FALSE	45	CTAAGAAGAAAGAGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEVQDTSGGTTALRPSASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHNLLIIDQHTFEVLHAHQFLQNEYALSLVSCKLGKDPNTYFIVGTAMVYPEEAEPKQGRIVVFQYSDGKLQTVAEKEVKGAVYSMVEFNGKLLASINSTVRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPSSPVWKWDFLELKPAH	680040	691071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_680103_681077_681202_681563_681729_682455_682551_687126_687274_690525
844931	contig_10023_pilon	+	1278	6	Intergenic	novelGene_123458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	12.4482930556763	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	122	982	46607	49530	FALSE	10	TCTATTTTCCTTCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKIALGLGIPASVTVVYILYRRYRESREERLTFVGEDDIEVEMRVPQEAVKLIIGRQGANVKQLRKQTGARIDVDTEDVGDERVLLISGFPVQVCKAKAAIHQILTENAAVSEQLSVPQRSVGRIIGRGGETIRSICKASGAKITCDKESEGTLLLSRLIKISGTQKEVTTAKHLILEKVSEDEELRKRIAHSAETRVPRKQQISVRREDVTEPHGGGDPALWENATCGTEQAVPLVVPPHRGGGDMAAIGLPPEDGSGAKANGDGFEEESAAQASPEMSMFESR	30032	49826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_30092_46544_46692_47359_47467_48077_48268_48979_49120_49191
844932	contig_4812_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_103622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAGAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71042	70687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_70700_71000
844933	contig_3787_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_102456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133072	1134199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_1133100_1134200
844937	contig_11816_pilon	-	717	8	Intergenic	novelGene_98517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	461.671320490309	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	67	489	999123	989430	TRUE	60	AAAAAAAAAAGATTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPTTAAIQNGFYPSPYSIATNRMITQTSITPYIASPVSAYQVAKETRENKYRGSAIKVQSPSWMQPQPYILQHPSAVLTPSMEHTMSLQPASVISPLAQQMSHLSLGSTGTYMPATSAMQGAYLPQYAHMQTTAVPVEASGQQQVAVETSNDHSPYTFQPNK	999313	986066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986288_989422_989505_990796_990878_992054_992166_995414_995466_996352_996401_999066_999161_999284
844938	contig_19769_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_102341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	404	760	188181	188537	NA	25	ATTTTTCAGTGTTAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSWWVPGLAFLQGVFRCVLWGLGTKCVCIFVSVSVFSTFSKCLHMLFFCQECFPCFSLTLSRSVRYLLPTHFFLLSGLLGSCFTTDSACCCKGRSLCDFETEKMGMCHKLLFLQGIV	187777	188966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_187800_189000
844939	contig_3424_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_55591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	251	613	1179200	1178838	NA	20	TGTTCTCTGGCCACATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGEDSARDKAYTVGSKEGPTAPVGAQTPSRSITPTLHSHLISGTLTQRLLSPTHTWGQRHRLPGLMWPPQTSFRRPAGSRVDHATSWEEAVSPAGARGIPEASTSPSLSSWPSCLRPG	1179450	1178541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1178500_1179400
844940	contig_8317_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_20551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCAAAAATCTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16453	16742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16700
844941	contig_11126_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_138150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829022	827270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_827300_829000
844942	contig_9206_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_137486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	79	621	132269	132811	NA	15	TACACTGCGCAGGCGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAQEKHFPRGGIGDGRARDAKRQSQISSTDTGFREKAVTVNGKSKEQHGQTRRRHEVELSGEGGVSESQNQERTGGPRCPPGATLRGEGRDVARDSPGKDLTRSRAGGVQGRVFSRKTTQTAASARPQGRKAGAGTASAQFYTETDADALPAVERPGLVTFHGRTGISAGWEAQVRGL	132190	132931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_132200_132900
844943	contig_4392_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_117300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAAATAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129531	130005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_129500_130000
844944	contig_15120_pilon	-	945	6	Intergenic	novelGene_108009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	47.6655011512519	461	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	112	672	186916	177068	FALSE	15	CGTGCTGCGTGGAATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLKIIWNKTKHDVKFPLDSTGSELKQKIHSITGLPPAMQKVMYKGLVPEDKTLREIKVTSGAKIMVVGSTINDVLAVNTPKDAAQQDSKAEENKKEPLCRQKQHRKVLDKGKPEDVMPSVKGAQERLPTVPLSGMYNKSGGKVRLTFKLEQDQLWIGTKERTEKLPMGSIKNVVSEPIEGHEDYHMMAFQLGPTEASYYWVYWVPTQYVDAIKDTVLGKWQYF	188157	176794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_177179_179800_179884_183807_183914_184065_184132_186721_186931_188060
844945	contig_7022_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_142164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCCCACAGAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342341	343752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_342300_343800
844946	SIRV5	+	298	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	32	875	32	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
844949	contig_8291_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_99970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828846	827564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_827600_828800
844953	contig_12150_pilon	-	712	6	Intergenic	novelGene_6957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	45.1911495759955	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	174	476	65329	27082	FALSE	65	AAAAAAAAAAAATCTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRFSFFLYIFTYGVRFLKKTPWLWDTRHCWYNYPYQPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGAMFLHHLVAIALITFSYVNNMARVGTLILCLHDSSDALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFATVFITMRLGIFPLWTSEKTEAQKS	121442	26845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_27116_36981_37089_42438_42568_65296_65390_74894_74946_121380
844956	contig_16714_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_161561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	472	1416	35	1450	678770	677355	NA	40	GAAAAGCCTGCAAAACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDPRVPKLSKMIENESPSVGLETGGNAEKVVPGGVSKQRKPPIVMTPPTCTDHSPSRKLPEIQHPKFAAKRRWTCSKPKSTSMLREAVMATSDKLMVEPPSAYPITPSSPLYTNTDSLTVITPVKKKRGRPKKQPLLTVETIHEGTSTSPVSPISREFPGTKKRKRRRNLAKLAQLVPGEDKPMSEMKFHKKVGKLGVLDKKTIKTINKMKTLKRKNILNQILSCSSNIALKAKAPPETSPGAAAIESKLGKQINVSKRGTIYIGKKRGRKPRAELPPPSEEPKTAIKHPRPVSSQPDVPAVPSNFQSLVASSPAAMHPLSTQLGGSNGNLSPASTETNFSELKTMPNLQPISALPTKTQKGIHSGTWKLSPPRLMANSPSHLCEIGSLKEITLSPVSESHSEETIPSDSGIGTDNNSTSDQAEKSSESRRRYSFDFCSLDNPEAIPSDTSTKNRHGHRQKHLIVDNFLAHESLKKPKHKRK	678804	677352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_677400_678800
844957	contig_14176_pilon	+	867	5	Intergenic	novelGene_74846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	139.245287173391	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	72	515	246102	264894	FALSE	20	TAAGGTTTTCTTGGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYSSALRTCEIQGWCPTEVDTVKMPVMVEAENFTIFIKNSIRFPLFNFEKGNLLPNLTAADMKTCRFHPDKAPFCPILRVGDVVKFAGQDFAKLASTGGVLGIKIGWVCDLDKAWDQCIPKYTFTRLDGISQKSSISPGYNFRSFAADLPNEYQFPWCKYSTRVNLKLQA	246030	265246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_246104_246453_246532_247689_247832_248399_248537_264809
844958	contig_4626_pilon	+	477	3	Intergenic	novelGene_158824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCGCAGCTCTAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146780	176146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_146908_170999_171145_175941
844959	contig_10063_pilon	+	797	6	Intergenic	novelGene_127738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.761856524935	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	379	795	392944	425679	FALSE	40	TAGAAGAACCCATACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQQQGQDGVKVQQATIAPVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRLRRVACSCPNCREGEGRGSNEPGKKKQHICHIEGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQR	374329	425681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_374497_374594_374685_386464_386520_392877_392951_415985_416215_425498
844960	contig_10057_pilon	-	557	5	Intergenic	novelGene_162341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	23	556	64936	35444	FALSE	75	AGAAGAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVHRTHMSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAK	64958	35442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
844961	contig_5321_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_153875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	204	96	299	56366	56569	NA	15	AGGCACTTCCTCAGGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGNCSSSCWNSLASEQPGTVVGAVCSFEKLVMTEEKITNLLNATDKTSLTTSFPPLPHSLIFAVTLAFVFFARRGSSCSSLKFLYLSFPQFGRGSLQG	56270	57377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_56300_57400
844962	contig_5586_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_143590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATATTACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511253	510761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_510800_511300
844963	contig_11964_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_164725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATAAAATGGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245679	244462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_244500_245700
844964	contig_12740_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_159211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAAAATGTGAGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65053	66251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_65100_66300
844965	contig_14326_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_120759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTGAATGAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596609	596017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_596000_596600
844966	contig_14326_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_120757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGAAGAAAAGTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584403	583836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_583800_584400
844967	contig_10581_pilon	-	864	8	Intergenic	novelGene_41387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_7	65.4706664336427	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	19	660	592288	580968	TRUE	15	TGTTAACTCTGCCTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVAVSRWGAWPVAVRRGPLVPCRRWSGAPADTVYDVVVSGGGLVGAAMACALGYDTHFCDKKILLLEAGPKKVLEKLPETYSNRVSSISPGSATLLSSFGAWDHICNMRHRAFRRMQVWDACSEALIMFDKDNLDDMGYIVENDVIMHALTKQLEAVSDRVTVLYRSSAVGYTWPYPFSMADSSPWVQITLDRCRWSQVRSTAGCWNPEY	592306	580488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_580581_580767_580831_580918_581027_581916_582016_583891_584016_584318_584378_585447_585583_592122
844968	contig_9195_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_155694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCACCATCTGCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755337	756863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_755300_756900
844969	contig_91_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_127090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229203	230668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_229200_230700
844972	contig_7057_pilon	-	790	8	Intergenic	novelGene_123235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.1696074605495	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	11	763	539698	537015	FALSE	20	AGTACGTATTTGCTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRYLGTGLPRAFPRPPAWPLLKPWPLCPPPWTGTVPGPTPPQSSAPSPPPSSPGSGTPR	539708	536987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537166_537495_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539509_539654
844973	contig_7695_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_41679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCCACTCCTCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031936	1033578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1031900_1033600
844975	contig_4519_pilon	-	1474	6	Intergenic	novelGene_123736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	35.3179840874306	1	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTGTCTTTAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810722	761348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761862_762544_762654_763395_763639_768630_768773_802298_802421_810377
844977	contig_9705_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_41751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463742	462192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_462200_463700
844979	contig_14220_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_159845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCCCTCTCTCATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248828	249327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_248800_249300
844980	contig_5423_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_85205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	319	624	301450	301145	NA	45	TTACATGAAAGAAACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKTNNNNQKNNAGRRKCHNCSLYCPYPLNWAPAILLPHLNSLFLTFSLHSGNYTFPLTLQLVNILQPPLPNTQSIWVVSFPSLGYKCIDTGVSFFEFES	301768	301030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_301000_301800
844981	contig_13456_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_153307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAATGTTGATATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542357	542764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_542400_542800
844982	contig_13456_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_153308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTGTTGCGAGGTTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543527	544070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_543500_544100
844983	contig_14618_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_136814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	209	487	590464	590186	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRFHRFQPTYPYLQHEIDLPPTISLSDGEEPPPYQGPCTLQLRDPEQQLELNRESVRAPPNRTIFDSDLMDSSLLGGPCPPSSNSGISATCYGSGGRMEGPPPTYSEVIGHYPGSASFQHHQGNGPPSLLEGSRLHPAHISHLESTAVWSKEKEKQKGHPL	590672	589625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_589600_590700
844984	contig_11417_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_103301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519959	518649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_518600_520000
844985	contig_5999_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_45637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCATCAAAATTGGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194862	194079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_194100_194900
844986	contig_401_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_42808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTACTCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709532	1710054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1709500_1710100
844988	contig_8697_pilon	-	269	3	Intergenic	novelGene_83199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7372	junction_1	851.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGGTGTTTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18503	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436
844989	contig_13831_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_160984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49431	48738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_48700_49400
844990	contig_3380_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_60118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGGAGAAAGGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441837	443351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_441800_443400
844991	contig_20842_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_160980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTTTCTTCCATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175171	174123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_174100_175200
844992	contig_18967_pilon	-	1042	5	Intergenic	novelGene_165333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	10.2469507659596	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	208	552	213330	211633	FALSE	85	AAAAGAAAAAACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTQQSKFVNWQVDGEYRGSDFTAAVTLGNPDVLVGSGILVAHYLQSITPCLALGGELVYHRRPGEEGTVMSLAGKYTLNNWLATVTLGQAGMHATYYHKASEQLQVGVEFEASTRMQDTSVSFGYQLDLPKANLLFKGSVDSNWIVGATLEKKLPPLPLTLALGAFLNHRKNKFQCGFGLTIG	223180	211142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_211773_212826_212930_213045_213123_213305_213429_223071
844993	contig_17198_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_62371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAATTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871557	870587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_870600_871600
844994	contig_8873_pilon	-	1403	11	Intergenic	novelGene_162895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19.8736005796635	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	680	1159	98392	90478	FALSE	25	GGATGACCGGCATGAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVYLIKGETLRSEMSERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMDWKEMYINRDYSKIFTENLVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGQWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQIGLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKILLTWDTLNFVFD	122985	90233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_90520_90840_90988_92171_92277_93268_93335_98272_98415_104115_104242_107794_107900_109563_109670_111263_111390_115840_115943_122893
844995	contig_11317_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_164080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATATTTACTGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105165	104418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_104400_105200
844996	contig_5628_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_157562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAATTAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85895	85478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_85500_85900
844998	contig_13292_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_142974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGTGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535956	536366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_536000_536400
844999	contig_5302_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_81541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCGTTGATATGCTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1619416	1617828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1617800_1619400
845000	contig_13112_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_98836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399217	398884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_398900_399200
845003	contig_10855_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_124365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCTCCTTTCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696120	696972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_696100_697000
845004	contig_4305_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_136659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATACGTGCATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499276	500764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_499300_500800
845005	contig_10009_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_82731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAATGAGCTTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53688	52737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_52700_53700
845006	contig_3584_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_108128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAATTTTACCTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250443	250005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_250000_250400
845007	contig_2332_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_58650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAGCCACATATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254561	255063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_254600_255100
845008	contig_8415_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_141688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176682	175693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_-_175700_176700
845009	contig_19743_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_173166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354707	356015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_+_354700_356000
845010	contig_7119_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_40870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAATTATAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81645	80187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_80200_81600
845013	contig_5880_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_151127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCGAGATAATATAGAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229554	230449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_+_229600_230400
845014	contig_9297_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_69846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700257	700938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_700300_700900
845018	contig_1442_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_172156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATTATTTAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396737	395485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_395500_396700
845021	contig_10437_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_38241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGATATCTAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355089	353929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_353900_355100
845022	contig_8241_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_157478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75745	74907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_74900_75700
845023	contig_12761_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_164055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATATTAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224192	223709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_223700_224200
845026	contig_4388_pilon	-	1023	3	Intergenic	novelGene_161988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	23	198	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	404	790	1311615	1307740	FALSE	15	CATCTTGTAGCTGTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRELNRQLRGVSKEEVIRLKQKRRTLKNRGYAQSCRFKRVQQRHVLESEKNQLLQQVDHLKQEISRLMRERDAYKEKYEKLVSSGFRENGSSSDNPSSPEFFITRRQCTYPPQADLPFCASSDNGS	1313217	1307506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1307813_1311301_1311684_1312882
845027	contig_5727_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_7976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCACAGTAAAATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222712	221188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_221200_222700
845028	contig_11052_pilon	+	678	3	Intergenic	novelGene_115449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2262.5	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	112	450	102902	107557	FALSE	25	GTAACATCAGCTACTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQR	102790	107785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106446_107551
845029	contig_14516_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_153920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATCCAAAGATAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243031	244274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_243000_244300
845030	contig_7275_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_111257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGGACCTTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429521	430382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_429500_430400
845031	contig_753_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_113026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTTACTTCTTTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389320	1388846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1388800_1389300
845032	contig_6056_pilon	+	1079	3	Intergenic	novelGene_157882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_2	20	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGGTGCTGTTATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267091	288055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_267124_281057_281162_287112
845033	contig_20742_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_150663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTAGCTCCTGTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150673	150344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_150300_150700
845034	contig_10045_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_163757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGCTACTCTAATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29399	27747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10045_pilon_-_27700_29400
845036	contig_2596_pilon	-	992	7	Intergenic	novelGene_53438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	3.13138237134266	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	70	813	14654	11969	FALSE	5	GTCCAGCTGCTGCTCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAWILLPVSLSAFSITGIWTVYAMAVMNRHVCPVENWSYNESCSPDPTEQGGPKICCTLDDVPLISKCGTYPPESCLFSLIGNVGAFMVALICLLRYGQLLERSRHSWVNTTALITGCTNAAGLVVVGNFQVDHAKSLHYIGAGVAFPAGLLFVCLHCALSYHGATVPLDLAVAHLRSVLAVIAFVFLVLSGVFFVHENSQLQHGAALCEWVFVIDILVFYGTFSYEFGAVSSETLVAALQPAPGRACKSSGSSSTSTHLSCAPESIAMI	15195	11789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_12211_12655_12834_13045_13174_13538_13607_14181_14269_14613_14662_15133
845037	contig_2596_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_53437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAATTCTAATTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11688	11454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_11500_11700
845038	contig_7894_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_170794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAACACTGTCGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242348	243932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_242300_243900
845039	contig_6233_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_74827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446004	447198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_446000_447200
845040	contig_11538_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_152285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTATTCATTAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138134	137101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_137100_138100
845041	SIRV6	+	296	3	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	19	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10721_10819_11031
845042	contig_17518_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_117361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAAAAATCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116032	120125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_+_116700_119453
845044	contig_7935_pilon	+	626	7	Intergenic	novelGene_171798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	3.947573094109	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	171	456	626	24755	25219	FALSE	15	GTAGGCATTGCTTTAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPCLPEWGQGDLSARVRVQLFCPPEPSPREADCHQVQNLGCYVVTGLIISALLPAVAHGGNYFLSLSQVITNNASCTVQNLTEPPGAPVHPEELQHTSRLNESNTQCQVVRCHLGQLAKGTEVSVGLLRLVHNEFFQRAKFKSLTVVSTFEMGTEEGSVLQLTEASRWSKSLLEVIQTHLVFISLWILIGSILGGLLLLALLVFCLWK	21593	25219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_+_21624_21772_21850_22742_22857_23114_23196_23348_23463_24715_24812_25105
845047	contig_6048_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_73318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTCCCTGAGTCTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2106965	2107232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2107000_2107200
845048	contig_6048_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_73319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCATTCAAAAGGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2107179	2108089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2107200_2108100
845049	contig_11898_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_144296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGTCGAGTTTAGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252543	253245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_252500_253200
845050	contig_8538_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_4904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTGTTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842783	843129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
845051	contig_11507_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_103349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATGGGGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20651	21656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_20700_21700
845053	contig_9482_pilon	+	2174	13	Intergenic	novelGene_44268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.31003351366192	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	82	1185	773923	793829	TRUE	15	TCCAGAATTTTTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAVGDLKQALPCVAESPTVHVEVRQRSSSTAKKEDIKLSVRNLLNRHNIVFGDYTWTEFDEPFLTRNVQSVSIVDTELKAKGSQPIDLSTCTVALHIFQLNEDGPSSENLEEETENIIAANHWVLPAVEFHGLWDSLVYDVEVKSQLLDYVLTTLLFSEKNVNSNLITWNRVVLLHGPPGTGKTSLCKALAQKLTIRLSNRYQYGQLIEINSHSLFSKWFSESGKLVTKMFQKIQDFIDDKDALVFVLIDEVESLTAARNACRAGTEPSDAIRVVNAVLTQIDQIKRHSNVVILTTSNITERIDVAFVDRADIKQYIGPPVSGCHLQDLPLVLGGAHEVSDHLPSPAAADPAGAGDDRLHREQRV	773841	796617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_774015_775545_775712_779879_780010_780675_780732_781733_781825_784686_784760_787534_787599_788388_788476_789042_789150_792108_792264_793746_793860_795235_795306_795728
845054	contig_17829_pilon	+	836	2	Intergenic	novelGene_157027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	33	506	17405	22453	FALSE	40	TGATATGCTAAGAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMYQVKPYHGGGAPLHVDLPTCMYRLPNVHGRSGCPAPGAGHVQGESDLSLQALESRQDDILKCLYELKAAVDGLSKMIQTPDADLDVTNIIRAEPTALKTSALDLNSVLGKVSSCVSVIKLLLMLENCASVIKALDFLVFKGGVFKGMGCLCFSK	17372	22783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_17540_22114
845056	contig_7230_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_52532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60850	60258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_60300_60800
845057	contig_5967_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_44420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGCCCAGCATCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477300	476508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_476500_477300
845058	contig_14275_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_162873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	420471	420875	NA	45	ATAAAATCTTGCTTAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYFQILICVKFIFKIGLSHVGISSSASGRSPLSSLRDQQHTYRLRTHQLGHHLYSHPPASAGGKAETHGIHSTQKVWLRISLPSELVQKIFPGQGQILKARKFISLRTGSGLGFSQQVYWNFKEYTHSVHQVEL	420468	421103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_420500_421100
845061	contig_8954_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_130286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157051	158041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_157100_158000
845062	contig_15457_pilon	-	1203	5	Intergenic	novelGene_168453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	9.06917857360853	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	519	1154	18771	16330	FALSE	80	AAAAAGAAACAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTAMNVHSSRPDVKSSQNWRFSTRANAKVKTCRDVYCPGSSTCVVDQTNNAYCVTCNRICPEPTSSEQYLCGNDGVTYSSACHLRKATCLLGRSIGLAYEGKCIKAKSCEDIQCTGGKKCLWDFKVGRGRCSLCDELCPESKSDEPVCASDNATYASECAMQEAACSSGVLLEVKHSGSCNSISEDTEEEEEDEDQDYSFPISSILEW	19729	16280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15457_pilon_-_16413_17146_17378_18095_18321_18674_18898_19337
845063	contig_1594_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_138801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCGCTGACCACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344131	343281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_343300_344100
845064	contig_19352_pilon	-	340	4	Intergenic	novelGene_122342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	3.55902608401044	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	264	75	338	66013	64014	FALSE	35	TTGTGACTCACTGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGKERGELVERLINEVSSDFENSMKRYLVRSVLVKPPVQWLEDEGGPLPESPLGLDYSNPWHSSYVQARNQILSNLHIVHPTMKMLLELGYTTFANTVLLDFTGIRAKGPI	66087	64011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_64030_64255_64415_65256_65330_65997
845066	contig_6576_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_42389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	669	17	685	1288431	1289099	NA	50	ATGCAAAGTAGCAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLAWLMTTVFFLSPGTKANYAHLWANNTIWDPVIQNKTGKNQDENINTNPITPEVNYKGNSTSKPEIATSSHIISLTPKSEQIYTLSVLRNSSPPVQNTENTSKSHSEILKKDVCDENNNKTAMLICFIIIAVLFLVCTLLFLSTVILANKVSSLRRSKQAGKRQPRSNGDFLASSGLWPAESDTWKRAKQLTGPNLMMQSTGALTATRERKDEEGTETLTNRCFNEE	1288414	1289101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1288400_1289100
845067	contig_6664_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_176071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTTGACAATAAATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33760	34667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_+_33800_34700
845068	contig_11396_pilon	+	871	7	Intergenic	novelGene_71435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	593.824048014224	1	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	313	825	1786255	1789745	FALSE	15	GGGTGTCCTCAACGATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782236	1789791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782416_1786121_1786259_1787252_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
845069	contig_5936_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_53595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTGTATTAAAGCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508777	509168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_508800_509200
845070	contig_6914_pilon	-	1311	7	Intergenic	novelGene_151764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.1038297722415	152	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	130	693	400568	398613	FALSE	20	TTGGAGGATGGGGAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPGQWRDTPGSLSWGKTCGAQKRLPSLILSDPLPSACAQHNGRPYCHKPCYGALFGPRGVNIGGVGSYVYSPPTSMPASSTPLSPSSFSPPRRRTGLPQGKKSPPHMKTFTGETSLCPGCGEPVYFAEKVMSLGRNWHRPCLRCQRCRKTLTAGSHAEHDGVPYCHIPCYGYLFGPKGGQPHPRH	401037	397994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_398697_398797_398893_399014_399087_399881_400014_400110_400284_400560_400656_400995
845072	contig_15518_pilon	+	955	4	Intergenic	novelGene_127616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	340	558	15096	37386	TRUE	5	TTATTCTCCTCTCCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11291	38430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
845073	contig_12164_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_177496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAACCTCTCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130342	130915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12164_pilon_+_130300_130900
845076	contig_10855_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_124300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	229	444	295782	295997	NA	20	ACGTTGACTCCTCAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVYKPALCKWDLISHPADLPVKVLLPAICSAVSASALETHPGRGWGLFCHPPPPGLAHCPRRGFLAQGWDSGKGFRMCLLGGRLGGILALAGVFWERLGYSGSGFSRMRAWVVGEGADKIRPRTVAAVTQPSTQLAGVGRRSLGGLG	295553	296064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_295600_296100
845078	contig_2113_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_161146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGCGTACGCATTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228118	228462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_228100_228500
845079	contig_7359_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_139848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCACAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30727	31537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_30700_31500
845082	contig_14924_pilon	+	1019	5	Intergenic	novelGene_104144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.49305018890286	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCAGTCAGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40934	43478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_41070_41205_41325_41520_41658_42535_42655_42969
845083	contig_3469_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_34209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTAACACAGTTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542473	541622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_541600_542500
845085	contig_12179_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_128000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTAAAATATGTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506980	508243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_507000_508200
845086	contig_10042_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_79116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAGAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36365	36739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_36400_36700
845087	contig_8898_pilon	-	758	5	Intergenic	novelGene_137239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41.1665823211012	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	168	641	286566	281993	FALSE	5	CAGCTTTGCTTTCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAALEVTARYCGQELERYGQCVAAKPESWQRDCHHLKMSIARCTSSHPIIRQIRQVCAEPFLAFEECLRQNEAAVGNCTEYVRRFLQCAEQVQPPRSPTTVEPVPPSSTRIPAPALFLASLTPLLSSHSGQSRHSRFLPPEDSWLQESWTRVTDHT	286733	281875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_282066_284850_284943_285082_285249_285321_285463_286564
845088	contig_8000_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_177500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCCATAGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159289	157784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8000_pilon_-_157800_159300
845089	contig_10640_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_175156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAAATGTAAACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20291	19918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_-_19900_20300
845090	SIRV6	+	334	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	4	39	4	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
845093	contig_18184_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_123891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGGAAAGGTGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678373	679158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_678400_679200
845094	contig_13702_pilon	+	902	6	Intergenic	novelGene_102617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	98.5381144532409	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	361	804	204115	206103	FALSE	35	ATGCACTCTAACAATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLLSTFEGKEWILFTIGATQVPALFFWSFNGLLLVVDTTGKPNFISRYRIQIGKNEPVDPVRLQQSIRTVLFNQYVVSLPITAFLYPFLKWWGDPCRRELPTFHWFLLELTIFTLIEEVMFYYSHRLLHYPAFYKKIHKKHHEWTAPIGVIALYAHPIEHVASNMLPAMLGPLLMGSHLSSITMWISLVLIITTISHCGYHLPFLPSPEFHDYHHLTFTQCYGVLGVLDHLHGTDTVFKQSKAYKRHVLLLGFTPLSQSIPDSPKE	196292	206201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_196345_199877_200000_203928_204135_204579_204686_205048_205216_205952
845095	contig_7189_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_117652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGCGAACCCAGAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483362	484879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_483400_484900
845097	contig_3068_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_137661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTATTACAATTTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424138	425402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_424100_425400
845099	contig_6557_pilon	+	1309	2	Intergenic	novelGene_33015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAAAATAATCCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597866	599595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_598162_598581
845100	contig_9216_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_163501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	937	1239	466547	466849	NA	30	CCGCGAATTGGCATGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLILDANYKQKPFMKTAGSSHLAAWFPASSRSYRKNPNLLTAPRMWQRPGCLPDGMNSSTRSGKFERQYVGVSNGKEIAPFISSHQSASQINMRCCIL	465610	466872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_465600_466900
845101	contig_16068_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_177503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTAAACTACCAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376530	377388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16068_pilon_+_376500_377400
845103	contig_6446_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_149172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCCATCAGGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119130	118744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_118700_119100
845104	contig_1339_pilon	+	277	4	Intergenic	novelGene_163137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4815	junction_1	2683.83759237071	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCATTAACAAGAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430922	433711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433677
845105	contig_5982_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_169155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCAGGAAACCACGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39798	40615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5982_pilon_+_39800_40600
845108	contig_13894_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_62080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTTCTGAGGCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427704	427244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_427200_427700
845110	contig_12638_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_33315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGCCGTGCTGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298651	1298306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298300_1298700
845111	contig_15031_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_138408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCATTTAATAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99783	99293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_99300_99800
845113	contig_7234_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_145955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516443	517955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_516400_518000
845114	contig_960_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_108220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313480	314415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_313500_314400
845117	contig_3077_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_26838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560288	559648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_559600_560300
845118	contig_17989_pilon	-	1791	1	Intergenic	novelGene_150819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAGTACCAGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209599	207808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_207800_209600
845119	contig_9931_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_134837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCATGTGGCAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341677	342587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_341700_342600
845120	contig_1154_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_87103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTATAATCCACATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368221	369243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_368200_369200
845121	contig_8677_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_174035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGCCTTACACCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138254	138714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_+_138300_138700
845122	scaffold_8345_pilon	-	1238	10	Intergenic	novelGene_107037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3.24703093248943	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	208	855	906770	882849	FALSE	10	GTGACACTGCTGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGAPEAKGAELLSQWAWKAELKPRTEGPPLRIWRVWSIPRVWGAGPLCKLSQRTEGISQAVFIGHDWGGMLVWYLALCYPERVRAVASLNTPFRPMNPEVTLMETIKANPLFDYQLYFQKPGVAEAELEKNLTRTFKCLFRRGDESLIALNKVSEMGGILVQFPDEPSLSTMITEEEIQFYVEQFKKSGFRGPLNWYRNMDRNWCWGCKSVGRKILIPALMLTAEKDFVLLPEMSKHMEDWIPHLKRGHIKDCGHWTQMDRPTELNQILIEWLETDARDPPMVS	909219	882465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_882922_883107_883167_885179_885261_886857_886928_888539_888643_891367_891402_893639_893712_903830_903943_906726_906813_909054
845123	contig_11838_pilon	-	431	4	Intergenic	novelGene_177507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTCCTCTTCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323478	306511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11838_pilon_-_306632_318982_319037_321674_321907_323453
845124	contig_11838_pilon	-	1457	5	Intergenic	novelGene_177505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAATTCTTTGGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277546	33561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11838_pilon_-_34637_231339_231473_238695_238817_256037_256143_277523
845126	contig_10331_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_54165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGCTGAAAGTGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513328	514565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_513300_514600
845127	contig_20890_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_147036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCTATGGGGGATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15959	16705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_16000_16700
845128	contig_11126_pilon	+	432	3	Intergenic	novelGene_138142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_2	40.5	1694	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	29	358	734342	746917	FALSE	20	GGAGGCCAATGTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQLLLQQGRAGALKTGLQAGALRGLASTVPLSAESGKSGKGLPPNPKKQSKPKQTEQAAAPAGPSDITTYKNLQHHDYNAYTFLDLNLELSKFRMPQPSSGRESPRH	734313	746991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_734390_735748_735867_746753
845130	contig_9578_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_67994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	614	940	1219741	1220067	NA	65	AACAAACCAAAAAGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKEERSSAKAVTDTSARMGMCSVITVAPTMFVLSYGGVFWTRYGHGAALSNVLAVKNCYVQEQHSLAVSASPAPRTIKAEPGVPGQLGAVGSCCLFLTRKSQSDERYH	1219127	1220069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1219100_1220100
845131	contig_12050_pilon	+	852	5	Intergenic	novelGene_62643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	214.666456392237	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	270	743	359783	363859	FALSE	5	TGGAGCCCTCTGTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTRMFAPALPADLLVNVYINLNKLCLTVYHWAGSLLPFPAELHPPPRQQQDGEGSRTPPPATGQGCGGPNKL	359513	363968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362084_362184_362571_362655_363729
845132	contig_19848_pilon	-	1455	3	Intergenic	novelGene_173823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTTTGTGACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121104	116875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_117364_117627_117730_120239
845134	contig_18414_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_170018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGGTGGACAGAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122453	122041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_122000_122500
845136	contig_4802_pilon	+	814	4	Intergenic	novelGene_172215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	57.412735714493	197	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	142	591	201746	231450	FALSE	20	GTCATTCTTGTCCTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKQATSPFACAADGEEAMTRDLTSREKEEGSDQHVASHLPLHPVMHNKPHSEELPTLVTTIQQDADWDSVLSSQQRMESESNKLCSLYSFRNTSTSPHKPDEGSRDREIMTSVTFGTPERRKGSLADVVDTLKQKKLEEMTRTEQEG	157746	231673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_+_157884_201741_201983_226326_226535_231445
845137	contig_5918_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_99603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCGACTCAGTGGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2090903	2090065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2090100_2090900
845138	contig_11413_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_103225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGTGTCTGACTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861366	853851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_854107_861258
845139	contig_9900_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_159506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGTATTTTTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121375	123372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_121400_123400
845140	contig_4426_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_15406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATAATTTAACTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813929	812848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_812800_813900
845141	contig_4350_pilon	-	1598	2	Intergenic	novelGene_136391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	75	926	310091	309008	FALSE	35	CCACTGTAGGCACTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCGAVDATEPLWPDPLGVEHFLREMGQFYEAESCLVEAGKLPVGQRRFAHFPGLALELLLRGLPLELVDGGSLSVPLRWVTGLLKELHTRLERRSRLVVLSVLGVPGTGKSTLLNTMFGLRFATGKSSSPRGAFMQLVEVAEGFSQDLGCDHILVIDSGGWIGGALTTTGERFELEASLATLIMGLSNVTVVSLAETRDVPLALLHAFLRLETTGHAPSYQFVYQNLHGTSAPNPQLRDGRQCPEPLSDGGLAVACGETRGDGVRTLADVAFGDPEKQHVWHIPGLGHPRAVMPSPGPRPVEVVSGA	310165	308335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_309075_309306
845142	contig_5758_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_119049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATTAACGGAAAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27861	26995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_27000_27900
845143	contig_4336_pilon	+	1981	1	Intergenic	novelGene_152376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACCACTCAGGCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446229	448210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_446200_448200
845144	contig_17274_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_26493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTCTGTCCATCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55305	55986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_55300_56000
845145	contig_15049_pilon	+	717	4	Intergenic	novelGene_160719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	44.8131925020102	553	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	237	557	224060	226557	FALSE	15	TGTCTTGAGGCCTGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVIEHQLDELLEGLERMPPSKIEQAAKAKEKERCMRLREEKVMIQKQLQEERLQRAQARAQAEIKKKKGRKLVCRSQPPILKTKMAPSHALMDKDKEEQLFFFT	223525	226717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_223669_223966_224173_225307_225402_226443
845146	contig_13806_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_173664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTTCCTTGCCTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125150	124551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_124600_125200
845147	contig_2888_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_151485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTTCTTGTGAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25172	25578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_25200_25600
845148	contig_12079_pilon	-	1012	2	Intergenic	novelGene_67361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190317	189251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_190025_190078
845149	contig_9785_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_157903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAAAAAAAAAACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508022	508860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_508000_508900
845150	contig_10064_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_122719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAGAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304329	305598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_304300_305600
845153	contig_3960_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_138036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604753	605604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_604800_605600
845155	contig_14034_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_72630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATTTTTGGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138626	137008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_137000_138600
845157	contig_9739_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_165090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAATATTGTAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187159	186251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_186300_187200
845158	contig_7416_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_134343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	755	1135	920834	920454	NA	45	GGGAAACACAGGAGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKRSAALTHQPLCGRKIWQSVPIKITALETLWGSSSLSYRVTMSQNPHYSNFFFFFFFKYWHQRLNQKECLAIPCNLSSSPLPFHFIFPKKQHSKTHNLATHTQYFNLEEVLYTLKLEKLKITK	921588	920295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_920300_921600
845159	contig_5258_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_100248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240325	241252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_240300_241300
845161	contig_7378_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_120280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGCAGCGTTCTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569764	569162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_569200_569800
845162	contig_7378_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_120279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGAGATTACCACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568673	567992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_568000_568700
845163	contig_13865_pilon	+	281	4	Intergenic	novelGene_122739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	91.9649691760703	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACACCTTTTGCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6401	11813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_6489_7289_7382_8660_8730_11780
845166	contig_12019_pilon	+	1943	1	Intergenic	novelGene_87762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAAGATGTTCCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662067	664010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_662100_664000
845168	contig_11602_pilon	+	308	2	Intergenic	novelGene_166581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGCACGTCCATGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44851	165209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_45021_165070
845169	contig_12010_pilon	+	1238	9	Intergenic	novelGene_160938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	40.1277257641148	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	292	1101	93514	155459	TRUE	55	AGTTATTAAAAATTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPLPLTPRPASAALLVSPPPAPQKEQPGPLIPGPGRTCLLATSGEGAPGGAPEIHRGRPLTLLSRPRSLGAPGRPPTPLPPRPSASEEQPARPPGKMARWSRHRLLLLLLRYLVVALGYHKVYGVSAPKDQVVTAIEYQEALLACKYPKKTLSSRLEWKKVGRSVSFVYYQQALQGDFKDRAEMIDFSIRIKNVTRSDAGQYRCEVSAPTEQGQNLEEDMVTLEVLVAPAVPSCEVPSSALRGTVVELRCQDKEGNPAPEYTWFKDGVRLLGNSKLGSQSTNSSYTVNSKSGTLQFNTISQLDSGEYSCEARNSVGYRRCPGKRMQVDDLNIGGIIAAVVVVALVISICGLGVCYAQRKGYFSSK	93222	167253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_93581_127865_127929_143314_143423_145199_145353_148152_148356_151397_151498_155343_155471_160025_160069_167170
845171	contig_6533_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_114661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTCTGGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275448	275042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_275000_275400
845172	contig_6175_pilon	+	1052	7	Intergenic	novelGene_16289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_2	19.0087699058443	353	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	17	646	1389917	1403413	FALSE	20	TTTTTAAAAGCTGGGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGCGKMAAAIAASALTVTFGRLASACSRSILRASAPGAAPLWSAVQRLRSQSTSPPQGYVPKTSLSSPPWPEIVLPDPVEETKHHAEVVGKVNELIATGQYGRLFAVVHFAGHQWKVTSEDLILIENELDAACGERIRLEKVLLVGSDNFTLLGKPLLGKDLVRVEATVVEKTESWPKVNMKFKRRKNYRRKRIIVTPQTVLRINTVEIAPCLL	1389900	1403819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154_1396213_1397764_1397851_1399127_1399292_1400927_1400981_1401374_1401479_1403348
845173	contig_21386_pilon	+	262	2	Intergenic	novelGene_177023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1360	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGCCTTGAAAGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23839	48921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_+_23985_48804
845174	contig_9481_pilon	-	956	9	Intergenic	novelGene_149674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	135	junction_4	78.4154600509364	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481948	398571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_398837_425709_425751_426403_426516_429921_430034_434999_435096_444006_444137_454514_454595_477024_477091_481894
845176	contig_14034_pilon	+	767	2	Intergenic	novelGene_72640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156998	157881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_157357_157472
845177	contig_1699_pilon	-	1292	2	Intergenic	novelGene_72806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGGGGGAGGGGCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32337	30862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_30926_31108
845178	contig_9188_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_175728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTCAGTGACGTGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19827	18783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_-_18800_19800
845180	contig_3465_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_173401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTCCACCGGCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800815	799210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_799200_800800
845181	contig_11978_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_62832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAAGGGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463543	462494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_462500_463500
845182	contig_7914_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_165018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74785	74354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_74400_74800
845183	contig_5047_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_157990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAGTGTGCCGCAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930136	931337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_930100_931300
845184	contig_3523_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_171488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCGGAAGTTGATCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306496	304588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_304600_306500
845185	contig_12250_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_80570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTTTCTTTTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311621	311206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_311200_311600
845186	contig_4884_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_63771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTGAGGCAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3563	4800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_3600_4800
845187	contig_6589_pilon	+	357	4	Intergenic	novelGene_26169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8966	junction_1	3715.87576039171	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	216	140	355	1886667	1887805	FALSE	30	GAAGCAGTTTCAGAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGT	1886012	1887807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
845188	contig_7521_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_160540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACTGGAAGCCAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217276	219023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_217300_219000
845189	contig_15067_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_154339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACCAAGTAGAGCGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134309	132264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_132300_134300
845191	contig_5910_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_168430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183504	184206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_183500_184200
845193	contig_5057_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_151521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTGAAGAAATTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507806	507044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507000_507800
845195	contig_7165_pilon	+	1164	3	Intergenic	novelGene_116899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	9	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAGAAAAAAATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096502	1101423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1096543_1097904_1098110_1100504
845196	contig_16259_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_174365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATATATATATGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12807	10696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_-_10700_12800
845197	contig_9646_pilon	+	1109	2	Intergenic	novelGene_117432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGCCATAAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172036	173215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_172527_172596
845198	contig_5018_pilon	+	1283	3	Intergenic	novelGene_46929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	104	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	119	1030	195328	207987	FALSE	90	AAAAAAGACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVCPGTLQKVLEPTSTHESEHQSGAWCKDPLQAGDRIYVMPWIPYRTDTLTEYASWEDYVAARHTTTYRLPNRVDGTGFVVYDGAVFYNKERTRNIVKYDLRTRIKSGETVINTANYHDTSPYRWGGKTDIDLAVDENGLWVIYATEGNNGRLVVSQLNPYTLRFEGTWETGYDKRSASNAFMVCGVLYVLRSVYVDDDSEAAGNRVDYAFNTNANREEPVSLAFPNPYQFVSSVDYNPRDNQLYVWNNYFVVRYSLEFGPPDPSAGPATSLPLSTTTTARPTPLTSTASPAATTPLRRAPLTTHPVGAINLAGGLKVELSPKLLPLALHPCLPGKPAPSLP	195209	208240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_196010_196876_197012_207892
845201	contig_8885_pilon	-	724	6	Intergenic	novelGene_115567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.586157515486	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	70	459	75477	49174	TRUE	35	GCTCATTAGAAAACTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLRELRRPGAAFQGATGGLREVLPVGGEVQLPQ	75546	45845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_45935_47150_47248_49094_49264_58183_58308_63031_63130_75399
845202	contig_10437_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_38438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGGAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862844	863527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_862800_863500
845203	contig_10163_pilon	+	1376	7	Intergenic	novelGene_82612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	48.7661654109577	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	182	1207	11226	24845	FALSE	40	AGAAAATGCAGGATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENMKLATVEDTVEYCLFLIPNEPRNPEKHKEILLKYIERIMTHFAPILVPYIWQNQPFNLKYKPEKGDVPAHMFGMTKFGDNIEDEWFIVYVMKQITEEFPELVARIEDNDGEFLLIEAADFLPKWLDPDNSTNRVFFHHGELCIIPAPRKPRAISWLPTTTPTIPQALNIISTHPEKILASESIRAAVNRRIREYPEKIQASLHRAHCFLPAGIAVVLKQRPRLVAAAVQAFYLRDPFDLRACRVFKTFLPDTRIMTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLVMLNQKFYFLLCVKVLLSNQWHSVESLGICPVYMRLS	6696	25014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6865_11212_11431_13892_14011_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602
845205	contig_7057_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_123283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	48	404	798463	798819	NA	5	CTTCCCTGCTGGTGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPSRLQRQVLSLYRELLRAGRGKPGAEARVRAEFRQHACLPRSDVLRIEYLYRRGRRQLQLLRLGHATALGAFVRLRGPPGEPGGVGAPGSLPDDGDGPRSHLEGARAPETPPSGR	798415	799473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_798400_799500
845206	contig_16714_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_161565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAGCTCTGCGTATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717408	718015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_717400_718000
845207	contig_11525_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_171088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63811	63525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_63500_63800
845209	contig_16098_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_46193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTATACTTTAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691836	692745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_691800_692700
845210	contig_4364_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_3320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533033	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
845212	contig_8907_pilon	-	270	3	Intergenic	novelGene_85821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6862	junction_2	2060	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAGATAATTATGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179874	178611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_178695_179391_179544_179839
845213	contig_7229_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_39844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACAGCCCCTTCCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122150	1122821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1122200_1122800
845216	contig_8064_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_164554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTCAAACCTAGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35602	35900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_+_35600_35900
845219	contig_960_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_108257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCTCTTGGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596592	595440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_595400_596600
845220	contig_1863_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_156535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	665	1030	79454	79089	NA	65	TCAGCTAAGAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTWFSIPDSLEVNGNKLRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSENSNEFEWEGKCVTVFTWFLLMSVCLYTRTRFLKWRSHIRKIGKTLNLIMRPAKIIVLRDFV	80118	78865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_78900_80100
845221	contig_13800_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_153725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATTCAGAAAGTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102998	103842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_103000_103800
845224	contig_4364_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	126	587	1497933	1498394	NA	45	TGGCAGAGAATACGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPPALQVALTDLCPAGPIQAMEIQVESASLADVCRTHHAVIGRIQVGGVRWASRWQLPCSGAGDPCPAPLCFHTHLSGAELQAGGPAAAPQPADTCLPCRGTRGCKGQVSLGGGFTPFHDQWLVSVPSLASWRSCPESGPAAGPGTWHPWL	1497807	1498939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1497800_1498900
845227	contig_13292_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_142964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACAAACAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400992	401766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_401000_401800
845229	contig_12120_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_21420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCATTTTTGCTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66715	68033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_66700_68000
845231	contig_8864_pilon	-	1666	13	Intergenic	novelGene_135984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	28.0816023205388	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1572	93	1664	190817	129950	FALSE	25	GTATGTCAAGTTGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTSSTSSTASTKQRRRQPKEQDEIRRAKDMGLVNKENIPSKFSDLDDCILNAQEVEKVHENCSGYGGERSKPKRQKSSTKLSELSENQDGLVNMESLNSARSHERTGPDGIELMTNESKENEEDCGHAQHAESSTMKIQEHPSIPDAKLQRSQDADDQQESFVPEVPQLDLAALCDGKSWEEPVPTFSTWQRESINSDEARLSPQAGRLIRQLLDEDSDPLLSPRFYAYGQSRQYLDDTEVPPSPPNSHSFMRRRSSSLGSYDDEQEDLTPAQLTRRIQSLKKKIRKFEDRFEEERKYRPSHSDKAANPEVLKWTNDLAKFRKQLKESKLKISEEDLTPRMRQRSNTLPKSFGSQLEKEDEKKQELVDKAIKPSVEATLESIQRKLQEKRAESSRPEDIKDMTKDQIANEKVALQKALLYYESIHGRPVTKNERQVMKPLYDRYRLVKQILSRANTIPIIGSPSSKRRSPLLQPIIEGETASFFKEIKEEEEGSEDDTNTKLDFTVTLKTDFSARSFLDQLEDDADGFISPMDDMMPSKCSQDTGLSNLHAAS	190909	129947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_130145_136023_136108_137851_137948_145581_145666_146305_146527_147385_147468_148398_148538_149075_149290_156779_156928_167857_167901_168264_168342_182504_182692_190815
845233	contig_3601_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_132965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGTCCCCGGGAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128980	1130153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1129000_1130200
845235	contig_15777_pilon	+	249	2	Intergenic	novelGene_75756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATGCTAAATGGCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261919	272719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_261980_272530
845237	contig_253_pilon	+	672	3	Intergenic	novelGene_129719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74	58	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	87	671	552099	554095	FALSE	15	TCCATCCCAAGGTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQWGARELTSLSTLPGLEVGAQHQDSRPMALPCALGLGTLLALPGALGSGGSTKDGSDSSVTIVLLLLLLLLLATGLALAWRRLSRDSGGYYHPARLGAMLWGRTRRLLWASPAGRWLRARRGAAPRPCSATYTPLLAAQPGMTALEQPGARAPTSPHCSDQPQSPSHPYSLCLCFPSCHSWTCPALDPSTTPCKDCNSPTCSRPCRPIHRNREQPLEIKLSS	552012	554096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_552102_553290_553567_553789
845238	contig_5782_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_162134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367259	366394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_366400_367300
845239	contig_14618_pilon	-	861	3	Intergenic	novelGene_136852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	237	830	1430372	1279769	FALSE	35	AAAAAGCCAGAGGGGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGFCMREEEVCARSSTDLGPAVKEAKVIGMGSMDSAGLEAQADLVASPEGLPPTASSGSHAPYPLLVRRVSVSIPTWTSSTRPFFFHKPNSGKPGMRAETFSFPSDTLMDAPASMIPLLGLTQYLRGAVVFTLKHTFRSVGLPSFRLVVTTSVKGPRNLSSCCGSRLRTCSTFAMFLGGAAPLAGRPLRSHLRREV	1430608	1279737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327380_1430053
845240	contig_7171_pilon	+	1044	10	Intergenic	novelGene_101356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	98.3700496424937	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	13	747	1321960	1327959	TRUE	20	ACAAGGCCTTATCTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVRMAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVR	1321947	1328739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325525_1325604_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327974_1328277_1328363_1328541
845241	contig_7895_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_154442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	35	430	624531	624136	NA	20	GTTAAATGGTTTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFYRSYTTQLTMNVPFQAIHFMTYEFLQEHFNPQRRYNPSSHVLSGACAGAVAAAATTPLDVCKTLLNTQESLALNSNITGHITGMASAFRTVYQVGGVTAYFRGVQARVIYQIPSTAIAWSVYEFFKYLITKRQEEWRAGK	624565	623809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_623800_624600
845242	contig_12312_pilon	+	1646	3	Intergenic	novelGene_63999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_2	23	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	89	385	477005	490486	FALSE	55	CACTTATAAAGAACCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSCSLGRAAVTVHRRRRGLHRRVRLPASMATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIGKCSCVELLGYFVGGGENRDPLLFL	476916	491747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349
845245	contig_15236_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_141662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTGAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719456	720303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_719500_720300
845246	contig_4065_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_133410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACTTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847462	848738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_+_847500_848700
845247	contig_10109_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_131338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGAAGAACGCTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249348	250599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_249300_250600
845248	contig_6360_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_165881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTGATGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69370	70198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_+_69400_70200
845249	contig_5649_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_82416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302341	1301517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1301500_1302300
845250	contig_10861_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_39426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTGAAGCGGAACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2229053	2229409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2229100_2229400
845251	contig_12842_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_168349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGAAATAGTTTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173287	172087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_172100_173300
845255	contig_13992_pilon	+	924	2	Intergenic	novelGene_147649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	153	419	576746	577012	FALSE	35	GTAAGAAGTGTTAAGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKDSPWTLRPPCPAGPQYSSPPGPGSPSFTWNPTLSPHQGALLAQNASSMNPSRPHGASSVHGLAQALVSGVSPCPLLWTLSLLCSLPSRVPQTKATKTTGGLKVLSCRCRGHMQLTTLDPPHPGFSPGQSSPVSGP	575017	577517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_575090_576665
845256	contig_11838_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_177506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109606	108273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11838_pilon_-_108300_109600
845258	contig_15543_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_164333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTACAGCCTTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21976	22693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_22000_22700
845259	contig_5374_pilon	-	1590	3	Intergenic	novelGene_166394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTAAAATATATGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267642	264586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5374_pilon_-_264661_265014_265102_266213
845260	contig_9900_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_159512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCAACTTTTTTTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181192	180386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_180400_181200
845261	contig_10861_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_39190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGTTCAGGAGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319425	319022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_319000_319400
845262	contig_12414_pilon	+	2292	10	Intergenic	novelGene_59637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.66666666666667	14	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	923	1861	740154	751252	FALSE	10	ATCCTGTCTCCAGTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGQQLQFTGGWFAHPIFKNGDYNEVMKTRILDRSLAAGLSKSRLPEFSESEKRRINGTYDFFGFNHYTTILAYNLNSASWITSYDADRGVASITDRSWSGSGSFWLKMIHFGFRKILNWIKEEYNNPPIYITENGVSQRGEVNLNDTARIYYLRSYINEALKAVQDKVDIRGYTAWSVMDNFEWATGFAERFGLHFVNYTDPSLPRILKESAKFYASVARCNGFPDPATGPHPCLQLEDAVPTISPRKEGVSFLGLTLGAAEAQTALYVLFSLVLLGVCSVAFLSYKCCTHSKQEETQPGQQELSNLSSF	734644	751683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_734778_734825_735011_735842_735981_736902_737194_739978_740178_745086_745197_746290_746426_748935_749160_750026_750255_751034
845263	contig_17470_pilon	-	673	2	Intergenic	novelGene_110478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTTAAAAAATACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140291	130655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_131250_140212
845264	contig_18113_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_137548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGAGGAGAGATTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246734	246412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_246400_246700
845265	contig_16098_pilon	+	1129	10	Intergenic	novelGene_45913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	71.5929853795437	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	501	1043	335192	336931	FALSE	15	CATTACCTGCATCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294756	337017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306434_306572_321945_322037_328159_328236_334179_334247_335156_335272_335357_335505_335727_335764_335870_336034_336814
845267	contig_12021_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_172202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAATCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173443	172027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_172000_173400
845268	contig_10037_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_148964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACAAGAAGAAAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385736	386452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_385700_386500
845269	contig_10377_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_115367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCCGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202244	202545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_202200_202500
845271	contig_12644_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_44593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGTGGGTGGGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2434255	2435064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2434300_2435100
845272	contig_14219_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_54280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289739	291226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_289700_291200
845274	contig_11115_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_102859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	780.594787468006	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	234	635	172756	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRDPGRRQPRDPEERDRLPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	171919	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_171981_172463_172595_172714_172964_173047
845275	contig_3825_pilon	-	607	5	Intergenic	novelGene_77949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGCAAAAAGAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15818	12982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_13104_13620_13684_14878_14912_15231_15300_15496
845276	contig_16882_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_148197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGAAAGATGTGACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174052	175450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_174100_175400
845277	contig_11370_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_98772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242917	243263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_242900_243300
845280	contig_2646_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_69556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCGCATTTGCTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855299	855682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_855300_855700
845282	contig_9389_pilon	+	764	8	Intergenic	novelGene_84006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.8763973266711	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	332	697	539202	541916	FALSE	5	CGCCCGCCCGCCAGTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAGHILAGTWLSPPKLVNAPGLFGLRILGLRSGVGAAVQARGIHQSAATGRPSSAQPAVPKAGAVVPKPTALPSSRGEYVLAKLDDLINWARRSSLWPVTFGLACCAVEMMHMAAPRYDMDRFGVVFRASPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRYVVSMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGILQLQRKIKREKRLSIWYRR	523005	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_523065_531579_531617_535010_535080_535512_535631_539153_539334_539899_539947_540720_540810_541818
845284	contig_15118_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_74561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGAGGTGCCTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182462	182237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_182200_182500
845285	contig_1009_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_121723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACTAGGCTTTAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105304	105816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_105300_105800
845286	contig_835_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_152133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACTTTCAACACATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74709	74265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_74300_74700
845287	contig_15640_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_177510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACCCCTGGGAAACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8970	9330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15640_pilon_+_9000_9300
845288	contig_11883_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_163766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45197	43951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_44000_45200
845289	contig_11551_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_168488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACAATCCCTAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916724	916072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_916100_916700
845290	contig_11186_pilon	+	1391	2	Intergenic	novelGene_98865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	539	904	137292	137657	FALSE	30	TGCTCCCACTAGAATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKTIYRYNANPIKIPTAFFKEMENLILNFIWKDKRPQIAKATLKKNKVTGLTLPDFKTYYTATVIKTTWYWFNDRCINQWNRIENPEINPNIYDEFIFDKRVKSIQWGRNSPFNKRC	136448	138144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_136971_137275
845291	contig_8682_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_165286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGAGTGTCTGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217060	216721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_216700_217100
845292	contig_2114_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_104292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765922	764986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_765000_765900
845294	contig_9982_pilon	+	1605	1	Intergenic	novelGene_55788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAGAGTGGTAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737315	738920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_737300_738900
845296	contig_6364_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_51838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCGCTGTTGTTTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704952	1706502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1705000_1706500
845298	contig_9195_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_155702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGATCACGGCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107571	1108049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_1107600_1108000
845299	contig_15720_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_41868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	451	795	276489	276833	NA	10	CTTCTGTGGAGTTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTAAWPSSLLSAQPSPAQPLGSEFEWGVGEGGFHSLTSFSPLMSLLKLEGLGKTRNIPISQFHFLMQAFSKGIWKLFWGGRLGKRVELGNKCLLSWGIGRDSKLSFLPLFLPP	276038	277279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_276000_277300
845300	contig_5816_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_158243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTGTTCCCTCCCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201893	202859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_201900_202900
845303	contig_6102_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_32069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGGAAAAAACACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676285	678166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_676300_678200
845304	contig_6210_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_171878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACAAATACAGTTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62685	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_61600_62700
845305	contig_9670_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_169935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAACAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75369	75941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_+_75400_75900
845306	contig_16633_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_165066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	174	407	50642	50875	NA	50	AGATTATTCTATGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASGDGLAVGAAGQTRDRRGGVALPGAAGAPADSEASLLEAVRATPRRSSIIKVREAMPLPERGGAGAGVAGPGRMHGPRRHLRLSIVFSLPLSTLPNLPSSSGGSQSQLLAVRGRSDFFFPDSQWRKSSVLRL	50468	52086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_50500_52100
845307	contig_7408_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_168718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	498	806	7948	8256	NA	25	TCCTGCATAGGCAGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLESGLTREGKLRLLQDPVGVWSRMYYPPHLWRQKRMTPDWYGTDLQKAFRVSESLIPVLKCFLYIRIIRKLLLELLSFQDLHLFLLISRGCYQPGTTLA	7450	8379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_7400_8400
845308	contig_7870_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_108980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401139	402680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_401100_402700
845309	contig_19744_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_120369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCATTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129599	130643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_129600_130600
845310	contig_10861_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_39453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGTATACATATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2606726	2608085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2606700_2608100
845311	contig_2646_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_69697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGATCACTTGAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2412895	2413988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2412900_2414000
845312	contig_6498_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_177511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGTGAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16645	15571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6498_pilon_-_15600_16600
845313	contig_18081_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_23834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427108	426314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_426300_427100
845314	contig_8044_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_132364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTCATGTTCTGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299524	297854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_297900_299500
845315	contig_4156_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_88126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCTGGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522526	521738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_521700_522500
845320	contig_12638_pilon	+	946	2	Intergenic	novelGene_33209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	328	738	357816	358226	TRUE	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFGSGTRLACGSRPPGQWPPGPGPQQAVSGRGSGAGLLAHGWSALSERCSPASASSPRPAGLAAGPPGGRRTRREELSASKVPQLFLLCAPVALVGPVFESILPQTQISGPGFTVFGGRTPRNHRESSDSQTKL	357488	358536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_358335_358436
845322	contig_8729_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_40083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGAACAGATATGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146138	146729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_146100_146700
845323	contig_9185_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_166887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAGAGCAAAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210490	211378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_210500_211400
845325	contig_9389_pilon	-	433	3	Intergenic	novelGene_84056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	68.5	5677	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCCGCCTGGATGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748575	744980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_745152_746766_746919_748465
845327	contig_4402_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_140801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	235	534	234608	234907	NA	20	TGAACCCCATTTGCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFCLSRWLAWCVDCFFSLCSFGVKLMDFQAHRRGGTLNRKHISPAFQPPLPPTDGSTLAPAGPEPPPQSSRAESSTGGGAVPSSVGTLEQGLSPGDGR	234373	235011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_234400_235000
845328	contig_14838_pilon	+	476	3	Intergenic	novelGene_151923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	34	junction_1	97	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGATGCTTATTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236085	253717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_236294_248326_248403_253525
845329	contig_10856_pilon	+	1181	3	Intergenic	novelGene_167636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	5	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	121	462	136668	139086	FALSE	15	ATGCTGTTGGATGCTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHHWGYGKHNGPEFWHESFPIAKGERQSPIDIDTKAAKYDPALKPLCISYEHATSRRILNNGHSFNVEFDDSQDKSVAVYLESLGEQVFISLSCLPISWRFQSTQRHLRRKA	136547	139805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10856_pilon_+_136702_137830_138029_138976
845330	contig_11056_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_130404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGTTTTACTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684563	685462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_684600_685500
845333	contig_990_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_76058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAACCCAGCAGCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052763	1053190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1052800_1053200
845334	contig_14202_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_157145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCAGACTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140335	140571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_140300_140600
845336	contig_20534_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_177513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAAAATTTTCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556	2753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20534_pilon_+_1600_2800
845340	contig_12429_pilon	-	871	3	Intergenic	novelGene_136203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	22	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	299	826	75734	73926	FALSE	85	AATACTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIEDLCVVDLYNPDGHMNRTKLASLVSACKHLHKAGFLNAILPSQSADLHHSIGTKLLTLVYKGIAPGEEGQCLPVLDTSCKRLAGGLLELAFAFGGQCKQLVGLLLSTSMLSMPSSGQLQRSIISFSHGEYFYSLFSETINTELLKNVDFAVMELMKSSEENPKMVLKFFFK	76032	73880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_74154_74869_75029_75593
845341	contig_7870_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_109044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATAGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625861	624364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_624400_625900
845343	contig_13831_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_160997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGGAATATGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124710	126141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_+_124700_126100
845344	contig_15327_pilon	+	970	4	Intergenic	novelGene_70752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	3.77123616632825	210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTGTGCACGTGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064609	1096492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1064890_1083080_1083180_1086845_1087004_1096059
845345	contig_14322_pilon	+	550	4	Intergenic	novelGene_115664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	13.8162545173751	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	20	325	533483	534177	FALSE	10	AGAGGGGCCCCTGTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGFGSDFGNSGGGKLDPGLIMEQVKVQIAVANAQELLQRMTDKCFRKCIGKPGGSLDNSEQKCIAMCMDRYMDAWNTVSRAYNSRLQREEAGAVWELPR	533463	534402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_533603_533689_533759_533972_534057_534144
845346	contig_517_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_171304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATACTGTAAGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105908	104887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_-_104900_105900
845347	contig_10428_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_162593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGTTTATGTTCAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60264	58834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_58800_60300
845349	contig_6137_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_59155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAAAACTAATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234753	1235662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1234800_1235700
845350	contig_10494_pilon	-	582	3	Intergenic	novelGene_102195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	0.5	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	178	315	1056716	1056579	FALSE	40	CAACTTTGTTAAAAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1057260	1056311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167
845351	contig_11883_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_163774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTGAAACCACTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69971	71012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_70000_71000
845353	contig_9730_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_150633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAACACATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460519	459935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_459900_460500
845354	contig_6227_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_49638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365736	366039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_365700_366000
845355	contig_19352_pilon	-	1573	4	Intergenic	novelGene_122397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.36357401145817	17	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	140	298	267783	265592	TRUE	50	ATTGTATATATTCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRRAALPQHWAYYVPLDSGGFYPQEVDFRKFKITLLPEKGRTISNMKKRNIAPLTILSPSVISGQNRLHGNRFGFLVSFLQYVLKLMLNITEWTFYC	268014	263620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_263840_264535_265713_267745_267895_267986
845356	contig_7308_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_159583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGATGGTGGTTCTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30745	32554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_30700_32600
845358	contig_2487_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_148484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAACCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211701	212982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_211700_213000
845361	contig_16310_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_70056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTATTAAAGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118399	119706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_118400_119700
845362	contig_9415_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_109749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACGAACAGTGCAGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609464	609920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_609500_609900
845363	contig_13894_pilon	-	1067	4	Intergenic	novelGene_62216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	17.7200451466693	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	79	627	816016	813511	FALSE	35	TTCAAAATGAATGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLHILDNFTEGSQPKTEDTFSHSTRYMDPDTFIYNFKNNPLGTGKYQTYLCYEVQLMNGNSGVLQNWIKGFLCNQSDPDPQLCCHAELCFLDWISSWQLYPGQHYSITWFLSWSPCPDCAQEVAAFLQRNSHVRLYIFAARIHDCCEGYEEGLRSLDNAGTNIGIMTYREFEYCWRAFVDNQLWPFKPWRGLKRNHEFMSNQLQRILQ	824762	813070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_813630_814066_814350_815869_816021_824688
845364	contig_7179_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_78114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGGGGTCAAAGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709646	710718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_709600_710700
845368	contig_7728_pilon	-	1041	7	Intergenic	novelGene_64700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	353.254747550074	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	43	621	752150	713836	FALSE	40	TCTAGAAATAAATGCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTAF	752192	713415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713842_725023_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
845369	contig_7426_pilon	-	828	4	Intergenic	novelGene_27558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.1543289325507	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCAGCGCCTTGTCCGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185856	1158907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1159076_1159793_1160247_1163544_1163680_1185784
845370	contig_7412_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_76276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAGAACAAGAAATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254371	256112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_254400_256100
845371	contig_15236_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_141677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGACACCACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826853	826220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_826200_826900
845372	contig_9415_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_109729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAGATAGTAGGTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493445	492651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_492700_493400
845373	contig_2100_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_50604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGGGGTCATTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716859	717732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_716900_717700
845374	contig_7308_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_159591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAGAGGCAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170489	170207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_170200_170500
845375	contig_7308_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_159590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCAACCCCACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170258	169346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_169300_170300
845376	contig_6839_pilon	+	423	2	Intergenic	novelGene_161878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297601	298943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_+_297895_298813
845377	contig_14575_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_101928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414678	414464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_414500_414700
845378	SIRV6	+	272	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	73	2915	73	-2888	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAGAAAGTCGAAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2589	7900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
845380	contig_11548_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_66718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTAGATTTTTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16554	17587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_16600_17600
845381	contig_14405_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_85656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705911	707356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_705900_707400
845382	contig_1093_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_139980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACTTATATTCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197027	197525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_197000_197500
845383	contig_5590_pilon	+	1164	9	Intergenic	novelGene_162998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	71.087534068921	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	46	1164	219220	235870	FALSE	35	AAGAAGCGACAGCGCGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTGFVQGSETTLQSTYSDTSAQPTCDYGYGTWNSGANRGYENYGYGYGYGQENTSNYGYGMATSNSWEIPSSDANANPSATSSASADSVLSKINQRLDMVSHMETDMMQGGMYGSGGERYDSYEACNSRAMLSDRDLYRSGYDYTELDPEMEMAYEGQYDAYRDQFRMRGGDAFGPRAQGWARDTRGGRPVASGYGRMWEEPMGARGQCMPGAPRLPSLFSQNILPEYGVFQGARGGGAFPGSSRFGFGFGNGMKQMRRTWKTWTPADFRTKKKKRKQLGSPDEPDSKASRTDGSDNSDSDNDEGTEGEATEAADGSEAVEKSSRVEGEDEEGKEDGKEDGKEDSGALTAQDESGQAKRKLQAGKKSQDKQ	219174	235870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_219233_226222_226298_231367_231401_231635_231877_233778_234233_234334_234432_234509_234581_234870_234929_235793
845384	contig_7189_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_117656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGAAAATGACAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529163	528583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_528600_529200
845385	contig_11416_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_145369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	389	772	585280	584897	NA	35	AAAAACCTGTTGCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPDPNHIRPHHKIQTLSTSCRLPDTSSSCPSIPAHPSGRPRCSPLPELLGPYLFPPECLTWPVAVPTHSRCRLPPTGRSQRRASSWHTRSLPCVWHHRAHLTRGLISDIFVLRGESGDCSFEMILN	585668	584729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_584700_585700
845386	contig_3153_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_104703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGACTGAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460992	459518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_459500_461000
845387	contig_14556_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_138538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAGCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189268	187897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_187900_189300
845388	contig_15732_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_88906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACTGTGGCTTTATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286550	286073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_286100_286600
845389	contig_8587_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_159122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	326	481	207124	206969	NA	60	CTGGTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRLPGLSSKAPLGGLKPPPFWLAARGTNRVPHSGTPTLLPAALTGLKEKLPCVGFYFAPTSVLPQHLGAPTPCGDRQTLWGWRCVGFPVVPWASSGRPPTFWFRRGSMKPSRGPVSMGQTGYQKQEFSGRGQKQKTRTEAKLQVSREGCGSSSDPRTA	207449	206592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_206600_207400
845390	contig_6325_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_143372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCAGGTGGAGGGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452411	453896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_452400_453900
845391	contig_5434_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_74682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTTTTTCAGACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345441	343812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_343800_345400
845392	contig_1143_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_86598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTTTTCACCACATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201478	201715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_201500_201700
845393	contig_8980_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_74022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAGGAAGGGAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743111	744354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_743789_744266
845394	contig_14722_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_110229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCAGGCACCCTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137228	137444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_137200_137400
845395	contig_11978_pilon	-	930	3	Intergenic	novelGene_62953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	10.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	135	305	1044307	1041965	FALSE	25	AAAAGTCTATCCTGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKLSVEGFAVDKMAGEVKAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1044715	1041339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289_1044338_1044611
845396	contig_7695_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_41617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	240	332	662815	662723	NA	10	GTGTTCTCATGTGCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPPERLGWERSPGDSCGLHQRTACGLLPAVAEPSCNPEAQVGGLGPCRAGLVSLKLKSWRWGPCNLGPLPTKVIPAPPLMHPSLLALSLPRGQFPSDPVGTALPPPSGA	663054	662242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_662200_663100
845398	contig_3797_pilon	-	1718	11	Intergenic	novelGene_120074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	49.1537384132682	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1602	115	1716	63677	50111	FALSE	50	TCAGGACAGAAAGACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVEVTECSDGFFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFYRDTDMAAVIYVYVQDYRSPFIASVSDQHGVVYISENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPEKRFVPDGNRIFWDSNKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVLGYKIYDVVLSPPHGVEMSVGEKLVLNCTARTELNVAVKFNWEYPSLKHQHKKHINQDVKTQSESEMKKFLSTLTIDSVTRSDQGWYNCVASSGRMTKRNSTFVRVHEKPFVAFHSGMESLVEATVGDHVRVPVKCLGYPPPEIKWYKNGRPLESNHTVKAGHVLTIMEVSEKDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVSLVVNVPPQIGEKSVISPMDSYQYGTMQTLTCTVYAVPPPRHIQWYWQLEEECNYIPTQSALTTKPYTCKEWRNVEDFQGGNKIEVTKNQFAVIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAINKAGLGERVISFHVTRGPEITLQPDAQPTEQESVSLWCTVDRMTFENLTWYRLGLQALPVQVGELPTPVCKNLDALWKMNATMFSNSTSDILILELQNASLQDQGDYVCF	63791	50108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_50395_51409_51519_52168_52293_53212_53370_56220_56385_56471_56587_57923_58102_59422_59563_60132_60302_60544_60676_63646
845399	contig_14643_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_99146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	384	698	167347	167661	NA	50	AAAAAAAAAACCGCTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFSCVTSSCSSSRNGGFTFPWSPPLSPLWAWSLCYGSFLPPAPTRTPGAEAVASRNGEAAAAGSGKASELNKTGRSSAQQRPEWAGCWEVAAPAAAETSFRSR	166963	167704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_167000_167700
845400	contig_2414_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_158452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAGAAGATAGACGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105143	104083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_104100_105100
845401	contig_5479_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_133617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCAGTTCCTCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406187	407348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_406200_407300
845402	contig_4732_pilon	-	732	8	Intergenic	novelGene_75472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.142266448176	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	135	686	720167	700651	FALSE	50	GAAAGCAAGAATTAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLKRCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEEGRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFPKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLQAVNMDPDQYQMGGTKVFIKNPESLFLLEEMREISSKLKMSRILSAKCQAESGILTS	721550	700604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_700726_706643_706671_712566_712712_712811_712911_713353_713461_715492_715575_720150_720237_721485
845403	contig_10861_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_39279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAAGAATATGATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351696	1350141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1350100_1351700
845405	contig_1244_pilon	-	1794	3	Intergenic	novelGene_38054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	65.5	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	88	1659	1041420	1034518	FALSE	55	ATTGTTAAAACATAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQRRRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAIVKMKELCAMYGKKDPNERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDMMASSKGGTDVDDLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMKDEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSPEQKTQGNHKAKEPICAGVSNKSENDESKGELEKEERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKNLQQQEITKQLRRQNVPHRFIPPENRKPRFPFKSNPKHRNSWSPGTHIIITEDEVIELRIPKDEEGRKGNKEENQEKGGRATSKDPQLPSGSQVMRSQDHIQVSKQHINNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSMRCQAAASSESLNSHSGHPTADLQTFQAKRHIHQHRQPYCNYNTGGQLEGSAANAYQKQTDRPNHCNQFVTPPRMRRQFSAPNLKAGQETTV	1041507	1034382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1035994_1041195_1041269_1041397
845408	contig_1840_pilon	+	1058	2	Intergenic	novelGene_177514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCGAACACAAGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8880	11729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1840_pilon_+_9851_11641
845409	contig_709_pilon	+	2468	1	Intergenic	novelGene_57646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAAACCCAGCAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3076647	3079115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3076600_3079100
845410	contig_10235_pilon	-	1265	2	Intergenic	novelGene_46580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	196	1239	548557	547514	FALSE	20	GAAACCTGTGACTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMPPGNPEGEKDTSQPQEQWKKNSRENLGSTTQIRQQPRDPPTEILELGPDPISQILENPQGTEKLAAELEGDSDRSHGSASELPEPFQASNLWHCPDGSFIKKIVISGQGLDKPKLGSRCRVLVLGFPFGSGLPEGWTELTLGIGPWREETWGELLEKCLESMCQGEEAELQIPGHPGPPVRLTLASFTQGRDSWELEASEKEALAREERAQGTELFRAGNPEGAARCYGRALRLLLTLPPPGPPERTALHANLAACQLLLGQPQLAVQSCDRVLERDPGHLKALYRRGVAQAALGNLEKATDDLKKVLVIDPKNRAAQEELEKVVIQGKKQDAGLAQGLRKMFG	549070	547487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_548632_548949
845412	contig_9319_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_154636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGGAAACCAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37786	39126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_37800_39100
845413	contig_4392_pilon	-	1302	6	Intergenic	novelGene_117298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	12	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	125	730	120039	108812	FALSE	10	GATGAGTGCCTTCCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPSHPVIAAKPDADARPVGTVSAAPWGSSSIVPISWAYIKMMGGKGLKQATEIAILNANYMAKRLEKHYRVLFRGARGYVAHEFILDTRPFKKSANIEAVDVAKRLQDYGFHAPTMSWPVAGTLMVEPTESEDKAELDRFCDAMISIRQEIADIEEGRIDPSVNPLKMSPHSLTCVTSSRWDRPYSREVAAFPLPFVKPENKFWPTIARIDDKYGDQHLVCTCPPMEVYESPFSEQKRASS	124207	108239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_108956_109492_109574_111640_111814_113348_113445_119927_120040_124083
845415	contig_12622_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_6059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	59	322	1729348	1729611	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALCPPQLRQQEEVLQVRGMAQLGHCLQVAQKLLESPAAAGNGLCSKVPAQALPGEGDGSHGAPKLPLQASVQLLKVRVAAGDLGWLAVWRPWAHHGEGVELRREC	1729289	1730781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1729300_1730800
845417	contig_3335_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_165003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGTCAGGGGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331844	332479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_+_331800_332500
845419	contig_14142_pilon	-	885	7	Intergenic	novelGene_120573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	24.3064920454506	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	61	885	487870	485049	FALSE	45	GGTAAGGGGGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCAGGPGRSPSELPGPPGRAMIPRALLLLGLLGALGTPLSPGVHGLEAEGRLRDKLFSGYDSTVRPAREVGDRVLVSIGLTLAQLISLNEKDEEMSTKVYLDLEWTDYRLSWDPAEHDGIDSLRVTAESVWLPDVVLVNNNDGNFEVALDINVVVSSDGSVRWQPPGLYRSSCSIQVTYFPFDWQNCTMVFSSYSYDSSEVSLWTGLGPDGQEQQEIHIHEGTFIENGQWEIIHKPSRLIQPPGNPRGQGKGQHQDVTFYVIIRRKPLFYLVNVIAPCILITLLAIFVFYLPPDA	487930	485048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_485258_485572_485721_486008_486118_486218_486329_486939_486985_487581_487722_487806
845420	contig_10434_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_82049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAAGGAAGATCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158452	159157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_158500_159200
845421	contig_4071_pilon	+	1306	5	Intergenic	novelGene_151879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	33.2340187157677	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	35	1306	187316	215331	FALSE	25	CCTGGTAGCGCTAACCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTSDEIVSVEQPSSSLNPLCFECGQQHWTKENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQPLDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFASVCQDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHWRVALEKRKTSKTQTEIENENGPTTLDPPGTVSPEADCLGTGTVPAEQNLTPVPLPAWPEEPGLDNPAFEESTGADTAQQPLSLPEGEITTIEIHRSNPYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGIIARDGRLLAGDQILQVNSYDISNVSHNYARAVLSQPCSTLHLTVLRERRFGSRASGHSDNNSPREEIFHVVLHKRDSNEQLGIKLVRRTDEPGVFILDLLEGGLAAQDGRLNSNDRVLAINGHDLKHGTPELAAQIIQASGERVNLTIARTGKPP	187281	215331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_187720_201174_201423_202725_202926_210339_210709_215280
845422	contig_19604_pilon	+	1133	8	Intergenic	novelGene_77226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3.14934395500694	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	41	1075	248602	255360	FALSE	25	ACCAAGGAGCAGGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGSSTISISFTPMVLSPDILNKVECTGYALGFMSLDSEVEREIPGRRRRLQDFDVGPVRLDLHGYVRPAQLSAELDYGGSMEFHHQASDLIPRQPCSGVLSELVTTHHLKLTNTTEIPHYFRLLVSKPFSVSQDGASLIASSPAWEQEYEEETVEEGKLLVLQPQENMLVNVSFSLSLELLSYQKLPADQMLPGVRIQQSASGQKEMVFTQNLLLEYANRTTQVVPLRATVAVPELQLSTSWVDFGTCFVNQTRVREVYLMNLSSCRSYWAVLMGQQEPAKGTAAFKVSPSNGLLEARSVNAPPSSITLQVIFTARSSELYESMLVVEGMLGEKACTLRLRGQGSYDEKYVTFRQL	248561	255418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_248680_248785_248881_249088_249174_249394_249608_253432_253595_254620_254775_255015_255140_255236
845423	contig_12964_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_131675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAAAAAAATTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209198	207734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_207700_209200
845424	contig_6589_pilon	+	1100	8	Intergenic	novelGene_25704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	561.797624975908	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	507	986	212845	216262	FALSE	10	CCTACATTGGTTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPLLLPLPLLLLPLLLVDPTIATLIRIPLHRVHPDPRTLNLPRGWRKPAEHPRFHHRFNPNASSSFQPNGTKFAIGGIKGTSVVFGEALWEPSLVFTFAHFDGILGLGFPILAVDGVRPPLDILVEKGLVDKPVFSFYLNRDPEAADGGELVLGGSDPAHYFPPLTFMPVTIPAYWQIHMERVKVGTGLNLCARGCAAILDTGTSLITGPTEEIQALNSAIGGVALMTGQYLIDCSKIPTLPPVSLLLAGVWFNLTAQDYVVQIARFGVRLCVSGFQALDVDPPVGPLWILGDVFLGSHVAVFDRGDKKGGARVGLARARPRGAGR	205132	216376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_205215_210348_210429_210868_210934_211399_211600_212765_212889_213033_213179_215758_215858_216070
845425	contig_9354_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_108063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGATTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230169	232004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_230200_232000
845426	contig_5375_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_169214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATATCAGGGATAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75899	76588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_75900_76600
845427	contig_13800_pilon	-	1051	9	Intergenic	novelGene_153752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	62.4194480911198	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	259	732	219043	193487	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFAMIIGAFVAASSDLAFDLEGYVFILINDVLTAANGAYVKQKLDSKELGKYGLLYYNALFMILPTLAIAYFTGDAQKAMDFEGWADTLFLLQFTLSCVMGFILMYATVLCTQYNSALTTTIVGCIKNILITYIGMVFGGDYIFTWTNFIGLNIR	223102	193167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_193574_197498_197578_199922_199991_212666_212760_216415_216519_218999_219057_219769_219857_221991_222060_223012
845430	contig_5093_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_135083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTATGTAAGGTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554227	553295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_553300_554200
845431	contig_13547_pilon	-	673	6	Intergenic	novelGene_104889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_5	264.241556156483	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	36	572	223705	114691	FALSE	55	GTAAGCCAGAAAATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNAIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQVIS	223740	114589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
845432	contig_15114_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_121111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCGCTCCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85749	85182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_85200_85700
845434	contig_9815_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_164239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACATAAAATCTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15109	15964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_15100_16000
845435	contig_9127_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_103025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTAGATATACTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234626	233212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_233200_234600
845436	contig_20429_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_169246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112278	111157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_111200_112300
845438	contig_7391_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_112152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATGTAACTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387935	386786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_386800_387900
845439	SIRV6	+	446	3	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	-92	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2380	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2648_3046_3165_10727
845440	contig_8059_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_111121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATAGAAAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335045	333571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_333600_335000
845441	contig_5918_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_99640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAACCTTACATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2267259	2266346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2266300_2267300
845442	contig_11026_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_167694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGACAAATGAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338144	339278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_338100_339300
845443	contig_10734_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_51325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGCATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562438	1563175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1562400_1563200
845446	contig_11719_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_154759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGGAAAAAATTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41631	43411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_41600_43400
845447	contig_8576_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_88754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCACAACACTAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708120	707113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_707100_708100
845449	contig_6975_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_74248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAATAGAAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135778	136752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_135800_136800
845450	contig_7695_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_41630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	688957	688610	NA	0	GCTGGGCTTGTTTGGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTAPQPCAWACCLPRLSFPRTPVFSVQSQGNLLPCHLSLSPGSWACPLQPHPLFIPNSRAPLPKLLGQWEGLARSLKVETQRLPSPDPGARNTEHLRSFQHPALPRPLLLYIEK	688959	688091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_688100_689000
845451	contig_10011_pilon	-	1482	12	Intergenic	novelGene_68042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_11	4.50160669205089	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	87	1328	175568	150534	FALSE	30	GTATCCCCTGAAGCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRDLRNFTEMMRALGYPRHISMENFRTPNFGLVSEVLLWLVKRYEPQTDIPSDVETEQDRVFFIKAIAQFLATKAHIKLNTKKLYQADGYAVKELLKITSVLYNAMKTKGMESSEIGEEDIGKFKFDLGSKIADLKAARQLASEITSKGASLYDLLGKEVELRELRTAAIARPLEINETEKVMRIAIKDILAQVQKTKDLLNNVASDEANLEAKIEKRKLELDRNRKRLQTLQSVRPAFMDEYEKIEEELQKQYDIYLEKFRNLTYLEQQLEDHHRMEQERFEEAENTLRLMQNKLKEEEKRLLKSGSNDDSDVDIQEDDESDSELEERRLSKPRTAMEMLMQGRPGKRVVGTMQGGDSDGEDDSEDSEIDLEDDEEDDDGLEDESLALSPAKPSRRVRKPEPLDESDNDF	175654	150379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_150684_153578_153635_156949_157058_157730_157804_159977_160120_161996_162131_164691_164776_166963_167060_170470_170651_171503_171589_172744_172857_175546
845452	contig_13780_pilon	-	2038	2	Intergenic	novelGene_149134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	182	junction_1	0	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCATTCTTCCTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886145	883759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_884336_884683
845453	contig_15361_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_167868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGGTAGTGGTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461301	460362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_460400_461300
845458	contig_4891_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_124536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406838	406467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_406500_406800
845459	contig_7657_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_30033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAATTAAAAAATAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204387	203488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_203500_204400
845460	contig_5881_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_129060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAGAAGTAGATCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581039	580589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_580600_581000
845462	contig_6677_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_114191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTGACAAAGAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556448	556651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_556400_556700
845463	contig_10196_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_132115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	216.891678033068	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGGCCCAGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922248	926558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_924432_924548_925701_925730_926203
845464	contig_7919_pilon	+	951	2	Intergenic	novelGene_28046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877119	879297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_877956_879182
845465	contig_5018_pilon	+	1190	8	Intergenic	novelGene_47004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	17.0413662382247	86	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	405	887	1218762	1221768	FALSE	30	TCCCAGCATTTTTATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVERMREAVQEMRDHLVSPAAIAFMERNNKEILAGKSAALKSPSDLLDASAVSPSSRYIEEQQATQQLIMDQQDQQLEMVSGSIRVLKHMSGRVGEELDEQGIMLDTFAHEMDQTQSRMDGVLRKMAKVSHMTSDRRQWCAIVVLLGVLLLVLILLFSL	1214015	1222071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1214188_1218401_1218572_1218699_1218795_1218874_1218938_1221115_1221224_1221317_1221425_1221517_1221613_1221691
845466	contig_253_pilon	-	926	6	Intergenic	novelGene_129739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	24.3918019014586	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	94	852	657441	655116	FALSE	5	AGCTTGGGGCCTGGTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPTNPTAISPDEYFDPTFSLESRNIGRPIEMSSKVQRFKATLWLSEKHPLSLGDQVTPIIDLMAISNAHFAKLRDFITLRLPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFSNLCGCDEPLSSVWVPAPASAASGSPFPCEVDPAVFEVPEGYSVLGAERSEPLRDEDDDLLQFAIQQSLLEAGTEAEQVTVWEALTNARPGTHPPPQPTVYEEQLQLERALQESLRLCTEPGGPGSPHRTPPSPVPPSFEEQLRLALELSSREQEELERRGQQEEEDLQRILRLSLTEH	657534	655041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_655330_655623_655716_655790_655955_656032_656144_656317_656476_657421
845467	contig_11602_pilon	+	1152	3	Intergenic	novelGene_166579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1.5	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCCCATGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44791	93950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_45021_92413_92613_93226
845468	contig_15857_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_152076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCTTGCTCATGTCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110802	109648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_109600_110800
845473	contig_14516_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_153954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGAAAAAAAAAAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421354	423132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_421780_422792
845475	contig_13051_pilon	+	955	4	Intergenic	novelGene_140127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	42.0898509804389	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	406	954	389473	427867	FALSE	55	AGGAGAAAAAACTAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSESALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHAGPIVSVWHRELRKVTEEKKSLKRTFQQIQEEEDDDYPGSYSPQDPSAGPLLTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSE	389067	427868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_389624_419906_420020_422064_422192_427709
845476	contig_7629_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_153605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAAAATAAATAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464255	463432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_463400_464300
845477	contig_2371_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_176552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCTCTGCGTGGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269316	245464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_-_245863_269223
845479	contig_3942_pilon	+	826	7	Intergenic	novelGene_128695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	455.311614904196	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	50	826	426591	430076	FALSE	30	AAGCCCTGACTCAGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQVPEGSLFPVTAVKTQLPPFFRLPALGPWITSAHPM	426541	430076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429971
845480	contig_14727_pilon	-	1268	5	Intergenic	novelGene_56619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	63.5270611629406	147	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	248	880	45809	27173	FALSE	10	TGAGTGTGTTTGTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVKLTTQAYCKMVLHGAKYPHCAVNGLLVAEKQKPRKEHLPLSGPGAHHTLFVDCIPLFHGTLALAPMLEVALTLIDSWCKDNSYVIAGYYQANERVKDASPNQVAEKVASRIAEGFSDTALIMVDNTKFTMDCLVPTIHVYEHHENKWRCRDPHYDYCEDWPEAQRISASLLDSRSYETLMDFDNHLDDIRNDWTNPEINKAVLHLC	46056	26784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_27333_28730_28826_29851_29922_36456_36534_45578
845481	contig_2251_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_128477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133518	132517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_132500_133500
845483	scaffold_12124_pilon	-	1297	7	Intergenic	novelGene_22184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	87.3207688162826	223	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	47	1054	1368625	1229338	FALSE	10	GCACCTGAGCGTGGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAGGRRGSSGDWAAMSPLCAARAAVRVYVAGAAVILAQLLRRLRGALPEPVFPPQSDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1368671	1229094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049_1333158_1368516
845486	contig_9389_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_84018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTAACTGTGTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569573	570871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_569600_570900
845487	contig_2703_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_101795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACCTGCCCACGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615083	615792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_615100_615800
845489	contig_7229_pilon	-	703	4	Intergenic	novelGene_39808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	17	junction_3	1881.52284658524	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	32	646	877522	875654	FALSE	20	CTTAAAAGTGTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878211	875596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877533_878190
845490	contig_9594_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_73909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAGAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16125	14612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_14600_16100
845491	contig_6958_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_70005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAGAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738745	737519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_737500_738700
845492	contig_4732_pilon	+	884	5	Intergenic	novelGene_75422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	356.045643141438	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	54	791	596758	609401	FALSE	0	CCTGCGCCTTTGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILLLRWEKTPLPSSHFLHAARSPLSPYPVLSPHLVRNLFASEAISPCFVYTTALVAFGFCYCRETQILYTLCKIDAKP	596704	609494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607378_607825_607900_609167
845493	contig_18404_pilon	-	988	3	Intergenic	novelGene_173055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	23.5	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	109	942	16218	5939	FALSE	35	TGAACAAATTCTGATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCSRVALVTGANKGIGFAIARQLCRQFSGDVVLTARDAARGRAAVQQLQAEGLSPRFHQLDIDDLQSIRALRDFLRREYGGLNVLVNNAGIAFKSDDPTPFDIQAEMTLKTNFFATRNVCTELLPVIKPHGRVVNISSLEGLKALDNCSEDLQERFRCEMLTEEDLVDLMKKFVEDTKNEVHEREGWPSSAYGVSKLGVMVLSRIQARNLDEKRKGDRILLNTCCPSWVMTYMAEDYSSRAAEEVVETPVYLALLPPDATEPHGQMVWDKVVQIW	16326	5892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18404_pilon_-_6376_14184_14293_15929
845494	contig_7342_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_71187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTACCAGTATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630242	629787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_629800_630200
845497	contig_12543_pilon	-	1013	6	Intergenic	novelGene_168366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.5463442476886	98	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAAAATCGTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246679	232279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_232756_236307_236435_241001_241163_241375_241452_244439_244512_246578
845498	contig_3004_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_127553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATATGTACTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816925	818038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_816900_818000
845499	contig_1090_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_131120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACTTGCCCACTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362029	363082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_362000_363100
845500	contig_14563_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_135021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45313	46183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_45300_46200
845501	contig_11721_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_177086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTACAAATGTCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93445	95401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11721_pilon_+_93400_95400
845502	contig_17074_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_145181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCCTGGTTGGAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601072	599628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_599600_601100
845504	contig_7720_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_155794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATACATAAGGGGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843787	842966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_843000_843800
845505	contig_7272_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_25426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCTTCTCAGAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964549	963735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_963700_964500
845506	contig_15867_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_170909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAAGGTTGTTGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288887	287026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_287000_288900
845507	contig_11896_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_87995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGAAAACAAAGGACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70682	71544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_70700_71500
845509	contig_14275_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_162871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGCATTTGCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362009	362470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_362000_362500
845510	contig_1143_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_86622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTAAAAGCATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004113	1004617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1004100_1004600
845511	contig_15760_pilon	+	1752	2	Intergenic	novelGene_131069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAAGCTCAGGCGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479285	482257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_480202_481421
845512	contig_10299_pilon	-	864	3	Intergenic	novelGene_79789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	55.5	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGACCGTCGGTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780600	704414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_705208_780135_780182_780575
845514	contig_8017_pilon	+	1899	2	Intergenic	novelGene_65372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTGCATTTAACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483946	1491393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1484030_1489577
845515	contig_10734_pilon	+	1362	5	Intergenic	novelGene_51217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	26.7616796931732	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	110	586	1159545	1162117	FALSE	50	GGGACTGAAAAAATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQQVFSQIVSLEGQEIQVKAKRPKPHCFNCGSEEHQMKDCPMPRNAARIYEKRKEFLDACGEANNQNFQQRYHAEEVEERFGRFKPGVISEELQDALGVTDRSLPPFIYRMRQLGYPPGWLKEAELENSGLALYDGKDGADGEAEAGEVQQNKSVTYDLSKLVNYPGFNISTPRGIPDVSILFVSLFWDVTLLC	1158861	1162893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1158928_1159501_1159563_1160095_1160239_1160513_1160657_1161944
845517	contig_9377_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_176303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGGCCCTGCGTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317847	318945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_+_317800_318900
845518	contig_2757_pilon	+	2038	7	Intergenic	novelGene_164568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	682	1314	19880	20512	FALSE	15	CCTCACCAGGGTTGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFMHGYHVYYYIFTDDPAAMPHVPLGPGRLLSVIPIQGYSRWEEISMRRMETISQHIANRAHREVDYLFCLDVDVVFRNPWGPETLGDLVAVIHPGYYAVSRQQFPYERRQVSAAFVEDNEGDFYYGRAVFGGRVTRVYEFTRGCHMGILADKANGIMAAWQEESHLNRRFISHKPSKVLSPEYLWDDRKPQPPILKLIRLSTLDKGTK	13536	21236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_13573_14460_14654_15196_15263_17490_17542_17622_17659_18710_18846_19715
845519	contig_15866_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_63593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243388	242379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_242400_243400
845520	contig_7569_pilon	+	335	3	Intergenic	novelGene_114598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGCTCTGAGGTCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151399	173616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_151544_158989_159105_173540
845521	contig_7569_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_114602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATATCTCTGGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173566	174781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_173600_174800
845522	contig_610_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_76802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATCCTGAATATCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299893	301486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_299900_301500
845524	contig_10861_pilon	-	900	4	Intergenic	novelGene_39205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11.0855260988773	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTCATTTGAAGTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432344	376390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_376849_377941_378039_410070_410163_432091
845525	contig_15185_pilon	-	857	2	Intergenic	novelGene_99376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	119	640	42236	39906	FALSE	10	GTGTAGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPPRAAVRGGPARAPGPAHLKKPRTPSSVLRHHKHHLLMGHQPRAVVHGCGAHKAGASREPDQSSGLGGPRPEQDGAGLKRKYSLAAERPRAPEGARTRSGLKGANPRSREGTSLPSEEEPGMEHFLWTQGVFTENLLDPGDRESCLTQEIEAAASTTEYIGRQMAAAEPGYWHRMAWWASRPMEQNGYSGYADRQSERAEHLMARGLLVE	42354	39688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_40241_42049
845527	contig_20429_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_169248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126431	125769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_125800_126400
845528	contig_14118_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_177177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAGAAAAGAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124377	123262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14118_pilon_-_123300_124400
845529	contig_12031_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_137561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGTGGGACCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273074	274652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_273100_274700
845531	contig_987_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_72242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230593	228982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_229000_230600
845534	contig_2940_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_81885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	368	670	421239	420937	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLKSTICSVKQDDMQPRSVGAGLPGQWPRGCCAVCARATLGHLRRALCRSSWHAAPESREGQGREAPGSGSGTVGVVSVTWRPHPSWPRNAFRHSGAG	421606	420699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_420700_421600
845535	contig_2768_pilon	+	742	3	Intergenic	novelGene_57478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_1	127.5	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGAAAAAATTCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656160	669010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656504_664570_664689_668729
845536	contig_1435_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_115508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACACAGTTAAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556888	556079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_556100_556900
845537	contig_13201_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_130896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACAACAAAAAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558527	559704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_558500_559700
845539	contig_5059_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_140760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507115	506086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_506100_507100
845540	contig_15474_pilon	-	1655	2	Intergenic	novelGene_136237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGATTTATTTTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123819	113720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_114352_122795
845541	contig_8544_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_55934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGGTGCTGAAATAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159888	159693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_159700_159900
845543	contig_19957_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_57747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385330	386407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_385300_386400
845544	contig_1076_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_101117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100543	99776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_99800_100500
845545	contig_13744_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_77218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAATAATGAAAAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146643	1147547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1146600_1147500
845546	contig_3270_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_104511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGATTTTTGAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406721	406397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_406400_406700
845547	contig_6062_pilon	-	491	3	Intergenic	novelGene_5245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_1	72	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	236	328	541481	541389	FALSE	30	GTGTCATAAATTGCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	546549	541225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484
845548	contig_11391_pilon	-	955	5	Intergenic	novelGene_177515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	2.9474565306379	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	313	630	39925	35014	FALSE	25	TTATTTCTACCTCCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMNFFERLRSATWRPVPKSYLGPAFYLGTLMAGPSPKDTFLRLQGWNYGFVFINGHNLGRYWHIGPQESLYLPGAWLHPEDNEIILFEKMMSGLYIESMDKPYL	41044	34688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11391_pilon_-_35080_35198_35316_39460_39573_39902_39991_40797
845550	contig_5590_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_163017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCAGGCTCCCAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303195	302661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_302700_303200
845554	contig_8447_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_69400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	240	629	31384	30995	NA	75	ATTAAACAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIAQIGSCNGGVRSGQILDNRTQRETADRLERSQGCLQGWGPEPLEGCCPQGADGAHGGERSGCTVAVVLSLRCLLDIRGEMEGQQLDTGVWCRESSLGWRYKFGSCCELGKIIKVSVEGGEGQVHMN	31623	30362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_30400_31600
845555	contig_5153_pilon	+	1521	6	Intergenic	novelGene_74323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	146.791825385476	34	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	213	602	550736	582409	FALSE	15	CTTAGTCTTGTTCATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSMDRHIQQTNDRLQCIKQHLQNPANFHNAATELLDWCGDPRAFQRPFEQSLMGCLTVVSRVAAQQGFDLDLGYRLLAVCAANRDKFTPKSAAGISRMSGERRAMEVHHPGLGPLLSAFELCDSRELT	482029	583328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_482110_507853_507937_550686_550796_558854_558969_565925_566032_582299
845557	contig_4924_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_84770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCTAGCAGCAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242370	241156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_241200_242400
845559	contig_7229_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_39856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATGAAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406298	1405160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1405200_1406300
845560	contig_10861_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_39469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCCCCCTGCTTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2799084	2798298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2798300_2799100
845561	contig_5018_pilon	-	1019	7	Intergenic	novelGene_46966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	22.4034967508795	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1017	3	1019	381100	375029	FALSE	15	GAGGAAGCCCGGCTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSKSERNSGAGSGGGGPGGAGGKRAAGRRREHVLKQLERVKISGQLSPRLFRKLPPRVCVSLKNIVDEDFLYAGHIFLGFSKCGRYVLSYTSSSGDDDFSFYIYHLYWWEFNVHSKLKLVRQVRLFQEEEIYSDLYLTVCEWPSDASKVIVFGFNTRSANGMLMNMMMMSDENHRDIYISTVAVPPPGRCAACRDASRAHPGDPSAQCLRHGFMLHTKYQVVYPFPTFQPAFQLKKDQVVLLNTSYSLVACAVSVHSAGDSSFCQILYDHTASPLVPSSPPAPQSPEVPPALPSLSHEAAPVRPSGASEPSPAIAKAKEFVADIFRRAKEAKGGTS	381102	375028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_375262_377225_377397_377484_377625_377714_377822_378770_378907_378990_379089_380968
845562	contig_1274_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_137813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTGGAAAGACCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484718	486579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_484700_486600
845563	contig_11292_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_109401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTCTCACGTATGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120981	121388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_121000_121400
845564	contig_10489_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_165629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGACCCTACTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227708	228311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_227700_228300
845566	contig_6233_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_74825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATTATGTGTCCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437440	436691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_436700_437400
845567	contig_5297_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_175668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGTTGCGTCGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77629	79280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_+_77600_79300
845570	contig_5031_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_133168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTTCCCATGCGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16221	15709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_15700_16200
845573	contig_1686_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_165597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	924	1247	301393	301716	NA	60	ATAAAAAAAAACCCCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRGGKGSASPGSLLQRMGRQASSLGEAVLGGLHVLQWNLTCTPGYGCNYRGSVEMLPQEGDAPAGRRCSCGEETLLWGGDGEGVHTRQHLFTLMYVFINVLNTCI	300469	301720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_300500_301700
845574	contig_10940_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_49282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTGCTACTAGGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901635	902211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_901600_902200
845575	contig_4301_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_65098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474466	475761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_474500_475800
845576	contig_1836_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_71076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGACTGAGAATCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979804	979040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_979000_979800
845577	contig_2450_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_160312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAAACAGGGATGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742983	742388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_742400_743000
845578	contig_2450_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_160311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAATTATACCAGATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741856	740668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_740700_741900
845579	contig_1055_pilon	-	1364	4	Intergenic	novelGene_149723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	73.7126553283461	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	61	801	97107	84543	FALSE	45	AACACCCCCAAGAGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQWDRLTDEQEEAVNRSESVKFDARSMTALIAQNPKNGPTLQEKLKSFKAALIVLYLLVFALLIPVIGIVAAQLLKWDMKNCTAGSINTNGISTSLTGKENDSKGETRFREIVMEHMSILEKRIHYIADTETNLIDSEHFQNFSVTTDQRFNDVLFQLSTLVSSVHGHGNAIEEISKSLMSLNTTLLDLLLRTETLNGKVQENTFKQQEVRCFVLEGRMLGLNTFSRSCLLRQFRKVKVANHVST	108852	83979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_85067_95486_95601_97004_97112_108796
845581	contig_8683_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_150267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCGGTTTGAACCCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705037	703836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_703800_705000
845582	contig_6533_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_114631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTTCTGCTTGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76297	75454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_75500_76300
845585	contig_15114_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_121167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCTGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198706	198192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_198200_198700
845586	contig_299_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_129445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAATTTTTAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926736	925736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_925700_926700
845587	contig_7345_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_159184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATATCAGTCTCTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266580	265746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_265700_266600
845588	contig_4845_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_53671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAAATCTTGGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763409	763005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_763000_763400
845589	contig_2487_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_148459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCTGACATGTAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130410	128992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_129000_130400
845591	contig_11719_pilon	+	438	5	Intergenic	novelGene_154745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2553.12733476025	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1	402	13921	20039	FALSE	45	AGCCAGAAAACTAATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13920	20075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14008_14364_14504_16247_16326_19126_19183_19997
845592	contig_14219_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_54281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTATCTAATAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296136	295179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_295200_296100
845593	contig_5686_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_45204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAAGAAGCGGTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76660	75529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_75500_76700
845594	contig_16884_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_161826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTATACATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95342	96591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_95300_96600
845596	contig_5419_pilon	-	1841	4	Intergenic	novelGene_15567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.63299316185545	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	359	541	658937	657618	FALSE	25	TATCTCATGTATTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARGRHETYLCYVVKRRDSATSFSLDFGHLRNQSGCHVELLFLRYISDWDLDPGRCYRVTWFTSWSPCYDCARHVADFLRGYPNLSLRIFTARLYFCEDRKAEPEGLRRLHRAGVQIAIMTFKDYFYCWNTFVANHERTFKAWEGLHENSVRLSRQLRRILLPLYEVDDLRDAFRTLGL	660687	656317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_657672_658300_658417_658924_659196_660587
845598	contig_10140_pilon	+	699	3	Intergenic	novelGene_148430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	6	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCCTGTGGCTATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317119	323406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_317328_322463_322613_323064
845599	contig_5253_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_61551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCATTAGGTAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134342	133375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_133400_134300
845600	contig_14300_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_133090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAATATGGGTGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145784	146185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_145800_146200
845605	contig_16578_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_148660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGGGGCAGTTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204022	203315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_203300_204000
845606	contig_14300_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_133125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCTTGAGACCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366207	367009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_366200_367000
845608	contig_16525_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_133835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGACTGGAATCATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158651	159341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_158700_159300
845609	contig_10904_pilon	+	934	7	Intergenic	novelGene_22600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	39.7733160129586	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	128	754	479077	482153	TRUE	5	CGGCTGGCAGCGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSSPTPSFSEAKAAGALLNGPPQFSTAPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPHPSDSERIRQYLPRNPCPTPPYHHQMPPPHSDTVEFYQRLSTETLFFIFYYLEGTKAQYLAAKALKKQSWRFHTKYMMWFQRHEEPKTITDEFEQGTYIYFDYEKWGQRKKEGFTFEYRYLEDRDLQ	474059	482434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_474157_479046_479147_479241_479441_479820_479954_480609_480736_482054_482246_482346
845611	contig_10196_pilon	-	897	3	Intergenic	novelGene_132337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	124.5	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	385	831	2449636	2447014	FALSE	5	GTGGTATGTGGGTCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLSRRVGQKKQRLSEAERSRSLPDVARTPSPEEPCSGPHTCLGPPATTGPQRSIYFLSPKDHPARLGSEFFDQPGVRLARALLGQVLVRRLADNTELRGRIVETEAYLGPEDEAAHSRGGRQTARNRGMFMKPGTLYVFIIYGMYFCLNVSSQGDGACVLLRALEPLGGLETMQRLRSTLGKGASGRALKDRELCNGPSKLCQALAIDKSFDQRDLATDGAVWMECGPPGPKPAVVAAARVGVSRAGEWAQKPLRFYVRGSPFVSVVDRTAEQMQA	2452550	2446947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2447385_2449560_2449766_2452295
845614	contig_8418_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_166068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAACAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173752	1174208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1173800_1174200
845615	contig_8980_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_74016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTGCAATTGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669292	670226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_669300_670200
845620	contig_11096_pilon	-	601	3	Intergenic	novelGene_143461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCATCTTACCTGTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198645	197648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_198039_198137_198237_198533
845621	contig_10627_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_59962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	736	1071	191386	191051	NA	65	AGTGAAAATGAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTFQKQIARPFFQGACGRVQTADLLFNSRVLTVCTTQELKLNKVKVNIVELQMLLVVKCNSFLEVVFICRSLVLRLLDQEVVLRILGLMNNLCTRFGNLSTHSPLQYSAR	192121	191048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_191000_192100
845624	contig_546_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_117168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAGGTACTGAGCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40595	41023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_40600_41000
845626	contig_4364_pilon	-	953	3	Intergenic	novelGene_161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	8	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	1244244	1238195	FALSE	5	GCCGGAGGCCTCCGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPGSGCGSLGSGDWSACTWGAGLEGGWSWVPDVGGGAPASLVSCNAELPWEVTEALPPFPTYSLPSTLSDESSLGTLSFGCVTSLKAPGYEGEDQVLERRGHLALGGQRRELWHLPDGFQRLLSRL	1244246	1237627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1238199_1243254_1243381_1243990
845627	contig_2100_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_50581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTGCACATGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318549	317501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_317500_318500
845628	contig_4364_pilon	-	507	3	Intergenic	novelGene_4571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	10.5	498	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	391	507	1761104	1760988	FALSE	35	AGAAGGACAACTGGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTDPRWRRPRGPGQGVHVSERSGVESRAGPPPRLPRTPGVLRGRGRGVRQVRAGLHCPRRTPEEGSLRPGVRGPAELLRCRGQEHHKGRLLAGTNPPRLLGCTHLRPTSAKPGLATGAARQTSDTGAETGMESLAPEWGGVSAVRAAGTEGEISQHSVHRVWDRIKHT	1762150	1760987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1761251_1761754_1761866_1762017
845632	contig_9995_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_47766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGGTGAGTGCGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702378	701682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_701700_702400
845634	contig_8195_pilon	+	860	2	Intergenic	novelGene_170052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTTTTAAGCACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127570	135544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_128154_135267
845635	contig_15897_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_49523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTTTTTTTTTTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281017	281864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_281000_281900
845636	contig_4519_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_123687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCTAACTTAATGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415063	415650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_415100_415600
845637	contig_602_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_134958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAAATAAGGGAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507354	508631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_507400_508600
845638	contig_18843_pilon	+	397	5	Intergenic	novelGene_165617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	793.756692885169	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	249	149	397	31251	36936	FALSE	30	GTAAGTTATATATCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCRGRLGVGSPPRDFFSRTLFSERCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDE	28898	36936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28974_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859
845639	contig_13607_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_170220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAATTTTTAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440906	442173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_440900_442200
845640	contig_4364_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1	462	1270591	1271052	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VETAPRLGESQIAKLKLPPVPPQEGWVASPRPPPELTHRHQTAPRQTKPVAKPYLAHLAWPEPRAWPVSIYCLHLCCLLGPPWPAFCHLYPALGATTHGQAPFPPDPARTDRDQAQSWEPSPVPLCPLPPVVASCLLGLRHLRQQRARPCFPL	1270590	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1270600_1271100
845641	contig_9753_pilon	-	422	5	Intergenic	novelGene_41334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_3	334.346657677327	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	38	421	93294	70468	FALSE	35	AAGATCCTTATTATGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWIIDSGAVSDWNVGRSPDPRAVSCLRNHDINTAHKARQVTREDFATFDYILCMDESNLRDLNRKRNQVKNCKARIELLGSYDPQKQLII	93331	70466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70559_73254_73317_85817_85932_86172_86247_93251
845642	contig_9218_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_157681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACGGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268738	268391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_268400_268700
845643	contig_15327_pilon	+	900	3	Intergenic	novelGene_70425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	205	876	36170	54552	FALSE	10	ACTTCAGCCTCTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVRNWLVGFSSLSRCSPAAAETPARSTRLSAGIPAALAASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEKSGLLAGDRLVEVNGENVEKETHQQVVNRIRASLNAVRLLVVDPDVDEQLQKLGVTVREELLRAQVGSGPAELQAATEAQGDGGESEPREAEKSQAERRELRPRLCAMKKGPNGYGFNLHSDKSKPGQFIRAVDPDSAFNSCVSTPTPGDPGSKGRAWLPLPSPEPGTIVRKLQ	35965	54576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36611_48133_48247_54434
845645	contig_1865_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_103231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAGAATACTTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39679	39248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_39200_39700
845646	contig_17790_pilon	+	894	2	Intergenic	novelGene_128482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	242	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80259	114024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_80402_113272
845647	contig_8538_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_4699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	87	320	842828	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	842741	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842700_843100
845648	contig_2251_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_128473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTAGGTACTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76977	76207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_76200_77000
845650	contig_18794_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_54668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGCATTTTGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346902	346430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_346400_346900
845652	SIRV6	+	379	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	152	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
845654	contig_18967_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_165310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCCAGCAGTTGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18725	17158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_17200_18700
845656	contig_9177_pilon	-	602	4	Intergenic	novelGene_32633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2079.39644020941	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	221	535	26442	25632	FALSE	15	TGAGGGCCTGGCAGGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGVRHHGVQEETETSENPYARRNCEDYHGG	32946	25564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_25715_25967_26070_26312_26476_32759
845659	contig_6589_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_26319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTCTCAGAAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2374533	2374917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2374500_2374900
845660	contig_4232_pilon	-	629	6	Intergenic	novelGene_63166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.093858300762	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	110	352	90379	89454	TRUE	60	ATAAAATAAAAGGGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHADGRGDWEARALELFLESLLKKACQVTQSRNAKTMTTSHLKQCIELEQQFDFLKDLVASVPDMQGDGEDNHMDGDKGARRGPEARQQQPEEWWHGKQRQGQEAVGDGLRAGGRV	90607	88834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_89034_89375_89465_89719_89815_89927_90048_90362_90457_90575
845661	contig_11912_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_177517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTCCCTAATATCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37726	38695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11912_pilon_+_37700_38700
845662	contig_9332_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_60740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACAAAATGCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595683	594795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_594800_595700
845663	contig_5947_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_101562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCATACAAAAATACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679494	679011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_679000_679500
845664	contig_10037_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_148954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCTGAGAAAAAGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214121	212730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_212700_214100
845666	contig_935_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_45519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTCATACTGCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28367	27343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_27300_28400
845667	contig_9053_pilon	-	390	2	Intergenic	novelGene_87924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGATTACTTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87584	87086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_87368_87475
845668	contig_15277_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_175426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAGAAGAAAATGCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246341	244577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_244600_246300
845672	contig_1996_pilon	+	1174	2	Intergenic	novelGene_131889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	346	924	218013	218815	FALSE	25	CAACGGAATCTGCCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQSGEEWGTALSHLVLGVVSLHAAVCTAQASRGAAAGFLLQALAAATMLAPGLGTDEDCLAGAWVATVISLPLLAFDFHWVNGDRSSANLLLGGGMVLAVAGDHLGTEGRSVAGQAVVLVVSVTILIVAVFTANTYGMWGGAMLGVAGLLSRLEEDRLLLLPKEDVCRWALAAGSWAYRRALQTQHLQWE	217667	219065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_218106_218329
845674	contig_5777_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_173324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51724	50910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_50900_51700
845675	contig_15720_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_41976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTTATCTTTTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387277	386646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_386600_387300
845676	contig_14666_pilon	+	581	4	Intergenic	novelGene_39613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	68	559	477340	485206	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAGLRHPAPGAQHGCHLSRQQHGHPGALQQGFRAHSVNFSFLAK	477272	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_484181_484489_484640_484732_485169
845677	contig_14841_pilon	+	1610	6	Intergenic	novelGene_177518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.489897948556636	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	380	1126	114852	149621	FALSE	25	CATATACCCTTATCTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGTEGAYYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKVMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGLPKEEGKQQEKPEGAETTAPTTNGSIGDPSKDVEYVCELCKGVAPADSPVVYSDRAGYSKQWHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFSEDYQRVEDLAWHRKHFVCEGCEQQLSGRAYIITKGQLLCPTCSKSKRS	69126	150105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14841_pilon_+_69196_105197_105287_114630_114888_127181_127518_146950_147167_149462
845679	contig_3382_pilon	-	606	4	Intergenic	novelGene_124027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	472.144281149547	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCGTTCATTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344850	176647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176890_306314_306380_309848_309943_344645
845681	SIRV3	+	432	3	NNC	SIRV3A	novel	436	3	NA	NA	4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4081_4566_4780_6572
845682	contig_19990_pilon	+	1418	7	Intergenic	novelGene_30745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_2	118.699901712961	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	137	1072	12837	70284	FALSE	20	TAAGATCTAGCTCCCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAKDYPFYLTVKRANCSLEVPPASSAAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNATPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEDLLSQLRDIRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAVSLSILSLLPCYFPHNGWWIG	12700	70630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_12933_39525_39634_59204_59376_62749_62813_64728_64826_64991_65069_69960
845683	contig_709_pilon	-	402	2	Intergenic	novelGene_57540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCAAAATGTTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511318	1501441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1501752_1511226
845685	contig_4924_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_84782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAGGATATCCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452120	450635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_450600_452100
845686	scaffold_16539_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_68306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTCAGAGCTGCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98800	96915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97555_98674
845687	contig_9332_pilon	+	1172	2	Intergenic	novelGene_60714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGATTTCTTGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80500	81726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_81273_81326
845688	contig_13823_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_145284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAAGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348599	347509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_347500_348600
845689	contig_14034_pilon	-	1453	5	Intergenic	novelGene_72639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAAGGAGCAAAAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158400	154463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_154582_156781_156859_156911_157010_157100_157331_157470
845690	contig_4769_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_118010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAATAGTAACGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061243	1059443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1059400_1061200
845691	contig_13123_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_136911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGATGTTTATTTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446878	446075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_446100_446900
845693	scaffold_9205_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_161108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGAAAAAAGAAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351729	351123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_351100_351700
845696	contig_7340_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_159898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1204	1545	141026	140685	NA	40	ACACACCTAATTTTCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPGLWPEMNNTLKSGVNLNALNTRKMPPTKASNLYSTFPLNPTRLPVSSDTARQKLPSTAHGQHRGSKTKYNGPTHPYFSPSEQQILNSKMTRQSRLKRLPEKQKLCKAAR	142229	140088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_140100_142200
845698	contig_4492_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_166116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTCTTTCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419143	418154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_-_418200_419100
845699	contig_16411_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_77306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAAACCAACTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121667	119881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_119900_121700
845700	contig_10323_pilon	-	881	3	Intergenic	novelGene_123560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	46	780	382096	333108	FALSE	10	GGTCCTTCTTTCTTAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGLPRRGLWLLLVHLLVVATACQNANYGPVIQELCLKRFQVDMEALGKTLWCDWGKTIGSYGGAHGLHQTRGREAALLLAEPRGGPLLHRRPQALLQELPRVRPGRAGPARQHPVPLCRAAHHGHPGCDSAGGLEEQAPGRHRVGGRSCPQARAPSAHRGRPGRARSPGPAQRQRLGPSSKACPKPPSSPSRGELQDFRGSLAQAFTLSDPERAAEVLKGRGASLSFISEEESQALLLPMCL	382141	333006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_333661_373133_373273_382053
845701	contig_6058_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_172385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGCTTTTTCTAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379194	379490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_379200_379500
845702	contig_4999_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_177521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCTAGATGGACATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202438	201059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4999_pilon_-_201100_202400
845703	contig_2043_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_169931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGGCAAATGCACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827667	828968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_827700_829000
845704	contig_12278_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_152594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGACTGTTTCCAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192033	192999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_192000_193000
845705	contig_6576_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_42374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTAAGGGTGATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244244	1245089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1244200_1245100
845706	SIRV6	+	435	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	28	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1642_1736_1845
845707	contig_2854_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_120894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154959	1153670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1153700_1155000
845708	contig_10377_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_115352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	396	743	177162	176815	NA	75	CCTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESGWRVCFSPILFTHRLVVQTPPRGASEGRPSDLFPKGHSLENPVQDSSLHTWGHRESESTPQKLTTSRLLPLPSSCPRKQHSRACQMETLIVDRVDAAISLPPTYLPFRLPG	177557	176727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_176700_177600
845709	contig_12884_pilon	-	1061	8	Intergenic	novelGene_105002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	603.4133520808	4	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	333	1046	906341	899583	FALSE	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNFLVHEKIWFDKFKYDDAERKFYEQMNGPVAGSSGQENGASVILRDIARARENIQKSLAGVSTAPGLAESLPQPCCKFRCKGRLQAVLPSPPEAPSQAAQGTSSGASSGPGGDHSELIMRMASLEVENQSLRRVVQDLQQAFSKLEARLSTLERSSPTHRATAPQTQGAPSWCQWATASISCRSSAWWRMTRWAPTCWRRRSPSSRSTCRVSTLLLSTRSEPSACVCVCEPAAN	915560	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899920_900647_900749_901038_901133_901462_901520_905692_905834_906224_906349_915235
845710	contig_10740_pilon	-	1528	3	Intergenic	novelGene_152250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATTGAAGAACCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163846	161112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_162498_163246_163272_163728
845711	contig_753_pilon	+	959	6	Intergenic	novelGene_112932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	10.0319489631876	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	143	958	607251	631690	FALSE	30	TGGCAGAGGAAATTCGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKVEVGTEVTDYRFFVRAIIRHSDLVTKEASFEYLQNEGERLLLEAMDELEVAFNNTNVRTDCNHIFLNFVPTVIMDPSKIEESVRSMVMRYGSRLWKLRVLQAELKINIRLTPTGKAIPIRLFLTNESGYYLDISLYKEVTDSRTAQIMFQAYGDKQGPLHGMLINTPYVTKDLLQSKRFQAQSLGTTYIYDIPEMFRQSLIKLWESMYTQAFLPSPPLPSDMLTYTELVLDDQGQLVHMNRLPGGNEIGMVAWKMTLKSPEYPEGRDIIVIGNDITYRIGSFGPQEDLLFLRASELARAEGIPRIYVAANSGARIG	606359	631691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_606448_607196_607353_608996_609201_613922_614079_615915_616063_631483
845715	contig_9011_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_159283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAATGTCCCTCTATTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194890	195960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_194900_196000
845718	contig_13607_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_170192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	10	324	270986	271300	NA	50	AGGAACCCAAAGGAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEMEERLSAALATAEPAVAPASLGVSPVCKAVGYFQCWALPRSSFIIHFHDSRFQGWEGTLQASDSRCCLWTCSQTNPLLQTEARSPHRGVGCCFRFKRALLRISL	270976	272159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_271000_272200
845719	contig_11321_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_86654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTCATTACTGAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158325	159481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_158300_159500
845720	scaffold_13505_pilon	+	1745	1	Intergenic	novelGene_111636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	18	350	750899	751231	NA	20	AACGTGGCTGCACTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTQNEMRKHVQGAPEVPGILPSPVEIYTQVPQLPCSRVRLTPQPDCGLPRAGTSDSLASCCEGAGLARAGILPTHVTCNVASHTNCSKHCGFKGPQVSLGVVHFTLRTEAAKGQG	750881	752626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_750900_752600
845721	contig_10339_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_125274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324635	324942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_324600_324900
845722	contig_17414_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_156944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	361	387	74201	74227	NA	5	CTTCTCTGTCTTGGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQKYGWSFLVDKAKREIREITHISHSLKDQHLLGTKSVRIKRWEIGGAEPLWPIPVWSLPASKYPPTLSTQTHTALCGEGNPLGLESVEGTVIACSRNVSKPLIQRLRNCPRSCSAHPEAMGGQLFCC	73840	74700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17414_pilon_+_73800_74700
845724	contig_500_pilon	-	1169	6	Intergenic	novelGene_31104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	16.2677595261302	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1044	125	1168	1535842	1529874	FALSE	15	TGGCCACGAAGTTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMGLARLFSSPRLLGLSVLQHLCPRRARWAGGREGPSWLQATGLTWSTPAAFSSSLSELPPGPGNQKNTGGLSSDLSQPSPTATPDEEEEEESFGTLSNKYSSRRMFRKSTAQLYNLRIGGQSVEEDEERELEPKSWRGPGNSPYWYFLQCKRLIREGKLAEALDLFERQMLKEERLQPLECNYTVLIGGCGRGGYLKKAFRLYNDMKKRDLEPSDATYTALFNVCAESPWKDSALQSALKLRQQLRARNVQLNLKTYHALLKMAALCADLRMCLDVFKEIVLKGHTVTEETFNFLLMGCIQDKKMGFRYALQVWRQMLSLGLKPSRHGYNLLLGAARDCGLGDPE	1541341	1529872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1529973_1531803_1531906_1533458_1533678_1534558_1534700_1535359_1535869_1541243
845725	contig_16625_pilon	-	926	5	Intergenic	novelGene_171110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	27.4169199583031	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAATTTTACCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63840	32419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_32997_34818_34929_54768_54849_55234_55267_63713
845726	contig_12312_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_63927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGTATTGTTATTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183961	184696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_184000_184700
845730	contig_9706_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_21006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	116	382	506613	506347	NA	25	GTATGGGTTGGGACCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPFPAFNSKVSKIFSFELNPSSLGPQRILFTSLVNFSMSVETHGRAEESFSASPAVTFSYLHNMTIHYALPKFIRSLLLLSRHSVNVFLLAVMGCPLLTIFHFMQIQVSLKKSIFLTIKKCALYV	506728	505963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_506000_506700
845731	scaffold_16539_pilon	+	602	6	Intergenic	novelGene_68414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	88.6823545018963	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	82	522	913956	918774	FALSE	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGFQSGGNRGRGRGGKRGNQSGKNVMVEPHRHEGVFICRGKEDALVTKNLVPGESVYGEKRVSISDARHPHKYRMLIAMVDVIFADVAQPDQTRIVALNAHTFLRNGGHFVISIKANCIDSTASAEAVFASEVKKMQQENMKPQEQLTLEPYERDHAVVVGVYRPPPKVKN	913874	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_913981_914073_914169_916124_916162_917177_917291_918487_918634_918749
845733	contig_7904_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_160035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAGTGAGCAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538268	538939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_538300_538900
845734	contig_7898_pilon	+	1333	2	Intergenic	novelGene_47589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497222	499905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_498486_499835
845735	contig_4686_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_118591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATATAAATAAAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840137	839465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_839500_840100
845736	contig_8241_pilon	-	919	2	Intergenic	novelGene_157496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTACAATAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571068	564902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_565255_570501
845738	contig_17144_pilon	-	674	7	Intergenic	novelGene_29163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	269.187460497121	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	175	660	162026	157620	FALSE	20	ATTTCTTTCTGCCTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQKEKLKIKQEWLMNKIVANPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHRRWVTKKALCIQVFQEAQKLKKQKRALKAAAAAARKQSQRSPEGPSKARPEALKENQ	164740	157605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_164215_164261_164648
845740	contig_4732_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_75362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGCCTAGTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136357	136775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_136400_136800
845741	contig_4732_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_75363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCCTCCCTTTTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136825	137091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_136800_137100
845742	contig_6674_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_148035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGCAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409809	411477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_409800_411500
845743	contig_2209_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_141026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271154	272252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_271200_272300
845744	contig_6691_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_60164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCTCCCAGGGCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380972	382807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_381000_382800
845746	contig_16046_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_145511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAGAACAACAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123521	123998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_123500_124000
845747	contig_16046_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_145512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAATTCAACTATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124099	124598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_124100_124600
845749	SIRV5	+	1086	2	Genic_Genomic	SIRV5A	novel	2473	1	NA	NA	1223	-5	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCGACCATGTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12356	13601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_+_12867_13025
845752	contig_10023_pilon	-	194	2	Intergenic	novelGene_123517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCAGAGTGGTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456381	456012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_456131_456305
845753	contig_8597_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_158726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAATAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135428	133912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_133900_135400
845754	contig_3818_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_99318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATATCTAAATTTAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142380	1141229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1141200_1142400
845755	contig_16124_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_175388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGCAACCCTATAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63129	62764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_-_62800_63100
845757	contig_1331_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_37880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429471	430551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_429500_430600
845758	contig_7843_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_152041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTGAGCATTGCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408288	410126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_408300_410100
845761	contig_9828_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_172262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCAGTGATGGTGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384548	383854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_383900_384500
845762	contig_7898_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_47553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	494	841	318244	317897	NA	20	GCATATACTTCCAGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADARDAFVDVVRAITGKDEAVPREKDRGLGGSRQEVYVVLTFFKHHLGYQVHFVPPSCGGFAGEECVLSGSVPGQVPFRKFQPPSVQTCHQRTTQWDGAAVQDSAFTLVDAHCL	318737	317834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_317800_318700
845763	contig_8375_pilon	+	957	7	Intergenic	novelGene_141328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_1	28.5817540865963	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	67	909	310847	320006	FALSE	30	CTGGTCTCTACAACCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAHLHSLNIVHRDLKPHNILLSMPNAHGRIKAMISDFGLCKKLAVGRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQRQANILLGAYSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWGLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGLIVKQLEKGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPTEVRETLGSLPDDFVRYFTSRFPHLLLHTYRALELCSHERLFQPYYCHEPPEPQPLLPPDAL	310484	320054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_310513_310808_311009_314343_314492_315571_315700_318004_318129_318576_318645_319793
845764	contig_6557_pilon	+	435	3	Intergenic	novelGene_32991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12582	junction_1	100.5	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	57	407	435225	440040	FALSE	45	AACTGCAAAAACGAAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	435168	440068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_435306_436630_436772_439911
845766	contig_10986_pilon	-	1044	9	Intergenic	novelGene_71469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	170.869787777126	1	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	382	717	74333	72175	TRUE	20	TCCCCGTAAGCTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR	80366	66792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67296_72167_72321_73924_74006_74224_74353_74985_75049_75476_75544_76171_76227_80189
845770	contig_9161_pilon	+	1329	2	Intergenic	novelGene_160653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	526	960	159508	159942	FALSE	85	AAAAAAAAAACAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDYSDDYRELEQDLFQRISKQEPRGSAEYTYWGLLPGRQGGLKLLCQRELCNISREAVRDSELHNLVKLNELAGTPAPEPSPERRLLLPLVTTPSSGEVLEKEEAFSALRTNQQQLWKGGGFVDMCSRGWEGPRRAEGRRELC	152514	160311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_152658_159125
845771	contig_13894_pilon	+	964	5	Intergenic	novelGene_62215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	59.1116528275094	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	27	626	799801	804320	FALSE	20	TGAAATTATTTTTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSERKQKMQNPEPMEEMEAGAASRDLMDKNTYQMQFTNDLSQLGLNKTYLCYEVELLDSNSWVPLDDCRGFLRNQPGLHAELCLLDLVPSWHLDPTKRYRFTWFLSWSPCPDCAQKVVAFLERNSHISLHIFAARIYDYRERYEKGLRSLQGAGAQVAIMTSTEFKHCWRTFVNNKGCLFVSWNRLNMNSQNLKMRLQSILENGNN	799774	804658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_799851_800677_800832_802777_803043_803923_804040_804305
845772	contig_10196_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_132289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCAGTTCTAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2306256	2306849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2306300_2306800
845773	contig_1996_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_131930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGTGAATTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497059	498040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_497100_498000
845774	contig_2342_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_132742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATATTTTAGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12499	13307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_12500_13300
845775	contig_14472_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_111184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAACAGAAATGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394836	394260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_394300_394800
845776	contig_10082_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_63884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATACTTAAAAGTAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315772	317089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_315800_317100
845777	contig_10044_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_156383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTATGCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138852	137767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_-_137800_138900
845778	contig_348_pilon	+	823	2	Intergenic	novelGene_67585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	231	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	145	552	249449	250446	FALSE	15	GAAGTGCCTCCTGGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAYPREDPRAPATRKPDGATHTALTLGEPRPQLPRDHMIWSIFSTLYLNLCCFGFLALAHSIKARDQKVAGDLEAARRLGSRAKCYNILAAMWTLVPPLLLLALVVTGALHLSRLAEGSAAFFSTKFDDADYD	249304	250717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_249644_250233
845779	contig_8980_pilon	+	1259	7	Intergenic	novelGene_74003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	4.43471156521669	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	41	1258	368205	377582	FALSE	35	ATCTAATCTCAGACAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIRNVHFGDAADYMFVAGKATSTATLYVEARHIEFRKHIKDIKVLEKKRAMFECEVSEPDITVQWMKDGQELQIVDRIKIQKEKYVHRLLIPSTRMSDAGQYSVVAGGNMSTANLFVEGRDVRIRSIKKEVQVIEKQRAVVEFEVNEDDVDAHWYKDGIEINFQIQERHQYVVERRIHRMFISDTRHSDAGEYTFVAGRNRSSVTLYVNAPEPPQILQELQPITVQSGKPARFCTVISGRPQPKISWYKEEQLLSTGFKCKFLHDGQEYTLLLIEAFPEDAAVYTCEAKNDYGVATTSASLSVEVPEVPSPDQEMPVYPPAIITPLQDAVTSEGQPARFQCRVSGTDLKVSWYSKDKQIKPSRFFRMTQFEDTYQLEVAEAFPEDEGTYTFVASNVVGQVSSTATLRLEGRVKLTTTFV	368164	377583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_368254_368973_369116_369199_369366_370520_370753_372145_372431_372653_372780_377364
845780	contig_16103_pilon	-	551	3	Intergenic	novelGene_118729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	40	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGCGTGCTACTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288669	276223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_276457_286996_287190_288544
845781	contig_5770_pilon	-	547	6	Intergenic	novelGene_74184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5733.0237187718	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	16	513	264932	261935	FALSE	25	AGAAGAATGTTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264947	261900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262900_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
845782	contig_7201_pilon	-	797	5	Intergenic	novelGene_152507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_2	310.097162192755	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	75	713	255800	224171	FALSE	75	AGAAAAATAAACAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVRNTLIQVTLGCFFQQRILGGFTA	255874	224086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_224396_229524_229661_238453_238545_239711_239821_255722
845783	contig_8820_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_79261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGAGAGAGGGACCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69269	67673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_67700_69300
845784	contig_15820_pilon	-	778	3	Intergenic	novelGene_174592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0.5	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	27	776	158566	21738	FALSE	25	TACAGTCTTCTCTGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGGCSSSMKRTQTAEEREREAKKLRLLEELEDAWLPYLTPKDDEFYQQWHLKYPKLILREADNVPEELHKEVQEAFLTLHKHGCLFRDLVRIQGKDVLTPVSRILIGNPGCTYKYLNTRLFTVPWPVKGSTIKYTEDEIGAACQTFLKLNDYLQTETIQALEELTSKEKSSGDALPVYIAPDFPRIGMGSSFDGQDEEDVKSRAAYNVTLLNFMDPQKMSYLKEEPYFGMGKMAVSWHHDENLVERSAVAVYNYSCE	158592	21735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_-_22365_41885_41964_158521
845785	contig_5955_pilon	+	1646	4	Intergenic	novelGene_177522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.4142135623731	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	185	619	216023	295507	FALSE	45	AAGTACTAATGAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTRRRSCLVLPCWAACGSRAPVRPGRSLGPLHPSRLAERRCGARRRTGRVAAARDVDAPDKMKSPIPVVLLACGSFNPITNMHLRMFEVARDYLHQTGVYQVIKGIISPVNDNYGKKDLVAAHHRVAMARLALQTSDWIQVDSWESEQAQWMETVKVLSCARAEAALRGRCPEDLPDSQPLERRAHPGNSGEVRLGVRGPGRPRP	153667	296534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5955_pilon_+_153811_215981_216132_283372_283557_295365
845786	contig_14666_pilon	+	508	5	Intergenic	novelGene_39621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	43	462	477340	485184	FALSE	85	TTAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQICTLC	477297	485230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483990_485169
845787	contig_13481_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_119298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGAGTGCTTATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195972	197343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_196546_197209
845788	contig_15867_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_170888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCCAACCTTAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69210	67608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_67600_69200
845789	contig_10331_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_54209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAAACATGATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811049	810579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_810600_811000
845790	contig_10331_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_54208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	182	349	810297	810130	NA	75	TCATGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSQSVRTVWVRRGTNRKSGNPVCKLRGEGSRISIQHQDCSITLTENPDKAKCHFLYPNLMISAGCREALRGGSVVSPGLMLFIVLTPSIAGVGGGWAATCRKIEKGDIEERVRA	810478	810063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_810100_810500
845791	contig_8898_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_137266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCTGTGTATTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394023	392119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_392100_394000
845792	contig_18113_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_137549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATAATGTGCACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248740	246785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_246800_248700
845793	contig_3825_pilon	-	1348	8	Intergenic	novelGene_78044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.986641118319	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	52	975	2443425	2427327	FALSE	20	TCACGAATTACTGTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVQEEKIFAGKVLRLHICAADGAEWLEEATEDTSVEKLKERCLKHCAHGSLEDPKNVTHHKLIHAASERVLNDTKTILEENVQDKDVLLLIKKRAPAPLPKMADVSEEEQKKQEEKAPDKDAIFQATANLPSYNMDREVVQTNMRDFQTELRKILVSLIEVAQKLLALNPDAVELFKKANAMLDEDEEERVDETALRQLTEMGFPESRAVKALRLNHMSVTQAMEWLIEHAEDPTIDTPLPGQASPGTSAAASAEAPAETSEGDEEARDELTEVFKKIRRKREFRADGRQVRGSWGHSVTCAAPES	2443476	2426953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2427381_2429607_2429825_2430513_2430623_2430924_2431028_2432244_2432353_2435075_2435150_2436262_2436384_2443287
845794	contig_3270_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_104474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAGAATAAGAGAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155454	154981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_155000_155500
845795	contig_15120_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_108040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGACTGAGTTTTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720280	720881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_720300_720900
845796	contig_15120_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_108041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCCCTCTTCAAGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721489	721738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_721500_721700
845798	contig_5084_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_64520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	378	425	385734	385687	NA	25	TAGTTCAGCACTTGTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTVSLFRFIFCAEFFLFVGYLFIFFIFVNFVFTESLFSSLFWWADLLIFFVVTVTFTFFILCLKQSVIFRYCLDFSVTTLLRPPFCFEVHIDFKLTCLEPCFQFCCFILLSRFLYLSWHLGDAVMWLAQVVVCWCWFSI	386111	385273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_385300_386100
845799	contig_7704_pilon	-	803	8	Intergenic	novelGene_154607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	174.079503300612	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	418	750	220403	216744	FALSE	5	CCAGGCTCCTGCTGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILADCTLVLAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFISRVTDCLTTVKSVNKTDSQTLLAIFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLKVP	266678	216690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_216795_217117_217187_217390_217463_219198_219299_220362_220440_222497_222598_223587_223692_266501
845800	SIRV4	+	249	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1522	632	1067	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2522	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
845802	contig_11370_pilon	+	773	3	Intergenic	novelGene_98734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1310	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	106	498	145831	148269	FALSE	20	CAAAGTGCTGTGTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRSDASLGDGQRRCPWWFDQQEML	145725	148544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147620_148205
845803	contig_4426_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_15460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCATGATGTTCTTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921336	921597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_921300_921600
845804	contig_12031_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_137555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATAAAGGAACGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151989	151724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_151700_152000
845806	contig_11396_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_71328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGTTGTTTTATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475813	477216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_475800_477200
845807	contig_7870_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_109074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTATCTTTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742183	742560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_742200_742600
845809	contig_9535_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_124492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAGGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606590	607015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_606600_607000
845811	contig_500_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_31096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1793	2092	1508418	1508717	NA	45	TCAAGCTTGCCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCSLWTPEDAGIAVALIPTTGSLLETEAHLISSEFLTQSKESVIRQPKLLRTPGTVAEILASPDFLDSSCKAIIGLLQNTSPIFNDYLASQGRLGLCS	1506625	1508735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1506600_1508700
845812	contig_8156_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_98914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	520	900	150867	150487	NA	35	GGATTAAATAAAGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKSPSLQLLCQSISLKVSLALAGPLLHQTLPPPLASDPSRCCIQRKQVHKSTADKMYKILLFGGTWEANWQAPAWLFSLRHALNITIWSYVIYAILQNFQVRDAISSLDNTCQDLTILQNYKVLS	151386	150087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_150100_151400
845813	contig_10727_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_159657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCGAAAAAAAGGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102902	101809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_-_101800_102900
845814	contig_16110_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_126773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTCAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7719	6897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_6900_7700
845815	contig_18869_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_56451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAACAGTAGTTAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151719	151007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_151000_151700
845816	contig_8866_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_77798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAATCAAATATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404870	403927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_403900_404900
845817	contig_10324_pilon	+	1024	6	Intergenic	novelGene_7844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	53.4318257221293	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	18	593	284977	296100	FALSE	15	CACGTGTTGAGGTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHIVCMAPKDFLGANFTLYRGGQVVQLLQAPAGQLGVTFNLSGNSSEAPGGAFYCQYSVIGEHSQPQPSDFSESIHVSFPVPTWILALSLSLAGVLFLALLVTVVMVIRKVKVTNLQKKRERESCWAQINFTPSDMSFDNSLFVISTKMVSEEDSTTLDAQSSSTAASSISQTWKRPTSTSSSLESPEFSTFRAPL	284959	296531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_285203_287181_287272_288007_288036_288830_288875_290728_290767_295950
845818	contig_18613_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_80227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATAAAGACCTAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26677	27859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_26700_27900
845819	contig_12852_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_141445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTTTAAAACTGATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479281	480433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_479300_480400
845821	contig_8587_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_159106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGCTCTTTTTAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117302	117835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_117300_117800
845822	contig_10331_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_54207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGGAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772858	774193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_772900_774200
845823	SIRV2	-	314	2	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	4137	345	2958	-345	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTGATAGAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1774	1380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741
845824	contig_7398_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_166152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69532	68848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_68800_69500
845825	contig_7138_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_120980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135113	136013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_135100_136000
845826	contig_10629_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_52942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACAGCTCCTGCTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440792	381986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_382451_440753
845827	contig_10861_pilon	+	529	2	Intergenic	novelGene_39377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	70	462	1685906	1687385	FALSE	20	TGTCTGTAATCTGATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRSGYQLGNVTQSPPPSLKTVCSEYGGVCVGGGSGWLLSKLCQGGRRAGLLVSLEKGSVALIMNSIIEYIAFVPFLQEGDFL	1685836	1687452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686055_1687141
845828	contig_4364_pilon	+	1095	9	Intergenic	novelGene_4584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	716	1072	2064256	2088713	FALSE	45	AAGGAAAGATGCCGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAVPHATPPRRVEVLPDPPEADGHPLAQQRVGVVKLLQADGDQVSLKAGFLPRVIAVDNHSQDEGRHGPMLGWHVGVCQDREEVLVAVVLHQVGLARAVHGEDLGPYEHQERPQLPG	2044191	2088736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2044303_2056557_2056725_2058525_2058668_2060258_2060373_2062469_2062610_2064214_2064408_2065040_2065107_2068874_2068951_2088650
845829	contig_9389_pilon	+	406	2	Intergenic	novelGene_83975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	13	405	366886	367556	FALSE	20	GTAAGTGTCCCGGCACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFVQLQLAAQHAPLQHRHVLAAAAAAAARGDPSTTTPVTSPCRPVSSAARVPPVPSSPAPASPSPVTAGSFRSHATSTTCPKMDCSPPASSSASTTSTPGGSPAPRPRKPGAVIESFVNHAPGVFSGTFS	366873	367557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_367135_367412
845830	contig_7179_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_78138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984148	983127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_983100_984100
845832	contig_9363_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_6674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAATGGAATCTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139922	1140361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1139900_1140400
845834	contig_4388_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_161997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGGAGGCAGCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315867	1314352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1314400_1315900
845835	contig_9036_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_155471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGCCAATGCAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233894	233308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_233300_233900
845837	contig_6434_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_61882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAAACTCTGCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884048	882034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_882000_884000
845839	contig_4824_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_176029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCCTTGCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543502	544246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_+_543500_544200
845841	contig_7247_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_176692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAATATTACACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143232	143426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_143200_143400
845842	contig_6496_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_103515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	99	410	847140	847451	NA	20	CAGTGTCCCCAAGACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNVNIDLFTKEFYNWSFEPGAIFQVCIINFSSDISFYLDVNMCPFPKLPLSKISKSKSIRNQYIPSLLQNFFTISYYALSFQSANLDSQRAVLPYYFMQQIL	847041	847959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_847000_848000
845843	contig_10042_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_79249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGGAGGGGGGAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201752	1200745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1200700_1201800
845844	contig_4769_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_117943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270037	268738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_268700_270000
845845	contig_5236_pilon	+	1606	11	Intergenic	novelGene_100919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.2212928939618	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	280	1389	468003	505606	FALSE	10	TTCTTATTTCTGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSNLIHPRKNFRDSKSTAVSKGDDSVNNTEEDEEEDVVDLAATSLLNKLIRQSLVESSHLVEVLQKDPSSPLYSVKTFEELRLKEELLKGIYAMGFNRPSKIQEMALPMMLAHPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVNALELFPQCLCLAPTYELALQTGRVVERMGKFCVDVQVMYAIRGNRIPRGTDITKQIIIGTPGTVLDWCFKRKLIDLAKIRVFVLDEADVMIDTQGFSDQSIRIQRALPSECQMLLFSATFEDSVWQFAERIIPDPNVIKLRKEELTLNNIRQYYVLCENRKEKYQALCNIYGGITIGQAIIFCQTRRNAKWLTVEMMQDGHQVSLLSGELTVDQRASIIQRFRDGKEKVLITTNVCARGIDVKQVTIVVNFDLPVNQAEEPDYETYLHRIGRTGRFGKKGLAFNMIEVDKLPLLMKIQDHFNSSIKQLDPEDMDEIEKIEY	457644	505823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_457712_457986_458032_458481_458618_467971_468065_468177_468281_469967_470083_471149_471328_496585_496824_498179_498343_500424_500614_505544
845847	contig_8505_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_173181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTATTTTTTCCCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2787	2453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_2500_2800
845848	contig_16907_pilon	-	967	5	Intergenic	novelGene_87450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	56.1671612243311	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	317	475	467716	449225	FALSE	10	GTTTCTTACATTCTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGSYLLCPRVLLFGDSITQFSFQQGGWGASLADKLVRKCDVLNRGFSGYNTRWAKIILPRLIRKGNSLDSPVAVTIFFGSNDSALKDENPKQHIPLEEYIANLKSMVQYLKSVDIPENRVILITPPPLCETAWEKECIIQGFLILFIRWTTFITKGK	474469	448732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_467610_467773_471189_471339_472567_472621_474411
845849	contig_4874_pilon	+	1291	2	Intergenic	novelGene_78632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	27	410	326353	359992	FALSE	25	TTTGAATTGTTTGACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESAEGLGTIPEHERILQEIESTDTACVGPTLRSVYDDQPNAHKKFMEKLDACIRNHDKEIEKMCNFHHQGFVDAITELLKVRTDAEKLKVRNILKFYLLLFSLNYLSIHLYYICAETYTSLNVLL	326326	360873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_326454_359709
845850	contig_19701_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_147894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114582	113276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_113300_114600
845852	contig_12724_pilon	-	311	2	Intergenic	novelGene_146878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541537	539928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_540162_541459
845853	contig_15952_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_154066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACGACCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283897	284645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_283900_284600
845854	contig_8544_pilon	+	545	5	Intergenic	novelGene_55928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_4	311.66729055196	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	5	544	90532	152824	FALSE	45	TAAATAATTTTTAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQRQKKVKVKKPKPEFPVYTPLESTYIESYEHGTSIEEIEEQMDDWLENRNRTQKKQ	90527	152825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_90625_91487_91586_92523_92618_120265_120357_152660
845855	contig_20614_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_107578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTAAGGTGAGGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244511	244875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_244500_244900
845857	contig_8452_pilon	-	642	3	Intergenic	novelGene_48108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	391	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	16	348	991128	962919	FALSE	30	GTAGAAATATGTTTCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANTPGYIFGKRIILFLFLMSLAGILNYYLILFFGSDFETYIKTITTTISPLLLIP	991143	962624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_981637_981738_991058
845858	contig_10937_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_67320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCAAGTAGTGTACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110306	110772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_110300_110800
845859	contig_10734_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_51029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCCTCCCTGCCCAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373843	372486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_372500_373800
845860	contig_9901_pilon	+	974	3	Intergenic	novelGene_126917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	2.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	483	545	102713	102775	FALSE	35	ATGTTTAATTCCTAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSISDQVENSDDSLLIESDVIDITKCKETPPEGRCNQATTLDNQRIIRELEGQTQNPQEEKSPESQNQQVFCGEELPSETKYTSSNDLRKFNKGSVFLLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLVQNVFVETHDRNFPLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYEAGSMPEKEILCQCGANKCRKKIL	98879	103204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_99218_101754_101844_102657
845861	contig_5316_pilon	+	663	4	Intergenic	novelGene_61231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	421.605133850252	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	318	662	453918	511753	FALSE	60	AAAAAATTAATGAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDSSYALTPRTEEKY	450411	511754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453778_453972_474052_474257_511666
845863	contig_8888_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_167760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	166	309	149983	149840	NA	20	CACAGTGTCTCTAATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAITTIPSTVFCPPPSTSLPEAFEPSSHSQFPVLRTEGARVETHRPLETRQVLAPMSHNSLSTGQRWEPLPRLLLRGRGSGSFHSLCWLATSLQQASGPVNK	150148	149103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8888_pilon_-_149100_150100
845864	contig_34_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_39981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCAGACCCCTGGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211090	211446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_211100_211400
845867	contig_9653_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_48199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTCACCATGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180245	179303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_179300_180200
845868	contig_12038_pilon	+	1932	2	Intergenic	novelGene_165822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAATTTATATAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435161	437686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_+_436988_437580
845869	contig_14687_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_107975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAACTTACATGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763725	764635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_763700_764600
845870	contig_5095_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_74958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACGCCTGGGTATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333441	332290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_332300_333400
845871	contig_13740_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_34779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787373	788331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_787400_788300
845874	contig_14332_pilon	+	563	3	Intergenic	novelGene_173050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	15.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	104	517	49696	56560	FALSE	30	GAGGATATTTCATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVFTTGVLSKSVNWRELEKQYYTQTVYEEEIIHMLEYCGVDSFKMGQEFVKHFPSSEDKLTNLNLFSRTLKLDLTDQVVSQKSAECHSCNKTSSSTTSEGLLLQDTSKMDCFNQPLPTNKSSYRGCSSQSYHLLSKEQRRSHLQKESLKFMKGVMDECTHVANFSGANFL	48921	56606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14332_pilon_+_48941_49611_49714_56164
845875	contig_266_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_166293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATAAATGTGATAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137188	136574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_136600_137200
845877	contig_15182_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_136474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATCAAACCCACTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650993	651398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_651000_651400
845878	contig_15182_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_136475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATGGAAGGGAGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651948	652411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_651900_652400
845879	contig_12157_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_135922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGATTTGTTAGGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215811	215162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_215200_215800
845880	contig_13542_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_131512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400914	400281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_400300_400900
845882	contig_14499_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_174029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGGATCACAATAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127647	128251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_127600_128300
845884	contig_5092_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_62322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTTAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500737	501589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_500700_501600
845885	contig_5075_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_174078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTATTTTAGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565645	566121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_565600_566100
845886	contig_12079_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_67557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGTCTAACTGCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864010	863251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_863300_864000
845888	contig_20029_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_138901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	618	974	11835	12191	NA	30	AAGGGAGAAACCCGCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAKKSAGTRDQPRGPEGLQGEATPHPASRPGTAGQAWVLKPLSWVALTLLIPWFEPLIHLGNTAIVLNVPEIRFSLGNQSYQLYRKANSSKADLIILMFGIRSLTFGAPASSVSALV	11217	12413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20029_pilon_+_11200_12400
845889	contig_6557_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_33024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGAGGCTGCGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628178	629120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_628200_629100
845890	contig_13780_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_149142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATATTTACGCTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956493	955666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_955700_956500
845891	contig_13014_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_169317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGAGAGTCTCAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12431	11625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_11600_12400
845892	contig_6444_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_177525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCCCCCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53136	51748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6444_pilon_-_51700_53100
845893	contig_5003_pilon	+	1029	6	Intergenic	novelGene_120216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	25.7449024080496	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTGCTTATAGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143350	155611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_143640_149989_150091_150771_150890_152308_152393_154237_154332_155268
845894	contig_10603_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_173378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTCTTTCTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147683	146435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_-_146400_147700
845895	contig_4125_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_25190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	501	560	1370076	1370017	NA	10	CAGCCTCTCTGCTTCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKPGCDVQDQAGQAPDVQGRGSWSAQSFPPGGASRHHTIHGGHQRLPCYYTTLQDSGWDNATSSQHEAELTRKYETSWAKHGKGTKGTKTWVACQCSCPQGLPCRGRRGWSWSRDNQGPVLGWLIRFRSHHTQRKSHHERETVSKEGAQLRSAEQADENHHTPLLKMSEHAEKEGVKNKITTRQL	1370576	1369042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1369000_1370600
845896	contig_6102_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_32244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCATTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287920	1287417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1287400_1287900
845897	contig_11548_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_66802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACCCAGAACTCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181126	181992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_181100_182000
845898	contig_202_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_127075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAACAAGCCAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302525	304504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_302500_304500
845899	contig_9647_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_127384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74894	73730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_-_73700_74900
845902	contig_9185_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_166898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATGTGTGCAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293679	292685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_292700_293700
845903	contig_3601_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_132911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGTGCATTTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245806	247544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_245800_247500
845905	contig_6673_pilon	-	683	3	Intergenic	novelGene_164003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	80	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	260	631	11117	5486	FALSE	75	TTTAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160357	5433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_11111_11199_160179
845906	contig_12841_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_55868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATTACCTCATGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388048	388860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_388000_388900
845907	contig_12113_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_134758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	70	315	349356	349111	NA	55	TCTCTACACATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSGSLSSDNTILHFIALINHIDMYKLNVMILLTTLIVLRIMCPSEASAEAEVSQFNMTITINQNVIWFNISMNKTHFMNTFNCTGKFCYVESCQIFWKDAQSN	349425	348400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_348400_349400
845908	contig_2799_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_85547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCCCCATTTTACAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705881	707349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_705900_707300
845909	contig_3004_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_127559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAATATCCATTGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849733	850583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_849700_850600
845910	contig_1154_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_87231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTATTTCAGCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646142	1647584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1646100_1647600
845914	contig_12761_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_164075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCCTGCCAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472936	472678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_472700_472900
845916	contig_8674_pilon	+	1289	3	Intergenic	novelGene_102937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	943	junction_2	593	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	156	770	456142	460416	FALSE	30	CATATGAAGCCTTAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQVSGIKSTKEAWLKCVNTEKRMQEANQKIDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGNSPLK	455986	460935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456506_457759_457844_460249
845918	contig_7426_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_27462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602391	601669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_601700_602400
845919	contig_10235_pilon	-	805	3	Intergenic	novelGene_46302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	38	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGTAAAGCTTTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85327	83497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_84172_84567_84640_85268
845922	contig_6048_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_73135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGGGCTACAGCGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978670	977658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_977700_978700
845923	contig_6048_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_73134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977603	977245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_977200_977600
845926	contig_6497_pilon	+	905	2	Intergenic	novelGene_35603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498150	505887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_498661_505492
845927	contig_1406_pilon	+	1633	7	Intergenic	novelGene_25464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	25.4274567260581	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	213	1028	690752	710945	FALSE	50	CTCATGAAATTAATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGGAGAPARRESPRPEREEERPRPNPERKQRCRFDGQETKESKYTSLNASDFSDPVYKEIALTNGCINRMSKEELRAKLSEFRLETRGVKDVLKKRLKNYYKKQKLMLKGDNCADSYYDYICIIDFEATCEEGNPPEFIHEIIEFPVVLLNTHTLEIEDTFQQYVRPEINTQLSDFCINLTGITQDQVDRADTFPQVLKKVIDWMKLKELGTKYKYSILTDGSWDMSKFLNIQCQLSRLRYPPFAKKWINIRKSYGNFYKVPRSQTKLTIMLEKLGMNYDGRPHSGLDDSKNIARIAVRMLQDGCELRVNEKMHSGQLMSVCTSSPIEGTPAPQMPHFRK	680600	711550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_680687_690625_690805_694353_694565_699428_699513_701116_701227_703237_703353_710702
845928	contig_14855_pilon	-	1109	2	Intergenic	novelGene_146028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGGCCTAAGGACTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532819	531231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_531994_532472
845930	contig_15122_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_162695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGGGTAGATTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179257	180367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_179300_180400
845931	contig_5084_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_64649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGTGATCTCCGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1440864	1441699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1440900_1441700
845932	contig_12886_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_135527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	59.7133778980891	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	252	407	658	832104	832582	FALSE	10	TCTGCCCTGCCACCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLLPDSKTTVPPTGSPKPLQPLPTPILTIAPHPGVQPQLAPQQPPPPTLGTLKLAPAEEVKSSEQKKRPGGIGTREVHNKLEKNRRAHLKECFETLKRNIPNVDDKKTSNLSVLRTALRYIQSLKRKEKEYEHEMERLAREKIATQQRLAELKHELSQWMDVLEIDRVLRQTGQPEDDQASTSTASEGEDNIDEDMEEDRAGLGPPKLSHRPQPELLK	824374	832582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_824591_825136_825179_825338_825451_832067_832261_832487
845933	contig_2854_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_120853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGATTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310125	310434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_310100_310400
845934	contig_2704_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_75294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGGGATCATACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45268	45638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_45300_45600
845935	contig_10940_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_49302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGCCTGGAGAGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053149	1053622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_1053100_1053600
845937	contig_8550_pilon	-	951	6	Intergenic	novelGene_72362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	71.2123584780058	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	187	951	147577	136176	FALSE	20	GTTATTCAATCCCAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANINFREVTLIVGVVTACYWNSLFCGFVFDDVSAILDNKDLLPSTPLKTLFQNDFWGTPMSEERSHKSYRPLTVLTFRLNYLFSELKPMSYHLLNLIFHAVVSVIFLKVCKLFLDNRSSVVASLLFAVHPVHTEAVTGVVGRAELLSSIFFLAAFLSYTKSKGSDNSIVWAPIALTVFLVAVATLCKEQGITVVGICCVYEVFIAQGYTLPLLCSTARQFLRGKSSIPFSMLQTLIKLIVLMFSTLLLVVIRVQ	164134	136175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_-_136317_136789_136906_138615_138716_140377_140597_147388_147606_163976
845938	contig_8453_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_125107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGATGCCAGTCACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62710	62974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_62700_63000
845939	contig_11751_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_150284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAATTAACAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85530	84725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_84700_85500
845943	contig_15866_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_63662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCTTATTTTTGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589550	589950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_589600_590000
845945	contig_16575_pilon	-	630	5	Intergenic	novelGene_146494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	101.16663234486	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	180	629	15762	7375	FALSE	45	CTAATGTAAGTATATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQKEAVIKHSLVHKVFLDFFTYAPPKLRSEMIEAIREAVVYLAHTHDGARVAMHCLWHGTPKDRKVIVKTMKTYVEKV	15941	7373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13320_15642
845947	contig_10044_pilon	+	1574	1	Intergenic	novelGene_156384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	60	302	140165	140407	NA	35	TCAACCTCCAATAACCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPNSFSKVTCTPHTAHRVMASQMIAFCELIRVPGWHGQACPEPCRPGAELTSRKLTFQVKKAQCIPISGTQSLSKHSILMVLVKITLHLFPYTLFFLG	140105	141679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_140100_141700
845949	contig_7272_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_25277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCGCAGTTGTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124605	124257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_124300_124600
845950	contig_9957_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_173845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAACAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682250	680908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_680900_682200
845951	contig_4845_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_53714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAAAAATAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017411	1016242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1016200_1017400
845952	contig_9177_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_32809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574057	1574512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1574100_1574500
845953	contig_11978_pilon	+	602	6	Intergenic	novelGene_63077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4712.40112893629	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	13	360	1827946	1831236	TRUE	15	CCTGCCTCTCAGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKCKRKGTANARMPEKPVPEGEGERVQEQADSHGTHP	1827933	1831965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830129_1830663_1830705_1831170_1831273_1831759
845954	contig_9177_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_32799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCAGGATAGTAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1529701	1530837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1529700_1530800
845955	contig_6533_pilon	-	1017	3	Intergenic	novelGene_114630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.5	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	204	698	88458	75770	FALSE	15	GTTCTGCTTGTGGATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAPASPAVSRCQVAPSLLPVTLRPTLPSFVPRASSRFPFSCAAGGRSRHREAAPRCPGQGHSHNQAMSYYLNSENHLDPGPIYVRENGQLHMVNLALDGVRSSLQKPRPFRLFPKGFSVELCMNREDDTAQKEKTDHFIFTYTREGNLRYSAKSLFSLVLGFISDNVDHIDSLIGFPEQIAEKLFSAAEARQKFTEPGAGLRALQKFTRLPWAIVETGDCLVPGVKEESL	102772	75450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_75843_88036_88472_102582
845956	contig_10129_pilon	-	935	2	Intergenic	novelGene_128160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	213	665	523380	522928	FALSE	45	ATAAACATAAAGTGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTAALITLVRSGGNQVRRRVLLSSCLLQDDRLLTPTCHSSTSEPRSSRFDSDGSGRPATWDNFGIWDNRIGEPILLPPSIKYGKPIPKISLENVGCASQIGKRKENEDRFDSAQLTEEVLYFAVYDGHGGPAAADFCHTHMEKCIMYVQ	531365	522657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_523460_531232
845957	contig_10803_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_170114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCCTTGACGGGCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349	614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_600_1300
845958	contig_1244_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_37948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACAGGAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834172	833676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_833700_834200
845959	contig_10003_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_88187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACCTCCACTCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452737	453682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_452700_453700
845962	contig_6062_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_5291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTAGCAATAATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759952	761061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_760000_761100
845964	SIRV7	-	424	3	FSM	SIRV7A	SIRV704	428	3	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTTCGTATTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114734	55849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_78841_78964_114680
845966	contig_10479_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_147098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAAAATCCCTTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53336	52653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_52700_53300
845968	contig_8588_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_146517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAAAAAAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547728	549010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_547700_549000
845971	contig_3948_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_53403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAGGATGGGCATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1832975	1831430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1831400_1833000
845972	contig_1699_pilon	-	1011	3	Intergenic	novelGene_72803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	9	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTTAAGATTTACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30708	28791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_29434_30238_30393_30493
845973	contig_4952_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_145535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGGGTACTTGTACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492521	493177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_492500_493200
845974	contig_8616_pilon	+	1016	8	Intergenic	novelGene_72390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_7	54.0626998049865	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTTGTACCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196155	199028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479_196640_196862_196914_197236_197268_197609_197657_197845_198124_198540_198858_198952
845975	contig_2403_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_70996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTCAAAGGCTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43814	43460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_43500_43800
845976	contig_15025_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_155962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAACTTCCTCTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6729	7681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_6700_7700
845978	contig_5423_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_85161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCGGGCACCTACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44937	47108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_44900_47100
845979	contig_5954_pilon	-	446	5	Intergenic	novelGene_28425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGAAGAAGCGAGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98981	97524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_97561_97836_97922_98016_98161_98635_98686_98850
845980	contig_10140_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_148422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299075	298477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_298500_299100
845981	contig_14133_pilon	+	659	3	Intergenic	novelGene_119900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTGAGTCTGGCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93407	94572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_93712_94009_94103_94310
845982	contig_2227_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_142345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAACAAAAATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255983	256408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_256000_256400
845983	contig_13425_pilon	+	951	3	Intergenic	novelGene_170844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	299.5	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	97	951	59676	61432	FALSE	35	CAGAGCAGCTCAGAGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKASVTGPFVPAAPASFPVQRLLAASATCRPNMAQEVSEYLSQNPRVALWVEALRCDGETDKHWRYRREFLLRNAGDLAPTGGVASSNTDEAADAKSGTCSRQLQQLISFSMAWANHVFLGCRYPQKVMDKILSMAEGIKVTDAPIHTTRDELVAKVKKRGISSSNEGVEEPSKKRGIEGKNNSAVEQDHAKTSAKTEYPLAKQENSSTCMGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSAS	59579	61432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60561_60980
845987	contig_8487_pilon	+	1096	2	Intergenic	novelGene_111925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGTATTTCTCGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306488	308709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_307253_308377
845988	contig_7753_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_41509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAAAAACTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235796	1234943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1234900_1235800
845990	contig_1450_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_27338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	76	327	209477	209226	NA	45	ACGGTACTGTACTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGWGSAAAADPWGGSWQVSFFSSDLMVQFTMVPTPSRASWAETGLLMDILREEEQGELRSDRADGNFRPLSSRGSDRTLGSPAPVPPGAPQTGTLSYTKCKLTLWNPQ	209552	208621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_208600_209600
845991	contig_9415_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_109910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGGTTTTTTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117509	2115984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2116000_2117500
845992	contig_12735_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_140782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296727	296140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_296100_296700
845994	contig_4845_pilon	+	743	2	Intergenic	novelGene_53719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTCTTCAAAATTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043905	1046624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1043924_1045899
845996	contig_15613_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_147222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCACAGAAAAAGGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247801	247266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_247300_247800
845997	contig_12080_pilon	+	171	1	Intergenic	novelGene_128363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATGAAGCAAACCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100082	100253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_100100_100300
845998	contig_6277_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_80408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCGAGATATACGGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709182	710170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_709200_710200
845999	contig_6277_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_80409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAGCTCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710468	710892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_710500_710900
846000	contig_4508_pilon	+	1047	3	Intergenic	novelGene_177530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	10	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGACCATTTTCGGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24410	41812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_+_24554_38555_38706_41058
846001	contig_13456_pilon	-	1121	3	Intergenic	novelGene_153271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	343	963	128826	105056	FALSE	5	CCTGAGCTTCGCTTTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRRSHADGHTRAGPARPGRPVQVSEAEAAGGIGGKLLSNPNGTELQSQSHSQTTGTPAGLGESPRHPRAGAGEGQCSRDSARLAPVPSSAVVIQWAANVAFFKLKLDQLMDSLCRVCRAESKQNLLKYSTSLSVSSISTLSRSISLGRKTSSIELLALSPFFFLFFLLLPFGCGESARISLPFCGHSPGEAGSVGTGVAFSSLM	129168	104897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_105216_119363_119445_128446
846003	contig_5643_pilon	+	429	3	Intergenic	novelGene_38994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTGGTGTCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623359	624934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_623433_623833_623958_624702
846004	contig_10235_pilon	-	1025	6	Intergenic	novelGene_46565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACGGTCTTCCGGCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440547	432316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_432479_432626_432766_438243_438341_438610_438751_439591_439688_440156
846005	contig_13481_pilon	-	1613	10	Intergenic	novelGene_119423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	39.701665232358	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	80	1201	785433	765792	FALSE	45	TTTATTAATATCAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQLRRCWGPGPVRCATGGLGARAREKPPWRVLFFGTDRFAREALRALHAARDNKEEELIEKLEVVTVPSPSPRGLPVKRYAVRSQLPVYEWPDVGPGDYDVGVVASFGRLLSEALILKFPYGILNVHPSCLPRWRGPAPIIHTVLHGDKVTGVTIMQIRPKRFDVGPILKQETVPVPPKSTAKELEALLSRLGASMLISVLKNLPESLNSGRQQPAEGVTYAPKISAGKSCIKWEEQTSEQIFRLYRAIGNIIPLQTLWMDNTVKLLDLVEVNSSILADPKLTGQAVIPGSLMYHKQSQILLVSCKDGWIGVRSVMLKKTLTATDFYNGYLHPWYQTNSQAQPSQCRFQTLRLPAKKQQKKKIVAMQQCIK	785512	765379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_765990_768792_768876_769889_769969_772727_772820_778106_778183_779741_779845_781113_781237_783134_783345_785212_785314_785376
846006	contig_7415_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_168669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCCATAGATAGATCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213854	214909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_+_213900_214900
846008	contig_7275_pilon	+	1105	7	Intergenic	novelGene_111247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.9890021097632	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCAAGAGATACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401688	410657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_401790_402438_402473_404454_404581_405425_405485_406427_406555_408457_408563_410104
846009	contig_6102_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_32066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGATCAGCCCAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672021	671562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_671600_672000
846010	contig_6058_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_172364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCTTGAAGATCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136078	134730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_134700_136100
846011	contig_6058_pilon	-	289	2	Intergenic	novelGene_172363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134200	133173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_133330_134067
846012	contig_14711_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_68874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAGGACAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36835	36098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_36100_36800
846013	contig_5033_pilon	-	1045	2	Intergenic	novelGene_29073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTCTGTACTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566817	565111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_566087_566747
846014	contig_4364_pilon	+	783	4	Intergenic	novelGene_177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	933.647447142419	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	89	409	1268714	1270694	FALSE	25	CCAAAGGAGCCAGTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALDCQTQAAPGPAPGGLGGLTSATS	1267008	1271068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268701_1268904_1269000_1269061_1270623
846015	contig_7565_pilon	+	1864	7	Intergenic	novelGene_172906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	413	1393	42313	75937	FALSE	60	CCATTTGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAPNACLETEMSCHILECRNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDGSAEERDHEYYNEIPGKPPPAGGVLDVQMKVQATEQMAYCPIRCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAVGHAHERGVHCQQDTSLMKHTCRVDLFDDPCYINTQALQGILGPARNQSSAQMLGSPWHRAKAPETVQPGATAQPASPCSLPHIKQQLRNEDCYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPGLLHSNK	41900	76408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7565_pilon_+_42350_42574_42699_44213_44383_46475_46537_62909_63090_74018_74273_75781
846016	contig_10711_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_118421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACAAGTATCGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588298	589438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_588300_589400
846017	contig_5600_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_174963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCCTCCTTTCCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415407	413396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_413400_415400
846018	contig_13453_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_146724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAATATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127098	128260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_127100_128300
846019	scaffold_13505_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_111409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	291	923	306175	305543	NA	70	CTCTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRCCCSDSQRPCLQQNETSNSNTARVKLRAPDPSLSKHPVPPLPSPPHHHPVAEAKNLGVILDISNPFKRASRTPTITLLVQVTLISYLGAHKDFLLASLFLLPSALSPFSPRQPEGAFLKGQLGHVTPLFKILQQVPITLRLHSKLLALAYKALPTSPPHSLCSSWSKSSRFLPQDICTCCFPSCNALPRLLSRLTHSGFSSQRPSSR	306465	305518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_305500_306500
846020	contig_7080_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_100106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCTAGAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476364	477677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_476400_477700
846022	contig_14976_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_139968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	57	383	28307	27981	NA	40	ATTGAGGAAACTGATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLLQQITVLCCFKIFPTMSALASEAASPLRSGPCRSTTLITLISSIITASISSKGGRLPVPIPRLSHTEMLLLTSCLIWRIILTNPLLRGAATRVPLRHRLLPGAQGVVDMVAGEAPKAEITAED	28363	27442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_27400_28400
846023	contig_10013_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_125062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	16	51	260	310	279392	279442	NA	40	TCTAGCAATAAAAGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALSEQLTLRPPSISPRPVLEPWGSYRPASCLREGTKSSGSEPEHSTWLGVPWPVHRFFLAPREPLHPPSADIIHPSGGCGISNEQMEAHPFHWGGSPALPH	279132	279894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_279100_279900
846025	contig_2969_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_157071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGGCAGTATCTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869992	870796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_870000_870800
846026	contig_10864_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_107052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTTGTCTTTTCGGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733297	732698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_732700_733300
846028	contig_9469_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_159219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	183	563	24143	23763	NA	25	GGTAGGACAGTCCTCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSALLYAGVKVDCADADSRTALRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNKADNEGRTALIAAAYMGHREIVEHLLDHGAEVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAVDSIDSE	24325	23762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9469_pilon_-_23800_24300
846029	contig_2863_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_174056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATAGAGTTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_0_800
846030	contig_11978_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_62858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTGAGATATGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588462	588922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_588500_588900
846032	contig_2463_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_43031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAAATAATTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519813	518844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_518800_519800
846033	contig_18113_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_137541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCTTGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192309	193122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_192735_192888
846035	contig_11328_pilon	+	745	6	Intergenic	novelGene_88387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2700.4	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	127	390	644338	645252	TRUE	35	TCATACATTAAATCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLSWRRGGDRVLHHEAFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLGRRIFQD	643639	648026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644260_644383_644805_645001_645228_645376_647069_647175_647899
846036	contig_8773_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_74535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152878	153645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_152900_153600
846037	contig_20875_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_153091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTATGAGTTTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11258	10661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_10700_11300
846038	contig_4232_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_63437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACACAATAAAATATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522236	521425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_521400_522200
846042	contig_15123_pilon	-	730	5	Intergenic	novelGene_110934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	15.1719313206988	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	89	454	320397	318930	FALSE	10	TTATTTTTCCCTTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI	320622	318653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319292_319627_319688_320277_320408_320544
846043	contig_11994_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_129352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAATCCTGGTTGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95573	93818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_93945_94953
846044	contig_817_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_132468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATCAAGACCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648540	649809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_648500_649800
846046	contig_1594_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_138849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTAACCCTCTCACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719340	718917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_718900_719300
846047	contig_16930_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_139170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGGGCAAGCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248844	249214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_248800_249200
846048	contig_6014_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_176282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATACATACATTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263741	264625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_263700_264600
846050	contig_6576_pilon	-	1189	2	Intergenic	novelGene_42347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTGTGTTAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723462	722222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_723147_723197
846051	contig_10667_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_137325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	306	680	262975	263349	NA	30	AAAATGGTGAGTTCACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRISTLPVFSKGSETSDLPQNLHFSSMQTPSTKRPAWHLAGEEPTGSLQFPGVIAQLHIMLLYRTFIARRESKHFRFLLILEPGLVSAIISPLPTAEVTAVWFQETFPKTRQLGSEMGAHLL	262669	264762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_262700_264800
846054	contig_13481_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_119429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGAGGTGAGCAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894817	896008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_894800_896000
846055	contig_14045_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_177214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAATAAGTTATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27592	28914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14045_pilon_+_27600_28900
846059	SIRV6	+	357	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	503	13	337	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGGTGGCTTGGTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640	2107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
846060	contig_990_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_76154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACCAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1802333	1803295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1802300_1803300
846061	contig_4071_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_151883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCTTAAAAGAATGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324463	325206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_324500_325200
846062	contig_6544_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_142106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGGCAACCCCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143043	142491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_142500_143000
846063	contig_6414_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_157006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATGCACTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43316	44639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_+_43300_44600
846064	contig_3817_pilon	+	761	3	Intergenic	novelGene_78324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1442	junction_1	96	156	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	30	329	178717	199164	FALSE	25	TTCAAGTTGTGCAACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITAGLDPEMALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKR	178687	199596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198009_199026
846065	contig_7234_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_145959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTTGAATGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529899	530286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_529900_530300
846066	contig_11815_pilon	+	1365	8	Intergenic	novelGene_50896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	33.9020196857873	4	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	452	883	137027	142839	FALSE	60	GGAAAAAGAAAGGAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEFFVKVYPSCRGGKVVLDQTGVSKGYGFVKFTDELEQKRALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVEYSQMYSYSYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTMQTYEEVGDDALEGKKGVHSFIPL	126649	143321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_126748_134759_134860_135233_135382_135466_135520_136974_137107_139155_139276_142441_142605_142770
846067	contig_17386_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_157944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAGGCCATGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318479	319969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_+_318500_320000
846068	contig_8650_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_162636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAATTAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384120	385159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_384100_385200
846069	contig_12142_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_147844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	318	954	191	1144	263820	262867	NA	15	ATCTCCTCCACATCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTCHQWPRSLSPLFPTGTVLSDIIQKYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCNPDLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSALSDFADALSEPLRIAKPNQISLIHMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEVSATIIQRAFRRHLLQRSVKHASFLFRQQAGSSGLSDEDAPEREGLIAYMMNENFSRRLDPPSSSS	264010	262866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_262900_264000
846070	contig_1009_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_121735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATGCTGCAATGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176722	176061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_176100_176700
846072	contig_7605_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_172954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGTAGTGAAATGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312689	313406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_+_312700_313400
846074	contig_17162_pilon	+	745	5	Intergenic	novelGene_171528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAATGCCAGGAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3427	10516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17162_pilon_+_3648_4223_4405_6482_6580_7164_7250_10354
846075	contig_6593_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_49859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAACAAAACTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278014	1279250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1278000_1279200
846076	contig_4604_pilon	+	622	4	Intergenic	novelGene_19189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	95.2797051959242	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGCCTTGGGTGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526619	548290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_545868_545950_547953
846077	contig_1274_pilon	+	472	5	Intergenic	novelGene_137763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	86.1974477580398	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	64	381	3825	79364	FALSE	80	TGTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPCSCMSFNPETRRLSIGLDNGTISEFILSEDYNKMTPVKNYQAHQSRVTMILFVLELEWVLSTGQDKHFSWHCSESGQLLGGYRTSAVASGLQVHVLSVNHC	3761	79455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3832_33354_33429_66680_66736_78585_78737_79333
846078	contig_12622_pilon	-	468	3	Intergenic	novelGene_6045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	1691525	1685282	FALSE	30	GACAGCTTAAAACCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGASWRVKTWGSRDVQSCAIPAVPTAAAPVLGAPKRGSSPAGRDPVPPRARQAAEFPPILRLPPRLRLQAPALPPSQALSIPEGHSTSCRQPRVVSTLFLQ	1691526	1685123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685368_1691095_1691276_1691482
846079	contig_12969_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_61665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTAGCGCGTTCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284672	284074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_284100_284700
846080	contig_16322_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_87552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	6	314	108570	108262	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPSTPLLAGKFWRSQALFPQSSFFLWLCLWPRSLDVCSTFSCSLLKGWRALWVSWCSVAIGSEASASGLQASPLICWFIMLPCLFIFYRNRRRGIGTESAD	108575	107549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_107500_108600
846081	contig_10861_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_39466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAATAAAAATAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738664	2737748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2737700_2738700
846082	contig_10196_pilon	-	655	6	Intergenic	novelGene_132179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.1182520563948	63	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	32	448	1072541	1069715	TRUE	35	AGCCTCCATTAAACAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGGAGGGSMEAVEEPGNLSGVRHIILVLSGKGGVGKSTISTELALALRHAGKKVGILDVDLCGPSVPRMLQAQGCAVHQCDSGWVPVFVDQEQSVALMSVGFLLETPDEAVVWRGPKKNALIKQFVSDVAWGGAGLPGGRHAPGYL	1072572	1068339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068420_1069478_1069533_1069641_1069798_1070308_1070508_1070597_1070717_1072525
846083	contig_5698_pilon	-	1042	8	Intergenic	novelGene_55054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.67819144635296	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	93	884	62973	60398	FALSE	10	TGTTGTGTGTCTTTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGPQSCWSSQKEVTHDSLVVGAIENAFRLMDEQMAWERRGYQVEGGCCALVVIYLLGKVYVANAGDSRAIIVRNGEIIPMSREFTPETERQRLQLLGFLKPELLGGEFTHLEFPRRIQPKELGQRMLYRDHNMTGWAYKKIEPEDLRFPLVCGEGKKARVMATIGVTRGLGDHSLKVCSSTLPIKPFLSCFPEVQVYDLTQYEHCPDDVLVLGTDGLWDVTSDCEVAATVDRVLSAYEPNDSSRYTALAQALVLGARGTPRDHGWRLPNNKLGSGDDISVFVIPLGGPGSYS	63065	60239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_60546_60683_60836_60977_61086_61242_61307_61493_61613_62189_62275_62607_62721_62970
846085	contig_6503_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_145780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCATTTAAATCTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357372	358576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_357400_358600
846086	contig_1337_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_84256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATCCACTTAGTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449892	450899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_449900_450900
846089	contig_7057_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_123281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTATTTTAAATAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797033	796738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_796700_797000
846090	contig_11849_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_171742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGCACTATCTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11434	12673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_11400_12700
846091	contig_91_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_127134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCACTTCGCCACCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948214	947618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_947600_948200
846092	contig_10042_pilon	-	1574	2	Intergenic	novelGene_79152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATAAACAGTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431515	421852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_422915_431003
846093	contig_6445_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_77057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663779	662097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_662100_663800
846094	contig_9706_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_20944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCGATAAATGCCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262333	261441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_261400_262300
846095	contig_15787_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_143999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCTCGTATCTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110654	111886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_110700_111900
846096	contig_6017_pilon	-	432	3	Intergenic	novelGene_152542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3344	37	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACATGGCTTATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442496	440516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442327_442457
846097	contig_11396_pilon	-	1124	2	Intergenic	novelGene_71297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	426	569	370706	369750	FALSE	20	TGATTCATTTTGGAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTYHVQLQQVELALGAGLEASEQADLHQLQGDLKELIELTEASLVSVRKSKLLATLDQEHPAQEDTEYLAFQKAISEVVEVPAATEAELETVSKEEVGPEPSIPQQEEEEGEEDDEEELSGTKVNAPYYSSWGTLEYHNAMIVGTEQAEDGSAAVRVLYLYPTHKSLKPCPFFLEGKCRFKENCRVY	371131	369194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_369760_370572
846099	contig_3818_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_99226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGACATAACTATCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281774	281429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_281400_281800
846100	contig_6576_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_42255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATTTTAAATTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319671	320315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_319700_320300
846101	contig_14846_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_85373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAATGTCTTACTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139224	138764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_138800_139200
846102	contig_9751_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_177538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCCAGAAGCCTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46702	45526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9751_pilon_-_45500_46700
846103	contig_5093_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_135086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGTGCTCGAATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566623	567068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_566600_567100
846104	contig_5093_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_135085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATTGTCCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564593	563833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_563800_564600
846105	contig_10446_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_162517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAATAATATAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157988	1158444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1158000_1158400
846107	contig_6233_pilon	-	709	7	Intergenic	novelGene_74807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	177.978150968657	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	294	707	149777	145746	FALSE	10	GCCCAGGGCGGTCCCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVP	250353	145743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_176316_176404_200462_200546_250239
846108	contig_9535_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_124483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTATTTTCTGATTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304151	305853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_304200_305900
846110	contig_14023_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_165352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCCTCAGGGAAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53689	53047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_53000_53700
846111	contig_5590_pilon	-	1241	3	Intergenic	novelGene_163009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.5	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGTCTGTCGTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284693	282290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_283194_283313_283505_284546
846112	contig_7810_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_144225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGACTCCAGGTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401495	402267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_401500_402300
846113	contig_2125_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_147710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCCTCCTTTTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266936	265610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_265600_266900
846114	contig_4519_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_123713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCTCTCTCCCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656870	657836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_656900_657800
846116	contig_12079_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_67376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTACTCCGTGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366083	367534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_366100_367500
846117	contig_6364_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_51762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658977	657385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_657400_659000
846119	contig_11250_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_127169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGTAAGCAAGAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252959	254023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_253000_254000
846120	contig_11448_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_66357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAGAAGACTCCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197983	198521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_198000_198500
846121	contig_7271_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_159949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCTGCTGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460847	462100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_460800_462100
846123	contig_9955_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_21376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	1095	1565	568366	567896	NA	10	CCCCCTCACTTCCGCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLSFCLHTVSLRRLGAPSELGLSHHPWVPGAARKPLCSVKLCRADQRLANCADSHPAWTSRSCAGRENRCGALAQDTPPLLRYSSTRPEPRSVKLAPPAQVALGTTGPGTESSGSSEPGPGLRSGEEAAQEALPVWEHGRKRKPPGLARPPLTG	569460	567632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_567600_569500
846125	contig_6576_pilon	+	479	3	Intergenic	novelGene_42219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	11	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	26	478	4566	18132	FALSE	15	TGCTCGTAAGGATTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQVYEKFLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPQTLFTLEELRAQ	4540	18133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_4677_12095_12263_17957
846127	contig_15866_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_63578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAGAATACACCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164965	162958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_163000_165000
846128	contig_15412_pilon	-	612	3	Intergenic	novelGene_165471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	201.5	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	17	370	137380	126206	TRUE	65	AAGAAGAAGAAAGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLAGQMWAVGRPGVTSVSPHTWFPADCRPRSRRSSGSFSVFMAGARGQGLEVVTVSLCSPSPPPSCSNSTMSLLSPLGHQSFPFDEDDGDEEDEEDVDEDDHDSEAKVASLKGMELQGCSRN	137396	116036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_116178_126104_126213_137033
846129	contig_1406_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_25647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742758	2743085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2742800_2743100
846131	contig_10042_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_79159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGATACCATAATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701007	700104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_700100_701000
846133	contig_13542_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_131553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAATTGTTATCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613221	613684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_613200_613700
846136	contig_11105_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_159828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTGTGTGAAATGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410768	409903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_409900_410800
846137	contig_7411_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_136981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAATGACACAGAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149662	148347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_148300_149700
846138	contig_20822_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_170641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75413	75854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_75400_75900
846139	contig_10000_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_139348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGATTAACCATGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336282	337597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_336300_337600
846140	contig_3818_pilon	+	1124	4	Intergenic	novelGene_99300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	7.40870359029762	16	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	12	386	961596	968357	FALSE	30	TTTTAGAGTATTCGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTMAAAVRAARCLPVLCGLPAGHLWARQLFLNTFPTTSILAFKTAISSGLDALPRSSNQTTSVHCRAVYCRGRHPPGGGPLSSPGTRGNHHYASLTHALQTQCCIYSPSSWMGQQYRPYSFFTKCK	961584	969095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_961654_963987_964069_967284_967375_968211
846141	contig_19098_pilon	+	633	3	Intergenic	novelGene_65788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCTCAGCGATTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50551	53414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_51068_52523_52579_53352
846142	contig_709_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_57589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATATGTAATAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2233498	2234140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2233500_2234100
846143	contig_16211_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_150075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGGGAGTGTTGACATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118878	119467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_118900_119500
846144	contig_9293_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_175194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGCTGAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84783	83812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_83800_84800
846146	contig_12021_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_172209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	344	787	329918	330361	NA	25	CTCAGAACCAGTGCCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSAYKHLNYGPHSCQQLGDCLCHQCAPSASGFVQIQNGVAPLKAAHQAPDGFVHPIPHVHACPCLQGRLKPPGLQNSLLRDFFLHPVQHIQTPEKIGKTSVHGLQSIEEHLPKMAEPSPLVCRSTGSSVKAGGDAETSQRGFCENRDTGSTEGGGGTQKTDSSSAHQTDKAESKVELSSSQTDAIVNSEHRNQSEPKFIFNHFVGEAGYVSCPNNPQSCGRIVRVKCNSVDCQMPNIDANVPAVLTHSELSGESLLIKTL	329574	330377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_329600_330400
846148	contig_709_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_57562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTCCATGCAAGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2055629	2054646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2054600_2055600
846149	contig_17785_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_175579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48659	49943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17785_pilon_+_48700_49900
846150	contig_13224_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_104097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATGTATATAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253648	254192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_253600_254200
846152	contig_14341_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_111803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	413	829	455656	456072	NA	25	TGAGTGTCACAAAGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHQRIHTKEKPHVCGDCRKAFMQSSSLALHQRTLSGEKPYKCNKCGKAYIQLSHLTEHYRAHTGERPFVWQGLQPHHATHAVPVVPRRRQAFGLRHVRHVSENLPRGWPLVYNRGFRFERSLLSVASAADPSAKVDS	455243	456847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_455200_456800
846153	contig_10962_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_103910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTCAAACAATTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363988	362653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_362700_364000
846155	contig_3942_pilon	+	886	8	Intergenic	novelGene_128872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.4113984215413	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	203	565	1492877	1499848	TRUE	20	GCTGAAATTGCTTTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEMQVKGKKVTDKFTESVYVLANEPSVALYRLQEHVRRSLPELAQHKADMQRWEEQSQGAIYTVEYACSAVKNLVDSSVYFRSVEGLLRQAISIRDHMNASAAQGHSPEEPPPLSSA	1492295	1503239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1492350_1492728_1492914_1495128_1495242_1495613_1495679_1498449_1498564_1499814_1499888_1502159_1502366_1503163
846156	contig_13267_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_146615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCGTATGATGGTAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165045	166004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_165000_166000
846158	contig_12622_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_5891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGACTTGCATATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1528312	1526777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1526800_1528300
846159	contig_2636_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_52047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAATGAGATATCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40914	41871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_40900_41900
846160	contig_7839_pilon	-	914	2	Intergenic	novelGene_45744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	106	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079082	1074317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1075157_1079007
846161	contig_8873_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_162893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTGATTTCTAATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88874	89474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_+_88900_89500
846162	SIRV6	+	464	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	7624	3	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106
846163	contig_4732_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_75486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747091	746750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_746800_747100
846164	contig_2637_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_100027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGAGCACCATGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54251	52484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_-_52500_54300
846165	contig_5039_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_65064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTTTTGCAATGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1841473	1842044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1841500_1842000
846167	contig_11016_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_163305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287438	288733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_287400_288700
846168	contig_6684_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_168591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAATGAACAGGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63402	62953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_63000_63400
846169	contig_6497_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_35611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAAGTTCAGGGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516735	517568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_516700_517600
846170	contig_6059_pilon	-	195	2	Intergenic	novelGene_44809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGCCCGTTGGAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531185	530879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_530954_531064
846171	contig_1725_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_24303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCTGCCCTTTGCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224802	224417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_224400_224800
846172	contig_5939_pilon	-	1203	2	Intergenic	novelGene_176251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	277	444	396809	396642	FALSE	15	ATCATCCTTCTGTCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLSLETNFAEGNVASPSCPEALSQKEILITPVVGFIDQDFQAKPNPDEVKDVFLAPLDYFLHPHVYHQNYLTYSDHRLVLHCFEYTNPENGMTYQIRGMTAKFAVFVALIILEKRPTFEVEYNLDDLISSSEESLLKLHKYVTSKL	407896	395882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_-_397011_407821
846173	contig_5018_pilon	-	1255	10	Intergenic	novelGene_46992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	52.9159594586746	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	720	1253	649963	644269	FALSE	20	TGCCCTGCTCAAGTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYNIWCDGCKNHIGMGVRYNAEKKKVGNYYTTPIYRFRMKCHLCVNHIEMQTDPANCDYVIVSGAQRKEERWDMEDNEQVLTTEHEKKQKLETDAMFRLEHGEADRSTLKKALPTLSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRAKKKAIKEEEERDQALQTKASLAIPLVPETEEDRKL	656301	644266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_644377_646983_647157_647239_647383_648077_648139_649914_650268_650897_650981_652225_652280_653429_653622_655111_655157_656260
846174	contig_2414_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_158523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980337	996614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_980447_995548
846176	contig_17194_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_155372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCAGAGGTAGCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244861	245807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_244900_245800
846177	contig_10431_pilon	-	846	3	Intergenic	novelGene_117396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84	83	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTCCTGTTTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226085	220518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_220648_223936_224110_225541
846181	contig_2093_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_153011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGATACAGTGAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452892	1453497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1452900_1453500
846182	contig_9434_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_150498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	28	327	304700	304999	NA	55	CTCTTTTAGAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCERVCECAKLCRGSGLLAARAKCAWGLEADQPAYGTMWSSWGIIDRKVGLDYMTVSEEFCKLWMTDSGRTSFGFKTQCSSPKMAMRYTPEKTRTPD	304672	305516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_304700_305500
846183	contig_7165_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_116898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCATTATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074811	1073525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1073500_1074800
846185	contig_10331_pilon	+	683	3	Intergenic	novelGene_54138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_2	3.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAGAAAAAGGAAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409534	502259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845
846186	contig_8677_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_174031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	68	475	80405	79998	NA	20	AGTTCTCCTTATACCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSWACLPLRRRAWKGQLLVISQGWRMGSIHEPRRVSLAEVNGEKVNQDKVVEEGKEVSRLVLRNDLPSFQTPRQSTWQRCSKPTVNPPSPVISSSSSHYMWNQKPTLIPHLPAARPYARHLTHSYLVGHMVPP	80472	79772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_-_79800_80500
846187	contig_4732_pilon	-	462	4	Intergenic	novelGene_75395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_3	191.803719115836	2018	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	26	364	523894	516689	FALSE	10	GCTTCTGTTTTCACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATRFIQLLRNWTSGQNLQAKLQLRYQEISKRTQPPPKLPVGPSHKLSHNYYCTRDGRREATPPSVIMSSQKALVSGKPAESSVAATEKKAVTPAPPMKQWELSQDQPYL	523919	516590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_516777_519120_519271_523305_523356_523843
846188	contig_6589_pilon	-	493	4	Intergenic	novelGene_25922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.4309521329882	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGATCCCCACCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178547	1158576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158625_1177210_1177382_1177927_1178079_1178424
846189	contig_11719_pilon	+	520	4	Intergenic	novelGene_154733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3249.35726977916	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	37	396	13921	14541	TRUE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSASAWDAPVATMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGTVPKLMSKDLL	12997	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14613_20036
846190	contig_16091_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_112348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	262	645	17524	17907	NA	75	TTAAAAAAAAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFILEQLNVNKIICHHLCLFLFKKIGNQRLHLLCEWGVWLVVLTWTTAHCHNDTFVPSRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKVGPA	17262	18813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_17300_18800
846191	contig_3184_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_169789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTTCTGGATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38253	37545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_-_37500_38300
846194	contig_15327_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_70661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATGTGGTGGGGAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900508	900322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900300_900500
846195	contig_20013_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_174937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACATATTGTTTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33641	31924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20013_pilon_-_31900_33600
846196	contig_5020_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_27949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAATCTTATGGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176703	177937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_176700_177900
846198	contig_13653_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_175686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGCATCTGCAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77351	79055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_+_77400_79100
846199	contig_935_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_45529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCAAATAAGGAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107832	107112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_107100_107800
846202	contig_5916_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_158038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAAGTCTGTGTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327723	327491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_327500_327700
846203	contig_11307_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_105261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230271	229728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_229700_230300
846204	scaffold_16539_pilon	+	757	7	Intergenic	novelGene_68406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.117292323665	87	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908236	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913737_915327_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
846207	contig_6489_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_128931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTACAGTTCAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198563	197618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_197600_198600
846208	contig_3252_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_61496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATAATTGTGGTAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305165	305823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_305200_305800
846209	contig_10372_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_112509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAACCACATAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26165	25029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_25000_26200
846210	contig_7057_pilon	+	343	4	Intergenic	novelGene_123351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	630.820277275725	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	178	315	941435	943696	FALSE	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFLPLFLLCFQPARPRKK	941037	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_941107_941208_941288_941405_941523_943646
846211	contig_7342_pilon	+	918	6	Intergenic	novelGene_71138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	11.2605506082074	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	126	782	290166	305572	FALSE	20	CCTGAGCTGTGTAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHRDCSRGDCYLPTGTNTQQPPPPPREPLPELLARTPELSMQNSESGSESPASVALRPSAAAPAPGAQPVPASPQRVLVQAAGSAPKGAQMQPISLPRVQQVPQQVQPMQHVYPAQVQYVEGGDAVYTNGAIRTAYTYNPEPQMYAPSSAASYFEAPGGTQVTVAASSPPAVPSHSMVGIAMDATGSPIISSAGAYLIHGGIDSTRPSLAHTSRSSPATLEMAIENLQKSEGITSHKGGLLNSHVSVCRSLPSALPCS	233676	305708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_233794_290157_290271_294500_294591_298005_298086_298730_298993_305452
846213	contig_2689_pilon	-	208	1	Intergenic	novelGene_100835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACTGAAGAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227699	227491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_227500_227700
846214	contig_2710_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_161772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCCTTTTGAATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886488	883950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_885172_886178
846216	contig_8452_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_48005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283719	284374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_283700_284400
846217	contig_11094_pilon	-	985	3	Intergenic	novelGene_177021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	123	431	511967	435875	FALSE	20	TTGATGTGTTTACAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAIACGREFLVNSSRVLLDTILQLLGDLKPGQCTKLKVLMLMSLYNVSINLKGLKYISESPGFIPLLWWLLSDPDAEVCLHVLRLVQSVVLEPEVFSKSASEFRSSLPLQRILAMSKSRNPHLQSVAQELLEDLRALEHDT	526439	435320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_-_436084_511867_511972_526321
846220	contig_8693_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_150883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGTCATCAACTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183609	1184168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1183600_1184200
846221	contig_16907_pilon	-	617	3	Intergenic	novelGene_87452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	15.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTACTTGGGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474486	448897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_467610_467773_474411
846223	contig_4678_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_125997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5932	6286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_5900_6300
846225	contig_5551_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_134272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGTGCAACAGTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650613	651935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_650600_651900
846227	SIRV6	+	280	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	29	2951	29	-2924	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGTGAGTTTCTAACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2545	7864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805
846230	contig_16883_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_161742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAATTTACAAACGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352300	353948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_352300_353900
846231	contig_5278_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_139777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298443	299293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_298400_299300
846232	contig_13760_pilon	+	991	7	Intergenic	novelGene_61320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	59.6396586919215	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	78	647	201712	204812	FALSE	20	TTTTCCCCCAGAAAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGTFGEVFKAKHRKTGKKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTGAASPLL	201169	205156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_201186_201650_201733_202500_202592_202950_203118_203240_203413_203569_203661_204784
846233	contig_8260_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_163227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16577	15900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_15900_16600
846234	contig_753_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_112935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGTTTTTAAAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687849	687278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_687300_687800
846236	contig_13558_pilon	+	752	2	Intergenic	novelGene_123032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATGGCTGATTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532367	533478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_532467_532825
846238	contig_16098_pilon	+	1100	10	Intergenic	novelGene_45910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	61.7163963647175	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	280	1047	321962	336931	FALSE	35	AGATTCTCTGTGATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIVSSTHRPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEVVSYSHATNKYEVDDIDEEGKERHTLSRRRIIPLPQWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294730	336984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_306428_306572_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335341_335505_335727_335764_335870_336034_336814
846239	contig_8161_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_156782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAATCTTAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487713	486954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_487000_487700
846240	contig_5018_pilon	-	1009	4	Intergenic	novelGene_46987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	21.3541565040626	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	248	871	647004	643667	FALSE	15	TCCCTGCCTCCAGTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQTLLFGCLHTQGEAQLDWHHHTARGIFTGKPWGPSARPHRRAGPGSGSTQHNTRVSSSFHIGRSHIQEAQSAWKDDFALNSMLRRRFRAKKKAIKEEEERDQALQTKASLAIPLVPETEEDRKLAALLKFHTLDSYEDKQKLKRTEIISRSWFSSASGSGAGSGNSKAGSVLKKLAQNRRSTAASSPITVGDLGIVRRQSREVLESPQDASGTPKSREPQVPKGTVQDRPTFPQDCSQETAETPESCCQDRPLPPQGSPQEAADTSDAPHPCSLSTSLVADYSDSESE	653658	643528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_644131_644237_644377_646983_647059_653465
846241	contig_6048_pilon	-	666	5	Intergenic	novelGene_73108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	9.09670269933013	115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	52	609	310049	297545	FALSE	15	CTTACGTTTAATTTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAKILFVGPCESGKTVLANFLTESSDITEYNPTQGVRILEFENPHVTSNNKGTGCEFELWDCGGDPKFESCWPALMKDSHGVVIIFNADIPSHLKEIEMWYSCFVQQQLLQDTQCLLIAHHKPGSGSDRGSLSLPSPLNKLKLVHSNLEDDPEEIRLEFIKYLKSIVNSVSESRDREEMSIIT	310100	297487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_297694_298527_298731_298999_299090_299204_299282_310010
846242	contig_6954_pilon	-	1833	12	Intergenic	novelGene_64425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGAAGCCTTTGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182232	167238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_167274_167960_168083_170054_170253_171428_171539_171893_172081_174646_174734_174833_175099_175240_175504_177098_177262_178077_178192_179610_179820_182152
846243	contig_6589_pilon	+	751	2	Intergenic	novelGene_26320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCTGGTGGTAAACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2377666	2394753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2377837_2394172
846245	contig_20844_pilon	-	952	2	Intergenic	novelGene_78588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	320	952	188472	187277	FALSE	15	TGGGGCCAGGGCAAGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRPSRMDLLPRPLPVGPRHPPASSSDPHSSPRAFISWFELIFYNNTKYPQTVSGLHLYLAGVTPPCPPSSSSSSFRSSRMRLSRSSRRPPLAQAGGHSGATADVEVAGVEDFGQVVLPPALRVCTGCPRHVGLSPVVAVGSRAGVGVGAAALCVPVPARGEDPCRIHGKAAPVAGGRGPHLCPAPGGGQGCESPGPGPDRTAEGEAGPG	188791	187276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_187504_188066
846246	contig_4364_pilon	+	826	4	Intergenic	novelGene_179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	900.364864312734	193	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	85	444	1268714	1270694	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLLLLLPAQGCGDGSTAWGKPDCQTQAAPGPAPGGLGGLTSATS	1267021	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268904_1269000_1269042_1270565
846247	contig_3155_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_26352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTTTCTTTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211596	210178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_210200_211600
846248	contig_16775_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_107747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGAATAAATGAATGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86683	87207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_86700_87200
846249	contig_7932_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_128427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACAGCAATACTCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213100	213589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_213100_213600
846250	contig_7932_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_128428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213661	214140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_213700_214100
846251	contig_14142_pilon	-	622	4	Intergenic	novelGene_120575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCGCCCAGGCCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527827	526691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_526980_527100_527133_527419_527502_527607
846252	contig_12080_pilon	-	1685	2	Intergenic	novelGene_128404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1188	496	1683	428407	427220	FALSE	35	GGAAAAGGAGATTGAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDNAPTIEIRGIGLVTHQDGVANISEDVAEETAVALVQVSDRDEGENAAVTCVVAGDVPFQLRQASETGSDSKKKYFLQTTTPLDYEKVKDYTIQIVAVDSGNPPLSSTNSLKVQVVDVNDNAPVFTQSITEVAFPENNKPGEVVAEVTASDADSGSNAELVYSLEPEPAARGLFTISPETGEIRVKTSLDREQRDSYELKVVAADRGSPSLQGTATVLINVLDCNDNDPKFMLSGYNFSVMENMPALSPVGMVTVIDGDKGENARVQLSVEQDNGDFVIQNGTGTILSSLSFDREQQSTYTFQLKAVDGGVPPRSAYVGVTINVLDENDNAPFITAPSNTSHQLLIPQTRLGETVSQVTAEDIDSGVNAELTYSIAGGNPYGLFQIGSRSGAIT	432799	427217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_428642_432538
846256	contig_9895_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_144682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTATGCCACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89069	88699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_88700_89100
846258	contig_6109_pilon	-	705	6	Intergenic	novelGene_160385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	46.8461311102635	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	298	705	618982	602601	FALSE	40	GCAATGTATCCTTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMASVMQKIIPHYSLARWLLCNGSLRWYQHPTEEELRILAGKQQKGKSRKDRKYNGHIESKPLTIPKDIDLHLETKSVTEVDTLALHYFPEYQWLVDFTVAATVVYLVTEVYYSFMKPTQEMNISIVWCLLVLSF	648724	602600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_602753_607184_607283_609540_609625_618908_619013_619657_619837_648636
846260	contig_12886_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_135465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATAAAATATTAGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285260	284758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_284800_285300
846261	contig_5816_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_158239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125043	126731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_125000_126700
846262	contig_9706_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_21011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCATCATTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526889	526268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_526300_526900
846264	contig_12951_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_68209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAATAAAATATCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766696	767497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_766700_767500
846265	contig_8045_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_35324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAATACTTTGGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68900	68567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_68600_68900
846266	contig_11525_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_171073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGATACTTGGGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26589	25597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_25600_26600
846267	contig_10051_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_175598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGTTAAATGTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274076	275683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_+_274100_275700
846271	contig_960_pilon	-	951	7	Intergenic	novelGene_108203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	41.9033278975416	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	801	151	951	124691	103913	FALSE	25	GATGAGGATGATCCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVLLKLVCVIALLVSSLQADKCQEPEPEIVSVSSANEISVHLCSSKWNEKKDTTIWYKNDGKTLIPMERDSRMHQFKEKLWFVPAKVEDSGHYYCVVRNATHCLKNKITVKFVENEPDLCYNTQAKFPQKLPIGQNGPLVCPNLHVFKDENRELSNIQWYKDCRPLLLDNINFIGDRNKLIIINVTEGHKGKYSCHASYIHLEKQYHVTRVIEFTPIGKDEVRGPVILSPVNETMEVELGSQTQLICNVTDLALGIVYWKWNGSEI	132795	103912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_103993_114132_114199_117163_117333_118155_118346_118458_118694_124630_124698_132651
846272	contig_5018_pilon	-	787	2	Intergenic	novelGene_46999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	952	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	138	608	1215079	1213627	FALSE	0	TCTGCTGCCTGTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQKEAQRIMTLSVWKMYHSRMQRGGLRLHRSLQLSLVMRSARELYLSAKVEAHEPEVPLPTGRSPDPRLHPPREAEAAAQAAPPDGLSHVATARYGLVPALLCLRVGAGADLITDENCSHLGISGGDYVLRHRDTIHPDVPGLNHERVGRAELP	1215216	1213447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1213836_1214817
846273	contig_1472_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_86112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTCAAGGAGAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72470	71339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_71300_72500
846274	contig_9785_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_157897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATAGTGGTGATTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239012	240197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_239000_240200
846275	contig_6873_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_129847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAATTACAATAACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800461	801832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_800500_801800
846277	contig_8710_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_73507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATACTCTGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281850	283159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_281800_283200
846278	contig_10629_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_52962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAAAATTTGAGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459074	459800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_459100_459800
846279	contig_1301_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_47334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281519	276676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_276870_281190
846281	contig_16098_pilon	-	800	3	Intergenic	novelGene_45797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	27	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	367	798	44533	42098	FALSE	20	CCCCAGAGAGGTGAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSDTTPFLSQADDTDDGPVPSTPGLPGSMGAPKSGEPEVLDREGLQRITGLSPGRSVLIVAVLCYINLLNYMDRFTVAGVLPDIEQFFNIGDGSSGLIQTVFISSYMVLAPVFGYLGDRYNRKYLMCGGIAFWSLVTLGSSF	44899	42095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_42223_44128_44195_44292
846283	contig_9363_pilon	-	1259	3	Intergenic	novelGene_6792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.5	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	87	1040	1603985	1595034	FALSE	10	CCCACCCGTGCCTGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEQQAEEEEEEEMQEEMVLLVKGEEGEGEEKYEVVKLKIPMDNKEVPGEAPAPSADPTRPHACPDCGRAFARRSTLAKHARIHTGERPFGCTECGRRFSQKSALTKHSRTHTGERPYECPECDKRFSAASNLRQHRRRHTGEKPYACAHCGRRFAQSSNYAQHLRVHTGEKPYACPDCGRAFGGSSCLARHRRTHTGERPYECADCGTRFAQSSALAKHKRVHTGEKPHRCAVCGRGFGHRSNLAEHARTHTGERPYPCSECGRRFRLSSHFIRHRRAHMRRRLYICAGCGRDFKLPAGATAGTATERCPKCESS	1604740	1594814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1595847_1603844_1603995_1604663
846284	contig_4364_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCCTGCGCTCTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299451	1299864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1299500_1299900
846285	contig_9816_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_177172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90498	89434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9816_pilon_-_89400_90500
846287	contig_1450_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_27335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGGAACCTCTCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196077	194772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_194800_196100
846288	contig_11538_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_152307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGGGAGGAGTTAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271226	269586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_269600_271200
846289	contig_11105_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_159824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCTAGAAAAAAAAGCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396768	395495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_395500_396800
846290	contig_9439_pilon	+	2504	17	Intergenic	novelGene_176907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTTTGTTGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71515	126604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_+_72045_73031_73180_73289_73417_75329_75482_77346_77418_79982_80089_81061_81261_85025_85101_87719_87905_90738_90853_92350_92466_93702_93827_100617_100721_115528_115743_117767_117838_120325_120444_126550
846291	contig_10135_pilon	+	1086	2	Intergenic	novelGene_106682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACGTTGGTTGTTCGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315007	316728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_315415_316049
846292	contig_3575_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_141114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTTAACTACTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465725	466346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_465700_466300
846294	contig_15410_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_130593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.80277563773199	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	7	528	132100	142152	FALSE	10	TCTGGATTTGCGAGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRPKEGVSGLDSADIEVTDRRLPQAPVVRHRCQHRRSETLDTSTTLPRVTQDDACSASKPPQTSGLFCVELIRGPAGFGLTFSGGRDVVGGDVPLAVLGLLEDGPAQRCGRLQAGDLVLHINGESTHSLTQAQVEERIHSGGPRLRLMLCRPFETHPGKPEISAWILGDRR	132093	142641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_132122_140746_140830_140906_141147_141260_141405_142119
846295	contig_10589_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_129369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19430	18921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_-_18900_19400
846297	contig_6102_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_32281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.88561808316413	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	56	442	1452324	1450261	FALSE	25	CAAATTGAATTTGCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPRLDPPGPTCEHTTHVHFAGWSICLPVPWRVLPPLLDPPSSLCSAPVESLPRTPKSQLIPMIGFICLGMGSAALYLLRLALRSPDVCWDRKNNPEPWNRLSPNDQYKFLAVSTDYKKLKKDRPDF	1452379	1449565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1450318_1450447_1450509_1451354_1451444_1452144
846298	contig_3787_pilon	-	465	3	Intergenic	novelGene_102414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_2	404	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGTATGGCTGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565126	559676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559901_561481_561596_564999
846300	contig_5050_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_110279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGATCTGTTTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531371	532635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_531400_532600
846301	contig_5120_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_169617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTTAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254022	253030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_253000_254000
846302	contig_5047_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_157978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCATAGGGTTTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777178	777788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_777200_777800
846304	contig_1274_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_137797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	673	1359	232362	233048	TRUE	15	TTGCTCTTGATCCGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFKAWNFSLRFLTLPCWLGSTGSLGPSSFSRYSADSCKSWPCPTPAASKLSPCPLPSSSPSGWGPFSMTITRWLFSRVRSAVTYKASPSSSPPWSGNPEGWGWAASPPPWPLLVFRLKQRLTLPGRGGSTMFSGTEWLRLTGTVRGRLPSAGSTSLWEAYLEHSSRTSGQLKVSVSKGLRGLRAEVRIPGKVVLGLAAEGLKEKRRGEVSLAEQGLGGLCSWVITGS	231689	233704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_233082_233587
846305	contig_12427_pilon	+	502	2	Intergenic	novelGene_40422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATCTAAGCTCAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209614	210470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_209737_210090
846306	contig_13300_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_125839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1	543	1179667	1180209	NA	35	CGGATCAAACTGGCTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDLYCPTWKPLATWGYLRLRSLAQVTWKPSSPITLPHFKGSVCACGWWPPYRTTPFSTDSSAEPVTPDKLRLTAKQQLEAAYFRRHTRDPHKSRRSSREGKSVPSRCHRENHLPHLQAEGGQVSPPATQLKFGPNALPRGKEREEGLERQVGNARRTSRQVALCASPRPPVATPGSPL	1179666	1180512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1179700_1180500
846307	contig_546_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_117242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATCAGAATCATAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432312	433124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_432300_433100
846308	contig_7321_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_53110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35170	33914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_33900_35200
846309	contig_9272_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_125972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACGGCTTTGGTCTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642126	640276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_640300_642100
846312	contig_3095_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_75268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACCTTTCTACAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255565	254540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_254500_255600
846316	contig_17968_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_154536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAGGAGCTGGACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8328	8771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_8300_8800
846317	contig_8651_pilon	+	256	2	Intergenic	novelGene_168196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCTTTGTGTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185685	189353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185757_189168
846318	contig_18898_pilon	+	1028	8	Intergenic	novelGene_77642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	398.524728446898	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	128	880	64645	70143	FALSE	30	AATTGTCAGCTTTATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSNDHKRSQLTRFRPDYSSIISSCCVSASGFPGWDKQAFTQQWDQCKCSSIPIHADGVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSQDQPHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGSRGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFNAPRDYSGYQRDGYQQNFKRGSGQSGPRGAPRGRGGPPRPNRGMPQMNTQQVN	63946	70291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_64012_64582_64692_64932_65063_66092_66244_67304_67500_67957_68059_68476_68541_70078
846320	contig_12841_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_55835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25975	25712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_25700_26000
846321	contig_10163_pilon	-	1406	4	Intergenic	novelGene_82661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.816496580927726	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	123	791	248449	240878	FALSE	35	CCCATTTAAGTGATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNLVTGLPKQTPGSSGDIIVRTSKLLIPVTCEFPRLYTISEGYVPNLRNPPLEIMSRNHGIFPFTLEIFKDNEFEEPYREALPTLKLRDSLYFGIEPLVHVNGLESLVESCFATPTSKIDEILKYYLIQDGCVSDDSVKQYTSRDHLAKHFQVPVFKFVGKDHKEVFLHCRVLVCAMLDERSRCAQGCHRRMRRDTAEEDTAGAENQVLTGGPIIIDWGD	249119	240262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_241049_242651_242752_248051_248468_249015
846322	contig_2438_pilon	+	805	3	Intergenic	novelGene_112069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	369	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	277	753	311851	312871	FALSE	15	TATATATGCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	311574	312923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305_312409_312729
846323	contig_11307_pilon	-	1281	7	Intergenic	novelGene_105256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_6	209.504706921401	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	279	1037	206778	168946	FALSE	40	ACAAGTAAGATTTCATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYWPQLRLLLWKNLTFRRRQTCQLLLEVAWPLFIFLILISVRLSYPPYEQHECHFPNKAMPSAGTLPWVQGIICNANNPCFRYPTPGEAPGVVGNFNKSIVSRLFSDAQRLLLYSQKDTSMKDIHKVLRTLRQIENSSSNLTLQDFLVHNETFSGFLHHNLSLPRPTVDKMMKADISLHKVFLHGYQLHLTNLCNGSKLGEVIQLGDQEVSQLCSLPREKLDAAEQVLRSNMDVLKPILVGRITVWRSFKH	231155	168701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_169162_171247_171370_188092_188212_189566_189709_194143_194238_206712_206878_230976
846325	contig_6375_pilon	+	555	4	Intergenic	novelGene_73077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	72.2787812723916	207	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGAGTCTTTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748884	751714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_748953_750937_751031_751230_751316_751405
846326	contig_6277_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_80413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728092	727408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_727400_728100
846328	contig_14637_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_114548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATCACATGTGGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361277	360226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_360200_361300
846329	contig_14637_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_114547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGAATTGAGTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	359809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_359800_360100
846330	contig_12277_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_139664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23512	24615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_23500_24600
846332	contig_15354_pilon	-	1443	6	Intergenic	novelGene_65746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.99714227381436	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGGACTCTATCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638339	630642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_631278_631545_631622_632742_632842_633995_634264_637889_638048_638132
846333	contig_10636_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_172272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAAAACTCCCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13763	12582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_-_12600_13800
846336	contig_6241_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_156420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGGTTGTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207071	205518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_205500_207100
846337	contig_9706_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_21053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGTAATTTGAGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722130	723147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_722100_723100
846338	contig_14953_pilon	-	890	2	Intergenic	novelGene_137275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	246	320	96839	96765	FALSE	40	TAAAGAAGAGATCTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSGWKENTAVYDTFVAFSENQHAPDSCPPYPGQRTEELVCLHRILATAGSKLKARAHGSCQSLLAGHSLIPNPPSAPPFSMCLSSGNLGCHDPVGNTGPKERLI	97172	96194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_97049_97136
846339	contig_4469_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_21924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACATCTCTTTAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545083	544804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_544800_545100
846340	contig_8541_pilon	-	679	2	Intergenic	novelGene_105587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	205	561	577314	548621	FALSE	55	TGAACTTTTTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKMKG	577518	548502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548631_576967
846342	contig_17311_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_57869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTGTAGATGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185741	187641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_185700_187600
846343	contig_7843_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_152045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTAAGGTAGGACGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457829	459252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_457800_459300
846346	contig_14666_pilon	-	476	3	Intergenic	novelGene_39655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2545.5	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTGCTGTTGGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492436	488762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490537_492242
846347	contig_10456_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_163470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	137	388	58797	59048	NA	70	AGGAAAAAATAACCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIPEALWRRTSRKALPVSVAKAPPWWAGAAILLASSSPPFLGVEMSGLSQPEMEGCRNLLGLLDNDEIMALCDTITNRLVQPEDRQGKGGPFSPRTAVPPRTPQRFQVAGDWGWGWDLGSVLARSRP	58660	60132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_58700_60100
846348	contig_3113_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_175794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	592	1776	10	1785	31735	29960	NA	45	AAAGAGTTGAAAAGTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AECMFTQMIEKLGFSVTASANGGGWGFNLDAGMDHSQHSESQESQQSRSEHSYFCTTKFSYIPLASCHFAIDQLQLSKAALQELKCIEDLLGQHAGPDTLPLLRYRTEAFFHSFGSHANQGPLHLGGIYCWKAVSEGFQSEQLAEVKQQSAEALDIYIRSSYCGFAVKTAAGVNISDSHSKMASQSTNFQNLQTNIQLSVAHIGGPPEADSFAQWKAGLMASNQTWCVIDRGFNLVPIWDIILSIHRSDFKNPVQVANCLKDSYTALTGLTTQIQDGEEFFSANMEAKIFLEDMKSWEVSHPEEQLKKLINFMQMLSQKIKSYDTWISMCLTDWNMQNFLVNTVNSCKKSSTYNTKFVKSQLCTLLDPHIYRVKDFPQAQSIMQWIFQSESYQEEVNISQFSEFIRTLKEIQNNFIEAKTKTESQETVQEAQRKVTYEVSLSLHSLLEKLRETGQPDTQLLLLCIAAGAGYHAVNNTFQYVLGYDELDYLLHEMQTAHDKYQELKNICSYRAQAFLVLTGLTATVGITAFSEEEKSKRLSLMRQHMQQSLSKEVAHVLTKFGAHCDWENLEKDLRLLIDGDYEATVSSLKMEDVR	31744	29959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3113_pilon_-_30000_31700
846349	contig_9415_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_109731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGCAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515384	516266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_515400_516300
846352	contig_5718_pilon	-	611	3	Intergenic	novelGene_110368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	46.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	110	454	947237	943922	FALSE	50	TACAGAAGAAAATGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVTGASSTSSSSTKGTYFPAILNPPPSPATERSHYTMEFGYSSPSPSTHRSYSYRPYSYRHFAPPTTPCSTDVCDSDYAPSRRMTSVATAKGYTSDLNYDSEPVPPPPTPRSQYLSAEENCESCPPSPYTERSYSHHLYPPPPSPCTDSS	948011	943764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_944217_947187_947286_947950
846353	contig_4686_pilon	+	850	3	Intergenic	novelGene_118603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	20	406	947378	990217	FALSE	15	CTTTATTTTCTTTTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGCVKITFLLLNHKDIESKCFVWTYWLFFLSFLLFLLFLVDIMANNTTSLGSPWPENFWGGSFSPLSPKTCQLTKPRFAGMRTTNSSSGSLEMMVLFNLTSSIEFLETLLLKVHTVLSLSGGAGSRS	947358	990661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_947559_989284_989389_990115
846354	contig_383_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_126149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAGCCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375610	374209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_374200_375600
846356	contig_4782_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_73683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCAATTAAACTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677371	676364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_676400_677400
846358	contig_6589_pilon	+	920	5	Intergenic	novelGene_25682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	42.7931069215592	489	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	166	732	73445	77654	FALSE	5	GCCTGCCTGTGTCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACPVSAELPAPNSAPGATAQGDAGAPGSGEPRGRRGERRCQATGERRGWGAEDVMSQAPGARPSPPCVYHERQRLELCAVHALNNVLQQQLFSQEAADEICKRLAPDSRLNPHRSLLGTGNYDVNVIMAALQGLGLAAVWWDRRRPLSQLALPQVLGLILNLPSPVSLGLLSLPLRRRHWVALRQVDGVYYNLDSKLRAPEALGDEDGVRAFLAAALAQGLCEVLLVVTKEVEEKGCWLQTD	72659	77842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_72811_73430_73591_75657_75784_77247_77443_77554
846359	contig_9242_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_155071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTGAATTAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657353	656479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_656500_657400
846363	contig_10252_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_162921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGTTGAGATGATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140355	139534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_139500_140400
846365	contig_10864_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_107130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGGGTCATGTGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509515	1509019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1509000_1509500
846366	contig_10437_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_38505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGACTCTAGGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307089	1306153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1306200_1307100
846368	contig_6546_pilon	+	463	5	Intergenic	novelGene_140968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4212.38192712864	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCAGCTGTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597575	599691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597670_597712_597775_598338_598414_599246_599365_599577
846369	contig_10426_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_144663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATAGAACATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69257	68364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_68400_69300
846370	contig_14219_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_54355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860443	860674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_860400_860700
846372	contig_8276_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_174480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152924	153661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_152900_153700
846373	contig_14034_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_72631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGAGCTCGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145687	147090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_145700_147100
846374	contig_7593_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_127335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCCATTTCTCAGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551035	551388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_551000_551400
846376	contig_18794_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_54671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401193	401934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_401200_401900
846377	contig_4125_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_25108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCAAGGGCCAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761136	759918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_759900_761100
846378	contig_15741_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_159662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCTTGTCTGTGCGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50026	49561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_49600_50000
846379	contig_6048_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_73105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGAAAGGAACAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248028	248991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_248000_249000
846380	contig_13110_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_138745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATCCTGTTGATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545093	545564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_545100_545600
846381	contig_12841_pilon	-	1179	14	Intergenic	novelGene_55894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	82.0997372949836	2	49	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	49	954	931717	892368	FALSE	35	AATCTTATTGATCTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVNQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIESGAEAKKLPGVGTKMAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVTGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFEDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEIKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHRVVEQLEKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLARENDEKEYPHRRIDIRLIPRDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRTHALEKGFTINEYTIRPLGVTEVPQKKGLVVCFQR	931765	892142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_892412_892624_892765_893298_893364_909443_909531_910220_910292_914691_914765_914862_914918_916588_916641_920814_920865_922934_922994_923995_924071_928612_928680_931372_931431_931707
846382	contig_91_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_127085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GACATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203295	203733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_203300_203700
846383	contig_8286_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_139785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45323	43993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_44000_45300
846384	contig_6228_pilon	+	1288	3	Intergenic	novelGene_164509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	12.5	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	40	435	252696	256322	FALSE	35	TGTTTACACTAATTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPEPLSGQDVGSFAYLTIKDRTPQILTKVIDTLHRHKNEFFEKHGEEGTEAGKKAISLLSKLRNELQTDKPIVPLVEKFVDTDIWNQYLEYQQSLMKESDGKPRWFHSPWLFVECYMYRRIHEALTQR	252656	257175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_252737_254681_254788_256073
846385	contig_10864_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_107116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTAAGGGCTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119236	1120783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1119200_1120800
846386	contig_7093_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_157967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTAACTTTAGATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67403	68003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_67400_68000
846388	contig_8597_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_158699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	254	565	26389	26078	NA	30	AGAGACTAATTTGCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRTARRMNKSVLEEVQPECSLEARMARLHLTYFGHVIRRNRSLEKDIMLGKVEGQQRRDRPSTRWTDSVAATVDSNIATVVRMVQDQAVSCSFVDGVAMSRN	26642	25806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_25800_26600
846389	contig_3472_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_166944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGTCCACTTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949124	948639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_948600_949100
846391	contig_20944_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_167536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAATGATGACATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27810	27569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_27600_27800
846393	contig_5590_pilon	-	849	2	Intergenic	novelGene_163002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246136	243086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_243538_245738
846395	contig_8058_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_149516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCCTTTGACCAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73100	73636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_+_73100_73600
846396	contig_5217_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_135804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAAGTACTTCCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706036	706654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_706000_706700
846397	contig_12724_pilon	-	725	5	Intergenic	novelGene_146874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	71.6798437498297	41	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	82	723	541481	448844	FALSE	75	CAAAAATAAAAAAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGLSRDGWCVWGEGGGNPPCRPGSGAMSNFKKQVFVGKVLKKLFPDVPSGQEKLAPATLASEKPPEKVRPKKANLRGVQPLTGTGLCLCLRKGLQPGPEKASGFPLLPLHVCCVPPCPLELSSPLREGCGVSGVLVKQYDGDTKLQTERRLYTVSLPPAGYIPCLPELSSCMNSENSSSSADIEDEDPHDQPKRKRIRRRKSKKNVKNPNNVHVEQAELEKQQSLLGEKLQPQHTDGPII	541562	448841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_449011_497701_497837_519843_520015_522974_523122_541459
846398	contig_10196_pilon	+	321	2	Intergenic	novelGene_132067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTTGTGTTGGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741641	742188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_741831_742056
846399	contig_4392_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_117328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATGTTAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527434	527044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_527000_527400
846400	contig_12270_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_114051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	27	341	14409	13872	FALSE	20	GTTTATTACTGTCAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAA	14435	13871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
846401	contig_14980_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_78221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATGGACACAAAATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289457	290192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_289500_290200
846403	contig_91_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_127080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCATGATTCCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73312	74234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_73300_74200
846404	contig_9727_pilon	+	1170	6	Intergenic	novelGene_86339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	296.075395803164	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	10	552	426080	430935	TRUE	25	CCTTTTATTAGAGGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425236	432428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425244_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430713_431083_431957
846405	contig_2069_pilon	-	1172	11	Intergenic	novelGene_23404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	263.390660426675	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	169	723	1256627	1251240	TRUE	25	GTTGAAACTCATTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKDTMTLILK	1256977	1233917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234171_1249409_1249513_1249791_1249868_1251222_1251315_1251737_1251881_1252234_1252273_1253085_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860
846406	contig_10011_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_68033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGAAATGACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121818	120624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_120600_121800
846407	contig_12622_pilon	+	778	6	Intergenic	novelGene_5807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	206.148878240945	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	28	723	349741	406044	FALSE	80	ACATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGEWLCRLLGERVCCVCCLLPCSSSKTRLFILPSGPITEYLCRDWCVNREQCLHAF	349713	406099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_401825_401940_404556_404650_405789
846408	contig_4364_pilon	+	979	3	Intergenic	novelGene_183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267027	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268743_1270204
846410	contig_10904_pilon	-	773	3	Intergenic	novelGene_22637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTCCCTCAGACTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505159	499196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499585_499667_499852_504958
846411	contig_4232_pilon	-	820	7	Intergenic	novelGene_63489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	443.92141446682	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	28	414	615916	614837	TRUE	35	AACATTTTTACACGGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	615943	607764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_607829_611924_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783
846412	contig_6589_pilon	+	839	7	Intergenic	novelGene_26080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	75.19012937584	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	68	811	1865997	1875151	FALSE	15	TACCAGCTCTGGCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQDGGNTRTQAQPQDRREALCTKPSSL	1865929	1875179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872787_1875073
846414	contig_1986_pilon	-	752	4	Intergenic	novelGene_64158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_3	548.200287810537	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	49	486	410391	402851	FALSE	60	AGTAAGAAAAGAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAGRVPPRPRPAAAMQFMLLFSRQGKLRLQKWYVPLSDKEKKKITRELVQTVLARKPKMCSFLEWRDLKIVYKRYASLYFCCAIEDQDNELITLEIIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLLGGEVQETSKKNVLKAIEQADLLQEVSY	412714	402584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_403001_403608_403718_410212_410392_412666
846415	contig_6654_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_85781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCACAAATGTTCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996279	995552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_995600_996300
846416	contig_5331_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_112769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAATTCACCTCTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244730	243801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_243800_244700
846417	contig_10299_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_79738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAGAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396468	394649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_394600_396500
846418	contig_14704_pilon	-	650	6	Intergenic	novelGene_82704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	143.552081141306	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	19	588	116413	77600	FALSE	40	ACATAAATTTATTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSAALRAGAAGLTAPWGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGIQAGL	116431	77537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_92429_92599_100845_100912_116359
846420	contig_253_pilon	+	817	3	Intergenic	novelGene_129785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGAACAACACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092776	1097447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_1093453_1093821_1093874_1097358
846421	contig_14537_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_158644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTAGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10099	10644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_10100_10600
846423	contig_14514_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_137446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGCAACTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4629	6288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_4600_6300
846426	contig_1009_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_121785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGGATAGTCTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332874	333248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_332900_333200
846427	contig_9668_pilon	+	315	2	Intergenic	novelGene_58158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCCGCTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427815	430294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_427891_430054
846428	contig_11994_pilon	-	2389	1	Intergenic	novelGene_129340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGGAAAATGTAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60511	58122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_58100_60500
846429	contig_6616_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_141757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGGGTGGGAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292801	293543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_292800_293500
846430	contig_385_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_177048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAGAAAACTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275442	275818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_275400_275800
846431	contig_14985_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_169092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATGGGCCAAATTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13596	13843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_+_13600_13800
846433	contig_9099_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_149889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGGCAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238499	237296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_237300_238500
846434	contig_2113_pilon	-	1863	1	Intergenic	novelGene_161151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360101	358238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_358200_360100
846435	contig_8576_pilon	+	742	3	Intergenic	novelGene_88722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	71.5	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	85	405	539680	542863	FALSE	10	GTTCCTCATGACTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAWTGRDFRERARRSDQEHLPCAAQDMSSLSEYALRMSRLSARLFGEVARPTDSKSMKVVKLFSEQPLAKRKETYDWYPNHNTYFALMGTLRHLGLYRDEHQDFKDEQLRLKKLRGKGKPRKGEGKRAAKKK	534707	543200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_534765_539652_539895_542757
846436	contig_10016_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_117864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAACTGACAACATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355804	354643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_354600_355800
846437	contig_5039_pilon	-	703	3	Intergenic	novelGene_64920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	18	395	1191889	1121990	FALSE	25	TATTATATGATCGACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRSGMPRYELALILKAMRRPETAAALKRTLEALMDRGAVVRNLENLGERALPYKMSAHSQQHVRGGYFLVDFYAPTTTVESIMEHLSRDTDVVRPNVVRHPLTQEVKACDGIVPVPLEEKLYSTKKKKK	1191906	1121681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1122183_1139439_1139580_1191844
846438	contig_1996_pilon	-	1018	9	Intergenic	novelGene_131919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.8927201313068	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	142	1017	378426	372407	FALSE	5	GAGGCGTCCGTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTKLWTLVSDPDTDALICWSSSGNSFHVFDQGQFAKEVLPKYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIEQGGLVKPEKDDTEFQHPCFLRGQEQLLENIKRKVTSVSTLKSEDIKIRQDSVTKLLTDVQLMKGKQESMDSKLLAMKHENEALWREVASLRQKHAQQQKVVNKLIQFLISLVQSNRILGVKRKIPLMLSDSGSAHPMPKYGRQYSLEHVHGAAPFAASSPTYSGSSLFSPDAMASSGPIISDITELAPASPSASPGGSIDERSRGPAQLGAFTSSPVSPRSSGGFTGALWTGPAVVNSQSHILDFYREVPLPSVEICRHTHGQRSVNNVPYA	393832	372405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_372618_375101_375239_375708_375806_375879_375942_376019_376096_376565_376691_377132_377270_378395_378505_393769
846439	contig_6589_pilon	+	866	2	Intergenic	novelGene_25810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCATGGTGTTGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674956	692181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_675099_691457
846440	contig_9571_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_136256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCGTGGTTTCCTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309412	310361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_309400_310400
846445	contig_9676_pilon	-	712	5	Intergenic	novelGene_177539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	10.0343161201947	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	128	712	23912	12136	FALSE	25	AATTTCGTTGTGAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQFFILENLMLITAAIVRSNKKNNTITRKMGEMTTDEFCEKMTNTSLGSPYHRYASVIRTTLRNKGFSCYPASYKESVNAFSSSSLDRNTYKTAKPWLYQSCTEFGYFFTTDLKNQSFTGLPLRYFAKKCSDVFGSVFNSDSLIRGAMVTNRYYGGLNVNGSKIIFLNGANDPWYHLGVTKDISDDLLAVFIKG	24857	12135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9676_pilon_-_12347_13215_13307_14550_14750_23828_23944_24761
846446	contig_9580_pilon	+	550	3	Intergenic	novelGene_167736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.5	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAGGAATTAGTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831376	854420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_831560_849254_849420_854218
846447	contig_6735_pilon	-	683	7	Intergenic	novelGene_15686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.95458756534	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	133	648	564813	542019	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTPTNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEPPPRPNLLSFLGFLVCLPGKVPRVPGLSGCAVCPLSFPAEISLNLLCAQS	568275	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542172_551204_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564795_564869_568198
846449	contig_13245_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_148813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26854	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25629_26702
846450	contig_1154_pilon	-	1064	2	Intergenic	novelGene_87185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001610	996517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_997112_1001140
846451	contig_240_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_173795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACATGGAGAAAGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458118	459486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_458100_459500
846456	contig_6270_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_99859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924913	924269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_924300_924900
846457	contig_7909_pilon	+	1256	6	Intergenic	novelGene_155929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	128.367285552044	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	73	582	883942	1015258	FALSE	60	TAGACTAATACACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGLGARGVGHGERSTGAAAAARTMAPAGDREGYWGSTTSTLDWCEENYAVTWYIAEFWNTVSNLIMIIPPLFGAIQSVRDGLEKRYIASYLALTVVGMGSWCFHMTLKYEMQLLDELPMIYSCCIFVYCMFECFKTKNSVNYHLLFILVLFSLIVTLVYLKVKEPVFHQVIFLNYHTFDYLTILACLVIFLF	883869	1015932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_884045_957605_957717_1001832_1001886_1006707_1006761_1010833_1010916_1015150
846458	contig_3414_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_80978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTACTTATTTTAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75113	76260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_75100_76300
846461	contig_18869_pilon	-	253	1	Intergenic	novelGene_56273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73605	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
846463	contig_14202_pilon	-	531	4	Intergenic	novelGene_157133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2321.64180412627	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGATTTGTTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88568	86147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_86274_87403_87487_88084_88214_88375
846464	contig_17753_pilon	+	398	2	Intergenic	novelGene_105047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	952	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGGCAACTGACCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45441	75174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018
846465	contig_10235_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_46379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	153	446	598	153997	153845	NA	20	CGAAGCCCGGTAGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVFLKAFRLRSTPLQLLLFTSQPLFSAVRNPAPSTCEKLEDLTHQSYPTSLALPKARPLSLPGQLQQRPRLRLPTTVGFCKFPAPFPKIPKFILPGQEPGPSFSHGLGVAVRPLPQEPAHPASAPQDTLRAGPGHFLPRPHIEAQRPQMQCQRSRRLGAATTSDSPAGQGLGLGRGEELLLPRGGSDSYTEGRAPDRGK	154442	153844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_153800_154400
846466	contig_10235_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_46372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTTTCCATATCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153895	153187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_153200_153900
846467	contig_3818_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_99250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGTTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461673	460411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_460400_461700
846469	contig_12864_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_76379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCAAGGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213634	212237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_212200_213600
846472	contig_7571_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_106401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGCGTTCTGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142954	142642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_142600_143000
846474	contig_7234_pilon	-	643	2	Intergenic	novelGene_145935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAAATTGTGTCTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420231	411415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179
846477	contig_11846_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_105992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATTTTAGTATATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390547	391450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_390500_391400
846480	contig_5095_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_74953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257072	257437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_257100_257400
846481	contig_7695_pilon	-	892	8	Intergenic	novelGene_41627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	339.55390903781	12	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	55	891	687243	680341	FALSE	15	GTGAGCCGAGGGTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REAEQSRLGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIMMPLRGQEMPSPPSPLSGAFESVALGCPGLLISLWPCPALQLVFKSLGCPLGCPPFLDSPLVSCQAFCKEKPLGERRKRTKIKSIHFHWPS	687297	680339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680506_681405_681514_681595_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
846488	contig_13888_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_151778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAACCTCCTTCCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245026	245830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_245000_245800
846491	contig_5050_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_110296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTATTTTCTTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645479	644849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_644800_645500
846492	contig_5050_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_110295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAGTCACAAATTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644388	643578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_643600_644400
846493	contig_9366_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_166264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029859	1028637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1028600_1029900
846494	scaffold_21177_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_145495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	178	477	230155	230454	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTFRWPFQLSECGHKFNKLSWVLPLTDLHLLSSTRNSSHSGLQGAHHPSLLASLDLFLYFMLDVILEGSKCLCVYSIHYVEFEVIVNSYVPNKKDGNM	229977	230460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_230000_230500
846495	contig_513_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_80120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	127	492	275057	277476	FALSE	45	TGTGTGTGTATCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIETYSQPSPRSVTTGPPVSMKIFMYLLTIFLITQMIGSALFAVYLHRRLDKIEDERNLHEDFVFMKMIQRCAKGEGSLSLLNCEQIKSQFGGFIKVRNSIVGKSVIENFYCILLGPETEI	274930	277526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_275213_277266
846496	contig_3472_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_166940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	916560	916240	NA	55	AGTAACATATTTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQDAGCDAVDPSGADPEVAGGGSWDSVFGPPSGDVAARAGPRRPAPEIVGGDTGTVSFEEPVVSSARRPPCTGAGPRRPCTCFLCTQQSCVSSLKVGLLPTATGWR	916562	915582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_915600_916600
846498	contig_16510_pilon	-	1022	9	Intergenic	novelGene_139081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	73.2081791878476	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	26	901	288583	277112	FALSE	5	TTTTGCCTCCATCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRREARLRREYLYRKAREEARQTAHEKKERLRRALEENRLIPTELRQEALALQGSLEFDDAGGEGVTSHVDDEYRWAGVEDPKIMITTSRDPSSRLKMFAKELKLVFPGAQRMNRGRHEVGALVRACKANGVTDLLVVHEHRGTPVGFIVSHLPFGPTAYFTLCNVVMRHDIPDLGTMSEAKPHLIMHGFSSRLGKRVSDILRYLFPVPKDDSHRIITFANQDDYISFRHHIYKKMDPHNVELTEVGPRFELKLYMIRLGTLEQEATADVEWRWHPYTNTAHKRVFLSAE	288608	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_277390_277488_277584_277660_277816_277901_278035_278140_278251_278978_279063_287990_288100_288580
846499	contig_8704_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_156343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGTTGCTAGCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580749	582359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8704_pilon_+_580700_582400
846500	contig_7066_pilon	-	669	2	Intergenic	novelGene_42174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATGAAAAAAAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918758	918004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_918216_918300
846501	contig_14807_pilon	-	1222	5	Intergenic	novelGene_124645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	10.0249688278817	84	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	52	564	21769	20598	FALSE	5	GTTTTACCTCTGGCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLNHGDWVHIFPEGKVNMSSEFLRFKWGIGRLIAECRLNPIILPLWHVGTPPSQAWRRWGAAGDRERCSLRLCWEVSAAWQRGPWEAPGLGPVSATLLHTAAFHSLHCAAGMNDVLPNNPPYFPRFGQKITVLIGKPFSALPVLERLRAENKSAVEMRKALTDFIQEEFQCLKTQAEQLHNHLQPLR	21902	19939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_20700_20819_20898_21256_21559_21738_21781_21862
846504	contig_6497_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_35613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTGGTGTTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542072	543361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_542100_543400
846505	contig_2646_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_69503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAATTATTTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508807	508470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_508500_508800
846506	contig_19604_pilon	-	1322	4	Intergenic	novelGene_77262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	477	1184	345051	344020	FALSE	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHAHMWWQQVFRGDPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQQVFRGDPKQQVLRGSPKQQVFRGDPKQQVFRGSPKQQVFRGSPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQQVFRGDPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQQVFRGDPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQQVFRGDPKQQVFRGDPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQQVLRGSPKQQVFRGSPKQHQRNHVEQNNNPIFTGAALYKIKATVC	346094	343881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_344155_344289_344828_345016_345264_345830
846507	contig_17964_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_33907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGCTAGATTCTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369597	368971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_369000_369600
846509	contig_6102_pilon	+	341	5	Intergenic	novelGene_31789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4999.08644154109	52	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCTGTTATGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360095	361225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360124_360233_360259_360591_360615_360864_360994_361089
846510	contig_5423_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_85245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGACACTAGTCCCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514751	515585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_514800_515600
846511	contig_9575_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_169718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGCAAGTGCTCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135270	134190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_134200_135300
846512	contig_14208_pilon	+	1633	3	Intergenic	novelGene_129073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCATCTAACAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97379	99157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_98131_98216_98760_98818
846513	SIRV4	-	304	1	ISM	SIRV4B	SIRV406	617	2	1214	3	1214	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAACATTTAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3944	3640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_-_3600_3900
846514	contig_16103_pilon	-	427	3	Intergenic	novelGene_118716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	456.5	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGCTGGTCTGCGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209710	207166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_207457_208676_208784_209680
846515	contig_4364_pilon	+	1148	7	Intergenic	novelGene_2	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	18.496996753227	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	238	540	144511	262680	FALSE	25	TGAGCTCATAAGCACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLLPEEDDVMTPQRVRLQLEAAAQHPTSIIGCQVRRDPPDSTERYTRWINQMSADQLLTQVFTSNGPTVIMPTWFCSRAWFSHVGWFDEGGQYSWTPQ	140279	263288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_140324_144216_144334_144434_144535_180872_180939_207801_207898_256295_256392_262659
846516	contig_10658_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_130073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTACTCCACATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181621	180213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_180200_181600
846517	contig_7898_pilon	+	402	2	Intergenic	novelGene_47577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1709	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCTGAGAATTGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484215	487523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484362_487267
846518	contig_4769_pilon	-	650	2	Intergenic	novelGene_117968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	246	599	408628	407585	FALSE	25	AGAAGCCTGGTTGATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFYIQIGSESFRLYKYQQTFSMVKIRRQVHLSRCSYIILIPYRLYRKEVLQKLIEKCVSKGYVFQMEMIVRARQLNYTIGEVPISFVDRVYGESKLGGNEIISFLKGLLTLFATT	408873	407533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379
846520	contig_1686_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_165595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTGGCCTGCGCGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276056	285036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_276386_277673_277859_277960_278067_279395_279515_284975
846521	contig_8822_pilon	+	1408	2	Intergenic	novelGene_117937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	820	1353	154744	155331	FALSE	25	GACTGGTCAGTAAGGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFIWFLSSVTSLMSSKVRTITECFPTEMAFIWLLSSVSSIVLYKVRKITEGFSTYMAFIRFLSSVSSIVLFKARTLNKGFPTKMTYIWFLSSMNSIVLYKISTISEGFPTQMTYIWFLSSVNSPMLSKVRICTEGFPTYMAFIWFLSSVSSIVLSKARKITEGFSTYMTFVWFLST	153924	155386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_155273_155326
846522	contig_8651_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_168162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATAAGTACACAACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123762	124047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_123800_124000
846523	contig_8554_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_160282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAACCTGAAGAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67244	67760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_67200_67800
846525	contig_8878_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_147874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTCTTTTACCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742795	743288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_+_742800_743300
846526	contig_2097_pilon	-	970	4	Intergenic	novelGene_177540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.55902608401044	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGCACAGTAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278644	275621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2097_pilon_-_276077_276809_277086_277866_277989_278527
846528	contig_6870_pilon	-	961	3	Intergenic	novelGene_103960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	33	junction_2	3	63	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGAGGTTATAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324734	1322969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1323359_1324043_1324115_1324233
846529	contig_11176_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_123446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTAATTTAAAGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95526	96545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_+_95500_96500
846531	contig_6100_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_168119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAGAGTCGATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485228	485855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_485200_485900
846532	contig_2310_pilon	+	1405	9	Intergenic	novelGene_71591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	17	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	51	1310	57436	63427	FALSE	35	TGCAAACTGGCTGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAGHVLRAALPGTPRGHRAQSALAQLRGVLERELEGIREAGTWKSERVITSRQGPYIHVDGVSGGILNFCANNYLGLSSHPEVIQAGLRALEEFGAGLSSVRFICGTQSIHKNLEAKIARFHQREDAILYPSCFDANAGLFEALLTPEDAVLSDELNHASIIDGIRLCKAHKYRYRHLDMADLEAKLQEAQKHRLRLVATDGAFSMDGDIAPLREICRLASQYGALVFVDECHATGFLGPTGRGTDELLGVMDQVTIINSTLGKALGGASGGYTTGPGPLVSLLRQRARPYLFSNSLPPAVAGCASKALDLLMESNAIIQSMAAKTQRFRGKMEAAGFTILGANHPICPVMLGDARLASRMADDMLKRGIFVIGFSYPVVPKGKARIRVQISALHREEDINRCVQAFVEVGRLHGALP	57385	63522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_57632_59059_59191_60447_60550_61070_61218_61761_61917_62052_62136_62314_62487_62899_63022_63275
846533	contig_10494_pilon	+	803	3	Intergenic	novelGene_102132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTGGTATCTCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300344	309016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_300864_304374_304553_308910
846534	contig_16098_pilon	+	1472	7	Intergenic	novelGene_46067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.03442593595562	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	92	1072	440763	444337	FALSE	15	GTGCTCTGGAAATGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEALHTLPGVSLNLENRELWKEFDSVGTEMIITKAGRRMFPACRVSVTGLDPEARYLFLLDVVPVDGARYRWQGRRWEPSGKAEPRLPDRIYIHPDSPATGAHWMRQPVSFHRVKLTNSTLDPHGHLILHSMHKYQPRVHLVRAAQLCSQHWGGVASFRFPETTFISVTAYQNPRITQLKIAANPFAKGFRENGRNCKRERDARVKRKLRGPEPVATKSYGSGDTPGGPCDSTLGGDVRESDLEQAPAPREAASAPAPPCGGPSAEAYLLHPAAFHGASGHLPTRTPNFPEAPDSGRPAPYSAAFLELQPGPGGSGYPVAPPTAPFAPHFLQGGHFPLSYPGPGGYLDVGSKPMY	440671	444737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_440786_441734_442003_442107_442255_442328_442400_443711_443786_443865_444050_444123
846536	contig_10341_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_47256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213366	215093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_213400_215100
846538	contig_7333_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_142755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTAAGTTATTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100566	102246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_100600_102200
846541	contig_12050_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_62622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	315	716	338691	338290	NA	30	GAGTCCCAAGTAGTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMRDLIYLLYCFISKHLPWSPGGTLVKSSAADQKVSSSNPPAVPWKPYGAVLLSYRVATSRNRPEGSGLLLDICPGVDKEVLNRKAPLQGAQRISAMTWACSSSALSTTVATSDMSPQSTRNVASVAENLNF	339005	337505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_337500_339000
846542	contig_12964_pilon	-	1769	3	Intergenic	novelGene_131691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	24	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	772	1101	521761	521432	FALSE	10	GATTTGCGTGTCTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWYVKVARVAGRVPRGAARKAAPLRRVRSPHPDSLKACMTERGRGRVQLGLAMASSGKRAWQWDGNVTIPWLWASRAQRPPAVVPAQCPKERQGGGFRCRASQGRKC	534320	520763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_522302_529325_529443_534206
846543	contig_6427_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_162578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACGATAATTAAGAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010363	1009004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1009000_1010400
846544	contig_5959_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_150211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAAGTTATTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422599	423436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_422600_423400
846545	contig_6677_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_114229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAGATCTCAATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760388	761106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_760400_761100
846546	contig_5827_pilon	+	1032	3	Intergenic	novelGene_129797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTTCTCGTTAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454015	461173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_454826_458192_458312_461070
846547	contig_9177_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_32693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	292.832527033608	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	113	511	437240	453000	FALSE	55	GTGGAAAGAAAAAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMDPFGAPAGAPGGPALGNGVAGIGEEDPAAAFLAQQESEIAGIENDEAFAILDGGALGPQPHGEPPGGPDAVDAIMNGEYYQESNGPTDNYAAISQVDRLQSEPESIRKWREEQTERLEALDANSRKQEA	437127	453002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_437457_442070_442109_444198_444317_452974
846548	contig_11265_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_174507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19563	20644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11265_pilon_+_19600_20600
846550	contig_4519_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_123756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGAGAACCCCCGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1427047	1427646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1427000_1427600
846552	contig_5918_pilon	-	1071	3	Intergenic	novelGene_99538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTTGGTCCCAGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723548	711716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_712473_723076_723327_723483
846555	contig_1856_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_84876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAAAAAAAGTTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233249	232693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_232700_233200
846557	contig_11026_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_167645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44324	45627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_44300_45600
846558	contig_5928_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_40399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAAAAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380623	379789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_379800_380600
846559	contig_9439_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_176910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATGGAAATGACTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163524	162510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_162500_163500
846560	contig_16310_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_70032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTCTGGTGTGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18390	18750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_18400_18800
846562	contig_987_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_72251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTGGTGGTAATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367617	366477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_366500_367600
846563	contig_5260_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_144430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAAATCTCTCCCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592827	592039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_592000_592800
846564	contig_9843_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_114342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGAGTTAGGTGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261167	261852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_261200_261900
846565	contig_5954_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_28494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGGTGCCGTCTGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407026	407904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_407000_407900
846566	contig_11629_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_161185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAATTATAAGACCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73988	72470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_72500_74000
846567	contig_11429_pilon	+	721	7	Intergenic	novelGene_60447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1127.58498078366	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	159	515	46214	48504	TRUE	25	CTTTTTTCTCATTTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLWTQRSRGFGFITFTNPEHASDAMRAMNGESLDGRQIRVDHAGKSARGTRGGAFGAHGRGRSYSRGGGDQGYGSSRYDSRPGGYGYGYGRSRDYSGSQGGYDRYSGGNYRDNYDN	45385	49080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11429_pilon_+_45475_46144_46229_46535_46620_47263_47370_47457_47552_48446_48530_48899
846568	contig_1239_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_150423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCTTAGAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686926	688430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_686900_688400
846569	contig_3602_pilon	+	1015	2	Intergenic	novelGene_60577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCTTTTAAAAACAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641269	645010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_641840_644565
846570	contig_5084_pilon	-	504	4	Intergenic	novelGene_64519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	18.263503375737	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGTATAGTGAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408218	380465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_380556_394664_394776_395696_395804_408022
846572	contig_17775_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_177541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAATGACTCCCTTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115112	113944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17775_pilon_-_113900_115100
846573	SIRV6	+	429	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	94	8	-93	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCCGCTTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2379	10780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
846575	contig_5954_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_28721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAACAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971585	972892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_971600_972900
846576	contig_7426_pilon	-	730	4	Intergenic	novelGene_27552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.8102382097174	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	1185804	1161950	TRUE	5	GCGCCTTGTCCGTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRQTAGKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185804	1158903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1158974_1161664_1162053_1163424_1163677_1185784
846577	contig_5461_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_156848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAATAAAAGGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893014	894744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_893000_894700
846580	contig_7357_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_36770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGCAAAAACTTCATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85144	85485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_85100_85500
846581	contig_14838_pilon	+	934	2	Intergenic	novelGene_151921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTTTCCTAACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150647	151853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_150881_151152
846582	contig_4754_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_35930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTTCAGTTCTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274345	274050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_274000_274300
846583	contig_6870_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_104010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCAAAAACTACCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608029	1608852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1608000_1608900
846584	contig_4156_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_88122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458269	459013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_458300_459000
846588	contig_14450_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_49069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491089	1491690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1491100_1491700
846589	contig_9195_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_155698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCCCACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795078	793626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_793600_795100
846590	contig_10064_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_122737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGAAAACAAATTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456476	455476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_455500_456500
846592	contig_8447_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_69439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	526	906	113704	113324	NA	30	AGAGGGTCGTCCCAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGVPGAGLCKRFPLGRVGNPLSEKPDTIRARERGRLFVTASNPRAPHSPALKGLSEHPHSPRLERGCLRPLLGRGGRGNPDHLLCTPSHYHLTRPEWGLASALRAWAREIEVEKKFPSKKRTRC	114229	113286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_113300_114200
846593	contig_8650_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_162633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAATTAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323343	324035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_323300_324000
846594	contig_13048_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_138935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTGGTACCCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491553	490272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_490300_491600
846596	contig_6364_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_51742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAACAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520619	519192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_519200_520600
846597	contig_20055_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_175063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGCAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63365	62511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_62500_63400
846598	contig_11678_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_160835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTCAACATTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165070	163464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_163500_165100
846599	contig_3948_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_53354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1610007	1610973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1610000_1611000
846600	contig_9871_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_75669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATAGTTTCTCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435286	433910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_433900_435300
846601	contig_13456_pilon	-	1296	2	Intergenic	novelGene_153310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAGATTACAGCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568981	565930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_567123_568877
846602	contig_13456_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_153309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTAGCAGACTCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565876	565592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_565600_565900
846603	contig_8693_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_150868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAGAGAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082372	1083071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1082400_1083100
846604	contig_8452_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_48070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905462	905086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_905100_905500
846605	contig_14744_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_66038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTATTTTCCAGGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307936	1306772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1306800_1307900
846607	contig_5429_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_127808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAACAATGGGAGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436243	436680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_436200_436700
846608	contig_11378_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_112228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTGACCCTCAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304673	302962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_303000_304700
846609	contig_5954_pilon	-	808	6	Intergenic	novelGene_28401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	131.521861300698	23	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	69	701	41040	16110	FALSE	5	TCTGGCTCTGGAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELPSPSQLQGPQGPPKHPLPRMAEEFITAVYCTGVSAQVQKHRAKELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVQCLQSGTLFRDDAFPPVAHSLGYKELGPNSSKTYGIKWKRPMEILSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPTKDGQLVFVPLPPYQEAAHEEGGLAAPPRSFFYIGDSKGTL	41643	16002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_16208_38368_38448_40149_40269_40544_40615_40773_41042_41576
846610	contig_10561_pilon	-	1425	9	Intergenic	novelGene_175931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	316	738	103458	85050	TRUE	65	AGGGAAAGAAAAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPLQHKDHYTQPRLLPLLHNLLEEEVEEGIHQRLVLPQVVVEVVYLKYFLGLWPQIPLKVTEELPVGWREEEEQEILDSGYKKVLRSSDSEGLFVKLWKEGVYRAMSPRLLEEYGERQVYSYCRTEQDDLEKHWEEMG	110935	41249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10561_pilon_-_41420_67430_67606_81306_81406_84105_84252_84952_85072_91268_91433_98615_98706_103311_103485_110646
846611	contig_19957_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_57729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACATACTGAAAACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271124	270314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_270300_271100
846613	contig_16883_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_161726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTGCAGATGAGGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255979	256278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_256000_256300
846614	contig_10446_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_162453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTCTCCCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466142	464991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_465000_466100
846615	contig_6446_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_149202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCTTACAAAGCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272598	271782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_271800_272600
846616	contig_15020_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_87394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTTTGAGTCCACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13165	13836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_13200_13800
846617	contig_5331_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_112764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTAAATATTTAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152672	154222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_152700_154200
846621	contig_8651_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_168174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCTTCCTCTCCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168377	168728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_168400_168700
846622	contig_6278_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_119827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547085	546579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_546600_547100
846623	contig_6270_pilon	-	593	3	Intergenic	novelGene_99879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_2	2	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	118	513	1082152	1058819	FALSE	45	AAAATGGTCCAACTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPYYHGPLSKRDCETLLLKEEVDGNFLLRDSESVPGALCLCVSFEKMVYTYRIFREKNGYYKIQTAEGTQKQLFPSLRELISKYQKPNQGLVVRLLNPVMSTHLRCRRLKIQLNDIYGKNFHMGVGEEP	1082269	1058738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1059017_1061613_1061678_1082018
846628	contig_10159_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_30812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAATTATTTTTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422440	421757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_421800_422400
846630	contig_7057_pilon	+	549	5	Intergenic	novelGene_123248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	223.380281135108	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	151	519	540255	541433	FALSE	15	TATTGACTTCCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLERVSNEEKLNLCRKYYLGGFAFLPFLWLVNIFWFFREAFLAPAYTEQSQIKGYVWRSAVGFLFWVIVLATWITIFQIYRPLTPSPAQAHGSAHSPRMGCSALGSLLSPLSLIPISHGLC	539981	541463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540890_540996_541177_541262_541314
846632	contig_5059_pilon	-	1485	2	Intergenic	novelGene_140767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTCCCTGTACCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	557005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_558071_559971
846633	contig_10627_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_60049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	7.42882897905181	41	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	100	609	1103117	1099907	FALSE	80	AAAAAAAGCAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGRISYHGSCPQGLADSAWIPFREHCYSFHLEMRLGHKEALQRCQRVGGAVLSILDEVENVFVWEHLQNSEGQSRGAWLGMNFSPKGGTLVWQDNTAVNYSNWGPPGLGPSMLSHNSCYWIQSSSGLWRPGACTNITMGVVCKLPRAEQSSFSPSGMLKVVLRLPLSPQAALCRLFFPLGRLNSEPLTLAPLSPFSPCSSF	1103216	1099307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1100024_1100735_1100786_1101515_1101696_1101887_1102008_1103074
846634	contig_10627_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_60000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTGCCGGCATCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306563	306093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_306100_306600
846636	contig_10940_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_49276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGGTTATGCAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877795	876994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_877000_877800
846637	contig_1442_pilon	-	1273	9	Intergenic	novelGene_172162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_8	33.3782769926789	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	148	1272	482116	448204	FALSE	30	ATATGTGGAATGGAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRINKNVILALLTLTSSAFLLFQLYYYKHYLSAKNGAGLSKSRGSRIGFDSTQWRAVKKFIMLTSSQNVPVFLIDPLILELINKNSEQIKNTSYGTTSDCKFFCVPRDFTVFALQYHLWKNEEGWFQIAENMGFQCLKIQSKDPRLDGIDSLSGTEIPLHYICKLATHAIHLVVFHERSGNYLWHGHLRLKRHIDRKFVPFRKLQFGRYPGAFDRPDLQQVTIDGLEVHIPKDLVHFLEEIPHSRFIECRYKEARAFFQQYLDDNTVEAMAFRKSAKELLQLAAKTLKKLGVRFWLSSGTCLGWYRQCSIIPYSKDVDLGIFIQDYKADIIIAFQDAGLPLKHKFGKVEDSLELSFQGKDDVKLDIFFFYEETD	486517	448202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_448285_449776_449911_452265_452396_463525_463659_466104_466383_468662_468867_471845_471906_482011_482199_486452
846643	contig_7912_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_129553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	28	354	31646	31320	NA	30	GTGAATTTGATATTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAANVKAPIPRLMLFAKESSQTGKALHLQGMCSLFVQYNGPRETLSGNCVPEVEPRASECPDMRIPEFQACVKKLSCTALHNIYFPGSLSVVLLPVSMAETRSPLQL	31673	30558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_30600_31700
846645	contig_10667_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_137319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATAGATGGGCTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101775	100736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_100700_101800
846646	contig_990_pilon	+	968	7	Intergenic	novelGene_76065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	101.755289242815	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	304	537	1082680	1086526	FALSE	50	AGATCCTAGAAAAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEGRRVRLPRSAVDLVRAHPSLEERARLLRGQSVQQVGPQGLLYVQQRELAVTSPKDGSISILGSDDATTCHIVVLRHTGNGATCLTHCDGTDTKAEVPLIMNSIKSFPDHTQCGRLEVHLVGGFSDDRQLSQKLTHQLLSEFDRQEDDIHLVTLCVTELNDREENENHFPIIYGIGK	1067225	1086957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1067295_1082067_1082171_1082245_1082312_1082614_1082724_1084382_1084457_1085874_1085929_1086464
846649	contig_13305_pilon	+	759	4	Intergenic	novelGene_146784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.25967446224258	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	56	499	247408	255687	FALSE	30	AAAACAATGGTTGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGTRRSTEGSAGPAVPAIMPPPTPPAHPPGPRVLDLQQHLERWGHNPENCPQVRVSGGCCRGPLVKMGGRIKTWRKRWFCFDRQARRLAYYADKEETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRCAFKSPSPRLTFCVKTYERLFYMVAPSPEAMRIWIDVIVTAADENHAP	247352	255947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_247411_252838_253059_253853_253940_255552
846650	contig_9733_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_160576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCACACAGTATCAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16231	15636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_-_15600_16200
846652	contig_9345_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_24601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCCCTAGGCACTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944547	944748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_944500_944700
846653	contig_10341_pilon	+	1098	10	Intergenic	novelGene_47260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	27.1925007817492	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	170	1069	507516	533233	FALSE	5	GCTTGCATGCTCTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEMLPAFIETSNVERKQNLSEDQEQSQKPKSGEGSEPISKRQMKKLIKQKQWEEQRELRKQKRKEKRKRKKLERQCQLESNSDGNDRKRIRRDVVHSTLRLIVDCSFDDLMVLKDIKKLHKQIQRCYAENRRALHPVQFYLTSHGGQLKKNMDENDKGWVNWKDIHIKPEHYSELIKKEDLIYLTSDSPNVLQELDESKAYVIGGLVDHNHHKGITYKQASDYGIEHAQLPLGNFVKMNSRKVLAVNHDPWLDTLNQLEKEKMNFTGTYKFWDTSLQKSLRLSPHLQILDLPVPTIV	500326	533262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_500444_506607_506640_507495_507701_508603_508767_509339_509412_509660_509736_511731_511882_512440_512547_531345_531410_533148
846655	contig_20522_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_177544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCTGCAATGCAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224318	223061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20522_pilon_-_223100_224300
846656	contig_7342_pilon	+	300	3	Intergenic	novelGene_71164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_2	8.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	3	299	429180	434893	FALSE	15	GTGAGTGGACCCCCCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRYWDIPDGTECHRKTYASTSIGGATGLVASAYSLTLSPPGSFFEGVARAGRYTFTAAAIGAIFGVTSCVSAQVREKPDDPLNYFIGGCAGGLTLGAR	429177	434894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_429262_434295_434389_434771
846658	contig_5605_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_143936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276041	275488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_275500_276000
846661	contig_6446_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_149201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271408	270042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_270000_271400
846663	contig_4388_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_161965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593186	593692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_593200_593700
846664	contig_13481_pilon	+	1384	4	Intergenic	novelGene_119499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGAGTAAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389249	1396149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1389579_1389671_1389844_1391335_1391435_1395365
846666	contig_18869_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_56238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73602	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_73600
846667	contig_3825_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_77999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAAAGGTGCTTACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380906	1385515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1380989_1384844
846668	contig_6364_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_51778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAAAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063811	1063320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1063300_1063800
846669	contig_7195_pilon	+	1319	2	Intergenic	novelGene_177203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATAGATAACACATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575171	576745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7195_pilon_+_575770_576024
846670	contig_15407_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_123042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATATAAAGGCTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288429	289408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_288400_289400
846671	contig_1734_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_164380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTAAAATATAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603703	603261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_603300_603700
846673	contig_4845_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_53725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586545	1585267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1585300_1586500
846674	contig_6084_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_127042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGATAGAAGGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330723	332293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_330700_332300
846675	contig_15067_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_154344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGGAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225475	225943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_225500_225900
846678	contig_10466_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_173629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTAAGAATATTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162097	163450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_162100_163400
846679	contig_8355_pilon	+	813	4	Intergenic	novelGene_177546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	1.69967317119759	70	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGACTCCAAAGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438229	447949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8355_pilon_+_438640_439566_439633_439845_439989_447755
846680	contig_13780_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_149102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	320	700	762505	762885	NA	25	ATATCCTACTTTGCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKECNNKSGSREREERGQTVGTPGTPVPARRRFVTSQEDWKHPGIPGWGRTQWTDADWNTGSAEKPSLPPRLCRCPVFLPRVWPAVGGIHGCKIPRRESVWTGVTRTVIESLPGGYITLVKLLSSG	762185	763978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_762200_764000
846681	contig_13021_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_8125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTAATCTCAGCAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173204	172493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_172500_173200
846682	contig_13924_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_147772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGCTTGTTTGAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8894	9786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_8900_9800
846683	contig_2550_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_135671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	653	1006	1239444	1239797	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHSVPSQSPKCYQILHSFPLRLHPLVTASIILPLLQAQRTCSVVSLVVSKGVSGPLRWSPLRNLSFWPERDLKIINCDIDSKEQARIVSAYIPYIEILPGKFILNLALGTKLSFPS	1238791	1240815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1238800_1240800
846684	contig_5906_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_174813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTAAATTCCCCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268309	267032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_267000_268300
846685	contig_1009_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_121755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAACTCCACAGCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263050	263682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_263000_263700
846686	contig_6677_pilon	-	1375	9	Intergenic	novelGene_114227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	18.9868375460475	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1359	17	1375	769846	727001	FALSE	20	AATGAGCCTGTTCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVSKMERMDSSLPEEEEDEDKEAINGSGNAAENRERHSESSDWMKTVPSYNQTNSSMDFRNYMMRDENLEPLPKNWEMAYTDTGMIYFIDHNTKTTTWLDPRLCKKAKAPEDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFENPVEEAKRKKQLGQADIGSSKPDVDKSHFTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRPDEFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGDVIVDINGNCVLGHTHADVVQMFQLVPVNQYVNLTLCRGYPLPDDNEDPVVDIVAATPVINGQSLTKGETGMNTQDFKPGAMVMDQNGKLGHTLTSDRLNGPSDPSEQRASMASSGSSQPELVTISLIKGPKGFGFAIADSPTGQKVKMILDSQWCQGLQKGDIIKEIYHQNVQNLTHLQVVEVLKQFPVGADVPLLILRGGPPSPTKTTKMKTDKKENSGSLEAI	769862	727000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_727043_732374_732407_733676_734283_736416_736606_743483_743579_748377_748436_761020_761101_764412_764591_769767
846687	contig_8561_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_161642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAAAAGTGAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151808	151054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_151100_151800
846688	contig_16098_pilon	+	1164	2	Intergenic	novelGene_46054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	34	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421067	423633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_421254_422655
846690	contig_10855_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_124358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCTTCCCCGGTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672708	672956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_672700_673000
846692	contig_5918_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_99490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTCCTACAGGCAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192402	191208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_191200_192400
846693	contig_10042_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_79232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	190	312	1187799	1187921	NA	50	AAAAAATCACTGTTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSVSVGGAQLTSLFPLPASVVAREAPSALLHGVHRGARVSGGGGEPVGSGSWSGGSGPRCRMATAGRMNIQLLLEAADFLERRERGARGRGEVQPSRGRGP	1187609	1188410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187600_1188400
846694	contig_14635_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_84364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578812	577728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_577700_578800
846695	contig_6175_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_16274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	519	1	519	17583	18101	NA	25	TGGGGACAGCGGAATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRREGVRFIRSRKGVSLKSQDPAPLPIPLSEKYDFDTRQQQTAESPESEVTLHGADWCHPGSFPCCDCPCCPPQGRLSAVQGRPSCTPRLARVRQCRLRPLKDTGTHCPFCLVWGGGTTVLAGAGRGSEPQCPVPLWDLARLLSLAGPDVSPQSDSLPGHGHTACISPYQLTY	17582	18101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_17600_18100
846696	contig_177_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_41791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAAAAAATCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387530	388041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_387500_388000
846697	contig_5018_pilon	-	640	6	Intergenic	novelGene_47133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.0298876705761	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	49	510	1494853	1491097	TRUE	10	TGCTGATTATGGTTCGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPADGGGGRGGGGSGGMDLSELERDNTDRCRLSSPVPAVCRKEPCVLGVDEAGRGPVLGPMVYAICYCPLSRLADLEALKVADSKTLSESERDRLFVKMEEDKDFVGWALDVLSPNLISTSMLGRVKYNLNSLSHDTAAGLVQYALDQGGHCGATREVPGAAAAVLSWD	1494901	1490865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1490925_1491025_1491160_1494015_1494089_1494220_1494348_1494478_1494551_1494726
846698	contig_11630_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_147185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTACAGTATGATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165117	164036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_-_164000_165100
846699	contig_7919_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_28129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511041	1511412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1511000_1511400
846701	contig_2062_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_139061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGCCTTTTCAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433246	1432783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1432800_1433200
846702	contig_2215_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_163837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAAAGTGGTTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105626	106017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_105600_106000
846704	contig_20398_pilon	+	1393	4	Intergenic	novelGene_155202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	461.353323266332	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	229	522	134054	136838	FALSE	55	TTTTAAGTGGAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPTTSAPSSSQVAGQPLSPSAQQSQQGLSPSHIQGSSSGQGQSLQQQQQQQSSSVQHTYLPNAWNSFRGYSSEIQMMTLPPGQFVITDSGVAAPVTAGQVKAVTPGHYVLSESQPELGEKQTSALSSGVQVQPSVHNDSLDPQTTSQQQTTQYIITATTNGNGSSEVHITKP	128998	137709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_129035_130536_130715_134039_134144_136634
846705	contig_15687_pilon	+	161	1	Intergenic	novelGene_129153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAACCAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248638	248799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_248600_248800
846708	contig_16400_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_150905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACACTTATTAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27665	27055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_-_27100_27700
846709	scaffold_13505_pilon	-	447	4	Intergenic	novelGene_111653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	12.657891697365	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831437	825652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_825854_826341_826531_831298_831341_831422
846710	contig_4388_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_161964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	100	432	588088	587756	NA	35	GGCAGCTATTGCAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERKEDRKTERKKMWLKRWRAKRSNKCESRVLFVSNHISIADLPLTRCVCVCVCVCVCVCVINTTFLCHLILDFRKFPVLRLEREIQIHFLKKGHMPCTSNLIQIFWVT	588187	587646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_587600_588200
846711	contig_5331_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_112785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGGGACAGAGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254271	255130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_254300_255100
846712	contig_6217_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_109564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGTCAACTTGATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35944	35036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_35000_35900
846713	contig_4071_pilon	+	1042	3	Intergenic	novelGene_151877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	17	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	322	987	187316	201436	FALSE	15	TTGCTTTCCCACCCTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTSDEIVSVEQPSSSLNPLCFECGQQHWTKENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQPLDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFASVCQDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHWRVALEKRKTSKTQTEIENENGPTTLDPPGTVSPEADCLGTGTVPAEQNLTPVPLPAWPEEPGLDNPAFEESTGADSTWT	134764	201491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_134976_187205_187720_201174
846714	contig_3721_pilon	+	870	5	Intergenic	novelGene_123783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCACTGGGCTACACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13599	58911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_13633_14273_14369_35282_35775_37957_38139_58842
846715	contig_11978_pilon	-	293	3	Intergenic	novelGene_63014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5778.5	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595942	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592058_1592272_1592304_1595890
846716	contig_10609_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_123978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTTTAATCTGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646630	647542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_646600_647500
846717	contig_8866_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_77801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTGCATACATTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410776	410146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_410100_410800
846718	SIRV3	-	380	3	Genic_Genomic	SIRV3D	novel	161	1	NA	NA	-1956	548	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTACAACTATCTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6718	4053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV3_-_4080_4573_4784_6574
846721	contig_9333_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_120340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCGAATAAAGTATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465312	464021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_464000_465300
846723	contig_2201_pilon	+	424	3	Intergenic	novelGene_168763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_2	19	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGGTGATCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48131	55173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_48207_53411_53475_54887
846724	contig_17840_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_154292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGAGCCCCTGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9006	10221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_9000_10200
846725	contig_8317_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_20708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAGAAACCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16500	16788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
846727	contig_7895_pilon	+	772	5	Intergenic	novelGene_154445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	18.2534243362718	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	39	770	690623	701154	FALSE	25	CCAGCTGGTATATGACCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGASLQIAYEVPTSTSGLSPKQEEAAKILLAEFNLGCDVQHTEHVYRVYVTTFLGFGGNFARQRYEDLVLNETLNKNRLLGQKTGLSPENPFLDPCLPVGLTDVVERNSQVLHVRGKGDWTTCGAMVSPLLARSNTSQASLNGIYQSPIDFNNSEFYGFSEFFYCTEDVLRIGGRYHGPTFAKAAQDYCGMAWSVLTQRFKNGLFSSHADEHRLKYQCFKSAWMYQVLHEGFHFPYNYPNLRT	690584	701156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_690692_692970_693138_695862_696188_699296_699383_701069
846728	contig_10627_pilon	+	1084	8	Intergenic	novelGene_59976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	36.5116699264266	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	599	1078	268023	269862	FALSE	40	ACTAAAGTTAGTGAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYRPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFSHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFTDGMNELVIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSALQSVHPLLKQVSVPLSPQINS	245811	269868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_245870_245946_246298_255307_255388_257049_257108_267971_268075_268512_268635_269423_269533_269665
846729	contig_3077_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_26857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATAAAGAAAAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033906	1033039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1033000_1033900
846731	contig_3163_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_168069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGGAGGATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210955	212242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_+_211000_212200
846732	contig_8651_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_168161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTGACTCCACTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121544	119882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_119900_121500
846735	contig_10731_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_177548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTTTCAAATTAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618884	617933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10731_pilon_-_617900_618900
846736	contig_9119_pilon	-	1122	2	Intergenic	novelGene_169747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	92	793	216513	215812	FALSE	30	ATAAAGCACTGGGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAASLNVHSSFWDYTGPAASGQGSPQAEAMRIQSLALLSFLLAAQVLLVEDKKERGRKKGHSLGRTRLAKGGFLTPDQAECRWAVVEDSNGARLKVECTRVENQFSCYFAGNPHSCPDFANKKRVYWKQIGRNLAQQTNICERSQTVLKTRLCGKKFPEAYLKMMNSTLIKTKESTEKFIQQTVITEAKTMSTTTTPKPAMVIETKETTPAKAQQQTMSANGPECEQDPDVQYQRKLAGDYCGDSWASFCQFFLTMLQDKPC	218867	215482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_216534_218796
846738	contig_4732_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_75372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	716	1129	196451	196038	NA	15	CCCGCTGGGGACAGGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSKQAAPDMRGGRAGCRLPLWPSLSRLHPDCFAFAGSSSSRGLAPVEPTSKNTPAHLAFPRGLGHTRAHHPKGGHSRDLSSFAGDLASFLEVLQGLCLSECWGTFRIAPSVSQEPRGVHRTFTLHLASRQPLLLR	197166	195852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_195900_197200
846739	contig_19730_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_142482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAGAGGGTTCTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104929	105228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_104900_105200
846741	contig_12967_pilon	+	1321	10	Intergenic	novelGene_169797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	60.8349314858568	25	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	48	926	145949	157116	TRUE	0	GCTGTCCTGTCTCTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYLISGGTGYVPEDGLTAQQLFASADGLTYNDFLILPGFIDFIADEVDLTSALTRKITLKTPLISSPMDTVTEADMAIAMALMGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKFEQGFITDPVVLSPSHAVGDVLEAKIRHGFSGIPITETGTMGSQLVGIVTSRDIDFLAEKDHTILLSEVMTPRNELVVAPAGVTLKEANEILQRSKKGKLPIVNDHDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDSHKQLLCGAAVGTREDDKYRLDLLTQAGADVVVLDLFHPPSCQVHDVLRRAQV	145901	159069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_146047_147795_147845_150604_150707_150867_150943_151218_151426_151576_151665_152867_153068_157056_157168_158313_158412_158823
846744	contig_3900_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_84206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAGATGATGTATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550699	551108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_550700_551100
846745	contig_7695_pilon	+	1211	2	Intergenic	novelGene_41614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	82	528	620999	621763	FALSE	25	CACACCCACAGCTGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELLDQSKQWAGTALVVPAFEIRRARRMPVSKTELVQLYQVGEVRPFYYGLCTPCQAPTNYSRWVNLPEESLLRPSYVVPWQDPWEPFYVAGGKVPPFDERFRQYGFNRISQACELHVAGFDFEVLNEGFLVHKGFKEALKFHPQKEAENQHNKILYRQFKQELKTKYPNSPRRC	620917	622446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_621254_621571
846746	contig_10958_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_5341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGTTTATTGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590827	591448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_590800_591400
846750	contig_20241_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_159740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAACCAGACTGTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225080	225293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_225100_225300
846752	contig_19186_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_176044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCCTTTGGTACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11264	12523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_11300_12500
846753	contig_7426_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_27487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGAGAGCCCCATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847057	846160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_846200_847100
846754	contig_12312_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_63925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTAAGGAACTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79987	78769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_78800_80000
846756	contig_10792_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_161008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145458	144735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_144700_145500
846757	contig_10404_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_138690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGACAGGTAGATAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116560	1117944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1116600_1117900
846758	contig_3394_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_152713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAATAATTTTAGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530869	532661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_530900_532700
846760	contig_9375_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_136073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACATGAAAGAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562465	562879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_562500_562900
846761	contig_14142_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_120639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTCAGGCATCTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620731	620208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620200_620700
846762	contig_13055_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_104958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGAATATACAATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103681	102185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_102200_103700
846763	contig_7342_pilon	+	276	2	Intergenic	novelGene_71197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCGCTAGGGGCGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665354	665703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_665499_665571
846766	contig_4402_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_140795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAATCATAAAACAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211482	210143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_210100_211500
846769	contig_7035_pilon	-	928	6	Intergenic	novelGene_83560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	63.5893072772459	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	822	107	928	958719	952258	FALSE	30	ACGTAAGGGGTTGGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENGDAATEPQVAEEKNEEANGRETTEVDLLTKELEDFEMKKAAARAVTGVLASHPNSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEHIDIYHLTREMPSSDKTPLQCVMEVDTERAMLEREAERLAHEDAECEKLMELYERLEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEPTNHLDLDACVWLEEELK	959431	952257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_952352_953359_953532_953614_953798_954256_954470_958559_958762_959367
846770	contig_12250_pilon	+	740	3	Intergenic	novelGene_80596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	822.5	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAAACATTTCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322750	332439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322862_328400_328687_332096
846772	contig_9091_pilon	-	1406	9	Intergenic	novelGene_32439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTGACTGGCTGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89423	67087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_67222_72060_72279_73557_73851_80351_80477_81357_81466_85773_85893_86397_86553_87127_87270_89311
846773	contig_17198_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_62367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAGAATGGTTCTGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812009	813099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_812000_813100
846774	contig_14357_pilon	+	1544	2	Intergenic	novelGene_121683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCACGTGTTAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564955	568902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_565609_568011
846776	contig_5590_pilon	+	1158	9	Intergenic	novelGene_162985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	29.4777458432628	55	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	82	1158	174610	185291	FALSE	25	TCAGTAAAATCTGTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAGGSQAGCRRLLSLGLVRKSRRPLTMDSLSPCRTFQPQLAAPTTLSSYRWHTGNGSEKGAGVSRWGRFTGWGRALSQPEPVVSNQPAPRSLFRRVLSVPSKEPRTSRLRLSKTLWGRHKSPPLEPEPEPEPQPPEPELEPEPEPPAPQIPEAPAPDVPVWDIGGFTLFDGRLVLLGGEEECLRRPRVGSGSSETSIQVAMVNLRDPDRTLGRTEPEAAGPNQVHNVRGLLKRLKEKKKARSELGANTPRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRVWPLHPSLLGEPHCFQVTWEGGSRCFFCRSAAERDRWIEDLRRHFQPSPTETPPELPIPPHVVWEQRDGHPTKVSDPCINPVWPRVGSGAAGTNQSSTMRLSSKILI	174390	185291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_174459_174596_174938_175989_176127_176246_176326_176431_176494_176865_176937_177600_177728_177820_177917_185114
846777	contig_9415_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_109788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAGACAAAGGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1669544	1670252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1669500_1670300
846780	contig_9653_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_48211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGCTTCATGACCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240109	239100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_239100_240100
846781	contig_5727_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_7932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGAAAGTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126543	128072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_126500_128100
846782	contig_10324_pilon	+	556	5	Intergenic	novelGene_7701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1013.31942150538	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	73	306	51839	80513	FALSE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRSLPPAWAGVAPARTPLPPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCPVTSP	51766	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68098_80490
846783	contig_4364_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_6	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTGGCACTCCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152943	154119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_152900_154100
846784	contig_5039_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_64928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAACCAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180627	1180238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1180200_1180600
846785	contig_7342_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_71190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644132	643535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_643500_644100
846787	contig_15206_pilon	+	607	4	Intergenic	novelGene_175722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	2.62466929133727	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAATTGATTCCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21493	24536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15206_pilon_+_21594_23310_23443_23620_23698_24238
846788	contig_11846_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_105978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337629	339320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_337600_339300
846789	contig_6098_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_145468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43001	43978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_43000_44000
846790	contig_3018_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_78903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGAAAGGACACGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603417	602606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_602600_603400
846792	contig_6048_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_73364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATGATCTAGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3069180	3068173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3068200_3069200
846793	contig_6286_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_165647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGTAAAGGAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106658	105674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_105700_106700
846794	contig_10801_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_74041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACACCAATTCAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270868	269534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_269500_270900
846795	contig_8260_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_163246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152955	154336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_153000_154300
846796	contig_5817_pilon	-	1489	8	Intergenic	novelGene_169580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_5	50.816195393651	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	61	993	121285	53282	FALSE	80	ACTAAACAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDFPLDSLPAAVQILDSFPMMSIKHTIQWLYPYTILLGHEGKMAVEGVLKRFELQDSRSSVLPKEIVRVEGVSESHVSQASVTVQIAGKEVTIKVPAGTKPLTQPCTSDHFIQTLSHKQLLAEMMQSHMVKDICLIGGKGCGKTVIAKNFADTLGYTIEPIMLYQDMTARDLLQQRYTLPNGDTAWRSSPLVNAALQGKLVLLDGIHRVNTGTLAVLQRLIHDRELSLYDGSRLLREDRYMRLKEELKVSDEQLRERSIFPIHPSFRIIALAEPPVIGSTAQQWLGPEFLTMFFFHYMKPLVKGEEIQVIKEMVRVRPVPAYCLDLFSF	124096	52785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_53502_66718_66833_68711_68873_105355_105434_105522_105658_108424_108557_121192_121298_124048
846799	contig_12951_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_68181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	214	438	398591	400011	FALSE	25	AAAAGCCTTTTGGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSRARDREGDPTEGPVASPRTNSGHSGSGGRSNSGNSSSSDSGDSSEPGGRATCGPAGAGSPRPPPRAPAFMQRLVAWDPACLPLPPPPAFKSMEVANFYYEADCLAAAYGGKAAPVPPAARPGRAGFEVDAIGLNMAGRVCTRD	398377	400238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_398746_399941
846800	contig_9011_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_159303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447358	446871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_446900_447400
846803	contig_16622_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_48412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	63	371	36525	36217	NA	25	TTCAATTTTAGGTGTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNFLVWHRTFRVGKPDVSAMGKRGSRSQSQLLNTLTKKQKKHLRDFGEEHPFYDRCGRGAGPRPELPESARSFPVWGPPSSQVMMTSAPASSYASPAGARLRILVTPRREMGFFMSLPTHC	36587	35524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_35500_36600
846804	contig_4103_pilon	-	936	2	Intergenic	novelGene_51957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGCAAAAACTGCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164193	157979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_158888_164165
846805	contig_19170_pilon	-	2102	13	Intergenic	novelGene_177549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.9568658332017	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	70	2085	106539	82205	FALSE	85	AAATAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDRRMCKDEDECEEGKHDCAEKQMECKNLIGTYMCICGPGYQRRPDGEGCMDENECQTKPGICENGRCLNTRGSYTCECNDGFTASPAQDECLDNREGYCFTEVLQNMCQIGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGSQCEICPFQGTVAFKKLCPHGRGFMTNGADIDECKVIHDVCRHGECVNDRGSYHCICKTGYTPDITGTACVDLNECNQAPKPCNFICKNTEGSYQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECTSDINLCGAKGICQNTPGSFICECQRGFSLDQSGASCEDVDECEGNHRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPAGFRYEQFSGGCQDINECGSPQAPCTYGCSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGGPEPPASGEMDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETNASNIEDQPEIDANVSLASWDVEKTAIFAFNISRVSNKVRILELLPALTTLTNHNRYLIESGNEDGFFKINQKEGISYLHFTKKKPVAGTYSLQISSTPLYKKKELNQLEDKYDKDYLSGELGDNLKMRIQILLH	106608	82187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19170_pilon_-_82595_83773_83949_87284_87517_93294_93415_94219_94349_95074_95192_98115_98239_98508_98635_100273_100481_101050_101177_103158_103291_104789_104913_106523
846806	contig_2332_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_58645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGGAAAGACAGGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220125	218902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_218900_220100
846807	contig_9415_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_109813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAGAATCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775558	1775020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1775000_1775600
846808	contig_5125_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_43483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCCCAATAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147008	148345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_147000_148300
846809	contig_16204_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_154469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	82	309	60786	61013	NA	50	TAGAAGAAACCAGATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEDRPYSFLCESLWCPAQSSIDNFSMTSVNPFNALDALLPSPSFPTCPCPPKEPRALRPCPFLPLVSRGGVIIKFVCQLGWAMILSGLTVMMWSGSHMMM	60704	61553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_60700_61600
846810	contig_7619_pilon	+	644	5	Intergenic	novelGene_162147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAATGAGAGTGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23662	30811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_23822_25227_25383_27647_27779_30135_30236_30712
846811	contig_7171_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_101325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCGCCCAAGCAGCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113567	1114377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1113600_1114400
846812	contig_10980_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_162555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCCAGCGGTCAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111950	112773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_112000_112800
846813	contig_7521_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_160537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTGGCCCTTCATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197960	199344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_198000_199300
846815	contig_7009_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_23692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTAAAAAAAAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026592	1024406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_1024400_1026600
846816	contig_14483_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_133774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGAACGAGCTAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176639	177845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_176600_177800
846817	contig_6230_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_102086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1007	1342	113981	115548	FALSE	35	AAACACAGTGGAATTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVLGAQSERFPSNLEVEASPQASSAEVNASPLWNLAHVKMEPQESEEGNVSGHGVLGSDVFEEPMSGMSEAGIPQSPDDSDSSYGSHSTDSLMGSSPVFNQHCKKKMRKI	112974	115646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_114054_115285
846818	contig_8291_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_99954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTAAATGCGGCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481422	481976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_481400_482000
846819	contig_7612_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_170369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCTCAGTAATTATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218087	219215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_218100_219200
846820	contig_7459_pilon	+	1796	15	Intergenic	novelGene_174776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_13	441.719044513268	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	254	1795	76742	175594	FALSE	30	AAACTATCTTTACTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRSNSGVRLDGYARLVHQTILCHQNPVTGLLPASYDQKDAWVRDNVYSILAVWGLGLAYRKNADRDEDKAKAYELEQSVVKLMRGLLHCMIRQVDKVESFKYSQSTKDSLHAKYNTKTCATVVGDDQWGHLQLDATSVYLLFLAQMTASGLHIIHSLDEVNFIQNLVFYIEAAYKTADFGIWERGDKTNQGISELNASSIGMAKAALEALDELDLFGVKGGPQSVIHVLTDEVQHCQSILNSILPRASTSKEVDASLLSVISFPAFAVEDSQLVELTKQEIITKLQGRYGCCRFLRDGYKTPKEDPNRLYYEPAELKLFENIECEWPLFWTYFILDGVFGGNAEQVQEYREALEAVLIKGKNGVPLLPELYSVPPDKVDEEYQNPHSVDRVPMGKLPHMWGQSLYILGSLMAEGFLAPGEIDPLNRRFSTVPKPDVVVQVSILAETEEIKAILKDKGVDVETIAEVYPIRVQPARILSHIYSSLGCNSRMKLSGRPYRHMGVLGTSKLYDIR	76488	175595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7459_pilon_+_76820_78027_78187_86020_86069_88689_88859_99699_99783_110104_110186_117607_117707_118656_118804_142645_142700_143848_143972_145540_145637_146570_146679_147683_147763_160988_161124_175511
846821	contig_2817_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_104350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	535	864	338385	338056	NA	0	TGGCCCTCTCTCTCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPQGGVREIQKRQCMMPGQARGTWELFSPSEFLPPNVTFFLGAERGQNRFFPEDTAQNSSHGFVPAEIQQAKTALMLISKNFCALIFSYSKVSISTLFTRRVKGFGI	338919	337403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_337400_338900
846822	contig_17560_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_167577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54250	52714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_52700_54200
846825	contig_7895_pilon	-	1618	10	Intergenic	novelGene_154464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	10.5315516542869	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	695	1618	882456	868653	FALSE	15	TTCACCTTCTTCCCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYPLLLMELLNATPESHPDKVPLTSAVLAVKEINVNINEYKRRKDLVLKYRKGDDDSLMEKISKLNIHSIIKKSNRVSSHLKHLTGFAPQIKDEVFEETEKNFRMQERLIKSFIRDLSLYLQHIRESACVKVVAAMSMWDVCMEKGNRELEQFEKVHRYISDQLFMSFKERTERLVISPLNQLLSMFAGPHKLVQKRFDKLLDFYNCTERAEKLKDKKTLEELQSARNNYEALNAQLLDELPKFHQYAQGLFTNCVHGYAEAHGDFVHQALEQLQPLLSLLKVAGREGNLIAIFHEEHSRVLQQLQV	929418	868652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_868737_869316_869650_871734_871864_875711_875817_876791_876923_882314_882515_883681_883846_887695_887796_888626_888821_929240
846826	scaffold_880_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_121499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTCTACCACTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546146	545489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_545500_546100
846828	contig_7164_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_172141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCATGTTTTTCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471500	471003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_471000_471500
846829	contig_6872_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_175743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAGCCTTTCCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438338	436847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_-_436800_438300
846831	contig_5324_pilon	-	728	4	Intergenic	novelGene_102049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	8.17856276425687	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	70	354	93305	81505	FALSE	10	TATTTGCATTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESWTADAAVVPRARRLLEHAASAMREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERISVYYNESSSQKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGA	93374	81130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_81513_91031_91143_92612_92722_93248
846832	contig_2596_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_53494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAGGGCAAGGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780423	779605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_779600_780400
846834	contig_14895_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_106696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	179	502	120774	121097	NA	20	TTGCCTTGGTTCTGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQKNYYILNSEVQVSPQKQIEVIEKKCLRNVPTGYQSRGGSQRGQDRTVCQRGPVQIRGLVWIWDPAWILGPGMGTEGGLSGEEPRGQQCPVQPSHLCLGFILQG	120595	121293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_120600_121300
846835	contig_9366_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_166247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	376	699	876470	876793	NA	40	TATGCCCACAAAAGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSLEYCLWLLLHCSGKIGFLLQSPYVALSLLCIAAWRATKESDAVITQQSHVYCPTFIFFYYQCKPVMLKQVQKRNVDFGCAFLRHSGLDSLVIKLDRRMLTFIIS	876094	877046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_876100_877000
846836	contig_5649_pilon	-	688	4	Intergenic	novelGene_82342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	3.68178700572909	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	387	404	791852	791835	FALSE	5	CTATTCCCCGGTTTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVDSAVAINDLSVVVDLLNIVNQKASLWKLDLCTTVLPQIEKLLQSKYESYVQTGCTSLKLILQRFLPLITDILAAPPSVGVDISREERLHKCRLCYKQLRSISGLVKSKSSLSGRHGSAFRELRLLMASLD	792911	791550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_791968_792288_792406_792677_792753_792832
846837	contig_13982_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_163484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACTTCCATGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374972	375691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_375000_375700
846839	contig_16870_pilon	+	415	3	Intergenic	novelGene_155500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	225	365	107799	107939	FALSE	20	CTACCACCACTGCACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVPSSCGPCGARACDVGPQRGPRHAGGGGCGRGGRRLRGSRIRCHQLHAGPSQALAWTLTTWLRYLLKGWLVDPMVGLPVWATLLALPFACLSRPPLPGIPSWSQVMGLPSTHIACLPNF	104507	107989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104632_107515_107544_107726
846840	contig_8954_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_130325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGGGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674037	674881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_674000_674900
846841	contig_13004_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_112662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583537	581116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_581100_583500
846842	contig_14314_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_176834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAACACCCACTCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55594	53858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_53900_55600
846844	contig_16231_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_176712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79641	78330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_78300_79600
846847	contig_7912_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_129578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	249	368	327866	327747	NA	60	TAGGAAAAGAGAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYYIGEKKARKFALRNFFHHDDAPAHSWRVARAVLPEFHWKPYLIHHTALIFPLQTFLFSKLKELLKGTQFESFKDAQTSVLMWLKLKNADYFREGLERWKYLLQKCIDLDGGYVKKQSFL	328114	326247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_326200_328100
846848	contig_7272_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_25420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAATTTAAACCCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914815	915909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_914800_915900
846849	contig_6445_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_77124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCAGCAACATAGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457765	1456331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1456300_1457800
846851	contig_8286_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_139813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAGCTACAATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215163	214835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_214800_215200
846852	contig_9438_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_154269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGCAAGACATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261006	260342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_260300_261000
846853	contig_13674_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_140296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGATATTTTGTGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2872	2258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_2300_2900
846854	contig_563_pilon	-	866	7	Intergenic	novelGene_169753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.5157055148524	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	11	865	148760	120846	FALSE	15	TCAGCCTGTCTCTGGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGERTECAEPPRDEPPADGALKRAEELKTQANDYFKAKDYENAIKFYSQAIDLNPTHAIYYGNRSLAYLRTECYGYALADATRAIELDKKYIKGYYRRAASNMALGKFRAALRDYETVVKVKPHDKDAKMKYQECNKIVKQKAFERAIAGDEHKRSVVDSLDIESMTIEDEYSGPKLEDGKVTITFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYVSFLSYFMSVIKYVKIKSLL	148770	120844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_120895_127473_127587_127956_128023_132665_132788_133533_133682_140853_141096_148645
846855	contig_16860_pilon	+	1986	4	Intergenic	novelGene_155335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.88561808316413	8	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	139	1266	72360	86037	FALSE	15	TAATCCCTTGTCATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSRGGQSRLVEPGIYEGQSSQARDTRPKELGSSADLGTSLPLDSWMNVTRLYDSQLKYGVPGPEVKSSPYDSHTCVVYPERNHILLHPHWNQDTEQETSELESLYQASLQASQAGCSKWGQQDVPWHPHRQTGSADGMGRRLHSAPGLGLSKTPTAEMEHSLCEASTVPDSQESSNVMKNPLETGHRCSSSSSLSLIHDPPVFLLGPQLYPPQPQFLSPDVLMPSMAGEPHRPPGTWRNVQQFLAMCDRGETSQGTKYTGRTLNYQSLPHHSRTDASWRPWSESNQHTGARFLTTPGCQPPQTHTATLPERCQGLQVPHAQSWGDLSHPPSHPPIVHHVSSPSRSLHVPLSSAWNSGPIPGAQAPGPRRVDMPPDDDWRQSSYASQSGHRRTGGEGFLFVLADAPRREQIRARALQHSRW	72221	86757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_72622_78193_78313_83666_83854_85477
846856	contig_19778_pilon	+	622	3	Intergenic	novelGene_143740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGAATAAAACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2637	6537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_2723_5643_5893_6249
846858	contig_4531_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_47882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTCACCTGTCTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247132	249098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_247100_249100
846860	contig_438_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_177393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGTGGAGAAGGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39255	39554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_438_pilon_+_39300_39600
846861	contig_15029_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_128200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196479	195623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_195600_196500
846862	contig_9363_pilon	-	692	4	Intergenic	novelGene_6598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	573.470719973275	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	10	486	777114	754119	FALSE	50	AAACATGTCAAATGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEVKTLLGLPGWK	777123	753912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754154_774893_775045_776037_776192_776977
846863	contig_16103_pilon	+	800	4	Intergenic	novelGene_118933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_3	89.5358401237553	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1	456	795893	799889	FALSE	15	TTAGCTAACTCTGGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	795892	800233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_795975_797698_797917_798357_798464_799839
846865	contig_1719_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_87350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	837	1139	683742	684044	NA	35	ATTAAACCTACCTTGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAPHGMFSYVEAKHMLDVSLCVCVRWGVCMRALHQQPLPKQAESSAPRYRGPTRPGLPWASKQSVLLKAKSYSAAPSKKEDGGHDVLRDKAVWSDVWA	682905	684136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_682900_684100
846866	contig_17144_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_29136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTTTACCACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42609	43386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_42600_43400
846867	contig_10722_pilon	+	1354	1	Intergenic	novelGene_70983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACTAATCGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17749	19103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_17700_19100
846868	contig_20719_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_140562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTGTTTTAACTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9481	8815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_8800_9500
846869	contig_9415_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_109773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCGTCTTGCCATGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616531	1617861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1616500_1617900
846870	contig_18822_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_111739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTGGGGGCCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227353	227749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_227400_227700
846871	contig_5549_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_81623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTAATCTCTCAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367945	368561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_367900_368600
846874	contig_10943_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_168261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATAACGGAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32039	32352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_+_32000_32400
846875	contig_8347_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_177550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTTTCTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120533	119123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8347_pilon_-_119100_120500
846876	contig_4769_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_118044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552361	1551829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1551800_1552400
846877	contig_14640_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_168047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	102	329	347024	346797	NA	40	CCAAAGTTTCTTCCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPERPGKFLRENHCAQQSFVVCWSTYLPLPYVVMQLLTHHTYNTSDAFNYFSINLLRIRTFFCINTLTIIKPKKNGKNSTISSNIWSRFRFIQFSQMSFIVVFFSSLN	347125	345826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_345800_347100
846878	contig_9884_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_177551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAATAAAATCAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13706	12981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9884_pilon_-_13000_13700
846879	contig_19330_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_163690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	639	1022	31002	31385	NA	30	ACTTGTTTAATTAATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCWYNLNNKIKFKKKYIKISMQELQSCIENTENASPCVFTYLFFAPVLYLCLSTGASEGWVVIYKPPLLWKFQTYLSLVLQNLLPELLILAFKYYFMLLFKYLMTTTTKNPNNPLLSSRFRLTAIL	30363	31562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_30400_31600
846880	contig_6854_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_169492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAACCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370705	369976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_-_370000_370700
846882	contig_6954_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_64415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	222	666	1	666	19681	19016	NA	70	AGGACAAAGAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSEFPHFRNNHKTARASDTVKTKDLKSRSPHLDDCSKTDPRVKSDVSRDLHHSASLPNLGKEGKSHSEKRSTSVLPPSIEKRCANGIWSRSHYHVGEGNSGEDNRREKKDIRHSQYSGGTDRIRKDFSTSCGSGELRNTETDQRLQGRSEKYGKGEPKAESKNSKFKSNTNSDYQSEHISSSREKEISRERSHIRVESQNDKRLERQSERSQNINKKDLKS	19681	19014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_19000_19700
846883	contig_12352_pilon	+	525	2	Intergenic	novelGene_57465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTTATAGTCCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247534	248392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_247575_247907
846885	contig_12884_pilon	+	1485	4	Intergenic	novelGene_105024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	535	942	1240489	1240896	TRUE	15	GACGGCACGGCAGCCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRRRSASWSLCCRWISSVCTNVIFSCVLISVRCSFSLISSACFRKRWASSSARAWARLISATRSLSRSASALISSCRCRSASSVRWKPCVSCASCCAICSLSSCSRRACSCASSFCCCSSSASALSCVASCTA	1239197	1248552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1239686_1240442_1241275_1248301_1248411_1248496
846888	SIRV2	-	271	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4602	34	3427	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
846889	contig_10506_pilon	+	1469	3	Intergenic	novelGene_125170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	340	junction_1	259.5	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	417	1469	9884	59239	FALSE	30	GTGAGTAGAATTTCATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSSLYNEDRNLLRIRDKERRNQEAHQEEAFPEKIPLFGEPYKTEKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLNTKPHPHRFDVSENRLGKPRYPLFPEKGSSIPPHSFHTSVHHQPVNTPASGPLPVGNISHNPKMAQPRMEPSLRAKSYGPPDSQHLTQDRFGQERYGSSHHKKGDHRADGDHCTSMTDSAPERELSPLLSSLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSNKVHSSNNNNKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDTLVALTSLGVAPPQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVE	9467	59239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_+_9901_57805_57924_58321
846890	contig_7444_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_174928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATCTGTACAACTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79519	79871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_79500_79900
846891	contig_7748_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_101056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161041	162015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_161000_162000
846893	contig_9389_pilon	+	310	4	Intergenic	novelGene_84028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	447.83429475148	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	168	141	308	585773	586222	FALSE	15	CCCCTCAAGTAGTCTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRNRRNGGSGAKEEADLPQVHLPRRGPGPAAGHVLRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQSPTSPSSTAGLASAPPTPPAS	584382	586224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585739_585878_586159
846895	contig_7049_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_171437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGATAACAAAGTACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96587	95948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_95900_96600
846897	contig_5451_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_167171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCTCCACTAGGGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456148	457251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_456100_457300
846898	contig_14855_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_146013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAATCACTCATGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431166	431614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_431200_431600
846900	contig_7342_pilon	-	270	2	Intergenic	novelGene_71198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	12433	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACATGGGGCTCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665699	665356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573
846901	contig_1154_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_87126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAACTAATTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449212	450870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_449200_450900
846902	contig_10196_pilon	+	671	2	Intergenic	novelGene_132123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	340	402	926220	926282	FALSE	30	CAAGGACACCCAGGCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSHLSLELEPTEIRGEGGTWPANLEAETLGLAYLEHCTPSFSPQPGCLSLPVWVHSCGAQFPEGLQHSPRPIPTPQAVRETQCKQRLSQPAVPAWPLHDSLCLNASRPTRALMVRDPLEEQADTQPRLVYER	925775	926551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_925834_925938
846903	contig_10311_pilon	-	865	8	Intergenic	novelGene_50394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGTAAAACAAGAGATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65120	59323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_59380_61183_61324_62514_62623_62825_62943_63585_63717_64629_64702_64770_64898_65006
846904	contig_6958_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_69970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTAATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288628	290463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_288600_290500
846905	contig_15691_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_60779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCGGCACACTCTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111368	112083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_111400_112100
846906	contig_6745_pilon	-	1513	5	Intergenic	novelGene_170740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	373.396237260099	3	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	957	1277	15890	4613	FALSE	45	AAACTTAATTTAAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDCGNQAVEERLQNIEAHLRLQTGGPVPRDIYQRIKKLEDKILELEGISPEYFQAVNFSGKRRKVQPPQQNYSLAELDEKISALKQALLRKSREAESMATHHLP	17253	4376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6745_pilon_-_4721_6220_6260_12030_12129_15814_15968_16374
846907	contig_12391_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_103616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAAACAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119649	119420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_119400_119600
846908	scaffold_16539_pilon	-	1150	7	Intergenic	novelGene_68318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_6	190.459677855679	214	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	78	926	144365	133848	FALSE	5	CCATTTCTTGTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPETRPNHTIYINNLNEKIKKDELKKSLYAIFSQFGQILDILVSRSLKMRGQAFVIFKEVSSATNALRSMQGFPFYDKPMRIQYAKTDSDIIAKMKGTFVERDRKREKRKPKSQETPAAKKAVQGGAAASVVGSVQGPVPGMPPMTQAPRIMHHMPGQPPYMPPPGMIPPPGLAPGQIPPGAMPPQQLMPGQMPPAQPLSENPPNHILFLTNLPEETNELMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFDNEVQAGAARDALQGFKITQSNAMKISFAKK	144878	133623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_134008_135191_135281_136121_136296_138729_138910_140940_141114_144292_144389_144824
846909	contig_5200_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_140172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTCACAGAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469916	468930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_468900_469900
846910	contig_10609_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_123979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAACTCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649760	648619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_648600_649800
846911	contig_13265_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_146000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCTTATTAATACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47763	47274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_-_47300_47800
846912	contig_7694_pilon	+	632	2	Intergenic	novelGene_159923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	0	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	24	362	174784	175536	FALSE	75	CCTAAAAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRRWFGMAAAAEAIPANRTEEPARDDAAVETAEEAKEPAEADINELCRDMFSKMATYLTGELTGETGSGFFRDMAVHHSLPPAVWLQETCDVLLQRQSTAPSSIPHALRPAFCYFGES	174760	175806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_174839_175252
846913	contig_3277_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_74738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTAGTACTGGTAGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270354	269318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_269300_270400
846914	contig_14858_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_177552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCCAACAATTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230599	230110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14858_pilon_-_230100_230600
846916	contig_9799_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_145558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTGTTGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926896	925677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_925700_926900
846918	contig_6842_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_130830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	618	1013	1791920	1791525	NA	75	ACCCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQPGNSVQLTVFRTNSWEEGMEPVRLRKAGCPMMRLPFTRVLEVDRAWCGMANISGSFHPGNGSECGKSPGQKLSGAIRCFPVLWRLLEAAVAVLLIILPMLPTLTRRSPLHGKDMKSGLAPRDSGLKT	1792537	1791419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1791400_1792500
846919	contig_6327_pilon	+	866	2	Intergenic	novelGene_147481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30115	34481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_30171_33670
846920	contig_15323_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_148524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGAATCATGGCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105788	104877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_104900_105800
846923	contig_9900_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_159516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACATTTTTTAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337419	337152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_337200_337400
846924	contig_8291_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_99963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATTTTTTCTAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737488	736956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_737000_737500
846928	contig_17158_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_141148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTGCGCCATCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125770	124679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_124700_125800
846929	contig_10319_pilon	-	1322	7	Intergenic	novelGene_147242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_4	58.4284938098603	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	266	832	250190	67761	FALSE	40	TTGGTGTCCAGCAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKVR	251606	67270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_67878_71419_71525_79991_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
846930	contig_10629_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_52890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCTTTGCCCCAGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213991	213761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_213800_214000
846931	contig_7415_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_168681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286147	286830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_+_286100_286800
846932	contig_15021_pilon	+	1034	9	Intergenic	novelGene_26996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCCGGAATCTGTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411655	428098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_411852_416003_416109_417090_417210_419337_419500_420184_420316_420895_420958_421586_421649_426120_426250_428030
846933	contig_16964_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_143128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGATGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211252	210591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_210600_211300
846934	contig_4678_pilon	+	960	5	Intergenic	novelGene_126068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	162.841947912692	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	173	706	714911	717945	FALSE	25	CCCTAAGAGCCCCATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKQDQCVVGPGPGAGLGKVVRALLLLLCFAARSGALYFHIGETEKKCFIEEIPDETMVIGNYRTQLYDKQREEYQPATPGLGMFVEVKDPEDKVILARQYGSEGRFTFTSHTPGEHQICLHSNSTKFSLFAGGMLRVHLDIQVGEHANDYAEIAAKDKLSELQLRVRQLVEQVEQIQKEQNYQRWREERFRQTSESTNQRVLWWSILQTLILVAIGVWQMRHLKSFFEAKKLV	714738	718199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_714921_715088_715190_716493_716620_716982_717130_717795
846935	contig_17744_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_177553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGGGACACTGGGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133576	133032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17744_pilon_-_133000_133600
846937	contig_8615_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_165228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAATGTTTGGATCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435300	434309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_434300_435300
846938	contig_3942_pilon	-	743	7	Intergenic	novelGene_128815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	163.910968380873	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	63	743	1054846	1050155	FALSE	45	AATAAATGGACCTAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGVVLDEIKPSSAPELQAVRMLAEYLASEGQRDEVVAHLDREMSRSVDVTNTTFLLMAASIYLHDGNPDAALRALLQGDSLECSAMVVQILLKLDRLDLARKELKKMQDQDEDATLTQLATAWVNLAVGGEKLQDAFYAFQELADKCSSTLLLLNGQAACHMAQGRWEDAEGVLQEDSGHPETLINLIVLSQHLGKPPEVGPLSVARPRMVPVRSGSGQKHHLPHQCPPLTSRPDPGSLVPAPPSLI	1054908	1050154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1050224_1051126_1051271_1052710_1052855_1053144_1053227_1053734_1053789_1054379_1054533_1054811
846939	scaffold_4805_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_161046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACCTAGTGACTAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955760	954526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_954500_955800
846940	contig_16303_pilon	-	716	2	Intergenic	novelGene_34123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	0	827	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTTTTTTAGTTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48028	46126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_46712_47897
846941	contig_12629_pilon	-	832	5	Intergenic	novelGene_150646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	26.4893846663149	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	35	718	81596	40326	FALSE	30	CGCAAAGCTTGTTTACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQRAACEKAGKMAASWRLGCDPRLLRCLLGFRGRRSPGLVKGAAGCSGCRVANWRWFHSTQWMHGDPIKILMPSLSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSAGDALCEIETDKAVVTLDAGDDGILAKIVVEEGAKNIRLGSLIGLMVEEGEDWKHVEIPKDVGPPSPAAKPSVPHPPPEPPISIPVQKEHTPGKLQFRVSPAARNILDKHALDASEGTATGPRGIFTKEYVCVFCNNQFHIS	81630	40211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_-_40468_42271_42472_50820_50922_63738_63820_81436
846943	contig_10777_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_101176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGGGTTGCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60827	61639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_60800_61600
846944	contig_3948_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_53252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAGAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233870	1234997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1233900_1235000
846945	contig_5826_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_71515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAGGCACATGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73525	72310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_-_72300_73500
846946	contig_5278_pilon	+	957	5	Intergenic	novelGene_139770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	52.2374386814668	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	107	601	194722	231951	FALSE	10	ATTGTTGAGTGGTTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDCALCSLVEELIPRETKVGFRMAKEEPQSISKDLQELQKKLSLLIESIQTNSKVVAFMTSPVGQYLDRHPFLALTLLMFIAMSAVPVGFFLLLVVLTSLAAFVGVILLEGLVISVGGLSLLCILCGLAFVSLAMSGTITVSYMVVSSLISYWFSPSLSLFWL	191765	232307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_191845_194694_194887_200452_200622_201964_202104_231929
846947	contig_6299_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_172941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAATGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953305	954236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_953300_954200
846948	contig_1127_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_98855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAGAATGAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22661	23788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_+_22700_23800
846949	contig_6272_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_160470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTATTCCGACTCACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686262	685006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_685000_686300
846950	contig_10176_pilon	-	984	8	Intergenic	novelGene_72697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	204.837018338074	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	53	862	225368	214602	FALSE	25	ACAAAGCTTGTTCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCWLVRQDSRQQRIRLPHLKAVVIGRSPETKITDKKCSRRQVQLKAECNKGYVKVKQVGINPTSIDSVIIGKDQEVKLQPGQVLHMESLGHWSQGLKISMQDPKMQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	232705	214479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223223_223311_223831_223879_225238_225376_232660
846952	contig_11126_pilon	-	1879	16	Intergenic	novelGene_138151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.618241233033047	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	45	1658	936655	905613	FALSE	25	TATTCAATGAATGGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDETPHLESAHAETGDLEKEEKGQQWIRPDTPSRCTWQLGKPATQSPHHHVTLSTPPKILPDILKKIGNTPMVRINKIGKNFGLKCELLAKCEFFNAGGSVKDRISLRMIEDAERAGTLKPGDTIIEPTSGNTGIGLALAAAVKGYRCIIVMPEKMSTEKVDVLRALGAEIVRTPTNARFDSPESHVGVAWRLKNEIPNSHILDQYRNASNPLAHYDTTAEEILQQCDGKLDMLVVSAGTGGTITGIARKLKEKCPGCKIIGVDPEGSILAEPEELNQTDQTAYEVEGIGYDFLPTVLDRSVVDKWFKSNDEDSFAFARMLIAQEGLLCGGSAGSSMCIAVKAAQELQEGQRCVVILPDSVRNYMSKFLSDRWMLQKGFMKEEKMIVKKPWWWHLRVQELSLSAPLTVLPTVTCEHTIEILREKGFDQAPVVDETGMILGMVTLGNMLSSLLAGKVQPSDQVRKVIYRQFKQIRLTDPLGQLSHILEMDHFALVVHEQIQYHSQGKSSKRQMVFGVVTAIDLLNFVAARERNQRTN	943770	905391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_905723_907761_907847_911666_911776_912959_913095_913278_913357_915072_915179_915807_915893_917218_917345_918233_918326_920368_920439_921007_921143_921254_921335_921816_921952_926365_926473_936494_936657_943727
846953	contig_8276_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_174475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATGCTCCTTAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132875	131014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_131000_132900
846954	contig_15021_pilon	+	714	4	Intergenic	novelGene_26921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.3474550920669	189	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	204	503	78749	90404	FALSE	25	TATCACTGTGTAGACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRECGFIRLQPDTNKVAFVSAQNTGIVEVEEGEVNGQELSIASHSIARISFAKEPHVEQITRKFRLNSEGKLEQTVSMATTTQPMTQHLHITYKKVTP	78250	90615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_78420_78714_78825_79743_79848_90284
846955	contig_8598_pilon	+	1043	3	Intergenic	novelGene_22886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	642	1043	80510	83402	FALSE	30	AAAACCTCTCTCCAGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTTSLVDSAGTLIRLDVHLVVVDVDLRDVHFKVIGQELDWFPHSANARPARRLEHLLQGGQVGACSYKTKSLVRPESGNLLFTTLTREGTGLPEQEQESIKEASFLPTQLKVSTSSDISGSFFFFFFLKKKK	79394	83402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_79931_80404_80530_83020
846956	contig_2770_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_107495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATACTAATAGTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818994	820381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_819000_820400
846957	contig_15327_pilon	+	941	6	Intergenic	novelGene_70831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	35.3802204628518	224	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACCTGACTCGCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639512	1645253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1639593_1640097_1640265_1640871_1640969_1641609_1641709_1643312_1643431_1644873
846958	contig_5145_pilon	+	1274	9	Intergenic	novelGene_131398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.8001572323157	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	54	1214	674698	690922	FALSE	30	AAGCTCCAATGTCTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARGLLWVVCLLRVALATVYFQEEFLDGERWRNRWVPSTNDSQFGHFRLSSGKFYGHKEKDKGLQTTQNGRFYAISARFKPFSNKGKTLVIQYTVKHEQKMDCGGGYVKVFPSDVDQKNLNGKSQYYIMFGPDICGFDIKKIHVILYFKNQYHSNKKSIRCKVDAFTHLYTLILRPDLTYDVKVDGQSIESGSIEYDWHLTSLKKMEKSSAESKDWDQATDSKTQDWEKHFLDASASKPSDWNSELDGDWSGPMLQKPPYQDGLKPEGIDKDVWLHQKMRNTNYLTEYDLSEFENIGAIGLELWQVRSGTIFDNFLITDDEEYAENFGKATWGETKGPEREMDAIQAKEEIRKALEEEEEEELLAGKFNARQNFFNQFHRQDEL	674644	690982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_674789_674996_675099_677319_677524_681087_681183_684596_684786_688526_688635_688733_688866_689777_689871_690775
846959	contig_2550_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_135659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCTTGTTACTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013136	1011357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1011400_1013100
846960	contig_10500_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_41137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	397	711	7698	7384	NA	25	TATGTGCGTGTATATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTLFLMRSFVDVMSAPHLSSLPSLSLYCHRSEAAVLVPFLPSVLGESFPPFQLVFIPSQTLIKFRVSSMLSVISQVISVCVKFFFSKSSLHIPLLYITVIL	8094	7118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_7100_8100
846961	contig_15114_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_121187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCCTGAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712521	710728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_710700_712500
846964	contig_10446_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_162509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGATCTAGAATTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049311	1048179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1048200_1049300
846965	contig_10549_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_110614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATACAAACTATATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204190	204543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_204200_204500
846966	contig_500_pilon	+	634	4	Intergenic	novelGene_31086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_2	1033.19902352946	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496872	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
846974	contig_934_pilon	-	724	5	Intergenic	novelGene_129005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	45.6255136957383	103	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	164	706	38927	28538	FALSE	20	ATGGAATTTTGTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRNLSQNHHIMQNDSCLKEQKKELDSSFIKKSGCPRKDEISSESLQNMGKLYEEKWTCCGVTCYYFTTEHKTWKDCQQICQNYGSFLLKIDDKDELVFIQSQAYHNTYWIGLAYDNMENKWKWVNSSTSSGFNFTIMSLPSRRGNCAFLTSTRITDIRCSNTYNCICEKRVDCIFPNSL	44394	28519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_28683_35551_35659_37441_37585_38779_38966_44269
846976	contig_10389_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_176570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAAAAAGGATACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42532	40331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10389_pilon_-_40300_42500
846978	contig_14727_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_56637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTCCTAGGGCCGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161494	160439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_160400_161500
846979	contig_5071_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_171277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAGCCTCCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148379	149278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_+_148400_149300
846980	contig_9272_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_125963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTACATTCTTCACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501431	500772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_500800_501400
846981	contig_12250_pilon	-	461	5	Intergenic	novelGene_80727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	434.379082714626	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGCTGGGGAGAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401316	400106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_400240_400314_400378_400528_400562_401003_401120_401200
846985	contig_5247_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_81839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGTCATCGAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552763	551457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_551500_552800
846986	contig_19352_pilon	-	617	3	Intergenic	novelGene_122374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	842	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGAGCCCACGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122946	103685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106005_122850
846987	contig_5815_pilon	-	1159	2	Intergenic	novelGene_141241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	20	541	1049947	1047910	FALSE	10	TGTATTGACTTGGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQLKQMMKDLAKEKDKMEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENHLYQAIATVTTLLLQIGEVGQCSSSSGSFSQEAAEDLRAPAPSPDQDLVFADPGSAPQNSRAFPEEAGRGDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLEIKSKLENAKISQYSLKTFEMSRHSQPELKLGNL	1049966	1047291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_1048369_1049884
846989	contig_15486_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_157314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCATTAAAATACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63237	62657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_-_62700_63200
846990	contig_15720_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_41864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	704	1006	260343	260041	NA	40	ACTAAATCAAATTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFPDMFHFQPPASTTHLSIGATCAPPVCALSSSHPRAVSPRVCPTALPPNCLVSHQDLQPTSSPALTCSALPWASGTGHVCWEAGFRGGLFVIKGKRP	261046	259806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_259800_261000
846991	contig_9840_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_173757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGCCATTCTTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30475	31432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9840_pilon_+_30500_31400
846993	contig_3212_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_174746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAGAAGATTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108085	107833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3212_pilon_-_107800_108100
846995	contig_15114_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_121168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTTCGTCTGATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321202	320197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_320200_321200
846997	contig_10732_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_114736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTACCTATTTTGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508704	509243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_508700_509200
846998	contig_11264_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_154204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCTGCCTTGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262833	261350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_261400_262800
846999	contig_5954_pilon	-	817	6	Intergenic	novelGene_28593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	621.753777632271	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCCTTCTCTGAGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960584	944716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_944965_945175_945263_945384_945527_946209_946335_959835_959941_960474
847001	contig_13542_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_131467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCAGGGCTCCTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53296	52751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_52800_53300
847002	contig_10938_pilon	-	442	4	Intergenic	novelGene_171764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_1	62.1950337424317	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAGATATGTAATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81754	56256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_-_56372_57672_57848_77726_77771_81646
847003	contig_3817_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_78396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTGAAAGGAAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204377	1205228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1204400_1205200
847004	contig_8312_pilon	+	956	2	Intergenic	novelGene_152870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAAAAAAAAATCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214086	215337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_214924_215218
847006	contig_13593_pilon	-	916	3	Intergenic	novelGene_156112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_1	536	168	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	135	617	82116	17085	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFANFRRILRLSTFEKRKSREYEHVRRDLDPNEVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGALAAAKVIETNSEEELEDYIVEIEILATCNHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAVDAIMLGESSWVQCVVGMGGLTQVLCLSPRHSPWDLRPLSPPL	82250	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_17247_55149_55315_81960
847007	contig_16870_pilon	-	1125	8	Intergenic	novelGene_155505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.3710478826381	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	261	611	121931	110538	TRUE	25	TGGAAACTCTGACATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAQHQQRLGEIQHMSQACLLSLLPVPRDVLEREEEEPPPRRWCNTCQVYYMGDLIQHRRTQDHKIAKHSLRPFCTVCNRYFKTPPQVCGACEVPGAQGQSQGAEDAREGDSRSR	123584	109057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_109337_109622_109746_110425_110576_110775_110891_111399_111488_121821_121947_122652_122765_123451
847008	scaffold_19766_pilon	+	1088	3	Intergenic	novelGene_34376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	223	705	723607	724277	FALSE	35	CTAGGGTGGGACTAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVSPARTMRLWLWGPRSLGVALGVFMTIGFALQLWGGPFQRRLPGVGLQLRQPWAPSRGPSVPSCTPRQRLVFLKTHKSGSSSVLNLLHRYGDRHGLRFALPTRYQFGYPRLFQASRVKNYHPQDGRAQPHFHILCHHMRFNLKEVRGVGGIGGTGKR	722196	724660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722248_723435_723738_723925
847009	contig_10051_pilon	-	598	6	Intergenic	novelGene_175599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_1	30.2826683104379	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	41	598	361470	317321	FALSE	15	GTTCTTAGCATTGCTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEILDLRRQVLVGHLTHDRMKDVKRHITARLDWGNEQLGLDLVPRKEYSMVDPEDISITELYRLMEHRHRKKDTPVQASSHHLFVQMKSLMCSNLGEELEVIFSLFDSKENRPISERFFLRLNRNGLPKAPDKPERHCSLFVDLGSSELRKDIYITVHIIRIGRMGAGEKKNACSVQYRRPFGCA	361510	317320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_317389_322688_322750_323296_323379_348853_349006_356685_356771_361360
847010	contig_10051_pilon	-	978	9	Intergenic	novelGene_175597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.8639664961947	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	108	977	272754	244499	FALSE	25	TAGACGACTCCCTGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVDKFRGAHIRFEFRHCSTKEKGEKKLFGFSFVPLMQEDGRTLPDGTHELIIHKCEENTNLQDTTRYLKLPFSKGILLGNNNQATKATKESFWITSFLCSTKLTQNGDMLDLLKWRTHPDKITGCLSKLKEIDGSEIVKFLQDTLDTLFGILDENSQKYGSKVFDSLVHIINLLQDSKFHHFKPVMDTYIESHFAGALAYRDLIKVLKWYMDRITEAERQEHIQEVLKVAQEYIFKYIVQSRRLFSLATGGQNEEEFRCCIQELLMSVRFFLSQESKGSGALSQSQAVFLSSFPAVYSELLKLFDVREVANLVQDTLGSLPTIMH	277557	244497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_244616_248872_249044_250177_250263_253075_253177_253345_253430_253534_253633_259642_259800_272697_272805_277500
847011	SIRV6	+	243	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	287	1	56	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2572	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
847012	contig_15866_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_63583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCCAGCCCTGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191404	190983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_191000_191400
847013	contig_1856_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_84885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGTACATCTCTAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262084	263001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_262100_263000
847014	contig_3426_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_57978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAGAAAAGAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582009	581146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_581100_582000
847015	contig_10658_pilon	-	1995	2	Intergenic	novelGene_130097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAGAAAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454008	451818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_452871_453065
847016	contig_5167_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_164102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACAAAAAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376276	375894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_375900_376300
847017	contig_9875_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_154408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCATAACACAGTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81674	82793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_81700_82800
847018	contig_294_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_166755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194259	193774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_193800_194300
847019	contig_4626_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_158826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATAGTTTCTCTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170556	169705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_-_169700_170600
847022	contig_2414_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_158522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTCCTTAAATGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920451	921509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_920500_921500
847024	contig_17796_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_33784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43549	44010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_43500_44000
847026	contig_5964_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_80375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGCTAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397665	396896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_396900_397700
847027	contig_6842_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_130846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGCCTAGGAATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2108315	2107765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2107800_2108300
847028	contig_10323_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_123533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCAGTTTTCCGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222801	221988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_222000_222800
847029	contig_12157_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_135902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATTGGGATGTTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138917	138062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_138100_138900
847031	contig_5084_pilon	-	678	3	Intergenic	novelGene_64610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	46.5	815	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTTGCTCTTCTGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029193	1025782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1026219_1027388_1027484_1029046
847032	contig_7080_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_100120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTATAAATCTTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546164	546931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_546200_546900
847033	contig_6496_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_103533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041532	1040780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1040800_1041500
847034	contig_9481_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_149683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGCACTGCTCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458155	457661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_457700_458200
847035	contig_9516_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_106191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCTAAGTGACATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973704	988465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_973738_978291_978404_979824_980113_982797_982945_987949
847036	contig_14915_pilon	+	184	1	Intergenic	novelGene_174309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAATTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142393	142577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14915_pilon_+_142400_142600
847039	contig_7057_pilon	+	773	4	Intergenic	novelGene_123246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	231.073340930729	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATATTGACTTCCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539959	541460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540033_540155_540316_540738_540996_541177
847040	contig_9366_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_166242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTTCTTAATAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852657	851363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_851400_852700
847042	contig_16310_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_70051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACTCTGCTGATAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66548	66965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_66500_67000
847043	contig_253_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_129786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCTATCTATCTACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100175	1100621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_1100200_1100600
847044	contig_16103_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_118957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAATTCGATAGCAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020917	1020438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1020400_1020900
847045	contig_1694_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_144945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTAATACCCTCAAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647569	646225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_646200_647600
847046	contig_10082_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_63858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTAAGACAAATAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189517	189291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_189300_189500
847047	contig_10082_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_63857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCGGTACCTTTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189078	188289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_188300_189100
847048	contig_9185_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_166918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCATCATGAAAAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757185	758392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_757200_758400
847049	contig_12689_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_145067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAACAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565922	565341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_565300_565900
847050	contig_6954_pilon	+	1008	5	Intergenic	novelGene_64454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.31790237980706	48	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	241	864	760879	768283	FALSE	30	TTCAACTTAAAGGCCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFEDVRDAEDALYNLNRKWVCGRQIEIQFAQGDRKTPGQMKSKERHPCSPSDHRRSRSPSQRRTRSRSSSWGRNRRRSDSLKESRHRRFSCSQSKSRSKSLPRRSTSARQSRTPRRNSGSRGRSRSKSLQKRSKSIGKSQSSSPQKQTSSGTKSRSHGRHSDSIARSPCKSPKGYTNSETKAQTAKHSHFRSHSRSRSYRHKNSW	750088	768427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_750231_760780_760883_762159_762268_762429_762572_767913
847051	contig_15021_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_26973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACCTTAGAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304138	305868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_304100_305900
847052	contig_20507_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_164210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACTGACTGTGAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130480	129969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_-_130000_130500
847053	contig_10600_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_169857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAGAAAAAAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79575	79232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_79200_79600
847055	contig_4565_pilon	-	340	3	Intergenic	novelGene_174699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	6.5	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCTTTCAGCTCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86700	26152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_-_26194_28530_28608_86478
847056	contig_13421_pilon	+	1439	9	Intergenic	novelGene_166796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	8.71690168580557	6	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	83	679	3289	12325	TRUE	15	GGTAAGTGAGTGTGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVNDELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKENPAELAERCLRELLGRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHCLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLSHLDANSRSAATVRAGIVEVLSEAAIIAATGSVGNGTLHEGMRAGSPLRAP	3206	18136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_3330_9117_9268_10495_10631_11140_11220_12133_12674_13693_13806_14199_14252_16981_17155_18061
847057	contig_5260_pilon	+	666	5	Intergenic	novelGene_144338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	78.4071903590481	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTTTGTAAAAACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61843	90822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_61996_62131_62217_70367_70468_90024_90107_90575
847058	contig_7467_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_69477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTAGAATTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75878	74882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_74900_75900
847059	contig_14687_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_107961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	141	497	655639	655283	NA	20	TTGCAGAATTGTGGCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLRIRINLEITGYNSEDEIQFFNCHSFQLLLSRPSLGPTVPGLFRRSASSHCLTPFLAMFSLLDLGGSQCGDLRSKLRALLPALLDNSELPLKLSGISPFISLLLPPRPGTDQSPQ	655779	655241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_655200_655800
847060	contig_15820_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_174594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTACCGGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99164	99903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_+_99200_99900
847061	contig_6674_pilon	+	854	3	Intergenic	novelGene_147983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	432	770	47388	54189	FALSE	40	TGAAGGGTACCTCTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVWLEDREVALWLHVKGRFRCPRINRTPREAFERRRRVLLVRLALSLLQPRNNDWGTRPVIFCLDSPVSATLPPTSQKSGAGLAIGPGRVQPVRLKRAQGAARMLVVENDT	46956	54273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_47554_53369_53519_54165
847063	contig_17047_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_177554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCTCATATAATAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71172	70418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17047_pilon_-_70400_71200
847065	contig_6446_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_149189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240815	241741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_240800_241700
847066	contig_14363_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_112528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATCTAGTGGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135410	135100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_135100_135400
847067	contig_14375_pilon	+	551	3	Intergenic	novelGene_170692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCCGAAAAGAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77244	88566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14375_pilon_+_77558_88226_88418_88519
847068	contig_11656_pilon	+	1403	1	Intergenic	novelGene_53967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGTATAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157655	159058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_157700_159100
847070	contig_5836_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_106275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1258	1563	51455	51150	NA	25	TTTTGTTACTTAATTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCSLPLFSEHNPDCLGSINFVYRRLQNMGICGNLMDRLSWPHFTSASLLVMMDCYSRASKHRKTGIPSWKMLQNLQLYSLKPFTPVDSEPLLIHFLESLS	52712	51021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_51000_52700
847071	contig_4131_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_127901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	130	348	392091	392309	NA	70	TAATAAAAAAAAAAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPTGWWRRILQVLYHQIGIFGPLNNCIGRKKLTFFNDYHLLLGMITQDTWPTRPKLQQPPLRCEVSSFALRLCTFRISALSSSPGGRNSPANETPLLMSFKTARLRSCITKPRKI	391961	393000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_392000_393000
847072	contig_12761_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_164065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGGGTTGGACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335548	336934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_335500_336900
847073	contig_16666_pilon	-	1722	9	Intergenic	novelGene_61811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.95803989154981	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	165	1343	266449	239392	FALSE	35	TTTACACATTTCTAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLTPPLSNRPELRFQGRARLQLPAARGVPRTLTRVSGFVRPRQTRTRSRLRPEMSSNDSFLMAGIIYYSQEKYFRHVQRAAAMGLEKFTNEPVLQFFKAYGVLREERIQDAISDLESIQNHPDVSLCSIMALIYAHRHREAIDREAVQELESSLREVRKTASGAALYYAGLFLWLLGRHDKAKEYIDRMLKVSSGSREGYVLRGWVDLTSDKPHTVKKSIKYLEQGIQDARDVLGMMGKATYLMMQQNYSGALEVVNQIAVASASFLPALVLKMRLFLARQDWEQTVEMGQRILEKDEGNIDAHQILAVHELARDGNLTKAAEHVRNLIKALEMREPQNPSLHLKKILVISRLCGRQQAILRLVCSFMERIFLANPSHTHVAMELGYLFILQDQVKEASLWYSEAMKLDESSIASLTGLCKQGGWLVGGGCREPKRVLGRILLRG	266613	239012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_239671_240599_240699_242698_242784_256621_256780_260092_260216_262141_262309_264129_264241_265026_265157_266422
847074	contig_5201_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_82196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGGAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439599	439200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_439200_439600
847075	contig_13992_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_147638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCTGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473057	472476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_472500_473100
847076	contig_5136_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_126617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210004	210568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_210000_210600
847077	contig_11105_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_159813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTCCAGAGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217500	216417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_216400_217500
847078	contig_177_pilon	+	1190	6	Intergenic	novelGene_41786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	47.0786575849397	35	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	386	814	380699	382456	TRUE	10	ATTGTACTCTTTGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESAGLKVTRDLKAAVSAILQGYGDGQQSVTDASAELHRLCGCLELLLQFDQKEKKSFLRPRKDYWDFLSTALWQQRGDMEPSRFVRSQEKVSRAERLASGSMKGPCQQALSKHGLGGKQAYLRALSHPSLLPMTPTAPLT	378659	401127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_378744_379288_379464_380572_380742_380856_380964_382177_382611_400905
847079	contig_16831_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_134804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510874	510299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_510300_510900
847082	contig_12050_pilon	+	1917	10	Intergenic	novelGene_62594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	8.29249251424235	83	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	111	1424	162496	175134	FALSE	15	GGAGCCAGCAGGTGGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPGGPGGCASRHRATVEETARTVRCRVAQNGGFFRMDTGECLGNVVSDGRRVSSSRGLQNAQFGIRRDGTLVTGYLSEEEVLDTENPFVQLLSGVVWLIRNGSVYINESLATECDETQETGSFSKFVNVLSARTAVGHDQKGQVVLFHADGQTEQRGVNLWEMAEFLLQQGVVNAINLDGGGSATFVLNGTLASYPSDHCKESMWRCPRRVSTVVCLHEPRCQPPDCSSHGTCVQGSCQCMGRFWRGAACNELDCGPSNCSGHGLCTETGCRCKAGWTGSNCSEACTNGSFGENCAQKCQCRNGAACDPVRGTCSCPPGFTGDICTQECPHGWYGPGCQSPCKCEHQCPCNPRTGNCSLSWTPAMTSLTSQVNRCFPSPEATLRARELSYFTGTTWLVLTLTLVFLLLLSMAVNVTLLRGSRTERNRHLDGGYVYHPLREVNGELQQRRRSSWETLTALSRTEASVCPDGLS	162385	175627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_162612_163590_163731_164877_164987_165844_165974_168535_168742_168830_168879_172023_172153_172655_172788_173361_173426_174893
847083	contig_14684_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_99661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATGAACAAATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299487	299830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_299500_299800
847084	contig_11846_pilon	+	422	3	Intergenic	novelGene_105981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGCCCTTCCATTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339664	437121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_339946_356655_356764_437088
847086	contig_9363_pilon	+	1198	9	Intergenic	novelGene_6697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	29.6352830254749	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	165	1154	1284441	1287989	FALSE	25	CACCGTGAACACCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQKSSQWLGLRKQSELELPSELQREPEKDFSSVGESATRMGTGVRTESGTATSVEVDDDPGASLFPPPLPQPRICMWKYLDIHSMHRLEKTANVEEMREVLAELLGLSCPEQNLREAITLDLFSHALIFCRQQGFSLEQTSAACALLHDLHKACIATPLGNVEECYRYFISVLFCHGVRRPPFSIDLFNEEQLLALSDYVVNTYFRHFKLYKYVFTPQVRLDLSLTYVGLQPPKLWSEEKEGSEEAEEQAVTPQQQELEIVAQPEQESSQVSTLRAFIKTQLNKELGKLRQLVEEQLMASEERLSSKLAALEQPFQLPPGKGKTKTK	1284276	1288033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1284645_1284914_1284947_1285512_1285579_1285727_1285898_1286482_1286554_1286775_1286893_1286979_1287041_1287116_1287207_1287810
847087	contig_11986_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_69252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGCCTCATCTAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819338	819905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_819300_819900
847088	contig_6076_pilon	+	837	3	Intergenic	novelGene_81753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	4.5	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176707	306982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_176791_214127_214250_306350
847089	contig_8453_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_125152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGGTGTAGGCTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346246	345553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_345600_346200
847090	contig_1301_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_47296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATACAAAGAACATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262087	261792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_261800_262100
847093	contig_5643_pilon	-	457	4	Intergenic	novelGene_38988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	7	387	616525	615275	TRUE	25	TACAGAAACTTCCCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYMLGDVLRLSWSISLGSLLPSSLRLRPSKLSRSEGDCGRGSSCSVLVFLGALVSSLSLSEISSLRPCLLTFGVEASSTRAFLAVCLDFSALPSLLDVLTPPGEARPLDLSSSRGPGASFFRPLLIDI	616531	615075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_615145_615273_615415_615570_615685_616398
847095	contig_12689_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_145068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGCCACTCTCGCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573746	573491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_573500_573700
847096	contig_14923_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_157771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840245	840957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_840200_841000
847097	contig_18869_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_56479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTTGTAATTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248465	246930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_246900_248500
847098	contig_15888_pilon	-	203	4	Intergenic	novelGene_84447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088.91821955962	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGACTGACTCCACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254596	251612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251620_254021_254066_254198_254282_254527
847099	contig_15570_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_137861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGCCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704068	705068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_704100_705100
847100	contig_5361_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_167200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGCTATGGGGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224606	225803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_224600_225800
847101	contig_8683_pilon	+	1886	10	Intergenic	novelGene_150240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.9944143071143	14	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1878	9	1886	367879	464406	FALSE	35	GAGCTTTCCCAGCAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLEGLTKVVDPSQLTPEFDGCLEYNHEEWIEIRVAFEDYISNATHMLSRLEELQDILAKKELPQDLEGARNMIEEHSQLKKKVIKAPIEDLDLEGQKLLQRIQSSDSFPKKNSGSGNADLQNLLPKVSTMLDRLHSTRQHLHQMWHVRKLKLDQCFQLRLFEQDAEKMFDWITHNKGLFLNSYTEIGTSHPHAMELQTQHNHFAMNCMQNVYVNINRIMSVANRLVESGHYASQQIKQIANQLEQEWKAFAAALDERSTLLDMSSIFHQKAEKYMSNVDSWCKACGEVELPSELQDLEDAIHHHQGIYEHITLAYSEVSQDGKSLLDKLQRPLTPGSSDSLTASANYSKAVHHVLDVIHEVLHHQRQLENIWQHRKVRLHQRLQLCVFQQDVQQVLDWIENHGEAFLSKHTGVGKSLHRARALQKRHEDFEEVAQNTYTNADKLLEAAEQLAQTGECDPEEIYQAAHQLEDRIQDFVRRVEQRKILLDMSVSFHTHVKELWTWLEELQKELLDDVYAESVEAVQDLIKRFGQQQQTTLQVTVNVIKEGEDLIQQLRDSAISSNKTPHNSSINHIETVLQQLDEAQSQMEELFQERKIKLELFLQLRIFERDAIDIISDLESWND	367870	464406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_368386_370147_370271_372624_372820_384557_384690_398681_398913_414330_414454_434729_434922_457281_457452_458781_458957_464376
847102	contig_3942_pilon	-	600	5	Intergenic	novelGene_128834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	211.825842380008	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	32	544	1283364	1276273	FALSE	5	GCTTGAGTCCCTGCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTTSGTCPVGDCRVSVALRRSVKVWGPRAAAAGTGWRAGLRQSPGIPDRFSSKNSYSMLAMGIGTLLFGYWSMMKWNRERRRLQIEDLEARIALMPLIQAEKDRRVLQMLRENLEEEAIIMKDVPDWKVGESVFHTTRWVPPMVGELYGLRMNDELLNANYGFMWYT	1283395	1276216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1276393_1276599_1276670_1276972_1277045_1278040_1278120_1283192
847103	contig_1594_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_138829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTACACATATATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602214	602661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_602200_602700
847104	contig_11846_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_105995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAGGAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396052	394695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_394700_396100
847105	contig_5230_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_173234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAAGATTTATTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49878	50655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5230_pilon_+_49900_50700
847109	contig_6445_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_77048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATCTCTGCCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640788	641567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_640800_641600
847111	contig_4136_pilon	+	168	1	Intergenic	novelGene_161254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTACAAGAACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223244	223412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_223200_223400
847112	contig_18419_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_141456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCATGGAGTGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27193	26385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_26400_27200
847114	contig_5690_pilon	+	722	3	Intergenic	novelGene_119681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	76	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	33	311	327887	359144	FALSE	35	ATTATGTTATCTATCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSEECQLFNMEAEVDKLELMKNPVTLLKELSAIKSRYQTLHTRFKPIAVEQKETKGHICVILNKTMTMIQELQKLTDMELSPLTEEEKTAEKQLKSHMPDL	327854	359555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_327920_352195_352373_359075
847116	contig_12746_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_152185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATCTTCCAATATATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494080	495361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_494100_495400
847117	contig_1239_pilon	-	859	4	Intergenic	novelGene_150402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	1.24721912892465	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATATGACATTGTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480527	323148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_323672_324057_324149_347382_347533_480432
847121	contig_11096_pilon	-	927	4	Intergenic	novelGene_143460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	4.10960933531265	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAGTAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198630	193633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_194107_197780_198039_198137_198237_198533
847122	contig_15866_pilon	+	1258	3	Intergenic	novelGene_63614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	231	junction_1	10	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	174	338	388135	388299	FALSE	50	AAAATTAAGTGAATGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSKPTVDIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPHVHVEYEWNLRQEEMDESDDDLDDKVSVSEDFWFPTLYRKGAFFVRLTRATVFAQPLILVEQSLPPQS	386583	389219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_386614_386775_386844_388059
847123	contig_10958_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_5356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCCTTTGTGCCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802219	796057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_796282_802017
847124	contig_12948_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_126219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGAGGAAAGAAGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296554	294819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_294800_296600
847126	contig_6266_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_171012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAGCTGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876089	876577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_876100_876600
847128	contig_14208_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_129083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAATGAGCAGGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127925	129434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_127900_129400
847129	contig_17383_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_177556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAGAGAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241	2519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17383_pilon_+_1200_2500
847130	contig_10626_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_138193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTCAAACAAAACTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38484	39360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_+_38500_39400
847131	contig_12312_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_63980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTTGATTTGGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284609	286157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_284600_286200
847133	contig_8475_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_171097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	195	440	22085	21840	NA	30	TTGGAGGTTCTGAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQCFFYKSVPGEEALKRNFPESQNTSKLHGYIFRGVAFAGPEDSVTRKPSRQKRSELAPAAQLTMTEAKHAHQGEFPQPSCLRSTRPGFGGSMRGRGAVAKVDDLERELDELGQQMGRERYLSNISKLLISLGFFLSPFSYFLGM	22279	21215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_21200_22300
847134	contig_17274_pilon	-	1098	8	Intergenic	novelGene_26585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	343.736788243325	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	108	698	247024	232847	TRUE	45	GAGCACTGAAAATGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVRTRQNPVRRMSPGKPGAQHSEMDLVRRELL	259002	231602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237202_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_258905
847135	contig_10074_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_57114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATACACTTAACCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281731	280667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_280700_281700
847136	contig_5921_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_142244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186495	185213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_185200_186500
847137	contig_3015_pilon	+	1075	4	Intergenic	novelGene_163308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	16.3571255285137	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55060	261935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_55260_111293_111353_117616_117705_261206
847138	contig_6340_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_176633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.5	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCAAATTTTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16569	67864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_+_16660_64401_64480_67071
847139	contig_14722_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_110225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTACATCCCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105782	104532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_104500_105800
847140	contig_13780_pilon	-	897	3	Intergenic	novelGene_149006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTTTGTTTCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155691	149322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_150027_151208_151282_155571
847141	contig_13607_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_170187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCAGACACACTCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238163	238693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_238200_238700
847142	contig_14094_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_145907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251785	250081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_-_250100_251800
847143	contig_6595_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_122549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTATGTAGAAGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650384	649508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_649500_650400
847144	contig_12050_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_62607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCAATAAGACATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320264	319180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_319200_320300
847145	contig_14780_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_166382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTTTCTGTCAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26105	24873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_24900_26100
847146	contig_5261_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_102469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAATACAGACTACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543191	543910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_543200_543900
847147	contig_11285_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_5492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTCTGATACCTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110731	111656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_110700_111700
847148	contig_14332_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_173049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAATTCAACGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39628	38606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14332_pilon_-_38600_39600
847150	contig_6871_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_21610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTCAAACAATAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454888	454135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_454100_454900
847152	contig_8773_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_74529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43793	44210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_43800_44200
847154	contig_5894_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_83048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAGAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512590	511466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_511500_512600
847155	contig_1194_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_177557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161785	286750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1194_pilon_+_161864_286199
847156	contig_10958_pilon	-	718	4	Intergenic	novelGene_5355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	72.3064466159292	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTGTGCCGGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803430	796054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_796282_797033_797266_802040_802219_803349
847157	contig_3233_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_56610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTATGTATATTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970596	969916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_969900_970600
847158	contig_9415_pilon	-	854	5	Intergenic	novelGene_109812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	194.250482624883	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	162	593	1819921	1775274	FALSE	20	GAATCTTTCTGAATCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGARREDVLAAATGSAHAVQVRAPPPRALRDPRVTKSGSRGAAGASESPSLPKMPHRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPLNGSKWTYVGPDGERSWSKKYSSCGGLMQSPIDLHSDIIQYDASLVPLEFQGYNVSANEQFILTNNGHSVKLSLTPNMYLLGLPFRYSATQLHLHWGDQSNPHGSEHTISGRHFAAE	1820082	1775012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1775277_1776039_1776183_1777877_1778058_1811720_1811742_1819836
847161	contig_1406_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_25498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATGCCAAAAACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386556	1387000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1386600_1387000
847162	contig_2878_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_176496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTTTTCCTATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209949	208712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_208700_209900
847163	contig_8880_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_165759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACCAGAGTAGGGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74107	74924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_+_74100_74900
847166	contig_10477_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_112497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAATAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347291	345676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_-_345700_347300
847168	contig_7513_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_88987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378540	378114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_378100_378500
847169	contig_6163_pilon	+	707	3	Intergenic	novelGene_103860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	13	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGCATCTGAATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506951	508015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_507337_507598_507666_507760
847170	contig_9436_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_60914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	127	519	421895	422287	NA	20	GGTCGTGGGGAAGGGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGVWEKYIFHHILVSSNNFSPGESGDVLPIRDLLPDLSDGGGHQSITWGRNSLTPSHAFSFPLPSYLQFSTPCLPGTRATSALTALGVGKADLGGVDPCCLLGRDSKPHPCRTKEGERFRALFRYRASA	421768	423533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_421800_423500
847171	contig_2733_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_128586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATGTATATTACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841736	840776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_840800_841700
847173	contig_11160_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_168796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39565	38714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_38700_39600
847174	contig_9888_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_162269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTTGGATATCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140764	138729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_138700_140800
847175	contig_9799_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_145566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTGAAATTCAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000026	1001154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1e+06_1001200
847176	contig_21027_pilon	+	1236	4	Intergenic	novelGene_127572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	581.557869481237	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	209	535	6371	8128	FALSE	15	TATGCTTGCCTCCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVELTESRGGMFLGIHEGKLWLACVKSGDKITLQLEEVNITDLGRNKEEAKCFTFIHSQNGPTTSFESAAYPGWFLCTESEGDGPVSLTNKPGNATKVTQFYFHVEQ	1759	8829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_1879_5171_5261_6370_6482_7912
847177	contig_15327_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_70565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTCAATTGCCTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628851	628384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_628400_628900
847178	contig_3612_pilon	-	876	3	Intergenic	novelGene_87816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	264.5	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	384	773	878967	872327	FALSE	15	CAACTGGGATCGCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKRRYHNFFSPLLFQGTKKRSQLDLELEIENMGAHLNAYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKFV	879350	872223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_872337_874616_874816_878786
847179	contig_10196_pilon	+	687	4	Intergenic	novelGene_132162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	486.411576982109	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	103	318	1038364	1053929	FALSE	20	CTTCTTCAGCTCCACAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHCYETAEDLNDCLLLM	1034607	1054298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1053883
847181	contig_11396_pilon	-	518	4	Intergenic	novelGene_71410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	116.996676116128	445	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	238	396	1644531	1644244	FALSE	10	ACCCGCTCACTCTGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPPRRKSELGRRLSAECRRNQDDDFRCPVSKPGARFPRLVQQVFGGVSGRKNVTERNNGHPGQAEGAGVHSADRRLPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNSAKSEPKEGDVKDKKDEEEDMSLD	1649984	1644121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1644351_1644479_1644536_1648663_1648831_1649918
847182	contig_12021_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_172206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTACAAATTCTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284432	283589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_283600_284400
847183	contig_4364_pilon	+	625	2	Intergenic	novelGene_148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214701	1215542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1214751_1214966
847184	contig_13206_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_161889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAACCCTATGAGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75209	76327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_75200_76300
847185	contig_15376_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_154694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282692	283333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_+_282700_283300
847186	contig_3382_pilon	+	942	5	Intergenic	novelGene_124000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	250.428133403577	23	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGGACAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106064	118126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_106084_106907_107147_108767_108858_116177_116388_117742
847187	contig_57_pilon	-	1664	10	Intergenic	novelGene_44916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	22.0252380489091	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	72	1463	286146	273121	FALSE	35	ACACTTATTTTAAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTWAKSRCRSSCPLFLYSGGGYIRFTSSPGEKVFQVKISAPDEQFTRVGVQVLDRKDGSFIIRYRMYASYKNLKVEVKFQGQHVAKSPYILKGPVYHENCDCPLEDSAVWLQEMNCPEIIAQIQRDLAHFPTVDPEKLAAEIPKRFGQRQSLCHYTLKDNKVYIKTHGEHVGFRIFMDAILLSLTRKVNVEFFVNLGDWPLEKKKSNSNIHPIFSWCGSTDSKDIVMPTYDLTDSVLETMGRVSLDMMSVQANTGPPWESKNSTAVWRGRDSRKERLELVKLSRKHPELIDAAFTNFFFFKHDESLYGPIVKHISFFDFFKHKYQINIDGTVAAYRLPYLLVGDSVVLKQDSIYYEHFYNELQPWKHYIPVKSNLSDLLEKLKWAKDHDEEAKNIAKAGQEFARNNLMGDDIFCYYFKLFEEYASLQVSEPKIREGMKRVEPQTEDDLFPCTCHRKKTKDEL	286217	272919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_273139_274871_274980_276381_276472_278806_279017_280544_280783_280903_281064_282198_282281_282454_282661_284639_284846_286072
847190	contig_6302_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_171689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCAACACTTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73585	72409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_72400_73600
847191	contig_3009_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_132508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTAAATGCCAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46168	47215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_46200_47200
847192	contig_8608_pilon	+	1421	2	Intergenic	novelGene_177558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAATTTCTTTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291687	293184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8608_pilon_+_292579_292654
847193	contig_6215_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_21242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGATGATAAAAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581826	581386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_581400_581800
847194	contig_5337_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_136568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAAGTAGGGTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362066	361496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_361500_362100
847196	contig_2933_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_111296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTCCCCCGTTCTGGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193894	193119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_193100_193900
847197	contig_11816_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_98441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTCCTGCCCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288361	287775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_287800_288400
847198	contig_11816_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_98442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAATTTAATGTGTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289015	288520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_288500_289000
847199	contig_8069_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_136769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221542	220783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_-_220800_221500
847200	contig_20398_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_155200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCATATACCTGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82307	82047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_82000_82300
847201	contig_14289_pilon	-	842	6	Intergenic	novelGene_110558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	257.909286377982	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	78	731	66533	51527	FALSE	5	CCATGTTGTCCTCTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFGAAGPLQLRFSPYAFNGGTILAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKILEARLKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHIPLSLDRALSLVRDVFISAAERDVYTGDALRICIVTREGIREETVDLRRD	66610	51415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_52034_58618_58744_61210_61293_64645_64754_66468
847203	contig_3832_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_161464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCTGTGCTTCCATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363222	362485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_362500_363200
847204	contig_11370_pilon	+	796	4	Intergenic	novelGene_98763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	111	662	212210	214415	FALSE	15	GAGGGGGATTGTATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSCLRRVRSHPNRKPRAAPGEQGLLSPSAPSSRRPEMHRLHQRPARADRLPVPNCPKNPRDVSERAAAGQVLLELLPRLVGSGPPPEAPRAASLSRRASSVGILLRAEELILKKPRSELVFEGQRYRQGTWTAALCQSLGAAAPEVRCCVDVVNFVTESTREQEAASEEVSDWVRMGKALDNICFWAALVLFSVGSGLIFLGGFLNQVPHLPFPPCIQT	212099	214549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_212312_213796_213984_214065_214173_214259
847205	contig_4469_pilon	+	818	2	Intergenic	novelGene_21976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGACTGTCCGACTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933903	934771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_934602_934651
847206	contig_7080_pilon	-	728	5	Intergenic	novelGene_100094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGACTCCCGCCGTCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542181	460785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_460862_488492_488593_525759_525810_527212_527314_541780
847207	contig_2093_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_152956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027772	1027087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1027100_1027800
847208	contig_9177_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_32827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCACTTGCTGCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716095	1715605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1715600_1716100
847209	contig_11292_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_109440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATAGGGCTACCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322334	321980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_322000_322300
847210	contig_9017_pilon	+	662	3	Intergenic	novelGene_130344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76.5	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	67	660	609506	610317	FALSE	15	CTGCAGAGCGACCTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCCCCCCCSCWSLAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNL	609363	610319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609395_609470_609855_610072
847211	contig_18859_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_150560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	582	980	246646	247044	NA	60	GACTAGAAAAATAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLLVSQLDSKGKADILIFGWPYYQKYVAKMIMNLANYHHQRQMESTEKGSTPYAGTQQAPEQPRRLAVSRLQMLYRSELPSFEGISCPGAGAMHRLKWKPRLEPVLIGLASIPWVKNDGVEFFSFPLLNI	246064	247612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_246100_247600
847212	contig_5039_pilon	-	339	3	Intergenic	novelGene_64913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	3.5	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGATTAAAGCGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834575	829203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_829391_833781_833898_834539
847213	contig_5039_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_64912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGAGAAAAAGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829198	828359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_828400_829200
847214	contig_5136_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_126639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285573	286722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_285600_286700
847215	contig_5690_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_119740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGAGAATTTCAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045399	1046530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1045400_1046500
847219	scaffold_4805_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_161039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554670	555777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_554700_555800
847220	contig_15207_pilon	+	1394	4	Intergenic	novelGene_176369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.49443825784929	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	11	622	304188	320571	FALSE	60	TAGAAAAAAAAAATCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSMAASKKGSSCEVRETPKHPRQLACGERRLRLKSEMALHGCFSLKYPGNPQLGDLIEVFRPGYQHWALYLGDGYVINIAPLEDGIPGSFTSTKSVFSRKALVKMQLLKEVVGNDTYRINNKYDETYPPLPVEEVMQRSEFVIGQEVAYDVFDNNCEHFVTLLRYGEGISEQAKRAISAIGFVTAAASALSLLGLLPKSQRAKHF	304177	321343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_304290_310996_311136_315437_315707_320469
847221	contig_1964_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_130923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGTTTCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539708	540506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_539700_540500
847222	contig_2750_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_164483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTTATAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156660	155135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_155100_156700
847223	contig_10506_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_125180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91987	90851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_90900_92000
847226	contig_13700_pilon	-	282	5	Intergenic	novelGene_68286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	313.943068087193	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAGGAAAATGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163612	121790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_121824_123039_123164_132870_132924_163213_163239_163565
847227	contig_6048_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_73353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	81	317	2970137	2970373	NA	70	AAAAGAAAAAAGGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSADCWANPTAAPQRCPCLNPRDCDYMIQALDPEMRDWLGHLGGPIQSLKSLSGFGWGQQRAETSSAEQEGPRAEDACASRSWDRQGNRLSPGTSRRNVALLTP	2970056	2971654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2970100_2971700
847228	contig_10437_pilon	+	1633	9	Intergenic	novelGene_38102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.36358901432946	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	502	1083	65008	66694	TRUE	0	CTCTGCCTGCCCTGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYQKELEKYRDIDEDEILRGLSPEELEQLDCELQEMDPENMLLPAGLRQRDQTKKSPTGPLDREALLQYLEQQALEVKERDDLVPFTGEKKGKPYIQPKREIPAHEQITLEPELEEALAQATDAEMCDIAAILGMYTLMSNKQYYDAICSGEICNTEGISSVVQPDKYKPVPDEPPESHRHRGDPSEGSRQ	64506	68271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_65131_65321_65479_65785_65903_66390_66481_66599_66732_66825_66934_67227_67372_67628_67774_68155
847231	contig_8850_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_172439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTGTATGTTGATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278956	278563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_-_278600_279000
847232	contig_16882_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_148253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580710	581392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_580700_581400
847233	contig_7207_pilon	-	855	2	Intergenic	novelGene_72023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAACCACCGGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88352	75818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_76566_88244
847235	contig_14208_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_129084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATTTGCCATCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131157	130758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_130800_131200
847237	contig_7593_pilon	+	991	3	Intergenic	novelGene_127325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	7	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCACTAACTTTATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532362	608885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_532925_605926_606043_608572
847238	contig_11816_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_98486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAGAAGTTCTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478585	479087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_478600_479100
847239	contig_9995_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_47744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAAAAAGCCTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581884	582946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_581900_582900
847240	contig_3960_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_138023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCTACTAAAAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472958	472209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_472200_473000
847242	contig_7049_pilon	+	872	7	Intergenic	novelGene_171451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_6	9.28110386155057	136	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	74	694	276483	277962	FALSE	30	GCAGTGGTTAAAAGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPLSIPAPPAPPHPSPSPGQGVMVPPPLSPSLSPPLCTLPAGPGPPRFVCYCEEDGDRGSFNLYVTDAAELWSTCFSPDNLPALKARFGLSAAEDITPRFRAACERQGVTLTLQEDIASLTLSGGPWTLTFDLSKVPGPEAAPRLQALTLGLAERVCRLERRLAAAEETAASPKKSPPRPGPQLFLPDPDPQRGGPGPGVRRRCPGESLINPGFKSKKPASGVDFDDA	276409	278140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_276608_276686_276748_277068_277119_277195_277387_277481_277551_277715_277801_277922
847243	contig_17382_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_165195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCAGTTTTTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127322	127986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_+_127300_128000
847245	contig_12292_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_167017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGTTGCCCAAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345234	346290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_345200_346300
847246	contig_15120_pilon	+	640	5	Intergenic	novelGene_108004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	74.9545695738425	2433	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2	472	154288	164824	TRUE	10	GTTTTTCAGTCTTCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLSVCVGRLPAAFAPLPRPTTFAAVRSLSTALCPAGIRTRPGAPQPISMLVQVPGRVTQLCCQYSDAPPLTLEGIKDRVLYVLKLYDKIDPEKLSVNSHFMKDLGLDSLDQVEIIMAMEDEFGFEIPDTDAEKLMCPQEIVDYIADKKDVYE	154286	165767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_154456_160019_160143_161629_161718_164732_164833_165607
847247	contig_8907_pilon	+	598	3	Intergenic	novelGene_85825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGTGGAGTTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371190	378138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_371316_374571_374733_377826
847250	contig_10235_pilon	-	524	4	Intergenic	novelGene_46348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	75.8346153737783	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	92	301	131757	131463	TRUE	15	CTTTGGTTTCTAAATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQRMLPQPQEQQQKRPCPEVHPLLLRRAPEMSRMELQLRQNHGQLQSPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPPE	140427	130272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_131425_131535_131619_131761_140339
847251	contig_13272_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_163944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68682	69411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_+_68700_69400
847252	contig_9578_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_67988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	540	875	1184292	1183957	NA	30	CACTGCTTAAGTTTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMIVTNVFWGGYGIVCQHLEDLHNSGNQYFQNYQWMMLQTHVLLKDLFKVQDKPVNFNVTEYENFIDGILYSILQLSFKELPLVEFWCCIKEQCPELSEKPKILIPFSIT	1184831	1183522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1183500_1184800
847253	contig_5451_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_167176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGGTAAAGGCTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547231	546862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_546900_547200
847254	contig_6062_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_5292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATTTAGTTGTGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763230	762645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_762600_763200
847255	contig_2438_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_112084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAATTGTGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397745	397372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_397400_397700
847256	contig_6365_pilon	-	961	4	Intergenic	novelGene_133997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.3837877040079	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	234	659	12349	10077	FALSE	25	CTCTTGACTATGAGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKVAKKIKEKTKTPRKSSNQGRSCPVTSTTATQEGQEESERDAASTPVQENTAV	17674	9774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_11092_11194_12081_12368_17459
847257	contig_9579_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_150580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAATACATCTCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705588	703809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_703800_705600
847258	SIRV6	+	345	4	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	224	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAGTAAGACTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2740	10811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2829_3106_3152_7798_7924_10724
847259	contig_7976_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_169401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAAGGCTATCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688788	689270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_688800_689300
847261	contig_5917_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_122154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536696	535054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_535100_536700
847262	contig_3817_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_78346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAATCTATTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486486	486094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_486100_486500
847263	contig_8843_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_156639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATGGGGCACAACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21202	20771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_20800_21200
847266	SIRV6	-	425	2	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-617	55	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATTGAAACAATATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	2303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2622_3057
847268	contig_3426_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_57956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACACAAGTAGGTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421410	421734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_421400_421700
847271	contig_9345_pilon	+	653	4	Intergenic	novelGene_24488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	31.6333157709821	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	94	558	665237	666379	FALSE	15	TCTCATGTTTTGTAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAFALRSLYRARPALRCPPAELLWAPRRGYRLTPADDELYQRTRISLLQRESPHAMYIDSYNSCGFTVNGDRVFGPCALLPHSVVQWNVGSHRDITEESLSLFWMLEPRIACATFNFLCHEGRVTGAALIPPPGETALTPSLAQAAECTARN	665143	666474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_665314_665530_665724_665891_665959_666251
847272	contig_20234_pilon	-	1821	4	Intergenic	novelGene_174323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGCACCTGAGTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149959	115568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_-_115684_119303_119501_130021_130230_148658
847274	contig_8063_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_152440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	161	307	703916	703770	NA	70	ACAAAAATTTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLQRPTCFFHISLSLPPCCSHTGYLSDSPASQVLFQSRAFALLPSPLSPALYVMSAHPSCLSFKKSHSDHRPYKPSTWSRLPVSCLYILSYNLQLHIHLLV	704076	702795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_702800_704100
847276	contig_8544_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_55931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGCTTTAAGAGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139012	140340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_139000_140300
847277	contig_4486_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_38633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGAAAAAAAGGAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901573	902694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_901600_902700
847278	contig_9415_pilon	-	1038	2	Intergenic	novelGene_109873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_1	0	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	25	495	2030179	2027180	FALSE	40	TTACATGAATATTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAAVREGMSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVEVLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWRTLEEFSNEERVLFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQPVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY	2030203	2026636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2027366_2029894
847279	contig_7695_pilon	-	634	4	Intergenic	novelGene_41534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	211.538806526525	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	47	493	380076	378805	TRUE	85	AATAAAAAAATAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQDLQFLWQEWQL	381051	360040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_360166_378788_378840_379664_380089_381017
847281	contig_6227_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_49661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459611	460704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_459600_460700
847282	contig_7275_pilon	-	912	5	Intergenic	novelGene_111254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3.49106001094224	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	414	866	414505	413354	FALSE	45	AAAGCATCTGTACAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIRNDITLLKLARPARFSLTVSEVCLPNAEDDFPAGSLCVTTGWGKTKYSAIKIPEKLQQATLPLLSNTDCKKYWGSKITDVMVCAGASGVSSCMGDSGGPLVCQKNGAWTLVGIVSWGSSTCSTSTPAVYARVTELVAWVQKTLDAN	429484	413307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_413516_413984_414119_414348_414530_414755_414835_429174
847283	contig_9753_pilon	-	902	3	Intergenic	novelGene_41336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	395	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAAACATTCTCCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93363	85215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_85932_86172_86247_93251
847287	contig_12000_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_43198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCAGCAGTGACACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601592	602239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_601600_602200
847288	contig_5698_pilon	+	459	2	Intergenic	novelGene_54996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	730	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	20	364	4103	8117	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVKYLLHYQRMFCFYLPYPLGTLVRQTSLPS	4083	8212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817
847289	contig_12638_pilon	+	504	5	Intergenic	novelGene_33084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	767.519828734086	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAAGTCGTAGTCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170769	178102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_176888_176961_178085
847290	contig_11721_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_177087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGCAAGGGCTCAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112874	113571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11721_pilon_+_112900_113600
847291	contig_14275_pilon	+	981	8	Intergenic	novelGene_162884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	3.89138242053607	15	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	109	981	485135	626051	FALSE	30	TGAGTTCTTGGGTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLARLQGRSAIVGNQYYFRNNVADEFRKQENDAAVKIQSWFRGCKVRAYIRYLHKKVTIIQKWWRGYLGRQQYQLTVKIAYYTMKMNLYNAMAVRIQRRWRGYRIRKYCFNYYYLKEYLRAVSETNDAIREALEEFAEMKEREEKKTVLEREEKKRDHQARKMHYLLSTKQIPGIYNSPFRKEPDPWELRLRKAKPLTHRRAEVTQKCCINLGDWLACTSSRSFPRSEILPPINRKQCQGPFRDIAEVLQQRYKPLEPTLRVAEPISESKDAREAFRREEWARNINDNM	485026	626051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_485203_503456_503547_506173_506256_532672_532724_546845_546950_591801_591926_619815_620020_625901
847294	contig_12324_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_166651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCTTCAAGAAAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141305	142082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_141300_142100
847296	contig_16578_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_148624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTGATATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106875	106205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_106200_106900
847297	contig_8365_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_150923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAAAATCCAGTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178420	177352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_177400_178400
847299	contig_18272_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_7074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAAAACAACCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518970	519419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_519000_519400
847300	contig_13744_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_77157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGCTCTTTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188587	189566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_188600_189600
847301	contig_14953_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_137284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATTTTAAGAATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194056	195547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_194100_195500
847302	contig_6210_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_171879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCAGAAACAATATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64727	65858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_64700_65900
847303	contig_7870_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_109087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTAAAGGTCAGCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804972	805729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_805000_805700
847304	contig_9415_pilon	+	789	3	Intergenic	novelGene_109808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	454	789	1777991	1820081	FALSE	0	TCCTGGCTCCCCGCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDCIRPPQDEYFLDQLLSPSGPKKGAKTLPFSGAGLEGCSFKMTSSRTAAACRLRWGIFGKLGDSLAPAAPRLPLFVTLGSRSARGGGARTWTACALPVAAASTSSLRAPG	1753721	1820081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1754084_1777899_1778058_1819812
847305	SIRV1	-	211	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	3893	0	3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6747	6449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_6474_6560
847306	contig_10437_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_38399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAGGAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735034	734515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_734500_735000
847307	contig_15042_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_115442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGAACATGAGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64035	64333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_+_64000_64300
847308	contig_1301_pilon	-	445	5	Intergenic	novelGene_47264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.69258240356725	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	102	343	444	13507	8971	FALSE	60	TAAAGCAGGAAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYEDDEAGQKERKREDAITQQNTTQNEAISLLDPGTSYLLQEPSRTVSSRYKSTTTSSEEDTLSRYPRPDKSGFSRYNRDTNASGNLVSSSTLEKKIEDLEKEVVRERQENLRLMRLMQDKEEMIGKLREEIDLLNRDLDDIEDENEQ	45770	8969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_9004_13438_13544_15308_15457_33630_33666_45647
847309	contig_14326_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_120767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680706	679871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_679900_680700
847312	contig_4364_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_11	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	715	1260	209705	209160	NA	20	TCGTCTCTTTCATCACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGLFVRQPVMGKNVAWTRENSMCYRQNVAGDGENMTCDGENVARDGQNVVCDGENVVCDGENVTCDGEDVACDGEDVACDGEKVACDGENAACDGENAACDGENAACDGENAACDGEDVKCDAENVACDRQNVVCDGKNVTCDGENVECDGENVTCDGENVKSMKQIFLMGAKPIDSSI	210419	208872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_208900_210400
847313	contig_12464_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_68732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCTTACATTACATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382549	383963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_382500_384000
847314	contig_9177_pilon	-	1036	3	Intergenic	novelGene_32704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	79	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	124	762	496626	491889	FALSE	75	TCAAAAAGAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPRGGSRPACFLALGLALGSEARWQRLELYFKTLSKRKKQVMEKNGNNRKLRVCVATCNRADYSKLAPIMFGIKTEPEFFELDVVVLGSHLIDDYGNTYRMIEQDDFDINTRLHTIVRGEDEAAMVESVGLALVKLPDVLNRLKPDIMIVHGDRFDALALATSAALMNIRILHIEGGEVSGTIDDSIRHAITKLAHYHVCCTRSAEQHLISMCEDHDRILLAGCPSYDKLLSAKNKDYMSIIRMWLGMYQTLV	510595	491614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_492364_496462_496669_510514
847315	contig_15486_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_157317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTTAGTCTCATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99485	100158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_99500_100200
847316	contig_10235_pilon	+	856	5	Intergenic	novelGene_46566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	20.3776838723148	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	205	534	438713	440204	FALSE	35	TGCCAAATAAAGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPRGLFEDALPPIALRSQVYSLLPDRTVADRQLVLKACDGRPFAGAVQKFLASVLPACGDLSFQQDQMTKTFGFKDPEITQLVNAGVLTVRDAGSWWLAVPGAGKFIKYFVKGRQAVLGMVRKAKYRELLLSELLGRRAPAAVRLGLSYHVHDLIGAQLVDCISTTSGTLLRLPET	432664	440526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_432767_438610_438751_439591_439690_439801_439950_440158
847318	SIRV6	+	293	3	ISM	SIRV6A	SIRV608	377	4	19	162	19	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031
847319	contig_6658_pilon	+	765	7	Intergenic	novelGene_168401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	120.666206260632	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGAAAGAACAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145586	175372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_145783_156281_156404_162208_162315_169698_169836_170463_170526_174496_174578_175311
847320	contig_13744_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_77144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTCTTAGCAGACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112931	112534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_112500_112900
847321	contig_1637_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_142392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679908	679470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_679500_679900
847322	contig_3818_pilon	+	646	2	Intergenic	novelGene_99327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAGAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331715	1332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1332259_1332355
847323	contig_13543_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_177559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTGGAGGTTTGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204158	204838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13543_pilon_+_204200_204800
847325	contig_13409_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_128452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAAAAGGAAGCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87983	87565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_87600_88000
847326	contig_19777_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_29716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCGGGGTCAAGTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24691	23863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_23900_24700
847328	contig_9653_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_48170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117073	117973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_117100_118000
847329	contig_12540_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_148054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCGGCCTCCAGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186161	187715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_186200_187700
847330	contig_2455_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_119204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTAACTAGTCAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857677	858435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_857700_858400
847331	contig_4845_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_53724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	296	891	102	992	1228234	1229124	NA	15	AACTGTTGCCTTATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDVFYLFEPLYHVQNTLIPRFTQGKSPADRRVMLGASRDLLRSLYDCDLYFLENYIKPPPVNHTTDRIFRRGASRVLCSRPVCDPPGSADLVLEEGDCVRKCGLLNLTVAAEACRERSHVAIKTVRVPEVNDLRALVEDPRLNLKVIQLVRDPRGILASRSETFRDTYRLWRLWYGTGRKPYNLDVTQLTTVCEDFSNSVSTGLMRPPWLKGKYMLVRYEDLARNPMKKTEEIYGFLGIPLDSHVARWIQNNTRGDPALGKHKYGTVRNSAATAEKWRFRLSYDIVAFAQNACQQVLAQLGYKMAASEEELKNPSISLVEERDFRPYS	1228132	1229191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1228100_1229200
847332	contig_5551_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_134215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAGGAAGAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65116	66004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_65100_66000
847333	contig_6277_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_80390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	147	731	90564	89980	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKKTCTRMFIPALFTMARNSTSPTIHQQENGQIELYFIYNEERNHNSDCLWLGWGRSGNGDWVGEQGNWGDENVLYLYEDGSYTGIYIGQDSSNSTFKICAFLHINYTSLKQTSQKKPRQLLVWKESGSGEILPVDNISKGSWAPQGSCQASENCGLIMDSASCTEHSTQVPTTEAAGKAFNHNAEAERVKV	90710	89953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_90000_90700
847334	contig_18113_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_137521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTGTAAACTGTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84438	84107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_84100_84400
847335	contig_7412_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_76268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212727	212037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_212000_212700
847336	contig_2710_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_161786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971757	970980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_971000_971800
847339	contig_15952_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_154087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCGGGATTCCCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671787	672407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_671800_672400
847341	contig_4952_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_145548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATGATCATATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604548	605912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_604500_605900
847342	contig_13118_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_177562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGATTTTGGGTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14953	14069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13118_pilon_-_14100_15000
847343	contig_14522_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_147319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACAAGAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68331	67862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_67900_68300
847344	contig_1813_pilon	-	524	3	Intergenic	novelGene_105512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	670	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGCAGACCTGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423111	415705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415914_417583_417746_422957
847347	contig_4364_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_2955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533022	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
847348	contig_17_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_173980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTACTTGTCAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085953	1084301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1084300_1086000
847349	contig_16010_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_165258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGCAGACAGAGGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6452	5834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_-_5800_6500
847350	contig_2798_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_119987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAATAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773	169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_200_800
847352	contig_10437_pilon	+	944	2	Intergenic	novelGene_38182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	65	568	204544	205555	FALSE	20	AACTTCACCCCATCTCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWCGEGRLAHRDLFHPQNVDDAMSVLPKLATGLDVNVRFTGVSDFEYTPECSVFDLLGIPLYHGWLVDPQSPEAVNAVGKLSYNQLVEKIITCKHSSDTNFVTEGDVPPFLRNSCPCCMWREGPGWHKRFALDCQRLAVQTHPVALQKKGLAICFLKDDSQETPME	204479	205931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_204757_205264
847354	contig_5643_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_38981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGTGGTTTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552441	552916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_552400_552900
847355	contig_2684_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_172704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCATGGCTCCCCCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193121	193841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_193100_193800
847356	contig_6266_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_170980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCTGAAAGCCAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109957	110713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_110000_110700
847357	contig_17427_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_30379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCACATGAGTGTAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178129	177654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177700_178100
847358	SIRV6	+	270	3	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	19	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3042	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_10724_10799_11034
847359	contig_16098_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_46171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCCCAGGACTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514047	513759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_513800_514000
847361	contig_709_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_57524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGGAGTATGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1450582	1450119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1450100_1450600
847362	contig_205_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_144317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAAAAAGACTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283567	282589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_282600_283600
847363	contig_17427_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_30301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGGGAAAAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171854	171585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_171600_171900
847365	contig_6241_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_156433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTTTCTCTGAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308227	307588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_307600_308200
847366	contig_1301_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_47394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATAATGACTTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768856	768086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_768100_768900
847367	contig_935_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_45532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAACTCCATCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203782	205078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_203800_205100
847368	contig_16578_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_148650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTACGAACAATAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177320	176945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_176900_177300
847369	contig_9939_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_158601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGAAAGGGAAGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229185	229864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_229200_229900
847370	contig_14450_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_49005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATCAGCTGTCCATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118926	1119532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1118900_1119500
847371	contig_13982_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_163492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442415	443734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_442400_443700
847372	contig_3956_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_14717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTGTCTGGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219779	220952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_219800_221000
847373	contig_13409_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_128453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATACCTCAAAACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90236	91585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_90200_91600
847377	contig_9333_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_120332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAACAAATTGGCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373678	374454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_373700_374500
847378	contig_14362_pilon	-	994	7	Intergenic	novelGene_142515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	19.2324956490022	170	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	142	318	33047	32033	TRUE	10	TCTGAATGTGCCTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGDASAQGGRSCFWPRRWSELRYSGKEKTETILEQQRRYHEERERLMDVMAKEMLTKKSTLRDQINSDHRTRAMEDVRTQKAYTMCPFSHNYLAAAPGFGPRSA	33188	26331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_-_26634_27675_27732_30007_30119_30223_30389_31990_32120_32670_32719_33005
847379	contig_16999_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_84981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGGGAAGAAGAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91180	92257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_91200_92300
847380	contig_10627_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_60050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	144	575	1117613	1118044	NA	50	CTGAACTGTGAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHAEDVGSTQQPRLMVTVHDSGGHSPPPPRSPLPLGSGFSGVGDEELCVLPTVPYPPTPHLSFRNRARGWKDACESVGQLQKHPHLPAAMVLLSSALAQLTCLLADGRQRLVTGTVIPATLLGTQGGGESQVHPPPNLPIPQ	1117469	1118913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1117500_1118900
847381	contig_7894_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_170786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAACATAGAGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221994	220793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_220800_222000
847382	contig_8980_pilon	+	1227	6	Intergenic	novelGene_74018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAGAATATCTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670744	681073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_671395_672287_672387_677305_677424_678539_678682_680123_680317_681048
847383	contig_12050_pilon	-	1429	8	Intergenic	novelGene_62682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	179.098080528462	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	181	699	486455	471181	TRUE	60	AAAAAAAACCAACTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDELNFDLDRGRVSGGRPGRGGRRGR	511518	467311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_467670_470434_470485_470858_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
847384	contig_614_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_132646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGATAGAAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958632	960198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_958600_960200
847385	contig_9185_pilon	+	1262	2	Intergenic	novelGene_166892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGTGCAGTGGAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250786	252408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_250794_251153
847386	contig_7171_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_101407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATAAAATAAACCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417901	1418509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1417900_1418500
847387	contig_2125_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_147730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614326	613431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_613400_614300
847390	contig_13780_pilon	+	1307	7	Intergenic	novelGene_149063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	92.0810331537753	134	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	67	1125	641946	644556	FALSE	10	CCTCTGACTCCGAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALKLRFPAEDEFPDLSGHNNHMAKVLTPELYAELRAKSTPSGFTLDDVIQTGVDNPGHPYIMTVGCVAGDEESYDVFRELFDPIIEDRHGGYKPSDEHKTDLNADNLQGGDDLDPNYVLSSRVRTGRSIRGFCLPPHCSRGERRAIEKLAVEALSSLDGDLSGRYYALKSLTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDARGIWHNDNKTFLVWINEEDHLRVISMQKGGNMKEVFTRFCNGLTQIETLFKSKNYEFMWNPHLGYILTCPSNLGTGLRAGVHIKLPHLGKHEKFSEVLKRLRLQKRGTGGVDTAAVGGVFDVSNADRLGFSEVELVQTVVDGVKLLVAMEQRLEQGQAIDDLMPAQK	641879	644738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_642052_642287_642443_642531_642665_642937_643110_643847_643972_644101_644292_644377
847391	contig_15952_pilon	+	848	6	Intergenic	novelGene_154030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.07629703354	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAAGGCCTGGGCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62181	64672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_62237_62281_62364_62533_62670_63344_63519_63695_63810_64385
847394	contig_6199_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_126326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGAGCTACCACACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8851	8128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_8100_8900
847395	contig_15120_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_107997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGTCAGAAAAGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116315	117275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_116300_117300
847396	contig_4156_pilon	-	1133	2	Intergenic	novelGene_88117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAGTAAATTAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409677	408446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_408764_408861
847398	contig_8464_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_125364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATCCCAGTGATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144814	142937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_142900_144800
847399	contig_3601_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_132933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTACAGCAGCACTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389860	390295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_389900_390300
847400	contig_6823_pilon	-	603	3	Intergenic	novelGene_131203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTGCATTCTAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63724	62364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_62404_63067_63215_63307
847401	contig_9480_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_177208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGAACTACACCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341778	340607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9480_pilon_-_340600_341800
847402	contig_3942_pilon	+	703	4	Intergenic	novelGene_128789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.69967317119759	155	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTCCACCGTCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797103	799164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_797312_797619_797825_798333_798414_798954
847403	contig_1276_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_159773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGATTCTGTACATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193404	192627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_192600_193400
847404	contig_18395_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_177566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	227	451	40555	40331	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELERAATGPAPSAQRILLAALRSGPAVRCFCFGCRGRGCTLSAGLRPPEAPVGLGAASGPAETELEDEAAAAGRRMGANQLVVLNVYDMVSAAPWRPPAQPASSRRSYSDPGPWRFLPCVSASSSVHCAWGGGDVLLLFLNPRTRRSAC	40781	38905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18395_pilon_-_38900_40800
847405	contig_2684_pilon	+	1864	2	Intergenic	novelGene_172702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	360	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	585	887	150983	152132	FALSE	35	TCATAATATTTTGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDFFNAQMRLGGLTQAPGNPVLAVQINQDKNFAFLEFRSVDETTQAMAFDGIIFQGQSLKIRRPHDYQPLPGMSENPSVYVPGEWGCACRLLCPSALSL	150398	153109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_151094_151940
847406	contig_10126_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_105774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTATAAATATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352904	351798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_351800_352900
847407	contig_11016_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_163296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143343	141676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_141700_143300
847408	contig_3161_pilon	-	1056	9	Intergenic	novelGene_84544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.8587515271537	4	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	27	938	823108	703851	FALSE	75	ACTGACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQNNCYIWMEKRHRGPGLAPGQLYTYPARCWRKKRRLHPPEDPKLRLLEIKPEVELPLKKDGFTSESTTLEALLRGEGVEKKVDAREEESNQGIQRVLENDENVEEGNEEEDLEEDIPKRKNRTRGRARGSAGGRRRHDAASQEDQDKPYVCDICGKRYKNRPGLSYHYAHTHLASEEGDEAQDQETRSPPNHRNENHRRTGGMSPKQEHLSQGQGPAQKGPDGTVIPNNYCDFCLGGSNMNKKSGRPEELVSCADCGRSAPPPPPPPPLPLPGPLLCVYFSQHRSLDCGRPSSPTQLSSEKSRERPKFVQ	823134	703732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_704006_716135_716265_716669_716724_733002_733141_756445_756525_769150_769247_778950_779079_802410_802519_823083
847409	contig_6227_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_49692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAAAGAGCTCCTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924398	925825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_924400_925800
847411	contig_8145_pilon	+	170	1	Intergenic	novelGene_118668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCGTTTAGAAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884182	884352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_884200_884400
847412	contig_7051_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_64275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGCCAGTGACCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183880	184865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_183900_184900
847414	contig_16109_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_80322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACAGGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208654	207625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_207600_208700
847415	contig_10803_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_170126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGTCTCAAGACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103872	102711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_102700_103900
847416	contig_8330_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_71904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAGTGATGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153735	1154003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1153700_1154000
847417	contig_7513_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_88968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACACTTCATTAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227540	225542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_225500_227500
847419	contig_7119_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_40964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCTCCTATCATAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136228	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_136200_136700
847420	contig_15021_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_26995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATAAGAAGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409072	408676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_408700_409100
847421	contig_8561_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_161638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGGCGCCTGTCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120908	122058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_120900_122100
847422	contig_5945_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_104591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAATTAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325088	324128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_324100_325100
847423	contig_10299_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_79797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTCAGAGGTAACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759851	757852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_757900_759900
847425	SIRV5	+	376	2	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	1	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1220_10818
847426	contig_19402_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_80872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219710	219205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_219200_219700
847427	contig_13481_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_119461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAATGAGGTATTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200961	1200610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1200600_1201000
847428	contig_9375_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_136032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGCACCAAAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90974	89124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_89100_91000
847429	contig_11564_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_158576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	841	1227	74830	74444	NA	75	AAACAAAAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPWRELWRMIPAGQTAGDLWSVRRAVRRGGGNHGSLLDTGYLQRTRSQTTRRRRQLRTASGEELLGFLTRLPPVPGLGCRILECYWGMPPTSSTSHFEFRYYCTPEVAKTTKGYWGTSSTTYLVFIY	75670	73892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_73900_75700
847430	contig_7376_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_108101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTGACTGGTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318083	316444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_316400_318100
847431	SIRV4	-	262	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTCTGCGAAAACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	2509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2500_2800
847432	contig_6069_pilon	+	843	6	Intergenic	novelGene_8058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	41.8110033364424	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	374	841	422759	423785	FALSE	10	CGGCACCTTCTCGGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TREDTVRQIVAGLTGDSDGTGDLAVELSKTDPTSLETGQDSEDDSGEPEDWAPDPVDADPGKSSSKRRSSDIISLLVSIYGSKDLFINEYRSLLADRLLHQFSFSPEREIRNVELLKLRFGEAPMHFCEVMLKDMADSRRINANIREEDEKRPAEEQPPFGVYAVILSSEFWPPFKDEKLEVPEDIKGALDVYCKKYEKLKAMRTLSWKHTLGLVTMDVELTDRTLSVAVTPVQAVILLYFQDQATWTLEELSKAVKMPVALLRRRMSVWLQQGVLREEP	421278	423787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_421461_422036_422179_422709_422786_422866_423071_423306_423437_423678
847433	contig_6069_pilon	+	363	2	Intergenic	novelGene_8059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	3	362	423881	424437	FALSE	25	AAAGCCGGTCGGCTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRPEGGGAAALLDLHPGHADQPGEPVPGAHLQHATHVRHDWPCAGRDRPPGAAGLPAEEGARPPAHLLGRRLPPAQKLQLTPRPPPPRRRPGPPCGPSAFTGWTALGPSPQTHTACAD	423878	424438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_423915_424111
847434	contig_9389_pilon	+	878	7	Intergenic	novelGene_83901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1008.61429969813	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	393	836	164498	168343	FALSE	40	TAGGGAAAAAAAGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMGTNKCASQSGMTAYGMRRHLYDPKNHILPPMDHSTLVPTHPSDLHLIADVTGWPSQMTPVSLPCPLPRTAQGPPLKILLGTSPHQEPRDHEIM	159534	168385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164409_164540_165815_165933_166074_166183_168166
847435	contig_4519_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_123726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGGAGTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735804	734810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_734800_735800
847436	contig_16632_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_154134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCCCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88161	87699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_87700_88200
847438	contig_563_pilon	+	537	3	Intergenic	novelGene_169777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	65.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	123	449	719136	720513	FALSE	15	TAGTACCTGTCTGGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKSGKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK	716890	720601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_716985_719107_719288_720338
847439	contig_13349_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_161134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATATGAAAAAAAAAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308035	307539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_307500_308000
847440	SIRV6	+	227	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	70	486	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10723	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
847441	contig_6833_pilon	+	1046	5	Intergenic	novelGene_175130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	5.33853912601566	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	117	521	206380	211387	FALSE	20	AAGTTACTTTATCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPIIIGRKPGSTSSPKCLSPSPVDPDYPVRDTPSLNTMIMNSATSLKQAPILNPSMVTNEELGLTATASRTNISSSSLKDCLPQSAQLLKSVFVKNVGWATQLTSGAVWVQFNDGSQLVVRAGVSSISYTSPNGQTTRYGENEKLPEYIKQKLQCLSSILLMFSNPTPSFC	206116	211912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_206142_206288_206434_208461_208603_209953_210061_211284
847442	contig_5590_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_162999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTACAGGGTTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221151	220874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_220900_221200
847443	contig_4131_pilon	-	641	2	Intergenic	novelGene_127874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1201	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	28	408	240333	239953	TRUE	15	ATTCCTAGTATCTCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	240360	222795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_223020_239943
847444	contig_10197_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_115331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	1650026	1649718	NA	70	TTCAAAAAAAAAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRLAVDVWSTLADFCNILTAVNQSEVPLYKDPDDDLTLLILEEDRLLSGFVPLLVAPQDPCYVEKTSDKVSPRPNIPPHSPLLLILQTFFILGKFSVQTEHD	1650026	1648889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1648900_1650000
847446	contig_4009_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_145454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTGTACTTACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261956	260946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4009_pilon_-_260900_262000
847447	contig_5954_pilon	+	360	4	Intergenic	novelGene_28424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	217.435558780578	6	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	57	323	97851	98994	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCQAADAVQPAFCQCRAHLRQEEGPQCQLVSPL	97523	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98112_98896
847449	contig_8269_pilon	+	1562	1	Intergenic	novelGene_106243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAAATATTTTCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326728	328290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_326700_328300
847451	contig_11386_pilon	+	965	5	Intergenic	novelGene_82812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	2.8613807855649	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	27	719	120770	126294	FALSE	10	CTGGATGGGTTTGGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLRLLLLLSVTGLSRAHNTTVFQGVAGRPLQVFCPYDSSKHWGRRKAWCRQLGKEGLCQRVVSTHRSWLLSFLKRWNGSTAITDDILGGTLTITLRNLQAPDAGLYQCQSLHGSEADILSKVLVEVLPDSLDSQDPGDFWVPKEPESFEEAQMEHSISRSLSEEDTPFSHTSILLLLACIFLSKLLVASVLGVAAWRGWKLRTPPASELNHDRHPGHQLQTVTGLRDT	120743	126540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_120810_122341_122693_125218_125310_125990_126185_126277
847452	contig_16431_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_87601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTCGGCAGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66883	66356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_66400_66900
847454	contig_5247_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_81832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGGCTGTGACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371282	371759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_371300_371800
847456	contig_15453_pilon	+	756	4	Intergenic	novelGene_112479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	226.133195754675	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	15	419	6924	17148	FALSE	35	TTAAATATATGTGTGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVLMLAVGVGGQSERLAGRRRKMAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRKGDWQHHVWQKGD	6909	17485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17105
847457	contig_14519_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_66844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTCAAAAGAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396039	397336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_396000_397300
847458	contig_14792_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_170483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATTAAATTCTACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5465	4375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_4400_5500
847459	contig_4689_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_165410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAACTCCTCGCCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090873	1090561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1090600_1090900
847460	contig_11171_pilon	+	1068	8	Intergenic	novelGene_48585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	50.60410566549	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	197	847	112640	117446	TRUE	15	TTTCAGACCCCCCGGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPHTARRGACPASCLPAALSSLWSYRRSRTSPRAQRSQCRSFFHPKPVPGFQVAYVVFQKPSGVSAALALRGPLLVSTESHPVKTGVHKWISEYADSVLDPEALRAEVDTFMEAYDKKIAEEEAKAKEEEGVPDEEGWVKVTRRGRRSALPRTELASLRVLEREKRKRAHKELLNFYAWQHRETKMEHLAQLRKKFEEDKQRIELMRAQRKFRPF	110789	117984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_110866_112519_112663_114396_114524_115280_115399_115760_115859_116303_116503_117360_117560_117876
847461	scaffold_14128_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_169522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATTAAATACGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225348	224650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_224600_225300
847462	contig_15888_pilon	-	643	5	Intergenic	novelGene_84436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1061.08870976936	14	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	53	502	259726	251741	FALSE	10	ACATTTCGGCTCCTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKGAPGPWCANLQSHCPRIYPFSLSG	259778	251599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251817_253998_254066_254198_254282_254527_254685_259659
847464	contig_5816_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_158256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAATAACATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311746	311121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_311100_311700
847466	scaffold_4805_pilon	-	1254	7	Intergenic	novelGene_161030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_6	76.5014524190373	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	60	1151	533627	512332	FALSE	30	AAAGTCACTGTGTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGAGGVRPGRGALVAEVMASWAALSPSIVEYFEGEDFYRCGYCKNESGSLSRGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRVVRSSPPSSQFKATFQESYQIYKRYQMIVHKDPPDKPTVSQVSGPRAVLTCKRNFPLQLLSSYEFFLYLWYILFIVTLQHTCKEVGLN	533686	512228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_512605_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_533521
847467	contig_12050_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_62761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	432	399	830	786287	785856	NA	25	TGCATTAGACGGCTCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPGPWLQAGLERWQAPCGLCKSGAGLGPQRLRGMTLATSMEGEEGRTFSWNLPKQGIFLGWSSPSIRPSCPAKGHCQLQPRPHPLRVRPQTPHLSPQPPRHGLDLKLPVTWAGGGTLPFSESQSLHRKYRDRGPKGAHGLRS	786685	785855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_785900_786700
847468	contig_10197_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_115310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAACAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1372885	1371544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1371500_1372900
847469	contig_6960_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_60231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATTAATCCTAATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155336	154991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_-_155000_155300
847470	contig_13780_pilon	-	871	3	Intergenic	novelGene_149024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	39.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCATGTGAGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483697	468637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482_469541_483206
847471	contig_6175_pilon	+	650	6	Intergenic	novelGene_16287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_4	27.0584552404604	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	25	468	1389917	1401410	TRUE	10	GACGGGGTTTGTGTTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRGCGKMAAAIAASALTVTFGRLASACSRSILRASAPGAAPLWSAVQRLRSQSTSPPQGYVPKTSLSSPPWPEIVLPDPVEETKHHAEVVGKVNELIATGQYGRLFAVVHFAGHQWKVTSEDLILIENELDAACGERIRLEKKGSCSSRSHSR	1389892	1403462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1390017_1396154_1396213_1397764_1397851_1399127_1399292_1401374_1401479_1403348
847472	contig_12078_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_74122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGGTGACCCCATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502003	502955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_502000_503000
847474	contig_5021_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_167100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGCCAGAGAAAGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339141	338258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_-_338300_339100
847475	contig_4968_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_177567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGTGAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114701	115736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4968_pilon_+_114700_115700
847476	contig_160_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_156312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAACTTGTCAATGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11649	13067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_11600_13100
847477	contig_13295_pilon	-	926	7	Intergenic	novelGene_31220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	287.730439049391	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	223	843	85663	64782	FALSE	45	TTTGTGTTAAAAAACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGISYQRLVRAEQGLPTRRHRSSTVQMPPHARTLAGGAVWVGFCPHSPRPQRTAVCGCPAPSSPNKDHLT	134107	64698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_64921_67420_67491_79381_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_133898
847478	contig_5945_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_104535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	561	980	25471	25890	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPEKDSKLNATGLLRINQRLQILTTGTRLYHMEFCNSAPPITGPQLQLFLPIIHAFPRHKLKPCWRSALGNAHRHPTHCQLKSQRLMQPKELFYLISQISEVTQNYPSENSDSKNLGGTQASVFFKNSVRKSSVYNQG	24910	26079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_24900_26100
847479	contig_5566_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_153678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAACAAAAATAAAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231592	232479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_231600_232500
847480	contig_12964_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_131666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTACCCAGATTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169510	168373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_168400_169500
847483	contig_7357_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_36927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAATCAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642948	642209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_642200_642900
847484	contig_9871_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_75653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTTCACTCAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391093	391533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_391100_391500
847485	contig_3424_pilon	+	623	3	Intergenic	novelGene_55521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	22.5	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATTTGTCTCTAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235098	243979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_235320_237579_237794_243791
847487	contig_12837_pilon	+	533	3	Intergenic	novelGene_57285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	24	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAGTCTGTCGTCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60816	75788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_60982_75310_75447_75556
847488	contig_8712_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_58743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGTTATGCCCTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91460	92114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_91500_92100
847489	contig_5918_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_99561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	312	671	1712279	1711920	NA	35	GAAAAAAGTAGTCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCQPRAHGLDDCSFQGSKLLSQRVRLQAIKRRGSCDSSYKTSCKHRTLIPMMSLKTLDIQNGKGTEKFSLKNIILETSGERVKLSAPFRGRNFELNQVTKRSLQSRIANSWYLFTSTG	1712590	1711731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1711700_1712600
847492	contig_10437_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_38507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAACCTGAATTCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310802	1311766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1310800_1311800
847494	contig_563_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_169776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAAGTTTGCCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716861	717775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_716900_717800
847495	contig_12970_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_50520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAAGGTCAGCAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122691	121321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_121300_122700
847496	contig_12078_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_74099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTAATTCCCTCTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214170	215326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_214200_215300
847497	contig_709_pilon	-	1026	4	Intergenic	novelGene_57546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATTTCTTTAACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1523214	1511222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1512014_1515787_1515866_1520266_1520348_1523138
847498	contig_12074_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_53784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGCAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88005	90049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_88000_90000
847499	contig_10734_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_51320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATAACGGAAGCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489310	1488682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1488700_1489300
847500	contig_5643_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_38917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGGGTAAGAAATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354306	353705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_353700_354300
847501	contig_5083_pilon	-	1243	6	Intergenic	novelGene_151683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCTACAAAGAGGGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674747	653254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_653337_658027_658160_658762_658926_659474_659580_666159_666214_674040
847502	contig_7260_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_169142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355391	356470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_355400_356500
847504	scaffold_16539_pilon	-	1517	6	Intergenic	novelGene_68317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	197.156181744322	192	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	445	1293	144365	133848	FALSE	5	CCATTTCTTGTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPETRPNHTIYINNLNEKIKKDELKKSLYAIFSQFGQILDILVSRSLKMRGQAFVIFKEVSSATNALRSMQGFPFYDKPMRIQYAKTDSDIIAKMKGTFVERDRKREKRKPKSQETPAAKKAVQGGAAASVVGSVQGPVPGMPPMTQAPRIMHHMPGQPPYMPPPGMIPPPGLAPGQIPPGAMPPQQLMPGQMPPAQPLSENPPNHILFLTNLPEETNELMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFDNEVQAGAARDALQGFKITQSNAMKISFAKK	144809	133623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_134008_135191_135281_136121_136296_138729_138910_140940_141114_144292
847506	contig_17062_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_176827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18069	19194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17062_pilon_+_18100_19200
847508	contig_10811_pilon	+	1279	4	Intergenic	novelGene_165784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	21.483844059096	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1242	37	1278	90593	192910	FALSE	50	TCAAAGAAGATAGGTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSTFLKVGQSIMHGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDDESENSVKRHATSSPKNRKKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLNDLFGRFDRLCEETKCEKISTLGDCYYCVAGCPEPRTDHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEKKEMVNMRVGVHTGTVLCGILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLDDRYEMEDGKVSERLGQSVVADQLKGLKTYLISGQRAKESHCSCSEALLSGLEVLGGSRGSSGPRLQGTASPGSVSDLAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGTVQNGCQDEHRNSTKASGGPNSKAQNGLLSPPPEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAVVSLDQSALLPLRFKNIREKTDAHFVDV	90556	192911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_91335_178991_179183_191536_191642_192706
847509	SIRV4	-	581	4	FSM	SIRV4A	SIRV404	592	4	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14612	8322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13823_14592
847511	contig_6871_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_21618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACAGTAATTCTCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501636	500673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_500700_501600
847513	contig_34_pilon	+	1196	2	Intergenic	novelGene_40051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACATTAAAAAGTTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304216	309371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_304361_308319
847514	contig_6576_pilon	+	1062	9	Intergenic	novelGene_42458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAAAACAGAAATAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413716	1444392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1413808_1418725_1418801_1419054_1419180_1419652_1419825_1429087_1429246_1429943_1430019_1431806_1431876_1437728_1437833_1444199
847515	contig_8520_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_85453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTAGCTTTAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273599	274176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_273600_274200
847516	contig_12402_pilon	-	1272	2	Intergenic	novelGene_133342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	236	670	191044	190610	FALSE	45	ATTAGGTACTGACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEELTNLNWLHESKNLLKSFGQSFLRSVSPVQDLDDDTRPSPAHSDMPYDARQYPCYCTTRTPPYSFSCLLFMALEDSPTKHLLTKEIYSWIFEHFPYFANAPTAWKNSMRHNLALNNSFKKVSKERSQVSLPCLEPKLFFI	212070	190007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_191222_212012
847517	contig_854_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_36369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTGTGTATGTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975493	974692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_975500
847518	contig_6230_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_102081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTAATGGTTTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58559	57721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_57700_58600
847520	contig_12836_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_170413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCAATGGTGGTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40489	38962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_39000_40500
847521	contig_5968_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_112206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTCCTCACTAGGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677468	679032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_677500_679000
847522	contig_10902_pilon	+	1062	5	Intergenic	novelGene_65659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_1	377.147517557785	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	74	796	79192	100353	FALSE	20	TCTATTCTTGTCCTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPRGPRALRGHLRVFPSVCPSDMEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDLSKTAVDGTSENPFLDNPDAFYYFVSEKSYPCVLGVMGLPGQMLD	79118	100619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102
847524	contig_10064_pilon	+	592	4	Intergenic	novelGene_122729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.579052259116	60	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	123	470	395972	404100	TRUE	45	AAAGAGGAATGTCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQASFRGHMARKKIKSLLSPQFPSRDGCRVPFAVTRLPCRVCDPLLPTNPPASGAPLRPQETPPRQAPSRSRQVRALSVSSPV	395849	404707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403097_403894_404114_404598
847525	contig_990_pilon	-	1307	3	Intergenic	novelGene_76100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	339	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	657	1229	1366288	1365428	FALSE	60	GGAAAAAAAAGGATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCATKSPSAIADKVKSPKKLKNLKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNANVKSLQELCHMESKTGNRNSEPQQGNMSLAAPPHSNSSAAVPTYKNSGMAESVYKGNQKKENLSARSVPSSPVERKDKEESMFQVSYPSAFSKLIVSRQVGPLLTSQSWSSR	1366944	1365349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1365591_1365679_1365838_1366036
847526	contig_6724_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_167974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACCAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338261	339417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_338300_339400
847527	contig_9389_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_84041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCTTCAACCAAGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585646	585863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_585600_585900
847532	contig_19055_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_177570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGCAAAAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14313	13024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19055_pilon_-_13000_14300
847534	contig_8571_pilon	-	717	2	Intergenic	novelGene_169195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	54	377	547574	546860	FALSE	40	TTACTATTCCAACAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGVATGRQAEDALPPPTEPSLPETKPLPPSQPPTPVAAPQPQQSPAPRPQSPSGVKEEENYSFLPLVHNIIKCQQVWVLLPVWHTAECCGMCQLEGKKTNGNDT	547627	546519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_546957_547347
847535	contig_11986_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_69173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGAGCTTCCAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537487	538387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_537500_538400
847536	contig_6269_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_170544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTCTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303335	302505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_302500_303300
847537	contig_4689_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_165418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACCAACCAACCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218844	1218148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1218100_1218800
847539	contig_2854_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_120869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975666	974882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_974900_975700
847541	contig_9919_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_137962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACTTTGTTTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551984	551535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_551500_552000
847542	contig_9919_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_137961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCCAAGCATATGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551184	550581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_550600_551200
847546	contig_12106_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_83737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCTACAGAACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141465	142068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_141500_142100
847547	contig_10479_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_147109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAACATAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121418	122031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_121400_122000
847548	scaffold_16539_pilon	+	631	6	Intergenic	novelGene_68407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	101.086893314613	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908236	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913644_916024_916162_917177_917291_918487_918634_918749
847549	contig_5018_pilon	+	1566	3	Intergenic	novelGene_47122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	0	34	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	261	929	1444796	1446691	FALSE	5	CTCTGTGGGTTTTGGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGEQYSLPPETLGAYASSQGLVTGLLGPEEHPGWARPAPRPQAPDAFVGPTLAPTPEPKALPLQSVYPGPGAGSSGSYFPRTGFSVPAAPSAPYGLLSGYPTLYPVPQYQGHFQLYRGLTAPAPGPAAPPHFLSCLGPGTAGAGLGGHRSRHRRNRRDRAMQAQPALVGAQETGGAHVRAPRLRQELHQELPPEGASSHAHGREAIRLHVGRLRLEVRAL	1443673	1447328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1443717_1444578_1445407_1446633
847550	contig_3975_pilon	-	854	6	Intergenic	novelGene_54897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	17.2464489098481	402	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	65	634	2116028	2112991	TRUE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLEEPAPKPRSRLRASSQHPMDDKKKKRSPKPCLTQPAQAPGTLRRVPVPTSHSGSLALGLPHLPSPKQRAKFKRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFGKECSFEQLEHVREMQEKLARLHFSLDVCGEEEEEEEEDGVTEGLPEEQKKTMADRNLDQLLSNSCLVPLLTETSLSLC	2117398	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2113039_2113492_2113684_2113803_2113971_2115864_2116039_2117344
847551	contig_1369_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_176792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	90	644	1102553	1101999	NA	60	GGAATTTAAAAGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCIPIFEGYCLPHGVQQLDLAGLDLTNYLMMLLKDHGIMLLSTADGQIVADIKETCCYVATDYEEEMAKKPDYLEKVYQLPDGKTIKLHDQLFSCPEALFAPRLMNLEAPGIDKMCFNSIMKCDTDLRNSFFSNIILAGGSTSFLGLEKRLVKDIAKVAPANTPVQVTAPPERKMSVWMGGSIIASLSAFQDMWITAAEYKEVGPNIVHQRCF	1102642	1101226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_1101200_1102600
847553	scaffold_19766_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_34467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCTTTTTCCAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922128	921326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_921300_922100
847555	contig_10898_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_172767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAGTGAGGAGTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157517	158225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10898_pilon_+_157500_158200
847558	contig_10953_pilon	+	463	4	Intergenic	novelGene_42566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2797	junction_3	1672.18366880622	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	139	417	423231	426254	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	422546	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_422657_423202_423365_425213_425291_426186
847559	contig_7234_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_145943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438993	439479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_439000_439500
847561	contig_6576_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_42367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTATCAAAAACAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108493	1106779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1106800_1108500
847565	contig_5247_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_81837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAAATATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397506	396825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_396800_397500
847566	contig_5939_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_176253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGTGAGAATTCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406086	404672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_-_404700_406100
847567	contig_18113_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_137524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94287	94956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_94300_95000
847568	contig_7652_pilon	-	1246	10	Intergenic	novelGene_170950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTAAATCTCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49409	16378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7652_pilon_-_16452_43893_44002_44624_44712_44981_45052_47506_47697_47806_48119_48612_48712_48895_49030_49144_49253_49344
847569	contig_4769_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_117985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGGTATGCGCAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839812	841300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_839800_841300
847570	contig_11335_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_104924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACATTAAGGCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403658	404324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_403700_404300
847571	contig_5936_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_53578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTTATATCTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311960	313025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_312000_313000
847572	contig_16930_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_139165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCCCCCACCAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206644	207359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_206600_207400
847573	contig_11449_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_170553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129564	128966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_129000_129600
847576	contig_14640_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_168050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406924	406360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_406400_406900
847578	contig_18850_pilon	-	442	4	Intergenic	novelGene_142450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_3	178.068026951	9153	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	34	390	193164	190635	FALSE	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFLMIRRHKTTIFTDAKESSTVFELKRIVEGILKRPPDEQRLYKDDQLLEDAKTLGECGFTSQTARPQAPATVGLAFRADDTFEALRIEPFSSPPELPDVMKPQDSGSSANEQAVQ	193197	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_190748_191759_191866_192915_193051_193161
847579	contig_15939_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_160260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTAAGAAATAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102779	103410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_102800_103400
847580	contig_5041_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_27023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAAAAACATTGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273083	272227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_272200_273100
847581	contig_835_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_152123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46579	45802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_45800_46600
847583	contig_11709_pilon	-	883	4	Intergenic	novelGene_168226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	5.43650214343336	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	27	452	220594	186734	FALSE	25	CTATACCTCCGCATGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSSRDLSMEAAGAGTGVPVSRQEAPKPSDDRLFLVKGGIFLGTVAAAGMLAGFVTTLSLAKKKSPEWFNKGSMATAALPESGSALALRALGWGSLYAWCGVGVISFAVWKALGVHSMKDFRSKMQSVFPTIPKNSKSAVEWEEALKSK	220620	186302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_186833_211147_211286_219876_219978_220506
847584	contig_1143_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_86636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGCTGGACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317968	1319121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1318000_1319100
847586	contig_1301_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_47398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTTGGGATTAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772807	773726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_772800_773700
847588	contig_7840_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_69057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAAGGTGTTTTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444589	444124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_444100_444600
847590	contig_15501_pilon	-	1312	1	Intergenic	novelGene_177574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTAAAATCCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21508	20196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15501_pilon_-_20200_21500
847591	contig_7171_pilon	+	754	6	Intergenic	novelGene_101232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	450.371579920403	70	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	608	619	764826	764837	FALSE	15	GAGATTTCAGCTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPQVPRKSVSAAFSSRRRPSPSARTPPRRPSASGRRRPAQPGFCRVPKVVGRCRASLPRWWYNATDGSCQLFVYGGCEGNDNNYLTEDDCLKKCAGITENAVDVLAARGNGAESSLPSVPRRQDSDDLSSDVFDYEEYCTAKAVTGPCRAAFPRWYFNTEKNSCDNFIYGGCRGNKNSYQSKVEFSWLILNPPASFPITKVMFS	733701	764972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_733830_755585_755757_758614_758675_759911_759966_760540_760678_764768
847594	contig_14101_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_122748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	8	316	64524	64832	NA	25	CCACCATGTTGCCTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEMCQSFLKENSWNIFRNDLVRLLVESRQHPPFTPRQPKKRERCSLKSVTLNLSALDKKTKPNYPIFMAPQKYLPPLRIVERIKAPRPKIQELLPQYKNAGVLV	64516	64856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_+_64500_64900
847595	contig_5331_pilon	+	879	4	Intergenic	novelGene_112784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTCCTGAGAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248589	251790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_249119_249437_249578_250439_250563_251703
847596	contig_13894_pilon	-	794	5	Intergenic	novelGene_62203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	299.27527044512	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	188	577	751330	750013	FALSE	50	AAAAGATAAATTTTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766605	749795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_761484_761600_766578
847601	contig_5732_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_119586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	276	611	250495	250160	NA	30	ATTGGAAAAGCACCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHTPLPARPSCPPAPPPRTVLAPQMDKELGKAERRCEQGRERGSRHSCEFPSGLESTYSAPTPSRGIGELAQTILREGKARLWFCFLGDYCFLSFFKFLLEFCLLANSV	250770	250123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_250100_250800
847602	contig_8177_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_86493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCACCAATGAGGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36088	36764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_36100_36800
847603	contig_13863_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_42057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGTAGATGACTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360127	361109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_360100_361100
847604	contig_3942_pilon	+	405	4	Intergenic	novelGene_128793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	14.7648230602334	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	1	405	817864	820100	FALSE	15	CGTCTGCAGCGAGTGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVSACERGCRLFSICRFVAKSSKPNATQAECEAACVEAYVKESEQQACSEGCWSQPLELEADSDPELEQKRKVLEAPSGVLSLLELFSTLCNDFISSAQGFVSSTWTYYLQTDNGKVVVFQTQPVVESPRPEGL	817863	820100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_817967_818043_818154_819338_819492_820061
847605	contig_4364_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	188	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	113	652	1268714	1271052	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKTAPRLGESQIAKLKLPPVPPQEGWVASPRPPPELTHRHQTAPRQTKPVAKPYLAHLAWPEPRAWPVSIYCLHLCCLLGPPWPAFCHLYPALGATTHGQAPFPPDPARTDRDQAQSWEPSPVPLCPLPPVVASCLLGLRHLRQQRARPCFPL	1266993	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268692_1268798_1270596
847608	contig_11016_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_163301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGAACACACACTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230077	229706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_229700_230100
847609	contig_12810_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_145709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	271	348	630140	630217	TRUE	25	GTAAGTGCCCTCAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLAICVCCCFALNTLGAAVLPCELCPSEDRVRKALCLPCFKCSQWHAVLVDAVSRDAFPWSEHWGRSSRNRADLRPTSSHLTSANWPEALMAPVVWPAAQKPSENRSSTATQCVS	629869	630685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_630251_630533
847613	contig_19402_pilon	-	1222	10	Intergenic	novelGene_80870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	5.01109879279097	23	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	141	1034	221026	201032	FALSE	60	CTTCCTAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAPINPSDINMIQGNYGLLPKLPAVGGNEGVGQVVAVGSNVTRVKPGDWVIPANPGLGTWRTEAVFSEEELIGVPSDIPLQCAATLGVNPCTAYRMLMDFEQLQPGDCVIQNASNSGVGQAVIQIATALGLRTINVVRDRPDIQKLTDRLKNLGAEHVITEEGLRKPEMKNIFKAIPQPRLALNCVGGKSSTELLRQLAPGGTMVTYGGMAKQPVIAPVSLLIFKDLKLRGFWLSQWKKDHSPDQFRELILILCNFIRQGQLTAPACSEVPLQDYQRVLEASMKPFVSSKQILTL	233703	200843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_201190_202673_202747_202934_202996_206423_206498_208033_208137_209248_209352_212401_212546_220189_220322_220980_221079_233615
847614	contig_5999_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_45651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAAGTTCAGGTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269841	270043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_269800_270000
847615	contig_8375_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_141258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCATCTCTCCTGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11562	10628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_10600_11600
847616	contig_10042_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_79220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	205	627	1094897	1095319	NA	30	ATTTTGCTACACAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSSRVLRHRGRTQVQPEPGSGAVGSARGPRTGGDTPGHGFCYCPGSLKRKRSSGAFCYCHPDSETDEDEEEGDEQQRLLNTPRRYLGGRAHTGPLPHLLGHGAPPPRAPATRPGDEPSARCAWEVRRSPACKERTCP	1094692	1095996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1094700_1096000
847617	contig_9335_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_147427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64733	63583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_63600_64700
847618	contig_12644_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_44452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	509	877	348373	348005	NA	15	CCGGCCCCCTCCCATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKGQGRAGPEFCPREGAEAERADASEQLLQKRQARQRLLPMMGKGGPGPGNGCSLADVSPVIPQQKLGALSPVPGPACPLPLALAAPSDTSFRGKDSSSKNRSPHPHTSSNTQQEPGSKQL	348881	348003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_348000_348900
847619	contig_5084_pilon	+	1304	8	Intergenic	novelGene_64602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	27.5214202291337	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	21	416	982509	1017294	TRUE	75	ACAACAACAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARVITMAVTKELLQMDLYALLGIEEKAADKEVKKAYRQKALSCHPDKNPDNPRAAELFHQLSQALEVLTDAAARAAYDKVRKAKRQAAERTQKLTERRKKVKLDLEAREREAQAHGNEEEEETRSTRTLEQEVAEP	982488	1019152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_982587_1014389_1014460_1014754_1014814_1015070_1015159_1017086_1017173_1017279_1017482_1018060_1018105_1018495
847621	contig_11396_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_71419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCGGGGGAGGGGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664799	1663714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1663700_1664800
847622	contig_6069_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_8069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	261	786	226	1011	519298	518513	NA	35	TAAATAAATGCAGTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLVSGFRLQGVRGLPPGPVGPTPCAGEAWGGGGCCVMGVDQAGSAIPHLVPVAFDRFGATAPLQLSRVGIQPPHLVRGRPRALAPRCTPASAALAPLLWTPERTANLPPLLPRPLLLSRSVPARLTTALGPHRAAPHCRRCPQGKGNVETSRELTKLDPGETLGSSCLTTVEPEPGRRLGSTQTLQTSHSNYALGPCFQPPAVQQRAWGGGVVSGARVLPTAWYTGAAADHSCSQYANSLYTSVVNWVLLRQLIFKLFI	519523	518217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_518200_519500
847623	contig_4364_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_4480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGACTTAAATCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533316	1533107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
847624	contig_13456_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_153284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTTATTAACTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294250	293799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_293800_294200
847625	contig_10985_pilon	-	1155	3	Intergenic	novelGene_175544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	713	1057	110441	110097	FALSE	30	CCAGAATGCATCGCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLSASNASDPRTGRPPALGAGSPPELRSPAEGNRFRAPRVSSSHSQPCGSRTRLSCCNQRQDRPIVLARRGFLNPGSARPGWPWPSAPGPVTLSCLRTNPEKRAARSRGENE	208916	109998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_110966_192199_192302_208830
847627	contig_8210_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_30256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153222	152736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_152700_153200
847628	contig_5815_pilon	+	382	5	Intergenic	novelGene_141229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	161	junction_3	14370.0865515835	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040934	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1044198_1045493_1045607_1045993
847629	contig_10404_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_138688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGAACAACACTAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106395	1107385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1106400_1107400
847630	contig_17344_pilon	+	699	2	Intergenic	novelGene_169591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69401	85391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_69762_85052
847631	contig_5084_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_64625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	52	300	1274926	1274678	NA	30	ACAAAGTCAGCATCTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRPTPIRCWSGCGHHPMSDSPPAKPGTGQPAPRACTTTCAVSRGLCCRTCCRSISWTFPSLPTLCRMSPGRPVTSDHGYRASSYWGLSTVTASCAEKP	1274977	1273945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1273900_1275000
847636	contig_14643_pilon	-	1797	1	Intergenic	novelGene_99131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	482	796	68872	68558	NA	30	AAAACTCTACCCTCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVSSMTSVILNLKKNLFVLVDSNF	69353	67556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_67600_69400
847639	contig_9440_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_59026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGCGGTCTCGGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239651	238919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_238900_239700
847640	contig_6079_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_160088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTGAAAACAACAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418208	417868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_417900_418200
847641	contig_6088_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_161269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAAACACTCATTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121249	120501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_120500_121200
847642	contig_5153_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_74352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATCAAGGAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954588	955495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_954600_955500
847643	contig_19545_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_170831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGCAAATCCTTTCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4271	2972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_-_3000_4300
847645	contig_2550_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_135676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCTTTCAGTAGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314661	1316598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1314700_1316600
847646	contig_5018_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_46968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTAGTTTGTCTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435181	434942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_434900_435200
847647	contig_14807_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_124740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAAAAAAAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254302	253609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_253600_254300
847648	contig_2770_pilon	-	699	3	Intergenic	novelGene_107502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	492	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCGTGCAAAAGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835279	830371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_830488_831484_831709_834920
847651	contig_5815_pilon	+	576	5	Intergenic	novelGene_141216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	405	junction_3	293.191383741064	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	115	576	566561	571776	FALSE	45	AAGACAGACCTGGAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAI	564350	571776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_564448_566543_566635_566892_567037_567804_568014_571741
847652	contig_14375_pilon	+	1063	2	Intergenic	novelGene_170691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAGGCAAATACATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77189	92270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14375_pilon_+_77558_91575
847655	contig_17212_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_88605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTTACATTAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63905	63300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_63300_63900
847656	contig_2414_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_158473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	161	466	221655	221960	NA	65	CGGAGAACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGTCCWSVWFAGTALGNGGFECFGFSSLTRAQKIHGDSQASPGAAPSASQPDKSHGPFFKEASSSRMKCGAVSFRGIDLTTATVNRVLWIHSTKSEIAV	221494	222743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_221500_222700
847657	contig_8801_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_66294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAAAATCATCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516692	517660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_516700_517700
847658	contig_11978_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_62882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTTAGGAGGGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661890	660772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_660800_661900
847659	contig_7840_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_68994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTGCTCCATGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244227	243293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_243300_244200
847660	contig_14740_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_174682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCCCCCCAAACAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41489	42043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_41500_42000
847661	contig_15114_pilon	-	685	3	Intergenic	novelGene_121164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3.5	201	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	8	346	204839	180686	TRUE	20	CCTTCCACAGTGAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRMKRWLGVVRVSACAHSRQCQFRGWLRTLRRTKGSEAAWLRAAGQRQPPTVNLAEKQNQPHTCISERGLSASPHSSGRGRPDPNPVTPVSQASSGLDRAPSGHSSSRDPVPSL	204846	179203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_179476_180618_180773_204587
847662	contig_8354_pilon	-	1504	2	Intergenic	novelGene_24088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGGCGACCAGGACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169374	166040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_166506_168335
847663	contig_15543_pilon	+	1057	3	Intergenic	novelGene_164360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	79.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	10	333	194078	202198	FALSE	75	AATGAAAACTAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYLMVGHKNEHARRYLSKATTLERTYGPAWIAYGHSFAVESEHDQAMAAYFTAAQLMKGCHLPMLYIGLEYGLTNNSKLAERFFSQALSIAPEDPFVMHEVGVVAFQNGE	194068	202922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_194119_194564_194691_202041
847666	contig_11742_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_166550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAAATTAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164681	164413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_164400_164700
847667	SIRV4	+	255	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1516	632	1061	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2516	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
847671	contig_7635_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_171362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCTTATGGGAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65088	65769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_65100_65800
847672	contig_17194_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_155381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATCTACACGGTATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288469	287420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_287400_288500
847674	contig_12636_pilon	-	2273	9	Intergenic	novelGene_177575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_8	191.007689635784	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	680	2272	141453	98303	FALSE	70	TTCAGAAAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLVTKVASVSAVPKLSSGPRLPAPQMVAAAKAPNTTILLPANFQLPPGTVVIKSNSGQLMLVSPQQALPRGDTTGNIISRPAVPANTQTVKTCMMPNSSSQLIKKVAVVPVKKLAQTGTTVVTTVPKPSSVQSVPVPTNVVTVTPVKLLNTVTTPEPSSFGVSPTPSSEPNLKTENSAVAQTRLSPMMLENVNKCKNFLAMLIKLACSGSQSAEMGQNVKELVEQLLDAKIEAEEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVIALRQLIPNSQSFIQQCVQQTSSEVIIATCTTAVTSSPVVTTAASSIQSEKTVIVSGVTAPRTVSVHTQNPLAGPGGANTGVVTLHSVGPSAVPGGTTAGTVLLQSSKPLVTSVPNTVTTVSLQPEKRVVSGTAVSLALPSVTFGETSAATICLPSIKPVVSFSGTTSDKPVVDAAVQIKLAQPNSILSQPPGIPQTVKVKQLVVQQPSGGIAKQVTTLSHSSALTIQKSGQKKMPVDTVISTSPFSPASILKQITLPGTKVLSLQASA	142132	98301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12636_pilon_-_98365_99251_99388_113561_114180_122952_123043_126454_126578_126849_127012_130809_130918_132155_132302_141305
847675	contig_8576_pilon	-	581	4	Intergenic	novelGene_88772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	8.83176086632785	239	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	17	349	778100	772655	FALSE	0	TTTCCTTGTTTTTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLAVLMGQGHRVAELILHHARASECRDVEAFKAEMATLVSQARKNTVTLEKLQVSSLLSSVFQLLMTHQVKLESNFASIVFATMVLEGLGRSLDPKLDILEAARPFLIGGPGSFP	778116	772422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_772796_775534_775589_776555_776685_778091
847678	contig_17897_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_153398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGTAGAGAGTCCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25294	26787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_25300_26800
847679	contig_15108_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_131192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATTTTCCTTCATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161722	161384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_161400_161700
847681	contig_1339_pilon	+	1172	2	Intergenic	novelGene_163160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	170	763	689361	689954	FALSE	15	CTTAAGAGTTGGTCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPPLVLSLLTWRRQLLGDTQRPRPTATCNYEVIPGPFRSRPDGRGCCTRPQPPLRMLVLSLPCPQSQALPSLEAMEASPPRTGRSPEPGPSSSTGSPQTSSPPRPNHYLLIDTQGVPYTVLVDEESQRGSGAEGAAAQKKCYSCPVCSRVFEYMSYLQRHSITHSEVKPFECDTCGKAFKRASHLTRHHSIHRAGGGRPHGCPLCPRRFREAGELAQHSRVHSGERPFQCPHCPRRFMEQNTLQKHTRWKHP	679997	690363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_680148_689341
847682	contig_3822_pilon	+	1744	12	Intergenic	novelGene_133282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	107.69945939381	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	311	805	148325	199352	TRUE	35	GAGAATTTGTTCAGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEKIRSLRRDHKPSKEEEGDLLEAGDEEAAAALGGTFTGGRIGTGGSGKGGKACHKIFSNHHHRLQLKAVPASSNPPGAPALPLHNSSLTTTSQSPAALTGTNSIAVVADGGGCPAHYPVHECVFKGDVRRLSSLIRTHNIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKG	148014	260396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_148773_195219_195266_199351_199457_204090_204177_204456_204503_210473_210541_214473_214619_221459_221592_224170_224298_255392_255473_256813_256913_260343
847684	contig_5954_pilon	+	422	3	Intergenic	novelGene_28817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_2	45.5	172	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	122	421	1547968	1556815	FALSE	40	GAATCATGTTCTCAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLIEIFRPFYRHWAIYVGDGYVVHLAPPSEIAGAGAASVMSALADKAIVKKELLYDVAGKDKYQVNNKHDDKYLPLPPSKIIQRAEELVGQEVLYKLTSENCEHFVNELRYGVSRSDQVRDVVMTAGIAGVGLAAIGLI	1542655	1556816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1542745_1547935_1548205_1556752
847686	contig_9552_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_167942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTCTGACTCTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189408	189889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_189400_189900
847687	contig_4364_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_8	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	163	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193590	191474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_191758_193300
847692	contig_5031_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_133165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCTATAGGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10801	10303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_10300_10800
847693	contig_1372_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_140504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGGTGTCCAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397578	397068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_397100_397600
847695	contig_7171_pilon	-	817	3	Intergenic	novelGene_101211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	109	junction_2	18.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	151	459	179620	177226	FALSE	0	GCGGCGGCTGTGCCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQTAAEWAEILALQKQFHSVEVHKWRRILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDSQPRPDDSFS	179770	176867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_177319_179322_179444_179525
847696	contig_6842_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_130822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTCCTTTCTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767687	1768171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1767700_1768200
847701	contig_9571_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_136267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGTTTTAGAAATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386157	387474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_386200_387500
847704	contig_5791_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_35817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTCGACAGTTCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364624	363543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_363500_364600
847707	contig_14030_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_62247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTACGGTTAAGCTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371851	373391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_371900_373400
847708	contig_6441_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_172881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATAGTATTTGTTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243044	242073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_242100_243000
847709	contig_27_pilon	+	1509	6	Intergenic	novelGene_175813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	16.451139778143	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	718	1308	94752	106959	FALSE	30	ACCTAGCACAGCCTTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPADPFAIVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKRETLEKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKENQREKEKLEAELATARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEEVWCLQVTNEHGRWESQKSQALDSPFW	68418	107160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_27_pilon_+_68673_76391_76470_94366_94878_99521_99667_100653_100747_106732
847710	contig_10766_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_151227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACCTTTTTAACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210796	211556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_210800_211600
847711	contig_12079_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_67363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGAACTTTTCCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274203	274438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_274200_274400
847712	contig_8964_pilon	+	371	4	Intergenic	novelGene_168714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	314.262098679855	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	26	319	552689	568043	FALSE	30	ATCAATGATTTTGACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKPRCVRLMHFPVICIRSVDFSRLILPENEAWRKKKKRGIQNGSFPGTVDVQGCGHRILSGGVGMPGPCSEGFVQGRDVGELQEPGLPGYLCCMCHQAITTNRDY	552663	568095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_552718_553794_553881_557390_557518_567991
847714	contig_7066_pilon	+	733	6	Intergenic	novelGene_42121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	1.93907194296653	196	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	261	614	603276	608232	FALSE	30	AAACTGTATGCTGAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTGTICSLLLLSVLWVDLAMAGSSFLSPKHQKVQQRKESKKPPAKLQPRATEGWLHPEDGSQAEGTEDELEIRFNAPFDVGIKLSGAQYQQHGRALGKFLQDILWEEAKEAPADK	599500	608351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_599588_602463_602608_603246_603384_603607_603725_607154_607264_608212
847715	contig_17134_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_171593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCTTACAAATTAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149	1420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17134_pilon_+_100_1400
847716	contig_9235_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_156238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGGTTTATCTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149417	150422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_149400_150400
847717	contig_3602_pilon	+	809	9	Intergenic	novelGene_60692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	274.676059204293	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	10	585	1360465	1369951	TRUE	10	CGTCACCTCAGGCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGSSGGGGRPCSKSAADSGFLGLRPTSVDPALRRRRRGPRNRKRGWRRLAQEPLALEVDHFLEDVRLQERTRGGLVSEAPDEKLFFVDTGPKEKDLKKRTKGQKKSLLLSNGAGRRLPGPCGCSGLHSGPPSSGTSSSSSCAGSRPRWRSGWQSWRGGGSSGGCSGWLRRTSPTGWGGSSIRPLTSMCS	1360455	1371971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1360689_1361999_1362065_1365074_1365121_1368948_1368982_1369366_1369543_1369919_1369987_1371411_1371489_1371591_1371649_1371916
847719	contig_5649_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_82384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCTTTATATTAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075879	1076701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1075900_1076700
847720	contig_3956_pilon	+	297	3	Intergenic	novelGene_14786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGCTGGTGCAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097055	1100894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1097133_1098606_1098735_1100802
847722	contig_2114_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_104263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	42	371	492039	491710	NA	15	ATAGTTGCTGCCCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAVWFDQCDPSSMSEHRGGSYWLHQESVQKGVTSELGFEAQIEVHQADEEGRVFHVEGTIDVKAREYYVSSIPPIPPSIDSVVPIWAGAVPLPGPGQLDSSLALGSQYHFFSHPGNHWKTL	492080	489893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_489900_492100
847723	contig_18850_pilon	-	1193	13	Intergenic	novelGene_142402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	20.9978504190839	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	96	1121	48665	46150	FALSE	10	ACGTTTCTTCCATGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAVPHAVPLGQMEVFQALQRLHMTVFSQSVSPCGKFLAAGNNYGQIVIFSLSAALSSEAKEESKKPVVTFQAHDGPVYSMVSTDRQLVSAGDGEVKAWLWAEILKKGSKELWRRQPPYRTSLEVPEINALLLVPKENSLILAGGDCQLHTMDLETGAFTRALRGHTDYIHCLALRERSPEVLSGGEDGAVRLWDLRTAKEVQTIEVYKHEECSRPHNGRWIGCLATDSDWMVCGGGPALTLWHLRSSTPTTIFPMRAPQKHVTFYQDLILSAGQGPCVNQWQLSGELKAQVPSSSPGLLSLSLNQQPAAPECKVLTAAGNSCRVDVFTNLGYRAFSLSF	48760	46077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_46231_46303_46439_46520_46632_46733_46797_46869_46920_47001_47105_47190_47263_47388_47438_47519_47558_47642_47747_47835_47901_48015_48132_48626
847724	contig_14514_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_137473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59791	57967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_58000_59800
847725	contig_11258_pilon	+	399	5	Intergenic	novelGene_67747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3773.42013298281	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATCTTCAGTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49210	53618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49280_49379_49422_50092_50215_52768_52872_53555
847726	contig_513_pilon	-	1197	3	Intergenic	novelGene_80147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	247.5	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCATGGTGAGATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416625	413611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_414538_415123_415208_416438
847727	contig_4385_pilon	+	1218	2	Intergenic	novelGene_141508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACAGGTTTTAGTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349842	351768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_350656_351363
847728	contig_13295_pilon	-	793	7	Intergenic	novelGene_31221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	263.430361871132	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	94	714	85663	64782	FALSE	40	GAATTTTGTGTTAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGISYQRLVRAEQGLPTRRHRSSTVQMPPHARTLAGGAVWVGFCPHSPRPQRTAVCGCPAPSSPNKDHLT	134766	64702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_64921_67420_67491_79381_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_134686
847729	contig_16385_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_86203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTACAAGAATATACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37120	36751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_-_36800_37100
847730	contig_12078_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_74119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCTTTTACTCGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463121	464054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_463100_464100
847731	contig_9753_pilon	-	765	6	Intergenic	novelGene_41328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	336.303077595195	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTTATGGGGTACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93365	69993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_85787_85932_86172_86247_93282
847734	contig_12010_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_160940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGGAAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127576	128588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_127600_128600
847735	contig_14443_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_126677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32688	33559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_+_32700_33600
847736	contig_9870_pilon	-	869	5	Intergenic	novelGene_177577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	7.84219357067906	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	31	624	27802	7226	FALSE	30	AAATATGTTTACCTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQTVTYSELNLAKKPKRQQIKPKDADSSFSVTEREITYVELNFHNASQDLQKKDTNSHCKAIGMMDENRTQKANHCHRCPEDWFSYSNHCYYISSDIKNWTESRMACVSKKSNLFYMDNEEEMMFMKILSSSSWIGLSRESSNYSWFWINGSPSNQTITEPSNPRYNCVMVFESSLQSASCGDEKIYICKHEILS	27832	6980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9870_pilon_-_7344_7658_7760_25359_25512_26470_26507_27615
847738	contig_3602_pilon	+	626	5	Intergenic	novelGene_60511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1215.39630882276	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	190	585	168543	169561	FALSE	10	GCTGCATGATTGCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADMKARAAGDARSLDSLFSRARTLSSTLPLRTLVLANTN	161658	169602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161774_168468_168613_168749_168857_169145_169252_169448
847739	contig_9185_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_166893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260373	259675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_259700_260400
847740	contig_14684_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_99674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAGTCTTGTAGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342413	342073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_342100_342400
847741	contig_10013_pilon	+	341	4	Intergenic	novelGene_125075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_1	26.5622957508487	3857	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTGTGGAAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463201	464922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_463280_464212_464300_464467_464501_464779
847742	contig_1575_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_45180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCACCCTCTTAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147741	148087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_147700_148100
847744	contig_13952_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_133248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCAGAGGCACCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37734	39028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_37700_39000
847745	contig_12638_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_33303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225146	1226344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1225100_1226300
847748	contig_15182_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_136442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTTTCCCCACATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317206	318160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_317200_318200
847750	contig_1719_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_87338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAGGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566757	567287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_566800_567300
847752	contig_8357_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_39683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGTTGCCAAGAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147024	148615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_147000_148600
847754	contig_10197_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_115313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	2	451	1515588	1516037	NA	10	TTTTGAGCATCTCTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGAVFSALEEPTVCWGLEEALETVAQALNKLGPFDGLLGFSQGAALAALVCALGQDGDPRFPLLRFTILVSGFCPRGLGLKEPILKAPLSLPSLHVFGDADRVIPSQESVQLASQFPGAITLNHSGGHFIPAAASQRQAYRKFLDQFAE	1515586	1516384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1515600_1516400
847755	contig_1076_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_101154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGCTAGGGTTAGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069894	1068854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1068900_1069900
847756	contig_15087_pilon	+	1057	2	Intergenic	novelGene_37164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70438	72828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_71173_72505
847757	contig_10765_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_122890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGATTCTAGAAAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63610	64495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_63600_64500
847760	contig_11642_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_172918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253982	254602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_254000_254600
847762	contig_7066_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_42204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGAAGGGCAGTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044575	1045141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1044600_1045100
847764	contig_1996_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_131911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGGAGATTTATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325423	325037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_325000_325400
847767	contig_7909_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_155880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGAAGCGCTATTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98527	97347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_97300_98500
847769	contig_16109_pilon	-	1107	3	Intergenic	novelGene_80330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	20.5	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	24	479	282019	269303	FALSE	45	TAAAACCATATGTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAAPARMATLVVNKPGAGLDGSRQGSRGTAVVKVLECGVCEDVFSLQGDKVPRLLLCGHTVCHDCLTRLPLHGRAIRCPFDRQVTDLGDSGVWGLKKNFALLELLERLQNGHIGQYGAAEEAIGISGEVLIELGEIFINLIFSFKIFTIISTVYNCT	282042	268674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_269515_273743_273907_281938
847770	SIRV2	-	312	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4557	38	3382	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATTCGCTCTATAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350	1038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
847771	contig_14618_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_136820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGTAAAGACTACAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679318	678465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_678500_679300
847772	contig_14618_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_136819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTTTAATATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677857	677540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_677500_677900
847773	contig_8801_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_66312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	257	580	592149	592472	NA	0	TTCTTTCCTGTGCCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCFPEPRSCVQRPGTPSKAVPDDVRDPALELPVLGLGRWPSGWVLTSRTGSLPSSKDSSISIQSGSLYSRPCGKLPLAAKGLPCPSWALTWDPTRRWRPQQLERKG	591892	592603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_591900_592600
847774	contig_10331_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_54124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTTAAAGTGGTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403217	402431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_402400_403200
847778	contig_8304_pilon	-	999	9	Intergenic	novelGene_153172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGCAAAAATACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112661	100400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_100652_100734_100798_103202_103321_104606_104710_105334_105386_106809_106883_106962_107031_107187_107232_112433
847779	contig_7446_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_101956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGTTAAATGTTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205861	207338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_+_205900_207300
847780	contig_12214_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_177331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118110	117225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12214_pilon_-_117200_118100
847781	contig_5586_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_143606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAATGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668590	668039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_668000_668600
847783	contig_7308_pilon	-	695	4	Intergenic	novelGene_159589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	5.18544972870135	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAAGCCTTGGCCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183282	166947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_167256_176548_176664_182565_182744_183188
847784	contig_2161_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_114973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACCTGGTCACAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061368	1060708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1060700_1061400
847785	contig_18967_pilon	-	1465	15	Intergenic	novelGene_165316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	63.9381477264855	38	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	49	1395	79466	46751	FALSE	10	CACCTGGCCTCAGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHEARKHERKLRGMMVDYKKRAERRREYYEKIKKDPAQFLQVHGRACKVHLDSAVALAAESPVNMMPWQGDTNNMIDRFDVRAHLDHIPDYTPPLLTTISPEQESDERKCNYERYRGLVQNDFAGISEEQCLYQIYIDELYGGLQRPSEDEKKKLAEKKASIGYTYEDSTVAEVEKVAEKPEEEESPAEEESNSDEDEVIPDIDVEVDVDELNQEQVADLNKQATTYGMADGDFVRMLRKDKEEAEAIKHAKALEEEKAMYSGRRSRRQRREFREKRLRGRKISPPSYARRDSPTYDPYKRSPSESSSESRSRSRSPTPGREEKITFITSFGGSDEEAAAAAAAAAASGAASGKPPAPPQPGGPAPGRNASARSLPCPPAGSGSAERRREKSGNASTAGRAARPPPATVGNTALPEGAHGPAPEAPITATRQKTGGEGGWGRWDSAG	80559	46680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_46846_47023_47049_47391_47494_53710_53931_55128_55171_56395_56470_56549_56629_57657_57755_58672_58822_60103_60189_62430_62511_62741_62844_63443_63542_79367_79496_80540
847786	contig_8330_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_71827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	160.160856641066	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	91	555	853991	857547	FALSE	30	GAAGTACGAATCTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRNVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVSRPSPTFSEFYSFPFLRFFSVCLFFIIFQDKEKESTQQMGILQ	853900	857547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_854060_854995_855090_855434_855535_855624_855699_857419
847790	contig_9386_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_175205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCTCTAAATCATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81789	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9386_pilon_-_80800_81800
847791	contig_1719_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_87377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCGGAAGCAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839795	839115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_839100_839800
847794	contig_8538_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_5080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGTCAAGGTCTTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843128	842857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842900_843100
847795	contig_10734_pilon	-	836	5	Intergenic	novelGene_51099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAACCTCAGCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590303	578773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_579151_580583_580686_588581_588720_589212_589385_590256
847796	contig_6189_pilon	-	671	7	Intergenic	novelGene_164944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	188.670273817107	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	99	644	172400	94171	FALSE	35	AAACACTTCCATCAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVTVSELMELFLQSPLVTWVKTFGPFGSGDQDNLTMYMDLVDGIFLNQIMLQIDPRPTNQRINKHVNNDVNLRIQNLTILVRNIKTYYQEVLQQLIVMNLPNVLMIGKDPLSGKSMEEIKKVLLLVLGCAVQCERKEEFIERIKQLDIETQAGIVAHIQEVLDTTETRILFRKMSLSKLK	172498	94143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_94234_94364_94449_96360_96420_112261_112332_164022_164132_171500_171602_172340
847797	contig_9656_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_121903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAAAGTAAAAAACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161389	160240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_160200_161400
847798	contig_15471_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_175210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	120	545	167639	168064	NA	70	AGGACAGAAAACAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVWQQESLAGPGSVVVANSRGLIRRAQRQKLRGDPVQGYSSRQQSPAAEQKPQELCRPPDSMAVAGGSSDVNIASDLNHGAPACPSTEEWTRVIRGRVSGSPSGIFCYCLLFPFYEQEQWLSLCPHCVSVSCVRLDHRGM	167519	168319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_167500_168300
847799	contig_7050_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_153635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810886	810306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_810300_810900
847801	contig_9121_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_134464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCGAATATACAATGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223776	222836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_222800_223800
847804	contig_17059_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_166091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	170	355	456845	457030	NA	70	AAGGAAAAAGAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRLLRPRPRGRSCFLEAAEVGPVSLGAFTGEVVGTLAAHTRVSRGSGVSGTGSAWEMQGPGPYGRRGRSPASQCPAPTSRPPPPRRFVVFSLQASLSQTFRALVKMRILIQQFGGGV	456675	457414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_456700_457400
847805	contig_13697_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_165907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAATAGAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36620	35421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_35400_36600
847807	contig_2917_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_147594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTACATAAGCTGTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104336	105138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_104300_105100
847809	contig_1719_pilon	-	658	5	Intergenic	novelGene_87316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	380.353454039792	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGGACTAAAACCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453437	446643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_447010_447306_447334_448474_448544_451554_451625_453311
847810	contig_7571_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_106402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAACTAAAAAGTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148432	146630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_146600_148400
847812	contig_15689_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_164157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCGGAGCTGCCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153493	154274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_153500_154300
847813	contig_1230_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_28824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGCGCGTACAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403947	402748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_402700_403900
847815	contig_5918_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_99550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAAAAAAAAGGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772577	771673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_771700_772600
847817	contig_2577_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_172050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTTTGTTTGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65401	66580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_65400_66600
847818	contig_14666_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_39534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGAGCCTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449908	449388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449400_449900
847819	contig_5643_pilon	-	1815	1	Intergenic	novelGene_39163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGATTGTAACACAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708320	706505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_706500_708300
847820	contig_10861_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_39468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACGAAAAAAAAAAAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2794171	2792580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2792600_2794200
847821	contig_11448_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_66399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATAACCAGACAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456136	455242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_455200_456100
847822	contig_5400_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_162811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGATCCCGTGGGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116140	51675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_51724_115838
847823	contig_11160_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_168836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	819	1118	319072	319371	NA	20	GAGCGCAGCCAGCATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLKEPSGGGGTALLNKENKFRDRSFSENG	318253	319371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318300_319400
847824	SIRV7	-	250	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69036	0	35817	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78921	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
847825	contig_9027_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_156359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCTTGAAAATCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115323	114009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_114000_115300
847827	contig_16594_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_53926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCAAGGGCCTCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307392	306996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_307000_307400
847828	contig_6494_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_108586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	565	909	137468	137124	NA	25	GGCATGCATGGGACAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKSSWPSSWQILTQGHALPSCPDWLSICHPYGPLGSPSVELLGQHKLGTEIANTVVWAVPGSQQVFTPTPPPPHRPSLPPISHLDRLTPECRRTCREALSHVGALGEGSGID	138032	136054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_136100_138000
847831	contig_6876_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_147027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTAGACCATTTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164166	162076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_162100_164200
847832	contig_10311_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_50484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGGACAAAGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125197	126016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_125200_126000
847835	contig_6589_pilon	+	1444	7	Intergenic	novelGene_26187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.61880215351701	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	127	1029	1914783	1924137	FALSE	35	GCAATAAAATCCAGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGRVHQAAPLSEAPHDDAHGNFQYDHEAFLGREVAKEFDQLSPEESQARLGRIVDRMDRAGDGDGWVSLAELRAWIAHTQQRHIRDSVSAAWDTYDTDHDGLVGWEELRNATYGHYAPGEEFHDVEDAETYKKMLARDERRFQAADQNKDSVATREELTAFLHPEEFPHMRDIVIVETMEDLDKNKDGYVQVEEYIADLYSEEPGKEEPAWVQTEREQFRDFRDLNKDGHLDSKEVGHWVLPPAQDQPLVEANHLLYESDTDKDGRLSKAEILGNWNMFVGSQATNYGEDLTRPHDEL	1914277	1924552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1914313_1914691_1914941_1917454_1917658_1919300_1919474_1921290_1921352_1923529_1923730_1924029
847836	contig_7009_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_23658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCTAGGAAACCCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503793	501986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_502000_503800
847837	contig_7129_pilon	+	853	3	Intergenic	novelGene_169296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAGAAAAAGAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894240	906557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_894609_900059_900217_906229
847838	contig_960_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_108288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	109	495	1022287	1021901	NA	15	CCTACACCGATTCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCNALEFTANNISQARQAVVDTGNQLQVTELLDSHAKEQTSEDLTEPEQQMTASEEGDQDLKTPELTKFLTKELAEAFRLTEAGMAKLEEQEPNTERFATVHRSYQGPQLLQGHLGREPEKLCRNRP	1022395	1021653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1021700_1022400
847839	contig_20010_pilon	+	488	2	Intergenic	novelGene_173764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTACAACCTTGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2661	6765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20010_pilon_+_2801_6416
847840	contig_6556_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_168503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTATTTCTTTACTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333772	334223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_333800_334200
847841	contig_5084_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_64594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGTGGGGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939483	938193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_938200_939500
847843	contig_12644_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_44555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTCTTTTCTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680224	1675549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1675776_1680146
847844	contig_15471_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_175224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAAACAGATCAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353888	352461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_352500_353900
847847	contig_11590_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_125616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004766	1003858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_1003900_1004800
847848	contig_4364_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_4473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533106	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533100_1533300
847849	contig_18039_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_171255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGTTCTCTAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216721	215941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_-_215900_216700
847850	contig_10752_pilon	-	1526	6	Intergenic	novelGene_153040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCCGCCGTCAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235928	183009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_183048_186640_187354_189330_189450_218946_219067_230376_230558_235573
847851	contig_5434_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_74683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345338	346489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_345300_346500
847852	contig_9903_pilon	+	654	2	Intergenic	novelGene_172018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117715	166406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_+_117794_165830
847854	contig_2067_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_158915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCGGGCAGCTGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367061	365164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_365200_367100
847855	SIRV6	+	333	3	FSM	SIRV6A	SIRV611	454	3	3	118	3	-118	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTGCGTAAAGCTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306	1832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1382_1468_1535_1640
847856	contig_16860_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_155336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAATAAATGAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82185	81344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_81300_82200
847858	contig_11027_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_169611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCAACTTTCATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16396	14817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11027_pilon_-_14800_16400
847859	contig_7867_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_162748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	163	513	258542	258192	NA	40	ATAATCTGAGAAACTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLQTGGIPETVAPECTVNPELKPFPKSTLQMKIRQDYKTKNNTREECAFSSVKYTRPNGQLLSRSRMRRPEGTGTGQGDTGNPVLKGGACFHIVGIATNVAKQCMYRSLNKKLT	258704	257488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_257500_258700
847860	contig_9875_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_154410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATTACAGGTATGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128530	129129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_128500_129100
847861	contig_17500_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_157922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACACCTGCCTGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252337	251022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_251000_252300
847862	contig_18184_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_123871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCTGTATGTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120847	122173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_120800_122200
847863	contig_19855_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_177579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56843	57472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19855_pilon_+_56800_57500
847864	contig_15777_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_75737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACAGAGGGAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119670	118347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_118300_119700
847865	contig_12765_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_106549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATATAAATAAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15109	15867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_15100_15900
847866	contig_3380_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_60095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379974	378807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_378800_380000
847868	contig_6728_pilon	-	1762	10	Intergenic	novelGene_177580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	3.5624932315292	10	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	196	1188	283391	234371	FALSE	30	AATCCCAGCTAATTCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIWLLLLLTIRVPPGSAQFNGYNCDANLHSRFPAERDISVYCGVQAITMKINFCTVLFSGYSETDLALNGRHGDSHCKGFINNNTFPAVVIFIINLSTLEGCGNNLVVSTVPGVSAYGNASSVQIGNISGYIDTPDPPTIISYLPGLLYKFSCSYPLEYLVNNTQLASSSAAISVRENNGTFVSTLNLLLYNDSTYEEQLIIPSIGLPLKTKVFAAVQATNLDGRWNVLMDYCYTTPSGNPNDDIRYDLFLSCDKDPQTTVIENGRSQQGRFSFEVFRFVKHKNQKMSTVFLHCVTKLCRAEDCPFLMPKRLQPTIHSLVLQVNLLSS	299151	233796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6728_pilon_-_234401_234818_234849_244731_244904_248600_248682_250060_250159_262076_262150_263542_263725_267816_268038_283285_283400_298964
847869	contig_753_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_112922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404763	405751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_404800_405800
847870	contig_9177_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_32736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACGAATAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897588	898438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_897600_898400
847871	contig_3004_pilon	+	1068	6	Intergenic	novelGene_127497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_4	44.5932730352909	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAAAAACAAAGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282589	287242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_282619_284105_284156_284376_284415_285297_285349_285713_285751_286379
847872	contig_7182_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_117119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGTGAAGATTACAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313882	313324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_313300_313900
847873	contig_10494_pilon	+	947	6	Intergenic	novelGene_102229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	40.8675910716548	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	90	806	1256366	1304167	FALSE	20	AGTGATCATTCCTGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILHVLPLHHVHGVVNKLLCPLWVGAVCVMLPKFSAEQVWEKFLSSETPRVNVFMAVPTIYSKLIDYYDKHFTQPHVQEYVRAVCKEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWRDITGHTLLERYGMTEIGMALSNPLTAARLPGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPTPPSMPSTPLTLSVPPMHTKCCFVPPMASKWPPLKFDAPNQNRMETWGWNGICQQ	1256276	1304308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1256393_1258330_1258486_1259908_1260055_1277331_1277445_1283905_1284011_1303996
847874	contig_7271_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_159945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAATTGTAAATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328206	329281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_328200_329300
847876	contig_5210_pilon	-	1002	2	Intergenic	novelGene_65422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGATTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444306	439104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_439957_444156
847877	contig_18208_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_176176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCCAGTCAACAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152045	153445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_152000_153400
847878	contig_10040_pilon	-	532	2	Intergenic	novelGene_176492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	5	400	89969	88685	FALSE	55	AAGGAGAAGAGAGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMSQPLDRGEVVAPPEVTAPAKLAPLSASEAPASPARGQRFNSCWSCRVLSGSGLIGAGLYVCSAARRRMKLGYTPNPGSATQMVVGVRLKIPSVDLSSPVSILRTHRASMGLMDVYGQTHGQTSALQILQD	89973	88552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10040_pilon_-_88819_89707
847879	contig_1309_pilon	+	1242	2	Intergenic	novelGene_73973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTATTATGAATTGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184278	185767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_184735_184981
847880	contig_11396_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_71382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTGTAACCATCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089190	1088202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1088200_1089200
847881	contig_11071_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_131018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGGTCTTTCTAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42918	43809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_42900_43800
847883	contig_18869_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_56452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCAGATCACTTACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157113	156234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_156200_157100
847885	contig_15456_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_139489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78223	77361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_77400_78200
847886	contig_8898_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_137256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGAGCAGCTGGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336273	336676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_336300_336700
847887	contig_20731_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_151591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAATTCTAATTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6675	6996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20731_pilon_+_6700_7000
847889	contig_14208_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_129087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCTGTTTCCATAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164135	163893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_163900_164100
847891	contig_9839_pilon	-	848	2	Intergenic	novelGene_88522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGGAAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49431	48539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_48915_48958
847892	contig_5643_pilon	-	453	2	Intergenic	novelGene_39129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGTCAAGCCCTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651419	646197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_646394_651162
847894	contig_13044_pilon	+	1495	11	Intergenic	novelGene_100012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.90787840283389	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	592	1320	392801	399147	TRUE	25	ACACCGTGGTCCAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPYFYAPELIYYSYKYREILAECCEAADKAACLTPKINSLKEKVLTASAKERLRCVSIEKFGERAFKAWGVSRLSQRFPKAEFTEISKIVADLAKIHQECCHGDLLECADDRADLAKYICDNQDSLSSKLKGCCDKPVLEKSHCILEVEKDDVPAGLPPIAETYVEDKDVCKNYHEAKDIFLGTFLYEYSRRHPDYSMFLLLRIAKAYEATLEKCCAADDPHACYAKVLDEFKPLIEEPQNLVKQNCEDFEHLGEYGFTNKLLVRYTRKVPQVSTPTLVEVSRKLGRVGTKCCKLAESERMPCADDFLSVILNRLCVLHEKTPVSERITKCCTESLVNRRPCFTALHADETYVPKEFNDETFTFHADLCTLPEDQKQIKKQTVLVELLKHKPKATDDKLKTVIGEFTAMVEKCCKADSPEACFTLEGPKLVATSKAALA	386929	400754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_387038_387846_387945_389568_389699_391324_391540_392760_392894_394088_394187_395771_395911_396520_396745_398337_398471_399105_399163_400594
847897	contig_5832_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_134180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAATAAGGATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584824	583491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_583500_584800
847898	scaffold_8345_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_107036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTCTTCTGAATTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877341	878617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_877300_878600
847900	contig_10405_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_165863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAAGGTTTCCGCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290337	289454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_289500_290300
847901	contig_2257_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_122504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTAGTAAGGCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311881	313591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_311900_313600
847902	contig_6983_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_177581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98964	99887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6983_pilon_+_99000_99900
847906	contig_5669_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_86042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	285	323	70592	70630	NA	15	GTGCAGTCCTCTGTTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEELAREQEKEEECKEEKKEETRKESWRELPSELSDIIEVDSAEDLEEYEAFQDLENKEDEDSDDPCPETTEENPLKLSESKKVTASTGWIKWEMGSGAQVPWCSG	70307	71510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_70300_71500
847907	contig_13823_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_145274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAACAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293385	294213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_293400_294200
847908	contig_8330_pilon	-	525	4	Intergenic	novelGene_71874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	652	junction_2	346.719226784761	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	121	354	953341	950747	TRUE	30	CTGAAAATAGGTATTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVQSVRCYSHGSHETDEEFDARWVTYFNKPNIDAWELRKGMNTLVGYDLVPEPKIIDAALRACRRLNDFASAVRILEVVKDKAGPHKEIYPYVIQELRPTLHELGISTPEELGLDKA	955567	947126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_947288_950736_950861_953221_953344_955449
847910	contig_8820_pilon	+	1131	3	Intergenic	novelGene_79308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	84.5	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	16	462	241900	310314	FALSE	40	TGAATGAATTGTAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGKEMNEIKTQFTTREGLYKLLPHSEYSRPNRVPFNSQGSNPVRVSFVNLNDQSGNGDRLCFNVGRELYFYIYKGVRKAADLSKPIDKRIYKGTQPTCHDFNHLTATAESVSLLVGFSAGQVQLIDPIKKETSKLFNEEHNRALSARPYPGG	241884	310983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_242122_292797_292981_310272
847911	contig_15206_pilon	+	461	3	Intergenic	novelGene_175719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.5	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	31	354	10298	13717	FALSE	10	TGAAGGGCTGGTGTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDLGSFPHKMQLLVLLLAFLLAPEAETGEIIGGHEARPHSHPYMAFLQFWKQKEKKRCGGFLIREDFVLTAAHCWGRETLGVPLCATIWPRALSPMDEKTGLLLGFSPKSRVSCSG	10267	13824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15206_pilon_+_10353_11400_11549_13596
847912	contig_20460_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_163952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCTCATGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17006	18166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20460_pilon_+_17000_18200
847913	contig_5317_pilon	+	773	5	Intergenic	novelGene_76625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	92.4591125849691	37	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	135	773	896836	904602	FALSE	55	AAAAAACACAGCTACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPECRGGAGEAAWNAALGAAACGVLDVKTLPLQSPQRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKVRTQTHLPSAHPPVHTHLCLVGPFCSHPSFFFFFLKTIGVPFFCKKK	885489	904602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885517_893291_893377_896813_896977_902552_902768_904319
847914	contig_7962_pilon	+	504	6	Intergenic	novelGene_149314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.903201886272	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	222	401	445795	446196	FALSE	15	CTTTTGTCTTATCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRLHEVGAGSRDPARYVPGSVSAAFVTCPNEKVAKEIARAVVEKRLAACVNLIPQITSIYEWKGKIEEDSEVLMMIKTQSSLVPALTDFVRSVHPYEVAEVIALPVEQGNSLYLQWVRQVTESVSDSSTVLP	444928	446299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_444975_445352_445425_445586_445647_445751_445798_445922_445973_446069
847915	contig_5766_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_175053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGTCATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880792	881681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_880800_881700
847917	contig_6870_pilon	+	1677	2	Intergenic	novelGene_103964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTATGTTATCAATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405051	1408604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1405174_1407049
847920	contig_1335_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_166522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCATTTTAATTCTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517913	518786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_517900_518800
847923	contig_15632_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_177583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTCACACAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89812	89457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15632_pilon_-_89500_89800
847925	contig_5551_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_134227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTCTTTTCTCATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246623	245122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_245100_246600
847927	contig_17311_pilon	-	458	4	Intergenic	novelGene_57854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	878	junction_1	8247.77272291671	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	30	392	123675	118871	FALSE	30	AAAACTTATATGTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKKE	123704	118804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_121530_121642_123344_123555_123642
847928	contig_5316_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_61226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAGATAAAGAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440944	441462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_440900_441500
847929	contig_960_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_108268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650882	650126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_650100_650900
847930	contig_20614_pilon	+	1261	7	Intergenic	novelGene_107577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	82.320005668934	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	36	836	245101	262091	FALSE	35	AAGTCAGTGTGAAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGWESYYKNEGDEEEEEQHEGPEAGGEYKYSGRDSLIFLVDASRAMFESQNEGDENELTPFEMSIECILSVYTNKIISSDRDLLAVVFYGTKKDKNSVNFKNIYVLQELDNPGAKRVLELDRFKGQLGKKHFQDLIGCGSDYSLSEALWVCANLFSDVQFKMSHKRIMLFTNEDDPHGNDSAKASRARTKAADLRDTGIFLDLMHLKKPGGFDISLFYRDIISVAEDEDIGVHFEESSKLEDLLRKVRAKESKKRALGSISSCIP	244445	262516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_244466_245085_245180_251570_251693_255565_255705_255999_256255_256970_257155_262069
847931	contig_11849_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_171752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130442	129167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_-_129200_130400
847932	contig_13015_pilon	+	604	5	Intergenic	novelGene_165566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	67.1677005710334	127	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	7	546	396085	427294	FALSE	55	TGAAAATAATTGTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGALEAAAVAVVEVGSARQFEELLPLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMTELAKEHPQVSFVKLEAEAVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQSIDRLDGAHAPELTKKVQRHASGSAFPPSTKEHPKEDLNLRLKKLTNAAPCMLFMKGTPLLMQSSGAGQEEKASCRFVYFTRFC	396078	427352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_396177_404045_404155_410294_410370_411107_411292_427214
847933	contig_6102_pilon	-	905	2	Intergenic	novelGene_32231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3343	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906123	904385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_905253_906085
847934	contig_10855_pilon	+	1769	7	Intergenic	novelGene_124375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	22.6083809435547	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	206	1363	780603	787695	TRUE	40	TTTATGAAACTTCTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDGDSTWVPAQDLGRPHEGNVEEKGMVAGFLTTWSQESVAFEDVAVDFTPEEWVLLDRSQRTLYREVMLETYRNLASLDWRTQLKTKESTSKQDIFGESMFKGMKMAPTHPGKRPCQYSQFGKAVRRSLGLTWPPGSPPGEKPYRCEECGKGFRHLSSLRRHARTHTGESPFACRHCGSAFCHQSSLKTHVRTHTGEKPYTCSQCGQRFSTRSYLTVHTRIHTGEKRYACADCEKAFSRSSYLRVHQRTHTGEKRYTCGDCGRVFGHPSNLRRHVRTHTGEKRYRCGRCGKAFVQSSSLVVHSRTHTGEKPYPCVKCGKAFIDTSSFRKHVRTHSREKPHKCMQCGEAFSHNAPLVVHKRAHAEGALRSVVDVKLPLSSSLS	772749	789011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_772824_780471_780634_781331_781418_782042_782170_785798_785882_786864_787977_788886
847935	contig_4674_pilon	+	1789	1	Intergenic	novelGene_174150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAATGCTAGCTGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358699	360488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_358700_360500
847936	contig_7272_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_25312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGATTTTCTAGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465988	466830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_466000_466800
847937	contig_6630_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_30734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTAGTTTCTCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794789	794285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_794300_794800
847938	contig_8696_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_153334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATGAACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954338	954997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_954300_955000
847939	contig_14341_pilon	-	318	3	Intergenic	novelGene_111892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	618	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGCCTCTCCCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730645	727839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_728020_729079_729152_730579
847940	contig_5549_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_81615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTAAAACTTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327725	326229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_326200_327700
847942	contig_935_pilon	+	847	3	Intergenic	novelGene_45514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATATCTTGAATAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19630	22507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_20239_21258_21434_22443
847943	contig_5331_pilon	-	1046	7	Intergenic	novelGene_112840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.263765237047	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	141	767	784416	778972	FALSE	10	TCTGCTTTTGGCAGTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPAAAVPASLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCQAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGYTFLPCPGLQCLRLSRSSQSP	789110	778692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779041_781143_781281_781396_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985
847944	contig_4305_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_136687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTACAGCTCTCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515605	516527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_515600_516500
847946	contig_826_pilon	-	704	2	Intergenic	novelGene_154954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	79	450	547403	547032	FALSE	5	TGGCATGGCTGGCGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKPDMGEIASFDKAKLKKTETQEKNTLPTKESEWSPPPGPWAPSQAPNPPSSCQPASFPRSGQPQPPFILHKVSCLPQPQASFLIPRPRGCLAHTRFVSAAVGDFRGALLPQCTFPALHSH	547771	546777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_547419_547708
847947	contig_1301_pilon	-	389	3	Intergenic	novelGene_47411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	956	junction_2	75.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	2	388	822584	814992	FALSE	50	ACCAACAGCAACAGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSY	822585	814990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_815045_819983_820203_822469
847948	contig_5200_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_140170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAACCTTTTTGGTTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432221	431943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_431900_432200
847949	contig_5590_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_162995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGGGCAGGCAGCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214114	214959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_214100_215000
847951	contig_5963_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_177584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAACATTCACGTCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76611	76225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5963_pilon_-_76200_76600
847952	contig_10541_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_144627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATGTACTAAGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111490	110055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_110100_111500
847953	contig_8978_pilon	-	1276	2	Intergenic	novelGene_49497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	873	1223	1804793	1803205	FALSE	25	GTTTGTACTACATTATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDIISSLPPERYCLNELVLFTDSLSASLGLRLVGPYDILAGKHKMKKKSAGLNCNLHWRFYYDPPEFQTIIIGDGRTQYHMGDSPDELPVYVGTNEAKKNCLIVQSGDNVFAAVK	1805665	1803151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1803308_1804545
847955	contig_7979_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_125531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTCCTCATAATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035406	1034357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1034400_1035400
847956	contig_12142_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_147819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAATAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123221	121678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_121700_123200
847957	contig_7411_pilon	+	1674	13	Intergenic	novelGene_137043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1001	1483	854868	858707	TRUE	5	AGGTGCCTGGGCTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPITFITGEMRKEGDHLHGLAEPRLVSQDAIEPLPVELGQPVQPDLLVVSERPVQQRRGVILHRGGDSSAALGQDGLGHGGHFCDVFCVWLPDVRPLCSLKLVHDEQRIYEHQILPTRPVSWVVFHIFFFACLFTVRSGLRPLKIRQEGTFVQLHQIK	847807	865849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_847847_848960_849129_850915_851110_852638_852770_852872_853050_853351_853520_854744_854883_856239_856416_857445_857641_858610_858719_863209_863299_865188_865252_865821
847960	contig_7088_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_159791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	164	583	699809	700228	NA	15	TCCACAACCCTTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSLRNVKAKVCHCFLASSVVTEKSNPIQIFPLLEGLIIFPFGSLHDLISNLVAMESVLTQQPYRTGSNCPTGFQACNFYRSRLPHHSPTEHLGSLNNQLWLAAEHLTAVPPGLLFLICGVYLNFNVVYFGLDLFFIYCVGYLGGPVVFLHNSALFVKCLLHWKLLLCGCWTTGTGPLVSLSPVFCPHVFYFR	699645	701024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_699600_701000
847962	contig_10641_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_171400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	93	440	202579	202926	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRVFWREGYGRRRRKKERGGRLPCPLRLRKMVFESVVVDVLNRFLGDYVVNLDTSQLTLGIWGGNENAAVPQSHLPPSPLAAPAGPRLFGAPSSPGSAACPLPFRLRLRKPGGRFRAFAHEFYFIGWVRDEKFPLSEQNSGLHGS	202486	203371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_202500_203400
847963	contig_5145_pilon	+	1033	6	Intergenic	novelGene_131368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	97	750	521677	527695	TRUE	5	GCCGGGTCCGACCCCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPQEVGRWPQFADRESGPRGVSQAQDAPSLVPMAPGQPPNPLSWTSSSWSPHSAPPWTWRAGVSAEHPGCHHGTCPGSHGCHDGHPHSLLRTAWGTCSPPGHQTGIRGSGWLLGTYLAGHHEHGENEDEAGFGDGEPACLLEGEEHGSIQAGFGGEGHVQDLVGLRLPDASEQLLNVGHEGDSRAFDPAGGDHDKPAMVVVMVRMVDAHCDLADPHHLLHGHEDELHGQEADTLVEEVQGAEEDQVPDG	521580	542879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_521924_522567_522691_523634_523722_526560_526745_527682_527839_542739
847964	contig_14640_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_168049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATGATGATCTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394263	394987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_394300_395000
847966	contig_13904_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_165501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAATGCGGCCACAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145320	144957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_145000_145300
847968	contig_12638_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_33304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229397	1228611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1228600_1229400
847969	contig_13607_pilon	-	1229	2	Intergenic	novelGene_170184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGGTTTCCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231768	225065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_225827_231300
847970	contig_8600_pilon	+	606	2	Intergenic	novelGene_125749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	19	534	301849	302773	FALSE	15	CTTATCCCTTGATTCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLERCARVLRGTLVRAAVRRYLPWALMTFMLAGSLLKELSPLPESYLSNKRNVLNVSRSLPCLGDATALPAFVRPRISTLSIPPACDSLIITGERPTFSPHPTFESLAPACARTPTQRYSAEEAGILQSLTFLLEFLGPSQSPKVHGSGPEKQPPLGSLRQLHPLTSFF	301830	302845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_302022_302430
847971	contig_9733_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_160578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTCTTATTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31280	32614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_31300_32600
847972	contig_12566_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_86022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCCAGAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203492	202629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_202600_203500
847973	contig_4486_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_38594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGACATTTTCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328888	328604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_328600_328900
847976	contig_10674_pilon	+	884	2	Intergenic	novelGene_6439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	734	junction_1	0	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	4	840	198581	209386	FALSE	5	TTTTCTTCTATTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSGNTFMST	198577	209430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607
847979	contig_14822_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_145416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAGAAGAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181679	183039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181700_183000
847980	contig_15236_pilon	+	1154	2	Intergenic	novelGene_141599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	92	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGAAGCTAACGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509137	511646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_509932_511286
847981	contig_500_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_30928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCAAAGGAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114610	1113527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1113500_1114600
847983	contig_7895_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_154447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTATTTTAATTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704575	705673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_704600_705700
847984	contig_12671_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_19211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	114	452	197316	197654	NA	25	ATGGCAGTGCTCGTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGVSPGRFSAATAPARCDAPAGGANVPSPPSAAASSRRLQHPAARGHLVVPGAGTAVGRGRSGGIRRCSGPSRPLTVSLWSPGCDMFLEIPFLEWRNKAPFFKFH	197202	198119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197200_198100
847985	contig_3155_pilon	-	677	2	Intergenic	novelGene_26431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	669	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2	436	300443	295041	FALSE	20	TATATGGATTCTTTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPAYNGPTQTQPSPTTEGGESQEEVFSCSPAPSSGRALIPSEQPSSSFPEVVLQTHTTSEGSEQPKRASLSRTSAPPSRPPPPRASPSPRLSSGSIPSSPTTSEGGSPTSSRAFFGAGTPSPRTSIEVSPDPELPENVRLRDI	300444	294799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_295065_300032
847987	contig_854_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_36457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGCTTAACCTACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456335	1455925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1455900_1456300
847990	contig_7695_pilon	-	1048	6	Intergenic	novelGene_41584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_2	48.1314865758372	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	50	553	423117	410430	TRUE	10	TCATGTGGGACTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTRAHLILQPVAGSRMSSASGDNGTSCTLEFAVQMTCQSCVDAVRKSLQGVAGVQGVEVQLENQMVLVHTTLPSPKVQALLESTGRQAALKGMGTSLLQNLGAAVAILAGVGPVQGVVRFLQLSPERCLIEGTIDGLEPGPHGLHVHQYGDLTRNCASTAETWGTSLLTLTAELSSGWRMRS	423166	409836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_410155_410252_410506_416919_417098_417316_417455_422698_422772_423078
847991	contig_3193_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_126315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	1274	1873	104083	104682	NA	30	AAGGAGCCAGGAGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGINNTAWRPQWCSQTGVPRQVSTGTHRQAPTGAHRQAPTDRHPQVLTERCPQVLTDRCPQTGAHRCSQTGAHRQAPTGAHRQVPTGAHKQAPTDRRPQVLTDRHPQTGAHRQALTDRRPQTGAHRQVLQTGTHRCSQKGGHRCSQTGAHRQAPTGAQTGVHRCSQTGTHRCSQTGAHRRSQTGAHRRVLTGAHRQST	102809	105111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_102800_105100
847992	contig_7035_pilon	-	752	3	Intergenic	novelGene_83551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	21.5	147	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	258	473	779961	778760	FALSE	5	TTTTTACTTTCGCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSRPRSGTLATYGHRGSLPSPPRGARRRRGCAERGLQLPQCPRPPGKGGACRCLWPRRLRPEVPTGPTWSWRGWALGSAAGKVGAMALIEGVGDEVTILFAVLACLLVLALAWVSTHTAERADPLPQPSGTPTSAQPSKAMAATDSIRGAAGSPSL	781000	778480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_778782_779767_779992_780773
847993	contig_14829_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_163830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261654	262838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_261700_262800
847994	contig_11825_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_155386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTACCCAAAATAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5174	5527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_5200_5500
847998	SIRV2	+	285	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-64	302	-64	-302	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGCAGTAATGCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044	1329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
847999	contig_804_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_138784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTCTTGATAGAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35034	34181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_34200_35000
848000	contig_593_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_102029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTCTGCTCTCTCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518371	517489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_517500_518400
848003	contig_854_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_36194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAACATAATAATGATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503100	504919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_503100_504900
848006	contig_5344_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_125328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACTATGCCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27016	28368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_+_27000_28400
848007	contig_11026_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_167675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_4	194.605940870833	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	254	874	196513	200289	FALSE	20	CCTAGCTCCGTCATCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFNGHLRIKNENFVDAYENSNSTEFAYLANRVKEALKLLYSGIPALGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSFPKHLVEEAERTMAEERVVILPPRARAHHSTVLTSVVAYPTDPRTALKTRDNSCNFALHARGGEWMRFATPGFPDSPYPAHAHCQWALRGDANSVLSLTFRSFDLAACDQRGSAVVTVYDSLSPIEPHAVVRLCGTYPPSYNLTFLSSQNVFLVTLISKSKRRHPGFEATFFQLTKMSGCGGYLHQAQGTFSSPYYPGHYPPNIDCTWNIEVGAVGSV	195137	200442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_195244_195440_195512_196436_196595_196795_196832_197071_197313_199622_199763_200167
848008	contig_12969_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_61712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAAAGTAAGCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658706	659174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_658700_659200
848010	contig_8570_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_120157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCACTCAAACACCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340184	339921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_339900_340200
848014	contig_6439_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_154241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGAAAAAAAAAAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361185	361914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_361200_361900
848015	contig_1442_pilon	-	770	5	Intergenic	novelGene_172153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	12.6293309403151	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	411	746	340259	304636	FALSE	60	CAAAAAAAAAAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPSKVTLLGSVMFTFQHTKHLAISKHNLMFFYTVFLVATKITMMLTETSTVSFAPFEDALGRMLFGCHQRFSPRVKKNETKSNGTGSSTSKPTADASDKLKKKHSKKTE	369371	304611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_304846_333688_333807_340251_340340_349654_349812_369198
848016	contig_18096_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_58050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTTGATTCGGACTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53622	52612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_52600_53600
848017	contig_2114_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_104304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGCACAATTAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898220	898886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_898200_898900
848018	contig_11386_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_82822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	167	325	154235	154077	NA	30	ACTAGAAGGTTCTCTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WALISQSHDVLGLACFYSACLDLLLYGKGKSCPGSAVLLSDSDLRWCPGCETQAVMSCRSGVAEAHGSLRTRNHFVVQSGSGVSALQVLFPLPHATYLLYPVPALTT	154401	153765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_153800_154400
848019	contig_11386_pilon	-	385	2	Intergenic	novelGene_82821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTCACTACTCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152733	151816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_152012_152543
848020	contig_10377_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_115353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTTGAGGAAGGACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178532	177732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_177700_178500
848021	contig_6896_pilon	+	696	2	Intergenic	novelGene_174222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	72	386	360855	361169	TRUE	10	GTGTGCGCGTGCGCACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSTHVSVSSPLYTVLNAPLPSSMSNFRNLPLGEVATAFISASSSISFSFFSLKQSFEDSEIVFEHCSYLTSCPPLSIFEGSLSTLGKSVAAFILSSLGEDSATLSSSVISTLFRKNLFLSTVSPEA	360783	453168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_361424_453112
848025	contig_13292_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_142955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATTTACTCAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344743	345094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_344700_345100
848029	contig_10734_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_51129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCCGTGCTCAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746441	745635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_745600_746400
848030	contig_10940_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_49194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCCCAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402938	401601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_401600_402900
848032	contig_2463_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_43004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGGAACACCAAGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255970	255337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_255300_256000
848034	contig_11978_pilon	-	348	5	Intergenic	novelGene_62989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	10.6858551365813	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACCGTGGTGAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506139	1504509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1504528_1504803_1504855_1504936_1504993_1505325_1505423_1506013
848035	contig_14209_pilon	+	1200	5	Intergenic	novelGene_88306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_4	1.4142135623731	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	125	739	16500	31426	FALSE	30	AAACCGTCGGGGAGACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFRQHRGLQLLALVEEVLPRHGSGRHGDWHISLSKPSEKEQHLLMTLVGEQGVVPTQDVLSMLGDIRRSLVEIGIQNYSTTSSCQARPSQVRSDYGTLFVVLVVIGAICVIIIVLGLLYNCWQRRLPKLKHVSHGEELRFVENGCHDNPTLDVASDSQSEMQEKQPSLNGGGAVNGPGGWSTLLGGKRDPEDSDVFEEDTHL	16375	31887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_16503_26872_27030_27835_27898_30214_30395_31213
848038	contig_563_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_169756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399845	398411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_398400_399800
848039	contig_7411_pilon	-	399	4	Intergenic	novelGene_137034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	394329	393016	TRUE	15	CGTCCAGCCAGTAGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNCDDLLYGASQSLNVVVPIQNRPNIKLLQGRALEPFPEKVLPHCGFCVEDGQGDGPVRDRRALRFPGDDVAAAQPCILDHLVAQELGQAFGRADGGGLLLPVVL	394331	392820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_392828_392943_393162_393741_393847_394262
848040	contig_7815_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_134415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTCTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902620	901732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_901700_902600
848042	contig_593_pilon	-	1091	7	Intergenic	novelGene_102011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	128	505	479149	388617	TRUE	10	CCGCGCCATGGCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKNESIFVFDHTQISTLTCTTGTSSNALIKSSSSTAPAPSFAAEDLDPRVDDPIRRVVPIPTFLRELGGALDDVELAEEGLLPSTESSSSKFLSFADCIMFPDFWTSSNFVKITFNLAVWIAE	479276	383306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_383643_385614_385717_386471_386568_388564_388639_420089_420159_471622_471775_479014
848043	contig_6873_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_129829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAGAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474594	473749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_473700_474600
848044	contig_6807_pilon	-	1027	3	Intergenic	novelGene_84579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	1.5	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCCAATGTTGCTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607410	499737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_500427_503219_503333_607185
848045	contig_8195_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_170047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATTCTGTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108223	107804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_107800_108200
848046	SIRV3	-	298	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	321	-2	321	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
848047	contig_13904_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_165503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148495	147279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_147300_148500
848048	contig_1301_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_47291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248253	249691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_248300_249700
848049	contig_6440_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_161675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACCTCGCCCTGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104481	102803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_102800_104500
848050	contig_15293_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_146533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTCTGGTTGGATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118804	118435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_118400_118800
848054	contig_5467_pilon	-	600	5	Intergenic	novelGene_111969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	189.738636023347	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	10	327	126940	126326	TRUE	10	CTGCCGCAGTGCTCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPGMFFNPEESELDLTYGKRYKNVKLPDAYERLILDVFCGSQMHFVRSDELREAWRIFTPLLHRIEREKSRPIPYVYGSRGPVEADELMKRAGFQYEGTYKWVNPHKL	126949	125709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_125914_126256_126417_126492_126586_126698_126776_126883
848055	contig_9799_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_145570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAATAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071659	1072701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1071700_1072700
848056	contig_7171_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_101204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTTTGCAAACACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47061	46606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_46600_47100
848057	contig_5075_pilon	-	1643	15	Intergenic	novelGene_174072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	3.71977616179758	6	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	16	1509	230967	155383	FALSE	20	CCATGAGTTGAGGGTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFQNIMRRTAQARDEEYRNFLRSVSLLKNLPEDKLTKIIDCLEVEYYDKGDYIIREGEEGSTFYILAKGKVKVTQSTEGHDQPQLIKVLQKGEYFGEKALISDDVRSANIIAEENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANLNRDDEKRHAKRSMSNWKLSKALSLEMIQLKEKVARFSSSSPFQNLEIIATLGVGGFGRVELVKVKNENVAFAMKCIKKKHIVDTKQQEHVYSEKRILEELCSPFIVKLYRTFKDNKYVYMLLEACLGGELWSILRDRGSFDEPTSKFCVACVTEAFEYLHHLGIIYRDLKPENLILDAEGYLKLVDFGFAKKIGSGQKTWTFCGTPEYVAPEVILNKGHDFSVDFWSLGILVYELLTGNPPFSGIDQMMTYNLILKGIEKMDFPRKITRRPEDLIRRLCRQNPTERLGNLKNGINDIKKHRWLNGFNWEGLKARNLPSPLKRELSGPTDHSYFDKYPPEKGVPPDELSGWDKDF	230982	155248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_155479_157472_157540_170799_170863_175546_175670_177771_177936_193865_194008_195724_195815_198096_198234_200104_200259_201600_201700_206668_206738_210110_210206_212002_212081_227005_227070_230914
848058	contig_4364_pilon	+	236	2	Intergenic	novelGene_98	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGGCTGGAGGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973973	1036618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_974051_1036459
848060	contig_7839_pilon	+	946	5	Intergenic	novelGene_45697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.06155281280883	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	59	889	213933	227954	FALSE	10	CTTCTGTGAACTTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSESLLLSLELASGSGQGLSPDRRASLLTSLMLVKRDYRYDRVLFWGRVLGLVADYYIAQGLSEDQLAPRKTLYSLNCMEWSLLPPATEEMLLQTSVVSGRFLGDPSHEYEHTELQKVNDGDKVFEEEVVIQIKEETRLVSIIDQIDKAVAIIPRGALFKTPFGTTHVNRTFEGLSLSEAKKLSSYFHFKEAVELKNKTLLEKADLDPSLDFMDSLEHDIPKGSWSIQMERSNALVVLRSLLWPGLTFYHAPCTKNYGYIYVGTGEKNIDLPFML	213874	228011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_214160_217792_217959_220183_220314_220794_220942_227793
848061	contig_7919_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_28141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605967	1604662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1604700_1606000
848063	contig_1719_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_87351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGATTAAGAGTGAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687918	686695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_686700_687900
848064	contig_14300_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_133110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCAAATTAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242354	242903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_242400_242900
848067	contig_14559_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_83732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351640	352545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_351600_352500
848068	contig_1331_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_37848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGAAAAAAAAAGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173707	172483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_172500_173700
848069	contig_14722_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_110215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATTAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49530	50217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_49500_50200
848070	contig_4519_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_123754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGAAAGAGCGTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393477	1392568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_1392600_1393500
848071	contig_12671_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_19206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAGATGTTTCTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159099	159767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_159100_159800
848072	contig_2646_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_69722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2617975	2618823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2618000_2618800
848073	contig_5894_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_83006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236720	236528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_236500_236700
848074	contig_7839_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_45758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTTACAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1535317	1536122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1535300_1536100
848075	contig_10734_pilon	+	1441	1	Intergenic	novelGene_51372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAACGACTCTGCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1804918	1806359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1804900_1806400
848076	contig_10636_pilon	-	1494	4	Intergenic	novelGene_172273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	15.369522511198	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	834	661	1494	37467	36634	FALSE	50	GAGGAAAAACTGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTACYGPLPSTNSCDNNKTDVSSADRVVNRTAQTDAVFNEMESSADNYPNVDTSAILSQNDVQNDESGKNTNNCLNHQLYVGDHCDGHFSSENSSIDKDAGNTFQEIPISSLSCEDTQSKYRETCFVGSSKHIESENGNKGHINESEENEEAPVLETSLEICADDWSKGNVLKNSVGKNIEPVKILVPQESIACNNNPSPEPKILSEGPSNKKSNVVDNKSGKLTAYDLISNRVIKKPMAASALFIQDYRAQFLAENSKANLKDATVQIEELWKTLSE	74536	36633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_-_37822_38363_38487_59455_59573_74470
848077	contig_160_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_156330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGATTTCATTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236779	238815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_236800_238800
848078	contig_8658_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_55830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGGCATGTGTTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88002	86218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_86200_88000
848079	contig_14133_pilon	+	431	4	Intergenic	novelGene_119903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	26.9938264547038	2	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	9	431	107814	110627	FALSE	35	TCTAAGAAGTAAGATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGDGAVKPLQSAMKLANGAIELDTGNRPREAYTEYLRSIHYISQVLLEEAEMIKEAGEIVPPDTSKMLKLAEQCLERAQSTAAKLGKPCLKPAKPVTAAVPSPTSRHRRVYSDEGGKLSPFLPPEIFQKLQMVESQN	107805	110627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_107913_109350_109427_110276_110370_110472
848080	contig_14225_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_52770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTCTCTTTAAAGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545628	547653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_545600_547700
848081	contig_990_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_76081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118053	1117052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1117100_1118100
848082	contig_11574_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_64106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563412	562847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_562800_563400
848083	contig_3394_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_152688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTTTTTTAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451902	453056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_451900_453100
848084	contig_10600_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_169864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAAAAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124515	125768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_124500_125800
848086	contig_2933_pilon	-	895	2	Intergenic	novelGene_111303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246871	241937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_242187_246225
848088	contig_4232_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_63427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATTGAAGAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493004	492021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_492000_493000
848089	contig_5917_pilon	+	823	3	Intergenic	novelGene_122138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	36.5	95	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTAGTGTTTGATTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204849	208461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_204875_205307_205830_208185
848092	contig_11028_pilon	+	1129	4	Intergenic	novelGene_163958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	134.92055275441	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	532	555	858596	864047	TRUE	55	CGGGAAAAAACTAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTREEEAQFSTTRRWLLLPPESASALAPSPPCPPPALLSARSPSLPLSLEGKVCNARNCLGKLNKGKPKGNDLKRTCFVPVKRPAGKSTPTLSSFEVASVCVCVCVSSKKQRRHKQLYVSALIRKLLAIEVNQQRKEYSLEPPAPQLKLHCFLSRYSNGDSWKTCISEKRSFQWKFMTHAGLR	858064	879071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_858609_864036_864176_870587_870730_878767
848093	contig_3153_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_104676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATTAAACTAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220008	221217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_220000_221200
848094	contig_4429_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_50817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGTATAACTGCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200556	200305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_200300_200600
848095	contig_12622_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_5786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTACTATTATAACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173673	174358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_173700_174400
848096	contig_5039_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_64804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGCAAAAAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204096	204754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_204100_204800
848097	contig_987_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_72248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCAATTAATGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337807	336595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_336600_337800
848098	contig_6635_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_127004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGATACAACTACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335682	334212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_334200_335700
848099	contig_6418_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_81129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCAAAACTTTTTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112070	112414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_112100_112400
848100	contig_10324_pilon	-	1523	6	Intergenic	novelGene_7907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.979795897113271	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	879	1298	816890	815398	FALSE	10	CCCATGGGTATTTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVAKAGLEHLAGKLLYITVEDSRFAGKELDPQTANYLPDLLGVVEEKLLKLQRQLESLDLPEMLQHIADREFYASLEGKLPLHNTRIDLPLVSSKDKFFDEEESEDDDNHVVTRAALKILSQKFIESRSKKRSRSRRS	818798	815172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_815517_815710_815796_816251_816408_816830_816988_817071_817234_818179
848101	SIRV6	+	336	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10485	5	1248	-3	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11485	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11500_11800
848102	contig_10581_pilon	+	1558	4	Intergenic	novelGene_41377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	9.93310961716756	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	389	571	534917	549192	FALSE	20	CACTGTAATGGCTTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRERGECESSEAPRLLQAGDERAARRAKGCRAERQEQTSTRRRRRQRGVLQAGCLGRRDSRRALASGTLCSLWSARASSLPSTPQPAWPRWSYSHPCSASAAHVCVVPGQHRNVDERVSWLNPRANKITMILIEKLIQQLEETKWKAQEKKKLLFRLIYVTNVFAVKEESTRASNLKCEYESGQAAAQF	530570	550179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_530882_534839_534926_540174_540238_549081
848103	contig_13607_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_170191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTGTTGAAATTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268045	269326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_268000_269300
848104	contig_1107_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_126602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGATAAATCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896837	896337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_896300_896800
848107	contig_12031_pilon	-	1351	2	Intergenic	novelGene_137566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	36	521	301709	299855	FALSE	30	CAGGTACCTCCAACAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALETLSCPQDMAPSHCAELKDQFLRLSHYRQLKTAEDYQALSRDIEAQVQQEGLREAGRIFYFSVPPFAYADIARNINSSCRPGPGTWLRVVLEKPFGHDHSSAQQLATELGSFFQEEEMYRVDHYLGKQVVAQILPFRDQNRKAFDHLWSRHHVERVEIIMKETVDAEGV	301744	299024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_299981_301349
848108	contig_5799_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_50272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTATAGTTTTAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272107	271871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_271900_272100
848109	contig_8017_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_65371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGGTTTCAGTGGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481597	1481867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1481600_1481900
848110	contig_15354_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_65721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATCAACAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513007	513595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_513000_513600
848111	contig_5047_pilon	+	1267	2	Intergenic	novelGene_157985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872491	873917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_872593_872751
848112	contig_9687_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_172727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41865	42251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_41900_42300
848113	contig_9036_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_155439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGGAGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52697	53281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_52700_53300
848114	contig_9995_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_47764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAAGTAACAACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699090	698698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_698700_699100
848116	contig_8310_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_75567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACCTCCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271244	271806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_271200_271800
848117	contig_3382_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_124229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTATTAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1949631	1950082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1949600_1950100
848118	contig_16578_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_148615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTATATAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57855	58702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_57900_58700
848119	contig_9389_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_84145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCCGCCCCACCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1822572	1821404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1821400_1822600
848120	contig_16846_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_82998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCTCCCACCAAAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580806	581623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_580800_581600
848121	contig_1734_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_164379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGTGGCACATATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584327	583162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_583200_584300
848124	contig_13810_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_177585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478	1984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13810_pilon_+_1500_2000
848125	contig_2646_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_69584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCTTCAAAGGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417169	1418044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1417200_1418000
848127	contig_15664_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_171506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57013	58393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_57000_58400
848128	contig_10962_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_103901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAATAAGTGTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328646	328062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_328100_328600
848129	contig_16525_pilon	-	502	6	Intergenic	novelGene_133796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2442.4398129739	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97647	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91886_95674_95725_96924_96975_97069_97133_97588
848130	scaffold_880_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_121516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	848	1186	571121	571459	NA	35	ACTGAGCACCAGATAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCDLLALLPLQLFNEKRLVGQVVSFFLPPCCQTAELASVWGEELSASPFSDLWLRSPLGLQVNEPIAKGTGLSLLLVTANSGNARLPGTRRPGFRTGSAFLTQLQRTPVRP	570273	572085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_570300_572100
848131	contig_15021_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_27002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAGAAGGAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496005	496647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_496000_496600
848132	contig_11396_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_71425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCATTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1754241	1752983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1753000_1754200
848133	contig_7189_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_117646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATAAATTACATGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304906	303221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_303200_304900
848134	contig_5696_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_117491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCAAAGAGAGACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181095	180505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_180500_181100
848135	contig_6551_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_155549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221844	220818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_220800_221800
848137	contig_14647_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_167373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55900	56176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_55900_56200
848138	contig_10023_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_123457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30029	33496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_30092_32702
848139	contig_3111_pilon	+	1412	12	Intergenic	novelGene_129987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	26.74241995021	1	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	840	572	1411	172077	178911	FALSE	10	GAAGGCTTCCTTCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATFNEDVQALKELVLHNPVTLKLQESQLPGPDQLQQFQVVCETEEDKFLLLYALLKLSLIRGKSLLFVNTLERSYRLRLFLEQFSIPVCVLNGELPLRSRCHIISQFNQGFYDCVIATDAEVLGAPVKGRRRGRGAKGDRASDPEAGVARGIDFHHVSAVLNFDLPPTPEAYIHRAGRTARADNPGVVLTFMLPTEQAHLGEIEELLSGGCHALGDQTSHTRGEAEGGERGAAALREAQDNPRDLQLLRHDLPLHPAVVKPHLSLLLFVELSALIRSG	170274	178912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_170335_170471_170634_171447_171605_171747_171909_172045_172137_173110_173356_173662_173783_174349_174464_174560_174656_176028_176119_176872_176944_178866
848141	contig_14811_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_74499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGCCCCAAATACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380173	380546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_380200_380500
848142	contig_4364_pilon	+	767	4	Intergenic	novelGene_143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3.09120616516523	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	1213406	1214187	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGERRGGLGLGATSRWGTPEKVQSYLGGPAPPSSVKLDLWGTLLVSAESPVGTSLQPSWEPGPCPSDSWSCQFPCPSDPRSPPPESQRVGCTGSSPARPERPTDGLSWGQRESACCAPGL	1213405	1215593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1213615_1213937_1214059_1214154_1214224_1215225
848145	contig_20561_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_166378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAAACAAAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124155	123090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_-_123100_124200
848146	contig_15982_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_145977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79652	80559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_79700_80600
848147	contig_8286_pilon	-	556	4	Intergenic	novelGene_139798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	188.900914649865	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	150	500	189870	179734	FALSE	25	CATATTGTCAGCAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKDCKESGVQLLGLPALCRPRSRGGRIPPQSLPKVSHHPFCLSVKGHVKMLRLAPEPYIVITGFEVTVIFFFIVLYLLRLDRLLKWLFWPLLDIVNSLVTTIFMIIVSVLALIPETTTMTVLGGVFGLVSVVCCIADGALIYRKLLFNPSGPYQKKPSHEQKLIL	190019	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_179860_182810_182907_184959_185077_189858
848150	contig_15185_pilon	-	1292	7	Intergenic	novelGene_99419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_3	18.1054012812629	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	2	1078	233099	231191	FALSE	20	ATCTAAGAGCCTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLVQNATFRCILATLLAVGNFLNGSQSSGFELSYLEKVSEVKDTVRRQSLLHHLCSLVLQTRPDSSDLYSEIPAVTRCAKVDFEQLAENLGQLECRSWAAKESLRALAKHELAPALRARLTHFLAQCACRVAVLRVVHRRVCNRFHAFLLYLGYTAQGAREVRIMQFCHTLREFALEYRTCRERVLQQQQKRATYRERNKTRGRMITETEKFSGVAGETPSNTAVPVAVGSGPGRGDADSHASMKSLLTSSPKDATHGRRSRGTVQSSSPVIPTPVGPSTAPPEEPLGSGSPTDTSDEIMDLLVQSVTKSSPRALAARERKRSRGNRKSLRRTLKSGLGEDLVQALGLSKGPGLEV	233100	230976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_231274_231347_231549_231623_231787_231867_232061_232154_232346_232776_232939_233015
848151	contig_10575_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_141818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTTCCAAGGCTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324366	325131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_324400_325100
848152	contig_9177_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_32729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	43	306	650083	650346	NA	90	AAAAAAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPRTRIVGSYDNSMFNFLKNCQTVFQFPKWLHHFTFPPTMYKDSLGCFWGRMSLKESDLGPVQPFTGCLTLGMSHIKSCAFLICKTGMIRSTYIYFIELF	650040	651522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_650000_651500
848154	contig_12031_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_137574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	133	312	390975	390796	NA	20	CCATCTTAGTCTGGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNGKNQWAKELECPWLNARSPGRLTEKAGRKAGFVTLLKPQGSPMAVPGLLESPALPCGPRPGGATTVFSLLLGELGPSSGCHGNPAGLTLQWTQSWYLEAKW	391107	390138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_390100_391100
848156	contig_4686_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_118509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTTACATATTTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403776	405213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_403800_405200
848157	contig_14033_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_167435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGGAGTATGTGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298585	298195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_298200_298600
848158	contig_7887_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_124897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	126	386	343628	343888	NA	45	AGAAAACTTCGGAAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEFPRKAGSVPVAGNFLTVTSPIQTPQSERSEAQVQVGHQPMPEDLGDVILTLPGPSDPCPGPPGLLPQCPAFGYFFHFIPWPRCHHHTHIPPPPPGLSLPCLPRLWALLLGTLLHIPSKLCPQITS	343502	343954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_343500_344000
848159	contig_13542_pilon	+	1369	6	Intergenic	novelGene_131542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	11.6721891691319	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	64	945	556885	561547	TRUE	15	GGCCTGGAGTGAGGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPATVLGAMEMGRRVDAAASAKAVRAFLERGHTELDTAFVYSYGRSESILGCLGLGWAAAAAEVTPAARPGHLAPPEGADLGRPDADRCAAVHRPTPAGPRSGCPASSPCRGADRPLLTPQLCELQALQTVKIATRASPWDGNSLKPDSLRSQLETSLKRLQCTQVDLFYLHAPDHSTPVEETLRACHQLHQEGKFVELGLSNYASWEVAEICTLCKNHGWILPTVYQLAPLPARHVQCHHPARGKGTLPLPQALWIEVRRLQPFGWGPADWQVQVRAQGWETAFGPLLWE	556821	565232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_557282_559915_560104_560273_560379_561127_561244_561471_561572_564832
848160	SIRV5	+	540	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	2	10	2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGCGGCTTTGGTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	2388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
848161	contig_5429_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_127818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAGAGTAGAACTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506121	505130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_505100_506100
848162	contig_9363_pilon	+	1193	9	Intergenic	novelGene_6699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	29.7856928742643	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	125	1147	1284441	1287989	FALSE	20	CCGTGAACACCTTCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQKSSQWLGLRKQSELELPSELQREPEKDFSSVGESATRMGTGVRTESGTATSVEVDDDPGASLFPVRAKRSGLLRNPPLPQPRICMWKYLDIHSMHRLEKTANVEEMREVLAELLGLSCPEQNLREAITLDLFSHALIFCRQQGFSLEQTSAACALLHDLHKACIATPLGNVEECYRYFISVLFCHGVRRPPFSIDLFNEEQLLALSDYVVNTYFRHFKLYKYVFTPQVRLDLSLTYVGLQPPKLWSEEKEGSEEAEEQAVTPQQQELEIVAQPEQESSQVSTLRAFIKTQLNKELGKLRQLVEEQLMASEERLSSKLAALEQPFQLPPGKGKTKTK	1284316	1288035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1284678_1284914_1284947_1285512_1285579_1285727_1285898_1286482_1286554_1286775_1286893_1286979_1287041_1287116_1287207_1287810
848163	contig_15354_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_65770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669980	669658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_669700_670000
848164	contig_7400_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_175058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455590	454374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7400_pilon_-_454400_455600
848165	contig_5894_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_83064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATTCCCATCTAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741992	740670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_740700_742000
848167	contig_61_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_177586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTAAATTTTGATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8960	7748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_61_pilon_-_7700_9000
848168	contig_8317_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_20152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTGTCACAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16440	16748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_16700
848169	contig_5590_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_163024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTCACTGGGGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341474	340934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_340900_341500
848170	contig_12113_pilon	+	1332	5	Intergenic	novelGene_134727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	12.7549010188241	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	119	844	40986	46509	TRUE	20	TTTAACTGTTTGCAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAPGAQFTLGLLLLLKLPGGTRAAPIDAHSLCYNFSSRQQWYIEIQGQVDGRTFLYYDYGSNNVITLGPLGTKVNGTDEWRDQTETLRDAAKLFKELLLDIKLENYKIRAPLTLQAKMCCQHKDGKRTRAFWQFGFDGYVFLLFDSENMKWSEGHPGSRLMRETWEKNEPLKMFFLTTSQGDCHRWLERFLAEWEKMLEPTAPVTMAAITAQANTAITQSPWMVLLIFSCSILLGIQGL	40867	48222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_41071_45021_45271_45535_45812_46393_46518_47742
848175	contig_9937_pilon	+	1336	3	Intergenic	novelGene_129224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_2	6	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTCCCAGCTGTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279711	308493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_280127_302281_302409_307699
848176	contig_11447_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_168104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	138	332	540514	540320	NA	50	TTTATATAATTTAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRVEAAQPVPQKHFTFRLKVKTTEFDPRAKQRLKKKKSHQTGCPMMCDGLLFLQEAVLCVAVLLFMAFLASKWHVEIKNGYSHCHPPPSTHSLQRTLAIGSADPGMYK	540651	540138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_540100_540700
848177	contig_6477_pilon	+	1993	12	Intergenic	novelGene_154200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	205	1365	825121	830346	TRUE	40	TGGGGAGAAAAGAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTCSPVSWSLGLGGSWSAASPGGRCQRSELGGEEASESATGWGLSWAGAPLSKGPAGGGLSACRFWASMPRGSVTLSRDAGDSGSGLVSKGSPISSSWTTDTTCLARRRFSERVAASGASGQGLPLPPVPSPPYSSPQSMGVPSARRCRLGSLLCMTMLSRYRLCFLCTAASFTALHDVLHDGLQHHLLICVLHQDEPGKVLKDQLLEPGQLRLAGGGQLPEQERDGDLQQRLPEEPLPHRAAVVVVFLQHPLQDPLDGLAQLLLGGPLPQLLVQEGLEGVHGVVHLLTHVDLGSLLKHRCTGHVETLLQPIEPQQLHLLVAALHLDGVVGQLGQLLHVLAQLVNAALVDDVQVHVGDLLEEDVPYLSEALAGGHHQGLQDGWDVGLDVVPDTHLCLGEDEGSDLVGQVLLGGNDLVHVGADDRFHGRSGQLQLGQHYLKVFLGLLIHHAVHSI	824916	839774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_825442_825918_826029_826175_826287_826500_826616_827179_827336_828139_828328_830186_830352_830445_830549_831121_831237_835718_835890_837236_837340_839643
848179	contig_6785_pilon	+	1672	1	Intergenic	novelGene_132582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTACAAATGAGGAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537413	539085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_537400_539100
848180	contig_15327_pilon	+	715	5	Intergenic	novelGene_70446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	8.57321409974112	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	12	539	275426	280626	FALSE	15	TAGGCTTCCTTTCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APDMAAAWCLRWGVSRAGAWLLPPPACCPRRTLHKQVDGAEFQSIYSLDKLYPESNGPDTAWKVPDDAKQANNDIPIDRLTISYCRSSGPGGQNVNKVNSKAEVRFHLATADWIAEPVRQKIAITDRKHESGKAATKKNKFCHQDKPKGRHGLRLPLQPAKTTLQGVRAAAAKSPLIP	275414	280802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_275612_276943_276981_279030_279091_279626_279710_280464
848181	contig_5744_pilon	+	937	3	Intergenic	novelGene_149342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGCAAGATGGGCTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641848	655742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_642269_648797_648916_655343
848182	contig_5423_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_85307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTAGGAATTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726486	726039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_726000_726500
848183	contig_13051_pilon	+	1423	2	Intergenic	novelGene_140125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	415	879	389473	402959	FALSE	60	AGGACTAAGTAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSESALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHAGPIVSVWHRELRKAKSNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTREFESVLVDAFSHVARYVVCLFVCFFFFFQCNTFLSFCSLHFCDSLCKLKTLYFKESVVEAILWLCFARPLTISII	389058	403503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_389624_402645
848184	contig_11855_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_67044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTCACCCAGTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982781	1982411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1982400_1982800
848185	contig_9424_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_143791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTAATGTCTCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277474	278717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_277640_278585
848186	contig_9527_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_134043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	23	370	315536	315189	NA	10	CTGCCTCCCTCCCTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCPLATMIRPSTATSLDTMTCPQYGIPRHRHFGARTAEEPRWCGKGQHTCPLLPKAEDRAWCTAPGAGLDRQAVNMNTFDEGSEWRGDGSLAPRCGRRWSAGRLGSLSRSTAPKAPRVLCT	315558	314483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_314500_315600
848187	contig_1719_pilon	-	868	5	Intergenic	novelGene_87370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	558.204711553029	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	76	615	803613	760866	FALSE	35	CAAGGTACAGAATGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLAVFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQRGSPFRKQHILNNLTPEVGCFSLHNGTFPSIPALSGIWRGRGCPCC	803688	760612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_761007_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
848188	contig_3742_pilon	-	1255	3	Intergenic	novelGene_177587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	5	3	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACATCATTAATCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170087	131015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3742_pilon_-_132100_133637_133784_170062
848190	contig_9272_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_125876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGGGTGTTGATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189030	188512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_188500_189000
848191	contig_7457_pilon	+	647	3	Intergenic	novelGene_31550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	36	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTCTTGTCTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820283	845497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_820365_840754_840821_844997
848195	contig_15293_pilon	+	1719	2	Intergenic	novelGene_146532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	809	1357	115250	115848	FALSE	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDSKGQRASEGGDSNKGLEAGNKKDGRESQEAAHVTLCNLPPPQRLWNHWGGGAVGRQEGANWEFVIEASVQMGTALLHLPEARGLLSERSVGLRQATSTGLRQAAPAPQPCDPRHSSLPSTPNAAARLHPSRQRLENCSLGSHQPKRTHLKETASSSPTGVHSHNPARAPASSPTGVHSH	114441	116210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_115747_115796
848198	contig_12841_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_55891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGACCGAAGCGAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892137	891288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_891300_892100
848199	contig_4364_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_4595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2164707	2163674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2163700_2164700
848200	contig_3151_pilon	+	1478	7	Intergenic	novelGene_139190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	45.5317349646254	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	600	1478	199696	222232	FALSE	65	AAAAAAATTAAAGCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNVISSTANHHILRTLSQCGAGVFEYFNSKSKHSWKTQIEDQMTRLHSPSCHSVSVKWQQLSTNLPEPLQAPAWVQSLFHNDRLLVYGFIPHCTQATLCALIQEKEFCTMVSTTELQKTTGTMIHKLTARALVRDFEYGILHENETHHQMKKQILKSLIIKISKENSLLTQFTSFVAVEKRDENESPFPNIPNILELIAKEDVDFLPYITWQEEQSGASMTQIISASSEWNEDLQHKSLTERKVKSPKPEVSEDVEVFNLATQLPVQPLILNSECGLVAKPLDLSWMNSLKK	199096	222232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_199813_200387_200559_201049_201131_202469_202551_203650_203747_206056_206180_222022
848202	contig_12967_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_169796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGTCAACTCGATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95241	94496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_-_94500_95200
848203	contig_4496_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_66642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTCAGGCATAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674424	673356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_673400_674400
848204	contig_15207_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_176367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCAGCAGAAAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16510	15615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_-_15600_16500
848206	contig_14807_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_124735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAGATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204951	206139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_205000_206100
848207	contig_91_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_127111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTTTTAGACAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396583	396143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_396100_396600
848209	contig_15034_pilon	+	642	3	Intergenic	novelGene_143635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	267	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTTAGAAAAAGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36232	42228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_36664_40329_40443_42130
848210	contig_6589_pilon	-	1224	2	Intergenic	novelGene_26275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	42	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGAATATGAGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2237564	2234636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2235736_2237439
848212	contig_11012_pilon	-	1224	4	Intergenic	novelGene_163684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATATGAATATGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430354	307907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11012_pilon_-_308818_317534_317584_331855_332072_430305
848213	contig_6445_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_76969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGACCGTCAGGGGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49124	47703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_47700_49100
848214	contig_17796_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_33776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACATAAACCGACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23397	24361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_23400_24400
848215	contig_3797_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_120082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCAAACTTAGAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320373	319317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_319300_320400
848217	contig_2114_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_104296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780137	779742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_779700_780100
848218	contig_15825_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_160205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAGGTTCAATTCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126654	124551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_124600_126700
848219	contig_12809_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_177588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGTAATAGTGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33619	32342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12809_pilon_-_32300_33600
848221	contig_14744_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_66145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATACATTTAAGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626925	1627859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626900_1627900
848224	contig_14034_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_72674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394647	394953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_394600_395000
848225	contig_2311_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_169808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165724	164671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_164700_165700
848226	contig_4131_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_127875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	264	584	225718	226038	NA	50	ATTTAAAAAATATATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVSSRVPRPPHFSPTGSYYSLEFDNLPEQLTELRKILCLRLQLCHSKKDLSKAMHRARPGRTPNMKLPCPKGRATLQALMSFTNHEAYGASVPRALTGGLITYT	225454	227399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_225500_227400
848227	contig_10299_pilon	-	1364	2	Intergenic	novelGene_79781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670059	667441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_667517_668770
848228	contig_6610_pilon	+	1146	1	Intergenic	novelGene_177590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	547	921	352777	353151	NA	0	GCGCTGGTGTGCGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHCPSSHGSTGLFLVSLLHWGDSLSPASPGRRSPPQSSLQSPQRLSPALRRLPALGEGILMWQHLLGRHGGAATLDLRTPPTQASSRGFKDRSRHWPLGHSWHKPCRHCTPSPGTRRADMSEQ	352230	353376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6610_pilon_+_352200_353400
848231	contig_5071_pilon	+	1732	1	Intergenic	novelGene_171276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133910	135642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_+_133900_135600
848232	contig_13051_pilon	+	1095	5	Intergenic	novelGene_140123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	62.0382946251749	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	675	1094	411044	427858	FALSE	60	TGTCAGAAAAGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSKSPPPKVTEEKKSLKRTFQQIQEEEDDDYPGSYSPQDPSAGPLLTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDV	389052	427859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_389624_410940_411075_419906_420020_422064_422192_427709
848233	contig_4364_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAAACCAATCTCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977787	979071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_977800_979100
848234	contig_5954_pilon	+	766	7	Intergenic	novelGene_28588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.15539510420646	135	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	317	733	943918	944732	FALSE	60	AAAAAGCCAAAAAGACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGPRARRAHRPREQDRDVQLSKALSYALRHGALKLGLPLGTDGFVPLRALLQLPQFRSFSAEDVQRVVDTNGKQRFALQPGDPRTGPLIRANQGHSLQVPELELMPLETPQALPPVLVHGTFWQHWPSILLRGLSCRGRTHIHLAPGLPGDPDVTSGMRPNCEVAVFINGPLALADGIPFFRSANGVILTPGNADGILLPKYFKEALQLRPTRKPLSLSGDEEGECQSGPEHNLREGRMVQQ	942775	944765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_942822_943032_943115_943640_943811_943899_944075_944279_944337_944412_944524_944640
848235	contig_11525_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_171090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102822	101057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_101100_102800
848236	contig_10734_pilon	+	1570	6	Intergenic	novelGene_51027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.07543101617981	27	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	90	551	355406	369575	TRUE	40	TAAGGATGAGACATTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEENKQLLTNLSHKDVSLSDEEFQRHEGMSERERQVMKKLKEVVDKQRDEIRAKDRELGLKNEDVEALQQQQTRLMKINHDLRHRVTVVEAQGKALIEQKVELEADMQTKEQEMGRLRAELGKLRERLQGKLSQNGEEEPEMEPGAEEGVSEADKLAMELTDPNRPPIHAAGAAGCAARTQ	344107	382159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_344195_355403_355523_356175_356398_369452_369627_372178_372272_381284
848237	contig_5331_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_112803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGGGGTTGGGGCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702508	703010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_702500_703000
848238	contig_5331_pilon	+	164	1	Intergenic	novelGene_112804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGTCTTGGTGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702957	703121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_703000_703100
848239	contig_17311_pilon	-	1590	2	Intergenic	novelGene_57876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	336	494	288446	288288	TRUE	75	AGGAAAAAAGTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNQTSAAQDWGKAFRNEGSKPKIWFESHPSPLYRLSNHRKAGLPRERLFGPIKKLAPPGGVPEDPRPDLLHPYKPLRLLFWEPSWRHKFRRARLLGQPNRAASFAFTHFLSMAATTGLGTVRLHSWRASRSELLGVWRGPPGVGGEHPVRPGDFSRGISPSAP	288781	272706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_273766_288250
848240	contig_9377_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_176304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCTTGTCCTGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418232	417431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_-_417400_418200
848241	contig_5236_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_100934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTACCTATGTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934054	933505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_933500_934100
848242	contig_6589_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_25993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAGGGGGAAACATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388237	1387759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1387800_1388200
848243	contig_13209_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_177591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACACTCTCCCCTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64607	65546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13209_pilon_+_64600_65500
848244	contig_5698_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_54994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTATGTACTGCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	4920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4000_4900
848245	contig_3601_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_132898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGCATATCTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188433	187520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_187500_188400
848248	contig_9481_pilon	-	715	2	Intergenic	novelGene_149648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	626	junction_1	0	233	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170870	149303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_149751_170602
848249	contig_6191_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_107857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194699	193638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_193600_194700
848250	contig_5918_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_99517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGATTCTGTTCCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515913	516776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_515900_516800
848251	contig_13044_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_100011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGATCCTTATATCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258747	257670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_257700_258700
848252	contig_13044_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_100010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACACAGTAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257068	256725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_256700_257100
848253	contig_11026_pilon	-	1083	2	Intergenic	novelGene_167652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112312	110430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_111412_112210
848254	contig_10244_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_171058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCGTTGAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28763	26843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10244_pilon_-_26800_28800
848256	contig_10051_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_175604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCTTGGAGAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471886	473098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_+_471900_473100
848257	contig_12357_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_6141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAGGACCTCCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37847	38980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_37800_39000
848259	contig_4686_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_118584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGTCTTGAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784778	783989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_784000_784800
848261	contig_8671_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_126265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTTTCAATCTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520877	519815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_519800_520900
848262	SIRV2	-	272	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	676	0	676	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4056	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
848264	contig_10857_pilon	+	572	2	Intergenic	novelGene_160885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21874	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21996_66447
848265	contig_4519_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_123650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAATTCTTCCTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19421	21172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_19400_21200
848266	contig_2069_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_23377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAACTGCTAACTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057231	1057622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1057200_1057600
848267	contig_1639_pilon	-	244	6	Intergenic	novelGene_74918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	68.281769162786	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAGATTTCGGTCCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340253	336033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_336066_336879_336926_338166_338210_338868_338933_339112_339150_340231
848269	contig_14275_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_162867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328456	330126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_328500_330100
848270	contig_13937_pilon	-	1099	7	Intergenic	novelGene_167355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_3	17.3757493843191	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	54	857	62067	54168	FALSE	0	GCTTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICKLGFEVVENRDINSIVTENGEVCWKTITECVSFTESDQSLDYQGSVRRLGPLCEAVHLHFSSLTKAQFEIRYAPWFQWTNFPELFPEIFDALESLQSAAISLSLTKLTSCLERALGNVFLLVGKECPFLLRDLLASDELAQVFGQPVMDVLKVFVGSPSGLNLRNVLWHGFAAPQEIPPKYCSVMVLLTAGLGQLLKRFLRQTNRTLWHRSFLALTNLEDWIVFPDVTSEALSVLEDVMKKSTFVFKTMLPYWEAAVIKFRSHR	62120	53925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_54287_54957_55095_55517_55616_57597_57688_57975_58078_59681_59822_61949
848273	contig_15104_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_163353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588685	589035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_588700_589000
848274	contig_15666_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_70107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGCTCTTATATTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45001	45814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_45000_45800
848277	contig_1107_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_126555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAAAGATGAGACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209726	210854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209700_210900
848278	contig_11566_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_166710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAGAAAAGAGAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213801	211857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_211900_213800
848279	contig_5344_pilon	-	486	2	Intergenic	novelGene_125336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAACAATTCTTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70868	68165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_68514_70730
848280	contig_6364_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_51748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTTATGAAGTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573345	575065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_573300_575100
848281	contig_10042_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_79131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAATGCTCCTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70066	69375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_69400_70100
848282	contig_10016_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_117842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAACGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214519	213316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_213300_214500
848284	contig_15277_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_175424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGTTTGACACAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227902	228325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_227900_228300
848286	contig_1996_pilon	+	1282	2	Intergenic	novelGene_131890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	71	562	229351	231240	FALSE	45	TTATGCAATTTAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPFHELTAHEAACAHPTKTGNELMEILDEMDQGRRKEMQLYNSIFSLLSFEKIGYTEVQFRPYRTDDFITRLYYETPRFTVLNQTWVLKARVNDSERNPNLSCKRTLSFQLILKSKVNAPLECSFLLLKGPYDDVKINPVIYHFVFTNESNETDYVPLPITDSVECNKLLAAKNINLRLFLFQIQK	229280	231960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_229451_230848
848287	contig_8276_pilon	+	978	3	Intergenic	novelGene_174484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	1.5	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	275	595	159132	164086	FALSE	25	AACAGTACTTGGGATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGALRYGRKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLENKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIRHEIESH	158857	164469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_159263_161606_161716_164005
848288	contig_10575_pilon	-	700	2	Intergenic	novelGene_141817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322474	320660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_321036_322149
848290	contig_4232_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_63441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACACTGGGTTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531945	530502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_530500_531900
848291	contig_11145_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_160531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGCTGAAGAGCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273433	274353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_273400_274400
848294	contig_1575_pilon	-	917	2	Intergenic	novelGene_45162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAGACCAGAACACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54847	53855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_54017_54091
848297	contig_15909_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_176419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCCGTCTTCTCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9105	8388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15909_pilon_-_8400_9100
848298	contig_13593_pilon	-	335	3	Intergenic	novelGene_156135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	19	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	249	87	335	144012	127573	FALSE	60	AACATGATAGAAGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSEGTGVALGRNQPLKKEKPKWKSDYPMTDGQLRSKRDEFWDTAPAFEGRKEIWDALKAAAHAFESNDHELAQAIIDGANITLPHGALTECYDELGNRYQLPVYCLAPPI	195594	127572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_127647_143837_144075_195570
848301	contig_12852_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_141437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGCCAGTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322574	322123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_322100_322600
848302	contig_14666_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_39486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACGAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301189	299925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_299900_301200
848305	contig_15123_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_110899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGATAATTTGGAGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113663	112807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_112800_113700
848306	contig_10011_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_68110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCTGGTGGTACCTGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327397	328242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_327400_328200
848309	contig_8864_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_135988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTATTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242712	243461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_242700_243500
848311	contig_5690_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_119706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGAACTCCTCCAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940721	939963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_940000_940700
848312	contig_6503_pilon	-	1014	6	Intergenic	novelGene_145801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.6651405201564	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	81	731	1429423	1414366	FALSE	30	TTAATTCTCCTGCTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSAEFRRSKAQFLGKADLSRKGSVDEDVVELVQLLNTRDQFFTTSSCAGRILLLDGGVNGFEVQKQNCCWLLVTHKPCIKDDVIVALKKANGDAILKFEPFILHVQCRQLKDAQLLHSAAVASGFRNSGITVGKKGKTMMAVRSTHSLEVPLSHNGKLMVTEEYIDFLLNIANQKMEENKKRIERVFDLKKQIVCCRSYMKITSQKYHQQGVHF	1429503	1414082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_1414457_1415203_1415338_1417671_1417744_1423697_1423797_1425476_1425558_1429249
848313	contig_16360_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_170073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	316	897	93797	93216	NA	30	AGACATGCTAAAGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTGFSSPNPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLNSSSSSSSNSSNEREDFDSTSSTSSTPPLQPRDSASPSTSSFSCLGVSVAASSHVPIQKKLRFEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKHKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKGNQGQNP	94112	92358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_92400_94100
848314	contig_7378_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_120247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATAAATTTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303430	302448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_302400_303400
848315	contig_13097_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_107689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCACTTACCACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148651	147389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_147400_148700
848316	contig_6589_pilon	+	1372	7	Intergenic	novelGene_26186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.21749194749951	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	120	938	1914783	1924137	FALSE	0	GGCTGCGTTTGTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGRVHQAAPLSEAPHDDAHGNFQRIVDRMDRAGDGDGWVSLAELRAWIAHTQQRHIRDSVSAAWDTYDTDHDGLVGWEELRNATYGHYAPGEEFHDVEDAETYKKMLARDERRFQAADQNKDSVATREELTAFLHPEEFPHMRDIVIVETMEDLDKNKDGYVQVEEYIADLYSEEPGKEEPAWVQTEREQFRDFRDLNKDGHLDSKEVGHWVLPPAQDQPLVEANHLLYESDTDKDGRLSKAEILGNWNMFVGSQATNYGEDLTRPHDEL	1914250	1924571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1914279_1914691_1914857_1917454_1917658_1919300_1919474_1921290_1921352_1923529_1923730_1924029
848319	contig_10437_pilon	-	661	3	Intergenic	novelGene_38481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.5	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	27	434	1205322	1204859	FALSE	25	GACTCTCATATGAGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARAERQRMLSGRLVRRLVSMAGRVCLSRGSAGSATVGPVEAAIRAKLEQALNPEVLELRNESGGHAVPPGSETHFRVAVVSARFEGLSPLQRHRLVHDALSEELAGPVHALAIQARTPAQWRENPQLDASPPCLGGSKKTRE	1205718	1204631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1204864_1204919_1205326_1205695
848320	contig_2278_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_118133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAAATCAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031607	1032704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1031600_1032700
848321	contig_5945_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_104579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGGGGCTTCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245548	246108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_245500_246100
848324	contig_11335_pilon	-	830	2	Intergenic	novelGene_104946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	0	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACAAATCAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459613	458548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_459279_459513
848325	contig_6191_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_107836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128889	128165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_128200_128900
848327	contig_1154_pilon	+	1335	3	Intergenic	novelGene_87182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	63	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	76	636	1013300	1015757	FALSE	20	ATAAAGCCTTTTGCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHPRKRAGRNEPLKKERLKWKSDYPMTDGQLRSKRDEFWDTAPAFEGRKEIWDALKAAAYAAEANDHELAQAILDGASITLPHGTLCECYDELGNRYQLPIYCLSPPVNLLLEHTEEESVEPPEPAPSVRREFPLKVRLSTGKDVRLSASLPDTVGQLKRQLHAQEGIEPSWQRWFFSGKLLTDRTRLQETKIQKDFVIQVIINQPPPPQD	958953	1016456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_958976_1013246_1013475_1015371
848328	contig_18799_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_171423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATCTCGTTGAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51439	50481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_-_50500_51400
848329	contig_12437_pilon	-	1214	2	Intergenic	novelGene_169087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGTGCTTTAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166361	135870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_137020_166296
848331	contig_7179_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_78111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAACAAGAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692091	691134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_691100_692100
848332	contig_2113_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_161144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCGAAACTTAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197180	198261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_197200_198300
848336	contig_151_pilon	+	895	2	Intergenic	novelGene_132567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAATTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208716	217624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_208856_216868
848337	contig_9468_pilon	-	1421	3	Intergenic	novelGene_59511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_2	13.5	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGTGATTGCTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369835	360302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_361076_361822_362005_369369
848338	contig_6833_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_175131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCCTTTCTATCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225717	224524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_224500_225700
848339	contig_11396_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_71394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5057	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554945	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554470_1554871
848340	contig_5954_pilon	+	625	7	Intergenic	novelGene_28724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	11.8274633328068	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	117	470	1167641	1169262	TRUE	15	CTGAGCGTTGACTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPAELRNRQGQDHWRLPAAGQVRHPHGGAYHPRRAQRQPGRRAPQLLPEQSRLGAGAPAPLGGYPNEAAAEVVLTALREWLEQHKDKVDRLVICVFLEKDEDIYRHRLPYYFPVA	1166508	1169583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1166579_1167594_1167712_1168282_1168405_1168758_1168833_1169064_1169147_1169257_1169292_1169457
848341	contig_15500_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_128985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_3	24.5537958142705	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	21	404	227727	233119	FALSE	20	TATGGTATAGTGTGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCLIRFMLEPDPERRPDIFQVSYFAFKFAKKDCPVSNINNSSIPTALPEPMTASEAAARKSQIKARITDTIGPTETSIAPRQRPKANSTTTTPSVLTIQSSATPVKVPAPGEFGNHRPKGNIVLPVRSSLLVT	219163	233567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_219179_227721_227826_229528_229609_232914
848342	contig_11396_pilon	-	672	4	Intergenic	novelGene_71289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_3	739.019771198459	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	115	492	249053	242976	FALSE	15	CGCTATGCTTTATACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAGQDINLNSPHKGLLSDSMMDVPVDTGVAARTPAAEGLTEAEEEELRAELAKVEEEIVTLRQVLAAKERHCGELKRKLGLSALDGLRQNLSKSWHDVQGSSAYMKTSEKLGEWNEKVTQSDL	249167	242795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_243040_243744_243894_245696_245843_249034
848343	SIRV4	-	206	1	Genic_Genomic	SIRV4B	novel	NA	NA	NA	NA	1317	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3841	3635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV4_-_3600_3800
848344	contig_10581_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_41361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98870	99579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_98900_99600
848347	contig_6387_pilon	+	446	2	Intergenic	novelGene_165428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	315	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGCAATTGAGTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74742	93278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_74984_93073
848348	contig_10082_pilon	+	887	2	Intergenic	novelGene_63834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAGCGGAGCCGAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6965	9179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_7551_8877
848349	contig_753_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_112898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGAATGATTGGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263279	264061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_263300_264100
848350	contig_6175_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_16272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	328	633	13714	13409	NA	20	TATTAAGTCTGTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSTQLLPSTLGPPSPSILAEDQHFRVLAHRHLHPPFSWLCCHPTPGEPHPFFLDSRGDLLTCLSTLFLPHPFEPIPCQQPEAQTQSYYRAQTALETSAP	14041	12223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_12200_14000
848351	contig_10708_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_174353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTAAGAAATGCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431067	432165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_431100_432200
848352	contig_10042_pilon	-	813	6	Intergenic	novelGene_79162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	13	junction_2	69.8369529690407	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	97	507	729444	717079	TRUE	30	TATAAATATGTCATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLFHKKNIISYFFFIHRQLFRIEGVKSVFFGPDFITVTKESEELDWNLLKPDIYATIMDFFASGLPLVTEETSSGEAGSEEDDEVVAMIKELLDTRIRVHDSVKNIQAYIETGPRGNKTDPQADCAGRWRRCHL	729540	714555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_714726_716942_717118_720481_720555_721699_721761_725762_725878_729321
848353	contig_11269_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_145815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAACAATTAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301152	300241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_300200_301200
848355	contig_4364_pilon	+	303	3	Intergenic	novelGene_733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	255	49	303	1530895	1531228	FALSE	30	TGGCACCACACTTTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVLSARCCLPASPIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKI	1530476	1531228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
848356	contig_7898_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_47554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCCACGTGCTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318706	319112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_318700_319100
848357	contig_6506_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_153488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATGGATGCCACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172031	171661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_171700_172000
848359	contig_7898_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_47505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTCTGCTTCAGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131463	130230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_130200_131500
848360	contig_1244_pilon	+	375	4	Intergenic	novelGene_38057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTTAACAAGATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041453	1045218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1041582_1043639_1043722_1044557_1044664_1045159
848361	contig_10594_pilon	-	720	7	Intergenic	novelGene_142317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	299	junction_6	69.6076304884904	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	10	663	298247	245965	FALSE	30	GCTGAACCAAAGCCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVEPETSPTPNPLPTEEEKTESNQEIANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENRDAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV	298256	245907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_246080_248490_248631_249627_249742_250651_250716_257917_258014_265849_265957_298229
848362	contig_6102_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_32017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAATAAATAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502542	504228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_502781_503616
848363	contig_6058_pilon	-	1015	6	Intergenic	novelGene_172374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.4	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	18	881	285527	272197	FALSE	20	TTTTGAGTTCAATGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALWALLALGCLWLGSAVDLQPQLASMTFVTNNPTLTTVALEKPLCMFDSSAALVGTYEVYLYVLAESPSFRNASVQDRTGVPLSSTFRQTEGGRTAPYKAAAFALQPCSDLPSLDAAGDASQASEILNTYLVRVGANGTCLSDPNFQGLCNPPLSAATEYRFKYVLVNMSTGLVQDQTLWSDPIRTNRLTRYSAIDMWPGRRSGGMIVITSVLGSLPFFLLLGFAGTIFLSFVDTGSPDGGTVHDSQVTQEAVPKSLGASEPSDASVNRGPPLDRAKVYSSKLQD	285544	272062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_272357_275085_275219_277488_277572_280073_280354_284312_284469_285475
848364	contig_7494_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_167440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAATTGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39843	40115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_+_39800_40100
848366	contig_12943_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_140358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATTTTTTAATTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39022	38597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_38600_39000
848367	contig_8357_pilon	+	478	2	Intergenic	novelGene_39769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCCTCCCGATGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883703	884267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_884072_884157
848368	contig_12125_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_76212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCAACACCCCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187103	188308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_187100_188300
848370	contig_4686_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_118510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTTACATATTTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403776	405213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_403800_405200
848371	contig_3975_pilon	-	832	4	Intergenic	novelGene_54704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	0.471404520791032	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	275	601	1349463	1347590	FALSE	70	TAATTAAAACAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYLSESDFVMVEEGFSTRDLLEELTLGASQATTGKVAAFFVADLGAIVRKHFGFLKCLPRVRPFYAVKCNSSPGVLKALAELGLGFSCANKVSPLPPAGVLNLAAY	1350496	1347358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1347812_1349358_1349545_1350199_1350321_1350424
848374	contig_34_pilon	-	605	3	Intergenic	novelGene_40046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2444	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247100	236482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_236819_243214_243354_246970
848375	contig_15062_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_162296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAACCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51106	52325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_51100_52300
848376	contig_1008_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_121583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATTTGTGCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690202	691289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_690200_691300
848379	contig_12327_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_140661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGATAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064516	1065437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1064500_1065400
848380	contig_8161_pilon	-	1427	3	Intergenic	novelGene_156770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	6	35	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	354	584	340222	339992	FALSE	45	TGTTAAATATTATACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKRTPSLQSLHLVSSSHQHRKAASFQNLHSLLRSKVDRSSLYLIGEPEDHSATGRPAKAPPRRALSVEDVGAPSLARTVGRVVEVYPDGTSQLQLQRSPEGTFGFCVASGNGRRDSGMPPPVPGFHSPGALVEHKPCQKPVIRGFFRPLPQPWSSRFREPLNQRTRILPLGALSEELRAPSEPDFQDPVPVQP	345878	339148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_340410_341698_341827_345840
848381	contig_7416_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_134322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAACACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98538	97090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_97100_98500
848382	contig_6808_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_173528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	185	475	221797	222087	FALSE	15	TTCTGGGAGCGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNQVLPPGVSLGNGLTPGAAKDLGLPVGIAVASSLIDAHAGGLGVIGADVRGHGLACEGQPMTSRLAVICGTSSCHMGVRLPGTKAGPLHSVEGSLGGDPEVLAPSPLDSISLFPSCLLVLCLARSPALSLTAFLRFARSFPRHQIFKMCGNGCICL	185801	222256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_+_185933_221743
848384	contig_7720_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_155785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	693	1079	807204	807590	NA	75	CGAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAPEMDNGGNCPSPQYLMLLNRSRRTKSFQLLPNAAASPAALQMIHGGGQEAVPGAQLASMHPSISGTHHIPRETRSLCQEDACPWYGVLGALEFRRAEGPSSARACPCVAEFGQLTYACTLKEKK	806511	808378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_806500_808400
848387	contig_6017_pilon	-	246	2	Intergenic	novelGene_152548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6688	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTTTTAATATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442225	440562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124
848389	contig_5236_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_100921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669882	671226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_669900_671200
848390	contig_6199_pilon	-	1175	3	Intergenic	novelGene_126420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	531	41	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	174	665	727793	717577	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKVRTKFVCKQGTRRMLGVCCNKPLSLRPLFPFGSWLGLSGRPRSACGVWKSPCSSVNF	727966	717066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_717868_725503_725694_727782
848391	contig_6048_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_73141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGCATGGTTATACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010994	1010248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1010200_1011000
848392	contig_13778_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_70862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGGCTTATCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318811	317071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_317100_318800
848393	contig_7457_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_31668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATCCAGTGGAGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125757	1126621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1125800_1126600
848394	contig_17198_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_62381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957658	958728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_957700_958700
848396	contig_6885_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_83691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAATGAGCATTCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266387	267120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_266400_267100
848397	contig_15596_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_139551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	93.5	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	44	523	217105	206528	FALSE	45	ATAGCTTGAAATCAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKVSVCCGVCSVCRLIA	217148	206221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_206826_215682_215829_217069
848398	contig_5331_pilon	-	803	8	Intergenic	novelGene_112813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCAACGTCCGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741597	711270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_711303_715043_715080_715219_715271_716506_716641_724567_724746_727438_727544_741169_741240_741400
848399	scaffold_17542_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_139224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCTTAATAAAGCATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318201	319879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_318200_319900
848400	contig_2940_pilon	-	462	3	Intergenic	novelGene_81938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9688	5	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	166	411	720887	717705	FALSE	20	CTATCTGGTATGTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLGAACRVAAFPPQEEELESAQTLNHQCVVFQRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE	723513	717653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_721028_723488
848401	contig_10307_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_170259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTAAAATAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384863	383493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_383500_384900
848404	contig_4151_pilon	-	696	5	Intergenic	novelGene_65208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	8.4372685153431	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	10	696	254597	97433	FALSE	25	GCTCTTTCCATTTTAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAMESQKEALTPGHPVARLPGDLTSQISNEEEEREGGAAPAVTTLRTEADGTSADGLWELPVEPTERRPECSRCSRPQKVCLCPFLPVHPLHISTRLYIIQHPAEENKVLRTVPLLAACLPRDKCKVKIGRRFSEERDPELSAVCQKSGTLILYPGAEAANLEEYVLDSPVYPSTVIIIDGTWSQAKDIFYKNSLFRLPKQVQLKTSISSQYVIRMQPTNSCLSTLECAAV	254606	97432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_97523_179461_179655_191437_191533_207517_207609_254379
848405	contig_4364_pilon	-	1927	14	Intergenic	novelGene_4577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.2966892442366	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	5	1549	1939981	1875129	FALSE	75	AATCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMHRLTENVYKTIMEQFNPSLRNFIAMGKNYEKALAGVTYAAKGYFDALVKMGELASESQGSKELGDVLFQMAEVHRQIQNQLEEMLKSFHNELLTQLEQKVELDSRYLSAALKKYQTEQRSKGDALDKCQGELKKLRKKSQGSKNPQKYSDKELQYIDAISNKQGELENYVSDGYKTALTEERRRFCFLVEKQCAVAKNSAAYHSKGKELLAQKLPLWQQACADPNKIPDRAVQLMQQMTSSNGAVLPGALSASKSNLVISDPIPGAKPLPVPPELAPFVGRMSAQDGAPVMNGISAPDSEDYNPWSDRKAAQPKSLSPPQSQSKLSDSYSNTLPVRKSVAPKNSYATTENKTLPRSSSMAAGLERNGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEKTKMRGWFPFSYTRVLDSDVSDRLHMSLQQGKSSSTGNLLDKEDLALPPPDYGTSSRAFPAQTAGTFKQRPYSVAVPAFSQGLDDYGARSVSSGSGTLVSTV	1939985	1874750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1875160_1875850_1875886_1876518_1876682_1877252_1877322_1879451_1879654_1880645_1880848_1880980_1881206_1884312_1884466_1893436_1893575_1894243_1894316_1895443_1895506_1921875_1921963_1925745_1925822_1939951
848407	contig_9389_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_83859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	984	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTCTGCCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9609	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9730_11447_11562_12189
848408	contig_1939_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_144873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGGAGCATTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394163	396112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_394200_396100
848409	contig_13718_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_142896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAGTAATTAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227395	228612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_227400_228600
848412	scaffold_7386_pilon	+	474	2	Intergenic	novelGene_136603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	343470	343835	TRUE	5	CTTGGGCTGTGCTACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVAVRGDGGEEADAHVGVDIVEALQHAAPGVLAGPAHRAQREQDPRQAQQQQAVGRHQVDHVDACLRPLAQTAAEDPERQAVEQGPQPQDEADGGAGGHLQQGAPVHAAVAGGVAGGYHP	343469	345391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_343869_345316
848413	contig_7962_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_149306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTGAGTATGAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398668	397339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_397300_398700
848414	contig_15762_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_177360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240835	240238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15762_pilon_-_240200_240800
848415	scaffold_13505_pilon	+	736	4	Intergenic	novelGene_111568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_3	72.692655902933	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCACTTCTCCAGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608578	613610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_613391
848416	contig_9527_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_134085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	145	498	495981	496334	NA	45	AAAAATCTCTTTGCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSALPKIKTHLVCSQKKHPQKNPPQKNASQNSTPAHSENNCPGVSQEMPRKMVAVDCEMVGTGPKGHVSSLARCSIVSYDGDVLYDEYILPPCHIVDYRTRWSGIRKQHMVNATPFKIARSQVRGLGHAAVSKVGGERSQSFFSKRYHPGKVPKDCRRRERSAR	495836	496838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_495800_496800
848417	contig_8616_pilon	-	1016	4	Intergenic	novelGene_72422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTCCAGAGACCCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251939	249555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_250004_250484_250669_251430_251490_251614
848418	contig_8991_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_170935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATGAAAATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61440	62444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_61400_62400
848419	contig_11378_pilon	-	1018	4	Intergenic	novelGene_112321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	27.6325090347503	24	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	162	791	1169877	1168428	FALSE	20	CTCAATTTCCTCTTTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWVSSLLGPVLPLAHPEPAVCRRWGPETSGGLFTTICTGSTRRRGTLRAAAVVMPDPAAHLPFFYGSISRSEAEDHLKLAGMADGLFLLRQCLRSLGGYVLSLVHDVRIHHFPVERQLNGTYAIAGGKAHCGPAELCEFYSRDPDGLPCNLRKPCNRPPGLEPQPGVFDSLRDAMVRDYVRQTWKLEGEALEQAIVSQAPQVEKLIATTAHERMPWYHSDLTREEAERKLYSGAQTDGKFLYVEAGAWGFGAVRTRTWGPGS	1179431	1168200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1168656_1169475_1169922_1179105_1179172_1179380
848422	contig_11677_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_85889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCTTGGTTTCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407379	407725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_407400_407700
848423	contig_8177_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_86491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25776	25151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_25200_25800
848424	contig_2733_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_128581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGACTGGTGGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821959	772077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_772160_821546
848425	contig_12277_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_139665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCTGCCTTTGACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28034	27356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_27400_28000
848427	contig_10063_pilon	-	893	2	Intergenic	novelGene_127760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	185	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGCAGAGCTCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730280	729280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_730074_730180
848428	contig_5894_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_83033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAATATTATGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364914	364104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_364100_364900
848429	contig_9843_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_114344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267766	268643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_267800_268600
848430	contig_9471_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_21750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318652	319114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_318700_319100
848431	contig_4364_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_4596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAACCACTACGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2177148	2176230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2176200_2177100
848433	contig_9730_pilon	+	610	3	Intergenic	novelGene_150636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	38.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	191	610	623594	643842	FALSE	15	TCGGCCTTCACCAGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLILINSLPLVSDAETSLTCIASGWHPHEPITIGRDFEALMNQHQDPLEVTQDVTREWAKKVVWKREKASKINGAYFCEGRVRGEAIRIRTMKMRQQGSFIHSVPRHEVPDILEVHLPHAQPQDAGVYSARYIGGNLFT	578443	643842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_578617_623576_623889_643717
848435	contig_8065_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_107339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATCATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209453	208776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_208800_209500
848436	contig_1107_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_126562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTGATATTTAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455778	456708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_455800_456700
848437	contig_2332_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_58703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722608	721504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_721500_722600
848438	contig_3960_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_138022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGGAAAAAAATTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453148	454063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_453100_454100
848440	contig_14740_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_174684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTAGTGGGCCCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140607	141038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_140600_141000
848441	contig_2487_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_148457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTAAAAGAATCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128972	128579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_128600_129000
848442	contig_5039_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_64906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667059	667472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_667100_667500
848443	contig_8712_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_58749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTTTTATGCAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102140	102604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_102100_102600
848444	contig_628_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_130246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGGATTAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228427	229025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_228400_229000
848445	contig_6163_pilon	+	503	5	Intergenic	novelGene_103826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	7	501	235648	237685	FALSE	10	TCTCAGGGAGGTGGCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGMNQPRPLHHTCVGALRGRWGPACLQHRRGLAAGWLGLLRQLTLLRLMGLNQLWLCYPNQLLQGLKHRLTVHLQHVQPGLILDPAVRHHRHQVEADVVVGLPAVARPIRSMMTLRALSVHSSSSPPGPMVNRVDLQPVQLKEPACDRHIADKMERLHGPHCTKTVL	235641	237687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_235674_236168_236320_236634_236765_237234_237307_237569
848447	contig_10500_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_41205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCAAGGGGTTATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465693	1467028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1465700_1467000
848448	contig_1406_pilon	+	974	4	Intergenic	novelGene_25567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	102	497	2173822	2185260	FALSE	35	TTTATGCAAACATGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCCRLPPPRISGLPAAAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173720	2185737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
848449	contig_15327_pilon	-	254	2	Intergenic	novelGene_70827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGCGAGTGAGGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571752	1571427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1571483_1571553
848450	contig_10135_pilon	-	517	3	Intergenic	novelGene_106659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCGGGCTGGGGGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120177	116709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_116742_118765_118869_119795
848451	contig_9955_pilon	-	905	3	Intergenic	novelGene_21322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGGCACCTAATCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66610	56670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_57113_65593_65836_66389
848452	contig_8312_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_152877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	443	871	251084	250656	NA	25	TTTAAGTAAACTTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYFKKSLSIYQEPGPAPGSLSLMSCKFIHQSTRKRDEGQTENLFPPNYHLCTRVFQICMLSTEVERKFKRFPELLCLLSFQHYILLSGLLYRKQKFSPTIAEGKTYKKNGQAQLPAEIIKVPSRDLILAFLLLNSILMNTQ	251526	250487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_250500_251500
848453	contig_3822_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_133280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAGAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147902	147016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_147000_147900
848455	contig_7979_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_125544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCCCTCACCATGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058791	1057925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1057900_1058800
848456	contig_12802_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_114241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47530	46349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_46300_47500
848457	contig_15383_pilon	-	1782	11	Intergenic	novelGene_162204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4.57820925690384	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	41	1687	157067	109420	FALSE	25	GTTTAAATTTCTATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRIVHLQETCDLEMLKPEARRYLEKSVKMGKRNGLHLPEQVQNEIKAMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFVDSLEKTDDDKYKITLKYPHYFPVMKKCCVPETRRKMEMAFNTRCKEENTIILQHLLPLRARVAKLLGYSTHADFVLEMNTAKSTSHVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECEEKGFEYDGKINAWDLHYYMTQTEELKYSLDQEILKEYFPVDMVTDGLLNIYQELLGLSFEQVPDAHVWNKSVTLYTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMSVAALVVNFSQPVAGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDIDSLRRLSKHYKDGSPITDDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNISLDAASEYAKYCTEILGVSATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEVGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLQNFLKREPNQKAFLMSRGLHAA	183920	109324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_-_109555_122115_122253_123826_123956_125269_125457_139548_139751_145714_146082_148510_148647_153933_154095_154729_154833_156977_157086_183898
848459	contig_6871_pilon	+	663	3	Intergenic	novelGene_21665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	12	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGCCAACTAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795172	796547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396_795495_796104
848460	contig_14208_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_129081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAAAAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116476	117461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_116500_117500
848461	contig_20916_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_177592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTCTAAAACTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7942	6768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20916_pilon_-_6800_7900
848462	contig_11447_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_168098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTATTTTGTTGGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481962	480767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_480800_482000
848463	contig_9982_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_55752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACAGCTGCATACTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328718	328953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_328700_329000
848464	contig_2710_pilon	-	1128	1	Intergenic	novelGene_161813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258314	1257186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1257200_1258300
848465	contig_10861_pilon	+	550	6	Intergenic	novelGene_39364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAAGGTTTCCGGCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581125	1585438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1581193_1581615_1581705_1582730_1582835_1583235_1583343_1584519_1584677_1585412
848466	contig_7275_pilon	-	636	4	Intergenic	novelGene_111240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.63299316185545	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	196	636	397840	396604	FALSE	20	TAGGAGCAGAGCCGGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDACNRHNKLNYSVAPTLFLEFHGSEQALAEQLRRAEEITQHNGAFHFFWAKEAEERSRLWTVRHNAWYAVLALRPGCKGYSTDVCVPISRLPEILVQTKEDLKASGLTGAIVGHVGDGNFHCILLVDPEDPEELHRVEAFAQQLGR	398035	396603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_396717_396822_396914_397531_397660_397731
848467	contig_14846_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_85371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAAACCTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106727	106122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_106100_106700
848468	contig_11855_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_66920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836620	836024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_836000_836600
848469	contig_9272_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_125987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGCAAAAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762381	761773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_761800_762400
848470	contig_12948_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_126197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAACCTGTGAGAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228380	230152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_228400_230200
848471	contig_6504_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_158788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTAGTATCAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266731	266987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_266700_267000
848472	contig_5770_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_74199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGACTGCTTTGGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358834	359818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_358800_359800
848473	contig_15668_pilon	-	1691	2	Intergenic	novelGene_169632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	33	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTTTAAAAAAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119358	117459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_118724_118931
848474	contig_6876_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_147034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2	463	253368	252907	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGRSCCAPVVFRWATESFGSARPWTHERVSAAGGRPGSGGARAELGAGSGSLPPGAAVTCCPCRLCPSWAPAPPQPAWEAPRANEAPRPGTGRGPQAVSGCQLEKQTPNTSSTTPTAEKPQTSPPCVVSEQARDPLGQEGSPLSSCLHCPSSC	253369	252507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_252500_253400
848475	contig_13558_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_123026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCTTATGTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390803	391681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_390800_391700
848476	contig_7179_pilon	-	647	3	Intergenic	novelGene_78135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_2	11.5	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	109	504	933323	907766	FALSE	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVEASSCDGKGQGVETSVTYYRLEEVAKRNSSKEIWLVIHGRVYDVTRFLDEHPGGEEVLLEQAGVDASESFEDVGHSFDAREMLKQYYIGDVHPNDLETENSSKVRSHQFLLCVPSVYISVHSHKIDF	933431	907622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_907871_908411_908541_933161
848480	contig_15327_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_70820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCCTGGAGGCGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1525991	1526829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1526000_1526800
848482	contig_3111_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_129949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTACATCATGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10994	10174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_10200_11000
848483	contig_1263_pilon	-	652	3	Intergenic	novelGene_170403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.5	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	5	631	60116	55502	FALSE	45	ATCACAGCACATTAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	60120	55480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_55589_58131_58321_59765
848484	contig_1244_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_37938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAGAAAAAAAGAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735539	734710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_734700_735500
848488	contig_12128_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_131976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGGGACAAAAGAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205944	204843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_204800_205900
848489	contig_9955_pilon	-	813	6	Intergenic	novelGene_21349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	44.1044215470513	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	97	663	118470	86976	FALSE	45	AAGGCTAAAAACTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGLGFLTSSFPKNSWSSVAFNLFILAIGVQWAVLLDGFLNKFSSGKIVIELSSIQLATMSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	123098	86825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_87003_91215_91290_109880_110029_113655_113807_118303_118491_123022
848490	contig_6364_pilon	-	1321	1	Intergenic	novelGene_51764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATGTATAAGACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883918	882597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_882600_883900
848491	contig_4364_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_56	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTCAACATAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643049	643420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_643000_643400
848492	contig_8866_pilon	+	633	4	Intergenic	novelGene_77805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.59966329107444	252	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	200	367	420099	436080	FALSE	25	GCTTAAGCAATTTGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAERSLLNRTRGDLQELAKEASEQRAFALLLGNRDEARTPSSEPGQLREPATPELAEKGPHPLELMWLQQTLVLLEENSNQKKKRIEEPSWAEERLDMLMETALSSVRKRCLLNIVCCPT	417839	436346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_417989_420048_420102_432264_432386_436036
848493	contig_9981_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_121027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGAAAAAATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37170	38090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_37200_38100
848494	contig_10451_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_138326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456611	455744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_455700_456600
848496	contig_3155_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_26333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85602	86190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_85600_86200
848497	contig_17897_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_153401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCGAACTTAAGATGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58715	59359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_58700_59400
848498	contig_9903_pilon	-	865	6	Intergenic	novelGene_172013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	57.6978335815133	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	260	631	101487	82602	FALSE	5	TTATGTGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTSLMYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106307	82367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_101467_101531_106091
848499	contig_7411_pilon	+	1872	14	Intergenic	novelGene_137042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	814604	816721	TRUE	10	GGGCCTCCCACTCCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGWRGPRLGLRRCLLGQLQLLLLHFDQVFRCQLPDGFDLGGRLGLDLRDLHLRGGRGRLGLLLLLLLLLPEKLEVCGGDGLSRELHPRGCRTPGSPESGPGPARASGWW	814603	824913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_814690_816370_816558_816664_816879_818355_818467_818540_818589_819595_819833_819941_820022_822355_822412_822532_822671_823330_823511_823617_823854_824190_824347_824430_824477_824816
848501	contig_2027_pilon	+	583	2	Intergenic	novelGene_39886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	182	382	103289	103591	FALSE	20	AGTCTGCAACTTGCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAQEEEVWWHVCSLCVSVQGQVRESGGWQVDHSHYTAVPSRDFEQPTRDGLGSDNIGSRMLQAMGWKEGSGLGRKKQGIITPIEAQTRVRGSGLGARGSSYGVTSTESYKETLHKTMVTRFNEAQ	103107	103792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_103364_103465
848502	contig_10196_pilon	-	484	4	Intergenic	novelGene_132099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	487	junction_1	167.803456460229	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	152	430	910150	908940	FALSE	10	TTCCCGTGTTGCCTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAFDFLVDRPVTLVRDFIERQHAKNRYYYYHRQFRRVPDITECEEKDVLCMFEAEMQWRRDYKVDQEIVNIIQERMQACQQREGESYKQNCANELEQFAQVSKAYQDRYHDLGAHFSARKCLAKQKQRMLAERKAAKEPAAA	912523	908885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_909044_909341_909482_910115_910255_912476
848503	contig_18970_pilon	-	689	3	Intergenic	novelGene_157815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.5	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	23	310	38902	31723	FALSE	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAHRDPRMTISDITAASLAGARHSTGGASYPAPQGRFRCLLETQRGSCSGRAPRGQAPGAGPTSFGTSLSHRGMFSAVGHSSLCSHCPQRSSKPTSPHWCVS	38924	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31789_33354_33462_38787
848504	contig_11292_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_109456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386125	385558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_385600_386100
848505	contig_10962_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_103882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCGTCAAGTCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273488	272444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_272400_273500
848506	contig_11161_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_175651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCACTATGTTGTTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287738	288993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11161_pilon_+_287700_289000
848507	contig_3575_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_141128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_1	0	1261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAGCTGTTTGTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820999	819203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_819434_820659
848508	contig_15596_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_139554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAACGAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217322	217901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_217300_217900
848511	SIRV2	-	323	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4549	35	3374	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
848512	contig_9721_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_155984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGAAACACTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141292	139624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_139600_141300
848513	contig_15031_pilon	-	838	4	Intergenic	novelGene_138409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_3	325.167990771266	31	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	201	566	129549	101704	FALSE	5	TTTCCTAGTGTTCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVDCTARFIPYKK	160695	101431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_101862_102970_103080_129450_129599_160544
848514	contig_3153_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_104673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCAATTAAAAAGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209002	209840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_209000_209800
848515	contig_9363_pilon	-	768	6	Intergenic	novelGene_6603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	446.353850661109	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	97	768	777144	754118	FALSE	25	GGCAGCTCTTGTGGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNESD	777240	754117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754125_773621_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977
848516	contig_15869_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_177594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGCTCCCCTAGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47516	46837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15869_pilon_-_46800_47500
848519	contig_9389_pilon	+	455	4	Intergenic	novelGene_83921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1040.33082345099	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	29	442	159587	168343	FALSE	55	GACCAAATTGCAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQPSDLHLIADVTGWPSQMTPVSLPCPLPRTAQGPPLKILLGTSPHQEPRDHEIM	159558	168356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_168181
848520	contig_3018_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_78780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTAAAAAAAGAGCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386994	387863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_387000_387900
848521	contig_13958_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_129547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGATATTGTTGTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254916	256190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_254900_256200
848522	contig_10779_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_165522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	207	548	67974	68315	NA	50	TCCTGGAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSTFPSSFNLSTYVCKALLYTLRTQLLADKNHCSCCTYILEEEDEELKHKLSPSVTRGMEARKRIKEKGHRMGMGCFFIGSLGKTALKWTSDMEERSERREGAHCRHAEGAG	67767	69953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_67800_70000
848523	contig_4336_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_152359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATACAAAAAGGGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340208	339655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_339700_340200
848524	contig_12623_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_138169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGCTACTAATGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93038	92759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_92800_93000
848526	contig_8671_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_126287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931171	932311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_931200_932300
848527	contig_8663_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_58013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCATTACTCACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297010	295815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_295800_297000
848528	contig_12622_pilon	+	750	6	Intergenic	novelGene_5865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_5	107.51855653793	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	107	487	1184229	1188258	FALSE	10	TTTGCTCTCTACTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKLPLTSIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLYITEQTRSDIKNGTILQLAISPKRQSILQTSCEKWLTFTEPHLSRSGRQQPRNAVSGGKLTFGVGSF	1169910	1188521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1169960_1184171_1184307_1184595_1184637_1185105_1185179_1185536_1185588_1188120
848530	contig_13878_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_165750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661085	662265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_661100_662300
848531	contig_1719_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_87337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTTGAGAAGTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561595	561206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_561507_561549
848532	contig_8286_pilon	-	655	4	Intergenic	novelGene_139801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_3	93.8663352266876	1521	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	207	599	189870	179734	FALSE	25	CATATTGTCAGCAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAEAEAVAARSPAEQCFEEKDCKESGVQLLGLPALCRPRSRGGRIPPQSLPKVSHHPFCLSVKGHVKMLRLVLTVTSMIFFILAQAPEPYIVITGFEVTVIFFFIVLYLLRLDRLLKWLFWPLLDIVNSLVTTIFMIIVSVLALIPETTTMTVLGGVFGLVSVVCCIADGALIYRKLLFNPSGPYQKKPSHEQKLIL	190076	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_179860_182810_182907_184959_185119_189858
848533	contig_17198_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_62382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGAGGGCGGAGTCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962304	961929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_961900_962300
848536	contig_8375_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_141296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATAGCATTATATGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144838	145499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_144800_145500
848537	contig_15545_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_120131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGCAATAATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59232	60417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_59200_60400
848538	contig_16176_pilon	+	711	2	Intergenic	novelGene_177595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATATTGTCTTATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3649	4493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16176_pilon_+_4288_4420
848539	contig_10765_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_122985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGTAAAGATTACAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500956	500488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_500500_501000
848544	SIRV5	+	337	3	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	-18	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8297	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8391_8469_8586_10858
848545	contig_15087_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_37248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTCTGCTGCTCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217594	218720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_217600_218700
848547	contig_5324_pilon	-	1468	8	Intergenic	novelGene_102053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	39.6340402035566	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	190	1062	308736	230887	FALSE	5	TCCGTGTCCCTACCGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPCREDEAAAAAAGDPWKECFEVAVQLALRAGQIIRKALTEEKCVSTKTSAADLVTETDHLVEDLIISELQTRFPSHRFIAEESAASGAKCVLTASPTWIIDPIDGTCNFVHRFPTVAVSIGFAVNQELEFGVIYHCTEERLYTGRCGRGAFCNGQRLQASRETDLSKALVLTEIGPKRDPATLKLFLSNMERLLHAKAHGVRVIGSSTLALCHLAAGAADAYYQFGLHCWDLAAATVIIREAGGIVMDTSGGPLDLMSCRVVAAGTQEMAVLIAQALQTINYGRDDGK	308925	230480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_231003_232140_232293_233167_233277_255399_255509_258687_258734_262513_262619_274405_274540_308634
848548	contig_7521_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_160538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAATAAATAAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201187	199346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_199300_201200
848549	contig_14142_pilon	-	1091	9	Intergenic	novelGene_120461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	71.5680401785602	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	496	1089	106677	105577	FALSE	20	AGCTGCCGAACCCCCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRAVDPPGARAAREAFALGGLSCAGAWSSCPPHPPPRSAWLPGGRCSASIGQPPLSAPLPPSHGSSSGHPNKSYYAPGTPTPRPLHGKLESLHGCVQALLREPAQPGLWEQLGQLYESEHDSEEAIRCYHSALRYGGSIAELGPRLGRLQQAQLWNFHAGSCQHRAKILPPLEQVWNLLHLEHKRNYGAKRGGPPVK	119033	105574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_105622_105709_105803_105902_106123_106227_106327_106540_106683_106774_106921_107175_107296_112101_112221_118928
848551	contig_15384_pilon	+	1179	8	Intergenic	novelGene_85127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	36.2232307915734	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	89	934	82713	84679	FALSE	30	GCCCTGACTGAAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALILVGGYGTRLRPLTLSIPKPLVDFCNKPILLHQVEALAAAGVDHVILAVSYMSELLEKEMKAQEQKLGIRISMSHEEEPLGTAGPLALARDLLSETEDPFFVLNSDVICDFPLPSHGAVPPAPRPGGLHRGFWMDIGQPKDFLTGMCLFLQSLRQKQPERLCSGPGIVGNVLVDPSARIGQNCSIGPNVSLGPGVVVEDGVCIRRCTVLRDAHIRSHSWLESCIVGWRCRVGQWVRMENVTVLGEDVIVNDELYLNGASVLPHKSIGESVPEPRIIM	82514	84924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_82598_82707_82842_82959_83041_83130_83180_83318_83463_84061_84190_84280_84464_84547
848552	contig_11543_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_175757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCCCCATTATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167408	168230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_+_167400_168200
848553	SIRV3	+	211	2	ISM	SIRV3A	SIRV305	436	3	710	3	710	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCGAATCTTAATAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4713	6715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4780_6570
848554	contig_12841_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_55856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTTATATTCTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310501	312058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_310500_312100
848556	contig_9375_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_136059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCCAGCTCTAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299683	300785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_299700_300800
848559	contig_5815_pilon	-	953	4	Intergenic	novelGene_141202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_2	2.86744175568088	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	30	596	398947	390067	FALSE	35	ATGTTATGGCTAGACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVSEPRYRLMIRRCMETGTKRFGMCLSTENAGISEYGCMLEIQGTRSFPDGSIDVDAIGVSRFRVLRHRQKGGYNTADIEYFEDEKVEGPEYVSLISLHDSVYQQSVSWFAALQDPRKAQLLSHFGAMPEREPEPQSNLNGPAWSWWILALLPLERKAQLAILGTTSLKERLLAIQRVLLLVTRSCEELASTSQRNN	398976	389709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_390253_391698_391849_394441_394605_398879
848561	contig_6199_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_126383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGATAAAGTCCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411382	412408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_411400_412400
848562	contig_10638_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_164310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCCTCTTCTGAAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449413	449870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_449400_449900
848563	contig_5423_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_85288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580341	579689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_579700_580300
848564	contig_5640_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_27297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTCTAGGATTCTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289658	1289165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1289200_1289700
848565	contig_7378_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_120306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGGCAATAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706245	705529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_705500_706200
848566	contig_12157_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_135886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAACAGTTAAAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70725	70320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_70300_70700
848567	contig_6270_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_99839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGAAAGAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245067	244360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_244400_245100
848569	contig_13365_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_168084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACTCAATAAATATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44944	46258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_44900_46300
848570	contig_4769_pilon	+	1173	3	Intergenic	novelGene_117983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	206	520	733836	738643	FALSE	60	AAAAAAAAAAACTTCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLSRELQKICKLVCTSLKKGDGVSPGIFVLPPLCRAIVGPEKISLPLESGFHGSWSPFTPPSRLLKSCAGGALGESLVLPFYRDNTEVEKGEVFRVTVSALG	651891	739296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_652084_733822_733898_738390
848571	SIRV5	+	449	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	77	26	29	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGAATGAAACGCCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085	2372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
848572	contig_6208_pilon	+	936	2	Intergenic	novelGene_53004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422023	423662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_422501_423203
848573	contig_8310_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_75589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGAAATTGGAATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309297	309823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_309300_309800
848574	contig_3161_pilon	+	1624	1	Intergenic	novelGene_84515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAAAAGAAGACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375964	377588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_376000_377600
848575	contig_11370_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_98777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCATCCCTCAAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293001	298553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_293352_298302
848576	contig_14855_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_146049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664965	664357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_664400_665000
848577	contig_6589_pilon	-	690	6	Intergenic	novelGene_25923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	90	518	1178015	1158779	FALSE	15	TGCCTAGGACCCTCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTRYAGKVVIVTGGGRGIGAGIVRAFVATRDFCPGLPTVAGGEPAGDIHLDQACPPSPAEEPREHHQHLQLGWSNWPAPGSSLRGHGAVTAMTKALALDESQYGVRVNWKHLDPTVEGICSLNSRPEGHNPRGHVGPAS	1178104	1158606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158787_1158899_1158986_1160512_1160581_1160882_1160984_1171911_1171990_1177927
848580	contig_8263_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_83077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCTGGCCAGGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97142	97810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_97100_97800
848582	contig_17270_pilon	-	1299	5	Intergenic	novelGene_67230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.1579177000004	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	88	966	133219	124028	FALSE	30	CAGAAATTGGCAGAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKFDLSGVQLIEREEEVCIFYEKINIQEKMKLNGEIEIHVLEEKIRFLKLKIAEKQRQILVTEKLLPAKRSLDADLAVLQIQFSQCTDRIKDLEKQFVNPEGKNRTRFLPGKDLTEEQMIKKLDELELQLAQKEEKLLEKDFIYEQVSRLTDRLYSKTQAGKQDTLLLAKKMNGYQKKIKDATEKLMALVAELSMKQALAIELQKEVREKEDFIYSCNSRIEKGLPLNKEIEREWLKVLRDEEMYALATAEKSQEFSEADSRQLPSGVYTTAEQRPNAYIPEADATLPLPKPYGALAPFKPSEPGANMRHIRKPVIKPIEI	133306	123694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_-_124232_125517_125767_130431_130570_130964_131094_133060
848583	contig_7247_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_176685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGGTTGTTAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54556	55458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_54600_55500
848584	contig_9297_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_69815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTATGCAACTGTACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323824	324615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_323800_324600
848586	contig_5084_pilon	-	1224	2	Intergenic	novelGene_64588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	430	435	908551	908546	FALSE	45	AAAATAATGTTTCACATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHGGGSQLSCPGKVGISWGRLKEARDLVGVGVRCSTVPDSRGRISRSSRSVRRNREDRQCLKEETSAADSQDPSDPDESGESQLLLQGDGDPWREPCHNPRAPDERPRGQAPWRPSWTSTRTRFPARRSCSPAAPAWASPTLVM	910004	907756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_908555_909578
848589	contig_6464_pilon	-	1419	3	Intergenic	novelGene_176352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	49.5	63	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGGCTTCTCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125805	100765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6464_pilon_-_102008_122004_122117_125740
848590	contig_15613_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_147230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTATTTTCACCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465437	464789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_464800_465400
848592	contig_13481_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_119465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCATGGAATATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230057	1230621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1230100_1230600
848593	contig_10205_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_143103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTTTCTAATAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133705	135322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_133700_135300
848594	contig_19155_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_173360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAAAATAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109586	110849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_109600_110800
848596	contig_5479_pilon	-	1384	2	Intergenic	novelGene_133569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAGTAGCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107764	102411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_103096_107064
848599	contig_9177_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_32666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATGAGGACCAGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113653	113349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_113300_113700
848600	contig_4151_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_65217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGGTCTCTATAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412759	412241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_412200_412800
848601	contig_3202_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_167395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTCAAAATATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102390	102927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_102400_102900
848602	contig_3202_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_167396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTCCAGCTCTCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103075	103493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_103100_103500
848603	contig_12402_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_133353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGATTGAATTGTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463206	462279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_462300_463200
848606	contig_5153_pilon	+	683	6	Intergenic	novelGene_74344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	139.18045839844	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	133	450	719819	724093	TRUE	25	CATCTCTGGAACACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLLSPQLKADVVPKTAENFRALCTGEKGFGYKGSTFHRVIPSFMCQAGDFTNHNGTGGKSIYGSRFPDENFTLKHVGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIKTDWLDGKHVVFGHVKEGMEVVKKIESFGSKSGKTSKKIVITDCGQLS	719113	724797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_719166_719738_719828_721755_721853_722435_722512_723957_724151_724621
848608	contig_15538_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_152639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAATAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65499	64706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_-_64700_65500
848609	contig_6510_pilon	-	487	3	Intergenic	novelGene_173526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATTAAAAGGTACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463226	458557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_-_458672_459301_459480_463031
848610	contig_10312_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_159022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACTTTTTCTGCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166488	167369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_166500_167400
848612	contig_7057_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_123435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAACAAAGGAGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655071	1652850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1652800_1655100
848613	contig_4271_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_171863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAAAGCTATTAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419801	420391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_419800_420400
848614	contig_11548_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_66807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	13.2759180473518	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	427	888	264441	276407	FALSE	10	TTGAATCCCTTTTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVSLRKATGVRGLEKVAKLNIPSRLIDYLSYN	237850	276546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_237886_241013_241073_263172_263361_264296_264448_267304_267440_275440_275633_276279
848616	contig_16724_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_105276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTAGGGGCCAACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405743	405409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_405400_405700
848618	contig_10864_pilon	-	972	3	Intergenic	novelGene_107133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGGGTGCCAGCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539911	1531390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1532154_1532536_1532694_1539859
848619	contig_14720_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_164993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAGGTGATATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219648	219093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_219100_219600
848621	contig_3942_pilon	+	877	3	Intergenic	novelGene_128790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	0.5	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	10	678	797245	798963	FALSE	15	CAGCTGCTCCACCGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSMRWYSGSTSSKLSVRRPSAGWRSKCSRVGGVQVPGVSVRFAAKVGRVLLWARSSRPLAGTQGVPPLLDALRRGFPLITNREGWACLGHPWGVRVSSVLQLPVGGPEVVSRAQGLGARPQDPHLPQSSPPVRAQRPALRLPALPGLGAQGNPGLRRRLAGGTGPGGRAGRAPSTAVARRPRARPAAAGADSPGHGGPAAADGGTGAEGAGGRLPDASAEDEGN	797235	799162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_797825_798333_798414_798954
848622	contig_12050_pilon	+	633	4	Intergenic	novelGene_62718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	55.1502996869061	92	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	117	521	666343	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	666010	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668352_683024
848623	contig_3463_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_62017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571517	572222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_571500_572200
848625	contig_7513_pilon	-	1333	8	Intergenic	novelGene_88932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	88.7185414208143	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	86	859	87692	43762	TRUE	45	CAAAAATATGCCCTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCRGSPPRLPPGRWLWLRAGLPAVDFRMSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGCCRTPWCTTTCRWSFSALSMTSCGLELHWKGCAPPLSSLTTLVGPAERRGREGFRVAHSLLRQPTDTGQGHRRFSLIQVPSPPMA	91702	36273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_36524_36741_36868_43663_43786_57076_57104_66270_66400_71522_71602_87177_87703_91627
848626	contig_14275_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_162857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTAAAATATCATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272548	271242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_271200_272500
848627	contig_9955_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_21373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGTCCCTCAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530728	531448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_530700_531400
848631	contig_7171_pilon	-	773	5	Intergenic	novelGene_101248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	290	772	764657	755696	FALSE	30	TCGCAGCCTCCGTACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAFLLLEKQNDPKPYGCHEHKSVLYFRNAHKCSAIAPSPIRCPALSINRGGNGCSQGVRVLHQVLLVVLGAPDGDEVIAGVLLGIKVPAWEGCAARPSDRLGIKNIAGEVIGILPSGNTRERGLSSIPSGGQHINSVLCDAGTLLQTVVLGQVVIVIS	764946	755694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_755755_758612_758674_759910_759958_760550_760635_764425
848632	contig_1154_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_87197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077441	1076164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1076200_1077400
848633	contig_6479_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_160626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACATATTCAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664515	665560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_664500_665600
848634	contig_2894_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_86550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACTCTGTGATTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311062	310466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_310500_311100
848635	scaffold_12510_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_151370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCACCCTCCCCGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203680	204505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_203700_204500
848636	scaffold_12510_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_151371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTGTGTCAACGCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204607	205167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_204600_205200
848638	contig_11642_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_172925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGTTCTCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318663	319341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_318700_319300
848639	contig_14722_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_110227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTACTGGGAAATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113532	112414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_112400_113500
848640	contig_15049_pilon	+	606	3	Intergenic	novelGene_160721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	376	438	226495	226557	FALSE	25	GGCCTGTGTAAGGAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCYHSLHPTQSGRQAVLTVSEASDSLRAGRSFAQGHTEGQAAGEPKQQGAGRVPALHRPPAGGQLGHSADADCHRTPAGRATGGPGAHAPVQDRAGCEGQGEGALHEKGRKLVCRSQPPILKTKMAPSHALMDKDKEEQLFFFT	223550	226725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_223669_223966_224173_226443
848641	contig_5229_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_117691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCACAGTAGTAGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457161	457640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_457200_457600
848642	contig_9460_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_155316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	509	1527	35	1561	427729	426203	NA	45	TGCAGATTTCAAACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPIPEQEAECPEDSRLSPEKSIQLSSANPAISSTPYQCTVCQSEYNNLHGLLTHYGKKHPGMKVKAADFAQDIDINPGAVYKCRHCPYINTRIHGVLTHYQKRHPSIKVTAEDFVHDVEQSADVSQNDVEETSRIFKQGYGAYRCKLCPYTHGTLEKLKIHYEKYHNQPEFDVFSQSPPRLPVSLEPEITTEVSPSQVSVTEEEVGEEPVSTSHFSTSHLVSHTVFRCQLCKYFCSTRKGIARHYRIKHNNVRAQPEGKNNLFKCALCAYTNPIRKGLAAHYQKRHDIDAYYTHCLAASRTISDKPNKVIIPSPPKDDSPQLSEELRRAVEKKKCSLCSFQSFSKKGIVSHYMKRHPGVFPKKQHASKLGGYFTAVYADEHERPLLMEEEERGSFEKAEVEGEVQEIEWLPFRCIKCFKLSFSTAELLCMHYTDHHSRDLKRDFVILSSGPRFQNSTYQCKHCDSKLQSTAELTSHLNIHNEEFQKRAKRQERRKQLLSKQKYADGA	427763	426200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_426200_427800
848645	contig_13044_pilon	+	325	3	Intergenic	novelGene_100013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	742	junction_2	27	19169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTTGCCTACCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438783	441368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_438900_440822_440878_441214
848646	contig_3270_pilon	+	513	6	Intergenic	novelGene_104437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5300.12243632164	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44122	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44245_44307_44596_44656_45153_45211_45934_46067_46576
848650	contig_709_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_57663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCATGAGCTGTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3871567	3872796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3871600_3872800
848651	contig_8550_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_72365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCTCAGACATAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146305	147384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_146300_147400
848653	contig_4519_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_123694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTACGGACCATAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510842	511312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_510800_511300
848654	contig_2703_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_101665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGATCAGAGTAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5503	5288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_5300_5500
848657	contig_11104_pilon	-	1021	8	Intergenic	novelGene_112448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	8.72481799120141	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	190	969	154738	129464	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDLLDINHLRARGLQPGEEELPDISPPIVIPEDSKDRLMSQLIDPSDIDESSVMQLAEMGFPLEACRKAVYFTGNMGAEVAFNWIIVHMEEPDFAEPLTIPGYGRAASAGASAFGATGLDNQPPEEIVAIITSMGFQRNQAVQALRATNHNLERALDWIFSHPEFEEDGDFVIEMENNANANIISEAKPEGPRVKDGSGMYELFAFISHMGTSTMSGHYVCHIKKEGRWVIYNDHKVCASERPPKDLGYMYFYRRIPS	162876	129411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_129558_133450_133536_147454_147609_149387_149555_151974_152119_153229_153257_154629_154753_162701
848658	contig_13044_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_99985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57374	58371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_57400_58400
848659	contig_10000_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_139336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTGTATTCATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290286	290906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_290300_290900
848660	contig_10000_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_139335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTTTCTAAGTACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289108	290223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_289100_290200
848661	contig_9733_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_160577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTGCCTGCATTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19288	19980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_19300_20000
848664	contig_10675_pilon	+	1382	5	Intergenic	novelGene_176288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.1118742080783	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	129	1025	118746	133151	FALSE	35	AAAATGACTTGTAAGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEFKKKLFWRAVAAEFLAMILFVFISIGSALGFNYPVSGNQTANASQDIVKVSLAFGLSIATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISILRAVMYIIVQCVGAIVGTAILLGVTSSLPNNSLGRNGLVPGVNSGQGLCIEIIGTLQLVLCVLAITDRRRRDLGGWAPLAIGFSVALGHLLAIDYTGCSINPARSFGSAVITHNFTDHWIFWVGPFTGGALAVLIYDFILAPRSSHLMDRLKVWTSGQVEECDLDADDINSRGQSSSTACDSSHDWEENRETQMTRRPLTGTDTA	118617	133508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10675_pilon_+_119136_129058_129224_130190_130272_131537_131697_133049
848665	contig_2093_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_152996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGAAATTAAGAGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405704	1407017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1405700_1407000
848666	contig_10793_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_83446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGTGAGGTAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168713	167646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_167600_168700
848667	scaffold_6394_pilon	+	517	4	Intergenic	novelGene_110981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1434.67216541697	10	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	48	359	398216	406119	FALSE	10	TACTGTGTTTTGATTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSPVKRQRMESALEQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQDLVEEAMAYGKQLGGSQEEKIKNTVDKLFVLFGAEHMFSAENGK	398168	406277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_398313_402118_402243_402864_402923_406086
848669	contig_6048_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_73360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGGTGGGCACAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3027935	3027462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3027500_3027900
848670	contig_10732_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_114705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACGCTAAACTGGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116180	115265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_115300_116200
848671	contig_3956_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_14763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839308	840072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_839300_840100
848672	contig_4388_pilon	+	719	3	Intergenic	novelGene_161970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAATGTATGGTCGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777300	798049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_777332_794688_794762_797434
848673	contig_6842_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_130849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAATAAAAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2127766	2128860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_2127800_2128900
848674	contig_10734_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_50967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	0.5	282	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCACCACTGTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217128	230243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_217415_227922_228009_229939
848676	contig_16775_pilon	+	935	4	Intergenic	novelGene_107791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCACTCCTTCAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177206	181909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_177585_178276_178355_179106_179257_181580
848677	contig_14151_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_171836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGAATTGTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106503	107005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_106500_107000
848678	contig_20819_pilon	-	1245	7	Intergenic	novelGene_55697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	48.7490740652807	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	520	909	119603	119005	TRUE	15	CCCTGCCACATCCAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDDWDKVIAVNLKGIFLVTQAAAQALVSNGCHGSIINISSIVGKVGNVGQTNYAASKAGVIGLTQTIARELGRLVRPLRLLGAFAEACRGSEGGDQCAVPSRISTHSPSTDMGFAVTLSSQGSLQHP	120221	118079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_118266_118455_118531_118722_118766_118972_119257_119356_119450_119558_119676_119774
848679	contig_19564_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_29644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTCGGATACTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12678	13000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_12700_13000
848680	contig_7410_pilon	-	952	2	Intergenic	novelGene_106116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTCCTGACTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605975	597611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_598258_605669
848681	contig_16666_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_61797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGTAACCACTGATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125296	125858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_125300_125900
848683	contig_14970_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_45090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAAAATTCTGTGGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223674	222703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_222700_223700
848684	contig_16701_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_177602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACCTAGAGTTCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211738	213065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_+_211700_213100
848685	contig_5297_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_175661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	279	623	18813	19157	NA	15	AGGGGACCCTGATGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLLSTDCPLPSISADISTSAPSARCPCCSMRPHQALCSPPGKRLGLLRGSVTIPASGKPFLTPHSFFCVSLAPGLAPGCWQCATTLDLVSHWTPSSLKTDTTSWPLCSPST	18534	19498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_+_18500_19500
848686	contig_3787_pilon	+	1407	10	Intergenic	novelGene_102458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.496903994999953	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	96	959	1222469	1253066	FALSE	10	CTTCTGTGTGTTCAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNYFLQAKARSHQGFDVDRDAKKLHKACKGMGTDEAAIIEILSNRTSEERQQIKHKYKAIYGKDLEEVLKGELRGNFEKTALALLDSPNEYAARELQKAMKGLGTDETVLIEVLCTRSNKEIIAIKEAYQRLFNRSLESDVKDDTSGSLKKILVALLQAGRDEGDDIDIDLAGQDAKDLYDAGEGRWGTEELAFHDVLARRSLKQLRATFQAYQVLIGKDMEEAIEEETSGDLKKAYLTLVRCARDREGYFAECLYKSMKGSGTDEETLIRIIVTRAEVDLQGIKAKFQEKYQKSLSDMVRSDISGDFQKLLVALLH	1222373	1253514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_1222473_1230361_1230457_1233604_1233776_1236591_1236626_1237300_1237381_1239052_1239122_1239566_1239669_1245408_1245485_1248631_1248745_1252946
848688	contig_7870_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_109000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAAAGATGAGCCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476490	477450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_476500_477400
848690	contig_5482_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_144502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGCAGGGAAGCTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619762	619236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_619200_619800
848691	contig_2987_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_125845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTTACCTTCCTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475320	474760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_474800_475300
848692	contig_7171_pilon	-	337	3	Intergenic	novelGene_101208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTGGGGGGAGCGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68305	66221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_66274_67530_67568_68057
848693	contig_7171_pilon	-	635	6	Intergenic	novelGene_101205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1.2	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCATTTGGTTTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65483	51160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_51544_57144_57186_57346_57390_57522_57598_60437_60468_65420
848695	contig_16666_pilon	-	1373	6	Intergenic	novelGene_61812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.93907194296653	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	218	913	266425	256618	FALSE	50	GGTAACTTTTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIIYYSQEKYFRHVQRAAAMGLEKFTNEPVLQFFKAYGVLREERIQDAISDLESIQNHPDVSLCSIMALIYAHRHREAIDREAVQELESSLREVRKTASGAALYYAGLFLWLLGRHDKAKEYIDRMLKVSSGSREGYVLRGWVDLTSDKPHTVKKSIKYLEQGIQDARDVLGMMGKATYLMMQQNYSGALEVVNQIAVASASFLPALVLKMRLFLARQDWEQTVEMGQR	266642	256157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_256780_260092_260216_262141_262309_264129_264241_265026_265157_266422
848696	contig_12427_pilon	-	755	3	Intergenic	novelGene_40444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_2	90.5	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGCAAAATGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295054	292967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_293628_293811_293878_295025
848698	contig_4486_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_38624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAACAACAATGAGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635256	634950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_635000_635300
848699	contig_10431_pilon	-	439	3	Intergenic	novelGene_117397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	115	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	56	376	224107	220630	FALSE	35	ATTTACTGAAAACTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFFDVQKRLGLNIDHWMTIQSAEQPYRHSARCHAFEKEWIECAHGIGGIRAEKECKIEFDDLTECLLRQKTMKRVATIKQQRAKLIKEGKYTPPPHHLGKDEPRP	225594	220566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_220735_223891_224110_225541
848700	contig_12886_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_135455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	504	809	236468	236163	NA	20	GTGAGGATTGTTGCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDVSSLFPESDNTVKPVRAGTPRDCLGFPGLASFLPLTEYSLTTFLSLSIRKYLSSPSLTGFCLARFPAFAGFTVVFKYWKNIYSAFLCYSQCNNYRHSND	236971	236161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_236200_237000
848701	contig_18113_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_137517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACAAAATGAACTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51457	52181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_51500_52200
848702	contig_9415_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_109759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTTCCCTGCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504633	1502264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1502300_1504600
848703	contig_5018_pilon	-	698	3	Intergenic	novelGene_46941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	52.5	245	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATACAGGCTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277966	276660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_277050_277305_277537_277888
848704	contig_10016_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_117850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAATAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279175	277935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_277900_279200
848706	contig_4754_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_35909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	8.74642784226795	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	358	771	166682	174335	FALSE	50	GAGAGTCAAAAATCCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRFLNRHLELIQKAQRQRIPVAGIVPSTKENDRGPEIWKVDDHLPEHLQNESRVNRSEQRHKHNTWENIFHQHRSHFPLRQNHNMFDLHEKSVKSNLTLINQSRSYKVKNSTEFNRDEKTFLHANHEQFHTEIKFP	163132	174335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_163188_163715_163798_164269_164394_166585_166794_174033
848707	contig_10297_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_112550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTTTGGGAGGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591544	590573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_590600_591500
848708	contig_19544_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_177061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATCACAAATTAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6763	5305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19544_pilon_-_5300_6800
848709	contig_1618_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_141784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	168	413	194767	194522	NA	35	GGAAAAAACTAGTCGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGINDSHTQPVTERVEVQVHPQAHWKKSLVIYFQNISHGKPYGAQFYSDTHGVAMSWSCLNGNWLTWADVSRQFLYMPLQESFLFFTGTDVHIITVFSPSISFPLCWKFPLPCNSPTHARSNLSTNYICYLQIFL	194934	193850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_193800_194900
848710	contig_294_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_166737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	504	806	106690	106388	NA	65	ATAAAACCAAAGGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSWQELTILFKPQFSHPQRGDNNNTYTVWDEITYLSHRQYRYSINVTVLLSMLSDPYSSFQAFHFLLFYTDTHLKQKFQGAIRNLTRHGLLTFNQIPCF	107193	105832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_105800_107200
848711	contig_5092_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_62261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	125	424	186979	187278	NA	20	CAGAGAGGTCCTCTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLKDGGHCSPEQRFECLAVEMERDGWFFEDTEDVETAASRPEWDSDQQWVALKPVYTLHPFDRAKLKEPRNRFPSATPQCLALPGTRVLHKLCQSKI	186854	188454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_186900_188500
848712	contig_1516_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_49915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGAAACCTTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66430	66841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_66400_66800
848713	contig_2444_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_83774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATGACAGTGAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233889	232878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_232900_233900
848714	contig_6217_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_109601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAATAGGATTAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341719	341359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_341400_341700
848715	contig_5499_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_57031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAATTATAAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430387	1429124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1429100_1430400
848716	contig_9239_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_137155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGCACCCAACATCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39039	38189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_38200_39000
848718	contig_12603_pilon	+	1061	7	Intergenic	novelGene_105814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	365	784	631126	638269	TRUE	30	GAGCAAAACTGCGCGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAHGMIFGFNSPVSGHFVINSNCAIRKGITKSIAIHGTKRGDYLCFCHFCHNLIFLKNSDIKILRSNKKLFLPITVKVAQGQGMNIISSNRPKEIISFMIKTLQGTISTNNRKGRGNVSQRPQHNCICPICYLSIEQI	630761	643147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_631153_631228_631336_635907_635984_636778_636840_637111_637239_638247_638475_643075
848719	contig_12923_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_30201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTTTTGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535887	535540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_535500_535900
848721	contig_18438_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_171389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACCCAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206481	205850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_205800_206500
848722	contig_4429_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_50778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGAAGTCTTATTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116117	115341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_115300_116100
848723	contig_16883_pilon	+	1602	5	Intergenic	novelGene_161714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTAAATAATTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9913	21363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_11094_14115_14167_15693_15762_15854_15936_21141
848725	contig_10235_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_46288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTTCAAAAAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19097	19356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_19100_19400
848726	contig_9995_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_47753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTCTTTCGCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650904	649905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_649900_650900
848727	contig_15613_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_147215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGATTTAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198010	199108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_198000_199100
848728	contig_16532_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_110045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACAAAATTGTAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191080	190092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_190100_191100
848730	contig_10581_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_41360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATTAATGGAATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96240	96521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_96200_96500
848731	contig_2455_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_119232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTTAATAATAATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1450329	1449866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1449900_1450300
848732	contig_10130_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_172721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAGAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35460	35192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_35200_35500
848733	contig_12312_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_64014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTACTGTTAATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538112	537700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_537700_538100
848734	contig_8729_pilon	-	734	2	Intergenic	novelGene_40081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	40	348	78111	77803	TRUE	35	GCAGCAAGAATGGCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGAGRTLPRIQARALPSPPEARLPAGSEEELYDCLDYYYLRDFPACGAGRSKGRTRRERELRTNRPVPGGHERKIAQKLLNGQRKRRQRQLQPRPRTRLA	78150	76940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_77138_77613
848735	SIRV4	+	237	1	ISM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	1534	632	1079	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	2771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV4_+_2500_2800
848736	contig_10456_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_163463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGTAAACATTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32867	32275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_32300_32900
848737	contig_5145_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_131370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTATCTTAGAGTTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535274	534626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_534600_535300
848738	contig_5145_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_131369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534626	534208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_534200_534600
848739	contig_3825_pilon	-	686	6	Intergenic	novelGene_77958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGACGACAGCAGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15651	13041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_13104_13620_13730_14060_14183_14723_14894_15230_15299_15496
848742	contig_7839_pilon	+	1116	6	Intergenic	novelGene_45696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	2.57681974534502	18	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	70	861	213933	224045	TRUE	10	CTTCTGTGAACTTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSESLLLSLELASGSGQGLSPDRRASLLTSLMLVKRDYRYDRVLFWGRVLGLVADYYIAQGLSEDQLAPRKTLYSLNCMEWSLLPPATEEMLLQTSVVSGRFLGDPSHEYEHTELQKVNDGDKVFEEEVVIQIKEETRLVSIIDQIDKAVAIIPRGALFKTPFGTTHVNRTFEGLSLSEAKKLSSYFHFKEAVELKNKTLLEKADLDPSLDFMDSLEHDIPKAGDSRMSSGETVLPGRQKPKLAGLLSGAKIPGKSSPGHQD	213863	228011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_214160_217792_217959_220183_220314_220794_220942_223923_224083_227793
848743	contig_12765_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_106550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34543	33612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_33600_34500
848744	contig_17074_pilon	+	609	4	Intergenic	novelGene_145156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	55.1603722491669	1325	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	5	313	281906	296751	FALSE	30	TTTTTAAAAGACAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMADDVDQQQTTNTVEEPLDLIRLSLDERIYVKMRNDRELRGRLHAYDQHLNMILGDVEETVTTIEIDEETYEEIYKSTKRNIPMLFVRGDGVVLVAPPLRVG	281901	297047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_281927_285334_285446_288891_288988_296670
848746	contig_9739_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_165085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAGCCACATTTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36216	36952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_36200_37000
848747	contig_14720_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_164998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAAAGTTCTATCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237699	236596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_236600_237700
848750	contig_709_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_57572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTATACAGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2157818	2156722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2156700_2157800
848751	contig_11145_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_160530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218030	219442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_218000_219400
848752	contig_7815_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_134387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAGAAGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529528	530522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_529500_530500
848754	contig_3151_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_139184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCGAGACTAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147701	146883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_146900_147700
848756	contig_10642_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_78659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165457	165916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_165500_165900
848757	contig_5084_pilon	+	1055	10	Intergenic	novelGene_64603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.8264761637878	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAGAGTTTGTGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982493	1025592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_982596_1014695_1014814_1015070_1015159_1017086_1017173_1017279_1017482_1018060_1018105_1018495_1018533_1019302_1019384_1019908_1020020_1025406
848758	contig_15108_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_131186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	848	1210	124102	124464	NA	15	CACTCTTTTCCCAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVDVAEVNYLGSCWVHWKLWASACSQTKTGPPRGVCVALCPADTGEVLLMEGGVVSNDKNTTKMTVLQFPEVGMVYDRVQGESSWLCSPSEILENTIPKLRWYLCSRDLSHVIPSTNV	123254	125126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_123300_125100
848759	contig_18392_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_143091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	462	857	71399	71794	NA	50	ATAAAAAGAAAATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVGETHSFRGPQDHLRFSNSLGELHIQLYSRVVVYYRERLPGTASRGKRYMEQSLRETRLKHPLSVESHRMHLIPPTVSCDVSYHNMCEMMPTREHFICQGSLLETQCRVSLGDCIKIPNSQKESRYSA	70937	72085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_70900_72100
848760	contig_11631_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_104189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGCAAAAGGAAAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110098	110922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_110100_110900
848761	contig_10263_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_135864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994938	994267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_994300_994900
848762	contig_7412_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_76279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTCCCTGGGTTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263402	263745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_263400_263700
848764	contig_5207_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_177603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCATGATGCGGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244575	245270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5207_pilon_+_244600_245300
848766	contig_6375_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_73062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCATCTTTTAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678329	677740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_677700_678300
848769	contig_987_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_72257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAACAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401158	400687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_400700_401200
848771	contig_5222_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_59019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGAAGGAGACTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425660	425427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_425400_425700
848773	contig_5499_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_56976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGAAAAAAAACGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179409	180809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_179400_180800
848774	contig_7398_pilon	-	986	4	Intergenic	novelGene_166174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_3	17.1464281994822	25	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2	466	414732	337054	TRUE	15	CTCTTCTTCCTTTCCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARLRHRPDAPSKSCGQTFSRRQLSFPGSPVKIGPGPEEPGRDLRAAAGRGAGCAGQARRQLTPSSSRCPARGAARGSVSPGPRHKLSGLSRDTSPASFRPRKEEPRSLTDFGCLLLGVSGSAGVSEIFPSSHQWSEQIQLLSRPLKRTITGER	414733	248861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_249244_336915_337065_337164_337288_414401
848775	contig_4519_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_123695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATTGCAATGAAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527787	529368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_527800_529400
848776	contig_3077_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_26784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGGACGGGTCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241072	240671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_240700_241100
848777	contig_3077_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_26783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGAAAAGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240671	239693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_239700_240700
848778	contig_17829_pilon	-	1357	2	Intergenic	novelGene_157036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGGGAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34259	31843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_32976_34034
848781	contig_6445_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_77107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAACCGATTCCAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179422	1178698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1178700_1179400
848782	contig_9482_pilon	-	744	4	Intergenic	novelGene_44314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121.89613064682	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	42	488	1238984	1236396	FALSE	5	AGCCTTTCTCTTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNEKATDITCNTDGSDDSEDR	1239025	1236139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236455_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915
848783	contig_10129_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_128161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	34	303	586326	586595	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSAAAWARSGMYFCWGAGSRVRLRREAEGGAELQQAASGERHALLLLSDGTVHSCGDNSWGQLGRRDKPHGKRPGERQGPSAESWRAESGSDVGGNGDR	586292	587136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_586300_587100
848785	contig_2209_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_141011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAATAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153260	152597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_152600_153300
848786	contig_9727_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_86267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84749	83825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_83800_84700
848787	contig_15498_pilon	-	819	4	Intergenic	novelGene_42617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	1.4142135623731	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	57	494	86666	74790	FALSE	40	TATTAAGCAAGTGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACRQRYSQQLLPLVSAGIMKLPLLCALLVITGVIPTQSGILNLNKMIKQVTGKIPFISYWFYGCHCGLGGKGQPKDATDWCCRNHDCCYASLKNSKCRFITDNYRYNFSHGKIQCSDKGSWCEKQLCACDKEMALCVQKNLDTYKKSLRYYWRPRCRGQTPRC	86722	74464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_74936_80011_80119_81185_81331_86626
848791	contig_3004_pilon	+	644	3	Intergenic	novelGene_127545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	24	229	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	138	434	802247	815399	FALSE	30	ACTAATTTGTAGTATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGAPAPGGSCRALVPHGPLRLGVASQAKAGERVPRRQRPGDPGEMEAASPTAAESAGREELDMDVMTPLINEPNFDGTSDEEREQELLPVQKHYQLDDQEGISFIQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVVRLIFVISS	802109	815609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989_814114_815278
848793	contig_5415_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_146137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCATGCTTTCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181249	180050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_180000_181200
848794	contig_1076_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_101144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCACTTTGTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986006	986564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_986000_986600
848795	contig_6489_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_128935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207770	208757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_207800_208800
848796	contig_6673_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_164031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAGAATAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158738	158148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_158100_158700
848797	contig_3068_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_137657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTATATAGTTCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420881	420380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_420400_420900
848798	contig_11838_pilon	-	629	3	Intergenic	novelGene_177508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTGAAATTGTCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396445	387985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11838_pilon_-_388404_391685_391815_396363
848799	contig_10444_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_139472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCTCTCTCTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888275	887378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_887400_888300
848802	contig_11594_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_80893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105386	105926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_105400_105900
848804	contig_14722_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_110214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGTAGCGGGTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42371	42889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_42400_42900
848805	contig_6175_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_16297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCAACTGACAGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443105	1442368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1442400_1443100
848806	contig_17753_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_105080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTTTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67066	65865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_65900_67100
848807	contig_9443_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_167136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGATAAAACAGGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252742	253593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_252700_253600
848808	contig_501_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_134885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACACAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178956	178708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_178700_179000
848809	contig_19061_pilon	+	1067	5	Intergenic	novelGene_173501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	10.0995049383621	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	5	685	32001	35716	FALSE	55	CATAAAGAATATTGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRVDMDHLEVVDVEDGKDRDLHVSVKNAFRLRCSATGESHLLCARKPEQKQRWLKALVSEREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKHQAAGKPKTTSRPYYLTRQKHPALPAGLPQQQVLVLAEPKRKPSTFWHSISRLAPFRKPQPQPVLSSTAASENGKQEFCANIWPRAHPFFPSRLWTLVAAGHPLHL	31996	36098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_32064_33132_33377_34338_34417_34920_35069_35568
848810	contig_16411_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_77322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCATCAAGCCCAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146589	145202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_145200_146600
848811	contig_5968_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_112208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTCCATTTTGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719707	718645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_718600_719700
848813	contig_12761_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_164071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCACACAGACACTCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396795	396158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_396200_396800
848814	contig_10986_pilon	-	978	2	Intergenic	novelGene_71493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAGAGCTAGCATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135344	133398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_134091_135058
848816	contig_4754_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_35979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATGACGGAGAACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485311	484684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_484700_485300
848817	contig_11590_pilon	-	640	6	Intergenic	novelGene_125564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	15.3701008454727	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	157	639	56286	52320	FALSE	30	GTAAGTCTTATTATTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKKKKEMQVAALTICHQDLESLRSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQICYIKQIAPLLEKEDKNGMCDPIIRSCLDILAGIYLSLSLKNPLKKVLASSLNGLPEFFLTEAIHSFTCRLQEELNTTDLCSYRKVIDNISSCLENFNLGRASVNNLLKN	60809	52318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_52352_52466_52616_54733_54865_55815_55911_56210_56311_60677
848819	contig_7066_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_42163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	87	401	823546	823860	NA	75	GCTCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPELLLDSNIRLWVVLPIVIITFFVGMIRHYVSILLQSDKKLTQEQVSDRSAPSPPRPTSHPRDLGQKSAGGYVSLPEFALRPPLTGLSWPSYRSVFHFGHL	823459	823959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823500_824000
848820	contig_7066_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_42164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTTCTGATTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823959	824378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_824000_824400
848821	contig_710_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_162951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAGAAAAATACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383987	384616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_384000_384600
848822	contig_19518_pilon	-	147	1	Intergenic	novelGene_170722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45498	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45400_45500
848823	contig_12299_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_29722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1097	1507	43250	42840	NA	25	TACTGATTGAGAACTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLMMVCFHRKRCPHITWGPYTVHSGFHCQLRGAHSPPCGAVCPAAAKAEVFPSQQVSLAGIAGGLAFDWQRVAGGLSASAGLCVPRGRGEPCHILNFWMCLGLCSLLCIRYLNPHRNLVDKETEVHSLTQGRVSR	44346	42684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_42700_44300
848824	contig_5954_pilon	-	891	2	Intergenic	novelGene_28753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	157	315	1321141	1320983	FALSE	25	TTATTAAGAGAGTTCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSHTQLRASENKDSPIEGNVGEGGFSQLQSPSPAPPPGLRGTLDLQVIRVRMEEPPAVSLLQDWSKHPPGTKGVGAGDTRDWPAVLSESSTPVRGEPEAGSGV	1330377	1320406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1321195_1330274
848825	contig_7189_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_117650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAAGAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463505	462797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_462800_463500
848826	contig_17743_pilon	-	1827	1	Intergenic	novelGene_176428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86007	84180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_-_84200_86000
848827	contig_1244_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_37918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACAGCTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279454	280061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_279500_280100
848828	contig_15087_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_37168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATCCCTGGTCTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108797	107925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_107900_108800
848829	contig_14925_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_55247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCAGCCTGGTTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93491	94223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_93500_94200
848830	contig_4732_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_75390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGATATGTGTATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465358	467470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_466060_466636
848831	contig_5482_pilon	-	372	4	Intergenic	novelGene_144436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.82842712474619	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGAGGTAAGGAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222665	140927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_141022_192971_193113_221516_221601_222612
848832	contig_4402_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_140874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAAAAGGCAAGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795614	796318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_795600_796300
848833	contig_10940_pilon	+	1214	3	Intergenic	novelGene_49287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	15.5	163	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	59	1063	959002	962598	FALSE	25	AACTTTGCATATTATCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFIEEAVRYHNSLAAQPVMQTKRTALRTNEERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDSQSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSFSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAVGGRNENGALSSVETYSPRTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGGHDYQIGPYRKNLLCYDHRMDVWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPLLHANSESGVAVWQGRIYILGGYSWESTAFSKTVQVYDCEKNKWSKGIDLPKAIAGVSACVCALKPRLEDKKKKGKSRRHQDQGQ	958943	962749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_959293_960831_960990_962042
848835	contig_7788_pilon	-	808	9	Intergenic	novelGene_177609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_7	18.203279237544	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	222	586	807	250420	249222	FALSE	35	AATCTGGTTAGTGTAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTALVFCAWQANLVISVSEDRTFKVWDCRVGTSVHTSPVLTAYPLLRVFVDEETKQLVAGCADGQLWIFSLVEAHHYRCVTRVDLRKKRASFSARKVPSGPCGLSGESQLSSRNEQEKEERIESVFLVLQLERCDLSHILNPVCECLPSENTKCLWIGSSAGLFLFNLANFELEAVLLYKDFTSLSIKVAGSCAIMNRTTNEKAFCLLASMFGNEIAVLEINLPALLRSQQGSGVGKGLSVLASSCVLPTSPLYFGAAEKKSTKPVGQK	264408	249220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_249298_249990_250113_250396_250465_252542_252647_258775_258897_260946_261068_261873_261945_263686_263739_264336
848837	contig_7788_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_177608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTTAGATGCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232779	232324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_232300_232800
848839	contig_7657_pilon	+	648	4	Intergenic	novelGene_29999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_2	368.493630278131	16	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	140	517	64638	75169	FALSE	35	ACTTTGATACATGTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQAAKRANIRLPPEVNRILYIRNLPYKITAEEMYDIFGKYGPIRQIRVGNTPETRGTAYVVYEDIFDAKNACDHLSGFNVCNRYLVVLYYNANRAFQKMDTKKKEEQLKLLKEKYGINTDPPK	64498	75300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_64668_66643_66763_74758_74898_75079
848840	contig_10064_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_122715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACTGAGTTTTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272042	271123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_271100_272000
848842	contig_9440_pilon	-	1024	7	Intergenic	novelGene_59036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.706052144883	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	146	811	411098	295318	TRUE	50	ATAACATTAAATGAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVTVVLATVTHQQQLLLSSSSSSSSSSPPPPSPSPTNNTTVIHSRETIMQTSETGSDTGSTVTLQTSVASQAAVPTQVVQQVPVQQQVQQVQTVQQVQHVYPAQVQYVEGSDTVYTNGAIRTTTYPYTETQMYSQNAGGNYFDTQGSSAQVTTVVSSHSMVGTGGIQMGVTGGQLISSSGGTYLIGNSMENSGHTVTHTARASPATIEMAIETLQKSDGLSTHRSSLLNSHMHLERSQSLEKLRSLLCQMVLPLRISSHCRVFIESTVR	546915	290282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_290496_295317_295435_322891_322967_342567_342827_367977_368076_410981_411107_546778
848843	contig_5770_pilon	+	238	2	Intergenic	novelGene_74172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTATGACCAGAGAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261899	262926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_261976_262764
848848	contig_4732_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_75365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	155	583	145080	145508	NA	10	CGCCTTGCTCATTCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPLPGALGASGPGGHPCQVRALAGRRYTRTLCPTVHSPAQLGTELLRGSCMVEGSGHCAQHWLALKELCISEVSKSGNSCRGPRPPNPVTASELSGPARRLSTRRMEGAGTPRTSSPTSQACTSLRLAPHSKPLSGALLCLGSLCPSVLHPACPHTTGRALGLQSHLTMVQHTPLTSSSPLWCAVTVNKVLAD	144925	145509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_144900_145500
848850	contig_9848_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_79936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTACCTTCCTAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96711	96052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_96100_96700
848851	contig_6215_pilon	-	1022	5	Intergenic	novelGene_21223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_1	565.424398129405	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	13	636	243029	233680	FALSE	70	ACAGAAGCAAACAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVVEMGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAGKLLSPRISSR	243041	233293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
848852	contig_10341_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_47257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGTTGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216691	217818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_216700_217800
848853	contig_6076_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_81731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGGGATAACCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46722	48148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_46700_48100
848854	contig_2414_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_158496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGACAATGGGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364086	365316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_364100_365300
848855	contig_19186_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_176045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTAACATGATCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30326	31366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_30300_31400
848856	contig_9988_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_113068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAGAACACATGGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418779	417181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_417200_418800
848858	contig_14618_pilon	-	983	6	Intergenic	novelGene_136833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_5	52.2746592528349	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	13	663	1187119	1115127	FALSE	25	GACATGAGTATCTGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIPLYFVDLQDDLDDYGFEDCAPDCDSMRVTAFLDIPGQDNLPPLTRLEKYAFSDNIFNRQIIARGLLDIFRDFSSNEEDFLTVMEIVVRLSEDAEPTVRTELMEQIPPIAMFLQENRSNFPVVLSEYLIPIVVRYLTDPNNQVRKSSQEVLLILLEQDLIFQHDIENKVCPILLDLSAPDSDDEYKAEAVNVSLSGAGSQHLRETFLQMTLLL	1187131	1114806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1115343_1126056_1126200_1127697_1127805_1149595_1149729_1186922_1186968_1187112
848859	contig_14176_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_74841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAGACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232667	233779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_+_232700_233800
848861	contig_4519_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_123701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560239	561077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_560200_561100
848862	contig_16503_pilon	+	869	6	Intergenic	novelGene_162061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	81.3083021591276	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	113	622	123420	143151	FALSE	10	GTTGGGAGCTCCACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPRAARSDADWGGSRCRWACSAEQKPEPTGSSRTSRMGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVRQAGTWAGGGTGQREARWPVCV	92053	143398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977
848863	contig_10930_pilon	+	404	5	Intergenic	novelGene_37115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9080.6825734633	2	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	28	393	339823	342083	FALSE	5	ATTTGGCTCTTGGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339585	342094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339604_339813_339921_340994_341098_341522_341625_342020
848864	contig_10095_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_57224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGTAAAATAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157778	157128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_157100_157800
848865	contig_9484_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_105698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGTAGCTGATGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277024	277827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_277000_277800
848866	contig_7457_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_31670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAACCAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173752	1174180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1173800_1174200
848867	contig_4301_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_65144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAACCCCTCTCCATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692339	692921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_692300_692900
848868	contig_9708_pilon	+	1026	9	Intergenic	novelGene_67274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	110.534426198357	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	10	996	768056	785223	FALSE	40	TCTCAATTAAAGCAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRAMRGIVNGAAPELPVSTSGPVVGAREQALAVSRNYISQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVTFFFPPFFIPVLIRESGT	768046	785253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_768192_776438_776495_781416_781516_782282_782377_782502_782581_783142_783283_783618_783721_784067_784166_785039
848869	contig_19778_pilon	+	604	3	Intergenic	novelGene_143737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	68	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	68	388	530	6314	FALSE	60	TCCAAAAACCAGAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEGIRLSLCDPGQCQYFPHKALQ	462	6530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_537_5643_5893_6249
848870	contig_10135_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_106573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAACATTTATCTCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4894	5156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_4900_5200
848871	contig_11337_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_107174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114138	114875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_114100_114900
848873	contig_10541_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_144633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAAAGATGTTTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132175	131407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_131400_132200
848875	contig_10042_pilon	+	540	3	Intergenic	novelGene_79216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_2	44.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	329	478	1082817	1082966	FALSE	25	ACTTATGGTATTCAGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYFHPITNKTKLSQLSSLTFWKYLPVSWHILRGILTLYFVWLQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKVNGLTSSICVTVARLVSIFSCLLSLLCPPASA	1076127	1083028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1076352_1082122_1082219_1082808
848876	contig_5620_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_161354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382827	382017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_382000_382800
848877	contig_15866_pilon	+	1191	1	Intergenic	novelGene_63665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCAGTCAGGTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594638	595829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_594600_595800
848878	contig_7612_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_170351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTATTGGTGGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20714	19825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_19800_20700
848879	contig_15185_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_99387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGACCATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78556	77370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_77400_78600
848880	contig_2933_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_111347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815342	814152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_814200_815300
848881	contig_20241_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_159727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118259	118808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_118300_118800
848883	contig_6954_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_64419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72631	71213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_71200_72600
848884	contig_6589_pilon	+	750	5	Intergenic	novelGene_26092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	84.8008696889366	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	102	539	1867977	1874963	FALSE	15	TTTTCTACCAGCTCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLFLLLLLPLVLLLLLAAAWRLHGRRRRRRTPCPSEQVRGGH	1867327	1875174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872792_1874950
848885	contig_18108_pilon	-	660	6	Intergenic	novelGene_33512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	481.162508930195	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCCAAGTGTGCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335395	266699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267079_267666_267728_269574_269637_269886_269955_316700_316759_335363
848886	contig_15003_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_137339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234622	235672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_234600_235700
848889	contig_3386_pilon	-	423	2	Intergenic	novelGene_34600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535673	534224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_534551_535576
848890	contig_5999_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_45649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGGTTTGAATCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265561	264095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_264100_265600
848891	contig_7165_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_116830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGTTGTTTTATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245659	246472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_245700_246500
848893	contig_13145_pilon	+	1085	8	Intergenic	novelGene_116642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	174	362	159115	188266	TRUE	10	CCGGCGCCCCAAGCCGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRLPIFYHNLFSRRGVFSLRLSILTQLPLGGQPPALQWGRRGCSCGTTGVLLVNLHMSVHVSVGGEGLAAHSTLVRSLTRVHQHVAVQGAGRAQRLPADAAGMVGPSSVRVVLTNVHS	158176	262835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_158206_158970_159119_186667_186835_188248_188331_193508_193724_194368_194492_197976_198095_262632
848894	contig_3797_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_120105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTGCTCTTTTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407930	407567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_407600_407900
848896	contig_3818_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_99224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATCTTTACGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275383	276064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_275400_276100
848897	contig_3751_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_158625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACCAAAACACCGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45214	46059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_45200_46100
848899	contig_7839_pilon	+	770	2	Intergenic	novelGene_45670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	471	770	55007	74757	FALSE	15	TGAGTCTGACCTGGGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRLRSAFPQLLSQAATSAPISAEDSGTQGLDNTTLPAWEEEEVATCPSPSPERLRSWAAHKPSCVFIWSAWRAAAMSLSITVLTRRAGWLWEKTLTL	54536	74757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_55175_74625
848900	contig_211_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_129891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGCCCTCCGCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385977	385638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_385600_386000
848901	contig_14647_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_167374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGAGTGTCCAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56983	56380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_56400_57000
848902	contig_14094_pilon	-	649	3	Intergenic	novelGene_145908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.5	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGATTAAGCATTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265035	263265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_-_263652_263786_263966_264951
848905	contig_9345_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_24574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTCATTTTCCTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909764	910751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_909800_910800
848906	contig_10746_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_176813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAGGTATTTTGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25959	26912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_+_26000_26900
848907	contig_6445_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_77046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCACCATGAGACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628444	627255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_627300_628400
848908	contig_11548_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_66795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	317	634	154752	155069	NA	80	CAGGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRRSSLSPECEKDGKMQLCWPPLTSLRTKTTTQRKAKLKESQKKTLSSEQTALEPALPSRIKKLYKPIKSCYCLSQFGFLSRAIRSILTDIITKTSYLHSLYI	154435	155426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_154400_155400
848911	contig_13300_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_125827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGAAGGTGCGTGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021146	1020237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1020200_1021100
848913	contig_12464_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_68742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTCATCTAGCATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431865	432319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_431900_432300
848914	contig_18843_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_165604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGAGGAAGCGGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29665	28495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_-_28500_29700
848916	contig_1406_pilon	+	1095	7	Intergenic	novelGene_25606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	463.738581770185	781	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	66	638	2214556	2231664	FALSE	10	GCTGACGTGTTCACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRFTQAVVSISAPTGDWGRAMAEKTRKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAHPDNITPDAGDSEPKPMIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKAYVGRNVILTSGCIIGACCSLNTFEVIPENTVIYGTDCLRRVQTERPQPQTLQLDFLMKILPNYHHLKKTTKGSSTPVKD	2214490	2232121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2214579_2218160_2218226_2225347_2225454_2226996_2227086_2228828_2228877_2229912_2230056_2231565
848917	contig_7887_pilon	-	620	4	Intergenic	novelGene_124951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	115	573	866661	855154	FALSE	10	GGAGGCCTGGGGCACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAWVVPTATLTPRASRMAARSCCCCWRRVSAMSRGRELKLAVRCSSLDSRLPICFSRSSLRSLSSVMRSYMTFCILERSTRVLAWSFSFLCSILTLLSLVDGLEELPLVFPDFGMIDLLQQLCVFVDQPGFPQHIGCCIFDFFLNYFGTSS	866775	855106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_855187_855408_855536_856968_857039_866432
848918	contig_11908_pilon	+	1122	19	Intergenic	novelGene_133221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAACAAATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275566	407981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_275734_277116_277169_277259_277320_277426_277457_279291_279373_279480_279523_280547_280638_281357_281412_282709_282764_283586_283626_286373_286413_289423_289484_294928_294973_306157_306212_326508_326564_362278_362334_396398_396434_397973_398031_407927
848919	contig_13110_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_138742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAATACAATTATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506311	507486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_506300_507500
848920	contig_7057_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_123271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	267.5	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACAAATCAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703755	705426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_703846_704826_704959_705180
848921	contig_6576_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_42354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGTACCCAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749176	748722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_748700_749200
848924	contig_2890_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_60268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCTGGAGAAGCGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266445	265704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_265700_266400
848925	contig_13945_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_173459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120698	119797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_119800_120700
848927	contig_6410_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_108655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATTAAATGTAAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491605	492247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_491600_492200
848930	contig_14219_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_54365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041169	1041845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1041200_1041800
848931	contig_12074_pilon	+	929	2	Intergenic	novelGene_53775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	70	927	46021	52528	FALSE	30	AACAGTTACACAGGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVFTAAVLLWPLCKLRFYRPSAMAEAMDLGKDPNGPTHSSTLFVREDGSSISFYVRPSPAKRRLSTLILHGGGTLCRVQEPGAVLLAQPGEALAEAAGDFISTQYVLDCVERNERLELEDYRLGSAADQASETKPGAQAEGAAAAVEPDPEPLTGRIAFTEADDVAILTYVKENARSPSSVTGNALWKAMEKSALTQHSWQALKDRYLKHLRGQEHKYLLGDAPVSPSSQKLKRKAEEDPEAADSGEENESPGFEIHITMCDDDPPTPEEDSETQPDEEEEEEKVSQPEVGAAIKIIRQLMEKFNLDL	45951	52530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_46694_52343
848933	scaffold_8345_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_107019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCATAGCAACCCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586333	585250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_585200_586300
848934	contig_4891_pilon	+	378	2	Intergenic	novelGene_124535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405286	410082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_405436_409853
848935	contig_17727_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_172592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73506	74536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_+_73500_74500
848936	contig_7318_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_152208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGATTATTTCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173941	152353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_152502_173808
848937	contig_4469_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_21912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	305	649	459894	459550	NA	85	GGAAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMTSLNCRLCPTIPPRAGVLGEILAPAGVFSPSGLEGKQQGPGQFVIKRAGGKATHATSEHVDSRKRNFTFMQPGCQTEVTKGSHITILPFLQQQNPSSYHSNGCIKWYIFPP	460198	459396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_459400_460200
848939	contig_6206_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_168155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179883	179482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_179500_179900
848940	contig_5586_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_143600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCTCAGAGGATAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620670	620380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_620400_620700
848941	contig_7179_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_78080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAAACTCCAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543767	544373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_543800_544400
848944	contig_8357_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_39759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGGTAGAATCAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812087	811641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_811600_812100
848945	contig_8357_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_39758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAAACAAAATTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811284	811006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_811000_811300
848947	contig_7362_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_147558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAAGCTGCACTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460293	458711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_458700_460300
848948	contig_8412_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_118366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTGAGCCTAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516987	515781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_515800_517000
848949	contig_2646_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_69713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTGAATATCTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2569162	2567985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2568000_2569200
848950	contig_4952_pilon	-	1469	2	Intergenic	novelGene_145542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCAGATCAAGATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531238	529033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_529777_530512
848951	contig_8865_pilon	-	1351	1	Intergenic	novelGene_164472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATAGTTGTTGACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500171	498820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_498800_500200
848952	contig_8286_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_139796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAACTTGATAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129216	129890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_129200_129900
848957	contig_3132_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_127465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508568	509208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_508600_509200
848958	contig_348_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_67624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTATTATGAGGATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351437	352205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_351400_352200
848959	contig_12721_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_175069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTGGAACAATCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54612	55250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12721_pilon_+_54600_55200
848960	contig_2646_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_69493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATGTAAACAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122519	123437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_122500_123400
848964	contig_7318_pilon	-	853	5	Intergenic	novelGene_152222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	11.2915897906362	4	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTATATTTTCCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273500	262768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_263246_263499_263546_265174_265235_269785_269940_273384
848966	contig_7915_pilon	-	653	5	Intergenic	novelGene_42986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	403.589132039008	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2	541	167239	142263	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYRHRYCSHRVYISSASPRTRGASADRPCLLSLCVCIPLPRPDAPLPPGKLPSHQQPPRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC	167240	142150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_148028_167063
848967	contig_10938_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_171762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAAACTCTCTGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30278	31566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_30300_31600
848968	contig_11370_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_98773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAGAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253625	253104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_253100_253600
848969	contig_6870_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_103938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	301	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	113	718	1178538	1179143	FALSE	50	GAAATAATTTCAAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDPDLKRQELQPSWAGSGLWAPGPEAYGVRRSREGSCMTLAFKTLFPQSLRVLSRKELCVFRERHHQPDIRQFSQCSETDLIHGCGLLLRKKPVLSFQRGSLRPRATCLVFSPGSHVGLCSGSSEMAEQRFCVDYAKRGTAGCKKCKEKIVKGVCRIGKVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQYIAGGVEKTAFSSYWCQEKIR	1175948	1179190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1176057_1178533
848972	contig_50_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_122230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAACAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124488	126222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_124500_126200
848973	contig_15114_pilon	+	710	4	Intergenic	novelGene_121077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	17.7826382244655	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	36	362	4179	24598	TRUE	45	TTCAAAAAAAATTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSTRDRTEAVHMPSSSLSRWALHTAMNRRARRGAQYVHTGRAEPKCPPFFFSQLPFPEMANSNGTEKAQLWVHATQCPERIHYEKNVNHSFQTLLWKELMRKQIGTFQVKSSTSFIPSL	4143	31494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_4365_24351_24450_24555_24722_31269
848974	contig_753_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_112987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	90	395	1210648	1210343	NA	35	CATAATTTGATGTCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGSSKSSSGGGSSCEEVVTVATAASATMARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTVSGSGRAGLAAPWQLFPLLPLPQPERCALEKECVATPRRGLLSSRPHKLAFAVGHSVTSAGPKPSAPYAL	1210737	1209007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1209000_1210700
848975	contig_6975_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_74308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	489	863	527493	527867	NA	75	AAAAAAAAAACCCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHPFLPSSRLLICSFASLMGQHFLTVSATEVLSFFSPVLEVTFFKSGLSNCSVILSVFLVICTSCDFSSTHPFDSDTSESSILLLVAWSKSVTITEESGGEVLSGELESSEILRGVGGNSDK	527004	528617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_527000_528600
848976	contig_4125_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_25162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGAACCACTGACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908992	909547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_909000_909500
848977	contig_10082_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_63876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAGCCGACACGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216535	217846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_216500_217800
848978	contig_13702_pilon	-	664	6	Intergenic	novelGene_102598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.9618874694645	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	12	584	99578	68217	FALSE	10	TTGTGGCTTGTCATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVLEQLGALWMQNLRSQGKLALGLLSPHNVLLQSHIHTSASLDISRKWEKKNKIIYPPQLPGEPRRPAIRGMSIDQALAQLEFSDKKGAQIIKEVLLEAQDMAVRDHNVEFRSNLYIAESTSGRGQCLKRIRYHGRGRFGIMEKVYCHYFVKLVEGPPPPPEAPKTAVTLAKEYIQELRNRTIIHTL	99589	68136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_68429_75046_75117_76558_76637_84002_84139_99421_99471_99550
848979	contig_19974_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_130453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAGTGAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70804	69143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_69100_70800
848981	contig_20842_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_160971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGATATTGCCTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107061	106386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_106400_107100
848983	contig_10311_pilon	+	653	2	Intergenic	novelGene_50482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTTTTGCAAGGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92148	93385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_92478_93061
848986	contig_10158_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_150775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118133	118979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_118100_119000
848987	contig_4151_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_65274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCCTCATTCCATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628322	627038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_627000_628300
848989	contig_10855_pilon	+	1155	3	Intergenic	novelGene_124306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	370.5	114	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	36	320	308080	310262	FALSE	5	TCTCCTTTTCCATCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGREDEDRRPRMDGVWKTPSQLSLLAPLVLQPAEAQSVAQRKLWLVGLSAALALLFLIFVLIVVYAIWCRESTDSNEEKEEETKEEKKGEQFGARARGERGVLKP	308044	311097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_308159_308240_308353_310168
848990	contig_11720_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_43918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGGTGTCGAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238920	237023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_237000_238900
848992	contig_7057_pilon	-	890	8	Intergenic	novelGene_123234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.5819142486106	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACGTATTTGCTAGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539708	536986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537536_537602_537712_537852_537897_538128_538201_538252_538336_538397_539420_539484_539654
848993	contig_2043_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_169934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837441	838163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_837400_838200
848996	contig_15613_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_147191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTTGATTAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51962	51368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_51400_52000
848998	contig_4769_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_118021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCTGTTCCCAGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155372	1155825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1155400_1155800
848999	contig_7904_pilon	+	977	8	Intergenic	novelGene_160025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	287.822862191314	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	223	942	464795	479312	FALSE	25	AGGTACTATGCAGGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRNVLFDSSAKRKTEDITVSKLCSDAQVKVFGKCCQLKPGGDSSSSLDSSVTSSSDIKDQCPKYQGSRCSSDANMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHQIRSPPQLMLSKVFTARTGSSICGSLNTLQDSLEFINQDNNTLKADNNTVINGLLGNIVHSNPMDMPGRELNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPNSSLTRSCASSYQRRWRRSQTTSLENGVFPRWSIEESFNLSDESCGPNPGIVRKKKIAIGVIFSLSKDEDENSKFNEFFFSHFPLFESHMNKLKSAIEQVSRVMLLTYLHPLFSFESYSPY	442582	479347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_442643_458570_458706_464767_464869_465302_465378_469399_469492_477700_477773_478378_478515_479041
849000	contig_6795_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_27679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTTGAATGGGCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67717	68109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_67700_68100
849001	contig_5424_pilon	-	642	5	Intergenic	novelGene_172814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	444.992696569281	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	226	558	155931	144242	FALSE	70	AAAAAACAAAAAATTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVEEDSDTVTVETVNSVTLTQDTEGNLILHCPQNEADEIDSEDSTEPPHKRLCLSSEDDQSIDDSTPCISVVALPLSENDQSFEVTMTATTEVADDEITEGTVTQIQV	168304	144157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_144343_152897_153021_155822_155940_156654_156778_168210
849002	contig_5832_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_134141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACGAAAAACAACTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267318	267746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_267300_267700
849003	contig_8801_pilon	-	1211	5	Intergenic	novelGene_66249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	48.002604096028	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	162	938	199038	181003	FALSE	5	TCCTGTGCTCCTCAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEGTPVFLNLGESCARLGGATLTSEAPIHTRRWARVGQTWRSWPSPCRTRRAPRRRPCRCCSQGRPPTASTTPLPMVLYSLASERQPASLRCTETSSSRGPEGLLHCRACSFKNH	218767	180729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_183962_184124_194487_194715_198830_199065_218632
849005	contig_12533_pilon	-	1202	5	Intergenic	novelGene_175395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	20.0062490237426	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	37	564	115076	98090	FALSE	20	GAGATGGAATTCTTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKEVLNEERFLGNTKEGAAQDQTMFTAMETFQMSDPKPKKRNGVKCFLALVTVYLILLTTGGGLLVVQVLNLQERIRALEIYLFNDTLAADDSSFFSLRQEMHHPHLARGAWDGEKLQNLQAQLMQVHASQQHLRWQVDNFTQSPELFGSKGEPGSPAQHHRFHGCMADASQG	115112	97451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12533_pilon_-_98140_98551_98588_99898_100130_100968_101071_114967
849006	contig_13265_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_146012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGGACAGACAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126607	127998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_126600_128000
849007	contig_6489_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_128951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350010	350907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_350000_350900
849008	contig_7568_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_173993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTGCAAACAAACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13584	14449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_13600_14400
849011	contig_934_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_129004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAAATGTTTTTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29324	28466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_28500_29300
849012	contig_4857_pilon	+	922	3	Intergenic	novelGene_48675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGTAAACACCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078709	1080852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1078753_1079283_1079937_1080626
849013	contig_20819_pilon	-	452	5	Intergenic	novelGene_55671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2218.05797658673	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	209	325	65941	65691	TRUE	5	GTGGTTCTCTCCATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKESWPMVWTTSSVKTWSG	69725	65391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65503_65674_65743_65876_65963_66048_66136_69625
849014	contig_6102_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_32317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTATTACTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1589465	1588863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1588900_1589500
849015	contig_16091_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_112351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGTTGAACGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31970	32915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_32000_32900
849016	contig_13014_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_169375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGCTGGCCTCTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573952	573209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_573200_574000
849017	contig_13014_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_169374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAACAAAAAAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573064	572652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_572700_573100
849019	contig_16617_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_177611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGAGTCTGTAGTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16617_pilon_+_0_800
849020	contig_1443_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_28330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAACAGAGCAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749756	749256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_749300_749800
849021	contig_11551_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_168485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	140	328	658847	658659	NA	50	AATAAAAATATGCTACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTNGRENNIKELDRKSKSVLRDLNPQCLFWNNDGFSSCTNVPVKKNMAKNIPSEWASFLDSVLRDPETPLLCPWAVGLRQVDTGGWQVCQRFALKQFLKHTGSGGESL	658986	657315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_657300_659000
849027	contig_8110_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_158615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134142	134453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_134100_134500
849029	contig_7340_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_159888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCAGTATTCTTTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84505	86077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_84500_86100
849031	contig_10629_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_52941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTTTGGTGAGTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373180	372191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_372200_373200
849032	contig_1521_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_145448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGCATTGTTCTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179158	163669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_163981_165931_166103_179059
849033	contig_10855_pilon	+	1217	6	Intergenic	novelGene_124279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	20.0299775336868	43	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	124	1068	39910	47308	FALSE	25	GCAAAGTCTCGGACTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLTIPPTPPGPPAMDLEEPRDTLAPSQDLAPVCPWDPVLGAPSGLNPMDFDGSGVQDLVQRFEALPGDLGGLFSEGAPCPLHIATGHGLPPQDIADAHGLLSAEAERGDLLSLLCRDECLPSQPCPQGSPEPAPRLLQPPDDPDEDTSLPEWAEGASAGQDGSRSSDSSPEPWLETVPLVRPEEPPATAQCPKTLASYPARQEVPGPCDHEDLLDGVIFGAKYLGSTQLVSERNPPPSTRMAQAQEAMDRIAERGGVRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAHSEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL	38951	47457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_39038_39872_40486_40561_40602_44312_44453_47037_47155_47236
849034	contig_1594_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_138809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424741	425497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_424700_425500
849035	contig_11448_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_66392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAAAGCGTTTGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420364	419503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_419500_420400
849036	contig_8616_pilon	+	1247	11	Intergenic	novelGene_72399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	22.7774010808959	284	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	453	1205	209271	213351	FALSE	10	CTTGACCTTGAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQDPAHPHVVATGGKENALKVWDLQGSEEPVFKAKNVRNDWLDLRVPIWEQDIQFLPESQKLVTCTGYHQVRVYDPASPQRRPVLEATYGEYPLTAMTLTPGGNSVIVGNTHGQLAEIDFRQGRLLGCLKGLAGSVRALQCHPSKPLLASCGLDRVLRVHRIRNPRGLEHKVYLKSRLNCLLLSGRDNWEDEPQQPQEPNKVSPEDTEMDELWASLEAAAKRKLPDFKQSQGALQARHKKKKRPGSTSP	207057	213393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_207140_207220_207328_207415_207538_209039_209145_209234_209382_209537_209640_211720_211822_211911_211968_212282_212429_212563_212621_213171
849037	contig_14405_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_85621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGGTCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333466	334583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_333500_334600
849038	contig_5020_pilon	-	806	6	Intergenic	novelGene_27958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	35.0177098051829	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	226	567	223081	210147	FALSE	15	CCCAGCCTGTGCAGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRTSRENPICSAGGFLLNTSRHYKTKPTHGIGRYKHLIIAQEPKKKRGKVEVRPINLGTDHEYGVVNIHLTAYDMALAESYAQYVHNLCNDLSIKVEESYALPTKTVEVLRLQDQGNKTFLDSVLTTHERVVQISGLSATFAEIFLEIIGNNLPEGVKLSVKEHTEEDFKGRFKARPELEELLAKLN	260446	209907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_210222_211256_211347_212688_212792_223007_223178_239656_239746_260406
849039	contig_5331_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_112759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAACAAAAAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66271	65566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_65600_66300
849040	contig_9844_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_177612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAGAGTGCTTTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168870	168045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9844_pilon_-_168000_168900
849041	contig_5047_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_157975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGAAAAAATATATACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694858	694562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_694600_694900
849042	contig_5047_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_157974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCGTAAGAAGCCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694562	693845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_693800_694600
849043	contig_4496_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_66675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAACTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874556	873404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_873400_874600
849044	contig_13612_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_157277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGATCTCCAGACCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35701	34732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_34700_35700
849045	contig_7292_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_175372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	93	452	403092	402733	NA	25	GTGTTATGGAAGATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVGQEGQDRDGGSHLKQARPSPYLPGHLPMGLALISSQGPELCTGKLLGVTPLELGVGQGCGSIKLSGRQVGLSVLDLDQPVSPFAPTTLLRYPFSHLLVHARDSGGAGRGQKSRLSDQESQPEVSGSSSWKSTPLSLSPLTSPKPPS	403184	402545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_402500_403200
849047	contig_15628_pilon	+	942	8	Intergenic	novelGene_147686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_7	179.646023828948	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	41	643	29120	68048	FALSE	25	GAACTCCTGGAGTCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRGRREHRVPEVMPPKRNDKYKLPVPLPEGMVLGDTEGKQWMLGKMIGSGGFGLIYLAFPTNKPDEDARHVIKVEYQENGPLFSELKFYQRAAKKDCIKRWVALKQLDYLGIPQFYGSGLTTFKGRSYRFMVMERLGIDLQKISDHNGTFEKSTVLQLGIRMLDVLEYIHENEYIHGDVKAANLLLGYKNPDQDQLTSLLSHEALLDDSSLY	26989	68347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_27025_29114_29256_47265_47316_48279_48350_49743_49832_51999_52106_53308_53402_67988
849050	contig_9919_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_138000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846110	845838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_845800_846100
849051	contig_3654_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_174989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATTGTTTACACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474253	472971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_473000_474300
849054	contig_4678_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_126000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATCTGGGCAGTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97471	99182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_97500_99200
849055	contig_13928_pilon	+	970	2	Intergenic	novelGene_177064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAATCTCTCTGTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302971	309014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13928_pilon_+_303112_308184
849056	contig_5352_pilon	+	919	2	Intergenic	novelGene_177066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAACAATGAGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55018	99174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_+_55140_98376
849058	contig_15867_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_170885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGGCTCCTTGATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61291	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_61300_62000
849060	contig_4103_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_51981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTATGATAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194812	195143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_194800_195100
849061	contig_19185_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_163675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGTAGAACTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181856	182661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_181900_182700
849062	contig_12270_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_114034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	27	344	14409	13869	FALSE	20	TTACTGTCAGTATGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAV	14435	13866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
849065	contig_5586_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_143610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709742	709346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_709300_709700
849070	contig_6048_pilon	-	710	3	Intergenic	novelGene_73316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	41	706	2122086	2102001	FALSE	40	GATTATCTTTGTATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAASGPGCRSWRLCPEVPSATFFTALLSLLVSGPRLFLLQPPLPPSGLSLRSEALRNWQVYRLVTYIFVYENPVSLLCGAIIIWRFAGNFERSVGTVRHCFFTLVFTVISAVIYLSFEAVSSLTKLGEVEDARGFTPVAFAMLGVSSVRSRMRRALVFGMVLPSALVPWLLLELPAGMPGDPQACVVYCWDSPLPPPRFFCPRSSGTGQCDCNALMDP	2122126	2101996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102142_2119345_2119684_2121899
849072	contig_20374_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_166017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAAAATAGCATGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21567	20352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_-_20400_21600
849073	contig_7049_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_171448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTCAAACCTGCAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204657	206665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_204735_205886
849074	contig_12125_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_76255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	200	448	651769	652017	NA	20	TTATGTACAGTTGTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWLSGSETTSVCTEQEDRQHHGEGPTDGQLAGGPGRRPPSVGWFLVSGALLTPGRAGEPGCDIAFLMACVCTPHPQACAAASAGVGGLSCLRLSLLTPGGGRSPVSGHLPCIATLNVAPRHTSCVHDGDTLSSKGVYFLTVHETFLRS	651569	652607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_651600_652600
849077	contig_9995_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_47825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925802	926581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_925800_926600
849078	contig_9571_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_136246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGTAGTGCTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273817	273230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_273200_273800
849080	contig_709_pilon	-	665	9	Intergenic	novelGene_57600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.427008000804	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	135	530	664	2332133	2329556	FALSE	50	TCACTCAGAGGAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYTFSAVCFHSANSNADHEGFLLGEVRQEETFSISDSQISNTEFLQVIEIHNHQPCSKLFSFYDYASKVNEESLDRILKDRRKKVIGWYRFRAKYAAADVFLLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQ	2349969	2329554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200_2334284_2334344_2334393_2337517_2337585_2340273_2340311_2345847_2345939_2349914
849082	contig_20371_pilon	-	1129	2	Intergenic	novelGene_129183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGGGTCATTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53023	43050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_43276_52119
849083	contig_10523_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_120964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAAAACCCTATGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83737	83969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_83700_84000
849084	contig_10523_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_120965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCCCTCTCTCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83969	84834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_84000_84800
849085	contig_18869_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_56478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATACATCGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245832	246839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_245800_246800
849086	scaffold_8345_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_106986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTACCTCTGGACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35446	36855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_35400_36900
849090	contig_6217_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_109666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACAATTGCATGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775106	774843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_774800_775100
849091	contig_11872_pilon	-	1565	6	Intergenic	novelGene_143151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTTTTAAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92327	61567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_62486_64364_64482_68492_68667_70193_70328_70715_70907_92296
849092	contig_15326_pilon	-	1074	8	Intergenic	novelGene_157700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	301.706574576785	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	304	837	82003	15820	FALSE	60	GTACGAAGAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSEYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	93235	15582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_15972_19883_19928_20501_20634_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83621_83742_93077
849093	contig_7171_pilon	-	913	3	Intergenic	novelGene_101373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.5	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360965	1359429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1359501_1359764_1360465_1360823
849094	contig_5253_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_61602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGCAGTTTTACTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371978	370801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_370800_372000
849096	contig_13753_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_136515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220007	218368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_218400_220000
849097	contig_19228_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_174413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCCTCCTTGGGGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35949	34736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_34700_35900
849098	contig_2550_pilon	-	1050	2	Intergenic	novelGene_135712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	53	442	1801470	1779815	FALSE	60	TATAACTTATAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKASVGKISVSSDSVSTLNSEDFVLVSRQGDETPSTNNGSDDEKTGLKIVGNGSEQQLQKELADVLMDPPMDEQPGDKELVERSHLDGEGDAPLSNQLSASSTVNPVPLVGLQKPEMSLPVKPGQGG	1801522	1779206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1780055_1801320
849100	contig_5765_pilon	-	1186	4	Intergenic	novelGene_141413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAGACTCTCTCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874266	866460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_866949_871064_871132_871770_871952_873816
849101	contig_10311_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_50489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGAAAGATTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229763	230736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_229800_230700
849102	contig_7179_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_78199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACTGATGTAGCTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369876	1369640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1369600_1369900
849105	contig_10437_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_38240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACAGAAATTTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350110	350461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_350100_350500
849106	contig_6664_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_176068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAGGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23517	22536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6664_pilon_-_22500_23500
849107	contig_13780_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_149100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738492	739643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_738500_739600
849108	contig_12509_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_177613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTGGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115623	115296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12509_pilon_-_115300_115600
849109	contig_9017_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_130339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	249	887	474292	476893	FALSE	25	GCCCAGAGCGGGGAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRSPSKDSGCWTVASWSWLIASHGLLEPVHIFADLCVDTGLFGDGTWILAPGDNALQRAVTDQRSPRVTLAGILARFLNAGTHHGVCDTAGIGILTLLVLSDGDVGTLQAVGQVHYWGLEVVPQPEMRQRVPAVTQCDDRVMGRTARVMKAGAAIFTNMMSLRWSLLGRLLLNSGWRKDSVAVRVCSQPSCCWRLCSPRCTTQYLSPEQA	474043	476913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_474504_474921_475062_475573_475836_476868
849110	contig_2114_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_104261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGGGAAGAGGTAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465282	463656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_463700_465300
849111	contig_13571_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_128129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305981	305471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_305500_306000
849113	contig_14970_pilon	-	597	3	Intergenic	novelGene_45147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_1	68.5	255	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACATGCATTCACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315890	299859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_300051_311919_312047_315611
849114	contig_12570_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_79391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTACTTTTTGATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291121	290618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_290600_291100
849115	contig_9705_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_41732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATTTCATTAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228348	227453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_227500_228300
849116	contig_6059_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_44785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGACAAACATAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125813	126968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_125800_127000
849117	contig_6397_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_146252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGGAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450466	449589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_449600_450500
849118	contig_4364_pilon	-	1696	11	Intergenic	novelGene_61	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	16.4572172617366	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	113	1483	698614	680297	FALSE	30	GAGAGAAGGCGTCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCEHCTRKECSKKTKNEDQEDASVDVTSPARGKEEKGEFHKLADAKIFLSDCLACDSCVTAEEGARVSQQNAKDFFRVLNLNKKCDTSKHKVLAVSVCPQSLPYFAAKFNLSVTDASRRLCGFLKSLGVHYVFDTTIAANFSILESQKEFVRRYQQHSEDERALPMLTSACPGWVRYAERVLGSPITPHLCTAKSPQQIMGLLVKDYFARQQNLSPDKIFHVIVGPCYDKKLEALREDVHAASHTLQGVDCVLTSGELLQIMEQSDLSVKEAAVDTLFGDLKEAAVWRPDGASSDGYLAHVFRHAAKELFGEDVENVTCRALRNKDFQEVTLEKDGEVVLRFAAAYGFWNIQNTIRKLRRGESPYHFVEVLACPGGCLRGRGQAQAEDGRVDKALLRQMEGIYAEIPVRPPETSEHVQMLYREWLHGANPHRVQEALHTSFPSPGLAASSLDIKW	698726	680083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_680539_681344_681503_681783_681922_684372_684437_686502_686633_688577_688697_689716_689852_692005_692139_692863_693008_696529_696611_698587
849119	contig_10063_pilon	+	1585	1	Intergenic	novelGene_127745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATAAATAAGGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411771	413356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_411800_413400
849120	contig_11258_pilon	+	260	4	Intergenic	novelGene_67738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_3	4071.9249338202	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATCTTCAGTGTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49139	53620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49232_49379_49422_50092_50154_53555
849121	contig_14954_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_165179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACAGGAGGAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87252	87789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_87300_87800
849122	contig_5871_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_160179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAGAACTTTACCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396646	396084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_396100_396600
849123	contig_9366_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_166285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGGCATGTGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067534	1068551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1067500_1068600
849124	contig_5423_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_85159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTAAAACTGTTCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23521	22837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_22800_23500
849125	contig_612_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_155631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTTATTTTAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258142	256933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_-_256900_258100
849126	contig_15866_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_63597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCAAATTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253323	253795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_253300_253800
849127	contig_12964_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_131718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAAAACCATGCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590375	589529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_589500_590400
849128	contig_12644_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_44546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTAAAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520192	1518817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1518800_1520200
849129	contig_13697_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_165917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCAGTTTTGTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148556	149944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_148600_149900
849131	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	6	91636	6	-91630	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAGTAAGTATAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	147667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
849132	contig_10238_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_170112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTCCAGGGTTAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446857	447871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_446900_447900
849135	contig_10496_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_59436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAAGTACGCCACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185436	186464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_185400_186500
849137	contig_4426_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_15371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150973	152177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_151000_152200
849138	contig_11117_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_148576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTTAAAAGTATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34338	32882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_32900_34300
849139	contig_4531_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_47883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273812	274694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_273800_274700
849141	contig_3018_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_78812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAGGATTGTAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536536	535491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_535500_536500
849144	contig_3942_pilon	+	579	5	Intergenic	novelGene_128736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTCCATGGCAGCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753131	770870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_753345_757213_757275_757492_757581_757666_757837_770823
849145	contig_19640_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_134865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGAAAAGGAAAATACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63149	62865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_62900_63100
849146	contig_8729_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_40171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902055	902652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_902100_902700
849147	contig_14577_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_164651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	686	junction_1	96.0566962209761	40	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	249	602	127106	83214	FALSE	25	CTTTGATTTCCTAATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGPVPGFTPTPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRGKVQFY	127354	83102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_83289_84848_84969_86764_86860_127042
849148	contig_8140_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_86441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCAAAGGAAGTAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555960	556679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_556000_556700
849149	contig_6304_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_122255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGAGAGAGAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141207	142080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_141200_142100
849150	contig_11304_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_156698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358409	357327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_357300_358400
849152	contig_2715_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_173174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112018	110837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_-_110800_112000
849153	contig_9389_pilon	+	542	3	Intergenic	novelGene_83995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	31	420	388899	392194	FALSE	10	GCTGGTGACCGACTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRRHRFCRAMGPQVGPQVAPPPPLSLLLQALLLSALLYGAQGATLSTQPTAKTTPSSPPPPAVTNDSQPGSPHNGTHPLSSPGSPLLRSFYVLTGISGLAALYFLIRAFRLKKPQRQRYGLLANSEDSAEMGSPSSGL	388868	392316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_389201_390982_391054_392177
849154	contig_14621_pilon	-	678	6	Intergenic	novelGene_105873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_5	116.190188914555	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	83	676	431679	411189	FALSE	20	CTTCCAGCTGGTAGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFAL	431761	411186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643
849155	contig_9345_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_24599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGAACTGTGTGTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944812	944546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_944500_944800
849156	contig_10554_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_166960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15430	14580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_-_14600_15400
849157	contig_8934_pilon	-	454	3	Intergenic	novelGene_167239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1604.5	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTCTTTATTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603929	595834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_596055_602567_602661_603788
849162	contig_10296_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_168884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896086	895391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_895400_896100
849163	contig_13224_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_104098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACACCAAAAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253652	254157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_253700_254200
849166	contig_3602_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_60684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCTGAAACCTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253992	1253137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1253100_1254000
849167	contig_9180_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_109110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGGCTGCTGCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381486	380487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_380500_381500
849168	SIRV6	+	359	4	NNC	SIRV6A	novel	377	4	NA	NA	-1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3180_10748_10819_11031_11109_11205
849169	contig_15236_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_141572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	299.5	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	129	830	419232	452419	FALSE	20	GAAGTGTTCTTGTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACPGISLVAVRRPSSFHLEELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGLLISVEQPARYFSSACLYCQRGELNRDINGQDRITLKFFRKGII	419103	452550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426113_452282
849170	contig_2867_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_135266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAGCACGTTGTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298291	1299126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1298300_1299100
849171	contig_5018_pilon	-	1038	2	Intergenic	novelGene_46926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	218	547	116018	115689	FALSE	25	CTGCATTAAATCCCTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWRLTQGKQVKVVPRSAQSEKSMAVSHGNSRSQLVCVHQRAPQIGAWSSSKPPFQSPEKLLFAFQHLHHQGSTLSLNFHCVAGRMQPKRCLGKNVLMEQGTCLGHLE	130667	115197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_116094_130525
849173	contig_5434_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_74667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	141	362	282473	282694	NA	70	TATGGAAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLYQGPDALQASAKGRACRTFPHTSQAAVQHEPGSVPATGSLAGEMQRLRRKVRSAPPVACGWRLGSGQGRKMADPASGHRLRLGVRPACLEAERTPSWDSMGTPLKFAFAEGAKGGV	282332	283668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_282300_283700
849174	contig_6509_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_145647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134229	134876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_134200_134900
849175	contig_4385_pilon	-	913	4	Intergenic	novelGene_141502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	28.0515398666257	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	247	753	326804	323422	FALSE	35	AAACACCTGGCCTTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTPELLKAFSKLMSVCVMFTNCMQRFTQSMKLDSELGRLTLEHGTMLGPPTEAERAEESARKKLAKKHLAEHMDAPQVTSGFEATISKFDKNFSAHLLDLLARLSIYSTSDCEHSMASVISRLDFNGFYTERLERLSAERSQKAAHHTPAPRGPPAAAPRIAVAAQ	327050	323261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_323558_324951_325116_325777_325907_326726
849176	contig_7179_pilon	-	1129	8	Intergenic	novelGene_78072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	194.965512387212	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTTTGGCCCTGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570890	413842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_414146_501947_502021_503927_504066_540603_540726_541039_541188_547032_547114_549412_549632_570845
849178	contig_16071_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_166005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87200	87946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_87200_87900
849179	contig_17427_pilon	-	440	2	Intergenic	novelGene_30397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAACCTTTCGAGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319261	315869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_316119_319070
849181	contig_7202_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_19106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATACCAGACTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65531	65277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_65300_65500
849182	contig_5039_pilon	-	912	6	Intergenic	novelGene_64881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.01980390271856	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	105	803	521811	507210	FALSE	20	GCCGAATGATACCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPIRGDPIGQSRSVPWGFQGCNLYRSRLPHLSSMEWLAGYDGESIGNCPFSQRLFMILWLKGVIFNVTTVDLKRKPADLQNLAPGTNPPFMTFDGEVKTDVNKIEEFLEEKLAPPRYPKLGTQHPESNSAGNDVFAKFSAFIKNTKKDANDIYEKNLLKALKKLDGYLSSPLPDEIDPYSAEDIPVSGRKFLDGDELTLADCNLLPKLHIIKIVAKRYRDFEFPPEMTGLWRYLNNAYARDEFINTCPADQEIVHAYSDVAKRMK	521915	507100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_507372_517635_517818_518620_518728_519932_520059_521479_521590_521799
849183	contig_3789_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_79812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTACAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83015	83466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_83000_83500
849184	contig_10494_pilon	-	792	5	Intergenic	novelGene_102191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	25.3475837112732	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	15	509	1059298	1056579	FALSE	20	ACCAGCTGCTGTCATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGLDSRGFLFGPSLAQELGVGCVLIRKRGKLPGPTLSASYTLEYGKAELEIQRDALEPGQRVVVVDDLLATGGTMRAACELLGQLQAKVLECVSLMELTSLKGRERLGTVPFFSLLQYE	1059312	1056295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056722_1056876_1056956_1057167_1057302_1058719_1058799_1059238
849186	contig_13542_pilon	-	1348	8	Intergenic	novelGene_131532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	15.8010591223422	23	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	100	579	530160	519241	TRUE	10	CCCAGTGAGGCCCGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKKLGSGNFSSCPNGSRQWIWDVFGECAVDSWDEASVGLGLISILCFAASTFPQYIKACRAGNMDQALSLWFLLGWLGGDSCNLIGSFLANQLPLQTYTAVYYVMADLLMLMLYFHYKYKKRASLSFSTPLLSRPDPVATPREVFRGADTPVCGTRQ	535251	516572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_517062_518192_518379_518957_519051_519239_519339_520016_520105_520758_520889_529996_530238_535229
849187	contig_6102_pilon	+	480	5	Intergenic	novelGene_31957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1302.5022072918	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCAGATTTGGTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413044	416198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_414194_414281_414693_414788_414877_414956_416020
849188	contig_10437_pilon	+	915	2	Intergenic	novelGene_38501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	178	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGAAGAACATGTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302356	1303521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1302431_1302680
849189	contig_10627_pilon	+	708	3	Intergenic	novelGene_59914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	19.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	36	605	29280	32932	FALSE	40	TCTGAATACAAACACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAVPQRPPKMSSFSCWVLPAALLTLLCCPDPPKQVILKLQPTSVTIGNPFTIECSVPGVAPLESLTLTLLRGRETLYNQTFEGATVVPQEAVATLNVTAHREDGHHNFSCQAELDLRSRGGGIVRSISEPQVLEVYEPMQDNQMIIIVTVVSVLLFLFVTSVLLCFVFGQHWHQKRTGTYGVLAAWRRLPWAHQAQVA	29244	33035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_29341_31515_31837_32744
849190	contig_12182_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_177614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAATGTAGAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10678	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12182_pilon_+_10700_11400
849191	contig_1719_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_87334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGACCTCCCATGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514081	512879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_512900_514100
849192	contig_5744_pilon	-	1256	9	Intergenic	novelGene_149333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.695970545353753	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	189	1256	487599	456146	FALSE	45	AAAATAGATGAGTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIESENLNQEEIIKELCLCNGLSYETVEQEGSDTTKLEMFFSGYPHIVGLSLFPNLTSLTIIAQDIKEISGLETCLLLKELWIAECFIEKIEGLQRCRNLEKLYLYYNKISKIENLERLIRLEVLWLNHNAIKNIEGLQTLKNLSDLNLAGNLISNIGRCLDPNEQLERLNLSGNQICSFKDLTNLTRLCHLKDLSLNDPQYKTNPVCLLCNYSTHVLYHLPCLQRLDTFDVSSKQIKELADTTTMKKIMYYNMRIKTVQRHLNEDLEKLNDRKCKLQKLPEERIKLFSFAIKNLERELAELKGSGKWHSDRSNNSKVSELKKSNGCETVTEEPSLQQKILIKLNALNERIAFWNK	492566	456145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_456332_467737_467894_471758_471942_482672_482744_483049_483114_483671_483813_487057_487277_487551_487633_492411
849193	contig_6208_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_53020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAATTCTAATTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483923	485417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_483900_485400
849194	contig_15327_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_70808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1150	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGTTTGTGGTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342494	1343343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1342500_1343300
849195	contig_8650_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_162627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTCCTGGAAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283779	284217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_283800_284200
849199	contig_12528_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_81361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022139	1021502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1021500_1022100
849200	contig_15471_pilon	-	764	2	Intergenic	novelGene_175232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTCAGGGAAGAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422448	420784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_421438_422337
849201	contig_4845_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_53638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAGCTCAGAATAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284529	285265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_284786_285171
849202	contig_10019_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_86672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATACGAAAGCAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254494	253869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_253900_254500
849204	contig_18850_pilon	-	1266	3	Intergenic	novelGene_142404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_2	20	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACACCTTTCCCCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110533	107218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_108285_109178_109252_110406
849205	contig_10777_pilon	-	1282	1	Intergenic	novelGene_101165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACAACTTAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22395	21113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_21100_22400
849206	contig_987_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_72265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGAAAAGGATATATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433418	433160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_433200_433400
849207	scaffold_6394_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_110961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGATACAGAAAAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234592	232669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_232700_234600
849208	contig_5832_pilon	+	841	6	Intergenic	novelGene_134143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	361.506071871552	132	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	125	766	314208	327257	FALSE	35	CCTCACCAATTATTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHLLPAADVLRRFAVTAECGLSPAQVTGARERYGPNVFPGKSLWALVLEQFDDLLVRILLLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVIRSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTDAISDPRAVNQDKKNTLFSVSLWDA	314083	327332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_314326_324643_324736_326269_326375_326565_326705_326980_327062_327150
849210	contig_14786_pilon	+	834	3	Intergenic	novelGene_174710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	51	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGGTTTCCTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65978	67089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_66092_66283_66459_66543
849211	contig_5812_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_167490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATGGAGAAGAGAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78078	77757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_77800_78100
849212	contig_7457_pilon	-	347	3	Intergenic	novelGene_31296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7490	junction_1	1176	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	90	332	159181	157884	FALSE	65	GTCATTAAAAATACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	159270	157868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098
849213	contig_614_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_132603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACATCCTGAAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210825	210095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_210100_210800
849214	contig_6102_pilon	-	1019	9	Intergenic	novelGene_32059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	61.773780845922	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	178	960	591254	587415	FALSE	70	AACTTAAAAGAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARILIVNSGFSRPSEAGNEGAGRSRRQGRWSWCRTRSGNEEPLQEPPVGAGTATPTRRQMAQWEMLQNLDSPFQEQLHQLYSNSPLPVDIRQYLAAWIEDQNWREAALGNDDSKANMLFFHFLDQLSYKCGPCSEDPECLLLQHNLRKFARDIQAFSKGPAQLAEMIFNLLLEEERILIQAQRAQSDQKEPALDAPVESQQHEIESRILELRAMMEKLVKSISQLKDQQDVFCFRYKTQTPVRTPSLDHHQARQQQLLQETINELDKRRKEVLDAVKALLGRLTTLIELLLPQLEEWKVQQQKACIGAPLDRGLEQLEK	598625	587355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_587416_588943_589093_589255_589342_589720_589797_589888_589979_590356_590453_590810_590965_591123_591262_598455
849215	contig_7866_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_171195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCAGAAAGGCTACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337869	336353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_336400_337900
849217	contig_6446_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_149166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99058	98360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_98400_99100
849218	contig_11340_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_173921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225800	226755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11340_pilon_+_225800_226800
849219	contig_5551_pilon	+	742	4	Intergenic	novelGene_134249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	169.645381769017	754	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCACAAAGATATATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492011	579932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_492174_493899_494114_579387_579481_579659
849221	contig_12125_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_76246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTACAGGCAGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604496	603709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_603700_604500
849223	contig_8992_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_174429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGTATCTCACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190665	189774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_189800_190700
849225	contig_10196_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_132212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAAATCATTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282154	1281688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1281700_1282200
849227	contig_4686_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_118586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTCGAGAAGGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805657	805373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_805400_805700
849228	contig_10490_pilon	-	429	3	Intergenic	novelGene_169880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	1	699	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTCCCTAGTTATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6840	5230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_-_5433_5922_6058_6748
849229	contig_14522_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_147329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACATAGCTTTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120269	121044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_120300_121000
849230	SIRV2	-	316	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	632	0	632	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4100	3643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
849232	contig_9940_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_125363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272339	273448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_272300_273400
849233	contig_6199_pilon	+	1255	3	Intergenic	novelGene_126324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	9.5	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	753	1085	5651	5983	FALSE	25	AGAACAAGGCCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAAVPSLLHSVSRSGSPPLSSLGLSPLRPTCCACHPLQEPTSRMSTAIRWAVLCSGSGGRKRPSMPWTKPSASCRPASDGSSGCGCASPSCSRSGRGRSGHRLTPARL	4149	6153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_4579_5136_5278_5468
849237	contig_15543_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_164343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACATAAAATTCAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48027	48856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_48000_48900
849240	contig_10861_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_39197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATAATACGTGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347888	348780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_347900_348800
849241	contig_9011_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_159265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	84	419	58727	59062	NA	15	GGGGGCAATATCTCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAKEEIFITDWWLVFVHGDFVWISLRLDIYNSVLLSRIVRYENRLYPQMVWAKSQPINCNSLQSKPFSKELASKYILKIFSLNGFVFVFPFGRRHPNIHFSKDYAARQM	58643	59913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_58600_59900
849242	contig_6272_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_160441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128564	127437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_127400_128600
849243	contig_990_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_76109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCCTTAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1428026	1429480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1428000_1429500
849244	contig_10063_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_127755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAGAAGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655810	657551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_655800_657600
849245	contig_3612_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_87807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGGGTAAATATCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854211	854644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_854200_854600
849246	contig_3612_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_87809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTCTTATTTAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856626	857042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_856600_857000
849247	contig_15501_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_177572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGTGAGAGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9244	8415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15501_pilon_-_8400_9200
849248	contig_177_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_41781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGAGAGAGAGGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338928	338441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_338400_338900
849249	contig_12150_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_6953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGCCTATGTATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15625	16815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_15600_16800
849250	contig_10324_pilon	-	1225	4	Intergenic	novelGene_7694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	78.8091929211871	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGAAAGAGGAAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19535	16616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_16669_17911_18268_18367_19166_19516
849252	contig_7993_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_170973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAGAAGTTGTAGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391969	390940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_390900_392000
849253	contig_665_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_158226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAAGTAACATATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365048	366106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_365000_366100
849254	contig_10752_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_153034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACAGAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136111	135781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_135800_136100
849255	contig_10235_pilon	+	604	4	Intergenic	novelGene_46496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	148	468	246609	247308	FALSE	20	TTGGATAGAGTTATTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGLALLAAVLRHWLALGPTCPQIFVATNFLSLVQLQLLPQGPLIKYLTMETCEDGDDLVFFYQICEGVAKASRASHTAAQAGLPDTLIARSKEVSDLIRSGKPIKPVKELLKKTQMENCQTLVDKFLKLDLEDPNLDLDIFMSQEVLPVATSIL	246262	247444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_246407_246605_246744_246901_246976_247196
849256	contig_9516_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_106144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAAGTGTCACTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578381	579423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_578400_579400
849259	contig_10148_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_172875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	206	505	333021	332722	NA	30	AATGGACTTGATGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELSCQFKEGVVGRITTPQNVDILTPSTLNMLGYYLQRGIKVADGALIAQWLSALLLTERLVVRTHQPLCDYSLGNPIGQFYSVLQGLYELERLNGIQ	333226	332009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_332000_333200
849260	contig_3948_pilon	-	608	2	Intergenic	novelGene_53408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_1	0	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTGGACTGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1905930	1905081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1905553_1905793
849261	contig_8576_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_88816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTCCTAGGCATAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962877	964262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_962900_964300
849262	contig_9696_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_68746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGTAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22566	23204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_22600_23200
849264	contig_16594_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_53785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGATTTTATTTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30729	29891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_29900_30700
849266	contig_8900_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_171629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293839	294193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_293800_294200
849267	contig_10752_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_153035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAATGAAAATAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182765	181441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_181400_182800
849268	contig_7912_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_129559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAACAGGGGTTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46716	47209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_46700_47200
849269	contig_6946_pilon	-	1472	5	Intergenic	novelGene_59750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1.58113883008419	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	46	1098	58129	52626	FALSE	40	GGCTAATTCAATTTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTRWRRPGPSREEDMEYYLVKWKGWPDSTNTWEPLQNLKCPLLLQQFSNDKHNFLSQVKKGKAITLKDNNKALKPAIAEYIVKKAKQRIALQRWQDELNRRKNYKGMIFVENTVDLEGPPSDFYYINEYKPAPGISLVNEVTFGCSCTDCFFEKCCPAEAGVLLAYNKNQQIKIPPGTPIYECNSRCQCGPDCPNRVVQKGTQYSLCIFRTSNGRGWGVKTLVKIKRMSFVMEYVGEVITSEEAERRGQLYDNKGITYLFDLDYESDEFTVDAARYGNISHFVNHSCDPNLQVFNVFIDNLDTRFPRIALFSTRTINAGEELTFDYQMKGLGDISSDSLDHSPAKKRIRTVCKCGAMTCRGYLN	79160	52251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_52733_53847_53978_55463_55611_57460_58133_79118
849271	contig_15952_pilon	+	1210	8	Intergenic	novelGene_154081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	24.3536863906951	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	413	469	537845	538490	TRUE	30	TCTATGAGAGATCACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRGSGGRWKPLVARHQARLKAELARLKVHRSVSRNEDLLELASRPGPALQVPRFVRVNTLKTCSDDAIDYFKRQGFSYQGRASSLEDLRTLKGKHFLLDPLLPELLVFPAQTDLHEHPLYQAGHLILQDKASCLPAMLLAPPPGSHVIDAFAAS	535511	539606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_535658_535745_535855_537602_537742_537826_537888_538476_538581_538774_538986_539092_539234_539307
849272	contig_10331_pilon	+	682	3	Intergenic	novelGene_54187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	7	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGAAAATTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604702	609117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_605105_605366_605501_608971
849274	contig_7410_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_106107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGAAACCCCTGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428339	428073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_428100_428300
849275	contig_5286_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_157377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTACATCTTGTATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592734	592109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_592100_592700
849276	contig_5286_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_157376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACCCGGGCTTGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592011	591437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_591400_592000
849278	contig_9127_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_103023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTAGAAATAGATAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227522	228106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_227500_228100
849279	contig_11629_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_161201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAACCATTCCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432938	433869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_432900_433900
849280	contig_817_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_132447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	46	693	548321	547674	NA	40	GCAAATCGCAGGCTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHCPRWPFWACPPSEVTLFRPLEHNAQASRAFPVLSAKGRKGPREPGKGVRMSQDKVQNWEARAGGHEFGLVPHPHLQIKCLIPFYKQHRDYAKDHALSNKNNILKRAGVCRQGLPEVGRIPYQPFNTEELDLKSMSLKASDLDFKGREPQVPRTNKVLQVSVLQCSISHKPSPPRCTTLPPTPPRGRAPPRQADRLGTSATISQVETEARRC	548366	547526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_547500_548400
849281	contig_10196_pilon	+	947	5	Intergenic	novelGene_132185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.06201920231798	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	298	555	1084288	1084734	FALSE	35	GACAGAGTGAAGACGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIFANLFPAGERRWPGTPGGRVEGPGPRGGGCTGVHERTFVAVKPDGVQRRLVGEIVRRFERKGFKLVALKLVQASEELLREHYSELRARPFYGRLVRYMGSGPVVAMVWQGLDVVRASRALIGATDPADASPGTIRGDFCIEIGKNVIHGSDSVESARREIALWFHADELLCWEDSAAHWLYE	1083837	1085126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1083929_1084014_1084146_1084212_1084315_1084386_1084500_1084616
849282	contig_8702_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_157736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGTCCCTGCTCGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86371	85568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_-_85600_86400
849283	contig_20028_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_170644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTCCAACTCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9881	9631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_-_9600_9900
849286	contig_11447_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_168106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCGCTCAGCTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547421	548029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_547400_548000
849287	contig_12032_pilon	-	838	5	Intergenic	novelGene_139283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_4	53.9044293170793	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	93	767	122315	106704	FALSE	35	ATTCAAAACAATGTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLGGSARVTRRVVSGELGLLLPKSRLRGHMAQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPGNITCDLTLRMKL	122407	106632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
849288	contig_13565_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_162385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTGCAGTTTTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154512	155938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_154500_155900
849289	scaffold_15027_pilon	+	757	6	Intergenic	novelGene_163575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	95.68991587414	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	328	756	88327	102845	FALSE	60	AGACTGAAAACGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSE	82637	102846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90207_91101_91218_102775
849290	contig_14640_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_168039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140071	140353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_140100_140400
849292	contig_12622_pilon	+	950	7	Intergenic	novelGene_5798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	174.850173958545	11	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	59	898	349741	406044	FALSE	65	CCTACATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEKNAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGEWLCRLLGERVCCVCCLLPCSSSKTRLFILPSGPITEYLCRDWCVNREQCLHAF	349682	406096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398346_398491_401825_401940_404556_404650_405789
849294	contig_18533_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_174051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1631	1951	154835	154515	NA	30	GTGACCTAGCAATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSLAARCGHVTLFWLLSCKKLLGGISGRSFKRSKFVCSSFFLPDVLNADVRTEIHVVFLGHKVTLFSRDQTTLGGKSRSLLQKGGLGHSHLWTKVNSWCCHVIL	156465	154364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_-_154400_156500
849295	contig_299_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_129465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTGAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081684	1081085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1081100_1081700
849299	contig_614_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_132639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGGGTTGTTGTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917680	916972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_917000_917700
849301	contig_16831_pilon	+	592	6	Intergenic	novelGene_134794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_5	56.6392090340252	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	18	497	382417	422420	TRUE	50	ATGAACTTATCATCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVAAPSFPSAAAFWSRDFSDEEQSVVYVPGITAEGNTRSRHKLMSPKADIKLKTSRVAAASISMESLKGAGDSVEQQNFFKGGIKSASLKDLCLEDKRRIANLIKELARIEGEIWHFEMNKTELETSKHTLMEYLRTFSRQKKNIKIKVTRGKQLPK	382399	434970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_382475_389316_389353_390080_390224_404533_404629_422272_422427_434881
849302	contig_6724_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_167964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAGATTTAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221979	222786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_222000_222800
849304	contig_9727_pilon	-	1744	4	Intergenic	novelGene_86349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	5.18544972870135	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	234	1106	459711	445776	TRUE	35	AATTCTTTTTTAATTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWTCCHQQAEKKHKTPPYKFIHMLKGISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGHGNLLVDAAEAGLLGQDKGPRGPNSGSCIDQLPIKVDYGEELRSPAVSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGGGHGAIGWGGPQHRQGTADQGHHQEEHPEVH	459944	444241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_444767_445662_445787_453380_454209_459677
849305	contig_6872_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_175738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	5	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCTCGTGTGTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236358	451975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_+_236430_417939_418044_451664
849306	contig_602_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_134930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCCAATCCACTAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128604	129121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_128600_129100
849307	contig_11564_pilon	+	1115	3	Intergenic	novelGene_158586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGACCAAGAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160907	167798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_161574_164733_164880_167495
849308	contig_15321_pilon	-	686	2	Intergenic	novelGene_177615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCCAGATGGCTCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213308	205213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15321_pilon_-_205832_213240
849309	contig_7234_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_145964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTGCCAAATTAAGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558243	556747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_556700_558200
849310	contig_15952_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_154074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326646	325609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_325600_326600
849312	contig_16757_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_175580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTTATCTTTACTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112870	112525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16757_pilon_-_112500_112900
849313	contig_3601_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_132938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCGCTTAACCACTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424772	425340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_424800_425300
849315	scaffold_12510_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_151382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCTATATACAGTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275855	276898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_275900_276900
849316	contig_12427_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_40513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACCTTTGAACTGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478921	478224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_478200_478900
849317	contig_8538_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_5053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842827	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842800_843100
849318	contig_2069_pilon	-	883	6	Intergenic	novelGene_23418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	176.593771124578	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	38	568	1259894	1253082	FALSE	20	TTAGAGATGGCCCTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPADFPRVEGDSVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGIIYRDLKPEK	1259931	1252766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1253193_1254293_1254374_1254549_1254631_1256596_1256679_1256860_1256978_1259834
849320	contig_8576_pilon	+	704	2	Intergenic	novelGene_88774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTCGTGTGGGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789613	793064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_789768_792514
849321	contig_10629_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_52891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	229	426	217437	217240	NA	40	TAGAATTAAAGGGTGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEGCRKAEVQAWGCQSNSGWNLRQRLRERAEVGAAFLTLLPPEASPGFLTHQTWKGLELHFNRDVVPSQSHPSSEMKSAAVGSLMPKACCSGEQEAQLPQPPTPPAGWPLQCQYAVCCPGKAGVALHFLPTETFRQGRQG	217665	216375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_216400_217700
849322	contig_10629_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_52892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCCCTTAAATTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218283	217764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_217800_218300
849323	contig_7066_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_42169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	6	18	404	421	879901	879884	NA	40	ACTTGACTTGAATAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVVVLLFSPGAVALCREWLQDGASAPRAHAPHDAFAASLSCVLPDFLQGRAPGRYLGACFDRLLHPDAVPSLFRTVPIFSLPTQLPDFLEALQGPGAPRPGRLRERTEHVSQALQKALDGCFPLPGVPGPRCRMGPGAG	880304	879882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_879900_880300
849327	contig_6871_pilon	+	625	5	Intergenic	novelGene_21668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	9.78199877325692	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	795239	796188	TRUE	20	CAGTTGTGCCAACTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPGEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASAVKEQYPGIEIESRLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYEKDLIEAIRRASNGEPLEKITNSRPPCVIL	795238	796545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_795295_795396_795495_795945_796023_796104_796269_796315
849328	contig_10734_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_51392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	431	790	1997417	1997776	NA	10	GGCTGGGAGTTCTGGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVCVTERNVAGSCAVFTTFGMLCMESHEGVRESAAVCVSDCFNSPGVEGPWLGLPGAPAAVFSGPMNNKGMGTWAVCSLACRPVDAQTCGDWDLCHGHLQGPHFVDICAFLPGSVQA	1996986	1998011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1997000_1998000
849329	contig_10734_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_51393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTCCGTAGTTTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1998315	1998923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1998300_1998900
849330	contig_9450_pilon	-	341	3	Intergenic	novelGene_174436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_1	397.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTATTTTTAAAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86305	70989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_-_71127_82987_83105_86218
849331	contig_7695_pilon	+	925	3	Intergenic	novelGene_41588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10	63	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	300	608	471127	473595	FALSE	0	CTCCCTCCGTCTTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCWVLGSDRGYCYQCQSQVPPRSGHCSACRICILRRDHHCRLLGLCVGFHNYRPFLCLLLHAAGVLLHVSVLLSPALSALLGAHTPLHAATLLLLPWLMLLTGRVSLAQFALVFVTDTCVAGALLCGAGLLFHGMLLLRGQTTWEWARGQHSYDLGPYHNLQAALGPRWALVWFWPFLASPLPGDGISFQTPADGGPVAS	469485	473912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_469520_470861_471140_473299
849333	scaffold_6394_pilon	+	829	4	Intergenic	novelGene_110964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	9.28559218478941	162	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	352	621	246951	247820	FALSE	20	CTTCTGGACTGACTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCQVPPFSEPLPPSQALPEPAFPNVDASQVYSPALPVALALPSSGPPYAPVSQPAVQFLLQGSLPLVGCGGAQGLAPVPTALTTVSEPAVPAPVTNDVEGKTTASKPAGEKAKNEEYMKKLHVQERAVEEVKLAIKPFYQKREITKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPTKVANLVRAYVEKYRHMRRYKKADPEEGPPPQEAEG	246232	248028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_246320_246548_246810_246947_247077_247676
849336	contig_10126_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_105765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	727	1044	171955	172272	NA	70	GAAAAAATTACATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHPGSHSELVGELGFKSGAPDSQPWNLLSSAKSSNWELGLLLCELLSSCPPTHGDPRHNRIRPLCSIGFSLADFSEVDRQAFLPSMSWSGFGIGPPLRFVVEWK	171228	172483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_171200_172500
849337	contig_2455_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_119195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCAGACAATTTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172197	170573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_170600_172200
849338	contig_5988_pilon	-	250	2	Intergenic	novelGene_15902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAAGGAGGAGACCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580547	580066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_580132_580362
849339	contig_5988_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_15901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	158	586	576725	576297	NA	5	GCCCAGGCTTTGGCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKLPPQVPAQVPSQDPFGLAPAYALEPRFPTAPPTYPPYPSPTGAPAQPPTMGPSSRPGTGQPGEFHTTPPGTPRHQPSTPDPFLKPRCPSLDNLAVPESPGVGGGKASEPLLSPPPFGEPRKALEVKKEELGAASPSYGPPNLGFVDSPSSGPHLGGLELKAPDVFKAPLTPRASQVEPQSPGLSLRPQEPPP	576882	576296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_576300_576900
849341	contig_3334_pilon	-	497	6	Intergenic	novelGene_137670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	135.007259064096	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	158	496	514064	440010	FALSE	30	CTGAAGTGCTCATCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSKKKSSEMERTVKANDREFNEKFQYADNRIHTSKYNILTFLPINLFEQFQRVANAYFLFLLILQLIPEISSLTWFTTIVPLVLVITMTAVKDATDDYFRHKSDNQVNNRQ	514411	440008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_440049_444741_444841_447474_447589_476258_476318_514036_514106_514295
849343	contig_11160_pilon	-	1105	2	Intergenic	novelGene_168848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1	474	787733	771124	FALSE	20	AGAGTTTGTTTGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASHLEAQDTLKGFPAPTDGATSRSKDPAFLLTVGAGQGAADLGCPQPDCFGQVKAWRWKKQEQGGKSGILVPQTREETAPSRLPVYLPACLLTQKCPHPISCPVEKWLRGCWPLGADSITTCFVSKDSFYGPNTGLSPSRFSSKTTTHNKPLTLL	787733	770492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_771450_787585
849346	contig_9921_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_23758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATGAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317799	316875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_316900_317800
849347	contig_5009_pilon	-	501	4	Intergenic	novelGene_119256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	220.455588876006	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAATTAAAACACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47746	43227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43540_43812_43886_44551_44622_47700
849349	contig_3878_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_174788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTATTACAAATGTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150461	149846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_149800_150500
849351	contig_710_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_162945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGGCTACTACAATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267964	267016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_267000_268000
849352	contig_15207_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_176372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGGGAGTTTCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323359	324429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_323400_324400
849353	contig_18272_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_7038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAACCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242992	244353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_243000_244400
849354	contig_6740_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_142697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCAAACCCGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642252	641395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_641400_642300
849356	contig_17737_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_72915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGATAGAAAGGAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95842	96056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_+_95800_96100
849357	contig_2596_pilon	-	710	4	Intergenic	novelGene_53467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	21	junction_1	49.9355139710763	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	111	470	722501	662616	FALSE	20	GTACTTTGTCCCTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSRAPRVRPRKSFCKVILTSEEISSDLYTRGLQQGSRIV	722611	662375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_662730_694908_695036_696168_696243_722456
849358	contig_10063_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_127744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCCCAAGATCTGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411423	410118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_410100_411400
849360	contig_6795_pilon	+	1206	3	Intergenic	novelGene_27708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAATGGCGACTCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128044	134321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_129061_129285_129401_134246
849361	contig_1964_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_130927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGTGTCTGCCGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581188	579511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_579500_581200
849362	contig_11855_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_67129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGGCTGGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2664938	2666281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2664900_2666300
849364	contig_1154_pilon	+	1273	2	Intergenic	novelGene_87212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGCCTTTTATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292156	1293614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1292466_1292650
849366	scaffold_14325_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_162663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATACTTGGGTTGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249003	248435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_248400_249000
849367	contig_17936_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_29963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACCATCCTTATAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86244	85573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_85600_86200
849368	contig_15003_pilon	-	924	10	Intergenic	novelGene_137341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	50.3940031705714	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	270	923	265931	245918	FALSE	40	GGTAAGGAAAAATGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDKVFFSRLTKILKIMVPRTFCKETGYLILIAVMLVSRTYCDVWMIQNGTLIESGIIGRSRKDFKRYLFNFIAAMPLISLVNNFLKFGLNELKLCFRVRLTKYLYEEYLQAFTYYKMGNLDNRIANPDQLLTQDVEKFCNSVVDLYSNLSKPFLDIVLYIFKLTSAIGAQGPASMMAYLVVSGLFLTRLRRPIGKMTITEQKYEGEYRYVNSRLITN	313680	245916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_246059_248538_248596_252630_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265953_270014_270051_273246_273284_313505
849369	contig_2733_pilon	-	800	5	Intergenic	novelGene_128592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAGAAAGTATTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900172	895696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_895954_896245_896424_896651_896826_899892_900005_900093
849371	contig_10938_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_171767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222354	223848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_222400_223800
849372	contig_9571_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_136316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	1.88561808316413	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	27	599	636969	624115	FALSE	35	ACTCACAGTAGATTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLQPPDPKMVPMLLLLSTLAGLFVGAAKGQAFHPGRCPNPPVQENFDVNKYLGRWYEIEKIPVTFEKGSCIQANYSLMENGNVKVINQEVRPDGSVNQIEGEATQVNLTEPAKLGVKFFWLMPSAPYWVLATDYENYALVYSCTTFLWLFHMDHVWILGRNRFLPPETVTYLKDILTSNNIAIDKMTNTDQVNCPEFL	636995	623873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_624351_627544_627634_630980_631103_636843
849374	contig_14300_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_133114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAGAGAAGTAGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274834	273638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_273600_274800
849375	contig_17833_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_174610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	383	421	220420	220382	NA	30	TGTATGTGGTAATTAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKFYGPGEEEEGEGEDPLQFRHDHDPLLTGWRLVAGYFAQPSRPPAPTRLDCRTWDGPPHAHPQPRAPLAFPPSQGHSDSPRTSFQDSSFSHPISPLAFSCAEFFKIFIVVTSHAGPRLFLSFLILGMAGDRREGRFLK	220802	219732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_219700_220800
849377	contig_11896_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_87991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34207	35379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_34200_35400
849379	contig_5337_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_136575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGAATTTCACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384573	385610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_+_384600_385600
849382	contig_13680_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_149571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGGAAAAAACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192844	193789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_192800_193800
849384	contig_9440_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_59043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTTAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392899	391770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_391800_392900
849385	contig_6842_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_130704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTGCAGGCTTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410476	410700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_410500_410700
849386	contig_1244_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_38072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGCAATCAGAGATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258827	1259734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1258800_1259700
849387	contig_16204_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_154480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178254	177535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_177500_178300
849388	contig_4364_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_3343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533034	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1533000_1533300
849389	contig_19654_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_176343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAATAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209103	208271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19654_pilon_-_208300_209100
849390	contig_18875_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_177616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGAGTGGGGTGGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4410	3821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18875_pilon_-_3800_4400
849391	contig_15327_pilon	+	828	3	Intergenic	novelGene_70569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	22	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	310	732	670809	671387	FALSE	10	GCCTGTGGCTGGTACGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVSGFAVGPLKPVRYRQGLEVQLLAQARRLPDGPEHSALRSQVCGRSLEPWTAAAGGTCPPGWAVEGRPTVPPCTLVQSPRAGPDALPGRGPSSPLRPEDGAEPRRPNPSVWAAFKSQRYSVLGVRAGSSFIPCPSSPM	670397	671483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_670557_670658_670908_671063
849393	contig_6446_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_149264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAACCCAAAAGTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778950	778385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_778400_779000
849394	contig_6418_pilon	-	787	7	Intergenic	novelGene_81110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	652	junction_6	300.8602942674	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	32	541	77025	68463	FALSE	35	AGAAGCAACTACTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTSGDFRKLMVVLAKGKRAEDGSVIDYELIDQDAQDLYDAGVKKRGTDVPKWISIMTERSVCHLQKVFERYKNYSPYDMLESIKKEVRGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKKKYGKSLYSCIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD	77056	68216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_68523_69615_69739_71814_71874_72348_72445_73022_73117_75091_75152_77007
849395	contig_4125_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_25260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATATAGAGAGATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032957	3032121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3032100_3033000
849397	contig_12642_pilon	+	437	2	Intergenic	novelGene_176404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTATTGTCTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31631	32213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12642_pilon_+_31936_32080
849398	contig_16525_pilon	-	525	5	Intergenic	novelGene_133868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1532.80092885541	3	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAGGTTCGAGGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181485	178105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178604_178686_181150_181253_181388
849399	contig_2480_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_63566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTTTCAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436687	435907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_435900_436700
849400	contig_9389_pilon	-	696	3	Intergenic	novelGene_84098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACATTTCTCCTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388686	1387496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1387764_1387893_1388149_1388512
849401	contig_11677_pilon	+	1406	2	Intergenic	novelGene_85895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_1	0	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1	471	448762	450996	FALSE	0	CGGGCTCGCGCGTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYAAHPGPVNSELFLRHVPGWLFPLLRPLAWLVLRTPRGGAQTPLYCALQEGIEPLSGRYFANCRVEEVPPAARDDRAAHRLWEASKRLARLGPGEEAEPGEDSQPEDAGSPSSLSTPHPEEPTVSELYPSPQSSPDLSKVTCRSQIKAEPETPTC	448761	451931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_448781_450544
849402	contig_11572_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_100058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATGTCAGCTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261893	263294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_261900_263300
849403	contig_6677_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_114232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866159	867098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_866200_867100
849404	contig_7049_pilon	+	844	9	Intergenic	novelGene_171439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	62.565965188751	35	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	208	831	122018	135206	FALSE	5	TATGCTGTGTCCTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRGDRNTGKTALWHRLQGKKFVEEYIPTQEIQVTSIHWNYKATDDIVKVEVWDVVDKGKCKKRGDGLKMENDPQEAESEMALDAEFLDVYKNCNGVVMMFDITKQWTFNYILRELPKVPSHVPVCVLGNYRDMGEHRVILPDDVRDLIDHLDRPPGASYFRYAESSMKNSFGLKYLHKFFNIPFLQLQRETLLRQLETNQLDVDATLEELSVQQETEDQNYEIFLEMMDARSRGHASPLVANGQSPASGSQSPVVPLGAASAGAGCSPVSSPFGP	115017	135219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_115145_119538_119587_121985_122039_123128_123221_126176_126318_126692_126799_128065_128170_130105_130220_135160
849405	contig_4385_pilon	+	817	5	Intergenic	novelGene_141506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4.81534007106456	81	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	165	488	349396	351442	FALSE	15	CAGGTTTTAGTCATGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKRHLYPADFRFDKPKKSRGRPAAPGATMPVSAKAPAGHGEQSEGDAMEVCSDGHVAPSPVPAGESSATPGLPGRRAYSHRIPATVCFGQGASRGFKSTKKRSKHH	347899	351771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_347927_348142_348217_349332_349458_350472_350656_351363
849406	contig_20844_pilon	+	1196	7	Intergenic	novelGene_78592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_5	30.8153100476587	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	126	836	198333	200708	FALSE	20	CACAAGTGTGTAGGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAQAQLHNLEAYAAQPHSFVFTRGRAGRSVRQLSLDVRRVMEPLTATRLQVRKKNSLKDCVAVAGPLGVTHFLILSKTETNIYFKLMRLPGGPTLTFRINKYALVRDVVSSLRRHRMHEQQFAHPPLLVLNSFGTHGMHVKLMATMFQNLFPSINVHKVNLNTIKRCLLINYNPDSQELDFRHYSIKVVPVGASRGMKKLLQEKFPNMSRLQDISELLATGAGLSDSEAEPDGEHNITELPQAIAGRGNMRAQQSAVRLTEVRSSPRGPNGEGDFL	198207	201068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_198363_198877_198980_199172_199224_199329_199501_200059_200137_200329_200438_200536
849407	contig_678_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_167826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	247	564	148882	148565	NA	0	TTTTTGTTTTCCTTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLRLRKRELHRRNSWGWSPGPAGRRVQNATQSALCLPQFPCRLSPSCVDAGAEPGRSRMISQDEFARQLQLSDPQTVAGAFSYFHQVRELEHAGQNPGARSPG	149128	148392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_148400_149100
849408	contig_12410_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_167257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGATGGTCTGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22063	21405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_21400_22100
849410	contig_12998_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_168967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAGCAATGAAAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35015	34469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_34500_35000
849411	contig_20176_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_172708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGATAGAATACTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56847	58555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_+_56800_58600
849415	contig_8693_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_150864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAATCTAAATTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065318	1063690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1063700_1065300
849416	contig_5921_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_142247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCCATACTCAACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212816	211543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_211500_212800
849417	contig_16714_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_161582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACATCCTGAACTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948763	947592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_947600_948800
849420	contig_11335_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_104942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGAAAAAAAATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449471	448518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_448500_449500
849421	contig_2201_pilon	+	1247	2	Intergenic	novelGene_168764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	19	519	104100	109277	FALSE	20	CCATAGGAATCCTGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIVVQAQRLLAPRRPCRPFFESLVRTLIIVCAAMAVVLSSVSICDGHWLLAEGRLFGLWHFCTTTNQSEPHCLRDLSQARVPGLAVGMGLARSVGALAVVVAIFGLEFLMVSQVCEDLHSRRKWALGSVFLLVSFLLSSGGAPELRDPSQEPGHPPGLHPDVLV	104081	110005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2201_pilon_+_104121_108797
849422	contig_408_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_84929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACTGAAGCAATGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199032	200029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_199000_2e+05
849425	contig_3956_pilon	-	1687	4	Intergenic	novelGene_14725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	158	343	330471	330286	TRUE	40	AAAATCCTTGGAGTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCQVDQSIKWHLFVFIQKHLGLPHTNPQVRFVELIRNIPTQGSKVSPLLNDGMEEAKAKQKLLPHYCLCAALEEYRVGDRVIEVGAQKIGSEPFGGLIGHFDPILENADWKLV	332697	321524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_322618_325415_325642_330260_330508_332576
849427	contig_19292_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_177617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTGCCTGAGGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25110	26316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19292_pilon_+_25100_26300
849428	contig_1867_pilon	-	693	5	Intergenic	novelGene_54617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	73.8156487474031	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACAGAGTTGTGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566826	546163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_566772
849431	contig_10864_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_107140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACCTGAACAGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613589	1614499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1613600_1614500
849432	contig_9931_pilon	+	203	2	Intergenic	novelGene_134844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCATAAAGACTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364408	365642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_364504_365534
849433	contig_12917_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_162891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGTGCTAACCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77381	78064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_+_77400_78100
849434	contig_16113_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_140544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCATTAGTAAATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15559	14559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_14600_15600
849435	contig_17270_pilon	+	1062	8	Intergenic	novelGene_67225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	95.6985061619702	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	221	835	84541	99859	FALSE	65	ATTGATTAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQITYSVFYFHKGHSKTFTAALGSADSHVTKGITFLNLDCYVAVYLPGHFFHLLNIQHPDLICHSLFLTGKNEMIDMLPHSPLQSLSGSMVLDWNSGKLYRALLNQSYLLQLLWNTPLDCERMAVLHCVLSCGRDSRFLEAQIIQWISENISACHSFDLIQEFIIASSYWSICPETSNVDKLLPYSSVITWNTEIPGITLVTEEIALPLMKVHSFKGYWEKLNYNLEYVKYAKPHLHYNNSVIRKEWNNLISEEVCVGFRRKQEAKALCIIRSRRCP	78026	100086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_78065_79454_79533_84312_84406_84529_84748_87306_87377_88027_88111_91559_91614_99658
849436	contig_6364_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_51819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGCTTCTTTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1576071	1577323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1576100_1577300
849438	contig_7051_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_64325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAACATGAAGGGACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303201	302710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_302700_303200
849439	contig_10109_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_131328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164132	162963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_163000_164100
849440	contig_7342_pilon	+	1131	10	Intergenic	novelGene_71185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	5.07718207057594	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	106	1053	541832	544918	FALSE	20	TTTAACACTGAGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDIGGKLYLAPLTTCGNLPFRRICKRFGADVTCGEMAVCTNLLQGQTSEWALLKRHHSEDLFGVQLEGAFPDTMTRCAELLNRTIEVDFVDINVGCPIDLVYKKGGGCALMSRSTKCRQIVLGMNQVLDVPLTMKIRTGVQERTNLAHRLLPELRDWGVSLVTLHGRSREQRYTKLADWQYIEQCVKAASPMPLFGNGDILSYEDANRAMQTGVAGVMIARGALLKPWLFTEIKEQRHWDISSSERLDILRDFTHYGLEHWGSDTQGVEKTRRFLLEWLSFLCRYVPVGLLERLPQKINERPPYYLGRDYLETLMASQNSADWIHISEMLLGPVPPNFVFLPKHKANSYK	541555	544996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_541598_541768_541922_542196_542314_542577_542644_542730_542842_543474_543572_543755_543832_544326_544516_544593_544723_544845
849442	contig_4469_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_21882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAGGCCAGGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222957	221985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_222000_223000
849443	contig_10196_pilon	-	972	5	Intergenic	novelGene_132194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.7831462460672	134	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	30	542	1152858	1143844	TRUE	25	TACTCAAAAGTCTTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNIFGPTEEPQNIPRRTNPPGGKGSGIFDESTPVQTRQRQNPPGGKTSDIFGSPVASTSPLAHPNKPKDHVLLREGEDPKPDLAATVSTPAREGPGEKGGTRGTDPTTEPELTAKVDSHEPRLGPRPRSHNKVLNPPPEASPASPSTKRGRGFPSSHTETQERGYPIL	1152887	1141306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1141683_1143789_1144098_1145035_1145085_1149127_1149271_1152791
849444	contig_2204_pilon	+	429	4	Intergenic	novelGene_71644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	127.88102109209	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	30	428	13204	25698	FALSE	40	CGGTGAACATCATAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDS	13174	25699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596
849446	contig_6286_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_165670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	451908	451567	NA	10	GCCGTTTATTCCCGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPWQRPPVALSLPVAVPPRGTVPPRGSAPPPWHCPSPWQCPSPWCCLSPWQCASGSHESFLLTSCALRPSSPTWNSASGVTGLLEGVVRLPGSAPVAASLPLLPRPGTSPFP	451909	450467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_450500_451900
849447	contig_12250_pilon	+	629	4	Intergenic	novelGene_80594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	745.184690007935	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTCCTGGAATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322742	332455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322828_328400_328449_328549_328687_332096
849448	contig_1484_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_177619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCATCACCAATAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43031	42355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1484_pilon_-_42400_43000
849449	contig_3825_pilon	+	2023	4	Intergenic	novelGene_78026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_2	34.6538437823121	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	42	1028	1633617	1652635	FALSE	15	AGATGTTTTGGGTTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHLARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWYMDGYHNNRFVREYRSMIDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDENGLWAVYATNQNAGNIVISKLDPISLQILQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL	1631605	1653630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1631632_1633601_1633822_1642888_1642996_1651960
849450	contig_3386_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_34474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	718	1101	29275	28892	NA	45	ATAAGATCATCGGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGFQTHKSSSLAPPSGRNQQICLFLLSNIFQPSNVMPLLPLGFKSTCYQYKWFPEKGVGLERNRREGNAGRRGSMPCFRVNRQKEALFWGRGGLVTQKVLQQNRELMGIKPHCVILIKTFNFFLPL	29992	28891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_28900_30000
849451	contig_4736_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_168631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGAATTTTTAAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270855	271704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_270900_271700
849452	contig_4156_pilon	+	1210	3	Intergenic	novelGene_88111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATGAATCTTGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366682	373366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_366984_367176_367265_372545
849453	contig_12773_pilon	+	1331	3	Intergenic	novelGene_122134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	194	478	137810	141416	FALSE	45	GAGATGTAATTTAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANGASSEAAAALVTFPLDRVWPSARGQASAGGWAYLVQAVRAAGKCDAVFKGFSDCLLKLGDSMANYPQGLDDKTNIQTVCTYWEDFHSCTVTALTDCQEGAKDMWDKLRKESKNLNIQGSLFELCGSGNGAAGSLLPALLVLLVSLSAALATWLSF	136198	142269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12773_pilon_+_136303_137720_137866_141187
849454	contig_7340_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_159896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTAAATGTGTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136581	135471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_135500_136600
849455	contig_3153_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_104658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCAGAATTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149993	149240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_149200_150000
849456	contig_116_pilon	+	1160	2	Intergenic	novelGene_154890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74771	79061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_75568_78697
849457	contig_4824_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_176033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGAAATTCGGCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790795	790124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_-_790100_790800
849458	contig_5586_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_143580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGATGTCAAAGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411593	412905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_411600_412900
849459	contig_5569_pilon	-	1117	6	Intergenic	novelGene_86720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.1864855372105	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	63	1091	235594	137048	FALSE	20	ATCACCTGAGTATGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSWMGRQAGGRERVGGADTVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFENKPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVDPKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISIIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALMWSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDLIKRARLAKVHAYIISYLFRDAKVSWFSSQNYFASLALFNCHI	235656	137021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_137127_150737_150764_160093_160507_200103_200202_212039_212217_235358
849460	contig_15244_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_118048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAATCAGGAGAATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416884	417644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_416900_417600
849461	contig_13292_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_142944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGAATTTGGTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252760	252519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_252500_252800
849462	scaffold_13505_pilon	-	340	6	Intergenic	novelGene_111471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6158.2052255507	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	119	301	547440	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAQRPHDAWSYCKRREPAGVRQSSGSLPQKVREAESPRMGRHCQAGKGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548318	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_541922_547412_547465_547734_547806_548295
849463	contig_13453_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_146696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4229	4797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_4200_4800
849464	contig_2577_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_172060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGCTTGCATCCCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116978	118509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_117000_118500
849465	contig_3172_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_173681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTAATCATAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35307	33938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_33900_35300
849466	contig_9177_pilon	-	534	4	Intergenic	novelGene_32552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1464.06215715044	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	94	441	23335	1804	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWCSLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLVSLGAQRRKSFGSGPLHPTSGFQPVPTTSALLILF	24035	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1879_22704_22894_23251_23357_23963
849469	contig_13697_pilon	-	1407	10	Intergenic	novelGene_165927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.840727211478	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	43	1284	244336	238717	TRUE	25	TTCAAGTATTTTTTTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRRPPGRQGLLLGLLVVVAAVHLVTCPYTKVEESFNLQAVHDLLYHWLDLDKYDHHEFPGVVPRTFLGPIVIAAFSSPAVYLLSLLEVSKFYSQLIVRGTLGLGVIAALWTLQQEVRRQFGATVATLFCWVTATQFHLMFYCTRTLPNVVALPVALAALTAWLRQRWACFLWLSALAAVVFRAELGLLLGLKLLLPLLGRKVPLGRALRHAVPAGAVCLGLTVAVDSYFWRYPVWPEGKVLWYNTVLNKSSNWGTSPFLWYFYSALPRALGSSLLFVPLGAVDRRARALLLPSLAFVLLYSLLPHKELRFIIYSLPVFNIAAARGCAYLLNNYRKSWLCKAGSLLVTAHLAVNAAYGATCLYVSHFNYPGGVAMQQLHTLVPPDTGVVVHIDAAAAQTGVSRFLETNPGWR	247630	237586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_237710_238716_238797_239201_239372_240288_240513_241000_241105_241575_241771_242207_242382_243954_244088_244174_244360_247611
849470	contig_18637_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_81860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACCATCCCTAGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202493	203624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_202500_203600
849471	contig_5954_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_28493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGTAAACTGCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397690	398173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_397700_398200
849472	contig_14563_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_135039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCATATAGCCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87821	87345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_87300_87800
849473	contig_1442_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_172174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAGTTATCCAAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665225	664804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_664800_665200
849474	contig_5588_pilon	-	2188	2	Intergenic	novelGene_172833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	4	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	13	1239	389145	384144	FALSE	30	CCTCACACCACTATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDEGQLTDIVVEVDHGKTFSCHRNVLAAISPYFRSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLNYAYTSRVILTEANVQALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLEPQNSIGVFVFADHYGHQELGDRSKEYIRKKFLCVTKEQEFLELTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQNEREVHLPEIFAKCIRFPLMEDTFIETIPPQFAQAIPKSCGEKGPSSTNGCTQRLGMTASEMIICFDAAHKHSGKKQTVPCLDIATGRVFKLCKPPNDLREVGILVSPDNDIFIAGGYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHTTNRWISKPPLLRARIGCRLVYCCGKMYAIGGRVYEGDGRNSLKSVECYDSRENCWRTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGR	389157	383194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_385267_389041
849475	contig_16804_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_167293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCACAGGAATTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51777	52292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_51800_52300
849476	contig_16804_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_167291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCATCTCCAATACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50243	51228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_50200_51200
849477	contig_5260_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_144379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAATTAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337301	336281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_336300_337300
849478	contig_10451_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_138297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACTTCTGTGTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102117	101083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_101100_102100
849480	contig_16668_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_177621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTATGCCTTTTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132094	132576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16668_pilon_+_132100_132600
849481	contig_5718_pilon	+	1352	2	Intergenic	novelGene_110333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560035	563326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_561268_563206
849482	contig_6958_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_69964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270303	268557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_268600_270300
849483	contig_6760_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_150795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGTCCTGGACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176208	176714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_176200_176700
849484	contig_11285_pilon	-	556	6	Intergenic	novelGene_5676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	343.1685300257	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	222	554	794634	784064	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYREDLICWARLSPEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPPRCPLLSTECPAALSTHKLELFHGGLLVSSPSLQSWATFFLLPNKEAKP	795456	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784210_793853_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794853_795339
849486	contig_7165_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_116829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAGATGCAAGAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241991	241312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_241300_242000
849487	contig_2125_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_147729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613104	611831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_611800_613100
849488	contig_9706_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_20948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264071	263377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_263400_264100
849489	contig_9424_pilon	-	399	4	Intergenic	novelGene_143790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2181.79289168844	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATGGTCTGAGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280144	277473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278674_279548_279629_280079
849490	contig_8396_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_177624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCATGCACACGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205506	203856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_-_203900_205500
849491	contig_3523_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_171492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTTTTTTCAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415219	415590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_415200_415600
849493	contig_6084_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_127067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523124	522196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_522200_523100
849494	contig_20398_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_155189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCACGCACATGTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24915	23815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_23800_24900
849495	contig_3394_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_152676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422767	421923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_421900_422800
849496	contig_3818_pilon	+	933	6	Intergenic	novelGene_99214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	50.5276162113354	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	65	904	200428	222477	FALSE	25	TGGCTTAACTTTTCCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRGAERDFQTSARRMGTSLLFQLSVHERELDLVFLDHSYAKPWSAHPDASSARPTRMLFVTPRRQHESTIESDVPIDVETVTSTPVPLYDNQKARSVMNECERHVIFARTDADAPPPPEDWEEHVNRTGWTLAQNKLFNKILKALQSDRLARLANEGACNEPVLRRVAVDKCARRVRQALASVSWDTKLIQWLHTTLVETLSLPMLAAYLDALQTLKGKIPTLIDRMLVSSHTKTGAAGAEALSLLLKRPWDPAVGVLSHNKPVSWTAQDLTGNFRI	198913	222506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_198927_200376_200643_203418_203590_214704_214796_214928_215115_222300
849498	contig_3942_pilon	+	271	4	Intergenic	novelGene_128762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGCCTTCTCTGCGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792276	795118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
849500	contig_6785_pilon	+	1200	3	Intergenic	novelGene_132590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774750	776545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_774875_775052_775114_775530
849501	contig_14509_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_168565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAACAACCCCATGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310086	308677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_-_308700_310100
849502	contig_5928_pilon	-	706	9	Intergenic	novelGene_40366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	43.1132230295996	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	30	671	251809	207629	FALSE	75	TGAAAACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRATPWQDMACGFRRSIAYQLSRVLDLPPENLIKSISAVPISKKEEVADFQLSVDSLLENNSDHLRPDIQDQAKRLAEKLKCDTVVSEISTGQGTVNFKINRELLTKTVLQQVIEDGSKYGLKSELFSDLPQKKIVVEFSSPNVAKKFHVGHLRSTIIGNFIANLKEALGHQVTRINYLGDWGMQFGLLGTGFQLFGYEEKLQSSPLQHLFEMFIHRCSIL	251838	207593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_207659_214487_214565_217593_217678_220326_220383_221490_221589_229383_229468_230831_230935_249346_249421_251773
849503	contig_3727_pilon	-	753	6	Intergenic	novelGene_146761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.0591260281974	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTCGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545838	527454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_527683_536755_536782_537352_537470_537987_538107_538333_538457_545698
849504	contig_10369_pilon	-	462	4	Intergenic	novelGene_171059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_3	168.266323296005	8813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCTTTTTTCCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318062	305392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10369_pilon_-_305571_310246_310350_311515_311618_317983
849505	contig_13762_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_156671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTCATTATCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42382	44053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13762_pilon_+_42400_44100
849506	contig_11413_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_103156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGCATTCTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328872	330087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_328900_330100
849509	contig_12179_pilon	+	757	6	Intergenic	novelGene_127985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10.8185026690388	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	67	756	316697	325946	FALSE	40	CAGTTGAGACAGCACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFPLGRGKRTPAGPLARSRGTMDSVGLKTLINYYCQERYFHHVLIVASEGIKRYGNDPVFRFYHAYGTLMEGKIQEALREFEAIKNKQDVSLCSLIALIYAHKMSPNPDREAILESDARVKEQRKGAGQKALYHAGLFLWHIGRHDKAREYIDRMIKMSNGSKEGQVLRAWLDITRGKEPYTKKALRYFEEGLQDGNDVFALLGKAQCLEIRQNYSGALETINQIIVSFPSFLPAFVKKMKLQLALQDWDQ	316630	325947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_316718_317808_317939_318031_318143_321104_321272_322426_322550_325808
849510	contig_2988_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_136543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGGAAGAAAAGGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62731	63722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_62700_63700
849512	contig_14855_pilon	+	1744	14	Intergenic	novelGene_146030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	613	1209	564866	568839	TRUE	15	CTCCAGCAGGGCCGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKICLRMFCSLISFCRSRLGLVTIMSRTFCPLLGTSLTKNTRSSSSWMTNLRSFWLMKPSFSFSTALASMELASLAKSRSRISDTGTDTMAKASLSSLVGQVPSMSRMGRSSSMSMGTFVLWIHVLVQRCRSRTYEFRGTKESVFCNVVGSSSKREAMSFPWGTATRRYLIFSPAFLRPARPWAPIPAALGSKASPL	562739	573192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_562910_563314_563439_563956_564129_564719_564877_566364_566505_567133_567297_567373_567473_568461_568605_568798_568850_569475_569576_569800_569940_572385_572471_572787_572891_573094
849513	contig_6589_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_25898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.217588765678	43	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGCATCATTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178509	1158485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158600_1177214_1177250_1177927_1178132_1178424
849514	contig_11898_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_144299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	570	890	287254	286934	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGARNALGSGRSIPRKRSASRAVPAWQPAKTLEQLQGEVGVVLKGVPQLGVARQPPRPERFLQEDQWRLRLCLLGCRIPSLLSTGKTPVCHASASGPEKAVCLG	287823	286891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_286900_287800
849515	contig_5566_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_153676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	366	826	1191	210665	210300	NA	40	TTTCACAACTAAACTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDWFFWLDIWDVPLMALSYRSLVSLQIGAFCSRTNCFTHPCSNTVCSFLTLSLCSCFQVLARSFMLYLHKYNPASFKDSSIPALEGFHKLFPALLINLFPLPEITIIFTIFSTHFNLTTH	211490	210298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_210300_211500
849516	contig_10299_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_79773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTATTTCTGGCCCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605662	606361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_605700_606400
849517	contig_4838_pilon	+	828	7	Intergenic	novelGene_144790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	67.0687872428168	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	166	561	268265	275659	TRUE	30	TCCCTTAAATTTTTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAPTEESLEWDILEVKRLLDHQDNILSLVNVNDLSFVTGSHVGELIIWDILDWTMQAYERNFWDPSLQLDAQQEIKLCQKPNDISIHHFTCDEENVFAAVGRGLYVYNLQMKRVIACQKTAHDSNVLHIAKLPNRQLISCSEDGSVRIWELREKQHLPAEPVPTGFFNMWGFGRVNKQASQPVKI	255294	279297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_255395_268199_268385_273286_273409_274222_274312_275548_275608_275653_275683_279053
849518	contig_7171_pilon	+	707	8	Intergenic	novelGene_101315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	169.247795632707	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	68	670	1077108	1088749	FALSE	0	GCTCCGCTGTGTCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEDTVPARSAAPARVWKASVVMAVFEQMRANVGKLLKGIDRYNPENLATLERYVETQAKENAYDLEANLAVLKLYQFNPAFFQTTVTAQILLKALTNLPHTDFTLCKCMIDQAHQEERPIRQILYLGDLLETCHFQAFWQALDENMDLLEGITGFEDSVRKFICHVVGITYQLKVWMSKYGWSADESGQIFICSQEESIKPKNIVEKIDFDSVSSIMASSQ	1077040	1088786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1077167_1078493_1078593_1079826_1079948_1081133_1081209_1084211_1084279_1084390_1084419_1086114_1086237_1088717
849519	contig_12620_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_98817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTCATATTTGTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489169	489792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_489200_489800
849520	contig_11370_pilon	+	928	5	Intergenic	novelGene_98762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_2	2.12132034355964	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	246	794	213625	214415	FALSE	15	GAGGGGGATTGTATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVATLIVMNCVIVLNVSLRTPTTHAVSPRLRHVLLELLPRLVGSGPPPEAPRAASLSRRASSVGILLRAEELILKKPRSELVFEGQRYRQGTWTAALCQSLGAAAPEVRCCVDVVNFVTESTREQEAASEEVSDWVRMGKALDNICFWAALVLFSVGSGLIFLGGFLNQVPHLPFPPCIQT	212082	214549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_212312_213608_213724_213796_213984_214065_214173_214259
849522	contig_16231_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_176721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTATGTTCTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183993	183254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_183300_184000
849524	contig_3147_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_142287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285228	284830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_284800_285200
849525	contig_2817_pilon	+	1114	9	Intergenic	novelGene_104336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	59.6049494589166	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	100	876	248944	268666	FALSE	25	TTTTAGTGTGTCAGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRRQDAPGPASSGSAAAASAHVADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVSSILAKKGVNPGKLDVEGRSAFHVVASKGNLECLNAILLHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHVDQQGRTALHDAAMADCTSSVQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMCRPTLCQLLIDKGADINSRDKQNRTALMLGCEYGCKDAVEVLIKNGADVSFLDALGNDSFYYARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQVACNFLKLYVLCTLSEMHSKIG	191603	268904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_191667_248907_249042_253093_253183_261105_261171_261967_262026_265495_265567_265666_265774_266805_266988_268559
849526	contig_4769_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_117984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	148	501	837656	838009	NA	90	AAAAAAACAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYTIVYIINIIYITPVIRVWEGNGVATSMGLCYFYSSSRGSPPRRRCLMGDLKNKTVRFMKLKNRAFQVAGKADTQVGSGFVWARNRREAHVAGGEFGKVVGKEDHQASCLDSGSF	837508	838720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_837500_838700
849527	contig_6208_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_52984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAGAAGAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360411	359310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_359300_360400
849530	contig_21196_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_174875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATAATTAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17124	18025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21196_pilon_+_17100_18000
849531	contig_5935_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_102717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAACGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054800	1054308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1054300_1054800
849532	contig_2480_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_63544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265297	266154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_265300_266200
849533	contig_7549_pilon	+	920	2	Intergenic	novelGene_164544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGCAAAAGGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967284	998004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_967502_997301
849536	contig_11978_pilon	-	920	6	Intergenic	novelGene_63141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	37.2848494699925	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	191	622	2008987	2003063	FALSE	40	TCCAGTTGTGACAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQGEAEESEKLNKMSSLLERLHAKFNQNRPWSETIKLVRQVMEKRVVMSSGGHQHLVSCLETLQKALKVTSLPAMTDRLESIARQNGLGSHLSASGTECYITSDMFYVEVQLDPAGQLCDVKVAHHGENPVSCPELVQQLR	2009177	2002764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_2003096_2003801_2003935_2004038_2004094_2004920_2005000_2006719_2006827_2008962
849538	contig_4385_pilon	-	919	6	Intergenic	novelGene_141521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCATGGAGCCGCCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468791	461668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_461774_463455_463522_465327_465431_466485_466565_468040_468100_468284
849539	contig_4782_pilon	+	1100	4	Intergenic	novelGene_73603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	156.610628275634	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAACTGTATTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88921	91567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_89008_90031_90107_90471_90540_90696
849540	contig_3948_pilon	+	758	3	Intergenic	novelGene_53153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	306	563	41088	41345	FALSE	15	TCTAGGTACTGTTGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLRALLLAVNTLLRKRRYHTALAVLKGFRNGAVLQDKLWAILQSTYTHSRNLAYFVFTYKGLCALQSHVQGKTYQVHSFLAAFIGGFLIFGDYNNINSQISMYLMSRTLYALCRLGVEKGYIPEPRWDPFPLVTATIWGLVLWLFEYHQSTLQPSLQSSMTYLYEESNVWHDISDFLIYNKRRSSK	28751	41540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_28852_37396_37596_41081
849543	contig_14184_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_66603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTAGCATTCTTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119364	118222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_118200_119400
849545	contig_10627_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_60031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGACATATAATTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596199	594430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_594400_596200
849546	contig_12912_pilon	-	546	4	Intergenic	novelGene_177628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.4142135623731	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGATAGCTTTTGGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107407	96629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12912_pilon_-_96796_102346_102477_105224_105409_107341
849549	contig_13707_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_43522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAAAAAAAGCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127308	128079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_127300_128100
849550	contig_11994_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_129351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGTGCGGGACCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94192	93797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_93800_94200
849551	contig_10523_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_120949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAATTAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23082	22532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_22500_23100
849552	contig_12644_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_44566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCATATGCTTTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2001028	2000223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2000200_2001000
849553	contig_11448_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_66401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCCAGCACCAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466852	465400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_465400_466900
849554	contig_9132_pilon	+	663	6	Intergenic	novelGene_121366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	14.388884598884	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	11	508	93567	95689	FALSE	15	GCCTCTTGGCCACACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGSMAWQGLATEFLQVPAVTRAYTAACVLTTAAVQLDLLSPFQLYFNPHLVFRKFQVWRLVTSFLFFGPLGFSFFFNMLFVFRYCRMLEEGSFRGRTADFVFMLLFGGVLMTVSFRAPRVWDCSGPHLLLLGGCVPQPAWRKEAAADPQLPEAANGFPGGGPQLSAPA	93556	95844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_93660_93828_93895_93971_94046_94138_94259_95443_95535_95635
849555	contig_15691_pilon	-	640	3	Intergenic	novelGene_60769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	508.5	131	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	80	523	114377	65935	FALSE	15	TTGAAGTATTGCCTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVALLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMGESVAERCNERGEKVCVCARTRARAQVGGIWQEFLTLRSKEKSSIPGSA	114456	65817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_66085_69380_69581_114283
849556	contig_16525_pilon	-	318	3	Intergenic	novelGene_133867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1149.5	15	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGTTCGAGGACTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181488	178102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178270_181201_181253_181388
849557	contig_10235_pilon	-	916	8	Intergenic	novelGene_46349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	228.15685617664	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	341	694	132372	131463	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELAAVINGRIRRMSRGVNPSLVSWLTTMMGLRLQVVLEHMPVGPSGRMLPQPQEQQQKRPCPEVHPLLLRRAPEMSRMELQLRQNHGQLQSPPEWVPIIQQDIQSQRKVKPQPPPE	133104	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_131425_131535_131619_131768_132076_132178_132339_132461_132546_132656_132784_132839_133015
849558	contig_3380_pilon	-	1493	4	Intergenic	novelGene_60136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	7.07106781186548	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	251	961	602632	601144	FALSE	30	GGTACGAATTATTACCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPASKNEADGPENDLQASEEDTSSSLVKDHLFQQDTIVTSEPYRSSNIRPSPFEDLNARRPYLQSQANQITFSQPGLDLPSRGMEYVQRQISRECGSLKPQNRVPLKSIRHVSFQDEDEIVRINPRDILIRRYADYRHPDMWKNDLERDDVDTSIQFSKPDSKKSDYLYSCGDETKLSSLKDSVVFKTQPSSLKFKKSKRRKEDGERSRCVYCQERFNHEENGRGKCQDAPDPIKRCIYQVSCMLCAESMLYHCMSDSEGDFSDPCSCDTSDDKFCLRWLALVALSFIVPCMCCYVPLRTCHRCGEACGCCGGKHKAAG	632389	600611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_601795_602572_602675_612426_612586_632340
849560	contig_7022_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_142144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTATTATACATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137732	136176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_136200_137700
849561	contig_3426_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_57951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAGAAAAATCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378874	378478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_378500_378900
849562	contig_6471_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_172092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGAGACTTGAGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52645	52240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_-_52200_52600
849563	contig_3397_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_154581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGCTAAAACAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135646	136658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_135600_136700
849564	contig_7396_pilon	-	464	5	Intergenic	novelGene_79648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	4545.73569403238	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTAGACGGTGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257077	252308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_256986
849566	contig_11050_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_173570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTGTTTGTAACTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860	571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11050_pilon_-_600_900
849567	contig_272_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_177631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70901	70634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_272_pilon_-_70600_70900
849568	contig_5899_pilon	-	801	2	Intergenic	novelGene_146964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	558	junction_1	0	210	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84487	52543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_53140_84282
849569	contig_11594_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_80951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	302	625	622798	623121	NA	75	TTTAAAAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVAVMWKDLTWDSLYNSVSQRAVILDGTLDCLGLCPRSFVCLKYFITTLCLGECAGCNSCMLLIARIDLANLAGASSLSLPNSWFPPNSQKLYSLKEDCPSSPVC	622496	623480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_622500_623500
849570	contig_19954_pilon	+	411	2	Intergenic	novelGene_173749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2	394	96629	97191	FALSE	25	CAGCTGTTGTTTCTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVLWDPEDAARPSGLGSAAPPSPSGSPPEQRASSQDPVRRVDRDAHWPGQEAGLPAFCPHSISRSRGFLLGSSVGGRTCSIRVPRCPDGLRFPGRQLDKFSRLRWEGQWVEKPLPHRGGESWGVVTCCGQ	96627	97208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_+_96675_96844
849572	contig_15596_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_139550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGGCTTTATGATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205692	205194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_205200_205700
849573	contig_7045_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_77472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382353	381574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_381600_382400
849574	contig_11328_pilon	+	1222	10	Intergenic	novelGene_88466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	199.934989434066	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	95	1072	867510	885362	FALSE	25	AGATTCAACATTTCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKISVECGGSFPQVVGSLFISPGGPKFVHLMYHFARYVAIKYIKTYSKNTFNVKPQDLHKCIARCHVARNRFFQILQREDCVTRKYQENAQLSVKQVRELRAECIGLQNHIKKMEPYDDQSNLQEKVQKVRSLWASVNETLMFLEKEREVVSSVLSLVNQYSLDGTNVAINIPRLLLDKIEKQMGQLHIGNVYEAGKLNLLTVIQLLNEVLKIMKYEHCQADQARLTIDLHYLEKETRFQRERLSDLKQMRYKIKEDLITIRRSIVEKQGEWYKKWKEFLGLSPFSLIKGCTPAVDLLPPMSPLSFDPASEEVYARSILFKYPASLPDTSKQCNQENDCRREKDTWGTVNELANR	866431	885512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_866448_867431_867565_870468_870596_873783_873850_874164_874214_876287_876459_877906_878101_878735_878863_879546_879650_885276
849575	contig_1982_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_151319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179978	179465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_179500_180000
849576	contig_3942_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_128712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	8.38152730712011	97	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	30	623	439035	442157	FALSE	15	CCGGGACACTGCCTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGGWRWVRGLRAAGKPLFQGRVLLVTNTLGCGALMAAGDGARQSWEVRARPGQRFDLRRSASMFAMGCSMGPFLHYWYLWLDRLLPASGLRSLPTILKKVLVDQLVASPVIGVWYFLGLGWLEGQTLDESCQELRDKFWEFYKADWCVWPPAQLVNFLFVPSQFRVTYINGVTLGWDTYLSYLKYQVPAAAVERG	439005	442761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_439222_439962_440134_441657_441735_441886_442016_442127
849577	contig_6102_pilon	+	326	3	Intergenic	novelGene_31812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGCCGAAGAATCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360162	361203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360833_361011_361150
849579	contig_11126_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_138157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGCAAGCATTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990129	989520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_989500_990100
849580	contig_14890_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_122526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATATGAACTTGATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370171	369722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_369700_370200
849581	contig_14467_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_138227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCTGTAGGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134505	133809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_133800_134500
849585	contig_13823_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_145264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTGGGTCCCCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260383	259794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_259800_260400
849587	contig_13015_pilon	-	705	3	Intergenic	novelGene_165555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	29	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTCCTCTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371563	367982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_368494_369169_369274_371473
849589	scaffold_4805_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_161040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595836	596668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_595800_596700
849590	contig_5585_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_143076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGACTTTCCCCAGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407042	408507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_407000_408500
849592	contig_4429_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_50818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACTTTTGGAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200941	201527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_200900_201500
849594	contig_17068_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_172573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCACTGTCTTTGGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160506	162064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_160500_162100
849596	contig_12644_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_44547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1526088	1527228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1526100_1527200
849597	contig_6266_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_170981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGATTCTAGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109974	111139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_110071_110674
849598	contig_12644_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_44517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTGGCAGAATTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141012	1142951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1141000_1143000
849599	contig_6915_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_162419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGCATCCAGAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244971	246341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_245000_246300
849600	contig_6885_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_83655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATGATTTTCATGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165801	164630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_164600_165800
849602	contig_6785_pilon	+	389	2	Intergenic	novelGene_132587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATATCCATATATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684006	685415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_684080_685099
849604	contig_4364_pilon	+	827	2	Intergenic	novelGene_169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266990	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267089_1270347
849607	contig_7695_pilon	-	876	7	Intergenic	novelGene_41625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	319.601314139977	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	473	610	681673	680696	TRUE	15	AGGAAGTTGCTGGTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPRQHVWLILPLLAPGA	685607	680319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680511_680620_680744_681583_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534
849608	contig_709_pilon	+	1205	9	Intergenic	novelGene_57543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_8	46.6728976494925	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	104	901	1506140	1526933	FALSE	25	ACATGTGCACGACTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEAWKKSLKEKWNAKPAYVVGSATASLVRKIGLETEGEKCGNAEKLAEYICSRESPSLPLLFPCGTLKGEILPKMLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1506036	1527237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511942_1512018_1515791_1515867_1520268_1520350_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795
849611	contig_5732_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_119585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAAAAAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153786	154508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_153800_154500
849613	SIRV2	-	263	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4610	34	3435	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
849614	contig_2726_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_165899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181994	181081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_181100_182000
849616	contig_14133_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_119924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATATGCTTCCTCTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137795	138564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_137800_138600
849619	contig_14556_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_138520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCCCCGATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119832	120541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_119800_120500
849620	contig_11855_pilon	-	497	4	Intergenic	novelGene_66988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTTTTAGTTTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278144	1274491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1274641_1276157_1276329_1277198_1277315_1278083
849622	contig_1959_pilon	+	1088	2	Intergenic	novelGene_160932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAACAGAAGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16299	24254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1959_pilon_+_16345_23211
849623	contig_6807_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_84572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATAAAATCTGCGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159175	157649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_157600_159200
849626	contig_5718_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_110367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	942	1271	944079	943750	NA	55	AGAAGAAGAAAAAAGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQSLCPHLPHLEASTCRQRRTVKAAHLLHTQRGATRITSTRRRPLPAQTPPEEGPSSSDCLQSQTVNKPWVCDLEGGRELRQKGEADHVQLKIIKRGREYWRYLYRRK	945020	943442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_943400_945000
849627	contig_753_pilon	-	1468	3	Intergenic	novelGene_112916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	9.5	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	227	823	324764	324168	FALSE	30	CTTAACATATTAGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGHSTLPRTLMAPRMISEGDIGGIAQITSSLFLGRGSVASNRQLLQARGITCIINATIEIPNFNWPQFEYVKVPLADTPHAPIGLYFDTVADKIHSVSRKHGATLVHCAAGVSRSATLCIAYLMKYHNVCLLEAYNWVKARRPVIRPNVGFWRQLIDYERQLFGKSTVKMVQTPYGIVPDVYEKESRHLMPYWGI	342503	323522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_324860_325958_326053_342466
849628	contig_7733_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_147126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGGTTTTTCCCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45728	46804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_45700_46800
849629	contig_10096_pilon	-	910	2	Intergenic	novelGene_177156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATCCAGACTATGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83520	71022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10096_pilon_-_71756_83343
849630	scaffold_7386_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_136607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGTTTGTCTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387122	386219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_386200_387100
849635	contig_8691_pilon	-	831	3	Intergenic	novelGene_72685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAATAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57462	38132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_-_38365_39645_39816_57033
849636	contig_14338_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_174838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90523	89588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_89600_90500
849638	contig_9363_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_6673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAGCCGGGGCCACCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079716	1078662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1078700_1079700
849639	contig_19604_pilon	+	606	3	Intergenic	novelGene_77223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	8	367	114054	123766	FALSE	80	AGAAAAAAAATGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRMGQLFECVLFTASLAKYADPVADLLDRWGVFRARLFRESCVFHRGNYVKDLSRLGRELSKVIIVDNSPASYIFHPENAVPVQSWFDDMTDTELLDLIPFFEGLSREDDVYSMLHRLCNR	114046	124005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_114102_118784_118971_123640
849640	contig_9274_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_151163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAGGACAGAAGCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561935	561342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_-_561300_561900
849641	contig_8978_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_49485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAGAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1738412	1740171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1738400_1740200
849642	contig_8554_pilon	+	565	4	Intergenic	novelGene_160280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.02768199119819	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCAGTGATCTACACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65532	101419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_65560_65795_66141_78477_78607_101355
849644	contig_3787_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_102357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133781	135175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_133800_135200
849646	contig_6275_pilon	+	560	6	Intergenic	novelGene_142474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	40.9360476841622	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	31	507	199344	211983	FALSE	30	TCTCAAATTTATGTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVSLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPISEEEVITTDMVQMIFSDNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIRLLKSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLE	199313	217728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_199401_199518_199619_204337_204433_210836_210969_211890_211984_217675
849647	contig_6275_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_142475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATATGTTAGGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220300	220636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_220300_220600
849648	contig_1575_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_45168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACTATTACCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81841	79829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_79800_81800
849649	contig_20742_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_150671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGCTGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206439	207251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_206400_207300
849650	contig_6689_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_175256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25975	25394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6689_pilon_-_25400_26000
849651	contig_7644_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_64265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213023	214078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_213000_214100
849653	contig_9843_pilon	+	635	6	Intergenic	novelGene_114327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	85.8803819274227	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	139	465	107444	116688	TRUE	25	AGTACCATCCCACCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYWKSQPKKFCDYCKCWIADNRPSIEFHERGKTHIENVAKRISEIKQKSLDKAKEEEKASKEFAAMEAAALKAYQEDLKRLGLESGSTSRRGIVESKCKHTLYIDT	107305	117746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_107446_108429_108503_111440_111504_111587_111712_116623_116827_117714
849654	contig_7702_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_177294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTTTCACCCCCATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80826	79856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_-_79900_80800
849656	contig_1275_pilon	+	444	2	Intergenic	novelGene_108843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTTGCATGGTAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746553	748096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747729
849659	contig_10196_pilon	-	821	2	Intergenic	novelGene_132264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	123	446	2003062	2002666	FALSE	10	CACGGTGTGTGCTGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRDRGRPAPAQLLVSLQDKYLADMDELFSQVDEKRKKRDIPDYLCGKISFELMREPCITPSGITYDRKDIEEHLQVRPWLAGTGTARPKARVLSDPVVPAARGPL	2003184	2002290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2002876_2002948
849660	contig_8616_pilon	+	849	8	Intergenic	novelGene_72511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	148.158629825727	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	301	756	337915	339244	FALSE	5	CGCGCTTGACTCCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAEYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	337137	339337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_337192_337275_337357_337467_337538_337819_337971_338065_338106_338231_338349_338836_339030_339194
849662	contig_1545_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_149739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAAGTAGTAGTAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104273	103008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_103000_104300
849663	contig_10197_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_115224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGCAACATTACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910626	912286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_910600_912300
849664	scaffold_8345_pilon	-	431	6	Intergenic	novelGene_107005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGATACCAGAAGCGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602670	570416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_570504_580075_580125_583891_583931_591069_591121_598123_598199_602540
849665	contig_12629_pilon	-	1208	2	Intergenic	novelGene_150647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAAAAAGAATTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81580	62755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_-_63820_81436
849666	contig_299_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_129491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGGGAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581931	1583243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1581900_1583200
849667	contig_8729_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_40086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCCTTTGCATCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199991	200576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_2e+05_200600
849668	contig_8729_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_40087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTAAAAAAAAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200676	201428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_200700_201400
849669	contig_8453_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_125135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACCCAAGCCCATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226106	226754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_226100_226800
849670	contig_18214_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_166021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATACAATGCAAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198956	198645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_-_198600_199000
849671	contig_9571_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_136242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCTCATAGGGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187184	188137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_187200_188100
849672	contig_5489_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_177632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTTACTCAATGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39517	39776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5489_pilon_+_39500_39800
849673	contig_9807_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_32904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123586	122812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_122800_123600
849674	contig_5041_pilon	-	545	5	Intergenic	novelGene_27109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAATGTGACCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636035	594995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_595108_598394_598549_605329_605420_616559_616692_635978
849675	contig_854_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_36321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGGAGTAGAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566091	565166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_565200_566100
849676	contig_9440_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_59074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATTCAAAAGAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133622	1132488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1132500_1133600
849677	contig_14618_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_136860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293083	1292554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1292600_1293100
849678	contig_10642_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_78682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTATATAACCTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209106	208419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_208400_209100
849679	contig_14467_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_138236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCAACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237942	238770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_237900_238800
849680	contig_8885_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_115579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147375	148903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_147400_148900
849681	contig_12503_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_143840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCCTTGGCTTTCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179992	180512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_180000_180500
849683	contig_8697_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_83196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14243	15059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_14200_15100
849684	contig_4845_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_53666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGAAAACGGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527140	528383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_527100_528400
849685	contig_12746_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_152202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704187	705217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_704200_705200
849687	contig_14744_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_65945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAACTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227064	227674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_227100_227700
849688	contig_10235_pilon	+	709	3	Intergenic	novelGene_46536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	17.5	272	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAATCTTTGACCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360789	362692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_360932_361211_361291_362204
849689	contig_7171_pilon	-	391	3	Intergenic	novelGene_101292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.5	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTATCTTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075812	1057619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057798_1075423_1075482_1075657
849690	contig_6589_pilon	+	483	5	Intergenic	novelGene_26087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	99.506281208776	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	19	471	1865997	1875167	FALSE	15	TACCAGCTCTGGCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGPRAEMTVLAPAWSPTSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPGKGSQLNPKTAGKPSVQSPHRYEFVYK	1865978	1875179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869059_1875097
849691	contig_19186_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_176049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGAAAGAAAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91238	91999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_91200_92000
849692	contig_10000_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_139313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGATAGCGATGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173938	173298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_173300_173900
849695	contig_4505_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_176036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAAAGGAGAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77549	77792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_+_77500_77800
849696	contig_4505_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_176037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAAAATCTTCACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77897	78638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_+_77900_78600
849697	scaffold_6394_pilon	-	120	2	Intergenic	novelGene_111053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCGCTGATGACCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444351	443351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_443387_444266
849699	contig_9058_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_149367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGCCCAGAGGAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60391	59741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_59700_60400
849702	contig_4531_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_47840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGGGAAAAAGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50459	50058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_50100_50500
849705	contig_7049_pilon	+	791	7	Intergenic	novelGene_171452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	10.7651701746368	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	74	790	276483	278146	FALSE	35	TTAAAAGATTGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPLSIPAPPAPPHPSPSPGQGVMVPPPLSPSLSPPLCTLPAGPGPPRFVCYCEEDGDRGSFNLYVTDAAELWSTCFSPDNLPALKARFGLSAAEDITPRFRAACERQGVTLTLQEDIASLTLSGGPWTLTFDLSKLPRRQLPAPRRAPHGRGLSSFYQTPILRGVALDLGSGDGALGSPSSIRASRVRNRPVVWTLTMPEGTAKSVTRPGIHLEGRGSPLETPFHLPTPVTAIAAVLLLPAHQAVPQAPSLPNKRSPVGAV	276409	278147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_276608_276686_276748_277068_277119_277195_277299_277481_277551_277715_277801_277922
849706	contig_4754_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_35937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAGAAGAGAACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325072	323824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_323800_325100
849707	contig_262_pilon	+	987	2	Intergenic	novelGene_140614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAAAAGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33628	35892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_+_34150_35426
849708	contig_12326_pilon	-	992	3	Intergenic	novelGene_177636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	6.5	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCTTCTATGTATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158195	128069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12326_pilon_-_128726_152605_152636_157889
849709	contig_12935_pilon	-	1014	6	Intergenic	novelGene_165714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	49.2479441195265	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	51	686	64900	5642	FALSE	25	CTCCAAGTGGTGATTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFDSNPFADPDLNNPFKDPSVTQVTRNVPPGLDEYNPFSDSRTPPPGNVKMPNVPNTQPAIMKPTEEPPAYTQIAKEHALAQAELLKRQEELERKAAELDRREREMQNLSQHGRKNNWPPLPGNFPVGPCFYQDFSVDIPVEFQKTVKIMYYLWMFHAVTLFLNIFGCLAWFCVDPTRGVDFGLSILWFLLFTPCSFVCWYRPLYGAFR	64950	5313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_5806_10036_10166_13159_13269_14675_14775_44442_44521_64843
849710	contig_5799_pilon	+	1141	4	Intergenic	novelGene_50294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	7.58653778449403	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACATATTTTGTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371264	516723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_371343_392046_392172_515466_515733_516051
849711	contig_15134_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_140232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	276	108	383	325230	324955	NA	10	TCTTTCCTCTTGGCTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQEALPWGGGALGRQHCLPSSLPLGSWPWGGHCPMGPGTCRRPWVIRALTLAPQVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKVGGWGEGGQPVEEAAGRGSREGQAQNPRQGCLWPKL	325337	324954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_325000_325300
849712	contig_16091_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_112345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	215	514	10139	9840	NA	30	CTACTTATCATGATTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAQVAQSFTLMQPITEQHGITSLNSPAAHSTLFPQQTNVSSHPPQPQVLLPSLLLDDRWDWNKVWRCTGENALCKKWVVFPSVHYKSCGCLMMRMRM	10353	9043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_-_9000_10400
849713	contig_2487_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_148470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTCAAAAGTATCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160022	160716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_160000_160700
849714	contig_5928_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_40379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATTATCTGTGAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259687	260205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_259700_260200
849716	contig_5451_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_167169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACACCTGAAGCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428071	427323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_427300_428100
849717	contig_17803_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_175026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCCAAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81421	80350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_-_80400_81400
849718	contig_6227_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_49644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCTCCTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391461	392562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_391500_392600
849720	contig_8682_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_165276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAGAGATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89342	88374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_88400_89300
849721	contig_13295_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_31204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGACATGTATTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20474	19579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_19600_20500
849723	contig_9903_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_172024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAATAAATTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187214	188574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_+_187200_188600
849724	contig_299_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_129501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGATGAAATAGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1620190	1618921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1618900_1620200
849725	contig_5640_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_27250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGCTAAGAAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82765	81762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_81800_82800
849726	contig_13868_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_172663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGAACAGAAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128868	128302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_128300_128900
849727	contig_14882_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_115033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324786	325497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_324800_325500
849729	contig_16098_pilon	+	909	2	Intergenic	novelGene_46164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTGCCATCCAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459563	461133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_459708_460368
849731	contig_18869_pilon	+	672	4	Intergenic	novelGene_56431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.8423039781937	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2	466	111260	113872	FALSE	20	GATGTGTTGAAACTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRTTYYRIVDFFCSSILKKYNRQALQILFKPLGKFISHLTFHELLQGLQGLTLPPASEKPVTVVLQNQDKHGCFDCLGDSPDAYSLSGRTPNLPQQPSSPVLPPRGQTIGTAAGSQDGVKRWQKQDYSPLFKPNLDLPGPTDLAVLEHTYVEKV	111258	114078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_111329_111620_111756_113277_113480_113813
849732	contig_9955_pilon	+	1130	2	Intergenic	novelGene_21367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	318	695	300886	301263	FALSE	0	CTGCTCTTCTCTTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDHYMKWTKAATAGASPWACVPASSGLQHHQPSHQGCSQSSRGKERFSFDLALSLRTERCLEYLFSDSPGSCSEAVLCQPRLPLRNVCGVITSFLLALSIRQALFWLWVLGHDQSISCTFFLRT	297386	301698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_297539_300720
849734	contig_7035_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_83559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTAGGCCCCAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951833	951250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_951200_951800
849735	contig_4812_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_103704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTACAAATCCAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914330	914982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_914300_915000
849739	contig_13740_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_34786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAATAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866533	864923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_864900_866500
849740	contig_3825_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_78027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCTGAGACATCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651185	1650518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1650500_1651200
849741	contig_5815_pilon	+	289	4	Intergenic	novelGene_141222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4142	junction_1	15211.6517694679	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAAACGTAACGAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040933	1045526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1044248_1045493
849743	contig_11986_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_69205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAAAGGTGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734550	733985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734000_734600
849745	SIRV6	+	435	3	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	330	2	164	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	34	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTCACAAGTCAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845
849746	contig_447_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_177637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGAAGGATGTAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33423	33138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_447_pilon_-_33100_33400
849749	contig_21315_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_151572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAATGGATATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52797	53721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_52800_53700
849750	contig_12793_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_164120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAAATAAAGATCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228644	228360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_228400_228600
849751	contig_4364_pilon	+	936	3	Intergenic	novelGene_208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	19.5	48	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	394	807	1337602	1338945	FALSE	30	TTTAGAGACACGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDVALLKPPTPAATAPGPDPAGLSLRRPWLLAASCPTPSRVSGIDPHIPGHTPGRRRGSVLRPPSVFAQNRIQILCGVRGTADHPPGCSRPNLDPGDTRPAHPTKELLRKRCVPAGPGDRDRNCACGEDPMGLWLK	1335755	1339074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1336051_1337503_1337627_1338556
849752	contig_15146_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_116931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATCTCTTGTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53481	55194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_53500_55200
849753	contig_3424_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_55574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	46	402	1086074	1085718	NA	85	AAAACTAAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCEGTNYHLTWTKPMQAAAGRGQQKQTPLRGATEPATSSQFYQHLGVETKTKHKLLTQGAQETLACSDACSAQCRTPMALSESLPKLQDRGAWAQRLGGLGRWVYPPVSVRAQRTRTAGQQVLPVPMQGPAQ	1086119	1084790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1084800_1086100
849754	contig_2933_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_111323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAATTTTAGTGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512196	511577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_511600_512200
849755	contig_50_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_122205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCTGGAGAAGGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6041	6315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_6000_6300
849756	contig_3426_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_57960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGCAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434967	434294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_434300_435000
849757	contig_11448_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_66402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAACATGAATTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467602	468971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_467600_469000
849758	scaffold_13505_pilon	-	605	2	Intergenic	novelGene_111673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871522	870344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870889_871461
849759	contig_8317_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_20670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16486	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
849760	contig_6914_pilon	-	783	4	Intergenic	novelGene_151732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	109.961609462374	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	37	561	123393	122480	FALSE	40	CCCTATGTACACAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTAGSERPLPRMAALVLAGDTMGPERIFPNQTEELGPHVGSAEGTGDWSSEEHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQALGLHLPDPPLESEDEEEEGATALSNHNSIPMDPEHVELVKRTMAGISLPAPGVPAWAREISDAQWEDVVQKALQARQASPAWK	123897	122257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_122632_122937_123041_123123_123406_123873
849762	contig_8006_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_173934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTCTGTTTTCCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461687	460900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_460900_461700
849763	contig_5765_pilon	-	645	2	Intergenic	novelGene_141432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATGTATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973222	967785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_968365_973156
849765	contig_8050_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_114872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTTGAGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435517	435189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_435200_435500
849770	contig_7057_pilon	+	541	3	Intergenic	novelGene_123252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_2	98	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	93	398	540255	541317	FALSE	25	CAATATTGACTTCCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLERVSNEEKLNLCRKYYLGGFAFLPFLWLVNIFWFFREAFLAPAYTEQSQIKGYVWRSAVGFLFWVIVLATWITIFQIYRPRWGALGDYLSFTIPLGTP	540162	541460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_540316_540890_540996_541177
849771	scaffold_12124_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_21979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTGAGAGTGGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686659	686342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_686300_686700
849772	contig_10904_pilon	+	420	4	Intergenic	novelGene_22574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	250.668882968926	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGACTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423261	426363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_423387_423523_423599_425434_425513_426221
849773	contig_15036_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_107146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGGGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49695	48629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_48600_49700
849774	contig_3948_pilon	+	634	2	Intergenic	novelGene_53151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCTAGGTACTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28672	41536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_28852_41081
849776	contig_2646_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_69574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGACACCATCCCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296049	1295589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1295600_1296000
849777	contig_5217_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_135727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTTCCTTTTAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440673	441738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_440700_441700
849779	contig_9267_pilon	+	312	2	Intergenic	novelGene_162017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTAAATCTTTTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379305	381127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_379373_380882
849780	contig_11563_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_142309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	586	891	323558	323863	NA	60	AAATGACAGGAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKSCLYDVNEAGLEAVMLTRQDYIYNIRLCFKSISFEIQRAERQGDLIPEEVRARRIVPPGYWTRDSCAEKLLNQGKMDDKDLPPEPTERESLPLELVP	322972	324241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_323000_324200
849781	contig_10159_pilon	-	735	3	Intergenic	novelGene_30839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	60	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642160	597440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_597913_606778_606838_641956
849782	contig_15893_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_128508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCTAGTGAGACCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55904	57257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_55900_57300
849783	contig_11292_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_109449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	188	430	338470	338228	NA	5	TCCCGAGGGTCCCGCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVGSDAGSGPRHQPLAFDTELVNIGGDFDAAAGVFRCRLPGAYFFSFTLGKLPRKTLSVKLMKNRDEVQAMIYDDGASRRREMQSQSVMLALQRGDAVWLLSHDHDGYGAYSNHGKYITFSGFLVYPDPAANPPGLGPPEL	338657	338086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_338100_338700
849785	contig_3942_pilon	+	152	2	Intergenic	novelGene_128661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATGGGGGCCCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178393	180116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178404_179974
849790	contig_7321_pilon	-	706	2	Intergenic	novelGene_53147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_1	0	173	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTAGTTGTAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208380	207222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_207860_208311
849791	contig_20561_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_166380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGATTTCTTTATGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202108	203154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_202100_203200
849793	contig_12092_pilon	-	800	2	Intergenic	novelGene_163443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	528	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	99	317	126337	124224	FALSE	10	AGGTTGGGTTTTTTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKITTGKRKHEDDEPVFEQIENTANPSRCPVKMFECYLSKSPQNLNQRMDVFYLQPECSSSTDSPVWYTSTSLDRNTLENMLVRVLLVKDIYDKDNYELDEDTD	126435	123740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_-_124417_126311
849794	contig_6503_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_145786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAAAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729399	729782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_729400_729800
849796	contig_2161_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_114914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTGATGGGTCCGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788758	788136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_788100_788800
849797	contig_4891_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_124538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTAGAATCCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412319	413590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_412300_413600
849798	contig_4732_pilon	+	269	4	Intergenic	novelGene_75399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2591.52477639452	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524029	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524233_524591_524671_525073
849799	contig_6434_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_61823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGTTTATTAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342814	343179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_342800_343200
849801	contig_4496_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_66641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAATCCACATATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666122	665402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_665400_666100
849803	contig_9727_pilon	-	986	6	Intergenic	novelGene_86290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	8.03990049689671	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	225	911	190748	189009	FALSE	10	TCACTTGCTGCCCTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDNARQAAERNSNLVGAAHEELQQSRIRIDSLSAQLSQLQKQLAAKESKLRDLEDSLARERDTSRRLLAEKEREMAEMRARMQQQLDEYQELLDIKLALDMEIHAYRKLLEGEEERLRLSPSPTSQRSRGRASSHSSQTQSGGSITKKRKLETSESRSSFSQHARTSGRVAVEEVDEEGKFVRLRNKSNEDQSMGNWQIKRQNGDDPLLTYRFPPKFTLKAGQAVTIWAAGAGATHSPPTDLVWKAQNTWGCGNSLRTALINSTGDEVAMRKLVRSVTVVDDDEDEDGDDLLHHHHVSGSRR	191773	188933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_189120_189547_189668_189765_189874_190307_190531_190623_190845_191645
849805	contig_6589_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_26318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAATATTAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2373416	2372972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2373000_2373400
849806	contig_2278_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_118121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAAAAACCTCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945578	946421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_945600_946400
849807	contig_2867_pilon	+	975	2	Intergenic	novelGene_135271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGCTTTAAAAATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534994	1538609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1535237_1537876
849808	contig_11574_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_64053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGCCTCCTAGTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439856	439355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_439400_439900
849812	contig_6123_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_177638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGCAAGCAAGACAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12250	11618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6123_pilon_-_11600_12200
849813	contig_8873_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_162896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCAAAAGGAACTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103871	104514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_+_103900_104500
849814	contig_8954_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_130285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCCAGCAGCACATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156095	155591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_155600_156100
849815	contig_16098_pilon	+	596	6	Intergenic	novelGene_46061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	469.092059195207	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	179	595	436826	439178	FALSE	15	CACCCCTCATTCTGTAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIRPECCSLGPSACKLLVRPDPLTPRVS	436000	439179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436759_436943_437045_437090_437263_437373_438749_438816_439097
849816	contig_11574_pilon	+	661	3	Intergenic	novelGene_64097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAAAAGATTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454418	462687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_454887_456382_456539_462650
849819	contig_4442_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_127937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCATCTACTCTACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177515	175936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_175900_177500
849821	contig_5092_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_62320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470452	472056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_470500_472100
849822	contig_2703_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_101667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	162	536	140352	139978	NA	5	CACTTCTTTTTTTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGRGSSPKLVWFPSVSGKPRCHTGLHPSSQAWPVLLFQHLSVTFEIQTFFGPFFSAVPALRKLSERQAPSSRHNYSPLVQAGGRTAPRHLDPSVLGGEVITTTGSLSCLSLTDRKRQLTLCL	140513	139954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_140000_140500
849823	contig_9177_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_32819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAAAACTCTTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653469	1653723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1653500_1653700
849824	contig_9177_pilon	+	156	1	Intergenic	novelGene_32820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCTCAATTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654300	1654456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1654300_1654500
849825	contig_6872_pilon	+	478	3	Intergenic	novelGene_175736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATATTTATCTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236358	451967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_+_236430_417939_418044_451664
849828	contig_12951_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_68183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGACTGGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399934	400221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_399900_400200
849830	contig_2646_pilon	-	1271	3	Intergenic	novelGene_69573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAATGAAGGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121802	1112426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1113454_1118594_1118783_1121746
849831	contig_9471_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_21749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATTTGGCTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309985	310349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_310000_310300
849836	contig_7775_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_37458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54814	56203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_54800_56200
849837	contig_5649_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_82329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCGTTTCCAAAGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448629	447727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_447700_448600
849838	contig_11642_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_172919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCTACCACTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262311	262804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_262300_262800
849839	contig_11642_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_172920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262751	263352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_262800_263400
849843	contig_19918_pilon	+	711	4	Intergenic	novelGene_172973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	146	343	135016	136871	TRUE	25	AAATGCAGTTTCCTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVDEERYDIEAKCLHNTREIKDLKLKVLDLRGKFKRPPLRRVRVSADAMLRALLGSKHKVSMDLRANLKSVKKEDTEKERPVEVGDWRKNVEAMSGMEGRKKMFDAAKSPTSQ	133718	138048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_133777_134928_135106_136763_136874_137682
849847	contig_14755_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_129396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACTTGCAAGAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357607	355857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_355900_357600
849848	contig_11171_pilon	+	665	5	Intergenic	novelGene_48544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2048.1500799502	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	130	450	48692	65739	FALSE	15	TTAACCTGCAGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSLVPLQPVHEAVPALHPSHHPREPGHQVPAAAHRQGGESSTMTPGGSALPCRRPSTFWACPSHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGDLARWWG	41771	65954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41891_48681_48755_49132_49235_51071_51211_65722
849850	contig_5302_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_81505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTATCATGCAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348567	347963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_348000_348600
849852	contig_1996_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_131869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	291	752	89630	90091	NA	45	TTGAGACCAGAAGAACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIHLTADRAVWGSGEWDHPTLCPGGLGPGLSSSLTAASFTIICLTAEVDETRRGAWKSCMRAGGGVDTATLVGTEPTARFRCAALRGNLPRAPSVPKFHEGGWNQEEASQPSCPVPAPLTLHGSVTLQAVRPPQVKAFRGTPLSTSWTIHTR	89339	90653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_89300_90700
849853	contig_2547_pilon	+	511	3	Intergenic	novelGene_165456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	165	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	150	452	6344	27503	FALSE	30	GCCATTGAAGGCTCAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQILRVKEDENVPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRADQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKMEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL	6194	27562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_6349_13687_13863_27380
849854	contig_12654_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_129269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202887	202310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_202300_202900
849855	contig_14326_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_120772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTTTGACCAACATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740479	738628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_738600_740500
849856	SIRV2	-	289	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	645	14	645	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGACGTTTCAGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4087	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
849857	contig_5050_pilon	+	886	8	Intergenic	novelGene_110235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	109	582	6241	9105	TRUE	15	GCCAGCATGTCACGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLPASSPPSSHWFLLQAEVGFTAREVAEVLLAEVARPVHCMRWRAAALRMSRWVRGEPGFKASRSIRRLLGHVSVGAGGAVQGRVNQQLVEDVSLGIAASDLDDPVADGQEQLHGTVSVPALSLHQGLAQRQPHVAGQVVLLASPCVLAGLLQCG	4676	13644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_4774_6229_6456_8195_8269_8513_8662_9067_9245_12176_12260_13414_13453_13600
849858	contig_3153_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_104684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGTAGCTGAGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303750	304792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_303800_304800
849859	contig_10054_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_171211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGTATAGGGAGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74107	75464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_+_74100_75500
849860	contig_12622_pilon	+	841	3	Intergenic	novelGene_5794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	76	290	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGTTCTAGAAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349098	358886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_358772
849861	contig_18859_pilon	+	313	2	Intergenic	novelGene_150538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATAGGATTATTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71544	85720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_71801_85663
849863	contig_19564_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_29647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAGAAAAAGAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15690	14778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_14800_15700
849864	contig_5978_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_152407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATACATGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748787	749984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_748800_750000
849865	contig_8210_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_30254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCTCCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97166	96302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_96300_97200
849867	contig_11629_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_161193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGCTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207699	206367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_206400_207700
849868	contig_50_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_122214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTATACAGATGTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58768	57571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_57600_58800
849870	contig_6831_pilon	-	1033	4	Intergenic	novelGene_165146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.43650214343336	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	20	553	116195	97259	FALSE	35	AAATTGTGTATGTTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFSAGEMEKLSLLIEENAQPRSPGRSSLDDSGERDEKLSKSISFTRESVSRGSETESFSGNTPKEGLGKEEPQSEKQIKKSPLLTSEKRLSRVPSKLLNLNTNEYLSLDKSSSSDSVGEENIPEKDLHGRLYINRVFHISAERMFELLFTSSCFMQRFASSRNILGGLFCYYLMINLGELYYP	116214	96778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6831_pilon_-_97453_108195_108359_111714_111848_116151
849872	contig_9415_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_109781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCCGCTGACATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643613	1642651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1642700_1643600
849873	contig_7412_pilon	-	660	5	Intergenic	novelGene_76284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	100.10088660946	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTTGCTTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271407	268992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_269135_270160_270292_270432_270579_270657_270792_271300
849874	contig_10479_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_147106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAAGTTCATAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81073	79790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_79800_81100
849875	contig_1037_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_84594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACTAGTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178080	179020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_178100_179000
849877	contig_10196_pilon	-	1260	7	Intergenic	novelGene_132177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	4.14996653266291	184	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	20	436	1072541	1069715	TRUE	10	TATGCGTGTGGTGTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGGSMEAVEEPGNLSGVRHIILVLSGKGGVGKSTISTELALALRHAGKKVGILDVDLCGPSVPRMLQAQGCAVHQCDSGWVPVFVDQEQSVALMSVGFLLETPDEAVVWRGPKKNALIKQFVSDVAWGGAGLPGGRHAPGYL	1072560	1068312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068883_1069276_1069347_1069421_1069533_1069641_1069798_1070308_1070508_1070597_1070717_1072525
849878	contig_13265_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_145996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGGAAATAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8650	9749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_8600_9700
849879	contig_202_pilon	+	1135	11	Intergenic	novelGene_127068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_10	11.2556652402246	31	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	27	986	69580	366155	FALSE	35	ATGTAACAATGCTAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRAVARAMGLWQRLLLSGGVLLRGVGGATARLGRSRVLVFRRQLSGVESETLKQRRTQIMSRGLPKQKPIEGVKQVIVVASGKGGVGKSTTAVNLALALAANDSTKAIGLLDVDVYGPSVPKMMNLRGNPELSQNNLMKPLLNYGIACMSMGFLVEETAPVVWRGLMVMSAIEKLLRQVDWGQLDYLVVDMPPGTGDVQLSVSQNIPISGAVIVSTPQDIALMDAHKGAEMFRKVHVPVLGLVQNMSVFQCPKCKHKTHIFGADGARKLARTLDLDVLGDIPLHLNIRETSDTGQPIVFSQPESDEAKAYLRIAEEVVRRLPPPPE	69553	366304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_69688_70258_70407_88351_88387_150383_150475_222601_222642_222726_222818_294937_295032_325752_325839_352418_352540_357629_357713_366092
849881	contig_6848_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_174872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAGAGGTGGCTCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60092	55836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6848_pilon_-_56047_59968
849882	contig_19722_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_171891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.523768684131	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	163	576	68446	76609	FALSE	45	AGAAGGTATTTTTAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVSGSRTPEGEASGSGGKRRSLSQSSRNQPYRSRSRSRSRERPSGPRGTPFASASSSAYYGGYSRPYGGDKPWPSLLDKEREESLRQKRLSERERIGELGAPEVWGLSPKNPEPDSDEHTPVEDEEPKKSTTSAST	68283	76611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_68513_68629_68832_75202_75284_76545
849883	contig_14341_pilon	+	635	2	Intergenic	novelGene_111785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAGTGGTGAATCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334303	344551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_334465_344077
849885	contig_1406_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_25618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2582955	2583226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2583000_2583200
849886	contig_13699_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_158339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAATGAAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142509	143296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_142500_143300
849887	contig_16685_pilon	+	710	8	Intergenic	novelGene_115057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_7	65.2455331178828	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	242	709	559058	563820	FALSE	15	ATGGCCTGGTCCAGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLCDSLQEPLTFTCNCSSTVDLLIYQTLCYTHDELRDVDVGDFVLKPCGLEEFLQNKHALGSHEYIQYCRKFDIDIRLQLMEQKAVRSDLARTVNDDQSPSTLNYLVHLQERPVKQTISRQALSLLFDTYHNEVDAFLLADGDFPLKADRVVQSVKAICNALAAVETPEITNALNQLPPCPSRMQPKIQKDPSVLAVRENREKVVEALTAAILDLVELYCNTFNADFQTAVHGSRK	555099	563821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_555147_555442_555564_558984_559097_559250_559331_559710_559775_561854_562002_562677_562712_563716
849888	contig_8452_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_48022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAATATACATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325195	324344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_324300_325200
849889	contig_7933_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_164661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	2	487	81754	81269	NA	25	AGGGTCCTAGACAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCQHSQGACHCQRQANLAPTLPLPLLRRLPAWAQTVAVSPLQGTKLYWQPPAQRCPAPLCVPALPTGTTLTALSATGSFLGLLLLALLQSPFWASSVLSAQCSRLFLFGCGRFSAQGPQVKGRTPFQALVDREVQKIFCEIGHLHRKTPCQFQDAAFLTGS	81755	80485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_80500_81800
849891	contig_14790_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_127919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACGGCCACTTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243857	243332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_243300_243900
849892	contig_4824_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_176030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGTGCTCGATGGTCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573874	573158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_-_573200_573900
849894	contig_10861_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_39317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGTGCAACATTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484273	1483226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1483200_1484300
849895	contig_14300_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_133127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGCCCAGCGCCCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385838	384256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_384300_385800
849896	contig_15327_pilon	-	664	4	Intergenic	novelGene_70594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.5318181259127	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	282	542	883415	882963	FALSE	15	GCCTGCCTGCCCCAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYPAGWFTCVPSSWHSDEAASSHFTVEEKEALKTQSPAQGRTYDIDAGSEPAGKELVSKEGFRRARHVVGEIRRTAQAADALNRGDYRAFGHLMVESHHSLRDDFEVSCPELDQLVEAALSVPGVYGSRMTGGGFGGCTVTLLEAATASRTMQHIQEQYSGTATFYLSQAADGAMVLPL	883871	882840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_883035_883137_883301_883389_883541_883715
849897	contig_6546_pilon	-	383	3	Intergenic	novelGene_140967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	228	299	597731	597660	FALSE	10	GAGTCCGCACGCTTGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRSSRWCSPSCWGRSTSPDIADEAPNVDVGQGLQHTRHRPERFNVYTGCFNEGIDLILLITVTSSSCRIRAEYMQASSETEAMARECWAGGCRARC	599350	597575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_597773_598334_598397_599226
849898	contig_4732_pilon	-	639	2	Intergenic	novelGene_75425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	291	638	609109	608686	FALSE	30	GAGGACGAGGACGTGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVKNVHPARSPPQRLALQVSAWKVLWVGARGRLGQVAREGGKQPLLGVCHGKCKKRARPGRPPGLWPALCTLPLSPPTKGPPGTHEEQEQQVELLAFLRWARPGGTAQLRLLRP	609399	608684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_608692_608767
849900	contig_12884_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_104983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	324	353	873398	873369	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAEVQHGGLAPERLPPSPARGSSSHGTQPAPSPEVVKVGVLVGHPPPTPPVGGPTLSRKRETRSTAAGASVAGSRWARARLGQAHPDRGPRGLDAQSKARLPCGSGMHAASALEL	873721	873150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_873200_873700
849901	contig_6470_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_145604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTGATAGTGCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010118	1011610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1010100_1011600
849902	contig_17144_pilon	-	493	5	Intergenic	novelGene_29169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	519	junction_4	55.5112601190065	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	178	492	162026	158046	FALSE	25	GCTGGGTGACCAAGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANQKEKLKIKQEWLMNKIVANPEDTSSLEARIVALTVKIRNYEEHMQKHRKDKAHKRYLLMSIDQRKKMLKNLRKTNYDVFEKTCKELGIEYTFPPLYYRKAHR	163015	158044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875
849903	contig_7815_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_134371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAATGCCATCAAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329176	328110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_328100_329200
849905	contig_10734_pilon	+	779	4	Intergenic	novelGene_51124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	741	38	778	737299	739462	FALSE	25	AGCCAACCCTACACCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGALSGDIGEVLMRTVTPASERRLGQARGQPPRGTAHSTQQASRQQPGPHLEGQAVPSGGLLEKKHMGRRRDVKSAAQVGDRQNGDTNLVDLSVPLFGYNFLQDLAVSLNEPGASRLGVHHLADDTLPGIPLLLGHGLHGLDAGLLLICQDWAILFLRSCSVPLVQRGAGQGLSLLRLGLLPVFLLQLLLPFFLLLPLVVLVLPPLLPAIAGGRGGRGGRRGARRTGRGGGRAGPWSPPGLGESLRGYSVTNSTAHRAE	737261	739463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_737596_738018_738138_738215_738487_739408
849908	contig_12970_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_50513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87073	87929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_87100_87900
849909	contig_18184_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_123863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1109	1474	91714	91349	NA	70	GTTGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISVEEEHQVPSPGALLPVAKKSLPPPPCRPVGDVGAGERKEAVNYNDCITVPYTPEFILITPTSRSPGGIVVKSSAADQKVSSSSSPPAAPWKPYRAVLFCLVGSLGVEIDSSATGLVF	92822	91209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_91200_92800
849911	contig_7530_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_141849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCATGTGTGCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308294	309239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_308300_309200
849913	contig_5047_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_157999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATGGAGCACAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215645	1216540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1215600_1216500
849915	contig_1037_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_84604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGGTCATACTTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304816	305644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_304800_305600
849916	contig_12142_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_147824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTATGTACAACAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138517	137203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_137200_138500
849920	contig_3382_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_124077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTGATTTCCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342870	343964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_342900_344000
849921	contig_6842_pilon	-	1224	2	Intergenic	novelGene_130753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAGAAGCAAGGATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306655	1303150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1303982_1306262
849923	contig_3956_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_15289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	254	655	1316703	1317104	NA	5	CACCGGTGTTCCTGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCLQPPLGQSVPAASAPKGTQLPCLSGQGGLVTPSPGQRVSTGRLAHLCSLQGAYPCPLVHSRLGAALELPWSCPGAALRQTLAFPNLPLWRLPARGCSTTASHWGPPSTSTPRPSWWLRGTCSVMSCLAA	1316449	1317320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1316400_1317300
849924	contig_4730_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_71694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTGAGTGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75168	73522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_73500_75200
849926	contig_12520_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_161062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369328	368352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_368400_369300
849927	contig_19744_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_120382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGCTACGCATTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154007	153471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_153500_154000
849929	contig_6589_pilon	+	565	5	Intergenic	novelGene_26147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6998.26467776119	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	23	463	1885124	1887829	FALSE	25	AAGTTATTTTTTCCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885101	1887931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886313_1886666_1886783_1887705
849931	contig_10982_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_87868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGATAAAATGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102083	102552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_102100_102600
849933	contig_1146_pilon	-	1008	2	Intergenic	novelGene_84807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATAAAGAAGAGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279822	273848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_274707_279672
849934	contig_8687_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_169672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308152	307384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_307400_308200
849935	contig_5585_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_143062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	443	1329	293	1621	323624	324952	NA	20	TACCTCCGCAATTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYLTTLDEADEAGKRIFGPRAGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKVILGCRLHNCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDKFVFGNYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWQTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYAAQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEAHSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGEREDRLELLKLSTFALIITPGDPHLVISSGCAARLFEALEVGAVPVVLGEQIQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPK	323331	324952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_323300_325000
849936	contig_1107_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_126592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841177	841681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_841200_841700
849937	contig_253_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_129619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATGCATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125403	126412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_125400_126400
849938	contig_5574_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_155857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCCTCCATTAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173321	172484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_172500_173300
849939	contig_2323_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_151851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATGATCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124036	124944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_124000_124900
849940	contig_4845_pilon	-	714	2	Intergenic	novelGene_53717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	37	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	17	406	1043666	1034334	FALSE	40	CTTATTTATGGGGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVVTAAAAALAPAPSIDGASSVHWFRKGLRLHDNPALLAAVRGARCVRCVYILDPWFAASSSVGINRWRFLLQSLEDLDRSLRKLNSRLFVVRGQPADVFPRLFKVSVYSRPREDSKSLLPKGPHR	1043682	1034025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1034509_1043451
849941	contig_16431_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_87600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACATAAGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56772	58125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_56800_58100
849942	contig_8663_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_58003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGAGATACTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70813	72185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_70800_72200
849943	contig_9389_pilon	-	919	6	Intergenic	novelGene_84096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.7303026388921	47	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	20	640	1389778	1387759	FALSE	15	GGCGTTGTCCTAGGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLCLGMTAALARGCLHCHSNFSDKFSFYRHHVNLKSWWVGDIPVSGALLTDWSQDTMKELHLAIPAEITEEKLDQVANAVYQRMDQLYQGKMYFPGYFPNELRAIFRDQVHLIQNAIIESRIDCQRHCGKWRPAQARRWGPPSRSKGSLPPVCVAGIFRYETISCANCTSSHVVCFGYNCESSAQWERAVQGLLGYMKEKHTGRQPVFPAA	1389797	1387479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1387805_1388516_1388565_1388648_1388833_1389242_1389315_1389406_1389488_1389588
849944	contig_1239_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_150397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAGAATAGGAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166244	165126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_165100_166200
849945	contig_4508_pilon	-	495	2	Intergenic	novelGene_177536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTCTGTTCCTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102453	95134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_95489_102312
849947	contig_9696_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_68810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGCACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382750	383259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_382800_383300
849949	contig_12790_pilon	-	710	4	Intergenic	novelGene_35270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	13.9124245031395	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	217	390	395581	320982	FALSE	15	CTCAGCTTTCCATCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEENESDRGQVWQSCRFGRGAQSVPAAGLWPRTRSARARWQHALDFPALRLDFREARKWTPFSWRHECQSPAMGVAEFAAYCLSMWGNNIKITRASWEPLQGILSTCSAKLGPLDSQMPTSAQCLGRGT	406752	320661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_321099_349175_349229_395577_395682_406636
849950	contig_11281_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_125491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTAACCTTCAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911782	911328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_911300_911800
849953	contig_5832_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_134135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207493	206129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_206100_207500
849954	contig_753_pilon	-	911	5	Intergenic	novelGene_112958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5634506425697	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	28	513	1174589	1169332	FALSE	35	ATTCCAAGCAACCTACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSTSGWKDMFNVNVLALSICTREAYQSMKERKVDDGHIININSMSGHRVVPQSVIHFYSATKYAVTALTEGLRHELREAQTHIRATHLCPQHSPARPDRRHPDEAHGAGDLVSSGEFLFPSHTPWLGYCLWILGVDFWTPGFHFPSLLPPEARKFVGGFYIVKFFPLQM	1174616	1168933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1169550_1169672_1169707_1170711_1170842_1171527_1171623_1174580
849955	contig_5039_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_64905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAATCAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636656	635666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_635700_636700
849957	contig_11846_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_106009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCGAGTCCGTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444199	443414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_443400_444200
849960	contig_10196_pilon	-	1242	5	Intergenic	novelGene_132245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	0.707106781186548	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	180	992	1529698	1528467	FALSE	20	ATGGAAGGCAGGTGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLVVLVLLLLAHAAPAPALERAGIVGGREAPMTKWPWQVSLRMHSGYWMHFCGGSLVHPQWVLTAGHCVGPKVADPGTFRVQLREQHLYYQDELLPVSRVIVHPNFYCAQKGADIALLELEDPVNISSHMQLVTLPPASETFLPGMPCWVTGWGDVDNGVSLPPPYPLKQVKVPIVENSLCDTEYHNGLYTADNIRIVHDDMLCAGNKGHDSCQGDSGGPLVCKVNGTWMQAGVVSWGDGCAQPNRPGIYTRVTHYSDWIRRYVPTEP	1529877	1528216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1528632_1528707_1528872_1528998_1529265_1529352_1529519_1529646
849961	contig_19012_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_159482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55906	55643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_55600_55900
849962	contig_3832_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_161473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCCCCCATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395301	394569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_394600_395300
849963	contig_15084_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_116714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTCTTCTTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251600	251300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_251300_251600
849964	contig_15084_pilon	-	228	2	Intergenic	novelGene_116711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCTGCCATGAGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251250	249406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_249508_251123
849965	contig_12257_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_152113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGATTCTAACCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155192	153546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_153500_155200
849966	contig_5728_pilon	+	360	4	Intergenic	novelGene_126683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	79.9041091976293	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	210	151	360	232123	235440	FALSE	40	CCCGAAAGTGCCAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLEPVLLPGEIVVNEVNFVRKCIATDTSQYDLWGKLICSNFKISFITEDPMPLQKFHYKNLLLGEHDVPLTCIEQIVTVNDHKRKQKVLGPNQKLKFNPTELIIYCKDFRIVRFRFDESG	208022	235440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_208048_231997_232135_234725_234799_235315
849967	contig_5429_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_127769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAGGAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17481	16967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_17000_17500
849970	contig_4364_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_4575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCAAACAATAAATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1821885	1820403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1820400_1821900
849973	contig_9377_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_176305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCTGGAATGAACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441314	441685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_+_441300_441700
849975	contig_6270_pilon	+	1171	3	Intergenic	novelGene_99830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	14	754	113233	115037	FALSE	30	GTAATTATTCGTAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAKVAVTVQELFQAPVLRMLGQVEARSAASGGVVVHCETRLHPQKRDTPLQFAFYKYSRVVRRFDWGAEYTVPEPEVEELESYWCEAATATRSVRKRSPWLQLPGRGSLDLAFTTVPAPQAATLAPSNKPLSFRKPPVFRSVSFVTSIPNTTSSGLLFPLGSGPPAGPPACAPPTTSLEQSAGALKPNVDLLLREMQLLKGLLSRVVLELKEPQALPELTGTPETPTLHLSMKGVTPETTTVET	113219	115454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_113267_113889_114181_114621
849978	contig_17829_pilon	-	1054	6	Intergenic	novelGene_157020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_2	23.9883304963059	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	42	767	17075	2820	FALSE	45	AAAAAGCAGTTAGCAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCGCCRGWSRSVFMERAEGSSTELAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSVDAGATNIDLRLKDYGVDLIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTHVETFGFRGEALSSLCALSDVTISTCHTSAKVGTRLVFDHSGKIVQKTPFPRPRGTTVSVQQLFYTLPVRHKEFQKNIKKEYVKMVQVLHAYCIISTGIRLSCTNQVGQGKRQPVVCTSGNASIKENIGSVFGQKQVVVTSY	17116	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_3009_6769_6954_7913_8017_8201_8289_12725_12866_17052
849980	contig_7049_pilon	+	761	7	Intergenic	novelGene_171450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	9.99444290037663	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	81	578	276483	277962	FALSE	30	GGTTAAAAGATTGGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAPPPLSIPAPPAPPHPSPSPGQGVMVPPPLSPSLSPPLCTLPAGPGPPRFVCYCEEDGDRGSFNLYVTDAAELWSTCFSPDNLPALKARFGLSAAEDITPRFRAACERQGVTLTLQEDIASLTLSAAEETAASPKKSPPRPGPQLFLPDPDPQRGGPGPGVRRRCPGESLINPGFKSKKPASGVDFDDA	276402	278145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_276608_276686_276748_277068_277119_277195_277264_277481_277551_277715_277801_277922
849981	contig_14744_pilon	-	418	3	Intergenic	novelGene_66094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTTTCTAACATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386688	1384514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1384632_1385887_1385998_1386497
849983	contig_7272_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_25305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415922	416762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_415900_416800
849984	contig_6031_pilon	+	1672	1	Intergenic	novelGene_56721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAACAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33298	34970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_33300_35000
849985	contig_7411_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_137013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGAAATCTTACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325442	323950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_324000_325400
849986	contig_12008_pilon	-	398	3	Intergenic	novelGene_25015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	2	327	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGTTTAAACCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121221	84050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_84263_120279_120345_121100
849987	contig_2854_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_120871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATAAAAATAAGTAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991542	990130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_990100_991500
849988	contig_5317_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_76646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	297	1842	2138	988217	987921	NA	5	GTTACTTCTTTGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNLGPAATAGSTLEVRPRLTDTAAPVRRLRTIKRVFPSLAMPLHSPHWGEFQKSTPQKHYHKPDKQGRGSWSYKEIAVLKEASQSSFCQPSRKIQVI	990058	987920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_987900_990100
849989	contig_9335_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_147466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	111	452	661784	662125	NA	25	CCACCAGCCACTCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQVLKKLVNLLYCPGETAVLGVVSGTMEEVRLGDITVPEGDTSTDPWASIRQLPQQEAHWFRWQVHLSLNTAPSTWATCRECSTSGTPNVCRTLLYRTQTFKTNYSPPRGCL	661673	662519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_661700_662500
849990	contig_9335_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_147465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658750	659034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_658800_659000
849991	contig_9706_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_20932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTTATGAGGTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228216	228498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_228200_228500
849992	contig_9706_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_20933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228798	229695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_228800_229700
849993	contig_5649_pilon	-	756	5	Intergenic	novelGene_82475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28.7782469931718	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	122	601	1654559	1648882	FALSE	25	TGTATTTCTTTTAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLLSPVVPQISAPQSNKERLKNMALSIAERYRAQGISANKFVDSTFYLLLDLITFFDEYHSGHIDRAFDIIDRLKLVPLNQESVEERVAAFRNFSDEFKRLKGTSSSSASRPQRVIEDRDSQLRSQARALITFAGMIPYRTSGDTNARLVQMEVLMN	1654680	1648726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1648993_1650155_1650228_1651700_1651785_1652259_1652378_1654464
849994	contig_2419_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_137131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTCTTCTGGATAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148880	148176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_148200_148900
849995	contig_6102_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_32321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	352	687	1605724	1605389	NA	25	TTATGGGATCAATTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLQEGYKMIGWGLGSAGSTQPEAQGHMHVNWKMLICWFHPDRGPRLYAYEEVKVSVSGMQKQKSQNGVGPTPKPVTLGMPGTSVLELLRDTKIVLNLVYESPFKLALLPS	1606075	1605228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1605200_1606100
849998	contig_9895_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_144702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCAAGGGATTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360333	360763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_360300_360800
850000	contig_16068_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_177501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	90	428	62405	62743	NA	50	TCCTCATTAAAACAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAGYPYYSLEAEFRPRQETSVLLLRSSLMDSDSCSTTCCGVALFKFMALPSFSVSVRVLQKTNRIWIQRDIDIKREISFKNCNWLTQPWGLARLRSVRQAGKVKSQTGCLCYSQNSFFSRKPQFFLLRSSADWMRPTHII	62315	63110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16068_pilon_+_62300_63100
850001	contig_9185_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_166904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAATCAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364940	366262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_364900_366300
850004	contig_5586_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_143528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294521	293778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_293800_294500
850006	contig_11677_pilon	-	1379	5	Intergenic	novelGene_85914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.11803398874989	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	53	661	583507	582001	FALSE	5	TGCCTGCTTGCACTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGLGTRESHSCPQQVPMTLGQEAQRVICGIDSSMVLTVPGRALACGSNRFNKLGLDHLSLGEEPSPHQQVEEALSFIPLGSAPLDLEPLLSVDLGTAHSAAVTASGDCYTFGSNQHGQLGTSARRSSRAPCRVQGLQGIKVAVVACGDAFTVAIGAEGEVYSWGKGARGRLGRRDEDAGLPRPVQLDETHPYTVTSVSCCHGNTLLAVRPVTDEPVPP	583559	581282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_582030_582426_582586_582759_582919_583009_583174_583409
850008	contig_5779_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_106508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228296	229069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_228300_229100
850010	contig_3975_pilon	+	1750	3	Intergenic	novelGene_54728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	8.5	13	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	122	505	1610001	1614008	FALSE	25	CTCAATATTGTTCATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAPSPEEKLHLITRNLQEVLGEEKLKEILKERELKVYWGTATTGKPHVAYFVPMSKIADFLKAGCEVTILFADLHAYLDNMKAPWELLELRTSYYENVIKAMLESIGVPLEKLKFIKGTDYQLSK	1609879	1615253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1610058_1613560_1613708_1613828
850012	contig_12340_pilon	-	879	4	Intergenic	novelGene_122102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	15.9652400197707	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	4	576	42866	23739	FALSE	70	CAATTTAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAGAPEGLVFVSPPDEEMATGADDPASVPAAPREDFRVLCTSKRAVTEVLELCGRFVQQLGDALPEKIREPALRDAQWTFESAVQENVSINGGAWQEASENCSMDSDIKVLEDQFDEIIVDIAMKRKQYPRKILECVIKTIKAKQEILKQYQPVVHPLDLKYDPNPGESIFICGNNKVSAYDFYGCLIVS	42869	23435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_23868_26700_26832_32416_32496_42632
850013	contig_6058_pilon	-	998	6	Intergenic	novelGene_172419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	234.607246264901	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	663	956	390928	387884	FALSE	40	AGTAAGTAGTCATCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECREVETKKRVMSHPE	398017	387841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_387925_390675_391174_391224_391339_392479_392667_395659_395744_397985
850014	contig_2332_pilon	-	1985	16	Intergenic	novelGene_58700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_9	11.9647630797921	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1956	28	1983	634378	590350	FALSE	30	ACATCCCAGCAGAGTCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPVRSDPSDMQFSMMKTDDRTSATESTISVVVGKKTLFLFNLNEPDSPIDLEFQQRYGTIVCYSWYGDGYIMIGFSCGIFVVISTHIREIGQEVFQARDHKDNLTSIAISHTLNKAATCGDNCIKIHDLAELKDMYAMINLDDENKGLGTLSWTDDGQLLALSTQTGSLHVFLTKLPILGNACSTRIAYLTSLLEVTVANHVEGEPPITVSVDVEPNFVAVGLYHLAVGMNNRAWFYVLGENVVKKLKDVEYLGTVASICLHSDYAAALFEGKVQLHLIESEILDAQEEREARLFPAVDDKCRILCHALTGDFLIYGTDTGVIQYFYIEDWQFVNDYRHPVSVKKIFPDPNGTRLVFIDEKSDGFVYCPVNDATYEIPDFSPTIKGVLWENWPMDKGVFIAYDDDKVYTYVFHKDTIQGSKVILAGGTKVPFSHKPLLLYNGELTCQTQSGKINNIYLSTHSFLDNLKDVGPDELRQMLTQTLMLKRFSDAWEMCKILNDNAAWNELARACLHHMEVEFAIRVYRTIGNVGIVMSLEQIKGIEDHNLLAGHLAMFTNDFNLAQDLYLASSCPIAALEMRRDLQHWDSALQLAKRLAPDQIPFISKEYAVQLEFTGDYVNALAHYEKGITGDNKEHDEVCLAGVAQMSIRMGDIRRGVNQAF	634405	590347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_590434_592716_592775_596077_596188_598589_598701_598893_599054_601521_601727_601854_602003_606632_606783_609284_609408_610442_610550_612198_612314_612405_612579_613050_613122_631649_631824_632073_632187_634324
850015	contig_5338_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_114565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTCTGAGAGTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346965	345106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_345100_347000
850016	contig_1107_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_126561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAGAAAACCCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244618	245718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_244600_245700
850017	contig_9656_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_121935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCCTAAACCCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446840	448074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_446800_448100
850018	contig_19848_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_173820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	37	297	52136	52396	NA	20	CTCATTTTGAGTCTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLFNDLLLSSHVMSLMASHSLSGLWSLVFSASNLFLRWSLNSGGIYSRSYFGSCGLVLIFFSFSLNLHMNNGWSVLLLAPGLVLTDDIELFHHLFPQM	52099	53036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_52100_53000
850019	contig_5958_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_140089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGCCTCCCCTTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180241	181979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_180200_182000
850020	contig_6842_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_130816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743729	1744582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1743700_1744600
850022	contig_10437_pilon	-	729	2	Intergenic	novelGene_38480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	39	452	1205322	1204909	FALSE	25	GACTCTCATATGAGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRKGPTWGSERMLSGRLVRRLVSMAGRVCLSRGSAGSATVGPVEAAIRAKLEQALNPEVLELRNESGGHAVPPGSETHFRVAVVSARFEGLSPLQRHRLVHDALSEELAGPVHALAIQARTPAQWRENPQLDASPPCLGGSKKTRETP	1205701	1204631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1205326_1205666
850027	contig_20662_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_177647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGTATAAGAGAATAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71862	71129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_71100_71900
850028	contig_20506_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_149730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGTAACATTGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13247	13497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20506_pilon_+_13200_13500
850029	contig_1331_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_37884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATCTTATCTCCAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462095	462783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_462100_462800
850030	contig_7943_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_173127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTATTACTTTGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74548	73176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_73200_74500
850031	contig_987_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_72258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCGCACACCCCCGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405284	406190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_405300_406200
850032	contig_10801_pilon	+	686	2	Intergenic	novelGene_74072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAAGTAGATCACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451885	456579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_452066_456073
850033	contig_8864_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_135963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47545	46822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_46800_47500
850034	contig_2067_pilon	-	576	3	Intergenic	novelGene_158936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGTGAGTAAAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652912	651857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_651941_652172_652520_652766
850035	contig_2067_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_158926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTTGGTGGATTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595178	594936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_594900_595200
850036	contig_16510_pilon	-	540	3	Intergenic	novelGene_139070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	45	1340	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	71	403	235677	234600	FALSE	15	TGTGGGGACTTTGCCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTYAVVQKRGAPEVARPEASGRRVEAAPLYTQVTPRALRPRADTAGVATRAEDARRALTGHARAIQSPVWPGAYEDVANGVQTSGLGFNLRIGRPKGPRDPPAEWTRV	235747	234462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_234668_234893_234969_235487
850038	contig_13542_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_131477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGCTTTGGGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252815	251639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_251600_252800
850039	contig_11702_pilon	-	715	8	Intergenic	novelGene_141985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.122644242594	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	47	715	380753	373302	FALSE	5	GTGAGGCTCTCCCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKVATAACGAAKAVFRPVILCRPWEVVGAHEAPRRSVSSVTSVSEVWRAAHGDDDPWGRHRAGAHAACQVCVQARVCAGGLRGGARELHCRRGGHPQRHHGHPAEPRGPEGQHRNKPQPAAIPQIPKQHSSSVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAHESGRKKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTSIRKAVLASMDNEN	380799	373301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373344_374174_374269_374525_374660_375128_375190_376308_376422_376699_376798_377234_377281_380672
850040	contig_4845_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_53657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAATGGTCCACTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488020	488899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_488000_488900
850041	contig_13004_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_112665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613520	612552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_612600_613500
850043	contig_6440_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_161677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114269	115614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_114300_115600
850045	contig_1264_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_161295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTCCATCCTGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22951	22599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_22600_23000
850046	contig_12120_pilon	+	545	3	Intergenic	novelGene_21448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_2	3	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	11	391	273980	293038	FALSE	20	TACAGTCTGTCTGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEMADEIAKAQAARPGGDTIFGKIIRKEIPAKIIFEDDQCLAFHDISPQAPTHFLVIPKKHISQISVAEDDDESLLGHLMIVGKKCAADLGLHKGYRMVVNEGSDGGQSVYHVHLHVLGGRQMNWPPG	273969	293192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_274091_276213_276319_292873
850048	contig_5935_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_102692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTAATGCCTTATTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813065	814170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_813100_814200
850050	contig_4156_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_88109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATCTTTTACAGATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356101	355349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_355300_356100
850052	contig_15327_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_70810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGTGTGTAAAAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376949	1377327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1376900_1377300
850053	contig_4751_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_173733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTAAATTTCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378316	377665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_377700_378300
850056	contig_11855_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_67038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGCGTGGAGCTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1964729	1965905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1964700_1965900
850058	contig_9940_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_125344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141815	141434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_141400_141800
850061	contig_11003_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_105459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGAATGACTCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452321	450471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_450500_452300
850062	contig_9389_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_84000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	43.5	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAGGAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500291	503007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_500333_501297_501428_502011
850063	contig_6631_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_174296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATATAGCACATGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885616	884311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_884300_885600
850065	contig_6269_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_170537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATGAAACAAATATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179239	177571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_177600_179200
850066	contig_20332_pilon	+	756	4	Intergenic	novelGene_156190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	381.513652005622	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	132	449	642243	644522	FALSE	30	TTAAACCATGTATGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLLELKVHGF	642111	644829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932_644035_644501
850067	contig_987_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_72356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTTGAGATTTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297618	1297254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1297300_1297600
850068	contig_3754_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_146846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTCAGGTATTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426928	427837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_426900_427800
850069	contig_13526_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_165200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGGGAGGTTCTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139313	139799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_+_139300_139800
850072	contig_11068_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_130559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGCACAACTTCCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722351	721461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_721500_722400
850074	contig_7943_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_173130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76070	75181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_75200_76100
850076	contig_10437_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_38095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTCACCAGCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37069	36532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_36500_37100
850077	contig_5690_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_119664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTCAAATTTCTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114654	113781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_113800_114700
850079	contig_6069_pilon	-	762	3	Intergenic	novelGene_8057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	33.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAAGAATCGTGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416729	414935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_415466_416004_416091_416583
850080	contig_11292_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_109481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTTTTTGAAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475335	474109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_474100_475300
850081	contig_11492_pilon	+	839	3	Intergenic	novelGene_152268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_2	42	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGAGCACCTCGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483575	487121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_483876_484297_484356_486640
850082	contig_12620_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_98819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTTTGTCAAATAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507409	508113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_507400_508100
850085	contig_12142_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_147823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133883	132776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_132800_133900
850086	contig_4232_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_63258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCACAGCCTTCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419535	420237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_419500_420200
850087	contig_20739_pilon	+	839	5	Intergenic	novelGene_83167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_1	163.562679117212	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	318	839	166924	180348	FALSE	50	ACTATTCTAGAAATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSEDEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIKKRKNCRGPSLIPSVKQEKRDGSSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAV	93970	180348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_94228_166863_167024_179289_179436_179848_180056_180279
850089	contig_5815_pilon	+	238	3	Intergenic	novelGene_141226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGAACGTTCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040934	1044247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041349_1041440_1044121
850090	contig_8640_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_117730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23028	23813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_23000_23800
850091	contig_10042_pilon	-	757	3	Intergenic	novelGene_79257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	4	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAATGTGTGCGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1269633	1242687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1243197_1254216_1254384_1269552
850092	contig_9189_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_165106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	134	301	260370	260203	NA	30	GAGGGCACTGGTCACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPAGLLIAPRGILVFLELDPSNTLGGPAEDLESASLFYLSVSGMRKSPIMSSHFTFQNWKLVTLCLLVIGIVWGVLALSSRFYPAASVLGGKYKQEWA	260503	259441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_259400_260500
850093	contig_1406_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_25508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCCATTGTATTTCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1460844	1459446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1459400_1460800
850094	contig_2312_pilon	+	659	4	Intergenic	novelGene_160750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTAGCGTCGGTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482597	495782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_482836_490592_490810_493535_493674_495716
850095	contig_13403_pilon	+	1081	4	Intergenic	novelGene_158086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	6.59966329107444	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTACAACCAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48916	80683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_49160_63069_63215_75081_75331_80239
850096	contig_6496_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_103504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAAAAAAAAAAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610569	609635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_609600_610600
850097	contig_10976_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_155609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGTAACTGCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249133	249992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_249100_250000
850098	contig_6266_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_170993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACAACACAGTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503523	504963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_503500_505000
850100	contig_18970_pilon	-	562	4	Intergenic	novelGene_157810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	81.5938450837779	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTAGGGCCCTGAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38915	27878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_28041_31659_31813_33342_33462_38787
850101	contig_1244_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_37940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765125	764137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_764100_765100
850102	contig_8636_pilon	-	818	5	Intergenic	novelGene_141924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.808669717323	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	375	707	391928	384902	TRUE	5	CCGGGTGGTGCTGGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKHHPDLIFCRKQAGVAIGRLCEKCDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSYQGRCVICGGPGVSDAYYCKECTIQEKDRDGCPKIVNLGSSKTDLFYERKKYGFKKR	392302	384411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_384492_384870_384992_390530_390698_391414_391439_391876
850103	contig_1339_pilon	+	291	4	Intergenic	novelGene_163133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4815	junction_1	2683.83759237071	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGCCCGAGCCACACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430921	433724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433677
850104	contig_4388_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_161945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAACCTGAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221329	220295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_220300_221300
850105	contig_13496_pilon	+	1115	6	Intergenic	novelGene_107623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	458.912453524635	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	149	1114	225105	378803	FALSE	85	ACCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGKLNMHMNVQNGKWESDPSGTKTCIGTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHAHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLADESDSVDSADAEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVRGNPLFAWIFLFLREKNSPYLSLKLSIHFTTTAFP	224956	378804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_225162_285095_285264_309234_309365_343908_344022_347585_347780_378499
850107	contig_12977_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_122820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACCCCCAAACCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156540	157665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_156500_157700
850108	contig_8822_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_117940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAGAGCATAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209840	210185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_209800_210200
850110	contig_7357_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_36862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGATCGTCTCTCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208701	209268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_208700_209300
850111	contig_7357_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_36863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTTCCTTCTGGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209320	209760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_209300_209800
850112	contig_4364_pilon	+	652	3	Intergenic	novelGene_172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2	433	1266998	1270512	TRUE	30	CCTCTGACCGGGAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDGQAGGWGSATFVISCRREREAARSNPPVSACGRRGGPSLRCGHRGQRLVAASACAVGQAAQATLPFLYPGSCQLSGRRVVWGVTGAQCPSEPLRVPRLSPASPPAPGTWSPPRCCQSPCNHDALTCGVRAGPSLTSYPVSA	1266996	1271045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267110_1270192_1270620_1270933
850113	contig_5482_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_144497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGCAATATTATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569941	568279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_568300_569900
850116	contig_15970_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_144056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185657	184720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_184700_185700
850117	contig_10148_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_172870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTTGCCCTAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311396	311102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_311100_311400
850118	contig_7682_pilon	+	1451	2	Intergenic	novelGene_177649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGTTAGCAGCATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15271	17058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7682_pilon_+_15573_15908
850120	contig_11171_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_48586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAATTTCACCAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120777	121026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_120800_121000
850121	contig_7870_pilon	-	315	4	Intergenic	novelGene_108967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	416.654399819429	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	441793	364867	FALSE	70	AAGAAGAAGAAAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQASQIE	441793	364866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364884_370811_370890_402901_403001_441672
850122	contig_15508_pilon	-	961	4	Intergenic	novelGene_177650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	14.9666295470958	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGCTTACAAATCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102093	72774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15508_pilon_-_73253_73480_73606_90012_90174_101896
850124	contig_12414_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_59666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATGATATTTTAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794663	793602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_793600_794700
850125	contig_12638_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_33270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTGGCCCAGCTCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844531	842917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_842900_844500
850127	contig_9840_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_173758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACTTGCCCTGGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52117	51198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9840_pilon_-_51200_52100
850128	contig_20293_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_153516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATACAGTCCAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38069	38885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_38100_38900
850129	contig_15326_pilon	+	987	3	Intergenic	novelGene_157708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	14.5	100	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGAAACATTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93377	104323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_93915_101708_101777_103941
850131	contig_4388_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_161995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCCTGCATCATTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311333	1310919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1310900_1311300
850135	contig_11447_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_168105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544114	544354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_544100_544400
850136	contig_7272_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_25388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAATCTGTGTCTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738697	737652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_737700_738700
850138	contig_12292_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_166996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGCCATCAAACAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225234	224317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_224300_225200
850139	contig_8697_pilon	+	202	2	Intergenic	novelGene_83198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAACATAAATGCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16458	18216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_16575_18130
850140	contig_6446_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_149249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGATAGGCTGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613850	614546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_613800_614500
850141	contig_4244_pilon	-	1134	5	Intergenic	novelGene_175899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.0078099585228	25	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	280	717	30203	26674	FALSE	15	GTGTAGTTTTGTGATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKGFEKVKDVQYIYTPLDSSLCGVKLEANTQKQYLLTGQVLNDRKVFIHLCNYIEPWENLSLLQRESLNHHYQLNCGCQITTCYTVPCTISAPNECLWTDWLLQRKLYGYQAQHYVCVKHVDGTCRWYQGHLPLRKEFVDIIQP	32003	26256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4244_pilon_-_26872_27534_27660_30088_30204_30655_30732_31800
850142	contig_12151_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_54967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	41	430	967204	967593	NA	20	AGTGGGCCTTAACTCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGFSSRKAAGWVLTANLWVSSPELNHYTTRAPFYIIKVAMIAAFSFPSLCRSFLLLPSVYLTVSWLKHGLLPKSYLYHLKQFSIPNDNQVLYFSIVIKHILGEIWTSNIFLTPNKQNNCYQNEMSRS	967163	967712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_967200_967700
850143	contig_2125_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_147716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410440	410148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_410100_410400
850144	contig_11259_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_144518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATATTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112612	111460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_111500_112600
850145	contig_18967_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_165321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCCAGCTCTGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78612	78082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_78100_78600
850146	contig_504_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_54438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAACCGTCTCACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228873	229332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_228900_229300
850147	contig_11832_pilon	+	294	2	Intergenic	novelGene_106947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCACGTCTTGGATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122553	135962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_122812_135926
850149	contig_11832_pilon	+	1143	6	Intergenic	novelGene_106953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	33.9022123171925	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	43	369	180346	183965	TRUE	40	ACCAAACCAGTTGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILCSQQHLAAPLVMLKLQPDGKLLSMVIQLQLPRVGSPPPPLFLPTDTPMVWLLAKCWVRSSDFQLYELQSHLLRGHLMAEVFAVATMRCLPSITSYLQGGEHRWRRPCGAAQASWSLSNL	180303	185887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_180394_181608_181820_183897_184068_184222_184345_184937_185039_185438
850150	contig_14925_pilon	+	310	2	Intergenic	novelGene_55055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	586	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCCTTCTGTGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3187	11995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_3364_11861
850152	contig_12761_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_164042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAAAACACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27559	26603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_26600_27600
850153	contig_10861_pilon	-	540	5	Intergenic	novelGene_39356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1504.41057810027	12	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	441	491	1581647	1581171	FALSE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1584636	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584525
850154	contig_6902_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_135614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	243	677	533908	533474	NA	20	GCCGGGGGGCGTGCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAPRNIHLDNLQRRISLRSHKLTVEFRNRNQRTRCGGCTLLSTIDPICFSLALQVPCQSQPWGSRGRGSQGPSSAVYSTVLSSGRDCTDVAGATEGDNREATAPCGQGTLRVTPDLRLLPLLWWQPPSGPGCGSGGRRSRKGA	534150	533414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_533400_534200
850157	contig_4857_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_48914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1749341	1748250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1748200_1749300
850160	contig_12019_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_87769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAATTGTGAATTAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690650	688989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_689000_690600
850162	contig_5947_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_101472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72752	73327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_72800_73300
850163	contig_5278_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_139766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAACAGTTTAGCCCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111507	110714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_-_110700_111500
850164	contig_1910_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_168274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCTTTTCATCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38496	38696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_38500_38700
850165	SIRV3	+	423	3	FSM	SIRV3A	SIRV305	436	3	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9581	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4016	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_4081_4568_4780_6570
850166	contig_8712_pilon	-	1112	2	Intergenic	novelGene_58868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTGTGGTTACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867167	865547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_866451_866958
850167	contig_11449_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_170555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCTGGATAATAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154173	155522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_+_154200_155500
850168	contig_5039_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_64794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCCCAACTCCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164272	163436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_163400_164300
850169	contig_8174_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_160057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGAAAAAAAATGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285412	285707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_285400_285700
850170	contig_1331_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_37866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316803	317090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_316800_317100
850171	contig_3787_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_102360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAACTCTGCAGTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208600	207805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_207800_208600
850173	contig_6496_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_103514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAGAAAAAAACTTACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833437	832105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_832100_833400
850175	contig_8801_pilon	-	1045	3	Intergenic	novelGene_66243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	1	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	360	722	187142	181046	FALSE	5	CTCCTCAGCTTCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEDCEVVPADHVIVTVSLGVLKREYTSFFRPGLPAEKVAAIHRLGIGTTDKIFLEFEEPFWGPECNSLQFVWEDEAESRTLTYPPELWYRKICGFDVLYPPERYGHVLSGWICGEEALVMEKCDDEAVAEICTEMLRQFTGNPSIPKPRRILRSAWGSNPHFRGSYSYTQVGSSGADVEKLAKPLPYTESSKAAPMQVLFSGEATHRKYYSTTHGALLSGQREAARLIEMYRDLFQQGT	187501	180722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_181184_183962_184124_187078
850176	contig_7622_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_132425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269768	270583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_269800_270600
850177	contig_9363_pilon	+	674	4	Intergenic	novelGene_6649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.18241233033047	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	49	636	963791	965935	FALSE	15	TTGGCCGAGTCTGAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVADYPGQSPRAARESMGTTWASPGWARLALCLAGFGLSLYALHVKAAHARDKDYRALCDVGTAISCSRVFSSRWGRGFGLVEHVLGPDSVLNQSNSIFGCIFYTLQLFLGCLRGRWTSILLVLSSLLSLAGSVYLAWILFFVLYDFCIVCITTYAINVGLTVLSFRGERPATCCHHISPQTMDQMCHPPSSALVLLALSSRAGFLISPIA	963742	965973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_963964_964729_964840_965511_965686_965804
850179	contig_11100_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_175539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTTACCAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230655	231044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_+_230700_231000
850180	contig_2689_pilon	-	266	2	Intergenic	novelGene_100812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGGCCATGAAGCACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2313	1851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_1861_2056
850185	contig_14569_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_165421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	396	422	353618	353644	NA	70	TATTTAAAAAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRTTSLCTRCGAPRLRPLPTVNARPTTTRRGSARGPTGTAGNDGDRLGLDPALPCALPRCPCGRALVLAWSRRGEPRVSDPAQWQAHPLAGQDHRQGLGSLVALPASWATQLFADLGSISIPYVRVKAQIVMAMENRGP	353222	354355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14569_pilon_+_353200_354400
850186	contig_6375_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_72920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGATTCTATACGTAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9994	9714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_9700_10000
850187	contig_1996_pilon	-	598	3	Intergenic	novelGene_131887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	28.5	179	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTGGGGCTTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170925	170162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_170421_170489_170603_170698
850188	contig_10734_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_51134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGAGGTTGCTGTCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850474	851158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_850500_851200
850189	contig_9527_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_134044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGCCCCTCTGGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318737	318000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_318000_318700
850190	contig_8365_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_150921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACTTTCAAAAAAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151199	152389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_151200_152400
850191	contig_15384_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_85111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAGAAGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68617	69210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_68600_69200
850192	contig_8683_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_150244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGCCTAGCAACCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476223	477520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_476200_477500
850194	contig_2703_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_101764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCATTTTTCTATGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586104	588059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_586100_588100
850195	contig_13412_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_80010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTCCCTGTCCAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363816	364703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_363800_364700
850198	contig_11602_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_166588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCGCTTTTTAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120902	122234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_120900_122200
850199	contig_10434_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_82021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCATCCATTCTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103118	102721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_102700_103100
850200	contig_10082_pilon	-	847	6	Intergenic	novelGene_63897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	33.7899393311086	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGAAGGATCTGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441199	424819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_424921_430299_430437_430563_430681_434677_434752_440433_440776_441123
850202	contig_12142_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_147829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGATAAAATGGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150465	150069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_150100_150500
850203	contig_14822_pilon	+	1220	9	Intergenic	novelGene_145428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.05326872164704	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	194	799	196511	197635	TRUE	0	TCCTCCTTGGTGTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGTGSARWRLCPGSGEVCNIWRLQLPPDIRLSRGCGLSWAVLRYPWLGEQGHKIPGARPLPQDMSRSLSWSEQLDVLLNATDGNVARIKRRLYPLGVSTAAGDLAGTWTSPVYLPPQSGVRAQQPWVLKTPPTVPEGLSWAEAHSPSSVWDAVTILQSQLRSQAQVIEALRQAVQGLLEEREHQKYQICALEASLRLLQGGPERRVLLLEQRLEGLRRGLEGLRRELQGLRSQVQEQAQAQAQKQPGPGKYSATSGLYQELQNE	196191	199488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_196294_196419_196589_196676_196711_196878_197073_197175_197258_197417_197636_197748_197817_198044_198113_199203
850204	contig_14666_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_39541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2524	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACTGAGCCTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450811	449389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765
850205	contig_17964_pilon	-	822	7	Intergenic	novelGene_33916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	216.194164275234	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	384	821	468667	397891	FALSE	65	AAAACGACAAAAGTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEAVPLRNSSLQMSLSYAAVQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSD	473136	397889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_397915_411236_411416_412391_412501_413439_413494_431364_431434_468664_468944_473029
850206	contig_10424_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_56789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	210	512	225016	225318	NA	25	TACTGTGTCAGAGGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPIPRSNNSPFQITEPRSGGVERMQLLLNKGITGGKPVQTAKRKLLMFSLKFHLSRGPGMLCKLQRLHIVSNITLNTRSKHTVILLQRNQSPKITLREE	224806	226412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_224800_226400
850207	contig_6269_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_170543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTGATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287093	288204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_287100_288200
850208	contig_9785_pilon	+	1051	4	Intergenic	novelGene_157888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	102.503116483787	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	179	868	195113	236466	FALSE	45	TGAAAAAAAAAGCCTCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRDTLVHLFAGGCGGTVGAILTCPLEVVKTRLQSSSVTLYISEVQLNTMAGASVNRVLSPGPLHCLKNRGEKRMGAFECVRKVYQMDGLRGFYRGMSASYAGISETVIHFVIYENIKQKLLEYKTASAMEEDEESVKEASDFVGMMLAAATSKTCATSIAYPHEVIRTRLREEGTKYRSFFQTLSLVVQEEGYGSLYRGLTTHLVRQIPNTAIMMATYELVVYLLNG	194934	236649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_195154_214250_214416_235070_235361_236272
850209	contig_4891_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_124610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	560	1027	1065891	1065424	NA	25	TTTTATTATTATTATCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSIHTQTLSADLDCGRSEATLQASLTTSICVPPPLLLFAPSLLLSFSSFLPSHGPCPHPLAPPRSTVKAAQDWPPWQLLRRGQGLFTFSGLEDPCLTCRYPKAPESEDKEGQTPLYRSLCNSTRFAKLCSNATRHGKTLVASHSQQYLVWSDL	1066450	1065310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1065300_1066400
850210	contig_513_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_80118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAGTGTCTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79949	79064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_79100_79900
850211	contig_1090_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_131099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATGGATGACAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152822	153557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_152800_153600
850212	contig_5758_pilon	-	1120	3	Intergenic	novelGene_119099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_2	13	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	111	383	220654	214843	FALSE	10	TTTTCTCTGCTTTTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPRLVVDIGFMCIG	231419	214105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_214976_220514_220696_231350
850214	contig_593_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_102034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562162	561368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_561400_562200
850215	contig_3627_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_78487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACACACACAGTATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495441	496574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_495400_496600
850216	contig_18869_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_56051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73566	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_73600
850217	contig_9206_pilon	+	982	6	Intergenic	novelGene_137498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.9839935948749	80	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	272	982	339346	359759	FALSE	10	GAGGTTTTTATGCGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGGRRKKEVSRMALPQGLLTFRDVAVEFSQEEWECLDPAQKTLYKDVMLENYRNLVSLGISVSELNIISVLEQGTEPWTLEGKEKIAKYPDVSPTWVNKILSAKENINKGELLKTMMNGIEDFDFRKVREDVPEFESQWGDIESNYKGVTMTLNKNFTCRKDHDKTDVGNKYMKCFENTIGLRFQLHLDEIQSCQTEEKMYESNQDEQSVSNGSSVSPLQTLSPSVKTNICNKYG	334540	359759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_334585_338085_338281_339313_339400_349581_349709_350330_350427_359325
850219	contig_5935_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_102705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACATCGAAAAGAAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965437	964860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_964900_965400
850221	contig_10962_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_103890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	274875	275171	NA	30	TCCATGTTTAGCCCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAEHPSQWIRRETGGGCPELEGDRWTNCHPNRVYIQIKESQAFHFFICGLHKTYYNVCQASSPLFPPSSAETSSRRVQITKCFRIPNLVLLRVPSLD	274873	276045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_274900_276000
850224	contig_6325_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_143374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCAGAGGACGCAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541498	540940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_540900_541500
850225	contig_4388_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_161981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTTCTTTTCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296563	1295128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1295100_1296600
850227	contig_4751_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_173731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGGAGAATAGAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335630	336708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_335600_336700
850228	contig_7919_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_28103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGGGTTAACAGCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332237	1332720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1332200_1332700
850229	contig_12119_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_88635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGTATCTATAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94129	95266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_94100_95300
850231	contig_5921_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_142262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACTCCAAGTTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489945	488687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_488700_489900
850232	contig_17060_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_176336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGGGGTGGAAAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070	442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17060_pilon_-_400_1100
850233	contig_17060_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_176335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17060_pilon_-_0_300
850235	contig_7704_pilon	-	1310	8	Intergenic	novelGene_154616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.11121418177355	36	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	359	904	325040	320997	FALSE	25	TGGAAAACTCGAGGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPDRSEAGETGEELDLQLRLAQSSPPKVLTPQPSPGSGTPQARTPSPSRSRDSNSWPDEPSLDKKEEEPWRQPEQEPITRQCLDSTDQSEFTLEPHLLVADLLYWKDTRTSGVVFTGLMVSLLCLLHFSIVSVAAHVALLLLCGTISLRVYRKVLQAVHRGDGANPFQAYLDVDLTLTREQTERLSQQIASRVVSAATQLRHFFLVEDFVDSLKLALFFYILTFVGAVFNGLTLLILGVIGVFTFPLLYRQHKVQIDQYVGLVTNQLSHIKAKIRAKIPGTGALASAAAAVSGSKAKAE	328095	320590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_321079_321477_321537_324033_324081_324186_324257_324374_324514_324891_325100_327687_327946_328054
850237	contig_10437_pilon	-	470	2	Intergenic	novelGene_38431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCTTAGCACATGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837975	837403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_837789_837890
850238	contig_15500_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_128987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	297	635	222681	222343	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLSYYSFFPKKKLGKKQHLYASISDALSFRNVTLRTYMFSAKACTASGLPLWRKLRVFQHFQDTVWVNLRAEHRLADPFGFRTKLYSAISFLNTQVDNLLSSCVPSLIWF	222977	222259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_222300_223000
850239	contig_3825_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_77990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGTCCAATGTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723772	723265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_723300_723800
850242	contig_7961_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_173124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTCTGACATGATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180318	181022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7961_pilon_+_180300_181000
850244	contig_18859_pilon	+	962	4	Intergenic	novelGene_150552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	25.9529488797623	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	43	558	170532	216927	FALSE	80	CTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLDKRGLRITVLLTSFLMVLGTGLRCIPISDLILKRRLIHTGQMLNGLAGPTVMNAAPFLSTTWFSADERATATAIASMLSYLGGACAFLVGPLVVPAPNGTSPLLAAESSRAHIEDRIETVLYAEFGVVCLIFSATLAYFPPRPPLPPSVAAASQRLSYRRSFCRLLR	170489	217331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_170554_180659_180754_212611_212878_216793
850246	contig_3469_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_34186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATACTGAAGCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459897	460284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_459900_460300
850247	contig_11742_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_166544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127624	127176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_127200_127600
850248	contig_8330_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_72003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGCATGCCCAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2122868	2121644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2121600_2122900
850249	contig_10777_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_101171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAGTTGAGGGTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44540	43986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_44000_44500
850253	contig_2463_pilon	+	1069	2	Intergenic	novelGene_42995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAATGCAAAGTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11248	13120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_11315_12117
850254	contig_3942_pilon	+	484	4	Intergenic	novelGene_128701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.056324406641	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTTGACAAGTCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426588	430177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_429528_429602_429798_429853_429936
850255	contig_7009_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_23588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAGTACAATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314037	314406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_314000_314400
850258	contig_16714_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_161555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAACAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561537	561972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_561500_562000
850259	contig_14300_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_133152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGGCCCAGTAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590096	591341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_590100_591300
850260	contig_14300_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_133153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAGGATGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591950	592188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_592000_592200
850262	contig_5988_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_15988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCAGTCCAATAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675143	676119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_675100_676100
850263	scaffold_4805_pilon	+	755	2	Intergenic	novelGene_161033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	59	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAGTATTAAGGAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533889	534889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_534121_534365
850264	contig_3942_pilon	+	1477	2	Intergenic	novelGene_128829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	252	1043	1197026	1198465	FALSE	15	GCACCGTCTGCTTAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTAHLSLKGWFLRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRIVMLIVVVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTHIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYQETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCKSCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAVVYSCRDAEMRRTFRHLLCCLCLRRSTHESARYTPSYQTGASTRIMLPENGHPLMDSTL	1196774	1198899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1197504_1198151
850265	contig_9724_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_172583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22586	21681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_21700_22600
850266	contig_6451_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_173698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73090	74173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_73100_74200
850267	contig_12886_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_135507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAGCAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600405	600971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_600400_601000
850271	contig_5145_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_131367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCCATTGTGAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521637	520378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_520400_521600
850272	contig_500_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_30934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTAAAAATGGTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195048	1195988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1195000_1196000
850273	contig_10437_pilon	-	998	2	Intergenic	novelGene_38132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAACAAAGAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148856	142823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_143696_148730
850274	contig_10953_pilon	+	245	3	Intergenic	novelGene_42553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	3287	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTACGCTGCCATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419997	423262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202
850275	contig_5297_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_175674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	78	461	96836	97219	NA	15	CCCCATGTGTGTTATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSGRVDSGRQCGQEREVNWGCSRLHGADWLERSCAGPLAAPDPRRREAALGDLVLASVLTSHIGSDHGCGRPLSCENQCLFFLETQFSTVRLRLESHCLQRFRSAASSPTTPVGRRSRVFDFQFF	96758	97433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_+_96800_97400
850276	contig_20756_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_176927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	3	620	12925	12308	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVVTGSEVRANPGTIASSRDHCPTSSRPPLQPSPPRSRGHLCLQALTCLQPAQGSGPCPSHPGDSHILVSPALRGPAPPTSQRPLPPPALWAPPTSTGTGPAAQRATSQLSAHWSQKTWPLRTPAPHGAPQLLSPGHPYNPVDPPAPRAPLSVHSRSAAWASCARHVELLPSQAPHPLGSPSERKPWDQTDNSSSEEGQEAQGQ	12927	11860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_-_11900_12900
850277	contig_12128_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_131966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCCCCCATAAAGAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129864	128811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_128800_129900
850278	SIRV2	-	378	2	ISM	SIRV2A	SIRV204	740	3	556	14	556	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGACGTTTCAGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4176	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966
850280	contig_11056_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_130353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACAAGTATCTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102426	101575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_101600_102400
850281	contig_5758_pilon	+	1053	2	Intergenic	novelGene_119063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTAATGTTGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67940	71923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_68450_71379
850283	contig_1856_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_84888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGCTGAATCAGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325163	326705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_325200_326700
850284	contig_12635_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_60828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAGACAGCTTTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250814	249867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_249900_250800
850285	contig_6375_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_73063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAGGAAGTCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680250	679539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_679500_680200
850288	contig_333_pilon	-	1278	2	Intergenic	novelGene_170914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTCCCAGGTCCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17740	14972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_-_16183_17672
850289	contig_7887_pilon	-	1130	3	Intergenic	novelGene_124875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_1	3	62	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	294	395	222183	221540	TRUE	15	GAAACTGTGTGTGGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGGRLAQSLRGGLGGGPPPAPAAPTSPPTSGGWWEQLTQASQVYASGGTQGFPLPRWGPRRHGTAAEGAQERPLPTEEAAPGRGVWLGRLFGVPGGPMETESGTLKFRRPSSWLPPTVSVLALVKRGGTS	222476	219312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_219988_221479_221610_222151
850290	contig_10058_pilon	+	587	4	Intergenic	novelGene_67704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	28.0515398666257	824	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	28	438	54227	55382	FALSE	25	GTCTTGGAAGCATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVPGRAGEMLRKATCRLGASLLRLITARTMAGVPTVSFLELRSLLSSGRARLIDVRSREEAAAGTIPGALNIPVSELESALQMEPAAFQALYSAEKPKLEDKNLIFFCHLGKRGFQATQLARGLGYTGACNYAGAYREWLEKMG	54199	55531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_54300_54474_54598_55084_55248_55330
850291	contig_5586_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_143624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTTGCTCTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884943	884682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_884700_884900
850292	contig_12050_pilon	-	805	2	Intergenic	novelGene_62672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	52	492	447086	446646	TRUE	20	AATATCCTGTCCTGTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQMKDSSFLPFALALLVGGRADWPGIGVAQPLAGGPVPGTRMTGGRAFAGHEVPCWAMRSARLSPAGQLGPLGQAGVWRQGCCADTGCSLVVSGGSLPAASWRPQSICISDASTWGPPARPAHPEGPARLPQLSCATSASLCVSL	447137	446060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446292_446563
850293	contig_16076_pilon	+	771	3	Intergenic	novelGene_173864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	32.5	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	318	770	148529	222517	FALSE	40	GTAGAGAATCCAGAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGGVVEVLGRAYPQDDHTNLTRKVLSKVGRNLHNQQHHPLWLVKERVKEHFYKQYVGRFGTPLFSVYDDLPPVVTTWQNFDSLLIAADHPSRKKGDNYYLNRTHMLRAHTSAHQWDLVHAGLDAFLVVGDVYRRDQIDTQHYPVFHQLEAVRLFSKHELFAGIKDGESLQLFEQSSRSAHKQETHTMEAMKLVEFDLKQTLTRLVTHLFGDGLEIRWVDCYFPFTHPSFEMEINFRGEWLEVLGCGVMEQQLVNS	148211	222518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16076_pilon_+_148691_192404_192565_222386
850294	contig_7131_pilon	-	908	3	Intergenic	novelGene_175336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAAACCCTTTGCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128642	126982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_-_127294_127565_127623_128102
850298	contig_15897_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_49543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTAGTTAAGCTCTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640947	640558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_640600_640900
850299	contig_6838_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_171790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42373	43547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_+_42400_43500
850300	contig_3787_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_102401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCACTATTTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510863	509991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_510000_510900
850302	contig_5935_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_102678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTATTAAAATATGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731053	729813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_729800_731100
850303	contig_8681_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_157206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAATTTTTTTCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192120	191314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_191300_192100
850305	contig_4962_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_107397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	446752	446429	NA	60	CTGTTTAAGAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRNQFGSLLSEFAVRVAWSLHSTAAQLRAAGAYQAPGVIATNPAAKAQRRPSGGNHRYDAHHWRYGRGTIVTVRTIGLWVVGRRPTGSNYSTAHSIGLGNQKDHVR	446752	445614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_445600_446800
850306	contig_6509_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_145656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCTGCCCCCCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192272	191704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_191700_192300
850307	contig_8571_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_169159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAAAAAAAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343718	343167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_343200_343700
850308	contig_12671_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_19205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACACGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157773	158694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_157800_158700
850310	contig_2646_pilon	+	1045	2	Intergenic	novelGene_69501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	151	468	353959	354276	FALSE	10	GGCTGACCTCTCACCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQEASVEGSQPTCHGGMKGKALLEKEQHGESVTVLSQPRGPGHVLQPSGTFPSVKQGSSEDLPTSTILHACCPRGSSTRPKTSRALLTPSSSAKIRRESIFLSS	353709	354853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_353820_353918
850311	contig_4686_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_118499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATTCCCTAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384032	384737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_384000_384700
850312	contig_7962_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_149304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTAAACTACAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390411	389546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_389500_390400
850313	contig_6871_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_21641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGGACAAATAATGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675615	676401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_675600_676400
850314	contig_6871_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_21640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGAAGCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674865	675161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_674900_675200
850315	contig_14363_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_112529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGAGACAAATAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145049	144334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_144300_145000
850316	contig_2480_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_63524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240945	240689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_240700_240900
850317	contig_3077_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_26846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGGGACTTCATTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698754	697273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_697300_698800
850318	contig_10163_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_82667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGATCAGGCAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353468	355124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_353500_355100
850320	contig_299_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_129500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616316	1615440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1615400_1616300
850321	contig_8934_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_167247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGGAAAAAGAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699824	699371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_699400_699800
850322	contig_19701_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_147888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATATTCCATTCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77750	79350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_77800_79400
850324	contig_11416_pilon	-	1206	3	Intergenic	novelGene_145345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	37	134	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	373	678	144289	143302	FALSE	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATEETRKVRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQALPLRPPPPPPVNDEPIVIED	144661	142773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_143453_143540_143693_144286
850325	contig_3948_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_53238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	70	384	1000837	1001151	NA	40	TAGCAGCCCTGAAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRRWLEWGLEGSEGTVLRTGPAPRPSQRARSASSGNLCLSPVLRPLLASHPAGENKVGVTGGRASSPKEHSTEEGRTGLILPVLFQTFSEHDQCPLDLHLPS	1000767	1001274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1000800_1001300
850327	scaffold_12124_pilon	-	1125	2	Intergenic	novelGene_22427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	77	565	1647267	1646021	FALSE	20	AGATTCATCTTGTATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSWIPNLTGLKRNPLECRECGKAFMDHSACNHHTRSFTGCNACQYKECGEACSSLSHLTTTMRTLNGKKPHKCQVRGKGFICVSVLKNPVTTLTNEKRCECQKCVKDFCSFSSFWTHMRGQKHECKECCKTYGLSSLILNKKFYNRDKLYECRECMKAFSHKSSLMKHIRTHSGERPYECKEWESL	1647343	1645460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1646035_1646792
850328	contig_302_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_145013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATAAGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82791	83651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_82800_83700
850329	contig_12622_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_5842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456608	455352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_455400_456600
850331	contig_17989_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_150818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTGTTTAGTTGGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204468	203544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_203500_204500
850332	contig_10861_pilon	-	681	2	Intergenic	novelGene_39451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2594353	2593579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2593786_2593878
850333	contig_11417_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_103280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCCTCCTGTTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370299	370813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_370300_370800
850334	contig_9516_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_106157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAACGGGTTTTCTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758465	759105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_758500_759100
850336	contig_776_pilon	-	405	4	Intergenic	novelGene_139932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	50.2150929059736	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAGCTATTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932096	833035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834739_834799_911670_911784_932023
850337	contig_13464_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_125239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATTACTTTCATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241370	242207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_241400_242200
850338	contig_12920_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_166324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	628	junction_1	244.991156302971	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	174	512	68688	169771	FALSE	30	TGGGATACCTTACAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEPRSSLTYRTTGSTCLHPLSELLGIPLDQVNFVACQLFALFAAFWFRLYLSPGKTSPDVRHAFATIFGIYFVIFCFGWYSIHLFVLVLICYGIMVTASIPNIHRYTFFVA	68514	169772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_68784_154408_154555_155550_155629_169752
850339	contig_6635_pilon	+	835	3	Intergenic	novelGene_127025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	95	junction_2	1	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATTATGTGGAGCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467188	472264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_467201_470250_470347_471537
850340	contig_7171_pilon	+	925	5	Intergenic	novelGene_101262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	10.7558123821495	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	115	753	897102	899066	FALSE	15	CCGGTAGGACCTATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGFLCSELQAARLLHLRHPLDPSLAQLLGEETEEGAGMVQELILTLRALGLPRPTPGTPASRLLQELRSKISELLPSLPPGSMQPLLSHPLDARRWEALESLSQSLRDQYRCRRRLLLTRLDLTTSAFHWSDRAKAQGEFMKAVLIPIREVLSPESDVSITHVLAARADLSRLVPATSVAARRGTCCAVNKVLMGSVPDRGGRPNELEAPMPSWQSRREGGDGRRAGHQRWGRKKKKKERGTGGGEGPP	896987	899238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_897201_897428_897507_897592_897710_898046_898215_898889
850342	contig_10235_pilon	-	1125	2	Intergenic	novelGene_46595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	442	870	586774	586346	FALSE	20	GAGAGAGATCTGGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSMDSSVCEEDSSPCGWKLILPSAPGTILPGSSWEHFSAPLLPPHGATCQWRLDSCNSEVSSLPVPRCLGSHTLLGTHGQIGLHTFFSASRKHTPMVQFFSGPGPTQPPAASLYYSNQTQGEEADISCCTHFCSLGTWGRN	587292	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_587014_587090
850343	contig_12620_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_98815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCCCTAAAATATATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464049	464800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_464000_464800
850344	contig_5018_pilon	-	587	5	Intergenic	novelGene_47175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGGGACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1558549	1553469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1553540_1554934_1555048_1555888_1555963_1556044_1556196_1558370
850345	contig_15185_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_99386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTATCTGGTTGTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68865	69226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_68900_69200
850347	contig_11417_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_103339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTAAATTAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630991	631794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_631000_631800
850349	contig_9981_pilon	-	697	3	Intergenic	novelGene_121035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	10.5	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	67	405	147235	142038	FALSE	35	AAGCTTCGTTCATGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSPVGYKSKFRASAPREGFKSKFRASAPAEGFLCQLWRKLHIINLPLVWELLCAGTAGPKDALLSWHCFLGALIGITGSGAIPVRIFAVQRHRMFFRRTCQI	147301	141745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_142068_144760_144826_146991
850350	contig_1982_pilon	+	1070	2	Intergenic	novelGene_151332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATTCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335008	359949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_335121_358991
850351	contig_3818_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_99276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	635021	635428	NA	30	TTAGGGAGGGACAGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGRPFVLSLCFLTDGGILVPALPSPPGCGEGYEWFGDDGCRGQERRGVAGISPVATSHSSHQGQPPLLPSDAEALSPSLCSGLALPRDTVTRSLRTLEPQAQWSLCLPARSPETAPSFCASLFLWGLNTVLLPK	635020	636044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_635000_636000
850352	contig_5250_pilon	-	1554	4	Intergenic	novelGene_176103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.471404520791032	7	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	48	452	551637	421575	FALSE	65	CATGGAAGGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFREHLDKLFAKGIGMLDIALNEAFNVLSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDAIFAKHNWPDRKVRIFTYLIGREAAFADNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDVVWTEAYIDSTVSPRGPWKRG	551684	420472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5250_pilon_-_421742_432579_432659_541418_541533_551592
850353	contig_3747_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_24744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGCGGGGCAAAGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200049	200768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_2e+05_200800
850355	contig_6230_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_102099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCCAGAACTGTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133931	134776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_133900_134800
850356	contig_9471_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_21754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTTAGGGAACACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365904	365649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_365600_365900
850358	contig_6048_pilon	-	493	4	Intergenic	novelGene_73109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	12.4721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	116	442	298705	297545	FALSE	25	CAGCTACTTACGTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDSHGVVIIFNADIPSHLKEIEMWYSCFVQQQLLQDTQCLLIAHHKPGSGSDRGSLSLPSPLNKLKLVHSNLEDDPEEIRLEFIKYLKSIVNSVSESRDREEMSIIT	299241	297493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_297694_298527_298731_299036_299090_299204
850359	contig_10437_pilon	-	601	3	Intergenic	novelGene_38420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.5	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGCCCGAAGGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811523	799139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_799590_810935_811053_811489
850360	contig_6795_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_27716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCATTTTGTGTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146837	145668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_145700_146800
850362	contig_4759_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_106353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAGAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988137	988408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_988100_988400
850363	contig_16970_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_157602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCAGCTTCTAGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90484	91246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_90500_91200
850364	contig_934_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_129007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTTATATGATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40385	39468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_39500_40400
850365	contig_2332_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_58701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATGCTCACTTAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682149	681884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_681900_682100
850368	contig_15146_pilon	-	910	2	Intergenic	novelGene_116933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	282	908	79114	78488	FALSE	25	GCCAGTACGGAGCAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPQGKKPGEGDGDRVTAQLLKAHTGEFALDSILLLKLRGLGLVDLGCLGECLGLEWLDLSGNALTHLGPLAALRQLAVLNVSHNRLTGLEPLAACESLQSLNAAGNLLAGPGQLQCLVGLRGLENLRLRDPLARLSNPLCSSPSYRAMVRELLPGLKVVDGERVAGCGSELYQLCRDLDSCLRPSPSPSPGPQATEAQPWVEPGYWES	96722	78485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_79270_96596
850369	contig_15146_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_116932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	101	430	78174	77845	NA	15	TGTTGTGTTAGCACCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRREARSSPPVVPFREGPALLGLLQSLGSHCSGLRLCGRKLLLPKAHGKKGRDGCVFHPSHSWEGEEHSGKLESPAFQTHCVYLTLRVSEASGPTHPHRCLLNLISA	78274	77843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_77800_78300
850372	contig_6436_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_134919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911201	911792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_911200_911800
850373	contig_13680_pilon	-	829	4	Intergenic	novelGene_149591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	25.3683967872539	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAGTCCAGACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377273	372804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_373163_374990_375067_375277_375356_376956
850374	contig_7171_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_101282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGAAACACTGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036073	1035616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1035600_1036100
850375	contig_13894_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_62211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTCCCCCCACCATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765802	766038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_765800_766000
850376	contig_13456_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_153304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524068	525520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_524100_525500
850378	contig_15105_pilon	-	887	6	Intergenic	novelGene_151033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.717384206134	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	19	714	839916	829338	FALSE	45	CAACTGAAAAATACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPDRNSYENRRALYNQQRL	839934	829164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829392_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836208_836548_839849
850380	contig_378_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_175170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTAGCAGATGTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244073	243543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_378_pilon_-_243500_244100
850381	contig_12884_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_104967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAGAAAACACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7198	7759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_7200_7800
850382	contig_3948_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_53402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTGCTCTGTGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1821729	1822117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1821700_1822100
850384	contig_1939_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_144860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTTGGAGACTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213655	212760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_212800_213700
850386	contig_11171_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_48625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGAACTGTTGACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381310	380043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_380000_381300
850388	contig_8050_pilon	+	1279	3	Intergenic	novelGene_114851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	880	junction_2	442.5	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	298	939	370898	375010	FALSE	75	GAAAGCTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNNIQYLPGPAHWKSLNLRELLFSSNQISILDLSEKAHAWSRVEKLHLSRNKLKEIPPEIGCLENLTSLDVSYNLELRSFPNEMGKLSKIWDLPLDELRLNFDFKHIGCKAKDIIRFLQQRLKKAVPYNRMKLMIVGNTGSGKTTLLQQLMKTKKSDLGMQSATVGIDVKDWPIQIRGKRKKDLVLNVWDFAGIYFSRLFNLVLLFFRMGI	370600	375350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_371069_372248_372431_374721
850389	contig_10331_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_54048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCAAAAAAAACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8306	7689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_7700_8300
850390	contig_10196_pilon	-	654	3	Intergenic	novelGene_132058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	0.5	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	89	538	667165	666538	FALSE	25	ACCCACAGCTTGTGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEVLVSESPAAAAAVLAEDPHTVLVEFSSMVADTQEYIIEATADDAETSEATEIIEGTQTEVDSHIMKVVQQIVHQAGAGHQIIVQNMTVDQQAGLGAEAAADTITIATPESLTEQVAMTLASAISEGTVLTARAGAHGAEQATVTMVSSEDIEILEHAGELVIASPEGQIEVQTVIV	667253	666421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_666892_666989_667053_667132
850392	contig_8020_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_114454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAAGAATTTCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377187	376492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_376500_377200
850393	contig_4364_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_4588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAACTTGAATCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2079226	2078682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2078700_2079200
850394	contig_4364_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_4587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGTACCAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2078208	2077875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2077900_2078200
850395	contig_10000_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_139342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAATTCTTTATTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318226	316973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_317000_318200
850396	contig_10196_pilon	-	667	4	Intergenic	novelGene_132230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.505802319505	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGGCCTGTGGGCTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448620	1431524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1431965_1442168_1442224_1442339_1442416_1448524
850397	contig_14341_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_111894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731250	730177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_730200_731200
850399	contig_16510_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_139074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	182	487	236525	236830	NA	60	TAAAAGGAAAAAAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLRKLAGVEIRVGTCGLRFTGDSLIRERGKGQGWIWQGPAPAPRTTPASGCCDGGSSRPLLWVLASEGIEGYLRWTGRQWRRNLYLLEFFIVRAGTLEC	236343	237358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_236300_237400
850400	contig_13876_pilon	+	605	4	Intergenic	novelGene_174246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_3	102.306728354819	41	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	131	451	44405	69402	FALSE	30	TATACTTCCCAAGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASAVMHALRKNKTLRYGVPMLMLIVGGSFGLREFSQIRYDAVKIKIDPELEKKLKMNKVSLESEYEKIKDSTFDDWKNVRGPRPWEDPDLLQGRNPEIVKIKTT	44274	69556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_44474_61740_61813_65260_65324_69285
850402	contig_7165_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_116815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159455	159165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_159200_159500
850403	contig_7869_pilon	+	738	2	Intergenic	novelGene_149997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92484	93272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_92668_92717
850404	contig_13215_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_145897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGCATAAAACCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169757	171063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_169800_171100
850405	contig_16204_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_154476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACACAATAAACACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152904	152596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_152600_152900
850407	contig_6175_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_16316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTGCAAAAAAACAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1478587	1477671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1477700_1478600
850408	contig_253_pilon	+	1139	2	Intergenic	novelGene_129618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTCAATCATGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119994	123521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_120298_122685
850409	contig_6415_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_175837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCATTGTGGTTATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35491	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_35500_37200
850410	contig_7914_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_165027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAATATTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133512	134600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_133500_134600
850411	contig_960_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_108222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	66	368	330434	330132	NA	50	TAGTTATACTATAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLYLTHFGHVISRDHSLEKDIMLGKVEGQRERGRPSTRWIDTVATMMDSSIAKIVRIVPHWAVFHSVVWIQRHLATRPLKEAQSQHTREIQSSIRCCLVGLEGTNCYVVEKPMWQQTASSL	330499	329890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_329900_330500
850412	contig_16098_pilon	+	1049	4	Intergenic	novelGene_46170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	1.24721912892465	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	432	824	512024	512574	FALSE	25	TCAAAACTGGTCCTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEDGGEEKEKEATGSGDNIGGDEKLPVRRKSKDRAQCKVGKRQSGSSEEDGEDSWRKVKLRNKSTGKTAKADSINGEDSDLEREVSDSEAGGSPKGERKNRSSKKSSKKGKTRSSSSSSSDGSPEPKGRKAVSGRRGEDHPAVMRLKRYIRACGAYRNYKKLLGSCHSHKERLSVLRAELEALGMRGNPSLEKCRALKEQREEAAEVASLDVANIISSSGRPRRRTAWNPSGEAASSGEPYRRTLDSDEERPHPPPPDWSHMRGIISSDGESN	511492	512799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_511885_511984_512154_512233_512333_512410
850415	contig_3916_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_141861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAACAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59461	58512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_58500_59500
850417	contig_10446_pilon	+	901	3	Intergenic	novelGene_162494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	2	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACATAATACTGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866316	876697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_866553_867033_867152_876150
850418	contig_8017_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_65370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAATAACTCCAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417045	1417321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1417000_1417300
850419	contig_2332_pilon	+	422	3	Intergenic	novelGene_58630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGAGCCGCGCTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64468	68040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_64650_65212_65352_67938
850420	contig_13481_pilon	-	771	1	Intergenic	novelGene_119486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAATCATACCCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308899	1308128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1308100_1308900
850421	contig_10005_pilon	+	686	1	Intergenic	novelGene_148907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGCATACAAACCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103264	103950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_103300_104000
850422	contig_7106_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_148315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTGTTCTTCCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535332	535507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_535300_535500
850423	contig_6607_pilon	-	285	2	Intergenic	novelGene_164220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATGGTAAGTGGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531905	506858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_-_507042_531803
850424	contig_2854_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_120829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251206	252307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_251200_252300
850425	contig_3942_pilon	-	478	3	Intergenic	novelGene_128727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39	124	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	94	405	637793	634270	FALSE	20	TGCTGGCTCAGGAAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGALVWVLLLPLLLQDARTQEYSCALFSGNVDWTKEFQDMCLNFSKKGLSLPRNQSLLASKVISLDLSANGLRELPPGFTLLLGPLLGQKAKREIRARGLEG	638387	634196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_634347_637558_637803_638303
850427	contig_15120_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_108006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCAAGATATATCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169531	170067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_169500_170100
850428	contig_2550_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_135643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1138	1491	507619	507972	NA	25	AAGGCTATTTTTTGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGTWVHSSAGEGDRIPSTARSCSGQEEMRWPGLLTRWRPLQGRGGGHTSLCSGTWNRLAQKGHSVHPMHNSFIRCEQHRWVLGHQEGREGSESLGQLFPRVWKIRVPETTTESQS	506481	508005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_506500_508000
850431	contig_13699_pilon	-	1409	2	Intergenic	novelGene_158337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTTTTAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135826	131886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_132494_135024
850432	contig_3818_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_99217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCAGCTGAAAACACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215879	216948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_215900_216900
850433	contig_18184_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_123877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAAGGCTGACCTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461924	461043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_461000_461900
850434	contig_16204_pilon	-	859	6	Intergenic	novelGene_154485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_2	182.236110581849	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	129	704	204810	197969	FALSE	35	ATAAATAAGGGGCGCGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYSARDPQGAQLLPDQRSPQPGASPQEDVTNFQVLVKILPIMVTLVPYWMVYFQMQSTYVLQGLHLQIPNIFPVNPANSFTALRTQPNSYTIPEAWLLLANVVVVLILVPLKDRVLDPFLLRHKLLPSALKKMALGMFFGFTSVIVAGLEFAYSEAPRSMQAAIIGIFFCLSGVGSLLGSSLLSLLSLPGGWLHCPEDFGNINNCRMDFYFFLLAGNPSCHILPISLDCWPL	205536	197813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_198070_198530_198687_202329_202499_203202_203314_204771_204920_205517
850435	contig_12050_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_62602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAGTAAATGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308016	308524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_308000_308500
850436	contig_15732_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_88915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTTATATATTTAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360221	359797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_359800_360200
850437	contig_3426_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_57970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGAGATAAAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534444	533986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_534000_534400
850438	contig_4686_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_118516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTATCATTCTACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422181	421699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_421700_422200
850439	contig_10347_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_177659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGAGAGAGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690097	1690667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10347_pilon_+_1690100_1690700
850440	contig_13481_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_119475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGAGTCTATTTTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302990	1302228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1302200_1303000
850441	contig_6418_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_81172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTTTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554732	553517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_553500_554700
850442	contig_6589_pilon	-	780	4	Intergenic	novelGene_25683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	146	511	77691	73557	TRUE	30	CAGGCGGAACGGACTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEVVVVFLRGVSLSVASSPFPPPLWSPPAAPHTGPEPVQLPRRPWHRPRPRGPQVPEAWSPGCSRHRPLGAGPPSAAGVVAGTAVQATQVRAGSESAPAPEAGPAGTGASCRSHRQPPG	77836	72667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_72809_73428_73589_77245_77439_77550
850444	contig_1594_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_138798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215295	216199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_215300_216200
850446	contig_9345_pilon	+	1419	2	Intergenic	novelGene_24712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTATTTACATACCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990050	996998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_990714_996242
850448	SIRV7	-	279	3	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	69007	0	35788	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78950	56031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841
850449	scaffold_17541_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_175238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	296	532	154024	154260	NA	35	TTAGCTATCAAAAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLELCGTAKWLPLCPSARAQSWALQSGQCGLSGRPAPGKGPAPPASAPVRTLPSADWTERPRSLPASCGALQARRAADSAAYLSRRPRGGPEGWGRRTMEGRVGAHTGRPVGWEPGWSCGEGSAGLQSWRAQRPPQRGRMPLRNRRVAGTTNQPKLVRSAGHCGENSPTWEATQQS	153728	155129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_+_153700_155100
850450	contig_5827_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_129787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAGGTCAAAAAATTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189715	190153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_189700_190200
850452	contig_9995_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_47796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGAGCCTGGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802159	802885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_802200_802900
850453	contig_7129_pilon	+	993	2	Intergenic	novelGene_169314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	124	477	981874	982227	FALSE	15	GGTGTATTTTGTACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQAHLEPWNSILHGDQFPAGMAVEEIGTQMVPPREVVSGYRPTQEHLVAGLALCQSSRAGQHGAHSEEDAFGILPVHHSHYFSACHTPGTKNLGCMVLIPGPLPPAHTHPILSEL	971913	982743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_971956_981792
850459	contig_9389_pilon	-	310	2	Intergenic	novelGene_84138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	295	300	1717276	1717271	FALSE	20	CTCGTAATCCATCCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTDTETGCPSRRRAGPGGPSDRQRQAAPHGAGLGLGAPQTDRDRLPLTALGWAWGPLRQTETGCPSRCRAGPAQGPIPSPAVLFLGCFGRPLFSRSRLM	1717962	1717260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1717558_1717949
850461	contig_11336_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_172664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGTATAAGTTGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6058	7130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11336_pilon_+_6100_7100
850463	contig_3233_pilon	-	1581	6	Intergenic	novelGene_56529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	6	995	536991	532140	FALSE	20	ATCTATACTTTTGTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTAREELPCAHFTVDKENISLWSKEPPSKMDWPLALRKPSTLCAALTFMTLVLLTSILLQGILYSWFLGTISDIRTNAQLMEGRVDNISTEGSEIKRNHGGLKAANIQIQRVNVSLNDVRSQLLRLQTGLEKASAGIQILTKSWEEVDALNAQIPELKKDLDKASALNAKVRGLQSSLENMDKSLRQQNDILQMVSQGWKYFKGNFYYFSRVPKTWYSAQQFCKSRNSHLTSVTSESEQEFLYKTAGGISHWIGLTKTGSEGDWYWVDDTPFNKVQSVRFWIPGEPNNVGNNEHCANIRAASLQSWNDDSCDNKLLFICKQPYIPSEP	536996	531553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_532291_532788_532908_534157_534310_534906_535282_536698_536816_536915
850466	contig_383_pilon	-	1287	3	Intergenic	novelGene_126132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153812	148218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_148831_150745_150862_153253
850467	contig_3588_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_72884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTTAAGAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117012	117583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_117000_117600
850468	contig_8322_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_143274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGCTGCTAAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517783	518287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_517800_518300
850470	contig_9189_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_165112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTAAAGTTTTCCGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275612	275080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_275100_275600
850471	contig_2867_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_135170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTAAACTGTGTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704659	704859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_704700_704900
850472	contig_6654_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_85764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTAATGGTTTTCTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591059	590611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_590600_591100
850475	contig_20089_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_177660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAATCCAACTAGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2417	1299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20089_pilon_-_1300_2400
850476	contig_2646_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_69588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGAAAAAAAAATAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431017	1431598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1431000_1431600
850477	contig_13780_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_149137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGACAGAGAGTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917657	918958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_917700_919000
850478	contig_11081_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_167082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTATTATACAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41108	40133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_40100_41100
850480	contig_17134_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_171594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCCATAAAAAAGAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9287	8638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17134_pilon_-_8600_9300
850481	contig_5145_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_131391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGAGTCAAAGGGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636779	636063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_636100_636800
850483	contig_6446_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_149231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467036	466258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_466300_467000
850484	contig_7919_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_28055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGCAGCGCCTGTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979382	979994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_979400_980000
850486	contig_5050_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_110258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGTTGCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292426	293046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_292400_293000
850487	contig_8576_pilon	+	424	3	Intergenic	novelGene_88775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	139	321	879834	881996	FALSE	15	CAGACCCCTTGGGCTCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFFVEIVGHYSLFLTPGEREERTLQREAFRKAVSSRSLRRFLEVFMETQTFRSFAQERTLRRQDVKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNRFLKGLGNKMKFLHKK	879695	882099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_879898_881222_881310_881964
850488	contig_8576_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_88776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAATAAATATAATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883392	883782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_883400_883800
850491	contig_14822_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_145389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTCTGTCCCTCCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42478	42823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_42500_42800
850493	contig_7342_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_71188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	371	790	641771	641352	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGGPGGRWSEMLVPMLVAAMAVRLWPLVRADSLCRWGSSSGLGCCRGPGGRWFIFELREVAGPLDTPGTLGTGPAWAESRKITPVPAFQPPFLSLTSQRLLSSLPLWAKVDNLPFLHPTPTAHHQALPFLLQTLAPF	642141	640600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_640600_642100
850494	contig_9389_pilon	+	473	5	Intergenic	novelGene_83974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	132	junction_1	355.336020549564	924	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	255	392	358006	358240	TRUE	0	TCTGTGCTGGTTGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTFASPTQVFFSGAHVRQVDVPTQTGAFGILANHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTTKYFVSSGSVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQAELSGAADEAQRAEIQIRIEAGEALVKALE	356358	358565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_356385_357231_357386_357931_358021_358117_358243_358486
850495	contig_10324_pilon	-	1385	8	Intergenic	novelGene_7810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	301	786	236016	222727	TRUE	5	GGTTGCCCATGGCGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLMRAPPESSRVSTWSPEPSILFSKSTPNCWTILQQGFGFACGVIRPEVLILLHLLLQGQELALQLAAQGRQRFPDMVGQLLIQGLLQVWGAHAVGYVSVGWVGKEELPLSSQGCTDILLALDVLLAAVHHADPHLFSRGGACSPGCLWRQCLRPSGRAW	236316	169062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_169212_200102_200176_218429_218582_219689_219891_222702_222811_228522_228676_232549_232695_235912
850498	contig_13542_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_131470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	183803	183507	NA	10	CTGTGTTCTCTTCCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQRFQGGALPAILGGQTQETPREKEERGLFRVATWGSLWCPTSTCPSPQLHFNPRGGAGTWGKGRLAWKTAPQYPVPGTACVCSSVPKVAARLPKSPA	183804	183396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_183400_183800
850499	contig_15134_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_140230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATGTTTCTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313555	312661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_312700_313600
850500	contig_2027_pilon	-	475	3	Intergenic	novelGene_39876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	198	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	168	374	53783	53400	FALSE	20	CTAGCTAGTGTTGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVLRWLNIAQATKSSNIWEFCLACFPPLSPDILGPDPENPDSHGYDKNPVVDLWNMRVVFFFGFSIVLVLGSTFVAYLPDYRMREWARREAERLVKYREANGLPIMESNCFDPSKIQLPEEED	55592	53298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_53527_53703_53835_55476
850501	contig_14643_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_99128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTATTTTATAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50122	50562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_50100_50600
850502	contig_11378_pilon	+	1453	3	Intergenic	novelGene_112209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	335	757	179973	182402	FALSE	30	AGATCTCAAATGTAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSWITIARQKRRGAPDQPPNQEDRPGVQSLKSEVGKPAKTPERAQESRQADFVRSKSFLIVPAKPPVEQKLGTKLDLTEGLQRGISVSHQNLAAQSVVMMEKELNHLKRASYASVDQPSWMELARKKSQAWSDMPQIIK	179638	183098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_180111_181818_181961_182259
850503	contig_10135_pilon	+	542	3	Intergenic	novelGene_106648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	60	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTCATTCATTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116647	120173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_119162_119217_119801
850504	contig_6506_pilon	-	959	3	Intergenic	novelGene_153481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATAGTAAGCGAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85396	62995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_63342_64375_64429_84836
850505	contig_5189_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_34883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAAGCCTTCAAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248639	249608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_248600_249600
850507	contig_8571_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_169173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAACTAACATCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396308	397343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_396300_397300
850508	contig_11855_pilon	+	909	3	Intergenic	novelGene_67117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	43	519	2445756	2446468	TRUE	35	AGGAGGAAGAGGTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGKTNLVLVLPFPFRFGMSLGTDFGNSGLVRLRGRRGFGAIPIYAVKPG	2445713	2447154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2446084_2446319_2446608_2446903
850509	contig_6326_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_168544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	151	336	685772	685587	NA	45	TACAATATTAAAGCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPNRLRVSSEDSASSSAQTAEEGARPGFSRDVLLQYRAQNRGFSRLFPCVMFFPFSYNISARRRQTVCTRLLAEKVGGSNPPRCTGKKGLEICFREDCDSQENPVEHSSAL	685922	685230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_685200_685900
850510	contig_14353_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_82125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGGAAGTGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175530	176394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_175500_176400
850511	contig_3132_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_127457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAGGGTGGCTTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417289	418128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_417300_418100
850514	contig_10159_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_30818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAAAAAAATATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480954	481920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_481000_481900
850515	contig_6589_pilon	+	673	6	Intergenic	novelGene_26085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	89.1771271122814	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	26	673	1865997	1875177	FALSE	15	TCTACCAGCTCTGGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEGPRAEMTVLAPAWSPTSDYLLQDYPVTVASNLQDDEVCGALWRLVLAQRWMIRLKTVAGSQMYILLEAVDTEIHFVTSCAFQPLPSCLRFVQTNISHLLQDTSAQLAALKPQIKSRNFSQCLELQCQPDPSTPLPPRSPWALGATALPTPQRPLLSSARGHTARMWRKSATGWSPSRRPAPFDLSPGWRQHQNPGSTPRPPGSPLYKALIVMNLYINKSSF	1865971	1875177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1867326_1867381_1867928_1868073_1868906_1869046_1872601_1872681_1874978
850516	contig_5236_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_100935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAACAACCCAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935584	936629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_935600_936600
850517	contig_3956_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_14741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGCAGGTGGTGCACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602656	601592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_601600_602700
850518	contig_7165_pilon	-	1134	2	Intergenic	novelGene_116819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGTAACTGTTGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166499	164749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_165699_166314
850519	contig_9083_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_150133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCGGAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062548	1060412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_-_1060400_1062500
850522	scaffold_13505_pilon	-	597	4	Intergenic	novelGene_111646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	22.0151463012778	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	44	475	803560	797900	FALSE	15	TTCTCCATCTATGGCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTPVPESSPAMDSPSLRELQQPLLVGAGREPPAQKPGKPELGPALRETAFAESLRGWEFPPPPLPSVSAGLGEMGHPDLEDTSSSDSDSDSDGGGRLSPLLPHDHLGLAVFSMLCCFWPVGIAAFCLAQKEAEESTSGLPY	803603	797777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_797936_799527_799678_801464_801703_803552
850523	contig_14684_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_99673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAAGTGAATGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338328	337520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_337500_338300
850525	contig_10323_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_123531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	7	342	137647	137312	NA	40	TAATAAACACAGCTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEVSLHQCYGHSGPGQSCVCVCWRGGFLNISTMDIQGQVTLSRVCGGERLSCVTGCLAASLASIHLMPAATPHACIVTKMSHSPKTKPNPQPSVNPTHSGPTGQSRTAP	137653	137177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_137200_137700
850528	contig_10297_pilon	-	393	2	Intergenic	novelGene_112536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTCATAGTTTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445277	441636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_441948_445195
850529	contig_11855_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_66931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACCAAAATGCTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940513	941396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_940500_941400
850530	contig_3380_pilon	+	629	3	Intergenic	novelGene_60097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	482	junction_2	66	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	111	359	385541	436502	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPAHGCRADPKARLEVKPTSSPFPTHPRLAHITQFQMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFDADGNLCRSNQLLQVILTMHRIIVSSAELLQKVITLYKDALAKNSPGLCLKICYFVR	385430	436772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_385617_426495_426602_436435
850532	contig_7307_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_177662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32662	31012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7307_pilon_-_31000_32700
850533	contig_11378_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_112238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCCTTTTTTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333708	332795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_332800_333700
850534	contig_5769_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_138775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGCCAACATCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282069	282892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_282100_282900
850535	contig_13496_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_107621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTGCGAAACACTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211061	212448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_211100_212400
850536	contig_253_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_129640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCCACAACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254425	253338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_253300_254400
850537	contig_20596_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_157224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_2	57	121	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTCTCCTTTATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41337	20483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_20856_24168_24241_41246
850540	contig_13211_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_123140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAGCTGCTATTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182945	183996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_182900_184000
850541	contig_14871_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_63736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTAAGAATGAAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292559	291387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_291400_292600
850544	contig_16303_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_34136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTTAAAAGTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65259	64272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_64300_65300
850545	contig_6069_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_8041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	607	1065	337318	336860	NA	25	GCACCCCTGGAATATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTDQPRFFTFDDAAELTSRAPRKRRRRSRVVLYPESSRKYLPRAERRSRAQRCLLLLVAIVGFQVLNAIENLDDNAQRYDLDGLEKALQRAVFGQPAAVGRIVALLRDYLATHVHSRPLLLALHGPSGVGKSHVGRLLARHFRAVLDDGALVLQYHARHHCPEPRAAQACREELARLVADVVARAEAEEKTPLLVLDEVEAMPTALLDEVHGFLQPQRSHQFHSAIYVLLSSTGGGEITRFVLQNATRALPRRPDGGPDSVRGARAEEELHASMRVLLAREHPLWKAAAIVPFLLLDKSDVVNCFRDEMAGEGFFPEQARAERLAAQLSYYRVVGREYSVTGCKQVVAKVNLL	337924	336741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_336700_337900
850546	contig_6862_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_63768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATAAATCTGGTGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765813	766431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_765800_766400
850550	contig_8978_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_49426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACCCCTGTCACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474393	472851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_472900_474400
850552	contig_4469_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_21927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTACCACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580546	581001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_580500_581000
850553	contig_5125_pilon	+	784	4	Intergenic	novelGene_43497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	74.9577658863087	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	10	630	977418	1023925	FALSE	85	GAAGAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCCFYIVGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQAIETNIVLRNGTETFDSWEKPPLPVYTQFYFFNVTNPEEILEGETPLVTEVGPYTYRELRDKANVQFGDNGTTISAVSNKAYVFERNLSIGDPKIDLIRTLNIPVVTAMEWVQNHFLREIIEALLKAYQQKLFVTHTVDELLWGYKDEILSLISVFRSDISPYFGLFYGVS	977408	1024079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_977535_1000321_1000480_1022096_1022245_1023727
850554	contig_16411_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_77316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGACCGCTAGCCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133992	133021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_133000_134000
850555	contig_5389_pilon	-	1728	6	Intergenic	novelGene_142998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCCTTTGTTACCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84869	75174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_75353_77019_77132_79032_80153_81617_81728_83642_83805_84823
850556	contig_17727_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_172588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGTAAAATTGTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37256	37916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17727_pilon_+_37300_37900
850558	contig_13901_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_146632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGAGGTGACTAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113226	112004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_112000_113200
850559	contig_6523_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_164887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGTACTTGACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285909	286646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6523_pilon_+_285900_286600
850560	contig_13453_pilon	+	867	6	Intergenic	novelGene_146721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	184.074332811503	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	334	867	132546	145455	FALSE	45	GCTACTGAAGAAGAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQAFSFKTKDIEDAMTNTLLHGGDLHSALDWLCLNLSDDALPEGFSQEFEEQQPKSRPKFQSPQIQATISPPVQPKTRKQEEDSKIKNERYLHLSAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKDAQEKIRKFQREMETLEDHPVFNPAIKILHQQNEKKKPLLATEGGSALNFNLFEKSAA	126491	145455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_131069_131184_132536_132667_136355_136502_141918_142046_145315
850561	contig_3424_pilon	+	663	3	Intergenic	novelGene_55595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	1	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	20	550	1189434	1191813	FALSE	5	GATTCCTGGGGCTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAAGGMLRAALRRVLELLSRERPRDPGLRQLWACRARLEAAGGRQAWSWRRLSSEPGPGPGTALGRVEAAHYQLVYTCKVCGTRSSKRISKLAYHQGVVIVTCPGCRNHHIIADNLGWFSDLDGKRNIEEILAARGEPVCRVAGDGAAEVVLEAAAAPQSTAAPEGGEDEDSAHPGKSELS	1189414	1191926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1189656_1190565_1190706_1191644
850562	scaffold_19766_pilon	-	822	2	Intergenic	novelGene_34265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	175	597	288455	288033	FALSE	15	AGTTGTGTTAATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENREHRGAVEAELDPVEYTLRKRLPHRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGARGQNACTELYIHGLGLAINRAINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDAREPLIRTRNNSAIHIRVFRVTPK	288865	287807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_288466_288701
850563	contig_8898_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_137231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTAATGGCAAGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210713	209772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_209800_210700
850565	contig_5918_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_99617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATGAAGAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2149036	2150072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2149000_2150100
850566	contig_5815_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_141175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101655	102870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_101700_102900
850568	contig_6557_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_32933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTGCTACTTGCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245176	244218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_244200_245200
850572	contig_9848_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_79975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	100	327	112907	112680	NA	70	AAAAAAAACGTGATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDRLVTRSPSGREAPQPTPRTFPQPLTANLVHMKTAHFPLCYFGRQSPRAAVASLPCPTQPWPLGAHLGLALPLLGALCLSLPPHLPTCSQNLVSERGQDSVWGVGT	113006	112633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_112600_113000
850573	contig_17618_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_173359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCGTGCCTCCTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49827	50614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_+_49800_50600
850574	contig_6488_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_44752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAAGTTGAAGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172165	171424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_171400_172200
850575	contig_6488_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_44751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAGATGACTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171474	171047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_171000_171500
850576	contig_14322_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_115650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCCAAGAGCATGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432302	433277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_432300_433300
850577	contig_1141_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_136918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGGCTAAGAAGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377645	378053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_+_377600_378100
850578	contig_7045_pilon	+	545	4	Intergenic	novelGene_77419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	8.5764535535124	328	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAGGTGTTCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146448	171101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_146529_155826_155959_168939_169090_170918
850579	contig_11720_pilon	+	1015	6	Intergenic	novelGene_44019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	140.076264941638	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	44	871	276923	280503	FALSE	20	GTCAGGTGAAGTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRARVRPERSAPGPMDSSAVITQISKEEARGPLRGKGDQKSTASQKPRGRGILHSLFCCVCRDDVEALPPHSGAPLLVEENGAVPKQTPVQYLLPEAKAQDSDKICVVIDLDETLVHSSFKPVNNADFIIPVEIDGVVHQVYVLKRPHVDEFLQRMGELFECVLFTASLAKYADPVADLLDKWGAFRARLFRESCVFHRGNYVKDLSRLGRDLRRVLILDNSPASYVFHPDNAVSASRWAKTKERGQAGPCPGPGAFSSPPSSQPSVSRVVHSLCPPALAACSLCDSSV	276879	280647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_276990_278462_278612_279036_279142_279264_279322_279968_280062_280146
850580	contig_18184_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_123868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAATAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119784	118779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_118800_119800
850581	contig_1450_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_27443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATTGGGCTGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486474	485664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_485700_486500
850583	contig_7171_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_101256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844946	843208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_843200_844900
850584	contig_15672_pilon	+	1349	3	Intergenic	novelGene_171827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	4.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1338	12	1349	107409	119215	FALSE	15	CTTGTCAAGGAGGTTCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAIMGNQLAGIAPSQILSVESYFSDIHDSEYDKSLGSTRFFKVARAKHREGLVVVKVFAIQDPTLPLTSYKQELEELKIRLNSAQNCLPFQKSVEKASEKAAILFRQYVRDNLYDRISTRPFLNNIEKRWIAFQILTAVDQAHKSGVRHGDIKTENVMVTSWNWVLLTDFASFKPTYLPEDNPADFNYFFDTSRRRTCYIAPERFVDGGMFATELEYMRDPSTPLVDLNSNQRTRGELKRAMDIFSAGCVIAELFTEGVPLFDLSQLLAYRNGHFFPEQVLNKIEDRSIRELVTQMIHREPDKRLEAEDYLKQQRGNAFPEIFYTFLQPYMAQFAKETFLSADERILVIRKDLGNIIHNLCGRDPPEKAEGEPKESGLVILVSVITSCLQTLKYCDSKLAALELILHLAPRLSVEILLDRITPYLLHFSNDSVPRVRAEALRTLTKVLA	107397	119215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15672_pilon_+_108142_116236_116371_118744
850585	contig_7253_pilon	+	1629	12	Intergenic	novelGene_140196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCGAAAAAAATTGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161713	179273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_161811_161934_161998_162333_162420_165965_166088_169479_169599_170667_170817_170939_171129_172775_172931_175884_176017_178166_178300_178449_178512_178951
850586	contig_3948_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_53351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	626	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	1510998	1510666	NA	75	AAAAAAAAAAACGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSLRGKRERTERFSGRKVQEGPRRRSPRSGAPASFSRKSLHFPPGSGSPGPRGLLSWGGARAARSRAARETRSGHPGECSGPACGGGDSTWPVSSAQSSWAAEGAPGLG	1510999	1510437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1510400_1511000
850589	contig_7171_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_101439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATTATAGCTGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1686795	1687665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1686800_1687700
850590	contig_14023_pilon	+	550	2	Intergenic	novelGene_165363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAGACTCCTATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109528	132106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_109678_131705
850591	contig_11356_pilon	+	937	7	Intergenic	novelGene_175262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.92160768674447	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCTGCCGTCTGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137341	141035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_137502_138044_138136_138303_138457_138729_138860_139363_139439_139861_139952_140797
850592	contig_16103_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_118943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGAAGTGTGTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919505	919853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_919500_919900
850593	contig_7009_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_23591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACACACGTGGGGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377148	376077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_376100_377100
850594	contig_8464_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_125404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCTACCACTCTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902798	904191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_902800_904200
850595	contig_5590_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_163001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243707	243086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_243100_243700
850596	contig_1244_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_38060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACCTTTTAGTTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131025	1131406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1131000_1131400
850597	scaffold_13505_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_111408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGCAGCCCAACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304518	303596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_303600_304500
850599	contig_6410_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_108641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTTTTATGGCATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368636	369060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_368600_369100
850600	contig_9575_pilon	+	1599	2	Intergenic	novelGene_169723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAAGCACTGAGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619291	622110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_620567_621786
850602	contig_5472_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_130030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCATCACTCAAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401600	402722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_401600_402700
850603	contig_6595_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_122550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657012	655958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_656000_657000
850607	contig_8464_pilon	+	717	6	Intergenic	novelGene_125402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	405.283801798197	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	249	557	891696	892583	FALSE	45	AAATGTTTGTATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLHSFHSQLPVLSDSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQRKMEKVLSPQKPTITLSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF	890857	892743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_890989_891109_891176_891319_891370_891694_891822_891981_892101_892519
850608	contig_20842_pilon	+	832	3	Intergenic	novelGene_160963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTTACAAGGGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30294	205466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_30344_85444_85561_204799
850609	contig_20842_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_160981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTTTGTTTTACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205466	205757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_205500_205800
850610	contig_15405_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_112103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTGTATATTTCACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99077	100360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_99100_100400
850613	contig_5964_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_80351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTCGGTGTGTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22689	24034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_22700_24000
850616	contig_4845_pilon	+	390	2	Intergenic	novelGene_53665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGTCCTAGTTTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521365	526690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_521650_526584
850617	contig_2894_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_86549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	229	378	304575	304724	NA	25	TAAATCTGACCATTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISHCNGHTEVTDYTYSYGVYEGSNRVLLGIRNDSEVTTQDTVLDQDSFFSPSAAGPCWRPSQASVTTLSSVGAVSMNPHNNPMGKLRLGDVKFLAHSHQMCLDKFKLLILNHSLFIVIPSVVWY	304346	305050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_304300_305000
850618	contig_8729_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_40116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387398	387953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_387400_388000
850619	contig_16113_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_140545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACACGACAGGCACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17416	17037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_17000_17400
850620	contig_13558_pilon	-	804	2	Intergenic	novelGene_123025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGTAACAGGCTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190791	189854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_190313_190445
850622	SIRV6	+	185	3	ISM	SIRV6A	SIRV616	531	4	465	1	234	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTTGAAAAAGTAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2750	10787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2815_3106_3165_10724
850625	contig_9836_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_176165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCTCAGAAAAGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151679	150844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_150800_151700
850626	contig_11978_pilon	+	477	3	Intergenic	novelGene_62871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	51.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGGAAAGTAAACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635016	637670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_635174_636884_637062_637527
850627	contig_7530_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_141827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGATGTGGCTGCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128338	127967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_128000_128300
850628	contig_6227_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_49777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1219814	1220098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1219800_1220100
850629	scaffold_19766_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_34260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTCTGCTGAACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172117	171444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_171400_172100
850630	contig_6110_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_163282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGCACTGTTGTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654294	652926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_652900_654300
850632	contig_756_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_134764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1	6	414	419	20004	20009	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVPRVAQAHKALLTLHNISLVLHFLLFISTTISRLSLPLTRLLPPPATGLPDSSPGSRSSLAFHIIAIFSFLKFFSSNGNHLVRYTQRHPNFTLEVQNQTPYPDHESTPQCDPFPNLSLFPPNSSSSSKLTCPGIPM	19590	20448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_19600_20400
850633	contig_2940_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_82011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTGGTTGGGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370241	1371110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1370200_1371100
850635	contig_5317_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_76628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	15	305	886839	887129	NA	35	TTCTAGAAAACGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEDGMVISGFQENSVSFGVEGLECGILVWVVSTQFLCEKKTGQGRAWPEVAAQVCLEARGMSPSPQLLCSCSQFPQHQAWQVRGSQPWTLASKLSMIIMI	886824	888002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_886800_888000
850637	contig_7870_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_108897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAACTCAGCAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159956	160515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_160000_160500
850639	contig_2414_pilon	+	638	3	Intergenic	novelGene_158528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	22	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGCATTGAGTGAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119787	1146384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_1119941_1127051_1127225_1146072
850640	contig_854_pilon	+	627	2	Intergenic	novelGene_36112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTTAGAACGGTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128572	131441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_128724_130965
850641	contig_7428_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_77678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	188	532	121899	122243	NA	15	AACTTCCTTTATGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRNGHCRIETGLAGEDGDGCYVQLPRSRPALELSALTAPHPGQGHGSQPVQAKLLAKKRVVRMLLVIVVLFFLCWLPVYSANTWRAFDGPGAHRALSGAPISFIHLLSYASACVNPLVYCFMHRRFRQACLETCSRCWPRAPRARPRPLPDEDPPTPSVASLSRLSYTTISTLGPG	121711	122823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_121700_122800
850642	contig_614_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_132613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGCCACTTAAACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384449	385442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_384400_385400
850643	contig_13244_pilon	-	327	3	Intergenic	novelGene_86960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3014	junction_2	460	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297392	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254
850647	contig_6503_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_145765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGTAAAAAAAGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140393	141616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140400_141600
850648	contig_13004_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_112713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCTGTATCACTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857774	858862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_857800_858900
850650	contig_13300_pilon	-	687	3	Intergenic	novelGene_125804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	1.5	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAGCAATATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250780	244131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_247267_247440_250575
850651	contig_7548_pilon	+	719	7	Intergenic	novelGene_117616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.960515969978	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	409	717	200810	212784	FALSE	55	CCATTGAAACCAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSHPRPLGRADSWRGRKRKLLEAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKYFLLGSWWSHRAPHPPVKMAGHSY	192668	212786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192738_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_212712
850652	contig_854_pilon	+	175	2	Intergenic	novelGene_36713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9664	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGGCCACCGAGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1709244	1709592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1709336_1709508
850653	contig_12638_pilon	-	640	5	Intergenic	novelGene_33307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.646494799135	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	40	390	1285702	1284445	FALSE	5	CCTGGCCCTTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGARAWASRRARAMPSDRPFKQRRSFADRCKEVQQIRDQHPSKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELVKIIRRRLQLNPTQAFFLLVNQHSMVSVSTPIADIYEQEKDDDGFLYMVYASP	1285741	1284194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1284454_1284670_1284810_1285107_1285215_1285295_1285352_1285662
850654	contig_19825_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_59693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	683	junction_2	106	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAGTACATTTGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77841	82113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_+_77962_80559_80685_81931
850658	contig_11378_pilon	-	996	5	Intergenic	novelGene_112244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	29.6057426861749	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	7	786	350123	341973	FALSE	20	GCATGTATTTTATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKMLPSISVNSHMQGNGALNSRDAARHTAGAKRYKYLRRLFRFRQMDFEFAAWQMLYLFTSPQRVYRNFHYRKQTKDQWARDDPAFLVLLSIWLCVSTIGFGFVLDMGFFETIKLLLWVVFIDCIGVGLLISTLMWFISNKYLVKRQSRDYDVEWGYAFDVHLNAFYPLLVILHFIQLFFINYVILTDTFIGYFVGNTLWLIAVGYYIYVTFLGYSALPFLKNTVILLYPFAPVILLYGLSLALGWNFTHMLCSFYKYRVK	350129	341762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_342110_343679_343782_343867_344008_348976_349098_349843
850659	contig_5003_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_120189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATACATGGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30290	29347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_29300_30300
850660	contig_2161_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_114959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTATAGTACTTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010462	1011141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1010500_1011100
850661	contig_602_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_134973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAACAGCTGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580952	579087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_579100_581000
850662	contig_5899_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_146980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAATAAATAAAGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180123	179597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_179600_180100
850663	contig_6557_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_33003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	4.18993502999218	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	130	486	535294	534247	FALSE	25	AATATAATCTCTGTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSRDYPLFGGAFSAILPPGAIDVSDLRPVPDNQEVFCHCGTDQSLIVELLELQAHVRGEEAARYHFEDVGGVQGARAVQVEAVRPLPLENLALGGCCQDAWVLSGKQQVVKENHQP	535423	533975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_534253_534657_534815_535012_535130_535217
850664	contig_6048_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_73140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAATAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006296	1007648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1006300_1007600
850665	contig_7138_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_121001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGCTTGAGACCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319913	318723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_318700_319900
850667	contig_3862_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_137436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGCCACAGTGGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640526	639846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_639800_640500
850669	contig_12790_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_35294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6.04648658313239	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	63	662	546670	532169	TRUE	30	AGACCTTTGAGCAGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLISQGRFKEAEDIIKKAAKMNSITTPEVIFDSMESQELKPLKQQKVFILDLFRTWNIAIITIMSLLLWMLTSVGYFALSLNTPNLHGDAYLNCFLSALIEIPAYITAWLLLRSLPRRYIIAGVLFMGGGVLLLIQVVPEDYYILSIGLVMLGKFGITSAFSMLYVFTAELYPTLVRNMAVGITSMASRVGSIIAPYFVYLGLTPVHAALHPLTLNTRS	546732	526639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_526745_532044_532225_532407_532591_535585_535801_538603_538705_546625
850671	contig_9937_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_129218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCTGGTTGTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218423	216697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_216700_218400
850672	contig_2455_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_119218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTGGATGTGCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380134	1380716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1380100_1380700
850673	contig_17108_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_109545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATACTACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370409	369562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_369600_370400
850676	contig_5797_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_56950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATGTGACCTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363840	364292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_363800_364300
850677	contig_5797_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_56951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364556	365184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_364600_365200
850679	contig_7051_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_64322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAGTGGAATAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235743	236232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_235700_236200
850681	contig_11855_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_66998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAGAAGGGTGGGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309560	1310323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1309600_1310300
850682	contig_7914_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_165037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTCTCTGAAATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231613	231891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_231600_231900
850683	contig_7457_pilon	+	1015	2	Intergenic	novelGene_31666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGCTGTTCTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066831	1068741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1066933_1067827
850686	contig_16650_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_61983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATAAACCAAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304695	305254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_304700_305300
850687	contig_10500_pilon	+	813	2	Intergenic	novelGene_41208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	133	309	1516104	1517982	FALSE	35	TTAGTAGAATACATGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSSAGTAELPPWKAAAVKSPSSFCALPANVALDHGNCCEGPRSGMLADSQSAHVQTSLPCSLIVLNTTFPGVRPLWTQFPAASCCAFPAECRVQTARSEVQI	1515971	1518486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1516173_1517874
850690	contig_9481_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_149693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCTTATTGTAAGAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579862	580472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_579900_580500
850692	contig_8241_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_157480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	473	796	118216	118539	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSMQDGVRFGSHRAEQVRGGGSSWDSEEVRGWEGEGTTVWAGKDLDGSGYFGEAPSGLSDTQHCELRFAPAPPAPGGTCCWGMGGQWRRPRALPRLSPGFTAGLLP	117743	118590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_117700_118600
850694	contig_3601_pilon	-	780	5	Intergenic	novelGene_132880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	259.913807828672	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	10	747	355137	168961	FALSE	20	ATCTTAGATCTCCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATASGALGALQASRARLVAAWCARLGLGLGLPGSVTSTRAGPAMWAQGWAPAAGGAVLRRGYSSEVNAENELRVRYLEEENRGADLKERVKMHSSEVGPFVSKIRAVVNDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLELALACDVRVAASCAKMGLVETKLAIIPGAGGTQRLPRAIGMSLAKELIFSARVLDGQEAKAIGLISHVLEQNKEGDAAYRKALDLAREFLPQVFIITLPFFPLFSCCP	355146	168927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_169200_252871_252929_254568_254662_274999_275087_354875
850696	contig_11498_pilon	+	541	5	Intergenic	novelGene_65535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAGACAAAGTAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292050	300616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_292124_292992_293088_293971_294089_296917_297064_300506
850699	contig_14744_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_65939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAAAAAAAAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197450	196589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_196600_197400
850701	contig_3161_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_84527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGCTTGAGCACCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439472	439987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_439500_440000
850702	contig_9053_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_87961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAGAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344849	345474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_344800_345500
850703	contig_3789_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_79897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614209	614969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_614200_615000
850704	contig_14618_pilon	-	1143	2	Intergenic	novelGene_136795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311041	308561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_308679_310015
850705	contig_12644_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_44571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAATTCTTCTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2020668	2021323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2020700_2021300
850706	contig_1982_pilon	-	826	2	Intergenic	novelGene_151322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	163	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	242287	198835	FALSE	55	CAAATGAAGACATAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPRWRWRRRRQPERDATGLRWQLQRRRLWPRPGPWISPGRERSGASPLAQLTRIKRKRPRREEAVSYRERARHLLPRHHGRDHQETDPEAPLQIYQKFIS	242289	198316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_198859_242005
850708	contig_2227_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_142350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCTGTATTTAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283806	282442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_282400_283800
850709	contig_16098_pilon	+	1154	11	Intergenic	novelGene_45912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	69.9156634810827	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	132	1070	305140	336931	FALSE	15	CCCATTACCTGCATCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLGEVRHCPHTICTTNQSGWRHWRPGNPESRALRSSVWPVQRSSPETDRHPLYTMALVSADSRIAELLTELHQLIKQTQEERSRSEHNLVNIQKTHERMQTENKISPYYRTKLRGLYTTAKADAEAECNILRKALDKIAEIKSLLEERRIAAKIAGLYNDSEPPRKTMRRGVLMTLLQQSAMTLPLWIGKPGDKPPPLCGAIPASGDYVAKPGDKVAARVKAVDGDEQWILAEWKANPETDPEALFQKEQLVLALYPQTTCFYRALIHTPPQRPQDDYSVLFEDTSYADGYSPPLNVAQRYVVACKEPKKK	294741	337015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_294851_305117_305152_306434_306572_321945_322037_328159_328236_328924_328998_334171_334237_335141_335272_335357_335476_335913_336034_336814
850710	contig_12425_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_46706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGGTGGTTCTAAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226454	226951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_226500_227000
850711	contig_10904_pilon	+	1090	10	Intergenic	novelGene_22584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.553172678449	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	53	613	439135	444451	TRUE	20	GTCCTCGGAGAGTGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKSIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGYRKPATWPWS	438423	454282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_438468_439126_439312_439431_439493_440066_440151_441447_441546_442680_442792_444421_444557_445256_445415_448343_448421_454145
850712	contig_5018_pilon	+	484	2	Intergenic	novelGene_47012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTAATCTCCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258321	1260212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1258488_1259894
850715	contig_8712_pilon	+	960	2	Intergenic	novelGene_58869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	160	573	868092	878523	FALSE	10	ACTCTGACTCCTCGGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTWSRALAAVSPAHHYPPPSAWTSRPDHAAAAVLWHRLAWLGMGPPKACSPQKLRANRDVPVQTQESGKETLGLRAQAPTGGRQGQPKTSPARSVALTAWPWRPTFCSFHGGQRSLARVCNPALQPQLHLLPPLNL	867932	878910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_868236_878253
850718	contig_14450_pilon	-	756	2	Intergenic	novelGene_48948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555262	554225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_554873_555153
850720	contig_16701_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_177599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81450	80502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_80500_81400
850721	contig_6129_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_159966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	27.5	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	184	525	71114	68750	FALSE	50	TAAAAAGTACAAATCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGGEHSILNS	74080	68334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_69064_71086_71200_73982
850722	contig_12032_pilon	-	800	2	Intergenic	novelGene_139282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTAAGGTTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105662	104662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_104739_104938
850723	contig_11081_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_167084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCCCTCTAACCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48667	49314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_48700_49300
850726	contig_12750_pilon	+	977	2	Intergenic	novelGene_172623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTTCAGAGAAAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63072	64345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_63158_63453
850728	contig_11751_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_150295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAGGAAAAAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119932	120251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_119900_120300
850729	contig_7593_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_127340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACCCAGCTACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594859	596302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_594900_596300
850730	contig_1008_pilon	+	733	4	Intergenic	novelGene_121606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	195.390776536549	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAAGGTGCTGTCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750548	769108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_750601_750930_751029_752457_752666_768733
850731	contig_6477_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_154152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTCCTCTTGCTTAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747726	747130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_747100_747700
850734	contig_10331_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_54090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCTCAACGTTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110108	110325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_110100_110300
850737	contig_12638_pilon	+	776	2	Intergenic	novelGene_33046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	203	664	8893	9438	FALSE	10	TTCCTGTAGTCTGATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEESLVATGASGSPAAPPEKRDGAGPSSDLERSSAGSFSIPEASPPAPKSSSPNAVPKAIPTPPVAASGYSRPGPETFRQRFRQFRYQDAAGPREAFRQLRELSRQWLRPDIRTKEQIVEMLVQEQLHAILPEAARARRRGRRTDVRITG	8690	9550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9104_9187
850738	contig_11448_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_66431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACTTCTGAAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610569	609605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_609600_610600
850739	contig_11448_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_66426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTATAGAAAGCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591589	591317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_591300_591600
850740	contig_7619_pilon	-	464	3	Intergenic	novelGene_162153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	55.5	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTCTCAGTTGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31584	30030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_30232_30708_30809_31421
850741	contig_5628_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_157563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTGTGAACCTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91261	92082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_91300_92100
850742	contig_990_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_76112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449868	1450590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1449900_1450600
850744	contig_2069_pilon	-	421	3	Intergenic	novelGene_23490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509896	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508565_1509033_1509111_1509754
850745	contig_14986_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_59721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAACTCTGCATGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143329	144681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_143300_144700
850746	contig_4131_pilon	+	731	2	Intergenic	novelGene_127882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1369	junction_1	0	3	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	63	455	240672	241064	TRUE	5	CTGGGTTTATTTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240609	248856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_241199_248714
850749	contig_4305_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_136707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGGGTGAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786699	786272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_786300_786700
850750	contig_7887_pilon	-	1290	5	Intergenic	novelGene_124916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.78791845139511	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	173	1180	551798	545922	FALSE	10	TGCCCGTTACTCCAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRASESPPGRSVTAGIIIVGDEILKGHTQDTNTYFLCRTLRSLGVQVCRVSVVPDEVATIAAEVTSFSSQFTHVLTAGGIGPTHDDVTFEAVAQAFGDELKPHPELEATIKALGGEGREKMSLVPTSARLHYGTDPHTGRPFKFPLVSVQNVYLFPGIPELLRRALEGLKGLFQNTAVQFHLRELYVAADEASIAPVLAEAQARFGCRLGLGSYPDWSSNYYQVKVTLDSEEEESLEEGLAYLTARLPQGSLVPYVPNAVEQASEAVYRLTESGLDLQRHLGLSAFSVCPILYPVRPRLHFTREPGEHGAEPSPEVPEPRRPPRLPPSLPAGK	552658	545811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_546030_546123_546198_548994_549740_551717_551943_552630
850751	contig_10196_pilon	+	664	5	Intergenic	novelGene_132119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.222440293453	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	13	297	922274	924513	TRUE	15	CCCAGGCCCAGTGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSAMSFCSFFGGEIFQNHFEPGIYVCAKCGYELFSSRSKYAHSSPWPAFTEPIHADSVAKCPEHSGLGVLKVSCGKCGNGLGHEFLNDGPKPGQSRF	922261	926559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922329_923962_924112_924432_924548_925701_925773_926297
850753	contig_9185_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_166916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCGCTCCTAGTTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646331	647062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_646300_647100
850755	contig_7171_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_101440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707728	1708201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1707700_1708200
850756	SIRV7	-	266	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	15	91645	15	-91639	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTAGCACGAAGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147942	147676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_147900
850758	contig_9548_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_141079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTTCCTGAGTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286566	287356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_286600_287400
850759	contig_12179_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_127987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	3.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	9	353	335325	338208	FALSE	35	GCGGTACAGTATTTAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAMEPQNAQLFYKITIAFSRTCGRNQLILQKIQTLLEKAFSLTPHLSEFATELGYQMILQGKVKEALTWYKTAMTLDETSVSALIGFIQCQLMEGQLQDADQQLEFLSEIQQSIGKS	335316	338208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_335382_337434_337628_338113
850760	contig_8015_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_176678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAACTTGGGGTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5819	7383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8015_pilon_+_5800_7400
850761	contig_6069_pilon	-	882	3	Intergenic	novelGene_8056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	17.5	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	95	454	416635	415358	FALSE	10	GAATCGTGCTGGCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQGAALQNYNNELVKCIEELSQKREELCRQIQQEEDEKQRLQNEVRQLTEKLARVNENLARKIASRNEFDRTIAETEAAYLKILESSQTLLSVLKREAGNLTKATALEQKASGGKDS	416729	414929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_415466_415890_416091_416583
850762	contig_6654_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_85727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGGATCAGGAGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369328	371200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_369300_371200
850766	contig_10765_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_122905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTCCTGTAGAGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108815	108307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_108300_108800
850767	contig_5229_pilon	-	403	2	Intergenic	novelGene_117674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	398	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCATCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155051	153502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_153773_154918
850768	contig_11396_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_71308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCACGCAGGCCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428364	427659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_427700_428400
850769	contig_15327_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_70786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	125	316	1183760	1183569	NA	25	ACAGGCTCACACCCGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATGSPCSPGARRPGGAAAPRTGQPTAEPPLGPAEQWWSSAMCSAVSAGSNAEGALWGAVEGVGSGRRCPAPGSASPDSPSPGSWVPAAGVRLGFSNPELRIPS	1183884	1183247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1183200_1183900
850770	contig_6233_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_74809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAAAAAGGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165092	165592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_165100_165600
850771	contig_10481_pilon	+	484	3	Intergenic	novelGene_170526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	473	junction_1	175	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	60	383	51012	61464	FALSE	45	GCTTCATCTAAGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVGSIKKHKGDKFNPVCLKMTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHSSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLVNLRELDVSKNGKIFF	40454	61565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_40505_51002_51201_61329
850774	contig_3018_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_78942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGAAATGTCAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683483	684901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_683500_684900
850775	contig_9221_pilon	+	553	4	Intergenic	novelGene_176236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	458.202526788707	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	229	552	17253	18448	FALSE	35	TAAAGTCATGGGCTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKVPEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKSFPQNPVELK	16264	18449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_+_16440_17199_17350_17455_17563_18328
850776	contig_1244_pilon	-	698	4	Intergenic	novelGene_37931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	301	junction_2	69.108610172684	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	92	682	349752	347026	FALSE	70	ACACTGTAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDIKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKVLCSIFLPLCFGNFC	350833	347009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_347215_347810_347975_349514_349764_350753
850777	contig_12965_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_65206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430479	429437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_429400_430500
850779	contig_6048_pilon	+	635	5	Intergenic	novelGene_73245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	28.3945417290014	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	142	477	1929986	1952592	FALSE	20	AGATTATGTTTGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLVLCEPTELYNILNQVTKLSRLTEPNYLCLLDVRTKREYDESHVITARRVKQEGKEYLTPESVDLQCVKYCVVYDSNTSSLEIILEDNDDENSDNHNQGTGCISAIPC	1917122	1952750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1917263_1929984_1930089_1940522_1940585_1944046_1944186_1952560
850782	contig_19680_pilon	-	989	2	Intergenic	novelGene_132002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	116	364	48029	44487	FALSE	30	CATGTTTATTGTATTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRIGSELHPLEAAGAIPGDPRDLGAPCLYVSAWGRVGMWEPCCIFTEERHLGVPCVCRDHRHSAVLRERKPNQLLATSSKSQRNLPTWGGLCGPVRLCCLGHQDNSNLTNIRSISPGLL	48144	43861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_44674_47967
850783	contig_5083_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_151641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAGAAGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209339	207847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_207800_209300
850784	contig_2933_pilon	+	497	4	Intergenic	novelGene_111379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	25.694789787469	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	44	496	1088869	1095700	FALSE	20	TGGCCGAGGCCAACGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGNGLRRRRRTVAMEDLGENTTVLSSLRSLNNFISQRVEGGPGLDVCASVPGSLQMQYQQSMQLEERAEQIRSQSHLIQVEREKMQMELSHKRARVELERAATTSARNYEREADRNQELLTRIRQLQEREAEAAEKMKEQLERNRSCRQSLDAANKKLREKEDG	1085157	1095701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1085188_1088855_1089019_1092650_1092792_1095538
850786	contig_12079_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_67491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAACTTGAAAATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647414	647926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_647400_647900
850787	contig_8991_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_170943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACCAAAATGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241146	242301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_241100_242300
850789	contig_17_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_173982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAGCACTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089507	1088856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1088900_1089500
850790	contig_16625_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_171122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCAATGTAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99969	100927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_1e+05_100900
850791	contig_10115_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_171931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATGAACACTAATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12203	12478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_+_12200_12500
850794	contig_6842_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_130696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACAGCACTGTCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381397	381974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_381400_382000
850796	contig_21375_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_177664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37235	38116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21375_pilon_+_37200_38100
850797	contig_13145_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_116653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAACAAAAGAAGAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220158	218537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_218500_220200
850800	contig_6710_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_89139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653668	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653700
850801	contig_4742_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_131004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247002	246128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_246100_247000
850802	contig_7760_pilon	-	148	1	Intergenic	novelGene_138436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCACTCTCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199486	199338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_199300_199500
850804	contig_5018_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_47178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTAATGACTCGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560841	1562049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1560800_1562000
850805	contig_11068_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_130546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	139	507	195787	195419	NA	15	CATTGACATGTTCTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLSEKDPKTALGGRGEGPSACCSLCVGCGQRGFRYSELTVLGLGMVSMIPKPLDCPRCLPPAWPRHLVLAPSGCVYITDPGHGGWGALCFFSPKPTTVQGSVLQKQPTCATGMKHRTCSRTEMDVITHCLCQSPPPGMPLTPSSVAWSQLPWYQCTLLGLWWVGAG	195925	194634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_194600_195900
850806	contig_5050_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_110301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTGTGCACGTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834437	799445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_800245_834303
850808	contig_21357_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_171860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGGAGAGGGGCAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140727	141291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21357_pilon_+_140700_141300
850809	contig_3612_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_87840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCTATAACTTTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975983	975115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_975100_976000
850810	contig_3612_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_87839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTTCCATTAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975113	974267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_974300_975100
850811	contig_19731_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_168518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGTACAGGCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44539	43148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19731_pilon_-_43100_44500
850812	contig_4426_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_15350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCAGTATTTTCTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13363	14588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_13400_14600
850813	contig_10341_pilon	-	511	3	Intergenic	novelGene_47220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCCACACGTCCATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65271	64104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_64158_64488_64611_64935
850814	contig_9753_pilon	+	1237	11	Intergenic	novelGene_41339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	7.04911341943084	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	193	1221	94587	147244	FALSE	40	TCTTTGAGAATTAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSRLSPRLRPRVNVASQDVCCSIGPFPTSGRRSPSQVESGSSSSLVVVLELEGRPKWTRLWGTMNNPIPSNLKSEAKKAAKILREFTEITSRNGPDKIIPAHVIAKAKGLAILSVIKAGFLVTARGGSGIVLARLPDGKWSAPSAIGIAGLGGGFEIGIEVSDLVIILNYDRAVEAFAKGGNLTLGGNFTVAVGPLGRNLEGNVALRSSAAVFTYCKSRGLFAGISLEGSCLIERKETNRKFYCQDIRAYDILFGDLPRPAQAEDLYEILDSFTEKYENEGQQINARKAAKEQRKASAKELPPKPLSRLQPSSVPVQLNSGSQSSRNEYKLYPALSSYHEDVGNSQQPTEVTALYSFEGQQPGDLKFQAGDRITVISKTDSHFDWWEGKLRGQTGIFPANYVTMN	93512	147260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_+_93570_94451_94588_112724_112836_117637_117752_121924_121990_129242_129356_130449_130579_132064_132234_132882_132962_139444_139502_147053
850818	contig_12427_pilon	-	745	4	Intergenic	novelGene_40554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1290.07321067019	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTAACAAGAACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578185	504690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505019_520308_520440_522284_522346_577960
850819	contig_1694_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_144985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCATGTTGCTGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662038	1660340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1660300_1662000
850820	contig_12265_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_149440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTTTCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27000	26805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_-_26800_27000
850821	contig_10446_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_162488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAAGCTACTCTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792901	791969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_792000_792900
850823	contig_9415_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_109783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGACAAAGATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647929	1648828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1647900_1648800
850824	contig_5018_pilon	-	823	7	Intergenic	novelGene_47132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	47.2913546245212	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	119	769	1494300	1489525	FALSE	55	ACAGCTAAAGAAAGCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSSPVPAVCRKEPCVLGVDEAGHSKTLSESERDRLFVKMEEDKDFVGWALDVLSPNLISTSMLGRVKYNLNSLSHDTAAGLVQYALDQGVKVTQVFVDTVGLPEKYQERLQQCFPGIEVTVKAKADALYPVVSAASICAKVARDQAVKNWQFVEKLQDVDADYGSGYPNDPKTKAWLRKHVEPVFGFPQFVRFSWRTAQSILEKEAEGVTWEDSSAEDQEGLGKITSYFLSEGPRPRLPHRYFQERGLESATTL	1494812	1489470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1489658_1489765_1489890_1490836_1490925_1491029_1491168_1494000_1494089_1494220_1494348_1494741
850825	contig_8671_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_126269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531345	529944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_529900_531300
850826	contig_20883_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_173830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGTCTTTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4406	5462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_+_4400_5500
850827	contig_2924_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_140259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACAATTCATGCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71165	72118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_71200_72100
850830	contig_14501_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_172030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	338	424	225399	225485	NA	25	GCCCACAGAAGACCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSIIYCPQLISITSITEIEIFSEKVKKILRFRQSPLDVAEACTGPSIRLAQGWKTTSGTPTFSQARGPGQEASRLTIREWEGGLSILIQQPCWPLGLLLSGNGEKGLPNPEGMFEVARGGLGRYTRAGGQHSGTAGPALH	225061	226202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_225100_226200
850831	contig_9415_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_109837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTGTTACACACAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1932994	1932476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1932500_1933000
850836	contig_16525_pilon	+	404	4	Intergenic	novelGene_133872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTGGCCTTAGACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178149	181435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_178322_178581_178682_181167_181253_181388
850837	contig_5935_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_102765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAGTACTTGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384151	1383221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1383200_1384200
850838	contig_5331_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_112762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTAAAGCACAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136581	136943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_136600_136900
850839	contig_15087_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_37229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAGTTCCATTTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143916	143406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_143400_143900
850840	contig_11566_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_166709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACAGAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210773	209902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_209900_210800
850841	contig_4442_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_127944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAAGGTATGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239157	239854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_239200_239900
850842	contig_5649_pilon	+	1084	6	Intergenic	novelGene_82336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.9648391190337	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	85	654	480530	494677	FALSE	5	TTTGTCCTATTTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNTFQSGFLSILYSIGSKPLQIWDKKHIKRITDNDIQSLVLEIEGTNVSTTYITCPADPKKTLGIKLPFLVMIIKNLKKYFTFEVQVLDDKNVRRRFRASNYQSTTRVKPFICTMPMRLDDGWNQIQFNLSDFTRRAYGTNYIETLRVQIHANCRIRRVYFSDRLYSEDELPAEFKLYLPVQNKAKQ	480445	495107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_480614_492114_492183_492851_492964_493558_493748_494097_494209_494671
850844	contig_7909_pilon	+	800	2	Intergenic	novelGene_155884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGTCTGCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154770	155644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_155017_155090
850845	contig_11493_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_143697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATAAGACTAAGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208679	208367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_208400_208700
850850	contig_3601_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_132966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATACCTGTGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138366	1139525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1138400_1139500
850853	contig_2770_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_107429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	575	901	546820	546494	NA	25	GACAGGCGGTGTGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAVVGRPGGHTRSVGEAVHKHAGRCQLSAGGSGLETVPFGGLHQADAPSPPEPCHCIFMRQCLALTCPSALRGTSVFVLECSLPGLDDIPITGHTLPNFYLSAIHY	547394	545888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_545900_547400
850855	contig_16892_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_172714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAAAATAGCTTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252152	251838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16892_pilon_-_251800_252200
850856	contig_10437_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_38457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTATCATCACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030137	1029287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1029300_1030100
850860	contig_5084_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_64581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGCTCTCTCCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728618	729810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_728600_729800
850861	contig_17144_pilon	+	270	3	Intergenic	novelGene_29133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCACACCGCGAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38097	38535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_38129_38223_38288_38360
850862	contig_3817_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_78370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCTCTTTTCCACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642903	641502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_641500_642900
850863	contig_7086_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_175763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGGATAGCTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238525	237579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_-_237600_238500
850864	SIRV7	+	252	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATTATCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56058	78950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840
850866	contig_15825_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_160199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64642	65548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_64600_65500
850867	contig_91_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_127127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGGTGGTGGTGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738712	739361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_738700_739400
850869	contig_10017_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_156993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTCTGTCCTTGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341348	340111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_340100_341300
850870	contig_19098_pilon	-	2015	13	Intergenic	novelGene_65794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_12	37.6684181008736	9	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	125	1939	136061	116465	FALSE	35	CAGGTAGTATTATGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKKHKPDFISLFKNPPKNVQQHEKVQKASTEGVAIQGQQGTRLLPEQLIKEGFILSDLFDIGELAAVELLLAGEHQQPHFPGLTRGLVAVLLYWDGKRCIANSLKALVQSRRGKTWTLELSPELVSMTTRFTDELMEQGLTYKVLTLVSQVDVNNEFEKLQRERGLGSEKHRKEVSDLIKECRQSLAESLFAWACQSPLGKDDTLLLIGHLERVTVEANGSLDAVNLALLMALLYCFDISFIEQSTEERDDMLQQLPLLTERQYIATIHSRLQDSQLWKLPGLQATVRLAWALALRGISQLPDVTALAEFTEADEAMAELAIADNVFLFLTESVVGSENFYQEEFYIRRIHNLITDFLALMPMKVKQLRNRADEDARMIHMSIQMGNEPPISLRRDLEHLMLLIGELYKKNSFNLELALEYWCPSEPLQTSTILGSYLGVAHQRPPQRQVVLSKFVRQMGDLLPPTIYIPYLKMLQGLASGPQCAHYCFSLLKVNGSSHVENIQGAGGSPVSWEHFFHSLMLYHEHLRKDLPSADSVQYRHLPSRGITQKEQDGLIAFLQLTSTIITWSENARLALCEHPQWTPVVVILGLLQCSIPPCPKS	140322	116388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_116570_117636_117843_119884_120036_121764_121903_122081_122199_124428_124605_126169_126335_129316_129546_129979_130140_130522_130668_134549_134722_136010_136154_140290
850871	contig_6871_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_21596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGGAACTTAAGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355889	356864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_355900_356900
850872	contig_826_pilon	+	486	2	Intergenic	novelGene_154952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATTTTCTTAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546772	547398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_547164_547303
850874	contig_5690_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_119670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGAAGCAATTATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150831	151323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_150800_151300
850875	contig_13924_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_147775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAAAATCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27654	26933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_26900_27700
850876	contig_17796_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_33829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCAGGTAGATATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90816	90236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_90200_90800
850878	contig_10286_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_98431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTAGTAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466625	467292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_466600_467300
850879	contig_12092_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_163442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGTAAACTTGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123157	124131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_+_123200_124100
850882	contig_11427_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_78984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTGACCAAAATGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259467	260408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_259500_260400
850884	contig_19815_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_154698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGAACCTGGCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54302	53076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_53100_54300
850885	contig_9516_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_106209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTAGGCTTCCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1442683	1443153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1442700_1443200
850886	contig_992_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_164296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACATATAATCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340912	341206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_+_340900_341200
850887	contig_6557_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_33025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGAGGCTGCGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628477	629120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_628500_629100
850889	contig_4876_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_137918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAATTAGTTTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627677	627043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_627000_627700
850890	contig_13496_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_107652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAACGAGAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394639	396022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_394600_396000
850892	contig_9011_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_159330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAAAACCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601080	599886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_599900_601100
850893	contig_8412_pilon	+	1062	6	Intergenic	novelGene_118360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_2	23.8042013098528	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	274	1062	332534	343818	FALSE	60	AAGATTAAAAAACCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEGEESTQETTLNPNITGQVRLSSETLGKFTSESTLVTPETKPGKNLRGSVLIGKNKAESHGSGSQKQHHLHSSETPQISSSPQPFGPTQRRLSVSASIGGETGLMSCVLPEELLVQILAERIQLSDCYRGVVFDSLETLFARNGTAALLCLLKAIGNREHIYVINMAQDYAAMKAQEKAKKEQEEHKRREAFLKEKERLQNMDEEEYDALTEEEKISFDREVQRALRERKKRELERLAKEMQEKKLQQELERQREEDELKR	332260	343818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_332556_335975_336191_337621_337760_339330_339515_341642_341785_343730
850894	contig_19469_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_135008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCAGGTATGATGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360602	361164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_360600_361200
850896	contig_5715_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_127984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGCAGCAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645845	645187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_645200_645800
850897	contig_11396_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_71365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGGGTAGAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804211	803319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_803300_804200
850898	SIRV2	+	295	1	FSM	SIRV2B	SIRV205	523	1	-74	302	-74	-302	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGCAGTAATGCTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034	1329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV2_+_1000_1300
850899	contig_17068_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_172577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCTATGGGGCAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206460	207262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_206500_207300
850900	contig_5916_pilon	+	1355	1	Intergenic	novelGene_158060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTAACTTTCAGGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486802	488157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_486800_488200
850902	contig_8576_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_88724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGGTGCTCTCAGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534807	535819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_534800_535800
850903	contig_14366_pilon	+	666	4	Intergenic	novelGene_177665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	5.79271573232759	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	29	394	7966	19958	FALSE	70	TTAAGAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GANEKEIALMNGLTVNLHLLLLSFFKPTPKRYKILLEAKAFPSDHYAVESQLQLHGLNVEKSMRIIKPREGEETLRMEDILEVIEKEGDSIAVILFSGVHFYTGQLFNIPAITKAGQAKVCTSLSPFYLA	7937	20230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14366_pilon_+_8002_9543_9616_10931_11007_19775
850904	contig_19564_pilon	+	760	2	Intergenic	novelGene_29665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAGTGGGAACTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64744	66016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_65284_65795
850907	contig_1154_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_87201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAATTATTTTTACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105312	1104553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1104600_1105300
850910	contig_12837_pilon	+	621	3	Intergenic	novelGene_57283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_2	9	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACCTAGTCTGTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60748	75783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_60982_75310_75447_75531
850911	contig_7644_pilon	+	1041	6	Intergenic	novelGene_64272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	279	1040	451093	490421	FALSE	25	CCTCAGAAATTGGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFRGHALPGSFFCFMGLWWSTKYILKYACKKYKRTCYLGSKALFHRIEVLEGIIIIAMALSGMTWEQFVPGGPYLTLYDYKEGQWNQLLEWQHCTMYFFFGLLGVTIIVCYMSRSLPVSLAKLMMSNAFFVEAFIFYNHTHGRDMLDIYVHQLLVLIIAVTGLLTFIDFMKSNIILELLQPSFILLQGTWFWQIGFVLYPPNGGPAWEPTDHDNIMFVTICFCWHYAFSLIVSGLNYVFVTWLVKFKLKRFC	354817	490422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_355090_451086_451283_452547_452761_452915_453098_480252_480399_490390
850912	contig_2311_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_169806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTTCCCTCCTCCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104213	105504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_104200_105500
850913	contig_21196_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_174873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATCCTTAATACATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3511	3008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21196_pilon_-_3000_3500
850914	contig_11720_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_44049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGACTGGACCCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704572	705173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_704600_705200
850915	contig_4125_pilon	-	1152	10	Intergenic	novelGene_25136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	460.357536843262	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	120	707	822728	813826	TRUE	25	GAGTGGAGCTCAAGGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREGGWDPAVRLIPLPGQRAPPSWPSTWAPWAS	846563	812641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815268_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
850916	contig_17198_pilon	+	620	2	Intergenic	novelGene_62402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCACCACAGCGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098447	1099575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1098759_1099266
850918	contig_9707_pilon	-	1038	2	Intergenic	novelGene_175102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCAGATTTGGAGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178299	174462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9707_pilon_-_175460_178258
850919	contig_7963_pilon	+	345	3	Intergenic	novelGene_58590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	31	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTCATTATTACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259852	270149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260482_269870
850920	contig_5083_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_151633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATTTCAGGAGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121835	121101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_121100_121800
850921	contig_5083_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_151632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121132	120847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_120800_121100
850922	contig_1406_pilon	+	829	9	Intergenic	novelGene_25616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	27.8017535418182	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3	593	2402664	2592261	TRUE	35	TAATTGTGAGAAATAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNGSKAEKENTPNEANLQEEEVRTLFVSGLPLDIKPRELYLLFRPFKGYEGSLIKLTSKQPVGFVSFDSRSEAEAAKNALNGIRFDPEIPQTLRLEFAKANTKMAKNKLVGTPNPSTPLPNTVPQFIAREPYELTVPALYPSSPEVWAPYPLYPAELAPALPPPAFTYPASLHAQMRWLPPSEATSQGWKSRQFC	2402661	2606596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2402730_2484611_2484690_2487623_2487663_2488903_2488967_2526460_2526612_2574414_2574546_2592198_2592269_2599096_2599201_2606471
850923	contig_3252_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_61472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTAAAACTTTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61073	60084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_60819_61042
850924	contig_8624_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_112580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTAATGTGTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176163	1175163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1175200_1176200
850926	contig_7207_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_72098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	180.872576387049	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTAAGTAGGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758494	734042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_734228_737456_737530_737916_738031_758376
850927	contig_5549_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_81658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTTTACTAAATAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446731	447740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_446700_447700
850928	contig_18208_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_176172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTGCAAATTATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139012	140223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_139000_140200
850930	contig_7056_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_43694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTTGTATGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919907	920970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_919900_921000
850932	contig_9036_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_155465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGTTTTAAAGCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192844	194184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_192800_194200
850934	contig_9982_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_55787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAGCTAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711629	713057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_711600_713100
850935	contig_12127_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_130107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTGTAGTTTGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98318	97885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_97900_98300
850936	contig_3252_pilon	-	1257	8	Intergenic	novelGene_61473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.728431359084683	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	37	843	121429	86244	FALSE	35	CAGAATGAGAGATGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGQAEDISEDLMEFSLEDQEDAKASLNRSYLYRSPSMPENLNRPRLKQVVEFKDNPVPDQGLGLKKTVSLCDIRVTQVLEEDSNQGHLIGDFSKVCALPTVSGRHQDLRYINAETVAALLWGKFQGLIEKFYIIDCRYPYEYLGGHIQGALNLYSQEELHNFFLKKPIVPSDIQKRIIIVFHCEFSSERGPRMCRFLREEDRALNQYPVLYYPELYILRGGYRDFFPEYTELCEPQSYRPMHHQDHKAELLRCRSQSKAWEGERQLREQIALLVNDMNS	121465	85829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_86394_86573_86686_87071_87206_87763_87863_101578_101642_107376_107479_108481_108593_121393
850937	contig_10116_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_177668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGTGTCACAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45218	43702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10116_pilon_-_43700_45200
850938	contig_4125_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_25065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTGGAGTGCAAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417885	418765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_417900_418800
850939	contig_15325_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_157162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACCCAACTTTCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72387	71838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_71800_72400
850940	contig_9366_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_166232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750413	749485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_749500_750400
850941	contig_11816_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_98543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTCCAGAGTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080780	1080192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1080200_1080800
850943	contig_17563_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_175679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGGAGCCCTGGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15451	14809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17563_pilon_-_14800_15500
850944	contig_12740_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_159217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGCGATGGTCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104557	105476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_104600_105500
850945	contig_4686_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_118484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352102	351378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_351400_352100
850946	contig_13015_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_165558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAGGTTTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392135	393177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_392100_393200
850952	contig_9443_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_167125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67155	66224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_-_66200_67200
850953	contig_5799_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_50290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTGACGTTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355257	354114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_354100_355300
850955	contig_5551_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_134229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATAGCTCCTGCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306369	307032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_306400_307000
850957	contig_9415_pilon	+	914	5	Intergenic	novelGene_109801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	53.204205660831	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	73	357	1720811	1759460	FALSE	80	AGATGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIFLIAGKANEGLKAINPEETAPSMRLLAYVSGLGFGIMSGVFSFVNTLSDSLGPGTVGIHGDSPQFFLHSAFMTLVIILLHIFWGIVFFDGCEKKRWHTLLVVLLTHLLVSALLQTL	1712924	1760017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1712945_1720758_1720830_1721860_1721984_1733129_1733258_1759445
850958	contig_10063_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_127756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	604	915	672907	673218	NA	65	ATGAAAAATGTAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGSDSSDLPYLALITSPSLFPVLVPGSLHRPLVRQTEEPGALSYTGRNYSSQRGHSVPKATQTVHDWDWKLSPLASSPGSFHHLIPQVQSDKTEKELEVHH	672303	673668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_672300_673700
850959	contig_695_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_177168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71943	70781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_-_70800_71900
850960	contig_15354_pilon	+	448	4	Intergenic	novelGene_65718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_3	31.2018517968975	3239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGTCTGGTGTCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228008	231419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_228093_229787_229898_230473_230610_231301
850961	SIRV5	+	352	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-23	876	-23	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8292	10990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
850962	contig_11117_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_148606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154674	156167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_154700_156200
850963	contig_4519_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_123734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATTTTAAACACATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762249	761298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_761300_762200
850964	contig_2596_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_53491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGTAATACATATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729039	729910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_729000_729900
850965	contig_7408_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_168719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGACTATAAAACGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10262	10908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_10300_10900
850966	contig_8291_pilon	+	1031	8	Intergenic	novelGene_99962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_7	30.8399422959306	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	118	990	665620	706772	FALSE	45	ACAAAAGAAACTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVKVIHRDLKSRNVVIAGDGILKICDFGASRFHNHTTHMSLVGTFPWMAPEVIQSLPVSETCDTYSYGVVLWEMLTREVPFKGLEGLQVAWLVVEKNERLTIPSSCPRSFAELLHQCWEADAKKRPSFKQIISILESMSNDASLPDQCNSFLHNKAEWRCEIEATLERLKKLERDLSFKEQELKERERRLTMWEQKLTEQSSTPLVLPLAARMSEESYFESKTEESNSAEMSCQITAASNGEGHGMNQSLQAMMLMGFGDIFSMNKAGAVLHSGMQINMKAKQNSSKTTSKRRGKKVNMALGFSDFDLSESDDDDGDEEDNDMDNNSE	661264	706813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_661308_665422_665452_665574_665713_675306_675394_685915_685991_691644_691752_702178_702315_706397
850967	contig_10003_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_88181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAATTTCCTAAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439578	440432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_439600_440400
850971	contig_12750_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_172630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTCCTTTTCTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119960	118975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_119000_120000
850972	contig_7307_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_177661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15419	14335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7307_pilon_-_14300_15400
850973	contig_7165_pilon	-	461	4	Intergenic	novelGene_116921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	41.6679999786673	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	19	327	1240225	1235077	FALSE	25	ACCTAATTTTATTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYKNDVMIRKEAYVHKSVMEELKRIIDDSEITKEDDALWPPPDRVGRQELEIVIGDEHISFTTSKIGSLIDVNQSKDPEGLRVFYYLVQDLKCLVFSLIGLHFKIKPI	1240243	1234942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1235177_1236917_1237001_1238422_1238534_1240210
850974	contig_10437_pilon	+	526	4	Intergenic	novelGene_38098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	111.416136872338	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	78	404	52773	63304	FALSE	20	TAGATGGACCCCATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGGRAPRKTAGNRLSGLLEAEEEDEFYQTTYGGFTEESGDDEYQGDQSDTEDEVDSDFDIDEGDGPSSDGEAEEPRRKRRIVTKAYKEPLKSLRPRKVSNPAGSS	52695	63426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_52890_56422_56576_56745_56796_63297
850975	contig_6346_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_172090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGATTAATTATAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245282	244853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_-_244900_245300
850976	contig_6346_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_172089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAAATAACTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244705	244041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_-_244000_244700
850978	contig_16205_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_156863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGAGTCTGTTTCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69804	69241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_69200_69800
850980	contig_7179_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_78148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCCTCACCTGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003741	1003059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1003100_1003700
850981	contig_9931_pilon	-	1384	1	Intergenic	novelGene_134839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTCAGTGTAGGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350961	349577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_349600_351000
850982	contig_14071_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_177670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391106	390522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14071_pilon_-_390500_391100
850983	contig_11416_pilon	+	806	5	Intergenic	novelGene_145363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	4	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	74	742	440858	448710	FALSE	15	CCACTGGCTTAAGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIEGAAVSRCTDSPYLRPLTLHYRQNGIQKSWDFMKTHDSVAVLMFDSSRRCLVLVKQFRPAVYAGEVERRFPGSLAAVDQDTPQGLLPALPGSVGVTYELCAGLVDQLGVSLEEVACKEAWEECGYRLVPSDLRRVAMYKSGVGLTSSNQTMFYAEVTDAQRSGPGGGLVEEGELIEVMHLPLDGAQAFVDDPDVPKTLGVIFGIFWFLSHVAPGLGAQ	440784	448774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_440939_444035_444080_444869_444935_445136_445375_448469
850986	contig_12450_pilon	+	830	2	Intergenic	novelGene_162315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253728	258765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_253985_258191
850987	contig_9415_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_109866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	2020207	2019863	NA	10	TATCTTTCAGGTTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PERGVLKHGPEPRAGPGEALPAVLVQEGEEVQQALVVELRYVHGEPASAAGLGPRAPAAASAPPQLGAAGHIWLRNGVYFWLTTGAEALRRGKPASQDPDIRAPVCGSASVRRD	2020209	2019414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2019400_2020200
850988	contig_6595_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_122545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGTTCTGCCCACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615276	616406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_615300_616400
850991	contig_7308_pilon	+	1340	9	Intergenic	novelGene_159592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	21.4184499906039	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	17	1339	214593	257482	FALSE	55	GTAAAAAAAAAATCGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGEDWMMYRHGKNHKVFQANNDAAEVVLNKLHMPLLTRFVRIRPQTWHSGIALRLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTREYLWSPSSARLVSSRSGWFPRIPQAQPGEEWLQVDLGAPKMVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQDPRILQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPVPAQYVRIYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSRPTVETLGPTMKSEETTTPYPIDEEATECGENCSFEDDKELQLPSGFNCNFDFPEETCGWMYDHAKWLRSTWTGSSSPNDQTFPDDKNFLRLQNDGRREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQYQATGSHGVTLQVVREASQESKLLWVIREDQGSEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGMIGKGRSGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAGENFQ	214576	257483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_214623_227786_227932_230000_230351_232425_232571_237778_237896_241619_241761_254088_254352_256155_256253_257447
850992	contig_5718_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_110311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAGAAAGAAAAGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438822	439210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_438800_439200
850993	contig_20614_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_107517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	265	495	57775	57545	NA	5	GAGCCCCCCGCTGGCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKEKESGWPTREQVQQVQSQIKGGGLRKHRPRPLKGPPPPPSARRNGIPTGCTAGSKASDRCSSACGLGADFQGSSGRIPGLCRDWEMVESHRATVSVSLAKKTRERRGATALIRSLRTAAEDRGLFVSCRGGAEGRAPQASPHPDPPAMLLLSQQTLGLPSA	58039	57186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_57200_58000
850994	contig_6287_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_160431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAATACGTATAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151401	150341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_-_150300_151400
850995	contig_14768_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_115078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	70	339	217648	217917	NA	5	CCTCCTGCCTCTGCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSGPGHTPPCVFLPAGGHRLPMHWWVGPCLCWPPDGAVFSSLEASLCPLSSRPQPSPLQLQDIASPCNILILIHIQIGFGGPRSWMRRALPSLTHIACPPPFPYTYPTYN	217578	218410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_217600_218400
850996	contig_5095_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_74947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAATTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203083	204083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_203100_204100
850997	contig_12470_pilon	-	1339	3	Intergenic	novelGene_177672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0.5	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATCTGTTAGTGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81820	76599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12470_pilon_-_77660_79946_80133_81727
850998	contig_18244_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_177674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTATCAATGTACCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171852	173070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18244_pilon_+_171900_173100
851000	contig_938_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_143925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTGATACAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336792	335696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_335700_336800
851001	contig_14704_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_82691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCAGAAAACTTGAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71431	128982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_71555_128563
851002	contig_10953_pilon	+	377	4	Intergenic	novelGene_42563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	2311.68067767924	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	57	335	423231	426254	FALSE	15	CGTACTCTGTTTCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRSLEATRRETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	420003	426296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_423202_423365_425213_425291_426186
851003	contig_15134_pilon	-	527	3	Intergenic	novelGene_140224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	71	278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	83	385	216759	215636	FALSE	25	AACTAGATTATTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSSCWSDPVVVVVVVVVVWLTAGEAIMTSTSKAIELQLQVKQNAEELQDFMRDLENWEKDIKQKDMELRKQNGVLEENLPPIRNGNFRKKKKGKAKESSKKTKEENTKNRIKSYDYEAWAKLDVVI	221856	215493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_215786_216606_216766_221780
851004	contig_17059_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_166099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATGGCTGTTCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540813	539497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_539500_540800
851005	contig_1406_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_25479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGATTACATTAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301049	1300565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1300600_1301000
851006	contig_15498_pilon	+	969	4	Intergenic	novelGene_42715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGGTCCAGGATAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992774	1022127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_993496_1011552_1011676_1014077_1014175_1022099
851007	contig_14300_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_133097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTTCAGGATCTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149870	149004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_149000_149900
851008	contig_2646_pilon	-	667	5	Intergenic	novelGene_69569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.707106781186548	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCATGTATGGGATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118784	1106475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1106621_1106764_1106908_1112373_1112415_1113305_1113454_1118594
851010	contig_5643_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_38725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAAACAATGAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52568	51394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_51400_52600
851013	contig_3602_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_60560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAGCATTAATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498008	499435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_498000_499400
851014	contig_9424_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_143772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTCTCAGAATCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273838	274725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_273800_274700
851015	contig_5549_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_81703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAATAAAATATGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850944	849903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_849900_850900
851019	contig_4974_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_161415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	271	405	107619	107485	NA	25	CTGAGTATCATTCCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLTVTTRHPKISPSPRSPASHPKDQLPFLTHALWAGPQADCLCRRHLHAKRPCNTSRISSGKKGTPPARAVLGHWTPRGTPSDSLRRDTMSGRGPGEPLKCKKESVMVFQSAWRLSPFIYSFFFPTISTCFIQ	107889	107194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_107200_107900
851021	contig_8317_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_20738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATCATTAACCAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17056	16622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16600_17100
851023	contig_13379_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_175867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCTGAAGAGGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91973	93061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_92000_93100
851025	contig_4055_pilon	-	848	6	Intergenic	novelGene_158169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.03960780543711	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	846	2	847	330683	290133	FALSE	30	GCAAGGCCAAGGTGAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGSSTQPEALHYDYIDVETSANVIQTAKQTFCFLSRRGVSANPYLGSTSNGYANPSGLALHYDYVPCINGSVKGKKPAVASSGVPGKGKTLSSQQKKADFTGGVKRAPSNSDQYKYGKNRVEADAKLLQSKEEELLKRKETLRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKTQVILEDKLKKLEEDCKQKEAERVNLELELTEVKESLKKALAGGITLGLAIEPKSGTSSPQSPVPRHRTLENSPISSCDTSDTEGSLPINSAAILKKSPPASSAGSSPCRGHVL	330684	290131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_290292_303145_303337_307458_307624_314354_314470_323384_323503_330585
851026	contig_4055_pilon	-	760	3	Intergenic	novelGene_158168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	290182	284330	FALSE	50	AAGCCATGGATAACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHPPPPRAAPPAEGTCCARPRTKLTSGRVAPRSLSAPSSPGRRDVAEVSPAQSALGLGAQKAGSQGADPQRTVVSREGAGVGVEERNIRPAGRLWLQEASDQLQGR	290182	283890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_284413_288981_289158_290120
851027	contig_3270_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_104476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175268	175789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_175300_175800
851028	contig_7057_pilon	+	335	3	Intergenic	novelGene_123197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	316	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGAGTGTGTGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417992	425755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_418086_419809_419927_425630
851029	contig_12540_pilon	+	1401	2	Intergenic	novelGene_148094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_1	0	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	595	909	968353	968819	FALSE	35	AAGTCGATTCTAACTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVPRSCQYPLGAESLQVRTASLGLTSTNISLFLWFYRERRISLSTSDVSGLLPSPAKTQSLSETVDGEPSSKKPVVQKKKSGDSASITDARLYPSPQADSK	967758	969311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_968539_968690
851030	contig_9218_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_157682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGACTCATAGTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300034	298557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_-_298600_3e+05
851031	contig_4339_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_146087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCGTGTACCTTTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062315	1061144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1061100_1062300
851032	contig_3787_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_102440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGTTTTTTTAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718660	718050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_718000_718700
851033	contig_10466_pilon	+	976	3	Intergenic	novelGene_173626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.5	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	157	465	132530	137026	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSVAPSQLQGNPLKKPKFIPPGRSNASPNEEITKLSPDVKLFEVAANKSQNDSRTCSLSLLHTEGNARQINHRDNYGGKYRSEASVMPTLDPPHTGKTVL	127894	137537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_128035_132513_132665_136852
851034	contig_4125_pilon	-	657	4	Intergenic	novelGene_25054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.8539897594894	5	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	334307	331722	FALSE	20	ACTTCTTGAGTTACCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCSARWAWARAPPRSRAAAPAAFRAGRSPTRAAAAPAPQAWRSVLSRTARVSSLSSTAETRGATAASTIHAHQARKHGPKGHSLLALSALTVPLEDQPV	334307	331364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_331749_332375_332409_333265_333389_334190
851035	contig_6101_pilon	-	1279	2	Intergenic	novelGene_114284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTTTCCAAATTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327592	320441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_321658_327529
851036	contig_13112_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_98843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCTGACTAGAGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653642	654853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_653600_654900
851039	contig_9366_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_166227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCTCAGTATTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676251	675310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_675300_676300
851040	contig_7521_pilon	-	1006	2	Intergenic	novelGene_160550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAATCGGCTAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383564	305871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_306857_383543
851042	contig_10549_pilon	+	711	3	Intergenic	novelGene_110585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	10.5	146	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTAAGTGATGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108885	138407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_109319_137905_138032_138255
851043	contig_987_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_72260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414171	414995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_414200_415000
851044	contig_14575_pilon	+	477	2	Intergenic	novelGene_101903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTGAAGAGAAAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61190	63898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_61637_63867
851047	contig_11413_pilon	+	421	2	Intergenic	novelGene_103148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199386	202546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_199491_202229
851048	contig_11572_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_100034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTCCAATATCCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137765	138089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_137800_138100
851049	contig_7362_pilon	+	1069	1	Intergenic	novelGene_147566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGTGTGTGTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699772	700841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_699800_700800
851050	contig_6677_pilon	+	470	3	Intergenic	novelGene_114185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	65	382	491683	497007	FALSE	20	CAATCACTTTCTTCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSVLGEPCSFDVAIIAGRLRMLGDQFNGELEASVRSVIAETTQKKAEAVLKDTVKSLSTTWCAQDSSLAYERAFLAVSVKLLECVAHMAPEIATWVAIPVINMINGNSAIRQFIQGQGGWENLES	491618	497095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_491758_496108_496334_496989
851051	contig_8848_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_140460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTTATTTCATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93577	92981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_93000_93600
851053	contig_9051_pilon	+	748	2	Intergenic	novelGene_170806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	365	691	1039112	1044378	FALSE	10	GCCACCTGCTTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPPPSWSNAEEPGRPPGQKMGSHGSVLKTSDQELSLQNAIQSPIHGKASPKWCAFKSGDTDRQTEEGRPVMLQLQDKELLEPPQAGKEAGTDSPSEPQEESTGLTP	1038747	1044435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1039271_1044210
851054	contig_5331_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_112794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	747	1055	439837	439529	NA	55	TTACCACAAAAAAAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRPPAGERMSKDGKSSSVTLTSRKGFRGQLKPVRFKSASEIPSHFNGNHTTDPFLQYSMIFFNPVMRFGFQMDGCFLVLTHVLGLVNDEELCWGSTSIAQV	440583	439215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_439200_440600
851055	contig_1301_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_47389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCCTTCTCTGGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731392	731631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_731400_731600
851056	contig_14536_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_69285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55219	56313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_55200_56300
851057	contig_9593_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_59701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87066	88899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_+_87100_88900
851058	contig_7410_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_106111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAACAAAATATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457493	459412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_457500_459400
851060	contig_12119_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_88633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCAATGCCAGGCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81810	82431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_81800_82400
851061	contig_6595_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_122547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTGAAGACTTCGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625894	626408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_625900_626400
851062	contig_18414_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_170017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAGAAAAAAAACTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115957	116201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_116000_116200
851063	contig_2215_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_163856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACTGTATGCTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207669	208166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_207700_208200
851064	scaffold_13505_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_111622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTATTATGTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675872	676085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_675900_676100
851065	contig_14970_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_45091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGTTGGTGGTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226393	225921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_225900_226400
851067	contig_10855_pilon	+	441	2	Intergenic	novelGene_124319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCGGTCCTAATCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319910	325523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_320325_325496
851072	contig_4689_pilon	-	882	4	Intergenic	novelGene_165394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTTTGGAAATACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885159	873716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_874015_880379_880594_881396_881709_885101
851073	contig_5210_pilon	+	458	2	Intergenic	novelGene_65436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	23	343	475315	475980	FALSE	20	AAGGAAGTGGCGGGTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAVACVMATPGPVTPKEPFDLSQPPVIEGFSANVYSNSESFKEKFLRKTRENPMVPIGCLGTAAALGYGLYCFHRGQSRRSQLMMRTRIAAQGFTVAAILVGLAVSAMKPRH	475292	476095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_475469_475813
851074	contig_5669_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_86088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCAAAACTAGCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200277	199507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_199500_200300
851076	contig_9437_pilon	-	972	2	Intergenic	novelGene_141705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	0	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAATGAACAGATGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77153	12140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_12753_76793
851077	contig_6938_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_69072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCTGTACAGTTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158888	157929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_157900_158900
851078	contig_3948_pilon	+	879	4	Intergenic	novelGene_53152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	2.62466929133727	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	50	688	28739	41345	FALSE	20	CCCATCTAGGTACTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPPQLRALLLAVNTLLRKRRYHTALAVLKGFRNGAVYGAKIRAPHALVMTFLFRSGSLQDKLWAILQSTYTHSRNLAYFVFTYKGLCALQSHVQGKTYQVHSFLAAFIGGFLIFGDYNNINSQISMYLMSRTLYALCRLGVEKGYIPEPRWDPFPLVTATIWGLVLWLFEYHQSTLQPSLQSSMTYLYEESNVWHDISDFLIYNKRRSSK	28689	41536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_28852_34543_34607_37396_37596_41081
851079	contig_1380_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_138877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATCAGATTGTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99037	99643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_99000_99600
851081	contig_15146_pilon	-	1119	2	Intergenic	novelGene_116954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCTTTAAATAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519433	518075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_519122_519360
851082	contig_4874_pilon	+	1435	9	Intergenic	novelGene_78623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.8146582964986	1	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	446	1417	67432	93142	FALSE	45	AACTCATTGATCAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILEEQSLAAESKTVLQKLISVLKTDLLNSLETILSPTVMSILKINSQIKHIFKTSLTVADKIEDQKKEMDDFLSTLCSNLHELQESTVSSLAESQKLCENLTEDLKTIKQTHSQELCQLINIWAERFCALEEKCDNIQKPLDSVQENIEQKSKDLINKTTSRGTKFCADSDGLSQELKQFNQEGTKLVEESVKHCDKLNSNLEIISQETEQKCEALNTSTLCFSEQWVSCLNKRQEELQNLFEVINQGCEASSSEITEKLSGYKAATENQRNTFLDQITTDEERLMSQSLELNETIKIGLTKLKSLKVRHHRGRIIYTHQHW	65352	93160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_65503_66154_66356_67337_67492_73744_73871_73946_74106_76474_76582_87005_87286_91368_91553_93086
851084	contig_7753_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_41477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTTTGCATAGGTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962593	962083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_962100_962600
851085	contig_3601_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_132931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAAGGGCCTCTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373680	374965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_373700_375000
851086	contig_14829_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_163817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTTCTAATACATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103266	103984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_103300_104000
851088	contig_12638_pilon	+	551	3	Intergenic	novelGene_33051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTAGTCTGATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8714	9550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9076_9270_9318_9407
851089	contig_211_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_129890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378795	379359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_378800_379400
851090	contig_9389_pilon	+	656	3	Intergenic	novelGene_83857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	984	8	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	266	307	9586	9627	TRUE	40	GGACTCAGCAATAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAVAVKAPGWKDGTLEGWVERVGWGLSPPLCPLPILRGCPFSGTVWARLTEGKGPLVYSWCKVLKEVAEEGRSGVPLSAAGPLPTEQMGPVKATRPPPPS	9320	12392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_9660_11447_11562_12189
851092	contig_9216_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_163517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	31	312	681577	681296	NA	40	TCAGAACTAGAAAGGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYGIRFRKKMKISLLLLLFFFKIWKGTQFFMVLLSFFFLYSIPWYSFNIISKTSPPSLQLTTTSLLPAACVSSDLRNKINVVSDIHCDENENVLECNALENM	681607	681093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_681100_681600
851094	contig_5250_pilon	-	636	7	Intergenic	novelGene_176101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1.88561808316413	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	48	635	551637	331157	FALSE	35	TCAGGCCACTGGTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFREHLDKLFAKGIGMLDIALNEAFNVLSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDAIFAKHNWPDRKVRIFTYLIGREAAFADNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVIDQEHDVVWTEAYIDSTLADDQGLVLMTTVAMPVFSKQNETRSKGILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHGYAFAITNNGYILTHPE	551684	331155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5250_pilon_-_331220_345581_345663_347244_347317_421607_421742_432579_432659_541418_541533_551592
851095	contig_7057_pilon	+	852	6	Intergenic	novelGene_123299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	84.1308504652128	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	6	740	898785	905717	FALSE	20	ATTGGCTACTGAGACGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMEVTGISAPTVTVFISSTLNTFRSEKRYSRSLTIAELKCKLELVVGSPASCMELELYGADDKFYSKLDQEDALLGSYPVDDGCRIHVIDHSGARLGEYEDVSKVEKYKISQEAYEQRQDSVRSFLKRSKLGRYNEEERAQQEAEATQRLAEERTQAAAITVGSRCEVRAPGQPFRRGTVMYVGLTDFKPGYWIGIRYDEPLGKNDGSVNGKRYFECQAKYGAFVKPSVVTTGDFPEEDYGLDEM	898779	905829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_898899_899284_899429_900750_900848_901239_901432_905387_905461_905602
851097	contig_5253_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_61563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195972	195566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_195600_196000
851098	contig_3163_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_168072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAAAAAAAAAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710136	709511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_709500_710100
851100	contig_14528_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_111260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACATAGCTCTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187486	186021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_186000_187500
851102	contig_10451_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_138321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	283399	283704	NA	40	ACGGCAAATAGAGCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNLSLCIQLTGFAPLKNPIKTASNTLIHIKILIPSDTKQTRTRVVVIPSKLHRTQQQTQSTTDHAGKPGGNKHRPEEAGYYGTLLSSPLSGSSQLHLSYIT	283396	283838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_283400_283800
851105	contig_6654_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_85723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTTTTTTTTTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318507	318944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_318500_318900
851106	contig_14333_pilon	+	920	7	Intergenic	novelGene_49075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	504.153002569656	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACGAAGAGACCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226852	285941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_227254_228226_228346_268099_268161_269945_270067_274012_274066_282470_282597_285902
851107	contig_709_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_57675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTCCCCAAGTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3982150	3984227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3982200_3984200
851108	contig_14530_pilon	-	1170	8	Intergenic	novelGene_108442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCCACGTTTCGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35398	9629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_9800_9882_10056_13903_14027_23779_23913_24256_24400_26701_26783_33246_33354_35158
851109	contig_5120_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_169622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCGAAAAAGATAAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347127	346287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_346300_347100
851112	contig_19330_pilon	-	1259	5	Intergenic	novelGene_163702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	6.57647321898295	22	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	115	1146	91579	85639	FALSE	25	CCTTAGAACTCCAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLFCELCDRPVCRDCVVGEHREHPYDFTSNVIHKHGNSMRELLKGTQPHVEALEEALTQIKGLNSALQERVETVAADVRTFSEGYIKAIEEHRDKLLKQLDDIRIQKENSLQLQKAQLEQLLADMRTGVEFTEHLLTSGSDLEILITKGVVVERLTKLNKVEYSARPGVNDKICFSPQEKAGRCHGYEVFGAINTKEVDPAKCVLQGEDLHRAREKQTASFTLLCKDAAGESMGRGGDNIQVAVVPKDKKDCPVRTIVQDNRDGTYSVSYTPKEPGIYSVWVCVKEQHVQGSPFTVTVRKKSRSHHGVFHCCTFCSSGGQKTARCACGGTMPGGYLGCGHGHKGHPGRPHWSCCGKLTEKSECTGTGGQSAPRSLLRTVAL	91693	85525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_85788_86641_86769_88941_89057_89684_89815_91068
851113	contig_16252_pilon	+	1340	2	Intergenic	novelGene_162610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	14	424	21014	21649	FALSE	45	TTCTGTCAAAATAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRRMEKKLRAFLVVLWLHFYWVSGNNKVEQSSGSLIILKGENCTLQCNYSVSPFNNLRRYKEDTGRGPISLIIMKYSESKKSNGRYTVTLDATAKCSFLHLPASQLSDSASYICAVGAPCSPGTCSLYTKLQVEVVKQV	21000	22565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16252_pilon_+_21066_21290
851114	contig_2799_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_85607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	310	720	806983	806573	NA	60	TAATAAAACACTTGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRLPQVKGDILWAPPRPPSPNPFPEVGLGSLAITQVHQHLCHQVLITNAPHVQPHGRSWSPTAGLTALGWLEVSTGGNMLPDSGVSLGASPSTPLRIAPLRGSSDDPVSYQANTCQQPWGPFRRAYLPSKTRSR	807292	805611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_805600_807300
851115	contig_11216_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_173595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGATAAAATCCAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73612	74771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_+_73600_74800
851116	contig_9921_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_23718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCTCTACTATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77665	79117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_77700_79100
851117	contig_16541_pilon	+	621	5	Intergenic	novelGene_126754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_4	223.067814800791	3026	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	124	591	441353	474766	FALSE	10	TTTTTCGAAGGTTTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQFVLFSTLFPSVFTELGEPRWVCNSSDISIWYTYCDNMKYPISLNLTPCITLKGSRGLLHIYYIPRRDVEKLYFNLYLSVNSINLPKRKEVICRGSDDSYSFCRALKGETVNTTIPFSFRGIKFSKGLYRCVAEAISGKTEEMLFCLNFTMIH	441229	474796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_441465_459495_459586_464057_464187_473751_473805_474682
851118	contig_12050_pilon	+	526	5	Intergenic	novelGene_62763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	86.6469128128637	1056	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	86	463	799806	811668	FALSE	10	CTTGTGTGTGCCCACCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKYLAQIIVMGVQVVGRAFARALRQEFAASRAAADARGRAGHRSAAASNLSGLSLQEAQQILNVSKLSPEEIQKNYEHLFKVNDKSVGGSFYLQSKVVRAKERLEEELKIQAQEDREKEQVPRT	799720	811731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_799809_809424_809510_810579_810717_811004_811071_811581
851119	contig_5258_pilon	+	886	2	Intergenic	novelGene_100232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAACAATTTTGTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115590	117413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_116371_117307
851120	contig_6785_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_132595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAAAAGTCCCATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878584	879177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_+_878600_879200
851121	contig_6589_pilon	+	771	5	Intergenic	novelGene_25691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.60555127546399	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	60	659	108636	115463	FALSE	20	CCTCCAGGTCAGTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPGKSKSDLCGAGEAGPGGMAERSLAPAYLTDRPGRLQRHLLSGEFDQLRDFPIFESNFVQVTRLGEVANKVTMGVAASSPALELPDLLLLAGPAKENGRLQLFGLFPLQFVQLFVHDECRRQLKVKFRTGRAFYLQLRAPHETRDREFGQWVRLLYRLRFHSAQGAVPFTQEDSALEDGGEEEEEEDDEAAVALEEGDETPAMEARLDPQISELWGL	108576	115575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_108643_108810_108930_109309_109441_114401_114688_115406
851123	contig_18272_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_7013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	20	304	175167	174883	NA	30	TAATTTTCTTTATTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REWRISMCVPVVCVCACTCAVCERVCARAFVCGACLHVWGCVCGVHVVCVCLSVCVHAVSRGVGPDKSGAALPGQAPGLSGAASSPAKSFNSRSQKAKLW	175186	174577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_174600_175200
851125	contig_10082_pilon	+	1048	5	Intergenic	novelGene_63899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	2.12132034355964	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	103	369	483065	485287	TRUE	0	GGTCTCTGGTCCTCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSRAGSRAADNTPPGPRAPDAASATGATAAREEMSQAGSISRNLLLAAYMYGQVPGHLPNEEVSGMTDPMVYFESTGLLAPPISNSARVGLRLALIGDEMDLWLRTPPPCPAGLAGLHHRA	454455	489941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_454551_483057_483217_485172_485288_487556_487675_489380
851127	contig_5779_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_106476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGCACTACGCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147057	146130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_146100_147100
851128	contig_6364_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_51816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAAAAATTTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569008	1567597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1567600_1569000
851129	contig_3948_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_53183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACCCATATTCCTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781074	780596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_780600_781100
851131	contig_10581_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_41453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTAATTGTCTTCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798367	799361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_798400_799400
851132	contig_6403_pilon	+	990	4	Intergenic	novelGene_139881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.24721912892465	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	142	351	895861	896070	TRUE	20	CTGAGATTTTCTTTATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRARREQTAAAAGARLGWPEAGPPFPGNSRKPLPHGAAAYSLLSPWMSRLMRTLAGAERSGDSPHPSSPQGGAQATKAEAQLERERDPETAKPTPPERGPPEPERLPAQGGDGLE	895719	909318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_896116_908429_908514_908626_908785_908966
851133	contig_9571_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_136334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAATGAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778716	779116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_778700_779100
851134	contig_12638_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_33261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCATAGCAATCCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819995	819033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_819000_820000
851135	contig_7426_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_27497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCCAGATCAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923434	924455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_923400_924500
851136	contig_6217_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_109576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAACCAAAAAAAAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101352	100456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_100500_101400
851137	contig_10135_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_106590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTAGGTTCTTTCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32381	31940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_31900_32400
851140	contig_10042_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_79147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAGCAAGTTATTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112908	112206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_112200_112900
851141	scaffold_19766_pilon	+	817	2	Intergenic	novelGene_34273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	114	422	365249	370064	FALSE	20	GCATGGGTTTTGGACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRKEIYSSEESDERLTRMYNVRIMRVEFYFLSQYVSPADSPFRHIFLGRGDHTLSALLDHLRLLRKGDSGAPGVSSPGVEPSLGFQESRFRRQLALLTWTLQGAANALGGDLWNIDNNF	365135	370459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_365273_369779
851142	contig_13697_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_165915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAGAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130659	129554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_129600_130700
851143	contig_4402_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_140800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCCAGCAACATTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227344	228391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_227300_228400
851144	scaffold_880_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_121501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	819	1130	549389	549078	NA	70	AAAAAAAAACAAACTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLPKWNHRINIFVTGDKRGVNHRRPYPTGQMDSILEIRKSGSTRDSFGDLFSKPGKVTLNCLLWLVHTDSITKLCWKNNNENKGIHKISYVNSNKNNANACK	550207	548988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_549000_550200
851145	contig_11160_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_168804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAAGCCTGGTGGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284991	284662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_284700_285000
851146	contig_13014_pilon	+	1375	3	Intergenic	novelGene_169336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	75.5	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	277	435	390014	390172	FALSE	40	TCAAAATTTATAGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFNFRAGSPSALRVLDAVQEGRARINPNKGCRVDVAFTTELYNPKEGAERLGRCSAQVFFRNQKSRPSVNVTCTRLIEKKKRQEEDYLLYQQMNQLKTPLGDISIPGMNKCLEFLRSETCVITKFLKKDDHLNVYPQTGTLIQP	370049	391112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_370122_387080_387144_389872
851148	contig_7035_pilon	-	857	2	Intergenic	novelGene_83534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	68	418	734808	729016	FALSE	30	TACAAGGGGCTCTGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKRVIGKPVRDSQKLKDKGQAWMQNGPDHRKGSSQSTQKWHLTRSNTPFIIKTLHKLGIEGTILNTINAIYEKPTASIILNGERPRAFASRSGTRQGCPHSPLLFNIVLEVLARAIRHEKEIKYPNWEGRGKTITFCR	734875	728576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_729339_734780
851149	contig_348_pilon	+	960	5	Intergenic	novelGene_67623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	88	462	346767	347649	TRUE	15	GGACACTGCCTAGCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRAGASTKASARGPALKGRRAAALVGVRVGVGVRVGAELPLHGLAHGVLQRREVTAGTNAHGLDDLVPGELVKHVHQLHGLMLLLLLCHAVHGVGRLLLHPPRHGVYAGFGFLILLRVRVLLL	346679	348297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_346971_347233_347355_347599_347745_347811_347955_348037
851150	contig_10324_pilon	-	743	8	Intergenic	novelGene_7853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.0636518129863	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	98	655	348024	343479	FALSE	30	GGTGATTCAGAGAGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADELTFHEFQEATDLLAETPDAVTTSKNDQPTPQGHVAVAMGLGGSYGAEEEVEEESDKAALLQGEKQQPGFWTFGYYQSFFDVDTSQVLDRIKGSLLPWPGHNFVRHHLRSRPDLYGPFWICATLAFVLAITGNLTLLLAQRRDPSIHYSPQFHKVHHSLLGRLPSCRRNIRDTSACPAPR	348263	343390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_343522_343597_343635_344348_344466_345789_345878_347257_347339_347429_347591_347993_348055_348196
851153	contig_13004_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_112611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTCAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170067	169558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_169600_170100
851154	contig_13004_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_112610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAGAAATTGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169092	168829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_168800_169100
851155	contig_12031_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_137567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATACATGGTAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305686	304891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_304900_305700
851158	contig_14405_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_85615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	367	933	171084	171650	NA	0	GTGCGTCCTTGTGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKATPGGSVRLRQVSVSEACPATEHSPPSPGQLLGSLFLEKKYSRERMRLLLTFDLNVRELLRRGGQRLTVVFCHLAETVKAAQLTVAVYLPLTTCHWRLFGKQCAGTQFRKRGVGRFACLAADPGFVVWSLQANLLLSSEEWPLSWWGLPLWPGMGEAGAPTRGSICGECWQNPPVRSWSGLESNVK	170717	171752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_170700_171800
851159	contig_3866_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_112384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGCACATTCGTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134667	134308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_134300_134700
851161	contig_5799_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_50293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTAAACAGACGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362202	362462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_362200_362500
851163	contig_15022_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_171801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGCCTTGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40855	39589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_-_39600_40900
851166	contig_6488_pilon	-	845	5	Intergenic	novelGene_44718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	781.073300017354	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	386	844	54113	34323	FALSE	35	AACAACAGTTTCTCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALS	91303	34321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_34366_36841_37030_53885_54122_90850_90998_91073
851167	contig_1516_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_50033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	216	584	608750	609118	NA	45	GGACTATGAAGGAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEQCKSVIASNRISRESLGDYSKESPNKRQERVRSQSGVDLQEDVVVRERPKSLEDLHQKKVGRAKRESRRMRELEQAIFSLELLKVRSLGGVSPTEERRWSTELMPEGLQSLQGTPDSESSQGSLEILSCEESQKSKLESVIPDEGDLQVPSPKISSSSPKFDSQDNALSASSETSYALMKKQKPCASEHFKN	608534	609119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_608500_609100
851168	contig_8594_pilon	-	685	3	Intergenic	novelGene_140073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	5.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	44	685	576841	565382	FALSE	25	CCAGGTAACGTTCTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYHHLLHAFTISVSKDLHVAEYGKNVTMACTFPVGKQLNLTVLVVYWEKEDKKIIQFVDGEEDLKVQHRSYSQRAQLLKDQLFLGKAVLQIRDLKLRDAGVYRCLISYGGADYKRITLKVNAPYRKINQRVSVDPVTSEHELMCQAEGYPEAEVIWTNRDHQVLTGKTIITKGQEELFNVTSTLRINTTAKEVFRCTFQRAGPEENSTAELVI	576884	565381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_565657_575339_575682_576816
851170	contig_18822_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_111730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAAAACGGGGTTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147835	147436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_147400_147800
851173	contig_10477_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_112494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1252	1554	287406	287708	NA	15	GGGAGTTGGAGAGGGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLLLGEAIWFLHHHLGLQLLSVQIVHRLLPPQLPGDGPFQAALLHGPGAAEGRSITHVLFQALQGGFPLRLLPLYLLLGHLQAVLAGTQVFLVTAVGG	286154	287897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_286200_287900
851174	contig_20842_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_160965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTAGTAATCCGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45437	46025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_45400_46000
851179	contig_10795_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_171291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159029	159539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_159000_159500
851180	contig_12312_pilon	+	903	2	Intergenic	novelGene_63972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACACAAGACATCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223251	225459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_224029_225333
851181	contig_4782_pilon	-	1104	2	Intergenic	novelGene_73643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTAGTGTCATTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417786	416485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_417327_417523
851183	contig_4845_pilon	+	1670	2	Intergenic	novelGene_53639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	148	1197	285319	301181	FALSE	45	AAATTTAAATTGGGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPITVLDCDLLLYGRGHRTLDRFKLDDVTDEYLMSMYGFPRQFIYYLVELLGASLSRPTQRSRAISPETQILAALGFYTSGSFQTRMGDAIGISQASMSRCVANVTEALVERASQFIHFPADETSMQVLKDEFFGLAGIPGVIGVVDCIHVAIKAPSAEDLSYVNRKGLHSLNCLMVCDLRGALMTVETNWPGSLQDYAVLQQSSLCSQFEAGMHKDSWLLGDSSFFLRTWLLTPLHIPETPAEYRYNMAHSATHRVIEKTFRTLCSRFRCLDGSKGALQYSPEKSSHIILACCVLHNISLEHGMDVWSSSMMGPVEQPPEEEYEHMESLDLEADRIRQELMVTHFS	285171	301654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_285989_300801
851184	contig_401_pilon	+	746	3	Intergenic	novelGene_42895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1808345	1810374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1808795_1809500_1809614_1810190
851185	contig_10307_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_170283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453827	454894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_453800_454900
851186	contig_17066_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_130950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATAATAGAGAAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154979	153659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_153700_155000
851187	contig_7962_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_149287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGCAGAGGTCACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115564	114481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_114500_115600
851190	contig_12694_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_171976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATAATGAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178306	179035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_178300_179000
851191	contig_2646_pilon	-	1866	1	Intergenic	novelGene_69495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	742	1065	213651	213328	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPYSLPTLSCGSSQAMLVSPPVGLSWAFPPPGSAHPVFLCLVTGMPNSIFASSSKPSHLTGPSSRATSSVKFPLIMATETSALETCSSFWFCCCCCYSFVLLYLLR	214392	212526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_212500_214400
851192	contig_12414_pilon	+	679	2	Intergenic	novelGene_59572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTATGTTCTATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370820	374590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370911_374001
851193	contig_2969_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_157061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTTAGTGACTCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790667	789753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_789800_790700
851194	contig_19606_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_148286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTTGCCTGTTTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175224	176038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_175200_176000
851196	contig_5936_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_53592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATGCTCAGATAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473562	472800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_472800_473600
851197	contig_13067_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_141349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAATTTAACCATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61165	62637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_61200_62600
851201	contig_2646_pilon	-	693	3	Intergenic	novelGene_69541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	105	410	819876	814188	FALSE	25	TGAGTACTGTGCTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDVTKNRVGCGGAATARTLRHLSPQDWTLGKVLRMLPAQGSSTLHPSHHGGGAAPAHQSLGRVSPAPGCPPCPPTPGLSPSMSSLQDSMEIAQEDTGKSKIQLLVSTIGLELKRKKETKDSKKKLVYKTISLHHQ	828238	813904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_814338_819720_819920_828177
851202	contig_8330_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_71723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACATGAATCTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160358	160871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_160400_160900
851203	contig_6048_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_73156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCGTCGCCATTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120888	1120346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1120300_1120900
851204	contig_6048_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_73155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118588	1118053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1118100_1118600
851208	contig_10437_pilon	+	544	3	Intergenic	novelGene_38478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	170	361	1173493	1173883	FALSE	0	CTTCGTGGTGTTTTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKVSEPLLWELFLQAGPVVNTPALGGSHHPDHHLECLILDPLQWACPPRGPPFGSPMGHPGPMPPHGMRGPPPLMPPHGYTGPPRPPPYGYQRGPLPPPRPTPRPPVPPRGPLRGPLPQ	1170377	1174066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1170440_1173385_1173497_1173695
851210	contig_6050_pilon	-	869	3	Intergenic	novelGene_123128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	4	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	325	867	394250	392575	FALSE	55	TAAAAAGAGTGAAAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGAAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKKMAEPDVWFTAVISSLSAPEPLHSDLGEKPVAGANPEPTGP	394574	392572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_392601_393640_393738_393830
851211	contig_2093_pilon	-	1265	6	Intergenic	novelGene_153001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	26.1732688061694	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATATCTGTGCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485431	1415093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1416030_1430744_1430791_1452802_1452862_1466682_1466723_1470471_1470531_1485306
851212	contig_312_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_128298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114007	114620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_114000_114600
851213	contig_1076_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_101146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	988945	989262	NA	75	AACAAAATCAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKAVECILTVFHPTEYNPHHYYVDGIPYTLFKYHHLPRKSNSCQFLGLPASLPPTSVDSVHFYSRQNPVASKLKVSYSLFYFIHIIILHQLTIDLLLNFPPGLWL	988943	990219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_988900_990200
851214	contig_11779_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_146438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCTTCATTTATAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3803	3204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_3200_3800
851215	contig_10371_pilon	-	1405	1	Intergenic	novelGene_175481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAGAAAAAGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744689	743284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_743300_744700
851216	contig_8312_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_152912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTGAATCCAATACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1550209	1550696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1550200_1550700
851218	contig_11574_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_64103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTTAGTGTTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473140	472027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_472000_473100
851219	contig_12864_pilon	+	413	3	Intergenic	novelGene_76401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	561	junction_2	68.5	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	16	411	225015	228609	FALSE	20	GCTCTCTAGGGGTAAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSRFLVGLILAALILQDTASSESYNEITVEEHEDKVILKCDGNISRLEGTEGNRLSDNKSLVLGKSIQDPQGMYRCTEKAAVFALQVYYRMCQNCVELDSTTLVGIVITDIIATLLLALGVYCFAGHETG	224999	228611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_225085_227822_228030_228490
851221	contig_6496_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_103538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTTTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149975	1148576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1148600_1150000
851222	contig_14895_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_106702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATGTGTAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271757	272474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_271800_272500
851223	contig_9609_pilon	-	1789	3	Intergenic	novelGene_23101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.5	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	52	1473	497569	495069	FALSE	25	AACAAATGCTTCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGPSPAVTLALMLAVAWATDLKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRHKVPLDLKAFDVQASPNEGWVNQNITIFYRDRLGLYPRFDSAGRSVHGGLPQNGSLPAHLKMLKTHVGHYIRTQEPAGLAIIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRQLSRQVVASRHPDWPQDCVGKQAQYEFEYAARQFMLETLRWVKAVRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWASYTGRCPDVEVARNDQLAWLWAESTALFPSVYLDEILASSAHGRKFVSFRVQEALRVAHTHHVNHALPVYVFTRPTYSRGLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGYTTSTNTCRYLKNYLKQLLVPYVVNVSWAAQYCSWAQCHGHGRCVRRDPSASAFLHLSTSSFRLVPGHEPGEPQLRPEGELSRADRDHLQTHFRCQCYLGWGGEQCQRDHGKAARGASQAWAGPHLPSLLALTALAVTWSS	497620	494752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_495480_496034_496125_496648
851224	scaffold_16539_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_68372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	89	409	522124	521804	NA	60	GTGGTGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPSLLYTWQCVSGGHTWNQCTSIGSSTDKEMGVTPTAKHHTAGNNTGLWCHTQTQTTLAGLGPSRRSQTPRTHGLISFLKLKTRVSVNGNASISGRITKKGKER	522212	521108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_521100_522200
851225	contig_1154_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_87108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	247	552	393783	394088	NA	80	AGAAAAGAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVKVDILGISELKWTGIGCFESDSRVVYYAENDKLKRNGVTFVVRKNISRSVLKFSSASDRIISICLQGRPVNTTIIRIYTPTANAKDGETEDFYQLLQ	393536	394619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_393500_394600
851226	contig_10399_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_114475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACCCTCGGCTGCGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107854	108896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_107900_108900
851228	contig_10569_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_44103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAGTGACCAGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462799	463266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_462800_463300
851229	contig_13536_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_177676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159721	159387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13536_pilon_-_159400_159700
851230	contig_2419_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_137128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128358	127922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_127900_128400
851231	contig_15182_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_136472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631579	632412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_631600_632400
851232	contig_3382_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_124186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCGAAGCACTGAGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969683	969334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_969300_969700
851233	contig_11370_pilon	-	763	5	Intergenic	novelGene_98787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_4	19.7151591421424	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	60	647	329088	324304	FALSE	10	TCTTGCTCGTCTCAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWEPSAHFHLLPALPNCLAMCTGKCSRFLGLSLIPLSLACIVANALLLVPNGETGWTNHLSWHVWLMAGFIGGGLMVLCPGITAVRAGGKGCCGAGCCGNRCRMLRSVFSSAFGALGAIYCIAVSGAGLRTGPQCFSNGEWKYPFENSNGEYLRNDSLWSLCDNPPRVVPWNVTLFSLLVVAACLEVVLCGVQLVNAAIGVFCGDCRKKEGNPS	329147	324187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_324319_324396_324581_324803_324941_325312_325394_328917
851234	contig_1274_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_137810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAACCTTTTATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475518	476498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_475500_476500
851235	contig_9440_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_59046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCAGACCAGCAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435907	436236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_435900_436200
851237	contig_8795_pilon	-	545	4	Intergenic	novelGene_146883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	48.2378366937085	659	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1	393	166063	117524	FALSE	20	TCCTGAGGTATTTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGARGATWRLFAALRGRSSSLAAMSADAHGLTAEERNRVILDLKAAGWSELSERNAIYKEFSFKSFNQAFGFMSRVALQAEKMNHHPEWFNVYNKVQITLTSHDCGGLTKRDVKLAQFIEKAAASM	166063	117371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_117620_118809_118891_162082_162215_165979
851240	contig_6954_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_64438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATATTATTATCCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459599	459154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_459200_459600
851242	contig_366_pilon	+	1989	19	Intergenic	novelGene_51550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.4906137598905	6	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	234	1769	385754	513043	TRUE	35	CTATGTAAAATCTCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSIPYQQNPYNPRGSSSVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDKVTFSGKECVCQTCSQSMTSSKPIKIHGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHSQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRCGDLSTTAKSKTSEDISQASKYSPAYSPDPYYAAESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEEDFDHSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMRGKHLPL	385140	519573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_385287_385666_385767_439580_439719_450664_450849_452928_453042_458838_458966_464475_464570_472041_472130_486282_486342_488757_488830_495568_495699_501091_501227_503549_503615_504908_505057_508192_508223_508845_508905_511725_511793_513029_513111_519420
851244	contig_3382_pilon	-	842	3	Intergenic	novelGene_124033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	230	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTGTTGCATTTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184339	176659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181582_183910
851246	contig_7553_pilon	-	850	2	Intergenic	novelGene_177679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCCTACTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286682	285723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7553_pilon_-_286091_286199
851247	contig_6980_pilon	+	275	4	Intergenic	novelGene_36003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_1	354.918143927426	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGCTCTCTCAATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346058	362352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331
851248	contig_9177_pilon	-	476	4	Intergenic	novelGene_32712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1544	junction_1	292.148744458861	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	178	474	580752	575784	FALSE	30	GTAAGTATATGTATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLQRIENEVELLGEHLPVGGFTYPPSAHPPTLPPSAPLQFLTHDPLHQEVSFGVPYPPFMPRRLTGRSRYRSQQPIPPPPYHPSLLPYVLSMLPVPPTVGPTFSFELDVEDGEVENYEALLNLAERLGEAKPRGLTKADIEQLPSYRFNPNNHQSEQT	581421	575781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_575904_579673_579759_580660_580768_581259
851254	contig_5918_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_99585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTCTGCCTGCTGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1973016	1972575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1972600_1973000
851255	contig_2703_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_101819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTACTGATTCTTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142505	1142991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1142500_1143000
851256	contig_10627_pilon	+	1571	6	Intergenic	novelGene_60048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	0.979795897113271	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	173	856	1063173	1069946	TRUE	20	TGACTTTATTTACGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRQDDGLNVENVPDDCTSVLDRPGSHDYERDWQDYLNSSRNSFDCFLSGRPSAQRSSMNSSYNIPGSLMHSALRDDISVDLSTSSSSVHSSDSEGNSRFNIRRPLSPIRSRNPFASAENHSDFPVNSAHEFDVRGEEDNTLTSQPQGAPLYSEDLLLNPQGGMSSVDSSSSSPSGMNLQGQFHMPEPLQENIPFSFFAVSDFPNQNVNGNRMAASGFPDEKEATKIKADSEKLKKLQESLLEEDSEEEGDLCRICQIAGGFPHQPPSWSLAAVWEACGLFIKSA	1063000	1092698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1063718_1069807_1069977_1072406_1072517_1082454_1082569_1088615_1088659_1092280
851260	contig_12939_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_166191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21724	21150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_21200_21700
851262	contig_9771_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_156931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTATTTGCTTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583872	583066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_583100_583900
851263	contig_8729_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_40079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTCTTTCCTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72051	71657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_71700_72100
851264	contig_6496_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_103530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTTTTCCAAAAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956202	957638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_956200_957600
851265	contig_17074_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_145173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	146	325	578798	578977	NA	25	GAAACTGGGGCTGTTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSQTLIESSFLSFFASCLCSRSRTAALSEGTPKRKCHFVLRHGGVVSLMVWQVTQGGSPKKGRQSPRGPGPGPPITSGWWSLGLAWPPMRTQTPSGRWPSLKAEHWL	578652	579205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_578700_579200
851266	contig_7207_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_72057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAAGTTCTAGGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632316	631458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_631500_632300
851267	contig_6446_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_149235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAATACAAGGTTTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491626	491214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_491200_491600
851268	contig_5039_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_64872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	35	352	393795	394112	NA	30	CTAAACCAGCTACCGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATQPHLGNLSPMYRSPDQCVPGQFLGVCKMMQTYVRTAVVRQCHTEVREKPAAEGLRRTRGSPDTNRGSGSDSLLLGEAEKSSYSEEFRPRLGTCNQRANSSASSPSLCFSDSKYQ	393760	394208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_393800_394200
851269	contig_9133_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_109315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTAGAAAAGCACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877237	876302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_876300_877200
851271	contig_10948_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_124970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATATCTACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134554	133824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_133800_134600
851272	contig_9332_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_60706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGAAGGGAGGGATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60283	60985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_60300_61000
851273	contig_6065_pilon	+	724	2	Intergenic	novelGene_132691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	144	junction_1	0	546	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGGAGCATATTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460460	463125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_460842_462782
851274	contig_11615_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_151248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	2	433	32057	32488	NA	35	TTAGGAAGCATAATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPFLLPPRLRSGNQTKDTGPPRPGRSLLAAQQPLLPPRRLCFVAGAAVWPQGVVPLGLAKWSRAGLCAAREDAPARPWAPGRSLEHREGSRTPTPPPPRRSPGAERFQPCQLLGLLLRTWGAFPPLAAIRISFSILSARLFL	32055	32997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_32100_33000
851279	contig_16714_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_161562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCAAAAGAGGGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687703	688757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_687700_688800
851280	contig_6344_pilon	-	793	5	Intergenic	novelGene_157105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.8315913853852	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTATTTTAAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994959	990753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991083_992837_992871_993900_994023_994403_994521_994767
851283	contig_4797_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_6926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGAAAACTTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630103	631233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_630100_631200
851284	contig_6048_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_73164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGAGCCTGCCTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189510	1188948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1188900_1189500
851289	contig_7019_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_149479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351752	1353221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1351800_1353200
851290	contig_12635_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_60872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTGTCCTACAGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714150	714735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_714200_714700
851291	contig_5018_pilon	-	640	3	Intergenic	novelGene_46940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	35.5	260	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGGCTGTTTGTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278061	276656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_277050_277305_277380_277888
851292	contig_6589_pilon	-	622	7	Intergenic	novelGene_25870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1250.19937298905	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	34	342	959104	956108	TRUE	10	CAGATGGCTCTTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVSA	959137	955184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955770_955831_956001_956116_956711_956815_957251_957360_957758_957846_959101
851293	contig_5815_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_141204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTAGCGCTTAAGCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467250	467546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_467200_467500
851294	contig_14333_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_49162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATGTTAACTAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501713	502353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_501700_502400
851296	contig_10523_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_120941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCCACAAAGAAAGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13341	13028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13000_13300
851297	contig_10629_pilon	-	1139	2	Intergenic	novelGene_52940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	294	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGTAAGTGTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361920	360259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_360328_360849
851298	contig_20739_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_83194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGTCCTTGGAGAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197806	196729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_196700_197800
851299	contig_16124_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_175391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGTTAAGGAGATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306244	306621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_+_306200_306600
851300	contig_11335_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_104936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAGAAAAAATAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426901	427503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_426900_427500
851301	contig_11335_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_104937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGACTTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427452	427826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_427500_427800
851302	contig_16752_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_177683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTATATATATTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88501	89209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16752_pilon_+_88500_89200
851305	contig_2278_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_118149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAACAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463066	1462268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1462300_1463100
851306	contig_835_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_152149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTGTAGTAAAGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198431	199685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_198400_199700
851307	contig_6635_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_127027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAGAGAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482392	482690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_482400_482700
851308	contig_3825_pilon	-	678	5	Intergenic	novelGene_77978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_4	4.38748219369606	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	14	676	145790	142409	FALSE	10	GCCCCTGCTGGCCACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPQLMAVFGSLSLYALGLWLPWRWLAVAGEVPVLVMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALQALAWLRGAHADIRWEFEQIQDNVQRQSSRVSWAEARAPEVYRPIIIALLMRFLQQLTGITPILVYLQSIFASTAVLLPPEDDAAIVGAVRLFSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSASIMFAANLTLGLYVHLGPSPLTPNGTIGLESAPLRDSEQPLASPTSYLTL	145803	142406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_142561_143088_143198_144401_144555_144944_145157_145753
851310	contig_1107_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_126550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCATCTGCCATGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198637	199390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_198600_199400
851311	contig_10403_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_175805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCCTCTGTCATATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96343	95609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_95600_96300
851312	contig_10196_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_132169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGAGGGTTTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041078	1039974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1040000_1041100
851313	contig_883_pilon	-	1074	6	Intergenic	novelGene_177684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.0591260281974	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATGTGTGGGTGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61669	34823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_883_pilon_-_35261_42577_42826_54246_54320_56564_56697_61262_61381_61603
851315	contig_10711_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_118443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCTGTTTGTTAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816855	817538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_816900_817500
851316	contig_6048_pilon	+	1174	2	Intergenic	novelGene_73332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	17	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTACTTTGTGTGCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2788433	2791332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2788586_2790310
851317	contig_8317_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_20715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16502	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
851319	contig_12150_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_6958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGGTGTCTCCAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44465	45243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_44500_45200
851320	contig_5324_pilon	+	544	2	Intergenic	novelGene_102041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	0	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATGATACTTGACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13494	15145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_13637_14743
851321	contig_10205_pilon	-	837	2	Intergenic	novelGene_143108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	71	397	222120	220404	FALSE	20	TACTCTCGGATCCATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRVSLELMCSLHRTDLYVETISEVMLLIFRFL	222190	219963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220653_222042
851323	contig_3018_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_78767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATTGAGAAAATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347361	348322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_347400_348300
851324	contig_7513_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_88994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTAGTCTTTAAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492827	494113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_492800_494100
851325	contig_5500_pilon	-	516	4	Intergenic	novelGene_159643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_3	63.4367576584918	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	92	307	647091	633437	FALSE	15	TACATAGTTGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARCFGVRTSPTGEKITHTGQVYDEKDYRQMRFVGRQKEVNENFAIDLIAEQPVSEVESRVISCDGGGGALGHPRVYINLDKETKTGTCGYCGLQFRQHHH	648529	633227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_-_633503_634475_634599_647064_647119_648465
851326	contig_13379_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_175878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185096	184706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_184700_185100
851328	contig_3721_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_123780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	447	3	449	13442	12996	NA	30	AACTCTGACACTCCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFLQKHLNVSNPTEPATIIFTAAQEGRETLKCLSHHIADAYTSSQKVSAIQIDGATRSSQDSDTVKLWVDVELSSGFENGQKAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLEASVGPRETEEKVRDLLWARFT	13444	12995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_13000_13400
851330	contig_4519_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_123676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTATGAAATCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73254	72575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_72600_73300
851331	contig_5451_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_167162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAACAAGAAAGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175480	174949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_174900_175500
851333	contig_821_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_149415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGATAAAATAGATGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247650	247017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_247000_247600
851334	contig_5350_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_99360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCATGTTTTTAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201405	200699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_200700_201400
851337	contig_7022_pilon	-	1538	7	Intergenic	novelGene_142162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	20.9417180659934	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	945	594	1538	311830	304081	FALSE	35	TCTCCACAGGAAGAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACLKGHRTVVQYLVEEGASIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTSVVVTLLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGMAEEFASKALELKPKSYEAYYARARAKRNSRQFVAALADLREAVKLCPTNQEIRRLLARVEEECKQLQRSQQLKQQCPPPAPPNDSDNEEDASAPGLNDHFHLEEAKEEET	312423	304080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_304322_304791_304893_305829_305977_307711_307804_309508_309642_311295_311472_311775
851339	contig_4151_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_65256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATACACTTCAACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574492	573999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_574000_574500
851341	contig_13004_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_112753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAATAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001807	1001151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_1001200_1001800
851345	contig_10197_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_115188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGCTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502376	501751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_501800_502400
851346	contig_12964_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_131683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGCCCTGGTGGTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403840	404423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_403800_404400
851347	contig_91_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_127133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAGGAAAGCACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943753	944846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_943800_944800
851348	contig_8822_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_117930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATTTCCCACGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68512	69217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_68500_69200
851349	contig_5375_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_169203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39815	40780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_39800_40800
851351	contig_7426_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_27550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCGAAAGAAAATGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102803	1101958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1102000_1102800
851353	contig_12948_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_126171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAGAAAAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160405	160970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_160400_161000
851354	contig_11163_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_153061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATCCATTCATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113450	114227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_113400_114200
851358	contig_4103_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_52016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTCCTTGTTGTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470569	471051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_470600_471100
851360	contig_12300_pilon	+	1305	9	Intergenic	novelGene_176514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	14.1045205519365	22	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	264	956	462598	502860	FALSE	85	TAAAAAATAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIFRVTVQVDNSLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWKGNNTEPLITLEGSISVKFLSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDIPEWRRDISRVIKRSLVEATGVPGQSILVAVLPGLPTAAELFVLPYQDPTGESRRLAEDLEQISELLIHKLNQNSVHFELKPGVQVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGLAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHTESRPNTPQTELRRPGQLLDEKVESQLIGE	452428	503209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_+_452507_460222_460357_462546_462671_468028_468142_472842_472975_486142_486243_500945_501052_501172_501334_502852
851361	contig_5758_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_119081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148758	149266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_148800_149300
851364	contig_11396_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_71249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGCAAAGTCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89903	90731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_89956_90435
851366	contig_9505_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_121862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGTATTATACACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585783	584975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_585000_585800
851368	contig_6192_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_170342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTTTAAGTGTGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820408	821784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_820400_821800
851369	contig_10405_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_165867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAACAAGAATCAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341051	341783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_+_341100_341800
851371	contig_18081_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_23812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTGGCTGCTAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153229	153522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_153200_153500
851372	contig_854_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_36474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCTATTGAAGCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612019	1611073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1611100_1612000
851373	contig_7839_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_45703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAACAGACCTTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234419	232608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_232600_234400
851374	contig_6631_pilon	+	749	5	Intergenic	novelGene_174304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	4.43705983732471	76	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	98	472	1164592	1176626	FALSE	15	TGCCGTGTGTGTTGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLFAQEVRLSKRHEEVVSQRLMLLQQMENKFGDQNTDKASQIQAAKAAYKRNLSLLNDIEAAAKSLQTRIHPLPRPEVVSLEARYWASVEEYIPKWEQFLLGRAPYPIGVENQNEAEKEVQQ	1163098	1176903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_1163165_1164560_1164645_1166299_1166424_1174248_1174324_1176503
851375	contig_18967_pilon	+	630	3	Intergenic	novelGene_165337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTAAAAAAAAACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348138	359881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_348190_351889_352037_359449
851376	contig_11292_pilon	-	592	4	Intergenic	novelGene_109476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	145.845428069888	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	174	353	463383	461999	FALSE	35	AAGAGGGGAAGAGTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDKEVEVEESPEKTKVQTAPKVEEEQDLKFQIGELANTLTSKFEFLGINRQSISNFHMLLLQTETRIADWREGALNGNYLKRKLQDAAEQLKQYEINATPKGWSCHWDRTSGSNYS	464425	461759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_462024_462342_462477_463362_463468_464336
851379	contig_19769_pilon	+	883	2	Intergenic	novelGene_102339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	169	882	184622	185335	FALSE	40	GTAATGAATGTAGGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSKPDVISRLEHGEEPWAPYLLRTEGCRIWRHRSDGCDSRTEIKELTRKQETSEEMRSQRAKSAHVKNISKEPDFEEMSKAEGKLKNYWRKSSVEELKECFCQKQIFRPVTVTHVKTPTGEKGQKFSAVGENCTVDSTPVEYLRVSRVECLHHSISRVENFEQNKDHIDLQGIHLGEGACQTDVFTEVPRQSSVLSENQRIISPEKPFECTDCGKTFSQNGTLVQHHRTQTGEKPYEYNQCGKTFIQHSILSKHQRIHAGEKPCKRVECDKAFGARSYCIQHCKIHTGEKPYE	180081	185336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_180191_184562
851380	contig_3095_pilon	-	471	3	Intergenic	novelGene_75255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1831.5	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAATTATCTGTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255483	246382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246565_253615_253806_255384
851381	contig_4686_pilon	-	631	2	Intergenic	novelGene_118518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAACATTTTCATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430406	425292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_425776_430258
851382	contig_10003_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_88269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTAAGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789583	790966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_789600_791000
851383	contig_13937_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_167359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCATAAGCAAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96193	97142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_96200_97100
851384	contig_3900_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_84184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAATTAAAATAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227857	227576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_227600_227900
851387	contig_11375_pilon	+	777	2	Intergenic	novelGene_152660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGCTGAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181718	182704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_182180_182388
851389	contig_14876_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_170245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTCTTTACCTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113791	114237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_113800_114200
851390	contig_4364_pilon	-	607	4	Intergenic	novelGene_4581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	35.4244109180222	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCCCGCCACACGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1968334	1965584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1965868_1966748_1966804_1967829_1967911_1968146
851392	contig_9982_pilon	+	860	6	Intergenic	novelGene_55712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.19089023002066	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	17	409	199451	209702	TRUE	25	TTTTTTTATATAGAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRYPTPLHGHVGRGAFSDVYEPAEDTFLLLDALEAAAAELAGVEICLEVGSGSGVVSAFLASMIGPQALYMCTDINPKAAACTLETARCNKVHIQPVITDLVKGLLPRLKDKVDLLVFNPPLCSDST	199434	214565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_199585_201960_202048_202805_202897_209621_209707_213092_213235_214260
851394	contig_17781_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_163682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCAGAAGCCTCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416885	417328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_+_416900_417300
851395	contig_13460_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_162185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233169	232459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_232500_233200
851396	contig_6958_pilon	+	1134	5	Intergenic	novelGene_70017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	138.811923119017	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGCAAAAGACTATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782678	802393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_792713_792825_797530_797827_801481_801648_802350
851398	contig_7229_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_39789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCAGTCTAATGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795714	794505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_794500_795700
851399	contig_13992_pilon	+	683	3	Intergenic	novelGene_147661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_1	81.5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAATTCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697920	700890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_697943_698839_698990_700379
851400	contig_10500_pilon	+	372	3	Intergenic	novelGene_41308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	0.5	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAATTATATAAAGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659856	1666440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1659903_1662313_1662431_1666231
851401	contig_5590_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_163015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAGAATATTGTCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296373	295709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_295700_296400
851402	contig_5899_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_146979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	166	468	168010	168312	NA	25	TTGCTGTAGAATAGTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTVLRSTGQAFCRMSLSWDLSDVFLMIKLGLWFWGRKTAEVKCHSRYIVFKGTYTQHDLSLLVLTSITWLRKYLSSFSTVKLFFCSLSHSLLFRRKSL	167844	169082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_167800_169100
851404	contig_10296_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_168883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	130	348	894503	894721	NA	55	GAAAAGAACATAGCCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DASVIVDVYFTFGPFSVKPSSGLGPVELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICHNRTVIHHRVPNEEDPSLDRPFISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGNVMFFLFSKKKINWYLSYWSP	894373	894808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_894400_894800
851405	contig_10734_pilon	+	550	2	Intergenic	novelGene_51161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	75	536	998765	1000762	FALSE	20	CACAGTCTGGGGTTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRESPPGSTAYHLCVSVLRINLPLQ	998690	1000776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_999155_1000690
851406	SIRV7	-	268	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91658	0	-91652	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCGATTTCTTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
851410	contig_4519_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_123649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	969	1274	18323	18628	NA	15	GTCTGTGTTCCAAGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRSCKGAPHSSQNAVSAIHLPGSSSVWSQAECPHYTQIIRMSQSRQHSPLFKLWKDLASLVLQGFRIVGNSSCPVQKAGKEEGFATPSQKNNTAGPPEKE	17354	18748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_17400_18700
851411	contig_9345_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_24577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTGTATTACTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935160	935653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_935200_935700
851413	contig_9177_pilon	-	499	5	Intergenic	novelGene_32632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2878.20299840022	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	143	499	26373	25413	FALSE	40	GGGACCTTACGAAAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVT	32933	25412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26383_32800
851415	contig_3151_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_139182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCTATGTGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77790	77472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_77500_77800
851418	contig_14385_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_177686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACATGGAATAAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88085	88670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14385_pilon_+_88100_88700
851419	contig_10753_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_105172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAACACCTTGCTGCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457314	457852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_457300_457900
851420	contig_20610_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_67659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATTTGCTAAAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118965	116066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_116478_118798
851421	contig_10855_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_124345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAAGTCCTCTACATGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552872	552367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_552400_552900
851423	contig_9571_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_136245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCCATAGGGCTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210439	210888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_210400_210900
851424	contig_9939_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_158611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATATATTTACAACGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456120	455004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_455000_456100
851427	contig_776_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_139938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGTCTGTCTGTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849026	847863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_847900_849000
851428	contig_7188_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_108535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAGAGAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150957	150302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_150300_151000
851429	contig_6919_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_163970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCAAACTAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11017	11722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_11000_11700
851432	contig_11498_pilon	+	910	2	Intergenic	novelGene_65520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACCTTGCCCGGGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201338	202695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_202162_202608
851433	contig_8687_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_169667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGACAAAGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263882	262101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_262100_263900
851434	contig_10307_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_170281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGCAATCACCGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442173	442710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_442200_442700
851435	contig_11825_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_155398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCCATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19363	18406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_18400_19400
851436	contig_9440_pilon	+	916	3	Intergenic	novelGene_59085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	64.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	156	593	1663420	1667874	TRUE	70	AGATAAAAGAAAAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPWPPPGLWSLPRSEGEAEEESDLDVSPGSPRCSQLPGGGAQIYSHGIELACQKQKEFVKNTLACKWNLAEAQQKLGSLALHNSESLDQEHAKAHTAVSELRQREEEWRQKEEALVQRERMCLWNTDAISKDVFNKVRPFIGP	1663264	1671844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1663552_1667568_1668184_1671830
851437	contig_4654_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_103070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAATAAAGAATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464445	464904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_464400_464900
851439	contig_9195_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_155673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99787	99206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_99200_99800
851441	contig_6102_pilon	+	398	2	Intergenic	novelGene_31803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCTGTTATGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360137_360864
851442	contig_8383_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_172756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAAATAGAGAAGGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286751	285682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_-_285700_286800
851444	contig_294_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_166734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTAGCCACCGGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72029	71072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_71100_72000
851445	contig_9389_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_83887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66672	67483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_66700_67500
851446	contig_854_pilon	+	572	4	Intergenic	novelGene_36466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.9267066322477	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	84	458	1514567	1527388	FALSE	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRLLLRRFLALAISRNPPQGRWAPLTSGALQSPQCHPGGLAATLSPARTVHTTRVCTTTFNIQDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDEPADS	1513610	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514830_1517440_1517535_1527370
851447	contig_6724_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_167963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	92	520	218216	218644	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEPPTFWLVAEYVHCLHQAGILLALLVDTNMNSELFVKTCVLLSLAAVQSIPTYGDPMCAEWNRSMVFLGCFQGLSDADRQAYLLRGLWVGSNVNLLASSQVLNYLHHPGTCMSISSHIIYIVHTESSPVQMVVRKSLQMAPDFKGRGQAQIQATWLETDMQNDAPLKLLLS	218124	219010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_218100_219000
851448	contig_13740_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_34785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTAGTCTAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850699	851618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_850700_851600
851449	contig_3601_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_132835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTACCATAATTTACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90212	90812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_90200_90800
851450	contig_12964_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_131662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATGGAATGGAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141066	140183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_140200_141100
851451	contig_19205_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_177687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAACAACAACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83960	85434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19205_pilon_+_84000_85400
851452	contig_6824_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_172791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCTTTTTCCTACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3916	2294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6824_pilon_-_2300_3900
851454	contig_6496_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_103544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAATGTAAAGGGCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172483	1170646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1170600_1172500
851455	contig_13481_pilon	-	1309	3	Intergenic	novelGene_119438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	17	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	169	546	963522	952433	FALSE	60	CGTAGGAAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCGACTCGAVAARLITSSLASAQRGISCGRIHIPVLGRLGTFEAQILRRAPFRTFTETPAYFASKDGISKDGSGDGNKKSVSDGSSKKSGSGNSGKGGNQLRCPKCGDSCTHVETFVCKYCFF	963690	951669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_952571_953557_953719_963443
851457	contig_5236_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_100915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	154	486	445639	445307	NA	40	TTAAAACCTGATCCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDCVIIGPEMDGVIKWRNVKPPVIKQTSAFVEGVKMRTYKPLMDRPKCQGLESRIQHFVRRGRIENPHLFHEEETKAKRDCADILEEENTILEKPTKRICVDTEIKRIT	445792	445020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_445000_445800
851458	contig_7898_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_47512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGACACGATGCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244215	246074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_244200_246100
851461	contig_2799_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_85556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATCAAAATAAAGAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720668	722105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_720700_722100
851462	contig_7904_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_160026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCTATTCTTTGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461447	460563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_460600_461400
851465	contig_2093_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_152970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTACTGTACTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297312	1296785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1296800_1297300
851466	contig_2093_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_152969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAAAATTCTAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293770	1293316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1293300_1293800
851467	contig_13244_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_86980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363354	364178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_363400_364200
851468	contig_1146_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_84827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGAAAAATTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842601	843509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_842600_843500
851469	contig_11507_pilon	+	721	2	Intergenic	novelGene_103352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	185	565	50559	50939	FALSE	15	TCTTTGGGTTGTAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKPLNSQKEPSACKDGEDCQENGVLRKGVPAPGDKVETDQISNEYSAVASPGTGDDTQHSTPAATTALVAEVHQVERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGQYPGPRSGAVT	35777	51095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_35847_50443
851470	contig_17501_pilon	+	572	3	Intergenic	novelGene_174153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32767	83799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17501_pilon_+_32961_67154_67300_83565
851471	scaffold_13505_pilon	+	555	2	Intergenic	novelGene_111414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	25	390	326262	326910	FALSE	75	AAAAGAAATGAACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGLSPALMSNNPLATIQALASGGTLPLTSLDGSGNLVLGAAGAAPGSPGLVTSPLFLNHAGLPLLSAPPGVGLVSAAAAAVAASISSKSPGLSSSSSSSSSSSSSTCSEGAAQTPGGPGGPEAGSKPE	326237	327075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_326293_326575
851473	contig_6479_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_160625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663170	663868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_663200_663900
851475	contig_6760_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_150787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAATTTATTTCGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153276	152713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_152700_153300
851476	contig_9670_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_169939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTAATCGGATGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101788	102646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_+_101800_102600
851478	contig_16525_pilon	-	545	5	Intergenic	novelGene_133847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	44	484	181436	178157	FALSE	15	CGAGGACTGTGCTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181479	178095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
851480	contig_6896_pilon	-	1976	5	Intergenic	novelGene_174220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6.74536878161602	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1671	305	1975	198631	182436	FALSE	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLPTIENNPCQRALFTFKSEHKDLVDGKISECASVESEQPAILYQVEDDRQILAPVTSSSNYSTSSVCAVPIECEGFTNQACIFLPVYSYHQAASQADILMTHPGESTQIAGNSLTTPAFTSDQKPQSLSVQQPTMDAEFISQEGETTVNTEASSPKTVMPTQTSGLEPTTFLPTTVLESDGERPPKMEFADNRIKTLDEKLRNLLYQEHSISSSYPESQKDTQSIDSPFSSSAEDTLSCSVPEVIAISHCGIQDSPAQSPNFQEISSKILSNVAVSQPANISVFKRDLNVITSVPSELCLHEMSPDALLPGDPEAYPAAVSSGGAIHLHTGVETEDMKSAVAPDPIPLTRESIADTRALSRCKVMSGSFQRGRFQVITVPQQQSVKVTSFGIEHIPAFNQMTNHSNEETLVFTKTAKSQLIEMEPAVHNPQTSFSLQKLQALYGTIKEDKGIPKQGDFLSFSTACETGISSMTPEKELEEPSATGSTMQSGSELLLKERETLTVGKLPSSDSELPAPLAGNEKSVAKIGPENDQCHEEQAYVQTQSSLFYSPSSPMSSDDESEIEDEDLKVELQRLREKHIQEVVNLQTQQNKELQELYERLRSIKDSKTQSSEIPLPPASPRRPRSFKSKLRSHPQSLTHVDNSIVGTGKSIIKV	198935	182434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_182668_186136_186748_187285_187417_187946_188038_198025
851481	contig_10371_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_175479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGGGGGTAGGAGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715972	717544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_716000_717500
851483	contig_14536_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_69295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAATTTTGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92304	91538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_91500_92300
851485	contig_8538_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_4700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCAAAGATCAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843127	842741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_842700_843100
851486	contig_9614_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_104422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131238	131703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_+_131200_131700
851488	contig_5236_pilon	+	1008	6	Intergenic	novelGene_100885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	323	junction_1	67.2951707034019	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	91	615	62791	68521	FALSE	45	AAGATAAATATGTACCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNGWQTEPSGFLRNVGQLFECHLLPPTDVRMTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGKALK	60635	68914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413
851489	contig_7050_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_153624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATGCACAGCATTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676549	675991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_676000_676500
851490	contig_1076_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_101142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965203	966030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_965200_966000
851491	contig_5718_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_110436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1617437	1617029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1617000_1617400
851492	contig_8044_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_132363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGGAGTAAGTAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278784	279163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_278800_279200
851493	contig_4519_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_123739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAACAATGAGTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790181	789920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_789900_790200
851496	contig_17311_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_57870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACGAGAAGGCCAAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196660	198027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_196700_198000
851499	contig_7748_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_101042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTGAAACTGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149766	148380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_148400_149800
851500	contig_11010_pilon	-	1370	10	Intergenic	novelGene_176022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	28.0871659105879	26	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	161	1324	178612	157352	FALSE	35	TTAAATTGATTTTTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFVHLDIRCLYTVLICTSFGCVLSSNTEIKVNPPLDFEIVDPGYLGYISMQWKPPLSLDNFKECTVEYELKYRNFDSESWKTIITTNLYYKDGFDLNKGIEAKIHTLLPEQCTNGSEVYSSWSEATYWTPPQGRGETKIQDLDCEYYNWQYLLCSWKPGVDVPFDTNYNLFYWYEGLDQAIECAEYMTSNGKNTGCRFPHLKSPDYKDFYICVNGSSQSMLIRSSYFIFQLQNIVKPLPPEYLSLTMKDSNEISLKWNVPRGPIPERCFFYEIILTEDYTTWVFTTMENEMCIKRTSNKSHQICLLVRSKVNIYCSDDGIWSEWSEEECWKGDTWKEIVIYFMIPFGFISLFVLLVTLLLLYKQRSVLETIFDSRKEVFTRQETLC	179348	157305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11010_pilon_-_157403_158152_158269_165398_165544_167502_167649_168837_169023_171553_171675_172203_172358_173627_173780_178518_178646_179221
851501	contig_5499_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_56974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGGGTAAGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91328	90585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_90600_91300
851503	contig_15120_pilon	+	529	4	Intergenic	novelGene_108003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	37	junction_1	86.5036929205273	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	22	369	154288	164824	TRUE	35	TAAAACAAGTTTTTCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLSVCVGRLPAAFAPLPRPTTFAAVRSLSTALCPAGIRTRPGAPQPISMLVQLSVNSHFMKDLGLDSLDQVEIIMAMEDEFGFEIPDTDAEKLMCPQEIVDYIADKKDVYE	154266	165759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_154456_161629_161718_164732_164833_165607
851505	contig_2793_pilon	-	679	4	Intergenic	novelGene_142871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	670.808633085638	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGAAGACAATTTGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84299	79201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79617_80792_80877_81588_81696_84226
851506	contig_4508_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_177533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTCTCTTCAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79274	77843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_77800_79300
851508	contig_4496_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_66613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTATTTGTAAATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573116	572691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_572700_573100
851509	contig_2480_pilon	-	1003	7	Intergenic	novelGene_63511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	31.503527139389	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	172	789	136343	123434	FALSE	25	CATATGGATACTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAARLAFAPDPTCSTNRESCCLQLWVPPAVPGTHCCTRERLFEFSVTVGRRNTRAPRMDFLVLFLLYLALVLIGVTLICIYSRTQFLKGLVRGGAQIFSCIIPECLQRAVQRLLHYLFHTRNHTFIILHLVLQGMVYTEYTWEVLGYCQELEFSLYYLLLPYLLLFVNLFFFTLSCVTNPGTITKANELLFLQVYEFDDLMFPKNVRCPTCDLRKPARSKHCIPVPALPKDHLLPGVCLGAQLPPGGLPMLCSVPGCHQPDH	138396	123219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123556_128835_128962_130073_130253_135239_135314_136226_136352_137755_137895_138372
851510	contig_15420_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_175292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	479	808	129703	129374	NA	35	TACCAGGTTCCTGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTHSPGIGEGRAVFPLMMKFQMEALFQLPELPHLSVCPARKEHQALRRHQDFAEKQLTCGSCTGVNVYPVQLRRHMCPSLKKTITVKNYLNHQRWHLVRACGNVDSYT	130181	129118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_129100_130200
851512	contig_8865_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_164470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAAGCTGGGGTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453227	452879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_452900_453200
851515	contig_3426_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_57985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCGGGTAGGGGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618632	617254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_617300_618600
851516	contig_15691_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_60773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAGAAAAAATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79275	78580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_78600_79300
851517	contig_9720_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_116796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGACACGTAGGCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420000	418242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_418200_420000
851518	contig_14219_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_54309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAAAATAAAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666490	666239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_666200_666500
851519	contig_12605_pilon	-	582	4	Intergenic	novelGene_64162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	40	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTGCAGAATTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4536	1774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_-_1884_2317_2479_3729_3991_4485
851520	contig_11855_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_66896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACCCCTGCCCTATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695102	694368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_694400_695100
851522	contig_12866_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_174652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCCACAGCTACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676270	675179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_675200_676300
851524	contig_8375_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_141277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAGAGAAAGAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43432	42568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_42600_43400
851526	contig_10734_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_51249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245689	1246252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1245700_1246300
851527	contig_11590_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_125560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACCCAAACAGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36973	35991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_36000_37000
851528	contig_12594_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_177689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	123	548	47055	46630	NA	15	CAGCACATCCTTGTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPSQGSPNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRNGLKKSNSPVHHNILSPVPGPAPAHQRALQNWQQQNLIEHLRANEDTPKAVPEENLFKGACEKHSQDLEMMTDDNIEDSTAR	47177	46212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12594_pilon_-_46200_47200
851531	contig_17198_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_62336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTCTAGGGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513155	512593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_512600_513200
851532	contig_13740_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_34787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAATAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866594	864923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_864900_866600
851533	contig_1870_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_177690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATTACTTATTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91478	91146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1870_pilon_-_91100_91500
851535	contig_11607_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_177218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTACTATATTTCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11840	12407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11607_pilon_+_11800_12400
851537	contig_4847_pilon	+	721	4	Intergenic	novelGene_156171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	428.519155542278	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACATTTTCTGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101441	110070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_101478_102278_102376_108569_108658_109570
851539	contig_12019_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_87699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGAAATTTTAATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176629	177146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_176600_177100
851540	contig_8020_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_114435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATAGTAGCCCTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291007	290366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_290400_291000
851542	contig_8900_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_171627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTGTTCTGAATGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259257	258927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_258900_259300
851544	contig_16870_pilon	+	474	3	Intergenic	novelGene_155525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	5	junction_1	5.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGTCTGTACACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209907	214437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_210003_212472_212568_214153
851545	contig_6102_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_31815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCGAAGAATCAAATCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360230	361207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
851546	contig_7171_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_101221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAATTAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516980	517484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_517000_517500
851547	contig_4364_pilon	-	2034	14	Intergenic	novelGene_4578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.2966892442366	6	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	88	1656	1940005	1875129	FALSE	75	AATCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSRSEEMHRLTENVYKTIMEQFNPSLRNFIAMGKNYEKALAGVTYAAKGYFDALVKMGELASESQGSKELGDVLFQMAEVHRQIQNQLEEMLKSFHNELLTQLEQKVELDSRYLSAALKKYQTEQRSKGDALDKCQGELKKLRKKSQGSKNPQKYSDKELQYIDAISNKQGELENYVSDGYKTALTEERRRFCFLVEKQCAVAKNSAAYHSKGKELLAQKLPLWQQACADPNKIPDRAVQLMQQMTSSNGAVLPGALSASKSNLVISDPIPGAKPLPVPPELAPFVGRMSAQDGAPVMNGISAPDSEDYNPWSDRKAAQPKSLSPPQSQSKLSDSYSNTLPVRKSVAPKNSYATTENKTLPRSSSMAAGLERNGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEKTKMRGWFPFSYTRVLDSDVSDRLHMSLQQGKSSSTGNLLDKEDLALPPPDYGTSSRAFPAQTAGTFKQRPYSVAVPAFSQGLDDYGARSVSSGSGTLVSTV	1940092	1874750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1875160_1875850_1875886_1876518_1876682_1877252_1877322_1879451_1879654_1880645_1880848_1880980_1881206_1884312_1884466_1893436_1893575_1894243_1894316_1895443_1895506_1921875_1921963_1925745_1925822_1939951
851548	contig_9389_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_84154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCAGTGGGTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854835	1855730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1854800_1855700
851550	contig_4442_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_127953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366329	366978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_366300_367000
851551	contig_10078_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_160011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGCTAGGAGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258787	259479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_258800_259500
851552	contig_8853_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_159158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6850	6515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_-_6500_6800
851553	contig_1127_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_98858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343971	342444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_-_342400_344000
851557	contig_13740_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_34766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAATGGATCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706219	704952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_705000_706200
851560	contig_5711_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_80288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAAGAAGAAGATTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215238	215763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_215200_215800
851561	contig_2100_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_50642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAGCAATTCTAGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000094	1001912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1000100_1001900
851564	contig_7976_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_169399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAATGAAAGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103970	103499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_103500_104000
851565	contig_11396_pilon	+	535	5	Intergenic	novelGene_71322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_3	23.7315717979235	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	208	534	464906	468213	FALSE	15	TGGTGGGGACCATGAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAEEEESLEAEVVYPITCGDSRANLIWRKFVCPGINVKCVQYDEHVISPKEFVHLAGKSTLKDWKRAIRMNGIMLRKIMDSGELDFFQHDKVCSNTCRSTKIDLSGARVSLSSPTSAEYIPLTPAAADVNGSPATITIETCEDPGDWTTSIGDDTFAFWRGLKDAGLLDEVIQEFHQE	460475	468214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_460599_464821_464926_465823_465982_467961_468034_468136
851567	contig_10159_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_30850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	2	523	643178	643699	NA	25	AGCTTTTTTTAAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDDSGVTRDCPQRCRQPSSARPSGRPGSERTREFAEQKLSAFHSRHAHPRGSTLGYPPGSAPSSAPPGGAGIAALVFCLLRGRLPAGARGKRLRNQEGSRSPAAAGGAKGLCFSPEAEIGESPSVRQCHPSCLPVLPYSLQRRCDVLAGTSGQGPSLFSAVRYPTTPAGGQPG	643176	644660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_643200_644700
851568	contig_5988_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_15911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAAAACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636881	636073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_636100_636900
851569	contig_17344_pilon	+	682	2	Intergenic	novelGene_169590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATTGAAGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69401	85374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_69762_85052
851570	contig_7083_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_125163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAAGTGCATTTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162418	161547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_161500_162400
851571	contig_5539_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_104752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52253	53307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_52300_53300
851572	contig_1288_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_147916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGTAAGAAACTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132446	133230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_132400_133200
851573	contig_9696_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_68832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATTATTTTAAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577509	575911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_575900_577500
851574	contig_18272_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_7058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGATTTACCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482948	481805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_481800_482900
851575	contig_15866_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_63623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446785	445948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_445900_446800
851576	contig_10074_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_57100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATCACTACTTATGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204229	203325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_203300_204200
851577	contig_11855_pilon	-	490	2	Intergenic	novelGene_67137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	136	390	2677062	2674178	FALSE	25	AAATCCATATGCCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLPPWSPFCAGGYGTSVSGRLYGRAFQGLANRKPHLGVSPGFTRMEAGIATKLLWRERKKLHKTNKQGGVGDVNQWGPGGIAANESGRTPGHVSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	2677197	2674077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2674287_2676916
851578	contig_21388_pilon	+	888	7	Intergenic	novelGene_136617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.1446603773522	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	44	625	16539	20891	FALSE	75	CCAGAAGAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDHPASREEPTRGPMLEVHIPSVGPEAEESGQSPEKGHMVFRVEVLCRGRRHTVLRRYSEFHALHKRIKKLYKVPDFPSKRLPNWRTRGLEQRRQGLEAYIQGVLYLNQDVPKELLEFLRLRHFPADPKANSWGTLEEFLPSSGSSQLHHRPVVSFCMDPYIWTPSPEPLPSVVVNGVLQGFYGFSISPSKAQPVAACHPAPLPPAP	16495	21154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_+_16614_16993_17078_17453_17559_18040_18136_19996_20030_20271_20340_20769
851579	contig_9931_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_134845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCAGCAGTGAATTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364422	364711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_364400_364700
851583	contig_15219_pilon	+	641	3	Intergenic	novelGene_40853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	37	351	66409	71947	FALSE	25	TTAAAAGCCTGTACGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPGEGEAAAAEMVRGRARAEGRERVGAMPTASGRGDGNHAQQLRQGPGARWEAGRSGAAFRPTPGHELRLQQDDQDPGPEEALRECPLPNLPGVGGGRQLAHHPDCAAGHPSPPE	66372	72237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_66437_71259_71398_71798
851584	contig_15422_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_173108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	838	1152	56056	55742	NA	25	GGTTTTGTCAGCTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCRPCRSRPAVPLHTKGETLRQGHLDCLAFLPSDKAPGSEAAAALGRNACEVHPGVLLGPSPGRALHHWKSRSGGGARGLEDSVSPSSAFYTRTVKQGSSPFGP	56893	55740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_-_55700_56900
851585	contig_9999_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_174666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAGATGAAAAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213306	213818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_+_213300_213800
851586	contig_740_pilon	-	991	6	Intergenic	novelGene_158939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.6748408762286	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGTTTGCGCAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165355	106475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_106628_108198_108379_109304_109488_113105_113211_116826_116894_165051
851588	contig_6635_pilon	-	962	3	Intergenic	novelGene_127009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	177.5	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	410	760	361855	347559	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVVLVRIYGNKTELLVDRDEEVKSFRVLQAHGCAPQLYCTFNNGLCYEFIQGEALDPKHVCNPAIFRLIARQLAKIHAIHAHNGWIPKSNLWLKMGKYFSLVPTGFADEDINKR	377520	347356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_347704_361649_361900_377155
851589	contig_10765_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_122920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187782	188766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_187800_188800
851591	contig_348_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_67628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTTTTGTTGCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387312	387823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_387300_387800
851592	contig_6266_pilon	+	1058	2	Intergenic	novelGene_170996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTACTTAAGTGCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761752	765588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_762254_765031
851594	contig_6958_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_69959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGAGCACAGCGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192226	191559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_191600_192200
851595	contig_19825_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_59686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAATAGTCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33412	32475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_32500_33400
851596	contig_2125_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_147709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACCAGCACCACTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256472	255906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_255900_256500
851599	contig_17171_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_147377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCCTTGTCCTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315939	317491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_315900_317500
851601	contig_11677_pilon	-	295	3	Intergenic	novelGene_85953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_2	18631.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTGTTCATTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598063	595816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_595892_597212_597397_598027
851603	contig_7887_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_124854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAGGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80932	80095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_80100_80900
851605	contig_5918_pilon	-	678	5	Intergenic	novelGene_99571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCAGACCAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2038991	1769053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1769321_1816159_1816288_1900329_1900458_1980609_1980673_2038899
851607	contig_5479_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_133608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAGAGAAAAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340245	341010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_340200_341000
851609	contig_7548_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_117613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCTTTAAAAAGGATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161817	163154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_161800_163200
851610	contig_9375_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_136062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGTTTTCTGAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341826	342786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_341800_342800
851611	contig_1331_pilon	-	1242	6	Intergenic	novelGene_37878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	139.880806403166	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	82	960	356415	349502	FALSE	30	ACTCACCCAGAGACACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKTTYLEDLPPLPEYELAPSKLGEEVDDVYLIRAQGLPWSCTVEDVLNFFSDCRVRNGENGIHFLLNRDGKRRGDALIEMESEQDVQKALEKHRMYMGQRYVEVYEINNEDVDALMKSLQVKPSPVVNDGVVRLRGLPYSCNEKDIVDFFAGLNIVDITFVMDYRGRRKTGEAYVQFEEPEMADQALLKHREEIGNRYIEIFPSRRNEVRTHVGSHKGKKMASSPTAKYITEPEMVFEEHEVSEDIRPMTTFESEKEIGKNVPLLRDGLPNKQGTHGFTCSYLLICSAPI	356496	349219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_349785_351403_351540_352156_352301_352796_352953_354006_354164_356412
851613	contig_8980_pilon	-	831	2	Intergenic	novelGene_74013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	421	junction_1	0	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	14	298	652311	648792	FALSE	40	GCTTTATGAAATAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNTRMELIIPGEQHFYMKAVNAAERQRWLVALGSSKACLTDTRTKKEKEISETSESLKTKMSELRLYCDLLMQQVHTIQEFVHHDETHSSPSVEVQQR	652324	648258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_648944_652178
851614	contig_14314_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_176835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	23	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	917	1252	122184	114151	FALSE	40	CTTTCTCAAGTATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIMYSAGSQTKLLPESASSSLPTVRALCLLGADIRTARTQDAGLVLADTLRKFLFELNVDDGLAALGYSTADIPALVRGTLPQERVTKLAPRPQSEEDLSALFEASMKLY	123100	113729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_114235_121932
851615	contig_12624_pilon	-	900	5	Intergenic	novelGene_61021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850553	843346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_843462_846472_846593_847461_847751_849706_849852_850322
851616	contig_8063_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_152442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCACAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712458	713548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_712500_713500
851617	contig_7342_pilon	-	705	5	Intergenic	novelGene_71148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	581	592	317849	317838	FALSE	15	TGGAGTCCTGTTTCGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGVCQPAFQALGKITDGLCQVTGHGPQHVRDERLHQRLVQDVVAGPHPLQDGVVFAKRNELVLCDDGTFEFFFTGRYGGRAIAGGGFRAPEGKPELLNVVELEVHHDVQCHLAVPPVGQLQGLDVAQREVPLQQHAVQVRGRELREDVGDIYVLLVVLALGGHGLLGRAVQTAVGAAVPEGVCLLGWPVPGQMSP	327250	317724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_317971_320666_320794_321083_321189_325193_325356_327185
851618	contig_5744_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_149346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667268	666158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_666200_667300
851620	contig_3964_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_174199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATCAGACATTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24717	24065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_24100_24700
851622	contig_10554_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_166961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCACCTCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18692	18024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_-_18000_18700
851623	contig_6017_pilon	-	199	2	Intergenic	novelGene_152549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6688	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCTTTTTAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442181	440565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124
851625	contig_4769_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_118026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATATGTTGTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205482	1204704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1204700_1205500
851626	contig_13501_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_169056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACACTATGGATATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12889	14032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_12900_14000
851627	contig_8676_pilon	+	821	2	Intergenic	novelGene_142192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	200	625	50931	51356	FALSE	30	GCAAATGGGATATCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSSEGALGADALRKGAATSAGATAGLSRSHGHASSASSGQASHPRLLSSVSLRLIQNAQPLPSDPRHLQAAAASQVRAQQSPHPAVTSSSWEVQVPLAGVVMGEPLRGGEARARASGSGSDTLSIECFSPRGGPSPPE	50357	51552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_50419_50792
851628	contig_7839_pilon	-	809	5	Intergenic	novelGene_45743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_3	1.08972473588517	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	108	560	1005576	1003960	FALSE	40	AAGTATTTCACACAGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAVTERLSRGSRDVVDAQRLSKDIGRLTDAVDTAVMPQWQRRELQATLKVLQRRANTAIRKLETGQAAKKTQELLERHMKGPLIVDTVPTESLSVLVKVVRQLCEQAPSTSVLLLSPRPLGNVLCACQVAQGVTPAFTAEAWALAVCSHMGGKAWGSRVAAQGTGNTADLESALSTARAYALNQL	1005893	1003710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1004125_1004531_1004643_1004764_1004849_1005483_1005595_1005804
851629	contig_16948_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_166426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTTAACCTCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425574	425320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_425300_425600
851630	contig_16948_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_166425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	335	673	424585	424247	NA	25	TTCCGGCAAGACAGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRRLAGLEPFLGDLPAGERLLSAMQGGPRSPEGKTSGQVRKWPRCLSLSSRYSKAESPAHVLVFKKGMKPSEPSVMPAALSARPVGSRLTPGPPTCAASRGLGRGDPRSF	424919	424164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_424200_424900
851631	contig_17518_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_117367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGACAAAACAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157229	155954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_156000_157200
851632	contig_13379_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_175869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105943	107181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_105900_107200
851633	contig_8065_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_107336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTCACTTGCTGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167018	166022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_166000_167000
851635	contig_401_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_42800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCATAAAATAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625022	1623661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1623700_1625000
851636	contig_7457_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_31457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTTAATTTTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477445	479053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_477539_477971
851638	contig_17212_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_88617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGTATGGTCCCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114358	113072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_113100_114400
851640	contig_14563_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_135053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133479	134525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_133500_134500
851644	contig_13244_pilon	-	324	4	Intergenic	novelGene_86974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3731	junction_1	740.454965244717	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	33	323	299402	297293	FALSE	45	CAGAAGTTAGAAAGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLPCSLSVGTMKVELCSFSGYKIYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQK	299434	297291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_297392_298566_298678_299204_299281_299397
851645	contig_9653_pilon	+	1063	2	Intergenic	novelGene_48342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAAAAAGGACAAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098053	1099907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1098576_1099366
851647	contig_5782_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_162130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAATAGTACAGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344882	343862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_343900_344900
851648	contig_3181_pilon	+	863	3	Intergenic	novelGene_136925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	18.5	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	340	750	267074	280983	FALSE	40	GTTATTTTAATTAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLAKMSCPAYQCFQALKIKKHHLPLCAARWSSTSVVPRITTHYTIYPRNKDQRWEGVNMERFAEEADVVIVGAGPAGLSAAVRLKQLATEHGKDIRVCLVEKAAQIGAHTLSGACLDPCAFEELFPDWKEKGV	266734	281096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_267108_280198_280340_280747
851649	contig_10718_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_164614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAAAAATTATCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83677	83274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_-_83300_83700
851650	scaffold_7386_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_136612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATGAATTAGAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433824	434863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_433800_434900
851651	contig_10074_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_57124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGAAATAGGAAAAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325358	325836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_325400_325800
851652	contig_4364_pilon	-	1601	2	Intergenic	novelGene_220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	115	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	305	475	1379501	1379331	FALSE	30	ACAACACTGACTTTCCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSVAWGSRAVVAVVRGSGTQWLSSGDWCQGLLRGSSSDLHSHLARVRVHDGCRAFRKDHKEAGSQAGADDIVQPKSSSPSGGPAESPYPLPPELQPPTNCCMSGCPNCVWVAYAEALLQHYQDGGERALAALETHVADENLRAFIRMEIQLRMRHSG	1381383	1378204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1379754_1381331
851653	contig_10235_pilon	+	489	5	Intergenic	novelGene_46307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1338.84322737952	628	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	60	410	88925	91792	FALSE	10	CCACCTGTGTCTCAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVHPAGHRLWEPVVGGQEMPEGKLWGPRHSLMPHFSPSPTCEEQLSTPGELCIYAAPALGGLLLLVMIILSTCLCWLHRRVKRLERSWELHYASLQRLPGTGGAEGLDLSEGDGKDAKEDPSADYACIAKKKPT	88500	91871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_88536_88900_89016_90395_90492_90833_90857_91651
851654	contig_12939_pilon	+	1599	2	Intergenic	novelGene_166208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATATTTCATTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145791	153016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_145856_151481
851655	contig_17108_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_109542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAGAGAGTCTGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163799	164171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_163800_164200
851656	contig_5018_pilon	-	689	2	Intergenic	novelGene_47002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	138	398	1215079	1213745	FALSE	30	AAAAAATCTGCTGCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAVSQRKLACGERRERARWPEYSSCQTCPTREPPLLLPPRPRAVMEVQKEAQRIMTLSVWKMYHSRMQRGGLRLHRSLQLSLVMRSARELYLSAKVEAHEPEVPLPTGALWVSTGAPVPSGGGGGRSHYR	1215216	1213453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1213815_1214888
851657	contig_7050_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_153639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843486	843834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_843500_843800
851658	contig_7165_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_116858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368998	369725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_369000_369700
851659	contig_12622_pilon	+	749	2	Intergenic	novelGene_6018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAACGGATTCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656472	1657788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1656553_1657119
851660	contig_18393_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_167462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58501	57218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_-_57200_58500
851662	contig_6062_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_5273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTGATGAAATGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689026	689621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_689000_689600
851663	contig_2093_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_152981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGCTGTGGTTACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350105	1348586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1348600_1350100
851664	contig_10734_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_51391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAATACATAGGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989551	1989165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1989200_1989600
851667	contig_8991_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_170940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	131	577	240144	221207	FALSE	45	TGAGAAACTGAGTAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLSLLGRIMRYFLLRPETLFLLCISLALWSYFFHTDEVKTIVKSSRDAVKMVKGKVAEIMQNDRLGGLDVLEAEFSKTWEFKSHNVAVYSIQGRRDHMEDRFEVLTDLANKTHPSIFGIFDGHGGEKGVEVSLSARYSGDRKRRKV	240274	221201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_-_221270_239760
851670	contig_10437_pilon	+	286	2	Intergenic	novelGene_38511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTGATCAAATTAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390311	1391889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1390418_1391709
851671	contig_11466_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_177693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGAGCATAATTCTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67011	66712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11466_pilon_-_66700_67000
851672	contig_7165_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_116840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268901	269432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_268900_269400
851673	contig_6711_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_169274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTTAATAAACTGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21771	22447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6711_pilon_+_21800_22400
851674	contig_6014_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_176273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105615	104937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_104900_105600
851675	contig_10404_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_138694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATCCAATCACTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130173	1129685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1129700_1130200
851677	contig_461_pilon	+	673	2	Intergenic	novelGene_177280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	3061	3873	FALSE	35	GAATTGAGTCTCGATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQARRWRNPIPFPETFDGDTAPPPSRASPALPLHIWTLSCAPAAGRAPVTHWTDRPQPGRCHPPPCQTTRPASICPETCAAVPSPASHRQTAALGPQDSPRRDQSWPQPLDNDSDSSPPP	3060	4183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_461_pilon_+_3120_3569
851679	contig_13224_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_104072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106044	105263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_105300_106000
851680	contig_11986_pilon	+	375	2	Intergenic	novelGene_69245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	0	1318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATATTTCTTCAGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797510	801243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_797702_801059
851681	contig_2791_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_172282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAACAAAGAGAATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2341	1227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2791_pilon_-_1200_2300
851682	contig_6677_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_114175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	5	18	475	492	438032	438015	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCRERSPIRSPRRGQAGCGLSVGACPAGGASLSGPLPRTGLRVLQPGCSWPREGIVFLRKWGSSGSFSGQLLLPPATSLLGVLLSLNDRGPPCLSSPGWFFPGCRGRFPVWGLCVCISQLCLSPWFEVIFAVWDREAVSGKDGGGGVGVEAFLSSLLMFCNC	438506	437879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_437900_438500
851683	contig_11078_pilon	-	1311	2	Intergenic	novelGene_171998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	0	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	475	846	245690	245240	FALSE	10	GATTCCTCCCGGCCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVQCLFRICEIQAVDCTTISSFTVRECEGSSRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSQEKDVGGPTEEELLKLLDQCDLSTSRCATPNISPATSVVQHSRLRESTSRWVWSGVL	246164	244774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_-_245404_245482
851684	contig_8177_pilon	-	522	4	Intergenic	novelGene_86505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	68.60029154457	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	122	463	60217	58045	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVRWKLACLLEDLEDMDFKKFKMHLEDYPPQKGCISLPRGPTEKADHLDLVTLMIDFNGEKKSWDMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPEWGLVLSWLNFSCKRTSFGCVIW	64057	57985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_58110_59940_60244_60804_60867_64024
851685	contig_7728_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_64732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTACACCAAGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772866	772537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_772500_772900
851686	contig_12886_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_135500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588469	589045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_588500_589000
851687	contig_5423_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_85206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315237	314134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_314100_315200
851689	contig_6445_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_77105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTTGGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165132	1165465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1165100_1165500
851690	contig_7887_pilon	-	384	2	Intergenic	novelGene_124908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAAGCGTGCCTCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474338	473865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_474186_474274
851691	contig_16113_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_140542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAGCAAATTCAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9798	8405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_8400_9800
851692	contig_10011_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_68023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGAGAAAAAATAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34751	33717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_33700_34800
851694	contig_12543_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_168395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAAACCCAAACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548775	549984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_548800_550000
851695	contig_2403_pilon	-	1002	2	Intergenic	novelGene_71010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	224	307	142358	142275	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQAKILYFIYGSYLFSHSINTYLVLTTCQSHPPIQSDSSLFLNLKTKNQTHCRRVNLDYNDPIGQSWNRLDGNGMTTPETSSVLLLAGAGVHRAFVGVHVI	148793	141579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_142385_148596
851696	contig_13206_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_161913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTTAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238539	240082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_238500_240100
851698	contig_990_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_76057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCTTAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051063	1050048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1050000_1051100
851700	contig_6079_pilon	-	346	3	Intergenic	novelGene_160126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGTTTGCTGTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542411	529871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_530021_531161_531247_542299
851701	contig_7810_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_144229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625028	624662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_624700_625000
851702	contig_5961_pilon	+	413	2	Intergenic	novelGene_144148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2253	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	52	411	197721	201967	FALSE	45	TCTAATGGAGAAGAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETA	197669	201969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_197889_201775
851703	contig_3956_pilon	+	612	6	Intergenic	novelGene_14782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	14.0996453856117	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	3	536	988863	991678	FALSE	10	CCCATGTGTTTGACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVIDVEEPFSCLSLDAVVSYFVTHTNKELVPFLLDEDYEKVLGPVPPAGGPKQPPPTSTPVSTQDKLPPLPPLPPPPDQDENYVIPIGDVPAANYVNDKVLPPSRQVALKLKKLPKAQAKAPKPPVKPKPEHKVVNSGLLARKLAASTAQPIFPTTGLADVTAELEEKLQKRRALEH	988860	991754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_988887_988991_989095_990441_990613_990708_990802_990877_990956_991613
851704	contig_4469_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_21894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCTCTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344741	344278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_344300_344700
851705	contig_5484_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_151099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTTCGTTGCCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262070	262633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_262100_262600
851707	contig_9516_pilon	-	865	2	Intergenic	novelGene_106196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGGTCACATCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117496	1114876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1114963_1116717
851709	contig_10017_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_156979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATATTGTTTTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255215	254813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_254800_255200
851710	contig_14846_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_85376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTATATTGCCTCTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190469	191554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_190500_191600
851714	contig_12842_pilon	-	564	5	Intergenic	novelGene_168355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.866025403784439	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	51	479	243023	226073	FALSE	30	AAGTTGGCAGTCTGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGQALVHLGLEALAMARPTRLSFSVGDGAPETEKNSGEPENTYILRPNFQQRFRPSVVKDCIHAVLKEELANAEYFPEEMPQLTKHLSEIIKDKLKEMGFDRYKMVVQVVIGEQRGEGVFMAARCFWDADTDNYIHDVFMNDSLFCVVAAFGCFYY	243073	225987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_226121_228737_228802_234753_234824_239874_240009_242910
851715	contig_7179_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_78207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAGAAAATATTTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672057	1672945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1672100_1672900
851718	contig_5260_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_144361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188403	189024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_188400_189000
851719	contig_6233_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_74817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	306	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTGCTGTTGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369713	369125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_369100_369700
851720	contig_3424_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_55461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTTTTAATGCCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132765	132408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_132400_132800
851722	contig_7704_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_154617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338982	338607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_338600_339000
851725	contig_6175_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_16363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAGTCCACAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1751741	1752906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1751700_1752900
851726	contig_14441_pilon	+	275	3	Intergenic	novelGene_100637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111299	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_116747_116866_117719
851727	contig_1037_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_84610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493424	494590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_493400_494600
851729	contig_20596_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_157239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAATGAAAAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110049	108506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_108500_110000
851730	contig_12964_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_131669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGATGGTAAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189373	191084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_189400_191100
851732	contig_13453_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_146698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTAGAGCATAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34395	34723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_34400_34700
851735	SIRV7	-	284	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91642	0	-91636	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCACGAAGTAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_147700_148000
851736	contig_593_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_102001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGTACAAATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337563	337252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_337300_337600
851739	contig_9580_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_167732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATAATAAAAATACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766872	766121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_766100_766900
851740	contig_1428_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_158408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAGAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138283	138973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_138300_139000
851743	contig_1274_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_137768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAAAGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7563	9006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_7600_9000
851744	contig_9099_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_149923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTAGGCGGTGGGGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414110	412942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_412900_414100
851745	contig_3825_pilon	+	777	7	Intergenic	novelGene_77944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1592.09020542877	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	497	769	14814	15603	FALSE	30	AACTGATTTTTCTGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGEWKKAQLVVIAHDVDPIEVRAASLCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12982	15611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14206_14422_14484_14799_14912_15231_15302_15498
851747	contig_501_pilon	+	722	7	Intergenic	novelGene_134884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	17.8699002049069	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	38	568	79664	248754	FALSE	25	CACACACACTAGTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVNKLKAESEKMKIELKKTHAAETEMTLEKASSKLKQIEKEYTQKLAKSSQIIAELQTTISSLKEENSRQQLAAERRLQDVIQKFEDEKKQLIRDNDRAIKALQDELDARSNQLRNAEKKLQHRELESQEQITYIRQEYETKFKGLMPASLRQELEDTISSLKSQVNFLQKRASILQEELTTYQNRR	79626	248908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_79721_144486_144550_153032_153183_203369_203460_244017_244120_247243_247309_248750
851748	contig_4087_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_156068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATTTGAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49252	50283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_49300_50300
851749	contig_9389_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_84068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAACCGAAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000291	999430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_999400_1000300
851750	contig_11978_pilon	-	1052	5	Intergenic	novelGene_63111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	276.367508944159	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	552	920	1891044	1877984	FALSE	40	ATCAGAGTTTCTAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLREISCEDFSFRYGNSLTWSCESSFP	1892485	1877851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1878059_1886351_1886565_1887741_1887799_1891020_1891066_1891955
851751	contig_2596_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_53455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAAGGTGTCCTTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539396	538054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_538100_539400
851752	contig_11742_pilon	+	966	2	Intergenic	novelGene_166553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	81	551	216167	226901	FALSE	15	TATGTCGTGCAGCCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVLGGRLLVTCDGAAVEAEAALQNKVVALYFAAGRCAPSRDFTPLLCDFYTELVDEAQPPAPFEVVFVSADGSEEEMRDFMHELHGAWLALPFHDPFRLELKKRYNITAIPKLVIVKQSGEVITDKGRKQIREHGLPCFRNWVEVADIFQNFSG	216086	227316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_216469_226732
851753	contig_7201_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_152500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAATAAAGAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109470	110130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_109500_110100
851754	contig_10011_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_68017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTCACTCAGAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14036	14559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_14000_14600
851757	contig_10347_pilon	+	500	5	Intergenic	novelGene_177657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	15.3215534460446	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	81	500	1631125	1649364	FALSE	30	TGTGAGGTAATGACTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEEISCYPENSDAKELKRILTQPHFMALLQTHDVVAHEVYSDEALRVTPPPTSPYLNGDSPESANGDMDMENVTRVRLVQFQKNTDEPMGITLKMNELNHCIVARIMHGGMIHRQGTLHVGDEIREINGISVANQTVEQLQKMLREMRGSITFKIVPSYRTQSSS	1631044	1649364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10347_pilon_+_1631128_1641737_1641927_1645804_1645884_1648153_1648240_1649301
851758	contig_12884_pilon	-	292	4	Intergenic	novelGene_104991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	526.303039026841	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGACTCCTGTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915297	899567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_899665_899797_899906_906323_906349_915235
851759	contig_8050_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_114836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGACTTAAAATGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332790	333817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_332800_333800
851760	contig_10642_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_78747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCAAAATAAGCACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320295	1319445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1319400_1320300
851762	contig_1082_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_170431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTTTGTGTGCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88601	87673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_87700_88600
851764	contig_15596_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_139531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCAAGGAGGGATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107948	107360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_107400_107900
851768	contig_2770_pilon	-	746	3	Intergenic	novelGene_107400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	53	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGTATTCTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73202	70261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_70810_71956_72129_73176
851769	contig_14483_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_133775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAGAGTGGTTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182759	183567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_182800_183600
851773	contig_10765_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_122891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGCATAGCAACCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70295	69801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_69800_70300
851775	contig_6634_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_171151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGCCCCGCTGAATGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393363	392936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_392900_393400
851776	contig_4232_pilon	+	1201	2	Intergenic	novelGene_63179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAGGCTCCTGCGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136070	138374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_136384_137486
851777	contig_7057_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_123261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556388	556582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_556400_556600
851778	contig_7189_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_117667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGACACTTCAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588757	589032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_588800_589000
851781	SIRV5	+	211	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	-5	-106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACTATTTAGCGAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	2292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2102_2157_2270
851783	contig_5918_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_99591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACCAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2007973	2008891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2008000_2008900
851784	contig_10864_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_107093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGACATACTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945150	945486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_945200_945500
851785	contig_1107_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_126532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTATTTGAAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59367	66679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_59877_66266
851786	contig_13051_pilon	-	1377	2	Intergenic	novelGene_140136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCTGACCAATTAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453843	426938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_427886_453413
851789	contig_10861_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_39188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATCTTATGGAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292306	292611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_292300_292600
851791	contig_9616_pilon	-	1125	8	Intergenic	novelGene_177313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2.20389266007736	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	154	714	171335	138431	FALSE	50	AAAAGAACTTCAGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLDKLSCLLGLKKKEVHVLCLGLDNSGKTTIINKLKPSNAQSQDIVPTIGFSIEKFKSSSLSFTVFDMSGQGRYRNLWEHYYKEGQAIIFVIDSSDRLRMVVAKEELDTLLNHPDIKHRRIPILFFANKMDLRDAVTSVKVSQLLCLENIKDKPWHICASDAIKGEGLQEGVDWLQDQIQAVKT	174634	138019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9616_pilon_-_138457_145185_145242_151321_151452_157692_157788_162037_162107_163500_163563_171212_171363_174508
851793	contig_12919_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_75879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTGAAACAGACAGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638302	638543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_638300_638500
851794	contig_13496_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_107664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTAACCAAGTCGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492730	494397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_492700_494400
851797	contig_13028_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_175960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATATAGTAATACACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15946	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13028_pilon_-_14400_15900
851798	contig_3825_pilon	-	1402	2	Intergenic	novelGene_78039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1314	89	1402	2317809	2315234	FALSE	15	TAAGCGCCTGCCCCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWQQKREQSPSRRGREHASLLASELVQLRMQLEEKRRAIEAQKKKMEALSARQRLKLGKAAFLHVVKKGKADGVPQPLRPEHSAKEYSQHNGEAFGDGVSKVEELLAGEEERDLLPESRDVEEGSRAFVQQHSLKDPSVLHDLERTKVLSAALLEDGVGGGVDVSECDLSIEKLNETISTLQQAILKISQQQEQLLTKPRSVPVPASKNGSQDQKVKPVAHLVEPLSPTGLTGHRKTPRLGQGRSSRSGRPAELKVPKDRQQGPSRSKTPTPSIETFPHLRSVPPNSHVRTPTDPGLDNGTEPGSDSRDKVIFDSYRLHDESNQRMFVLSSSKDANILSEQMGITEALEKSGREAGLSSSNVAGKESVPVEEPLRSKTSLIEVDLSDLKAPSEDGDMDTHDSSGGLVSDCDQKLGVGFFFKDEQKAEDELAKKRAAFLLKQQRKAEEARVRKQQLEAEVELKRDEAR	2317897	2315233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2315372_2316633
851800	contig_8616_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_72495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTGGCAAATAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325241	324490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_324500_325200
851801	contig_2646_pilon	-	926	5	Intergenic	novelGene_69611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_4	8.8423695919137	630	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	125	577	2013948	2008282	FALSE	5	TCGTTTTTTTCCATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF	2014072	2007932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2008400_2011714_2011799_2012331_2012426_2012507_2012592_2013875
851803	contig_1719_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_87347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	11	343	673969	674301	NA	45	ATTTTAAAAAATATTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNNYSKLPLSLAAGSGVSSTGTTPVLSRHRHQGAGTDDRPLGQSAGFPPVLRTSRTPGSATVQLCDPGASVSLSGNGGDKNDAQMGLWPSVILAATLRVLLYLSSTL	673958	674584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_674000_674600
851804	contig_12671_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_19203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTATGGAAAACAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150494	149891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_149900_150500
851805	contig_10864_pilon	+	1289	9	Intergenic	novelGene_107132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	17.6635217326557	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	361	951	1542358	1615556	FALSE	20	TTATATTTGTATCGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSVIFDTSHLSGEEDVLTFIVTAQSGNVERSETQHDNILSLIVPLVHEVDTSVTGVTSPTSFVYGESVDASNFVQLDDLECHFQPLNVTLQVYNTGPSTLPGSSVSISFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQKNPTPCIIPQEQENIFHTIFAFFTKSGRKVLDCEKPGMSCLTVRCNLSALAKEESRAIGIYVLLNTEILKKDSSSVIQFTTRARVKVDPALRVVEVPNGNPEEMTVVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKSQ	1527382	1615894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1527460_1533918_1534009_1536545_1536655_1542273_1542382_1576802_1576929_1578504_1578625_1582879_1582982_1600253_1600374_1615457
851807	contig_16532_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_110057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	431139	431477	NA	55	ATAATCTCAAAAGCAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELHPTTVGTTKKPESGGILVHRDARSNEWNPPTLSHTIHSHTPTHSLTDTLLPCCFYLFFFFGSLLLRNFLGGFKLIFNSKIPHVTEWKCPIAFTLEDLRQLILSIRHYPNL	431136	431694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_431100_431700
851809	contig_13744_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_77213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGAGAAATATTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119498	1117541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1117500_1119500
851811	contig_3241_pilon	-	1422	2	Intergenic	novelGene_146430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	269	604	1036069	1035734	TRUE	30	TCTGTGCGGACAAGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAGMDLRNYLARGYRLTIQVSRMFYISRSWQHLKSGRVHRKDFWLPFKIEIDLATPGPHFYVKTTSDSWAVAAPSDRARALQLTTVPTTPYCFPGIAFDLQTQMTPKIY	1036337	1033731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_1034336_1035519
851813	contig_2087_pilon	-	1291	6	Intergenic	novelGene_65549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	5.56417109729742	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	344	928	30019	22830	FALSE	20	AGCACCAATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQERPLEADCKHLSPDRCKCKKVKPTLATYLSKNYSYVIHAKIKAVQRSGCNEVTTVVDVKEIFKSLSPIPRTQVLLITNSSCQCPHILPHQDVLIMCYEWRSRMMLVENCLVEKWRDQLSKRSIQWEERLQEHQRTVQVPRRTVQDKKRTAGRTSRSNPPKPKGKPPAPKSASPKKNINARSAQKRTNPRRV	39843	22466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_23037_24320_24385_27359_27559_29811_29878_29970_30052_39532
851814	contig_9389_pilon	-	1377	12	Intergenic	novelGene_83894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	193.292054109366	25	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	224	1297	147015	142182	FALSE	5	CAGCGCCGCGTCCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEFFVLLKALLVLSVLAYIHVAFSRSPINCLEHVREQWPREGVLRVEVQHNSSRAPVFLQFCDGDARGSFPGLAMEPGAGGLEPEDEDEEELTMEMFGNSSVQFELDIEPKVFKPPAGADALNDSQEFPFPETPTKAWPQDEYIVEYSLEYGFLRLSQATRQRLRIPVMVVTLDPTRDQCFGDRFSRLLLDEFLGYDDILMSSVKGLAENEENKGFLRNVVSGEHYRFVSMWMARTSYLAAFVIMVIFTLSVSMLLRYSHHQIFVFIVDLLQMLEMNMAIAFPAAPLLTVILALVGMEAIMSEFFNDTTTAFYIILIVWLADQYDAICCHTSTSKRHWLRFFYLYHFAFYAYHYRFNGQYSSLALVTSWLFIQHSMIYFFHHYELPAILQQMRIQELLLHAPPPGPGSPTALQDNLNNNAAGPGPSGHKSL	150341	142101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_142214_143154_143300_143922_144023_144101_144235_144307_144392_144897_144956_145251_145353_145426_145550_145635_145747_146128_146229_146928_147214_150316
851817	contig_19405_pilon	+	1383	8	Intergenic	novelGene_176205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_7	29.3445402215868	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	1039	1383	82078	85453	FALSE	15	GTGCCTAAGGGCAGGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNATFQITPDVIKESENIQLGQDLKLSCHVDAVPQEKVTYQWFKNGKPARMSKRLLVTRNDPELPAVTSSLELIDLHFSDYGTYLCVASFPGAPVPDLSVEVNISSETVPPTIS	50180	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_+_50301_69653_69795_76124_76300_78147_78345_79192_79326_79586_79857_82075_82406_85436
851819	scaffold_14128_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_169524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	903	1466	272588	272025	NA	10	AGCGCAGGGCCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLMGLWLLRVVNRVVGLGIGLGGNPLLLTKLCKDGEKHCFPMPRVGDGAGDTGMKSMRFGEADFSTSLSLRLKLSSQEWLICIAVCTSRSCTVSRLMRSMPSSCLIWCRRLLCMRTGEAGSSRPWRLGNVVLFRLALGASAWNTGEVSLRPWIRGALLDLRRTPPPPSAGLPPAPGGSSRSSSIFS	273490	271959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_272000_273500
851822	contig_19173_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_176357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGAACATATATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	1241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19173_pilon_-_1200_1500
851823	contig_9653_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_48333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTGTGTTTGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040385	1041679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1040400_1041700
851824	contig_2596_pilon	+	590	5	Intergenic	novelGene_53430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	148.195816405187	1451	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	50	511	9097	10726	FALSE	10	CCCTTCGGCTGCATTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAVKLGSEGCVSVAVMASYFDEHDCEPLDPEQEARTNMLLELARSLFNRMDFEDWGLVVDWDHHLPPPAAKAVVESLPRTTIRGSQAELKCPVCLLEFEEEETAIKMPCHHLFHSNCILPWLSKTNSCPLCRHELPTDDDTYEEHRRDKARKQQQKHRLENLHGAMYT	9047	10805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_9183_9821_9953_10112_10223_10378_10454_10666
851825	contig_3584_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_108139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAACTAGTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330170	331148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_330200_331100
851827	contig_20615_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_146912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATATACAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151464	150646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_150600_151500
851828	contig_11742_pilon	+	1028	2	Intergenic	novelGene_166541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115684	117581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_116311_117179
851831	contig_11846_pilon	+	561	4	Intergenic	novelGene_105982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCAAAACTCCGCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339671	467872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_339999_356655_356766_437088_437159_467818
851832	contig_5551_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_134298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	60.5	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGAAGGTGTTTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834242	827469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_827843_828074_828333_834179
851833	contig_2867_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_135203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGCACTTTATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911848	912766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_911800_912800
851834	contig_14755_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_129386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTAATAATAGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222891	223269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_222900_223300
851835	contig_7549_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_164543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTGATGAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919034	920740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_919000_920700
851836	contig_8357_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_39752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACACCAAACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764562	763649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_763600_764600
851838	contig_2577_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_172066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160108	160505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_160100_160500
851840	contig_16768_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_168311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAAAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12154	11102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_11100_12200
851841	contig_1836_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_71048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791332	791756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_791300_791800
851842	contig_5457_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_139001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79383	80301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_79400_80300
851846	contig_7870_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_108904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	153	500	203712	204059	NA	35	AAACCCCCACAGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQCLCVGCLNLNRKMRHQESEWNPFLTMQRSVLGKYSRLCKKMGEQGVKRAELCSNQRSCAFENRIFLGCKRIAKNMSKWKERIRLKQRITLQVFSLHEQIYPVLMPSTEIQIN	203559	205518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_203600_205500
851847	contig_7816_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_66525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTAAAAATGGCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194632	193245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_193200_194600
851848	contig_7300_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_170459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAACAATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512549	511709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_-_511700_512500
851852	contig_6361_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_23901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126497	126831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_126500_126800
851854	contig_11126_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_138145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744700	745894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_744700_745900
851855	contig_6842_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_130802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1665972	1665016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1665000_1666000
851857	contig_8330_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_71715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAGAGAAGGAGCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99818	99561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_99600_99800
851859	contig_6227_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_49784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAGTCACAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239861	1239289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1239300_1239900
851860	contig_14450_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_49022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTTTGAGGCGTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197137	1197995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1197100_1198000
851861	contig_2312_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_160752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGACTATTGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495751	496661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_495800_496700
851865	contig_19974_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_130482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289390	290888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_289400_290900
851866	contig_9335_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_147470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710234	710781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_710200_710800
851867	contig_13608_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_52390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATATGCACTTCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445252	446363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_445300_446400
851868	contig_4852_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_153968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAGGGAACTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60704	59410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_59400_60700
851870	contig_13496_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_107642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324141	324985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_324100_325000
851871	contig_11978_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_62974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCGACACTTCTTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469192	1470280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1469200_1470300
851872	contig_8615_pilon	+	726	4	Intergenic	novelGene_165221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_3	42.1926797231726	340	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	102	338	165908	177818	FALSE	15	GGTTTTTGTAAGCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSDALCEFDAVLADFASPFHERHFHYEEHLERMKRRSSASVSDSSGFSDSESADSLYRNSFSFSDEKLNSPTDSAPALLSPPVAPQKAKLGDTKELEDFIAHLDRTLASM	165806	178206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_165966_173536_173645_176201_176265_177810
851875	contig_5832_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_134129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACACTTAAGCTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182315	181259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_181300_182300
851876	contig_16098_pilon	-	737	5	Intergenic	novelGene_45796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	36.5128402072476	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	94	363	38403	37536	TRUE	15	CCCAAGTGCCTGCTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPFLFLSLASARGSIVATYIFIFIGETLLSMNWAIVADILLYVVIPTRRSTAEAFQIVLSHLLGDAGSPYLIGLISDRLRRSWPPLLPVRVPGPAVLTHALRLCRGTGRCGLPGHRDLH	38833	36888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_37228_37500_37674_37984_38084_38370_38437_38773
851877	contig_6076_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_81757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAGTGATAAATGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299890	299169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_299200_299900
851878	contig_2646_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_69614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGCAATATCACAGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2027772	2026774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2026800_2027800
851879	contig_14017_pilon	-	781	2	Intergenic	novelGene_165689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCCATTTTCATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52182	48801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_49504_52103
851881	contig_7035_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_83555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATACTCACGACCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882787	881459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_881500_882800
851882	contig_776_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_139960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTGTGTGCTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571576	1572137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1571600_1572100
851883	contig_9002_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_116718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAGAAGTTACAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310190	309501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_309500_310200
851884	contig_4271_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_171865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAGTTAGGAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433184	433676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_433200_433700
851885	contig_4271_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_171866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTAATCCTTATACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433777	434827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_433800_434800
851886	contig_2125_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_147714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGAACTGCCCCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391437	390824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_390800_391400
851887	contig_7057_pilon	+	765	5	Intergenic	novelGene_123191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	175.288868728165	302	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTGGCTGGGCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401512	410186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_401736_401970_402020_406975_407030_409662_409858_409942
851888	contig_16185_pilon	-	961	5	Intergenic	novelGene_144749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.5834164173731	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	31	402	87671	82386	TRUE	35	GCACTCAATAAATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	87701	81745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82169_82249_82419_83278_83451_86018_86156_87641
851889	contig_11978_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_62859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATGTCTGATTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589288	589574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_589300_589600
851890	contig_18392_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_143095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCAGTGAGAGCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128660	127879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_127900_128700
851892	contig_2093_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_152963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAATAGCCTTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104899	1105549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1104900_1105500
851897	contig_7171_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_101271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACTTAATCAATGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918765	918390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_918400_918800
851899	contig_7004_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_126516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAATAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461189	462068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_461200_462100
851900	contig_12886_pilon	-	1566	13	Intergenic	novelGene_135530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	18.2092391079059	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1440	125	1564	857741	846451	FALSE	35	GGACAAAAAGGTGCATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAAGFLRSDKMAALFTKVGKTCPVAREICQKVQELQQQVEGRKPSGGSHEALRIQCSASGKAPTRSPQALKHIWVRTALIEKVLDRVVQYLVENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCALEYTKLKTADHYWTDPSADELVQRHRIRGPASRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLAACAREYVESLHQNSRTRLLYGKNNVLVQPKKDMEAVPGYLSLHQAAESLTLKWTPNQLMNGTLGDSELEKSVYWDYALVVPFSQIVCIHCHQQKNSGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHLLSFLSCLENGLLPHGQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSMRSVDVEEMGMGQATDYVFRIVYPGHRHEHNAGDMIEMQGFGPSLPAWHPKPLCSQGSPCLSCSSSSSPYATPSHCSCIPDRLPLRLLCESMKRQIVSRAFYGWLAYCRHLSTVRTHLSALVHHNIIPLDRPPGSSGGLTKDVWSKYQ	866466	846448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_846585_846670_846736_848525_848680_854350_854478_854623_854785_854968_855037_855440_855566_856079_856215_856533_856680_856780_856849_857158_857321_857646_857810_866410
851901	contig_7129_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_169301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACACCAAATACCACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899487	897832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_897800_899500
851903	contig_12886_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_135488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	382453	382860	NA	25	GGGGTAGGTACCAAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVNVRIVCAGPVCQRRRRAQQRAGGGGWGTPHSGTRGFDRWSKGGCVHLLAPGSVDFGVTSHPSTLSRRIVETWSTTLDLQGFLLHSPRESNSLIIQTRTLRPETKKCPNPAARLFSLSFQRRGTASKSPQHESV	382452	382972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_382500_383000
851905	contig_13074_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_153432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAGGATGAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426800	427478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_426800_427500
851906	contig_10500_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_41217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATATGGCTACCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1622265	1621885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1621900_1622300
851907	contig_7378_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_120232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGAAGTTGTTTCAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87920	87380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_87400_87900
851908	contig_17074_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_145161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCAGCTTCCCTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499732	501461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_499700_501500
851909	contig_15108_pilon	+	1037	2	Intergenic	novelGene_131178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	521	673	96977	98297	FALSE	40	GCATGCCCTTTGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQDLASITPTPTPGSCSAWDTELEDPAFHPLCSGRVSVRARPPGGAPNPWPSTWEKASEDPRSGPLAQLSLSCASQPGPFLSAITRPPSWPELALPPHSGNPRSGEAEGPFPSLKAEPRLTWCCLSRSLPLPAEQKEKTSSVYLSLHLTGGGPRDEALEGRIRTSQGDSGPAQMSKLSCPIAPGVTSQDWVSEPEQRKGLPRRRAKTSRGISRQKKLRINPKR	96456	98661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_96986_98153
851910	contig_5955_pilon	+	790	4	Intergenic	novelGene_177523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	8.17856276425687	189	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	191	598	321706	359321	FALSE	10	GCTCACAGTGTCTGTTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WILLRALCAFGIQLSPPPRAPGPRRARISGPPTAPLASVAAVPAESRAAPARSLAVRPQSPAEMPVDFTGYWKMLTNENFEEYLRALDVNVALRKIANLLKPDKEIVQDGDHMIIRTLSTFRNYIMDFQVGKEFEEDLTGIDDRKCMTTVSWDGDKLECVQKGEKEGRGWTQWIEGDELHLEMRVQGVVCKQVFKKVQ	321515	359513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5955_pilon_+_321779_322213_322393_357103_357206_359267
851911	contig_11476_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_170505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCCCATAAAGAAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53937	54576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_+_53900_54600
851912	contig_9099_pilon	-	1261	2	Intergenic	novelGene_149912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATTTTTAAAAAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349703	347185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_347851_349107
851913	contig_3654_pilon	+	1626	5	Intergenic	novelGene_174991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	19.5831560275661	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	685	1509	512296	537337	FALSE	60	CACAAAATTTCATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDIINAKSNDGWTPLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQNGFLLRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM	498822	537454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_+_499236_499416_499516_507196_507318_512244_512507_536723
851914	contig_17964_pilon	+	264	3	Intergenic	novelGene_33937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGCCTATAACTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693383	713307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_693464_707481_707606_713247
851915	contig_8276_pilon	-	958	2	Intergenic	novelGene_174473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCGATTTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127688	116879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_117102_126952
851918	contig_4469_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_21887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAACTGCCTCATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261680	261073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_261100_261700
851919	contig_4732_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_75506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTCTTGGTATGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087029	1087558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1087000_1087600
851921	contig_6397_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_146264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACATGTAGTGTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481089	480151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_480200_481100
851922	contig_7378_pilon	-	957	3	Intergenic	novelGene_120262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_2	4	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	35	658	624621	442469	FALSE	80	TAAAAAAAAAAATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGRGLQSVGSMSGGGDVVCTGWLRKSPPEKKLRRYAWKKRWFILRSGRMSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQVDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICHICGFNQAEESTDSLRNISSASHGPRSSPAELSSSNQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPPVSNNIQPTLSTSAPQEYLYLHQCISRRAENAR	624655	442169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_442717_478307_478609_624546
851923	contig_13645_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_146166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	27	junction_1	15.5	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTACAGTTAATGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255114	323002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_255288_262073_262134_322700
851924	contig_13945_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_173452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60434	59837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_59800_60400
851925	contig_9839_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_88537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAGAAAAACAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67351	67953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_67400_68000
851926	contig_18214_pilon	+	392	4	Intergenic	novelGene_166022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	98.5269280732712	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	49	390	226615	234593	FALSE	60	CGAAATGGAAGAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFKFSLLNAKREETKAMESQRAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLKVPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFE	226566	234595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_+_226619_228140_228269_234301_234480_234561
851929	contig_3270_pilon	+	1293	9	Intergenic	novelGene_104518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTATAAATGAAAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426291	437957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_427007_427308_427397_428848_428912_429003_429076_430086_430197_435742_435794_436723_436812_436894_436965_437921
851930	contig_10737_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_133890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	70	423	268090	267737	NA	75	GGAAAAAAAGGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGRANPRFRRGLRLRRPQGKVVMASVFTVAGMLPPTLAGGSFCCKRQAGSCPGCQYRWAGWLRTGSAIRISRDPLPPRRNPARALPGGGLRRPFYLLSEDVGGEVTALPSVPLLVGNACPAAILVPPPPPVMCLKTQKT	268159	266696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_-_266700_268200
851931	contig_9216_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_163505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACTGGGACCCCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506006	504921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_504900_506000
851933	contig_6079_pilon	+	643	6	Intergenic	novelGene_160124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGACCGGAAGAGGCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526595	548940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_526724_529875_530021_531161_531245_532393_532434_542332_542447_548807
851936	contig_7758_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_163538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGTAACTTAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155546	156067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_155500_156100
851937	contig_15629_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_122440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAATGCAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80867	81244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_80900_81200
851938	contig_7450_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_177695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535782	536537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7450_pilon_+_535800_536500
851939	contig_10892_pilon	-	727	3	Intergenic	novelGene_116734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTGACGGCCGGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65005	37927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_38248_46838_47077_64836
851940	contig_15134_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_140234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGCAGGGAAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345235	343783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_343800_345200
851941	contig_20610_pilon	-	266	2	Intergenic	novelGene_67637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTGTTTTTAAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26401	25984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_26098_26248
851943	contig_17142_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_177096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTTATGAGCACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142384	142045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17142_pilon_-_142000_142400
851944	contig_17142_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_177095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141452	141086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17142_pilon_-_141100_141500
851945	contig_10734_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_51334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTCTCTCCTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616940	1617891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1616900_1617900
851947	contig_4083_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_152331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGATCTAAAACCAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119111	118799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_118800_119100
851950	contig_678_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_167784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27045	28104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_27000_28100
851952	contig_14516_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_153909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAACTAAATCCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210399	211814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_210400_211800
851953	contig_14599_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_167897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	171	431	21043	20783	NA	80	TAAAAAAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKGLEIYLQKSASENPVDHSSLIRNRSWGWLRTGQRFIPSSTVWLRTGPRFILSSMLSPCVRADWMAAGNSSNKQRARCASSLHGERAAEHRLEVDAWGPDSSDGLSFSIRQVGFLVGSPSQGCWETHRHCSALVPGPSAR	21213	20409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_-_20400_21200
851954	contig_10658_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_130093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGGACAGAGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394140	393834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_393800_394100
851955	contig_5260_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_144387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAGGAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410343	409333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_409300_410300
851956	contig_14151_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_171837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAACTAACACTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109015	107823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_-_107800_109000
851958	contig_19744_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_120404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAATAATAGCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223779	223034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_223000_223800
851961	contig_5758_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_119052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTCACAGTGCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33063	32739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_32700_33100
851964	contig_6795_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_27753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	454	768	371364	371050	NA	30	GCATGATTTGATGGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVGGGMGAHGEGWGAVRTSLYRCDEARPSLSSATGERGPLPCRIEGQEWLEEGALAPAGPALSLAQSLHLYSESMSPTPAMSQSLRILRAVPSPSGVLRKEV	371817	370741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_370700_371800
851965	contig_2646_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_69583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGCAGGTGGGATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1412834	1413556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1412800_1413600
851967	contig_8650_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_162622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACACCGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217276	216136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_216100_217300
851968	contig_854_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_36115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	144031	144333	NA	45	TCAATTAAAAAAGGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRPLHPADLCTPTLWPGGSEGLGPTPVVTNDSCSPGDCRLKRRFPYLRVKKDLGDPQVQPSSVCQCRERGKAQGLESPLQAVGHDWLSSTHVLCSLLPW	144030	144947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_144000_144900
851970	SIRV3	+	426	3	FSM	SIRV3A	SIRV305	436	3	1	9	1	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATATTTCCGAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	6709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_4081_4568_4780_6570
851972	contig_1331_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_37855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTACCGGGAGTGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225375	226336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_225400_226300
851973	contig_11056_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_130374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATCAAAAGCAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346284	345517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_345500_346300
851974	contig_15031_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_138411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGCCTTCCCTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104110	104642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_104100_104600
851977	contig_11003_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_105439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	343	432	83984	84073	NA	15	TTGTATACCTGTGTCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLQEERLDAVTLLYATSLPSFCLLAGAALVLEAGVAPSPTPTDSRLWVCILLSCFLSVLYNLASFSLLALTSALTVHVLGNLTVVGNLVLSRLLFDSHLSTPSYVGIALTLSGMFLYHHCEFIASWATRRGLWQGDQPGKGL	83641	84608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_83600_84600
851979	contig_10019_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_86670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGGAGGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249320	250393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_249300_250400
851980	contig_6241_pilon	+	1061	5	Intergenic	novelGene_156444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	37.3321242363732	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	382	876	528875	544832	FALSE	45	CAACAACAATCTTGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNAASELEFSNQTSSEEISQLSSLELSSREKSSSCSAEKPGYPDFIYVMAANIFQGIRFEKSPEKVLIKYGNEPLPSSPESEDESFQRLSYELAFSALKYQDILESILIDSYIFPSTTIPDHLSSLIIVMLYDFQDRKFQARLLSDNEDSISEVQEVENLLHR	528200	545017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_528490_528782_529176_543808_543868_544245_544377_544828
851981	contig_12344_pilon	+	342	4	Intergenic	novelGene_164862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	5.90668171555645	187	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCCAGCTCTGCCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30773	73018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_+_30827_52931_52970_65268_65351_72849
851983	contig_17470_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_110541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAACTCATGACAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282436	282734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_282400_282700
851984	contig_17470_pilon	+	110	1	Intergenic	novelGene_110542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAGAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282583	282693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_282600_282700
851985	contig_12125_pilon	+	1015	3	Intergenic	novelGene_76256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	8	805	660905	677511	FALSE	10	CTCGCACATGGCTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGKKYCVYCLAEVSPLRFRCTECQDIELCPECFSAGAEIGHHRRYHGYQLVDGGRFTLWGPEAEGGWTSREEQLLLDAIEQFGFGNWEDMAAHVGASRTPQEVMEHYVSMYIHGNLGKACIPDTIPNRVTDHTCPGGGPLSPSLTTPLPPLDISVAEQQQLGYMPLRDDYEIEYDQEAETLISGLSVNYDDDDVEIELKRAHVDMYVRKLRERQRRKNIARDYNLVPAFLGKDRKAPSSHCLDFARPRPAERVHVTVSGTEL	660897	677721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_661175_675544_675989_677427
851988	scaffold_13505_pilon	+	371	2	Intergenic	novelGene_111616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	36	junction_1	0	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTAATGGTCTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660095	667988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_660174_667695
851990	contig_6732_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_177697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	480	30	509	61338	60859	NA	20	GTCAGAGGATGTTTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTWPEEGAMESTMEQRSMLVHSKISDASKRNGLINTRNLMAESRDGLVSVYPAPQYQSCQVVAGTMPAVLDGSRSEPVQQLLDPNTLQQSVESHYRPNIILYSEGVLRSWGEGMAADCCETTFIEDHSPTKDSLEYPDGKFIDLSADDIKIHTLSYDVEEEEDFQELE	61367	60858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6732_pilon_-_60900_61400
851992	contig_6001_pilon	+	439	3	Intergenic	novelGene_128035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	1.5	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTTTAACTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256164	258795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_256240_256723_256797_258504
851993	contig_15613_pilon	-	737	5	Intergenic	novelGene_147228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.44948974278318	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAATGTGTCATGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381190	361297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_361624_374705_374760_377725_377888_380433_380610_381171
851996	contig_1335_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_166508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTACTGGCATTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319449	320429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_319400_320400
851998	contig_10042_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_79149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGTGAGTCAGAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115878	115363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_115400_115900
852000	contig_7622_pilon	+	494	6	Intergenic	novelGene_132409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	126.903743049604	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	125	451	252116	256445	FALSE	20	TATGAACGGGTCTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTVVAVGLTIAAAGFAGRYVLRAMKHVEPQVKQAFSGGYYRGGFEPKMTKREAALILGVSPTANKGKIRDAHRRIMLLNHPDKGGSPYIAAKINEAKDLLEGQAKK	251991	256488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252974_253027_253105_253156_254141_254222_255063_255135_256374
852001	contig_15049_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_160717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAACAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216172	216884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_216200_216900
852002	contig_13592_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_33747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACCTAAAAATAGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342206	343045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_342200_343000
852003	contig_15354_pilon	+	737	6	Intergenic	novelGene_65736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	116.82362774713	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	111	662	591728	600633	FALSE	25	TATGAATCAGTGTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVRALRAYSGLAAAAAIFPWHLSFSILRARDLPSGAMSEGVDLIDIYADEEFNQDPEFNNTDQIDLYDDVLTATSQPSDDRSSSTEPPPPVRQEPSPKPNNKTPAILYTYSGLRNRRAAVYVGSFSWWTTDQQLIQVIRSIGVYDVVELKFAENRANGQSKGYAEVVVASENSVHKLLELLPGKVLNGEKVDVRPATRQNLSQFEAQARKRSPTGKRMR	590996	600708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_591056_591676_591782_598174_598394_599232_599337_599700_599847_600604
852004	contig_19957_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_57746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAATTTGCTGTGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383511	384225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_383500_384200
852005	contig_7293_pilon	+	710	2	Intergenic	novelGene_54272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTGTTGCAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567016	570511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_567160_569944
852006	contig_15893_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_128495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGCCATGTGGTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13587	13081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_13100_13600
852007	contig_2940_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_81907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTCAAGTGAAGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471326	470069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_470100_471300
852010	contig_4891_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_124528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATACACGCTTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110778	111766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_110800_111800
852014	contig_8059_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_111109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATCATCACTAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242920	243930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_242900_243900
852015	contig_9468_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_59480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTCAAAAAGAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258087	258779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_258100_258800
852016	contig_8588_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_146500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCCACATGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145455	144178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_144200_145500
852017	contig_5485_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_37764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535960	535236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_535200_536000
852018	contig_8447_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_69441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGGCCAAGGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114232	113838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_113800_114200
852019	contig_7179_pilon	-	847	3	Intergenic	novelGene_78137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACAAGTTCAGTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984148	965120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_965336_974432_974557_983640
852020	contig_7963_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_58526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCCACTGTCAGCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212353	213321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_212400_213300
852021	contig_10023_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_123512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATGTTCTAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446487	446783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_446500_446800
852022	contig_854_pilon	+	1465	1	Intergenic	novelGene_36120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCAGACTTTCCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296399	297864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_296400_297900
852023	contig_1443_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_28356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACACACACCCACGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937521	937023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_937000_937500
852024	contig_7513_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_89009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAGAGAGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648567	647968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_648000_648600
852025	contig_10074_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_57138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCTAACTACGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425004	426045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_425000_426000
852026	contig_12031_pilon	-	1317	4	Intergenic	novelGene_137564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	29.8030572630095	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1302	15	1316	301709	280307	FALSE	25	CCCAGCAGCAGCTGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPQDMAPSHCAELKDQFLRLSHYRQLKTAEDYQALSRDIEAQVQQEGLREAGRIFYFSVPPFAYADIARNINSSCRPGPGTWLRVVLEKPFGHDHSSAQQLATELGSFFQEEEMYRVDHYLGKQVVAQILPFRDQNRKAFDHLWSRHHVERVEIIMKETVDAEGRTSFYEEYGVIRDVLQNHLTEILTLVAMELPYNVSDVGAVLRHKLQAFRALRGLRRGSAVVGQYQAYSDQVRRELQKPDSFQSVTPTFAGVLVHIDNLRWEGIPFILMSGKALDERVGYVRVLFRNQAYCVQSERLWAAGQSQCLPRQVVFYIGHGDLGSPAVLVSRNLPRPTLPSDSWKEVEARPGLRLFGRPLSDFYTYIPVREQDAYSILISHIFHGRKDSFITTENLLASWHFWTPLLASLDREAPRRYPGGAENGHLLDFEFSGSQLSF	301723	280305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_280861_282187_282458_299862_299981_301349
852028	contig_8820_pilon	+	1136	3	Intergenic	novelGene_79324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	4	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	695	1024	407578	407907	FALSE	45	TAAAGGATAAAGTCTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRAELVAAGGQKRESEVTEEVLASVKRTRRGCVPKDATEPLAAPRRGQERPRTGRAPAAREGGGPQVNGHSSHHCGEAHPAAGPPSGRSVFPAGQQLRAFADIDAQSGSVGSALLPQDAQECSGQSPGGSPCGSGLCSTLVSSGGLGSLPPGGTRNAGVGNLGSACASHPDGRQPSPSTVTLTAVTTLPSKTALSPEAPPVDHASRTASGPGPQPSLDGLQLAARGLGSHMGDWSQFSCRAEEAAQQTELENVVAVGEAVTFEVPNGCHELFSQGQEQIFIQTSDGLILSHPGTVVTREEDVVIVTEAEGPALQMGLLPEGVPLGAVEAFLSMGTEPCP	405617	408019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_405670_405804_405941_407071
852030	contig_11071_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_131022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGGGCTTCAGTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85707	86616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_85700_86600
852032	contig_7839_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_45757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATCCATAGTGTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1525497	1524291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1524300_1525500
852033	contig_6412_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_149949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATATCGTGAGTCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218699	217133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_217100_218700
852035	contig_18648_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_177698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGATTGTCAAAAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24817	25643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18648_pilon_+_24800_25600
852037	contig_15066_pilon	+	1167	10	Intergenic	novelGene_149517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	0.785674201318386	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	109	1113	24124	27353	FALSE	20	CAACCCTTGTCTGATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRRERPIPLRGSAAALCNNLSVLQLPTHNLTHFGVVHGPSAQLLSAAPEGVPLAQRQLYAKQGAGVSPPLITQVHWCILPFRVLLVLTSHRGIQMYESDGSVMVYWHALNSGDASPVHAVFARGIAACGHFVCVGTWSGRVLVFDVPVKGPNIALCEELAGHQTPVTDIATEPAQGQDCVADMVTADDSGLLCVWKSGPEFKLLTSIAGFGVPCPSVQLWQGIIAAGYGNGQVRLYEASTGTLHVQINAHARAISALDLAPEVGKLLSAAEDTFVHIWKLSRSPESDNIEVEHCHGECVPDTQVCGARFCDPSGSSFAVTGYDLAEILRFRSV	23684	27407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_23735_24065_24346_24489_24553_24972_25040_25129_25184_25523_25652_26538_26640_26733_26897_27068_27144_27221
852038	contig_13004_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_112591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	84	308	55619	55395	NA	50	AACATTAAAAAGTTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNVEQNSNSQKKTRLTGLTETGETPETMAPRHSANSELKLFPKPTFQTKIRQAYKTKSNTCEEFNQIYETKRATPVQKQDENAGKEYPLPNSVKLTISDIQ	55702	55316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_55300_55700
852043	contig_7893_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_177700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGCTTGGTGGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12420	11785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7893_pilon_-_11800_12400
852044	contig_15118_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_74601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGACTGGTTTATTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386645	387513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_386600_387500
852045	contig_9293_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_175192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATCCCATAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70328	71593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_+_70359_70466
852046	contig_8020_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_114375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATCACCAGGACCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105721	105095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_105100_105700
852047	contig_12113_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_134763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCTAAATTCACATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387681	386784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_386800_387700
852048	contig_1154_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_87045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	57	257	313	62292	62348	NA	15	TCCTTCCTATTCTCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHKLADLGQIQSRSYLEPKKKKPNLLPSSRFRLIVTLQHNRTVPQGFQAVAGGFKLQIFWLAAELLTTEPPELRSYLRHPYFLKMAVLYDRPHLPYQVEFRD	62035	62921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_62000_62900
852050	scaffold_16539_pilon	-	297	3	Intergenic	novelGene_68316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACTCCGGATCTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128367	127310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_127401_127708_127820_128271
852051	contig_15293_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_146531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	814	1314	115250	115750	NA	40	AGAACAGATGAAAGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDSKGQRASEGGDSNKGLEAGNKKDGRESQEAAHVTLCNLPPPQRLWNHWGGGAVGRQEGANWEFVIEASVQMGTALLHLPEARGLLSERSVGLRQATSTGLRQAAPAPQPCDPRHSSLPSTPNAAARLHPSRQRLENCSLGSHQPKRTHLKETASSSPTGVHSQ	114436	116156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_114400_116200
852053	contig_3130_pilon	+	853	2	Intergenic	novelGene_103582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	101	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGCTTATCTGCTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167814	169729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_168037_169098
852054	contig_1406_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_25459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATGGGAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563820	564742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_563800_564700
852056	contig_5880_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_151129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGGAGAAAGGAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319724	320671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_+_319700_320700
852057	contig_5918_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_99582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTGACTATAATAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924974	1924316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1924300_1925000
852058	contig_3846_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_137152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAACATTTTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226484	225368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_225400_226500
852059	contig_5451_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_167188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721428	722346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_721400_722300
852060	contig_4891_pilon	-	1116	2	Intergenic	novelGene_124529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	297	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	204867	200441	FALSE	40	AATAAAAGGGGAGGGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGGSIHSGCITAVHNVPLNVLIRPLPSVLDPAKVQSLVDTIREDPNSVPPIDVLWIKGAQGGDYFYSFGGCHRYAAYRQLQRETIPAKLVQSTLSDLRVYLGASTPDLQ	204867	199654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_200645_204741
852061	contig_12540_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_148122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGTGCCAAGATTGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242808	1241899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1241900_1242800
852062	contig_9957_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_173844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623162	622515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_622500_623200
852065	contig_710_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_162946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGTCAGTGCCCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277948	279265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_277900_279300
852069	contig_4364_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCATGCCTGCATTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487677	1488585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1487700_1488600
852070	contig_9113_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_68608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGCAGAAAATGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412139	414420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_412258_412741_412975_414387
852074	contig_12624_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_60996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGGCCATGTATTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130467	131048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_130479_130711
852075	contig_8058_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_149515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAAAGGAAACAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68645	68055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_68100_68600
852076	contig_2715_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_173168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCATCACAAAACCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68037	69041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_68000_69000
852077	contig_6433_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_162753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTGGGTAAGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49753	50423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_49800_50400
852078	contig_12638_pilon	-	1293	6	Intergenic	novelGene_33210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	24.9479458072203	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	138	1037	364750	357745	FALSE	20	GCCCTGCCTTTCACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQKEEEILELREAQQRRNPKDSPQSHKASPVEKSSPTFDSLGSKMQQELERLQGALKQTEAREIEWREKAQDLALSLAQSKASISSLQEVAMFLQSSVLERDSEQQKLQDELDLTRQALEKERLHSPGPAGRAEPGPRGEQTIQPGVVSGVEAKPSPGIEEKQRQRLEHLQQAVAQLEIDRSRLQRHNVQLRTTLEQVERERRKLKRDSMRASRAGVLEISQATAPLPTQQDGIGGQKGFSDAKHMAELQKEVALLRAQLALERKQKQDYIARSVQTSRELAGLHQNLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRKLDESLTQSLASPGPILLHPSPSPSPSAAQATPR	364887	357488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_358021_359711_359775_360883_360986_361508_361659_361835_361950_364555
852080	contig_12046_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_83489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	111	428	480208	479891	NA	40	CAAGCAAAATATTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITRSYYRNSVGGFLVFDITNRRSFEHVRDWLEEAKMHVQPFRIVFLLVGHKCDLASQRQVTREEAEKLSADCGMRYIETSAKDATNVEESFTILTRDIYELIKKGEICIQDGWEGVKSGFVPNTVHSSEEAVKPRKECFC	480318	479229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_479200_480300
852081	contig_6496_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_103495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACATTATTTGGTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534430	533186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_533200_534400
852082	contig_6557_pilon	+	312	2	Intergenic	novelGene_32992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12783	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGCGCCTTTTTGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436627	440079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_436772_439911
852083	contig_14829_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_163814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTCAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51411	51053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_51100_51400
852085	contig_3980_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_172332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTAACCACAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70783	70218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_70200_70800
852086	contig_12624_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_61002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGGCTGTATGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418647	417252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_417300_418600
852089	contig_15204_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_177461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACGCACACCACCCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16279	16051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15204_pilon_-_16100_16300
852090	SIRV2	-	248	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4625	34	3450	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
852091	contig_12292_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_167015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTGAAAACCCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338743	339458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_338700_339500
852092	contig_14288_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_153836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443878	444718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_443900_444700
852093	contig_6365_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_134014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCCTTTTGTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126966	127448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_127000_127400
852094	contig_1442_pilon	-	1387	10	Intergenic	novelGene_172161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_9	41.1879162430493	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1125	262	1386	482116	448204	FALSE	30	ATATGTGGAATGGAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRINKNVILALLTLTSSAFLLFQLYYYKHYLSAKNGAGLSKSRGSRIGFDSTQWRAVKKFIMLTSSQNVPVFLIDPLILELINKNSEQIKNTSYGTTSDCKFFCVPRDFTVFALQYHLWKNEEGWFQIAENMGFQCLKIQSKDPRLDGIDSLSGTEIPLHYICKLATHAIHLVVFHERSGNYLWHGHLRLKRHIDRKFVPFRKLQFGRYPGAFDRPDLQQVTIDGLEVHIPKDLVHFLEEIPHSRFIECRYKEARAFFQQYLDDNTVEAMAFRKSAKELLQLAAKTLKKLGVRFWLSSGTCLGWYRQCSIIPYSKDVDLGIFIQDYKADIIIAFQDAGLPLKHKFGKVEDSLELSFQGKDDVKLDIFFFYEETD	486478	448202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_448285_449776_449911_452265_452396_463525_463659_466104_466383_468662_468867_471845_471906_482011_482199_483401_483555_486452
852096	contig_7293_pilon	+	925	3	Intergenic	novelGene_54271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTTACAAATAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349900	351764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_350104_350210_350295_351126
852097	contig_4659_pilon	-	651	4	Intergenic	novelGene_118188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	42.9444085093999	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	81	476	134687	130201	FALSE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPFTPLGWHHNNLELLREENGEKQAMERLLSANHNHLMALLQQLLHNESLSPSWRDIIVPLVCQVVQTVRPDVKNRDDDMDIRQFVHVKKIPGGKKFDSVVVSGFVCTKNIAHKKMNSCIKNPKILLLKCSIEYLYREETKFTCIDPIVLQVRTYY	134767	130025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_130327_133348_133424_134065_134247_134673
852099	contig_5445_pilon	+	722	3	Intergenic	novelGene_135429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_1	20.5	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	34	309	124846	130921	FALSE	25	GTGCAATTGCAAAGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPSQPLPSGTMKVSAAALAVLVIAAALCAPASASPYASDTTPCCFAYHPRKMPRAHVKEYFYTSGKCSMQAVVFVTRMNRQVCVDLEKKWVQEYINSLEMS	124812	131334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_124922_126545_126658_130833
852100	contig_10082_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_63852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140765	139490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_139500_140800
852101	contig_10734_pilon	-	401	2	Intergenic	novelGene_51411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGACGTGTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2079611	2072641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2072950_2079518
852102	contig_91_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_127130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTACAGTAAAAAGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801033	800338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_800300_801000
852103	contig_2204_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_71640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTTTTAATATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6177	5761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_5800_6200
852106	contig_18829_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_177706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACTCAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31951	32384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_+_32000_32400
852109	contig_12327_pilon	-	682	6	Intergenic	novelGene_140641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	20.9418241803335	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	107	682	179394	176596	FALSE	65	AAGAAGAAGAAGCACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REAQLRGPRSRPGAWRGWPRAHLGVCPSPAAPAGTMFGSSRGGVRGGQDQFNWEDVKTDKQRENYLGNSLMAPVGRWQKGRDLTWYAKDRVGPVGLSREDELAAVRQAEQEALMAALGYKNVKKQPTGLSKEDFVEVCKREGADPEDKGVDRLLGLGSSSGSAGRVVLSREDKEAAKLGLSVFTHHRVEGSGTGASPASARKKLHSEEKVEPCSENHKKSKKEKKKK	179500	176595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_176639_178000_178087_178279_178353_178593_178677_178801_178848_179149
852110	contig_9575_pilon	+	2242	12	Intergenic	novelGene_169725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.5754627964088	7	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	42	1448	672058	705000	FALSE	30	ACCTTGCAACTGAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDSFVLSRARSSLPSNLEIRRLEDGTEGVFAVTQLVKRTQFGPFESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNEDDCNWMMLVRPAVEHEHQNLTAYQQDSDVYFTTSRDIPPGTELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQACAGTHAAGTPESSAPVEAEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLTHLEQAKGAPPTSQSEATPGKEPEVPRGELPAGPQSVSATKEQKKKPRRGRKPKTPRTEQPLVIVEDKDPAEHVAEIVTEVPPDEPVSAAPDERIMELVLGKLATATSESGSIPKFPHHPHSTISLKRSLILSSRHGIRRKLIKQLGEHKRVYQCNICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKLFSRKESLKQHVSYKHSRNEVDSEYRYRCGTCEKAFRIESALEFHNCRTGLSPHGGSFVSLGLT	629717	705794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_629750_672048_672095_672686_672781_675256_675411_677927_678181_686165_686268_697770_697996_700934_701065_702294_702477_702755_702851_703289_703378_704953
852111	contig_3862_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_137430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623913	623415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_623400_623900
852112	contig_11417_pilon	+	741	3	Intergenic	novelGene_103266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	366	junction_2	2.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	99	470	284496	319962	FALSE	65	TTTAAAAAAAAAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKYVQNISLHFKIFCFTVFSI	284397	320233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751
852113	contig_7035_pilon	-	681	7	Intergenic	novelGene_83552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCTCGATGCGCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853777	795017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_795060_851995_852056_852273_852357_852517_852606_852750_852893_853354_853491_853647
852114	contig_8443_pilon	-	1255	2	Intergenic	novelGene_150608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAGCAATCTTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750094	741157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_741213_748894
852115	contig_4686_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_118569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTTCATTATTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688448	687594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_687600_688400
852117	contig_14326_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_120673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	575	889	99075	99389	NA	50	AAGGATTAAATGTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISSNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEYVSRLSCGVGHGTDPLGDQAVAFNFPTLSLCLGTEPVTTSDLVYQPGMFSGQQRCQAESTVELLGAGGHH	98500	100287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_98500_100300
852119	contig_7078_pilon	+	651	3	Intergenic	novelGene_130201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	57	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAAATTTCTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951286	982393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_975279_975387_982119
852120	contig_7308_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_159633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTACCAAATGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617432	618640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_617400_618600
852121	contig_8866_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_77788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACTCCATCACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349811	350711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_349800_350700
852122	contig_11709_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_168213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAAGGTCTGCAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43782	42998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_43000_43800
852123	contig_2444_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_83785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGACAACTGAAAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250126	250623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_250100_250600
852125	contig_593_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_102019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGAGGTTATGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421082	420664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_420700_421100
852126	contig_5978_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_152399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360061	360889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_+_360100_360900
852128	contig_14133_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_119905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	712	1038	122392	122718	NA	30	GCAGCCATTACAAAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLAFPPWHTHRKKGGHEAKEGAKCSPIPGLAPRIFSDNQAVGWQVGWVGMRAAALWGSQLASGSRRGRCLSSEAPNRVLFTQCPASHLLSFPVLRMTPSTSCESEP	121680	122739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_121700_122700
852129	contig_10494_pilon	-	577	4	Intergenic	novelGene_102131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	6.0184900284226	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	373	462	300547	300458	FALSE	30	TCATTGTAGTCAACATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLHLVHWNSVRYQTYNDAILGENGLAVIGVFLKLGAWHKELQKLVDVLPEIKHKDARATLTPFEPAGLLPSCRDYWTYSGSLTTPPLTESVTWVIQKQPIEVAPDQLSAFRTLLFSALGEEEKTMVNNYRPPQPLMNRKIRASFQTTEEGTSS	309059	300342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_300602_304372_304529_308764_308828_308960
852130	contig_15219_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_40839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAACTCTTAGCTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25802	26120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_25800_26100
852131	contig_12019_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_87714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGTAATATTTGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295619	296690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_295600_296700
852132	contig_10864_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_107068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	438	749	835986	835675	NA	30	AAACATTTATTGTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLLHSRASAPVTLPLPILLQTHWPPWSSDLPGMLPFCLLSPWNTHPLNSLMTHSRTSTGSVLKCHIRREALPEPPNLSRGPSHPELPILPLLVLSIALNTI	836423	835374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_835400_836400
852134	contig_8059_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_111074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATAAGTAATTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18779	19038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_18800_19000
852137	contig_14322_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_115665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	179	310	601972	601841	NA	5	CGCTCTGCCTCTGGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGALSAGPLLLFYFEGFRVLRHLSVTGVQTVAPHVLPVLLASPCLLQGCTRSSPDSRAPMQEAVLERVVFYLTGRALAPQQTWGAHRDPRLARPRTLQTLPP	602150	601236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_601200_602200
852138	contig_7895_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_154435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTTGTCTACTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425846	427363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_425800_427400
852139	contig_12125_pilon	+	793	2	Intergenic	novelGene_76263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAACAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727190	736771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_727372_736159
852140	contig_8020_pilon	-	538	4	Intergenic	novelGene_114374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	190.746486788675	137	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	185	487	105876	104794	FALSE	40	AAATACCTAAACAGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLEDRFQPNMTLEDAQGLLVEAITAGILGDLGSGGSVDACVITRTGAKLLRTLSSPTEPIKRRGRYHFAPGTTPVLTQTVRPLTLELLEETVQAMEVE	107305	104742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_104906_105029_105182_105837_105886_107130
852141	contig_4678_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_126075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGACATTGTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771547	772299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_771500_772300
852143	contig_8065_pilon	+	1086	4	Intergenic	novelGene_107324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_1	53.6055552676731	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	383	952	125393	139388	FALSE	35	TGGTGGTTTACCAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMVRYIILFRSG	125010	139522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184
852146	contig_18116_pilon	-	1440	2	Intergenic	novelGene_175451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	717	1154	184535	184098	FALSE	25	CACATGGCTTTGTCAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPPPSEHLSLLESHNPDQSCSLKTVASSLSQNCRPGSANPGPLRREDASALDTAGALLPWEHSPCWETAPSAWPDYSRGLLITQAWWFCTATITILPVAQEAQESNGKGAQLHCGGFWAVGPPKRLRHIGIDPPTSPSLSGLA	185677	183811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_-_184856_185281
852147	contig_11602_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_166606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364755	365999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_364800_366000
852148	contig_9470_pilon	+	819	2	Intergenic	novelGene_176413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	34	junction_1	0	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTAATGACCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419218	432380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9470_pilon_+_419359_431701
852149	contig_5461_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_156813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214299	215929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_214300_215900
852150	contig_4364_pilon	+	213	3	Intergenic	novelGene_432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGGACAGAAGGACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530449	1531111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
852151	scaffold_19766_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_34282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGGTTGATGGGTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400388	401299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_400400_401300
852152	scaffold_19766_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_34283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCTCTTTCTGAACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401499	401923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_401500_401900
852153	contig_13718_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_142885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCGGCTCCTTAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109184	108494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_108500_109200
852154	contig_6017_pilon	-	229	3	Intergenic	novelGene_152552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4630	junction_2	1029	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATGTGAATGGAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442477	440598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442225_442457
852156	SIRV2	-	295	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4578	34	3403	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1300
852157	contig_16483_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_177710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853	582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16483_pilon_-_600_900
852158	contig_16103_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_118772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCAATATGATAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491657	492453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_491700_492500
852159	contig_16578_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_148652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAGAAATTTTGAGATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187071	188085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_187100_188100
852161	contig_2342_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_132747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	11	328	71344	71661	NA	25	TTTCATTATTGTATATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRQLIFQDSIIFLYYFINITLIIKLEIKKIRCIIFNLPFFTIMRKMDIKEIFIKCGKLLNSSIVLVQTISSQKQKFFFKNFCDLIKYSGGLLSANDRIQNSGCI	71333	72069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_71300_72100
852164	contig_20842_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_160959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTGGAGGTTCAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7738	7067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_7100_7700
852165	contig_10477_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_112502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448798	449593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_448800_449600
852166	contig_7009_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_23593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTGGAACTGTCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387303	387754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_387300_387800
852168	contig_8712_pilon	+	1001	5	Intergenic	novelGene_58837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	375	815	384182	391787	FALSE	45	GTAAATGAATTAATGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANLTIHALGHAFNLLELGLRLENVEEIAHKLFGQKSFWGQEKESKDQPGNPPEPEVGHIPQSSSPECSGERSRKMRDLQQKVTERRGERRTLLCKLSVKVFGHELSFVNCGAMGSHVKWQSLNLAELAVKLLKVSQAGLGPVLPC	379772	391973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_379803_382370_382530_383996_384233_386135_386331_391592
852171	contig_14243_pilon	-	815	6	Intergenic	novelGene_57442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	82.1875903041329	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	35	646	707783	702878	FALSE	40	AAAACAGCATTGGGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPRKRLTGAAGPDKKGPSGKRTKTGNPDETSAKMENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMVDVQFVRMMKRFIPLAELKTHHKAHKATGGPLKDVALFTCQRLSVQPLTQEEFNFILSLEEKEAS	707817	702708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703269_703421_703632_703729_704317_704411_705856_706039_707740
852174	contig_19628_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_166572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGTGCTTCAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21690	21346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_-_21300_21700
852176	contig_9440_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_59048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACGAAACTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442270	441652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_441700_442300
852177	contig_11227_pilon	-	914	2	Intergenic	novelGene_163215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	113	538	480646	472612	FALSE	80	TAAAAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESSLAERGDRSEEQVSGAKVVAQALKTQVRVTHLGLIKGSYGSRRGLGVVLETRNAGSGLRQSFSFSDQEGGKEGYRGHRAFISLFSGPQGVEYVFGIVGVPVTEIAVAAQGLGIWYIGMRNEQAACYAASAIGYLTGR	480758	472235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_472657_480265
852178	contig_14666_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_39494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	65	319	307475	307221	NA	20	GCAATTTTGTCATGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQWCFYQILQHLENESKSQVMKEAFHTRWAGRRAAAAAATAAFPQKRHGKHKHTQNNRLAIVPWRFDAEKRKSTSKSASTCSISPSEQQTRIKAFAVFFFWFVF	307539	307143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_307100_307500
852180	contig_8317_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_20692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTAATGAGAAACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16495	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_16800
852182	contig_13172_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_146321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCATCTGTTTAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22818	23031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_22800_23000
852183	contig_13592_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_33684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGACAGAAGGTTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136059	136296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_136100_136300
852184	contig_13592_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_33685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136760	137407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_136800_137400
852185	contig_10196_pilon	-	881	5	Intergenic	novelGene_132258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	10.1980390271856	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	163	867	1966807	1965459	FALSE	10	CCTGAGTTTTGTTTAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDDPTEALTELRERRLGALELLQVAAGSGLAAYAVWALLLQPGFRRVPLRLQVPYVGASARQVENVLSLMRGRPGKMVDLGSGDGRIVLAAHRCGLRPAVGYELNPWLVGLARLHAWRAGYASNVRYLREDLWKVSLRDCYNVSVFLAPSVLPMLEAKLQAELPVGARVVSGRFPLPTWEPVAVVGEGLDRVWAYDVHCDGLAREVPFSPGTPIQAAVDPGAPASHTGCQTQ	1966969	1965444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1965705_1965840_1965892_1966041_1966183_1966264_1966370_1966645
852187	contig_15777_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_75764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCGAGTTAAATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280587	280144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_280100_280600
852190	contig_11056_pilon	-	829	4	Intergenic	novelGene_130390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	146.843075726739	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	196	816	655706	644748	FALSE	20	TGCCAGTGTCCTTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHSHDRYLPGDTFVLGNSLSRSLEPHSDPMDSALNPNNLVVSTSQNLRAPAYRPLLPSCGLPQSTASAVRRLCSRGSDRYLESRDGSRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQLGPHADLTSLSMGRRGSLSASPPFPHWGLCSSEPHVRECEPPPCHIYRQSSTQASCPDQNCYRRRLGPMILGPGSPNVNGREGSPGWSLAPPTLLSICFLCKQVCSKLPLLPSGLILCRFVYK	668003	644734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645099_647071_647203_655567_655766_667867
852191	contig_6544_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_142063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATTATACATGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10758	10506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_10500_10800
852194	contig_11493_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_143672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAGATAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152615	151636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_151600_152600
852195	contig_12620_pilon	+	485	4	Intergenic	novelGene_98797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	85.7787852560294	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	120	479	165660	169119	FALSE	45	AATACTGTATACTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLTGALRSFSNVTKQDNYNEEVADLKTKRSKLYEKNLDLGLTWKKIVKFLNENLDKNEVQTVNEDLKDILQAAKQIDAHVAYSEWQQWKLNFDCYTSRNRPNIFTDCSYLKEIII	156576	169125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_156661_165624_165750_168525_168677_169000
852196	contig_7057_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_123383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGAGCCCTGGTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186300	1185247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1185200_1186300
852197	contig_7612_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_170359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAATAAAGATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61065	59860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_59900_61100
852198	contig_3602_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_60578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645257	645621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_645300_645600
852199	contig_9363_pilon	+	1886	5	Intergenic	novelGene_6477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	379	882	332923	336918	TRUE	30	GTCAAAACCGCCAGTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLWLLSGLAVRGQELLTGGLLHSSRWHHLLRKHFRTCNNLLPAFLEFSLYIFYHSHSLFSAFRVMFSHPDLELFRQDGQELFQHQQLQDLLFGVQLWSQPLTAEHPQLAECLPGSRCLMVLEVLEALVKSLKCRWTVLLHPGAVFFFHFHYSKVFLLLRSLSWRV	327764	338275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_328035_328329_328422_332906_333046_336537_337882_338234
852200	contig_10795_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_171292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCCACAACATGTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175416	174454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_-_174500_175400
852201	contig_11448_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_66437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGAGCAGGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648090	649646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_648100_649600
852202	contig_6873_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_129812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAGGGTAAATTTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195446	196201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_195400_196200
852203	contig_253_pilon	-	905	4	Intergenic	novelGene_129778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_3	25.5081686262787	37	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3	509	1054725	1053545	FALSE	30	ATTTAACTTGGGTAACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWLRNQVIAPLTEELVFRACMLPMLAPCTGLGPAVFTCPLFFGVAHFHHIIEQLRFRQSSVGSIVLSAAFQFSYTAVFGAYTAFLFIRTGHLIGPVLCHSFCNYMGFPAVCAALEHPQRRPLLAGYALGVGLFLLLLQPLTDPKLYGSLPLCVLLERAGGSEAPLCS	1054727	1053148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_1053781_1054056_1054120_1054399_1054472_1054589
852204	contig_11396_pilon	-	1054	4	Intergenic	novelGene_71292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	69.7726466620138	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	7	570	348795	347940	FALSE	15	GGTTTTTCCATAATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVMFQCLWKSCGKVLSSASGMQRHIRVVHLGRQAETEQSDGEEDFYYTELDIGVDALTDGLSSLTPVSPTASVPPAFPRLELPEPSAVPGLLQPLTLPSPPMLSSVVPRPVCHIHSDHAYQGCLAPIHLEPQPTTVRACFTPALPSKLAANPRKPRGDAKKCRKVYGMDRRELWCTACRWKKACQRFLD	348801	347455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_348052_348138_348234_348322_348594_348709
852205	contig_13004_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_112742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCGTATTCGGTTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941623	941149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_941100_941600
852206	contig_10064_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_122734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGAATGTAGGGGGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418835	436704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_418908_436336
852207	contig_10011_pilon	-	1019	6	Intergenic	novelGene_68048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_4	311.868818576016	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	241	921	194838	188024	FALSE	30	GTATTGGAAAAGTGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVVPSSALSEVSLRLLCHDDIDTVKHLCGDWFPIEYPDSWYRDITSNKKFFSLAATYRGAIVGMIVAEIKSRTKIHKEDGDILASNFSVDTQVAYILSLGVVKEFRKHGIGSLLLESLKDHISTTAQDHCKAIYLHVLTTNNTAINFYENRDFKQHHYLPYYYSIRGVLKDGFTYVLYINGGHPPWTILYPLPRGRRAVAPPRRGGGALSDGAGRPVGALVSFR	212638	187925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_188368_189103_189201_190973_191104_194728_194845_203360_203463_212506
852208	contig_16578_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_148692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTCAAGGAGCTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346749	345712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_345700_346700
852210	contig_6302_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_171694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAATAAAAGGCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110782	110479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_110500_110800
852211	contig_12970_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_50531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGATATGAAAGGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247853	248806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_247900_248800
852214	contig_7494_pilon	+	1475	4	Intergenic	novelGene_167442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.6562449087639	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	315	821	49302	55075	FALSE	30	TGAATTCCTAAACTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLVFTTSKSQTSSDITHLYQTEVPTKNTRLIPQGLVLHGQEQPAPEEGTGKALVEKAPPSSLGQGQTSRQKRSVENTGPMEDHNWPQYFRDPCDLNPCQNDSICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAMQVHGSVLELMIGGTAGAIFLTFTILSIIFQRSRQ	48898	55729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7494_pilon_+_49071_49159_49351_50749_51051_54918
852215	contig_8063_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_152446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTGGAAATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818375	819052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_818400_819100
852218	contig_20842_pilon	-	972	5	Intergenic	novelGene_160978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	102.433820098637	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	346	774	235273	157622	FALSE	25	TTTTAGGCCACTAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPWKILMAAPLFFLLALHTSASPAYNDQPTTSHSGSRVCVGCVVVVSVIEQLAQVRNSTAQAAMERLCSYLPEKLFLKSTCYLVIHIFGSDIIKLLSADMNADVVCHTLEFCKQDAGRPLCHLYPPPKEKSSRVRKETET	235618	157423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_157661_173524_173625_187148_187216_207155_207252_235146
852219	contig_10148_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_172857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCCTCCAGGAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237131	237703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_237100_237700
852220	contig_3956_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_14729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	816	1139	367328	367651	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRSRGRNNVILGGQGRRLSGSDISAETLMVTKRPSMGTAKGRVVREGRTEGAQALRWEPTSKSNVNTAEAYRGDEATGRQMPAQVAGWALEKSSESKGKTLVDYK	366512	367892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_366500_367900
852222	contig_16204_pilon	-	868	6	Intergenic	novelGene_154487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	194.386213502913	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	140	868	205576	198563	FALSE	10	GGGGGGCTGGCTACACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFIQQNISFLLGYSIIVGCVGLAFFIFLFSTPVFIIKPPTGSQVSSMLKLALRNCCPQLCCRYSARDPQGAQLLPDQRSPQPGASPQEDVTNFQVLVKILPIMVTLVPYWMVYFQMQSTYVLQGLHLQIPNIFPVNPANSFTALRTQPNSYTIPEAWLLLANVVVVLILVPLKDRVLDPFLLRHKLLPSALKKMALGMFFGFTSVIVAGVLEMERLDYIHHNETVSQQIGQDLYYAAPLSIWWQIPQYLLIGISEIFASIPGRHHRHLLLPVRGGLAAGLQPAVPTVPA	205715	198562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_198646_200099_200259_202329_202499_203202_203314_204771_204920_205517
852224	contig_13051_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_140105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACGTAAGTTGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123089	122502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_122500_123100
852225	contig_57_pilon	+	854	3	Intergenic	novelGene_44918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.5	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	406	852	294280	299006	FALSE	55	AATTTCTAAGAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHKPERKSPEENLQGAVNSFCTSASGAPLGPKGDGHYPWSCPVTHTREKIYAICSDYAFLNQATSIYKTPNPTCSSCLPDSTSLAAGNNSSRYIGIPSSVSEIIYNEENSLENLSSSLGKLPLAWEIDKSEFDGMTTNLKHKSGNVKK	286845	299008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_287090_294118_294713_298992
852227	contig_500_pilon	+	646	6	Intergenic	novelGene_31099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	259.270515099577	48	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	205	645	1512837	1524598	FALSE	5	GGTCCTGTGTTCATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVKRSRKAPPDGWELIEPTLDELDQKMREAETEPHEGKRKVESLWPIFRIHHQKTRYIFDLFYKRKAISRELYEYCIKEGYADKNLIAKWKKQGYENLLPLRYPVLGAALLCPALPQTRTGVWAPWGRLRCSSAVICKNKTSQPL	1510909	1524599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1510945_1512133_1512275_1512808_1512931_1522521_1522645_1522858_1522941_1524456
852228	contig_10864_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_107058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765241	765939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_765200_765900
852229	contig_8676_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_142188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAACCAGATCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6770	4935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_4900_6800
852231	contig_10589_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_129368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAGTATATACTAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9967	10955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_10000_11000
852232	contig_2161_pilon	+	1438	7	Intergenic	novelGene_114925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	25.6672077865037	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	750	1115	839930	859116	FALSE	50	CCAAAATATCAAAGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHFVIAGAVTGSLFRINLGLRGLVAGGIIGALLGTPVGSLLMILQKYCGESVQERKQKDRQALHAMKLDEWKARLQMTELLPEEIESSLQKNRSEDDAKKIEALLNLPRNPSSTDKQDKD	832685	859439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_833137_834735_834902_839290_839380_839886_839955_847906_847986_850901_851013_858965
852233	contig_6241_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_156438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAGTTCTATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341212	340499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_340500_341200
852234	contig_1008_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_121556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540019	541075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_540000_541100
852237	contig_10930_pilon	+	452	6	Intergenic	novelGene_37106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10006.840700241	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	68	439	339608	342091	FALSE	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCQGCHRRIFQMQEMSK	339425	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339456_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341611_342041
852239	contig_7644_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_64271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGTTTGGATTGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260141	259807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_259800_260100
852240	contig_8241_pilon	-	789	6	Intergenic	novelGene_157507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	19.4483932498291	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	74	637	767350	752823	FALSE	5	CCCCCTTGTGGTATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFASVFSSRWSRKSASRAEDTDSTMADGEGYRNPTEVQMSQVVLPCHTNQRGELSIGQLLKWIDTTACLSAERHAGCPCVTASMDDIYFEHTISVGQVVNIKAKVNRAFNSSMEVGIQVVSEDLCSEKQWSVCKALATFVAHRELSKVKLKQTTPRTEEEKTEHSVAAERRRMRLVYADTIKDLLANFPIQDDVKEQIKQAETGEKRCQAT	767423	752670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_752882_756041_756178_756651_756751_757958_758020_764979_765050_767211
852242	contig_5947_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_101537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATCTCCTGTTGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548234	546827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_546800_548200
852243	contig_1008_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_121636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATAACAATGGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1370330	1369941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1369900_1370300
852244	contig_12728_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_155814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGATATTATGCAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200306	201407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_+_200300_201400
852245	contig_5350_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_99359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTACAGATGGTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195500	195947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_195500_195900
852247	contig_15628_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_147703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAGAAAAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150506	149971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_150000_150500
852248	contig_20078_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_177711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGAACAAAATTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42686	42356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20078_pilon_-_42400_42700
852249	contig_15047_pilon	-	661	4	Intergenic	novelGene_52278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTCAAGTGAAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41492	29316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_29405_31865_32176_33128_33213_41313
852252	contig_9797_pilon	+	746	4	Intergenic	novelGene_65574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	29.7694847490215	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3	443	82441	86900	FALSE	5	TTTTGCTGCTGAGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQPPPPTPSARQVPEPGERSRTMPRTVPGSTMKLGSLERKKLRYSDLDFEKVMHTRKRHSELYHELNQKFHTFDRYHSQSTAKEKPSPGERPGLSQQRRHQSWSTFKSMTLGSLPSKPRERLALHRAAAWEPTEPPDGDFQTEV	82438	87203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_82561_85455_85492_85837_85937_86714
852253	contig_10549_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_110651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAAACAGCGCCGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553652	552853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_552900_553700
852254	contig_14744_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_65952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCTCCACAGGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327077	326607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_326600_327100
852255	contig_11702_pilon	-	823	6	Intergenic	novelGene_141945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	25.6982489675853	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	19	729	83649	72629	FALSE	0	GTTGCCTCCGCCTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQLRFMDQMLDAIWSLSIGYSSCSSVEQHFKDTREKNEALLGDLFSSPHLQALLNPECDPWPLDMQPLLGQQRTKLSSESEERKVTELARQLQESAAKLQELRTQCLPQQKEAAAVAGADPSTLDQKLRLVISDFHQLIVAFLQVYDDELGECCHRPGPDLHPCGPIVQAVYQTLTSCSQLLKAVVEATNTSVSTANMVAKHQGEQSCWGSDNSMMSLATKMQELTLKYKLFNETLRKGPD	83667	72534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_72700_80794_80910_81848_82074_82777_82875_82968_83113_83590
852256	contig_9415_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_109761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATAGGGAGAGTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509390	1508724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1508700_1509400
852257	contig_5797_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_56952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGGTGGAAAAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368641	369593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_368600_369600
852258	contig_18214_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_166026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCTATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250068	249352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_-_249400_250100
852261	contig_3081_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_133950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTGTAAATTTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449181	450296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_449200_450300
852264	contig_12884_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_104980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	442	1326	160	1485	783417	784742	NA	35	GTCTACGTTAAAACAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTQHIKPCGTQLKHCLEENVNVYVKTERCLEENVNVYVKTERCLEENVNVCVKTERCLEENVNVYVKTERCPEEKVNVCVKTERCLEENVNVYAKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYAKTERCPEENVNVYVKTERCPEENVNVYAKTERCPEENVNVYAKTERCLEENVNVYAKTERCPEEKVNVCVKTERCLEENVNVYVKTERCLEENVNVYVKTERCLEENVNVCVKTERCLEENVNVYVKTERCPEEKVNVCVKTERCLEENVNVYAKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYVKTERCPEEKVNVYAKTERCPEENVNVYVKTERCPEENVNVYAKTERCPEENVNVYAKTERCPEENVNVYVKTERCPEENVNVYVKTERCPEENVN	783257	784742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_783300_784700
852265	contig_5906_pilon	-	574	6	Intergenic	novelGene_174809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_5	29.1794448199413	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	317	511	224340	213789	FALSE	30	GTTGTCTATCTTAATAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALRACGLPSGSCRDKKNCKVVFSQQELRKRLTPLQYHVTQEKGTESAFEGEYIHHKDPGIYKCIVCGTPLFKSETKFDSGSGWPSFHDVISSDAITFTDDFSYGMHRVETSCSQCGAHLGHIFDDGPRPTGKRYCINSASLSFTPAESSGAEGGSGVSSPAQVDKTEL	354209	213725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_213954_224310_224409_290264_290294_326870_326949_328549_328659_354177
852266	contig_6595_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_122555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGACAGCTTCCCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703810	705423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_703800_705400
852267	contig_9580_pilon	+	471	3	Intergenic	novelGene_167737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.5	1219	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTGGCAATTGATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831735	854430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_831836_849260_849420_854218
852269	contig_7285_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_143395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGCAGAGTGAGGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239678	240455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_239700_240500
852272	contig_3818_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_99283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTCTCAGCGTGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700015	700791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_7e+05_700800
852275	contig_5083_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_151623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGCTCTACTTCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58722	57748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_57700_58700
852276	contig_9858_pilon	-	482	2	Intergenic	novelGene_140539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATGTATGTAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273319	270079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_270411_273168
852277	contig_16611_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_177712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_5	9.70360757656656	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	125	1186	48322	66340	FALSE	40	AAGATTTTAAAATGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPNEETIFHALMQWVRHDVQARQRDLAMLLSYIRLPLLSPQLLADLENSSMFAGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRPMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKVWSVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVAALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMECFDPHTNKWSLCTPMSKRRGGVGIATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKADSWSTVAPLGVPRDAVAVCSLGDKLYAVGGYDGHTYLNTVESYDAQKNEWKEVLS	48197	66375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16611_pilon_+_48412_51153_51341_56568_56794_58381_58545_63923_64137_66156
852278	contig_3153_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_104664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTATTTGTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191692	193150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_191700_193200
852281	contig_13800_pilon	+	639	4	Intergenic	novelGene_153698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.9103822808329	91	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCAAACAAAAAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94184	95987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_94393_94603_95566_95668_95759
852282	contig_10196_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_132204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTACAGTGTCTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253219	1254096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1253200_1254100
852284	contig_12503_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_143841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192475	191587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_191600_192500
852285	contig_9548_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_141068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161253	162117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_161300_162100
852286	contig_11056_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_130358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	60	431	113532	113980	FALSE	25	ACGGCAGTTGAACTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYTAKGELELAELKTRRHPMLPVEAQKRKDYFQVNLYKYIFDAMVQGKVTPASLIHHTKLCPEKPLGPSVLRHAQQGGFCVKSLGDLMELVFLALTLSDLPVIDILKIEYIHQDTATVLGTEIVAFEEKEMKGKHMQLCRHL	113472	114394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_113877_113953
852288	contig_10196_pilon	-	781	5	Intergenic	novelGene_132271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_2	1.29903810567666	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3	593	2017999	2016937	FALSE	10	TGGCCACGAGCCTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAISAIQTRSKEYGDFGVPGADLWLAASGDQRVSVWAADWLEDRCELVDWLSFPAPAPAEASGCLPPSLAAFCPWDGDLLVCAGLGPREELLLYSLRQKQVVETVPLPFFAVSLSLSPGAHLVAVGFAERLLRLVDCESGTAQDFAGHGDSVHLCRFSPSTRLLLTAAHNEILVWEVPAAEAQEPQCRVSWGESPR	2018001	2016748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2017143_2017369_2017455_2017525_2017646_2017729_2017874_2017963
852289	contig_9527_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_134051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGTTGAGGAGGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420968	420637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_420600_421000
852290	contig_6387_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_165429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTTCGAACCACTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74747	74983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_74700_75000
852292	contig_15067_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_154342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	69	467	149461	149859	NA	10	CTAGTATTGGGGTGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFTIPNRSDWNRLTAGMSTILPSSPYSCSLHCDFAAPPGSGAEVYFPTLEPGLACHLFWSTVCGGIADGPVTILGFKRPHVPLPFLLEPCHSHLEKLRLRWWRMRNYVEGSSVIPAVATQTSLQSAHSSH	149392	149993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_149400_150000
852294	contig_11551_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_168468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406357	405562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_405600_406400
852295	contig_16156_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_137075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTCTGTCTCCAGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131388	132217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_+_131400_132200
852296	contig_1406_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_25473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAAAGCCAGAGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837942	838843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_837900_838800
852298	contig_12427_pilon	+	751	2	Intergenic	novelGene_40565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGCTACCCTGCTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505667	508094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_506126_507801
852299	contig_12391_pilon	+	693	2	Intergenic	novelGene_103599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56798	57668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56887_57063
852301	contig_8059_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_111111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATAGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251893	253678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_251900_253700
852302	contig_5423_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_85212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGAATGTGGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334861	333832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_333800_334900
852303	contig_3426_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_57929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	442	762	238279	237959	NA	20	GCAGCCTAGCTTGTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSCIIPLAVQSLPQRGSLVSGFNSVLVAPTLSPPPPFQWVEPCCSVNMWKILPFPWFCEAWREFFKRNSDQGAKERAAEFCSANFPSFSCCPRLIVFPEGKQRSS	238720	237676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_237700_238700
852306	SIRV6	+	131	2	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	591	2936	2	-2909	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGACTAAATCCATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3107	7879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_7805
852308	contig_846_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_136092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCTGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66678	66396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_66400_66700
852310	contig_3818_pilon	-	741	7	Intergenic	novelGene_99325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	1.7950549357115	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	7	741	1310848	1303481	FALSE	65	ATGAAAAGGAAAGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYMQWVEENFPKNKEYLTTLLEHLMKEFLDKKRYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFYEFLYNHGIGTLSSPLYVAWAGHLEGQGELQHASAVLRRGIQNQAEPRELLQQQYRLFQKRVTETHLPAQARTSEPLHNAQVLNQTITSNSNPENNTGCVSKNQGSQLSGVTSSTCDKESNMEQRVIMISKSEYSAHSSSAAKTDVKQVVMYCKEKLIRGESEFSFEELRAQKYNQRRKHEQWVNEDRHY	1310854	1303480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1303501_1305157_1305343_1305435_1305489_1307235_1307337_1307972_1308017_1309808_1310006_1310713
852314	contig_7894_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_170784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATAGTGATTTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213762	212890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_212900_213800
852315	contig_7342_pilon	-	909	3	Intergenic	novelGene_71136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	43	636	189548	186035	FALSE	20	CACAGTTTCTGTGGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASSSSSSLCLAQWMLRCLRTVMAEEGSGCPVPRLAWASLLRGAFLLFLIGVVSTMVICCMLCIRKPQESREWDIAELQLNHTGLQQDPRLHWQAGPALGRSFLHGPMLDNGQLCVQRDGIYKLHIQVTLANCSSTRTTTPREATLAVGICAPATRRVSLLRLNFYLGCTVASQRLTPLAQGDTLCTNLTVPLQASRNADDTFFGVQWVHP	189590	185761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_186421_188478_188513_189374
852316	contig_2069_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_23322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529438	527902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_527900_529400
852317	contig_11281_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_125453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTGGCTGTGCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824340	823343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_823300_824300
852319	contig_3081_pilon	+	404	4	Intergenic	novelGene_133916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	83.4386001800126	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158775	168063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158811_163708_163785_165087_165137_167819
852320	contig_6823_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_131246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTTGAAAAACACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441283	441679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_441300_441700
852322	scaffold_19766_pilon	+	707	3	Intergenic	novelGene_34298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	15	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTGAAGAAACTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519695	530088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_519769_520209_520239_529483
852323	contig_1090_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_131148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAATTCTCTAAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517438	518068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_517400_518100
852324	contig_16907_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_87435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTCTGAGTGGGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392095	391757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_391800_392100
852325	contig_16907_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_87434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAATAATGCGGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391682	391021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_391000_391700
852326	contig_10557_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_171918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATATTAAAATTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12002	10582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_10600_12000
852327	contig_1939_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_144867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGCTTAATCGGGTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289902	289615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_289600_289900
852330	contig_3426_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_57937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACGGGTTTCCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332589	331627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_331600_332600
852333	contig_11744_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_176851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAATTCTAACTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100826	100479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_-_100500_100800
852334	contig_17108_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_109549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGGGGTGTTACTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411038	412467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_411000_412500
852335	contig_5352_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_177076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCAAATGTGGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528546	527392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_527400_528500
852337	contig_1406_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_25509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	96	317	1461776	1461997	NA	40	CACAAGAGCTGAGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSWAWCHVCKKKKHFGWKRSAASASPRRCCSMPLTSWRTRMGEWGERGKTERRPQSCQGCYPPHCSLVAEVAVFHEGEMSEAVWSSLGTCGNMNSSLEGETRII	1461680	1462073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1461700_1462100
852344	contig_1516_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_49908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAAAGGAAAAAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14421	14003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_14000_14400
852346	contig_3394_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_152674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAGTAAAGAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406964	408266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_407000_408300
852347	contig_1984_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_173204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCCTGTATTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271367	270725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_-_270700_271400
852348	contig_6497_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_35633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTATGAAGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738383	736673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_736700_738400
852349	contig_6902_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_135599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAGGTGTTTAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484717	485907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_484700_485900
852351	contig_7070_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_104030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCAGAATTTCGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45671	44948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_44900_45700
852352	contig_7657_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_30050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAAAGGCATCTGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331190	331659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_331200_331700
852354	contig_7919_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_28077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGCTGACCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071178	1070752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1070800_1071200
852355	contig_10196_pilon	+	1111	8	Intergenic	novelGene_132353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_1	66.4158205888461	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	49	1104	2487371	2493701	FALSE	10	GTATTTCCTATTTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLARTAVLHTSSSGGTMGWGRCFQGGWTSEGEALIQEVGAWLLVCTCVCWGAFLPVGGGVTVPGPGLGTVSCLNNNILRIDCYLSAPALDPGTDPWLLLTSACSVELPPEEVLVPSDSFTITLHRFIAGQEQVSLVDPQYLPRRHVKLDPPSALQSNVSSDYCILTWSISPALEPMAGFLAYELAFKRQEEAWEQARHKDRIIGVTRLTLEAMELDPGSTYEARLRVKMAQEDDVTKEEHYEGPWSEWSPSVRFPAPRRPDPLTPPWGRPDSTLVAVSVFLLLTGLTYLLFKLSPRVKRAFHQHVPSPAAFFQPLYEVHHGNFQVRAQLALRSRSPGCGLWSSVGALSFFCISGGLKCTQCLRCAKN	2487322	2493708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2487399_2490023_2490126_2490355_2490480_2490611_2490746_2490883_2491030_2491481_2491681_2492071_2492178_2493484
852356	contig_5033_pilon	+	682	2	Intergenic	novelGene_29079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTGAGTTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646902	649317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_647021_648753
852357	contig_9415_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_109923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2192944	2193588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2192900_2193600
852358	contig_11281_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_125503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGTACAGAGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941959	942489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_942000_942500
852359	contig_20614_pilon	-	1876	4	Intergenic	novelGene_107619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1334	1633	618660	618361	TRUE	25	TTCTGGGGGTAGAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVTSLRSWRWVLKDTGWEERGLRLGAGEGGDPHLRLIHRFDGLVPTAETCSREPVVLLQPFLLHEGAGPGVESSVRETWRLRKCVSTVTLTVPSDPK	622225	613506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_613555_616416_616519_618267_618711_620942
852360	contig_500_pilon	-	782	2	Intergenic	novelGene_30914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	345	650	985867	984521	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNTTGLNELYLQHLFIFSCKEGDGAKHQLKQLEVQVGELHIGAHFWQAVKEIFYQNCSKQSRGSRICQKGIGNNLKGIIFGDSFHHVRDCGLKDFFKC	986211	984388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_984594_985634
852361	contig_7078_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_130136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGTACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164408	163390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_163400_164400
852362	contig_9375_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_136085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTATTCATATTCCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678543	677700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_677700_678500
852363	contig_15752_pilon	+	1524	7	Intergenic	novelGene_148776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCTGGAAGTAGAGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331796	404396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_332535_333156_333268_334072_334167_343264_343451_360194_360359_367191_367369_404342
852364	contig_15629_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_122467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCACACTGATGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142315	142960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_142300_143000
852365	contig_3233_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_56523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGGCAGTAAATCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255287	255557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_255300_255600
852366	contig_7412_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_76339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGCCCCATCATCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372092	371749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_371700_372100
852367	contig_7272_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_25416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887262	886515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_886500_887300
852371	contig_9575_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_169732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGAATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748660	747680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_747700_748700
852372	contig_11815_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_50878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15321	14222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_14200_15300
852374	contig_4891_pilon	+	294	2	Intergenic	novelGene_124527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGCCACAGAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92946	103769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_93012_103540
852375	contig_160_pilon	-	942	5	Intergenic	novelGene_156321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_3	47.4552420708187	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	192	941	105783	73725	FALSE	50	AAAACACAAATGATGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSKQIRILFLNEMEKLEKTLFRLEQGFELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLKWENPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHILPLDCVTLQTFLAKCMGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGVSRSCYSLADQLELNPDFSRPDRKYSWNDVGQLVEKLKKEWNILCITDVVYNHTGTSFINRLLFLRMLYSYHFIPCCLYNINF	106505	73723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_74015_74909_75077_75663_75875_105701_105852_106382
852377	contig_253_pilon	+	601	7	Intergenic	novelGene_129740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	254	601	667155	668292	FALSE	5	CAGTCTCTGTGTGGCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTGPHGSQQSFWLVQGEPQSLRVDHLPVMVHLHHQGSRLLALEDEAPPAALPGHVLKAEEAGVHPQALTALPHAVHVARAHLGHEGYPAGELPLHLHVEIGGLAEFVEQFGNAG	657685	668292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_657721_657965_658054_658460_658522_667085_667277_667452_667597_667670_667716_668255
852378	contig_2414_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_158517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807555	804283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_804534_807369
852379	contig_10042_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_79231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	210	332	1187799	1187921	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGCCSAAGSVSVGGAQLTSLFPLPASVVAREAPSALLHGVHRGARVSGGGGEPVGSGSWSGGSGPRCRMATAGRMNIQLLLEAADFLERRERGARGRGEVQPSRGRGP	1187589	1188400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187600_1188400
852380	contig_13702_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_102601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGAAGCACTGCCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82850	81687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_81700_82800
852381	contig_16587_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_177714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGCTACGAAATATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16587_pilon_+_0_700
852382	contig_10795_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_171287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	235	540	79484	79789	NA	25	GTAGTGGAACACTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFYDPENRVLWGMWFSILSSVNLGLSREPIPHALGKQHPSLLPLMLRPWLLSASPVLHPLSSLLMSCWCACAVVSLGFVLRGLGGKGFRLQRCSYSLRK	79249	80101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_79200_80100
852384	contig_7919_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_28054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAGAATGTCAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979000	978713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_978700_979000
852385	contig_6975_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_74313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGCATCATGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599677	598962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_599318_599521
852389	contig_5145_pilon	+	697	2	Intergenic	novelGene_131389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGACTCGAGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630282	632080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_630576_631676
852390	contig_6414_pilon	-	987	8	Intergenic	novelGene_157010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	353.39490542971	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	192	569	59393	47241	TRUE	25	AAAGCTCTGTGTTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNRPFISQKIHFPDFSTRDIHRNYVDCVRWLGDLILSKQHVEEDWHGGACEGASQGEGTAGKQTQKAHIICVEIRLVKMPLCAGNLAKWKMI	67629	44742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_45072_46095_46170_47225_47296_53600_53711_57068_57175_59286_59421_63319_63412_67557
852391	contig_2219_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_67166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCGGGAAAGGCAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87379	86268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_86300_87400
852393	contig_6576_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_42297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAAATTTATTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449578	448564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_448600_449600
852396	contig_11338_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_6207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	124	453	10916	10587	NA	30	CGAGGCTCATCCAGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTVTGPRKLQRKPLVGSNQQLHERRGVPSAPPEPQAGALQRGACHVCTALPHAPGLPHSLEDTAVALAVDSSRDADDDAGRAIADEAEPARAQALAREDAHHEEVELQA	11039	10584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_10600_11000
852398	contig_1301_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_47372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGAGATAATATCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604756	603495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_603500_604800
852399	contig_6020_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_155570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGAATACAATAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300601	300841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_+_300600_300800
852401	contig_5918_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_99595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAACTTTTATGTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2055410	2055984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2055400_2056000
852403	contig_7720_pilon	+	1225	9	Intergenic	novelGene_155757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	24.1751421919293	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	464	943	567290	635419	FALSE	35	GTGAGAATCCAGCACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKWRNGDIVQPVLNPEPNTVSYSQSSLIHLVGPSDCTLHGFVHGGVTMKLMDEVAGIVAARHCKTNIVTASVDAINFHDKIRKGCVITICGRMTFTSNKSMEIEVLVDADPVVDNSQQQRYRAASAFFTFVSLSQEGKPLPRMRRSALRKAKGDTCR	497536	635701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_497569_546498_546617_557212_557370_561411_561505_567226_567342_574306_574394_599033_599151_612956_613130_635368
852404	contig_5526_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_111708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAGAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378884	379979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_378900_380000
852407	scaffold_880_pilon	+	366	2	Intergenic	novelGene_121423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAACAACAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376296	558900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_376386_558623
852409	contig_6602_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_166444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	2	466	385850	386314	NA	15	AGCCTTTGTGGGGCTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRRKDKHSQQRLGEVQKGSGLLSECPGVSGSPPPSLGRRSSFLCCRTPRAQNHDGEWEKSGSASSASQGRRPRVLAFISCGICRKGTRRWSWAHLTNPQRLAPRRRLPHEPGDPGAARVEIVQRTRIGGYFRPAPTNYSGPAPQSGRRKSLKS	385848	386677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_385800_386700
852410	contig_15282_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_177718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGTGCCATCAGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21760	20622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15282_pilon_-_20600_21800
852412	contig_5023_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_7360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTAAAGATTAGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617881	617399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_617400_617900
852415	contig_7909_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_155911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTAATTTGCGGTGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486180	485911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_485900_486200
852416	contig_3797_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_120104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACCCCCAGCAAGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405425	405832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_405400_405800
852418	contig_10196_pilon	-	1913	3	Intergenic	novelGene_132189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	15	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	87	890	1106407	1104983	FALSE	35	TGATATGCTCATGACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNDGMQPLGDYGGRNGKRAREKRHSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDVCQEPRLDRTGNSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEGEGPYCQLCIATLSMGGLTPAMEGLPSQLPRTHSHPLLFTMPGARLSQDRLTPSTIHHAMCTAVPGHTPFTIYHPTCTAVPGHTHTFYNSPCHVLSCPRTHTLYKSPRHVHGCPRTHSHPLQFTMPRAWLSQDTHPLQFTTPRARLSQNTLMPS	1106493	1103959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1105572_1105864_1105968_1106295
852419	contig_9463_pilon	-	822	5	Intergenic	novelGene_83816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	240.490514365952	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	70	624	44553	39863	FALSE	10	CAGAGCTCTTGGGCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRLLLPLVALLSLRLGSDAQGTELPSPLSVWFEAEFFHHMLHWTPILNQSQSTYYEVEFLCYGEESWKAIPTCNQTLAQSCDITAVTLGLYHNNGYRAKVRAVDGSRRSNWTISDTRFTRDEVTLKVDSVKLEIHNGCIFGTIQPLRPKIAPAGDMYEHIFKNFREYEIDIRKVPGEYTMRK	44622	39664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_39875_40123_40294_41370_41556_42167_42289_44486
852420	contig_11815_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_50941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326118	325011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_325000_326100
852421	contig_16883_pilon	-	1047	10	Intergenic	novelGene_161735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	153.135379466812	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	124	1047	329756	280697	FALSE	60	AGAGAAAGAGAGACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLPLAAGSAGAAPLPQTGAGEASAAEISLSFVILSVCSLMLLIVLIANCVSCCKEPEIDFKEFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSLQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGSGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASASPKEQDTFLKNGEPYYVLQHPNILQCIGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRNEHEHMRGDSQTMLLQRMACEIAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDKLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSHLSNIDVLNQVI	372498	280696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_280788_285269_285392_286714_286800_296959_297094_314952_315041_318206_318326_323282_323357_326859_327005_329690_329816_372434
852423	contig_9333_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_120346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATTCACTCAACAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576150	574947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_574900_576200
852425	contig_13786_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_174577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	223	588	137002	137367	NA	15	TTTTTTGAAACTTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METHSSSLKRQHCTVLQHLRLGKDYWAFLGTRLLQSLDRQKPNLVNSGVGNRNLYSFLIKGSLAFLVLGLEALLGRDMSIVGILVMLPSQKHSSDLSGYEANAFMVRTVFAHHFLASFSDK	136779	137854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_136800_137900
852426	contig_12969_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_61695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAACTGAGCAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580152	581381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_580200_581400
852427	contig_15182_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_136462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAACAGAAGCCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563225	564292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_563200_564300
852428	contig_10437_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_38475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	64.1681818002938	170	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	30	362	1169851	1173883	FALSE	0	TTCGTGGTGTTTTCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLYGYQRGPLPPPRPTPRPPVPPRGPLRGPLPQ	1169821	1174067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169885_1170349_1170479_1170741_1170815_1173786
852429	contig_11855_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_66910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTATTAACAAAAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788618	789595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_788600_789600
852432	contig_14405_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_85633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCATCCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404998	405880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_405000_405900
852433	contig_2892_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_119006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184084	184691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_184100_184700
852434	contig_19744_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_120420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287418	286533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_286500_287400
852435	contig_4152_pilon	-	546	4	Intergenic	novelGene_177306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	2.16024689946929	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	219	407	280011	275965	TRUE	35	TGCCAACAGTCAACTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSEEKKKRKQRRNRTTFNSSQLQALERVFERTHYPDAFVREDLARRVNLTEARVQVWFQNRRAKFRRNERAMLANKNASLLKSYSGEVTAVEQPIVPRPAPRPTDYLSWGTASPYRSSSLPRCCLHEGLHNGF	286528	269946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4152_pilon_-_270069_275947_276020_279877_280060_286358
852436	contig_5229_pilon	-	1026	5	Intergenic	novelGene_117725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48.5180378828328	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	12	578	896733	890462	FALSE	45	AAGAATAAAGACTCCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEMERYSAAFEEAADGARQQERHYQLLSALQSLVKELPSSFQQRLSYTTLSDLALALLDGTVFEIVQGLLEIQHLTEKSLYNQRLRLQNDHRVLRQALRQKHEEAQQACRPHNLPVLQAAQQRELEGAEYLRAALRCPRRGRQWNIGSVRSSEQWMRRSSWSWTGRWQTSRARWRRRVSPASTSPPTHRS	896744	890013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_890469_890923_891112_891999_892101_896378_896540_896623
852437	contig_9443_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_167131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTTATTATGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151896	152541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_151900_152500
852438	contig_4802_pilon	+	847	4	Intergenic	novelGene_172217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	65.3010124134552	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	196	645	201746	231450	FALSE	30	ATAAATGATGACCTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKQATSPFACAADGEEAMTRDLTSREKEEGSDQHVASHLPLHPVMHNKPHSEELPTLVTTIQQDADWDSVLSSQQRMESESNKLCSLYSFRNTSTSPHKPDEGSRDREIMTSVTFGTPERRKGSLADVVDTLKQKKLEEMTRTEQEG	157865	231652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_+_158057_201741_201983_226326_226535_231445
852441	contig_18637_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_81852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTAAACTCTGAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169117	170299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_169100_170300
852442	contig_1093_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_139977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115422	116325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_115400_116300
852445	contig_14047_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_176578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGCCTCCCAGCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18919	19454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_18900_19500
852446	contig_14158_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_136132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTCCTGGTGGTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36636	36976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_36600_37000
852447	contig_9609_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_23087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAATAAAATGTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455883	456247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_455900_456200
852448	contig_7342_pilon	-	339	4	Intergenic	novelGene_71200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	5129.07817145429	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTAATAAAGCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667023	665375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665615_665709_666725_666821_666997
852450	contig_2161_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_114899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639931	641093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_639900_641100
852452	contig_7106_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_148311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGATTACAGCCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429532	428302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_428300_429500
852454	contig_4797_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_6951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATCGGGATAATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672022	673185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_672000_673200
852455	contig_15042_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_115432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATAAATAAACACAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18821	19639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_+_18800_19600
852456	contig_12050_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_62659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACAGGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416348	415311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_415300_416300
852457	contig_2550_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_135620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCCTGCACATGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301781	303276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_301800_303300
852458	contig_11615_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_151256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTCGTAGCTCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44709	43761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_43800_44700
852464	contig_5959_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_150196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAGTCCCCAACTTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214964	215413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_215000_215400
852468	contig_10455_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_177434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75579	74382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10455_pilon_-_74400_75600
852469	contig_165_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_117086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	204	112	315	505763	505966	NA	10	CCCACAGTCTGTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQNHRNKSSRPPVCKRTFVTFDKHYSLDQPWTTTEQMPKPIIHLFEQNPRCAGEAGLAGCVSVSAMLSFLSGGEGEGGGVESSQRLWQSLEGSGPATPQPRRS	505651	506029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_505700_506000
852470	contig_16804_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_167295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56002	57083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_56000_57100
852471	contig_20819_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_55621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTCACATGGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28855	29452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_28900_29500
852472	contig_13828_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_158287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTACATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172375	173289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_172400_173300
852473	contig_4891_pilon	-	583	3	Intergenic	novelGene_124585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	55	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	23	460	964296	928522	FALSE	20	TTTTCTGACCATTGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVAAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTVNIVFYMETNPENFQFIQSAPNTQLQHLSFMTIWNGSHSSRHSSCLHRLCTSYMHLHLHRKCERNNGSSVPVERKKRSLRDCHPVIPCTAHTLNLTGDTLLKVFLNVLFFPFCKKRH	964318	928398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_928875_964127_964176_964259
852474	contig_14220_pilon	-	1177	1	Intergenic	novelGene_159843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTGACATACTCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236409	235232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_235200_236400
852475	contig_5428_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_160421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTATGTATCCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197821	198851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_197800_198900
852476	contig_13823_pilon	+	296	3	Intergenic	novelGene_145237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCCAAATGGTAAGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55239	58217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_55289_56053_56185_58101
852478	contig_13823_pilon	+	659	5	Intergenic	novelGene_145235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_2	8.60232526704263	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	74	658	51463	55231	FALSE	50	TTAGGAAAAAATCCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSQDRVTWRSADELPWLLLQQGSKQKLHDCLLNLFVSQNLYKRGHFAELLSYWQFVGKDKSAMATEYFDSLKQYEKNCEGEENMNCLADLYETLGRFLKDLGLLSQAVVPLQRSLEIRETALDPDHPRVAQSLHQLASVYVQWKKFGNAEQLYKQALEISENAYGADHPHIARELEALATLYQKQNKYEQAEH	51389	55232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_51474_52079_52203_53590_53781_53945_54188_55212
852479	contig_10135_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_106666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGAGAAAAAAATATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120631	121464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_120600_121500
852480	contig_16103_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_118961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030016	1030367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1030000_1030400
852481	contig_7057_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_123210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTGGAGAGGACGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531205	530690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_530700_531200
852484	contig_15301_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_176929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAATTTGTGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107029	106382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15301_pilon_-_106400_107000
852485	contig_6871_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_21653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757366	756092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_756100_757400
852488	contig_2646_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_69699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAGATAAAGAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2440744	2439970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2440000_2440700
852489	contig_938_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_143926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGATTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367196	367690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_367200_367700
852490	contig_9389_pilon	+	656	6	Intergenic	novelGene_83908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	878.324404761703	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	39	656	159587	168340	FALSE	30	TGAAATACTCACTGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKAKTKGLQSGVDIGVKYSERQERNFDDATMKAGQCVIGLQMTPVSLPCPLPRTAQGPPLKILLGTSPHQEPRDHEIM	159548	168340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164540_165815_165933_168229
852491	contig_6217_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_109573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCCTGCATGCTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89048	90050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_89000_90000
852493	contig_9434_pilon	+	1276	1	Intergenic	novelGene_150512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	60	305	388395	388640	NA	15	CTGAACCCTGACTTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLFQPVTPNQVLECLKACLMQLQGIRCTRTPPPLTCLTPSPHGACKHQSQPVLRLCREVQLPLTCQIGYSHHREFPRYSPTLYCLTVKIMMQHTPSVVES	388335	389611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_388300_389600
852494	contig_9305_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_148178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAGAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12977	13671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_13000_13700
852495	contig_18800_pilon	+	805	2	Intergenic	novelGene_110673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAAAACTAAGAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83033	84784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_83596_84541
852496	contig_6102_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_32256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	180	515	1344406	1344071	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFWPLPSSGQCFKAVVSDFLGVWQSRVQGPRAGDVDVRDEGLCTTYLPKILVEEEPQASTQSAPGRKVSRVEDMAVNDSKSKRGISTLPPSLRCFWAPLAQGHPHLSLVT	1344585	1343435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1343400_1344600
852498	contig_15327_pilon	+	771	3	Intergenic	novelGene_70753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	8	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGTGACCTTGCAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064638	1096480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1064890_1083080_1083180_1096059
852501	contig_6735_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_15817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGACAAAGCAGGTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586810	587930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_586800_587900
852504	contig_4769_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_117992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTTTTTTTTAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862434	863042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_862400_863000
852505	contig_9871_pilon	+	338	2	Intergenic	novelGene_75714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3308	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCTGTATTGCTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583590	584416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_583630_584117
852506	scaffold_12510_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_151346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	55	408	53714	51512	FALSE	40	AACGGAAACTAATTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFSCLIKSCGIINTTLRVPALAGFSSCSMPACTSCSSQRPGCRLCPWTLNGERRAISEGSGLGLAREGGLQSQTHFTVGTSHSCHALVAQQDNVVATHSEGRTYLKGRLFLFFFF	53768	51353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_51810_53658
852507	contig_13863_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_42045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGAGGTGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119909	120388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_119900_120400
852508	contig_8588_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_146506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTGCTGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372052	371238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_371200_372100
852509	contig_401_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_42729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTTTATATATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105604	105269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_105300_105600
852512	contig_7380_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_157518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACGAAAAAAAATCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138907	140000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138900_140000
852514	contig_6576_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_42293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTATGATGCTTCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380533	379354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_379400_380500
852515	contig_16907_pilon	+	964	6	Intergenic	novelGene_87483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_2	44.5573787379823	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAACTCTCAATGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524959	540720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_525201_535479_535559_536983_537121_539149_539243_539756_539907_540456
852516	contig_4538_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_153064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAGAAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7070	6257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_6300_7100
852520	contig_13760_pilon	+	221	2	Intergenic	novelGene_61323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAGAAAGTGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204507	205159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_204599_205029
852521	contig_14441_pilon	-	1274	11	Intergenic	novelGene_100808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	4.24735211631906	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	48	1154	258443	243638	FALSE	10	CTTCTCAGTGGTACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSLQLRHSEFLQSHMILGLVGTLSPALDSKFQKARQELNQKLQQLTGRQLMPQTPRWMKCVKETGTFFQPTLAALFVQEAFNLPTQRAAMELFSDIKDALLNRLQRLPWMNEKARKEAQDRVTRVRVKMGAPEWTLEPELVTQGYPEVQLGPSFLQLYLSCVRALQARKVRSFLQPFHSRRVFPWGVDAYYSVSDHVVVLSPGLLQPPFFHPGYPRAVNFGAAGSIMAHELLHIFYKLLLPGGCPDCDADALQGALLCVERHYAALSLPGETSFNRSGTILENAADIGGLAITLQAYHKRLLLQQKGNHPAPPGPQPGAALLSKLRPGDVWGAPTPGPTGPAQPSPTSNPWADQQHPGLRHAFQLSRRGPHEPQQPLRALVT	258742	243517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_243805_244896_244994_245256_245427_246413_246482_246576_246688_246847_246943_247312_247391_247624_247724_248736_248848_258332_258463_258714
852522	contig_2854_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_120816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCTTCCTGCTTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88719	89601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_88700_89600
852523	contig_21006_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_177726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTATTTCTATCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39087	40513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_+_39100_40500
852524	contig_16870_pilon	-	489	2	Intergenic	novelGene_155526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGATGAAATAAAAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212876	211340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_211726_212772
852525	contig_15066_pilon	+	595	5	Intergenic	novelGene_149520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	46.5960030474718	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	34	594	53680	56077	FALSE	0	GGGGCTGCCCTGCCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLWRRGSTSGAMEAPEPGEALELSLAGAHGHGVHKKKHKKHKKKHKKKHHQEEETGPTQPSPAKPQLKLKIKLGGQVLGTKSVPTFTVIPEGPRSPSPLMVVDNEEERMEGVPLEQYRAWLDEDSNLSPPPLRDLAGSLGGQEEEEEQRWLDALEKGELDDNGDLKKEINEHLLTARQRALLQKARSQPSPMLPLPMA	53646	56078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_53699_53911_54105_54312_54432_54600_54771_56017
852526	contig_7206_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_177730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCTGGAATATTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50405	51427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7206_pilon_+_50400_51400
852527	contig_9389_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_84079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	2	691	1110699	1111388	NA	15	AATCCCGAGTGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQPHSVRGRLLHVRLWPRFPHLCPVLLSESINCFNKETLSRGRRPPVCGVSGAGSPYCRKVRLVSPPSKGRFLKGGQGWGTAGRCFPGPVCRGEAPRPPKPKGHWRVGTWPPPTKMLHQSLAAPPSFARPCVGLAGPARQVATVHLIPEAGPRHQTCGDILPGVAVWVPPASGAAGDKTALKSPAWHRGHLQGPGRPRLPDRWAAVVRVYFLLYKVYRNGIYVSLMLP	1110697	1111440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1110700_1111400
852528	contig_1996_pilon	-	807	5	Intergenic	novelGene_131917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCGGAGACAGAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371005	369700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_369932_370065_370096_370267_370334_370447_370511_370588
852529	contig_7898_pilon	+	948	3	Intergenic	novelGene_47511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGGCAGTTCGAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242413	243707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_242729_242908_243099_243264
852530	contig_13542_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_131567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTACTGAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688397	689429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_688400_689400
852531	contig_15236_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_141654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695428	696137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_695400_696100
852533	contig_8682_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_165279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGTGAAACTCCGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134345	134592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_134300_134600
852534	contig_5765_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_141401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCCCTGATAATCAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724019	725009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_724000_725000
852535	contig_755_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_119759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79559	79015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_79000_79600
852536	contig_2377_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_67872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAGAAGGATGTATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4267	3967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_4000_4300
852537	contig_10642_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_78702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	44	307	641854	641591	NA	10	CTGGAATGTTCTTCCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVRLRHPGQGRALRMAAALVVAFFVLWFPYNLALFLHSLLELQVFGDCKVSHNLDYALQVTESIAFLHCCFTPVLYAFSSRRFPPVPEGFPSHCAWMASGT	641897	640903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_640900_641900
852538	contig_6102_pilon	+	1255	2	Intergenic	novelGene_31943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTTCATTTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405073	406847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_406266_406784
852539	contig_11832_pilon	-	709	4	Intergenic	novelGene_106978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	488120	487298	TRUE	15	TTTTCCTGCAAGCTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNLLHLYLGLGLLAGSGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGAASLLLAPALQLLLDTFGWRGALLLLGATTLHLTPCGALCWQRLGPTG	488122	486801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_487080_487165_487328_487709_487931_488074
852540	contig_7362_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_147563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGACTGTAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502128	503501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_502100_503500
852541	contig_12250_pilon	+	695	4	Intergenic	novelGene_80686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	8.25967446224258	234	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	290	643	396673	398534	FALSE	35	CAGAATGATTATATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSASWGRGKAELSSAGCSLDLLLGPAGGGYRRRGLPEPAGCLLAESASRTHLSRACHGGGGDLIPGLREDVPARRPVPARCCEPAVAGARAAVRGMPVPHSVPLFHSHLALSVMLEVALNQVDNQKLVPQPHVPPVIVLENHGLCWAPRDKNLVMWRDWQELCQMVGALLEGRAHQHLVDFDSHLDDIWQNWTNQQLNTQITQWIGPTNGNA	396243	398586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_396405_396544_396751_398103_398199_398353
852542	contig_6102_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_31949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCGGACTGTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412232	412734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_412200_412700
852544	contig_1244_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_37896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	40.7093355386697	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	147	899	119377	126324	FALSE	35	CAATTAAACTGTGACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTGPAAATTATTTSSNVSVLQQFASGLKSRNEETRAKAAKELQHYVTMELREMSQEESTRFYDQLNHHIFELVSSSDANERKGGILAIASLIGVEGGNATRIGRFANYLRNLLPSNDPVVMEMASKAIGRLAMAGDTFTAEYVEFEVKRALEWLGADRNEGRRHAAVLVLRELAISVPTFFFQQVQPFFDNIFVAVWDPKQAIREGAVAALRACLILTTQREPKEMQKPQWYRVRRGSHSSHQQSIFT	116922	126521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_117017_119324_119539_123483_123593_124314_124548_126075
852545	contig_12250_pilon	-	788	5	Intergenic	novelGene_80648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.651563596415	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	21	530	379717	375947	FALSE	25	GGAATCAGTATCTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHSQLRMASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYDSSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380542	375688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376044_378708_378758_379009_379194_379537_379719_380523
852546	contig_8357_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_39672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTCAAGAATACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4596	5960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_4600_6000
852549	contig_12919_pilon	-	1006	2	Intergenic	novelGene_75876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636638	634890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_635796_636537
852550	contig_5779_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_106500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGCCCTGGTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205871	206996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_205900_207000
852553	contig_16907_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_87444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTACCAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412129	410932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_410900_412100
852554	contig_6556_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_168499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325532	326192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_325500_326200
852555	contig_1008_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_121564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAATATTAACAGAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600680	599964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_6e+05_600700
852556	contig_15327_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_70434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTAAAAATAGATTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51764	51319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_51300_51800
852557	contig_8587_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_159108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAATCTTTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122005	121672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_121700_122000
852558	contig_8587_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_159110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAAGGAGAATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123695	123418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_123400_123700
852559	contig_14814_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_137709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	664	124	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACTTCCGCCTTTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279385	283807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_282889_282922_283621
852560	contig_6871_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_21575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGGGAAGTCAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132092	132384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_132100_132400
852561	contig_3472_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_166945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGAGAAAGGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949114	950224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_949100_950200
852563	contig_5588_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_172840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031455	1031682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_+_1031500_1031700
852566	contig_10000_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_139326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	204	560	236656	237012	FALSE	30	CTTACAAGCGAGCAGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQDGLQERPPLVARRLLVKHARLDDLLVHIQLVLGSGENFLLHAVHRAQPQNAHLVLLADAVSPVLRLQILWREQDAVRVSGPGHTLPRRETREGYLIHRGLPGERTSQSYRKNNQNA	233942	237013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_234130_236639
852567	contig_13778_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_70858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGAATTCTGTGAGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305974	306380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_306000_306400
852569	contig_2100_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_50654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170269	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1169900_1170300
852570	contig_6403_pilon	+	871	3	Intergenic	novelGene_139891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAATTATTCAGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092471	1094136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_1092628_1092878_1093037_1093579
852571	contig_7720_pilon	-	1162	13	Intergenic	novelGene_155783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.274221615646	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	161	964	860670	795966	FALSE	20	ACCCAAGCCCGGTGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPESTTGSPARLSLRQTGSPGMIYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEQLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSPLPPHYFPSEMILSSPRS	872295	795767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_796024_802405_802485_802604_802726_804526_804613_809126_809214_810967_811012_811705_811751_813796_813842_816478_816559_821502_821541_822326_822371_860593_860723_872187
852572	contig_21394_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_128433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCATCTCTCAGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5532	4849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21394_pilon_-_4800_5500
852575	contig_987_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_72250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAGGAGTAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360921	359865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_359900_360900
852576	contig_4730_pilon	+	311	4	Intergenic	novelGene_71709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_1	74.593714361347	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTAGTGCTCTATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135829	141559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_135874_137082_137173_140626_140712_141467
852577	contig_678_pilon	+	780	4	Intergenic	novelGene_167832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	7.58653778449403	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAACATGACGCTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178497	181293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_178590_178694_178861_180537_180675_180908
852578	contig_6418_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_81232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGAATTATCCAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407750	1409334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1407800_1409300
852579	contig_366_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_51619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAATTTCTCATTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180040	1179635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1179600_1180000
852580	contig_3068_pilon	+	861	3	Intergenic	novelGene_137639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGATCGGTCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253255	257576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_253936_254870_254979_257503
852583	contig_10074_pilon	+	688	2	Intergenic	novelGene_57142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTATGCTTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440642	441394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_440708_440771
852585	contig_1275_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_108813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	202	549	673582	673929	NA	30	GCCTTAAGAATTCACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGVQQGQQSCQSQSFLLFSEGKAEAHSLDMFLMVLCSFMAFSQSLPLNSSMATLRTVPSSRQCGAIPREKWHRERGDPNETGYSTGSQTNPHLQASFYYISGVRSYTLYLTT	673380	674096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_673400_674100
852586	contig_11285_pilon	-	1082	1	Intergenic	novelGene_5511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGGCAGTATGTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561583	560501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_560500_561600
852587	contig_14209_pilon	+	530	4	Intergenic	novelGene_88316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	206.438045589147	197	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGAGGTTGCCCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32297	34482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_32422_33874_33938_34049_34106_34195
852588	contig_12050_pilon	+	582	4	Intergenic	novelGene_62652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	278.472420337973	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	143	490	359783	363859	FALSE	15	GATCTTCAGACTTTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGQSHHTRPISAPSLRAQGVQKWKDVPHSPNPRSIPAAVRQDVNLKMPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQIQDARNHVSQAIYLLANRGKSYQFKTGAEVLKQTRACWPRSGVLHPLPQLMDAVMLQLTRARNRLTTPATLTLPEIAASGLTVRQGCGGPNKL	359640	363951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359849_360750_360847_362033_362188_363827
852589	contig_14005_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_154727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGACATTTAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19702	19236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_-_19200_19700
852590	contig_16098_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_45824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGTTCTTATCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169524	169850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_169500_169800
852592	contig_12250_pilon	+	1434	3	Intergenic	novelGene_80531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	298	456	210259	210417	FALSE	15	ACCCTATTCCCTCCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEIAPLQRLPPTPPPRSHPIRVSHDFQKPLTPSSLTSSSKLWSSGGSAPLVPNKELENLKFVGQGGFGAVFRAHHRAWGYDVAVKLLNSKAISREVKAMANLRNQYVLLLLGVTEKLEWENVCGPTLVTRFMENGSLSELLQHQCPRPWQ	209645	211395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_209774_209988_210130_210230
852593	contig_10196_pilon	-	451	5	Intergenic	novelGene_132026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_1	29.6521500063655	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	207	449	341675	338420	FALSE	45	AGACATGCACATCCAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAGQPLPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIKENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETCTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLN	345175	338417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_338451_339070_339216_341608_341747_341971_342015_345083
852594	contig_6958_pilon	-	918	4	Intergenic	novelGene_69918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	526	918	138028	132014	FALSE	40	CTGGAGAGAGAGAGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSILVLEGVPVEAVCAEVHGGLLVAGILRELHSLGEELLCLSVGHHQQGDDLLHGLLHDVSGLQVPADLLEKNPGLLQVIGGHQLPFQDRKGYLRARGEVKVSDRRQRDGRADFVSDTLKLHQLHGRDG	138764	132013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_132213_135016_135183_138000_138074_138284
852596	contig_1594_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_138813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGGCGAGAATTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486864	487458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_486900_487500
852599	contig_10749_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_133428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGACCTGGATTTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121288	122243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_121300_122200
852601	contig_8683_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_150250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGGATTTACATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539275	538215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_538200_539300
852602	contig_17993_pilon	-	905	5	Intergenic	novelGene_61938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCCTTACCTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97083	86849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_87141_88026_88242_94075_94195_95311_95492_96983
852603	contig_3153_pilon	-	1396	7	Intergenic	novelGene_104690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_3	63.6354635578482	14	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	150	1394	407472	336522	FALSE	80	AATTAAAAAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVGAVNEFARWTTEEERLRRPKQPGASQASAPPARCPPLPPPGRPPLPRSPHKRSLYYFSYPLLVGFALLRLVAFHLGLLFVWLCQRFSRALMAAKRSSRASPASASASPPAPVPGGEADHVRAFHKQAFEYISIALRIDEDEKGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVIGQGEPCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLEKLQPVLQFSKSQTDVYNDNTNLTCRNGHLQSESGAVPKRKDPLTHPSNSLPRSKTVTKTGSTSLSGHHRAPSCSGLATVSGVRQGPGPATAIHKGTPKTNRTSKPSSTPPTAGQKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQELAKQALQEIVILPSLRPEVRTLYYHFPITSLFTESRVLVRKYLTYARMFNSYKITV	407621	336519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_336733_337192_337330_337884_338073_366753_366850_373045_373130_383893_383978_407027
852605	contig_17212_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_88622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAATTCTTATATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149746	149408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_149400_149700
852607	contig_13158_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_107291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTGGTTAACAACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133694	134473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_133700_134500
852608	contig_7426_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_27513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGAAGAATCGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982212	982857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_982200_982900
852609	contig_9272_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_125908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293543	292806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_292800_293500
852610	contig_10437_pilon	+	1080	1	Intergenic	novelGene_38398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGCTAAATGACGTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728467	729547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_728500_729500
852611	contig_10299_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_79751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAATGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513987	513539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_513500_514000
852612	contig_15412_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_165477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCTTCCGTTTCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305346	304554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_304600_305300
852614	contig_7229_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_39866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAATTAGGATTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475552	1476299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1475600_1476300
852615	contig_8650_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_162615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66338	65798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_65800_66300
852621	contig_17840_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_154297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGATTAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58863	57814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_57800_58900
852622	contig_13697_pilon	+	999	9	Intergenic	novelGene_165941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	113.721974569562	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	410	994	624246	629177	FALSE	30	GAAGCCCCTGTTTGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKMDERTLLREAKEVSLEKLHQAVRQNGVMSGLMQMLLLKVSAHITEQLGMAPGGEFREAFKEASKVPFCKFHLGDRPIPVTFKRAIAALSFWQKVKLAWGLCFLSDPISKDDVEKCKQKDLLEQMMAEMIGEFPDLHRTIVSERDIYLTYMLRQAARRLELPRASDGEARTPILHIIHTRRCALSLRHSNKV	613477	629182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_613516_614132_614214_619778_619842_623540_623708_624185_624327_626795_626907_626996_627137_627337_627525_629111
852624	contig_7565_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_172910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	614	874	200458	200718	NA	40	AATAAACTTGCATATGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLEDAEQGDRKLVGSKGSHSDFNFGDNSCSQLDILPGNVSPEFVPCEGERGLSLHKKKDLLSDIGSESPLHSAAYPFLGTFGNKPSPRCTPGLSESGSTCIAFRGPNERPGLKVYKCSPLTEGENAAPETSRGSGVQETPVKDGGALSVSLDWRASSAALPCHSHEVSFLHSGPQVTLDTLTESVKSKPSSATNCLPDTEKNNMICKPMKCQTDHTPGLSAETMYSQPEKISMTLGHPSHHTTDLLKSDLKKLSSTVPSSVYWQPLRKSIPPLASQQDSGFASPFVHLD	199844	201015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7565_pilon_+_199800_201000
852626	SIRV5	+	216	3	NNC	SIRV5A	novel	533	6	NA	NA	1	-251	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACGCGAGTAAAGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	2147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119
852630	contig_1939_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_144877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATCTTCATAGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406273	406543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_406300_406500
852631	contig_1939_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_144878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAACTACAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406602	406897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_406600_406900
852633	contig_15867_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_170895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTATAAAAAAAAATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101020	99986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_1e+05_101000
852634	contig_563_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_169758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	11	36	343	378	404526	404491	NA	15	GACCCCTCGGCTTATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQLRPPGGRHGRNRRPAEGLAGIHEPAGHAVVTAQSAAPLPTQLPLGYCVGAGQGGLPSQSGPPPNRCWGEGFQVRPRPSWFWGVSRFEALAFLVLWWGFSRCEALPRPRPPAMQAAWEGLCYL	404868	404470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_404500_404900
852635	contig_1516_pilon	+	911	2	Intergenic	novelGene_49935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAAAATCATTGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146235	152765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_146375_151993
852638	contig_8330_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_71754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTCATTATTCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571140	570652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_570700_571100
852639	contig_7457_pilon	-	394	5	Intergenic	novelGene_31295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3035.60005394321	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	33	323	160764	158043	TRUE	90	AAAATACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSALVVAVEMGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKDVFRDPALKRKARREAKVKFEER	161040	157861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158042_158115_159130_159269_160683_160767_161010
852640	contig_6556_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_168505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGAACCCACTACAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336482	336888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_336500_336900
852642	contig_7362_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_147559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACAATTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462515	461696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_461700_462500
852643	contig_8397_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_177734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTCCTGTTTTTCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173981	174587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8397_pilon_+_174000_174600
852644	contig_20293_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_153522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAATAAAACAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74946	76042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_74900_76000
852645	contig_7357_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_36934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAATGAAAATGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784655	783699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_783700_784700
852646	contig_7411_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_137009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGATGTGAGGACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290805	291109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_290800_291100
852647	contig_11396_pilon	-	281	5	Intergenic	novelGene_71402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1644.74055704844	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGTAAAACTCGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555549	1554279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554867_1554944_1555079_1555144_1555230_1555294_1555518
852648	contig_7272_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_25433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTACCGGCCGGCGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008200	1009747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_1008200_1009700
852649	contig_4442_pilon	+	552	2	Intergenic	novelGene_127929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTTTCAGTTCATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151269	153423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_151381_152982
852650	contig_8712_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_58839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGCCGTTCACTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432407	433530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_432400_433500
852654	contig_12920_pilon	+	648	5	Intergenic	novelGene_166355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	5.71729831301464	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	66	647	317721	330307	FALSE	30	TGGAAAGGAGTCAACTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTAAEVRATEGDISNDSNLHTSQVEGFRKGVCSVRHGLSVILLLCNFAIYTQQMNISIAIPAMVNHTIPPSHPSASTERPPTDSQDYWNETLKEFKAVAPVYDWNPEIQGIVLSSLNYASFLAPLPTGYVAGIFGAKRVVGAGLFISSVLTLFIPLAADTGVTLLIVIRVAQGIAQVMVTTGQYSFWVKWAPP	292489	330308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_292519_317684_317812_327738_327945_329940_330175_330256
852655	contig_16775_pilon	-	1090	2	Intergenic	novelGene_107792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCATTTGATAAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179022	177240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_177587_178278
852656	contig_13292_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_142941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTGGCACTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242104	243115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_242100_243100
852657	contig_1867_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_54612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAGAAAAAGGAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518980	518058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_518100_519000
852659	contig_7020_pilon	+	291	3	Intergenic	novelGene_57052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2807.5	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAATCTTGAGGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79453	81771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_79486_79910_80017_81618
852660	contig_405_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_135306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333039	332132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_332100_333000
852661	contig_5023_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_7106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAGTAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59071	58304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_58300_59100
852662	contig_8248_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_125010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAAGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35913	36505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_35900_36500
852665	contig_10323_pilon	+	911	4	Intergenic	novelGene_123536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	182	694	236338	240258	FALSE	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSPKATRLEFKALMRWLISGTCMITPVSLLASMMVTRHVVGWTAARTSSTSACPLTLDTGTKVTVATPSSFRCSRGRRMESCSTVQVTKCGLAPLPRGSTPSSLAIWLSRKCLTIEWITKLFDCRDGAEKALTKSVLREELNNSLSHLYFLLWLTLKKKKKKVSDPSP	235193	240475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_235281_236243_236409_236634_236763_239944
852666	contig_4156_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_88114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCTTCCCCATGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378674	377613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_377600_378700
852669	contig_14405_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_85666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATACCCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737571	738031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_737600_738000
852670	contig_6996_pilon	+	615	2	Intergenic	novelGene_177736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAGAAAATAAATTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10860	11575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6996_pilon_+_10911_11010
852671	contig_9180_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_109116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAAGAAAAAAGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417323	416429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_416400_417300
852672	contig_19205_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_177688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	26	81	246	326	141488	141568	NA	70	TAAGTGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCWISRSVESQHFDPTLTKLESCQQSFTYHILGKYAEITLTTQGVTSVDKQRKQKSILLPFQGFETRKFCLLPFLLLLRLGMQAWAYLKVPWDSISALSSLFFAVLP	141242	142457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19205_pilon_+_141200_142500
852673	contig_8017_pilon	-	928	2	Intergenic	novelGene_65383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTTAAAAGCTCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1582127	1580505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1581334_1582027
852674	contig_11186_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_98868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAATTTTTTCAGCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232885	232353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_232400_232900
852675	contig_18850_pilon	-	379	5	Intergenic	novelGene_142449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	225.407824841996	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	26	379	193164	190583	FALSE	0	GCCTGGGTCCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFLMIRRHKTTIFTDAKESSTVFELKRIVEGILKRPPDEQRLYKDDQLLEDAKTLGECGFTSQTARPQAPATVGLAFRADDTFEALRIEAAPTNRPCSEGRPSPSPTSPIKEIWVS	193189	190582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_190667_190721_190748_191759_191866_192915_193051_193161
852676	contig_13760_pilon	-	454	3	Intergenic	novelGene_61342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	13.5	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTAAAGCCATCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334608	331249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_331474_333930_334018_334465
852677	contig_15300_pilon	+	797	3	Intergenic	novelGene_177737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	3.5	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCACAGTCTCTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8703	63172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15300_pilon_+_8839_60401_60599_62707
852678	contig_14033_pilon	-	660	3	Intergenic	novelGene_167431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	37.5	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	162	590	284801	278231	FALSE	20	CCAAATGGGTATCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGTSGRPSLSRDLTLQPPRRPKSTNPFTRAQEENWRRRNKTVLTYVAAAAVGMLGASYAAVPLYRLYCQTTGLGGSAVAGHTSDQIESMVPIKDRIIKVTFNADVHASLQWNFRPQQTEVYVVPGETALAFYKAKNPTDKPVIGISTYNVVPFEAGQYFNKIQVQQNANFIEYDKGTMKLCNTKFAALFWYRYL	284962	278160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_278453_279983_280140_284750
852679	contig_5346_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_161859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAATTAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355728	356665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_355700_356700
852680	contig_13021_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_8101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAATAAAAAAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90681	89997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_90000_90700
852681	contig_4402_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_140803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239679	240550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_239700_240600
852682	contig_9364_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_177738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	679	981	100975	101277	NA	40	CTCCTAACAAGAGTGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFAWVPLESMLPATRHSIPYVVCQEQCSHHLQKLPEYYISPSQVIRNRKKIKSKITKRKEILNMREEIHYVKNKCMLERINKNRSCTFLFFEKSNKKLQ	100296	101278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9364_pilon_+_100300_101300
852684	contig_16492_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_100318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTGCCCTCCCAACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186901	186252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_186300_186900
852686	contig_11846_pilon	-	724	5	Intergenic	novelGene_106007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	27	junction_1	149.304010327921	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGTCACAGTTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557907	437088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_437157_454705_455004_467816_467906_476996_477072_557713
852687	contig_1244_pilon	-	666	2	Intergenic	novelGene_38050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGCACGCTAACCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986061	984185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_984258_985467
852689	contig_14621_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_105836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.94392028877595	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGTTTGGAGTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116085	185024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_116168_153027_153113_183249_183371_184798
852690	contig_15152_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_126954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCAAAAGCCACAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80553	81262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_80600_81300
852691	contig_4659_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_118253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGTCTGGATATTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871286	871565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_871300_871600
852692	contig_6607_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_164218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTTTAAAATCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376677	377123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_+_376700_377100
852693	contig_3818_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_99312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAATTTTATAGACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095748	1094903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1094900_1095700
852694	contig_2552_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_139011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAGAATTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120965	120736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_-_120700_121000
852696	contig_12312_pilon	-	760	5	Intergenic	novelGene_63936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1057.53699698876	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	78	644	326065	213942	FALSE	30	GATGGAGATGTTAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGNKKNHSCSPSSSSVSSHWFTLYAGCAFLQYQCSRYSEAKKKRKSLNDD	326142	213825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214091_259853_259882_260267_260419_278130_278202_325897
852697	contig_6975_pilon	+	798	2	Intergenic	novelGene_74301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	418	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAATAGAAGCCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505157	509508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_505533_509085
852698	contig_16148_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_50374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAATAAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82902	81701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_81700_82900
852699	contig_1262_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_133547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAGAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188455	189472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_188500_189500
852700	contig_13206_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_161903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTGTGGAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174196	174603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_174200_174600
852701	contig_12312_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_63984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCAGGGCTTCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325052	326166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_325100_326200
852703	contig_1369_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_176791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTGCAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098206	1099602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_+_1098200_1099600
852704	contig_10746_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_176815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTCAAAAATACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64744	63903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_63900_64700
852705	contig_7138_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_121004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTATTGGAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347227	347909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_347200_347900
852709	contig_9939_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_158609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCAGGTTTTTTACGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398971	399784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_399000_399800
852710	contig_2799_pilon	+	931	3	Intergenic	novelGene_85462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAATTGTTATGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347121	377485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_347412_374517_374652_376978
852714	contig_17171_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_147388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAAAACTTTACTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338956	337909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_337900_339000
852715	contig_12939_pilon	-	214	3	Intergenic	novelGene_166195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1250	junction_2	130	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46060	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031
852717	contig_7678_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_175951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCCTCTTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73055	73970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_73100_74000
852719	contig_7009_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_23580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCATTCATGGACTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198436	198184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_198200_198400
852720	contig_5400_pilon	+	1362	3	Intergenic	novelGene_162816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACGAGCGGCGCCCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244194	251734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_245360_247058_247138_251616
852721	contig_9863_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_154001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGCAGATATAATCGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56384	57314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_56400_57300
852722	contig_4876_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_137921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646334	647011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_646300_647000
852723	contig_5041_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_27050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGGACGGCAGGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513808	512955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_513000_513800
852726	contig_7593_pilon	+	530	3	Intergenic	novelGene_127318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAGTTCAGTGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359969	361217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_360170_360797_360923_361012
852727	contig_18113_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_137538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAATTAATGGGGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175849	174514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_174500_175800
852728	contig_252_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_99917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66590	67472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_66600_67500
852729	contig_9213_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_177740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGTTCCCAGACATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15145	14698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9213_pilon_-_14700_15100
852732	contig_9561_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_100851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGAGATGAGGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80679	81816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_80700_81800
852733	contig_14871_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_63737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294317	293491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_293500_294300
852734	contig_9389_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_83920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	968	815	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	210	389	163736	168343	FALSE	10	GTGGCTGGAGAGTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPPASAASHELHAVQQGALVRALGRGQESAPVQVRPSEGGGAPQLDRGTHRPLYRPRLPEGPEGWNYLMHVPTHPSDLHLIADVTGWPSQMTPVSLPCPLPRTAQGPPLKILLGTSPHQEPRDHEIM	159556	168397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_168169
852737	contig_2161_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_114912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTGTCTCTATTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764155	764394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_764200_764400
852738	contig_7396_pilon	-	772	3	Intergenic	novelGene_79524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	44	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	159	542	207649	201876	FALSE	40	AATGAAGCCTAAATTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGFGPSECLGSERSRRPPAPSTQGIPITSASYYATVTLEQVQHIFRSDTDVPMPLIEERHRILNETGKILLEKFEGSFLNCVRKSEQSAQKLMHLVVESFPSYRDVTQFEGKRISFYKRAQILVADTWSVLEGQGDGCFKDISSITMFADYRLPQVLLHLGALRYSDELQKKLLKGLQP	208833	201645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_202086_207475_207736_208761
852740	contig_5153_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_74383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	978493	978828	NA	15	ACCTTCCTTGTGGGAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSRLPGPPGLKQAPLPSGWASVPTSGKSAGLIRCPQESARSSDSLGCLCNQNASTAGIYFLFLRGVFQNLVTQLQPLGEVLDTAACRSPTSSVCSFSKLGSPRCQPFAGGV	978490	979836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_978500_979800
852741	contig_9375_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_136047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGATGGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162869	163775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_162900_163800
852743	contig_859_pilon	+	640	4	Intergenic	novelGene_132822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	279.62395383006	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTTTCTCTTAACATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94607	131159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_94829_118678_118764_119225_119338_130937
852745	contig_13753_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_136514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTTATGTAAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214292	213392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_213400_214300
852747	contig_6958_pilon	+	1145	3	Intergenic	novelGene_70020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	71	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGTAATCTAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783159	798527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_792713_792825_797530
852748	contig_16632_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_154144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAACAGCTGGAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142417	143558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_142400_143600
852749	contig_4364_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_4570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758349	1759187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1758300_1759200
852751	contig_1397_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_174406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAGAAAAAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49792	50658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1397_pilon_+_49800_50700
852752	contig_2933_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_111309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATGGAGCGGCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284231	283483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_283500_284200
852753	contig_2646_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_69605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGCAGGGGGCTGCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1519319	1519969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1519300_1520000
852754	contig_15134_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_140225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAATAAATTTCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253418	252930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_252900_253400
852755	contig_5669_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_86083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCAACTGCATGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190822	190375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_190400_190800
852756	contig_9696_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_68848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	401.433291469455	38	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGAAGGAGGTATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646101	676107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_646334_660811_660905_669674_669849_674854_674927_676020
852760	contig_6807_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_84584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3739	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAACTTTCTGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608964	609192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_609000_609200
852761	contig_19715_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_177741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATTTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64090	63377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19715_pilon_-_63400_64100
852763	contig_5451_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_167178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCCACCTACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579008	580035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_579000_580000
852764	contig_3533_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_176535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTCAGTCATGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373521	371532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_371500_373500
852765	contig_6228_pilon	+	808	3	Intergenic	novelGene_164510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	21.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	231	332	256221	256914	FALSE	20	TAACTTTTGAGTCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRTPQILTKVIDTLHRHKNEFFEKHGEEGTEAGKKAISLLSKLRNELQTDKPIVPLVEKFVDTDIWNQYLEYQQSLMKESDGKPRWFHSPWLFVECYMYRRIHEALTQS	254704	257390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_254788_256073_256319_256910
852767	contig_5196_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_38707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCAGGACGGACAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342961	342192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_342200_343000
852770	contig_7730_pilon	-	535	4	Intergenic	novelGene_156255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	678.518156639075	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	109	498	43591	2295	FALSE	35	TTTAGCATGCTGCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDRCARARCPRGGRQQRRPWNAEGAEGVRGGGCNSEMAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQAKKKTFRDY	43699	2257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2325_4074_4177_7798_7895_43429
852771	contig_5935_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_102703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCACATACACAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946540	946149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_946100_946500
852772	contig_14986_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_59717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAACACAGCAGATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115781	117456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_115800_117500
852773	contig_7378_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_120288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	593578	593171	NA	40	TGGAGAAGGAGGTGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVLFLICFVFFSLFVFLHYSVSHLSILFLLFLSPEYLALSDTSIPSSQAVLHSLGATSPDLVVALLGSLGALLFFLIFIYSFFSSPFCFLHCVLNITPPSSPGTAYWNLPCTDYQPALVAIVSATNNPSQQLLFS	593579	593127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_593100_593600
852775	contig_1380_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_138874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTATAGTTTGTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85505	85914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_85500_85900
852776	contig_6808_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_173529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	185	475	221797	222087	FALSE	15	TTCTGGGAGCGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNQVLPPGVSLGNGLTPGAAKDLGLPVGIAVASSLIDAHAGGLGVIGADVRGHGLACEGQPMTSRLAVICGTSSCHMGVRLPGTKAGPLHSVEGSLGGDPEVLAPSPLDSISLFPSCLLVLCLARSPALSLTAFLRFARSFPRHQIFKMCGNGCICL	185801	222256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_+_185933_221743
852778	contig_6556_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_168498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	225	812	325215	324628	NA	40	TAAATAAGGACATTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKAGWGSPLWVVFLEPLTPALHHACHLRGSLQKPTSGCQFWWVVGDLPPWSHRCAGVNLELGQDAGSDRAQQLCPHRWQAAQAPTPQPLSKLCISVFPAALLSPCRAGEMPPFHDQDLFPLLPLILTEQHCWSFYTQLAENSWWTQEWSWKGVFCLQGPSEACLPVACATPASSSFLLLLPKCTLTSKLWFTPK	325439	323729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_323700_325400
852779	contig_13702_pilon	-	599	6	Intergenic	novelGene_102599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	36.0943208829312	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	52	519	99463	68217	FALSE	10	TTGTGGCTTGTCATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REREQDGGRSTGTIGCVMDAESEEPGEVGVGEIYHCRRQIKYSKDKMWYLAKLIRGMSIDQALAQLEFSDKKGAQIIKEVLLEAQDMAVRDHNVEFRSNLYIAESTSGRGQCLKRIRYHGRGRFGIMEKVYCHYFVKLVEGPPPPPEAPKTAVTLAKEYIQELRNRTIIHTL	99594	68136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_68429_75046_75117_76558_76637_78077_78144_99421_99471_99550
852780	contig_20614_pilon	-	905	2	Intergenic	novelGene_107563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGAATAAATCCTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244142	230045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_230674_243865
852781	contig_10765_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_122958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGACCCCATGTGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363573	363815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_363600_363800
852782	contig_10765_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_122959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATTTTCCTCTCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364172	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_364200_364500
852783	contig_9901_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_126915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAACAACAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49438	48315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_48300_49400
852784	contig_13697_pilon	+	1779	11	Intergenic	novelGene_165939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.48660687473185	17	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	265	1599	555040	582471	FALSE	15	TCTCCGCAGCATCCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIEAVLQVYCALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESQVLRPGAMVRVNATCRFEETIIDAVKPYCRDGEDIWKASRFRVIITTCSSAGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGLISDVNGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSMLERLMSRPAYLRDENAFGACGAYNPLLVTKLVKNYRSHSALLALPSRLFYHKELEVCADPKVVTSLLGWEKLPRKGFPLIFHGVRGSEAREGRSPSWFNPAEAVQVMRYCCLLSRSLSSQVSANDIGVITPYRKQVEKIKILLRTVDLTDVKVGSVEEFQGQEYLVVIISTVRSNENRFEDDRFFLGFLSNSKRFTVAITRPKALLIVLGNPYVLVRDPCFGALLEYSVTNGVYTGCNLPPELQSLQSCD	554775	582651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_555169_555910_556058_556503_556626_557820_557921_559096_559262_560287_560462_574311_574462_580803_580912_581739_581878_582052_582145_582461
852785	contig_3424_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_55599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACAATGAAAAAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313039	1314795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1313000_1314800
852787	contig_5797_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_56913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAAAATGAGGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98184	98672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_98200_98700
852788	contig_5050_pilon	+	657	3	Intergenic	novelGene_110245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCGTTTTTGGAAACATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69025	75544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_69112_71359_71577_75190
852789	contig_10629_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_52932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGGTCAGAAAAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344458	345361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_344500_345400
852792	contig_10734_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_51370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	1799636	1799941	NA	20	TGGCCCTAACAGCTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPQRPEESPAAETTPVLPAAVTCGALGTRLQGPRQETGPETLPPYFQLVQGTRSWTSPASGVWGLWLDLWIILELSPFPAGASDHELASRLTLKPWPQGE	1799633	1800603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1799600_1800600
852793	contig_7816_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_66530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAATAATACAATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216124	217185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_216100_217200
852794	contig_8312_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_152910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCAGCCCGCAGAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1523229	1523602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1523200_1523600
852795	contig_14483_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_133742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGATGGGGCGGGGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17901	19151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_17900_19200
852797	contig_1154_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_87139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACATGGTTTGGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820559	819630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_819600_820600
852798	contig_18850_pilon	+	603	3	Intergenic	novelGene_142401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	7	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	192	347	45617	45772	FALSE	15	ACAGCAGCTTGGTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVDSEEALSGALLDRDEAVNKALELSLELGRVSLERDSLSRELLRAIRQKVALTQELEDWQDDMQVVIGQQLRLQRQKELSTAGSSPRRTSARFSLRPGSGPAGGFLGNLFRRT	45160	46028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_45225_45409_45531_45610
852799	contig_8801_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_66317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTACTACGTGCAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623293	623751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_623300_623800
852800	contig_15888_pilon	-	634	7	Intergenic	novelGene_84402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTCAGCCAGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224897	222273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_222369_222512_222572_223073_223170_224074_224157_224386_224474_224564_224635_224752
852802	contig_10196_pilon	+	942	6	Intergenic	novelGene_132356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	57.9779268342703	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	354	932	2490973	2493701	FALSE	5	TTTCCTATTTGTTTCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNNILRIDCYLSAPALDPGTDPWLLLTSEHAPGSKHRCVFRASACSVELPPEEVLVPSDSFTITLHRFIAGQEQVSLVDPQYLPRRHVKLDPPSALQSNVSSDYCILTWSISPALEPMAGFLAYELAFKRQEEAWEQARHKDRIIGVTRLTLEAMELDPGSTYEARLRVKMAQEDDVTKEEHYEGPWSEWSPSVRFPAPRRPDPLTPPWGRPDSTLVAVSVFLLLTGLTYLLFKLSPRVKRAFHQHVPSPAAFFQPLYEVHHGNFQVRAQLALRSRSPGCGLWSSVGALSFFCISGGLKCTQCLRCAKN	2490394	2493711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2490480_2490566_2490746_2490883_2491030_2491481_2491681_2492071_2492178_2493484
852803	contig_935_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_45506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGATGAGATTACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17164	15872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_15900_17200
852804	contig_7079_pilon	+	453	3	Intergenic	novelGene_129230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	550.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	163	396	342612	349756	FALSE	20	TTCTCTCTCTAAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSLAREDKGRRRHEWGPCGRQTRGPRRSSSAEHTLHPPSGPREPATLRDAWTEMLDTGYRSCSAVPGAAPWSRALDQGALWGCVLPASHWYLLSSPLPWQHPTLCIQALSPVSSQSTPPVLLSLTGPHSP	342449	349813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343037_349619
852805	scaffold_13505_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_111645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGTAGAACTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795689	794934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_794900_795700
852806	contig_8589_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_107368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282740	283486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_+_282700_283500
852807	contig_8357_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_39779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGACCTTTTTCAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890737	889632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_889600_890700
852808	contig_6595_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_122554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGAGATATGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701238	701829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_701200_701800
852809	contig_8682_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_165271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTATGAAAGAAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56729	55741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55700_56700
852811	contig_7254_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_145838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTTTGAGCCATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169623	170024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_169600_170000
852813	contig_9434_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_150523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATGCTAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483458	482679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_482700_483500
852814	contig_12019_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_87719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAACAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354556	353876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_353900_354600
852817	contig_15471_pilon	-	775	2	Intergenic	novelGene_175231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTAGTGAACAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422444	420769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_421438_422337
852818	contig_4228_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_151173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGAGTAGTTTTCCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476407	476833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_+_476400_476800
852819	contig_5643_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_38930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429848	430718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_429800_430700
852821	contig_8677_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_174037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	187	402	288885	288670	NA	5	TTATTCCTCCTTTCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSIDDHNPTKERQWYYQSYTEFGFFKTLDSKNQPFTGVPLSYYVQQCSDFFGAEFSYYSLNMGVMSTNEYYDGFNVRRSKIIFSNGSFDPWHIVGITKDISKDLSAVFIKGEGHCSDLLVPRDTDSAELIQA	289071	288466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_-_288500_289100
852822	contig_6735_pilon	-	1380	8	Intergenic	novelGene_15651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	16.1396962771413	41	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	99	1379	465772	445501	FALSE	40	TACACTGTGTTATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGGRSCHRIRLLPSGRALGLWFALNCRGGFAMNLSRRNGKRRRSASGSDSPGSGGDGSDSCQLPLGSVLSPPPGLGRNLKDHDRLSAAAAGTCKQAVPEDQTDKLLLANWGLPQVVLEKYHSFGVKKMFEWQAECLLLGQVLEGKNLVYSAPTSAGKTLVAELLILKRVLETRKKALFILPFVSVAKEKKYYLQSLFQEVGIKVDGYMGSTSPTGHFSSLDIAICTIERANGLINRLIGENKMDLVGMVVVDELHMLGDAHRGYLLELLLTKVCYITQKSASCQADLASLQSNAVQIVGMSATLPNLELVASWLNAELYHTDFRPVPLLESVKIGNSIYDSSMKLVREFQPMLQVKGDEDHVVSLCYETVLDSHSVLLFCPSKKWCEKLADTIAREFYNLRHQAEGMVKPSEHPPVNLNQKGLLEVMDQLHRLPSGLDSVLQKTVPWGVAFHHAGIPY	465870	445499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_445659_449085_449234_455315_455536_457414_457524_459152_459310_460905_461037_464418_464599_465594
852823	contig_16113_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_140553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTAAATCACTATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108379	109366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_108400_109400
852825	contig_9438_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_154267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATCCTCGCTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222298	224010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_222300_224000
852827	contig_8898_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_137264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTAAAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380541	381638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_380500_381600
852828	contig_9375_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_136087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715538	716284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_715500_716300
852829	contig_2310_pilon	-	801	4	Intergenic	novelGene_71630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	4.78423336480244	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	7	801	417285	393574	FALSE	25	GGGTAAGTCATCACCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKMQFFGRLVNTLSSVTNLFSNPFRVKEVSLADYNVSSRVQEEGQLILFHNVPSRTWDCVLVNPRNSQSGFRLFQLETEADALVNFQQYSSQLPPFYESSVQVLQAEVLQHLTDLIRNHPSWSVAHLAVELGIRECFHHSRIISCANSIENEEGCTPLHLACRKGDGETLVELVQHCHAQMDVTDNSGETAFHYAVQGDNPQVLQLLGKNASAGLNQVNNHGLTPLHLACQMGKQEMVRVLLLCNARCNVMGPGGYPIHTAMKFSQK	417291	393573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_393760_396172_396357_397401_397618_417076
852830	contig_4732_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_75431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTCAGTGATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629113	629614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_629100_629600
852833	contig_10196_pilon	+	784	6	Intergenic	novelGene_132272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	11.443775600736	200	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	25	639	2042922	2044627	FALSE	10	TCTCGTGTCCATGTACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGILRVGMLVAAAAERNKEPILRVLQQYVDPAQRGVRVLEVASGSGQHAAHFARAFPHAEWQPSDVDQRCLDSISATTQAQGLANVKAPLYLDVTWGWEQWGGIEPQSLDLLLCINMMHISPLRCTEGLFRAAGHLLKPKALLITYGPYAINGKISPQSNVDFDLTLRCRNLEWGLRDTALLEDLGRASGLLLERTVDMPANNKCLIFRKE	2042897	2044772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2043119_2043431_2043595_2043680_2043741_2044271_2044340_2044425_2044505_2044579
852835	contig_6795_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_27676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGGTATTAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60545	60280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_60300_60500
852836	contig_3241_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_146409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAGGCTGTGACCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876236	875399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_875400_876200
852837	contig_3571_pilon	+	700	3	Intergenic	novelGene_88716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	333	608	105329	107095	FALSE	20	AACATTTGTTTGCTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFRPASWFIRSLSSLSTPTLASRLQLLQSSWINRCHLQSSDSALPPPVSSANDGGLHFRHHSTLPESPEAGRCRGDCVHSRSAVRGASRSRARLRPLQLPLSRSGLAIARMGTRKKVHAFVRIKPTDDFAHEMIKFRDDNKSIDIHLKKDTRRGVVNNQQTDWSFKLDGVLHDASQDLVYETIAKHVVSQALDGYNGNLVK	100251	107187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_+_100579_105323_105422_106912
852838	contig_16103_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_118743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATATGGAAAAGCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313191	313997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_313200_314000
852839	contig_2854_pilon	-	1389	4	Intergenic	novelGene_120840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	28.7672653471886	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	566	1252	274434	257841	FALSE	5	GTGGGGGTTACTGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	274999	257703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368
852840	contig_7071_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_177743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTACAGATATGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165115	164400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7071_pilon_-_164400_165100
852841	contig_17964_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_33903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359232	360083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_359200_360100
852842	contig_15407_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_123078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAGAGTACAGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450422	450919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_450400_450900
852843	contig_1082_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_170426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAAAGAAAATGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40627	40209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_40200_40600
852844	contig_3948_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_53294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1453818	1454248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1453800_1454200
852845	contig_6589_pilon	+	966	5	Intergenic	novelGene_26068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	57.0805352112259	688	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	188	889	1757003	1763824	FALSE	20	GCAGCACTATTTCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPQVSGLGSRPELFVFNSPWTAGGVRESVDLTVGWHRGETQRTARSVGEGLSRRSSLPFRPEMWRPLVLLLLLPSILVPPSTAAPIRDGDFQESSSGLLGLQSLLQGFSRLFLKDDLLRGMDSFFSAPMDFRGLPRNYHQEENQERRLGNNTLSSHRQIDKMTDNNTGEVLISEKVVASIEPAEGSFEGDWKVPKMKEKEALVPVQKAVDDFHVEPRPRVAFWIMKLPRRRSHQDTQEGNHWLSEKRHRLQAIRDGLREGTHEDLLHEGPQGSLHPRLPARKAHFLYILRPSQQL	1756563	1763901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1756732_1756983_1757159_1757897_1758039_1758165_1758259_1763512
852846	contig_3942_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_128726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	262	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGGCTCAGGAAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638377	634196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_634641_638303
852847	contig_13715_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_177745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6371	5873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13715_pilon_-_5900_6400
852850	contig_5954_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_28553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCTCCCCGGGCCCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608149	607275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_607300_608100
852851	contig_8322_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_143217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACATTTCCCCTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80766	81746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_80800_81700
852852	contig_5964_pilon	-	2144	9	Intergenic	novelGene_80372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	14	550	400551	400015	TRUE	5	TCGCTTCCTCTTGCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSMDFLVFFQGRAMQEGLPTHLTFIRFLFTVNFLKLITGQAGLKGFLMLIICVITEVPSTMGFLVVDQGRAMEEGLLTHPTFIEFLFTVHFLELAKGWAGHEGFLVFLILTFHEILSRVDFPVLSKSGALIEGLPTLLTLKALPSGLAFLNLTNGHAMDEGFAVLIEILPRVHDLVLNKL	400564	380534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_380563_389863_389958_391997_392479_393072_393157_393934_394033_395103_395197_398118_398221_399258_399353_399494
852853	contig_4908_pilon	-	662	2	Intergenic	novelGene_117384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTATAAATTATTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292529	266946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_-_267553_292473
852856	contig_1082_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_170432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCTACCTCAAACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103419	102461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_102500_103400
852857	contig_10238_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_170097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	259	435	126254	126078	NA	20	AGAGCCGCCCATGTCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KITPNGYFPKSGLQDSIFCPKHKQRRGNPAHFGLNHPTSLFPKPRVLRGWDRAAVGLAACCALLCLTSKRLVERPPSQKRHWDVDGMDTARGVYSLGFPSPSTLWRVSPVPSPASTEAANRHLRITHGKRNGFVFSRHGELCTG	126512	125986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_126000_126500
852859	contig_11413_pilon	+	472	4	Intergenic	novelGene_103134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2127.97415397838	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	13	423	87465	90649	FALSE	30	GAAAGGTGTTGGAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPDKMEGIRVPVLLLLLLLGLTWSEPTSLTEDFSLSQAEVLKLSINTYNEHSGEEYAFRVLEAQQQPDWDPTLLKPQSLSFIIKETNCKIVEKLTPEKCPFKDDGQVKNCSVLFKTGEEDISVELTCEPQKPTGVRLAEA	87452	90698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_87660_88139_88248_88420_88514_90634
852860	contig_2414_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_158512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTCCACTGAGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491082	490145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_490100_491100
852861	contig_4732_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_75383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTACCACGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236104	236836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_236100_236800
852862	contig_7179_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_78075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448336	448896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_448300_448900
852864	contig_15628_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_147696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCACTGTATCTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109526	108863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_108900_109500
852865	contig_14687_pilon	+	686	3	Intergenic	novelGene_107889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	34	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	75	422	375621	421559	FALSE	10	CCTTTCACATCTCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLALGAQRGAAPPLRRAPLLLPSMCPGATAPLPQAAAYPGVYGSNGRTPQPGSSTEQTSRPFISCREIRRGYFLSQKSCSNRYGKVFMYLMKCSCWQDNGITKELDKSAGSDSIFFKQSLAELFVHIPTLVTYWIMFR	375546	421823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_375706_391200_391286_421381
852866	contig_13206_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_161890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTTCCCGGGGTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82496	81648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_81600_82500
852867	contig_4364_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_4110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTCCAGCGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533302	1533070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1533100_1533300
852868	contig_9516_pilon	+	957	2	Intergenic	novelGene_106187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	123	836	918822	929575	FALSE	20	GATTATCGCATGCCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPILGHGTLQPASAAGLAALELDSSLDQYVQIRIFKIIVIGDSNVGKTCLTFRFCGGTFPDKTEATIGVDFREKTVEIEGEKIKVQVWDTAGQERFRKSMVEHYYRNVHAVVFVYDVTKMTSFTNLKMWIQECNGHAVPPLVPKVLVGNKCDLREQIQVPSNLALKFADAHNMLLFETSAKDPNESQNVESIFMCLACRLKAQKSLLYRDAERQQGKVQKLEFPQEVNSKTSCPC	918699	929696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_919080_929119
852871	contig_9011_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_159294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370660	370199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_370200_370700
852872	contig_17753_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_105093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAGCCTCAAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97505	96315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_96427_97057
852875	contig_8375_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_141324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	246	470	278068	277844	NA	75	AAATGAAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCPCEFSVALQGLLAQFGNCRPKHSRSSKVGPNSSPLLSQSHLFPTHLKLSCWSLCSPLPDPSPSILICLSFGISSNVPFSMKSKIDGPQHLACPYAALVAFLKGQVLNCTCLLWFSNIWCTGLNLKLFEGQAPCILLIVKYTKKSTKAYVQFDE	278313	277444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_277400_278300
852876	contig_20157_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_145870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTTATTATGTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152368	150702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_-_150700_152400
852880	contig_8354_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_24083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCACAGCAACTCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133127	133778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_133100_133800
852885	contig_4742_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_131017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	206	1198	293877	292885	NA	25	AGTGGGCTCGTGAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDFLCISLVNSSVQFRYNLGGRTIILETLQKVIINGSTWHVIKAGRVGAEGYLDLDGINVTEKATTKMNFLNINTDFYIGGVSSLNLVNPMAVANEPVGFQGCIREVIINNQELQLTELGAKRGSNVGDCDGTACGYNVCRNGGECIVNGTTFSCRCLPHWTGNTCEQSVYCLNNLCLHQSLCVPDESFSYSCLCPLGWVGRYCENKISFSTAKFIGNSYIKYIDPNYRMRNLQFTTVSFNFSTIETEGLILWMGKAQNEENDFLAIGLHNQTLKIAVNLGERIFASVIHNNGTFCCNKWHHVIIIQNQTLIKAYLDGNLILSENTDPCKNFVALNYEGVSYLGGFEYGRRVNIVTQETFKRNFVGKIKDVVFFQDSKKIELIKSEGYNVYNGDEQN	294082	292407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_292400_294100
852887	contig_20402_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_72845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158102	159462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_158100_159500
852888	contig_10437_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_38349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	161.210007960631	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	122	529	523324	528678	FALSE	40	GCGAGGAAGATCATCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKQEEENPSEETGEEKQDKQEKEGILPERAEEAKLKAKYPSLGQKPGGSDFLMKRLQKGQKYFDSGDYNMAKAKMKNKQLPSAGPDKNLVTGDHIPTPQDLPQRKSSLVTSKLAGLRKERNELHSCLPPVSTA	523202	528695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_523381_525030_525157_526368_526536_528620
852890	contig_9895_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_144705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378672	379866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_378700_379900
852892	contig_2367_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_65308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGACAAGAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147158	146379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_146400_147200
852895	scaffold_19766_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_34334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACCTAGAGAATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597244	596404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_597196
852896	contig_3902_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_177746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAACAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123974	122911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3902_pilon_-_122900_124000
852898	contig_9931_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_134811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTGCTTCAATAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295175	293833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_293800_295200
852899	scaffold_13505_pilon	+	917	4	Intergenic	novelGene_111650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	11.5566238822398	198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	120	647	821102	827357	FALSE	10	GGTGTACCTGCCTTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGAAAEGSASEISRCLEGAGRGGSQAWEVGALGERDRAMAEVHVIGQIVGATGFSESSLFCKWGIHTGAAWKLLSGVREGQTQVDTPQLGDTAYWSHPIDLHFATKGLQGWPRLHLQVWSQDSFGRCQLAGYGFCHVPSSPGTHQLDCPTWRPLGSWREQLARAFVGGGPQLLHGDTIYSGADRYRLHTAAGGTVHLQLGLLLRHFDRYGVEC	820071	827627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_820187_821097_821190_823913_824040_827043
852900	contig_9006_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_177475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125001	126112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9006_pilon_+_125000_126100
852901	contig_19520_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_177747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18611	19261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19520_pilon_+_18600_19300
852902	contig_9321_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_174712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTAGGTAGGGGGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7757	8295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_7800_8300
852903	contig_14288_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_153825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGTAAGTGTAGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365149	364887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_364900_365100
852904	contig_10235_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_46545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	342	704	417136	417498	NA	10	TCACCTTTTTCTTGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRDNFKGRIKKTWQILGYANTRKIRDKILHPNMGELTAISPIWRVKKRNYIRILNTTAASILGIQELSVRHWMELEKSSLGMTSSYVVLKAMERKTTPWQITQKRKSTLWKACLLDLH	416794	417614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_416800_417600
852906	contig_2219_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_67210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	42	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCTAGATGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373117	370434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_370758_373053
852907	contig_3942_pilon	+	563	5	Intergenic	novelGene_128681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	566.582021864443	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	299	409	429805	429999	FALSE	30	ATAAACTTTTCTGGATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRGLLPSGRPLFHPASPPRWSWPGFCRSWRCCCYYRAPRRRARPRRGRSTRWRPPARLASCVRGRPSRIRVPCPSTSASNALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426530	430153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428045_429556_429607_429798_429853_429936
852908	contig_9696_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_68831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	246	452	567832	567626	NA	55	TTTGAAGAATACAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCSSLDLHISLFKTFGPPPPPLPLPNCISNPVAVVIGTLKLYEEIAEENKLRLSWIRKLDCQTVFSSRATFKGAVEKVQKTMTRVAKDMATTSCEELLSEIGREKTKVEVGKLLLAFFSVALGRLYDIVIISPELDLHSNPNSTTFWLI	568077	566965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_567000_568100
852910	contig_13014_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_169338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTCTGTTGTCTCCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370197	371293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_370200_371300
852911	contig_6501_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_150571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGTTAAGAGACTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260445	261116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_260400_261100
852912	contig_20819_pilon	-	1416	4	Intergenic	novelGene_55699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.4449494897321	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	231	911	123688	120957	FALSE	5	CTTGCAGTCTTTGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMARSLGAPHWVAVGLLTWAALRLLVAGHGGHGDLHDDLHEDFHGHSHGDSHEDFHHGHSHAHGHGHTHESIWHGHTHGHDHGRSHEDLHHGHSHGHSHESLYHRGHGHDREHSHGGYGESGAPGIKQDLDTVTLWAYALGATVLISAAPFFVLFLIPVESNSPRHRSLLQILLSFASGGLLGDAFLHLIPHALEPHSHHAMEQPGHGHSHSGTSAKGKSCSLREW	123918	120451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_121001_122801_122856_123016_123186_123274
852915	contig_15172_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_158769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265428	264500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_264500_265400
852916	contig_2069_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_23569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCTCCCACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2272796	2286943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2273039_2286329
852917	contig_11216_pilon	+	896	6	Intergenic	novelGene_173593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11.0018180315801	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	225	896	65856	69602	FALSE	25	GAAGGTATGGAGCAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSYDEASLAAEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYAQQLTDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAMMTEADKVSELHQEMKNNLLNEDLEKVKNWQKDAYHKQIMGSFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTEQSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYM	14561	69602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_+_14723_65792_65919_67181_67339_68575_68812_69272_69429_69542
852918	contig_11216_pilon	+	507	3	Intergenic	novelGene_173594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	70377	72063	FALSE	70	CAAAACAAAAAACACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGATLANATGAVESISQAGDRGSVSSYDRGQAYATEWSDDESGNPFGGSEANGGANSFEDDAKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI	70376	72204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_+_70445_71243_71432_71953
852919	contig_11121_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_167053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGACTTGATGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52006	53116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_52000_53100
852920	contig_11121_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_167054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGTAATTTCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53557	53250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_53200_53600
852923	contig_7412_pilon	-	695	4	Intergenic	novelGene_76282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.2825877028341	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATTTGAGTAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270894	268956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_269135_270190_270292_270432_270612_270657
852925	contig_12327_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_140637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAAAAGACCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167429	165967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_166000_167400
852926	contig_7876_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_144845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTTAGTTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222232	223229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_222200_223200
852927	contig_2817_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_104359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460840	459646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_459600_460800
852928	contig_7622_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_132402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAACAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147192	148149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_147200_148100
852929	contig_11253_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_126833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTAAAGAAATGATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169857	169433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_169400_169900
852930	contig_4232_pilon	+	706	4	Intergenic	novelGene_63259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	3.77123616632825	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2	433	428493	429193	FALSE	15	CTTTACCCTTGGCTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCCCRQGRGWGAQCRPCPPRSAGSQCPTSQSESNSFWDASPLLLGKVQRDEDSSEEDSDECRCVSGRCVPRPGGAICECPGGFQLDSSRARCVDIDECRELNQRGLLCKSERCVNTSGSFRCVCKAGFARSRQHGACVPQRRR	428491	429466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_428560_428645_428727_428804_428937_429041
852931	contig_8710_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_73508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	176	424	320755	321489	FALSE	35	TTGTATATTTTAACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEERSRRVLAEVLQEASYHSWECSVRCLATASAVDLLVLQAGAGEALVAQWLSSRLLTMAQWLNIQRLTRRCHCISSDSKRPYVQQNETLPGPAASSQLLSPLLQPLCQSISLKVFLFFADPLPSVMSSWDWSLLITCPK	320579	321694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_320793_321278
852933	contig_9389_pilon	-	893	7	Intergenic	novelGene_84050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.10554159678513	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	391	735	660559	658205	FALSE	15	CGGCAATGGGTTTGGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPSWALRRPTNGCLSMGSAGCDGLLGSGTREDQCGRCGGANDSCLFVQRVFRDAGDHPPRPQHAPGAVPLTNRGSPEAKSRADWALCAPAALLFNLIGQCQIVPPSPERPRF	662989	658046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_658493_660502_660613_660782_660845_661087_661180_661274_661348_661949_662013_662942
852935	contig_20452_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_167298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTAGAGGCTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25760	26274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_+_25800_26300
852936	contig_13244_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_86977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	585	516	1100	343479	344063	NA	25	GGTACGTCAAAAGTCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVASGLSPVSPTVELRLQGINLDLEDDDVANESVKGLENQDLDKEEEKALWAAKGNSVKIMQSEISAEVNEKAGLLPCPEPPILSAVLKDDKHSLTSFLQSVGHSVFHTQPDSEETMSQTALEKIPCRISTQRSVALGQDKVAIQKLNEAATKLQAFWRGFYARNYNPRARDVRYEIRLRRMQEHIVCLTDEIR	342963	344064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_343000_344100
852937	contig_7876_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_144851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510092	508900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_-_508900_510100
852938	contig_10307_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_170298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTTCCCACAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635815	634730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_634700_635800
852939	contig_10135_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_106674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAATAGGAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222429	223849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_222400_223800
852940	contig_4350_pilon	-	529	3	Intergenic	novelGene_136394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	9	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTTAGTATTTATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388409	356491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_356915_359616_359688_388374
852941	contig_14288_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_153821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACCTGCTCAAGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313793	312931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_312900_313800
852945	contig_11428_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_138494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99904	98491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_98500_99900
852946	contig_11498_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_65524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTTATTCTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240384	239383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_239400_240400
852948	contig_240_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_173806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTAAAATAACTAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712815	712248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_712200_712800
852949	contig_2739_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_165836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCTGGAACAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228321	227637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_227600_228300
852950	contig_5009_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_119249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36354	35568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_35600_36400
852951	contig_10481_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_170529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCTACCACTATCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73572	74768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_73600_74800
852952	contig_10753_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_105169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTGTTACAGTGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451465	451665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_451500_451700
852953	contig_11742_pilon	+	1146	3	Intergenic	novelGene_166534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.5	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72743	117581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_72827_115621_116297_117193
852954	contig_6673_pilon	-	811	5	Intergenic	novelGene_164005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	59.851900554619	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	338	760	11168	5486	FALSE	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVSYQVDERTCIQFAMKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160313	5434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_11111_11199_68208_68318_93275_93340_160179
852955	contig_9771_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_156932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTATCAGCAGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623139	624279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_+_623100_624300
852956	contig_7078_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_130138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTGAGACAGATTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169193	169787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_169200_169800
852957	contig_533_pilon	-	640	2	Intergenic	novelGene_174256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCACAGTTGCATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130854	127836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_-_128163_130540
852959	contig_19680_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_132012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGTTTACAACAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170331	169299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_169300_170300
852960	contig_1244_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_37907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACAGAATACTGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243234	242548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_242500_243200
852962	contig_9527_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_134058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGAGCCTCTCATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454366	452888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_452900_454400
852963	contig_19677_pilon	+	827	8	Intergenic	novelGene_125153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	9.14062472745508	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	80	787	20696	83929	FALSE	25	CACGGGATGGCCCATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSCGPRPGDGRRQAGEWLAGSSTWKMRSVVGGTFKVLFLFFASLCAWYSGYLLAELIPEVPLSNAVYSVQSIGAKPVIKAPAPKRQKCDHWTPCPQNTYAYRLLSGGGRDKYAKICFEDELLIGEKTGNVARGINIAIVNYVTGKVIETRFFDMYEGDNSGPMTKFIQSAPQKSLLFMVTHDDGSSRLKDDAKNAIEALGSKEIRNMKFRSSWVFLASKGFELPAGIQREKINHSDSKKNRYSGWPAEIQIEGCIPREPS	20616	83969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19677_pilon_+_20715_33900_34045_51906_52031_61129_61189_63042_63094_64741_64830_67119_67253_83839
852964	SIRV2	-	342	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4531	34	3356	1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCTATAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376	1034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1000_1400
852965	contig_8057_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_176645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATCACTGGAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131304	130994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_131000_131300
852966	contig_2733_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_128575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACAGTATACAGCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724532	723999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_724000_724500
852967	contig_10734_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_51343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGCTATGCTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701774	1701298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1701300_1701800
852968	contig_12090_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_80506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276806	275866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_275900_276800
852969	contig_8396_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_177627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACTCTCTCAGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325030	324502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_-_324500_325000
852970	contig_9440_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_59039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGGGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309063	307642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_307600_309100
852971	contig_9696_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_68775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAAAAGCATTAGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148311	147386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_147400_148300
852973	contig_10446_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_162515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCAATGAGAGTCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131625	1130823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1130800_1131600
852974	contig_16122_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_134515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAAAAAACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140396	140999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_140400_141000
852977	contig_5765_pilon	-	923	2	Intergenic	novelGene_141408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGGCATGGCCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847352	842576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_843445_847297
852978	contig_11702_pilon	-	869	7	Intergenic	novelGene_142007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	247.188636919706	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	75	818	517074	506100	FALSE	15	CTGATGCGGGTGGCAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLLSLASVNAAIRNYYLQDVPDLMDCCDTGFHLALGQVFRSYTAAESRTQASQMQGLGSLEEALEALDPPGDKAKVLELHAAAFCPPLRFDYQPHEGDEVAEIQVEMELRDEIMPRAQNIQSRLGRQTIETEEVNKTLKATLQALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAAGPSAGGPALPLHLPQPPGPVQRREHDGSLQPGCVLRADAAACACWAGPRGPASPWPCPASSGHLPLTLCRGGQTGFLDLTPLPAPALA	517148	506048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506219_508465_508566_508678_508731_510756_510900_511114_511217_516746_516969_517068
852979	contig_8687_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_169657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36606	37517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_36600_37500
852981	contig_12050_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_62759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAACCATGTTCCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773866	774067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_773900_774100
852982	contig_9633_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_139603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGGTAATTGAGGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443857	445707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_443900_445700
852984	contig_11340_pilon	-	611	2	Intergenic	novelGene_173918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	55	321	191330	189608	FALSE	50	GGAAATTAAATATGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCQQRPGRAAAQGCGAQRMGGVSEGPQEWGRRARMRLLAPVGTQNHAAHTRRDPWPLRTPTRTCLPSSGARLSCLICYFSRDLLLMPLLSEQKWITCFHFLKTLFI	191384	189317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11340_pilon_-_189695_191150
852985	contig_10882_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_172747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGTGGCAGCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18212	16824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_16800_18200
852986	contig_3382_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_124233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAAACACCCTTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270942	2272217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_2270900_2272200
852988	contig_9706_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_20952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGGAAAAGGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279786	280376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_279800_280400
852989	contig_12299_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_29762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACCAAGGCATTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654963	654310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_654300_655000
852990	contig_14727_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_56683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATTTCATTCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403918	403067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_403100_403900
852991	contig_11216_pilon	-	798	2	Intergenic	novelGene_173592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAACCAAACCCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15057	13575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_-_14143_14826
852992	contig_13868_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_172641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTACTCTGCTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12387	13222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_12400_13200
852993	contig_5899_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_146982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTCTGATCTTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200158	201081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_200200_201100
852995	contig_815_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_175033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19397	18263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_815_pilon_-_18300_19400
852996	contig_7229_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_39837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAAAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946582	946800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_946600_946800
852997	contig_10953_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_42608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGGGTAGTCCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464463	464213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_464200_464500
852998	contig_14322_pilon	-	1023	6	Intergenic	novelGene_115623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	11.6550418274668	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	83	1021	209846	205959	FALSE	20	CTCCCAGGACGCCAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAILELKKAECERRGLPYDARINAWDMRYYMNQVEEMRYSVDQNLLKEYFPMQVVTQGLLAIYQELLGLTFDREEGATVWHKDVTLYTVRDSASGQVIGKFYLDLYPREGKYGHAACFGLQPGCLRPDGSRQISIAAMVANFTKPTPDAPALLQHDEVETYFHEFGHVMHQLCSQAEFAMFSGTHVERDFVEAPSQMLENWVWEREPLLRMSRHYRTGDAVPPGLLDKLIQSRQANTGLFNLRQIVLAKVDQALHTQTGADPAEEYARLCQEILGVPATPGTNMPATFGHLAGGYDAQYYGYLWSEVYSTDMFHTRFKQEGVLNSKVGMDYRSCILRPG	209928	205956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_205998_206657_206795_208124_208254_208544_208732_208879_209082_209601
852999	contig_13565_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_162372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91281	90264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_90300_91300
853001	contig_2093_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_152982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	748	1068	1349630	1349950	NA	70	GTTATAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCGTLGIINMAHLLIVLLAGSHGSIYEHLAGAYWGDEEGHAHQPPVSAHQIFLRGLGLQSTALGGRLISTPHNPESVIFQNNTYQNNLELDVSTLANKSALLFSE	1348882	1350105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1348900_1350100
853002	contig_20879_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_168602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATCACCATTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172425	171440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_-_171400_172400
853003	contig_14142_pilon	+	558	2	Intergenic	novelGene_120462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATCTCGGATCCTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108257	109209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_108413_108806
853004	contig_5643_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_38840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	0	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233614	234834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954
853005	contig_12958_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_136196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAACAAAAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54702	54477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_54500_54700
853006	contig_19769_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_102247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCATCAAAAGAAGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49032	49630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_49000_49600
853007	contig_1154_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_87224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603533	1603072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1603100_1603500
853009	contig_3077_pilon	-	1160	5	Intergenic	novelGene_26902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.6984250992003	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	97	792	1633326	1630212	FALSE	15	CATCCGTCTATCACTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGAGPSRSSYWPAWSSRPFSGRPGPGRPTPTMPPAGLCRAAPLAAAAFLVLGAPLALAGEDCLWYLDRNGSWHPGFDCEFFTFCCGTCYQRYCCSDLTLLITERQQKHCLAFSPKTIAGIASAVILFVAVVATTICCFLCSCCYLYRRRQQLRSPFEGQEIPMTGIPGQPVYPYPQDPKAGPAPSQPGFVYPPSGSAPQYPFYSAGPPLYNPAAPPPLYATAALLSRSLRNQLCLHCPFSDASLGRCPILCLRLTLGWAGVL	1633422	1629843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1630361_1630577_1630746_1631752_1631887_1632737_1632910_1633253
853010	contig_4876_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_137886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATCATACTTAATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227712	228288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_227700_228300
853011	contig_6199_pilon	-	759	2	Intergenic	novelGene_126329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	282	758	31305	30829	FALSE	30	TTGAAGGACACTCCAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTWAGRLGHQGQRPSSWGQVRTSNFPGSPRAEPEPSIVLPFSCLAPLWRGFSFKKIPWLPQMTGIGGRIGPASSLWNFCFGTLQHLRHDLKIKTHTFADLCDSQHDWANIHCGGQAQSQNAQCHIREVQPVDAQRRQKLILPLGSGKASPGSALDLD	32716	30827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_31352_32481
853012	contig_15882_pilon	+	484	3	Intergenic	novelGene_144806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	124	483	56875	61150	FALSE	10	GATGCCTTTTCATGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALIILIQLSTGSSSHCSKARKRSKRHTNCNGGNKTVPICRWHDCLHRKPQAPLKPVQHHSNTQASSDRWVITAHEPGIELTSPWKARLLPLNHQCPLHKCIENQNSDGLVSTNKIVVV	55875	61151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_55981_56856_57032_60947
853014	contig_14980_pilon	-	1010	3	Intergenic	novelGene_78224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.5	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	41	520	345102	340734	FALSE	50	AAAACTACCAGGTACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRSRLPSGAVCPAAYPDTPAEFPPHLQAGAMRRRFWGVFNCLCAGAFGALAAASAKLAFSSEVNMGLCVLGIVGMAFTNSMMWTFFSRGLSFSMSSAIASVTVTFSNILSSAFLGYVLYGECQEVLWWGGVFLILCGLTLIHRKLPPTWKALPQKQQ	345142	340243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_340875_342957_343105_344910
853015	contig_11538_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_152311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATCTACTCAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289265	288258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_288300_289300
853016	contig_9177_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_32740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGCTAGGTGCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086013	1084710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1084700_1086000
853017	contig_9871_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_75694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAAATTCTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541695	542458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_541700_542500
853018	contig_2113_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_161159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATTAAAGTTTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559625	558830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_558800_559600
853019	contig_504_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_54453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAGAATAGATTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292078	293000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_292100_293000
853020	contig_8161_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_156785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTCTAATTTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599811	601069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_599800_601100
853021	contig_13464_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_125246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCCCAAGTAATTGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441780	441105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_441100_441800
853022	contig_5201_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_82157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGGAAAATAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136601	136049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_136000_136600
853024	contig_10324_pilon	-	885	5	Intergenic	novelGene_7912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	8.5841423566947	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	84	629	860702	858525	FALSE	20	TCCCTTAGGCCTGGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAELVAAVPESTEPEAEADGEELDGSDMSAIIYEIPKEPEKRRRSKRSRVMDADGLLEMFHCPYEGCSQVYVALSSFQNHVNLVHRKGKTKVCPHPGCGKKFYLSNHLRRHMIIHSGVREFTCETCGKSFKRKNHLEVHRRTHTGETPLQCEICGYQCRQRASLNWHMKKHTAEVQYNFTCERCGKRFEKLDSVKFHTLKSHPDHKPA	860785	858268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_858703_858975_859076_859384_859500_860447_860560_860661
853025	contig_14357_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_121664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTAGTTAATATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487680	488709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_487700_488700
853027	contig_5153_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_74322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATCCATTATTTCGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480771	481205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_480800_481200
853028	contig_7292_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_175363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATAGAGCCTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137366	136375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_136400_137400
853029	contig_16103_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_118815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTCTTTATTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699419	699040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_699000_699400
853030	contig_9114_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_155186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAAAAAAGAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273088	271770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_271800_273100
853031	contig_299_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_129495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAAAAAAATTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599902	1600983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1599900_1601000
853032	contig_15596_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_139538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGCCATCTTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142573	141878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_141900_142600
853035	contig_6159_pilon	-	1358	6	Intergenic	novelGene_128243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.6450252717869	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	55	813	112094	101679	TRUE	20	GCCCAGGCACCTTGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGGECRDKESSWAGSSEPMDTGEVTACRFDAERALPLPPSCPPREWGPESRPSELSLEELSISSWHQPSSPTPAPPALAPSVPGPRAGSPAEEPAPRPSRKRKLLEDSESGKTLLLDAYRVWQQGQKGMAYDLGRIERIMSETYMLIKQVDEAAALEQAVKFCQVHLGAAAQRQAAGDTPTTPKHPKDSRENFFPMMVAPTTPDSVPADALQQPSDSHAKLRPAPAAASAAISCLPCASASTPDLAKDPGPPHLHRPEATPSTAEREKSW	112148	99628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_99793_100003_100259_101552_101699_105300_105572_107198_107274_111701
853036	contig_10968_pilon	-	845	7	Intergenic	novelGene_84303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	13.2591687354659	133	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	151	753	182951	181387	FALSE	15	CATTATCTCCCGAGCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGSLCPLRWPWARPHWELPSPPASSWSRPEKRLLPPEDSPLWQYLLSRSMREHPALRNLRLLTLEQPQGDSMMTCEQAQLLANLARLIKAKKALDLGTFTGYSALALALALPPAGRVVTCEVDPGPPELGRPLWRQAEEEHKIDLQLQPALETLNELLAAGEAGTFDVAVVDADKENCAAYYERCLQLLRPGGVLAIPSVLWHGEVLRPQQRDMVAQCVRNLNERILRDARVHISLLPLGDGLTLAFKI	183312	181294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_181540_181758_181893_182219_182275_182350_182470_182559_182666_182915_183021_183231
853037	contig_7056_pilon	+	668	5	Intergenic	novelGene_43689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.11803398874989	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	97	549	903225	905410	FALSE	0	CCCTGGCTGCTCTCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPAAELQPGVDKTSAASPPTRQPSSSRAAGTMKDDIALLATITLLGVLLQAYFSLQVISARRTFRVSPPLTTGPPEFERVYRAQVNCSEYFPLFLATLWVAGVFFHEGAAALCGLVYLFARLRYFQGYARSAQLRLAPLYASARALWLLVALAALGLLCHFLPVSLRAELLGRLRTLITWT	903128	905529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_903283_904531_904632_904750_904822_904913_904996_905268
853038	contig_10864_pilon	+	902	3	Intergenic	novelGene_107135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAATCAAAGATGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533834	1542892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1534009_1536545_1536655_1542273
853039	contig_9415_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_109772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATGAAAAGAAAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1599249	1598308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1598300_1599200
853040	contig_10642_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_78750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTGGGGAGCCCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369088	1369889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1369100_1369900
853042	contig_4857_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_48655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGGAGGGAAAACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448987	449502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_449000_449500
853044	contig_6048_pilon	-	642	6	Intergenic	novelGene_73110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	1.93907194296653	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	58	501	669738	660774	FALSE	20	TCTGAGTTTTCGTGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRRARKRAEGGASSNVFSMFDQSQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKQDLRDTFAALGRINVKNEELEAMVKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGTDPEETILHAFKVFDTEGKGFVKADFIKEKLMTQADRFSEEEIKQMFAAFPPDVCGNLDYRNLCYVITHGEEKD	669795	660632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_660873_661240_661290_663396_663476_668112_668218_669190_669267_669702
853045	contig_5153_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_74330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	244	555	588652	588341	NA	30	CACCAACTCATCGAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLKPKSQHVAPLLKTLLPSSGSQLMTCKLRTTLSPVTSLTSFPSSLPVYSAPASPYFLGQTRGMKPQGSLSRSRYPKLPPLLTFHLTLLSCPSFLLSTYDW	588895	587465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_587500_588900
853046	contig_9706_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_20988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTCCATCAACACGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418957	418372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_418400_419000
853048	contig_7285_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_143393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACAGAAGAAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229537	230835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_229500_230800
853049	contig_14514_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_137464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCGTAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30250	30712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_30200_30700
853050	contig_8241_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_157493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	48	413	464304	464669	NA	40	GGTACCGGAAGGGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAERVAVTGGARVGAMEPAVSLAVCALLFLLWIRVKGLEFVIIHQRWVFVCLFLLPLSLIFDIYYYVRAWVVFRLSSAPRLHQQRVRDIQKQVSGARIGSRAARAACARYEGPRSSQANGRGNTYADSGTRGCCIR	464256	465052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_464300_465100
853052	contig_5039_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_64885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTCTCCTTGGTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560871	561377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_560900_561400
853053	contig_7165_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_116871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCACCAGATGTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583261	584184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_583300_584200
853058	contig_8942_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_143203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410395	411111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_410400_411100
853059	contig_10904_pilon	-	798	7	Intergenic	novelGene_22640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	350.637871124422	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	36	389	515110	510240	TRUE	20	CTACAAGAGCGCGCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPGSAEPRTRTMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLLPRPGACLDLLLSPVLPRPQPAGPAHTHALHQCCPVAAHAEAGESGQ	515996	505042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_505184_507170_507417_510217_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
853060	contig_15092_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_57821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAATAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338724	338982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_338700_339000
853061	contig_3424_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_55600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319904	1318723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1318700_1319900
853062	contig_13412_pilon	+	628	2	Intergenic	novelGene_80023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGTGTACGTCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705059	707169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_705186_706667
853064	contig_5732_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_119595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCAGCTAGCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303299	302840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_302800_303300
853065	contig_10037_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_148967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCATGGAATCCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444159	442960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_443000_444200
853066	contig_990_pilon	-	422	3	Intergenic	novelGene_76054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGCATGGATAAACGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919540	914094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_914174_915743_915979_919432
853067	contig_7179_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_78076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGGAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496488	497090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_496500_497100
853070	contig_7057_pilon	+	612	3	Intergenic	novelGene_123193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	56	481	401608	410055	FALSE	5	TCCCTGGCTGGGCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPAPGLPGAGGPVVPGPGAGIPGKSGEERLKEMEADDFRIFCGDLGNEVNDDILARAFSRFPSFLKAKVIRDKRTGKTKGYGFVSFKDPSDYVRAMREMNGKYVGSRPIKLRKSMWKDRNLDVVRKKQKEKKKLGLR	401552	410186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_401726_409662_409858_409942
853071	contig_10354_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_50869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACCTTCAAGCAAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470166	469265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_469300_470200
853072	contig_12250_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_80729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTGTCTTCCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408475	408265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_408300_408500
853073	contig_11285_pilon	+	581	6	Intergenic	novelGene_5510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	194	580	550250	552031	FALSE	20	CTGAGGGGGGTTGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDSIKPGGDQDHIRGELMGNGHHHCPEGRQVLHVSDGGVHTSCPCHVHIVPHACPSANLFRCPTAWKEVPVVVAMQGDIEHRGVVVERLLGAIAMVDVPVHDEDLANIQLLLQEFCCDGYGVEEAES	549300	552032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_549323_549593_549726_550210_550331_550493_550591_550834_550956_551943
853074	contig_9127_pilon	-	761	4	Intergenic	novelGene_103003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.0720922897661	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	58	363	116927	96823	FALSE	30	CAAATTTTGTTGAGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFAITFKLYLEKYWPGKKMIKFFLMVNKQGQTRLSKYYEHLEIKKRTLLESEVIKSCLSRSNEQCSFVEYKDFKLIYRQYAALFIVVGVNDTENEMAIYEFIHNFVEVLDEYFSRVVIR	116984	96424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_96831_112228_112302_114352_114440_116789
853075	contig_7057_pilon	+	559	7	Intergenic	novelGene_123311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1067.46782413127	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCACCCCATTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936005	943695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937024_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941111_943618
853076	contig_2215_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_163839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTATTATTTGCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106899	107712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_106900_107700
853078	contig_990_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_76103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGAATGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1377432	1376855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1376900_1377400
853079	contig_14094_pilon	+	911	7	Intergenic	novelGene_145903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	481.862935790759	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	84	593	181946	275518	FALSE	70	GCATTAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCREPVGGPRSERGSLGGDRGVSCPKMHSDAAAVNFQLNSHLSTLANIHKIYHTLNKLNLTEDVGQDDHQTGSLRSCSSSDCFSKVMPPRKKRRPASGDDLSAKKSRHDSMYRKYDATRIKTEEEAFSSKRCLEWFYEYAGADDVVGPEGMEKFCEDIGVEPENVVMLVLAWKLDAQNMGYFTLQEWLKGMTSLQ	181862	275836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_181971_218500_218572_218751_218792_244345_244461_248134_248227_256789_256861_275422
853081	contig_8628_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_164433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTATTTAGTACAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644535	643330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_643300_644500
853082	contig_3382_pilon	+	943	4	Intergenic	novelGene_124142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.44948974278318	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	90	449	848014	851375	FALSE	25	GAGAGCAGTTTGCACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPTTHLQGPKIVWAAESRESGRVRGSDVMALFVSLGTGTLSAPSARGGVGVSRRLPEAVASVAVPASRCHQVDADSQQPPRDRVRLPQRVSSWRINEKTKTLNEMDCHSDCTNGLTHNSDHEDGPGPGSVSFVVRRVSMSQNQLDGT	846990	851869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_847046_847979_848133_850262_850336_851207
853084	contig_11978_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_62945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCAGATATATAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038556	1037888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1037900_1038600
853089	contig_753_pilon	-	898	3	Intergenic	novelGene_112954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_1	1.5	44	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	1166083	1165373	FALSE	30	GTAGGCACTCAACAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEIPHSSEIPVISCLEFLWDRPTLLVLGNEGSGLSQEVQASCQLLLTILPRRQLPPGLESLNVSVAAGILLHSICSQRKGFPAEGEREQLLQDTPESSATFKEPRVAQHPGLSSGSETERQNAG	1166084	1164850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1165546_1165783_1165904_1166001
853090	contig_6397_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_146285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATGCATATCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590806	590439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_590400_590800
853091	contig_14528_pilon	-	947	3	Intergenic	novelGene_111276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	150.5	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	217	729	192609	190953	FALSE	0	TGGCTGCTTCCTTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	195166	190734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192731_195071
853092	contig_9363_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_6654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	95	544	990767	991216	NA	15	ACTTTGACGTTTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEGSAAPAAATGLGDTPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMTVEHVECQNAGVGEVSGPLGGSGEGSEEVDEKPPQFVCRECKETFSTLTLLRRHERSHPELRPFPCAQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPRCPKGFLSASDLRKHERTHPVPIGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA	990672	991428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_990700_991400
853093	contig_7272_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_25325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGTTCAAAACCAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539686	540555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_539700_540600
853094	contig_7801_pilon	-	588	2	Intergenic	novelGene_169682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	49	585	516962	415989	FALSE	15	GATGCACCAGGTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSLASKSCVRLVEQHRSAWFFGFLVVGYLLYLVFGAVVFSSVELPNEDLLRQDLNKAKRRFLDEHECLTEEQLEQFLTRVLEASSYGVSVLSNTSSNWNWDFTSALFFASTVLSTTEVPVWHEQFLLDLLKAWWFKLTQQCHRRKVCRSASMKIIAKKTLWSRFYSATRGVVISQN	517010	415985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_-_416171_516607
853096	contig_8616_pilon	-	919	2	Intergenic	novelGene_72396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACCTAAAGAACAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199006	197849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_198586_198823
853097	contig_5935_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_102686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781637	782356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_781600_782400
853098	contig_12837_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_57382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAAAAGAAAAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379011	380241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_379000_380200
853100	contig_13780_pilon	-	602	4	Intergenic	novelGene_149027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	42.7421207813661	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTATGCCCTAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485432	468650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_468960_469482_469541_483206_483338_485328
853101	contig_5988_pilon	+	765	8	Intergenic	novelGene_16035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.2399776785471	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	14	667	839554	845188	TRUE	20	CATGAGGCCCGCCTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLQATKDPLPRGVSPTPSKIPILSQRSLPLSTSKPCALDQENQDPRIPPSERSFHSSTRPNFLELRRVTGGSNRTSVSQASGLPVETPSQPASCLPEGEREVVTHSDKGRGGPLCLAQRVPLRETHTKDSRDSHLMPSPAPVAQPMPGRMVPPTVTRPSPFGWAQRVPSPHLSAPTSYSVLRHLAIHPKTQFTPIPRVKQVREGRGALLFTHSSL	839540	845555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_839698_841088_841172_841624_841678_842123_842234_843459_843601_843707_843802_845159_845210_845478
853102	contig_12180_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_160351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCACCTTCAACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97129	96322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_96300_97100
853104	contig_20028_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_170645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATAAGGAATATGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10144	10736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_10100_10700
853106	contig_4305_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_136650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACATTACAAAATATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52294	53306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_52300_53300
853107	contig_9415_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_109879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAACACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049509	2048304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2048300_2049500
853108	contig_7097_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_174451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	156	449	516862	517155	NA	20	TCTCTGCTGTGTGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHHLPTALLQPNGLHASESTPCRLSTTSEVPPAHGSALLTATFAHADSALRMPSTGSVAPCVPPLSTSLLSLSATVHAAAAAATAAAHSFPLSFAGAFPMLPPNAAAAVAAATAITPPLSVSATSSPQQTGSGTNKPYRPWGTEVGAF	516706	518435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7097_pilon_+_516700_518400
853110	contig_15219_pilon	+	420	3	Intergenic	novelGene_40845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	118	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTGTGTGTGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61012	64291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_61077_62372_62449_64011
853111	contig_9177_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_32818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGTGCAATGAAAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651451	1652862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1651500_1652900
853112	contig_6397_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_146284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTAAAAGTAAAGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588898	587317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_587300_588900
853113	contig_12278_pilon	-	1005	6	Intergenic	novelGene_152605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	7	666	243519	241873	TRUE	30	CTGGAAGCAAGTGCAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCEGHASPAAAATSAWPVAGGWSSCPLAFARFRCSFCSFWTCLGSLGLALESGTGASRGRRMDGEVCRASRRPGSASRMALAPCSRGEEQHCSSPRVSCQRRNWMRCSRSIWRSVTGNSTTSWTRKASCMILGLRLRSRSMVSYWPWQALSFSGEPSACFSSTSPTRKMILTTFTKEHVPDAQHRAPGQGAGKDTHEPLCHVQQWVNLLPAEVLVGHG	243525	239989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_240095_240809_240925_241010_241079_241821_242015_242100_242252_243152
853116	contig_4156_pilon	-	901	3	Intergenic	novelGene_88076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	34	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	240	575	169307	161269	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLSALQVKLAEPGKSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYEVICQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQEDLLLFSCAGAHPRHQRICPCRDFIKGQVALCKDCL	170929	160942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_161468_169170_169329_170711
853117	contig_14454_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_161870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAGTCTAAGAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26024	27533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14454_pilon_+_26000_27500
853118	contig_5346_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_161851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTTCCTGCAGCCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132462	133042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_132500_133000
853119	contig_3862_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_137435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAGCAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639895	639404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_639400_639900
853120	contig_4392_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_117325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475033	474847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_474800_475000
853122	contig_6496_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_103531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGCTTTTTAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985056	984227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_984200_985100
853123	contig_299_pilon	-	999	3	Intergenic	novelGene_129526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	4.5	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	98	394	1741293	1738793	FALSE	20	CGACACCCTGTGCAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAATPLYSAGSSPPLPLFSPSAAGGGGTFPFPMYNSPVAGMPAPATVEHRPLPKDYMMESVLVTLFCCLLTGLIAIVYSHETRAALSRGDLAQAEEASRKARSLVLFSLLFGVFVSTSWVIYVVVALYLP	1741390	1738187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1738943_1740309_1740454_1741290
853124	contig_13158_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_107293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143064	144020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_143100_144000
853125	contig_11396_pilon	-	230	4	Intergenic	novelGene_71401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3956	junction_3	462.318072326834	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGTCTGTGTTAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555122	1554267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554413_1554470_1554871_1554944_1555079
853126	contig_10235_pilon	-	799	4	Intergenic	novelGene_46570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.1708605701682	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	205	372	538358	537592	FALSE	25	GGGAGTTGAAGGAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKAVPTQPPGPPERGSVGQLQLYRHPDRSQPEFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNATVPPSLRKQPSPTPSNTTRGPLPAPAGSQAHQASHQPLYLSHP	538924	537164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_537726_538324_538410_538548_538661_538883
853127	contig_9836_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_176166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACAACCTGGATGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151866	152106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_151900_152100
853128	contig_13850_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_141170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCATAACAAAAGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88659	87941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_-_87900_88700
853129	contig_14553_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_124991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	62	715	5806	14421	FALSE	10	GTGAGTACCCCCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWTPGLPSRHIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDAEEGEFLLSFLQGLTSLSFELSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIQLNRKLTASSLSLDTASLSQLSCSLNSDSGLLQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQ	5744	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_5835_13796
853132	contig_7457_pilon	-	892	2	Intergenic	novelGene_31459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	459	875	482560	482047	FALSE	15	TCCAGAGCCTTTTTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIECGPVHTAFQEKLEGGLGGALDSADAKTRDLFSRYQRHCERVFREAAQDPEEVTEVFLTALRAQRPALRYFTTEHFLPLVRLRFDDSSGCSYVAAMRRAVFEDESAEGPESARVEPEAAGLGGSELGAPATAPQ	483018	482029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_482287_482383
853133	contig_8019_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_126991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159099	158399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_158400_159100
853134	contig_12620_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_98816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTATTGCCAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489052	488202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_488200_489100
853137	contig_11551_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_168483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTATCTATATGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608998	609405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_609000_609400
853138	scaffold_6394_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_111057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTCCTCCTTGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460802	461086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_460800_461100
853139	contig_7171_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_101225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGAAGTGGCTCGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680333	680818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_680300_680800
853140	contig_13037_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_155150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	2	631	66678	67307	NA	5	TGCTTGCCACGCTTTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGTPVSRHLDSSSLSPACPILQATVWTFKDLRLGCGVGDRDQGPGIPAGSWWCLGGLGNPGLGSWQDGLSQVVISPRGQNESALPSACLHGSRYSARSGISLLGSVRAAEGDSRLSSRGVALQKLTSTWRRGAQVGRLVDGTLEAVVTWLCTQYSRAQWALLALDAGGFGAVPSLVSYWAALVRVSGTRCQDFNFRGLLSDTGCQVSL	66676	68144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_66700_68100
853141	contig_18916_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_136876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTCGTAAACTTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29546	30391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_29500_30400
853142	contig_10082_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_63910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAAACATTTGCGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574254	573281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_573300_574300
853143	contig_8238_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_165237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGCTGAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67908	67207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_-_67200_67900
853144	contig_14450_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_49014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177863	1178725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1177900_1178700
853145	contig_6589_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_25951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGAGCGAGGGGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290233	1289992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1290000_1290200
853148	contig_11417_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_103251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATCCCTCTGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28753	29116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_28800_29100
853149	contig_8873_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_162900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCTGGGAATGATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368151	367307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_367300_368200
853150	contig_5649_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_82284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97070	96295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_96300_97100
853151	contig_12479_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_56852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGGATCTGCCTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310867	310318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_310300_310900
853153	contig_14483_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_133764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	449	793	117857	117513	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHVRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVHLSALVTEPRGAQAPPLPEHVACALVLEESLAQLAISRFTCLQDPDKKPKCVTLQMR	118305	117431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_117400_118300
853154	contig_13227_pilon	+	1209	7	Intergenic	novelGene_176075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.78713553878169	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	530	1141	7802	9118	FALSE	0	CCTTGTGTCTGGGTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMVVADLFSAGMVTTSTTLDWALLLMLLHPDVQRRVQQEIDEVIGQVRPPEMEDQARMPFTTAVVHEVQRFGDVVPLNLPHMTSRDTEVHGFHIPKGTTLILNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGRFVKPEAFMPFSAGRRSCLGEPLARMELFLFFTCLLQRFSFSVPPGQPRPSDHGVYAFLVTPFPYQLCAVPR	6767	9186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13227_pilon_+_6920_6994_7156_7414_7592_7762_7905_8072_8261_8697_8840_8939
853156	contig_3787_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_102387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGTATCAGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437841	436398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_436400_437800
853157	contig_7521_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_160535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGCACATATAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193966	193159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_193200_194000
853159	contig_5954_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_28747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295651	1295252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1295300_1295700
853160	contig_10013_pilon	+	493	4	Intergenic	novelGene_125084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_3	62.7180640290782	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	96	431	477429	479307	FALSE	10	GTCCGCAGCCATCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSGPSSRLERKERLEPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRKLWPFVSDPAPTPSSQAAVSARFGHWHKNKAGVEVRAGPRLIVYVVGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKTLDQKLEDIPLP	477333	479369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_477435_478243_478330_478470_478629_479221
853161	contig_19957_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_57738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAGAAGTTCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336803	337183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_336800_337200
853162	contig_9739_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_165082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7239	7994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_7200_8000
853165	contig_2710_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_161783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTGTATAGTATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954791	955431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_954800_955400
853166	contig_8195_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_170069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1062	1397	622348	622013	NA	60	TCAAATAAAAGGCAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISRSWLNGQGSERHGGLLPSSHCAHGHSQCGFYVRSGVGARPVCSTGVHHVDSSRWPQAAWMVGEREGAESVTGSRENGRIRGKKGERRSGQHAPPPRVLLTVYFMQH	623409	621852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_621900_623400
853167	contig_4845_pilon	+	1192	7	Intergenic	novelGene_53642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	70.8341176427166	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCCCTCGCCCGGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307824	492457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_307982_355117_355374_356325_356510_357872_358046_358990_359058_359620_359760_492241
853168	contig_20241_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_159751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCTCGGAGAGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267593	267316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_267300_267600
853169	contig_18637_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_81862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTGCCACATAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220866	220417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_220400_220900
853170	contig_11284_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_174903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATAGGCAAATGTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28714	27980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11284_pilon_-_28000_28700
853172	contig_501_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_134896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAATTTTTTTTCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748010	748554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_748000_748600
853173	contig_4769_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_117950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTTAGTCTCTCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311235	312178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_311200_312200
853174	contig_15545_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_120129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26254	25631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_-_25600_26300
853175	contig_2455_pilon	+	1284	10	Intergenic	novelGene_119239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	28.7170100579198	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	301	1251	1493186	1502534	FALSE	20	CGCATATTGTCTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISQHQFYLDRKQSKAKIPSARSLDDIAMDLTETGTPRVSKLVSLEAKNQLIMASNGSLISSGSQDSEVSEEQKREKILELKKKEKLLQEKLLQKVEELKKICLREAELTGKMPKEYPLSVGEKPPQVRRRVGTAFRLDDNLLPSEEDPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLAREPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKKLQEIENAINEYRMRCGKKPSQKATVILPEDIIPSESSSLSDTTAYDDPNDSFTLAGQRSSSVPRSPRILPPKSLGIERIHFRKSSINEQFVDTRQSRWKKIKRNILQYVKIWNLNCSVHK	1490084	1502567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1490217_1491514_1491592_1493094_1493234_1493867_1494010_1494984_1495119_1495212_1495333_1496495_1496725_1500063_1500121_1501407_1501556_1502461
853178	contig_7843_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_151999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGCTGTTAGCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12715	12388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_12400_12700
853179	contig_19012_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_159478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATATTTTCTGTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37285	38577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_37300_38600
853180	contig_13645_pilon	-	616	6	Intergenic	novelGene_146162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	73.4040870796715	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	44	409	23717	13998	FALSE	55	GAAGTAAAGATGTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLEQAEDLKAFERRLTEYIHCLQPATGRWRMLLIVVSVCTATGAWNWLIDPETQKVSFFTSLWNHPFFTISCITLIGLFFAGIHKRVVAPSIIAARCRTVLAEYNMSCDDISCVHSTSS	23760	13790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_14028_15103_15159_15278_15389_19509_19584_22530_22603_23692
853181	contig_7909_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_155908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGCACTTAGCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444285	445195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_444300_445200
853183	contig_6102_pilon	-	697	3	Intergenic	novelGene_32405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAGCTGCCAGCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1824828	1816896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1817307_1823941_1824112_1824711
853184	contig_4924_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_84740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGATAAGGTGGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147926	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_147900_148600
853185	contig_6975_pilon	+	948	9	Intergenic	novelGene_74277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1.61535599791501	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	146	889	199847	211418	FALSE	60	AAAGAGAGAGAGAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSETAFIRKLHPTDNFTQSSCFGLRWFTPTTEVSLCGHATLGSAAVLFHKKKNVNSTLTFVTLSGELKARKAEDGIVLDLPLYPAHPLDFQEAADLIKTAIGDTLVQDICYSPDTQKLLVRLSDTYDRSFLEGLKVNTQDLLQVENTGKVKGLILTLKGEPGGQTQAFDFYSRYFAPWVGVAEDPVTGSAHTVLSSYWSQQLGKKEMRAFQCSQRGGELVISVRADGRVDIRGGAAIVLEGTLTT	187199	211477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_187306_199807_199908_200279_200379_203539_203650_203736_203767_207052_207142_207392_207572_209547_209611_211305
853186	contig_12250_pilon	+	575	6	Intergenic	novelGene_80603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6.28012738724303	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	335	478	334357	334673	FALSE	10	GATCCTACCCTCGTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVFDLDYTLWPFWVDTHVDPPCHSSGDGTVRDSRGRTIRLYPDVPEILERLLGLGVPVAAASRTGEIEGANQLLELFDLVRYFVHREIYPGSKVTHFQRLQQKTGVPFSQMIFFDDEKRNIVDVSKLGVTCVHVQNGMNLQTLTQGLETFAKAQVGP	333405	334770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_333426_333541_333603_333675_333787_334118_334227_334322_334409_334581
853187	contig_10196_pilon	+	775	5	Intergenic	novelGene_132269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.08220700148449	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	369	668	2005910	2006290	FALSE	15	CCCCTGCCTGTAAGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALHGEVLRARAGSQGRLETLDRWYREELPAAIGGRAEKHVTRDELERLLAWKLARGRFRPRLQQLVASNPPELVVQCSAAAFRLLPDVLAAVTELCALRGVGPATASAVLAAGAPEAAAFMSDEAVAAVPSLSALQYTLQHYQLYLGQVQERAAALNRGSLCSFPVSVSGPWTPHLVETALWTWAVGQQLCPGVLPDLGPGTANVGDTRPAKRRRTQTD	2005074	2006397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2005151_2005288_2005383_2005562_2005723_2005871_2006025_2006105
853188	contig_1925_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_162207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAACAGAGAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140382	140850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_140400_140800
853189	contig_18916_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_136877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32256	32969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_32300_33000
853190	contig_6557_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_32930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATCATTTGCGACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195943	197007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_195900_197000
853191	contig_6048_pilon	-	2442	1	Intergenic	novelGene_73365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	640	951	3073499	3073188	NA	30	GGAAACTTTGTCATTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSALGWCFGSLVRYGFHPEAQEEVFLAPLHFLMQLWERIEAVASLDPDAQGTSSLHSSCEVGSGLMDPRGCLRRVQLRRNVGLELGDPGSFPVNAVHCLRF	3074138	3071696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3071700_3074100
853192	contig_13744_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_77199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTATCATCAAAACCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1032019	1031466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1031500_1032000
853194	contig_4125_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_25270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCAGTGAGTCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3303425	3304124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_3303400_3304100
853196	contig_11370_pilon	+	997	6	Intergenic	novelGene_98703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.2614551505325	75	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	44	748	109733	113969	FALSE	10	CATATGTGTCTTTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRKLSPAIQPSPVMQVPEDGDNFIPFAKCSRVVSRSPPPSLPSQDLRMMPQRYGDIFWENLSQRPSSIWMEEQYIPPMLRAIGCSHAGLFTPEGLPPPEMLCRRKRRKPRLAGVQQGPGGTPARVKAVTYHLEDLRRRQGIIDELKKAQWSSSGATSEPLVFGEEGPGFLDTTEYPDLEEERAACLREEDHFLTPGRAQLLWSPWSPLGQESSCLSRGQSFLASYGTVTASRRQLYGPWGMEFESEE	109689	114218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_109777_111790_111905_112511_112552_112807_113002_113454_113621_113822
853197	contig_5964_pilon	+	508	2	Intergenic	novelGene_80371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGCCGTTTTTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380521	382594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_380568_382132
853198	contig_2646_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_69701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCCACCTCACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2508292	2507840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2507800_2508300
853199	contig_3787_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_102384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422201	421953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_422000_422200
853200	contig_1847_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_171726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	53	355	53718	52197	FALSE	35	CAAAGAATCTTTTATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVIGPNRAPSLTDKVQMPYTEATIMEVQRLTVVVPLAIPHMTSVKTVLQGYTIPKGTMVIPNLWSVHRDPAIWEKPDDFYPNRFLDDQGQLIKKETFIPFGIGQLNFLKVIINKTVE	53770	52194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_52409_53627
853201	contig_1406_pilon	+	540	4	Intergenic	novelGene_25605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	30.739045022396	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	111	521	2214556	2227213	FALSE	75	ATCAACAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPLPTLSGSPIAGRDHRFTQAVVSISAPTGDWGRAMAEKTRKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAHPDNITPDAGDSEPKPMIIGTNNVFEVGCCILYINLNHSQLPVSTNSLPTENVIIYLSKRVTFLGLDHQAL	2214445	2227232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2214579_2218160_2218226_2225347_2225454_2226996
853203	contig_10627_pilon	+	1062	5	Intergenic	novelGene_60047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	5.49431524395898	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	119	835	1009749	1049669	FALSE	25	GACTCATTCGATTTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHEAKERQKFVSDAQYLRDIQHKEDSEYQACLRRQEYRRDPTEKKRDQYRGQDTSFERSRFSSGSSSRQSSAEEDPLAEPRLSAKTSSIKCDSKLPAIDQTSVKQKHKSTMTPKKPEKAGPSKPCPGDSSEHPLFCVEYSPYCTVFALSPVPQPDTDYCCLLLPLVPPVPRLARDPPTSLPPVAFPSFTSPPAFSPGPVPQSPAALCYFPISSPTPTETPVLCLPGPRRPSKIYLVW	1000816	1049896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1000918_1009731_1009839_1020986_1021107_1040493_1040666_1049334
853205	contig_5302_pilon	+	875	7	Intergenic	novelGene_81394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1091.09309359417	15	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	317	763	155422	170054	FALSE	40	AATTGAATTAGTGGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSIKLQSSDGEIFEVDVEIAKQSVTIKTMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEEEEAQVENQWCEEK	152099	170166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152189_152643_152871_155421_155519_161142_161217_167388_167494_169186_169332_170028
853206	contig_12603_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_105819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_2	107	3230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	729261	731030	FALSE	15	TCTAGTCTAGTTGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGYEEAGGLVSSSKPSSGLTPSSPPAFQPLASPSSKWTPTAPALLVTPVSALVPANAKSADALPARRAAAPAAPWAVPSAPRAASAKGHLTSAAAAPDVGEPCPDVNRATCRKPEFSFHTTNPDPFDTFHFL	729260	731064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_729396_730018_730085_730832
853207	contig_4059_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_140586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAACATAATACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176818	175781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_175800_176800
853209	contig_7331_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_67232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468505	469142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_+_468500_469100
853210	contig_20844_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_78618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCCCAGGCCCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231881	232688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_231900_232700
853211	contig_10627_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_60066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAAACTTCCTTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312910	1313403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1312900_1313400
853212	contig_10475_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_148717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAATAAAGAAACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19538	19010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_19000_19500
853213	contig_14133_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_119984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATACGCTTTACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281560	280457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_280500_281600
853218	contig_7630_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_133640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	136	471	420295	420630	NA	35	AATCAAGAGTATCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSVVWQLCNDVVRQLCNDILILRDVISQSVIRGVSLGVCPASNIYMDILAKLAHLLWILYHPAHHHLTSGSWDLSQQPAILPADLGIHWPPQPVANSLPSYLPVLDLSASAAREPAAYCMTCQSWICQPLQPHESEEASSLTPDPWTWNLPASTTA	420159	421123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_420200_421100
853220	contig_9345_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_24460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	35	397	490255	490617	NA	40	AACTGTACATGTAGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNSRQNNLSLMAWSNRGKRVKNGRRKCNVWLIASMNNCLLFHEIRTGCCPATITEYFDQRVYRRILIKRGKILNRISNCYGLQTFWSHGGWMNPQNYCLKTIFKNLKPKTPPGVNLKPKKFSLTSKKGLP	490220	490788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_490200_490800
853221	contig_2455_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_119217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAGGACAATCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368247	1367023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1367000_1368200
853222	contig_1093_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_139986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGGGAATGTGATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737975	738396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_738000_738400
853223	contig_11846_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_105919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCTATGCCTGCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149860	149262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_149300_149900
853224	contig_9995_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_47718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGCAGTCAAGAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372301	371481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_371500_372300
853225	contig_13481_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_119336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAACGAATTAAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339262	340112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_339300_340100
853226	contig_11709_pilon	+	1430	5	Intergenic	novelGene_168220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	167.657388742638	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	99	1052	62966	76309	TRUE	55	AAACCAAAATCAGGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDVYNMQYGGQQQEMYSQYGSSYSGPDRRPLQGQYPYPYNRERMQGPGQMQAHGLPPQMMGGPMQAASGEGPQQNLWAARNDMPYPYQNRQGPGGPAQAPPYPGVSRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSHRQPYMPSSASMQPITRPPQSSYQTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPAVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPPGSVEASQPVLKQRRKITSKDIVTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDSTVATFNLSQVSHFPEELRNFTLDSAS	61226	76763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_61310_62950_63735_65859_65998_76262_76379_76454
853227	contig_6871_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_21679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGAGGAAACAGGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998184	999470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_998200_999500
853228	contig_12520_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_161075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	50	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAATATACACAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509184	510417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_509770_510080
853230	contig_4202_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_147072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	258	419	45651	45490	NA	35	CGCAAAGCATCCAGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSYPLFLSPSPFSWSTDPLLTFLPFLPRLDSLHLKYSFLKVLILLYPPLSPAQDLSSHSLLCSCPKHPEENGTPPHREEHHWRFMVFPLPSLSFFSTAENIRLVVQWLRAQLLTKRLAVQIYQLLPGNPLGQFYSVL	45908	45030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_45000_45900
853231	contig_3818_pilon	+	987	1	Intergenic	novelGene_99215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACCAGCATGTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202217	203204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_202200_203200
853232	contig_11056_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_130401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTTTTATGTTTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651721	652345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_651700_652300
853236	contig_20507_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_164207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGCCGCGTTGCCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121534	122074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_121500_122100
853238	contig_12919_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_75872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAACAAATTAGAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306742	307343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_306700_307300
853239	contig_5023_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_7374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGAGGTTCGAGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628685	628968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_628700_629000
853240	contig_11396_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_71446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGAGCCCCCTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1795602	1794525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1794500_1795600
853241	contig_16103_pilon	+	376	3	Intergenic	novelGene_118713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGGGGCCCGTCCCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198401	199920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198555_199041_199206_199861
853242	contig_13447_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_176315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21182	21864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13447_pilon_+_21200_21900
853244	contig_9297_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_69860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGTGTTTTTCTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855080	854145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_854100_855100
853245	contig_9679_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_173416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAAGTGACTGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127399	128762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_127400_128800
853246	contig_18647_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_162840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26478	25346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_-_25300_26500
853249	contig_3654_pilon	-	400	4	Intergenic	novelGene_174984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_3	25.2498624858742	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	33	398	95878	71120	FALSE	30	TAAGTTGGGAGTTGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLTHEYTVETMVVADANMVQYHGAEAAQRFILTVMNMVYNMFQHQSLGIKVNIQVTKLVLLRQRPAKLSIGHHGERSLESFCHWQNEEYGGARYLGNNQVPGGKDDTPPVDAAVFVTRTDFCVHKNEPCDTV	95910	71117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_71163_82898_83057_83805_83890_95797
853251	contig_11448_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_66371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGTCCATGCCAGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286136	285141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_285100_286100
853252	contig_8864_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_135989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTGGAATTTGATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269100	270623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_269100_270600
853254	contig_16622_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_48515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGTATTACGTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214414	214905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_214400_214900
853255	contig_13481_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_119374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGGCTGGGTTAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491181	492020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_491200_492000
853256	contig_4364_pilon	+	660	2	Intergenic	novelGene_147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214585	1215542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1214672_1214968
853259	contig_8069_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_136768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCAAAAAAAGAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173687	173347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_-_173300_173700
853263	contig_11096_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_143471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAAAGGTTGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230900	229946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_229900_230900
853264	contig_11551_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_168458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCAAACATAAAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333264	334062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_333300_334100
853265	contig_9696_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_68788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATCCCAAAATGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219543	220158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_219500_220200
853266	contig_4908_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_117383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTAATGTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264568	265684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_264600_265700
853270	contig_14970_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_45035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATAAATACCTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181572	182646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_181600_182600
853272	contig_19261_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_177748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTGGGAAACATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7536	8175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19261_pilon_+_7500_8200
853273	contig_15114_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_121209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907121	906727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_906700_907100
853274	contig_6102_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_31750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237365	236579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_236600_237400
853275	contig_8885_pilon	+	808	2	Intergenic	novelGene_115578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	307	807	222558	223058	FALSE	20	TCTCCACCAGCTACTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMVWKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPN	141997	223059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_142114_222367
853276	contig_6102_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_31996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCTAGCGAAGAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440648	439312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_439300_440600
853277	contig_16503_pilon	+	856	8	Intergenic	novelGene_162066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	136.664343766554	97	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	95	787	123420	147658	FALSE	15	CTCAGCCTGCCACAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSDADWGGSRCRWACSAEQKPEPTGSSRTSRMGSACIKVTKYFLFLFNLLFFILGAVILGFGVWILVDKSSFISVLQTSSNSLRVGSYVFMSVGAFTMLMSFLGCIGAVNEVRCLLGVYFAFLLLILIVQVVAGTVFYFKTGEVKQEMGNIVMELIRNYNSSHNNSAQNTWDYVQAQVHCCGWVSFQNWTENAELMSSTNITYPCSCKDKKQVNDGPVMGFCQLPSNSTVIGNDPEYWPFLVRQFSVPPGVEWVRLCLVGK	92071	147727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_92146_123399_123483_126886_126960_131755_131881_132016_132092_142977_143080_145454_145641_147589
853278	contig_18113_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_137514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTTTAAAAAAAAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33696	34019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_33700_34000
853279	contig_13211_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_123137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104894	104109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_104100_104900
853280	contig_10196_pilon	+	395	2	Intergenic	novelGene_132228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGGTAGTCAAGAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413317	1413976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1413344_1413607
853282	contig_3269_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_117045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGGCTGACAAGGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235282	235818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_235300_235800
853284	contig_6488_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_44742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCTCCATCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82326	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_81700_82300
853285	contig_15146_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_116928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATGGCCGAGTTTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44318	44838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_44300_44800
853288	contig_8729_pilon	-	600	2	Intergenic	novelGene_40080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	422	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	69	377	78111	77803	TRUE	15	ACTCTGATGTTTTTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGAGRTLPRIQARALPSPPEARLPAGSEEELYDCLDYYYLRDFPACGAGRSKGRTRRERELRTNRPVPGGHERKIAQKLLNGQRKRRQRQLQPRPRTRLA	78179	76920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_77138_77796
853290	contig_7135_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_136948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAGAAAGTAGGATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234570	235240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_234600_235200
853293	contig_20742_pilon	+	642	2	Intergenic	novelGene_150672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGTCTGTAAAAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213494	216123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_213793_215779
853295	contig_13525_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_145086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATTTCACCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58054	57282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_-_57300_58100
853296	contig_6266_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_171005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAATTGAATATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816077	815273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_815300_816100
853297	contig_20596_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_157230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAGTGATGTTTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77405	76412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_76400_77400
853298	contig_13901_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_146619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	3	422	2147	1728	NA	70	TAAAAAAAAAAAACAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGGKRAQVAAGGGGGNADARASLPEGIGEPQRQPSPPSWKERKIRDWALASTGQSDASGWGRKPVSLTAAQPSVSGVFSSPFAPLLLSSRCCPALPSVRALVVLLPPPLPSYLLAAVPVGANVRGPEIACGQALQHQP	2149	1163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_1200_2100
853301	contig_6576_pilon	+	835	4	Intergenic	novelGene_42362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	38	598	820831	825972	FALSE	40	CTCTTTATAAATAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASRAPSSGPPGMDPQAAGAQALGAAKLPRGLPPPSAREAPPSLGIGFAAFDRSHQMERETGKATDRLARGAQSIPNDSPVHGEGAHCEEEDFALDDEDSDGELNAWELPEGVSGCLPKEQTADLFNEDWDLELKMDQGNPYDADDIQGSISQEVKPWVCCAPQGDMVYDPSWHHPPPLIPHYSKMVFETGQFDDAED	820793	826209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_820930_823166_823237_825080_825303_825802
853302	contig_13760_pilon	-	781	5	Intergenic	novelGene_61280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.92028643696715	61	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	31	630	138342	136846	FALSE	15	GCCGCAATGGTCCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWCVLEPRPPGKRWLVAGLGNPGLPGTRHSVGIAVLGQLARRLGVAESWARDRRCAADLALAPLGDAQVVLLRPRRLMNANGRSVARAAELFGLTAEEVYLVHDELDKPLGKLALKLGGSARGHNGVRSCISCLNSSAMPRLRVGIGRPTHPDAVQAHVLGCFSPAEQELLPPLLERATDLLLDHIRERSQGRPMLGI	138372	136694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_137032_137138_137185_137346_137447_137692_137913_138294
853303	contig_19416_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_175524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGTGAATTGTCGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34771	33357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_-_33400_34800
853304	contig_1435_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_115469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTGCCCGCTCCCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282736	283014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_282700_283000
853305	contig_4426_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_15360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75040	75917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_75000_75900
853306	contig_7945_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_161606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTGGATATTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435029	435617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_435000_435600
853307	contig_7945_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_161607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGCAAATGTGAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435777	436236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_435800_436200
853308	contig_10940_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_49209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGAGAACTACTCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828607	827852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_827900_828600
853311	contig_5549_pilon	-	345	7	Intergenic	novelGene_81648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	162.566311256532	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGGAAAAGTGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445632	441969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442535_444483_444522_444722_444755_444949_445003_445604
853312	contig_16103_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_118709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCAAGTCTACACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199108	198316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
853313	contig_3818_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_99264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTGAGAGCTCCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531761	532249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_531800_532200
853315	contig_15508_pilon	+	936	2	Intergenic	novelGene_177654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCTAGATTAACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107993	108971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15508_pilon_+_108420_108461
853316	contig_18364_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_102589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208932	209459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_208900_209500
853319	contig_821_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_149394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAGCACAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153303	153708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_153300_153700
853321	scaffold_13505_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_111417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	183	455	336743	336471	NA	10	GATGTGCTTTTGCCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTETSLQVHRRIHTGERPYPCPDCGKAFRQSTHLKDHRRLHTGERPFACEVCGKAFAISMRLAEHRRIHTGERPYSCPDCGKSYRSFSNLWKHRKTHQQQHQAAVRQQLAEAEAAVGLAVMETAVEALPLVEAIEIYPLAEAEGVQISG	336925	336207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_336200_336900
853322	contig_7045_pilon	+	595	4	Intergenic	novelGene_77416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.16024689946929	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAAAACCCCCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146439	169158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_146529_155826_155959_160941_161097_168939
853323	contig_6375_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_72919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	40	387	9927	9580	NA	15	ATCATCTCTCATCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFRNVSWRLESIVMSASVVSVITRFLEEYLSSTPQRLKLLDAYLLYILLTGALQFGYCLLVGTFPFNSFLSGFISCVGSFILAGNDSIRNRNNNVLLWCVAFYSHNTPFYIRPPPHEALGRAYLVVVL	9966	9369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_9400_10000
853325	contig_11248_pilon	-	483	4	Intergenic	novelGene_142552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	258.210508435785	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	91	483	294216	285286	FALSE	65	GAAGAAAGAGAAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAGEVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQKEI	302272	285285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_285439_290108_290226_294093_294235_302200
853326	contig_5812_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_167495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACCCAGCAACTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126495	126235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_126200_126500
853327	contig_2799_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_85486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGACCGCACACTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513395	513780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_513400_513800
853328	contig_9888_pilon	-	638	4	Intergenic	novelGene_162279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.4031038161234	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	103	375	227903	224845	TRUE	35	CAAGGTAAAACTGGCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKAGTDWIGTREDWENISRRPGRLALGSQAALSEMERREARAGRPAANAHPETLRRADGQETHVVIRGQSNTRPLGRTDWAGQHWTGETLCAMSGQSIARETSVNTSQSHHDSPLTVNPHSTIL	228005	221008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_221269_224841_224914_227463_227598_227833
853334	contig_13995_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_164084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAATTCAGCCCAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19846	18425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_-_18400_19800
853337	contig_6278_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_119817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476742	477860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_476700_477900
853338	contig_6929_pilon	+	620	8	Intergenic	novelGene_139365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	491.776620934708	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	38	385	77977	90382	TRUE	0	TTGTTGTTTGTTTTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDISIGGQEVGRMKIELFADVVPKTSENFRKDGVPIGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGPSTNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFECSHRPQQ	77595	96481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_77621_77964_78030_78660_78706_79893_79937_85387_85481_88936_89025_90356_90447_96310
853339	contig_9186_pilon	+	915	7	Intergenic	novelGene_85353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	968.512949491814	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	444	752	477472	491002	FALSE	40	CATACTGTACAGACTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHRSGVKLHRLQTALSLYSTSLCGLVLLVDNRINSYSGIKRDFATVCQECTDFHFPRIEEQLEVVQQVVLYARTQRSSKLKESRDSGNRNGGSDDKTKNTDRNYLNILPGEFYITRHSNLSEIHVAFHLCVDDNVKSGNITARDPAIMGLRNILKVCCTHDITTISIPLLLVHDMSEEMTIPWCLRRAELVFKCVKGFMMEMASWDGGISRTVQFLVPQSISEEMFYQLSNMLPQIFRVSSTLTLTSKH	461764	491165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_461891_462735_462865_469614_469690_477358_477562_489510_489569_490169_490238_490909
853340	contig_7057_pilon	+	1142	3	Intergenic	novelGene_123187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGAGACTTGCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383523	385611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_384434_384734_384917_385561
853342	contig_11978_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_63146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATAAGTTTAACAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2035786	2037067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2035800_2037100
853343	contig_14684_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_99652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAGAGAAGAGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250608	250122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_250100_250600
853345	contig_2878_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_176500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTTTTTCTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284384	283679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_283700_284400
853347	contig_5620_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_161344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254382	255261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_254400_255300
853348	contig_10732_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_114749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGTCACAGCATGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567376	566482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_566500_567400
853349	contig_2854_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_120895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAGAAAAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169172	1169879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1169200_1169900
853350	contig_19735_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_167889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147416	145876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_145900_147400
853353	contig_50_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_122229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCCACAACTTCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118258	117153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_117200_118300
853354	contig_987_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_72272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAGAACGGGCAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491595	490589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_490600_491600
853357	contig_5918_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_99495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATAGGATGTATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212352	211563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_211600_212400
853358	contig_593_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_101994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297332	296661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_296700_297300
853359	contig_4364_pilon	-	883	2	Intergenic	novelGene_4592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGGGAAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2150946	2149199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2149790_2150653
853361	contig_5590_pilon	+	623	2	Intergenic	novelGene_163068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	138	386	988404	988652	TRUE	40	TGAGTACCACAGAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRYEPVGGRFCVCRSQAWSGRRCSPPGLRALPLLSCAVLTSYSWAMPRASRRSRCPATRPLSCSWCCSCHRRRFPVVAAVAATAPPPRHLLGEPNPPGTCPPGPQLLSACGGLESRLGELDIGLSVH	988266	1002148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_988656_1001914
853362	contig_9008_pilon	+	919	2	Intergenic	novelGene_58621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	221	544	125683	126006	FALSE	65	AGAAAAATATAAAGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPHCCLFTLVASVIVPAAFILEDVDCYQMDLLEANHSSSNASFPPSFELSAGSHPGNDVIIAKEGASVSIECLLTVGHNEDVHWYNSRGQQLDDRDRGNCCCVPSS	112606	126381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_112658_125513
853364	contig_11505_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_140915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCTCGAGTTACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39138	38689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_38700_39100
853365	contig_9527_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_134025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAACAAGAAAAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52768	53989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_52800_54000
853368	contig_8898_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_137258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339341	338176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_338200_339300
853373	contig_11677_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_85892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTTATTTCCGCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414338	413833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_413800_414300
853374	SIRV5	+	355	3	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	2	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGGTTTACCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2207_2316_10884
853376	contig_12292_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_167030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGACAAAGTCACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496072	497415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_496100_497400
853377	contig_7286_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_108722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACTTTGTTTATGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477972	476887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_476900_478000
853378	contig_7009_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_23687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791921	793546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_791900_793500
853379	contig_8276_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_174488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGGGAGAAGAACGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178644	179186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_178600_179200
853380	contig_8017_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_65361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTTTTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967455	966234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_966200_967500
853381	contig_13498_pilon	-	917	6	Intergenic	novelGene_176524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	22.3839228018683	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	86	835	211734	128243	FALSE	55	AAAAAAAAAAGTCTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNPFLDIPHDPNATVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVLKLKTADWRVLLFQAQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITSELAEHRSYPPDKKVKAKEIDEYKLKDHYLEFEKTRYDIYVSILKEGGQELLSNSESEGAGLKKSHSSPSLNPDSSPVTAKIKRNVSERKDHRPETPGIKQKVT	211819	128160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_-_128459_149727_149872_163231_163377_167667_167826_185107_185179_211718
853382	contig_5758_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_119075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGTATGATGTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96247	95911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_95900_96200
853383	contig_14687_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_107913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACTTCTGTAAATTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445307	445924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_445300_445900
853384	contig_8656_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_162366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTGTTCTCTGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650717	651044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_650700_651000
853387	contig_10437_pilon	+	551	5	Intergenic	novelGene_38228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	147.107741128739	322	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	80	403	318795	362078	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARKREASREEGDLMPPRMKNQEGSASLDLGSLH	318715	362226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_349796_349909_355625_355671_360481_360527_361981
853388	contig_20419_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_177749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCCACAAATAAACCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	1191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20419_pilon_-_1200_2000
853389	contig_8907_pilon	-	161	2	Intergenic	novelGene_85820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8678	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTAAGTTTGCTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178686	177975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_178039_178588
853391	contig_14322_pilon	+	189	1	Intergenic	novelGene_115638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAACGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331159	331348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_331200_331300
853392	contig_1996_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_131877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	259	738	141200	141679	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCAPPCGLFSSCASRALEVGLVLSPAYRGGQSAGVCPPPTTRHKSSLRQGSACAPTGPEARERGHILGPFCTGPRPWGEMLCPWLPACKALLCACSGPSSICLATFHCLQWEWDPPREPRSSSKLTDGAGAGALPMGAWGPPNPRHYLGLNVLGKML	140941	141703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_140900_141700
853394	contig_8059_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_111112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGCCCCAAGTGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253938	254648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_253900_254600
853395	contig_4519_pilon	+	631	4	Intergenic	novelGene_123668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	98.7803399242762	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAGAAAAAGAAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68241	78817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68480_70705_70919_77856_78014_78794
853397	contig_8476_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_121325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACAACAAAGCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62851	62253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_62300_62900
853398	contig_9463_pilon	+	474	6	Intergenic	novelGene_83852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.489897948556636	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGAGGGCGTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233549	241350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_233653_238560_238600_238786_238862_240652_240690_240844_240875_241160
853399	contig_4232_pilon	-	608	2	Intergenic	novelGene_63246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	498	584	314739	314653	FALSE	20	GAAGCCATTGCCATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAEEPEPAFPSVPEPRWFAHYDVQSLLFDWVPRPWGLGSHTEVVPGTPASTEDGAASSDLLLGAPGFVSELGGEGELGLGGPVSPPVPPALPNAAVSVLEEPQNRTLAYSLEHADLGAGYYRKYFFGKAPTWPNAGPAQNCPGPGGHLGRTGPSALLRNFLPVRRMCLALPPLPGPLSGDRFAPILSLFVNIL	322161	314628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_314850_321774
853402	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3022	11270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
853403	contig_8027_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_158842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295900	294812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_294800_295900
853405	contig_5500_pilon	-	439	3	Intergenic	novelGene_159645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	66.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGACGGTACATAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648583	633235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5500_pilon_-_633503_647064_647119_648465
853407	contig_12292_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_167029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACAGTGTATTACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495831	495485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_495500_495800
853408	contig_11285_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_5724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAACGAAGCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845510	844757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_844800_845500
853410	contig_3878_pilon	-	506	6	Intergenic	novelGene_174792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_3	42.8140163965027	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	25	504	270912	199649	FALSE	30	TCAGGTTGAAATCACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPPHPARMPKVKALQCALALEIRSVTCPGVVLKDKEDIYLSICVFGQYKKTQCVPPTFPLVFNARMVFEKVFPEAVDPGDVVAQLEYDTAVFELIQLVPPVGETLSTYDENTRDFMFPGPNQISGHHDSNRQVTMRRISGLRGIAPKMEFSTTSVITECLISSRKCR	270936	199646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_199724_222085_222211_223244_223287_246886_246936_248066_248205_270861
853411	contig_3878_pilon	-	639	5	Intergenic	novelGene_174789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_2	78.519105955175	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	47	577	194468	156689	FALSE	30	GCAATATTTAGTTACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSKSHSPSPYTKRRMCELSEDTRRRLAHLNLGPYEFKKETDKPPFVIRHVDPPSPRADALFGSSGRDCERDGWHRMHNDHSHHGCYRPKDYKLVRAPHGRDFDDSLERCDEYLNTRPCSKPQHSARTLLVHSAPSTTPKHSPSPVLNRASLRERFHSDWCSPSNCDEIHDRVKNVLKSHQAHQRHLYVSF	194514	156626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_156801_160651_160837_179586_179628_189035_189124_194363
853412	contig_8461_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_163924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAGAACCAAACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385131	385438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_385100_385400
853418	contig_6364_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_51856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGTCTGAGTTGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2063184	2063650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2063200_2063600
853420	contig_6102_pilon	-	1004	6	Intergenic	novelGene_32242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.85472369909914	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	313	762	1225634	1224575	FALSE	20	AAAGGTTTGGTCAGTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKNSLPSITILDNKWPPAPYKCFNTANQELRRLCHQWKCKKFRDQLSPEQVQVLKEKLCASELFKGKKASYPQSVPVQFRGDYIGLQGNPKLQKLKGGEKGPVLMAETVKKINRGNGKTSSRILLLTKEHVILTDAKKSRAKSVIGLDSVAEVSVTSLSDGLFSLHLTEMSSMGSKGDFLLISDHVVELLTKMYRAVLDATQRELPVTVTEKFSVKFKENIVAVKVIQGPGGGGNSQLSCKKKGSHGLEVTVK	1227060	1224332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1224702_1224974_1225103_1225273_1225427_1225592_1225726_1226434_1226542_1226946
853421	contig_10196_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_132277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATACTGGAGCTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2126689	2126417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2126400_2126700
853422	contig_5095_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_74948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAGCAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206185	205607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_205600_206200
853423	contig_19416_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_175527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATGCAGAGGTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46062	46499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_+_46100_46500
853426	contig_5947_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_101464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAAAACTCTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35868	36207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_35900_36200
853427	contig_6277_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_80385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35744	34686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_34700_35700
853428	contig_8291_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_99958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGTATTTTCCAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542968	541948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_541900_543000
853429	contig_9548_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_141061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACACTGGATCAGAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141869	141519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_141500_141900
853431	contig_6048_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_73324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGCACTTTGCCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270265	2269291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2269300_2270300
853432	contig_8276_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_174477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCACAGAAAATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141675	141985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_141700_142000
853433	contig_12327_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_140644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACTAACTGAATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182248	181034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_181000_182200
853435	contig_8284_pilon	+	917	2	Intergenic	novelGene_125673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAACCAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254819	256298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_255043_255604
853436	contig_7943_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_173132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85543	84170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_84200_85500
853438	contig_14023_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_165369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAGTTGGAAACATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166301	167752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_166300_167800
853439	contig_7179_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_78078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522392	521866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_521900_522400
853441	contig_14326_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_120661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	25	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAATAAACGTGCTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54914	79646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_54988_66314_66415_79520
853442	contig_13697_pilon	+	641	5	Intergenic	novelGene_165929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.5771644662754	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254335	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_254401_254726_254811_257483_257583_258050_258191_259883
853443	contig_15376_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_154689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATCTGAAGTACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214463	213986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_214000_214500
853445	contig_5549_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_81630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTACTCCAACAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434003	433353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_433400_434000
853446	contig_7707_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_72109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7331	7951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_7300_8000
853447	contig_1450_pilon	-	853	4	Intergenic	novelGene_27447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	5.43650214343336	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGGGTCTCCAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866916	767486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_767953_777900_777980_835932_836037_866712
853450	contig_14694_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_152461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCCCCTGACTTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24546	23155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_23200_24500
853451	contig_672_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_174850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80342	79703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_672_pilon_-_79700_80300
853452	contig_1625_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_174945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41368	41702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1625_pilon_+_41400_41700
853453	contig_10437_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_38219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAATAGAAAGAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250995	252092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_251000_252100
853454	contig_4686_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_118575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATATAAAACTGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751673	752136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_751700_752100
853455	contig_2646_pilon	-	1714	6	Intergenic	novelGene_69607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	3	junction_1	2.33238075793812	18	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	32	973	1782732	1780744	FALSE	15	ATTCTCTGACCCCGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNAASLKVIATAQSGLSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKDSFVSAGFASFDLVAQMTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV	1782763	1780002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1780853_1780950_1781107_1781207_1781402_1781491_1781642_1781752_1781969_1782615
853457	contig_3956_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_14720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTTTGAAAGGATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239780	240788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_239800_240800
853459	contig_5059_pilon	-	500	5	Intergenic	novelGene_140740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_4	366.917139828599	129	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	73	435	292591	276470	FALSE	15	CTTTCTTTTTTTAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRWQDSKEGSAEAAVPCRPSPAATMGIKFLEVIKPFCAVLPEIQKPERKIQFREKVLWTAITLFIFLVCCQIPLFGIMSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKREH	292663	276404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_276613_283551_283631_288493_288560_290235_290304_292584
853460	contig_19362_pilon	+	609	2	Intergenic	novelGene_157787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTCATTAAAAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24814	25517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_25037_25130
853461	contig_1443_pilon	+	874	4	Intergenic	novelGene_28250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	3.55902608401044	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	143	514	543109	549822	FALSE	20	TGCCAGAATTTGAGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGVKIGCLFSLLVLNLVCGLIPICFKWFQIHAATGRHCRLLSLLGCTSAGVFLGAGFMHMTAEALEGIESELQRFTIQNRTENGGNSSDAADSTQEKTRWRPPTDQEPAFHLCHQEIVL	542966	550182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_543224_543374_543506_543746_543798_549747
853462	scaffold_4805_pilon	-	1122	9	Intergenic	novelGene_161035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	27.0066542726047	100	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	176	880	555930	546452	TRUE	25	TAATTGTAGTTACTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DILNAGDKLTEVLEEADTLFNGVSRAREAALDAQFLVLASDLGKEKAKQLRSDLNSFDMLRYVETLLTHMGVNPLEAEELIRDEDSSDFELIVYDSWKISGKTAENTFNKTHTFHFLLGSIQGELPVPKPRVDRPKKVRTTEEQRAMPDQLKRMEESHQEATEKEVERILGLLQTYFQEDPDTPMSFFDFVIDPHSFPRTVENIFHVSFIIRDGFARIRLDEDRLPVIEPVNINEENEGVDHNTQIRHQGIIALTYRDWEVKLCMPPRRPSYPSCFALKPAPKHSVFSARRL	559416	545513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_545680_546375_546646_548097_548147_549367_549463_550528_550620_551336_551437_553345_553498_555906_556038_559348
853465	contig_826_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_154935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGTGCATTTCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17024	17650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_17000_17600
853468	contig_10627_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_60005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAAAGACAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321908	321478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_321500_321900
853471	contig_15866_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_63576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACTAAAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157210	156911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_156900_157200
853472	contig_1699_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_72807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAACAAATTAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30862	39647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_30928_31112_31267_39572
853473	contig_5967_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_44405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCCATAAGTGAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422938	422039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_422000_422900
853474	contig_8934_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_167254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACCCTTCAGCCAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816677	815820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_815800_816700
853477	contig_7635_pilon	-	924	5	Intergenic	novelGene_171374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	206	601	151771	140323	TRUE	45	AAAAGGTATTGAGACCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVFLLECLSGLEVLLAHACDGVGQIQPLVIGHMQRQQPRRPQLRSSAGRCCVAQHRRPQGWSALHSSQHGARSQTGLGMDMVLPWGSSGLTLRGQLLVVFRVQASVREWNYCRGSVHQFVELGYWILKQE	151976	138481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_138792_140309_140441_141027_141223_141954_142033_151766
853480	contig_2577_pilon	-	874	4	Intergenic	novelGene_172061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGAGGACATGTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168237	121767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_122334_137478_137535_160151_160270_168103
853482	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	11	346	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14419	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
853483	contig_13780_pilon	-	756	5	Intergenic	novelGene_149040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	26.7336398569293	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	6	518	603860	563292	FALSE	50	AAGGAAATAGCATGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMAAWRLRTKIFFPQLCRAFAGRRCQLAAERRDAAPGPVSRFCPPKTSCHDWIGPPDKYSNLRPVQFHIPEDESPLEQKLRELRQETQEWNQQFWANQNLTFSKEKEEFIHSRLKAKGLGLRTESGQKATLNAEEMADFYKGFLSKNFQKHMYYNSRYQAPALCWPRGPQC	603865	563053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_563341_575156_575248_580521_580586_581725_581924_603749
853484	contig_20629_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_177752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTGTATTTCCCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8560	7973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20629_pilon_-_8000_8600
853486	contig_14133_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_119910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	471	809	135898	135560	NA	35	AGGATTTGCTTTAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPIVVGSVNYSLITCIFQVRSKRRGLPILFPSLRRRRRRDRPWRPGRQIRSLETASVGLQRPPTWGRGHPDASGLLLHLKLKVGYTRRGQNQRLKFPTVWEPISKTYMMGY	136368	134788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_134800_136400
853487	contig_7119_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_40869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATATGAAAAGATAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74025	73382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_73400_74000
853490	contig_12050_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_62749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGTGTGAAATGCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689129	689848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_689100_689800
853491	contig_12050_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_62750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATATGTTCTGCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690056	690642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_690100_690600
853492	contig_8330_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_71838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	339	695	858627	858983	NA	45	ACTATGAAAGAAACACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLLIKQAGGGPLVQPMLCRSSRGQLHLNSRVRTWKVACVCSSSPYCPSSHHSLPPSPVQQPPCLLQSTLSAHSQTNSETRPFHPYVNTNCMLTLEFSSEQDRPLWRSQLGRQTSIK	858288	859011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_858300_859000
853493	contig_9375_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_136057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATGGCTGTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232400	233310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_232400_233300
853494	contig_14679_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_174191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTAGGGAGCATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249163	248288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_248300_249200
853495	contig_10990_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_7494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTACAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717106	716585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_716600_717100
853497	contig_2215_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_163831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20360	21111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_20400_21100
853498	contig_15114_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_121166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	310	411	195307	195206	FALSE	10	CCTAGACTTCGGTCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRVSACAHSRQCQFRGWLRTLRRTKGSEAAWLRAAGQRQPPTVNLAEKQNQPHTCISERGLSASPHSSGRGRPDPNPLPPSRLQLRATACSQNETWPGYSVFMILGAWESIAATIMAVSLIEGPLVFADLLLYQP	204821	195197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_195383_204587
853499	contig_13510_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_164197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACAGCAGTGGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56990	57304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_+_57000_57300
853501	contig_13004_pilon	-	951	2	Intergenic	novelGene_112738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGAACATCTGTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941144	930663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_931151_940680
853502	contig_3382_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_124085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	270	353	525426	525509	NA	70	AATGAAAAATAAAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGSGLPGSAGFAGSFSCTVPAPSQWTKDKDRRIGKGRRRLLSPALGQLCYCPLQPAWDWSPSGGAELLRPCPGGQLSPATACPTPWVPMARPHSVLARGFCGADTSSFLTWSVAT	525156	525586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_525200_525600
853503	contig_3382_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_124124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAATAATTTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736062	736944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_736100_736900
853505	contig_2924_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_140255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGCACTAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59959	59574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_59600_60000
853506	contig_7068_pilon	-	999	5	Intergenic	novelGene_177753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	6.89202437604511	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	237	971	71306	53253	FALSE	55	AGAATCTAGTGTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERRANQKLSSKSIMDSNQNVKCKIVVVGDSQCGKTALLHVFAKDCFPENYVPTVFENYTASFEIDTQRIELSLWDTSGSPYYDNVRPLSYPDSDAVLICFDISRPETLDSVLKKWKGEIQEFCPNTKMLLVGCKSDLRTDVSTLVELSNHRQTPVSYDQGANMAKQIGAATYIECSSLQSENSVRDIFHVATLACVNKTNKNVKRNKSQRATKRISHMPSRPELSTVATDLRKDKAKSCTVM	71542	53224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7068_pilon_-_53505_55051_55187_58786_58897_70570_70659_71156
853508	scaffold_6394_pilon	-	988	5	Intergenic	novelGene_110970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.1860576069539	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	191	682	309343	284553	FALSE	15	CCTGCCCCACCGGACGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QITTSGALTFDRASTVEATAVISESPAQGDVFAGATVQEAGVQPPCRVSHPEPHYPGYQDSCQMAPFPEAALPTSHPKIVLTSLPALAVPPSTPTKAVSPTVVNGLEMSEQRSWLYLEEMVNSLLNTAQQLKALFEQAKQASSYREAAVAHAKVQADAERKEQSCANCGREALSECTGCHKVNYCSTFCQRKDWKDHQHVCGQSAAVTVQADEVHVAESVIEKVTV	310887	284246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_284658_293350_293441_306665_306914_309294_309424_310777
853509	contig_14243_pilon	-	742	7	Intergenic	novelGene_57447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	105.578827843886	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	63	566	707783	702904	FALSE	35	TCAAAGTTGGAAAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPRKRLTGAAGPDKKGPSGKRTKTGNPDETSAKMENSSPQKTSATNNCGKNPSSHWLMKSEPESRLEKGVDVKFGIEDLKAQPNQTACWDGVRNYQARNFLRAMKLEEEAFFYHSNCKEPGIAGLMKIVKEAYPDHTQFEKKSPHYDPSSKKDNPKWSMKSLILF	708121	702727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_702925_703632_703729_704317_704411_704759_704829_705856_706039_707740_707817_708092
853510	contig_7344_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_168919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	172	390	6287	6069	NA	15	CCTCCTGGCGGGACACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFFKGIDQNIERAVRSEIFLHESYCIETSNQPLLPATQKSPTNGADCGIQWWNAVFIMLLIGIVLPVFYLVYFKIQATGETPSSWNTTAVPSDSIAMTAIPGKAPKLVMPVPAIPNSDSHFGQTTHAGN	6458	5385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7344_pilon_-_5400_6500
853512	contig_14711_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_68935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTTTTATTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101002	101909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_101000_101900
853513	contig_11838_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_177509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAGCTGAAATTGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396439	387988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11838_pilon_-_388404_396363
853514	contig_10793_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_83355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	23	313	7904	7614	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSQYNIQMILLKQKSDHVISLPKTKPSHLHKSQHLQGLKDLATPPATSLASSPAPPSLLASPPPPCFTHRGFPVLSSALQAHITDVQPFDGPSYSLCNKYEAS	7926	7087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_7100_7900
853515	contig_5167_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_164101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAGAAAGGAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324627	323979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_-_324000_324600
853516	contig_7201_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_152527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCATTAAATTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336754	337687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_336800_337700
853517	contig_5549_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_81621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCCTCTCCTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364918	365672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_364900_365700
853518	contig_13710_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_177754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGTGTTTACCAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17265	17621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13710_pilon_+_17300_17600
853520	contig_7229_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_39823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894813	893937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_893900_894800
853522	contig_8712_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_58752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGATTTTTTCCTAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149478	150614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_149500_150600
853523	contig_2799_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_85575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTACTGCCATCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766454	765524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_765500_766500
853525	contig_12603_pilon	+	350	3	Intergenic	novelGene_105778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	33	350	496719	501331	FALSE	15	TCCCCACTGACCATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPWNRLPPGMMATPGCQRSDSQCVLGRRPHTRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDETTNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDIFEEKIKK	496686	501331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_496787_496922_497053_501211
853527	contig_253_pilon	-	524	5	Intergenic	novelGene_129647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	134.292591009333	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	66	491	268582	267057	FALSE	30	TAAAAGTGCTCTAATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR	271286	267023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_267189_267267_267397_268417_268591_269480_269510_271258
853528	contig_10082_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_63902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	103	507	492701	493105	NA	15	CTGCCCCTGCATGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSGLGKVASARSSNYPPASIPGTPSRIPQPQACTQAARSIFGSPPFCHRGSPVGGGCARWVFFPVWQADQTIAGSNPTRTLVGALCQLVTGQATWPLWGQFPHPDNEDSGTTPYRVVKVSGLEGMLLTKEQH	492598	493280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_492600_493300
853530	contig_17833_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_174607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAGAATGATCTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208608	209613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_208600_209600
853531	contig_960_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_108248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521144	520438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_520400_521100
853532	contig_15132_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_176089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	148	600	20743	20291	NA	70	ATTAAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQEGTRLGSCPGRVNLLAQHCITTESAERKETLLCGSQSGKPGGSGLWHHPAAEQTALPSQIMALIEHCVHGQRPAQGSSAWVSFVSWLLNKIFTLCLSSKTVPRNQQAERAGDVHPPVTLLPAPVNCSTHPACKLELVISLQGSGVK	20890	19594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15132_pilon_-_19600_20900
853533	contig_9730_pilon	+	606	2	Intergenic	novelGene_150637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGGCCATAGGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684462	686123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_684518_685572
853534	contig_14142_pilon	+	740	5	Intergenic	novelGene_120495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_4	16.5132522538717	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	65	379	307972	309017	FALSE	10	CTTTTGTGCTGTTGGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVRIREAEEGDCGDILRMIRELADYENLLDQVKISEEALRADGFGDNPFFHCVVAEILPPHSEPQEPRVVGYGLYYFIYSTWKGRSVYLEDVYVMPEYRSGA	307907	309378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308250_308382_308467_308566_308669_309006
853541	contig_14275_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_162872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387004	387894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_387000_387900
853542	contig_2043_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_169915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATATCCTGTATAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701269	702077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_701300_702100
853543	contig_8676_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_142217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCCTTCAATGCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531472	531918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_531500_531900
853544	contig_2043_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_169889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAGTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92392	90893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_90900_92400
853545	contig_821_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_149424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGAAACCCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428879	428451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_428500_428900
853546	contig_6556_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_168501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCATTTCTGGAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330856	331209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_330900_331200
853547	contig_3270_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_104460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAGATATCCAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94158	93628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_93600_94200
853549	contig_10074_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_57188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTCTTTCGGTGGGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573190	573492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_573200_573500
853551	contig_8907_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_85857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGTTTGCTGGGTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794321	795032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_794300_795000
853552	contig_21386_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_177031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAGTAAAAAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72346	71399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_71400_72300
853553	contig_15327_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_70758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCTGTTTGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127362	1126970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1127000_1127400
853554	contig_1443_pilon	+	1004	4	Intergenic	novelGene_28156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCATAGAGCTTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294398	343367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_295055_327009_327123_331883_331947_343195
853557	contig_3825_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_78040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	138	458	2318060	2318380	NA	35	CCTGCAGGGGGGAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRQGLERPLASSLSSCSFTFMSSCSFADSSSPVYFARMTGPSSPVRLCSASSMSATSESESCLRRVHGSESCEPGLFKQLMLSLPSGSSAALATCRKKPSTDCT	2317922	2319087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2317900_2319100
853558	contig_13371_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_177755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89993	88989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13371_pilon_-_89000_90000
853561	contig_6069_pilon	+	640	3	Intergenic	novelGene_8018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	497	577	117509	117589	FALSE	10	GGCTGCCTCACCTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCCWLPACTEASRSYTARRRWEQENTHLSSLLKACGLLESPLALCLSEEKQDTCLVSVSHTLHSSLTYGADWSWLSLQPSPKAQPLVPSASFLHSDTGARPADLLHSLKVQGTSVATAPDRVGDEDGEGQASQAQHVADDVRKVGSQLHVAGGKPCDYDATLEGMNLDISLLATCLFYDHALHLWKWEVS	107159	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_107227_107601_107681_117158
853563	contig_1594_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_138847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAAGTATTTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711724	711490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_711500_711700
853565	contig_10603_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_173377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96812	96219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_-_96200_96800
853566	contig_665_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_158195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCTGGAACAAAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124061	122966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_123000_124100
853568	contig_1076_pilon	+	522	2	Intergenic	novelGene_101121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	113	520	639409	643161	FALSE	35	CTTCCCAGTAACAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKERGLVHVWQAGSCSVTPERLPGWGGKTVLQAALGMKHGVLLTEDGEVYSFGTLPWRHEPAEISPSSPILENALVGQYVVTVATGSFHSGAVTEGGTVYMWGENSAGQCAVANQQYIAEPNPVSISDSETSPLLAVRILQLACGEEHTLALSISREIWAWGTGCQLGLITT	639296	643163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_639437_642781
853569	contig_1244_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_37964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTAAATATGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902772	901942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_901900_902800
853570	contig_10003_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_88219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTTAAAAAGCTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561750	560183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_560200_561800
853571	contig_10951_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_61635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTCTTCTGGGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218504	217836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_217800_218500
853572	contig_8878_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_147875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	21	653	744069	743437	NA	90	AAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILILVMRRVAGDELTGVCYVGSMDVNALTGFVLIPLACYLIIGTSFILSGFVALFHIRRVMKTGGENTDKLEKLMVRIGVFSVLYTVPATCVIACYFYERLNMDYWKVLATQHKCKVNNQTKNVDCLMAASIPAVEIFLVKMFMLLVVGITSGMWIWTSKTLQSWQNVCSRRLKKKSRRKPASVITSSGIYKKAQHPQKTHHGKYEIPAPPPTCV	744089	743245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_743200_744100
853574	contig_7347_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_172490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAACCTTCAAAGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11628	12229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_11600_12200
853575	contig_9058_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_149374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTCATGAGGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310440	311262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_310400_311300
853576	contig_7697_pilon	-	1131	2	Intergenic	novelGene_128286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	104	379	244060	241064	FALSE	30	TTTTGGCATCTCACAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKISEQSCKRKIKTQRFLEVSPFTNKKELIIFSIMVQLYLVERREIKFFLAMNFFRCKTVAWAEQRIHFRFNPPEFAAIAFQTDAYLLITSVIIIILFLLLFRCLFVGTVLCFGFTLQHKQKILY	244163	240311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_241182_243902
853577	contig_1706_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_155039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATTTTCTCACTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113687	114667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_113700_114700
853579	contig_13740_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_34769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746164	745540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_745500_746200
853580	contig_13051_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_140101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108131	106827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_106800_108100
853581	contig_5361_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_167206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	775	1149	416819	417193	NA	80	TAACAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVFALRVYLSSQPRLSGKMHTHGHAGTHGRPQSVKVTEHLLTLKGKDKPQYSPSQQPSEPLVTHIHIHTLKHSFTYLISDRRTTAALLSQCKIRSQLLFSVSVTAVVLLTVFYIMCYLQKGR	416044	417697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_416000_417700
853584	contig_9272_pilon	-	1522	11	Intergenic	novelGene_125954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	27.4563289607333	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	4	1353	475970	459165	FALSE	65	ATTGATGAAAAAATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAAAGNGPGPGAGAGPGPTAAASAAAAEEGETKPVTAVAAAPTGEGTSAAPAAEPSSGEAESGDANLVDVSGGLETESSNGKDTLEGAGDTSEAMDTQAGSVDEENGRQLGEVELQCGICTKWFTADTFGIDTSSCLPFMTNYSFHCNVCHHSGNTYFLRKQANLKEMCLSALANLTWQSRTQDEHPKTMFSKDKDIIPFIDKYWECMTTRQRPGKMTWPNNIVKTMSKERDVFLVKEHPDPGSKDSEEDYPKFGLLDQDLSNIGPAYDNQKQSGAVSTSGNLNGGIAAGSSGKGRGAKRKQQDGGTTGTTKKARSDPLFSAQRLPPHGYPLEHPFNKDGYRYILAEPDPHAPDPEKLELDCWAGKPIPGDLYRACLYERVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGKLRP	475973	458995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_459350_462224_462443_463396_463491_465686_465763_466666_466763_467390_467487_470334_470430_470698_470788_474813_474960_475078_475146_475782
853586	contig_9955_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_21351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCACATTTGTATAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121477	122100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_121500_122100
853587	contig_7919_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_28066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAACAAGATCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037572	1038439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1037600_1038400
853588	contig_6740_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_142702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAAGTGATTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649216	650381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_649200_650400
853589	contig_9484_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_105686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTACACAAGTTAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202743	202008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_202000_202700
853590	contig_1719_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_87273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACATACTAAGGGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352370	353451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_352400_353500
853591	contig_12425_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_46644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTAAGGTGAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170957	172256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_171000_172300
853592	contig_13440_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_170514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTCAGCAAATGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65084	66365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_+_65100_66400
853593	contig_3878_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_174803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCAGTTCCACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611964	612948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_612000_612900
853594	contig_13525_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_145083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37183	37593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_37200_37600
853596	contig_6589_pilon	-	535	4	Intergenic	novelGene_25921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	131.592806287679	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGTGCAGCCCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178056	1158542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1158808_1176835_1176938_1177210_1177250_1177927
853597	contig_21025_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_76489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28520	27839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_27800_28500
853598	contig_4421_pilon	+	642	3	Intergenic	novelGene_177248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	255	434	51586	52258	FALSE	10	TTCAATGCCTGCCTGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTTGPPAISTTTTVEIRKSSVTTTEITSKVEKSPTTATGNSSCPSTETEEEKAKRLLYCSLCKVAVNSASQLEAHNSGTKHKTMLEARNGSGTIKAFPRAGVKGKGPVNKGNTGLQNKTFHCEICDVHVNSETQLKQPPAKG	29478	52466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4421_pilon_+_29716_51568_51748_52240
853599	contig_5732_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_119607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	621	67	687	456991	456371	NA	25	CTGCAGCACATGCGCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASEDKVKQLVKAIGREIQQLNMAGCYWLSGATVEHVACCRNLVKVNFSGCHLTSLRLSKVLSALQHLRSLAIDVSPGFDAGQLSSECKATLSRVQELRQTLFTPSYGVVPCCTSLQKLLLYFEILDRTREGAILSGQLMVGQSNVPHYQNLRVFYARLAPGYINQEVVRLYLAVLSDRTPENLHAFLISVPGSFAESGATKNLLDSMARNACLDALQLPKSWLNGSAL	457057	456370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_456400_457100
853600	contig_665_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_158188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTCTGTGGTCATGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86775	87401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_86800_87400
853601	contig_8548_pilon	-	641	3	Intergenic	novelGene_170568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	2.5	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTCTTGGAGGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483982	482524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8548_pilon_-_482653_483006_483074_483536
853602	scaffold_12124_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_22121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCAGAATCTTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920147	920486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_920100_920500
853603	contig_7342_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_71094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGGACCCAGTGCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46843	47614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_46800_47600
853607	contig_12624_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_61004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACCCCTTGCTAATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757371	757099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_757100_757400
853608	contig_20842_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_160977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTCCGTGTAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155122	154328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_154300_155100
853610	contig_6674_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_148028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339659	339240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_339200_339700
853611	contig_10451_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_138335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCATGCCTGACGTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503937	501995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_502000_503900
853612	contig_18604_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_173857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAGGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85702	85030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_-_85000_85700
853613	contig_8570_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_120170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGAAGGGAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395541	396593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_395500_396600
853614	contig_14426_pilon	-	1051	2	Intergenic	novelGene_170628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTTATTTAGCACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187316	183714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_183784_186334
853616	contig_3818_pilon	-	616	4	Intergenic	novelGene_99308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	101.69999453731	139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	163	411	1033549	1031871	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAELAVHIPHRITRRKPETCVDSERWQRGRRIVTELSWLWRQSTEGLRGPGMDPHRLLPGAHPPGPGLGDVCVRVLLRGHHCTAHPVHDWRPQRGDFLGHPGCSLPVCCLSVLPQCLSSGSPRHHPDARRLYQ	1069749	1027109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1027287_1031842_1031969_1033398_1033567_1069604
853617	contig_3424_pilon	+	681	7	Intergenic	novelGene_55588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	7.03364928200306	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	26	679	1154501	1158948	FALSE	30	GTGAGTCTGAAGACAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATKLAAGQMPVEAGGAMDADAEREKIAQEIRELERILDPSSSGLGAELSESSLHSDSDADSLCSEDSDAPGPPISEEERWGEASNEEEDPKDRNLPEDPETCLQLNMVYQEVVQEKITEVNLLLAQNREQQEEITWDLAGSKGPKMKGRKSLPPQMYIGHFMKPYFKDKVTGVGPPANEDMREKAAQGVKSFEELLVTKWKGWEKTLLRKSVVSDRLQRLLQPKLL	1152629	1158950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1152655_1154500_1154655_1155951_1155999_1157558_1157727_1157811_1157938_1158346_1158426_1158868
853618	contig_8820_pilon	+	1553	7	Intergenic	novelGene_79265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	400.388006258374	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	108	944	81509	84787	TRUE	25	GGCATAAGGAGGTTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIREYQTQLIQRVKDDIGSLHDKFKVQYPQSQACKMSHVRDLPPVSGSIIWAKQIDRQLTAYMKRVEDVLGKGWENHVEGQKLKQDGDSFRMKLNTQEIFDDWARKVQQRNLGVSGRIFTIESTRVRGRSGNVLKLKVNFLPEIITLSKEVRNLKWLGFRVPLAIVNKAHQANQLYPFAISLIESVRTYERTCEKVEERNTISLLVAGLKKEVQALIAEGVALVWESYKLDPYVQRLAETVFNFQEKVDDLLIIEEKIDLEVRSLETCMYDHKTFSEILNRVQKAVDDLNLHSYSNLPIWRLKGYWVFACKLA	81401	87991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_82145_83237_83397_84745_84898_85581_85729_86874_87016_87653_87831_87957
853620	contig_11396_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_71389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	12.2551009787761	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	21	845	1134570	1151265	FALSE	20	TGTAGTGTTTGGAACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPSELMNVPLHQQQNKCTTLVKNKTAAATTALQFTYPLFTPNACSAAGSSNLSQTQSSGNSCSILEAAKHQDIGLPRAFSFCYQQEIESTKQTLGGRNKALPEQVWIKVGEALCKQAINKRNRSRIRQLDTNVERRALGEIQNVGEGSTAAQGAWQSAESSQSNLGEQTQSGPQGGRSQRRERHNRMERDRRRRIRICCDELNLLVPFCNAETDKATTLQWTTAFLKYIQERHGDSLKKEFESVFCGKTGRRLKLSRPDSLVTCPAQESLPSSPATEMK	1134549	1151903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1134723_1134999_1135163_1137116_1137361_1140125_1140268_1151142
853622	contig_7530_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_141826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAATAATAATGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124371	123707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_-_123700_124400
853623	contig_6364_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_51773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964469	963878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_963900_964500
853624	contig_17964_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_33926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAACTCAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464286	465365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_464300_465400
853625	contig_7176_pilon	-	808	2	Intergenic	novelGene_107877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	34	666	705888	704340	FALSE	45	AAATGAAGTTTACATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSTISHAPKEEMKALEEEEPESKQNALGQMQNIQFQKITGDARIPLPINSFQVPVSTQEALVTSKDALDFPGTEERQESFEEFIARACSPPADAISGTGSQRKEEELSRSSRSSSEKVTKTGECSKKQSAKKQHGKDLHFCSNSTVNWQSKGIRGSSPLINEPIKSESLKRHISAKKEGGIVTASSRTNKSKPNPLEHSESDTLGSDFEFQESIHTLSHLT	705921	704197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_704904_705819
853626	contig_11699_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_171473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACAGAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37949	36562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11699_pilon_-_36600_37900
853627	contig_6958_pilon	+	563	4	Intergenic	novelGene_69991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.49443825784929	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCCATGAAGACAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718519	725132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_718723_718914_723190_723336_724940
853629	contig_10526_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_142577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTAGGCACAACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286210	285548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_-_285500_286200
853630	contig_9049_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_83144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGCTCTTAACTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89612	88815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_88800_89600
853631	contig_9345_pilon	-	945	2	Intergenic	novelGene_24527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAACAATAAAAAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699982	697277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_697973_699732
853632	contig_15118_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_74544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	11.5	336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCTCCATTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125258	153823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_150719_150892_153680
853634	contig_5084_pilon	-	1148	11	Intergenic	novelGene_64677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	48.9800979990853	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	574	945	1765654	1756873	FALSE	15	TGCTTTCATAGATCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGISGLFEIHGATVIPNVSVVAPEKLSASTRRRYETQVQTRLQTALASLHQKSSEIEILAVDLPKDTILQFLSLEWDADEQAFNTTVKQLLSHLPKQRYLKLVCDEIYNIKVEKKGVCAIPV	1784819	1756669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1756897_1757452_1757573_1759069_1759115_1759649_1759719_1760961_1761060_1765638_1765752_1772727_1772815_1774485_1774611_1775040_1775149_1782038_1782105_1784729
853635	contig_10126_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_105709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAGACAAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111665	111327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_111300_111700
853636	contig_19098_pilon	-	1821	3	Intergenic	novelGene_65796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTACATCATCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131610	128974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_129546_129978_130140_130521
853641	contig_10196_pilon	-	1597	3	Intergenic	novelGene_132310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGTTTTAAATAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367461	2348723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2348830_2352495_2352600_2366074
853643	contig_4244_pilon	-	1139	5	Intergenic	novelGene_175900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.97496867163	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	65	739	31939	26674	FALSE	40	ATTATACATATGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSRAAPSWALLLRLLALLRPPALSEACSCAPTHPQQHVCYSALVIRAKIASEKVVPASADPADTQKMIRYEIKQIKMFKGFEKVKDVQYIYTPLDSSLCGVKLEANTQKQYLLTGQVLNDRKVFIHLCNYIEPWENLSLLQRESLNHHYQLNCGCQITTCYTVPCTISAPNECLWTDWLLQRKLYGYQAQHYVCVKHVDGTCRWYQGHLPLRKEFVDIIQP	32003	26273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4244_pilon_-_26872_27534_27660_30088_30204_30633_30732_31800
853644	contig_8110_pilon	+	447	4	Intergenic	novelGene_158613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	40.2850951207626	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	15	446	112462	141188	FALSE	45	ATGACTTACGAGAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGAMERARKFSGSGLTLGWSSASASASASAWRRASQRWAWPLRSLRPGGDAREPRKIILHKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRRGDRILSVNGVNLRNATHEQAAAALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKI	112447	141189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_112608_113513_113671_114901_115005_141162
853645	contig_10774_pilon	+	779	4	Intergenic	novelGene_158688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	4.96655480858378	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCCACTTGGGATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97592	100302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_97797_98726_98790_99326_99633_100096
853646	contig_6969_pilon	+	1029	2	Intergenic	novelGene_176947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	127	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGTCTGGTGTCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335066	344923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6969_pilon_+_335455_344282
853647	contig_3627_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_78411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCATACCCCAAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16123	15427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_15400_16100
853650	contig_5059_pilon	-	531	5	Intergenic	novelGene_140739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	370.408136384718	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	95	466	292568	276470	FALSE	15	CTTTCTTTTTTTAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDPEVKFLEVIKPFCAVLPEIQKPERKIQFREKVLWTAITLFIFLVCCQIPLFGIMSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKREH	292662	276404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_276613_283551_283631_288493_288560_290235_290304_292552
853652	contig_50_pilon	-	862	2	Intergenic	novelGene_122216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGGCAATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60686	59403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_60202_60622
853653	contig_15327_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_70570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687791	687134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_687100_687800
853654	contig_11720_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_44026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAAATTAGAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383492	382795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_382800_383500
853655	contig_12157_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_135911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAATGAATACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169665	170875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_169700_170900
853656	contig_13074_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_153450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTCAGGTTCTTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549700	550541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_549700_550500
853657	contig_2550_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_135648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569248	568744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_568700_569200
853658	contig_7744_pilon	+	571	2	Intergenic	novelGene_62580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTTTGCACTTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892295	893004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_892536_892673
853659	contig_16532_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_110041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCTCCCATGCTGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150099	150513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_150100_150500
853660	contig_15570_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_137847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAATAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608244	609375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_608200_609400
853661	contig_7853_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_172635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATAACCCTTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41753	42915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_+_41800_42900
853664	contig_4180_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_8430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCCCAGCGACAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150619	1152104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1150600_1152100
853665	contig_12923_pilon	+	400	2	Intergenic	novelGene_30154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTTTGTTTTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248373	248884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_248412_248522
853666	contig_12884_pilon	+	563	4	Intergenic	novelGene_104973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	189.702105652227	400	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	108	413	512166	513630	FALSE	10	CTGACTGCGCAGCCCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFLPVLLAALLGVERAHSLVCFSCKNQKSNFNCLAPTMCSSSDNYCACFLCARVCVFAPCSFAGVSRGEFAWGRGGSTTQACFLWHLHPPPTMFHSCQG	510536	513780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_510598_512119_512218_512679_512772_513468
853667	contig_6677_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_114192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCATTTTGTCTGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557524	556788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_556800_557500
853669	contig_3469_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_34148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACGAGCACCGCACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270553	301133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_271408_275074_275153_277138_277239_277667_277742_301018
853671	contig_10074_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_57221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTAGTAGACATAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719236	718640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_718600_719200
853672	contig_15114_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_121188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAACCTGCAGAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719487	718952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_719000_719500
853676	contig_665_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_158232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAAGGATTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968817	968375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_968400_968800
853679	contig_7457_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_31315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	306	344	183652	183690	NA	25	CACCAGGAGGACTCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQVPGLSLSPFSFQGAPNSFELILPCLLVLNHNDHSWKLVQLSSFTHSKNIYPVSIYLHMTYARYCTRIQG	183346	184224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183300_184200
853681	contig_7909_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_155941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	170	349	1016103	1015924	NA	25	ACTGTGTAACCTTGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFHFLHCPNKSSKQRHKLHSDIISSYNNQENDDVSSCSIYFSTSAFSWHVEKQDTIMWFWNLFQKPDSSYILLYSLSLKSYRNIYSLYKHNIVRHKASNTPETCAYLFLCISLLK	1016272	1015869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1015900_1016300
853682	contig_17108_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_109532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGGAGGGAAGGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81423	80786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_80800_81400
853683	contig_17108_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_109530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTAGTATTGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80681	80436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_80400_80700
853684	contig_7179_pilon	+	1096	2	Intergenic	novelGene_78136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922032	925837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_922636_925344
853685	contig_266_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_166297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGTTTACAGAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569177	569889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_569200_569900
853686	contig_11338_pilon	+	712	4	Intergenic	novelGene_6247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	14.290634073484	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	92	646	82534	84021	FALSE	10	TCTATGCATCCTCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLPGMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTDTSYTRAVDWWGLGVLLYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSAEAIGIMRRLLRRNPERRLGSSDRDAEDVKKQPFFRTLGWDALLTRRLPPPFVPTLSDRTDVSNFDEEFTGEAPTLSPPRDARPLTATEQAAFQDFDFVAGDC	82442	84087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_82696_82974_83083_83183_83265_83817
853688	contig_5062_pilon	-	797	4	Intergenic	novelGene_157826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGACATGGTGCCGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130295	117118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_117220_123813_123914_128894_128930_129734
853689	contig_6412_pilon	+	852	6	Intergenic	novelGene_149939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	149.177210055692	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	168	851	90047	148701	FALSE	65	TAAAAAAGAAAAAGCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFNLDRFRFEKRSKIEEAPEATPQPSQPGPSSPISLSAEEENAEGEVSRASTPDSDITEKTEDSSVPETPENERKASISYFKNQRGIQYIDLSSDSEDVVSPNCSSTVQEKKFSKDTVIIVSEPSEDEESQGHPTMAGRNNDDIAELEDLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFGDAGGGPRKRKVSSSSEPYEDDEFNDDQS	89620	148702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_89740_89998_90237_125832_126011_132421_132594_136034_136102_148624
853690	contig_378_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_175169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACATGTTGCATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240095	239706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_378_pilon_-_239700_240100
853692	contig_4999_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_177520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCCAAAGGGTATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200406	198988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4999_pilon_-_199000_200400
853693	contig_1984_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_173200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCTCATTAAAGAACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226862	227807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_+_226900_227800
853694	contig_11413_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_103152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAAAAGTCCAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244154	242943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_242900_244200
853695	contig_9653_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_48335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058026	1058774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1058000_1058800
853697	contig_3269_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_117028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAATGTTAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163074	162153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_162200_163100
853699	contig_5894_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_83044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATAGAAAGCTGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444066	443027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_443000_444100
853700	contig_12746_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_152183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGGCAAGAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485798	485083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_485100_485800
853702	contig_1337_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_84254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTGAATTGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445706	446172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_445700_446200
853703	contig_13504_pilon	-	1324	1	Intergenic	novelGene_157958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATTAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136227	134903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_-_134900_136200
853705	contig_1861_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_77648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCCCTCCTGACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77807	76993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_77000_77800
853707	contig_1406_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_25453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTTCGTCAGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499932	501463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_499900_501500
853709	contig_10549_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_110627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATGAAACTTTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385105	384509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_384500_385100
853711	contig_8954_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_130261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTCTATACATATATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71481	71147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_71100_71500
853712	contig_7728_pilon	-	738	2	Intergenic	novelGene_64736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACCCCTTAACAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866851	864539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_865085_866658
853715	contig_4486_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_38557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCTAAAGCTACTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311470	310434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_310400_311500
853716	contig_6441_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_172888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCCAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300652	301899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_300700_301900
853717	contig_13403_pilon	+	520	3	Intergenic	novelGene_158087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	7.5	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGACTGTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48971	87868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_49160_75081_75331_87785
853718	contig_7368_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_158807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCCCTGTGAATTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134750	133695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_-_133700_134800
853720	contig_5955_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_177524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCCAGGATCAGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342692	344051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5955_pilon_+_342700_344100
853721	contig_6175_pilon	+	879	6	Intergenic	novelGene_16329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	189.727594197576	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	182	772	1502638	1520939	FALSE	25	AACTCAAGTTTTCTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1495323	1521046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1495499_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1518667_1518761_1520852
853723	contig_10399_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_114481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	217209	217526	NA	25	CACCACCATCACGCCGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRVRAAIRVFLLQFRAALQSGDGVRGREPYRRPPQTFPTEEIGVENALGDAGLVLGPQKGPPGPLISPSKGKLGQGELCSHRVVLGGEEGLVGAVGVALASAGSP	217207	217939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_217200_217900
853724	contig_9177_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_32554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26478	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1957_26362
853725	contig_19737_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_158981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGAGGCCCGGGGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65181	64364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_64400_65200
853727	contig_8027_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_158854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGTCTGCTACACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471795	472631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_471800_472600
853728	contig_18506_pilon	-	274	3	Intergenic	novelGene_67958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGGACAGGACCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55267	48559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_-_48616_53813_53974_55209
853729	contig_1939_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_144879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTACCATGTGTTTTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425965	424737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_424700_426000
853730	contig_10857_pilon	+	657	5	Intergenic	novelGene_160872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1868.91967457138	47	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	85	657	21903	66898	FALSE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAKRLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQPPCTPLTPTIIAVTSFCSWTLQLSPFHPSPQLCFSPREEERDALNCWHRAGSPECPRRQRTEALPEQNKAWQPAGPQGSTGDLRLCSGPCIPPCPLLHPSAPANLLCVIKLPCVP	21818	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21919_58780_58876_59617_59662_59830_59904_66553
853731	contig_10000_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_139350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340583	341214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_340600_341200
853732	contig_3081_pilon	-	1061	9	Intergenic	novelGene_133983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAACACACCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2870288	2153298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_2153540_2328629_2328805_2388377_2388435_2488691_2488792_2662263_2662414_2680976_2681059_2807132_2807243_2834259_2834308_2870190
853736	contig_10769_pilon	+	944	4	Intergenic	novelGene_177004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	2.16024689946929	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	225	704	70931	74721	FALSE	20	TGGGGTAAAGTTTTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEGEACGVYTPRCAQGLRCYPHPGSELPLQALVLGEGTCEKRRDAEYGASPEQVADNGDDHSEGSLVENHVDGTMNMLVVGGTAARKPLKSGMKELAVFREKVTEQHRQMGKGGKHHLGLEEPKKLRPPPARTPCQQELDQVLERISTMRLPDERGPLEHLYSLHIPNCNKHGLYNLKQCKMSLNGQRGECWCVNPNTGKLIQGAPTIRGDPECHLFYNEQQEARGAHAQRMQ	43869	74961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10769_pilon_+_44038_70874_71105_71757_71899_74556
853737	contig_13831_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_160989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAAATAAAAATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74223	73698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_73700_74200
853742	contig_11413_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_103190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAATTCAACCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532868	534012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_532900_534000
853743	contig_7070_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_104026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCACAGAGTCGAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7307	6861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_6900_7300
853745	contig_8020_pilon	+	1176	5	Intergenic	novelGene_114408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	37.8615900352851	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGAATTATTTTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167202	181434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_167235_169128_169206_171004_171097_173357_173501_180602
853746	contig_14151_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_171831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	268	564	5550	5254	FALSE	25	AGTAGGTTTGACTTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVTIRYFCYGCLFTSVTWTALLFVYFNFSEVTQPLKNVPIKGSGPHGPFPKKFFPRFTRGPSRVLEPQFKAHKMDNVIDNHFEDPEKGNVKFSPELG	42085	5252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_-_5589_41856
853748	contig_3382_pilon	-	1166	3	Intergenic	novelGene_124140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	138	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	675	980	830074	829769	FALSE	50	AAAAACTGTTTTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSYMIILDQDSTDFFCKEPDSMYFRLCGSSGLCHSSPLPLWRESSHRQYVEECGYVPVKLYFWMLKFKFRIIFPCHKYWSSFDFFQPFKNAKPSLGVSL	846815	829582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_830548_842450_842544_846707
853750	contig_9995_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_47704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACAGGATGATTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308712	310142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_308700_310100
853751	contig_5942_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_177365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCACCAGTGGGATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82887	82546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5942_pilon_-_82500_82900
853752	contig_19908_pilon	-	614	4	Intergenic	novelGene_167616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	6.79869268479038	541	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	35	328	75026	59366	FALSE	25	GTAAATGTCATGGTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDDRRFPASNMTKKKRDNLGVALEIDGLEKKLSQCRRDLEAVDDRLHQAELSPEARRSLEKEKNSLMSKASNYERELKLLRQENRKNMLLSVAIFILLTLVYVCWTM	75060	59079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_-_59470_61002_61056_61477_61573_74984
853753	contig_5643_pilon	+	1245	3	Intergenic	novelGene_39179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	827794	835676	FALSE	25	GAGGGGACACACCCTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGHSLASSHRNSMVPSAATLIIVVCVGFLVLMVILGLVRIHSLHRRVSGTGSTPGASSDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQVCVAGAAGGQQEDEDSSDSEAADSPSSDERRIIETPPHRY	827791	836535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_827834_835065_835269_835535
853754	contig_709_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_57644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGAAGAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3035286	3036564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3035300_3036600
853755	contig_5894_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_83046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACATAGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477458	476562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_476600_477500
853757	contig_12644_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_44433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	264	401	156785	156922	NA	55	ACATACAACAGAATATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWAGDRAVPDGQVLHDAREVLQLVAELVEGDGTAAVLARRLKERQRQLVQLLVGQRDGALAQARLQHRAELVRVNGAAASAGWGWNLMERGACPVPPADSPALHKHCIGSGGLRDFSCSPTSSFLPANSPLG	156521	158093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_156500_158100
853759	contig_401_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_42912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGCCCATAACTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1932041	1930595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1930600_1932000
853760	contig_6654_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_85741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCCCTTCACCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454950	454468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_454500_455000
853761	contig_3394_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_152677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACATAAAATGCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424273	423114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_423100_424300
853762	contig_7870_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_109065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCTTGAAAAGTTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691785	691313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_691300_691800
853764	contig_160_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_156332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCGCAGTGGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458627	458009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_458000_458600
853766	SIRV6	-	157	1	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAATCTACGACGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11833	11676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_11700_11800
853767	contig_7904_pilon	+	805	2	Intergenic	novelGene_160014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGACCTTTTAAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40695	65352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_40734_64585
853768	contig_17198_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_62399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTGGTTAACATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085517	1085823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1085500_1085800
853770	contig_7338_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_156805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAAAAAAATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400587	400951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_400600_401000
853771	contig_11850_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_125184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACAGCAGTCATGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173337	172203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_172200_173300
853772	contig_10864_pilon	+	714	3	Intergenic	novelGene_107106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCCAAGTAAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028650	1037664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1028687_1035154_1035555_1037386
853774	contig_15495_pilon	-	1506	2	Intergenic	novelGene_177756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTCTCTGCGTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534552	531466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15495_pilon_-_532571_534150
853775	scaffold_7386_pilon	-	524	6	Intergenic	novelGene_136576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	88	357	212309	209499	TRUE	30	CATCGAGAGGAACGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGPRVLFSQSRDDLPQRGQGLVDVGSFLMRRVPLAPVESARSLPARSTRLTLLTFSVVMLVSASWRFWVKMMLKTAWERLLVSFMFVAATVLALFPESMRSWMSLYEVTASLERSST	213139	208887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_208955_209398_209576_210690_210805_211634_211713_212308_212377_213119
853777	contig_4754_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_35902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGATTTCATTGCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119698	121262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_119700_121300
853778	contig_14980_pilon	-	680	6	Intergenic	novelGene_78225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	4.73286382647969	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	155	679	363258	351533	FALSE	35	TAAACTCTGAAATTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTPPHFQTHLAKLLETQEQEIEDGRASKISLEHLVTKLNEDREVKNAEILRMKEQLCEMDSLRLEAQQLREQNWLLQGQLDDITRQKDSSDPNHPDNQQLKNEQDEIIQERLAKSKLVEEMLKMKAHLEEVQSALQNKETDCLRMAEEVERTRTLESKAFQEKEQLRSKLEEMYEERERTCQEMKMIRQQVECLAEENGKLVGHQNQHQKIQYLVRLKKDYVKLVE	363412	351531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_351665_351915_352082_355934_355973_356686_356760_359793_359904_363252
853779	contig_5640_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_27291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCCTTAAGACAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255533	1254843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1254800_1255500
853780	contig_8273_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_113088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAATAAACATATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259042	258411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_258400_259000
853781	contig_5999_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_45610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAGAGAAAAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97290	97067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_97100_97300
853782	contig_165_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_117084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463423	462244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_462200_463400
853785	contig_7569_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_114597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCCCAGTTTTGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143322	142448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_142400_143300
853786	contig_16685_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_115053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491711	492614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_491700_492600
853787	contig_4364_pilon	-	562	3	Intergenic	novelGene_9	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	177	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	70	393	193543	191644	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQCPTHGSRADPVLHGTEQRCVEEVHRHATLHRTQDIPGAQPPCCKEAQAATWRGCVVVPTTASINARHTKGERSEQRGGDLTTTKKEEQEQTASFGPRVPLLRTS	193612	191474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_191758_192528_192630_193434
853788	contig_12624_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_60969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATTCAACCATTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20283	19725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_19700_20300
853789	contig_7887_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_124851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72111	72768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_72100_72800
853790	contig_5928_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_40383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACCCAGGCTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296160	296560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_296200_296600
853791	contig_8820_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_79304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	30	368	241873	242211	NA	15	TTTACTCCTGTTCCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEGGGKEMNEIKTQFTTREGLYKLLPHSEYSRPNRVPFNSQGSNPVRVSFVNLNDQSGNGDRLCFNVGRELYFYIYKGVRKVPTRASPGSASGVGRGREQGGDSGSQGDR	241843	243438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_241800_243400
853792	contig_14694_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_152478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATAATTGGCGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136771	135698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_135700_136800
853794	contig_12142_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_147793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCCAGTCTCCCCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32988	33819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_33000_33800
853796	contig_17198_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_62408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGCTAACTACAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100638	1101301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1100600_1101300
853797	contig_2894_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_86544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTCATATGAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287909	287136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_287100_287900
853798	contig_2726_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_165897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171995	172999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_172000_173000
853799	contig_2310_pilon	+	577	5	Intergenic	novelGene_71621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	58.5763390798708	2104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	110	493	195390	208840	FALSE	5	CTTTCAGCCCTTTCCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD	195280	208924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_195410_199428_199499_204122_204254_208234_208307_208749
853800	contig_8866_pilon	+	492	4	Intergenic	novelGene_77811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_3	1265.63054114013	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	52	336	516999	518669	FALSE	20	AGTTGGACTACTTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLSVGDLQENPYATLTMSLAQTNFCRKHGFDPQSPLCAHIMLSGSITKVNETEMDFAKHSLFTRHPEMKDWPSDHNWFFAKLNITNIWVLDYYGGAKTVTPEEYYNVKFQ	511630	523618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_511658_516974_517095_518480_518670_523462
853801	contig_1154_pilon	+	1136	1	Intergenic	novelGene_87070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200050	201186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_2e+05_201200
853803	contig_20241_pilon	+	1061	6	Intergenic	novelGene_159722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	6.29285308902091	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	204	824	99491	127986	FALSE	80	ACAAAAAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPYVPLPMPVGNPVSSFTTNRNQRSPSFGSISTSSNSSKGQLEDTNMGTDSSIEYSARPRESEEQNPETVSWEDRPSTPTILGYEVMEERAKFTVYKVLVKKTPEESWVVFRRYTDFSRLNDKLKEMFPGFRLALPPKRWFKDNYNADFLEERRLGLQAFLQNLVAHKDIANCLAVREFLCLDDPPGPFDSLEESRVSAVLYIT	97669	128223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_97772_99389_99639_99725_99866_107573_107661_113677_113827_127889
853804	contig_10055_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_177758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27234	26861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10055_pilon_-_26900_27200
853808	contig_13901_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_146646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGCAGTGTAGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203246	202072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_202100_203200
853810	contig_10235_pilon	-	753	5	Intergenic	novelGene_46457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	5.78791845139511	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	54	563	215916	214222	FALSE	15	GACCTTTTAGACTGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGVRKALQDLGLRIVEMGDENATLDGTDVLFTGREFFVGLSKWTNHRGAEIVADTFRDFAVSTVPVSGFSHLRGLCGMGGPRTVVAGSSDSAQKAVRAMAVLTDHPYASLTLPDDAAADCLFLRPGLPGASPFLLHRGGGDLPNSQEALQKLTDVTLVPVSCSELEKAGAGLSSLCLVLSTRPHS	215969	214031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_214339_214527_214678_215424_215545_215674_215749_215867
853811	contig_2933_pilon	-	650	2	Intergenic	novelGene_111335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	208	540	672383	671884	FALSE	20	ATTATTTACCCTTTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWWERREETDVNFLGRWQFQMEEISRGKHSNSRENDCPYYCTVTDRATRTFLSHPKSPVRSTPLLWKEKHTGAVKSILKELVDCDTAELPIGFPKLSPLWNRTATPFS	672590	671773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_671997_672163
853813	contig_9484_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_105675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTACAAATTTCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163060	163821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_163100_163800
853815	contig_6952_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_173647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACACTAATGTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316123	315393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_-_315400_316100
853816	contig_5331_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_112849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834160	833350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_833400_834200
853817	contig_10093_pilon	+	447	6	Intergenic	novelGene_147509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	144.617288039847	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	67	447	93078	103703	FALSE	65	AGAAAACTGGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTLLLSTHRLIWRDQKNHECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKRSFFRFGILDASVEVKQMLNFTGNAIAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEFYRRLSEEMTQRRWETMPVSQSLQTNRRPQSGRIRAVGIVGIE	90948	103703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_91006_93068_93140_93810_93886_101699_101815_102834_102925_103664
853818	contig_7022_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_142133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATCTGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73417	72610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_72600_73400
853821	contig_12031_pilon	+	680	3	Intergenic	novelGene_137568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATATTAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314585	338012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_314649_319316_319567_337645
853822	contig_6726_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_86214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57118	57964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_57100_58000
853823	contig_14618_pilon	-	1355	8	Intergenic	novelGene_136809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	14.5349683908307	68	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	341	1234	567433	559577	FALSE	5	CGCTTCCTGACCTGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVTCTGPATWCLGGDGTRDVVPTEPAEPGPSCGYRPSEEAAQKSLQNAATIPQSTGSPLGEQRQKAIYTLLAANGPRDALSIARALGMKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPEDSGRKNQFTKNIYQQSTVNMFIQTGPSGTISITNSKGIQIGSANMMQKHTASGKSGSTAPPRPPPVAPDDPSMQEAPAGDWGPRDIHVVHCRQVQLGHHNTMTLHGPLDKSPVCTPTGSPPDAGFARCDSDFPGDVGQAAPGIITTLSSQMDTLSFGREDPTPAENRAPTEGN	570326	559455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_559735_562212_562411_563700_563869_565414_565589_566228_566298_567306_567553_569796_569856_570164
853824	contig_18272_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_7001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGACCGATCATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137880	138647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_137900_138600
853825	contig_8044_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_132394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTATTCAAAGAAATACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555638	554591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_554600_555600
853826	contig_2757_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_164613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	209	472	600474	600737	NA	30	AATCATTTTCTTTATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTFIGRPRGNTALLNSCFLNTQVGWRLASPRSKSRTNRENPAVSRGRAELQPAPSLCCGEKTRNFLHEMLEKLETYQKVFYTLSLQNCASEWLVEAWVAPDWCPVLVKGGLWRTTAVLSTEFCVPQTIVKATALVFGGGGGDPDRYQWGWGVSRV	600265	601047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_600300_601000
853827	contig_9919_pilon	-	662	2	Intergenic	novelGene_137989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	63	311	839277	835210	FALSE	25	TATGTCTTACTGACTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQQQQRPLTENKRSSDEGRMPPGREKKVKQIENVVDKTFFHQENVRALTKGVRAMTGYEPGSGLVTAATQSREFVAGKPWKKHGNRNKKEKSRRLYKHLDM	839339	834858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_835390_839208
853828	contig_4751_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_173732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAGTTATTTCCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348071	349390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_348100_349400
853829	contig_7051_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_64306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATTGAATGCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209818	210287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_209800_210300
853830	contig_12078_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_74090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGTTTTTACATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183025	181693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_181700_183000
853831	contig_8000_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_177498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAAACGCTGTGGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92327	92127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8000_pilon_-_92100_92300
853832	contig_8000_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_177497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTTAAAAAGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91965	90796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8000_pilon_-_90800_92000
853833	contig_9935_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_164854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTGCAAAGGTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5725	6303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_+_5983_6211
853834	contig_11028_pilon	+	499	3	Intergenic	novelGene_163957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	163	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGCATGCCCAGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857996	864090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_858365_858531_858609_864036
853835	contig_19938_pilon	+	655	4	Intergenic	novelGene_146567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.142135623731	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	72	476	8802	17293	FALSE	25	GTGAGAACCGAGCCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSSAGSSRLSLCTLSLGPRESRMTPNTLTVNGVDVASTLSQPTHIHIHIHQESALAQLLKAGGSLMCRLSHPRDTASPKARMSHGQLALGVTQILLGAVSCALGVFLYFGPWIELRGSGCAFWAGTVVIESWHLEPLSSRAACQVCSPWLASPQSW	5746	17472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19938_pilon_+_5817_8800_9006_16532_16648_17207
853836	contig_4962_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_107381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTTCACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165021	165327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_165000_165300
853837	contig_9389_pilon	+	1063	3	Intergenic	novelGene_84017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_2	7.5	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	29	556	562030	565465	FALSE	20	GTTAAGTAAGGTGTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPKPCTPRGMQPERTRPKEGWQKGPRSDNSKSNKIFVGGIPHNCGETELREYFKKFGVVTEVVMIYDAEKQRPRGKGRPRLSWSFLLPSSDGKLSQPRLWRPGASPSVRALSHADAGPACASARPAAAWGRPGVAPFLAPFGLFTSQRDFHCGFCLERVLKICGSFPLSPSLPRMVPRLQLVPV	562001	565972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_562066_563624_563736_565084
853838	contig_7165_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_116861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCTGCTGTTCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392498	393218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_392500_393200
853839	contig_1948_pilon	-	900	5	Intergenic	novelGene_31149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.2719129761921	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCTTGTAGCATTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288553	204852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_205192_252349_252474_269208_269321_270081_270198_288344
853840	contig_1406_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_25474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACACAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167331	1168056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1167300_1168100
853841	contig_3721_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_123830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTAAAGTCTATGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269757	268785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_268800_269800
853843	contig_19155_pilon	-	1267	4	Intergenic	novelGene_173361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	259	798	134779	124031	FALSE	30	CATCATGACTCAGTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLVQQWSVAVFLLSYSVPSSGHSLEGLGRRLKRAVSEHQLLHDKGKSIQDLRRRFFLHHLIAEIHTAEIRATSEASPNSKPAPNTKNHPVRFGSDDEGRYLTQETNKVETYKEQPLKTPGKKKKGKPGKRKEQEKKKRRTRSAWLDSGAAGNGLEGDHPSDISATSSSLELNLRRH	135573	123561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_-_124041_128026_128456_134678_134802_135337
853845	contig_10323_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_123642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCAGGACGGCCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526585	527614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_526600_527600
853846	contig_990_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_76072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGGGATGATAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088365	1087592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1087600_1088400
853847	scaffold_19766_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_34416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGGCTGTCCTAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843767	844316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843800_844300
853848	contig_1516_pilon	+	1076	4	Intergenic	novelGene_49958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1328.66775380454	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	119	313	347241	348018	TRUE	15	GCAGCTGTTGGGGAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLEAEATDSGKGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGNFPVSGNIEGDD	335163	348951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347399_347981_348068_348237
853849	contig_14450_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_49030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252139	1251223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1251200_1252100
853850	contig_14326_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_120672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTTAATGTTTCTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86553	88200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_86600_88200
853851	contig_13607_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_170224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	24	467	468542	468985	NA	35	GGGTCATTTTTCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGIQLLNMQSLHKAHHQSQDITCPFPSTGFIPPPLIFGAGIDSTCLFWSTFCGEQGACVLYDNVVYRYLYVSIAIALKSFAFILYTTTWQCLRKNYKRYIKNHEGGLSTSEFFASTLTLDNLGRDPVPTNQTHRTKFIYNLEDHEWCENMESVL	468518	469022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_468500_469000
853852	contig_7513_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_88990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454018	453070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_453100_454000
853853	contig_11417_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_103274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTATTTATATACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315261	316773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_315300_316800
853854	contig_14023_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_165382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279386	280578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_279400_280600
853855	contig_14322_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_115643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	297	761	385806	385342	NA	70	TTGTAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPSQPPISGNVKVGAPAHDRDGVPIVQFVYHKQGSQLPGKMGSGARAGTRVRGVRHSPQIQSLRGLQQPRHKIYNTALPPCKKTNTNADKPTVNKVSTFYTKTESDRAGIRVRRARHSSWVQNRCPCCQGLLSPLRFIETHVTAQNGPTGFS	386102	385154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_385200_386100
853856	contig_12021_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_172208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318899	317965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_318000_318900
853859	contig_12886_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_135535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAATGTGAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871780	872817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_871800_872800
853860	contig_14698_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_168132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83799	82585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_-_82600_83800
853861	contig_4125_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_25151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869006	867678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_867700_869000
853862	contig_16802_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_177457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12335	11831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16802_pilon_-_11800_12300
853863	contig_9177_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_32749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGATTTAAAGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190094	1189673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1189700_1190100
853864	contig_10594_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_142314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTCTCTATGCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243867	242781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_242800_243900
853865	contig_11924_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_128033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTGTAATAAGTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819777	819047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_819000_819800
853868	contig_5487_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_157648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATGAGGCTTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185435	184302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5487_pilon_-_184300_185400
853869	contig_2933_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_111304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAAAAAAAAAAGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246881	246059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_246100_246900
853870	contig_8330_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_71993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTATTAAAATGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2077907	2078740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2077900_2078700
853872	contig_12019_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_87688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTATAAGGACATCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54445	55324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_54400_55300
853873	contig_4659_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_118177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATAGTTTTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111564	110964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_111000_111600
853876	contig_5039_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_65013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGATGCCTCTCCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718903	1720264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1718900_1720300
853877	contig_18967_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_165311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCATTGTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21101	20351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_20400_21100
853878	contig_3557_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_173611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCCTGAATCTTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174573	174319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_-_174300_174600
853879	contig_5918_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_99567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1733017	1732236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1732200_1733000
853880	contig_11258_pilon	+	242	3	Intergenic	novelGene_67751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5107	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGTGTCTTGTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50100	53624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_50154_52748_52858_53544
853882	contig_1694_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_144983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATGGTATTTTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1637834	1636801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1636800_1637800
853883	contig_6975_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_74309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCCAACTTTTGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532503	533345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_532500_533300
853884	contig_11375_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_152648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAACTTTCAATTTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30320	31383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_30300_31400
853886	contig_16185_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_144766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATGTCTGAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167205	166252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_166300_167200
853887	contig_11307_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_105257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCTCCACAAGGTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172526	171261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_171300_172500
853888	contig_343_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_163907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAGGCTAGAAGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199614	198825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_-_198800_199600
853889	contig_8538_pilon	-	672	3	Intergenic	novelGene_4605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACGTGCATGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688235	687053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_687489_687582_687758_688173
853890	contig_3472_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_166956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGCCCTCGAGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054215	1055043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_1054200_1055000
853892	contig_9995_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_47797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAGCAGGTACTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804594	805295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_804600_805300
853893	contig_10734_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_51415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACTAAAAAAAGCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2086225	2085662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2085700_2086200
853895	contig_13051_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_140137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGAGAAGTGTTGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430140	430839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_430100_430800
853896	contig_7057_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_123371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094103	1094479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1094100_1094500
853897	contig_19007_pilon	-	603	2	Intergenic	novelGene_168449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATAAATGTATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74978	74163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_74255_74466
853898	contig_9440_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_59033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATCAGAATTAGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276865	275494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_275500_276900
853899	contig_2377_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_67933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAAAAGAAGATACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825264	825072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_825100_825300
853900	contig_2278_pilon	+	1976	5	Intergenic	novelGene_118110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.06155281280883	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	25	786	908902	925018	FALSE	25	GAATTATATCATCTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGYVIPGMDEGLLGVCIGEKRRIVVPPHLGYGEEGRGNIPGSAVLVFDIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPDCSVLSKKGDYLKYHYNASLLDGTLLDSTWNLGKTYNIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKRTVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLVFDIELLELVVGLPEGYMFIWNDEVSPNLFEEIDKDGDGEVLLKEFSEYIHAQVASGKGKLAPGFDAEMIVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLKDQEAKHDEL	908877	926208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_908990_913307_913495_919442_919589_921331_921496_924841
853903	contig_6191_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_107855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184392	185268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_184400_185300
853904	contig_8631_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_121992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGCTTTCCCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863759	864214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_863800_864200
853905	contig_9389_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_84067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAATTAAACAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991913	990765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_990902_991502
853907	contig_13542_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_131531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTTAATACACATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516337	515812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_515800_516300
853908	contig_18822_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_111714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGCACAATAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98259	98775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_98300_98800
853910	contig_8443_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_150610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGTGTCACTTCAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748772	747894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_747900_748800
853912	contig_13945_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_173450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATCTAAAAAAGAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37740	38454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_37700_38500
853913	contig_14450_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_49048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGATCCACTCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349362	1350730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1349400_1350700
853914	contig_2394_pilon	+	1236	9	Intergenic	novelGene_177760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.9208879284245	48	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	277	936	21090	88891	FALSE	40	TATTTATTTAAAGAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGEDPPTPPPRPQKTHSRASSLDLNKVFQPSAPAAKSGSLPQPPALPPRPCPSQVSEHSVNSEPSTQPKPPAQPYGDFRLQEQSEQTSEAEVHPQSSRGPSQAAESSPAKKDIPYSQPPSKPIRRKFRPENQAPENQELPPTVGGPASAATMKPHPTVQKQSSKQKKAIQTAIRKNKEANAVLARLNSELQQQLKEVHQERIALENQLEQLRPVTVL	15539	89191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2394_pilon_+_15670_17006_17122_21058_21196_56445_56508_58883_58971_80013_80098_80577_80724_82082_82189_88822
853915	contig_6557_pilon	+	1250	8	Intergenic	novelGene_33041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	55.9142930140881	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	144	1061	667900	669463	TRUE	25	CTTCCAGGATGTGGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPLEGADGGGDPRPGDAFCPGGSPSLGPPQHRPCPGPSLADDTDANSNGSSGNESNGPESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANEEYYQQWSLEEGEPCAMDVSTYTLEELEHITSEYTLRNQGYLLGGCLLPDRLHCVYLGAGRYPAALQAGCVPGCPLLRAPGTPGCGRLLWFHCPISPAHLGHWGLSRFRPQGLHPREVCLLPYQWRS	667756	670001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_668175_668293_668393_668484_668640_668734_668858_668948_669151_669260_669313_669451_669595_669943
853917	contig_10466_pilon	+	1060	3	Intergenic	novelGene_173628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	241	549	132530	137026	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSVAPSQLQGNPLKKPKFIPPGRSNASPNEEITKLSPDVKLFEVAANKSQNDSRTCSLSLLHTEGNARQINHRDNYGGKYRSEASVMPTLDPPHTGKTVL	128046	137537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_128271_132513_132665_136852
853918	contig_18184_pilon	-	959	1	Intergenic	novelGene_123867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCAACGGAGGTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106830	105871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_105900_106800
853919	contig_9239_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_137156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGCCTTGCAACAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40957	40045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_40000_41000
853921	contig_6403_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_139888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGGTGGTTGGTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090029	1090403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_1090000_1090400
853922	contig_10109_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_131324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAATCCTGGTAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121633	120670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_120700_121600
853923	contig_14047_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_176585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGCATTCACAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51054	50076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_-_50100_51100
853924	contig_8412_pilon	+	531	2	Intergenic	novelGene_118358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGTAAGTCCAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70867	73145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_71032_72778
853927	contig_6980_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_36064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTCAAGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360760	361140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_360800_361100
853928	contig_7171_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_101418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACAGAGAAAGAGGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455338	1455854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1455300_1455900
853929	contig_9939_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_158607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGTAATCAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369845	368995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_369000_369800
853930	contig_501_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_134887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCTTTATTAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354625	355654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_354600_355700
853931	contig_6086_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_171461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATACAGGAGTAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64741	63005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_63000_64700
853933	contig_9578_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_67972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAATTCTACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068360	1069486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1068400_1069500
853934	contig_6208_pilon	+	796	2	Intergenic	novelGene_53049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	150	515	554493	556423	FALSE	15	TGTTTCTGTGTATATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIGISTSIFTDLGGVLVKSSTANQKSKRKRRKPKNWRRNQTTGLIISMNHCLLYPETRRTRWCPATTTKRSDQGHNRWILIEREKNMELNFRFLKSLDLLDPLSGKKLLKLLPWILFKP	554343	556704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_554574_556138
853935	contig_3233_pilon	+	1563	2	Intergenic	novelGene_56618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACTCATGAAAGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1436843	1443952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_1436924_1442469
853937	contig_5315_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_175355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305798	307216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_305800_307200
853938	contig_6914_pilon	-	665	4	Intergenic	novelGene_151761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	110.894344109858	1111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	31	561	329488	326164	FALSE	20	CTTTACATCTGTATATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVAGPREHGDLGEPGKPGRLALYFCGSIRGGREDRAMYERIVSRLRRFGAVLTEHVAAADLGARGEEAAGGDRLIHERDMAWLQQADVVVAEVTQPSLGVGYELGRAMALNKRILCLFRPQSGRVLSAMIRGAADGSRFQVWDYEEAEVEAMLDRYFEAEPLQHVAASHDLTA	329518	326059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_326313_326481_326593_326783_326853_329286
853939	contig_6513_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_117747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCACATTGTAAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55392	54446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_54400_55400
853940	contig_4686_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_118589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCAACCCTGTGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828890	827593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_827600_828900
853941	contig_10732_pilon	+	1155	3	Intergenic	novelGene_114734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	401	829	454534	455701	FALSE	30	TATACCTACTCTGCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWNRERVRGGPKICRVSRRETGRSTQRRRTRGEKLRGSCSGPGTAQRTTAGPHLAPGVCSIHVRSGVSTPWTSVPCWQQGGVRRAACKPPVSQPGKRECFSFHSIEEETEGQSGHTASKYGLIQNVSPELRTCPHPVLATT	448167	456027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_448498_454463_454677_455415
853943	contig_3153_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_104687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTTCTTATCAGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308952	309631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_309000_309600
853944	contig_5451_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_167193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGGCTAGAAAGGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828955	829679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_829000_829700
853945	contig_7088_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_159803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGATTGCCAAGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725747	724551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_724600_725700
853946	contig_13295_pilon	+	767	3	Intergenic	novelGene_31229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACTACAGCGCCGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82641	134751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_83228_85560_85683_134692
853948	contig_1938_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_114888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTAACAATAAGATGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265813	267078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1938_pilon_+_265800_267100
853949	contig_11656_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_53961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATGCCTATAGGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144899	144265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_144300_144900
853950	contig_4574_pilon	+	980	5	Intergenic	novelGene_174919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.22474487139159	19	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAATTGCTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32700	37302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4574_pilon_+_32809_33498_33526_33715_33743_35841_35869_36511
853951	contig_13459_pilon	+	1064	2	Intergenic	novelGene_177764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTGTTCTGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202073	203587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13459_pilon_+_202113_202562
853952	contig_10197_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_115261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095884	1096921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1095900_1096900
853954	scaffold_6394_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_110975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTGAATTCCTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342070	342613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_342100_342600
853955	contig_9389_pilon	+	450	5	Intergenic	novelGene_83916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	970.904056794491	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	35	325	159587	165859	TRUE	20	GACGCCACCTCTACGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAPRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWRQDKGAAERRGHRC	159552	166126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164295_165815_165933_166074
853956	contig_5217_pilon	+	486	2	Intergenic	novelGene_135803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAAAAGTACTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705752	706651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_705937_706349
853957	contig_10238_pilon	+	568	3	Intergenic	novelGene_170091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_2	206	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	93	311	84644	88831	FALSE	15	CCCGTTGTCACTGAGTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKMKWIPLGAKHSACFGRHPRSARENPRPPGASWEQRWAHRSLPPPGCFLSTALLSACSGDSYLLKACHVPSLL	76296	89088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_76338_84592_84646_88614
853959	contig_16525_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_133839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGTATACTGAATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175901	175266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_175300_175900
853960	contig_12173_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_172959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28617	29571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_28600_29600
853963	contig_4782_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_73692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	13	5262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTCTTGAGTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787231	798121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_787390_793914_793964_797895
853964	contig_762_pilon	-	940	7	Intergenic	novelGene_135941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	46.8852025933793	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	96	818	266669	255361	FALSE	0	CCTGGGTGCGTCTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATASIAGAPTQYPPGRAGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP	266764	255238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_255399_256309_256436_256765_256905_257514_257668_259724_259837_263903_264056_266666
853968	contig_9976_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_147908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAGTGATCCTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72941	72726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_-_72700_72900
853969	contig_17470_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_110483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCACTGGGAGGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163905	164409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_163900_164400
853970	contig_6616_pilon	+	428	2	Intergenic	novelGene_141770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	521	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	437461	457037	FALSE	20	TCACCTGGGTAACTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWVRNSAGENEETGAGTEVGALPWAPPPEELSIPGGFLPGGCPLPAPAPARAPAQRKPAECRADLEPCTPASTFLLGLRVKAFLLELSHRAQKGPSSPLSISLHPGHAPPCYLLPRVTSSHAWSQVTKPPPQGCK	437459	457056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_437597_456765
853971	contig_5434_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_74669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319760	319422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_319400_319800
853972	contig_12624_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_60972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGATGCTTCCATATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30773	31556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_30800_31600
853973	contig_4364_pilon	+	521	3	Intergenic	novelGene_234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	4563.5	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	108	521	1530895	1531387	FALSE	10	TTTCTGCTCGACTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQVTVGLRHWIHSCCLLNR	1530417	1531387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096
853975	SIRV6	+	449	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	4	6	4	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGAAAGTAAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2520	10809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
853976	contig_14300_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_133111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGAGGTAGCCACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254597	255002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_254600_255000
853977	contig_7333_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_142757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTCTAGTTCAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131480	130679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_130700_131500
853978	contig_17968_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_154542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42383	43367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_42400_43400
853980	contig_12866_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_174643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTAGAAAGGAGATCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640331	640772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_640300_640800
853981	contig_14744_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_65954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419713	420179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_419700_420200
853982	contig_6217_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_109609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACCAGCTGCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407276	408003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_407300_408000
853983	contig_15273_pilon	-	808	5	Intergenic	novelGene_140412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	89.5739917610017	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTATTACAGTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55064	9970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_10141_27929_28094_35310_35396_53305_53484_54853
853984	contig_10444_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_139453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAGGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667734	668158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_667700_668200
853985	contig_6102_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_32020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAGAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509733	509476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_509500_509700
853986	contig_7861_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_77412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGTCCTAGAATTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128504	129304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_128500_129300
853987	contig_7695_pilon	-	706	7	Intergenic	novelGene_41629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	70	705	687243	680420	FALSE	35	GCATTTTGCAAGGAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATILEREAEQSRLGATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAALGVPPIPRFPSGVMS	687312	680418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680467_681570_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
853988	contig_2054_pilon	-	1321	6	Intergenic	novelGene_51688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	47.7828421088574	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	303	965	150933	124977	FALSE	50	CAAGTCACTCACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSLQTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQVTYLF	203918	124620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_125109_127144_127254_130938_131141_132268_132354_150798_150952_203634
853989	contig_3602_pilon	+	540	2	Intergenic	novelGene_60521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAATACAGTGACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169793	171109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170088_170863
853990	contig_3948_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_53255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTTTTAACTTCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277674	1278951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1277700_1279000
853991	contig_11121_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_167061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224874	224189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_224200_224900
853993	contig_15610_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_154281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAATAAAAGGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647350	647779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_647400_647800
853994	contig_19680_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_132021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAACTTGTTATACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217998	219240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_+_218000_219200
853995	contig_6576_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_42365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	207	590	1101780	1101397	NA	30	AAAGCCATCCACTTCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIKDMATQFFVKEIKPVTDGSNQLPQQKTHQLGLKETEKNERKECCLPLGILQAGNRPQELHLLTFKKRKEPSLEQFGDSRPVGRSAESRAASVSSGAHRDKAFPLEPAPCIQAYSRLNCEKINLFV	1101986	1101396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1101400_1102000
853996	contig_5623_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_154873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTCAAATATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276253	277151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_276300_277200
853998	contig_15114_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_121239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGAAGAATCATAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697467	1696374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1696400_1697500
854001	contig_8452_pilon	-	1077	2	Intergenic	novelGene_48009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCCAAATACCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312585	309836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_309922_311593
854002	contig_5084_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_64626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAGGGAGAGCCACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276667	1277346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1276700_1277300
854003	contig_4364_pilon	+	660	6	Intergenic	novelGene_140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.78567765543682	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	84	659	1179951	1182544	FALSE	5	GGTCTGTCTGCCGGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCSFIPYCSSDVWSGASSKSEKDEYAFMGALIIREVVRELLGKGLSGAKVLLLAGSSAGGIGVLLNVDRVAEQLEELGYPAIQVRGLVDSGWFLDNKQYRPTDCIDTVACAPTEAVRRGIRYWKGMVPERCRRQFKEGEEWNCFFGYKVYPTLRCPVFVVQWLFDEAQLTVDNVHLTGQPLQEGQWLYIQNVGRQLRDTLQDVAATFAPACLSHEIIIH	1179505	1182545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1179575_1179936_1180040_1180821_1181014_1181171_1181273_1181995_1182144_1182498
854004	contig_12148_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_140322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTTACGTGAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41280	42322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_41300_42300
854005	contig_5317_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_76620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCATAGTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885419	884440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_884400_885400
854006	contig_7157_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_131289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAACAAAATTTAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857007	858124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_857000_858100
854008	contig_7513_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_89032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTGTGGGAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703429	704431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_703400_704400
854009	contig_7157_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_131284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTTTTTTACTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835341	836159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_835300_836200
854010	contig_7919_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_28045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGCAGAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640144	639473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_639500_640100
854014	contig_1996_pilon	-	1008	7	Intergenic	novelGene_131925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	3.3870669054836	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	33	836	418643	416617	FALSE	10	GGGGCCGACACCTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDNLAVRQKDMCASVRRLVLRGLANLASGSPDKVRTHGPQLLTTLIGGLDDVDDLHSLVALEAMVGLARLLDLVEPWDLRSVLLHTAIRIRPFFDSEKVEFRRASICLFGHLNKACHGDCEDVFLEQTVSALGPLLLHLRDPQATVVGACRFALRMCGPNLACEELTAAFEKHLQDGRSLHFGEFLNTTCKHLMHHFPDLLGRLVSTNLFYFKSSWENVRATAPMFMGFLVLHADRELRHQVDLEQLIAALQLLLKDPAPTVRMKAAETLGRLVKFA	418675	416444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_416703_417202_417269_417347_417451_417552_417688_417756_417913_418254_418444_418574
854015	contig_2209_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_140998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTTATAACCACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115385	116310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_115400_116300
854017	contig_5021_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_167102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAACACATCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381491	380612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_-_380600_381500
854018	contig_7898_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_47604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558889	558581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_558600_558900
854020	contig_9505_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_121827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGGTGTATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410551	411164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_410600_411200
854021	contig_9132_pilon	+	495	4	Intergenic	novelGene_121364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	13.490737563232	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCTTGGCCACACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93530	95844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_93660_93828_93895_95443_95535_95635
854022	contig_8864_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_136006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAGCCCCAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736357	736093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_736100_736400
854025	contig_4644_pilon	+	361	2	Intergenic	novelGene_160187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	28	360	9281	10018	FALSE	40	ACTGCCAGCAGGATATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDSSVQLLKMRFPAQLLGLLMLWIPVSSGDIVMTQTPGPLPVTLGEPATISCKSSQSLLHSDGNTYLNWYQQKPGQAPRLLIYTVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVAVY	9253	10019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4644_pilon_+_9330_9734
854026	contig_3942_pilon	+	259	2	Intergenic	novelGene_128622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCTAAACTACCTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151621	152151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_151704_151974
854027	contig_6556_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_168500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328490	327858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_327900_328500
854028	contig_14694_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_152475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTACTTCAGGGATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119474	118227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_118200_119500
854029	contig_7457_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_31388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAGTCATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448781	449257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_448800_449300
854032	contig_13101_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_172776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71065	71558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_71100_71600
854033	contig_15327_pilon	+	631	6	Intergenic	novelGene_70448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	15.7810012356631	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	3	623	275426	280549	FALSE	30	CTGCAGCCGGCAAAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAWCLRWGVSRAGAWLLPPPACCPRRTLHKQVDGAEFQSIYSLDKLYPESNGPDTAWKVPDDAKQANNDIPIDRLTISYCRSSGPGGQNVNKVNSKAEVRFHLATADWIAEPVRQKIAITHKNKINRAGELILTSECSRYQFRNLAACLQKIRDMITEASQTPKVPSKEDAVLRRIRTENMNRERLRQKRINSAIKTSRRVDMD	275423	280557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_275612_276943_276981_279030_279091_279626_279710_279797_279968_280464
854034	contig_4426_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_15442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACACACACATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840507	841455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_840500_841500
854036	contig_7379_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_150010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACATACTGTTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390970	391730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_391000_391700
854038	contig_3602_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_60529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	188	475	192270	191983	NA	80	AAAAAAAAAAAACACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSTNSSSFTPAGLGEQKLWRSKWGWLNGTWVSGNKGQAWRRPGLWPEEGDCLEEEREGGWRMWTADAENKGKSEGTGLVPGDQLPCMHGTVAGDLDNLFKGMTGQPPGSGHPELFPATPSCEVKPRLGSVPGHEAKREEPGFERRLLPLLLSHFSC	192457	191431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_191400_192500
854040	contig_1699_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_72814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAAAGATCATGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51467	51706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_51500_51700
854042	contig_6870_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_103978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATGCATATCAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449711	1450575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1449700_1450600
854044	contig_1996_pilon	-	484	2	Intergenic	novelGene_131924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCAGACTTCTAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403273	398665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_398817_402940
854045	contig_7753_pilon	+	435	2	Intergenic	novelGene_41486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGTTGCACAGGGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028324	1028858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1028740_1028838
854046	contig_12479_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_56854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGATTTCGTTAGCATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437765	436659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_436700_437800
854047	contig_9389_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_84009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCTTCCAGAGCTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528898	529550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_528900_529600
854048	SIRV5	+	159	2	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-14	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1097_10875
854050	contig_10494_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_102143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410558	409850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_409800_410600
854052	contig_13800_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_153717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAGCAAGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99449	98354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_98400_99400
854055	contig_8330_pilon	-	1019	7	Intergenic	novelGene_71908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	4.38431547932197	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAGTGGTGGAGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242573	1234256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1234295_1234403_1234529_1235907_1236048_1239193_1239325_1239483_1239642_1240950_1241013_1242208
854057	contig_10500_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_41169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACTGGAAATAAAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290921	1291780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1290900_1291800
854058	contig_13702_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_102657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	105	512	259592	259999	NA	55	GCATCTGTGATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTLAAYLWASANPPFSAQVVKNRAGLSQGEVALMEKKPCACGFRWKSLQNQDAENNWRQAAQHVVLGSPPAWVLPLVEMEDCHLEACPPTASRASSSSNPPVTAGASRLVAFDASMSSVWVSPLVIMLLLATEMPSGLLKDQRNPINHSYFLYLKRMTGDNCLRPTQE	259487	260615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_259500_260600
854059	contig_6557_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_33026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACGCGTGGGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631841	630610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_630600_631800
854062	contig_3956_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_14810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCAAAGTGTCGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232275	1231552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1231600_1232300
854064	contig_9200_pilon	+	786	7	Intergenic	novelGene_173989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAGTCCAGAAGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153655	225574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9200_pilon_+_153746_155852_156061_158567_158656_159435_159475_218543_218673_219073_219217_225485
854065	contig_5574_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_155853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161523	161013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_161000_161500
854066	contig_14033_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_167433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	2	457	285113	284658	NA	50	AAAAAAAAAATCCCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHWLARWRHIVLCGWRWSQAGFLTRAGERVEPFLRPWWSGTGGAERGLRRLGTSGRPSLSRDLTLQPPRRPKSTNPFTRAQEENWRRRNKTVLTYVAAAAVGMLGASYAAVPLYRLYCQVGAGAAHWASRSIGALVQDRALDSDRATVS	285114	284456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_284500_285100
854067	contig_1925_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_162209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205503	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_204700_205500
854069	contig_11448_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_66425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGCTGCGCTATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583618	583393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_583400_583600
854070	contig_13481_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_119472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTTAGGTTAAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291406	1290252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1290300_1291400
854073	contig_14882_pilon	-	374	3	Intergenic	novelGene_115038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATTGAGTAAGTATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487746	479761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_479946_487064_487185_487676
854075	contig_4364_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_4591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGTAAAATGGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2132196	2133210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2132200_2133200
854076	contig_3382_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_124061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCTGCTTAATAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247902	247493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_247500_247900
854077	contig_253_pilon	-	1171	5	Intergenic	novelGene_129650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.80788655293195	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	75	923	281565	273085	FALSE	15	CGAGCTGCTGCCTGGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGQTCVAPDYVLCSRETQERLLPAMQSAITRFYGEDPKSSPDLGRIIGEKQFRRLQGLLGCGRVAIGGQSDESERYIAPTVLVDVQETEPVMQEEIFGPILPIVNVRGLDEAVDFITRREKPLTLYAFSNNSQRPLLGAWFREGPHCVLLTDHNRGARPDSQASDQAGAGGHQQRGLLRERRLHARDAHHPALRRSGCQRDGQVPRQVLLRHLLPPPRLPAARPRDGEDLCHPLPALLATQPEVAAGGHGDPQLQLHPALSCLGEGAQVHVWVPWLVETGLESRGQEEDVLCQGQGCLLPSCPPTR	281639	272836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_273416_274871_274972_280140_280232_280555_280723_281405
854080	contig_13460_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_162195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGAAACGTGTAATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325881	324807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_324800_325900
854081	contig_1146_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_84790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCTGAGGTAAGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137821	136771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_136800_137800
854082	contig_5495_pilon	+	992	2	Intergenic	novelGene_157663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	209	817	41787	42395	FALSE	80	GGAAAAAAAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQVLRRGLQSFCHRLGLCVSRHPVFFLTVPAVLTITFGLSALNRFQPESDLERLVAPSHSLAKIERSLASSLFPLDQSKSQLYSDLHTPGRYGRVILLSPPGDNILLQAEGILQTHRAVLEMKVNHRGYNYTFSHLCVLRNQDKKCVLDDIISVLEDLRQAAVSNKTTARVQVRYPNTKLKVCSSCMLLPIKEAALHFLP	41263	42570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_41435_41749
854083	contig_15354_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_65771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAGATGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672984	674223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_673000_674200
854084	contig_6980_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_35992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTGACTCATAGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225455	224611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_224600_225500
854085	contig_12528_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_81288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATGAGCAGGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320941	320645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_320600_320900
854086	contig_4315_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_46778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCTCCTCACCACTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301884	301036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_301000_301900
854087	contig_1008_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_121534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGTCCTATCCAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219386	218986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_219000_219400
854088	contig_1008_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_121533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACCCAGATCTCCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218496	217998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_218000_218500
854089	contig_13191_pilon	-	824	2	Intergenic	novelGene_177766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335249	332754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13191_pilon_-_333501_335171
854092	contig_20716_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_176134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGGATACAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84154	84929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_84200_84900
854093	contig_15323_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_148527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATGTGAATGTGACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115828	114763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_114800_115800
854095	contig_9981_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_121062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTAAACTTACTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306858	307341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_306900_307300
854096	contig_17964_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_33913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391499	391940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_391500_391900
854097	scaffold_9100_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_83233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494247	493404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_493400_494200
854098	scaffold_13505_pilon	-	457	5	Intergenic	novelGene_111481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6014.89908477274	2	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	36	455	547805	540194	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGWQLPTRNIRTNDAGLINCLIR	548330	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
854099	contig_2940_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_81921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGTGAAATTGCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548577	547289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_547300_548600
854100	contig_9981_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_121043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTCTGGGCATGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210455	211028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_210500_211000
854102	contig_9440_pilon	-	835	2	Intergenic	novelGene_59075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGGAAAGAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146522	1143795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1144041_1145932
854103	contig_16103_pilon	-	583	4	Intergenic	novelGene_118796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	507	junction_3	37.853518844209	1575	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	279	419	589403	589263	FALSE	10	TGTTTTCTTCCCCGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGCFWRLISAPLLPLTPCSHAEAPVREDKQSVSTSNLQCWLVEEFVVAEECAPCSYFQAKTIPECSSTGYVEKITCSSSKRSELKSCRSAVMEQQLFWKFEGAVVVVAMVFACLVIVRQRLLDRKALEKVRKQMEST	590663	589098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_589420_589795_589876_590287_590371_590564
854105	contig_6175_pilon	-	757	3	Intergenic	novelGene_16371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	128	565	1819672	1808591	FALSE	25	TTTAAACGTAACTGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSCLTLVPGGQPELGRWAVSGAAQRLTHLVPFPAGISCSKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPPILNPPPSPATDPSLYNVDMPYIIRGMVPPTTPCSTDVCDSDYSASRWKASKYYLDLNSDSDPHPPPPTPHSQYLSAEDSCPPSPATERSYFHLFPPPPSPCTDSS	1819799	1808398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1808853_1811545_1811602_1819552
854106	contig_20371_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_129186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACTGTAGGTCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67376	68093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_67400_68100
854107	contig_20371_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_129187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTCTAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68040	68469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_68000_68500
854108	contig_19076_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_74202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATCCCCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92476	93023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_92500_93000
854109	contig_1575_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_45176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGTTGACCTAGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132803	133116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_132800_133100
854110	contig_5039_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_64759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGAAATAGCTATCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116838	117537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_116800_117500
854112	contig_11702_pilon	+	467	3	Intergenic	novelGene_142016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50.5	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTCGTGGGGACGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531186	535773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_531477_535097_535182_535680
854113	contig_2332_pilon	-	491	4	Intergenic	novelGene_58631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	658	junction_3	874.597939373033	3314	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTCAAGTTTGTAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68040	64468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_64652_64900_64970_65214_65352_67938
854115	contig_5050_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_110302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTGTGCACGTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834437	799445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_800245_834303
854118	contig_20742_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_150665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCTCCCAATGTCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157687	156285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_156300_157700
854119	contig_7272_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_25329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAGACATATGGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558846	558319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_558300_558800
854120	contig_10734_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_51101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACTTTATAATATTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596829	596080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_596100_596800
854121	contig_7695_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_41661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	471	815	892584	892240	NA	25	CGGTTAATGAGGTTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVYFFGQSPNTSRSLVCDGASLSVPSWPLSVQAHLQLNCSNPSLSNIKSLQPFYMGPMLVILACLSFLNIYHYVCLVIFGQLPSLACWIEKASADWQEAAVQQRGINKITGCC	893054	891875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_891900_893100
854122	contig_12490_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_169048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAAAGCACTAGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51657	50929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_-_50900_51700
854123	contig_116_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_154884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCATTTTTTAACTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16714	17465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_16700_17500
854124	contig_7051_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_64296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGGAAAAAAATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185188	186432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_185200_186400
854125	contig_8866_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_77908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTATATGCTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149340	1148657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1148700_1149300
854127	contig_8276_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_174470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	339	686	104211	104558	NA	40	CAAAGTTACAAAGGCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVLTPTYNYLLKPDDSFRAGRQVRNHRSNPISLHFMVEKTEAHRGSVVGSIYIHSQGAETSSHSVLSGSHLPRCSENLPMQEASLPIRFEEGALLQVSLILGFFIFEMEIPELA	103872	104891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_103900_104900
854128	contig_7201_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_152516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATACGTCCTCAGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297689	298156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_297700_298200
854130	contig_17198_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_62356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGAGGTTCTTCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718976	718364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_718400_719000
854131	contig_740_pilon	+	397	2	Intergenic	novelGene_158943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	411	junction_1	0	3813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGAATTTTGTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199883	201988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_+_200013_201720
854133	contig_8907_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_85783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCAGTTTCCTCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22160	23332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_22200_23300
854134	contig_7057_pilon	-	405	4	Intergenic	novelGene_123201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACCGGAGGCGGAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425756	418024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_418084_419807_419925_421270_421372_425628
854135	contig_12031_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_137580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTTGGTAAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444550	445306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_444600_445300
854138	contig_10063_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_127754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624557	623747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_623700_624600
854140	contig_593_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_102022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	500	937	438825	439262	NA	75	AAAAAAAAGAAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGRSDDPHSADVNTGSEKYSVLCRLEGAPGFLMSGEHLNSGHIPLLYLLPPKIWVIYSERAHFLIDFAPWARNVQTFIQHEGVTLWGQEAVTLLSDVTYARTEAASGFCCIISVTPCDCTPPCMRYLVWHGCPVSEDKPRQVD	438325	439361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_438300_439400
854141	contig_8310_pilon	-	707	4	Intergenic	novelGene_75540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.49443825784929	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCCAAAGGTTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191715	169781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_170025_177787_177959_186018_186080_191483
854142	contig_13607_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_170179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTAATGATGTGTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214484	215197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_214500_215200
854143	contig_8554_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_160268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCAGAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10648	9433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_-_9400_10600
854147	contig_6192_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_170339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764124	765779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_764100_765800
854148	contig_15327_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_70473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371124	370320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_370300_371100
854149	contig_14526_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_111206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTTGTGAGTTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297354	296050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_296000_297400
854150	contig_7707_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_72237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGAAGCTGAGTTGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201920	1203356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1201900_1203400
854152	contig_13901_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_146661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAAGATTACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262746	263766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_262700_263800
854153	contig_17968_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_154546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAGTTAGATGAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61629	62874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_61600_62900
854154	contig_10549_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_110630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAGTTACACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399226	400159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_399200_400200
854155	contig_7345_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_159174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTGTTTCATTCTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116517	115107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_115100_116500
854157	contig_3797_pilon	+	1196	2	Intergenic	novelGene_120113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	112	417	544545	716657	FALSE	45	ACACCATAAAACGCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFPGRPDAGIRRNPGRPQTTHSGEDILRRVLWRGPHGEVKPPPLKPPASSHRSQLGSRFSRPSEISDDCTRGWHLDCSPVNNSEPEPPAKLLSDSPQKL	544433	717436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_544605_716411
854158	contig_13992_pilon	-	1023	8	Intergenic	novelGene_147625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	219	662	386178	380180	TRUE	30	AAAGCCGAGCGCTGCCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSEISSSFTPLSFRSGVLDGGMGVRFPAGLKTLGVVGLRNGACFGMPLSGVVVSILRSSPPPLGVEGHPCASLQLLGRLGGLLQELCSQRGALGLPFQLEVLHGGREGSGQGGQGVFVQVLALQWQHGRRLALAHCFSLSSPKIS	387973	360561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_360781_380037_380210_381795_381962_384490_384582_385923_386053_386150_386221_386758_386847_387885
854159	contig_12993_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_136735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTTCTGCTAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112707	113391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_112700_113400
854160	contig_6576_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_42459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495435	1494311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1494300_1495400
854161	contig_5961_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_144155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCCACCAGATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218454	217527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_217500_218500
854163	contig_11932_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_85391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCGGGGCGGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107083	107564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_107100_107600
854164	contig_7066_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_42202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTGCTTGAATGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035688	1036638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1035700_1036600
854165	contig_14338_pilon	-	1137	2	Intergenic	novelGene_174839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95175	93640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_94654_95051
854169	contig_10451_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_138320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCCTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275907	276296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_275900_276300
854172	contig_3754_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_146844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGGATTGGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388436	388865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_388400_388900
854174	contig_19032_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_172558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAATGATTTGAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167344	168142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_167300_168100
854175	contig_8110_pilon	+	273	3	Intergenic	novelGene_158617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_2	9	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGCAGCATACAGGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152089	153415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_152206_152441_152518_153334
854176	contig_3095_pilon	-	323	2	Intergenic	novelGene_75204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253718	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246621_253642
854177	contig_8415_pilon	+	1338	2	Intergenic	novelGene_141696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAGTCTAACAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234971	240383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_235541_239614
854179	contig_2100_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_50645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTCTATTTTATATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018088	1018864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1018100_1018900
854181	contig_6975_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_74281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACCGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398238	397647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_397600_398200
854184	contig_7662_pilon	-	1745	1	Intergenic	novelGene_176565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	503	913	409260	408850	NA	10	AGCGCCATTTGTTGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFRCEAWRPQGVGRTGHRCVSSMKLSDHTRDGTGHRCLRCEVQRPQRKGTRHRYVLGVKLRDHMGDKSGHRRVSGVKPGDHTDNETGHRCVSGVKLRYLTGTAQEHPMCLSALENPYIVTGSTPFNLTIQGLKPD	409762	408017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7662_pilon_-_408000_409800
854185	contig_1172_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_162028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTTTCTCCCAAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579992	579426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_579400_580000
854186	contig_10163_pilon	+	868	4	Intergenic	novelGene_82659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2.05480466765633	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	87	449	226271	238676	FALSE	55	TTAGAAAATTTGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSYFDSFLELLGGKNGVCQYRCRYGKAPMPRPGYKPQEPNGCSSYFLGLKIPESMDLGIPAMTKCCNQLDVCYDTCGANKYRCDAKFRWCLHSICSDLKRSLGFVSKVEACDSLADTVFNTVWTLGCRPFMNSQRAACICAEEEKDEL	209115	239095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_209191_226259_226349_235440_235607_238557
854187	contig_12786_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_103455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCCACCCCTGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658658	658070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_658100_658700
854189	contig_21389_pilon	-	1278	10	Intergenic	novelGene_176728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	446	964	17691	14718	FALSE	45	ACTAATAGTAAGCAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVDEGLVKAIGISNFNHFQIERLLNKPGLKHKPVTNQIECHPYLTQEKLIQYCHSKGISITAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIKQIAAKHNKTAAQVLIRFLIQRNLAVIPKSVTPARIAENLQVFDFQLSAEEMATLLSFSRNWRVCCLSDLANVEDYPFAAEY	25642	14403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21389_pilon_-_14761_15414_15498_16044_16129_16650_16733_17221_17329_17571_17695_20298_20377_21326_21444_22490_22658_25562
854190	contig_16098_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_45803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATGGCTAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99592	98585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_98600_99600
854192	contig_18055_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_117795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25848	25353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_25400_25800
854194	contig_2770_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_107414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCAACTCATAGCGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183813	183405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_183400_183800
854195	contig_13707_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_43509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGCTGTGTTACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46736	46261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_46300_46700
854196	contig_10636_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_172271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGACTTGTTCTTGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11970	11515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_-_11500_12000
854197	contig_5361_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_167224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647699	646559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_646600_647700
854198	contig_14744_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_66151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAACGAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655498	1656175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1655500_1656200
854199	contig_15130_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_177108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGGGAGCTGGGACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210162	210803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_+_210200_210800
854200	contig_9706_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_20949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAGCATAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267792	266571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_266600_267800
854201	contig_13481_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_119515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTATTACTTATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414705	1415597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1414700_1415600
854202	contig_5918_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_99520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTCCTTGGAAACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574261	573470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_573500_574300
854203	contig_14040_pilon	+	268	2	Intergenic	novelGene_177767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTATCAACCCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16490	17294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14040_pilon_+_16644_17179
854204	contig_9647_pilon	+	1225	1	Intergenic	novelGene_127391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGGGAAAATCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117135	118360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_117100_118400
854205	contig_11448_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_66387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	54	302	397846	398094	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELEEWYTLHSVEPWVWMFLEPVSRWQLTESHLCFVAHLHLQRGVWVGTPIRCAHLRTNCLNIITTLGKLPLPNGESGPLPPRTITWAGHIDPLTFFTW	397792	398513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_397800_398500
854208	contig_15459_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_106370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTAAAAACTAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11382	12077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_11400_12100
854211	contig_14665_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_171052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74504	73784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_73800_74500
854212	contig_14450_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_49062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGCTCCAATAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468186	1469367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1468200_1469400
854214	contig_5727_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_8000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAATAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016557	1017535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_1016600_1017500
854215	contig_10182_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_134626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	95	475	351118	351498	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYRLQVRVPTFTSLLGRGQKSPRKKEVTARPMKKKSKAHTVATEKSLFRVDCHESKCDPMPHFPLPCPHYMPRKKEEKFSNQDSQQTLIPTPLAAWSASVRSERAGQACFPQLGPPGFAGNALFKEPAFTKSFHFFLTYSCFFLSFSSFPVACIFFF	351023	351566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_351000_351600
854216	contig_5539_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_104793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAACAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392949	393305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_392900_393300
854217	contig_4659_pilon	-	394	3	Intergenic	novelGene_118168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	646	1031	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTAATGCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91124	87467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87670_90822_90924_91033
854219	contig_6479_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_160612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCAGGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593928	593693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_593700_593900
854220	contig_3382_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_124226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACAGGTTACTAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1944551	1944954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1944600_1945000
854221	contig_4519_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_123702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGTACACATGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568536	567986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_568000_568500
854222	contig_5718_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_110394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	76	486	1275433	1275023	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQKQTSRSKIKPTVNRSSYHTKDPDPAWVRATAQAPRTDWKFRQGLSCEGHGGYLQRQRLLVNKGTSSGPSVVLNRNEGQGEGKENKFVLSRVGEILPLKSPPEEKCSLLTLPPPSLVSTFCPYSTTEYYIVGSG	1275508	1274672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1274700_1275500
854223	contig_7050_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_153621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTGATACTTAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648738	649032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_648700_649000
854228	contig_10769_pilon	+	467	4	Intergenic	novelGene_177005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.4142135623731	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTTCCCATGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241840	249705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10769_pilon_+_242043_244207_244240_245923_246031_249579
854231	contig_12644_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_44549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATCACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563964	1564722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1564000_1564700
854232	contig_3825_pilon	+	980	7	Intergenic	novelGene_77996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	119.943621015135	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	29	979	979951	1003543	FALSE	5	CTGGTACGCCCTCCCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLSSPINGMGPPFSVISSPMGPHSMSVPTAPALGFGSGSPQLNSPMNLVSSTEDIKPPLGLNGVLKVPAHPSGNMASFTKHICAICGDRSSGKHYGVYSCEGCKGFFKRTVRKDLTYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLAMGMKREAVQEERQRGKDRNENEVESTSSANEDMPVEKILEAELAVEPKTETYVEATVGLNPSSPNDPVTNICQAADKQLFTLVEWAKRVPHFSELPLDDQVILLRAGWNELLIASFSHRSIAVKDGILLATGLHVHRNSAHSAGVGAIFDRVLTELVSKMRDMQMDKTELGCLRAIVLFN	979922	1003544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_980050_986269_986421_986842_987023_996728_996899_1000661_1000792_1001413_1001547_1003455
854234	contig_7322_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_164903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15691	16661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_15700_16700
854237	contig_5586_pilon	-	647	2	Intergenic	novelGene_143598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCATGTCTTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652448	615541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_615858_652117
854238	contig_17603_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_152781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCATAAATATGCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45932	46628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_45900_46600
854239	contig_9888_pilon	-	795	4	Intergenic	novelGene_162257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	17.2819751957543	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAATATACAGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43725	36692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_36999_37132_37223_37446_37784_43663
854240	contig_3602_pilon	-	602	3	Intergenic	novelGene_60574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	33	190	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	224	487	598176	597153	FALSE	10	GATTCTGAGTGGTGGCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFRGALLPPPRPRSGCSRGSFAPGHGPRAGASTPPVSELDRADAWLLRKAHETAFLSWFRNGLLASGIGVISFMQSDMGREAAYGFFLLGGLCVVWGSASYTVGLAALRVPMQLSLGGCGCRGRGCAGSQPALGLCGWSLYGSARAGRGAGARGRQDSHC	599437	597037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_597383_598142_598236_599273
854241	contig_7342_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_71182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTGCTCAGAAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484628	484971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_484600_485000
854243	contig_5495_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_157665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	280	840	140	979	252949	253788	NA	25	TGCAAAATGTTACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHHEANPYQHHVIQHFLREHYNEWITNIYVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQIGDGANIINLLASDSPSVSYAMVQQKYFSNYSPVIGFYVYEPLEYWNSSVQEDLRRLCSGFTAVSWVEQYYQFLKVSNISANNKSDFIHILQSSFLKKPEFQHFRNDIIFSKAGDENNIIASRLYLVARTSRDKQKEVIKVLEKLRPLSLSKSIRFIVFNPSFVFMDNYGLSVTVPVLIAGFGVLLVLILTFFLVIHPLGNFWLILSITSIELGVLGLMTLWNIDMDCISILCLIYTLNFAIDHCAPLLYTFVLATEHTRTQCIKSSLQEHGTAI	252809	253789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_252800_253800
854244	contig_5059_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_140742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTGAATGGAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285352	284390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_284400_285400
854245	contig_2476_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_157636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTTGTCAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391600	390664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_390700_391600
854247	contig_4305_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_136704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGCAAATGTACTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767781	768306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_767800_768300
854248	contig_8631_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_121942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGGAAAATCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664582	665664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_664600_665700
854249	contig_6954_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_64407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAATAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11694	12115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_11700_12100
854251	contig_7254_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_145837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACGACAAATTGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165416	164912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_164900_165400
854252	contig_10642_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_78712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACATAACTGTATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890001	890824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_890000_890800
854255	contig_8064_pilon	-	482	3	Intergenic	novelGene_164549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATGTAAAGAAGAGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39594	22889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8064_pilon_-_22936_24131_24259_39285
854256	contig_6101_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_114291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATATAAAAAAAAGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345945	345111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_345100_345900
854257	contig_15631_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_151531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	414	758	33585	33929	NA	45	AGGAGGAGGCCAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAHYLLALKQQAALSSHATLAHAKSSREDRTSYSMVCRQGSFWEAADGLVHFPAPNKKCLVLNGPVPGVLPCDLPSYLNLREMQTALGEWFMCVNIDVVTLVLQVLDTVVLR	33171	33972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_33200_34000
854259	contig_15838_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_174345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTTGAACATCGGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291372	291614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_291400_291600
854260	contig_12496_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_170710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAATGAAAATACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305304	305094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_-_305100_305300
854262	contig_13571_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_128133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAAAGAGACTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356160	355449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_355400_356200
854263	contig_17440_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_7648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3521	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3500_4000
854264	contig_15866_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_63590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCCAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224839	225604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_224800_225600
854265	contig_6589_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_26064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTAATATAACGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1732726	1732010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1732000_1732700
854266	contig_6445_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_77021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCACTACCACCTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525159	524658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_524700_525200
854267	contig_6445_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_77020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524483	523972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_524000_524500
854268	contig_4305_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_136700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	165	776	650678	650067	NA	35	GGGGGAAGAAGGACCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRQLVSHLRDHPELLINLLRDLLGLHIIIPREHLGWFINLSDVLRQQIDYRRLMGQPANLHRELLAWLDDLLGDLLGWSANFHKNFLDQTINLHRAPLAWLVDLLRVLLAKLTDFLRDLAGLLAWQTDLRDLLACLVNIVMVLLAWLADILRGFPAQLAITRDLLAWLADLRHLPAWLADFLGDVPARLAEFLNELLAWVADLLRDILAWLAGLHRWLLWGLISFKSFFLPFYRLLCSIPRSLLTLPKALTFFSHM	650842	650012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_650000_650800
854270	contig_10003_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_88224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAAGGAGATCGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599102	599606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_599100_599600
854271	contig_6589_pilon	+	580	2	Intergenic	novelGene_25809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACAGTGGCACTTCGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674658	675538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_675078_675377
854272	contig_5331_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_112805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCACCTGTCTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710898	708239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_708614_710703
854273	contig_3155_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_26330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56926	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_56000_56900
854274	contig_14640_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_168048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATCCCCCTCCCTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357507	356827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_356800_357500
854275	contig_2414_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_158515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGCTCCACCAACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519857	521236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_519900_521200
854276	contig_4496_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_66649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGACTTTATGGCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723148	722747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_722700_723100
854277	contig_12278_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_152584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGTAAAGGAAAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151263	149970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_150000_151300
854278	contig_3817_pilon	-	810	6	Intergenic	novelGene_78312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	48.9595751615555	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	137	703	165128	160335	FALSE	25	GTACGTCTTTAACAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPTLPSYWCSRRLLGQQLARQQEQADRLRQQWDQNSRYFQLSDICSSKQAEWSSKTSYQRSMHAYQREKMKEEKRRSLEARRERLRQLMLEEQDLLAKELEDLRLSMNSRERRIRERHGNLKSAREEQRKLIAEQLLYEHWKKNDPKLREIELDLHKKHVINSWEAQREEKKQARNRLSPRLLNTC	166571	160227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_160377_160471_160541_161333_161391_162147_162359_164940_165129_166435
854281	contig_753_pilon	+	1441	1	Intergenic	novelGene_112933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATAGAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620716	622157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_620700_622200
854284	contig_5317_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_76612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTGGATATTATCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760037	760807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_760000_760800
854285	contig_14807_pilon	+	853	5	Intergenic	novelGene_124647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	19.4679223339318	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	103	591	33602	34836	FALSE	30	TGTGCATTGTAGCTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSGPTWTPWRVPAAMPWPAALLLLVLASGAEAFRICAFNAQRLTLTKVTREPVMDTLVRILARCDIMVLQEVVDSSGNAIPLLLRELNRYDDSGPYSSLSSPLLGRSTYMEKYVYIYRVSGSRFKITENPKEMSSCPQMFIASIVRDSQKVKETQVSINR	32733	35098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_32816_33581_33785_34135_34225_34307_34395_34706
854286	contig_9375_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_136086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAATTTTTTTTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710216	711585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_710200_711600
854287	contig_9185_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_166896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTGAAAGAGGTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281752	280714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_280700_281800
854290	contig_6110_pilon	+	1579	1	Intergenic	novelGene_163283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	993	1328	659570	659905	NA	15	TCTCTTTCTTCCTCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRVIFFSYPYADLILHIANTGFWLPICEKFRKSLLTSLCAHRSQSCREQACKPRACKPRACKPRACKPRACKPRACKPQACKEQACRVEASLVALVLGRTKLLHRIMRR	658577	660156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_658600_660200
854291	contig_19743_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_173156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTATTAGCAACCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246545	247361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_+_246500_247400
854292	contig_15354_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_65762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	124	297	646417	648005	FALSE	45	AACATGTTTTTAAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLAIASVVSGINEKLFFSLTNVTKPYSSLPSEAVFANTTGMLVVIFGLLVLYILLASSWKRPEPGILTNRQPFPWRVYPCCSWRALLISTLWLTMKM	645114	648477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_645174_646352_646510_647924
854293	contig_9389_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_84002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508600	507612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_507600_508600
854294	contig_3163_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_168066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCTTGCTATCCACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183825	183547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_183500_183800
854295	contig_2550_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_135650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCGGCAGGCAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832427	834314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_832400_834300
854298	contig_12485_pilon	-	354	3	Intergenic	novelGene_147283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTTATTTTGTTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129281	121849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_122007_122152_122264_129195
854303	contig_7898_pilon	+	427	4	Intergenic	novelGene_47569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	699.534289525697	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	9	338	483973	487407	FALSE	50	AGATGGCTTAAATAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKMAVVVGSRVSGLLLRSRPQLGRPMASSAHGEEGSARMWKTLTYFVALPGVGLSMLNVFLKSHHGEEERPEFIAYPHLRIRSKPFPWGDGNHTLFHNPHVNPLPTGYEDD	483964	487496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484076_484218_484362_487267_487350_487405
854304	contig_19311_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_144093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCAGAGACTCCTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262673	263526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_262700_263500
854305	contig_16411_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_77379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342031	342963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_342000_343000
854307	contig_7057_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_123384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTTGTATATTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187906	1187396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1187400_1187900
854309	contig_14986_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_59719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	110	307	139484	139681	NA	30	TTAATATTTCTCCAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQPGVLPESLSTATILVTRWPGSAERGASSTQVEPSMGRVGYRISGALSFWSSTNRVSDTLLLSNGSPLSLAVIHNFRSQKCSKSKERSPYRTPVSEFMEK	139374	140282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_139400_140300
854310	contig_6735_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_15826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAGCCACTAAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647371	648160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_647400_648200
854311	contig_3956_pilon	+	896	7	Intergenic	novelGene_14745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_6	12.6852933220587	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	199	894	627594	633400	FALSE	10	CCGGGACCGGCCTCGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIALTSGEWEVLARHGSKIWVNEETKLVYFQATKDTPLEHHLYVVSYAAAGEIVRLTTPGFSHSCSMSQNFDMFVSHYSSVGTPPCVHVYRLGGPDNDPLHKQPRFWASMMEAASCPPDYVPPEIFHFHTRSDVQLYGMIYKPHTVQPGKKHPTVLFVYGGPQVQLVNNSFKGIKYLRLNTLASLGYAVVVIDGRGSCQRGLRFEGALKNQMGQVEIEDQVEGLQYVAEKYGFIDLSRVAIHGWSYGGFLSLMGLIHKPQVFKRPGRDEPPSSLPAAADPRTASGYTQPHRQLSVAG	623493	633402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_623548_627449_627603_628530_628667_631001_631148_632330_632478_633006_633160_633295
854312	contig_4156_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_88123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATAGGGTTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462853	463505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_462900_463500
854315	contig_10074_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_57165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	148	456	537661	537969	NA	25	CTTCTTTTTTAAACGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLYERGENYERIHTRLFNLSSWSVGRDVYIFELYVLYGTIKPCCFCNLKLQIREQTLKVSWWVNVGCDLALYRSHSPAVRGSSVQKRRSRSSPAAPLFELL	537513	538404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_537500_538400
854318	scaffold_4805_pilon	+	1104	6	Intergenic	novelGene_161047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	5.95315042645489	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	66	569	1036937	1044891	FALSE	20	ATACATTGTCTCCTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTGIVSTTQRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISFAIPSDKIKKFLTESHDRQAKGKAVTKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFPDVLSGAYIIEVIPDTPAEAGGLKENDVIISINGQSVDSANDVSDIIKKESTLNMVVRRGNEDIMITVIPEEIDP	1036871	1045426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_1036970_1038345_1038379_1039995_1040111_1041494_1041553_1043061_1043158_1044722
854319	contig_9753_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_41338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATAACCGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93040	91876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_91900_93000
854320	contig_4964_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_157251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATCAGCACAGAGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47225	47935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_47200_47900
854321	scaffold_19766_pilon	+	1110	7	Intergenic	novelGene_34372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGAGCCAGCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687211	696071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_687654_687872_687946_689162_689245_689556_689659_689922_690097_695733_695893_695993
854323	contig_11110_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_177257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26940	27270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_+_26900_27300
854324	contig_8268_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_147011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAGGGAGTGAGCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331926	331398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_331400_331900
854325	contig_16666_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_61786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGATTTGGCAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114103	114540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_114100_114500
854326	contig_15185_pilon	-	1014	3	Intergenic	novelGene_99400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	3	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	393	722	171550	170451	TRUE	20	GTGAGGCGCGCGGAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPKECEEWVGSAYLFVESSVDKVILSDTYANPQKKVAVYSALRTALAESSGSPDQLQMLKIHRSDPQLILQLRFCGRQPCDRFLRAYREGGRCAPRCRGAWRRHLP	171942	170077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_170269_170349_170630_171399
854327	contig_12886_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_135485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATCCTCCAAAGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355923	357622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_355900_357600
854329	contig_6557_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_33016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611587	612178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_611600_612200
854333	contig_9633_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_139597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104057	103315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_103300_104100
854334	contig_4982_pilon	-	725	7	Intergenic	novelGene_172231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	103.494632174277	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	92	724	63978	36958	FALSE	25	GTAATCAGAGGGTATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIQLRSYQLEGVNWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLARRLNDEGPFLILCPLSVLGNWKEEIERFAPSLSCVVYTGDKEERAHLQQDLKQESCFHVLLTTYEICLKDASFLKSFPWSVLVVDEAHRLKNQSSLLHKTLSENSLQELYSLLSFVEPDIFSKEQVEDFAQRYQDIEKESESATELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSAMQKKYYKAILMKDL	64069	36956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_37113_37733_37852_39258_39341_43972_44005_44628_44744_54312_54420_63954
854337	contig_9415_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_109887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2057161	2058587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2057200_2058600
854338	contig_8650_pilon	-	608	4	Intergenic	novelGene_162639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	16.062378404209	1176	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	117	359	395742	389059	FALSE	10	CTGTTTCTTCTGCAGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSAAASVLSAFAAIVRERRASAAHATEVLGTGRSRVVKMSLRKQTPSDFLKQIIGRPVVVKLNSGVDYRGVLACLDGYMNIALEQTEEYVNGQLKNKYGDAFIRGNNVLYISTQKRRM	412320	388809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_389094_391470_391585_395648_395753_412214
854340	contig_5479_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_133574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGAGAGAGCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132081	132501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_132100_132500
854341	contig_4732_pilon	-	1025	6	Intergenic	novelGene_75357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.54919333848297	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	48	632	29103	26663	FALSE	15	TTTTTCTCTACTACTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCLTRVSLPLLLLLLVSLGLIFVLLVITQVQVAGPQKQLQSDLEEIRQQLTWMNTSLAGLCRPCSWSWEFFQRNCYFLSQTQGTWEASVSACRDQGAQLVIVNSVEEQRFLQFWKVRRDTRTWIGLSDHHNEGAWHWVDNTKLQLSFWIEGEPNNIGEEDCAELLTTGWNDNKCTSENFWICEKPSTPCPGL	29150	26269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_26805_27194_27308_27764_27917_28162_28241_28890_28984_29096
854342	contig_3449_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_73703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACATCTCGGAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295944	295696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_295700_295900
854344	contig_10296_pilon	+	480	5	Intergenic	novelGene_168896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	46.2736426056994	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	50	340	978088	988219	TRUE	25	TATACCAAGTCTGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFRQLALAFCNSLPSNMPGPTPSGTNVGSSGRSPSKAVAARAAGSTVRQRKNASCGTRSAGRTTSAGTGGMWRFYTEDSPGLKVGPVPVLVMSLLFIASVFMLHIWGKYTRS	978038	988414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_978091_978281_978380_984694_984797_988131_988261_988315
854345	contig_8254_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_48366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGTGTGGTCGCCACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20043	22391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_20162_22151
854346	contig_21374_pilon	+	1697	5	Intergenic	novelGene_177039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	1325	1696	37856	38227	FALSE	5	CTGGCTTCTGCTGCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWLQTKRRNNDVVVWQVGVGSSPFSICSFRQVQTIQHTMGAEPMLNKAVLLLIKSKARRAWSSSWKCFKKYSFLSISKKPSISMRSGCCIKSQSCLSAQGRVVIRRVALGNIFLVSKLLKRMG	28544	38228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21374_pilon_+_28612_28944_29124_34341_34501_36230_36411_37116
854347	contig_10734_pilon	-	913	5	Intergenic	novelGene_51123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	204.638095182691	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	124	768	739047	737389	FALSE	10	TTGGTTGTAGACTCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRRRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKVGITILPVTHLSCTFHVPSPAHVLLLQQATRGDGLAFQMRAGLLP	739487	737243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737597_738019_738138_738215_738501_739013_739056_739372
854348	contig_13702_pilon	+	1030	3	Intergenic	novelGene_102659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGAGCCTTCCCCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268854	273107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_268924_271388_271587_272344
854352	contig_9363_pilon	-	1072	6	Intergenic	novelGene_6669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	43.7492857084547	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	461	1072	1067938	1065483	FALSE	40	AACTACCCAGCATATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIIHAQLDIKGQQRMKYYELIVNGSYTPQTVPTGGKALSEKFQGSSAATETTESRRRSSSDTAAYPSGTAVVGTPGNGTPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQSSQGTPYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRRSENSYQDSFSRRHFSASLAPTTTSAAISATTAATSTSSSSSTSLSSSSSSSSSSSSSHFRGSDS	1070378	1065482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1065706_1066001_1066232_1066677_1066800_1067901_1068174_1069932_1070029_1070249
854353	contig_1213_pilon	-	614	2	Intergenic	novelGene_76458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	39	587	37952	29514	FALSE	20	TCCCCTCATTAAGGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNREVPGYSSRWGTTQDTALWSGQLRGHAHRQASPWPLASQPLATRDSWASPASTLLRKLLQSSLALLISGQRHPTPPGSLQPEGAQLSRSVGRHGHCSHLAQWARKSTAPSPVGLLVLLPPFLCHHFLLSRAISGVRALSPGSSRFSAQGPQVQRMHSAPCLFLVVVRSPPFCLWDGSF	37990	29486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_29543_37432
854356	contig_2106_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_177769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305270	305726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2106_pilon_+_305300_305700
854358	contig_8552_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_80102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGTCTTTTCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545528	546418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_545500_546400
854359	contig_19026_pilon	+	308	3	Intergenic	novelGene_173474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.5	67	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTATGGTCAGGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8357	18311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19026_pilon_+_8533_8711_8793_18259
854360	contig_10861_pilon	+	782	3	Intergenic	novelGene_39382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.5	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	40	369	1685906	1686361	TRUE	45	ATGAACTCTATAATAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALSPVRGCYEAVCCLSERSLAIARGRGKGPAAEEPLSLLDDMNHCYSRLRELVPGVPRGTQLSQVEILQRVIDYILDLQVVLAEPAPGPPDGPHLAIRTHSRTRDLQ	1685866	1687322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1686202_1686327_1686409_1686956
854362	contig_5472_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_130036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGATAAAAAAAAGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411994	411737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_411700_412000
854367	contig_9132_pilon	+	385	3	Intergenic	novelGene_121365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGGCCACACACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93551	95846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_93660_93828_93895_95635
854368	contig_19185_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_163643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	356	685	108761	109090	NA	60	TCTAAAAAAAAAAAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRQCALCREDTKEGIWRSHVLFCSDLILNKRRKVGGCTRGKKQQARWITLGLQRKSRRKVGLQISPRVLTSKRMAFLNKLSSLNLSKPKQMYQTTLLVLPQKRKSCP	108405	109262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_108400_109300
854370	contig_6136_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_154103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCTGTAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247867	248948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_247900_248900
854371	contig_16103_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_118950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGCTTCTTACTTAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994799	994154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_994200_994800
854372	contig_2854_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_120873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAAACTTACTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018056	1017314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1017300_1018100
854374	contig_12118_pilon	+	768	2	Intergenic	novelGene_168904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAGCATACCTGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43428	48382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_+_43502_47687
854377	contig_17603_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_152800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTGGAACAGTGGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192363	191780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_191800_192400
854378	contig_9900_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_159520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGAGTTTCTAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376366	377304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_376400_377300
854379	contig_9051_pilon	-	684	7	Intergenic	novelGene_170815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	41.8678476478869	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	15	683	1063626	1050009	FALSE	10	CAGTCTGGGCACTTGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLEHYLDSIENLPCELQRNFQLMRELDQRTEDKKAEIDILAAEYISTVKTLSPDQRVEHLQKIQSAYSKCKEYSDDKVQLAMQTYEMVDKHIRRLDADLARFEADLKDKLENSDFESSGGRGLKKGRGQKEKRGSRGRGRRTSEEDTPKKKKHKGGSEFADAILSVHPSDVLDMPVDPNEPTYCLCHQVSYGEMIGCDNPDCPIEWFHFACVDLTTKPKGKW	1063640	1050007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1050072_1050252_1050389_1052591_1052686_1052850_1052963_1053893_1054061_1060851_1060924_1063601
854381	contig_12520_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_161084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGTAAAATTTAATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570970	571785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_571000_571800
854382	contig_15044_pilon	+	791	2	Intergenic	novelGene_174970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	71	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	159	761	130233	130835	FALSE	10	GCATGCCTGGTCCCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRLLISVALLPTILETSEEGLSRGPVQESPPSPSLDDYVRSICQLAQPASALNEASAGQRPSRLHRSARACERRHTAMSPQDVTTCFSSQGPLLPGAGTADPLDWLFGESQETPSSRKDLMRRTGTSADSWGLHRQMDTGEARSGPRARFCDARGPGHSLLRLSQGGHLSSNRDSRQPCPNDSILRALHSDLPVIHEL	129401	130865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_+_129532_130204
854383	contig_6275_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_142471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACAGAACGAACAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184467	183710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_183700_184500
854384	contig_6503_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_145759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCCAGAGCCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126071	124886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_124900_126100
854385	contig_1450_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_27341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAGACCATTTCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221309	221893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_221300_221900
854386	contig_3700_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_138099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTCACGAAGATAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379862	379108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_379100_379900
854387	contig_15327_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_70552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGAGTTTCGCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558870	559872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_558900_559900
854389	contig_401_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_42928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATTTTCATTCTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947931	1947538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1947500_1947900
854390	contig_13966_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_158152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAAAAAAAAAATGCGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430204	429170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_429200_430200
854391	contig_12120_pilon	-	494	4	Intergenic	novelGene_21441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	34.4512538072113	154	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAAAGGTCCTGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270618	242249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_242376_251077_251149_254532_254606_270394
854396	contig_5231_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_65900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAAAAAAAAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222239	220977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_221000_222200
854397	contig_16782_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_176774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67445	68126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_+_67400_68100
854399	contig_3081_pilon	+	519	4	Intergenic	novelGene_133960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	52.8393792544916	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGTTTATTAATGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129271	1191688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1129365_1134580_1134639_1178703_1178795_1191411
854400	contig_5039_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_65066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCGGGTGTCAACCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1859550	1859063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1859100_1859600
854401	contig_12277_pilon	+	951	6	Intergenic	novelGene_139681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGGGGTCAAACGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149230	162979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_149551_150008_150131_151644_151822_152175_152335_157604_157704_162905
854402	contig_6513_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_117788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGAGGTATCTTAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290402	291226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_290400_291200
854403	contig_10196_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_132268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	2.94392028877595	58	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	560	859	2005910	2006290	FALSE	20	TACCCCTGCCTGTAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEAVAAVPSLSALQYTLQHYQLYLGQVQERAAALNRGSLCSFPVSVSGPWTPHLVETALWTWAVGQQLCPGVLPDLGPGTANVGDTRPAKRRRTQTD	2005021	2006395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2005383_2005562_2005723_2005871_2006025_2006105
854404	contig_11594_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_80914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAACAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320609	320051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_320100_320600
854405	scaffold_12124_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_22120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911763	911130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_911100_911800
854406	contig_19865_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_170145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCAGATCTGCACATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4373	4998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_4400_5000
854407	contig_11512_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_43330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGACAGCACACTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549052	549730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_549100_549700
854408	contig_6163_pilon	+	1485	1	Intergenic	novelGene_103846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCGTATACCTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450506	451991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_450500_452000
854409	contig_7801_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_169688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATGCAGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515285	516392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_+_515300_516400
854410	contig_18055_pilon	-	870	1	Intergenic	novelGene_117825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATCTGAAACAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45783	44913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_44900_45800
854411	contig_14792_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_170490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54432	54113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_54100_54400
854413	contig_4940_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_177771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAGCCAAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524650	523892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4940_pilon_-_523900_524600
854414	contig_13571_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_128104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTCAGCTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64616	63500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_63500_64600
854416	contig_8597_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_158690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATTAAATTTTTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16301	15504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_15500_16300
854417	scaffold_14325_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_162657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATATGGGAGGCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67130	66876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_66900_67100
854419	contig_11720_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_44016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAATAAAACAGATTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273900	274510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_273900_274500
854420	contig_19918_pilon	+	538	3	Intergenic	novelGene_172977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	66.5	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGATCTGTGTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403696	425045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_403717_404933_405018_424611
854422	contig_9389_pilon	+	866	2	Intergenic	novelGene_84109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	198	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395696	1397910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1395874_1397221
854425	contig_2414_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_158484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275411	276952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_275400_277000
854426	contig_8447_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_69452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCAAGAGGCTTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180762	180355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_180400_180800
854427	contig_8059_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_111094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCCTCCCCCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135772	134554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_134600_135800
854429	contig_184_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_177772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCACTAGGATTTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32867	32191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_184_pilon_-_32200_32900
854431	contig_1686_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_165596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCGAGTCAGTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283569	284081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_283600_284100
854434	contig_16578_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_148657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCCCTTGGCCCCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198606	198265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_198300_198600
854435	contig_16578_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_148656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATTATTTAAAACAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198103	197787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_197800_198100
854436	contig_13348_pilon	+	1218	2	Intergenic	novelGene_162690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	366	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGAATCTTGAATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323525	325903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_323595_324754
854437	contig_8576_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_88755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAAGCTGTGACAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708681	708047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_708000_708700
854438	contig_6546_pilon	+	480	3	Intergenic	novelGene_140978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	125	451	597703	599670	FALSE	15	GCTGTTGATTTTACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTLSNITEVFSTCAACVAGPGQRQHWEPHLQCRGWWTCPSSWGCTSGRTCPLHCCCPRKRKWKQRRKNLKSPMMTWVLVFLTKSLL	597578	599699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_599197_599365_599582
854439	contig_5039_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_64864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTGTCCCAGCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361992	362271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_362000_362300
854440	contig_8616_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_72550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGCCCTTTAGCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425438	424588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_424600_425400
854441	contig_6885_pilon	-	1022	1	Intergenic	novelGene_83688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAGGAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255062	254040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_254000_255100
854442	contig_7182_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_117089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACGTGGATTTCAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88134	88440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_88100_88400
854443	contig_19974_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_130473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAATTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200020	199699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_199700_2e+05
854444	contig_5988_pilon	-	1008	5	Intergenic	novelGene_16138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.4777130721117	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	9	521	1622355	1589469	FALSE	40	ATAAATGAGTCTGAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAAGALSLLWGWLWSERFWLPQNVSWADLEGPGDGYGYPRARHILSVFPLAAGIFSVRLLFERFIAKPCALHVGIQDSGLYQAEPNAILEKVFMSITKYPDEKRLEGLSKQLDWDVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCFFTKWYAGIGGGRG	1622363	1588981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1589513_1598984_1599020_1599715_1599847_1600464_1600571_1622158
854445	contig_476_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_177774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGAGGTAGGGGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6976	5949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_476_pilon_-_5900_7000
854447	scaffold_4805_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_161031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAAACTCTATGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527437	527967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_527400_528000
854448	scaffold_13505_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_111678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGCCTGCACAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898915	899671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_898900_899700
854449	contig_9875_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_154418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	37.3452361977624	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	159	279	437	293888	293465	FALSE	30	TGGAGCTGACCCCAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLQFWLLNIEAKAPNAVVLVVGTHLDLIETKFRVERIATLRAYVLALCRSPSGARATGFPDITNKHLHELSCKSLEGQEGLRQLIFQVTCSMKDVGSTIGCQRLAGRLVPKSYLSLQEAVLAEQQRRSQRDAVQYLTDRQLEEL	296761	293463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_293573_293837_293959_294982_295156_296726
854452	contig_3277_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_74736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTATTTATGAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265393	264855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_264900_265400
854455	contig_5958_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_140083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGCCTTCTACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117281	118330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_117300_118300
854456	contig_9819_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_175589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16566	14977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9819_pilon_-_15000_16600
854459	contig_11098_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_166683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182341	183379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_182300_183400
854461	contig_9363_pilon	-	505	3	Intergenic	novelGene_6527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1165	junction_1	444	9532	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	68	346	604749	604265	FALSE	10	TTCCAGTGTCTGTCCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNTHTPKSVGETYTALLARRQMALLQANKDLISTGMREFNILLNQQVMHDNPIPEEAMVIVVDDWVNFYVNYYRQKMTGEQEEQDRALQELQQELNTLATPFLAKYSAFLKTL	604987	604105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_604469_604674_604754_604924
854464	contig_1450_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_27334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGTCTGGAGTGATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193049	193479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_193000_193500
854465	contig_776_pilon	+	400	4	Intergenic	novelGene_139959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_3	34.1792659696229	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	252	149	400	1564839	1569828	FALSE	35	CAGTTTAATGAATTCCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNVAKVWKDYDRDKDHKISWEEYKQATYGYYLGNPAEFQDSSDHHTFKKMLPRDERRFKAADLDGDQTATREEFTAFLHPEEFEHMKEIVVLETLEDIDKNGDGFVDQDEYIADMFSHEDNSPEPDWVLSERE	1563656	1569828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1563755_1564788_1564968_1566688_1566750_1569766
854467	contig_17797_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_177284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGATTTCCCTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43215	44197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17797_pilon_+_43200_44200
854470	contig_10626_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_138197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCCACTGAATTGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76928	75765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_75800_76900
854472	contig_10451_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_138312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTGCAGCTCAATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157956	157331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_157300_158000
854473	contig_8900_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_171625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230484	229943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_229900_230500
854474	contig_13778_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_70856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACTCTTTGTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299137	300064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_299100_300100
854475	contig_4364_pilon	+	1160	11	Intergenic	novelGene_4572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	7.56571212775109	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	27	1040	1762460	1767533	TRUE	5	TTTTCTCCTCTCTTCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGREEANIMAAAPPLRDRLSFLHRLPVLLKGTSDDDVPCPGYLFEEIANISHESLGSSQCLLEYLLRRLQSSSGHVKLKVLKILLYLCGHGSLSFLRILQRNSAFIQEVTVFAGPPDPLHGNSLYQKVRVAAQDLGSALFSDAVSPLPAPRAPRPLPPTGMGSQPRPHGTLRGFGYSQERGHTGSAGGAFLSSVQKAAEVVANAMRPGHEQPGAQKSAPGGDTYQPAVTLSASYGYSLPGRLLPGAGPGPRGHLQVSPEAREPREQREALGTDLPLPLPAVRHQPGQPGGGWEELDSSPSSRGSSQENSGQSRASDSGSGCVSDGRSGASREPGDLAERGSRLWP	1762433	1770676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1762508_1764294_1764368_1764603_1764696_1764799_1764894_1765114_1765183_1765413_1765493_1765578_1765651_1765938_1766143_1766837_1767100_1767511_1767613_1770635
854476	contig_8161_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_156767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	246	623	331108	331485	NA	40	AGGACCTACCTCACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGCCLAGKAQRARSRRAHTQPPPALPSRLVKSCLFGGRGAETGARKLPHAQSPPGSSPSRLGAPSLVRVSKLDSKEEGCDGPVCDAELGRLLDQQIWGWRGVCQEPGGNKAPSHTRRGPSVSL	330862	331717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_330900_331700
854477	contig_6533_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_114648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAACACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177311	175564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_175600_177300
854478	contig_21006_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_177728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAGACCTGCAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73815	74626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_+_73800_74600
854479	contig_11370_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_98760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCAAGCTCCAAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210180	211370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_210200_211400
854480	contig_10116_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_177667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGTGTCCATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14550	13891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10116_pilon_-_13900_14600
854482	contig_19311_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_144086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152814	153155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_152800_153200
854484	contig_7057_pilon	+	937	2	Intergenic	novelGene_123298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	42	539	898785	899668	FALSE	65	ATAAAAAAAAAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTGISAPTVTVFISSTLNTFRSEKRYSRSLTIAELKCKLELVVGSPASCMELELYGADDKFYSKLDQEDALLGSYPVDDGCRIHVRPSCLGHHPTSIHLFNKYSLCPALCDNQDRPHPPGAPVQHGERQIHHQAGQGWDGESPEEVPDPTGEYQEGLPGGVGV	898743	900066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_898899_899284
854485	contig_14033_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_167436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCTGTAAACCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316131	316766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_+_316100_316800
854487	contig_18414_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_170019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAACAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136159	135285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_135300_136200
854488	contig_14450_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_49021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCCTGCTTTTGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196580	1195282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1195300_1196600
854490	contig_14450_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_49004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGGGATGTCAGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115971	1116572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1116000_1116600
854491	contig_5918_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_99573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTAGTAAATTATAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781246	1780582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1780600_1781200
854492	contig_11396_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_71353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	423	1	423	512486	512908	NA	5	AGCCCTTTCTGCTCCTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEWTWRGLGPTARCIPQVLALAGSPGAGAFETIGRGVFAGWDLQLPLWVAGPCPAFCPCPTFPPGSSGPGKQTSLSGCKPTCLCLKSHRRVSAGAVLCLRERWASLPATCCRPRSTSTFQPLYLSDCTVTEYNFYHKGNTE	512485	512908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_512500_512900
854493	contig_12327_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_140643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCTGGAAGCCCAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180915	180186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_180200_180900
854494	contig_6137_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_59151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAATAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118153	1118785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1118200_1118800
854497	contig_9227_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_154310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGTTTCATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92260	91830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_91800_92300
854498	contig_12672_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_141483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGATAAAAGGAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116285	115408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_-_115400_116300
854499	contig_3787_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_102389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGACAGATGCCAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442626	444159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_442600_444200
854500	contig_3233_pilon	+	750	3	Intergenic	novelGene_56589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTACTGCACACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757612	796092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_758059_768058_768208_795937
854501	contig_2770_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_107428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATATTTCACCTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538716	539382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_538700_539400
854504	contig_57_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_44919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290398	291269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_290400_291300
854505	contig_6589_pilon	+	755	5	Intergenic	novelGene_26232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	76	642	2077838	2080065	FALSE	15	TGTGTGAGCTGCATGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLFLEGRTETVRSCTREACNFVKAMEDDEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVDRHLFALYIVSRFLHLQSPFLAQVHSEQWQLATSQIPVQQMHLFDIHNYPDYVSSGGGFGPADDHGYGVSYVFMGDNMITFHISSKKSSMKTDAHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQGLRRRCRGLGGKDSGHKCGSLSLQTESSRAPTTSADF	2077762	2080178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2077859_2078872_2079026_2079346_2079461_2079650_2079744_2079879
854508	contig_15144_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_177776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAGGAGAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9050	8456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15144_pilon_-_8500_9000
854509	contig_5649_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_82343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	848	1177	816184	816513	NA	15	ATATTTTTTGCATCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPTTMPTHTLINTDFAAHRNKALILHNHCCQHTKKTSNSVASSPYSHFPNRPKHMFDNIFFLTRSQLRFSILGSFRLILVQSPNLFLKRPDHLPCKLSLIVGLSDSS	815336	816917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_815300_816900
854510	contig_5346_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_161857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACACTGATAATGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173170	173789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_173200_173800
854512	contig_2069_pilon	-	437	3	Intergenic	novelGene_23289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCACGGTGGATGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345484	342627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_342734_343524_343658_345286
854513	contig_10986_pilon	-	710	4	Intergenic	novelGene_71491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	344	junction_1	107.282596704011	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	82	513	80340	74908	FALSE	25	TTTGTATGTGTTGGAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKVRQLEMRWLCHICRRCFLIDLKSIS	80421	74710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_75049_75476_75544_76171_76245_80189
854515	contig_5954_pilon	+	917	3	Intergenic	novelGene_28465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	67	474	162062	162952	FALSE	30	TGAAACAAGTCCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPPDLSCWLFPTGPLVSAVEKFEEAAAALNQRMLALKEGSPDPLQVRMFNDQLMLLERAFLNPRAFPEERYYSHVLWAPRTGGVATFPGLANACSRANNTAPGSAAWAEVQQQLSIVVTALEGAAATLRPVADL	161995	163395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_162190_162292_162386_162765
854516	contig_14666_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_39549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGTACTCAGAGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475126	472620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_473130_475054
854518	contig_18869_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_56353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATCCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73362	73780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73400_73800
854519	contig_13876_pilon	+	646	4	Intergenic	novelGene_174247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_3	102.306728354819	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	107	427	44405	69402	FALSE	45	CTCTCAATAAAAATGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASAVMHALRKNKTLRYGVPMLMLIVGGSFGLREFSQIRYDAVKIKIDPELEKKLKMNKVSLESEYEKIKDSTFDDWKNVRGPRPWEDPDLLQGRNPEIVKIKTT	44298	69621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_44474_61740_61813_65260_65324_69285
854520	SIRV3	-	475	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTATTTGTATGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1979	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
854521	contig_10494_pilon	-	447	3	Intergenic	novelGene_102184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.5	152	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	15	446	1059298	1056296	FALSE	15	CCAGCTGCTGTCATCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESELQLVARRIRSFPDFPIPGVLFRDMSPLLKDPDSFRASISLLASHLKKTHDGKIDYIAGSVVGAAAVTSLGHQGHWMPTWDFFFPNDFCGSVSFLVGAGPSCGFWCVKALSLSPVPEPRPGHSWFIYTHSKTRINNFVKS	1059312	1056294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056541_1058719_1058827_1059218
854524	contig_8801_pilon	+	1441	2	Intergenic	novelGene_66322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	799	1236	812298	813999	FALSE	85	CAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFLDPHAPSFPCKAYRAGRCTPGFGAPTGSSDPGHSSCSWSSCYSSTWGCPWGNSHTWKWRSALRAAVVRRDTVVVAPVAVVSVGCAAVTVCVLVTSVMVKSYEGKEKSINRDSFSSEKLQAITVAVEHNLRLRLKKKGNTMGK	811499	814204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_812487_813750
854526	contig_15134_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_140237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCCCAATTAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405442	406426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_+_405400_406400
854527	contig_1262_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_133550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAATACTTGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221518	222583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_221500_222600
854528	contig_14953_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_137300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGCTAAGTGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423135	422688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_422700_423100
854529	contig_5997_pilon	-	672	2	Intergenic	novelGene_168609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	63	671	327322	144330	FALSE	35	ACAGGGAAATGATTCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGEPRRVANDAGIPPLSPEEMLLLRVADLNGQPPLFSQEHHRASVSEASAPGTAVVLISASDANEPGTDRARLRYALIQPLPHCIPETLSSTVRCGPYFTTDPESGVISTMRTLDPEVHETVELKVVAQDLGEPLLSATCRVSITVDDVNDNEPIFRRQVYNATVAEHSPVGHCFLQVKASDADAGLYGFVEYSLYDGFQSYEAPRAFQINPHDGQICISQDI	327384	144328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_144468_326851
854538	contig_5728_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_126681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTTTGTTAAAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20686	20457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_20500_20700
854539	contig_2444_pilon	-	997	2	Intergenic	novelGene_83800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATGTTACTTTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279796	278753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_279520_279565
854540	contig_6397_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_146222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGATGAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131675	132500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_131700_132500
854541	contig_5018_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_46964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	207	338	372284	372415	NA	10	TTTGGCTACTGCTGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGISAIKAVGVASSPELGPPLLLSPRGGALPGLAGGGRRGAWPPASKEHRAAQPDQPGDLLWAVGPDMPGACLGPLPEPTSPPLVCNRTFSALLLFPETVLFLRDVTPTL	372077	372773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_372100_372800
854542	contig_8140_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_86429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATTCAGAAGTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174661	173802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_173800_174700
854543	contig_2817_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_104360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTTACAAAATAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468399	467919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_467900_468400
854546	contig_10324_pilon	+	633	7	Intergenic	novelGene_7721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1019.10299610327	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	16	594	51839	80728	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPALAMEDERKDGAYGTPQKYDPTFKGPIYNRGCTDIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRHLTLRILLPNVLNSGDLVSLFPLCHFPRFPQLLVLAHKHCPWIPEGEFPVRGLPFPVPVPAPTHTPPFSLHTPRV	51823	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_68991_80499
854547	contig_2733_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_128567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAATCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606214	605592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_605600_606200
854549	contig_5307_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_176012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCACCTTTATGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18000	17448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5307_pilon_-_17400_18000
854550	contig_9516_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_106186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCTAAAAGTGTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908154	907168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_907200_908200
854551	contig_14357_pilon	+	1248	6	Intergenic	novelGene_121707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	2.85657137141714	19	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	19	609	774181	785181	FALSE	35	CCCAGCCAAAACTGGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKPEPKKEATKAPAPAPAPAPAPAPAPEPPKEPAFDPKSVKIDFSADQIEEFKEAFSLFDRTPTGEMKITYGQCGDVLRALGQNPTNAEVLRVLGKPKPEEMNAKMLDFETFLPILQHISRNKEQGTYEDFVEGLRVFDKESNGTVMGAELRHVLATLGEKLTEAEVEQLLAGQEDANGCINYEAFVKHIMSG	774162	785820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_774313_777188_777217_781821_781972_783787_783962_784494_784573_785152
854552	contig_8735_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_173711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAAGTTAGACCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14987	16405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_+_15000_16400
854553	contig_5302_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_81518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGTGTGTGTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408953	1409188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1409000_1409200
854555	contig_7180_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_169045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAATGTGAAAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459907	461042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_459900_461000
854556	contig_19094_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_177783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACAAGGGCATGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12882	13463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19094_pilon_+_12900_13500
854557	contig_6871_pilon	+	729	2	Intergenic	novelGene_21561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	189	524	122965	123300	FALSE	25	CTCAGTGGTGCACTGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWRECVGSREGALSGSSSSGRPIYKSRLWSQTWTGAKKAMFLDGSFSPASKAPRWPQSHKGLSLKSEGSLVHPVLSSHPSLPHHSLLAFIIFAFSIRPQPQVETQQTAVKGLKWPLPPTPQLRTSGRQGLILSSLCPQVFGACGQKMFVE	121903	123505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_122853
854558	contig_15327_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_70573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	194	370	690795	690971	NA	25	CATATTGGGCAGCACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDVLSGASEDHPLSNRALRRATEPLTLGVATGPAFVVSQYVTKALHQAHPLTAESRVQPKEIIMMCVETDCENVPPFIHQIFTEHSLCAGLVLGAEDTASAPAEPALSGELAQNSITLQSQ	690601	691316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_690600_691300
854559	contig_13700_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_68264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGAGCAAAGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49943	50559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_49900_50600
854560	contig_13048_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_138904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTTTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180276	181057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_180300_181100
854562	contig_16836_pilon	-	1304	1	Intergenic	novelGene_177792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGGTACCGCATCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4269	2965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_3000_4300
854565	contig_1428_pilon	+	591	2	Intergenic	novelGene_158399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCTTAACAGAAACTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117050	120503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_117132_119993
854566	contig_7411_pilon	-	1745	13	Intergenic	novelGene_137041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	124.307721892979	1	61	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	688	1743	822577	814604	FALSE	20	CCAAGTGCAGGCGCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMTAGKRSPPIKPLLGMNPFQKNPKHASVLAESGINYDKPLPPIQVASLRAERIAKEKKALADQQKAQQPAVVQPPQQPPPPPQPQQPPPPLPQPQSVASQQPAGQPAVPAQAQPPPQPQPVQPQPKVQPAITTGGGAAVLAGTIKTSVTGTSIPTGTVSGNVIVNTIAGVPAATFQSINKRLASPVAPGALPSSGGPTPAPVVHTQPRAVGSPAAATTDLVSMATTQGVRAVTSVTAPAVVTTNLTPVQAPARSLVTQVSQATGVQLPGKTITPAHFQLLRQQQQQQQQQPQPAPPPSQVQVPQIQAQSPAQIKAVGKLTPEHLIKMQKQKLQLPQQAPPQAQPGPPPPT	824475	814601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_814691_816371_816551_816658_816867_818353_818464_818537_818584_819587_819834_819942_820022_822355_822413_822533_822671_823330_823493_823622_823848_824183_824345_824429
854567	contig_2377_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_67934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTAAGACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834180	832961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_833000_834200
854568	contig_17880_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_167337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGAAAGCTTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41263	40449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_40400_41300
854569	contig_4012_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_176885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAATTGCAATTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664528	663401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_-_663400_664500
854570	contig_2550_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_135654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGATCATGCACTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933040	932693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_932700_933000
854571	contig_4838_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_144788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGGCAGCTCAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227850	228475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_227800_228500
854572	contig_11307_pilon	+	771	2	Intergenic	novelGene_105246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCTTTTTATTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87717	88532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_88045_88088
854573	contig_10451_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_138315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAAATTCTTCAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253640	252434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_252400_253600
854574	contig_5728_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_126682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATATTAAGTTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207080	206317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_206300_207100
854575	contig_1516_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_50031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATATTCTCAAGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592117	593280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_592100_593300
854576	contig_709_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_57674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAACAACCTAGGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3981634	3980831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3980800_3981600
854577	contig_12327_pilon	-	322	3	Intergenic	novelGene_140646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCACCTCAGTCTGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188993	183838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_184025_184752_184784_188888
854578	contig_5337_pilon	-	218	1	Intergenic	novelGene_136563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCATAAAAGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324702	324484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_324500_324700
854579	contig_11370_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_98765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAGGGGGATTGTATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214096	214547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_214100_214500
854580	contig_9705_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_41706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATTTTACTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100592	101096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_100600_101100
854581	contig_6364_pilon	+	936	5	Intergenic	novelGene_51854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	160.557427420845	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	371	844	1784725	1786958	TRUE	15	CCTTCTTGCATTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPGAQPAGKADKVMKSFKPTSEEALKWGESLEKLLLHKYGLAVFQAFLRTEFSEENLEFWLACEDFKKVKSQSKMAAKAKKIFSEYIAIQACKEVNLDSDTREQTKNNLQSVTRGCFDLAQKRIFGLMEKDSYPRFLRSDLYLDLINQKKMSPSL	1784354	1787359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772_1786989_1787297
854582	contig_13744_pilon	+	648	3	Intergenic	novelGene_77160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	33.5	68	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAAAACCATGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297441	301031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_297615_298569_298608_300594
854583	contig_10962_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_103903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTTTATCAGTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332642	333850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_332600_333800
854584	contig_2646_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_69608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTGGCTAATTCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2005822	2006678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2005800_2006700
854585	contig_12733_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_129601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGGGGAGTACTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375049	376461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_375000_376500
854586	contig_16883_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_161730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	207	383	274218	274394	NA	35	TTTAAGTTCACAGAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVSKYSTLHKAADELSPWGTLGAASTPLPQPHLETSGQAGRVFLGPELCPHHSWSSFYFFPTDKLPLSMGRKPWWRSGEEVRLLTKRSAVQIRQVLLGNSMGQFHLVLYGCYESELTQRQQVFFFL	274011	274418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_274000_274400
854587	contig_7009_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_23691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAGGATTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955322	956366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_955300_956400
854591	contig_11815_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_50918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTGGCAATAGTTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209628	210461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_209600_210500
854592	contig_9484_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_105695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTTTCATGATAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259685	258700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_258700_259700
854593	contig_6654_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_85734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAAGAATCACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427041	426618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_426600_427000
854594	contig_12654_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_129259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATACAATTCTTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68187	68956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_68200_69000
854595	contig_15036_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_107162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253566	252407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_252400_253600
854597	contig_9706_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_20930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTGCCTTCAAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215652	214790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_214800_215700
854598	contig_7744_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_62480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	146	475	487994	488323	NA	30	TAATAAAGTGCTCACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKELWTTTLLRQKGHICHHNAMGFPHIVEALGAGGEVVREGPVGRLPTGKYASCPQKAFPLQGGPDFFLHTLGRGRLSVPTLKSPQGCAHFHPLPGERKLCRWQQSQ	487848	488366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_487800_488400
854600	contig_17171_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_147375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275294	274564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_274600_275300
854602	contig_14744_pilon	+	855	5	Intergenic	novelGene_66025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.5	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAAAAATTCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970143	981865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_970205_977395_977576_978768_978851_979102_979266_981496
854603	contig_11498_pilon	+	693	4	Intergenic	novelGene_65515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGCACCGCATTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172650	179055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_173067_173555_173690_178409_178520_179022
854605	contig_7106_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_148327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAAAAAAAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684061	685112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_684100_685100
854608	contig_12278_pilon	-	766	6	Intergenic	novelGene_152578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.91918358845308	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATATTCACTGCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104058	100817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_101044_101594_101691_102478_102577_103238_103331_103415_103525_103913
854609	contig_15354_pilon	-	1699	12	Intergenic	novelGene_65695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	1205	1699	56318	47268	FALSE	5	CCCGATGTCGCGGTCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPSRSAKKEGLASNSFMSSAAWRRARKSSTSWAILGSIQAGLVRGQLTNQQGLQELAHEIEVGVEGAEGVRGVLSAVVANEAAAARVPLRPAADIVDPALDDQPLVARQVVRADLLPAEGGQRRSPRAWSLTGLPDAAHGCAPKCSRPWICPGEARGDTARQSG	62200	47267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_47549_55711_55824_56216_56414_56830_56933_57066_57190_57437_57501_58168_58245_59201_59299_59742_59839_59971_60055_60265_60389_61854
854610	contig_10732_pilon	+	815	8	Intergenic	novelGene_114747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	26.5299214980723	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	34	783	558675	571283	FALSE	15	GTACAGGCATGGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCINLPTVLPGSPSKTRGQVQVILGPMFSGKSTELMRRVRRFQIAQYKCLVIKYAKDTRYGSGFSTHDRNTMEALPACLLRDVAQEALGVAVIGIDEGQFFPDIVEFSETMANAGKTVIVAALDGTFQRKAFGSILNLVPLAESVVKLTAVCMECFREAAYTKRLGSEKEVEVIGGADKYHSVCRLCYFKKSSSQPPGLDNKENCPVLGRPGEAVTLSPLGLRPGGPGFSSGSGHVAGARDKILLWRL	558641	571315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_558741_558871_558904_560027_560139_562808_562903_569793_569884_570270_570391_570473_570606_571178
854612	contig_498_pilon	-	1845	9	Intergenic	novelGene_148564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	6.24374687187109	32	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	38	1414	850675	779634	FALSE	15	TATGGTGTCGTTCTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEILHGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGDTATFDVSVEAWSCPSRQAEHRFTLRPVGFRDSLEVGVTYSCTCGCSARLEPDSPRCSGNGTYVCGLCECNPSYLGTRCECQEGENQSGYQNLCREAEGKPLCSGRGECSCNQCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTGISSCQAKDGQICSDRGRCICGQCQCTEPGAFGETCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPAGNQTCHNYCKDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTTQDCVMLFTYAELPSGKTNLTVLKEPECGTAPNAMTILLAVVGSILLIGIALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFSFNKFNKSYNGTVD	850712	779202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_779730_780708_780876_782247_782368_786470_786575_796565_796789_820805_821236_840436_840572_848526_848617_850663
854613	contig_14516_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_153901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTGTGGAAGTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158843	159225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_158800_159200
854620	contig_6304_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_122258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCAGGATGCTTACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166146	167021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_166100_167000
854621	contig_20614_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_107541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGGTAATAAGAGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109789	111076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_109800_111100
854622	contig_1996_pilon	-	789	3	Intergenic	novelGene_131960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	3.5	163	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	8	745	530570	528442	FALSE	15	CACATGCCCTACTGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLDLLSDQGYRVDGRRAGELRKIQARMGVFAQADGSAYIEQGNTKALAVVYGPHEIRGSRARALPDRALVNCQYSSATFSTGERKRRPHGDRKSCEMGLQLRQTFEAAILTQLHPRSQIDIYVQVLQADGGTYAACVNAATLAVLDAGIPMRDFVCACSAGFVDGTALADLSHVEEAAGGPQLALALLPASGQIALLEMDARLHEDHLERVLEAAARAARDVHTLLDHVVRQHVCEASLLLGD	530577	528397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_528802_528898_529106_530399
854623	contig_10057_pilon	-	352	3	Intergenic	novelGene_162345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	326	junction_1	55.5	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	225	127	351	50348	35456	FALSE	60	AGGCAGCAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDS	52233	35454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130
854626	contig_8954_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_130324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTCACCCCCACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672452	672840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_672500_672800
854627	contig_6270_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_99867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	195	413	1042295	1042077	NA	20	AAGTTGCAGTTGTTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLSAPQQGFPGQSQLFKTKKPNQLPVFLIFSLVGSQFESWQPQVLQSRTVLRKIFKAVTFQKLMARPILRCMKTGGGGGEAWAGPLTTASPFSVIMYEITSHLAYTASPEDSAPRNVTLWSTLKRICQVCWEDFF	1042489	1041560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1041600_1042500
854628	contig_11372_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_176661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAAGTTTGACGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669093	668437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_-_668400_669100
854629	contig_11136_pilon	-	564	3	Intergenic	novelGene_169020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	51	311	146878	137418	FALSE	15	CTGGGGAGTGATAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALFGCWFRVGGARSAMAGRVIPVGPTVVQTSMSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVPPPPAQSLCGEAA	146928	137164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137459_144287_144478_146848
854630	contig_19743_pilon	+	1159	1	Intergenic	novelGene_173153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACTGGCTGGAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165815	166974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_+_165800_167000
854631	contig_6497_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_35547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAATTAGACAGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73253	73626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_73300_73600
854632	contig_12157_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_135907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCATTAGATTTTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157669	158360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_157700_158400
854633	contig_17270_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_67227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTGATAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100629	100926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_100600_100900
854634	contig_16999_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_84972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGTGGAGGGAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51921	51552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_51600_51900
854636	contig_10196_pilon	-	805	2	Intergenic	novelGene_132038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTTTAAAGAGATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614218	600045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_600158_613525
854637	contig_10311_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_50483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGTCTCGCCTCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98491	97965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_98000_98500
854638	contig_3426_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_57930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAGGTCTTTGGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254049	255247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_254000_255200
854640	contig_17198_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_62379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948277	947985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_948000_948300
854641	contig_10734_pilon	-	489	3	Intergenic	novelGene_51088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGGAACGTGCGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544073	540616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_540678_542879_543157_543922
854644	contig_2093_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_153010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433171	1434191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1433200_1434200
854645	contig_4469_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_21874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTGATGATTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97297	98350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_97300_98400
854647	contig_14874_pilon	-	420	2	Intergenic	novelGene_177480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	786	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTTTCAAAGTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79287	56056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14874_pilon_-_56385_79195
854648	contig_709_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_57615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGCTCAGCTAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2415457	2414628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2414600_2415500
854649	contig_11590_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_125602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGCGACAAATACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752548	753198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_752500_753200
854651	contig_19352_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_122426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGGTGATTTAGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409811	410858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_409800_410900
854652	contig_91_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_127139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCTAGCCTCATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197991	1197447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1197400_1198000
854654	contig_8260_pilon	-	527	4	Intergenic	novelGene_163260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	7.03957069398096	109	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAAACAATTCATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315634	271254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_271373_277172_277305_282550_282687_315493
854656	contig_6915_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_162413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTGCGAGTGGCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198734	198146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_198100_198700
854657	contig_1813_pilon	-	1391	12	Intergenic	novelGene_105520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	1.96666433207127	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1017	373	1389	457260	447756	FALSE	35	CAATTACACCCAGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLTNQPPCLDSSQHEAFIRSILSKPFKVPIPNYQGPLGSRALGLKRAGVRRALHDPLEEGALVLYEPPLLSAHDQLKLDKEKLPVHVVVDPILSKVLRPHQREGVKFLWECVTSRRIPGSYGCIMADEMGLGKTLQCITLMWTLLRQSPECKPEIDKAVVVSPSSLVKNWYNEVGKWLGGRIQPLAIDGGSKDEIDQKLVRFMNQRGARVPSPILIISYETFRLHVGVLQKGSVGLVICDEGHRLKNSENQTYQALNSLNTSRRVLISGTPIQNDLLEYFSLVHFVNSGILGTAHEFKKHFELPILKGRDAAASEADRHLGEERLRELISIVNRCLIRRTSDILSKYLPVKIEQVVCCRLTPLQMELYKRFLRQAKPAEELCDGKMSVSSLSSITSLKKLCNHPALIYDKCVEEEDGFEGALDIFPPGYTSKALEPQLSGKMLVLDYILAVTRSRSNDKVVLV	465037	447753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_447827_447997_448109_448630_448762_448901_448977_449946_450074_453458_453610_456630_456756_457034_457324_457437_457508_457969_458106_458771_458833_464995
854658	contig_9593_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_59700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGTACTTTGTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71328	72132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_+_71300_72100
854659	contig_5424_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_172807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98108	97054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_97100_98100
854661	contig_4783_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_108392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACTAAATGAATTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253569	254110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_253600_254100
854663	contig_1090_pilon	+	1053	9	Intergenic	novelGene_131150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.54835134966506	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	60	773	529445	539084	FALSE	15	TTAAGGTTTTGGCTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASEERRGEAVHTLVRKNLPMAPSRRKHTGKSMKSAMEDQVIRAYDFEKEDKKDLSGSEEDVPEGKTPVIDKRGKKRPSTGIAEEDVGGEVRNMLEKFGADINKALLAKRKRLEMYTKASLKSSNQKVESIWKTQQQQRQKLNEEYSQQFRTLLQQWDTDVQKAEEQEEKLVNMFRQQQKVFQQSRIVQSQRLKTIKQLHEQFIKGMEDLEKNHENFFNGAQNELRKEMAMLQKKIMMDTQQQEMASVRKSLQSMLF	528505	539364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_528548_529427_529578_529960_530031_530193_530229_531921_532040_532835_532936_535882_535982_538800_538906_539030
854664	contig_5862_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_54963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAATAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235172	233933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_233900_235200
854666	contig_13744_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_77204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCACCATTTGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048728	1048285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1048300_1048700
854667	contig_7019_pilon	+	567	2	Intergenic	novelGene_149464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAATAAATTTCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539054	539736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_539563_539677
854668	contig_7775_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_37522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473507	473092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_473100_473500
854670	contig_6871_pilon	-	964	2	Intergenic	novelGene_21613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	99	470	494021	489989	FALSE	10	AACTGCGTCCGCCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIEKSQEAYLLAFEHYVNHRKHNIPHFWPKLLMKEREVQSSILYKGAAAEGRPGGSLGVHPEGQQLLGMHVVQGPQVRQLEQQLGEAGSLQGPVLQHQSPKSPQQRLLELLHRSGILHARAVCGEDDSSEAGSSSSSSDEEAEVCEDLAGNAASP	494119	489494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_490355_494015
854671	contig_10753_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_105173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCCCCATACTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457760	458214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_457800_458200
854672	contig_15384_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_85123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGACCCCCAGCCCCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82115	81626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_81600_82100
854675	contig_10475_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_148744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATTTGGACACAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254481	253548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_253500_254500
854676	contig_8020_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_114463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399989	400512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_4e+05_400500
854677	contig_5799_pilon	-	1058	8	Intergenic	novelGene_50316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGAACTTGGAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675057	612812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_612914_619550_619741_631541_631615_633744_633806_650864_650972_667932_668110_671823_672049_674933
854681	scaffold_9100_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_83226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCAGCTGGAGAGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221793	222993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_221800_223000
854683	contig_6589_pilon	-	418	2	Intergenic	novelGene_26276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	76	417	2239390	2239049	FALSE	15	GGGAGAGGCTGGGCGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRPEELWEAVVRAAECFRARTGTELVLLTATPPPRPGPCSYAAHGRGALAEAARRCLHDIALAHGVAAAARPPVPRLLPQPPSPVRSPPRPALAREEDEEDEDEPTETETS	2241466	2239047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2239398_2241398
854688	contig_6576_pilon	-	458	2	Intergenic	novelGene_42404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTCAGATTAAAAATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301577	1295670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1295756_1301204
854689	contig_7138_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_121000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGAAGAAACAGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310616	311360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_310600_311400
854691	contig_10236_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_169118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94609	95369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_94600_95400
854693	contig_14666_pilon	+	642	3	Intergenic	novelGene_39576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1754.5	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	86	523	477340	485019	FALSE	25	ATGTAGTCACCTTGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQSSSAGFPSTSRPCSEGRRLCTGTRARGWTCRSLERPRGISMTWCPSTNRFKMPRWLWRKAERSRSGRRPSQKTSDVNGREAAGQMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477254	485138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479906_484709
854694	contig_6276_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_174128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTGGAACAGAACCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183450	184235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_183400_184200
854695	contig_5428_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_160407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148217	149409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_148200_149400
854696	contig_4388_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_161946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAGAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237690	238577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_237700_238600
854697	contig_21416_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_172820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGCTCCCTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126047	125614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_-_125600_126000
854698	contig_6433_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_162766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAATAACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291216	291643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_291200_291600
854699	contig_5649_pilon	-	1595	1	Intergenic	novelGene_82470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATCGTGTTGTCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1570431	1568836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1568800_1570400
854700	contig_13456_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_153272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109321	108877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_108900_109300
854701	contig_3975_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_54937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATAGGTGGTCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2340288	2339044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2339000_2340300
854702	contig_3181_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_136931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAAACATACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299591	300652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_299600_300700
854705	contig_10196_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_132339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	108	254	361	2448185	2448292	NA	20	CTGATCTTTCTGTGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASAYSCPDGTWEAALGRRRSHTPSPACRPKLVTRCPLTASLQRIRDIEARELLKHSPCLPLWAEAGSQDPHLLSPPDVSHFLTMETSSMAACCPPRPPTLSPFLWGVILHIPTNKANVT	2447931	2448294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2447900_2448300
854706	contig_10868_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_173906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679452	678227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_678200_679500
854709	contig_15118_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_74540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGCAGTAAATAAAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57959	58937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_58000_58900
854710	contig_19848_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_173827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTATTAAGATTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186584	187134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_186600_187100
854715	contig_405_pilon	-	1340	9	Intergenic	novelGene_135323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_5	69.8994814000791	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	264	1316	555100	513919	FALSE	45	AAGTAGGAATGGCGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSRLDRLFILLDTGTTPVTRKAAAQQLGEVVKLHPHELNNLLSKVLIYLRSTNWDTRIAAGQAVEAIVKNVPEWNPVPRTKQEPTSESSMEESSTTDRLNFDRFDICRLLQHGASLLGSAGAEFEVQDEKSGEVDPKERIARQRKLLQKKLGLNMGEAIGMSTEELFNDEDLDYTPAAAALVNKQPTLQAAELIDSEFRAGMSNRQKNKAKRMAKLFAKQRSRDTVETNEKSNDSTDGEPEEKRRKIANVVINQSANDSKVLIDNISDSSSLIEETNEWPLESFCEELCNDLFNPSWEVRHGAGTGLREILKAHGKSGGKIGDSTLEEVSVLRQQLSPGFHSWPLFPG	555363	513894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_514072_515227_515297_515998_516129_519314_519452_522877_523042_529289_529437_531016_531132_534540_534665_555086
854716	contig_12113_pilon	-	741	6	Intergenic	novelGene_134744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_3	182.42631389139	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	27	605	259537	217850	FALSE	50	AAATGTAGAAAAATTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLLRVCLAMAWKSGGASHSELIHNLRKNGIIKTDKVFEVMLATDRSHYAKCNPYMDSPQSIGFQATISAPHMVGPTGKVIGIDHIKELVDDSINNVRKDDPMLLSSGRVRLVVGDGRMGYAEEAPYDAIHVGAAAPVVPQALIDQLKPGGRLILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIKMKPLMGVIYVPLTDKEKQWSRWK	259563	217713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_218030_220158_220245_222269_222391_231872_231905_233167_233273_259482
854717	contig_3155_pilon	+	997	1	Intergenic	novelGene_26446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTACCTTGCCACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336727	337724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_336700_337700
854718	contig_16775_pilon	+	448	3	Intergenic	novelGene_107806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATGATTGTTAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235858	253363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_235949_238364_238656_253296
854719	contig_11832_pilon	-	626	4	Intergenic	novelGene_106976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCCTCCATCCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466508	464745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_464929_465610_465799_466004_466111_466359
854720	contig_6101_pilon	+	755	2	Intergenic	novelGene_114286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAATCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329105	334027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_329210_333376
854722	contig_15185_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_99437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	221	409	428201	428389	NA	20	TTTTTATTTCTCCTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNVGRWELSKRLLLANLPRELLQAYGEDYIEHFHGQFLNSLSLALPDLSPVVDAITDALLAAQPRRRYYPGRGMGLMYFIHYYLPEGLRRRFLQTFFISPCLPRALRPGQPGPTSTQEAAQDPNPNPGPSPTAAR	427980	428888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_428000_428900
854724	contig_9363_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_6725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTCTCCTCATTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438276	1437211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1437200_1438300
854725	contig_9363_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_6724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTCAGCACATGTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1437103	1436699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1436700_1437100
854726	contig_8683_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_150241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTTAAGATGAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412527	413852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_412500_413900
854727	contig_11307_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_105247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATATCCATTCTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87799	88519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_87800_88500
854728	scaffold_6394_pilon	+	817	3	Intergenic	novelGene_111068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAAGCAGGAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525967	533887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_526172_530880_531310_533703
854729	contig_8045_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_35461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATTTTGGGAATTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509714	510535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_509700_510500
854731	contig_10414_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_146947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTAGGCCAATCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186497	187381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_186500_187400
854734	contig_15407_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_123053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCTTCTTGAGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386319	384985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_385000_386300
854736	contig_8850_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_172432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	263	613	50135	50485	NA	30	CATCTTCAAAATCGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPQPAGVPGWCKWLTEGLVVPIQPEMPWKKGLVIYFQKDQPLETLWSTVQNKMASSPQLAGVPGWYKWLIGKIGGSNPTRGALEERPGDLLLKRSAIENPMEHRSALTHMGSS	49872	50661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_49900_50700
854737	contig_5136_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_126628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAGGGAGGCATCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265905	265386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_265400_265900
854740	contig_6047_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_24227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCCCTAGCCCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162485	161702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_161700_162500
854741	contig_19132_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_169989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317806	318426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_317800_318400
854742	contig_6740_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_142678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTAGATATAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614472	613498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_613500_614500
854743	contig_709_pilon	+	824	5	Intergenic	novelGene_57548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	12.6959639255946	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	187	525	1520334	1526933	FALSE	20	CCCGCACATGTGCACGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDQGIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1515840	1527232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1515867_1520173_1520350_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795
854744	contig_5954_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_28462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	206	571	137982	138347	NA	50	TTTTTAATAAAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVPGVELGGLASGDLPPLSLFSILVISKAALLCHHPAVAQVIITYGVYKFMILESRNMEGLLDNRTSGKTSAWLGSSGATAQARWALTKPFARSGSPRASVWHVVPRQTLHTGPLREAL	137776	138528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_137800_138500
854745	contig_5954_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_28463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCTTGCTTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138566	138808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_138600_138800
854746	contig_5649_pilon	+	909	2	Intergenic	novelGene_82481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAATAATATCCTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661398	1663719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1661510_1662921
854747	contig_312_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_128301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTGAAAATCATAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231426	232057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_231400_232100
854748	contig_5050_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_110298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662927	663645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_662900_663600
854749	contig_1918_pilon	+	894	2	Intergenic	novelGene_168332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCCCCCTCAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49757	52696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49860_51904
854750	contig_10466_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_173632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202159	201806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_201800_202200
854751	contig_5690_pilon	+	774	4	Intergenic	novelGene_119684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	36.7544403968948	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	19	354	327917	359144	FALSE	30	TCTATCATATATATGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDKLELMFQKADSDLDCILYRLEYEIKNNHPDSAGVKNPVTLLKELSAIKSRYQTLHTRFKPIAVEQKETKGHICVILNKTMTMIQELQKLTDMELSPLTEEEKTAEKQLKSHMPDL	327898	359564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_327920_347629_347717_352195_352373_359075
854752	contig_5832_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_134125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAACCCAGTAACAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148084	148417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_148100_148400
854753	contig_1856_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_84866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGACCCAGCTTCGATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145633	145301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_145300_145600
854754	contig_3004_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_127487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGAGGCTATCGCGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276731	275525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_275500_276700
854755	contig_19544_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_177063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGATGCTTTGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17456	18072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19544_pilon_+_17500_18100
854757	contig_8535_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_177277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCCAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29927	29496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8535_pilon_-_29500_29900
854758	contig_16103_pilon	+	1057	7	Intergenic	novelGene_118752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.10554159678513	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	170	943	407274	408914	FALSE	10	CAGAGCGGCTCCGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFQYIGELCRYIVNQPPSKAEHGHKVRLAVGSGLRPDTWERFVRRFGPLQVLETYGMTEGNVATFNYTGQRGAIGRDSWLYKRLFPFSLIRCDITTGEPVRDTRGHCMATSPGEPGLLVAPVSQQSPFLGYAGGPELARGKLLEDVFRPGDVFFNTGDLLVCDDQGFLHFHDRTGDTFRWKGENVATTEVAEVLEALDCLQEVSVYGVSVPGHEGKAGMAALVLRPPHSLDLVRLYAHVSENLPPYARPRFLRLQESLATTETFKQQKVRMASQGFDPSSLPDAFYVLDEAAGAYVPLTAARHAALLAGDLRI	406861	409028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_406914_407156_407352_407458_407550_407678_407878_408120_408219_408307_408439_408737
854761	contig_5816_pilon	-	1752	3	Intergenic	novelGene_158250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	27	23	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	354	1445	274086	233164	FALSE	55	CTAAAAAAAAAAATCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEDFKQEEGDGARAQEPTLHADPIDSAHPSMSADPSASVHLSVSAHPSVSTHHSVSAHPSASIHPSASIHPSVSIHPSVSIHPSVSAYPSALARPSALSQPSDSGPEDFSVIKVSKRRWAVVLVFSCYSMCNAFQWIQYGSINNIFMNFYGVSAFAIDWLSMCYMLTYIPLLLPVAWLLEKFGLRTIALTGSALNCLGAWVKLGSLQPHLFPVTVLGQVICSVAQVFILGMPSRIASVWFGANEVSTACSLAVFGNQLGIAIGFLVPPVLVPNIEDRDELAYHISIMFYLIGGVATLLFILVMIVFKEKPKYPPSRAQSLSYALSSPDASYLSSIVRLFKNLNFVLLVITYGKVQMCQEHS	274439	232856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_233337_237302_237445_273309
854762	contig_16884_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_161827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCACTGGCTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108550	107711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_107700_108600
854764	contig_8045_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_35416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGCATATTAGATTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185370	184236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_184200_185400
854765	contig_12019_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_87715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAGAAAAGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315609	316690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_315600_316700
854767	contig_5918_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_99507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299322	298594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_298600_299300
854768	contig_4469_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_21914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462908	462054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_462100_462900
854769	contig_9434_pilon	+	543	3	Intergenic	novelGene_150472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	473	junction_1	36.5	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAGAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51059	83218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82476_83184
854770	contig_1719_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_87390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTGGTGGCACAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926992	926286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_926300_927000
854771	contig_709_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_57577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGATCTCATTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2178078	2176939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2176900_2178100
854772	contig_15897_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_49582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTTAACGCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857398	857632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_857400_857600
854773	contig_9839_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_88593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAGAGTTCTAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476009	475178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_475200_476000
854775	contig_9516_pilon	-	695	5	Intergenic	novelGene_106198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.12132034355964	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	248	670	1134995	1126936	FALSE	25	ACACTGTGTCCTACAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPTHHLIHRIMSSSSYNEEDLTSFSSDNEEDQMPDPSAKITEDSFEFFTPENPSSIKFTTLFQRDSILASTSSSKDGTSDSGKRVNSKRKLKMMKKVSSTLSKVFPRSDANKPKTSSSYPSSRTDTATSDVNKPADLP	1135242	1126910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1127115_1129323_1129391_1132179_1132224_1133780_1133831_1134912
854777	contig_5928_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_40389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331626	332005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_331600_332000
854778	contig_6325_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_143349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCAGTCCTAGCACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157622	156914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_156900_157600
854779	contig_3787_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_102437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCTAAATCTGTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701998	701308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_701300_702000
854780	contig_11259_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_144537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTTGAGATGATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143594	144436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_143600_144400
854781	contig_3277_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_74741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGAGGAGATACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278464	277928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_277900_278500
854782	contig_10074_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_57132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAACCACTTGTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362154	363086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_362200_363100
854783	contig_14640_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_168044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317178	318093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_317200_318100
854784	contig_7078_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_130168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATATTTGAAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654800	654096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_654100_654800
854786	contig_3964_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_174210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATAAATTTCAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85235	86251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_85200_86300
854788	contig_7247_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_176686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATAACAACTGAAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77484	76360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_76400_77500
854789	contig_8461_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_163940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACCCAGCAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536126	535773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_535800_536100
854790	contig_11855_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_66921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATTGAAGTATGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843418	844437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_843400_844400
854791	contig_4232_pilon	+	745	8	Intergenic	novelGene_63160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	64	744	41751	44373	FALSE	20	TCTGACGTGGCGTTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFAFMLLPLPLSTIYGVFWAFCFSWSRATVPRGVSLELIFFRSCLLVQLLHAPLRLHLARALPVEAVGQLPECLLGRKLPARLIHVLDLHVGLIAVLLLEVLGEATVLLSPAVLVIDGHLVLDAVHRRGQRLVGCLHPGHLLHRGLQQPFVLTQEQGSRQPSVHDGLLVQDGGGGGGEILLLLLLIQVDGAPADVLLPVGLGAELLLLLPVAGQPVGGDLPQRSAE	41687	44374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_41759_41881_42007_42078_42167_42780_42917_43024_43116_43696_43786_44094_44169_44303
854793	contig_14925_pilon	+	311	2	Intergenic	novelGene_55056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCCAAATTAAAGAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3187	12086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_3359_11946
854794	contig_9481_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_149642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATATGTTGTTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131404	130702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_130700_131400
854795	contig_3956_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_14743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAGAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619861	620190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_619900_620200
854796	contig_8059_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_111100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGTTTCATGACAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191261	190906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_190900_191300
854797	contig_10093_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_147517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTCTTGCTCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144380	143193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_143200_144400
854799	contig_15422_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_173115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCACTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168530	170451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15422_pilon_+_168500_170500
854800	contig_11126_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_138125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACCAAAAAGAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293852	294697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_293900_294700
854801	contig_6726_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_86215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57446	57964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_57400_58000
854802	contig_5253_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_61591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGAGAAGGAATCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343563	343220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_343200_343600
854803	contig_4492_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_166109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGTAACCTTCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29460	30888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_+_29500_30900
854805	contig_9839_pilon	+	343	2	Intergenic	novelGene_88471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCTGTGGATTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26779	29693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_26929_29499
854806	contig_11281_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_125512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGCTTGGAGTGCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964501	965086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_964500_965100
854807	contig_1996_pilon	-	669	2	Intergenic	novelGene_131886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	0	186	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGGGCTTCCTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170925	170160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_170603_170698
854809	contig_4654_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_103057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAAGAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437076	436483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_436500_437100
854810	contig_8865_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_164464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTAGTAGTATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423244	422158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_422200_423200
854811	SIRV6	-	108	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	168	0	168	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2615	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGTCTACTTGGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652	1544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1500_1700
854812	contig_13995_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_164089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCTGGTTTCTGTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66677	66195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_-_66200_66700
854813	contig_16686_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_162104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAAAAAATTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187646	187123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_187100_187600
854814	contig_15105_pilon	-	1053	3	Intergenic	novelGene_150947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGATATCGGCGGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436875	365685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_365735_431348_431563_436085
854815	contig_17753_pilon	+	555	2	Intergenic	novelGene_105120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	69	305	147837	148073	FALSE	10	TATCTTTTGGGTGTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSVSWWIHIRALTVFPSDVPTCMLKPCPLLSLLAQYRITHLQMVLSPDVSFIPSLCQEPPSPGQEPRPRVRSPAPGSGAPPRRDELGLIPFLCRIASAPP	147711	148323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_147758_147814
854816	contig_13412_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_80012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395594	396316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_395600_396300
854817	contig_3588_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_72891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCAGCATGCAGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132054	132662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_132100_132700
854818	contig_6410_pilon	-	931	2	Intergenic	novelGene_108649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTCTAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419324	417781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_418648_419259
854822	contig_10642_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_78646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95492	94486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_94500_95500
854823	contig_5039_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_65056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATGAGGGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1828807	1828199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1828200_1828800
854824	contig_6441_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_172882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACACTTTTGTCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245664	244859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_244900_245700
854825	contig_9571_pilon	+	810	5	Intergenic	novelGene_136309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	25.3906971152822	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACTGTGCCAAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592817	602522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_596578_596678_600426_600593_601528_601673_602258
854826	contig_2394_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_177762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATGGTAATAATAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91887	92398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2394_pilon_+_91900_92400
854828	contig_10629_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_52922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTGTGTGGGGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245973	246671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_246000_246700
854829	contig_13437_pilon	+	682	4	Intergenic	novelGene_131643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.6144555520604	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCTTTCTCCAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54024	69412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13437_pilon_+_54045_56492_56550_56887_56993_68912
854830	contig_5779_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_106527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAAAAGGTACCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333737	334254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_333700_334300
854831	contig_13547_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_104897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTCTGTAAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215702	216337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_215700_216300
854832	contig_6446_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_149248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGCTCAATCTCACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597916	598152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_597900_598200
854833	contig_16930_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_139157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAAACTCTATGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109453	108982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_109000_109500
854834	contig_13481_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_119352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGATTCCGACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420337	419841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_419800_420300
854835	contig_17993_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_61940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99993	99611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_99600_1e+05
854836	contig_10135_pilon	-	605	4	Intergenic	novelGene_106575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	40	junction_1	112.443566092309	686	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	26	490	24943	5490	FALSE	25	CAGAATGCTTAGCTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETQQVAKMAENSGRAGKSSGSGAGKGAVSAEQVIAGFNRLRQEQRGLASKAAELEMELNEHSLVIDTLKEVDETRKCYRMVGGVLVERTVKEVLPALENNKEQIQKIIETLTQQLQAKGKELNEFREKHNIRLMGEDEKPAAKENSEGAGAKASSAGVLVS	24968	5374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_5667_6613_6738_6849_6939_24868
854838	contig_17108_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_109558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGAGGATTTTGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452053	451772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_451800_452100
854840	contig_2799_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_85574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTAATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764594	765249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_764600_765200
854841	contig_7285_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_143390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGGGTTGGACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226107	225428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_225400_226100
854842	contig_2537_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_33430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAAACAGGATATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248703	250415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_248700_250400
854844	contig_16148_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_50383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCCCTTAACCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111667	112392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_111700_112400
854845	contig_4125_pilon	+	1662	11	Intergenic	novelGene_25099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	6.23297681689897	16	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	220	1011	727727	729349	TRUE	0	CCGCTTCCCTTCCCCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHLGRLVVEVALGNAARALDLLRRHPEQVDAKNQGKTALQVATYLGQVEMVRLLLQARAGVDVPDDEGNMALHYAALGNQPEAARLLLSTGCCADAFNGSRSAALHIAVQRGFLEVVRVLCEHGCDVNDAHANTPLHCAISVGTGASGIVEVLTEVPGIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDARKEDGFTALHLAALNNHRDVAQILIREGHCDVNLRNRKLQSPLHLAVQQAHMGLVPLLVDAGCSVNAEDEDGDTALHVALQRHQLLPLATDGAGGGPRALAAAVQAAGLGPPGQR	727351	730332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_727374_727447_727582_727663_727813_727896_728048_728152_728314_728394_728522_728610_728846_729317_729497_729573_729762_729836_729903_730082
854847	contig_7870_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_108931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	237	548	278831	278520	NA	70	AAGAAAGAAAGAGCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSVYSSCFRIWAKQSWVDTSCRSYHLPPNSHFSTPVARFLMSVASGPCVSTLPFRSLHSLKSIAFSGSGFTTSIVQVPFSHSWKTPAPAAKCPEGCSYLLC	279067	278362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_278400_279100
854848	contig_6375_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_72981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_2	325.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTTCTCCCACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241671	244535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241865_241940_242009_244369
854849	contig_8210_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_30261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAACCTGTTCCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287448	288899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_287400_288900
854850	contig_12758_pilon	-	967	6	Intergenic	novelGene_177796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	2.93938769133981	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	113	565	263118	237694	TRUE	20	GACCATTCCTTTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLFQLDIKGRDCGDEAAQWFTNFLKTEPFRLVQFETNMKGRPSGEILSPSVPNYEVAYPDCSPILVLSEASLADLNTRLEKKAKMEHFRPNITVTGCGPFDEDTWDALLIGNVELKKVMACPRCILTTVDPDTGVIDRKGPLETLRSYRLCDPSERHIYKSSPLFGSYYLVEKLGSLKVGDPVYRMV	263230	235248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12758_pilon_-_235620_237662_237818_239132_239205_239341_239404_261315_261457_263064
854851	contig_15066_pilon	-	722	3	Intergenic	novelGene_149549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_2	50.5	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCAAGGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112608	111689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_111867_111967_112392_112487
854852	contig_6079_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_160086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCCCTGAGCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407060	406810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_406800_407100
854854	contig_8476_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_121315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAATCTGTGGTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26609	25849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_25800_26600
854855	contig_12090_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_80493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGATAATAGTAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161544	162184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_161500_162200
854856	contig_7164_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_172138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCCTTCAATGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463190	462444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_462400_463200
854857	contig_5153_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_74336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAAGAAACAGCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633998	633632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_633600_634000
854858	contig_10864_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_107115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATAAAGAAGTTACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116600	1117632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1116600_1117600
854859	contig_5605_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_143938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAATTTGTGCTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305920	306601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_305900_306600
854860	contig_14855_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_146020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	112.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCGACCTCAAGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514606	530198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_514755_526144_526220_530022
854861	contig_18610_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_168058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTTTCTCCCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17699	18443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_17700_18400
854863	contig_7775_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_37475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATGACATCCCAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113698	114023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_113700_114000
854864	contig_11742_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_166554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	8	313	216167	216472	NA	25	CTTTTACTCCCCACAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMVDVLGGRLLVTCDGAAVEAEAALQNKVVALYFAAGRCAPSRDFTPLLCDFYTELVDEAQPPAPFEVVFVSADGSEEEMRDFMHELHGAWLALPFHDPFRL	216159	217394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_216200_217400
854866	contig_18514_pilon	+	859	5	Intergenic	novelGene_175036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.58602010819715	38	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	33	605	1155	5622	FALSE	30	GAATACTTAAGCTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSLQASEGKMKSLNLWIESFQKKAEIFTEVQKVLDQSKENLERLQNQNVYLTEALQELKTNQGDTCESPLHHWIQYTDHCYHQTMEMVSWFNCSDLCVSLNATFVKTESSGLISFLKLFVANHTWLGLSYEEEDNQWRWENGSSLSLDLGLPAPRVDFQGKCVHLKAHTIGIDNCSTSSSCMCERNCTNPRKEKSKEKL	1122	5876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18514_pilon_+_1243_2107_2180_2323_2476_3314_3422_5468
854868	contig_7272_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_25432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTGTATTAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992026	991079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_991100_992000
854869	contig_10437_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_38352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTGCAACAACTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541500	540357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_540400_541500
854870	contig_6654_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_85687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATTTAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38409	39328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_38400_39300
854872	contig_7444_pilon	+	1292	6	Intergenic	novelGene_174931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	79.6291403947073	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	215	838	254087	283746	FALSE	35	AGCTCAATCTTATGAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVCAVASSQCINTEGGYVCKCLEGYRVDGIHCIDTTPPSHLGKDDLHPVRHIYPGCPPSHDGYCLNGGLCMYIEQVDEYACNCIVGFIGDRCQHRELRWWQLRHAGPGRQQNITVVAVCVTGLVLLLLLALWGTRYYRNQKLLSKNPKNPYEESSKDMSSSRPTDSEMGLSSCPQPWFVVLKEHQDLKCGSQPVALKDVQAADVGQLSSLEPGSIQTTSYRKEPQVHGMDAEQSCWIPSSSNKTSGSQGIEKNLHLPFYVARPIAVGVEQPHSSPVS	247785	284200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_247890_253976_254122_258223_258392_263125_263244_278978_279085_283549
854873	contig_12671_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_19207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGAAGATTGGCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161643	162086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_161600_162100
854874	contig_16525_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_133838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCGACATGATGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172922	173634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_172900_173600
854875	contig_7635_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_171359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGCTCTCTGTGTGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37045	37475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_37000_37500
854876	contig_7635_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_171360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37428	37788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_37400_37800
854877	contig_9389_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_84140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCAGCACTGTCCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767700	1767241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1767200_1767700
854881	contig_14314_pilon	-	1227	2	Intergenic	novelGene_176841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACGTAGAGGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153499	150410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_151297_153158
854883	contig_10733_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_109972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	225	678	66	743	323479	322802	NA	15	CTGCATGCCTGGTCCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWHFSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVLTRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTSRLPQYRKGLVRASLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQDCEALIQAAFAALQDSELFDSSVEAIVNAISQPDAQR	323544	322709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_322700_323500
854884	contig_15029_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_128219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCAGGGAATGGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273494	273930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_273500_273900
854886	contig_5690_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_119753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTGCCTTATAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100512	1101173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1100500_1101200
854887	contig_4364_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270480	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1270500_1271100
854889	contig_10404_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_138625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATTATGTCAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18635	17942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_17900_18600
854890	contig_12042_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_170437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTATTCTGATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155798	156787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_155800_156800
854892	contig_6391_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_173683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	33543	33905	NA	50	ACAGAGCCATCAGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTGTFLITYVAHIVFPVDGAAFKALLHSPPCSLSSGHSGLLLVCEHDKLGQIHPCCCAFDFFFHLFRALLLTSPPKPLLRALLNGHLHKESSLTTQPTAAALSHSTPFPCLVSLQSIYTI	33541	34644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6391_pilon_+_33500_34600
854893	contig_8651_pilon	+	368	3	Intergenic	novelGene_168192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	232	333	189217	189318	FALSE	10	TGTTGCTTTGTGTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQDQGSGPSRQEEGGAAETAGGSEGGAVPAARRQSDWRCGVQALRVVRKSIARVLTVINQTQKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185618	189353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185750_186928_186987_189174
854895	contig_12402_pilon	+	1041	2	Intergenic	novelGene_133345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCAACGTGCTGTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239235	241367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_239749_240839
854896	contig_14341_pilon	-	1108	2	Intergenic	novelGene_111876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	136	408	688243	686002	FALSE	5	GGCCTGAGTCGTGGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAPPTAPAAAPSGTAARSSAAETPAYECTHCRKTFSSRKNYTKHMFIHSGEKPHQCAVCWRSFSLRDYLLKHMVTHTGVRAFQCTVCAKRFTQKSSLNVHMRTHRPERAPCPACGKVFSHRALLERHLAAHPAP	688378	685301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_686259_688227
854897	contig_5725_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_167151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCTGGCTTTGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251781	252372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_+_251800_252400
854898	contig_14326_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_120687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	150027	149683	NA	75	AGAAAAGGAAAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRWGSACPHSHRLAIRLQVAPASQTRECKGSAASAHHGTNPCSAVAALSAALHATLCWSAERRTLARRNSTALRPGCPRANAQFQLFIFRLPRVLPNPIHYFLTVVYTFIIQI	150029	149349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_149300_150000
854899	contig_11986_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_69111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATGGGTGTATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86434	85632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_85600_86400
854901	contig_12046_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_83466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247257	248333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_247300_248300
854903	contig_13526_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_165201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCTATAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159854	160447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_+_159900_160400
854904	contig_4519_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_123704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTCTACCCAGGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586945	586546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_586500_586900
854905	contig_9070_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_171958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCGAAAATTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393175	394149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_+_393200_394100
854906	contig_2854_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_120866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTTAGAAAAAGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957942	958215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_957900_958200
854907	contig_12411_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_145689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGTAACTTCGCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454162	453608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_453600_454200
854908	contig_6109_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_160387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	503	805	612996	612694	NA	15	TTCTATTTTATCAGTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISDLRWSLHNAWRFLYALLRQLFNPNLFSSNFPHVCHSITLKLLKPEPITFIFTPPNPQPSLHMQLFLFFMYFNFGYGGLPDSCALDPVPSPLHPGFAS	613498	612684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_612700_613500
854913	contig_1594_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_138810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGAGGACAGAAACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428248	428743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_428200_428700
854917	contig_990_pilon	-	819	2	Intergenic	novelGene_76020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCATTCCTTGTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592652	570550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_571340_592622
854919	contig_12120_pilon	-	353	4	Intergenic	novelGene_21440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	43.2768863123133	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTCCTGGAAATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270302	242245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_242376_251077_251149_254532_254606_270223
854920	contig_13014_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_169335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCGTGTGTTTTTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307958	307309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_307300_308000
854921	contig_13014_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_169334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGGTAGTTCCGCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306909	306500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_306500_306900
854922	scaffold_14128_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_169528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339103	339731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_339100_339700
854923	contig_5918_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_99555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGATTAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792467	793668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_792500_793700
854924	contig_8377_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_35167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTACAATTGCTAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358009	357172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_357200_358000
854926	contig_10541_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_144640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219174	220496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_219200_220500
854928	contig_9267_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_162016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGCCCGGGAGGCCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372980	372642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_372600_373000
854932	contig_16541_pilon	-	333	4	Intergenic	novelGene_126749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	259.087286878809	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAAGTATGCATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423551	400547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_400605_402577_402722_406168_406222_423472
854935	contig_15543_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_164345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCACAATGGGCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50156	49179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_49200_50200
854936	contig_21006_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_177722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAAAAAAAAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21905	21547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_21500_21900
854942	contig_9415_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_109930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTTTCTTTCTTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2315557	2315025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2315000_2315600
854943	contig_12694_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_171981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGCAACACAATTCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307725	308109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_307700_308100
854944	contig_4012_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_176886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666798	667746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_+_666800_667700
854945	contig_5718_pilon	+	1238	4	Intergenic	novelGene_110410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	91.0640800023075	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	264	626	1423986	1459171	FALSE	25	CATAATGGTATGCCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSKVGGGKVKKPGKRGRKPAKIDLKAKLERSRQSARECRARKKLRYQYLEELVSSRERAICALREELEMYKQWCMAMDQGKIPSEIKALLTGEEQSKSQQNSSRHMKAGKTEANNNSW	1423722	1459783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1424001_1451533_1451732_1456074_1456220_1459166
854948	SIRV1	-	391	3	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	3578	-427	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGCTGAGGTGGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6788	1433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1485_6337_6464_6574
854949	contig_17989_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_150849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAAAATTACACATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317578	317255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_317300_317600
854950	contig_17989_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_150848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGACCCAATTTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317050	316633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_316600_317000
854951	contig_9415_pilon	-	1369	5	Intergenic	novelGene_109718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_1	110.657975311317	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	935	1369	451171	446192	FALSE	65	CAAAAAAGAAGAGAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAIHSINLLLKSIGATLTDVDDLLFKLAYYEIQYQFYRRDQLIWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPYGLIRGLSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLFGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAITMDKEYQ	452105	446191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_446275_446895_446972_447788_447903_449028_449111_451091
854952	contig_17790_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_128489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAGAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98533	99194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_98500_99200
854953	contig_10354_pilon	+	348	2	Intergenic	novelGene_50829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACTTGGGACTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352190	358907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_352386_358754
854954	contig_3747_pilon	-	937	2	Intergenic	novelGene_24739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTTAAGCTGGTATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114746	102484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_103296_114620
854957	contig_8461_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_163939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521768	522759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_521800_522800
854958	contig_2646_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_69727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGCCATTTCCTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2630574	2630128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2630100_2630600
854959	contig_11507_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_103365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGCATACAACCTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120166	119081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_119100_120200
854960	contig_5620_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_161348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGTGTGCTGGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382803	348374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_348846_382718
854962	contig_16220_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_163632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172720	172424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_-_172400_172700
854963	contig_4232_pilon	+	667	4	Intergenic	novelGene_63233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	169.436320388123	406	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	51	566	265429	266487	FALSE	15	CACAGCGCCTGTGAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTRQLWPQPETHSDRRMESGDEEATEKHRVHLRPATLRDAAPVALHLLPCEVLANRPAPVERFFVPAIRQRPAGLEVSFRGRILRGEEVVVPPGLAGYVMVMDEKAEVLIGLERKQELKGSEDDEEEQQEGPEPLERDFDRFIRATASFARFHLWGLETIPGPDAKVRGALTWPTLAAAIHTQVPAD	265378	266588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_265601_265782_265980_266057_266178_266460
854964	contig_5324_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_102046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTGGAAAGGCAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52510	53748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_52500_53700
854966	contig_12029_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_177352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGGGGAAAGTATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32394	32603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12029_pilon_+_32400_32600
854968	contig_10299_pilon	+	643	3	Intergenic	novelGene_79784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.5	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTCATCTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670185	679350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_670287_677664_677742_678885
854969	contig_3449_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_73717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340152	340886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_340200_340900
854970	contig_12528_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_81351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTACCCCCAACCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987826	987100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_987100_987800
854971	contig_8865_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_164463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGCGTGTTAGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418335	419187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_418300_419200
854972	contig_6505_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_175690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAACCTTAATAGGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38385	36937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_-_36900_38400
854973	contig_2768_pilon	+	1155	9	Intergenic	novelGene_57470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	117	449	534143	536415	TRUE	20	CAGATCCCCTCAAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSLIPYRITILNSLKYSFKYLILINRVIFIINDCGIAFQSSFLSIIFFPIFIISIFTCLLSQNLQIFLPIFINIIFITSQFLRFIIIFSFIIIITVILVFCMAGICSF	533066	540256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_533110_534069_534187_535017_535225_536333_536539_536642_536867_537612_537705_539472_539575_540008_540133_540215
854976	contig_9242_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_155085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	43	360	869137	869454	NA	35	ACATGCTACTGCAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASQGLASFYLQGKMPNNYELGLARHPRASPKPTGLGVGDGGPKTGEGLRITLLPQADFLRIGVNLEQVQLRILKHFQTQDKRCPLLRAERLTALSINFIRLINTTWKFLTYVKLTDGL	869094	870300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_869100_870300
854977	contig_9290_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_77522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192314	191243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_191200_192300
854978	contig_4659_pilon	-	359	3	Intergenic	novelGene_118169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1327	junction_1	9	10494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTAATGCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91167	87467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_87670_90900_90924_91033
854979	contig_15021_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_26934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAGGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196476	197117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_196500_197100
854980	contig_5881_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_129062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	104	544	597779	597339	NA	30	ACAGCAATAATTTGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAPGAGCSVPGRAASSWLEPGTNGARPGEVSSPCSGSGTLGLGFHVSEARRSAEQVWGEVGCHALPLHQGGEGASLRLFVFRGPAPLVTLGLVPSGPAPPHPRLPGDPALGDSELPGHSLATAVLEETLARSWPVRLHPIFLGF	597882	596974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_597000_597900
854981	contig_8712_pilon	-	1102	11	Intergenic	novelGene_58884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	21.1	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	7	552	1020797	1008922	TRUE	35	TGTAAAGAGCATTCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGMQEVPQDCPGTGSAQAGRGASCQGCPNQRLCASGAGAAPDPAIEEIKEKMKTVKHKILVLSGKGGVGKSTFSAHLAHGLAEDENTQIALLDIDICGPSIPKIMGLEGEQVHQSGSGWSPVYVEDNLGVMSVGFLLSSPDDAVIWMWTGGRLTTSLWTRHLGLLTSTSQLFSISREHTSMEL	1020803	1003303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1003539_1004233_1004318_1007841_1007945_1008229_1008341_1008904_1009035_1009923_1009997_1010655_1010689_1013095_1013165_1018936_1019071_1020595_1020701_1020778
854983	contig_16870_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_155479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATAGAGACTGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27160	27699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_27200_27700
854985	contig_15043_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_175506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTGCCTTAGCCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239032	240054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_239000_240100
854986	contig_15732_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_88920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAATCATGATCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371704	372760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_371700_372800
854989	contig_11986_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_69117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	325	633	107446	107754	NA	25	TTTTTTAAGTATGGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGAKLQYNSLYLHPLFYHWCMDLYMLQISQYSIIIFARQKCVFKIHKDKKEKVYSLLYLPTYFPFLVFHMTSFRSKVPYAVISLQSEKLSLAFLIVQIRW	107121	108398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_107100_108400
854991	contig_13607_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_170194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGCATGAACAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283846	282954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_283000_283800
854993	contig_16907_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_87426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338587	337647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_337600_338600
854994	contig_11677_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_85870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87119	87417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_87100_87400
854998	contig_987_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_72281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCATTGTATAATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915420	916062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_915400_916100
855002	contig_10013_pilon	+	553	3	Intergenic	novelGene_125077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	234	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAACAAACCCAAACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464211	468743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_464300_464467_464501_468311
855003	contig_5423_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_85201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	270570	270905	NA	35	GTCTAGTATGAGTCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITNLFLPFPSHAVKTQFALTSISWPPGHSSNPCNVSTENALNKLTSDCILAKCSRYILFLTFLWYLKPLTTPSFLKLYHPLCGICDSAQFTLQLLLLLELFLRLLVFCLP	270569	271497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_270600_271500
855005	contig_16714_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_161566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGGGAGAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721412	722179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_721400_722200
855007	contig_12644_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_44539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTAGGACTCTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456550	1455995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1456000_1456600
855008	contig_3424_pilon	+	592	2	Intergenic	novelGene_55470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCCATTAGGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149859	151200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_150061_150809
855009	contig_18787_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_175647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	96394	96729	NA	55	AAGAAAAGACAGCATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEKYIFDVPEGQNFLKMIICFHSELPEKMSRVGKKRKRSSWKRFPHHFLVEELHAPKVSWDQWPPLLGKKIATSYRTQCFQELNSCYSHKTTVKSRQQTADVHEVFVSLN	96393	97218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18787_pilon_+_96400_97200
855010	contig_2078_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_100163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGAGACTGTATATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483344	484038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_483300_484000
855012	contig_4180_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_8420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAATTGAATCTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899131	898516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_898500_899100
855013	contig_4924_pilon	-	668	3	Intergenic	novelGene_84758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_2	1948	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	87	437	252772	197716	FALSE	80	TAAAAGGAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGVSRFPFVPKSLYCLKMVPFN	252858	197484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_197862_252398_252596_252764
855014	contig_7933_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_164663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGACCACCAGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96714	97023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_96700_97000
855016	contig_6191_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_107843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGTTGATCAGTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155117	153720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_153700_155100
855017	contig_11056_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_130373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTCTCATTAAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335958	335510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_335500_336000
855018	contig_8182_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_173267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	244	543	416950	417249	NA	10	GGCAGCCAGCCGCTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKRQFATDQVAGLHSAGSQEKHEYDIDKQEDYNHGKNDYSLHIQGHGAMQNTVVFQVGGRQIGRCQSLFCQTVHTATMLETRGGSRVIREGLDLAPE	416706	417598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_+_416700_417600
855020	contig_5832_pilon	+	885	5	Intergenic	novelGene_134187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	18.6061145863396	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	10	885	686080	697509	FALSE	35	TACAACATCACCCTAACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLMRELTASDTGKTCLMKALLNISHNTKEIVRILLTFAEENDILDRFINAKYTEEAYKGQTALNIAIERRQGDITAALIAAGADVNAHAKGVFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMENEQTDITSQDSRGNNILHALVTVAEDFTTQNDFVKHMYDMILLRSGNWELETTRNRDGLTPLQLAAKMGKAEILKYILSREIKEKPLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTESSVLEIIVYNTNIDNRHEMLTVEPLHTLLHMKWKKFAKYMFFLSFCFYFI	686070	697509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_686249_691420_691562_693454_693736_696226_696404_697401
855021	contig_9008_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_58620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAGAAAAAAGGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112532	113084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_112500_113100
855022	contig_9239_pilon	-	599	4	Intergenic	novelGene_137174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	3.09120616516523	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	285	512	153931	153555	FALSE	15	TGCCAGACTGTTCTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFAFRKQLWEKEKVYSELRWQEKNTLEEIAELQKDIRHLEEDLQRKFLSLKLSHTRLESRTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATITALKQKMAQAQDALDALYKHLARLQADIACKANFMLLDTKCMDTRRKLTVPAEKFVPEVDTFTRTTNRTLSPLKSRQLELA	154505	153467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_153769_153917_153998_154150_154295_154431
855024	contig_11978_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_62958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTATTGCATAATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077806	1076588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1076600_1077800
855026	contig_19990_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_30768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	294	341	123395	123442	NA	25	CTCTTTGTAATTTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REKAAEPRSPAPSLPVEVGSSSGLKLVRKAAAPSRKDGARRPSLPPLKAEKLVCPPQDASEKSHCGNSSWPWILGLSPRPLRFEDHKCFSLWKFFSFMCLLEIGLMSASSLV	123101	123552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_123100_123600
855027	contig_5620_pilon	-	683	5	Intergenic	novelGene_161339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	59.8054136345532	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAAGTAAACCTGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275952	179622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_179697_189281_189368_198068_198190_214183_214318_275684
855028	contig_9345_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_24525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTTTCTCTTTTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690011	691373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_690000_691400
855029	contig_1264_pilon	-	808	5	Intergenic	novelGene_161296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	53.6161123171011	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	97	807	27347	23797	FALSE	15	TCGTGAGTCACCTGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLK	27443	23795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_23943_24613_24785_25427_25657_27031_27181_27331
855032	contig_14755_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_129385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201199	201870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_201200_201900
855033	contig_14158_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_136113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATGGGTCTGAGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17519	17053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_17100_17500
855034	contig_15897_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_49506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAACAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82659	81111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_81100_82700
855035	contig_1719_pilon	+	683	2	Intergenic	novelGene_87294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTACTGGAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389013	392381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_389482_392166
855037	contig_6192_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_170336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	126	419	597234	596941	NA	20	CCTATTCTTGGAAGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGDVEGGSGPSPGAAGDSGELALLLRRQIRALNLCGTDRTMESPSKILLVRPALDSPQDSKLTGCQSWQGTNFQSVHFTHGKTEALRGETTCAGSYTQQSRNGTRVPPPFGVTAARLGPDPSTDPRLRWQRAARTTL	597359	596698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_596700_597400
855038	contig_5954_pilon	+	707	4	Intergenic	novelGene_28522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.68178700572909	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	205	441	460873	461457	FALSE	20	TTCCTCTCTCTGTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGRIKLPREVSKAVIFSETDCHIFLLQSGWYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEDYVKCQEKVSALYKNQREWTRMVIRNIAASGKFSSDRTIAEYAREIWGIEPSRKRLPAPDETV	460516	461723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_460606_460757_460893_461118_461186_461307
855039	contig_14727_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_56663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAGAAGGAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337177	338238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_337200_338200
855040	contig_14687_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_107982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAAAAAAAAGAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854711	855065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_854700_855100
855041	contig_8866_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_77896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	169	306	1087755	1087618	NA	70	ACATGCAAAAAACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKNYTDIFPLRSVTRHYSLPLLSVVLEVLADCSEERQIKGIQIEKEETELSLFKDDMIVYVENPKELTKNLLELISKYSTVAGYRLIYKSQLLSCISPMKN	1087923	1087025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1087000_1087900
855045	contig_7138_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_120994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAATGTTTGGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233741	234756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_233700_234800
855047	contig_1996_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_131923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTAGTTTCTAGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398387	398159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_398200_398400
855048	contig_10428_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_162594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTCTGTTTCCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88667	87890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_87900_88700
855050	contig_7056_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_43588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGCTCATTGGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656574	655795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_655800_656600
855051	contig_19186_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_176048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89584	90733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_89600_90700
855053	scaffold_13505_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_111389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	525	2	526	136846	136322	NA	15	TGCACCCACTCCTGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGARTETGTGSRAPGGSPLGVSLVYSDKKSAAATSPAPHLVAGPLLGTVGKAPAAVTNLLVGTPGYGTPAPPAVQFIAQGAPGSGATSGSGTGAGSGPNGPVPLGILQPGALGKPGGITQVQYILPTLPQQLQVAPAPVAAPGTKAAAPGAPAPTTSIRFTLPPGTSTNGKVLAA	136847	136319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_136300_136800
855054	contig_20844_pilon	+	688	6	Intergenic	novelGene_78585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2.0591260281974	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	302	598	153453	154481	FALSE	30	TACCCAAACTCTGACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QERAEQDQAGLGLQRPGPGSGKALKCSAFYNLPTKESFLRKICHKDVCRCAEEQCASLRKGQLRQTELQVAACEPGVDFVYKAGVKSVEVSDSNPYVYYNMQLQDIIKSGTDFAKPLTMKKFVSHATCQDSLGLQEQQAYLIMGQTTDLWRVRSDYTHVLGKETFIMHWPADQDAGKKEFLAQLEGFSEYMHTHGCQT	152461	154571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_+_152530_152737_152828_153227_153309_153390_153481_153582_153719_154348
855055	contig_10324_pilon	-	870	4	Intergenic	novelGene_7834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	49.8820831784542	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	265	693	269976	268845	FALSE	15	GCCCTTTCAGGAGTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTVEPTEAGDYKLCFDNSFSTISEKLVFFELIFDSLQDDEEVEGWAETLGWPDAVEPEEMLDVKMEDIKESIETMRTRLERSIQMLTLLRAFEARDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT	271428	268667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_269064_269626_269829_269968_270067_271254
855058	contig_11317_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_164077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAAAGCACCTACCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85210	85999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_+_85200_86000
855059	contig_5261_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_102489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACCTCTTATAGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768182	768808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_768200_768800
855061	contig_10016_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_117876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGTATAAATTTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436316	436898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_436300_436900
855062	contig_8260_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_163235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGGCATGTATTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97462	96957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_97000_97500
855063	contig_14986_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_59740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	399	1200	30	1229	276727	275528	NA	30	TTTGGATTTAATATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRDSGENGKMVCYIQDDLPFLLKPSVENFYVLMTEGPLDRESRAEYNITIAVTDLGIPRLKTQHNITVLVSDVNDNSPSFSQTVYTVFVRENNSPALHMGSVSATDRDSGTNAQITYSLLPPQDPHLPLNSLVSINADNGHLFALRSLDYEALRAFEFRVGATDAGSPALSSEALVRVVVVDDNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEAGYLVTKVVAVDGDSGQNAWLSYQLLKATEPGLFSVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPRLSATVTLHVLLVDGFSQPYLPLPEVAADRAQADSLTVYLVIALTSVSSLFLFSMLLFVGVQLCRKNRDASVGRYPVPEGHFPGHLVDVSATGTVSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLNPVMPKSQTQGH	276756	275491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_275500_276800
855064	contig_10434_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_82015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGACTACTTATCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79034	79442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_79000_79400
855065	contig_21373_pilon	+	850	7	Intergenic	novelGene_164225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	26.1050229308887	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	271	360	80516	80716	TRUE	5	TGTGATCTCCTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLQIERILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLVQYCESKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLDDPRIKAIANKHGKTVAQVLIRFPMQRNLIVIPKSVTPERIAENFQISPRSGS	78850	84197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21373_pilon_+_78914_79390_79498_79791_79874_80497_80582_80692_80734_81710_81794_83807
855067	contig_8140_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_86448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTTTAGGAAGAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771273	774662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_771351_774394
855069	contig_6760_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_150785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTATAAATCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135406	134269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_134300_135400
855070	contig_4429_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_50824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAACTCACAAAGAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227512	228539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_227500_228500
855071	contig_16126_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_141874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCATTAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34367	35323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_34400_35300
855072	contig_17859_pilon	+	1251	2	Intergenic	novelGene_155727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246563	251142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_+_247025_250352
855073	contig_17471_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_168661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTCCACAGACCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28227	27849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17471_pilon_-_27800_28200
855074	contig_8276_pilon	-	1456	2	Intergenic	novelGene_174482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	296	751	158160	156822	FALSE	45	GGAGCATGAAGAAGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFRKGALHSLRERTFSTRSRSRANSSNKKSGLNFADGWHHLTGSVNLHTLTRRQSSFETQNFKPIFLLTPLPYFPPAPASEGRDMSAQSKDIFVVLGFPEFLDDIPGISDHVTDGFCLWGIGELPDFHLGLILVFGGTFPALTGEEIGIL	158455	156116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_156877_157759
855078	contig_11227_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_163171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGGAATACTGTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101138	99993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_1e+05_101100
855079	contig_312_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_128299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225682	227127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_225700_227100
855081	contig_12697_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_122827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGTAAAATTAATCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223987	225042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_224000_225000
855082	contig_5084_pilon	+	528	4	Intergenic	novelGene_64528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.49443825784929	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATTGCAGAGGTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468121	482192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_468390_468631_468699_477827_477951_482122
855084	contig_9011_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_159320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525644	524554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_524600_525600
855087	contig_14744_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_65977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCCCCTCATTGAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903261	902141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_902100_903300
855089	contig_11744_pilon	+	513	1	Intergenic	novelGene_176850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97087	97600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_+_97100_97600
855090	contig_12644_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_44502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGAAGAAAAAGGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053931	1052623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1052600_1053900
855092	contig_19179_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_142382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGCCCACGTCCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64530	65558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_64500_65600
855093	contig_7004_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_126518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCCTGGACTCTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465273	465607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_465300_465600
855094	contig_13699_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_158329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTGAGCAATCAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88271	86774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_86800_88300
855095	contig_5302_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_81464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTGTACTGGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244673	245076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_244700_245100
855096	contig_16650_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_61952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTTTTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226432	227252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_226400_227300
855097	contig_7697_pilon	-	1410	10	Intergenic	novelGene_128275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_9	26.6583320308429	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	331	1410	136402	130646	FALSE	25	TGAGCCCCCAGCACCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGATPAQSLSALRGYRVYARRWVFLLVLSLLSCSNATLWLSFAPVADTVAKRFSLSIKQINWLTLVYLVVSIPFGVAAIWVLDSVGLRVATVLGAWLNFLGSVFRALPCMDLSFRTPFAFLMAGQSLCALAQTLVVFSPAKLAAVWFPEHQRATANMIATMSNPLGILLANVLSPALVQEEDDIPLMLGVYVIPAGVACLLATACLWENVPPTPPSAAAASSTSVKFLDGLKLLMRNKAYIILALCFGASIGIFSSFTALLEQILCVKGYYNDFAGLCGALFIMCGFLGALGLGLYVDRTKNFTEATKIGFCLTSLACVAFAVVSQLPGQTIWLAVVCSLFGLFGLSIAPITMELAVECSFPVGEGIATGLVFVLGQIEGMLIMVVLTALTVHRAEPSFSTCQHGEAPLDWTASVLLMASLCAVCSCVFVIFFHTPYRRVQLEASASPSIQEDYVQGDTNPEPASATTP	143243	130645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_130816_131563_131674_131919_132078_132414_132568_133779_133897_134158_134297_135964_136042_136245_136460_138139_138299_143129
855098	contig_3068_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_137664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTCTTGTTGTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449166	449554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_449200_449600
855100	contig_6635_pilon	+	1124	3	Intergenic	novelGene_127019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.5	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	208	513	454257	454690	FALSE	50	TACTCTATAAAACAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLKVKIVAGRHLPVMDRASDLTDAFVEPFFQRLLRDCSPCDGCAARRCPRHTPPRREAGCSCSACWGDPDVRTQQATCHSGNPKAWLHGHRNTHTHFL	453890	455301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_454069_454227_454347_454474
855101	contig_9651_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_162849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCAAAATTCAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35827	37008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_35800_37000
855102	contig_2988_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_136554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAAGTTATATGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173883	174348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_173900_174300
855103	contig_3004_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_127531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACCCCAGCTTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471781	472048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_471800_472000
855104	contig_15516_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_177467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCTAGTTTCCTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35799	35152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_-_35200_35800
855106	contig_151_pilon	-	646	2	Intergenic	novelGene_132579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	10	351	253657	253036	FALSE	20	GTTTAATGCATGTCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKGCGVGLLRAFWVVVPGGPSARSPKRWPLVRPALSFPGARPVRRFSGIVYISILVKRLSSYLLLLIPECVMCFRKRKVALR	253666	252740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_253278_253557
855108	contig_6361_pilon	+	1597	4	Intergenic	novelGene_23902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	4.18993502999218	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1473	124	1596	134543	147871	FALSE	50	AAGGTAAGCGAAAATTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSKWIRAVNRVDPRSKKIWIPGPGAILCSRHFQESDFESYGMRRKLKKGAVPSVSLYKVPQAAHLKGKARQKILRQPLPDNSEEVTTEDHNYSLRRPLTIGAEKLAEVQQMLQVSKKRLISVKNYRMIKKRKGLRLIDALVEEKLLSEETECLLRAQFSDFKWELYNWRETAEYSTEMKQFACTLYLCSSKVYDYVRKILKLPHSSILRTWLSKCKPSPGFNSNVFSFLQQRVENGDQVYQYCSLTIKGISLKQQLQWDPSSHRLQGFMDFGLGKLDADETPLASETVLLMAVGIFGHWRTPLGYFFVNRASGYLQAQLLRLTIGKLSDIGITVLAVTSDATAHSVQMAKALGIHIDGDNMKCTFQHPSSSSQQIAYFFDSCHLLRLIRNAFQYFQNIQFVKGTACWQHLVDLVALEEQELSSMERIPSTLPNLKNHVLKMNCAAQIFSESVASALECLLSIGLPPFQNCTGTIHFLRLINNLFNVFNSRNRYGKGLKGPLLPETYSKINHVLTEAKTIFVTLSDANNNQII	134419	147872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_134594_137448_137753_138909_139061_146904
855109	contig_9516_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_106164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAGAACCCATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832822	831822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_831800_832800
855111	contig_7019_pilon	-	812	2	Intergenic	novelGene_149456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	234	581	518291	517944	FALSE	30	ACAGTTTCTTGCTCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECSYTLQHMGSPWFRIYLTTGYWFFWFGLTGQVVVWYYLCTSIPKLGWNFCPNLEDFLSICSALHIIFNENKFFYIEAACGQDFYPFISVCVFAQGKVFPLIVKKTKVCCLFRQ	519390	517712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_518499_519364
855112	contig_15325_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_157156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	156	335	39626	39447	NA	35	ATACATCTAGCAGCTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFFLSKKPPRGAAYIHKFHVNFKIWHFHQGHELTNPLSVGHEHLICVVDTMDYNSPHLSVCLLTNPCKVHTNHRAGCSPGPDKKHQNQLAYSLPRKCQSTWTKVRNPLG	39781	39076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_39100_39800
855113	contig_10667_pilon	+	182	1	Intergenic	novelGene_137315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61283	61465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_61300_61500
855114	contig_21138_pilon	+	705	4	Intergenic	novelGene_177797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.69967317119759	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGACATCCTCTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4631	9726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21138_pilon_+_4711_7043_7237_8920_9036_9408
855115	contig_6097_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_174446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236481	236836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_+_236500_236800
855117	contig_15062_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_162299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGACAGGCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71048	70667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_70700_71000
855118	contig_8268_pilon	+	1037	5	Intergenic	novelGene_147001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	24.8696602308918	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	103	708	98489	242954	FALSE	35	ACTTAAACAGACTCGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKWQPRKKAYFRQGVALQYLGRHADALAAFASGLAQDPKSLQLLVGMVEAAMKSPMRDSLEPTYQQLQKMKLDKSPFVVVSVVGQELLTAGHHGASVVVLEAALKIGTCSLKLRGSVFSALSSAYWSLGNTEKSTGYMQQDLDVAKTLGDQTGECRAHGNLGSAFFSKGNYREALTNHRHQLVLAMKLKDRENSRVVILK	98386	243283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_+_98516_229719_229868_239329_239603_240573_240705_242927
855120	contig_10239_pilon	+	473	3	Intergenic	novelGene_175245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	1.5	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	183	291	473	36688	36870	FALSE	35	GATTATCCAAGCCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVSFEDVTVDFSREEWRHLDSAQRRLYRDVTLENYSHLLSVGYQVPKPEVIFKLEQGEEPWTLEAETLHQSYSDSKFGIETSQRRTTEKATFHSEMEDEDTRDDSLYSILEELWQDAEQIERYQEKQNKPLNHTAFVNKKILTTEWDYENKDIGKF	29513	36870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_29643_29885_29982_36622
855121	contig_9571_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_136277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATAAAAAACAGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433448	432311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_432300_433400
855123	contig_15114_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_121103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAACCACTGACATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42845	41803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_41800_42800
855124	contig_2867_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_135195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACTTAGAAGCCTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863502	864080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_863500_864100
855125	contig_2867_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_135196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCCTTTATCACTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864184	864481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_864200_864500
855128	contig_6102_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_31825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTTTGCAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362459	362134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_362100_362500
855129	contig_6131_pilon	-	904	7	Intergenic	novelGene_177438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	5.02217305777312	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	557	904	191811	189321	FALSE	20	TCATGGTGAGAGGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSQVEFSHSGPGPNIDFHMSYLIPSRHGMKDTIINMSFVSSSRAGGNSHDGLLPFVFSVAPDKRIGHGECCEGIPRQCGSGLFVPIEGGVCLNVRSPPQFGLVNVSLTGRWKSY	201421	189320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6131_pilon_-_189512_191024_191151_191780_191911_194891_195015_196297_196434_198828_198965_201359
855132	contig_990_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_76021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACAGTTGCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618057	619018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_618100_619000
855134	contig_14618_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_136801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	60	362	390113	389811	NA	15	TCTAGGCTGCTAAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTDLKTLWSTVLLCTHEVTMGRHGLDNSQQLQTPAISRLLKSGRGGWRERTRETQCEDSALHCSLCKKGATSQRTEFHQQPNEQDTDSPQRSPKRTPDSSCDPEQRASRVPWASAPGKL	390172	389791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_389800_390200
855135	contig_9114_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_155185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATGATGAAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195282	194881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_194900_195300
855136	contig_610_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_76652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAATAGATATTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22195	23082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_22200_23100
855137	contig_21399_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_173668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTACGATTGTTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88993	89710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21399_pilon_+_89121_89309
855138	contig_15610_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_154277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465987	465628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_465600_466000
855140	contig_935_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_45538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315638	315185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_315200_315600
855141	contig_20064_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_175638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	101512	101141	NA	15	TATTTGGGGATTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDGADTSWAVPCPPARQDPPLAVVQLVPKHLKPQAGFGHTIPCPLGPPLPHQLLFPTSGVSSCPKTPIGNSPLALVESICPSVHLSILVPSLPPGNTSWLGAPPSTWLTCLGPASAPTTQPL	101514	100942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20064_pilon_-_100900_101500
855142	contig_15118_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_74637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGCATTTCTCTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472530	473353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_472500_473400
855143	contig_10286_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_98429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCCATCATTCCTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461442	460891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_460900_461400
855144	contig_10286_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_98428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	65	406	460519	460178	NA	15	CCGCAGCCCGCATGCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKTHAFPGRPEPPDTAVLFSSSSSCDRLSLHLVPARLSLIAVSRLLEPGMPWGLDQSSVSDGRGASEKSLGGASGRAVQTHPEAPRKTGLVICFRKITALKTLWSSSTLHT	460583	459854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_459900_460600
855145	contig_14450_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_49007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTTTCATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133085	1131752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1131800_1133100
855146	contig_1865_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_103243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTACTATTGGATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145639	146232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_+_145600_146200
855147	contig_13224_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_104084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCAGTATTAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208874	208501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_208500_208900
855148	contig_7893_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_177701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATACTGTCTATTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69278	69671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7893_pilon_+_69300_69700
855149	contig_4876_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_137908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATATCAGGGAAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613627	614311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_613600_614300
855150	contig_9199_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_65641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	124634	124951	NA	35	CTCTTCATAACGAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRSPARCSCTSALKARLTRCSRSTCRSGTRLRTCGSSTSSQGRSRSLQVKKRWRRRPKAAPLSAIPPPFYSCAPAPRSVPPDPAPTQLPSPVLSPASAPPVLGT	124633	125984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_124600_126000
855152	contig_6433_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_162762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCCATTTATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278829	278444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_278400_278800
855153	contig_6983_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_177582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100736	100183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6983_pilon_-_100200_100700
855155	contig_14151_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_171832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAACAACCCCACGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8461	8787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_8500_8800
855157	contig_1150_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_61462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGTATGTCATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343024	341964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_342000_343000
855158	contig_6503_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_145798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTAAATAAAAATGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399677	1398867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_1398900_1399700
855162	contig_2892_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_118991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCCAGATCGAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67308	66934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_66900_67300
855163	contig_4364_pilon	-	413	2	Intergenic	novelGene_157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	319	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	1244247	1237665	FALSE	0	CGCCTGTTCTCTTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAGPGSGCGSLGSGDWSACTWGAGLEGGWSWVPDVGGGAPASLVSCNAELPWEVTDHHPALPGLPSPTQLCRDSPQLCTGEWGLTSPPSGVLRPSSQGQPPSQAVAGLKQGRYVFPVTS	1244249	1237613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1237858_1244080
855164	contig_2863_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_174065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTTCGGGCAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137453	138121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_137500_138100
855166	contig_10777_pilon	+	306	2	Intergenic	novelGene_101177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAAAAAAAAATGTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457793	458734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_458026_458660
855167	contig_3956_pilon	-	1050	8	Intergenic	novelGene_14762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	58.7703937682356	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	335	841	832681	830636	FALSE	35	TGAAAAAACTTTTATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSSDSEPEAGLDREAKKSAKKLQPQTLEPVRKPSQKEKRGRLEEKSRAKPPKVERTRKRSEVLTPDRKVEKKKEPSVEEKLQKLHSEIKFALKVDNPDVKRCLNALEELGMLQVTSQILQKNTDVVATLKKIRRYKANKEVMEKAAEVYTRLKSRVLGPKIEAIQKTNRVGAEKEKAEVERAEEPLAGEEAPKEKAEGEPGADLGTPVNGEAASQNAESTGDREQEEVQTSAEGPQLDSSEDPHDNLREGPDPDRPGNDRLPERERVRMDSESLDDES	835987	830426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_830736_831229_831360_832203_832418_832618_832721_833042_833114_833499_833574_834469_834574_835941
855168	contig_2830_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_165846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCTTCCTCCCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412350	411179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_411200_412400
855170	contig_7657_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_30061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464068	463063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_463100_464100
855171	contig_4125_pilon	-	847	4	Intergenic	novelGene_25184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.8088153692684	279	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	8	670	1271240	1265499	FALSE	15	AGCCAGTCTGCAGTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMAADAGGGYRPRLRLRRRRPPSEAGAPDSVPRPPSGRPWFLQETGSGSESESAEPWAELLRTLLPGMDLSTAPPPLPAFPLQEPRRDPEHTAPVEVFTVGGKDFPWTPFPPAPGRGTRSSCLLRGIRGRPGSPAPSAFRHPEPEPGVTPIAKEQPSVEEKPPSVEEKPPSVEEKPPSVKEVPALVCCPMCQAEFSTKLSQLDIDAHLAQCLAESTADVVW	1271247	1265321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1265572_1270087_1270432_1270638_1270811_1271166
855173	contig_11594_pilon	+	436	4	Intergenic	novelGene_80925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	304.055915910215	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	29	436	540415	548978	FALSE	70	GGAAAGAAGAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAALSSLKALGLNYDDTWRFREQSREDSLCLGVERLGPATSKSTGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGAT	540386	548978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_541179_541306_543390_543493_548949
855174	contig_15031_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_138412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCTATCTCTAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105557	104801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_104800_105600
855175	contig_5084_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_64509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATATTCAGAAATAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351047	352722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_351000_352700
855178	contig_11003_pilon	+	1130	2	Intergenic	novelGene_105442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAACAATCTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123570	129662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_123609_128570
855179	contig_8693_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_150870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092372	1091398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1091400_1092400
855180	contig_10020_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_168285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105568	104072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_-_104100_105600
855181	contig_19692_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_174887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAATAAAAAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60909	60171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_-_60200_60900
855182	contig_6217_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_109640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTTCTAAGACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596273	597123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_596300_597100
855183	contig_12970_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_50540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	24	506	421996	422478	NA	35	GGAATAAAATTACTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTNTEKIMSNSFKIVADWPSSDSADWPSSDLAQRQRRSRTPKARFNEPDLKFGIRDNMSEMSLYTAHEACWGTSPEELKTLGSSCLGSSEMLSSEMTWENKICLSEKNHGQHALCLSFTNSAPIVSEVAEPQILAEFPEGKSKGVPGIEIGLCTQTEPQDFALLWKIE	421972	422479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_422000_422500
855184	contig_1406_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_25620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	17	54	336	389	2598074	2598021	NA	80	AATGAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRAEAHERHSSPGTHQRRESQGNTWVIISCLSSGSENFETCLQKGQRPIKGFVFKSPPAGSWFSQEFLVDPGRKPCSVHVDAHGPFPTNLSTLQPCLGLFSFLQTEAVPGMQGSMNIRAQLMSCSKL	2598409	2597856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2597900_2598400
855186	contig_15327_pilon	+	1207	10	Intergenic	novelGene_70436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	29.9109790322327	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	142	1206	61750	130765	FALSE	0	TCCTGGCCCTCTTCCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGAGGAGGWPERAALQVSGETGGGSCSPAAPAQKEPWLLDLSSLLKMAGEITETGELYSPYVGLVYMFNLIVGTGALTMPKAFAAAGWLVSLVLLVFLGFMSFVTTTFVMEAMAAANAQLRWKRMESPKEEEEDSSSSASDSDVLIQDSYERAEKRPILSVQRRGSSNLFEITDRVEMGQMASMFFNKVGVNLFYFCIIIYLYGDLAIYAAAVPFSLMQVTCSTTGNDSCGVEADTKYNDTDLCWGPIRRVDAYRIYLAVFTLLLGPFTFFDVQKTKYLQILTSLMRWIAFTIMIVLALVRIGHGQGEGHPPLADLAGVRNLFGVCVYSFMCQHSLPSLVTPVSSKRHLTGLVFLDYMLILAFYSLLSFTAIFCFRSDSLLDMYTLNFAHCDVVGLAAVRF	60970	130766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_61038_61675_61795_71960_72083_75160_75243_75914_76012_76626_76708_80163_80264_81304_81414_108983_109078_130430
855190	scaffold_19766_pilon	+	1197	2	Intergenic	novelGene_34243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	112	1065	147267	148745	FALSE	10	TGGGGGTGCCCCACGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLLFLLGGGAGAEDLEDRELLVTVRGGRLRGIRLMAPGGPVSAFLGIPFAEPPVGPRRFLPPEPKRPWAGVLDVKAFQSVCYQYVDTLYPGFEGTEMWNPNRELSEDCLYLNVWTPYPQPASPTPVLVWIYGGGFYSGASSLDVYDGRFLAQAEGTVLVSMNYRVGAFGFLALPGSREAPGNMGLLDQRLALQWVQENVAAFGGDPMSVTLFGESAGAASVGMHLLSPPSRGLFHRAVLQSGAPNGPWATVGVGEARRRATRLARFVGCPPGSTGGNDTELVACLRTRPAQDLVDHEWSVLPQESVFRFSFVPVVDGDFLSDTPEALINAGDFQGLQTGCTLKTQRALGRQ	147155	148877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_148176_148700
855191	contig_3529_pilon	-	537	4	Intergenic	novelGene_105358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	315.070715166541	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621478	541509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_541842_544822_544892_550497_550582_621426
855192	contig_10023_pilon	-	449	5	Intergenic	novelGene_123469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.29903810567666	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTCCTGTTCTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101758	95064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_95171_95793_95923_96992_97040_101149_101227_101668
855193	contig_12528_pilon	-	200	2	Intergenic	novelGene_81272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACTGCATTTGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205023	200774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_200867_204915
855194	contig_18967_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_165341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAAGGGCGTAGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445145	444452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_444500_445100
855195	contig_10711_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_118428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	484	816	743948	744280	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEGLVKTLRLLHCLLLSAAPCWCRKGSVAPSPERERGKGKQVKKLKCSHQEQVVEVGKEEEACFARCCVFPGMLATPSRSLRLPFAGPCPRTMAQDDLGQMPGWCGLVV	743464	744402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_743500_744400
855196	contig_3424_pilon	+	190	1	Intergenic	novelGene_55590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTTTTATTGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177275	1177465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1177300_1177500
855198	contig_9484_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_105605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATTCTGATAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75506	74494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_74500_75500
855199	contig_7457_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_31475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAGAATCAACTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533031	532683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_532700_533000
855202	contig_4769_pilon	+	952	1	Intergenic	novelGene_118002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAGGAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913139	914091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_913100_914100
855203	contig_17814_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_168520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76476	75219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17814_pilon_-_75200_76500
855205	contig_6163_pilon	-	707	6	Intergenic	novelGene_103810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	241.061319999705	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	15	428	79431	77815	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGLCFRVMPTARLSHWRPRLPQTPSLL	79445	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76092_77094_77238_77811_77893_78322_78458_78698_78816_79347
855208	contig_15122_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_162691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTAACTCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36672	37023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_36700_37000
855211	contig_11498_pilon	-	1114	2	Intergenic	novelGene_65522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	190	900	232367	231657	FALSE	40	TGGTGAAACCAAACAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSEDEDPARAAGGWNSRGPRTQSPGGCSAEAVLARKKHRRRPSKRKRHWRPYLELSWAEKQQRDERQSQRAFQVREEMFAKGQPVAPYNTTQFLMNDRDPEEPDLDVPHRVSHPGSSGESEAGDGDGPGQAHGEFLQRDFSEACERYHTESLQGRSKQELVRDYLDLERRLSQAEEETRRLQQLQRYTNQQPCRQLEELAAEVERLRTENQRLRQENEMWNRVGGSCSEELGT	235374	231442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_232446_235263
855212	contig_9561_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_100858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGGGAACAGAGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224738	225759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_224700_225800
855213	contig_4847_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_156146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	79342	79019	NA	15	GTGGAGTGGAACTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSGPKEAASVALCSRSSVVGCGIGERELGFFRTRRFGIQVSKLPELADVRALQVRFPGSGLRGPHIPALHTFPSSLVLVSNFQIGPRTSRVAARPREGGGRAPWEV	79342	78783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_78800_79300
855214	contig_4847_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_156145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACATGCTTTATATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78063	77734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_77700_78100
855215	contig_9437_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_141726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACCCTGTATTCTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226442	227037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_226400_227000
855216	scaffold_15568_pilon	+	415	3	Intergenic	novelGene_122574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	10	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCCTATGGAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57815	82082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_57935_81493_81621_81913
855217	contig_12142_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_147786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTTTCATAGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9400	9935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_9400_9900
855218	contig_9177_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_32660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTAAAAAAAAAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99943	98697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_98700_99900
855220	contig_10734_pilon	-	1202	11	Intergenic	novelGene_51170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	10.8466584716216	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	213	1004	1053089	1042957	FALSE	20	CAGATTTTTTTTTTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTRQLTFAHRTRALQCLLYLADKQTVESLFKKPIEEVKSYLKCITFLASFETLNIPITYELFCNSPKEGMIKGLWKNHSHESMAVRLVTELCLEYNVYDLQLWNGLLQKLLGFSMIPYLRRVLTAISSIHSLWQVPYFSKAWQRVIQIPLLSASCPLSPNQLSDCCESLVAVLECPVSDDLDMIGVARQYVQLELPAFALACLMLMPHSEKRHQQIKNFLGSCNPQIILQQLEEHMNTGQLAGFSHQIRSLILNNIINKKEFGILAKTKYFQVLKLHMMNTNSITELVNYLAKELSLDEASVFIMEYSKHCGKPVPPGAAPCDILKMFLSGL	1053767	1042758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1042978_1044492_1044584_1045834_1045981_1046749_1046840_1048582_1048713_1049722_1049787_1049874_1049930_1051643_1051701_1052085_1052182_1053047_1053184_1053649
855221	contig_8941_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_177799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTCTTTAAAACAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9933	9563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8941_pilon_-_9600_9900
855223	contig_12142_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_147790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAATACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17528	18435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_17500_18400
855225	contig_13894_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_62072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAGCTAAGCTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391062	391709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_391100_391700
855226	contig_3382_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_124138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCTTGTGAAGTTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827676	826648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_826600_827700
855228	contig_5832_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_134117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGTACATGTTACTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45516	46484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_45500_46500
855229	contig_13267_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_146618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTTAATAGGTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256949	258088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_256900_258100
855231	contig_7457_pilon	-	1330	7	Intergenic	novelGene_31727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	815	1330	1315633	1313530	FALSE	20	ATTGAGGTTCTGCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYCSRISASTRVRSTPGAASISTLTWPASWLPYSFISLLVVFLQVGQFLIQTLDLHLQVSPGQGQLVQHPAQAVDVGLHTLVQGQLVLILESEVIRGQPGIIDLQDDTGVVNGGCQDLVPELLNGLEVVTVVPLRAGWALLLVPVADLQLQVGIGLLQGTHLVQVGGQAV	1317750	1313529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1313687_1314650_1314736_1314846_1315004_1315516_1315678_1315760_1315888_1316081_1316325_1317350
855235	contig_12409_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_169436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTATTTTTACTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34873	35369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_+_34900_35400
855237	contig_2799_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_85469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGTGAGGGAAGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406932	408333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_406900_408300
855238	contig_5799_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_50253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTACCAAAAATTCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183781	184797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_183800_184800
855239	contig_5260_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_144362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTATCTTTCCCATTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210101	211330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_210100_211300
855242	contig_5812_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_167487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATAAACAACTACCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68396	68810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_68400_68800
855243	contig_5812_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_167486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTTAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68105	68329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_68100_68300
855245	contig_15765_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_177801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGAGCCGTGCTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30463	29851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15765_pilon_-_29900_30500
855246	contig_4071_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_151862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGGAAAGATGTGGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26868	26133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_26100_26900
855247	contig_7457_pilon	-	592	3	Intergenic	novelGene_31276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	140.5	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	40	330	147574	146723	FALSE	15	GCATGATGTTCTTCCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLRVQVRPLELPMVTTIQVSSQISDRRVLVSGFPAGLKLSEEQLLDKLEIFFGKDSNGGGDVEIRELLQGGAMLGFTRDGDLLPASALLSGGVQHPRHPGWPRAARCP	147613	146460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_146809_147268_147456_147556
855248	contig_5827_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_129792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445640	447323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_445600_447300
855249	contig_6202_pilon	+	706	4	Intergenic	novelGene_139828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	72.1495360730445	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	31	543	486530	493636	FALSE	20	GTATTGTAACAGCGTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKVDQETLTEMVKPSIDYVRHKKFRSGNYPSSLSNETDRLVHWCHGAPGVIHMLMQAYKVFKEEKYLKDAMECSDVIWQRGLLRKGYGICHGTAGNGYSFLSLYHLTWDKKYLYRACKFAEWCLDYGAHGCRIPDRPYSLFEGMAGAIHFLSDILGPETSRFPAFELGSSQGDIKVQKDN	486499	493799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_486677_489888_490066_490365_490439_493520
855250	contig_11823_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_171022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATAAATTTTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40599	39817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_39800_40600
855251	contig_5515_pilon	-	578	7	Intergenic	novelGene_52307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.5657137141714	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTGTGTGGTGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37516	33055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_33137_33340_33386_33476_33588_33672_33802_34833_34899_36599_36700_37469
855254	contig_7398_pilon	-	179	1	Intergenic	novelGene_166190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGGAAATGTCTAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411905	411726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_411700_411900
855255	contig_10129_pilon	-	1733	11	Intergenic	novelGene_128153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	19.9037684873996	1	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	320	1303	314407	291451	FALSE	45	GTATTAGAAGTATTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLAEFYAISTFFRETKTELDGLFGVQKKKKSSAFKEITYATSFCHQLRWITRRSFKNLLGNPQASIAQLIITAILALIIGAIFYGIENDQTGIQNRAGVLFFLTTNQCFNSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFFGKLASDLLPMRMLPSIIFTCIIYFLLGLKPTAEAFFIMMFSLMLVAYTASSMGLAVAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMLFSGLLVNLRTIVPWLSWLQYFSIPRYGYVALQHNEFLGQHFCPDLNATTNSTCNYAICTGEEYLTNQGIDLSPWGLWRNHVALACMIIIFLTIAYLKLLFLKKYS	321271	291020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_291599_293868_293952_294824_294915_300323_300479_301933_302059_303289_303380_308105_308189_314197_314445_314837_314940_316867_317020_321243
855256	contig_1009_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_121722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGCTTTTCCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101594	100860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_100900_101600
855258	contig_5586_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_143594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCAAACTGCAAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553285	554290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_553300_554300
855261	contig_1982_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_151327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTTTAGAGACCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249976	250298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_250000_250300
855262	contig_366_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_51615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGCAACCAGCCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169683	1168683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1168700_1169700
855263	contig_5918_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_99502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251262	251780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_251300_251800
855264	contig_3382_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_124141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCAGGAAACCTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832508	833390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_832500_833400
855266	contig_11121_pilon	+	710	2	Intergenic	novelGene_167060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	361	675	213975	214289	FALSE	35	AAGTGTTCAAGCACTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLLQGEVLESEGEAYHQLPRCDPSTTEISPNIEVGSSYSSQSWEALEEQGTVGTFILNNASGSRVHQSKGQHVGGTQYVFRSTFLLYQKSERKERKKNKGSK	212801	214324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_212918_213730
855269	contig_9883_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_87577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAGAAACGCTGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55376	55850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_55400_55800
855271	contig_6403_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_139882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCAGATCAAGAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897639	896949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_896900_897600
855272	contig_13283_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_154013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	173	493	32858	32538	NA	25	TGAGACTAGCATTAGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKYTKKTKRNNREGQKKKLNSSELSTMKSPLWRCWAGGSGGAYIIDTLGGSEGAPERGKPRERMRPLWEDHQQEQLGKNTEIPPKDWLYYTSLEVEVQVSLKTE	33030	31419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_31400_33000
855273	contig_5569_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_86719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	217	309	76310	76402	NA	10	CCCACGTGCAGTGTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQSEHPTPRRLKALNRGLGPSLLLEARSEAQPPYSCCYRCSWPWSPRSGPERASSSSTGKTWGAVSVPARVEMGGRQPRAAVTVLVGVVRARAPCVRPSLLP	76093	76451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_76100_76500
855274	contig_12540_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_148064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221264	222091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_221300_222100
855275	contig_11816_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_98550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTCTGATCTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099570	1099334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1099300_1099600
855277	contig_10235_pilon	-	780	3	Intergenic	novelGene_46289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	249	698	33674	33225	FALSE	30	AGACTAGAGACTGATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLVGRVSSKPKQQAQGRGIVADTGPVQWRGLPSIYVKAWVSLEESLGPDQPSCRQVTTEATLSALAAGGRGHGTLRLRRKEKGSSQDPSLGWSLPLHLTLYALFLPPVPRFFLNPHQEMRPILTLIPYQMAGLEKNLRGVEVTDLIF	43238	33142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_33724_35453_35619_43204
855278	contig_10109_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_131339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTATGACAATTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253668	253414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_253400_253700
855279	contig_7843_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_152053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGGCCCAGAAAAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538728	540041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_538700_540000
855280	contig_3942_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_128898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTTGTGATACTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661673	1661424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1661400_1661700
855281	contig_3241_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_146383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACCCGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726306	725190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_725200_726300
855284	contig_5814_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_143055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350695	351302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_350700_351300
855285	contig_15449_pilon	-	751	4	Intergenic	novelGene_33643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	53.4748123470813	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	116	556	106929	104664	FALSE	15	CCCAGTGACCTCGACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLLLLLGAWVIPGGLGGRSPLTATAPQLDDEERYSTHMPTHLRCDACRAVAYQMWQHLSEAEAKLHTPESGRRRELSESGYTDVLDRSCSQSWQGYGVREVNQVKHLTGPGLSKGPEPSISVMVTGGPWPIRLSMTCLRYLGEFGEDQIYEAHQQGRGALEALLCESPRGACSKDEPVTKEEL	107044	104468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_104821_104907_105019_105397_105523_106881
855286	contig_10940_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_49212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTGTCATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838246	837601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_837600_838200
855287	contig_8673_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_129918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATATACCCCAGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305249	306480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_305200_306500
855288	contig_3956_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_14787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	7	534	1105584	1106111	NA	20	GCATTGGAGTCTGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLMKHLGLEIPTWDGPLVLERALPPLPRPAAPKLEPKEERPARLNGSASPSPEQESPAQRNGSGHASPKQESPAQRNGSGPASPKQESPAQRNGSGHASPKLESQAQRNGSGPTSPKREWPDTPPPPQAPEKGEGRGGPQLTRVLGDGGAFVKNCGFSFFLLVSLCYLYLASGAAVR	1105577	1106545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1105600_1106500
855289	contig_16322_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_87573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255813	256212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_255800_256200
855292	contig_7428_pilon	-	532	5	Intergenic	novelGene_77736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	224.838136222483	467	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	155	451	436221	435430	FALSE	5	GGGCTGGTCCCTCCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAERRGTVPVSAGGAAPPEGALSNGVYVLPSAANGDVKPVVSSTPLVDFLMQLEDYTPTIPDAVTGYYLNRAGFEASDPRIIRLISLAAQKFISDIANDALQHCKMKGTASGSSRSKSKDRKYTLTMEDLTPALSEYGINVKKPHYFT	436502	435348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_435520_435700_435816_435901_435967_436194_436350_436476
855293	contig_9415_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_109724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAACTCTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465258	466480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_465300_466500
855296	contig_6870_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_103980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTAAAACTCTTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455617	1457018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1455600_1457000
855297	contig_4179_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_177802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCAGATTTACTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40710	40442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4179_pilon_-_40400_40700
855299	contig_3077_pilon	-	566	4	Intergenic	novelGene_26861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	18	449	1312338	1311253	FALSE	45	AGGGAATAAAGACAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIVTDMVTVNWVAESNTAGWPCTLLRVIHRESRKERQVQQLQFPSWEPGHELPATTLLPFLAAVGQCCSRGKREKPGTLLSHSSKGVAQLGIFLAMEQLLQRAGAECTVDVFNVALQQSQACGLMTPTLEQYIYLYNCLNSALVDELP	1312355	1311135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1311313_1311545_1311682_1312003_1312168_1312266
855301	contig_5954_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_28801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTCGAAAATAGAGATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443054	1443851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1443100_1443900
855303	contig_3960_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_138039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACCCACCCCCCCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642011	641447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_641400_642000
855304	contig_7887_pilon	-	1424	2	Intergenic	novelGene_124898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	385	693	366405	366097	FALSE	5	CTTCTCTGCCTTCCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLHFFLDGRWGTSRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAAERLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWACAVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTIGMGKILLGSGASSNPGLTGRDGPAASCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLECPLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD	367809	365365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_366491_367510
855306	contig_15244_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_118057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAACATTCATATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592750	593204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_592800_593200
855308	contig_15498_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_42718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATCCTTTTAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013845	1014259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1013800_1014300
855309	contig_6076_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_81762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATGTGATTCATAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362334	363506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_362300_363500
855311	contig_15471_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_175226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTCAGCGAAAAAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373802	374635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_373800_374600
855312	contig_1093_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_139982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGTATATATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212456	211526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_211500_212500
855313	contig_10986_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_71504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCCATTGCTGTAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163796	164201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_163800_164200
855314	contig_7457_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_31374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387485	388238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_387500_388200
855315	contig_9982_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_55790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	142	453	842163	842474	NA	90	TAAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEQWGTNGHSDLFWKTKTKTLLFYYYLESTHSNLFGGGRENEKYMSIQIHFKRTGVTSQGIAVYVRVCSSRFLVSVYITGVICTDVWKVLARLSEIFSPKVGHEHILFCSLKVSCRCFLGSCHSLFSLSSSLMASKDTCEGRFPLSS	842021	843059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_842000_843100
855318	contig_10299_pilon	-	1304	11	Intergenic	novelGene_79748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	632	1033	500751	498430	TRUE	65	CTAGAAAAAAAAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKGLVYEDILHICLYHLAPLRSDPAHKAIHVHLPLCVHHVQHGINDDKGTRTPDTRTAVDHDGPCILRVTGLHLLEKLEHANWGERHPKVWPAGKVELSDEALWLSVGHVAHLLNAELSDCVVYQDGHILY	511975	489793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_489900_497080_497184_498367_498488_499228_499392_499832_499975_500712_500862_502290_502387_502702_502780_503290_503422_511679_511809_511887
855319	scaffold_6394_pilon	-	454	2	Intergenic	novelGene_111061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	0	3006	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGGCCTCAAGTATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472370	469905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_470179_472189
855321	contig_13112_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_98850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGAAAAAAAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704419	704200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_704200_704400
855322	contig_20614_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_107610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGAACCAGCCTTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475927	475559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_475600_475900
855323	contig_19514_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_166316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATGGATTTACTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56724	57768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_+_56700_57800
855325	contig_2757_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_164585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAGAAGACAGAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205956	205661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_205700_206000
855326	contig_11551_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_168469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGAACTGCCTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423559	422081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_422100_423600
855328	contig_14704_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_82710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATACGAAGAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107783	108376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_107800_108400
855329	contig_12886_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_135499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAAAGTGAGTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584599	584855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_584600_584900
855330	contig_16103_pilon	-	420	3	Intergenic	novelGene_118726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	47	340	229039	227354	FALSE	30	ACTTTTTGTTTGAAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWNDILRRHKYERSKMSRPLERTLAVMVTTFHKYSGQDGDKFKLSKREMKELLHKELPSCVGTAMDEERLKKLMDDLDKNNHQQVDFQEYTVFLARVTMMYNDFFQGYTERS	229944	227273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_227507_228898_229047_229905
855334	contig_7050_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_153640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	598	918	848474	848794	NA	15	TCAGGTGTCTGATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTKSLSLCWKRCPAGCKCAAVCRHATAVACGHLSITPASLAPSQSLRSSLCVEAWNSTLAALFQYVIRGPHRGKSCFLSSGGFQETWCQCLFCCLVYPALPNKDF	847876	848796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_847900_848800
855335	contig_10324_pilon	-	748	4	Intergenic	novelGene_7906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	14.9740516301441	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	367	591	795727	794978	FALSE	10	CCCACCGCCGGTGAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTERLEDLVCFWEEAASVGVGPDNYSFTYQLEGEPWKLCRLRQALTAHGAVRFWCSLPTADTSSFVPLELRVTTTSSGAQRYRRIIQVNEVVFLDPPAGLLARQADEGGHVVLRWLPPPGAPMASHIRYEVDVSAGNGAGGAQRVEILEGRTECVLSNLRGRTRYTFAVRARMAEPSFGGFWSAWSEPASLLTASG	796648	794820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_795137_795661_795820_795896_796076_796553
855337	contig_9389_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_84063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGTTCAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938702	938292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_938300_938700
855338	contig_5153_pilon	+	801	5	Intergenic	novelGene_74324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	132.759886637493	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	196	765	550736	566321	FALSE	15	TGACCCCTTGGCATAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSMDRHIQQTNDRLQCIKQHLQNPANFHNAATELLDWCGDPRAFQRPFEQSLMGCLTVVSRVAAQQGFDLDLGYRLLAVCAANRDKFTPKSAGRCPFGGFADVIRRWAGEPGCVLGLAPPPASWHLGLSRFLQGGAPGSGAHEWGRSLRAPKALSLRLLPGSILALGGGASGPTMNLRHTAPQQQALC	482046	566357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_482110_507853_507937_550686_550796_558854_558969_565925
855339	contig_1301_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_47390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGCTTCTGAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740291	741346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_740300_741300
855340	contig_9363_pilon	-	615	2	Intergenic	novelGene_6639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	94	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	179	379	889572	889372	FALSE	70	CCAAGGAAAAAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGGYGQQSGYGGQQPSYGQQQSSYNSPQGYGQQNQYNSSSGGGGGGGGGGNYGQDQSSMSSGGSGGYGNQDQGGGGGYGGGQQDRGGRGRGGGGGGGGGGYNRSSGGYEPRGRGGGRGGRGGMG	889956	889135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_889599_889804
855342	contig_15952_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_154049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	473	673	106062	106262	NA	45	CCAAAAGAAAAGTTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCARRWPRLLLWRLWRARGAPQNLGSSLGHGVWTRSRSDGPYSRTALYELLGVPSTATQAQIKAAYYRQSFLYHPDRNSGSAEAAERFSRISQAYVVLGSATLRRKYDRGLLSDEDLRGPGVRPSKTAAADSGSPRAPPSASRAHSGGQAAPGASRTMFDFDAFYQAHYGEQLERERRQRARREALRKQQEDRTKKGFRWDEVRDTTCVFLLLTIFVIIGFRI	105589	106700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_105600_106700
855343	contig_10904_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_22768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700936	701277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_700900_701300
855344	contig_3818_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_99195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTCCCAGCAGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4198	4933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_4200_4900
855345	contig_7165_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_116827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTATGAAAAAAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231757	232576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_231800_232600
855347	contig_9053_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_87965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAATTACATTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390201	389620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_389600_390200
855348	SIRV5	+	475	2	NNC	SIRV5A	novel	552	2	NA	NA	3	-49	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCGTTTAAGGTCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011	2349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_2012
855349	contig_3942_pilon	+	665	6	Intergenic	novelGene_128730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	11.5516232625549	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	27	356	698231	699603	FALSE	10	GTAGCTGTTTCTCGCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPPGTPIMASPGDSNSSENMYTIMNPIGPSTSRANFPLGPGPEGPMAAMSAMEPHHVNGSLGSGDMDGLPKSSPGAVAGLSNAPGTPRDDGEMAAAGTFLHPFPSESYSPGMTMSV	698204	699912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_698247_698325_698394_698478_698558_698911_698941_699111_699220_699573
855351	contig_5605_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_143932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235558	236299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_235600_236300
855352	contig_5482_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_144476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACGCGGCGGCGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391176	390204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_390200_391200
855353	contig_12080_pilon	+	625	4	Intergenic	novelGene_128415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	43.1817862838798	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	210	533	538806	540158	FALSE	10	CTTTGATTTCGTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLSPTQVRPDA	531732	540250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_531784_537435_537578_538789_538960_539988
855354	contig_10494_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_102147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTTCATTCGTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595847	596612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_595800_596600
855355	contig_4426_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_15392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATTAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482503	481231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_481200_482500
855356	contig_15108_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_131170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	431	742	52843	53154	NA	90	CAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPNTRSISHTTPSHQGPPAHLLHLPAQPPKPKIWMKGLFYFNLDLLISTEAPRLLTHPSRVSRTQAFWTMWNGPPPKGLGKPVSLVAPSPVIRSNQTQLPS	52412	53316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_52400_53300
855357	contig_6489_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_128914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	968	1381	89073	88660	NA	45	GTAAGTACTACCTTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTLEGTGKEGKKVSSKKRTVAGSPAEGLLQPVKLNRAELYKEPTSEELNRLRETESLFHSSLLRLQVLLGGWDLGWGDGLGTLRLLDLPLLPLQVEELLKEVRLSEKKKERIDAFLREVNQRILRVPSIPETEVK	90040	88375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_88400_90000
855359	contig_15185_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_99401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174572	175172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_174600_175200
855360	contig_5816_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_158263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGGATTGAACATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340720	341870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_340700_341900
855361	contig_9363_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_6538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCCTGACTCAGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656093	657310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_656100_657300
855362	contig_12635_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_60837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCCTTCAGAGGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453701	453331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_453300_453700
855363	contig_10414_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_146944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAATCAGGTTAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169518	170387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_169500_170400
855365	contig_6017_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_152564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACGTCTTCCCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479275	478645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_478600_479300
855366	contig_5669_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_86086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194393	195206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_194400_195200
855367	contig_91_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_127124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATATATAAAAAGAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694611	694093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_694100_694600
855368	contig_6137_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_59318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683995	1685005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1684000_1685000
855369	contig_2933_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_111298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGAAAATAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215766	216104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_215800_216100
855370	contig_8541_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_105588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTAGTAGAAACTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552080	551042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_551000_552100
855371	contig_11802_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_177140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATACCGTTCTCAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28733	28375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11802_pilon_-_28400_28700
855372	contig_10779_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_165516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTTAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46344	45577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_45600_46300
855373	contig_12492_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_77502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCCAAGGCCAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283226	281954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_-_282000_283200
855374	contig_9833_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_68563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCATCGATAGGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257931	258937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_257900_258900
855377	contig_8476_pilon	+	532	6	Intergenic	novelGene_121322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCCCAAGAGTAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40386	130115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_40492_104781_104863_106929_107096_113160_113257_114099_114143_130074
855378	contig_6164_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_121269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCATTTTTAACATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343572	344175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_343600_344200
855379	contig_14953_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_137279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATGAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145468	145752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_145500_145800
855380	contig_4812_pilon	-	651	2	Intergenic	novelGene_103619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGACAAGCTGGTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81619	16953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_17533_81547
855381	contig_19514_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_166312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTTAAGTTTGCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11555	10447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_-_10400_11600
855382	contig_3975_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_54773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	261	842	1987463	1986882	NA	25	AGGGCCTCATTCAAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESADGKIYLVMELAEGGDVFDCVLNEGPLPENRAKALFRQMVEAIRYCHGCGVAHRDLKCENALLQGFNLKLTDFGFAKVLPKSRRELSQTFCGSTAYAAPEVLQGIPHDSKKGDVWSMGVVLYVMLCASLPFDDTDIPKMLWQQQKGVSFPTHLGISAECQDLLKRLLEPDMILRPSIEEISWHPWLANT	1987723	1986709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1986700_1987700
855384	contig_6227_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_49671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCCACCCAGAGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507408	506718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_506700_507400
855387	contig_12661_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_166716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTCTCAGGGAGAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56845	56257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_-_56300_56800
855388	contig_1694_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_144942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549699	550091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_549700_550100
855390	contig_15084_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_116691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCCTTTAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188491	188102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_188100_188500
855391	contig_12864_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_76352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCTTCAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102016	102817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_102000_102800
855393	contig_11413_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_103220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGAACAGAGGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832093	831444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_831400_832100
855394	contig_5526_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_111696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATCTGGTCTACAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254505	255100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_254500_255100
855395	contig_4674_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_174138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	51	392	238878	238537	NA	35	ACAAAGAAGTTTTGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLVAKEQWVMGRQMGQGWGSGSCPPHRLLLCCDLLRLPPRVPGKSRSCPCPRVPCWVTLNLISRPLKLSISACTGDLTKFSNNPIPTENVGRQVVGHGCLQLGCPSLRPLE	238928	238004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_238000_238900
855396	contig_16204_pilon	-	657	3	Intergenic	novelGene_154490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243404	235191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_235437_242065_242402_243328
855397	contig_12672_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_141480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAGAACAGCAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100445	100839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_100400_100800
855398	contig_5791_pilon	+	408	2	Intergenic	novelGene_35824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTAACACACTCTTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958542	987389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_958571_987009
855399	contig_18438_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_171394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGACAATTCCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295771	296811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_+_295800_296800
855400	contig_11145_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_160526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTGAAAATAAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152796	152082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_152100_152800
855401	contig_10235_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_46368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCAATCCTAAATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148040	145727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_145790_147808
855403	contig_3463_pilon	-	725	5	Intergenic	novelGene_62012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	74.5486418387351	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGTGTTCTTGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597532	535302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_535471_542246_542314_551883_552007_565091_565315_597388
855404	contig_11356_pilon	-	522	6	Intergenic	novelGene_175268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	9.77752524926425	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	159	364	522	328617	323109	FALSE	25	GTGAGTTTGAATGCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLKYCLLILNQPLDDCFRRLWSKAVLKACADGGANRLYDVTEGERKRFLPEFINGDFDSIRPEVRDFYTAKGCELISTPDQDSTDFTKCLQVLQRRIEENGLQVDVIVTLGGLAGRFDQIMASVSTLFQATRITPLPVIIIQEESLVYLLQPVFFTVMFTEAHHQASLLWYRW	434426	323108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_323172_328521_328669_344171_344268_364499_364573_385794_385865_434353
855405	contig_14546_pilon	+	434	2	Intergenic	novelGene_157413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56676	59075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_57019_58983
855406	contig_13680_pilon	-	470	2	Intergenic	novelGene_149605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	416	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	119	307	424552	424193	FALSE	10	TTCTGGCTGTTTTCACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVRETVVPASAAESTAQGLTATTVEEPGKDVGVWLRFPDMEGGLRLSGQTGRVHHRLQQTLLAGQHGPPRGPRQGHSFRSRWRWWFVSRGAGRRQPKLKRG	424670	424029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_424276_424446
855407	contig_14666_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_39510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCCAACGTGTGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423099	424316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_423100_424300
855408	contig_5039_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_64918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATGATCGACTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122402	1121679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1121700_1122400
855409	contig_7870_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_108996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAACTGTATTGTGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461094	461535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_461100_461500
855412	contig_10737_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_133897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCAACCTTTCTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291634	290803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_-_290800_291600
855414	contig_20609_pilon	+	247	2	Intergenic	novelGene_118470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1232	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCCTCCTGTTTTCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43670	59334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_59231
855416	contig_20596_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_157243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCATATGCTTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132710	133237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_132700_133200
855420	contig_10296_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_168893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTGTTTTTGATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974344	973811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_973800_974300
855421	contig_14895_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_106695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112353	111547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_111500_112400
855422	contig_12496_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_170708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACGAGGGGACTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225300	225715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_225300_225700
855423	contig_2455_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_119209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGGTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343163	1343746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1343200_1343700
855424	contig_5482_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_144468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAAACATGAACTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349578	349024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_349000_349600
855426	contig_12638_pilon	-	926	4	Intergenic	novelGene_33309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	124	junction_3	147.092563449762	301	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	113	478	1285702	1284647	FALSE	0	CCTGCCTGGCCCTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPVNARRGAPGAPEPQPHPRAALPGARAWASRRARAMPSDRPFKQRRSFADRCKEVQQIRDQHPSKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELVKIIRRRLQLNPTQAFFLLVNQHSMVSVSTPIADIYEQEKDDDGFLYMVYASQETFGF	1285814	1284198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1284810_1285107_1285215_1285295_1285352_1285662
855427	contig_10953_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_42546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415512	414623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_414600_415500
855429	contig_10549_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_110628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCACGTCATACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385079	385664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_385100_385700
855430	contig_7640_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_177338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173659	174650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7640_pilon_+_173700_174600
855431	contig_8278_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_165291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTAGTCCAGAGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186773	187557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_186800_187600
855435	contig_11720_pilon	+	599	3	Intergenic	novelGene_43886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	9	819	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAAGGAACCAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113728	116147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_113801_114577_114738_115780
855437	contig_18794_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_54656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGCTTGCATAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324780	323914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_323900_324800
855438	contig_4364_pilon	-	753	2	Intergenic	novelGene_135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	0	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTGGGTCCATGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118301	1117469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1118128_1118206
855440	contig_12841_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_55839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAGACTTTAAACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162482	163340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_162500_163300
855441	contig_11815_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_50944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGACTGATAGCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456903	456503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_456500_456900
855442	contig_4469_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_21888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCAAGGACAGGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264315	265275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_264300_265300
855443	contig_1939_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_144871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCTATATAAAGAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311259	310600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_310600_311300
855445	contig_11227_pilon	-	902	4	Intergenic	novelGene_163214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	4.08248290463863	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	113	433	480646	470759	FALSE	20	TTTATACGTGTGTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESSLAERGDRSEEQVSGAKVVAQALKTQGVEYVFGIVGVPVTEIAVAAQGLGIWYIGMRNEQAACYAASAIGYLTGRPGACLVVSGPGLIHALGGMANANMNCW	480758	470289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_470844_472615_472657_480265_480371_480556
855446	contig_5988_pilon	-	708	6	Intergenic	novelGene_16126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	2.82842712474619	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	65	706	1469082	1464142	FALSE	25	AGTCTTCGGCCCTACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLEPRTETESSGTPQSNNGGMRLHDFVSKTVIKPESCVPCGKRIKFGKLSLKCRDCRVVSHPECRERCPLPCIPTLIGTPVKIGEGMLADFVSQTSPMIPSIVVHCVNEIEQRGLTETGLYRISGCDRTVKELKEKFLRVKTVPLLSKVDDIHAICSLLKDFLRNLKEPLLTFRLNKTFMEAAEITDEDNSIAAMYQAVGELPQANRDTLAFLMIHLQRVAQSPNTKMDVANLA	1469146	1464139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1464188_1464358_1464465_1466163_1466363_1466449_1466546_1467694_1467860_1469052
855447	contig_10453_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_162044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAATAATCAATCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221910	222738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_+_221900_222700
855448	contig_3975_pilon	-	611	4	Intergenic	novelGene_54895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	18.3726850393609	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	13	408	2116028	2112974	TRUE	0	GCTGTGTGTCCTCTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQHPMDDKKKKRSPKPCLTQPAQAPGTLRRVPVPTSHSGSLALGLPHLPSPKQRAKFKRVGKEKCRPVLAGGGGGSAGTPLQHSFLTEVTDVYEMEGGLLNLLNDFHSGRLQAFELPGAPLDRNLPFSLLTAGRS	2116040	2112045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2112240_2112964_2113039_2113803_2113971_2115864
855450	contig_17158_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_141137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAGGCAGAGTTCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7645	7044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_7000_7600
855451	contig_17158_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_141136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTACACTAAAGATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6974	6248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_6200_7000
855452	contig_1694_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_144972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCACCAGCTGCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596561	1596960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1596600_1597000
855453	contig_10930_pilon	+	175	1	Intergenic	novelGene_37057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGTGTGTGACCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278443	278618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_278400_278600
855454	contig_9484_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_105596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGAAAGGATGACGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20451	20954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_20500_21000
855457	contig_2739_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_165832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99201	98158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_98200_99200
855458	contig_7904_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_160029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGGAAGCCAAGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479863	480605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_479900_480600
855459	contig_11719_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_154765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGTTGAATATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107929	108976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_107900_109000
855460	contig_8354_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_24080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGACCCCAGTGATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124830	126320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_124800_126300
855461	contig_14679_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_174192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGGAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271766	273176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_271800_273200
855462	contig_11855_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_67156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATCTATTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2720821	2721906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2720800_2721900
855465	contig_12050_pilon	+	402	4	Intergenic	novelGene_62771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	29.2726645334669	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGATAAACTACCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882568	928187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_882709_922169_922272_923069_923166_928123
855466	contig_10056_pilon	+	1665	15	Intergenic	novelGene_170930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	16.6206166539988	29	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	310	1443	89167	106918	FALSE	25	TATTGAACATCTCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFIARSLSGRLRLGLAEQSVLAALAQAVSLTPPSQEFPLAIVDAGKGKTAEARKTWLDEQGIILKQTFCEVPDLDRIVPVLLEHGLEHLPEHCRLSPGIPLKPMLAHPTRGVSEVLKRFEEAAFTCEYKYDGQRAQIHVLEGGEVKIFSRNQEDNTGKYPDIIDRIPKIKLPSVTSFILDTEAVAWDREKKQIQPFQVLTTRKRKDVDASEIQVQVCLYAFDLIYLNGESLVREPLSRRRQLLWENFVETEGEFVFATSLDTKDTDQIAEFLEQSVRDSCEGLMVKTLDVDATYEIAKRSHNWLKLKKDYLEGVGDTLDLVVIGAYLGRGKRAGRYGGFLLASYDKESEELQAICKLGTGFSDEELEKHHQSLQPLVLPSPRSYVRADGAVAPDHWLEPSTVWEVKCADLSLSPIYPAARGLVDREKGISLRFPRFIRVREDKKPEEATTSAQVAQLYQAQSQIQNQKGASSESDLEDFY	85817	107140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_+_85832_87006_87099_87361_87462_88373_88460_89149_89266_91791_91888_95630_95742_96290_96363_98223_98369_99065_99149_100959_101113_102817_102872_103511_103656_106589_106683_106834
855468	contig_9988_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_113067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTACTTTAGGGTAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317438	319060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_317400_319100
855469	contig_12644_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_44462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACAATTGGATGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978322	979546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_978300_979500
855470	contig_6470_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_145603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCACCAAGCGCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006429	1005586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_1005600_1006400
855471	contig_9290_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_77556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480011	480573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_480000_480600
855472	contig_9471_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_21737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAGCCAGATAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214614	213274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_213300_214600
855473	contig_3862_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_137415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGACCGTCTACCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545270	544408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_544400_545300
855475	contig_6131_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_177440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAATAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256260	255034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6131_pilon_-_255000_256300
855477	contig_14682_pilon	+	1182	2	Intergenic	novelGene_139131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGACGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156243	158822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_157239_158635
855480	contig_19737_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_158976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTGGGGACTACCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56938	58036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_56900_58000
855481	contig_5753_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_174312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTTAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66108	67123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_66100_67100
855482	contig_15752_pilon	+	1879	8	Intergenic	novelGene_148800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.35606035749581	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	82	1254	556682	571794	FALSE	0	GGCCTCTTGCTGTGGTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPRLLAALCGALLCATGLFAFSGPCLPNPCQHNAECQVTNDSRRGDVFTQYICKCPQGYAGIHCETSCTVPLGMEHGAIADSQISASSVYFGFMGLQRWAPELARLHRTGIVNAWTASNYDKNPWIQVNLLRKMRVTGVVTQGASRVGSAEYLKTFKVAYSDDGRKFQFIQDAEGLRDKVFVGNVDNNGLKTNLFDSPLEAQYVRLVPVICHRGCTVRFELLGCELNGCSDPLGLKNNTIRDQQITASSVFKTFGLNAFSWRPSYARLDMQGKFNAWTAERNSASEWLQIDLGSRRQVTGIITQGARDFGYIQYVAAYKVAYSDDGVNWTEYKEHGAVDSRIFRGNSDNNSHKKNMFETPFKARFIRVLPVAWHNRITLRVELLGCML	556600	572419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_556755_560096_560229_562480_562663_563134_563291_563981_564127_570145_570331_571402_571559_571650
855483	contig_1339_pilon	-	694	5	Intergenic	novelGene_163104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	40.6717039229979	427	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	154	630	164607	162104	FALSE	10	CTGGGAGTGACTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVIKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADVMMQALLGTRAKETFDLRAHLKQVKKEDTEKENRGVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG	165321	162039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_162188_162910_163088_163842_163933_164481_164614_165174
855486	contig_7744_pilon	-	619	6	Intergenic	novelGene_62581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	10.9105453575887	28	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	114	590	894554	893152	FALSE	25	TCCCTCATTAAAGTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVAARLSVSLLRHTQLLPADKAFYEAGIAAKAVGWENMAFIFLNRFLDLTDAIDEGTLDALDHSDFQDTDIPFEVPLPAKQHVPEAQREEVRDWVLTVSMDQRLEQVLPRDERGAYEASLVAASTGVRALPCLLTGYPILRNKIEFKRPGKAANKDNWNKFLMAIKTSHSPVCQDVLKFISQWCGGLPSTSFSFQ	894888	893122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_893242_893451_893544_893739_893894_894226_894326_894512_894573_894793
855487	contig_3754_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_146836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299356	300612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_299400_300600
855490	contig_5586_pilon	-	792	4	Intergenic	novelGene_143617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	68.6488650063981	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGAAAGGAGGTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893312	829573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_829718_886835_886953_888034_888204_892950
855492	contig_6513_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_117754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGGAAATGTAGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97141	97822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_97100_97800
855493	contig_13780_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_149143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCTAGAAACAGTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963392	963641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_963400_963600
855494	contig_5649_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_82408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTAAAAATCATAGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275601	1274474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1274500_1275600
855495	contig_6412_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_149942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAATTAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132063	130496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_130500_132100
855496	contig_16045_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_130862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77368	76974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_77000_77400
855497	SIRV3	+	427	3	NNC	SIRV3A	novel	436	3	NA	NA	11	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAATCTTAATAGACGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4014	6719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4081_4568_4772_6561
855498	contig_6509_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_145618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	398	1003	69757	70362	NA	25	CTCTAACTCATCTTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSFLSLSCMSTPGGFFVGSSRLFLRMSSANLVLSLSFGSPDLCLIFSICFILSLCLLWRSSISRSFWESILSKLVIIRSPSTSNFSRGRWSFLLESLDGGSFSFPLLIFAKSPFSWLSLNFSFSLTSPSLRVSSLDLSLKLEFGGLSLSLAPGFGSSLWCLRKPSGCFSRCFSFSSLHFSLCFSLFFFSFRMLMALDP	69359	70451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_69400_70500
855499	contig_14522_pilon	+	1104	2	Intergenic	novelGene_147338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167603	173606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_168685_173583
855500	contig_18822_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_111717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAAGCTACGATGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125111	125707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_125100_125700
855501	contig_2770_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_107418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATTTAAAAGGGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207363	206707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_206700_207400
855503	contig_16666_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_61716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACAAGCGGAGGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5312	5545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_5300_5500
855505	contig_9983_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_177803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCATAATTCTAACTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29338	29668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9983_pilon_+_29300_29700
855506	contig_10549_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_110621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAATAAGGTTTGGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230603	230246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_230200_230600
855507	contig_12644_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_44457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTGGCAAACTTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920693	919740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_919700_920700
855508	contig_990_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_76102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGTTTTAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368454	1367916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1367900_1368500
855510	contig_14314_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_176833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAGAAAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7918	7160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_7200_7900
855511	contig_15866_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_63649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACAGAGTAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523283	522520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_522500_523300
855514	contig_9651_pilon	+	626	3	Intergenic	novelGene_162852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	14	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGCGCCTAGGACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76780	86127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_76822_84624_84768_85685
855515	contig_11267_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_175386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414354	414857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_+_414400_414900
855516	contig_14300_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_133145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAGCATTCCGTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465650	466529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_465600_466500
855517	contig_19564_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_29673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTATTCTAAAGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71156	70445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_70400_71200
855518	contig_15354_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_65720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGGGACACCGCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306075	306536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_306100_306500
855519	contig_1406_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_25456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAGAAAGAATGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537733	537464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_537500_537700
855520	contig_8980_pilon	-	348	3	Intergenic	novelGene_74002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTTCCACCAGTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356477	354008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_354098_355272_355416_356361
855521	contig_20739_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_83183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTCTGAAAAAGAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159275	159959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_159300_160000
855523	contig_15029_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_128202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTCTAAAATAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227815	226646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_226600_227800
855524	contig_8673_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_129945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAACCAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565297	566005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_565300_566000
855525	contig_12046_pilon	+	800	3	Intergenic	novelGene_83496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	45.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTCGGAGAATTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856641	862749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_856784_861163_861300_862227
855526	contig_5954_pilon	+	760	5	Intergenic	novelGene_28819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4790199457749	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	191	760	1638580	1645628	FALSE	25	CAGGTAAGGCCCTTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAAEHQTHHLSSEKAPFCEKPEPGDLIEIFHIGYKDWAIYVGDGYVIHLAPPSEFPRFGSSKMFMFLSRKAVVANDPLEDVAWGCLYRVNNHLDHQYRPRPVDEIIGSAKKMIGDKKTYKVLFENSEDFVTDLRYGWPRCKLSCQDPQPGDLIAISRAAYKHWAIYMGDGNVVHLNKSGIQVVVKQEPLKEVVKEDEYWVSNYLDCKYKPRPVDEIISLAKKTIGKKVKYNLLCCNCEHFATELRYGRRHSK	1630698	1645628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1630751_1634062_1634172_1638550_1638820_1644141_1644251_1645407
855528	contig_9578_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_67961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033322	1033731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1033300_1033700
855529	contig_14822_pilon	+	1179	9	Intergenic	novelGene_145429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	162	1007	196511	199311	FALSE	10	TTTAATCCTCCTTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVQDLGRSAIFGAFNSHLTSAYQGCGLSWAVLRYPWLGEQGHKIPGARPLPQDMSRSLSWSEQLDVLLNATDGNVARIKRRLYPLGVSTAAGDLAGTWTSPVYLPPQSGVRAQQPWVLKTPPTVPEGLSWAEAHSPSSVWDAVTILQSQLRSQAQVIEALRQAVQGLLEEREHQKYQICALEASLRLLQGGPERRVLLLEQRLEGLRRGLEGLRRELQGLRSQVQEQAQAQAQKQPGPGKYSATSGLYQELQNERQLLWKESEVLQEELKLLQDQLSQHQELLLKQMTEGRQVQACSWKISQEAPFLTWSPTAFSSRPRVLSRRTYPFRAPRSS	196221	199483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_196294_196421_196589_196676_196711_196878_197073_197175_197258_197417_197632_197748_197817_198044_198113_199203
855530	contig_753_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_112899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCATAAATAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264477	265202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_264500_265200
855531	scaffold_19766_pilon	+	698	2	Intergenic	novelGene_34244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGCCCCAGCCAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151592	152606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_151773_152088
855532	contig_8729_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_40170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	396	707	877048	876737	NA	35	TAGTTCTTCACCAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSKKLLSGLRSFYIKDTSEWRNECLLPGAASSHTNCPGHNSFRKVFGGPGNRSSVIIPLVKGETGSLSTEPRTNLLEYNDKTTGICLLLILLQEPLGGMNS	877443	876395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_876400_877400
855534	contig_11068_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_130552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCACATGTCAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314117	313357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_313400_314100
855535	contig_11720_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_43766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAAAATTAAAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18208	17572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_17600_18200
855536	contig_16103_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_118948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAATGGGAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969896	970444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_969900_970400
855538	contig_11417_pilon	-	311	2	Intergenic	novelGene_103343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGCTGTAAGAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677655	677255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_677548_677636
855540	contig_15752_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_148789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATTGAGTGTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373621	372863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_372900_373600
855541	contig_5229_pilon	-	755	4	Intergenic	novelGene_117682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.63299316185545	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	122	457	372205	370124	FALSE	0	TGTGTGCTCTGCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNGACRHPCPVGAQPGCTQYPHTVALEEVWGLLRTSDADSGYPPHLCRGGGQASHLQALGPGPHRNGLLRLSCHPCKDRAPAYNYHRYCCRHRRQTSQSPHPGRLQDLP	374411	369825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_370147_371113_371337_372115_372281_374365
855542	contig_11846_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_105912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACATTCACTAGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109385	108720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_108700_109400
855544	contig_16846_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_82927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGGGAAAGGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489430	490149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_489400_490100
855547	contig_10968_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_84283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120798	121827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_120800_121800
855548	contig_11989_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_68464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATTACTTGGTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160988	161777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_161000_161800
855550	contig_7416_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_134330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGTAAACTTTTACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860591	860221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_860200_860600
855551	contig_5797_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_56968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAACAAAAGGAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1551406	1552561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_1551400_1552600
855552	contig_5317_pilon	+	698	3	Intergenic	novelGene_76648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018432	1021368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_1018455_1020299_1020349_1020741
855553	contig_5057_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_151508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAGAAAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371551	372707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_371600_372700
855554	contig_12113_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_134748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAGAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236899	236055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_236100_236900
855555	contig_10711_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_118426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTTTACATGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735391	736374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_735400_736400
855556	contig_5352_pilon	+	792	2	Intergenic	novelGene_177074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCGGGAATCCTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503830	510340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_+_504024_509741
855557	contig_8464_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_125412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAATGGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942824	943283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_942800_943300
855558	contig_1699_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_72818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCTGACCTCTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70215	69203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_69200_70200
855560	contig_10082_pilon	-	625	4	Intergenic	novelGene_63869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.275217738226	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377286	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_210603_260726_260842_329290_329409_377231
855561	contig_8263_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_83116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAACATGGGTTCCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195756	196145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_195800_196100
855565	contig_6397_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_146224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCAGGACAACATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172589	173233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_172600_173200
855567	contig_18544_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_152765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	242	553	217199	216888	NA	70	GTACAATTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFLILYEGVCCRLESSTIGMVLSIHMKWHLWTRISRCFFDTHDNHLSVCVNFVALDLTFIPGSEDNSRKFMLPLERGMFKITNLNRCASLNLRDYGPRTPC	217440	216591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_216600_217400
855570	contig_9297_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_69844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTCTGGGCCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686007	687505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_686000_687500
855571	contig_3523_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_171490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408214	407297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_407300_408200
855572	contig_15182_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_136447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCGACCCTATAGAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416527	415830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_415800_416500
855573	contig_14637_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_114564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	494094	494441	NA	35	GCGGAATTAAAAGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVKTRTLGAISPSGELSPTKRRFVQCISPPATPVASPHPGRAPKAVSLAFCWSATPTRGWNEKSLTWCRAHASCSVIVGLASLQLTGCGRVDSDSYDRSLVKLTRLLEKSLNTRH	494092	494845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_494100_494800
855574	contig_5812_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_167494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAGTTTCATTATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116440	117170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_116400_117200
855575	contig_10581_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_41422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAGAAAAGAAAGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645314	644868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_644900_645300
855576	contig_14048_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_146333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386264	387183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_386300_387200
855577	contig_16185_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_144757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGAAGACAGTGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107707	108193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_107700_108200
855579	contig_10042_pilon	-	768	2	Intergenic	novelGene_79193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGACCTTTTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944848	943798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_944415_944696
855580	contig_10793_pilon	+	926	3	Intergenic	novelGene_83448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	63	503	184605	185045	TRUE	85	GAAAAGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTVDCVERKGKYMYFTVVMAEGKEIDFRCPQDQGWNAEITLQMVQYKNRQAILAVKSTRQKQQHLVQQQTPQPQLQPQPQPQPQLQPQSKPQSQPQQLHPYPHPHPHSHPHPHPHPQPHPQPHPHQQPHSQSHGQRLLRSTSNSA	184073	185926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_184102_184570_185072_185529
855581	contig_2799_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_85480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAATCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495568	495168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_495200_495600
855582	contig_16948_pilon	+	762	4	Intergenic	novelGene_166414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	125	junction_3	24.6080384337223	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	33	761	359529	368620	FALSE	15	GGCTCATTCTCCAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRILFKNDDFMNALVNAYVMTSREPPLNTAACRLLLDIMPGLETAVVFQEKEGIVENLFKWAREADQPLRTYSTGLLGGAMENQDIAANYRDENSQLVAIVLRRLRELQLQEVALRQENKRPSPRKLSSEPLLPLDEEAVDMDYGDMAVDVVDGEQEEASGDMEISFHLDSSHKTSSRVNSATKPEEGGLRKNKSAKQGDRESFRKAKQKLGFSSSDPDRMFVELSNSSWSEMSPWVIGTNYTLYPMTPAIEQ	359496	368621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_359538_361625_361740_366995_367134_368152
855583	contig_16948_pilon	+	590	4	Intergenic	novelGene_166415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_3	36.7695526217005	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	92	589	374079	379147	FALSE	30	TTTTGATAGAATACGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASLLLHNKFATEFVAHGGVQKLLEIPRPSMAATGVSMCLYYLSYNQDAMERVCMHPHNVLSDVVNYTLWLMECSHASGCCHATMFFSICFSFRAVLELFDRYDGLRRLVNLISTLEILNLEDQGALLSDDEIFASRQTGKHTCMALRKYFEAHLAIKLEQVKQSLQRTEGGILVHPQPPYKACSYTHEQIVEMME	373987	379148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_374145_375436_375617_376100_376311_379105
855584	contig_19986_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_159227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCATCAAGAGTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28855	28249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_28200_28900
855585	contig_14683_pilon	-	827	3	Intergenic	novelGene_166040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	238	567	112883	110521	FALSE	10	CCAGTTTCGGTGCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMGSTPVAELLLLHGAEPNCADPVTLTRPVHDAAREGFLDTLMVLHRAGARLDVRDAWGRLPVDLAEERGHRDVARYLRAAAGETEGRGHAHADAAEGAAAGRRQPQL	137500	110260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_110547_112579_112887_137266
855586	contig_11370_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_98709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTGTGCGCGGTTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145250	144667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_144700_145200
855587	contig_14191_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_153765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAGACACAGAACCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37861	36722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_36700_37900
855589	contig_6269_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_170541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCCTCTACTTTACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264966	264086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_264100_265000
855590	contig_5084_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_64666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATAAAACCATTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692679	1693820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1692700_1693800
855591	contig_14353_pilon	+	1248	9	Intergenic	novelGene_82124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	461	994	172134	182933	TRUE	15	TTCGCCTGCGGGAAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRTICGDPCGSHLIEETSSMRFPSWDSWDLLRVSVGKLGSSWKTLRLGGGGVRGGLSLVCRRSCGVVGGVMKLCKARGVSRPLACSGIQVSARPSLGPGVEESKAGRADTETERGPWALLPTLPSWELPGGQVMLVGKSVSEEGPELLSRWTSNGLQPESSLCSPPPGLSPSAGR	159901	214018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_159916_164355_164524_166566_166675_166777_166838_168399_168483_172106_172172_177884_178351_182903_183051_213881
855592	contig_4083_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_152336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTTAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320261	319426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_319400_320300
855593	contig_665_pilon	-	702	2	Intergenic	novelGene_158215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTGAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315322	302273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_302846_315192
855594	contig_16722_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_118295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATATTACCTTCAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148490	147114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_147100_148500
855595	contig_13158_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_107284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	197	499	92973	92671	NA	20	TCCCTGAGTCTTAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVVLPGRVVHLEIGKIALADHVPLTTRTCAPFLSVTDVFSFSLTSPATRSHQNSASVQVTALRVSCFRQPSKSVASVLRVTWAFQNKAIFSETFLKSE	93169	91876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_91900_93200
855596	contig_4071_pilon	+	485	3	Intergenic	novelGene_151884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	37.5	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	233	454	342457	343578	FALSE	55	AAACACAAAACCAAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESERVSRHSPLAAPSEILPITWSDTGPTLTKELTFSSNIGQHDLDTKSKQIQQWIEKNYQVQITIKKGKNVEDPENKMEAIFNQILQTMPGIATFSSKPQAVKGGRAVMCVLRHLSTKEENMYREAQKTQKGDILNKENRNDRPPDVLHQ	331757	343609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_331835_342301_342460_343359
855597	contig_15021_pilon	-	998	2	Intergenic	novelGene_26933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTGCATTTAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179655	178613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_179025_179068
855598	contig_12485_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_147269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTCAAATATTTGCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20412	21312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_20400_21300
855599	contig_8156_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_98950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTTGCCGTTGAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449575	449103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_449100_449600
855600	contig_9373_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_162729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATCTATTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288510	287627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_287600_288500
855601	contig_1301_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_47417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCCCAACGAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842141	842746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_842100_842700
855602	contig_2733_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_128578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	384	713	741199	740870	NA	20	TTTGTCTTTGGGGATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWLLLFSTSSVKLRPHSLVTFLTDHRRHTLSYPTNTTSKCFQQNVSLSSRMSPFPISMHHLCPGHTHHHPPVACCPVSHLFSKYLLRARLPLGSAIPLTQENWNMYR	741582	740734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_740700_741600
855603	contig_9406_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_136182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGTTAACTTTTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430768	430158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_430200_430800
855604	contig_7629_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_153575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTCTGAAAAACAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318511	317959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_318000_318500
855606	contig_9074_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_156626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTTATGGAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70069	69326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_69300_70100
855607	contig_19744_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_120360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAAAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93677	92885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_92900_93700
855608	contig_6418_pilon	+	495	4	Intergenic	novelGene_81184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.945742975679	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAAGCATGATGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156940	1160671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1157088_1158760_1158886_1159629_1159662_1160480
855611	contig_6557_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_33018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAACCTGCCCCACCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612918	612424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_612400_612900
855613	contig_14768_pilon	+	2002	7	Intergenic	novelGene_115075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	27.6867397061401	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1680	322	2001	199592	206501	FALSE	25	ACAGTCCCAGCGTCAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAGARSHRLERGLSYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDPVPPPSPERLPSTEPPTQGRPEFWAPAPLPPVPPPVQPGTREDGGREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIAHRHYPAPEGPAPAPPGPLPPAPNSGTGPSGVPGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDM	174372	206502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_174424_198498_198763_199585_199988_202410_203307_204665_204828_205286_205410_206398
855614	contig_13453_pilon	+	233	2	Intergenic	novelGene_146697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCACCGGACTGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34388	89693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_34570_89641
855615	scaffold_6394_pilon	-	493	3	Intergenic	novelGene_111062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTAGGAGGGCCTCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472331	469910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_470179_471001_471085_472189
855616	contig_14923_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_157770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591652	592725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_591700_592700
855617	contig_16360_pilon	+	708	6	Intergenic	novelGene_170077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	87.6118713417308	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	178	594	129488	136142	FALSE	35	GATACTAAAATGCTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKDPVKIVRCHEHIEILTVNGELLFFRQREGPFYPTLRLLHKYPFILPHQQVDKGAIKFVLSGANIMCPGLTSPGAKLYPAAVDTIVAIMAEGKQHALCVGVMKMSAEDIEKVNKGIGIENIHYLNDGLWHMKTYK	128079	136256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_128139_129369_129523_130077_130176_133137_133272_135066_135135_136060
855618	contig_13048_pilon	+	1291	7	Intergenic	novelGene_138903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	34.5611374555616	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	106	885	163621	239441	FALSE	25	TAGGCCCAGCTCACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAWQRLALYASLLKRQITGGPDVIKWERRVIPECARSIYSVTGEWTKEYTLQTRKDVEKWWHQRIKEQVSKISDPDESKPKFYVLSMFPYPSGKLHMGHVRVYTISDTIARFQKMRGMQVINPMGWDAFGLPAENAAIERNLHPESWTQSNIKHMRKQLDRLGLCFSWDREITTCLPDYYRWTQYLFIKLYEAGLAYQKEALVNWDPVDQTVLANEQVDEHGCSWRSGAKVEQKYLRQWFIKTTAYAKVSVSLKALR	155758	239847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_155843_163599_163855_170674_170804_188952_189045_192597_192659_231066_231157_239267
855619	contig_18081_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_23805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCTGCAAAAAATGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141047	142251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_141000_142300
855620	contig_3751_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_158629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAGTAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61554	60711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_60700_61600
855621	contig_17993_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_61946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTGTCAGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116359	115656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_115700_116400
855623	contig_14333_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_49166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCCTTATAGATAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550026	549542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_549500_550000
855625	contig_13044_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_100000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGAAATCTTATCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216479	215637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_215600_216500
855626	contig_9797_pilon	+	480	3	Intergenic	novelGene_65582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	55.5	148	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	172535	192028	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESPCPAIRTGRAAQELQDKHPEPLRVATTLGPPHGGGQYGSGVPPGGGYGGPAPGGPYGPPAGGGPYGPGGLTSGTPGGPYGGAGGTWTVCSLGIFGQATALPACIFTCLPCSAWL	172533	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_183682_183904_191930
855628	contig_3077_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_26839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTATTTGAAAGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568979	569787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_569000_569800
855630	contig_13496_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_107641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322904	321757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_321800_322900
855631	contig_756_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_134769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGAAAAGAAGCTGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176962	176021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_-_176000_177000
855633	contig_13607_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_170166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATAATTTTTACTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130898	130097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_130100_130900
855635	contig_6451_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_173708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGGAGAGGAAATGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229977	230237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_230000_230200
855636	contig_4684_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_175437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566712	567381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4684_pilon_+_566700_567400
855637	contig_7057_pilon	-	399	6	Intergenic	novelGene_123291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	67.0152221513889	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	57	356	898079	897021	FALSE	5	GTTTGTTTCGTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE	898135	896977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_897084_897306_897359_897464_897540_897628_897703_897944_897978_898076
855638	contig_2114_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_104258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	11	313	455799	456101	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYAMAEARARLWAGRTYVIPHSGVLAGRAIEIGDRSWAVGPREASGPRRVGACRGSGRAKIRLSTVAIQDWCAENRAGYEARSQACTGHHKPNTREKQLRPNF	455788	456575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_455800_456600
855639	contig_1694_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_144950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGATTTTGATGATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765718	766172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_765700_766200
855641	contig_6375_pilon	+	1210	1	Intergenic	novelGene_72941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	697	999	24924	25226	NA	60	AAGAAACATTAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTKRKQTGLRRKNVQVKLLKPYTSRKVFFSHRSQPFHVFLLPPQGLAWFSDSGQTSSASLQTFLKMIPYQNISTTAMHRIPGKDRSRGGQVWSRNSSC	24227	25437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_24200_25400
855642	contig_8269_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_106254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCGATTTTAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372709	371922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_371900_372700
855643	contig_6065_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_132695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATTCTAAGATGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493924	494840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_493900_494800
855644	contig_7179_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_78178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATAGGACAGTTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165099	1164335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1164300_1165100
855645	contig_7730_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_156265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAAGTGGCAGTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68777	70140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_68800_70100
855646	contig_14559_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_83733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGGCAAGCAAGCGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353217	353838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_353200_353800
855648	contig_17074_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_145148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245050	245868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_245000_245900
855651	contig_12661_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_166720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTGCCCCTGTCGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77228	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_77200_78100
855653	contig_9561_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_100864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262990	263622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_263000_263600
855655	contig_15236_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_141532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCACTCAAAATACAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62150	61525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_61500_62200
855656	contig_3721_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_123809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTCTTGGTTTGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102860	103775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_102900_103800
855657	contig_1996_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_131872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGGTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133071	132146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_132100_133100
855658	contig_6885_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_83648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCACAAAGGAACTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137024	136312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_136300_137000
855659	contig_10436_pilon	-	982	6	Intergenic	novelGene_108465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7.73045923603508	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	74	850	66858	65548	FALSE	35	AAAACATTCACGTTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVIVNTDTLEAPGYELQVNGTEGEMEYEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPSIFITKIIPGGAAAQDGRLRVNDSILFVNEVDVREVTHSAAVEALKEAGSIVRLYVMRRKPPAEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGRLQIGDKILAVNSVGLEDVMHEDAVAALKNTYDVVYLKVAKPSNAYLSDSYAPPDITTCESPSNPRTPHVPSHLPCGIQSHDIPVTVPRQVVPMQCPQPLICPVIGEEMENQSP	67070	65415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_65863_65992_66130_66228_66399_66495_66621_66828_66889_67027
855660	contig_14219_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_54383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGACAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070550	1071348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1070600_1071300
855661	scaffold_12124_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_22153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAGACCCGAGTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975568	976169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_975600_976200
855662	contig_4924_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_84718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGCCTTGAAAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105376	104256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_104300_105400
855665	contig_11677_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_85915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGGCGGAAGAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594924	594170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594200_594900
855666	contig_3334_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_137680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTTAATAGTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815685	814945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_814900_815700
855667	contig_8742_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_173943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26513	25631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8742_pilon_-_25600_26500
855669	contig_11285_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_5731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACTATGCAGGCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042061	1041821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1041800_1042100
855670	contig_4232_pilon	-	487	5	Intergenic	novelGene_63254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_4	82.0407673050417	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	149	487	387975	384330	FALSE	20	GCCACAGCCGATGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRQRRRRERGLGSEPRTTPHGQGPWGPRPGQRSRASRSPGPEERAAGTMTSVWKRLQRVGKRAAKFQFVACYHELVVECTKKWQPDKLVVVWTRRNRRICSKAHSWQPGIQNPYRGTVVWMVPENVDTAVTLYRDPHVDQYEAKEWTFIIENESKGQRKVL	388123	384329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_384357_384457_384512_384853_384950_385160_385219_387871
855672	contig_3382_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_124214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTTTATAAAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485733	1485498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1485500_1485700
855673	contig_9440_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_59078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCATGGAATGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255165	1255951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1255200_1256000
855674	contig_665_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_158207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAGAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231995	232874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_232000_232900
855675	contig_17144_pilon	-	983	3	Intergenic	novelGene_29134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	86	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	125	721	40893	39611	FALSE	15	CTCAGTGACTTGATCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNFPPAGTSARVRPALQPPGSRAGRAEWPGPDRAGATGRECMRLPGTEARRGRAGLPGSRARTADKRAAPHQSSMDAPRRDMELLSNSLAAYAHIRANPESFGLYFVLGVCFGLLLTLCLLVISISCAPRPRPRGPPPRRDLRSSTLEPEDDDEDEEDTVTRLGPDDTLPGAELSPEPDGPLSVNVFTSAEELERAQRLEERERILREIWRTGQPDLLGTGALGPGPTATGTLGRMHYY	41017	39348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_40042_40338_40439_40827
855676	contig_9389_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_84059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGCCGCTGAATCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756005	756263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_756000_756300
855678	contig_12427_pilon	-	418	4	Intergenic	novelGene_40516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1314.04168714526	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGATTTTGCCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555755	504668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_504823_520312_520440_522284_522346_555679
855681	contig_593_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_102031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATGAAACGCTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530191	529663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_529700_530200
855683	contig_16400_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_150903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTAAAAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21770	22732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_21800_22700
855684	contig_10037_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_148951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCTTGATTGGCCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140629	141693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_140600_141700
855685	contig_14441_pilon	+	529	2	Intergenic	novelGene_100699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGCGCTGCCTACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115059	117783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_115504_117698
855689	contig_16204_pilon	+	730	4	Intergenic	novelGene_154527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	36	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAGTGGAAGAGGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427585	433976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_427634_432163_432244_432950_433043_433466
855692	contig_15888_pilon	-	826	6	Intergenic	novelGene_84458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	132.875279868003	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	61	771	285743	279168	FALSE	15	ACGGACGGGACTGTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPLVPSSQKALLLELKGLQEEPVEGFRVTLVDEGDLYNWEVAIFGPPNTYYEGGYFKARLKFPIDYPYSPPAFRFLTKMWHPNIYETGDVCISILHPPVDDPQSGELPSERWNPTQNVRTILLSVISLLNEPNTFSPANVDASVMYRKWKESKGKDREYTDIIRKQVLGTKVDAERDGVTVPTTLAEYCVKTKAPAPDEGSDLFYDDYYEEGEVEEGADSCFGEDEDDSGTEES	285897	279112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_279382_281789_281925_282103_282202_282741_282829_285566_285759_285852
855693	contig_15146_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_116948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGCGTTTCCTGTTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409400	409748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_409400_409700
855694	contig_3956_pilon	-	583	6	Intergenic	novelGene_14792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGAGCCTCCGTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172303	1163079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1163142_1164820_1164872_1165016_1165143_1166341_1166564_1169328_1169387_1172239
855696	contig_3382_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_124185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTAGTGAAATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968527	969225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_968500_969200
855698	contig_5797_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_56929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCTCTCACAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223968	225074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_224000_225100
855699	contig_5279_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_105567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTAAAAAAAGAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325166	326078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_325200_326100
855701	contig_10864_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_107127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200129	1201586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1200100_1201600
855702	contig_17603_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_152798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACGTGGGTAGGTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91530	90694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_90700_91500
855705	contig_3386_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_34495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATGTTTAAAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398119	397319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_397300_398100
855706	contig_3818_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_99287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAGCTATCAAGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877840	877555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_877600_877800
855707	scaffold_13505_pilon	-	338	3	Intergenic	novelGene_111665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	2	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGGCCGACTCAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862766	859728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_859905_862143_862274_862734
855708	contig_1335_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_166517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGTCAAATACTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483800	483191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_483200_483800
855710	contig_4315_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_46812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAACGTAAGATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332193	333037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_332200_333000
855711	contig_1076_pilon	-	1160	4	Intergenic	novelGene_101156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4.49691252107735	53	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTCAAGTTATTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144203	1088153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_1088854_1090071_1090141_1133023_1133343_1144131
855713	contig_8269_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_106238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGATATAATTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319556	320587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_319600_320600
855716	contig_16882_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_148231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACACTTGGTCTAGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337777	338712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_337800_338700
855718	contig_10437_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_38217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAATAAGGTCCACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245789	245367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_245400_245800
855719	contig_8396_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_177623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAAAAAGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200897	202150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_+_200900_202200
855725	contig_10238_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_170109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCAATTTTTCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436123	435584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_435600_436100
855728	contig_91_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_127089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTTCAATACAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224754	225373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_224800_225400
855729	contig_11285_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_5725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAAAAACCCTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848617	849772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_848600_849800
855730	contig_6412_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_149971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAAATTCCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503469	503244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_503200_503500
855731	contig_7909_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_155947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTACCTTGGAAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066424	1065239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1065200_1066400
855732	contig_934_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_129025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAGTGTTTAAACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156871	156464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_156500_156900
855733	contig_5815_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_141183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCTAACCCAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176545	177503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_176500_177500
855734	contig_15105_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_150962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547946	549148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_547900_549100
855735	contig_10331_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_54056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCACAATGAGATACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42044	40752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_40800_42000
855738	contig_4223_pilon	-	1004	9	Intergenic	novelGene_117275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	48	junction_2	139.81768262634	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	13	813	302064	195116	TRUE	50	ATTAAAAGCTGATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPGMQREEGFNTKMADGPDEYDTEAGCVPVLHPEEIKPQSHYNHGYGEPVGRKTHIDDYSTWDIVKATQYGIYERCRELVEAGYDVRQPDKENVTLLHWAAINNRIDLVKYYISKGAIVDQLGGDLNSTPLHWATRQGHLSMVVQLMKYGADPSLIDGEGCSCIHLAAQFGHTSIVAYLIAKGQDVDMMDQNGMTPLMWAAYRTHSVDPTRLLLTFNVSVNLGDKYHKNTALHWAVLAGNTTVISLLLEAGANVDAQNIKAILRCHMAL	302076	193647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_193758_195034_195146_200478_200642_201495_201561_210425_210571_211161_211240_236437_236561_242200_242305_301971
855739	contig_9373_pilon	+	1270	4	Intergenic	novelGene_162722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTATTTCAGTTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237156	246796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_237485_242599_242837_244218_244399_246271
855740	contig_8650_pilon	-	730	5	Intergenic	novelGene_162638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	15.5463018110418	868	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAAGTTTCAAGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412314	388785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_389094_391470_391585_395648_395753_410442_410547_412214
855741	contig_4426_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_15384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGTAAGAAAAAGAACACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431063	430468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_430500_431100
855742	contig_16647_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_170320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAAATTCTTCAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660110	659256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_659300_660100
855743	contig_3956_pilon	-	644	5	Intergenic	novelGene_14726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.4372685153431	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	98	508	361228	350190	FALSE	0	GTTTTGGTCTCTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTATRQEVLGLYRRIFRLARKWQAASGQIEDTIKERQYILNEARTLFQKNKNLTDADLIKQCTDECTARIEIGLHYQIPYPRPIHLPPMGLTPLQGRGLRSQEKLRRLSKPVYLKSHDEKGQPGFQIMFKHKQEK	373829	350053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_350240_350918_351028_356473_356567_361069_361229_373732
855747	contig_4211_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_80233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509557	510259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_509600_510300
855748	scaffold_19766_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_34356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTTACTTCCCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671855	670898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_670900_671900
855749	contig_6286_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_165645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTATGTTCTTTGGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91778	91264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_91300_91800
855750	contig_7308_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_159594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274719	273902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_273900_274700
855751	contig_10183_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_169516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGAACTTAGGACGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155539	154737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_154700_155500
855752	contig_10183_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_169515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAATAGTGACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154533	154167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_154200_154500
855754	contig_17518_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_117363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAGAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124656	123131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_123100_124700
855755	contig_14683_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_166045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTAAATCATACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147425	148244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_147400_148200
855756	contig_15323_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_148530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTATCACACCACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133183	132413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_132400_133200
855757	contig_6589_pilon	-	1011	2	Intergenic	novelGene_25754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCATCTATTCTCTATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650827	649569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_650046_650292
855758	contig_1037_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_84614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	24	374	519777	520127	NA	40	GTAGCCAACGAGTAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIEIKKIMTEYYEQLYNNKLDNLDEMIQFLEAYNLPKLTQDKVESLNRPITSAEIKSVIKNLPTKLFLNQTASTGEFYQTFREELTLILFELFQKTEKEDVIVKAVSTWLGHDSQWFDSYDVV	519753	520205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_519800_520200
855761	contig_8866_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_77758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAGCAGAATGTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229020	228419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_228400_229000
855762	contig_6808_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_173533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325638	326935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_+_325600_326900
855764	contig_4071_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_151874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107281	108379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_107300_108400
855765	contig_2078_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_100143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCTCTTGTAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278093	276918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_276900_278100
855766	contig_11986_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_69177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGGTTGCTGAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554485	554865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_554500_554900
855767	contig_11986_pilon	+	186	1	Intergenic	novelGene_69178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCCCCAGCAGATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554923	555109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_554900_555100
855768	contig_13744_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_77141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATTAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66159	65106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_65100_66200
855770	contig_9828_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_172245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTTAAAAGATTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20491	21392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_20500_21400
855771	contig_7521_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_160545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATAAGCCACCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273738	274671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_273700_274700
855772	contig_5954_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_28698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949967	950690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_950000_950700
855773	contig_14030_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_62242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGCCCTAGTGGCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354525	354061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_354100_354500
855774	contig_9609_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_23043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATACCAAGAACTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435515	456271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435586_455992
855775	contig_16882_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_148242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACAGAAAAGTTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445701	446435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_445700_446400
855776	contig_253_pilon	-	419	3	Intergenic	novelGene_129653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	11	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	65	418	289529	289043	FALSE	20	CAGACACTGTTCTAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSQAAGQSRAARRKGNLARLRMDPFADTLQRLREAFRSGQTQAADFRATQLKGLGRFLRENKQLLQDALAQDLHKAKTCICPSIIHPSSINPSIHPSFFHPSIHPSSIHPSSIHPSIIHPSIHPSIHPSDNYLSSTYCV	294886	289041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_289235_289367_289531_294823
855777	contig_4125_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_25231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCCAGAAGACAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796439	1795665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1795700_1796400
855778	contig_9727_pilon	+	301	2	Intergenic	novelGene_86287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCGTGATAGTATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167515	169649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_167556_169388
855779	contig_10139_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_177813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGTAAAAGTCGTAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184403	184797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_184400_184800
855780	contig_16045_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_130857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACACTTAATGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14174	14992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_14200_15000
855781	contig_15043_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_175502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCCTGCACAGAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105965	105473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_105500_106000
855783	contig_13112_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_98848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTGTATTATAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668634	667649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_667600_668600
855784	contig_5057_pilon	-	410	4	Intergenic	novelGene_151509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	29.7097066068763	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTATGGATGTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447880	444328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_444400_446066_446139_446935_447054_447731
855785	contig_5945_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_104540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCTAATAGAAAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50664	50017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_50000_50700
855786	contig_15476_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_174656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTTTAAAAATGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72210	73007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15476_pilon_+_72200_73000
855787	contig_6403_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_139887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTGCACCTCTGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072090	1072337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_1072100_1072300
855789	contig_2537_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_33405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTCCTATAGGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135907	135566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_-_135600_135900
855790	contig_12078_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_74102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACACAATACATAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225835	226163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_225800_226200
855791	contig_4600_pilon	-	747	7	Intergenic	novelGene_174018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTAAGTTTCTCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204767	184448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4600_pilon_-_184549_186023_186195_189740_189883_200070_200142_200744_200841_203591_203673_204681
855793	contig_11642_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_172927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGTTCTACAACTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444620	445601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_444600_445600
855794	contig_15146_pilon	-	976	3	Intergenic	novelGene_116927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.5	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	75	374	26895	25348	FALSE	30	ATGAAGGATTGACTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASARTASGRSRRPRLPGPGDGLGMKIKQEKQEWLLQTLVPQAALTIHRRIHTGERPYPCPECGRRFSQKPNLTRHRRNHTGERPYQCAACGRSFRQKQHLLKHQRVHWGALNPVPRPKEEVL	44056	24745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_25587_26834_26910_43996
855796	contig_19228_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_174414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCTGCCCACCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213901	214153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_+_213900_214200
855797	contig_15293_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_146518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACTTAAAAAGCAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72891	72003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_72000_72900
855798	contig_11173_pilon	-	581	6	Intergenic	novelGene_156907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTGCCTTTTTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434924	431807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_-_431841_432243_432342_432696_432789_433336_433427_434009_434132_434778
855800	contig_13762_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_156672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATAAGGTTAACCTGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60867	61508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13762_pilon_+_60900_61500
855801	contig_2768_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_57515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACTGTTTTGTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798282	798894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_798300_798900
855802	SIRV6	-	279	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	-1	-2	-1	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29505	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTACTTGGGCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1821	1542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1500_1800
855803	contig_15185_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_99395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACACCATCTAGCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134518	133655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_133700_134500
855804	contig_8443_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_150616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCAGGATAGTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797017	797935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_797000_797900
855805	contig_14720_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_164979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCAGTCCAGTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124536	123536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_123500_124500
855806	contig_709_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_57571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTCCTCAAGAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2145445	2145781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2145400_2145800
855807	contig_4782_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_73654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACACAAATGACAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485722	484723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_484700_485700
855809	contig_4769_pilon	+	916	2	Intergenic	novelGene_117947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGGGAAAAGTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301851	363426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_301942_362600
855810	contig_3601_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_132921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAATGACTTACGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338704	337864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_337900_338700
855811	contig_11056_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_130380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAGCTAGAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362591	363769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_362600_363800
855812	contig_8304_pilon	+	755	2	Intergenic	novelGene_153181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCCCACCTAAACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151506	152327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_152036_152101
855813	contig_13828_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_158290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAACACCAGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233181	233930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_233200_233900
855815	contig_2577_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_172073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCACGCCTCCTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251007	250691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_250700_251000
855817	contig_14405_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_85610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	9	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	120	788	14713	80332	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTEKDLAEDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVNKRIGNLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKHMYRKYHQRPTFRQMQLENVSVALEFLDRESIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLVWTLILHYSISMPVWEDEGDDDAKKQTPKQRLLGWIQNKIPYLPITNFNQNWQDGKALGALVDSCAPGLCPDWESWDPQKPVDNAREAMQQADDWLGVPQVYMQAFHVP	14593	80737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_15005_78497_78747_80204
855818	scaffold_14128_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_169517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACTTTCTCCAAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47342	48686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_47300_48700
855820	contig_13228_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_177814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701	3564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13228_pilon_+_760_932_972_1207_1292_3334
855821	contig_14665_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_171045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACCGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46442	47180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_46400_47200
855822	contig_12964_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_131711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAGAATCTCTCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574452	572928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_572900_574500
855823	contig_11413_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_103194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576007	575354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_575400_576000
855824	contig_13592_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_33690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTTCTGTTTAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247026	247515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_247000_247500
855825	contig_9721_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_155989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCACCCCTCCAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363222	363824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_+_363200_363800
855826	contig_12535_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_177815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCATTCCCACGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157246	158552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12535_pilon_+_157200_158600
855827	contig_5331_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_112761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGTGATGCAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93701	94256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_93700_94300
855828	contig_17518_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_117364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACTCATTTTCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137888	137271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_137300_137900
855831	contig_5261_pilon	-	1227	1	Intergenic	novelGene_102477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATCCAGCTAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661123	659896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_659900_661100
855832	contig_7058_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_136013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTCAGGAAGAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8009	8517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_8000_8500
855834	contig_7895_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_154448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTGTTCCTTCCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707868	706817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_706800_707900
855836	contig_9423_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_99178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTCAGTCTAACTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47298	48831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_47300_48800
855837	contig_1996_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_131920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGTACGGGCCATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379991	380437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_380000_380400
855838	contig_10609_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_123901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTTTAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154883	155973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_154900_156000
855839	contig_9752_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_122044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAATGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217053	216667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_216700_217100
855840	contig_10341_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_47227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAATAGAAAATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68632	69529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_68600_69500
855841	contig_5482_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_144491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGAACCCTGATGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521311	520598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_520600_521300
855843	contig_3942_pilon	-	1118	4	Intergenic	novelGene_128891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	5.09901951359278	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	332	649	1601666	1599011	FALSE	10	CGTGAGTGTGGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMASKRISQETFDAAVRENIEEFEMGPDEAVREAMEQFESQGIDLSNIVKTVPRVSAEGPEEPEHEVLQRLGGPHYHQEEPGAKCVISTLGPCTENLLDLRESC	1628096	1598541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1599119_1600394_1600478_1601539_1601707_1627805
855844	contig_9269_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_177818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATATGGAATAGCAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374696	374351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9269_pilon_-_374400_374700
855846	contig_11160_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_168847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAATAAATAATTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458954	459410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_459000_459400
855847	contig_10627_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_59977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	59	496	245872	246309	NA	65	CCAATGACAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEEAELRRGRNCVLTPGPGMGWRGRLAPFSVQPLLALMPIPSPQGRAFVKAAFQGPASSSTGRSSPRPSRSLRPPRSLQQGAAAREHNRPGPAWGHRSLAAGRRGELLLSIPLGLAFGNLGPRCQFVLKPRDGRFQVLPTPRPHPQAGPAAAQAPSGHRIQVTP	245813	246832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_245800_246800
855850	contig_7398_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_166154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGCTCCCGGCCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106911	106161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_106200_106900
855851	contig_19812_pilon	+	818	4	Intergenic	novelGene_101012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_3	53.5557860760368	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	372	818	82226	110127	FALSE	55	GTAGGCTCAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETWFFGLQYTIKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFFLQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAK	81854	110127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_82340_105596_105723_107675_107799_110043
855853	contig_8594_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_140074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAATCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568549	568044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_568000_568500
855854	contig_8921_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_161626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	17	385	50174	49806	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSCSPGLVVWASGSLVLVLHRHKKQVEHIHSSSLSPRPYHGVRATHTILILVSMFVSFYSLPSILLACISLTVNPGQWLVDTSVLVASGFPAFSPFVLMTSDARVSRFFFACLLCNKIVFV	50190	49551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_-_49600_50200
855855	contig_4083_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_152330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	144	500	85709	85353	NA	30	CATTCAAATTTATCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATLYLPIDIADFWQRQILISKELVSTGLPFQLDLWHKGRAVAFGVIFYVISKLREMKSLFLENLAQDFTHPVTFYVSTWRSYHHFTLYMYNLPLPINFSFLHFYFKLATLFSSVFIY	85852	85351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_85400_85900
855856	contig_12543_pilon	+	1071	4	Intergenic	novelGene_168396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	43.4383343245213	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTGTTGATTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548775	569141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_548899_558949_559028_562254_562382_568398
855857	contig_9995_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_47779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCGACCCTATAAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740594	741429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_740600_741400
855859	contig_16635_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_153146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGCTAATACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77581	78185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_77600_78200
855860	contig_13496_pilon	+	760	6	Intergenic	novelGene_107635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	502.994234559403	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	49	759	285144	378698	FALSE	20	GAGGTAATCCACTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPTDGNAGLLAEPQIAMFCGKLNMHMNVQNGKWESDPSGTKTCIGTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHAHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVSEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVV	285095	378699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_285264_309234_309365_343908_344022_347585_347674_347718_347780_378499
855861	contig_17382_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_165186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25748	25337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_-_25300_25700
855862	contig_13901_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_146663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTGGCTCTTTTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268968	269509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_269000_269500
855863	contig_14467_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_138241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTTACTATTCTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277062	275563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_275600_277100
855864	contig_10446_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_162473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAACTCTAGCATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690656	689699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_689700_690700
855866	contig_17270_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_67220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACTTCTCTTCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34779	33462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_-_33500_34800
855868	contig_9937_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_129203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAACCTGTCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89395	90354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_89400_90400
855869	contig_5434_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_74642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTCTCTAGAGGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38677	38360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_38400_38700
855870	contig_13992_pilon	+	1161	6	Intergenic	novelGene_147642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	83	junction_5	44.4765106545017	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	398	1159	520325	557998	FALSE	15	CACGTTGCAGACCCTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVKCGCCPPVHPVFISLKSVHFSCWTLRPERSCAGARAPWAPVSAGLVFTGPWSLPVRCWHSSHPLWDDSIVEKSLKSLKDKNKKLEEGGPVYSPPVEVPVRKSIGQKVLDELKHYYHGFRLLWIDTKIAARMLWQILHGHTLTRRERRQFLRICADLFRLVPFLVFVVVPFMEFLLPVAVKLFPNMLPSTFETQSVKEEKMKKQLRVKLELAKFLQDTIEEMALKNKVAKGNATKDFSTFFQKIRETGERPSNEEILRFSKLFEDELTLDNLTRPQLVALCKLLELQSIGTNNFLRFQLIMRLRSIKADDKLIAEEGVDSLNVKELQAACRARGMRALGVTVDRLKEQLKQWLDLHLNQEIPTSLLILSRAMYLPDTLSPADQLK	519927	558000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_520379_539137_539282_540651_540790_542877_543082_556902_557023_557896
855871	contig_1008_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_121543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTTCATCCTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322504	321961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_322000_322500
855873	contig_12270_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_113659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14138	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13900_14100
855874	contig_19957_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_57728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267011	267670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_267000_267700
855876	contig_7513_pilon	-	566	3	Intergenic	novelGene_89043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGCTGGGGGGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913078	905073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_905163_907384_907496_912712
855878	contig_3960_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_138027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAGAATGGAATTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528021	526824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_526800_528000
855879	contig_3942_pilon	+	178	1	Intergenic	novelGene_128876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCAGGCCATGAGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499056	1499234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1499100_1499200
855880	contig_2770_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_107421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTAAATCTTTTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247662	248878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_247700_248900
855884	contig_7368_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_158798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGCTTGTTAGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38023	38317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_38000_38300
855886	contig_14275_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_162863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCCACTTTCCGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313837	314582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_313800_314600
855887	contig_7272_pilon	-	1003	1	Intergenic	novelGene_25411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCAAGTCTTTCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843206	842203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_842200_843200
855888	contig_4845_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_53688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTCAGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851137	852076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_851100_852100
855889	contig_9195_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_155671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGGTATCTTCATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41392	40731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_40700_41400
855890	contig_6228_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_164491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGTCCAGGGCAAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167781	168344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_167800_168300
855891	contig_9548_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_141096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGACTATTAACAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338155	339253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_338200_339300
855892	contig_7180_pilon	+	366	4	Intergenic	novelGene_169037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.6123516451666	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	139	309	34705	35130	FALSE	30	ATTTTTAGTAGTAGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGSYLAEFLLDKGYEVHGIVRRSSSFNTGRIEHLYKNPQAHTEGNMKLHYGDLTDSTCLVKIINEVKPTEIYNLGAQSHVKVDPAVVTPSWMCFLPFQITL	22185	35187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_+_22234_32790_32879_34702_34813_35067
855893	contig_2365_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_103761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGTCTCGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256918	255947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_255900_256900
855895	contig_2596_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_53503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACTCTACATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017851	1017512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1017500_1017900
855897	contig_17204_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_177820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6.5	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	163	405	45464	47082	FALSE	20	GTAGGCCCCACACCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAEVKHQYTIDELKHREDLTQAQREEAQARREELEEHKAAFIEHLDGSFLFDSMYAEDVEGNKLSYLPGVGELLEAYKDKFVIICLNIFEYGLKQQEKRKMEIDTFNECIQEAIQENQEQGKRKIAEFEEKHLL	44689	47082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17204_pilon_+_44807_45418_45531_46906
855898	contig_14333_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_49160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAGAAGAAAACAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473354	473862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_473400_473900
855899	contig_1984_pilon	+	1246	2	Intergenic	novelGene_173203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269470	270812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_+_269559_269654
855900	contig_21388_pilon	+	1011	6	Intergenic	novelGene_136618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.31516738055805	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	42	590	16539	20891	FALSE	25	CGCCCCAGGAGAACCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHPASREEPTRGPMLEVHIPSVGPEAEESGQSPEKGHMVFRVEVLCRGRRHTVLRRYSEFHALHKRIKKLYKVPDFPSKRLPNWRTRGLEQRRQGLEAYIQGVLYLNQDVPKELLEFLRLRHFPADPKANSWGSQLHHRPVVSFCMDPYIWTPSPEPLPSVVVNGVLQGFYGFSISPSKAQPVAACHPAPLPPAP	16497	21312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_+_16614_16993_17078_17453_17559_18040_18136_20271_20340_20769
855901	contig_11602_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_166605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTCAGATCCTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349362	349758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_349400_349800
855902	contig_8538_pilon	-	789	2	Intergenic	novelGene_4623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	44	526	779296	773265	FALSE	40	TATTAGCTGTACAGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLTRLTERFVLGVDMFIEVLWKVWTEVLGVFGLDVANLSQYFSPASVANSPARALLAIGVVLLAYWFLSFVLGLAFSILHMLFGRCFWFVRVLLFSMSCVYVLQKYESEPENAVLPLCLVVAVYFMTGPMGFYWRGSPSSPSVEEKLEHLESQVRLLNIRLNRVLESLDCSNDK	779339	773001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_773687_779235
855903	contig_10627_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_60015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCACACAGGGAACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379983	379365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_379400_380000
855904	contig_7898_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_47514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAGTTAAGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276983	276207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_276200_277000
855905	contig_14060_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_156052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53567	52955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_53000_53600
855906	contig_10855_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_124398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	213	344	1040110	1040241	NA	10	TTACTTTGTGCCTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAELTGVSPSPPAGTSAFDTQAPAQGVTASPPWTRGLRCAQGNPDYTFKRPTLIQSRRSAQARRERKGLMSPGSEGRTGLRGHPGNCALFVTYTLNSEGTTCDEGSAFKIHS	1039897	1040840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_1039900_1040800
855908	contig_5590_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_163052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434052	433445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_433400_434100
855909	contig_14322_pilon	-	1954	15	Intergenic	novelGene_115666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	10.2807527716126	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	7	1809	618964	602878	FALSE	5	GCGTCCCCGAGGTCTCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAAAAALARLWAALFLLVAQVACEYGMVHVVSESGGPRGRDYCVLYNPQWAHLPHDLGKAPLLQLQDWSASVLCSPADLPTGGFSNQIPLVARGNCTFYEKVRLAQGSGARGLLIVSREKLVPPGGNKTQYEEIGIPVALLSHRDTLDIFKSFGRAVKAALYAPNEPVLDYNMVIIFIMAVGTVAIGGYWAGSRDVRRRYMKHKRDDGLEKQEDEAVDVTPVMICVFVVMCCSMLVLLYCFYDRLVYAVIAVFCLASSTGLYSCLAPAVRRLPFGRCRVPDNSLPYFRKRPQVRMLLLALACVTVSVVWGVFRNEDQWAWVLQDALGIAFCLYMLKTIRLPTFKACTLLLLVLFTYDVFFVFITPFLTKSGNSIMVEVATGPSDSATHEKLPMVLKVPRLNASPLALCDRPFSLLGFGDILVPGLLVAYCHRFDSQVQSSRIYFVACTVAYGIGLLVTFVALALMQRGQPALLYLVPCTLVTSCSVALWRRELAMFWTGSGFAKDLPQTPWDAAPVDGLQPPKDPSAPPCQQLPSEDAINTALPEEQPPGPPAPQELGAAASPVTQEPTSPAGSPQHVAQEQVQPGPVGPAAQPGTLD	618970	602732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_603166_604934_605096_607128_607207_607738_607839_607990_608054_608199_608275_608982_609065_610500_610618_610834_610932_611431_611575_612115_612256_612589_612680_613635_613819_614425_614546_618898
855910	contig_4496_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_66658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859046	858482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_858500_859000
855913	contig_2450_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_160327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	250	756	849954	850460	NA	25	ATAGAAGCGTATTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNQAQTPHSTCCGNPKLCQDFWKFQTTFILVTSGLCFWAALSVLHCADPNEASILFLYFHPKQHIPNTHASLHLDVTEAGGGRWAENEGGGVHITEIQKHQTAYDPPWILKYFPTTSLLHEGSRGLHGNESSVSHTTSKAPSSFLSSPLFLTLQISSGNPRSFQSIT	849704	850791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_849700_850800
855915	contig_6445_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_77027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGTCAGTGGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538810	539722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_538800_539700
855917	contig_8866_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_77915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGAAAAATCCTTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176902	1176091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1176100_1176900
855918	contig_253_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_129701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498507	498775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_498500_498800
855919	contig_6270_pilon	-	885	2	Intergenic	novelGene_99899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACAGGTATGCAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202317	1200752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1201620_1202299
855920	contig_16220_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_163622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAGTTTTTATGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13106	14031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16220_pilon_+_13100_14000
855922	contig_13004_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_112686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATAAATTTTTTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709454	710401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_709500_710400
855923	contig_15420_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_175295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGAGAGAAGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148476	147597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_147600_148500
855924	contig_10402_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_175140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCGGTGGGATCATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25437	24697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10402_pilon_-_24700_25400
855925	contig_8260_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_163228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAGTTATTTGCTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25927	25472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_25500_25900
855927	contig_5317_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_76642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	307	348	987481	987522	FALSE	5	GCCTAGGCCCCGTCCTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSDRVLGASAARGGTAKVTVDPRVLQPALKDGCHAGGCHHVDQRPCQADPGGPGDPPAALGPRWGTPHGGQDPAVHSHGAVCCGLWECAGKEATLTVGRVLMGEGSELPARPGV	966595	987775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_966681_987259
855928	contig_9406_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_136175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAATCCACCAGCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110510	111354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_110500_111400
855929	contig_5906_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_174808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATATTTTCTTCTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211213	210764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_210800_211200
855930	contig_8594_pilon	+	635	5	Intergenic	novelGene_140064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	33.1209903233584	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGAAATGAGCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488165	537940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_488276_496157_496237_517945_517983_534656_534924_537798
855931	contig_14326_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_120669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGATTGTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71696	72246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_71700_72200
855932	contig_15866_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_63584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACTTAGTGCCAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199099	200544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_199100_200500
855933	contig_5229_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_117671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTTTGAGTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51357	51923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_51400_51900
855934	contig_21208_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_175778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGACTAACTTGAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70721	70094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_70100_70700
855935	contig_9939_pilon	+	1134	9	Intergenic	novelGene_158599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_7	56.6695464954503	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	101	1123	90046	139610	FALSE	15	ATAGCTGCATGTTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTQSLHLSDLHRKSHLWRGIVSITLIEGRDLKAMDSNGLSDPYVKFRLGHQKYKSKIMPKTLNPQWREQFDFHLYEERGGIIDITAWDKDAGKRDDFIGRCQVDLSALSREQTHKLELQLEEGEGHLVLLVTLTASATVSISDLSVNSLEDQKEREKILKRYSPLRIFHNLKDVGFLQVKVIRAEGLMAADVTGKSDPFCVVELNNDRLLTHTVYKNLNPEWNKVFTFNIKDIHSVLEVTVYDEDRDRSADFLGKVAIPLLSIQNGEQKAYVLKNKQLTGPTKGVIYLEIDVIFNAVKASLRTLIPKEQKYIEEENRLSKQLLLRNFIRMKRCIMVLINAAYYVNSCFDWDSPPRSLAAFVVCSYCTTYIVIH	89945	139621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_90115_93610_93742_109981_110169_114956_115051_134686_134790_136540_136644_136972_137075_137454_137530_139451
855936	contig_19082_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_175906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136282	135975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19082_pilon_-_136000_136300
855937	contig_15538_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_152641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTGTTACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80962	79643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_-_79600_81000
855938	contig_11978_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_62962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118992	1117561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1117600_1119000
855939	contig_6471_pilon	+	681	3	Intergenic	novelGene_172099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	33.5	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	115	510	233863	253003	FALSE	10	AGGTCTTCTTGTTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRFLSGKDESQFRHQGAVELLVFNVLLILTILTIWLFKNHRFRFLHETGGAMVYGLIMGLILRYATAPTDIESGTVYDCGKLAFSPSTLLVNITDQVYEYKYKREISQHNVSPHQGNAILEKVDLQRCS	233748	253174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_234032_250825_251029_252979
855940	contig_12277_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_139695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGACTAAAATGGTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270542	269926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_269900_270500
855941	contig_4055_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_158180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTTAACCACTGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976050	977049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_976000_977000
855943	contig_6833_pilon	+	700	2	Intergenic	novelGene_175127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACCACCATTCCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144000	144952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_144062_144313
855944	contig_6551_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_155548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209022	209327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_+_209000_209300
855947	contig_7356_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_60399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGCTTCACAAATGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462123	461062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_461100_462100
855948	contig_19032_pilon	+	330	4	Intergenic	novelGene_172530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATCAACCCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148967	157090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_149036_149650_149750_151622_151699_157003
855950	contig_3233_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_56604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTTTAAATCAGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948700	947472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_947500_948700
855951	contig_10235_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_46546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACTCAAGAAAAAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418125	417633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_417600_418100
855952	contig_3975_pilon	+	264	3	Intergenic	novelGene_54687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGCGTCCCTGGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062568	1072344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1062673_1071982_1072067_1072268
855953	contig_10627_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_59999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAACCTTATCTACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306179	305158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_305200_306200
855954	contig_11630_pilon	+	603	4	Intergenic	novelGene_147170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	132.788051671326	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGATAGCCACTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77618	109454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_96043_96137_97081_97254_109204
855955	contig_6871_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_21648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGTTAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727848	728679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_727800_728700
855956	contig_2046_pilon	+	948	6	Intergenic	novelGene_151559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTTTTCTCCAACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39867	45890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_+_40263_40375_40470_42473_42587_43713_43836_44005_44188_45848
855957	contig_7730_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_156254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGTCTAAAATTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43764	1747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_1832_43429
855959	contig_10196_pilon	+	1197	3	Intergenic	novelGene_132080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	70	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1	627	876091	876895	FALSE	30	TGCAATATGGCAGTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPPPPPPGLATTVSKPPPGFSSFLPSPQPACVPNTTTKAPRLTPPPRAYLVPENFRERNLKLIQSIKDFLQSDEARFSKFKSRSGEFRQGVISAAQYYKTCWELLGESFQKIFSELLVLLPDTVKQQELLLAHTDFCSHEKPPGTKSKKSKKSAWQASTQTTGLDCCVCPTCQQVLAHGDVSSHQALHAARDDDFPSLQAIARVIT	876090	877465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_876213_876304_876456_876541
855960	contig_14472_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_111192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	408	278	685	495107	495514	NA	45	AAAGAGTATGTGTAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQVKLEDHKIVTACLPGEHVNQLTTEPATGPFPEIQSSLRDSEEEVDVVGDSSASKERCNENTNNVLDTSLESVPVSGEPEPSSVLDCVSAQMMSLSEPQEHRYTLRTSPRRAAPARGSPSKNSSPCRENGQFEENTLSPNETNATVSDNISESHTNPDEISQNEKGICCDSENYGSEGLSKPLSEARLNIGHLPSAKESASQHVTEEEDDDPDVYYFESDHVALKHN	494829	495514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_494800_495500
855961	contig_7357_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_36945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTATGGTGACATCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990886	990460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_990500_990900
855962	contig_4364_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_73	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCGTGAGAACTACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709802	709064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_709100_709800
855963	contig_6674_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_148042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTCTGTGACGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488275	489036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_488300_489000
855964	contig_6102_pilon	-	1264	1	Intergenic	novelGene_32379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGAACTAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1729616	1728352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1728400_1729600
855965	contig_10937_pilon	+	670	4	Intergenic	novelGene_67332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	23.3285709425636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATACCCTTAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180581	185969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_180699_181497_181654_181931_182017_185657
855967	contig_2087_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_65566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	516	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69217	70653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_69264_69994_70172_70524
855968	contig_10064_pilon	+	641	5	Intergenic	novelGene_122726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	152.321001506687	105	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	136	312	395972	403488	TRUE	25	TGTCCAAGTATTCAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPRGERLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQASAHLFLSLSNPHPLFAPRGPKRN	395836	404716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403061_403417_403501_403911_404108_404595
855969	contig_7724_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_177821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGATTTGATCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22041	23459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7724_pilon_+_22000_23500
855972	contig_18391_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_174098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCACCATGCTTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174914	173991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_174000_174900
855976	contig_6870_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_103944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGACCTGTCTTCTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205403	1204460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1204500_1205400
855978	contig_4388_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_161947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGATTTGTTACACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304962	305645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_305000_305600
855979	contig_9434_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_150500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATCCATAGGATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343570	344380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_343600_344400
855981	contig_5083_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_151648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACAAAGAAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270247	271147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_270200_271100
855982	contig_3942_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_128897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTTGTGATACTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661672	1661424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1661400_1661700
855985	contig_15752_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_148751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTAAAAAGTAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125715	124672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_124700_125700
855987	contig_2710_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_161798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101295	1100274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1100300_1101300
855988	contig_4964_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_157252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCCAAAGGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56618	57315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_56600_57300
855989	contig_1719_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_87288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACTAGCAACAAACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372164	372941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_372200_372900
855991	contig_5569_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_86723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCGGTTACCAGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151726	151028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_151000_151700
855992	contig_11217_pilon	+	1198	6	Intergenic	novelGene_176113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTTCGTTAGATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107248	189637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11217_pilon_+_107280_116344_116419_117617_117776_119441_119692_128373_128550_189128
855994	contig_14744_pilon	+	798	5	Intergenic	novelGene_66024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.73205080756888	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAAAAATTCTAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970126	981865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_970205_977499_977576_978738_978851_979102_979266_981496
855995	contig_6414_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_157016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTGAAAGAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130217	129484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_129500_130200
855997	contig_10042_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_79115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGAGATACAGCAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14037	14288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_14000_14300
856000	contig_6208_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_52973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCCAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337530	338424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_337500_338400
856001	contig_5964_pilon	-	1121	6	Intergenic	novelGene_80362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2.48193472919817	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	502	993	78947	77704	FALSE	15	GTTTTTATAGTTGTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELADALIYCHEKKVIHRDIKPENLLLGLRGEVKIADFGWSVHTLSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDERVDLWCIGVLCYELLVGSPPFESPSHTETYRRILKVDVRFPSSLPSGAQDLISKLLRYQPLERLGLAQVLEHPWVQTHSQRVLPPSAQMAS	79991	77575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_77875_78046_78222_78801_78951_79034_79174_79528_79721_79824
856002	contig_14341_pilon	+	521	3	Intergenic	novelGene_111800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	4.5	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCTTGGGGATCGACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422356	427148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_422509_426478_426673_426973
856005	contig_9054_pilon	+	678	2	Intergenic	novelGene_160676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATCATACAATATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441718	444572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_441827_444002
856007	contig_6871_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_21589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCACCCCAAAGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308292	308576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_308300_308600
856010	contig_9752_pilon	+	1237	12	Intergenic	novelGene_122036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.123518451439	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	649	1182	218730	228642	FALSE	30	AATACTCTGTCTTGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKIVGGHYLKVTLKPILDEICESSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKVFSTIIESSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTVRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEERYIRAVKKV	192671	228697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_192720_194322_194383_198978_199056_200022_200125_217236_217394_217658_217808_218674_218790_219180_219256_219969_220094_222352_222460_228053_228138_228558
856011	contig_10437_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_38400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACAATAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737118	736789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_736800_737100
856012	contig_16870_pilon	+	395	4	Intergenic	novelGene_155530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.35412613473634	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	52	330	247276	256709	FALSE	20	TTGACCTAGATGTCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPTSPLQKLLLAAGSAGMALYNPYRHDMVAVLGETTGHRTLKALRDQMRRDPEGAQILQERPRISLSTLDLGKLQSLPEGSFGREYLRFLDVNVDWDQLMHLRWLLSSF	247224	256774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_247304_251280_251378_251892_251996_256658
856013	contig_8693_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_150865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGACAGCGGTGACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080946	1081418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1080900_1081400
856014	contig_8693_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_150867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAGAAAAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081518	1081820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1081500_1081800
856017	contig_4125_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_25169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCTAGTCCTCAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932057	933076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_932100_933100
856018	contig_20157_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_145871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTCATGGAACCCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169228	169574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_169200_169600
856019	contig_10319_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_147238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGCAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46998	47836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_47000_47800
856020	contig_15777_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_75749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214422	215814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_214400_215800
856025	contig_5770_pilon	+	1441	9	Intergenic	novelGene_74198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.61904085496962	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	243	1439	340053	356782	FALSE	20	CAGGTAACTGGGGATTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCCFAAGSPARVGAEGRLQDELHKSRHIQVAAKPSVRFNLRTSKDSEDEGCYLSLSHDQSLEDCGFNVTAKTFFIIHGWTMSGLLENWLHKLVSALQTREKDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNSRVVGHSIATMLNWLQGKDDFSLGSVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMFEGVDIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIVYGTITEVMKCEHERAVHLFVDSLLNQDKPSFAFQCTDSDRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKVHIFSYKNTGEIEPTFYVTLYGTSADSQTLPLEIVEQIGLNATNTFLVYTEEDLGDLLKIKLTWKGTSQSWYSLWRELRSYLSQPRSPSPELNIRHIRVKSGETQQKLTFCAEDPENTSISPGRELWFHKCRDGWRMKNE	335078	356784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_335139_338217_338400_340052_340233_341426_341539_347317_347540_349755_349999_350852_350974_351903_352123_356682
856026	contig_20402_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_72842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81761	82312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_81800_82300
856027	contig_8464_pilon	-	735	7	Intergenic	novelGene_125400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTTCTAATGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892688	889958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_889994_890868_890983_891104_891176_891320_891400_891694_891816_891952_892097_892517
856028	contig_1735_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_106905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190026	190642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_190000_190600
856029	contig_5696_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_117519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTAACTCATCAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427217	427975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_427200_428000
856030	contig_9995_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_47832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAACAAACACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962489	962135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_962100_962500
856031	contig_13481_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_119348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTATATTATAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385595	386605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_385600_386600
856032	contig_6031_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_56738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGTGCTCAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201013	202322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_201000_202300
856034	contig_7707_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_72122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	119	532	43808	43395	NA	40	AAAAAGGCAGCTGGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGITRTCGHFASFSSGILIRTEEWTVGRMEDSLQWPLRPSSDHLIRSVGPGIFHVNEGWELSLPLSRFLLLPYQGNSFLFYLCMCIIWHLDNLTTPSGEGMGLLNHGNPKLAAGSNPLAMGDRCTLLKLTLLCLFSM	43926	43064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_43100_43900
856035	contig_11300_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_168648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATAGTCATCAAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86217	85409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11300_pilon_-_85400_86200
856037	contig_10211_pilon	-	522	2	Intergenic	novelGene_173608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33867	31844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10211_pilon_-_32099_33599
856038	contig_5084_pilon	-	826	2	Intergenic	novelGene_64627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAGAAAAGGATCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280443	1279028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1279327_1279915
856040	contig_7056_pilon	+	514	2	Intergenic	novelGene_43711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAACAAAGTCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930608	932008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_930638_931523
856041	contig_20819_pilon	-	700	3	Intergenic	novelGene_55691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	1	310	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2	388	113297	112448	FALSE	20	TTGAAACCCGCAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQTRYVKTTGNATVDHLSKYLALRIALERRQQQEAGEPGGPGGGASDAGGPDGGGGEGGGAGGGDGPEEPALPSLEGVSEKQYTIYIAPGGGAFTTLNGSLTLELVNEKFWKVSRPLELCYAPTKDPK	113298	112135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_112550_112831_113106_113286
856042	contig_7135_pilon	-	895	4	Intergenic	novelGene_136943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	2.16024689946929	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	239	784	142714	129981	FALSE	20	CTACTCAGTCATTGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGFEVVAMDCEMVGLGPSRESGLARCSLVDAHGVVIYDKFIRPEGEITDYRTPVSGVRPQHMQGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFKVLKEDMSRYNIYDTSTDMLLRHQAHLDHCRRVSLRVLSERLLKRRIQNSLLGHSSVEDAKATMELYQISLRIRARRGQPSLGVVG	143227	129869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_-_130098_133148_133350_142486_142738_143012
856043	contig_2940_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_81905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAACCAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463456	464086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_463500_464100
856044	contig_12050_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_62769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCATCATGGTGCCACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847441	846895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_846900_847400
856045	contig_15021_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_26965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	39	308	240776	241045	NA	25	GAAAGGCAGGTGGGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRSRFTETSRAMPLGQDSGWGEVWVHRGLQGYGLGAGQCPERGLGSERCTYHRTPISTAEEDLLNTHYRKIKCSIKVQKVGFSTGQMLIFLKKLFLKLVE	240737	241402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_240700_241400
856046	contig_12638_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_33211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	244	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	93	572	377005	374776	FALSE	70	CTCAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCISRFRPSFTLSPHPICHKSPSAAAVCLGMIMITLTQQALALPAPPQMRLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETSEMLQAQLQEAQRELEEAAQQHRDDLVAVKAEGNTLLQDKMDLQKQVFSSPPSPTALPQHGQLSTISCRPGGAVALLPELGRGRVGYNTEWNIEG	377097	374773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_375067_376816
856047	contig_20398_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_155205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAATCAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161787	162170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_161800_162200
856048	contig_13481_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_119521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGACATGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430627	1429997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1430000_1430600
856049	contig_710_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_162940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGGGTGAACCTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91541	91193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_91200_91500
856050	contig_16930_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_139153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCCTGACTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96459	96131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_96100_96500
856052	contig_7300_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_170456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACAATCTCACATGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460747	461916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_+_460700_461900
856053	contig_299_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_129488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGGAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434630	1434384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1434400_1434600
856054	contig_9852_pilon	+	866	4	Intergenic	novelGene_138483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_2	3.55902608401044	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	553	588	668456	668491	FALSE	25	ATATTTTCTTATTTGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYDPLGGKVLIDGEEIKHLNVQWLRAHLGIVSQEPILFDCSIGENIAYGDNSRTVSQEEIVQAAKEANIHPFIESLPDKYNTRVGDKGSQLSGGQKQRIAIARALVRQPCILLLDEATSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFENGKIKEHGTHQQLLAQKGIYFSMVNVQAGAKRL	658130	668769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_658158_664830_665038_667552_667700_668284
856058	contig_20779_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_112367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTCACCTAATGATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72064	72624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_72100_72600
856059	contig_20779_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_112368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGGTTAAAGATAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73021	73382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_73000_73400
856061	contig_7378_pilon	+	1720	2	Intergenic	novelGene_120249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTCCCCTCCGCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369478	388168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_371181_388150
856062	contig_8242_pilon	-	746	9	Intergenic	novelGene_80198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGGGTCATATTTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197559	183408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_183481_184361_184407_185665_185709_185794_185851_188433_188490_188902_189104_193938_194131_195902_195948_197523
856063	contig_12841_pilon	-	806	9	Intergenic	novelGene_55863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	576.779623751568	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	741	66	806	418821	353156	FALSE	25	GATGATTATCGAATTCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPEQQRFLVRWGGAAKPQEGKMFNVESVERVELCESLLTWIQTFNVDAPCQTVEDLTSGVVMAQVLQKIDPVYFDENWLNRIKTEVGDNWRLKISNLKKILKGILDYNHEILGQQINDFTLPDVNLIGEHSDAAELGRMLQLILGCAVNCEQKQVMEESVQHVVMTAIQEYVLYVFVSYQLKKTTEELNEALSAKEEIAQRCHELDMQVAALQEEKSSLLAENQVLMERLNQSDSIEDPNSPAGRRHLQLQTQLEQLQEETFRLEAAK	418886	353155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_353172_358155_358320_365469_365584_378171_378219_384082_384216_388868_388920_392187_392261_408511_408598_418764
856067	contig_11702_pilon	-	593	3	Intergenic	novelGene_142021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	9	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	74	337	548510	547750	FALSE	25	GAGCACGTGAGAGCAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYLAIQSTQAGGEPKSAAPAQLAFMRVYCGPSPSCLVQSSSLSNAHIDYTTKPAIIFRIAARNEKGYGPATQVRWLQETSKDSSGTKPASKRPMSSPEMKSAPKKSKADGQ	548583	547493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_547790_547935_548000_548350
856069	contig_1836_pilon	-	814	2	Intergenic	novelGene_71085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCAAAAAAAAAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097461	1096154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_1096823_1097315
856070	contig_9389_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_84077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	482	802	1071022	1071342	NA	20	CACATCAAGCGCTGGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPGPEALQAVGTVSPRLPFPVATCAGRHSASRGGQAVVRAKAVRGLQGVQGCSRGVWPEACSSHTQGSGLPRPSNAAVPESGRPWVGDVPLGCRQASPPHISHP	1070540	1071400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1070500_1071400
856071	contig_12622_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_6021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683203	1683924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1683200_1683900
856073	contig_16686_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_162112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAAATTCTCAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251044	250037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_250000_251000
856075	contig_6418_pilon	+	475	3	Intergenic	novelGene_81239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	159	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	4	378	1441197	1444680	FALSE	25	TAAATTCAGTCTGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1441193	1444777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1441282_1441958_1442066_1444497
856076	contig_5302_pilon	+	1553	3	Intergenic	novelGene_81558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	214	1311	1669761	1672325	FALSE	25	GAGAGCTTTAGAAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLYKAYATKEGIPKSSRSHLYNTVRLFTPCAQHKQTPGNQVTGILPSVDLLFNLDSVTTLEHLLKSVLLYTFNDSVSFPSAVKCVCNLVIMEPKASSKTLPRAPYSFTFNSKFEFRKKHKWIEIDVTTLLQPLVASNKRSIHMSVNFTCEKDQLQHPSAQDRWFNMSPLVPPSLLLYLNDTSIQAYHGWYSLHYTRRASQSPDQKTSLAAHPMGEETAECGRASRHRRGQETVSSKLKESLVPASFNLSEYFKQFLFPQNECELHDFRLSFSQLKWDNWILAPHRYNPRYCKGDCPRAVGHRYGSPVHTMVQNIIYEKLDSSVPRPSCVPAKYSPLSVLAVEPDGSIAYKEYEDMIATKCTCR	1667655	1672567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1667806_1669697_1669894_1671360
856077	contig_7347_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_172501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACTGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265841	266301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_265800_266300
856079	contig_12250_pilon	+	1201	3	Intergenic	novelGene_80626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	60	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	523	1014	352268	353808	FALSE	5	CTTCCCGGTTTCTGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPFFLTWSVVNSVHWANGSTQALPATTILLLLTVWLLVGFPLTVIGGIFGKNNASPFDAPCRTKNIAREIPPQPWYKSTVIHMTVGGFLPFRYPPFIPWPSLSGP	351505	353995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_352017_352256_352443_353491
856080	contig_6808_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_173532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACTTAACCAGTAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233101	234125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6808_pilon_+_233100_234100
856084	contig_1996_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_131867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	40	321	86263	85982	NA	70	GAGGAAAAGAGAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERIPIKRYSCDGQMFPSQAARSRRRQHLPSQPTDCVSPSLENTELSTVQPGGLCGQHRGKTRGQDAQAAVRRSLLSPSHTVLHTAHTTSRDRLPNKQGTHGLTSAY	86302	84910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_84900_86300
856086	contig_10756_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_170673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATCCAACTTCCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353851	354271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_353900_354300
856087	contig_7086_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_175762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAATGTACAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121384	122157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_+_121400_122200
856089	contig_10296_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_168882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTGTCCACCCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874121	873596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_873600_874100
856090	contig_8991_pilon	+	913	2	Intergenic	novelGene_170942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAAAGAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241129	242269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_241935_242161
856091	contig_8330_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_71756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTACCCTGATGTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601408	602766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_601400_602800
856092	contig_2113_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_161150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356874	357926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_356900_357900
856093	contig_8375_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_141270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTGGGGATTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23507	22314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_22300_23500
856094	contig_5997_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_168613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCACTGCTGAACGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322707	323555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_322700_323600
856095	contig_6589_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_25818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAGATGTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766221	767286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_766200_767300
856096	contig_15245_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_145210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGGTTAAAGCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39607	38515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_38500_39600
856097	contig_9694_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_177824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCCCAAGTGAAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59564	60810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9694_pilon_+_59600_60800
856099	contig_6677_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_114235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939893	940457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_939900_940500
856100	contig_6470_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_145594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGCGCAGAGAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933633	935024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_933600_935000
856102	contig_695_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_177164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCTAAGGGCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23117	23943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_23100_23900
856103	contig_8576_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_88725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541177	540626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_540600_541200
856104	contig_1442_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_172160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATCTAAGAATATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434238	433047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_433000_434200
856105	contig_8631_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_121953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTAAGCCTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691640	691361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_691400_691600
856107	contig_11855_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_67077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACTCTGTAAGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120644	2119846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2119800_2120600
856108	contig_5316_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_61248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAGGAACGTGTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484679	485741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_484700_485700
856109	contig_3862_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_137417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGTAGTACACATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574129	574594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_574100_574600
856110	contig_3727_pilon	-	871	5	Intergenic	novelGene_146763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.08972473588517	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	554	871	537460	527473	FALSE	20	TTCCCTTTGTTAAACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGSFKTGIGALTPTYCPPEKELCKQKRFHQGGKTREASRDTWEPHTTKKAVPGAERILWTEVPMQRSSQTKGRLMTWTFLQCRQRKRSPGPEFGLVAYCTVRIN	546001	527472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_527683_537352_537470_537987_538106_538333_538457_545698
856111	contig_12427_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_40512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGTTTGCAGAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464062	462936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_462900_464100
856114	contig_10339_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_125258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAGCATAATGCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260214	259605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_259600_260200
856115	contig_3584_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_108119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTTTGACCCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210227	208424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_208400_210200
856117	contig_2438_pilon	-	197	1	Intergenic	novelGene_112075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313149	312952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_313000_313100
856118	contig_8276_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_174490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGCATTACTAGGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445234	444255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_444300_445200
856120	contig_6017_pilon	-	170	2	Intergenic	novelGene_152545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6688	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTTTAATATACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442148	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124
856123	contig_16846_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_82857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGACTTTTAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96279	94878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_94900_96300
856126	contig_4114_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_15612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCACAGTGGTTAAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360581	360936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_360600_360900
856128	contig_8445_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_177055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATATGGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110667	110985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8445_pilon_+_110700_111000
856129	contig_5782_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_162126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTAATCTTTCTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281694	280302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_280300_281700
856130	contig_6227_pilon	+	1085	2	Intergenic	novelGene_49657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	140	571	451261	451692	TRUE	25	AGGCAGCTAATCCATTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPQRARWPRCRSVGSLPRRRLGPRPRRSVSGGAACSRKCCRISRYMSVVVLKEPPPCSNSSWWHLDTIHEKTGRWHRPCRAEVALSRQTRRSATPGSRWCFRIYSSMPSSEKPLRLSSLQTYFLRSAVTASGRLVSTLRAFFSRLPCRRLKSRFCTDVGSVGEQWRSPSVNLNLNSSKPSKVSSTRSG	451121	457918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_452153_457864
856131	contig_6210_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_171881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACTTTTGATGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66732	66257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_66300_66700
856132	contig_4845_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_53728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCCTGCTCAGACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716019	1716582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1716000_1716600
856133	contig_12229_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_169395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGTTTTTTTTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122379	121585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_-_121600_122400
856135	contig_7979_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_125527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCCCCCTACCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392446	391962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_392000_392400
856136	contig_10596_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_173587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGGTGCCAGCTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793981	793701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_793700_794000
856138	contig_12050_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_62605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGGATGATTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313208	312784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_312800_313200
856140	contig_5145_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_131412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGAGTATGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789814	789450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_789400_789800
856141	contig_14034_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_72667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	380912	380595	NA	30	CATTCACAGGTATAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAAITNTTSGCFNKQIYFLTVKEARSPHSGYWLGKGSLSVGSKGKSLSQLLQAATLGVPGLVDRSVSIIFRQCLSFLCVCLLLCLICSFISQKYTHCTDIASLT	380914	380564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_380600_380900
856142	contig_4496_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_66698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAAAACCATTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969320	968546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_968500_969300
856143	contig_4103_pilon	+	371	4	Intergenic	novelGene_51935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	223.38208423138	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	17	370	92181	94594	FALSE	20	TACTGTCTCAGAATGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAATRGVGAKLALREIRIHLCQRSSGSQGVRDFIEKKYVELKKTNPDLPILIRECSDVQPRLWARYAFGQEKNVSLNNFSADQVTRTIENGLYWTEYNMEKHILFSIKLVSLCCK	92164	94595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_92282_92399_92507_94390_94462_94519
856144	contig_3721_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_123816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAAATCAAACCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147382	146907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_146900_147400
856146	contig_16666_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_61800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAACCCAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178520	178160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_178200_178500
856150	contig_2867_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_135160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTGCTATAGCAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519989	520731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_520000_520700
856152	contig_15500_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_128986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTCTTCCCCTGCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220118	219799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_219800_220100
856155	contig_9840_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_173759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGAAACAGAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54387	55271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9840_pilon_+_54400_55300
856156	contig_3575_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_141125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAATGCTGTGCAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773761	773362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_773400_773800
856157	contig_12531_pilon	-	1532	7	Intergenic	novelGene_177826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	204	1106	316792	272673	FALSE	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGSSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR	327816	272246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12531_pilon_-_272949_295219_295411_300860_300930_310332_310535_311080_311167_316713_316965_327785
856159	contig_18189_pilon	-	474	3	Intergenic	novelGene_170758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	646	junction_2	9	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	256	300	52222	52094	FALSE	10	ACCACTGCTGGCTCCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STALGIAVGSAVGHVVGSALTGAFSGGGAFTGGSSEPSQPAAQQFPASAAPQPLQLGPCAYEIRQFLDCATTQSDLSLCEGFNEAMKQCKYNHGLSSLP	53175	51919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_52114_52197_52346_53043
856160	contig_2646_pilon	-	713	2	Intergenic	novelGene_69679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	23	439	2291512	2290964	FALSE	40	TTGAATCATCTCCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALCLSLMVVSLLETVFITYLLHLADTEPPPMPQWLHSLLLHYTSPKKCCPTAPQKENKGLGLTPTHLPGLKEPEVLAGKMPNPGEAELNGRPESARALQEPEAQKKHLVDLWVQFSHMMDTLLFRIYLLFMASSIITVIILWNT	2291534	2290689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2291194_2291325
856161	contig_7009_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_23684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGATAATTTTCACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555120	554042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_554000_555100
856162	contig_5302_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_81553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGTATTAAAGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658266	1659303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1658300_1659300
856163	contig_504_pilon	-	524	3	Intergenic	novelGene_54402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	7.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGGAGGATGGGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32428	25769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_25833_25924_26053_32095
856165	scaffold_19766_pilon	+	639	3	Intergenic	novelGene_34448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACCCGCTTTGTGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855861	860708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_856017_857368_857451_860306
856166	contig_15114_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_121123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCATCCACTGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99833	94773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94837_99552
856168	contig_6175_pilon	-	1338	4	Intergenic	novelGene_16357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_3	137.937989288263	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1	411	1793689	1719671	FALSE	15	TCTGGGGCAGAGTTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRFADGFGERVSRLSATSGGSRAPPGKSRLGPFLSCTVSSSLNKAFQFSASVTTSLPRGKPPAAHLTYITLGELLFPVPLFSCSSANAVTWKTTVARITCNGQGATEKKTLLLIFKLWFGRPACFGSLIFTHHPT	1793689	1718743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1719717_1746007_1746156_1770748_1770887_1793610
856170	contig_1856_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_84871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGACATAAAATCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181677	181900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_181700_181900
856171	contig_13992_pilon	+	787	7	Intergenic	novelGene_147609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	523.739120809842	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	285	608	33152	34997	FALSE	15	TCGACGGGCACCGTGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLILLEAAEYLERRDREAEHGYASVLPFDGDFARKKTKAAGLVRKAPNNRSSHNELEKHRRAKLRLYLEQLKQLVPLGPDSTRHTTLSLLKRAKMHIKKLEEQDRRALSIKEQLQHEHRFLKRRLEQLSVQSMERVRTDSTGSAISTDDSEQEVDIEGMEFGPGELDSVGSSSDADDHYSLQSGGSSDGSYESPAAAWAAC	23059	35176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_23111_23189_23290_27566_27597_33048_33164_34085_34249_34699_34820_34968
856172	contig_6630_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_30722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGCAGTGTACCACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722462	723076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_722500_723100
856174	contig_15354_pilon	-	638	3	Intergenic	novelGene_65729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	58	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGCCTCAAAGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590908	572240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_572527_589799_590024_590780
856175	contig_9707_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_175101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCTGCTTTGGGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171205	172034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9707_pilon_+_171200_172000
856176	contig_8452_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_48027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGCATCGTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357769	357396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_357400_357800
856177	contig_10603_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_173374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCTTTAAAAAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64792	65794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_64800_65800
856178	contig_4891_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_124531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	4	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGAGAGGTGATGACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374160	465421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_374362_453386_453475_464942
856179	contig_9200_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_173992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACAATAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258362	259100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9200_pilon_+_258400_259100
856180	contig_5669_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_86089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	259	591	205657	205989	NA	25	TTTGTATTGTACTGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMFSFLLGRYLRVELLGHMETLRSIGGIIVQRSAANQNVSSLNSPAALREKRPGDLLLDGTQHGNSMVNHLRNCQTVTQSGCTILHSHHQCMKVPVYPYSHQHVTVSFF	205398	206067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_205400_206100
856181	contig_12622_pilon	+	892	2	Intergenic	novelGene_6055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	307	768	1692294	1694045	FALSE	10	TCATTGGAGGGTCTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAHIRVDPSGTRATRVESFAHGVCFSREPLAPGQVFLVEIEEKELGWCGHLRLGLTALDPDSLPAVPEFSLPDLVSLGHTWVFAITRHHNRVPPEGHPEAEAMFPSRSPALLEEPYLCIEQFRIPRDRLVGRSRPGLYSHLLDQLYELNVLPPTARRSRLGVLFCPRPDGTADMHIVINGEDMGPSARGLPATQPLYAVVDVFASTKSLRLVQLEYGLPSLQTLCRLVIQRSVVHRLAIDGLHLPKGLKDFCKFE	1691987	1694169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1692640_1693929
856182	contig_9272_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_125909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGTTCTATTCTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293441	293730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_293400_293700
856185	contig_4336_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_152370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTGACCATTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395242	394628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_394600_395200
856186	contig_14341_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_111794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTTACCAGCCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383352	384800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_383400_384800
856188	contig_9833_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_68490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATAAAGACTTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202166	202759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_202200_202800
856189	contig_11304_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_156730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	491266	490940	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDALYHWCFDLSGSKHGTWILIELLLCLFSRVWLLTGHRGCGWSSGLPSHCVRLLTSGLPELRCWAGKQRHQHLLLQQTFFQPLTPSQPSTWSSFHGHVTGYPIHWD	491267	490666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_490700_491300
856190	contig_10196_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_132164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGAAGACAGACACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037795	1037404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1037400_1037800
856193	contig_9646_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_117466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACCGTGATCTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354412	355116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_354400_355100
856194	contig_602_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_134929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126306	127457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_126300_127500
856195	contig_253_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_129659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTCTGTGGTTCCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383145	383343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_383100_383300
856196	contig_6191_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_107861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	52.7530936428271	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGCATATTTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206069	215947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_206283_207543_207691_212868_212929_215651
856198	scaffold_12124_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_22170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAGCCACTCGTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056644	1057239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1056600_1057200
856200	contig_8576_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_88819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTCTTCCTTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982838	982016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_982000_982800
856201	contig_6048_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_73173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACTGTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1223084	1223825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1223100_1223800
856205	contig_6412_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_149987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTATTCATTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658975	657966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_658000_659000
856207	contig_11550_pilon	+	416	2	Intergenic	novelGene_177827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAACAACAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15407	52251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11550_pilon_+_15511_51938
856210	contig_4845_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_53705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTCTCGGCCTCATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960327	960612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_960300_960600
856211	contig_15114_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_121162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	120	533	167121	167534	NA	40	CATGGAAACTGAGTAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKKTCQANDNQKKAGVAILISDKIDLKSKSIIRHKAGHNIMIKGSIRQEGITLINTYMTNDRPLKYIEQTLTELKREIDSPTTIVGDFNTPLLVMDRTTREKLSKDTEDLNNAPPKGSMVHVFLHHTWIILQNRP	167001	167653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_167000_167700
856213	contig_4519_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_123657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTACTAATGGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55978	57031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_56000_57000
856215	contig_8365_pilon	-	1314	1	Intergenic	novelGene_150907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTATAAGAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20974	19660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_19700_21000
856216	contig_7078_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_130129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAACCAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88561	87628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_87600_88600
856217	contig_10299_pilon	-	809	3	Intergenic	novelGene_79765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	12	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1	420	591106	580210	FALSE	15	CCCCTCCAGCGGGGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLTRGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	591106	579820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_580419_584724_584887_591057
856220	contig_13244_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_86936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTCATCTTTGCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251564	250919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_250900_251600
856222	contig_10627_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_60025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489868	489255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_489300_489900
856223	contig_16870_pilon	+	645	5	Intergenic	novelGene_155522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.59016994374947	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	232	426	211744	214218	FALSE	25	TATCAGTCTGTACACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLSGPLCSSPWTLLCCRPPPKRGPGTPGLRRTQPGLSKSYRGAFRSPRPSPKSGQASGASEDSQQLDIQKLKEKRDMLDKEISQLISEGYSVDELEDHISQLHEYNDIKDVGQMLLGKLAVIRGVTTKELYPEFDLDVND	209524	214437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_209620_209953_210003_211656_211779_212472_212568_214153
856225	SIRV1	-	335	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	566	4	-286	-4	3prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTGTGAGGCGCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11077	10651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10792_10882
856228	contig_16714_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_161570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	151	471	768963	769283	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVFGGITQGEEKSLGGLSMKFRSFHICAVQQLLKLAEERTHLPAPGLTLADSSTLFHAEPELTSLGSPPTTNVQSHPLGSISYYARPAKYVFISKNEHGVFKNQ	768812	769494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_768800_769500
856229	contig_9828_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_172244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACAAAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15798	15201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_15200_15800
856233	contig_16109_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_80323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTCTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209683	209303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_209300_209700
856235	contig_6785_pilon	-	687	2	Intergenic	novelGene_132591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTGAAATCAGAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779766	778428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_779021_779671
856236	contig_10733_pilon	-	714	5	Intergenic	novelGene_109970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	20.7530118296116	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	101	646	308109	306944	FALSE	0	CTGCTGCCTCTGCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGAGWGWAYQLHLLQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGFFTELLPRCGEVEPVGKVVQEDGRMLLVAVLEAIGGQASRSLMDCFADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFPSARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYTADY	308209	306875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_307041_307136_307319_307608_307699_307841_307901_307991
856237	contig_9345_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_24422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAGAATGCAGATGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206870	206263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_206300_206900
856238	contig_34_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_40037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTTTTGTTGTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224568	223917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_223900_224600
856239	contig_13456_pilon	+	890	3	Intergenic	novelGene_153301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	99	junction_1	15.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	298	888	349407	354501	FALSE	25	GCCTTCCTTCCTGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFCPQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFNTLTDRELEEYRREVERKHRGSEENVDETREQKDKSPPDPPAAPQTPPSTPIKLEEDLPQEQTVRDDSDAAALKPTLPDLSPDEPSEALGFPTLDEEEEEGLGEAPDPQSPPKSPLAASPEPAPAQVAEEAASPAAEEGAAVDPGSDGSPGKSPSKKKKKFR	349109	354503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_349582_352158_352258_354184
856241	contig_13464_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_125251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGAGGAATATTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506909	507934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_506900_507900
856244	contig_10948_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_124981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187391	187819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_187400_187800
856248	contig_4364_pilon	+	590	4	Intergenic	novelGene_103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	47.2087562499444	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	26	589	981308	1011329	FALSE	40	GTAGGAGAAAAACAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVMEEGGAWGPAGGEPTGTGDQGPQATQRSLELRLQRKLRAAAKSILRLQQEKEQLVEASNRLRAGLGRPRDTAGTPPGPSPIPVLEARSPGELPRPPLDCSLPLGQVQPRFTAQSQLRISTATCKSTHQKENRSPKPPQAQELHEENGPHTQRSLSLASSSLQDTWKLLDLGSSPSGPTSQDDSTP	981282	1011330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_981338_981481_981669_1004892_1005024_1011113
856250	contig_13664_pilon	+	1222	5	Intergenic	novelGene_144199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	25.5636460623284	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	14	814	56144	80673	FALSE	25	TATGTATGATTCATTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLTLPPGGAAAVDEYLEYRRIVGEDDGGKLFTPEEYEEYKRKVLPMRLQNRLYVSWRSPTGIDCKLVGPETLCFCTHRYKQHKTDFEMMPQQRPISLPCRVTGCQCKAYLYVPLNGTQPIRCRCEHFADQHGAAPGFTCSACSKCSGFHSCFTCACGQPAYTHETVVETKEERLAQGKPVGQDVPYAAMGGLTGFSSLAEGYMRLDDSGIGAPSVGFLDSPVTAMDHPFLKAFQASSGSLQEKPTDGNEIEEIFLDIVNKNIGL	56130	81081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_56209_62056_62231_68383_68575_70917_71125_80509
856251	contig_13992_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_147612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTCTTTTCCTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53048	53615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_53000_53600
856252	contig_7594_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_55453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTGTGTAGATCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566483	566717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_566500_566700
856253	contig_19934_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_166633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGTGTTTATACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259260	236741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_237070_259097
856254	contig_8880_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_165764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162771	163327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_+_162800_163300
856255	contig_5236_pilon	-	925	3	Intergenic	novelGene_100929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	3	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3	578	928362	926172	FALSE	30	TGTGTGGATATTAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPTCSVPGLWVWGTGQRVGNLFLLVSKPFCTAAAASRPLDAQRLAERLRAQKQEQKKEPVPTNPVQRRVRELVRFTQQLQRVHPNVLAKALSRGILHQDKDLVVINKPYGVPVHGGPGVQLCISDVLPVLAKMLRGHKAEPLHLCHRLDKETTGVMVLAWEKEVAHRVQQLFKTRQVAKKYWYASHRWW	928364	925824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_926399_927647_927814_928179
856256	contig_6277_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_80416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAAAAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771772	772594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_771800_772600
856257	contig_6595_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_122557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708821	707831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_707800_708800
856258	contig_7165_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_116900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	399	182	580	1109892	1110290	NA	20	ATTCCCAGCAGCCTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSGGPRPGAEPCVQLLPGRTEDEAMVSLHPPRAWPALWEAVGKRGLFPNEAYHTATATIFMTDSLRHWQKLTSGVPLSPMRPSMMPAGAGTYEHIQMPLAEARHVCLHVQTHAGGRAGADPHTEADLSPGR	1109710	1110290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1109700_1110300
856260	contig_3627_pilon	-	553	3	Intergenic	novelGene_78414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	153	353	34162	21554	TRUE	30	TTTATTAAAGCCATCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSALRIGGRPVGLPPVHPARPLLCSLVGGSADLLATLESGHCVGDDSRLMAASAAALAVRLSRSVANRGSYGAFCKRLTRTLLAFFDLAWRLRMNFPYFYLVASVILNVRLQNLF	34314	21313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_21463_21502_21566_33973
856261	contig_11378_pilon	-	631	2	Intergenic	novelGene_112295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGCTGGAAATATCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578542	575772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_576204_578342
856262	contig_18081_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_23830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTCCCTCCCCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393907	392992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_393000_393900
856263	contig_4136_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_161258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372900	371528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_371500_372900
856266	contig_15327_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_70590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGTGTGGATTCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846273	845543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_845500_846300
856268	contig_2203_pilon	+	681	5	Intergenic	novelGene_176092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	6.96419413859206	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	337	681	198839	226319	FALSE	45	AGAAAGGATCCAAAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWLLPSFVAIAYFCTIVQGQVAPPTRLRYNVLSHDSIQISWKAPKGKFSGYKLLVTPASGGKTNQLNLQNTATKAIIQGLMPDQDYAVQIIAYNKDKESKPAQGQFRIKDLEK	175787	226319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2203_pilon_+_176065_198779_198906_218851_218969_223019_223164_226302
856269	contig_10135_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_106678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGGAACAAGATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268661	269660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_268700_269700
856270	contig_16532_pilon	-	434	2	Intergenic	novelGene_110056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAAAATGAGTCGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412366	411348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_411624_412207
856271	contig_9705_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_41766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTATAAAAAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539484	540193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_539500_540200
856272	contig_3184_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_169790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATGGCCAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45242	45604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_45200_45600
856273	contig_14683_pilon	-	741	3	Intergenic	novelGene_166039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	23	481	116845	110521	FALSE	10	CCAGTTTCGGTGCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAAGSSMEPTADSLATAAVRGRAQEVRELLQAGAQPNAPNRYGRRPIQVMMMGSTPVAELLLLHGAEPNCADPVTLTRPVHDAAREGFLDTLMVLHRAGARLDVRDAWGRLPVDLAEERGHRDVARYLRAAAGETEGRGHAHADAAEGAAAGRRQPQL	116867	110260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_110547_112579_112887_116719
856275	contig_13265_pilon	-	890	2	Intergenic	novelGene_146006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCAGATGTTTTAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77792	76436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_-_77158_77623
856277	contig_6102_pilon	-	802	6	Intergenic	novelGene_32045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	173.968962749106	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	160	387	555780	554600	TRUE	40	CCAAAAGTACAAACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSAFASGRSYSPPDLSWSRGAARHASLGPSESGRGPRSLEPLLWWSDPVTLKMKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVERPTSQSC	556871	553683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554624_555412_555529_555692_555806_556737
856279	contig_10323_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_123630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTAGAGTAAATAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498696	497843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_497800_498700
856280	contig_5947_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_101527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTACATCAGAACGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512745	513629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_512700_513600
856281	contig_13158_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_107289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTAGTGAGGGCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104929	106365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_104900_106400
856283	contig_9036_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_155456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATTTAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143047	143408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_143000_143400
856285	contig_11594_pilon	-	465	3	Intergenic	novelGene_80875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	191.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTTGTACCTTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56810	24854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_25135_55728_55812_56708
856286	contig_15838_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_174338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAACTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215866	216553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_215900_216600
856288	contig_11512_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_43266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTAGTTTTGATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358225	357959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_358000_358200
856290	contig_6206_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_168150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATGGGCCCCACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98814	99161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_+_98800_99200
856291	contig_6206_pilon	+	268	2	Intergenic	novelGene_168154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAATCTGACACTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148816	182286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_+_148896_182097
856292	contig_6175_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_16295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAAGTAACGTGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401454	1400967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1401000_1401500
856294	contig_20951_pilon	-	119	1	Intergenic	novelGene_43086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTAACTTGCGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27227	27108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27100_27200
856296	contig_3700_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_138087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATGTGACCCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268005	268475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_268000_268500
856297	contig_1339_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_163154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	193	426	636107	636340	NA	5	GCTGCTTGAGTCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGYFRKHLAAHQGGRPFRCSSCGEGFANTYGLKKHRLAHKAEGLGGAWSGGWRPGRERSLSRGMATHPSNQMPPPGPPARLMSALPPPCCIPILQNVEQSRLLPDLSVQTQDCITPILGLSGSTLIPSDANLIRRPPAFL	635914	636563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_635900_636600
856298	contig_6837_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_149847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAATAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193713	193240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_193200_193700
856300	contig_10299_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_79774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAGAAAATCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607614	608783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_607600_608800
856302	contig_3654_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_174987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGGTCAGCCTAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447154	445751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_445800_447200
856303	contig_1348_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_174366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.11247489949718	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	149	1108	292034	281281	FALSE	45	AATAAAGGAACCCCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLLLALLILCGFLWNYKRQLKIADITDKYIFITGCDTGFGNLAARTFDKKGFHVIAACLTESGSTALKAETSGRLHTVLLDVTDPEKVKKTAQWVKNQVGEKGLWGLINNAGVLGVLAPTDWLTVEDYREPIEVNLFGLINVTLRMLPLVKKARGRVINVSSIGGRLALGGGGYTPSKYAVEGFNDSLRRDMKAFGVHVSCIEPGLFQTGLSDPIKVNEKKRAIWKHLSPDIRQQYGEGYIEKSLEKLKDSTSFENVDLSLVVECMDHALTSLFPKTHYAAGKDAKIFWIPLSHMPAVLQDFVLLRQKVKLANPNAV	292560	281153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_281505_284280_284445_287737_287997_291721_292105_292482
856304	contig_11832_pilon	+	618	4	Intergenic	novelGene_106975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	36.3348623531481	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	35	385	463912	466401	FALSE	10	TTGGTGTCTTCGGCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPEAGGPPIKKQKADSLTLDSGTSHDLC	463877	466634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_465610_465802_466357
856305	contig_3825_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_77986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTCTTAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595620	594576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_594600_595600
856307	contig_15548_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_173481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACTCTTTAGTAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245978	246716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_+_246000_246700
856309	contig_15185_pilon	+	766	6	Intergenic	novelGene_99415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_4	17.7606306194347	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	101	622	228773	230712	FALSE	15	GCTAATGGCTGTGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKGKVGTRGKKQIFEENRETLKFYLRIILGANAIYCLVTLVFFYSSASFWAWMALGFSLAVYGASYHSMSSMARAAFSEDGALMDGGMDLNMEQGMAEHLKDVILLTAIVQVLSCFSLYIWSFWLLAPGRALYLLWVNVLGPWFTADSGTPAPEHNEKRQRRQERRQMKRL	228672	230856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_228779_229390_229487_229942_230003_230083_230221_230385_230471_230574
856310	contig_4350_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_136389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACAACCACAGAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288345	287903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_287900_288300
856311	contig_4659_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_118213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATGCAAATTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552724	552192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_552200_552700
856312	contig_6433_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_162761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCCAGATAGCAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254173	254460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_254200_254500
856313	contig_15067_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_154343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTTATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204420	203935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_203900_204400
856314	contig_4769_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_118046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	3	608	1571903	1572508	NA	40	AAAAAAGTTCTGATTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVEAAVAALEGAVGAVDALVDPQGGLAGAGVAALRALLGVLRLVHAAVLPERGLAVAQEVAVRTLEVIPAVLDADVRLEVPLHGAADIAELTLERLLPRVHAHVPFQVRADFELGTTEPALEGGVPCQHKVSFDKNRQATTTADPPEAHTRKSLIPRQAGGGLLTSAPGRRKKNKTGRGFSSFPKLNHHRSYKTQKTKTGD	1571900	1572892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1571900_1572900
856315	contig_253_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_129718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	424	738	547659	547345	NA	10	CTGTCAGGTGGTGTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVQSSEPLAMTSSLWGHQSMSRTGPVCPHTVGEALSTRPVCRHGGDTQGKPKTPRLHPSQSLSLPPYGAGMTRLACPTGGCLKGHWTVIDCAPPACQVSRKRF	548082	547254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_547300_548100
856316	contig_2987_pilon	+	1038	4	Intergenic	novelGene_125846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACTGACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483985	489475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_484064_486394_486490_488192_488310_488727
856319	contig_16204_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_154498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGCAAAAAAGTGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269372	270119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_269400_270100
856320	contig_4087_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_156075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAACATGTATAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111889	113150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_111900_113200
856321	contig_5047_pilon	-	494	4	Intergenic	novelGene_158015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	45.0653845971483	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	65	493	1696071	1689143	FALSE	45	AAGCGAACATTTTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPSAEAQCPGGRSGDFLTALSMDGGDRSEGPAASPAGQAKTDARKKDDVLLLADETFDFDLSLSSSSANEDDEVFFGPAGHEDRRVAASVELNNPIPEEPLLAACGSRFPWSPLTGEKFAEVYKEAHLLALQIEGNSKNKATDAKKPGGPGDQDVEIFVQESKL	1696557	1689141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1689435_1689519_1689578_1695992_1696094_1696515
856322	contig_14744_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_65955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAATAACCTAGCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592098	591799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_591800_592100
856323	contig_7411_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_136982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCGCTGTTTAGTCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149617	150558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_149600_150600
856325	contig_5999_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_45623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGATTTTCTTTGTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134356	133327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_133300_134400
856326	contig_8683_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_150259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGACTCGCCGGCCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616031	614403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_614400_616000
856327	contig_1309_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_73977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	627	2	628	209432	210058	NA	60	AAAAAAAAAAGTCACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRAAPAANAGLWAGCRQQGARPCGENVPVTPAGVPRPREDDASAEGSQAVASAATADSGYPGSRVPAVADAPGKEKPVLGCEGLGAPRERREEKFASGNFGENESLRGVPGAAGSPLRCSAPRAPHGRDPTGGRRAADAGPGVQAEVAPRGRGKERPERPSLQRRGLRGLGGITAAKLGCGVRGAAAQGSGKITPEGVFSAPNRNLE	209430	210647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_209400_210600
856329	contig_8037_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_177828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATATTTAGAAGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84132	84617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8037_pilon_+_84100_84600
856332	contig_15888_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_84456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATTTCTCTATGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260956	260500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_260500_261000
856334	contig_5059_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_140729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGATATAAAAGTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259559	259165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_259200_259600
856335	contig_3241_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_146418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAACCAGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927999	927322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_927300_928000
856341	contig_17214_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_153473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGCTCAAAGAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85844	86310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_85800_86300
856342	contig_10951_pilon	-	624	3	Intergenic	novelGene_61615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	79	junction_2	80.5	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAGAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68475	50140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_50635_60377_60426_68393
856343	contig_9274_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_151166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGGCCAAGTAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627585	628611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_627600_628600
856344	contig_8377_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_35174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423131	424224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_423100_424200
856345	contig_8017_pilon	-	474	3	Intergenic	novelGene_65384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	4	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTCAGTTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1617573	1615685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1615915_1616894_1617074_1617507
856346	scaffold_13505_pilon	-	228	3	Intergenic	novelGene_111487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1613.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATCTTGGTCTGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541952	540194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540251_541284_541353_541848
856347	contig_12139_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_146463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATCTGGTCCCAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74358	73757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_73800_74400
856349	contig_18473_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_169646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGGTAAGGTGAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69115	69899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_69100_69900
856351	contig_8284_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_125658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183568	184073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_183600_184100
856352	contig_6496_pilon	-	397	2	Intergenic	novelGene_103496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGTCGTCTGGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535232	533712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_533905_535027
856353	contig_4580_pilon	+	1068	6	Intergenic	novelGene_173381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	26	junction_5	12.0598507453451	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	268	765	34697	125348	FALSE	10	TCCTTCGGGTTGATGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKSQTIPEDILGKIAVSVSTS	34429	125651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_+_34713_113935_114003_121140_121190_121902_122017_123902_124023_125216
856354	contig_8907_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_85832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGGATTCTTGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433706	433287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_433300_433700
856355	contig_3651_pilon	-	1680	11	Intergenic	novelGene_177829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.41774468787578	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	578	1381	96257	18360	FALSE	30	TAACTGCATGCCTACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVSPAKSTSQTFPRESSMLSTARSIQRATILGFSKKHSHLYLIQVIRSNNQTSLTEKSFDQFSKFHNQLQKQFASLTLPEFPHWWHLPFTNSDHKRFRDLNRYMQQILNGLDEVANSDRVISFFLADPVQQTVEESSFVNPGEKFADEKPKAQLVISYEDTKLTILVKHMKNIHLPDGSTPSAHVEFYLLPYPSEVRRRKTKSVPKSTNPTYNEIVVYNEVTELQGHVLMLIVKSKTTFVGAINIQLGSVLLNEEKWYPLGNSII	158210	18060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3651_pilon_-_18513_27263_27390_55540_55636_67871_67948_91878_91988_95514_95637_96134_96325_122900_123015_138364_138522_156031_156202_158141
856356	contig_9939_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_158597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	11.5	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	182	358	51693	55452	FALSE	40	TTCCAGCAAGTATTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSDPYVKFKIGGKEVFRSKIIHKTLNPVWEEKACILVDHLREPLYIKVFDYDFGLQDDFMGSAFLDLTQLELKRPIDVTLTLKDPHYPDHDLGIILLSVILTPKEGEPRDVVSHSTA	31479	56554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_31625_51656_51737_55319
856357	contig_8049_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_166869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACTAAAAAGTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274544	275298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_+_274500_275300
856358	contig_7119_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_41037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCAAGGCTGGGAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411774	411498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_411500_411800
856359	contig_5954_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_28798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAGAAACTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425932	1425458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1425500_1425900
856361	contig_8587_pilon	+	850	2	Intergenic	novelGene_159114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	79	387	137185	138033	FALSE	45	AAAAAAATTCTAGTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALDCWVFLSCLEVLQRIEGCCDRAQMDSNIAHTVGLWSYATEKLKSLGYLCGLASEKGPNSEDLKRTVDLLAGLGAERPETGTFQTVSGDVESDENVGCNPARFSDVLRTYSLFGRLYPLLANRVHI	137106	138496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_137239_137778
856362	contig_7707_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_72219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798666	799144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_798700_799100
856363	contig_15235_pilon	-	683	2	Intergenic	novelGene_177831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	5	682	17019	6046	FALSE	25	GTAAGTGTTGCTGGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAAPAFCNLRRSPNELPRDPSQEDEDCDSEDWVSDAGSFSSASSDYDDLKPDWLDSVQRNGELFYLELSEDEEESLLPETPPVNHVRFSEKEIIIEEDEYKEGKKYEPKLKRFTKILKSKRLLPKRYSKKNSNDTGPVSILKHQSNQKTGVIVQQRYKDVNVYINPKKLTVTKTKEHLKLLEVLVGIIHQTKWSWRRTGKQGGGERLVVHGLLPGGSAMKSGQILI	17023	6044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15235_pilon_-_6584_16879
856364	contig_665_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_158193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	119	511	105195	104803	NA	30	CCAAGAAGCACTCTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNRKRTWITRTLTRSWLCVRGRSTALEKKKEVFPYAVLLLLCHTHTHIQRIGGKGTARRLTGIWLLSDSLLEHTPHTPPDCTLLSVTRTTQPNILPVTGGYRLQNLYVSMTTIQPAKKGGICSVSEKTIP	105313	104802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_104800_105300
856365	contig_12923_pilon	-	598	2	Intergenic	novelGene_30155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTGCAACATTAAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250627	249236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_249804_250596
856366	contig_11816_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_98577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTAGCCTAAGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320629	1321468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1320600_1321500
856368	contig_3878_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_174804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAACCTAGAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613966	613045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_613000_614000
856369	contig_12485_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_147268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	8550	8197	NA	60	GTAAAAAAAGGAAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQRNCLNGNASVSSSYHTKAVEPRFNQWKDPSQPSNQHRTRASIHTFYKPARPSLACRSSSTSNCCTPVVQWLKHSAAIRKVDGSNPPAALREEDEAVCIHKDDSLGNTTGQFSSVL	8552	7548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_7500_8600
856370	contig_8260_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_163236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTTAATTAACAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99741	100461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_99700_100500
856371	contig_10864_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_107105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCGTTGCCATCGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026059	1025009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1025000_1026100
856373	contig_11258_pilon	-	549	3	Intergenic	novelGene_67854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.5	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	127	369	354760	352035	FALSE	50	CCTACAACAAAGAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFHQHQCQAHLQVPRLPQPQPKACLCRPRRWPRSLLSSIHFLLLVFLKVPLFLSMLSAVLWVNRPQRDPREGPYENQ	354886	351854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354745
856374	contig_5794_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_69744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAGAAACAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473953	474170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_474000_474200
856375	contig_10437_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_38186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCTTTGATGAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211643	212350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_211600_212400
856377	contig_1154_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_87202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAATCCAATTAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104553	1105312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1104600_1105300
856379	contig_6825_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_155120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGCCAAAGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38739	39775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_38700_39800
856380	contig_6048_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_73347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTTCTTTTCTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2933386	2933018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2933000_2933400
856382	contig_10734_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_51344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAACAGTTGGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1701323	1701714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1701300_1701700
856383	contig_3380_pilon	-	1110	1	Intergenic	novelGene_60086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAGAGATTTATTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188768	187658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_187700_188800
856384	contig_14814_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_137730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	549	890	341806	342147	NA	20	GCGTAACCACCAGCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLITLRVVQRAQRPSHQPVLVSPTVQLSPHPSSSDLQLNFYWRQLCVLPVVPLPPSFPYTPTATFTFCVCSCLSCPSPAPSTQLPSGWTHSTCCWDLVPRAHLSTTRGVCISW	341257	342532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_341300_342500
856385	contig_13697_pilon	-	764	6	Intergenic	novelGene_165951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	7.67854152818099	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	256	615	697723	695515	FALSE	20	CCTTCTCCTGAGCAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKYDIRDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAATLEDKVTDL	698061	695365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_695620_695705_695781_696978_697055_697172_697238_697684_697833_697915
856386	contig_11028_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_163964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTGGAATTGTTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922967	921729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_-_921700_923000
856387	contig_10196_pilon	-	1039	7	Intergenic	novelGene_132057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	3.80423740350444	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	118	789	664931	663367	FALSE	10	ACGCCGCTCCCAGCCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAAELRIGAFNIQSFGDRKVSDPARGRVIAQILAGYDIMLVQEVRDLDLSAVSALMEQINSVSEHKYSFVSSEPLGRDHYKEMYLFVYRDDAVVVVDTYHYPDPEDAFSREPFVVKFSAPGSAAEEFVLVPLHAAPHDAVAEIDALYDVYLDVIDKWGTDDILFLGDFNADCSYVRAQDWASIRLRSSEIFKWLIPDSVDTTVGNSDCAYDRIVACGARLRRSLKPQSAAVDDFQGEFGLDQGQALTISDHFPVEVTLKSS	665183	663116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_663421_663835_664088_664232_664346_664497_664599_664678_664763_664863_664953_665087
856388	contig_9870_pilon	-	963	6	Intergenic	novelGene_177576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	9.32952303175248	156	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	26	706	27802	7226	FALSE	35	CTATCTGTATAAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQTVTYSELNLAKKPKRQQIKPKDADSSFSVTEREITYVELNFHNASQDLQKKDTNSHCKGKLIAGTLGLICLILMAGVITMTVTVITPSIGMMDENRTQKANHCHRCPEDWFSYSNHCYYISSDIKNWTESRMACVSKKSNLFYMDNEEEMMFMKILSSSSWIGLSRESSNYSWFWINGSPSNQTITEPSNPRYNCVMVFESSLQSASCGDEKIYICKHEILS	27827	6968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9870_pilon_-_7344_7658_7760_25359_25512_26470_26507_27088_27176_27615
856389	contig_11850_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_125182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGACTGATGAGGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111672	111053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_111100_111700
856390	contig_4989_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_160782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCTTCATCACAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83771	84373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_+_83800_84400
856391	contig_6440_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_161674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTTACCAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62738	63388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_62700_63400
856397	contig_8412_pilon	+	1159	7	Intergenic	novelGene_118393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.6573417452361	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	197	832	686772	694544	FALSE	35	GAGATGACAATGACCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLHRMGPNLQLIEGDAKQLAGMITFTCNLAENVSSKVRQLDLAKNRLYQAIQRADDILDLKFCMDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEVHSLSLF	684944	694871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685081_686711_686795_687497_687613_689265_689441_690471_690666_692513_692620_694521
856399	contig_8464_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_125390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTAACCATTTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848970	848488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_848500_849000
856403	contig_14508_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_79057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTTCATGGGAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83556	84141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_83600_84100
856404	contig_6047_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_24230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAAGTTGCTGGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173410	174384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_173400_174400
856405	contig_19143_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_177832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGTTTCTCCCTTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9564	8714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19143_pilon_-_8700_9600
856406	contig_10732_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_114667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGCGTGAGACACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32772	31987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_32000_32800
856408	contig_11932_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_85437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507307	506950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_507000_507300
856410	contig_13982_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_163489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATACTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399378	399834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_399400_399800
856411	contig_9363_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_6539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGGGGAAAACATTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661119	660590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_660600_661100
856412	contig_16846_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_82849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAATGGATGCTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60383	60100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_60100_60400
856413	contig_13481_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_119416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAGCAACAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727424	728145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_727400_728100
856414	contig_3380_pilon	-	1012	8	Intergenic	novelGene_60130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	93.5457980164294	47	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	26	1012	509820	467996	FALSE	20	GAAGGCGGTGGAAGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGPEAGPEPTMEGDVLDTLEALGYKGPLLEEQALIQAAESGLSSPEFSELCIWLGSQIKSLCNLEESITSAGRDDLESFQLEISGFLKEMACPYSALISGDIKDRLQKKDDCLKLLLFLSTELQALQILQNKKSKNSQLDKKSEIYQEVQAICDTLAIPKSTTSDIPLLLSQVESKVKVILSKVQKNHVGKPLLKIDLNPEQAKQLERINDALSCEYECRRRMLMKRLDVTVQSFGWSDRAKVKTDDIARIYQPKRYALSPKTTITLAHLLAAREDLSKIIRTSSGTSREKTACAINKVLMGRVPDRGGRPNEIEPPPPEMPPWQKRQ	509845	467995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_468086_472585_472754_477182_477300_477891_477973_490121_490301_492650_492786_493942_494089_509749
856416	contig_10958_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_5390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTAGTAAATGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878704	878216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_878200_878700
856418	contig_10734_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_51072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGGGATTGGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466026	467271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_466000_467300
856420	contig_10143_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_163329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66766	67209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_66800_67200
856421	contig_4732_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_75413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	177	344	577141	576974	NA	30	GCCAGACCTCCCAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSERQSRGNSNLTLLPPRLFHDSPWLFSVPLKPHKPPSPPPTVFLVPRTLRATGTLHMLVPLQRRGALFPHISLPASPSLTSQNQLPLSQFRLSVTPLCVRVQLRSTVFSRL	577317	576780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_576800_577300
856424	contig_10811_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_165806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGACTAAAGTTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404990	406533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_405000_406500
856425	contig_11846_pilon	-	1134	3	Intergenic	novelGene_105988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGGAAGAAAGAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419738	356721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_356764_418540_418713_418818
856426	contig_12327_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_140640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAGAAAGTATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175742	175502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_175500_175700
856427	contig_1090_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_131155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAACAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550011	550277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_550000_550300
856428	contig_5753_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_174317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174097	174413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_174100_174400
856429	contig_7009_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_23587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTGTATTTGTGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306431	307794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_306400_307800
856431	contig_3077_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_26913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGGTCGGCGATTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1884101	1884928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1884100_1884900
856433	contig_2933_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_111305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCCCTATAAAAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253143	252335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_252300_253100
856434	contig_3111_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_129972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGTAAGGGTTAGATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59911	60995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_59900_61000
856435	scaffold_7386_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_136577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	2	418	280623	281039	NA	25	CACAACCGCCATGTCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASSVESAPWGAPEWSPEHACLSQDAWLPVLPGPRLPTWCVWFIYLPGTRFLPLRQGGLLWGPEGTVPIEGAKGRFSLSCRLPRPERWRHKAVPWGVFAVLFAQAASSRWFGTTLLPLGVALSLRVLLPPWPREPRVQ	280621	281569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_280600_281600
856437	contig_7035_pilon	+	235	1	Intergenic	novelGene_83554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGGCCTTGTTTGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880299	880534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_880300_880500
856438	contig_5105_pilon	+	813	6	Intergenic	novelGene_168911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	26.7312551145658	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	295	642	497861	502857	FALSE	30	AATACCGGAACTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWFQGNRIQLARYSFGILLRNLSASKTTLPVLTLFTKDPCPLCDEAKEVLKPYNNRFILQEVDITLPENAAWYERYKFDIPVLHLNGQFLMMHRVNISKLEKQLLKLEQQGAGG	479808	503028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_+_479839_491735_491832_492297_492459_497853_497975_501949_502007_502680
856441	contig_11370_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_98776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1	504	292800	293303	NA	10	GTCTTTTTGTGGATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPSPWQQEREQARVPSRGSGAEQEPDPTPQRPGAGRRTAPDLTSAGFSSILVPPPLPSARPASRCAVFGRDPPLPCGARGRLDTSSWLLSAGLFVCPVPSVRGRPAAALWALGAAHIPPLGRRPPGPFLPACAAWTPAGRASATGICRLPSWAGYELPGAWPSQRL	292799	293643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_292800_293600
856442	scaffold_19766_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_34263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCGGTTACATTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181605	182382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_181600_182400
856444	contig_16643_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_158102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACTCTAAGTCGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9053	8594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_8600_9100
856445	contig_8576_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_88728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATACAAAAATAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607062	607934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_607100_607900
856446	contig_11720_pilon	+	523	2	Intergenic	novelGene_43919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	64	357	239233	239744	FALSE	10	TCTTCCTGGCCAGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSDEIEPPPVFEKKPLAWEEDMELYSKFMDRKEELRLSHNSYMLHHPEAHALISDFLLFLLLRQPADVVTFAAEYFGPFSVRRQPTPALPSSNRPSPFRSLAPEPSSSCGFTPASGEG	239169	239910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_239266_239483
856448	contig_19974_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_130456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAGAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96746	96161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_96200_96700
856450	contig_14954_pilon	+	959	5	Intergenic	novelGene_165166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	1.4790199457749	42	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	521	748	53177	53494	FALSE	25	AGCTGAGTCTGCTTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTKDHEKENLRRIKEIQRRFWEQERSREQCQPRPLKALWRSPKYDKVESRVKAQLQEPGPASGTEHAHFLRAHSRCGPGLPPPRPQLIPPDPSAKGPGLGVDFISHNARTAKRAPRRHSCSLQVLAQVLEQQRQAQEHYNATQKGHVPHYLLERRDLWRREAEARQHSQPDPAMPPGHTRMPENQRLETLSSLLQSQSQLLRELVLLPAGADSLRAQGHRAELDQKLVQVEEAIRIFSRPKVFVKMDA	51495	53705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_51665_52620_52738_52842_53007_53106_53244_53333
856451	contig_7165_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_116817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGGAAGAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164018	163549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_163500_164000
856452	contig_10404_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_138693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGAACTTTGGCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128496	1129435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1128500_1129400
856454	contig_10143_pilon	+	620	2	Intergenic	novelGene_163327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48394	50893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_48793_50671
856457	contig_4413_pilon	+	531	4	Intergenic	novelGene_116982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	112.902120834327	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATGAGAATGTATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125869	142690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_126084_131813_131906_139572_139682_142574
856458	contig_9935_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_164851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	273	31	303	6268	5717	FALSE	30	ATAGCAATCCTCCCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASERVTINCKSSQSVSSYLHWYQQKPGQAPKLLIYKATNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDAAVYYCQQD	6298	5715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_5941_6219
856459	contig_15410_pilon	-	740	8	Intergenic	novelGene_130586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.4914544161358	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	10	597	57724	55163	TRUE	15	TGAGTACACCCTGCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWTMTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISAVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRGSVTSAPAWRSNCWFSLDTSVGVCSLTWQAQSLALHLLRLPSMHIRVMWPACP	57733	54854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54984_55148_55248_55358_55436_56124_56207_56333_56443_57295_57401_57488_57564_57669
856463	contig_9011_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_159304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAAAACAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450397	449214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_449200_450400
856464	contig_12644_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_44536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447848	1448624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1447800_1448600
856465	contig_5039_pilon	-	1168	2	Intergenic	novelGene_64904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	101	439	628705	628367	TRUE	20	CCAGACTCTGCAGTCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALLLLQQLKTKVNQTKNCQGKGRKASFTFTGRTSSAPNAKSHLVYLQVSWKGAGLHSPGSSCSFCELSVLALGLTAGRVRANGKSDRVSFRLPEARADMETGWQGRQWKV	628805	627559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_627997_628074
856466	contig_10734_pilon	-	518	2	Intergenic	novelGene_51062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	149	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCAAGGGAAGCAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437067	435220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_435652_436980
856467	contig_12775_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_172289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACATTCACTTGTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20052	20461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12775_pilon_+_20100_20500
856468	contig_6266_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_170989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444153	443748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_443700_444200
856469	contig_5361_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_167211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464595	463678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_463700_464600
856472	contig_1244_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_37939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGGCCCTGAGAGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756586	758090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_756600_758100
856474	contig_14814_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_137750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGGCCCCTCGAGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400562	399844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_399800_400600
856475	contig_5260_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_144401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTAGAGAGAAATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459313	458834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_458800_459300
856477	contig_5018_pilon	+	437	2	Intergenic	novelGene_47011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGTTAATCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257892	1260209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1258015_1259894
856480	contig_10958_pilon	-	554	3	Intergenic	novelGene_5358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	32	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	104	355	802556	796257	FALSE	0	CTCCCCTTTGTGCCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPEGLWLRLQTAETPARSKRRGYSEAFPEVPSAMALRSRFWALSVCRNPEFGFAALSTSSKSAVKPEVANEAVASEFTNRNPRNLELLAVARKERGWGTVWPSREFWHRSNDYKVL	802659	796057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_796282_802040_802219_802507
856482	contig_8475_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_171103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGTTTAATTATGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91512	90745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_-_90700_91500
856484	contig_10864_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_107121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	647	991	1154740	1154396	NA	60	TTATAATAATGAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNKAMNHGTLGKPNFKYHCHETFLDKLKKNKPLRTYQSRDLVTRLLRHLPSEGHINLVSTPYNAIDKQSQIRYCPQSCFTVFIQPRHFLCGCLCHRGLASFERTILYVSSFR	1155386	1153777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1153800_1155400
856485	contig_5916_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_158033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAAAAAAAGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298283	297535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_297500_298300
856486	contig_4114_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_15635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAATCACGGATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500195	499508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_499500_500200
856488	contig_6576_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_42451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACTCTGTAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314205	1315122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1314200_1315100
856489	contig_1007_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_176054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTTGCTACGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296732	296290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1007_pilon_-_296300_296700
856490	contig_5200_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_140162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGAATGAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339875	339012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_339000_339900
856491	contig_7057_pilon	+	308	3	Intergenic	novelGene_123323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	66	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCGTGGCATCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936074	943713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936145_936966_937024_943532
856492	contig_16685_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_115061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGAAACTGCTTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612518	612155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_612200_612500
856493	contig_8258_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_130445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	168	308	38063	37923	NA	50	GGTATCCAGACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAKFHIQPGYGKVLYADWERQCTPSVISLFQNIFPDFLLSQQLQTLSFYVLSVRMHPSESAECLQAKGWKLTNLILCTNVIHHNNRIIKTKITQSSQYMH	38230	37686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_-_37700_38200
856499	contig_14441_pilon	+	515	3	Intergenic	novelGene_100791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	142	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	281	310	126274	126535	FALSE	0	GCCTGGCCGTGTGTCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVVWGRAGESRTGGTGRPGLARAVAWASVACRQPGFVLLGKGSLSAIPPSLSDCGLSSVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKDS	125872	126740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_126055_126175_126283_126514
856500	contig_1472_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_86129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCAGCTTCAGGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561488	561719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_561500_561700
856502	contig_8461_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_163937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGAAGTGGCTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518659	517456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_517500_518700
856503	contig_14202_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_157128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACCTCGCAGTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61078	62196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_61100_62200
856504	contig_6069_pilon	-	786	7	Intergenic	novelGene_8053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	6.10100173924104	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	25	786	399437	389397	FALSE	35	GAACAGGAGAAGCTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGDPPDNMKNFWRFLFRKNLPPTSLCQMDFAVLGLGDSSYTKFNFVAKKLHRRLLQLGGCALLPACLGDDQHELGPDAAIDPWLHDLWGKVLGLYPVSPGLSMIPPGVSLPSKFTLQFLQEVSRTEEWCGPTTDPQGPPSELQPFLAPMVSNQRVTGPSHFQDVRLIEFDIAGSGISFAAGDVVLIQPENSASHVQQFCQVLGLDPDWCFTLQPREPDVCCPARLPQPCSVHHLVSRYLDITSVPRRSFFELLAGLSPDEL	399461	389396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_389528_389647_389770_390885_391090_391190_391293_391374_391474_394141_394240_399431
856506	contig_10063_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_127741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAAGGGAACTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385708	386232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_385700_386200
856507	contig_19330_pilon	-	775	2	Intergenic	novelGene_163689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTACTTGTCTCTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32852	12272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_12835_32639
856508	contig_4136_pilon	+	967	2	Intergenic	novelGene_161249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGTAAGTTATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135093	143259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_135904_143102
856509	contig_5935_pilon	+	518	4	Intergenic	novelGene_102727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	44.8998886412873	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	1105434	1116002	FALSE	35	TAAATTATATTTCATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPQDAEAQLNSESGPGAETSTAVEKKEKPLPRLNIHSGFWILTSIAVTYYVDFFKTIKENIHTSSWFLFGGALLLVSLSVAFYCIIYLEWYCGVEDYDAKHPSLIPITTATFIAAGI	1105431	1116161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1105489_1107351_1107494_1111358_1111518_1116001
856510	contig_10432_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_171315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATAATGAGGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197140	198142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_+_197100_198100
856511	contig_6576_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_42356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCTGCCCAAGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762152	762990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_762200_763000
856512	contig_8652_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_168784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTATCAGTCTCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487923	488670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_+_487900_488700
856513	contig_7057_pilon	-	300	2	Intergenic	novelGene_123228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	168	133	300	537144	536977	FALSE	10	GCTAGCCTGTGGGCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPRGQPGYPESGLILSLSDSRPQGPIPATVPEKGIDGVPQTTGMAAFETLAPLPSTLDRHSSWSDPSSKLRSLPTPIFPRLRNSTMKSVGHRELIKYVF	537491	536976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537430
856514	contig_6589_pilon	-	293	3	Intergenic	novelGene_25884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCTAAACGAATGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085844	1082568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1082643_1083276_1083352_1085700
856515	contig_6589_pilon	-	634	5	Intergenic	novelGene_25883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	91	531	1081525	1080293	FALSE	20	CCAAGTGTCTGACTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLIWCNNCEKEVHACRKSKDCGERQVEVQQMQDMILDCELNWHRASQGLTDYSFYRVWENKTETLVSKGKDPILAKPMVGPEDAGTYRCELGTVNNSPATIIHFHVKVLPKTIQEETMPLTITAPGVITTVLHQAPNTDKMLKRHLIWLLISGVAVVTAGIATVIFFLRPRKDPES	1081786	1080189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1080333_1080605_1080775_1081036_1081191_1081447_1081549_1081719
856516	contig_5959_pilon	-	258	2	Intergenic	novelGene_150224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGCCATTGAGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515348	511372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_511431_515148
856517	contig_10258_pilon	-	731	1	Intergenic	novelGene_155044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATCACCTAAAAAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64918	64187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_-_64200_64900
856520	contig_12915_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_148358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGCACTTCTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163138	161982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_162000_163100
856524	contig_19606_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_148280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTGAAAAAATCCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68976	69416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_69000_69400
856525	contig_12125_pilon	+	319	2	Intergenic	novelGene_76233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAACGAACCAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386240	386709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_386350_386499
856526	contig_5832_pilon	-	1159	4	Intergenic	novelGene_134134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	295	603	208591	205043	FALSE	75	AAACTTAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARTSLIFMSARSLFSGKSRRPPGSLSLKYVHSERKVSCRDCLCSCSVTFFIMMKRWFRRVCRSGKKMAAPLRRVFLTSCFNISMGTESPLTLSTTSHKCV	208885	204486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_205062_205678_205813_207444_207515_208505
856527	contig_14682_pilon	+	682	5	Intergenic	novelGene_139126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	400	junction_4	88.9901679962455	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	264	674	142535	158811	FALSE	70	ATCAAAAAAAAAAAGACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNMINTVKGKALEVAEYLTPVLKESKFKETGVITPEEFVAAGDHLVHHCPTWQWASGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGKRRPEWHIFCLNCFKLFYNVF	142271	158819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_151306_151357_157167_157239_158635
856528	contig_7207_pilon	+	959	3	Intergenic	novelGene_72036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAGTTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296378	356008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_296502_326065_326148_355254
856529	contig_12046_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_83464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	246810	246490	NA	55	CAGAAAAGAAGGGAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIADLGRSHCSLRRYDFGHQCGYRQSAAVGARKQVFALCDGEFSLTQSICPCPQIPSPTHSFRTVLYAPCFTPFFSALLSHPPSGFSHNPLARPLHLSPYCPDLTS	246812	245812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_245800_246800
856530	contig_13300_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_125822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270461	270684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_270500_270700
856533	contig_2480_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_63525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACTTTTTATCCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246460	246929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_246500_246900
856534	contig_12429_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_136213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	7	372	296148	296513	NA	35	GTACATGTTATGCTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMAVSTGRFPVQLFLSDPALPVPPATRGQALTVWEKAECARSDTAPSRAKPKAGESGRDGTGAGAEGPGCRQEAAAGRVRVSASRLAGLGRGHTRRVGLARVSVLAAAGLTFERKEVREEGE	296141	296690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_296100_296700
856536	contig_10371_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_175465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28326	28029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_28000_28300
856537	contig_5253_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_61557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182743	183739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_182700_183700
856538	contig_253_pilon	+	742	4	Intergenic	novelGene_129736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	11.1455023315337	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	202	537	623817	624522	FALSE	20	TGACCTTCAGTCCCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCYGPTSETPASSAASGICIPFEAPPRTSCPGPPALDNPAAIKNFRRDGRANCCPQLSLLWRNMWQEESHRESPAPPSTIRLQEPPLRVCAEEAAPLLDGEWSLRTRTWP	623264	624727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_623304_623482_623579_623750_623863_624232
856539	contig_9304_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_177840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGCAGGAGCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21566	21017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_-_21000_21600
856540	contig_9304_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_177839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTCAAAGGGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20913	20288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_-_20300_20900
856542	contig_10319_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_147246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTCTCCTTGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96644	97277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_96600_97300
856543	contig_3942_pilon	-	378	4	Intergenic	novelGene_128733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	7.31816613336672	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	15	377	745337	721350	FALSE	25	CCACTGACGACTCCTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKESRSYGLSCGRLGDGSRVSVFHVKLTDSALRAFESYRASQDSVSLRPSIRFQGSQGHICVPQPDCPSEARTFSFYLSNIGRDSPQGSFDCVQQYQSSPGDVHLDCLGSIQDKITVC	745351	721348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_721408_721680_721803_724726_724775_745202
856544	contig_2069_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_23340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	549	261	809	613523	612975	NA	25	GCCTGGCTCTCCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEPWGQPALSPSSHACQRPLECHILSQASLPRAAICSWTQRELSPLAPGWFQVGSLSPGALRGTLQAVIGFPSSACSFVTATRSDAGHTIKACSVPPAPILAKLPVPGLSVASPRADAIGEEGQEELCRVSRAMQEACDLCPWWKDCALGSAAWHSWILGPPPDQQEKTNKSASKGELAPVS	613783	612973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_613000_613800
856545	contig_9471_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_21751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTCTTGGTGTAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320140	319071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_319100_320100
856546	contig_7057_pilon	-	780	2	Intergenic	novelGene_123185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCACCCCGATGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240857	239980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_240438_240534
856551	contig_17833_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_174606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAGCTCTATCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203899	203173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_203200_203900
856556	contig_6266_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_171000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAGGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800528	801328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_800500_801300
856557	contig_12021_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_172183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAAAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36212	35546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_35500_36200
856558	contig_12031_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_137558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACCTAATCACTGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233214	234013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_233200_234000
856560	contig_15360_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_171261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGGGTCAGAGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202369	203567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_+_202400_203600
856561	contig_13460_pilon	-	919	5	Intergenic	novelGene_162182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCGCGGGCCAAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200745	170021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_170232_174670_174907_181702_181842_190321_190486_200575
856562	contig_12540_pilon	+	980	7	Intergenic	novelGene_148129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	10.6366765904059	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	5	757	1267904	1281934	FALSE	25	TAAAGCTCAGTTTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDRLFRHLRGSPSGARLRREVYSFGEMPWDPELMQTCYREARRKQERLQKLATPFGFLGTRSLVFRVQDLTQQLMADAATTFLQLADQCLTAALDCQQAAKQLEKVRGRVLKKFESDCGSAKRQFVREWLVRIFLPFVLGQLEPGRKLELPEDEENILSGCGQALTIEGIYEDVVRGVLLQRIDQELKKALGASDVSCTPDGFLDAPWDQDGADEETETQRGGWTYPRQPCSSTEVQPLCPLPPERTFRS	1267899	1282157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1267964_1270302_1270462_1271632_1271750_1271826_1271935_1276447_1276560_1280435_1280520_1281821
856565	contig_10437_pilon	-	943	5	Intergenic	novelGene_38508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.6583123951777	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAAATAGATAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349481	1316539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1316881_1317133_1317389_1318762_1318845_1344666_1344757_1349306
856566	contig_9014_pilon	-	604	4	Intergenic	novelGene_106784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.3551211587844	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	29	481	149986	147381	FALSE	15	ACCTCAGTATTTGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPGGVAEAMAIFSVYVVNKAGGLIYQLDSYAPRAEAEKTFSYPLDLLLKLHDERVLVAFGQRDGIRVGHAVLAINGMDVNGKYTADGKEVLEYLGNPANFPVSIRFGRPRLTSNEKLMLASMFHSLFAIGSQLSPEQGSSGIEMLETDTFKLHCFQTY	150014	147257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_147386_148883_148982_149517_149693_149811
856567	contig_6589_pilon	-	665	6	Intergenic	novelGene_25880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.24961536185438	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	470	661	978475	977359	FALSE	15	CCCCATCGAGGATTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAPRPVVNVSGGPLLYSHRLSELRLLFGARDGAGSEHQINHQGFSAEVQLIHFNQELYGNLSAATRGPNGLAILSLFVNVAGSSNPFLSRILNRDTITRISYKNDAYFLQDLSLELLFPESFGFITYQGSLSTPPCSETVTWILIDRALNITSLQMHSLRLLSQNPPSQIFQSLSGNGRPLQPLAHRALRGNRDPRHPESRCRGPNYRLHVDGGPHGR	979633	977354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_977385_978309_978476_978690_978846_978930_979004_979166_979263_979488
856568	contig_7318_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_152237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTGGGGATCAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343234	344573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_343200_344600
856569	contig_17074_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_145146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCTTAAAATTCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240413	240856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_240400_240900
856570	contig_12638_pilon	-	1334	8	Intergenic	novelGene_33212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_7	47.942993359248	31	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	193	1161	398353	391633	FALSE	20	TCGCTACCATATCCCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGGPGLNNMKPQSLQLVLEGQVLALQQQMAENQAASWRKLKSSQEAQQRQASLVRKLQAKVLQYRNWCQELEKRLEATGGPIPQRWESMEESNLEQLLIRLEDEQQRCENLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEKLTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWRQVVTFRRHFLEMKSATDRDLTELKAEHMRLSGSLLTSCLRLTMGTQSRESDGSGRLDGSEPAQLLLLLAKTQELEKEAHEKSQELIHLKSQGDLEKAELQDRVTELSALLTQSQKQNEEYEKMVKALRETMEILVHAHLF	407138	391459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_391751_393392_393645_394148_394256_395974_396141_396367_396451_397599_397657_398167_398455_407047
856571	contig_4832_pilon	+	1280	1	Intergenic	novelGene_163396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGTCCCATTTCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249567	250847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_249600_250800
856572	contig_9433_pilon	+	464	3	Intergenic	novelGene_168509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAAATTGGCATCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21081	146577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9433_pilon_+_21140_33508_33672_146334
856573	contig_13823_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_145238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCCGAGCATTGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57104	56141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_56100_57100
856575	contig_14744_pilon	+	893	1	Intergenic	novelGene_65923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGCTTCGTTAGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138461	139354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_138500_139400
856576	contig_2069_pilon	-	998	2	Intergenic	novelGene_23403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAAACTCATTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235216	1233917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234884_1235184
856577	contig_5744_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_149343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTTCAACAGATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642509	642154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642200_642500
856580	contig_5222_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_58970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19664	18914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_18900_19700
856581	contig_18081_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_23832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACGTAACCCTCTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421250	421648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_421200_421600
856582	contig_3004_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_127544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATTTTTAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797786	797438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_797400_797800
856583	contig_8942_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_143198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCTCACTGTTACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341438	342200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_341400_342200
856584	contig_12630_pilon	-	990	2	Intergenic	novelGene_173060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGTGATAAGAATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23165	21746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_22367_22795
856585	contig_7730_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_156283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACACAAAACCTCGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355760	356298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_355800_356300
856587	contig_5153_pilon	-	1084	2	Intergenic	novelGene_74348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGTAAGTAAGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760777	759561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_759990_760121
856588	contig_10040_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_176493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGAATTTCTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95325	95636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10040_pilon_+_95300_95600
856589	contig_6084_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_127034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	276	653	258833	258456	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTINSAFSKFQIIALAESLRDGIRIRGCEHKPKACDPCGQTASRKACGKGVWTLGLDTPILENSLSVRKRGGTGSLQGLSRIRGGAGSAPEIIHVSVLQGAPVAAGQETRRPWRLCRTGPNHWPP	259108	258195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_258200_259100
856590	contig_11493_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_143662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTCTTCAAAGAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129462	130062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_129500_130100
856591	contig_9720_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_116770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGCATTTTGTGATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209312	208312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_208300_209300
856593	contig_2770_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_107508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCTCCTGAGCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837700	837069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_837100_837700
856595	contig_10642_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_78759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTCTTTAATCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485875	1486344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1485900_1486300
856596	contig_302_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_145008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCAGAAATATGTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37334	37979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_37300_38000
856597	contig_2703_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_101655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAACTTTGAAGAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1371	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1400_1700
856598	contig_6589_pilon	+	276	2	Intergenic	novelGene_26073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCAGGTGAGAGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1854171	1854731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1854257_1854540
856599	contig_6589_pilon	+	585	3	Intergenic	novelGene_26074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	0.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	142	474	1863894	1865094	FALSE	10	CTAACCCTGGCTGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAGLQGPVLRLREPLGVLAIVCPDEWPLLAFVSLLAAALAYGNTLVMVPSGACPLPALEVCQDMATLFPAGLVNVVTGDRDHLTRCLVLHQDIQALWYFGSAQGSQFVEWASAGNLKSVWVNGGCRRAWDQEAEGAGPEFRLRAARTKALWLPMGD	1863752	1865205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1863942_1864268_1864392_1864932
856600	contig_10323_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_123631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTTATATACCACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500727	500442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_500400_500700
856602	contig_366_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_51611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068939	1069798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1068900_1069800
856604	contig_16883_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_161732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	189	986	279135	278338	FALSE	25	GAGAGCCCATAATTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSHLSNIDVLNQVIRERETKLPKPQLEQPYSDRWYEILQFCWLSPDKRPAAEDVHRLLTYLRMQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDTSNNAAFPILDHFTRDRLGREMEEILTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRVNPDEALSYTSIFFPMEVFESSLSDPGPGKQDESAQEVPLGAPGVVPVFDAHNLSVGSDYYIQLEEKGGSNSELDCPMALLTTEMAAHPERMSDEASQFVTLRNVEFEESSTEEDFFQTSTDPKDSSIPEDLHVTSGPESPFNNIFNDLDKSEDLPGHQKIFDVMELNGVQADFKPATLSSSLDEP	280740	278336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_279221_280637
856605	contig_10196_pilon	+	768	2	Intergenic	novelGene_132287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTGCCTGGGGGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2266676	2267968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2266737_2267260
856606	contig_5620_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_161356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCCCTCATATGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403227	402459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_402500_403200
856608	contig_8712_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_58860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAATAAAATGTTAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785532	784602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_784600_785500
856609	contig_2793_pilon	+	626	4	Intergenic	novelGene_142873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.24721912892465	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	29	568	276057	289385	FALSE	30	AGACTGAGATGTTCATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLRIQPTVMASVRLSYREDLQMDWDGRGRLLVKLSPVYAGKTCGLCGNYNGNKGDDFLTPSGLEEPLVEDFGNSWKLHGDCQDLQKQDSDPCNLNPRLTKFAEEACAVLTSSKFEACHHAVSLQPYLQNCHYDVCSCSDGRDCLCNAVASYASACAQKGVSIAWREPSFCGRHDLDSLKAGTKSHHH	276028	289443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_+_276132_285796_285993_286658_286875_289332
856610	contig_12402_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_133359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGAATATACATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503775	504460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_503800_504500
856611	contig_11829_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_128144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGGAAAGAGCAACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186786	187247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_186800_187200
856615	contig_10011_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_68069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAAGTGAGTCTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243805	244245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_243800_244200
856616	contig_829_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_168928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGAAGCACCGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180163	179609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_179600_180200
856617	contig_15706_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_172036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7288	7634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_7300_7600
856618	contig_7066_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_42109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCTGTGGAATGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540495	539903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_539900_540500
856620	contig_1996_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_131879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGGCCGTGGTCACCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147197	147673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_147200_147700
856622	contig_16633_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_165077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGCTCTGGGGATAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92569	93036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_92600_93000
856624	contig_14151_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_171840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTAAAAGGATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163577	164356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_163600_164400
856625	contig_500_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_30941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTGAAGCTGTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1223049	1222507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1222500_1223000
856626	contig_3948_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_53350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCCCCACCGAAAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509776	1510355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1509800_1510400
856627	contig_7342_pilon	-	449	3	Intergenic	novelGene_71163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	111	338	448	429221	429111	FALSE	20	AAGGGCAGCTGCCGCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THIQISFIFSHISAHPGAGASHLGLHEHFPALQLAHLDQGSSCAHAHAGGGAHAVAVHACPQGQASGAASDEIVQGVVGLLPDLGADTGRDTKYGTNGGCGAADTGAGIGLAMALGAVRDVPVPLKQQPRHDHQPRIRHRSPDRPAPRA	436519	429109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_429260_434769_434895_436345
856628	contig_9014_pilon	-	719	4	Intergenic	novelGene_106818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTCCCTTCCTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245390	228233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_228556_234865_234922_243771_243878_245155
856630	contig_10013_pilon	-	606	5	Intergenic	novelGene_125073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	74.3824576093046	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	177	605	460871	458600	FALSE	20	CCGACCAGCTGGGCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLWLDYCQFLMDQGRVTHTRRTFDRALRALPITQHSRIWPLYLRFLRSHPLPETAVRGYRRFLKLSPESAEEYIEYLKSSDRLDEAAQRLATVVNDERFVSKAGKSNYQLWHELCDLISQNPDKVQSLNVDAIIRGGLTRF	462947	458598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_458696_458782_458918_460673_460872_461173_461298_462895
856631	contig_14450_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_49047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCCATGTAATCAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329078	1327245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1327200_1329100
856632	contig_19957_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_57697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGAGGGGGGATGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124947	125778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_124900_125800
856633	contig_2703_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_101831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATGTAGAACATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240010	1240338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1240000_1240300
856634	contig_11370_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_98702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGAGCTTGTGACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79452	79224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_79200_79500
856635	contig_3424_pilon	-	477	4	Intergenic	novelGene_55576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGACGCTGCGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108967	1087736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1087813_1088115_1088291_1089244_1089342_1108838
856636	contig_5899_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_146994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGATGAAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537402	536484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_536500_537400
856638	contig_5047_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_157981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	430	792	845440	845802	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKSVQLLTERLVVQTHQLLRRRKPLAICSCKDSSLKTPGGQFYSVTHGVAMGQNPLDSIQQRQQGAGGRSGLPHGSSPGAALQPQHHAQDLQPSRNNLQASLFLLASPPVSPRAQLTNL	845010	846190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_845000_846200
856639	contig_8295_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_176350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGGGGGTAAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832180	832629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8295_pilon_+_832200_832600
856640	contig_7272_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_25326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCCTCCTTGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551035	551624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_551000_551600
856641	contig_18113_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_137552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGCTCTAGGAACAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271621	272962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_271600_273000
856644	contig_11548_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_66801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169954	170855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_170000_170900
856645	contig_5959_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_150237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	654846	654487	NA	70	AAGATAGAAAGGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYRETDLEDSLKTQRPSETEWTYNQQRSLSRHVRKLGWNSLLTTPPGTPGCPQRKAFSRAAAAARSGEGPRCACARVRGWSGEPAPGSATDPGEPAPRDSRDLGPGRVIGRKQSVDSVG	654847	653567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_653600_654800
856646	contig_7345_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_159181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209905	208881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_208900_209900
856650	contig_13823_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_145243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGTATCCCATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70197	70769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_70200_70800
856653	contig_19469_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_135009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	587	889	366166	365864	NA	60	CAATCCTATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTILQSCFSSPGHAPDLQTPRASWTLPFWITHRYLVLNMSKIEVIMSSNICFLESCFLGLASPSSPCYTSQFEIRLILQLKRFIEIVSFSSPPCYFLVL	366752	365808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_365800_366800
856654	contig_3975_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_54711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	117	509	1401705	1402097	NA	15	GAGTGTCTCCCATTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTKGVFPASPCSQFLLCVHLCPFFKARCTWAVSFHLAGQSLSVVTGAHNNFVTPTLLFPLLQLGKLRSEGLSLPLGYVASNWQSGDLILHLSVSKAPTLSAAIFCPRLDFSPTLACFVGCIWCWRCRE	1401588	1402706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1401600_1402700
856655	contig_16740_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_116996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGTTACTGTTTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26586	25869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16740_pilon_-_25900_26600
856656	contig_20365_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_85322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTCAGCTTGAGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22175	22529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_22200_22500
856658	contig_10811_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_165793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTCCTCTAGACAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320892	319536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_319500_320900
856659	contig_19628_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_166568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAACAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8253	8962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_8300_9000
856660	contig_13542_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_131530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505404	504376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_504400_505400
856661	scaffold_16539_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_68373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGTTTCCCTCCCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540109	540603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_540100_540600
856663	contig_10855_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_124395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGAATATGTTCATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016185	1016378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_1016200_1016400
856664	contig_10003_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_88240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACCCCAAAAACATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669802	670840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_669800_670800
856665	contig_12107_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_176737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAACATGTTCCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37375	36923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_36900_37400
856666	contig_10327_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_177841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCAATGAGTAGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5799	6227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10327_pilon_+_5800_6200
856667	contig_18919_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_156020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGGTAGTGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65171	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_64800_65200
856668	contig_11416_pilon	-	1128	3	Intergenic	novelGene_145372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	52	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGATCTTGCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602135	598920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_599699_600565_600683_601902
856669	contig_10324_pilon	-	420	3	Intergenic	novelGene_7925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	195	224	418	969676	969482	FALSE	25	GGGGAATGACTGCAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEHQFAVGEDTDGNLSSPVTLYLRNLFSTFTITRLKETTLAANQPRDRASRLQWTPNTDPALHTPTSSLDSTAMAITLQPMEIRTFLASVRWKRLQSRQVVHLRAGAPSTMGWVNHCLSILLLLLQTRAIKMPPTSPR	970262	969479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_969721_969996_970100_970186
856670	contig_3956_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_14740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGATGCGGCTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599158	599502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_599200_599500
856671	contig_1337_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_84225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89230	88512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_88500_89200
856672	contig_7057_pilon	+	451	3	Intergenic	novelGene_123194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	273	392	416495	416614	FALSE	0	GCTTGTCGTGTGTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDSTASSEGCQSSDRTTGSEPRQQSDRTALTCYPKTNHRGPIQLWQFLLELLRDGARSSCIRWTGNSREFQLCDPKEVARLWGERKRKPGMNYEKLSRGLRYYYRRDIVLKSGGRKYTYRFGSRVPGLA	415388	416673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_415509_416113_416227_416455
856676	contig_15327_pilon	+	1025	8	Intergenic	novelGene_70703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	84.3418699129214	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	33	851	908669	933900	TRUE	15	CTCAGCTGTGTCCAGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPGPGGSAASSAPPAATAQVLQAQPEKPQHYTYLKEFRTEQCPLFVQHKCTQHRPYTCFHWHFVNQRRRRSIRRRDGTFNYSPDVYCTKYDEATGLCPEGDECPFLHRTTGDTERRYHLRYYKTGICIHETDSKGNCTKNGLHCAFAHGPHDLRSPVYDIRELQAMEALQNGQTTVEGSIEGQSAGAASHAMIEKILSEEPRWQETTYVLGNYKTEPCKKPPRLCRQGYACPYYHNSKDRRRSPRKHKYRVVSLSERETRGRVGRPWQV	908636	936232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_908773_926772_926983_927869_928047_928171_928303_929001_929139_933840_933959_934898_934984_936201
856678	contig_19743_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_173158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAATGCGTAGCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256214	255772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_255800_256200
856679	contig_1146_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_84794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAATCGGATTAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179753	178797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_178800_179800
856680	contig_9670_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_169937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAATGACAAATGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82933	81903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_-_81900_82900
856682	contig_3878_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_174787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125121	125697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_125100_125700
856683	contig_1443_pilon	+	844	5	Intergenic	novelGene_28232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	61.6699886492612	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	16	540	536007	541541	FALSE	30	GGAAATGAATTTTGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASGFMVAASGLKYLLTLGGWRRGRGVVPQSRALAILVPGMSQVDNKSDFLEKKPHRQHPGILQGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535991	541845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536326_540746_540798_541028_541125_541340
856685	contig_7151_pilon	+	247	2	Intergenic	novelGene_40711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTGATATAAATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65607	66635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_65694_66474
856686	contig_2264_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_177846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCAAACGAGAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144765	145649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2264_pilon_+_144800_145600
856687	contig_7361_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_163378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACGATGATGATGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175478	174401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_174400_175500
856689	contig_10096_pilon	-	391	2	Intergenic	novelGene_177158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83533	82741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10096_pilon_-_82943_83343
856690	contig_5718_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_110403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTAGAGGTTCTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355190	1354661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1354700_1355200
856691	contig_7707_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_72127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTATTACATCTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64794	64255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_64300_64800
856694	contig_7318_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_152214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTCAGAGCCATGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189198	188475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_188500_189200
856695	contig_13412_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_80009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTTTTTTCTTTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363816	364657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_363800_364700
856696	contig_12391_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_103617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130054	129729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_129700_130100
856697	contig_5917_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_122167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCTCAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703394	703838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_703400_703800
856698	contig_6497_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_35630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAGACTGGTTCAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725388	724733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_724700_725400
856699	contig_9995_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_47803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTAGAGATAGGAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823072	823649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_823100_823600
856701	contig_348_pilon	+	484	2	Intergenic	novelGene_67627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTTTTGTTGCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373671	387823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_373744_387411
856702	contig_14219_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_54301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAGAAAAAAGTTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630797	631676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_630800_631700
856705	scaffold_6394_pilon	-	177	1	Intergenic	novelGene_111056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGTGTTTAAATTAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456043	455866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_455900_456000
856706	contig_9147_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_167233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGCCAGAGGGGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114584	114278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9147_pilon_-_114300_114600
856707	contig_8615_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_165230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGTGACATAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459264	459682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_459300_459700
856708	contig_13542_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_131478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312398	311825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_311800_312400
856712	contig_6059_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_44789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTGAATTTTAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370461	371762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_370500_371800
856713	contig_7066_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_42210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTATATCTTTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104262	1103886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1103900_1104300
856714	contig_11855_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_67033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGGAAATGTTCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1918203	1918783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1918200_1918800
856716	contig_10868_pilon	+	624	3	Intergenic	novelGene_173907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACTCCCTCTCTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728111	729717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_728186_728814_728947_729299
856717	contig_13888_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_151776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCCAGCCCAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13318	12381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_12400_13300
856718	contig_17897_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_153403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCCTAAAGAAACATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140587	141109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_140600_141100
856719	contig_7619_pilon	-	563	4	Intergenic	novelGene_162159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	25.9358182185692	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	64	561	371731	369443	FALSE	40	GGCCAAGATCAAGCCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRAKTATVRRPSASAKPSGHPPPGDFIALGSKGQASESKTASTLLKPAPSGLPSERKRDAAATLSGASALTGLTKRPKLSSTPPLSALGRLAEAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVLPTVLLDEIEAAELEGNDERIEGVLCGAAKQLRLTRAKPDSTLYLSLMY	372110	369440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_369592_370144_370436_371673_371775_372090
856724	contig_13329_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_177847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGACATGGGTCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17610	16548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13329_pilon_-_16500_17600
856725	contig_7887_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_124940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATACTTTGTTATGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690063	690912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_690100_690900
856726	contig_12837_pilon	+	801	4	Intergenic	novelGene_57345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	168.667325426909	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	68	799	213153	238343	FALSE	5	TTTCTAGGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHLFLLLALCQAGHIARACSYSLRGSWQIRNANGSLELPGTVPGCVHSALFQQGLIQDPYYRFNDLHYRWISLDNWTYSKEFKIPFNHSKWQKVNLIFEGIDTVTKILLNNVTVGKTDNMFSRYSFDITTMVRDVNFIELRFQSAVLYAAQQSEAHTGYQVPPNCPPLVQKGECHVNFIRKVMVSHMDGALALRIDCDSMRSACLKTLVAFQKLSLSLAPSVGFENLKQDSKDYLNVCGESS	213085	238345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_213330_232120_232216_234965_235072_237989
856729	contig_7272_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_25375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACGTAATTCTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627929	628719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_627900_628700
856731	contig_8978_pilon	-	592	4	Intergenic	novelGene_49498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	30.6267856622271	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	21	539	1811402	1803205	FALSE	25	GTTTGTACTACATTATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRGGCRMVGGGGKRRPGGKRRPGGEGQQCEKAVDVKKSKSCEADVSSDLRKEVENHYKLSLPEDFYHFWNFCGELDPEKPADSLSASLGLRLVGPYDILAGKHKMKKKSAGLNCNLHWRFYYDPPEFQTIIIGDGRTQYHMGYFRDSPDELPVYVGTNEAKKNCLIVQSGDNVFAAVK	1811422	1803151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1803308_1804536_1804727_1806946_1807107_1811336
856732	contig_10196_pilon	-	209	2	Intergenic	novelGene_132175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCGTGTGGTGTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068645	1068312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1068435_1068558
856733	contig_2054_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_51674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	845	1267	74567	74145	NA	50	TGGAAAAAAAAACTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLLHGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETCWEWQEAHEQGMDQDKNPSMFSVVYIIVHVTKQI	75411	74137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_74100_75400
856737	contig_8852_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_159838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATACAAACATGCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23768	22950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_-_23000_23800
856738	contig_10855_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_124315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGGCTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318675	317983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_318000_318700
856740	contig_6191_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_107869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541463	542134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_541500_542100
856745	contig_6479_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_160627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTATACCTCAGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668155	667140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_667100_668200
856747	contig_8650_pilon	+	1117	3	Intergenic	novelGene_162628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	0.5	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACAACCGAGACCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290759	319066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_290830_315560_315707_318165
856748	contig_9051_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_170803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	126	485	926174	926533	NA	30	CAAGATAAGGTTGTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPSVCEPRGLSRETHAGTSSLISAVSCLQLSITEDKILSKMQRDNQIISRMATQPPGPERACGVSAGLRQLGVGVHQPECPTPACSGIQTPSTRPPTGPAWGEAVRRHQGMDRQTWNGGRPWEPVWGPVKADSGGPEAGRVLLWIKLSPPKMCVNLARL	926048	926665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_926000_926700
856749	contig_817_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_132440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	20	313	542965	542672	NA	50	GTGGGCGAGAACAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWVGGGMGAEFLRGWPCIPKADLQIPLPNAAVNVRDVKRRRPHQYQSTSRKSPHLHSLHNCESAEWAGADTVTVAIRGPPEGPGRAFPGACPALLRAPEARAD	542984	541998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_542000_543000
856750	contig_16917_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_161936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCTTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147866	147258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_147300_147900
856751	contig_9435_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_156957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTTATTTATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299120	298220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_298200_299100
856752	contig_165_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_117062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGAGTGGTGGAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50146	50355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_50100_50400
856753	contig_5718_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_110312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	311	670	445967	445608	NA	25	ATAGGGCAGTTCTACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKELVYRWVWSGLKEEKGSARGRKWPLYQQPWQQRCWARVLVVMMGGNMAKAVVQVSGTPTPHVSTWLGYKDQVIMQKIGDMHKWRMTTSDHKISCKTYMSFWSREVENVGGCCMSQ	446277	445323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_445300_446300
856754	contig_9839_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_88488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGATTTAGAGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45310	45914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45300_45900
856755	contig_12917_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_162886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTAATAAACTGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16627	17152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_+_16600_17200
856756	contig_2414_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_158501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAATTACGGTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393859	394428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_393900_394400
856757	contig_14788_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_176918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAATGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106212	105544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14788_pilon_-_105500_106200
856758	contig_4812_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_103723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAGATGTCACCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947833	949495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_947800_949500
856759	contig_14405_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_85622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAATTCTCTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336117	335074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_335100_336100
856760	contig_8878_pilon	-	641	4	Intergenic	novelGene_147873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.39934634239519	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1	423	596059	590046	FALSE	10	AGGATGTTTTTGTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLKSVGRGYNPRLTVIVVKKRVNARFFAQSGGRLQNPLPGTVIDVEVTRPEWYDFFIVSQAVRSGSVSPTHYNVIYDNSGLKPDHIQRLTYKLCHVYYNWPGVIRVPAPCQYAHKLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL	596059	589827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_590163_590320_590469_592440_592567_596027
856761	contig_9375_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_136069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGTCCAGAACCTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419757	419266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_419300_419800
856762	contig_14142_pilon	-	876	2	Intergenic	novelGene_120451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	8	487	97190	96554	FALSE	10	TACCTTCTGGCATCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMADVPGAQRPVPGGSPEPRDPLDCWACAVLVTAQNLLVAAFNLLLLALVLGTILLPAVTMLGFGFLCHSQFLRSQAPPCTAHLRDPGFTALLVTGFLLLVPLLVLALASYRRLCLRLRLADCLVPYSRALYRRRRAPQPRQTRASSGAQALPTSGKVWV	97197	96164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_96824_96980
856763	contig_12414_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_59638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1047	1394	741087	740740	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDSPFLCVDRMVNQSANHVPMADMSGKDLRQTGPRFPAFTQDPRNHMDEYKSTLISSELEERKIAVFSRGNDRSTIPYARPLKSEVFWNDFFFVFWKSSKLHVTFHRAQESSP	742133	740715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_740700_742100
856764	contig_6501_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_150570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAGAGGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255130	254391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_-_254400_255100
856765	contig_15697_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_173305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAGGTGAGTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48771	48511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_48500_48800
856766	contig_14976_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_139966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCTAGCAGTCAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26293	26547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_+_26300_26500
856767	contig_14575_pilon	+	779	1	Intergenic	novelGene_101916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGGTGATTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232976	233755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_233000_233800
856768	contig_6403_pilon	+	323	2	Intergenic	novelGene_139880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGGCCCGCAAAGCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668991	679099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_669202_678986
856772	contig_12229_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_169388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACTACCGAACTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79349	80235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_79300_80200
856773	scaffold_13505_pilon	+	870	4	Intergenic	novelGene_111652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.5941909605289	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	74	601	821102	827357	FALSE	15	AGGTGTACCTGCCTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVHVIGQIVGATGFSESSLFCKWGIHTGAAWKLLSGVREGQTQVDTPQLGDTAYWSHPIDLHFATKGLQGWPRLHLQVWSQDSFGRCQLAGYGFCHVPSSPGTHQLDCPTWRPLGSWREQLARAFVGGGPQLLHGDTIYSGADRYRLHTAAGGTVHLQLGLLLRHFDRYGVEC	820145	827626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_820187_821069_821190_823913_824040_827043
856774	contig_6164_pilon	+	742	2	Intergenic	novelGene_121303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	109	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	133	618	722963	767185	FALSE	65	GTTTGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGPVRAPAEKPRGSRCSNGFPERESPRPGPSRPAEKTPGPEAKSAQPADGWKGERPRSEEDNELNLPNLAAAYSSILRSLGEDPERQGLVKTPWRAATAMQFFTKGYQETISDVLNDAIFDEDHDEMVIVKDIDMFSMCEHHLVPFVGKVRFSFLMFFS	722830	767309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_723306_767042
856776	contig_755_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_119786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562583	561910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_561900_562600
856778	contig_5988_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_16011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTGTATAATTTATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770979	771533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_771000_771500
856780	contig_1435_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_115505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTAAACAAAGGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543749	544411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_543700_544400
856781	contig_10602_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_159642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105.578827843886	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	22	780	37611	33745	TRUE	20	GTTTTTCGAGCTAATGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEPTAKMAAARCWGLLPRIRGLSLHTAAKVDVVAPETSGPDVASAPVARYPPIVASLTAKSKAARQRRIERWQAAVHAAESVDQKLRILTKMQFMKYVVYPQTFARNADRWYQGFTKTVFLSGLPSPLVEPAPALELASLRAAACDCLLQEHFYLRRKRRAPLYQDREAIASPFLDQLVAALVGLLSPHNPALAAAAIDCKRPVHFYWMRGEEIIPSGHRKGRVDALRYQIDDKPHNQIRISKQLTEFCSYRNPCYEL	37632	32618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_32732_33691_33781_35529_35676_37034
856782	contig_7979_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_125528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422615	423327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_422600_423300
856783	contig_15543_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_164337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCCAAGGAGCAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33326	34001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_33300_34000
856784	contig_10135_pilon	+	688	2	Intergenic	novelGene_106681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCATACAACGTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315007	316720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_315025_316049
856785	contig_13110_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_138746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGTGAAATTATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581236	581781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_581200_581800
856786	contig_11681_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_102968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCAGTTTATAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111177	112462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_111200_112500
856787	contig_13645_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_146170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCAGTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456675	457607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_+_456700_457600
856788	contig_4845_pilon	-	977	9	Intergenic	novelGene_53661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_8	122.494642739999	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	257	976	521011	515155	FALSE	60	GCAAGAAGAAAAAGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVAARASSATQPGTKRPGSPPHLGACPLLPVPRYLRRRQASPHLLPADVVYDHTFWGLHGCYRRLSQRRPSGHHLGPGGRRASGTMASPVLPTSVRQLSRRRQVALRRKSVGPQAWSALLVKAITKSGLPHLALPPPTPGALCGESERQIRSTVDWSESAAYGEHIWFETNVSGDFCYVGEQYCVAKMLQKSVSRRKCAACKIVVHTPCIEQLEKINFRCKPSFRESGSRNVREPTFVRHHWVHRRRQDGKCRHCGKGFQQKFTFHSKEIVAISCSWCKQAYHSKVSCFMLQQIEEPCSLGVHAAVVIPPTWILRARRPQNTLKA	521267	515153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_515170_515265_515383_515475_515548_516441_516511_516935_516993_519701_519780_520091_520188_520466_520576_520904
856789	contig_19640_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_134877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAACCAAAAAACCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112507	113396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_112500_113400
856790	contig_16883_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_161725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATAGAGGTGAGTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200946	202050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_200900_202000
856791	contig_6842_pilon	+	458	2	Intergenic	novelGene_130783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGAGCATGGAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376810	1377399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1376909_1377039
856792	contig_5836_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_106291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTGAGTACAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143730	144578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_143700_144600
856793	contig_3956_pilon	+	896	7	Intergenic	novelGene_15287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	44.7266388433361	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	208	894	1303014	1314160	FALSE	20	GGCGGTGAACTATGACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFRQEDVEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREEIEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKESLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKDVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNI	1301474	1314162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1301586_1302917_1303076_1304902_1305264_1311396_1311527_1311790_1311840_1312585_1312613_1314102
856794	contig_10063_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_127766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATGATTTTTAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772587	771613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_771600_772600
856796	contig_8174_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_160043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGTCAAGAAATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211989	212413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_212000_212400
856797	contig_10460_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_157468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAAAGGTGTAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76492	75476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_75500_76500
856798	contig_14985_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_169096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGACGCGGGCACGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28780	28500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_28500_28800
856801	contig_10526_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_142574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCCAAAAAAGTAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237648	239097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_237600_239100
856802	contig_14516_pilon	+	857	1	Intergenic	novelGene_153949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTACCGTCAAGTTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399029	399886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_399000_399900
856805	contig_15517_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_176409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACACCCGTTTGGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39002	39559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_+_39000_39600
856806	contig_14526_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_111225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435787	436755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_435800_436800
856807	contig_13044_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_99973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAACTGATTATCACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22577	21701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_21700_22600
856810	contig_1717_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_146115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACTCCAGAGCCCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142384	143104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_142400_143100
856811	contig_16098_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_46168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_2	14.5	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAATTTGAATTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509545	508245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_508822_509026_509098_509252
856812	contig_11702_pilon	-	413	4	Intergenic	novelGene_141971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	113.33431372125	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGTCTCGGTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374058	372886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373501_373949
856813	contig_6513_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_117752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAGATGAAGAAGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83119	83592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_83100_83600
856814	contig_10068_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_148713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTCGAGAAGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45131	45405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_45100_45400
856815	contig_5331_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_112792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGAATTTCCCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369436	368875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_368900_369400
856816	contig_7391_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_112147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTAATAATTTAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330051	331144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_330100_331100
856817	contig_12689_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_145042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAGGGCTCAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72375	73360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_72400_73400
856818	contig_9653_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_48220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGATGCAAAGATGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512336	512068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_512100_512300
856819	contig_9727_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_86259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCCGTCTGCTGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67307	68070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_67300_68100
856821	contig_12277_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_139704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343972	343682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_343700_344000
856822	contig_14450_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_49006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAGAGGAACACGCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121762	1122803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1121800_1122800
856823	contig_16632_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_154133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAGACTGAGAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86872	86159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_86200_86900
856825	contig_9389_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_84095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	805	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTTTACACCTCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384986	1385382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1385000_1385400
856828	contig_1274_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_137806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTGCTTAGCGTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449504	449933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_449500_449900
856829	contig_3627_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_78420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143449	142884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_142900_143400
856831	contig_6691_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_60163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAACTTTCCAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377782	377536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_377500_377800
856832	contig_7078_pilon	-	772	3	Intergenic	novelGene_130155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_2	132.5	81	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	278	622	557296	549413	FALSE	35	CATAGTATGCATCCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFGGNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDSDTIISDWFKVLGSTISNQAVEPDEGLEEEIPDSPGIEKHDKEKDHKEPKKLRRKLLFSVLLMI	557573	549262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_549551_554026_554126_557188
856834	contig_13129_pilon	-	1066	2	Intergenic	novelGene_177853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTTAAGACTGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143446	140553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13129_pilon_-_141486_143312
856837	contig_4486_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_38649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACGCTATCCAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029710	1028575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1028600_1029700
856840	contig_17144_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_29135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	254	649	39624	40019	NA	30	TCTGGAAAAGACTGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPRVPVAVGPGPSAPVPSRSGCPVRQISRKIRSRSSSRCARSSSSADVKTLTLRGPSGSGDSSAPGNVSSGPSRVTVSSSSSSSSSGSRVLLRRSRRGGGPRGRGRGAQEMLMTRRHRVSSRPKQTPSTK	39370	40097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_39400_40100
856841	contig_12915_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_148357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158956	157758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_157800_159000
856843	contig_4223_pilon	+	547	2	Intergenic	novelGene_117273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	106	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGACAATCTACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190646	198434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_190690_197930
856844	contig_9527_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_134100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACATAATGTTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753949	754678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_753900_754700
856845	contig_5780_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_29787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGGCTAAATGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77307	77953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_77300_78000
856846	contig_13158_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_107300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGCATTCATACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180424	180954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_180400_181000
856848	contig_5457_pilon	+	299	2	Intergenic	novelGene_139005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTCTTACACATCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211980	273501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_212167_273388
856849	contig_8304_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_153171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAGTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95490	96226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_95500_96200
856851	contig_5586_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_143557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	171	581	369889	370299	NA	40	TCTGCCCAGTAGAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSSLASWLTVTQAAFFQNGCAWSHHEAFDSEAPGLGLGMCILSSPDINALPSPPRLRTTLWGQYLLLHLPNLQPASHFPATGSFGCIIFGHLSSLILSLSFSISLSQSGLPIIFHMTEVSISIFMYLAYFKILV	369718	370780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_369700_370800
856852	contig_6434_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_61843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGAGCATCATTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757441	758241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_757400_758200
856853	contig_6127_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_157052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAGAATATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241476	242059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_+_241500_242100
856855	contig_7345_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_159193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCAGTTGTCATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315598	316688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_315600_316700
856856	contig_4315_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_46825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTACTGGTTCCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367704	366451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_366500_367700
856858	contig_10238_pilon	-	185	1	Intergenic	novelGene_170101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAGCTCTACCAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402937	402752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_402800_402900
856860	contig_9363_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_6718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAGAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319032	1319839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1319000_1319800
856861	contig_4402_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_140792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTTGACACATATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205612	206432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_205600_206400
856862	contig_5247_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_81836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCGGCTGGTGGATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394000	393267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_393300_394000
856863	contig_2257_pilon	+	860	5	Intergenic	novelGene_122498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	361.582978028557	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	236	772	291452	313937	FALSE	5	TTGTTTCCTCTTTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLTLPLYWIMFVSGLTTRMQTPLQQELCSLLFHLCLVYRRCPVIQKE	291216	314025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_313799
856865	contig_10629_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_52947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCTAAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411162	411778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_411200_411800
856866	contig_12786_pilon	-	590	4	Intergenic	novelGene_103390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	710.269432445651	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	252	452	593240	590985	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLYHARCSNVTIIRIGTSGGIGLEPGSVVITQQAVDACFKPEFEQIVLGKRIIRSTHLDDQLAQELTRCSKELDEFPTVVGNTMCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRCGPLSWCSGRGVCHPAQPTGRRPDQQPT	600859	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591072_592845_592935_593215_593426_600793
856867	contig_9321_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_174719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGACAAACCCCATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34221	35226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_34200_35200
856869	contig_11003_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_105451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAATTTAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432768	433579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_432800_433600
856870	contig_10857_pilon	-	568	3	Intergenic	novelGene_160928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTAGTGGCTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541225	539278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_539652_539975_540043_541097
856871	contig_10196_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_132333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACGGATCAGTATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2407435	2407756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2407400_2407800
856873	contig_7760_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_138437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	519	833	200090	199776	NA	25	AAACCCATTGCTGTCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNILWTARRTNKSLLEEVQPECSLEARMVRLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVSKKKGRPSTRWIDTVAATMGSSITMIVRMVQDWAAFHSVLHRVPNNIL	200608	199487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_-_199500_200600
856874	contig_8276_pilon	-	670	5	Intergenic	novelGene_174491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTCCCAGCTCCGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453770	445482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_445594_448047_448248_449282_449480_453162_453286_453731
856875	contig_9345_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_24714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAGAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999228	1000125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_999200_1000100
856877	contig_13349_pilon	-	1380	13	Intergenic	novelGene_161132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.994712280981	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	108	1361	300183	274104	FALSE	40	CCACACACAGTCATTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSEGSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKNEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSASEVCAQPLSLPCT	303862	274084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_274145_274916_274992_276017_276123_276597_276674_277015_277139_281507_281674_283361_283484_285319_285461_286030_286084_290960_291022_294272_294381_300000_300187_303758
856879	contig_10600_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_169871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGGATTAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172185	171379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_171400_172200
856881	contig_7549_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_164530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGGAACTCCCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700783	700069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_700100_700800
856882	contig_14664_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_169539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGGAAGAACAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188552	188227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_-_188200_188600
856883	contig_1442_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_172175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705197	703981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_704000_705200
856885	contig_16846_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_82882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAGGCAGTCTTAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244182	243272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_243300_244200
856886	contig_10082_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_63835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCAAGTCCTGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11633	12367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_11600_12400
856888	contig_4232_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_63248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTTGGTTGGCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326237	325606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_325600_326200
856890	contig_5189_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_34884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTCCAGTGGGACAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252130	253181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_252100_253200
856891	contig_6005_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_158907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTCCATGAGTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636896	637622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_+_636900_637600
856892	contig_6058_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_172386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATGGTTTTCAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380139	380551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_380100_380600
856893	contig_5047_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_157987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	950	1276	884383	884057	NA	55	CAGCAAACAATTTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKGERPLAKGRHGRWLRNLINEFRFWNVSWARTRQCCHLQSEFKGKRRTKKGPACCLGRSERKLGYFTLVWLLNSRKRRVFTWKGELGHHVERLKPGPCGHSVLGP	885332	883832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_883800_885300
856894	contig_5084_pilon	-	1097	4	Intergenic	novelGene_64587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	5.71547606649408	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	319	1095	909669	904836	FALSE	20	GTTCCCCAGCAATCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILDEYEDSLSRSAVLQPGCPSVGIPHSGYVNAQLEKEVPIFTKQRIDFTPSERITSLVVSCNQLCMSLGKDTLLRIDLGKANEPNHVELGRKDDAKVHKMFLDHTGSHLLMALSSTEVLYVNRNGQKVRPLARWKGQLVESVGWNKALGTESSTGPILVGTAQGQIFEAELSASEGGLFGPAPDLYFRPLYVLNEEEGPAPVCSLEAERGPDGRGFVIATTRQRLFQFIGRAAEGTEAQGFSGLFAAYTDHPPPFR	909987	904833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_905288_905437_905530_908412_908555_909578
856897	contig_5827_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_129791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAAGAAACCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311685	312593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_311700_312600
856898	contig_3948_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_53272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAAGATGCTTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407691	1407997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1407700_1408000
856899	contig_2463_pilon	+	548	4	Intergenic	novelGene_42997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	3.09120616516523	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATCTTCATTAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12411	72158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_12577_57261_57408_66035_66118_72003
856901	contig_5260_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_144405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCAGGGAAGCTAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472746	472248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_472200_472700
856902	contig_14528_pilon	-	531	4	Intergenic	novelGene_111259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.94392028877595	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	6	383	156430	150304	TRUE	10	CTGGTGGGGCATGGCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPASRLGPLAAALLLGLLLLGLPPVRSDTETQKPGVCPELQGDLNGMEECVSDGDCAENLKCCRAGCSAVCVMPNEKPGSCPRLDKGIPPLGICEDQCQMDSHCPGQMKCCRNGCGHVSCATPSF	156435	145585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_145733_150302_150456_155616_155755_156342
856903	contig_6063_pilon	-	588	5	Intergenic	novelGene_27591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	771.272446999113	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	117	494	27938	20210	FALSE	50	TTGCTAACAAACCAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAHYIIHL	28932	20115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_20231_25920_26121_27527_27622_27875_27990_28867
856904	contig_2377_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_67874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	13	345	26494	26826	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AINVMKQTVYKLLNGKLMWGINFHLKHNKMLKKMQLLKTSSRRPGGAMVKHSAANQKAGSSIYPAAPQEKDPVCSCKNYSLEIPKGNPQNYTHPPDTLLTQNRNILKEHFSDKN	26481	27103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_26500_27100
856905	contig_16103_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_118757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACACTAAGACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437063	436724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_436700_437100
856907	contig_15188_pilon	+	985	5	Intergenic	novelGene_163076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.9164728671689	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	305	985	123500	124180	FALSE	20	GGCGAGCGGCCCTACAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREERMYKEEPTREATLEKLKKPSRHSCVWGDAWGWKEQADALSGSEGVLWKPAPATCEDVSREQDSSPGLGESEGGSPFRSALFVQQSIPAEAGFHDNIHVTSFRSIEAVTQHQRTCAGRNAFRSIDHGKYCRAGKLRGTGPGDGLFACGECGKAFRQSSSLALHRRWHTREKAYKCHECGKAFTWSTNLMEHQRIHTGEKPFFCSECGKAFSCHSSLNVHQRIHT	110041	124180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_110070_110473_110520_117665_117793_118407_118491_123479
856910	contig_10444_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_139476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTATAGCTCCTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897738	896769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_896800_897700
856912	contig_6364_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_51805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACAAGCAATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439465	1440477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1439500_1440500
856914	contig_10642_pilon	+	453	4	Intergenic	novelGene_78718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCAGCAAACCCAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915906	921237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_915958_916269_916458_920784_920866_921104
856915	contig_12724_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_146875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465875	467126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_465900_467100
856917	contig_10323_pilon	-	613	6	Intergenic	novelGene_123556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	242.196944654552	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTGTACTGTATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292699	268205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268513_275265_275329_277887_277921_278700_278773_285478_285551_292633
856919	contig_19899_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_102533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344655	344270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_344300_344700
856925	contig_8412_pilon	+	772	3	Intergenic	novelGene_118397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	7.5	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	45	368	710894	715040	FALSE	40	CACCCTGAATAAAGACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLSPVIYDSLTSLMTNLVAIELEKVVLKSTFNRLGGLQFDKELRSLIAYLTTVTTWTIRDKFARLSQMATILNLERVTEILDYWGANSGPLTWRLTPAEVRQVLALRIDFRSEDIKRLRL	710849	715444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_710954_714546_714676_714905
856926	contig_1008_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_121576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATCCTATAGGGTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663842	664223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_663800_664200
856928	contig_7333_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_142802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGGAGGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369210	370025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_369200_370000
856929	SIRV6	+	435	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10390	1	1153	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11390	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
856930	contig_4364_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_81	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	515	829	826055	825741	NA	20	GCAAGGGCGGCCCGGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGEPDSCLQYTRGSGSESVAQVSSGEPRTLPSPSSTRLPWGFGSPDPLPCPHPLPPYLGQGRISAKKEPWPRLLLPWPRGGGCCTPGGPFPRTRSWGQVSKG	826569	825548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_825500_826600
856931	contig_6954_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_64465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865144	866257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_865100_866300
856932	contig_3469_pilon	+	1185	9	Intergenic	novelGene_34138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	881	1183	203859	210007	FALSE	30	TCCCATCTAAATATTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLGVEHVPQVLGDFLLFALLPLCSDFVKLVLAGLNFILQLLKSLTLYLLFFHPPLDLSDICSHLDICHQLGATEQQFSQFLSAFFFLFVALALVFLTLL	177436	210009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_177641_178152_178288_184755_184896_201089_201213_201860_201950_202923_203059_203804_203992_206735_206852_209953
856934	contig_20398_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_155188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22337	21727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_21700_22300
856938	contig_19146_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_172287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	107	436	19571	19900	NA	40	GGAAAGCAGAGGGACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSSPVKRTSALTQQPPPLQFLVRGRKVGFLREAHVSHTFARLLHVPRDHPRQLSWSLPLPGDKSVGGFFYHLPANLLLVVVYEDEGLFAPDLAWDSPALLSQTAVLA	19464	20152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19146_pilon_+_19500_20200
856940	contig_18735_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_132684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCCGGAGCTAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77815	77217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_77200_77800
856943	contig_10926_pilon	-	1586	1	Intergenic	novelGene_137511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCAGCCTCTCCTGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283109	281523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_281500_283100
856944	contig_211_pilon	-	612	2	Intergenic	novelGene_129871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAGTTTTCTACATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234522	231032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_231092_233969
856948	contig_14023_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_165385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACGGTTGTTTTAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302423	293209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_293468_302131
856950	contig_7123_pilon	-	748	4	Intergenic	novelGene_170580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.5407887880287	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	237	614	434051	433674	FALSE	40	TCCAGCAAGTACAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNPCQSPTTSNFDDVGVLQKKLVPFVTDLTIHLAQELEKQKEDPGKVEQLQAWLQAWLLPHTNEVSQQINDNLCELQQRLVPCTNHPSVKTVCCCFTSTLQLSHTMSVWPILTGNMGKGVLEM	437273	433539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_434141_436918_436987_437108_437171_437256
856952	contig_9233_pilon	+	476	2	Intergenic	novelGene_78267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTCTCTCAAGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802078	802752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_802294_802491
856954	contig_8955_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_175083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184185	184742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_184200_184700
856955	contig_13597_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_175645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAATAAGCAGGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81180	81463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13597_pilon_+_81200_81500
856956	contig_12884_pilon	+	719	4	Intergenic	novelGene_104976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	17.9071680247511	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGCCAAGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618066	620885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_618204_619243_619451_619940_620021_620590
856957	contig_8362_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_150692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAATCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304691	304942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_304700_304900
856958	contig_12178_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_156544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212101	213169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_212100_213200
856960	contig_9571_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_136280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTAAAGACACACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442292	442895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_442300_442900
856963	contig_8375_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_141275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCACAATAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37950	38384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_38000_38400
856964	contig_6217_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_109600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGCAACGGGCCAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326150	326435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_326200_326400
856966	contig_12503_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_143823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCAAGTAAGAATAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115970	116399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_116000_116400
856967	contig_9646_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_117435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTCTGGACACCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181510	180974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_181000_181500
856970	contig_9435_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_156954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTAGTCTCGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264077	264726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_264100_264700
856971	contig_299_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_129522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGATTTTATAGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1732937	1732311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1732300_1732900
856972	contig_7457_pilon	-	375	5	Intergenic	novelGene_31297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2975.47898455022	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	33	374	160764	157893	FALSE	15	GGTTTTAGATCTTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTSALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKL	161040	157891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158098_159098_159269_160683_160767_161010
856975	contig_6159_pilon	+	973	5	Intergenic	novelGene_128247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	51	407	173102	176974	TRUE	20	GGCAAGGGGTAGGGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLGQRRRGGRLRGPAVAQLKSGSPHPPGRPSLFFRSFGCVLLLAPGKGSFCSLLHKADQHFCTNPRVRLSQKLQDGRMKSEHLQGLHGQLRGVVVVDLLRVTGSLLMQVVASLPVV	173051	191755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_173205_173472_173619_176866_177131_190679_190939_191604
856976	contig_11396_pilon	+	841	3	Intergenic	novelGene_71313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	126	junction_1	2.5	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	230	649	453291	459602	FALSE	60	GGCCCAATTAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPDVSVHMEEVVVVTTPDTAGDGVEEVKTVLVTTNLAPHGGDLTEDSMETENAAAAAAAAFTASSQLKEAVLGRKPASPRGHHRAAPELTHPEQGASQGVWVTAGDEQGRSSSQIQKPPLWQGPLAGGHPAYGVRQL	441736	459794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_441908_453232_453416_459307
856977	contig_9656_pilon	-	589	6	Intergenic	novelGene_121916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	367.818977215695	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	215	520	432186	430496	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	438081	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436972_437030_438026
856978	contig_12464_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_68667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAATGAGAATGCCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147802	146464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_146500_147800
856979	contig_10640_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_175158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGAGTTGCTATGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53289	54161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_+_53300_54200
856980	contig_8140_pilon	-	375	3	Intergenic	novelGene_86424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_2	52	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	82	375	12555	6334	FALSE	35	GGAAAAGATATACTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVILTRCRAARAQPVYLWRICGSAAAMSWGLLLALCALLLLVVQLLRFLRADGDLTLMWAEWQGRRPEWELTDMVVWVTGASSGIGEELAYQLSKLGVSLVLSARRVEELERVKRKCLENGSLK	12636	6333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_6351_8777_8931_12431
856985	contig_2215_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_163835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTTACTGCGTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104481	103861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_103900_104500
856986	contig_5640_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_27283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTAAGAGATATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090767	1091295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1090800_1091300
856987	contig_13481_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_119302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	244	318	248229	248155	NA	55	AAAAATCAAGCCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPGPRVPQPPPPPPPPRSGTTRAARKTRTLDYWALGSGFRDGVESGAGERRETRNLVKEPNPGSRNARSPGARIKVLARGMLENPASQLRQTETRRNLDWRART	248472	247615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_247600_248500
856988	contig_753_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_112945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAACGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764919	766145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_764900_766100
856989	contig_5917_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_122139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAACAAACAACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205305	205960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_205300_206000
856991	contig_5815_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_141237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTTCTTGTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041385	1042304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041400_1042300
856993	contig_12157_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_135924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	81	404	224436	224113	NA	30	GTATGACTTGCTGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSQIPFYISSKTSKANYIHIFLYIHSDAYHVHIFIYIYLAVTHAHTYRERRSPGGPVLKHLAANKKLSVQTHQQLHRRRDLAICSFEDSSLENPMGQFYCHIGLL	224516	223724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_223700_224500
856994	contig_9389_pilon	-	975	7	Intergenic	novelGene_84081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	161.198032108198	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	319	975	1129901	1122675	FALSE	15	GGGTCGATCCACGGGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVTPENKRKVLGAALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILMDREVVSLFLHFTVNPKPRVDFIDRPRCCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRVRFSVNKRIFVVGFGLY	1156101	1122674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1122721_1123241_1123435_1126671_1126870_1127283_1127390_1129787_1129952_1131589_1131710_1155953
856996	contig_5811_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_177404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTTGTGTAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53756	54003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5811_pilon_+_53800_54000
856997	contig_294_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_166754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCATAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173890	174378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_173900_174400
856999	contig_2817_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_104348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGATTAACATTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296871	297453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_296900_297500
857000	contig_15740_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_177854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAAATATTACCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179813	180126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15740_pilon_+_179800_180100
857001	contig_12790_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_35292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	125	643	483225	482707	NA	30	ATCTGTCTAGAGAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDYDEVTAFLGEWGPFQRLIFFLLSASIIPNGFNGLSAVFLIGTPEHYCRVPDSANLSSAWRNHSIPLRLQDGQEVPHNCRRYRLATLANFSALGLVPGRDVNLTQLEQERCLDGWDFSQDVYLSTIVTEVGPTPTSSRGQRLGRGRRARGPWTHDPAPGIRWTLSLTTPS	483349	482441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_482400_483300
857003	contig_11356_pilon	+	1159	8	Intergenic	novelGene_175259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	4.37525509460387	38	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	292	1053	134108	140916	FALSE	45	TAAAATTGAATCCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKSQRRQAEASPGAARSSSTPPSCSTRSTVTCSSTRRSRVSSGRTAWLSPPGSHPPRQPRKALVSSESYLQRLSSASSSSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEAKFELIISEASYLRSLNVAVDHFQLSTQLRAALSNQDHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFTFHVCDVVLNHAPHFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLLNSNSHFREVLERLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSLEEAEATKAHHALEELIRDCNSNVQRMRRTEELIYLSQKIEFECRVRRKEGADVCVVYHLWCESSGRMHGEERTGLTRRTSSSWT	133626	141022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_133693_133882_134138_137340_137502_138303_138457_138729_138860_139363_139439_139861_139956_140797
857004	contig_14855_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_146017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	192	656	448379	447915	NA	25	GTGCTCAACCAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVREGCFAVFPSSLCVMYAPALSQHCRPHPHSPMCGESVYLSVHAGAGGFNRKGQMVVMPLSQEQMGVEGLSPPGSGLSPTKSHSLSSSPHFAGLAKATNSLWTELQGHLPAVGAPRRQPSSMVSGPPGSSPSPFFPGCPLTGNEQTCPSQLL	448570	447274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_447300_448600
857006	contig_12951_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_68186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGTAGTTACGATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585694	584498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_584500_585700
857007	contig_12599_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_176964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGTGCTGTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28308	26264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_-_26810_27809
857008	contig_4769_pilon	-	733	5	Intergenic	novelGene_117948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTCGGGACCGCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363013	301859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_301960_331409_331508_338547_338691_362495_362614_362739
857009	contig_17440_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_7546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAACGGACGTTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737	1124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_700_1100
857011	contig_7045_pilon	+	692	5	Intergenic	novelGene_77417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.7082439194738	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATTTTCAGGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146445	171097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_146529_155826_155959_160948_161097_168939_169090_170918
857012	contig_16934_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_132543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAACGAATTCTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271502	272211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_271500_272200
857013	contig_8801_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_66316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCGCCTGTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614261	613453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_613500_614300
857014	contig_8063_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_152457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCGAAGTCTAGTGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194979	1195993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_1195000_1196000
857017	contig_7662_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_176566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTAAACCCAGCGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420287	421340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7662_pilon_+_420300_421300
857018	contig_10753_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_105161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429255	430051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_429300_430100
857019	contig_8820_pilon	+	1183	7	Intergenic	novelGene_79326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	13.5205604749047	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1083	99	1181	442915	482981	FALSE	35	TTTGTATTCATTATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVRRGYRGSPQVSLDARVPFPARRSSVETSAMASLSEPVTFREFCPLYYLLNAIPTKIQKGFRSIVVYLTALDTNGDYIAVGSSIGMLYLYCRQVNQMRKYNFEGKTESITVVKLLSCFDDLVAAGTASGRVAVFQLVSSLPGRNKQLRRFDVTGIHKNSITALAWSPNGMKLFSGDDRGKIVYSSLDLDQGVCNSHLVLEEPSSIVQLDYSQKVLLVSTSQRSLLFYTEEKSVKQIGTQPRKTAGKFGACFIPGLCKQSDLTLYAARPGLRLWKANVQGTVQATFILKDVFAGGVKPFELYPRLEPADRGSCSAPEKHLGLVSCFFQEGWVLSWNEYSIYLLDTINQVTIAGLEGSGDIVSVSCTENEIFLLKGDRNIIRISSRPEGLASI	429567	482983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_429599_442847_443134_464343_464473_465041_465174_472140_472299_479319_479633_482849
857021	contig_3956_pilon	+	435	3	Intergenic	novelGene_15295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCCCAGACACTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462799	1465626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1462897_1464453_1464593_1465427
857022	contig_10556_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_176831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	71	445	157392	158923	FALSE	15	AGGACCTATGCTGTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGKFSPFLALSILVLWQAGNLQAAPFRSALENSPDPATLNEEEARLLLAALVKDFVQMKASELEQETEDSSLDSLRTKRCSSLSTCMLGTYSQDLNKFHTFSGINFGAGTPGKKRGRYGRRF	156291	159259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10556_pilon_+_156353_157382_157478_157698_157831_158766
857023	contig_12027_pilon	-	947	2	Intergenic	novelGene_177855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGATATTTTATGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85554	82610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12027_pilon_-_83304_85300
857024	contig_19934_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_166636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAACCATCAGACCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279510	278660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_278700_279500
857025	contig_5780_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_29765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAGTTCGTGCAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22019	22718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_22000_22700
857026	contig_5018_pilon	+	1074	8	Intergenic	novelGene_47006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	16.2819544532076	89	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	31	780	1218111	1221768	FALSE	45	GAAATAAAATCCCAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFEDPFFVVRGEVQKAVNTARGLYQRWCELLQEGTAVEREELDWTTNELRNGLRSIEWDLEDLEETIAIVEANPGKFKLLAGDLQERKMFVERMREAVQEMRDHLVSPAAIAFMERNNKEILAGKSAALKSPSDLLDASAVSPSSRYIEEQQATQQLIMDQQDQQLEMVSGSIRVLKHMSGRVGEELDEQGIMLDTFAHEMDQTQSRMDGVLRKMAKVSHMTSDRRQWCAIVVLLGVLLLVLILLFSL	1218080	1222062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1218146_1218401_1218572_1218699_1218795_1218874_1218938_1221115_1221224_1221317_1221425_1221517_1221613_1221691
857027	contig_14281_pilon	-	761	3	Intergenic	novelGene_177856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAAGGCTTACAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8955	4620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14281_pilon_-_4967_8257_8330_8612
857029	contig_5954_pilon	+	793	4	Intergenic	novelGene_28549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.5303111850471	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	196	792	553791	557290	FALSE	45	AGGGGAACTCAGACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPDCLRVGCAPSAAGKGPETLFAGHKLNDNEWHTARVVRRGKNLQLSVDNVTVEGQMAGAHTRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLM	553595	557291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_553831_555685_555815_556234_556617_557244
857030	contig_13206_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_161896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGGAAGAAAGATAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109073	109740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_109100_109700
857031	contig_641_pilon	-	616	2	Intergenic	novelGene_170138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	664	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAGATGTATATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53206	45954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_46172_52807
857033	contig_5769_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_138752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGACACTCAGCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82708	82938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_82700_82900
857034	contig_5769_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_138753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82797	83005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_82800_83000
857035	contig_6833_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_175124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAAGTTTGCGTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122095	120640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_120953_121839
857036	contig_5018_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_47129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	837	1370	1451816	1451283	FALSE	10	CTTTCTGGGGCTCATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSLNRSLSSSDSLPGSPTHGLPARSPTHSYRSTPDSAYLGASSQSSSPASSTPNSPASSASHHIRPSTLHGLSPKLHRQYRSARCKSAGNIPLSPLAHTPSPTQASPPPLPGHTVGSSHTTQSFPAKLHSSPPVVRPRPKSAEPPRSPLLKRVQSAEKLGASLAADKKGALRKHSLEVGHPDFRKDFHGELALHSLAESDGETPPVEGPGTPRQVAVRRLGRQESPLSLGTDPLLPEGTPRPLASSKEKESPGGAEACTPPRATTPGGRTLERDGGSMRHQSVQTEDGTGGVAKAALSPVQEHETGRRSSSGEAGTPLVPIVVEPARLGTKAEPPQPPGTDSKEMQQPMPLAPPVPEAPRGRERWVLEVVEERTMLSTPRSKPTSPKLCPEPQASVLAPSKSVPSSTGPPAPPASLLVPGTKPEVGMSSRCPAEAVPPPGLTKKGAPCPAPPGP	1452764	1451198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1452530_1452641
857037	contig_3382_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_124056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234449	233585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_233600_234400
857038	contig_15312_pilon	+	878	2	Intergenic	novelGene_176397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	133	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26108	27241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15312_pilon_+_26600_26854
857039	contig_12450_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_162321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCGGGAGACAGAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357423	358286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_357400_358300
857040	contig_9481_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_149699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTGTGGGAGCCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588150	587401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_587400_588200
857041	contig_521_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_174736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTCCCTAGTTTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39687	39271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_39300_39700
857042	contig_2487_pilon	+	786	2	Intergenic	novelGene_148491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACGCCAGCAGCCTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227690	229126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_228294_228943
857045	contig_14822_pilon	-	928	7	Intergenic	novelGene_145401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	13.1244047484067	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	30	734	111178	109080	TRUE	35	ATATCTTCAGAAAGGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKENVGPGKMVLREELFVTSKLWNTKHQPEDVEPALQKTLADLQLECLDLYLMNWPCAFEQGDNPFPKNADGTIRYDSTHYKETWKALEAQVAKGLVRALGLSNFNSRQIDDVLSVASVRPAVLQVECHPYLAQKELIAHCHAHGLEVTAYSPLGSSDHAWGDPDEPVLLEDPMVLAQVEKYGRSPAQVLLRGSRSSEKAAWRMKQCLGGLTTLPHLPQSPAFGGRSSGKWSPSPNPSEHPGV	111376	108340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_108456_109000_109088_109234_109384_109499_109700_110005_110202_111026_111179_111347
857046	contig_7694_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_159937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAAGTCATAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239285	238362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_-_238400_239300
857047	contig_6266_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_170995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCGCCGTTAACAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750098	749045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_749000_750100
857048	contig_18869_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_56474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGGGAGGTGAGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213683	213962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_213700_214000
857049	contig_19016_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_173336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAATATTTTCCGCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17804	16763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_16800_17800
857050	contig_6048_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_73142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGATCCCAGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013957	1014400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1014000_1014400
857052	contig_333_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_170910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTATCGCTATCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7387	7777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_333_pilon_+_7400_7800
857053	contig_9177_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_32790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482045	1481360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1481400_1482000
857055	contig_9646_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_117451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTTCTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262110	261192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_261200_262100
857056	contig_10023_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_123493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGCATGAAAAAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216618	217629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_216600_217600
857058	contig_15732_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_88905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTCCCTCTCTTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281207	282070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_281200_282100
857059	contig_12638_pilon	+	728	2	Intergenic	novelGene_33047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	276	614	8966	9438	FALSE	10	CCTGTAGTCTGATGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPARARTWNVAPQVPFRFQRPHRPPPNPPAPTPSPRRSLRLPWQLPQPRDAAGPREAFRQLRELSRQWLRPDIRTKEQIVEMLVQEQLHAILPEAARARRRGRRTDVRITG	8690	9552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9116_9249
857062	contig_14451_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_176876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCTTAAGTGTACAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419536	418423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14451_pilon_-_418400_419500
857063	contig_6440_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_161669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTATAACTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49863	50995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_49900_51000
857066	contig_3602_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_60592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTCCCAGGATAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774796	775583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_774800_775600
857067	contig_12113_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_134762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCTTACACAAAGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365401	366211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_365400_366200
857069	contig_3068_pilon	-	791	1	Intergenic	novelGene_137603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGATGCTGATGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160542	159751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_159800_160500
857073	contig_11493_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_143719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGGGAAAAAAAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316221	315240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_315200_316200
857074	contig_7976_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_169407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTGAAGCAGGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753031	753533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_753000_753500
857075	contig_13004_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_112679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTATTTGCTGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675190	675577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_675200_675600
857076	contig_10500_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_41158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCAAACTGCCACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246813	1247456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1246800_1247500
857078	contig_9177_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_32659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCCACAGCAAAACAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97055	97657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_97100_97700
857079	contig_3161_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_84519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTGATAGTTTTCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389560	388671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_388700_389600
857080	contig_2988_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_136542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATCATATCACTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58365	57613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_57600_58400
857084	contig_12353_pilon	+	982	1	Intergenic	novelGene_165774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTTATGTCCTAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118061	119043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_+_118100_119000
857085	contig_13481_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_119330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGGAACAGGTCTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326597	327018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_326600_327000
857086	contig_10371_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_175466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGGGCCCCTCCTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89326	87302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_87615_89134
857087	contig_19966_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_177857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGTCTACTTCCCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8395	8171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19966_pilon_-_8200_8400
857088	contig_6102_pilon	+	462	2	Intergenic	novelGene_32285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTCTCCCCCTCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454154	1458345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1454228_1457956
857089	contig_13481_pilon	-	527	3	Intergenic	novelGene_119426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	231	395	864499	863467	FALSE	50	GGCAAGAGTAAACCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPHQLHPDSAADLLSALSQEEQDLIGPVVALGYPLHRAIVALQKTGRQSLSQFLSYLSACDRLLRQGYEEELVEEAMEMFQFSESQAGEFLRLWEQFSDMGFRQDRIKEVLLVHGNRHEPALEELVACAH	874088	863334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_863602_864469_864572_873930
857090	contig_9516_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_106142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGACCTTGAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571689	571189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_571200_571700
857092	contig_14341_pilon	-	867	2	Intergenic	novelGene_111815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTTGCTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524222	523183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_523986_524157
857093	contig_2062_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_139059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATTCAATTACTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425515	1424973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1425000_1425500
857094	contig_10937_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_67330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTAAGTGTCTTGCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171405	170653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_170700_171400
857095	contig_6326_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_168543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAATTTCTGTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679706	679195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_679200_679700
857096	contig_11292_pilon	-	1298	8	Intergenic	novelGene_109395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.77281052085584	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	307	978	85075	83343	TRUE	10	TGCAGTCTGTGGTTCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKATLVLQIVDKPSPPQDIRVMEAWGFNVALEWKPPQDDGNTELRGYTVQKADKKTMEWFTVLEHYRHTHCVVPELIIGNGYYFRVFSHNIVGPSDTAATTKEPIFIPKPGKTYKPPSYKALDFSEAPRFTRPLVNRSVIAGYNAVLCCAVRGTPKPKISWFKNGLDLGKNARFRMFCKQGVLTLEIRKPCPFDGGIYVCRATNLQGKAQCQCRLEVRVPQ	85538	82867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_83157_83311_83354_83597_83785_84073_84211_84298_84459_84681_84822_85038_85235_85391
857099	contig_3956_pilon	+	761	7	Intergenic	novelGene_14781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	12.6150263134442	122	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	2	685	988788	991678	FALSE	10	CCCATGTGTTTGACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLVSSWPRSSPVIRHYRVKHEGPTYVIDVEEPFSCLSLDAVVSYFVTHTNKELVPFLLDEDYEKVLGYVEADKENGESVWVAPSAPTAPGPGPVPPAGGPKQPPPTSTPVSTQDKLPPLPPLPPPPDQDENYVIPIGDVPAANYVNDKVLPPSRQVALKLKKLPKAQAKAPKPPVKPKPEHKVVNSGLLARKLAASTAQPIFPTTGLADVTAELEEKLQKRRALEH	988786	991754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_988887_988991_989095_989218_989294_990441_990613_990708_990802_990877_990956_991613
857100	contig_9752_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_122016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCGTACTATTTTCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84401	85957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_84400_86000
857101	contig_6098_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_145460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	72	419	16526	16873	NA	15	CCTGCGGCTGGCTGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQSRHFGGRSHPGPPAAGCPLSRGSSGRRSWITLDTCIYTVQRSWACQLSSPLLDLRLSCKHAPPDPPPGDLIPSALTCPNCVGVRLPLSPWERSSDQTLSCLVLPSASPPGP	16454	16891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_16500_16900
857102	contig_9505_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_121856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530737	531909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_530700_531900
857103	contig_4857_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_48817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAGATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277995	1276771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1276800_1278000
857104	contig_17198_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_62350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAATTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679857	680951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_679900_681000
857107	contig_5586_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_143526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAAATTACAGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290889	289511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_289500_290900
857108	contig_3822_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_133340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGCCCAAGTTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357469	357129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_357100_357500
857111	contig_9646_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_117478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTTGTTCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423469	422710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_422700_423500
857112	contig_12540_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_148074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTACAGCCCCCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907957	907735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_907700_908000
857113	contig_5864_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_162775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGAATCTATGGTTTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80730	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_80100_80700
857115	contig_6299_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_172948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCAGATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972174	971805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_971800_972200
857117	contig_16948_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_166397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGGATCTGTGCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148702	148020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_148000_148700
857118	contig_15882_pilon	+	414	3	Intergenic	novelGene_144807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCCTTTTCATGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55895	61151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_55981_56906_57032_60947
857121	contig_7744_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_62536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	249	872	832207	831584	NA	65	AATAAAGGAAACACTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTWIHSPGLTAPTDALLLPDLSLHVSPGGASFLPDCGQLQGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRGCGQELEESEGSRLGAAMCGRCGQGEAGGGASGGPQGPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCTRCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYSCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHDHGGVGGPGLSASEGWVPPHSPPSVLSSRGPTALGTAGSRTLHTDSP	832455	831259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_831300_832500
857122	contig_5988_pilon	-	713	6	Intergenic	novelGene_15881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	8.28009661779378	568	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	98	694	460165	457041	FALSE	60	AAAAAAAAAAAACCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRPSLLLLQLLLLSGAMCWAEAGVETESPVRTLQVETLVEPPEPCAEPAAYGDTLHIHYTGSLVDGRIIDTSLTRDPLVIELGQKQVIPGLEQSLLDMCVGEKRRAIIPSHLAYGKRGFPPSIPADAVLQFDVELIALIRANYWQKLVKGILPLVGMAMVPALLGLIGYHLYKKASRPKVSKKKLKEEKRNKSKKK	460262	457021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_457259_458512_458584_458955_458990_459294_459383_459793_459860_460045
857125	contig_9482_pilon	+	246	2	Intergenic	novelGene_44271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTAAAGATATTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806492	812761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_806700_812722
857126	contig_6137_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_59142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTGAACCACTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942662	943017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_942700_943000
857127	contig_5649_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_82290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144353	143440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_143400_144400
857128	contig_4852_pilon	-	870	2	Intergenic	novelGene_153967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	16	483	57004	56302	FALSE	30	TAGAGTGAATTCAAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKIKTMSYYKDGRELFLSTYVSNFLIQRALFNDSGQYHCAISGQFIFSWKKTSEAVKIKVQELFPPPVLTVSPSQLTEGTPVTLTCETWLPPQRLDTELQFFFFREDQSLGPGWSRSPELQIPTIWSQDSGSYWCEAQTVTHRVKKQSLKSHIHVQSKYQ	57019	55914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_56601_56835
857129	contig_9440_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_59072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010538	1011030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1010500_1011000
857130	contig_14807_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_124743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	49	309	277794	278054	NA	10	CTTGCCAGCGCGTATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHWPRGPERSGVPCSGMRGAGSPESKVGRLQPRLPKEPLAICVAESSGWGPGNVESCSVAVLWLSLLTGSRSSESPTSPQCRAPPPKPGFTGTQVSLWRLRA	277745	278799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_277700_278800
857131	contig_14980_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_78229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTATTTGAGTGACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423133	423643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_423100_423600
857132	contig_7657_pilon	+	525	3	Intergenic	novelGene_30000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	274	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTAGATCATTAACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64523	75036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_64652_66643_66763_74758
857134	contig_10197_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_115239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCTTGTTGTATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976364	977060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_976400_977100
857135	contig_6102_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_32177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842545	842917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_842500_842900
857136	contig_366_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_51565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCTTAAAGGGCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648953	648276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_648300_649000
857137	contig_15327_pilon	+	716	2	Intergenic	novelGene_70576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	786085	786854	FALSE	15	ATGTTTCTGTGGCGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAAQAEESASGGARGGGGLLCHPPFRSHSPAVAAHRLQLLLRPLLLPPAARQEDPSAACDLAVRDGGTTEEKLERSLPQPGPQPQHRQSATLQPSAQDREPPAQDREPPA	786084	787234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_786168_786601
857138	contig_4364_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_4583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCGGAGGGACTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1985307	1985004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1985000_1985300
857139	contig_10734_pilon	-	1202	13	Intergenic	novelGene_51142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_12	152.714944149768	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	75	1013	903455	875086	TRUE	20	AGGTGTGGAGAACGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIKNVPARVLSRRPGHSLEAEREQFDKTQAISISKAINNQEAPVKEKHARRIILGTHHEKGAFTFWSYAIGLPLSSNSILSWKFCHVLHKVLRDGHPNVLHDCQRYRSNIREIGDLWGHLHDRYGHLVNIYTKLLLTKISFHLKHPQFPAGLEVTDEVLEKAAGTDVNNIFQLTVEMFDYMDCELKLSESVFRQLNTAIAVSQISSGQCRLAPLIQVIQDCSPLYHYTVKLMFKLHSCLPADTLQGHRDRFHEQFHSLRNFFRRAADMIYFKRLIQIPRLPEGPPNFLRASALAEHIKPVVVIPEEAPRR	903529	874478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_874550_874811_874875_875030_875173_875303_875380_875490_875549_876310_876452_878657_878720_879126_879204_879611_879693_881433_881491_881669_881813_882293_882358_903362
857142	contig_1309_pilon	-	1465	3	Intergenic	novelGene_73967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAATATGCCAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167513	162822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_163885_166785_166904_167228
857144	contig_9011_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_159297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAACTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420733	420320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_420300_420700
857145	contig_11512_pilon	-	424	3	Intergenic	novelGene_43319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.5	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGTACAGTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409397	401000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_401252_408965_409056_409314
857147	contig_593_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_101992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACACCTAAAGCAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279629	280166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_279600_280200
857149	contig_13041_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_127718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAATCAAAGTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34597	33686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_33700_34600
857150	contig_4604_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_19119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTATTTTAATGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20881	21762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_20900_21800
857152	contig_4442_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_127927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGAACTGACTCAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129554	129154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_129200_129600
857153	contig_11621_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_177858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAGTTAACAAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8116	7500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11621_pilon_-_7500_8100
857156	contig_13888_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_151780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAATTGAAGAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251847	252585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_251800_252600
857157	contig_13982_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_163491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCACAATATCTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431344	431657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_431300_431700
857162	contig_8696_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_153326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654668	653611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_-_653600_654700
857163	contig_4364_pilon	-	761	3	Intergenic	novelGene_162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	43.5	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACGCTTTTATCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244456	1237668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1238199_1243254_1243381_1244351
857164	contig_7446_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_101945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGCAAGAAGATGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164724	164099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_164100_164700
857165	contig_9981_pilon	-	1069	4	Intergenic	novelGene_121063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	156.390536798107	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	53	577	347273	314190	FALSE	40	AAGAAATATTTCTGCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHRPAGCPRCGGAAAAAMQQAQPYEFFSEENSPKWRGLLVSALRKVQEQVHPNLSANEESLYYIEDLIFQLLNKLCMAQPRTVQDVEERVQKTFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLLLPVDKIHPSLKEVLGYKVDYHVSLYIVAVLEYISADILKLAGNYVFNIRHYEISQQDIKVSMCADKVSVKR	347325	313697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_314373_315560_315693_319213_319340_347189
857167	contig_5480_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_107231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCATATGTGTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105508	106284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_105500_106300
857170	contig_5586_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_143517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCCCTTTCTACTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258810	258448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_258400_258800
857171	contig_4339_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_146102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	602	919	1210104	1209787	NA	35	CTGAACATTCCTGTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPYGSPLPVVLVAAAAIAAAAAGAVSGGWRNGQWQLRGPQPELSKSKPARRACCSAYLRSRSSLGTAAPATTCLPTGQSPRACAQSHRCICGWMLPEWTLCDT	1210705	1209714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1209700_1210700
857173	contig_5605_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_143946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAAACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395312	394788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_394800_395300
857174	contig_12532_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_111160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTGTACACAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135686	136004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_+_135700_136000
857175	contig_12158_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_104848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTCTGTCTCCTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77367	77729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_+_77400_77700
857177	contig_14599_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_167901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGGTTGATTTCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141720	142639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_141700_142600
857179	contig_5947_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_101469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTATGCTAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58814	57982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_58000_58800
857180	contig_10768_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_166445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAATAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87073	86018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10768_pilon_-_86000_87100
857181	contig_20332_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_156176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	141	365	60527	59804	FALSE	20	TTGAAATGGTTCTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTQTCRRWQCGPATYYEDRARPIPLSWSAGAAVTEIPQVDGFNKEMFILSQSGRPEVKIQGISSRGRLSLSAGSGGRSLSPIFPWTRSFSAQEPRVQRTRCAPGAAFLVSGYDLLRNVG	60667	59617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_59837_60335
857182	contig_14142_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_120587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	103	393	584052	584342	NA	40	AGCAAAGCACAGAGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVGATTRRGTGRTGWTGERKRRWGWDCDSGASPRMWPRRLRQPPGVRDLTSATWPGPGSRTRHSENTEARPFPTSCSCGEFLRGRVLSRGIPGMPPGRGGWSALAPSQPGPAPAPPRGRPAPTPHRRPLS	583949	584548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_583900_584500
857183	contig_6102_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_32008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTTTAGTCAGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458348	457855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_457900_458300
857184	contig_3241_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_146390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGGCGGTTTGAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759878	759108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_759100_759900
857185	contig_8688_pilon	-	304	2	Intergenic	novelGene_175588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATAGTATTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40999	38356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8688_pilon_-_38556_40894
857187	contig_12689_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_145025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTATCCGACTCGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22945	23469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_22900_23500
857188	contig_4812_pilon	-	1064	2	Intergenic	novelGene_103701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	144	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	58	738	753970	634578	FALSE	5	TCTTGGTGTGATGTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSQLPPRLPCATHPPKVVMLFFTQCFGAVLDLIHLRFQHYKAKRVFSAAGQLVCVVNPTHNLKYASNRRAVAQSAPEQASFHPHHLTHHHRHHRHHRHLRHHAHPHHLHHQEESLHDGQVMPCMCPLFSCQWEGHLEVVVSHLRQTHRVDILQGAEIVFLATDMHLPAPADWIIMHSCLGHHFLLVLRKQERHEGHPQFFCHHDADRDPHSGRLLHLSPGAQQKPSAAQVGGHPPALSWSAWTL	754027	634251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_635124_753835
857189	contig_18303_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_146800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAGATGAGTATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20991	20336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_20300_21000
857191	contig_6364_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_51750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593417	594257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_593400_594300
857192	contig_15752_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_148766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTTCCATCTTCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204853	205865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_204900_205900
857193	contig_12886_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_135489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	410	709	416114	415815	NA	50	TAAAATAAAACTCATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPWGTQAAEPPLGGQPGLVQGECSTVGLGNASPYSSADALWGPITCKPRKSEFLRYSLLFPPTLWPVGALGHKALGESVAGVLWSIPLLEAQAQHWS	416523	414846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_414800_416500
857198	contig_8254_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_48379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68490	67642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_67600_68500
857199	scaffold_19766_pilon	-	450	3	Intergenic	novelGene_34315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_2	55.5	4	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAATTTGTCTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597243	596397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596973_597196
857201	contig_7619_pilon	+	858	9	Intergenic	novelGene_162158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	545	856	363817	365339	FALSE	30	AGAGGCCCGCAAGTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTTVCSHHTASRWIAAIWFWKARSTSRFLFSPLSQATPASFTWAVIPSIMETASRSVTWITKRTLNSMSRCGGSLRSCMRPRQSAWKLISCLVCLMISRSRA	359744	365341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_359767_359875_359935_360135_360233_361740_361838_362572_362731_363258_363340_363786_363905_364368_364474_365220
857202	contig_5499_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_57036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1577722	1578536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1577700_1578500
857203	contig_13894_pilon	+	888	3	Intergenic	novelGene_62212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATGCTATGTTGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766804	769077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_767021_767106_767344_768642
857204	contig_7898_pilon	+	482	3	Intergenic	novelGene_47597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	651	junction_1	51.5	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATTTGTATTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537546	539836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_537560_537784_537923_539505
857207	contig_3111_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_129966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCTGCCCACACAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44459	43852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_43900_44500
857210	contig_2215_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_163834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATGAGAAAGCATGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94876	94438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_94400_94900
857211	contig_5523_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_169098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCATTTGGCAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394681	394263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_394300_394700
857212	contig_10437_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_38108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	10.688779163216	64	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	64	495	71164	69994	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKREGDDWSQLSVLKKRRVGDLLASYIPEDEALMLRDGRFACAICPHRPVLDTLAMLTAHRAGKKHLSSLQGFYGKKQPGKGMEQNPRQQNELRREETKAEAPLLAQTRFITHSALHRAPHYNSCCRRKYRSVGWESQRKI	71227	69504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_70117_70233_70332_70430_70520_70784_70856_71113
857213	contig_14684_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_99675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347288	346810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_346800_347300
857215	contig_18173_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_160774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTAGCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64615	65223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_64600_65200
857216	contig_1863_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_156516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	250	753	60	812	32874	33626	NA	45	AGAGAAGAAAATGTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETFKEAVKAIISCFPNVFMASKLVRVVYASWSRVQADLNCMEDLLQSPVPWKYFLNTCGTDFPIKTNAEMVQALKMLNGKNSMESEIPTEYKKNRWKYHYEMTDTLHVTSQKKGPPPDNLAMFTGNAYIVASRDFIRHVLENPKSQKLIEWVKDTYSPDEHLWATLQRAPWMPGSVPNHRKYDISDLAAIARLVKWQGHEGDISAGAPYPPCTGIHQRAVCIYGAGDLHWLLQNHHLLANKFDPKVDDNALQCLEEYLRYKAIYGTEL	32814	34128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_+_32800_34100
857217	contig_6445_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_77039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTATCACTTAACTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566641	565105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_565100_566600
857218	contig_1406_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_25463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATCCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680466	681106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_680500_681100
857221	contig_4924_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_84750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCTGAGTGAGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178145	177102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_177100_178100
857223	contig_1288_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_147915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAGAAATGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123039	123528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_123000_123500
857224	contig_12485_pilon	+	662	3	Intergenic	novelGene_147294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGACCCAGAAATTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466920	471343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_467141_470186_470371_471085
857225	contig_11656_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_53976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACCTTCAGTCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189084	189843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_189100_189800
857226	contig_7530_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_141831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCAAGAACAGTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135433	136145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_135400_136100
857227	contig_11100_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_175537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGCACAAAACGCAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200744	200081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_200100_200700
857229	contig_7775_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_37474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGACTATTTTGTGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107729	108468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_107700_108500
857231	contig_12761_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_164072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCCTTTCTCTCGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415776	416137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_415800_416100
857232	contig_12761_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_164073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	405	731	416752	417078	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQPPGRRQRPRTCSPGALASPPSWPQRPPPARALSAASSSDRPDAAGLREQGRPARGGQGPPPTSTPQTLNHEKLFEKVLPHCLLSESGIGTVYIDHLCEVLSINAI	416347	417080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_416300_417100
857233	contig_15021_pilon	+	1379	4	Intergenic	novelGene_27001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	19.2930615046504	3	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	214	783	484829	487607	TRUE	25	CAGCCATGCCCAGTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTSGKLKRVLYCCPEIFTMRQRDIDDIVGVLREKCLFTVRQVTEILHRCPYVLREEPGELEYKFQYAYFRMGIKHRDVVKTDFLQYSITKIKQRHIYLERLGRYQTPDKKGQTQVLNPSLKDIFRVSEAEFLVKTACSSPEEFEVFKKLLAREEEEGPGGCTSDDSASSDGDVEDRDAEEEFTDGRD	484615	490775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_484845_486390_486576_487238_487625_490196
857234	contig_4426_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_15441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAAATTATCACAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827333	828080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_827300_828100
857235	contig_11855_pilon	+	647	3	Intergenic	novelGene_67122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	28.5	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	74	472	2642479	2644779	FALSE	25	TAGTACAAGTAGTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGGSQEAETRVPGSRTARGPSAGMHRRGVGAGAIAKKKLTEAKYKERGTVLAEDQLAQMSKQLDMFKTNLEEFASKHKQEIRKNPEFRVQFQDMCATIGVDPLACKDLSLRVHLFLRNRGSPSGHHHCLGALCRSAYGEIQRMCSLRGCNESGST	2642405	2644954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2642533_2642911_2642963_2644485
857236	contig_2704_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_75301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGATGATGTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91386	90985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_91000_91400
857237	contig_10196_pilon	-	923	2	Intergenic	novelGene_132129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTCAAATAAAGGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030503	1020972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1021830_1030437
857238	contig_12324_pilon	-	518	3	Intergenic	novelGene_166647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.5	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCCTTTTCCTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184748	102857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_103055_118660_118851_184617
857239	contig_1146_pilon	+	837	2	Intergenic	novelGene_84820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	258	junction_1	0	57	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3	431	841497	841925	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRVSVRSRRHRLLLAVFFLGPGVAGRARVWKRRRLPFLRLPFAAPLPPPRPALRAQAEPGTAVRFPRPPPPPPPPPSSRLPSQPRAGAECRWRPVRAATRASSGGGAWPCRVGEGNEPQSPGVSAEQRRRRRRHQVPAELE	841494	865409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_865015
857240	contig_3817_pilon	-	1449	11	Intergenic	novelGene_78375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_4	47.7434812304256	4	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	276	1448	869873	856737	FALSE	25	TCATTGGGAAGGATGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STREEPIHILNVALQSADHLEDEELVPIFRTFVQSKRNILVDYGLRRITFLIAQKKEFPKFFTFRARDKFAEDRIYRHLEPALAFQLELSRMRNFDLTAVPSANHKMHLYLGAAKVKEGAEVTDHRFFIRAIIRHSDLITKEASFEYLQNEGERLLLEAMDELEVAFNNTSVHTDCNHIFLNFVPTVIMDPCKIEESVRSMVMRYGSRLWKLRVLQAEVKINIRQTTTGVAFPIRLFITNESGYYLDISLYREVTDSRSGNILFHSFGNKQGPQHGMLINTPYVTKDLLQAKRFQAQSLGTTYVYDFPEMFRQALFKLWGCPEIYPKDILTYTELVLDSQGHLVEMNRLPGGNEVGMVAFKMRFKTREYPEGRDVIVIGNDITFRIGSFGPGEDLLYLRASEMARAEGIPKIYLAANSGARIGLAEEIKHMFQVAWVDPKDPHKGFKYLYLTPQDYTKISPLNSVHCKHIEEGGESRYMVTD	874660	856735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_856753_857302_857401_858481_858752_858853_858977_864678_864835_866121_866326_867193_867350_869723_869940_871524_871567_871810_871868_874550
857242	contig_10732_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_114744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552891	553444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_552900_553400
857243	contig_3721_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_123791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATATGCTCCCATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52212	53143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_52200_53100
857244	contig_6202_pilon	-	296	1	Intergenic	novelGene_139832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAACATTATGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567595	567299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_567300_567600
857245	contig_11748_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_177355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGGTTCTGTTTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235522	236257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11748_pilon_+_235500_236300
857246	contig_5083_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_151630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAATTAGAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113699	114631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_113700_114600
857248	contig_1804_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_177416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAAGGTCCTCTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206449	207615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_+_206400_207600
857251	contig_6673_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_164020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACCAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107057	106677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_106700_107100
857252	contig_7229_pilon	+	359	2	Intergenic	novelGene_39786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269453	305615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_269566_305368
857253	contig_19974_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_130487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340511	339661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_339700_340500
857254	scaffold_19766_pilon	-	1214	3	Intergenic	novelGene_34293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.5	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	154	327	433431	432413	FALSE	50	GAAAAAATGAGCATCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAESRADAAGCSASVRVAERAEVAEEAGRRQWLKGLRRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVIFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTSLVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRW	444470	431525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_432533_433377_433472_444357
857255	contig_8934_pilon	-	515	4	Intergenic	novelGene_167240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3139	junction_1	405.943619511654	10824	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTCTTTATTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603936	595834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_596052_601775_601837_602571_602661_603788
857258	scaffold_16539_pilon	+	692	7	Intergenic	novelGene_68411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.117292323665	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908250	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913683_915324_915365_916028_916162_917177_917291_918487_918634_918749
857259	contig_6557_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_32995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATTGCTGTTAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482627	481827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_481800_482600
857260	contig_1452_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_115165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTGTAAAGAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707196	706061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_706100_707200
857261	contig_5083_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_151631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCATCACCACTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116102	115511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_115500_116100
857262	contig_17964_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_33932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCTAAAAGGACGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652341	652108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_652100_652300
857263	contig_1406_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_25632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGAAAAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2624188	2623347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2623300_2624200
857264	contig_19518_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_170731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCCTCTTGGAGTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45377	45576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_45400_45600
857265	contig_19727_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_169006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACTTTCCACCTCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37400	36917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_36900_37400
857267	contig_12090_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_80487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACTCATAGCAACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79436	80416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_79400_80400
857268	contig_6028_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_156567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTATTTGGTCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279633	279429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_279400_279600
857269	contig_8671_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_126275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGAGCCATCTATATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557271	556371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_556400_557300
857272	contig_10371_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_175482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746766	745664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_745700_746800
857274	contig_14205_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_162114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAGTTTTTTTGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14465	13670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14205_pilon_-_13700_14500
857277	contig_8122_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_40219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTATGATTGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494838	494278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_494300_494800
857278	contig_1244_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_37933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGTGGTCTGAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718892	718150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_718200_718900
857279	contig_3424_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_55577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGCTGCTGTGATGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092255	1092540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1092300_1092500
857281	contig_3536_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_177859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTATGTGTCATAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318766	1319892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3536_pilon_+_1318800_1319900
857282	contig_7933_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_164660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAACTAAAACAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72751	73500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_72800_73500
857283	contig_7173_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_37541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAGCGAGATAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249452	248184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_248200_249500
857284	contig_15888_pilon	-	409	3	Intergenic	novelGene_84407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259753	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251799_254571_254685_259659
857285	contig_6446_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_149245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	126	434	567161	566853	NA	65	AATAAGAAAATAACTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRFTFPFSPIPCPHTTPSLFHLTALSPQMCNWTRDCCFNAFLISMFKSKDFIPWLLDEGRAKYRPGCSALIVKRINLFPCMWLGHSRQLSGPGVDEQPGS	567286	566155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_566200_567300
857286	contig_4884_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_63784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAATTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158591	159065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_158600_159100
857288	contig_15236_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_141536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTAGAAAAAGTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87697	87371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_87400_87700
857289	contig_1335_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_166521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTTTTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517081	516562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_516600_517100
857290	contig_8273_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_113091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285189	285591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_285200_285600
857291	contig_6065_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_132705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCGTTCAGAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507486	506531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_506500_507500
857292	contig_13876_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_174250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCAATTTCAGTGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67165	66316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_-_66300_67200
857294	contig_6302_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_171695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTCTAATCCAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113205	112554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_112600_113200
857295	contig_4369_pilon	+	564	4	Intergenic	novelGene_177860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	6.16441400296898	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	170	562	170040	174323	FALSE	15	TTGTTATTTGTTATATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEIGTGILLLPKVSKQTEYWNNVPAEYKHFNFNDLLNNKLEFEHFRQFLEAHSSSMDLMCWTDIEQFRRILFRDRNQREAKSIYIKNKYLNKKYFFGPNSPASLYQQDKIMHLSGGWGKILHEQLDAPVLLEIQKHVLNRLENVWLPMFLASEQFAARQKIKVQMKDIAEELLLQKHERKIGVWKA	168992	174325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4369_pilon_+_169161_170038_170202_172053_172213_174251
857297	scaffold_13609_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_124412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGACATTACAAGTCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621591	620943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_620900_621600
857298	contig_10838_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_129169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTCCTCCTGCCTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103919	89911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_90455_90944_91003_103512
857301	contig_8671_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_126281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTCCAATCCAGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626339	624820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_624800_626300
857302	contig_3193_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_126321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	54	410	142782	143138	NA	20	GGACGACGCATTCGGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNSRTLHLWHFVPHKQTLSSCMSTQKVQDRGALPSRVSGLLGMTPASHPAAPLLHFPPPTENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYAYRFVCDEHYYGEGCSVFCRP	142728	143140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_142700_143100
857303	contig_14536_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_69288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAATTTTCTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82089	81838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_81800_82100
857304	contig_12689_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_145057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTCTAAAAAAATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271137	269986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_270000_271100
857305	contig_11293_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_134661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCGCAGCTCAGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12310	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_11700_12300
857306	contig_6842_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_130738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAGAAATGAGTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235470	1236577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1235500_1236600
857307	contig_7410_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_106059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATGCATGTTGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159381	160121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_159400_160100
857309	contig_7887_pilon	-	996	9	Intergenic	novelGene_124909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	39	junction_1	29.5582052905788	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	378	995	479645	478090	FALSE	5	GGCGTTGTGCCTCCTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPEQPLRQRHTRRRRRDVVTETKIVELVIVADHSEVQRYPDFQHLLNRTLEVAFILDTFFRPLNVRVALVGLEAWTRADLVEISSDPSITLNNFLRWRRTELLPRLPHDSAQLVTATSFSGPVVGMAIQNSICSPDFSGGVNMDHSMSTMGVASSIAHELGHSLGLDHDLPGSTCPCPGPAPAKNCIMEASTDFLPGLNFSNCSRQALEKALLDGLGSCLFERPASLSSTGPFCGNMFVETGEQCDCGFPDDCTDPCCDYFTCQLRPGAQCASDGPCCQNCQLRPAGWQCRPSRGDCDLPESCPGDSSQCPPDVSLGDGVPCAGGQAVCMQ	481517	478088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_478237_478365_478459_478719_478895_478975_479125_479591_479677_479815_479986_480062_480132_480213_480280_481476
857310	contig_11594_pilon	-	990	5	Intergenic	novelGene_80894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	75.9555791235904	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	227	835	114812	106343	FALSE	75	CAAAAAAAAAATTAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIEEIAHQIIEQQMGEIVTEQQTGQKIQIVTGLDHNTQGKQFILTNHDGSTPSKVILARQDSTPGKVFLTTPDAAGVNQLFFTTPDLSAQHLQLLTDNSSPDQGPNKVFDLCVVCGDKASGRHYGAVTCEGCKGFFKRSIRKNLVYSCRGSKDCVINKHHRNRCQYCRLQRCIAFGMKQDCMYYLNGENTFKDSGKLKVY	142322	106187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_106585_107801_107884_111145_111377_114758_114833_142116
857311	contig_9527_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_134052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	118	450	427199	427531	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPSSVLNEKQTPRLTPAHRSSSAVRSLASVFLPFPKTPPHTSSHCPSGLSLACRQDCPTRIPPSVSCSDTCNYCLESSVYIYTPLPGTQGRASCRGIFLCFKALPPGSH	427081	428297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_427100_428300
857314	contig_18822_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_111740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCAGTGGGATGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227770	228614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_227800_228600
857315	contig_18822_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_111741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	189	323	229003	229137	NA	50	GCTATTTTAAGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQTLKSRGFGVRRCSDLLGSVERKRGDLVPSKPGPQEALPTSSHSLLERCHLPVGKPRPAHWMEGERHEAPPLISQPLTDLATDHPAQTRTSSYPHPRVPKHRIMR	228814	229146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_228800_229100
857316	contig_1545_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_149734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATATATGGAAACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24474	23831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_23800_24500
857317	contig_12019_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_87689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAGGTTAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55383	56082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_55400_56100
857318	contig_9389_pilon	-	829	7	Intergenic	novelGene_84062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	2.16024689946929	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	804	26	829	933871	927466	FALSE	15	GGTAGGTGCCCTCAGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTLTQNIMTFKKCCINGHIYGPDNEDTLPKVNPYLWNEFADGKLLFHNKELLSAVRAKKDKVVQEFWRLLALCHTVMVREQNNQLLYQAASPDEEALVTAARNFGYVFLSRTQDTITVVELGQERVYEVLAMMDFNSVRKRMSVLVRNPEGSICLYTKGADMVLFQRLSKRDVTETATEEALAAFAEQTLRTLCLAYKEVDKDAYEAWSLRHQEANLLLQNRAQALHQLYEEMEQNLQLLGATAIEDRLQDGVPDTIRCLKNGNIKVWVLTGDKL	933896	927465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_927577_927685_927851_928981_929095_929201_929391_931127_931285_931375_931405_933831
857319	contig_10951_pilon	-	697	4	Intergenic	novelGene_61614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	96.7689114448552	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	57	446	63149	50392	FALSE	75	ATAAAAAAAAAGAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVRVNRYAPRGVGRKALKVKKKKPSVKQEWDNTVNDLTVHRATPEDLLRRHEIHKSKNRALAHWELQEKALKRKWRKQKPEAASLEKRRLAIMKEVMLKFIIFKVRKKVKRFLFFPTFVYIVERLVN	68449	50140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_50635_60377_60426_63050_63150_68393
857320	contig_9807_pilon	+	1416	1	Intergenic	novelGene_32903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTGGAAAACAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121064	122480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_121100_122500
857321	contig_3252_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_61513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	501	297	797	662722	662222	NA	30	TGCAGGCATAGCAGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHMLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLLDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSPGICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTAMATTYRDPTTEYTKRISSSSYHVGDKEIPT	663018	662219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_662200_663000
857322	contig_1534_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_176129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	45	329	29825	30109	NA	10	CGGTTACAGTCTTTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTWRFVFPAQRACMASEKFKGRFSGFGGDLLGVTLQRLLCRVFTGLPQEPRISVKIVPLKKFSQARCEDCFLMSLMCSASGAVADPWGKRLIQECAKICSSFHTQRT	29780	30947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_+_29800_30900
857324	contig_14814_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_137692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTCAGCTGTTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89754	88685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_88700_89800
857326	contig_11003_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_105454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTAAAAAAAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445295	444349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_444300_445300
857327	contig_12158_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_104840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAACAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22379	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_+_22400_23400
857329	contig_3161_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_84539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGACGACTGATCTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532736	532046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_532000_532700
857330	contig_10890_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_166776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAACTTGTCTTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124493	124166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_124200_124500
857331	contig_5095_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_74954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCGTTAGCAGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259498	258610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_258600_259500
857332	contig_1275_pilon	+	589	3	Intergenic	novelGene_108814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACAAAAAGAGCAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673386	689659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_673794_674992_675107_689591
857333	contig_4842_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_177863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTCATGCCTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218027	231147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4842_pilon_+_218094_230916
857334	contig_5918_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_99516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAATTGCTCTCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512303	511401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_511400_512300
857336	contig_14575_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_101911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTATAAAATTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183446	182007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_182000_183400
857338	contig_10855_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_124354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTTTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625236	624302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_624300_625200
857340	contig_1867_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_54499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAGACAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17833	18752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_17800_18800
857341	contig_7080_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_100121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAATGTTGAATTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548476	549042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_548500_549000
857342	contig_5945_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_104601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383969	382987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_383000_384000
857343	contig_11512_pilon	+	1023	2	Intergenic	novelGene_43328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACATAAGACTCGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529018	530735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_529969_530662
857344	contig_14638_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_71587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAATAACTCCCTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267652	267124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_267100_267700
857345	contig_10868_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_173892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTTCAAGCAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399909	400370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_399900_400400
857347	contig_3818_pilon	+	636	3	Intergenic	novelGene_99326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAGAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320019	1332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1320058_1331714_1332210_1332355
857351	contig_10239_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_175250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGAGTAAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56214	56749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_56200_56700
857353	contig_12292_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_167021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACGAGACCAAACGGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409074	409689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_409100_409700
857354	contig_3797_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_120107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482327	483445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_482300_483400
857355	contig_9335_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_147464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCTGCCCCATCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655281	657211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_655300_657200
857356	contig_7080_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_100111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGAGCCAGGCACTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509933	510335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_509900_510300
857357	contig_13481_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_119337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCACCCCTATACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340248	340053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_340100_340200
857359	contig_15410_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_130596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGGAAATAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137300	136611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_136600_137300
857360	contig_9484_pilon	+	174	2	Intergenic	novelGene_105597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATCGAATGTGGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20919	45799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_20982_45687
857361	contig_14783_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_176471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCGGCCGGCCCCGCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41624	40500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14783_pilon_-_40500_41600
857363	contig_11304_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_156707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACGGTACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382395	381641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_381600_382400
857364	contig_5153_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_74326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553950	554719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_554000_554700
857365	contig_13349_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_161143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGGCTGCTAACCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415170	415606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_415200_415600
857368	contig_20028_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_170646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCCCAGGCTTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11553	10829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_-_10800_11600
857370	contig_9515_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_73799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	45	320	30472	30197	NA	35	TTCTTGAAGCTGAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSTPVLPHPCRSWMRSFGKGCPERERLPETPPHAHPEPGPAPTCCISEAGSRGQAGPHSQPLGMACPSWLLGPPKLLWVKAWWWLREVSLLGTVEPQGDCTGTA	30516	30086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_30100_30500
857372	SIRV3	+	441	3	NNC	SIRV3A	novel	436	3	NA	NA	4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4081_4568_4772_6553
857373	contig_5434_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_74699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGGTCTCAGGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445890	446873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_445900_446900
857374	contig_4402_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_140830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTTTTTAGGTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591869	590941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_590900_591900
857375	contig_1848_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_177864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTCTGAGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58218	57545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1848_pilon_-_57500_58200
857376	contig_6654_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_85728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAATTTCAGAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388551	388156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_388200_388600
857380	contig_10642_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_78642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGGTTCTATCTCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25031	24306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_24300_25000
857382	contig_10675_pilon	+	1058	4	Intergenic	novelGene_176289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	10.9848380355227	6	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	31	672	118746	141263	FALSE	35	GATATGAAATGGAGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPPAKPPAASMASEFKKKLFWRAVAAEFLAMILFVFISIGSALGFNYPVSGNQTANASQDIVKVSLAFGLSIATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISILRAVMYIIVQCVGAIVGTAILLGVTSSLPNNSLGRNGLVPGVNSGQGLCIEIIGTLQLVLCVLAITDRRRRDLGGWAPLAIGFSVALGHLLAIDYTGCSINPARSFGSAVITHNFTDHWT	118715	141649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10675_pilon_+_119136_129058_129224_130190_130272_141257
857383	contig_6489_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_128923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACCCTGAATATCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116187	115617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_115600_116200
857384	contig_6589_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_25979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	373	783	1312347	1314617	FALSE	10	ATGTGGCTTCTCCTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNKLLDSSLALGMKVLELVHGREFLHIQSIGGHNIWFPLEEVLSLDGSDLGDSSEDMSTVGGRSLHAVAVINLPLTCFLVHIEILQVVVEVHSTSTQVTPQQRGMGGKDGSHGQPPGSAQAKPDARQPLVKVCNN	1311053	1314617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1311295_1311918_1312041_1312337_1312457_1313765_1313911_1314461
857386	contig_3956_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_14783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAAGGAAGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029223	1028786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1028800_1029200
857387	contig_13680_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_149590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAAAAAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372417	371522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_371500_372400
857388	contig_6217_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_109562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACAGTTCTATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22933	23717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_22900_23700
857391	contig_13456_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_153315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTAACCTTACTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594999	594554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_594600_595000
857392	contig_10057_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_162330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTAGGGTAAGGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32993	31925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_31900_33000
857393	contig_7840_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_68950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAATAGTCTAACTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40134	40835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_40100_40800
857394	contig_10711_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_118448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCTTGAGCAATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832245	831612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_831600_832200
857396	contig_17103_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_176948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAAGTAATTAAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142363	143807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17103_pilon_+_142400_143800
857399	contig_5954_pilon	+	301	3	Intergenic	novelGene_28467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAGTGGTGAAGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164871	169019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_164916_168619_168795_168937
857400	contig_5954_pilon	+	195	1	Intergenic	novelGene_28469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171377	171572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_171400_171600
857401	contig_17470_pilon	+	527	3	Intergenic	novelGene_110501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	20	junction_1	11	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	34	465	249499	252803	FALSE	25	TAGAGACAAGTCTTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAANHRWSQKAMDDTFYLSNVAPQVPHLNQNAWNNLEKYSRSLTLTYQNVYVCTGPLFLPRTEADGKSYVKYQVIGKNHVAVPTHFFKVLILEAAGGQIELRSYMMPNVPVDEAIPLERFLVPIESIERASGLLFVPNILARAGSLKAITAGSK	249465	252865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_249538_251205_251316_252520
857402	contig_3604_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_139996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGAAGGTAGCATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53720	53035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3604_pilon_-_53000_53700
857406	contig_1008_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_121563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCAGAGCATACGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594190	594706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_594200_594700
857407	contig_16187_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_101071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	71	436	53023	52658	NA	50	GCAAGAAAATCAAGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRQFAFFAEYFSENSVQAPIDFSLVRPEFESRSCPRWLPRRHWGTISSSRGPGTRTVSRSSGRSGRQPGRGSSGLFQQLMCLCFVANFCFPFRKCKAILFIFSMKTQICLIFKLLHFRR	53093	51824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_51800_53100
857408	contig_19352_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_122379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115542	116301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_115500_116300
857409	contig_3424_pilon	+	270	2	Intergenic	novelGene_55563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATCATTTGTACTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985547	986687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_985598_986467
857412	contig_12414_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_59665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCCTGGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785572	786381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_785600_786400
857413	contig_4385_pilon	+	905	4	Intergenic	novelGene_141507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	8.37987005998436	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	196	582	349094	351442	FALSE	25	CCCTAACAGGTTTTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEFTCQVAGCCQVFDALASYEHHYHVLHSNVCSFCKRAFPSGHLLDSHILEWHDARFQILAERQDMYQCLVEGCEEKFKTSQDRKEHMVKRHLYPADFRFDKPKKSRGPAAPGATMPVSAKAPAGHGEQSEGDAMEVCSDGHVAPSPVPAGESSATPGLPGRRAYSHRIPATVCFGQGASRGFKSTKKRSKHH	348898	351765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_349097_349332_349458_350475_350656_351363
857416	contig_10434_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_82028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACATACCACAAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127995	128731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_128000_128700
857418	contig_14499_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_174026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAGAGAGGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111605	112005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_111600_112000
857421	contig_4838_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_144791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATTTTCAGATAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264451	263875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_263900_264500
857422	contig_8412_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_118382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668718	669071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_668700_669100
857423	scaffold_12124_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_22171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215798	1216121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1215800_1216100
857424	contig_5403_pilon	-	744	4	Intergenic	novelGene_87970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	107.350930234545	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGTTTCAAGACTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430980	424186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_424714_425189_425316_428421_428475_430942
857427	contig_960_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_108329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTAAACATAAGTAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079736	1078459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1078500_1079700
857428	contig_10765_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_122894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACAGCCCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87811	87193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_87200_87800
857429	contig_4305_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_136654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCGTATGTTCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463437	464344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_463400_464300
857430	contig_11253_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_126834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAATTCATTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169881	170516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_169900_170500
857431	SIRV6	-	101	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	167	8	167	-8	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAGTAAGAGTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653	1552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1600_1700
857432	contig_4364_pilon	+	842	3	Intergenic	novelGene_210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAGAGACACGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337209	1339073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1337249_1337503_1337627_1338393
857434	contig_2278_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_118142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATGAGTTCTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389030	1389741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1389000_1389700
857435	contig_12644_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_44464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTAAGAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002013	1002261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1002000_1002300
857437	contig_5623_pilon	+	651	3	Intergenic	novelGene_154877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289381	293775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_289432_291579_291931_293525
857438	contig_1406_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_25496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCACTGGCTACAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366684	1365511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1365500_1366700
857439	contig_9146_pilon	+	862	3	Intergenic	novelGene_79516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	2.5	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCTTATGGCAGGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359598	372604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_359763_360662_360930_372173
857440	contig_13937_pilon	-	887	5	Intergenic	novelGene_167345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	114.635018646136	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	127	885	37830	30854	FALSE	45	AAAACACTTGTAAGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYLKITKRLLFQVLRCEESIHSWPALPLPEERILEAARLEGQFETNACKSLIIKIMSELCRHLPGYHSGLDNLDYFPAEKWSQALRVLCGTSIPTLYCPRIVLEVLAVLRKVSAQCQQVCDQVVSSAKLRHRQWVEKTLRSRQRQNYLRMLGSIKLLSPVLYLILLLIALELVNIHAVQGKHTCEYQRYLKFLKSVLQYTENLATYTSQEKNKWDETVSLTHGVLLKIWTYSEKKQMLMHLAEKPTDKAVS	37956	30851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_31035_33433_33548_36079_36299_36824_36951_37711
857441	contig_7457_pilon	-	354	3	Intergenic	novelGene_31289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7490	junction_1	1176	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	82	324	159181	157884	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	159262	157853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098
857442	contig_10016_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_117843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACCCCAATAATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216784	218333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_216800_218300
857444	contig_3822_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_133287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAACAGAAAGGAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184598	184922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_184600_184900
857445	contig_16686_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_162099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCCCAGATATAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166159	166567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_166200_166600
857446	contig_7410_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_106133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTAGCTTTCTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929970	933450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_930652_933158
857447	contig_6842_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_130821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	232	642	1765511	1765921	NA	30	CTCCTGTAACAGAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTSTNRQVVAVHEVRWLGIEPRSPTWKVRILPLNHHFTIHNAFSYLLTWLLFSQVTGRQREGKMFPLPVPASGRLLSIFSSLVKSPSKTGTGFELALSALPPQSLAKCLRPTPSSSADAAGNVYNHNQALREPQH	1765279	1765937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1765300_1765900
857448	contig_7644_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_64266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213088	214073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_213100_214100
857449	contig_3380_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_60129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.7156650905785	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	14	310	509787	467682	FALSE	10	TGTATTCCTGTGGACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPTMEGDVLDTLEALGYKGPLLEEQALIQAAESGLSSPEFSELCIWLGSQIKSLCNLEESITSAGRDDLESFQLEISGFLKEMACPYSALVQEILKTTEIR	509800	467280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_467718_492708_492786_493942_494089_509749
857450	scaffold_12124_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_22428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTAGTTTATGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661782	1660866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1660900_1661800
857451	contig_4732_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_75448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGTTCTACATTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653530	654204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_653500_654200
857452	contig_12278_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_152585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	44	388	158674	159018	NA	45	AGAAGATATAAAACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSVLCCVHTGKVGPTSPSRMQGWDQPVQEQRLLGALLCSSGASCLPSSQAAPQHPGRGLGERVRDGTAAPRDWGLSLACLLGCSWRLRLVFCVYLLGGGLGEELSGLGDTLA	158630	159317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_158600_159300
857455	contig_19098_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_65825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAGAAAAAAAATAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368897	369380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_368900_369400
857456	contig_15353_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_151959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATAAAAAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214463	214687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_214500_214700
857457	contig_6489_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_128939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGATTTGAAGAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238699	239032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_238700_239000
857458	contig_6270_pilon	-	396	3	Intergenic	novelGene_99861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACCGTCCGGACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006505	988679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_988786_1004599_1004768_1006383
857460	contig_1594_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_138828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTCGCCAGTTATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583232	583577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_583200_583600
857461	contig_7356_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_60359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTGGACTGTATGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114302	115011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_114300_115000
857463	contig_15114_pilon	+	1619	12	Intergenic	novelGene_121215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	12.0707282025089	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1566	52	1617	967395	994595	FALSE	50	TAGAAAACAGGACACCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPKRTVPKRKAPDGHNGAAYPAGAAKRARADELTGVQFKTQLRDSQDAGPALEAFVSAAKQLPQEGAYDVVEGYIKISVECAEIFQLLSGEKRPESETLLMFQAFEAILLRTASDLSHFHAVGTNIVKKLLNNHMKLICESLYASGYRLARACLNLMAALVAQGAEAARDVCSHFDLNKKPLYALVTKRDSKGVPDVRLAYIRFALSFLVAGDDNTIVQVLELKEFIPCIFSSGIKEDRISTINLLLSTLKTKVVHNKNITKTQKVRFFTGQLLNQIASLYAWKGITDVDTDGVKASAEEAGKTMVRELVHNFLMDLCCSLKHGINFYDASFGTFGRGGNLTLLHFLLGLKTAADDELVADLVVNILKVCPDLLNRYFKEVTFSFLPRVKSAWLNNIRLLNKIYEAQPEISRAFQTREFIPLPRLLPMVMVTTVPLVCNKIMFTQALNLDSKLVKHTALSLISVILKRALKNIDHCLNKEVWQESGVYTPEMTEEFVPLFREALSKILPDLNTIVWVWQS	967343	994597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_967552_968741_968882_969433_969586_970736_970870_977236_977334_979713_979800_981377_981504_982830_982956_986846_987043_988685_988824_992346_992521_994553
857464	contig_16382_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_160239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGGCATATAGAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288665	288079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_288100_288700
857465	contig_12644_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_44524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCACAGTCCCGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346511	1347317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1346500_1347300
857466	contig_935_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_45540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAATTACAGAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327073	327845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_327100_327800
857468	contig_11354_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_177865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATAAGGCCTGCGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236490	236804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11354_pilon_+_236500_236800
857470	contig_6902_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_135566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTTCCACCATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309285	310109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_309300_310100
857472	contig_1399_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_166659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45900	45587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_45600_45900
857473	contig_10711_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_118410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGTATTGAAGCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179074	178058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_178100_179100
857476	contig_13481_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_119447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGCTCTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066918	1084438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1083899_1083990_1084237
857478	contig_7182_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_117103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTGGATCTACCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113557	114415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_113600_114400
857482	contig_345_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_176941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCTGCTTTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102136	103048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_345_pilon_+_102100_103000
857484	contig_3774_pilon	-	290	2	Intergenic	novelGene_142033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146444	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370
857486	contig_1996_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_131891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAGAACTGCACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230167	230538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_230200_230500
857489	contig_9516_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_106207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404850	1405957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1404800_1406000
857491	contig_6304_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_122262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATCTGGGAAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221912	221435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_221400_221900
857493	contig_4732_pilon	+	476	3	Intergenic	novelGene_75421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95	161	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAACCTGCGCCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596704	609488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604102_609185
857494	contig_12630_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_173068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTACAGTTCAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61860	61062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_61100_61900
857495	contig_7695_pilon	-	514	3	Intergenic	novelGene_41632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.5	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	181	378	693955	692987	FALSE	15	TCGGTGAGCCCAACTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSNHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLREELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDTSPQRGEGGRSPKTLWMTCFPMRRSRAQPPVLEEEMWPPSMEATKSRPGSAPCTT	694135	692850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_693071_693727_693799_693912
857496	contig_1719_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_87263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACTGGTGGCTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257319	257669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_257300_257700
857497	contig_3832_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_161434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATAGACTTAGTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101583	100911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_100900_101600
857498	contig_13481_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_119463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCACTGCAGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212572	1213120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1212600_1213100
857501	contig_5039_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_64902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTGAGTTTGAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622602	621757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_621800_622600
857503	contig_5551_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_134246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAACTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480028	479241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_479200_480000
857504	contig_14300_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_133147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAAAACTTTGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485453	486184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_485500_486200
857506	contig_14273_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_21133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	822	1136	33254	33568	NA	15	CACCTCTTCTAGCTAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHGSTIVDSCQRLVDREYGKADSRCSQQETEHPVTSETCFPTPPCLPLLDLHRFLGGRSVGSRRVDSRLPRRPIWCFSVGCFPASQRADSQLPGGLIPSFPVG	32432	34008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_32400_34000
857507	contig_10258_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_155042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1	513	61251	61763	NA	65	AAATTTGAAAAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGENKPGVVVAHSRDSRPRSLFTRQGSVALSGFSAAVALHSSGQCRLEFPRAPQGCGEVRAPHNTPSWPLLSPAALPEGAGWTLDQSTSAPGLALLFLQGLILGPRPAPPPELLSQPSNFPSPRWSLEGLTVLGGYRSGRSPGPPTRAARRARRCRERLSGRGGWRKKRP	61250	62315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_61200_62300
857508	contig_12790_pilon	+	975	1	Intergenic	novelGene_35290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	349	711	457457	457819	NA	50	ACTAATACAAGGCCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHWGPFLGSSVPSLRGPEMITRGPQIHEYDENLGYNDGYTRVHELFYEFPSHPSVGKPDSYKYKIQLMAYETLPICDVAQPLSFFFSLTGSFFLLKHAKLIPASGFLPLLFLLPEMFFS	457108	458083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_457100_458100
857510	contig_10446_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_162510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068207	1067712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1067700_1068200
857511	contig_9132_pilon	+	565	6	Intergenic	novelGene_121368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	14.388884598884	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	161	343	94035	95521	TRUE	15	GCCTCTTGGCCACACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AACVLTTAAVQLDLLSPFQLYFNPHLVFRKFQVWRLVTSFLFFGPLGFSFFFNMLFVFRYCRMLEEGSFRGRTADFVFMLLFGGVLMTGLQWATSTTTWRMCSPTSLEERGCC	93628	95844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_93660_93828_93895_93971_94046_94138_94233_95443_95535_95635
857514	contig_17519_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_177302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62948	62318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17519_pilon_-_62300_62900
857515	contig_18251_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_50178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAATTAAATGCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153087	152422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_152400_153100
857516	contig_2438_pilon	-	633	2	Intergenic	novelGene_112086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	285	425	462574	462434	FALSE	15	CCAGCTCATGTTTGCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPGRLAGLALPRLPAHYQFLWDGGVRHLVSLTQRGPPYSDTCPDLTLHRLRIPDFCPPAPDQIDRFVKLVDEANARGEAVAVHCALGFGRTGTMLACYLVKERGLAAGDAIAEIRRLRPGSIETYEQEKAVFQFYQRTK	463979	462225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_462620_463740
857517	contig_7976_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_169417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATAAAGCTAAACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837085	836647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_836600_837100
857518	contig_1435_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_115524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGACACACCTTAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584235	583611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_583600_584200
857519	contig_11416_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_145357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGGAGTGATTTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348708	349419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_348700_349400
857520	contig_11751_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_150281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	19	336	7470	7787	NA	60	TAAACTATAAAAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQWKQMVINVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYNTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRK	7451	7925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_7500_7900
857521	contig_11855_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_67157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATTATTATACACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2724548	2725447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2724500_2725400
857522	contig_1735_pilon	-	283	2	Intergenic	novelGene_106904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAAAGCCATCCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177485	174968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_175157_177390
857524	contig_4068_pilon	-	409	4	Intergenic	novelGene_161692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	50.9901951359278	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	12	407	10743	3842	FALSE	60	AAAGAAATGTGAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKQMGKIEHLQKNLLGTSSSEDEKEQLKKLIELKQSLEYRLDQEMKKNGELEKEITGFKKLLKMTRKKLNEYENGELSFYGDLKTNQIEMDIQMAMLKHKIDDLTAKLETSSSKCLHLDAKNQALQQELLAVKAV	10754	3839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_3947_7887_8018_10186_10300_10695
857526	contig_11396_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_71370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGGTGGAAGCAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036263	1036003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1036000_1036300
857528	contig_12644_pilon	-	605	2	Intergenic	novelGene_44438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCATGGTCATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223699	222992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_223397_223498
857530	contig_5894_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_83068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803586	804243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_803600_804200
857531	contig_6424_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_109262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGATTACTTTGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20935	20685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_20700_20900
857532	contig_6557_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_32934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGGTTCATTTATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245243	245907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_245200_245900
857533	contig_18272_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_7061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGGTTAAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505217	504649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_504600_505200
857536	contig_11396_pilon	-	517	4	Intergenic	novelGene_71400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_3	709.857732225268	187	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCTGTGTTAGTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555545	1554265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554470_1554871_1554944_1555079_1555294_1555518
857537	contig_12532_pilon	-	811	1	Intergenic	novelGene_111153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATCCTTATGAAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107770	106959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_107000_107800
857540	contig_7866_pilon	-	970	3	Intergenic	novelGene_171202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTACTGAAGCTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420815	418697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_419372_420125_420256_420649
857541	contig_11978_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_63148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGCTGTGTATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2076216	2076918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2076200_2076900
857542	contig_16714_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_161554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	548794	548387	NA	70	CTGAAAAAAAAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNALLSRRWAGRIGPDDGVEPSGALGKAKERDTFKRSLSVRYSGSQPSSTSVLLDHLPESRRPIKEERAGDTLSSHLSDSIQGAHLIPFHLLARKIQRETPSIRKHSKGRKGADFATGFVVTQFPLIGFHFIWF	548795	547684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_547700_548800
857544	contig_9479_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_176675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32463	32943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_+_32500_32900
857545	contig_756_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_134768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCAAGATATAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156679	156137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_-_156100_156700
857548	contig_753_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_113005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATTTAAAGTGCCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324586	1323582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1323600_1324600
857549	contig_2278_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_118158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGGATTTGTGCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1507602	1508270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1507600_1508300
857550	contig_8357_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_39690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTTAAAAAAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240796	241512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_240800_241500
857551	contig_3252_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_61517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAAAAAAAATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728711	729766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_728700_729800
857553	contig_10489_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_165626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACAATTTCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62469	62709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_62500_62700
857554	contig_10013_pilon	+	515	4	Intergenic	novelGene_125085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	21.9241115365405	248	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	96	434	498970	500692	FALSE	20	GCCAGTGTGAGAGATTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVSLFLLLLPVLELLVSGESLCPVDAAINQKIQKGTISLILEALRRIHLDCRSVTSSGDLVTCPSGFAVTSCTCGSACGSWDVRAETTCHCQCANIDWTGARCCRIQASI	498687	500773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_498773_498959_499094_500143_500222_500555
857555	contig_7457_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_31570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGTCAGAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894635	895427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_894600_895400
857557	contig_12619_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_73555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCGTGATCTGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674762	675480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_674800_675500
857558	contig_2219_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_67184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGTGTCATTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136111	136305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_136100_136300
857560	contig_9594_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_73953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTTTATTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311069	311664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_311100_311700
857561	contig_13904_pilon	+	1028	7	Intergenic	novelGene_165504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAACAGACAGCATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148576	165101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_148860_150287_150426_154693_154812_158081_158162_161132_161287_162465_162628_165008
857562	contig_4315_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_46762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAGTATTTAGGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254593	255347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_254600_255300
857564	contig_5472_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_130039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433001	433599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_433000_433600
857565	scaffold_16539_pilon	-	701	4	Intergenic	novelGene_68400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.4957911384305	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	117	458	796029	795027	FALSE	15	CGAATCCTGCTTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVNEGVSLLITLVIVPSAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLED	796145	794783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795469_795639_795772_795838_795923
857566	contig_11068_pilon	-	1288	12	Intergenic	novelGene_130545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	45.7107325950937	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	191	967	247620	149110	FALSE	20	TAATCATTGGTGGGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGSLSPAPSPPCNQDQRLSPRVQPENLQKNWLREFYQIVHAHKPHFLALHCQEFGGKNYEASMSHVDKFVKELLSSDVMKEYNRARVYLDENYKSQEHFTALGSFYFLHESLKNIHQFDFKAKKYKKVTGKEIYSDTLESTPMLEKEKFPQEYFPECKWSRKGFIRTRWCIADCAFDLVNIHLFHDASNLVAWETSPSVYSGIRHKALGYVLDRIIDQRFEKAAYFVFGDFNFRLDSKSVVETLCTKATMQTIRAADTNEVVKLIFRESDNDRKVMLQLEKKLFDYFNQEVFQDNNGTAESTAQAVCVAALHPAAADPGT	295094	148788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_149176_149379_149455_149887_149984_171655_171741_182883_183004_184510_184564_194499_194604_201035_201100_241947_242036_247594_247696_279848_279891_295021
857567	contig_9272_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_125937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415559	414893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_414900_415600
857568	contig_1008_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_121536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGATTTGTAGTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254507	254133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_254100_254500
857569	contig_610_pilon	-	910	3	Intergenic	novelGene_76694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	6.5	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	59	781	161765	148620	FALSE	25	TCAGTGTATTTCGGTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPKGLLSLNLLLLLSLAFELSCGTGGHSIDCRKIIQRLGSNIVLPLTYEGINKSMSKSIRIVVTMETSPGSTFKKKIVSLDPSEGGSPPNLEHRYKFHLENLSLEILESRKEDEGWYFMTVEQNFSVQQFCLELRLYEEVSTPEIKVLNWTQQSGNCSLMLACTVEKGDHVVYSWNKEMDAHPLSLANDSHLLYLTLGPQHVNNAYICTVSNPISTRSQIFIPGPSCRPNPSGECPGGG	161823	148490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_148928_151219_151559_161689
857570	contig_9727_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_86289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCCCTGGCTGCTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187049	186752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_186800_187000
857572	contig_15182_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_136444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCAGGATGTACTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369953	370898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_370000_370900
857573	contig_1154_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_87038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATAGAGGATGCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40651	41584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_40700_41600
857574	contig_4426_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_15352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCAGAGCAGTTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16755	15812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_15800_16800
857575	contig_8652_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_168788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	777508	777161	NA	55	TTGCAAATCATTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSRTPSYRFQACHISPPETGFLRSLTCGQLHFVRYVFLILPRENSHRCRWRLRQTPSLLPKIGRACESTKLEAELFRVPAFSNKERNFLSQESRKWCYCELVLTLCLSEFSVLK	777508	776727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_-_776700_777500
857576	contig_15114_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_121190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCCAAGACTTAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724495	724761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_724500_724800
857577	contig_11416_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_145365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGACCAGCTGCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565584	564304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_564300_565600
857578	contig_7057_pilon	-	278	5	Intergenic	novelGene_123295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	33.0340733183179	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGGCCGAGGTGAGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898108	897316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_897359_897464_897540_897628_897703_897944_898000_898076
857579	contig_4531_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_47837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44597	43533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_43500_44600
857580	contig_7612_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_170356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37738	38192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_37700_38200
857582	contig_3252_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_61511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATTGTTAGGTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656718	657750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_656700_657800
857585	contig_10428_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_162591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTGCTTTTCATTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44518	43821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_43800_44500
857587	contig_7619_pilon	+	557	5	Intergenic	novelGene_162155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	109	516	303599	305821	FALSE	25	GCAGAGAGGAGCCAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVPARPAAAHSGVLLFLFLQILDKRNLGFFLWSPPLLWRSSFWIMSCSIWSSSCSLSRSLSRKSTMSLRSFTVFTYWFSSSFSRCRSWGDFRASACPSASAAPPPGPSAVPPGAGLWTCTSAPTPASAAAASHG	303490	305862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_303724_304094_304137_304766_304885_305588_305658_305767
857588	contig_8570_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_120153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAGCAACGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327230	328108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_327200_328100
857590	contig_6589_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_26233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCGTACTCACATTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139569	2139848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2139600_2139800
857591	contig_8386_pilon	-	745	4	Intergenic	novelGene_82238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_3	31.3793987620328	4248	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAGAAGTAATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86987	78702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_79207_82649_82775_83696_83720_86894
857592	contig_9720_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_116795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAAATGTTGAATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415807	416341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_415800_416300
857593	contig_9720_pilon	-	200	1	Intergenic	novelGene_116793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412861	412661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_412700_412900
857595	contig_21418_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_177866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAACAGACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980	469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21418_pilon_-_500_1000
857596	contig_14954_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_165182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGTGAGGAAATAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135630	136892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_135600_136900
857599	scaffold_16539_pilon	-	841	3	Intergenic	novelGene_68325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	119	577	266874	264034	FALSE	5	CCTTTTGCCTCTATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPYGPELYPAPVLPYDAYPPPPGPFARREAPYGAPPFDMPDFEDDGGPYGESEAPAPPSPGTRWRYRPRDTRGSFSEPEELPEGGGYNGAPAGRYEGLEAEECGILDGCAHGRCVRVPEGFTCDCFDGYRLDTTRMACVDINECDEAEETAPLCVNARCINTDGSFRCLCRPGFAPSHQPHHCTPARPRA	266992	263769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_264189_265842_265996_266723
857600	contig_10765_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_122992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATAAAAAAAATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596390	595900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_595900_596400
857602	contig_15456_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_139491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94340	93344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_93300_94300
857603	contig_10976_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_155601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAATCTGAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219347	218907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_218900_219300
857606	contig_2323_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_151850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123147	123730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_123100_123700
857607	contig_14184_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_66610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGAGATGTCTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275249	274887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_274900_275200
857608	contig_11656_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_54037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGATATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519412	519152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_519200_519400
857610	contig_3426_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_57952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATCTTTGTGACAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385016	384508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_384500_385000
857611	contig_7707_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_72235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAAGGAGAAAGGGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167815	1167341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_1167300_1167800
857612	contig_1244_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_38051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGCAAAAATTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001343	1000212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1000200_1001300
857615	contig_2227_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_142324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	229677	229312	NA	50	CTTGGAGAACTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPVGGLLLCRLKLRLCLHALAAWIVLHVRGAGHRAYSVFTFLSPLRVYLAGYTSRRSLQRGVGASAIGAGWRAAGWEGKWRERALAALSARGTGCSLGFPSGRAANATEGFLPSPGVGVE	229678	228938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_228900_229700
857616	contig_3123_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_162977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCTGTCTCAAGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156737	157521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_156700_157500
857618	contig_401_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_42799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613990	1613300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1613300_1614000
857619	contig_14426_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_170625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	280	843	153	995	175898	176740	NA	20	GAATGAATTCTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEISDADKNLVRDAIRRDRFESIFSYLHFADNSHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLEEYYCFDKSMCECFDSDHCLNGKPTRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEQSTVTADKDLDLGIGGNLVMNFADVLLERGQYPYHLCFDSFFTSVKLMSALKKKGLRATGAIRENRTEKCPLMDAEHMKKMKKGYFDFQVEENEEIMLCRWHGDGIISLCSNAVGIEPVNEISCFTDDEEILQISQPSIVKLYDECREGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDLAMNNAWQLHRACNPGASLDLLDFRRCVAHFYLEHNANLSD	175745	177029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_175700_177000
857620	contig_10312_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_159025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCCCATTCCCTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208550	209014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_208600_209000
857621	contig_10748_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_150741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144980	144361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_-_144400_145000
857623	contig_7171_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_101438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTAAATTGACAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1674888	1675385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1674900_1675400
857624	contig_14740_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_174683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCTGAAAATCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136680	135390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_-_135400_136700
857625	contig_10297_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_112568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	75	485	769799	769389	NA	75	AAAAAATCAAATCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGECGPREAAGRVRLGQPFLRMRERGGARARGRPPQPGCGLRRQQRGGLGPQFPEPGPQNEAPSPTRRKQEERFHAKFILGPEGCILKSYPGAGAGGQPLRAASGARAAPFGLFSWTPERCGRGCLLPGIRPATG	769873	769037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_769000_769900
857626	contig_3727_pilon	-	980	5	Intergenic	novelGene_146764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.78535710713571	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATTTTCCATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546030	536929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_537220_537352_537470_537987_538106_538333_538457_545698
857627	contig_10711_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_118437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGCCTCACAGATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787502	788276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_787500_788300
857629	contig_5921_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_142245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203149	204100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_203100_204100
857630	contig_3081_pilon	+	448	3	Intergenic	novelGene_133961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	85.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCAAAAATTCCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129342	1191678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1129365_1178703_1178863_1191411
857631	contig_5718_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_110434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGGAACAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547965	1548279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1548000_1548300
857632	contig_15327_pilon	-	696	3	Intergenic	novelGene_70540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_1	74.5	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	37	474	517568	513059	FALSE	5	TTTCACCGCTGCTCCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	517604	512836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_513245_513894_514064_517485
857633	contig_4732_pilon	-	955	4	Intergenic	novelGene_75393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.44948974278318	15	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	532	561	504215	504186	FALSE	0	TGCCTGCCTCTTGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCRTNGFCLPVAWRCDSDRDCADGSDEEECSIELCAQDGRCPPPTGCLGGQGKSPHNCSPQPCPADELRCALGGACIPLTWRCDGHRDCPDSSDERGCGTTETFQGGNATSTGTPVILESVTDLSNAGDQDLGQPRNQSTLGVIAAAAVLSAALAAAALLALCQLIGPGRLLKESSLMSDNKAFLL	505872	503791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_504305_504477_504625_505074_505279_505781
857634	contig_14575_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_101919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGGTTTTTTGGTCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256828	257741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_256800_257700
857635	contig_15293_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_146537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGACACCCACCTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132524	133626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_132500_133600
857638	contig_3424_pilon	+	346	2	Intergenic	novelGene_55593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGACTTGCGGATGTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184014	1189052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1184103_1188794
857639	contig_11719_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_154766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAACTCCAAAGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110084	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_108900_110100
857641	contig_8063_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_152424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82573	81800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_81800_82600
857647	contig_12357_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_6065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCGCTCTGTGGCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18263	17796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_17800_18300
857648	contig_15456_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_139501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAAATTATTCTCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131120	130301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_130300_131100
857650	contig_5711_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_80256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACAAAGAACTGAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45071	46439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_45100_46400
857651	contig_1037_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_84618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGGGAACTCAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571700	572486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_571700_572500
857653	contig_2867_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_135153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACTGATACTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466038	464857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_464900_466000
857654	contig_6825_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_155123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTCAGCTGCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48979	48440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_48400_49000
857655	contig_12638_pilon	-	872	3	Intergenic	novelGene_33229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2	553	712900	711279	FALSE	50	AACCAGAGAAAATCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THVLEGNGTNVTILQLQPLEEPESWARTERGLKRYLQDFHGLVRLVHLERSLAFPLIIRCFLGCELPPEGSKAHIFFEVTVNGSSFASFQPESASWVAPSQTRSTVAAYTLKELNTHNRTRYELREFLQDTCVEYVQEHTVNNLKGSQTGRSYTSLVLGILVGSFIITGVAVGIFLCTGGRRC	712901	710959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_711395_711609_711886_712740
857656	contig_20293_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_153515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTAAACCTCTAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38112	37522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_37500_38100
857657	scaffold_6394_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_110972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGAGCATGTGTCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307920	308814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_307900_308800
857658	contig_6079_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_160122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATGCAAGGGTAGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509251	510087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_509300_510100
857659	contig_11115_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_102788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGAGGCAGGAACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133774	134529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_133800_134500
857662	contig_9687_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_172726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGTTGATTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28206	28811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_28200_28800
857663	contig_14333_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_49138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427041	427419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_427000_427400
857665	contig_12250_pilon	-	1005	7	Intergenic	novelGene_80631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.84754619472471	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	126	482	367597	366932	TRUE	15	GGGCGCCTCTTGATCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPPARRRRRRPLLFWDKETQISRQKFQEQLQTKAHCWECPMVQPPKRTTMSPAELFRTPTHPDWLPPELLAFWTRCAQLPPRVLRRRPPREPEEEAAEREAAAEVERRKTEALSDIEVLREAQEPSGPLMLSLGKAEGRVSPGEEGQWRPSLSTVPGN	368062	366040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_366088_366227_366313_366407_366528_366660_367058_367260_367428_367533_367601_367940
857666	contig_10498_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_177869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGTGCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8670	9316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10498_pilon_+_8700_9300
857667	contig_15219_pilon	+	386	3	Intergenic	novelGene_40851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	53.5	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	49	384	66409	71993	FALSE	10	GCCTGGGGATTGAGCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRAEEPGEGEAAAAEMAGKELERCQQQAVEVTEIMLNNFDKVLERDGKLADLEQRSDQLLDMSSAFSKTTKTLAQKKRCENVRCRIYLGLAVGGSLLIILIVLLAILLPQNSEGSSAPEAQGAGTAS	66360	71995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_66412_71259_71398_71798
857668	contig_10861_pilon	-	287	2	Intergenic	novelGene_39246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCTCTGTAGCAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780032	772607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_772710_779847
857670	contig_16204_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_154510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTGATTATTTTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307551	306874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_306900_307600
857672	contig_12299_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_29757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCTTGTAAAAAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581735	580714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_580700_581700
857673	contig_4385_pilon	-	411	2	Intergenic	novelGene_141492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTGTGCGCTCGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297462	288927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_289267_297390
857675	contig_10196_pilon	+	991	6	Intergenic	novelGene_132078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.64572444143	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	6	905	836596	843792	FALSE	25	GATAAAGGCGTGGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRSRSCARGAGSRGGGEEAVPLRRGEAAAEGRQSHCPVKRQRKAQRLCVAYEAADGDGEEGKGAEPLQAPGWEPQDWRRQLANIRTMRSRKDAPVDQLGAEHCYDPSAPPKVRRYQVLVSLMLSSQTKDQVTAGAMQRLRARGLTVDSVLQMDDSTLGALIHPVGFWRSKVKYIKQTSAILQQCYGGDIPSSVAELVALPGVGPKMAHLAMAVAWGTVSGIAVDTHVHRIANRLRWTRKQTKAPEQTRAALEEWLPRELWGEINTLLVGFGQQTCLPLHPRCQTCLNQALCPAAQGL	836590	843878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_836690_837884_838130_838783_838955_839742_839903_843470_843577_843668
857676	contig_10437_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_38459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAGAAAAAAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090132	1091012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1090100_1091000
857677	contig_12599_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_176968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112875	113150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_+_112900_113200
857681	contig_935_pilon	+	1013	2	Intergenic	novelGene_45522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTTCTCTGGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32328	33435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_32425_32518
857682	contig_16948_pilon	-	1120	4	Intergenic	novelGene_166405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	23.2522400354604	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	162	884	205994	202062	FALSE	30	TACCTTAGAGGAGGTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRPGPDVVICDEGHRIKNCQASTSQALKNIRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMVDFVRPDFLGTRQEFSNMFERPILNGQCIDSTPQDVRLMRYRSHVLHSLLEGFVQRRGHTVLKIHLPAKEENVILVRLSKIQRDLYTQFMDRFRDCGSSGWLGLNPLKAFCVCCKIWNHPDVLYEALQKESLANEQDLDVEELGSAGTSTRCPSQGTKSKGEDSALASSMGETTNSKFLQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFR	206155	201825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_202185_202404_202657_203853_204032_205824
857683	contig_10541_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_144624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCCAGTTTACTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76078	75665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_75700_76100
857684	contig_1986_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_64160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGCCTGCGCGCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414132	413099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_413100_414100
857686	contig_8050_pilon	-	470	5	Intergenic	novelGene_114809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	12.9687123493429	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCACCACAAGCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255106	241771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_241848_243041_243100_245576_245669_253808_253962_255015
857687	contig_4891_pilon	-	726	4	Intergenic	novelGene_124588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	46.9491450638052	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCACTGTATTTTCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964352	928408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_928875_930104_930224_964127_964176_964259
857690	contig_5331_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_112755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	134	298	14187	14351	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQCSEHFKYKLSNGKLICSVNFHLKHNLEKKIFKYHFLLCHPKNMKYLEINLTKICARPIFKTTKHCLEIKGDLNKHRVMPCYGLKDSRLLKCQFYPN	14053	14683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_14100_14700
857691	contig_12638_pilon	-	450	2	Intergenic	novelGene_33150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1845	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	126	365	203911	202871	FALSE	30	ACAGTGGTCTGTTAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSFPDFPEPLSLLPTSLPPASSHFPGWRPGPHVPISHTPQMPVAVGPYGQSQPSCFDRVKMGFVMGCAVGMAAGALFGTFSCLRIGMRGRELMGGIGKTMMQSGGTFGTFMAIGMGIRC	204036	202785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_202980_203780
857694	contig_11104_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_112454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTATTAGTGTATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306294	305908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_305900_306300
857695	contig_11978_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_62973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAACATACAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1464259	1465546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1464300_1465500
857697	contig_11855_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_66956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTTTTAAAATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072761	1073625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1072800_1073600
857698	contig_6442_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_166474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATATAAAGTTACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24117	23254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_-_23300_24100
857700	contig_5279_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_105541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18279	19127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_18300_19100
857701	contig_10196_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_132059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTTCGTGCATGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682981	681093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_681722_682755
857702	contig_5196_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_38693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACTGTCGCCCATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249389	248240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_248200_249400
857705	contig_4686_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_118485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352102	351378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_351400_352100
857706	contig_6929_pilon	+	299	3	Intergenic	novelGene_139422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4374.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130934	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948_132075_132178
857709	contig_1406_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_25504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTCTGGCTTGTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448082	1447666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1447700_1448100
857712	contig_10923_pilon	-	1183	4	Intergenic	novelGene_66226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	317	1120	44972	43790	FALSE	25	CACCACATCGTGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLLSVLGCQAGAHVGPFIDSYRCFQPKKEGAFTCWSAVSGARHLNYGSRLDYVLGDRALVIDTFQDSFLLPEVMGSDHCPVGAVLSVSSVPTKQCPPLCTRFLPEFAGTQLKILHFLVRLEQDAVFGQSALQLSNQTRVQTLQNKACARSTRPRPSQPGSSRGQKNLMSYFQPSSSRPQASPDLELPSLMGSLVTPLSFLLLLPQGPLPFPFLILLQGQSSSLFLLCFSSLVSFLHLDAVTQSLTRLPIFLSEVPGNQLLQELCF	51622	43726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_-_44000_44378_45006_50238_50323_51423
857714	contig_3787_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_102430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGTAAAAAACTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609831	609124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_609100_609800
857716	contig_7129_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_169299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATAAGTGTTAGACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895535	896271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_895500_896300
857717	contig_5590_pilon	+	604	4	Intergenic	novelGene_162994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	118.712537950575	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	166	438	184204	185134	FALSE	15	TCTGTGGTTTCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLCKHTPLISKSQSLRSDRGAGGWAQPRPEEERPPRRPRPLSSLVEALVAQVRAMEEQQEYLRGQLQDLNARLGAGTSQLEPERDLPSSESHRLKSLERRLAEMESTHAQLRDAVQSLQLLPRTPGFRNQPLTLEAPCANGDTT	183347	185300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_183471_184161_184269_184806_184871_184990
857718	contig_3103_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_146212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158878	158409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_158400_158900
857719	contig_7171_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_101275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	141	292	432	982443	982583	NA	25	ACCTTGGGCAAGTGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSTPLDVAAASVIDNNELALALQEQDLEKVWRVEVGPLVWGGGWLLPGPSGCLLILAPFERVTLDGPGPNQKGSNLQGQDRTQLFICGAPRAECRSMLHNSQLSGLGTCPGSLCLYFCVYSEGCGLWSSATWVLLPSPSCLLC	982151	982584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_982200_982600
857723	contig_2703_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_101817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGCATTTTTTGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111631	1112480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1111600_1112500
857724	contig_11929_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_171234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGATGCTTGTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51636	52050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11929_pilon_+_51600_52000
857726	contig_7297_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_169694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATTGTAAATATAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124440	123448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_123400_124400
857728	contig_9097_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_173575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAGCACTCAGATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63811	63584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_63600_63800
857729	contig_8044_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_132366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330657	331300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_330700_331300
857730	contig_16503_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_162082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATAATTGGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476121	475673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_475700_476100
857732	contig_11417_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_103248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTTTATTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24861	25891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_24900_25900
857734	contig_5415_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_146147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTCACTAGTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300622	299897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_299900_300600
857735	contig_6954_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_64437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGACCTTTTCAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449618	448974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_449000_449600
857736	contig_20742_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_150668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCCCTTCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194200	193169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_193200_194200
857737	contig_854_pilon	+	803	7	Intergenic	novelGene_36434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	6.36832439151427	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	24	653	1188182	1199666	FALSE	10	GCCGCAGCAGCTCTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKPRRCKMSLEETIAVAIHVGGEAPRRTRKMHPLCHRQACQGDPTVGKTALAQIFRSDGAHFQKNYTLTAGVDLVVKTVPVPDTGDSVELFIFDSAGKELFSEMLDKLWESPNVLCLVYDVTNEQSFNNCSKWLEKVRSQAPGSSLPGVLVGNKTDLASRRAVESSQAQAWALGQGLECFETSVKEMENYEAPFHCLAKQFLHLYREKVEVFHALV	1188158	1199816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1188285_1188870_1188951_1189323_1189384_1190682_1190743_1193271_1193390_1194251_1194362_1199567
857738	contig_405_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_135332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCCAGCTTTGTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609851	608926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_608900_609900
857739	contig_16565_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_174859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTTTAGCAATCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10650	10037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16565_pilon_-_10000_10600
857740	contig_14357_pilon	+	788	8	Intergenic	novelGene_121706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	2.9485382057929	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	63	653	774181	785181	TRUE	35	CAGCCCTTCCTGTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKPEPKKEATKAPAPAPAPAPAPAPAPEPPKEPAFDPKSVKIDFSADQIEEFKEAFSLFDRTPTGEMKITYGQCGDVLRALGQNPTNAEVLRVLGKPKPEEMNAKMLDFETFLPILQHISRNKEQGTYEDFVEGLRVFDKESNGTVMGAELRHVLATLGEKLTEAEVEQLLAGQEDANGCINYEAFVKHIMSG	772049	785797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_772078_774146_774313_777188_777217_781821_781972_783787_783962_784494_784573_785152_785198_785678
857741	scaffold_12124_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_22187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCAGGATATGGCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240169	1239866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1239900_1240200
857744	contig_10437_pilon	+	503	2	Intergenic	novelGene_38430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGTGGGGGAACGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833458	837014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_833597_836649
857745	contig_5549_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_81600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTGAAGTACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94632	94209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_94200_94600
857747	contig_11630_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_147184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATAAAGATCTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134141	134807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_134100_134800
857748	contig_6446_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_149200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266777	266248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_266200_266800
857750	contig_10732_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_114668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATGTATGCATAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46777	45766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_45800_46800
857752	contig_9414_pilon	-	836	4	Intergenic	novelGene_131086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.64098759787715	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCCAACATCCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545619	532334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_532515_536009_536242_536363_536452_545283
857753	contig_8636_pilon	+	848	6	Intergenic	novelGene_141934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	166.027226682855	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1	738	453266	456878	FALSE	15	AGAAGTTTTTCTCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSQRLQLLEPFDKWDGKDLEDLQILIKVKGKCTTDHISAAGPWLKFRGHLDNISNNLLIGAINVENGKANSVRNAITQEFGPVPDTARYYKKHGIKWVVIGDENYGEGSSREHAALEPRHLGGRAIITKSFARIHETNLKKQGLLPLTFADPADYNKIHPVDKLTIQGLKDFAPGKPLKCIIKHPNGTQEIILLNHTFNETQLSIVYKCSPCALSEPDWSRASHSVLPQTVWSDTPALPSSAH	453265	456988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_453353_454293_454486_455494_455628_456086_456209_456561_456640_456752
857754	contig_10263_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_135819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCTCCTAAAAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246889	246459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_246500_246900
857756	contig_3817_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_78337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCAATCCTGACTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261172	261648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_261200_261600
857757	contig_10518_pilon	-	757	5	Intergenic	novelGene_177871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.82915619758885	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	108	722	33695	31824	FALSE	40	CCGAGTAATAAAGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLDLLSQPCRAVYIFARRNGIPFELRTVELLKGQHMSKEFLRVNSLHKVPTLKDGDFILAESVAILIYLSLKYQTEAHWCPPNMQACARIHEYLGFHSNCIRDTFGVPLWTQVLAPLIGAQVPEEKVRRNQTSMDQALQQLEDNFLGDKPFLASHQVTLADIMALEELMQPVALGYNLFEGRPRLAAWRERVEAFLGAELCQEAHGPILSILEQVANKTIPVPPPEVHPSMLLRIARIP	34284	31788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10518_pilon_-_32034_32351_32526_32607_32759_33615_33704_34185
857759	contig_5480_pilon	+	519	2	Intergenic	novelGene_107232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307046	307818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_307199_307451
857761	contig_2933_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_111336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAACCTTACGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675231	674475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_674500_675200
857762	contig_5047_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_157986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATAGACCTAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882388	883102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_882400_883100
857763	contig_15118_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_74553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGGAGAGAGAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138460	139092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_138500_139100
857766	contig_16122_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_134571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAACCAAAACAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580626	580223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_580200_580600
857767	contig_20356_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_159553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTAAATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166655	170751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_166852_170354
857768	contig_500_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_30963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTCCCTAATGATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446847	1447608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446800_1447600
857769	contig_6914_pilon	+	717	4	Intergenic	novelGene_151739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33.4697209761633	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCCTGAAGCTCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128333	130452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_128359_128472_128551_128674_128756_129919
857770	contig_11552_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_171662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACAACAGTATTCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2147	3263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_2100_3300
857771	contig_13749_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_156337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTGTTTAAAGAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131157	130000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_-_130000_131200
857772	contig_5389_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_142993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCTAGTATTAATAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31214	32227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_31200_32200
857773	contig_12638_pilon	-	593	5	Intergenic	novelGene_33308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.646494799135	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	113	577	1285702	1284211	FALSE	5	CCTGGCCCTTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPVNARRGAPGAPEPQPHPRAALPGARAWASRRARAMPSDRPFKQRRSFADRCKEVQQIRDQHPSKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELVKIIRRRLQLNPTQAFFLLVNQHSMVSVSTPIADIYEQVCLFRPLPVCPSAPHSPEALPPAWTCSPLKDWSLAPLVLIWCMDPVVIVPLQN	1285814	1284194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1284372_1284708_1284810_1285107_1285215_1285295_1285352_1285662
857777	contig_7457_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_31532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTATGTTTATCATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729591	730598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_729600_730600
857778	contig_13101_pilon	+	1401	12	Intergenic	novelGene_172773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_10	20.9414768950391	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	115	1401	89511	134902	FALSE	35	AGCACAATTGCTAGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVYVPNTTYRNLLYIYPQSLNFANRQGSARNITVKVQFMYGEDSSNAMPVIFGKSSCSEFSKEAYTAVVYHNRSPDFHEEIKVKLPATLTDHHHLLFTFYHVSCQQKQNTPLETPVGYTWIPMLQNGRLKTGQFCLPVSLEKPPQAYSVLSPEVPLPGMKWVDNHKGVFNVEVVAVSSIHTQDPYLDKFFALVNALDEHMFPVRIGDMRIMENNLENELKSSISALNSSQLEPVVRFLHLLLDKLILLVVRPPVIAGQIVNLGQASFEAMASIINRLHKNLEGNHDQHGRNSLLASYIYYVFRLPSTYPNSPSPGPGGLGGSVHYATMARSAVRPASLNLNRSRSLSNSNPDISGTPTSPDDEVRSIIGSKAMDRSCNRMSSHTETSSFLQTLTGRLPTKKLLHEELALQWVVCSGSVREAALQQAWFFFELMVKSMVHHLYFNDKLDAARKNRFPERFMDDIAALV	45993	134902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_46023_89425_89544_92889_92961_96522_96662_98404_98507_104094_104182_114313_114546_117819_117985_119701_119872_129933_130024_130974_131071_134800
857779	contig_6031_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_56781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAGTGAGATAAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523091	530118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_523134_526431_526606_527784_528002_529587
857781	contig_1734_pilon	-	923	2	Intergenic	novelGene_164377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTACAATAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580788	564316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_564385_579933
857782	contig_19790_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_109491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAACACTTTAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41625	42339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_41600_42300
857783	contig_5765_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_141380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTCCACAAGACCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553741	554719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_553700_554700
857785	contig_13680_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_149613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAAGGACGCAATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483433	482715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_482700_483400
857786	scaffold_7386_pilon	+	442	2	Intergenic	novelGene_136584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1018	junction_1	0	107	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	68	328	293714	294591	FALSE	20	ACACCTGGCTGAGACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAASIPASPSVPGSFHWSWGEMLFQVVVCGLRGRETVVDVATSEDTFKQTTVQQLMLLVSKKMLQNESEDFTLLFANERLDPVKTLQDYAIRNKSSLLIVVKLPGGA	293646	294705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_293850_294466
857787	contig_5981_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_35501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGACAAAGTAAGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24401	25061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_24400_25100
857788	contig_10600_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_169860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTCCATATTCGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87158	86439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_86400_87200
857789	contig_9424_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_143798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAAACAGGTTCCGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282200	280584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_280600_282200
857791	contig_14744_pilon	-	456	2	Intergenic	novelGene_65951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCACAATGGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316428	315854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_316251_316368
857792	contig_16103_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_118715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCACTCCGGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201499	201213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_201200_201500
857795	contig_2537_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_33431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAGAGGGCTGGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267762	267368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_-_267400_267800
857796	contig_6175_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_16341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTGTTCTGTAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654730	1655012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1654700_1655000
857797	contig_7866_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_171197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAAGCCCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407308	406553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_406600_407300
857798	contig_6929_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_139444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTGGACTCCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345138	344863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_344900_345100
857799	contig_8568_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_156937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAGAGTAGCATAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78734	79314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_78700_79300
857800	contig_14516_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_153911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGCTCTTAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212528	211769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_211800_212500
857802	contig_6589_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_25708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGACTGAAGCCCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429440	430803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_429400_430800
857803	contig_7593_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_127377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTCAGAGAAGTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767235	766671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_766700_767200
857805	contig_7894_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_170798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACCTTAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327603	328159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_327600_328200
857806	contig_6109_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_160393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648996	649438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_649000_649400
857808	contig_10500_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_41186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAGGATGACTTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353392	1352969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1353000_1353400
857809	contig_6062_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_5280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTGCTACACCCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724029	723813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_723800_724000
857810	contig_6175_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_16319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCCAGCTGTCCCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482689	1482303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1482300_1482700
857811	contig_3727_pilon	-	1134	6	Intergenic	novelGene_146765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.89736659610103	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATTTTCCATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546051	536929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_537220_537352_537470_537987_538106_538333_538457_538645_538779_545698
857812	contig_6674_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_148043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATTTTTGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489758	488990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_489000_489800
857813	contig_6047_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_24226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTAGTCGAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160651	161474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_160700_161500
857814	contig_12277_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_139701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACAAGCAGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312480	312761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_312500_312800
857815	contig_18604_pilon	-	395	2	Intergenic	novelGene_173858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATAGTAAGTACATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102924	95111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_-_95238_102655
857816	contig_16964_pilon	+	1129	2	Intergenic	novelGene_143129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAAGAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212009	230969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_+_212702_230532
857817	contig_7695_pilon	-	793	7	Intergenic	novelGene_41628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.589707361908	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	30	791	687243	680347	FALSE	10	CTCGGGTGAGCCGAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATERAAAAAMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAGLSHPCPALQLVFKSLGCPLGCPPFLDSPLVSCQAFCKEKPLGERRKRTKIKSIHFHW	687272	680344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_680520_681570_681749_681834_681967_684947_685044_685156_685253_685534_685608_687229
857818	contig_10163_pilon	+	779	4	Intergenic	novelGene_82657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.39934634239519	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTTGAAAAGAGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208625	239100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_208817_226259_226349_235440_235607_238767
857819	contig_9481_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_149636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAATAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116161	116596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_116200_116600
857821	contig_10019_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_86668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCCAGAGAAGGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231218	230616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_230600_231200
857823	contig_8576_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_88718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACCCCAAGGGCCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27766	28412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_27800_28400
857824	contig_9578_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_67993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAGGAATGTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1214397	1213900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1213900_1214400
857825	contig_9450_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_174435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTATTGGTCTTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70593	71008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_+_70600_71000
857826	contig_5718_pilon	+	584	2	Intergenic	novelGene_110429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTAAAATCTGATCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538012	1538657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1538241_1538301
857828	contig_5954_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_28448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	218	571	102428	102781	NA	5	TCTGCCTTGTTGCCCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNVLFAYAHTLALYHGGDDALLSDFCATLLGVSGALGAQQVFASAEEALLAAVHALETGEHPPGPLGTRGAMQETARILLGEGPASQKGYTLAALGHLAQILGRARKRTMAAEERDRLYRARKKCQFLLAWTNENEAALTPLALDCARTHRAHAVAAEEMAALTGEVERLWGGPMPPAPRTLIEELPG	102210	102818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_102200_102800
857829	contig_7870_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_109026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566600	566027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_566000_566600
857830	contig_2854_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_120910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGAAAAGCCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323846	1323158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1323200_1323800
857831	contig_2854_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_120909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTCATTAAAGTAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322998	1322515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1322500_1323000
857833	contig_8570_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_120175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACTCGCAGTAGTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434205	433559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_433600_434200
857834	contig_6833_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_175133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGATACGATCAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238692	240038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_238700_240000
857835	scaffold_9205_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_161102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238572	239639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_+_238600_239600
857841	contig_5136_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_126659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTTTATTAAAATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438844	435207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_435478_438574
857842	contig_9363_pilon	+	731	3	Intergenic	novelGene_6790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	42	545	1589418	1592259	FALSE	10	GCAACCTCTGGTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRCFQSCSRVGGMSGVGGDMRGEKEGEGAVSAGPFSFSPEPTLEDIRRLHAEFAAERDWDQFHQPRNLLLALVGEVGELAELFQWKPDEELGPQAWPTRERAALQEELSDVLIYLVALAARCRVDLPQAVLSKMDTNRRRYPVHLSRGSASKYTDLPHGAASEDQVVGPADLATGQAST	1589376	1592445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1589519_1590223_1590335_1591967
857843	contig_8683_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_150254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTGTTTTTTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588621	589070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_588600_589100
857844	contig_4845_pilon	-	486	3	Intergenic	novelGene_53726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	1.5	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGGTTTTTAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592919	1591693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1591959_1592047_1592148_1592798
857847	contig_16103_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_118753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTTTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434613	435254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_434600_435300
857848	scaffold_16539_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_68389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTTAGTATAGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750185	750424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_750200_750400
857850	contig_13044_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_99987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTCAAGAGCCCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66908	66155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_66200_66900
857852	contig_6954_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_64440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485087	486026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_485100_486000
857853	contig_9114_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_155181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTGAACAATTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94521	94855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_+_94500_94900
857856	contig_9434_pilon	-	1058	2	Intergenic	novelGene_150508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAACTTGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373938	369718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_370431_373592
857857	contig_9177_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_32658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAACAAGAAAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94450	95540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_94400_95500
857858	contig_15123_pilon	+	611	5	Intergenic	novelGene_110927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	2.48746859276655	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTCGAAGTTACTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292461	307188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_292490_299380_299459_300034_300171_306554_306704_306968
857859	contig_5959_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_150175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTCATTTTCAGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98924	98014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_98000_98900
857860	contig_10163_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_82653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAGACTACTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187505	187992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_187500_188000
857861	contig_11396_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_71303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCTGGTGCGTTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379674	380368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_379700_380400
857864	contig_12570_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_79365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCGAAAGATAACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227516	227193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_227200_227500
857865	contig_8354_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_24077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTAGACATTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119843	120666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_119800_120700
857867	contig_7411_pilon	+	635	2	Intergenic	novelGene_137035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433393	435509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_433486_434966
857868	scaffold_9205_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_161097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTAGTTAATGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143253	142641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_142600_143300
857869	contig_10490_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_169882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATAGGGTTTCCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16441	15892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_-_15900_16400
857870	contig_11171_pilon	-	641	6	Intergenic	novelGene_48542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGAAAGGACAGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65964	41756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_41885_48679_48754_49126_49223_51064_51200_51760_51812_65807
857878	contig_8020_pilon	+	682	3	Intergenic	novelGene_114432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	9.5	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	117	374	293994	300701	FALSE	45	CCTTCCAGAGGCAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIPVISIIENSPRRDIQTSLCLTWNTSHQVQQRNGLTTMSSHVQLLSGESRGERDHWERHVPDFCFPRNRGEQRGSPPESRVPGFRKTRRALTVLNCSFVSLYFSPWTCWTSNSAVFGTSTKS	281922	301009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_281976_293930_294035_300484
857879	contig_9886_pilon	+	1226	4	Intergenic	novelGene_147087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGGCGCTCGATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238384	271410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_+_239269_243993_244083_254998_255120_271278
857880	contig_9363_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_6652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	132	719	978842	978255	NA	20	TGCTCTTTGAAGACCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLHAQYRPYRCPNCPRAFRLPRELLEHQQSHEERQERLWEEKGMPTTNGHINESGQDHLPTAQMLNGSGELSTSGELEDSGLEEYRPFRCEDCGRTYRHAGSLINHRKSHQTGVYPCSICSKQLFNAAALKNHVRAHHKPRQGTGEGRQSSVTPLITPKEEEDPTTTLDHRPYKCNECGRAYRHRGEPGEPPPHPSDRRVSVFTLSPQVLQPHGPAQPRSRTLQGCSLQCRPRGRGSP	978973	978123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_978100_979000
857883	contig_7057_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_123286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTCCTAGTGCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838906	837957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_838000_838900
857884	contig_4105_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_21515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135407	136466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_135400_136500
857885	contig_9177_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_32798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACTCATAGTGACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1529486	1528849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1528800_1529500
857887	contig_7031_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_132791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAAATCTGTGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242104	241623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_241600_242100
857888	contig_6027_pilon	-	1462	8	Intergenic	novelGene_74460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	0.925820099772551	5	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	16	1200	349345	343748	FALSE	30	GAAATTCTGCTGCTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGHLMSETFLCVKTSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPHGPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDSLVKQTHVPNLFSLQLCGAGFPLNQSEVLASVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCWQAGTTPWNIFPVISLYLMGEATNQSFRITILPQQYLRPVEDVATSQDDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTPDMEDCGYNIPQTDESTLMTIAYVMAAICALFMLPLCLMVCQWRCLRCLRHQHDDFADDISLLK	349360	343485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_343990_344641_344814_345077_345228_345595_345698_346870_347006_347662_347801_348312_348530_349316
857889	contig_6477_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_154155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACTACAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748116	749198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748100_749200
857890	contig_11931_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_159901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATTTTTAAACACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130590	131638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11931_pilon_+_130600_131600
857891	contig_14048_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_146343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGTTGCCATCCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596441	597270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_596400_597300
857892	contig_7720_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_155755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTGGGCTCCTCTCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496864	496341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_496300_496900
857893	contig_6470_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_145592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAGTTCTTCGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892450	891894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_891900_892400
857894	contig_1594_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_138804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAACAGAGAGTCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371691	371150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_371200_371700
857898	contig_10674_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_6426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTTTTCTCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191420	190598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_190600_191400
857899	contig_9297_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_69896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGCAGTAAGAGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944073	942683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_942700_944100
857900	contig_6533_pilon	+	510	6	Intergenic	novelGene_114639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_5	43.7154434954056	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	62	415	113801	179452	FALSE	15	GAGTCCCTTTTATGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVDLCLSSEGTEVILATSSDEKHPPENIIDGNPETFWTTTGMFPQEFIICFHKHVRIEKLVIQSYFVRTLRIEKSTSKEPVDFEQWIERDLVHTEGRLQNEEIADESRVQCGAGP	103186	179547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_103233_113785_113899_125966_126074_127313_127383_141030_141075_179416
857901	contig_14618_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_136835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGTGCTCTTAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120099	1119453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1119500_1120100
857903	contig_6501_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_150573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATAAACCCATAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264340	265245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_264300_265200
857904	contig_3572_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_175289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAAACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204763	204060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3572_pilon_-_204100_204800
857905	contig_12107_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_176740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTGACTGCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64660	63979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_64000_64700
857907	contig_10197_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_115316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCCAGATCAGATCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563610	1562594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1562600_1563600
857909	contig_10711_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_118465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAATAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890083	889024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_889000_890100
857910	contig_517_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_171302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCCCTCTCCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86680	87048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_+_86700_87000
857911	contig_5669_pilon	-	1196	4	Intergenic	novelGene_86094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	53.4665004153691	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	147	485	222000	216811	FALSE	45	GAGCATAGAAACAGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSFMLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKVSPVK	224294	216099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_216921_219864_220057_221963_222100_224247
857912	contig_17212_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_88623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171535	172171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_171500_172200
857915	contig_5718_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_110401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1342729	1342405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1342400_1342700
857917	contig_16484_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_177221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGTACTACAGAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12831	13083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16484_pilon_+_12800_13100
857918	contig_12490_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_169054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTGGCAGTTCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272185	271457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_-_271500_272200
857919	contig_4678_pilon	-	452	3	Intergenic	novelGene_126042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28	150	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	115	435	535997	535677	FALSE	5	TCCCGTGTGCCCTTATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQPGRKDFLFEEGQAPLQEPRLLSRVSPSCPLLPDPAPAGGVMVLEPSPQDFWVGLAKVAPAPAPGPSLGSPMPCLTPCTAPLPQPASHNGAGHTSPYSLPVPQ	551792	535659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_536000_536164_536225_551740
857920	contig_9982_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_55770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAACACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352214	351458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_351500_352200
857921	contig_5918_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_99513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGCCGGGTGCCTCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481209	480432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_480400_481200
857923	contig_4754_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_35921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCCCAAGTTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243342	243798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_243300_243800
857924	contig_9389_pilon	+	515	4	Intergenic	novelGene_83922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	912.639152251437	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAACCTCTGTTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159558	168369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163800_164401_164515_168238
857925	contig_3818_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_99235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGATCCTCATTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418192	417637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_417600_418200
857926	contig_16724_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_105275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCACCCAGAGGCACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377814	376935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_376900_377800
857927	contig_7943_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_173126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAATCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69663	70831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_69700_70800
857928	contig_15185_pilon	+	714	4	Intergenic	novelGene_99380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	0.471404520791032	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATGATGCTCACCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42605	49108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_42759_44630_44670_47649_47821_48757
857931	contig_6829_pilon	-	457	2	Intergenic	novelGene_123775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCTATGAACAGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88511	85914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_85990_88129
857933	contig_14450_pilon	-	728	1	Intergenic	novelGene_48958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGACAAACTAAGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036966	1036238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1036200_1037000
857934	contig_14895_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_106699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGCTATCTATTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162517	162937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_162500_162900
857935	contig_854_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_36432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATTGGACTCGGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181130	1179989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1180429_1181046
857936	contig_12644_pilon	+	841	2	Intergenic	novelGene_44439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAATATGGCTTCTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223840	227422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_224083_226823
857941	contig_1836_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_71039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644941	645425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_644900_645400
857942	contig_5623_pilon	+	595	4	Intergenic	novelGene_154790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	107.77754868246	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	176	595	159130	178222	FALSE	40	AAGAACAGAGGAGCACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFAGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKTTGEGLIRSKEKLDCELQKDYTFTIQAYDCGKGPDGTSVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVVEGKQYDSILRVEAVDADCSPQFSQICSYEVVTPDVPFTVDKDG	158034	178222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_158100_159019_159143_175870_176067_178011
857943	contig_12046_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_83486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGAATAAATTTGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426427	426699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_426400_426700
857944	contig_19863_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_148544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCTTAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9539	9792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19863_pilon_+_9500_9800
857945	contig_9646_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_117489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTTCTTTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578009	578753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_578000_578800
857946	contig_10864_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_107090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCCATATCTGGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927509	926428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_926400_927500
857947	contig_9752_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_121999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGGCCCTCAGTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16300	16850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_16300_16800
857948	contig_500_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_31121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	7	462	1730206	1730661	NA	20	GTGAGTATGGTATGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGMLMRGLVSFAILLGLKSAIPEAHRGTSQPPRRRDGSRVHPFTQGPCAENELDPGNSCNTGDGIRQQEGAAENRQHQNQETSSRWCVGLPSPWSKRTEHLRAGSLLVEWGASGHLLADLKSFLTLGRARQRGQTRGQGAERGLPVGTAEELS	1730199	1730734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1730200_1730700
857949	contig_833_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_176484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTACACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559376	559965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_+_559400_560000
857950	scaffold_8345_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_107003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTTTAGGCTTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548342	548821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_548300_548800
857951	contig_15185_pilon	+	815	8	Intergenic	novelGene_99422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAGGGGTAGGTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236527	238098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_236569_236647_236797_236905_237050_237140_237235_237316_237434_237683_237773_237845_237957_238028
857953	contig_2550_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_135704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGAAAATAGAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1708524	1707891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1707900_1708500
857957	contig_16883_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_161736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCTAGGGTAACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284251	284672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_284300_284700
857958	contig_2069_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_23384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068532	1069087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1068500_1069100
857959	contig_11935_pilon	-	453	2	Intergenic	novelGene_175652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGTGTCTAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51057	16378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11935_pilon_-_16756_50981
857960	contig_5023_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_7311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGGTGCCTCTGGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598361	597595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_597600_598400
857962	contig_14266_pilon	+	309	2	Intergenic	novelGene_162248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	246	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	120	190	309	121123	136771	FALSE	35	CAGCTGGTAAGTAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAVVSWLSLPSSGPFWPPHPLCLPIRSTTPKPPRAYPLPPALSQLRAGPTGPSRATRAQSLTMASLFKKKTVDDVIKEQNRELRGTQRAIIRDRAALEKQEK	120933	136771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14266_pilon_+_121157_136685
857963	contig_628_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_130245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGATGTCCTCAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199317	199764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_+_199300_199800
857964	contig_16724_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_105279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAATACATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421545	420521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_420500_421500
857967	contig_6020_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_155567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGATTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293594	292740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_292700_293600
857968	contig_10609_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_123915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGGCATAGTGTAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255828	256545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_255800_256500
857969	contig_4769_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_117999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903326	902289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_902300_903300
857970	contig_16595_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_150143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTAACTCCATCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281680	280815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_-_280800_281700
857971	contig_5083_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_151638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAAATTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197252	198358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_197300_198400
857972	contig_9053_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_87927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTATGGTTTTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104338	104725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_104300_104700
857974	contig_6599_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_175996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAAAAGAACTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	262340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262300_262700
857975	contig_5967_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_44410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGATCAGGCTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430926	431113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_430900_431100
857977	contig_2219_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_67200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGGAGCCTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207548	207130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_207100_207500
857979	contig_3975_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_54697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAAAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114095	1114561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1114100_1114600
857980	contig_8412_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_118383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATTAACAGCCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683380	683774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_683400_683800
857981	contig_4769_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_118008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAACAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000909	1001823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1000900_1001800
857983	contig_3394_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_152694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGATAACCACTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477083	478444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_477100_478400
857984	contig_5286_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_157350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTGACTCATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535373	535008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_535000_535400
857986	contig_19737_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_158966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCAGCCTAGCTTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31411	30692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_30700_31400
857987	contig_10196_pilon	+	298	3	Intergenic	novelGene_132121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	264	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCCCAGTGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924450	926561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_924548_925701_925850_926508
857988	contig_7412_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_76275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGTAACCAAAGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253761	253410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_253400_253800
857989	contig_19765_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_177872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACCAATGTCATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556	1903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19765_pilon_+_1600_1900
857993	contig_12603_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_105824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGCCAGGTCCCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819752	820308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_819800_820300
857994	contig_3068_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_137611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTACCTCCTCTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166673	168136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_166700_168100
857995	contig_8650_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_162618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154298	153575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_153600_154300
857998	contig_5947_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_101575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGGAAGGGAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811561	811904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_811600_811900
857999	contig_12654_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_129257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGGCCTGAGGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59013	58139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_58100_59000
858002	contig_5590_pilon	-	344	4	Intergenic	novelGene_163043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGAGGGCTCACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369181	360194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_360308_361038_361150_368968_369022_369114
858003	contig_15264_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_158866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGGTTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72497	73827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_72500_73800
858004	contig_7189_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_117661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGAAGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538068	539072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_538100_539100
858005	contig_15430_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_174695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTTTTAATTGTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37747	38681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15430_pilon_+_37700_38700
858006	contig_10074_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_57090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113977	114764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_114000_114800
858008	contig_4402_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_140857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608405	608919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_608400_608900
858010	contig_11708_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_138949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217910	217491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_217500_217900
858011	contig_990_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_76052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898136	899131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_898100_899100
858012	contig_3193_pilon	+	1151	3	Intergenic	novelGene_126322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	3.5	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	78	476	148258	149805	FALSE	35	AAACAGAGATGTCTTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLTSCHREKDVSVSVIGSPQIKNTNKKADVHGDHGADKGSFKARYPAVDYNLVQDLKNEDPARDTHGKREARPEPHGCVGLEKGPAMLRGGEASERKRPDSTYSMSKDTKYQSVYVISEEKDECIIATEV	148180	150480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_148533_148641_148760_149799
858015	contig_6189_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_164936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGATACCTTAGATACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42185	42523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_42200_42500
858017	contig_7898_pilon	-	705	2	Intergenic	novelGene_47558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335565	332655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_333262_335466
858018	contig_17781_pilon	+	1038	2	Intergenic	novelGene_163679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	41	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAACATCACTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412113	424822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17781_pilon_+_412468_424138
858019	contig_6738_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_166143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCATCTAGATGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99835	100497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_99800_100500
858021	contig_1996_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_131880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTCCACACCTCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150048	150603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_150000_150600
858022	contig_7521_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_160552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGAGTCACATTCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315559	314328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_314300_315600
858023	contig_11832_pilon	+	621	5	Intergenic	novelGene_106969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	33.4019086281009	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	101	562	463912	466553	FALSE	40	CAATAAAAACTACCCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAVAGAVRSPGPLWSRLAWQWQQQCLREEARGAMTSASTKVGEIFSAAGAAFTKLGELTMQLHPVSDSSPAGAKWTETEIEMLRAAVKRFGDDLNHISCVIKERTVAQIKATVKRKVYEDSGIPLPAESPKKGPKKVASGVLSPPPAAPPPSSSIVPGSSGTRTKAYTRESQKAAGAGKVHLTVPV	463811	466612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_463933_464137_464233_464826_464929_465610_465761_466459
858025	contig_405_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_135325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCCTGTTACCGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579703	580067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_579700_580100
858026	contig_12050_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_62756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCACCAAAAATACATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758992	758653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_758700_759000
858028	contig_4519_pilon	+	597	4	Intergenic	novelGene_123669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.54606056566195	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATTTTTTAACAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68273	72796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68480_70705_70919_72193_72281_72705
858030	contig_3602_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_60566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCTGTGGAGGGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514048	514918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_514000_514900
858032	contig_14289_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_110575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	114	425	86815	86504	NA	35	TAATTTGGTCAAACCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDRWPVRQEGGAWRWSAGGSGWSRCARRVWGCLGPGAAAPGPTLTASSPQVMPQLLNLLKADSLGTSVDWGVLAIFTCADSCALGTGYAEEFVWKQDVTDTA	86928	86115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_86100_86900
858033	contig_8063_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_152449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAGAAAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895536	894987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_895000_895500
858034	contig_14973_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_171224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGACAATAAAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191008	191435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_191000_191400
858035	contig_4055_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_158176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGGGCGTGATTTGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943563	944299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_943600_944300
858036	contig_10235_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_46292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	766	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCTGAAATGCTAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83826	83467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_83500_83800
858037	contig_9199_pilon	-	825	2	Intergenic	novelGene_65639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	60	686	124244	123094	FALSE	0	CCTCTTGCCTGGCGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRAALTRLLRDAEGLQELMLAPCHEWLSDEDLVPVLARNPQLRSVTLAGCGQLSRRALGALAEGCPRLQRLSLAHCDWVDGLALRGLADRCPALEDLDLTACRQLKDEAIVYLAQRRGAGLRSLSLAVNANVGDTAVQELARNCPQLEHLDLTGCLRVGSDGIRTLAEYCPALRSLRVRHCHHVAEPSLSRLRKRGVDIDVEPPLHQALVLLQDVVGFAPFVNLQV	124303	122954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_123284_123807
858039	contig_4125_pilon	+	536	2	Intergenic	novelGene_25050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATCGATTAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220242	221180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_220652_221053
858042	contig_11815_pilon	-	712	2	Intergenic	novelGene_50935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATCGCAGCTTCTCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323104	300116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_300659_322934
858043	contig_17704_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_177182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247681	248710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17704_pilon_+_247700_248700
858045	contig_4442_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_127934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161614	162521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_161600_162500
858047	contig_3382_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_124082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481170	480629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_480600_481200
858049	contig_3825_pilon	-	1030	4	Intergenic	novelGene_77918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	14.3836326735943	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	197	619	10619	7304	FALSE	0	GCTGCTGTCTCCTCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQRALPQSKETLLQSYNKRLKDDVKSIMDNFTEIIKTAKIEDETQVSRATQGEQDNYEMHVRAANIVRAGESLMKLVSDLKQFLILNDFPSVNEAIDQRDQQLRTLQEECDRKLITLRDEVSIDLYELEEEYYSSRYK	12027	6892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_7523_9001_9083_10496_10769_11980
858051	contig_14142_pilon	-	767	7	Intergenic	novelGene_120607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	116.959632162364	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	23	682	587543	584636	FALSE	25	CTCTTTCCTTCATAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEARVDAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEVRGRRGSRGPPRGQPPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGSQENATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	587565	584550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586352_587288_587404_587508
858054	contig_5758_pilon	+	600	2	Intergenic	novelGene_119102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	658	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACGTGAAAGGCCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231551	232966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_231942_232756
858055	contig_5452_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_101018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAGAAATAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444566	443606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_443600_444600
858056	contig_5096_pilon	-	1049	7	Intergenic	novelGene_111981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.1982225081292	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	8	622	98271	65754	FALSE	40	TTAAAAAAGGGGTTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGIYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINMLKSSFATCVLVSEEDKNAIIIVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKTSTGEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMECGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVQIKKKGNIYSLNEGYAKDFDHASVWRNLSVPCQQEEPQRKAETAV	98278	65326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_-_65771_67647_67708_69467_69565_72970_73112_79489_79570_80123_80273_98200
858057	contig_13753_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_136509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGGCTAATTAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139049	138302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_138300_139000
858059	contig_11566_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_166711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAATTTACAGCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246944	247934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_246900_247900
858061	contig_4442_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_127959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACGCCCGCCACCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349442	1348617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_1348600_1349400
858062	contig_10082_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_63838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGTCCAGTGGTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35635	35113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_35100_35600
858063	contig_6674_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_147987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAACAACTTTCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70133	71456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_70100_71500
858064	contig_6076_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_81741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATCAAAGCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55240	54549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_54500_55200
858065	contig_2033_pilon	+	864	6	Intergenic	novelGene_71537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCGGGACCTGGGCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132019	182635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_132252_132335_132445_137972_138032_146863_147093_182312_182463_182550
858066	contig_9177_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_32728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640517	641274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_640500_641300
858067	contig_15325_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_157158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTGGTCGGTGAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62548	63101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_62500_63100
858069	contig_19974_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_130469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160307	160943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_160300_160900
858071	contig_7513_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_88981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCGGAAAACAGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295297	296112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_295300_296100
858072	SIRV3	+	270	2	ISM	SIRV3A	SIRV305	436	3	654	0	654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4657	6718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4780_6570
858073	contig_10986_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_71513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCCCTCTGAGATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193698	192372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_192400_193700
858074	contig_5935_pilon	+	658	3	Intergenic	novelGene_102720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	1	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	225	317	1069738	1069830	FALSE	10	TCTGAGCTTCCGTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYKNHVKCISEDQKYGGKGYEGKTHKGDIKQQAWIQKINELIKKPNVSPKVRELLEQISGFDNIPRKRAKFQNWMKNSLKIHNESILEQVWSIFSEASRNVSWL	1067047	1070171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1067158_1069514_1069623_1069731
858075	contig_9029_pilon	-	985	3	Intergenic	novelGene_155138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	24.5	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	25	351	914666	886119	FALSE	35	ACTTCCTGCAAAACAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWFFTGDMGKVRELRTRVHSSAVRPSEEAALGPAPSPQGPSPPHLSSGGARGKDGASVGTNIFAGTKIDLSALEQKLDLVTRTLASFKRGAETKSLLPKKEKLKLRHERWLQSKS	914690	885484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_886199_900321_900431_914528
858076	contig_18934_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_175883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55684	54686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_-_54700_55700
858077	contig_10990_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_7435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTCTGTATGTAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701533	702258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_701500_702300
858080	contig_15905_pilon	+	745	4	Intergenic	novelGene_154701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	180	446	64636	72667	FALSE	70	ATTAAAAATAAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLFLASFTATALLTLAYKLPVAAPSEASENVTVLYFLEYCTKPYCRFGPFLVGLLLSSFMYQNQQANILKTKVQALLGWICTLSTLFAVGHSALHGGRHLYQALHRTVWSTAVGWATYACQEGCGGCDFTLAKFFWPRDLRSWLLPT	58709	72966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_58795_64541_64675_66117_66278_72599
858081	contig_12661_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_166719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCGAGGCACCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76150	75851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_-_75900_76200
858082	contig_9274_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_151154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGGTTTTTTCAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404019	403212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_-_403200_404000
858084	contig_11016_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_163290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTTTGTGGAAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127568	126806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_126800_127600
858085	contig_8242_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_80196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGTAGATGGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180849	181526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_180800_181500
858088	contig_11816_pilon	+	590	2	Intergenic	novelGene_98584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	90	299	1347677	1347886	TRUE	25	GGTATGTATTTTAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGARRVAEQTTKGGSSTCCQRELGCPVGMREEPATSDPKSTMPMSLSSLPRRLCLTSTSFPFLSDPFGPLRSLKAGFPGCSAWRKLCRELNPSLGSG	1347587	1433795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1348103_1433720
858089	contig_8019_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_126996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGTAAACATGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221443	220903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_220900_221400
858090	contig_8019_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_126995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGCTGTCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220952	220388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_220400_221000
858091	contig_2798_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_120072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTACTTTGAAGGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189551	190142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_189600_190100
858092	contig_9180_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_109107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	270	344	243598	243524	NA	20	ATCTGAATGGGGAGTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHECGEIGAGDREPRRGGRADTWTLIAPAPPSPDRDSGDGQDLLSHSAQASSALVSSSRIWDCSFRGPGTRADFPAAQLTFTGRFGRLSMPIWKYASLYLRDASVSLPLIPWE	243867	243072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_243100_243900
858094	contig_6163_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_103794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTTTCTTCCTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50320	51190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_50300_51200
858095	contig_1143_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_86570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAATTAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86935	85988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_86000_86900
858098	contig_7457_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_31377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACCTTCCTGTGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407824	408202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_407800_408200
858100	contig_7894_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_170780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGACCCCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185297	184420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_184400_185300
858104	contig_2365_pilon	+	890	2	Intergenic	novelGene_103770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	338	661	360538	360861	FALSE	60	CAATTACAAAAGCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRLCPVLHHLSSCGSPAPNLRPEPWEWFWISGMFYPSWFGCYDTQCLFFFIKRCKLWASKRWKLRIFHLFVERQTVWHDFNQTLKWSLARLKRKRENHDTLYSSF	358442	361090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_358717_360474
858105	contig_14202_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_157143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATCCTTATGTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111875	112890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_111900_112900
858107	contig_10976_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_155588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGCAGAAAGAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120938	122052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_120900_122100
858108	contig_11855_pilon	-	805	3	Intergenic	novelGene_66999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313815	1312513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1312965_1313095_1313222_1313587
858109	contig_4659_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_118266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATCTGTCAGGTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911023	912023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_911000_912000
858110	contig_13074_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_153449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546717	546447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_546400_546700
858111	contig_11512_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_43331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTAGCTTCTTTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551272	551645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_551300_551600
858112	contig_2414_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_158479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	41	319	237965	238243	NA	30	ACAAGAGGCAAGTGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSASSCPRVPPPGMRDLPHHSGTSASALGRTSAFPRGAAHTPGRTRRFRSPGRPEEEEGTPGLESDSNRCSVGDALDSEGRSQNGAGVRAREGLPGRETNTLATD	237924	238838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_237900_238800
858115	contig_1406_pilon	+	825	4	Intergenic	novelGene_25515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.94422221866655	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604926	1684634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1604948_1610666_1610914_1666964_1667282_1684394
858116	contig_12570_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_79338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGAAGAGATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88912	89759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_88900_89800
858119	contig_10196_pilon	-	1493	10	Intergenic	novelGene_132197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	9.66091783079296	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	921	572	1492	1174645	1168396	FALSE	10	CCTCCCCGTCCAGCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGAFFAVPTTLPPNSRHGKLFSPSKDAELTFRQHLNSVSSDFFLPKPRKLRNRHHRKPLVVQRTLLPRPSESQAHNVCSFSILSNSSITGRGSFRPIQSSLTKAALSRPIVPKVLPPQATGHLASAIDLAAKSAGIIPGSPLPVLDPEGLSGISPLSSDNVTAAVAGQGSTRSCQNGHPVSTVGGARDPFISVPSRLEPEPEPVADSFQGSPVLSLSELPKAPLQNGLSAPLPSEGSSTRLSPPNVSALLDLSLPGPPEDVLSQGEPATHISDSIIEIAISSGQYGEGVSLSPAKLNGSDSSKSL	1180667	1168394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1168455_1169366_1169596_1170003_1170079_1170817_1170997_1171234_1171340_1172137_1172220_1174363_1174433_1174522_1174707_1177276_1177455_1180335
858120	contig_5434_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_74666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAAGAATTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281499	280393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_280400_281500
858122	contig_19311_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_144095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269702	269064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_269100_269700
858123	contig_6707_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_167046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209910	209642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_209600_209900
858124	contig_13258_pilon	-	971	10	Intergenic	novelGene_146929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	41.4097262982837	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	236	862	111754	61186	FALSE	25	GGCACACACATTGTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEKMELDLEPLPSSTTTDGNILRRSSSAPLISGLGDNSQVFQTDTLRTRRNSTSFTSQTCLEENMDLINRETICEREIQAAIQIDQFGEENLNLSDDNLETPSSLNHVGLIPVPSVSSPSGGIGQQCFSPSLQTFVSCNSLPPNPIPHPTQRFTTSQSPISSIRPSVLGPLKRKGEMALEDQPKRFFQGTTNTLSFDTTQLPDKNA	112147	61076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_61187_83878_83976_86732_86792_87350_87440_88051_88145_89578_89634_89745_89790_104311_104391_111644_111832_111989
858126	contig_13055_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_104948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAATATTTTATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19157	19509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_+_19200_19500
858127	contig_15825_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_160193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAACTCACCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26591	27457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_26600_27500
858128	contig_7912_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_129558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAAGTTTATTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45980	45175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_45200_46000
858129	contig_11702_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_142023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTGTGGTCTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569789	569347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_569300_569800
858130	contig_19848_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_173824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATAGAAAATAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159189	159992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_159200_160000
858131	contig_1379_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_134576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	6	428	362564	362986	NA	80	AAAGAAGAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMSLQQAPSSRVFVELVPWADRGQENSLVSGRETLPGIRRPLSSAQSQTTTREVHVSGTAEVSADPDRAQVAVRVSSTKAAAAEAKKSVYRRLDYITQSLQQQGLQVRASPGGGYELDRTKDGAKGSPDGPLDLWWGLGGL	362558	363573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_362600_363600
858132	contig_5815_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_141181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCACTTGTGATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163831	165058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_163800_165100
858133	contig_4125_pilon	+	1078	7	Intergenic	novelGene_25100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	253	1032	733075	734651	FALSE	5	CGCTTTCTCTACTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSDVSPFSFREVAPELPSDFRIGFYPVNHTDCLTSALHHCFDGPTGELAHAFFPPHGGIHFDDSEYWVLGPTRYSWKKAHEIGHALGLMHSQHVRALMHLNATLRGWKALSQDEMWGLHRLYGCLDRLFVCASWARKGFCDARRRLMKRLCPSSCDFCYEFPFPTVAATPPPPRTKTRLVPEGRNVTFRCGQKILHKKGKVWYKDQEPLEFSYPGYLALGEAHLSIIANAINEGTYTCEVRRRQRVLTTYSWRIRVRS	732562	734697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_732745_733004_733145_733209_733378_733762_733895_734052_734164_734268_734393_734476
858135	contig_6007_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_87912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAGTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59197	60499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_59200_60500
858136	contig_13904_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_165479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAAATTCAGTGCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48926	48530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_48500_48900
858137	contig_1262_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_133555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCCCCCCCCAATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283013	282185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_282200_283000
858138	contig_15815_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_177873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATACTTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57060	56660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15815_pilon_-_56700_57100
858140	contig_17859_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_155715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTTGCTAGCTCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89206	89947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_+_89200_89900
858141	contig_4364_pilon	+	1227	2	Intergenic	novelGene_78	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	157	306	816430	817483	FALSE	25	CAAATGTCTTGTTATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELLQITRSRGSEGRKAGDGRGRELTTVETWDRCICRQGSSLCAYLCSKFSIMRAVFWIRSLPGISPVSLPQRPRLRSGKRAQRTWDMRPRDTLELARGGK	816273	818404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_816572_817475
858142	contig_14618_pilon	-	598	2	Intergenic	novelGene_136836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	126	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTTTTGCCTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186968	1152411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1152964_1186922
858143	contig_17198_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_62378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAAAAAGCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925148	926061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_925100_926100
858144	contig_10404_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_138726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAAGTTCTTGTGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537837	1538628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1537800_1538600
858146	contig_5485_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_37761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGGCTGTAATCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505475	504598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_504600_505500
858149	contig_2113_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_161158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTTCAGCTGAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524266	524897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_524300_524900
858151	contig_4305_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_136714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCAAGTTGAAGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808028	807242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_807200_808000
858152	contig_15471_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_175211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTGAAGAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170834	169708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_169700_170800
858154	contig_5033_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_29072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATAAAAACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565076	564036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_564000_565100
858158	contig_7869_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_149992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAGAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55092	55657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_55100_55700
858159	contig_11304_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_156689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCATAAGGCAAGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286387	286864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_286400_286900
858161	scaffold_17542_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_139221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTTAAGACCAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267139	268067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_267100_268100
858163	contig_7839_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_45684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTAATTACTGTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115965	116431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_116000_116400
858166	contig_7415_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_168677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTCTTTGAGGACTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249230	249841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_+_249200_249800
858167	contig_5916_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_158054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTACCTCCTCCTCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466475	465761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_465800_466500
858170	contig_9471_pilon	+	465	2	Intergenic	novelGene_21698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65878	66414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_66210_66280
858171	contig_4110_pilon	+	752	4	Intergenic	novelGene_177877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGACATCTTCACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931754	936386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4110_pilon_+_932265_934597_934705_935737_935824_936337
858172	contig_7171_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_101334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGGGCAGGCTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299335	1298600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1298600_1299300
858173	contig_10011_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_68019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTAGCAGCCAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29941	29644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_29600_29900
858174	contig_21057_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_177878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTGTTGCATGTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5338	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21057_pilon_-_5100_5300
858175	contig_1964_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_130910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATATCACAACTTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154750	155410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_154800_155400
858176	contig_19848_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_173817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGCTGGTGTATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34367	33676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_33700_34400
858177	contig_13542_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_131566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCGAATTAGAGCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686279	686036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_686000_686300
858178	contig_13542_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_131565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCACCTTAAGTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685985	685452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_685500_686000
858179	contig_13831_pilon	-	911	3	Intergenic	novelGene_160992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	58.5	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAAAAACTTAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124528	104855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_105543_121195_121292_124400
858181	contig_7234_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_145914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTGCACCTTGCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210972	211669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_211000_211700
858185	contig_5862_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_54955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATATTAAAGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175081	173843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_-_173800_175100
858186	contig_5696_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_117504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAGAACCCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310991	309781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_309800_311000
858188	scaffold_6394_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_110957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	380	838	158370	157912	NA	60	ATTACAAACAATAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSHAGCCFVRLHTFKSLCDPPTVQSCVCHASALRNSSVTKKSVCVLSPPPNPGHHVAVICPVQFQLAYEGNHTVCGLLGLTDLEPRWPSQRWTLRRCVSTGCPCLTPKSEPGQGSVLLRTHKHRRAYIPGEEKGESSEGGHGQFRWPRIV	158749	157191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_157200_158700
858190	contig_2646_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_69677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAGTGTTTGAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2215330	2214909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2214900_2215300
858191	contig_7898_pilon	+	357	3	Intergenic	novelGene_47573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	854.5	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTGGACCATTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483968	487379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484076_484223_484362_487267
858195	contig_15039_pilon	+	496	2	Intergenic	novelGene_110189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAGTGTGAATGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363083	414988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_363174_414582
858196	contig_91_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_127109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGGTTAAGTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392570	393070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_392600_393100
858197	contig_16103_pilon	+	336	4	Intergenic	novelGene_118808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4537.73991713447	15	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603902	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604351_605006_605118_605492
858198	contig_6442_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_166481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTGAGAAAACAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213391	212970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_-_213000_213400
858199	scaffold_12124_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_22422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	508	822	1636291	1636605	NA	35	ACGTATGTATATAATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCWFTGLWVPGNPTICRLDGRLLDHRAVGARESHNLQVRRLLDHRAVGAGKSHNLQVRRQAHIPRTRSQRMMSWMQDEEAASFARTSVYIGGLVIYFRRINH	1635783	1636739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1635800_1636700
858200	contig_7057_pilon	-	497	6	Intergenic	novelGene_123292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.3245197568194	945	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTCGTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898137	896977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_897084_897306_897359_897464_897540_897628_897777_897944_898000_898076
858201	contig_14984_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_174159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76686	75787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_-_75800_76700
858202	contig_10600_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_169858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	95	352	82560	82817	NA	25	GAATACTTGAATTTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLHPLVVGGKALGVHVTSHTWSLYSLFSSLMSVFSDSTPSLAITGAHHIITGCFQSGLTTLGPLLSDVSSGPEPAVPQPVWGRADSHALFLHHVCNRVCLLSQAPLSVGICRAEA	82465	83306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_82500_83300
858203	contig_8689_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_170035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	482	904	180060	179638	FALSE	0	CCTTCCCCTTGCCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLDFKTYVDQACRAAEEFVSIYYSTMDKRRRLLSRLYMGTATLVWNGNAVSGQESLSEFFEMLPSSEFQINVVDCQPVHDEATPSQTTVLVVICGTVKFEGNKQRDFNQNFILTAQASPSNTVWKIASDCFRFQDWSS	183506	179369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_180121_183085
858204	contig_1339_pilon	-	716	8	Intergenic	novelGene_163113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.538973448401	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	138	635	266321	258777	FALSE	55	ATAAAGGAAACCATTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPEIPVPNPVVKHLLQHCRLVERILTSWEENDRVQSRGGPRKGYMGHLTRVANSLVQNAEKGPNVEQLGQLLKELPEEQREQWEAFVAGPLMETNKKNTVDLVSTHPLHSSSDDEDDRLKELSFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTANITFSLNADDENPCPGWGSGWGPPPSQVSGAPAPAAK	267190	258695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_258855_264199_264258_265449_265548_265626_265717_265998_266085_266233_266350_266545_266611_267146
858205	contig_2646_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_69589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGGCATAGGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438949	1439636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1438900_1439600
858206	contig_3942_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_128720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTAAACCCCTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532582	533253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_532600_533300
858207	contig_6691_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_60149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTTAAGATTCCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312843	311916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_311900_312800
858208	contig_6217_pilon	+	288	1	Intergenic	novelGene_109667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCGCTAAGGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780195	780483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_780200_780500
858209	contig_5502_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_155010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACGTTGACAGCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491695	490955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_491000_491700
858210	contig_2646_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_69497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACCTCCAAGGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219259	218522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_218500_219300
858211	contig_2646_pilon	-	410	3	Intergenic	novelGene_69491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTTGGGAGGAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168836	94112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_94173_150789_151105_168801
858212	contig_9460_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_155307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAAAGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68380	69755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_68400_69800
858213	scaffold_13609_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_124409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAAAAAATACCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538701	537321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_537300_538700
858214	contig_11186_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_98862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAATGAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64395	62965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_63000_64400
858216	contig_11378_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_112311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103969	1103186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1103200_1104000
858217	contig_6501_pilon	+	906	2	Intergenic	novelGene_150567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	197	316	60448	60567	FALSE	25	GATTGTATTAGCTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSEPSFVAKHEDSLFKDLFEDYERWVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLLVSIVGSLGLFVPVIYKWANIMVPVHTGNTNK	43057	61157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_43212_60405
858218	contig_13409_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_128456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTGTTCTTTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107948	108928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_107900_108900
858219	contig_13740_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_34722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCCTCTTCCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163723	164528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_163700_164500
858220	contig_18859_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_150563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	259	666	275370	274963	NA	35	ACCCTGCAGGACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSLHSTLTTQKVLPSCCLILRLRYKITSHESTSIDSALCSPGNLYASHLCQPPESLELQCSLKFMVRHFNERTEAKIFNAFNQNLLQNFQNNNKIDNMNFRISHQLSNTNIRIHFRAHKEYNNSILKFCMWSY	275628	274822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_274800_275600
858222	contig_6266_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_171015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATGGAAAGTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913865	913222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_913200_913900
858224	contig_5628_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_157585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTATCGAGTTGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424508	423947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_423900_424500
858225	contig_8972_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_167622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	67	315	231578	231330	NA	30	AGTAGCATTTATCCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSAAQVNSELKIFSRRTLRLHMALLVNSTKCKILENANSPTEKANQSFLWGAQGQIKKRKTRYLDCGDGFTGGYIGLNLSKIAHFEHSHLTVYQLYIHKAVKK	231644	230694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_-_230700_231600
858226	contig_10196_pilon	-	189	2	Intergenic	novelGene_132317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11870	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGCCCACGGCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2385495	2385099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2385171_2385377
858227	contig_935_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_45527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAGTTTAAGGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69771	70611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_69800_70600
858230	contig_7171_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_101274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAAATATTTTTACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980033	979253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_979300_980000
858231	contig_15897_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_49583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859337	858957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_859000_859300
858232	contig_5057_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_151525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGGAGGACAGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520167	520655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_520200_520700
858233	contig_7171_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_101217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGATTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423834	424611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_423800_424600
858235	contig_11898_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_144301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAGTTAAAGATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312005	311056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_311100_312000
858236	contig_3960_pilon	+	613	5	Intergenic	novelGene_138005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	56.2999777975089	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	155	613	335201	510359	FALSE	25	GTTATTCTTCTCATATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFVWELLGATVPGPSPRAKTRLHYAKSYSFDVDNGTSAGRSPLDPMTSPGSGLILQANFVHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLIVTPFAQVLASLRTVRNNFAALTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITGKNIWE	335046	510359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_335290_468834_469027_498132_498170_507639_507714_510292
858237	contig_12977_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_122799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGCCAGGCAAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42925	43753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_42900_43800
858238	contig_7810_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_144227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455775	455035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_455000_455800
858239	contig_11551_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_168479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	599	907	563848	564156	NA	35	AGTGAAATCTTGACAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDRFLLITHPKYVRHSLAILASKEHSGCTSSQTDLFVLLAVHGIFNILGQHHNSKALILLWSSLFIVQLSHAYEVIANTMAWVRQTLVLKVTCCFLTL	563249	564247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_563200_564200
858241	contig_3825_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_78037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGCAGTGTGAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2305759	2305244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2305200_2305800
858246	contig_13565_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_162384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTCTCCTGCTTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150337	149181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_149200_150300
858248	contig_1093_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_139972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAACTTAGAATCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77714	78333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_77700_78300
858250	contig_12292_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_167010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCCAGCACCTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320329	319358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_319400_320300
858253	contig_8570_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_120164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTCCTCGGAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375854	376536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_375900_376500
858254	contig_6807_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_84578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCTTGGCCTCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171815	172337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_171800_172300
858255	contig_13854_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_154122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283700	284442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_283700_284400
858256	contig_13697_pilon	+	668	4	Intergenic	novelGene_165920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	31.1126983722081	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	17	451	164601	191965	FALSE	15	CAATTTGTTTTCCAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKPRLMNGSTSVGVVRRSAAPREAHLREPAVLISVQPVIWSLNGAGKQSYRSRRSSYKSKFRASAPGEGFFSLSALEEGPRHHQSSPGLGASLRRNLGSKGCTLLPVHLSWWYDIPNFPLASLSFYLLQEIKGDTGRTPGKLPYIGPGM	164584	192182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_164682_167069_167140_182150_182202_191732
858258	contig_6069_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_8010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	70	351	80811	81092	NA	70	AAGATTAAAAAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLLPLRALAPRPAPRQARRKRVMEDWWCPREAARALERGALGTRSHRPSPDLRGPFPGRPCDPTPATLQTLSLLLRGPLPGRPKNSCPAFPSCQSLCGRSSRRCACRACCVRRAA	80741	81602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_80700_81600
858260	contig_15570_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_137873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904874	904212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_904200_904900
858261	contig_9437_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_141713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGGGTTTCCAAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102120	101796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_101800_102100
858267	contig_11702_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_141987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCAATGTCTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380786	379754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_379800_380800
858269	contig_5936_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_53576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306032	307302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_306000_307300
858271	contig_10526_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_142565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAACAACTTTATTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223181	222490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_-_222500_223200
858274	contig_11400_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_177879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTTTAAAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30125	31165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11400_pilon_+_30100_31200
858276	contig_13823_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_145257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTCAGAAGTTTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237490	238110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_237500_238100
858278	contig_6442_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_166477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATCAGGGTGCTAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112004	112792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_112000_112800
858280	contig_299_pilon	+	982	2	Intergenic	novelGene_129466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	127	459	1110051	1110383	FALSE	25	AACTGGGGAGAAGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRDALPVCGQPLVLFVEHEQGWVGQVRVGGIALVAAQVWVLMGAEPLRWVSARDARGLHLHFDVVLQAHHLGLAGVELPGGALIGGHPGFADVVVPRGQREAVQEESQQVQHDCEVRRGVAPRGPGEAATCGLSMEMPHLPSNGGRDIPGT	1085429	1110906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1085555_1110049
858281	contig_12622_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_5812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCTCCTATTTAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353707	353095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_353100_353700
858282	contig_6898_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_35734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTTATGTAAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71238	70607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_70600_71200
858283	contig_14219_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_54315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAGGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679504	680454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_679500_680500
858284	contig_19311_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_144072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAGAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91386	91111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_91100_91400
858285	contig_19311_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_144071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90482	90035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_90000_90500
858286	contig_18919_pilon	-	797	2	Intergenic	novelGene_156030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAATTCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125518	122597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_122797_124920
858293	contig_11338_pilon	-	437	3	Intergenic	novelGene_6270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	355.5	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	82	381	151561	150855	FALSE	10	CCTGCCTCTGACTGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVATQQQMNDAQLVLQQRDYCAHYLIRLLKCKRDSFPNFLACKHEQHDWDYCEHLDYVSRMKEFERERRLLQRKHRREKKAADAARGHGSGEVAPEVAL	155324	150798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_150988_151394_151564_155245
858294	contig_4857_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_48773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATTACCTTAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210617	1209990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210000_1210600
858295	contig_11016_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_163299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212271	211653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_-_211700_212300
858296	contig_20004_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_167526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAGAAAAAAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22516	23163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_+_22500_23200
858297	contig_11378_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_112303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	697	999	1055563	1055261	NA	65	CAAAAGGAAAAAAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNTTANSYTWLFKFKLIEIKLNVHLLSHHSHISSAQRPHVPSGHCTGQQRYGTLPSSQEVLLGSTGWESRKHKGTSASRLLELLTFCSVRTYSRACVV	1056259	1055084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1055100_1056300
858298	contig_13663_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_177880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATTTTTAACAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14117	15000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13663_pilon_+_14100_15000
858299	contig_1154_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_87116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAAAAAATCTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421532	422348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_421500_422300
858301	contig_15859_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_50205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGTAACCATAGATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352666	352060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_352100_352700
858302	contig_7254_pilon	+	1459	7	Intergenic	novelGene_145834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTACCCTCTTTTATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67949	84226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_68530_69079_69120_70352_70463_74755_75033_80151_80429_82519_82626_84157
858304	contig_14755_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_129381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGGAAATTTCCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130306	131486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_130300_131500
858305	contig_11719_pilon	+	212	3	Intergenic	novelGene_154753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1576	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16254	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_16319_19126_19183_19997
858306	contig_5988_pilon	+	584	2	Intergenic	novelGene_16132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	345	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTTTAATTTAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560366	1606677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1560469_1606195
858307	contig_6589_pilon	+	734	4	Intergenic	novelGene_25846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	37.4966665185054	324	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	119	709	934093	939875	FALSE	5	GCCCAGCGCCCCGGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYLGRNPRDVVVSLYHYSKIARQLKDPGKPEQFLQDFLNGEVQFGSWFDHIKGWIRLQGKENFLFITYEELHQDLCGSVQRICEFLGRPLSEEALGSVVAHSSFGAMKANTMSNYTLLPPSLLDHRRGAFLRKGVSGDWKNYFTVAQSEAFDRIYREQMRGQPTFPWDEAPKDASPDLEPSPDPSPGQAPETPYH	933974	939900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_934220_935022_935118_939258_939440_939687
858308	contig_15325_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_157165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAACTGCTACTCAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85001	86223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_85000_86200
858309	contig_10372_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_112521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTAAAGATGCAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84211	83228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_83200_84200
858310	contig_14191_pilon	-	1161	4	Intergenic	novelGene_153767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2.94392028877595	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	129	512	86394	82468	FALSE	25	TTCTACCATTTTAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFSVGWNTFACSESLEKPLNWLLFNYYLTTCLQSSVNKHRHMFVKQIDMDHVMKAKSIREFDKRFTSVMFGYRTIDDYYTDASPNRRLKSVGIPVLCLNSVDDVFSPSHAIPVETAKQNPNVALVLTSHGGHIGFLEGIWPRQSTYMDRVFKQFVQAMVEHGHELCNM	87979	81818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_82647_86110_86277_86355_86405_87861
858311	contig_6059_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_44802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTAATCACAATATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402189	401369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_401400_402200
858313	contig_7357_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_36915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGCAGTTCGAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494017	494670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_494000_494700
858316	contig_11171_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_48632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTTCACCCTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443011	444175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_443000_444200
858318	contig_7356_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_60422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAACATCTCCCCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495051	495746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_495100_495700
858319	contig_10732_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_114706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATTAAAAAAGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117941	117079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_117100_117900
858320	contig_383_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_126091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82617	82212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_82200_82600
858321	contig_610_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_76677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTACTTCTTGCTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31615	32067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_31600_32100
858322	contig_4538_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_153074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTGAGGAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95604	96194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_95600_96200
858326	contig_3018_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_78781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAGCTTTGGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392267	392989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_392300_393000
858327	contig_7688_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_160398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGATTTAAATGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120099	120983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7688_pilon_+_120100_121000
858328	contig_12951_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_68171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTTTTAGGGAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304708	305110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_304700_305100
858329	contig_12951_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_68172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305057	305268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_305100_305300
858330	contig_7963_pilon	+	480	3	Intergenic	novelGene_58583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	31	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTTCATTATTACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259758	270148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260502_269848
858331	contig_5039_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_64950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACACCATTTACGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1622521	1622250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1622200_1622500
858332	contig_5684_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_80995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGGTTACAGAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143825	144164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_143800_144200
858333	contig_7066_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_42122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGAATGTTCAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603248	608359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_603384_603607_603725_608212
858334	contig_5302_pilon	-	416	3	Intergenic	novelGene_81557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_2	11.5	11480	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTTGTTGTGGTGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667389	1666048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1666246_1666920_1667089_1667338
858335	contig_10861_pilon	+	1124	3	Intergenic	novelGene_39414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	316	1122	2179899	2180705	FALSE	65	ATCAGAAAATGAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFTSYKETASSRHLRFKLQSLSRRLDELEEATKNLQKAEDELLDLQDKVIQAEGSNSSMLAEIEVLRQRVLRIEGKDEEIKRAEDLCQLMKEKLEEEENLTRELKSEIERLQKRMAELEKLEEAFSRSKNDCTQLCLSLNEERNLTKKISSELETLRVKVKELESSEDRLDKTEQSLVSELEKLKSLTLSFVSERKYLNEKEKENEKLIKELTQKLEQNKKMNRDYTRNASNDLLIEDGISSTLPSKESRRKGTLDYLKQVENETRN	2095845	2180707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2095935_2150766_2150874_2179779
858336	contig_8000_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_177499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120248	119014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8000_pilon_-_119000_120200
858338	contig_13145_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_116648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197566	196884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_196900_197600
858339	contig_17758_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_177881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	2	529	33275	33802	NA	40	CAAATTTAAATGAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVECLQPLTRLKRRLSYSDSDLKRAELLLEQGVTPWTVPAQVLLCHNLKQQKIISHCYIPQSPQLDLNKETLVHNTFSFWNQAKFGGLEGLKDDELPLFQRRDISKEIQRSRTFSSGVSGLYNPGEPVTPNFVNVHKEPNHSHQQVDHCQCKSHCSWGQESILAGGGTCCPPSRL	33273	33939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17758_pilon_+_33300_33900
858340	contig_7057_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_123196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	416114	416437	NA	30	TAATATCCCGTCAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLFSCGSSYWSCSATGLVAAASAGRATAASSSSATPKRFGRPPAPPGQTPPQSPLVQPRPGLYPSLNQSYVSPTPLGPTNLGQDPTPSPPQTPPIRCQSRSFPALSV	416112	416658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_416100_416700
858341	contig_14768_pilon	+	832	1	Intergenic	novelGene_115079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	70	339	217648	217917	NA	5	CCTCCTGCCTCTGCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSGPGHTPPCVFLPAGGHRLPMHWWVGPCLCWPPDGAVFSSLEASLCPLSSRPQPSPLQLQDIASPCNILILIHIQIGFGGPRSWMRRALPSLTHIACPPPFPYTYPTYN	217578	218410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_217600_218400
858342	contig_12761_pilon	+	1059	9	Intergenic	novelGene_164049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	36.133217058546	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	59	1057	176202	195089	FALSE	45	AGGGAAAGACCGCATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEILRKRETRTARELYANVMLGDDSINDCRIIFVDEVFKIERPGEGSPVVENPIRRKSGPSCKHCKDDESKPCRVCACHLCGGKQDPGKQIMCDECDMAFHIYCLCPPLSSIPDEDEWYCPECRNDASEVVLAGEKLKESKKKAKMASATSSSQRDWGKGMACVGRTKECTIVPSNHYGPIPGIPVGTMWRFRVQVSESGVHRPHVAGIHGRSNDGAYSLVLAGGYEDDVDHGNFFTYTGSGGRDLSGNKRTAEQSCDQKLTNTNRALALNCSAPINDRDGAEAKDWRAGKPVRVVRNVKGGKHSKYAPAEGNRYDGIYKVVRYWPEKGKSGFLVWRYLLRRDDEEPGPWTK	176143	195091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_176210_188611_188713_188808_188996_191836_191961_192053_192162_192391_192497_192606_192714_194757_194921_194993
858343	contig_9221_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_176241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCCATCCCTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36051	36858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_+_36100_36900
858344	contig_6443_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_175152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAGAAGGGGGAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665917	666667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_+_665900_666700
858346	contig_8354_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_24160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTCGGCATGGACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570149	571394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_570100_571400
858347	contig_14243_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_57425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCAGAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565666	564861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_564900_565700
858349	contig_9363_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_6543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTGAACCATATGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753389	752324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_752300_753400
858350	contig_4732_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_75415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGCTGCTGCATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592226	591638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_591600_592200
858351	contig_4156_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_88095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCGGTCCTGTAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270818	271400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_270800_271400
858353	contig_3721_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_123811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGATAATGCTACAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104622	105838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_104600_105800
858354	contig_8673_pilon	-	879	2	Intergenic	novelGene_129943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTTTAGTGACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557646	556620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_557015_557161
858355	contig_3942_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_128833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	71	307	1243980	1244216	NA	5	TGATGCCTTTGTCTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLIAVSHPTPAQNHSLVLGFLRMSLSPATPSQSNEWVRTQSHPLPSPTCRLFWDMACDPAILASSVCPEGTVQLPLGAGGTLPPHHLSRRIRGAGLGLLA	1243909	1244821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1243900_1244800
858357	contig_16907_pilon	-	779	7	Intergenic	novelGene_87490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	15.983498435018	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	179	778	586585	566911	FALSE	80	CTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKNGFLTISHGTANRPPAKLNLLTCQVKTNPEEKKCFDLISHDRTYHFQAEDEQECQIWMSVLQNSKEEALNNAFKGDDNAGENNIVQELTKEIISEVQRMTGNDVCCDCGAPDPTWLSTNLGILTCIECSGIHRELGVHYSRMQSLTLDVLGTSELLLAKNIGNAGFNEIMECCLPAEDSVKPNPGSDMNARKDYITAKYIERKYARKKHTDNAAKLHSLCEAVKTRDVFGLLQAYADGVDLTEKIPLANGHVRVWVS	598522	566909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_567119_574307_574403_583790_583925_586422_586590_586673_586723_592231_592320_598485
858358	contig_7678_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_175952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86062	86779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_86100_86800
858359	contig_17964_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_33917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAACGACAAAAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399026	397890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_397900_399000
858360	contig_9875_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_154420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAGCAGCTACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357955	357452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_357500_358000
858361	contig_2596_pilon	-	1318	10	Intergenic	novelGene_53458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_9	14.3759057685652	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1233	85	1317	627145	601445	FALSE	40	AAAAGTACCCCGGCATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGYKNMPWRRLQGISFGMYSAEELKKLSVKSITNPRYLDSLGNPSVNGLYDLALGPADSKEVCSTCVQDFNNCCGHLGHIELPLTVYNPLLFDKLYLLLRGSCLNCHMLTCPRAVVHLLVCQLKVLEVGALQAVYELEHILSRFLEENSDPSAFEIQEELEQYTTKIVQNNLLGPQGAHVKNVCESRSKLIAYFWKSHMSAKRCPHCKTGRSVIRKEHNSKLTITYPAIVHRKSDQKNTETLGIEEAQLGKRGYLTPTSAREHLIALWENEGFFLNYLFLGLEDVGMESRFNPNMFFLDFLVVPPSRYRPVNRLGDQMFTNGQTVNLQAVMKDIVLIRKLLALMAQEQKLPCEVAAAAADEEKDSSIVMDRSFLSTLPGQSLTDKLYNIWIRLQSHVNIVFDSEMDKLMM	627229	601443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_601592_604440_604604_604895_605002_606127_606215_611363_611468_611579_611666_612884_612993_624992_625143_626023_626229_627068
858362	contig_9354_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_108050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	339	401	162511	162449	NA	40	ATCTAAGTCATTCAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAGENLDCESWVRDKVLFLLHPERWLGTSGDPAREEVAGGEDLPQAGGDDQEPGCPSSLFPRGQRISDNRVDSPSVSLRQDSAAPPKSVLVRVVDYQVTQEVLQTAWTKGSMTTRTEKHSMTAVTFRTNRA	162849	162093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_162100_162800
858363	contig_9354_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_108049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATACTACATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162093	161576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_-_161600_162100
858364	contig_10104_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_160150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCTTCCACCCTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586422	586833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_586400_586800
858365	contig_14744_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_66138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTCATTCATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598818	1599684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1598800_1599700
858366	contig_19737_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_158990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATACACACTCGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130356	130888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_130400_130900
858367	contig_12635_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_60830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAAAAGATGGCCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259886	260501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_259900_260500
858368	contig_16116_pilon	-	173	1	Intergenic	novelGene_177884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTGTTTTCCACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96581	96408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16116_pilon_-_96400_96600
858370	contig_7342_pilon	+	724	2	Intergenic	novelGene_71225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	653	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	90	398	716998	718483	FALSE	25	GTAGTCGAGTGCTTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLGGAILCSEPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGIHLYLILLGA	716908	718809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360
858371	contig_1545_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_149737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93272	92539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_92500_93300
858372	contig_10765_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_122955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGAATTTAGCTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351633	350755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_350800_351600
858373	contig_18869_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_56460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAATGGAATGGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184340	183560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_183600_184300
858374	contig_2027_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_39942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	638288	637914	NA	10	GGCTTTTTTCGGTCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCLPTPHPADDDGLAPGQTTPPVPGGGRRDPGAAILELSFRSGLPACARGQLQKPSLAGPTLTCHAATAAAASILGLSSCLLAGSASTTPRAFTIGFTGLSPPSLLDCWHAHQGNRRNVGRVPD	638288	637780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_637800_638300
858375	contig_13300_pilon	-	771	4	Intergenic	novelGene_125803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	25.7207222984806	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAGCAATATATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250749	244131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247029_247267_247440_250575
858376	contig_6361_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_23916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220933	219757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_219800_220900
858377	contig_9682_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_125308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	489	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	429300	429620	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGVGGREGGRAGGRAARARSWAAGGGTGGARSKQPTVCEQSLLWGRGSTPPPAAPFSVYRREPGSAPRPPSAWIRGPARRPGWGKLASETIIIALRSLELSEDAA	429298	429917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_429300_429900
858378	contig_1088_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_177885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTTCCCCCGTCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265380	264937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1088_pilon_-_264900_265400
858379	contig_6353_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_177886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCACCTGAAGTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82149	81808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6353_pilon_-_81800_82100
858380	contig_17066_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_130954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAATGCCAAAGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226285	225315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_225300_226300
858381	contig_10437_pilon	+	467	4	Intergenic	novelGene_38476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	64.1681818002938	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	13	387	1169851	1173883	FALSE	25	TGGGCTAAGGCACTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLYGKPIRVNKASAHNKNLDRGPLPPPRPTPRPPVPPRGPLRGPLPQ	1169838	1173963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169885_1170349_1170479_1170741_1170870_1173799
858383	contig_4336_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_152362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAGAAATTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358864	358176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_358200_358900
858384	contig_15043_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_175501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACCAGATTTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101895	101532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_101500_101900
858385	contig_9363_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_6721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTATGTCTCTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388893	1383317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1383606_1388660
858386	contig_10140_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_148428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTAAAATATAGAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311327	310919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_310900_311300
858387	contig_11678_pilon	-	1093	1	Intergenic	novelGene_160836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGAGGCTGTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165070	163977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_164000_165100
858388	contig_5794_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_69743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470063	469444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_469400_470100
858389	contig_7457_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_31375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACACGATTCTGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398764	398077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_398401_398575
858390	contig_10627_pilon	+	595	2	Intergenic	novelGene_59975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCTCTCTGCCCAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245799	246471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_245870_245946
858393	contig_6568_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_152865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159964	160522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_160000_160500
858394	contig_7004_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_126521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAGAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475186	475731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_475200_475700
858401	contig_15787_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_143956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGCCACTTGAGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45586	42632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_42924_45327
858403	contig_18189_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_170756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	0	1290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	75	443	42548	41437	FALSE	40	GCTATGGTGAAGAGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQCPVAPGAGPSRRKPACPLPLPMATWCLVLLTGVLLAASQPTLAQPDALLVFPGQMAQLSCTLSPHHAAIRDYGVSWYQQRAGSAPRYLLYYRSEDDQHRPADLPARFSAARDMARDACILTISPVQPEDDADYYCSVGYGSSP	42622	41308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_41760_42502
858404	contig_15628_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_147691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	76593	76273	NA	35	ACTTGTTGAGCAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPRIETGKKKRHEKEKQDLSQCVLGGVRVLEKTTQVGKQVSISFENRVKKTAHNSVSKYKSSTVFWQEILLVLAASERRKWKQSPLRRQNNSPGKRQQEVGLGHR	76595	75497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_-_75500_76600
858405	contig_11832_pilon	-	539	2	Intergenic	novelGene_106963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATACATTTGCCTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461597	460189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_460587_461455
858406	contig_14273_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_21167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317566	316773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_316800_317600
858407	contig_10016_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_117877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGACCTTGGAGTAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491316	490273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_490300_491300
858408	contig_10074_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_57085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTAAACTAGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102242	103369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_102200_103400
858409	contig_9582_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_106851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	239	403	723784	723948	NA	55	CAGCTCTAAAAAATAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKHSATNQKVGGSSPPRGTSEERPGDLLLTKQPLKTLWSPVLLRHTRGYRESESTLWHLIPWGWDLGFQGAVGQVQGSVMGTAGPVPRPVHKSACAHSCRVAVWTTHTGRAQVRPLRMSSHPRPCHGSHQGVI	723545	724019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_723500_724000
858410	contig_5039_pilon	+	523	2	Intergenic	novelGene_64916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTAAGTATAATCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047291	1048253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1047339_1047777
858411	contig_14426_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_170624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGGGTTTGCATTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123759	124552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_123800_124600
858412	contig_13292_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_142943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	270	614	250869	251213	NA	45	AATCTGTTCATTAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLIIWILFSSKFIISKLTTVVCCPTPPQFTTGLYPEPVSLFCTLSWLNMNCFSREEIWEWVERNGVNKSGQSGLFGTFSTAPDPVSPTAIWAANEPLVRNPIFLLYFSRCHA	250599	251886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_250600_251900
858413	contig_2100_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_50634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAAGATCACTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924440	923055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_923100_924400
858414	contig_10627_pilon	+	607	3	Intergenic	novelGene_59979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	38	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	22	453	245872	255313	TRUE	15	TAATGTCCAGGGTCCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTPGPGMGWRGRLAPFSVQPLLALMPIPSPQGRAFVKAAFQGPASSSTGRSSPRPSRSLRPPRSLQQGAAAREHNRPGPAWGHRSLAAGRRGELLLSIPLGLAFGNLGPRCQFVLKPRDGRFQVLPTPRPHPQAGPAAAQAPSGHRIQV	245850	268075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_246298_255307_255364_267971
858415	contig_5711_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_80299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251386	252814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_251400_252800
858416	contig_18438_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_171386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104530	104242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_104200_104500
858419	contig_4496_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_66639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTCTACAGGCACAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648544	648108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_648100_648500
858421	contig_9653_pilon	+	672	3	Intergenic	novelGene_48174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	86.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATATAAATACTACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162287	172992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_162604_171528_171609_172716
858423	contig_8687_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_169673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGTGGGGTAGATAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317542	317032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_317000_317500
858424	contig_17936_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_29977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATCAAAATGGTGGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156817	157576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_156800_157600
858425	contig_9484_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_105689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAAAGGGCGTAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221138	220412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_220400_221100
858426	contig_3382_pilon	+	459	2	Intergenic	novelGene_124092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGATTTAACACAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569975	578149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_570189_577903
858430	contig_15130_pilon	+	673	2	Intergenic	novelGene_177110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	15	341	218019	222171	FALSE	65	TACCGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSVRMGWEMATGVGWTAAGVFQRPGPLLVKVDAGVMDLEEWFRCSWLDVLDSTEELWFIHRSLSDFRSSAGAVRCRSSWYSWSSRSSSWERVTRWITTLEWSLSVCTCGLSS	218004	222503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_+_218288_222113
858431	contig_5361_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_167219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576563	577189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_576600_577200
858432	contig_8843_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_156654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACTGAACATTAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85922	85182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_85200_85900
858433	contig_3818_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_99324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCTCAGAACTTCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289018	1290327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1289000_1290300
858434	contig_6387_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_165425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCATGGTAGTTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45710	46113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_45700_46100
858437	contig_8447_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_69436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAACGTATATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111673	111101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_111100_111700
858438	contig_6846_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_107310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTACTGCTTTCTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326738	326414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_326400_326700
858439	contig_12528_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_81364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTACTTACTGAATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037369	1037646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1037400_1037600
858440	contig_1836_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_71056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATCTAAAAAAATGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882833	882045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_882000_882800
858441	contig_16098_pilon	-	747	4	Intergenic	novelGene_46173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.2385120867876	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	423	746	520403	517881	FALSE	5	CCTTTGGCCCAGGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRLRGEREEHSARLQRELEAQRAGFGAEAEKLARRHQAIGEKEARAAQTEERKFQQHILGQQKKELAALLEAQKRTYKLRKEQLKEELQENPSTPKREKAEWLLRQKEQLQQCQAEEEAGLLRRQRQYFELQCRQYKRKMLLARHSLDQDLLREDLNKKQTQKDLECALLLRQHEATRELELRQLQAVQRTRAELTRLQHQTELGNQLEYNKRREQELRQKHAAQVRQQPKSLKKKTNTNKISERNC	520910	517879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_517920_519784_520025_520358_520563_520647
858442	contig_19825_pilon	+	346	3	Intergenic	novelGene_59695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.5	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCACTGTGTACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77847	82071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_+_77936_80566_80685_81931
858444	contig_3627_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_78413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	148	387	34162	21493	FALSE	30	TTTATTAAAGCCATCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSALRIGGRPVGLPPVHPARPLLCSLVGGSADLLATLESGHCVGDDSRLMAASAAALAVRLSRSVANRGSYGAFCKRLTRTLLAFFDLAWRLRMNFPYFYLVASVILNVRLQKEASRETWGPPTTKKQ	34309	21313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_21544_33973
858445	contig_11372_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_176656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAGAAAAGGTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288741	289581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_+_288700_289600
858447	contig_10196_pilon	-	184	2	Intergenic	novelGene_132315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	686	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGTGTGGCCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2385508	2384635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2384751_2385439
858448	contig_15897_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_49553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCATTAATTTCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669490	669219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_669200_669500
858450	contig_5918_pilon	+	419	5	Intergenic	novelGene_99504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	26.6505159424729	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	96	326	277840	283157	FALSE	30	TTTACAGACCGTGTCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKANIGQFDRIWDRGALVAVNPADRQRYADIMLSLTRKRFRYFACVVSYDPTKHPGPPFYVPDAEIKRLFGTVCSIHCLDSVDVFEERHRSWGIDYIFEKLYLFTEK	258199	283250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_258207_269818_269894_277826_277913_282581_282627_283044
858451	contig_3789_pilon	+	786	1	Intergenic	novelGene_79890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAGGAAAGACCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583126	583912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_583100_583900
858452	contig_5018_pilon	-	652	2	Intergenic	novelGene_46975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	96	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	62	652	550339	549165	FALSE	30	GATGTGCCTTATGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSQNLNNGEKSSSEHIIVRFMKKNTWSSMLGEISELHGNKDPHKNERIHLRRHTVENLCESNEVIQCGKTFSWIPNLTVVKRNLPEVNPFECCECGKAFMDHSSNKYRTRSHIGCSHQHCKQCEACSCLSHLTTTMKTITGKKLQKYMVCGKDCISTLKNSVTTLTGGKHYECNECGKHFCSFPSFCAQVRGHKHECKECKTCSPSSLILHKKIYNR	550400	549164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_549664_550247
858454	contig_14142_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_120545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAATGAGACTCCGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366022	364836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_365687_365939
858455	contig_14727_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_56647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAGATTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280076	281009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_280100_281000
858456	contig_4496_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_66687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTTTCTAAGAGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924294	923177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_923200_924300
858457	contig_19721_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_99161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	160381	160752	NA	40	TATCCACCCGTTTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQDLPKLARAPLLRGFRNLEVAPAPVSGSRSPEVVPSGPSHLLPAGPSLSLTLLLSVRGPEWPQPSAGEPQPKLPKPALPLPLAVPLSRAAFWAPGHPLRVCLLIRLYCNFLRPYRGDKLWPP	160380	160916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_160400_160900
858458	contig_5988_pilon	+	572	3	Intergenic	novelGene_16032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	7.5	1531	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAACCTCTCTAGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810262	811331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_810365_810603_810684_810941
858459	contig_16869_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_137595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCATCTTTTCATGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77642	76990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_77000_77600
858461	contig_14029_pilon	-	226	2	Intergenic	novelGene_151931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGACGGTTAAATTGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45526	44648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_44730_45381
858462	contig_19076_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_74214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACCAATTAAACATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110975	110154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_110200_111000
858463	contig_14341_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_111756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAGAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205069	204426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_204400_205100
858464	contig_3956_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_14779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGGAAATCTTACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976236	976681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_976200_976700
858466	contig_12622_pilon	-	728	6	Intergenic	novelGene_6012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.6256805104516	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	295	711	1653250	1645562	FALSE	10	TCCCATGCCCCAGCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANENHGSPREEASLLSHSPGTSNQSQPCSPKPIRLVQDLPEELVHAGWEKCWSRRENRPYYFNRFTNQSLWEMPVLGQHDVISDPLGLNATPLPQDSSLVENPPAENKARKRQLSEEQPPCPVPQRHTSNSLQIPCK	1656829	1645544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1645620_1651694_1651805_1652911_1653037_1653126_1653270_1654659_1654834_1656728
858467	contig_7318_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_152209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTAGTGTTGGGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173924	173407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_173400_173900
858468	contig_4964_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_157246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTGTGATGCTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29616	30953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_29600_31000
858469	contig_7095_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_166467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488864	488285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_488300_488900
858470	contig_3948_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_53186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACGGTAGTGGGAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828716	827930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_827900_828700
858472	contig_9258_pilon	+	458	4	Intergenic	novelGene_104615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2988.70466181514	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	64	426	97238	99684	FALSE	15	GCCTTCCTCCCAACCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRHQTPVWLLGVTECEKVAGNMSQMEHSIETIINVFHQYSTRLGHPDTLNQKEFKQLVQKELNEKKNDAAIKDIMEDLDTNVDKQLSFEEFSILVGQLTEASHEKMHEGHPKGTDHSHGPGLGGKSGLGWLHSQSCHATQP	96757	99716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9258_pilon_+_96794_97210_97361_99327_99528_99644
858473	contig_8671_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_126285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCACTAGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895703	894714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_894700_895700
858474	contig_8615_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_165223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGTTTTTGTAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177392	178202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_177400_178200
858475	contig_1435_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_115529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609198	609647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_609200_609600
858477	contig_7379_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_150044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614960	614704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_614700_615000
858478	contig_12644_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_44526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	339	746	1352640	1352233	NA	30	AGGACGTGGAGGAACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGALWVRRGQGIPPRHLGPQRGTQARAGDQVWGLPRTPTAGPLAPLRGGGEAPACSGGPQRAPSPSRHSVCPTGSPLPAFSIRILPWTFSVGLIPLVLFHGALTKAKSSFVSISTPAPRGSHPRSAQTWGPVF	1352978	1352041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1352000_1353000
858479	contig_10013_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_125087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	53	412	514931	515496	FALSE	5	TTCCCCAGTGTGTCCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKAARPSRRPRLPGCGGMEARFTRGKSMLLERALARPRTEVSLSAFALLFSELEQANDDARTFYIIEREPLINTYISVPKENSTLNCASFTAGIVEAVLTHSGFPAKVTAHWHKGTTLMIKFEEAVIARDRTLEGR	513432	515527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_513473_514918_515039_515244
858480	contig_7839_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_45698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGCAGCAGATAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225695	225267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_225300_225700
858481	contig_10414_pilon	+	1538	4	Intergenic	novelGene_146935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_3	9.7410927974683	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	734	1456	57266	67937	FALSE	50	CAGGAAGATCAAATAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFYKEAPYQNVTEFDGQDACGSNSWTVVDIDPPQRSNDPKSQPHPGWLMRGLKPWTQYAIFVKTLVTFSDERRTYGAKSDIIYVQTDATNPSVPLDPISVSNSSSQIILKWKPPSDPNGNITHYLVFWERQAEDSELYELDYCLKGLKLPSRTWSPPFELEDSQKHNQSDYEESTSECCACPKTDSQILKELEESSFRKTFEDYLHNVVFVPRSDFSRVSMAWCWGDGRYIGNPMKGGR	56532	68019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_57286_59202_59454_62134_62303_67653
858482	contig_6346_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_172087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216306	216732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6346_pilon_+_216300_216700
858483	contig_17440_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_7577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTGTTCTAGTTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1868	1620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1600_1900
858485	contig_2310_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_71638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATCTTTTTCTCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502175	503136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_502200_503100
858486	contig_1719_pilon	+	354	3	Intergenic	novelGene_87345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	235	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	234	121	354	669224	674221	FALSE	20	ACGCCCAAATGGGCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKPLARASPPRAPPPSSAGTGIRGPAQMIGHWGNQPASLLSSGPRGRPVLPLSSCVTLEPRFHCLEMGVIKM	654925	674221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_654992_669169_669248_674011
858487	contig_12671_pilon	+	615	3	Intergenic	novelGene_19221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	665.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	61	417	197316	203897	FALSE	45	AAGGAGTGCATAGAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSREIFLPPVKIGVVHSFSNFLSPYFKFLSQLHMFIV	197255	204095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200256_200410_203720
858488	contig_19237_pilon	+	200	1	Intergenic	novelGene_162966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGGTAAGTATTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74407	74607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_74400_74600
858489	contig_10013_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_125046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTTTCTTTGCCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198212	197691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_197700_198200
858491	contig_5791_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_35803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTTATATAGTTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163616	164311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_163600_164300
858493	contig_383_pilon	+	721	4	Intergenic	novelGene_126087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1301	junction_1	353.875056419007	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	138	719	69445	116959	FALSE	75	AGGTAAACAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWRSRGAAVTATRSLRALTAEDSSGARRALPRSPGAAAGRRREGAMFADCPRFWVLVVLGTSWAGWGSQETQAAQLRQFYVAAQVISWNYCPQPTDPSLNTSETFFKKIVYREYEAYFKKEKPRSSISGLLGPTLYAEVGDTMKVHFKNKADKPLSIYPQGIKYSKFSEGASYPDHTFPVEKIDDAIAPGQEYTYVWNIMEDSGPTQDDPPCLTHIYYSYENLIQDFNSGLVGPLLICK	69307	116961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_69603_79320_79413_89956_90080_116750
858494	contig_6208_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_53007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGCATACTTACACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449468	448972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_449000_449500
858497	contig_17880_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_167323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTCCAGAGAAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27114	26202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_26200_27100
858498	contig_5463_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_144775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTAAGCTTGCAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37115	37726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_+_37100_37700
858499	contig_3866_pilon	-	935	2	Intergenic	novelGene_112399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAGAACTTTCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173097	170696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_170750_172215
858500	contig_18889_pilon	-	1160	9	Intergenic	novelGene_167115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	31.3326407281608	3	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1098	63	1160	229649	174044	FALSE	45	AAGCCAGACACTGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDHVCRFIGCGRNDRFNYVVMQLQGRNLADLRRSQSRGTFTLSTTLRLGRQILESIESIHSVGFLHRDIKPSNFAMGRFPSTCRKCYMLDFGLARQFTNSCGDVRPPRAVAGFRGTVRYASVNAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVIGQLPWRKIKDKEQVGSIKERYDHRLMLKHLPPEFSMFLDHISSLDYFTKPDYQLLTSVFDNSIKTFGVIESDPFDWEKTGTDCSLTTTTTSTAPQLHTRLTPAAIGIANATPIPGDLLRENTDEVFPDEQLSDGENGIPVGVSPDRLPGSPGHPRPQEKDVWEEMDANRNKIKLGICKAATEEENSHGQANGMLNAPSLGSPIRVRSEITQPDRDFPLVRKLRSIHSFELEKRLTLEP	229711	174043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_174224_177462_177680_186004_186163_202581_202708_203381_203475_209918_209985_222782_222888_224885_225027_229637
858503	contig_9727_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_86366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATGTGTTCAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569473	568927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_568900_569500
858504	contig_8234_pilon	+	617	5	Intergenic	novelGene_177888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	43.412987688018	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	155	616	442776	478537	FALSE	25	GTAAGTCACAGTGGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLCISGQCKNTEGSFRCTCGQGYQLSAAKDQCEDIDECQHHRLCTNGQCRNMEGSFQCVCDQGYRASALGDHCEDINECLENNHICLGGDCVNTAGSYDCTCPNGFQLNDSKRCQDINECEQPGLCGPHGECLNTDGSFQCVCEQGFSISADGPTCEDVNECELLSGVCGEAFCENVEGSFLCVCADENQEYSPMTGQCRSQASE	440290	478538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8234_pilon_+_440392_442722_442846_448794_448918_454453_454580_478394
858505	contig_5352_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_177078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535522	535192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_535200_535500
858506	contig_11258_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_67761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTAAAAGGAAAACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155745	155293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_155300_155700
858511	contig_15867_pilon	-	359	3	Intergenic	novelGene_170901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0.5	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGCTGTTTGAGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225639	215109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_215342_220939_220996_225568
858512	contig_9919_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_137982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGTGAGGAACGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762382	762122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_762100_762400
858515	contig_12427_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_40584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563765	564242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_563800_564200
858518	contig_8017_pilon	+	470	2	Intergenic	novelGene_65369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTTATTTTTTTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162277	1163472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1162705_1163429
858519	contig_6873_pilon	+	546	3	Intergenic	novelGene_129821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11	93	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAATGGCTAATCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431694	451599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_431843_447242_447420_451378
858520	contig_10861_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_39208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAGGACGTGGCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429810	430801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_429800_430800
858521	contig_16535_pilon	-	431	3	Intergenic	novelGene_167709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	215	376	349638	349402	FALSE	25	GACAGAGAGCATCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQKFVQETELSQRIRDWEDTIQPLLREQEQHTPFDIHTYGDQLVSRFSQLNEWRPFAKLVAGQPAFEVCRSMLASLQLANDYTVEIAQQPGLEVAVDTMSLRLLTHQRAHKRFQTYAAPSMAQP	350006	349346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_349543_349617_349768_349921
858522	contig_16515_pilon	-	1081	3	Intergenic	novelGene_177889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	462	1022	4517	3018	FALSE	45	GCACCAAGCAATAAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGCPLEMGRVLSLHLGQGGLLGSTVSLPQVWALPLKCVSMGWRRMGSVWPARPLGGFRSPRFSGETVVERSSWLPLRPMPKMLMGCFRGAFTGGERQLCEERDLLHPQPHPGPGEGKGHFHPRALFSPGLSLEAGFGCEPEHVGARHPWGWLFSQEGTFSKGAGAEGQSYVNEAGLNLQDCISS	4978	2958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16515_pilon_-_3067_3892_4031_4143
858523	contig_11094_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_177018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGACGCCCGTGCCCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290159	290752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_+_290200_290800
858524	contig_13206_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_161902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	63	308	172833	171178	FALSE	25	GTACCAATACTGTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCLSDTNPLKGIFKSNYDSMQLLNQPSPHHQLLVIDTELIPTHGDLMFVRVEVLHSVFEAVTFRKQIARPVSQGTSNPVTLPLSRFRLIATRWQQVFFFF	172895	171141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_171209_172618
858525	contig_5050_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_110288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591980	592998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_592000_593000
858526	contig_11396_pilon	+	1078	8	Intergenic	novelGene_71358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	15.0183561153731	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	258	1013	610005	619801	FALSE	20	TGCCAAGTACTGATTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYRYCPVLWAPTPALQPPMPWRLKPWFLPVVTGALVLFSFHLFLRPFFVCCSLF	587525	619866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_587560_608712_608804_609587_609715_609999_610176_611173_611300_612472_612584_613093_613190_619549
858527	contig_16622_pilon	+	715	3	Intergenic	novelGene_48451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATGAATGAATGGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110155	127976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_110206_125774_125848_127384
858528	contig_7345_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_159196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGCTAAATTGCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320770	321848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_320800_321800
858530	contig_6191_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_107828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGACAAAATAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70086	70516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_70100_70500
858531	contig_13241_pilon	-	1629	3	Intergenic	novelGene_158914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGGATCATATTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312707	289089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_-_290215_291416_291556_312342
858532	contig_16310_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_70057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120617	119997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_120000_120600
858536	contig_8138_pilon	-	485	3	Intergenic	novelGene_52496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACAAAGGATAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448730	446782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_446871_448154_448223_448401
858537	contig_5918_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_99633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGATAGGAGGGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2241283	2240619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2240600_2241300
858539	contig_935_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_45591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAATAAATTTTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841822	842576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_841800_842600
858541	contig_11678_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_160828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAAATTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103831	104307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_103800_104300
858542	contig_4852_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_153966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	538	897	55455	55096	NA	40	AAATCTGGATTGGCATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSYIHPGVPVANVSLETQPPGGQAIEGGKLVLFCSVSEGTGNITFSWHKDATETSLGNKTQHSLSAELEILAVRESDAGKYYCRADNGHRPIWSEVNVTVRSESHYHSSQVGIPKLES	55992	54966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_55000_56000
858543	scaffold_880_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_121384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAGACCACTACACTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259800	259524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_259500_259800
858544	contig_17059_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_166076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGGAAAAGAAAAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375831	376676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_375800_376700
858545	contig_19378_pilon	-	1389	3	Intergenic	novelGene_73767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	18.5	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	133	1011	9138	6564	FALSE	40	CATATGTAAAAGTCGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLNPAAVADNVERADALQLSVEEFVERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTREEGGNQQDEAITWFNIIHPRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGIHELEESTFFDFSRLLFWSRATE	9270	6185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_6925_8101_8491_9009
858548	contig_14243_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_57438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTGATCAGGTTTACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680718	681633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_680700_681600
858549	contig_5999_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_45663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCAAACCACCGACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286600	286017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_286000_286600
858551	contig_3002_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_177890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGCTGGGAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10242	11086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3002_pilon_+_10200_11100
858552	contig_2487_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_148492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGTCTGATTTCTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300189	432357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_300305_413339_413508_432244
858553	contig_16647_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_170319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTAAGTACAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398625	397728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_397700_398600
858555	contig_5832_pilon	-	905	4	Intergenic	novelGene_134183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_2	7.34846922834953	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTCCCTGTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593121	589927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_590192_591301_591407_591676_591829_592737
858556	contig_12644_pilon	-	1084	1	Intergenic	novelGene_44538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATAAGATCCCTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455076	1453992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1454000_1455100
858557	contig_5814_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_143054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTTGCATAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343927	344661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_343900_344700
858561	contig_10940_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_49301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTTTTTGTTAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045591	1046711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_1045600_1046700
858563	contig_13945_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_173461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132144	131544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_-_131500_132100
858564	contig_12479_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_56881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTAAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537500	538144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_537500_538100
858566	contig_5964_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_80377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	510	2	511	615216	615725	NA	10	CCGCCTTCAGCCACGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAKTFRSRASLLEHQRIHTGEKPYECSQCAKSFRFSSALIRHQRIHTEEKPYRCSQCAKAFTQIAHLTQHQRTHTGEKPYRCGECGAPFSQSASLAEHRRIHTGEKPYKCADCGKAFTQVSHLSQHQRTHTGERPYSCADCGKGFSNRSHLLQHHLVHTGEKPYRCGECG	615214	615726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_615200_615700
858568	contig_5758_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_119103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236917	237168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_236900_237200
858569	contig_2798_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_120062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGACATGAGATACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187992	187435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_187400_188000
858570	contig_2377_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_67928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAAAACTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367259	368215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_367300_368200
858571	contig_3068_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_137617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAGCGTGTAGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193569	192877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_192900_193600
858572	contig_11548_pilon	-	822	3	Intergenic	novelGene_66791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	112	junction_2	20.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	150	656	127835	123918	FALSE	45	ATAACCAACTTCAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSYLLQVIIAGLCTNQKNAKTQLLLPNLIYSVVQLKEIVKILEKLNGNGRWKWLLHYRENKKLKEDVRVDSVARKKNLIMKSFQSANIIELLHYHHCDSRSSTKAENLKCLLNLQIQHIDARFAVFLTDKPTVSREVFENSGILVTDVNNFIENIQKVAAPFRSSYW	127984	123751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_124037_124405_124588_127629
858574	contig_3004_pilon	-	685	5	Intergenic	novelGene_127535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.2429764195352	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAATTTCTGTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576303	514789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_514983_516121_516233_520868_521070_573821_573937_576238
858576	contig_16122_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_134570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGCCCATAAGAGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577504	576806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_576800_577500
858577	contig_12046_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_83493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGGAATGCGTTCCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644173	644845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_644200_644800
858578	contig_15092_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_57756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGATAATAAATGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189673	189239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_189200_189700
858579	contig_1910_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_168275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39172	40067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_+_39200_40100
858580	contig_6631_pilon	-	1124	8	Intergenic	novelGene_174295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	430	846	919959	750652	TRUE	15	CTGCTGCTGCTGAGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDALQPVDNRIQCRIVPRTDLLKKYGHGSDYSVFRNCSLKAVKVIWIIEENLHLDRKPPAIDAVFRAGGAVAVAPVKFHLLSFESPRQAGAADKIVVFQKDGNCFPCVFHPGFVRGLVVEAIELQVLVLLADTRVLV	992012	615430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_615633_750575_750756_763112_763262_847652_847750_919892_919962_945551_945709_957883_958078_991936
858581	contig_9650_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_177382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGACTCATGGACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560776	559745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9650_pilon_-_559700_560800
858584	contig_17769_pilon	+	1256	1	Intergenic	novelGene_124267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGATAAAAAGAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105391	106647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_105400_106600
858585	contig_602_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_134962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGGAAACAATCTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525042	524214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_524200_525000
858586	contig_8260_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_163270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543914	543559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_543600_543900
858587	contig_15361_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_167860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAATAACAGTGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421597	420821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_420800_421600
858590	contig_17103_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_176949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACTGGGCCACGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143807	142430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17103_pilon_-_142400_143800
858591	contig_12625_pilon	-	1071	6	Intergenic	novelGene_140488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	2.31516738055805	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	179	721	58341	44461	FALSE	30	TCGCTGGCATACCCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRPLQNMKSQKILIININHTQSSPRTHKGSPYIPTSLMESLRSADLELDRIPWLYKLHGILLREIASGERVVLACSALKKMYRDILIRGKDGTPRKHDKLGKEEEPPEVKLFVVHLSGSFEVISGRLLKRKGHFMPPKLLQSQFNTLEPPSAPENFIQISVDKELSEIITTIMEALKVQ	63529	44110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_-_44813_47303_47348_51869_52009_58333_58421_58993_59025_63461
858593	contig_511_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_132725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGAATTTAGAATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27508	26302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_-_26300_27500
858594	contig_3975_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_54698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAATCCCTCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115301	1114720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1114700_1115300
858597	contig_6635_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_127016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCCCGCAAACAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376825	375593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_375600_376800
858599	contig_10437_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_38339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486284	485546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_485500_486300
858600	contig_7292_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_175369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATACTAAAGATAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200575	200137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_200100_200600
858602	contig_4413_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_116993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTTAAGCATCTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156004	156928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_156000_156900
858603	contig_19311_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_144080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAAAAAAAATCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127474	126372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_126400_127500
858605	contig_6557_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_33019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCCAGCCATGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612827	613171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_612800_613200
858606	contig_10196_pilon	-	440	4	Intergenic	novelGene_132326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.4125300177453	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	24	383	2396440	2395724	FALSE	20	AGAAACTCGCGTGTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNRHASAMLSAQERAHVAQVWDLIAGHEAHFGAELLLRLFTVYPSTKTYFPHLGACQDQEHLLSHGQRMLAAVGVAVQHLDNLRAALSPLADLHGQVLRVDPSNFPLLIQCFHVVLASHLQDEKYR	2396463	2395666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2395736_2395801_2395853_2395954_2396160_2396348
858610	contig_408_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_84899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGAGGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40193	39664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_39700_40200
858611	contig_5594_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_150120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116458	115827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_115800_116500
858612	contig_2278_pilon	-	607	6	Intergenic	novelGene_118130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_5	119.376714647372	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	23	607	1036228	1025589	FALSE	80	AAAAGAAAGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRPGRDDAGAGSARRPRELSEQELQRRREQKRRRHDAQQLQQLKHLESFYEKPPPGLIKEDETKPEDCIPDVPGNEHAREFLAHAPTKGLWMPLGKEVKVMQCWRCKRYGHRTGDKECPFFIKGNQKLEQFRVAHEDPMYDIIRENKRHEKDVRIQQLKQLLEDSTSDEDGSSSSSSECKEKHKKKKKKEKHK	1036250	1025588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1025707_1026465_1026528_1028252_1028345_1029364_1029495_1029767_1029799_1036076
858613	contig_9195_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_155696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATCAAAAAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785542	785138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_785100_785500
858614	contig_15114_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_121169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	132	434	328084	328386	NA	45	TTTGGGAATTACCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCQAFFFLSRNLKCLPTIPPTLPPTACIGPHWARKLDPLKRQTMGTRNCGKRVRGNMWFGCSPGPSSVSTQAGCLLHSPPPLEASGRHSGRHPLTAGRLSAERCVCSSVLFRLAGAEACKETTRHFLKCYFFLRRSTVFGNVG	327952	328389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_328000_328400
858616	contig_15760_pilon	+	697	2	Intergenic	novelGene_131062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATATAAAAAGGGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425182	431362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_425641_431123
858617	contig_5643_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_38891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCTGAGGCCTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250831	249787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_249800_250800
858618	contig_8552_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_80098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGATTGCCACATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537052	536264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_536300_537100
858619	contig_385_pilon	+	908	3	Intergenic	novelGene_177043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	3	428	159904	160499	FALSE	20	CATTTATTCTCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSAGKALHDLLLSAQRQGCLTAGVYESAKVLNVDPDNVTFCVLAADEEDEGDIALQIHFTLIQAFCCENDIDIVRVGDVQRLAAIVGAGDEAGAPGDLHCILISNPNEDAWKDPALEKLSLFCEESRSVNDWVPSIPLPE	159901	160979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_160005_160090_160305_160388
858620	contig_7707_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_72224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCCCACGCCAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816756	816307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_816300_816800
858621	contig_13868_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_172648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACACAAAGCACTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65559	64594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_64600_65600
858622	contig_9415_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_109914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2138822	2137880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2137900_2138800
858623	contig_5794_pilon	-	740	2	Intergenic	novelGene_69777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCACAGGGAATGGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734405	733588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_734155_734231
858624	contig_3077_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_26853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACTTTTATTAGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919557	920624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_919600_920600
858625	contig_6833_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_175125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACCACTGGTCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138878	139378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_138900_139400
858626	contig_990_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_76152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGGAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1793171	1793627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1793200_1793600
858628	contig_9920_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_177891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATATTCGCTTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34214	34691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9920_pilon_+_34200_34700
858630	contig_8650_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_162624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAATGAGAATAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234727	235249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_234700_235200
858631	contig_2646_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_69502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTTGCTCTCCGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442311	443363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_442300_443400
858632	contig_15067_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_154340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138583	139085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_138600_139100
858633	contig_8322_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_143233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCATCTGACGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256476	256939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_256500_256900
858634	contig_9721_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_155995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561894	561035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_561000_561900
858635	contig_12977_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_122796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATTGACTTGACGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21884	21387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_21400_21900
858636	contig_15897_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_49533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAGTGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564898	564346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_564300_564900
858638	contig_9548_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_141046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	263	792	24	815	42131	42922	NA	30	ATCAGGGATTGCTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEEERKCMAINQKKAYILVTPLKSKKVIEQKCMKYNLSSTTIKEITDSAMSNHQKESESDLNKTANPIRKPTRTLENTFAYSVDHKSKNQEDCSECDLLTVNQKIKIPTPKKEQMATCNLKKNKRSPALKEVENQVATSFHKHQSSSDLSCEDSETAKQVERKSRVVKKTKERNTKETVVHLRKSTRNTTRNIVVISESETEESENDYHTKQKKVRSSAKETVQKSGIRNEFPVVEGMGSDKMNRHPSECLPGLTQDEEWNEKEIQKLHR	42107	42980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_42100_43000
858639	contig_9443_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_167124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGCAGTGGTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54480	55062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_54500_55100
858640	contig_1274_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_137825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTAAATATATTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794914	795253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_794900_795300
858641	contig_5539_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_104747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCCATTCCCCGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40631	40013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_40000_40600
858642	contig_19960_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_164192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTAAGTTTTTCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46364	47460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_46400_47500
858643	contig_1534_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_176126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAGTCTGTCTTAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20112	19387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_-_19400_20100
858644	contig_10957_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_177892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAATACAGTTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54658	54172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10957_pilon_-_54200_54700
858645	contig_6946_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_59762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	65	391	375689	376015	NA	65	TTGGAAAAAATATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPCLELGCCCSVSCARWGQRSTPRHRTRPSLPRSSPGQPDRALGAGRERLLLQTKEGPVGLSPDGVRVTTVLFPNSRKVNFHIFDHSQFILLQGTLCGMASAHKES	375624	376530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_375600_376500
858646	contig_3132_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_127459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGCTGAAATGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420691	421647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_420700_421600
858647	contig_9706_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_20950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAAGAGTTCCATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270056	269607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_269600_270100
858648	contig_7915_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_42983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGATTTATTCAGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140918	140245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_140200_140900
858650	contig_6100_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_168122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493482	494205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_493500_494200
858651	contig_16685_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_115051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCTAAAGAAGCAGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483769	484631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_483800_484600
858652	contig_7904_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_160027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACGCTGTACTGCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470626	470256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_470300_470600
858654	contig_7327_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_172111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGCAATTACTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84879	85141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_84900_85100
858656	contig_16846_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_82848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAAGTGACAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6038	6742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_6000_6700
858657	contig_9482_pilon	-	836	6	Intergenic	novelGene_44252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTTTTCAAATAAAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649619	629984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_630063_631415_631543_632576_632768_633276_633388_637160_637337_649466
858660	contig_8394_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_27328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	326	532	123654	123860	NA	65	GAGGAAGAAAAATAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAFKAIRSGSRIRCCIRLQASNCFILTCSVIQVIICVVWLESLPPFSDIDTRSEPEFIIVECNKSSVTAFYCVLDYPVFLALVSFIISFAAKNLPDTFNETKFLTFSMLVFCNIWVSFLSTCQSMKGKAMMAMDIFAILASSVGLLGCIFAPKCYAIMLRPDMNAHLRINFKKDI	123328	124597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_123300_124600
858661	contig_10311_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_50481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	24	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTATAAATGAATGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94136	88924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_89096_89664_89827_93888
858663	contig_6446_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_149222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGACCAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397056	397448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_397100_397400
858665	contig_7171_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_101321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGAGTGTTATCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085857	1085567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1085600_1085900
858666	contig_16525_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_133815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	127	507	140798	141178	NA	15	GGATTCTGACCTTTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLFRVGRVSLLRDPHLPPASPIRFTACQDALALPGSGGGEGHPPHKGRQELAPPCRPLTAECAGRRRPHSDGQDPALLPPFPAPLLTPPSPSTMISPSVSPLSPAPLAESALSNCTVFLAVGED	140671	141252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_140700_141300
858667	contig_614_pilon	-	743	5	Intergenic	novelGene_132610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	345	656	361671	329976	FALSE	35	GCCTTCTGTAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLTLSISAINETSLSMMLLCNSAKAALIFFMELSTSSLIMMRYLVRETVQRCKSFTDFSIFGTSFLCQLIWLYFKMSCRDIGLNRRCFCLRLAWVTRLLS	373666	329888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_330093_331662_331795_354811_354874_361670_361779_373429
858668	contig_7078_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_130120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTCCCCCCACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32263	31118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_31100_32300
858669	contig_16068_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_177502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCTCAGTGGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333987	334849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16068_pilon_+_334000_334800
858670	contig_3380_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_60135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598022	597092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_597100_598000
858671	contig_7730_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_156261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43784	44450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_43800_44400
858672	contig_16541_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_126723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTCCTGCGGTCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216748	216039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_216000_216700
858673	contig_4392_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_117341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTCACAAAAAAAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611890	611548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_611500_611900
858674	contig_6445_pilon	-	242	2	Intergenic	novelGene_77110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGGGTCGGGGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333481	1332797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1332969_1333410
858675	contig_498_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_148550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTTGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579411	578626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_578600_579400
858676	contig_6283_pilon	+	709	5	Intergenic	novelGene_100206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	20.5608851949521	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	3	476	607367	609958	FALSE	10	CCTTGTCTCATTCCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIRLQFDSVGRLSRQGQDPAQLLQEAGLESRCPPEGRLGGGAPEPRLAAQRQAGQSPWCGGAGPGQLQHLKSLLDGEQQPRAALEEPGPSSPKDQEATQFPKVATKGLSKKCLILSSVPVTERAILPALKQSLKSNFAERQKRLQVVQSRRLHRSVL	607364	610191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_607396_608323_608493_609482_609563_609636_609694_609819
858677	contig_14300_pilon	-	818	6	Intergenic	novelGene_133108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGCTCGGAACAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250344	233422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_233691_243472_243578_243771_243862_246860_247018_248954_249106_250297
858679	contig_12520_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_161070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTATCTCAAAGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463676	462968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_463000_463700
858680	contig_7327_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_172108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCATAATTGAGTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50820	50192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_50200_50800
858683	contig_7815_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_134396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	420	362	781	608332	607913	NA	25	TATGTTGACAGTTGCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVFLEEKILAFCRCSMCKEKKNPLGLYLSCRWQNVNEEVRVWTRKDMCPPAVDPRISPQPHGTCSAAGVRDALMSMVVSPISCPIQICKLGQWQRGKLQLLLVIQGLPDNCPPGRRSACWPSVFYCIAIQIVNHNLTV	608693	607912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_607900_608700
858686	contig_14133_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_119923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	273	641	137018	137386	NA	50	GGAAAAAACAAAGTAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGPLEPGNVGSEGSRGRTLVQPASLTILSKSGKKSLDEKLSLRARHSCKRPSSPQPSREGLCTPILHMRKEMKRKSVTGPCPRQPGFESVFSAGRPTAPPGPLCPLCAQGLGGGRRGAKE	136745	137919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_136700_137900
858687	contig_11994_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_129360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTAAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158640	157795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_157800_158600
858688	contig_9571_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_136293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGCAAAAGAAGAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513597	513308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_513300_513600
858690	contig_15073_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_172826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGAGTTGATTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409811	410466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15073_pilon_+_409800_410500
858691	contig_15073_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_172825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCAGAAGGTATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409193	409551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15073_pilon_+_409200_409600
858693	contig_9389_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_84049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	404	784	621453	621073	NA	85	AAAAAAAATGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQARAGEGGPETQQQGGAGTRLGTPALSGRSCETGMRLPTPSHFLSSKAPPINPVIRIPVSGSASRDRQLSHYLGMLLLPQPPSPRSSSEGDLEWVAGKLDSPGSCPFLWSPWVVKRLMRSAAK	621856	620930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_620900_621900
858694	contig_10424_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_56795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCTAAAACACAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276974	276363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_276400_277000
858695	contig_7410_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_106048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGCCACATAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56718	57206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_56700_57200
858696	contig_11318_pilon	+	635	2	Intergenic	novelGene_48159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCGGGGAGCTTATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56870	58292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_57357_58143
858697	contig_835_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_152142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGCACGGAACCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108032	108375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_108000_108400
858699	contig_8027_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_158851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCAGATGACAGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454386	454982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_454400_455000
858700	contig_14919_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_171155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTAGGTGAAGGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29528	29066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14919_pilon_-_29100_29500
858701	contig_10143_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_163343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231417	231995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_231400_232000
858706	contig_9133_pilon	-	597	2	Intergenic	novelGene_109293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	46	597	51886	48277	FALSE	60	CAGAAAATGGAAAGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTHRGFLLYLSGNVLMFFGLFTPLVFLSNYGKSKHYSSEKSAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTRWIRPRVQYFFAASIIANGVCHMLAPLATSYIGFCVYAVFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPMLGRLNDVYGDYKYTYWACGVILIFSGIYLFIGMGINYRLVAKEQKEQK	51931	48276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_48417_51474
858707	contig_6076_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_81763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACATTAGGAAAGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364512	363514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_363500_364500
858708	contig_15062_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_162282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGTGAATGAATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2964	4032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_3000_4000
858710	contig_5039_pilon	+	811	6	Intergenic	novelGene_65022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	322.046828892942	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	24	467	1773369	1786952	FALSE	45	CAAAAAATACAGCTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFLDNFRWPECECIDWSERRNAVASVVAGILFFTGWWIMIDAAVVYPKPEQLNHAFHTCGVFSTLAFFMINAVSNAQVRGDSYECSSLAVHWFHVDVWVTYCLHVDSFWCICYPDYPGLAVFFQNALIFFSTLIYKFGRTEELWT	1773345	1787296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1773468_1775230_1775344_1776931_1776977_1781414_1781508_1784547_1784596_1786906
858711	contig_11902_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_176152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	185	499	18400	18086	NA	30	GAAGTGGAGGTAACACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPSVLGPGYQVTSVQRRLRRKQAKEQVWATGGWAGVQRSGEGMGCGQGKTVSAMTTFKGGHKGDRKEQLKTHESLSIPIGSGTPSTGTATRGGSENPESPSC	18584	17997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_18000_18600
858714	contig_15049_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_160725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGAAAATTGTCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229751	229361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_229400_229800
858715	contig_6069_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_8035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	3	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	15	386	311584	313599	FALSE	5	CCCCGCGGGACGGCCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSKDMMKHLMQLNGHHEGPSGTGEETTPREDRQGTGSAPEPAPRDCAYDPPCRWLEASDLQTITPATLGNGTRLQLAGVPAGVLWRPGQWPFYCCTGCGKVFWEGSHLGRLTAHFHEVLETPPPQLL	311569	313620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_311639_312967_313007_313321
858717	contig_8866_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_77833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCGGCTCCTCAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594852	594055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_594100_594900
858718	contig_12327_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_140642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCGCGCGGCCCAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176625	177126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_176600_177100
858719	contig_7587_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_163712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAATCACTGTGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142391	141802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_141800_142400
858720	contig_14023_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_165359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTTCTCTTTCTACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87570	87160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_87200_87600
858721	contig_312_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_128300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229998	230522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_230000_230500
858722	contig_5959_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_150219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCCCCCACAGGAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446482	445998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_446000_446500
858723	contig_567_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_34020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAAAGATAGCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664420	664729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_664400_664700
858724	contig_8195_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_170053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGATGCCCAGTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133785	134643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_133800_134600
858725	contig_10864_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_107120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCTGGGGATATACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153071	1152632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1152600_1153100
858726	contig_8606_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_159384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCAAACCCAGTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5626	5921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_5600_5900
858728	contig_5033_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_29105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811291	810319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_810300_811300
858730	contig_6589_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_25706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTTACCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216135	215456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_215500_216100
858732	contig_6589_pilon	-	811	6	Intergenic	novelGene_26196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_4	15.3805071437843	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	160	555	2003500	2000047	FALSE	20	ATATCAGGGGGTGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKSALTIQFIQSYFVSDYDPTIEDSYTKICTVDGIPARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRAGHGFLLVFAINDRQSFNEVSKLFTQILRVKDRDDFPIVLVGNKADLETQRQVPQSEASAFSASHHVAYFEASAKLRLNVDEAFEQLVRAVRKYQEQELPPNPPSAPSKKDGGVPLHPPVAWAW	2006072	1999790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2000147_2000674_2000794_2002841_2002951_2003432_2003536_2003648_2003737_2006036
858733	contig_9616_pilon	-	1240	8	Intergenic	novelGene_177310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_5	17.5208330805568	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	63	1238	37790	11181	FALSE	25	AGTGTCATATTTTCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STNQPSSVLSLLQSVSERLKMNIDEDGQEAGEEGEEEEEEEELVHRGSLRSRRREHMSFQLPDSPIAFYSEDDQETTGLSKHSYAMSNEPTTSNLQIGLWPEKTSFLQKSDLTSKLHSSLKSAYHQYLQASKTHSSEKGARFGGIFQEPVSKSFHVQDNSARLSLFTENIDKQTLRCIPRPGKMVIYDLHGSKYKQEIYSNIPDATSWSFPNGVLIKVVRGCWILYEKPHFQGHKCVLEEGEKVLNRDWILQNRKHPQRNFVLGSIKRVLKDCSIPEIELCSQSDPACCPVYIQRAVPNLEELNIPKSVSFTVKSGVWLAYPDINFKGQATVLEEDCGLFEISATEMKSLHPLQMGGLKVEMPMNLKVIIYEKPHFFGQAKDFSEHIDSIPNFLKNDRDFHGIGSIRVIGGV	37852	11178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9616_pilon_-_11316_13492_13529_17572_17688_19146_19284_34440_34589_35611_35728_35971_36017_37346
858734	contig_2739_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_165837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTATAGGACAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232694	233023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_232700_233000
858736	contig_4024_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_177895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102340	102887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_+_102300_102900
858737	contig_8354_pilon	-	702	3	Intergenic	novelGene_24134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_2	692.5	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	50	700	513617	503434	FALSE	20	ATCTGAGTGAAGCGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRVRLASVWGVGGRRPELPSAEPRERRPLSTIRPLPLCHTVSAGCSGCLWFRFIRDVKTLLILLVTVTA	513666	503431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_503824_505824_505966_513497
858738	contig_15410_pilon	-	921	3	Intergenic	novelGene_130592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTCCCGCCTTCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120078	115521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_116200_117848_117995_119981
858739	contig_6302_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_171701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGATGGGATCAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143412	142619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_142600_143400
858740	contig_11171_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_48578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAACCACTGCTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80840	81215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_80800_81200
858741	contig_7088_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_159796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAACAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710460	709821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_709800_710500
858742	contig_998_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_153799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTTGTTGAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353970	352745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_352700_354000
858743	contig_15434_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_56718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGTCTTATATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76213	75598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_75600_76200
858744	contig_2854_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_120897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211879	1212933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1211900_1212900
858745	contig_13904_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_165499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGCTGCTCCGTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122405	122667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_122400_122700
858747	contig_10013_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_125050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGCTATGAGCATCTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235207	234797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_234800_235200
858748	contig_15108_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_131174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGATCTTTTTAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65501	66185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_65500_66200
858749	contig_19899_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_102508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCCTGATAAAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116140	116489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_116100_116500
858752	contig_4093_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_27649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGAAATGAGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65586	64581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_64600_65600
858753	contig_13206_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_161914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACCAGAGGTTTGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242326	242926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_242300_242900
858755	contig_14048_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_146334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGTACTTCTGTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524843	523897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_523900_524800
858756	contig_12080_pilon	+	2301	1	Intergenic	novelGene_128327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	725	2175	127	2301	7573	9747	NA	25	GTAAGGGTTGGCAAGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFAVGNVVADLGLDLGSLSARRLRVVPRASRKFFEVNWETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELIVERPLELFRAEVVIQDINDNNPSFPTREMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYFALRVQTREDNTKYAELALERALDREREPSIQLVLTALDGGTPARSASLPIRITVLDANDNAPAFNQSLYRARVPEDAHPGTLVVQVRATDLDEGPNGDIIYSFGSHNRAGVQELFALDLVTGMLTIKGQLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSPVPEDAPLGTVIALLSVTDLDTGENGLVTCEVPPDLPFSLTSSLQNYFTLKTSAALDRETMPEYNLSITARDAGAPSLSALTTVRVQVSDINDNPPQSSQSCYDVYVEEDNLPGVPILNLSVWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRESGVVSSLVPLDYEDRREFKLIAHISDGGTPILTTNISVNIFVTDRNDNAPQVLCPWPGGSSVVMLPRGTAVGHIVTRVVGWDADAGHNAWLSYSLLGAPNQSLFAVVLHTGQISTARPVQDTDLPRQTLTVLITDNGEPSLSTTATLTVSITEDSPEAQTEFSSGSDPREQNKNLTFYLLLALILVSVGFAVTVLGVIIFKVYKWKQSRDLYRGPVSSLYRTPGPSMHADAVRGGLIPPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPNASSPLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQ	7446	9747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_7400_9700
858758	scaffold_6394_pilon	+	574	4	Intergenic	novelGene_111055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	225.658050057062	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	507	518	454556	454567	FALSE	10	GCTTAGCACTGCCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGANIIEVSKEARKRFLGPLHPSFNLVKTIRGCLVKTLPADSHERASGRLGISLTRVSDGKNVIISHFNSKDELIQANVCSTFIPVYCGLIPPSLQGVRYVDGGISDNLPLYELKNTITVSPFSGGERHLPAGQLHQHPRAASHQHQHPAVQYYSGELCTRSPSRFSMLR	451041	454623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_451275_451356_451423_451802_451957_454502
858759	contig_19647_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_144023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAGTAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123485	124872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_123500_124900
858760	contig_10063_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_127761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACTTTTTCAACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732262	731889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_731900_732300
858761	contig_10765_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_122967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAATGATAATGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399593	398696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_398700_399600
858762	contig_16896_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_174909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAAAATGTATCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92839	93999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_+_92800_94000
858766	contig_7379_pilon	-	385	2	Intergenic	novelGene_150037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTCTTGTAGACCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569897	553010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_553328_569829
858768	contig_15974_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_164819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAATACTTTTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319955	319155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_319200_320000
858770	contig_3602_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_60688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCAGCTTTCGTCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285095	1285503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1285100_1285500
858771	contig_2854_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_120794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTAACCTAAAGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52140	52750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_52100_52800
858774	contig_5728_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_126710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGACTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372375	372892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_372400_372900
858780	contig_5331_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_112828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTCTGTCTCCCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757988	758415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_758000_758400
858781	contig_6873_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_129846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCACTTATCACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797031	797387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_797000_797400
858782	contig_11702_pilon	-	1063	4	Intergenic	novelGene_141948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	6.59966329107444	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	97	624	213736	207871	FALSE	40	GGTGATACAAACCCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLQSIPIATACTIYHKFFGETDLDAYDPYLIAMSAIYLAGKVEEQHLRTRDIINVSNRYLNPSSEPLELDARFWELRDSIVQCELLMLRVLRFQVSFQHPHKYLLHYLISLKNWMNRYSWQRTPISVTAWALLRDSYHGGLCLRFRAQHIAVAVLQLALQVYGVEVPADADAEKPWWQVFSDDLTKPTIDNIVSDLIHIYTMDTEIP	213832	207431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_207961_209956_210185_212306_212440_213659
858783	contig_5457_pilon	+	366	3	Intergenic	novelGene_139006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCCCTCAATAAAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212002	273467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_212167_261808_261932_273388
858784	contig_9554_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_170684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAACTGACAATATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80556	80988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_+_80600_81000
858786	contig_12969_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_61678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGTGCATGCTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452095	451414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_451400_452100
858788	contig_6795_pilon	-	789	1	Intergenic	novelGene_27750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAATTTCACCTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359211	358422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_358400_359200
858790	contig_4071_pilon	+	796	2	Intergenic	novelGene_151876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	322	729	187316	187723	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTSDEIVSVEQPSSSLNPLCFECGQQHWTKENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQPLDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFASVCQDVMQRCDLEAHLKNR	134764	187790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_134976_187205
858791	contig_6673_pilon	-	814	5	Intergenic	novelGene_164006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	59.9291248058905	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	347	769	11168	5486	FALSE	55	GCTGAGGTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVSYQVDERTCIQFAMKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160301	5440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_11111_11199_56429_56515_68208_68318_160179
858792	contig_19693_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_175177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21944	21119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19693_pilon_-_21100_21900
858793	contig_12079_pilon	+	714	5	Intergenic	novelGene_67380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	63.0753517627924	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	160	570	421017	427092	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLYTLSKRHFVLVFVIFFVCFGLTVLVGIKGPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQIVSNPLSTYNQQLWLTCVVELNQSKGMPPDALGDFSLYEAPYFRGLKGFTVFGQDDEEGCSLLFIIAASWKSLKCLPGLSA	405161	427236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_405245_411211_411278_421006_421111_423247_423304_426831
858796	scaffold_9205_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_161099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAATACCTCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180638	181133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_+_180600_181100
858797	contig_11594_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_80919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCCCCTTCCCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451518	450687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_450700_451500
858798	contig_20487_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_154378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTAGTTTTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2634	3456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_+_2600_3500
858799	contig_11590_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_125571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366147	367226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_366100_367200
858800	contig_4940_pilon	+	1404	3	Intergenic	novelGene_177770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	130	741	114788	119905	FALSE	35	TGTTAAACCTACAATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAEDSCSGVRRRVNPDPSLHQGLKEKAQKPRAPLPLFERNQTMQIPVTQHPFLTAGGWLLPGTSTLCPPASPHPQFGGPLSLPSTHGCERYPALRSHRATPYPSPYTHRNNSPTYSDNSSACLSMLQTHDNWSSLGMPAHTSMLPMGHNSSPSTASSQYPNLWSVSNGAITPGSQTPAVANGLGTQFFRGSPAHYTPLTHTASASSGSPLYEGGATATDIPDSQYDAAAQARLVASWTPVSPPSM	114658	120568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4940_pilon_+_115002_116463_116594_119637
858801	contig_18272_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_7075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACAGATATTAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520240	519602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_519600_520200
858803	contig_13947_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_173101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9128	8622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_-_8600_9100
858806	contig_5341_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_167999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183179	184085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_+_183200_184100
858809	contig_12057_pilon	+	1110	2	Intergenic	novelGene_131621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGATTACTAATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21847	23902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_22460_23404
858810	contig_14300_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_133109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236141	235618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_235600_236100
858812	contig_13542_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_131526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGGGAGGGGCAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494508	493138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_493100_494500
858813	contig_2987_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_125844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATGTCATGTCTGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473504	474800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_473500_474800
858815	contig_6954_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_64463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTGTTTTATAGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786040	785396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_785400_786000
858816	contig_12157_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_135894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATAATATTTACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100671	100357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_100400_100700
858817	contig_4125_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_25189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCTGGGCTGGACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353636	1353238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1353200_1353600
858820	contig_16322_pilon	+	370	4	Intergenic	novelGene_87555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	797.497892717522	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTGGACCCTTCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109199	111155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_109295_109541_109618_110870_110945_111030
858821	contig_13015_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_165535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	82	627	74827	74282	NA	30	GAACCCCTGCTAAGCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCWGCAHPGSLRPQAQAPGRATSGEEAPAIFPPAARSGHTEEGGWAWGERLTSSPRKAPLQPDPRPESGDASKSFWQMAIFYSINTAHRGTGRALAFLLCAIQKSGGAVGKSSSANRKVGSSDPPAAPWKPSGTSSILSCRVTVFQNRLDGNGSGCFWWRVVKRIPTHRDPTGQSRTAP	74908	74126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_74100_74900
858822	contig_1154_pilon	+	1082	8	Intergenic	novelGene_87188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.494871659305394	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	35	919	1021734	1027799	FALSE	15	TACTGTTTGTGACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRGAAHQKLPMDKLVLEDEKHQGAQSQALQKVKGQERVRKTSLDLRREIIDVGGIQNLIELRKKRKQKKREALAASQEPPAEPEEEITGPIDAETFLKASVEGKMKVIEKFLADGGSADTCDQFRRTALHRASLEGHMEILEKLLESGATVDFQDRLDCTAMHWACRGGHLEVVKLLQSRGANADVRDKLLSTPLHVAVRTGHVEIVEHFLSLGLDINAKDREGDSALHDAVRLNRYKIIKLLLLHGADMMTKNLAGKTPTDLVQLWQADTRNALEHPEQKLEQNGLEGPTKSGRETPQPVPAQ	1021699	1027962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1021803_1022591_1022754_1023082_1023191_1024814_1024914_1025284_1025384_1026463_1026563_1026760_1026860_1027649
858824	contig_18208_pilon	-	450	4	Intergenic	novelGene_176169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAGCAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134059	29000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_29140_50700_50801_133189_133285_133943
858826	contig_6163_pilon	-	245	1	Intergenic	novelGene_103824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAACAGGCCCTCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231807	231562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_231600_231800
858827	contig_9730_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_150627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407529	408222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_407500_408200
858828	contig_1339_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_163122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAATAAATAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343944	343293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_343300_343900
858829	contig_7428_pilon	-	787	2	Intergenic	novelGene_77679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	9	692	153226	151944	FALSE	20	CCACAGCCCAGCTCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATMLEALRERQGGLARRQGGLAGSVHRIQSGLGALSRSHDTTSNRLAQLLAKAERVGSHSDAAQERAVSRAAQMQRLEANHGLLVARGKLHVLLFKEEAEIPGSAFQKEPEPLGLEDLSELGPELPEAEIEESSEEEPVESRARRLRRTGLQKVQSLRKALSGRKGPAAPPPTPVKPPRLGPGRSAEGQPEAQPAQASTLEPEPPQDTEEDPGRPGAAEGALLQTENAA	153234	151848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_152346_152944
858833	scaffold_880_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_121491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACTCATAGCAACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516834	516597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_516600_516800
858834	contig_5787_pilon	-	790	1	Intergenic	novelGene_167895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCTTATAGGGTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93377	92587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5787_pilon_-_92600_93400
858835	contig_6975_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_74246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATATTAATTAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106302	106954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_106300_107000
858837	contig_10477_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_112498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACTCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356988	357622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_357000_357600
858839	contig_9177_pilon	-	1016	1	Intergenic	novelGene_32769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCTTAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351283	1350267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1350300_1351300
858840	contig_4754_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_35916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGCACTTTCCGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218543	218241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_218200_218500
858842	contig_5918_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_99572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770498	1769515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1769500_1770500
858843	contig_1141_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_136917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAGGGGGTAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375722	375218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_-_375200_375700
858844	contig_3956_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_14814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233597	1232949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1232900_1233600
858845	contig_5640_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_27248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56668	57214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_56700_57200
858849	contig_2342_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_132750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCACAGTGGTTAAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108912	109946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_108900_109900
858850	contig_9423_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_99194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGGGTAGAAGTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163412	162751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_162800_163400
858853	contig_13460_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_162186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	444	926	243120	242638	NA	65	GGCAACTAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKKLESRGMSDLHLLGTSFVLILIVNPHEFGQVFMLHYSTQHQTTTEVREILYSLTHKITPVSQLLNTCLNFHLVQIHISGYSVGSKHNACYGQSTTKIREPQHAGSPHMRAVPLLSLVLQAFIYPFNKTHSVKHSHASNSALDSKHLVRSPFMCRCSF	243563	242521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_242500_243600
858854	contig_19405_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_176208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAATGAAATAATAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82573	82905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19405_pilon_+_82600_82900
858855	scaffold_16539_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_68415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	223	345	927681	927803	NA	30	AAAGAGCTTTCTCACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPPPPGADGCEPGGRPSGLLPTSPSTCPPAPGCLSPPDSDDGRSSTPPAPRRPCHSGASSGPPWCTPEHGSQLMTLPPSWGPPEAIPPPHLGALGSHPHFSPRLELLLPSWGG	927458	928039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_927500_928000
858856	contig_12967_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_169804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216150	217053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_216200_217100
858863	contig_7840_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_69020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGTTTTTTCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313656	313349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_313300_313700
858865	contig_6086_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_171464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAGAAACCCACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93929	93531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_93500_93900
858867	contig_8558_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_123167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558342	557716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_557700_558300
858868	contig_5481_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_144567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAGTTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99131	98382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_98400_99100
858869	contig_19934_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_166637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	32	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	77	439	280941	279730	FALSE	45	AGGCTAAATACAACTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLWLQIPFFCGHSSECWNVGSRWAMDQAKYNLINEYFLVGVTEELEDFIMLLEAALPRFFRGATELYRTGKKSHLRKTTEKKLPTKQTIAKLQQSDIWKMENEFYEFALEQFQFIRAHAVREKDGDLYILAQNFFYEKIYPKSN	282896	279414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_-_279957_280805_280964_282842
858870	contig_7031_pilon	+	737	2	Intergenic	novelGene_132801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTACAAGAGGTGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343268	344766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_343772_344532
858871	contig_817_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_132493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762566	761351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_761652_762303
858872	contig_9027_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_156365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTAGGTGTTTAGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170739	171483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_170700_171500
858874	contig_4232_pilon	-	417	3	Intergenic	novelGene_63159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	45	359	54593	41741	FALSE	10	TCCCCTGCTCGTGGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSKKHRGEKEAAGTTAATSTGGATEQPPRHREHKKHKHRSGGSGSSGGERRKRSRELLKKMSSSDTPLGTVALLQEKQKAQKTPYIVLSGSGKSMNANTITK	54637	41682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_41760_41882_42005_54419
858875	contig_19960_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_164191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGTAGGACCTAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46364	47356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_46400_47400
858876	contig_7644_pilon	-	280	2	Intergenic	novelGene_64273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGAGTTGTGTTTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426679	421375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_421384_426407
858877	contig_13481_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_119285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCAGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175146	175733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_175100_175700
858878	contig_10985_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_175547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTAGGTTTCTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180254	179147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_179100_180300
858880	contig_8330_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_71928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296380	1296809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1296400_1296800
858881	contig_11986_pilon	+	745	7	Intergenic	novelGene_69083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.666763341035	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	43	426	14216	18605	TRUE	10	CTGGGTCTGTCTATGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCWEDFVGQELYRFMVMDFIFMLVDTLFGELVWRLISEKKLKRRQKPEFDIARNVLDLIYGQTLTWLGVLFSPLLPAMQILKLLLLFYIKKTSLMANCQAPRRPWLASHMSTVFMTLLCFPSFLGAAVFLCSLSSTSTSRW	14173	22185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_14275_15956_16053_16436_16513_17150_17272_18573_18653_21266_21335_21981
858882	contig_5350_pilon	-	119	1	Intergenic	novelGene_99331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGAGCAGGCCGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142080	141961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_142000_142100
858883	contig_6446_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_149268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808256	809119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_808300_809100
858884	contig_5602_pilon	+	1099	1	Intergenic	novelGene_133030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCTTCCTTTTTTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552207	553306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_552200_553300
858885	contig_4105_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_21514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125281	124793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_124800_125300
858887	contig_13607_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_170202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAATCACAGGTACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314942	314575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_314600_314900
858888	contig_16411_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_77329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAACTCTTGGTTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165398	164485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_164500_165400
858889	contig_12619_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_73568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATATAACTCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822254	821458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_821500_822300
858890	contig_4962_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_107385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTTAAAAGGATCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205095	206005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_205100_206000
858892	contig_9389_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_84001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTAAGGAGAAAAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504144	503613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_503600_504100
858898	contig_12644_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_44573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACACTCACCCTTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2025493	2026217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2025500_2026200
858899	contig_12299_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_29735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCGAGTCAATTCCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116952	117221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_117000_117200
858900	contig_15691_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_60774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	194	421	80974	80747	NA	25	CTGAGGAAACCAGTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTSALFLLLVDLLKVPEFSFGISYLSNIIKAVSFPEVDLPLPLDKLATLLLELPATGCSNPVFMISPKMLAHEEDEMTGTPPRVRSVVLFKWTAGEWLTLFPARCSNSRFPSRASGLCQQMVLFWIYIFIPRCVFDFP	81167	80307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_80300_81200
858901	contig_5765_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_141375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAGAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538851	538495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_538500_538900
858903	contig_14855_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_146019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTAGTGTGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514600	526430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_514755_526144
858904	contig_4364_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_4589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2094405	2093426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_2093400_2094400
858905	contig_3789_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_79901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTTGTGACATTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644809	645287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_644800_645300
858906	contig_9706_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_20981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACAAAATATCTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376229	375076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_375100_376200
858907	contig_12540_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_148115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATATAGAAGCTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132559	1132340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1132300_1132600
858908	scaffold_6394_pilon	-	508	6	Intergenic	novelGene_111034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	10.6470653233649	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3	446	413523	409798	FALSE	0	TGCGCTGCCTCCTCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAKLESIDGARYHALLIPSCPGALADLASSGSLARILQHFCSESKPICAVGHGVAALCCATSEDGAWLFQGYSVTGPSVYELVRAPGFAHLPLIVEDFVKDAGASFSASEPDAVHVVLDRHLVTAQNASSTVPAVQNLLFLCGSRK	413525	409735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_409805_409891_410004_410237_410332_411781_411877_413086_413195_413495
858909	contig_11416_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_145377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	525	246	770	764792	764268	NA	35	AGACCACACAGGTTGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSSKWQGPRAALKTGSHAALQAGRWGPGFRPAVSVGKAIYFPGGGEPALGFNTGFTPSSALSHCEVNGKEVDGARSVADSSEELYVFNAPVAWERVPCGGVCWRRVQACFRWVCCRSSGARQPPAGSPAAEASPRVTLEDSCPWPVSGGRFCDPPGGGCCLVSCPNDDDDDGN	765037	764265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_764300_765000
858911	contig_6589_pilon	-	456	6	Intergenic	novelGene_25995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	218	373	1421286	1420133	FALSE	10	CCTGCCAAGCGTGGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSPPGSPLSFYQPSLQTRPGQTGSATFQPSLGLGPQDVQEYRNYQPGSLCGYCSFCKRCTECENCHCDEENMREHCDQCQHCQFCYLCPLVCETVCTPGSYVDYFSSSLYQALTNMLETPEP	1425454	1420049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1420170_1420378_1420416_1420837_1420893_1421259_1421329_1421839_1421911_1425350
858913	contig_1084_pilon	+	721	3	Intergenic	novelGene_152385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	6.5	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCTCTCAATAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529973	533184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_530421_532131_532169_532947
858914	contig_10561_pilon	-	1418	3	Intergenic	novelGene_175935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	8	676	171434	157139	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANFSYRFSIYNLNEALNQGETVDLDALMADLCSIEQELSSIGSGNSKRQITETKATQKLPASRHTSKHGTLKGSSSSSNRITKPSHANYSLDDITAQLEQASLSMDEAAQQSVLEDSKSLVTSQHRRTASAGTVSDAEVRSISNSSRSSITSAASSMDSLDTDKVTRPQELDLTQQGQPITEHAISLRCPSKQAKHHIDFTEEQAELTPVSYANIPVGLLK	171441	156396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10561_pilon_-_157259_170071_170578_171391
858915	contig_8375_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_141290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAGAAAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124014	125175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_124000_125200
858916	contig_2093_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_152951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAATACAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983575	982347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_982300_983600
858917	contig_13954_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_130051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCACAACCACCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42035	41621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_-_41600_42000
858918	contig_13215_pilon	-	299	1	Intergenic	novelGene_145900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGTACAATTAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205014	204715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_204700_205000
858920	contig_14986_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_59730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCATTCCGTAGGAACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150268	150647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150300_150600
858921	contig_6654_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_85722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTTCAGCTATCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303831	304621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_303800_304600
858923	contig_21377_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_174772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	975	1349	19412	19038	NA	10	GCCAAGCTCCCGGCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTSPPSFAPHGIKLRGLRRVAPPSRGPFLIAGRQGGGTFGRSNSAAAASPELGHATGQGPTTRGAQPGAPSGVVPPRSHGRMRGRAGGPRPHGHQKRIRWREAREGPGRRRDVAGSRLPVRQ	20386	18999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21377_pilon_-_19000_20400
858924	contig_8866_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_77906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATTAAAGAAAATGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144737	1143486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1143500_1144700
858930	contig_6137_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_59188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGAAAACTATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292971	1293302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1293000_1293300
858931	contig_12300_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_176516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAACCTTGCAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506460	506058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_-_506100_506500
858932	contig_5084_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_64580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTACATAGACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727232	726392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_726400_727200
858933	contig_15036_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_107152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATATTTTGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99955	99662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_99700_1e+05
858934	contig_2332_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_58723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861991	861185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_861200_862000
858936	contig_6217_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_109704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	137	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAAAAAAAAAAAAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083347	1081829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1082108_1083140
858937	contig_7629_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_153606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470231	470641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_470200_470600
858939	contig_2332_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_58691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480179	479292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_479300_480200
858940	contig_13051_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_140114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCATGTTAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203801	204566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_203800_204600
858941	contig_9235_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_156236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAAAAAAAAAAACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75967	75343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_75300_76000
858942	contig_9982_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_55775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCTCAGAGCCAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616139	615641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_615600_616100
858943	contig_8464_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_125408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGTGCAAGTCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925915	926468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_925900_926500
858944	contig_6552_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_163603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACGATTACTTGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137039	136161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_136200_137000
858945	contig_5921_pilon	-	654	3	Intergenic	novelGene_142249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTGTACCTGCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383268	326732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_327011_345435_345497_382953
858946	contig_15036_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_107147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAACCAGAATGAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60148	61202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_60100_61200
858948	contig_10726_pilon	+	608	2	Intergenic	novelGene_132499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGAGTGGTTGTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10319	11422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_+_10810_11304
858949	contig_8312_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_152905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTGCAGGGCTGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302011	301063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_301100_302000
858950	contig_5954_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_28581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACATTGGATTTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929497	930382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_929500_930400
858951	contig_6364_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_51855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGCTACAGTTGGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2056034	2056850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2056000_2056800
858952	contig_16122_pilon	-	631	3	Intergenic	novelGene_134563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	67	630	440056	438345	FALSE	40	AGGATAAGAGAAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSSQRGDFVSLFGPYCLWERIMAAVPQNNLQEQLERHSARKLNNKLSLSKPKSSGFTFKKKTSSDNDVSVTSVSVAKTPVLSDKDINVVEAFSFSEPLPHASSQQTRLHDFFKNAPEDQQTARGGSKPSSPDLLQTPREVLCTAQNTRAIRESHDVAFKKLEFSSSTDSLITINDWDDMDDFDISGNSKAFVTPLKTHNIRVSTAQKSK	471622	438343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_438811_439958_440061_471560
858953	contig_20053_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_177900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCTGACGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2972	4064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20053_pilon_+_3000_4100
858954	contig_938_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_143923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGAACATTCGGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141234	141707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_141200_141700
858955	contig_10095_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_57253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAAAAAAAAGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371183	370202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_370200_371200
858956	contig_13412_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_80007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTGCTTTGGTCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352451	350760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_350800_352500
858957	contig_6825_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_155125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCAGCGACGCGGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53637	54009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_53600_54000
858960	contig_14643_pilon	+	496	4	Intergenic	novelGene_99139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGGCGGGATCCGGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114485	167528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_114513_122065_122319_167025_167154_167440
858961	contig_9678_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_146356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194876	194054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_194100_194900
858964	contig_15076_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_177253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111136	111837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15076_pilon_+_111100_111800
858965	contig_15327_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_70816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	105	590	1467355	1467840	NA	25	AAAGTGATGTTCCCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDIRFTLGTFLRLASLRTYQGQLAYLPVGGAASRMPSSPALDQGGPVNTLLVPLDQPVPAHWTVVPEQDFVLVLVLLHSHLGSDMFTAPMGRCAAGVTHLFYVRAGVSRVMLLRLFLAMEKGRHMEYNCPHLVYVPVVAFRLEPKDGRGVFTVDGELMVSEAVQGQVHPDCCWMVSGCAEPSSRQGPPRTPPQPL	1467250	1468089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1467200_1468100
858966	contig_10734_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_51237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAGAATAACAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218356	1217434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1217400_1218400
858968	contig_5791_pilon	+	1235	10	Intergenic	novelGene_35804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	215	547	191376	199565	TRUE	30	TCGCACCAACAATTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYTCKKVIYRLGVAPCALQDSWINKNDFRKSGSTECFFFSSFLFFSLYFSSPPVSQPSNISGIFFILLSDQPSIHSTWHFFCKAGLLSQFITKLKFAESIIKTICKFC	186460	211324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_186487_190782_190921_191325_191482_193295_193384_199426_199569_200456_200570_204412_204522_205232_205483_206660_206795_211245
858969	contig_3825_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_78041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAAAAGAAAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2331829	2330628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2330600_2331800
858973	contig_12019_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_87718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	351819	352142	NA	70	TCAAAAATAACAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVRSRVCFWASKVIRARSGRGEVGVANHVVQTPGDWFVFSDWWESPGEPLTSQAAERGLGESVRHEESTSVAGESQNHLPSWSCLLQKKAGGRHLFLFLLSLRPNF	351817	352802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_351800_352800
858974	contig_11702_pilon	+	591	2	Intergenic	novelGene_141947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	102	572	107319	108109	FALSE	5	ACTGCTGGCCTTGCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLVHVPPFLPRGLQRLTLHHNRIERIPGYGFAHMKPGLEFLPLSHNSLRDDGIHSASFLGLHRSLAELLLDHNQLQAIPRGLLSLKGLQGLRLSHSQIRHVPLNSICDTRVAQDSNLISTHLEDNLIDPRHVPPTAFSCIRAYHSVVLQPHPPTSPLPCAALWDCWLGEPSGRRSTSQRLTEAGISART	107217	108128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_107516_107835
858975	contig_5732_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_119603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACGTCTTGGCTGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373669	374371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_373700_374400
858976	contig_2069_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_23388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGTTAGGGTAATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100466	1101105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1100500_1101100
858977	contig_2106_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_177768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGGAGTTAAGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277921	278484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2106_pilon_+_277900_278500
858978	contig_7411_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_137024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTGGCGCTCCCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355641	355229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_355200_355600
858979	contig_14029_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_151930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45192	44639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_44600_45200
858982	contig_7080_pilon	+	605	7	Intergenic	novelGene_100086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTCCGCGACCCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285166	300240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_285245_287169_287275_287759_287817_290269_290364_296582_296689_297136_297232_300170
858984	contig_12886_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_135510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAACAATGTAGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615839	616476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_615800_616500
858985	contig_2646_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_69721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATACCTTACTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2612768	2613507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2612800_2613500
858986	contig_12566_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_85983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGACTTTCATTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5580	6520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5600_6500
858987	contig_16643_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_158129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATGTATGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255431	272704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_255557_257277_257439_272504
858989	contig_20561_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_166379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAAAAAAAAAGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124398	125332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_124400_125300
858990	contig_13992_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_147618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAATGCCAGTAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125252	124767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_124800_125300
858991	contig_6589_pilon	-	489	3	Intergenic	novelGene_26304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1	447	2290237	2272133	FALSE	60	TTGTGAAACAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGKGRRRRPRLKKDGWSGQRSLSLCPPATSAAAPGTGALGFSLKAPGTASSASTVTSTAAAATTTATGFALNLKPLAPSGLPSTVPTAGTVPSGPGAASGGPTSPALTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVSLLVFTLCCLL	2290237	2272090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2272172_2273662_2274009_2290175
858992	contig_4845_pilon	-	741	8	Intergenic	novelGene_53662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_7	129.988382526427	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	654	86	739	542039	515269	FALSE	15	AGTGAGTCCTGCCTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCDVAAALGPTETLGRGEGEQPGVVRQMWRYRSWDVPQIPAEAPQTQKAITKSGLPHLALPPPTPGALCGESERQIRSTVDWSESAAYGEHIWFETNVSGDFCYVGEQYCVAKMLQKSVSRRKCAACKIVVHTPCIEQLEKINFRCKPSFRESGSRNVREPTFVRHHWVHRRRQDGKCRHCGKGFQQKFTFHSKEIVAISCSWCKQAYHSKVSCFMLQQIEEPCSLGVHAAVVIPPTWILRARRP	542124	515266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_515383_515475_515548_516441_516511_516935_516993_519701_519780_520091_520188_520466_520576_541980
858993	contig_5999_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_45660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATAGTCAGTGGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279804	280032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_279800_280000
858994	contig_9438_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_154265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAAGTGAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77995	78397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_78000_78400
858995	contig_5084_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_64682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGATCTTGCAAATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1779093	1779894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1779100_1779900
858996	contig_6767_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_174621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTGCCTCCTGTGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139902	140392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_139900_140400
858997	contig_11416_pilon	+	389	2	Intergenic	novelGene_145362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	27	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCTGGACCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416442	417113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_416574_416855
858999	contig_12031_pilon	-	1093	2	Intergenic	novelGene_137570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACACATGTGAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362324	341849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_342711_362092
859000	contig_5997_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_168622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTGTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347211	346604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_346600_347200
859001	contig_12540_pilon	+	587	3	Intergenic	novelGene_148100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	6	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTACTGTGTGTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994856	996511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_994955_995858_995913_996076
859002	contig_8683_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_150238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATATTAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251895	251381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_251400_251900
859004	contig_13456_pilon	+	703	3	Intergenic	novelGene_153321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	21	398	635053	640368	FALSE	30	TAAGCTGTCTATACTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSAKVMRARSGGFPTDGGSGAQAPFLPVALLPPGPQCPLYPLEGMFRRITAAATRLLTSDSSDGSFYALEGLNSHVRAMIPTHPSLVLLWCQLLLLANYTDYRWWAEVQQTPKCSPPALGPACSGRPVPF	635032	640673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_635168_638087_638296_640313
859005	contig_7775_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_37450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21693	22458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_21700_22500
859006	contig_9995_pilon	-	681	1	Intergenic	novelGene_47667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAATAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175768	175087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_175100_175800
859008	contig_2161_pilon	+	985	5	Intergenic	novelGene_114956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	22.3313120975907	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGGTGTGATTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995899	1007095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_996086_996223_996314_1000587_1000697_1005866_1006032_1006660
859009	contig_13680_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_149584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAAAAAATGAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311672	311952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_311700_312000
859011	contig_12019_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_87721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	586628	586287	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGWVVAPQPGRCHSNREPLLVPLRGLLHLRPEEGAEEEPQAPSVPRRHVGCLRARCALQERGRTGGAGYEGKVHGGPTAVSGAADPPLKAQRLQASSCQPGRAFGANCALQS	586629	585954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_586000_586600
859012	contig_16098_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_45901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACCAGTCTCAGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294922	294100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_294100_294900
859013	contig_10196_pilon	-	153	2	Intergenic	novelGene_132316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAAGGTGGCGGACGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2389799	2385085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2385146_2389706
859015	contig_17204_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_177819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6606	5154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17204_pilon_-_5200_6600
859016	contig_10324_pilon	+	899	2	Intergenic	novelGene_7885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	462	764	567686	569706	FALSE	15	TTGCACTGTTTTATGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAFGKSPFPPSPCQSCEVITGRTWGQLFLGGGRPWGSNVDISVRSVFSHHVCLRACVALTFIHQNDDNTQRESLSHQSPLTVMKCLSHQVYLVLPQPLS	567224	569841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_567868_569585
859017	contig_14694_pilon	+	276	2	Intergenic	novelGene_152463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTTGCTCTTTATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55355	76359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_55445_76172
859018	contig_5782_pilon	+	621	2	Intergenic	novelGene_162136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127606	1128685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_1127709_1128166
859020	contig_2854_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_120843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTACCCAGGTCACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270037	271032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_270000_271000
859021	contig_14443_pilon	+	1200	2	Intergenic	novelGene_126676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGGAGGTAGTTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31346	36125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_+_31459_35037
859023	contig_18850_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_142452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAAATTTATTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226535	226161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_226200_226500
859024	contig_8235_pilon	+	516	2	Intergenic	novelGene_175745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGATTTGTTTATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197302	199691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8235_pilon_+_197364_199236
859025	contig_12250_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_80742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTAAGACTGTCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430619	431047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_430600_431000
859026	contig_1301_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_47339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGTTTTACCATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287590	288260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_287600_288300
859027	contig_7513_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_89005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTCTTTTTCTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637605	637903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_637600_637900
859028	contig_7513_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_89003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTACCACAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631753	631254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_631300_631800
859030	contig_12050_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_62705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619975	619475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_619500_620000
859032	contig_13593_pilon	-	848	2	Intergenic	novelGene_156139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTGTGGTGAGTGCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458698	457272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_457567_458144
859033	contig_521_pilon	+	910	5	Intergenic	novelGene_174738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCACAGAGACCAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49547	59045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_+_49602_51534_51633_52676_52758_56530_56618_58455
859034	contig_9389_pilon	+	658	5	Intergenic	novelGene_83926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	981.569502124022	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	28	468	159587	168200	FALSE	45	AAAAAAAGTGGCTGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRRPPPPAMSSTQFNKGPSYGLSAEVKNRLLSKYDPQKEVELRSWIEELTGLSIGPDFQKGLKDGIILCTLMNKLQPGSVPKINHSMQNWHQLENLSNFIKAMVGYGMNPVDLFEANDLFESGNMTQVQVSLLALAGKVRPREGSSPPTPRTFI	159559	168390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_159650_163619_163742_164232_164300_164401_164556_168165
859035	contig_20241_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_159730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACATAAGGCATACAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168016	167297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_-_167687_167871
859036	contig_7357_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_36930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAGAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776616	775498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_775500_776600
859037	contig_5286_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_157346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCAGTTCTGTCGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522652	523020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_522700_523000
859038	contig_7816_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_66559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347865	348436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_347900_348400
859039	contig_4385_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_141509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGAGGCTCTGCTGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407114	406064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_406305_406776
859040	contig_5586_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_143499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCCACATTTACCGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198082	198408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_198100_198400
859042	contig_7695_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_41697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACAACTAGGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191108	1191905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1191100_1191900
859043	contig_8616_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_72447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGTAAAAAAGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257262	258035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_257300_258000
859044	contig_7171_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_101393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGAAAAAGATGACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403524	1404380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1403500_1404400
859045	contig_7050_pilon	-	601	5	Intergenic	novelGene_153614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	122.354760839127	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	37	438	677188	585724	FALSE	15	TTGCTTTTCATTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAALSVSLGHIAMAAGGGVAPAGEGLRYAEYSPPSARRPDADIDPGLSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGEQRPIVPWMAAWKLLRPQTLCNELGGGSPYLATKINEAKDLLESSTKH	677224	585560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_595561_595640_631905_631977_637860_637938_677083
859048	contig_15474_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_136226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34767	34299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_34300_34800
859049	contig_15516_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_177471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAATCCTCCCTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41554	40682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_-_40700_41600
859050	contig_5285_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_177901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACATATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41122	40516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5285_pilon_-_40500_41100
859051	contig_8660_pilon	+	477	2	Intergenic	novelGene_136477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCATGATTTTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12414	65681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_12529_65318
859052	contig_16532_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_110039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTATTCACTGGCCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145299	144760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_144800_145300
859053	contig_7058_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_136022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGTTGATTAAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165564	166351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_+_165600_166400
859054	contig_5906_pilon	-	757	6	Intergenic	novelGene_174810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42.6305055095527	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	332	700	328577	213789	FALSE	40	ATAAAAGTTGTCTATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRRKGPKVPSKENTYITKILGYINALFVERHCSSWPSFHDVISSDAITFTDDFSYGMHRVETSCSQCGAHLGHIFDDGPRPTGKRYCINSASLSFTPAESSGAEGGSGVSSPAQVDKTEL	433654	213731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_213954_224310_224409_326870_326949_328549_328659_354177_354305_433531
859056	contig_11641_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_177902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGCCAGCTCTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5437	4529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11641_pilon_-_4500_5400
859058	contig_6975_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_74314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTATCTCCCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599647	598999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_599000_599600
859059	contig_253_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_129620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACACACTCAGCTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132623	130999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_131000_132600
859060	contig_5598_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_148292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTACCTTCTTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778217	778757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_778200_778800
859064	contig_7066_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_42157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTAATTATTTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807683	807261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_807300_807700
859065	contig_11702_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_141951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	450	574	1023	285451	285900	NA	20	AAAGCGGCTCCTGCTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDPSPRQVGSREASPPPDAHSPGVRACSVVSCGDLGRSPGVLRLAHTLLPGLGQDGRDPRWAQTRKGILGVPPASQLKADALSTSEVFHTAALTHVCVTTKPRQLSRPEKGFPLTVTDIGGGVRAGPAGTLRLCYKATCKHSNKNMSFS	284877	285900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_284900_285900
859067	contig_8044_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_132386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	192	512	502367	502047	NA	30	CTTAATGTAGCAGTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWGFLVCFSETSFFFFNQLTNIFILKCSLPRSFWYYSAPSLKQHKLRCVILLRSSRSPCAQCLMQYSLIRDVLGHLLQPLSAVGRADMQAAAPCSPRPPARTSRLGCLRGLRCHPAVKGAPLPLPPPPHTPAPLGLAVGKVEVWNRGTACIHYGVCTSSSYFTECISGR	502558	501729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_501700_502600
859068	contig_14780_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_166381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAAAAAAGAAAAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6093	5264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_5300_6100
859069	contig_5981_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_35536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGGAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299665	300626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_299700_300600
859071	contig_4689_pilon	-	788	3	Intergenic	novelGene_165389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	106	369	128730	127560	TRUE	20	GAAAATTTTGTGCCCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCHGSGGKKPFQPKGSAAECKQSQRNAANARERARMRVLSKAFSRLKTSLPWVPPDTKLSKLDTLRLASSYIAHLRQLLQEDRYENGYVHPVNLTWPFVVSGRPDSDTKEVSAANRLCGTTA	128835	126349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_126732_127522_127647_128553
859072	contig_7788_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_177610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCGGAAAGCTAGCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272455	271989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_272000_272500
859073	contig_5569_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_86757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTCTTCTTCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491133	490115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_490100_491100
859074	contig_8263_pilon	-	1515	2	Intergenic	novelGene_83072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAACAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42857	41182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_42340_42499
859075	contig_6446_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_149207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295122	294756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_294800_295100
859076	contig_11986_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_69119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCTAAAGTGTCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114772	115397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_114800_115400
859078	contig_12257_pilon	+	437	4	Intergenic	novelGene_152102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.46337971105226	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGTTCTATAGGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148667	159025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148776_149449_149522_157405_157514_158876
859079	contig_6842_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_130799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGTAAAATGTATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655321	1655710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1655300_1655700
859083	contig_1037_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_84606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTAAGCTGACGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306686	305685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_305700_306700
859085	contig_14405_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_85619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331540	330410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_330400_331500
859086	contig_16798_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_172265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGACCTGTTCTCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207030	207316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_+_207000_207300
859087	contig_13947_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_173103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGAAGTCTCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29081	30017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_+_29100_30000
859088	contig_12624_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_61081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGATCTCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874080	874774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_874100_874800
859089	contig_2890_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_60298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATAAACTCCAGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391975	392841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_392000_392800
859091	contig_7165_pilon	-	563	4	Intergenic	novelGene_116920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.615612782035	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	69	416	1241993	1235087	FALSE	35	TAATTTTATTATTTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDVMIRKEAYVHKSVMEELKRIIDDSEITKEDDALWPPPDRVGRQGSRRLTSILLSCPGPEVFGLQSYWITLQD	1242061	1234939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1235177_1238422_1238534_1240210_1240270_1241905
859092	contig_4964_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_157250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46261	46604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_46300_46600
859093	contig_401_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_42931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGCTACAGGAGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961841	1962265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1961800_1962300
859094	contig_12485_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_147279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTAGGCAGATAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84412	83395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_83400_84400
859095	contig_13760_pilon	+	901	7	Intergenic	novelGene_61271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	14.3759057685652	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	122	703	25333	84107	FALSE	25	TATGTATGTTCAGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVEDINKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDAPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRG	25211	84305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_25370_69312_69363_75791_75874_78978_79056_80725_80805_82071_82176_83954
859099	contig_15084_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_116704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATAATTGTTGTATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239502	239877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_239500_239900
859101	contig_6241_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_156394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGGCCAGGGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8020	7528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_7500_8000
859102	contig_11117_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_148605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAGTACAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139393	139757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_139400_139800
859103	contig_9416_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_177905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGGCAATGATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46877	47510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9416_pilon_+_46900_47500
859104	contig_3081_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_133956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAGTCTTACACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624192	624856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_624200_624900
859105	contig_1008_pilon	+	720	2	Intergenic	novelGene_121613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTTTCTATGGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774154	775487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_774755_775367
859106	contig_4151_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_65285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATATTTTGCATCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683054	683964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_683100_684000
859107	contig_9843_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_114313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGGAAAAAAAAGCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28497	28946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_28500_28900
859108	contig_10968_pilon	+	973	4	Intergenic	novelGene_84273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	127.188399191471	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	107	973	114414	126908	FALSE	25	TCATGCACATCTACTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEARRAPESDGVSDAGSEVGPGSRAPTAGAVEEEMAGPNQLCIRRWTTKHVAVWLKDEGFFEYVDILCNKHRLDGITLLTLTEYDLRSPPLEIKVLGDIKRLMLSVRKLQKVHIDVLEEMDYNSDSPMGSMTPFISALQGSEWLCNGDPSHDCDGPITDLNSDQFQYMNGKNKHSVRRLDPEYWKTILSCIYVFIVFGFTSFIMVIVHERVPDMQTYPPLPDIFLDSVPRIPWAFAMTEVCGMILCYIWLLVLLLHKHRDRSEMMMKSHEPAIDSLDLSFFRNKQEMSFSVVETPPRTVFDQMYGWKKLFCLEGAIKKDIILI	75969	126908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_76061_114398_114992_126412_126509_126715
859109	contig_11094_pilon	+	648	4	Intergenic	novelGene_177020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCATCCCCTCCTATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343237	344822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_+_343281_343375_343483_343815_343925_344433
859110	contig_3111_pilon	-	230	2	Intergenic	novelGene_129948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTACATCATGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10954	10174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_10321_10870
859113	contig_211_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_129884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTGACTACAACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321087	322593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_321100_322600
859115	contig_3942_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_128795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCAGCTCAAGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864825	865479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_864800_865500
859116	contig_1337_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_84240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAGTGACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421754	422162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_421800_422200
859117	contig_12079_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_67349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64443	63225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_63200_64400
859118	contig_6433_pilon	+	898	3	Intergenic	novelGene_162751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	39302	39601	TRUE	45	CTCAGTAAACACAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QESRFLCGPVWTAELFTLHAPAVIIRGEAAVPLKDVLNELWVRTPPRESAFVLWLSLPLSQTAAVRVVAPSRGWTRSPSWKQEEVGHRRGGGYNKELQS	39299	97277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_39603_39748_39903_96836
859119	contig_16882_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_148248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCATGGTACTTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501595	500645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_500600_501600
859123	contig_6434_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_61836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACCATCATGTGTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709255	708187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_708200_709300
859124	contig_5479_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_133622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCTCTCACTGCCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441247	440332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_440300_441200
859125	contig_9471_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_21738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTCTACCTAATGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217765	219323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_217800_219300
859126	contig_14563_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_135012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGTTATTTTGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16326	16732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_16300_16700
859127	contig_2799_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_85534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGGACTAATCTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686375	685428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_685400_686400
859128	contig_9668_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_58207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAAGTCTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526308	526634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_526300_526600
859131	SIRV5	+	147	2	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	3	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_1150_10951
859133	contig_7452_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_109164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAATCTGAGTGGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201156	200672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_200700_201200
859134	contig_3641_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_177906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCAGTTCATTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295589	294996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3641_pilon_-_295000_295600
859137	contig_12046_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_83467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAATTGTTGCTGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258668	259419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_258700_259400
859138	contig_17198_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_62427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAGTATGTAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186849	1186462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1186500_1186800
859139	contig_3866_pilon	+	364	4	Intergenic	novelGene_112379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	14.3061758225833	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTGGCTGTTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101652	105329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_101767_103302_103328_104947_105038_105194
859140	contig_11594_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_80947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582544	583208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_582500_583200
859141	contig_16231_pilon	+	635	4	Intergenic	novelGene_176711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTTGCCAGAGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62934	84022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_63038_73641_73834_82929_83169_83921
859142	contig_10734_pilon	-	804	2	Intergenic	novelGene_51244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGATTGATCATGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227302	1222144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1222876_1227229
859143	contig_13226_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_175338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAATCACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136756	136383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_-_136400_136800
859144	contig_17603_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_152787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2006	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	141	380	61616	60596	FALSE	10	GTGCGTGTGTGTGTAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKEEHEVDVLAAPRGPAAPVRSTVINIRTETSVPDHIVWSLFNTLCMNWFCLGFVAFAYSVKSRDRKMVGDVIGAQSYASTAKCLNICALLLSLLLTVGAIILLATGALISMEAISRMVNHLDGN	61756	60403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_60788_61568
859146	contig_8375_pilon	-	587	2	Intergenic	novelGene_141284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGATAAATTTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107764	106364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_106700_107512
859147	contig_5222_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_58980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	144	533	81963	81574	NA	30	GTGAGAAAACGTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKKGPAICFQMVTTMKTPWSTILLCNTWGHYESELTATGLTWLEDPMSAFERFSNFCLQLTGQNCLHGPALHKGSKMCKPTMCSEWDKNWKYLSDSTNDHCNLQGHTAAVHSFHNQFSVSTMYQALF	82106	81095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_81100_82100
859150	contig_11709_pilon	-	853	4	Intergenic	novelGene_168218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGGGGGCGGGCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62971	53199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_53782_58106_58258_61210_61309_62949
859151	contig_567_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_33946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGTCAATGAGGATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40130	41205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_40100_41200
859152	scaffold_6394_pilon	-	852	5	Intergenic	novelGene_110958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	29.6763794961582	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	14	583	164400	162712	TRUE	10	TTGACCTGGAGTCGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDVHQYREQIKRVKDSDDVPMVLVGNKCDLPARTVESRQAQELARSYGLPYIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQHKLRKLNPPDESGAGCMSCKCVLS	164413	162353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_162608_162696_162832_163499_163660_163740_163920_164289
859153	contig_4797_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_6925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGGTGAATAGCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602072	600641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_600600_602100
859154	contig_10196_pilon	-	947	2	Intergenic	novelGene_132128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAATAAAGGAATGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037416	1020969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1021830_1037329
859155	contig_8616_pilon	+	740	2	Intergenic	novelGene_72425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	388	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	4	591	252110	253055	FALSE	20	TGGTACCTGTGAATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMAAWRPGCLRLRLALRPLLARRALHDAAPPRDVLLFEHERGRFFAVLGLFCAGQGVFWASLAVAALARPPAAEVPERGRFDLRSTLWRYSLAVGCGAIGTLVLGAGLLFSLRSVRSVMLRAGGQQVTLTTHAPFGLGTHITVPLNQVSCMAHRGEVPAMLPLKVKGRRFYFLLDKSGHFPNTQLFDNTVGAYRSL	252106	253204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_252405_252762
859156	contig_4496_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_66657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGGGGAGGAGAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858658	858046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_858000_858700
859157	contig_16589_pilon	+	284	2	Intergenic	novelGene_177908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27672	31284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16589_pilon_+_27727_31054
859158	contig_7359_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_139849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGTAGAACTAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32357	32891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_32400_32900
859159	contig_12638_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_33049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	197	547	8893	9438	FALSE	10	TTCCTGTAGTCTGATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEESLVATGASGSPAAPPEKRDGAGPSSDLERSSAGSFSIPEASPPAPKSSSPNAVPEAFRQLRELSRQWLRPDIRTKEQIVEMLVQEQLHAILPEAARARRRGRRTDVRITG	8696	9550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9073_9267
859161	contig_5899_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_146990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTGTTAGGGAGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512385	511731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_511700_512400
859162	contig_9202_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_168940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAAACGATGCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261212	260297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_260300_261200
859165	contig_12102_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_151056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAAGAATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42422	42221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_42200_42400
859166	contig_8865_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_164469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCCAGTAATGCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449609	450685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_449600_450700
859168	contig_5484_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_151098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTCTATTTTTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260080	259134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_259100_260100
859169	contig_5033_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_29094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	40	498	708385	707927	NA	5	TCCCCATTCTCTCTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPKIHILFCKADPDWQRCQHSLKDGPCISRRRQMSCGHGHSKNIGTRTARGLGAMQAVPEAKQNYMLCMHTCGHICTYCGHVWPRRGGSCTTVAMTQGQVLARRQSSRTQEGTREPGKPGLEYHRWRHQRVSSFSPGLEEAGYEGHFVSQI	708424	707430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_707400_708400
859170	contig_17753_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_105102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTGAAAAAAATTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128515	128913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_128500_128900
859172	contig_9784_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_165695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGTAAGGAGTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19839	19267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_-_19300_19800
859173	contig_11677_pilon	-	1040	3	Intergenic	novelGene_85884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	177	419	276360	274668	TRUE	35	ACTGTATCTCTAAGTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEPDNEKLREEQVPSSTEPPLVAEEARLTGAETAEARSKSEAHRFSSPRPVRLPTSEKMELRSSSSSDFLPWLGSSLGPVRAFLGGLSGEAARSLRVVKSESSSPAPPMESFKLKATCLPGTLQAAIIRSCLGRSLVF	276536	273067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_273602_274580_274746_276195
859174	contig_4426_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_15364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCCTGCCATTAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103210	103503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_103200_103500
859178	contig_6674_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_148023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTAGAGAGCCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308416	308924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_308400_308900
859179	contig_12078_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_74140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGGAGTTGATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866574	867326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_866600_867300
859180	contig_934_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_129028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGATGAAGAAAACAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171367	170250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_170200_171400
859181	contig_5145_pilon	+	1128	8	Intergenic	novelGene_131393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	25	junction_2	47.4995166463055	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	51	677	638955	645780	TRUE	15	GCCCCAGCCATCCCGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMPLPPDDQELRNVIDKLAQFVARNGPEFEKMTMEKQKDNPKFSFLFGGEFYSYYKCKLALEQQQLICKQQAPEMEPAAALPPLPQPPLAPAAPIPPAQGAPSVDELIQQSQWNLQQQEQHLLALRQEQVTAAVAHAVEQQMQKLLEETQLDMNEFDNLLQPIIDTCTKDAISAGKNWMFSNAKSPPHCELMAGHLRNRITADGGAL	638904	648997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_638980_639269_639444_644499_644685_645274_645413_645675_645829_647417_647530_647617_647708_648796
859182	contig_15182_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_136446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGTGTTAAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411248	410623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_410600_411200
859185	contig_14341_pilon	-	671	3	Intergenic	novelGene_111895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	309	junction_1	9.5	129	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCCTCCGTATCTTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732510	731446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_731968_732060_732125_732424
859186	contig_6595_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_122546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAGAAATATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616406	615276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_615300_616400
859187	contig_10399_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_114494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAGCCAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353438	352094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_352100_353400
859189	contig_10855_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_124286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACTTAAAAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172451	171300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_171300_172500
859192	contig_10855_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_124297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282474	281615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_281600_282500
859193	contig_10078_pilon	+	620	5	Intergenic	novelGene_159995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	2.82842712474619	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	105	389	72663	85428	FALSE	20	GAGCCATGTAAGTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQVPDALSKVSRSQSNSVLLRNRQLCSTCRERKMVQPRTMLIPDDLKLSFENFMSHRMMGLHPPRAKTVPKLPHDDILTENIDYRLPILGPRTAVFQDLLSDAYRTLQERQLSSLPRKGPISKTMRR	63463	85659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_63496_72590_72666_79192_79261_82194_82263_85282
859194	contig_1244_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_38071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAACACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256882	1255983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1256000_1256900
859195	contig_4364_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_62	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	14	514	682723	683223	NA	25	CTGGTGGAGCCAGTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHTCMLGEILPLAVTRVPQDVGNLRATREGTFSAEVGRGPGIFCILQTSAPSPVRGTHTEFFSLNFEGVNKAGPVTCLAQLADSASALCVRGWGTGCAPRGSHNGWFRWGILGTNGVQKGSTSGCRCVYTPSWKIQGLEDAASTLWKPIKPPAFPQAGEGSAPPSCLSPV	682709	684213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_682700_684200
859196	contig_11396_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_71320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACCCTTCGCAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457430	458223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_457400_458200
859197	contig_6069_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_8023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	90	350	123767	123507	NA	45	AAGACCTTTATGTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTSKRGPRTFYKGRGAKGTGVHAPGRKFVMIKEMVPEFVVPDLTGFKLKPYVNYRVPAGTETPLTAKQLFLQAVAPAIEKDFKEGTFDPENLEKYGFEPTQEGKLFQLYPKNFPR	123856	123407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_123400_123900
859198	contig_1076_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_101123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	228	299	685504	685433	NA	40	AAAAATTTTTTTTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTHLSLCWRRLVVRATAILSHAFQTSPWPGISQPSWRQHSSNTAFHFSSADTARFPSFLLIKSCQPFINHFFCAKMDLKSRNFLMHNWECFCDKNCLG	685731	684784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_684800_685700
859199	contig_6175_pilon	-	791	5	Intergenic	novelGene_16286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.017180121086	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	22	624	1389754	1382098	FALSE	55	GAAGCATATAAACAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGPAAAMASATVESFVTKQLDLLELERDAEVEERRSWQESISLKELQSRGVCLLKLQVSSQRTGLYGRLLATFEPRRCGSAAVLPSNSFTSGDIVGLYDAANEGSQLATGILTRVTQKSVTVAFDDSDDFQLSLEREKSYRLLKLANDVTYKRLKKALLALKKYHSGPATSLIEVLFGGSDPSPADVTHSLFLTVESLSGADVLGC	1389775	1381930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1382154_1382534_1382633_1383097_1383291_1387258_1387429_1389668
859200	contig_14142_pilon	+	463	3	Intergenic	novelGene_120546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.5	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	131	340	410362	415525	FALSE	35	AAAAATCCATTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLGATPRVALCPGVLWFPLWGLGWNIPSALVRIEASPDSHSHMGWRTQDQKVRQQGSRSQAVKMNPKSGRQDDRAERKGKQAEREDLIPPRKQHQEPSTSFGPWIPARRSS	403373	415648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_403443_410300_410457_415410
859201	contig_6795_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_27721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTAGCCACTACTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267260	266332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_266300_267300
859202	contig_7009_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_23586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290336	289596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_289600_290300
859205	contig_7057_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_123422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	8	322	1539734	1539420	NA	40	ACCTTGGCTACATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNMLIWTTFKTTGCVKFELGDGGLSRPMDPSLLCRNKPPGGYHTEARLALLCNPGLRQCGTRAKTDKKGNGTNRIQRQIHKHRNTSFMAKMALQRVGKKSFR	1539741	1539015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1539000_1539700
859206	contig_16776_pilon	-	843	5	Intergenic	novelGene_130536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.3994466785404	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	83	319	99795	96958	TRUE	25	AGAAACTCAGTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFQLKEPSCPENLSTWGKNPQDGLIGEMKWLSCKLQDCRTSNASLDSPTGLGLLCSENTTILKSERKYNGLSRHSSYCRFWLCWGCGLHLTPGGSLVCDPEEMEA	99877	95675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_96145_96385_96439_96955_97058_97348_97398_99707
859207	contig_7707_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_72145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTATTAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140711	139609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_139600_140700
859208	contig_9957_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_173841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374706	376034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_+_374700_376000
859209	contig_6208_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_53018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGCAGTTGCCGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482128	482719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_482100_482700
859210	contig_6208_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_53019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAAGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482728	483013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_482700_483000
859211	contig_2062_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_139016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAGAACAAAATTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76662	76983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_76700_77000
859212	contig_18081_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_23816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGATCAGGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166906	167440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_166900_167400
859213	contig_5317_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_76607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730264	729896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_729900_730300
859215	contig_15825_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_160210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTTCATTTTTGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192833	193480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_192800_193500
859216	contig_4689_pilon	-	1377	1	Intergenic	novelGene_165409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGGAAGGAAAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089446	1088069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1088100_1089400
859217	contig_4114_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_15618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAAAAAACCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381385	382179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_381400_382200
859219	contig_9706_pilon	+	206	1	Intergenic	novelGene_20783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704	910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_700_900
859223	contig_7866_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_171196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACACAACCTGTGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338157	339231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_338200_339200
859224	contig_1450_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_27387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	209	322	285477	285364	NA	60	AATCTTTTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPAHQHGQPNSRDRAARRPAAGSRWLKARNVSVGTSTVPEGWEEVQLQADLAGPSNSTRKPGRLWAGQDMGLLSVGRCMHNPSRRSKRSMPGIYVSEKGTVQQADE	285685	285280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_285300_285700
859225	contig_12951_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_68144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGCAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153312	153953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_153300_154000
859226	contig_16882_pilon	-	898	5	Intergenic	novelGene_148230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	13.3229125944742	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	20	532	368911	318693	FALSE	65	GAATAAAAAATAAAGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVPFSMRILHAELQQYLGSPQESLDRLHRMKTICSKILTNLEQGLAEDGSMSNITQENRKASIQLWRSRLGRVMYSMANCLLMMKDYVLAVDAYHSVIKYYPEQEPQLLSGIGRIFLQIGDIKTAEKYFQDVEKVTQKLDGLQGKIMVLMNRYLLLHYMYIFFPQISQDSLNCTY	368930	318326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_318867_338463_338563_345751_345826_349446_349520_368818
859227	contig_5302_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_81385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACATTGGTCTAAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123902	124301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_123900_124300
859230	contig_2956_pilon	-	1041	4	Intergenic	novelGene_177909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	16	741	1442863	1438955	FALSE	25	TTTTCTAGAGTATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLSKMMDQIESVCQNSSTESFEEVREALERSGPLLHQCPEATTTELSLCRITGMREMLRKFSTDITLDPVTANAYLVLSDDLKSVKHGGIRQQLPDNPERFDQSATVLGAQTFTCGRHYWEVEVGNKTEWEVGICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVQKVGVFLDYESGHIAFYNATDESLIYSFPPASFQGALRPIFSPCLPNEGTNTAPLTVCTLNRHA	1442878	1438654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2956_pilon_-_1439506_1441016_1441115_1441293_1441317_1442809
859232	contig_11338_pilon	-	546	3	Intergenic	novelGene_6269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	305	junction_2	208.5	3323	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	140	490	155131	150855	FALSE	10	CCTGCCTCTGACTGTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTFPPDYGIPGRKEREMVATQQQMNDAQLVLQQRDYCAHYLIRLLKCKRDSFPNFLACKHEQHDWDYCEHLDYVSRMKEFERERRLLQRKHRREKKAADAARGHGSGEVAPEVAL	155270	150798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_150988_151394_151564_155082
859233	contig_14846_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_85385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATGAAGTAAAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233063	232495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_-_232500_233100
859234	contig_15434_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_56713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66537	66005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_66000_66500
859237	contig_12969_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_61672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTTAGTACCAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345189	344065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_344100_345200
859238	contig_10734_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_51529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAGCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2286659	2287451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2286700_2287500
859239	contig_7730_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_156302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAGGAGGAGGGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448041	448618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_448000_448600
859240	contig_3241_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_146397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCAGCTCTTTCTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803975	805357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_804000_805400
859241	contig_5429_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_127793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166290	166796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_166300_166800
859244	contig_2310_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_71629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGATTCAAGTTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359343	358560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_358600_359300
859245	contig_13051_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_140138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAGAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437373	437622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_437400_437600
859246	contig_9571_pilon	-	272	2	Intergenic	novelGene_136257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTCAGACTTCTGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321802	314882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_315043_321690
859247	contig_12644_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_44592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTATAGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2413749	2413069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2413100_2413700
859248	contig_7391_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_112159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTGAACCCAAAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427010	429448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_427172_429076
859249	contig_10437_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_38471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGATTTAACTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159573	1160177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1159600_1160200
859250	contig_14322_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_115724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTGAAGTTTAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671540	671349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671300_671500
859251	contig_3523_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_171489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACATTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323446	324008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_323400_324000
859252	contig_16504_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_167946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAAAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131676	132576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_+_131700_132600
859253	contig_10734_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_50966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAACCAAAACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195257	194788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_194800_195300
859254	contig_1154_pilon	+	869	8	Intergenic	novelGene_87146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	360	731	866457	870504	TRUE	35	CTGCCAAGACAAAAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSSQLRGKSRVSSEPSISKGTACNTTSGPMLVTAAPSAWSSAAVWGKWGDRRRSHRDWRHFFITGWACRPHTSKKTHSSCNTELHAAWNLYVRPSSTALNILVTYWAGPGAAEVMEPMLAM	858936	870850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_858991_859464_859625_859715_859781_866376_866499_866713_866857_868105_868220_870431_870528_870735
859258	contig_2332_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_58721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGCATCACAGCAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844549	843636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_843600_844500
859262	contig_13744_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_77216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134813	1134470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1134500_1134800
859263	contig_6630_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_30726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	225	314	761092	761003	NA	25	ACCTGAGCCCACACTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFNLKVNKRFALVPWESKHKYTSGAWAGSNTECDYKPDPAGSGVSHSPVPAGAPGPKGQTNRKQTPIWGLLQPCMYPDGREAPKVGVVKSATKVSQKGHRQGF	761316	760380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_760400_761300
859269	contig_11721_pilon	+	1096	4	Intergenic	novelGene_177085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2	628	60905	114927	TRUE	80	AAAATTTAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPCIQKPAHKNAILQGPVPRFRTSQVCSCICPAPSASQPPPGGELSSPSPRTRRGWRSDSPSAAGHRGSAWPPCYSFCALPSTCHPVQIIGDEDFASFLNHGLWFQFFLRELAFARIKHFLARDAGEGKVCWVWLITHRDLDGVRINGTRCIAVCWQQLTWSDGALHAVWGWEARVNGCRGPTAEVHDGRGSRGSRLQPRRVRAVVVL	60903	117406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11721_pilon_+_61164_67097_67316_114777_115116_117126
859271	contig_15244_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_118068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTAGTAATATGGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708845	708377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_708400_708800
859272	contig_17386_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_157949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482052	481103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_481100_482100
859273	contig_12993_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_136730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCAGGTTCTTAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88442	88801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_88400_88800
859274	contig_5083_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_151637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCTTTTTAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195814	196148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_195800_196100
859275	contig_10855_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_124346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGAATTCCACTTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555110	554139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_554100_555100
859276	contig_12540_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_148105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACTGCTATTATTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052273	1053045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1052300_1053000
859278	contig_9682_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_125318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCCAAAGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572652	572371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_572400_572700
859279	contig_6872_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_175742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429116	428688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_-_428700_429100
859280	contig_12250_pilon	+	320	4	Intergenic	novelGene_80670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTCGGGCCAGTGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381506	383410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_381621_381916_382010_383027_383065_383334
859282	contig_9415_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_109857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTTGAAAAAAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1993228	1994057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1993200_1994100
859283	contig_5590_pilon	+	551	3	Intergenic	novelGene_163066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	3.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGAATGAGGAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783118	784962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_783448_784161_784241_784819
859284	contig_16098_pilon	+	621	6	Intergenic	novelGene_46057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	12.9707362936728	45	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	3	566	430576	434669	FALSE	10	TTAGTCATGTGTTTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLEDLFQRFPRTPMSVEVKEQNEELIHKIAGLVRRFDRNEITVWTSEKSSVMQKCKAANPEMPFSFTLSRGFWMLLLYYLGLLPFVPIPEKFLFSFLPTIINRTYFPFSCPGLNQLAAVVSKWVIMRKSLIRHLEERGIQVIFWCLNEESDFDMAFSLGATGVITDYPTALRRYLDNHGTAARAS	430573	434724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_430666_430748_430839_431196_431331_432631_432692_432798_432851_434531
859287	contig_9233_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_78266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	83	298	801284	802681	FALSE	15	TTTCCTCTCTCAAGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAFSARRDGAPPPLTGAGKRARDNPAMTSGAADPRGRSDLHAGSEPASSRGEARRSEQNRRQRLLLKTRPRLSVPSELGLTGLARASGVLFRRPKIS	801201	802752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_801310_802491
859290	contig_4151_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_65297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTGTTCCAAATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782438	782085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_782100_782400
859291	contig_8676_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_142213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAAGACAGCAGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455689	454794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_454800_455700
859292	contig_13224_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_104104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTAAAAAAAGAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264916	265836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_264900_265800
859296	contig_15449_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_33652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173396	173650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_173400_173600
859297	contig_8615_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_165227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCTGTCGAGTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375326	374782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_374800_375300
859298	contig_3817_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_78403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACATTAGGACGCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270127	1270630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1270100_1270600
859299	contig_9580_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_167727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTACTACTGTTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431283	430887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_430900_431300
859301	contig_10926_pilon	-	664	3	Intergenic	novelGene_137507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	62	598	138034	134988	FALSE	15	CCCAAGTTCTGTTTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGAQVTYIGLQITSFLLLLMDLLSTGNPGCGLKLSAFAAISSVLSGLLGMVAHMMYSQVFQATANLGPEDWRPHAWNYGWAFYTAWLSFTCCMASAVTTFNTYTRMVLQFKSRHSKSFKDNLSRCPHHHQCFLQQLSSAAQSGGPLTGYHQYQNQPVHSISEGVDFYSELPNRGLQQGTSQGLKEEVTGSSVEEEQC	138095	134921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_135334_137230_137343_137955
859302	contig_7202_pilon	-	955	6	Intergenic	novelGene_19109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	389	817	144596	144168	FALSE	10	AGTGCCTTGGGGGACTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVEAAGSLEALLAIFLLDLRMVFSCLATREYLSASEAWGPGAIRLRRTDFGFAWEPVGIEKLSGKTGANTCSCHGESGELGMSCGTEEACAILSLDADRPAPTPWALGPWGVAIRGLTETDSSLPASDFLGVDSLSDVRIS	152670	144029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_144608_150210_150258_150744_150801_150921_151041_152087_152139_152566
859303	contig_709_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_57624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCGGCTGACTTGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2510321	2510055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2510100_2510300
859304	contig_9345_pilon	+	468	3	Intergenic	novelGene_24484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCGGTCTCCATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652288	659794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_652451_655476_655549_659560
859305	contig_5018_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_46962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTCCACCCAACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334756	335936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_334800_335900
859306	contig_3789_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_79874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	97	393	520883	690877	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSSALSFLSGFSTGNGNCFNHKARQAASYLRNMNKDSPVLLTSWESFYYLTPRAVTASRPAPGLGVRGPAGSAETRRGRSKMELCWLPPPTPHSPPGARLGLRGNTRQSQPAGQTDRKGPARRTVVQIFKK	520786	690878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_520897_599255_599322_690660
859307	contig_3465_pilon	+	768	5	Intergenic	novelGene_173391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_4	408.157062293426	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	10	735	722012	751102	FALSE	15	GAGGGCATTGGTGGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETMDAELAVAPPGCSHLSSFKVDNWKQNLRAIYQCFVWSGTAEALKRKAKSCVCHVCGAHLNRLHSCLYCVFFGCFTKKHIHEHAKSKRHNLAIDLTYGGIYCFLCQDYIYDKDMEIIAKEEQRKAWKMQGVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLINLGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFLSDRHKCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEVQLLASSRRLLCNYLCFIFFPF	722002	751135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_722150_740095_740229_748491_748606_750082_750185_750863
859309	contig_2932_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_47956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGCATGCTGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315239	315650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_+_315200_315600
859311	contig_8452_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_48013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315466	314837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_314800_315500
859312	contig_8702_pilon	-	927	1	Intergenic	novelGene_157732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63617	62690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_-_62700_63600
859313	contig_3132_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_127440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	283347	282991	NA	5	TACTGCCTTCTCTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSSEHGSALPDNKDKTPGRHRRFTGDSGIEVCVCNRGHDDDLKEFNTLIDDALDGPLDFCDSCHVRPTGDEEEGLYRPSEEQAREPSHPHLPQPPACLLLNTINEQDSPNSQSSSTPS	283347	282323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_282300_283300
859316	contig_9415_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_109762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTCTGCTCAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515244	1514163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1514200_1515200
859318	contig_6630_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_30716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCATGTAAAGCTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412858	412257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_412622_412719
859321	contig_2455_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_119224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTCTTTGTTAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401098	1401313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1401100_1401300
859324	contig_11264_pilon	-	321	3	Intergenic	novelGene_154210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	56	junction_1	161	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	216	106	321	634422	623800	FALSE	15	GGCCTGGAGGGTCGAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAQKIVTTRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQMSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDIPPAANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKK	634527	623799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_623836_632346_632503_634398
859326	contig_2733_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_128579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCACAGGCAACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743319	742710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_742700_743300
859327	contig_9414_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_131080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAAAAAAAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386827	387433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_386800_387400
859330	contig_6654_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_85718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTACTGGGTTTGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272236	271367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_271400_272200
859331	contig_4847_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_156167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCCTAAAAAAAAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99619	100225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_99600_100200
859333	contig_14536_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_69324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291572	292274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_291600_292300
859334	contig_1596_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_131614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATATTTGGCTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174189	175182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_174200_175200
859335	contig_9708_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_67285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAAAAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816038	815695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_815700_816000
859337	contig_16098_pilon	+	963	3	Intergenic	novelGene_46182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	29.5	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	151	624	623746	626853	FALSE	30	TTCATGACCCATTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKGQCRRVAAACERGDRPLWLRGRHYGVFGSGPQGAERASDRRLPPLPGMSAEASGPAAAADPSLEVPKPSGIESGSAAYGLSPLSPNSKYVKLNVGGSLHYTTLRTLTGQDTMLKAMFSGRVEVLTDAGGWVLIDRSGRHFGTILNYLRDGSVPLPESTRELGELLGEARYYLVQGLIEDCQLALQVVQPSPRSISKSFIALNSI	623595	627192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_623990_625278_625449_626793
859338	contig_5718_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_110332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCCGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559177	558597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_558600_559200
859339	contig_9366_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_166226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAATTTTTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674365	673302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_673300_674400
859340	contig_11356_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_175273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474005	475238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_+_474000_475200
859343	contig_20241_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_159750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAATAAATGTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254366	254979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_254663_254700
859345	contig_1154_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_87179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952245	952571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_952200_952600
859347	contig_500_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_30943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGCCCCCTAGGGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227627	1226970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1227000_1227600
859348	contig_6340_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_176632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	3.39934634239519	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	16570	67127	FALSE	20	CTTAAATGCTGAGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNFAVLVDLHVSPQGSNRDTSWFSEEKKEEVCLLLKEAIDSRVKEYLEVRKQHRPSNAEFTRSSPLSLKGYGFQITAYFLKRGIHLRCIRSSPRAELCVFPDRFVVCVSQLTF	16569	67193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_+_16660_21919_22041_64401_64480_67071
859349	contig_12661_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_166715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTAGGCCAGGGTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49605	48797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_-_48800_49600
859350	contig_5423_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_85213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCTTCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337916	338750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_337900_338800
859351	contig_6441_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_172894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCCCTTAAAAGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336632	335642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_335600_336600
859352	contig_3787_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_102416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGGTATGGCTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560589	559677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_559700_560600
859353	contig_3948_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_53243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTTTTGGGGGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130857	1131222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1130900_1131200
859354	contig_15498_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_42719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGACTAACCTAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015353	1016030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1015400_1016000
859355	contig_8357_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_39691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGATACACCAGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241817	242250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_241800_242200
859357	contig_3866_pilon	-	1149	1	Intergenic	novelGene_112370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATAGAAAAAGACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16958	15809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_15800_17000
859358	contig_12761_pilon	+	596	4	Intergenic	novelGene_164059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	311.807989349571	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	297	596	280241	285662	FALSE	35	ATGGACCTGTACAGCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTSCSHGVRGPWCPEPELQDHDVPPDHGGVQGLQQIRGLHRVPGRPPRRPGQDHPPPKEWKPRQTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLERKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLQTILDMVERECGTVIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTED	268932	285662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_269092_280103_280282_281287_281403_285518
859359	contig_12761_pilon	+	452	4	Intergenic	novelGene_164063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	208.674121272593	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	50	451	325007	378732	FALSE	45	AGGAACACAGACACTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKDMVKISMDIFVRILQPERYEQWKQGKDLTVLDHTRPTALSSPALSSWSASRASLKAKLLRRQISL	324957	378733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_325061_332310_332449_369013_369211_378719
859363	contig_9915_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_174169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCAGCGCTAATGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604141	803250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_+_604638_802773
859364	contig_3463_pilon	-	499	4	Intergenic	novelGene_62011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	83.8424448328861	9	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGTGTTCTTGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597529	535302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_535471_542246_542314_551883_552007_597388
859367	contig_14556_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_138523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGCTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123928	122659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_122700_123900
859368	contig_16882_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_148249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTGTACTATTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525459	526246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_525500_526200
859372	contig_15867_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_170883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGTATTAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58412	57315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_57300_58400
859374	contig_10801_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_74024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAATAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184081	184528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_184100_184500
859375	contig_4055_pilon	+	794	2	Intergenic	novelGene_158171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	393	737	676295	676639	FALSE	20	TTTATTTTCTCACAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHHVTNNALGPLAPLLTLGSLGLRAASSLSSCVTLAQHLHLSEPRCYLYRGGGGSRAQQEGLTEMVCQSACTSLAQQALRKRLLPLTVSNFPIILTVLGPAPYGIPSLCLSLS	675381	676696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_675511_676031
859377	contig_12050_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_62774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAAATGGTTAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917458	917124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_917100_917500
859381	contig_13004_pilon	-	698	3	Intergenic	novelGene_112632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	159	junction_2	220	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	304	696	287899	250848	FALSE	40	TCACAGAGATCATCGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELEPEVQAIDRSLLECSAEETAGKWLQATDLTREVYQHLAHYVPKIYCRGPNPFPQKEDMLAQHVLLGPMEWYLCGEDPAFGFSKLEQVNKPSHLCGRVFKVGEPTYSCRDCAVDPTCVLCMECFLGS	288202	250845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_250903_279490_279751_287821
859382	contig_3469_pilon	-	882	7	Intergenic	novelGene_34146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	28.9621400375655	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	81	671	301073	264922	TRUE	15	TGTAAGCTTTTTTCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPFWNNIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFIAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDVSQVVVHYV	301153	263140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_263321_264890_264940_271140_271404_275070_275146_277132_277242_277670_277740_301016
859384	contig_4732_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_75499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTATTCCTCTATTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004754	1005946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1004800_1005900
859385	contig_9051_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_170814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGCATTGGGAGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046467	1045527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1045500_1046500
859386	contig_14516_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_153944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACTCACAGCAACCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363159	362013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_362000_363200
859387	contig_12677_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_110767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCCAGCATCATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358	1153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_1200_1400
859388	contig_11678_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_160840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222804	222560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_222600_222800
859393	contig_11285_pilon	+	1218	5	Intergenic	novelGene_5527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.0178344238091	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	506	934	738959	740397	FALSE	5	GGGCAGCCTGGTCTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEPLSAEASLSSDSQRLGDCKRDEEPWGPIGKDPTPSMLGLCGSLASIPSCKSLASFKSNECLVSDSPEGKPGTEPQLRSSIGSASPTCLGPWMPATFPQSSPIQTTLPENAAHPTRDLWGKMGPLPLAHFCFQPEEAKL	737418	740681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_737596_737687_737867_738698_738838_738948_739056_740065
859394	contig_15423_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_171586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGATGTAGAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236032	236340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15423_pilon_+_236000_236300
859395	contig_18734_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_172362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTGCTTCCCCCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33829	34319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18734_pilon_+_33800_34300
859396	contig_1146_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_84832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAATAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891982	892935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_892000_892900
859400	contig_5253_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_61600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTAATTCTCACATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366353	365651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_365700_366400
859402	contig_5999_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_45632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAAAAAAAAAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170371	171253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_170400_171300
859404	contig_8210_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_30204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACATGTATGTAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2559	2858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_2600_2900
859405	contig_8284_pilon	+	660	2	Intergenic	novelGene_125663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAAAATAAAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194887	197395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_194967_196814
859406	contig_6302_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_171698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGAGAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138488	137580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_137600_138500
859408	contig_13718_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_142899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237020	237911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_237000_237900
859409	contig_5041_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_27029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTATCTAGTGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300036	299599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_299600_3e+05
859410	scaffold_13505_pilon	+	400	4	Intergenic	novelGene_111674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGTCGCCCCGGTTCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870357	904387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_870416_897129_897223_900568_900695_904264
859413	contig_2757_pilon	-	846	4	Intergenic	novelGene_164608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCAAGCACAAGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536123	533266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_533706_534398_534519_534651_534758_535942
859414	contig_5018_pilon	-	470	4	Intergenic	novelGene_46984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.327692160818	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	31	318	634721	632152	FALSE	10	TACCCCGCTGTGATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAVSCARAAMAQGQCKFQAKKPGKSKAAAAASERNRGPRKGGRVIAPKKARVVQQRKLKKDLEVGIRKKIEHDAAPAARAQIYARGTLGCTVGRRNPAPGLGGT	634751	631999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_632248_632373_632413_634465_634522_634624
859418	contig_7820_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_159917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATGTATAAATGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34653	35190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_+_34700_35200
859419	contig_19012_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_159485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCTTAGGTAAAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84299	83286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_83300_84300
859420	contig_7563_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_145551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAACAAACACAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57520	58275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_+_57500_58300
859421	contig_6544_pilon	-	888	5	Intergenic	novelGene_142070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.06155281280883	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	189	584	28427	26435	FALSE	40	ACAATACTATCTGGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRNLGLDPHLLPPSDVLGPAPYDPGLPPSPSVSLICKLQAWQGLTWARTPQPKAWASLVLFNRDQRVLSGRWRLPLRSFPLDSSLSLGQLNGIPQMSSSSLEGSSLAPSAGFADPPPPAEESLTGVKDRD	29580	26130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_26543_27610_27822_28350_28446_28547_28697_29559
859422	contig_8447_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_69456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGCTTAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247640	247304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_247300_247600
859423	contig_2703_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_101683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATTTGTTTTAGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253060	252177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_252200_253100
859424	contig_5502_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_154995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTAAGGAGGGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424282	423806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_423800_424300
859427	contig_17886_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_177910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCGAAATTGGATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4223	3718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17886_pilon_-_3700_4200
859428	contig_15498_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_42714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992774	993607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_992800_993600
859429	contig_15610_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_154278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATAAAGTATTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486372	485606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_485600_486400
859432	contig_5918_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_99522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605050	604095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_604100_605000
859433	contig_6069_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_8042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCGTTTTGGTGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341443	340800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_340800_341400
859434	contig_9575_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_169724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	13	42	334	375	620720	620761	NA	75	AAAAAGAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQFFNHYQSPPTQRAHGLTFLKGSAFAASPWLETSSGSSKVVTGLHLSRVCEASELKTRQVESAVKDLRGSWVCPFGTQRPPPPHTFRKEPGARSLDARCLHLVAVLCRTLMGQGFTQEIKTSR	620386	621894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_620400_621900
859435	contig_9177_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_32770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTCCCCATATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353188	1353620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1353200_1353600
859436	contig_11160_pilon	+	201	1	Intergenic	novelGene_168856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGTAAGAACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826872	827073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_826900_827100
859437	contig_12644_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_44431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32011	31104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_31100_32000
859438	contig_11702_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_142018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	79	330	545337	545588	NA	25	GGTAATATTGAGTCACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGALGPREPQRCGAAPRWPTQHTELRMLNLGLVLDYLVRSSLSSWLVSTEDSPVPPVQAAPSDSRTWTVPWQGCDRAGWWGWWGFLGGSGPEARAFHSATGGNPAASLL	545258	545997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_545300_546000
859439	contig_4769_pilon	+	761	3	Intergenic	novelGene_118028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTGTGAAATGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224935	1237505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1225123_1229128_1229230_1237032
859440	contig_6839_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_161873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTAAATGACCAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226654	227512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_+_226700_227500
859441	contig_12300_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_176511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATCCCAGGATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210408	211233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_+_210400_211200
859442	contig_16103_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_118687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTTGCTCCTTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113134	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_111786_113019
859443	contig_16882_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_148245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTCCACAACAACAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461223	462074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_461200_462100
859444	contig_7815_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_134378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGGCAATGGGTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418634	419090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_418600_419100
859445	contig_5020_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_27934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGAGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150439	150825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_150400_150800
859447	contig_10176_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_72703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239455	238813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_238800_239500
859448	contig_8628_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_164441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	150	521	661413	661042	NA	65	GAAATATATGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLSYMNTLQAFDQDNVMEEISGKMIHTARTLNLEVDIANVEQLIDHKEGELTDQDFRDSEEERNAEEERNNEEEEKLSKNFTVKGLGGVFPKLISGFSYLKTQSQTQITLLKLKGRFGKQ	661562	661030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_661000_661600
859453	contig_11256_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_150893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAGAACTGTTTTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20479	21508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_20500_21500
859456	contig_19851_pilon	-	567	5	Intergenic	novelGene_29886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	8.09320702811932	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAGTTAAAAGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120210	98443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_98682_101685_101751_113783_113862_119543_119636_120116
859457	contig_11982_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_100259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATACCATCTACCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106355	106665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_106400_106700
859458	contig_9937_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_129209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGACTTACTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146966	145834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_145800_147000
859459	contig_6048_pilon	-	595	7	Intergenic	novelGene_73326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.4923155284635	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	17	589	2727399	2588107	FALSE	10	TTCTCTGACTGGGCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWPAGMFQFSAPSGQAPEENKQILARQKSSSQSDSHEEEISPMPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGEIVIQQGDEGDNFYVIDQGEVDVYVNGEWVTSISEGGSFGELALIYGTASVGVSVPCKPRPVPRAPRMLHVLLNVQ	2727415	2588100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2588195_2631403_2631481_2643958_2644006_2644361_2644424_2698946_2699039_2703382_2703554_2727363
859460	contig_987_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_72337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285097	1285751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1285100_1285800
859461	contig_8017_pilon	-	615	5	Intergenic	novelGene_65348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	24.5662369930765	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	123	614	891450	880914	FALSE	55	CCTTAAAAAAAGGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAGIMLLLRSVRAASKFTSSSDIPVEFIKRNVKLRGRLRRITENGLEIEHVPITLPIISSWKKEPRGALLVKLAGVELTLAGRVWLQRELKPSQLLWFQLLGRENSALFCYLLVKKGGYFNVSLNEEILRRGLGKTVLVKDLDYDSKIYWTIHRNLLKAELT	892830	880912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_881052_882725_882887_888962_889111_891405_891466_892723
859462	contig_12312_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_63986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432525	432087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_432100_432500
859464	contig_3155_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_26451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTGTTGCTGTTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359152	359734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_359200_359700
859465	contig_9515_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_73844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	108457	108792	NA	75	CTTAAAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYKVYLVLFAGSSPNPFSEDVKRPPAPLVTDKEARKKVLRQGQQEGSWGPGPLSRSSSWPDLTGLRPHSRVPRPRPQFPHVKCWEVFLAWGETGTVVSFPGKSLRRGKPWE	108454	109251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_108500_109300
859467	contig_13412_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_80005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGTAGGCACAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342174	341646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_341600_342200
859468	contig_9727_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_86300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTTAATGAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272172	271643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_271600_272200
859469	contig_6109_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_160380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTAATTATTTACAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577900	578476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_577900_578500
859472	contig_12654_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_129262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	356	685	84706	84377	NA	55	AAAAAAACACACTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFIYYKAFSMLYSVITITTELCCKLPGTGTAESPPTAEQLHTPSETPTPCDAVIHLERSLELAVRRYRLLQFLLLGSSTVADLEDKLLRTQSHLQRMDLLLPVCGRF	85061	84294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_84300_85100
859473	contig_6270_pilon	+	786	2	Intergenic	novelGene_99872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1051881	1056978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1052578_1056888
859474	contig_3465_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_173395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGACTAAACAGGTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769353	768642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_768600_769400
859475	contig_9429_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_155094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTAATTTGGTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43628	44592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_43600_44600
859477	contig_7234_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_145951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTACCATAGATTAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484243	483523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_483500_484200
859478	contig_9434_pilon	+	624	2	Intergenic	novelGene_150509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTGTTGAAGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375981	376907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_376054_376355
859479	contig_7356_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_60358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAAGAACTAACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112653	112072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_112100_112700
859480	contig_7057_pilon	+	745	2	Intergenic	novelGene_123207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	134	436	510206	510654	FALSE	20	CCGAGTCCAGACTCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATCVGHDGKAGRLSPQHPSPPPPARVRPYSCSVCGKRFSLKHQMETHYRVHTGEKPFSCSLCPQRSRDFSAMTKHLRTHGAAPYRCPLCLAGCPSLASMQAHMRGHSPSQLPPGWTIRSTFLYSSSRPSRASPSPCSPPSSTT	510072	510963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_510234_510379
859484	contig_2834_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_27970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCGGGGTAGGAGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210597	209691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_209700_210600
859485	contig_776_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_139918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	257	junction_1	0	99	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCTAATTATGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789224	814148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_789370_813729
859486	contig_3394_pilon	+	441	5	Intergenic	novelGene_152678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	315	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTAAGTTGATCGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431599	507422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_431686_445594_445679_503541_503597_504426_504573_507352
859487	contig_3382_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_124225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGAGGCGGCTGAGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924392	1924701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1924400_1924700
859488	contig_9915_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_174173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGGTCAGGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719229	718288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_718300_719200
859493	contig_2716_pilon	+	751	2	Intergenic	novelGene_173564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAACATAAGTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878906	885502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_879467_885311
859494	contig_12125_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_76254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTTAGTGTCCTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637013	637760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_637000_637800
859497	contig_10005_pilon	+	824	2	Intergenic	novelGene_148920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCATCTTCTGTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179968	182194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_180544_181945
859498	contig_3612_pilon	-	816	2	Intergenic	novelGene_87844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	647	junction_1	0	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	42	317	995319	988331	FALSE	25	ATTCTGTATGGGAGACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIRELGGIPIVGNMIDSPNHSIKEKALNALNNLSVNVENQDIIKIYISQVCEDVLSDPLNSAVQMAGLRLLTNMTVTSDHQHMFNSYMTDFFHVLLTGNGNTKV	995360	987831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_988514_995226
859500	contig_7919_pilon	+	838	4	Intergenic	novelGene_28042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	1.24721912892465	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTCCTTCTCTCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348532	454062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_348754_363258_363342_452910_453084_453701
859501	contig_8057_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_176643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTTGGAGAAAAAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98633	98104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_98100_98600
859503	contig_8671_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_126235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTAATTCCTATTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40713	39591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_39600_40700
859504	contig_5791_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_35821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	146	307	782378	782539	FALSE	30	TAAATTTCAAGAGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGYPQRVIKHFPRIGLRVDAAFQHKGFFYFFRGPKQFEYDPKAKNITRMMKTNTWFQCKEPLNSSSDFGVKEKVRSGGVEVSYQKSLSLLIFTIVQLLKKT	780853	782565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_780931_782309
859505	contig_563_pilon	+	664	3	Intergenic	novelGene_169757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	1	70	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	7	588	399887	403862	FALSE	50	CAATAAACATGCAGCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAMSRRCMMLTCALLALLALGAVQVEGTSSCTIVPRSEWKAKASECNQRLNLPVRYVIVSHTAGSTCNSPALCEQQARNVQYYHMHSLGWCDVGYNFLIGEDGLVYEGRGWKTKGAHTGATWNPISIGISFMGNYMERVPPSRAIRAAQNLLTCGVELGALTRNYEVKGHRDVQQTLSPGDQLYALLRKWPHYRE	399880	403938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_400168_403057_403180_403683
859506	contig_10323_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_123623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478656	479620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_478700_479600
859507	contig_7376_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_108103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTTTGCTTCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333965	333046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_333000_334000
859508	contig_15570_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_137871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTTTGGTCTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896519	897165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_896500_897200
859509	contig_4388_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_161957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424272	423522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_423500_424300
859510	contig_12214_pilon	+	604	3	Intergenic	novelGene_177332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	14.5	321	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAGTATCTTGAGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244779	247849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12214_pilon_+_244849_246363_246469_247419
859511	contig_6058_pilon	+	730	2	Intergenic	novelGene_172384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCCTCTAAAATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377361	379126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_377608_378642
859516	contig_12050_pilon	-	311	2	Intergenic	novelGene_62767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCTAAAACACTATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816040	815471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_815677_815934
859517	contig_9185_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_166914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528902	529506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_528900_529500
859518	contig_10861_pilon	+	136	1	Intergenic	novelGene_39308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCATCAAAAAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454864	1455000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1454900_1455000
859520	contig_2161_pilon	+	1264	9	Intergenic	novelGene_114919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	19.9859325526731	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	218	574	806282	813466	TRUE	25	GGGGGGATCCAGGAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWTCSPLCLWLLLLLLSPALGRQESGSKWKVFIDQINRSLENYEPCSSQNCSCYHGVIEEDLTPFRGGISKNMMVEVVRRKLGTHYQIIKNRLYRENDCMFPSRCSGVEHFILELIGRLPDMEMVINVRDYPQVPKWMEPAIPVFSFSKTSEYYDIMYPAWTFWEGGPAVWPIYPTGLGRWDLFREDLAR	804164	825221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_804242_805105_805197_806232_806377_810900_811037_813340_813468_819172_819220_820660_820761_823275_823333_824736
859521	contig_5918_pilon	+	916	6	Intergenic	novelGene_99523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	38.804123492227	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	180	914	607831	613095	FALSE	40	CCAGGTAAGACAGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKRLYGKRRDPFYEAQENHNLIGVANVFLECLFCDVKLQYAVPIISQQGEVAGRLHVEVMRVTGAVPERVVEDESSENSSESGSLDVVDGSGEVIHRVKKMTCRVKIKEASGLPLSLSNFVFCQYTFWDQCESVVAAPVVDPEVPSPQSKDAQYTVTFSHCKDYVVNVTEEFLEFISDGALAIEVWGHRCAGNGSSIWEVNSLHAKTRTLHDRWNEVTRRIEMWISILELNELGEYAAVELHQAKDVNTGGIFQLRQGHSRRVQVTVKPVQHSGTLPLMVEAILSVSIGCITARSTKLQRGLDS	604241	613097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_604394_607803_607966_608674_608849_610778_610931_612639_612773_612954
859522	contig_7816_pilon	-	662	3	Intergenic	novelGene_66544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2.5	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAACCAGGTTCCGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282373	277718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_277922_281544_281765_282134
859523	contig_5999_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_45601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACCACCACCAACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57414	56882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_56900_57400
859524	contig_6497_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_35608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAGAAAAAATAAAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506199	506927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_506200_506900
859526	contig_4847_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_156157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAAGTCAGCCACAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82735	82231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_-_82200_82700
859527	contig_13894_pilon	-	635	3	Intergenic	novelGene_62180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.5	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGACAAACACACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701302	696240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_696753_701014_701107_701271
859528	contig_6479_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_160602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTGGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68964	69859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_69000_69900
859529	contig_12638_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_33050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	190	735	8893	9438	NA	10	CCTGTAGTCTGATGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEESLVATGASGSPAAPPEKRDGAGPSSDLERSSAGSFSIPEASPPAPKSSSPNAVPKAIPTPPVAASAAPELPLGPTPLGSAPLADAAPRSPPSPGYSRPGPETFRQRFRQFRYQDAAGPREAFRQLRELSRQWLRPDIRTKEQIVEMLVQEQLHAILPEAARARRRGRRTDVRITG	8703	9552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_8700_9600
859531	contig_6415_pilon	+	695	2	Intergenic	novelGene_175838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAACACGTCTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35513	37852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_35651_37294
859532	contig_14202_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_157129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCCACTTTGTGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65721	66258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_65700_66300
859533	contig_11719_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_154763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGGAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82252	81494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_81500_82300
859534	contig_15371_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_151429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTAGCCAGCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12762	13496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_12800_13500
859535	contig_11026_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_167647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTGAACGAGAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64012	63532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_63500_64000
859536	contig_8260_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_163237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTAATTTAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108892	108264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_108300_108900
859537	contig_1150_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_61471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465396	466287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_465400_466300
859540	contig_7165_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_116845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATCACCACCTGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282916	283147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_282900_283100
859541	contig_12120_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_21428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110024	110529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_110000_110500
859542	contig_2768_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_57516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAATATTGTTCATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815272	814276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_814300_815300
859544	contig_18393_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_167467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAGAAATGGCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106742	107617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_+_106700_107600
859546	contig_1210_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_171521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGAATGGGAGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290294	288388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_288400_290300
859547	contig_10482_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_152853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGCCATTGTGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218580	218120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_218100_218600
859549	contig_5961_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_144172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGGTTTGTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267843	266835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_266800_267800
859550	contig_14142_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_120584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	52	459	567918	567511	NA	50	CAAGAACACAAGGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYKALLALPVSAQRYSTMPASLLPKGTQVSRSVVQETHYAVSCVVSLPLLLSLSFSVCRFQELLRAGILGPKDTLFAPGCSCVVVIESSLSCLWDDSPQAQWDGKTDQSPWWDTTTLFARSRPITGLELQEYGEKDHTKAIHHITLMKDMNS	567969	567298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_567300_568000
859553	contig_11709_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_168214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAGGCAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43771	44935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_43800_44900
859554	contig_2125_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_147717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413956	413189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_413200_414000
859555	contig_14288_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_153808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	375	677	151223	151525	NA	30	ATAATATGCCTCACACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSDVLMNSYLNSYSAQESPPSGKPSPRSPISHKAVLGTSSLCTHGKQSARFAFYLSPLTLHCNHFFSCLSLSPEEKPLEIRDCLLSLRLSSCSQNNEQA	150848	151669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_150800_151700
859556	contig_14829_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_163810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37665	37370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_37400_37700
859558	contig_6506_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_153479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAGCTAACTGACAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32810	33463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_+_32800_33500
859559	contig_10953_pilon	+	1420	8	Intergenic	novelGene_42543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	197	724	344011	349255	TRUE	15	ATATCACCCTTGCCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVFVALVLAGVLPERVLLLGEDLEVLLAQLHRGQSLQPEVGPGVQEAHQVLEGVQAQAVIPIVGQMCHEDADLIEEHGEEELAPIDDLVQLAGATRVLIVEDGVCEEAAGLPWEDHDAIVDEATAIAGWLQVGGTPPCWSRGCSTLASRPRTAARAQGIHLSGGVPRRTPCLWECHAPQRTSCSGPSARPARTGCGKGGAACGSTCGETTRTPSHTIAAGRPQHPQHHYLCGRISLSSPG	342085	360521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_342119_343847_344034_344706_344832_347068_347260_347966_348116_349215_349311_352716_353209_360372
859560	contig_8017_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_65357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	266	801	272	1072	935326	934526	NA	30	TTACTGGAAATCATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTVAHKDSSRQRRPGTFSLSLEVKSGSLPPDGWDDGPDSAGGEGDGEALLQDTGPGGASRVVRSCRAELSSVLLLLFLYVLQGIPLGLAGSIPLILQSKNVSYTDQAFFSFVFWPFSLKLLWAPLVDAVYFRNFGRRKSWLVPTQYILGLFMIGLSTRVDHLLGNGEGRTPDVLALTVTFFLFEFLAATQDIAVDGWALTMLSRENVGYASTCNSVGQTAGYFLGNVLFLALESPDFCNKYLRIQPQPRGIVTLSGSVFKLLRC	935597	934458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_934500_935600
859561	contig_8027_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_158838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAACTCTATACGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259750	260169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_259800_260200
859562	contig_10629_pilon	-	559	3	Intergenic	novelGene_52885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAAGGAGAAGCGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83430	81095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_81117_81759_81804_82936
859563	contig_16883_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_161739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAAGGTTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321341	320440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_320400_321300
859564	contig_3789_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_79908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAGATGAGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684393	685427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_684400_685400
859566	contig_1379_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_134592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAATTGTCATTTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439205	438117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_438100_439200
859567	contig_5779_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_106485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGACCAGATGTCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162535	162089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_162100_162500
859568	contig_10074_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_57121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGAGAAAAACATCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316535	317388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_316500_317400
859569	contig_12923_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_30115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57850	58653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_57800_58700
859571	contig_13044_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_99989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGGCTGGCTTTGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93954	93253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_93300_94000
859574	contig_4531_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_47846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAAGATTTTAGTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123509	122579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_122600_123500
859575	contig_15039_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_110202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGGCTTCTTTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643559	644514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_643600_644500
859576	contig_9653_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_48233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	623015	622647	NA	20	TCTTCGAAGCTCACCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCFLGTPLRWPRNNSNLLICLDTAPPPFYCSPLRPFPGRSPLIGTTSHPVTPAKNPGVTSLLSPHPTPSGNLLPKCSFHLCGVFIPAITAKFRQALISFGLDYPQKIPIRYPDSCLDPTPTF	623016	622360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_622400_623000
859578	contig_10600_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_169876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCAAGGGTGAGATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315291	316192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_315300_316200
859579	contig_13300_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_125783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTTTTTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98813	98572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_98600_98800
859580	contig_9554_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_170679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGCAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75303	74285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_74300_75300
859583	contig_8848_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_140475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370785	369669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_369700_370800
859584	contig_5845_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_98897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTTTGCTGAATCGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184597	183859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_-_183900_184600
859585	contig_11058_pilon	-	1476	7	Intergenic	novelGene_177911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.60727512683216	8	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	146	706	310856	300849	FALSE	15	CCTCAAGTGTGTGGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVVIVAIGVLATIFLASFAALVVVCRQRYCRPRDLLQRYDSKPIVDLIGAMETQSEPSELELDDVVITNPHIEAILENEDWIEDASGLMSHCIAILKICHTLTEKLVAMTMGSGAKMKTSASVSDIIVVAKRISPRVDDVVKSMYPPAGPETPGCTDDCIAPVCQSSGAGDEECLPPDRGPGLD	313320	300078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11058_pilon_-_300936_302313_302375_305499_305616_308007_308042_309011_309144_310725_310935_313253
859588	contig_9955_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_21260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAGAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37493	36817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_36800_37500
859589	contig_6228_pilon	+	840	4	Intergenic	novelGene_164514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.816496580927726	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	69	707	391089	416739	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAHNLQRKLKTQKERLESKELHMSLLRQKIAQLQGEKQARTALAVERDEATLAGRKLEKKVERLQKELSACRESNTELKAKLADTNELKIKTLEQTKTIEDLNKSRDQLEKMKEKAEKKLMSVKSELDTTKHEAKEHEERARNMTEVVTSEMKTLKKSLEEAEKREKQLVDFRQVISQMLGLNVTSLALPDYEIIKCLERLIHSHQHHFVTCACLKDVTTGRDRHPQDLLKPLQ	387380	416872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_387407_391046_391290_414200_414438_416538
859590	contig_10855_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_124357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668549	668208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_668200_668500
859592	contig_4751_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_173726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286222	287192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_286200_287200
859593	contig_14666_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_39493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAAAACACTTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304518	304888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_304500_304900
859595	contig_7513_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_88995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCATTGGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507095	506556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_506600_507100
859597	contig_6410_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_108615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGGAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293818	293217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_293200_293800
859598	contig_13037_pilon	+	721	2	Intergenic	novelGene_155144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	3	719	39192	65133	FALSE	30	CATCGCCCACAAACGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEKPAAEAAESGEEGLATEGDSSKKTYKCEQCGKGFSWHSHLVTHRRTHTGEKPYACTDCGKCFGRSSHLIQHQIIHTGEKPYTCPSCWKSFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCERCAKRFTRRSDLVIAHQGTHTGAKPHKCPVCSKCFTHSSALVSHQRTHTGVKPYPCPECGKCFSQRSNLIAHNRTHTGEKPYHCLECGKSFSHSSRLSAHQRTHRGVRPYSCPLCGKSYSHSSN	39189	65135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_39577_64801
859599	contig_8020_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_114465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTAGATTCACAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413273	413979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_413300_414000
859601	contig_16076_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_173867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTACGTTTTGGATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203320	204628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16076_pilon_+_203300_204600
859602	contig_17840_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_154298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCTGGGCCTCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58833	58034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_58000_58800
859604	contig_8978_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_49436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTAATGATTTTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053424	1052775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1052800_1053400
859605	contig_19735_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_167894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCTCTAAAAAAGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187596	186769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_186800_187600
859607	contig_3394_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_152722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559970	560351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_560000_560400
859608	contig_7333_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_142748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACTATAACCTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55864	56429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_55900_56400
859609	contig_5894_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_83067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTTTCAGCATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796570	797129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_796600_797100
859610	contig_13481_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_119568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCCGTTTAGGCTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591804	1593189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1591800_1593200
859611	contig_14133_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_119975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCTGCAAAGGCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235738	235266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_235300_235700
859612	contig_10627_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_59997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAAAGTTTTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298558	298124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_298100_298600
859614	contig_11978_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_62785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGCAAGAAGATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188489	188919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_188500_188900
859615	contig_14686_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_88067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAATTTGAAGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57582	58515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_57600_58500
859616	contig_8375_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_141329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGTGTCCAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321357	320517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_320500_321400
859617	contig_10734_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_50973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATGTGCATATGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238542	237970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_238000_238500
859619	contig_4305_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_136708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGAGAACTGGCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793740	793207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_793200_793700
859621	contig_401_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_42749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAATAGAGAAAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937308	936601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_936600_937300
859622	contig_12139_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_146457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	296	607	66273	66584	NA	25	TGAGTTACACGGCAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFLVEKPFHLNANKSFKVQDNRIQMPNLNSPMCSTLQPNEMGGKKLGSSAGYHPLLPQEKGVEIHKAFPLCLRCRQCASEERAPTDFLRASVCSTTTNYHL	65977	66681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_66000_66700
859624	contig_593_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_102016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390092	389823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_389800_390100
859625	contig_18113_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_137532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATGAAATGAAAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147475	146105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_146100_147500
859628	contig_6958_pilon	-	785	2	Intergenic	novelGene_70022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815374	814055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_814300_814833
859629	contig_3004_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_127562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGTGGTAAATGCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859649	860243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_859600_860200
859630	contig_17311_pilon	-	315	4	Intergenic	novelGene_57851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	413.893169254526	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTATATGTGTCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126886	118801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_121530_121603_123357_123499_126862
859631	contig_16204_pilon	+	533	3	Intergenic	novelGene_154471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	31	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTATAAAGGGAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70603	81386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_70886_71621_71733_81246
859632	contig_1150_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_61464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATTGGATGGGTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380997	382052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_381000_382100
859634	contig_6279_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_164756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAATCCTGGAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11807	12352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_11800_12400
859643	contig_11413_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_103154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTCCATTGCTTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290048	290906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_290000_290900
859645	contig_8373_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_176382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATAAATGGTGCTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64118	63686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_63700_64100
859646	contig_6631_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_174300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068042	1066758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_1066800_1068000
859647	contig_12793_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_164134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279521	280792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_279500_280800
859648	contig_7009_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_23589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAATTGTTAATTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374809	373705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_373700_374800
859653	contig_960_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_108282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019798	1019209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1019200_1019800
859654	contig_7359_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_139858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGTAACTCCAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59299	58698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_58700_59300
859655	contig_20609_pilon	+	377	4	Intergenic	novelGene_118469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	45.6167610521493	427	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	62	376	43732	59326	FALSE	5	CCTGCTACTGCCTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGSGSGAGTSGTRTGADWTMAVNLSRNGPALQEAYGRVVAEKSPTDWALFTYEGNSNDIRVAGTGEGGLEELVESEGRYKSVTTTAHASVGPALPVCQPCAPLGQLQLLLQSSCFRKSNKKMAH	43670	59327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_+_43815_48944_49001_52520_52541_59170
859656	contig_7704_pilon	+	813	2	Intergenic	novelGene_154622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAATAGTAATTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347284	348149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_347654_347705
859657	contig_12050_pilon	-	1033	5	Intergenic	novelGene_62768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	339	1031	820539	816219	FALSE	25	GCCTGAAAAGGATGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVYPTGCGRYRRFLPEDQSGSPTRLAAPDPSPPITMHSLDEPLDLKLSITKLRAAREKRERTMGVVRHRTLHRELGLVDGSPTPGSPGSPPSGFLLNPKFPEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSAPDFQPLRYLDSMPSSFQFFLPLGSGSALHLPASSFLTPPKDKCLSPELPLPKQLVCRWAKCNQLFELLQDLVDHVNDYHV	820877	816216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_816279_816358_816536_816635_816809_817870_818113_820498
859658	contig_7428_pilon	+	728	2	Intergenic	novelGene_77698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCAATAAATTCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250701	254969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_250839_254378
859659	contig_15613_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_147197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCAGATGGTAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71344	70667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_70700_71300
859660	contig_8554_pilon	+	941	5	Intergenic	novelGene_160270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	12.457427503301	62	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	424	804	28406	32541	FALSE	25	AAGCAAGGGTTTCTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKHPKGVLLYGPPGCAKTTLVRALATSCHCSFVSVSGADLFSPFVGDSEKVLSQVFRQARANTPAIVFLDEIDSILGSRSVSQTGCDVHERVLSVLLNELDGVGLKTIERRGNKSDRQGKYQELEKSEEVEFQEVFNGNVMIIAATNRPDVLDDALLRPGRLDKIIYIPPPDPKGRLSILEVCTKNMPVGPDVSLENLAAETRFFSGADLRNLCREAALLALQENGLEATTVKQEHFLKSLKTVKPSLSHKDLTLCENLFQKQELF	23608	32678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_23774_26797_27023_28372_28508_29283_29410_32388
859661	contig_10196_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_132187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGTCTTCACTCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085500	1085143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1085100_1085500
859662	contig_15687_pilon	-	222	1	Intergenic	novelGene_129128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCGCGCGCCACCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85333	85111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_85100_85300
859663	contig_5720_pilon	-	262	2	Intergenic	novelGene_177912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTCATTAGTGTTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742751	727096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5720_pilon_-_727222_742614
859664	contig_11448_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_66337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTACTTGAATTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136880	137959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_136900_138000
859665	contig_16686_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_162098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTTATCTGAATGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164449	165382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_164400_165400
859667	contig_7342_pilon	+	279	2	Intergenic	novelGene_71206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCCGACTGGCGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673850	674907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_673870_674647
859668	contig_9516_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_106202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTTCTGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301412	1300656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1300700_1301400
859669	contig_12603_pilon	+	668	6	Intergenic	novelGene_105820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	17.3827500701126	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	104	643	770639	839886	FALSE	15	GTGAGCGTGCCCCCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTEGFGELLQQAEQLAAETEGISELPHVERNLQEIQQAGERLRSRTLTRTSQETADVKASVLLGSRGLDISHISQRLESLSAATTFEPLEPVKDTDIQGFLKNEKDNALLSAIEESRKRTFAMAEEYHRESMLVEWEQVKQRILHTLLASGEDALDFTQESEPSYISDLGPPRSKLSG	751275	839911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_751361_770620_770818_780821_780940_822705_822769_828344_828474_839835
859670	contig_9582_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_106844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATTATTAAGATAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444980	444429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_444400_445000
859671	contig_1406_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_25461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCAAAGGAGAATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679057	678841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_678800_679100
859672	contig_8505_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_173189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAATTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83793	83293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_83300_83800
859674	contig_12520_pilon	+	308	3	Intergenic	novelGene_161052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTCAAACCCCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91880	103215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_91921_100735_100946_103157
859675	contig_12520_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_161053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129158	129522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_129200_129500
859676	contig_12327_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_140633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGACAAGAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150441	151429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_150400_151400
859677	contig_11564_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_158591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTAGTGACCAAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191533	190704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_190700_191500
859678	contig_7730_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_156305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGGGATGACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458046	457776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_457800_458000
859679	contig_12931_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_166763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75710	75239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_75200_75700
859684	contig_14684_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_99671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAAAAAATTTTGGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334953	335252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_335000_335300
859685	contig_3465_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_173396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAAATCCTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771632	771063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_771100_771600
859688	contig_10749_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_133495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208293	208877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_208300_208900
859689	contig_3132_pilon	-	947	5	Intergenic	novelGene_127412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	245	481	20761	19562	FALSE	45	TTTACGACCAAACTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCCCCQGACRVQPRKYPSSEALRKVNSCQSRHAAPVQVQGSPKKFATLAVSLILKCPQKCDLQCTKCPCPSLPTDHRLYQMNLLSRRCHAVRGRCRCQFSACQFSYPLGATLCLLQKRVVSVHPPRSGQSRTAMVDGSSQAGDGETAEAETALLTLRH	22768	19095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_19724_20013_20081_20753_20927_22579_22632_22741
859690	contig_8418_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_166071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAGAAAGCAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213124	1213761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1213100_1213800
859691	contig_14184_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_66601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTTCCAGGTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115715	115084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_115100_115700
859693	contig_5324_pilon	-	1042	2	Intergenic	novelGene_102059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGAGGCGCTCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430607	417128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_417510_429946
859694	contig_6589_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_25689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTCCCTAAATATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101418	100726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_100700_101400
859695	contig_10437_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_38185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCACTGTAGTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210321	209945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_209900_210300
859696	contig_835_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_152163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTCTTAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291216	292310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_291200_292300
859700	contig_4782_pilon	-	542	2	Intergenic	novelGene_73642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	121	474	418385	414167	FALSE	60	TAAAAAAGAAGTAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICQFFLQGRCRFGDRCWNEHPGAKGASGGRQQPQQQPSGSNRRGWNAANHRYSSVIQPSSFSKSTPWGGSRDQGKSSLGSFESGTSASRDREFGLSQNPFASLSPDEQKEEKKLL	418505	414098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_414400_418264
859702	contig_1154_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_87226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACCAAAAAAAAGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1616075	1616569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1616100_1616600
859704	contig_10141_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_84619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCCTGAAAGACCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275719	275069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_275100_275700
859705	contig_1143_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_86628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTAATGTTTCCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273872	1272901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1272900_1273900
859706	contig_14243_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_57424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGATTGCTACCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562726	562275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_562300_562700
859707	contig_15430_pilon	+	630	2	Intergenic	novelGene_174696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAAATGTTCGATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51866	52936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15430_pilon_+_51998_52437
859708	scaffold_12124_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_22010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGTGGCTCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792425	792052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_792100_792400
859709	contig_15326_pilon	+	1095	9	Intergenic	novelGene_157714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	3.29535658161602	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	978	117	1094	161627	202309	FALSE	55	TACGGAAGAAAAATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPWDYMQSDLLAELHVNTRLLPRVPRSFPFNTSVMFKKTVFVEFTDHLFNIAKPRPPWMGLLGPTIRAEVYDTVIITLKNMASHPISLHAVGVAYWKASEGAEYDDKTSQREKEDDKVIPGESHTYIWQVLKENGPMASDPPCLTYSYLSHVDLVKDLNSGLIGALLVCREGSLAKEGTQTLQEFVLLFAVFDEGKSWHSEAGESSAQGVDSASTLPWPKMYTVNGYVNRSLPGLTGCHRKSVYWHVIGMGTTPEVHSVFLEGHTFLVRNHRQAFLEISPITFLTAQTLLMDLGRFLLFCHIPSHQHDGMEAYVKVESCPEEPQ	158669	202310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_158752_161592_161689_175710_175833_181552_181676_189391_189605_194788_194858_195656_195774_197803_198026_202259
859710	contig_16635_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_153145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTGTAATATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76694	77445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_76700_77400
859712	contig_4055_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_158172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	788207	792673	FALSE	30	CACAGTTACTCACCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDRLNERVAYHRLAALHHRLGHGELAEHFYLKALSLCSSPLEFDEETLYYVKVYLVLGDIIFYDLKDPFDAAGYYQLALAAAVDLGNKKAQLKIYTRLATIYHNFLVDREKSLFFLPKGQGLRH	788206	792839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_+_788405_792496
859713	contig_8357_pilon	+	327	3	Intergenic	novelGene_39727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	9.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	4	327	544891	552189	FALSE	25	CATGTAAGATTTTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMTAEETVNVKEVEIIKLILDFLNSKKLHISMLALEKESGVINGLFSDDMLFLRQLILDGQWDEVLQFIQPLECMEKFDKKRFRYIILKQKFLEALCVNNAMSAEDEPQ	544887	552189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_545049_548705_548790_552107
859714	contig_6726_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_86221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGCTGTTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287650	204102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_204389_287437
859715	contig_2312_pilon	+	790	3	Intergenic	novelGene_160749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCCAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482597	493870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_482836_490592_490810_493535
859716	contig_16883_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_161729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGATGAGTCAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265036	264612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_264600_265000
859718	contig_12118_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_168905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGGGCCGCGGCCCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44374	44016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_-_44000_44400
859720	contig_366_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_51608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATGTTTCCATCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807743	808444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_807700_808400
859721	contig_9727_pilon	-	470	4	Intergenic	novelGene_86261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.5785207353054	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	6	329	101964	73872	FALSE	10	TTGGTGGGCTGATGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAEASGCDSSNRCEENGREGSSPKSLLPGTTISRVKLLDTMVDTFLQKLIAAGSYQRFTDCYKRFYQLQPEMTQRIYDKFITQLQTSIWEEISEIKQEAYRRFYGTA	101969	73730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_73905_80867_80892_81860_81967_101803
859722	contig_4305_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_136701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTAGTGCTGCTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653578	653277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_653300_653600
859723	contig_11428_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_138490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAATTACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67035	66763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_66800_67000
859724	contig_2332_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_58644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACTTACCCCTAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215875	216208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_215900_216200
859725	contig_10140_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_148429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTGTCCATCTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316426	315860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_315900_316400
859726	contig_7411_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_136961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGCAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46122	45343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_45300_46100
859727	contig_9752_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_122017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTAAATGTTGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87574	87830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_87600_87800
859728	contig_2463_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_43005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAACTCTGAATATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339902	338872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_338900_339900
859730	contig_7733_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_147142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAAGACTTGCTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105479	106145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_105500_106100
859732	contig_13992_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_147629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAATCACCATTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394260	393806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_393800_394300
859733	contig_12057_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_131618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAGTTTATTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13654	13100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_13100_13700
859734	contig_14034_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_72663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAAATCTTACTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341515	340974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_341000_341500
859737	contig_5361_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_167203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	257	643	289107	289493	NA	55	CACCAACAAAAAAAAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPWAPSSSHTNSPPPLISVIPYNYRGVPGWCKQLMHRAANGKVRGSSPCRGPSEERPADLLLKIQPLKTPCGAQFYSDAHRGSPRVELNGRHLSLVSSLPSAPPPAFRFFADFPISQMEVIISRALK	288850	289675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_+_288800_289700
859738	contig_6631_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_174303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAGCAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099954	1100346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_1100000_1100300
859739	contig_10163_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_82640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTGGCAAATTAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151941	151237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_151200_151900
859740	contig_10050_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_119630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGAAATAAAAGCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247298	246657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_246700_247300
859741	contig_3878_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_174801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAACAACCCCAGCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591041	590325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_590300_591000
859742	contig_7398_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_166164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	312	259	570	152040	152351	NA	25	ACTCAAATTCTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRSLMGQLSQCCNIVYKTHVLHPRVVSSVWGVRKRQLRVSPRQEQNSKKVTKSSEKKQVYTSHNLIYPETRRTSWCPATTTDYSDWGHNRWSRIEWRKIYSR	151781	152351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_151800_152400
859744	contig_7830_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_177916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGCCTCCTAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266767	260218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7830_pilon_-_260480_266663
859745	contig_9939_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_158608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTCGTTAATTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397820	399000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_397800_399000
859747	contig_1986_pilon	+	552	3	Intergenic	novelGene_64130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	9.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGATTAAAAAAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328725	333146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_328881_330040_330239_332947
859748	contig_13854_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_154124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308857	309284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_308900_309300
859751	contig_20694_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_141245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAATAAAGGCATTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2531	3498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_+_2500_3500
859753	contig_1443_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_28251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGTAATAAAAGGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544606	545138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_544600_545100
859755	contig_8730_pilon	-	642	3	Intergenic	novelGene_177917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCAGTGTTTGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313502	308867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8730_pilon_-_309207_310970_311130_313358
859757	contig_9809_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_176741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTACCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43231	43994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_43200_44000
859758	contig_7549_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_164546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGAAAAGATAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000423	1001017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_1000400_1001000
859759	contig_91_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_127102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAGGATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341515	340278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_340300_341500
859761	contig_12671_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_19209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAAATACTATGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195287	194741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_194700_195300
859762	contig_2693_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_167598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAGTAAACATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295284	294572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_-_294600_295300
859763	contig_7815_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_134360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCTTGAGGGTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152720	152068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_152100_152700
859764	contig_6309_pilon	-	290	2	Intergenic	novelGene_171532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACTTGTGTTCTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48266	43997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6309_pilon_-_44193_48171
859766	contig_10948_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_124973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	151	609	137961	138419	NA	75	TCCGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVTVAGLPARLTLSVLTGAGRFSILGSGVATRKDLPEVLRRGFSDSRPQPLPCPDIRESSSCVSKCRLDYKRYVISRRLAETLAQILQGKRKTPQLVLECNPGEFSVDCIFLEVSYFCILSLITQEALPKTLPFKQLTWRECPRHVAYGLC	137810	138519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_137800_138500
859767	contig_3382_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_124147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAACCTTTGTACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891661	892563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_891700_892600
859769	contig_10197_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_115263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTTCCTGTTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105528	1106115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1105500_1106100
859770	contig_9706_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_20987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGTCAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417981	418517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_418000_418500
859771	contig_6496_pilon	-	893	3	Intergenic	novelGene_103481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATACTTTGTGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300536	296233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_296745_297422_297515_300246
859772	contig_11293_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_134680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGCTTGTTTACTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124432	124827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_124400_124800
859773	contig_6479_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_160605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGGGCTAGAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80598	80014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_80000_80600
859774	contig_5023_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_7145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTCTCTCTCTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344218	343754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_343800_344200
859775	contig_11708_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_138974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGGCAGTTCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285843	287173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_285800_287200
859776	contig_5033_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_29098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772658	773386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_772700_773400
859777	contig_1406_pilon	-	603	3	Intergenic	novelGene_25513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	2	182	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCAAAACCTTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522356	1520570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1520806_1520897_1521073_1522163
859778	contig_14509_pilon	-	828	2	Intergenic	novelGene_168560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATCCAAATATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336574	210468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_-_211210_336487
859779	contig_5023_pilon	-	1004	1	Intergenic	novelGene_7113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTAGTCCCGAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89439	88435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_88400_89400
859780	contig_12964_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_131655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTATTAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117409	116346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_116300_117400
859782	contig_2768_pilon	+	613	4	Intergenic	novelGene_57479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	217.663859093685	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	104	547	656383	668934	FALSE	65	GAAAAACTAAATTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGSVAERSQTGALHTTPAGDRAAGTRVPATLGSGHHLKEKAREEAGSARTSLLILVSIFLSAAFVMFLVYKNFPQLSEEERVTMKVPRDMDDAKALGKVLSKYKDTFYVQVLVAYFATYILYPLTEKCFLVCSRKRFQDVYCSVL	656163	669000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_656262_656377_656504_664570_664689_668729
859784	contig_14275_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_162880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTGTTTATATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466529	467715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_466500_467700
859785	contig_5569_pilon	+	555	4	Intergenic	novelGene_86762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	38	junction_3	17.9133717900592	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	227	553	519152	538223	FALSE	40	GTAAGCGTGTGAACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAKKEKISVDDEAVDKNIFKDCSNIAFYRRQKKQLSKKSTCRAVLDSFTTGKDSTSFQIINEATKIPLLAEVYGLEGNIFRLKINEESPLKPRYEVRDVLTSKLSTV	518925	538225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_519181_520518_520582_522686_522796_538097
859786	contig_10609_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_123950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGGCAGATAGACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479250	480380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_479200_480400
859787	contig_11250_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_127162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAATAGTTAAAACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200639	201344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_+_200600_201300
859789	contig_13418_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_177920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCCTACGGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279245	279662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13418_pilon_+_279200_279700
859790	contig_3602_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_60679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	87	386	1219109	1218810	NA	20	TGTTGCGTAAGTGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEWGLRGDRPGAWTRPEHAPQWSRLRGRESVPPGSLLRPLGRADGIPSSPETPRLRCAISAPPGRERLAGGTPASTRSLGEPLVTAYCVPGVLLGTRR	1219195	1218687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1218700_1219200
859791	contig_5758_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_119140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATGCTGACGTGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665103	665432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_665100_665400
859792	contig_5988_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_16058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTCCTTTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125672	1126158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1125700_1126200
859794	contig_9593_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_59702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCAGGGCAGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93146	93724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_+_93100_93700
859796	contig_11850_pilon	+	863	1	Intergenic	novelGene_125183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGGGAAAGCTTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171279	172142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_171300_172100
859797	contig_20419_pilon	-	303	3	Intergenic	novelGene_177751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	22	junction_1	3.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	66	302	14037	13029	FALSE	10	CATGGAGGGGTTGCTTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRDTLAFREELDALKFLCKDMWVAVFQKQMDGLRTNHQGTYVLQDNDFPLLVRMASGLQYLEEAPKFLAFTCGLLRGTLSTLGIKSLVTASVAALPACE	14102	13027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20419_pilon_-_13128_13304_13389_13983
859800	contig_5317_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_76492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATAAAATAAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10791	10129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_10100_10800
859802	contig_5279_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_105548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAGGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264720	264515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_264500_264700
859803	contig_6743_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_33543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTCTTTTTTTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198189	197442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_197400_198200
859804	contig_14202_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_157127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGCTATGTGGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60402	60686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_60400_60700
859805	contig_7408_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_168757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGCTGAAAAATAAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89073	88166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_88200_89100
859807	contig_14684_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_99651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATAAAAATATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247485	246861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_246900_247500
859808	contig_829_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_168923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTTTATATAACCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63590	62607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_62600_63600
859809	contig_5031_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_133195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAAAGAGTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35498	34712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_34700_35500
859810	contig_19743_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_173165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338761	337931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_337900_338800
859811	contig_5346_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_161846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62081	62965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_62100_63000
859814	contig_6228_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_164517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCTAAAAGAGGCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531078	531791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_531100_531800
859815	contig_5236_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_100936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCAAAAAAAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946110	946367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_946100_946400
859817	contig_10864_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_107112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAATGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081710	1082684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1081700_1082700
859819	contig_10311_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_50443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAACCATTTCTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65129	65481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65100_65500
859820	contig_10197_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_115183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATTCATTTAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463088	463337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_463100_463300
859821	contig_6048_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_73086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88172	89058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_88200_89100
859823	contig_15172_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_158776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAATATGGCCCCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280581	281049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_280600_281000
859827	contig_15596_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_139519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGGTTGCCTTTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89625	90653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_89600_90700
859828	contig_2035_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_174637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTGGGGACGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113446	113168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2035_pilon_-_113200_113400
859832	contig_5921_pilon	+	486	2	Intergenic	novelGene_142254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395769	399996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_396176_399916
859833	contig_13780_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_149098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGACCTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730768	730249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_730200_730800
859834	contig_14744_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_66111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTGCCTTCCCTCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554442	1553612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1553600_1554400
859835	contig_15966_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_176506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGTAGAATTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70533	70136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15966_pilon_-_70100_70500
859836	contig_11121_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_167059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACGAGCCACTCCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202637	203943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_202600_203900
859837	contig_16594_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_53899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCACATGACTCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242473	241986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_242000_242500
859838	contig_10196_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_132052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAGAGAAAAACAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644550	644102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_644100_644600
859840	contig_11751_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_150296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGTACCACTGGGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122095	123023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_122100_123000
859842	contig_9571_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_136338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGCATTAACTCATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791573	792144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_791600_792100
859843	contig_9389_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_84071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCTGGATTTTCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009655	1009208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1009200_1009700
859844	contig_4782_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_73599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCATAACTAACTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69282	69964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_69300_70000
859845	contig_12619_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_73562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792228	791994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_792000_792200
859846	contig_15021_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_26969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAACACAGATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269939	269082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_269100_269900
859847	contig_11492_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_152251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGTTCAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311586	312622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_311600_312600
859849	contig_12079_pilon	+	413	2	Intergenic	novelGene_67455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTATACTGAATCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580158	580615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_580506_580549
859850	contig_695_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_177165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGTGTTTCATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58897	60175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_58900_60200
859851	contig_6102_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_32305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1535967	1536581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1536000_1536600
859852	contig_7695_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_41657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTAGCACTTGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863363	862953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_863000_863400
859853	contig_5777_pilon	+	479	2	Intergenic	novelGene_173326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGGAAGGCTTCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162004	162626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_162324_162466
859854	contig_16666_pilon	-	687	2	Intergenic	novelGene_61816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTAATACTGCGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281753	280507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_281163_281721
859856	contig_1666_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_160582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTCTCACCCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679558	677980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_678000_679600
859858	contig_3465_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_173397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	242	328	775452	775538	NA	20	CCCCCAGCTGTTGACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQKFSVVGRDDKDLASVFQLESTSNEKHDKSETSRIIRRNEQTSKKALTDEHFAVHWCEFLKNVYYHEKLCAYWSSVVHFMQRCAVRSPVIWSAVHFMQQYAVHSPVI	775210	776226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_775200_776200
859859	contig_13375_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_151075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATATCATGTTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13215	12387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13375_pilon_-_12400_13200
859860	contig_14202_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_157147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCCTTCGGCAGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150967	149715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_149700_151000
859861	contig_11427_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_78976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACTCTAAGTTCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99788	100099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_99800_100100
859863	contig_13982_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_163488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGGGTGGGTTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396651	396968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_396700_397000
859866	contig_4079_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_167485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGGCGTCTTTTCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139347	139921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_139300_139900
859867	contig_2799_pilon	+	1335	1	Intergenic	novelGene_85524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAGAAGAAACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635131	636466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_635100_636500
859868	contig_15691_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_60781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCGCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117788	118149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_117800_118100
859869	contig_9593_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_59703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTTCAGAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141746	140567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_140600_141700
859872	contig_12950_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_114799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	221	535	204826	205140	NA	15	TATGTGTTTGTTTAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGWATVRFSRALVPLRSRGAGAARAGSGAAPRTAWPPALRAQRSLIFSSCEVVSGAAGRSTRQVRRPLRSSAPMLRTSSAALHCPPAEEIAHSRHCGHSLRLWWGLAGLGYPNGWVNLAWELMHVRSAYREEEEAGACTPQKSTSSQYAQQYVQNAIVLNRDSSVVDVVKCPRVGCN	204605	205389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_204600_205400
859873	contig_11121_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_167052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGTTTCTGAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23889	24804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_23900_24800
859874	contig_13440_pilon	+	654	2	Intergenic	novelGene_170518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCTTTGTCACTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155595	157640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_+_156013_157403
859876	contig_10734_pilon	-	1104	2	Intergenic	novelGene_51215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAAAATTTGGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160461	1158824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1159562_1160094
859877	contig_11396_pilon	-	1037	4	Intergenic	novelGene_71423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	5.90668171555645	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	398	934	1746247	1744161	FALSE	20	AGGCAGAGGATTTTCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSARWQTALEGVGRWTPPTRLVLRPSQLLQPTAKLLSVSCASCAKRQESPRKKLLSEKKLVPLGTLVKEGEDTVADLSHPGDEYIAALGGAGGKGNRFFLANDNRAPVTCTPGQPGQERVLFLELKTVADAGMVGFPNAGKSSLLRAISRATPAVAAYPFTTLKPHVGVVQYEGHQQVTVADVPGIVRGAHQNRGLGLAFLRHIQRCSFLLFVVDLSVPEPWAQLQDLKYELEKYEEGLSERPHVVLGNKIDLPAARARLPELQARLGRTLVPLSAATGENLEALLLRLKELHDDHVEAKQAHGHQPPSW	1750273	1744057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1744556_1745354_1745494_1746244_1746464_1750092
859878	scaffold_16539_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_68387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646765	646154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_646200_646800
859879	contig_5965_pilon	-	739	3	Intergenic	novelGene_154660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	4.5	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCATTGCTTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177201	171490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_171882_174885_174959_176926
859881	contig_12964_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_131694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCTGAAAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555316	554719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_554700_555300
859882	contig_4769_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_118027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCCCTGAATTAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208957	1208364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1208400_1209000
859883	contig_12078_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_74136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAACAAAAAAAAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742607	743108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_742600_743100
859885	contig_10734_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_51267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGCATTGTTCACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311530	1312639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1311500_1312600
859886	contig_960_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_108249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCATGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524783	525434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_524800_525400
859887	contig_12817_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_174770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACATTTTTTCACATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128062	129735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12817_pilon_+_128100_129700
859888	contig_5400_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_162831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGGCATCTAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270906	270475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_270500_270900
859892	contig_12128_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_131994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAGCTAATATGCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434478	435383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_434500_435400
859895	contig_15610_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_154284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGTTTAACTGAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686394	686802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_686400_686800
859896	contig_12257_pilon	+	579	6	Intergenic	novelGene_152104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.5334890961481	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTTCTATAGGAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148851	159027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_148945_149449_149522_151405_151453_156678_156787_157405_157514_158876
859897	contig_11908_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_133239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGAAAAATATATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743863	744562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_743900_744600
859898	contig_11548_pilon	+	1015	6	Intergenic	novelGene_66806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	12.5443214244534	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	51	887	237843	276407	FALSE	25	ACAACGGTCCCTTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRAADGSFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGETLQLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQVQCVQLLLAAGARVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVSLRKATGVRGLEKVAKLNIPSRLIDYLSYN	237792	276535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_237886_263172_263361_264296_264448_267304_267440_275440_275633_276279
859899	contig_12250_pilon	+	446	2	Intergenic	novelGene_80599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1653	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGAATCTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328602	332458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_328687_332096
859900	contig_7898_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_47653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAAAACAAAAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855033	855401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_855000_855400
859903	contig_8020_pilon	-	1009	6	Intergenic	novelGene_114376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	6.40624695121879	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	12	704	113522	112150	FALSE	35	TTGGATGTCATCAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLAIFLYHLRLEAEVEVVEMHNSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMRLTKTEQEREAQLVKDRHSVLRLESLYSDEEDESAAGADKIQMTWTRDKYMAAESLDPTHAPDNFQELVHIKPDQSNVWRMHTAVKLNEVIVTRSHDARLVLLNMPGPPKNSEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGREVITIYS	113533	111844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_112242_112408_112543_112688_112877_113075_113184_113266_113399_113483
859904	contig_7088_pilon	+	910	2	Intergenic	novelGene_159784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCATTTGGTCTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641962	643040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_642291_642458
859905	contig_7993_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_170969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAAACCTGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39988	40912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_40000_40900
859906	contig_9389_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_83966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAACGTGAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249078	249532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_249100_249500
859907	contig_18533_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_174049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137404	138211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_+_137400_138200
859908	contig_7562_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_140875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGTGCATATAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53561	52500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_52500_53600
859909	contig_6833_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_175126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTACATATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140345	141182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_+_140300_141200
859911	contig_10386_pilon	+	730	3	Intergenic	novelGene_173546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATGGCCTTTATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713065	734239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_713322_728030_728103_733837
859912	contig_6445_pilon	+	1138	1	Intergenic	novelGene_77136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	204	611	1502106	1502513	NA	80	AAAAACAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSSTACRQLHTPRLNSCKRGQVRVQVHSHCQQLYPSQGAISQLHRRWRLTLEPSLPSFTSRFRNSSMRPGWVSTATVRNSKTMTLMRMSSILLCSRNRKASRMAAASLPRQAYTDIGATWWRPGHVGLDLCLQATSRGFCRRVLENSQKRGRKGNIQTRSSESERRLLQENYSTRCLTIYRRNSNQHKKMLNLSHDHINAK	1501902	1503040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1501900_1503000
859914	contig_7241_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_171549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATAGATAGCTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188857	189351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7241_pilon_+_188900_189400
859915	contig_16873_pilon	-	624	6	Intergenic	novelGene_177921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.4	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	64	624	18349	2250	FALSE	40	TAATAATTTGAAACTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKNRFWGAAEIQCTRCAKKVSRVSGHHHELQCGHAFCELCLLIPEEYSTIICPDCEVATAVSTRQGNYPIDGSIKEDSFMERLQPKKTKNCSQDFKKTADQLTIDFENSTSIHRTVLNPSTIMAETKTTEEIDEALKIAGYNFEQLNIAVKMLEHMQNQTEEETDSLIEVIEKQFDQLFTSLDSR	18412	2249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16873_pilon_-_2352_3777_3859_4885_4998_10347_10440_16135_16231_18270
859916	contig_4083_pilon	+	1097	7	Intergenic	novelGene_152344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	7	414	420894	423434	TRUE	5	CCCTCTGCAGCTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMGLLEGVTPSLLRVEREAMLGQKSSALLSVWVLLSLLPVLAWALLVDVVEAVGDSAEGGGVGSMVAEACSWCSFPSSNPMLPFQVFSSFFSSTSWLLVREVWRECVPVAAAMDGTERAGRRLEESVFPASLRDRC	420887	460036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_421128_423260_423491_424598_424721_430564_430757_436037_436188_440554_440701_460019
859919	contig_8050_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_114884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGCTACTTCTTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497572	498281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_497600_498300
859920	SIRV3	+	288	2	ISM	SIRV3A	SIRV305	436	3	625	11	625	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCATATTTCCGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4628	6707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4780_6570
859921	contig_15273_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_140420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGGTTACAAGGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39082	38534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_38500_39100
859923	contig_12151_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_54968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAAACAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973412	973822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_973400_973800
859925	scaffold_17541_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_175239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309505	310118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_+_309500_310100
859926	contig_2278_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_118151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTACTTTGGCCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469421	1468055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1468100_1469400
859929	contig_13968_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_106864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGCAACAGTATAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5903	5251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_5300_5900
859930	contig_15703_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_176778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAGAGAGCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32557	33466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15703_pilon_+_32600_33500
859931	contig_3382_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_124076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGCGACCCTACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342137	342436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_342100_342400
859932	contig_5485_pilon	+	1082	3	Intergenic	novelGene_37731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	7.5	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	120	1082	319727	323005	FALSE	25	GGTAAGTATGTAGTGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLRRRRLVLRTGEARFEAIISSQKRKPPSGILTSFLLAMIKCLSDEVQAKLRSGLAISSLGQCVEELTLNSIDAEAKCVAVRVNMETFQVQVIDNGFGMGSDDVDKEEDCLEQEMPCLTGSPITLTELSHFDRDSLNVEKSPESLASKLSRMKGSERETETMESMSHFNELPQSDSSRKDRLTLDSCKLFKNEHKKTESIIPMSDSVAQDNSCNKDRETCYGNSTTGSYVIPETPLVLPSNNSPKVISKDSDDLISSESQIGNIDSPSRMLMSHVDDSTADQNETCVQSEESKARACSENEESNTCSVDWQQHFDVALGRMVYINKITGLSTFIVPTEDTQAACTKDLTTVAVNVILEN	318291	323005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_318348_319663_319931_322246
859933	contig_165_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_117079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440051	439309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_439300_440100
859934	contig_935_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_45573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCCTTATAGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608483	608114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_608100_608500
859935	contig_7411_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_136998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTATTTGAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238913	238278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_238300_238900
859936	contig_13244_pilon	+	942	2	Intergenic	novelGene_86988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGTTTCTGATGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438038	440324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_438452_439795
859937	contig_12735_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_140774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTTCTCTGGCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90143	89222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_89200_90100
859938	contig_2032_pilon	-	483	3	Intergenic	novelGene_175553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	23	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTGACTCCTCACCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50968	32895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2032_pilon_-_33136_33906_34002_50820
859939	contig_7562_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_140887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAAATGAGAGACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280437	279556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_279600_280400
859940	contig_10159_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_30823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTACCTACAGGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513176	513829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_513200_513800
859943	contig_18393_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_167461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10743	9655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_-_9700_10700
859945	contig_10489_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_165628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85393	86331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_85400_86300
859946	contig_10937_pilon	+	529	5	Intergenic	novelGene_67347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	194.394572969515	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	26	529	206453	209272	FALSE	10	CTGGCTCCCCACTGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKNIPPSDMAQIKAKVAAMGLLQGLRQDWGCRRAWVRDYLSSATDNPTASGLFAQRLQTLREKDGFGAVLFSSHVRKVNRFLKSRDRALLLTDHHLYKLEPGKQYRVMRAVPLQAVTGVSVTSGKDQLVVLHTRGQDDLVVCLHRTRPELDNRVGELCPISVAAVLASPFSGRAAE	206427	209272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_206555_207238_207344_207621_207736_208862_208989_209215
859947	contig_8712_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_58838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425447	426647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_425400_426600
859948	contig_21066_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_177922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAAGGGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21066_pilon_+_0_400
859949	contig_9571_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_136297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528329	527480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_527500_528300
859951	contig_7801_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_169684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAGTTAGCTTGATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465346	465748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7801_pilon_+_465300_465700
859952	contig_3602_pilon	+	299	2	Intergenic	novelGene_60634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	64	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGGACCTTTAAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001910	1003213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1001942_1002945
859953	contig_9705_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_41727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTGAAAAAAAGTAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200868	201481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_200900_201500
859954	contig_4783_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_108372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTGAAATATGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159238	158185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_158200_159200
859956	contig_4103_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_52026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTAAACCTTCACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538222	538873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_538200_538900
859957	contig_9797_pilon	+	446	2	Intergenic	novelGene_65573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	372	419	56162	68565	FALSE	20	AGCCTGGGCTATACATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFDKNFVQLCLSAEPSEAPRLLAPAALAFRFVEVLLINNNNSSQFTCGVLCRWSEECGHAAGRACGFAQPGCSCPGEVGASPATTTPSGPPAAHTLSNALVPGGPAPPAEADLHSGSSNDLFTMEMRYEVRSRKRNRR	55790	68592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_56178_68533
859959	contig_10057_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_162331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCTAGCACCCACCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34184	33237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_33200_34200
859962	contig_7340_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_159895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTGTTTAGTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135198	134868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_134900_135200
859963	contig_15420_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_175299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAGTAAAAGACATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160577	160081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_160100_160600
859964	contig_4339_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_146107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCATCGAGTCGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229575	1230574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1229600_1230600
859966	contig_7909_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_155949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAGAATAAATGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163971	1165108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_1164000_1165100
859967	contig_11855_pilon	+	1049	1	Intergenic	novelGene_67056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTGCTTTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002504	2003553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2002500_2003600
859970	contig_10404_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_138722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACCTATTTCTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312133	1311694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1311700_1312100
859971	contig_7895_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_154460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATCTCAGTCAATCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781101	781534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_781100_781500
859972	contig_7362_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_147556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTAGAAAACAGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450449	449840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_449800_450400
859973	contig_9113_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_68601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGACCCCGGCGGCCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365428	364843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_364800_365400
859975	contig_8921_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_161624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTTATGTGGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36480	36986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_36500_37000
859979	contig_14599_pilon	+	472	4	Intergenic	novelGene_167898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	49.886537930254	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	253	390	141561	146099	FALSE	0	GCTCCCCGTTTGTGCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSVAGARVAAGRWPVLGPRLAARFFPQRPPQQTPEPGLALQRSLHATAVRAVPLIPIVVEQTGRGERAYDIYSRLLRERIVCVMGPIDDSLASLVIAQLLFLQSESNKKPIHMYINSPAPLAAEPGAP	141211	146181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_141401_141497_141570_142212_142305_146062
859980	contig_9839_pilon	-	717	4	Intergenic	novelGene_88547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	10.2089285540757	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3	455	169186	162192	FALSE	25	TGTCTTAATAGTTATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSEHWLQVKIRRKSYVNYLQPQSYELHLGTGCPVTRELLDFFEFFYGLSSCGIKVNERPSSILIESSVTYEPVNLDIIGHIPISCYIQRPFLFTFVTKTELNTSSAFQSLVRKNNSTSPKVEDTEIHPGVSFENNFSPVKTYIVLSAPL	169188	161929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_162244_162974_163107_165751_165850_169015
859982	contig_8357_pilon	-	910	7	Intergenic	novelGene_39732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	442.31804168494	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	30	908	657152	644142	FALSE	40	ACTTCAGGACTATGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENLISMREDHSFHVRYRMEASCLELALEGERLCKSGDCRAGVSFFEAAVQVGTEDLKTLSAIYSQLGNAYFYLHDYAKALEYHHHDLTLARTIGDQLGEAKASGNLGNTLKVLGNFDEAVVCCQQHLDISRELNDKVGEARALYNLGNVYHAKGKSFGYPGPQDTGELPEEVRDALQAAVDYYEENLSLVTALGDRAAQGRAFGNLGNTHYLLGNFRDAVIAHEQRLLIAKEFGDKAAERRAYSNLGNAYIFLGEFETASEYYKKTLLLARQLKDRAVEAQSCYSLGNTYT	657181	644139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_644224_646872_646989_647106_647231_647761_647905_648607_648744_649118_649341_657096
859983	contig_5918_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_99634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	101	487	2241879	2241493	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGDILHAGGRHKSLSLFRRGWGGERKLREPFVRTASGLTRSHYSEGLLTPLGEIPRKRPESPLFLTEEEEPVPTRGQQCPVALWFSGAASRGPSRVSWGFLGKSLARPGSELTGSKIGLQNPVAAT	2241979	2241229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2241200_2242000
859985	contig_10868_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_173899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCGATCAACGCCGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484404	483838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_483800_484400
859986	contig_10868_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_173898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGCAGGAAGACCCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483838	483405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_483400_483800
859987	contig_10938_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_171763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50967	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_51000_51700
859988	contig_4461_pilon	-	943	3	Intergenic	novelGene_177927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACACTACTTCCACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99528	95739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4461_pilon_-_96371_97607_97757_99365
859989	contig_6829_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_123776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88476	88074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_88100_88500
859990	contig_11115_pilon	+	774	5	Intergenic	novelGene_102865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.52769256906871	59	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	373	519	192299	192445	FALSE	15	ACTTCCATCCTCTGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVFLRAARGAWWSRPGGFSGAGEAATPATARKFRATGSRPAGEEEAGDSERPGDVVNVVFVDRSGQRIPVSGRVGDNVLHLAQRHGVDLEGACEASLACSTCHVYVSEDHLDLLPEPDEREDDMLDMAPLLQENSRLGCQILLTPELEGAEFTLPKITRNFYVDGHVPKPH	188444	192700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_188557_188641_188697_188906_189014_191991_192080_192288
859991	contig_6589_pilon	+	504	3	Intergenic	novelGene_25805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCCGCTGCGCTCGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673999	675585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_674230_675011_675078_675377
859993	contig_4769_pilon	-	255	2	Intergenic	novelGene_118036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACAGGTATGCATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410963	1406220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1406334_1410821
859994	contig_4125_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_25067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	238	543	454434	454739	NA	30	AGCAAAGCCCATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRDLPLHNHQAVACLAACLSHVHVEVSSVSLYPFGAQRPRPGCHCGMGEMWVFPAVRPGTHPQGSEHQGSPHRSELLETAQEPPPPHLPASPPPHLPGG	454196	454765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_454200_454800
859995	contig_829_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_168931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACAATCCGTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289652	289076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_289100_289700
859996	contig_2903_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_148981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCATAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187799	187086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_187100_187800
859997	contig_7571_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_106407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTAAATATCTGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298445	299646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_298400_299600
859998	contig_1986_pilon	+	852	4	Intergenic	novelGene_64125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.68178700572909	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	102	323	262646	275824	TRUE	45	TAACAGTAATAAGAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGRAQELRVLAALRGNAQDTVVEFGSFDPSCLMSICPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQAIEADDDQHQFRPDPSVSPLVAPRHIRRHSPISSQTDEKAHTE	256913	276513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_256973_262603_262760_275716_275836_275995
859999	contig_13074_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_153433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAAGGATGAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426800	427478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_426800_427500
860000	contig_5018_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_46972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTATTTATGGGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506898	506430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_506400_506900
860001	contig_3068_pilon	-	496	4	Intergenic	novelGene_137630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_1	279.738369830732	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	57	305	234636	233625	FALSE	40	AAAATGAAGGTGTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	234855	233433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820
860002	contig_5959_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_150197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAATTTATAAGGCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218739	217967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_218000_218700
860006	contig_4388_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_161959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGGTGTGGAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446816	447700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_446800_447700
860007	contig_3523_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_171494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATGGTGCTAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444228	444926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_444200_444900
860008	contig_7391_pilon	-	802	8	Intergenic	novelGene_112158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_4	36.9351334319054	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	117	788	425770	411653	FALSE	55	AAACAAGAACGAAGACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFEVVLGRAQAASPQASSLPPAASECLSASQFLVSEKMAEELDLMGQDSDGDSDEVVLTPAELIERLEEAWMNEKFAPELLESKSEIVECVIEQLDHMEENLRRAKKGDLKVSIHRMEMERIRYVLNSYLRCRLMKIEKFFPHILEKEKTRSDREPSCLSPEEFAFAKEYMANTETYLKNVALKHMPPNLQKVDLLRSVPKPDLDSYVFLRVKERQENILVEPETDEQRDYVIDLEEGSQHLIRYKTIAPLVASGAVQLI	426801	411638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_411750_411846_411938_415022_415112_415305_415404_419823_419938_420760_420848_425674_425790_426704
860009	contig_14341_pilon	-	1204	1	Intergenic	novelGene_111816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCTGGCTGTGGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526262	525058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_525100_526300
860010	contig_12157_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_135910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATATTAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169315	169110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_169100_169300
860011	contig_366_pilon	-	1094	5	Intergenic	novelGene_51612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	80	310	1163646	1157397	TRUE	80	AAAAGAAGACAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLVSTWHSTISPNSSKRLFSSRELMSLERFRTYTTRPSPMAFSRCFLASRTLGVPSEHGPLLSHLKFLRVAGDRERQEEEPELERLREQSCRLALLGRLW	1163725	1154609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1154648_1155241_1155316_1156724_1157506_1161493_1161572_1163602
860012	contig_1154_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_87135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGTGTTGGGTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805628	806085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_805600_806100
860013	contig_9919_pilon	-	430	4	Intergenic	novelGene_137943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTTTCGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235409	233979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_234082_234205_234304_234532_234621_235267
860014	contig_14855_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_146018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGCTGAGGTCACTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505683	506020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_505700_506000
860015	contig_12292_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_166999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTAACTGATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250010	250276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_250000_250300
860016	contig_10492_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_177928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	109	510	179172	179573	NA	65	AATGCAAAGAAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVAGRICSDYTFQALRKVLQWDAFLHRLLDVDTLHLRTQNLSYDNTSPVPSLISSSEATARMDRQVGHILHFAWLPSTLFLFAVTCGAGVGARCSGGACNAWGTFSSVGLRLLYQPLFVSHSECASFCTHP	179063	179924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10492_pilon_+_179100_179900
860017	contig_19957_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_57684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTACTTTAAATCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57726	58695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_57700_58700
860018	contig_7945_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_161590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCACTGTGAGTAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366228	366701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_366200_366700
860020	contig_8896_pilon	-	704	8	Intergenic	novelGene_171566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	38.3208793729785	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	25	702	27594	4489	FALSE	15	ACGGTGACTATTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFGGQMVEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPALKRRLECSLKVYLYCSPVTKELLLTNPKYRFWEKRTISIEVETPTQIPLIDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAKGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLNGILELVRGWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEQFGAQ	27618	4486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_4630_6002_6076_8023_8126_8667_8724_18688_18749_20000_20086_23457_23510_27485
860021	contig_15185_pilon	-	415	3	Intergenic	novelGene_99410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	344	361	214769	214752	TRUE	10	GTGAGGGCAGTCCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQLYFCCNLCWVGVSVLLHFPYSEAPSRFNDAAVVAEVEVGGGWGHGGRLLRDGHVLQLQQPQLGLHGQQQLEIQPCLLTAHGAAQQGTQPICPQVELPLGGGDEVEVCLLLPMVIAD	215195	214611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_214643_214728_214816_214898
860024	contig_15207_pilon	+	1378	3	Intergenic	novelGene_176370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	4	573	304188	315766	FALSE	75	AAAACTGAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAASKKGSSCEVRETPKHPRQLACGERRLRLKSEMALHGCFSLKYPGNPQLGDLIEVFRPGYQHWALYLGDGYVINIAPLEDGIPGSFTSTKSVFSRKALVKMQLLKEVVGNDTYRINNKYDETYPPLPVEEVMQRSEFVIGQEVAYDVFDNNCEHFVTLLRYGEGISEQVSFSLGDIRCFLPWQRENY	304184	316571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_304290_310996_311136_315437
860026	contig_8110_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_158619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTGGAGCTGAATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239670	240113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_239834_239979
860028	contig_9389_pilon	+	486	2	Intergenic	novelGene_84100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	633	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	335	424	1391915	1392004	FALSE	5	CCTCCTCTGTTCTCTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRLALRDLCLPRALARPRSPFTSARTEPQESLAGSAAPSFLGTSGPLREVDPAPAGGVGAGLVLRRVLPRGVSLLEVRVSRVAAARGETTRWDSWDSDCQKSHPWQTSEQDMELQSPAVPKHHSPTPRQNPCLKDWGFPS	1390212	1392066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1391853
860031	contig_2069_pilon	-	1082	4	Intergenic	novelGene_23364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.3553390593274	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	27	374	979042	971562	FALSE	10	CTAACCTGTGTCCCGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPRTREVMINGQMVKLKYCFTCKMFRPPRTSHCSVCDNCIKGSWSSKRGGEASVNPYSHKSVITNCCAVLCGPLPPSLIDRRGFVQSDTVLPSPIRSDEPACGAKPDASMDTCQDFAISCTA	979068	970853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_971601_973947_974048_974876_974990_978946
860034	contig_8520_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_85454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAAAGACTTTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275424	274524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_274500_275400
860035	contig_709_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_57569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGACTTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2122331	2121988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2122000_2122300
860036	contig_17470_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_110495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGAATGGGGATTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207140	208717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_207100_208700
860037	contig_19878_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_177929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAATAAAAGTAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4725	4500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19878_pilon_-_4500_4700
860039	contig_5499_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_57016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTCAAGGGGGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807340	806964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_807000_807300
860042	contig_15551_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_176332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGAAGGTCTCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140511	139947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15551_pilon_-_139900_140500
860043	contig_19990_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_30747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	351	512	13307	13468	NA	30	TTCCCAGCAGTTGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVCLSVSLYPLLSQLPPVSLSVSSARSTSRPPSRTLAQWLPVSIALSVSSAGPFSLDQARAAASVCLSSSGQGAAVSPAGPQTGHHLSRLAEGLTPPVFSGPDVTEDCHLTAAFLMSGLGEQGEVLGDPSERLTCQTWPCNCLAAKTGHSISACHLWPVGVIQLAAWG	12956	14158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_13000_14200
860046	contig_13800_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_153716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTGGTTTACAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97940	98384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_97900_98400
860047	contig_91_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_127132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAATGGGAGTAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920982	921688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_921000_921700
860048	contig_6740_pilon	+	903	3	Intergenic	novelGene_142737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	124	327	762606	773186	TRUE	35	TCAAAAACCAGTGCCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRRRLGEDKAGGGPGDYSSLALGPGLRGWLVLQCPGGAWLMRDLAAWLLDQRLAPGPAPRESQERLGLAGDPWALSRSEVRLFSSHLFTNAGIPSVHGSRRLEITHR	762482	815285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_762785_773161_773330_814852
860049	contig_11855_pilon	+	1311	3	Intergenic	novelGene_67079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	527	934	2172922	2174001	TRUE	50	AGAAGAAAGAGCTACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGWLQHQSSECGDRVGALVGSHGGCGRGLAAQALNNVGSLDAAQGSQESVERCAVLGSPAGKQGTDRAGLMGEGVYVLGLVAQLARQVPPGIPCRAVEQLLHLLSLGWGQAAVEASITLEGLACGRLRVGLLVM	2172395	2175570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2173287_2173958_2174129_2175320
860050	contig_14516_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_153918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTTTATTTATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226048	226647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_226000_226600
860051	contig_14745_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_147848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATCAGCATGCTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48753	48228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_-_48200_48800
860053	contig_13460_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_162180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAACCAGTTGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151135	150666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_150700_151100
860054	contig_2463_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_42998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACTCTCACCAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30228	29818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_29800_30200
860055	contig_4429_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_50820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTTTTAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209947	210912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_209900_210900
860056	contig_17171_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_147389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTTGAAGCTGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351035	351531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_351000_351500
860057	contig_9646_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_117440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGAAAGAGGAAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192170	193017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_192200_193000
860058	contig_11590_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_125559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31895	34204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_32032_33758
860060	contig_10197_pilon	-	931	8	Intergenic	novelGene_115312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	145	336	1514489	1513448	TRUE	50	GGAAGACAGAAGAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSRSERRHLLVSATAIFTTRGWRGARGPFLHLPQGRRAQSLAGPLLPMVHCPRPQGAAGVEVHGVGLLPGNVPQGHSCLIGCQQRLGEGCAPVNREPWTCHLHPHIHLRK	1514786	1510626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1510786_1510937_1511064_1512606_1512683_1513094_1513246_1513364_1513468_1514000_1514078_1514394_1514536_1514688
860061	contig_7895_pilon	-	672	4	Intergenic	novelGene_154440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	108.009258862377	9	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	163	543	626028	623938	FALSE	20	TTAAATGGTTTCATTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNVTATGAGPAHALYFACYEKLKKTLSDVIHPGGNSHIANGAAGCVATLLHDAAMNPAEVVKQRMQMYNSPYHRVTDCVRAVWQNEGAGAFYRSYTTQLTMNVPFQAIHFMTYEFLQEHFNPQRRQHCYALPLQHILCLLACTGLEWSWKKGTGLSPGCWCFGSHQFLPTFIAATFPSRP	627311	623808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_624107_624457_624654_626012_626070_627190
860062	contig_13865_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_122742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCACTCCCCAGCTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32831	33234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_32800_33200
860064	contig_1594_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_138848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCCAGCACATAGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716817	716538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_716500_716800
860067	contig_710_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_162949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACCCTATTAGCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351379	351958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_351400_352000
860068	contig_12427_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_40438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATCCTGGTGATGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264068	263753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_263800_264100
860071	contig_5317_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_76571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141999	142792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_142000_142800
860072	contig_8420_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_69363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTGACATATTGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168432	168852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_168400_168900
860074	contig_20344_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_134726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAATAAAGAATGATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15376	16345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20344_pilon_+_15400_16300
860075	contig_14536_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_69312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGTCGATATAGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220085	219378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_219400_220100
860077	contig_16836_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_177790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCAGTTAAAAAGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1528	1211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_1200_1500
860078	contig_8320_pilon	+	655	2	Intergenic	novelGene_152278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGGAGTCAAAACAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623463	644674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_+_624053_644608
860079	contig_8320_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_152279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAATTTCATTTGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658211	658660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_+_658200_658700
860081	scaffold_8345_pilon	+	495	6	Intergenic	novelGene_107006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	107.786084445071	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGAAAAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570416	602696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_580076_580125_583891_583932_591070_591123_602191_602322_602559
860082	contig_16310_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_70100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAGAAAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334575	335441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_334600_335400
860083	contig_6217_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_109639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTTATTCTTCTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595473	594896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_594900_595500
860084	contig_13740_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_34784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGTAACCTTAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846935	847260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_846900_847300
860085	contig_5317_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_76568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATATAAATAATCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128026	127350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_127400_128000
860087	contig_11631_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_104169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAAAAAAACTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34460	34220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_34200_34500
860088	contig_2854_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_120808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAGTCTCATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71514	70556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_70600_71500
860090	contig_10951_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_61618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAATTCCTGAATGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114192	113450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_113400_114200
860092	contig_10855_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_124377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGGAACAGGCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773991	773472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_773500_774000
860093	contig_17178_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_176340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGATGGTGGTAGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108634	109951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17178_pilon_+_108600_110000
860094	contig_7201_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_152506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	960	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	161	469	229608	224171	FALSE	50	GAAGAAAGGGAACAGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVRNTLIQVTLGCFFQQRILGGFTA	229768	224072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_224396_229524
860095	contig_10951_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_61623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAATCCTTCCACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138802	139664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_138800_139700
860096	contig_12142_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_147787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGGGGTGGGGAGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13536	12324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_12300_13500
860098	contig_1062_pilon	+	1453	1	Intergenic	novelGene_171380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGGAGCTTACATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120238	121691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1062_pilon_+_120200_121700
860099	contig_6634_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_171128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26428	27141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_26400_27100
860103	contig_7887_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_124954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATACAATTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876271	876619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_876300_876600
860104	contig_9415_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_109811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAAGAAAGGCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772751	1771721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1771700_1772800
860106	contig_8310_pilon	-	822	3	Intergenic	novelGene_75544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTATTTGCCATGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191732	176342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_176744_177787_177960_191483
860107	contig_18488_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_177930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTCTCAGTAGCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162098	161786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18488_pilon_-_161800_162100
860108	contig_19647_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_144017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGTTGGTAAGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96282	96808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_96300_96800
860109	contig_8200_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_169832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTAATAAAGCAATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458504	459350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8200_pilon_+_458500_459400
860110	contig_9436_pilon	-	574	3	Intergenic	novelGene_60935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAAGGCAGACGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470513	465344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_465362_469147_469341_470149
860111	contig_11681_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_102987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAATAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207693	208197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_207700_208200
860112	contig_3602_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_60583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCCATGTCCAGACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659771	658392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_658400_659800
860113	contig_990_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_76011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATGGATTGCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376468	377123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_376500_377100
860114	contig_614_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_132654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAATCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071011	1070183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1070200_1071000
860116	contig_5954_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_28569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACACTCTGTTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863059	862835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_862800_863100
860117	contig_3627_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_78553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTCTTAAATTATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704713	705410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_704700_705400
860118	contig_9852_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_138473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAACTCAATGGCAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323525	324632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_323500_324600
860119	contig_12107_pilon	-	671	3	Intergenic	novelGene_176739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAACTTCTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64082	53487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12107_pilon_-_53937_58854_58951_63956
860121	contig_3942_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_128855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATAACCTGGCACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1436967	1437314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1437000_1437300
860122	contig_6277_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_80397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACTTACTCAGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209656	210395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_209700_210400
860123	contig_8954_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_130281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	639	977	137242	137580	NA	35	CTCAGCTATATTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQAWVFHFSLNTTPAPLPFLHLTPQTNSPFTSKADTMQPSRVLPLRTGVLVPFFHILCARGHVSSAFVGIKASAVEIIFSLGYDPPNLPQHNLLALNSALVSGSWSFLFVYN	136603	137580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_136600_137600
860124	contig_7234_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_145918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTTTTAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277833	276887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_276900_277800
860125	contig_11677_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_85911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAATGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529529	530122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_529500_530100
860126	contig_8006_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_173935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCACCCTCACAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468015	467321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_467300_468000
860127	contig_7912_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_129560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACTGGAGTTGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48557	49253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_48600_49300
860129	contig_10951_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_61636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTCAAGATGCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232868	232518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_232500_232900
860130	contig_2062_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_139055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	1324934	1324056	FALSE	40	TAAGAGGGTCCTTAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPQCVEEDKPVGPRGTSFSLGKKKKTRGGEVRSSRWAARAAGRRRASCRDKGFRNAVLPGEAAHSPLAAPQQPESCARQLCIGAVVTVGWPAGEGSWDPFREASQTWSKDDQIWSV	1324934	1323836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1324317_1324841
860131	contig_13607_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_170196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGCCTCTGGGACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291108	292024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_291100_292000
860132	contig_1337_pilon	+	806	1	Intergenic	novelGene_84268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGCAAGCAGTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649226	650032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_649200_650000
860133	contig_6375_pilon	+	416	3	Intergenic	novelGene_72974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_2	118	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCACTGTTCTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241657	244542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241699_241806_242009_244369
860134	contig_9424_pilon	+	772	5	Intergenic	novelGene_143768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCTCTCCAGCACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38067	45884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_38464_40635_40699_42684_42791_45015_45099_45760
860135	contig_10446_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_162492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAGAAATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823365	822783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_822800_823400
860136	contig_1948_pilon	-	589	2	Intergenic	novelGene_31138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATGGCTTCTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96545	90655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_91177_96477
860137	contig_6287_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_160427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCTGGAAAAAAAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149685	148704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_-_148700_149700
860138	contig_3449_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_73698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288798	289162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_288800_289200
860139	contig_1996_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_131868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACCACGCCCCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87752	87480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_87500_87800
860140	contig_8972_pilon	+	932	7	Intergenic	novelGene_167621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_6	7.38805341976717	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	92	757	225867	233910	FALSE	10	CCGTGGTGTCAGGGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKFWELDTDHDLLIDPDDLARHNDHAISRKMVDRIFSGAVTRGKKVQKEGKISYADFVWFLISEEDKKNPTSIEYWFRCMDLDGDGVLSMYELEYFYEEQCRRLDNMAIEALPFQDCLCQMLDLVQPQQEGKITLHDLKKCKLANVFFDTFFNIEKYLDQEQREQLSLLRESESDGPELSAWEKYAAEEYDILVAEEAAGDPWNDGYEPELSPVDPKLRLQLDARPFLEASSALGAVDLYEYEGEDGPQLL	221855	234085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_221933_225852_225902_226264_226355_227123_227300_228012_228132_228387_228495_233771
860141	contig_12735_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_140778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGAGGAACAATCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175975	176261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_+_176000_176300
860142	contig_8773_pilon	-	834	1	Intergenic	novelGene_74533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCTAGTTCTTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78958	78124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_78100_79000
860143	contig_5280_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_52647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234453	234086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_234100_234500
860144	contig_10446_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_162462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATATGGAAATAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545910	547310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_545900_547300
860145	contig_10811_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_165816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGATTGAGAACGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459755	460695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_459800_460700
860147	contig_7347_pilon	-	1017	6	Intergenic	novelGene_172500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.93963561409139	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	23	754	262821	254905	FALSE	25	TGTGTGGATCCTGTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSLAAPMASPGSGFWSFVSENGSADPENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYRDAEKPAESDGSEPWRVAARKAVCACEQKPCSCPNADVDFALLHATDLLPACEGERPTLAFLQDVMDILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMNCRTTLKYAIKTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPGI	262843	254641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_255026_255568_255660_260415_260650_261609_261760_261952_262013_262745
860148	contig_9333_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_120347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581042	580329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_580300_581000
860149	contig_6589_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_25750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGAGCTCATTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525967	525160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_525200_526000
860153	contig_10456_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_163456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTCACTCTCGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14541	15197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_14500_15200
860154	contig_9435_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_156956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATAGCTAACTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273733	274420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_273700_274400
860155	contig_12758_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_177795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAAATCTTTTGTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121962	122693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12758_pilon_+_122000_122700
860157	contig_13542_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_131550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGCGACTTTGGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607460	606797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_606800_607500
860158	contig_5041_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_27014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACGAAAAAAGAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214375	214682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_214400_214700
860159	contig_10446_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_162467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACATTTGATTTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637017	637670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_637000_637700
860160	contig_7070_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_104045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAGAAAAAATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124993	125744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_125000_125700
860161	contig_7234_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_145954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCAAAGTCCTTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509704	509137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_509100_509700
860162	contig_18145_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_37369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTTAGAAAAGAAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102105	101741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_101700_102100
860163	contig_6842_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_130764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323830	1323351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1323400_1323800
860168	contig_567_pilon	+	400	5	Intergenic	novelGene_33992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	280.094961575534	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	442621	458710	FALSE	0	TCTTTTCTGCTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVSCFSFPLHLSLAQNTAGVSVGQQRVWALEKVNSSIKFNCFVIHLMTYPRVT	442620	458732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_452646_455775_455847_458626
860169	contig_4151_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_65279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAATTTTAAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651248	650160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_650200_651200
860170	contig_7571_pilon	-	364	4	Intergenic	novelGene_106388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	5.79271573232759	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCAAGTAGTATTTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67974	55017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_55161_58066_58108_66849_66969_67913
860171	contig_11978_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_62975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCACTTCTTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470877	1471122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1470900_1471100
860173	contig_16883_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_161737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGAGTCCCCTCGCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296608	297037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_296600_297000
860175	contig_6325_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_143361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAACAGGCACCAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407181	406572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_406600_407200
860177	contig_4732_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_75364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138380	137536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_137500_138400
860179	contig_14123_pilon	-	962	3	Intergenic	novelGene_177130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTTTTGATTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223990	195596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14123_pilon_-_196108_197045_197157_223650
860181	contig_9199_pilon	-	414	3	Intergenic	novelGene_65642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	185.5	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	220	387	142798	142389	FALSE	20	TTAAGGCAGTCCCCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGLSLGDAALQNLEQLLDGPGAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRKTASPSGSLLRSYELAGGDLAGLLDALSDMGLEEGVRLLRGPEPQDCPPSSPLPGYPLYSIPTCSNSYLTPHTHPSVGANKGFS	143146	142361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_142506_142747_142844_142972
860183	contig_4461_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_177925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATAAAGACTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90596	91050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4461_pilon_+_90600_91000
860186	contig_13447_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_176316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	2	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAGAAATGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33594	36172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13447_pilon_+_33657_35427_35581_36034
860187	contig_5039_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_64834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCGGCCAGTGAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290581	291479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_290600_291500
860188	contig_6726_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_86247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341816	341113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_341100_341800
860189	contig_10093_pilon	+	1021	1	Intergenic	novelGene_147515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGATTAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130574	131595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_130600_131600
860190	contig_5429_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_127774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAAAACAAAAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105107	105589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_105100_105600
860191	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
860192	contig_12173_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_172963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167896	167351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_-_167400_167900
860197	contig_9616_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_177311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16402	16824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9616_pilon_+_16400_16800
860200	contig_7457_pilon	+	417	2	Intergenic	novelGene_31376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTCCTGTGGGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402242	408204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_402326_407870
860202	contig_2380_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_117908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533288	533591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_533300_533600
860203	contig_6589_pilon	+	686	6	Intergenic	novelGene_25994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.62480768092719	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	317	427	1391587	1391697	TRUE	30	TTATTTAAAGATCTTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVEPLGLERDVSRAVELLERLQRSGELPPQKLQALQRVLQSRFCSAIREVYEQLYDTLDITGSAEIRAHATAKATVAAFTASEGHAHPRVVELPKTDEGLGFNIMGGQGAELTHLHFPCHPPGVWLTATEASSVGTSCCQ	1389564	1393437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1389597_1389969_1390089_1390367_1390440_1391493_1391706_1392865_1393030_1393350
860204	contig_12970_pilon	+	990	2	Intergenic	novelGene_50546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAATTAGTGAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561284	566117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_561501_565343
860205	contig_16525_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_133836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGATTTCGAAAGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160330	159879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_159900_160300
860206	contig_6674_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_147988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTACCATGAGCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80368	79473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_79500_80400
860207	contig_5145_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_131414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809916	810621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_809900_810600
860210	contig_7720_pilon	-	315	2	Intergenic	novelGene_155771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTAGAAACCAAACTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707476	705016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_705129_707273
860212	contig_10196_pilon	+	484	3	Intergenic	novelGene_132210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	1	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	270	215	484	1275051	1275591	FALSE	10	CTGCAGTCGCTGGACTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFSKALELAFTTQQFTALQLIAEDLNEKSDPALLARCSDFFTEHSQYEKAVELLLAAKKYREALQLCLEQNMALTEEMAERLTVPKDSTDLSEGARRELLEQIANCCMRQGSYHLATKKYTQAGNKLKAMRALLKSGDTEKIVFFAAVSRQKEIYVLAANY	1274487	1275591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1274666_1275014_1275222_1275492
860213	contig_12644_pilon	-	959	3	Intergenic	novelGene_44525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAACAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1351735	1347491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1348090_1350021_1350283_1351635
860215	contig_7378_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_120266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGGCTGTCCAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476939	477668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_476900_477700
860218	contig_19012_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_159493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTTTATTGTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98281	97788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_97800_98300
860219	contig_6202_pilon	+	746	2	Intergenic	novelGene_139829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	97	414	489922	490539	FALSE	70	AGAAAAAATAACAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECSDVIWQRGLLRKGYGICHGTAGNGYSFLSLYHLTWDKKYLYRACKFAEWCLDYGAHGCRIPDRPYSLFEGKREGKTIDSNIPVHEIDPSVSVWTSIIKFDRS	489825	490871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_490066_490365
860220	contig_8285_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_174977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCAAAAAAAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252796	254107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_+_252800_254100
860222	contig_11846_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_105915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGAAGGCCTCCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147839	147596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_147600_147800
860223	contig_19243_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_177407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGAAGAAACAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64522	65119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19243_pilon_+_64500_65100
860226	contig_5084_pilon	-	714	4	Intergenic	novelGene_64599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	7.71722460186015	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	167	385	977378	976973	FALSE	15	ATTCCTTGGACCCGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLQDYRLPDSDDDEDEETAIQRVLQQLTEEAALEEASGFNIPAEPAPRPRAQPHMTEPEAAAPRPEAEAEEELPWCCICNEDAALRCAGCDGDLYCARCFREGHDAFELKEHQTYVYRPPQAGREH	977839	976643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_977052_977135_977261_977363_977463_977757
860227	contig_9181_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_177103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686637	686203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_-_686200_686600
860229	contig_11629_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_161194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTTTTTTTAAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222829	222290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_222300_222800
860230	contig_10196_pilon	+	812	3	Intergenic	novelGene_132274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAACAAAAAATACACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2069703	2073017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2069885_2072080_2072213_2072518
860234	contig_7410_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_106049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATAATATAAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58980	58113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_58100_59000
860235	contig_9848_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_79929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAAAAATGTAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73321	74123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_73300_74100
860238	contig_7702_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_177298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTGCACAGCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309060	309869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_+_309100_309900
860242	contig_5201_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_82190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	89	388	384572	384871	NA	55	AAAAATCAAAATCTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTYMHNQKDAVQVPSETLKANMVPEKVPRRCATVAANKIKIMSNVKETISGPENVWIRKSSRKLPHRNASAAAKKRLLNVYKEDDTSVNSESENARRY	384483	385313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_384500_385300
860244	contig_9180_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_109125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498231	496502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_496923_498077
860245	contig_11552_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_171669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCACCTAAGAAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126721	127775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_126700_127800
860246	contig_5039_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_64863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTCTGTGTACATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360481	361094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_360500_361100
860247	contig_13456_pilon	+	669	3	Intergenic	novelGene_153320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	53	364	634237	640368	FALSE	30	TAAGCTGTCTATACTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLHQNLRPVNLAVSGMFRRITAAATRLLTSDSSDGSFYALEGLNSHVRAMIPTHPSLVLLWCQLLLLANYTDYRWWAEVQQTPKCSPPALGPACSGRPVPF	634184	640673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_634286_638087_638296_640313
860248	contig_4180_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_8429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTTAAGATTTTGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149640	1150555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1149600_1150600
860249	contig_16884_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_161822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACTGTTAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63943	64822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_63900_64800
860250	contig_4156_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_88130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGCAGATAAAACAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572182	571403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_571400_572200
860251	contig_10042_pilon	-	924	8	Intergenic	novelGene_79155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	97.0293454453395	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	365	916	654897	651768	FALSE	30	TAAACTCTGGGCAATTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNAFQQVIARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE	667983	651759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_651813_652485_652648_653565_653734_654318_654447_654848_654941_664497_664656_665058_665180_667941
860253	contig_10765_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_122993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGGAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639704	639986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_639700_640000
860255	contig_5954_pilon	+	443	3	Intergenic	novelGene_28473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAAGCCGTCTACTTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187241	188785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_187301_187603_187752_188549
860256	contig_6823_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_131245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAAAGTAAACCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441058	439953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_440000_441100
860257	contig_5050_pilon	+	482	2	Intergenic	novelGene_110256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	32	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCACCTGCTCCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278341	279112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_278496_278784
860258	contig_2438_pilon	+	897	5	Intergenic	novelGene_111985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	126.13583947475	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	86	394	111473	112209	TRUE	45	ATAAACTGGTTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPGRLVAQLDTEGVGSLGPGYEGRHIAMEKVASRTYRLRLEAARPGDAGTYRCLAKAYVRGSGARLREAASARSRPLPVHVREEGVVLEAVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGPPGLRLAANWAPG	111387	113237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_111645_111905_112030_112196_112320_112658_112790_112975
860259	contig_10074_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_57088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGCTGAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109410	108477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_108500_109400
860261	contig_1154_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_87082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAGAACAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330568	329760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_329800_330600
860263	scaffold_19766_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_34449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCGCTTTGTGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859368	860710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_859400_860700
860265	contig_10064_pilon	+	319	3	Intergenic	novelGene_122725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138.5	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	395836	404709	FALSE	15	TTCAGAGGGTGCCAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPERRAAGSARVGGRPGAPESPPSLKQTPPPLCSNLRPTEDPQHQHGLLHRERLLQTGRRHSRHPCPCWSRPRRAPGAVARRFLISACACDRAGLECEQ	395833	404726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403014_404604
860268	contig_17198_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_62377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAACATACAGAATATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914510	915281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_914500_915300
860269	contig_10323_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_123628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTTCTGATGTCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494009	493519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_493500_494000
860271	contig_4736_pilon	+	775	4	Intergenic	novelGene_168627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_3	19.7540431867054	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	49	651	248143	257609	FALSE	15	GATTGTTGGGCAGGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGVFCAGSVCLISDSTMYHNSSQKRHWTFASEEHLASLRADANRKFKCKAVANGKILPNDPVFLETHEEMIICKYYEKRLLEFCSVFKPAMPRSVVGTACMYFKRFYLNNSVMEYHPRIIMLTCAFLACKVDEFNVSSPQFVGNLRESPLGQEKALEQILEYELLLIQQLNFHLIVHNPYRPFEGFLIDLKVNLLIQPVECTPLLLFFNQKNPNFY	248094	257733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_248260_250224_250348_256168_256243_257320
860273	contig_18919_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_156040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGGAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161203	160629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_160600_161200
860274	contig_3111_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_129976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATAAGCACATGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95942	97251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_95900_97300
860275	contig_3825_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_78030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATCTTTAAAATCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1912498	1912205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1912200_1912500
860276	contig_1948_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_31142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACGTTTTCAATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110993	111470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_111000_111500
860280	contig_10658_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_130069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTCGCTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159853	160686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_159900_160700
860282	contig_10636_pilon	-	858	2	Intergenic	novelGene_172275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAGAAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117995	72779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_-_73570_117927
860283	contig_8651_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_168182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	2	9	304	312	184821	184813	NA	15	CCCTGGACTCGGGAATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSALEASRRRIRGRGKEKVGGADLCNYCRVTAGSANGAAAGESRLRPSGGGPSYCPSSPARRSWSAVLWCRCLLPDPDPALEAVVVGIAAGEIEAQSLPEMA	185124	184715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_184700_185100
860284	contig_3942_pilon	-	469	4	Intergenic	novelGene_128617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	138.266248793968	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	76	468	157401	142083	FALSE	20	GGCAGGGTGGGCACAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWDFPPATARLRNQPGSALARQAAFMAPPSEETPLISQRSCSLSSSEAGALHVLLPPRGPGPPQRLSFSFGDHSAEELCVRAAKASGILPVYHSLFALATEDLSCWFPPSHVFSVEDAGTQVLVYRLRLNSSSPALILALEVFVSSSFSPNLGAP	160716	142081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_142168_156420_156545_157217_157415_160654
860285	contig_2033_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_71543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAACAGTAACATTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155142	155397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_155100_155400
860286	contig_2033_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_71542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGGGAAAAATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145674	145957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_145700_146000
860287	contig_9482_pilon	-	862	6	Intergenic	novelGene_44253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCAGCCGCGGCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649636	630009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_630060_631412_631543_632576_632768_633276_633424_637162_637337_649466
860288	contig_9406_pilon	-	696	2	Intergenic	novelGene_136160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1344	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	44795	43809	FALSE	35	ACATGCCATGAAAGGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLPSRARRFQRRPSPNSSGILPKESKFPRTVCQLNRDLHGLVTAPKPTKTTKTLIADGQPVTSLSLDCETRHHLSRLTLCRSCRFGLLTPTSPTVLIFLLNS	44796	43425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_44063_44737
860289	contig_17976_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_32461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCGTGAACATTGGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11801	12175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_11800_12200
860292	contig_3602_pilon	+	262	3	Intergenic	novelGene_60597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	3	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCCCAGCACAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824215	828864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_824381_828656_828704_828814
860293	contig_2854_pilon	+	1015	1	Intergenic	novelGene_120819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137747	138762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_137700_138800
860294	contig_3529_pilon	+	471	3	Intergenic	novelGene_105377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	72	470	745173	748055	FALSE	15	ATCGCTCCAGGTGAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMDEKVKESFVLDTASAICNYDAHYKDYPKYWCRGYFRDYCNIIAFTPNSTGRVALRDTGNQLIVTVSCLTKEDTGWYWCGIQRDFARDDMDFTELVVTDNRGALTDDFSSEKDLLGNKNRSCRASKVVQKA	744564	748056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_744631_745167_745516_747999
860295	contig_10104_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_160151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCCTTAGCCCCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588079	588518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_588100_588500
860296	contig_17103_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_176950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAAAAAAACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164724	164037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17103_pilon_-_164000_164700
860299	contig_4388_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_161974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATACATTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817499	816274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_816300_817500
860300	contig_15508_pilon	+	831	5	Intergenic	novelGene_177652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	46.357307945997	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	696	136	831	102436	110051	FALSE	45	TGCCACTATGCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGGNTAAPAPGDAEDLEATRLSSEEAGDSGGVHKDPPDPGDGDLEETGSKAKDLLPSLLSSLPQPEAPSGTCGLWGPTAPGSSPKGGPENGPGGQGGDPSDEDWRNQRKHVFVLSEAGKPIYSRYGSVEALSATMGVMTALVSFVQSAGDAIRAIYAEDHKLVFLQQGPLLLVAVSRTPQSAAQLRGELLAVHAQIVSTLTHAVCQLATKERQIMKRDANRARLLSTNYG	101879	110051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15508_pilon_+_102005_102425_102584_103437_103768_104357_104490_109965
860302	contig_7080_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_100108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGATTGGGGCGCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491843	492309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_491800_492300
860303	contig_10319_pilon	+	936	1	Intergenic	novelGene_147248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCATTTTCTCCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128936	129872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_128900_129900
860306	contig_5954_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_28466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	237	392	163648	163493	NA	30	CATGGCCAATAGCTAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLFRLLRTLSYLASCAVHGHVAHARRGALARLARALSTPKGQTLPLDFLVHLLALDGPKEARDLCQAHGLPLDGEEGVMFLRGLYREEGLPHAGTCNLLVDSKLRGRTLEEVVMAEEEDEVVDRPESQA	163884	163394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_163400_163900
860307	contig_10054_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_171217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	108	782	156917	156243	NA	60	GCGAGAAGAGAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLSPVVLAAYAQNRSLSGLLPASGSLLCQAFAFFMSFFGLASMLQLLAMALQCWLSLGHPFFYRRHITLRRGVLVAPVVGAFCLAFCALPFAGFGEFVQYCPGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYASLMALLVLATVLCNLSAMRNLYAMHRRLPRRPRCGTRGCPEPGAGEREASPQPLEELDHLLLLALMTGLFTMCSLPLIVSRLAPRLRGFGGLRPRAPGGKDGACLDRAQEELRGGRENLLLRSADQFLPQS	157024	156223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_156200_157000
860310	contig_4678_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_126073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTACAGATTCTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726132	725141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_725100_726100
860311	contig_6556_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_168489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACTCCAAATTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305040	309335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_305128_308889
860312	contig_2161_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_114960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGATTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013533	1014212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1013500_1014200
860313	contig_4305_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_136715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAAAACGTGTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809135	808018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_808000_809100
860315	contig_6902_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_135605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTAAAGATAACCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501925	502458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_501900_502500
860316	contig_12802_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_114239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGTCTCTCTCGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37332	38044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_37300_38000
860319	contig_5324_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_102050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88719	88358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_88400_88700
860320	contig_15732_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_88868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAAAGTTTTCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106854	105994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_106000_106900
860321	contig_12031_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_137556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	299	691	178990	179382	NA	15	ATCACACGCTCCCGCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVHLPKTYLGRRWVWKEEQCEEQRACRDLAGRCGLLHTRVTHRDVARNAHMGAVRSLLQLHCYNPHLPPSLHTLLSPKEKVQSCGLEAPAASEQHLWIEFLRRNSECVLASLWLCLKCGLGRGRPTHP	178691	179503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_178700_179500
860323	contig_1781_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_168567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTAGTTATCGGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144370	143750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1781_pilon_-_143800_144400
860325	contig_5954_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_28719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965737	966509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_965700_966500
860326	contig_8673_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_129944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTGTCTCCAGTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565392	564634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_564600_565400
860327	contig_9895_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_144676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTTCCTTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14390	13618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_13600_14400
860328	contig_7230_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_52535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTCCTCCAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97982	97665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_97700_98000
860329	contig_14326_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_120671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTACAGAAAGTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82699	83451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_82700_83500
860330	contig_5039_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_65014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATATGTAACACTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735047	1734725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1734700_1735000
860331	contig_7157_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_131262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAGATTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33489	34195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_33500_34200
860332	contig_7095_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_166461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCAGTGGAAGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476178	475736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_475700_476200
860335	contig_11416_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_145373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	80	490	649932	650342	NA	15	CCCGTACTCCCGTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKAPKTKPSLQSKLSKKRESPFLIHMKVSPLKTRKKVSWQRLGLPAGWRRPLQEPSRACWSRRNTPAVSLLPGPPPNEGREVGSSAEGRHTRSPKTEFVHVYGTPHPDNALLRTKQKREGPCNHHVLKCPPKMRPEKCLAPPNSCKQGRHSDSPPDSEFTI	649852	650402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_649900_650400
860336	contig_10013_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_125065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGCGCTTTACTAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353789	353322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_353300_353800
860337	contig_934_pilon	-	592	6	Intergenic	novelGene_129012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	89.0002247188174	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGTTCCAATAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57711	49314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_49429_49542_49645_52243_52327_54241_54354_55210_55270_57589
860338	contig_4151_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_65216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411288	410914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_410900_411300
860340	contig_12761_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_164060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGACGCTAGAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276768	277841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_276800_277800
860342	contig_3948_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_53162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161555	162006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_161600_162000
860345	contig_3602_pilon	+	468	6	Intergenic	novelGene_60596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	31.8245188494657	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	130	432	816942	830439	FALSE	25	ATGACATTCCCCTAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWTRRPTVRSRGRRGVFGTGTHSAASRFCRGGVLGPRPQPASKMAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRLVEKENVAVEVEKSLRPSRRSPGTPRPPGPISGMPTSRFCP	814615	830475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_814674_816870_816945_817095_817201_819184_819287_819477_819532_830400
860346	contig_15244_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_118063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCACAATGGATTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633545	634760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_633500_634800
860348	contig_8420_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_69375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAAGCCAGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305046	304709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_304700_305000
860349	contig_13051_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_140132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392448	391557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_391600_392400
860350	contig_7679_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_173744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAATAAAATAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250564	251701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7679_pilon_+_250600_251700
860351	contig_10446_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_162450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCTTGACCGTTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260807	260464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_260500_260800
860353	contig_7412_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_76270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTAAAATGAAGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231253	230777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_230800_231300
860354	contig_8674_pilon	-	730	3	Intergenic	novelGene_102942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCGTGGTGGCGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527803	525047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_525442_527260_527386_527592
860356	contig_14048_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_146337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATACTACGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578460	577190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_577200_578500
860357	contig_8683_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_150257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599208	598755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_598800_599200
860358	contig_3825_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_77992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATTACATTCTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739374	738688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_738700_739400
860359	contig_3601_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_132936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGCCCTCTCCCTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419896	420433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_419900_420400
860360	contig_1055_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_149725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAGAAAAACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101504	102247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_+_101500_102200
860361	contig_6677_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_114230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAATTAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788175	788454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_788200_788500
860362	contig_10455_pilon	+	1424	4	Intergenic	novelGene_177436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	14.6590889515307	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	126	1424	187408	192989	FALSE	60	GAAAGCGAAGAGAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRWALVCNLCKLKTGACIQCSVKSCITAFHVTCAFEHSLEMKTILDEGDEVKFKSYCLKHSQNKQNPLVEAEHPTHRGAEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVATELGLPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEDSIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLAHSKIQEQIFGLQVQLVNQEIAAGLPLTSALENSLFYPPPRITLKLKMPRSTLEDCKNSSTEPDHGPLSTDSGSPVVNRRSVQVPQESLEMRVKSYPRHPLESKSNCLLTSLSHSRSEAKDSSPAWKTPSPEFYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKIQPNSRLAKSNGLEDSLSGEVTQKDSSSEMSCGQESMLSSHLASQGSFRKSTVEHFGRSFKEATNRWVRTTEDLQCCVKPTKINPKEQLWGKQLLRRSAGKAPYQENDGYCPDLELSDSEA	172612	192989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10455_pilon_+_172675_187344_187819_190027_190146_192219
860363	contig_9216_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_163521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAATATATATCTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715313	715926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_715300_715900
860364	contig_5669_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_86097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCATGATAGCCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276967	277306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_277000_277300
860367	contig_4654_pilon	-	656	5	Intergenic	novelGene_103045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	551.266949852791	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	6	656	416075	385746	FALSE	55	TTTGAACAAAAAGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAKRNTVIGTPFWMAPEVIQEIGYNCVADIWSLGITAIEMAEGKPPYADIAIFMIPTNPPPTFRKPELWSDNFMDFVKQCLVKSPDQRATATQLLQHPFVKSAKGVSILRDLINEAMDVKLKRQEAQQREGDQDDEENSEEDEMDSGTMVRTVGDDMGTVRAASTVSDGANTMIEHDDTLPSQLGTMVINAEDDEEEGTMKRRDETMQPAKPSFLEY	416080	385745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_385793_408273_408461_409127_409257_414183_414322_415925
860368	contig_11846_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_105909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42082	41449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_41400_42100
860369	contig_13558_pilon	+	714	2	Intergenic	novelGene_123031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGGTTTTCAATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526805	533470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_526875_532825
860371	contig_18272_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_7016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGAAGAAAGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181518	182746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_181591_182256
860372	contig_11413_pilon	-	604	2	Intergenic	novelGene_103121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTGTCTCCTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107519	86405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_86797_107306
860373	contig_7806_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_157537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCTATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229145	228528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_228500_229100
860374	contig_4782_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_73658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTCCAAGGGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554976	529093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_529371_554670
860376	contig_12970_pilon	+	487	2	Intergenic	novelGene_50548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATAAGTGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568128	610700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_568245_610329
860377	contig_16768_pilon	+	658	6	Intergenic	novelGene_168323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	360.015777432045	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	361	480	68149	68662	TRUE	35	AATACCTTAATTACCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDLPNAAQAQKEEQLKIDEAEPLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKTVQSTFSSAENIIWY	63701	69361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_63759_64111_64235_64963_65097_68101_68221_68614_68823_69343
860378	contig_14243_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_57422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGATTACCGGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551549	551061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_551100_551500
860383	contig_10196_pilon	+	1233	8	Intergenic	novelGene_132251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	2.43276948084663	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	140	1090	1813242	1853021	FALSE	20	CCACCCGCCCAACACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWESQLLETGFLGIFLCPLWTLSRLPRRTPTSRIVVWGFRWLILRIMLGAGLIKIRGDRCWWDLTCMDYHYETQPVPNPAAYYLHRSPWWIHRAETLGNHIVELLVPFFLLLGRRMCILHGILQVLFQVVLIISGNLSFLNWLTIVPSLACFDDNALGFLFPSRPGGLRDCVLHLQEEEARGAGPVQTRGCVVRRTVHLALAALIGYLSIPVVLNLLSSQQVMNVSFNPLRIVNTYGAFGSITKERTEIILQGTASPNASAPSAVWEDYEFRCKPGDPRRRPCLISPYHHRLDWLMWFAAFQTYEQHEWIIHLAGKLLANDAWALSLLAHNPFTGRAPPQVGPCRALPLQVQPPRRPARRAG	1813102	1853164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1813254_1830770_1830837_1841587_1841756_1845829_1846014_1846141_1846296_1848123_1848308_1848857_1848972_1852952
860384	contig_3449_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_73716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGGTAAAGAATGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336978	337403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_337000_337400
860388	contig_14405_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_85665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGTTGTCCAAGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734741	733569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_733600_734700
860389	contig_5231_pilon	-	761	5	Intergenic	novelGene_65883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5.44862367942584	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	85	498	158754	125539	TRUE	15	GTGCGTTTCTCCAGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKELPDHYKPWMEIVNKLPHLIESHQLRAHVNKMPLLNCHFLKSYREQRLAHLVLSFITMGYVWQEGETQPEQVLPRNLALPFVDVSRNLGLPPILVHSDLVLTNWTKRNPEGPSQGTWIPLFHFLGEKACVVLYW	158838	123906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_124132_125500_125612_129324_129444_132042_132163_158652
860390	contig_13876_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_174251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTGAGTAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77501	78241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_77500_78200
860391	contig_695_pilon	+	1044	5	Intergenic	novelGene_177169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	36.2861888326674	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	146	1042	85624	100684	FALSE	40	GAAAACAGCTTCCCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGNRDESNIVKSPAVRSKRHKQCICDDCKTDDPPSLSHQEKTRESLSMHQTINAILQDIEEKQERLLAFEIRTPEDAEQYIEKMLQIKEVMDSVLAKQKAERDDLAKKYRVSIESFKHGALREQLANLATRQKSLLVVAKKQRSISLKIQNYKNVTSLSGLSLRKLPSSPEISNEEDSQKLTSLEKSVQPLSGSLSPANLVSGNMQEAQLPLETCVTVENDSQNTSIGQNSETVRREEFSGNKQNSKQNVSDYTLDGLSKSSHLDGTEKIKLPSQPIAFIAQVDYSQKENDFIKTTAKGYESCHPPTVTGALNISEITSVLAQKDAHLSAVICDQALSNYDPKTRN	82537	100686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_82570_85510_85627_91844_91933_97042_97140_99975
860393	contig_4364_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_57	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTGAACTTGGAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655233	656034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_655200_656000
860394	contig_15002_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_162428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCGAATGATAAGTATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16549	17223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15002_pilon_+_16500_17200
860396	contig_10163_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_82663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGAAGATGATGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301616	300642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_300600_301600
860397	contig_4125_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_25188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	67	321	1347596	1347342	NA	60	GAAAAGAAGCCCCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAGRGKQPIPHASPGGPSKPQMWVWGLAERQRTRQLAESGGWARLGHRVLSPRVLPAREGGESESLHLPFKQHQKTLLSSSRESMSSPFNVTAEAQNEDSQDPVC	1347662	1346517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1346500_1347700
860400	contig_5728_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_126684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCATAACTGTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210045	209549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_209500_210000
860401	contig_8571_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_169180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTTACAGTTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447575	448409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_447600_448400
860402	contig_5753_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_174311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTCACCCAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55425	56325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_55400_56300
860404	contig_15273_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_140446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182829	182048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_182000_182800
860406	contig_9038_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_143326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATAATCAAATAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384720	385938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_384700_385900
860407	contig_19469_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_134989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAAACATGAGCAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75670	75965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_75700_76000
860408	contig_12079_pilon	+	379	2	Intergenic	novelGene_67351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	0	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAGAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84722	164269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_84795_163962
860409	contig_12543_pilon	-	641	4	Intergenic	novelGene_168369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.83176086632785	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAGAAAAAAAATCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246682	232283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_232756_241375_241452_244439_244512_246661
860411	contig_9727_pilon	-	462	4	Intergenic	novelGene_86263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.5785207353054	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	6	440	101964	76520	FALSE	15	TCTGTGAGGACACTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAEASGCDSSNRCEENGREGSSPKSLLPGTTISRVKLLDTMVDTFLQKLIAAGSYQRFTDCYKRFYQLQPEMTQRIYDKFITQLQTSIWEEISEIKQEGNLEAILNSLDKIVEEGRDRKEPACQSPLMAPLPASREPPMFSPHP	101969	76497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_76587_80790_80892_81860_81967_101803
860412	contig_14618_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_136863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361193	1360846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1360800_1361200
860416	contig_10019_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_86662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCAAATGTTTGCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187642	188638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_187600_188600
860417	contig_11413_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_103201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630938	630403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_630400_630900
860419	contig_15248_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_149160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGGAGATAGAAAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197074	196687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_196700_197100
860421	contig_348_pilon	+	583	3	Intergenic	novelGene_67626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTTTTGTTGCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373651	387823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_373744_377628_377708_387411
860424	contig_9582_pilon	+	997	2	Intergenic	novelGene_106845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	24	401	445455	445832	TRUE	45	ATCCCACAGCTTTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRYSPKMASPLRGKPSSPRVETTRRKETSTVCVETSSHRMETSSRQVRTSTRQVETSQRRSEGPSIAPSGKLLPHILEVSSQHVETSSQRTETSSRHIRASTRRVETSLHSVESPARRDKPAPRQNVKMAP	445431	449740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_446142_449453
860425	contig_6589_pilon	+	1205	6	Intergenic	novelGene_26194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	0.748331477354788	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	25	630	1955179	1960512	FALSE	30	GGAAGAACTGAACCGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSRCPQNMRGHPSLLLLYLGLTTCLDTSPSGEQDQEVFLDSPKAQNFLSSQSRIPRANHWDLELLTPGNLERECLEERCSWEEAREFFEDDTQTKHFWETYIYNGKGGHGRADIAGLAVGLTSGVLLIVLAGLGAFWCLHYRRGRGQHSCPQEAVIISPLNPPSSLGPPTPLPPPPPPGLPTYEQALEASGVHDAPPPPYTSLRRPPH	1955154	1961087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1955264_1955527_1955704_1955887_1955928_1958213_1958350_1960027_1960175_1960490
860426	contig_8775_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_166825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTCTTTGCCATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96965	95906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_95900_97000
860428	contig_9870_pilon	-	563	4	Intergenic	novelGene_177578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.48528137423857	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	261	563	27131	7673	FALSE	35	CCTTCCAACCAAACGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVITMTVTVITPLTHILYSANHCHRCPEDWFSYSNHCYYISSDIKNWTESRMACVSKKSNLFYMDNEEEMMFMKILSSSSWIGLSRESSNYSWFWINGS	27790	7672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9870_pilon_-_7760_25359_25533_27088_27217_27615
860430	contig_10980_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_162569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTAATAAACTGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338383	338082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_338100_338400
860431	contig_12566_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_85996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41473	40954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_41000_41500
860433	contig_15360_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_171269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGAAAGAAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314862	314506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_314500_314900
860435	contig_9436_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_60890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTTTCAAACAGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348276	348744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_348300_348700
860437	contig_2074_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_155333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGAGAAACTGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141753	141397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2074_pilon_-_141400_141800
860438	contig_498_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_148549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATACAACTTAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430369	430905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_430400_430900
860439	contig_16109_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_80340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTCACACATATTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314670	314130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_314100_314700
860440	contig_13004_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_112640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCATCTTGTACCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274408	273923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_273900_274400
860441	contig_7009_pilon	-	406	1	Intergenic	novelGene_23688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATAGGAAAAGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832815	832409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_832400_832800
860444	contig_18869_pilon	-	671	2	Intergenic	novelGene_55966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	55	618	29176	23445	FALSE	20	CTTTACCAGTCTCACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLSLGQFKGPIQYIIWKEMQSTLSPGLSPLTLDPKTAHPNLVLSKNRTSVWHGDIKQVMPDDPERFDSSVAVLGSKGFTSGKWYWEVEVAKKTKWTVGVVRESIIRKGSCPLTPEQGFWLIRLRNRTDLKALDLPSCSLKLTNNLNKVGIYLDYEGGQVSFYSAKTMTHIYTFSSTFIEKLYPYFCPCLNDGGENKEPLQILHPQ	29230	23391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_23987_29154
860445	contig_8683_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_150252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGGAGGCTCACGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578552	577722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_577700_578600
860447	contig_2867_pilon	+	603	3	Intergenic	novelGene_135269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	2.5	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACTTCGTGACTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534978	1542995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1535237_1541791_1541916_1542774
860448	contig_10196_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_132081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACCGTGTCCTGGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880275	879792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_879800_880300
860449	contig_16532_pilon	+	531	3	Intergenic	novelGene_110072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	21.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTTTTCAGTTCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588952	598234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_589017_592299_592368_597835
860450	contig_4565_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_174702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTGATAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84881	84326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_-_84300_84900
860451	contig_5864_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_162770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTTAAAAAGAAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38067	37078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_37100_38100
860454	contig_13968_pilon	+	826	2	Intergenic	novelGene_106870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTTCCTCTTTGGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41778	70197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_+_42430_70022
860456	contig_6175_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_16322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGAGGGGGGAGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491226	1490757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1490800_1491200
860457	contig_7593_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_127349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACTTTGGTAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640297	640093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_640100_640300
860458	contig_7753_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_41491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACATTATCAGCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079772	1080229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1079800_1080200
860462	contig_1406_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_25510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACTCAAATGAAGGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462991	1464332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1463000_1464300
860464	contig_990_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_76156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATTTGGACTTCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1807933	1807506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1807500_1807900
860465	contig_12842_pilon	-	872	6	Intergenic	novelGene_168341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.72046505340853	4	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	225	650	134323	130990	FALSE	30	AATTTTGAATTCTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVHVVWVNHRAFRLQWCQKCGFHRPPRTYHCPWCNVCVEDFDHHCKWVNNCVGHRNFRLFMLLVLSLCLFSGAVLVTCLVYLVRTTHMPFSIDKAVAIVVAVPATGLLVPLSLLLLIQALSVSAAERSYEGKGLRELEST	135446	130767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_131017_132644_132751_132994_133168_134203_134344_134885_135002_135358
860466	contig_9721_pilon	-	514	2	Intergenic	novelGene_155992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTGACCCAAGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437749	403412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_403718_437540
860467	contig_16970_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_157596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59983	60689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_60000_60700
860468	contig_13112_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_98844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGGATAAAAATCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658691	658037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_658000_658700
860469	contig_8594_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_140059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCGTACATAATAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480791	481291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_480800_481300
860470	contig_6616_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_141750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAATAAACTGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273813	273077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_273100_273800
860471	contig_5799_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_50288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344031	344448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_344000_344400
860472	contig_14807_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_124742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGACTCAAGGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268118	268675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_268100_268700
860473	contig_2550_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_135638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465852	464810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_464800_465900
860475	contig_10334_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_177931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGTTAAATCTTGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295466	295834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10334_pilon_+_295500_295800
860477	contig_7594_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_55438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGCTAATGAGGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544139	544688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_544100_544700
860479	contig_11883_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_163780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTATGTATGTTTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120960	120208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_120200_121000
860480	contig_16071_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_165994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGATTGAAGTTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47666	48173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_47700_48200
860481	contig_11098_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_166684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAGCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234618	234147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_-_234100_234600
860482	contig_19727_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_169002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGACTTTGGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28688	27901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_27900_28700
860483	contig_11081_pilon	-	886	2	Intergenic	novelGene_167087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCAATACAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93929	82852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_83687_93877
860484	contig_11702_pilon	-	730	3	Intergenic	novelGene_141946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_2	7.5	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	515	649	80858	72629	FALSE	25	CAGGTTCTAAGAAGTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSCCKPRALLGASCPLRLLVSVSSCLTSPLALHPPTSAAVLSAWLGLFRSDAARGRRSGWVPQEQERAGRHHLRSASQCLPQQKEAAAVAGADPSTLDQKLRLVISDFHQLIVAFLQVYDDELGECCHRPGPDLHPCGPIVQAVYQTLTSCSQLLKAVVEATNTSVSTANMVAKHQGEQSCWGSDNSMMSLATKMQELTLKYKLFNETLRKGPD	82311	72547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_72700_80794_80910_81848
860485	contig_6048_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_73163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGATTTTTCACTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184643	1184164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1184200_1184600
860486	scaffold_6394_pilon	-	599	2	Intergenic	novelGene_110948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	7	429	48575	47895	FALSE	20	AAAGTCTTTTTGGATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYMLTGPGLGVTLTNTPDPHTLVPQTPSSDFWKELQLALPRKVRYRAMEGDPQTQLQDDKDPMLIVRGSVPEARTLDPELDPDPEGDLGVRGPVFGEPSVSPHASGFALGEGRGTEVDVSDLGSRNYSARTDFYCLVSEDDV	48581	47724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_48059_48316
860487	contig_3252_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_61515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGTTGAATTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675251	675857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_675300_675900
860489	contig_5894_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_83055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACGTCACCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561326	560973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_561000_561300
860490	contig_1009_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_121728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTACTTTTTCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129590	130595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_129600_130600
860491	contig_4364_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGATTAATGGAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994402	993921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_993900_994400
860492	contig_7338_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_156791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	319	483	169953	169789	NA	65	AAAGACACAAACCAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAFNHTALDAELRRLFRERYLLQPRFVAAVHYEEPTIQIELQQNASQKAPGDVDIADAAYYFERDVKGESLFSGPATFDVRVRGEPLVVERTLIYYLDEKPPRFSMKRLTAGLIAVIVVVVVALVAGVVVLVMSNRRKSGKYKKVEIKELGELNKEPSL	170271	169120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_169100_170300
860493	contig_2069_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_23391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGGGGAAACATTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107893	1108671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1107900_1108700
860494	contig_6276_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_174129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAATTAGCCTGAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208135	209161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_208100_209200
860496	contig_3832_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_161465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369483	369865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_369500_369900
860497	contig_5832_pilon	+	729	5	Intergenic	novelGene_134142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	478.551133631507	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	125	661	314208	327257	FALSE	45	GAAAGAACCTCACCAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHLLPAADVLRRFAVTAECGLSPAQVTGARERYGPNVFPGKSLWALVLEQFDDLLVRILLLAALVSFERNAESAIEALKEYEPEMGKVIRSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTDAISDPRAVNQDKKNTLFSVSLWDA	314083	327325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_314326_324643_324736_326565_326705_326980_327062_327150
860498	contig_9708_pilon	-	769	2	Intergenic	novelGene_67286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	235	615	834909	833821	FALSE	15	TCATGCTGTCTGTAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHRDKGAGCPFPRWQPSALPSRPGLRRGGCSAWEGPLLCRACLCVVCLHPPPRGVVLPSPGHPTHAGPGLAHSPRWQMPCLGCTSPRPRVARVAQGDLECTVSCDPATSPPRGVASLLCGWTGS	835143	833666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_833841_834548
860499	contig_11416_pilon	-	1481	12	Intergenic	novelGene_145382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.481045692920835	18	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	383	1141	826605	819904	FALSE	15	CATGGCAGCCACTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYDFHLLPSGIINSKAVSFIGNGVVIHLPGLFEEAEKNEKKGLKDWEKRLIISDRAHLVFDFHQAVDGLQEVQRQAQAGKNIGTTKKGIGPTYASKAARTGLRICDLLSDFDEFSARFKNLAHQHRSMFPTLEIDIEGQLKKLKGYAERIRPMVRDGVYFMYEALHGPQKKILVEGANAALLDIDFGTYPFVTSSNCTVGGVCTGLGVPPQNIGEVYGVVKAYTTRVGIGAFPTEQINEIGDLLQNRGHEWGVTTGRKRRCGWLDLMILRYAHMINGFTALALTKLDILDTLDEIKVGVSYKLNGKRIPYFPANQEILQKVEVEYETLPGWKADTTAARKWEDLPAQAQNYIRFVENHVGVAVKWVGVGKSRESMIQLF	836679	819563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_819957_820473_820624_822487_822586_823053_823179_824249_824405_825384_825512_826554_826637_826785_826894_828393_828461_828781_828833_829686_829750_836617
860500	contig_5434_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_74639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAACAAAAAAGGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11686	10961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_11000_11700
860501	contig_3900_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_84191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTCCTGGTTCTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246774	247349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_246800_247300
860503	contig_8688_pilon	-	325	2	Intergenic	novelGene_175587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGATGACTTCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40993	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8688_pilon_-_38556_40894
860504	contig_5145_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_131390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCATATTATAACTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633090	632347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_632300_633100
860507	contig_2854_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_120822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTGACACACAACATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221934	221442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_221400_221900
860508	contig_15731_pilon	-	599	3	Intergenic	novelGene_171974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	7.5	150	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACCTAGTATTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83804	46024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_-_46371_51531_51704_83723
860510	contig_12886_pilon	-	398	2	Intergenic	novelGene_135526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTTGATGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824125	818482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_818772_824016
860511	contig_7271_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_159946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACCCAGAGCCATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331782	332791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_331800_332800
860513	contig_4429_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_50828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAAATATCAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243875	244431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_243900_244400
860514	contig_1694_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_144935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTTACGACCCAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501122	501923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_501100_501900
860515	contig_3956_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_14711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTCATTATGTATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210063	210460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_210100_210500
860518	contig_3335_pilon	-	414	2	Intergenic	novelGene_165009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAGAGAAAAACCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689116	687745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_687855_688811
860519	contig_6446_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_149234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCACCCTACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491593	491196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_491200_491600
860522	contig_57_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_44898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTATCCAAGATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101356	100254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_100300_101400
860523	contig_10746_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_176816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTGCCCACTAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155938	155643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_155600_155900
860527	contig_6954_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_64422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAGGGGAAGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116872	117826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_116900_117800
860528	contig_15838_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_174339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225729	226165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_225700_226200
860530	contig_5344_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_125331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	30	362	41677	42009	NA	15	AAGGTAGGCTCCCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPNRLNWHLTQRLCQHSSPFRQVFHTGTPHLARQEVTTPQFWGQSGRGKEASVPMPEYLNTSAPSPALPWPLCKSSLSGFSPHCGKNNFLFKCLNLSDFIHTFWHIAG	41647	42220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_+_41600_42200
860531	contig_5894_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_83027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACATAAAAATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345322	345959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_345300_346000
860532	contig_6102_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_32238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAAAGTTTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921988	921363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_921400_922000
860533	contig_12031_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_137560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCAAGCTCATGCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270460	269769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_269800_270500
860534	contig_4293_pilon	+	1244	4	Intergenic	novelGene_177334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACAGCGGCAAGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124193	153601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4293_pilon_+_125264_126483_126544_130621_130700_153565
860535	contig_9668_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_58203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGGAATCAAGGGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516263	516818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_516300_516800
860536	contig_14209_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_88369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGAAAGATAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125556	124717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_124700_125600
860537	contig_1076_pilon	+	665	5	Intergenic	novelGene_101134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.083880194282	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	220	579	974036	989508	FALSE	40	CAATGTTTATTAAACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMILGTDRVEQMTKTYNDIDMVTHLLAELFKILSLKLEDWVAVA	945725	989594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945931_974021_974073_980669_980865_988168_988246_989457
860538	contig_2069_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_23395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCACGTGTTTTGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131193	1130115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1130100_1131200
860539	contig_14718_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_177934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCTAAAAGCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46103	46641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14718_pilon_+_46100_46600
860540	contig_1987_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_177223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCCCTTATGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367624	367060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1987_pilon_-_367100_367600
860541	contig_9017_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_130327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	152055	152357	NA	15	CTGACTTGAGCAGCCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALSRYLRAALAPYNWPVWLGVHDRRAEGLYLFENGQRVSFFAWHRAPRPQPSAAPHPLSPDQPNGGVLENCVAQASDDGSWWDHDCERRLYYVCEFPF	152052	152533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_152100_152500
860542	SIRV6	-	264	1	FSM	SIRV6B	SIRV617	276	1	2	10	2	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAATTAGTAAGAGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1818	1554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_-_1600_1800
860543	contig_10733_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_109973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAGGTATGAGGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326029	325321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_325300_326000
860544	contig_11572_pilon	+	876	2	Intergenic	novelGene_100080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	23	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399436	400364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_399533_399584
860545	contig_20398_pilon	+	819	5	Intergenic	novelGene_155192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	61.7535424085129	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	187	759	68898	91231	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAATACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLGVPSGEEMDSKAENSHVWPTAAEHEQNTAQVHFVPDTGTVTQIVYTDEQGRPPQQVVYTADGASYTSVDGPEHTLVYIHPVEAAQTLFTDPGQVTYVQQDATAQQASLPVHNQVLPSIESVDGSDPLATLQNPIGRLEAKEEEEEDEDEGTEEDEEEDGEDTDLDDWEPDPPRPFDPHDLCKFRAL	25264	91291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_25370_68816_69000_71642_71808_73526_73587_90985
860546	contig_6445_pilon	+	443	2	Intergenic	novelGene_77067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTCCAAGCTCTGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671855	675154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_672040_674895
860547	contig_9290_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_77578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516667	517320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_516700_517300
860548	contig_13108_pilon	-	937	7	Intergenic	novelGene_135871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	5.3748384988657	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	843	93	935	97382	90047	FALSE	30	GTGATGCTGTTTATCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPENARAQPSSSPSGAVLTPSDLGPSTLGGTLQSSEGTEPPRALLGISTVGPTAVTPSAPENRTMDLFPVLPICVCDLTPGACDINCCCDRDCYLLHPKTVFSFCLPGSVRSSSWVCVDNSLIFRSNSPFPTRVFMDSNGIRQFCVHVNNSELNYFQKLQKVDTTNFQALAAEFGGNHFISTFQTQSPPLFYRAGDPILTYFSEWSVVSLLRQPAGVGAGGLCAESNPAGFLESKSTTCTRFFKNLASSCILDPALDAASYYNFTVLKVPRGMTDLHNMK	97474	90044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_90083_90525_90642_90729_90839_91079_91208_96488_96608_96884_97009_97171
860549	contig_17380_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_177935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCCTACTCATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32008	30936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17380_pilon_-_30900_32000
860551	contig_7976_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_169416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832023	832401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_832000_832400
860552	contig_7513_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_88992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGAAAATTTCACCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461170	460716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_460700_461200
860553	contig_2710_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_161812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAACAAAACACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1250022	1250589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1250000_1250600
860554	contig_4156_pilon	+	579	3	Intergenic	novelGene_88081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.5	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCCAGCCCATGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177247	179473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_177334_178849_178984_179114
860558	contig_13004_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_112652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487468	486949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_486900_487500
860561	contig_14890_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_122510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACATTTTTTTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78597	79452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_+_78600_79500
860563	contig_2550_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_135699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAGATTCTGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666269	1666965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1666300_1667000
860564	contig_16185_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_144763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGAAAAAATTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134838	135650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_134800_135600
860566	contig_11702_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_141979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCAACCACAGTCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373230	372893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_372900_373200
860567	contig_11986_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_69253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCCTTGTGGCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839771	823785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_823975_839389
860568	contig_3382_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_124098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTGACTTCTGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667698	666288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_666300_667700
860570	contig_10861_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_39446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAATGGGTTGGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2556418	2556013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2556000_2556400
860571	contig_5816_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_158260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGTGAAAGAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333092	333692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_333100_333700
860572	contig_5916_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_158044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCCTTAGGGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349428	349115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_349100_349400
860574	contig_8377_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_35169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCTTGTATTCACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373278	372575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_372600_373300
860575	contig_8330_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_71989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGAGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2053423	2054126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2053400_2054100
860577	contig_13697_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_165950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	57	449	695216	694824	NA	35	AATACACCAAGCTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHGEHSDTGLSSRRHSRTISSMGALGPPPWGVCSACGPRLCLCLSVPGMRRREQAVRCLPDLTCLPCGHCRSKSTQAGRPGPTSKVKLDVRRRGPGSQRGPQQMGPGLRPVRPSSPGPPPPFVNLVNCKS	695272	694823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_694800_695300
860578	contig_960_pilon	-	914	2	Intergenic	novelGene_108205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	257	655	248220	247822	FALSE	80	AAAGCAAAAACAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSAKRSAKPTEVVLQLCLGDAFRMTKKRGPLTCPAPQSPGFLGRILYAGGVCFPPHHGDCLHDDSQEHLAPDFLSCIQQGTRISHQTQHGKGDRQSHCTCLQANLTHGLFLLLSNTLPTNSFLRRKFSFL	250221	247562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_248286_250030
860580	contig_6914_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_151752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAAAAAGGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266232	266921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_266200_266900
860581	contig_6063_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_27599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATCATGAGATAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58469	59429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_+_58500_59400
860582	contig_9839_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_88542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGAGCAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95817	96260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_95800_96300
860583	contig_6691_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_60166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398518	397845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_397800_398500
860584	contig_2704_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_75315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGATCTCATTAGCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278119	277542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_277500_278100
860586	contig_8050_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_114882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCCCAACCCCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467408	466347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_466300_467400
860587	contig_10756_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_170669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACCTGATTTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98007	98471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_98000_98500
860588	contig_6589_pilon	+	555	3	Intergenic	novelGene_25987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	26.5	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGATAGTGGCCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1364278	1384087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1364480_1365197_1365248_1383783
860589	contig_3916_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_141853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCATAAACCAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15860	16510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_+_15900_16500
860590	contig_10093_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_147510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGACTCTCCTTGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105205	106235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_105200_106200
860591	contig_18272_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_7072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCCAGTAGGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518021	517395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_517400_518000
860592	contig_4782_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_73591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGGAGAACTAAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14013	14585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_14000_14600
860593	contig_8852_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_159840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAAAGAAAGCAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57881	58408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_+_57900_58400
860596	contig_15500_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_128978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGAGAGAGGTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184582	184050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_184000_184600
860597	contig_10627_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_60045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAGAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869679	869063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_869100_869700
860598	contig_1037_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_84609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493095	492574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_492600_493100
860599	contig_8587_pilon	+	653	6	Intergenic	novelGene_159130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	44.2700801896721	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	81	653	404791	437124	FALSE	30	TTTCTATAAATAGTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVDLEKLRMSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLISEGYEGLVEGGENINQANWLSVSNIIQLGGTVIGSARCAAFTTREGRLAAAYNLVQRGIANLCVIGGDGSLTGANIFRSEWGSLLAELVKEGKISESTAQTYSHQAQCTRQPLRGAAARGPHCDPAVAKLATVADQSLAP	404710	437124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_404876_413962_414037_416692_416771_417444_417635_419894_419930_437013
860602	contig_8801_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_66259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACGTTTTCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368828	368055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_368100_368800
860603	scaffold_17541_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_175233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	630	995	104306	103941	NA	35	ACCCATTAAGTATTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDGEDDLHGQVVDEEGTGTVGGTHGSGRAVLVVNEDAQVAEAWADLPQEHVGAVAQEGEGGAVEGGVVGVAPDGADACGTEHGEALGVLSLPLSCLLSSSTTPESCHLQRVTWPHRPHQ	104935	103676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_103700_104900
860604	contig_14215_pilon	-	436	4	Intergenic	novelGene_59359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1354	junction_1	315.861784118729	935	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGTGAACCATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186877	181120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_181253_181834_181900_184496_184623_186764
860606	contig_4519_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_123710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGGGTTGAATGACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645825	646298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_645800_646300
860608	contig_6477_pilon	+	500	4	Intergenic	novelGene_154194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_2	76.38498979948	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	141	308	794167	795993	FALSE	20	CTAACATTTCTTGTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERQRLHKQLKQTEQNISHRIQKLLEENQRQKKSSEILKSLENERIRMEQLMSVTQEETENLRRREIASAMQQMLTESCKNRLIQMAYESQRQNLVQQACSR	790857	796185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_790946_791893_791939_794159_794231_795889
860609	contig_1154_pilon	-	1215	2	Intergenic	novelGene_87148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	49	525	881770	880772	FALSE	45	TCTAGTATCCACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSGKLPSGVSAKLKRWKKGHSSDSNPAICRHRQVARSRFFSRPSGKSDLTVDAVKLHNELQSGSLRVGKSEAPETAMEEEVDLAVTEKSSGTFLSGLSDCTNVTFSKVQRFWESNSAAHKEVRAEGPECATGGLMLFIFLWLWLDSCRVTAASIPG	881818	880081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_881110_881631
860610	contig_5286_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_157342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCTTTAATAGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516700	515668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_515700_516700
860613	contig_18511_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_126893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAAGTAAAAGAACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57173	57641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_57200_57600
860615	contig_11986_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_69109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAAGGAAAAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84270	83770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_83800_84300
860616	contig_8520_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_85445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATAGAAATAAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223850	223452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_223500_223800
860617	contig_12884_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_104970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGCCGAGCCTTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277717	276969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_277000_277700
860618	contig_3155_pilon	+	1049	9	Intergenic	novelGene_26336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	33.6786282380978	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	136	1047	108330	119947	FALSE	45	CAAGATGAGACCAACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALWGSAITSGPFVSRRLQLGCSGLVLGAPRSSKLHLSPKADVKSMISYVVTKTKVINEKYHRFLDRNFPRFYVLYTIFTKGLRMLWADAKKARRIKANMLKHNIKFHQLSYREMEHLRQFRRDVIKCLFLGIISIPPFANYLVFLLMYLFPRQLLIRHFWTPKQQADFLDIYHAVRKQSHPEILTCLERTIPVISDAGLRWHLTELCSKAQRGTQPAVNDILVLRECFSDHPLGMNHLQALQLKVLSQAMLLTPHLPPFLLRSRLKNHTTVIHQLDKALAKLGIGELTSQEVKSACYLRGLNSTHIAEDRCRTWLGEWLQISCSLKAIPGAATWKGHAIHLREETRS	107620	119949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_107713_108286_108439_110327_110444_111195_111279_112561_112749_112865_112968_113065_113219_113903_114001_119882
860620	contig_21185_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_177937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTTGAATTACTACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12566	13396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21185_pilon_+_12600_13400
860624	contig_6865_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_177059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACTGAATGAAATAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62189	62582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6865_pilon_+_62200_62600
860627	contig_10437_pilon	+	1011	2	Intergenic	novelGene_38467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	66	398	1131049	1136094	FALSE	80	AAAACTTAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDMDAVLSDFVRSTGAEPGLARDLLEGKNWDVSAALSDFEQLRQVHAGNLSPPFSEGSGGPRTPEKGFSDRESTRPPRPTLQRQDDIVQGTGVTERRFCIRSRKGWDS	1130983	1136707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1131134_1135846
860628	contig_10074_pilon	-	550	3	Intergenic	novelGene_57128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCAAGTGTGCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371859	344093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_344427_344901_344953_371693
860634	contig_13048_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_138911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAAGGATGTTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301053	300511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_300500_301100
860635	contig_602_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_134933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAATTTCATATAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233623	232714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_232700_233600
860636	contig_4125_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_25180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	33	404	1248656	1249027	NA	80	CATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLKSCEERSMVSPEFCGVVPARHTSARLPGLHGPQSKKGSTPDALLSCVTWPWSRPGGWEAPLPEATLPKVQGQKQGVRRPEGECRPQPQAGTLHVTERHLDLARADGCWIDARTAVSTDKAEVRVSQSPTH	1248623	1249057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1248600_1249100
860637	contig_821_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_149404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGGATGCCTCCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210097	210531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_210100_210500
860638	contig_14341_pilon	-	657	3	Intergenic	novelGene_111787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGTGTCCAGCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344503	336979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_336994_337526_337743_344076
860639	contig_10523_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_120960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAAGGCCTAAATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67202	67515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_67200_67500
860640	contig_5018_pilon	-	862	2	Intergenic	novelGene_47128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	692	778	1451369	1451283	FALSE	10	CTTTCTGGGGCTCATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAGASSQSSSPASSTPNSPASSASHHIRPSTLHGLSPKLHRQYRSARCKSAGNIPLSPLAHTPSPTQASPPPLPGHTVGSSHTTQSFPAKLHSSPPVVRPRPKSAEPPRSPLLKRVQSAEKLGASLAADKKGALRKHSLEVGHPDFRKDFHGELALHSLAESDGETPPVEGPGTPRQVAVRRLGRQESPLSLGTDPLLPEGTPRPLASSKEKESPPASLLVPGTKPEVGMSSRCPAEAVPPPGLTKKGAPCPAPPGP	1452540	1451198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1451417_1451896
860641	contig_7049_pilon	+	494	5	Intergenic	novelGene_171434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	49.300101419774	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	94	459	90484	92452	FALSE	20	TTTTTCCAACCTGAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLGLSRVDDAVAAKHPGLGEYAACQSNAFMKGVVTFVTGTGAAFGLQMLIHRKFPYPLQWTVLVAVVTGSVASYGVTRVETQKCSNLWLFLETGRLPKDAGSGERPFWSLHPQQVRGDS	90390	92487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_90538_90815_90883_91084_91169_91549_91666_92407
860643	contig_7962_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_149300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204004	205004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_204000_205000
860644	contig_9177_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_32653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAAAATCTGATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58435	58889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_58400_58900
860645	contig_11948_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_174386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCCAGGATCCACATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144858	144569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_144600_144900
860646	contig_9841_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_177939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATCCTTCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3687	4301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9841_pilon_+_3700_4300
860650	contig_13051_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_140121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371383	370415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_370400_371400
860651	contig_11071_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_131042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTCTGTAGGAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194188	193534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_193500_194200
860653	contig_12072_pilon	-	612	4	Intergenic	novelGene_177940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.4142135623731	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	10	336	31211	25997	FALSE	45	ATGAAAACAATCCTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRMLLVRVKNYEPRRLSMMFTFKFNMPKKATELKHLQCLVEELKPLEDVLNVAPSKQNTRELISNINVTALELQGSKTPFMCEYDDKAATIEEFLNNWIAFCQRIISTLT	31220	25720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12072_pilon_-_26108_27938_28074_31038_31099_31190
860655	contig_15114_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_121220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCAGAATACAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1627138	1627812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1627100_1627800
860656	contig_6724_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_167962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGAGCTGGGTTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199845	200572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_199800_200600
860658	contig_12427_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_40439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGGAATGGTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270341	271071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_270300_271100
860659	contig_19564_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_29649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCAGCCTCCTTGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15806	17847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_15937_17384
860660	contig_2403_pilon	-	905	6	Intergenic	novelGene_71019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	3.31058907144937	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	843	63	905	194999	185814	FALSE	50	ACTAAGAATAGAAATGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKERCLKKSFQDSLEDIKKRMKEKRNKNLSQIGKRKSFVVAPCQITSNTSTLLKNYQDNNRMLVLALENEKSKVKEAQDIILQLRKECYYLACQLYALKEKFTSRQTEEPAQNQEVCPYGMDSNDDDSSGELSVKNLPQIPLQEADLPGQGESFQVEEQVPAVPHERLRFDFDSGEDKSPDNGLPRTVSVRRGLKRHFNNLRQFDTLGDFESSYLPGESFEWERIRFADPLISINLPENVEKDVCQWNKDQINLSPKLTHPGSLTITKEVILESKSEQTK	195967	185813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_186182_187563_187623_189228_189306_194580_194778_194857_195007_195912
860661	contig_12622_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_5878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAATATTTTTTGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217376	1218732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1217400_1218700
860662	contig_9058_pilon	-	599	4	Intergenic	novelGene_149373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGCACGACGCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307783	292281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_292446_299250_299360_305933_306241_307764
860663	contig_7720_pilon	+	531	4	Intergenic	novelGene_155734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_3	42.5284218689886	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	11	442	188297	215193	FALSE	75	TTAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCMLYHPDKHRDPELKLQAERLFNLVHQAYEVLSDPQTRAIYDIYGKKGLEMEGWEVVERRRTPAEIREEFERLQREREERRLQQRTNPKGTISVGVDATDLFDRYEEEYEDVSGSGFPQIEINKMHISQSIEVKHTNTSLRTVS	188286	215282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_188385_190684_190759_196990_197093_215025
860664	contig_5047_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_158007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	438	533	1609184	1609279	NA	50	TGAGAAAAGAGTCTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTHRCDLPFAGPPSGLPGALPSQFLCPSALVHVFLTLTDAWVSPGVTVLPANFPALLDAKDLQAGLSPIRRVWPVTSFYFKWPIVQRDKTRATLFNGYHTALEIHTEDQLGLSHRGHQHGVACGLWHGAQSRSDTFYFSVAFAPQMRCPNKQSAQLMQTRVHFMFYSDENANIVAE	1608746	1609687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1608700_1609700
860665	contig_8571_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_169158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	105	320	307821	307606	NA	35	TTTGATGAATGAATGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRLSLTSSPTSLPLLHSAPGPSAFWLFCRHTRHMPTSGPLHHCSLCLGCSPLDTCVVPSSPSLMSLLKYHLLTVASPDHPVKVTNVPFVPNTLDPLPCLFLHST	307925	307445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_307400_307900
860666	contig_4339_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_146092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	411	146	556	1086115	1085705	NA	40	TGAAAGAGGAGGAGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAADAVLCAYNSNIPVIHAFRRRVTDPSLIFKQLPKKLYPEYHKVYHMMCTQLYSVDSNLSDYTSFPEHHVLSFKSDMKCILQSVSGLKKIFKLSAAVVLIGSHPNLSFLKEQGCYLGHNSSQPITCKGNPVEIDAYTYECVKEANLFALGPLVGDNFVRFLKGGALGVTRCLATRQKKKQRLF	1086260	1085702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1085700_1086300
860668	contig_2278_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_118125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	1.5	273	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAATTTTATAAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999568	1015375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1000068_1006343_1006497_1015229
860669	contig_15434_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_56719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATATTCCTGATTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76197	76927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_76200_76900
860670	contig_9345_pilon	+	769	5	Intergenic	novelGene_24487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	22.3439029715043	479	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	114	686	665237	666379	FALSE	30	AATTTAATCATCTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAFALRSLYRARPALRCPPAELLWAPRRGYRLTPADDELYQRTRISLLQRESPHAMYIDSYNSCGFTVNGDRVFGPCALLPHSVVQWNVGSHRDITEESLSLFWMLEPRIEIVVVGTGDRMERLQPEVLRAMRQRGIAVEVQDTPNACATFNFLCHEGRVTGAALIPPPGETALTPSLAQAAECTARN	665123	666462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_665314_665530_665724_665891_665959_666065_666167_666244
860672	scaffold_12510_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_151380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCAACTGCTGTAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253896	255317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_253900_255300
860673	contig_6102_pilon	+	1143	11	Intergenic	novelGene_32016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATAGCCCTTGCGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494667	499010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_494725_494932_495042_496324_496406_496484_496623_496805_496876_497084_497198_497301_497391_497602_497718_498108_498191_498442_498668_498946
860678	contig_10197_pilon	+	1030	2	Intergenic	novelGene_115321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAGGAGGTGAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601292	1602363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1602045_1602085
860679	contig_5536_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_177941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTCTTTCTAATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6207	6954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5536_pilon_+_6200_7000
860680	contig_7976_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_169427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTAGATAAGAGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921653	921103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_921100_921700
860681	contig_10079_pilon	+	927	5	Intergenic	novelGene_175826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCTCCCCTCCTGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204608	268258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10079_pilon_+_204873_208268_208426_210563_210707_210803_210845_267936
860682	contig_8259_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_148862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77625	76616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_76600_77600
860684	contig_15076_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_177254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGAAAAAAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120636	120293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15076_pilon_-_120300_120600
860685	contig_401_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_42752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAATAATGACCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962465	963515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_962500_963500
860686	contig_5093_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_135106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTAATTTCCCAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650870	651989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_650900_652000
860687	contig_2830_pilon	-	931	4	Intergenic	novelGene_165847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.4142135623731	31	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	32	580	613210	608736	FALSE	15	GCCTGGAGGTTCAGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVVGHLRQGMVALQEAQDTMQGTSRSLRLIQDRVAEVQQVLGPTERLVTGMMEQLSGFRARIEALRRQAGQQRVQAAQAQQLAAGASERALSAQEGFERVKQKYAELKDRLGWSSSLGEQGNRILSIKMEAEELFGETMEMMDRMKDMESELMRGSQAILLRSAALTGLEKHVEQIRDHINGRVLYYATCK	613241	608384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_608873_611427_611582_612536_612714_613129
860688	contig_11281_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_125434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGAACGGGGGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506088	505242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_505200_506100
860690	contig_2069_pilon	-	666	5	Intergenic	novelGene_23324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACCTGACGGGGAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550399	547033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_547194_547298_547373_547927_547971_549461_549610_550158
860691	contig_20614_pilon	+	231	2	Intergenic	novelGene_107510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCTGAAGCGGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117	1773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_1214_1638
860692	contig_8285_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_174976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTATAATATAAACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239133	240311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_+_239100_240300
860693	contig_5023_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_7165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATGAGGCCACGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407867	408594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_407900_408600
860698	contig_9440_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_59041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATGTAAACTTTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324370	325363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_324400_325400
860700	contig_4114_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_15579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTATGAGCAGGCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175362	174765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_174800_175400
860701	contig_1719_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_87305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAACAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407245	408033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_407200_408000
860702	contig_6568_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_152863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	44.0782133132559	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	112	612	148823	160522	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDEEKVSPPVLPHDSDRGSSVSSDLQEEYEELLRYAVVTPNIESSTSQLSHPKGDVVQDVKIPTIIGDILHNQGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKVLRTGVHQLCNSSTLKATVVSFN	144106	160522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_144206_148810_148907_153348_153491_160247
860705	contig_9480_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_177205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCATTAGTCTCGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119777	118861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9480_pilon_-_118900_119800
860706	contig_5514_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_75290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATGTGTTTGTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103277	102923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5514_pilon_-_102900_103300
860709	contig_5515_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_52301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACAACAGAATAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29683	28949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_28900_29700
860710	contig_11505_pilon	+	872	1	Intergenic	novelGene_140926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140715	141587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_140700_141600
860712	contig_9727_pilon	-	603	2	Intergenic	novelGene_86291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	130	603	206211	193889	FALSE	20	GACGGTGAGCTGCATGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGASREPAGRRAPTPSSLCPSARAPRPSRDPCPLGSAATLPAMETPSQRRATRSGAPASSTPLSPTRITRLQEKEDLQELNDRLAVYIDRVRSLETENAGLRLRITESEEVVSREVSGIKAAYEAELGDARKTLDSVAKERARLQLELSKVREEFKELKARNTKKEGDLLAAQARLKDLEALLNSKEAALSTALSEKRTL	206340	193888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_194007_205855
860713	contig_3270_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_104513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTAAAAGAGTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408888	407958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_408000_408900
860714	contig_6960_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_60230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94240	93250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_-_93200_94200
860715	contig_6278_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_119816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTCATTATAAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474390	474788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_474400_474800
860716	contig_2438_pilon	+	594	3	Intergenic	novelGene_111986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_2	135.5	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	275	298	112751	112774	TRUE	5	TCCAGGGCTGGCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSVELVGPRSHRLRLHALGPQDEGAYHCAPSAWVQHTDYSWYQAGSARSGPVTVYPYTHALDTLFVPLLVGTGAALVTGATVLGTITCCFMKRLRKR	112137	113256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_112320_112658_112790_112975
860717	contig_4125_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_25112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	173	487	795096	794782	NA	60	GGAAAAAAAAAAAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGGRFRGGRGSPWCRVRGRNRTALSLTSGQVRVGVTVRCTSPKGPGNDVSSQLWSPMAGWPSASRGRAFCWVLEQKLSPWPRHCLSYLMSSDSGRCCNFVYKQPSDFFFTWVHGAFWAFTWFTVILTLGALEQVATTAIQENKLLFRGRVFVQWLFKKNF	795268	794630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_794600_795300
860718	contig_5039_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_64932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTAGGAACGGGCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362461	1361463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1361500_1362500
860720	contig_5033_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_28942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGACCTGAAACCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450561	451181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450600_451200
860721	contig_3948_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_53159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGGCATAACAAATTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137003	135903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_135900_137000
860722	contig_13481_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_119269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATTGGCCACTTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49568	50214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_49600_50200
860723	contig_8581_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_22805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGAACAAGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241608	240576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_240600_241600
860726	contig_19899_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_102532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278291	277285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_277300_278300
860728	contig_4631_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_177944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAATTTTTGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67938	68238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4631_pilon_+_67900_68200
860731	contig_9460_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_155312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGGCCAATTATTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354845	355270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_354800_355300
860732	contig_14220_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_159870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTCACTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336451	336050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_336000_336500
860733	contig_2215_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_163881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGAAGTAAGAGATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462009	462494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_462000_462500
860735	contig_16525_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_133882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTCGTCACTTCTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201624	200749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_200700_201600
860737	contig_11590_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_125558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	157	495	16903	17241	NA	45	AAAGATTATTTGTAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYSTGVCHLGHPGTEFSSSLYRNFSFTYLFIINKYLLCTYFYWAPCCALGNEYIGRILVKLYFQEGKLQEKERVVRDWRGSRNQTITGPGQRSPMYLKQGCEEGPPGNRNS	16746	17243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_16700_17200
860738	contig_16930_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_139143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGGGCTAAAAATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36236	36580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_36200_36600
860740	contig_4782_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_73644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTGAACATGAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418073	418806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_418100_418800
860744	contig_11304_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_156725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCTCTTCAGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460871	460604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_460600_460900
860747	contig_10446_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_162460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGAGCCCCGTGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504984	505620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_505000_505600
860750	contig_13519_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_124616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCAGGATGCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56857	56510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_56500_56900
860751	contig_15839_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_136419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121826	121278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_121300_121800
860752	contig_4769_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_118045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCATCCCATTAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571060	1570641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1570600_1571100
860753	contig_12586_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_121795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATCAAATATATGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33335	34092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_33300_34100
860754	contig_5623_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_154856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242111	266340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_242435_266101
860755	contig_3601_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_132913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGAAGCCTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251716	250659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_250700_251700
860758	contig_13123_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_136886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTATAGTTATTCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412522	411689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_411700_412500
860759	contig_11538_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_152310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGAAATTATAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283751	283076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_283100_283800
860761	contig_13292_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_142926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68197	67889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_67900_68200
860763	contig_2113_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_161157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTGCCATTGTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522215	523048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_522200_523000
860764	contig_12977_pilon	-	980	1	Intergenic	novelGene_122801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAAGCACTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47123	46143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_46100_47100
860765	contig_8587_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_159120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATATTGCAGGTGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189271	189624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_189300_189600
860766	contig_8671_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_126239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138335	138783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_138300_138800
860767	contig_2310_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_71611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAATGTGAGTTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106078	106549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106100_106500
860768	contig_1813_pilon	-	1194	9	Intergenic	novelGene_105462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCAGCCTGCGGCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66475	25659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_25940_28683_28803_32843_32891_33929_33993_42572_42624_43781_43831_49972_50068_51877_51986_66093
860769	contig_12250_pilon	+	680	5	Intergenic	novelGene_80600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.07387763097757	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	54	353	333287	334168	TRUE	30	ACAAGAGATCCTACCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QADHPIPVWRRSSRCFCMSRQGGFLPAGALPDTLWPWRKLRLGARSVRDPVMARLPKLSVFDLVMELYEIAGVGPSDFTQMCPRSWNDCWAWGCLSRPLPGQVRLKGPTSCWSSLT	333233	334764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_333426_333675_333787_334118_334227_334322_334409_334581
860770	scaffold_7386_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_136610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATACCGTGGCTGGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414704	410447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_410917_414622
860771	contig_13403_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_158088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	388	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48976	49528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_49000_49500
860772	contig_16071_pilon	-	996	4	Intergenic	novelGene_166006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	23.0988215187606	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	3	620	97562	88613	FALSE	65	GTTCCAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKREKVLFLRTFRGRTLRIVREHYLRPSVPCNSPLCPQPAACRNDGKLLTMDVTHYVIPDWKVVQDYLEILEFPELKGIIFMQTACQAVQHQRGWRQYNKLRSLLKDARRDCILFANEFQQHCYLLRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQDRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVISFKVFPAVVCIRVSVSVCSYPP	97564	88236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_88809_91970_92100_95476_95631_97423
860774	contig_5084_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_64694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAACAATTATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1872074	1871518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1871500_1872100
860775	contig_6496_pilon	-	438	4	Intergenic	novelGene_103471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.3041913500602	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	59	436	285171	205063	FALSE	25	GTAGGTGGATGGATTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSDKAVKYYTLDEIKKHNHAKSTWVILHHKVYDVTKFLDEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDAREMSKAYIIGELHPDDRSKLAKPSMDIQFCQHHLLKRLSFPHLMDFGPLSKIK	285229	205060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_205153_263148_263179_264936_265066_285042
860776	contig_5039_pilon	-	995	2	Intergenic	novelGene_64854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGAAACTCATAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340839	332697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_332790_339936
860777	contig_3077_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_26852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881291	881951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_881300_882000
860778	contig_5338_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_114573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCGCGGGAGCTCCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366622	367179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_366600_367200
860779	contig_1986_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_64123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112603	113232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_112600_113200
860780	contig_6266_pilon	-	749	3	Intergenic	novelGene_171008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	49.5	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	60	398	852241	848812	FALSE	45	TGTTTTGAAGAAAATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRERSRESGAQRGKNISIMAHSKSRTNDGKITYPPGVKEISDKISKEEMVRRLKMVVKTFMDMDQDSEEEKELYLNLALHLASDFFLKHPDKDVRLLVACCLADIFRIYAPEAPYTSPDKLKASTDFKTS	923681	848460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_849043_852133_852261_923641
860782	contig_19934_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_166638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGAAGCATCTTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284308	284954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19934_pilon_+_284300_285000
860784	contig_6740_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_142676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATGTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610973	610019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_610000_611000
860787	contig_21138_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_177798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGGATGCACTGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24099	23035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21138_pilon_-_23643_24064
860788	contig_5854_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_68868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTAGATTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439799	440205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_439800_440200
860789	contig_2332_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_58689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAAGCACTGATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441551	440856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_440900_441600
860790	contig_4000_pilon	-	394	3	Intergenic	novelGene_176080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAACCTAGGAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225694	211467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_-_211636_221014_221128_225581
860791	contig_8633_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_177945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	8	421	63531	63118	NA	10	AGTTTGTTTCTTTTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACER	63538	63115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8633_pilon_-_63100_63500
860792	contig_3942_pilon	-	466	5	Intergenic	novelGene_128838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	212.684478747275	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	99	431	1278111	1276273	FALSE	40	GAATAAATGCCGTGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAMGIGTLLFGYWSMMKWNRERRRLQIEDLEARIALMPLIQAEKDRRVLQMLRENLEEEAIIMKDVPDWKVGESVFHTTRWVPPMVGELYGLRMNDELLNANYGFMWYT	1283431	1276237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1276393_1276599_1276670_1276972_1277045_1278040_1278120_1283341
860793	contig_9415_pilon	+	807	1	Intergenic	novelGene_109727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCAATTTTTTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486869	487676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_486900_487700
860795	contig_5588_pilon	-	561	4	Intergenic	novelGene_172850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	10.1980390271856	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	85	327	1071130	1064617	FALSE	20	GTTTTCTCAGACGCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALWSWRQDHVVDSWQSAVCGAFAGGFAAMVTTPLDVAKTRIMLAKAGSSTATGNVLSALHEVWQTQGLSGLFAGVFPRMAAISLGGFIFLGAYDQTRSLLLGLGRETP	1077398	1064382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328
860796	contig_5260_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_144434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTGTGTTTTCCTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728538	729644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_728500_729600
860797	contig_19825_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_59692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACAAACTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77840	78550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_+_77800_78600
860799	contig_10642_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_78699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATTGTATGCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469421	470274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_469400_470300
860800	contig_8650_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_162625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATGGTTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248069	247327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_247300_248100
860802	contig_3382_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_124080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACTAATCCCATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439008	439299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_439000_439300
860808	contig_16666_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_61801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAACATACTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178810	178554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_178600_178800
860809	contig_12503_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_143832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTGATTGGCCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156941	157541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_156900_157500
860810	contig_16382_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_160222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	411	112	522	88115	88525	NA	55	CAGAAAATGAAAACCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEHCPTHLLSTCHQEGSMTGGGHHVWCSVVHKAAMDHSQLDSSSLSFSLSIYKSIKPPGAKTALDCLNISSFSILELPGLVILSQSMWLQFPYTFSFLWEVAGLFQVQPLSTTEAENSRALWEAMCSNFKGIPGAS	88003	88527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_88000_88500
860811	contig_11250_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_127155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCATGGATTGTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109960	105797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_105970_109838
860812	contig_6102_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_31785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTTACATTTTTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353885	352765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_352800_353900
860813	contig_11396_pilon	+	188	4	Intergenic	novelGene_71403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTGGCGGCTCCCCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554915	1555552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1554938_1555073_1555147_1555232_1555285_1555511
860814	contig_4769_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_118040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGATTGAGCAGTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511037	1510623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1510600_1511000
860816	contig_7629_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_153607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTCATAACAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527332	526974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_527000_527300
860817	contig_7697_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_128284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	24	335	222630	222319	NA	70	GTAAAAAAAAAAACCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKTAPTMWQSGRKTRFLEPRHSSPGYSRGQALPHVQVWLLETHPEYSEQCQALTAATGRHRAVPRNTAQGRLRPLLLAEGCEPQLLPAHGHGWTQLSPRRKSHRTQHGP	222653	222111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_222100_222700
860818	contig_6501_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_150578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACAAAGCCCAGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351879	352701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_351900_352700
860820	scaffold_13505_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_111398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	522	662	1183	202527	203048	NA	20	AGGTGAGCTTGTGGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPGPTPAPGWEEDECLDYYGMLSLHRMFEVVGGQLTECELELLAFLLDEAPGAAGGLARARSGLELLLELERRGQCDESDLRLLRQLLRVLARHDLLPHLARKRRRPGTAEPEGEPEGDRRACLLPLAPPPSGSHGALIQTVRDQTTCVPSHSLLLPEYQQDTLEGGGMVLE	201865	203049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_201900_203000
860821	contig_12019_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_87697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTTTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128339	127909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_127900_128300
860822	contig_12402_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_133352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	227	301	455825	455899	NA	20	CTCCTGGTTACTATATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAEAGKQPRRQDTRGIVRIQEVACLWSSPGRAERPALRRRPGAVPLDPGTAVLDQEERQQTQYVPHKGAGERPNMATAGERALPLPVSGRLGEEEEGF	455598	456103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_455600_456100
860823	contig_12142_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_147795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	70	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	186	389	68026	69819	FALSE	30	CTTGAGATGACTCAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLVSLAFAAGAISSLRISLISQTPSILPASLSCALALLASYLCFLLPETQNQPLADRIKHMSSQLSLQKKMSQEDPLETLTEDTSSEDVSEEAAKNAVLNTMVQKVDSDILVTMPQQPRKRADRQDP	67840	69983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_68043_69632
860824	contig_2480_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_63501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCAAGGATGACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23752	24194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_23800_24200
860825	contig_7695_pilon	+	699	5	Intergenic	novelGene_41612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.1139542868376	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCTGGCCTCTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552243	555236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_552298_552816_552913_553290_553385_553471_553632_554941
860827	contig_20951_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_43110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCTGAGCTCTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153125	152212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_152200_153100
860828	contig_4328_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_176808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181457	180954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4328_pilon_-_181000_181500
860830	contig_15350_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_164263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAGCCAAAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255904	254783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_254800_255900
860831	contig_9323_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_177946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAAAAAGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180452	181189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9323_pilon_+_180500_181200
860832	contig_9332_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_60730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTAATTACCTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545717	545516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_545500_545700
860833	contig_14796_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_159380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTGAATGTATGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240248	240508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_240200_240500
860836	contig_4156_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_88120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTTTCAATGGCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449748	450485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_449700_450500
860838	contig_9423_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_99189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGTGCACCCTTTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94927	94579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_94600_94900
860839	contig_3584_pilon	-	713	4	Intergenic	novelGene_108107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_3	12.0369800568452	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	40	711	178621	153309	FALSE	30	TGGAAAGATGCACATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPPLMGEVELGPVGPLEPPEAPEVLVSRRPGGIRVLKRNMKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGAETNTATTTATTSLSSDLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPSERPLQMVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCQMDHLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQ	178660	153306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_153461_159885_160020_170118_170388_178504
860840	contig_17964_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_33886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACAGTTATCACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150512	149963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_150000_150500
860842	contig_3382_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_123980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAATAGACAAAGATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39921	39252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_39300_39900
860845	contig_6304_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_122260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAAATAACCCAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190871	191244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_190900_191200
860846	contig_504_pilon	-	800	3	Intergenic	novelGene_54459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	337	660	499637	497713	FALSE	65	TCTTAGGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAVFSEKSAVEAYLVFLIPFLHFIIFVFILRCLEWKFGKKTMRKDPVFRISPRSSDVCQNPENPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNSDEVKHSNVVISPNNTDVVN	499973	497572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_497888_499021_499114_499580
860847	contig_8177_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_86512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTCTGGTTAGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162790	163540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_162800_163500
860848	contig_6189_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_164952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTGGGAGCCCTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149693	150498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_149700_150500
860849	scaffold_16539_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_68404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36.0647565729573	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	221	331	918548	918774	FALSE	5	CCTCAGTCTGCTGCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRACAPLHVRKPETRGVGVAADLGAAQRRAQHEARFQSPRGGFRGRGGFGDRGGFGGDRGGRAEAVFASEVKKMQQENMKPQEQLTLEPYERDHAVVVGVYRPPPKVKN	908217	918854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_908323_913599_913681_918513_918634_918749
860850	contig_18719_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_172270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTCCAAGACACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11672	10918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18719_pilon_-_10900_11700
860851	contig_5569_pilon	-	621	2	Intergenic	novelGene_86742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACATTGCACAGAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463869	462431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_462838_463654
860852	contig_15104_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_163368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAGCACAATAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906936	906560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_906600_906900
860854	contig_12810_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_145705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAACAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524357	523763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_523800_524400
860855	contig_3424_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_55571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	196	381	1060503	1060688	NA	55	TAAAAAAAAGAACTCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEASWSRPFYPGTTGKGSTPDRHPHAGPHSPACALDTHPRPLSPPGPTPLGPVGRWSPTRVTGSPMSPLPVQDKREPKTTSHVWSFLHSQPSAGHPDTCNGTRDPGTVTVLRMKWLIFRSSGAKSP	1060307	1061197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1060300_1061200
860856	contig_1435_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_115530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGATCTCTCCACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614395	615240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_614400_615200
860858	contig_14838_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_151928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCATTAACCAATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255894	255373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_255400_255900
860859	contig_7119_pilon	+	639	7	Intergenic	novelGene_41023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.493669064224	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	239	637	217304	223400	FALSE	60	GAAAGCACTGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQVGPFLHFLTDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKYANMWLEYYNLERAHGDTQHCRKALHRAVQCTSDYPEHVCEVLLTMERTEGTLEDWDIAVQKTETRLARVNEQRIKAAEKEAALAQQEEEKAEHRKKARAE	216241	223402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_216340_217036_217142_217268_217328_218346_218457_221063_221177_222163_222241_223325
860860	contig_6127_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_157051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTAGTATGTGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166798	167400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_+_166800_167400
860861	contig_5317_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_76645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAAATTGTTGGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986220	978796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_979333_986192
860863	contig_4962_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_107392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCCCGAGATAAGACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440366	439323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_439300_440400
860864	contig_9272_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_125928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGCACCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342975	343292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_343000_343300
860865	contig_10079_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_175827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	25.7196422992234	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	329	871	268005	204740	FALSE	55	TTATTTAAGAAAAAATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFK	268333	204608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10079_pilon_-_204873_208268_208427_210564_210707_210803_210847_267938
860866	contig_7640_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_177337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCCAAATTTTCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170463	169642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7640_pilon_-_169600_170500
860867	contig_14522_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_147332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGTTACAAGGTTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144282	143759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_143800_144300
860869	contig_9415_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_109752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTATTATGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135826	1135244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1135200_1135800
860870	contig_6954_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_64426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAGTTTTACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176545	175778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_175800_176500
860871	contig_6217_pilon	+	632	2	Intergenic	novelGene_109638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	92	junction_1	0	591	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATTTTTCTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594800	596208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_594987_595762
860872	contig_15720_pilon	+	652	4	Intergenic	novelGene_41867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.01387685344754	22	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGTTTATTCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266470	277283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_266582_275787_275818_276407_276469_276833
860873	contig_12019_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_87767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTTAGCATAGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674590	675509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_674600_675500
860874	contig_5229_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_117677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGCACCACCTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195532	196709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_195570_195804_195837_196379
860875	contig_4103_pilon	+	1162	6	Intergenic	novelGene_52011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_3	1.78885438199983	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	210	836	419816	430239	TRUE	25	ATTCCATATGCTCCAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPSVVLKLLLATVLSALVTGESLERIRRGLAAGTRNPDPPTGSTDQLLPAGDVRGREVLDLDEANLDLFRVAFSSKPQAVATPSKEEYGKRKKKGKGLGKKRDPCLRKYKDFCIHGECKYVKELRAPSCICQPGYHGERCHGLSLPVENRLYSYDHTTILAVVAVVLSSVCLLVIVGLLMFRYHRRGGYNVENEEKVKLGMTNSH	419606	430899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_419862_420046_420221_423235_423414_429183_429340_430166_430258_430591
860876	contig_4091_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_172981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCATATTTTGAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6310	6074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_6100_6300
860877	contig_3774_pilon	+	815	3	Intergenic	novelGene_142026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	199	813	82163	86424	FALSE	30	CCGTGCTGATGAATGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALNPQIDAPLEVAGCLIMKMEKDPEWASESITEGSDSSESETFRKCFRRFCYEDVTGPHEAFSKLWELCCRWLKPEIRSKEQILELLVIEQFLTILPEKIQAWAQKQCPESGEEAVALVVHLEKETGRLRQQVSSPVHSENQSSLGATWEVADFQPEQVETQPRVVSLEEPGGLHSGCQEQLNRRREHRPFPKKAQLSPWVP	81964	86426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_+_82568_83756_83944_86401
860879	contig_19132_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_169999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACCACATATATGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384889	384194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_384200_384900
860880	contig_11253_pilon	-	733	5	Intergenic	novelGene_126845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	53.2775750198899	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAAATGGGGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262199	257740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_257770_259433_259646_261169_261321_261731_262019_262145
860881	contig_9008_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_58623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATTAATAACACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122437	123283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_122400_123300
860882	contig_7206_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_177729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCAAAGGGCATTTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12632	13176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7206_pilon_+_12600_13200
860884	contig_9875_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_154401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAGAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45686	45128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_45100_45700
860885	contig_14002_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_175105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45828	45523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14002_pilon_-_45500_45800
860886	contig_6102_pilon	+	320	3	Intergenic	novelGene_31764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATAGCATGTTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296181	298516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296202_296439_296642_298418
860887	contig_9363_pilon	-	1007	7	Intergenic	novelGene_6840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.73205080756888	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	466	915	1627616	1626232	FALSE	10	TTATCGGCGGCGCCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDQTQIQEFKEAFTVIDQNRDGIIDKEDLRDTFAAMGRLNVKNEELDAMMKEASGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEDVITGAFKVLDPEGKGTIKKQFLEELLTTQCDRFSQEEIRNMWAAFPPDVGGNVDYKNICYVITHGDAKDQE	1633880	1626139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1626337_1626422_1626472_1626771_1626851_1626941_1627047_1627246_1627323_1627580_1627674_1633472
860888	contig_1244_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_37895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGATGTATCATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116013	115651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_115700_116000
860889	contig_7452_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_109165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCACGCATTGTGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202008	202402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_202000_202400
860890	contig_6069_pilon	+	587	3	Intergenic	novelGene_8085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0.5	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	55	372	573741	574409	FALSE	0	TGTGGCCTGTGCGTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPVCRQPGDQRLAHSAEMYHYQHQRQQMLCLERHKEPPKELDSASSDEENEDGDFTVYECPGLAPTGEMEVRNPLFDDSSLAAPPLASRSPSPLQCDPGPDTHQRPMGRGAEPGVSIRKNTL	573686	574624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_573788_574057_574155_574235
860891	contig_5217_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_135802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATGGTGCCAGCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703781	704461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_703800_704500
860892	contig_5196_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_38673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTTTCTAATCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78275	78963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_78300_79000
860893	contig_8168_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_168240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTACATATTTTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154870	155597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8168_pilon_+_154900_155600
860896	contig_3584_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_108132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAACAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300934	301549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_300900_301500
860900	contig_6137_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_59182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATGCTTAGCAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270754	1271295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1270800_1271300
860902	contig_4136_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_161259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCACTGACAATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392696	392165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_-_392200_392700
860904	contig_8676_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_142229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTCTAAATAAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696401	697225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_696400_697200
860905	contig_3825_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_78045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTGTCTGCTGTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435335	2436024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2435300_2436000
860906	contig_7630_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_133660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTCGAAAAAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534684	535274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_534700_535300
860907	contig_2710_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_161780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATCTTTCTGCGGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947865	948608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_947900_948600
860908	contig_11396_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_71251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGCCAGGCGAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108038	108770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_108000_108800
860909	contig_6412_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_149985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAATGAAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650760	650069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_650100_650800
860910	contig_11285_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_5524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667519	667047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_667000_667500
860911	contig_15905_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_154702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88777	89515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_88800_89500
860912	contig_3270_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_104514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTGGATTCATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410367	410730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_410400_410700
860913	contig_14666_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_39473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTCCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17166	17678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_17200_17700
860914	contig_1719_pilon	+	218	1	Intergenic	novelGene_87339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAAAAAAGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579158	579376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_579200_579400
860917	contig_16525_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_133837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGTCTTGGCGGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161733	161112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_161100_161700
860918	contig_8322_pilon	-	544	2	Intergenic	novelGene_143285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	28	423	569032	565001	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGW	569059	564879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_565192_568827
860919	contig_11989_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_68444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAATCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48286	48883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_48300_48900
860922	contig_19606_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_148263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATAAATAATGATATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10449	10932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_10400_10900
860923	contig_11978_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_62905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGATTTACTAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776776	777145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_776800_777100
860924	contig_4125_pilon	-	874	4	Intergenic	novelGene_25171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	14	517	965078	963647	FALSE	15	GTCCTCTGCCAGTGTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRRMALGKPAARGLLLLLPQVALGFADGSCDHSDQLVLLAVLLLLLCAVTASCVRFCCLWKQAHLPPPQPCDLTVIPVDSDSPVHSTVTSYSSVQYPLAMRLPLPFWELDPDTVAPPAYSLYVLELPPSYDEAVKTAKPSHQEPAPLPEAQPPPRNPPSQAPAPSLGPQA	965091	963289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_963892_963978_964143_964894_964939_965027
860925	contig_7619_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_162157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	328	510	341143	341726	FALSE	30	GATCGGAAAGACGTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAHQPLQVGREEAEDLWSPPGHLVDVAQDLQQILDGLAPGESLHVGGHLCCCQRGEEGDANQGQGASWALILTLFIQAPVSDTAPAGQAQPCQEGLEHHQVTVVEGQVMEHIRVLLQEGDSSRGITGDVLVDELHQLADEGGQVAGGLAVILECRQGHRAAQGCITWK	339026	342016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_+_339057_339265_339337_340019_340134_341030_341144_341544
860926	contig_3960_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_138052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725579	726214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_725600_726200
860927	contig_10074_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_57126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAAAAGAGATTTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339494	340810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_339500_340800
860928	contig_7912_pilon	-	705	4	Intergenic	novelGene_129574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	5.43650214343336	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCAGTTTTACTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309627	296804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_297078_305911_306039_308681_308721_309361
860929	contig_9389_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_84159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGTACAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1927116	1926692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1926700_1927100
860930	contig_10163_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_82648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGGAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168398	168785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_168400_168800
860931	contig_8276_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_174468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAAGAAGTCTGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99620	100276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_99600_100300
860932	contig_8276_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_174469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100994	101240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_101000_101200
860933	contig_14846_pilon	+	939	6	Intergenic	novelGene_85374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	37.6	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	45	938	151362	235617	FALSE	5	CCTCCCCAGCCCCCGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRLQDPGEGPSRMPGRQGPIGDDPLGGRLRKLSLGQYDNDAGGQPSFSKCNWGKTTTVDQDPSMASFLNSADTKETVITSYPSDIDVINGRIFSPTKNGSESAPSTPAFPVSPETPYVKTPPHYPPFNPLEPKMSSPVSLYKGAHDPRGRPEVLNHSVGMSERPTGPEPAVLWADMPTTPSLQQAFTSSCTISSNSPIQRRESPSSAEHQWLETSPKCTVSMLGSSQPAGALLGTSEFSGPMKDSPALPHFPPSELQGSFNSHELSLAERLPEALATQSGPAFLSFSGAAVGSGLPPGETAGTLLANSHG	151317	235618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_151378_187856_188030_189491_189619_189711_189796_233520_233693_235295
860934	contig_9554_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_170678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGGAGCCACCGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12146	12724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_+_12100_12700
860935	contig_2817_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_104357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTTCAGGAGCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424462	424937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_424500_424900
860936	contig_5765_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_141404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776275	776591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_776300_776600
860937	contig_5033_pilon	-	468	2	Intergenic	novelGene_29099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	332	409	781263	773365	FALSE	30	GCCGTAATGGGGTTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRVQRWAFSDKCNLLTRSHFSRDPPSISHRSQTAGGGQRKLSQPRSGRKDIKILQKSRDSRSNPDHDARPELRAAGAATAAPCRGRPGRRRRQRAQGGRDPRQFHGGRAMAVVHLAVQRQDQALEPFPRRPLED	781594	773305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_773382_781202
860938	contig_9099_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_149902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCAGGGTTTCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309977	309104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_309100_310000
860939	contig_8291_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_99955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAACATTTCAGAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507484	508494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_507500_508500
860940	contig_2377_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_67880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATAATTTGCAATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160760	161551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_160800_161600
860941	contig_19402_pilon	-	1011	9	Intergenic	novelGene_80871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	6.96419413859206	3	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	146	1009	221026	201027	FALSE	30	GGAAGAGCCAGAGTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATSSYSASAEPSWVRALVYGHHGDPAKVVELKNLELPAVGGSDVRVKMLAAPINPSDINMIQGNYGLLPKLPAVGGNEGVGQVVAVGSNVTRVKPGDWVIPANPGLGTWRTEAVFSEEELIGVPSDIPLQCAATLGVNPCTAYRMLMDFEQLQPGDCVIQNASNSGVGQAVIQIATALGLRTINVVRDRPDIQKLTDRLKNLGAEHVITEEGLRKPEMKNIFKAIPQPRLALNCVGGKSSTELLRQLAPGGTMVTYGGMAKQPVIAPVLLFPCLTSPTSHRPVQGADPHTVQLHPPRPADSPCLLRGPTAGLPACLGSFHEALRVFKADSYLVMI	233916	201024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_201228_202934_202996_206423_206498_208033_208137_209248_209352_212401_212546_220189_220322_220980_221079_233823
860943	contig_9921_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_23757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATACAAGGCAGGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301845	301537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_301500_301800
860945	contig_12566_pilon	-	512	2	Intergenic	novelGene_86017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1772	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCAAATGGGGAGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108905	107402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_107592_108582
860946	contig_15410_pilon	+	878	3	Intergenic	novelGene_130601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	303	677	141363	142427	FALSE	15	TAGTTCTATCCGGTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTQDDACSASKPPQTSGLFCVELIRGPAGFGLTFSGGRDVVGGDVPLAVLGLLEDGPAQRCGRLQAGDLVLHINGESTHSLTQAQVEERIHSGGPRLRLMLCRPFETHPGKPEVLRGPQKRDLSLDPRGPEVRRSCNASASPLQHPGSRTMANTWGSPEPSSEAVVRSAAVSPSERRTKDPDDQTPSSPGPWLVPSEERLSRALRAPGGAQLALEMAAARRRY	140946	142628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_141147_141260_141430_142119
860947	contig_7066_pilon	+	711	6	Intergenic	novelGene_42197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	4.44522215417857	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	184	528	1026049	1028319	FALSE	50	AAGAGGATAAAACCACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAVDCWSIGVISYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKNFAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLHLGTSQEGQGQMASHGELLAPAVGGPAAGCCCRDCCVEPGPELSPTLPHQL	1024460	1028502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1024508_1025419_1025533_1026025_1026105_1026197_1026286_1028010_1028129_1028236
860948	contig_6445_pilon	+	189	1	Intergenic	novelGene_77094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGGGGACGCTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094951	1095140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1095000_1095100
860949	contig_2027_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_39913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGGTGATAAATGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127819	128348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_127800_128300
860950	contig_10037_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_148958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTTAAAAACGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290996	292001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_291000_292000
860951	contig_6088_pilon	+	451	4	Intergenic	novelGene_161274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	231.373195412856	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	7	450	209385	217149	FALSE	65	TAGAAGAAAGGCAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNMIYTLRRTGLIFPIEAAKHGVGFQHPIRYMNDYQPSYGRSLRRTQRRRQHTYQTRSNIEHNSQASCQNSGVQEDSDSSSEEDETVGTSDASVEDPVIEWHSESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQATRKICSSSEEENLKP	209378	217150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_209475_210876_211027_216373_216451_217022
860953	scaffold_12124_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_22202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	168	491	1353319	1353642	NA	20	AGTGGTTAAGCGTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVQKNFLLGSSYRGSAVFSRSRKVGSSTTDVGYSPLADETHDGGRQLLLPLGVGAMARLGGQSVLGHLLRRLGLQLGEGGGERLTHLLCVALDKLAEFFRVILLQVVGQVGGVAGVGDLGHADAAIDLLPLQNASLRVRVEAEVLPHLAFCARVCHQLQVSL	1353151	1353949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1353200_1353900
860955	contig_14822_pilon	+	1142	8	Intergenic	novelGene_145427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.0690449676497	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	204	965	196511	199311	FALSE	0	TCCTCCTTGGTGTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSLSWSEQLDVLLNATDGNVARIKSGVRAQQPWVLKTPPTVPEGLSWAEAHSPSSVWDAVTILQSQLRSQAQVIEALRQAVQGLLEEREHQKYQICALEASLRLLQGGPERRVLLLEQRLEGLRRGLEGLRRELQGLRSQVQEQAQAQAQKQPGPGKYSATSGLYQELQNERQLLWKESEVLQEELKLLQDQLSQHQELLLKQMTEGRQVQACSWKISQEAPFLTWSPTAFSSRPRVLSRRTYPFRAPRSS	196183	199488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_196294_196417_196589_196928_197073_197175_197258_197417_197632_197748_197817_198044_198113_199203
860959	contig_5860_pilon	+	396	2	Intergenic	novelGene_147955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTATGAAGGTGACATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136876	138487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_+_137115_138329
860963	contig_11873_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_175438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTTGACTTAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177033	176601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11873_pilon_-_176600_177000
860964	contig_8120_pilon	-	756	2	Intergenic	novelGene_159717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	442	756	57119	48970	FALSE	20	TCTCCTTTCGACTCTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGVFRMRVWAPVGVLTSLAYCLHQRKAALAEPQEADRRNPVDRNLLELKMVQVVFRHGARSPLQPLPLEQSQQVEWNPQLLEVPSQTQFDYTVTDLAGGLKPH	57560	48969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_49069_56903
860965	contig_9833_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_68519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGCCTCTGTTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229012	229578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_229000_229600
860966	contig_15508_pilon	-	993	1	Intergenic	novelGene_177651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACCAACCCCTTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102093	101100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15508_pilon_-_101100_102100
860967	contig_11937_pilon	-	449	2	Intergenic	novelGene_171576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACGCAGTGATAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12660	11900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_12279_12589
860969	contig_18108_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_33464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTTATGTGGGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119253	118554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_118600_119300
860971	contig_7593_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_127344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	277	597	620163	619843	NA	50	CAAATCTATTTTTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPCQLASNWVQSKEGTRRRPVGQERETEVFLPCSFLLWLPVQAVPIPLHHSSCHVTPSSGLRSHQVPVTPFPLPAPLGLGIVTSSHCCWSQILQLLSYLCEKSLY	620439	619599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_619600_620400
860972	contig_6589_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_25751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCCAGTGTTTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608879	608143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_608100_608900
860973	contig_15105_pilon	+	460	3	Intergenic	novelGene_150945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	167	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGCTTTTCTCATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333958	338648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_333992_336811_336966_338375
860974	contig_2312_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_160739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237546	237059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_237100_237500
860975	contig_16766_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_153355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCATTCAGTAACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125190	125948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_125200_125900
860977	contig_6589_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_26308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTGTAGGGTTTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2296022	2295419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2295400_2296000
860978	contig_953_pilon	-	918	8	Intergenic	novelGene_130012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	19.8976975388345	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	8	841	350110	347366	FALSE	30	GAACATTGTCATATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMAPLRFSANLSWLFPELPGLTARFRAAGSAGFEAAEVAFPYAEPPEALARAAREAGLRLVLINTPPGDPEKGEMGLGAVPGRQAAFREGLEQAVLYAKAVGCPRIHLMAGRVPLGVDRASVRGEMERVFLENLRHAAGVLAQENLVGLLEPINTRITDPRYFLDTPQQVAAILQKVGRPNLQLQMDIFHWQIMDGNLTGNIREFLPIVGHVQVAQVPGRGEPDSPGELNFPYLFQLLEDEGYKGFVGCEYRPQGDTIEGLRWLRSYWDRQGCPQTGQ	350117	347288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_347440_347579_347715_347850_347921_348028_348079_348167_348247_348440_348556_349722_349835_349911
860979	contig_11677_pilon	-	850	3	Intergenic	novelGene_85885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGTATCTCTAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276954	273069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_273602_276195_276395_276835
860980	contig_3081_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_133934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAGTAGTTACATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209930	211091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_209900_211100
860981	contig_8286_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_139806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTCATCTTCTTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188378	189391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_188400_189400
860982	contig_15760_pilon	+	515	3	Intergenic	novelGene_131059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	203	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCCTAACAAAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424976	478135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_425186_441480_441568_477916
860983	contig_1069_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_172298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTCATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52070	52813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1069_pilon_+_52100_52800
860984	contig_4519_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_123741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCACACAGGATAATGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797864	796868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_796900_797900
860985	contig_12270_pilon	+	170	2	Intergenic	novelGene_114150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGATCAGCTCACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14038	14431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
860986	contig_7457_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_31458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	123	503	482560	482180	NA	15	TCCAGAGCCTTTTTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIECGPVHTAFQEKLEGGLGGALDSADAKTRDLFSRYQRHCERVFREAAQDPEEVTEVGAGRGSGSRGRRWCPCPARPARANEPLPVAAGLPHRTARPAARTALLYHRTLPAPGALALRRLQRL	482682	482029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_482000_482700
860987	contig_5050_pilon	-	700	5	Intergenic	novelGene_110241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	4.26468052730799	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	33	575	33413	28219	FALSE	35	AATTCAGTGACATTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPWDLSCSSAMVEPASLRDCQAWKDAGLPLSTPSNEACRLFDAILTQCVKWTNDKSLGGLEGCMSKLKEADPAFAMGHVISNGLLLIGTGTSVRLSPELAQALKVMVEISETQPLTQRERLHVSAVETFAKGNLPKACDFWEQILRDHPTDMLALKFSHDTYFYLGYQEQMRDSVARVYPFWTPDVPLSR	33445	28093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_28397_28941_29114_30029_30112_32193_32272_33380
860990	contig_5649_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_82429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGACTCTTGGCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439849	1439349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1439300_1439800
860991	contig_5845_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_98893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140953	140281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_-_140300_141000
860993	contig_7138_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_120978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAATAAAAGAAAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114296	113842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_113800_114300
860994	contig_9375_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_136045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151275	152046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_151300_152000
860995	contig_9955_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_21352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGAGAAGCCATGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127923	127308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_127681_127812
860996	contig_9957_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_173837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAATAAATTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299623	298717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_298700_299600
860998	contig_5337_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_136571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373920	373461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_373500_373900
860999	contig_1150_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_61455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAAACTCTAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327721	326893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_326900_327700
861000	contig_10367_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_169451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85066	84029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_84000_85100
861001	contig_7066_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_42126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAATAAATGTGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640000	640431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_640000_640400
861003	contig_14666_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_39498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTCTATTTCTCAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312265	311970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_312000_312300
861004	contig_10531_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_114511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGAGGGTGGCTTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365797	366712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_365800_366700
861006	contig_16046_pilon	+	578	4	Intergenic	novelGene_145508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.05480466765633	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	73	576	63777	66860	FALSE	20	GACCCAAGGGCGGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKVLHKDKSLENFGVLRNGGLLFRMTLLASGGAVMLYIRWKIMGTGPPAFTEVDNPASFADSVLVRAINYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSAGDWRLIVPAALWFCLIGLLCQALCSEDSHRRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGFCVLLTFGFGALSKHAKKKV	63475	66862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_63509_63737_63903_65221_65425_66685
861007	contig_6031_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_56737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192786	191844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_191800_192800
861008	contig_10238_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_170092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCAAGCTACCCCGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77417	76463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_76500_77400
861009	contig_13201_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_130880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGTTGGAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142973	142388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_142400_143000
861011	contig_9828_pilon	+	889	6	Intergenic	novelGene_172242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	153.156913001013	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	519	887	33561	48302	FALSE	20	TTGTATCTCGGAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGDGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGLDTGQQQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLT	10978	48304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_11250_31742_31864_33434_33592_36224_36353_47555_47681_48217
861016	contig_6842_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_130844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2071315	2070391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2070400_2071300
861017	contig_10196_pilon	-	191	2	Intergenic	novelGene_132086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGCGTGTGGGTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906147	905647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_905744_906052
861018	contig_2646_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_69582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATGAAAAAATACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388974	1387995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1388000_1389000
861019	contig_401_pilon	-	1145	10	Intergenic	novelGene_42935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2	460	2006866	2004570	TRUE	35	CTGTGGAGAAACAATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVQIPILVVFIFCRGGWGLLLLTGGQLINGHLVGDATCCPFLPFLLVFLNVSGPSRAEADHIRIRLSHFHIQRRLAPLEAGLVFRLGVLIRQGLHTLLCHISEHRERGLHNEVNETCNQSGTVPREWTCDHRVEKRAGPALPPCHPDGRIPP	2006867	1999921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2000037_2002301_2002444_2002846_2002949_2003056_2003182_2003308_2003409_2004468_2004590_2004901_2004989_2005311_2005424_2005917_2006050_2006758
861023	contig_17704_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_177185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAACTCTCCCCAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296082	297459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17704_pilon_+_296100_297500
861024	contig_2646_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_69599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463725	1464482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1463700_1464500
861025	contig_14711_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_68875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATACTGGATTACTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41106	40846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_40800_41100
861026	contig_13571_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_128132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACCATAGCCGAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334459	333335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_333300_334500
861027	contig_2476_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_157645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCTCTGTCAAGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484528	484833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_484500_484800
861029	contig_10968_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_84274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTAAATTTTAGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86077	86323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_86100_86300
861030	contig_15689_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_164162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCACTCGTATGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208041	207078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_-_207100_208000
861031	contig_4816_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_115602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAACAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65221	64704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_64700_65200
861035	contig_4496_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_66654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAAAAAAAAAAACGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745028	745331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_745000_745300
861036	contig_8357_pilon	+	325	3	Intergenic	novelGene_39705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATGTGTCTGTTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469003	470498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_469055_469571_469697_470349
861039	contig_4151_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_65242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCTCCAAAAGTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538695	539338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_538700_539300
861040	contig_9609_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_23098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	255	431	487696	487520	NA	15	GGGCTGCCTGTTATGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDPEDLVVNCGPRRLQCVRRTPGDQSGQRSPSQSEIPSRAERRRGASRSPASTCQYCSLPTRGVPVLAVRCASRPSRVCGPQVAMLSRTPSLSRLVPPRVCRATPTHRVKLPKPPPRRNSTFRDPLGGRGKPRHWRDGAVPL	487950	487313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_487300_488000
861042	contig_9972_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_162798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATAAATAATTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320814	321524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_320800_321500
861043	contig_10331_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_54197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	112	453	620968	621309	NA	35	TCTAAACAGTGATTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GACELLRLWASYEGAGSLVRYPAPPNGGFRPSSAHFGMSLNSHTFLPNTLSSASFFPSNPTILSCRASGHIGAGNPEHVPAGSLLPANPPGGRGHVVSPPAGRSKHAEQHGPASWRPPRDPPQGRGYSTAVGTMPATSLMHKIVDFLLLS	620856	621646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_620900_621600
861044	contig_14796_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_159376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGCCAAAGAACAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167958	168885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_168000_168900
861045	contig_3960_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_138038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATGCCAAAATTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622940	623343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_622900_623300
861047	contig_9571_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_136259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCATCTCATCATTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353371	354604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_353400_354600
861048	contig_11855_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_66927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGTGAGCATTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892988	893282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_893000_893300
861049	contig_10003_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_88152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAACGAAATATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379131	377964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_378000_379100
861050	contig_20614_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_107606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTCTGAGGGAAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451749	452432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_451700_452400
861052	contig_9185_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_166897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTAATTATCATGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288301	287964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_288000_288300
861053	contig_6842_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_130726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521138	521621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_521100_521600
861054	contig_1275_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_108728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGGGGTGAAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331124	330426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_330400_331100
861055	contig_5423_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_85165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCTTATACCTAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73404	73950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_73400_74000
861057	contig_835_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_152176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATTTTGCTAGATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404391	403838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_403800_404400
861061	contig_10135_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_106593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAGATCTAAAACTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40162	41313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_40200_41300
861062	contig_4816_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_115608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGCAGCAGCAACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641621	640975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_641000_641600
861064	contig_6102_pilon	-	569	1	Intergenic	novelGene_32402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTACCTTGGGCAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1815236	1814667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1814700_1815200
861065	contig_9871_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_75675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492327	491718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_491700_492300
861068	contig_12964_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_131676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210186	209552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_209600_210200
861071	contig_5419_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_15476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAGGAACGTGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77065	77834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_77100_77800
861072	contig_9415_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_109875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCTCCTGCCCCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2029557	2028939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2028900_2029600
861074	contig_9939_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_158600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGGGCCTTATAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169737	170785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_+_169700_170800
861076	contig_3193_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_126306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATCTTCCCTACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49985	50899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_50000_50900
861078	contig_4659_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_118247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCTCTTTAACCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834793	835141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_834800_835100
861079	contig_6132_pilon	+	399	2	Intergenic	novelGene_163614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGATGTAAGTATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64003	70406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_+_64116_70119
861080	contig_6410_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_108645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	784	1110	408236	408562	NA	75	GCTGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLGGLYWQPKGSHKAGLSHCPPELVNRPRLVNRPGLVNHPRLVNPPGLVKDGYKPDLLRRRWRGRHRKACLVHPQYKKGKWPEVSEESKLGLEIMKIALFIFLLSK	407452	408574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_407500_408600
861081	contig_3942_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_128603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTGGAAAGTAGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11771	12404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_11800_12400
861082	contig_11175_pilon	-	771	5	Intergenic	novelGene_61174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	1.4790199457749	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGAAAAAATGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85179	63847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_-_63886_67494_67650_73534_73722_84607_84834_85014
861083	contig_11396_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_71443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	57	461	1788974	1789378	NA	65	GGAGAAAGAAGAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRQVDLPGEARLERETGVMVTVAVGVAGGSVRAGQEGVPVDGVDFSRPCLLSTEAVGTGTLDWAHVSVKGACMLTACRGGRGASSRLLVPSSLQVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKVIAVFPGFLLPVDSSQWSGWGSTSLGGNLSSVPTKCV	1788917	1789699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1788900_1789700
861084	contig_6871_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_21617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	208	303	497223	497318	FALSE	25	GCTGACAGTTATTGAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKDLEEEWGEEFGGALDFHVEEAAGVAGPDHAEVSHLHQQLGPEVRNVVFAVVDVVLERQQEFPSLLPMAALGIGAAMGLRRNVDQVPLFGSGLWSLLQ	493904	497722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_494091_497201
861086	contig_14326_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_120685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGACTTGTCAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130634	130993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_130600_131000
861087	contig_4769_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_118019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAATATATTCTTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130607	1129624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1129600_1130600
861089	contig_10019_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_86674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAAAACTTTATTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257116	257414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_257100_257400
861092	contig_20550_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_142600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAATAACCCCCGTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2543	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_2500_3500
861093	contig_9216_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_163507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCAGTAAATTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566489	566071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_566100_566500
861096	contig_7285_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_143392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTGGTTCCCTTAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227774	227024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_227000_227800
861097	contig_19476_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_116809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	18	311	173665	176963	FALSE	15	CACCTTCTGCTGACCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCLHMLVLLVGFKIVYATFRSLLSSSVDLHQRHSSALDSTERKILHFSCFSCLGVHLEPVHLEAVLPSWQAADFEMSDCPFPVGVFSTTDPSFLVVPVSKW	173647	177563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_+_173693_174804_174907_176799
861098	contig_11982_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_100261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGTCGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119954	120321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_120000_120300
861100	contig_3960_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_138028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATCAAAGACACCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529640	530731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_529600_530700
861102	contig_1406_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_25524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1755431	1755741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1755400_1755700
861103	contig_1406_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_25525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGTTCCCCATTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1755946	1756532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1755900_1756500
861104	contig_6589_pilon	-	803	4	Intergenic	novelGene_26321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.62466929133727	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	2421046	2405269	FALSE	35	CATTCATGAATGGAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPDIFQLTLKGSNQAGPTLIHLLAGRSRIPRVLHCLRAWSAKRHLEAGESEPVSVTEPRDLQGCGCELYQGGVGPAGSCSEETLPRCDAGELREPGLHRL	2421047	2404772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2405276_2414390_2414518_2420349_2420439_2420963
861106	contig_11552_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_171663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTGTAATTTATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14021	12761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_-_12800_14000
861107	contig_4232_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_63161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46004	46648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_46000_46600
861109	contig_18533_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_174055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAAAAAAAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179342	180394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_+_179300_180400
861110	contig_2069_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_23328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGGATATCTGAGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574765	575618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_574999_575207
861111	contig_5279_pilon	-	695	3	Intergenic	novelGene_105546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	160	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	76	495	117981	111832	FALSE	85	TAAAAAGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEKGMSSGEGLPSRSSQVSAVKVTAEELETKQSHKEKRVGFVLVHAGAGYHSESKAKEYKHVCKRACQKAIEKLQAGALATDAVTAALVELEVFLFSVYVLFKMFMSWDSLFLSDVKVELGNHELYDQCFPTILTKL	118056	111631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_112039_113731_113800_117836
861112	contig_10437_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_38094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTTAGCAGCCGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32453	33055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_32500_33100
861113	contig_10404_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_138734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	426	725	1593936	1594235	NA	20	TGTGAGAACCTGATTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMIRETTILTEIQEQNHCTSVPQRNWTWEPGLAPRLPQGTEQQECVDPHLTAPPLMRLSNNQVSVSSTGFCLGRQLVSLLLYSVAFFYIIVSAFSHP	1593510	1594599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1593500_1594600
861115	contig_3817_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_78333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGGATACTGAGGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204263	203528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_203500_204300
861116	contig_8615_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_165212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCTCTGACATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57384	58475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_+_57400_58500
861117	contig_6047_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_24231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCTGATGGTTTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173662	174340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_173700_174300
861118	contig_6654_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_85689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAGGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44305	44715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_44300_44700
861119	contig_5350_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_99361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTAGTGAGAATGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204725	206317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_204700_206300
861121	contig_5482_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_144437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCCAAAAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162048	161396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_161400_162000
861122	contig_16620_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_156008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAAGTCACAACCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45392	45959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_45400_46000
861124	contig_7119_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_41030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAGAAAAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242227	241794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_241800_242200
861127	contig_6189_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_164950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGTCCTTACGCAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131233	131648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_131200_131600
861129	contig_12402_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_133368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTAGAGAAGCAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572442	571826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_571800_572400
861130	contig_5590_pilon	+	713	4	Intergenic	novelGene_163064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	2.16024689946929	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTATCATACACATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783085	797425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_783448_784161_784241_793009_793134_797277
861131	contig_5236_pilon	-	444	2	Intergenic	novelGene_100917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	50	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCGAGATTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454856	454303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_454705_454813
861132	contig_15866_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_63663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAGTTGGAAACAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590192	590572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_590200_590600
861133	contig_4350_pilon	-	683	4	Intergenic	novelGene_136390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	21.483844059096	195	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	29	532	295044	292683	FALSE	10	TCTCAGTCTGTCTCTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPEGFTWPKMAAPVCGGWFWLSVLAGSRELLCAWRALHTSSACAKNRAARVRVGKGDKPVTYEEAHAPHYIAHRKGWLSLHTGNLDGEDHAAARTVEDVFLRKFMLGTFPGCLADQLILKRRANQVEICALVLRHLPPHKFYFLVGYSETLLSHFYKCPVRLHLQTVPSKVVYKYI	295072	292531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_292967_294654_294767_294850_294920_295005
861135	contig_2310_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_71625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTAAACTGAGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235595	235308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_235300_235600
861136	contig_16667_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_153251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9581	9271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_-_9300_9600
861140	contig_9463_pilon	-	660	2	Intergenic	novelGene_83849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGGTTTTGAAAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221395	219861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_220011_220884
861141	contig_1379_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_134580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATTCTGTAACCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382763	382161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_382200_382800
861142	contig_11978_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_62856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTTGTTTAACAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576853	576177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_576200_576900
861144	contig_10064_pilon	+	690	5	Intergenic	novelGene_122720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.77263412660235	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	67	513	329105	348091	FALSE	20	CTGCGAGACTATGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPFSNTHYRIPQGFGNLLEGLTREILREQPDNIPAFAAAYFENLLEKREKTDFDPAEWGAKVDDRFYNNRAFQEEEPPEKDVPEKEQSQESVNEEETPVTVLESSEEDKEKMEFAAIKIQAAFRGHLARQEVKKMKLVERAKEETA	327946	348268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_327986_329077_329259_343360_343432_345206_345294_347956
861145	contig_9335_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_147445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGGAGACACTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371064	372131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_371100_372100
861148	contig_2358_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_156103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAACCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64713	63626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_63600_64700
861149	contig_11564_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_158592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAGTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195583	194919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_194900_195600
861150	contig_9189_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_165124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTTGCCTTTAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393268	394138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_393300_394100
861151	contig_7943_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_173138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACCACCGAGCCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161271	161762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_161300_161800
861152	contig_14472_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_111181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTTTTTATGGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373378	373860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_373400_373900
861153	contig_15777_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_75746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCCACCTTTGCGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208791	209211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_208800_209200
861156	contig_7004_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_126454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAATCCTGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283564	284131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_283600_284100
861157	contig_17897_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_153396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAAAAAATCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15364	16290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_15400_16300
861158	contig_3797_pilon	-	1186	3	Intergenic	novelGene_120114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGCGGTGCCCAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717422	544466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_544597_677343_677388_716410
861159	contig_3130_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_103570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCAATTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105261	105555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_105300_105600
861160	contig_5467_pilon	-	267	2	Intergenic	novelGene_111952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1811	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTCTTGCTAGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88489	88115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_88311_88417
861161	contig_1380_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_138883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGTTGGACGTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130570	130101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_130100_130600
861162	contig_1984_pilon	-	501	4	Intergenic	novelGene_173199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	221027	214996	FALSE	60	AAACAAAAATTTAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVYPVVLKISSKNISFTSNGLPCIYITGQLPKYLIKRFTSNAALERISFKVGCFCNRSLSFVSKKSLNRSLSCTSSTITCVTVDNVLSPAINVRSNTPLVQNVRSVFGETLLSNRI	221028	214846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_-_215015_216416_216521_217374_217533_220957
861163	contig_91_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_127081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTTCTATCAAAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93039	93673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_93000_93700
861165	contig_563_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_169763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAAGGCCCTCGTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631191	631495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_631200_631500
861166	contig_16109_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_80328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACAAAAAGTAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264944	264161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_264200_264900
861167	contig_4845_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_53694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATCTAGGGTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881617	880706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_880700_881600
861170	contig_11590_pilon	-	288	3	Intergenic	novelGene_125580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	22	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAATTACATATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451054	449505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_449617_449956_450084_451004
861172	contig_13645_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_146169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1	423	429610	429188	NA	15	CAGGAGAGTTGTGGGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVDGLQVDLQHGQAVKVPLGTVGAAVDNLGPALPVIPHLLLPPQRLQGGVWGGAALHRGTGVRRGAAHGGHAAQHRVGADTVVAGVGLPVAVQVAVDLLHRGELLGAHGALVFLVGVGLVDVGEQRVLVDEDLGAVDAL	429610	428610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_428600_429600
861173	contig_4024_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_177894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	60	371	90251	89940	NA	30	AATGGGGTCAATAGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDMFCHGKRVARSGISNWKRGTCTITTIFCSSSIMKREPDSAYLVRGIRGKDTVLGLIQASVPWYDHRGKRQNLVEIKSKELIERQGNLQYRDHKVQRVLN	90310	89349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_89300_90300
861174	contig_3817_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_78397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227531	1226878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1226900_1227500
861175	contig_6069_pilon	+	697	5	Intergenic	novelGene_8073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	71.0154032587297	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	72	614	560908	566722	FALSE	45	TACAAATTTTGTAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPLLPDSLLSAVPRHPRPARPLMAGKVLPLLLLAVAGLVGLLLLCVRTRDVREPPGLKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYADNPSRAGQSLVECLDQALRDVPKERHAGTPLYLGATAGMRLLHLTDPEASAEVLLAVTQTLNSYPFDFRGAHILSGQDEGVFGWVTANYLLGVGFLF	560836	566805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_561016_562528_562647_563216_563368_563516_563662_566701
861176	contig_6471_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_172094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGGGCTCGCCGTACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76914	77888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_76900_77900
861177	contig_20756_pilon	-	726	1	Intergenic	novelGene_176925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACAATAAAAGAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11436	10710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_-_10700_11400
861178	contig_776_pilon	-	559	5	Intergenic	novelGene_139931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	91.6324178443415	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	88	468	861870	833127	FALSE	20	GTTTTAGCTATTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGPGEKGPAESWVRVDPASLVPECSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRYYGPIPYGLIRGRIFFKIWPLSDFGFLRDNPNGHRFSDD	932095	833035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834687_834799_857382_857510_861796_861886_932023
861179	contig_744_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_145078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACTAAAACTGGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199991	199308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_-_199300_2e+05
861180	contig_3270_pilon	-	776	6	Intergenic	novelGene_104473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.56116276042	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	118	711	159921	139599	FALSE	25	TGAGTCTCACGAGATGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDVEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARGIKRRQSSFIRNKSHVGGPTRRDSSSF	161528	139533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_139682_141828_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450
861181	contig_16595_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_150141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACCTAAAAAAGGAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195543	196737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_+_195500_196700
861182	contig_5018_pilon	-	976	2	Intergenic	novelGene_46930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	170	337	197006	195972	FALSE	25	GGCATCACATAGATGCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGLSTSIPCWVAGHWTRRTSRGSQKSSGDTCRLGARGRRVLGAGAVAGGKSGPSWLMAPTGCVVRGARRSGVVAAGEAVLVSGVGRAVVVVLRGREVAGPALGSGGPNSRL	197175	195332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_196007_196873
861183	contig_4654_pilon	+	611	1	Intergenic	novelGene_103066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTTTTTTTTAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451969	452580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_452000_452600
861184	contig_11396_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_71265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATATTATAAAATACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193657	194909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_193925_194614
861185	contig_9735_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_177948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28265	27585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9735_pilon_-_27600_28300
861186	contig_5302_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_81549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTACCTTTAGATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654470	1655037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1654500_1655000
861189	contig_7229_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_39791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCGTCTGCGGGGCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836205	836877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_836200_836900
861191	contig_14744_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_65944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTCCGGCTAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223994	224722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_224000_224700
861193	contig_9044_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_177949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGTGTTGAGACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3971	3541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9044_pilon_-_3500_4000
861195	contig_4211_pilon	-	406	3	Intergenic	novelGene_80250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	25	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	34	405	1246842	1239614	FALSE	45	TCAAAGAAGAACAGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQLREQLPRYLMGETQLCTTRCVLKELETLGKDLYGAKLIAQKCQVRNCPHLKDAVSGSECLLSMVEEGNSHHYFVATQDQNLSVKVKKKPGVPLMFIIQNTIVLDKPSPRTIAFVKAVEAGQLVSGHEKQNIKQ	1246875	1239612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1239782_1240689_1240865_1246813
861196	contig_6839_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_161877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296066	296836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_+_296100_296800
861197	contig_8330_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_71716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	100	372	107932	107660	NA	85	GAAAAAAAAAAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSPGPRQGRGIAGPAALVPHRAGRGHCCLSSAMLGRSGYRALPLGDFDRFQQSSFGFLSSQKGCLSPERGGVGTGAGEWPPRTADPGGACRRPYSQTPSPLRNQLARPSRTLRGGTERRLRR	108031	107504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_107500_108000
861198	contig_6470_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_145595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGGTGGTTTATCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942322	941192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_941200_942300
861199	contig_6278_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_119813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTTGATTGGATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395899	396717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_395900_396700
861200	contig_17885_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_177953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	29788	29453	NA	25	TGCCCTCAGAAGTCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTRSLAASELRGEGRGPGDGGGREGCAAGALGAGWRSPAPRSARSEVAVLCCRGGSECLGDAEDAGTRSRFPEKAQLFPTPLSLQTWCFNRGFKIESLVTDLWHKYSSYG	29789	28868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17885_pilon_-_28900_29800
861201	contig_5715_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_127977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCTGGAACATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607640	608126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_+_607600_608100
861202	contig_10196_pilon	+	797	2	Intergenic	novelGene_132186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	77	406	1084288	1084734	FALSE	35	TGACAGAGTGAAGACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASEELLREHYSELRARPFYGRLVRYMGSGPVVAMVSAGGAGGRPGARTRADHTPRPLQVWQGLDVVRASRALIGATDPADASPGTIRGDFCIEIGKNVIHGSDSVESARREIALWFHADELLCWEDSAAHWLYE	1084211	1085125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1084500_1084616
861203	contig_6823_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_131213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAGATAAATATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203148	203823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_203100_203800
861204	contig_9799_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_145569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057797	1057364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_-_1057400_1057800
861205	contig_17144_pilon	-	1066	2	Intergenic	novelGene_29132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	220	510	37972	37682	FALSE	20	GTGGTGATGAAGGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNRRCSLSVFNSSRIPVSFFSSCTPISSRDLLRDSTSSFSLTTSTLSSLLSVGFSGTREWREGVSWGSGVGLMGCGFFPAGANSVGGTSSLGDTSLFGGASSFGAVSSFQVASSSPGVSCRRGAASFEGWALSGVGMDSGLDLSSGWSGEVSLSSRWGLVTQKLHPGV	38286	37125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_38129_38223
861206	contig_16963_pilon	+	1094	5	Intergenic	novelGene_177954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	34	672	45159	59505	FALSE	30	TTTTATCTGATAGAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPLPPPPPLIMGPGPRLLLPLVLCMGLSALVPSSRASGARKRGPLVTDKVFFDVRIGDQDVGRIVIGLFGKVVPKTVENFVALATGEKGYGYKGSKFHRVIKDFMIQGGDFTAGDGTGGVSIYGETFPDENFKLKHYSIGWVSMANAGPDTNGSQFFITLTKTSWLDRKHVVFGKVLDGMTVVHSIELQATDGHDRPLTDCWIVNSGKIDVKTPFVVEVSDW	45125	59927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16963_pilon_+_45276_51878_51993_52484_52579_56829_57015_59376
861207	contig_11720_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_44021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTCATAAAGGCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323799	323273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_323300_323800
861208	contig_1008_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_121553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACGGGGAAATTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533795	534306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_533800_534300
861210	contig_2596_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_53462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAAGTTTTCCCCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627690	628049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_627700_628000
861211	contig_16122_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_134562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTTCTTTCTCTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363114	366796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_363166_366514
861214	contig_6871_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_21614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGACTGTAATTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493084	493374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_493100_493400
861217	contig_1443_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_28370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAACTAAGAATCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991023	991594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_991000_991600
861218	contig_5894_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_83058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAAACCCATTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577262	576541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_576500_577300
861219	contig_5954_pilon	-	228	2	Intergenic	novelGene_28446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGATGGAAAACAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99031	98635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_98701_98868
861220	contig_1925_pilon	+	259	2	Intergenic	novelGene_162227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAGACCTGTATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592747	597311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_592805_597109
861223	contig_11068_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_130557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAGGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581921	582559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_581900_582600
861224	contig_7207_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_72038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATTCCGATGCAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297975	297335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_297300_298000
861228	contig_5403_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_87985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAAGCACAGTGAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458638	459087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_+_458600_459100
861231	contig_4732_pilon	+	216	2	Intergenic	novelGene_75411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5569	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524534	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524671_525073
861234	contig_14637_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_114544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294780	295564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_294800_295600
861235	contig_12050_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_62625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341607	340688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_340700_341600
861236	contig_9389_pilon	+	1091	7	Intergenic	novelGene_84143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	53	junction_6	37.7510117598044	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	787	1089	1809965	1810343	FALSE	25	TCAGAGCCCCAGCATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVYKSPHSPFYQLPPAVQRHASSPLLAAPTPPALQKLLESFKIQYLQFLAYTKTPQYKANLQQLLDQEKEKNAQLLGAARQLFSHCQAQKEEIRRLFQQKLDELGVKALTYNDLIQAQKEISAHNQQLKEQTEQLEKDNRALRGQSLQLLKARCEELKLDWPTLSLEKLLKEKQALKSQISEKQRRCLELQISIVELEKSQRQQELLQLKSYVPADEALSVHLRGKGALSREQEPDPSRLHLELDCAKFSLPSFSSLSPELSMNGHTASYELYSTLSRSSSKQNTPQYLASPLDQEVVPCTPSHGGRPRLDKLAGLALPDYTRLSPAKIVLRRHLSQDPAANGKAAAGELHPRVEHAKENGLA	1803416	1810345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1803532_1804103_1804196_1807816_1807919_1808133_1808272_1808995_1809122_1809751_1810237_1810312
861237	contig_5482_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_144509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACAGGGGACCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689611	690715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_689600_690700
861238	contig_9982_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_55771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGTGGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538650	537563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_537600_538600
861239	contig_11078_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_172002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307212	306509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11078_pilon_-_306500_307200
861240	contig_20507_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_164206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	120	374	109844	109590	NA	10	CAAGGTGGCTCCTGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTGLVEGREPSFHLSFLEETQEFLGPGLQAFVSCCSRVIMGVGGLFILPVLTPAWTPECPIPVPLVPSGLAGARNRRNTSPESACFPSKCTPLPPWCLALTPTPAMAPLQRRDWRLQQGFPFS	109963	109463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_-_109500_110000
861243	contig_6175_pilon	-	780	4	Intergenic	novelGene_16372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	18.8030730348939	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	108	779	1862256	1850937	FALSE	30	CCAACAGGATTGAAGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRCTGGPWVRNEVIDVDGTKRRTLLEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVIGTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATKCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLETTNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSSNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVIEFGLDYPEGMAVDWMGKNLYWADTG	1862363	1850935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1851060_1852961_1853252_1856471_1856689_1862214
861244	contig_7411_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_137060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGGCTTCTCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019337	1018636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_1018600_1019300
861245	contig_7049_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_171441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	94	393	134905	135204	NA	15	AAGCTCTCCTGTTTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGAAFLRDVTEACEGAAGSVYRGHTARTPGMPTPQLPLLLALGAHPPPTRSHYMQTTPPRPRGRSPGRTRWSLRAAPSPLGGAAGVQQHRQRLLGRVPPLFFYSAISGHGCGGHPGLEPGAPQSHLHLDH	134811	135205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_134800_135200
861246	contig_11751_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_150305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTTCATTAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175559	174454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_174500_175600
861247	contig_1301_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_47374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCACCAAACACATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657102	656532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_656500_657100
861248	contig_7079_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_129229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGCCGCCTCCCTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335251	335684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_335300_335700
861250	contig_7308_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_159620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGTAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587256	587847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_587300_587800
861252	contig_13004_pilon	-	745	2	Intergenic	novelGene_112641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	159	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	291	632	287899	279487	FALSE	35	TAACAACTATGTGTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELEPEVQAIDRSLLECSAEETAGKWLQATDLTREVYQHLAHYVPKIYCRGPNPFPQKEDMLAQHVLLGPMEWYLCGEDPAFGFSKLEQVNKPSHLCGRVFKVGEPTYSCR	288189	279373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_279751_287821
861253	contig_10000_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_139343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTAGGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320427	321228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_320400_321200
861254	contig_1309_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_73958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTTGAGTAAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88662	89490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_88700_89500
861255	contig_15991_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_70935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAAATTGTAGTTTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115121	114789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_114800_115100
861258	contig_960_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_108331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCAATCCCAGCACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190899	1189768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1189800_1190900
861260	contig_2829_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_175003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATTATTAGGTAGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331138	330448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2829_pilon_-_330400_331100
861261	contig_1694_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_144943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACCTTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568769	567880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_567900_568800
861262	contig_5571_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_75524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAATCAGATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181953	182418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_182000_182400
861263	contig_16122_pilon	+	588	4	Intergenic	novelGene_134542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	17.2111075245674	144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	22	480	234895	236716	FALSE	40	ACCCTGATATCATGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEVAQVLEAADFAARKHRWQRRKDPEETPYINHPIGVARILTREAGITDIVVLQAALLHDTVEDTNTTLDEVELHFGAQVRHLVEEVTDDKTLPKLERKRLQVEQAPNSSLGAKLVKLADKLYNLRDLNRSTPKDKNIYFGGVQCFMCLG	234873	236824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_235007_235301_235358_235465_235707_236666
861264	contig_14784_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_177955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGTTAAATACATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9950	9626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14784_pilon_-_9600_10000
861265	contig_14341_pilon	-	243	2	Intergenic	novelGene_111761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAAGGATTGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226575	223426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_223508_226413
861266	contig_14034_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_72626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTGAGTAAAGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82584	81943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_81900_82600
861267	contig_10196_pilon	-	469	3	Intergenic	novelGene_132327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36.5	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	24	467	2396440	2395671	FALSE	20	TCAGAAACTCGCGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNRHASAMLSAQERAHVAQVWDLIAGHEAHFGAELLLSPAPGRLPGPRASSEPRTANARGSGRGRAAPGQPARCTEPAGRPARASAARGPLQLPAADPVFPRGAGLPFAGRVHGGNAGSMGQVPDGRGRGADREVSLSTAPRRPGSVRVNKRGLE	2396463	2395668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2395853_2395954_2396125_2396348
861271	contig_9527_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_134097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACAGAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741348	740839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_740800_741300
861272	contig_4689_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_165416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAGGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197185	1197626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1197200_1197600
861278	contig_9363_pilon	+	323	3	Intergenic	novelGene_6540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	13	306	672231	672850	FALSE	30	CCCTGGGGCAATAAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITAMALPLRFLSRGLATAAKGGHGGAGARTWRLLSFTVALPSVAVCTLNSWLHAGHGERPEFIAYHHLRIRTKPYSWGDGNHTLFHNPRVNALPTGYETH	672218	672867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_672304_672518_672656_672766
861279	contig_205_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_144316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATATTTTATGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280502	280252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_280300_280500
861280	contig_205_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_144315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280086	279918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_279900_280100
861281	contig_11756_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_106030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTATTGGAACTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41757	42774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_+_41800_42800
861282	contig_10800_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_152626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTCACTGTCTACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503151	503677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_503200_503700
861284	contig_16231_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_176716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123186	123819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_123200_123800
861285	contig_2716_pilon	+	591	8	Intergenic	novelGene_173552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	37.1560416160202	431	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	89	589	502816	525204	FALSE	30	CTGTGTAGAAGATCTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSRSTCEDLARRVTSAVWRRAGPGVCPAMPAEQPASSGGSLASDMVEQPETAVITPAMLEEEEQLEAAGLERERKMLEKARMSWDRESMDIRYRRLQHLLEKSNIYSKFLLTKMEQQQLEEQKKKEKLERKKESLKVTKGKNSVDSSEENPVMRKKRGREDESYNISEVMSKEEILSVAKKNKKENEDESSSSTN	502727	525206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_502847_503265_503388_509945_510069_515459_515517_517484_517522_517614_517680_519744_519787_525180
861286	contig_4350_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_136392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	633	104	736	310823	310191	NA	20	AGACTCTTCTCAGCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSHWLQFKLLTDISSAVFILTDNISKKEYKLLFSMKESNTKYYFILSPYRGKRNTNLRFLNKLIPVLKIDYSHVLVKVSSTDSESFVRRLQSIVRCVMRSPCRRVSVEDMAHAARKLGLRVDEDCEECQKAKERMEKITRKIRDPEAYKREELRLQGEPWRKVAQVEKELCQLHWAGDSPEKCRSELRGRLLELRAQQNSLDPTWGVQEFVRGISSPSPGEKQYFLRWMELGLARLAQQRLRPPP	310926	310189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_310200_310900
861287	contig_10432_pilon	+	506	3	Intergenic	novelGene_171308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	20	406	128819	141040	FALSE	25	GAGCAACTGGTACAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPGASARALLLTTAPGPGRKRRARAAGAATSKQQVLDEEEYIEGLQTVIQRDFFPDVEKLQAQKEYLEAEENGDMERMRQIAQSLGLLLGPGLAGPASRHGACCRAAATPPEDSGLLEAQLWDRGS	128799	141140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_+_128954_130247_130362_140902
861288	contig_6616_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_141762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	385	765	345711	346091	NA	10	GCTGCAGCGCGCTCCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRCKHVGRLRLAQDHSILNPQKWCCMECSTTESVWACLKCSHVACGRYIEDHALKHFEETGHPLAMEVRDLYVFCYLCKDYVLNDNPEGDLKLLRSSLLAVRGQKQDQLVKRGRTLRSMASGEDLV	345326	346093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_345300_346100
861290	contig_15471_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_175219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACACAATAAAATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286407	286180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_286200_286400
861291	contig_8268_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_147004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGACAATCTATTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267940	266770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_266800_267900
861293	contig_1210_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_171523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGGTAGCCAAGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294378	294887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_294400_294900
861296	contig_15282_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_177719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCACGCTGTTGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75114	75584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15282_pilon_+_75100_75600
861297	contig_7056_pilon	+	623	3	Intergenic	novelGene_43690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGGCTGCTCTCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903165	905529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_903283_904750_904996_905268
861298	contig_10414_pilon	-	510	5	Intergenic	novelGene_146942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	47.0445267804874	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGCAGGAACCTGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174554	162124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_162227_162818_162908_163477_163606_166211_166294_174445
861299	contig_7347_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_172495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAACATGTCCAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50415	49953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_50000_50400
861300	contig_10674_pilon	-	455	3	Intergenic	novelGene_6415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	265	444	29866	28779	TRUE	30	GGTGAAGCTGCAGGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIAPSAIKLKFSRRSECTSAPPQISPCCWGGLSQPSKLSPGVVPGLRITQGPAEPAEQRSDVKILLTDRTLLISDSCVSKACTHWPERMSHTMAFLSHPPDTKVFPVSEGARSKQRTSATCPWKLCSSCPLSTSHKAHVPSPLAVRI	30130	27113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_27121_28774_28926_29833
861301	contig_5551_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_134217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAATATAAACCCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94772	95144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_94800_95100
861302	contig_15376_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_154692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232862	232484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_232500_232900
861303	contig_9177_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_32737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGGCAGCTGCTACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920000	920996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_920000_921000
861304	contig_5236_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_100911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.7651576458218	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACGAATGTTAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436163	451231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_436191_446976_447282_448525_448629_451153
861305	contig_2455_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_119229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGCGTTTTCATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439506	1439912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1439500_1439900
861306	contig_7760_pilon	+	159	1	Intergenic	novelGene_138435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTAAGGGCTCGGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159875	160034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_159900_160000
861307	contig_5569_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_86738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGGAAAAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444261	443156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_443200_444300
861309	contig_15365_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_111134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACAGCATGCTAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110258	110781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_+_110300_110800
861310	contig_1230_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_28821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388514	389695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_388500_389700
861311	contig_1244_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_37958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTACCCAACACCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887642	888280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_887600_888300
861312	contig_5451_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_167172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCTACAACCAGAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461340	460800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_460800_461300
861313	contig_16122_pilon	-	840	6	Intergenic	novelGene_134518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGAAGTTCAGGTCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152030	141717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_142175_145554_145637_145989_146054_147636_147683_147880_147952_151910
861314	contig_16110_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_126791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAAAACAGTAGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84754	85470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_84800_85500
861317	contig_11285_pilon	-	510	3	Intergenic	novelGene_5494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	280	348	224441	224373	FALSE	20	GATGCCCAGCATTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEDYRVLGSTANETEKKSTRRKKESSDNQENRGKPEGGSKARKERTAFTKEQLRELEAEFAHRNYLTRLRRYEIAVNLDLSERQVKVWFQNRRMKWKRVKGGSAHLPTWAGPRGW	239163	224210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_224469_225671_225845_239084
861318	contig_11413_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_103163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAGAGGCAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375670	375076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_375100_375700
861319	contig_9646_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_117453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTGGAAAATCAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286128	287082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_286100_287100
861320	contig_6418_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_81152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAATGGCTTGCCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258366	259671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_258400_259700
861321	contig_1107_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_126605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTGATTTTTCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077237	1076308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_1076300_1077200
861322	contig_8671_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_126279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575833	575316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_575300_575800
861324	contig_9027_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_156349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAAGGAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39973	40672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_40000_40700
861325	contig_5424_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_172798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7391	6548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_6500_7400
861327	contig_9389_pilon	+	431	2	Intergenic	novelGene_83997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	9	332	388899	392217	FALSE	10	GCTGGTGACCGACTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAMGPQVGPQVAPPPPLSLLLQALLLSALLYGAQGATLSTQPTAKTTPSSPPPPAVTNDSQPGSPHNGTHPLSSPGSPLLRSFYVLTGISGLAALYFLVWTVTVAAPPP	388890	392316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_389182_392176
861329	contig_7197_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_177266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCCTTCTGAAACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33985	33446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7197_pilon_-_33400_34000
861332	contig_10436_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_108508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGAGAACCAAATCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104585	103907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_103900_104600
861333	contig_7695_pilon	-	609	4	Intergenic	novelGene_41586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	46.1808040928985	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	77	451	423117	410001	FALSE	10	TTGTTTTCATGTGGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRCWELRFSTRAHLILQPVAGSRMSSASGDNGTSCTHRGDLGNVLADADGRVVFRMEDEKLKVWDVIGRSLVIDEGEDDLGRGSHPLSKVTGNSGKRLACGIIARSAGLFQNPKQICTCDGLTIWEERDRPISGEGRKQPAQPPAHL	423193	409842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_410155_410252_410357_410427_410506_423078
861334	contig_14814_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_137723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGGGTTTTAGCCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298821	298341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_298300_298800
861335	contig_20165_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_54474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	496	966	55714	55244	NA	20	AGGAGCTAGTCCTGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLQTTQSCSVLCSETLESTRQSSCSLHRPEPHPQNLACHGSSHAWLTDGHGLPSQAETRNSTPKVPALASRVIAEQGPLASPYGYSAPSHWRPLSLSWRLCAVTPGASALVPGPTSHLEAGTAPEPVSLKEAWMPPSHVVSTERQPASEQPALPL	56209	54882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_54900_56200
861336	contig_19098_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_65806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATATTTTTTTTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260664	259745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_259700_260700
861338	contig_4505_pilon	-	724	2	Intergenic	novelGene_176038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTTTTGATGCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91261	90269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_-_90324_90591
861339	contig_6364_pilon	+	727	5	Intergenic	novelGene_51775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_4	21.2764541218691	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	119	727	1051635	1077833	FALSE	35	GTAACGAGTGAGCCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKALDKFLKRITDHPVLSFNEHFNVFLTAKDLNAYKKQGMALLTRVGESVKHVTGGYKLRSRPLEFAAIGEYLDTFALKLGTIDRIAQRIIKEEIEYLVELREYGPVYSTWSALEGELAEPLEGVSACIGNCSTALEELTDDMTEDFLPVLREYILYSDSMKSVLKKRDQVQAEYETKLEAVALRKEDRPKVPADVEKCQDRMECFNADLKADMERWQNNKRQDFRQLLMGMADKNIQYYEK	1048950	1077833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1049042_1051607_1051804_1053562_1053763_1064443_1064531_1077680
861341	contig_2817_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_104349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAATAAAAAGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303189	303417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_303200_303400
861344	contig_9995_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_47660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAACATATCAAATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121277	122158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_121300_122200
861345	contig_12886_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_135525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTGAGCAGCGCTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813894	812982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_813000_813900
861350	contig_3942_pilon	+	504	3	Intergenic	novelGene_128655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	883	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGACTGATGATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178308	180106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_178490_179045_179172_179909
861352	contig_8461_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_163916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAGCAGGAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140046	140717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_140000_140700
861353	contig_11427_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_79025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAGGAAAAAAAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822108	822510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_822100_822500
861354	contig_11883_pilon	-	1014	2	Intergenic	novelGene_163762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTCTTGATTATCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20492	17045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_17192_19624
861357	contig_6724_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_167985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTAGGGACAGGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390033	388784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_388800_390000
861359	contig_6829_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_123774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAAAGAGGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86358	85697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_85700_86400
861360	contig_13101_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_172779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197240	197740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_197200_197700
861361	contig_12142_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_147815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATCCCTAGATGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109621	110111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_109600_110100
861362	contig_7644_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_64269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCCTAAGTCAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256594	256978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_256600_257000
861363	contig_14017_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_165692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCAGTGATTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65945	65545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_65500_65900
861364	contig_3077_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_26912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAACACAGTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1804265	1804723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1804300_1804700
861365	scaffold_16539_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_68326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	207	371	282230	282394	NA	25	GGCTGAGATAACTTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELVWEGGSSSGAKAGAGPSQGWVLEPDGAGFSPRHSAARGPARKPGPHTQRKLPGVFSQRPGAQGVGMRRHSSTSEGTEGAGQGVSGQSPLPCLRPPRPPGSPMQWVPWGLSRKPESHTQV	282023	282682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_282000_282700
861367	contig_3081_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_133955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAATTAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622910	623428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_622900_623400
861371	contig_19986_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_159231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAAAAGAGGGCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54043	53403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_53400_54000
861372	contig_11216_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_173600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTTGCTCTGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150812	150097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_-_150100_150800
861373	contig_12654_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_129281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACGAGGTTCATATTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705191	705560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_705200_705600
861374	contig_17127_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_168310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAACAAGAGAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90684	91478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_90700_91500
861375	contig_5092_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_62257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCATTCACTGGAGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165035	164633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_164600_165000
861376	contig_755_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_119790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTGGGACCTCATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598154	597593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_597600_598200
861377	contig_11978_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_62933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTACCTGTTCCATCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949768	949068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_949100_949800
861378	scaffold_12510_pilon	-	706	4	Intergenic	novelGene_151405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	157.472396170108	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	5	466	602701	599424	FALSE	25	GTGTGTAGCTCAGTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKAMCKRRSWMSKVFSGKRPEAEFPPHHSQSTFRKTSPTTGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLHLFEKLGDGSFGVVCRGEWDAPSGKTL	602705	599183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_599430_599603_599826_601680_601752_602538
861380	contig_5936_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_53579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAGAAAAAATATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325871	325248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_325200_325900
861381	contig_9267_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_162006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTCCAACCAGGTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230237	230786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_230200_230800
861382	contig_8276_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_174466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGACACTTGGCACAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94055	93167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_93200_94100
861383	contig_14142_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_120435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66676	66255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_66300_66700
861384	contig_15727_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_158076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8503	8086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15727_pilon_-_8100_8500
861385	scaffold_4805_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_161041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.82915619758885	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	229	552	793412	797049	FALSE	80	AAAAAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCSFKRACVLLSSSIEYSEFRTERDVCAFCISEDEQREKSVSHHTVQQLVVEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKKCAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAYQASLRKEQLRVDALERTLEQKNKEIEELTKICDELIAKMGKS	789120	797466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_789218_793280_793442_793691_793799_794524_794646_796983
861387	contig_8907_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_85789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTAAAAAAAAGTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76693	77356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_76700_77400
861388	contig_18391_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_174086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCATGAGATATACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8266	8719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_+_8300_8700
861389	contig_10795_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_171290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107384	107823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_107400_107800
861390	contig_9389_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_84091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTCCTGTTACAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264834	1263870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1263900_1264800
861391	contig_5280_pilon	+	588	2	Intergenic	novelGene_52641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTTTGCCAAAGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127211	127907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_127336_127443
861392	contig_2878_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_176498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGACAAGGTTACATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239380	238514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_238500_239400
861393	contig_6217_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_109570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68931	68168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_68200_68900
861394	contig_11702_pilon	-	627	6	Intergenic	novelGene_141977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_5	60.8230219571504	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	27	536	374527	372981	FALSE	20	CAACCACAGTCTCGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGLVAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLRLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDIIRHIRIINGRAVEA	374553	372889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_373083_373301_373363_373453_373549_373930_374078_374165_374269_374525
861396	contig_6674_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_148004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAATAAATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152835	152065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_152100_152800
861397	contig_13171_pilon	-	976	7	Intergenic	novelGene_177958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.4675241068906	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	219	863	132036	126086	FALSE	20	AGACTTCGTTCTTGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPDLSSTFAVSTLDPAFLQDSEIPLSSEDHSCPQSVDLFPCNDLEPQMPTRARSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSVGYQLGKPSLISHLEQEELLRTEERGSHQGTCPDWEIPSKTKWSILLEDIFGKELSNGVTAVRISWKRENSLQIIRVDVEWRCVQPRSLSSCADENSYWERMNFPVNEITFVSLLS	147639	125972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13171_pilon_-_126240_129332_129430_130103_130200_130642_130770_131281_131422_132005_132130_147514
861398	contig_10496_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_59434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149922	148828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_148800_149900
861399	contig_2114_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_104305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGATCTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899258	898952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_899000_899300
861400	contig_10494_pilon	-	344	1	Intergenic	novelGene_102157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGCGGGCGATGGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892775	892431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_892400_892800
861403	contig_5854_pilon	-	875	6	Intergenic	novelGene_68859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	9.06421535489973	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1	675	270258	260417	FALSE	35	AAATACCATTCTTAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVTRQVSGRADPAPVPTGPESGQPLAAAVAELPVLDASGKRVAFGALFRERRAVVVFVRHFLCYICKEYVEDLAKIPKSFLEEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCTLTGYAHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEEIASSGQSPHVKSNLLSGSIRSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINSVLQLVGVQHVNFTNRPSVIHV	270258	260216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_260545_263793_263926_268394_268501_268666_268721_269570_269640_270072
861404	contig_4364_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_4566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCAGTGTTGGGCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564008	1563109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1563100_1564000
861405	contig_11986_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_69174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAACAACTAAAAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543198	543930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_543200_543900
861406	contig_10042_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_79139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGTCCTAGTTTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86644	86158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_86200_86600
861407	contig_12450_pilon	+	432	2	Intergenic	novelGene_162316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	183	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTTTCTTTGCTGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343145	345356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_343344_345122
861408	contig_6914_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_151746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	79	369	156681	155042	FALSE	10	TCCTTCTGTATGTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIRERQAAGLKARVVCRAQWNLACPMALRVLTRTLGSLSLAPPAASTPAQNLLPAAQVIRNAFLQPLFASKLLPCRPVLTFVALNAKFVSWKSHTKYTVTPVKMKKSGGRDHTGGSEVKGL	156759	154950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_155237_156585
861409	contig_1274_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_137796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTCTTCTGAGGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225864	225332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_225300_225900
861410	contig_8259_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_148899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTTTTTAAATAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407834	408422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_407800_408400
861411	contig_6873_pilon	+	600	2	Intergenic	novelGene_129848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACAGGCTGTTAGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800474	802602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_800859_802386
861415	contig_4736_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_168624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247865	247109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_247100_247900
861416	contig_5945_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_104539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAAGCCCTGGTGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45807	46203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_45800_46200
861417	contig_9578_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_67999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATTAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276422	1275831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1275800_1276400
861418	contig_7457_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_31520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAAAGTGATAGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682749	682112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_682100_682700
861419	contig_11572_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_100051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAATATTAACCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250943	249865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_249900_250900
861420	contig_10711_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_118442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	246	545	816339	816638	NA	5	TGCTTGCTGTGTTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPGVRVPCPSLLHQATFCVKYNEKKELNLNCGGNQKDGKSHNCLVWKNSTSPFRGMRKCTANNGQTSTQADILGNGILYVGDLKTTSIICGGVMEQF	816093	816966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_816100_817000
861423	contig_10263_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_135829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTCAAAACCAGCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841630	857893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_841863_857466
861424	contig_3202_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_167387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTAAACTTTCACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14040	13121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_-_13100_14000
861425	contig_1274_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_137769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAACACACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12921	12593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_12600_12900
861426	contig_16503_pilon	-	382	4	Intergenic	novelGene_162075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	2	382	145592	131815	FALSE	25	GAAGGCCCCCACGCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEAHHRSVIHLLLVLAGTGVGDVGATHELSILRPVLEADPAAALPYLCLYVVPRILRAVVVAAVVVPDELHHDVAHLLLHLARFEVEDGASNHLDNEDQEEEGKHPQQAADLVDGTNAAQEAHEHG	145593	131814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_131881_132019_132090_142975_143089_145460
861427	contig_20951_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_43102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTAGGCCGCTGTCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51573	52491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_51600_52500
861428	contig_709_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_57573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACGAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2166448	2165433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2165400_2166400
861429	contig_6100_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_168121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGCTTTGTTGCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492404	491460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_-_491500_492400
861430	contig_11016_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_163306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAAAGGCTCAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333539	334146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_333500_334100
861431	contig_10196_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_132211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTCAAGAGTACAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279249	1279891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1279200_1279900
861432	contig_7088_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_159808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748720	748192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_748200_748700
861433	contig_1996_pilon	-	931	5	Intergenic	novelGene_131963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	7.29725975966321	30	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	267	506	550546	550146	FALSE	5	TTTGTGTACTTCTGTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQLALLLDWAEQFEAESRQDGEAVAFSVLLGDLNFDNCSRGDAREQKHQLFSRFQDPCRLGLRREQPWALGTLLSTRVLHHSEASSPEMLRRALEQEEGRRLYLAGGPARSRPAEPWRGRRLDYILYRGVPGAPLSPEVEQVIFSTALAGLTDHLAVGLRLRVSAPS	550976	549720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_550239_550314_550451_550535_550600_550680_550771_550853
861434	contig_14722_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_110220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	61	375	85264	84950	NA	40	CCCAAAAGAATAGCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQSAGKSASSVLALTNPDSVQRAGVSSCHWAVCECRGSKNSTASSHLSALASLCLAVISLQARPRAVSVLGPLPASVCKILRKDFSVSLGSHVLHGPVFVARR	85324	84825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_84800_85300
861435	contig_5711_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_80282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTGTGAAAAGGATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123156	123584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_123200_123600
861436	contig_5889_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_133684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTTTCGTAGCACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116963	117642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_117000_117600
861442	contig_10129_pilon	-	778	4	Intergenic	novelGene_128159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	28.0832096931007	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	630	149	778	523380	513831	FALSE	30	GCTATTTTGTGTAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTAALITLVRSGGNQVRRRVLLSSCLLQDDRLLTPTCHSSTSEPRSSRFDSDGSGRPATWDNFGIWDNRIGEPILLPPSIKYGKPIPKISLENVGCASQIGKRKENEDRFDSAQLTEEVLYFAVYDGHGGPAAADFCHTHMEKCIMDLLPKEKNLETVLTMAFLEIDKAFSRHAHLSADATLLTSGTTATVALLRDGIELVVASVGDSR	530698	513830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_513920_521503_521605_522940_523460_530629
861447	contig_3956_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_14806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGGATCCTGAGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226932	1226518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1226500_1226900
861448	contig_9415_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_109796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCTTAATAATGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705849	1706683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1705800_1706700
861449	contig_5684_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_81082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCAACATATGAGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471265	472008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_471300_472000
861452	contig_8322_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_143259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATGTATATGTTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373395	372943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_372900_373400
861453	contig_15471_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_175222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAACACATGTATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315097	314317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_314300_315100
861454	contig_5594_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_150118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAGTAGACTCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91713	91446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_91400_91700
861455	contig_16156_pilon	-	1053	11	Intergenic	novelGene_137087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	56.5628853578033	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	88	822	655076	641441	TRUE	30	GATCATTTACACACAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPQTRERALDMQADEDTGDGLQSSHRMLSFSDALLSIIATVMILPVTHTKIYPEEQFDTTIRKLLATKIAVYLMTFLLVTVAWTAHIRLFQVVGKIDDILALLNLACMMTITFLPYTFALMVTFPDVPLGIFLFCVCVITIGLTQVGGDRGVRVPLPAPPEPTDRTLCPQSRLPAAHPGHRPAWPRPVLCRRPLLPLLLPCVVPADGDGHLPPIHQQGRRLVQGQDQGPKGPPHPEPGVLHL	658532	637959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_638101_641350_641487_641868_641948_644612_644778_645761_645850_646616_646653_647079_647132_649034_649133_654711_654751_654944_655108_658476
861456	contig_10082_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_63880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	161	304	258799	258656	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQTGAPHLGNVSHETAGVVGAAAVTDVSPERGGRRCLVRCILTAWWESGWHNWMKLCRNRQSQDNLEVPLGQCWESGLPSAPAPATGFWSPGSREDGLSL	258959	258138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_258100_259000
861457	contig_15327_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_70438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCCGACACATCCTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76834	77453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_76800_77500
861458	contig_16831_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_134806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	558994	559350	NA	15	TGATTGTCTGCTATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRPCVPKSVESISIFSPPFLSLSQLVSFQVATAVQAANTPRETPSSFTCGLESVEKIPEKKDLEKCILNFVYYQHKYQVCACTRQTENSKAKALRTGLKLELPLREGEKDFASEPHLT	558991	559380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_+_559000_559400
861459	contig_15430_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_174697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGAACTGCTGACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53662	53277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15430_pilon_-_53300_53700
861460	contig_504_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_54406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31965	32414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_32000_32400
861461	contig_2890_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_60275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	24	320	297289	296365	FALSE	10	CTCCCTGAGCCCTCACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVDDRPVMLQTTCAVHGGSSGGPLFSTRSGDLLGIVASNTRDNNTGATYPHLNFSIPITVLQPALQQYSETGDLRSLRQLDRATEPVQVVWRLQRPLAEVPRSKL	297312	296101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_296583_297210
861462	contig_12079_pilon	+	634	4	Intergenic	novelGene_67382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	78	junction_1	28.2488937836511	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	62	490	405237	427092	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSCECRCRSCCAGPRARGAEMEPLAPMRLYTLSKRHFVLVFVIFFVCFGLTVLVGIKGPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQIVSNPLSTYNQQLWLTCVVELNQSKGMPPDALGDFSLYEAPYFRGLKGFTVFGQDDEEGCSLLFIIAASWKSLKCLPGLSA	405175	427236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_405245_421006_421111_423247_423304_426831
861463	contig_11028_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_163962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGGTTTCAGTGGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872652	872373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_-_872400_872700
861464	contig_6616_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_141772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACAGGTATGAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441773	442371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_441800_442400
861466	contig_3817_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_78352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562921	563440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_562900_563400
861467	contig_12638_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_33045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCCACTAGCCCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8595	7930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_7900_8600
861469	contig_5551_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_134299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTGAGTGTATGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828294	828851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_828300_828900
861470	contig_5799_pilon	+	703	1	Intergenic	novelGene_50319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCGGTGTTATTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626854	627557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_626900_627600
861477	contig_14923_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_157759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTTTGAGCATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363569	363105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_363100_363600
861478	contig_4213_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_124834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAATGATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184629	184075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_184100_184600
861479	contig_12790_pilon	-	1119	7	Intergenic	novelGene_35299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	163	984	605346	595493	FALSE	25	ACTGACCTCGAACTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRGPSPWGFRLVGGRDFSAPLTISRVHAGSKAALAFLCPGDLIQAINGESTELMTHLEAQNRIKGCHDHLTLSVSRPEGRSWPSSPEDSKAQAHRIHIDPEAQDGSPAPNRRPSATGIGPGDVRPSLGSPYGQPPRLPVPHNGSSSEATLPAQMSTLRVSPPHSAADPARGLPRSRDSGVDLGSDVYRMLREPAEPTASEPKQSGSFRYLQGMLEAGEGGERPGPGGPRNLKPTASKLGAPLSGLQGLPECTLCGQGIVGTIVKARDKLYHPECFMCSDCGLNLKQRGYFFLDERLYCEGHAKARVKPPEGYDVVAVYPNAKVELV	610220	595357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_595698_595842_595961_596286_596454_596673_596856_601374_601457_605278_605431_610142
861480	contig_16593_pilon	-	580	4	Intergenic	novelGene_177486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.48074069840786	243	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	118	480	11079	9413	FALSE	10	CTGTCCAGATGCCCGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKRVACAAIGGTVAVAAVPVVLSTVGFTGAGIAASSLAAKMMSTAAIANGGGVAAGSLVATLQSVGAAGLSMSSNILLGSVGSALGAWLGGSKKKPPPPPPDEPKTEEGDSDEDGDQDE	11196	9312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16593_pilon_-_9577_10136_10299_10914_10945_11072
861481	contig_15114_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_121156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAATTAACTTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145796	146236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_145800_146200
861483	contig_7909_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_155918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532785	532452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_532500_532800
861484	contig_9482_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_44267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773498	773040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_773000_773500
861485	contig_18869_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_56482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGCAAAAATGGTTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299044	298658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_298700_299000
861487	contig_5899_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_146996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCAAGGCTGTGTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561191	562378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_561200_562400
861488	contig_5341_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_168037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTATCTACCCAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351024	351922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_+_351000_351900
861489	contig_2894_pilon	-	852	2	Intergenic	novelGene_86548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	370	807	300667	292550	FALSE	0	GCCCTGCCTGCCTGCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRELRGLFERSERSGQWDRCGCWAQPGGVGPSMDELLACLPGDPVRPSRGPLVTCTCENPHCRGPTCQGAWCTVVLVQEEGRHPQVHRGCGNLHQELCRGRPTEFVNHYCCYSPLCNYNVSLVLKAPLPAGRGDGGLCWVEVA	301036	292504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_292606_300285
861491	contig_8690_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_177960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCTAGCAAGTGTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139648	138122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8690_pilon_-_138343_139616
861492	contig_5918_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_99587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTAAATAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1986234	1985475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1985500_1986200
861494	contig_10196_pilon	+	621	7	Intergenic	novelGene_132161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.172333818748	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAACGCCGCCATTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034599	1047043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034634_1038298_1038469_1039041_1039090_1043818_1043937_1044831_1044931_1046385_1046475_1046980
861495	contig_15777_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_75754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGGAAAAAAAAAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252500	251781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_251800_252500
861496	contig_11815_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_50917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATAATCTAATTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207863	207138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_207100_207900
861498	contig_14786_pilon	+	351	2	Intergenic	novelGene_174707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	0	1489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTTGTGGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35516	36605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_35629_36366
861499	contig_12250_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_80540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACGTAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252510	252918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_252500_252900
861501	contig_12839_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_177961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGCCCAGAGGTCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298318	298698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12839_pilon_+_298300_298700
861502	contig_17964_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_33941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATAAGTATTAGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713311	713954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_713300_714000
861504	contig_10864_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_107136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAGTTAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581228	1582189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1581200_1582200
861505	contig_2888_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_151490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAGAGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67425	66590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_66600_67400
861506	contig_3575_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_141122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACAATGTATGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740700	739653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_739700_740700
861508	contig_6846_pilon	+	514	2	Intergenic	novelGene_107306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTTGAATGAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310523	313787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_+_310744_313493
861509	contig_17493_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_122200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAGGGCAAACAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132939	132678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_132700_132900
861510	contig_11448_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_66452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATAATAATAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709846	709635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_709600_709800
861511	contig_19564_pilon	-	83	1	Intergenic	novelGene_29648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAAAACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15643	15560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_15600_15600
861512	contig_10437_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_38176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTAGCCACTCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174206	173277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_173300_174200
861515	contig_5799_pilon	+	1016	1	Intergenic	novelGene_50233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCAGCCCTCATCGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137643	138659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_137600_138700
861516	contig_2933_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_111375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	139	399	1041028	1039478	FALSE	30	GAAGGAGAAGGCGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLGSRPQLTPGGTEGWCCTADHTCLHCIQEEGGRLVASQEITWSTMGSTVEPRPQLLGRELVPNPTACSKPPYLQASSWVEGLAPCDTETCAVASRGRPQSHCTVYTQRTGNAGWKPHTPHVSRRDPSSPG	1041166	1039340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_1039534_1040823
861521	contig_14618_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_136830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTGGCATAACACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103971	1104813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1104000_1104800
861522	contig_7775_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_37451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGAAAAAAAAAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32869	32460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_32500_32900
861523	contig_12301_pilon	+	378	4	Intergenic	novelGene_110011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	27.7408643620842	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	34	378	72928	75923	FALSE	50	AGTGAAAGCCAAGTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVDAWEVAKAFMPRGLADKRGPEECDAVALLSLINSCDHFIVDRKKVTEVIKCRNEIMHSSEMKVSSAWLRDFQMKIQNFLNEFRNIPEIVAVYSRIEQLLTSDWAVHIPEEDQRDGCEYEAGIYL	68443	75923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_+_68471_72921_73042_75399_75550_75842
861524	contig_4315_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_46768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATCATTAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262595	262080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_262100_262600
861525	contig_8598_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_22878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGACTCCAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43974	45368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_44000_45400
861526	contig_299_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_129499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	153	194	346	1613619	1613467	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLALREASHHIVRALKEHSEVYREKNCDLSPTVKTLEANPPDLVEPLDDCSPGGYPYCNLVKGQMRITQLEYSQIPDQQKLCKVINVYRFLNNGIIVIYNSWLPLRRICRVPSS	1613812	1613087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1613100_1613800
861530	contig_7045_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_77431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGCATTTGCTTATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224495	225682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_224500_225700
861531	contig_6208_pilon	+	743	2	Intergenic	novelGene_53048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	250	615	533061	543354	FALSE	45	TAAAGCTTTTCAACTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYGLEKKITSASNSHTEVKSEQLPPCANPGNPVFSCMLDPKTLRTATSLSKPQMIMYKTKSSDYGEFSPIPQFLPCSYSPKEQVFSSRLRATGFYQNNTLNTAPDRTRTLDFPNFQHTL	532811	543482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_533079_543006
861532	contig_5999_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_45633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGAAAAAAAAAATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171673	171339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_171300_171700
861534	contig_2087_pilon	-	1129	5	Intergenic	novelGene_65550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.76085931090146	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	400	1128	31760	24345	FALSE	45	ATCAACTTAGTAAAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWNLTRMPNHLHHSTQENAILAIEQYEELVDVNCSSVLRFFLCAMYAPICTLEFLHDPIKPCKSVCQRARDDCEPLMKMYNHSWPESLACDELPVYDRGVCISPEAIVTDLPEDVKWVDITQDMMVQERPLEADCKHLSPDRCKCKKVKPTLATYLSKNYSYVIHAKIKAVQRSGCNEVTTVVDVKEIFKSLSPIPRTQVLLITNSSCQCPHILPHQDVLIMCYEWRSRMMLVENCLVEKWR	32159	24343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_24385_27359_27559_29811_29878_29970_30052_31417
861535	contig_533_pilon	+	634	4	Intergenic	novelGene_174260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3.85861230093008	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGAATGAAGGAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131014	155855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_+_131139_143946_144059_144428_144567_155595
861536	contig_3942_pilon	-	156	2	Intergenic	novelGene_128665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCATGTCGCGGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180025	179728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_179841_179981
861538	contig_15631_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_151532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	241	351	345417	345527	NA	10	GCCCACCGTACTTCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQDLLGLLLLFPPGCVCGGGIGGEGSATPRTHPGHGRGSVSEDGSGGKPGVPAPPHASVGSPHSSAHPREQKLEPLRGLMSCLSSGLGPAPQPSRRGLPPRTPSAAAQPAHALKI	345176	345533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_345200_345500
861540	contig_13744_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_77217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCGAGTGTTCCACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140470	1140728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1140500_1140700
861542	contig_5551_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_134230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGGTAAGATATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319118	319415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_319100_319400
861543	contig_2863_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_174059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTGGAATGTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14984	14529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_-_14500_15000
861544	contig_9029_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_155130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTGACATAAAGAGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125288	125865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_+_125300_125900
861545	contig_14986_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_59712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTACAAAAGAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27292	26671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_26700_27300
861546	contig_10958_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_5389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCTACAGGGCAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877005	876556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_876600_877000
861548	contig_15631_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_151551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGTATTGTCCTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553110	552602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_552600_553100
861549	contig_9099_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_149900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGGCTGGAAACATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285820	285173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_285200_285800
861550	contig_13958_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_129549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAATTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276160	276766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_276200_276800
861551	contig_593_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_102015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384494	384903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_384500_384900
861552	contig_5588_pilon	-	575	1	Intergenic	novelGene_172834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGCCAAGCAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389907	389332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_389300_389900
861553	contig_1472_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_86134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAATTAAAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600479	601463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_600500_601500
861554	contig_13301_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_153131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGGGCCATCCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178036	177106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_-_177100_178000
861555	contig_8820_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_79323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCCCCTCTGGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398393	394933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_395215_398157
861556	contig_7410_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_106132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAGAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927789	927171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_927200_927800
861557	contig_4364_pilon	+	716	3	Intergenic	novelGene_205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	95	559	1292332	1293165	FALSE	35	TCAATAAACGTGGTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTVRYTRYSPQQRRRRMLADRSVHFPNDVLFLDHIRQGDLGQVGRFIRARKVALDTIYPSGLAALHEAVLSGNLECVKLLVKYGADIHQRDEAGWTALHIACSDGHPAIARYLISLGADRDAANDDGDLPSDLIDPDFKDLVELFKGTKMD	1292237	1293322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1292522_1292614_1292766_1293041
861558	contig_10990_pilon	-	424	2	Intergenic	novelGene_7433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGGAAGTAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708341	691716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_692043_708243
861559	contig_4469_pilon	-	379	3	Intergenic	novelGene_21876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	307	342	188612	188577	FALSE	15	TGAGTATGGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHRKLSLGATVHASGDTSKSLESTFLNPNCVSFFAPQEVQKPKAQRNQRQGKRRAYHHQGRRDPKETAQWASHRERKLSAFKQRLRARERYACEHSWREAVLMEELYPDCSRT	192530	188539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_188775_191634_191665_192416
861560	contig_11176_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_123443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCCTTCTGCTCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67783	67335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_67300_67800
861561	contig_6550_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_110653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCTAAGTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14713	13855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_13900_14700
861562	contig_5482_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_144453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293954	294706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_294000_294700
861565	contig_5779_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_106420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCATCCCGGTGCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62189	61755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_61800_62200
861566	contig_5779_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_106419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTTATTAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61755	61246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_61200_61800
861567	contig_9389_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_83895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	173	643	151251	151721	NA	15	TAACGAGCGCCTGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPSPVTSEVQPLPAARNSARQKHLSNTCWVHGFKNSQIRGPSGNFLSFSLCESGYVSVHLFPACSQTLAPQTPGPARRDFGVPRGKRCAPGACKVLQPQEGVVRAADTRPSWLPRIWDVCLPLHHASWTPDRAMQPWTVHAVPGSAPGCLLAAE	151078	151739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_151100_151700
861568	contig_15371_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_151457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAGTTGCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178716	179743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_178700_179700
861570	contig_5153_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_74339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	57	247	303	648591	648647	NA	25	ACCAAACCTGTTGCTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHEPCQHGSWHDALGDERPSYGHEPAPAAWHQPLWHAWAADAPADLPGPPAPVPSHPEHKEAIPGRGEWDRAEWWAGWRRVRMWGLKAQGFEWCLGKGMD	648344	649070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_648300_649100
861571	contig_5889_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_133685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAGAAAAAAAGAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143699	144410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_143700_144400
861572	contig_18511_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_126895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCAGCAAGTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57979	58520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_58000_58500
861573	contig_12270_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_114053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTCACATTACAAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13871	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_+_14141_14363
861574	contig_11709_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_168233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATACAATAGTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580651	579734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_579700_580700
861575	contig_5935_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_102694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816695	816296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_816300_816700
861576	contig_15151_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_177962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	354	653	142407	142108	NA	5	TTCCTCAGCCCTTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYIMKYVYMCLERGITDEINKLILNINVRFLKGISQKWFEASLRVRTPVFSFLTPALNLFSREYFIKVFDNLKTWYILLFVDFRFHLPLERTLKHTKL	142760	142100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15151_pilon_-_142100_142800
861577	scaffold_17542_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_139226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCGAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321771	321180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_321200_321800
861578	contig_10600_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_169863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105620	106380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_105600_106400
861579	contig_1686_pilon	+	799	2	Intergenic	novelGene_165599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	320868	321497	FALSE	20	TACTGTTTGTATTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEEGFVLPFTVDEDVRKRVALCIDGPKRFCFNSKNLLGKEAIKQRHLRLLGYEVVQVECSRFFVSKSTFLIQTYSIQGTTWSASPVDQDSYTYTYQLC	320865	321997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_320921_321253
861581	contig_11427_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_79006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAAGACTCACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655720	655074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_655100_655700
861582	contig_10627_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_60046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCATGTTCTTGGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869704	869092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_869100_869700
861585	contig_7753_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_41471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAGAGGGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576579	576096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_576100_576600
861586	contig_5947_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_101558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620154	620513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_620200_620500
861588	contig_11702_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_141986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCTCGCGAGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379735	380795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_379700_380800
861589	contig_709_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_57659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGAGCCGTTGGGTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849635	3850340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3849600_3850300
861590	contig_10765_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_122870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTGAAATTGTGCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23194	24239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_23200_24200
861591	contig_18613_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_80210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTCAACACCCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23560	22772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_-_22800_23600
861592	contig_1996_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_131878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAATGAAGACACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142632	141696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_141700_142600
861593	contig_7035_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_83521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAAGCAGGAAAATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287771	288242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_287800_288200
861594	contig_11898_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_144283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	17	325	220665	220973	NA	30	TGCCCTCCTAATAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGPQMPPIPSSEDPGLRELLFYPKLGQLAWYNQHLECEQFSSPCGLLWWACPRHGPRADSTQRQGAESPAPYLTPATQEKSASPPDEEETAEEPITSSPLQQPSGV	220648	221218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_220600_221200
861598	contig_11968_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_172509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48694	47624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_-_47600_48700
861601	contig_3212_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_174748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130572	130214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3212_pilon_-_130200_130600
861604	contig_10801_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_74034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTTTTTCAGTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244923	245832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_244900_245800
861606	contig_3335_pilon	+	464	4	Intergenic	novelGene_165007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	2.16024689946929	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	70	378	562833	578401	FALSE	30	GCAAAATGTGTAGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERASPSFSLYAGVDAADLGFKEMEPENVSELSRTTQFVTEPVGQHSAVHSLTVEPSQFSTLSQEPQKMNKSQASVSFKDVAVELTQEEWQHMGPAQRTLYRDVMLENYNHLVSVGERTSPCDSL	561110	578487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_+_561170_562822_562924_563539_563599_578242
861607	contig_8801_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_66270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAGAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415036	414334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_414300_415000
861608	contig_7004_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_126513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTACTGTCGGGGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459884	460433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_459900_460400
861610	contig_4364_pilon	+	671	3	Intergenic	novelGene_207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	159	572	1337602	1338945	FALSE	15	TGCAGTTGGGTTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDVALLKPPTPAATAPGPDPAGLSLRRPWLLAASCPTPSRVSGIDPHIPGHTPGRRRGSVLRPPSVFAQNRIQILCGVRGTADHPPGCSRPNLDPGDTRPAHPTKELLRKRCVPAGPGDRDRNCACGEDPMGLWLK	1327705	1339044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1327766_1337503_1337627_1338556
861613	contig_5718_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_110371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGGTATTAACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978352	979328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_978400_979300
861614	contig_6286_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_165648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTAAAGGCAAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108225	108765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_108200_108800
861615	contig_9919_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_138002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884055	883157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_883200_884100
861616	contig_5316_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_61232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGTGACACACACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454150	450425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_450590_453778
861617	contig_9579_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_150599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGTCATTTCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828332	828621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_828300_828600
861618	contig_4732_pilon	+	229	3	Intergenic	novelGene_75409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5569	junction_2	581	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGTTGTGAATAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524200	525136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524233_524536_524671_525073
861619	contig_14405_pilon	+	530	3	Intergenic	novelGene_85655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTTACCTGCTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661725	662691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_661867_662005_662088_662384
861620	contig_11961_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_153684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGAAGAGAGTCCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16563	16177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_16200_16600
861622	contig_12919_pilon	+	236	1	Intergenic	novelGene_75918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGATAAGAAAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826470	826706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_826500_826700
861623	contig_14357_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_121647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59577	58836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_58800_59600
861624	contig_4874_pilon	+	731	1	Intergenic	novelGene_78633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGAAAAATCACCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329681	330412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_329700_330400
861625	contig_6489_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_128945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCCCCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280396	281210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_280400_281200
861626	contig_6552_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_163609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCTTTAACCTAGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173355	174050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_173400_174000
861628	contig_11483_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_172695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCTTAGGGTCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171115	170585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_-_170600_171100
861629	contig_5200_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_140155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178509	179050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_178500_179000
861632	contig_4402_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_140810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAATAAAGCTGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371561	372102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_371600_372100
861633	contig_6674_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_148040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAACTCTTCTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483627	483100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_483100_483600
861634	contig_6674_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_148039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTACACAGGTTAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483049	482762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_482800_483000
861635	contig_9981_pilon	-	559	3	Intergenic	novelGene_121039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	22.5	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAATGAGGAAACAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198616	179269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_179425_182279_182417_198349
861636	contig_7935_pilon	-	613	6	Intergenic	novelGene_171799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGCAGGAGACATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25219	21770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_-_21850_21964_22053_22735_22857_23348_23462_24713_24810_25103
861637	contig_5917_pilon	+	793	3	Intergenic	novelGene_122177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	190	573	793372	794730	FALSE	15	GCAGTGAGTTTACGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQRDPVEEERTAEQPGMGHPIPALAMEHGGQHSYGATMARYRRRERNSLCLWRASDTMKEQMDTGPTQGVTKRDKEPGTDLQTCVGKWQTDHRLDQQTQELLRRGRMLLVLPESLTKAKAKAKV	793182	794950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_793470_793614_793793_794622
861638	contig_13707_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_43528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACATTGTGCTGAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167955	168527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_168000_168500
861639	contig_4640_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_147967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTAAGGAGTCACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394864	395134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_394900_395100
861640	contig_8651_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_168181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATACTATTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181032	181776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_181000_181800
861641	contig_13786_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_174566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	215	379	53063	53227	NA	25	AATAGTGTTTTTATACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCSPAAEGGGRWQRWRWEPARWLRETARCRQPPALLRTPPSARLAALSPPESGDVSHRPGVAAARARNRGAMSEAGGGPGCGSPVPQRAPWSLVAATAALCLVSATSVWTAGAAPMSREEKQKLG	52848	53618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_52800_53600
861642	contig_1836_pilon	-	682	2	Intergenic	novelGene_71084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTCGGACTATTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098414	1096139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_1096712_1098304
861643	contig_3202_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_167388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGGGCACCTTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16781	17406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_+_16800_17400
861644	contig_7630_pilon	+	401	2	Intergenic	novelGene_133627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAACTATGTATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35607	36425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_35679_36095
861647	contig_5954_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_28520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATTCCCGCTCTGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446760	447046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_446800_447000
861648	scaffold_12124_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_21982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707114	707544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_707100_707500
861649	contig_10904_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_22602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGAGCTGCCTCCCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481329	482001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_481300_482000
861651	contig_11285_pilon	+	440	3	Intergenic	novelGene_5522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	118	432	661942	663782	FALSE	10	CTATCCCTAGCCCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEKSLNATFSQSMCDSVVLNLELSLDGRLFFIHSSKVSMSSWDQRSVAFGGGHFQVCGAIGFSVHSPAVQPPPRLCWRGKLGSKPPHPEEEIPVPPFKQAER	661281	663790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_661361_661903_662087_663612
861653	contig_1154_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_87136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACATTTGCCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814468	815015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_814500_815000
861654	contig_14522_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_147341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174837	174269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_174300_174800
861655	contig_9852_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_138475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTTGAATTTGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346604	346924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_346600_346900
861656	contig_835_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_152178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508766	507991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_508000_508800
861659	contig_14326_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_120760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGTAAAATACAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598309	597791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_597800_598300
861661	contig_18967_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_165325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACCAGAAAGCCCCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98792	98142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_98100_98800
861665	contig_13992_pilon	+	756	8	Intergenic	novelGene_147607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.949825945096	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	33	755	23047	35175	FALSE	15	TCGACGGGCACCGTGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELNSLLILLEAAEYLERRDREAEHGYASVLPFDGDFARKKTKAAGLVRKAPNNRSSHNELEKHRRAKLRLYLEQLKQLVPLGPDSTRHTTLSLLKRAKMHIKKLEEQDRRALSIKEQLQHEHRFLKRRLEQLSVQSMERVRTDSTGSAISTDDSEQEVDIEGMEFGPGELDSVGSSSDADDHYSLQSGGSTEPPAPPSWAGPPAGRQGPAPPSQGAQRSRPRSVFRILIIPEVLNVIAAN	22893	35176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_22911_23031_23111_23189_23290_27566_27597_33048_33164_34085_34249_34699_34802_35026
861667	contig_2257_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_122491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	546	98	643	288451	288996	NA	70	AAAAAAATACTAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRCGAGYHSAVGGGWRGLWAGAPATASVCPVMAAAAAVVTPSGLEDGVSRSRGEGAGEVVVERGPGAAYHMFVVMEDLVEKLKLLRYEEELLRKNNLKPPSRWVPLSPSAWVPAEPGERPSPVRPAGERPAQVREPLLPPSWSGRGDSPQTSRRWAQPWYFCRVNKFLDGRKYWKTPFLFFKTCTRTSTKQKLYFVIIKVMKKSVVDNVEQHK	288353	288996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_288400_289000
861668	contig_7151_pilon	+	402	2	Intergenic	novelGene_40713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	2107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	90	313	402	123819	123908	FALSE	10	TTCTTTGTTGAACTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKGPCKSKPPKNSCLWWNLTQILPATDCEKCSFQTPRPQSCRENKRRQERLVSAVPWERISERGGSWDERRPLTYHGSGSRENPGSLSSNSLKVAEPIRNPCDIMSQERASETIIMCVCTEVKLVINTLPCYEE	116441	123908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_116591_123655
861669	contig_3382_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_124121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	221	334	731675	731562	FALSE	15	TCTGAGGCTTTTCTCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASRARARPLSCFGAAFRENLLEQERGFCSLDYDSQHAKARASVTSEKLCRAQHELHFQAATYLCLLRSVREHMALHQEFHGKGERSVEESAGLVGLQLPRQPGGKGCEP	735986	731476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_731766_735856
861670	contig_13097_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_107737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGCTTGGAAACAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262065	262679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_262100_262700
861671	contig_8631_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_121987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTCTTGAAATCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852881	854241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_852900_854200
861672	contig_17008_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_124234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTACTTAGTAACTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40025	40406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17008_pilon_+_40000_40400
861673	contig_8541_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_105593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGGTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576853	576225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_576200_576900
861674	contig_14288_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_153822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTGGGATCCAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319186	318736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_318700_319200
861676	contig_401_pilon	-	889	2	Intergenic	novelGene_42750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	292	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	54	776	949257	942371	FALSE	35	CTACATGCTTTGAAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGTGCPVTCNGRWAAAMSERKPNGGSGGASTSSSGTNLLFSSSATEFSFNVPFIPVTQVAASPASLLLPGEDSTDVGEEDSFLGQTSAHTSTPQTFSYFSQVPSSGDPFGNIGQSPLTTATASVGQSPFSKPPAALPFTTGSQDVLNAFSPSVSKAQYGAPPMPQMGVNAYLPSQQSGLPPAHFGSPPPGAPQQGYNPYRHTPGSSRANPYITPPQLQQCQTPGHPTQLPPPGPPVQMYQMPPGALPPVWRQVFIS	949310	942257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_942931_949094
861678	contig_11518_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_109138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	313	687	459009	456830	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAGTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLGHIMRLDLEKIALEYIVPCLHEVGFCYLDNFLGEVVGDCVLERVKQLHCNGVLRDGQLAGPRAGVSKRHLRGDQITWIGGNEEGCEAISFLLSLIDRLVLYCGSRLGKYYVKERSKKVTVN	459321	456634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_456848_458652
861681	contig_10437_pilon	+	190	1	Intergenic	novelGene_38422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTAAACCCTTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811593	811783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_811600_811800
861682	contig_4952_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_145541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAACAAAAAAAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527659	528204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_527700_528200
861683	contig_15236_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_141615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAATAAAGAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605691	605140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_605100_605700
861684	contig_8712_pilon	+	1042	2	Intergenic	novelGene_58835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	345850	346212	TRUE	55	GTAGCCAATGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGNLHGPPEPACPEQWKRQDRNQTPLPCPCLAFCPEISIGGLQEAALSPPAPPFPAPQDEKRCPPPHWSEAPPFLLTGSGANNLIGGLRLAGSWPWKPPPPRPVPLSPPPWGRRVLSRLL	345849	347029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_346758_346895
861685	contig_20092_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_177963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATCACCCCAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33772	33085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20092_pilon_-_33100_33800
861686	contig_233_pilon	-	538	2	Intergenic	novelGene_14484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGAAGCGGTTGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22447	21077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_21509_22340
861687	contig_15777_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_75751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAATACAAAGAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218525	217678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_217700_218500
861688	contig_1339_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_163123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTCCCTGACACCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346092	346435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_346100_346400
861689	contig_12951_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_68243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	84	611	830245	829718	NA	20	TCAGCAGCCAGAGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYLSSKRVPFHPSPGSPLHGIPPLPHPCSSLDKPTLPQPHRPKHALAAWYWSSTSQALTLQNPHKSPTQHEETDTERRSPLPRASWFDVAEPGLDPRVWFQRATTEPLLNGRCPVPSLGRDPPELWLQENHSRPPRQGLLWCFSFFAQCPALFKGHLLSGRVEGGEDFHYCLY	830328	829483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_829500_830300
861690	contig_9682_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_125310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCCCTGCCCACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432645	432152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_432200_432600
861691	contig_12700_pilon	+	890	1	Intergenic	novelGene_175818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTATTGGGTAGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62604	63494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12700_pilon_+_62600_63500
861692	contig_15001_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_177964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATTCATGAATGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7294	7668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15001_pilon_+_7300_7700
861696	contig_7272_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_25409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAATGGAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806604	805542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_805500_806600
861698	contig_5978_pilon	-	1164	1	Intergenic	novelGene_152408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	212	325	783098	782985	NA	25	GCCACGTGGAGGATAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLCCVCWKEESKDSETKPGSPGGQSQWPSHTLARWDVAGAGDVKTHCFSLLQGDLVLGTWGLLQGTDCSMSSHSENLAPSLLDRAGPSSAETGHAVCHWGGSAHLG	783309	782145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5978_pilon_-_782100_783300
861700	contig_9886_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_147088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241159	241709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_+_241200_241700
861702	contig_12931_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_166765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTGAGGATTTAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91072	91562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_91100_91600
861703	contig_3397_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_154591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGTTAAGAAGAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178976	178638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_178600_179000
861705	contig_3789_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_79876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGTCCATGTCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539588	540539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_539600_540500
861706	contig_2550_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_135693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGGCTGAACTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642307	1642910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1642300_1642900
861707	contig_10711_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_118434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTTAGCCCTAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775103	774388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_774400_775100
861709	contig_16072_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_175859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGAAAGTGCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40421	39269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_-_39300_40400
861710	contig_9272_pilon	+	345	2	Intergenic	novelGene_125965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGTGTCTGTAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619314	654750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_619512_654602
861711	contig_15327_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_70450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTAATTTTATTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285288	285791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_285300_285800
861712	contig_8598_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_22879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGACTCCAATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43974	45368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_44000_45400
861713	contig_7594_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_55400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAACAGTTTCAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380295	379229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_379200_380300
861714	contig_1545_pilon	-	305	2	Intergenic	novelGene_149743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	61	303	146164	139570	FALSE	40	CAAAATTTCAGTTAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVPGSLSSLLHLHNRQRQPMPASMPGTLPNPTMPGSSAVLMPMERQMSVNSNIMGMQGPNLNNPCASPQVQPMHSEAKMVNNSIIILSFFMTFSHDFYSD	146224	139567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_139744_146095
861716	contig_10126_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_105737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGCCTAGGAGATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150737	151829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_150700_151800
861718	contig_4783_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_108434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGATGAAAAACTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460178	459875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_459900_460200
861719	contig_10196_pilon	+	493	4	Intergenic	novelGene_132293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	37.1513421321791	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	94	342	2346785	2352062	FALSE	20	GTTAATGAGTCTTTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEADRSRFRRRSCCCCEEPSRPSLPPTPATMSAQAQMRALLDQLMGTARDGSVYLCLPTSICKGVAEKPHVHRAETKPDRGSSSQMTVSARVTFWTAAPMTSWLGRLGADHL	2346691	2352213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352040
861720	contig_15066_pilon	-	793	5	Intergenic	novelGene_149564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	11.1803398874989	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	349	792	119957	119216	FALSE	25	CTAGTTTCTGTCTAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKGEGRGARKKWGSLDKRGGRTTSGPLPAAVGRAQVAPPRENFGFRPGSPGAWARGLRVTSNAQRDIRVKAVTSPRKCLPAPWGSRVACRQLGLGYASHGLQETWYWDSGNITELVMSGVRCRGTELSLDQCAHHGPHITCKKTGTHFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGHRRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK	136735	119214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_119295_119396_119641_119836_120000_120136_120184_136476
861721	contig_13722_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_174634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACACAACCACTTAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23890	24691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_+_23900_24700
861722	contig_13722_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_174635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24640	25093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_+_24600_25100
861723	contig_12654_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_129309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAAGCTGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780694	781094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_780700_781100
861724	contig_7697_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_128289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAACTTTATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251368	251700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_+_251400_251700
861725	contig_12884_pilon	-	167	1	Intergenic	novelGene_105013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCCTGGCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095512	1095345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1095300_1095500
861726	contig_13201_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_130868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCGAGAAACTGAGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35590	35943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_35600_35900
861729	contig_14467_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_138246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAACAAAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305660	305013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_305000_305700
861732	contig_6418_pilon	-	1249	4	Intergenic	novelGene_81146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	29.6310647800581	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	149	697	317697	228358	FALSE	55	TTGGGAGGAAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRRSQQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLYAEVQKHRLQQQQRDHQQQPGEAEPLTPTYNISANGLTELHDDLSNYIDGHTPEGEQGGLCSQQLLPGHTAFPRPVGPGYQRHQTRTNM	317845	227805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_228672_231839_231982_250909_250996_317690
861736	contig_12923_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_30174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACCAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313270	312814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_312800_313300
861738	contig_19352_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_122430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCCCAGCTTGATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417459	418022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_417500_418000
861739	contig_3754_pilon	+	1071	1	Intergenic	novelGene_146848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTTTTGCTCCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474853	475924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_474900_475900
861741	contig_10800_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_152628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAATAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524938	523998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_-_524000_524900
861742	contig_5649_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_82479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1656312	1656864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1656300_1656900
861743	contig_7292_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_175368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAACAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199496	198730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_198700_199500
861744	scaffold_19766_pilon	-	522	3	Intergenic	novelGene_34387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	121	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCTAGGGGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737653	734272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_734622_735124_735243_737598
861745	contig_4232_pilon	-	922	7	Intergenic	novelGene_63230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.897527467855751	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	93	611	153267	151091	FALSE	10	AGGGGCCTGCTGGAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVDDFFEHERTFLLEYHTRIRDACLRADRVMRSHKCLAEDYIPISAALSSLGTQEVNQLKMSFLKLAELFERLRKLEGRVASDEDLKLSDMLRYYMRDSQAAKDLLYRRLRALADYESANKALDKARTRNREVHPAESHQQLCCQRFERLSDSAKQELIDFRSRRVSSFRKNLIELAELELKHAKASTLLLRNTLVALKGEP	153359	150779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_151145_151449_151536_151614_151775_151887_151975_152728_152769_153005_153082_153251
861746	contig_9738_pilon	-	326	2	Intergenic	novelGene_169271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCGTCAGGAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257111	255221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_255405_256968
861747	contig_11294_pilon	+	961	5	Intergenic	novelGene_50037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	15.7638827704344	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	128	799	16520	95816	FALSE	25	TGAAGGAGGTATTTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIAEVREETKPYLPAREPFPGNLQADHASFSFPQTSGYQPALMFSPTQPGRLHTGNIDIPRMTSAEAKFRLPLAFNHTVGHIILSEHKDVKFNCSINIPNVYQDAAVISWWKDGKELLGAHHSVTQFYPDDEVTAIIASFSITSVQRSDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYIEVQGLPHFTRQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPVNIFWVQNSSRVNDQPEKSPSVLTVPGLTEMAIFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKGQGS	16392	95978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_16816_25230_25332_26418_26593_56906_56994_95802
861748	contig_2733_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_128598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATCTATATGAATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930471	930797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_930500_930800
861749	contig_5039_pilon	+	463	3	Intergenic	novelGene_64751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	156	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCTGAAACATCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111206	279552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_111396_111513_111628_279392
861750	contig_12786_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_103370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATAAACTATCCAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76003	75533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_75500_76000
861751	contig_2854_pilon	+	664	7	Intergenic	novelGene_120891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	115.723329060691	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	120	512	1134662	1195393	FALSE	30	AATTTTAAATGTCTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNSDKQTDLFVLRERNDLIVFLADQSAPYFKPKVKLSLMNHSALITSVVPGDYNGDSQMDVLLTYFPKNHANSDLGAVILWGQNQTLDSNNMTILNRTFQDEPLIMDFNGDLIPDIFGITNESNQPQILLGGNLSWHPALTTESKMRIPHSHAFIDLTEDFTAGERNG	1132973	1195545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1133022_1134590_1134664_1140504_1140651_1141884_1141943_1143319_1143395_1161452_1161548_1195376
861753	contig_14071_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_177669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCTGGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224075	222712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14071_pilon_-_222700_224100
861754	contig_5039_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_64848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGAAAGTGAGAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326501	327559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_326500_327600
861755	contig_13145_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_116651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGGCTGGCCCAGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208310	207257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_207300_208300
861756	contig_5816_pilon	-	673	5	Intergenic	novelGene_158241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	24.9937492185546	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	224	598	193008	171043	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVMARDLEETASSSEDEEVVSQEDHPCITWTGGCRRIPVLVFHAEAILTKDSNIRVIGERYHLSYKIVRTDSRLVRSILTAHGFHEVHPSSTDYNLMWTGSHLKPFLLRTLSEAQKVNHFPR	194499	170967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_171154_172618_172702_184663_184771_192934_193104_194371
861758	contig_2903_pilon	+	585	4	Intergenic	novelGene_148991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.09120616516523	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	99	584	328520	350470	FALSE	45	AAGAGCAAGAACGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTRNAERRKTTSTSGVGDSGKGAPAGAEAPQMEKSKREPRTLTSMTGMGLGSPLRKCDFPTGLSKRSSSPVTSKLTSKAYPPSPKNVKPPYLGSPVRYRLPSFSNREIPKKKAEKEKTNKERESATGQQAFGAHGEDVPEKHVVDKHTTEKLAASGGKAESVEGKPTAGTTDAGEASKILAEKRRQARLQKEQ	326701	350471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_326800_328519_328648_349547_349817_350381
861759	contig_15066_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_149567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAACTCACAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274063	273733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_273700_274100
861761	contig_14516_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_153927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTCAGCCCCACCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276329	275301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_275300_276300
861764	contig_4315_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_46752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230508	231513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_230500_231500
861765	contig_10159_pilon	-	877	1	Intergenic	novelGene_30876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971056	970179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_970200_971100
861767	contig_14363_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_112527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATCTAATCACAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133077	132613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_132600_133100
861768	scaffold_4805_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_161023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTGGTAATGATGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465074	463874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_463900_465100
861769	contig_3942_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_128621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	72	431	151657	152016	NA	20	TCTTTTCCGCCTAAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDDVGGLQPPRTTIRLDFSLGMGGGVQRSEVKDPQSLLPVLIQGSLPEVNSEPRTQGHMIYLEDDPRNPGGGWGSETGREGAPQAATISRGLCDNQDSFLGNFGQLTSQSYPIRGVQV	151585	152145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_151600_152100
861770	contig_10399_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_114497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAATGCGTAATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392337	391828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_391800_392300
861771	contig_14450_pilon	+	482	2	Intergenic	novelGene_48983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCGTGTCGCTGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041629	1043114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1041959_1042961
861772	contig_10135_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_106677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCAAGATGACAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268527	268082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_268100_268500
861774	contig_3818_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_99198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTCACTCATTTATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31960	32318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_32000_32300
861775	contig_5753_pilon	+	155	1	Intergenic	novelGene_174315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGTGTTATATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173646	173801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_+_173600_173800
861777	contig_4754_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_35926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAAAAAAAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266352	265652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_265700_266400
861778	contig_8729_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_40121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTAAAAAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470627	471411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_470600_471400
861780	contig_14519_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_66834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGGTTAAAGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368861	368283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_368300_368900
861781	contig_7357_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_36941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTTCTTAAGAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954217	954772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_954200_954800
861782	contig_13905_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_130407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGACGCAGGAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34733	35343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_34700_35300
861783	contig_13905_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_130408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCTCACATAGTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35343	35654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_35300_35700
861784	contig_11293_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_134683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGATAGCAGGAGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141683	142659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_141700_142700
861787	contig_9221_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_176242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAAATAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54091	53570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_-_53600_54100
861788	contig_15752_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_148756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGTGCCCAGCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188187	188963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_188200_189000
861789	contig_10629_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_52930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAATGATTTTTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338901	340057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_338900_340100
861790	contig_9995_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_47823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGAGCTCGGCTGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918949	919570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_918900_919600
861791	contig_6048_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_73205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAAGTATTGTGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1512076	1512683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1512100_1512700
861793	contig_8102_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_85336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAATGTAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152715	152314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_152300_152700
861796	contig_19012_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_159471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6601	6178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_6200_6600
861797	contig_3233_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_56605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGAAGTACATTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954147	953720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_953700_954100
861798	contig_2757_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_164607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATGTAATCAGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513058	513751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_513100_513800
861799	contig_2312_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_160756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528303	528596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_528300_528600
861801	contig_13496_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_107653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGTCTGATTGCAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398162	397494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_397500_398200
861802	contig_16116_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_177883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66958	66276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16116_pilon_-_66300_67000
861803	contig_6101_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_114272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAACGAAGACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165776	164709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_164700_165800
861804	contig_10063_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_127751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCCTCAGTGCCATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448907	448107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_448100_448900
861805	contig_6870_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_104000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGAGCAGCTGGTGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1523347	1524270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1523300_1524300
861806	contig_9415_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_109751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAGGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127970	1127134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1127100_1128000
861807	contig_5210_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_65446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	67	357	565866	566156	NA	55	AATCCTAGCATAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTEKLLQFQVAASTRCGRCRLGMGSGTLEEPRILFRLSSASSGQRAAPSPQTPTAPLLRAPEPLSVAGLPAMAAARPASPLPLYPQRICFPSFLQRRPSSTILTSPATGRTLSAKTPL	565799	566744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565800_566700
861808	contig_13004_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_112599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91608	91051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_91100_91600
861809	contig_5770_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_74168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTAAAAAGTTTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260913	259976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_260000_260900
861810	contig_5718_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_110399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298683	1299060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1298700_1299100
861811	contig_8452_pilon	+	565	3	Intergenic	novelGene_48006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTTCTATTGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288239	291867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_288325_289422_289574_291538
861812	scaffold_4805_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_161027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAACCAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479193	479898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_479200_479900
861813	contig_14341_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_111781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAGTGATTTTTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313825	315189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_313800_315200
861814	contig_7640_pilon	-	1115	2	Intergenic	novelGene_177339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	224	1114	183427	181879	FALSE	45	AGGAAGCTGCCAAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILGAAISNYCKKVPSDSITCVTYPINIVLEDESTKDAQKTSWLVCNSVAGRGICSKLDSLADELKFIPLIGIAMSLSSRDDDEKGATSDFSGKAFCFLPLPPGEESKTGLPVHISGFFGLTDNRRSIKWRELDQWRDPAALWNDFLVVNVVPKAYATLILECIKRLETEKNSDIPLSVEIIYRLWPDMNKVKVHWQPVLEPLFNELFQNAVMYSISNQWVKLEQAHFSELDESLEHTKTVLNYLQSSGKQVAKVPANLAAAVQVTASSAKPVKRVTPALVRQVLRKSSHLGSAAEKLHLLEFVLSDEAYSELLGLELLPLQNGNFVPFSSSVSDQDVIYITSEDYPRSLFPGLEGRFILDNLKPHILAAL	183650	181877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7640_pilon_-_181949_182606
861815	contig_6434_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_61832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGGGCAACGAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697004	696143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_696100_697000
861817	contig_12503_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_143815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTCCCCATACTGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69573	68888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_68900_69600
861818	contig_8452_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_48069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTGTGTGGCATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554328	553535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_553500_554300
861820	contig_11396_pilon	+	607	5	Intergenic	novelGene_71300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.3582684801391	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	84	494	372974	378548	FALSE	35	AAGACAAAATTCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERRCVLGPFFWFYAFSCTLTQYYAECHGVIYVIDSTDEERLSESKQAFEKMVTSEALEGVPVLVLANKQDVETCLSIPDIKTAFSDCTSKIGRRDCLTQACSALTGKGVNEGIEWMVKCVVRNVHRPPRQRDIT	372890	378661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_373040_377451_377537_377647_377719_378290_378392_378460
861821	contig_12884_pilon	+	739	4	Intergenic	novelGene_105029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	171.332036311563	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2	397	1305747	1306460	FALSE	25	AAGCGGAAACGCCTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGITTTVCFTVVIFSMQTRYDFTSCMGVLLVSVVVLLIFAILCIFIRNRILEIVYASLGALLFTCFLAVDTQLLLGNKQLSLSPEEYVFAALNLYTDIINIFLYILALSDLYVHRRHSVRTRVATHGLL	1305745	1306802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1305804_1305891_1306036_1306122_1306245_1306387
861822	contig_7022_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_142158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGTCAAATGCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289829	288733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_288700_289800
861823	contig_8122_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_40236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTAAAACTCTGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685741	686325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_685700_686300
861824	contig_19098_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_65854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAAGACTGAGTTGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454126	454811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_454100_454800
861825	contig_4125_pilon	+	1113	7	Intergenic	novelGene_25101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	245	1060	733075	734651	FALSE	5	TCTACTGGTTTGTTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSDVSPFSFREVAPELPSDFRIGFYPVNHTDCLTSALHHCFDGPTGELAHAFFPPHGGIHFDDSEYWVLGPTRYSWKKGVWLTDLVHVAAHEIGHALGLMHSQHVRALMHLNATLRGWKALSQDEMWGLHRLYGCLDRLFVCASWARKGFCDARRRLMKRLCPSSCDFCYEFPFPTVAATPPPPRTKTRLVPEGRNVTFRCGQKILHKKGKVYWYKDQEPLEFSYPGYLALGEAHLSIIANAINEGTYTCEVRRRQRVLTTYSWRIRVRS	732568	734704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_732743_733004_733145_733209_733378_733729_733895_734052_734164_734268_734396_734476
861826	contig_10506_pilon	-	1018	3	Intergenic	novelGene_125172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAACACTGGCCAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58829	9497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_9893_57799_57917_58323
861827	contig_9415_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_109907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAAAATGAAACCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2111238	2110640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2110600_2111200
861828	contig_14142_pilon	+	776	4	Intergenic	novelGene_120487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	12.7540843131393	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTTTTGTGCTGTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307797	309375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_308038_308197_308281_308382_308467_309006
861830	contig_14687_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_107977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGCACAATAGATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777181	776299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_776300_777200
861831	contig_7758_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_163545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186462	186091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_186100_186500
861832	contig_7070_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_104027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31412	30997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_31000_31400
861836	contig_345_pilon	-	1036	9	Intergenic	novelGene_176943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	33.2957861447962	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	164	1036	348057	312164	FALSE	40	GTAAAAATTAATTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAHKQKKSKKKRVLASGQVSADVTTSEMGLKSISSNSIFDPDYIKELVNDIRKFSHMLLYLKEAILSDCFKEVIHIRLDELLRVLKSVMNKHQNLNSVDLQNAAEMLIAKVKAVNFTEVNEENKNDLFREVFSSIETLAFTFGNILTSFLMGDVGNDSLLRLPVSRDSKSFENISVGSVDSSSEKGNFSPIELDNVLLKNTDSVELALSYAKTWSKYTKNIVSWVEKKLNLELESTRNIIKLAEATRTNIGLQEFMPLQSLFTNALLSDIESSHLLQQTIAALQANKFVQ	354018	312163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_345_pilon_-_312275_312680_312746_313744_313883_314325_314375_316553_316627_317218_317316_330226_330362_347852_348090_353887
861838	contig_6634_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_171140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAATTATGAATGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192818	193598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_192800_193600
861839	contig_18829_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_177709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTCAAGAGGCCTTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127550	126674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_-_126700_127600
861841	contig_11160_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_168801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205911	206269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_205900_206300
861843	contig_10371_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_175478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAATCACAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715768	715229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_715200_715800
861844	contig_6302_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_171711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATAGGAGGGAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239896	239160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_239200_239900
861846	contig_11227_pilon	+	612	3	Intergenic	novelGene_163167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	14	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGATGAAAAAGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89037	96649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_89456_92686_92796_96564
861847	contig_8873_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_162897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGAAGGAGAGGGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192227	191505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_191500_192200
861848	contig_10627_pilon	+	681	1	Intergenic	novelGene_60001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGTTTACATGAGAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307121	307802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_307100_307800
861852	contig_10792_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_161009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATAGTAAATTGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180437	179733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_179700_180400
861853	contig_18113_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_137543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCCCGGAACATAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201260	202000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_201300_202000
861854	contig_16883_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_161765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597161	597686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_597200_597700
861855	contig_10324_pilon	-	586	5	Intergenic	novelGene_7890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_4	1845.93694028263	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	310	564	579008	578583	FALSE	5	GGTCAGCTGGGGTGGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGLLSLLGANRADAQQRRLLGHHEQVVDRLLEAQDSAERLLREILTTEKEVAQNLVDTKEKAHQGVAELQQLEAELQKASEEDTHLKANLFQLTSELEGLKEMEVDLQRQEREVDEDTTVTIPSAVYVAQLYHRISKIEWDYECEPGMIKGIHHGPSVAQPIHLDSTQLSKKFISDHLWSLVDTEW	583452	578560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_578690_578762_578840_578937_579043_579209_579355_583322
861856	contig_14353_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_82128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAACAGAGCCGGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200206	200701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_200200_200700
861859	contig_8658_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_55832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105993	105024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_105000_106000
861860	contig_11417_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_103249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATAAACGGTGCCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25909	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_25900_26600
861863	contig_8161_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_156779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAACGGATTTTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455954	456414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_456000_456400
861864	contig_6576_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_42225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATCTCCTAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228476	228896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_228500_228900
861865	contig_2733_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_128573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATACAGTTCCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720514	720822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_720500_720800
861869	contig_10494_pilon	+	1411	1	Intergenic	novelGene_102127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	340	726	279631	280017	NA	80	TTAAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACWARPGWRHGGGYSTDPHTPGAISPLPGRDKEGRGRWATSAQKLWKPASVHFPMPNGWVKMTARSDRSRVASTTQHWENWPTQTLLPVAFLQAKRLGYAQSCFSEPEQLPLMERLPWAKPTATSLI	279291	280702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_279300_280700
861870	contig_6593_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_49853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTGACAGTCTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244976	1246033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1245000_1246000
861871	contig_11416_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_145380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	122	343	805253	805032	NA	10	GGGCTCTCGTCTGCATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRHPTHPSTHTPTLRGQGQAPRTPTDLFQPEGHRSALFHMSDWLWVAEGWGLCLPMLLRSSAPSPVASPTAPQLPDCRKEHPGVREAGRPQLAGVALPAGPVGTLILRGWRF	805374	804530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_804500_805400
861872	contig_14838_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_151926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAGAAGAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248989	248298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_248300_249000
861873	contig_10489_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_165642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641216	642084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_641200_642100
861874	contig_3386_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_34598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTGGCTGTACACCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532321	531912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_531900_532300
861875	contig_9363_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_6734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGGCTCAGAGACGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487978	1488357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1488000_1488400
861876	contig_7056_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_43748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAATACCCTTCGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165177	1164469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1164500_1165200
861878	contig_4769_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_118005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGAGGTCATCGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986599	987714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_986600_987700
861880	contig_7411_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_136997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGTTTTACTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237802	238245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_237800_238200
861881	contig_15474_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_136236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	103	348	86343	86588	NA	10	CCCGTTGCCGCCGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLVESSVLCSLGSSSSGPGHEGERSHQAGNSQSEMLQQRCSLQRSPMRWPGLRRRRRTEHDVVLQVLKQQLPAGSGLLWRDAVAVLQMVVRDLSDQIAREETQLMQEGAHEVAKR	86240	87079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_+_86200_87100
861883	contig_21208_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_175775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATATATGATTACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43763	44764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_43800_44800
861884	contig_8122_pilon	-	770	1	Intergenic	novelGene_40227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACCCACTCCAGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537740	536970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_537000_537700
861885	contig_7657_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_30024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACTTTATTCACTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176032	177060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_176000_177100
861887	contig_1154_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_87249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGCCCTGCTTCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1869146	1868154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1868200_1869100
861888	contig_13894_pilon	-	732	4	Intergenic	novelGene_62170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGCAGCGATTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605911	593306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_593351_601429_601527_603709_603812_605422
861889	contig_1996_pilon	-	1005	4	Intergenic	novelGene_131931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	10.9645894689324	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	24	944	500466	499013	FALSE	25	AGCAAACTGGATGTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFLFKEMMTWVQGSERDSKALLRNRCGQKLEDMIQNLQMETWRPFAGRLSVELPNVSEPSELTPPKATLSQASQVSGPASRLRTSSRVSWTYSSISSAPSRVSETLSMTTLSAGLDLAAQERQTEPAQLRTRRTWRTLSDSLQAFCAVPEAFVRSSAPAALQGLPLPLEQTEWSHSQLLDLEYIDVLNFFCERQLERHQSSLPEEAEPESPSSRAPVPNTVVRQPPDRRYQPILRLQESRVQTARVNLRGRKPPWLCPGGPLRMLKLPLPRVEPQPFPPDWPAPARPRPPLLLQPALQRYFVPDDADPDGYS	500489	498951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_499204_499311_499374_499458_500031_500370
861892	contig_9363_pilon	-	344	3	Intergenic	novelGene_6618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAGGAGACCAGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857553	856718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_856806_857115_857157_857337
861893	contig_9981_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_121036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGATTTCTTTTATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169742	169246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_169200_169700
861894	contig_6589_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_25701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAATGCCGCTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205001	204370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_204400_205000
861895	contig_10196_pilon	+	689	4	Intergenic	novelGene_132296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	268.152112718799	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	71	310	2346785	2352510	FALSE	25	TAGTTTCGACAACTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRRSCCCCEEPSRPSLPPTPATMSAQAQMRALLDQLMGTARDGSVYLCLPTSICKGVAEKPHVHRAETKPDRGSSSQMTVSARVTFWTAAPMTSWLGRAWI	2346714	2352889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2346846_2347670_2347742_2348736_2348832_2352497
861896	contig_20944_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_167538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAACTCAATCAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31063	30544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_-_30500_31100
861898	contig_7996_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_165160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATTATATAAACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326048	326723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_326000_326700
861899	contig_7744_pilon	-	874	6	Intergenic	novelGene_62496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.15142259969188	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	74	505	792615	776503	FALSE	40	TTGTCCTAATAAGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWRAYQRALAAHPWKVQVLTAGSLMGLGDVISQQLVERRGLQGHQAGRTLTMLSLGCGFVGPVLGGWYRVLDRLIPGSAKVDALKKMLLDQGGFAPCFLGCFLPLVGILSGLSAQDNWAKLQRLWPAVQLANFYLVPVHYR	793063	776133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_776560_777090_777187_777301_777395_777637_777754_792545_792621_792995
861901	contig_2636_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_52055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	140	361	58917	59138	NA	20	AGCCCCCCTTACCCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGFNVSKSSSWCLLTERFGSQQQTLTSLPSSFLKQLVSWQDSFPVMQTTYSSAERNYFFRPRNSPGQGVRTQPRASLGTPDGKGHSGSRAHSAPRPGWPAAALKPFESPARGDDTGRV	58777	59320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_58800_59300
861903	contig_9389_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_84080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCACGTACTTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121679	1121341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1121300_1121700
861904	contig_12277_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_139705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAAAATACTGTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346520	345835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_345800_346500
861905	contig_14664_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_169538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTGTGGTTTCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165502	164411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_-_164400_165500
861907	contig_6595_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_122534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432713	432405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_432400_432700
861908	contig_12677_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_110769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTAATTAGTTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2082	1746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_1700_2100
861910	contig_5050_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_110260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCTCCTTCTCTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298184	298668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_298200_298700
861912	contig_8412_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_118370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAGCAAACCCTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542992	543736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_543000_543700
861913	contig_10734_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_51100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGACTCGGAAGGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591390	592252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_591400_592300
861915	contig_8050_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_114847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTCCTCCAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359796	360519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_359800_360500
861916	contig_5346_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_161844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAGAAAGGAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59144	59800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_59100_59800
861918	contig_9995_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_47705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAAAGTACTACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317314	316697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_316700_317300
861919	contig_9706_pilon	-	555	1	Intergenic	novelGene_20931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTCTTTGCTGTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216259	215704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_215700_216300
861920	contig_4816_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_115604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAATATGAAATATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577086	576328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_-_576300_577100
861921	contig_5499_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_57033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTTAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458543	1459033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1458500_1459000
861922	contig_5039_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_64835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTATTTTCCACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293282	292343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_292300_293300
861925	contig_16351_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_175138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTACAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34772	34170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16351_pilon_-_34200_34800
861926	contig_15112_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_124767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	121	465	42494	42838	NA	5	GGCTCCGCCGCCACCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKHFFCQFSQVHHKVRCECQAPPPTLGTITQRAALGGGQPGKLRFNHSRPSASGLGDLPSKGSLRQALGPPAQPGPKALSRIGPLALPLAQIFQVSSLCGGVWVGWGKRRVC	42373	43046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_42400_43000
861929	contig_7605_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_172957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGTCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358880	358437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_-_358400_358900
861930	contig_9440_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_59080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	101	529	1311831	1311403	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLHRTSGAPQGPGMISGPHIPPLRAHSGTPGPSSCGSSPSPALGSLANSLHLKMPSGGGMAPPGNMAESAIHLPALSPRRQVLTNGKPRFQVTQAGGMAGPHPLKPKQQEFGRPFPPNLGKGRTVFLRPLKSGNYYYFFSP	1311931	1311050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1311000_1311900
861931	contig_14871_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_63695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCTTAGTGTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194835	195339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194800_195300
861934	contig_4742_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_130998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAATTTAAAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218524	218997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_218500_219000
861935	contig_12635_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_60834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACAGGGAATTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420873	421272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_420900_421300
861936	contig_8354_pilon	-	612	4	Intergenic	novelGene_24132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	692.055071668594	7	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	70	570	513617	500051	FALSE	50	CTGTAGAACAATAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKISFQSAVAGVKGDKADKAPAAAPATGPATEILLTPAREERPPHPRYKKGSSVGSVCYLSMGMVVLLMGLVFASVYIYRYFFLAQLARDNFFHCGVLYEDALSSQVRTRMELEEDVKIYLEENYERINVPVPQFGGGDPADIIHDFQRGLPTSIRLGCSLETKL	513686	500008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_500102_503634_503824_505824_505966_513497
861938	contig_11104_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_112467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGATTGAGAACTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332135	331440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_331400_332100
861939	contig_4923_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_109332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTTTCAAGCCTGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484880	484295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_484300_484900
861941	contig_6418_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_81165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGCCGGCATACACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506225	505189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_505200_506200
861942	contig_12116_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_167501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTACACATATTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36618	35833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12116_pilon_-_35800_36600
861943	contig_6872_pilon	+	277	2	Intergenic	novelGene_175740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCGAACATAATGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343465	344011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_+_343536_343804
861945	contig_14516_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_153919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCATTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227966	228971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_228000_229000
861946	contig_13504_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_157959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	185	364	143906	143727	NA	80	GACTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPSLHAPSAGRGSWRCTWESVAGDEADPSLRTFCLACAVRILGNPGRIPPWACEQVSDGAMLSLGAQVSAHRRPWSPTESAARLVQASGLTDVREGFRARSPGFDSQKSSRLLSGRTGR	144090	143065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_-_143100_144100
861947	contig_1442_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_172165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGAATTTTTGAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489406	490003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_489400_490000
861948	contig_16098_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_46185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATTGAGGAAGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631686	632219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_631700_632200
861950	contig_11396_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_71307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	45	584	411417	410878	NA	65	ATAAGGAAAAAAATCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDIQDTGLLPLSPEPRPRPVVARRLFSCGWAAGPHPGSCFVVASAWHARPVSLLFAPWPGCGLSIPSLSARIPRVCPYYLSRNLKQQADIIFMPYNYLLDPKVRARPVCGQFCYCRGCLWAQDASGASAWLRVSRGLELAAQLWTAWAVGHRATSHGGQAVGVRTLVGQQAVIKHTSQ	411461	410081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_410100_411500
861953	contig_253_pilon	+	459	2	Intergenic	novelGene_129717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGGTCTGACCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546956	551624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_547017_551225
861955	contig_6509_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_145665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261307	261884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_261300_261900
861957	contig_4964_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_157266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGACTCCCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205895	206585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_205900_206600
861958	contig_9470_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_176411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTAAAAAATGCGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176316	175530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9470_pilon_-_175500_176300
861959	contig_1223_pilon	-	367	2	Intergenic	novelGene_177965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTACACACTCCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109437	106155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1223_pilon_-_106428_109342
861960	contig_11602_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_166598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCACGGAAATTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192483	193141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_192500_193100
861961	contig_6488_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_44709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCCTTTATAGAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6515	5667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_5700_6500
861962	contig_11416_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_145352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGAAAACCTCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214870	214513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_214500_214900
861964	contig_3584_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_108124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230284	229932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_229900_230300
861966	contig_6608_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_162545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	51	518	285617	286084	NA	40	AAAAGGACTTATCTAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVPAVGDVISGEYNGGMKELMEHLKAQLQALFEDVRAMRGALDEQASHIQVLSNDVCANQRAIVSMCQIMTTAPRQGGLGVVGGKGSFPSAPQEPENPSPGTGDSGLLGRDPEDEEDEEEEKEVPSPATPTSHCERPESSCAGLLGEDGPLVEPLDLPDITLLQLESEASL	285566	286437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_285600_286400
861967	contig_10331_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_54177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCATGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579147	578725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_578700_579100
861969	contig_15613_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_147225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGACACACACACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267061	265872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_265900_267100
861971	contig_10304_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_166495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGTTCCATGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100241	99397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_-_99400_100200
861972	contig_3241_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_146386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAGAAAAAAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748303	747907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_747900_748300
861973	contig_12427_pilon	-	323	3	Intergenic	novelGene_40480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3427	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	325948	314393	FALSE	10	CTTTTTCTGATTGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLKINSRYLASRFPPGCVRVSAAAGPLRRQSDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325949	314370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315456_325856
861975	contig_7086_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_175765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596124	596470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_+_596100_596500
861976	contig_9777_pilon	-	825	6	Intergenic	novelGene_154427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_1	420.909206361657	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	14	775	38219	16162	FALSE	35	TCTCAAACCATGTGTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AITQMCEVTGGRSYCVRTQRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKTGPDPLPIGEDGLTDSSRPSNPFAAQPWHSCHKLIYVRPNSKTGVPVGHWPIPESFWPDQNLPSLPPRTSHPVVRFSCVDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQYILERKSPHTCWQVFVNNSGKYNELGYPFGYLKASTTLTCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKLKPNLKWRQAFDSYLKTLPPYFLLVCIYVYICINYRNDDSCLELYP	38232	16111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_16326_25840_25974_29883_30037_33480_33645_37094_37224_38200
861977	contig_2757_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_164571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49317	48886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_48900_49300
861979	contig_12042_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_170445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCCCAGTATATAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213496	214072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_213500_214100
861981	contig_2209_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_141013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTATTTACTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167604	168441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_167600_168400
861983	contig_19032_pilon	+	423	2	Intergenic	novelGene_172515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	43	318	13034	27716	FALSE	20	TTCTCCCCCAAATCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELGKEYKGNAYHLMHKNCNHFSSALSEILCGKEIPRWINRLAYFSSCIPFLQSCLPKEWLTPAALQSSVSQELQDELEEAEDAAASAAMASTAAGSRPGRHTKL	12991	27821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_13076_27482
861986	contig_18438_pilon	-	396	4	Intergenic	novelGene_171395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_3	11.0453610171873	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTAATAGCAGGGAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311664	303598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_303718_303811_303886_310568_310653_311545
861987	contig_18438_pilon	-	546	5	Intergenic	novelGene_171393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_3	14.7542366796795	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	1	546	299776	292911	FALSE	35	CTGTGTGACAAGGTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDIILLPSDKDPPKLKDCLPTVGALKHLKEWHSAKITIAGNHREINCQKIAEYLSANIVSLEDLRNAIDSKELWRGKIQIWERKFGSEISFPEFSLKGVTPKNFSTSNLNTCFLAKKIISSKDKSILPKVYHYYGPALEFVQMIKLSDLPSCYMSDLEFELGLTKNNTRQNSMLLLEQISS	299776	292910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_292972_295332_295428_297045_297181_298298_298417_299639
861989	contig_8588_pilon	-	313	3	Intergenic	novelGene_146499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	1	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	108	206	313	109542	74701	FALSE	55	AAAATATTGAATAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEVRLRQLEQFILDGPAHTNGQCFSVETLLDILICLYDECSNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAM	172468	74700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_74746_109479_109572_172292
861990	contig_2689_pilon	+	633	5	Intergenic	novelGene_100829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTACGGTTCTTATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157206	189439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_157325_158485_158684_161632_161743_164370_164488_189349
861991	contig_13424_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_151605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGGAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177151	177725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_177200_177700
861992	contig_6885_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_83681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTAATTTCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240254	240644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_240300_240600
861993	contig_10434_pilon	+	814	3	Intergenic	novelGene_82026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	10.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACATACCACAAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125428	128731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_125661_126692_126823_128279
861994	contig_10734_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_51133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAAAAGTCAGAGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849359	848898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_848900_849400
861996	contig_9389_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_84051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTACATGTGAGCTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713278	712960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_713000_713300
861997	contig_5917_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_122171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGACCAAGATACAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734569	735525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_734600_735500
861999	contig_17198_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_62431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTTTTTCATATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218966	1218343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1218300_1219000
862002	contig_3789_pilon	-	781	1	Intergenic	novelGene_79815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGTTCTCCAAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106789	106008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_106000_106800
862003	contig_1939_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_144863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATAGGAAACCACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251129	250750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_250800_251100
862004	contig_10451_pilon	-	376	4	Intergenic	novelGene_138295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAATGCAATAAGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93099	86744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_86881_88787_88883_91303_91371_93021
862006	contig_7179_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_78118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGGATAAGTCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749805	749348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_749300_749800
862007	contig_12479_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_56820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14198	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_13800_14200
862008	contig_8012_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_177968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGTTAATGGTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384849	383526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8012_pilon_-_383500_384800
862009	contig_11677_pilon	-	498	4	Intergenic	novelGene_85975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCGAGGGGCGGAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737614	727239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_727296_727546_727682_727765_727884_737425
862010	contig_4315_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_46815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGAATCCCTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341043	341985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_341000_342000
862011	contig_16930_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_139171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGGGATGAGAAGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264828	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_264100_264800
862012	contig_19564_pilon	+	430	3	Intergenic	novelGene_29686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	408	junction_1	21.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	102	428	100157	102908	FALSE	15	GGCTGTCATCCGCTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLDCRWRTRCVACGTSETQGRELKMILLPACRFIDVGGYKLLNNWLTYSKTTNNIPLLQQILLTLQHLPLTVDHLKQNNTAKLVKQLSKSSEDEELRKLASVLVSDW	100055	102910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_100394_100795_100848_102870
862013	contig_6938_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_69075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAGTACAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169214	165017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_165538_169092
862014	contig_5799_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_50260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATATGCTCCACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221269	220485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_220500_221300
862015	contig_13123_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_136885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGCTCTACCTTCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361623	362230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_361600_362200
862016	contig_7816_pilon	+	540	4	Intergenic	novelGene_66576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	1.24721912892465	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	82	540	691281	695148	FALSE	30	GGCTCCAGGACATATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNVFLTRTNIIKVGDLGIARVLENHCDMASTLIGTPYYMSPELFSNKPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMNSLVYRIIEGKLPPVPKDYSPELAELIRTMLSKRPEERPSVRSILRQPYIKHQISLFLEATKAKTCKNNVKNGDFKSKPVATVISGKTQSNNEVISPQPYSSE	691199	695148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_691356_691767_691876_693092_693248_695027
862017	contig_8420_pilon	+	793	2	Intergenic	novelGene_69345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTATATTCGCTTACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10982	11826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11470_11520
862018	contig_1107_pilon	-	707	2	Intergenic	novelGene_126581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	196	705	677579	673116	FALSE	5	CTCCTCCTCCTTCCGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYPSPPYHFGKHLGVLGFTFFFLSSSFYQLSRKSNPVFKTTLLELTCAGTGSENRTSSASSWMASGADGFPSGSAGPASLGGLADTCISRGLSRSAHTPERSHSSCRGPLGRSAWVSLSFGAGSCRWHTGTTFSPFSIDLIWLGVSDWNSVSGPSPRDRSALIFQKV	677774	673113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_673477_677430
862020	contig_3825_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_78042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTTCTGTCTTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2421688	2421106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_2421100_2421700
862022	contig_8310_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_75569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCGGGCTATGGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275338	274569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_274600_275300
862024	contig_9415_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_109750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACAGTTACCTGCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028859	1029398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1028900_1029400
862026	contig_12778_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_173492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCTGAGTTTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134842	134119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12778_pilon_-_134100_134800
862028	contig_7895_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_154457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCCAAAACAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725328	726071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725300_726100
862030	contig_4496_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_66696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAATGGCTGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964527	964170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_964200_964500
862033	contig_7088_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_159805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGGCTAAGAGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740686	739502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_739500_740700
862034	contig_10064_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_122722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138.5	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	154	396	395972	404706	FALSE	45	TAAAGAGGAATGTCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERGREDPRGERLVRRGSAGVPEPQSPHPASNRPHPRSAPTSAPPRTPNTSMDCCTESACSKPDDDILDIPLDDPGANAAAAKIQASFRGHMARKKIKSGERGRKGRAPGAVARRFLISACACDRAGLECEQ	395818	404706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_395987_402969_403118_404626
862035	contig_9121_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_134425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCATGTTTATGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38919	39892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_38900_39900
862037	contig_15365_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_111137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGAGACGAGCAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181601	182134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_+_181600_182100
862038	contig_10135_pilon	-	822	6	Intergenic	novelGene_106603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGCCCAGGGGCCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80831	79147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_79374_79525_79666_79798_79913_80084_80216_80511_80661_80769
862039	contig_2892_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_118983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAGAGAGAGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17160	16859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_16900_17200
862040	scaffold_13505_pilon	-	369	2	Intergenic	novelGene_111391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTCAGTTCTTTGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182647	182194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_182431_182514
862041	contig_2987_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_125865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAATACGAGATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540444	541262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_540400_541300
862042	contig_12466_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_176399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGTCTTCTGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65111	64312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12466_pilon_-_64300_65100
862043	contig_13780_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_149036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACATTGGTTGCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495291	495806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_495300_495800
862044	contig_6445_pilon	+	441	5	Intergenic	novelGene_76974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCAGCGACGCGCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86115	96343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_86266_88140_88215_88472_88594_89656_89717_96307
862045	contig_6634_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_171138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCCAAGATGATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163216	164181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_163200_164200
862046	contig_1274_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_137822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671147	671595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_671100_671600
862047	contig_8375_pilon	+	615	3	Intergenic	novelGene_141310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACGGTGCACACAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190063	205789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_190173_195207_195310_205385
862048	contig_10627_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_60042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAGAGAAGTAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793661	792931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_792900_793700
862049	contig_12701_pilon	+	540	3	Intergenic	novelGene_169562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7.5	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAGAAAGAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52694	54019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_+_52963_53217_53446_53975
862052	contig_7426_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_27498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTCAGGGGCAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925066	924418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_924400_925100
862053	contig_12948_pilon	-	730	6	Intergenic	novelGene_126182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAGAATATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196076	185052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_185205_191149_191232_192707_192803_195493_195624_195707_195849_195946
862054	contig_13464_pilon	+	270	2	Intergenic	novelGene_125233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCCGGGCTATGACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205776	236441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_205967_236361
862055	contig_6325_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_143368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGAAATATATATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423539	424621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_423500_424600
862056	contig_5502_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_155012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCATGTCACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499150	498718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_498700_499200
862058	contig_11590_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_125556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGTTATTTTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10912	11708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_10900_11700
862059	contig_7904_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_160023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAGTAATAGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401700	402383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_401700_402400
862060	contig_5372_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_149715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACCCCACTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171500	171074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_171100_171500
862061	contig_5799_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_50243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTTGAAAAAACTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164808	165135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_164800_165100
862062	contig_934_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_129014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAATAAGACATTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144215	144468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_+_144200_144500
862063	contig_14034_pilon	-	670	4	Intergenic	novelGene_72642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	9.03081145609604	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	31	669	214919	194850	FALSE	25	TATGTATTTGCCACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGLRRRWRAMAASPGPAGVGSAGTFHGSDSSGFAFDSGLEIKTRSVEQTLLPLVSQITTLINHKDNTKKSDKTLQAIQRVGQAVNLAVGRFVKVGEAIANENWDLKEEINIACIEAKQAGETIAALTDVTNLNHPESDGQITIFTDKTGVIKAARLLLSSVTKVLLLADCVVVKQIITSRNKVLATMERLEKVSSFQEFVQIFSQFGNEMVEFAHLTGDRQN	214949	194848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_194970_196609_196798_203500_203691_214778
862064	contig_5954_pilon	+	606	7	Intergenic	novelGene_28482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_6	28.6206025249101	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	51	605	312342	315865	FALSE	20	TGCTCAACCTGCTCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTAVRIHLDPRKNVKEFLVTLRLHRATLRHCVSPPEQSWHSQLLEFLDVLDDPVLGYLPPTVITVLHTHLFSCAVDYRPLYLPVRVLITAETFTLSSNIIMDTSTFLLRFILDNSALYLSDKCEVEALDLRRDYVCVLDVDLLELVIKTWKGSTEDKLSQPLFELRCSNNVVHMHTCADSCAL	312291	315866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_312393_312505_312587_312833_312941_313021_313115_314520_314592_315136_315214_315790
862065	contig_4868_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_136763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGCAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203836	204138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_203800_204100
862066	contig_14528_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_111283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAATATAAACCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211421	210875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_210900_211400
862067	contig_10990_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_7432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGTTAAGGGCAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684024	684551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_684000_684600
862068	contig_13460_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_162194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATTATGAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305966	305148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_305100_306000
862069	contig_2770_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_107509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTATCTTTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839213	838924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_838900_839200
862070	contig_8864_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_135992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	254	340	461214	461300	NA	20	TTTTTATGACTTTCTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQNTEDCEHVDIENIDQWFESQSNDSSCKVLTDNEGAEDQAKPAEQKPSSKTRKTEPNPEKHISHKAALEWTESLLDYLEQQDDMLLSDKLVLRRLRTIIRRKQKIQNSKNH	460960	461654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_461000_461700
862071	contig_10011_pilon	-	523	3	Intergenic	novelGene_68053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.5	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	312	425	202587	202474	FALSE	25	TATGTGTGAGAATTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRLRPGCGPCRLRNSSPVPRGPTRRLPATPGCAEPHDALCCRRLPPKREHENPKWRPHSQLVLRPRSICQGHEARLKLSGQESGEASGFQVQVPQVHGPLAAMTPICRGPSAGLGFRPHAHPRRDISFPSCSPLCGNLI	212652	202375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_202651_203360_203463_212506
862072	contig_14288_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_153831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTATAAGACAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414974	415190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_415000_415200
862074	contig_15029_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_128225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAACATAGTTAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509228	509891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_509200_509900
862075	contig_5727_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_7927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAACTTAATATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126239	125005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_125000_126200
862076	contig_13300_pilon	-	587	6	Intergenic	novelGene_125826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.33757453113766	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	239	538	289565	283177	FALSE	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPWAGLAPCPLPQQTPEPAYPTSPAFPPLSCPFASRVVYQDGFYGAEIYGGYAAYRYAQPAAAAAAAYSDSYGRVYAAADPYHHTVGPAATYSIGTM	291055	283127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_283180_286779_286859_287988_288054_289412_289591_290275_290409_290975
862077	contig_1380_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_138871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGCTTTATATGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60698	61291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_60700_61300
862078	contig_14546_pilon	-	420	3	Intergenic	novelGene_157429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	35	216	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTCTCTCGTGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484490	468978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_469093_472846_473019_484356
862079	contig_4364_pilon	-	363	3	Intergenic	novelGene_43	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	13	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	45	362	499956	494670	FALSE	25	TAGCAGATTTGCACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPAWSLPPRARVPMEQLLRAELRTRTLRAFGSSGAGYISEGRAYDTDAGPVFVKVNRRTQARQMFEGEKASLEALQATGLVRVPRPVKVIDLPGGGAAFVMEYLKMRSLSSQASKLGEQ	500000	494668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_494695_495979_496132_499815
862080	contig_7806_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_157536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAGTCAAAAGTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228088	227353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_227400_228100
862081	contig_7914_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_165024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113212	112355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_112400_113200
862082	contig_8587_pilon	+	592	2	Intergenic	novelGene_159123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACATTTGCAGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215915	217529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_216016_217037
862083	contig_10658_pilon	+	734	1	Intergenic	novelGene_130082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231173	231907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_231200_231900
862084	contig_2069_pilon	+	695	6	Intergenic	novelGene_23471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.748331477354788	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	193	360	1505705	1507088	TRUE	25	AAAGCACCCGCCCCCGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DILDGFFPSELQRLYPDGVPFKVSDLRNQFYPEDGLDLFPGEGRVVGWQKIRKASGRLENSGSRMTAERFLNRLPKVVIRQGEVVDIRGPIRDSLPELLPIASPDPGDRGGDSCFGRGA	1504316	1507573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1504383_1505450_1505569_1505696_1505793_1507008_1507092_1507161_1507303_1507382
862086	contig_7898_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_47560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCGGGAGAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335478	336110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_335500_336100
862088	contig_5590_pilon	+	610	6	Intergenic	novelGene_163005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	55.2354958337481	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	251582	254107	TRUE	10	TGAGGGGCCCGGCTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRWRGFERSGPDGPGRKRRLLQAYEEPDAKQPRVDSEGDYSDNADDGPGDFRSGDEEFRGEDEFGELGRQRGPTAYGTTLLLTLLLSSSPSFRQRPLAKSPHAL	251580	255393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_251712_251911_251962_253027_253062_254006_254171_254826_254915_255250
862091	contig_2550_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_135660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTAGCTTTAGTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151974	1153046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1152000_1153000
862094	contig_16934_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_132535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	367	789	210208	209786	NA	35	ATAACCTCCTTTTCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYCMGVMCSKPGGGTSQYLRIFPFLSWRGEGINPPRASSAPLLKVLLRHRESRGALRWSRLRRSRLWIRCSRSRFRERLRLCFRCLFSLSCRWNSSKPDMLRRPRRAPCSARSPYRPPALSVSATSAADSTLCFKKPM	210574	209767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_209800_210600
862095	contig_13992_pilon	+	409	4	Intergenic	novelGene_147635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	197	379	422594	428070	FALSE	20	CACTGTGAGCCGAGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSVKDVEGDELLLNPRVEGAAAEARFRFFSGLHASDRFFVAVWLFSEEAASVTLEEFVLAVLSLMVSLFRRLCLSVLSLFLGASSTSKSSVGSCVLFVWFLFFPFNLPESSSDWGEVTRANFVL	421233	428100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_421361_422524_422607_424867_424980_428012
862096	contig_3787_pilon	+	422	6	Intergenic	novelGene_102374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	322.124572176666	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAAGTCCTCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383726	519000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_383810_395746_395809_401341_401416_515231_515317_517945_518038_518974
862098	SIRV5	+	376	2	Genic_Genomic	SIRV5A	novel	2473	1	NA	NA	1961	0	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13094	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_+_13343_13478
862099	contig_6084_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_127037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCATTCATTTCGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295036	294143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_294100_295000
862105	contig_15108_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_131193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGCGTTTCACAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167432	167648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_167400_167600
862106	contig_12050_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_62660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCCATCCAATGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419176	418552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_418600_419200
862107	contig_14665_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_171056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	257	343	99752	99838	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSWNRLSGNGFGFVCVPSIRVGVPGWRKQLSDGLPAERLAVQTPPRGTSGDRLVIFFQKITALKTLWSSCTLHTWGHHKSESTCMATNHNKASDQWSLQLNRLPSETATTGS	99495	99957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_99500_1e+05
862108	contig_11566_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_166706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGAGGATTCCAGGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197291	197724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_197300_197700
862109	contig_14341_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_111903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTTGATGTAGTGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760211	760865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_760200_760900
862110	contig_4000_pilon	+	290	2	Intergenic	novelGene_176084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCCATAACCACCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285981	309105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_+_286005_308838
862111	contig_4678_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_126074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCATCTAAAAGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727834	728598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_727800_728600
862113	contig_498_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_148551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627796	628367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_627800_628400
862114	contig_3948_pilon	+	775	1	Intergenic	novelGene_53259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAACTGCTGGGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309359	1310134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1309400_1310100
862115	contig_7308_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_159587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGCCTTGGCCGTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167519	166945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_166900_167500
862116	contig_2940_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_81916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCTCAGAAGTACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536373	537392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_536400_537400
862117	contig_2364_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_170823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAGGAAACTTTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8847	9726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_+_8800_9700
862118	contig_7428_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_77676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTAGAAGAAAATAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59742	59008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_59000_59700
862119	contig_5253_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_61573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAGAAGAATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233328	232658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_232700_233300
862120	contig_18919_pilon	-	806	2	Intergenic	novelGene_156042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCTTAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163102	162249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_162863_162909
862121	contig_1090_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_131119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCACATTTAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361643	361021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_361000_361600
862123	contig_6191_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_107848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAACTGCTTTTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165713	165978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_165700_166000
862124	contig_10569_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_44094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAGACATTAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412113	412878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_412100_412900
862125	contig_2414_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_158521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAACCTAACATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891260	891779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_891300_891800
862126	contig_20356_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_159556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTCTTCCAAACGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256493	256720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_256500_256700
862127	contig_5779_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_106421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTGTGACATTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62234	62880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_62200_62900
862129	contig_3463_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_62007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTCCAGGGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522429	522957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_522400_523000
862130	contig_7135_pilon	+	502	2	Intergenic	novelGene_136955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	20	502	319564	323044	FALSE	30	AACAACTTCTTAGCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVTRTLLGVARGWWRLEGLSTASLSIRSLALSAAPSNSGCPWRLLGALCLQRPPLVSKPLTPLQEDMAALLKQIEVERSLYSDHELRALDEAQKLARKKADLYEEEEDGKEILLVQDLEDMWEQTFLQFKPGARITGLWPCRASKREGKEMGSGSQIK	319544	323044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7135_pilon_+_319792_322789
862131	contig_6654_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_85760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCACCCAAATAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579570	578568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_578600_579600
862133	scaffold_7386_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_136605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	84	410	356608	356934	NA	30	TGGAAGGAGCTGTGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEYQGGHGGPHASCPQFPASTLTRSPMLSSSQGAAASDLPVVSPLPLSQEAGTGLWHWSPAILWSGGQCLDPSQSEALTPSDWSAYTEDPVGYGNMSRTWCWEPWDGRTSVQPLSSTPPVANTLRAEPTTHPPL	356524	357209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_356500_357200
862134	contig_6327_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_147490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGGATTGTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71499	71990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_71500_72000
862135	contig_7976_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_169428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923924	923623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_923600_923900
862136	contig_4469_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_21926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCAAAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573375	573651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_573400_573700
862137	contig_1867_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_54613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAGAAGAAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520153	519332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_519300_520200
862138	contig_9759_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_167226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATCTATTTAGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83340	82692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_82700_83300
862139	contig_2114_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_104308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063335	1063995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1063300_1064000
862141	contig_5690_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_119692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494180	493422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_493400_494200
862142	contig_10235_pilon	+	384	4	Intergenic	novelGene_46499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	7	384	263545	264206	FALSE	15	TCGTAGTCATTCTGGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPQLPGDAPVPNVVHPGMPRPLMGLGQDAEVAPRHGSAGGLGHLPAAHVPLRPQQRLHHVLGTVAKRHHHGVVLYVPEQSLLLQCRQHCLPGLKPGQALGGGTLMRAPRESMMLTVSSPCRCPT	263538	264206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_263581_263694_263855_263935_264044_264132
862144	contig_3754_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_146829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCGGGAGGCTTCTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184470	185332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_184500_185300
862146	contig_9406_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_136161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATTCGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45010	44243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_44200_45000
862147	contig_15781_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_177969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAAAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17314	16784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15781_pilon_-_16800_17300
862148	contig_5947_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_101560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCCACTAGGATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659751	659370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_659400_659800
862150	contig_4783_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_108421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTACCCTTGCAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411523	411961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_411500_412000
862151	contig_8576_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_88753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTTGGCATCCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706031	706547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_706000_706500
862152	contig_10973_pilon	-	110	1	Intergenic	novelGene_150394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCTATACTTATCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2240	2130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2100_2200
862155	contig_7272_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_25288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCCATGTGTGCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332984	333313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_333000_333300
862156	contig_12735_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_140780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTACTTCCACTTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181738	181346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12735_pilon_-_181300_181700
862158	contig_13041_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_127717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTAAAAGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29172	28685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_28700_29200
862159	contig_5988_pilon	+	779	8	Intergenic	novelGene_16033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8.91913787359312	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGCGTGAGGTTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839184	842141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_839290_839542_839698_839802_839890_840532_840673_840761_840900_841088_841172_841624_841678_842123
862160	contig_15123_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_110895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40414	39807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_39800_40400
862161	contig_20241_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_159748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	108	419	244201	244512	NA	40	GTTTTGCCAGATAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVHSLSKAHKKPVAVESIPTHSNPVGQSRTVPWGFQGCKFLWKQTSRSFSHCVAGGLEPVTSRLTATHFNHHAIRAPSLKPSRVKSVAVVFPCCPAVLLVSQ	244093	244924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_244100_244900
862165	contig_11473_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_159254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCCCTTTCCCTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107444	106837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_-_106800_107400
862167	contig_16503_pilon	+	223	3	Intergenic	novelGene_162077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	221	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTCTGCGTACACAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143005	147663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_143080_145454_145528_147587
862168	contig_9673_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_119181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTGAAGACTGAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181189	181467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_181200_181500
862169	contig_11292_pilon	+	783	3	Intergenic	novelGene_109438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	42	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	199	603	313199	324135	FALSE	25	GAGAGGAGCGATTTAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPGAPGPPRDSLGSCPRVPTCEGTSSKASDCLQPSSSSSFQLSSRLSTATSGAERSPLCQAPKRGMAAAALLEAGLARVLYYPTLLYTLFRGNMPGRGHRDWYHRIDPTVLLGALPLRSMTRRLVQDENVRGVITMNEEYETRFLCNSSKVHNWSPEEAVRFITKIRPHIHVRPGQLEVLKEFYKEITPGAAKNEASHT	313000	324315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_313373_313499_313581_323985
862174	contig_17102_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_141701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTTTTTGGTAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18310	17467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17102_pilon_-_17500_18300
862176	contig_6740_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_142691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAACATACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626383	626801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_626400_626800
862178	contig_3382_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_124206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACATATTTCTATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430215	1430429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1430200_1430400
862181	contig_9199_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_65638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAGCTGAGGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116390	117244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_116400_117200
862182	contig_14811_pilon	+	765	2	Intergenic	novelGene_74498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	514	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	24	359	377150	379519	FALSE	0	CCCTCTGCTGTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLKLLFMWSREAPGVGRSLDSAEDTSQFSMFMAIITMKKTETPTDLLKNMRPLISQSGPAIQVFCLQHLRLSTSLLNTAEPWFEDPGSLGFASEEHLQSQLVLPTPGSRFIKCTQTG	377126	379925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_377213_379246
862184	contig_7815_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_134365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186573	185888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_185900_186600
862185	contig_14326_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_120655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACTTTCTTAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40357	40004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_40000_40400
862192	contig_6980_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_35997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCAGCTTAAGTTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274423	275296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_274400_275300
862193	contig_16382_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_160238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGACTTAACGGCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287274	287667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_287300_287700
862194	contig_9290_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_77561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGTATAATAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498042	497593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_497600_498000
862196	contig_7179_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_78100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGTTTTTATTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631294	630578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_630600_631300
862197	contig_7056_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_43724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATTAAGTCTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966479	966820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_966500_966800
862199	contig_16934_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_132524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGCCCATTCTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164332	163807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_163800_164300
862200	contig_15219_pilon	+	546	3	Intergenic	novelGene_40852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.5	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	96	389	71314	72008	FALSE	20	CTTGAGAGCAGCCTGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGARRGRGGGGGDGGKELERCQQQAVEVTEIMLNNFDKVLERDGKLADLEQRSDQLLDMSSAFSKTTKTLAQKKRCENVRCRIYLGLAVGGSLLIILIVLLAILLPQNSEGSSAPEAQGAGTASGPGD	66369	72165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_66415_71263_71398_71798
862201	contig_253_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_129773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCCTTTTCTTGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810350	809410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_809400_810400
862203	contig_500_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_31119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTGGAAATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685941	1686379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1685900_1686400
862204	contig_5247_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_81828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCATTTAAAAAAAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355437	355096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_355100_355400
862205	contig_11631_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_104178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58417	57806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_57800_58400
862206	contig_3015_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_163315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAAGAGAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174185	174995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_174200_175000
862208	contig_9939_pilon	-	1397	1	Intergenic	novelGene_158598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAAAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84143	82746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_82700_84100
862211	contig_1369_pilon	-	601	4	Intergenic	novelGene_176789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.35702260395516	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	188	601	436182	426866	FALSE	25	GTACAGTGAATTTGTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDEFCNVKFYIDASQPDVGSWLKYIRFAGCYDQHNLVACQINDQIFYRVVTDIAPGEELLLFMKSEDYPHETMAPDIHEERQYRCEDCDQLFESKAELADHQKFPCSTPHSAFSMVEEEFRQQLESESDLREIHAIQECKECDQVFPDLQSLEKHMLSHTEEREYKCDQCPKAFNWKSNLIRHQMSHDSGKHYECENCAK	448706	426865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_427014_432445_432663_436133_436237_448573
862212	contig_12733_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_129595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGGAAAAAGTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340055	341063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_340100_341100
862214	contig_10096_pilon	-	433	3	Intergenic	novelGene_177154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	1.5	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCAGAGAGCAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83516	67549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10096_pilon_-_67738_68828_68901_83343
862215	contig_15720_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_41857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGACCGTTGGAGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230175	231109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_230200_231100
862218	contig_11338_pilon	+	334	2	Intergenic	novelGene_6256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTACAGTTCTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112677	115445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_112735_115168
862219	contig_15353_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_151958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182841	182503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_182500_182800
862220	contig_10803_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_170123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91441	91012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_-_91000_91400
862221	contig_10494_pilon	-	403	3	Intergenic	novelGene_102190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGCTGCTGTCATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059307	1056295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1056541_1058757_1058827_1059218
862222	contig_6210_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_171880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTAGGCTCTCAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65975	65630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_65600_66000
862224	contig_6631_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_174294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAGTATAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16929	16576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_-_16600_16900
862225	contig_9614_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_104427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149045	148120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_148100_149000
862226	contig_4418_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_98380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCCCACAACACGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814685	814160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_814200_814700
862228	contig_12015_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_164289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	163	300	1747	1884	NA	20	TGATCCTACGTTTATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVLLLLLLQPPPAKLLPEHAHTLEKYSWEAFDSHGQDSSGQLPEELFLLLQSLVMATQEKDTEAIKSLQVEMWPLLSAEQNHLLHLVLQETISPSGQGI	1584	1972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12015_pilon_+_1600_2000
862230	contig_4388_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_161967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAACAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668322	668881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_668300_668900
862231	contig_15327_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_70464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAAAGGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332573	332888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_332600_332900
862232	contig_5676_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_159087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCATTAGTTTTTGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242624	242097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_-_242100_242600
862234	contig_5643_pilon	+	1028	9	Intergenic	novelGene_38766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	19.0197266016102	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	78	1028	192911	209464	FALSE	25	AACATGTGTGTTTTGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQLYEFHLPLSPEELLKSGGVNQYVVQEVLSIRHLPSQLKAFQAAFRAQGPLAMLEHFDTVYSIIHHFRSIDPGLKEDTLEFLIKVVSRHSQELPAILDDAALSVSDRSAHLNALKMNCYALIRLLEAFETMTSQTNLTDLDLGGKGKKARAKAAHGFDWEEERQPVLQLLTQLLQLDIRHLWNHSIIEEEFVSLVTGCCYRLLENPTISHQKNRPTREAITHLLGVALTRYNHMLSAAVKIIQMLQHFEHLASVLVTAVSLWATDYGMKSIVGEIVREIGQKCPQELSRDPSGAKGFAAFLTELAERVPAILMS	188828	209464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_188883_192887_193038_205555_205632_205905_205965_206452_206635_206943_207087_208848_208977_209048_209173_209352
862235	contig_19974_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_130450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCGTCTGAGGGCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51252	51559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_51300_51600
862236	contig_6205_pilon	+	599	4	Intergenic	novelGene_160335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	24.1660919471891	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAGAGGGCAGACGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25081	42998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_25145_27049_27165_27540_27677_42713
862237	contig_8019_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_126987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTAGAACATTGCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131856	132384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_131900_132400
862238	contig_4519_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_123647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAACCAACTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14012	14313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_14000_14300
862239	contig_13496_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_107657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439568	439098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_439100_439600
862240	contig_602_pilon	+	766	3	Intergenic	novelGene_134936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	53.5	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	89	430	296691	302964	FALSE	60	ATCGAAAAAAAAATACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEHAVTQTEHMATIEAHAVAQQVQQVHVATYTEHSMLSADEDSPSSPEDTSYDDSDILNSTAADEVTAHLAAAGPVGMAAAAAVATGKKRKRPHVFESNPSIRKRQQTRLLR	233729	303300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_233812_296684_296914_302845
862241	contig_21006_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_177721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATCAAAGAATGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17101	16725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_16700_17100
862242	contig_3942_pilon	+	511	3	Intergenic	novelGene_128822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	32.5	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCACCGGGTATGGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177686	1179368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1177791_1178051_1178342_1179251
862244	contig_10431_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_117408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTGCTTTTAAGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255981	257245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_256000_257200
862247	contig_13854_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_154118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGTTGAGAATGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36633	35787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_-_35800_36600
862248	contig_6048_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_73128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948364	949122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_948621_948822
862249	contig_12528_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_81299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351766	350868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_350900_351800
862250	contig_2069_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_23573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAGGGATTGTTTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2312129	2313054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2312100_2313100
862251	contig_5039_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_64865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364448	364986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_364400_365000
862252	contig_8762_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_145295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147371	147772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_147400_147800
862253	contig_1399_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_166672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAACTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478561	479401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_478600_479400
862255	contig_9438_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_154261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	89	373	23526	23242	NA	40	GCCACATTACAAGAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EETGIKSEFRSLLSIRQQHANPGAFGKSDMYIICRLKPCSFTINFCQHECLRCEWMDLSDLVKTENTTPITSRVARLMLYGFREGFDKIDLTMEELPAVYTGLFYKLYHKELPESYKTMAGMY	23614	23184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_23200_23600
862256	contig_9809_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_176742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAACAATGAAACAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52612	51712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_51700_52600
862258	contig_5779_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_106532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAGAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341170	340792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_340800_341200
862260	contig_12464_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_68684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAACTTGTATAGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204449	204077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_204100_204400
862262	contig_992_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_164301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGATACCTCTTGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375145	374664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_374700_375100
862263	contig_6415_pilon	-	509	2	Intergenic	novelGene_175845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121952	89115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_-_89598_121925
862264	contig_5039_pilon	+	325	2	Intergenic	novelGene_64756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAGCTGATGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111524	117762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_111628_117540
862266	contig_602_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_134925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAAACCTCCCATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46697	47271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_46700_47300
862267	contig_8616_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_72515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTAAAACTATGAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344821	344108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_344100_344800
862269	contig_9594_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_73923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACTCAGCAGATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174940	174453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_174500_174900
862271	contig_3818_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_99311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATGTGATGTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081198	1081690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1081200_1081700
862272	contig_57_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_44921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAAAAAACTTCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298139	299014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_298100_299000
862273	contig_12424_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_174267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCAGGTAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15498	16259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_+_15500_16300
862274	contig_1274_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_137800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAACCTTCACGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423766	424287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_423800_424300
862276	contig_9389_pilon	-	748	6	Intergenic	novelGene_84097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.2311078811365	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	20	703	1389778	1387533	FALSE	10	CTCCTTGAGGCGTTGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLCLGMTAALARGCLHCHSNFSDKFSFYRHHVNLKSWWVGDIPVSGALLTDWSQDTMKELHLAIPAEITEEKLDQVANAVYQRMDQLYQGKMYFPGYFPNELRAIFRDQVHLIQNAIIESRIDCQRHCGRRRSGSEQCKASSGRRSTQADSRCSPQPDLTKLHMPGAATPGQPDSGKRLRVPDPPLTDRRTAPTTGLAQPTLLEQACCCLGVPHTARTRGREEGREMAFVHR	1389797	1387487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1387805_1388522_1388565_1388805_1388833_1389242_1389315_1389406_1389488_1389588
862279	contig_11378_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_112276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAACAAATAATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448784	449652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_448800_449700
862281	contig_9571_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_136252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACAGTTTGAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297404	297194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_297200_297400
862282	contig_11978_pilon	+	638	2	Intergenic	novelGene_63041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATTATTGAAATAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653066	1654249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1653109_1653653
862283	contig_6842_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_130763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	689	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATAAACTCCTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312726	1315923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1312876_1315712
862285	contig_15893_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_128506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTACAGGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49939	49475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_49500_49900
862286	contig_2689_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_100836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACCATCTTGAAATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228827	228002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_228000_228800
862287	contig_6182_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_171660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAACGGATTATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300422	300979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_300400_301000
862288	contig_15570_pilon	+	511	4	Intergenic	novelGene_137852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	66.0353440716914	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	128	511	656070	692391	FALSE	35	CCACTTTCAGTGAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLLEKSSVAAGFWSSVLSQPNPTQPSHSHQHLTRSRTPNAAMKPAVFLPVPDLRCSLLLLVTWVFSPVTTEITSLDTENIDEILNNADVALVNFYADWCRFSQMLHPIFEEASNVIKEEYPNENQVVFARVDCDQHCKYLSRKSGRNCPIPTSPTHPHTPFFFFFFFND	655942	692391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_656127_686130_686204_687918_687959_692177
862289	contig_4131_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_127900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGCAAACTGCAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391447	391794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_391400_391800
862290	contig_2924_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_140254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAAAGCTGTAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55458	56045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_55500_56000
862292	contig_2703_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_101843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAATACACTCTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324095	1325062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1324100_1325100
862295	contig_16951_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_98630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAGTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66593	67088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_66600_67100
862296	contig_5018_pilon	+	907	1	Intergenic	novelGene_46996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGTATAGCTGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208757	1209664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1208800_1209700
862297	contig_19744_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_120354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGACTGATGTCATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35111	34771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_34800_35100
862298	contig_1863_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_156534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAAATGAATAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77930	78957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_+_77900_79000
862299	contig_18055_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_117836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACTCTCCAGAGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95215	96031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_95200_96000
862301	contig_18303_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_146806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTGATTTACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54881	53766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_53800_54900
862302	contig_15697_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_173310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCCAAATATCTGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62719	61723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_61700_62700
862303	contig_12697_pilon	+	774	4	Intergenic	novelGene_122823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_3	5.43650214343336	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	94	579	215749	221636	FALSE	25	GAAGTATCTTAGTCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLRSLTLLLPRAVGLRRRTLCALALCSTPVAHPVVACGRAAELLGRSRAAPLCGPRRLRVAGEVHRFRTSDVAQATLASVAPVFTVTKFDKEGNVTSFERKKIELYQELGLQARDLRFQHVMSITTRSNRIIMRMEVDYFISSTFLYHSLSKIAYYLDE	215655	221831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_215939_217053_217128_219954_219992_221451
862305	contig_11171_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_48626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAACAGGTGCCTCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383209	382309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_382300_383200
862306	contig_8452_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_47964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13017	12499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_12500_13000
862307	contig_8452_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_47965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAATGAGACATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35544	34782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_34800_35500
862308	contig_9578_pilon	-	1069	4	Intergenic	novelGene_67959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	12	533	167349	122871	FALSE	25	ACTTTTTCCAAAAGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQDMSEISPYSGSAMQEGLSPNHLKKAKLMFFYTRYPSSNMLKTYFADVKFNRCITSQLIKWFSNFREFYYIQMEKYARQAINDGATSTEELSITRDCELYRALNMHYNKANDFEVPERFLEVAQITLREFFNAIIAGKDVDPSWKKAIYKVICKLDSEVPEIFKSPNCLQELLHE	167360	122334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_123057_151734_151930_160183_160290_167314
862309	contig_1406_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_25549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAAGAATTCTGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2136846	2136632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2136600_2136800
862310	contig_710_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_162943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGTTATTTGCACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265289	264744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_264700_265300
862311	contig_5253_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_61578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAGAACACAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279297	278681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_278700_279300
862314	contig_3382_pilon	+	1104	7	Intergenic	novelGene_124087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_6	33.8940342177728	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	3	695	536408	556738	TRUE	20	GATTGTCATCCCCGACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDLEGSDMLVEKADRREFIDLLKKMLTIDADKRVTPIETLNHPFVTMTHLLDFPHSTHVKSCFQNMEICKRRVNMYDTVNQSKTPFITHVAPSTSTNLTMTFNNQLNTVPNQPSAASMAAVAQRSMPLQTGAAQICARPDPFQQALIVCPPGFQGLQASPSKHAGYSVRMENAVPIVTQAPGAQPLQIQPGLLAQQAWPSGTQQILLPPPRGSSSRAWPPTRPCSTRP	536405	564228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_536587_539300_539464_542385_542513_544213_544336_556636_556782_560007_560188_564042
862315	contig_3818_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_99284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTTCTACTGTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701086	701811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_701100_701800
862317	contig_12295_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_177970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACTTCTTAAATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190359	190037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12295_pilon_-_190000_190400
862318	contig_16156_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_137083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGGCCAGTCTCTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272339	271654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_271700_272300
862319	contig_5780_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_29770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAGATTTGAGCTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66812	66262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_66300_66800
862323	contig_11356_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_175269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTAACCTGAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324146	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_323500_324100
862324	contig_7720_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_155753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAAAGCTGCTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410158	410615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_410200_410600
862327	contig_6589_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_25996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGCCAAGCGTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420653	1420051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1420100_1420700
862328	contig_4232_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_63251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCCCAAGTGGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366232	366537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_366200_366500
862332	contig_15066_pilon	-	962	2	Intergenic	novelGene_149519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAACAAAGAATCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56842	52818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_53753_56814
862333	contig_3193_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_126318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGAACGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113227	112590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_112600_113200
862335	contig_8964_pilon	-	660	2	Intergenic	novelGene_168712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAATACTGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549466	548769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_549202_549238
862336	contig_11721_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_177089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCCACTGCTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115507	116789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11721_pilon_+_115500_116800
862338	contig_16917_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_161925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTACTGTAGACTGCGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71168	70619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_70600_71200
862339	contig_11855_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_67119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAAATGAAACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470625	2471016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2470600_2471000
862340	contig_5878_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_145734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCTATTGTTGCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358142	357388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_357400_358100
862341	contig_5247_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_81798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATCCTAAGACATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142165	141777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_141800_142200
862345	contig_12638_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_33186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCAAATCAAGCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251509	250880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_250900_251500
862346	contig_11336_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_172668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61617	61855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11336_pilon_+_61600_61900
862347	contig_8375_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_141320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCGTTGGTGTCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225188	224866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_224900_225200
862348	contig_18108_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_33491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGGTGGAAAATACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255047	255357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_255000_255400
862349	contig_1146_pilon	-	456	2	Intergenic	novelGene_84799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTACTTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248187	232207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_232644_248167
862351	contig_10082_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_63898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTTCCATAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426411	425713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_425700_426400
862352	contig_6208_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_53006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGCCTAACCAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448931	448198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_448200_448900
862354	contig_13901_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_146645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGGAGCTAATTTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192930	192280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_192300_192900
862355	contig_826_pilon	-	1115	3	Intergenic	novelGene_154955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCAATCTTTGGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590051	588219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_588671_588716_588818_589488
862356	contig_12654_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_129270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTCAATGTAAGAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403039	402241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_402200_403000
862359	contig_2114_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_104278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTATGACTTCTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610100	609004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_609000_610100
862360	contig_12969_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_61684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATTATATATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474030	473400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_473400_474000
862361	contig_9698_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_82512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACTGCAGTTTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277511	278249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_277500_278200
862363	contig_16650_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_61982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACAGGGTAATGGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299811	300304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_299800_300300
862364	contig_3122_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_64378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247468	248318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_247500_248300
862365	contig_6175_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_16365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCCTTGTGTTTGACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766705	1766469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1766500_1766700
862366	contig_1008_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_121565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTGAGAGTCCTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600683	600148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_600100_600700
862367	contig_20055_pilon	-	1083	11	Intergenic	novelGene_175064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTTATTCTGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121649	83974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20055_pilon_-_84045_86540_86690_90570_90669_93937_94060_96187_96369_102257_102347_104884_104937_105917_106006_112297_112362_118474_118536_121540
862370	contig_9955_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_21261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAAAAATAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39437	38590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_38600_39400
862371	contig_7457_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_31664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	269	810	16	825	1048518	1049327	NA	15	CAGGTGCAGTTACTCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVCSLMTRKHSFGLTEVKGKLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDKWHNLESAPKILRDVKALAIEDRFVYIAARTPVDRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESLPLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPKSYSLENEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIEGAAICYYKDDVFIIGGWKNSDDIDKQYRKEAYRYCAERKRWMLLPPMPQPRCRATACHVRIPYRYLHGTQRYPMPQNLMWQKDRIRQMQEIHRHALNMRRVPSSQIEC	1048502	1049566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1048500_1049600
862372	contig_18850_pilon	+	961	4	Intergenic	novelGene_142403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	49	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	438	944	49464	50296	FALSE	20	AGCGAAGGCTTCAGTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKRRLEEEQEPLRKQFLSEENMATHFSRLSLYNDHPYCSPPRAVPPALPPLRGPCSELLLWRYPGNLIPEALRLLRLGDTPTPPLPCYPSWGYNGALSTDGQCPAHLPSSLHKGDQHPTKRPAALLLLHQTRPPGTRTVPHHGRRCGRSPGWEGRSLGGRHATEEH	48732	50313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_49147_49440_49496_49608_49738_49950
862373	contig_10626_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_138198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTTTGAAAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83362	82206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_82200_83400
862375	contig_13878_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_165748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGATGGTCTGAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652881	653673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_652900_653700
862376	contig_854_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_36096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81409	80494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_80500_81400
862377	contig_5092_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_62323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAAAATAGACTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542321	541605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_541600_542300
862378	contig_8864_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_135952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCGCAAAGCACGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9617	7925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_8303_9447
862380	contig_17500_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_157919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAATTAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238857	238412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_238400_238900
862381	contig_5499_pilon	-	623	1	Intergenic	novelGene_56972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATTTATTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39269	38646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_38600_39300
862383	contig_9481_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_149694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAATTCCAAGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582292	581878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_581900_582300
862386	contig_15327_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_70754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCGCCTCAGGCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064992	1065681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1065000_1065700
862388	contig_5779_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_106525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAACGAGAGGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323759	323395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_323400_323800
862389	contig_9670_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_169941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTATAAAGAGACCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114641	115208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_+_114600_115200
862390	contig_5331_pilon	+	639	2	Intergenic	novelGene_112796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	212	598	506889	508716	FALSE	25	ACTTCAAATTCTGATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCEGCGPSGGEPPPGGPQGLHGLHPDHLPRTDGVKYEGLPCCFYEEKQVAHGSGRGSSCYTEDYSVSVQYMLAEEPPPSCHPGAQDLSQRIPIIPEDVDCDSSLPSDCQGTQVCSLWSGTLGLDTPQPYRGLGMSQKGEWALGCPVGALLQPGCPPEEKGVSRASFPSPLQDTQASDTMAAEASGSGSCPADTSGTGA	506677	508757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_507232_508672
862392	contig_12532_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_111156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTAGTTAACATTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119084	118735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_118700_119100
862393	contig_5083_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_151647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGTATATGTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269056	269688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_269100_269700
862394	contig_10011_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_68026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72225	73007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_72200_73000
862398	contig_12638_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_33251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAAAAAAACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786336	785584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_785600_786300
862403	contig_8978_pilon	-	861	4	Intergenic	novelGene_49439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	9.41629792788369	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	170	730	1075043	1066565	FALSE	65	AAAAAAAAAATATTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVCAIFGGSRGIGRAVAQLLAQKGYRLAIVARNLEVAKAAAGELGGGHLAFSCDVAKEHDVQSTFEEIEKHLGRVNFLVNAAGINRDSLLVRTKTEDMIAQLHTNLLGSMLTCKAAVKTMVQQQRGSIVNVGSIVGLKGNSGQSVYSASKGGLVGFSRALAKEVARKKIRVNVVAPGQCKLLIK	1075212	1066433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1066726_1070067_1070205_1073444_1073566_1074901
862404	contig_826_pilon	-	350	2	Intergenic	novelGene_154951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTCATGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454418	448630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_448835_454272
862405	contig_3252_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_61490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTGACCTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253832	253545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_253500_253800
862406	contig_13718_pilon	+	381	2	Intergenic	novelGene_142880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTTTAAATGGCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63683	66965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_63783_66683
862407	contig_9852_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_138479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAAACTGACTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357321	358162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_357300_358200
862408	contig_5083_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_151639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCCTACATCCAGAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201464	202591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_201500_202600
862409	contig_5620_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_161342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGAGGTGGTAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188156	187607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_187600_188200
862410	contig_10581_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_41429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	77	304	720690	720463	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDKHTPQRKRWGGESFSLWDWARKVMSEDSVVCVCQIMPQPGLKTRVSFPELFALPYSHSLKRSARLLLVIFHWSQVHTTDHTSGGYFSAQVTAAKWFLF	720766	720140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_720100_720800
862412	contig_5916_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_158067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACAACCTCCACCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707114	706705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_706700_707100
862413	contig_11815_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_50938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACGCACCATCATTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311581	310879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_310900_311600
862415	contig_13526_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_165199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133346	134108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_+_133300_134100
862416	contig_2799_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_85608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	323	646	808352	808029	NA	15	ACTGCAGTTTCTCCCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVLPNTWPTMPPPTSLLSDRLSALIHCVSMSPASFYLDFQNCQIHTSGPFAHPELSIWTAGAPCLANSCPSFRSQVKYYFFRGFFFLNNLPTSSTKIKVLVLISL	808674	807959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_808000_808700
862418	contig_15105_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_150940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAGTTAGGCCAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323915	323107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_323100_323900
862419	contig_2114_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_104254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTCGTCTTCTCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407564	408685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_407600_408700
862420	contig_7009_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_23644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATTTTCTTAACATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453513	454098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_453500_454100
862421	contig_19006_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_145583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	28	390	36334	35972	NA	25	TGCTAGGCTAGGCACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLRGLLIPYLAPPLREGMSLSPNSGPGENPSSALSWDRDGNRTSPLWVPPGNNSRCVLGLITRSWPSGAPCWFLVKKYLGNIQRQHWLLESGLLPHTGPRTGQRVLARVQTGRQGVLN	36361	35779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_35800_36400
862422	contig_5260_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_144367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGGTCTTAAGGGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251425	250866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_250900_251400
862423	contig_9389_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_83889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAAAGTAGGTGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86038	86648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_86000_86600
862424	contig_12079_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_67468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGATTCCCTGCGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593631	593228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_593200_593600
862425	contig_16594_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_53883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTAACTTGGTAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202863	201872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_201900_202900
862427	contig_5331_pilon	-	567	4	Intergenic	novelGene_112848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	107.483332041143	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAGAAGAAGAAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835846	809785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_809827_813314_813378_825906_826313_835789
862428	contig_9649_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_160689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAAAATGCTGTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27811	26840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_-_26800_27800
862429	contig_8362_pilon	+	439	3	Intergenic	novelGene_150686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACTTTGACTGTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101747	103000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_101944_102437_102572_102891
862431	contig_7158_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_163727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATAATTAGAATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052163	1051401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_-_1051400_1052200
862432	contig_16535_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_167725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTGGAAGACAACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495677	496174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_495700_496200
862433	contig_14491_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_177971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGGGCAACTAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7714	7429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14491_pilon_-_7400_7700
862434	contig_7066_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_42206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAATAAATGGATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054724	1055342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_1054700_1055300
862436	contig_14300_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_133159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATTAAAAAAAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788396	787531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_787500_788400
862437	contig_16103_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_118771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488494	488828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_488500_488800
862438	contig_17687_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_177977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAAAAAAAACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22565	22163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_-_22200_22600
862439	contig_2903_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_148972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACTCTTAGTCCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122285	121835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_121800_122300
862440	contig_8027_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_158839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCCGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263240	263779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_263200_263800
862441	contig_5241_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_174394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATACTCTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55374	54924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5241_pilon_-_54900_55400
862442	contig_504_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_54414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGAGATATATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139413	138776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_138800_139400
862443	contig_18829_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_177707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCTTGTGTTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46172	45087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_-_45100_46200
862446	contig_17311_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_57877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTAAACAGACTTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420887	421240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_420900_421200
862447	contig_10299_pilon	-	625	6	Intergenic	novelGene_79787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	3.96988664825584	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	310	417	690597	690490	TRUE	5	GTGAGTGGGGGCCTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLEDAAPEENLEDEVCDTVNSSVVSGESIRFFVNVNLDTQPSQTAETEASGGCVLLHTSRKYLKLKNFEEEIRAHRDIDGFLAQASIILNETATSLDDVLRAMLHRFAQDPHHAEPGCDMDLLMTVLFTDAGAPPGE	693712	690004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_690129_690315_690398_690487_690721_691002_691053_691176_691294_693693
862450	contig_8241_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_157495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAAATTGTTGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560541	559925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_559900_560500
862451	contig_5935_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_102757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAATGCCAAATTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358710	1359713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1358700_1359700
862452	contig_7457_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_31298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGCAGAAGGGTAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163827	164766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_163800_164800
862454	contig_10395_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_177979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	100	438	176599	176261	NA	10	CCCCGGGTTCCATTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLPHFRNGPKSPCCTPPGLGWADLGALRADTSMWAAHTHGSFRMLTPMLQPACLPAVQSAVTSGLQSSAFPEESSSPGPGRHSEAYIPLKVSWVSQHRVSHGDGGMEALVWDQSTLKEAPCCIVPAKGARLALQIKGCPVQTPA	176698	175963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10395_pilon_-_176000_176700
862457	contig_11564_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_158595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACTTGATGCTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212982	212358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_212400_213000
862459	contig_12790_pilon	-	397	4	Intergenic	novelGene_35273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	14.3836326735943	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	186	211	396	395581	346751	FALSE	35	CCACATAAACATGGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENESDRGQVWQSCRFGRGAQSVPAAGLWPRTRSARARWQHALDFPALRLDFREARKWTPFSWRHECQSPAMGVAEFAAYCLSMWGNNIKPGETHECSLLGKEDSDYPRAAVWPHLHPYPTPSSCCTGIRRSF	406746	346749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_346880_349175_349229_395577_395682_406636
862461	contig_6102_pilon	+	208	2	Intergenic	novelGene_31769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAAGTGTCTTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297810	298526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_297942_298449
862462	contig_1699_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_72808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTGGGAAAGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30917	31681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_30900_31700
862463	scaffold_13609_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_124405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTTGGAGATAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518205	518720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_518200_518700
862464	contig_5860_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_147957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTAATAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151760	152387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5860_pilon_+_151800_152400
862465	contig_9434_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_150514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAGAAACAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402330	401396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_401400_402300
862467	contig_2892_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_118987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGAAAAAAATTGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56434	55816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_55800_56400
862468	contig_14577_pilon	+	199	3	Intergenic	novelGene_164647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCGCCGATTCTATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78021	83277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_78057_78631_78752_83233
862470	contig_8676_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_142191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31593	30913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_30900_31600
862471	contig_7173_pilon	-	403	2	Intergenic	novelGene_37542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTTATCTAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535025	476226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_476407_534802
862474	contig_4385_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_141494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTTTAAAAAAAAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294901	295337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_294900_295300
862476	contig_8312_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_152876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTCCAGCAGCAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234364	234606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_234400_234600
862477	contig_4783_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_108382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAAGAATAAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215781	215035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_215000_215800
862478	contig_8330_pilon	-	537	5	Intergenic	novelGene_71860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	272.306353212701	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	8	340	916072	902099	FALSE	45	TGTTAATAAAAATAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSASQVWLSS	916079	901901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_902125_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
862479	contig_6552_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_163608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165597	166165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_165600_166200
862482	contig_6470_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_145610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATATAAGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091612	1093005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1091600_1093000
862483	contig_5799_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_50285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATGTAACAAAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327693	326983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_327000_327700
862484	contig_10403_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_175806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAACATAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100040	99587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_99600_1e+05
862485	contig_6564_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_177980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGAACTCTGTCCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337135	337617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6564_pilon_+_337100_337600
862486	contig_3469_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_34181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCAAAGGGAAATGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439140	438404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_438400_439100
862489	contig_8044_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_132393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAACAGGGAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552553	551953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_552000_552600
862490	contig_7513_pilon	-	704	3	Intergenic	novelGene_89036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	144.5	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTATATAGGTAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744663	738582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_738934_740809_740918_744418
862491	contig_13496_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_107648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381201	381746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_381200_381700
862492	contig_3654_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_174992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTTTAATGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508506	507529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_507500_508500
862493	contig_19636_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_177981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGGCTCGGCCCAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18438	17957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19636_pilon_-_18000_18400
862494	contig_12540_pilon	-	749	2	Intergenic	novelGene_148101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	250	345	999307	999212	FALSE	5	TGCACGGCTGCCCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLGRLQVDSAEYGCLKAIALFTPDACGLSDPAHVESLQEKAQVALTEYVRAQYPAQPQRFGRLLLRLPALRAVPASLISQLFFMRLVGKTPIETLIRDMLLSGSTFNWPYGSSQ	1000852	998807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_999487_1000782
862495	contig_6048_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_73084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78249	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_77600_78200
862496	contig_5921_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_142248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCTTCATAACTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300000	299722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_299700_3e+05
862497	contig_12120_pilon	-	585	5	Intergenic	novelGene_21439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	30.9273341883842	201	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	207	521	270412	242305	FALSE	25	TCCTGGAAATGTAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAAKVLQLFKTLHRTRQQVFKNDTRALEAARIKINEEFKSNKSETSPKKIEELMKIGSDVELLLRTSVIQGIHTEHNTLKLVPRKDLLIENVPYCDAPTQKQ	270618	242240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_242376_248826_248909_251077_251149_254532_254606_270394
862500	contig_3602_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_60624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATTGATATGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916181	916585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_916200_916600
862501	contig_17936_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_29976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCGGGAGCTGACTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155998	154947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_154900_156000
862502	contig_5649_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_82331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAATAAAAGGTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457413	458050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_457400_458000
862503	contig_3818_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_99277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCCATCCCTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636928	637670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_636900_637700
862506	contig_15070_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_164895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGGATATTATCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481860	482486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_481900_482500
862508	contig_13421_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_166806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGCATAAAATCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183421	183181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_183200_183400
862509	contig_2332_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_58707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGGGATATTCATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765416	764967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_765000_765400
862510	contig_6847_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_143878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACTAGAGAACTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97939	98624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_97900_98600
862513	contig_2125_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_147718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGTGACCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417462	417142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_417100_417500
862514	contig_20419_pilon	-	312	4	Intergenic	novelGene_177750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	13.4412301024373	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	35	310	14308	12077	FALSE	40	GGCTGCTCACACACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQKTSLSVLEGMGFHVGQALGERLPRDTLAFREELDALKFLCKDMWVAVFQKQMDGLRTNHQGTYVLQDNDFPLLVRVEPHGCGVSLGVSATGGAVGEELGFG	14342	12074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20419_pilon_-_12161_13349_13389_13983_14102_14273
862515	contig_9653_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_48323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGGAAATATTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028249	1027648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1027600_1028200
862516	contig_9995_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_47777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCAAATTAGTATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737917	738418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_737900_738400
862517	contig_12885_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_176898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCATCTGCATTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7688	6871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_-_6900_7700
862518	contig_9720_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_116774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAGAGAGAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284663	284379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_284400_284700
862520	contig_13904_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_165505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204643	205247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_204600_205200
862521	contig_5551_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_134287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGGTGGAATTATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808089	808684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_808100_808700
862522	contig_4832_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_163392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	130	630	248049	248549	NA	30	CATTTACCATAGTACTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLVGGCPRGGPRARAACARGSVARVCRGLGSREWRHEPSLHFTMSFLIDSSIMITSQVSHRLPGPCSLPFPDRPLGAPALQSGPGLALPPHSRPEPATQVPKERGGCEICCVQFPLPSSSGGWPAVIRAGYRRRSRDSQVHFQKRSASLSAESWYREKGTVHKTPGRFRAPSLTHGLGTTVVPGAGCATRQSRLALGDTCRLFWFVVKY	247919	248818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_247900_248800
862524	contig_4469_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_21971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTCCTCACAAACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914608	914072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_914100_914600
862525	contig_20378_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_159567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATATATTTTTTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66668	66088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_66100_66700
862527	contig_14243_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_57416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTTGTAGTGTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521908	522489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_521900_522500
862531	contig_5782_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_162137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128088	1128681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_1128100_1128700
862533	contig_6557_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_33005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGCTTCCCTTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550277	550045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_550000_550300
862535	contig_13481_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_119347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAATGAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377870	377303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_377300_377900
862537	contig_12964_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_131647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGACAGGTAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71686	70687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_70700_71700
862538	contig_6159_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_128234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCCAGTTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24916	24468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_24500_24900
862539	contig_13092_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_177040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTATTAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20274	20738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13092_pilon_+_20300_20700
862541	contig_4838_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_144793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATCCAGCATTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274245	273865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_273900_274200
862542	contig_709_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_57568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	96	395	2113590	2113291	NA	40	TCCTTACAAGTCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSQRRLTILALTAQVLRSPNRSALIVSLGALPAGLNLCLLHGGRHLIPGAVPMQQSLKVTPKVRENICLFGDGGQAQPEKQGKTEQNKKQTRVLKGP	2113685	2113048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2113000_2113700
862543	contig_5033_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_29078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645225	645953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_645200_646000
862545	contig_7540_pilon	-	703	3	Intergenic	novelGene_177982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGTAATGAGAACCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146212	126738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7540_pilon_-_126875_128088_128151_145707
862546	contig_11883_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_163778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	159	308	117540	117689	NA	20	TTGAAGCTGTGACCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTIYKICTTWWKSNDSSRTQSLYYGVVLSSCWIKGPPGLDESHGYPSPERRHMGQLTACTVSRSRTLQKKTLVFLAFSLFWLPSIWILFLYLGSPPCMYES	117381	118322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_117400_118300
862547	contig_8671_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_126238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103786	104468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_103800_104500
862549	contig_10182_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_134622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCGGGTGTGCAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330148	329403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_329400_330100
862551	contig_2114_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_104249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCACTGCGCCACCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261089	261795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_261100_261800
862553	contig_6361_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_23919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	61	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	306	986	231334	230654	FALSE	65	AGGTAAAAAAAAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVPAEVNSLLPEEIMDTGITLVDDDSIEAVIVSSPIPMETELEEIVNINSTGDSTATPISTEPITVYSNHTNQVAVNTTVTKADSNTTVKPTFPSGLQKLGAQTPVTISANQIILNKVSQTSDLKLGNQTLKPDGQKLILTTLGKSGSPIVLALPHSQLPQAQKVTTQAQSGDAKLPPQQIKVVTIGGRPEVKPVIGVSALTPGSQLINTTTQPSVVQTQQLKTV	245591	230652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_231367_245318
862554	contig_5947_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_101456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGCAGTAAGGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10648	9787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_9800_10600
862555	contig_11832_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_106914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCAAATATTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80836	79884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_79900_80800
862556	contig_4952_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_145523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGCTCAGTTTTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364807	364136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_364100_364800
862557	contig_7357_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_36900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAGGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275527	276116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_275500_276100
862559	contig_10962_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_103900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTTATAAATTTGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328136	327297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_327300_328100
862560	contig_14326_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_120713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGAAGAATGTTTTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380601	378041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_378363_380347
862561	contig_10000_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_139317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAACAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181526	181947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_181500_181900
862562	contig_10347_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_177655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGACGCAGCCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504396	505334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10347_pilon_+_504400_505300
862563	contig_5954_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_28796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATGTAAATTCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419104	1418562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1418600_1419100
862564	contig_8260_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_163266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCACACTGGCCTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518385	518639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_518400_518600
862566	contig_10947_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_167137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCACCATCTATAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32811	33455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10947_pilon_+_32800_33500
862567	contig_7057_pilon	-	358	4	Intergenic	novelGene_123361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	7.58653778449403	466	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTACCCCAGCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945913	944410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_944531_944924_945010_945128_945216_945847
862568	contig_11543_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_175756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGATGTTCACAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167116	166667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_-_166700_167100
862569	contig_9373_pilon	+	1076	10	Intergenic	novelGene_162708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_9	2.76664435510861	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	164	961	125654	143236	FALSE	30	AGACACAAATGTTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTLSWYFLLCVNYFFYGETVADYFATFVQREEQLQFLIRYHRFISFALYLAGFCMFVLSLVKKHYRLQFYMFAWTHVTLLITVTQSHLVIQNLFEGMIWFLVPISSVICNDITAYLFGFFFGRTPLIKLSPKKTWEGFIGGFFSTVVFGFIAAYVLSKYQYFVCPVEYRSDVNSFVTECEPSELFQLQSYSLPSFLQAVLRRETVSLYPFQIHSIALSTFASLIGPFGGFFASGFKRAFKIKDFANTIPGHGGIMDRFDCQYLMATFVHVYITSFIRGPNPSKVLQQLLVLQPEQQLNIYKTLKTHLIEKGILQPTLKV	109297	143351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_109313_111572_111713_125645_125705_127369_127453_128941_129030_131819_131889_133957_134111_136443_136564_138818_138923_143106
862571	contig_8049_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_166870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	102	407	327143	326838	NA	65	CTCTAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYISPSYFCIMVIKKQRYMREHLSLIWRLDWQDPLIYTLNKFPKIGRMEIPQKVIWKPEEYRVDYGHPKSSINYTSLVSDNRSKVQYNMPSNEIILKTIL	327244	326074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_-_326100_327200
862572	contig_5964_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_80359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTTAATTTGAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47868	48755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_47900_48800
862573	contig_12837_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_57286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCTGAAGCAGTGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60847	61468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_60800_61500
862574	contig_6278_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_119831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATTAGTCAATTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594494	593958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_594000_594500
862575	contig_2646_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_69587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1428324	1429210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1428300_1429200
862576	contig_2214_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_144263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGCAGTGCAGCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306429	307351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_306400_307400
862577	contig_6048_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_73139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002014	1001404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1001400_1002000
862578	contig_11643_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_177983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCTGTTTCAGGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650	2039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11643_pilon_+_1600_2000
862580	contig_7179_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_78081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAAGTCGCCCCTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570136	570511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_570100_570500
862582	contig_3975_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_54926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGTAGGAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2263290	2264334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2263300_2264300
862583	contig_13597_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_175644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTCTACCTGTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73511	74681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13597_pilon_+_73500_74700
862584	contig_1406_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_25499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386958	1387875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1387000_1387900
862585	contig_16098_pilon	-	678	6	Intergenic	novelGene_46186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.8	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	78	434	664888	662669	FALSE	10	TTCTCCTCCCCGCAACTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTPTKNEEKKGNWPTQAASSLAGGQASLSRSEEFLTRISTELTDEALFIAGYRMNRVPTKEKQTQDQGTQISKHVFITKTRGTDTRCDRNRTRTKAHLLPSPREKGPLPSNLTSGG	665830	662424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_662705_663688_663747_663936_663971_664247_664396_664807_664893_665757
862592	contig_12864_pilon	+	852	2	Intergenic	novelGene_76349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86358	87778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_86494_87061
862593	contig_11227_pilon	+	549	2	Intergenic	novelGene_163216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	213	521	525881	526189	FALSE	20	TGCTCAGTGATTGGGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSIMSGASSKLALFLFGCYVAALGAHTGKHRVAEHRMAEHHVAEYYVAAVYEHQSILSPDPLALTSRKQALELMNQNLDIYEQQVMAAAQKARSAPPCNMS	480979	526217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_481188_525876
862594	contig_3270_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_104512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGGAAAAGAAAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407601	407030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_407000_407600
862598	contig_14405_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_85674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGAAAATTGCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882797	882201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_882200_882800
862599	contig_9937_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_129222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAACCTTCCCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218859	219818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_218900_219800
862600	contig_9363_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_6672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTCTCTGTGCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075559	1075014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1075000_1075600
862602	contig_1443_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_28155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	23	325	293905	293603	NA	15	CTCCCCGGAATGGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKFICPTATILHEHKILEPGLVDIKTLEPELAGSEPVWRVFKYSSNQTPRSFPECELRFASPPRLLKLFPRSGILSPSLIRTHVKSYSSFLLWHHVFL	293927	293542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_293500_293900
862603	contig_401_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_42934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCACTTTAGCTCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978449	1978924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1978400_1978900
862604	contig_16917_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_161926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTATCTTAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88811	87905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_87900_88800
862605	contig_19986_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_159224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATCTTTAATATACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15825	16456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_+_15800_16500
862606	contig_12397_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_177984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGGAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29894	29462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12397_pilon_-_29500_29900
862608	contig_5981_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_35522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTGCACTTGAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166895	167618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_166900_167600
862609	contig_9389_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_84064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGACACTGTCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949932	949372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_949400_949900
862612	contig_7471_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_161282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGTTCGAATCCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17834	17638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_17600_17800
862613	contig_7471_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_161281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAATAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17485	16989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_17000_17500
862614	contig_5084_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_64683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTTGTGGCGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1780707	1779226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1779282_1779775
862616	contig_7744_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_62467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCGTTCGGCTCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451195	451400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_451200_451400
862617	contig_8493_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_177160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82594	81977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8493_pilon_-_82000_82600
862620	contig_3426_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_57962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	204	111	314	439207	439004	NA	35	GGAGGTGACTATTACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVVGSSADRWDRICPISWSWRFSLQCLTPGCKWNPMGNFEIYRWLKKMLMPSLHPHRSLMWLVWGRPSVSVFFKSLSNEKQIQVLMGRGIIQKEKEGRGLIIV	439317	439002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_439000_439300
862623	contig_593_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_102020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTGAAAGGTTTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430929	430180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_430200_430900
862624	contig_13878_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_165736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCATGTATAAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178346	178079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_178100_178300
862626	contig_7376_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_108100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTAGAATAAATTAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273150	272416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_272400_273200
862627	contig_13300_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_125833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGGGTGCAGCCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142520	1143321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1142500_1143300
862630	contig_16204_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_154535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTACTTACCACACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475205	475726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_475200_475700
862633	contig_5628_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_157569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	27	581	209147	209701	NA	45	TGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAKKYCFIVGIFSTLNTIQFLLFDVNYVISFGYKEGLFSIYNETHPDQDSWFIANMRGIKICLSIITLIVSCTLLYCIHMNICLGLLTYTIWIIIYEVFNFPLALLLKDSIRNLFEELSYLHLIFQISRMLLHFCCLPFIIKQMLILYKDPKMSSKMGHRRHSSISTVDSWSPVGLALYRKLN	209120	209882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_209100_209900
862635	contig_563_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_169762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTCCCGTTTTCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617169	617668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_617200_617700
862636	contig_1076_pilon	+	506	5	Intergenic	novelGene_101148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	5.30919014539883	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	14	496	1029725	1037306	FALSE	20	GTTGTTTTTCATAGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAFLMKWKISGQSRRQNGKRMRRWSGKRSCYSKEFLKQHKLDTLKLEELAKTKEIVEGELHAQAIILESLNTTLYQTQMELQKEKATVMNLEKTLQTKLAEAEEKYKYTIQILTQENMQLRQKIIAKNEEIYEGRSGRSASITIYEDYSDILEDGSSSCNKKQE	1029711	1037316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_1029812_1032602_1032666_1035929_1036020_1036152_1036263_1037173
862637	contig_9415_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_109786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACTTATATAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1665700	1665296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1665300_1665700
862638	contig_7912_pilon	+	538	2	Intergenic	novelGene_129579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGGCCGCCATGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329774	346277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_330048_346012
862639	contig_15003_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_137338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAAAATATGAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219258	218987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_219000_219300
862643	contig_17833_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_174611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCCTATGACCATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228216	228872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_228200_228900
862644	contig_8017_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_65342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTCATACAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525967	525173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_525200_526000
862645	contig_13358_pilon	-	236	2	Intergenic	novelGene_177985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAAATATTCTCCGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45216	44900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13358_pilon_-_44982_45061
862648	contig_11121_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_167063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266516	265671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_265700_266500
862649	contig_4256_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_176396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGACGGAGAGATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546171	546486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4256_pilon_+_546200_546500
862650	contig_9871_pilon	-	767	7	Intergenic	novelGene_75695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.62995563967658	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	101	766	551486	542411	FALSE	45	CTGAATCATACACGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPGPVSDWTECSSSAEPSAAARTEGGGGGSARHSYHQNSKGTDRIKDGHKVDSHTAKLLDLWKTPQIQTIHIPKSMKDASFLKHPDLTIGQKRYLCSIAKLYNANYLRTLMKRQYMHVIQHSSQKPGVLTHHRSRLSSPYSQKQHYPCTTWRHQLEREDSGPSNITAACTPEMIMPHSLWRPVRNKEGLKTGYASKTRCKSLKIFSRPSRLFMQPVSTND	551586	542409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_542425_544011_544095_544647_544832_544909_545040_546155_546278_550003_550045_551394
862651	contig_8354_pilon	+	885	1	Intergenic	novelGene_24119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAGTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292634	293519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_292600_293500
862653	contig_15114_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_121171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACGTAAAGCCAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373057	372829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_372800_373100
862656	contig_11815_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_50879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35579	34953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_35000_35600
862657	contig_12638_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_33179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAGAGATTTTGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240896	241316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_240900_241300
862659	contig_15029_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_128203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATATAAAAGAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229772	229114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_229100_229800
862661	contig_16714_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_161577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTAATTCTCCTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919955	919242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_919200_920000
862663	contig_10943_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_168260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAATGTAAGTATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21973	22637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_+_22000_22600
862664	contig_1406_pilon	+	927	2	Intergenic	novelGene_25476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAATGCAGGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1236291	1242537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1236743_1242061
862665	contig_15360_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_171270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGATATCCTGTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372509	371229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_371200_372500
862667	contig_13863_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_42107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACTCTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502597	502249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_502200_502600
862668	contig_18850_pilon	-	820	2	Intergenic	novelGene_142405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	99	560	137971	136267	FALSE	30	TCCCATCATGGACAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPLDSQGWARQEEEALTSIAGLGVACGQPCTGMPLPEPSEQEGESVRAGQEPAREPGTDVIPAAPRIPKKFSKLVLLTASKDSAKVAGTKRKGVHCIMSLGMPGPATLAKALLKIHPEAQRAIEAAAQEPEQKRSRLNTDAEGKGDGRFTRQPPPTRAVEGEESAPSPGRGRESAAGSTARSASA	138069	136006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_136407_137649
862669	contig_7057_pilon	+	413	4	Intergenic	novelGene_123269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_1	41.2983723112129	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	77	313	703803	705218	FALSE	40	AAATAACTCTAGTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPPWLLRTSLDHSPLSDLSSPPLAMPPPGLILLLLLLPVAAAQTTPGPCSGCGPLSLPLLVGLVAADAVLSLLTVGVVFMCARPRHQPMPDDKIYINMPVRG	703726	705318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_703846_704345_704370_704826_704959_705180
862670	contig_12079_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_67350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64418	63229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_63200_64400
862671	contig_19402_pilon	-	876	2	Intergenic	novelGene_80794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCATAAAGTGTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55569	36506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_37086_55272
862672	contig_6344_pilon	-	687	4	Intergenic	novelGene_157104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.9866648884147	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTATTTTAAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994597	990753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991088_992833_992871_993900_994023_994403
862673	contig_12402_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_133341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAACAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189470	188494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_188500_189500
862675	contig_9450_pilon	-	430	4	Intergenic	novelGene_174438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	45	junction_3	268.646401220803	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	74	376	83101	71055	FALSE	35	TTATACAACAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSGPSACRWRHLKQLHAGVGNTTMAKNKLRGQKSRNIFHIASQKHFKSKNKAKPVTTNLKKINIVNEEKVNRVNKAFVDIQKELAHFSKGLSLEPLQKQLIPQQHHENEPVNVDEATRLMAQL	86319	71000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9450_pilon_-_71127_71483_71601_82987_83105_86249
862676	contig_6589_pilon	+	548	6	Intergenic	novelGene_25997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.632455532033676	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	19	537	1467052	1468772	FALSE	35	AGACTTCAAAGAGTAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNLLIAMFSHTFGTVQGNSDLYWKAQRYSLIREFHSRPALAPPFIIISHVRLFIRRLRRLWTRLPYSPQVEHFRIYLSKQAERRLLTWESVQKENFLLARARDKRESDSERLKRTSQKVDSALKQLGQIRQYEQRLKGLEREVQHCSRVLAWMAETLSHSPLLPPGRPPPPAPPEPKD	1467033	1468783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1467060_1467495_1467690_1467981_1468115_1468256_1468330_1468420_1468527_1468767
862679	contig_10907_pilon	+	608	2	Intergenic	novelGene_144912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGAAGGAAAAAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41617	84175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_+_41831_83780
862682	contig_2332_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_58696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAATGAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559482	558991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_559000_559500
862683	contig_5690_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_119697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832742	833289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_832700_833300
862686	contig_12031_pilon	-	193	1	Intergenic	novelGene_137569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATCAATTCCATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341667	341474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_341500_341700
862687	contig_5264_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_165048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAATCTGGCCTGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12311	13352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_12300_13400
862688	contig_14450_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_49072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTAAGTTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502391	1502035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1502000_1502400
862689	contig_987_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_72271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490485	489619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_489600_490500
862691	contig_10158_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_150778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164899	165165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_164900_165200
862692	contig_10629_pilon	+	356	2	Intergenic	novelGene_52961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGATTGCTCGGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455766	456646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_455934_456457
862693	contig_211_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_129885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGGTGCCTTCTTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343882	344606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_343900_344600
862695	contig_1450_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_27450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAACTGCAGCCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947072	946711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_946700_947100
862698	contig_14209_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_88367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAGTAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68454	68024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_68000_68500
862699	contig_15887_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_177464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAGAAAATAAAATAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30106	29677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15887_pilon_-_29700_30100
862700	contig_18283_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_170697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGAAACGAGAGAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47533	47893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_47500_47900
862701	contig_12841_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_55836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACAATAGTTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135327	136468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_135529_136076
862702	contig_12841_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_55840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCATTATTTTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167261	166860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_166900_167300
862703	contig_2487_pilon	-	416	3	Intergenic	novelGene_148495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGACTTTGGAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432178	366715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_366911_413339_413508_432125
862704	contig_7179_pilon	+	997	2	Intergenic	novelGene_78162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	39	464	1049751	1051444	FALSE	20	GGAAGTGTTTGATGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQRLVQRLVQVMRRRHCVGLSAPQLGVPLQVLALELPEALLRAYTPCMREVRQMEPFPLRVFVNPTLRVLDNRLVTFPEGCESVSGFLACVPRFQAVQISGLDPRGQQVVWQASGWAARIIQHEMDHLQGCLFIDKMDSRTFTNTHWMEVND	1049712	1051977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1050019_1051286
862705	contig_8312_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_152915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCTATGCGTGGGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571820	1570751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1570800_1571800
862706	contig_4496_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_66656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATGGGCAACACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753931	754267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_753900_754300
862707	contig_8063_pilon	-	301	2	Intergenic	novelGene_152444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGGGTAAGTCGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751424	734859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_734991_751254
862708	contig_13780_pilon	+	381	4	Intergenic	novelGene_149008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	104.295520304352	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACCTCTGCCTGTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288612	295593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778_292903_294733_294758_295430
862710	contig_14913_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_177986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAATCCTGGAAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319	837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14913_pilon_-_800_1300
862711	contig_15631_pilon	-	312	4	Intergenic	novelGene_151548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	3	311	512027	504402	FALSE	25	GGCAGCACTACCGGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISVGRGTRKKDEDSGTDVGEGTDEWSQSKATVRPPDQLELTDAELKEEFTRILTANNPHAPQNIVRYSFKEGTYKLIGFVDQLAVHFSQVGNLIPKDSDEGR	512029	504400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_-_504498_509106_509188_509399_509499_511994
862713	contig_12142_pilon	+	521	4	Intergenic	novelGene_147796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_3	66.2537210695034	157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	37	465	87452	95846	FALSE	0	GCCTCCCTGTTTTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRRTRPGPVAIMAGPARRCCLGWDFSTQQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQVKCGALLGTATHPTHGVSLERRCQPDGGGRDGGLGHVATVSTHSLLTRHPCTPGHGPALMGPPPCSSRKSLLL	87415	95902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88923_89007_94352_94423_95624
862714	contig_8616_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_72527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	342	737	362981	363376	NA	30	GTCTGATTAAACCACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPPACSARGRWGGGRDAPGLRERSRLPCRPSARVWQFRLHHSCCPPAPSDEPRTLPCPCLFRVDTSPSLFDVHGRWARPGQDPVSSHSAWMMLLKHNMYLNGLFRTLEFVLPKKRFESHHQHHKMFTGT	362639	363740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_362600_363700
862716	contig_14322_pilon	-	725	4	Intergenic	novelGene_115622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.9566858950296	12	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	202	573	222295	205613	FALSE	20	TCACACCTGAGTTTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNYLRWDLSAQQIEELTRELMEKTKRVYDQVGAQEFEDVSYESTLKALADVEVSYTVQRNILDFPQHVSPSKEIRTASTEADRKLSEFDVEMSMRQDVYQPAWLRRTLPCRRPESPWPPLSH	227259	205460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_205682_217183_217315_222123_222337_227099
862717	contig_16883_pilon	+	714	4	Intergenic	novelGene_161734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280696	297376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_280790_285272_285394_286716_286800_296959
862718	contig_6898_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_35735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	94	315	82366	82145	NA	35	GCATAGGAAGAGTGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTRAIFYYHPHNSKWSQCLTPKVLRISSLPMWSHKNTKDTPSQKARLDFRTFSKAKNGVWGKEQKLAPDPQSPVEYSFGLLCLFSNLPNYYQQQLYNYQIGTI	82459	82126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_82100_82500
862719	contig_8375_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_141278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAACCTATAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45175	45659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_45200_45700
862720	contig_18916_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_136878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAACAGAGGTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47816	48440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_47800_48400
862724	contig_990_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_76155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTTCTGACCAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1803619	1803233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1803200_1803600
862726	contig_4759_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_106341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGGAAGGGATGAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588345	588117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_588100_588300
862728	contig_3269_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_117026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138833	138158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_138200_138800
862729	contig_3130_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_103556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAACAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46561	45714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_45700_46600
862730	contig_11264_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_154209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTACAACTATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623009	622157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_622200_623000
862732	contig_16535_pilon	-	1005	9	Intergenic	novelGene_167719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	677	1003	409312	408226	FALSE	15	CCTCCTCGGCCAACTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELAEEEGHAAAADGQRVSERGLDDLPVTCTQRDGSLRAPSEGDGAGQQVPNDALQGHTQALDVDRVDEPQAVPEHLRVVQPRHEHQGLRSKQLAGGTWGYGRELHRA	411278	408223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_408330_408511_408621_409047_409153_409303_409439_410179_410289_410402_410518_410624_410702_410948_411067_411147
862733	contig_990_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_76092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCTTCACAGATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331618	1332051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1331600_1332100
862735	contig_5918_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_99635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATGAAAAGACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2254643	2254387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2254400_2254600
862736	contig_3380_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_60106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTCAAGTCGATTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415277	414877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_414900_415300
862738	contig_7657_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_30002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGCACTAGCCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75348	75020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_75000_75300
862739	contig_7593_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_127321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	79	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTGTTTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406646	464046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_406806_449971_450120_463958
862741	contig_11105_pilon	+	671	3	Intergenic	novelGene_159834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTAAGACTTTGGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571309	586083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_571532_575375_575636_585894
862743	contig_14219_pilon	-	879	1	Intergenic	novelGene_54380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTTTAAAAATCATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064893	1064014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1064000_1064900
862744	contig_12485_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_147293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAGCGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354312	354936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_354300_354900
862745	contig_3077_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_26776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTTTCTGGACCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31921	32203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_31900_32200
862746	contig_4232_pilon	+	569	3	Intergenic	novelGene_63235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105	228	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	147	440	265860	266448	FALSE	25	AATGAGTTCTGCACAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPPGAPRVEHRLTQALRLFPSGLEVSFRGRILRGEEVVVPPGLAGYVMVMDEKAEVLIGLERKQELKGSEDDEEEQQEGPEPLERDFDRFIRATASFARFHLWGLETIPGPDAKVRGALTWPTLAAAPPPDVAPATGSQQSNSR	265713	266577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_265980_266057_266178_266394
862747	contig_7411_pilon	-	649	3	Intergenic	novelGene_137048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	30.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	53	442	916738	914893	FALSE	10	GATGTGTTTTATCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNVKASVPVGAKEEQDKKGWSRQGRARVWEETEQKAKKLKSNEDEGQSTKLPKRKVVLLLAYSGKGYHGMQRNAGSSQFRTIEDDLVSALVQSGCVPESHGEDMKKMSFQRCARTDKVLRALPSLWG	917463	914685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_915064_916519_916749_917421
862748	contig_9924_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_175930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176801	176487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_176500_176800
862749	contig_6871_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_21609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGTTAATAAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448997	448144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_448100_449000
862750	contig_14925_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_55238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTATTAATGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62283	61531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_61500_62300
862751	contig_6374_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_158444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAGTTAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360156	360544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_360200_360500
862757	contig_1624_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_138382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGTTCATAGACCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212001	211444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_211400_212000
862758	scaffold_15568_pilon	+	661	5	Intergenic	novelGene_122578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	36.1757861006502	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAATAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57865	82055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_57935_77519_77787_77969_78026_81493_81621_81913
862759	contig_11512_pilon	-	246	3	Intergenic	novelGene_43396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTGCCTGGTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608514	607674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_607781_607954_608057_608476
862761	contig_5718_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_110400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACAGCTTATAGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341221	1341672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1341200_1341700
862762	contig_10064_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_122721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCAGTCCTCCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327951	328175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_328000_328200
862764	contig_12543_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_168359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTCAGGATATACACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171538	170470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_170500_171500
862765	contig_14300_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_133107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACATTTCAAGTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229648	228770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_228800_229600
862766	contig_3900_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_84212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAAATCTTGACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644951	645523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_645000_645500
862768	contig_10003_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_88235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCTGGAGGCCCCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655377	654710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_654700_655400
862769	contig_9571_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_136278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436127	435530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_435500_436100
862770	contig_7380_pilon	-	592	2	Intergenic	novelGene_157510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTCTTTGTATTTGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138487	137734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_137924_138084
862772	contig_6489_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_128944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273748	273286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_273300_273700
862773	contig_11466_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_177691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCTCCTGGAAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51608	52559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11466_pilon_+_51600_52600
862774	contig_10003_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_88288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGAGTTAACTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887268	886870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_886900_887300
862775	contig_4791_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_177988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATAAGAAGAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571947	571448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4791_pilon_-_571400_571900
862779	contig_14479_pilon	-	359	3	Intergenic	novelGene_177990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATACTAACCATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37429	35361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14479_pilon_-_35544_36302_36416_37365
862780	contig_18272_pilon	+	535	4	Intergenic	novelGene_7042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.49443825784929	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	82	306	406505	430276	FALSE	65	AGAAAGAGAGAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKRPQSLREAQDLVFLLSLRQSSAESAMSYFVDSAVGGPAPYCAVRAGAARQEPVNTYEDPRMMYGFPSSYHQQRTCYPFWDEMATQEVPTGLEHCGSGSL	393968	430505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_394036_406490_406574_423930_424076_430265
862782	contig_13806_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_173652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92620	91596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_-_91600_92600
862783	contig_12411_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_145670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAGTTTCCTGGGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144012	144554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_144000_144600
862784	contig_3137_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_167748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATACAGAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251340	250396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3137_pilon_-_250400_251300
862785	contig_9668_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_58151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCAGCATTCAGTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364917	365547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_364900_365500
862786	contig_16504_pilon	-	1238	5	Intergenic	novelGene_167945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.87082869338697	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	617	1237	53720	42312	FALSE	40	GTGGGTCAAACTATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTHTPSQQGAQDARNTTKPKQECQFEFKAPQATQEQDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDEILEINGETTKNMKHSRAIELIKSGGRRVRLLLKRGDGSVPEY	54336	42310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_-_42450_44372_44517_45492_45554_45683_45778_53536
862787	contig_6914_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_151718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACATATAAAAATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66586	66973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_66600_67000
862791	contig_12635_pilon	-	889	2	Intergenic	novelGene_60877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGGAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016649	1014330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_1014834_1016263
862792	contig_2867_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_135181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786539	786251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_786300_786500
862793	contig_7695_pilon	+	684	4	Intergenic	novelGene_41613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.7782138482991	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	71	385	552314	553627	TRUE	5	CATGCTGGCCTCTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLSRATRALRKPEAGGVIRTILRAGQAMPGPPLGPILGQRGVSINQFCKEFNEKTKDIKEGIPLPTKIFVKLRMMPLPYRMCLCPLWSAPSLALLVPWASEC	552243	555236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_552437_552816_552913_553531_553632_554941
862794	contig_8377_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_34889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATAAAGAAGATGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38739	39658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_38700_39700
862795	contig_4884_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_63793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	98	346	218476	218724	NA	60	TTTGAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLTVCFTYLIVSNFESADYSQCKGHCALTHFMFYLHCMHSDKQNPLLELFVALSSVCHTENLKRCKINGLKRGGNNSHPKCCFSTGILLPGPQGRSALWIPAFRLCPFSLLTV	218378	219195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_218400_219200
862797	contig_15130_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_177112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283645	282990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_-_283000_283600
862798	contig_8616_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_72520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCTGTGAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347846	347471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_347500_347800
862800	contig_11304_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_156691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAGGAAAGAGAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305730	306540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_305700_306500
862801	contig_11321_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_86651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155174	155652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_155200_155700
862802	contig_5286_pilon	+	702	6	Intergenic	novelGene_157375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	33.6986646619714	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATTATTTGTAGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589907	712540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_590037_620687_620753_621050_621278_622205_622282_663819_663882_712397
862803	contig_12750_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_172633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTATAAAAGAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169812	170622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_169800_170600
862806	contig_11338_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_6250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	188	433	92734	90821	FALSE	5	GGACCTGTGTGCTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQIGLEDFIFAHVKGQRKEVEVFKSAEALGLTITDNGAGYAFIKRIKEGSVIDHIQLISVGDMIEAINGQSLLGCRHYEVARLLKELPQGRTFTLKLTEPRKAFGQIGRPFPPPTLSTSAAKLVPLSPWGLGFFLGVTTFLVS	93024	90577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_90940_92607_92789_92891
862807	contig_7271_pilon	+	606	2	Intergenic	novelGene_159943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	41	514	327475	336344	FALSE	35	GTCTAGTAATGGAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGCCGVKKQKLSSSPPSGSGGGGGASSSSHCSGESQCRAGELGLGGAGPRLNGLGGLTGGGSGSGCTLSPPQGCGGGGGGISLSPPPSCGVGTLLSTPATATSSSPCSSSAASSLLPGSRKMVVSAEMCCFCFDVLYCHLYGYQQPRTPRFTNEP	327434	336436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_327948_336343
862809	contig_7171_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_101330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143550	1144301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1143600_1144300
862810	contig_9389_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_84118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAACACAGTCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411133	1411643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1411100_1411600
862811	contig_14686_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_88061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGAAGCCTAGCAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26318	26960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_26300_27000
862813	contig_1996_pilon	+	566	5	Intergenic	novelGene_131918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.543982164397	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	170	478	370477	370938	FALSE	15	CCAGAGTGACTCCCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVGQLLLAELEHSCPQVVPETLLQAHASEGRQQVDGQDRGVPSLGFLPRVVSIPLRMFRLWAFTGMMAQIPLAWITSRFLQGNYGNAAVWLTLIIGQPVAVLIAPTHCPPPRACLLAGVRMGVCQEPEGRLPAGLPPPSLPWEASLPLWGPFPSGIGL	370036	371026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_370098_370269_370358_370456_370516_370598_370700_370769
862814	contig_9609_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_23108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACATGTCCCTCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512624	513300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_512600_513300
862815	contig_14599_pilon	+	619	3	Intergenic	novelGene_167903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	45	440	147829	149614	FALSE	35	AAAATTAGAGACGCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGGLALRTLPGQGWVRGSSPAVLSRLRDAAVVRPGFLNAAEEETLSRELEPHLRRRRYEYDHWDAAIHGFRETEKSRWSEASRAILQRVREAAFDPGQALLPRVHVLDLEPRGYIKPHVDSVKGLGPV	147784	149793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_148033_149024_149199_149596
862816	contig_960_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_108242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGATCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451409	450817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_450800_451400
862817	contig_15631_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_151552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCCATTTCTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554876	555413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_554900_555400
862818	contig_5718_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_110317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466088	467059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_466100_467100
862821	contig_10148_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_172877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTCCTCCCAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384086	383567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_383600_384100
862826	contig_5765_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_141389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAAAAAAAAACCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652408	652849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_652400_652800
862827	contig_11815_pilon	-	837	2	Intergenic	novelGene_50946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAACCTCAGCATCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460810	458453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_458711_460230
862828	contig_13481_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_119278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTCAAATCCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133799	133501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_133500_133800
862829	contig_14732_pilon	-	927	5	Intergenic	novelGene_169703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGAGGGGATGGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64519	24608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_24652_26028_26072_26401_26436_63419_63547_63839
862830	contig_9133_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_109319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGGAAAATACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913345	912553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_912600_913300
862831	contig_12079_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_67374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCGCCCCCCACTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363504	362647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_362600_363500
862832	contig_6418_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_81193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAATTACCTTCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1188770	1189796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1188800_1189800
862833	contig_10347_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_177656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTCTCTCCTTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623191	1623656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10347_pilon_+_1623200_1623700
862834	contig_6344_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_157100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	63	512	854688	855137	NA	30	GATTTACTTGCATTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPGAKVWCLLLAARLREARAMVQDQEREDSHQLSGSPSLFVRCGVHSPATDFVLAQKLLLLTCTLYLPSSSSHSLELLFPITSTSSPTPPKKPSRRLCPCGLFYPPIPLFSDPVPSLFSSSLIFLRLRPLLAYSVFLFGHLHFCPFLLLSIPFSDPFPLTFPKHPFTSQ	854625	855234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_854600_855200
862835	contig_2867_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_135273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCCTTGGGTGGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1558052	1558317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1558100_1558300
862836	contig_9721_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_155993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCCTCTGATGTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435428	434874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_434900_435400
862837	contig_7070_pilon	-	313	2	Intergenic	novelGene_104034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGATGATTCTCTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62802	61976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_62238_62750
862839	contig_13780_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_149061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATAAACTAGGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641559	644713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_641589_641843_641993_644486
862840	contig_2552_pilon	-	275	2	Intergenic	novelGene_139012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTTCTTGATAGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142232	136662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_-_136783_142077
862841	contig_14744_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_65950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGACATCTGAAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304335	303509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_303500_304300
862842	contig_9839_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_88591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGGAGTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458303	457832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_457800_458300
862844	contig_10864_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_107061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816127	816528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_816100_816500
862845	contig_11978_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_62857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGCTGTAGGTACAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578498	577975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_578000_578500
862846	contig_11986_pilon	+	289	3	Intergenic	novelGene_69084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	134	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGGTCTGTCTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17262	22184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_17285_17442_17535_22009
862848	contig_8864_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_136000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTAAGAGGAATAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701145	700066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_700100_701100
862851	contig_21185_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_177936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACAATATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10162	10954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21185_pilon_+_10200_11000
862852	contig_7035_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_83561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTGTGCTCTTCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967135	968021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_967100_968000
862853	contig_4962_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_107377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAATCTTAGAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125773	124622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_124600_125800
862854	contig_10319_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_147256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTATGATTCTCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237281	237722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_237300_237700
862855	contig_401_pilon	+	278	2	Intergenic	novelGene_42797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATAATTGGGTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131962	1135526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1132070_1135355
862856	contig_9633_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_139599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419872	420415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_419900_420400
862857	contig_14768_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_115072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGTCAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172904	172437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_172400_172900
862859	contig_6489_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_128918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTAATTTCCTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101871	102262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_101900_102300
862860	contig_9389_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_84052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	730841	730494	NA	10	TGAGGCTGGCATCTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERIAASARPPPQEPAGATPEGPFTTSVSPQRPDSLWPPCWLPQPESRCWGAGTRVACESPPAPCLHRLERCVYAAWPPVCAACGCRSPASVTLLEGVEDPACREPPEGRQSRGHS	730843	730441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_730400_730800
862861	contig_5899_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_146970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAGAAGATGAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79354	78619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_78600_79400
862863	contig_18303_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_146802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	2	526	26455	26979	NA	30	GAATGCATTTCCCAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGCLAAAGGGRAGGEGVRLLGADLEPQPAQSQAPGSEDDHSCSGKESLPPHAFTLESPPGYLSSPAPVSPDLSQAVPRRKGPDAVGKDRNHRPLRVGNVSDSSSATPELPTAENVSPRPCGRSLPTPGNPEAPFSTPPSTPPSPVSFEPLSGSATARLSFLPLTVTLLDPFGFL	26453	27871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_+_26500_27900
862864	contig_12127_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_130103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCATGAACTGTCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80996	81312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_+_81000_81300
862868	contig_10811_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_165804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTTCACAGAGACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369242	368028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_368000_369200
862870	contig_12809_pilon	+	636	3	Intergenic	novelGene_177589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	52	636	56876	59789	FALSE	25	GTGAGTACAAGGCCATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPEEGTKTLQDYTQLYTMTTLKVGARSVPGVTAPDNVHVIQPRYTLASGIHAQPSVVTTYPTSSKVVQCDAERANLQNPLMVHQNPAGVTGAQSQLLVHQYPAGTAGLQISPAVVQNLPRRTDPQTLPQVSHNPPNFIPGPMNTSNQFQWNMSFGSFSTFDPKKFINEEVRTLGAIQILIGLTHIFAGINPLLYQPIFLNGASAYLFWGGLS	53551	59789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12809_pilon_+_53591_56863_57347_59675
862871	contig_14694_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_152476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGGCAAATAAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125982	125300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_125300_126000
862872	contig_10734_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_51112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGGTTTGCTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735742	734975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_735000_735700
862873	contig_16431_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_87599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTAAAGTGTACAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53984	54356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_54000_54400
862874	contig_6513_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_117739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCAGTGGCTTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48343	47694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_47700_48300
862876	contig_2036_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_131838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGCCAAGGGTCTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617924	617149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617100_617900
862877	contig_7138_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_120996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGAAAGCATGCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281280	280611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_280600_281300
862878	contig_6691_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_60165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTCAAGGATATATACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394909	394026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_394000_394900
862879	contig_15022_pilon	+	822	5	Intergenic	novelGene_171802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	2.87228132326901	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	186	647	47956	51099	FALSE	20	GCTGGCTCATCATAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAETLYDVLHDIEYRRKWDSNVIETFDIARLTVNADVGYYSWRCPKPLKNRDVITLRSWLPMGTDYIIMNYSVKHPKYPPRKDLVRAVSIQTGYLIQSTGPKSCVITYLAQVDPKGSLPKWVVNKSSQFLAPKAMKKMYKACVKYPDWKQKHQPHFKPWLHPEQSPLPSLALSELSVQHADSLENIDESSVAESKEERTGGAGGEGSDDDTSLT	47102	51274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_47229_47896_48001_48711_48830_50548_50602_50853
862881	contig_20112_pilon	+	185	1	Intergenic	novelGene_177991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGCTCTAAACCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25382	25567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20112_pilon_+_25400_25600
862882	contig_14684_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_99670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCATTTGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333748	334222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_333700_334200
862883	contig_5649_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_82322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	477	788	318496	318185	NA	25	TAATACATTGTGTTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNVEHFRKVEREMNEIMKCYREIYEEEKKNTVQTKLSDYFQKVTPSSTPVSPQLQSSISGLQTPSSGTFDDPNDPQPSTSYSFTDDSENAEKLPSERFISD	318972	318099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_318100_319000
862886	contig_5961_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_144126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141945	141713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_141700_141900
862888	contig_6515_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_177996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATTGTTACCTCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534060	534886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_+_534100_534900
862889	contig_12638_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_33153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	492	junction_2	676.5	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	258	326	202877	202809	FALSE	25	AGTAATCACAGTGGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYRSRERDAGGRGSLRAVPTKLLRPCEDGLRNGLRRGHGGRGPLRHLFLSQDRNAGSGADGRHWENHDAEWRHFWHIHGNRDGHPMLTSAMVAHYIYPVPSIPAHVV	204124	202792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_202980_203780_203912_204100
862891	contig_16033_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_177998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGTATAATTGAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56630	57511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16033_pilon_+_56600_57500
862892	contig_9512_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_177999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGCTTCTTTGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156016	156262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9512_pilon_+_156000_156300
862893	contig_15123_pilon	+	894	4	Intergenic	novelGene_110901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	174	563	122280	123894	TRUE	40	CAGGTCAATGATATCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACSSTSPAENWNWQIGHWTQEMGGGELSGEETHTTDWDEDGDEEGEAGRGGEVSPQVAACRGRISMVKEPKHKWGIVHYPGHHCFGFGVGVVASVHGFGFGVGVVSVRCFRFGVDVVVLFPSRLAES	122106	128097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_122499_123723_123911_125957_126031_127855
862894	contig_2054_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_51696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	61	438	203615	203992	NA	30	GAATAGAACGCGCATGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAASLTCQTFTPRPEARELLGRFLSCRTQPLPPPELQDPRAEGGKEAGKVATVPEPREMYIGGAGGPGRQLCASPSSPAAYSSSREQHRASLGLLLPGLRQQQPGFRRPHPAPSLLGLHHLVGGG	203554	203994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_203600_204000
862895	contig_8447_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_69391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAAATAGTTCTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7804	7542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_7500_7800
862896	contig_7644_pilon	+	251	2	Intergenic	novelGene_64224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTTTCTTGGGAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75625	82238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_75695_82056
862897	contig_8687_pilon	+	903	1	Intergenic	novelGene_169668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAGGGCATCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278137	279040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_278100_279000
862898	contig_6110_pilon	-	753	3	Intergenic	novelGene_163277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	271	366	476557	476462	FALSE	5	CTTGGCTTGTGAGGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAAGAGWRSSRRPSPETGTGTSRRLAAPVAGDSARPSLPRTASSPRTSDLAVSAALASACPPQAGWRSLLLEERSRALRTGHRTLLSSVMVCNGAEKVFLQSFTLNDMVGGFLVVKSFER	477442	476074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_476636_476754_476846_477341
862899	contig_2450_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_160325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812044	812751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_812000_812800
862901	contig_1575_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_45192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTTGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184102	184893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_184100_184900
862902	contig_3533_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_176533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGGAAAGGAGTAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154466	153794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_153800_154500
862904	contig_10732_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_114762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	98	487	577439	577050	NA	0	TCTGCCCCCTGCCTGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTPSGTQRCCSEGFCHRCGYLLRMGVWAVKEGGWLCAAVLTSHPTVPSIQDSGLGDAQCDRAQLLEPTRGSKSDLVTFPSPAPGVTPHLLVAPSSGSIHSPFTPWGSPGRYSGPHVACAPSVTLTCN	577536	576952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_577000_577500
862905	contig_7629_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_153589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGATGAAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355360	354893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_354900_355400
862908	contig_9440_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_59079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATAATTTCCACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302841	1302018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1302000_1302800
862910	contig_8873_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_162899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGGAAACTATGAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301311	300994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_301000_301300
862911	contig_6415_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_175846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACTAATTGAAAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117254	117995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_117300_118000
862912	contig_6275_pilon	-	504	4	Intergenic	novelGene_142470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	216.5286740057	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	147	503	171337	160706	FALSE	40	AAACAAAATCTTCTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLICSNYHILQEHVDLHLEESSFGQGMDRVQCSRDLELAHQLQQEEDRKRRSEESRQELEEFQKLQRQYGLDNSGGYKQQQLRNMEIEVNRGRMHPSEFHRRKAEMMESLAVGIDDG	185044	160704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_160859_165857_165980_171255_171367_184927
862913	contig_5003_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_120198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTACTCCAGTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87012	87591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_87000_87600
862915	contig_20293_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_153514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTAGAGTCATAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34072	34429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_34100_34400
862916	contig_5083_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_151681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCACAATATCATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633104	632794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_632800_633100
862917	contig_19518_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_170715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	15793	16113	NA	20	CAGAGATGTCCTTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAFCAKCFPSSRTAEGGGDWRGQSGPDAAGSRGAEVSGIPPRGRRREHSSGHSQARARGRSQVPVSRLLQPPAGRTRPAWRQVPKLLGQRSLGTGCLVLLWERHR	15791	16382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_15800_16400
862918	contig_4732_pilon	+	713	2	Intergenic	novelGene_75414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATATTTTGTTTTTCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581584	583218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_581638_582558
862920	contig_8050_pilon	-	355	4	Intergenic	novelGene_114883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTTCCTTTAGGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498700	494556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_494580_496552_496651_497093_497220_498592
862921	contig_7057_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_123300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCCATTGCCATCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899407	900074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_899400_900100
862922	contig_12638_pilon	+	393	2	Intergenic	novelGene_33052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTAGTCTGATGTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8718	9552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_8834_9274
862923	contig_10848_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_133530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	413	718	816905	816600	NA	20	CCACCCAGGACCGTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITVQWHLPPPHPKLGAHRLAAPTPLLSHSHWGPTDWWHPLYPATCTGSLWTGGAPFSAHPPMPGACGLAAPTPKPSHLSQARKLAASTLPPGHRCQGPKD	817317	816191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_816200_817300
862924	contig_8286_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_139787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTACAGGGATTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61186	59949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_59900_61200
862925	contig_5302_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_81386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAGATGGTCCCGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126618	125893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_125900_126600
862928	contig_8174_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_160072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCAGTTTAATCATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421227	421635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_421200_421600
862933	contig_2161_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_114943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGGGACCTCCCCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938909	938166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_938200_938900
862934	contig_9303_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_176823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43478	43010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9303_pilon_-_43000_43500
862935	contig_1624_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_138377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCTAAAGCACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176533	177106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_176500_177100
862936	contig_9915_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_174170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGAATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642119	641460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_641500_642100
862937	contig_8491_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_154218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATAATAATAAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265528	265057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_-_265100_265500
862938	contig_11872_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_143147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCCCCAGTTCTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51241	50798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_50800_51200
862939	contig_7333_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_142803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACATTTTTGCAGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377351	376814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_377200_377236
862943	contig_16022_pilon	+	639	4	Intergenic	novelGene_160266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.816496580927726	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCCCCGAGGGACCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6046	15440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16022_pilon_+_6207_7964_8078_9978_10244_15339
862944	contig_9705_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_41722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACATAACGTATGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179597	180249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_179600_180200
862945	contig_8063_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_152456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATATTTTGTACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155063	1154397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_1154400_1155100
862946	contig_11100_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_175536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAATAAGAAACAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197877	197675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_197700_197900
862947	contig_6217_pilon	-	1136	1	Intergenic	novelGene_109636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAAGGTGTTTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534883	533747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_533700_534900
862949	contig_10549_pilon	+	523	3	Intergenic	novelGene_110581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	1.5	285	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAAAATGATTTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31494	32277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_31664_31773_31845_31994
862950	contig_7806_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_157556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACCAAACCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610071	610448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_610100_610400
862951	contig_14353_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_82122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGGCGTGATGGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149236	148502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_148500_149200
862952	contig_10235_pilon	+	671	3	Intergenic	novelGene_46340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	115	junction_1	225	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAGATGGACAGAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114003	117234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_114184_116075_116251_116918
862953	contig_8241_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_157498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCTTTGCAGAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610004	611460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_610000_611500
862954	contig_7025_pilon	-	429	2	Intergenic	novelGene_104402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	246	184	429	104326	96935	FALSE	55	AAACTGAATTTAGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTVKSSSLLQEIKSEHKSGPLPNYFDGRGEGNRSRELGRSAGGYDADGLRPRNQFGGARSMVTTKVTLPAKPKHVELNLKNSKNLDSLGNEHNPFSQPVHKGNTATKISLFENKRANSSPKHADARGAKNILPSNKTFVGQA	104509	96934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_97158_104303
862956	contig_5217_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_135790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAACAACTAAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597236	597959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_597200_598000
862958	contig_8742_pilon	-	498	4	Intergenic	novelGene_173946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.7082522694727	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	75	395	77466	59121	FALSE	15	TTCCTTGGAGATCTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATTPQNLSLVVHGAGDLRLENYPIPEPGPNEVLLKMHSVGICGSDVHYWQHGRIGDFVVKKPMVLGHEASGTVVKVGPLVKHLKPGMGTGLKMNDLNHPKAKD	77540	59017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8742_pilon_-_59177_61962_62128_64312_64347_77400
862959	contig_2487_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_148462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGGAAAAAAAAAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135207	135711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_135200_135700
862960	contig_10404_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_138674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086103	1086749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1086100_1086700
862961	contig_13244_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_86987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGCTTTTAGGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425765	426536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_425800_426500
862963	contig_10953_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_42592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTAATTGTTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456204	457027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_456200_457000
862965	scaffold_8345_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_106998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGCAGAGCATGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187270	187666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_187300_187700
862966	contig_7619_pilon	-	661	6	Intergenic	novelGene_162163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.2294019855571	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	312	527	418348	414575	FALSE	30	CTTATTCATGTATAAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWQWICFFSCPFISTGLRHPHPAGGQHIYLHLRSYTVPNEQRYIIRLLFIVPIYAFDSWLSLLFLGGHQYYVYFDSVRDCYEAFVIYSFLSLCFQYLGGESAIMAEIRGKPIKSSCFYGTCCLQGMSYSIGFLRFCKQATLQFCIVKPAMAALTIVLQAVLGNVGAGRWPCCDR	419359	414440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_414626_417067_417128_417699_417776_418319_418411_419027_419194_419276
862967	contig_15498_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_42694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAGACAGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827369	827926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_827400_827900
862968	contig_14790_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_127911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGGTATTACATGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167708	168512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_167700_168500
862970	contig_11253_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_126841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAGGTAAATTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202322	202975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_202300_203000
862972	contig_1379_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_134593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTGCATTAAGGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447464	446430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_446400_447500
862974	contig_5153_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_74402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCGTGCACCCAGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006236	1007087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1006200_1007100
862975	contig_3155_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_26430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCTCTCCTCAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293736	294159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_293700_294200
862977	contig_10377_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_115397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215045	215438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_215000_215400
862978	contig_11512_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_43392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCGACTCATAGCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578266	579101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_578300_579100
862979	contig_6885_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_83682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCTGATTATTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241481	241040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_241000_241500
862981	contig_9727_pilon	-	611	5	Intergenic	novelGene_86264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	26.3569250862084	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	6	536	101964	76573	FALSE	15	TCTGTGAGGACACTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAEASGCDSSNRCEENGREGSSPKSLLPGTTISRVKLLDTMVDTFLQKLIAAGSYQRFTDCYKRFYQLQPEMTQRIYDKFITQLQTSIWEEISEIKQEGNLEAILNSLDKIVEEGRDRKEPAWRPSGIPEADLRSTMAPYLLQQRDALQRRVQKQEAENRQLADAVLAGESVSNLH	101969	76497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_76601_78576_78712_80790_80892_81860_81967_101803
862982	contig_12886_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_135444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATAAAACTTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205876	206491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_205900_206500
862984	contig_9363_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_6605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTCCAAAGGATGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758223	758569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_758200_758600
862985	contig_10953_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_42593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTATTCTCTTGTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457877	458631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_457900_458600
862986	contig_13300_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_125781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGCATGAGTTAACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85759	86131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_85800_86100
862988	contig_2733_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_128549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGAGTCCAACCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529798	530552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_529800_530600
862990	contig_14811_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_74503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCCTTTTGTGAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407534	407996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_407500_408000
862992	contig_11615_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_151259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAAAAAAGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54098	53459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_53500_54100
862993	contig_13004_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_112618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTGAAGCAGAACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178948	177978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_178000_178900
862994	contig_5623_pilon	-	602	5	Intergenic	novelGene_154817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	419.016109475519	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTATGTCTCCACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275921	205941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_206094_218322_218450_220829_221000_239340_239459_275886
862996	contig_5075_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_174073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221960	222887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_222000_222900
862997	contig_2940_pilon	-	160	1	Intergenic	novelGene_81908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGAAAAACAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485995	485835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_485800_486000
862998	contig_3380_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_60108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	382	714	420222	419890	NA	80	CACAATAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRTHCKMDMKHENKYPTPERNPEQSFLPLCFGFHGNLLMCKGILSVPKAECQKLVYRGQASCQCWGHNMKSQVCCNQGPGNGSGKAGIRKRQWGNMMSTRSLNCTREDC	420603	419857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_419900_420600
862999	contig_5039_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_64845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	26	81	234	314	322067	322147	NA	60	AAGTAAAGTCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCQSRTVLRRVFNGSFFRRRLPGLSSKLPLDGLEPPTSQLATEPLTVAPPREVPVNSVVNNNSVSVLAHYCNKCTSGMLGVHNRKNWGRGGYGNSLTFCAIFL	321833	322165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_321800_322200
863000	contig_11594_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_80899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAGAGAAACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144086	144777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_144100_144800
863002	contig_4402_pilon	+	224	3	Intergenic	novelGene_140820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCGCAGCGCCACGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411875	462726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_411955_440938_441020_462662
863003	contig_15021_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_26930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	407	433	151246	151220	NA	15	ACAGGCCTGCATGGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPIHTSDSGGADGPQPACSTSLAWDAQAWLQVADAPALYGPLLGLADQVAPCQDSGHRPTPQQCCSFPQPSKGRQGLLGPWDRLRPRNLVAEPRQGGCGGAGYLGHSLGVTSCLRLVGRKPLSPAAALESGDRSPMARHGGRL	151652	151122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_151100_151700
863004	contig_12837_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_57288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTCACTCCAAATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69770	69302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_69300_69800
863008	contig_10769_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_177008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTGTTTTGAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764005	765382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10769_pilon_+_764000_765400
863009	contig_11720_pilon	-	600	5	Intergenic	novelGene_44025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_4	41.6803310927349	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	175	600	360057	353433	FALSE	45	AACCCAGAACCTATGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNRLPRVLILHLKRYSFNVALSLNNKIGQQVIIPRYLTLSSHCTENTKPPFNLGWNAHMTVSRPLKASQMVNSCITSPSTPSKKFTFKSKSSSLALCLDSDSEDELKRSVALSQRLCEVSGGEQQQEDLEKDSKLCRLEPDKSELENSGFDVMSEEELVAAVLEISKRETSPSLSHEDDDKPTSSPDTGFAEDDIQEMPE	363328	353432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_353640_354758_354904_357615_357682_360049_360215_363311
863010	contig_16382_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_160219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCAAATTTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57567	57259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_57300_57600
863011	contig_9733_pilon	+	530	1	Intergenic	novelGene_160579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCGGAGACAGCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53917	54447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_53900_54400
863012	contig_348_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_67582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGGCTTTTAATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168171	170066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_168201_168872_169070_169757
863013	contig_15236_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_141594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTGGTTAGCAGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459380	460222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_459400_460200
863014	contig_3818_pilon	+	872	2	Intergenic	novelGene_99317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGGCCCCTTGTTCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106197	1116870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1106465_1116265
863016	contig_13878_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_165741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAACAACTAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311112	311516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_311100_311500
863017	contig_10197_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_115233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAAAAACATTCCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938757	938150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_938200_938800
863019	contig_152_pilon	+	437	6	Intergenic	novelGene_162644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	165.108933737699	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGCAAAGAGCCTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722951	728085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_723716_723823_724555_724613_724850_724951_726442_726498_728064
863020	contig_19564_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_29672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAACGATTTGAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70209	70489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_70200_70500
863021	contig_1146_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_84801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGTGAGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259544	260485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_259500_260500
863022	contig_4392_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_117313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAATAAAGGTAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303215	303914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_303200_303900
863023	contig_9527_pilon	+	394	2	Intergenic	novelGene_134098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTGGGGAGCCCGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742174	742897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_742233_742561
863025	contig_2867_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_135213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGACAAGCAGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985210	984806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_984800_985200
863028	contig_3601_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_132902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAAATAGTGCCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215683	214903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_214900_215700
863032	contig_12102_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_151059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTCTTTGACCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87025	86677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_86700_87000
863033	contig_8850_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_172438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTATCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215431	215056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_-_215100_215400
863034	contig_11068_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_130556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573614	573186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_573200_573600
863035	contig_12885_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_176902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTGCAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173981	173205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_-_173200_174000
863036	contig_7229_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_39788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695501	694807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_694800_695500
863037	contig_5728_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_126696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	33	299	326863	326597	NA	10	GGTGGTGGCTGTGAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYCPDFGSDVMGSQCMTRRSHCGFVSTMLLWESELTTRFVSVRISVNETRLCAGGVHSCSIMPDKQYFGYNGNSGFLFIYIFDGCKTTSCRLKKCSVT	326895	326250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_326200_326900
863038	contig_9150_pilon	+	846	7	Intergenic	novelGene_140899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.42670329642684	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTAATCTTGTCTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37821	42573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_+_37836_38217_38320_38574_38827_38979_39182_41454_41547_41659_41746_42475
863039	contig_546_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_117167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTTAAGAGTGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18222	17623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_17600_18200
863040	contig_9097_pilon	+	830	6	Intergenic	novelGene_173577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGGAGAAAGAAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143440	209599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_+_143700_148597_148707_149101_149233_153894_153972_179511_179663_209496
863043	contig_12543_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_168360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	72.9944347193675	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAGGGACGTCAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172003	183634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_172118_172800_172869_176115_176204_178630_178758_183476
863045	contig_953_pilon	-	598	5	Intergenic	novelGene_130011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17.4696164811939	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	240	521	348031	347366	FALSE	30	GAACATTGTCATATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFSANLSWLFPELPGLTARFRAAGSAGFEAAEVAFPYAEPPEALARAAREAGLRLVLINTPPVAAILQKVGRPNLQLQMDIFHWQIMDGNLTGNIREFLPIVGHVQVAQVPGRGEPDSPGELNFPYLFQLLEDEGYKGFVGCEYRPQGDTIEGLRWLRSYWDRQGCPQTGQ	350103	347288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_347440_347579_347715_347850_347921_348028_348079_349911
863046	contig_10135_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_106685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTGTGAGTGCAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316056	316486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_316100_316500
863047	contig_11396_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_71391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCCTGTGTCCCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1319706	1318941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1318900_1319700
863048	contig_8600_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_125746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132428	132811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_132400_132800
863050	contig_13542_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_131577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGAGAGCTGAGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744949	745483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_744900_745500
863053	contig_11335_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_104938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGCAATAATAATGAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436078	436473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_436100_436500
863054	scaffold_17306_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_175319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23757	24212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_+_23800_24200
863056	contig_11003_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_105452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATTTAAGCTCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439749	440302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_439700_440300
863057	contig_6048_pilon	-	265	3	Intergenic	novelGene_73102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	50	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAGGTGAAAGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223334	219879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_219979_220412_220490_223245
863058	contig_9303_pilon	+	607	2	Intergenic	novelGene_176824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGAAAGTTCAGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44100	45924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9303_pilon_+_44565_45781
863059	contig_6412_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_149976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTACCTAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549475	550131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_549500_550100
863060	contig_8885_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_115592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360802	360454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_360500_360800
863061	contig_5954_pilon	-	504	2	Intergenic	novelGene_28459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	121	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGAAAGGATGCGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130033	129176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_129494_129846
863062	contig_4364_pilon	-	877	2	Intergenic	novelGene_47	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGGCAAAAACATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519089	517865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_518592_518938
863063	contig_6738_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_166142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAACAATGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90304	90924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_90300_90900
863064	contig_253_pilon	+	576	2	Intergenic	novelGene_129611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	106	429	73827	74150	FALSE	25	CCGGTCACCACAAGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTGAEHPPVPHMHHRACHGQEAPPGAAFTSHKARPHMVPILQRFKEEDGPRWEHALSCCLWWVSEVLQARLSAWRWDREPKRALRGLCRVHGRVEEKGKQQSPEG	69907	74297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_70011_73824
863065	contig_11227_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_163174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGATTTACAGTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113842	114256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_113800_114300
863066	contig_2161_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_114934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGGTCATTAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870532	870163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_870200_870500
863067	contig_4845_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_53653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463425	462714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_462700_463400
863071	contig_18039_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_171256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATTATTGTATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229694	230460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_229700_230500
863072	contig_4754_pilon	+	815	1	Intergenic	novelGene_35898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAACAAAGAGATGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114777	115592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114800_115600
863073	contig_6862_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_63744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48684	48127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_48100_48700
863074	contig_10868_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_173900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGTCTGTTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497427	496293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_496300_497400
863075	contig_5013_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_110100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263996	263177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_263200_264000
863076	contig_6589_pilon	-	838	4	Intergenic	novelGene_25812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	6.12825877028341	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	82	669	707962	691040	FALSE	40	ACAAAATGCCCATCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVARGVWGSKVRVLPAFLGPPRALSSLAAKMGEYRKMWNPKEPRNWAQQYREHFIPFSKQQLLRLLIQEFHSSPTEKAALEEFLAHVEFCTLFHYHEILDRLQALYDPINPDRETLDQPSLTDTQRLSNEQEVLEALKPLLIQANFSQLSEDTLAYALVVHHPQDGVQVPGPKFPAGLGVGVGRLRSRGCWEL	708388	690870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_691313_702986_703092_707752_707985_708329
863077	contig_10011_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_68122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCAAGCGCAGACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342139	342826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_342100_342800
863078	contig_11903_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_164732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTCAAATTGCTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11816	10953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_-_11000_11800
863079	contig_15021_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_26927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTCATGTTAACGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97355	96967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_97000_97400
863080	contig_10990_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_7419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604684	604161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_604200_604700
863081	contig_253_pilon	+	219	1	Intergenic	novelGene_129747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGCAACCCCATGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681340	681559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_681300_681600
863082	contig_2917_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_147604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACCAAGGTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178320	177660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_177700_178300
863083	contig_15629_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_122432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTACAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56193	55299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_55300_56200
863084	contig_9363_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_6619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACCGGCCGTGTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857129	857549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_857100_857500
863085	contig_11998_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_175786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTAGGAAATGCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99649	99128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11998_pilon_-_99100_99600
863086	contig_10437_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_38469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAAAACTTGTCGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135719	1136678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1135700_1136700
863089	contig_9668_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_58270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCATTATTCTGCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689567	690165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_689600_690200
863091	contig_8576_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_88741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCCGGATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669700	670485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_669700_670500
863092	contig_5917_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_122146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236519	235993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_236000_236500
863094	contig_7593_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_127310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAAAGACCCAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261107	259743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_259700_261100
863095	contig_5928_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_40382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCTTTATTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295314	295851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_295300_295900
863096	contig_13697_pilon	-	1157	2	Intergenic	novelGene_165948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	164	976	661392	660580	FALSE	30	AAGTAATTTTAGCGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASITQLFDDLCEAHLPAAKAHLGQHGLDRRKVKQSLKKVAYNMLFTNLFQDETHKLQPDLSKLPVKNKILMLSFNLRVGGLGPEADRLEDLVEELEAARWCPLVEVLSVLDLLVQLAGSGPPQVLPPKRDYFFNNKHVGRNVPYSGYNCYDLSVSEMDIQSRISREEYLCHDMVQKTLQLMEAAPGTGLLTFGRFSYGDSWNKFERDTRASLFGALVHSRTLDMDVQLDLPPVPDSADLSGLAIKVRYLLSRLQLSSGSETLSGVLVLW	661834	660398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_661463_661741
863097	contig_9363_pilon	+	389	2	Intergenic	novelGene_6512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGTTTTGCTTAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518588	519440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_518728_519190
863102	contig_10734_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_51313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGTGAAATACACTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387623	1388200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1387600_1388200
863103	contig_12139_pilon	-	159	1	Intergenic	novelGene_146480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171751	171592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_171600_171800
863104	contig_14704_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_82689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGATAGGCAAGGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70290	69423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_69400_70300
863105	contig_10541_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_144629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGCAATGAAGAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113420	113127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_113100_113400
863106	contig_1996_pilon	+	480	5	Intergenic	novelGene_131951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.5548047910945	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	292	417	515533	515732	FALSE	10	GCGAGTGGCCTTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVFSEFGFPPAVQRWVVGRHDGDPAFLYLLSSPRETPGFRPQRPQKTDGELGRLFPQSQGLPRAPQPASTSPPSPLQPGWSCPSCTFINALSRPGCEMCSTQRPSTRDSLPAAATQQPPKVTRREDGPSLPGLSGDLC	515018	515795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_515075_515119_515176_515258_515378_515472_515602_515675
863107	contig_7333_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_142745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCTTGCAGTCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47124	46317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_46300_47100
863108	contig_6496_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_103550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	904	1227	1222279	1221956	NA	50	AAAAAAAAAACCCTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEALVNLTHAISLLTSNQWRQQDQSNDERVPITGPRIDNSVLNNQKGNMDQSMTQELLVQFRMTRSLLSPSPSLPPSAFLSLSSRLELLPETREGRESLGTQTEHE	1223182	1221730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1221700_1223200
863109	contig_2733_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_128599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAAATTGAGGAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994156	992860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_992900_994200
863110	contig_4364_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_12	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAGCCTCATGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218360	218891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_218400_218900
863111	contig_14322_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_115629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTGTATTGTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233178	233523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_233200_233500
863114	contig_11986_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_69138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGACAATAATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223650	224091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_223600_224100
863115	contig_10196_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_132053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAATTTTTCATTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646408	645911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_645900_646400
863116	contig_12543_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_168367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAACAGAAAAAAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232282	232756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_232300_232800
863117	contig_7882_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_175005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGGCTGACATTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29049	30104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_+_29000_30100
863118	contig_5791_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_35842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGAGAGTTTCAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044540	1044978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1044500_1045000
863119	contig_9706_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_21042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCAGCTGTATTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651283	650468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_650500_651300
863120	contig_9297_pilon	+	604	2	Intergenic	novelGene_69822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473689	474438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_473864_474008
863122	contig_10040_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_176489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCATTTTCTCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87684	88529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10040_pilon_+_87700_88500
863123	contig_211_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_129880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290584	289609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_289600_290600
863124	contig_10323_pilon	+	480	6	Intergenic	novelGene_123569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACCTCCCAGAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447091	452508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_447164_448195_448299_449822_449903_450803_450921_452275_452328_452452
863125	contig_4315_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_46711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACAGTTCGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43019	43334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_43000_43300
863126	contig_13386_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_178003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAGAGAGGCCCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60865	60101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13386_pilon_-_60100_60900
863127	contig_12786_pilon	-	289	2	Intergenic	novelGene_103458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTTTGGTTTTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753233	739039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_739213_753117
863128	contig_11709_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_168239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATAGTTTTGTACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624520	625194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_624500_625200
863129	contig_1785_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_175093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAATCACTGGTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351986	352678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_+_352000_352700
863131	contig_10196_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_132190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAATCTCATGCGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125622	1125070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1125100_1125600
863132	contig_5023_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_7169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGTAGAACTGTGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423746	423175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_423200_423700
863134	contig_5780_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_29788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGCCTTGGAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78954	78087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_78100_79000
863135	contig_10140_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_148433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAGGAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372524	373570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_372500_373600
863136	contig_20934_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_178004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTGGAGAAGGTAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53184	54310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20934_pilon_+_53200_54300
863137	contig_19604_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_77236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267596	266991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_267000_267600
863138	contig_7457_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_31370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACCTCTCTTATCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361788	361293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_361300_361800
863139	contig_7915_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_42965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAATAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99481	99069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_99100_99500
863140	contig_6418_pilon	+	713	3	Intergenic	novelGene_81143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGGTGAGAAAACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210948	214518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_211123_212992_213104_214090
863141	contig_5286_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_157358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTCGAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544279	545118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_544300_545100
863142	contig_4418_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_98375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCCTTCAAAAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788996	789926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_789000_789900
863143	contig_9706_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_20956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTCAAAACCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296277	295808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_295800_296300
863146	contig_9875_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_154402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTGTGGAGAAAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49169	49730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_49200_49700
863148	contig_3863_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_178005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATTTCAAAATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112798	112285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3863_pilon_-_112300_112800
863149	contig_14846_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_85379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGCTTGGTGAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195424	196255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_195400_196300
863150	contig_11590_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_125557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12393	11851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_11900_12400
863152	contig_9272_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_125913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCAGGGTTCACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301506	301061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_301100_301500
863153	contig_9455_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_161843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAACTTTAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381964	382704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_382000_382700
863154	contig_14497_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_177425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAGTAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6774	7411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14497_pilon_+_6800_7400
863156	contig_12654_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_129276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAACTGAGAGAAGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653024	653399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_653000_653400
863158	contig_2733_pilon	+	366	2	Intergenic	novelGene_128570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCAGCTAGGGAAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704789	821614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_705090_821548
863161	contig_11248_pilon	-	687	2	Intergenic	novelGene_142533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128578	119296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_119492_128086
863163	contig_13753_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_136521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291204	291926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_291200_291900
863164	contig_7839_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_45749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGCATCTCTCAGATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079193	1079673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1079200_1079700
863165	contig_2799_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_85582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATGTAAACTTAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777411	776415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_776400_777400
863167	contig_10000_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_139346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGCGACCTCATGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329582	329084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_329100_329600
863169	contig_11629_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_161186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACGCAATAATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108433	108987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_108400_109000
863170	contig_7057_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_123266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGACTAGAGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694442	693871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_693900_694400
863171	contig_16362_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_161173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395321	394741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_394700_395300
863172	contig_4754_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_35903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATGTGTATTTGGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121377	121153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_121200_121400
863173	contig_13456_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_153288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAGAGAAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308094	308654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_308100_308700
863175	contig_11594_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_80905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTTAGTACAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219471	219742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_219500_219700
863176	contig_9982_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_55784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671140	671668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_671100_671700
863177	contig_4732_pilon	-	440	4	Intergenic	novelGene_75471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	524.399338926611	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGAATTAACTTACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715553	700600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_700770_712807_712911_713353_713461_715492
863178	contig_9415_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_109912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAAAGAAAAGCTGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2133104	2132493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2132500_2133100
863179	contig_15039_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_110113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGGGTGTGTGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169486	169024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_169000_169500
863180	contig_5686_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_45207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAAAAGAGAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93616	93130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93100_93600
863183	contig_11120_pilon	-	411	1	Intergenic	novelGene_161292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51625	51214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11120_pilon_-_51200_51600
863184	contig_17964_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_33853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134503	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134293_134350
863185	contig_11656_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_53981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAATTGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219753	218895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_218900_219800
863188	contig_4732_pilon	-	272	3	Intergenic	novelGene_75397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	55	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCGCTTCTGTTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523883	516594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_516777_523305_523356_523843
863189	contig_3382_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_124181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAAAAAAACCAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962258	963059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_962300_963100
863190	contig_5649_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_82398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGAAAGACAAGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189662	1188716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1188700_1189700
863191	contig_10801_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_74026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTTAGAAAGAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234770	234073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_234100_234800
863192	contig_4782_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_73624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTACAAGAAGAGAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234260	233544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_233500_234300
863194	contig_13823_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_145236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56263	55205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_55200_56300
863195	contig_11677_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_85888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCACCCCCAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406772	407469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_406800_407500
863196	contig_2730_pilon	+	441	2	Intergenic	novelGene_135399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	527671	528378	FALSE	15	TACATTTTCTCATTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPAEKHAFVGSQRLTPKFRPLPKAVRLRDCATPPTCRPVGVQQRCLPSPRPPVWSLEEKVFKKKEKSKPRKGLNGFLKDWLLFVGVYSSYTNPYRPEGPNTKTLEDIRL	527668	528484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_527823_528197
863198	contig_5039_pilon	-	386	3	Intergenic	novelGene_64752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	232	297	111622	111557	TRUE	40	AAAAAAGCGATGACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPRAEVYFSNGTSLQTECRNIQGLPWSGSPGQVQTGADGRRTPQIQTRDVAHSFGLRHLGCLPTFPSTQRDWSAPLMKHCGYEGNDSNMLSEAMASS	233978	111349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_111393_111510_111627_233751
863199	contig_15185_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_99411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTGGAGTAGACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215573	215820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_215600_215800
863200	SIRV6	+	256	1	NIC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	-421	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1864	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1900_2100
863201	contig_4364_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_13	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTTCACCAACACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259130	258651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_258700_259100
863202	contig_15853_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_177445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32106	31729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15853_pilon_-_31700_32100
863204	contig_9614_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_104429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATATGTATAAAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158087	159082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_+_158100_159100
863205	contig_8920_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_146050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAATTCAGAATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10311	10775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_10300_10800
863206	contig_5400_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_162814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGGTGTTACGAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129361	129750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_129400_129800
863207	contig_6833_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_175123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAAGTTTGCGTGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121629	120640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_120953_121532
863208	contig_7058_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_136024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAACATTTTCTTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168898	168281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_168300_168900
863209	contig_563_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_169759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAATCGGGGCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525520	525954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_525500_526000
863210	contig_7707_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_72126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATAAAGTCTGCCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61958	62627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_62000_62600
863211	contig_12046_pilon	+	322	3	Intergenic	novelGene_83502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATACTAAAATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955084	962405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_955186_955632_955742_962293
863212	contig_6862_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_63763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAGAAAATAGTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229228	229948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_229200_229900
863213	contig_5145_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_131423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAAACCTTACAACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854115	854431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_854100_854400
863214	contig_7272_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_25310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAACAACTGGTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455711	456213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_455700_456200
863215	contig_5331_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_112806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAGCACCTGTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710527	708241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_708614_710374
863216	contig_1301_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_47352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486481	487355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_486500_487400
863217	contig_4364_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_14	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGATCTGATTTTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259111	259948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_259100_259900
863218	contig_821_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_149391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCAGTGACAAACAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141331	140537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_140500_141300
863219	contig_12178_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_156539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGTTATGTTTCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10136	10540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_10100_10500
863220	contig_12178_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_156540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATCTTTTTGGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10490	10732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_10500_10700
863222	contig_11313_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_178006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTATATTTTGTCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10911	9902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11313_pilon_-_9900_10900
863223	contig_16846_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_82901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAAAATAAAGCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443998	443341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_443406_443528
863226	contig_8885_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_115595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCCAAGGGCACATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390215	389368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_389400_390200
863227	contig_7035_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_83537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGACCCCTCTCTTCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753526	753838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_753500_753800
863230	SIRV6	+	255	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	260	-132	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGTCTGTCGATACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1563	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1600_1800
863231	contig_5947_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_101531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATTTGAGAGTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525603	526355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_525600_526400
863232	contig_13744_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_77196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCCCATCCAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767331	766513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_766500_767300
863235	contig_4392_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_117346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATCAAATCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664839	664286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_664300_664800
863237	contig_6028_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_156555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGAACCTAATTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196171	195567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_195600_196200
863238	contig_8357_pilon	+	535	4	Intergenic	novelGene_39694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAGTGGATGTGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248212	261199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_248302_258246_258335_258881_259071_261030
863239	contig_14326_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_120692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAGAGACCAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167394	166809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_166800_167400
863240	contig_13607_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_170190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAACTGAAAAATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251468	251989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_251500_252000
863242	contig_1996_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_131929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAATATAATCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464451	463570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_463600_464500
863243	contig_15277_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_175423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGAGAGAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209922	211034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_209900_211000
863244	contig_6324_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_178007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAATCCTGCTTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32412	31377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6324_pilon_-_31550_32332
863245	contig_14414_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_166500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGTTGCCCAACCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35290	36007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_+_35300_36000
863247	contig_8354_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_24075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGTATCTCCTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116365	115873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_115900_116400
863248	contig_8505_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_173191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGATAGATAGAAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89140	89371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_+_89100_89400
863249	contig_1154_pilon	+	517	5	Intergenic	novelGene_87172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_4	24.0455297300766	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	32	361	920864	923168	FALSE	30	TAAAGAACACGTCGTCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FREAYAAIEKMKQLDKNKQQAVVNQTYHQTPPPTFSFRERITHKSLVYLWFLCSSVALALGALTVWHAVLISRGETSIERHINKKERCRLQAKGKVFRNPYNYGCLDNWKVFLGVDTGR	920695	923324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_920724_920860_920909_921741_921828_922770_922895_923093
863250	contig_13421_pilon	+	490	3	Intergenic	novelGene_166797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	1	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAATAAGAATCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28694	31209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_28803_30378_30429_30877
863251	contig_9114_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_155187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGGAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305155	304788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_304800_305200
863253	contig_846_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_136112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATGAAATTAAATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292957	292509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_292500_293000
863254	contig_17500_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_157916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAGGAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231697	232418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_231700_232400
863255	contig_2093_pilon	-	1058	8	Intergenic	novelGene_152965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	2.50713268211203	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	930	127	1056	1139031	1120908	FALSE	40	GGAAGACCAGATGAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLEDFRDYRRKHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRISNRPAFMPSEGKMVSDIAGAWQRLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERVEHLAEKFRQKASTHETWAYGKEQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYHDAVNVNDRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALERTEKLLETIDQLHLEFAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDMFIVHSIEEIQSLITAHEQFKATLPEADGERQSISAIQNEVEKVIQSYNIRISSSNPYSTVTMDELRTKWDKVKQLVPVRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANAIGPWIQNKMEEIARSSIQITGA	1139157	1120905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1120944_1121892_1122028_1125080_1125264_1128137_1128279_1130408_1130518_1134035_1134187_1136736_1136885_1139004
863256	contig_3948_pilon	-	1123	5	Intergenic	novelGene_53356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCAAGGCGGCTGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695078	1689156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1689407_1692883_1693085_1693473_1693569_1694379_1694495_1694616
863257	contig_16870_pilon	+	281	2	Intergenic	novelGene_155534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGACTGTGGGAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300477	301168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_300518_300927
863258	contig_7049_pilon	+	329	4	Intergenic	novelGene_171432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	54.6321028944216	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	21	309	329	92298	92318	FALSE	10	GACTTCTGTAGCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSPLTLRSVLSPPHFLPGPELAGLLPARGQHGEPRPVQGGRRRGRQAPRTRGVCSVPVERLHEGRCHLCHRHWCSLRPADADTQDIRPERAVPGVVLASRNMVDIVNQ	90387	92318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_90538_90815_90883_91084_91125_92246
863259	contig_10437_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_38354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552542	553047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_552500_553000
863260	contig_15073_pilon	-	446	2	Intergenic	novelGene_172824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAATAAAGGCCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317165	302278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15073_pilon_-_302632_317072
863261	contig_3975_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_54701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138495	1138093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1138100_1138500
863262	contig_7380_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_157521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAATTTGTCCATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164118	164726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_164100_164700
863263	contig_5018_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_47200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	130	357	1595435	1595208	NA	35	TACAACTCTCACTTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVLHTCVLDVIVDYGHRDQAVRARRARGTFLDTGAQVGHCPIPMSRPHRGSEVLRGAMGVPGTRPHSLLTAIKVLVHRLQPAHIIMCVGHQMHVEHVRLHLGAHLHRDPKHTHTISEA	1595564	1595064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1595100_1595600
863264	contig_4989_pilon	-	799	4	Intergenic	novelGene_160788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	6.16441400296898	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	217892	105093	FALSE	45	CACAGAACTCACGGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSARGALLALLGGPRCRPSRPDGAELSAQPEELATSPHSFKKKAFKKSKVCGVCKQIIDGQGISCRVCKYSCHKKCKAKVAVPCCVPVPWEQVCPLHFFRLLQHLVRGSFFLYSV	217893	104642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_105204_141866_141905_166730_166843_217805
863266	contig_4964_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_157249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCTAACCCGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46243	46596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_46200_46600
863267	contig_3252_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_61476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	18	428	155219	155629	NA	70	ACATTAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FENTFMLVLYVCGGTEMRKQNSEPVEYFTSLQNCSRIAVTIMKLLLITMASVESGLAVLFSFFIKETSFGPRACGPFQFAPHTVVNTSVLQSKVLFLYSGVEFARSQPVIGQMFIQLCLRCFQACLVLSNAYSRAPPVKDE	155201	155982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_155200_156000
863269	contig_4426_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_15405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810188	810516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_810200_810500
863270	contig_6854_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_169491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236239	236801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_+_236200_236800
863272	contig_11413_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_103167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGCTTGGGGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388789	388053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_388100_388800
863275	contig_9099_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_149899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGATGACAGCAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285802	285139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_285100_285800
863276	contig_14184_pilon	-	646	5	Intergenic	novelGene_66608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.6583123951777	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	179	646	176157	163424	FALSE	40	AATTTGAATAATAGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYYRKCIKAVIEQLSKFRPEKDSPEQFLEAESLVLQTLSPLKRAFILEVLSGCLEYQKLLKIVVDAFYVRDGQFCLWADYSLFEVICYLATFQLEELGFQLFCEIIKSQPPDKMRKIPITSNYQCILTACSINFKLQKLVKIFNFYIFDLSCWYI	182886	163423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_163541_167521_167617_168605_168751_176046_176184_182734
863279	contig_20360_pilon	+	369	2	Intergenic	novelGene_178008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	7	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAATTTCGTATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7803	10641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20360_pilon_+_7920_10388
863280	contig_7362_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_147562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483902	484300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_483900_484300
863281	contig_8617_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_73493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATATAAATATCCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63867	63547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63500_63900
863283	contig_2455_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_119213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAGAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355548	1355881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1355500_1355900
863284	contig_11304_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_156715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGCTCGGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417805	416654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_416700_417800
863285	contig_11396_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_71421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTCACCGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702710	1703140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1702700_1703100
863287	contig_14501_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_172027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94576	93638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_-_93600_94600
863288	contig_4352_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_178009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTCTTTGTCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976974	973104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4352_pilon_-_973157_976617
863289	contig_11248_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_142555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGATATTCTAGATAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301451	300895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_300900_301500
863290	contig_709_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_57526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469942	1470495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1469900_1470500
863291	contig_7895_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_154465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGGTAAAATTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916826	915955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_-_916000_916800
863293	contig_11816_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_98503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATTCTAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593018	592481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_592500_593000
863296	contig_12672_pilon	+	875	9	Intergenic	novelGene_141485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	55.2707822904652	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	20	532	165017	180956	TRUE	45	CAGGATATTGCAGATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRRQAMKEMSIDQAKYQRWLIKNKMKAFYAPVHADDLREGVQYLMQAAGLGRMKPNTLVLGFKKDWLQADMRDVDMYINVFHDAFDIQYGVVVIRLKEGLDISHLQGQEELLSSQEKSPGAKDVVLSVEYSKTSDLDTSKQSGEKTVKDEEEDGKTPTQPLLKKIQRPCCAFKCS	164997	186002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_165140_170271_170379_173874_173955_176161_176282_179440_179487_180919_181043_182453_182566_184428_184516_185944
863298	contig_10235_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_46537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTGATTGCCAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365757	366225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_365800_366200
863302	contig_10627_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_60051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAATTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168949	1168634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1168600_1168900
863305	contig_5744_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_149336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTTTTAAATACCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638280	637502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_637500_638300
863306	contig_2799_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_85606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTTAGTCTCTCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805463	804739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_804700_805500
863308	contig_12923_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_30202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACTGAATGGGGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566130	565846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_565800_566100
863309	contig_4103_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_52010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCTCATTGAGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353622	354042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_353600_354000
863310	contig_12543_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_168368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAGAAAAAAAATCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232893	232283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_232300_232900
863311	contig_3601_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_132958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGTATTAATATAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481274	480511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_480500_481300
863312	contig_1264_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_161300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	196	378	126583	126401	FALSE	20	CCAAGTTCCCAGTCACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILSSPLEGRFHENRSPVCSLQNDAWRTVDGDEVGKEVQVPGGEDESEKDLALPRDACSQRGQETMRTKTPRPTHIPEAQNLELEKPRECPLHLMKTPCPGQLSLSWGQETHAFPLDHLSRRSSH	127192	126359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_126691_127104
863314	contig_15613_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_147210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAACAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146824	147179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_146800_147200
863315	contig_19727_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_169007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCACTTCTAGTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50622	50146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_50100_50600
863317	contig_3832_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_161476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTCTTTATGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433927	433218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_433200_433900
863318	contig_16578_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_148662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCTGGAGAAAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212747	212260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_212300_212700
863319	contig_16103_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_118756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATGAAGGTCATGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436721	436996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_436700_437000
863320	contig_6599_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_175999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTCTTCCCGGAGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262713	262453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262500_262700
863321	contig_4339_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_146095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116580	1115929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1115900_1116600
863322	contig_13715_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_177744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCATTTGCCGGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13715_pilon_+_0_500
863324	contig_10765_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_122946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCGTGCAAAGAGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291956	291293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_291300_292000
863325	contig_6576_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_42368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115568	1115311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1115300_1115600
863326	contig_2757_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_164573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAGAAGAACAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101213	100543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_100500_101200
863328	contig_15267_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_151072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATTGAACAATATCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53495	53920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_53500_53900
863329	contig_7444_pilon	+	1070	1	Intergenic	novelGene_174926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGCCAACACTGAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64054	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_64100_65100
863330	contig_6503_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_145747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.78535710713571	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	61	567	108929	115086	FALSE	70	TAAAAATAATAAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWLISNSFAVNRLEAVTLASMLMEENFIRPVGIRSMGAIRSGDLAEQFLDDSTALYTFAESYKKKINPKEEISLSTVELSGTVVKQGYLAKQGHKRKNWKVRRFVLRKDPAFLHYYDPSKEENRPVGGFSLRGSLVSALEDNGVPTGVKGNVQGNLFKVITKDDTHYYIQASSKAERAEWIEAIKQLT	108868	115506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_109043_109696_109799_111752_111837_114077_114157_114958
863331	contig_9875_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_154415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	249931	250230	NA	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVQAPYHLLAPALRAARNGGDHRGSRVGLQPLADFQGGAVDDQQARPVAVPDLGATVDHLHSPHRIGVLSHVLVRDAEHGPVGCVGAQVAAAVVWGAP	249930	250438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_249900_250400
863333	contig_9900_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_159504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGGAAAAGAGACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52662	53275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_52700_53300
863334	contig_14315_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_178010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	90	506	12985	12569	NA	5	GTCACCCTTGGCCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSKLSGSFNLDAFSSIKIPRRNQGHASLMPLYSSHSGIWSVSSKNLQSLPQRSQKPCSSMPTTISASSQLEEELVIHKLDPLPHDKLPEGTEEKALGRATLSSLVAAGPLGAQGQTSIDLCPVLIPEPSSPSGEALQPGASRVLWLKVIHMDSASEISEEGDLQNV	13074	12171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14315_pilon_-_12200_13100
863335	contig_15354_pilon	-	448	3	Intergenic	novelGene_65730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	92.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAAAACTTTCCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590855	572263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_572527_589605_589716_590780
863336	contig_14300_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_133148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487642	487116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_487100_487600
863338	contig_4114_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_15640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATTTTTGTGTGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567111	566505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_566500_567100
863339	contig_17796_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_33830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90813	91579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_90800_91600
863340	contig_10235_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_46494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGCTGGTGGAAGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222822	222490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_222500_222800
863341	contig_7051_pilon	+	823	1	Intergenic	novelGene_64372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACTCCATTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354450	355273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_354400_355300
863342	contig_10494_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_102174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	175	522	950060	949027	FALSE	20	GCTATCAGTGCCTCGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSFLVKTHSSHRIPNYGQLETQRGTQEACDNQEDGLYSLRAEAQRDQSGPYLAQQLLGTRTHLGTTGGPEREQRKEGHQPALPGGPYHPMSLERRRPTPRSGTQPRLPPGGDF	950234	948954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_949299_949984
863343	contig_3525_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_135144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGGAACAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618157	618990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_618200_619000
863347	contig_19007_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_168440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGATCCTTGGATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22676	21680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_21700_22700
863348	contig_3285_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_153389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAAAATATATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199200	199703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_199200_199700
863349	contig_3382_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_124120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGCTTTTCTCTATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731751	731474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_731500_731800
863350	contig_1331_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_37873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCACATACCCTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336958	337683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_337000_337700
863352	contig_16362_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_161176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCCTCCTGGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428128	428799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_428100_428800
863353	contig_1090_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_131116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGACACTTGCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357776	357311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_357300_357800
863357	contig_2646_pilon	-	999	1	Intergenic	novelGene_69577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTAAATGGAACCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329816	1328817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1328800_1329800
863358	contig_20891_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_178011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGCCCAACGCGACGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68502	67316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20891_pilon_-_67300_68500
863360	contig_14770_pilon	-	395	4	Intergenic	novelGene_169470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	15.1730755689881	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACAACTTCATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60361	41886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14770_pilon_-_41989_52498_52599_60058_60180_60289
863361	contig_8284_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_125688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCGCTAGCGCATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376580	376087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_376100_376600
863362	contig_4413_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_116992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142646	142217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_-_142200_142600
863364	contig_5196_pilon	-	390	4	Intergenic	novelGene_38710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	0.471404520791032	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	46	390	365082	359236	FALSE	60	ATAGATCTGAATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVHAGVVSNILGGQISVVISKGIPYYESSLANNVTSVVGHLSTSLFTFKTSGCYGTLGMESGVIADPQITASSVLEWTDHTGRENSWKPEKARLKKPGPPWAPFATDEYQWLQ	365442	359235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_359421_360410_360452_364963_365098_365412
863365	contig_11574_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_64115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCACTAAGTAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797634	796729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_796700_797600
863366	contig_5361_pilon	-	530	2	Intergenic	novelGene_167216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	182	529	501992	501645	FALSE	25	TTGTGTACCCAGCTGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEEDLFSSGFDLFGEPYKTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKDLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQTPINKNEPSFLPEQKNRMIPPHQDNTQPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPDWPRDSPNPSTVPASQASNQPSKMQTSTQDQPQARLEDF	511672	501643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_502053_511551
863367	contig_10489_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_165631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTACAGAGACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313238	312296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_312300_313200
863372	contig_7411_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_137045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	874687	875022	NA	60	TTACAACAATAGTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETPACGPSRALGRAVRAGWAAAAEWGTGWRGAQGRGQGAAESSQEFAAVSATPPSGAAVRIAVRTTGLQQGHWQEAAWQGAVAAGCAGWRHSAQVAPWKGRTAADSASAP	874686	875490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_874700_875500
863373	contig_19633_pilon	-	388	2	Intergenic	novelGene_177287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAGGTGGAGGCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6845	6347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19633_pilon_-_6425_6534
863374	contig_9785_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_157892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211257	210826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_210800_211300
863375	contig_14450_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_49054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	15	302	1383575	1383288	NA	80	GGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALHMGRGTRLQPGLIWCFWLHSALSHIRHSADVNGAHEELKKEAAFHVDTGANCLMTDLCVRVCVWLCVLKGVRLRSTGFFRGTLGFLCKRVLPFAQC	1383589	1383068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1383100_1383600
863378	contig_8712_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_58801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311224	312208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311200_312200
863379	contig_14640_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_168041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAGAAAAAAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151629	152592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_151600_152600
863380	contig_10482_pilon	-	264	3	Intergenic	novelGene_152801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAACTGAGGGACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77998	7785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_7903_64577_64642_77915
863381	contig_6462_pilon	+	539	4	Intergenic	novelGene_176345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	3.29983164553722	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	173	538	83330	111178	FALSE	55	AAAGAGAAATTACAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFLAHCLCYGNRDYKLVLLCRGDKTDRIQSLPVPAHLENPGRTQLQKAQRQQAKPFMTLDHQILNQTLKRSHLPAASGSLPVRHGHVSPDSGAGLTGRPLTKLLTLGEEDDNVEWHMEDVIEDIIGMESSFKEEGTDSPMLIQRTLSGSILDVYTGEQGISPANMGLTSASCPSSLPR	54933	111179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6462_pilon_+_55034_83257_83510_94166_94254_111079
863382	contig_9705_pilon	+	400	2	Intergenic	novelGene_41745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTGTCCTGGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450114	450936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_450631
863384	contig_5413_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_168096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430827	431362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_+_430800_431400
863386	contig_990_pilon	-	532	4	Intergenic	novelGene_76053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	26	481	919484	898591	FALSE	25	TCAACAGTAGTGTTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPLCLPVMLLLLPLLPDLGPRPGAASRKSHVHRRGLLELAGTLQCASTLSALAYISYGCHCGLGGQGQPRDTTDWCCHRHDCCYAVAEQAGCRPKLDRYSWKCMDKRVVCGPAEDKCQELICKCDREAADCLARAEYNIQHLFYPYFLCGKDSPKCDS	919509	898539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_898737_914066_914174_915827_915979_919432
863387	contig_5954_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_28535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAATCACTCTGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491902	491194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_491200_491900
863388	contig_12425_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_46704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGAATCGACTTAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205369	205729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_205400_205700
863391	contig_11396_pilon	-	565	4	Intergenic	novelGene_71422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.8730042868667	44	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	37	555	1754254	1744024	FALSE	30	TGAAATGCAGTGGCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLPSRASDPEAMLPFEPVAMVPARLFSARWQTALEGVGRWTPPTRLVLRPSQLLQPTAKLLSVSCASCAKRQESPRKKLLSEKKLKRYFVDHRRVLVRGGDGGHGASCFHSEPRKEFGGPSGGDGGQAGTRPPAAELVAPSRDRTPAAEPVAPSEDRAASTSSRYSGVWAPAEGRGFSGLLHK	1754290	1744013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1744200_1747592_1747714_1750092_1750297_1754236
863393	contig_17158_pilon	+	622	2	Intergenic	novelGene_141138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTGGTTTTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8011	19527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_8154_19047
863394	contig_8626_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_174857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCACTAAAAATAAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27106	27870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8626_pilon_+_27100_27900
863395	contig_13697_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_165910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	201	106	306	79977	79777	NA	15	CGCCCACGGCACGCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRCHRGPTARHPSSPCGVKHSPTRETLTYAQAQRMVEIEIEGRLHRISISDPLEIILEDDLTAQEMSECNSNKENSERPPVCLRTKRHKNNRVKKKNETPP	80082	79774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_79800_80100
863396	contig_12761_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_164062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTAAAACAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287786	288510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_287800_288500
863397	contig_3797_pilon	+	305	2	Intergenic	novelGene_120112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACATGTTTGATGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544433	546759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_544650_546670
863399	contig_14814_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_137746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAGAAGAAGAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398967	398395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_398400_399000
863400	contig_11816_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_98443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATGGAAAAAATAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292423	292862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_292400_292900
863401	contig_9391_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_178012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGTTTTAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20429	20055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9391_pilon_-_20100_20400
863403	contig_5588_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_172842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAAGGCCTGGAGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044063	1044757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_+_1044100_1044800
863405	contig_7457_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_31588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932888	932644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_932600_932900
863407	contig_7775_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_37455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTCCACCCACCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46162	46856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_46200_46900
863408	contig_16951_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_98662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATTTTTGAGATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110112	110738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_110100_110700
863410	contig_18671_pilon	+	498	2	Intergenic	novelGene_150004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTTCTCCACAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78143	82649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_+_78600_82607
863412	contig_10864_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_107065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	26	298	832846	833118	NA	50	GGTATACAAAAGAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGSAGAKMSFVAGVIRRLDETVVNRIAAGEVIQRPANAIKEMIENWYRKGRAGLPYRLQRRVLRTPTVAAKCRGPRVSAFHLAGTGCFLGALARGSL	832820	833820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_832800_833800
863415	contig_1686_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_165600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTTTTAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322811	323009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_322800_323000
863416	contig_740_pilon	+	241	2	Intergenic	novelGene_158944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	0	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGCCACTGAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199893	201980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_+_200013_201858
863417	contig_13547_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_104890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAATTGGAAAATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116683	117232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_116700_117200
863419	contig_2455_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_119237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479100	1478462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1478500_1479100
863420	contig_18299_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_135347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTCTAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59837	58876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18299_pilon_-_58900_59800
863421	contig_17860_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_169238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATCACCTTGTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41891	42651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17860_pilon_+_41900_42700
863424	contig_10106_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_73854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGCCACCTGCAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55579	56258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_55600_56300
863425	contig_9516_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_106166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGGAAGGTGAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837869	838341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_837900_838300
863427	contig_6497_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_35602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTCCAGAGAAACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497705	496554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_496600_497700
863428	contig_13481_pilon	-	841	7	Intergenic	novelGene_119569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.52752523165195	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	377	766	1610509	1602409	FALSE	20	GTCAATCTACCTGCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMTSTDYSLSDLSQSSSHAQCFPNSSYHALACGGPATSQASTLDRNSPTKLSNRSLDRDTAGWTPYSYVNVLDSHFQISALEARYPPEDFYIELRHLSRPAEPHSQGACGMDRRQNTYIMDKGFKDAN	1612275	1602333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1602420_1602685_1602743_1605232_1605335_1605907_1605975_1608682_1608802_1610475_1610714_1612103
863430	contig_13657_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_174398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCAACACGTCCAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100083	100561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13657_pilon_+_100100_100600
863431	contig_4131_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_127887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCTCTACAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252078	251457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_251500_252100
863433	contig_13224_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_104119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAACGTTTTCTGTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368064	367513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_367500_368100
863435	contig_1150_pilon	-	151	1	Intergenic	novelGene_61428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309081	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309100
863436	contig_5988_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_16154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGAGCCAGAAGGGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1962331	1961739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1961700_1962300
863438	contig_10753_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_105152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	435	767	365289	365621	NA	45	ACAAACGAATAGAGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIAVSSVMAPNRKVSRCPSTTEWINTSCYIHTIEYHKALCMNLNYKMSLMNIMLIERSQTQKITYYVILFTNRTKAGKKQIHGDGNQDGGFPWWGVMIRRRHRRGSGSW	364854	365750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_364900_365800
863440	contig_10596_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_173591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	222	587	803268	803633	NA	20	CTTCTGTATTATCTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLYIALSRKPKAFQKCWLLSSTIDNITQSTSLTANVFLRFSSGHTAFTVKNLQPRMQRNKNSTEKRQRMQTVQGQDSQQMNDEHENVPLHSDLSANQKANKMPLFTARRVGMTQSANSSC	803046	803815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_+_803000_803800
863442	contig_6795_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_27715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTTCCTCAGTGACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144575	144170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_144200_144600
863444	contig_14681_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_134202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAATGAAGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45580	46323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_45600_46300
863447	contig_11518_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_109130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290540	291185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_+_290500_291200
863449	contig_299_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_129487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCTCCGATTTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419993	1419391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1419400_1420000
863450	contig_1008_pilon	+	225	2	Intergenic	novelGene_121589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTGTTACTGCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701797	717303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_701820_717100
863451	contig_8045_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_35469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGACAAGGTTATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567309	568058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_567300_568100
863452	contig_3077_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_26837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGGAACAACAAATGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557639	557097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_557100_557600
863453	contig_5419_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_15559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552879	552572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_552600_552900
863455	contig_3601_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_132982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACTCTTTCGATAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190786	1190082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1190100_1190800
863456	contig_12638_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_33267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCAGAGTCCCCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832978	833667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_833000_833700
863458	contig_7887_pilon	+	221	2	Intergenic	novelGene_124930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCTGTCTCGTATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577970	586728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_578050_586586
863460	contig_12837_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_57391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGATAATATGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399158	398717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_398700_399200
863461	contig_6005_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_158896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTAGGGGGGTTTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323679	323132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_323100_323700
863462	contig_6914_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_151727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTAAGGTAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119627	119082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_119100_119600
863463	contig_9682_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_125314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTTCTGATTATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506902	507517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_506900_507500
863465	contig_14516_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_153950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406949	406659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_406700_406900
863466	contig_1107_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_126598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGGGAGTGGGAAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865591	866379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_865600_866400
863467	contig_10451_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_138313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTGATTAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170648	170174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_170200_170600
863469	contig_6270_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_99852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457495	457085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_457100_457500
863470	contig_9186_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_85359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCATGTGTATTATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621637	622327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_621600_622300
863471	contig_990_pilon	-	510	3	Intergenic	novelGene_75997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCGTGGGCCGAACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219170	205039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_205299_206722_206905_219101
863472	contig_14275_pilon	+	587	5	Intergenic	novelGene_162883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.30919014539883	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	189	587	485135	591856	FALSE	50	CTGGAAAGGGAAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLARLQGRSAIVGNQYYFRNNVADEFRKQENDAAVKIQSWFRGCKVRAYIRYLHKKVTIIQKWWRGYLGRQQYQLTVKIQRRWRGYRIRKYCFNYYYLKEYLRAVSETNDAIREALEEFAEMKEREEKKTV	484946	591856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_485203_503456_503547_506173_506256_546845_546950_591801
863473	contig_12654_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_129249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGATTTGAACTCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8608	9628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_8600_9600
863475	contig_678_pilon	-	476	2	Intergenic	novelGene_167817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	0	2804	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCTTTTACTTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130498	129746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_130118_130393
863476	contig_20731_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_151593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAATAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26587	26911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20731_pilon_+_26600_26900
863477	contig_7593_pilon	+	623	4	Intergenic	novelGene_127326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATGGCAAGAGCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532362	622393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_532642_532797_532925_605926_606043_622292
863478	contig_1339_pilon	-	302	3	Intergenic	novelGene_163129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGGGCCATGCCTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428330	422536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_422687_427939_427964_428202
863479	contig_13749_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_156340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAGGAAAAAAAAATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233227	233869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_+_233200_233900
863480	contig_18850_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_142400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTTATTTGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25313	24917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_24900_25300
863482	contig_16883_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_161718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTCCAGCAATTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153390	152342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_152300_153400
863483	contig_9997_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_169477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAACAAAACGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132885	131961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_-_132000_132900
863484	contig_4336_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_152349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAATGTGGAAGCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244700	243894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_243900_244700
863485	contig_15325_pilon	-	673	2	Intergenic	novelGene_157160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66817	64944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_65530_66729
863486	contig_6217_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_109583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAATGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195007	194667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_194700_195000
863487	contig_15114_pilon	-	1153	2	Intergenic	novelGene_121181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAAATTTTACTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684220	682414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_682653_683305
863490	contig_11396_pilon	+	412	4	Intergenic	novelGene_71323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.0640800023075	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	176	412	464906	472935	FALSE	15	GCGTATTTCCTAACCGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVYPITCGDSRANLIWRKFVCPGINVKCVQYDEHVISPKEFVHLAGKSTLKDWKRAIRMNGIMLRKIMDSGELDFFQHDKVCSNTCRSTKIDLSGARVSLSSPTSAEYIPLTRAGGAPSHFVRHFVSTCLAFWFQIK	460507	472935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_460599_464821_464926_465823_465964_472858
863491	contig_6488_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_44728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50038	50518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_50000_50500
863492	contig_7760_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_138429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGCAATTTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21632	22030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_21600_22000
863494	contig_12464_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_68641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTAAAAAGTTCTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90327	89893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_89900_90300
863495	contig_14522_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_147328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAATGAGGGAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117868	117132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_117100_117900
863497	contig_12644_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_44579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTCCCCCTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2068725	2068271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2068300_2068700
863498	contig_6929_pilon	+	220	1	Intergenic	novelGene_139425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132096	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_132100_132300
863499	contig_10531_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_114529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGCAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454196	454850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_454200_454800
863500	contig_10196_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_132087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTCAAATAAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906052	905677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_905700_906100
863501	contig_5791_pilon	+	425	2	Intergenic	novelGene_35874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAGTTGTATGAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112061	1113052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1112117_1112682
863502	contig_2365_pilon	+	413	2	Intergenic	novelGene_103736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	0	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACATTTTTAAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116791	130482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179
863505	contig_9921_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_23755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	295	411	299494	299610	NA	35	GAAACTGTGCTACCGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAWSCSGRAAPAGGCPRQGLASVASSSAVQVSARPPPLKVPRCGALSEPRALPSGVCTRRAALKYLRRGRRRGADRCPDPVLPSPPSLVVPPSTYAPRMGGPGETLRDRATTFQRLLPGFGKLQRAPAACVSRAVR	299199	300280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299200_300300
863507	contig_7308_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_159586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCCACCTCGCCCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163587	162950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_163000_163600
863508	contig_5260_pilon	-	365	1	Intergenic	novelGene_144394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGGTGTGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433480	433115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_433100_433500
863509	contig_15264_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_158878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATGAACCAGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132976	132103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_132100_133000
863510	contig_9097_pilon	-	484	2	Intergenic	novelGene_173580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAACATATAAGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212962	212231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_212576_212822
863511	contig_7057_pilon	+	450	3	Intergenic	novelGene_123375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	3	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	252	308	1129366	1129422	FALSE	30	TAATTGTTTGGCTCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVRASSYWQQGRGRRRLRLEPGSELGPEPFLQRLKQHLLWTLECIYSGTQKRINKYIQLKKSHGPWVGDVQRCSYRCLSGGVGMPGSCTEEFVQRCHVREL	1119075	1129564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1119183_1121265_1121357_1129312
863512	contig_3386_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_34497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGAGGTGTTAAGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398756	398964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_398800_399000
863514	contig_4754_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_35987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAATTTTGTTACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526680	526036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_526000_526700
863515	contig_12689_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_145049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCATACCTTGTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177406	178142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_177400_178100
863516	contig_9839_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_88579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGGGCAATAGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331154	330237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_330200_331200
863517	contig_10766_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_151191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTCACCTCCTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115300	114664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_114700_115300
863521	contig_12540_pilon	-	452	2	Intergenic	novelGene_148087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975871	948830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_949262_975850
863522	contig_5461_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_156816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAGGAAAAGCCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238258	237843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_237800_238300
863524	contig_13498_pilon	-	591	3	Intergenic	novelGene_176525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	70.5	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTGTGGATATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150658	128176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_-_128459_149727_149872_150493
863525	contig_12010_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_160941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGTAAAACTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159495	167262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_160069_167170
863526	contig_7720_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_155744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCGTACGCACGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258530	258967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_258500_259000
863527	contig_6873_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_129852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTAGATTGAGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825008	825250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_825000_825200
863528	contig_11602_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_166604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTAGAAAAGATATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300770	296152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_296320_300062
863529	contig_9995_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_47826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTCCTTATACAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930939	931247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_930900_931200
863531	contig_3818_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_99278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCTGGCCTGAGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694888	695239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_694900_695200
863532	contig_8942_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_143194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGACTTCTAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310667	309907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_309900_310700
863533	contig_16643_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_158135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATTATAAAAGAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306750	305860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_305900_306800
863535	contig_9799_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_145572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGATTATTTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115651	1116231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1115700_1116200
863536	contig_6885_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_83687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCCAAGAGAACAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252818	252327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_252300_252800
863537	contig_401_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_42911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGCAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1929774	1930345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929800_1930300
863538	contig_10159_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_30874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAACAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967864	967177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_967200_967900
863541	contig_5954_pilon	+	402	2	Intergenic	novelGene_28574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTCAGAGGGGGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893930	898136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_894055_897858
863542	contig_5684_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_80996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACCCTAAGGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145655	145460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_145500_145700
863543	contig_11321_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_86653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGGAAGGATCTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158150	157684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_157700_158200
863545	contig_12125_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_76225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTCAGAGGCCTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384443	383989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_384000_384400
863546	contig_12125_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_76224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCACCAGGTGTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375075	374873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_374900_375100
863547	scaffold_13505_pilon	+	658	2	Intergenic	novelGene_111397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	101	658	202527	203084	FALSE	25	AGGATCATGGCCACTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSKTSGCGCLPGVVGGQSPARVPSLFPPPPPGMALPGPTPAPGWEEDECLDYYGMLSLHRMFEVVGGQLTECELELLAFLLDEAPGAAGGLARARSGLELLLELERRGQCDESDLRLLRQLLRVLARHDLLPHLARKRRRPGTAEPEGEPEGDRRACLLPLAPPPSGSHGALIQTVRDQTTCVPSHSLLLPEYQQDTLEGGGMVLEQVSLWNLATSVI	201811	203084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_201873_202487
863548	contig_9552_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_167940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGTTATTTATATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161417	162587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_161540_162108
863550	contig_9406_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_136183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTGGTGCAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433781	434529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_433800_434500
863551	contig_20878_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_173439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTCATTAAAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15002	14117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_14100_15000
863552	contig_6283_pilon	-	631	4	Intergenic	novelGene_100207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	334	630	609858	609295	FALSE	5	TTGGATTGGCTGCCCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSVTGTELRIRHFLERPLVATLGNCVASWSLGELGPGSSRAALGCCSPSNRDLRCCNSWACRRLAFHSWRMTTSHCCTVVGFRRCGGQAYQGGHRPA	610191	609293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_609414_609480_609563_609636_609693_609818
863553	contig_4876_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_137902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAGAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406442	406014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_406000_406400
863554	contig_20610_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_67655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104575	105064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_104600_105100
863560	contig_3449_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_73718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAGGACATCAGAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470849	469644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_469600_470800
863561	contig_7357_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_36910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTTTAATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435654	436305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_435700_436300
863562	contig_5690_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_119682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCAGTTCCGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327865	328784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_327900_328800
863563	contig_10013_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_125078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGGGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467904	468573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_467900_468600
863564	contig_19012_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_159479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAAGTCAGCAACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39819	38714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_38700_39800
863566	contig_7254_pilon	+	491	2	Intergenic	novelGene_145833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTAGTGTAAATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22341	30708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_22404_30279
863567	contig_5434_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_74643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTTCCAGCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39577	38637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_38600_39600
863568	contig_7594_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_55414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCAATTTTCTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518994	518188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_518654_518919
863571	contig_12340_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_122115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAACAAACTAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142552	141985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_142000_142600
863572	contig_14522_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_147343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATGCTGCAAGAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189986	189545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_189500_190000
863573	contig_13021_pilon	-	823	5	Intergenic	novelGene_8104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGCATTGGAAAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120423	112008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_112031_113885_113949_115565_115653_117780_117865_119856
863574	contig_5331_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_112786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	131	319	255184	255372	NA	80	CGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCILVGWEQDGKKELKQLSFLISRPFEGTEFLLFPGPGNECPNMYFLPGCWQREISNYLFKLGWPSSGCPEHTLLLWAGKGSGSSCRTNKPASLLTLIHLELPGS	255053	255623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_255100_255600
863575	contig_16098_pilon	-	614	3	Intergenic	novelGene_45900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATACAGCAGCTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294928	282620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_282915_283190_283341_294758
863576	contig_17615_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_178013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATGAAATGGAAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10075	10902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17615_pilon_+_10100_10900
863579	contig_262_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_140609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTGATGGGAATGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5886	5099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_-_5100_5900
863580	contig_2010_pilon	+	938	1	Intergenic	novelGene_176268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAATGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176933	177871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_+_176900_177900
863582	contig_12925_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_178014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGTTGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84368	83630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12925_pilon_-_83600_84400
863584	contig_18113_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_137526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATGAGCACCAGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106749	105937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_105900_106700
863585	contig_9189_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_165117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCTGAACAAATATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308433	307845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_307800_308400
863589	contig_11160_pilon	-	236	2	Intergenic	novelGene_168803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCACTTGAGAGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297456	283917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_284074_297376
863590	contig_6589_pilon	+	440	4	Intergenic	novelGene_25949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	30.4010233745876	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	26	439	1287530	1289948	FALSE	15	GGGTGAGGCCTCCAACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPTSSEQIMKTGALLLQGFIQDRAKRMGGATPELALERVPQDPSTKKLSECLKRIGDELDSNLELQRMISAVDTHSPREVFFRVAAEMFSDGNFNWGRVVALFYFASKLVLKALCTKVPELIRTIMDWTLDFLRERLLGWIQDQGG	1287504	1289949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1287559_1287645_1287793_1288282_1288419_1289846
863592	contig_10404_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_138646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATCTCTCAATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585677	578630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_579250_585654
863593	contig_9113_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_68597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAATAATTTTCTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352215	351482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_351500_352200
863594	contig_17346_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_178016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAGAGCTTATGCGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2577	3313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17346_pilon_+_2600_3300
863595	contig_10855_pilon	+	564	2	Intergenic	novelGene_124281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	18	57	359	415	47252	47308	FALSE	25	GCAAAGTCTCGGACTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAADVRDPQHRPLSPGHHRHHPPAPCPRAAGLLRGGRHREARPRVPGGGWVTPSAAPEQRPLPSPQICSLLRGGIAERGGVRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAHSEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL	46811	47457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_47155_47236
863596	contig_13854_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_154127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTTGTTAGTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773816	774116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_773800_774100
863599	contig_3700_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_138075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGTAGGCAGGGAATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213299	212982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_213000_213300
863600	contig_3269_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_117011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCTCTAGTTATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64054	64749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_64100_64700
863601	contig_13542_pilon	+	548	2	Intergenic	novelGene_131551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCTGAGGTCATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610364	611159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_610567_610813
863602	contig_5917_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_122176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATAATAAACAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790085	790404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_790100_790400
863605	contig_5539_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_104761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGCAAACGGTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148973	149360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_149000_149400
863606	contig_5229_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_117686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	20	334	396383	393185	FALSE	10	GCTGGGCTTTGCTTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVTEHMASHGTQFLRGCTPLQVRRLPDGHLQVTWEDRASGRQDTGTFDTVLWAVGVSDNRLGTRRAEDFLSADVPITALSEDSQPAQGSNSPREVNQLWPECDWDGASD	396402	393152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_393352_396235
863607	contig_20259_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_178018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTTTTGTATTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53856	52000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20259_pilon_-_52241_53747
863608	contig_15939_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_160248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTGCCACCTACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20976	21437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_21000_21400
863609	contig_9415_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_109876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTAACTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2029557	2029093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2029100_2029600
863610	contig_9091_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_32450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTCAGACACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230588	230297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_230300_230600
863611	contig_12644_pilon	-	362	3	Intergenic	novelGene_44441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAAGATGCTTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337925	334482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_334538_335124_335352_337845
863612	contig_2799_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_85488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTAAAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535644	535177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_535200_535600
863613	contig_9333_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_120341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501638	502884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_501600_502900
863614	contig_10734_pilon	+	598	1	Intergenic	novelGene_51045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGGGATACAGCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401621	402219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_401600_402200
863615	contig_9297_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_69857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823258	824220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_823300_824200
863617	contig_13074_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_153411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCATTATCCTCGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139816	139244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_139200_139800
863620	contig_5586_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_143601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653249	653886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_653200_653900
863621	contig_500_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_30979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463113	1463565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1463100_1463600
863622	contig_14643_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_99123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATTCCACTGCCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28764	29404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_28800_29400
863624	contig_2903_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_148990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATTTCTCAGTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243628	244315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_243600_244300
863625	contig_835_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_152143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCTTTTTTCCTGTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108441	108081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_108100_108400
863626	contig_835_pilon	-	158	1	Intergenic	novelGene_152141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGGGATCCCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108132	107974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_108000_108100
863627	contig_12993_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_136722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGGCCAAGGTCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39330	38701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_38700_39300
863629	contig_17964_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_33906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCATCTTCCAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368732	367534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_367500_368700
863630	contig_14871_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_63685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCTTGGGCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161549	162218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_161500_162200
863633	contig_5297_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_175662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACCAGTTTTATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34297	33699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_33700_34300
863635	contig_7398_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_166185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTTCCAAATTGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342372	342833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_342400_342800
863636	contig_8263_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_83074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGACTCCCTTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61998	61352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_61400_62000
863638	contig_15327_pilon	-	347	3	Intergenic	novelGene_70577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCATCGTTGTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808165	806318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_806403_807261_807406_808046
863640	contig_15327_pilon	-	150	1	Intergenic	novelGene_70575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCTTTCTCTCAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774197	774047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_774000_774200
863641	contig_9017_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_130334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAATTAAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220913	220522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_220500_220900
863642	contig_8273_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_113096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457286	457917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_457300_457900
863643	contig_1719_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_87257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATATATATTTGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126472	125976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_126000_126500
863644	contig_9982_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_55794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAGCCCTCATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949848	950945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_949800_950900
863646	contig_7050_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_153637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCCCTCCTCCACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828164	828935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_828200_828900
863648	contig_13224_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_104115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCATTAATTCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307447	308149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_307400_308100
863649	contig_6551_pilon	-	563	4	Intergenic	novelGene_155550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.2565175405668	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	273	563	269603	266116	FALSE	45	TAAGTACATTTACAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLKQPRSDGTARQEVRPVALETFSSQSKWRDSGSPGFQCAPPGTGGSLPPVSAPRGTTAGRSTQLRRGSRGPPLVQGVTSTADSRGTKLAMKKNKINTQRSFVNVPNVIVPDIEMEIRRMENGACSSFSDDDDDSASVSEESENENFHSRGSFRKSSHIRRGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQ	341716	266115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_266180_268596_268717_269496_269618_341458
863650	contig_8978_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_49314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCTCCCTGTTCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186557	187139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_186600_187100
863651	contig_9535_pilon	+	752	3	Intergenic	novelGene_124481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTTGAATAATAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303552	306880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_303759_304736_304806_306403
863652	scaffold_7386_pilon	+	679	3	Intergenic	novelGene_136611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.5	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	78	464	421141	422243	FALSE	35	TACATATATTGCTTTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAEDPGEQGSSSSFPKRDLASAREMEDEESEGPLKEQDLKEAYIRLVQGTQEWQDGCTYRGEFGLRTKLGFGEFSWPTGETYRGHFYRDHRHGSGTYTWPDGSSFTGTFYLSHREGFGTMYLKSSLFQVTGAGPLCLGSVQSISRLWGSLFN	420437	422458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_420493_421118_421309_422024
863653	contig_8310_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_75582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCACCTGACCTGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290083	289148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_289100_290100
863654	contig_15325_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_157161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69293	69933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_69300_69900
863657	contig_2414_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_158493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGCATCACACACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327530	328672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_327500_328700
863658	contig_16535_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_167718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTACATCTGAAAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399838	399387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_399400_399800
863660	contig_12884_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_104968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAGAAAACACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7198	7759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_7200_7800
863661	contig_4059_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_140590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGCTTTTAATTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179979	179199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_179200_180000
863662	contig_15307_pilon	-	706	4	Intergenic	novelGene_174783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	11.2644968324772	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAGAAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163304	155781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15307_pilon_-_155829_161809_161926_162608_162880_163032
863663	contig_3187_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_176233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAATAGAAATCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259450	258561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3187_pilon_-_258600_259400
863667	contig_13699_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_158310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCATTACCCACCTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26989	26276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_26300_27000
863668	contig_9189_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_165108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACACATTCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270860	270109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_270100_270900
863670	contig_16362_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_161175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCTACCCAAAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423178	424069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_423200_424100
863672	contig_10023_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_123509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433633	434214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_433600_434200
863673	contig_16948_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_166422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395230	394776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_394800_395200
863674	contig_6724_pilon	+	439	2	Intergenic	novelGene_167984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCAGGGCACAGCCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386340	485863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_386642_485725
863677	contig_10557_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_171920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCCTTGTATATCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16475	16248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_16200_16500
863679	contig_2940_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_81869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTTTATAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220914	219979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_220000_220900
863680	contig_10064_pilon	-	469	5	Intergenic	novelGene_122713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTATAGTTCCCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271828	267148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_267252_267829_267967_268049_268108_268269_268414_271801
863684	contig_2069_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_23230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATGATGAGAACGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251650	250781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_250800_251600
863685	contig_7057_pilon	-	474	2	Intergenic	novelGene_123264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	28	372	572964	571437	FALSE	15	GCATCTCCCATCCGGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRERRRNRMEIPVPVQPSWLRRASAPLPGLSTPGRLFDQRFGEGLLEAELAALCPATLAPYYLRAPSDEHGYIAREFHRRYRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPAPAQSTPPPPAAAK	572991	571334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_571605_572787
863686	contig_4884_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_63797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGGGGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239107	238406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_238400_239100
863688	contig_13526_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_165204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGAACATCACTCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241452	240882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_-_240900_241500
863689	contig_9515_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_73803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCCAAGGATATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46058	46642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_46100_46600
863691	contig_6217_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_109676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTCAAACATTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843802	842841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_842800_843800
863692	contig_8829_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_140947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATGAGAAACTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72231	72518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_72200_72500
863694	contig_9843_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_114343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCACTGTACCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264816	265440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_264800_265400
863695	contig_13607_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_170214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAAGGAAGAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363961	364863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_364000_364900
863696	contig_4442_pilon	+	527	1	Intergenic	novelGene_127955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTTGTGTATTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397013	397540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_397000_397500
863697	contig_6062_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_5281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTATATTTTTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726831	726407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_726400_726800
863698	contig_11126_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_138131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAGTATAAATTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354613	355775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_354600_355800
863699	contig_5586_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_143495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	73	327	146846	149839	FALSE	40	GTCTAAAATCTGCAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGLKEAASSTFKVGFCSAPSTPQEMAPTFLVHPPTRSRANFSTFRLSSTQLAVSRQREHSQPRTPSALDSPQSVVLGNCLWRMRRASSFVRREKKLDKMILKYITISQ	146773	150054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_147049_149787
863701	contig_4496_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_66628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTACCCACAGAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610453	611047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_610500_611000
863702	contig_3560_pilon	-	335	1	Intergenic	novelGene_149492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCACACAGCTCTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172933	172598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_-_172600_172900
863703	contig_17068_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_172576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCATAGAGACGCTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205314	205619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_205300_205600
863704	contig_5832_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_134186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679418	679851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_679400_679900
863705	contig_9972_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_162806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369569	369044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_369000_369600
863706	contig_2371_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_176557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287225	288054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_+_287200_288100
863707	contig_6470_pilon	+	793	2	Intergenic	novelGene_145611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCTGGTCTCTTCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168118	1187148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1168642_1186878
863708	contig_9482_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_44229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACCGTGTGAACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213224	213907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_213200_213900
863711	contig_6445_pilon	-	901	2	Intergenic	novelGene_77134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTAAAGAGTAAATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486655	1484834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1485381_1486300
863712	contig_12644_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_44550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTTTAAGTAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578542	1578238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1578200_1578500
863714	contig_5954_pilon	+	192	2	Intergenic	novelGene_28447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5068	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98675	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_98694_98857
863716	contig_4924_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_84696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACACCATGCCCAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70914	70271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_70300_70900
863719	contig_8964_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_168691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGTAATAACTCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499665	498993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_499000_499700
863721	contig_15360_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_171271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420141	419311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_419300_420100
863722	contig_4364_pilon	-	280	2	Intergenic	novelGene_156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTTCTCTTGGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244207	1237611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1237830_1244145
863723	contig_8177_pilon	+	719	4	Intergenic	novelGene_86514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	170	718	245318	247934	FALSE	60	GGAAAAAGAAAAGGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTHFQDDFLPSCFIILIFLQLLPAVIHGNGNTSFEVIGPDDAILAMLGEDTELSCHLSPSISAKDMELRWYRDNFSDAVFVYEKGEDVYEEQMEEYQGRTTFVRDYITKGKAAVRIHNVTVFDNGTYRCYFKGGTYNREATLQLKVAAFFSGRSWPTVWRISLPLILVALGVVVAGAICVF	244173	247935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_244301_245275_245412_245593_245948_247833
863724	contig_3132_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_127461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAAAGAACCCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451866	451436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_451400_451900
863726	contig_17340_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_177343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAATGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15756	16448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17340_pilon_+_15800_16400
863728	contig_10855_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_124355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	465	815	642025	641675	NA	65	AAATAAAAGAAACTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGRVLSEDPIVFQVNTSKNPLPKIPQYPLKQESKEVLTPIIQDFLAKGLIIPCTSHCNTLVFPVKKRSNHDWGLGQDLNAINCVVVPRFPVVSNPHLFISNVCPEASHFTVVDL	642489	641313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_641300_642500
863729	contig_8879_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_158992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCCATGGCATTGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292829	293455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_292800_293500
863730	contig_15327_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_70819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATTGCTTCACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509319	1508709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1508700_1509300
863731	contig_517_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_171300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGTCAAGGTGATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48819	49176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_517_pilon_+_48800_49200
863734	contig_5423_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_85209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATATATTATGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323414	322511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_322500_323400
863735	contig_3751_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_158636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAACAGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141049	140508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_140500_141000
863736	contig_776_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_139905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTTTTTAATTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327982	327236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_327200_328000
863737	contig_7697_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_128280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGGGTGAGTCTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187775	188629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_+_187800_188600
863738	contig_10446_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_162476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGTATACACCATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719014	719705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_719000_719700
863739	contig_10238_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_170087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAAACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26434	27010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_26400_27000
863740	contig_17519_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_177303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64041	64394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17519_pilon_+_64000_64400
863741	contig_8561_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_161643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAGAAAAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158229	158836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_158200_158800
863742	contig_9014_pilon	+	381	4	Intergenic	novelGene_106808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2677.33652888255	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	3	380	150672	152314	FALSE	30	GTGAAGATGCTTGAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLSFPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAA	150669	152315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150690_150939_151036_151578_151763_152234
863743	contig_11590_pilon	+	387	3	Intergenic	novelGene_125611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	7	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	9	386	894058	921566	FALSE	35	AGTTATACGCTTAGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRVADVVVGEAEQVAGGGLASGSAARGPAVSATLAASRWKLLRQVLKQNHLDDCLRRVSVRRFESFNLFSVTESKKRETEEEVGTWVQYTSVFYPEYSISLRHNNGSLNVEDVLTSFDNTGNVC	894049	921567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_894196_912346_912520_921499
863744	contig_2332_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_58697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTTTCATCAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574484	575069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_574500_575100
863745	contig_7810_pilon	+	566	3	Intergenic	novelGene_144216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCACCTTGTGTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261713	263690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_261899_261996_262035_263347
863746	contig_8554_pilon	+	529	3	Intergenic	novelGene_160277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_2	29	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTTAGATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40412	43796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40486_41396_41458_43401
863747	contig_10861_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_39452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0.5	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	85	420	2600571	2605826	FALSE	40	CACTCTGAGAATAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPYSHTLYFLETARLRPHRFQPDQLRAKMILFAFGNALAQARHLYGNDPKVLEQPVVVQSVGTDGRVFQFLVFQLNTTDLTSSEGIKNLVWMDSDQLLYQHFWCRPVIKKKVLVEPVGPTGFQPETFRKFLALYLHGAV	2600486	2605941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2600625_2603659_2603864_2605748
863748	contig_9705_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_41763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTCCTTTGAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532554	531787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_531800_532600
863749	contig_12080_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_128417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGTCTTGACTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531943	532328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_531900_532300
863750	contig_16766_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_153352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGCAACAAAGACACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105548	106059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_105500_106100
863754	contig_16098_pilon	+	758	3	Intergenic	novelGene_46204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	113	415	711203	711693	FALSE	30	CAGGGAGAAGGCACTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAFRNDSICFPDMPSTRSRSSTWLKGPWSSLQPTMSWAFFWPMRCRLRRSRAEPLFSRSRIFWRPWASSSRLICGSQQSSAFSSGSEASRDSSYEVRGR	711090	712036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_711210_711300_711365_711461
863755	contig_5120_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_169615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249466	250065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_+_249500_250100
863756	contig_4659_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_118218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCGTTCCTGCATTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703710	703217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_703200_703700
863758	contig_5765_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_141414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTTTATAAATAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870862	871453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_870900_871500
863759	contig_3825_pilon	-	611	2	Intergenic	novelGene_77980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCAGATGGGTCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352620	348040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_348513_352481
863761	contig_3948_pilon	+	420	2	Intergenic	novelGene_53352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	168	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGGGATTTGTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1527223	1528088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1527335_1527779
863762	contig_6364_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_51765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATAGAAAACATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901380	900601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_900600_901400
863763	contig_13074_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_153437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCAGTCTATGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459458	460403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_459500_460400
863765	contig_8615_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_165229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAATAGCAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444621	443984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_444000_444600
863767	contig_11186_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_98869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAATATTGCATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234183	233318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_233300_234200
863769	contig_385_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_177044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	237	647	207240	206830	NA	70	AAAAAAAGATAAAGATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPLSLKKSIACSQRGCQQTGAQSEPLLQFMWFLPAHGHSPGRHGTFNTDAGPLAYLQKGFLLLAWALLGKQGSPGKGNTPRETKCCLPGADTGGEKPEDTARTWNVRGGRPRKPLELWGRSMLEAKSQRKVLSC	207476	206414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_-_206400_207500
863770	contig_15673_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_169840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTGTCTTATACAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165569	165161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_-_165200_165600
863772	contig_15559_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_141894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149079	149695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_149100_149700
863773	contig_4754_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_35986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAATAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510600	510013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_510000_510600
863774	contig_8576_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_88717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18633	18138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_18100_18600
863775	contig_8195_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_170049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109534	108720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_108904_108940
863776	contig_6576_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_42241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTACAAAAATAAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287236	286511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_286500_287200
863779	contig_2547_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_165467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTTTATGCCTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444193	445028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_444200_445000
863780	contig_11378_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_112272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAATTGTCCCAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418379	417146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_417100_418400
863781	contig_9698_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_82491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTTCCCCTACCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148020	148779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_148000_148800
863785	contig_10711_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_118433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTGTCAGGGGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767392	766870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_766900_767400
863786	contig_2940_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_81950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAACAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824707	824266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_824300_824700
863787	contig_12080_pilon	+	328	2	Intergenic	novelGene_128403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	675	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTAAACCACCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302872	323948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_302965_323712
863788	contig_870_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_176027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGGGAGAAGCATTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29681	29223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_870_pilon_-_29200_29700
863789	contig_10159_pilon	-	670	2	Intergenic	novelGene_30840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGATATAAAGTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642169	597455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_597913_641956
863790	contig_7398_pilon	-	650	1	Intergenic	novelGene_166150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	184	513	32039	31710	NA	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYHTHNHQHIWNIAPSWKEVMGKCMQGIWEKLLSYVSMLQAFDQDNMKEYIAGKTVHMARTLNLELGITDVEQLTDHKDGELTDQDLMDFEEERNNEEEEEEKLSKIL	32222	31572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_31600_32200
863791	contig_21386_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_177024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCACTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29038	28752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_28800_29000
863793	contig_12229_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_169383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66451	66807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_66500_66800
863795	contig_17829_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_157041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATAAAAGCTTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55734	56197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_55816_55945
863796	contig_13530_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_175570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28059	27785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13530_pilon_-_27800_28100
863797	contig_17560_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_167588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATAAGAGAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149220	149879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_149200_149900
863799	contig_5400_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_162817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251751	252274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_251800_252300
863800	contig_5229_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_117726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAAAGTAGTACCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896860	897318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_896900_897300
863801	contig_12689_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_145029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGGAATGAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39586	38534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_38500_39600
863804	contig_5916_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_158029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	149	316	278679	278846	NA	60	TATTTGAAAAGAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCIHAPQTASEAQKSVGALTCCHQPGLWDSICYSDPETLSTVSVLLLLMDDAGVGILASPFSGLLTRDVEVCMSLRGAWQRKRIMVTPSGLASVPAFESSFRR	278530	279125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_278500_279100
863805	contig_13051_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_140108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141875	142573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_141900_142600
863808	contig_13464_pilon	+	700	1	Intergenic	novelGene_125247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTCTTTTTAATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441730	442430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_441700_442400
863809	contig_10000_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_139351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCCTTTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341701	342685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_341700_342700
863810	contig_5389_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_143019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGTACAGAATCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404984	404567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_404600_405000
863811	contig_5538_pilon	-	475	1	Intergenic	novelGene_23702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCAGCACCTGCTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76373	75898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_-_75900_76400
863812	contig_9216_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_163520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710844	711192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_710800_711200
863814	contig_10446_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_162474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAGAAAAGAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691045	691635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_691000_691600
863815	contig_802_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_178019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTCAGGGCTTATCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47199	46764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_802_pilon_-_46800_47200
863818	contig_9366_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_166277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAGGAGAAAGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049425	1049689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1049400_1049700
863819	contig_2863_pilon	-	228	1	Intergenic	novelGene_174061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGAACAGGCCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23156	22928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_-_22900_23200
863820	contig_10801_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_74049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCATGGAGAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309727	308942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_308900_309700
863823	contig_8505_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_173185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGCTGTATCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20390	19705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_19700_20400
863824	contig_14219_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_54287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAACTGCCTTTACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596457	595981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_596000_596500
863825	contig_17440_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_7673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCCTTCGGTTAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4014	3664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_3700_4000
863826	contig_3818_pilon	+	916	4	Intergenic	novelGene_99329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.16024689946929	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCGTTTTAAAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350696	1353702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1350959_1351784_1351881_1352578_1352770_1353335
863827	contig_16883_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_161767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTGTGTGTCCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697156	697950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_697200_698000
863828	contig_20610_pilon	+	808	1	Intergenic	novelGene_67660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	3	467	118445	118909	NA	35	TTGCTAACGATGTGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSHGSDNWLSLPSKAWTRFRTNPQRRRLQRSPSAPEGSSARPRAARSPGALAEAQPTTRSGSPAEWNATPRTPRLGSWPVPAHAVQVGFPRPSAAAPTLQLSTRACLPGSRDTAALTDLRWQRSRCTAASGLVADTPAGGVRTRARWRLQRREQ	118442	119250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_118400_119200
863829	contig_6418_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_81267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTCCCCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677841	1677349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1677300_1677800
863831	contig_14273_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_21140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTTAAAGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127916	128501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_127900_128500
863833	contig_9670_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_169943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149621	150031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_+_149600_150000
863834	contig_13409_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_128457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	474	545	110849	110920	NA	60	TCGGGGGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IERRPPDSGRGPLILARAPSLSGRALNSGKWELQARFARVWALLSFGTVAQGRRGRDTEKEPGKRRGGESLETELGLGELPQRQSPSRLVALGVRSSRRRLAPPWGARPRLSSRREGLGGGCCVTPGSLGTQLLGYGGQLHRLLPGASCDRDPLCGPMPCADGAHEERDRENKDRVVYIL	110375	110956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_110400_111000
863835	contig_3241_pilon	-	307	1	Intergenic	novelGene_146395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGCTTCTCATGAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774146	773839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_773800_774100
863836	contig_16714_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_161557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCGGCTGTTAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574958	575371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_575000_575400
863837	contig_20429_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_169240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAAAAGAACTTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87589	88177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_87600_88200
863838	contig_10196_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_132195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGATGCGAAAGGACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1160691	1161086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1160700_1161100
863840	contig_8260_pilon	+	632	2	Intergenic	novelGene_163258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGCCCCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206750	209589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_207190_209396
863841	contig_9653_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_48243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827572	827814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_827600_827800
863842	contig_9981_pilon	+	420	7	Intergenic	novelGene_121076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAACAAAAATGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556034	594588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_556095_556883_556924_557011_557060_560508_560564_565937_566006_566461_566556_594533
863843	contig_12626_pilon	-	382	2	Intergenic	novelGene_80471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCCGCCGCACCACGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359439	358830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_359001_359227
863844	contig_8762_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_145287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGGACATACTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70360	70640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_70400_70600
863845	contig_6227_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_49673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAGCAGGAAAGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827694	827366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_827400_827700
863846	contig_9415_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_109728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGAGGTAGACTATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488558	489094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_488600_489100
863847	contig_6842_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_130672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGCTAACCAAAAGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304586	304202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_304200_304600
863848	contig_4232_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_63247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATGTTGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316096	316701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_316100_316700
863849	contig_8295_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_176351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAACAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911064	911430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8295_pilon_+_911100_911400
863850	contig_8453_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_125100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19681	18810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_18800_19700
863851	contig_3424_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_55597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATACAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248896	1249662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1248900_1249700
863852	contig_13300_pilon	+	886	5	Intergenic	novelGene_125823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	804	81	884	277009	278999	FALSE	45	TGACAGACATTAAACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCLADAWNGGSSLLIRGAIPPEVGHMAVRLFSLQVPMPPKVFLSLVYKLEGPTAVTVALELSMGDASSCHISGISALNAETSLRHSTRPLRVPPSKLARSAGRCGQPFGGGWVQRCYEVSLRGCLLQDLFISFSRPLGSRQEETFVCRLGEIQVVDAKSLLSPLAPVQAVTVSHVRWQPAGSEPEGPSAPTWLRLSCTLRWTYPLPQIHCFRIHCRRGPGGDPRGGESPGPEKPVFLGLAFTNQYRVVDLAVAAMAPGRDGRVDFLVQPVPREGFLVPQAEWGRATLLYASPA	276928	279001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_277020_277233_277383_277967_278077_278328_278444_278579
863854	contig_299_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_129502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633520	1633791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1633500_1633800
863856	contig_9708_pilon	-	424	2	Intergenic	novelGene_67287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAGAATGCCGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834741	833684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_833848_834480
863857	contig_11677_pilon	+	457	2	Intergenic	novelGene_85905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGGGGTGAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486800	487370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_486932_487044
863858	contig_1406_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_25619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCGCGTGGCTGCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2586032	2586635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2586000_2586600
863859	contig_10197_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_115184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGAGAACTGTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474775	473512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_473500_474800
863860	contig_3602_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_60532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTAGCCTCAGTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226259	227258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_226688_226969
863861	contig_12464_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_68685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCACAAACAACAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209351	209701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_209400_209700
863862	contig_7457_pilon	+	682	8	Intergenic	novelGene_31305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2.1189138534559	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	16	483	174145	179148	FALSE	0	TTCTCTGTCTCTTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAIMARQHARTLWYDRPKYVFMEFCVEDNTDAHVLIEDHRIVFSCKNADGVELYNEIEFYAKVNSKDSRDKHSSRSITCFVRKWKENVAWPRLTKEDIKPVWLSVDFDNWRDWEGDEEVELAHMEHYAELLKKVSTKRPPPAMDDLDDDSDSTDAKGT	174129	179347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_174153_174564_174679_174796_174864_174969_175069_177550_177641_178351_178406_178898_178927_179140
863863	contig_9389_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_84155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAACAAAAGGCTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1878827	1879570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1878800_1879600
863864	contig_7051_pilon	+	339	2	Intergenic	novelGene_64285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTGTGATGAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184028	187716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539
863865	contig_7816_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_66531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	54	458	220572	220168	NA	40	AGACTCATGGAATGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAPAPQAVGRLEPTSKMLYYSQTLQNLMSPRLEGFRGLGSGTGYVKCYFLHGETHITLLHTPSKQRTFGGEWEGQLWPQLCRRGVGRSRRREGSGRERSAWASHHSGAACPISPASSQSTQPLHDDRSPGEICVRFVVIVDIMQMSVSWL	220625	220051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_220100_220600
863866	contig_6550_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_110662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGGATAGAAAATAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97167	96049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_96000_97200
863867	contig_15071_pilon	+	630	4	Intergenic	novelGene_178020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	163	630	5889	16472	FALSE	55	TCTGCAACAACTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIDSFTVPKKQTPFLASEAAVIGEGEDYFHSLFGDSEKLNTCSSHLEKTWKHFSMILDEVGHFRSSALGHIKIVDVNANGLFVRLINSSRDKEMEIGDHILQQNLNGQRVSSYRFLPKIIMQANSTVTVWAAASEAKHQPPSDFLWKEQNKFGTSPNCTTILCKPNGEAIAWYTPIHWKQAWAKLETDIEFDRCSVVTATPQKNMFQWPT	5726	16472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15071_pilon_+_5924_10405_10593_11219_11340_16346
863868	contig_15410_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_130637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTAAGCTGAGGCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232991	233361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_233000_233400
863869	contig_11171_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_48618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTTGCAGCTGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252081	252346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_252100_252300
863870	contig_8900_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_171633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTGTTTGTTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366686	367151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_+_366700_367200
863871	contig_154_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_178022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTGTTCGTGTGCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283221	282527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_154_pilon_-_282500_283200
863872	contig_9721_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_155983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATGTTGAAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86589	85841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_85800_86600
863874	contig_12057_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_131622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCATCTTCATCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21854	22819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_21900_22800
863875	contig_8412_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_118364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTGCAAGTCCTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473732	474244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_473700_474200
863876	contig_7110_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_176017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAGGAGAAGGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134638	134233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7110_pilon_-_134200_134600
863878	contig_7720_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_155784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTGGTATACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806017	806345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_806000_806300
863880	contig_8354_pilon	+	118	1	Intergenic	novelGene_24123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497191	497309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_497200_497300
863881	contig_4519_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_123725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATCCTTGCATTGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726400	726128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_726100_726400
863883	contig_21416_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_172817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24595	25269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21416_pilon_+_24600_25300
863884	contig_91_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_127149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGTATTTAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220189	1220588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1220200_1220600
863885	contig_4131_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_127856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	43	453	138441	138031	NA	40	CCCAACTTTTCAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	138483	137963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_138000_138500
863886	contig_8019_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_126982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91865	92350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91900_92400
863887	contig_10962_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_103927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATAATTAACCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733975	733402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_733400_734000
863888	contig_10453_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_162047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233205	232607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_-_232600_233200
863889	contig_12993_pilon	+	669	1	Intergenic	novelGene_136724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATGAAAAAAAGAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42207	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_42200_42900
863891	contig_7816_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_66572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGAGGAGTTTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606941	607299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_606900_607300
863892	contig_6446_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_149212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAACCCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344270	343733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_343700_344300
863893	contig_13772_pilon	+	566	3	Intergenic	novelGene_176293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4.5	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGATAACTATGTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2823	6145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13772_pilon_+_2877_5128_5193_5696
863894	contig_1339_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_163151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	99	280	378	620854	620756	NA	10	CCCGCCTCGCGGAAGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRTHKCKSPPSHSRKTIRNEGVPAPLPRPSTSSKLGLGRGGQGCESGWLFLLRPLFICPRRGRDALVVPRQLRPGVRGTQGFPQGFGVLALGMAPQRVGLGEAQPADGALVGALPQSGRGGGGPA	621133	620753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_620800_621100
863895	contig_9571_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_136260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTAGAAAAATATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374555	373919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_373900_374600
863896	contig_7088_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_159783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTTTAACCTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631795	631106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_631100_631800
863897	contig_5120_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_169618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCATAGAGAAAATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284111	283638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5120_pilon_-_283600_284100
863898	contig_15248_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_149163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATCAAGTGACTCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256802	256172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_256200_256800
863902	contig_5794_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_69753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAACAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506706	506400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_506400_506700
863903	contig_6048_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_73157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAGAAAGCTCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126367	1127534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1126400_1127500
863904	contig_5894_pilon	+	393	2	Intergenic	novelGene_83063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATGCTCATTGATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703648	721603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_703707_721268
863905	contig_16548_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_167093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	24	341	25728	25411	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTAAPRPMCPGAPCTQVFAEHLNHMMSYFTEHITDVQQRTTVLQKISQQKPCGSQQPDPQPITGMAQDQEVLRSIVLGVAMSRAHSMAANNSNDGRKHALSFPWVWPPTGPR	25751	25096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_-_25100_25800
863906	contig_14300_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_133141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	139	345	424186	424392	NA	85	ACCAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIGFYTWPISLIHTALVATAGICICSPWNSKTSYHCWKLQTEQEALMTKTCQLSLTSFLLHSWGEKEQTSVGCHCHVCVIKSQTRQHSSCRAAEHMAIKEIQRTHIWLIQTTGL	424047	424596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_424000_424600
863907	contig_2114_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_104300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCACAGCGTTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833511	834189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_833500_834200
863908	contig_3285_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_153377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTGCTGGCGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56080	56642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_56100_56600
863909	contig_14599_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_167905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCAGGCCTGGTTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147806	149810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14599_pilon_+_148033_149596
863911	contig_5669_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_86040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	208	591	55435	55052	NA	20	TCTAGTGTTGCTCATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSKTGDRVLLVLVKLFIRTRGGVCPGRGATGLGNQAEGLIWKLEGADPGRRSEEPDPTSKRCPLTVGMGLSKPGQRPGSRATEQIKLSLTGYSLHLVGPPQAVSLGGLPPTGRSRPQRGCGGRNGLSTPLPLDERAPPLGGNGQRACARIASVSSGETGVGTPSPGPPPLTWIRAHPRNHPTEDGIALELYVPR	55642	54927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_54900_55600
863912	contig_10711_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_118468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAAGGAATTTCGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898901	898113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_898185_898394
863913	contig_5936_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_53536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTATTTTTGCTGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31407	30551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_30600_31400
863914	contig_15857_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_152080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGGAAGAACTAACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135398	136087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_135400_136100
863915	contig_15628_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_147688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGAAGAAAATGCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39675	40204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_39700_40200
863917	contig_12293_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_165586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACTTCTGCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11694	10928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_-_10900_11700
863918	contig_18406_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_88055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAGAACAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62110	62599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_+_62100_62600
863919	contig_17753_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_105090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCCTGTTGAGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92001	91085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_91100_92000
863920	contig_15105_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_150992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAAAAGAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739191	739835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_739200_739800
863921	contig_15277_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_175431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTAAGTAGAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345211	346082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_345200_346100
863922	contig_15383_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_162202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTATGAATAAAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19283	19809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_+_19300_19800
863923	contig_13700_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_68274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAAGACCATTGTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96323	96987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_96300_97000
863924	contig_990_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_76145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATAATGTCTAGGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1756345	1756599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1756300_1756600
863926	contig_13258_pilon	-	763	7	Intergenic	novelGene_146928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	41.7509148269698	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	265	753	111754	61083	FALSE	20	CACACATTGTCTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEKMELDLEPLPSSTTTDGNILRRSSSAPLISGLGDNSQVFQTDTLRTRRNSTSFTSQTCLEENMDLINRETICEREIQAAIQIDQFGEENLNLVKWHLKISQRDFSKARPTRFLLTLPNCQIRMRRRRAGFVRYKIFPVLSGHYQRQQLHSKHHTCRLK	112176	61072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_61187_83878_83976_89578_89634_89745_89790_104311_104391_111644_111832_111989
863932	contig_17769_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_124251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCTCCTGCACCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50420	50637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_50400_50600
863933	contig_3818_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_99310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGTCTCACTGGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076195	1077030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1076200_1077000
863934	contig_18506_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_67944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	623	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGCAGGAGGTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9590	9159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_-_9200_9600
863935	contig_15021_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_26985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCCGTGTATCAGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354840	355487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_354800_355500
863937	contig_5389_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_143000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93074	92537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_92500_93100
863939	contig_2342_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_132749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTCAAAAGAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106177	106981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_106200_107000
863940	contig_233_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_14677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAGAATAGCAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90081	89279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_89300_90100
863942	contig_7056_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_43679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAATAGATTTCACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818608	819323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_818600_819300
863944	contig_10074_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_57157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAGGGTTTTATGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510609	511398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_510600_511400
863946	contig_7416_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_134348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCACTATGAAGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944064	943652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_943700_944100
863948	contig_6497_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_35612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTTAATTACACAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529770	529165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_529200_529800
863950	contig_9053_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_87939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTATGTCTTCAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169167	169736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_169200_169700
863951	contig_3787_pilon	-	440	2	Intergenic	novelGene_102405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCGTGAAATTATCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540245	535016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_535376_540164
863954	contig_2703_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_101687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACCTATCAGGCTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274981	274009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_274000_275000
863955	contig_6445_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_77093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094748	1094186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1094200_1094700
863956	contig_6364_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_51796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAACATACTACCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391627	1390839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1390800_1391600
863957	contig_16666_pilon	+	334	2	Intergenic	novelGene_61802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAATTACCTTGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179633	180591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_179787_180410
863958	contig_2438_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_112083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGTTAGCTAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347202	347921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_347200_347900
863960	contig_16960_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_178023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGAAATTGTTTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8182	8498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16960_pilon_+_8200_8500
863961	contig_6958_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_69979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCAAAAAAAGAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692302	691902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_691900_692300
863962	contig_8447_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_69449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGTTCTCATTTAGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160792	159884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_159900_160800
863963	contig_15897_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_49588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874984	874237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_874200_875000
863964	contig_4812_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_103683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACAACACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83048	83718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_83000_83700
863966	contig_15114_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_121137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCCCCGAGGACTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105622	106554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_105600_106600
863968	contig_5718_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_110370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATAATTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975928	975672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_975700_975900
863971	contig_8065_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_107338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCAGCAAACTCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187558	187064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_187100_187600
863972	contig_10864_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_107111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAAAAGTTTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075632	1075173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1075200_1075600
863973	contig_6233_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_74812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATGATAAGAGAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193558	192874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_192900_193600
863975	contig_7426_pilon	+	521	2	Intergenic	novelGene_27506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGGTACAGAACTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952238	953008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_952318_952566
863978	contig_2480_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_63569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCCTCCCAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483499	484111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_483500_484100
863981	contig_34_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_40052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAAAATCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333990	333454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_333500_334000
863983	contig_504_pilon	-	464	4	Intergenic	novelGene_54427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	97.0097360520525	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	71	454	187841	178574	FALSE	20	TCAGATGTATCGTGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAADAPPGGIDPPLTCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHVKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQMLLFPFYLNEEVCLME	187911	178563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_178625_181414_181585_183341_183425_187761
863984	contig_11832_pilon	-	453	3	Intergenic	novelGene_106979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	75	323	488685	486932	FALSE	15	TTTTCCTGCAAGCTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRQPGRNFLALPLPPTARRGRTAMTPKPAGPPDGGWGWVVAASAFAVNGLSYGMLRSLGLALPDFAEHFDRSAQDTAWVSALALAVQQAGAALLWSSFTSSHPTA	489016	486801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_486983_488487_488692_488948
863985	contig_8273_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_113074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCCTGCTCTATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72387	72780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_72400_72800
863986	contig_8017_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_65344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637791	638435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_637800_638400
863987	contig_2380_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_117901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATTATAAAACATTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494807	495621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_494800_495600
863989	contig_6557_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_32997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAAGGCTCCTCCTCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492468	492229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_492200_492500
863990	contig_12543_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_168361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	327	644	173366	173049	NA	65	TATGAAAAAAAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISLSNHSLKALTLISTRYISIPSNCLNNLTYGYVAIKGGEKDNLGPWEGGYEALVTQWLSTGLLTERSAVGNHQTLCERKMWQSVFIEITALETLWGQFYSVL	173692	172897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_172900_173700
863991	contig_4305_pilon	+	498	5	Intergenic	novelGene_136702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	27.9676152004421	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	59	496	713965	725009	FALSE	55	GAAAGAGGAGAAGGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEQMDPTGSQLDSDFSQQDTPCLIIEDSQPESQVLDGSGSHFSMLSRHLPNLQTHKENPVLDIVSNPEQTAGEEQGGNNSGFSEHLKENKPSEPMDSSHLDTCGSISQVIEQLPQPNRTSSVLGMSVESVPVSEEKEEEEVEEK	713906	725011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_713972_714543_714726_714917_715012_715241_715327_724939
863992	contig_14450_pilon	+	443	4	Intergenic	novelGene_48954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	71	442	734849	752772	FALSE	10	TAAGTTCTGTCCGCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLLAWSYFRRRKFQLCADLCTQMLEKSPYDQAAWILKARALTEMVYVDEIDVYQEGIAEMMLDENAIAQVPRPGTSLKLPGTNQTGGPSQAVRPVTQAGRPITGFLRPSTQSGRPGTMEQAIRTPRTAYTARPITSSSGRFVRLGT	734778	752773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_734876_750839_750961_752444_752509_752612
863995	contig_11978_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_63127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1916641	1917316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1916600_1917300
863996	contig_9501_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_164278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411566	412075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9501_pilon_+_411600_412100
863997	contig_16211_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_150052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTCGAAAGCATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74065	73420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73400_74100
863998	contig_15867_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_170884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGTATTAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58412	57315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_57300_58400
863999	contig_4301_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_65136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTGACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575824	576352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_575800_576400
864000	contig_5018_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_47015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTACAATGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260577	1260922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1260600_1260900
864001	contig_15383_pilon	+	394	2	Intergenic	novelGene_162201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGGTCCCTGAAGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19196	19745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_+_19522_19676
864002	contig_7909_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_155932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCTGATATGAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900261	899776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_899800_900300
864004	contig_7308_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_159615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATATGGTTGAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562861	563608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_562900_563600
864005	contig_12125_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_76237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTTTCCTGCTTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489287	489959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_489300_490000
864006	contig_11816_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_98590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382845	1382257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1382300_1382800
864007	contig_2577_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_172057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104906	105217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_104900_105200
864008	contig_4305_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_136695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATAAAAGCATTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542058	541414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_541400_542100
864009	contig_11742_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_166543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTTCTAGACGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125324	126359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_125300_126400
864010	contig_10861_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_39383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCTACAGTATGCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712990	1712502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1712500_1713000
864011	contig_17563_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_175681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAATTAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26926	27387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17563_pilon_+_26900_27400
864012	contig_6870_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_103934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163271	1164104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1163300_1164100
864013	contig_10042_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_79256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCAAAAGGAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226104	1226666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1226100_1226700
864014	scaffold_19766_pilon	+	603	5	Intergenic	novelGene_34249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTCAGGGTCTTTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152676	154151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_152863_152982_153085_153217_153309_153504_153644_154066
864015	contig_6048_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_73243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTGTTAGGAAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1900741	1900151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1900200_1900700
864016	contig_10958_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_5344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	143	322	616301	616480	NA	25	TAGGCATATAGGCATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKNARQTRHFLVNHRKHSHQRKDPINLLTSITTESLVNTTRFKGIREMKLRKRDPKLSLSADDQSKIYLENSRDNKLTDKLSELIKAQQDGSIQNLNLKTNSFPIH	616158	617196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_616200_617200
864018	contig_5307_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_176011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGAAACCGGACATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15251	16064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5307_pilon_+_15300_16100
864019	contig_12837_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_57272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACAGCTGACAGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44942	44483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_44500_44900
864020	contig_665_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_158202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACTCAAATTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163417	163087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_163100_163400
864022	contig_8045_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_35338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCCTAACACTCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95506	96015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_95500_96000
864023	contig_19654_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_176342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAGAAACACAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208236	207724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19654_pilon_-_207700_208200
864025	contig_9481_pilon	+	632	1	Intergenic	novelGene_149669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374833	375465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_374800_375500
864026	contig_5899_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_146968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCTTTTCTTCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67178	67913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_67200_67900
864030	contig_18967_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_165339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTTACCAGCTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350840	351660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_350800_351700
864032	contig_8631_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_121994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161686	1161451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_1161500_1161700
864033	contig_2364_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_170828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGTTTGTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438120	437354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_-_437400_438100
864034	contig_3130_pilon	-	421	2	Intergenic	novelGene_103589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTGTAACCCACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202629	195625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_195878_202460
864035	contig_9735_pilon	+	1061	4	Intergenic	novelGene_177947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	35.6121078036982	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCATCAATGAACACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8818	58386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9735_pilon_+_9283_46443_46807_57155_57300_58296
864036	contig_4364_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_53	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGCCCGGCTACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612223	611980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_612000_612200
864037	contig_9185_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_166885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTCCCCCGAGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206641	207076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_206600_207100
864042	contig_18822_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_111742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCAGTGGTGCCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238045	238407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_238000_238400
864043	contig_10444_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_139466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850968	851843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_851000_851800
864044	contig_9389_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_84107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCCCCGCTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394199	1393598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1393600_1394200
864045	contig_14047_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_176587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	83	397	57536	57850	NA	65	GTATACAAAAAAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLQSSLRPPGSFPFLPHPPSRNLNSSSLAPAARTAWWHHGRSRSLRLGVTCRVPWPNGAVALCGITLGGSSTVCWSLSEMNTIEQAGSDGCQDPVPLMPQGRG	57453	58028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_57500_58000
864046	contig_12279_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_50113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCCATCAACTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63059	62395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_62400_63100
864047	contig_7357_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_36953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGTAAAGCCTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234251	1234902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_1234300_1234900
864050	contig_89_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_176389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTGATTTCATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186006	185466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_-_185500_186000
864051	contig_7173_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_37549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTAAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554181	553217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_553200_554200
864052	contig_6589_pilon	-	153	2	Intergenic	novelGene_25693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGTACAAACCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144413	143109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_143186_144336
864054	contig_13481_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_119546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	1	549	1501695	1501147	NA	60	GGGGGAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERRAGDKLNGLGAPQRSAPRVPPPRVTGPGAAVQALPGAHAGASGAVSAGAATRAEVPCGAVTAWSGDSGGTGVGRPGLGQQRGQPRSPPGVPRSRAALHGLDLPGDGAAVLGEEHPRFCIGRVGGSHVFVPDFLFRAGLGLLLFGGGDGGGEKGGPGTGILTSPLHKTKVASWNPTCSAY	1501695	1500946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1500900_1501700
864056	contig_9335_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_147472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGGACTACAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735264	735988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_735300_736000
864057	contig_8676_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_142230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGAACTTTGAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703370	702618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_702600_703400
864058	contig_8907_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_85848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCTCCTAAAGGGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679301	678724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_678700_679300
864059	contig_4125_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_25110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGTGTGCCTAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770531	771243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_770500_771200
864060	contig_15613_pilon	-	649	2	Intergenic	novelGene_147196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	5	466	71642	68851	FALSE	50	AAAAATGTCTAAAACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMDTMSTASQHQTVAGDAVSETPHVLSKEDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSPRRSLYRTLSDESICSNRRGSSFGSSRSSILDQALPNDILFSTTPPYHSTLPPRTQPVPSMGSLRSKWAGMLLPGPVSSVWAELNSRCALVASSDFMS	71646	68667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_69172_71501
864061	contig_4315_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_46767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAACACATTAAGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261128	260815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_260800_261100
864062	contig_709_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_57550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536681	1537244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1536700_1537200
864063	contig_9727_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_86348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442432	441609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_441600_442400
864064	contig_6445_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_77056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTATGAAGAAGCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661089	661822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_661100_661800
864065	contig_3818_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_99323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286976	1287723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_1287000_1287700
864066	contig_13937_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_167368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGAAAAATTGATTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110404	111034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_110400_111000
864067	contig_8254_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_48406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	53	409	141831	141475	NA	20	CATGTGAAAGCCCCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRSQGRRRGSQRESGKMWEPSGAEVGAVAFRGALFLLLFVLGVRELLKQRRPTRFPPGAAGAAIYRQYLLPGRLSRAPPCLHEKAEPGVRRGTTPRGPGQGGAAVCSSGLAWAFLPIGFMVIPGPKLVEILSSA	141883	140980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_141000_141900
864069	contig_18113_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_137534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATGAATCACAACGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152588	153107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_152600_153100
864070	contig_8606_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_159401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106891	107338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_106900_107300
864073	contig_9981_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_121030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98356	98736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_98400_98700
864074	contig_12120_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_21407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAAAGTATTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21417	20909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_20900_21400
864075	contig_13214_pilon	-	439	2	Intergenic	novelGene_175715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACGGTTTTCTAAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21697	20772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_21132_21617
864076	contig_6102_pilon	-	500	2	Intergenic	novelGene_32018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508917	507377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_507823_508862
864077	contig_5881_pilon	+	335	1	Intergenic	novelGene_129039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGGAGGAGGCGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328530	328865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_328500_328900
864078	contig_13305_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_146767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	345	127	471	50565	50909	NA	40	GGAAATGGGTTGAGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSLQFQTGQEGLRFTEEETEARRGYLTGPRSHSQSLNKWDSDPSVEPRALSTLSDLLSERQRAAPHFTDSAERGRQIVAELGNGDPGLVPRESFPFTTRSPTEPSHLLPPEKV	50438	50910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_50400_50900
864081	contig_13015_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_165541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAATGAATTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140744	141309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_140700_141300
864082	contig_1686_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_165601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGCGAGGGGTTGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332718	333000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1686_pilon_+_332700_333000
864083	contig_5361_pilon	-	629	1	Intergenic	novelGene_167222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	69	386	619490	619173	NA	65	AATCAGACGTAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERRPTSSPGTWSEDLNFPLSLSLCPQPILYYLLISSSPSPPYFLPSTNLTEHLPSTGYFTEYRQEHDDDIVLVLEQLTIQLEKTLPNTISVSLGKTMTQPYG	619558	618929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_618900_619600
864084	contig_7904_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_160031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTTGTATCTGCAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512381	512035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_512000_512400
864085	contig_7753_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_41521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGCAACAAAAAGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309476	1308689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1308700_1309500
864086	contig_5482_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_144504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTACCACCGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643948	644467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_643900_644500
864089	contig_8693_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_150876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACTAATTGTGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145417	1146168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1145400_1146200
864090	contig_10331_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_54110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAGTCTATCGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310508	311303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_310500_311300
864091	contig_9705_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_41757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAACAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475943	476892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_475900_476900
864092	contig_5084_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_64684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGAACAAGTGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1801827	1801266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1801300_1801800
864094	contig_11903_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_164738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTACCGCGGACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175123	174616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_-_174600_175100
864095	contig_9582_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_106829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222468	221833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_221800_222500
864096	contig_3956_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_14714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGAAGCCTTTTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212177	210915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_210900_212200
864097	contig_10196_pilon	+	1482	10	Intergenic	novelGene_132198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	78	503	1169384	1170963	TRUE	10	GCCTGCAGCCCAGGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLFELSLPFSFAGERETPSPYWPELMAISMMESLMCVAGSPCDSTSSGGPGRERSSRADTLGGESRVLEPSEGSGAERPFWSGALGNSDRERTGEPWKLSATGSGSGSSLEGTLMKGSLAPWRRGVHSGSFWWSPGRQRLQSHCLRIAERCQTSPRGPRRGGGSRE	1168394	1180669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1168451_1169362_1169598_1170005_1170080_1170825_1170994_1171233_1171337_1172136_1172222_1174365_1174432_1174520_1174715_1177287_1177458_1180338
864098	contig_8710_pilon	-	534	3	Intergenic	novelGene_73503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3.5	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATTGTGCCTGCGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256760	179808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_180170_198264_198376_256698
864099	contig_15118_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_74627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCTCTTGTTAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434312	433999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_434000_434300
864100	contig_15859_pilon	-	577	3	Intergenic	novelGene_50203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	45.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	44	577	344895	341139	FALSE	30	AACAACATCGTGCGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGH	346187	341138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153
864101	contig_15897_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_49507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTTTTTTTTTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93819	93380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_93400_93800
864102	contig_9303_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_176825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAGAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59242	58354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9303_pilon_-_58400_59200
864103	contig_6510_pilon	+	894	5	Intergenic	novelGene_173527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.3824115301167	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	70	606	514269	524536	FALSE	30	TTTGTTAAAACCATCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNLVVKPLQLQVGINKSQLNLAMANHDIPPDAVRDKKLCRLPPLDTSTLVGVFVEYIISPSQFYIRIYSRDSSELLEDMMIEMRRCYSNQLVSDRYVMPEYFIQPGHLCCVRISEDKWWYRVIIHRVLGRQEVEVFYPDFGNIGTVQKSSLRFLKCCYTKLPAQAIPCSLAWVRPVEIALIQCKGSFPGCGLQHLLSFKR	513143	524824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_513177_514232_514454_516645_516859_517214_517282_524464
864104	contig_16541_pilon	+	379	2	Intergenic	novelGene_126741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353354	355857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_353490_355613
864105	contig_12474_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_172214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	292	876	244	1119	124151	123276	NA	25	CACCCTGGCCCAGCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTKMPYSHPAEEAPLALHSEGNKNHGPPKLPLLFPQPPRPKYDSQMIDLCNVGFQFCRTLEHLGAKSIKQEPIKPSAVWAQPTSPPFPPPPYPYYPKVHPGLMFPFFMPSSPFPFSRHTFLPKQTPEPLLPRKAEPQESEDTKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGAQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTRCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDF	124394	123273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12474_pilon_-_123300_124400
864108	contig_5766_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_175049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGGTAAAGAAGCGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792118	792667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_792100_792700
864109	contig_5947_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_101573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTTTTGTAGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804067	804503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_804100_804500
864110	contig_10864_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_107059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774147	774567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_774100_774600
864111	contig_4686_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_118517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTAAAAAAAAAAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422818	422432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_422400_422800
864112	contig_19688_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_173058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATTGAAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59856	59387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19688_pilon_-_59400_59900
864113	contig_6919_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_163981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGTGCTGCTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43330	42942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_42900_43300
864114	contig_11121_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_167065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCACCCTTGATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306595	307420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_306600_307400
864115	contig_7157_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_131307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952709	952058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_952100_952700
864118	contig_6589_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_25925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	28	300	1179349	1178718	FALSE	20	GTAAATAGCCTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATEASQWHRMMTGGNLDARGDPLPPAPSPRSDLTSRVTFPPRSPAAANSRTAASSSQGSGRGGGSAPSESTWRPGTAPPALTPAEGAWPLRVTLLQSSF	1179376	1178526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1178981_1179339
864120	contig_9561_pilon	-	626	3	Intergenic	novelGene_100850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	5	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	175	624	131515	79905	FALSE	30	ATGCTGCCTAAAGTGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METQEAENTAIFMCKCCNLFSPNQSELLCHVSEKHAEEGVNVDEIIIPLRPLSTPEPTNPSKTGDEFLVVKRKRGRPKGSTKKPCAEEELTEHVATPAEGSPLASEEGNSLAPSTLECSKCCRKFSNTRQLRKHICIIVLNLGEEDGDAG	131689	79902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_-_80159_97384_97562_131496
864121	contig_5891_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_151589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168653	168192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_168200_168700
864124	contig_2867_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_135175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCTTCAAAAGCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773392	774005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_773400_774000
864125	contig_12922_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_157779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGATTTCATTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74353	74805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_+_74400_74800
864126	contig_14816_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_172451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCCATTGCCTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36270	36617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_+_36300_36600
864127	contig_2798_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_119989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATAACATAATCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31526	30974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_31000_31500
864128	contig_7182_pilon	-	621	2	Intergenic	novelGene_117164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTGTTAAAGCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044307	1033673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_1033744_1043756
864129	contig_12935_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_165717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACGTCTAATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66853	67121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_66900_67100
864130	contig_992_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_164298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATGTTCTGCTCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363045	363423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_+_363000_363400
864131	contig_11898_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_144286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTTATTGAAGAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238391	238780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_238400_238800
864133	contig_1406_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_25436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGATAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241085	240704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_240700_241100
864136	contig_10386_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_173544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTCAGAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126854	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_126900_127700
864137	contig_6058_pilon	-	205	2	Intergenic	novelGene_172377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGGCACAGCACAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366450	366156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_366283_366371
864138	contig_7816_pilon	+	719	3	Intergenic	novelGene_66575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	59	307	612914	614205	FALSE	50	AAAAAAGATGATGCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRRLPETPSDNSSCTARTMSQPGAPEAPIKKKRPAVKEEDLKGARENLTKNQEIKSKTYQVMRDCEQAGFAAPSVFSGARTGTETVFEKPKAGPTKSVLG	612855	614617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_612923_613810_613944_614098
864139	contig_16865_pilon	+	401	4	Intergenic	novelGene_178024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCGCCTCCGGAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30562	36618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16865_pilon_+_30756_31313_31381_32591_32657_36542
864140	contig_4429_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_50822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGCTATGGCTGCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215322	215582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_215300_215600
864141	contig_6842_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_130794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGAAAAAGCAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420279	1420713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1420300_1420700
864142	contig_2770_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_107430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551875	553046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_551900_553000
864143	contig_16071_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_166004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCTCTCCCTTCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71874	71372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_71400_71900
864144	contig_7870_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_108948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCATTCATGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304632	304067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_304100_304600
864145	contig_7391_pilon	+	318	2	Intergenic	novelGene_112170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTCCTTCCTTTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458454	465868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_+_458553_465648
864147	contig_2043_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_169899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGATAATAAATGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645059	644800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_644800_645100
864149	contig_4857_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_48887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAGAATCAGGAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417189	1416726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1416700_1417200
864150	contig_11105_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_159818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTTACCCAATCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268255	267737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_267700_268300
864151	contig_12689_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_145066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTGACCTTTGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379624	380135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_379600_380100
864152	contig_11473_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_159255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCTTCTAGTTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118780	119375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_+_118800_119400
864154	contig_5832_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_134164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTACAATGAATCTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514860	515322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_514900_515300
864156	contig_5023_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_7105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGGATAACCATCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39675	40204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_39700_40200
864157	contig_11316_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_122663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATCAACCCTAACCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138988	139201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139000_139200
864159	contig_14727_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_56642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAACCTGGAGCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259585	259020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_259000_259600
864160	contig_7171_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_101226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTTCCTGGCTGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717142	716711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_716700_717100
864161	contig_11574_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_64049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTGATTTGTAGACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418965	419374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_419000_419400
864164	contig_19777_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_29709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTGGCAAGAACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14947	15274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_14900_15300
864165	contig_348_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_67586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATTAAAAGCCTTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250357	250695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_250400_250700
864166	contig_17687_pilon	+	600	2	Intergenic	novelGene_177972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	14	376	6764	24606	FALSE	20	TAAGCCACCCACCTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGEMVAGLHPTAAAPLWWMLRFLSLAVSRPLTHWNSLRVRHSRRWRMDRPLLPWPSLRTESSTKLAPHSNSMPGGQLTSSAWKSGAAATAAEKRSKASGSGRRWRIFEDVMGSYWSGVDPNPI	6750	24830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_+_7069_24548
864167	contig_10414_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_146941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	40.5490101262931	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	120	488	174488	157439	FALSE	40	ATCGCATGTGAGAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPDSSVGLLGRAALSGLETQESKTPGNCGDWKVKVEGLQMGVEEAAEDPCVAPNLESIPKVKELTSKQRVFRKKQTKHMKTERSHLGVKLNECNQCFKVFSAKSSLTQHKRIHTGEKPYDCNQCGKSFSSSSYLTVHKRIHNGEKPYECSDCGKAFSNSSSF	175944	157436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_157682_158168_158252_174445_174554_175890
864169	contig_13699_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_158311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATATAAGGGAGTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27282	27958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_27300_28000
864170	contig_3060_pilon	-	713	2	Intergenic	novelGene_178029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTATATAGGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590052	587485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3060_pilon_-_587876_589729
864172	contig_1813_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_105506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAGAAAGTGATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367284	366812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_366800_367300
864174	contig_9363_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_6731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCAAAATACACAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470184	1469727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1469700_1470200
864175	contig_10451_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_138319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAACAAGAGCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270102	269850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_269800_270100
864176	contig_14341_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_111817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGAAAAGAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529245	528697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_528700_529200
864177	contig_10354_pilon	+	257	2	Intergenic	novelGene_50830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTGTTACACTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352290	386201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_352386_386039
864179	contig_8445_pilon	+	470	2	Intergenic	novelGene_177052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAATGGATACAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42149	46595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8445_pilon_+_42552_46527
864180	contig_7171_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_101410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTGTATGGTTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438940	1439685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1438900_1439700
864181	contig_6825_pilon	+	326	2	Intergenic	novelGene_155129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACCCACTTGTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112320	122272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_112478_122103
864183	contig_8587_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_159099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATAGCCCAACCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80130	79362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_79400_80100
864186	contig_11413_pilon	-	162	1	Intergenic	novelGene_103158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAAGACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362217	362055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_362100_362200
864187	contig_15491_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_75989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152130	151330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_151300_152100
864188	contig_5083_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_151649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAACAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289069	288086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_288100_289100
864189	contig_7338_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_156793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAAAAATACTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251099	250204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_250379_250911
864190	contig_4402_pilon	+	322	4	Intergenic	novelGene_140819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCGCAGCGCCACGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411845	462725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_411955_440938_441041_462246_462296_462663
864191	contig_15777_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_75750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTCTTTGGCCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215814	214917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_214900_215800
864193	contig_5538_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_23703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGTGTTGCATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97515	96601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_-_96600_97500
864194	contig_776_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_139921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGCATAAGTAATTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804729	804187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_804200_804700
864195	contig_6497_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_35653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGTGAAACAACTTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834681	834141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_834100_834700
864198	contig_10236_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_169128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCAAAAAAACAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259909	259649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_259600_259900
864201	contig_4797_pilon	+	211	3	Intergenic	novelGene_6920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2368.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369968	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_370026_370914_371020_371705
864202	contig_5419_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_15475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTCTTGAAAAGACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70797	71092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_70800_71100
864203	contig_19986_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_159228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTAATAAATACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33965	33327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_33300_34000
864204	contig_6415_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_175839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTTGAAGGTCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38326	38955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_38300_39000
864205	contig_11100_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_175529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGAGAGGGTCGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145745	145440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_145400_145700
864206	contig_1150_pilon	-	156	1	Intergenic	novelGene_61443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTAAAACCTGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309098	308942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309100
864208	contig_3862_pilon	+	172	1	Intergenic	novelGene_137410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499621	499793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_499600_499800
864210	contig_8614_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_178031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478464	478091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8614_pilon_-_478100_478500
864211	contig_3602_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_60683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACATAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1250667	1250460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1250500_1250700
864212	contig_7368_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_158802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCAGGGTGGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85790	85561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_-_85600_85800
864215	contig_4151_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_65245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGTAGAAATAAGAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546869	547270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_546900_547300
864216	contig_2444_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_83747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGGAGGCTACACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178798	177947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_177900_178800
864217	contig_7197_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_177267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCCAAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53995	53410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7197_pilon_-_53400_54000
864218	contig_10734_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_51258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTTTTATCTATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281223	1280697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1280700_1281200
864221	contig_11751_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_150298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCAAACCCGTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153344	152675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_152700_153300
864222	contig_4732_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_75420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAAGATTGACGCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596704	609376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604151_609242
864224	contig_14522_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_147333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTACCATACCTGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146071	145449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_145400_146100
864225	contig_13292_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_142929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCAGTATGATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86675	87423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_86700_87400
864226	contig_9272_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_125936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAATTTAAATGTAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414419	414885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_414400_414900
864227	contig_6025_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_178036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAATAAAACTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233186	232701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6025_pilon_-_232700_233200
864228	contig_6241_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_156422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGAGAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208192	208810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_208200_208800
864229	contig_12080_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_128418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAGTCTCAAAGACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557306	557804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_557300_557800
864230	contig_9099_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_149911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGAAAAGGAAATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336332	337044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_336300_337000
864231	contig_13481_pilon	+	935	4	Intergenic	novelGene_119299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	6.68331255192114	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAATTTTAAAAAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220200	242659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_220654_221894_221987_236494_236598_242372
864235	contig_9363_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_6526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGCTCCTCTTGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571024	571379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_571000_571400
864236	contig_9708_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_67284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGGCAGAACTTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801885	801631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_801600_801900
864240	contig_5341_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_168038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAGTTGATTCTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386021	385154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_385200_386000
864242	contig_8050_pilon	+	180	1	Intergenic	novelGene_114855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTCAGGTGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383193	383373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_383200_383400
864244	contig_11994_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_129339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCTTTGTTAATTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54778	55414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_54800_55400
864247	contig_10196_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_132252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1822000	1822443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1822000_1822400
864248	contig_9345_pilon	-	372	4	Intergenic	novelGene_24428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.5401984900797	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTGTTGAGAGCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267598	265892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_266067_266981_267036_267348_267435_267540
864249	contig_4589_pilon	-	428	5	Intergenic	novelGene_178037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGACAAAAAACAAGGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157352	14282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4589_pilon_-_14434_24301_24377_83040_83104_90963_91027_157276
864251	contig_833_pilon	-	276	2	Intergenic	novelGene_176483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	101	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGTTGTAATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551594	547970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_-_548163_551510
864252	contig_9696_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_68777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGATTCCTGCTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193634	194237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_193777_193852_193976_194103
864254	contig_13718_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_142881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATGGCTACATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64668	66970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_64731_66683
864255	contig_6175_pilon	+	874	2	Intergenic	novelGene_16369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCTATAAATATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775859	1780243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1776512_1780021
864256	contig_6497_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_35647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAGTCCATATTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776617	775848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_775800_776600
864258	contig_9099_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_149929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGTTGGCAACTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431592	430806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_430800_431600
864260	contig_1516_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_49932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTAGGGATGAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136597	136882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_136600_136900
864261	contig_1813_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_105494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTCAAGCCCCTGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127756	127367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_127400_127800
864263	contig_7630_pilon	-	876	6	Intergenic	novelGene_133625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	118	453	16427	12112	TRUE	30	TTTGTAGAATGAGTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVGCISGIVSTLGFVYLTPFLEAHLQIQDTCGIHNLHGMPGLIGGIVGAVTAAYANSEVYGHEGLVQAFDFEGSNSNRTTQLQGSFQAAGIFVSLAMALVGGGIVGIILKLPCWGQPADENCFEDKIYWEIPEKQEEENYRPEDPTLSL	16705	10367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_10759_12079_12172_15632_15707_15920_16046_16350_16488_16648
864264	contig_4496_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_66714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGAATAGATGATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324379	1324794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_1324400_1324800
864265	contig_14868_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_150440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGTACAGTACATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118128	117536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_117500_118100
864268	contig_5959_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_150207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	85	444	410161	410520	NA	30	TATGCTTATAATGACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLFSSPLSYFPSDSSCACSTFSSDPNHPDLGQTSQVKGHSRPGCEVCPRLQTAASLGVPMRPSLLTCWLQIGRNLRPLRIPAVNSGVPNQKKKPLPMSGFQLMVTPCVTEFHQAFLA	410076	410736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_410100_410700
864270	contig_8552_pilon	+	284	2	Intergenic	novelGene_80058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTTTTAAATAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272854	274135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_272936_273932
864272	contig_10196_pilon	+	671	2	Intergenic	novelGene_132262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	18	512	1999654	2000239	FALSE	5	AGTCGCTGTCTGGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPRCVPCVPCPPGTADAEARPTGGACRVLTSLPLPAPPRPSPHRQEHWYTSYIDLLQRFRLWNVSNEVVKLSTSRAISCLNQASTSLHVNCSHCKRPMSGRGWVCGRCHRCASMCAVCHHVVKGLFVWCQGCSHGGHLQHIMKWLEGSSHCPAGCGHLCEYS	1999636	2000398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1999980_2000070
864273	contig_13966_pilon	+	460	3	Intergenic	novelGene_158159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	4.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	72	446	518847	520236	FALSE	45	ATCCAAATACAGTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAIREVGVWRQTRTLLLKNYLIKCRTKKSSVQEILFPLFFLFWLILISMIHPNKKYEEVPDVELNPMDKSILSNLILGYTPVTNITRNIMQKVSTDHLPDGIVSLYLYSVYNVKSLQYLSAC	482942	520250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_482999_518831_518949_519963
864274	contig_11171_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_48620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGAATGGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269572	269957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_269600_270000
864275	contig_990_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_76010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAAGACGTTCAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369000	368657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_368700_369000
864276	contig_10583_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_167910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120185	119682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_119700_120200
864277	contig_5009_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_119245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAATTGTCAGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15189	14051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_14100_15200
864279	contig_15221_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_133074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142189	142776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15221_pilon_+_142200_142800
864280	contig_6364_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_51817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTAAAGATTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573138	1573692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1573100_1573700
864281	contig_7380_pilon	-	636	2	Intergenic	novelGene_157511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATATCCCAATCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138499	137745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_137967_138084
864282	contig_2332_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_58651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACAGAATTCACCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263774	262937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_262900_263800
864283	contig_7161_pilon	+	571	2	Intergenic	novelGene_178039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAAACACTGTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861246	862323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7161_pilon_+_861427_861932
864284	contig_11416_pilon	-	695	4	Intergenic	novelGene_145381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	10.1434160364686	117	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	21	560	809607	804673	FALSE	20	GACAAGAGGGCTCTCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPAADMPKRGCPFGDAAPLQLKVRVGPKELSRGVCGERHSREVFERTRQLLFRGAQACMDPMCDEASPEDCTLVHLPESPKPSPTGVPGLTSGQMLIGPGGRLLRSCVQASGADPSEAAPRACSSCVRSADGKAACGRCERPLCGRCVRTCWSCSTVACALCSAIDYSDIHEKALCTSCAVFEA	809627	804537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_804731_806777_806935_807472_807680_809489
864285	contig_11417_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_103250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCTCCTATCGGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27877	28526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_27900_28500
864287	contig_20378_pilon	+	286	2	Intergenic	novelGene_159566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAAACAAATAAACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25684	26182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_25830_26041
864289	contig_11512_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_43324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAAATTGTGAATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414693	414900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_414700_414900
864290	contig_12886_pilon	+	317	3	Intergenic	novelGene_135521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	32.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTTTCTGGGAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740037	745590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_740113_743925_744055_745477
864293	contig_16766_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_153369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161971	162812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_162000_162800
864294	contig_1986_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_64126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGACAAGAAAAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267689	268397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_267700_268400
864295	contig_2834_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_28013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288752	287935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_287900_288800
864297	contig_10531_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_114510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGAAAAAAAAAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363629	363212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_363200_363600
864298	contig_11924_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_128030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACTCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77088	76414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_76400_77100
864299	contig_6427_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_162585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTCCCGGCAGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171706	1171244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1171200_1171700
864300	contig_16103_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_118941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGGGGAGCAATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907108	906556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_906600_907100
864301	contig_1055_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_149727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAACCAGGGAAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106239	105620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_105600_106200
864303	contig_1213_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_76459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCCTACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38645	39215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_38600_39200
864306	contig_11908_pilon	-	930	8	Intergenic	novelGene_133222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	17.3487634094403	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	7	930	579786	516077	FALSE	45	AAAGGAGAGCCGGTAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTMRHTSSWKLWLWVAVLLLPASVSMTVKDKPEKLCPVLRTDGYQFIQGSRDKLEVSGFDLGESFSLRHAFCEGDKTCFKLGSALLIRDTIKIFPKGLPEEYSVAAMFRVRRTTKKERWFLWQVLNQQNMPQVSIVVDGGKKVVEFMFRAAEGNVLNYIFKNRELRPLFDRQWHKLGIGIQSRVISLYMDCSLIERRQTDEKDAVDFHGRTVIAARASDGKPVDIELHQLKIYCNSNFVAQEACCEISDTKCPEQDGFGSTASLSVTAHASKMSAYLPTKQELKDQCQCIPDKGEAGLPGAPASPGEKGD	579792	516076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_516128_517413_517540_521176_521258_526070_526347_527718_527843_564589_564690_565528_565604_579695
864307	contig_10766_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_151226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTCAGGGTTCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210169	210811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_210200_210800
864309	contig_5434_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_74681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340268	339905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_339900_340300
864310	contig_11264_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_154211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTGAAAGAACTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640602	641243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_640600_641200
864313	contig_12297_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_161376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGTTCTAACTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710932	711274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_+_710900_711300
864314	contig_10629_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_52933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	11	310	346041	345742	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWSMSRPLLGLILLNEKVGEPELCRQPEAVVGTQLAVIFLGTVRNPYKTPQNGEMEKKGPIYKAYPIHALNISYTNNYLKWLEVSTWQSDKVKDEEAFSSWK	346051	345515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_345500_346100
864315	contig_16970_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_157608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTCCTGTTTTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148682	148257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_148300_148700
864318	contig_1719_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_87256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACAAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108407	108875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_108400_108900
864319	contig_9199_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_65649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCTAGTTTTTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162520	162988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_162500_163000
864320	contig_11003_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_105438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCCTGTTAAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67299	67779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_67300_67800
864321	contig_11677_pilon	+	1137	10	Intergenic	novelGene_85957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.415739709641549	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	8	787	600306	603093	FALSE	15	GTTTTTAGCACTTTGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKMNILAPVRRDRVLAELPQCLRKEAALHVHKDFHPRVTCACQEHRTGTVGFKISKVIVVGDLSVGKTCLINRFCKDTFDKNYKATIGVDFEMERFEVLGVPFSLQLWDTAGQERFKCIASTYYRGAQAIIIVFNLNDVASLEHTKQWLAEALKENDPSSVLLFLVGSKKDLSTPAQYVLMEKDALKVAQEMKAEYWAVSSLTGENVREFFFRVAALTFEANVLAELEKSGARRIGDVVRIKSDDSNLYLTASKKKQTCCS	600298	603443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_600360_600565_600658_601660_601727_601828_601931_602024_602090_602222_602275_602456_602539_602616_602708_602835_602944_603025
864323	contig_7171_pilon	-	543	4	Intergenic	novelGene_101227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	2.94392028877595	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	10	543	721721	717113	FALSE	10	CTTCTCCCTGGTTACATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQRLGKRLLSKLQAPSRARGPGGSPGGLQKRHARVTVKYDRRELQRRLDVEKWIDGRLEELYLGREADMPDEVNIDELLELETEEERSRKIQGLLKSCRNPTEDFVRELLGKLRGLHKQPGLRRPSPSDDSDGGSLSPRQDRARTAPPLTRALHAGSFIACTSRLCNNNTAWLFSL	721730	717112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_717332_718223_718257_719229_719311_721520
864324	contig_16578_pilon	+	866	1	Intergenic	novelGene_148629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTTCATGAAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118840	119706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_118800_119700
864325	contig_7775_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_37454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAAAAAGGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46094	45775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_45800_46100
864326	contig_5499_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_56986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGACCCCATGGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776479	776997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_776500_777000
864328	contig_4055_pilon	-	722	1	Intergenic	novelGene_158170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGAGCCACCTGAGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521132	520410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_520400_521100
864330	contig_405_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_135301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTAGCTCAACAGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268988	269482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_269000_269500
864333	contig_18274_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_164036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCTTTGCCATTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34242	33896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_-_33900_34200
864335	contig_2114_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_104326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	589	888	1161693	1161992	NA	35	GGGGTAAAGCAGTAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEMAVSGRGSVRSDGLRNGRREEKPRGKTGAGNGQGKAGQRFGGQDLGCQRAWGDHEESIISCGEGTGLGPRRKGYCLPVHKQGRKGRKARTDGRK	1161104	1162063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1161100_1162100
864337	contig_3335_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_165010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTATTTCCTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836445	837411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_+_836400_837400
864341	contig_5260_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_144433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTAGCAATTGCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694230	694954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_694200_695000
864342	contig_2924_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_140288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421619	421377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_421400_421600
864343	contig_18392_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_143086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32673	31868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_31900_32700
864344	contig_6050_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_123109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGTGGTGACAGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307448	306292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_306300_307400
864345	contig_5201_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_82189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAAGGAAAAAACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373402	373808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_373400_373800
864347	contig_1996_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_131866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTTAAAACATTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84338	85036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_84300_85000
864348	contig_15327_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_70838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTCTCAGTGCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657348	1656913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1656900_1657300
864351	contig_10037_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_148953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCCCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210841	209966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_210000_210800
864352	contig_13702_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_102605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAACTCAAATGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137950	138461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_138000_138500
864354	contig_10541_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_144657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351470	352291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_351500_352300
864356	contig_9995_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_47771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAACAAAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721048	721857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_721000_721900
864357	contig_1331_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_37849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTAGGTAAGGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192895	192127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_192100_192900
864358	contig_18544_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_152726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATGAAAGAGAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27419	26891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_26900_27400
864359	contig_16532_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_110044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189798	190157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_189800_190200
864362	contig_6102_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_31945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAAGCGCGCTCGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408024	408516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_408000_408500
864363	contig_10037_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_148952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTAGTTAACAGAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189752	190820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_189800_190800
864364	contig_13214_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_175716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGGAGTGGGGGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21833	22339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_+_21800_22300
864365	contig_11978_pilon	+	950	2	Intergenic	novelGene_62782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	33	317	150938	152240	FALSE	10	CGCCGCTCAGTCACCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKCSTPVYPWMQRMNSCNSSSFGPSGRRGRQTYTRYQTLELEKEFHYNRYLTRRRRIEIAHALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKESKLLSASQLSAGEEEEKPAE	150905	152873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_150963_151980
864366	contig_19974_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_130479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTGCTGGAATAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245051	244451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_244500_245100
864367	contig_7744_pilon	+	552	4	Intergenic	novelGene_62453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	44.8503685108111	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	26	367	389959	390724	TRUE	35	GTGTAATAAAAGTCCACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPTGPKSMQTSGRLSSVAPPCILRKNPPSARNGGHETDAQILELNQQLLDLKLTVDGLEKERDFYFSKLRDIELICQEHESENSPVISGIIGILYATEEGFAPPEDDEIEEHQQEDQDEY	389933	391573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_390079_390220_390374_390655_390854_391517
864368	contig_5059_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_140730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGCATACTTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262088	262396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_262100_262400
864369	contig_5059_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_140731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTTTATTTTTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262396	262652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_262400_262700
864370	contig_9180_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_109113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTGTAAGTTCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385922	386600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_385900_386600
864371	contig_1442_pilon	-	654	2	Intergenic	novelGene_172154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTTCTTGTCATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369311	349270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_349812_369198
864372	contig_15185_pilon	-	472	2	Intergenic	novelGene_99379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCCATTGGGTTCGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44810	42466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_42757_44628
864373	contig_10498_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_177870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGTCGCGTAATACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9732	9305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10498_pilon_-_9300_9700
864374	contig_11171_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_48607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACATGTGGTTACTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225499	225751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_225500_225800
864375	contig_15952_pilon	-	430	2	Intergenic	novelGene_154102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCAGTATTAACGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764946	763236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_763533_764812
864376	contig_13021_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_8097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGGTATATGAGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64354	63920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_63900_64400
864378	contig_7549_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_164538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGATAGGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729998	730584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_730000_730600
864379	contig_19957_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_57724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247042	244036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_244217_246841
864380	contig_16103_pilon	+	486	2	Intergenic	novelGene_118766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGCAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454187	542494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_454230_542050
864381	contig_12761_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_164074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTCTACCAGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417796	418168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_417800_418200
864383	contig_6228_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_164487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGCTATGGATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156616	157171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_156600_157200
864385	contig_3410_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_58957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGCAGAATTTATCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386212	387409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_386200_387400
864387	contig_11702_pilon	+	170	2	Intergenic	novelGene_142008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGTCTCAAGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506301	507326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_506406_507260
864388	contig_2069_pilon	+	367	2	Intergenic	novelGene_23325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	184	309	559551	559676	FALSE	10	CCCTTAGCCACTTCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYITFRLPGEADHYQLVLGQFSEGTAGASVSFHSGRPFTTYDADHNTNGAIVRWLSTEPGGMNLAIHPISMGATRHLRPQLTSMASTGTQAVAWATPTAGFG	558549	559734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_558629_559446
864389	contig_987_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_72247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAAGATGTATTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277977	278291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_278000_278300
864390	contig_1055_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_149724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAACGCAGCTTTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94827	95542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_+_94800_95500
864391	contig_2924_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_140286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCCAACTTCTAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403595	402970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_403000_403600
864392	contig_11505_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_140914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCTGATGTCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19552	19876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_19600_19900
864393	contig_11253_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_126815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTACCAGTCCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26274	27098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_26300_27100
864394	contig_12540_pilon	+	468	4	Intergenic	novelGene_148118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3.09120616516523	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	79	468	1160355	1165341	FALSE	15	TCCAGAGTCCTGATCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGPGNDSVPLTGLAWSSASAPPPRGFSSISCTVEGAPASFGKSFAQKSGYFLCLSSLGSLENPQENVVAEIQVLVDKSYWGRGGLLSLSPRGQGWGWTETSAFESFVSNSTVPGEEECPPAINTASLP	1160276	1165341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1160445_1160572_1160672_1160786_1160837_1165190
864396	contig_10734_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_50964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	47	637	46604	47194	NA	5	CCTTATTTCTGTTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKYLEELKVKSHKLNMLASELEQRAGTIAYLTSQLHAAKKRLLSSSGTSEASPSGSPSAQRSVPASYKPAPPKDKLPETPRRRMKKSLSAPLHPEFEEVYRFGAESRKLLLREPVDAMPDPTPFLLARESAEVHLVKERPLVIPPIASDRGGGGASEQPSPVHDKKAHVGVAHRIQHAAQPPTQPEVETLAVDQVNGGKVVRKHSGTDRTV	46557	47730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_46600_47700
864397	contig_11512_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_43399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAATACTAAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651404	652529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_651400_652500
864398	contig_3817_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_78372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGGAAGCACTTGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831336	831069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_831100_831300
864399	contig_6270_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_99851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATTATCTTTAACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445068	445317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_445100_445300
864400	contig_5586_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_143501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATTTAGCAAACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200365	200968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_200400_201000
864401	contig_3382_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_124128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGAATGTACATATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768099	767446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_767400_768100
864403	contig_9785_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_157911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAATATAAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610464	611633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_610500_611600
864404	contig_4156_pilon	-	680	1	Intergenic	novelGene_88124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATTATTGGGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474379	473699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_473700_474400
864405	contig_5039_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_64841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAGACAGTTTCTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307628	307921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_307600_307900
864407	contig_12644_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_44469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACACCAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011417	1012261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1011400_1012300
864410	contig_4486_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_38533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATAAATGTTTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129955	129460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_129500_130000
864412	contig_16575_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_146492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTTCAGAGTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4141	3703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_3700_4100
864413	contig_10583_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_167914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAATGAGGGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150507	150156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_150200_150500
864414	contig_16122_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_134486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATATAAAACCCACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102673	102111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_102100_102700
864415	contig_20203_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_178040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATATTCCACACTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6384	6661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20203_pilon_+_6400_6700
864416	contig_3817_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_78374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGGGTTTGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835346	834850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_834800_835300
864420	contig_4364_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_4567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTCACGCGTGTGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564601	1565257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1564600_1565300
864421	contig_11492_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_152262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCCTCAAACGGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413110	413992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_413100_414000
864422	contig_9727_pilon	-	660	2	Intergenic	novelGene_86360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	20	355	561878	561440	FALSE	10	TGCTGGGTCCCGCAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAEQSGMAGGAREVLTLQLGHFAGFVGAHWWNQQDAALGRPTDGKERPGELCPDVLYRTGRTLRGQDTYTPRLILMDLKGEAEAGVSRCLAFPFRARSLEHPFASRSSGGTGLKDQR	561897	561134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_561692_561794
864423	contig_13175_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_178041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGAATGTGGTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3339	4262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13175_pilon_+_3300_4300
864425	contig_9455_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_161834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCTTATATCTACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263172	263662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_263200_263700
864426	contig_10446_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_162501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATTTAGTTTTTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962788	962147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_962100_962800
864428	contig_12125_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_76239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTTGTTCTTATTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548882	549207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_548900_549200
864429	contig_19438_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_175894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATCTCTCGTTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6367	5670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_-_5700_6400
864430	contig_13490_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_129117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTATGTGCCTGGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20842	20212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_20200_20800
864431	contig_5207_pilon	-	572	2	Intergenic	novelGene_177604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	36	368	256940	252056	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DATIFGHLAQAMWTLPGTRPERLIKGELINLAMYCERIRRKFWPEWHHDDDNTIYESEESSEGSKTHTPLLDFSFYSRTETFEDEGADNSFSRTPDTDFTGQSLFDSDVDMDDYTDHEQCK	256975	251851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5207_pilon_-_252346_256897
864433	contig_8242_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_80197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184662	183355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_183481_184361
864434	contig_8671_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_126277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACAGCCCTGCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566648	565947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_565900_566600
864437	contig_7224_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_172967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAGAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50757	60851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7224_pilon_+_50909_60080
864438	contig_15886_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_144334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGAGTGGGAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37844	38582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_37800_38600
864439	contig_4857_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_48741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGGAGGAGGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194059	1193781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193800_1194100
864440	contig_8330_pilon	-	531	4	Intergenic	novelGene_71749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.10960933531265	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTCATCCTCATGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566420	538347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_538498_549835_550001_566111_566265_566357
864442	contig_14514_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_137447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATTAAGACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6846	7315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_6800_7300
864443	contig_5765_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_141364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404920	405914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_404900_405900
864444	contig_6724_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_167952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTATTTAGAGTCTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28627	29440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_28600_29400
864445	contig_10734_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_51326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGGGTGCTTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565084	1565669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1565100_1565700
864446	contig_15092_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_57829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATTCAGGAGGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356957	356536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_356500_357000
864448	contig_7260_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_169144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457780	458578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_457800_458600
864451	contig_7758_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_163527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGGCACAGTCTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109099	110216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_109100_110200
864452	contig_18108_pilon	-	383	2	Intergenic	novelGene_33436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTTGTGCTTCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42741	42254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_42572_42675
864453	contig_6677_pilon	+	655	2	Intergenic	novelGene_114154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAAGGGATGGGGGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383936	384923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_384309_384640
864455	contig_7428_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_77744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTTGGACTAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511351	511926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_511400_511900
864456	contig_405_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_135282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86038	85422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_85400_86000
864457	contig_8464_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_125395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTGCTTAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857214	858003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_857200_858000
864458	contig_1154_pilon	+	809	1	Intergenic	novelGene_87144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	14	400	853736	854122	NA	75	ACAGAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPSFMTQSLTTPPRLQLQNRLKNLYTHDLTRSSEQPNEVDAILIPKLQMRKLRHKGLSGHSGRGRSLGQVTPRFLLLGSMLPDYCTALFSGWLLLSLHPAWFGSHGQQPPICSRFCYQQCLSAGLGDRAALP	853722	854531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_853700_854500
864459	contig_1009_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_121779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACGAGGAAAAGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305788	305190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_305200_305800
864461	contig_15384_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_85122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCCCCTTGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82115	81621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_81600_82100
864462	contig_6630_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_30724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCACTTTTTTGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747539	748455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_747500_748500
864463	contig_9875_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_154412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	57	374	141407	141724	NA	60	GTTAGAAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHTPYWIMSSLDYGLWAFFIVRYGDGSSVPSKQGPVSIKWMVRAVAGGATSPGGCDICAASDQLHRKALSSPRRLPMGLQGVAGQSCLLGLPRSWASTAGAPRS	141350	141990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_141400_142000
864466	contig_6513_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_117782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATTTCTGCAACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204460	203972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_204000_204500
864468	contig_8238_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_165235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38640	39102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_+_38600_39100
864469	contig_5725_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_167143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225767	226684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_+_225800_226700
864470	contig_12743_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_178042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTGGAAAGACTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729	1116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12743_pilon_+_700_1100
864471	contig_12993_pilon	+	519	2	Intergenic	novelGene_136723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCATGCTTCCTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40952	76563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_41064_76155
864473	contig_14682_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_139134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAGACTCAAGTAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161243	162031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_161200_162000
864474	contig_10940_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_49205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1	6	351	356	522983	522978	NA	45	TCAATAAAAGTCAGCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADPGAVGPGCPCGAAADTPGLHGQAAFFWPWGHLRTPLPGLQHPEHPLQTAGPPEEVPHGLLKAQGSCPPSLGRALWWSSQAGGGSGATGTTFEGSVVVEEGTRASRIVCPVVYKFM	523333	522753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_522800_523300
864475	contig_9440_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_59082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATATTTATATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333165	1333620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1333200_1333600
864476	contig_6084_pilon	-	938	5	Intergenic	novelGene_127048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	26.8083475805578	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	231	938	361272	354875	FALSE	25	TCTCCTACACATTGTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATCSDDTTIALWDLRKLNTKVCTLHGHTSWVKNIEYDTNTRLLVTSGFDGNVIIWDTNRCTEDGCPHKKFFHTRFLMRMRLTPDCSKMLISTSSGYLLILHDLDLTKSLEVGSYPILRARRTTSSSDLTTSSSSSGPRVSGSPCHPSDSNSLSEKHMSRASQREGVSPRNSLEVLTPEVPGERDRGNCITSLQLHPKGWATLLRCSSNTDDQEWTCVYEFQEGTPVRPVSPRCSLRLTHYIEEANVGRGYIKELCFSPDGRMISSPHGYGIRLLGFDKQCSELVDCLPKEASPLRVIRSLYSHNDVVLTTKF	369575	354874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_355172_356073_356220_359404_359519_361121_361325_369397
864477	contig_2113_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_161148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGCTGCTGGCGAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308827	308433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_308400_308800
864479	contig_8552_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_80100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGTAGCTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543715	543490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_543500_543700
864480	contig_2463_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_42994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGCCTCTCCCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11471	11217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_11200_11500
864481	contig_10404_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_138708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCTCTGACCCTCGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228717	1229012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1228700_1229000
864482	contig_8907_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_85827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	106	459	425499	425146	NA	60	CAGGTTAAAAAAAGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELLSYPSTLNCELLESRDPADSLFCHRGPTEYKIPAFEDVTSLLERANVKLSNYLLKASKCQALVRQYISEPSEMPLGGLKPPTGLLVSSQACLLSVCTTRGHRFRNKWKIFCRL	425604	425127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_425100_425600
864483	contig_4364_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGTTCTTAGCAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278832	1279493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1278800_1279500
864484	contig_15383_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_162200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAAAAGGAGGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17720	17013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_-_17000_17700
864485	contig_5961_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_144177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGATATGGAAAGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284037	283458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_283500_284000
864486	contig_7707_pilon	+	1102	1	Intergenic	novelGene_72230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCAGAAGCAGGTACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973912	975014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_973900_975000
864487	contig_14882_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_114988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67488	68065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_67500_68100
864488	contig_5794_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_69755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524524	525073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_524500_525100
864489	contig_15866_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_63605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGATAGGAAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331362	332544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_331400_332500
864490	contig_5916_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_158025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTTTAGGCTGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252869	252498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_252500_252900
864492	contig_11448_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_66427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGGCTAAGCAGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595792	596668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_595800_596700
864493	contig_6361_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_24039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGCCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689166	688576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_688600_689200
864495	contig_9436_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_60883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATATATTTTGTAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237437	238147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_237400_238100
864496	contig_11370_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_98764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGACGCGGAACCGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212852	212516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_212500_212900
864498	scaffold_9100_pilon	-	1146	1	Intergenic	novelGene_83229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTATTAAACTACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460018	458872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_458900_460000
864500	contig_16045_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_130861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCAAAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49577	48742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_48700_49600
864502	contig_5832_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_134124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	65	577	145793	145281	NA	20	CCTGTAGGGGGAACTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVRGRELLLGLAVAAVAMVGAWLMGWWIPRSGFRLFIPEELARYRGGPGDPGLYLALLGRVYDVSSGRRHYEPGAHYSGFAGINEAIHAFLFFGAGQSLPVRRSFIYSSAFPPYTFIRSARRAGLSRTILLVFCCGGTMAIFYRSLPSLSFPTAQRDFYLRNTSPASY	145857	144768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_144800_145900
864503	contig_5891_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_151583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134446	133900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_133900_134400
864504	contig_15498_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_42721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038969	1039240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1039000_1039200
864505	contig_18184_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_123893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	297	599	685734	685432	NA	55	AAAAAATAATAATTAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPFQERMWMKGPVSDGIGGFRETRAYSVEDPRSLLLSPRMIVGEVVEKLHCNILLWGGNGSMVSAIPTEAGVKKGTGRMTQERGRRGWGPLKEQRGFGC	686030	685090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_685100_686000
864506	contig_16503_pilon	+	253	2	Intergenic	novelGene_162078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACTCAGCCTGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143014	147723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_143103_147558
864509	contig_12977_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_122797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAATAAAAGGCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26821	27325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_26800_27300
864510	contig_12939_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_166207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACGGAAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137690	138153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_+_137700_138200
864511	contig_4732_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_75459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTTAGGAAGAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694480	694905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_694500_694900
864512	contig_7171_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_101276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCACTGGCATGGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987751	988249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_987800_988200
864515	contig_10096_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_177157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCACTTGCTCTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71252	71881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10096_pilon_+_71300_71900
864516	contig_7575_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_176021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTCATTTCTATCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66518	66184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7575_pilon_-_66200_66500
864517	contig_10962_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_103911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATATCGGTTAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376770	376123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_376100_376800
864519	contig_5918_pilon	+	423	2	Intergenic	novelGene_99620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	21	403	423	2221415	2221435	FALSE	45	CTGAAGTTTCCAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EISSDLKIDSSTVERIADGHSPGVAVIQFAVGEHRAQVSVDVLVEYPFFVFGQGWSSCCPERTSQLFDLPCSKLSVGDVCISLTLKNLKNGSVKKGQSVDPASVLLKHSKTDSLAGGRHRYTEQENGINQGSAQMLSENGE	2206702	2221435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2206814_2221123
864520	contig_5832_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_134175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	212	397	565922	565737	NA	15	ATCAAGGCGGCCGCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGARPPAAAQLGTLRSGEGGVFPGSHSRDFSPSSSLSRLLKRVQPGAAVRGVSLGLGFQGGAWVPGHLCFMAGEVKAPLRENGAGAQAPPLQEPRVRRFVNLFGASVSLLCKMGARKDRKEPTREHSPPRR	566133	565684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_565700_566100
864522	contig_2069_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_23555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	1655363	1655695	NA	20	TCTATTCCCCATTTATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGTAALPLVAAADPHPVQLQPRWAPRGESRSSRRAGRGGRQGLSGPRLTAKTAVVLSGPDCQWAHKPPESSGYAGAVSEVPAHLRLDSQHGTNSYPETRANRSFSCYTDH	1655361	1655850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1655400_1655800
864523	contig_11413_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_103226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCGTGTCTGACTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854362	853852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_853900_854400
864524	contig_12837_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_57365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGGGTGCAGAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285493	284947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_284900_285500
864526	contig_9177_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_32664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTGTGTAACTACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107353	107818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_107400_107800
864527	contig_10122_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_177146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGAAACAATCACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37301	36778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10122_pilon_-_36800_37300
864529	contig_2480_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_63504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGCTTTCATTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96179	95945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_95900_96200
864530	contig_5954_pilon	+	392	2	Intergenic	novelGene_28552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607127	607682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_607183_607345
864532	contig_8576_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_88823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGCAAGGGAACACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003951	1003388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_1003400_1004000
864533	contig_2463_pilon	+	657	2	Intergenic	novelGene_43034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	239	622	544034	549044	FALSE	25	CATTTATTGAGTGCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELPAPSSAPRKTEEPGPRAEVMEEVTSCSFNSPLFQQEDKRGITYRIPALLYIPAARTFLAFAEKRSTCRDEDALHLVLRRGLRTGHLVQVTAYPFSGPEPQFLSRVSQDLCLYPSVQEKLCEGS	543795	549079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_544098_548724
864534	contig_11719_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_154760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAGAACATGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43420	43829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_43400_43800
864536	contig_6720_pilon	+	609	2	Intergenic	novelGene_178044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAAGGTTTAGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288813	290445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6720_pilon_+_288973_289995
864537	contig_18934_pilon	+	559	1	Intergenic	novelGene_175888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	21	365	122147	122491	NA	20	TTTGCTCTGTAAACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWWECKMVQPQSKRLMDHMNHSLHDPETRRTRWCPATATTNCSDWDHNRGSWTEREKTVEQKIKFTKKTRLAGLTETGGAPETMALRHPSDLEIKPETIFQPNDRQAHKRNSNTQEERTP	122126	122685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_+_122100_122700
864540	contig_11281_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_125514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGCTGAGCTTGCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964715	964922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_964700_964900
864541	contig_5945_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_104592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATGTGTTTGAAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329800	329194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_329200_329800
864542	contig_11160_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_168846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGGTGACAACATGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341982	342240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_342000_342200
864545	contig_8252_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_50347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACCAAAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182136	182956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8252_pilon_+_182100_183000
864546	contig_5827_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_129801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAGGCAGCAGGCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465127	465894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_465100_465900
864548	contig_5479_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_133587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATACAGAAAAGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234054	233739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_233700_234100
864549	contig_14744_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_65968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAGTAAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736477	736076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_736100_736500
864550	contig_15888_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_84462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGTGAAACAATTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577717	578068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_577700_578100
864551	contig_7050_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_153608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATAAATAAAAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578020	577319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_577300_578000
864552	contig_11978_pilon	+	923	3	Intergenic	novelGene_62931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCACAGGCAGTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917722	920117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_917816_918458_918590_919418
864555	contig_10451_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_138338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGCCCTCAGCTTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531369	531067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_531100_531400
864557	contig_7866_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_171194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTGGAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247430	248188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_247400_248200
864559	contig_16860_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_155344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAGAGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119518	120135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_119500_120100
864560	contig_1618_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_141775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGAACCCTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91356	91934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_91400_91900
864561	contig_15353_pilon	-	631	2	Intergenic	novelGene_151982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAATGGCGGATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530194	529346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_529451_529667
864563	contig_5047_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_158005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGTTAGCAATGTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380311	1379157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1379200_1380300
864564	contig_10306_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_175733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAATTTTTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8792	7984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10306_pilon_-_8000_8800
864565	contig_15887_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_177465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCATCGCGCGCTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32269	31918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15887_pilon_-_31900_32300
864569	contig_5686_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_45376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATATTTGGCCCTTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143313	143637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_143300_143600
864570	contig_14745_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_147849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCCTGCCTGCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54116	53872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_-_53900_54100
864572	contig_9272_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_125969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGTATACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621626	620994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_621000_621600
864574	contig_5039_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_64846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACCAAACCCATCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324115	323737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_323700_324100
864576	contig_15031_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_138402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCAGTGAGAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76044	76419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_76000_76400
864577	contig_7933_pilon	+	915	1	Intergenic	novelGene_164662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAGAAGACAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82639	83554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_82600_83600
864578	contig_12630_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_173063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACATATTGAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37863	38350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_37900_38400
864579	contig_10988_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_104721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCACTCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47614	48340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_47600_48300
864580	contig_9216_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_163518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGGAGAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701865	702106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_701900_702100
864582	contig_13366_pilon	-	902	1	Intergenic	novelGene_99773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTACTTATGCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55884	54982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_55000_55900
864583	contig_19311_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_144091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCCTCTTGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221233	220576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_220600_221200
864584	contig_19701_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_147899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTTTTTAAAAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140364	139943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_139900_140400
864585	contig_13941_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_174661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTAGATGGTAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82712	83166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13941_pilon_+_82700_83200
864586	contig_2323_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_151839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTTGTGAAGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35674	35047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_35000_35700
864587	contig_13349_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_161120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCGAAAAGCAAGATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21088	20786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_20800_21100
864589	contig_9883_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_87598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTCCTCGAATCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105226	104732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_104700_105200
864590	contig_11708_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_138972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279618	280269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_279600_280300
864591	contig_12327_pilon	+	445	6	Intergenic	novelGene_140650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.380402472601	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	40	354	209738	215081	FALSE	30	GCTTGTTGAGAAAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAALGRAPSDGMSGPRPVVLSGPSGAGKSTLLKKLLQEYGSVFGFSVSHTTRDPRPGEENGRDYHFVTREAMQRDIAAGDFIEHAEFSGNLYGTSKAAVRAVQAMNRICVHGTPQ	189236	215172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_189274_209735_209850_210256_210299_210406_210504_211767_211811_215060
864592	contig_405_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_135297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACTAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190093	189502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_189500_190100
864593	contig_12528_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_81269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGTAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183211	183855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_183200_183900
864594	contig_9646_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_117481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATGATCATCAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454966	454450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_454400_455000
864595	contig_18895_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_176800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACAAACCTGTGGGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11548	11128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18895_pilon_-_11100_11500
864597	contig_9091_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_32455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240814	241346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_240800_241300
864599	contig_9812_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_173475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAATAATCTGCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25305	24487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9812_pilon_-_24500_25300
864601	contig_12128_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_131993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAATAAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411845	412357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_411800_412400
864602	contig_9995_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_47776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAGAGAAAGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737819	737247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_737200_737800
864603	contig_20228_pilon	-	659	4	Intergenic	novelGene_178045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.62466929133727	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	186	521	23254	12210	FALSE	40	AAAACTTCCTGGAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVKVLYKQLAGCELEQVDVPIGTGLEHILETIRTYWERDVEKNRVEAGALLQAKQQAGAARMAQTREEKLATALRVELHNTSCQVQSLQAEMESLQALKRGLENTLHDAKHWHDIELQNLGAVVGRLEAELREIHAEAEQQREEREHLLEHKCQLQKELAAYHALLDREEGR	40907	12071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20228_pilon_-_12214_14408_14630_23143_23276_40743
864604	contig_2550_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_135662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165670	1165113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1165100_1165700
864605	contig_8284_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_125685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTTTTAAGAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367714	367301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_367300_367700
864608	contig_2888_pilon	+	334	1	Intergenic	novelGene_151484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGGGTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6744	7078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_6700_7100
864611	contig_15114_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_121109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAAAAAAAAAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74319	74658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_74300_74700
864612	contig_8552_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_80082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAACAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493841	493310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_493300_493800
864613	contig_19851_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_29888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGATAACATCACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151324	152419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_151300_152400
864614	contig_17560_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_167583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAGCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95087	95611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_95100_95600
864615	contig_6767_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_174616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCTGTGAGTTAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19137	19579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_19100_19600
864617	contig_17068_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_172574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAGGGAGTAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185494	185108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_-_185100_185500
864620	contig_9571_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_136339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801476	800823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_800800_801500
864623	contig_9713_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_170254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292391	293326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_+_292400_293300
864624	contig_15354_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_65696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTTGTAGCTCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73004	72673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_72700_73000
864625	contig_9189_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_165121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379045	378295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_378300_379000
864626	contig_9389_pilon	+	329	5	Intergenic	novelGene_84008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	17.4696164811939	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	14	328	528462	539228	FALSE	15	ACATGGACCGCTTCGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETKMATLPAPGLFGLRILGLRSGVGAAVQARGIHQSAATGRPSSAQPAVPKAGAVVPKPTALPSSRGEYVLAKLDDLINWARRSSLWPVTFGLACCAVEMMHMAAPRY	528448	539229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_528478_531579_531617_535010_535080_535512_535631_539153
864628	contig_12031_pilon	-	524	2	Intergenic	novelGene_137572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	318	335	361431	361414	FALSE	10	TCGAGTGCTTACCTTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSSAGFGFPRRRPGRGAQAVGSGIQSCGEEPGPFSHHDHAALRRVGTCTGDPQDPATKAARKGLFRQHPAPNHLVSASCPTQSEPRTLRELAALGLALLRVAFTMELVG	362396	361224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_361445_362092
864629	contig_13479_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_168556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	113	385	10537	10265	NA	55	TTTGTCAAATAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGGVEGEEAVQGDQKGAEPLPRQPHPTPASRQPTASMQRRRGEAAADTVALAATDAGPGPGPGPPFPRLLCPVPAPFAPPPARPASTAGPARFQPPPLVGWGDPLPSDSGIAGWKTGPFTALWTLL	10649	9991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13479_pilon_-_10000_10600
864630	contig_15596_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_139549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAATACATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204510	203886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_203900_204500
864631	contig_14638_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_71589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	491	805	270138	269824	NA	40	GTTGGCTTCAACAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSGSASVRQMDGWGLSAPQPMPLRKLTAAQLLCCGPSRQLVDALRALLWKGKSPVVKDSCQLFIVSGWKGWEVPRRLAVPFLSCLGILEASGVGGLLAWSMA	270628	269716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_269700_270600
864633	contig_17198_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_62419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGGGGATAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140677	1140391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1140400_1140700
864634	contig_15744_pilon	+	229	2	Intergenic	novelGene_83566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACTTTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20805	22015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_20958_21938
864635	contig_15236_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_141583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTGTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427503	427017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_427000_427500
864636	contig_3975_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_54712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACCAGTAACCAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402910	1403545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1402900_1403500
864637	scaffold_15568_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_122590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAGGCACTAAGGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247383	247670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_247400_247700
864638	contig_14472_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_111162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTACTTACTGCACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72403	72065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_72100_72400
864639	contig_9091_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_32454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGGGATCTTCCACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240716	241303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_240700_241300
864642	contig_19899_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_102529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCCATCTTTCCACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188916	187991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_188000_188900
864643	contig_10749_pilon	-	496	4	Intergenic	novelGene_133422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	149	496	95219	92042	FALSE	85	GAAAGATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWEVSSSAFFSREDTHSFRFWRQREAAARLRSRKRCRRSSGSSSTVRRRLPPVLGVGWAGETCGWAGDGASGCWMRIWLCSGRAVTMVLAVPTTVPQPPLIEETWWVRVAFSLCG	102687	92041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_92200_95029_95230_96469_96577_102656
864644	contig_11815_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_50911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTGTTCTTTAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174841	175224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_174800_175200
864647	contig_10734_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_51398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAAAGTCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2037487	2036920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2036900_2037500
864648	contig_7045_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_77486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTTTTTTAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547780	548389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_547800_548400
864649	contig_2733_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_128569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGATCAAAAACCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616343	617266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_616300_617300
864650	contig_614_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_132655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTTTAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077716	1076965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1077000_1077700
864651	scaffold_4438_pilon	-	345	1	Intergenic	novelGene_174546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTCCTCAAAGTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411494	411149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_411100_411500
864653	contig_987_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_72273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495272	494698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_494700_495300
864654	contig_2854_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_120849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGCCACCCCTCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299224	298872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_298900_299200
864655	scaffold_7386_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_136604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	156	146	301	353775	353620	NA	15	TATTCACTGTTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPGRRCRAEVTGLPAPGPGAWSSPAAVDVLGLSSLRWGGGRGEEGMCWLQWFSAAPTPSELGPGALHPKGQQTDPTAGHSQTLTCAIRLLKSFAFFS	353920	353617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_353600_353900
864656	contig_12139_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_146471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	216	350	120136	120002	NA	65	GACTTAAAAAAAATAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAPEGPAVGQYCTRPVAHAARASHGKRQPPPLAYEDAGAQRGYSTHPGSHSTHTAELRSGPRSGLDAVPTMLPSGLHQAAVAAWIWAVEMELAGGKSGQTRTLRCRSFTRQAPS	120351	119845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_119800_120400
864657	contig_10711_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_118419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTATGCAACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238002	238333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_238000_238300
864660	contig_5947_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_101589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880270	879563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_879600_880300
864661	contig_6707_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_167047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGGACGGCACACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211680	211334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_211300_211700
864662	contig_149_pilon	-	850	3	Intergenic	novelGene_173781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	39.5	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGAATTTTCATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69390	43251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_44000_55556_55608_69339
864663	contig_11720_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_43871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCTATCGTACTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98525	98753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_98500_98800
864664	contig_12079_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_67492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	229	312	823355	823272	NA	10	TCCCTTGCCTACACTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSVAPTACPGNLPSRPPHFVSPLLASRNPCPWHYLHLSGSHDTLAPTCLKARLHRKEGGPRPDVTLSLTDHSSPAMGTYTYTSRPRPLPCQRRRYRDSLLQP	823583	823167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_823200_823600
864666	scaffold_13505_pilon	+	613	2	Intergenic	novelGene_111640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773143	774000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_773589_773832
864667	contig_9366_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_166287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGACATTGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086544	1087622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1086500_1087600
864668	contig_17474_pilon	+	681	3	Intergenic	novelGene_176649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	4.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTTCGCCAGCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14534	18032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17474_pilon_+_14681_17358_17430_17568
864669	contig_9436_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_60881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAAAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235883	236252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_235900_236300
864671	contig_14807_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_124714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	53	373	42003	41683	TRUE	15	CTGGCCTGCAGACGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLLETICSHSNKTLGPQSCLFRGQMVAGDCHFSLTCCSAPGRQQAPLEAEQRRATSRDWQNPDGSQWWSKSVQPGGGGQTLLARGVWQESGGFPPALGTATPTA	42055	41420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_41564_41618
864672	contig_10864_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_107096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGGTTTTTACATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976492	975933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_975900_976500
864676	contig_3862_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_137434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCATCTTTACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638147	638526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_638100_638500
864677	contig_11986_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_69221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGACCTGTTTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746655	747418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_746700_747400
864678	contig_15273_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_140448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCATCAAAATAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186059	186268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_186100_186300
864679	contig_5718_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_110344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACCCGCTGAATCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599306	599549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_599300_599500
864681	contig_5093_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_135091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTCACTTGGTCCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597271	597914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_597300_597900
864682	scaffold_12124_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_22163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTAGGATGAATTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012495	1013231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1012500_1013200
864683	contig_211_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_129866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCCTGTGCTCCTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147515	147221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_147200_147500
864684	contig_11267_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_175385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCAATGTAGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337184	336244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_-_336200_337200
864685	contig_18096_pilon	+	466	3	Intergenic	novelGene_58046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1062	junction_1	213	89	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAGACATTTAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40372	44461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145
864686	contig_2414_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_158487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTATTCGTCTGACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298063	298310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_298100_298300
864688	contig_7338_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_156804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	140	451	380109	380420	NA	15	GCTTCAAGCTGCCCACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCLSCATCSLSMLAVDASSEFCAFKVFTFSSSRAILSSFLFRHLEAAMRFLMRFLSALIRSCDSMSMGDRGGVSPGISGTVCGSSFRAWSRGCCTAICWGR	379969	380889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_380000_380900
864692	contig_11924_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_128021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGTCAATCAGCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34039	33603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_33600_34000
864693	contig_15613_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_147205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120965	121910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_121000_121900
864694	contig_13305_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_146779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGTTAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144871	144393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_144400_144900
864695	contig_6975_pilon	+	204	1	Intergenic	novelGene_74315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGTAAGACGGTGGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607066	607270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_607100_607300
864696	contig_6975_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_74275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGTGAATATCCTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167246	167595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_167200_167600
864697	contig_8576_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_88758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTGCCACTTACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716842	715916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_715900_716800
864698	contig_9435_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_156953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAGAATTAAAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233997	234657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_234000_234700
864701	contig_14514_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_137445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAATCCATTTTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858	1245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_900_1200
864702	contig_11017_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_128059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCAGCTGTTCGTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64715	63795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_63800_64700
864703	contig_8656_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_162352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAGAGACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548374	549244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_548400_549200
864704	scaffold_16539_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_68377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTTTAAAAGGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610445	610849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_610400_610800
864706	contig_476_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_177775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	471	560	9617	9528	NA	20	CAGACACTAGTTTCCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLLQLVAPTGVDCYPGRNWGQRRSQPARRTCRVGERLRWAHSECHTSHAPFPNDGLLWGAPKLKDKLVLLESLWYKLPVLSLVPQASLLALGVSGWSKRLPDVPSSAPTIPLQVAPHFPWRRPSGLVERGPAPQETFSKFHLLPCGPRSALEPGGMRLKAIQARGSFGMTASSRDKSVLIGGDC	10087	9507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_476_pilon_-_9500_10100
864707	contig_9481_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_149666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCATCTGTTCGTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361994	362323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_362000_362300
864708	contig_10196_pilon	+	947	5	Intergenic	novelGene_132335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	52.6230700358692	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	208	825	2419317	2435007	FALSE	10	GTTGCTTTTTTGATTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDNTSPISVILVSSGSRGNKLLFRYPFQRSQEHPASQTNKPSSRYAVNSTGDHSEDQDGDSRFSDVILATILATKSEMCGQKFELKIDNVRFVGHPTLLQHGLGQVSKTDPSPKRETPTMILFNVVFALRANADPSVISCLHTLSRRIAVVLQHEERRCQYLTREAKLILALQDEVSAVSDGERAPCAVGGQLLSRAQRHPPLC	2419109	2435129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2419435_2421905_2421976_2429142_2429273_2431508_2431584_2434782
864709	contig_4301_pilon	+	359	3	Intergenic	novelGene_65079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	90	270	359	337570	338448	FALSE	55	CCTGGAAAAACAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQTFHSYLEDIINYRWELEEGKPNPLREASFQELPLRTRVEILHRLCDYRLDADDVFDLLKGLDADSLRVEPLGEDNSGALYWYFYGTRMYKEDPVQGKSNGEISLSRESEGQKNVSNV	335704	338448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_335890_337485_337626_338414
864710	contig_10424_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_56815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	140	325	330881	330696	NA	75	GTAACCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLLTPELIRPQGLRLLPGQVWQLLAPSEPSFPPSAPQSSFSTPPLMFSAPTLPYIIESLVSLSLCCKRVHQKCLTTLPSWPCLYSFEWHRNVPWWEGTIIYLAVFF	331020	330434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_330400_331000
864712	contig_10063_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_127743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGGTGGTTAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396149	396863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_396100_396900
864713	contig_2114_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_104317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAATGACTACTGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138830	1138513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_1138500_1138800
864714	contig_5877_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_178046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAGTTGTGATCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355075	353590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5877_pilon_-_353600_355100
864715	contig_6593_pilon	-	453	2	Intergenic	novelGene_49831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTCTGATGGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196122	189123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_189510_196055
864716	contig_10500_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_41148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCACAATGTCTAGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1188254	1187673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1187700_1188300
864718	contig_10371_pilon	+	373	2	Intergenic	novelGene_175477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTCTGTGTGGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713628	714372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_713820_714190
864721	contig_5725_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_167150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCATTCCAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250287	250046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_250000_250300
864722	contig_9575_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_169717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCTTCTGAAGTAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115093	114747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_114700_115100
864727	contig_11416_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_145383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTCTCCAAGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851835	851397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_851400_851800
864728	contig_11386_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_82830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGATTGCTGGCAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229290	228580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_228600_229300
864729	contig_5084_pilon	+	324	2	Intergenic	novelGene_64608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	250	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGTTTGTGCCTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024425	1025595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1024561_1025406
864730	contig_6202_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_139830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTATTTCTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495753	495034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_495000_495800
864731	contig_5315_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_175352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGGAAAAAAGAATCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142290	142718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_142300_142700
864733	contig_8650_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_162620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTCATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201671	202397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_201700_202400
864734	contig_15293_pilon	-	645	2	Intergenic	novelGene_146545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	252	536	193324	193040	FALSE	50	CACAAATTCAAGAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGVVLCAENIFPSSDAEGPGSGDDAIVQICACAKILAHAGAKIWRQIQTAVRDRGLQGRRAWSKPQLETAARKDSKRSRISLMKESGRSLLACKPAGELLAPLPRSGLATASGWWLDVCEYWTSRLRSHQGLRPWGWQRCVSCFPWACCEAQNPIPDHVSPTPVPTPLWQDADRDT	219866	192930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_193338_219628
864735	contig_2757_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_164604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAATTCCTCTAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509730	509045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_509000_509700
864736	contig_8712_pilon	-	697	2	Intergenic	novelGene_58758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	190741	183283	FALSE	15	CATAGCGCTTTTGTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADGRTDGPTGGRAEPGLRSCCGRAVGLRAAPWTLRSSLTEQATPKSFLPREPPRSDHVYHGPQPHHGRGYGDCHPHRHRCPGGLDPGLLVLPSAPAHQPVRR	190743	182896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_183497_190646
864737	contig_16666_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_61726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACCTTGAGAGTATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30325	29715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_29700_30300
864738	contig_5954_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_28800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGTAGCGTTTCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1442811	1442097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1442100_1442800
864739	contig_4565_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_174701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCTACAAGATACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52760	52431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_-_52400_52800
864740	contig_753_pilon	-	492	2	Intergenic	novelGene_112952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGGGTGTGATTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120558	1119664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1119963_1120364
864744	contig_8598_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_22888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCTATAGTCTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87716	87221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_87200_87700
864745	contig_8276_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_174472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109165	109604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_109200_109600
864746	contig_2323_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_151837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26731	26028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_26000_26700
864747	contig_2689_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_100848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	143	445	321277	321579	NA	30	AACCTTAATTGTAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQILNRGSNRNELVRSPASWRNFVSLTFEVWVGPPKTLPHKRLVTEGGILRALSRPCQARTEAGARKRPAWPVYPPTTPLLRSSFSRNFAKRDVGHGV	321134	321716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_321100_321700
864750	contig_9297_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_69859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAGTGACACCAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849781	849290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_849300_849800
864751	contig_9011_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_159312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTTTTAAAAATTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497338	496746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_496700_497300
864752	contig_3817_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_78350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGCATTATTTTGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552242	552785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_552200_552800
864754	contig_16951_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_98615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCCTGTGGAGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25644	25359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_25400_25600
864755	contig_15236_pilon	-	664	1	Intergenic	novelGene_141651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	3	392	687951	687562	NA	65	AAAAAAAAAGAAAGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLTTSLSLSISGKYLSFLSLTGFRLFQVPAFTGLAVLYFLLFFSVLTVLQPHCSPRPQNSWYPPLSAEHLLSSLLGKFFHQTAARLSPSFHSGHLNLGFSWPPCHALISRSALADHFSLRAVVLSNAY	687953	687289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_687300_688000
864756	contig_2312_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_160754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	3	584	497302	497883	NA	60	GCAGATCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSARRRSSGAAELVEGGDASAAAERPQALPPASRALAPPPPPPLSSCRTGEPGYHSLPTLVSCSRLSRSAVVRRKGFITHRRRRRGPRSPLRGALPASLGPPCDTTGGGDAEPSGAGHPWAVSRLPKLLTAGFRGTRAGVGEAEAGGQGGRPRLRLSGAFSGPGAGKGRRGDGEGIVRVGLRPRKPVPTVPA	497299	498116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_497300_498100
864757	SIRV2	-	231	1	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	4574	102	3399	-67	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTAGGACTATTCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333	1102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1100_1300
864759	contig_5075_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_174080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGGACAAAAGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570942	570130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_570100_570900
864760	contig_11413_pilon	-	586	4	Intergenic	novelGene_103120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	2.44948974278318	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	14	529	70409	68475	FALSE	15	CAACTTCCTCCAGGCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGTMETQKGSTSLQWWSLLLLLLGLVVPPAAVEAFSYQEAVLRAVDGFNQRSSNANLFRLLKLDQQPDGDEDPDTPKPVSFTVKETVCPRKTQRPPEQCDFKENGLVKQCVGTVTLDQTRNSFDITCDRPQRVKRSGNLGRLIRKGGEKIGKKIERVGQRIKEFFEKLAPTTES	70422	68417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_68613_69223_69296_69436_69545_70211
864761	contig_3426_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_57923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCTTTCAATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162257	162799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_162300_162800
864763	contig_6375_pilon	-	302	2	Intergenic	novelGene_73064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATCAGTCAATGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687404	683987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_684224_687338
864765	contig_9571_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_136320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAAATTCTCTGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644198	643727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_643700_644200
864766	contig_8896_pilon	-	434	3	Intergenic	novelGene_171575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAAATCAGGTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187993	187366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_187618_187703_187767_187873
864767	contig_6277_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_80412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCCTACATGACAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725833	724902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_724900_725800
864768	contig_16685_pilon	-	485	3	Intergenic	novelGene_115056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTCCAAAGAAAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558178	554464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_554679_556082_556263_558087
864769	contig_7272_pilon	+	690	2	Intergenic	novelGene_25285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGAACCTAGCTCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314274	315621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_314863_315519
864770	contig_13464_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_125241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCTTCCAGGTTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242152	241780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_241800_242200
864771	contig_20293_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_153518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAGACAGGCAAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	55601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_55600_56000
864772	contig_9185_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_166915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACTCTTTCAACACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547795	547571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_547600_547800
864773	contig_10466_pilon	+	867	1	Intergenic	novelGene_173635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAAACTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690711	691578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_690700_691600
864774	contig_16103_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_118962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAGTAGTGACGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031803	1030727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1030700_1031800
864775	contig_8330_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_71973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTCCCTCTGCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2035195	2035789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2035200_2035800
864776	contig_12635_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_60832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATGACAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263255	263731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_263300_263700
864777	contig_8978_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_49317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATACTTGGTACGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189017	187981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_188441_188915
864778	contig_5047_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_158004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCATGTGGCTTAAGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274022	1273634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1273600_1274000
864780	contig_14223_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_156973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGTTTTGCTGGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32533	33378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_+_32500_33400
864781	contig_1154_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_87050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAGGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97364	96936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_96900_97400
864782	contig_5602_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_133053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACTGTTTGAAAGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873785	874190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_873800_874200
864783	contig_14682_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_139133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACAAGACTAATGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161848	161243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_161200_161800
864784	contig_2940_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_81943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAGGCAGCGCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722579	723489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_722600_723500
864785	contig_12765_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_106548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTACACACCTAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11188	10739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_10700_11200
864786	contig_8651_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_168175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAGGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169135	169583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_169100_169600
864787	contig_20605_pilon	-	612	4	Intergenic	novelGene_176230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	31.947874212014	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	7	612	11062	5825	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEMGHNFGMFHDSYVCKCPSTICVMDRALSFHIPTDFSSCSRVSYDKFFEDRLSNCLSNVPLPTDIISTPICGNHLIEMREDCDCGTPEECTNICCDAKTCKIKAGFQCALGECCERCQVKAAGTVCRPAKDECDLPEMCDGKSGNCPNDRFRVNGYPCQNGKGYCLMGMCPTLQEQCTEMWGPGRNTNSSIAGIPASSYEPPK	11068	5824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20605_pilon_-_6080_8405_8496_9909_10088_10979
864788	contig_7816_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_66538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAATGGTACCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245965	245684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_245700_246000
864791	contig_9571_pilon	+	490	3	Intergenic	novelGene_136312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	40.5	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAACGTCTTGCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592821	682639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_592955_596578_596678_682381
864792	contig_5297_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_175670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	494	958	86379	86843	NA	30	AGCCACTACGTAATAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCVVHEPWLAKTWGMAEEGVWWQPASAVSGYLGDSPLCLQPVHTVSLSWKTRTWSRHSGADNRKRGMAVLTGLRPGPSPPKWARGLCSLPPSSVMCRQDLELGSGATGGDPGFGSSEDIVEDIIRPCSLAERRTVIFRRQHVPTVNGGELFLP	85885	86919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_+_85900_86900
864793	contig_13428_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_143450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGTATTTTTCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84934	85270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_84900_85300
864794	contig_1037_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_84593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACACAGTAAATCTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166112	165585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_165600_166100
864795	contig_7056_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_43691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAACCCTGGCTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905083	905524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_905100_905500
864796	contig_12327_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_140654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	41	301	267158	267418	NA	50	TACTGAATTTTAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYANLGVQNVYQPMKEEKLKGSEHMGKKWACSELRLCPSFSIGPDEVRVCPSNTPEIPSSPKEMTCFMGIEATTFPYSRNIVSHCQTHFNHKCWTNLLN	267117	267430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_267100_267400
864797	contig_9858_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_140533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAGACTTACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227481	228070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_+_227500_228100
864798	contig_10711_pilon	-	655	2	Intergenic	novelGene_118441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAAGGGGCAGCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806834	806040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_806117_806255
864801	contig_8676_pilon	+	632	2	Intergenic	novelGene_142221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAGGAGAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661206	662491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_661797_662449
864802	contig_5499_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_57032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441711	1442168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1441700_1442200
864805	contig_18081_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_23813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	13	42	279	320	158955	158914	NA	15	CTCCTAACTTCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTSCVQPSVHLRIHKSCRRQLPTCGPPVAHSDTDLLGCVRHGPSQGSALGLTPETSVSIESGCLVSLWLEWQQLHFRSVYQKEPEIVVYSWMKALWHHTAQIAY	159233	158870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_158900_159200
864806	contig_9721_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_155985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAGAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222896	223205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_+_222900_223200
864807	contig_6109_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_160382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581837	582133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_581800_582100
864808	contig_8260_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_163253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAGAAAAAAAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177974	178736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_178000_178700
864809	contig_1244_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_37902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189913	190480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_189900_190500
864810	contig_20672_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_176905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGTTTTCATCAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1875	1117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20672_pilon_-_1100_1900
864811	contig_7058_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_136028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCCAGAGACTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204629	204153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_204200_204600
864813	contig_14219_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_54295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGAATGTTATATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625557	625162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_625200_625600
864814	contig_14986_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_59713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	245	778	47285	46752	NA	25	CCCTGTACGAACTGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVVGNLAEDLGLHVRDLLTRNLRVSAEKQYFTVNTDDGNILVSDRIDRESLCPRKPLCVLPLEIVAENPLNVFHINVIIEDINDNPPHFPQDGFVLQINELAIRGSRFGLESAIDADVGRNSLQSYRLSSNEHFSLMVKDKTKGKNAPELVLEKPLDREQQSSHLLVLTAVDGG	47529	46749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_46700_47500
864815	contig_16103_pilon	-	270	2	Intergenic	novelGene_118677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5398	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17949	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17743_17879
864816	contig_4418_pilon	+	788	2	Intergenic	novelGene_98358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTTTGCTGCTACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658735	667764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_658813_667053
864818	contig_13526_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_165198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCGAGTATCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130983	130108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13526_pilon_-_130100_131000
864820	contig_11594_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_80898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGAAAAAGTGCGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141694	141059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_141100_141700
864821	contig_9435_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_156958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCTAGAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319528	318810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_318800_319500
864822	contig_776_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_139956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTATTTTTCTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120728	1119923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_1119900_1120700
864824	contig_5236_pilon	-	493	1	Intergenic	novelGene_100898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCAAAACATCCGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71360	70867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_70900_71400
864825	contig_5918_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_99486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGCAGTGGTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186700	187115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_186700_187100
864826	contig_5959_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_150231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGAAGATTAAATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588241	588592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_588200_588600
864827	contig_5502_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_155024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCCAAAGCCTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538538	539167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_538500_539200
864829	contig_7164_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_172139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464953	465224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_+_465000_465200
864830	contig_10861_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_39243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGATATGAACTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634273	633771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_633800_634300
864831	contig_9119_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_169740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93034	93607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_+_93000_93600
864832	contig_9389_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_84139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1759709	1759442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1759400_1759700
864833	contig_4402_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_140811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACCCTAGCTGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373506	372771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_372800_373500
864834	contig_2924_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_140265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACATGCTATAATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118402	118946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_118400_118900
864835	contig_2312_pilon	+	185	1	Intergenic	novelGene_160758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAGACCCAGGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615899	616084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_615900_616100
864836	contig_14322_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_115670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665346	664908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_664900_665300
864837	contig_16211_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_150108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCCACATTCTGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240575	240942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_240600_240900
864838	contig_2894_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_86539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTATGTTTTGGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223799	225040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_223800_225000
864839	contig_16211_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_150083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTAATAATTTAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173976	173489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_173500_174000
864840	contig_614_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_132658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGGAAAGATGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108280	1107927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1107900_1108300
864841	contig_1877_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_178047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTAACTAAGTATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254067	254413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1877_pilon_+_254100_254400
864845	contig_12768_pilon	+	593	3	Intergenic	novelGene_178048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	61	405	138394	142300	FALSE	30	GAACAGTCCTATAGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLILAVLAICCLAACVVEGVGSEVPDRSVCVSLHTRSLPVQKIKSYTIKEGSMKAVIFITKRGLKICADPQAEWVKTAVRSLDKKSTTRKNMVQTTPMGAQQSTNTAATLTG	138333	142488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12768_pilon_+_138455_140970_141086_142131
864846	contig_13888_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_151804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCACCCATCTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347198	346827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_346800_347200
864847	contig_12644_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_44432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACATGAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35433	35046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_35000_35400
864848	contig_5571_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_75519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATCTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142943	142577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_142600_142900
864849	contig_9414_pilon	+	366	3	Intergenic	novelGene_131078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	263.5	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAATTTTGGAGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369489	393068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_369642_370401_370511_392963
864850	contig_8735_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_173712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTAGGTACTACAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39134	38818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_-_38800_39100
864851	contig_5352_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_177071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGTTACTTCAGTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285927	285435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_285400_285900
864853	contig_20398_pilon	+	655	5	Intergenic	novelGene_155191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.1840462387393	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	187	546	68898	74142	FALSE	35	TTAAATTCTCATTAGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLGVPSGEEMDSKAENSHVWPTAAEHEQNTAQVHFVPDTGTVTQIVYTDEQGRPPQQVVYTADGASYTSVDGPEHTLVYIHPVEAAQTLFTDPGQVTYVQQDATAQQGVKLIRRHRS	25264	74251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_25370_68816_69000_71642_71808_73526_73587_74109
864854	contig_6398_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_177409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTACAATAATGAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18606	18130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6398_pilon_-_18100_18600
864855	contig_8942_pilon	+	660	6	Intergenic	novelGene_143200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCGGGCTGAAGATAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356837	515643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_356929_385117_385278_392278_392475_513044_513147_513979_514031_515583
864857	contig_3905_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_170460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCTAATAAAAAATTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137504	136974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3905_pilon_-_137000_137500
864860	contig_14219_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_54392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTGAATTAAACTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115094	1114239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1114200_1115100
864861	contig_7697_pilon	+	666	2	Intergenic	novelGene_128287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACCAAAAGAGGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247670	249141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_+_247752_248556
864862	contig_4339_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_146088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAAAAAGGCAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063219	1062925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1062900_1063200
864863	contig_3018_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_78779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTCGTAATATCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383328	382596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_382600_383300
864864	contig_4232_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_63253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATGAATGAACAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372389	371907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_371900_372400
864865	contig_299_pilon	-	764	4	Intergenic	novelGene_129414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTTTGAAAGAAACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230757	165413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_166016_167877_167937_212553_212637_230737
864866	contig_5954_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_28577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGAGTGTCCTCTGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899818	900183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_899800_900200
864868	contig_18822_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_111710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGTAAGTCTAAGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90806	90019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_90000_90800
864871	contig_13456_pilon	+	301	2	Intergenic	novelGene_153303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	37	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTTGTGAGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482881	483360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_483031_483208
864872	contig_16548_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_167092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTCTACAGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24318	23845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_-_23800_24300
864873	contig_11448_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_66361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222594	222074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_222100_222600
864874	contig_11702_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_141950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAATAAAATGCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284417	284713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_284400_284700
864875	contig_5222_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_59013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACTGAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348561	347899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_347900_348600
864876	contig_8362_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_150691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTTGAACACATCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284724	258761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_259024_284600
864877	contig_5217_pilon	+	205	1	Intergenic	novelGene_135734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAAAAGTGGTCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528802	529007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_528800_529000
864878	contig_563_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_169779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770519	770743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_770500_770700
864880	contig_12654_pilon	-	688	1	Intergenic	novelGene_129306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	144	485	770360	770019	NA	60	ATCCTAGGGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGQILVCCGGCRVHCRVFSSIPGPCPPDAKSTPSVVTARIVSRHCQMSLGIRIPPAKNCYSRGSCGLMLLGAVVGTSSLRSTSHTCYPSVYVPEPLPEAVVYVPANQTSPKWTCGQKLKRNAPHPLCPNFPSSLTVGLLEGSTAKPLGSQALESGKTGF	770503	769815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_769800_770500
864881	contig_4659_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_118173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTACGTGGTGCGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91131	90902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_90900_91100
864882	contig_11924_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_128032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81530	82072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_81500_82100
864883	contig_8978_pilon	-	451	4	Intergenic	novelGene_49316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	14	junction_3	6.16441400296898	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	34	411	189409	188009	FALSE	35	GAAGTTACTGGAATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIIDLCDETGTMKLFFLMKTPGEYASKFLTARNTYYVCKVERGPQGTRLERAYKAFVPLLKNPEPELIDALRTQCEILERNRIKMLRIQEAKKVVAIESSVNLPSKAGRAEEEGPPRRGPSHRTRVDFVSRRDKHR	189442	187968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_188108_188333_188441_188915_188985_189306
864884	contig_14575_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_101932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGAAGCAGACTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434501	434089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_434100_434500
864885	contig_11396_pilon	+	610	2	Intergenic	novelGene_71316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	126	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAGGATAACGTAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441811	453746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_441908_453232
864886	contig_13158_pilon	-	575	3	Intergenic	novelGene_107296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_2	157.5	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	174	554	187708	166758	FALSE	65	TCTGAAAAAAAAAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRDTTVAGAPAPVTDRRLAELCGSRLKVGPEAGRHGSPPQCPGGRLPRAPWAPRGIMSTASAASSSSSSSAGEMIEAPSQVLNFEEIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVSLSLLYWQLSIKNDMGDMWSLVYEAI	187881	166736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_166908_170883_170995_187588
864887	contig_5200_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_140147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAATTTCTTTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111160	111359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_111200_111400
864889	contig_4782_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_73689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTGGTGTTTGGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718104	718717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_718100_718700
864890	contig_253_pilon	-	958	1	Intergenic	novelGene_129713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATGTAATTTTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530020	529062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_529100_530000
864891	contig_13592_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_33692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCACTCTTCGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249079	248491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_248500_249100
864893	contig_6576_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_42298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATAATTCTCCTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449600	450262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_449600_450300
864894	contig_142_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_176920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGAGTCTGGACCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31023	30310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_142_pilon_-_30300_31000
864895	contig_10732_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_114730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGGTTTCGTCTGCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427288	427074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_427100_427300
864896	contig_12599_pilon	+	618	1	Intergenic	novelGene_176967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAACCTGCTTCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110139	110757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_+_110100_110800
864897	contig_8295_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_176348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAATTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643643	643900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8295_pilon_+_643600_643900
864898	contig_17198_pilon	-	519	1	Intergenic	novelGene_62325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGCATCTCAGCAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417863	417344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_417300_417900
864900	contig_12884_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_105009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	628	1101	946928	946455	NA	10	CTATTGCATGGGGGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTFTYVHTIFRNKNGTPYLFTWNTSPLLACPGQPLTPGRAGTCRRAWIGCCWRQSQCFLSSYCARGCRECSSLSASMRRDLPEVFWPLVPLPPIQEAHVLAGRHAWEKDWLCTAGLCPSPGASCPPRQLLCSPGRGLHGGRLGERPVTTGMPSTDR	947555	946333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_946300_947600
864901	contig_10003_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_88279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACAATCTCCCTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834011	833725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_833700_834000
864902	contig_2854_pilon	-	742	2	Intergenic	novelGene_120787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTCTTTTATTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26448	24290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_24914_26329
864903	contig_10437_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_38440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGGGGAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871560	871169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_871200_871600
864904	contig_9296_pilon	-	454	2	Intergenic	novelGene_178049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTAAATGATGACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347456	346561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9296_pilon_-_346731_347171
864905	contig_5279_pilon	-	639	1	Intergenic	novelGene_105551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAATAAAGTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275917	275278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_275300_275900
864907	contig_8242_pilon	-	336	1	Intergenic	novelGene_80203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197468	197132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_197100_197500
864908	contig_2364_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_170827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCCCCAGTCCTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281535	282733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_+_281500_282700
864909	contig_12046_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_83491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAATGAAATGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493290	492666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_492700_493300
864911	contig_4125_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_25066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCAACTTTGGCACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435005	434495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_434500_435000
864912	contig_4407_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_122269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGATAGAAAAATATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26925	26437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_-_26400_26900
864913	contig_5815_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_141189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGAGATCAGAAGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202146	202454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_202100_202500
864914	contig_15188_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_163079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGCTGATTGTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151253	150850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_150800_151300
864915	contig_13241_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_158912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAATCCTTCTTGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192546	191850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_-_191800_192500
864917	contig_9921_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_23727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122227	121630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_121600_122200
864918	contig_4519_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_123749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTCACCAAGCAATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1267445	1267000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_1267000_1267400
864919	contig_9696_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_68853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTCCTTCCATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686644	687472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_686600_687500
864920	contig_11538_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_152309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAGATAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282482	282185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_282200_282500
864921	contig_12638_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_33310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286183	1286970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1286200_1287000
864922	contig_15264_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_158876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCCACAACTGTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112994	113463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_113000_113500
864923	contig_7171_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_101324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113015	1112455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1112500_1113000
864925	contig_2365_pilon	+	211	2	Intergenic	novelGene_103725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCTCTCAGCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12197	13276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_12329_13196
864926	contig_4364_pilon	+	327	3	Intergenic	novelGene_221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	22	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	168	159	326	1382185	1383324	FALSE	25	GGCGCATGGAGCAGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQGRRRRQQQEELRGKQRPALRPGQCRKEKKKVNCKPKNQDEQEIPFRLREIMRSRQQMKNPISNKRRKTEAHVAFRKTLEKEAKGVEPDIAVPKFKQKKWESDGAYM	1381614	1383325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1381697_1382108_1382243_1383214
864927	contig_14933_pilon	-	761	3	Intergenic	novelGene_165047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTGTGTCTAGGTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61347	59631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_-_59970_60456_60718_61185
864928	contig_8443_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_150612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCCCTACTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767128	766219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_766200_767100
864930	contig_14807_pilon	+	568	2	Intergenic	novelGene_124715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTTGCTGGGCTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41420	42055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_41446_41512
864934	contig_9053_pilon	+	553	1	Intergenic	novelGene_87915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCAGTATGGATGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20200	20753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_20200_20800
864935	contig_1013_pilon	-	857	5	Intergenic	novelGene_178050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.53553390593274	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	124	855	190736	185070	FALSE	20	TGAGGTGAGATGGCGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRAKHGGKEHINICEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSDLTERPEEFGFILDNVQSLLILNKTNFTYYPNPVFEAFGPSGILELKPGTPIILKGRNLIPPVAGGNVKLKYTVLVGEKPCTVTVSDVQLLCESPNLIGRHKVMARVGGMEYSPGMVYIAPDSPLSLPAIVSIAVAGGLLLIFIVAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIPFLDYRTYTMRVLFPGIEDHPVLRD	191278	185067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1013_pilon_-_185207_188924_189160_189757_189905_190523_190764_191182
864936	contig_2093_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_152967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGCTCCCAGTTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297410	1267105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1267300_1291488_1291575_1297321
864938	contig_10402_pilon	+	438	2	Intergenic	novelGene_175143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGTTAACCCATTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305215	307823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10402_pilon_+_305463_307632
864940	contig_9468_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_59495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAATAAAAATAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319942	320253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319900_320300
864941	contig_4486_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_38628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAATAGCAGACCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686163	686629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_686200_686600
864942	contig_7049_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_171453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	489	75	563	278806	278318	NA	15	CCACACCTCCCCCCGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATGIVGTGLVSQTSQARAGQGGRMAEEGGEPGRSPGLPGARARWARAGPHSSTLPHPVAAASVGLAVGAVPAGNCPGPAACILAWYVAVRAGSVGVGCAGQDACRVAVGVVSPTWVALGLPCAGWTGGENWAGSARAEARSLEDLVTRSLLPGAQAATSLSHDAMTQSAYVLWPRPQASPQGVSLA	278880	278317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_-_278300_278900
864943	contig_8375_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_141318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGAGTAACTGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224839	223999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_224000_224800
864944	contig_10000_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_139314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAATCAAAAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175337	174761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_174800_175300
864945	contig_4876_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_137887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTAGCTCTCCCTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236705	236308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_236300_236700
864947	contig_10600_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_169875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTAAAAAAAAAAGTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294267	294743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_294300_294700
864948	contig_16622_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_48509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164800	164102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_164100_164800
864949	contig_5023_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_7141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCCTCGGCGGGGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325281	324279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_324300_325300
864950	contig_6488_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_44748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_1	2	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGCCTCTATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165339	164464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_164759_164906_164964_165321
864951	contig_9852_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_138466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAGCAGCTGTAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42984	43590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_43000_43600
864952	contig_4068_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_161699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTTACCTTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27673	28320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_27700_28300
864953	contig_9345_pilon	+	841	4	Intergenic	novelGene_24482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.942809041582063	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	191	622	650699	651814	FALSE	25	CCGCAGGCCTAACAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRLTRLSPEIVELSEPLQVVRYGEGGHYHAHVDSGPVYPETICSHTKLVANESVPFETSCRYMTVLFYLNNVTGGGETVFPVADNRTYDEMSLIQQDVDLRDTRRHCDKGNLRVKPRQGTAVFWYNYLPDGQGWVGDVDDYSLHGGCLVTRGTKWIANNWINVDPSRARQALFQQEMARLARGGGAESQPEWALDRAYRDARVEL	649769	652033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_649956_650694_650786_650975_651100_651593
864954	contig_14300_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_133129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGAAAAAGGAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388288	388020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_388000_388300
864958	contig_6724_pilon	+	430	1	Intergenic	novelGene_167967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTCATTTTGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282007	282437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_282000_282400
864961	contig_3942_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_128732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTATTTTTGTACGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708612	708195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_708200_708600
864962	contig_9670_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_169942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAGGAGGGAGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126799	126049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9670_pilon_-_126000_126800
864967	contig_12570_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_79343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCATTGCATTGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174964	175442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_175000_175400
864970	contig_1948_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_31154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTAAGTTTTATTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414232	413638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_413600_414200
864971	contig_710_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_162938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGGCCTCTCCTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13121	13520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_+_13100_13500
864973	contig_15021_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_26929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	430	555	150818	150943	NA	30	GTCCTGCCACCTTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYRSVGTVLPELRCVHEDPGGSRAAPTPCKVHPTRSPDAASTPPARALLSRWCHDAGPARRRAGTRDPARGEGPAILSSLQGWGLSPLGLSGLTEPGSFLLPGLRGRAPGPPLPSCHRLGARVGQRRGAPSPHLAWDPACVALMVCSAWVALGQALSPAVLVTTPHSVLFFKKNQTLFPEVFRG	150388	150972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_150400_151000
864974	contig_13702_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_102658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGAATGAGGCAGGAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268716	269048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_268700_269000
864976	contig_2867_pilon	+	489	3	Intergenic	novelGene_135151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	20	487	445600	457467	FALSE	35	CAGCAAAGAGTGGATCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVEWNVMAGSSDSEDDSFMAVDQEETVLEGTMEQDDEAHPALEIEETRHNRSMSELPEEVLEYILSFLSPYQEHKTAALVCKQWYRLIKGVAHQCYHGFMKAVQEGNIQWESRTYPYPGTPITQRFSHSACYYDANQSMYVFGGCTQSSCNAAFNDLWRLDL	445580	457469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_445850_448327_448445_457366
864977	contig_11708_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_138968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAAAAAACATACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265868	264976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_265000_265900
864978	contig_12624_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_61010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTCTAAAATATAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789125	789751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_789100_789800
864979	contig_15327_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_70441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTGCTGTCTGGGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89311	88650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_88600_89300
864980	contig_9218_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_157678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACTTCGGGGGAGGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260763	261125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_260800_261100
864981	contig_1301_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_47294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATTACATACCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259972	259481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_259500_260000
864982	contig_405_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_135303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTTCCACTGATAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282740	283097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_282700_283100
864983	contig_5018_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_47113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424885	1425248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1424900_1425200
864985	contig_695_pilon	+	474	3	Intergenic	novelGene_177170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	269	319	128721	128771	FALSE	40	ATTGTAGTAAGATTAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKYVSEEVPVPPEPNLVLQQCQPSLLDRKEASQPQDQPVLVYNFVSGLENGVSEDCLGTCREPVQSNPHYLQINEILLISDQEFLPCHIMDQHWKFYAECEELMF	113485	128926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_113566_128415_128509_128625
864986	contig_10446_pilon	-	679	2	Intergenic	novelGene_162442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	492	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	55	444	190588	188325	FALSE	85	AATAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIHRCTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGSLPTPSISASTSTLQLSPPRTKTLTAKNPIKSNTNKPNAPKPSASKPNASKPPNGSKSKCKPKISNMQKKQNTLTGSNKKSKVNTALRNLR	190642	188089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_188640_190513
864988	contig_8269_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_106236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTCTTTAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312240	312658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_312200_312700
864989	contig_7229_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_39847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGTAAAAACATAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204605	1204094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1204100_1204600
864990	contig_9195_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_155674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	3	353	104658	104308	NA	25	AAGGCGACCCTGACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEEATRSRTGVRWAADPPPPLESERVRGGGSDLRENARESTWEAQAAPRGQGGGPRGRRQFRTRGACRVAHGLAVPATAAAPRLPGLQAPPLRPAALIHHWTPYTGDAARHRAPEPG	104660	104307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_104300_104700
864991	contig_3382_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_124123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATACTTTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736114	735658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_735700_736100
864992	contig_13112_pilon	+	372	2	Intergenic	novelGene_98852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTATTTCTAGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931024	936671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_931179_936453
864993	contig_11832_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_106948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	190	321	153429	153716	FALSE	20	ATATCAACTGCTGCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLVPEVLPSQGEVERKGGSPPAGPPPQELVEEEPPAPPTLLEEETEDGGDKVPPPPEASAEEEMDTETEAAALQEKEQDDTAAMLADFIDCPPDDEKPPAATEPDS	153239	153763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_153468_153623
864994	contig_5936_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_53596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGTAAATACAAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509934	510430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_509900_510400
864996	contig_16948_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_166427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCACCCTAATGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425631	426330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_425600_426300
864998	contig_753_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_113014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACCCACTAGGATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1360008	1359432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1359400_1360000
864999	contig_15267_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_151070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATTAAATTATCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43861	43464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_-_43500_43900
865001	contig_10023_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_123511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAAAAAAGCTAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441473	441192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_441200_441500
865002	scaffold_17306_pilon	-	537	3	Intergenic	novelGene_175322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCCTTTGTCTCTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310033	304494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_304834_305274_305424_309984
865004	contig_12120_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_21423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77966	78334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_78000_78300
865007	contig_1143_pilon	+	915	6	Intergenic	novelGene_86617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGATCTTCCTCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823763	839251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_823871_823955_824054_827373_827508_829380_829461_838606_838800_838948
865009	contig_12300_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_176515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTACCTCGTTGTTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505133	505632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_+_505100_505600
865010	contig_7025_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_104404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTATTTTCTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105621	105957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_105600_106000
865011	contig_11126_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_138109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGCCCACAGTTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118831	118049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_118000_118800
865012	contig_2054_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_51667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATTAAGTAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34695	34287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_34300_34700
865013	contig_4519_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_123716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGATGAGGATGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668824	668448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_668400_668800
865014	contig_13982_pilon	-	549	5	Intergenic	novelGene_163477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	91.5870487569067	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	8	298	388809	353103	TRUE	35	TTCTTCTGCCACCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKMWKPGDECFALYWEDNKFYRAEVEALHSSGMTAVVKFIDYGNYEEVLLSNIRPVQTEAWEEGTYDQTLEFRRGGDGQPRRSTRPTQQFYQPPRARN	388816	343314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_343529_344369_344398_353093_353217_383217_383344_388758
865017	contig_9181_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_177100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGCAGTTTGTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235329	235902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_+_235300_235900
865018	contig_9578_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_67979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121977	1122565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1122000_1122600
865021	contig_11104_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_112473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGCAAAGAGAAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483507	483071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_483100_483500
865023	contig_12786_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_103379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGCTTCTTTTGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572390	574170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_572510_573733
865025	contig_2703_pilon	-	193	3	Intergenic	novelGene_101674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGTAAGTTCCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180981	172075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_172146_174424_174466_180899
865026	contig_10734_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_51234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGCCTCCCTCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207267	1206723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1206700_1207300
865029	contig_8145_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_118662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCAGCAATTCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856213	855707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_855700_856200
865030	contig_9283_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_164400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATTTACTGATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113710	114197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_+_113700_114200
865031	contig_7912_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_129552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAACCATGTGTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30580	30300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_30300_30600
865035	contig_5649_pilon	+	528	2	Intergenic	novelGene_82330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTTTAAAAGAAATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451757	458060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_451852_457626
865036	contig_10467_pilon	-	579	3	Intergenic	novelGene_175404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	1	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	44	445	62627	29470	FALSE	25	TGAGAACTTTAAGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSKIQSRIEQQQQQMRNSARTLNFVKHSSPKDKMSPASPMDDIERELKAEASIMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSENEECSSSPSDPGNYNSGHHTMSAMLQCKIPDMEASHNRFYDNSGLMMNTLRNDLQLSDSGSDSDY	62670	29335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_29517_58991_59253_62533
865038	contig_4686_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_118598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGCTCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869108	869679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_869100_869700
865040	contig_9036_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_155474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGAGGTAGCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259419	259618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_259400_259600
865042	contig_8978_pilon	+	216	1	Intergenic	novelGene_49451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCTCCCACAAAAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646681	1646897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1646700_1646900
865044	contig_1406_pilon	+	517	2	Intergenic	novelGene_25622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACACTGTATAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2600221	2606585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2600625_2606471
865045	contig_11483_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_172686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATTAAACTTTACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9370	10320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_9400_10300
865046	contig_15383_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_162205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAATAAACTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114823	114331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15383_pilon_-_114300_114800
865047	contig_12750_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_172627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCGAGGCTTTGACTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115297	114448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_114400_115300
865048	contig_13188_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_176786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCGTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114749	115030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13188_pilon_+_114700_115000
865049	contig_10424_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_56792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAGGGAAGGAATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244899	244055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_244100_244900
865052	contig_20718_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_169153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117917	118155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_+_117900_118200
865053	contig_20823_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_159906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACGAAAAGGGTAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12310	11976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20823_pilon_-_12000_12300
865055	contig_16920_pilon	+	689	1	Intergenic	novelGene_138449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATTCTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9406	10095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16920_pilon_+_9400_10100
865056	contig_8057_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_176644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCAGTCTGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131030	130333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_130300_131000
865057	contig_8420_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_69350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCCCTAGGTCTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31674	31137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_31100_31700
865058	contig_10800_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_152627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	12	464	511795	512247	NA	25	TATTGAGTACCTACTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSMTKPESGLSIHSPPLGPAPSLHGATGPASPGSACPDLLCTIQTKFRPTHHLHFYCLMGQDQTLSPAHGAHLSGARPGRQPPLLPLLRQHPTVQPLPTAGLPQLFHSSPPLPYCPPLLLIPDALDCLYLSFNLSPSSGSFQKSSLPPQPLS	511783	512373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_511800_512400
865059	contig_10444_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_139447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAACAATATTATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55100	55541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_55100_55500
865060	contig_17074_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_145096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	117	416	198145	198444	NA	70	AAAGTACTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDFLAWHSGPRPSLSGWTITPQTPTVQQNECPSLQTVHQCSRSFLLPFRKGTVTSQNSHGSLTVHTVPTPTCEQPHLYPVIPPPPGLTGICRQMKTVY	198028	198526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_198000_198500
865064	contig_3745_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_85084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393619	394009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393600_394000
865067	contig_16532_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_110073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCTAAATTTAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589836	590364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_589800_590400
865068	contig_4531_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_47881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236714	237376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_236700_237400
865069	contig_5947_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_101515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	193	306	433969	434082	NA	50	AAGCCATTAAAACCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPVPRSFKHGFAVGWPLVSFSSLQFTDCTVQSVPRPPFRQEPDRANPSLPEPPLALPQFSASGMGSPGCALLPGPPSKGDSPSLQFPPATGRGNRAAEAN	433776	434382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_433800_434400
865070	contig_7086_pilon	+	747	1	Intergenic	novelGene_175764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550977	551724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7086_pilon_+_551000_551700
865071	contig_13828_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_158283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55726	55115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_-_55100_55700
865073	contig_8801_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_66321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAACAAAAATAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807760	807264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_807300_807800
865079	contig_6302_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_171696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGTAGGGAGACAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120453	120872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_120500_120900
865080	contig_10056_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_170926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	47	484	34325	33888	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEERLDVGKHLGCPRMERLDPPPGTAVGQEEQELRERAFFSWAEFSRFFDAWCQQRLALFFVKSSMHLARCRWASAPPLYTLIDVLKYSYVRLVCKDVRAPSRPAVGCVSPSHRPAGGGKRVQRWAESPHPAMGGRAADQDTCREVQRDEETLIPGRLRHK	35250	33886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10056_pilon_-_34336_35214
865084	contig_11986_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_69145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3	398	297263	296868	NA	35	AACATTTGCCATTTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSWQEQPPRLRTFCPWQLFPGRGASCPVPLTQPDAAANSLSCPRPLRGANAVVVHPFGPETAPPAPLKAEDVVICCRIVLYKVEYVSPRNPGDALILCNLSYVWNTGRDKNAIFSVVFTPGCPAFNLDAGE	297265	296583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_296600_297300
865088	contig_11507_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_103360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTAACCACTGTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112114	112521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_112100_112500
865091	contig_6616_pilon	+	316	1	Intergenic	novelGene_141769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTTTTAAATTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379935	380251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_+_379900_380300
865092	contig_2969_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_157090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACGGGGTATGATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1198013	1197716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_1197700_1198000
865093	contig_5018_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_46934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATTAAAAAAAGAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237452	236934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_236900_237500
865094	contig_3410_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_58939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAGTGTGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73219	72849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_72800_73200
865095	contig_4600_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_174021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTGAAAAAGAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208078	208523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4600_pilon_+_208100_208500
865096	contig_299_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_129506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAATCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659892	1659208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1659200_1659900
865097	contig_5105_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_168909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATAGAAAATGTAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203303	202700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5105_pilon_-_202700_203300
865098	contig_19352_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_122428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCATCAAAAATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413511	413055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_413100_413500
865099	contig_16846_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_82871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGCTAGAGGGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180745	180960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_180700_181000
865100	contig_13992_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_147626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGGGAGACGGTCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361889	361321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_361300_361900
865102	contig_1594_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_138852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAAGATAGAGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730200	729931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_729900_730200
865103	contig_11106_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_167453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACGTAGGGTCACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148732	149135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_148700_149100
865107	contig_12119_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_88696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATTTAATTTATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424617	425010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_424600_425000
865108	contig_10019_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_86701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412012	412482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_412000_412500
865109	contig_7788_pilon	-	421	2	Intergenic	novelGene_177605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGACTTTGCATAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122027	108340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_108606_121871
865110	contig_13048_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_138916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAGAAAAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364654	365055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_364700_365100
865111	contig_8597_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_158698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24784	25144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_24800_25100
865112	contig_5331_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_112827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTGGAATTTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742417	741796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_741800_742400
865113	contig_8616_pilon	+	143	1	Intergenic	novelGene_72525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCAGCGCCTCTGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362243	362386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_362200_362400
865114	contig_2414_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_158520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	73	387	849175	849489	NA	90	GAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPARPRWAGSRPHLQTCSSFLPLWRRWKAEATQFQLPREAGFGREYNSAFCFVSLAPQSCLQREFDTSPQTFRCKKHTLSPFPEPPRQPSLVACQEDYSLCLI	849102	849653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_849100_849700
865116	contig_7411_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_137063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAACATTACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030365	1030013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_1030000_1030400
865117	scaffold_19766_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_34285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTGAAGGTTCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412666	412977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_412700_413000
865118	contig_6048_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_73138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGAGGATCTTACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000888	1001452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1000900_1001500
865120	contig_11846_pilon	-	142	1	Intergenic	novelGene_105939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGCCTTAAATCAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248665	248523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248500_248700
865121	contig_3382_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_124122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAACTTTTTAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735296	735625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_735300_735600
865123	contig_13707_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_43523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAAAAAAATTTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132767	131963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_132000_132800
865124	contig_11416_pilon	-	458	3	Intergenic	novelGene_145331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.5	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	19	438	119557	107205	FALSE	0	CTCGTGTTCCTGTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EACAGCMGRRRRWVGQVAGTRAGALPEAIAALSRTLSAGPSPETFRRAKFDFPEAAPPLWRLLFYVLTAPPPPPAGAGSLATSSLPPAPNLPLPTAVAPLASGSLSLRVWYGAIRLCPMGFTKTGAGEGGRLKAFASIRRYVSKN	119575	107184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_107442_119282_119319_119410
865125	contig_11258_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_67869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTTTGTGACATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391891	392380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_391900_392400
865127	contig_12540_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_148139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGAGAAGGCCTGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1316252	1315654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1315700_1316300
865128	contig_11293_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_134667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATGTTGTAACATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34608	35162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_34600_35200
865130	contig_10129_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_128172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATCCATCTATGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628503	628880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_628500_628900
865131	contig_5640_pilon	+	655	1	Intergenic	novelGene_27278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATCTTCCATTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056760	1057415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1056800_1057400
865132	contig_11417_pilon	-	427	1	Intergenic	novelGene_103257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTGTTATGGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259096	258669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_258700_259100
865133	contig_723_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_169433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTTAGACTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19699	20062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_723_pilon_+_19700_20100
865135	contig_10074_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_57212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGATGTCAGCGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625438	626012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_625400_626000
865136	contig_546_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_117257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAACTCTTAGCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754918	754595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_754600_754900
865138	contig_10444_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_139464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	433	786	809306	809659	NA	10	GCTAGTGGCTGACTCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFILGSESDLVHSCWNWNWWSKCTPPVMLVALGVSPGSMGHLDGELPLCQHNSALHSHIYRKGFKVLCVVLICDNLLLRLFEWYGNIFTSFSVWGEHLFKTMYKYTGAQYLELLND	808873	809854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_808900_809900
865139	contig_5649_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_82327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAGAGAGTGGTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419067	419607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_419100_419600
865140	contig_10003_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_88305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACAACTGCAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015978	1015703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_1015700_1016000
865141	contig_10235_pilon	+	601	6	Intergenic	novelGene_46367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	3.74165738677394	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	129	479	144137	145465	FALSE	5	TCATTCCTGGGTTTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELITHQKLFPEPHLGQWYFIAGAAPTREELATFDPVDNIVFNMTAGSIPMQLQLRATIRTKNGLCVPRKWTYHLTEGSTDLRTEGRPDMKTELFSSSCPGGIMLKEMGQGYQRFLLYNRSPHPPEKCVEEFQSLTSCMDSKAFLLTPRDQEACELSSN	142634	145587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_142661_144034_144190_144477_144552_144646_144746_144920_145020_145439
865143	contig_10986_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_71490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTTTAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72291	72584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_72300_72600
865145	contig_3789_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_79829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGATTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258705	259142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_258700_259100
865146	contig_13095_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_178051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155204	155697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13095_pilon_+_155200_155700
865147	contig_7179_pilon	-	456	1	Intergenic	novelGene_78129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGACATATCCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888881	888425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_888400_888900
865148	contig_8452_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_47989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACTTTGTAACCGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117181	117663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_117200_117700
865149	contig_15022_pilon	+	642	2	Intergenic	novelGene_171812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATCATATAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86844	89977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_87182_89672
865150	contig_11286_pilon	-	557	3	Intergenic	novelGene_156668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	171	557	268203	267817	FALSE	30	GTAAGTGTCCTCATAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECEKSKGVKKFLLPFQPANAKSKKVKEKNNGPVFWRLTEPRSLNKSSFRYHQESYTMLKDSTLYTSSDLKKLPLHGQSAFRPLPTPSRRSCQSTPGLGKAVTMPSSTTNSKEPRGLADHKDSLSESPLKYDRNGNEFYLGNSFQASLLQSNPDLEKKESELHLYVVSTTSSIFLHLKSSWNNCII	286974	267816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11286_pilon_-_268226_281511_281585_286899
865152	contig_19185_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_163674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAACTCTGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180641	180973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_180600_181000
865154	contig_8742_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_173944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGTCTCCCCTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26498	27114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8742_pilon_+_26500_27100
865157	contig_14341_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_111898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	3	452	737678	737229	NA	10	GGCCCACCCAGGGCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHLRVHTGEKPFACPECGQRFSQRLKLTRHQRTHTGEKPYHCSECGLGFTQVSRLTEHQRIHTGERPFACPECGQSFRQHANLTQHLRIHTGERPYACPECGKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRRFHQSTKFIQHQRVHSAE	737680	737101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_737100_737700
865158	contig_6952_pilon	+	804	2	Intergenic	novelGene_173646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCTTCTCTGAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35985	36868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_+_36101_36179
865162	contig_5400_pilon	+	657	2	Intergenic	novelGene_162818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGACAAATGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251800	253333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_251948_252823
865163	contig_6634_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_171142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATGAATTCTAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221248	220577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_220600_221200
865164	contig_3956_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_14730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAATGGAAACCAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370563	370797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_370600_370800
865165	contig_1406_pilon	+	697	2	Intergenic	novelGene_25655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAACGATGAAGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2778732	2780017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2779280_2779867
865166	contig_9335_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_147447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGTGGCAGGTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403150	402736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_402700_403200
865167	contig_5236_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_100900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	316	657	72821	73162	NA	65	AAAGAAAAAGGTAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVCFWSVCELCVVSLLPGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPGLCSDVASFRIITISFRICQLPSPMLFLSVYPVQCKGWLSTFF	72505	73518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_72500_73500
865168	contig_16259_pilon	-	386	2	Intergenic	novelGene_174362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGTTTACTTCTCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7822	6493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_-_6777_7719
865169	contig_15067_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_154341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGAGGAGGAGGTTAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141050	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_140500_141000
865175	contig_3382_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_123982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAACAAACAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43395	43829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_43400_43800
865176	contig_14151_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_171834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAAGGAGGACTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98799	99553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_98800_99600
865178	contig_14047_pilon	-	796	3	Intergenic	novelGene_176589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	32	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	195	794	79287	71588	FALSE	65	CAAAAAAACAGATTACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEKRPAPRPPYEGLFADGHLVLWTLCSVLLPVFITFWCSLQRSRRQLHRRDIFRKSKHGWQDTDLFSQPTYCCVCAQHILQGAFCDCCGLRVDEGCLKKADKRFQCKEIMLKNDSRALDAMPHHWIRGNVPLCSHCVVCKQQCGSQPKLCDYRCIWCQKTVHDECMKNSLKNEKCDFGEFRNLIIPPTYLTSINQMRK	80132	71585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_-_71724_78823_79310_79960
865180	contig_6375_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_73020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAAATAGGTTTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412896	413393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_412900_413400
865181	contig_14773_pilon	+	621	1	Intergenic	novelGene_174764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGGCAATATGTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64133	64754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_+_64100_64800
865182	contig_1939_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_144886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTAAAAAAAAATAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930920	930456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_930500_930900
865183	contig_14527_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_178052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCCTAGAAGGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65341	64853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14527_pilon_-_64900_65300
865184	contig_8330_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_71944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTTGTGTAGGATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384778	1385286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1384800_1385300
865186	contig_8330_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_71752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTTTTCAAGTTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563597	563010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_563000_563600
865187	contig_19812_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_101013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACAGTTGGAGCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83525	84021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_83500_84000
865188	contig_8491_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_154221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGGGAAAAAGGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273123	273451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_273100_273500
865189	contig_15236_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_141678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGCTGTCTCTTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885632	886416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_885600_886400
865190	contig_2227_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_142341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239687	240115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_239700_240100
865192	contig_3948_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_53187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829346	829731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_829300_829700
865193	scaffold_6394_pilon	+	558	4	Intergenic	novelGene_110959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.71404520791032	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	8	427	200114	201859	FALSE	25	CACAGGGATGGTGTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKVWVDGIPRVVCGVSEQTTCQEVVIALAQAIGQTGRFVLVQRLREKERQMLPQECPVGAQATCGQFASDAQSRALEAELRLAKDTSGPPAPSGVYCQPARPQALVTARPALPGDGGGPAATAGSFPHGMRRLAPWD	200106	201990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_200217_200457_200568_200981_201040_201710
865194	contig_12638_pilon	+	533	2	Intergenic	novelGene_33048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	197	496	8893	9506	FALSE	15	TTGACAGTTCCTGTAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEESLVATGASGSPAAPPEKRDGAGPSSDLERSSAGSFSIPEASPPAPKSSSPNAVPKAIPTPPVAASAAPELPLGPTPLGSAALCGLGPLSDPGP	8696	9543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_9142_9455
865195	contig_5939_pilon	+	648	2	Intergenic	novelGene_176249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	335	646	75354	80663	FALSE	70	GGAAAAAAAAGAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSECSCSETFQGSPSPRLSGKESPPRWQSCCALSFKKCREEAVLLKIFNHLFRVSYFGSQSFKDVTLIHGCGNLANEFFQRLQALEAKIHPGSCQIYTCRYTQ	75019	80665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5939_pilon_+_75414_80411
865196	contig_15887_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_177462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAATAAAAGTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8520	7640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15887_pilon_-_7600_8500
865197	contig_10037_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_148963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAATAAGTCCAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366683	366131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_366100_366700
865198	contig_7165_pilon	-	517	2	Intergenic	novelGene_116872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAAGATTTACAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587931	584530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_584800_587683
865199	contig_12644_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_44551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1579864	1580334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1579900_1580300
865204	contig_5317_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_76621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACCATAGTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885419	884440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_884606_885212
865205	contig_5338_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_114571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	231	554	360119	360442	NA	20	TCAGTTCCCCGGGAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVAPLPLVPPSPLSSTHLPLVTTPETLVQPGTPVRRCRSLPSSPELPRRMETALPGSGPPPVGPSAEERMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSAQPWSSQSGPPLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPP	359888	360442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_359900_360400
865207	contig_13409_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_128455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAATTTTTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102824	102224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_102200_102800
865209	contig_2867_pilon	+	479	2	Intergenic	novelGene_135204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATCCCTGCTGCGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964052	964662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_964122_964252
865210	contig_9189_pilon	+	686	1	Intergenic	novelGene_165132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501036	501722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_501000_501700
865211	contig_2036_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_131813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGGTGCCTCTGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569988	569641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_569600_570000
865214	contig_6076_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_81720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTTCTGTGTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15549	16097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_15500_16100
865216	contig_5523_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_169104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAATAAAAGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420679	409039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_409487_420613
865219	contig_8396_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_177625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGATACGAAGGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307916	308160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_+_307900_308200
865221	contig_16148_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_50388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTCTACAGTAGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153449	154022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_153400_154000
865222	contig_2867_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_135155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGATCAGAAAAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491202	490575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_490600_491200
865224	contig_12046_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_83498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875370	876003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_875400_876000
865225	contig_4088_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_178066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGGCTGTTGCAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439272	438520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_438500_439300
865230	contig_5684_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_81081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCCCCCATTAAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465287	464711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_464700_465300
865231	contig_15323_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_148507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGTGGTTAAGAGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42185	41639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_41600_42200
865232	contig_9011_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_159341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAACAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683205	682610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_682600_683200
865233	contig_1706_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_155038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAGTTATGCTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102865	103420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_102900_103400
865237	contig_14322_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_116612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	700558	700241	NA	15	AGTCTCCCTATGGCGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSGSRGPPSSPRSSPSGSGGASPGSGGPPSCSWGASLKSWSAPPDSHAPNAEAPSPLRRPWQPPSPSARQLRGSPFLQAGFRSCVSLQRAVGCFYTAPWPALVH	700560	700236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_700200_700600
865238	contig_10371_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_175484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763681	764045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_763700_764000
865240	contig_15066_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_149528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCAGGCCGCCGACTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68007	67444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_67400_68000
865241	contig_10627_pilon	-	605	3	Intergenic	novelGene_60032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_1	37	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	95	604	610737	597854	FALSE	45	TAAAGAGCTCTAGCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFVHNVAALLCRSPQLTAYREQLLREPHLQGMLSLRSCVQDPMASFRRGVLEPLESLHQERKIPDEDFIILIDGLNEAEFHKPDYGDTIVSFLSKMIGKFPSWLKLIVTVRTSLQEITKLLPFHRIFLDRLEENEAIDQDLQAYILHRIHSSSEIQNNISLNGKMDNTTFGKLSSHLKTLSQGSYLYLKLTFDLIEKGYLV	610831	597852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_598112_601736_601904_610652
865242	contig_5586_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_143609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTCTAGTGTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699566	699018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_699000_699600
865243	contig_1337_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_84255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	79	309	449487	449257	NA	25	ATAAAGCTCAGGCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQHGVRGNATRPARWGTSGQFVRALMSSGLGLARWGRCDAEVPGIHIPLPSCLSRASTSRVGGVRGRGCCRSPRSALIRNQHPPKPRATGATSCSPLCCIL	449565	449160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_449200_449600
865244	contig_312_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_128320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572666	571858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_571900_572700
865245	contig_8270_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_143805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCAGAGGATAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392837	393282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_+_392800_393300
865246	contig_11292_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_109463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAACAGAATGGTAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430024	430778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_430000_430800
865249	contig_5286_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_157399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGAGCTCACTCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747034	746693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_746700_747000
865250	contig_1719_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_87389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864345	865097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_864300_865100
865251	contig_7025_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_104365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTAGAGGGCTGACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35160	34728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_34700_35200
865252	contig_593_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_102005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTAAGAGAAGTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371779	372175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_371800_372200
865253	contig_16310_pilon	-	483	2	Intergenic	novelGene_70052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTCAAACCAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81541	80605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_80826_81278
865254	contig_14895_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_106689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	26	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGCAATCGTTGGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19807	55644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_+_19912_20006_20061_55369
865256	contig_12810_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_145712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAAATTGCCTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678684	679408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_678700_679400
865257	contig_19352_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_122348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	420	1260	75	1334	91503	92762	NA	40	TACCCAGCAGCACAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLLSARAALRGVWRAEERRGRAESVTEAAAGAMERAVVRCVPSEPKLSLSFALADGSHKNMQRDQSEPLGRVLSRIATNALKGHAKVIAAKKSRKNRPNASGGAACAGPGAEPAAPCEPVVKLYYREEPVAEDVLNVDAWQDGAVLQIGDVKYKVERNPPAFTELRLPRYIMAGFPVCPKLSLEFGDPASSLFRWYREAKPGATEPEGEGPSSLSPSSASPRWAETGVNERVYTPSNADIGLRLKLRCTPGNGQRFGPSRELESVCPVEAGPGTCTFDHRHLYTKKVTDGSLIRTVSYNLLADTYAQTEFSRTVLYPYCAPYALELDYRQNLIQKELTGYNADLICLQEVDRAVFTDSLVPALEAFGLEGAFRVKQHEGLATFYRKSKFSLLSQHDISFHEALQSDPLHKELLEKLAL	91428	92762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_91400_92800
865258	contig_13123_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_136888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAGAAAAGCAAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434420	434028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_434000_434400
865259	contig_5968_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_112177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCTCCCACTGCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612999	613368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_613000_613400
865261	contig_5264_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_165064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCTTTCAAAAATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311438	310618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_-_310600_311400
865262	contig_14536_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_69321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGCATAAGAAACGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249799	250002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_249800_250000
865263	contig_9995_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_47722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAAAATAAATTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378489	377542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_377500_378500
865264	contig_7816_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_66476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTCTCGTTATGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152979	153239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_153000_153200
865265	contig_13633_pilon	+	428	2	Intergenic	novelGene_15303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCAGAAAAAATGTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5024	20632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257
865266	contig_4213_pilon	+	407	2	Intergenic	novelGene_124835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATTAAAATTCTGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212565	216691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_212597_216315
865267	contig_7513_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_89006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGAGGCAGCCTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639928	639628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_639600_639900
865268	contig_8920_pilon	-	710	5	Intergenic	novelGene_146060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.0919760103381	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATATATGTGGAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93912	64206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_64428_74320_74440_75704_75835_85672_85783_93782
865270	contig_10095_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_57249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288840	289581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_288800_289600
865273	contig_6589_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_25831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTATGTATCTTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854701	854275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_854300_854700
865275	contig_18620_pilon	-	523	6	Intergenic	novelGene_168577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.7029038625532	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	29	523	54276	44632	FALSE	75	AAGAAAAAAACAGATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGVREGGAAMATGESMAQRMVWVDLEMTGLDIEKDQIIEMACLITDSDLNILAEGPNLIIKQPDELLDSMSDWCKEHHGKSGLTKAVKESTITLQQAEYEFLSFVRQQTPPGLCPLAGNSVHADKKFLDKYMPQFMKHLHYRIIDVSTVKELCRALDDISESIRELQFYRNNIF	54304	44631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_44693_48072_48182_49498_49611_50211_50290_53171_53256_54225
865276	contig_4884_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_63773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAAGGCTGCTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57396	56951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_57000_57400
865279	contig_3095_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_75267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACCCCCACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253372	252973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_253000_253400
865281	contig_15516_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_177469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37698	37350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_-_37400_37700
865282	contig_6275_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_142472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	46	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCATTTCAGAGGTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189214	199387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_189345_193498_193633_199298
865284	contig_6083_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_177119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAGAAGAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6158	5277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6083_pilon_-_5300_6200
865286	contig_10196_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_132283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	73	336	2212302	2211037	FALSE	15	AATTCACTGCGTCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESILAEHYHDLRRKPFYPALVSYMSSGPVVAMVWEGHNVVHASRAMIGDTDAAEAAPGTIRGDFGVHISRNVIHASDSVEGAQREIGLWFRSSELVDWPDRGPHSSVSPA	2212374	2210751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2211161_2212051_2212165_2212275
865288	contig_91_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_127140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATGTCTGCACTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1198373	1198136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1198100_1198400
865289	contig_10000_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_139323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTCCTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210871	210088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_210100_210900
865290	contig_6862_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_63766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGGAATCAGGAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564115	564833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_564100_564800
865291	contig_5229_pilon	+	466	5	Intergenic	novelGene_117722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.24404424085076	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	44	466	680319	688634	FALSE	40	ACCACAAAGCTATTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMVVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLTVSLKPPFLRPELLEHGAPLKAGCPFQAVTLFLPFWDKQ	680275	688634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_680399_680619_680723_681092_681185_681309_681404_688580
865292	contig_6445_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_77086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGCTGACTTCGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916872	917503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_916900_917500
865293	contig_960_pilon	-	226	2	Intergenic	novelGene_108207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTTTGTCGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259998	258931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_259114_259954
865295	contig_12922_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_157778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCCAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73207	72814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12922_pilon_-_72800_73200
865296	contig_10863_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_59339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107755	107119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_107100_107800
865297	contig_9305_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_148179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20503	20278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_-_20300_20500
865298	contig_16210_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_147681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGAAATAATAAGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73636	72778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_72800_73600
865299	contig_7457_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_31591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950065	950338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_950100_950300
865301	contig_11681_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_102960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	20	376	9885	10241	NA	70	AAACTTAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSWIQVMEMGMAPLTITPTDPLAKFLLPVPTTLCSMGLEVLVPKGGKFPQGDKTLIPLNWKLRMPLSHFGLPMSLDQQVKKRATILAVVIDKTDYQGEIRLIFHNGGQEEYVWNTGDSTGCLVV	9865	10443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_9900_10400
865302	contig_6048_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_73144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTAATGCCGCGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023294	1023762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1023300_1023800
865304	contig_2596_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_53452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66799	66242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_66200_66800
865305	contig_3270_pilon	+	244	3	Intergenic	novelGene_104485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	28	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAGCAGAAGTGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320728	323621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_320848_321672_321754_323577
865307	contig_14679_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_174178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGCACCACTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21735	21143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_21100_21700
865309	contig_15596_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_139533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	118624	118313	NA	45	TATGTAAAAGATAGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVYIDPASLRGVPIPDCSELGKITTLHALTFSCCDLQGGHQNPQARQWPGATARSYRKRLASPVGRTVLTLQPLKETNGSGPFNHDFIQGQPVPQEEDQIHGA	118625	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_118200_118600
865310	contig_5095_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_74950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCAGTGGTCGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226142	225530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_225731_225916
865311	contig_21343_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_170230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAATTTCCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28966	28247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21343_pilon_-_28200_29000
865312	contig_13300_pilon	-	436	6	Intergenic	novelGene_125825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	6.61513416341649	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	370	375	286782	283177	FALSE	75	CAAAAAAAAATCACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKLNPVVGAVYGPEFYAVTGFPYPTTGTAVAYRGAHLRGRGRAVYNTFRAAPPPPPIPTYGAVVYQDGFYGAEIYGGYAAYRYAQPAAAAAAAYSDSYGRVYAAADPYHHTVGPAATYSIGTM	291030	283115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_283180_286779_286859_287988_288054_289412_289453_290275_290409_290975
865314	contig_5590_pilon	+	617	4	Intergenic	novelGene_163065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	3.09120616516523	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTATTTGCAATGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783109	795809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_783448_784161_784241_793009_793134_795733
865316	contig_13592_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_33689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGAATTTGATTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225444	226300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_225400_226300
865318	contig_6410_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_108654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAGAAATAGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491251	490238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_490200_491300
865320	contig_776_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_139947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	35	391	932343	932699	NA	45	GAAAAAAGTAACATCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCGTGAGGTGFMAAATSKNNVTGFQRKGPRAGGTDSSGSRLVSIAGTRPSVRNGQLLVSTGLPALDQLLGRFGTEIQVQQRGSSGGEPTERCTLTPHPFLTLQPSNVERIAGSDIEKGEEGLRGDSNLF	932308	932958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_932300_933000
865321	contig_2444_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_83752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCTGCCCAGTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188184	188517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_188200_188500
865322	contig_13412_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_79998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAACTGTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67035	67822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_67000_67800
865323	contig_5222_pilon	+	672	4	Intergenic	novelGene_59006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.2836838484589	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	129	446	253910	268052	FALSE	30	TTGAGAGATTTTCAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVWLRIPGKVSRPWKQPFQRRWTRPAGATNRRPSPVGVSSLWMGGAARGPGRKDAGPPGAGLPPQQRRLGDAVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEPPLPRRLSVTTEQLTSEHTQHFLNGGEACLTGDWKDSHFSCHHTNRLQRK	253781	268278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_253987_256289_256402_262120_262173_267975
865324	contig_7078_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_130140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213835	213133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_213100_213800
865326	contig_9389_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_84084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGAAAACGGAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201814	1202109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1201800_1202100
865327	contig_3410_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_58931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTGCCCCAGTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25029	23993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_24000_25000
865328	contig_12923_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_30117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACCCCAACTTCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67338	66983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_67000_67300
865329	contig_13273_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_178067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTGAGAAAAATCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21040	21416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13273_pilon_+_21000_21400
865330	contig_8285_pilon	+	271	2	Intergenic	novelGene_174979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGACTTTTGTAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739013	750149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_+_739133_749997
865331	contig_4891_pilon	+	675	1	Intergenic	novelGene_124539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATGATGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501050	501725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_501000_501700
865332	contig_3942_pilon	+	470	2	Intergenic	novelGene_128796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAACTGACCTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875823	885856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_875961_885523
865333	contig_383_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_126139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCTTTATTACGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170944	171787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_170900_171800
865334	contig_6888_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_147062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCTTAATTGGATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24436	25011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_24400_25000
865335	contig_11386_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_82841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235428	234682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_234700_235400
865336	contig_8019_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_126998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	377539	377240	NA	60	AACAAAAAACAGACAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPHNTRRAAAAAQGRWGSQGGRFPGSSGDTALSEPQAGWAVQSRALPNAVLPHKRVQAEGTLHCRLAPSPASPSRAGLGPLCRSRCVSLVAGTIDRPLP	377540	377121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_377100_377500
865337	contig_2209_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_141019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAGCCTTGTATTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211374	210492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_210500_211400
865338	contig_13542_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_131525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTTGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482946	483749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_482900_483700
865339	contig_11126_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_138130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAATATTCACCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345501	345899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_345500_345900
865340	scaffold_4805_pilon	+	845	4	Intergenic	novelGene_161043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.69967317119759	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	155	754	793100	797026	FALSE	25	GATACACGGACAGGCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPLETDPGWSPGSGFIPKKSRGPGCTPLVSPSRMEGSAGPETRLESTGLIVLLLSLLPEDEQREKSVSHHTVQQLVVEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKKCAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAYQASLRKEQLRVDALERTLEQKKNSPRFVTS	792945	797117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_793442_793691_793799_794524_794646_796996
865341	contig_10980_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_162554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAAGTGGAGTAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107670	106951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_107000_107700
865342	contig_10079_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_175828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256944	257427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10079_pilon_+_256900_257400
865343	contig_12250_pilon	-	397	3	Intergenic	novelGene_80671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCACTGGCCCGAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390678	383429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_383454_383568_383658_390394
865344	contig_11026_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_167688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGGATATGCATCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284698	283879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_283900_284700
865348	contig_20742_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_150669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCATCATGATGCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194748	194153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_194200_194700
865349	contig_1735_pilon	+	227	1	Intergenic	novelGene_106898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATTAGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134920	135147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_134900_135100
865350	contig_9835_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_166487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTTTCTGGATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10619	10150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9835_pilon_-_10200_10600
865351	contig_4125_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_25038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGAAAACTTGTTTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164184	164867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_164200_164900
865352	contig_776_pilon	+	897	1	Intergenic	novelGene_139951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAGATAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075321	1076218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1075300_1076200
865353	contig_9863_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_153988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAGAAATATTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18021	17650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_-_17600_18000
865354	contig_10768_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_166447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATTACTTTTTTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117349	117808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10768_pilon_+_117300_117800
865356	contig_16125_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_155217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTATCAGAAAACAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75865	76219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_75900_76200
865357	contig_15167_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_178069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGAGCCGTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151240	152098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15167_pilon_+_151200_152100
865359	contig_7057_pilon	-	292	2	Intergenic	novelGene_123218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGCTGGAGTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537565	536969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519
865360	contig_15036_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_107159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAAGAATGAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198208	197519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_197500_198200
865361	contig_15888_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_84398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTCCCCCTCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39826	39554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_39600_39800
865362	contig_13958_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_129546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTCAACAAACCCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240510	240197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_240200_240500
865363	contig_8850_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_172434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATCAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80574	80227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_-_80200_80600
865364	contig_4962_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_107384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199522	200038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_199500_2e+05
865365	contig_9698_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_82509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAATTGAGCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263681	264023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_263700_264000
865367	contig_12951_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_68184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTGGGGGCAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400002	400242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_4e+05_400200
865369	contig_9416_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_177904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTAATAGTAAGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38657	39342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9416_pilon_+_38700_39300
865370	contig_5815_pilon	-	765	6	Intergenic	novelGene_141203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	8.11418511004032	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	54	764	416297	400183	FALSE	25	TGTCAGATGATTTGTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHHVKAQALSRLGRTKEMLKELLYCLALNPEFQTVKEEAEKVICELFFPDSGNVHQNSASSIQSRMLNTGLTRHSNSRSSAASSLREGRNAGSAKNRSKKAYVFRDVNASVLYFLMGRNYEEDEKILDSVLSIKPSTGSKRQFPDDLVDVPDPNTPGKTPKKDTASLPQRSMDSETGESPGFSIDVTDFECSLCMRLLFQPVTTPCGHMFCRKCFECSLDRASHCPLCKEILSEFLLSRNFNITTLAEELISQY	416350	400181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_400243_410254_410370_410650_410751_412338_412541_413890_414053_416225
865372	contig_8259_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_148874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCCTCAAGGAGTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166510	165541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_165500_166500
865373	contig_14472_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_111173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318026	318904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_318000_318900
865374	contig_15167_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_178068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCAGCGCCCAAAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149919	149030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15167_pilon_-_149000_149900
865377	contig_5848_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_163804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGACTGCCACATCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109138	109533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_+_109100_109500
865381	contig_5341_pilon	+	864	2	Intergenic	novelGene_167997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGCAGGAGAGGCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179664	181301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_+_179886_180658
865382	contig_14755_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_129401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATGAGAAATAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973541	973132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_973100_973500
865383	contig_9647_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_127383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCACAAAGAAAGTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47972	48227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_48000_48200
865384	contig_15003_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_137344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAATTATGAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294651	294242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_-_294200_294700
865385	contig_18272_pilon	+	257	2	Intergenic	novelGene_7018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGTATAAAAAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182509	328669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_182655_328557
865389	contig_7260_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_169138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGTCCACAAAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303842	303420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_-_303400_303800
865390	contig_6654_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_85685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATCTTAACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34503	33991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_34000_34500
865394	contig_7704_pilon	-	959	3	Intergenic	novelGene_154600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	2.5	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	48	407	198501	195465	FALSE	5	TTGGCTTCTTTCTCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVQHGAAIFATTLSDGTTAIEKCDPYREGYTDCATYLADVEQSMGLMHNGTVYALWDYSAEFGDELSFREGELVTVLRRDGPEENDWWWATLHGQEGYVPRNYFGLFPRVKSQRNKV	198548	194912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_195504_196454_196655_198380
865395	contig_10196_pilon	-	581	4	Intergenic	novelGene_132071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.1780056072107	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	198	323	803766	803065	FALSE	25	AATCATTTATTTGACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTKDGDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVIITPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDCEPQPAPGARAPSGARQGPSRAHTRL	804699	802806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_803143_803718_803769_803843_803923_804583
865396	contig_12119_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_88644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTGAGTAATGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128621	128859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_128600_128900
865397	contig_5467_pilon	-	498	2	Intergenic	novelGene_111951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATTCCGTGTCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73928	72386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_72729_73772
865398	scaffold_12124_pilon	+	660	3	Intergenic	novelGene_22169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.5	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAGCCACTCGTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054069	1057239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1054450_1055003_1055127_1057082
865399	contig_5836_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_106273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42030	42320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_42000_42300
865400	contig_12622_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_5899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAAACACTGTAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544669	1543679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1543700_1544700
865402	contig_3151_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_139174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTACAGCGCAATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39252	38626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_38600_39300
865403	contig_7051_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_64274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTAAAAGGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169753	169426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_169400_169800
865404	contig_10236_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_169129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	163	432	261155	260886	NA	20	AGGTGGAGAGGGGGACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPRIHLPFHIPVPSPQLASCSQVQRPIPRCYLAAVGALWRPPPRVGTSLSLLQMAWAEGQRWVPVCWARPRTEVRDEARLSFCLPVGSWVRGMDLPAHSKMRPKQFRSSPPFSVLIPILKVGGSSRELPCNSLPVSKDPFNS	261317	260587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_260600_261300
865405	contig_13138_pilon	+	496	2	Intergenic	novelGene_143160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	128	496	237530	238457	FALSE	35	AGGGAAAAGGTGTGTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLRTITYQPAASTKMCEQALGKACGGDSKKKRQQQHPEEPQALQPSLQVQPAAPHHHHHHSHSGTEISRIIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPHQ	237402	238457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13138_pilon_+_237800_238358
865406	contig_16897_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_174462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCTTGAGATAAGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156691	157090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_+_156700_157100
865407	contig_211_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_129869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATTGGAAAGTAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230132	230334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_230100_230300
865408	contig_10197_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_115250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005046	1004758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1004800_1005000
865409	contig_13379_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_175880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCATGGTTGGGCGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366375	365818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_365800_366400
865412	contig_14807_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_124688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37401	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37200_37400
865413	contig_2161_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_114957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAGAAATTGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996169	997247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_996200_997200
865414	contig_6513_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_117773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTGAAAGAATGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173527	173027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_173000_173500
865415	contig_17603_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_152772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCGAAGTGTGAGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23377	22913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_22900_23400
865417	contig_10095_pilon	-	178	1	Intergenic	novelGene_57232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAGGGAAAGATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190115	189937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_189900_190100
865418	contig_14980_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_78227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGAGTGGATCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421861	422433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_421900_422400
865419	contig_7408_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_168717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAAGTACCAGGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5807	5171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_5200_5800
865420	contig_3975_pilon	+	734	5	Intergenic	novelGene_54719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.6393596310755	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	218	541	1520291	1521176	FALSE	25	AGATGCTCCATGTGGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATWLPPHDAVALQYCVVNIFSVTSAIVVITSGIAAIVLSRYLPSIPLRWTVFGSSVACALLSLTCALGLLASMAVTFATQGRSLLAACTFGSPELLALAPDCPFDPTRVYSSSLCLWGIALVFCVAESVFAVRCAQFTHHLLELRPWWGKSSHHPILESPEPTEGCDVLNCTSSELLTL	1517781	1521369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1517864_1519992_1520053_1520215_1520405_1520521_1520657_1521101
865423	contig_6960_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_60233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTTTCTAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233876	233193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_-_233200_233900
865424	contig_20610_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_67639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGATAACATACATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34338	33934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_33900_34300
865425	contig_2113_pilon	+	353	3	Intergenic	novelGene_161154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	83	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTATGACTTAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505634	508649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_505845_507642_507673_508536
865426	contig_5062_pilon	-	676	1	Intergenic	novelGene_157823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25445	24769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_24800_25400
865428	contig_3575_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_141113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACTAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429152	428779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_428800_429200
865430	contig_6217_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_109637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTGTCCTATTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564813	564437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_564400_564800
865431	contig_2069_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_23449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGGGTAGAGGAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348433	1348143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1348100_1348400
865432	contig_2403_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_71015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGAGTCATAATCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151939	151432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_151400_151900
865434	contig_4782_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_73631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	348	383	278695	275988	FALSE	20	GTCATTTCAGATTTGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWRGALSCGLRPTVGAGTRPPSGPPLGLAYLAPGPTRGLHGGTRPEERAEGVADEGRRESSAADHTSLKFDIDTLVSLLRQENARDICVIKVPPEVKYTDYFVIGSGTSTRHLHAMAYYIVKMATW	284052	275792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_276000_278671_278851_283860
865435	contig_4125_pilon	-	1038	6	Intergenic	novelGene_25273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.54919333848297	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	521	688	3383923	3379899	FALSE	40	CAGACATGAAGTCAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKHLTDLSIRSTLFVPQNSGLGENETLSGRDIEHHLANVSLIFYDDLVNGTILRTRLGSQLLITSSQDQPDLKETRFVNGRAILQWDIFASNGIIHVISSPLKAPPAPVTSAHAGLGTGILFAVILVLGVIAFVAYSYFRLNQRTIGFQHFESEEDINVAAFGKEQPENISNPMYESTTSAPLEPSYGPFSDSDEWQLKSSDPLGGALRASQPSPTGSMEYPQKGYQL	3390961	3379548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3380013_3383869_3383987_3385533_3385663_3386590_3386702_3389006_3389148_3390885
865437	contig_5623_pilon	-	409	2	Intergenic	novelGene_154875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAAACCAAAGATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279961	279025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_279291_279817
865438	contig_10861_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_39316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACACTGAGATCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473625	1474636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1473600_1474600
865440	contig_7912_pilon	-	513	1	Intergenic	novelGene_129554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	119	511	32975	32583	NA	25	AAAGGGGCTTTGTGAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSEHSISLEGVSQVRTPQADPSTQKTQPWEICVPALKDIMAEHKATNPRQNLCLGGACVRASWLSTKPPQHQKHHSGEKPFRRDVDGALFVKCCRFQESWQHFTHGEVGKDSTVPLNLFQYEVNPNGEKPLSSLEYGEAFHCGKSRYKWEECGKGFSHKHTLSHHQSICT	33093	32580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_32600_33100
865441	contig_5033_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_29081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGAAAAGCTCAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651926	651503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_651500_651900
865443	contig_8198_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_178074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGCAGAATTTGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103431	103012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8198_pilon_-_103000_103400
865444	contig_12964_pilon	+	356	3	Intergenic	novelGene_131737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	9	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACTAGTAAGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637052	670792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_637256_658360_658458_670736
865445	contig_8631_pilon	+	449	1	Intergenic	novelGene_121943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAAGGCTGGTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666989	667438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_667000_667400
865446	contig_7398_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_166182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGGAAGGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322493	322057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_322100_322500
865447	contig_16541_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_126764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCATGAGATGATGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475635	476129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_475600_476100
865449	contig_18391_pilon	+	683	1	Intergenic	novelGene_174097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGAGATATGTGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113303	113986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_+_113300_114000
865450	contig_6286_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_165646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTTCCACCACAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101950	103302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_102047_102553
865452	contig_10300_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_152932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAACAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178867	178380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_-_178400_178900
865454	contig_16532_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_110058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGTCATCCACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489173	489540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_489200_489500
865455	contig_11422_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_99031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1000
865458	contig_6058_pilon	-	284	3	Intergenic	novelGene_172376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCACTTCTCCAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366450	360110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_360190_366156_366283_366371
865460	contig_20420_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_172476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTGAAATTGATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19233	18702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_18700_19200
865461	contig_5317_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_76567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCCCCTAGGATGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93529	94223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_93500_94200
865462	contig_18934_pilon	-	621	2	Intergenic	novelGene_175885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAACTTATGGGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134135	106683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_-_107130_133960
865463	contig_1996_pilon	+	585	4	Intergenic	novelGene_131962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	13	540	549040	550033	FALSE	15	GGCCCCTGACAGGCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAHMGYYETVAGGVGAGPGWHGRSGVHSHMTNTRITDPEILESRYPVILRRFELRPGSGGRGRFRGGDGVIRELLFREEALLSVLTERRAFRPYGLHGGEPGACGLNLLIRKDGRTVNLGGKTSVSVYPGDVFCLHTPGGGGYGDPEDPAPPPGSPPQASAFPERGSVYEYRRAQEAV	549027	550078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_549162_549260_549422_549564_549663_549886
865466	contig_9091_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_32447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATTTAGGAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201994	201402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_201400_202000
865468	contig_7571_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_106389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAGATAAATAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67841	67152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_67200_67800
865469	contig_12479_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_56874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGTTCGGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502538	503016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_502500_503000
865470	contig_19012_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_159466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2805	3553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_2800_3600
865471	contig_6915_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_162417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGACAATCAGCCAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229869	229320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_229300_229900
865472	contig_3818_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_99219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGATTCTCTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230583	231230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_230600_231200
865474	contig_9333_pilon	-	155	1	Intergenic	novelGene_120333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTCAGTTAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378987	378832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_378800_379000
865475	contig_9320_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_176700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694922	694687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9320_pilon_-_694700_694900
865480	contig_6658_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_168400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGGTCCTGTCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144011	144837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_144000_144800
865481	contig_11449_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_170556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166033	165166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_-_165200_166000
865482	contig_9799_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_145562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969656	970176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_969700_970200
865483	contig_9516_pilon	+	334	3	Intergenic	novelGene_106201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAACACACAGTAGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211803	1228621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1211845_1214634_1214724_1228417
865484	contig_14704_pilon	+	287	2	Intergenic	novelGene_82690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	1146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTCATGTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71397	78169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_71555_78039
865487	contig_9038_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_143334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTAACTCAGCAACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445703	446067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_445700_446100
865488	contig_5947_pilon	+	565	4	Intergenic	novelGene_101503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	111.044535610218	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	59	565	407778	412124	FALSE	35	CAGGAGGAAGCTGCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAG	407719	412124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_407805_408918_409063_410065_410181_411903
865489	contig_14933_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_165045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCTTTACAATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15105	14459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_-_14500_15100
865490	contig_6479_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_160608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCAATGCCCCCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135715	209032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_136107_205869_205957_209015
865491	contig_12654_pilon	+	531	2	Intergenic	novelGene_129285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728677	729294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_729019_729104
865492	contig_10734_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_51248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTGCTGGCATACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244005	1244341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1244000_1244300
865493	contig_8122_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_40271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAAATCAGAGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760524	761340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_760500_761300
865494	contig_11602_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_166602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246462	246853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_246500_246900
865495	contig_4426_pilon	-	303	3	Intergenic	novelGene_15397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGGTAAGTTACAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722887	694962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_695059_720729_720889_722839
865497	contig_6434_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_61826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGGTCACGTTGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687488	687947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_687500_687900
865499	contig_10864_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_107047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAAAATGCAACGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711406	711813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_711400_711800
865500	contig_15165_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_145329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTACATATCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368794	368211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_368200_368800
865501	contig_5549_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_81669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCAAGTTTTAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529520	529825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_529500_529800
865502	contig_7171_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_101272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGCACATAATTGTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924057	923696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_923700_924100
865503	contig_13558_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_123034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAAACCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570288	571176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_570300_571200
865504	contig_1076_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_101126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACAAGTTTGTGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889464	889172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_889200_889500
865506	contig_5331_pilon	-	792	2	Intergenic	novelGene_112845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	409	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATATTTCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799912	798083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_798311_799347
865508	contig_8865_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_164454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAGAAAAAGAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383156	382929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_382900_383200
865509	contig_9871_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_75676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATTGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492096	491727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_491700_492100
865510	contig_7569_pilon	-	802	1	Intergenic	novelGene_114590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGATCTCTTCCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17286	16484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_16500_17300
865511	contig_3081_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_133990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAACCAAGTAGGGCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2993388	2993783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2993400_2993800
865512	contig_8743_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_149487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGCACCGCCTACGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79921	80770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8743_pilon_+_79900_80800
865514	contig_1107_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_126560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAAATTCTAGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244301	243791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_243800_244300
865515	contig_4469_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_21903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTCCCCCTCCTAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430752	431385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_430800_431400
865516	contig_253_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_129673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTGGTGGATCAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418693	418906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_418700_418900
865517	contig_5917_pilon	-	462	1	Intergenic	novelGene_122141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCACTAGCAGTAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207457	206995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_207000_207500
865519	contig_9982_pilon	+	682	5	Intergenic	novelGene_55713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.77263412660235	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	4	396	199451	209702	TRUE	40	GTAAATACGTATGTCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAPRYPTPLHGHVGRGAFSDVYEPAEDTFLLLDALEAAAAELAGVEICLEVGSGSGVVSAFLASMIGPQALYMCTDINPKAAACTLETARCNKVHIQPVITDLVKGLLPRLKDKVDLLVFNPPLCSDST	199447	214542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_199585_201960_202048_202805_202897_209621_209707_214260
865520	contig_11816_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_98538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCTTCCGTAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055702	1056337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1055700_1056300
865522	contig_5728_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_126686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAATTATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232406	232799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_232400_232800
865523	contig_16387_pilon	-	526	2	Intergenic	novelGene_174525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCCAAAAATGGAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81846	79644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_-_80128_81803
865524	contig_12229_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_169396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACATATAAAAACAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283977	283195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_-_283200_284000
865525	contig_7080_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_100119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	9	30	286	315	539671	539700	NA	60	AATATCTAGAAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKACGSGVCRHPRTPSCLALRPGWAPTALCSSLSPLRLRSFIRARFHGWKNFGDKQVVGPVVDGLARVWQESDQRPGVCPCSVRRSWGPSSSACMEDAPLESV	539385	539809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_539400_539800
865526	contig_546_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_117238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGATATGAGTGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156102	156455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_156100_156500
865527	contig_1107_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_126610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATATTAAGAAAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248105	1247766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_1247800_1248100
865528	contig_7593_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_127316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTCACTAAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287612	286896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_286900_287600
865530	scaffold_13609_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_124420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATGAATATTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709696	708952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_709000_709700
865531	contig_10078_pilon	-	567	3	Intergenic	novelGene_159991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGGAATGAATGAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15730	8141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_8482_10202_10377_15677
865533	contig_6914_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_151721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGTATGCTGCCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83719	83461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_83500_83700
865534	contig_3147_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_142274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGCAGCCCATTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82313	81911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_81900_82300
865535	contig_5936_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_53581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358716	359080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_358700_359100
865536	contig_6707_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_167035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTGTCTCGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122251	122502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_+_122300_122500
865538	contig_10583_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_167917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCAATCTTATCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206787	207290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_206800_207300
865539	contig_2204_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_71691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTAGAAAAAGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172446	172725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_172400_172700
865540	contig_12786_pilon	-	344	2	Intergenic	novelGene_103456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGGAAAAATTAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674490	673748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_674044_674441
865541	contig_15070_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_164890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGAAACCCGTAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388471	388841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_388500_388800
865543	contig_11898_pilon	-	557	1	Intergenic	novelGene_144285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGTACATACATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233977	233420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_233400_234000
865544	scaffold_13505_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_111651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTTTTGGTTAGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820074	820574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_820100_820600
865545	contig_401_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_42798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTGGATGTGAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513080	1513513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1513100_1513500
865547	contig_18420_pilon	+	802	1	Intergenic	novelGene_109380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137624	138426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_137600_138400
865548	contig_13753_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_136520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAATAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291204	291921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_291200_291900
865549	contig_4125_pilon	+	342	2	Intergenic	novelGene_25174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCTTCCTTCTGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126522	1262051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1126603_1261789
865550	contig_8793_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_178078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAAAATCTGTAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36269	36626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8793_pilon_+_36300_36600
865551	contig_11602_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_166595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180318	181036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_180300_181000
865553	contig_8710_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_73551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTGTCAAAGCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519322	520192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_519300_520200
865554	contig_1143_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_86584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTGCTAACCAAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125227	125674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_125200_125700
865556	contig_8921_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_161622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTAAAATGTAGTTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15325	15830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_15300_15800
865557	contig_253_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_129734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCATTTGCTGATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605902	604799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_605331_605877
865558	contig_11378_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_112278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTGGTCAGGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465391	465825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_465400_465800
865559	contig_16907_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_87489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560498	559584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_559600_560500
865560	contig_13481_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_119276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGGAGAAAAAGGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125925	125299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_125300_125900
865562	contig_10500_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_41143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	39	509	459240	444935	FALSE	40	CACAGGATGCAAACCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNVVGGSPLAKGMTTTIHPGGGSLSSPATATRPALTLTTPQAHAQHQASSPAVGSCLRHSAQPAASQARSTIPTAAHSAAQAQDRPTATVSPLRTQNSPSRLPTAGLRPHSVVSPQHVHQPPIQMVVGGSVPPAGHPPHVSSVSHHPSQRQRGQPQWGDRRGGPSVAC	459278	444918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_445219_459053
865564	contig_13453_pilon	+	401	3	Intergenic	novelGene_146726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	80.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	21	308	151176	155585	FALSE	55	AAGCAGGGGGAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGYQIRMESRASESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRFFILKI	151155	155678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_151293_154791_154941_155563
865565	contig_6102_pilon	-	534	2	Intergenic	novelGene_32258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	53	532	1363507	1360415	FALSE	30	CATCTACTATGTGCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSCQIPLPCAYPSRGSMGVTATAQNGMIAGKAGEAAAFPFLPLPRWGANYTPAAHCAGAVVWLQQVSFDAAAREGAVCVGAELAAGAVHRALIKVCQEKGKTGHFQCNTGREMGALQHHQWECWRCPLLLWRIRWKNLVTFEMCKPYDPARPFLVSTLEKHLHVCTFIYSFSKDFL	1363559	1360412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1360771_1363383
865566	contig_8676_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_142232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTAAGATTTTTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720557	720171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_720200_720600
865567	contig_8576_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_88726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGACCTTAAGTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544972	545265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_545000_545300
865568	contig_1406_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_25675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	101	421	3121820	3122140	NA	40	TTCTTTCACCAACAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGRAELCTAITGAYGLCLPVPVVDHNSGTYELMYVSRTECELLLSMLLYRQPVHGSPFCVCPLRPGDLSPSLDNVKPGIKIYLKEMAHAVAGAGKSQIRRVRRQAGNLCWFMGLQGLQSKICGSGDRLETSAGLQPRN	3121719	3122406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3121700_3122400
865569	contig_1406_pilon	+	197	1	Intergenic	novelGene_25451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTTATCATCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490132	490329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_490100_490300
865570	contig_6654_pilon	+	631	1	Intergenic	novelGene_85777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGATGCTTAATCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	690849	691480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_690800_691500
865571	contig_4429_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_50779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCCTTGCAGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116305	116595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_116300_116600
865572	contig_3382_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_124133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786817	787178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_786800_787200
865573	contig_9272_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_125982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTGTCGCTGACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674614	676048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_674704_675787
865575	contig_2596_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_53508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCTTTGCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026462	1025956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1026000_1026500
865576	contig_10855_pilon	-	274	1	Intergenic	novelGene_124353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAATGCTGTGGCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587186	586912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_586900_587200
865579	contig_8795_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_146886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGTTATGAAATGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155614	155151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_155200_155600
865580	contig_5988_pilon	+	195	2	Intergenic	novelGene_16111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3212	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAACTTTTGTACTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1223394	1224882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1223461_1224753
865581	contig_91_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_127104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTTTTTTAAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343064	343476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_343100_343500
865582	contig_7887_pilon	-	415	4	Intergenic	novelGene_124876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	9.89949493661167	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	51	413	224404	219324	FALSE	20	GTGGGAGTTGAAACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSWSFAGVPGAQRLWMAEAQSGTGRLQEQKKGLLIAVSASVDKIISHFGAARNLVQKAQLGDSRLSPDVGHLVLTTLCPALHALVADGLKPFRKDLITGQRRSSPWSVVEASVKPGHPWWVGLWCWSVSFLICPNK	224454	219321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_219390_223806_223978_224108_224186_224355
865583	contig_10861_pilon	-	491	1	Intergenic	novelGene_39428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTATAAAACGACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2342117	2341626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2341600_2342100
865584	contig_7179_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_78128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGAACTGCAGCCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782016	781567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_781600_782000
865585	contig_593_pilon	+	754	4	Intergenic	novelGene_102027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_2	56.944417344167	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	231	575	530967	537005	FALSE	20	TTTGAGCACCCTTATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTPSSEKRSKIPRSQGCSRETSPNRIGLERFGLGQPGRVPGSVNALRVLSTSTDLEAAVADALKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSERSYGSRNGGIPHYLRQTEDVAEVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHSKVSLGMSHIPVCMCVRALVYPPLE	513271	537184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_513362_527459_527564_530930_531176_536869
865586	contig_8330_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_71949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGGAAAGAGCGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449328	1448902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1448900_1449300
865587	contig_14209_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_88363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCAGATGTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50472	49874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_49900_50500
865588	contig_2278_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_118131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTATCTTTCTAGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030068	1030537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1030100_1030500
865590	contig_2414_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_158497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAATTTACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368617	368099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_368100_368600
865594	contig_13300_pilon	+	373	3	Intergenic	novelGene_125824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAAAAATATTTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281125	284282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_281269_281530_281673_284194
865596	contig_5084_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_64653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATTCAACAATTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457281	1457623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1457300_1457600
865599	contig_593_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_102038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAATACGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597270	597964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_597300_598000
865602	contig_10813_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_87026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTAGACTTGTGTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86519	87096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_86500_87100
865603	contig_15459_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_106385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGAAGGGATTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20666	21309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_20700_21300
865604	contig_1372_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_140510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGCTGGTTCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433222	433924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_433200_433900
865605	contig_13780_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_149015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	330	341	323740	323729	NA	15	GAACTTCCCGTGGTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGCGLQEGRAYLIHVCARAGLGSSRSFKGGEEVSGTTARSAECLHQAESAGTDASPLDLGSIEDRIGVGAQGPVWSSRRALCCGGYFCIWIAITKINSGSTSFEHLLCAMSF	324069	323620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_323600_324100
865607	contig_3825_pilon	+	840	1	Intergenic	novelGene_78052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	264	590	2597547	2597873	NA	15	CATCCTTGTCTGTAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPGTCSKNCTNASWGVLFLFVKFGEALSARVKFALCLILTDEKERREGEGRGGTPSHTFSELVMGRTTLRATMSSAWGTAVCARLELSTLTGSVMVAGPSPCPLPG	2597283	2598123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2597300_2598100
865610	contig_4686_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_118537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTCAAGGTTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490722	491100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_490700_491100
865612	contig_11026_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_167696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGCACTTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343929	343563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_343600_343900
865613	contig_5590_pilon	+	435	3	Intergenic	novelGene_162984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	184	417	167503	168583	FALSE	15	CATGTGCATGTGCCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELARRRNSLGFVVGSDGYVYEGRGWHYVGAHTLRYNSRGFGVAFVGNYTAELPTEAALRTMRDELPRCALRSGHLRSDYKVLGHRQVVSTECPGDALFNVLRTWPRFAADVKPRTARRASWRSRRELPPLLPAADPQ	166822	168601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_166855_167351_167650_168496
865614	contig_11631_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_104191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAGAAGGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111867	112377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_111900_112400
865615	contig_12019_pilon	+	595	4	Intergenic	novelGene_87710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_1	56.6882311909232	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	214	594	275625	277060	FALSE	20	GTATCAGTCCATCTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNVADCKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTKVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEKGSALHEAALFGKTDVVQILLAAGIDVNIKDNRGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIE	265147	277061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_265268_275531_275829_276591_276668_276959
865618	contig_20739_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_83192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAGAACCCATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193477	192901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_192900_193500
865619	contig_9189_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_165134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAATAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513258	512950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_513000_513300
865620	contig_4470_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_171777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	438	854	252116	251700	NA	30	AAACACCTACTCCATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAHEFLNAKEGKCSDRSGFLREWVGPARLPSELWNCLFPTDSSLGTTTKKGCSCIDWACCCLLRCVTTQPGSLPGFSVFLLEEPGPRACDAATRSCRFVLGVPSSTRLFQGCLLFAHTIPPLPGSPCPSSPMPFRVRL	252553	251697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_-_251700_252600
865621	contig_7730_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_156282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCAGGGGCGGGGCCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354188	354611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_354200_354600
865622	contig_7009_pilon	-	251	1	Intergenic	novelGene_23613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTCTGGGGGCCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431173	430922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_430900_431200
865626	contig_4402_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_140828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAGCAGATTTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460808	461643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_460800_461600
865627	contig_5057_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_151528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGAAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549361	548499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_548500_549400
865628	contig_12150_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_6965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	139	459	113266	113586	NA	30	TTGCAATCCCCACAATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLAPFCFASCSCQYLQEMHLHPSSNSSFQEWQLVPVCSLPHSQNQLHHTLLETSWSMFSPLKVWSNSTAPPSSFWILIIPTSSFCSPVLNTVVAPCYYYFLLCFR	113127	113650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_113100_113600
865631	contig_1107_pilon	+	483	3	Intergenic	novelGene_126572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	14.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	319	438	549478	549597	FALSE	85	TAAAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATEYYSPLALLKQELQHRQQQEAPAGGGGCNPQSGDWGNQYSAECESSFLNFHDSDCEPKGSPACDSLLSLNTEKILSQAKSIAEQKRFPFATDNDSTNEELGKMNLRILLYLPRIIRCRTGRQGGVVERTLKLVLPITSCLT	512046	549642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_512189_546387_546483_549396
865633	contig_3557_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_173609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTGCAAAGCCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217	1525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_+_1200_1500
865635	contig_5021_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_167096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAAATTTGCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296236	296004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_-_296000_296200
865636	contig_8978_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_49492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGACTCTCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766133	1765270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1765300_1766100
865637	contig_3382_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_124215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATTAAAAAAAAAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487008	1486526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1486500_1487000
865638	contig_9683_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_151267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACCATAAATAACAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16863	17269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_16900_17300
865639	contig_14986_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_59718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	130068	130397	NA	15	GAGGACATGGGTGCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLADERIGLVGLREDQVTLPRVGGEGDLVGIGLQEGLNPIHAHKALGGRGGRTAAGGLKLPRFVPAPHPERQEHNDKGEEDTGDRGHSHHQVQREVGGVRVVGGLEAV	130067	130849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_130100_130800
865642	contig_10436_pilon	-	559	3	Intergenic	novelGene_108516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	12	398	119641	119039	FALSE	25	TGGAAAACAGGCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALMVVSLVLGFLAMFVATIGMKCTRCGGDDKVKKARIAMTGGIVFIVAGLAALIACSWYGHQIVQDFYSSLIPVNAKYEFGPAIFIGWAGSALVLLGGALLSCSCPGSESKTGYQAPRSYPQPNSAKEYV	119652	118877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_119202_119299_119385_119502
865643	contig_11028_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_163961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTGGAGAAGTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864332	864688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_864300_864700
865645	contig_18829_pilon	+	203	2	Intergenic	novelGene_177702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGTAGAATACTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7316	17047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_+_7405_16932
865646	contig_5967_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_44421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	210	587	495832	495455	NA	45	TTTTTCCTTAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCWRKGFLFLVLVSCVLLFIAPAARSVSGAYGWGHPVELCLGHALRARRPSTTLQPQSRPRDHLATTLFMWMLCTPASGLQQCPECVCVPASSLGLPAPRGLLPAALLYGHCALPALCLRQCSPTTSARLPTSLSLPVPRGLLPAATVPSQHCASGSAPLTTSTHLPTSLSLPAPQGVVSGLPGNFGPTLVRVT	496041	495306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_495300_496000
865647	contig_15104_pilon	-	327	2	Intergenic	novelGene_163360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACAAACCTGAGCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641930	640791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_641061_641872
865648	contig_3307_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_86892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACCATTAAAGAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144336	144599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_144300_144600
865649	contig_14142_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_120463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	108335	108736	NA	20	CAAGCCATCTCGGATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVFLLAYLSPEAPCLRQLRAYPASPQVGSRLRSRDRPIESLEYKEQREASVEYKAAGAGPALQLEQAPSRKPGESRGQRLGAAGKFTFAERSLRCGEISTLPTRAGRFLVKSDLPPQGHGRWFVRQRLGSHRS	108332	109206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_108300_109200
865650	contig_5959_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_150215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTCCTGAAAGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430940	430307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_430300_430900
865651	contig_10011_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_68016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	272	493	9017	9238	NA	75	AGCAAAAAAGAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPEKQGVCVWRGGELLCLENWVSLNSAPCTSSSCCKRGEAADSAVSPPATRSALVPSPQVFIRELISNSSDALEKLRHKLVCEGQTLPEMEIHLQTDADKGTITVQVSPPYPDCEDPLCPPPDDASATHSVTGPGSWWAGAQLHTRARERRACILALSLDST	8745	9332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_8700_9300
865652	contig_11677_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_85962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACCAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640588	641338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_640600_641300
865653	contig_15293_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_146543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCCAGGGTGAGAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142515	142120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_142100_142500
865654	contig_11328_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_88435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAGGAAGAAGCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761283	761876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_761300_761900
865655	contig_19990_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_30765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72830	72583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_72600_72800
865656	contig_16714_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_161575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879824	878927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_878900_879800
865658	contig_18116_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_175449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGATGGCTCCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117275	117841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_+_117300_117800
865659	contig_10466_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_173625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108147	108771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_108100_108800
865662	contig_11964_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_164721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTATATTTTCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235552	235920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_235600_235900
865663	contig_18354_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_178080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAAATATTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192	610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18354_pilon_-_600_1200
865664	contig_6228_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_164503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTTAAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235936	235380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_235400_235900
865666	contig_6189_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_164968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	231218	230874	NA	50	ATAAGGAAGGAAAACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGRHLRDRLSPPPLSELPPPRQLGARLVRGLRCSEAAGLSSVSLNGGANGPPLQLLPGRPRARLLRSEPRWRRHWLCEEDGRGGGSGEEEGTSNSQERSVGRGFSESPDQRQQ	231219	230788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_230800_231200
865668	contig_12078_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_74132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTCGAATCCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698325	697900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_697900_698300
865669	contig_16211_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_150107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACAGTCTCCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240467	240096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_240100_240500
865670	contig_504_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_54426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTAATATTTCTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177818	177290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_177300_177800
865672	contig_8898_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_137234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAAGGGTACTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218145	218712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_218100_218700
865674	contig_21208_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_175781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGCCATCTCAACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85285	85979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_85300_86000
865675	contig_4059_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_140589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGCCGCCGGGCTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256745	178806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_179053_256436
865676	contig_6418_pilon	-	465	1	Intergenic	novelGene_81131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTGTACAAAGCAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115768	115303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_115300_115800
865677	contig_7009_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_23610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGAGAGAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430753	430998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430800_431000
865678	contig_13300_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_125782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGCATGAGTTAACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85759	86131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_85800_86100
865680	contig_8980_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_74020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTGCTCTAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727514	727229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_-_727200_727500
865681	contig_16541_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_126719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAATTACAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160733	160472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_160500_160700
865682	contig_9272_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_125906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTAAAATAGTGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282246	281852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_281900_282200
865683	contig_5935_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_102689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATGTATTTTGGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804923	804252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_804300_804900
865684	contig_4797_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_6923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGATCAGACAGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565830	565203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_565200_565800
865685	contig_4125_pilon	+	675	4	Intergenic	novelGene_25235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	30	314	2267109	2523221	FALSE	50	GGAATAAATGACTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGIWAKKKMEVGERFGPYMVAPRTTLKETDFGWEQILTDSEVSSQEGCIKKISEDLGGEKFCVDANQTGAGSWLKYIRVAYSCDDQNLTMCQINEQMKMKFE	2267079	2523582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2267187_2355984_2356036_2519690_2519826_2523200
865686	contig_12919_pilon	+	365	1	Intergenic	novelGene_75924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGATTTTGGGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855907	856272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_855900_856300
865687	contig_5341_pilon	+	525	1	Intergenic	novelGene_168000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGGAAGGGAGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221831	222356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_+_221800_222400
865688	contig_12802_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_114246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97519	98042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_97500_98000
865689	contig_12327_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_140659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040908	1041252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1040900_1041300
865690	contig_4857_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_48883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTCAGCAATTCATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404150	1404923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1404200_1404900
865691	contig_9195_pilon	+	936	7	Intergenic	novelGene_155670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2	9	450	458	45198	45206	TRUE	65	AAAACAATAATGAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLQGGQQRRRPECPHGQRFSFQHDHLTALRLRLIWIWLLNFQQFLKIIHKEFLQWRALWPLQRIQKLLDFGGHSAVHRDTIGCFQDAPAATSPRDTSHGSHLRTFTVRKLPEARGDIRRGRVQVYVGVSRKAGEGGSGAGNGGRSPSRMR	27961	68891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_28086_29822_29940_40138_40276_45126_45358_47386_47519_62682_62814_68827
865693	contig_8161_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_156762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAGATTACAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280109	280595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_280100_280600
865695	contig_10371_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_175495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGGGCTAAGTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910109	911137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_910100_911100
865696	contig_10444_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_139455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706939	706373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_706400_706900
865697	contig_8900_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_171622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTTTAATATGAAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219239	218728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_218700_219200
865698	contig_4730_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_71697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	153	470	84213	84530	NA	60	AAAGAGAGAAGTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYNAKDEVDGGPPGAPGGTTKNRRPDNTAFKQQRLPAWQPILTAGTVLPTFFIIGLIFIPIGIGIFVTSNNIREIEVRGVSGGGSWRCLGAGFLLPALFLPQLS	84060	84755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_84100_84800
865700	contig_15084_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_116700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACATTTTAAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226820	227425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_226800_227400
865701	contig_11126_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_138152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGACTAATGGTTGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987234	987714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_987200_987700
865706	contig_11986_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_69113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCATTACTTGTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91173	90496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_90500_91200
865707	contig_8762_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_145290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAACAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106110	106532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_+_106100_106500
865708	contig_5261_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_102466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCAAGGTAGATGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513128	513580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_513100_513600
865710	contig_10095_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_57227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175338	175904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_175300_175900
865712	contig_15043_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_175508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACCACTGACCTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260567	259775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_259800_260600
865714	contig_12080_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_128347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTAAAGCAACCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51670	52129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_51700_52100
865715	contig_10003_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_88230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632789	633258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_632800_633300
865716	contig_20819_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_55704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGGTATCGCAGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170462	170853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_170500_170900
865717	contig_20878_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_173443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25375	25649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_25400_25600
865718	contig_6227_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_49634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCATGTCCTAAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354250	353769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_353800_354200
865719	contig_3825_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_77976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCACTCTGCACTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139662	139910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_139700_139900
865720	contig_7815_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_134385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	206	391	500521	500336	NA	50	GCCTGAAAGGAAAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKEEYSRHREEHTLRWKVRDSIVTDSELKAPVKWLYLQFLGLFQIYSWATWCGDLCCTKTGTGASGRKMGIIGPSVAGGYSEQFGGDNRDKAAWLWLIDGGENVDQVYWQSIWLILIWSIKDRAEVFAD	500726	499996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_5e+05_500700
865721	contig_5598_pilon	+	431	1	Intergenic	novelGene_148290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCGGGCAGATTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717113	717544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_717100_717500
865722	contig_1452_pilon	+	733	1	Intergenic	novelGene_115121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172954	173687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_173000_173700
865723	contig_5765_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_141360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGAAAACTGGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372137	372430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_372100_372400
865725	contig_15413_pilon	-	624	1	Intergenic	novelGene_176955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAAACACTTAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75590	74966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15413_pilon_-_75000_75600
865726	contig_18438_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_171383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTAACCGAGTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72789	72452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18438_pilon_-_72500_72800
865729	contig_7457_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_31592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCTGAAGAAAAAGAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950790	950305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_950300_950800
865730	contig_19330_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_163698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACAAGGTCCCCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70123	70663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_70100_70700
865731	contig_7707_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_72164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACATGGAAGAAATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265930	266729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_265900_266700
865733	contig_2854_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_120830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATGTAACATATTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256898	256277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_256300_256900
865737	contig_14483_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_133746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAAAAAATGAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38316	37606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_37600_38300
865738	contig_19409_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_172898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	46	756	149393	150103	NA	25	CAAACGCCTGTTTGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDYYEVLGVPRQASSEAIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERRFKQVAEAYEVLADAQKRDVYDRYGKAAVDGGGGGPFDDPFDFVFTFRDPAEVFREFFGGRDPFSFDFFGDPLENMWGSRRSSRGSRSRGSLFSTFSEFPAFGSGFSAFDTELTSFGSMGSGGLSSFAMSCGSGRSGNFKSMSTSTEIVNGKKITTKRIIENGQERVEVEEDGELKSLIINGKEQLLRIDTQ	149347	150226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19409_pilon_+_149300_150200
865739	contig_19721_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_99149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAGAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134224	133519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_-_133500_134200
865740	contig_272_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_177629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGAGAGAGTAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45111	45323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_272_pilon_+_45100_45300
865741	contig_15114_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_121197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCGCTGGATACAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766370	767042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_766400_767000
865743	contig_9345_pilon	-	833	5	Intergenic	novelGene_24431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.16624148553054	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	243	494	311803	302791	FALSE	20	TTTTTTTACTTTGTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVAALLLTVAILLSLRSLKSNVRGIHANLAAALGVAELLFLLGIHRTHNQLVCTAVAILLHYFFLSTFAWLLVQGLHLYRMQVEPRNVDRGAMRFYHALGWGVPAVLLGLAVGLDPDGYGNPDFCWISVHEPLIWSFAGPVILVIVMNGAMFLLATRTPLPRL	312265	302451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_302809_310896_310933_311366_311480_311718_311894_312113
865744	contig_8978_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_49484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGGAACAATTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1732447	1732954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1732400_1733000
865745	contig_6109_pilon	-	506	1	Intergenic	novelGene_160373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCCAAAAAAAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566508	566002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_566000_566500
865747	contig_6967_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_174625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCGCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126221	126951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6967_pilon_+_126200_127000
865753	contig_7056_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_43741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGTACTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120718	1121208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1120700_1121200
865754	contig_2550_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_135649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGAGGGGGTCGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571805	570629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_570600_571800
865756	contig_4519_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_123738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTTGTTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767218	767781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_767200_767800
865758	contig_2863_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_174064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGTAAAGCATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120313	120702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_120300_120700
865759	contig_8461_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_163942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCTCTGCTTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558577	557973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_558000_558600
865761	contig_14666_pilon	+	211	1	Intergenic	novelGene_39472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTTTTAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17042	17253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_17000_17300
865762	contig_5539_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_104759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGTGACATTGATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131445	131801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_131400_131800
865763	contig_8328_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_174040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGAGTATTTATTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42822	43245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_+_42800_43200
865764	contig_12078_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_74139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTTGAAGAATGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866540	866069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_866100_866500
865765	contig_10877_pilon	-	634	2	Intergenic	novelGene_166210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAATCCATTATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45251	43197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_-_43323_44742
865767	contig_18643_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_178082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	232	576	4658	4314	NA	30	AACTTATGTAACCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLEIQDTFSLIAIQAFLTSHYFAKSERHIYSKSLMQFSQGSRVMATIRWENHCSRLPSVSIIPFVTFPFWSANYKPDYSGFFHHTQCCASSFLSRLFLEELIRGHDYMTWRG	4889	4076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18643_pilon_-_4100_4900
865769	contig_11702_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_141969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAAGTGGAGCCCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322516	321665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_321700_322500
865770	contig_1150_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_61469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456917	457457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_456900_457500
865771	contig_10003_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_88265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779709	780086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_779700_780100
865773	contig_13718_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_142908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAATTATGAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264167	264723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_264200_264700
865774	contig_1154_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_87122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435657	435177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_435200_435700
865775	contig_5947_pilon	+	594	2	Intergenic	novelGene_101603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAGGAAAAACATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952984	970670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_953059_970150
865777	contig_5744_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_149332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGCCCTAAGCAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345228	344550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_344600_345200
865778	contig_17074_pilon	-	259	1	Intergenic	novelGene_145143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCAGCAACCATAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237301	237042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_237000_237300
865780	contig_19402_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_80824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTATCTTCATTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100032	100508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_1e+05_100500
865781	contig_5093_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_135100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAATTAGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637540	636914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_636900_637500
865782	contig_14666_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_39511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTTTGTTGGGCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428102	428454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_428100_428500
865783	contig_953_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_130014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTCTTACAAACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515132	515531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_515100_515500
865785	contig_1301_pilon	+	315	3	Intergenic	novelGene_47420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGAGCCATTTCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851666	865398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_851709_857384_857521_865261
865786	contig_8396_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_177626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATTTTGTGAACTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314100	313560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_-_313600_314100
865787	contig_10093_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_147516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAAAAAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130589	131591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_130600_131600
865788	contig_13643_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_178083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAATGTTTAGTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4520	4118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13643_pilon_-_4100_4500
865790	contig_10323_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_123542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAACTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252691	252283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_252300_252700
865791	contig_20116_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_159082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	197	394	6675	6478	NA	40	TTTGAAATAAAGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQLCPRSLQNSISFSKNAFKCTDHDLKQLVLKCPALLYYSVPVLEERIQGLLKEGISIPQIKETPMVLELTPQIVQYRIRKLNSLGYRIKDGHLANLNGTKKEFEANFGKIQAKKGRPLFNPVAPLNVEE	6871	6317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_6300_6900
865793	contig_6101_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_114283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAGGAAGGGGTCGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223843	224200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_223800_224200
865794	contig_10801_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_74075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAAATCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505450	504337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_504300_505400
865796	contig_2476_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_157638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCACAACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427180	426723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_426700_427200
865798	contig_8322_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_143224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGGAAGGAAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176022	176292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_176000_176300
865800	contig_7379_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_150013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATGGAAAGCAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436528	437414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_436500_437400
865801	contig_2867_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_135236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTGGAAAAAAACCTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224972	1225210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1225000_1225200
865803	contig_5602_pilon	+	227	2	Intergenic	novelGene_133021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAAGTTACCTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516798	522338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_516942_522254
865805	contig_5871_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_160176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGATTGAAGAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356160	355878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_355900_356200
865806	contig_5954_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_28755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	1383104	1383454	NA	75	TTACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPPFSTAGSFKRDGLAHRDRPLSAVISSLIRNFFAQCVSYSGNSQPSLYAVKGLFPHFTAARVNAFRLVKVLSGRGGIFALPLHSGGRNSPSPFVFKESQLLPFIRLLKGQFTLD	1383101	1383632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1383100_1383600
865807	contig_5916_pilon	-	639	2	Intergenic	novelGene_158073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTCTTCATTATCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843874	811349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_811853_843738
865808	contig_1009_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_121763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTAGTTTTTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292979	292214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_292200_293000
865810	contig_7657_pilon	+	253	2	Intergenic	novelGene_29994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATTACAAATGTGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7512	10280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_7678_10192
865811	contig_13744_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_77209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGAATCGGCCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066999	1067908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1067000_1067900
865813	contig_252_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_99923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAATTATTTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224273	225041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_224300_225000
865814	contig_10042_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_79236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTCACACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187635	1188391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187600_1188400
865816	contig_177_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_41782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATTTCATCCATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377478	372510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_372792_377456
865818	contig_14341_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_111875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAAAAGTACTTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657332	657839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_657300_657800
865819	contig_5084_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_64558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCCATCAATAAATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531845	531620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_531600_531800
865820	contig_11413_pilon	+	453	2	Intergenic	novelGene_103222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	452	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	84	452	847992	849224	FALSE	20	TGGCCAAGAGGTGAGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFRNLRLPKRLRVVYFLARTRLAQRLIMAGTVVWIGILVYTDPAGLRTYLTAQVTEQSPLGEGALAPMPVPSGVLPASHPDPAFSIFPPDTPKPAENQTSTGEPSGPMGPAEGVHDSPVPEVTWGPEDEELWRKLSFRHWPTLFSYYNIT	847908	849225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_847995_848858
865821	contig_3426_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_57973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGCTGAGAATGTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562255	562684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_562300_562700
865822	contig_16643_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_158116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCATGTATGCCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196052	196598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_196100_196600
865823	contig_10196_pilon	+	1075	6	Intergenic	novelGene_132072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	250	408	806881	807194	TRUE	15	GTTCCCCACCAGCCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRARPSSPGAGQAARSPSRVPDCDRALASGLSRPTSALSPASPRISCKVCSSGEELDLLRGCEGWKERSTHGWPPLEDTTRSMGMPPGHQLLCAQWLLLLAGDRGRPAISIDTLAVPVWAWGRLEVLKLRELGG	806631	810693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_806953_807107_807239_808907_809111_809895_810111_810393_810503_810597
865824	contig_5526_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_111689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATTATAAAACAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198108	197564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_197600_198100
865826	contig_1008_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_121634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTCTTCTGCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345454	1345116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1345100_1345500
865827	contig_16686_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_162105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACAAGGGTGCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196411	195694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_195700_196400
865829	contig_12229_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_169397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCCTAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434121	434877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_434100_434900
865830	contig_12864_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_76355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGAATACAAAAATCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108092	107706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_107700_108100
865831	contig_7078_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_130119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30850	31227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_30800_31200
865832	contig_13702_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_102654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211923	211544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_211500_211900
865833	contig_5690_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_119707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATTACTGAACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940689	939970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_940000_940700
865836	contig_1804_pilon	-	503	5	Intergenic	novelGene_177418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.82915619758885	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAATGACTGACAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503183	445641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_-_445860_448094_448167_448737_448813_498030_498150_503164
865837	contig_8273_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_113090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTACTAAAAAATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277435	276926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_276900_277400
865838	contig_4232_pilon	-	349	2	Intergenic	novelGene_63165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCGGTGTCTCTCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91161	88818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_88975_90968
865839	contig_10951_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_61640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	55	729	291126	290452	NA	30	TGAATGTAGGGAAGCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNVFDPSLPHLPLSTSGSMILGRQQPTTEKRGSIVRFMPDSPQVPNDNSAPDQHTLSQNFGFSFIPEGGMNPPINANTSFIPQVTQPSATRTPALIPVDPQNTLPSFYPPYSPAHPPLSNDISIPYFSNQMFSNPSTEKVNSGSLNNRFGSILSPPRPVGFAQPSFPLLPDMPPMHMTNSHLSNFNMTSLFPEIAAALPDGSAMSPLLTIANSSASDSSKQSSNRPAHNISHILGHDCSSAV	291180	290319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_290300_291200
865841	contig_16103_pilon	-	585	2	Intergenic	novelGene_118906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTAAAAAGAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762825	762017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_762261_762483
865842	contig_2646_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_69705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATCATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2530662	2531133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2530700_2531100
865844	contig_13697_pilon	-	310	2	Intergenic	novelGene_165947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCTGCAGGTTTATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641934	641533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_641679_641769
865845	contig_6589_pilon	+	603	3	Intergenic	novelGene_25813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	56	571	719482	722799	FALSE	15	GGGTTCTGACACAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQNKTDSPQLHCVLNSNAMACSFAVGAGLLAFLSCLVFLVLDAHEGRIAGSRFKTAFQLLDFIVAVIWACVWFVGFCFLANQWQHAQPREFLLGSSSAKAAITFTFFSVLVWIFQAYLAFQELQEDAPVPYKRSLEEGAVVLTTLSPPSAASPVSSSATGPNSLNYASSALSPYLSTPKVPRLAMIPDN	719426	722831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_719624_721964_722105_722565
865847	contig_5669_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_86092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTAAATCTATCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215529	216137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_215500_216100
865848	contig_8276_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_174465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61599	62024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_61600_62000
865850	contig_11829_pilon	-	483	3	Intergenic	novelGene_128148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	62	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	19	342	243807	232778	FALSE	50	AAAACAAAACGCAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWGTGSMSWGAMHGRDHRRTGNMGIPGTMNQISPLKKPFSGNVIAPPKFTRSTPSLTPKSWIEDNVFRTDNNSNTLLPLQDRSRMYDSLNMHSLENSLIDIMRAEHDPLKGLP	243825	232636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_-_232789_235605_235697_243585
865851	contig_4295_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_169974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTCTACTCCTGTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59860	60271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_59900_60300
865852	contig_6533_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_114622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAAGTCAGTGGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10594	11163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10600_11200
865853	contig_4369_pilon	-	409	1	Intergenic	novelGene_177861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206322	205913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4369_pilon_-_205900_206300
865854	contig_14322_pilon	+	328	1	Intergenic	novelGene_115655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477425	477753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_477400_477800
865855	contig_2933_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_111378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085093	1084652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_1084700_1085100
865856	contig_10317_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_177442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATATTCAAGCCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139983	140613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10317_pilon_+_140000_140600
865858	contig_12528_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_81350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCATTTCAGTTACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985495	984971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_985000_985500
865860	contig_14970_pilon	+	286	2	Intergenic	novelGene_44925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGACAGGGGAGGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103947	121090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_103986_120842
865862	contig_11566_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_166707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTGTCTTATCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202144	201674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_201700_202100
865863	contig_6488_pilon	-	178	1	Intergenic	novelGene_44769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219577	219399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_219400_219600
865864	contig_211_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_129863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCAAATAAAAGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102492	103172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_102500_103200
865871	contig_14326_pilon	+	479	4	Intergenic	novelGene_120771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	11.8133634311129	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTGTGAGAATAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736521	738503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_736575_736802_736881_737357_737491_738288
865872	contig_6795_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_27763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGAATCACCTCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406186	406607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_406200_406600
865873	contig_16884_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_161825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAGAAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94273	93930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_93900_94300
865874	contig_2757_pilon	+	328	3	Intergenic	novelGene_164590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	15	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	294	34	327	258365	258745	FALSE	65	AACTTGAAGAAGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKHADTTKEVEMMKAAYRKELEKNRSHVLQQTQRLDASQKRILELESHLAKKDHLLLEQKKYLEDVKLQAREQLKAAESRYEAQKRITQVFELEILDLYGRLEKDGLLK	252612	258746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_252637_258355_258544_258630
865875	contig_11378_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_112275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATCAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448805	448192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_448200_448800
865876	contig_2933_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_111313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTTCATGGCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327835	327332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_327300_327800
865877	contig_2689_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_100839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGGAAATTAACACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238177	238453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_238200_238500
865879	contig_9527_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_134056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACAAGCACCCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444026	444353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_444000_444400
865880	contig_8354_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_24085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTTTCGTCATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147210	149874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_147375_148932_149050_149724
865881	scaffold_8345_pilon	+	518	5	Intergenic	novelGene_107000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.84700778176325	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	153	518	518091	535091	FALSE	50	CTAAATGACTTAATAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTNNFKTPSKLSEKKKSVPCSTPCINIPASPFMQKLGFGTGVNVYLMKRSPRGLSHSPWAVKKINSKCNDHYQNMYQKRLTDEAKILKNLHHPNIVGYRAFTEASDGSLCLAMEYGGEKS	485229	535091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_485362_518070_518149_522857_522952_534210_534354_535020
865882	contig_7050_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_153625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAGTAGCCACATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677091	676477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_676500_677100
865884	contig_7009_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_23690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949706	949044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_949000_949700
865885	contig_6047_pilon	+	684	4	Intergenic	novelGene_24232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	59.7550555741242	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	19	522	222023	231497	FALSE	30	TGCTTTGAAAAATATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSLLNWRRVSSFTGPVPRARHGHRAVAIRELMIIFGGGNEGIADELHVYNTVTNQWFLPAVRGDIPPGCAAHGFVCDGTRILVFGGMVEYGRYSNELYELQASRWLWKKVRPQPPSSGLPPCPRLGHSFSLYGNKCYLFGGLANESEDSNNNVPSCRRVDYDSC	222004	231659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_222186_223694_223844_225076_225238_231466
865891	contig_11378_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_112212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATGCCAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209238	209728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_209200_209700
865892	contig_9460_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_155319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAGGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461306	460969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_-_461000_461300
865894	contig_12181_pilon	+	165	1	Intergenic	novelGene_178085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGCGGTACACAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4879	5044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12181_pilon_+_4900_5000
865895	contig_4087_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_156072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAGCCAAGGAACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72275	72647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_72300_72600
865897	contig_10399_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_114493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATTTATTAGGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349994	350523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_350000_350500
865898	contig_4301_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_65145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGAAAATACTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695688	696019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_695700_696000
865899	contig_10238_pilon	-	667	4	Intergenic	novelGene_170098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	247	615	171917	171237	FALSE	15	CAGGCAGGTGTGGCACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVMMPFMPVLCSTLGRCWMASWVRGEMGECWWLWGWEAGRLLLSPPPPLLPPLLCSVPGLQMGACSTVVVDARMDFSRSRSRSRSLSDEDVVVGFVKCVGPPGERGELLCRLLKAWGAGGR	173701	171184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_171295_171515_171651_171741_171943_173480
865900	contig_9014_pilon	-	128	2	Intergenic	novelGene_106812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGGAAGAAAGGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152453	152233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_152332_152423
865902	contig_7342_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_71244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTCCTTTCTCTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738696	738077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_738100_738700
865904	contig_6735_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_15831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCCCAGGATGCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669392	669005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_669000_669400
865906	contig_15236_pilon	-	718	1	Intergenic	novelGene_141652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTCTCTCAAAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691338	690620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_690600_691300
865907	contig_9272_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_125877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTATATATATATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210056	210464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_210100_210500
865908	contig_4388_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_161998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCTCCAGTCTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501829	1502200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1501800_1502200
865909	contig_16685_pilon	+	499	4	Intergenic	novelGene_115055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	37.8623236946117	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	20	499	550787	555474	FALSE	25	ACCCTGTGCTACACCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STYDAEMLRDATRGWKEGRGPLDFSKDTPGKPVARSKTMPPQVPPRTYASRYANRKNAAPGKNRRISATPVGSRPRTIASGHELFEVSEERDEEVAAFCHMLDVLRSGSDIRDYSLTGYVWSAVTPSPEHLGDEVNLKVTVLCDSLQEPLTFTCNCSSTVDLLIYQ	550767	555474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_550979_554274_554376_554991_555147_555442
865910	contig_10371_pilon	-	563	5	Intergenic	novelGene_175472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	18.5118205479634	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	249	563	655480	642919	FALSE	20	GTACAGGATCTGTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGFCYFNSVAIAAKLLQQRLNVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYNDPNVLYISLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFAGGLDPPMGDTEYLTAFRTVVMPVAAEFSPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSAKCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNE	658202	642918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_643053_644247_644367_655418_655517_655602_655723_658110
865911	contig_15777_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_75744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAGAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206102	205501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_205500_206100
865912	contig_14355_pilon	+	597	4	Intergenic	novelGene_178088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	261	337	597	63703	76860	FALSE	30	CGTAAGATGCGTTACGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWLGRKAQSNPYYSGPYLNLKAFENFLGQALTKALEDSSSLKRSGRDSGYSDIWCTERGEFPTPAGSHKREDSFESLDSLGSRSFTSYSSDITLKGGREGCESDTDSEFTFKMQDYNKDDMSYRRISAVEPKSALPFNRFLPHKSRQPSYMPAPLRKKRPDRNEDNRRSWASPVYTDADGTFSRSKSMSDVRSEDDQNL	54791	76860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14355_pilon_+_54891_60726_60926_63664_63918_76814
865915	contig_11855_pilon	-	1082	7	Intergenic	novelGene_66985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	0.897527467855751	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	27	1082	1138275	1129333	FALSE	25	GTACAAGCCTGTCATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGVYAGLGMLQALLVMLSAFMMAMGGVQAAKSLHAALLHNKMRSPQSFFDTTPSGRILNRFSKDIFVIDEVLAPTIQRLLGAFFNSVSTLVVIVTSTPIFAVVILPLAALYISVQRFYVATSRQLKRLESVTRSPIYSQFSETVTGASVIRAYGRSQDFVANNDTKVDINQRGCYAYIISNRWLGIRVDFVGTCVVLFAALFAVTGRSSLSPGLVGLSVSYALQVTFALNWMVRMMSDTESNIVAVERVKEYSKTETEAPWVVEGSRPPKGWPPQGKVEFRNYSVRYRPGLDLVLKNLSLCVHGGEKVGIVGRTGAGKSSMTLCLFRILEAAEGEIRVDGLNVADIGLHDLRSQLTIIPQ	1138301	1129332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1129492_1129717_1129865_1134359_1134462_1135542_1135670_1135830_1136031_1137293_1137605_1138265
865918	contig_2933_pilon	+	342	2	Intergenic	novelGene_111332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACTTTCAAAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665530	668511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_665661_668299
865920	contig_19977_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_175619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGATCTCTTCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51800	51441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19977_pilon_-_51400_51800
865921	contig_12464_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_68741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGTAAAATTAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431329	431820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_431300_431800
865923	contig_1274_pilon	+	805	1	Intergenic	novelGene_137824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCTATTTAAAATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773922	774727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_773900_774700
865924	contig_401_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_42736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118556	118968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_118600_119000
865926	contig_4059_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_140588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	178719	178405	NA	25	ACTCTGGCCTAAACACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLQTKEWSGLVTGGAALRGAPSATQLFRTRARQRFPVRQAGKAALQPGSHRAAPGWPPLQTTRFLFCFRCVFSSVLSGRQTTAEKIRRFLLSCSAVFPCVYSF	178719	178369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_178400_178700
865932	contig_3161_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_84538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAATAAAAGGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532073	531087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_531100_532100
865933	contig_5586_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_143503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202668	202923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_202700_202900
865935	contig_3818_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_99206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	211	540	105487	105158	NA	30	ATATGTGAGTGAACTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVRSLLSFLELLSHQHRKEKDSYHPVPQGTLFTLHVWSKSDILGHHHGIAHQIPQRRAARAHTYREEVHQVMPFSTSPFRRPPRALQNLEASSSAPFHVTQFPTSCHS	105697	105053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_105100_105700
865936	contig_7004_pilon	+	412	2	Intergenic	novelGene_126517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAATTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461242	462072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_461375_461792
865937	contig_14618_pilon	-	460	2	Intergenic	novelGene_136818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAATAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680200	676712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_676816_679843
865938	contig_5959_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_150204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGAGATTTGTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407107	406874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_406900_407100
865939	contig_6825_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_155126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACTCATTGGAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54832	55730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_54800_55700
865940	contig_14923_pilon	-	733	1	Intergenic	novelGene_157773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCATTTGTGGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846477	845744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_845700_846500
865941	contig_1706_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_155040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124182	123595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_-_123600_124200
865942	contig_10205_pilon	-	595	4	Intergenic	novelGene_143113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	13.1402688962847	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	152	505	222120	220058	FALSE	30	TTAATACTCTCGGATCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYTQSNSVCYAKNGQVIGIGAGQQSRIHCTRLAGDKANCWWLRHHPRVLSMKFKTGVKRAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLVKWKELFEEVPELLTEAEKKEWIGKLSEVSVSSDAFFPFRDNVDRAKRSGVAYIAAPSGSAADQVVIEACDELGIILAHTSLRLFHH	224444	219967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_220178_220496_220653_222042_222226_224398
865943	contig_14467_pilon	-	303	2	Intergenic	novelGene_138269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCTGGCACATAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351773	340999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_341247_351717
865947	contig_8145_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_118657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTGCAAAATAAATAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826833	826028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_826000_826800
865948	contig_12635_pilon	-	701	6	Intergenic	novelGene_60838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_5	34.6733326924309	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	32	700	510606	461808	FALSE	50	TCTGAAATTTGACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLPGVPEQTRPEQGAPDPLRAGFVVGLDVGSSVIRCHVYDQEARIRGSSAQKVESLYPQTGWVEIDPDVLWVQFVAVIKEAVKAAGIEMNQILSLGISTQRATFITWNKKTGNHFHNFISWQDLRATDLVKSWNSSLIIKLIRGSCRLLHFFTRSKRLLAASLFSFTTQHVSLRLAWVLQNLMEVQKAVEEGNCCFGTVDTWLLHKLTKGKDDLIISSTSR	510637	461806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_461919_475802_475935_485126_485221_493660_493737_496272_496367_510444
865949	contig_6975_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_74279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGTTTCTTGTATCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248834	249234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_248800_249200
865950	contig_6097_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_174442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGGGCTCGGTGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153414	153167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_-_153200_153400
865951	contig_5083_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_151668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCAATTACATTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497465	496715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_496700_497500
865952	contig_2365_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_103749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAATAGTGACATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211412	211817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_211400_211800
865954	contig_3584_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_108137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTAGGGAAAGCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319346	320410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_319300_320400
865956	contig_5018_pilon	-	265	2	Intergenic	novelGene_47005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGGAGGCGTCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215218	1214113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1214164_1215003
865959	contig_10494_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_102148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	136	375	748769	749008	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPGGAARVENAGRVQPGPPAPTARRAFLSLGRCELQISVGATAPMAIAKSDKRPYLRPPGPAGLSNNSAEVSQSGEWGPRTRAGWGREQAPAQVGLGEFSPQTHFIAKKLGLPARAGRWYSPP	748633	749249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_748600_749200
865960	contig_13481_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_119570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTCCGGGTAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1603781	1602852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1602900_1603800
865963	contig_14814_pilon	+	504	2	Intergenic	novelGene_137700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	157152	167079	FALSE	20	TCTTTTAAATCTGCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFLCPQRHGLFSCCPPVLGCSKSSLDSDHGQQRHRRQAHTRSPATPGPRAVFQISQLELESWACAVRDQVDRQVASPRKYCLGTKITGHTSSKGGRAYFRSEKSISHFRAKILPRPLFEYI	157150	167213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_157303_166861
865964	contig_756_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_134767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151616	151960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_151600_152000
865965	contig_6110_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_163286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	271	582	792215	792526	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEISTTRVPTRLKFFSMLLGIWAPLFQNLTQGSKRMIRKLSNKKGTAFNFKVAEKSTRITRREVISNDLQMVMQRTSSGPRRILYSSYLIWIANILQRVAP	791944	792572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_791900_792600
865966	scaffold_12124_pilon	+	921	2	Intergenic	novelGene_22165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	320	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	17	919	1020565	1022792	FALSE	35	GGAAAGGTAAATTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATIVHDTSEAVELCPPHGLYLKPITKMTISVALPQLKQPGKSISNWEVMERLKGMVHSHQFSTLRIAKSTMDFIRFEGEVENKSLVKSFLACLDGKTIKLSGFSDILKVRAAEFKIDFPTRHDWDSFFRDAKDMNETLPGERPDTIHLEGLPCKWFALKESGSEKPSEEVLVRVFEKFGEVRNVDIPMLDPYREEMTGRNFHTFSFGGHLNFEAYVQYREYAGFIKAMSALRGMKLMFKGEDGKAVACNIKVSFDSTKHLSDASIKKRQLERQKLQELEQQREEQKRREKEAEEKQRA	1020548	1022794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1021327_1022651
865967	contig_7909_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_155934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934790	934287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_934300_934800
865968	scaffold_6394_pilon	+	460	2	Intergenic	novelGene_110963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	243443	247910	FALSE	30	ATCTTTAGAAACTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALTSHNRPTPAPAPAPASWVPAHTARPAVRLGPSAAPRARAVQTQKLASSTLASHRGALPRFNGDSKRASLAGSTSPKISNSNSRSPSRRPVLLRGRCWARVSAVRGRRCCQASL	243440	248017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_243719_247835
865973	contig_17178_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_176339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGACCTTGGAATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97145	96548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17178_pilon_-_96500_97100
865974	contig_9345_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_24451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTCCCAGCCTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433383	432907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_432900_433400
865975	contig_12758_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_177794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGGTGATGGTGGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120347	120672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12758_pilon_+_120300_120700
865977	contig_8693_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_150873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACAGGAATCTAGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134639	1133943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1133900_1134600
865978	contig_14768_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_115088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTACAAATGACCACACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262727	262328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_262300_262700
865979	contig_19727_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_169000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTCTAAAATTTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19474	19881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_19500_19900
865980	contig_8954_pilon	+	130	2	Intergenic	novelGene_130312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	379	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCCTCTTGAATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621522	623317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_621620_623284
865981	contig_9029_pilon	-	994	3	Intergenic	novelGene_155139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	24.5	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	34	360	914666	886119	FALSE	35	ACTTCCTGCAAAACAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSARLWFFTGDMGKVRELRTRVHSSAVRPSEEAALGPAPSPQGPSPPHLSSGGARGKDGASVGTNIFAGTKIDLSALEQKLDLVTRTLASFKRGAETKSLLPKKEKLKLRHERWLQSKS	914699	885484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9029_pilon_-_886199_900321_900431_914528
865983	contig_10801_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_74047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATACAGAGAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294543	294987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_294500_295000
865984	contig_10496_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_59439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACGAAAAGATAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195409	196192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_195400_196200
865985	contig_15273_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_140440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGTTGGGAAGGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148982	149676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_149000_149700
865986	contig_9609_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_22968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTCATTTTATGCTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266683	267013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_266700_267000
865987	contig_3754_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_146847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAATATCTTTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460401	460932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_460400_460900
865989	contig_15548_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_173478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAAAAAAAAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36736	36434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_36400_36700
865991	contig_1618_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_141802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAAATTACTTTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353412	352680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_352700_353400
865993	contig_4797_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_6889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTTAAAAAATCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101201	100636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_100600_101200
865994	contig_17993_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_61922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAATTGTACTTACGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36735	35898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_35900_36700
865995	contig_8795_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_146881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACATAATAAGCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93110	92850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_92800_93100
865996	contig_16541_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_126761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATATAGATAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454472	455106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_454500_455100
865998	contig_3825_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_77985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATAAGCGATTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489425	489034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_489000_489400
865999	contig_19719_pilon	-	252	2	Intergenic	novelGene_176889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAAACTGTACTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38095	37393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19719_pilon_-_37528_37977
866002	contig_5321_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_153869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTCTTTCAGACAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34923	35667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_34900_35700
866003	contig_11978_pilon	+	245	2	Intergenic	novelGene_63147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCCCATAATAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2070802	2074476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2070891_2074319
866005	contig_9415_pilon	-	453	2	Intergenic	novelGene_109880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6	359	2049536	2048528	FALSE	30	TTTTCCCAGTATGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMALTESGEVFSWGDGDYGKLGHGNSDRQRRPRQIEALQGEEVVQMSCGFKHSAVVTSDGKLFTFGNGDYGRLGLGNTSNKKLPERVTALEGYQIGQAWNKSIICSIRSSFLTSSVCA	2049541	2048433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2048750_2049404
866006	contig_678_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_167819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAATCGCTGTCAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130112	129788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_129800_130100
866007	contig_5003_pilon	+	249	1	Intergenic	novelGene_120184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACTTTCACCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16567	16816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_16600_16800
866008	contig_11360_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_174254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTGTTGGGTCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245873	246377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11360_pilon_+_245900_246400
866009	contig_4271_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_171867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGAGGCAGCCCTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436767	435825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_-_435800_436800
866010	contig_3602_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_60678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCAGCTATCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144063	1143394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1143400_1144100
866011	contig_6871_pilon	+	485	2	Intergenic	novelGene_21611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCAAGGGCACCGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456446	459432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_456474_458974
866012	contig_8420_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_69368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230173	229797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_229800_230200
866014	contig_1339_pilon	+	471	2	Intergenic	novelGene_163098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAAGCTGTGTCAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114443	115007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_114537_114629
866015	contig_11016_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_163297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152376	152982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_152400_153000
866016	contig_7839_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_45756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAAACTCCAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1517051	1516399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1516400_1517100
866017	contig_11292_pilon	-	506	5	Intergenic	novelGene_109416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	260.364168041611	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	74	337	163426	161946	FALSE	10	TCAGGTCCCTGCCACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFIDELDAIGTKREKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQA	164436	161776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162151_162209_163014_163161_163372_163461_164397
866018	contig_3281_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_128534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	245	385	189295	189155	NA	30	CTTACGTTCCCAATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	189539	189092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_189100_189500
866019	contig_16525_pilon	+	555	3	Intergenic	novelGene_133888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	209	334	238683	239404	FALSE	15	CTATGACTCGTCCGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASPGPSQGDPQRFLLPLALGLLVAASLAGAAFLLVHLRRRDPGRDTGSRLLAGTPEPPIHALPDALNNMRTREDSGDGPSLSTDWSRPEDGDSRAIYVISAPSIYAQEA	238474	239625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_238718_238977_239063_239398
866020	contig_10236_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_169117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTAGCCAGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91081	90663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_90700_91100
866023	contig_8606_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_159409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGGTTAACCATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135585	135064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_135100_135600
866024	contig_9434_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_150522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAATAAATGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480210	479633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_479600_480200
866025	contig_10183_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_169511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCCTTCTTGTTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146727	145952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_146000_146700
866026	contig_1244_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_37944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTCTCTGCTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810831	811485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_810800_811500
866027	contig_1694_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_144956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTACAAGCTTAACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821996	822422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_822000_822400
866028	contig_13129_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_177851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTTTAAAGCATAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119338	118592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13129_pilon_-_118600_119300
866029	contig_20719_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_140557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3788	3470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_3500_3800
866032	contig_3789_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_79823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAACAAAACAAGTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191302	190920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_190900_191300
866033	contig_10813_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_87022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACCTTGGAACACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63939	63499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_-_63500_63900
866036	contig_5317_pilon	-	502	3	Intergenic	novelGene_76572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	102	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAGAACAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171019	147465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_147584_148237_148380_170777
866037	contig_12638_pilon	+	424	2	Intergenic	novelGene_33053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	240	332	9346	9438	FALSE	30	TGAAAAGCGTGTTTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPPPLRVAQALPFSRKRFPPPTLHSPGYSRPGPETFRQRFRQFRYQDAAGPREAFRQLRELSRQWLRPDIRTKEQIVEMLVQEQLHAILPEAARARRRGRRTDVRITG	8750	9530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_8828_9183
866038	contig_513_pilon	+	476	2	Intergenic	novelGene_80178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	147	314	483229	483396	TRUE	65	TTCTTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPDEVALLGVLVPPADLSFFLSFLPLPFPRFRSRPWWVPGEPEPALKMNARGLRGGGNLRAPGRPLQDERSAGAGAAPGPTGRPLHGFLSPQVGSGNFCEED	483082	485421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_483411_485273
866039	contig_6609_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_175455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	279	241	519	287332	287054	NA	15	TGGACTGACTGTTCACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITRRLRRLRALSPDISAHGLRQPSHHRRTRKPQPSSQRYGAKRSPHGQAQPAVAAPLSSFPRSLAHQPAPSLPACVTAAAMAENGESNGPPHPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEAISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIH	287572	287051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6609_pilon_-_287100_287600
866040	scaffold_12124_pilon	+	397	2	Intergenic	novelGene_22418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625478	1631279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1625555_1630958
866041	contig_12543_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_168385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATGAAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367611	368235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_367600_368200
866043	contig_2703_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_101688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACCTATCAGGCTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274981	274009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_274000_275000
866044	contig_13744_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_77145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113463	113193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_113200_113500
866045	scaffold_12124_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_22172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGATTAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217353	1216817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1216800_1217400
866046	contig_12894_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_140957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAGACTGAAACAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106116	105677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12894_pilon_-_105700_106100
866049	contig_13992_pilon	-	399	4	Intergenic	novelGene_147623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.43650214343336	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	65	352	308628	306911	FALSE	10	CACACCTGCCTCTGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCWSWGSRTSAASGSLRSAMAPQSPCRSLMSPPPPLLLLLLGVALLGAQARGEPAAGSAVPAQSRPCVDCHAFEFMQRALQDLRKTAYSLDARTETLLLQAERRALCACWPAAS	308920	306863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_306977_308146_308236_308495_308656_308883
866050	contig_7806_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_157543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAGAATCAGGAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262556	262054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_262100_262600
866051	contig_9752_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_122018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATGGGAACCATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90253	89889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_89900_90300
866052	contig_4496_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_66672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAGGAAAGAAAGACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859783	860081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859800_860100
866053	contig_11566_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_166686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTACTCGGGAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154632	154243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_154200_154600
866054	contig_4868_pilon	+	410	2	Intergenic	novelGene_136758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	171	239	409	217003	217173	FALSE	35	CCCTAGAGAGCACCAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFDKQPQSRERGITLDLGFSCFSVPLPARLRSALPASEAASEAGPEPAEPQLQVTLVDCPGHASLIRTIIGGAQIIDLMMLVIDVTKGMQTQSAECLVIGQIACQKLLVVLNKIDLLAEGKRQAAIDKMTKKMQK	111849	217174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_112068_216982
866058	contig_998_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_153802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGAATCTACTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373662	372799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_372800_373700
866060	contig_7788_pilon	-	574	6	Intergenic	novelGene_177607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_5	23.1032465251098	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	102	572	223564	180429	FALSE	20	TCAGGTACAGCTTTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFTARLRWQPYWSASCFFRYKQKSKFKPVHRLSMTNATEITSLSAVNDFYSHIVLTAGRNRTLEIFDLNAGCSAAVISEAHSRPVHQICQNKGSSFAAQQPEAYNLFLTTAVGDGIKLWDLRTLRCERCFEGHANRCHLCGVALSACGRRVACGAEDRHVYLYEMGSSTFSRRLGGHTDTVTQVAFSPSA	241459	180426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_180522_190908_191012_193386_193485_223286_223409_223509_223608_241401
866061	contig_20756_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_176923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAACTTTTAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5914	16868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_+_6130_16715
866066	contig_8652_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_168780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106006	105400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_-_105400_106000
866067	contig_10176_pilon	+	447	3	Intergenic	novelGene_72706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	176	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGCAAAGAAAAGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243960	245125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_244229_244599_244742_245088
866068	contig_11324_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_177012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCGTGCACTGGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169277	168621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11324_pilon_-_168600_169300
866069	contig_9293_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_175195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCTTTCTCTTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86043	85680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_85700_86000
866070	contig_9440_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_59070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928629	929268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_928600_929300
866071	contig_16860_pilon	+	447	1	Intergenic	novelGene_155339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAAAGAAGGGCTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95156	95603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_95200_95600
866072	contig_7943_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_173136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGATGGGCTGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123779	122875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_122900_123800
866073	contig_5954_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_28559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTATTTTGTGTCTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829650	829377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_829400_829600
866075	contig_10494_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_102156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888914	888462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_888500_888900
866076	contig_11823_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_171027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAACAGAATGCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58156	57624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_57600_58200
866078	contig_7357_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_36861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAGAGAGAATGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206436	205919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_205900_206400
866080	contig_12125_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_76248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAAAAAAAAGAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625755	626713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_625800_626700
866081	contig_6418_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_81182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAACAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156644	1156119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1156100_1156600
866083	contig_12113_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_134745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAAGATCCCAATCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218393	219013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_218400_219000
866084	contig_4845_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_53729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758615	1758201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1758200_1758600
866085	contig_6270_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_99880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCAGGTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070622	1071046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1070600_1071000
866086	contig_6047_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_24228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAGAAAACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163688	163942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_163700_163900
866087	contig_10377_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_115359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAAGAACTATGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191083	191503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_191100_191500
866089	contig_8980_pilon	+	802	6	Intergenic	novelGene_73999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.62480768092719	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	660	141	800	255575	275608	FALSE	60	TTATAGTAAGAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REELSCLRVAWQVKTTENKPVKQQWGAFKEQLKKTTHNLKVLQEALMPVSALDLGGSLQTVLDLRRKWNEMKPQFQQLNDEVQYIIKVSEELSGKGAPVKEKSQQVRDLIRLHQKQRERIRDYEDILYKIVQFHQVKEELGQLIKSRELEFLEEPKELSDAHDVQVDLSRSQEKQAHIDHLYKLALSLGVSIISSMQQPNCSNVSAKNLQQQLEILEGDSVNCRAQAEEYNRALSRSLQYCTARDEIKELQESFKDTKKKFNNLKF	255249	275610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_255354_255538_255665_257956_258146_259391_259572_263421_263572_275557
866090	contig_7070_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_104043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACCAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97231	97542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_97200_97500
866092	contig_7635_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_171364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACCCCCCCCCCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75669	75144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_75100_75700
866093	contig_9919_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_137970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAGGAGGAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588269	588971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_588300_589000
866095	contig_4252_pilon	-	294	2	Intergenic	novelGene_176358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGCTCTCGGAAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121484	121016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_-_121163_121336
866096	contig_6708_pilon	-	695	1	Intergenic	novelGene_178089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGATTTCCTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62705	62010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6708_pilon_-_62000_62700
866097	contig_3825_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_77981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTGCAGGAGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423043	422785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_422800_423000
866098	contig_8263_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_83099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAATTGGACCCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143360	143975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_143400_144000
866099	contig_14637_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_114563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTTTAAATGTTTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407551	407922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_407600_407900
866100	contig_500_pilon	+	283	3	Intergenic	novelGene_31052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	215.5	22	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1485776	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492017_1499411
866101	contig_12790_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_35183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACTAAAAAGAAATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84376	84081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_84100_84400
866103	contig_11708_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_138992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401286	400763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_400800_401300
866104	contig_19990_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_30770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTGCTAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133386	132901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_132900_133400
866105	contig_11525_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_171093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	246	200	445	256897	257142	NA	35	AGCCCAGGAGGACTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYPLLKESALILLQTVPKQIDIKHLIKELRNVDGVEEVHELHVWQLAGSRIIATAHIKCEDPTSYMQVAKIIKDVFHNHGIHATTIQPEFASVGSKSSVVPCELACRTQCALKQCCGTRPQVLSGKDAEKAPTVSISCLELSDNLEK	256697	257143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_256700_257100
866106	contig_5018_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_47198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGCCTTCCTCTGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592886	1593184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1592900_1593200
866107	contig_10196_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_132170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCCAGCCCTCGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042428	1042919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1042400_1042900
866109	contig_4336_pilon	-	615	4	Intergenic	novelGene_152355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_3	12.4721912892465	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	45	614	313689	307446	FALSE	20	AGCGGCAGCGAGCTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVSHGASLSARTSMDEMPIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNLYRKEYEGEAILWQQRSASEDRTSMYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFSTKIPRGELDMPVENGLRAPVSTYQYALSNGDVWKVHEVPDYSVAYGNPGMADATPPWSGYKEQSPQTLLEL	313733	307444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_307701_312457_312624_312716_312847_313670
866111	contig_2113_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_161156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACAGGGAGGCTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508130	507722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_-_507700_508100
866112	contig_7775_pilon	-	836	2	Intergenic	novelGene_37502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATAGGGCAGGCAGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299644	298591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_299262_299478
866113	contig_10861_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_39241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAATAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619335	618828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_618800_619300
866114	contig_14755_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_129382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGGTATTTTGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147340	146956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_147000_147300
866115	contig_7281_pilon	+	538	3	Intergenic	novelGene_178090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	45	308	88949	89615	FALSE	35	ACTTTTCCAAGTTAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEYEQLLNIKTRLEMEIETYRRLLDGEGGDSCFGGSDFRNSGSRNTGSRGSVSGGDSGSGSSSGQGRDPSKTRVTKTIIEEVVDGKVVSSQVSNISEVKLK	88904	89845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7281_pilon_+_88993_89213_89330_89511
866116	contig_11780_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_134302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCAAATGATGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42144	42512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_42100_42500
866117	contig_3942_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_128800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTGCCTCCTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944356	944809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_944400_944800
866120	contig_2450_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_160313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGACAAGCTCAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743334	742896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_742900_743300
866121	contig_5954_pilon	-	187	1	Intergenic	novelGene_28502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTGTTTTCTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429723	429536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_429500_429700
866122	contig_10196_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_132069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGTGTCCGTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802073	802819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_802100_802800
866126	contig_6451_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_173710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATTGTGCTGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252598	253637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_252600_253600
866127	contig_10855_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_124376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATATATCTTTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772921	773208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_772900_773200
866128	contig_5832_pilon	-	706	3	Intergenic	novelGene_134188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	164	706	696240	691318	FALSE	20	ATGAAAGCCGTTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFRISALPILAASCSGVRPSLLRVVSSSQLPLLNRIMSYMCFTKSFCVVKSSATVTSACRMLLPRESCEVMSVCSFSISSCTISGWLVHAARARGVTLTEVEAFVLVLGVEEDTLGVGVDVGASGNERRGDVPLPPLDGDVQRCLPCGQVGMGGGRSERGTRRQAPSALGLPCPPGNIGE	696403	691317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_691575_693463_693734_696224
866129	contig_5375_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_169223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAGGAAAAAAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105230	105846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_105200_105800
866130	contig_10855_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_124307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACATCACCCAGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312851	313672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_312900_313700
866131	contig_498_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_148565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843908	844383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_843900_844400
866132	contig_11328_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_88460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAACAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835513	836062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_835500_836100
866133	contig_12977_pilon	+	399	1	Intergenic	novelGene_122818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	250	324	143274	143348	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQAQGREAPGSSEQLGPWGEGAPGSLGLGGALESVLLKNLLCFSDLEDLKSPYSTASSRGQPLPDTPGQKPAAQLWPQKRDRMSQAHFYPIQLHQHWLNRVDRHQH	143024	143423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_143000_143400
866134	contig_2646_pilon	-	694	2	Intergenic	novelGene_69671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTAAACTAAGCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2200072	2197893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2198433_2199917
866135	contig_6189_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_164969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGAGTAATTTCTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231364	231866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_231400_231900
866136	contig_9460_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_155322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAGCCCATCATTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489743	490225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_489700_490200
866138	contig_17768_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_140383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATAGGTATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11318	10889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_10900_11300
866139	contig_7357_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_36920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCTCTGGTTTCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534361	535056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_534400_535100
866140	contig_19185_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_163677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACGCATGTGTGTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186378	186739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_186400_186700
866141	contig_8683_pilon	-	658	1	Intergenic	novelGene_150251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTAACTTTCTGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542105	541447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_541400_542100
866142	contig_4388_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_161996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGGCAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314040	1314413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1314000_1314400
866143	contig_3948_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_53228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTTCATTTCTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877187	877674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_877200_877700
866144	contig_7357_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_36935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAGAACTCTGAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822447	823454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_822400_823500
866145	contig_1275_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_108725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269555	268945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_268900_269600
866148	contig_15498_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_42723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATTAAGCAAACATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070161	1069631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_1069600_1070200
866150	contig_366_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_51603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGATTCCATAAAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786693	786139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_786100_786700
866151	contig_20241_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_159726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCTTCACAAGGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98328	99124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_98300_99100
866152	contig_10437_pilon	+	525	2	Intergenic	novelGene_38353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTGATTTCATAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540395	544899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_540670_544648
866153	contig_990_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_76080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATATTTCGGTGGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114792	1115335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1114800_1115300
866155	contig_7260_pilon	+	738	2	Intergenic	novelGene_169145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457780	458578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_458156_458215
866156	contig_4857_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_48908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAATAAAAACAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1642579	1643276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1642600_1643300
866157	contig_9186_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_85347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAGAATCGAGAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310801	310529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_310500_310800
866158	contig_13481_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_119284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAGAAAAACATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173372	172571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_172600_173400
866160	contig_13894_pilon	+	335	2	Intergenic	novelGene_62067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTCCAGTTTATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288635	289672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_288742_289443
866161	contig_17144_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_29154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTACAAAGTGCCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122861	122075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_122100_122900
866162	contig_5765_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_141402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCTCCAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725739	725329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_725300_725700
866164	contig_9177_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_32682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCTGTTATAAACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396132	396481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_396100_396500
866166	contig_9389_pilon	-	772	1	Intergenic	novelGene_83947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	314	754	193445	193005	NA	25	GTCTGTGCCTTGTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPTRPLPCLRPWRDSRSCPALSLACLPEYPIISVCWQPSHEVGTLITPTLQMRKLRQREGKCTSQPSHRFSVYTGPKPKALNPAPPHLQTFLIGKRQCARRITKRKARTVYVGENKSIGTAETAESWLHWCRQGRGPGHGLGGQL	193758	192986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_193000_193800
866167	contig_8954_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_130309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGAGCGTTTGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618521	618987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_618500_619000
866168	contig_14559_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_83731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342842	343245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_342800_343200
866169	contig_8798_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_143189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51859	52107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_51900_52100
866170	contig_8045_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_35460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAGAAAATAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485644	486082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_485600_486100
866171	contig_9297_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_69810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATTTGGAACTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264738	264298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_264300_264700
866173	contig_2550_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_135696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATAAAGTGCTTCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658137	1658671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1658100_1658700
866174	contig_7378_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_120308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTGAAAGGGGAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761490	760800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_760800_761500
866175	contig_7644_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_64233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAACTTCCATTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116518	115794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_115800_116500
866176	contig_9389_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_83967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	250144	249501	FALSE	50	AAATGTATATAATGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRLTLTSPGGYSRPPAGLSRHHPSTLGPSRRAVTRAAARWAGGSPTAHTPRPAPGPVPVGNGVRALCRHPPPLAGGNRDSAFLEPAAVCFVCVVFFSHVHGFLIFFLIVV	250145	249500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_249544_249854
866177	contig_11602_pilon	+	357	1	Intergenic	novelGene_166596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATGGCAAAATGAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184375	184732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_184400_184700
866178	contig_1339_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_163128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATACCCCTTGGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386196	386588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_386200_386600
866179	contig_13172_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_146330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCATGCCTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101346	101719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_101300_101700
866180	contig_10299_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_79805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAAAAATTATGTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815524	815142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_815100_815500
866183	contig_15286_pilon	-	194	1	Intergenic	novelGene_124430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTATTTCTTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275	1081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_-_1100_1300
866184	contig_9479_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_176676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTAGCATGATTAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34821	35588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_+_34800_35600
866185	contig_5643_pilon	+	281	2	Intergenic	novelGene_38931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGGTCGTGCTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433764	438516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_433985_438455
866188	contig_3533_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_176539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACGAGGACATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432859	432416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_432400_432900
866190	contig_15118_pilon	+	453	3	Intergenic	novelGene_74628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCGCGGCTCCGCGCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436410	437725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_436608_436740_436882_437610
866192	contig_15146_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_116947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACAAAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402572	401904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_401900_402600
866194	contig_5341_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_167998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGATGACTTTGTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181334	179769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_179887_180659_180723_180838
866195	contig_3832_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_161479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTCCCTCACCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439904	440324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_439900_440300
866196	contig_14208_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_129094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACATACTATAATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195342	195962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_195300_196000
866197	contig_6364_pilon	+	388	3	Intergenic	novelGene_51774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	80.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTATATGAAGTAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016581	1043185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1016616_1031638_1031750_1042942
866198	contig_7123_pilon	-	522	3	Intergenic	novelGene_170573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	4.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	109	522	431079	421071	FALSE	70	GAGAAGAAAGAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSQRFGIAPREVKGPTPKVVLLRAKPPKGQGVERHLERIQHNHEKRQAILTSIKTNERNRLKVEWDQHNDRKFLDSLVQARIKDSMQGFIINTEERRNKLRELLASEENEYFTEMQSKEETIEVKKDRMREKARLLK	431187	421070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_421186_422032_422263_431010
866201	contig_7285_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_143400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACTTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264638	264963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_264600_265000
866202	contig_9895_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_144677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAAATTGCCATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37096	37476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_37100_37500
866204	contig_17522_pilon	+	544	4	Intergenic	novelGene_160822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	165	380	544	121432	122973	FALSE	65	CCCAAAAATGCAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIEYLHNNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTTYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGDLTPHLQNIFSKSPTFAGVVLPQVQH	102886	122973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_103059_116404_116584_121403_121517_122893
866205	contig_3866_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_112380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAATTACTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103887	104427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_103900_104400
866206	contig_16391_pilon	-	571	7	Intergenic	novelGene_176984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	15.1813116107345	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	3	569	69933	64411	FALSE	30	TCGTAAGTAAGATGGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTTVISPGVTPGVGGGSTPGELDTGATSPGKSGSPEVSVVSSTIGPVSQSTNVASATPATTSGSKSGTSVTSATVTSGSEGTPGLPGSGTTTSGSASGTTGGSEVATTGGSEVATTGIAGTPGTSGGATSGGESTPGLPSSGITSSSTKTGTPGVPAGTSTEASEESPAVTSGPTGVASGSTVAPGSSN	69935	64408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16391_pilon_-_64461_64568_64635_67624_67718_68764_68831_69184_69278_69547_69650_69836
866209	contig_15185_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_99402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	13	405	178217	178609	NA	20	TCTCTGTGTCCGGTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWAAMRRRHPGLAVELELEPTLSADTVRRVLQPSVPVAALRLNLSGDSVGPVRFAAHHYATSLRVLEVRAAASAELDAALEELATRCAGLREVHCFCVVRPTVLGAFRAHCPRLRSYTLKLTREPHPWRPTLVA	178204	178943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_178200_178900
866210	contig_18238_pilon	+	531	1	Intergenic	novelGene_178091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGCCTTCGAGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50143	50674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18238_pilon_+_50100_50700
866211	contig_10163_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_82615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTTATTTAAAATGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45966	45550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_45600_46000
866212	contig_5415_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_146124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTTTTTTTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21250	20438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_20400_21200
866217	contig_5628_pilon	-	334	1	Intergenic	novelGene_157581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGTTCAGAAAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415297	414963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_415000_415300
866219	contig_9609_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_22953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAATAGTTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211185	211554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_211200_211600
866221	contig_10148_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_172854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTCTCAAGTTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236133	235767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_235800_236100
866222	contig_5083_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_151688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTACAGTACAGAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205075	1205903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1205100_1205900
866223	contig_1076_pilon	+	224	2	Intergenic	novelGene_101136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGAAAAATTTGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945754	973848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784
866224	contig_5799_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_50295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCCCCATGGGGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437913	437397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_437400_437900
866225	contig_10627_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_60002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATGGGAGTTCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307702	308069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_307700_308100
866226	contig_563_pilon	+	575	6	Intergenic	novelGene_169754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTTGCCCAGCGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120870	140879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_121027_127532_127587_127956_128030_132672_132791_133533_133679_140850
866227	contig_7816_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_66566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAGATCCTATCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481877	481296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_481300_481900
866228	contig_11416_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_145360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAACTACAAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382214	382878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_382200_382900
866229	contig_12429_pilon	+	999	8	Intergenic	novelGene_136200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCATCCATCTCCAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23524	32513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_23648_23727_23855_26540_26654_27916_28047_28652_28815_30164_30300_32110_32234_32427
866230	contig_2450_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_160306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCCTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466319	466709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_466300_466700
866231	contig_9482_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_44333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGTGTCTGTCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256025	1256944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1256000_1256900
866232	contig_10346_pilon	-	608	1	Intergenic	novelGene_161221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAAGAGGAGTTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277834	277226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10346_pilon_-_277200_277800
866233	contig_9945_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_104797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	12	347	12132	11797	NA	25	CAGGGCATTGCAGAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWFPHKASSAHSYYLDKVCLLQIRIPYVLAPLATPINNPTAVQLHGWLMMSRSHRPSFFFFFPLPPGISNGLTGILRTILIPSGKTTSFVTSAKPSVVASGNKHTLSHA	12143	11723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_11700_12100
866235	contig_8161_pilon	-	442	1	Intergenic	novelGene_156763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTATTAAGTTAGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291442	291000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_291000_291400
866236	contig_6589_pilon	-	931	2	Intergenic	novelGene_26279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	103	495	2258103	2257711	FALSE	15	CGGTTAAAGCCGCGCGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAHSCLSDRLRYSRIVGGWDLLPRALLSSLSGPMLLHTPVVAVKQGQREVQVHVSTSRGASLQKVLTADMVLLTMSGPALQRVSFSPPLSHKRQHALRSLHYVAATKVYLSFRRPFWRDEHIEGGHSSTDRPSRIIFLPATRRGARCCWPRTLGQTRRRPSRA	2258428	2257274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2258171_2258393
866237	contig_9345_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_24737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCTGCTGCCTCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107487	1107865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1107500_1107900
866239	contig_7816_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_66545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATGAATTATGGCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282328	277734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_277922_282134
866240	contig_5472_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_130028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGACCTTGCCGGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219373	220010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_219400_220000
866245	contig_3529_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_105357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTCTGTTTTCATAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540151	539704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_539700_540200
866246	contig_7976_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_169423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGCCCTTTCTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896951	897363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_897000_897400
866247	contig_9333_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_120322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	5	349	142532	142188	NA	15	CTTGATCTGTATTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAFSGAFVEAGGGVGGSFHASALRRLVGSFLGRSGQVLRCIGGRCRLQPRRYPRCGTSGGSQEARSAWLSVAECVSLQMLAGIILRCLLSSTVSAWLSCQGRRGCEKDAVALL	142536	141984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_142000_142500
866248	contig_5744_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_149330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCCCCTCCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308722	308374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_308400_308700
866249	contig_6589_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_25882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTGACTCACTCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080421	1080185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1080200_1080400
866250	contig_13014_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_169353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCGTCAAAAGCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407906	407589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_407600_407900
866252	contig_10246_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_46885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACCTGTTAGAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121286	121658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_121300_121700
866253	contig_10126_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_105777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACAAAAAACACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453116	452624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_452600_453100
866256	contig_5084_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_64620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTTATTAATCAATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144666	1144398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1144400_1144700
866257	contig_6165_pilon	-	214	1	Intergenic	novelGene_167409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACCACCGGAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485212	484998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_485000_485200
866258	contig_7612_pilon	+	414	4	Intergenic	novelGene_170365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.0653845971483	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	40	366	212797	215180	FALSE	15	ACTGCTTTTTGTCTGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPASEVNFALKDMEKERIASDLPKNMTQDSVVFEDVAVDFTQEEWALLDLAQRNLYRDVMLENFQNLASLAGYPLHIPHLISQWEQEDLKIVKRGLIQDTCTGEHQEGKNPQEENCPGWG	208569	215228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_208604_212791_212845_214328_214456_215028
866261	contig_5423_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_85314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACAAGATGAGAATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780086	780320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_780100_780300
866262	contig_9389_pilon	-	323	2	Intergenic	novelGene_83968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGTATATAATGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250160	249500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_249689_250025
866263	contig_6102_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_32393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGGAAAAAAAAAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1778278	1778977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1778300_1779000
866264	contig_14666_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_39497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAGGATGGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311693	310954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_311000_311700
866265	scaffold_7386_pilon	+	433	2	Intergenic	novelGene_136597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCAGCGCCTGATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308636	310345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_308812_310087
866266	contig_13718_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_142900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGCTGATATATAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243274	242750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_242800_243300
866267	contig_5782_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_162129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGACTTCCGCTAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339812	340217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_+_339800_340200
866268	contig_4769_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_118025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204720	1204216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1204200_1204700
866270	contig_14986_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_59720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGAGGCCTAACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140487	141438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_140500_141400
866271	contig_10023_pilon	-	714	3	Intergenic	novelGene_123465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAATCCTCCAGTGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60528	58582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_58831_59551_59638_60148
866272	contig_7179_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_78197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAACTCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295444	1295743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1295400_1295700
866273	contig_11396_pilon	+	578	1	Intergenic	novelGene_71359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACCTAGCAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617974	618552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_618000_618600
866275	contig_299_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_129525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCAAAAGACAAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736841	1736367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1736400_1736800
866276	contig_7129_pilon	-	209	1	Intergenic	novelGene_169307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGATTTATAAAGACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933862	933653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_933700_933900
866277	contig_14635_pilon	-	741	1	Intergenic	novelGene_84377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTCATCTCTAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614661	613920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_613900_614700
866278	contig_6191_pilon	+	661	1	Intergenic	novelGene_107847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAAGGAAGTAGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164927	165588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_164900_165600
866279	contig_12125_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_76240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAATACTGCTGCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555111	553047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_553182_554910
866280	contig_12603_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_105806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCAGCCTTTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614656	613661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_613700_614700
866281	contig_7513_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_89039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGGAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796392	795609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_795600_796400
866284	contig_12324_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_166649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCCACTGTGTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119743	118944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_118900_119700
866288	contig_11910_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_178092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19275	20053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11910_pilon_+_19300_20100
866290	contig_2863_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_174060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	17054	17359	NA	35	TTTAATATCAAGCTCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVAPWTLSGGADPALAAWSCASRGVCVHSGPDGRSGGRGVQLGLAVSSDAAKQRCRTERTERSGGKSCAGPCASLYVHTRETASRAVKRQSGRRGASADG	17051	17819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_17100_17800
866292	contig_11396_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_71369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	103	399	1012119	1011823	NA	45	GGGTATGTAAAGAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGAGCPCPHPVRGPWPIPGDPRLLPPCGFSVLTMHFENAAKASKPLSEPVGPSSLPPHPHHQSPAQGSQTPQGVHCRGACCVGVLPCLLPGGWVSRHPQQPCQSWTPAVGEVPQIEASPHSYTPRSRPCHE	1012221	1011799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1011800_1012200
866295	contig_9437_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_141719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAGTTAAAACTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162806	163084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_162800_163100
866296	contig_5718_pilon	+	512	2	Intergenic	novelGene_110359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708437	710269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_708691_710010
866298	contig_1719_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_87292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTATAGCAAGGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379361	380066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_379400_380100
866300	contig_11136_pilon	+	445	5	Intergenic	novelGene_169035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.4163333279998	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	77	445	184942	186450	FALSE	10	CTCAGGCTGTGCCCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEESQLVFYGHQGSIDCVQLINEEHMVSGADDGSVALWGLSKKRPLALQREAHGLRGEPGLEQPFWVSSVAALLNTDLVATGSHSSRVRLWQCGEGFRRLDHLCDIPLTRPMVADQRGSELRLYHPPPQGPHAPGCWLLTLPLFYLIL	184787	186450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_184824_184901_184965_185192_185339_185417_185498_186330
866301	contig_12119_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_88665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGGAAAGGAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308454	308918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_308500_308900
866302	contig_253_pilon	-	444	2	Intergenic	novelGene_129630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTATATAAAAACAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225953	206904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_206990_225594
866304	contig_7815_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_134392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581219	581759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_581200_581800
866307	contig_9633_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_139620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGAATAAATGAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030283	1029881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1029900_1030300
866308	contig_3081_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_133954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAATATTATTTTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618480	617952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_618000_618500
866309	contig_5145_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_131384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGTGCATCGAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616025	615686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_615700_616000
866310	contig_14666_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_39471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAAGAAGAGAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16112	16704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_16100_16700
866311	contig_4364_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_4576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	1834510	1834806	NA	75	AATGAAAAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRLLPAHWVAGDWGSAVRPALDFHAPSGKRANFLPNVATGRNVRGSPAHGWTHSFWVDSLQNSSWSPASLCPQGGHTARSGRCIAEPWWPCTSPHHA	1834509	1835211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1834500_1835200
866312	contig_13004_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_112749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCGGAGGCTGCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959298	960047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_959300_960000
866313	contig_7057_pilon	+	609	1	Intergenic	novelGene_123436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	1655235	1655552	NA	25	AGAAATCCCCGGGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLTHGSVDICTVYETKIRRRQFSYHRVQKLLSRGPVRSADRDSVAGAPEDFEKRWPSWRFTGACQRPVNRRCALTFSGTEERGYRTQVPARRALPAQKRWAGCTA	1655233	1655842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1655200_1655800
866315	contig_12786_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_103457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAACCAACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674533	674133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_674100_674500
866317	contig_4736_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_168632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCCAGGAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273967	273563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_273600_274000
866318	contig_3018_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_78910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAGAGAATTACGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624149	623803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_623800_624100
866319	contig_21418_pilon	+	745	2	Intergenic	novelGene_177868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTATGACACGTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5709	6959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21418_pilon_+_5760_6264
866322	contig_10095_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_57248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGATCTCTGTTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288436	287740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_287700_288400
866323	contig_10500_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_41209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACAAAAGGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1528178	1528552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1528200_1528600
866325	contig_15066_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_149533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTGAGCCTCATGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103199	103722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_103200_103700
866327	contig_10296_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_168889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGTATTGATGGGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920856	921267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_920900_921300
866328	contig_8520_pilon	-	635	1	Intergenic	novelGene_85448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCCTCTGAGGTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245451	244816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_244800_245500
866330	contig_11044_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_176593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAGAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57601	57185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11044_pilon_-_57200_57600
866331	contig_7050_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_153619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATGGAGCACAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618926	619331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_618900_619300
866332	contig_8552_pilon	+	455	6	Intergenic	novelGene_80069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	441	junction_5	344.661921308403	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	135	362	413743	438229	FALSE	15	TTGGTATATCTTCTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEG	400574	438322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167
866334	contig_13201_pilon	-	378	1	Intergenic	novelGene_130893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCATAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505512	505134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_505100_505500
866335	contig_3751_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_158631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAGATGAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100107	99717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_99700_100100
866336	contig_211_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_129894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435361	435730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_435400_435700
866338	contig_12761_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_164051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAATATATTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215863	216533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_215900_216500
866339	contig_11416_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_145347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCTTGTTACGAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179904	179602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_179600_179900
866340	contig_12864_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_76367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATGGGAGAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181830	181288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_181300_181800
866341	contig_10371_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_175470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATGGAAACGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625105	624688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_624700_625100
866342	contig_2854_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_120786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTAGCAGCTGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22042	22413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_22000_22400
866343	contig_6707_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_167043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAAGAAATAAGCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186243	185590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_185600_186200
866345	contig_11564_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_158531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCTGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35012	34293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_34300_35000
866347	contig_6217_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_109615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTAATGAGAATTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423445	423880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_423400_423900
866348	contig_2646_pilon	+	260	2	Intergenic	novelGene_69504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAATAAGTGAAGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553997	560405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336
866349	contig_10437_pilon	+	234	1	Intergenic	novelGene_38134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATATCACTGAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149449	149683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_149400_149700
866350	contig_6272_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_160465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTTTAAAAAACTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331543	331963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_331500_332000
866353	contig_5018_pilon	-	482	3	Intergenic	novelGene_46973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	9.5	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	105	332	508003	507776	FALSE	15	GGTCAGCACGCTTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLVHGAPDPTAGAGIEDANCWHLDEEQIQEQVREMLRMQDSNGARMLILMTEQFLQDPRLALWRQQGAGMTDKCRQLWDELGKTQPGARQMSSFSLRLGPGPGILPLLI	511114	507625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_508013_508170_508251_511099
866355	contig_10949_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_146692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAGGAAAGGAAGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110940	111313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_110900_111300
866356	contig_7548_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_117639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238994	239532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_239000_239500
866358	contig_8412_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_118362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGATTGGTAACTGGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440178	440680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_440200_440700
866359	contig_14807_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_124737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGTTCCCTTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227935	227263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_227300_227900
866360	contig_7744_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_62578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890846	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_890800_891200
866362	contig_4091_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_172980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGATCTCAATACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2271	1852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_1900_2300
866363	contig_5351_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_178093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTCATTAACTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113166	113462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5351_pilon_+_113200_113500
866364	contig_5286_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_157386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTACAGATAAAGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643559	643977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_643600_644000
866365	contig_720_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_155158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGAAAACAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71572	70958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_71000_71600
866366	contig_14970_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_45153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCAGCATTTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365646	366364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_365600_366400
866369	contig_10352_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_49613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTATTTTGGAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40996	41580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_41000_41600
866370	contig_14219_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_54354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTGACTCAAATGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855383	855106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_855100_855400
866373	contig_17108_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_109541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCACGAATTTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160635	160175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_160200_160600
866374	contig_7207_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_72037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGACGTTCCCACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296806	297250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_296800_297200
866376	contig_16675_pilon	+	498	3	Intergenic	novelGene_178094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	14.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	174	497	83533	92285	FALSE	60	AGAAAAAAGATGGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLLVTGRLCGDSDPAQAACRPVRSQQWPSRTTAPGIGRQPSGLGRSPAERTSLLRTMSRPSSVSPRPPAPGGGGGGSGGGGGGPAQCGLGGGGRAKGLKDIRIDEEVKIAVNIALERFRYGDQREMEFPSSLTSTERAFIHRLSQSLGLVSKSKGKGANRYLTV	83359	92286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16675_pilon_+_83738_84954_85046_92257
866377	contig_14326_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_120781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAACAAATAATCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841247	841616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_841200_841600
866378	contig_13244_pilon	-	216	1	Intergenic	novelGene_87006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACCCTCCATGTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478257	478041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_478000_478300
866380	contig_5643_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_38992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACTCTCGAAATGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622274	622926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_622300_622900
866382	contig_12299_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_29748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297095	297511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_297100_297500
866383	contig_5236_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_100876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACATTTATTCAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39395	40154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_39400_40200
866384	contig_12923_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_30126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGATAAACAGACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90517	90149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_90100_90500
866388	contig_10197_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_115189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	386	736	502679	502329	NA	50	GGCAAATAGACACAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLKKLIQLPYDSAILLLGTYPKELEVGTKKDTCTPMFMAELLAIAKRWKQFKCPSIHKWINKMWDVHTTGYYLIIKRNEILIRAATQMNLENSMLNKSDTKGQILYDPTHMKYQE	503064	502326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_502300_503100
866389	contig_15888_pilon	-	764	4	Intergenic	novelGene_84388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	669	716	18369	18322	FALSE	10	GTCCTCTGCATCTGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCGGALIHSRFVLTAASCFRIGNPTTATVVLGAYDLRRQEHSRQIFSVRGVSENGYDPQENLNDVLLLQLDREANLTSRVAVLPLPQQNATVEAGTNCQVAGWGITGPRGRLSRYLRVVNVTVTPEDQCRPNNVCTDVLTHRGGICQGDGGTPPRVQWPRARCSLLLPESLRQGRRLLRPRGTLPKLDRLRSKRPIGRACGGPVTPPTPSQLLPPCHSHCVSMSMALRVSPELHLWA	20926	18273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_18595_19214_19449_20279_20422_20859
866390	contig_1406_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_25466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGACAATACATAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771169	770792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_770800_771200
866391	contig_614_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_132600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTACGTCATTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178211	179039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_178200_179000
866393	contig_5988_pilon	-	734	7	Intergenic	novelGene_16125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	26.9902245678361	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	64	498	1355838	1337268	FALSE	30	GGAACTGTCAAGACTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLTLACCSGPRRHFPWNLILLMVFTLSMAYLTGMLSSYYNTMSVLLCLGITALVCLSVTMFSFQTKFDFTSCQGVLFVLLMTLFFSGLILAILLPFQYVPWLHAVYAVLGAGTFTLFLAFDTQLLMGNRRHSLSPEEHIFGALNIYLDIIYIFTFFLQIFGTNRD	1356232	1337031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1337418_1352313_1352368_1354073_1354170_1354435_1354524_1355084_1355123_1355829_1355870_1356200
866395	contig_7452_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_109140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGCTGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73614	76099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_73693_75809
866397	contig_6163_pilon	+	492	6	Intergenic	novelGene_103831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5.62138772902208	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	446	478	357939	362612	FALSE	10	GTGCCCTCAGCGGATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIFVPHSDLLTNLTLDELARIRAHRQLVFRYHVVGCRQLRSQELLDAEYVTALSGHPLRFSEREGSIYINDFARVVSSDQEAVNGVLHFIDRVLLPPDVLHWEPDAAPTPQRNVTAAAESFGYRIFSGLVKVARLLPLLQDVSHKPFTMLWPTGGLGA	356324	362626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_356371_356481_356629_357154_357296_357400_357461_357887_357955_362595
866399	contig_7171_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_101286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGTGGTTGCGACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049938	1050239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1049900_1050200
866400	contig_16504_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_167944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36311	35873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16504_pilon_-_35900_36300
866401	contig_4924_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_84756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTATTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195908	195421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_195400_195900
866402	contig_1154_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_87200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	499	822	1100705	1100382	NA	60	AAGTACCAAATAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAENGSIFPRNHKDFSQKAWGVEKEERLEAVGSHESTKGRDCCHCSAQFRTGLEACCIGPIPQQTEKKPNSSASALPFLTLYLGCMIFPWEACGQHADSAYHSYY	1101203	1100297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1100300_1101200
866403	contig_12842_pilon	-	441	4	Intergenic	novelGene_168339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	195	398	124832	123948	FALSE	25	GAGACACGGCCCCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAVPATGLLVPLSLLLLIQALSVSAAERSYEGKFRYLQGYNPFDQGCARNWYLTICAPLGPKYMAEAVWLQRVVGHDWVPLQNLHSPTCPSAPSPLASQPLSLYIPGRGLPGSGEASALQEEHLHQSLTS	132748	123904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_123978_124658_124837_125151_125238_132644
866404	contig_13403_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_158091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAACGGGCCACTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61566	61019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_-_61000_61600
866406	contig_9919_pilon	-	502	4	Intergenic	novelGene_137988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_3	6.16441400296898	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826041	814801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_814958_817950_818050_823980_824186_825999
866407	contig_4364_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCACTGTGCCACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401821	1402319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1401800_1402300
866409	contig_1719_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_87348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	11	343	673969	674301	NA	45	ATTTTAAAAAATATTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNNYSKLPLSLAAGSGVSSTGTTPVLSRHRHQGAGTDDRPLGQSAGFPPVLRTSRTPGSATVQLCDPGASVSLSGNGGDKNDAQMGLWPSVILAATLRVLLYLSSTL	673958	674584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_674000_674600
866410	contig_16715_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_178096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTTAATACCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71313	70809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16715_pilon_-_70800_71300
866411	contig_5084_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_64621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATTCCACCGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145348	1145674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1145300_1145700
866414	contig_9443_pilon	+	224	1	Intergenic	novelGene_167127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCGCAGGGGAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67298	67522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_67300_67500
866415	contig_6361_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_23900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCAGAATTTAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126306	125930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_125900_126300
866417	contig_10324_pilon	-	567	4	Intergenic	novelGene_7884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7.07106781186548	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	583413	578971	TRUE	20	GCAACAGTGGGGTCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAQQRRLLGHHEQVVDRLLEAQDSAERLLREILTTEKEVAQNLVDTKEKAHQGVAELQQLEAELQKASEEDTHLKANLLYPHQRAGGAQGDGGGSPKTREGS	583413	566436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_566662_578937_579039_579204_579355_583322
866418	contig_663_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_163746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTATTCTCACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83744	83182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_83200_83700
866419	contig_16322_pilon	-	478	2	Intergenic	novelGene_87551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAATGAAAAATATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108579	103416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_103858_108542
866420	contig_5640_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_27301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328294	1327941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1327900_1328300
866421	contig_10986_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_71510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174815	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_174800_175100
866423	contig_8063_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_152421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCACGAACAATGAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69486	68723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_68700_69500
866424	contig_12837_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_57328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAACGAGACAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147825	148391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_147800_148400
866425	contig_15049_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_160716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTGCAAACCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177688	177158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_177200_177700
866426	contig_13823_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_145276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGCAGTTGCCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311282	311742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_311300_311700
866427	contig_10734_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_51104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGACTTATATGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610782	610570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_610600_610800
866428	contig_5092_pilon	-	347	1	Intergenic	novelGene_62254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGCCTTGCAATTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161280	160933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_160900_161300
866429	contig_4486_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_38611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTGTTGCAAACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369216	369862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_369200_369900
866430	contig_7894_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_170778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAGTTTATTCCTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168128	168609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_168100_168600
866431	contig_19564_pilon	+	946	2	Intergenic	novelGene_29664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAAAATAGTACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51249	52498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_51322_51624
866432	contig_16525_pilon	-	135	1	Intergenic	novelGene_133843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGACTGTGCTGTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178229	178094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178100_178200
866433	contig_3975_pilon	-	240	1	Intergenic	novelGene_54954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCTAAAAAAAAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2361237	2360997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2361000_2361200
866434	contig_13214_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_175712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCAGGGAATTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11484	11086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_11100_11500
866435	contig_13697_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_165940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAATACTCGCCTCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606629	606965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_606600_607000
866436	contig_1813_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_105505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCAACAGCAAGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366745	367030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_366700_367000
866437	contig_3774_pilon	-	423	5	Intergenic	novelGene_142052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94.3967690125038	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTTCAAATGATAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210513	193506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_193543_198895_198941_198982_199018_200890_200979_210294
866438	contig_10749_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_133499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231155	231525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_231200_231500
866439	contig_11572_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_100033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTGAGGATGTTATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137852	137509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_137500_137900
866441	contig_1301_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_47355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCCTTCTTTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521663	521289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_521300_521700
866444	contig_9297_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_69852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAGCCACAATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810898	810350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_810400_810900
866446	contig_13592_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_33720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGTCACCTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263715	263060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_263100_263700
866448	contig_3825_pilon	+	595	3	Intergenic	novelGene_77998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	300	419	1268571	1268690	FALSE	55	TACTTCCAAATAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWHRIALSIHKKNVTLILDCKKKATKFLDRSDHPIIDINGIIVFGTRILDEEVFEGDIQQLLLISDHRAAYDYCVHYSPDCDTAVPDTPQSQDPNPDEYMVKGGSSVSQCHCCPLWAECPEGLSEPARGWSLGLLKIE	1249860	1268866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1250028_1268169_1268302_1268570
866449	contig_9363_pilon	-	363	1	Intergenic	novelGene_6793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCCGTGCCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595178	1594815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1594800_1595200
866450	contig_12532_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_111147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	289	669	43752	43372	NA	25	TCAGCTTACCGAGGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCLQAAYRGYKVRQLIKQQSIAALKIQTAFRGYNKRVKYQSVLQSTLKIQRWYRAYKSVYDTRTLFLKTRAAVIFLQSVYRGWKVRKQIRREHNAAMKIQSAFRMSKARKQFRSLRRATLVIQQHLRARTEGKKQRTEYIELRRVVLVLQATWKARKLRRQFQRQHKCAVAIQSYYRMYVQQKKWRGLKKAALLIQTYYRAYSIGQKQRHLYLKTKAAVVILQ	44040	43371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_43400_44000
866451	contig_7056_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_43693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGAGGTAGGTGTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908095	907596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_907600_908100
866452	contig_4350_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_136387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGCACAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270744	271206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_270700_271200
866453	contig_7426_pilon	+	413	2	Intergenic	novelGene_27490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAAGCGCCCCTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881944	883673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_882076_883391
866454	contig_1987_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_177224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTATACATGCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390139	390577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1987_pilon_+_390100_390600
866455	contig_3018_pilon	+	174	1	Intergenic	novelGene_78787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426224	426398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_426200_426400
866456	contig_13048_pilon	-	245	2	Intergenic	novelGene_138933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACAAAAAATTGTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488618	487663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_487835_488544
866458	contig_12277_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_139716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408775	408387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_408400_408800
866459	contig_11136_pilon	+	334	2	Intergenic	novelGene_169033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGACCAGGAAGCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162666	164324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_162821_164144
866465	scaffold_6394_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_110974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAGATTTTTATAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336629	337196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_336600_337200
866467	contig_14744_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_66112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	30	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	28	540	1560352	1563297	FALSE	10	ATCTTCCTCCTCCTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPLEFPLAMAFAEQLLSWRSEDGEGKSEDEPDTIPTSVLLQVVELLGNFLWTTDMAACVKEQVFHLLAELLRTVHALEQRKHPAGLSSSIALQLNPCLAMLMALQSELHKLYDEETQSWVSGSTCGGSGAAVAADQGRFSTYFHALMEGCLAVAEVTLPTNMSVTASGVTSTTAPNLSD	1560324	1563299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1560467_1562899
866468	contig_10182_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_134610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAACCCTACAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54686	55141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_54700_55100
866469	contig_5084_pilon	-	639	5	Intergenic	novelGene_64497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	313210	311785	TRUE	30	GGAACACCGAAGCCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQGLHQNWVELPVKVTALAIGSSHSPQTEGLRAQCLGFLWGQGQFLGSLSYEAAQAAPEIKAAQLGPGSDIPTGRGQDPEQFHGSSTGHSVSTGERPHPHGGPAGRQELSNHGLDQPRALQDPRG	313211	311425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_311558_311659_311796_311890_312060_312569_312732_313171
866473	contig_14322_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_115624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213008	213295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_213000_213300
866475	contig_240_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_173807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGGAGCTGAATCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716492	715978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_716000_716500
866478	contig_2296_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_177479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATAAGATGATGACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176291	176990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2296_pilon_+_176300_177000
866480	contig_21388_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_136620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21627	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21400_21600
866481	contig_12799_pilon	-	183	1	Intergenic	novelGene_173285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATAATGTGTCTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151290	151107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_-_151100_151300
866482	contig_13464_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_125249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGTCAACAGCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464055	463353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_463400_464100
866485	contig_13593_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_156140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACAGCGTCCGCCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461537	460936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_460900_461500
866487	contig_16896_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_174911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTCTTCATGTATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95464	96041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_+_95500_96000
866488	contig_6070_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_177494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCCCACAAGAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229750	229418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6070_pilon_-_229400_229800
866489	contig_4364_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_46	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGTCCTGGACTTGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519083	509647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_509932_519011
866490	contig_20939_pilon	-	394	2	Intergenic	novelGene_172449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAACAGTAGAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161356	144049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_144367_161279
866491	contig_2219_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_67208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGTTTTCTACCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343931	344409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_343900_344400
866493	contig_13292_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_142952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGATAAAAAAGAAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326748	326132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_326100_326700
866496	contig_10511_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_126902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAATAAATAATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574528	574179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_574200_574500
866497	contig_11986_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_69172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	159	542	536181	536564	NA	25	ATGTTCACGGCAGCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLPPTPTPSPTPSSARLSYKPTHFLCSHSGCVSPTPGETTDLQAFHFPFLSRSGPCASKGNSRSVARTCLETQMTTQHPHPPPHPIRLLTQAYSTQLGSKPKVPWPQEACREESSENCKQTQLTL	536022	536764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_536000_536800
866498	contig_8587_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_159112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATTGTCAATAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129622	129248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_129200_129600
866499	contig_12042_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_170446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGCAGGGGGATGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239073	239611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_239100_239600
866503	contig_6269_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_170542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAATAAAGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267058	266446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_-_266400_267100
866504	contig_4891_pilon	+	459	3	Intergenic	novelGene_124584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	6	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTGTGAGTCTGATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907572	912508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_907699_909626_909788_912336
866505	contig_14679_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_174190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAAGTTCAACAAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245274	245897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_245300_245900
866506	contig_2114_pilon	-	404	2	Intergenic	novelGene_104216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	839	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTTTAGTTGCCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62679	60169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_60484_62589
866507	contig_4232_pilon	-	364	2	Intergenic	novelGene_63466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGAGGTACGTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572019	571412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_571664_571906
866510	contig_5485_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_37724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCAAAAAATACCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248427	249075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_248400_249100
866511	contig_6227_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_49660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAGAAAAGAAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459628	459034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_459000_459600
866513	contig_16907_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_87424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAAGGGGCTTTTGGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328517	328755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_328500_328800
866515	contig_7308_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_159596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCATTATGCTCTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483301	484028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_483300_484000
866516	contig_14647_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_167382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGAAGTTGGGGGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153363	154250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_153400_154200
866519	contig_5341_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_168036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343145	342675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_342700_343100
866520	contig_15084_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_116686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACTATCATATAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168960	169274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_169000_169300
866521	contig_2114_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_104289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCAGACCTTTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732070	731436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_731400_732100
866524	contig_5253_pilon	+	265	1	Intergenic	novelGene_61569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAACCCTATATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218192	218457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_218200_218500
866527	contig_9515_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_73802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGAGAGCTCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36448	35760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_35815_36076
866528	contig_6102_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_32291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475624	1476147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1475600_1476100
866530	contig_11115_pilon	+	338	5	Intergenic	novelGene_102879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	142.923712168415	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	129	210	338	289296	293665	FALSE	45	GAGTAAAACCAGGAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRRLNCILRDACPHRPGPGARAGLPRHLTARRCPQALTFHLAPGLQGKLPGRPPSHLILQKALPNGNLMKSLKKQNQKILLMKKTKTRMKRDVELPPKNQLLDLSLQKSRK	278231	293665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_278345_288130_288207_289275_289355_293202_293238_293630
866531	contig_500_pilon	-	697	1	Intergenic	novelGene_31103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	103	345	1529501	1529259	NA	10	CTGGACGCTGTCCTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTGLKANLLSLGTVPPTVVSLGTVATPADRLALMGGMEGFLGKMAEHGLQPDIKTLTLLAEVVAPGSPEESSLLATLDVHHVEADVTFFNTLMRKKSKLGDLEGAKVRAQGQH	1529603	1528906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1528900_1529600
866532	contig_4125_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_25173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074129	1075160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1074100_1075200
866533	contig_10482_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_152839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCATTTAACATCTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127228	126874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_126900_127200
866534	contig_12724_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_146862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATCGTATTAAGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246955	247347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_247000_247300
866536	contig_1759_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_171353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126487	127044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_126500_127000
866538	contig_13707_pilon	-	436	1	Intergenic	novelGene_43583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTTTGGTTATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283533	283097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_283100_283500
866539	contig_3155_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_26351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAAATCTCCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200580	200145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_200100_200600
866540	contig_1107_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_126582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAGAAGAGACAGAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677760	677432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_677400_677800
866541	contig_11126_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_138144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGGTGAGGTGATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738415	737769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_737800_738400
866542	contig_13163_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_178100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAGAAAGAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7980	8415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13163_pilon_+_8000_8400
866543	contig_9197_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_154365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63523	63780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_63500_63800
866544	contig_9177_pilon	-	248	1	Intergenic	novelGene_32576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1700_2000
866545	contig_1435_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_115486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAGAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485938	485385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_485400_485900
866546	contig_10304_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_166493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGGGAAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73065	73576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_73100_73600
866547	contig_9389_pilon	-	579	4	Intergenic	novelGene_84082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	166.607322768239	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	195	440	1131672	1129623	FALSE	10	ACGTTTATCGTGGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAALLREPVYNWQATKPTVKERFAFLFNNEVLCDVHFLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQN	1156110	1129483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1129629_1129787_1129945_1131589_1131710_1155953
866548	contig_14146_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_178101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	11	36	414	449	63251	63216	NA	75	TAAATTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPLILSKEDIRDNIVSYNDEGGGEEDTQAFDIGTLRNPAAIEEKKLRRDIIPETLLIPRRTPTAPDNTDVRDFINERLKEHDLDPTAPPYDSLATYAYEGNDSIAESLSSLESGTTEGDQNYDYLREWGPRFNKLAEMYGGGESDKDS	63664	62817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14146_pilon_-_62800_63700
866549	contig_6110_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_163280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAAGTCGTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639567	640207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_639600_640200
866550	contig_6740_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_142663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAACCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375209	375490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_375200_375500
866552	contig_11338_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_6242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	53514	53182	NA	20	GTCATTTTTAATGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLRSYRRPSCAGPAAGHPLGARGKFPTLPEAKDSRIPGGRALWGSRDPLETQKTATNLTPPFANSGLLATTGRRVLLSRARELPHCLETIRVLGRSAFKSGWFEDDPHP	53515	53066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_53100_53500
866553	contig_4131_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_127853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCTGACTTGGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132489	132160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_132200_132500
866554	contig_1244_pilon	-	331	4	Intergenic	novelGene_37965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_2	51.227162933567	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	103	327	911358	903322	FALSE	30	CTTAGCCAGGAGGAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFVLCLLAQPGAAAGNLDWAVLASTSFCPDRPAGMEDEEAEEQQRFSYQQRLKAAVHYTVGCLCKEVASEKEMQFSKQTIAAISEKILQKTLKCLPDMQKEAQLTRMM	911460	903317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_903360_906509_906544_907493_907599_911310
866555	contig_16322_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_87518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_2	106	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTGCTTTCTTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57629	36370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_36438_36986_37098_57465
866556	contig_4388_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_161952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAACAAATGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353584	352969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_353000_353600
866557	contig_12450_pilon	+	586	1	Intergenic	novelGene_162325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATGGTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379416	380002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_379400_380000
866560	contig_12689_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_145061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTAAACACACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324257	324562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_324300_324600
866561	contig_2817_pilon	+	311	3	Intergenic	novelGene_104344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	99.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAGTAGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287073	293517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_287167_289783_289808_293323
866562	contig_20429_pilon	+	451	2	Intergenic	novelGene_169241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88517	90001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_88666_89698
866563	contig_11378_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_112286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCACTTAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516188	515751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_515800_516200
866564	contig_5499_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_57028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGGCCTGGCACATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385464	1384568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1384600_1385500
866565	contig_9272_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_125983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	679720	679376	NA	60	ACAAAAAAACAAACCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLPLLLPQLVWARDSGGLALPPRLSQTQADTQASPHAVFSTEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTHIHWYHNRAPVEGDEQAGVLLGESLIHDCTFITR	679721	679047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_679000_679700
866566	contig_11016_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_163295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	139248	139610	NA	70	TCAGGAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIFKTGSKEKITWPNLLFPVNEELRLPFTILEGSSEVSALHSWRSTALSVYLRLTRKCIDRGSFLTVTSTYLSHCHTANEIQAIELSASVALSAQLKEKGIPKPTHVLLPSQHNVKLQPE	139247	139765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_139200_139800
866570	contig_829_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_168926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGGCTCTGGGCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73458	73950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_+_73500_74000
866572	contig_5023_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_7122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAATAGCAAGGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144275	143663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_143700_144300
866573	contig_6673_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_164010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTCCTGTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41456	40958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_41000_41500
866575	contig_6557_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_33014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	77	298	587364	587143	NA	65	GGAAAATAGACATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLARDPLVPFLLSANSGLPNFSQKMLTAMCHFSDSTTSQEMLLPGSPGSKNLYPATIFSSPLNSKPESRGSVTGCECLARRRQGREPLWSRSCRQPL	587440	586979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_587000_587400
866576	contig_7471_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_161288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATTAAAGATACAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42476	42081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_42100_42500
866577	contig_8357_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_39735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATCGTGTGCCAGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735013	734531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_734500_735000
866580	contig_9177_pilon	+	465	2	Intergenic	novelGene_32708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAATCTTTAACAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510767	511376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_510917_511060
866581	contig_7549_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_164531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAATAACCAAGCACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703628	703309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_703300_703600
866582	contig_5092_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_62255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTGTATCAGTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161620	161937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_161600_161900
866583	contig_6436_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_134923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAGTATTTTCCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947239	946743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_-_946700_947200
866585	contig_10642_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_78653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCACTGTTCCCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137761	138195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_137800_138200
866586	contig_7457_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_31443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGGTATATGAGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469287	469650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_469300_469600
866587	contig_10437_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_38370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATATGTCAATAAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561095	561312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_561100_561300
866588	contig_3161_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_84496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTTGGCTTAAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20386	20075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_20100_20400
866589	contig_11507_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_103361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACACCTGTTTGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113306	112906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_112900_113300
866591	contig_9937_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_129215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185049	184770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_184800_185000
866592	contig_5428_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_160402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGGGAGGTAGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36310	35991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_36000_36300
866593	contig_10868_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_173891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAATAAATGATTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397801	397252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_397300_397800
866598	contig_13014_pilon	-	780	6	Intergenic	novelGene_169366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.93907194296653	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	11	766	491589	471980	FALSE	15	AATTTGTTTAGTTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSFMAHRESMQQMMKSFSEPFGRDLYSISNGRGRARNRRGHDDDENSFSHTDVNPFQAVDRMMLNMRKSMQELQRNFGQLSMDPNGHSFCSSSVMTYSKVGDEAPKVFQASTQTRRAPGGIKETRRTLRDSDSGLEKMAVGHHIRDRAHVIEKSKNRKTGNEEVSQEFTNMSESDAHAFDDEWQSEVLRYKPGGRWHNLEDKRMSSVGHENAGSRELRRREKPRQSPAIESGKRSKAFVDKLNVKGSSVQIGKK	491599	471965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_472086_473634_473774_475242_475403_477247_477377_478347_478432_491451
866600	contig_91_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_127110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTCTTAACACTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395443	396116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_395400_396100
866601	contig_6673_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_164033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	14	376	168168	165226	FALSE	25	CTGTGGACTAGGACCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGGMTTQGWPAKTQLGRACRSYRKRTSSEPVQLHRPKPGSSTRCPPPADSREPASGERRMRRIIAHARKAENPQAQREEESAAINEESESETSRERLSSGWVYIQRQHPGLHTLPVSSPECFS	168181	165035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_165387_167966
866603	contig_6544_pilon	-	198	1	Intergenic	novelGene_142114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370898	370700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_370700_370900
866604	contig_3832_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_161435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAAGGAGCCCTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102161	101803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_101800_102200
866605	contig_5769_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_138774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTGCCAGCTGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278098	277203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_277200_278100
866606	contig_3789_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_79811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTATGTAGTTGGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82403	82812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_82400_82800
866608	contig_15236_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_141554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTCTTTATTGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322731	323381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_322700_323400
866611	contig_15420_pilon	+	564	1	Intergenic	novelGene_175303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240552	241116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_+_240600_241100
866612	scaffold_6394_pilon	+	527	3	Intergenic	novelGene_110960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGGGATGGTGTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200106	201990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_200217_200486_200637_201723
866613	contig_6266_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_170979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGACCGGAGTGTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109434	109033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_109000_109400
866616	contig_10857_pilon	+	410	5	Intergenic	novelGene_160898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1601.99336765169	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	273	404	61421	66878	FALSE	5	TCCCGTGTGTCCCATGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTHSGCAQDPASLPAPCCTPLPPRTCCV	58783	66884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61474_66799
866618	contig_14822_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_145431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTCTCTCACCTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203962	204472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_204000_204500
866620	contig_12113_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_134759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGGTGCCGAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353217	352560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_352600_353200
866622	contig_11896_pilon	+	454	2	Intergenic	novelGene_87997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAGTCTTGAGTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79834	80376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_79947_80034
866624	contig_10196_pilon	-	582	1	Intergenic	novelGene_132278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACCAAAAAAACGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2158202	2157620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2157600_2158200
866625	contig_13048_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_138914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACCTGTGCAACCGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325940	326490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_325900_326500
866626	contig_7171_pilon	-	715	3	Intergenic	novelGene_101273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGATAGATGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977258	974507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_975012_975360_975471_977157
866627	contig_7171_pilon	-	231	1	Intergenic	novelGene_101223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACGAAAAAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649263	649032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_649000_649300
866628	contig_5836_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_106292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTCATGGTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253300	253826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_253300_253800
866629	contig_13300_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_125828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAACATGGAAAGCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104073	1103753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1103800_1104100
866630	contig_3382_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_124208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTAGGTAACAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434105	1434558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1434100_1434600
866631	contig_9345_pilon	-	457	1	Intergenic	novelGene_24486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGATTCATATCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663263	662806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_662800_663300
866632	contig_7530_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_141847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCTTTTGAAGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290939	291322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_290900_291300
866633	contig_18222_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_176935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18222_pilon_-_0_300
866635	contig_10962_pilon	-	677	2	Intergenic	novelGene_103883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAATGATATTCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273479	272525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_273104_273380
866636	contig_13496_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_107629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTAAAAGAATCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240849	241207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_240800_241200
866637	contig_11719_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_154764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGACTCATAACTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106844	107719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_106800_107700
866638	contig_14976_pilon	+	705	1	Intergenic	novelGene_139967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACTACCTTACAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26647	27352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_+_26600_27400
866639	contig_610_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_76790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACTAAAATAACAGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284033	284276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_284000_284300
866641	contig_13721_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_169481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGACTACCCTTTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16780	17071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13721_pilon_+_16800_17100
866642	contig_5551_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_134244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTGGAGAATAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455187	455697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_455200_455700
866645	contig_16578_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_148631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAAAAATATATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122883	123424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_122900_123400
866646	contig_6872_pilon	-	625	1	Intergenic	novelGene_175741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAAAGAGATTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412066	411441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6872_pilon_-_411400_412100
866647	contig_11986_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_69143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTTGAAGCAACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284718	285299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_284700_285300
866650	contig_8357_pilon	+	471	5	Intergenic	novelGene_39783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.6809513236909	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGTAATAATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919719	933583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_919818_923007_923079_924095_924222_926697_926768_933477
866651	contig_13490_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_129116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTATGGCAAGGAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17268	17902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_+_17300_17900
866652	contig_10861_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_39386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAATCTGTCATCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1875644	1876448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1875600_1876400
866653	contig_9415_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_109954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	148	495	2528518	2528865	NA	30	ACCATAATTCTGACTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVPQLLELHWWEWTLSLFSGSDLVTAFRGNLVTPAPPPGSAATKPTTAEMPLPERAPGPVLSVLVGGWLRFGEGQPKAGECRKQSLYPDHCPDTRDEPMLPSIFFNRLSYLEKATQSLPCLPNILLSSLILSFQSLLYACFYIVVMIYTKYFVPCFDHSTLYIL	2528370	2528945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2528400_2528900
866654	contig_5050_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_110300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTTGTACAGAGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716340	715495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_715879_716268
866656	contig_4950_pilon	-	526	5	Intergenic	novelGene_150638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGGTTTGAAAATGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269802	195585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4950_pilon_-_195856_229195_229264_244487_244547_269275_269384_269781
866657	contig_19606_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_148269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCCCAGACAATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41759	42191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_41800_42200
866659	contig_8322_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_143271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTCCTCATCTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503807	503454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_503500_503800
866663	contig_8896_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_171573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCCCTTTTCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42385	42728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_+_42400_42700
866664	contig_1337_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_84237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACAAAGTTGAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181815	182523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_181800_182500
866665	contig_4519_pilon	-	301	2	Intergenic	novelGene_123665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	7	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAATTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69192	68220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_68290_68960
866666	contig_3523_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_171486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAGGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109873	110274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_109900_110300
866669	contig_7909_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_155882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAATACAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119416	119852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_119400_119900
866672	contig_11422_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_99109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCACGGCCGTAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194	983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1000_1200
866673	contig_11413_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_103216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCCACCCCACTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811020	811330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_811000_811300
866674	contig_14225_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_52769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATTATCAGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537234	537914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_537200_537900
866675	contig_6048_pilon	+	365	2	Intergenic	novelGene_73119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	440	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGAGAATTCGTAGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909083	994936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644
866676	contig_14727_pilon	+	439	2	Intergenic	novelGene_56688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATACTGCATTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460471	461695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_460495_461279
866677	contig_6764_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_173739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGAGCCATTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63702	63420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6764_pilon_-_63400_63700
866679	contig_15888_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_84399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTGTGCCTTTGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48062	47431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_47400_48100
866680	contig_5758_pilon	+	730	2	Intergenic	novelGene_119113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAATACTTGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266798	268864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_266888_268223
866681	contig_6418_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_81236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCATAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430396	1430668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1430400_1430700
866682	contig_15327_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_70802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAACCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261793	1261087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1261100_1261800
866683	contig_8284_pilon	+	787	2	Intergenic	novelGene_125654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	5	298	70978	71719	FALSE	25	CCTCAGGACTCACCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMKKGLETDTVPPRRPCVCGHTELPRQEDGSYGLTPKAVWLGNQPGLGFFQEDVTPAEVTSQEVVPETEVPGGRMSKLSNQLELPTLGRSKTPSLISS	70973	72208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_71129_71576
866684	contig_12951_pilon	-	481	2	Intergenic	novelGene_68143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACAAAATAATAAAGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146399	145865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_146098_146150
866685	contig_10183_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_169502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40399	40905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_40400_40900
866686	contig_8978_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_49491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAGAAAAAAAAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763369	1764003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1763400_1764000
866687	contig_4125_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_25176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1164267	1163705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1163700_1164300
866688	contig_7594_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_55391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGAATAAATGGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357232	356476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_356500_357200
866690	contig_12050_pilon	-	206	2	Intergenic	novelGene_62677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTACTGTGTATTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511538	446097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446239_511473
866696	contig_17743_pilon	-	537	1	Intergenic	novelGene_176425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATAATTATAGGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61188	60651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_-_60700_61200
866697	contig_10341_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_47247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTAGGGCAATTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158282	158739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_158300_158700
866698	contig_15882_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_144812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAAAGTGTCCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313772	313400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_313400_313800
866700	contig_5917_pilon	-	634	1	Intergenic	novelGene_122175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTGGGATCATACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750352	749718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_749700_750400
866701	contig_5574_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_155820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTTATTGTAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55009	54698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_54700_55000
866703	contig_10734_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_51289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	1368340	1368023	NA	35	TTTGCATTTACACTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGAESGAVTWGWNWVREGPRLERREFTRRLSSCEGGDLAAGALSLQHQEVGSPAGQQQRAYEHRVAEQHESQQLPQQLQHVDGRRGRHRLHGGPRTCRRGAERP	1368340	1367846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1367800_1368300
866706	contig_5226_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_140495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6551	5986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_-_6000_6600
866707	contig_9999_pilon	-	528	1	Intergenic	novelGene_174671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTCCCCCCAAAATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323576	323048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_-_323000_323600
866708	contig_4364_pilon	+	528	3	Intergenic	novelGene_153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	6	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTACACTTTCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222882	1223730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1222945_1223102_1223184_1223345
866710	contig_294_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_166739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTACTATGCCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122006	121358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_121400_122000
866712	contig_12464_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_68745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCATAAAATGCTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435537	435316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_435300_435500
866714	contig_12935_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_165716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	59	592	64900	64367	NA	20	GAGGGCACCGAGTACGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFDSNPFADPDLNNPFKVSVVPSHLPPRLVVVCENRQVPSRPLRPPFASSQQSREGLEVAAPRLRVAPGSPVTGLGVGETLSSVSGCPFLACPAGEGRAPAREGSWQASPAPWQPGESEPGAGGVVTCLASVAGRVGWVTGSLGGGGLSSGGVVLGTKGEGGKELRGVMAVEEERG	64958	64366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_64400_65000
866715	contig_6048_pilon	+	524	2	Intergenic	novelGene_73122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	20	junction_1	0	155	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	243	404	910674	914569	FALSE	20	AGTATTTGGGTACATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGTPQDCGVLGRSSCSEPQARRGDRAGTLHPAPESPPLLGGAFLLVAPHPEERCALGVRPAHAISALAVPDQSRDSARWMLCVAGAKLKLFKEEPCSLSLCPTAVYRDVPVMPSQKLGAWIPKRMEHLQMME	910431	914689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_910704_914437
866716	contig_3525_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_135120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCCCAGAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40240	40624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_40200_40600
866717	contig_15105_pilon	+	742	5	Intergenic	novelGene_151043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.4790199457749	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	124	660	866301	875721	FALSE	40	ACATAACCCATTTTATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLDLIQFQSSHVWTADLPHRVLAYLNSRNVAFTIASLQAAMENHLEQRLYQPQKLLEDLRETDAQRFRTAMKCLLEDKKDHLELEDVVIDLREIRERALQSPGVIRSLFLITLERCFQVLNALECVEILGRVLRRSSGSFIQPDITQRLPQDLHEDAFKNLSAVFKELYDQTSAHSQRALYSWMTGVLQTSSKATGEPVLQDGITLWGSPSSKEVLHL	863226	875803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_863256_864741_864830_866294_866427_870385_870622_875546
866718	contig_6589_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_25830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGGAACGCAGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830557	830280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_830300_830600
866719	contig_11492_pilon	+	337	4	Intergenic	novelGene_152267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	100.41358916446	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCGACGCTGAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480851	486739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_480922_481010_481074_483808_483914_486640
866720	contig_20712_pilon	+	436	3	Intergenic	novelGene_178103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	4.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	66	434	59112	65606	FALSE	45	TTATGAAGAAGAATTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHVRDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALTAEASKDRKLREQSEHYSKQLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDFEKKSI	59046	65608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20712_pilon_+_59277_59518_59630_65513
866722	contig_6873_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_129841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738752	739131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_738800_739100
866723	contig_8260_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_163242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCTTTGCTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126921	127280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_126900_127300
866724	contig_10109_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_131340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258797	258485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_258500_258800
866727	contig_10494_pilon	+	433	3	Intergenic	novelGene_102180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGAACACCACCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975793	976599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_975962_976256_976355_976432
866728	contig_11794_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_173194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15482	15941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11794_pilon_+_15500_15900
866729	contig_1964_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_130905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAATGCACCAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127781	128397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_127800_128400
866730	contig_9440_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_59125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGTCCTAAATGATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1994743	1994285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1994300_1994700
866731	contig_17427_pilon	+	561	1	Intergenic	novelGene_30277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTGTTAATAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86459	87020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_86500_87000
866732	contig_5361_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_167218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTCACATCAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571917	571368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_571400_571900
866733	contig_9180_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_109118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACTTAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470569	471025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_470600_471000
866737	scaffold_880_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_121443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426011	425698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_425700_426000
866738	contig_10734_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_51534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTGCATCACCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2295464	2294844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2294800_2295500
866739	contig_15039_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_110108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	516	46	561	142134	142649	NA	30	ACCCAGCAGAGCCCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIHTETQFDGDQEVMQCGDTIREPFSCQFTRFPGFGGFRRLQKSVFSPMTAGSRESAWMPGGHGNQAARALGGGHAMGTELPSRRSAFLMCLCSRQAAPARWGLGLGVSCTRCAYLHRVGHSKGHESVHGHHPRRDGGSKTLPEERPKRDILPLLNVSSCSRRAGSRLTKADGPRPMAPSFPRPRS	142088	142651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_142100_142700
866740	contig_10331_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_54205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGAAACGTGTCCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649653	650110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_649700_650100
866741	contig_7720_pilon	+	592	1	Intergenic	novelGene_155745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGTTTTCTTCCTGAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266853	267445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_266900_267400
866742	contig_12496_pilon	+	381	3	Intergenic	novelGene_170711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	5.5	10	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGCAATACCTGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305903	308942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_306049_308538_308685_308852
866743	contig_6028_pilon	-	1051	9	Intergenic	novelGene_156613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.05775970414429	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	53	418	482131	475380	TRUE	35	AAGTATTGCCAGATTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGGYFQLEKEENPEVWMNISEIITYNGYPSEEYNVITKDGYILSVNRIPCGRRDARSTGPRPVVYLQHALFADNASWLENFASGSLGFLLADAGYDVWMGNSRGNTWSRRHKTLSVTEEEFWAFRFLMKWPNMISQE	482183	463865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_463999_467314_467387_468281_468354_470205_470353_472660_472798_475307_475418_478867_479069_481363_481482_482122
866745	contig_6205_pilon	-	764	4	Intergenic	novelGene_160342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.4142135623731	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	273	764	383721	307441	FALSE	20	CCACCTTCCCATACTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLPPSHKQHSAQHHPSITSLNRNSLTNRRNQSPAPPAALPAELQTTPESVQLQDSWVLGSNVPLESRHFLFKTGTGTTPLFSAATPGYTMASGSVYSPPTRPLPRNTLSRSAFKFRKSSKYCSWKCTALCAVGVSVLLAILLSYFIAMHLFGLNWQLQQTENDTFENGKVNSDTMPTNTVSLPSGDNGKLGGFTQENNTIDSGELDIGRRAIQEIPPGIFWRSQLFIDQPQFLKFNISLQKDALIGVYGRKGL	428789	307440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_-_307638_337580_337704_383549_383789_428584
866746	contig_10446_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_162522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATAAAAAAGAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263456	1264000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1263500_1264000
866747	contig_7644_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_64268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGATCAGGTAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243657	243343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_243300_243700
866750	contig_366_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_51607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGGAACTAACCACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804259	803748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_803700_804300
866751	contig_6442_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_166475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCAGTAAGACATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27227	27590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_27200_27600
866752	contig_10371_pilon	-	609	7	Intergenic	novelGene_175474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	37.1827319538997	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	16	609	680030	658115	FALSE	10	CTGGGTGAGCGGCGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATFPMSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGNTNSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRSKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHALLYGTNPLNRQKLDSQKLLGSLSSVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSSGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPRTPCRGEHAHGLLLLQLSGHRSQAPPAEAERQQDSHRG	680045	658114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_658199_661146_661204_664605_664714_668895_668943_675387_675509_679001_679136_679987
866753	contig_6159_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_128261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACACAAGTAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261970	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_261500_262000
866754	contig_7450_pilon	+	451	3	Intergenic	novelGene_177694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTGGGGTAGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396294	399395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7450_pilon_+_396473_398072_398271_399320
866755	contig_10642_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_78752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTATTAGCATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433211	1433548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1433200_1433500
866756	contig_4151_pilon	+	678	3	Intergenic	novelGene_65213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGAACCAGTTAACTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363586	392894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_364108_383758_383883_392861
866757	contig_7839_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_45688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTAAGGGATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154802	155239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_154800_155200
866758	contig_12019_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_87780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726790	727139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_726800_727100
866759	contig_4782_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_73633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTTCTATTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278652	278209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_278200_278700
866760	contig_2854_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_120881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099576	1099982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1099600_1100000
866761	contig_9875_pilon	-	755	5	Intergenic	novelGene_154416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	37.2692903071684	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	274	492	292424	280409	TRUE	65	ACTGGAAAAAGAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAVQYLTDRQLEELVELTPDNDIKDYEDLQAAISFLIETGTLLHFPDTSHGLRNLYFLDPIWLSECLQRIFNIKGSRSVAKNGVIRAEDLRMLLVGTGFTQQTEEQYFQFLAKFEIALPVANDSSPVPFDVFQLPPAAPPSLQARPGHPQHAASHGQHHQEGV	293506	276147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_276168_277433_277598_280329_280530_292326_292604_293412
866762	contig_9863_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_153994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTTAAAACTAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27583	28067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_27600_28100
866764	contig_6958_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_69961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGCTGGAGCCTCAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207708	208174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_207700_208200
866765	contig_12864_pilon	+	213	1	Intergenic	novelGene_76359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATGCAAAAAAGAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139418	139631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_139400_139600
866766	contig_1244_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_38058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACAAAAAAGGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065244	1064655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1064700_1065200
866767	contig_17108_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_109557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAATAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450385	450699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_450400_450700
866768	contig_5623_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_154882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344886	345343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_344900_345300
866769	contig_6556_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_168490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCCACAGTGGCTCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305042	305386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_305000_305400
866771	contig_10197_pilon	+	568	5	Intergenic	novelGene_115201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	14	421	665402	680780	TRUE	50	AAACATAAAATACCATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRAMADTIFSSGNDQWVCPNDRQLALRAKLQTGWSVHTYQTEKQRRSQCLKPAEVEAILQVIQRAERLDIMEQQRIGRLVERLETMRRNVMGNGFSQCLLCGEVLGLLGSSSVFCRDCRKQAGDLVLPWAGRRSPLSF	665388	681018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_665479_668419_668564_675600_675731_680723_680823_680913
866772	contig_6299_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_172930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433163	433523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_433200_433500
866773	contig_10074_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_57130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAAAATCGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353667	353158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_353200_353700
866774	contig_7171_pilon	-	359	3	Intergenic	novelGene_101308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.5	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTAGCCTCTGCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075818	1057630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1057764_1075416_1075482_1075657
866775	contig_9345_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_24438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCTAAAGAAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355686	355385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_355400_355700
866776	contig_17198_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_62417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTAATAAAAATTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121440	1120797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1120800_1121400
866777	contig_1545_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_149738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGCAATTCTGAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100452	99889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1545_pilon_-_99900_100500
866778	contig_2487_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_148465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTGGGGAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144087	143557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_143600_144100
866779	contig_7644_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_64227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTCCACGTCACTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76177	75634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_75600_76200
866780	contig_835_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_152177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACCAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492356	491902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_491900_492400
866781	contig_9114_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_155182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGAAAAGAGAAGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104194	104671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_+_104200_104700
866782	contig_13300_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_125752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	21587	21946	NA	80	CTCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTTSPHHRPGTNRHQGYRNAHSTGLPTGEVGRRTIPTGTHYCNVRHWKTLTSARYLNPDTNDNPSQEISPLSSQRQPNSHSQRARGNRQQSLTSGFHEPVKCQEKKTREQRVAKFLLC	21584	22006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_21600_22000
866783	contig_11448_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_66429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAGGAAGAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601910	601394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_601400_601900
866786	contig_6876_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_147017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCCCCGCACCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82226	81740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_81700_82200
866787	contig_16535_pilon	-	405	3	Intergenic	novelGene_167701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	229	354	207461	206851	FALSE	10	CCCTGTGGGCAGAGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLLQCLQHLLGDHGHPPQEVIVLTRIHGQVKEQRGLVCGQRGRGVTGWVCCCIAVGRALGEEVSLVLPTPHGEDPMDLIWVGRVEEDRLPGALACAQQHGAEVKAIQGDVGQWGLG	207781	206799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_206924_207408_207513_207604
866788	contig_15327_pilon	+	743	1	Intergenic	novelGene_70785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGGTGAAATGACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169162	1169905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1169200_1169900
866789	contig_1154_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_87066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166097	165742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_165700_166100
866790	contig_2487_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_148449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGGAAAACGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102574	102266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_102300_102600
866791	contig_10864_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_107102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAGTTTGTAAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012454	1012959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1012500_1013000
866792	contig_4469_pilon	+	367	3	Intergenic	novelGene_21929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAATTGAGTGGTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612294	707961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_612345_616121_616324_707846
866793	contig_5988_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_16121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGGAAGTCATGTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299706	1299234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1299200_1299700
866794	contig_299_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_129464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGTTTCCCTCTTGCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1036814	1036310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1036300_1036800
866796	contig_2278_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_118135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	94	351	1048523	1048266	NA	75	AGATACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQSDPAHPSLGSPCQWFLIFVALRRKRALSMDLAAVSRIGTVANASVCALVVGVVLVQYKFTLKRKIQLKSKILEMVSAEGQRPGARKDHCPHVGLKIQGLWHLNLSCLEKALEH	1048616	1048221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1048200_1048600
866797	contig_4847_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_156142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTCCTGAAGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11094	11599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_11100_11600
866798	contig_9373_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_162719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAAAAGCTGTTTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196351	195824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_195800_196400
866799	contig_15185_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_99403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGGAGGAGTGGAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184193	183901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_183900_184200
866800	contig_12790_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_35298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577190	576900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_576900_577200
866801	contig_7902_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_175851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTCACTGACAGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102128	102513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7902_pilon_+_102100_102500
866803	contig_5201_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_82181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGAGGAAGATGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296161	296647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_296200_296600
866804	contig_2043_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_169919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTCTGTACCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733505	733799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_733500_733800
866805	contig_5429_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_127819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596709	597168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_596700_597200
866806	contig_12119_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_88664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308030	307606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_307600_308000
866807	contig_2100_pilon	+	549	1	Intergenic	novelGene_50628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870836	871385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_870800_871400
866808	contig_7870_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_109086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATTAATAGAGCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803601	804258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_803600_804300
866809	contig_12078_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_74123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTGAAAATAAATGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503314	502895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_502900_503300
866810	contig_938_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_143921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCATTTAAAAGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128804	129107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_128800_129100
866811	contig_16666_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_61808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAATCTGGCCTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214951	215249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_215000_215200
866813	contig_14450_pilon	+	155	1	Intergenic	novelGene_49071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAATGCAGCAGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502012	1502167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1502000_1502200
866814	contig_6208_pilon	-	372	3	Intergenic	novelGene_53050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	132	241	372	586570	582296	FALSE	30	CAGAAATACGCCCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLQVSDYSWQQTETAVFLSVPLRGVCVRDADVFCTDSYLKVNCPPFLFEVFLYAPIDDESSKAKIGDDAIVFTLYKKEAAMWENLSISGVDKEMMQRIREESVLRAQETARGATEAKAAAKRED	587150	582295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_582400_586542_586691_587030
866815	contig_5317_pilon	-	292	1	Intergenic	novelGene_76640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAGAAAAATAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965786	965494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_965500_965800
866816	contig_12919_pilon	+	539	5	Intergenic	novelGene_75873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.92028643696715	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	16	522	428764	431648	FALSE	25	AGAATGCTTTGCTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKGKMIGALSINDDPKMRHSLQTARNQSDRLYKENYEKTKAKSVNYCETPKYQLDTLLKNFGENKYKDSYVKNILGHYVGSFEDPYQIHCRNVSAQNSDKNYKAEYEEDKGKCYFPQTITQEYEAIKKLDQCKDRTYKVHPDKTKFTAVADSPVLLQAQLNTKQLSDVSVLI	428748	431665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_428839_430010_430113_430206_430315_430404_430510_431531
866817	contig_3825_pilon	+	576	1	Intergenic	novelGene_78032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTCGGTTTATGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924227	1924803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1924200_1924800
866819	contig_13977_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_80957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGTATAAGTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194355	193696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_-_193700_194400
866820	contig_7272_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_25279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACCAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269604	269003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_269000_269600
866821	contig_5758_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_119051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAGATGAATAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32710	32136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_32100_32700
866822	contig_8671_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_126286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898395	897543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_897500_898400
866823	scaffold_15568_pilon	+	214	1	Intergenic	novelGene_122588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTAACAAATAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124106	124320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_124100_124300
866824	contig_6375_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_72970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGGAGAGGCACAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221097	220821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_220800_221100
866826	contig_6576_pilon	-	352	3	Intergenic	novelGene_42292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	54	350	370327	360694	FALSE	15	CTTCTGGAACATCTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFAVDELLSHPARLWQRMKLKGLQKNWSGMKCQFKLLRMAVALICMSMEFGRAVWLRFHPSAYPPCPHPSFVAHLGGVAVGITLGVVVLRNYEQRLQDQSLWWIFVAMYAIFVLFA	370380	360691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_360906_363913_363975_370303
866827	contig_6599_pilon	+	192	1	Intergenic	novelGene_176000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGGAGGGGAGAGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262526	262718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_262500_262700
866830	contig_11126_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_138134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTAGGCCACTTGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687417	687773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_687400_687800
866831	contig_8461_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_163938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAGTCTATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519795	520339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_519800_520300
866832	contig_12644_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_44570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGGGCAAGGCATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2013024	2013403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2013000_2013400
866833	contig_5480_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_107219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCTCAGAACAACGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54237	54610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_54200_54600
866834	contig_4892_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_162856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGCATTGCCTTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61594	61252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4892_pilon_-_61300_61600
866835	contig_9653_pilon	+	337	2	Intergenic	novelGene_48181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAATACCCCAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171560	173005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_171609_172716
866836	contig_2894_pilon	+	529	1	Intergenic	novelGene_86561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGGGGCGGTCAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389277	389806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_389300_389800
866837	contig_2215_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_163841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTTTTTCATTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117862	118222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_117900_118200
866838	contig_7513_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_88969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCGCTTTCCAGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234527	234863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_234500_234900
866840	contig_7056_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_43729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTAGCAGTGCAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015398	1014889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1014900_1015400
866841	contig_4125_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_25035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAAAGAATTAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62048	61626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_61600_62000
866842	contig_9839_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_88472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTGGAAACAGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35926	36302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_35900_36300
866845	contig_11171_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_48577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAAACCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76211	76682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_76200_76700
866846	contig_3627_pilon	-	504	1	Intergenic	novelGene_78584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTCTTTAATCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325166	1324662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_1324700_1325200
866847	contig_9835_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_166488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGCGGAACAGATCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11481	11101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9835_pilon_-_11100_11500
866848	contig_2414_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_158485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGAGCGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277372	277957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_277400_278000
866850	contig_8303_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_154926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103665	104371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_103700_104400
866851	contig_9721_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_155987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGCAGCAGCTGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314860	314319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_314300_314900
866856	contig_7695_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_41696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185938	1186179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1185900_1186200
866858	contig_3533_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_176536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCTAACAACTGGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384876	384151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3533_pilon_-_384200_384900
866859	contig_12512_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_24191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCATTCTTGACTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600134	600523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_600100_600500
866860	contig_19145_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_164145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGCACTGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211120	210796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_210800_211100
866861	contig_3018_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_78934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAGACCTAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662948	663359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_662900_663400
866863	contig_1339_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_163118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	54	512	333093	333551	NA	15	GGAGCCTGGATTCCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDGGSWSLLGVAFQSHTSALFRRVRSFLSHLNPALEMRLGAGAPRLPKHKRCLLGAPGVGAPGSSPRPPSARSTPLPGPPGSPRSSGGTPLHSPLHTPRASPTGTPGTTPPPQPGWWRWGSRLEESSQLYPQQLLGLPSLSPAQDAGYAVF	333039	333609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_333000_333600
866864	contig_11098_pilon	-	395	1	Intergenic	novelGene_166681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACAAAAACATGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45996	45601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_-_45600_46000
866866	contig_2924_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_140279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTAGTTCTTGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264157	264599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_264200_264600
866867	contig_665_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_158186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGCAAATTAGTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78869	78486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_78500_78900
866869	contig_13048_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_138929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTTTTAATCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462284	462702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_462300_462700
866870	contig_11629_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_161187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGGAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149575	148796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_-_148800_149600
866872	contig_12312_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_64033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAACAAAAGTTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622951	622427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_622400_623000
866873	scaffold_19766_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_34303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGACCTTGAGCAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548267	548680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_548300_548700
866875	contig_14094_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_145904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTACAGCCTGTAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201232	184432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_-_184539_200997
866876	contig_5728_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_126711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGTCCACATGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372925	372572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_372600_372900
866877	contig_9724_pilon	+	225	2	Intergenic	novelGene_172578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATGATTATATTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8710	10624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_+_8833_10521
866878	contig_9375_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_136049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171225	171678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_171200_171700
866879	contig_7272_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_25290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCTACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338956	339309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_339000_339300
866881	contig_5482_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_144490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGACATGAGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520214	519542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_519500_520200
866882	contig_13932_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_168861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5122	4827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13932_pilon_-_4800_5100
866884	contig_13528_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_66879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42832	43409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_42800_43400
866886	contig_11016_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_163291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTATGGATATGGAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127930	128423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_127900_128400
866887	contig_10489_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_165639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAATTTTTGCTGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554110	553713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_553700_554100
866889	contig_12969_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_61675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAATAGAAGAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394709	395104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_394700_395100
866890	contig_8520_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_85461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTCAAGAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370483	370163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_370200_370500
866892	contig_8866_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_77791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAGCTCTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370912	371644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_370900_371600
866893	contig_14333_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_49079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAGGAAAATAGAAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245094	245689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_245100_245700
866895	contig_11552_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_171665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATAAATCAAAATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20523	21077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_20500_21100
866897	contig_5539_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_104751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGAAGCTAAGAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49284	49660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_49300_49700
866898	contig_2455_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_119202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAACAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846507	846774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_846500_846800
866899	contig_7019_pilon	-	428	2	Intergenic	novelGene_149469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211724	1204401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1204656_1211550
866900	contig_7707_pilon	+	569	1	Intergenic	novelGene_72234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACCCAGCAGTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128590	1129159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1128600_1129200
866901	contig_12689_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_145037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGGAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58632	59309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_58600_59300
866902	contig_11250_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_127166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233309	232993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_233000_233300
866903	contig_5264_pilon	+	704	1	Intergenic	novelGene_165056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGAGGAAACATTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124345	125049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_124300_125000
866904	contig_4232_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_63155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24331	23798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_23800_24300
866905	contig_11978_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_62921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAATATTTGTTCCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860843	861083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860800_861100
866906	contig_9738_pilon	+	203	1	Intergenic	novelGene_169257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCCATCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29150	29353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_29200_29400
866907	contig_11986_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_69122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGAATATAAAGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123006	123296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_123000_123300
866908	contig_6552_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_163582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAATAAAGTCCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50694	50205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_50200_50700
866909	contig_8712_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_58888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184450	1183694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1183700_1184400
866911	contig_3942_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_128875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	128	307	1498256	1498077	NA	5	TGTCTGAGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREGGREGEGLHRVQPPRALHSRYRSDLAPPWGSSSCTQTASMQQTAWVRRSLCVPAAKHSPFGDKSQKGGHTDISFSSQTTYPVSEGRLSTEPSAALSLD	1498383	1497656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1497700_1498400
866912	contig_8357_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_39718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATACCGCGGAGGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478888	478317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_478300_478900
866914	contig_9008_pilon	+	613	1	Intergenic	novelGene_58617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTACTTAAGCCTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82403	83016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_82400_83000
866915	contig_11873_pilon	-	407	4	Intergenic	novelGene_175440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.09901951359278	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGATAACCTGTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332461	264129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11873_pilon_-_264274_278960_279101_318065_318115_332387
866916	contig_7165_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_116860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGTTTTACAATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388445	388010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_388000_388400
866917	contig_15952_pilon	-	272	2	Intergenic	novelGene_154044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTCTCTGGCTCTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93791	93274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_93464_93708
866918	contig_10777_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_101175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAAACCAAACATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55793	56185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_55800_56200
866920	contig_5300_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_144243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAAGTTTATCTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43539	43830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_+_43500_43800
866921	contig_5389_pilon	-	512	1	Intergenic	novelGene_143041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAACCCTGTACCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061503	1060991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_1061000_1061500
866922	contig_6805_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_163894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAGTGAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425465	425952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6805_pilon_+_425500_426000
866924	contig_10225_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_86877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCCTTTAGTCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96129	95701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_95700_96100
866925	contig_10689_pilon	-	516	1	Intergenic	novelGene_118604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTATTGTATACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34491	33975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_-_34000_34500
866928	contig_6837_pilon	-	208	2	Intergenic	novelGene_149806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTGGGAAAAAGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11186	10757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_10833_11053
866929	contig_5039_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_64970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAGAGTTGGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1669359	1668872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1668900_1669400
866930	contig_1594_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_138800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGTGTTTGTTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256397	256759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_256400_256800
866931	contig_5832_pilon	+	501	1	Intergenic	novelGene_134185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCATGCTGTGGGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602730	603231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_602700_603200
866933	contig_8978_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_49431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCTAAAGATGAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521434	522186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_521400_522200
866934	contig_1575_pilon	+	338	1	Intergenic	novelGene_45179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTCAACCTTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147295	147633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_147300_147600
866935	contig_10599_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_49889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATCTAAGTGTGTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166922	166331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_166300_166900
866936	contig_19743_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_173154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGTTTAAAGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222970	222606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_222600_223000
866938	contig_3942_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_128670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298327	298070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_298100_298300
866939	contig_5253_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_61579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAGAACACAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279297	278681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_278700_279300
866941	contig_3789_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_79840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCAGGACTGGCCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409374	409024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_409000_409400
866942	contig_1093_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_139976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATCCATGGCCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107875	107167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_107200_107900
866944	contig_3956_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_14701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCCAAAAGCAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22811	23254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_22800_23300
866947	contig_8138_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_52397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATATGACTCATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11455	11883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_11500_11900
866948	contig_5485_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_37713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89743	90160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_89700_90200
866949	contig_12644_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_44545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGGAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504055	1503635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1503600_1504100
866950	contig_8658_pilon	-	567	5	Intergenic	novelGene_55831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	15.7876534038469	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	204	566	112821	93069	FALSE	15	ACGATGGATGGTTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVYIYKQIDQNWYEGEHHGRVGIFPCTYIELLPPAEKAQPKKLTPVQILEYGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPLVKAPMDYGDLPFSSSPSRSATASPQQPQAQQRRVTPDRSQTSQDLFSYQALYSYIPQNDDELELRDGDIVDVMEKC	113178	93067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_93163_96086_96146_110862_111058_112806_112933_113086
866951	contig_6373_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_178105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6086	6525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6373_pilon_+_6100_6500
866953	contig_5718_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_110326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGGTAACCATCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535406	535688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_535400_535700
866954	contig_5669_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_86049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGGATGATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119801	119360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_119400_119800
866955	contig_1143_pilon	+	435	1	Intergenic	novelGene_86641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGAAATGTCTGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1372328	1372763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1372300_1372800
866956	contig_6418_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_81139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTCTTTTCAATCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188254	188013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_188000_188300
866957	contig_3252_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_61514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCTGCAGAATATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662974	663410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_663000_663400
866958	contig_3241_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_146431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATATAAATTAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037650	1037894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_1037600_1037900
866959	contig_5758_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_119082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGACCCCTAAATCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150240	149516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_149500_150200
866960	contig_8580_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_156082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAAAGGTACACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195682	196034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8580_pilon_+_195700_196000
866961	contig_18999_pilon	-	539	3	Intergenic	novelGene_177321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	43	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAGGACTAGATTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24066	20803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18999_pilon_-_21072_23568_23713_23939
866964	contig_18414_pilon	-	293	2	Intergenic	novelGene_170010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGGACCAGGCTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78748	73929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_74130_78655
866965	contig_3679_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_112135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAGAAGTGAAAACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089021	1088504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1088500_1089000
866966	contig_14219_pilon	+	248	2	Intergenic	novelGene_54276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCGCAAGCAACATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208179	220442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_208345_220359
866967	contig_10861_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_39349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACATGCTGTTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515559	1515231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1515200_1515600
866968	contig_9468_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_59445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTTATGCAAAATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49213	49836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_49200_49800
866969	contig_11292_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_109464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447528	447019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_447000_447500
866970	contig_3754_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_146824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAATAGATATTAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130417	130204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_130200_130400
866971	contig_13607_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_170206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTAAGAAATGGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319232	319625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_319200_319600
866972	contig_6344_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_157125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384444	1384920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1384400_1384900
866977	contig_10838_pilon	-	223	1	Intergenic	novelGene_129168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTCCTGTTTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86976	86753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_86800_87000
866978	contig_11396_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_71390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	1191033	1190698	NA	35	CCTGAGGAACTTGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILRAAEGSPPSSPACTLLPVTPTELLPGLLQRVPQGTPVEQGPDQENVPELASNKNVVFCLSSEVAISLPGDWLPLFVFLSSGASRPGPASGEGGLGHSRLGPTRRCLPRT	1191033	1190446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1190400_1191000
866979	contig_16882_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_148226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAGCATCTACCATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316966	316335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_316300_317000
866980	contig_5300_pilon	-	499	1	Intergenic	novelGene_144233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTTCATATAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8243	7744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_7700_8200
866982	contig_2704_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_75296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATGAAAGAATTAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59480	59033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_59000_59500
866983	contig_10003_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_88221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAGTAAGAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566179	565669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_565700_566200
866984	contig_10930_pilon	-	715	4	Intergenic	novelGene_36959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.16024689946929	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	70	714	254144	246497	FALSE	20	TTGATATTTTTTCTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSHFPKYVALFALFVLSVGSTQSLDTFIAAVYEHAVILPNSTETPVSKGDAVRLMNKNIDVLEKAVKLAAKQGAHIIVTPEDGIYGWVFTRETIYPYLEDIPDPKVNWIPCRDPQRFGHAPVQERLSCLAKDNSIYIVANIGDKKPCNASDPQCPADGRYQYNTNVVFDSEGKLVARYHKYNLFAPEIQFDFPKDSEVVTFETPFGKFGIFTC	254213	246495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_246596_248642_248836_253699_253831_253922
866985	contig_9937_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_129208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCCCGGCGGTGACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145505	145736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_145500_145700
866986	contig_10393_pilon	+	600	1	Intergenic	novelGene_178106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTATGTTTGTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67	667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10393_pilon_+_100_700
866987	contig_5718_pilon	-	250	1	Intergenic	novelGene_110322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGGCCTTGGGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502348	502098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_502100_502300
866989	contig_6228_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_164493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCAAAAGAGAAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194243	194698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_194200_194700
866990	contig_8673_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_129931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAACAAATGGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326932	326500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_326500_326900
866991	contig_1244_pilon	-	379	4	Intergenic	novelGene_38059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_3	25.5734237050888	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	143	379	1086855	1079473	FALSE	30	CTTACAACTTTGGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKQDTDTNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKS	1086997	1079472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1079497_1080232_1080311_1086127_1086240_1086832
866992	contig_6954_pilon	+	706	6	Intergenic	novelGene_64427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	72.2301875949384	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	29	706	183354	192809	FALSE	20	ATTCCCCGGCTCCTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IERATNQDWMLRVKWLYHLAKNIPQGLESIQIHLEASAASLRNFYSNSLSAGVSNVIKILQPNITDEFVVPLDPRWNIQALDIIRNSMDFDPQTDQSEQLFTLLESVANKTVIYLDREKRIFTEANLVSVGGKKLRNSVLRMSFEFHKDPESYQSLPHEIVVNLAAFFELCDALILLWVQSSQGMVSDASVNEILGSVRWRDRFWTVADTVKVDAPGLALLALHWHWLLKHLVHQ	183325	192809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_183409_184267_184382_186048_186182_187384_187501_189820_189955_192683
866995	contig_8978_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_49318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCTGAAGAATCCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189561	188947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_188900_189600
866997	contig_15123_pilon	+	559	4	Intergenic	novelGene_110946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	95	388	704530	711586	FALSE	30	CAAAAGGGTATCCTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSTPHQPARIPRRGGPTAEHSPPGHARPPATMLSSKRLGLSRLTLALSLLVCLSALIEAYPSKPDNPGEDAPAEDLARYYSALRHYINLITRQRYGKRSSPETLISDLLMRESTENVPRTRLEDPSMW	703290	711757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_703385_704529_704718_709377_709459_711561
866999	contig_2168_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_147262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGGAGATTAAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238801	238357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_-_238400_238800
867001	contig_7657_pilon	+	337	3	Intergenic	novelGene_29995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCCTTATTTTATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10193	14142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_10331_11048_11155_14048
867004	contig_10793_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_83447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGATAAAAACCAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173548	173987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_173500_174000
867005	contig_4686_pilon	+	320	2	Intergenic	novelGene_118582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCCAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770215	770732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_770336_770532
867006	contig_6842_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_130796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAAGCATTGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499957	1500481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1500000_1500500
867007	contig_12414_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_59672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACTAATATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873877	874440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_873900_874400
867008	contig_14618_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_136845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAACTTCTCATGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234687	1235102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1234700_1235100
867009	contig_7279_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_145991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATGAATAAAAACCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101186	101416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_101200_101400
867010	contig_6027_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_74459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTTTTTATCTGGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342510	342032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_342000_342500
867011	contig_11896_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_87996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	96	617	75887	75366	NA	15	GTTGTCTCCCACATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLEGQRGPPSSPGDSPQRIPAASRAQLRERMGNGIPVDRVLKARGDGHAPPANPLQACPCDLPLEEGQNHKVQAAERERVPALSVASSFAHPTPALANMVGTPTSVGGFRLPTLPGLKSGRLELAWGLLCSPPPPSLSFVRWWPAVPRETMVTVRRRNLRLRSRGEGWPDCTRSGAPALLPSPRVPSSARLRILRKDRNVGGK	75982	75311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_75300_76000
867012	contig_19098_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_65778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCCACTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44726	44086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_44100_44700
867013	contig_563_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_169766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATAAAAATATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698884	698415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_698400_698900
867016	contig_11258_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_67757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103374	103940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_103400_103900
867017	contig_5797_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_56930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGCAAAAAAAAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228039	227430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_227400_228000
867018	contig_8330_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_71778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCACCCTGAATTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822281	808608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_808679_822043
867019	contig_854_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_36762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	6	299	1756383	1756676	NA	45	TCCAACCCTTCTACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMKQDPYLTLYTNTNSKWIKDLNIKPKTTKIIKETTGSTLETLTHGINRIQTITTNIQTPEDKLDNWNLLKIIHLCSSKAFIKKSKKRTYRLVKNFGL	1756377	1756717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1756400_1756700
867021	contig_14157_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_171781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAATTGGGCACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285098	285663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_+_285100_285700
867022	contig_18850_pilon	-	626	1	Intergenic	novelGene_142412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTGACTTTCTGCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171594	170968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_171000_171600
867023	contig_4232_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_63257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTTCTCCTTGGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394100	394575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_394100_394600
867024	contig_1442_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_172159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAATGTCTGCTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429438	428871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_428900_429400
867025	contig_8729_pilon	-	335	2	Intergenic	novelGene_40127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTCCCCTCCCTCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566856	530342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_530412_566590
867026	contig_8269_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_106237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAATCAAAAAAAATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314390	314934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_314400_314900
867027	contig_16724_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_105328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAGAAAGAAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564463	564158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_564200_564500
867030	contig_2933_pilon	+	449	4	Intergenic	novelGene_111346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGGTCGAGCTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793775	795493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_793835_794417_794498_794611_794772_795343
867031	contig_18272_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_7099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCAGGATGAGGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542725	543113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_542700_543100
867032	contig_5485_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_37756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAATGAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470291	470072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_470100_470300
867033	contig_5005_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_84326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCTTTTAAGACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525308	525552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_525300_525600
867034	contig_7182_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_117129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAAAATAAAGGCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870119	870410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_870100_870400
867035	contig_16883_pilon	-	474	2	Intergenic	novelGene_161724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGCGGGGATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204543	196070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_196359_204357
867037	contig_9027_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_156361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACCTCTAAAAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127266	126897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_126900_127300
867038	contig_6424_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_109275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACATATTGTCTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94823	95235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_94800_95200
867039	contig_12327_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_140663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTCCCGGGTTGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086760	1087109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1086800_1087100
867040	contig_13780_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_149029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACATTTAACTACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472767	472209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_472200_472800
867041	contig_11337_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_107187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCCTAATAACTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175744	176087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_175700_176100
867044	contig_5145_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_131409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753230	753522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_753200_753500
867045	contig_3472_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_166937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCTCCAGCATGTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693222	692868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_692900_693200
867047	contig_1339_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_163121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATTTGTATCCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341498	341053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_341100_341500
867048	contig_9727_pilon	-	171	1	Intergenic	novelGene_86296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATAAAGCTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245070	244899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_244900_245100
867050	contig_8820_pilon	-	406	2	Intergenic	novelGene_79321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCGTCTCCCAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321231	320739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_321035_321120
867052	contig_15047_pilon	+	292	2	Intergenic	novelGene_52290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAAAAATGGAGCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93529	96359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_93583_96120
867054	contig_11417_pilon	+	445	3	Intergenic	novelGene_103338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_1	9	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	59	322	616754	677591	FALSE	35	AAACTAGAAGCATCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIALHTQRQAEETRAFEQLMTDLTLSRVQFQKLQQLRLTQYHGGSLPNVNQLRSSASEFQPSFHQADNIRGTRHHGLVERHTRNRFHPLHRRSGDKPGRQISFFTV	616695	677714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_616778_625120_625220_677450
867055	contig_8865_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_164473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAAACATACAGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532110	532409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_532100_532400
867056	contig_17493_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_122203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTTCATTTTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159514	159888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_+_159500_159900
867058	contig_4470_pilon	-	474	2	Intergenic	novelGene_171780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCAAGCCGGCAGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288050	284236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_-_284638_287977
867059	contig_20429_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_169256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAATAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167240	166996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_167000_167200
867060	contig_12079_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_67355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTAAGAAGGGAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140121	139600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_139600_140100
867062	contig_8354_pilon	-	472	1	Intergenic	novelGene_24065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGGAGCTGGTTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31941	31469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_31500_31900
867063	contig_5794_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_69756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTTAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695124	694515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_694500_695100
867067	contig_10158_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_150777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAGCAAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140435	139870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_139900_140400
867068	contig_17829_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_157023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAGAAATTTTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17345	17779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_17300_17800
867070	contig_8328_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_174045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCAGCAAAAACAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122740	123226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_+_122700_123200
867071	contig_19744_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_120367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGTAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118211	117763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_117800_118200
867072	contig_2867_pilon	+	770	2	Intergenic	novelGene_135148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACTTTAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81921	83608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_82208_83124
867073	contig_18473_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_169644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAGAACAATTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45416	45858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_45400_45900
867074	contig_2414_pilon	+	515	2	Intergenic	novelGene_158524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAACAAAAAAACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980352	1005011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_980447_1004590
867075	contig_6191_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_107871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591575	592080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_591600_592100
867076	contig_11780_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_134308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGAATAATTTCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122390	121824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_-_121800_122400
867077	contig_10437_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_38233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319081	319572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_319100_319600
867080	contig_10197_pilon	+	348	1	Intergenic	novelGene_115187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485510	485858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_485500_485900
867081	contig_13379_pilon	-	434	2	Intergenic	novelGene_175870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	86	433	120918	120571	FALSE	15	TGATCCATTGAGTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALHLPPRTPAGTAALSCRAPDPRDPTRVMEYMSTGSDHKEEIDLLIQHFNVSDVIDMMENLYTSEEPAVFDPGLMAVCPCANENEERSESLLLGAQEVPWLSSVRYGTVEDLLAFANRISNTAKHFYGHRPQESGILLNMVRYF	124591	120569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_120942_124529
867082	contig_13625_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_150169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCCAAATCATTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43128	42670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_42700_43100
867083	contig_3068_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_137619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAGCCAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230409	229878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_229900_230400
867084	contig_13744_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_77173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAGCAAAATAAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514332	514764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_514300_514800
867085	contig_14101_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_122753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTTCTTTGCTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76079	75764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_75800_76100
867086	contig_3015_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_163313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAATGTACTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160824	160505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_160500_160800
867087	contig_20634_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_173426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTCATCTCTTTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179314	178926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20634_pilon_-_178900_179300
867088	contig_7457_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_31526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGGGTCCCGATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705892	705528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_705500_705900
867090	contig_8552_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_80101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGGTAATGACCATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543510	543877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_543500_543900
867091	contig_10404_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_138718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTAAGAATACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270395	1269870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1269900_1270400
867092	contig_6576_pilon	-	202	1	Intergenic	novelGene_42444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGTCCAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303330	1303128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303100_1303300
867093	contig_5669_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_86038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAATAACTAGTTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18722	18212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_18200_18700
867097	contig_10734_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_51271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCCTCTGTGTCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324317	1324902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1324300_1324900
867098	contig_5153_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_74351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGGGTAATTGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947872	948315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_947900_948300
867099	contig_14829_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_163824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161702	162032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_161700_162000
867100	contig_19416_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_175522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGACTTCATCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15787	15035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_-_15000_15800
867103	contig_9646_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_117485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAACTATTGCAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532812	532213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_532200_532800
867104	contig_13697_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_165926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGACGTGTCTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238027	237574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_237600_238000
867105	contig_12454_pilon	-	222	2	Intergenic	novelGene_171734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAATCTGCTCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104727	104417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12454_pilon_-_104586_104673
867106	contig_11335_pilon	-	287	2	Intergenic	novelGene_104944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTGTTAAATTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459279	455472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_455601_459120
867107	contig_5033_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_28891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGTCAAACACAGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419648	420244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_419600_420200
867108	contig_6364_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_51795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382279	1381863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1381900_1382300
867109	contig_8541_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_105594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTCTGGTAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577420	577717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_+_577400_577700
867112	contig_5639_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_178107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTTTTTAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231090	230728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5639_pilon_-_230700_231100
867113	contig_116_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_154885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCTCCACACAGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18917	18515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_18500_18900
867114	contig_8020_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_114414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTGCCTTGCAGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207929	207349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_207300_207900
867115	contig_5324_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_102060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACGATGAGAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440200	439742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_439700_440200
867116	contig_11498_pilon	+	542	2	Intergenic	novelGene_65490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	18125	20200	FALSE	5	CGAGTTTTTCTTGGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSLGYEGERGLQKDRLLKQGPWFRAHGFCAASGLYLAVDLPLKFQGKPTTAIIVTGEGSSTNHARAGAARAREWSRGTDLSGERGAQSCPRAGGGRGTGPGPQCRARCWHRCDSRRPGQWTQGTSWRRVRP	18124	20343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_18312_19988
867117	contig_13292_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_142948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATATCTTTAAGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293885	294304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_293900_294300
867118	contig_12967_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_169794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAGAACGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14237	13696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_-_13700_14200
867119	contig_753_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_112918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGGTCAAGATTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328755	328170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_328200_328800
867120	contig_15293_pilon	-	449	1	Intergenic	novelGene_146544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142968	142519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_142500_143000
867121	contig_7342_pilon	+	603	1	Intergenic	novelGene_71189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	642277	642618	NA	40	AAACTAATCCCAGTCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPWRRAQATCDCGAQRGVGHCGGRSWPPRGDELQLRPKPGCPGAGGPVTPRFPGLCGVEAPRPRVSGGGFGRGVTAVEAAHSLAVRTPPRAAQRMGSGARGAARAAGRAPS	642275	642878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_642300_642900
867123	contig_3602_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_60625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAGAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937722	938257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_937700_938300
867124	contig_12920_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_166339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185945	186421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_185900_186400
867127	contig_13753_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_136507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	227	316	16456	16367	NA	20	GCGCAACGTATGGCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSPPLYFTRSTRERRPDRAIPLGGPRRSRAQTSPLPEGLRQIPAGDLGAAPPVPGVSVSAPCSDVSPRSGFLARMRGPGKRKRSGLGSWGKNSRLSFEEVSLV	16682	16173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_-_16200_16700
867128	contig_12292_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_166994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTGCTGGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214974	214672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_214700_215000
867130	contig_5649_pilon	-	303	1	Intergenic	novelGene_82430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAATCTAGTGTAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1444953	1444650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1444600_1445000
867131	contig_2854_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_120868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAGAAAACCCAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968177	967734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_967700_968200
867134	contig_6418_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_81149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTGACGCATCCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244025	244608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_244000_244600
867135	contig_9730_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_150630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGCTCCCTGATTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426509	426799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_426500_426800
867139	contig_2550_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_135657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCCAATTCCGACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007943	1008292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1007900_1008300
867140	contig_19558_pilon	+	383	1	Intergenic	novelGene_164752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTAACAGTAGTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167599	167982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_167600_168000
867141	contig_18244_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_177673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCAACTGTCTCTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156636	156987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18244_pilon_+_156600_157000
867142	contig_7119_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_40994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGGATGTGTGCTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155816	156256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_155800_156300
867143	contig_7870_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_108900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGGGGAGTAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181160	181784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_181200_181800
867145	contig_19908_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_167612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAGATTTCCCTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15385	15874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_+_15400_15900
867146	contig_11932_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_85395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	176	493	125041	124724	NA	35	CCAGATACACACTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTLRPADLPFSPEALVDRKEFWAVCRVPGPLHSGDILGLVVNADGELHLSHNGAAAGMQLCVDVSQPLWMLFSLHGAITQIRILGECLRRARQLTPTTPVRGPGTPTPEAGPHLPSSRPSIVPFLEAGRGAEGWGGGKKGDPHPPPQYIWPCQGFTDPESDF	125216	124629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_124600_125200
867147	contig_10324_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_7829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTACTGTATCCCATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263066	263457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_263100_263500
867148	contig_3386_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_34480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAGGTTATGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92291	92028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_92000_92300
867150	contig_5797_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_56910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATATTCATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82015	81714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_81700_82000
867151	contig_12042_pilon	-	499	2	Intergenic	novelGene_170447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCGCTCTGGGAGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242241	240390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_240493_241844
867152	contig_16103_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_118758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGGGGCGGGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436724	437067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_436700_437100
867153	contig_13456_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_153314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACTAACAGTAAGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594047	594531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_594000_594500
867154	contig_9554_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_170690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAGTAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124869	124497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_124500_124900
867155	contig_12644_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_44456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCGTTTGAGGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907529	907223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_907200_907500
867156	contig_9690_pilon	-	289	1	Intergenic	novelGene_178108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGGGGAAAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278834	278545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9690_pilon_-_278500_278800
867157	contig_6823_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_131244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCAGGCAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437617	438187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_437600_438200
867158	contig_7979_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_125549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGAAAAATGCTAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086872	1086391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1086400_1086900
867159	contig_11173_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_156894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATATATTAGGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74007	74964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_74069_74424
867160	contig_1939_pilon	-	618	1	Intergenic	novelGene_144872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTATCCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366450	365832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_365800_366400
867162	contig_17522_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_160820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAAACTTGGGGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97361	97032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_97000_97400
867163	contig_11590_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_125618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCCAACAGGCCAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096287	1096790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_1096300_1096800
867164	contig_2646_pilon	-	195	1	Intergenic	novelGene_69616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTAAGCTCACTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2039995	2039800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2039800_2040000
867165	contig_12793_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_164107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCCCAGTTATAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121974	121636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_121600_122000
867166	contig_8991_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_170938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAACAAAGGAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112703	112318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_-_112300_112700
867167	contig_9363_pilon	+	242	1	Intergenic	novelGene_6638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886017	886259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_886000_886300
867168	contig_14536_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_69293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGAGCACTGTTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89413	89024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_89000_89400
867169	contig_4364_pilon	-	450	5	Intergenic	novelGene_139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	28.2875856163088	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	8	436	1164003	1152547	FALSE	35	GTAGTTACAAACCAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKMAAPAGSGGSTVSVLAPNGRRHTVKVTPSTVLLQVLEDTCQRQDFNPCEYDLKFQRSVLDLSLQWRFANLPNNAKLEMVPAARSREGPENTVRVALQLADGVRLQDTFCAGQTLWELLSHFPQTRFALSGHFISGSPQVTNV	1164010	1152532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1152602_1158677_1158779_1159559_1159675_1162608_1162665_1163901
867170	contig_11396_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_71266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTGCTTTTCAGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195055	195539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_195100_195500
867171	contig_7230_pilon	-	272	2	Intergenic	novelGene_52564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1465	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGTAAAAAATGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177645	176946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_177012_177438
867172	contig_16714_pilon	+	489	1	Intergenic	novelGene_161584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTCCCTTTCCGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973062	973551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_973100_973600
867174	contig_14133_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_119974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGACCTGCTTAAATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231476	231924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_231500_231900
867175	contig_15897_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_49560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGATCCTCTCCTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727244	727838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_727200_727800
867176	contig_10444_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_139461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTCTAAGGCACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780618	780202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_780200_780600
867177	contig_3103_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_146215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGACTCTGGCATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476533	477375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_476500_477400
867178	contig_6496_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_103494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAAAAAGTTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466212	465705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_465700_466200
867180	contig_12145_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_172327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194357	193848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_193800_194400
867181	contig_6056_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_157884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGTTTAGATGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285457	285720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6056_pilon_+_285500_285700
867183	contig_11396_pilon	+	436	3	Intergenic	novelGene_71357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	13	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	89	436	567134	569966	FALSE	10	GCTGCGGGCGTGGGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPIEAPLRSHPSPRVRPQVVPAPHTPGRMGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIV	567045	569966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_567278_568857_569038_569942
867184	contig_9516_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_106210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGAGAAATGAAGAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467136	1466859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_1466900_1467100
867185	contig_11656_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_53983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGTAAATGCTACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226307	225869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_225900_226300
867187	contig_5832_pilon	+	459	1	Intergenic	novelGene_134120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCCTGTGCGAGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123799	124258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_123800_124300
867188	contig_19469_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_135003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACCCTGGTTTTAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304234	303696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_303700_304200
867193	contig_405_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_135300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTGGCTGTCAGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251480	252057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_251500_252100
867194	contig_3380_pilon	+	452	1	Intergenic	novelGene_60140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGAACTGCTTGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884866	885318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_884900_885300
867195	contig_10765_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_122939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	52	420	243671	243303	NA	40	GGAAATAGGACAGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNEDVSLYTVASSAWKMGVQEGVGREVMGQCVWLQGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLVSRDFPPGGLGRLLFLTKAVVSFLLAAEETSHSCFP	243722	243092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_243100_243700
867197	contig_1847_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_171725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATACATTAGGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49887	50390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_+_49900_50400
867198	contig_1813_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_105461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTCACTGTGTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18406	18802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_18400_18800
867200	contig_9727_pilon	-	279	2	Intergenic	novelGene_86262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAGAGGAATTGGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74216	73741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_74002_74197
867201	contig_4678_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_126005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGATGTCAATAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170336	170606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_170300_170600
867202	contig_7379_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_150014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATGGAAAGCAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436528	437414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_436500_437400
867203	contig_753_pilon	+	305	1	Intergenic	novelGene_112955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	273	31	303	1166339	1166611	NA	15	TTTTTGAGGCGGGGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVKRPKSSLMDGWSGKASLKWPLSVALKEIREHLHSEVGVNTQTRGNGLELPNTGQYCLLVSSKGSTAEDRDKEGFPKIIHRPFLDFKVWDFSFSFFFFF	1166308	1166613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1166300_1166600
867205	contig_5461_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_156847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCATAAACTGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892092	892421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_892100_892400
867206	contig_7389_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_171907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGGAGTGGGGCGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82525	83199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7389_pilon_+_82500_83200
867207	contig_10765_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_122908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAATGACAATCGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122123	122564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_122100_122600
867208	contig_5711_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_80291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224187	223920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_223900_224200
867209	contig_5965_pilon	-	403	1	Intergenic	novelGene_154662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAACCACCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199862	199459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_199500_199900
867211	contig_18284_pilon	+	673	4	Intergenic	novelGene_177326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	1.24721912892465	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	174	671	161613	190634	FALSE	35	AGGCACACCATGAGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWKRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNAEWEKLNLHSADWQRKIDEALERLQELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIVPLKENVNHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQ	142117	190636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18284_pilon_+_142252_161573_161695_162335_162605_190487
867212	contig_11378_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_112330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATTCTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235934	1235219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1235200_1235900
867213	contig_8671_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_126266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521761	522076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_521800_522100
867214	contig_7513_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_88998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	607180	606830	NA	30	CATCCTCAATCGCCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAPPPPGSRPAPRTRSRPGVDPRAWILGEVGGKEVEESSLVNNCRVNLRPAGPRERRSKRLQETAGARLEPRAGSLRRDVAGRAFQGRSWPALLTTPRPHAEPRTGCDHLGFAPT	607182	606638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_606600_607200
867215	contig_13379_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_175871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	203	526	120918	120595	FALSE	35	TATTAAATATGGTACGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYMSTGSDHKEEIDLLIQHFNVSDVIDMMENLYTSEEPAVFDPGLMAVCPCANENEERSESLLLGAQEVPWLSSVRYGTVEDLLAFANRISNTAKHFYGHRPQESGI	125092	120593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_120942_124913
867217	contig_17198_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_62338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533901	533625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_533600_533900
867218	contig_5338_pilon	-	705	2	Intergenic	novelGene_114567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTAGGGTCAAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355977	354710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_355267_355828
867219	contig_12464_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_68734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAGTTAAACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402319	401455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_401500_402300
867220	contig_12951_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_68155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAAAAATATATGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212787	213188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_212800_213200
867221	contig_3380_pilon	+	410	1	Intergenic	novelGene_60141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGATTGTTTAGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002063	1002473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_1002100_1002500
867222	contig_10482_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_152845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGGAAACCTCATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158061	158500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_158100_158500
867224	contig_20263_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_175834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGGTGGTGGTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48542	49286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20263_pilon_+_48500_49300
867226	contig_16098_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_46202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGAATCAGGCTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710756	711066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_710800_711100
867228	contig_13201_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_130891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCACGCACGCAATGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477679	477126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_477100_477700
867229	contig_6515_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_177994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCGTATCCTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436830	437182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_+_436800_437200
867231	contig_6069_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_8043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAAAACGGTCCGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352239	351826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_351800_352200
867232	contig_16382_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_160218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATCAAACCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51870	51521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_51500_51900
867233	contig_16620_pilon	-	256	1	Intergenic	novelGene_156007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAATAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41857	41601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_-_41600_41900
867234	contig_10371_pilon	+	400	1	Intergenic	novelGene_175494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAATTTGGGTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900014	900414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_9e+05_900400
867235	contig_4125_pilon	-	489	3	Intergenic	novelGene_25248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	7.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGAAGAAGAAGAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2996873	2990004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2990230_2996286_2996457_2996779
867236	contig_11978_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_62929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATGAAACTGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916092	915853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_915900_916100
867237	contig_11978_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_63137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1990620	1990919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1990600_1990900
867240	contig_16503_pilon	+	440	5	Intergenic	novelGene_162081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCACCCGCGCAGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471533	485599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_+_471583_471903_471960_472604_472764_473537_473637_485522
867241	contig_3825_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_78025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	53	382	1609241	1606046	FALSE	10	CTCAGGGCGACCCCGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SILASLGHSGLQVPGTRMERSQRWGLQGRLARPSEWPRSVGGWRDRWQLEGRLGQKDSASPEQTDGACTPRVVQLPVPEPCKPPALTLSGLRPPRLPWLRPSSARLTYLVKWNLMNDKNFLRTVMG	1609293	1605904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1606241_1609106
867242	contig_3942_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_128840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAGCCTAGAAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287006	1287542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1287000_1287500
867243	contig_5718_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_110425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCAATTTAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520762	1520200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1520200_1520800
867244	contig_5429_pilon	-	482	1	Intergenic	novelGene_127827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAAAAAAGGACTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609648	609166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_609200_609600
867246	contig_6325_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_143363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCTTTCTTTAGGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413586	412981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_413000_413600
867248	contig_7342_pilon	-	533	1	Intergenic	novelGene_71183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTTCTTAAGCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539542	539009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_539000_539500
867249	scaffold_13553_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_73748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGAGGGACTCAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16413	16732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_16400_16700
867251	contig_11068_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_130555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACAGTTTTAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572180	571862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_571900_572200
867253	contig_10674_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_6444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCTGCAACTAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227071	227347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_227100_227300
867256	contig_20722_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_178110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAATAACTTGTTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13411	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20722_pilon_+_13400_13800
867257	contig_960_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_108247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCAGACAAGAGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510327	510745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_510300_510700
867258	contig_5732_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_119606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTAAGAAAGTGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446057	446314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_446100_446300
867259	contig_1301_pilon	-	405	1	Intergenic	novelGene_47356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACTTTTTGTATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526724	526319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_526300_526700
867260	contig_12644_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_44562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTCTCAGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1991053	1990228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1990200_1991100
867264	contig_4125_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_25167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGACGGAATATAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929584	928962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_929000_929600
867265	contig_7457_pilon	+	225	4	Intergenic	novelGene_31316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	25.9529488797623	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGGTTGTCGTATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189513	195100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_189537_189996_190064_190243_190308_195029
867266	contig_10235_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_46599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGAAAGGGCTAGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595821	594698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_594840_595575
867267	contig_3818_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_99210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAATACGCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123095	122656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_122700_123100
867268	contig_15559_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_141893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	148328	148645	NA	35	TGGGTTGTGGTAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPNLVCTKALSITFSRNSNCAEFAQTAPSPETSSLTLQLTVEILSPGALPSPSLLSPGLCSGPSFAPKCSRPRCLPILHHSSVTTCPRTSPSPHHTATQAAIV	148325	149050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_148300_149000
867269	contig_8978_pilon	-	430	2	Intergenic	novelGene_49442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	1	429	1363610	1246974	FALSE	50	AAGGAAAAGAACCTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESALLDLLECPVCLERLDASAKVLPCQHTFCKRCLLGIVGSRNELRCPECRTLVGSSVEELPSNILLVRLLDGIKQRPWKPGPAGGSGTNCTSALRAPNSSVANCSSKDLPNSQGGQQPRVQAWSPPVRGIPQLPCAKALYNY	1363610	1246972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1247016_1363223
867270	contig_5779_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_106477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGTTGGAGTTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149004	148650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_148600_149000
867272	contig_8866_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_77839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCAGTATATTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615815	616435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_615800_616400
867275	contig_1712_pilon	+	218	2	Intergenic	novelGene_178111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATATGTAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141401	168898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1712_pilon_+_141428_168706
867277	contig_3386_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_34496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAACATGCCTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398396	398809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_398400_398800
867278	contig_10197_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_115259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTACCTCTGAAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066243	1066730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1066200_1066700
867280	contig_4131_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_127872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	217025	217342	NA	70	CAGAAAAAAAAAGAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCCLTLAPLAFFTLLLAAFLAPAVLGFLTFLVLGFFADFGSLDKTSFLVLPEADFFTLPLVGSKAAFLLSLKEPEAPVPLVCTRIPLLTKLLRPHLIRLLFFSTS	217023	217568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_217000_217600
867283	contig_6217_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_109645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAACAAGTTAAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714822	714390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_714400_714800
867284	contig_15498_pilon	+	546	2	Intergenic	novelGene_42629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAACATCCTGACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654048	658801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_654090_658296
867287	contig_13112_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_98837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAGTAGAAAAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401720	401448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_401400_401700
867288	contig_3068_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_137652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406840	406367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_406400_406800
867289	contig_16766_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_153372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	191948	192304	NA	45	CGAAATTTTCTGTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGGRSSRRGPGLTGLGSRFQLPAPPGDAGAAADGQGHSAGSCVNRFPSRDPPVSGESRLCSCAGPAGATAPERGGGELAAPSSLRLGLAGAGPAQVTTALRGGPGRWKLDCRGHERC	191946	192613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_191900_192600
867290	contig_11551_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_168463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGATGATTATGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359787	360264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_359800_360300
867291	contig_8242_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_80202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGAGGCTAAATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190810	191264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_190800_191300
867292	contig_11179_pilon	+	249	2	Intergenic	novelGene_178112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAATTTCAGCTTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40500	43747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11179_pilon_+_40549_43546
867294	contig_8581_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_22852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATACTCAGTAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345989	345443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_345400_346000
867297	contig_4125_pilon	+	262	1	Intergenic	novelGene_25193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAATTTGGAGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1377929	1378191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1377900_1378200
867299	contig_10940_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_49284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATGAAGCAATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906976	906576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_906600_907000
867300	contig_13481_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_119375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAAAGCTTGGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510582	510890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_510600_510900
867302	contig_10642_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_78760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACCACATCACGCGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487339	1487711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1487300_1487700
867303	contig_9955_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_21366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGTAGATAAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296754	297046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_296800_297000
867305	contig_10196_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_132171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAACCCCTGCCTGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050562	1050792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1050600_1050800
867306	contig_11005_pilon	+	321	2	Intergenic	novelGene_178113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	103	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACAGCTTTTCCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41531	43107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11005_pilon_+_41645_42899
867307	contig_4742_pilon	+	309	1	Intergenic	novelGene_131006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGGCTAGGTGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261232	261541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_261200_261500
867308	contig_5954_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_28492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCCGCATTGTCCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394819	393854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_394082_394692
867309	contig_7342_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_71175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCAGGGACATGATTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475645	475149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_475100_475600
867310	contig_10600_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_169877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCATATCCAAGTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330170	330843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_330200_330800
867311	contig_2733_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_128596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGTTGACCAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913363	913754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_913400_913800
867312	contig_4350_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_136388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTTAAAGCATTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280809	279965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_280000_280800
867313	contig_6593_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_49830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAGAAAATAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182287	182062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_182100_182300
867315	contig_10299_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_79730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAGAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346221	346573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_346200_346600
867316	contig_5003_pilon	+	591	1	Intergenic	novelGene_120199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTGCTCCAGTGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87962	88553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_88000_88600
867317	contig_8396_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_177622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8954	9338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8396_pilon_+_9000_9300
867318	contig_3787_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_102362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359920	359570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_359600_359900
867319	contig_10864_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_107139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAACGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1613307	1612705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1612700_1613300
867320	contig_5201_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_82169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGTGATGCAATTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209274	209736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_209300_209700
867321	contig_11378_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_112308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAACAAGGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083501	1083965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1083500_1084000
867322	contig_6227_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_49786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAGGTAGTTTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245742	1245201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1245200_1245700
867323	contig_15087_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_37123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTTTGGGCAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33416	33074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33100_33400
867324	contig_20614_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_107607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGGTCCTCATCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452659	453038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_452700_453000
867325	contig_2768_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_57477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGTCGCAAAACGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655618	655913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_655600_655900
867326	contig_8616_pilon	-	313	2	Intergenic	novelGene_72410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAATGAGAACACTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239373	238904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_239169_239324
867329	contig_12123_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_144586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGTGGGATTGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63416	63995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_63400_64000
867330	contig_9705_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_41700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGCGAAATTATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87178	86365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_86400_87200
867332	contig_10848_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_133539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAATTCACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882726	882458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_882500_882700
867333	contig_3193_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_126298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAATGTAGATGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44996	44594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_44600_45000
867334	contig_10636_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_172274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAGAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44395	44138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_-_44100_44400
867337	contig_17195_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_168976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTACCAGTTTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103686	104202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_+_103700_104200
867338	contig_9915_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_174167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGGCTTACTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394533	394154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_394200_394500
867340	contig_9668_pilon	+	427	1	Intergenic	novelGene_58259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCTAACATAAAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635376	635803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_635400_635800
867341	contig_14326_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_120657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTCAAGTCTCTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51279	51702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_51300_51700
867342	contig_10765_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_122936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAAATATTAAACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235267	234983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_235000_235300
867343	contig_5196_pilon	-	511	2	Intergenic	novelGene_38676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTATTTTAGGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100100	99233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_99566_99921
867344	contig_16532_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_110040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCACCTGCCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146636	147010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_146600_147000
867345	contig_1639_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_74924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343947	343610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_343600_343900
867348	contig_5023_pilon	+	426	1	Intergenic	novelGene_7379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAATCTGAGGCGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638050	638476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_638000_638500
867349	contig_11269_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_145828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAGCAACAAGGTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339711	339250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_339200_339700
867350	contig_10345_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_158375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGCATATTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7861	8217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_7900_8200
867351	contig_14363_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_112534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGTTAAAAGAATGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167149	166679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14363_pilon_-_166700_167100
867352	contig_15744_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_83569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	33	299	47316	47582	NA	25	GTGTAACCAGGTCACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDCPGETFDTMSPSLERVLLLEAHEQLPGPSYQPRVSGAAAPLTCPTHALPPVRGWVCSAGSGLLVRGWACLAGSGSSAACGRPAQPGRPAAEVEASP	47283	48031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_47300_48000
867354	contig_10855_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_124352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCATAAAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575016	574593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_574600_575000
867355	contig_13844_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_79406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGTGCTATTGCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97844	97391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_-_97400_97800
867356	contig_3575_pilon	+	466	1	Intergenic	novelGene_141115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	10	33	298	330	475722	475754	NA	15	CTTCGTTATGTTAGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IATDPHLGRKKRKGGRTPFSPLTNYLIWYTLGCFPESLFKESILSDHKACLCHWRQVWARASLGGTGWVPPDSDISLLSAQPLLHSSVGLLTLPCGALGMDTEAPAARL	475424	475890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_475400_475900
867357	contig_12943_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_140351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGGTGTATACTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28272	27875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_27900_28300
867358	contig_16231_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_176709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACTTATAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32386	32027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_32000_32400
867360	contig_9074_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_156628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGTGATGGAGAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81071	80705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_80700_81100
867361	contig_7229_pilon	+	305	2	Intergenic	novelGene_39787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGATTTGTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456510	464157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_456557_463898
867362	contig_17769_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_124259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGATAATAAAGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97259	96749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_96700_97300
867363	contig_15236_pilon	-	764	2	Intergenic	novelGene_141552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	10	33	303	335	157629	157597	FALSE	20	CTTTTAAAATGGTTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGRRPLLGRIASGAGFRRTAVAVDEREDKRALCDRETSTAPHGGGACGAADLVQLLAPDSSACSAHCCCAGDQNTHGAFLGGTFEACRKARKRSEIQILMERHGSHNLV	164452	157167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_157901_164421
867365	contig_5918_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_99593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAGTATAGGAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2039388	2038904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2038900_2039400
867367	contig_6674_pilon	-	497	1	Intergenic	novelGene_148018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTATCCATACTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241241	240744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_240700_241200
867368	contig_4131_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_127852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCCAAGGACATTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122748	122946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_122700_122900
867370	contig_4891_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_124577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAACAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740368	739833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_739800_740400
867372	contig_20224_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_178114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACAGCTTCCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18871	18340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20224_pilon_-_18300_18900
867373	contig_9370_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_177245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67364	67984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_+_67400_68000
867374	contig_12139_pilon	+	484	1	Intergenic	novelGene_146465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82234	82718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_82200_82700
867376	contig_5954_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_28751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCCCTTGGTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318484	1318171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1318200_1318500
867377	contig_11630_pilon	+	352	2	Intergenic	novelGene_147163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATGATCATGATGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77613	132154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895
867379	contig_8567_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_178115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTAAAGCTTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14588	14045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8567_pilon_-_14000_14600
867380	contig_12000_pilon	-	342	1	Intergenic	novelGene_43178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490142	489800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_489800_490100
867381	contig_13982_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_163493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGGGATGGTCTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452027	452481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_452000_452500
867382	contig_11855_pilon	+	384	3	Intergenic	novelGene_66932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACGCAATTTGGCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999928	1000607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1000047_1000267_1000358_1000431
867384	contig_9051_pilon	-	599	1	Intergenic	novelGene_170817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCCCAAAGAAGAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053220	1052621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1052600_1053200
867385	contig_9363_pilon	-	232	1	Intergenic	novelGene_6615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGACTCCTTCTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851025	850793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_850800_851000
867386	contig_15867_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_170882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTAGGACAGTTTGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55801	56098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_55800_56100
867387	contig_500_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_31058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATTCAATAAATCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487849	1488223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1487800_1488200
867388	contig_8443_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_150620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACCAGAAAAACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830365	829806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_829800_830400
867389	contig_11656_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_54044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCTCCAAACTGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535390	535042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_535000_535400
867390	contig_11294_pilon	+	436	1	Intergenic	novelGene_50061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	251452	251754	NA	10	ACCCCTTATCCTTCCGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AACSPVSTVLGPGGCGRRPRARALGKDGQRCKWVSEPRRGASGALRVLGRLSGFHVFSPASPAPGLFVGSPPGHLWICSYASGPFLCYERFFVHGDSSPI	251449	251885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251400_251900
867393	contig_12701_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_169564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAATTTTCCTTCCCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85031	84587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_84600_85000
867394	contig_7171_pilon	+	390	2	Intergenic	novelGene_101419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCGTGAGTGAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463377	1464045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1463439_1463716
867395	scaffold_13505_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_111395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTTGGTCACAACGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196018	195782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_195800_196000
867396	contig_16071_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_166008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101408	101016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_101000_101400
867397	contig_8330_pilon	+	342	1	Intergenic	novelGene_71747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGGAAACAGATGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520233	520575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_520200_520600
867399	contig_14563_pilon	-	372	2	Intergenic	novelGene_135069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAAGTATTCAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248340	238668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_239011_248310
867400	contig_15104_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_163367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATAAAAGGAAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824137	824458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_824100_824500
867403	contig_14184_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_66609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTGAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186068	186486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_186100_186500
867404	scaffold_13505_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_111628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATTTAGAAAACATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733960	734527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_734000_734500
867405	contig_2892_pilon	-	342	3	Intergenic	novelGene_119044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTTCTGGTTTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471016	440766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_440960_469936_469992_470922
867406	contig_10734_pilon	-	592	1	Intergenic	novelGene_50962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGGTTACGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23162	22570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_22600_23200
867407	contig_3184_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_169791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATGATGATAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45719	46025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3184_pilon_+_45700_46000
867408	scaffold_13505_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_111635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGGGGTTACCTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746371	746724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_746400_746700
867409	contig_7411_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_137061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019324	1019646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_1019300_1019600
867410	contig_15752_pilon	+	363	4	Intergenic	novelGene_148752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.7704215656966	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGCAAAGAAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184099	192518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_184240_184978_185079_192289_192355_192460
867411	contig_15153_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_166458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGGGGGGCGGGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154253	153497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_-_153500_154300
867412	contig_15066_pilon	-	440	2	Intergenic	novelGene_149527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACTCACCGAGTAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67169	66576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_-_66951_67103
867414	contig_5585_pilon	+	301	3	Intergenic	novelGene_143085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCAGATTATGAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595182	696869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_595239_599305_599377_696695
867416	contig_3335_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_165011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGATTCCTGAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865514	865857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_+_865500_865900
867417	contig_19640_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_134872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAATAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99796	100107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_99800_100100
867419	contig_7247_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_176688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAATCACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102596	102123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_102100_102600
867420	contig_10581_pilon	-	467	1	Intergenic	novelGene_41389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592301	591834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_591800_592300
867422	contig_12411_pilon	-	552	1	Intergenic	novelGene_145681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTCTATACATGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415133	414581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_414600_415100
867423	contig_2480_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_63505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTGCCAGAATAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106083	105737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_105700_106100
867424	contig_2414_pilon	+	419	2	Intergenic	novelGene_158526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACCCAGAGCTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095428	1108194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_1095582_1107928
867426	contig_10599_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_49896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCTGGAAGTAGGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248703	248186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_248200_248700
867427	contig_5817_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_169583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185629	186027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_+_185600_186000
867430	contig_3787_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_102372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGCGAAATGAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382821	383164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_382800_383200
867431	contig_8044_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_132381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGCAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459497	459168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_459200_459500
867432	contig_2757_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_164576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGCATTCATTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170675	170223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_170200_170700
867435	contig_14357_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_121653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458722	459248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_458700_459200
867436	contig_9199_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_65657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACATCTGGACTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185108	185361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_185100_185400
867437	contig_7513_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_88962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAAAAAATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154023	153446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_153400_154000
867438	contig_2100_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_50635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGTGCATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930898	931249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_930900_931200
867439	contig_4486_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_38634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGTTGAATCGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963001	963413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_963000_963400
867440	contig_16322_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_87556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACCCGATATGTATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131824	131468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_131500_131800
867441	contig_10988_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_104746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGAGCCATTTGAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477814	478270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_477800_478300
867442	contig_18869_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_56423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCAAGCCGTGGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79673	80583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_79700_80600
867443	contig_2036_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_131828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAGAAAAAAACATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614604	614266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_614300_614600
867444	contig_641_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_170141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAACACTTATGTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54019	54682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_54000_54700
867445	contig_3151_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_139180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGTCCGGACTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40154	40736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_40200_40700
867446	contig_5718_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_110426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAATAACTGCATGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520200	1520926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1520200_1520900
867447	contig_16860_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_155337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAATGCTAACAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83677	83365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_83400_83700
867451	contig_50_pilon	-	318	1	Intergenic	novelGene_122234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTTGGAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133991	133673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_133700_134000
867456	contig_10196_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_132027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAAGAAGAGAGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361340	360639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_360600_361300
867457	contig_9919_pilon	-	589	1	Intergenic	novelGene_137944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGTTTGGTGTACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484942	484353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_484400_484900
867458	contig_20522_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_177543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGCCACAATGTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129209	128813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20522_pilon_-_128800_129200
867459	contig_19892_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_158956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGCAGCTATTAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72847	72492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_-_72500_72800
867460	contig_1154_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_87176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCAGGAATAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931787	931630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_931600_931800
867461	contig_709_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_57525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCATGTCTTTGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466067	1465590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1465600_1466100
867462	contig_11572_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_100052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGCCGAAGGCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253867	253641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_253600_253900
867463	scaffold_9100_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_83237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGCATAACCCCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539618	539100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_539100_539600
867464	contig_8647_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_178117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTGCCAATCTATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953283	952704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_-_952700_953300
867465	contig_15327_pilon	-	523	4	Intergenic	novelGene_70707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCCAGGAGGATGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939118	936774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_936973_937570_937636_938034_938213_939036
867466	contig_7049_pilon	+	363	2	Intergenic	novelGene_171445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	155249	155879	FALSE	5	CGTGCTGTCCCCAGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPEERGLPLPGAPRDRGSAGLRQHTLQRGRHHAPDARRQRPVAARRLGAASPGTAPGRVWSGSGTAQALQRYRTVPTGPSPQAGPQEPRGPGNLHPPSLA	155246	155934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_155337_155661
867467	contig_14338_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_174842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	123895	123587	NA	50	ACCACTTTAAAAGGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVTEGKKSSRIKYLCKSFYLRQQPFKINLLSTAQQNPGRAVSQTSVFWVPSLSFLPDLSPKLQSFGYHLCHFCQTYVPEEPLSYFKLTSLFFPFLSFTYLF	123896	123570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_123600_123900
867468	contig_4782_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_73690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTTAAGAGCTCGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747425	747027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_747000_747400
867469	contig_7753_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_41518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAGAACAAAATTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255960	1256211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1256000_1256200
867472	contig_6870_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_103981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467130	1467436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1467100_1467400
867473	contig_13292_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_142954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAGGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343381	343748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_343400_343700
867475	contig_18506_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_67952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGCTTATTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	12071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_11500_12100
867476	contig_14341_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_111818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	102	494	535905	535513	NA	25	GGAAGTCACTTGGCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSGSRILTSWTGRVRPVQGRRQARDVSWRPLPMPRTPAPGRGILRVSAVNTLTHLSVHSASLKVAGCRASQSFPSALLGTVRRPGEYPGSGACPLGTATMQGQEKTSRNLQEACVTMSRGRPSMPRYHLGPSRAEWRALRTTCTGDGQTPVRNGIKQAWVTP	536006	535438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_535400_536000
867477	contig_498_pilon	+	535	1	Intergenic	novelGene_148548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358500	359035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_358500_359000
867478	contig_10940_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_49215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTTCTTTAAAACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872608	872310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_872300_872600
867479	contig_16109_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_80332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATGAACACCATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270592	269996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_270000_270600
867480	contig_8942_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_143193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACGGGTAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309175	308782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_308800_309200
867484	contig_19899_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_102502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAAAAAACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88459	88854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_88500_88900
867485	contig_9335_pilon	+	640	1	Intergenic	novelGene_147444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGTGAATTTCACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370242	370882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_370200_370900
867486	contig_17935_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_170592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATCAAGTGAATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11423	11727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_+_11400_11700
867487	contig_4923_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_109329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCCAGCAGCAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425377	425097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_425100_425400
867488	contig_13806_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_173655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTGTATGGAAAATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93870	94278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_93900_94300
867490	contig_7019_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_149483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTATATACCTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715970	1715557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1715600_1716000
867491	contig_2487_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_148474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCATTGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170168	170515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_170200_170500
867492	contig_10296_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_168899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	72	299	1124532	1130490	FALSE	10	GTGAGTCTCTTCTCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPLCVNSLKSPYASDYQGPFEHMMIFFLKILQKKKGLNGSQDWQKLKSLCEPRKEAAKGKRKKVDMLIARLVLVQSASDPQEVNISPRTLRTTWKLP	1124460	1130524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_1124691_1130421
867493	contig_612_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_155635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATAGAGATGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294074	294561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_294100_294600
867494	contig_9335_pilon	+	721	1	Intergenic	novelGene_147451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGGCTCTAAATGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465663	466384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_465700_466400
867495	contig_11986_pilon	+	370	1	Intergenic	novelGene_69110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTATATCATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84784	85154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_84800_85200
867496	contig_20693_pilon	+	187	1	Intergenic	novelGene_60265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCAAGAACCCTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30095	30282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_30100_30300
867498	contig_8284_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_125689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAGGAAAGCGAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389678	390039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_389700_390000
867500	contig_1443_pilon	+	443	1	Intergenic	novelGene_28341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAGAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799626	800069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_799600_800100
867501	contig_5434_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_74702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAGGAAAAAAAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467802	468190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_467800_468200
867502	contig_1007_pilon	+	281	1	Intergenic	novelGene_176052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCTCGTAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290226	290507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1007_pilon_+_290200_290500
867505	contig_9242_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_155077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741362	741864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_741400_741900
867506	contig_11615_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_151247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGGAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30222	29842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_29800_30200
867508	contig_5084_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_64493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATACAAGCTCTAGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138759	138444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_138400_138800
867509	contig_6175_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_16284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTATGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211391	1210966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1211000_1211400
867511	contig_2550_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_135639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	48	308	473995	473735	NA	70	TCTGAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVVLCRPSQPCHTQMNAAGSRAQEPHSELFRFQEEVRRQRMVKQLDNHDELQMSCSSAHYPATRFEIFQFCSVNQLDSHPTTLHPGRTLRHGACSAHATS	474042	473629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_473600_474000
867513	contig_10106_pilon	+	323	2	Intergenic	novelGene_73871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1	321	132423	132827	FALSE	25	TAAGTTCCTTACATGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRSRVPHPELGPEVGGTSALLISRPGWAPGTRQVPWRLPAACDLRFERQFALSSSAKRAPGTTERRVTGQGSRRSSSTPAALRVRNPGPSSVLPKGRGVSTPGQTY	132422	132829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132673_132756
867515	contig_11413_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_103172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	48	353	422180	422485	NA	10	GGTCCCCAGCCTGTCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGNVGASSVAGFIPGLEAEWHIFECQGQQAWHPPDSGGPAHGPPARHSGRAAHPQDWLGFSSLFPTAPLSFHSPVRPSVCQDTVCPLFCGVVVRGPWSST	422132	422594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_422100_422600
867516	contig_4857_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_48860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCCCTTGAATCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348866	1348434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1348400_1348900
867519	contig_16782_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_176775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGCAGCAACCATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68888	69448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_+_68900_69400
867520	contig_3787_pilon	+	298	1	Intergenic	novelGene_102356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAATGAGGGAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119317	119615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_119300_119600
867521	contig_5649_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_82454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGGAAAATTTCAAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520803	1520437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1520400_1520800
867524	contig_9435_pilon	+	225	1	Intergenic	novelGene_156949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTCTGTACAATGAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155624	155849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_155600_155800
867525	contig_18406_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_88054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGCCAGCTGAAACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61925	61367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_61400_61900
867526	contig_8304_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_153187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCCTTAAAATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174172	174423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_174200_174400
867527	contig_3410_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_58967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGAAGTTCTGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467711	467954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_467700_468000
867528	contig_720_pilon	+	399	3	Intergenic	novelGene_155156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCTGCCTCCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51553	52755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_51705_51831_51919_52594
867529	contig_2009_pilon	-	237	1	Intergenic	novelGene_165439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATTAATGCATGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20831	20594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_20600_20800
867532	contig_10496_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_59407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAACAAGAAAGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37660	37216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_37200_37700
867539	contig_15236_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_141535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGCTAATTTCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76553	77041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_76600_77000
867541	contig_4845_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_53731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAACAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1807309	1807660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1807300_1807700
867542	contig_4087_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_156071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGAGAGGGAACAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71257	71623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_71300_71600
867543	contig_1107_pilon	-	595	1	Intergenic	novelGene_126604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCACATGATCGTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977469	976874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_976900_977500
867546	contig_10331_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_54118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393501	393946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_393500_393900
867548	contig_1699_pilon	-	562	1	Intergenic	novelGene_72810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACATTTACATTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39142	38580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_38600_39100
867549	contig_817_pilon	-	413	5	Intergenic	novelGene_132443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	104	412	696546	542690	FALSE	20	AGGCTCGTGCAGACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLRSGGHPLYSDFMCRPLGDELSSIRSHKLQSTFLSEAYANPFLCPGFIFWPVFPPQLHSLHNCESAEWAGADTVTVAIRGPPEGPGRAFPGACPALLRAP	732017	542688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_542818_622221_622292_685546_685626_696514_696622_731989
867550	contig_11720_pilon	-	169	1	Intergenic	novelGene_43873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGGCCTTCCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105323	105154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_105200_105300
867551	contig_14208_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_129099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214581	214256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_214300_214600
867552	contig_11363_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_160486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAGAAAGCAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146907	147160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_146900_147200
867556	contig_960_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_108281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAATCACTTAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015796	1016154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1015800_1016200
867557	contig_3832_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_161440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAATTCAAATAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117130	117488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_117100_117500
867558	contig_18794_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_54631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTTATTTTAAGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82674	82139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_82100_82700
867559	contig_5424_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_172799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1	435	95447	95881	NA	45	GTAGAAAATCTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAPEPRHPISAGCGPGPGAPARPGLLGVRAAGDAEVWPAGAERLPGGRPICAEQSRDSLSLTLPRPRLLPSSGKSCRELGWLFGRCNKCEGIQVVWRCHCRDPNPQRCGRGLRRIQLHSGNFASPATRELRGWEGGEALESGL	95446	95933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_95400_95900
867560	contig_13158_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_107288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAGAAATAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104970	104263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_104300_105000
867561	contig_16231_pilon	+	380	2	Intergenic	novelGene_176722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCATGCATTGATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186429	197084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_186544_196818
867562	contig_10811_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_165788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179825	180280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_179800_180300
867563	contig_21369_pilon	-	236	1	Intergenic	novelGene_176295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCTAACACCTGGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3060	2824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_2800_3100
867564	contig_2940_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_81955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGCATAAAGGAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989847	989501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_989500_989800
867567	contig_1836_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_71074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCAACCAAACAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971910	971484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_971500_971900
867568	contig_14133_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_119973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTCTCCTGTGGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226879	226462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_226500_226900
867569	contig_10902_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_65686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAGAAAGGGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167958	167544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_167500_168000
867570	contig_15327_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_70457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAGCAGGCCCAACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298790	299470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_298800_299500
867571	contig_5260_pilon	-	108	1	Intergenic	novelGene_144410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAATAACGGGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481658	481550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_481600_481700
867572	contig_5878_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_145740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGGAAAAGAAGCAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388601	389019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_388600_389000
867574	contig_4364_pilon	-	298	1	Intergenic	novelGene_119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGACAGTCTCTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026966	1026668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1026700_1027000
867576	contig_5988_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_15989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAATAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680677	680408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_680400_680700
867578	contig_299_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_129508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGCGAGAGAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663793	1664125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1663800_1664100
867579	contig_10023_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_123455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCTAATGTTGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11995	11522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_11500_12000
867580	contig_6674_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_148036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424938	424629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_424600_424900
867583	contig_91_pilon	-	571	5	Intergenic	novelGene_127088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCCCAATCTCAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216198	208738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_208839_209707_209855_212746_212843_214753_214916_216132
867584	contig_18869_pilon	+	272	2	Intergenic	novelGene_56475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATGCTTCCATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219874	222848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_220053_222754
867585	contig_3975_pilon	-	206	1	Intergenic	novelGene_54694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATTAAAAGAATCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094908	1094702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1094700_1094900
867586	contig_5684_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_81089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAAACACAGTGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500062	500380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_500100_500400
867588	contig_5247_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_81813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAAAAAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171265	170919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_170900_171300
867589	contig_9833_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_68568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309307	309770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_309300_309800
867590	contig_8712_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_58851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGCATCAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700796	701362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_700800_701400
867592	contig_15867_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_170893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAATGAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98635	97170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_97525_98615
867593	contig_7627_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_175565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATGAAACCTACGTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167399	167106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_-_167100_167400
867594	contig_401_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_42869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728896	1729188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1728900_1729200
867595	contig_7815_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_134407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	112	402	879422	879132	NA	65	TACAACAGAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWDSRVGREVQSSLRRGHTGPPGGGGRTPRRAGIGEMASLGCCQHARCSLIRPRARRRVDQEDPCPYCGAGAGPSCRGKRWSAGPPAAWSPSYKVITVTKLIILATATLRESSVTANTWDGGHLILYFLWMS	879533	878897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_878900_879500
867597	contig_6602_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_166443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCAGGCTCCCTTCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385198	385721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_+_385200_385700
867598	contig_17829_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_157044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATGTTGGTTATTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90158	90418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_90200_90400
867599	contig_15122_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_162705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAGTGCTATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467985	468255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_468000_468300
867600	contig_21418_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_177867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGGGGACCGAACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5060	5289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21418_pilon_+_5100_5300
867601	contig_17074_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_145160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAAGGTGTGTTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297336	297770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_297300_297800
867603	contig_13481_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_119548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAATTGAATGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560193	1560439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1560200_1560400
867604	contig_8210_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_30257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGATATTGGGTTGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158373	158883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_158400_158900
867606	contig_10437_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_38097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGATAGGAAGGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48231	47898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_47900_48200
867607	contig_7720_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_155800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGATAGCAATGGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858692	859349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_858700_859300
867608	contig_9233_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_78259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692297	691889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_691900_692300
867609	contig_10307_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_170260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCCCATCCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385949	385686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_385700_385900
867611	contig_5047_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_157997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCACTGCCGTCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132423	1132807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1132400_1132800
867614	contig_8420_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_69364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGATGGTCTCCACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178945	178364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_178400_178900
867615	contig_4519_pilon	-	341	2	Intergenic	novelGene_123667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAAACATCACATCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68891	68236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_68290_68603
867616	contig_7308_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_159616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTCCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564621	564054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_564100_564600
867617	contig_15031_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_138388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAATAGGAAGAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66209	65879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_65900_66200
867618	contig_13593_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_156123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAAAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61072	61462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_61100_61500
867619	contig_2646_pilon	+	295	4	Intergenic	novelGene_69618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCCACGCCGGCAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2054181	2055717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2054253_2054530_2054601_2054787_2054881_2055656
867620	contig_13844_pilon	-	416	1	Intergenic	novelGene_79402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAAGGAGTTAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78182	77766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_-_77800_78200
867621	contig_294_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_166735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCTGGAAGAGAGTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74590	75442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_74600_75400
867622	contig_20371_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_129185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56481	56113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_56100_56500
867624	contig_4125_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_25243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCAGGCCTGTCCCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2974217	2973736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2973700_2974200
867625	contig_5041_pilon	+	369	1	Intergenic	novelGene_27017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTAGAATTTTTTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239015	239384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_239000_239400
867626	contig_4732_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_75358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87013	87385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_87000_87400
867627	contig_19564_pilon	+	279	1	Intergenic	novelGene_29683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAGAAACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92195	92474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_92200_92500
867628	contig_8291_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_99959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAGAGAAGGCAGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550247	550795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_550200_550800
867629	scaffold_13505_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_111390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTGTGTTGGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158681	157962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_158000_158700
867630	contig_1337_pilon	+	384	1	Intergenic	novelGene_84249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436825	437209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_436800_437200
867631	contig_12925_pilon	+	273	3	Intergenic	novelGene_178015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGACATGGTCTCCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83916	84760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12925_pilon_+_84057_84231_84324_84719
867633	contig_20701_pilon	+	574	5	Intergenic	novelGene_178125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCAGCTGTCAGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5044	15863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20701_pilon_+_5173_10444_10616_10730_10847_11925_11980_15758
867634	contig_9919_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_137952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAATAAAATTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538581	538162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_538200_538600
867635	contig_8443_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_150603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634005	633466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_633500_634000
867636	contig_3241_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_146428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCATCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028105	1028424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_1028100_1028400
867637	contig_14326_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_120694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGGATAATTCCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221557	221211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_221200_221600
867638	contig_2069_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_23348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTTCAACCTGCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783905	784399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_783900_784400
867641	contig_10446_pilon	+	320	1	Intergenic	novelGene_162452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCAAGGATTGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464637	464957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_464600_465000
867642	contig_3018_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_78950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCAATTTCATTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366082	1366550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1366100_1366600
867643	contig_4065_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_133417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAGATAGACTTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984993	984347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_984300_985000
867644	contig_13992_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_147637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCTTCCTTTACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433059	433388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_433100_433400
867646	contig_2917_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_147592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCATGTATTTCGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95896	95591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_95600_95900
867647	contig_18850_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_142456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308085	308498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_308100_308500
867648	contig_14023_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_165371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTACCAGAAGAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186843	186470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_186500_186800
867650	contig_6497_pilon	-	318	2	Intergenic	novelGene_35555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTGCTAATAAACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156314	154709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_154962_156248
867651	contig_15327_pilon	+	312	1	Intergenic	novelGene_70823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556772	1557084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1556800_1557100
867652	contig_10064_pilon	-	285	1	Intergenic	novelGene_122712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAAGCGGAACTGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267392	267107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_267100_267400
867653	contig_7129_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_169298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAACAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895128	895548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_895100_895500
867654	contig_1369_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_176790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCTCCGACAGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090470	1090022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_-_1090000_1090500
867655	contig_7702_pilon	+	396	1	Intergenic	novelGene_177299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	42	311	309921	310190	NA	60	AAGTCTTATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALTSCGVVLESGMNLTLAPPSCSHFSPSLLFALPHFLLLWLLLSCSAWLRKENKHLLASQLTFPLLRGLAERDISPTHLGEVLGISRERGSLEAKIGCLPR	309879	310275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_+_309900_310300
867656	contig_6069_pilon	-	357	2	Intergenic	novelGene_8040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGCAGCTGCAGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323242	322670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_322907_323121
867657	contig_9438_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_154271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAGGGAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316034	315467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_315500_316000
867659	contig_4678_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_126032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCACCATTATTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406161	406611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_406200_406600
867660	contig_2646_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_69560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAGACAGGCTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866265	865705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_865700_866300
867661	contig_5997_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_168618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329832	329215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_329200_329800
867662	contig_5585_pilon	+	304	3	Intergenic	novelGene_143084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGATCAATAACAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595182	696851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_595260_599305_599377_696695
867663	contig_6871_pilon	-	215	1	Intergenic	novelGene_21587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATATTTATTCTACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283862	283647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_283600_283900
867664	contig_5988_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_16007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTTTTTTGCAGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692598	692127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_692100_692600
867665	contig_1925_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_162218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTGACGTTTGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225571	226068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225600_226100
867666	contig_10339_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_125260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGCCTCTTTCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292128	291849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_291800_292100
867667	contig_1637_pilon	-	278	1	Intergenic	novelGene_142397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGGAAATGAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777273	776995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_777000_777300
867669	contig_4659_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_118267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACAACAACACATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916331	916809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_916300_916800
867671	contig_3103_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_146178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAGATCCCGATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22784	22289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_22300_22800
867672	contig_1008_pilon	-	515	1	Intergenic	novelGene_121572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGCTGGTTCCCAGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657053	656538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_656500_657100
867673	contig_11642_pilon	-	444	1	Intergenic	novelGene_172923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292231	291787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_-_291800_292200
867674	contig_8330_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_71958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTTTTTGGTCTGCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506448	1506169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1506200_1506400
867675	contig_10734_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_51245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229707	1229428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1229400_1229700
867676	contig_10857_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_160905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGGGTCTAGCCGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420130	419502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_419500_420100
867677	contig_1379_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_134584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTTGTTACAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409789	409238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_409200_409800
867678	contig_8284_pilon	+	325	2	Intergenic	novelGene_125712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAAATACATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429164	445860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_429410_445780
867679	contig_4364_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_58	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657731	657448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_657400_657700
867680	contig_10557_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_171924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGGGTTAAACTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76279	76821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_+_76300_76800
867682	contig_14519_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_66846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATATATGTGTGTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404362	403720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_403700_404400
867683	contig_4531_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_47935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAGCACCAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680598	681424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_680600_681400
867686	contig_14525_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_149787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCAAATAAAGTAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234670	235165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234700_235200
867691	contig_10196_pilon	+	464	2	Intergenic	novelGene_132284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGACACCTCGAGTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2220208	2220869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2220333_2220529
867692	contig_13592_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_33681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672	2299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_1700_2300
867695	contig_7887_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_124911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537328	537107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_537100_537300
867696	contig_14618_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_136864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368188	1368593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1368200_1368600
867700	contig_4151_pilon	+	302	3	Intergenic	novelGene_65290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	246	junction_2	23	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	174	127	300	723778	740996	FALSE	60	TGAAGAAATAAGAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHFHPTLVTPPSNPWSRTLSSRGSACVCVCVCVSVFVSAAGIMASPLRFDGRVVLVTGAGGGLGRAYALAFAERGASVVVNDLGGDFKGDGKSSLAADKV	723651	740998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_723836_726654_726709_740934
867701	contig_2799_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_85566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCATGGTCTGCGAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730873	730553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_730600_730900
867702	contig_4674_pilon	+	330	2	Intergenic	novelGene_174137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	16	330	226107	232834	FALSE	25	GTAGGTGCTTGTTTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVHEMTLDEWKNLQEQTRPKPEFNIRKPESTVPSKAVVIHKSKYRDDTVKDDYEDDSHIFRKVANDITSQLEINFGNLPRPGRGARGGTRGGRGRIRRAENYRPRAEVV	226091	232834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_226236_232648
867704	contig_9785_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_157899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421559	421920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_421600_421900
867705	scaffold_7386_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_136599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGCGGTGGCTGCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337505	336874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_337355_337475
867707	contig_13786_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_174569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAATGTACATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64204	63946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_-_63900_64200
867708	contig_12142_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_147789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCTTTATTGATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16697	16320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_16300_16700
867709	contig_6471_pilon	+	413	1	Intergenic	novelGene_172096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTTTAAGAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78596	79009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6471_pilon_+_78600_79000
867710	contig_14744_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_65971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCGATTCATACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783539	783295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_783300_783500
867714	contig_10050_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_119622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGAGCCTTTCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217564	217195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_217200_217600
867715	contig_15114_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_121107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTGCCCATCCCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55750	56091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_55800_56100
867716	contig_7843_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_152049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCATACTCTAACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482172	481631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_481600_482200
867717	contig_7171_pilon	-	537	3	Intergenic	novelGene_101277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	2	535	1001551	999178	FALSE	35	CTGAGGGAGAGGAAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKSLHPCGLIDAQVVDDDSQDIPQQGVEVVGGDSCAGQGGVGGQGRLRPIFPPAGQVAAEHGQRDLDDVWHLCVAGPRLSQPPDVCHEPLQHGDVRAHLLHAVGEPQDGPLPGRLGGVHRAGVILIQVRLQERHRHGRCQPGQALPEGRPQLFDVNVLGGPQRVDTAQNSVARDLDVV	1001552	999175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_999258_999835_999967_1001228
867718	contig_7171_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_101212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATTTTCAAGCTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190031	189763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_189800_190000
867719	contig_3233_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_56603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAACAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946498	945963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_946000_946500
867721	contig_5954_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_28722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAACGACTCCCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062487	1061854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1061900_1062500
867722	contig_14549_pilon	+	433	1	Intergenic	novelGene_176218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAGAGAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9933	10366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14549_pilon_+_9900_10400
867725	contig_14023_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_165348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31996	31659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_31700_32000
867729	contig_17989_pilon	+	371	1	Intergenic	novelGene_150846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGAAAAGAGAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284027	284398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_284000_284400
867731	contig_1172_pilon	+	349	2	Intergenic	novelGene_162024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGCCCCGGGAGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566121	572566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_566265_572360
867733	contig_13645_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_146168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1	423	429610	429188	NA	30	GCAGGGGGAAGGCAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVDGLQVDLQHGQAVKVPLGTVGAAVDNLGPALPVIPHLLLPPQRLQGGVWGGAALHRGTGVRRGAAHGGHAAQHRVGADTVVAGVGLPVAVQVAVDLLHRGELLGAHGALVFLVGVGLVDVGEQRVLVDEDLGAVDAL	429610	428580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13645_pilon_-_428600_429600
867734	contig_5201_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_82185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGATTTTGTATCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324351	324608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_324400_324600
867735	contig_10951_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_61622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGAAATCAACTGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138158	138646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_138200_138600
867737	contig_3382_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_124218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAACAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1806272	1805707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1805700_1806300
867739	contig_5799_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_50286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATGGGTTGTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339991	339493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_339500_340000
867740	contig_5988_pilon	+	253	2	Intergenic	novelGene_16127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	71	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAAATCGAAACCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538169	1539081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1538254_1538912
867741	contig_6842_pilon	-	322	1	Intergenic	novelGene_130843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTGCATTTCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2008515	2008193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_2008200_2008500
867742	contig_8576_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_88814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTCCTAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961692	961413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_961400_961700
867743	contig_14123_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_177131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTCTTCTTCACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218124	217880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14123_pilon_-_217900_218100
867744	contig_9886_pilon	-	532	1	Intergenic	novelGene_147084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTGCGGCTGCTGCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228915	228383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9886_pilon_-_228400_228900
867745	contig_7368_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_158801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCTCAATAATGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55438	55125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_-_55100_55400
867746	contig_12540_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_148066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCATATAACCAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232486	232888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_232500_232900
867747	contig_17106_pilon	+	368	2	Intergenic	novelGene_127669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCAATGGAGACTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78967	84689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_79008_84361
867749	contig_12884_pilon	+	165	1	Intergenic	novelGene_105026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATAAAGCTGTTACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284005	1284170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1284000_1284200
867750	contig_9901_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_126944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCATACTTTAATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249638	249930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_249600_249900
867751	contig_8571_pilon	-	303	3	Intergenic	novelGene_169174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_2	24.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	150	153	302	427783	427151	FALSE	25	GTGCCCAGTACAAAGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAFTDSAISAKVNGEHKEKDLEPWDAGELTTTEELEALENDVSNGWDPNDMFRYNEENYGVVSTYDSSLSSYTVPLERDNSEEFLKREARANQLAEEIES	430397	427149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_427233_427715_427808_430269
867752	contig_6842_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_130842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCTGCAAAGTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1962519	1962158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1962200_1962500
867755	contig_4891_pilon	+	274	1	Intergenic	novelGene_124508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCGCCACCAGGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17174	17448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_17200_17400
867756	contig_14029_pilon	-	396	1	Intergenic	novelGene_151933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85561	85165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_85200_85600
867757	contig_19640_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_134856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTAAGGCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40431	40782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_40400_40800
867758	contig_4508_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_177526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGTTAAAAATAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4529	4295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_4300_4500
867759	contig_7839_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_45711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGATCCAAATTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810633	810333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_810300_810600
867762	contig_14133_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_119902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCAGGAAATTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107635	107340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_107300_107600
867763	contig_7022_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_142145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTGAGAAGAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151025	151404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_151000_151400
867765	contig_2219_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_67189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTTCCTTAATAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155730	155282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_155300_155700
867767	contig_3103_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_146213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGCGCCTGGGGCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313711	313939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_313700_313900
867769	contig_1331_pilon	-	196	1	Intergenic	novelGene_37892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATTCTTCAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527974	527778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_527800_528000
867771	contig_3320_pilon	+	405	1	Intergenic	novelGene_133061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATAGTGATAATAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134257	134662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_134300_134700
867772	contig_6227_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_49646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	272	481	406067	405858	NA	5	GCATTCCTTTTTTCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASSLGGGRRALCIDPLVAPAPSRPGPRGAEPADVSLDTPPAPVFPPTPAFPGGLPGRGSVVAAAGPPERRRLGGGSRAERSLRLQSRLQMRKLRHRPLAGSPRPQLASRAPGYDISLLYRGAYQSVLGCLRLPSRKSGRGFGLVRGVLLFLSVSLFSG	406338	405796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_405800_406300
867773	contig_3161_pilon	-	284	3	Intergenic	novelGene_84545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTCTGGCCCTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823131	778950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_779079_802410_802519_823083
867775	contig_4388_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_161942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATATAGCATGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100341	99986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1e+05_100300
867780	contig_5056_pilon	+	158	1	Intergenic	novelGene_171163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTTATTCCTCAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134970	135128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_+_135000_135100
867781	contig_8357_pilon	-	394	1	Intergenic	novelGene_39780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAACGCGCAAAGGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892418	892024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_892000_892400
867782	contig_9705_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_41735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238437	237897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_237900_238400
867783	contig_14077_pilon	-	346	1	Intergenic	novelGene_174861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTGATACGAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30591	30245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_-_30200_30600
867784	contig_3787_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_102394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATGAATAGATTATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454245	453825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_453800_454200
867786	contig_15152_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_126968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGTTCTCCCTCTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202645	202892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_202600_202900
867789	contig_20614_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_107558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAGAAAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179808	180212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_179800_180200
867791	contig_2312_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_160751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATACGGATTATCTACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495027	494612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_494600_495000
867792	contig_9406_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_136180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCCCAGGAATGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154013	154350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_154000_154400
867793	contig_14666_pilon	-	285	2	Intergenic	novelGene_39550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAAAAACAGAGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475123	472629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_472846_475054
867795	contig_5814_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_143058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATATAAAGGAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393206	393664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_393200_393700
867796	contig_8676_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_142218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGAAAATCTTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533496	534237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_533500_534200
867798	contig_13680_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_149589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGCCAATAAACGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366460	366921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_366500_366900
867799	contig_10986_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_71492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTTTTAAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80566	80987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_80600_81000
867800	contig_13780_pilon	-	431	3	Intergenic	novelGene_149017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421092	418408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_418611_419862_420007_421007
867809	contig_1406_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_25617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2527989	2528456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2528000_2528500
867810	contig_8552_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_80055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAACTAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139937	140193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_139900_140200
867812	contig_8866_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_77863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTATGTCCTACCTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753541	753962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_753500_754000
867814	contig_6137_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_59303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1608596	1608302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1608300_1608600
867815	contig_16650_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_61951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTAGGCACTCTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208491	208915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_208500_208900
867816	contig_9272_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_125985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAAGTATGACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744843	745194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_744800_745200
867817	contig_20694_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_141249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGCACCCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55186	55459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_+_55200_55500
867820	contig_4402_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_140793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCTAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208748	208366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_208400_208700
867821	contig_9527_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_134055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAAGGGGGCTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433562	433936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_433600_433900
867822	contig_11815_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_50921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATAATCCTTCCCTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222766	222285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_222300_222800
867823	contig_12964_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_131656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGGCCTCCACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122263	121880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_121900_122300
867824	contig_14219_pilon	-	404	1	Intergenic	novelGene_54363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881454	881050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_881000_881500
867825	contig_8210_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_30255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGAGAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122978	123394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_123000_123400
867827	contig_13496_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_107650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGGGAAAATAAAAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388171	387838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_387800_388200
867828	contig_4232_pilon	-	435	3	Intergenic	novelGene_63435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	6.5	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCTTGAAAAATAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515184	514372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_514663_514766_514851_515123
867829	contig_1227_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_161371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTGGCGGAGAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76567	76877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1227_pilon_+_76600_76900
867830	contig_1301_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_47410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAGTGAACATACGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813157	812783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_812800_813200
867831	contig_15207_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_176368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGTGTCCTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27924	27252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_-_27300_27900
867832	contig_15982_pilon	+	392	1	Intergenic	novelGene_145970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAATTACCTTTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11616	12008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_11600_12000
867833	contig_7057_pilon	+	403	1	Intergenic	novelGene_123282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	58	321	797723	797986	NA	0	CGTGCGCGTGCCTGCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRLQTACGNYNGVAADDLMLPGRLRASSLDALFRAYGTRSFNDWGGLAEAARDLGGQAPTPTGRGRDQPSSPRPRLPWPAGRPNPLRASPRSTDKLIPPAEDLPT	797665	798068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_797700_798100
867834	contig_14357_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_121669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510101	510415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_510100_510400
867835	contig_9389_pilon	+	356	1	Intergenic	novelGene_83976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCCCTTCTCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370397	370753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_370400_370800
867836	contig_9833_pilon	+	596	1	Intergenic	novelGene_68475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATCAATTCTCTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76848	77444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_76800_77400
867837	contig_14225_pilon	+	360	1	Intergenic	novelGene_52738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165186	165546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_165200_165500
867838	contig_3424_pilon	+	298	4	Intergenic	novelGene_55548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1875	junction_1	171.79509758883	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAAACATCCACGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309782	313053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_309886_310236_310385_312001_312034_313038
867839	contig_8702_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_157725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCAGAAAAAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45717	46186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_45700_46200
867840	contig_89_pilon	-	366	1	Intergenic	novelGene_176388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCTTAACAAAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157992	157626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_-_157600_158000
867841	contig_10016_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_117849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCTGCTCCCTCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274757	275003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_274800_275000
867842	contig_4392_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_117348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAAATAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671884	671565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_671600_671900
867844	contig_9833_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_68566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAAAACCTGTCTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296861	297276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_296900_297300
867845	contig_3281_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_128532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	8	319	149223	149534	NA	10	TTCAGGGCCCCCCCCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG	149215	149570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_149200_149600
867846	contig_14322_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_115642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAAAATAAACCATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382041	382321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_382000_382300
867849	contig_3900_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_84211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAAGTGAATGAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576088	576473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_576100_576500
867850	contig_7707_pilon	+	604	1	Intergenic	novelGene_72144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGCCTAGTCAGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127795	128399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_127800_128400
867853	contig_8964_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_168690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGACTTGCTAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473614	472835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_472800_473600
867855	contig_7412_pilon	+	312	2	Intergenic	novelGene_76341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCAAGTCTGGAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377772	391068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_377834_390817
867856	scaffold_9205_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_161109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGACGGGCTTTTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359104	358736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_358700_359100
867857	contig_16643_pilon	+	397	1	Intergenic	novelGene_158128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGAGAAAAAGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254371	254768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_254400_254800
867859	contig_10912_pilon	-	360	4	Intergenic	novelGene_176804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTTCTGCCAGAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885844	855635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10912_pilon_-_855677_858209_858320_863191_863295_885738
867860	contig_8063_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_152435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTTAGCATATATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598573	598151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_598200_598600
867863	contig_14405_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_85613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACAATGTTCTCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85737	85287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_85300_85700
867864	contig_16635_pilon	+	140	1	Intergenic	novelGene_153153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTTAATTCTTTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97569	97709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_97600_97700
867866	contig_8636_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_141918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGTAGCCATGGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375207	375513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_375200_375500
867867	contig_10297_pilon	+	509	3	Intergenic	novelGene_112535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	294465	298631	FALSE	45	ACTTAAATAATTGTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDLSHVTSKCGSLKNIRHRPGGGRVKIESVKLDFKEKAQAKVGSLDNAHHVPGGGNVKIDSQKLNFREHAKARVDHGAEIITQSPGRSSVASPRRLSNVSSSGSINLLESPQLATLAEDVTAALAKQGL	294463	298749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_294526_298083_298197_298415
867868	contig_8153_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_34789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGTTGATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4093	4348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_4100_4300
867869	contig_4071_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_151878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAGATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170290	170554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_170300_170600
867870	contig_8864_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_135994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGATTTGATTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677329	676833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_676800_677300
867871	contig_3601_pilon	+	238	1	Intergenic	novelGene_132862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACATGGTGCAGGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130409	130647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_130400_130600
867872	contig_19013_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_162085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	78	503	31684	32109	NA	40	AAATTCTTAAATACTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGPRPSALHRQACNRRATRDCRRRMTLGLGLPSLSFLRVVAGCGARSERGGPGTAVVEPSRASSPHFLTEVGDRAISVKPPDPKILGGPNRPGREQGGLAAGSALRPAPTVLSAEFLPELSPALRNKTYSLLFWSCPFSLCCGPCFMLPKVLVLGGPTEYLVCTR	31606	32125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_31600_32100
867875	contig_10371_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_175473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGCTGTGGACCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655675	654891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_654900_655700
867876	contig_6047_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_24236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGCTGAGGGGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236399	237076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_236400_237100
867878	contig_6427_pilon	-	653	1	Intergenic	novelGene_162582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068158	1067505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1067500_1068200
867879	contig_8712_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_58845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACAGAACGACTACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634956	634525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_634500_635000
867880	scaffold_17542_pilon	-	396	6	Intergenic	novelGene_139223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	265.211613622028	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	55	396	371124	298377	FALSE	20	GTTGGTATAGATGCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACAVEVFGLPEDEENSRIVRVKVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLYDPMNGVFTCVQTKTIKKTLNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLP	371178	298376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_298428_334715_334770_353803_353843_353943_354023_359085_359160_371079
867881	contig_19727_pilon	-	313	1	Intergenic	novelGene_169005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTTTGTTAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34128	33815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_33800_34100
867882	contig_1309_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_73984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCCCCTCTAGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302487	302095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_302100_302500
867883	contig_9319_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_154644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAGAAAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77897	78189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_77900_78200
867884	contig_8686_pilon	-	254	1	Intergenic	novelGene_154683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTGTGTTTGCTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245713	245459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8686_pilon_-_245500_245700
867885	contig_10734_pilon	+	297	2	Intergenic	novelGene_51327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACACACACGCGCACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568646	1576520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1568728_1576304
867886	contig_3601_pilon	-	432	1	Intergenic	novelGene_132935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATCCAGCTTTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406720	406288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_406300_406700
867887	contig_15904_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_178126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACATGTGCATATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51740	52103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15904_pilon_+_51700_52100
867888	contig_5649_pilon	+	476	1	Intergenic	novelGene_82323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACCAAGAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321756	322232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_321800_322200
867889	contig_10135_pilon	-	192	1	Intergenic	novelGene_106680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACCCTAAAAAGGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275989	275797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_275800_276000
867890	contig_12622_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_5825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAACAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415579	415985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_415600_416000
867891	contig_753_pilon	-	328	1	Intergenic	novelGene_112931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTGACTGAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572899	572571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_572600_572900
867892	contig_11281_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_125492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCACTCGGATGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913681	913313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_913300_913700
867894	contig_7513_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_88959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACTACAGCTATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149555	149246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_149200_149600
867895	contig_7678_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_175953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGACTAAAAATTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90375	90726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_90400_90700
867898	contig_7066_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_42129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATATGAAAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682602	682173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_682200_682600
867899	contig_8273_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_113095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	2	358	454039	454395	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRSQDPERDGIALLISQSGGGRRVFWICCASRSSKHKQLEGRARGGGLGRCPPEERPLRSPYWEEVITLLRRWWPFWASVLSKEKLLCPPAWTDSPSRLRNGGDSIELQPRDQKLKSQK	454037	454396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_454000_454400
867902	contig_6576_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_42377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1261880	1261598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1261600_1261900
867903	contig_5718_pilon	-	415	1	Intergenic	novelGene_110455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAACAACAACGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1735499	1735084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1735100_1735500
867904	contig_5586_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_143603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAATGATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660649	660897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_660600_660900
867905	contig_6589_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_25707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTGGCTGCCTGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237939	238196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_237900_238200
867907	contig_3193_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_126320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140970	141394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_141000_141400
867908	contig_11304_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_156737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATTTATTCCCGTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632546	632231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_632200_632500
867909	contig_6630_pilon	+	304	1	Intergenic	novelGene_30737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCCAAACAAACAGACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799099	799403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_799100_799400
867912	contig_13786_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_174580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAAATATTCCAGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139996	140340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_140000_140300
867913	contig_5992_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_176604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGAGAAATGAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99917	99528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5992_pilon_-_99500_99900
867915	contig_10861_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_39465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAGTGGCATCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2716422	2716826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2716400_2716800
867918	contig_5452_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_101025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGGAAAATAAAGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502947	502593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_502600_502900
867919	contig_11855_pilon	+	233	1	Intergenic	novelGene_66987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAGAAGGAAGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264232	1264465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1264200_1264500
867920	contig_8357_pilon	+	355	3	Intergenic	novelGene_39729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	44.5	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGATTTTTTTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590368	597931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_590468_597119_597274_597829
867921	contig_13966_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_158161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCCAAAACAAAGACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507224	506805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_506800_507200
867922	contig_10042_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_79188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGTCAGAGGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900395	900666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_900400_900700
867924	contig_7962_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_149308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCGGCCGGGGCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410379	409966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_410000_410400
867925	contig_20104_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_178127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAATGCCGGAGTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47764	48143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20104_pilon_+_47800_48100
867926	contig_6677_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_114201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATGAGGTTGCATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584105	583584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_583600_584100
867927	contig_7272_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_25407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTGAAAGAATAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796932	796311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_796300_796900
867928	contig_16187_pilon	+	450	1	Intergenic	novelGene_101077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTGAGGTAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55479	55929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_55500_55900
867929	contig_9363_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_6727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATTATAGTATATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1452895	1453250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1452900_1453200
867931	contig_14569_pilon	-	640	2	Intergenic	novelGene_165420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGACTTCCCACATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352789	351404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14569_pilon_-_351539_352283
867932	contig_7898_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_47596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGTCCTCAGATTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513954	514474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_514000_514500
867935	contig_9186_pilon	+	376	1	Intergenic	novelGene_85348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398185	398561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_398200_398600
867936	contig_11849_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_171749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGAAAAAAAGGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116015	116498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_116000_116500
867937	contig_19851_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_29811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCGAGGTATTTTCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21051	21404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_21100_21400
867941	contig_1380_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_138892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATCAGATTTGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161475	160806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_160800_161500
867942	contig_5482_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_144452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCTTGAAATTTTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293325	293602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_293300_293600
867944	contig_12278_pilon	-	488	6	Intergenic	novelGene_152583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6.56048778674269	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATGATTTATGACTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137285	128948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_128973_129719_129909_130162_130223_130809_130850_135066_135143_137186
867945	contig_7157_pilon	-	434	3	Intergenic	novelGene_131304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_2	100	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGAAATAAAATTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953252	913067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_913132_952167_952300_953014
867946	contig_7357_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_36905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACAGCCCCTCATTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417575	417224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_417200_417600
867949	contig_1986_pilon	+	408	2	Intergenic	novelGene_64129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	294	320	330295	330321	FALSE	45	TTCATAATTAGTCAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGEVRATEKRSVHPLWESVDLVPRGDRQSPINIRWRDSVYDPCLKPLTISYDPTTCLHIWNNGYSFLVEFEDSTDKSGESKIWGSNLELKDTLATSMVLMDLIC	310412	330409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_310452_330040
867950	contig_4152_pilon	-	492	4	Intergenic	novelGene_177305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	7.1336448530109	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	138	326	280011	275965	TRUE	80	CAAAAAGCAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPQCSGEHKPEEQNSVWLFLSRHPKQNCEVWFQNRRAKFRRNERAMLANKNASLLKSYSGEVTAVEQPIVPRPAPRPTDYLSWGTASPYRSSSLPRCCLHEGLHNGF	284572	269919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4152_pilon_-_270069_275947_276020_279877_280060_284483
867951	contig_294_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_166751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGGAAAGAAGGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153150	153479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_153200_153500
867952	contig_10074_pilon	+	326	1	Intergenic	novelGene_57145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458735	459061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_458700_459100
867953	contig_6946_pilon	-	207	1	Intergenic	novelGene_59759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAACTCCCCCAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133421	133214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_133200_133400
867955	contig_5419_pilon	-	326	1	Intergenic	novelGene_15547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAAAAATTTATGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449187	448861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_448900_449200
867956	contig_16072_pilon	+	455	1	Intergenic	novelGene_175853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAACTAGCTTGATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21756	22211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_+_21800_22200
867957	contig_6059_pilon	+	387	1	Intergenic	novelGene_44810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTTTGGTAACCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549502	549889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_549500_549900
867958	contig_3270_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_104506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTGTCATTTAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381597	381149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_381100_381600
867959	contig_15596_pilon	+	401	1	Intergenic	novelGene_139537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGGTGTCCCTTTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141475	141876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_141500_141900
867962	contig_6217_pilon	+	143	1	Intergenic	novelGene_109675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAATCTCTGTGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810653	810796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_810700_810800
867963	contig_9965_pilon	-	443	2	Intergenic	novelGene_176468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAGAGAAAAAAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87746	86709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9965_pilon_-_87112_87705
867964	contig_9363_pilon	-	226	1	Intergenic	novelGene_6694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGTAGTCGAGCGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278888	1278662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1278700_1278900
867966	contig_14536_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_69296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAAAATTAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93550	93253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_93300_93600
867967	contig_15867_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_170898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGCACAGGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147156	147656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_147200_147700
867968	contig_10148_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_172873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAATTTTCTTAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328628	328351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_328400_328600
867969	contig_8652_pilon	+	680	1	Intergenic	novelGene_168783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCTACAATCCCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357302	357982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_+_357300_358000
867970	contig_3424_pilon	+	317	2	Intergenic	novelGene_55564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGTAATATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010992	1013748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1011139_1013577
867971	contig_13982_pilon	+	423	1	Intergenic	novelGene_163498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGCCTCTGCTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543818	544241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_543800_544200
867972	contig_1836_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_71066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATTTCTTTCTGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941073	941482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_941100_941500
867973	contig_5302_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_81532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACCACAGCACTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555684	1555332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1555300_1555700
867975	contig_3727_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_146756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359987	359714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_359700_360000
867976	contig_10732_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_114728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTGAGCCTTACACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397922	397529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_397500_397900
867978	contig_4868_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_136757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGCCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54720	54329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_54300_54700
867981	contig_13992_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_147664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGATTAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775823	776032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_775800_776000
867982	contig_6414_pilon	-	222	2	Intergenic	novelGene_157017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAACCTTAAGGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172285	171235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_-_171422_172249
867983	contig_11196_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_178128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	73	504	11078	10647	NA	45	AAGCAAATAGCAAAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLISALSYPASASVRHFFCDVTVMLSLATSDISAAKTAIFSEGLAVVLTPLLLVSLSYAHIFVAVLGARSAEGRRRVFSTCGAHLVVVSLFFGSVLSVYFRPSSAYSARYDRLASVVYAVVTPTLNPVIYSLRNKEVKGALKKGVQMDGCTPSVMRTGLHSVTFQK	11150	10545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11196_pilon_-_10500_11200
867984	contig_3382_pilon	+	421	1	Intergenic	novelGene_124099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAATTCATAATACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667764	668185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_667800_668200
867985	contig_16860_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_155334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGGTTAATTCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69335	68949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_68900_69300
867986	contig_3424_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_55596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTATTCCCAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192098	1192452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1192100_1192500
867988	contig_9528_pilon	-	382	1	Intergenic	novelGene_172335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGTTCAAGAATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64063	63681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_-_63700_64100
867989	contig_11883_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_163769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATGTTAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58643	58331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_58300_58600
867990	contig_9753_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_41309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTAAAGAATCACTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68096	67576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_67600_68100
867994	contig_3960_pilon	-	377	1	Intergenic	novelGene_138032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTTTCTAATAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550661	550284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_550300_550700
867995	contig_12520_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_161048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACATTGTGTCCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45622	45270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_45300_45600
867996	contig_2450_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_160310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGCAAAAAACAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739370	739745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_739400_739700
867997	contig_2414_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_158477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232307	232047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_232000_232300
868000	contig_10238_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_170100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGTCTGGTTTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209851	210495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_209900_210500
868001	contig_4769_pilon	+	363	1	Intergenic	novelGene_118020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAAGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148903	1149266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1148900_1149300
868002	contig_7057_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_123413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATTACATGCTGGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425333	1424857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1424900_1425300
868003	contig_5539_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_104748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAGAAAATCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40800	41274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_40800_41300
868004	contig_16071_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_165997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAGCTAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63368	62961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_63000_63400
868005	contig_11448_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_66374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTATCCAAACAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301112	300870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_300900_301100
868006	contig_4125_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_25114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACACTTTGTCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799070	798460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_798500_799100
868007	contig_19186_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_176050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117663	117992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_117700_118000
868008	contig_2724_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_172106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACGCAAACTACCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84751	85199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2724_pilon_+_84800_85200
868011	contig_12520_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_161058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAGGAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355509	355028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_355000_355500
868012	contig_57_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_44903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115521	115226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_115200_115500
868013	contig_11105_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_159831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTGTAATAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418020	418320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_418000_418300
868014	contig_10082_pilon	+	521	1	Intergenic	novelGene_63895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	149	469	406891	407211	NA	10	ACGTTCTTTCTGTCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECRPGGSKATASPSSFTLKLFKNLGKGVVRTNGRPSAGLARAPPRYGWLHVSINITYSRRLGVGSGSRACVQIPMPVAPTSSEPRDPCVCVPVCHEISLPFFSEF	406742	407263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_406700_407300
868016	contig_20064_pilon	+	275	1	Intergenic	novelGene_175636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAACAATAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71969	72244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20064_pilon_+_72000_72200
868017	contig_11709_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_168206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAAAAAAAATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30747	30252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_30300_30700
868018	contig_6497_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_35616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAGAGTGCTCATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646646	646839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_646600_646800
868019	contig_11396_pilon	-	244	1	Intergenic	novelGene_71445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCTCTCAACTGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1791701	1791457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1791500_1791700
868021	contig_11370_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_98761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGTACGTCTGAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212180	211474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_211500_212200
868022	contig_14740_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_174681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAAAAGGCCAGCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41180	41480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_41200_41500
868023	scaffold_2602_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_127680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTGAAAATATAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24969	24601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_24600_25000
868025	contig_6418_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_81126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAAAGGATGAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96065	95494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_95500_96100
868028	contig_13992_pilon	-	327	1	Intergenic	novelGene_147660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691635	691308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_691300_691600
868029	contig_11823_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_171017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14112	14622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_14100_14600
868030	contig_15123_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_110923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGCTTCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251383	251781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_251400_251800
868031	contig_3380_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_60142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTAATAAAAAAAACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040360	1039943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_1039900_1040400
868032	contig_1639_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_74891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTATGCTGTAAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280070	280411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280100_280400
868033	contig_715_pilon	+	454	1	Intergenic	novelGene_167557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	210	377	156681	156848	NA	30	TTCGGGAAGGGAGGATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLSLRKEVQALWRRRLWSRRGRCCRRRRLEQRRRRKILGRCGITPNAGTCCIESRGAATAAAPSREQCRMRHLPRTNVCSGGGRRGGRLGWLVHCVGYRGTEKQSAISFCTVIFVFKTRKGKRD	156471	156925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_156500_156900
868036	contig_13015_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_165536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACAACCTTCAGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74877	75221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_74900_75200
868040	contig_2114_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_104301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCGATTGTTCTACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877852	877581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_877600_877900
868041	contig_7943_pilon	-	380	1	Intergenic	novelGene_173141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAACTAATCTTACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169117	168737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_168700_169100
868043	contig_3751_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_158634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGACAGATGTGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108815	108352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_108400_108800
868044	contig_8285_pilon	-	508	2	Intergenic	novelGene_174978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCTTCGTTTGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740707	714230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_-_714594_740562
868046	contig_6445_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_77007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGCAGTAATAGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512146	512470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_512100_512500
868047	contig_8978_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_49363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255252	255450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_255300_255400
868048	contig_3797_pilon	+	193	1	Intergenic	novelGene_120095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTGGCTTATTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365202	365395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_365200_365400
868051	contig_8386_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_82241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAGGAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86035	86317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_86000_86300
868054	contig_9482_pilon	-	309	1	Intergenic	novelGene_44215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACGCGGGACCGCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68069	67760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_67800_68100
868056	contig_10780_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_155426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCTACACAACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92749	93019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_+_92700_93000
868057	contig_8850_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_172442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCAGGACGAGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374269	373948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_-_373900_374300
868058	contig_6634_pilon	+	382	2	Intergenic	novelGene_171147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCTTTTTGGCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300212	326086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_300362_325853
868061	contig_715_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_167551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGTCAAAACCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115878	116252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_+_115900_116300
868062	contig_3584_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_108131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGGCGAGACTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298828	298302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_298300_298800
868063	contig_938_pilon	-	393	2	Intergenic	novelGene_143904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCAGTGATCTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24150	23220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_23424_23960
868064	contig_9440_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_59034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAGAACTTTCAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277252	276901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_276900_277300
868066	contig_12689_pilon	-	548	1	Intergenic	novelGene_145062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGACACGGGAACTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325534	324986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_325000_325500
868067	contig_17198_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_62420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAGAAAAAATTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143889	1143333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1143300_1143900
868068	contig_5918_pilon	+	247	1	Intergenic	novelGene_99524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCCAGAATTTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606598	606845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_606600_606800
868069	contig_9424_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_143769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTTTGAGTAAGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68863	69362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_68900_69400
868071	contig_8624_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_112578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTTTTAACTAGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127764	1128132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_+_1127800_1128100
868072	contig_14288_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_153837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAGAAATACCTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445690	446247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_445700_446200
868077	contig_10235_pilon	-	235	3	Intergenic	novelGene_46532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	17.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAGGAGGAAGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358107	356289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_356325_357747_357904_358063
868079	contig_15108_pilon	+	395	1	Intergenic	novelGene_131187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGAGAATGTCCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134149	134544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_134100_134500
868080	contig_9516_pilon	+	407	6	Intergenic	novelGene_106136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	3.286335345031	2	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	12	395	406	313610	313621	FALSE	60	AGAAAATAAATTCACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPCALTLSQRNGQYELIIQLHEKEQHVQDIIPINSHFRCVQEAEETLLIDIASNSGCKIRVQGDRTRERRFEIPDEEHCLKFLSEVLAAQEAQLQLLVPEQKDSSSWYQKLDTKDKPGFSGLLGFEDNFSSMNLD	295804	313622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_295850_300097_300178_303616_303656_312487_312599_312970_313058_313577
868081	contig_5050_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_110242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAATACAATGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64723	64129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_64100_64700
868082	contig_8616_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_72496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAATAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325250	325839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_325200_325800
868083	contig_20524_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_176469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGATGGACATAATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	1432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20524_pilon_+_1100_1400
868085	contig_18794_pilon	-	375	1	Intergenic	novelGene_54630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTTTCAGAAAGTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79361	78986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_79000_79400
868086	contig_12624_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_61000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389909	389690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_389700_389900
868087	contig_8487_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_111908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAGTTAGGAAGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54921	54416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_54400_54900
868088	contig_18113_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_137520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTATATTTCTTTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76612	76979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_76600_77000
868090	contig_16883_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_161764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	138	267	404	581671	581808	NA	60	GGAAATAATAAACAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQGLCRQPDQGLCAHPGAECGGTERWPQGLGVWVPGVRLVVDLVVAVAALFVWPLPDHVQPLPRTGSPRAPWGLPVPLPAPHKEVNGYMAAGWVNEARRRGRRKKSWRRRHCGDWDAPWSPAAHFGDWGLYNHQ	581404	581810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_581400_581800
868091	contig_7816_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_66467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAATAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136622	136342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_136300_136600
868092	contig_5286_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_157335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGAAAAGGAATAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498963	498497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_498500_499000
868095	contig_5744_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_149334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGCAGATATGAATTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492729	493299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_492700_493300
868096	contig_2078_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_100152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGGGGGTGCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331615	331342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_331300_331600
868099	contig_11498_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_65518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGGTCCCAGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185235	185613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_185200_185600
868100	contig_6227_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_49668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGGCAAGTGCATAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489706	490052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_489700_490100
868102	contig_14537_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_158659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAAAGGCATAGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92637	92230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_92200_92600
868106	contig_8558_pilon	-	354	1	Intergenic	novelGene_123159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAAGCCATTTTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436119	435765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_435800_436100
868107	contig_11994_pilon	+	514	1	Intergenic	novelGene_129356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATTTCCTCCAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103040	103554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_+_103000_103600
868108	contig_4364_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCCCGGAGTGGTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235483	1235175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1235200_1235500
868109	contig_6937_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_175013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGAGATATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121849	122213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6937_pilon_+_121800_122200
868111	contig_1223_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_177966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGCCGCGGCTTTGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217177	217634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1223_pilon_+_217200_217600
868113	contig_15501_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_177573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTTAAAAAAAAACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12817	12365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15501_pilon_-_12400_12800
868114	contig_5092_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_62321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCCAGGCTCATTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491082	490661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_490700_491100
868116	contig_4782_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_73669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAGACAAGATAGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555191	555520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_555200_555500
868117	contig_5954_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_28576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGAGTGTCCTCTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899791	900182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_899800_900200
868118	contig_8820_pilon	+	459	2	Intergenic	novelGene_79273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	376	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	86	334	105695	106930	FALSE	20	AGTGGGAGAGAGTGGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRHVPVVYVDYPGPASLTQIYGTFNRAMLRLIPSLRTYAEPLTAAMVEFYTMSQERFTQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLPVEGLIRIWAHEALRLFQDR	105609	107055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_105776_106762
868119	contig_10732_pilon	+	412	1	Intergenic	novelGene_114685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCTAAGTTTTCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71952	72364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_72000_72400
868122	contig_2684_pilon	+	329	2	Intergenic	novelGene_172703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	361	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	42	329	167201	178776	FALSE	40	AAGGAAAATATGTACGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHRLLTLLLPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQC	167159	178776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_167429_178716
868124	contig_3942_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_128798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTCTGCCCCGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940295	940598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_940300_940600
868125	contig_10627_pilon	-	290	1	Intergenic	novelGene_60063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATTAGAAGTCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288685	1288395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1288400_1288700
868126	contig_5023_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_7111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGAATTAAAAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83933	84282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_83900_84300
868127	contig_9027_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_156371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302060	301818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_301800_302100
868128	contig_4469_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_21866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTAGCCCGTCTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5937	6480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_5900_6500
868129	contig_3397_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_154587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGTTCTGAGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165902	165489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_165500_165900
868130	contig_7562_pilon	-	566	1	Intergenic	novelGene_140888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGAGAAGGATCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281123	280557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7562_pilon_-_280600_281100
868131	contig_14341_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_111783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGAAAAACATGAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334194	333822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_333800_334200
868133	contig_2078_pilon	-	392	1	Intergenic	novelGene_100141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGACTCAGTGACCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269958	269566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_269600_270000
868135	contig_12638_pilon	-	537	2	Intergenic	novelGene_33363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCAATATAGTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463541	1462546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1462984_1463441
868137	contig_6871_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_21582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248859	248437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_248400_248900
868139	contig_7410_pilon	+	257	1	Intergenic	novelGene_106122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAATAAAAAGAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628240	628497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_628200_628500
868140	contig_18272_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_7029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATTTATTTAATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222757	222358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_222400_222800
868141	contig_8615_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_165226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTGAAGCCCTGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366240	365926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_365900_366200
868144	contig_14405_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_85654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACGGAAGAGGCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558607	559067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_558600_559100
868147	contig_4091_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_173035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAAGAGTTATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20129	20490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_20100_20500
868152	contig_563_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_169768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705708	705988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_705700_706000
868153	contig_3747_pilon	-	275	1	Intergenic	novelGene_24740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCGACTGCATAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109815	109540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_109500_109800
868154	contig_5083_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_151699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAGTCTTAATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634716	1634361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1634400_1634700
868158	contig_7182_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_117126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACATTTTCCAGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846090	846454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_846100_846500
868159	contig_16589_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_177907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAATGAAAGAAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8160	8680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16589_pilon_+_8200_8700
868160	contig_8676_pilon	+	434	1	Intergenic	novelGene_142195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAATCCAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133161	133595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_133200_133600
868161	contig_16714_pilon	+	374	1	Intergenic	novelGene_161572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808604	808978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_808600_809000
868163	contig_10021_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_168662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGACATTTATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917830	918286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_+_917800_918300
868164	contig_3825_pilon	+	342	2	Intergenic	novelGene_77995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCCCTGCAAGTGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760449	761149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_760535_760892
868165	contig_15543_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_164340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTGTATCATCCAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43881	44165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_43900_44200
868166	contig_9222_pilon	+	192	2	Intergenic	novelGene_177268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTAAAGGTGGTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21129	29052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9222_pilon_+_21244_28974
868167	contig_17493_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_122178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGGATTATAATCTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49770	49383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17493_pilon_-_49400_49800
868168	contig_5916_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_158049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCCCTCCCCAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419188	419502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_419200_419500
868169	contig_19292_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_177618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTGATTCCAGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27835	28142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19292_pilon_+_27800_28100
868170	contig_3789_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_79839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCAGAAAACAGATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404755	405057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_404800_405100
868171	contig_8312_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_152908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACCATTGCCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504907	1505457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1504900_1505500
868173	contig_14445_pilon	-	576	1	Intergenic	novelGene_137364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCAGGGGAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310193	309617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_309600_310200
868176	contig_10855_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_124389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAACTTCTACAAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843438	843741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_843400_843700
868177	contig_1450_pilon	+	393	1	Intergenic	novelGene_27442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACGTGGTCTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463452	463845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_463500_463800
868178	contig_15596_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_139515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAGAAAGAAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19455	19725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_19500_19700
868179	contig_567_pilon	-	368	1	Intergenic	novelGene_33948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTGGTACCTGGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221400	221032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_221000_221400
868181	contig_709_pilon	-	307	2	Intergenic	novelGene_57636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTTCTGCTTTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2735286	2734426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2734598_2735150
868182	contig_9436_pilon	-	410	2	Intergenic	novelGene_60895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	234	176	409	392596	392239	FALSE	15	TGATCGAACTGGGCGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALRTRAGEKVKLEEGGQTRGGGLGATGTPRRPAVPTPRPAADPGSKQGTWRPGTLGRMADPGLEPESEPESVFPREVGLFADSYSEKSRFCFCGHVLNITQNFGSRLGVAASVWDAALSLCSYFESQNVDFRGKK	392771	392237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_392296_392419
868183	contig_7173_pilon	+	437	1	Intergenic	novelGene_37535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAGAAAAGGCAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216684	217121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_216700_217100
868184	contig_5947_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_101564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATCTTCCCCTCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782359	782059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_782100_782400
868186	contig_9480_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_177204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTATTTCTGTTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18187	17984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9480_pilon_-_18000_18200
868187	contig_9363_pilon	-	447	1	Intergenic	novelGene_6676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTCAAGGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149142	1148695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1148700_1149100
868189	contig_4388_pilon	-	276	1	Intergenic	novelGene_161972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785311	785035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_785000_785300
868191	contig_5588_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_172851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGTGCCATTCTAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065318	1064895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064900_1065300
868192	contig_15360_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_171268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACTCCCAGCCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317484	237543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_237741_317316
868193	contig_9189_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_165111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTTTTTTATCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274781	274512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_274500_274800
868194	contig_8712_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_58853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711042	711379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_711000_711400
868198	contig_1339_pilon	-	261	3	Intergenic	novelGene_163130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTTTGCTTGTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428489	422561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_422687_428212_428326_428466
868199	contig_18272_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_7043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCGATGCAGAGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467897	467208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_467200_467900
868200	contig_184_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_177773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAAATCCAGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84196	83788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_184_pilon_-_83800_84200
868201	contig_6578_pilon	+	416	3	Intergenic	novelGene_162231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTCTTCGGCGGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74923	98117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_75036_77719_77971_98064
868202	contig_14508_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_79063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTATTCACTCTCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111949	111683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_111700_111900
868203	contig_7707_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_72238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTCCAACATATCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221222	1221638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1221200_1221600
868205	contig_3409_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_172318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAAACCCAGGTTCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330465	330132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_330100_330500
868206	contig_9332_pilon	+	246	1	Intergenic	novelGene_60695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAAATTGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10913	11159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_10900_11200
868207	contig_7593_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_127370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATTTAGGCCCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729782	729328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_729300_729800
868210	contig_11978_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_62860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTCCTAGAGAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595550	596013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_595600_596000
868212	contig_14322_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_115639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAGACATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352345	352842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_352300_352800
868214	contig_10437_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_38474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169817	1170090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1169800_1170100
868216	contig_17459_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_175519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGTGAATGGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18044	18366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17459_pilon_+_18000_18400
868217	contig_4659_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_118192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAGAAATTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169049	168499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_168500_169000
868218	contig_10197_pilon	+	317	1	Intergenic	novelGene_115193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAGCAATTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529764	530081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_529800_530100
868219	contig_6488_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_44767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCGCCTTGTGCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208734	209289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_208700_209300
868220	contig_1090_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_131136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAGGGAGAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470545	470243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_470200_470500
868221	contig_11338_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_6324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCACTCGCACCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255635	255124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_255100_255600
868224	contig_5902_pilon	+	380	1	Intergenic	novelGene_178129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAAGGTAGATATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38324	38704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5902_pilon_+_38300_38700
868226	scaffold_6394_pilon	+	311	1	Intergenic	novelGene_110950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCCAGCTCTGGGTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125711	126022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_125700_126000
868227	contig_13525_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_145094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTGCAGAATACGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111866	111492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_-_111500_111900
868229	contig_14698_pilon	+	464	1	Intergenic	novelGene_168127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTGTGGGTCTGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21691	22155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_21700_22200
868230	contig_15672_pilon	+	310	1	Intergenic	novelGene_171829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCCAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143264	143574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15672_pilon_+_143300_143600
868232	contig_15471_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_175227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAGAGAAAGATGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376120	375797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_375800_376100
868233	contig_10855_pilon	-	448	1	Intergenic	novelGene_124295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	267643	267293	NA	35	GTACTTTGAATGCATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPASPILCLNPKISVPPSVPAVTSPSLAFKAGRRPPPCSQPPPSFFKHRAELCPPKLGGPRNCPNLCYLPGACQTWVFQIPTAPARTLLKFKQLLIAEPLVTPPSPRSNQPLVPVK	267644	267196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_267200_267600
868235	contig_3602_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_60572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCCAGACTTAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552941	553439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_552900_553400
868236	contig_9919_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_137953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGACTTCTTTCCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539785	539350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_539400_539800
868237	contig_13700_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_68297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAGAAAAAAAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162975	163239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_163000_163200
868238	contig_2067_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_158919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCATAGAGATGACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508321	507897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_507900_508300
868239	contig_11483_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_172694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTCAGGAAGCAAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165767	166157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_+_165800_166200
868240	contig_5429_pilon	+	268	1	Intergenic	novelGene_127794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATTTCACATTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196684	196952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_196700_197000
868241	scaffold_12124_pilon	+	286	1	Intergenic	novelGene_22020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAGAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818559	818845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_818600_818800
868242	contig_10051_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_175603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTCCCACGTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460817	460403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_460400_460800
868243	contig_1594_pilon	-	235	1	Intergenic	novelGene_138855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTAGCTTTAGCCATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750505	750270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_750300_750500
868244	contig_14341_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_111819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCAGCTTCCTACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547210	546624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_546600_547200
868247	contig_15146_pilon	+	454	2	Intergenic	novelGene_116941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATAATAAAATGACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223924	224730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_223961_224312
868248	contig_2278_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_118134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCATCATTTCAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035926	1035565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1035600_1035900
868249	contig_3382_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_124224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1923753	1923356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1923400_1923800
868250	contig_14341_pilon	-	374	1	Intergenic	novelGene_111900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAAGCCCGTGTGTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747501	747127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_747100_747500
868252	contig_5901_pilon	+	430	2	Intergenic	novelGene_178131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGTTACGTTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349889	355087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5901_pilon_+_350140_354907
868253	contig_3754_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_146842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAATTTGATTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379210	379595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_379200_379600
868254	contig_3787_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_102382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGAGCCCTGGGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417429	417817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_417400_417800
868255	contig_6770_pilon	-	485	1	Intergenic	novelGene_178133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTCCTGGCTCTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19861	19376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6770_pilon_-_19400_19900
868256	contig_17518_pilon	-	369	1	Intergenic	novelGene_117357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACATGAGTCCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103111	102742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_102700_103100
868257	contig_13496_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_107637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATGAATATACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285475	285318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_285300_285500
868258	contig_6217_pilon	-	468	1	Intergenic	novelGene_109608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAATAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405003	404535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_404500_405000
868259	contig_10437_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_38345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCAAGGTACCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520721	520357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_520400_520700
868260	contig_4114_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_15637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAAGAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553364	553949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_553400_553900
868261	contig_11883_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_163779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTAGCAATATCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118503	119006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_118500_119000
868263	contig_10017_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_156997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTATGGTTTGAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346084	345772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_345800_346100
868264	contig_12301_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_110014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGGAAAATAGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90345	89932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_89900_90300
868266	contig_3285_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_153385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGAGGGGGAGAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124727	125167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_124700_125200
868267	contig_13456_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_153277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGATAATTATTTCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199384	199636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_199400_199600
868268	contig_16310_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_70061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTCCTTTTGTGCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199909	199472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_199500_199900
868269	contig_1090_pilon	+	209	1	Intergenic	novelGene_131095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAGAAATATCTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116324	116533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_116300_116500
868271	contig_10300_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_152933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCACTCACTTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382915	387053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_383090_386877
868272	contig_9647_pilon	-	266	1	Intergenic	novelGene_127380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAGGAAAATTAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42202	41936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_-_41900_42200
868273	contig_5881_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_129035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGCCAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260447	260886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_260400_260900
868274	contig_4754_pilon	-	265	1	Intergenic	novelGene_35917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218913	218648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_218600_218900
868276	contig_6589_pilon	-	269	1	Intergenic	novelGene_25952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCCAGCCTAAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292237	1291968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1292000_1292200
868277	contig_16790_pilon	-	233	1	Intergenic	novelGene_171672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAGAAAAACAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2414	2181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_-_2200_2400
868278	contig_7412_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_76271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAATCCAAAGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235059	234738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_234700_235100
868280	contig_14023_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_165372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGACCCGAAATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201069	200638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_200600_201100
868281	contig_10437_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_38175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCACTCTGCAACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164500	164109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_164100_164500
868282	contig_9785_pilon	+	283	1	Intergenic	novelGene_157906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCACAAGTCTCCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548987	549270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_549000_549300
868283	contig_11356_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_175267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTAAAAAAAAATTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313275	312876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_312900_313300
868285	contig_8453_pilon	-	323	1	Intergenic	novelGene_125115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATATTAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104021	103698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_103700_104000
868286	contig_19330_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_163697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAAAGGCTCCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63173	62634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_62600_63200
868289	contig_8955_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_175082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGGGGAAAAAAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180149	180567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_180100_180600
868290	contig_9144_pilon	-	276	2	Intergenic	novelGene_151147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAGGAAGAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848801	836758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_-_836790_848556
868292	contig_8801_pilon	-	341	1	Intergenic	novelGene_66253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGCGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195949	195608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_195600_195900
868293	contig_12644_pilon	-	471	1	Intergenic	novelGene_44523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	42	398	1346026	1345670	NA	5	TTCATCGGTGTCGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPCGGSACAVFGARGIVSSGFPQGSDTGPRKDCESLTEPVPCRNPGLVRGQEPQTMDRKRVGMARGLRLGLQGRMSATSGWAGTRPQLSLGFCGPAPCTWDKWKGAYVHFVVRLSIV	1346067	1345596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1345600_1346100
868294	contig_4244_pilon	-	293	2	Intergenic	novelGene_175902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCCTCCATTCTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57216	55984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4244_pilon_-_56196_57134
868295	contig_11447_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_168100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGGGCACAGGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502393	502748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_+_502400_502700
868297	contig_6410_pilon	+	341	1	Intergenic	novelGene_108653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCAAAACAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489007	489348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_489000_489300
868298	contig_16666_pilon	+	313	1	Intergenic	novelGene_61809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCTCCCCCAGGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223334	223647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_223300_223600
868300	scaffold_14325_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_162664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGACTAGTTTGAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309311	308880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_308900_309300
868301	contig_4339_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_146106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224613	1224900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1224600_1224900
868302	contig_13800_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_153715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGGCTCCTGAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97150	97458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_97200_97500
868304	contig_16503_pilon	-	358	1	Intergenic	novelGene_162079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGTCAGGAAATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377588	377230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_377200_377600
868306	contig_4857_pilon	+	229	1	Intergenic	novelGene_48681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAGACCCCTTCGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1109574	1109803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1109600_1109800
868307	contig_3789_pilon	-	426	2	Intergenic	novelGene_79884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTTAAAAAGCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558264	555996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_556324_558165
868308	contig_9752_pilon	-	333	1	Intergenic	novelGene_122032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGGAGAAAAAAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178791	178458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_178500_178800
868309	contig_9150_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_140910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAGTCAAGCGGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59761	60028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_+_59800_60000
868310	contig_5628_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_157588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAATACGGTCCCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433445	433727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_433400_433700
868312	contig_7171_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_101434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAACTTCGGTCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1590431	1590871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1590400_1590900
868313	contig_9609_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_23100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAAATGCTTCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495131	494752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_494800_495100
868314	contig_10235_pilon	-	350	1	Intergenic	novelGene_46504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTTTTTCCTCTCTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280471	280121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_280100_280500
868315	contig_5566_pilon	+	232	1	Intergenic	novelGene_153653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTATAAAACTGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167789	168021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_167800_168000
868316	contig_11493_pilon	+	479	1	Intergenic	novelGene_143736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGCCTTTTAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356831	357310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_356800_357300
868317	contig_10600_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_169878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGAAGCCAGGGCCGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336120	335815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_335800_336100
868318	contig_3861_pilon	-	271	1	Intergenic	novelGene_57883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCCGGTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141272	141001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_141000_141300
868319	contig_6445_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_77095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCGTGTAAGGAGAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095245	1095493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1095200_1095500
868320	contig_9679_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_173405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12221	12539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_12200_12500
868323	scaffold_19766_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_34313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGGTGGAACAGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563906	563442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_563400_563900
868324	contig_1055_pilon	-	339	1	Intergenic	novelGene_149719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCTTTACTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20524	20185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_20200_20500
868326	contig_6427_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_162584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCCACCGCCTCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171026	1170477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_1170500_1171000
868329	contig_10196_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_132279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	7	309	2159415	2159113	NA	5	CACTCTGGTGTCTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCMCLCVVCVYEMHLKSTHFTLNTWAGYRELEFSVCGRSFSETKFTTVKRMGFKDSFSEFWQVPMPAKQICQGHCRPGCTTGRFPLAPPPAGSFVADFCHCR	2159421	2159068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2159100_2159400
868330	contig_11855_pilon	-	182	1	Intergenic	novelGene_66880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTATTATTATTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594582	594400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_594400_594600
868331	contig_8647_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_178120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTAAATCACCCATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978893	979247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_978900_979200
868332	scaffold_16735_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_160364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382155	382544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_+_382200_382500
868334	contig_641_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_170140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCATGGAGGGCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46897	46536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_46500_46900
868335	contig_9389_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_84072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTCTCTTTAAATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016144	1015784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1015800_1016100
868336	contig_1154_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_87178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGTGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951664	951955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_951700_952000
868338	contig_4782_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_73608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142836	142407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_142400_142800
868340	contig_13722_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_174631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCGACTTGGAGGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13750	13501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_-_13500_13800
868344	contig_6088_pilon	+	253	1	Intergenic	novelGene_161278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTATAAATTAAAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261338	261591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_261300_261600
868345	contig_2596_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_53442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAAGAAACGAGGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23882	24368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_23900_24400
868347	contig_5084_pilon	-	370	1	Intergenic	novelGene_64595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	47	370	940966	940643	NA	30	CATTATCGATGACGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAHTRIRGLSLLHIPVSAKRTWAQSTPLASFTWLPTGCKLLQNCVILGSSSASILPPSAVNGSHSLNAEWMPGAGARYLLWHLEHHISPLAPYFCQPLIHPSRSDT	941012	940642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_940600_941000
868349	contig_12871_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_140382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATGTTTCATTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102072	102433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_102100_102400
868350	contig_15353_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_151965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGATACTGAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265488	265728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_265500_265700
868351	contig_15882_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_144802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTTTATAGATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45593	45139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_45100_45600
868352	contig_9919_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_137974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAGGAAAATGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601339	601101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_601100_601300
868353	contig_7004_pilon	-	394	3	Intergenic	novelGene_126443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTGCTCTCTCTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164955	164294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_164511_164672_164815_164919
868354	contig_14326_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_120764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTATGGTTTTCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620573	620197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_620200_620600
868356	contig_3202_pilon	-	317	1	Intergenic	novelGene_167393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTTGAGGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75683	75366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_-_75400_75700
868357	contig_5217_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_135807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGGGGTGGGCTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015359	1015896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_1015400_1015900
868358	contig_602_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_134924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTGTTTAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39070	39384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_39100_39400
868359	contig_12709_pilon	-	238	1	Intergenic	novelGene_147392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26722	26484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_26500_26700
868360	contig_17936_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_29975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGGAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142132	141872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_141900_142100
868361	contig_11656_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_53986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGTGCTGCCTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371662	371279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_371300_371700
868363	contig_546_pilon	+	207	1	Intergenic	novelGene_117250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAACAAAACCCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464052	464259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_464100_464300
868368	contig_7411_pilon	-	371	1	Intergenic	novelGene_137052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTCCAAAGCATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986962	986591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_986600_987000
868369	contig_89_pilon	+	273	1	Intergenic	novelGene_176390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAAAAAAAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188206	188479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_+_188200_188500
868370	contig_9785_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_157898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAATAAAGTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401550	401931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_401600_401900
868371	contig_4782_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_73653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTATTACAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474047	473731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_473700_474000
868372	contig_9434_pilon	+	210	1	Intergenic	novelGene_150511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATTGCTGAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382420	382630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_382400_382600
868373	contig_2093_pilon	-	351	1	Intergenic	novelGene_152959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCCAATAAATTAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064412	1064061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1064100_1064400
868375	contig_829_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_168929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAAGGTTTTTTGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212486	211996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_212000_212500
868378	contig_11989_pilon	-	330	1	Intergenic	novelGene_68443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAAAAAATTATCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48071	47741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_47700_48100
868379	contig_12545_pilon	+	388	1	Intergenic	novelGene_178138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCCCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89387	89775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12545_pilon_+_89400_89800
868380	contig_3960_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_138007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTTATGAAATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342137	342515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_342100_342500
868382	contig_5643_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_38918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTGGTGGAAGGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386052	385733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_385700_386100
868383	contig_3601_pilon	+	292	1	Intergenic	novelGene_132907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAAAAAAAATGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229111	229403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_229100_229400
868384	contig_990_pilon	+	307	1	Intergenic	novelGene_76069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGTGTAACAATATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075291	1075598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1075300_1075600
868385	contig_4782_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_73598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAACCCAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65373	65143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_65100_65400
868386	contig_7171_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_101375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361121	1361376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1361100_1361400
868389	contig_3627_pilon	+	230	1	Intergenic	novelGene_78427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAACCCAAATTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220074	220304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_220100_220300
868390	contig_12123_pilon	-	291	1	Intergenic	novelGene_144592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCATCGAGTCAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72384	72093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_72100_72400
868391	contig_2867_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_135166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTGAGAAAAACCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556111	556410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_556100_556400
868392	contig_7416_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_134338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTCCCACTCCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892522	892087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_892100_892500
868394	contig_6557_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_33023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCCGTCGAGGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627460	627701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_627500_627700
868395	scaffold_7386_pilon	-	215	2	Intergenic	novelGene_136602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGATTGCCACCACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343551	342674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_342766_343427
868396	contig_4751_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_173725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGGAAAGAAAAAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281913	282265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_281900_282300
868397	contig_9852_pilon	+	273	2	Intergenic	novelGene_138482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGAAAAGGTAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572652	573470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_572871_573415
868398	contig_5669_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_86099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAGTTATCCATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285199	285666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_285200_285700
868399	contig_10627_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_59981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAAGAGCAAGGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250922	250670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_250700_250900
868400	contig_5264_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_165057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAATTTCTGTATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125581	125881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_125600_125900
868402	contig_9074_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_156621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATCCTACCTTAACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60825	60539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_60500_60800
868403	contig_5125_pilon	+	252	1	Intergenic	novelGene_43508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAAATGGAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117044	1117296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1117000_1117300
868404	contig_9375_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_136066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTTAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373863	374217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_373900_374200
868406	contig_5084_pilon	-	282	1	Intergenic	novelGene_64495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGACTAAAGACCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277347	277065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_277100_277300
868409	contig_7229_pilon	-	280	1	Intergenic	novelGene_39859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGGAGATGTGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424027	1423747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1423700_1424000
868410	contig_7695_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_41616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	280	375	623044	623139	NA	15	TGCGCACGGCGCTTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELGGAAGIGTFGRLSGSPGREARGPPPHLPAVRIATPNPWFCLSGPVGRALPNLLLPGRSGDLNRPDAYGAAGPKAAAGETAILPPASPHPEMRRGRAARAPRKGRWWGGASLPGRAASRSSV	622764	623153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_622800_623200
868411	contig_10331_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_54160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTGTGCCAGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502673	503214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_502700_503200
868413	contig_7979_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_125555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTTTTCTTAGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137242	1137713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1137200_1137700
868414	contig_15707_pilon	+	336	1	Intergenic	novelGene_173238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAGACAAAGAACGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66571	66907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15707_pilon_+_66600_66900
868415	contig_3150_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_171917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329182	328844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_-_328800_329200
868417	contig_7331_pilon	+	352	1	Intergenic	novelGene_67237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAATTAAAGCAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645082	645434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_+_645100_645400
868419	contig_709_pilon	-	388	1	Intergenic	novelGene_57557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAACTGTGTTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555019	1554631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1554600_1555000
868420	contig_5125_pilon	+	300	1	Intergenic	novelGene_43494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	42	259	300	909402	909443	NA	15	CTCCCGAAGGGGATGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPEVEEGCRIPQALLSEGPGRCAAAAATRTAPSAARRRSPSPLELNGRSSDAGVRDRSSAGRGPRKARPGHLYGLPGGQEACSGQMAVGEVCGEWGGSS	909143	909443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_909100_909400
868421	contig_20889_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_127653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGAAGAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59447	59153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_59200_59400
868422	contig_6842_pilon	-	338	1	Intergenic	novelGene_130705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGTGTATCTCAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411678	411340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_411300_411700
868424	contig_9527_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_134033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAGGAAGGTGAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219823	219402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_219400_219800
868425	contig_8581_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_22803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201378	201654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_201400_201700
868427	contig_5145_pilon	+	259	1	Intergenic	novelGene_131364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343636	343895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_343600_343900
868428	contig_15327_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_70814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTATAATTAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416443	1416926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1416400_1416900
868429	contig_9177_pilon	-	348	1	Intergenic	novelGene_32766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCTTAATCTTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333599	1333251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1333300_1333600
868430	contig_11855_pilon	+	476	3	Intergenic	novelGene_66933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	1	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTCTCAAGCTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999940	1000689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1000047_1000245_1000358_1000431
868431	contig_8772_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_21064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAAGGCGAGGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14210	14572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_14200_14600
868432	contig_15412_pilon	+	482	1	Intergenic	novelGene_165473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGCTGTGATAAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137593	138075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_+_137600_138100
868434	contig_7321_pilon	+	302	2	Intergenic	novelGene_53148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTGGCAGAAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433684	439372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_433971_439356
868435	contig_1172_pilon	-	225	1	Intergenic	novelGene_162034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621327	621102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_621100_621300
868437	contig_3797_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_120115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAACCCTGGAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545503	545188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_545200_545500
868438	contig_9415_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_109836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAAAAAGTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1929604	1929907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1929600_1929900
868440	contig_14953_pilon	-	279	1	Intergenic	novelGene_137267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21249	20970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_21000_21200
868441	contig_6048_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_73198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAAGTCCTATGAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481736	1482060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1481700_1482100
868442	contig_5814_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_143049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGATCCGCTCCCCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295196	294891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_294900_295200
868443	contig_6634_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_171153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGACTTAAAGACAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452013	452297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_452000_452300
868444	contig_10196_pilon	+	318	1	Intergenic	novelGene_132225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTATTAAGGAACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406653	1406971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1406700_1407000
868445	contig_15410_pilon	+	440	1	Intergenic	novelGene_130602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCGGGACTCCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142912	143352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_142900_143400
868446	contig_8683_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_150261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAGACCCCCACCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621507	621851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_621500_621900
868447	contig_11642_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_172928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467193	467621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_467200_467600
868448	contig_19973_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_173776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAAAAAAATTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33112	33516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19973_pilon_+_33100_33500
868449	contig_10500_pilon	+	297	1	Intergenic	novelGene_41216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAGAAAAAAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598116	1598413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1598100_1598400
868450	contig_6954_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_64453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACGTGTTGTCGACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702770	702325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_702300_702800
868452	contig_1575_pilon	+	338	2	Intergenic	novelGene_45169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTTTCGATGGAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81945	82686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_82237_82639
868453	contig_10938_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_171771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAATGGCTCACATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252528	252059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_-_252100_252500
868454	contig_18869_pilon	+	245	1	Intergenic	novelGene_56473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212905	213150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_212900_213200
868455	contig_3956_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_14815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAATTTTTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281408	1281122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281100_1281400
868457	contig_13129_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_177852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140133	140427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13129_pilon_+_140100_140400
868458	contig_7775_pilon	-	343	1	Intergenic	novelGene_37481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCATGTTCTGAGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146715	146372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_146400_146700
868460	contig_10003_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_88285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTATTACATTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866846	867253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_866800_867300
868461	contig_7704_pilon	-	211	1	Intergenic	novelGene_154631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTTCTACGATTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416459	416248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_416200_416500
868462	contig_4413_pilon	+	277	1	Intergenic	novelGene_116994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTTCTGTATTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158474	158751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_+_158500_158800
868464	contig_10183_pilon	+	468	1	Intergenic	novelGene_169500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAATGTAAATTCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15447	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_15400_15900
868465	contig_7342_pilon	+	289	2	Intergenic	novelGene_71143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAAATCTGGGCTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298921	305350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_298993_305132
868466	contig_10811_pilon	+	368	1	Intergenic	novelGene_165785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGACAGAATTACTACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96602	96970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_96600_97000
868467	contig_7106_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_148310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGAGGTGACGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420076	420400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_420100_420400
868468	contig_7272_pilon	+	516	1	Intergenic	novelGene_25389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGACCTGTTTGGGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747428	747944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_747400_747900
868469	contig_7704_pilon	-	355	1	Intergenic	novelGene_154633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTCGCGGAGTAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458857	458502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_458500_458900
868472	contig_5649_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_82405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCAAGGTAGAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257400	1256988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1257000_1257400
868473	contig_14575_pilon	+	302	1	Intergenic	novelGene_101906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCAGTAGAACTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88155	88457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_88200_88500
868474	contig_9415_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_109902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTGAAGTATTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2102783	2102506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2102500_2102800
868479	contig_5845_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_98895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCGGAAAATGCCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158102	158518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_158100_158500
868481	contig_13051_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_140129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	74	225	85	309	391161	390937	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQPDIVSPALRPWKWHLATPSFSFLVCKMKVTPSTSQIVENTHKLTSPARKGLPHLGCPAQLLRSRNISSSFHYGTRSGIGGIGAHLSPPTVSNLRTPPHTE	391245	390802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_390800_391200
868484	contig_11702_pilon	-	268	1	Intergenic	novelGene_142024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGGCTGGGGAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571004	570736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_570700_571000
868486	contig_12644_pilon	+	367	1	Intergenic	novelGene_44440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTATGAGCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308041	308408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_308000_308400
868488	contig_10331_pilon	-	229	1	Intergenic	novelGene_54222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCAAGGTATACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605423	1605194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1605200_1605400
868489	contig_9919_pilon	+	322	1	Intergenic	novelGene_137955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAGAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543550	543872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_543600_543900
868490	contig_7171_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_101215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCTCAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371523	371162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_371200_371500
868491	contig_8386_pilon	+	319	1	Intergenic	novelGene_82240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTTGATTTTACTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85975	86294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_86000_86300
868492	contig_12964_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_131679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243393	243081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_243100_243400
868493	contig_10749_pilon	+	269	1	Intergenic	novelGene_133420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAATTCTTCTTTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67939	68208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_67900_68200
868494	contig_16599_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_175675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTTTTATAGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454698	454410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16599_pilon_-_454400_454700
868495	contig_8820_pilon	-	243	1	Intergenic	novelGene_79274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107933	107690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_107700_107900
868498	contig_7569_pilon	+	375	1	Intergenic	novelGene_114601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTCCAGTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172379	172754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_172400_172800
868499	contig_9527_pilon	+	261	1	Intergenic	novelGene_134086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTTTCTATTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501404	501665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_501400_501700
868500	contig_5039_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_64750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTATAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111015	110720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_110700_111000
868501	contig_18607_pilon	+	228	1	Intergenic	novelGene_175117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCTATCCAATCAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309239	309467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_309200_309500
868504	contig_10196_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_132068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	240	311	793335	793406	FALSE	55	AGCTAGACAGACAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDRPPRSRFTRVQRATCCVLLLCLFLGANAVWYGVVGDAAHSAQLVSSVIPLSVDTLAVGLVSSVVVYPVYLGILFLFRMSRSQVGRGRGPWMKWCRGCAIF	792974	793465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_793102_793222
868505	contig_7870_pilon	-	234	1	Intergenic	novelGene_109043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGCTCAACTCAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621386	621152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_621200_621400
868506	contig_3382_pilon	-	273	2	Intergenic	novelGene_124221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAATAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1847864	1846811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1847061_1847840
868507	contig_3817_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_78401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAAAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264517	1264058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1264100_1264500
868508	contig_5338_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_114578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTTTTATCTTACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384550	384273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_384300_384600
868509	contig_753_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_112930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAGATCCCATCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515812	516151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_515800_516200
868510	contig_4469_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_21941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAAACACACCCATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728835	729174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_728800_729200
868511	contig_9189_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_165137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGATTTTTTTTAGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565112	564848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_564800_565100
868514	contig_1986_pilon	-	361	1	Intergenic	novelGene_64141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTTACCTTTCATCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372540	372179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_372200_372500
868515	scaffold_16539_pilon	+	295	1	Intergenic	novelGene_68416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGTTTGTGCAAACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928951	929246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_929000_929200
868516	contig_3193_pilon	+	389	1	Intergenic	novelGene_126319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAAGGAAGACAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117000	117389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_117000_117400
868517	contig_6888_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_147056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCTCAACCTAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4281	4587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_4300_4600
868520	contig_3956_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_14793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTCACCCGTCGGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168889	1169267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1168900_1169300
868521	contig_253_pilon	-	417	1	Intergenic	novelGene_129631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGGGTTTCTTACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216504	216087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_216100_216500
868522	contig_11378_pilon	+	291	1	Intergenic	novelGene_112213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGGGGGCAAGATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257801	258092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_257800_258100
868525	contig_11378_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_112252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTTAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362831	362412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_362400_362800
868526	contig_366_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_51555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGGAGGATGGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624586	624262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_624300_624600
868528	contig_9440_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_59089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGTAATATTCATCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695510	1695754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1695500_1695800
868529	contig_10042_pilon	+	331	1	Intergenic	novelGene_79194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGCTTTTGCTCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945250	945581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_945200_945600
868533	contig_6397_pilon	+	358	1	Intergenic	novelGene_146221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTCACACGAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32932	33290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_32900_33300
868536	contig_12496_pilon	+	507	1	Intergenic	novelGene_170709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGTGAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302799	303306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12496_pilon_+_302800_303300
868537	contig_15021_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_26994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	108	362	406575	406829	NA	50	CTCTAAGAACCAAAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVRSTLLPPATPALWCSGYGWCRAPLRCNASGAYMASQSELSLRENTQKRLSLLPHIRKLIAENCGTQDSTGKSPCRTPPCEEEHRRRFLQPSLQHSHPSRVDTARIFHLWFFQNVAL	406467	406871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_406500_406900
868539	contig_13744_pilon	-	312	1	Intergenic	novelGene_77165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315990	315678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_315700_316000
868540	contig_16231_pilon	-	424	1	Intergenic	novelGene_176718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGTATCTCCATGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136971	136547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_136500_137000
868541	contig_15327_pilon	-	390	1	Intergenic	novelGene_70530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAACTAGAAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489913	489523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_489500_489900
868542	scaffold_12124_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_22387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCAGTGAATCGAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497127	1497414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497100_1497400
868545	contig_5039_pilon	+	345	1	Intergenic	novelGene_64941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTGACTGACAGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1445173	1445518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1445200_1445500
868547	contig_12229_pilon	+	215	1	Intergenic	novelGene_169389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81541	81756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_81500_81800
868548	contig_13740_pilon	+	251	1	Intergenic	novelGene_34752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTAAGATAACTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682625	682876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_682600_682900
868550	contig_9571_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_136337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTACTATTTGGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790839	791106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_790800_791100
868553	contig_15021_pilon	+	445	1	Intergenic	novelGene_26915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	63	341	6355	6633	NA	5	GGCCCCTCAGCTGTCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQCRSWQSLARSKELQSLSEMNYIIPSAVHCDFPDINLHSRGAPSDSSSRPASTGGSEARRHLHLGRFPRVHRILVQLGARPRRQEFGAPPARSPFLPPRAGQPAAWRRPPR	6292	6737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_6300_6700
868554	contig_7720_pilon	+	350	1	Intergenic	novelGene_155801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGCTGTCTTTTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858961	859311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_859000_859300
868557	contig_12886_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_135532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACACACAAAAAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870792	871145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_870800_871100
868558	contig_935_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_45505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACCTTTGAAATGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13133	12813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_12800_13100
868560	contig_6919_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_163972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAAAAATGTTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19469	19264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_19300_19500
868561	contig_8866_pilon	-	186	1	Intergenic	novelGene_77850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTACTAAGCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647493	647307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_647300_647500
868562	contig_14980_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_78235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACCATAAGGATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548715	549008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_548700_549000
868563	contig_8673_pilon	+	425	1	Intergenic	novelGene_129936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACAGTAAACATATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351997	352422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_352000_352400
868564	contig_17_pilon	+	217	1	Intergenic	novelGene_173985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101987	1102204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_1102000_1102200
868565	contig_14441_pilon	+	264	1	Intergenic	novelGene_100384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAACAGATAGATGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39549	39813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_39500_39800
868566	contig_11846_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_106027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTTCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608288	608705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_608300_608700
868567	contig_7662_pilon	+	244	1	Intergenic	novelGene_176563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTAAACAAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387013	387257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7662_pilon_+_387000_387300
868568	contig_14048_pilon	-	287	1	Intergenic	novelGene_146332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCCATTACCCAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319445	319158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_319200_319400
868569	contig_15245_pilon	-	267	1	Intergenic	novelGene_145224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGGAAAAAAGAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86167	85900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_85900_86200
868570	contig_2069_pilon	+	289	2	Intergenic	novelGene_23472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCACCCGCCCCCGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1506993	1507573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1507092_1507382
868571	contig_13460_pilon	+	379	1	Intergenic	novelGene_162177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATATAACTTAATGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106984	107363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_107000_107400
868572	contig_10238_pilon	+	298	3	Intergenic	novelGene_170095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	394	junction_2	28.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCGGCGCCGCGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96276	104531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_+_96446_100782_100838_104457
868573	contig_8045_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_35434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTGCTTCTTGGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414687	414425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_414400_414700
868574	contig_2043_pilon	+	260	1	Intergenic	novelGene_169893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTGCATTAGGATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334784	335044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_334800_335000
868575	contig_675_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_136359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTCATCCTTTGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260339	260058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_-_260100_260300
868577	contig_4732_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_75359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTGTATTTACATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95296	95562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_95300_95600
868579	contig_11720_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_44017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATAACCCTGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275842	275584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_275600_275800
868582	contig_10958_pilon	-	353	1	Intergenic	novelGene_5361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACCGCGTAGCAGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803287	802934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_802900_803300
868583	contig_8027_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_158845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTTGCAAAAAAAAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315358	315767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_315400_315800
868586	contig_1575_pilon	-	273	1	Intergenic	novelGene_45172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGCAGACCCGCGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83827	83554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_83600_83800
868588	contig_15165_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_145328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355708	355453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_355500_355700
868591	contig_14953_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_137280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATGAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145468	145752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_145500_145800
868593	contig_9290_pilon	-	413	1	Intergenic	novelGene_77576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTGTCTTCAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511835	511422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_511400_511800
868594	contig_7070_pilon	+	344	1	Intergenic	novelGene_104058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAATAGGGCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224104	224448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_224100_224400
868595	contig_8014_pilon	-	246	1	Intergenic	novelGene_178143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTAAGACATCTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468539	468293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8014_pilon_-_468300_468500
868596	contig_11602_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_166603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATACACAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264416	264657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_264400_264700
868597	contig_9720_pilon	+	315	1	Intergenic	novelGene_116777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385807	386122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_385800_386100
868600	contig_19564_pilon	+	267	2	Intergenic	novelGene_29646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCCCTTCAGCTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14357	14702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_14533_14610
868603	contig_11448_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_66360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATGGCCCTAGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215478	215089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_215100_215500
868604	contig_1443_pilon	-	210	1	Intergenic	novelGene_28264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGCGCTGTGTCTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646326	646116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_646100_646300
868605	contig_3948_pilon	+	285	1	Intergenic	novelGene_53371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAAGAAAACCAGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1812707	1812992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1812700_1813000
868606	contig_12619_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_73585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGAATTCTAGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005377	1005698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_1005400_1005700
868607	contig_12437_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_169075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGATTTTGGAAGGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46840	47167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_46800_47200
868610	contig_13937_pilon	-	191	1	Intergenic	novelGene_167362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGCGTGCACTTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100388	100197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_100200_100400
868611	contig_6446_pilon	+	293	1	Intergenic	novelGene_149259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATTCTACTCTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694504	694797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_694500_694800
868613	contig_8263_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_83100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTTAAAAAATAAGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143986	144315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_144000_144300
868615	contig_14405_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_85653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACTGTGAACCACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554155	554487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_554200_554500
868616	contig_513_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_80137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAACTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327847	328174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_327800_328200
868617	contig_3424_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_55598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGTTGCATAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308441	1308800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1308400_1308800
868618	contig_4364_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_4594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACGCTCCATCACGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2158227	2158554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2158200_2158600
868619	contig_14790_pilon	-	230	1	Intergenic	novelGene_127918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAACCGCAGCGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197174	196944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_196900_197200
868622	contig_6364_pilon	-	227	1	Intergenic	novelGene_51820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAGGTCCAGTATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585177	1584950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1585000_1585200
868623	contig_7548_pilon	+	382	3	Intergenic	novelGene_117638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	9	314	235047	238418	FALSE	30	GCACAATGGCAGACATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMQGAAGLLGLKTGGVHFVTAEGLGEVRGIFSRQATGSWQARGALGMTHHLALETFGCLASKVHSIQTHSTLCGSHVQSHVESVRNIVVHALLKTPTEFLWS	235038	238486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_235202_235765_235904_238405
868624	contig_5918_pilon	+	256	1	Intergenic	novelGene_99594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAATAATTTTTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2040726	2040982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2040700_2041000
868625	contig_9267_pilon	-	301	1	Intergenic	novelGene_162010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTCCAGTTTGAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298752	298451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_298500_298800
868627	contig_16594_pilon	-	332	1	Intergenic	novelGene_53786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAATCATAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71275	70943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_70900_71300
868628	contig_12540_pilon	-	265	2	Intergenic	novelGene_148068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCATACCTCCTCTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253844	244327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_244397_253648
868629	contig_4079_pilon	+	250	1	Intergenic	novelGene_167470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATGGAGTGCCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103560	103810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_103600_103800
868631	contig_10627_pilon	-	293	1	Intergenic	novelGene_59933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATAAAGAAGTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129266	128973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_129000_129300
868632	contig_14508_pilon	-	249	1	Intergenic	novelGene_79037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGAAAAGGAATACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33225	32976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_33000_33200
868634	contig_9535_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_124479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTCTGTAAGAAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300208	300445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_300200_300400
868635	contig_6175_pilon	+	306	1	Intergenic	novelGene_16330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACTGACACCATTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510168	1510474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1510200_1510500
868636	contig_3654_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_174990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGGCTTCGCTGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498359	498075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_498100_498400
868637	contig_7035_pilon	-	321	2	Intergenic	novelGene_83538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAATAAATGTTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755046	754184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_754236_754776
868638	contig_19006_pilon	-	258	1	Intergenic	novelGene_145578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATTAGAAGAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21769	21511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_21500_21800
868640	contig_15067_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_154350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTACTCTATGTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290286	290647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_290300_290600
868641	contig_10323_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_123563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGTTTAATTCAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375821	376023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_375800_376000
868642	contig_14341_pilon	-	300	1	Intergenic	novelGene_111877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGGAACTACAGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719424	719124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_719100_719400
868643	contig_16715_pilon	+	239	1	Intergenic	novelGene_178099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATTTCACGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80133	80372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16715_pilon_+_80100_80400
868644	contig_10196_pilon	+	289	1	Intergenic	novelGene_132120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATATGGACACAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922709	922998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_922700_923000
868646	contig_4131_pilon	-	294	1	Intergenic	novelGene_127849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAATATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102179	101885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_101900_102200
868648	contig_7513_pilon	+	361	1	Intergenic	novelGene_88988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGCCTACACGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381828	382189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_381800_382200
868649	contig_2969_pilon	+	208	1	Intergenic	novelGene_157074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880209	880417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_880200_880400
868650	contig_13015_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_165537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTAATGTGTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78533	78809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_78500_78800
868651	contig_5718_pilon	-	316	1	Intergenic	novelGene_110432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGAGGGCGGCACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544198	1543882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1543900_1544200
868652	contig_6058_pilon	-	226	2	Intergenic	novelGene_172372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTGGAAAAGACAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267515	255311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_255328_267305
868653	contig_14353_pilon	-	190	1	Intergenic	novelGene_82136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATAAAGCGGCTCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309074	308884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_308900_309100
868655	contig_19242_pilon	+	291	2	Intergenic	novelGene_166449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCACCCTGTGCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6145	7734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19242_pilon_+_6201_7498
868658	contig_5640_pilon	-	263	1	Intergenic	novelGene_27267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCCTGTGAGTGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873364	873101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_873100_873400
868659	contig_18869_pilon	+	314	1	Intergenic	novelGene_56439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAACAAATAGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116468	116782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116500_116800
868660	contig_7025_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_104395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAGGAGGGAAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76369	76148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_76100_76400
868661	contig_7362_pilon	+	226	1	Intergenic	novelGene_147564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665307	665533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_665300_665500
868663	contig_2854_pilon	-	277	1	Intergenic	novelGene_120842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAACAAGGCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269889	269612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_269600_269900
868666	contig_6630_pilon	-	241	1	Intergenic	novelGene_30713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCACGTTGCGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381106	380865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_380900_381100
868670	contig_7340_pilon	+	255	1	Intergenic	novelGene_159891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGCCGGCGAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94622	94877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_94600_94900
868672	contig_9177_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_32746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATTTGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1147248	1146978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1147000_1147200
868673	contig_10667_pilon	-	255	1	Intergenic	novelGene_137309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAATGACAAAGTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46507	46252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_46300_46500
868674	contig_13481_pilon	+	202	1	Intergenic	novelGene_119353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTCTAAAAAGAATACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420476	420678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_420500_420700
868678	contig_4769_pilon	+	199	1	Intergenic	novelGene_118031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCAGAGATCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248601	1248800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1248600_1248800
868680	contig_20675_pilon	-	494	1	Intergenic	novelGene_161689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCGTCACCAGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52821	52327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20675_pilon_-_52300_52800
868681	contig_3334_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_137669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATAAATGAAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433761	432508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_-_432500_433800
868682	contig_5690_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_119688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCCTTCTAGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419502	420038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_419500_420000
868683	contig_15047_pilon	-	1044	3	Intergenic	novelGene_52252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGTCGCTGTCGAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21639	2675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2825_3220_3498_21021
868684	contig_5951_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_153240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153105	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_153100_155100
868685	contig_2924_pilon	+	667	2	Intergenic	novelGene_140261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTAGGTTGTCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74894	76713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_75312_76463
868686	contig_6165_pilon	-	308	1	Intergenic	novelGene_167419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACGGAAAAAGAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494277	493969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_494000_494300
868687	contig_4180_pilon	+	3418	6	Intergenic	novelGene_8345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1177.34436763421	9142	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	62	718	865772	888134	FALSE	25	GTATATCATTTTATGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865710	890834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
868689	contig_6735_pilon	+	1855	13	Intergenic	novelGene_15801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGGGACAGGAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542105	564870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_542603_542792_542860_543008_543291_543787_543896_544853_545065_545877_545945_546577_546634_547243_547357_551181_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
868691	contig_15112_pilon	-	1039	2	Intergenic	novelGene_124751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATTAAAAATCAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18418	16776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_17752_18354
868692	contig_5696_pilon	+	1120	6	Intergenic	novelGene_117545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	899	junction_5	442.065786959362	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	204	1118	689252	705130	FALSE	35	AGGTAAGTGAATAGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYY	684215	705132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014
868693	contig_5023_pilon	+	3265	17	Intergenic	novelGene_7191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	2139.66228351579	7	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	130	1713	607279	643427	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGSWEKFMHLQFQGPKD	580799	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639105_639160_639197_643413_643539_646861
868694	SIRV2	-	602	5	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	57	2636	41	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGGTAATTGACGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5854	3671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
868697	contig_593_pilon	+	1205	1	Intergenic	novelGene_101991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAACTTCTACTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275984	277189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_276000_277200
868698	contig_8153_pilon	+	4938	19	Intergenic	novelGene_34788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	59	junction_10	100.736868457713	368	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	449	2782	15499	46488	FALSE	15	TTTTTGAGATGTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDIQARAVVLTWSPPSSFINGETDETTTVPDLYGYEILVSSTGKDGKYKSVYVGEETNITVNDLKPATDYYAKVQAEYNSIKGTPSEAESFTTLSCEPDTPNPPRIANRTKNSLTLQWKAPSDNGSKIQSFILEWDEGKGNGEFCQCYMGLQKQFKITKLSPAMGCKFRLSAKNDYGTSGFSEEVLYYTSGCAPSMPASPVLTKAGVTWLSLQWSKPSGTPSDEGISYILEMEEETSGYGFKPKYDGEDLAYTVKNLRRSTKYKFKVIAYNSEGKSNPSEVVEFTTCPDKPGVPIRPSVKGKIHSHSFKITWDPPKDSGGAAISKYVVEMAEGPNGNKWDIIYSGATREHLCDRLNPGCFYRLRVYCISDGGQSAVSESLLVQTPAVPPGPCLPPRLQGRPKAKEIQLRWGPPQVDGGSPISYYGVEMSPVEKDESREVYQGSEVECTVSNLLPGKTYSFRLRAANKMGFGPFSEKCDITTAPGPPDQCKPPQVTCRSAACAQVNWEVPLSNGADVTEYRLEWGGVEGSMQICYCGPGLSYELKGLSPATTYYCRVQALSVVGAGPFSEVIAWATPPSVPAIVTCLQEISDDDIESSHYSPSTCLAISWEEPCDHGSEILAYSIDFGDKQPLTVGKVTSYIIDSLQPDTTYRIRIQAFNSLGAGPFSHVIKLKTKPLPPDPPRLECVAFSHQNLKLKWGEGTPKTLSTDSIQYHLQMEDKNGRFISLYRGPCHTYKVQRLNESTSYKFCIQACNEAGEGPLSQEYVFTTPKSVPAALKAPKIEKVNDHTCEIMWECLQSMKGDPVIYSLQVIVGRDSEFKQIYKGPDSSFRYSSLQLNCEYRFRVCAIRQCQDPVGHQDLVGPYSTTVLFISQRTEPPASTNRDTVESTRRRRALTDEQCAAVILVLFAFFSILIAFIIQYFVIK	3009	48644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_3172_5049_5110_7023_7163_12776_12831_15465_15591_16548_16724_18318_18406_22454_22594_23354_23424_24344_24464_26890_26997_27083_27260_29109_29224_29963_30114_30202_30487_30606_30820_38003_38171_39361_39490_46173
868699	contig_10990_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_7519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTCATCTTCATCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754095	752111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_752100_754100
868700	contig_18272_pilon	+	1170	5	Intergenic	novelGene_7070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3221.38746311275	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	13	582	514336	538332	FALSE	10	TTTTGTGCCAGTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	514323	538920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_514361_518778_518888_518938_519040_537077_537197_538116
868702	contig_2100_pilon	-	1537	1	Intergenic	novelGene_50615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGGAACGAGATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809711	808174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_808200_809700
868703	contig_4232_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_63239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAATCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273390	274565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_273400_274600
868704	contig_10437_pilon	+	1174	2	Intergenic	novelGene_38325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434503	439323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_434715_438360
868706	contig_4426_pilon	-	4274	7	Intergenic	novelGene_15342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_6	454.537371645305	2318	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	94	681	171430	10019	FALSE	25	CTGAGTTTATCTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGRDWDARSRARRRPGPEDAEPWLRPSPEQMMAIRELKVCLLGDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERFHSLAPMYYRGSAAAVIVYDITKQDSFHTLKKWVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	171523	6425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_10117_25070_25181_71325_71433_72710_72783_97613_97696_110145_110226_171391
868707	contig_9698_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_82494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCAACAGCAATAGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166446	165510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_165500_166400
868708	SIRV5	+	451	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	1	7431	1	-38	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGACACTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009	3560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
868709	contig_678_pilon	-	1841	2	Intergenic	novelGene_167804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTATGATCAAACTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76166	73944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_75074_75454
868710	contig_10958_pilon	+	1701	2	Intergenic	novelGene_5460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGCTTGATTGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895279	901583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
868711	contig_11422_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_98991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1503	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCGTAGGGAAAGTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
868712	contig_8317_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_20696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTTTTCTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16496	17246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_17200
868713	contig_5791_pilon	+	4075	8	Intergenic	novelGene_35859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1058	1375	1085717	1088260	TRUE	30	TGTTAGCAAACTTCACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVTGLNLTYELLSFNSYQVLSPWKPLGMFHPWIISRFPTSQSTVTAKAFDIIAMTQIIKTSTCKLLRMNWHTRWPVTECFKPSCLCLHAQIRNSVSRRFLKLIF	1079303	1093186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085780_1087896_1087999_1088107_1090731_1092956
868714	contig_513_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_80156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACCAACTGATGAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445790	446948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_445800_446900
868715	SIRV6	+	1024	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	493	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	33	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	GAAAGAGCAATCAACTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868716	contig_4091_pilon	+	2517	5	Intergenic	novelGene_173011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	134.727502760201	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATCTAAAGTACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10827	38650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_25756_27543_38623
868717	SIRV6	+	1241	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	795	-10	-403	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	120	452	2002	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1882	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868718	SIRV6	+	1469	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	56	3	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	668	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868719	contig_10958_pilon	+	2216	5	Intergenic	novelGene_5438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	29	430	888255	894000	TRUE	15	TACCGCTTGATTGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888226	901583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894040_895233_895855_900457
868720	contig_12357_pilon	-	3924	10	Intergenic	novelGene_6131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCCATTTCATCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53916	26086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30321_30931_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42249_46434_46565_51127
868722	SIRV6	+	978	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	539	11	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868723	SIRV6	+	1468	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	55	5	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868724	contig_15407_pilon	+	366	1	Intergenic	novelGene_123052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACTACAAAATGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374877	375243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_374900_375200
868725	contig_9696_pilon	-	4161	1	Intergenic	novelGene_68761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAGGTTCTCAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138838	134677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_134700_138800
868726	contig_8866_pilon	+	1702	2	Intergenic	novelGene_77787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2	526	348923	349447	TRUE	25	AGCCACTGTACAGCTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCSEALPPSISPEGFGGCSSPVALSSCFFVSWLVCSDLSSSFPAFSSFTSVDSSVSTSSPAVISSVGLPHPFSAFGLEARGGSVASSWAVLWRSSSTECTAAFSHCLVSSADPPFSSRFSVQLDVLLRGGFWSNSRLLLTSFPTALSLDGGGPGALLLDVNTSSPFSSLAPFS	348921	353353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_349547_352276
868727	SIRV6	+	1022	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TGACTATGGGGAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11023_11109_11205
868728	SIRV6	+	848	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	262	-16	101	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868729	SIRV6	+	495	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-35	8799	8	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGGTAGTATCTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095	2532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
868730	contig_9366_pilon	-	1535	13	Intergenic	novelGene_166260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACTATTCTGATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025613	979169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_979237_986836_986966_996450_996572_998921_999054_1001880_1002066_1005404_1005504_1006879_1007019_1007199_1007232_1007331_1007453_1021921_1022050_1022297_1022517_1024139_1024215_1025525
868731	contig_10159_pilon	+	4316	11	Intergenic	novelGene_30862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	115.478136458812	627	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1838	2518	993261	996016	FALSE	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPLWLFFFPFPDAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	957454	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_982654_982861_992071_992208_992585_993570_994447_994678_995874
868732	SIRV6	+	994	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	10	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	187	519	1673	2560	TRUE	35	ATGTAATGGAAATTGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1098	11303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868733	contig_6102_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_32138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCATTAAAGTACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838256	836650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_836600_838300
868734	SIRV6	+	1439	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	66	23	16	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	192	683	1733	10736	TRUE	40	AGAAGTTTTTAAGATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1153	11802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868735	contig_5727_pilon	+	2106	9	Intergenic	novelGene_7963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1515	junction_1	764.641868785643	1	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	66	1421	175544	179323	FALSE	35	CTACTTAATTTATCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	175478	180008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
868737	contig_11752_pilon	+	891	6	Intergenic	novelGene_37667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_3	733.501029310798	176	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	29	598	88745	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	88716	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
868738	contig_4364_pilon	+	1462	6	Intergenic	novelGene_691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	24	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	61	1188	1530895	1532568	FALSE	25	GAGGTGTGAGGGATGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530464	1532842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
868739	SIRV6	+	899	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	11	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	411	743	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
868740	SIRV6	+	1398	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	425	-13	209	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	115	606	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1512	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868741	contig_17274_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_26564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1071	1451	219586	219206	NA	30	GCTCAAGTCCCAAGAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFEAPEVMAIPFETEAAWLFVFLVFSFCFLWPLGPQGSRRHLPCWGKCSKALVGTPPGSLLHTGTQLSFSMVWLQRRLMQVSWFCCCWFSALPLLCCCRFSAASGPLLLLLLYPFSFKTASTF	220656	218914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_218900_220700
868742	contig_4730_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_71706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCATTAAACAGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128704	129361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_128700_129400
868743	contig_11307_pilon	-	6585	26	Intergenic	novelGene_105248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_19	75.320924051687	718	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	951	2856	225	3080	123825	93992	FALSE	30	TGTTGGTCTATACAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGISETTLEEIFLKVAEDSGVDAETSDGTLPARRKRRAFGDRQSCLRPFTADDAVDPNDSDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVKGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPSLELQPWMYSEQYTFVSNDAPEDISTQKLLNALTKDPGFGTRCMEGNPIPDMPCLVGEEEWITAPVPQTITDLFQKGNWTMENPSPACQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGLPPPQRRQNTADILQNLTGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGASNSQVLPPSEEVNDAIKQVKKHLKLVKDSSADRFLSSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAILRANLQKGENPSKYGITAFNHPLNLTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFVPASFVVFLIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLTSVNLFIGINGSVATFVLELFTNNKLNNINDILKSVFLIFPHFCLGRGLIDMVKNQAMADALERFGENRFVSPLSWDLVGRNLFAMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPRPVNTKLPPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEIKDLTKIYTRKRKPAVDRICVGIPPGECFGLLGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSNIDEVHQSMGYCPQFDAITELLTGREHVEFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLLKYGEKYAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPTTGMDPKARRFLWNCALSIIKEGRSVVLTSHSMEECEALCTRMAIMVNGKFRCLGSVQHLKNRFGDGYTIVVRIAGTNPDLKPVQEFFGLAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSSLSSLARIFSILSHSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNFAKDQSDDDHLKDLSLHKNQTVVDVAVLTSFLQDEKVKESYV	127138	90486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_94133_94712_94957_95683_95777_96398_96503_97657_97793_98350_98493_102147_102255_103979_104043_104836_104958_105229_105360_106391_106516_108427_108573_108666_108783_110782_110961_112247_112418_112943_113019_113884_113991_115211_115245_116238_116334_117360_117551_120273_120373_121996_122122_123705_123855_124916_125031_125220_125270_127106
868744	contig_1450_pilon	+	2970	20	Intergenic	novelGene_27360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	526.295999627944	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	226	2769	244426	355748	FALSE	70	AAGAAAAAAAAAAAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKASPAELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244200	355949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342638_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
868745	contig_5769_pilon	-	5021	23	Intergenic	novelGene_138748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	363.327573437297	1921	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1032	3099	160	3258	88682	17416	FALSE	35	TTTCCTAAAATTATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRESRHYRKRSASRGRSGSRSRSRSPSDKRSKRGDDRRSRSRDRDRRRERSRSRDKRRSRSRDRKRLRRSRSRERDRSRERRRSRSRDRRRSRSRSRGRRSRSSSPGNKSKKAENRSRSKEKTDGGESSKEKKKDKDDKEDEKEKDAGNFDQNKLEEEMRKRKERVEKWREEQRKKAMENIGELKKEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDDPAEAEKEGNEVEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKVVVDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTSVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKRYEEELEINDFPQTARWKVTSKEALQRISEYSEAAITIRGTYFPPGKEPKEGERKIYLAIESANELAVQKAKAEITRLIKEELIRLQNSYQPTNKGRYKVL	88841	15652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_17464_18739_18814_26431_26577_26929_27149_28007_28185_35367_35518_35838_35977_37983_38178_45026_45190_45707_45873_64681_64765_66475_66555_68991_69114_70056_70233_70766_70888_71597_71764_72647_72762_73844_73997_74881_75048_79407_79505_85358_85503_87062_87252_88665
868747	SIRV6	+	1448	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	35	45	-2	-44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868748	contig_4857_pilon	-	4338	23	Intergenic	novelGene_48685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	549	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1931	2545	1170750	1156493	TRUE	25	CCGCAGACTCTGGGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKIHALYCIHHSVKFYRPHYPRHLIELLRRHREKVVRTLKSRRVNFRHRNQLGLDVSRSSRAIEFHGFWCFLWPGVVLSKGMVFINIWIQILQGILWNILSGHDFVIANDIRESNSRKFFLRVGFNCMEIRFASVLGSLHPRERDGPFPAALTEPQQEGPWLLILQQGAFSLFADEAHDTPIIPEREQVFFNEFKDAFNPKPE	1172680	1123511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1123660_1127712_1127839_1128627_1128775_1130169_1130268_1133429_1133521_1136156_1136236_1137331_1137424_1137632_1137784_1139970_1140131_1141537_1141631_1143087_1143159_1145849_1145950_1147159_1147202_1151574_1151659_1152121_1152222_1152753_1152890_1155449_1155499_1156466_1156563_1157634_1157781_1160367_1160553_1161804_1161883_1162987_1163090_1170716
868749	contig_10020_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_168286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAGAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113379	110467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_-_111068_112631
868754	SIRV6	+	1037	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1446	-13	17	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2533	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868755	SIRV6	+	986	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1494	-10	65	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2581	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868756	contig_5023_pilon	+	2271	11	Intergenic	novelGene_7338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2267.7994532145	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	109	1287	608043	647201	TRUE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRKPMDLLQASPLSPSPLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	607934	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629239_647053_647616_647734
868757	contig_6102_pilon	+	3811	30	Intergenic	novelGene_31861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	533.416939542794	4	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	875	2707	373928	393075	TRUE	10	AGCTGTGGCTCTTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370745	395263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372743_372946_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394724
868758	contig_5041_pilon	-	2748	17	Intergenic	novelGene_27070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	563.74148760203	39	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	102	1928	616721	532759	TRUE	35	ATCCTAATAGTCTCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKHAQSKMVMFLQCQINNQFCSMVILMQHKK	636081	525072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532849_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
868759	SIRV6	+	1089	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029_11109_11205
868761	contig_13787_pilon	-	3023	8	Intergenic	novelGene_40611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_1	501.824304565912	2889	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	385	1101	205032	159290	FALSE	20	TTATGATGATCTCTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVLGMIFSMVLFCQIGEK	205416	157367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_159344_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
868764	contig_14333_pilon	+	3414	1	Intergenic	novelGene_49096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGGGGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295712	299126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_295700_299100
868765	contig_4754_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_35935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCCTCTTGGTTGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301451	302816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_301500_302800
868766	SIRV6	+	1462	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	55	11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868767	contig_5988_pilon	+	2585	11	Intergenic	novelGene_16073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1635.29770989872	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	101	814	1218380	1224777	TRUE	45	TTAAGGAAAATGCTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209843	1226748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1224996_1225195
868768	contig_6361_pilon	-	4150	27	Intergenic	novelGene_23863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	259.266024194793	593	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1219	3660	74	3733	109608	55091	FALSE	15	CTTTACGTGTATGTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVAVKDSDQVAQSDGEENSAAEEQLLGERIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	119058	54673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73524_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_89922_90001_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107368_108691_108816_109529_109610_118986
868770	SIRV6	+	952	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	574	2	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	816	13	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868771	contig_16496_pilon	-	1532	2	Intergenic	novelGene_5138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	308	325	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3592	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
868772	SIRV6	+	1226	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	800	0	-398	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	115	447	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1887	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868773	SIRV6	+	477	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10348	1	1111	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11348	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
868774	contig_18145_pilon	+	3290	17	Intergenic	novelGene_37324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	478.870007804832	67	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	485	2770	90771	100744	FALSE	20	ATGGAGTCTGAGTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86646	101264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90661_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
868775	SIRV6	+	1171	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	855	0	-343	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	60	392	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1942	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868776	SIRV6	+	1456	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	70	2	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868780	contig_20693_pilon	+	3135	14	Intergenic	novelGene_60241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	591.452129340807	2978	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	868	1482	27396	34261	FALSE	50	TTAAAGCAAAGGAAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	14644	35914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25832_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
868781	contig_5302_pilon	-	2599	9	Intergenic	novelGene_81424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	693.210274285516	2	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	35	943	209238	177220	FALSE	25	CCTTTTCAAAACCTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209272	175563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
868782	SIRV6	+	607	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8542	-4	249	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	20	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGTCGTCTTCGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
868783	contig_16098_pilon	+	1428	10	Intergenic	novelGene_45951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	992	1369	350352	352260	FALSE	20	ACTTGCTGGAGCGGACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPSVSTAAPVPTSHTRITLSQPALSSTFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSLLGATGDDIVIVWAPGNVQHGGCVATDSRHVLVHTSSLAQGQHQESPSPTGLTDQGHKLGVDGAEATVPGGL	348287	352319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349492_349603_349712_349956_350075_350235_350421_350511_350603_350778_350889_352152
868785	contig_12357_pilon	-	2091	12	Intergenic	novelGene_6075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCGAACACAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53806	25962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_26135_27417_27530_29522_29654_30216_30321_30931_31058_34120_34313_35036_35190_42109_42249_46434_46565_51127_51238_52758_52842_53167
868787	SIRV6	+	1039	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	478	11	16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	TCACCATAAATTTGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868790	contig_4364_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532809	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
868791	contig_1532_pilon	-	1997	8	Intergenic	novelGene_37426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_7	982.682438792006	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	68	1261	32217	13113	FALSE	45	TTATTAAAGGTAATAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34928	12376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
868792	contig_12624_pilon	-	2242	16	Intergenic	novelGene_61057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	997.186874272933	200	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	558	1886	900272	862389	FALSE	45	ACAAACAAGGCACCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903781	862032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_901976_902140_903447
868793	SIRV6	+	1425	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	70	-4	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868794	contig_6059_pilon	-	1954	15	Intergenic	novelGene_44854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5291.08526202328	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	176	1606	580626	569146	TRUE	35	TAATTTGGATTATAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	581012	567840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568056_568110_568237_569138_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578194_578326_580594_580711_580921
868795	contig_7839_pilon	-	2601	12	Intergenic	novelGene_45717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3301	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	641	1000	956514	955729	TRUE	10	CTAGTCCCTGGATCCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSMLAVQPYVLVTMQQGEDTSLLEIVTFSTFLSKISFMSLQRFSNLALLSSIFFFSSSSSGSSRPSLVTETKLFPSNSFSCCTQYSSIGSVIYTTSKPLFLTRSTKAELATCSLLSP	957269	950850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_950997_952470_952620_953274_953478_953589_953753_953916_954052_954238_954543_954894_955063_955277_955466_955583_955732_955881_956151_956426_956761_956875
868796	SIRV6	+	1279	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	-10	-441	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868797	SIRV6	+	1469	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	29	-7	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868799	contig_16541_pilon	-	4688	1	Intergenic	novelGene_126745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTTTTGTCTATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398769	394081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_394100_398800
868800	contig_4604_pilon	-	3162	19	Intergenic	novelGene_19144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGGGCAATCTCACAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380719	348527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_348677_358977_359177_360195_360306_361426_361527_363854_363935_364277_364409_364510_364634_365238_365454_367055_367198_367287_367447_372056_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374926_377353_377531_378438_378604_379334_379468_379806_380109_380257
868801	SIRV6	+	704	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-10	8167	-4	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
868802	contig_12873_pilon	+	2050	6	Intergenic	novelGene_27128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_2	708.628252329809	7382	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	496	1476	16357	19855	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVEYPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15861	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
868803	contig_8687_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_169651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAATTATTTTCCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18145	19524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_18100_19500
868805	contig_5280_pilon	+	2432	1	Intergenic	novelGene_52663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATCAACTATTAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326787	329219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_326800_329200
868806	contig_7919_pilon	-	5902	3	Intergenic	novelGene_28078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	398	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGCTGTGGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080815	1071418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1075118_1078332_1079568_1079847
868807	contig_9183_pilon	-	2315	7	Intergenic	novelGene_40305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	148	2031	323783	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325965	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
868808	SIRV6	+	1491	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868809	contig_1301_pilon	+	2104	11	Intergenic	novelGene_47407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	1454	2104	815000	824436	FALSE	75	CAAAGTACAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLNTLLLRNLNKILTRISNRCGTVSSTLGIGWHHSGRSCYWLYRGGYRINGESSGSWTWCGWFYGCHLSSLLSLSILSCTLTITCFRGCLIVGFSNRRLRLGSGSYSSSSCCWLLVFSYLVILCSSWGWWGWCFLLPLGITIVSCCVCSGVASISSSCCSSCNRYWSRPGNCNCGGCWCIGSSNCVSSYWSLMNGVASNCSWMRIGYTRSWLLAIL	799255	824436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_799397_800425_800589_804161_804307_805024_805141_805932_806133_810302_810594_811764_811961_814798_815041_819977_820203_822469_822555_824136
868810	contig_1301_pilon	-	1781	10	Intergenic	novelGene_47405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	691	junction_3	206.003236220534	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	953	1780	810346	799239	FALSE	55	GCAAGAACAAAGAAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRLQYKKKVNPDLQVEVKPSIRARKIQEEKMRKQMQKEEYWRRREEEERWRMEMRRYEEDMYWRRMEEEQHHWDDRRRMPDGGYPHGPPGPLGLLGVRPGMPPQPQGPAPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKIVSITERALKLVSDSLSEHEK	822513	799237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_799398_800425_800589_804161_804308_805024_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469
868811	contig_1301_pilon	-	1862	9	Intergenic	novelGene_47408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_8	347.173745227084	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1764	99	1862	852137	805028	FALSE	45	AAAGTTAGTAAAGTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGVSAPRRLASRHGTRLSVPAAVPSRLGEDAKMATGNYFGFTHSGAAAAAAAAQYSQQPASGVAYSHPTTVASYTVHQAPVAAHTVTAAYAPAAATVAVARPAPVAVAAAATAAAYGGYPTAHTATDYGYTQRQQEAPPPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRLQY	852235	805027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469_822615_824145_824429_852066
868812	contig_1301_pilon	-	1443	8	Intergenic	novelGene_47409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	509	junction_7	265.879057974463	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1092	1442	810346	805034	FALSE	45	AGTATAAAGTTAGTAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRL	824183	805032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469_822615_824145
868813	SIRV6	+	950	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	567	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868814	contig_17964_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_33873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGCTTCTCTCTGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135583	134201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135600
868815	SIRV6	+	1031	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1439	0	10	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2526	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868816	SIRV6	+	1023	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1447	0	18	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2534	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868817	SIRV6	+	1468	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	56	4	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868819	SIRV6	+	694	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	758	574	-440	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	157	489	2002	10736	TRUE	35	CACATATGACACGAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1845	11251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868820	SIRV6	+	1237	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	786	3	-412	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	129	461	2002	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1873	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868821	SIRV6	-	1418	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9215	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11762	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
868823	SIRV6	+	1323	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	27	350	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	35	GTTTAGAAGTTTTTAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868824	contig_15236_pilon	+	6264	7	Intergenic	novelGene_141605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	246.969240099968	1281	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	176	955	561157	581657	FALSE	40	ATTGAAAATTAATAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLKSSQKDKVRQFMIFTQSSEKTAVSCLSQNDWKLDVATDNFFQNPELYIRESVKGSLDRKKLEQLYNRYKDPQDENKIGIDGIQQFCDDLALDPASISVLIIAWKFRAATQCEFSKQEFMDGMTELGCDSIEKLKAQIPKMEQELKEPGRFKDFYQFTFNFAKNPGQKGLDLEMAIAYWNLVLNGRFKFLDLWNKFLLEHHKRSIPKDTWNLLLDFSTMIADDMSNYDEEGAWPVLIDDFVEFARPQIAGTKSTTV	560981	586966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_561160_563914_564132_565387_565557_568402_568534_579482_579566_579797_579895_581577
868825	SIRV6	+	1487	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	12	-8	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	40	AGATAGTTACGCTAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868826	contig_6047_pilon	+	2666	19	Intergenic	novelGene_24205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	508.23399454373	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	1001	2407	115917	123624	FALSE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105146	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109266_109360_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
868827	contig_5864_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_162776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAATAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91916	90658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_90700_91900
868830	SIRV6	+	1512	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	-10	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868832	SIRV6	+	1536	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	-10	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	GGAGTATACTTAGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868833	contig_9363_pilon	-	6963	2	Intergenic	novelGene_6500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	437	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	6636	6962	452935	446591	FALSE	15	AACTCCCCCATCTTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNMDLLQSVGQVAVFQIFWHRQVRTSSPHPFVETSQLVFRQFLKPCFFFCQVVSAAWASFFNTSSFLPFASAALPSRGQRVRLGKPPCFSIGWPPAPLAAPISACGP	459570	446589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_446682_452699
868834	contig_9185_pilon	+	1558	7	Intergenic	novelGene_166917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10.816653826392	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	405	977	770383	784633	FALSE	15	TATGATATGTCTTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLQICFVNDSGSDKDSDADDSKTETSLDTPLSPMSKQSSSYSDKDTTEEESESLDDMDFLTRQKKLQAEAKMALAMAKPMAKMQVEVEKQNRKKSPVADLLPHLPHISECLMKRSLKPTDLRDMTIGQLQVIVNDLHSQIESLNEELVQLLLIRDELHTEQDAMLVDIEDLTRHAESQQKHMAEKMPAK	727321	785214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_727594_748386_748506_770369_770488_771473_771672_772543_772668_776066_776161_784581
868835	contig_10958_pilon	+	1994	5	Intergenic	novelGene_5430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4731.09678087439	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTAAAACTAGGGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888222	901703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889050_893824_893888_895423_895855_900457
868836	contig_16496_pilon	-	905	2	Intergenic	novelGene_5233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	45	CAGAGTTAACACATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
868837	contig_10958_pilon	+	2203	5	Intergenic	novelGene_5435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	5	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	31	432	888255	894000	TRUE	20	CCGCTTGATTGCACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888224	901585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894040_895250_895855_900457
868838	contig_16496_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_5137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	14	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	307	324	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3591	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
868840	contig_6735_pilon	-	2215	15	Intergenic	novelGene_15752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	968.928084355625	22	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	242	1738	564868	542464	FALSE	35	TTATGCTGAGCTAAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	541986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564874_565275_565430_568198
868841	contig_7840_pilon	+	1739	5	Intergenic	novelGene_69018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1017	1400	311076	318469	TRUE	10	CACCGCAGGCTGGTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCFGVVFRAVIPTARWAEHEAGNGNSWHSRSWSNIHCHRAGPAGSNHSWPAQAGRCTPCQGPSAGQPVPLTWRDHLHLSAAADCLAPTVGAARIGALVPGPRVVDQQRAVWGLVNTAISPDRQPVP	310059	319596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_311280_315742_315920_318466_318574_318668_318796_319488
868842	contig_17198_pilon	-	704	1	Intergenic	novelGene_62400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGAAGAGAACTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087164	1086460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1086500_1087200
868843	SIRV6	+	1297	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	66	337	-65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	35	AAATTATGGATTTAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868845	SIRV6	+	707	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	367	137	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	33	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	63	551	1733	10736	TRUE	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1670	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868846	SIRV6	+	1517	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	-7	18	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868847	contig_7843_pilon	-	3888	3	Intergenic	novelGene_152020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_2	177	865	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	135	542	197252	187898	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAASSEHFEKLHEIFRGLHEYLQGAPERLLGTAGTEEKKKLIRDFDEKQQEANETLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMVSFFLFKGLWDKN	197386	184551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_188132_190893_190953_197137
868848	contig_4604_pilon	+	3481	19	Intergenic	novelGene_19137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1170.17106483952	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	432	2570	358980	379462	TRUE	25	CCTGAAATGAATCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNGSSSAKGTR	339848	380712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378593_379432_379470_379808
868849	SIRV6	+	890	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	5	739	5	130	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTTAAAGTCTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092	11098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
868850	SIRV6	+	1491	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868852	contig_13041_pilon	-	3991	2	Intergenic	novelGene_127732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287298	273472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_275164_284998
868853	SIRV6	-	1110	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8784	431	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	475	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAATTTCCCGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11331	1113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
868854	SIRV6	+	1127	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	899	0	-299	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	16	348	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1986	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868855	contig_11507_pilon	-	4416	7	Intergenic	novelGene_103355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	291.565172817331	1636	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	352	1878	96311	85079	FALSE	20	GCCTATTGCATTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTKLEIQKALAEDATVYEYDSIYDEMQKKKEESNPKLLLGKDRKPKYIHNLLKAVEIRKKEQEKRMEKKIQREREMEKGEFDDKEAFVTSAYKKKLQERAEEEEREKRAAALEARLDVTKQKDLSGFYRHLLNQTVGEEEVPKCSFREARSGIKEEKSRGYSDEVSLENRIPHEKCILQTGMKAEENPDADSEFDAKTSEDDEIEENNKVNCRREKGTKFSENDPKHHRNQTHSRSSSEERGHSAKRHTKSSKSRGHEKREDEHQERQSRDQENCHTDRDYRKERKDSHRHREASHRDSHWKRHEKEDKRRGRDHRGREGNDREWKREKDREKYIPREQERDRQLNECDRHSEKGGEKEKQSKAKEEHMKGRKEKYENNDKYRDREKQEGSVQSSEINRDRKESSPSFRAKDRLLDQEKSNKMKNMEKEKERNQEKPSSSETSLGAKHRITEERQEKSKEHERPPEAVNKFAKRNNEDTVMSARDRYLARQMARVSAKTYIEKEDD	126076	82540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_86151_88088_88198_89141_89350_90254_90384_96302_96360_124689_124784_125867
868856	SIRV6	-	1487	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9264	430	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAACCCAATTTCCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	1114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10819_11034_11109_11205
868857	SIRV6	+	1269	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	0	-441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868859	SIRV6	+	1464	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	52	12	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868860	scaffold_12124_pilon	-	2197	10	Intergenic	novelGene_22343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1045	1380	1508404	1508069	TRUE	20	AGGGTTTCTAATGGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509577	1483640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1486529_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496388_1506628_1506684_1508007_1508780_1508908
868861	SIRV6	+	874	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	165	497	1673	2560	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1120	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868864	contig_14516_pilon	-	1134	1	Intergenic	novelGene_153906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	686	997	192093	191782	NA	35	CACTGTCGGTCAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRSKDSETLSHLLWTHYQEGPAHEEGKVEGQQKRARHSVRWTDTVAAKMRSNLAMIGRMVQDWATFHSVKHRTAMSQNQLPGTQQLPPPPSVRVLFVSIFS	192778	191644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_191600_192800
868866	SIRV6	+	1472	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	64	-8	14	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	194	685	1733	10736	TRUE	30	CGGGAGTATACTTAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1151	11833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868868	SIRV6	+	1173	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	850	3	-348	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	65	397	2002	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1937	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868869	contig_5023_pilon	+	2747	16	Intergenic	novelGene_7294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2168.57811480242	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	65	973	607279	625731	TRUE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSGEAGLPAVCHSH	580864	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618654_625690_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647380_647737
868870	contig_5023_pilon	+	3040	16	Intergenic	novelGene_7291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	2080.08824171796	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	683	1783	618569	646990	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580863	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647678_647731
868871	contig_12427_pilon	-	2221	6	Intergenic	novelGene_40522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	4175	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	235	858	522337	506035	FALSE	10	TCATCTGATTTTGCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578186	504671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
868872	contig_10958_pilon	+	2277	3	Intergenic	novelGene_5453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888848	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_889354_895279_895855_900457
868874	contig_5502_pilon	-	5300	25	Intergenic	novelGene_154990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_13	156.934677670538	458	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1007	3024	198	3221	462262	409281	FALSE	30	TTCAGTCCCATAATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVAGRRQRRHLTGLPVSRRLVVALPPGFGTCLRLLGRGAWKEAYRGDSRTIRGRSGPPLAAPRSAMSWMFKRDPVWKYLQTVQYGAHGNVSRLSYPTFFPRFEFQDIIPPDDFLTSDEELDSVLFGTLRGHVVGLRYYTGVVNNNEMVALQREPDNPYDKNAIKVNNVNGNQVGHVKKDLAAVLAYIMDNKLAQVEGVVPFGANNAFTMPLHMAFWGREENRKVVLDQLKKHGFKLIPPPKTLGFSLESNWGSGRAGPSYSMPVHAAVQMTTEQLKTEFDKLFEDLKEDDKTHEMEPAEAIETLLLPHQKQALAWMVSRENSEDLPPFWEQRNDLYYNTITNFSEKDRPENVHGGILADDMGLGKTLTAIAVILTNFHDGTPLPVERIKKNQLKKECNVNNDSVKLEGNTSEKADGLIKEGSRCSKESSISDIKEKNKYPMSEFSSSRPKRRKTADKYIESSDSEEFETTELPQKTKGKLKNAKSETKSRGKGSSTIKDDSEFARALISSAPTTKKKMLRKGLSAVEESKKTDLGEKPRTTLIICPLSVLSNWIDQFGQHIKSEVHLNFYVYYGPDRIRDPALLSKQDIVLTTYNILTHDYGTKGDSPLHSIRWLRVILDEGHAIRNPNAQQTKAVLDLEAERRWVLTGTPIQNSLKDLWSLLSFLKLKPFLDREWWLRTIQRPVTLGDEGGLRRLQSLIKNITLRRTKTSKVKGKPVLELPERKVFIQHITLSDEERKIYQSVKNEGRATIGRYFNEGTVLAHYADVLGLLLRLRQICCHTHLLTSAVSSSGPTGNDTPEELRKTLIRKMKLILSSGSDEECAVCLDSLTVPVITHCAHVFCKPCICQVIQNEQPNAKCPLCRNNIDGNNLLECPPEELASNTEKNTNMEWTSSSKINALMHALIDLRTKNPNIKSLVVSQFTTFLSLIETPLKASGFVFTRLDGSMAQKKRVESIQCFQNTAAGSPTIMLLSLKAGGVGLNLSAASRVFLMDPAWNPAAEDQCFDRCHRLGQKQEVIITKFIVKDSVEENMLKIQNTKRELAAGAFGTKKPNANDMKQAKINEIKTLIDL	462459	407201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_409434_411817_411899_417560_417742_418063_418177_418527_418654_420495_420675_421567_421693_426622_426803_428391_428528_429245_429385_430295_430440_436176_436275_442526_442614_443718_443764_443855_443936_445721_445816_447105_447179_449806_449903_452469_452662_452815_452891_454154_454253_455347_455482_457100_457268_460885_461094_462242
868875	SIRV6	+	945	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	550	-4	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868876	SIRV6	+	1303	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	594	19	378	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	52	543	1733	10736	TRUE	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1681	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868877	SIRV6	+	764	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	0	-40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	11	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAAGTCGAAGTTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087	10748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724
868879	SIRV6	+	935	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	575	18	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	121	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868880	contig_5033_pilon	-	2596	12	Intergenic	novelGene_28981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3607.61818818671	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	172	1455	545288	532125	FALSE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	547686	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551
868881	SIRV6	+	1037	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	480	11	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868883	contig_5967_pilon	-	2039	9	Intergenic	novelGene_44386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	468.476503546336	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	263	1327	488569	388566	FALSE	75	GAAAAAAGAAAACTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	505851	387853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_505602
868884	contig_7898_pilon	+	1579	4	Intergenic	novelGene_47562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	4.18993502999218	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	160	1098	361514	371600	FALSE	60	TATAATAATAAAATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGLTVRSAQGRWTPNASRQCSHGSVGLFVPASSPLDPEKVKELQRFVTLSKRLLVITGAGISTESGIPDYRSERVGLYARTDRRPIQHWDFVRSAAIRQRYWARNFVGWPRFSSHQPNPAHWALSNWERLGKLYWLVTQNVDALHTKAGSRRLTELHGCMHRVLCLTCGEQTARGVLQGRFEVLNPTWSAEAHGLAPDGDVFLTDEEVQSFQVPSCTRCGGPLKPDVTFFGDTVKPDKVDFVHKRIKEADSLLVVGSSLQVYSGYKFILTAQEKKLPIAILNIGPTRSDHLASLKLDSRCGELLPLIDPH	358651	372081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_358804_361506_362005_371029_371325_371447
868885	contig_14450_pilon	-	2230	2	Intergenic	novelGene_49038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	438	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGTTGTAGTTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292629	1290239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1291943_1292102
868886	SIRV6	+	820	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	513	11	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
868887	contig_4891_pilon	+	3165	7	Intergenic	novelGene_124545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_4	477.85585925279	5083	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	148	963	701017	756631	FALSE	15	TAACCTGCTCCTCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700869	758833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579
868888	SIRV6	+	1280	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-436	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	213	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	153	488	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1849	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868889	contig_1406_pilon	+	3915	3	Intergenic	novelGene_25585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	70	74	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	53	421	2173822	2183974	FALSE	10	CTATTTTAGTTTGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLVSDKLLGYILLSMILYSHCCHRFRLIETL	2173769	2187468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697
868890	contig_4093_pilon	-	3264	5	Intergenic	novelGene_27610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3703	junction_3	741.614244402034	1	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	14	751	69245	41737	FALSE	25	TACCTTATTTCCTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	69258	39223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951
868891	contig_11171_pilon	+	3235	8	Intergenic	novelGene_48554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	148.392199585959	1	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	87	695	70574	90478	TRUE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAEQFQAVCVQGPPSHQSGPE	70487	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88457_90415_90591_91202_91281_93673_93804_104185_104253_105710
868893	SIRV6	+	1162	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-361	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	TRUE	30	GCAGTTTAGAAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11028_11109_11205
868894	SIRV7	-	1974	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33106	2	-79	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114817	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
868895	scaffold_12124_pilon	+	2713	11	Intergenic	novelGene_22026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	506.394915061358	111	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	353	1288	836073	852375	TRUE	40	AAACTTGGATCTCTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829505	858962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829829_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
868896	SIRV6	+	1295	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	617	4	401	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	29	520	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1704	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868898	contig_16703_pilon	+	2826	3	Intergenic	novelGene_72762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3349	junction_2	611	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACTCAGCAACAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14956	22138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_15480_16921_17019_19932
868899	SIRV6	+	1112	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-24	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	239	730	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1106	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868900	contig_8452_pilon	-	4985	1	Intergenic	novelGene_48079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	725	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCAGCTCCACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965341	960356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_960400_965300
868901	SIRV6	+	1471	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	55	2	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868903	contig_9183_pilon	-	2287	8	Intergenic	novelGene_40311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	491	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	171	2003	323783	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325988	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323326_323376_323834_325868
868904	contig_9183_pilon	-	2256	7	Intergenic	novelGene_40301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	89	1972	323783	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325906	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
868905	contig_6980_pilon	+	2062	8	Intergenic	novelGene_36032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	879.871859872742	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	329	961	364894	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346097	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_361102_361226_362331_362446_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
868906	SIRV6	+	967	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	165	498	240	737	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1105	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
868907	contig_3018_pilon	-	1869	12	Intergenic	novelGene_78852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	453.207430661294	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	528	1342	1869	570257	562929	FALSE	60	GGAAAAAAAGACAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKK	625123	562928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_576687_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585123_600008_600194_624772
868908	contig_5686_pilon	-	2547	14	Intergenic	novelGene_45295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	735	1406	208699	203000	TRUE	20	CCTCCAGATACTGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	212396	93858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_211283_211876_212276
868909	contig_4924_pilon	-	1963	13	Intergenic	novelGene_84671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1129.70086994547	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1024	1473	74819	65524	TRUE	75	GAAAAAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252595	63637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_77273_77353_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
868910	SIRV6	+	1010	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	517	1	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	138	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868911	contig_7056_pilon	+	3521	16	Intergenic	novelGene_43663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	581.024245047772	88	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	165	1946	798314	810882	TRUE	10	GGATGCATTTTTCTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLARRQQGWPRPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781767	812550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828_812414_812506
868912	contig_8866_pilon	-	2801	7	Intergenic	novelGene_77781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_6	359.974729051298	14	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	307	1566	418087	342321	FALSE	10	GGGTTGGTTCTTATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVSPFHSPPSTPSSPSVWSRSSEPEEVPVSFDQPPEGSHLPCYNKVRTRGSIKRRPPSRQFRRSQSDCGDLGNFRAAESSQENGAKEENGDEVFTSKSKAPGPPPSSDSAVGKEVRRSLELDQKPPLRRTSSWTEKREEKGGSAEDTKQWEKAAVHSVEEERQSTAQEEATEPPRASSPKAENGCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	418393	341085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349552_352283_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
868913	contig_8377_pilon	-	2664	4	Intergenic	novelGene_35150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCCTGGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199173	193276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_194115_194344_194521_196079_196217_197660
868917	SIRV6	+	970	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	18	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	180	521	1673	2560	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1105	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868918	SIRV6	+	885	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	166	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	18	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	153	644	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1469	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868919	SIRV6	+	581	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	8503	164	288	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
868920	contig_5253_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_61550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121443	123593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_121400_123600
868921	SIRV6	+	1438	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	72	18	63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	TCGCAAAAATTATGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868923	contig_8063_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_152431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATCATCCATCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156398	155947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_155900_156400
868924	SIRV6	+	458	1	ISM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	10297	71	1060	65	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11297	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11300_11800
868925	contig_9183_pilon	-	2518	7	Intergenic	novelGene_40325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	307.706931276427	2829	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	170	1492	323783	318417	TRUE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	325987	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743_323834_325868
868926	contig_5280_pilon	+	2649	9	Intergenic	novelGene_52590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	761.822885830427	1740	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	34	1098	38343	76641	TRUE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGTESTI	38309	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56392_76629_76731_78042
868927	contig_5125_pilon	-	2473	9	Intergenic	novelGene_43432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGGGAAAAGGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59968	26027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26076_26190_26500_35608_35766_49979_50109_53630_53706_53840_53984_54293_54522_58446_59367_59504
868928	contig_1230_pilon	+	2466	8	Intergenic	novelGene_28834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1099.34162115332	4291	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	996	2228	406520	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404451	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
868929	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	524	2	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868930	contig_8377_pilon	-	2481	1	Intergenic	novelGene_35060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1278	1631	106552	106199	NA	55	CACTTTTAGGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLKQKAKNKPAGVKSISTHSDPIGIGQSKTAPGGFQGGAGGFELPTFWLAAERLDAHIAHQYSLTLIKIDLTEFSYLKQFKNVKSPSATFGRLVSSGLSTVTHYWSIFHVTRFFY	107829	105348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_105300_107800
868931	SIRV2	-	862	4	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	3204	0	2025	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCGCTCTATAGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2707	1035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1662_1741_1854_1973_2065_2674
868932	contig_10197_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_115214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTTAAGAACTTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908439	910326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_908400_910300
868933	contig_5684_pilon	-	2559	1	Intergenic	novelGene_81056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1565	1939	405872	405498	NA	15	CCACCAGCGGTTCCGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTKFMVKRLRASAVVRFLDGTFSSSTPQSGACSNNISLLLIFPRLCSRHLRQKLQIQRILLHLRDSFLYKCHLVSVLEALQNPKRQDRLHPLVSVAGKNHLSNSPPGRWRDRRSNGSGTAAP	407436	404877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_404900_407400
868935	SIRV6	+	1363	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	-13	350	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868936	contig_10904_pilon	+	2725	3	Intergenic	novelGene_22470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	919.5	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	245	1213	149100	150068	FALSE	15	AGGACTTGTGTGTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	144886	151580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_145053_146149_146226_149097
868937	SIRV2	-	383	3	ISM	SIRV2A	SIRV203	686	5	1095	300	-68	-300	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCGTAGTCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4800	3965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687
868940	contig_567_pilon	-	3181	11	Intergenic	novelGene_33950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	965.458859817444	61	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	206	1021	326946	308820	FALSE	15	TATTGACTTTCCCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338138	306659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329364_338065
868941	contig_7357_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_36926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCAAACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636521	638665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_636500_638700
868942	contig_18145_pilon	+	3415	15	Intergenic	novelGene_37335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	252	junction_11	460.783915004127	10	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1292	2110	96213	98154	TRUE	50	AATAAACATTGGGTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKVSYKGLGCVFLAWEQGRDRGCCFGRIETILSLATWLER	86670	101246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98541_98826_98983_100326_100482_100638
868944	SIRV6	+	872	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-8	224	-2	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868945	contig_20527_pilon	+	867	7	Intergenic	novelGene_138598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	1155.90882954592	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	184	522	24977	26633	TRUE	35	CGTGAGAAAGATGCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQNAGERIRVDGKLRDSNNAVIYILAKGTPAKAGIFGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSM	13576	27469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_13994_14078_24905_25023_25434_25614_26238_26346_26626_26818_27308
868946	SIRV6	-	990	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8736	456	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGATGGTTTCTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11283	1088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
868947	contig_3424_pilon	+	3961	2	Intergenic	novelGene_55498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	409	junction_1	0	644	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	1645	3729	163695	170678	FALSE	25	GTCTCAAATATTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	162050	170910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_163803_168701
868949	contig_5419_pilon	+	2761	3	Intergenic	novelGene_15497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	862	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	68	469	238919	249830	FALSE	25	CATCACAGACTCCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREKVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238851	252122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_248706_248878_249614
868950	SIRV6	+	1109	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	20	2	-19	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8900	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	GAAATTGGCGATGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
868951	SIRV6	+	1460	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	42	-11	-41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	GCCTACTAAGCAGCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868952	contig_15093_pilon	+	3078	15	Intergenic	novelGene_143304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	72.2463543321441	23	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1806	1272	3077	147520	175303	FALSE	40	TAAGTAAACTTACTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSSHQLSKQISDLIRQPSTAPQPVKEDIATPLPSEKTPTSVNQTPVETNEFPQLPEGLEKKPVVLKFSAMLDGIAIGAALLPSLKAEYKMGRMRSHGMTGAQTRFTFELPNHRLRFTSKVSATDMSTIPPSASLNLPPVTMSGKYIMEEHDSYSDQVWSIDELPSKQGYYLQGNYLRCVAEVGSFEHNLTTDLLNHLVFVQKVFMKEVNEVIQKVSGGEQPIPLWNEHDGTADGDKPKILLYSLNLQFKGIQVTATTPSMRAVRFETGLIELELSNRLQTKASPGSSSYLKLFGKCQVDLNLALGQIVKHQVYEEAGSDFHQVAYFKTRIGLRNALREEISGSSDREAVLITLNRPIVYAQPVAFDRAVLFWLNYKAAYDNWNEQRMALHKDIHMATKEVVDMLPGIQQTSAQAFGTLFLQLTVNDLGICLPITNTAQSNHTGDLDTGSALVLTIESTLITACSSESLVSKGHFKNFCIRFADGFETSWDDWKPEIRGDLVMNACVVPDGTYEVCSRTTGQAAAESSSAGTWTLNVLWKMCGIDVHMDPNIGKRLNALGNTLTTLTGEEDIDDIADLNSVNIADLSDEDEVDTMSPTIHT	133011	175304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_133090_137281_137989_138422_138669_140889_140988_147377_147585_149036_149276_153800_154046_156651_156758_162970_163069_163793_163980_165028_165198_168391_168604_169729_169929_173024_173085_175076
868953	contig_11328_pilon	+	788	2	Intergenic	novelGene_88383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACCCATTTGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640243	797861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_640746_797575
868954	SIRV6	+	1282	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	-13	-441	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868955	contig_15092_pilon	-	5045	1	Intergenic	novelGene_57827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1513	1968	351089	350634	NA	15	ACATTATCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIGVFFNPISSILFSSLFLKFRSLKDAWINITVGKWDMVSTKETAVFFHINITHPLSTFGKVPQLTVAPSGSVIDPGLQLDPWLMQTGLYIKLFIKVIKCSWYGKEKVCPAGRTIIWQPWLSPSRTGMITLQMLLKCPEIEKESVCIQST	352601	347556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_347600_352600
868956	contig_15666_pilon	-	2093	2	Intergenic	novelGene_70199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAAATCTACAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129231	126824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_128404_128717
868957	SIRV6	+	1288	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	610	18	394	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	36	527	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1697	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868958	contig_1532_pilon	+	2070	8	Intergenic	novelGene_37399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2516	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGACCCCACCCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12363	34988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13518_15732_15889_17971_18110_27255_27379_28825_28963_29437_29507_32051_32225_34868
868959	contig_6062_pilon	+	3670	15	Intergenic	novelGene_5305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_7	359.705435043731	1251	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	864	2595	4	2598	791734	815564	TRUE	25	ACTTTTTCAGATTCCTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKKPLEFHAKRPWGPEKAVEDPDEDDEDDNDEAESGFSLEEVLRLGGTKQDYLMLATLDENEELVDGGKKGAIDDLQQGELEAFIQNLSLAKYAKTFLTEEDGEPSKKENAGKKEAKVSKIDNKKQNTAESDRTSVSKIKNKKRPEQLPDENSTISKVKKDKQEDIFEYSERQTLLLKPGGKWYDLEYTSEYSLELQPRDVVSKYKTLAQKLYEHEINLFKSKTNNQKGGSSTWMKAIVSSGTLGDRMAAMILLIQDDAVHTLQFVDTLLNLVKKKGSKQQCLMALDTFKELLITDLLPDSRKLRIFSQHPFNKLKELSSGNKDSRDRRLILWYFEHQLKHLVAEFVHVLETLSHDSLVATKTRALTVAHELLCNKPEEEKALLVQVVNKLGDPQNRIATKASHLLETLLSKHPNMKGVVCSEVERLLFRSNISPKAQYYAICFLNQMTLSHEESELANKLITLYFCFFRTCIKKKDIESKMLSALLTGVNRAYPYSQTGDDKVREQLDTLFKVLHIVNFNTSVQALMLLFQVMNSQQTISDRYYAALYRKMLDPGLLSCSKQAMFLNLIYKSLKADIVLRRVKAFLKRLLQVTCEQMPPFICGALYLVSEILKAKPALRSQLDDHPESDDEENFVDIGDNEDREKFTDADKETDTVKKVETEETKTPEPASWVHFDNLKGGKQLNTYDPFSRNPLFCGAEHTSLWELKKLSEHFHPSVALFAKTILQGNYIQYSGDPLQDFTLMRFLDRFVYRNPKPHKGKENTDSVVMQPKRRHFIKDIRSLAVNSKEFLAKEESQIPVDEVFFYRYYKKVAIAKEKQKRHADEESIEDVDDDEFEKMIDTFEDDNCFTSGRDDLDFAG	791730	822802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_791890_793882_795385_800518_800751_801584_801745_803000_803090_804994_805049_806061_806165_806270_806340_813447_813515_814664_814766_815502_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
868960	contig_17144_pilon	-	1375	11	Intergenic	novelGene_29287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2259.83202030593	2	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	131	1291	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLATCTL	183212	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166170_172616_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173694_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
868962	contig_19719_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_176888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	193	300	26346	26453	NA	25	ATTCAGCCTGGGAGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTILASKEHSSCTSFKTDLLVLWTVHGILNILRQQHNLNTSILFWSSLSIAQLSHACEAIENIMAWVRHTLVLKVTSLLFNTLKRSFGGRFAQCHLTS	26153	27841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19719_pilon_+_26200_27800
868963	contig_5643_pilon	+	2210	15	Intergenic	novelGene_39038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_14	759.054544166892	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	647	1624	634983	640340	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGEGHLWERRVGNGRVASL	631202	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640538_640636_640729_641102_641214_641412
868964	contig_1532_pilon	+	1924	8	Intergenic	novelGene_37432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAAGTAAGAGATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12429	34908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_13518_15732_15889_17971_18110_27255_27379_28825_28963_29437_29507_32051_32225_34868
868966	contig_8772_pilon	+	1922	9	Intergenic	novelGene_21066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	13430	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	205	1605	15355	23105	FALSE	5	TCTTGCTGTGTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15150	23422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
868967	SIRV6	+	998	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-12	-49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	16	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTATTGCCTACTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2504	11775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2613_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868968	contig_14184_pilon	-	4503	1	Intergenic	novelGene_66598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	489	827	101774	101436	NA	10	CTTTGTTTATTTTGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRPLRLLSLHRLLSGAFLPPSSSSGLGLHALTAPPPPPTHFTWGCLVNPCGVCSPENPWEMGETNVGAGSAVLGVGRWPEEAHFLIVANLLGCPVVSHCGLNMCFPDYE	102262	97759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_97800_102300
868969	contig_9363_pilon	-	2870	19	Intergenic	novelGene_6545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	655.97802065332	81	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	269	1822	773929	754431	FALSE	35	ATATGTGTCAGGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	776116	753382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759556_766182_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037
868970	contig_12873_pilon	-	1903	6	Intergenic	novelGene_27171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTACTCTTCTCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20429	15966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16375_16751_17021_17734_18012_18982_19262_19609_19700_19849
868971	contig_10958_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_5454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTTGATTGCACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888870	901585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_889289_895262_895855_900457
868972	SIRV6	+	913	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	59	556	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	264	22	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	199	690	1733	10736	TRUE	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1146	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868973	SIRV6	+	1338	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	578	0	362	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	68	559	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1665	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868974	contig_7334_pilon	+	2862	2	Intergenic	novelGene_50561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	509	junction_1	0	567	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	391	1458	120109	121176	FALSE	15	ATTGCTTTTGGTGTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITTTTKDYDMTTEYDYGDSTPCQKKEVRAFGAQLLPPLYSLVFVTGLVGNILVVLVLMQYKRLRSVTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDNWAFGEVMCKFLSGFYYIGLYSEIFFIILLTFDRYLAIVHAVLSLRARTITFGIISSIVSWALAILASIPGWQFSKTQWEITHYTCSLFFPYESLKRWKKFQALKLNILGLVLPLLVMIVCYTGIIKILLRRPNERKAKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLAVLVSAFQDSLFTNECEQSKHLDLAIQVTEVIAFTHCCINPIIYVFVGEKFRKYLRQLFHRLTDVHLAKCFPFLSTDRLERASSVSPSTGEHELSMEF	116650	122580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_117030_120097
868975	contig_12119_pilon	-	5698	2	Intergenic	novelGene_88685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	460	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCAGTTGTGAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391584	382630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_383874_387129
868976	contig_13123_pilon	-	2291	5	Intergenic	novelGene_136889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGCGCACCCGCCTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446272	434319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443548_444544
868977	SIRV6	+	1482	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	4	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868978	SIRV6	+	1412	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	18	164	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868979	contig_513_pilon	-	3601	11	Intergenic	novelGene_80155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	402.400658548169	2150	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	200	1375	453421	449687	TRUE	25	TATGCATTTTTTGTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454771	445781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_447914_448785_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
868980	contig_12622_pilon	-	2413	9	Intergenic	novelGene_5941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_3	1601.1338950881	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	340	639	1588902	1588376	TRUE	40	CAGAAGCGAATTTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRGTSAQPTRFSPVPWSFIGP	1589626	1583549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523
868981	contig_16766_pilon	-	6198	19	Intergenic	novelGene_153346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_18	231.674053972279	1449	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1196	3591	314	3904	188414	98812	FALSE	30	CATGTTGTCTTTAACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRFGKTYSRKGGNGSSKFDEVFSNKRTTLSTKWGETTFMAKLGQKRPNFKPDIQEIPKKPKVEEENAGDPFGFDSDDESLPVSSKNLAQGKGSSYSESSEAAQLEDVTSVLEANSKISHPVGEDSVVSDKCLPLEDTLVGKEKSTNRIFEGDSSKSSCAKLITSGKVENFSEEHEKNIHHIYKNAEDSSKKPSAETTVTSGYKPDEVKETNDAWNSQVGKRSESPSETSQIKGSVRTGLYEWDNDFEDNRSEDCILSLDSDPLLEMKDEDFKKRLENLNEAIEEDIVQSVLRPSNCRTYCRANKAKSSQGASNFDKLMDGTSQALAKANSESSKDGLNQAKKGGVSCGTSFRGTVGRTRDYTVLHPSCLSVCNVTIQDTMERSMDEFTASTPADLGEAGRLRKKADIATSKTTTRFRPSNTKSKKDVKLEFFGFEDHDETGGDEGGSGSSNYKIKYFGFDDLSESEDDEDDDCQVERKKSKKRTKTAPSPSFQPPPESSDNSQDSQSNTNNAENLDFTEDLTGVPESVKKPTNKQGDKSKENTRKIFSGPKRSPTKAVYNARHWNHPDSEELPGPPVVKPQSVTVRLSPKEPNQKDDGVFKAPAPPPKVIKTVTIPTQPYQEIVTALKCRKEDKELYTVVQHVKHFNDVVEFGENQEFTDDIEYLLSGLKSTQPLNTRCLSVISLATKCAMPSFRMHLRAHGMVAMVFKTLDDSQHHQNLSLCTAALMYILSRDRLNMDLDRASLDLMIRLLELEQDASSSKLLNEKDMNKIKEKIRRLCETVHNKHLDLENITTGHLAMETLLSLTSKRAGDWFKEELRLLGGLDHIVDKVKECVDHLSRDEDEEKLVASLWGAERCLRVLESVTVHNPENQSYLIAYKDSQLIVSSAKALQHCEELIQQYNRAENSICLPDSKPPPHQNVTSHVGKAVEDCMRAIIGVLLNLTNDNEWGSTKTGEQDGLIGTAMNCVLQVPKYLPQEQRFDIRVLGLGLLINLVEYSARNRHCLVNMETSCSFDSSFYSEDRDDSLRIAGQVHAVQALVQLFLERERAAQLAESKTDELIKDAPTTQHDKSGEWQETSGEIQWVSTEKTDGTEEKEKKEEEDEELDLNKALQHAGKHMEDCIVASYTALLLGCLCQESPINVTTVREYLPEGDFSIMTEMLKKFLSFMNLTCAVGTTGQKSISRVIEYLEHC	191595	96517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_98878_99170_99267_108520_108610_111647_111856_116752_116918_117295_117412_117723_117900_119909_119987_121054_121153_121509_121622_125866_126095_129300_129413_130659_130797_131084_131238_132813_132910_157012_157132_160302_161347_187915_188437_191304
868982	SIRV7	-	1731	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	71685	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	42	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43053	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1623_1704_2676_2993_3112_43028
868983	SIRV6	+	1497	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	1	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	285	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868984	contig_8978_pilon	+	3720	8	Intergenic	novelGene_49394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	181.818927642255	33	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	76	1047	339807	343861	TRUE	15	TTTCCTGTGCTATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKEREQPPRFAQPGSFEYEYAMRWKALIEMEKQQQDQVDRNIKEAREKLEMEMEAARHEHQVMLMRQGEYKPIKS	331587	348141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350_343447_343638_345397_345627_345738_347113
868985	contig_15063_pilon	+	1712	7	Intergenic	novelGene_11187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3648.97149892953	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	232	1467	34808	39515	FALSE	15	ATTCTCCTTATACTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27137	39760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
868986	contig_9183_pilon	-	2305	8	Intergenic	novelGene_40315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1023	2021	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	326007	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323675_323726_323834_325868
868988	contig_10904_pilon	-	1723	9	Intergenic	novelGene_22553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_8	192.872205099646	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	107	961	396033	375280	FALSE	25	TGTTCTTGAACTTCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEQGRYCISWSREDILSNTNGKTEGISVEQAEGAAMISQFLFLLCFENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	396139	374517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389492_395999
868989	contig_10904_pilon	-	1702	9	Intergenic	novelGene_22549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	226.161999460564	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	353	715	388922	378683	TRUE	0	TTCTTTTGTGTGTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGEFREATPSLPRNLKKW	396148	374477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379283_379395_381161_381213_388756_388993_389359_389453_389757_389798_395999
868990	contig_6576_pilon	+	2399	3	Intergenic	novelGene_42401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	112	1458	1301228	1302574	TRUE	40	AAATGCATGCTTGAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295665	1304262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303168_1303914
868991	contig_5551_pilon	-	6039	7	Intergenic	novelGene_134255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	924	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	5442	5888	601619	587170	FALSE	45	AAATGTGGAACTATTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAVVFFISYSAFSSCFLKTSFSWAVSSSCFLFSSSVSTSLCLVRRSSLFNTSALSSAWSKSFRRAILLVTSSWARSSFSCSNLMLASCNLRFSLSSKVIDQLLFSIIGTKTIEKKISNEIVHLLIQLGNGKNKNRHLLMLFCYFVFP	618621	587018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_587331_591032_591143_598372_598479_601549_601634_605379_605452_612217_612416_613464
868992	contig_848_pilon	-	3046	11	Intergenic	novelGene_83335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_3	194.267238617323	3378	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	249	1583	571558	549337	FALSE	55	ATTTAAAAAATCTAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTSSNLQKAIDLASKAAQEDKAGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVKYEAQGDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKKKEKKPQKPVKEGQPSPAEDKGNDSDGEGESDDPEKKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFPHLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSLSSSDLVSKWLGESEKLVKNLFQLARENKPSIIFIDEIDSLCASRSENESEAARRIKTEFLVQMQGVGVDNDGILVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEAHARAAMFKLHLGATQNSLTEKDFQDLGNKTDGYSGADISIIVRDALMQPVRKVQSATHFKKVCGPSRADPNNMVDDLLTPCSPGDPGAIEMTWMDVPGDKLLEPVVSMSDMLRSLSSTKPTVNEHDLLKLKKFTEDFGQEG	571806	547873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_549439_551874_552016_552746_552967_555057_555140_555808_555958_556436_556594_559111_559232_563380_563449_566202_566360_567558_567671_571531
868993	contig_9988_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_113071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAGTACAGTTCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567988	567235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_567200_568000
868994	contig_2799_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_85500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGACGCTACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585566	584559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_584600_585600
868996	contig_6059_pilon	-	4316	10	Intergenic	novelGene_44781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_5	101.718565988057	498	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	291	2807	126340	99949	FALSE	10	TATCATTGTCTTTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQETGFISKYNEGLCVNTGPDLILMSILDMSLHRQMGSDRDLQSSASSVSLPSVKKAPKKRRISIGSLFRRKKDNKRKSRELNGGVDGIASIESIHSEMCTDKNSIFSTNTSSDNGLTSISKQIGDFIECPLCLLRHSKDRFPEIMTCHHRSCVDCLRQYLRIEISESRVNISCPECTERFNPHDIRLILSDDILMEKYEEFMLRRWLVADPDCRWCPAPDCGYAVIAFGCASCPKLTCGREGCGTEFCYHCKQIWHPNQTCDAARQERAQSLRLRTIRSSSISYSQESGAAADDIKPCPRCAAYIIKMNDGSCNHMTCAVCGCEFCWLCMKEISDLHYLSPSGCTFWGKKPWSRKKKILWQLGTLVGAPVGIALIAGIAIPAMIIGIPVYVGRKIHNRYEGKDVSKHKRNLAIAGGVTLSVIVSPVVAAVTVGIGVPIMLAYVYGVVPISLCRSGGCGVSAGNGKGVRIEFDDENDINVGGTNTAVDTTSVAEARHNPSIGEGSVGGLTGSLSASGSHMDRIGAIRDNLSETASTMALAGASITGSLSGSAMVNCFNRLEVQADVQKEQYSLSGESGTVSLGTVSDNASTKAMAGSILNSYIPLDKEGNSMEVQVDIESKPSKFRHNSGSSSVDDGSAARSHTGGASSGLPEGKSSATKWSKEATAGKKSKSGKLRKKGNMKINETREDMDAQLLEQQSTNSSEFEAPSLSDSMPSVADSHSSHFSEFSCSDLESMKTSCSHGSSDYHARFATVSILPEVENDRLENSPHQCSISVLTKTASCSEVPQLHHIAEEHGNNGIIPNVDLYFSDALKETNNNHSNQTMELKVAIQTEI	152097	98439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_100640_101554_101699_103289_103504_106696_106859_107389_107505_110669_110833_111483_111629_117575_117785_125666_126435_151901
868997	contig_7230_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_52555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_4	211.773463871185	265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	88	654	177508	134622	FALSE	55	TACAAAAACTAAGATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGKYLRFTFPAFRALPPPSRVGVPGRRCEMSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177595	133558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
868998	SIRV6	+	981	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-14	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	18	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	237	728	1733	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
868999	SIRV6	+	1128	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	317	33	177	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	46	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	30	AAATTCTTGCGTCAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869001	contig_7816_pilon	+	3154	13	Intergenic	novelGene_66508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_7	885.035886748856	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	61	1557	170169	208036	TRUE	45	ATATGTTTTGAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKAQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLPESELLNLRKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYSLLGDGELSEGSVWEAMAFAGIYKLDNLVAILDINRLGQSDAAPLQHQMDIYQKRCEAFGWNAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAILAKTFKGRGISGVEDKESWHGKPLPKNMAEQTIQEIYSLIQSKKKILATPPLEDAPSVDIANIRMPTPPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSELFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRDRTVPFCSTFAAFFTRAFDHIRMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVSTEKAVELAANTKVGRCHGLNYVPQKMCVSFGQAMIPGIVWFSYML	170108	211748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_170276_181011_181130_182013_182128_182986_183085_192896_193089_194850_194970_195755_195950_196744_196910_207503_207661_207803_209151_209284_209379_210627_210751_211482
869002	SIRV6	+	1420	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	38	70	1	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	220	711	1733	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869003	contig_9183_pilon	-	2231	8	Intergenic	novelGene_40295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	942	1940	322898	312131	FALSE	20	TCCATGTTGTGCTTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325965	311839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323615_323705_323834_325868
869005	contig_854_pilon	+	2821	4	Intergenic	novelGene_36311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_3	2239.99766864958	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTTTTACTTCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556174	564941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556201_557001_557752_562271_562405_563029
869006	contig_11338_pilon	+	2909	9	Intergenic	novelGene_6202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	514.148811143233	70	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	261	491	8903	10638	TRUE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLSSTSSWCASSRARA	8087	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8189_8743_8924_9814_9979_10592_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
869007	contig_9363_pilon	-	3877	31	Intergenic	novelGene_6778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	317.196293939398	27	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1158	3477	110	3586	1548961	1506537	FALSE	40	AGAAACTGTAATCTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1549070	1506245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509595_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
869008	contig_8914_pilon	-	761	5	Intergenic	novelGene_112875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3976	junction_4	1628.07422665553	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	46	729	268130	264566	FALSE	10	TCTTATTTGTGATGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268175	264533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075
869009	contig_5023_pilon	+	2770	13	Intergenic	novelGene_7339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1509.04945247	3	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	20	1459	611764	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRLFSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607935	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607944_611752_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629273_630191_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
869010	contig_14142_pilon	-	2144	5	Intergenic	novelGene_120551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.8422954058972	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	555	1703	434030	432882	FALSE	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	435187	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_434039_434143_434259_434453_434572_434695_434883_435061
869012	contig_12638_pilon	+	3797	3	Intergenic	novelGene_33145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	879	junction_1	88.5	110	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGAAATCTCATTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196098	200477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_198843_199335_199415_199503
869013	contig_8357_pilon	-	3247	6	Intergenic	novelGene_39772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	521.303213111141	37	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	274	849	891622	887100	TRUE	50	AAAGCGAAGTAGAAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQGQLAEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKVTHVEPWEKGSRKTAGQTGMCGGVRGVGTGGIVSTAFCLLYKLFTLKLTRKQVMGLITHTDSPYIRALGFMYIRYTQPPTDLWDWFESFLDDEEVCQQG	891895	883790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885477_887179_887257_887410_887717_887787_891346
869014	contig_15047_pilon	+	1633	6	Intergenic	novelGene_52175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	4	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	24	389	2194	3306	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGAPPPRVQSVGL	2170	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3268_3498_4158_4434_4552_4676_20999
869015	contig_5947_pilon	+	3491	14	Intergenic	novelGene_101517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_3	297.677061823874	659	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	394	2127	502299	544234	FALSE	50	ACCAATAAATGGTAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVQVQVQNPSAALSGSQILNKNQSLLSQPLMSIPSTASSLPSENAGRPIQNSALPSASITSTSAAAESITPTVELNALCMKLGKKPMYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGAYPPRYFYPFPVPPLLYQVELSVGGQQFNGKGRTRQAAKHDAAAKALRILQNEPLPERLEVNGRESEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFEVARESGPPHMKSFVTKVSVGQFIGEGEGKSKKISKKNAAIAVLEELKKLPPLPTVERVKPRIKKKTKSIVKLHTGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPLSVCGRC	476299	545598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_476537_486781_486854_502214_502504_509702_509842_511128_511295_523233_523333_536193_536407_537648_537793_539875_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543545_543632_544218
869016	contig_8538_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_4648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	89	1918	841232	843061	FALSE	25	GTTGTTGCATTCCCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840962	843114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841048_841228
869017	SIRV6	+	938	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	146	478	1673	2560	TRUE	35	TAATTGTTGGTAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1139	11288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869018	SIRV6	+	1185	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	820	21	-378	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	95	427	2002	10736	TRUE	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1907	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869019	contig_4604_pilon	+	2826	16	Intergenic	novelGene_19128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1232.07042367264	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	446	2272	358980	380165	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVDLVHLTQLVIAKSTLPV	339834	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374922_380112
869020	scaffold_12124_pilon	+	2603	12	Intergenic	novelGene_22062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	530.829944287308	1654	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	225	1160	836073	852375	TRUE	25	ACTGGCGTCTTCTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829671	858980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_835281_835433_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869021	contig_5698_pilon	+	2167	8	Intergenic	novelGene_55024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	18	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	20	769	4103	19491	FALSE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKKKDSTCGHMINKWFINKSDILLGLSK	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_19353_19410
869022	contig_2377_pilon	+	3438	2	Intergenic	novelGene_67906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	870	junction_1	0	1895	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	26	1438	253864	270398	FALSE	30	TCGAGTCACATTTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLFLTLMLCSSLERISHTSLLSLSHSAPWHCGRCPHRAAPCSVRSLRVVPRAWVAQLGCSCGICWRALGSRHFLSEVTWQWCALFSHFCNFQLAQRLRLGSGPRLRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLYSMRSSQKCSRATIDTGTEVVMPLSQMTVNCLKN	253838	272398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329
869023	contig_1996_pilon	-	590	2	Intergenic	novelGene_131927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456654	442385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_442948_456626
869024	contig_10581_pilon	-	4469	12	Intergenic	novelGene_41395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	87.2531227980783	803	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	884	1891	627511	609845	FALSE	50	AAAGGATCTAAACCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTAEPLMGSSLLEEASVPSKNLVSVNSQPSLGGESLNLPNTSSILGVDEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649952	607266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_614126_614265_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
869025	SIRV6	+	882	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	554	480	338	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	92	583	1733	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1641	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869026	SIRV6	+	1134	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	836	56	-362	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	79	411	2002	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1923	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869027	SIRV6	+	1077	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1384	9	-1	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTACGCTAGAAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2471	11816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869028	contig_5515_pilon	-	3478	9	Intergenic	novelGene_52325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_2	413.399908532888	1668	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	147	1277	99142	68158	FALSE	35	AAGGGGAAGTACATACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGPGHSKRRRQAPGVGAVGGGSPEREEVGAGYNSEDEYEAAAARIEAMDPATVEQQEHWFEKALRDKKGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	99288	65956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044_89139_99118
869029	SIRV6	+	1000	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	524	4	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869030	SIRV6	+	1434	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	387	-11	171	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	153	644	1733	10736	TRUE	30	GAGTATACTTAGTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1474	11836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869031	contig_8394_pilon	+	4011	3	Intergenic	novelGene_27321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	234.5	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	671	1264	87061	87654	FALSE	15	TGTCATGCATCGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVPQIFLVSSNDVSKYDFPTLTDTLLKDLPAQKRHILMLSLPSVTEEAIEIKRNSLRQKIWLDALKAGVLATLPMVGIINDNDVKKLEASLKEYRVLFGVDDISLQNLAEDLQVPVEQLQAIIESPTLLEKKEDKSIRETLLKCLEKFCSANGGLLATGLYFRKNFYLQYHFLDIVTNDAKILLKKTFSEKKLMSH	75636	90401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_75716_86380_86827_86915
869032	SIRV6	+	1443	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	77	8	27	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	181	672	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1164	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869033	SIRV6	+	874	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-9	223	-3	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	224	715	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869034	contig_14925_pilon	-	2860	7	Intergenic	novelGene_55259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1035.46662857327	84	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	41	550	322420	130798	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPHTVIGRIRTVLQNPQRPVQKLQGQSNISLGNPQPGYHASGDKHSQWPSPLAL	322460	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_130662_130955_321808_322113_322371
869035	SIRV7	-	2358	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	99	5	94	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147824	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
869036	contig_12425_pilon	+	3009	8	Intergenic	novelGene_46628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_1	124.302461925806	1353	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	202	1455	167145	198400	FALSE	10	TTTGTGCGGTGCAGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	166943	199954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
869037	contig_3095_pilon	+	2293	2	Intergenic	novelGene_75136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6759	junction_1	0	7	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	300	662	149574	149936	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTSWVLLHLSLLIPTLTPFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNGTSLCCSPRHGNL	149274	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_151163_151848
869038	contig_16098_pilon	-	2153	10	Intergenic	novelGene_45934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1248.71276931363	3031	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	645	1610	350452	348413	FALSE	30	GCAAAGCTCAGCCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354122	347869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350643_350765_350889_352152_352352_353990
869039	contig_10134_pilon	+	2226	4	Intergenic	novelGene_16213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1478	1963	34954	38820	TRUE	15	AGCTGAGTCTGTGTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILPYHSRAVIISTVIVVCLWDGEVGIFTKKLLGFSILVERDLVQKPVLPAVAPQHNGLPLLKHQVRGLEQQPIGKHVQLHRVAEAGLACLAPVLPAAAGSGVKAVAGLDLSWDGDPSVEPLDGVVPRGVGPVALQSHIVPLEHIDPWGFKVHHCLREIC	32180	39847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_33627_34922_35178_38558_38835_39598
869040	contig_13453_pilon	-	2710	21	Intergenic	novelGene_146699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_20	181.891203745536	450	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2472	239	2710	126079	37764	FALSE	30	GTATGGCACAAACTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAFGDELFSVFEDDSTTAAGTKKDKEKGKWKGPPGSSEKAGKCVDVKLQSESTNSGKKRDADFESTDEPIFGKKIRIEESITEDLSLADLMPRVKVQAVETVEGCTHEVALPADEDYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYAIALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGLMTGDVTINPTASCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIILLPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGGDGLHLVVDENGDFREDNFNTAMQVLRDAGDLAKGDQKGRKGGTKGPSNVFKIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKKMVEEVFSNAIDCLSDEDKKLPQVEHVLPLLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETFAMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSPTIGKQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVEKVKKSEEQYNKIVIPNEESVVIYYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRLVKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSKESLKNSATEAAKPAKPDEKGEMQVVPVLVHLLTAISSVRLYIPKDLRPVDNRQSVLKSIQEVQKRFPDGVPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPLHNDPNLETVYTLCEKKTQ	126317	37763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_37953_38993_39105_44871_45001_49649_49719_50311_50485_54077_54229_55371_55498_62180_62283_63740_63852_65543_65624_66901_67034_68747_68851_69339_69439_70543_70669_75262_75354_76817_76993_102399_102513_103445_103509_112729_112797_114880_115016_125951
869041	contig_18145_pilon	+	2695	16	Intergenic	novelGene_37326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	515.733453981372	1	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	900	2510	93431	100744	FALSE	35	GCGGCAGAAAGTGAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKAVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86649	100929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93350_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98545_100330_100482_100638
869042	contig_6735_pilon	-	2038	13	Intergenic	novelGene_15706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	790.333100484993	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	83	1558	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPLPSSLLLDISLIPIAPSSLSLSPPSPKTTLILFAVSEASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568280	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545180_545915_545945_546577_546634_547243_547314_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
869043	contig_4924_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_84639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTCGCTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61012	58572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_58600_61000
869044	SIRV6	+	1522	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	4	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869045	contig_6102_pilon	-	3335	28	Intergenic	novelGene_31888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.188852574577511	1	80	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGGGAAGTTGACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395115	372721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_372746_372938_373074_373198_373272_373402_373464_373630_373725_373902_373955_374378_374502_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375728_375962_376037_376205_376292_378875_379031_379329_379485_379615_379793_379953_380018_380554_380635_380897_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
869046	contig_4315_pilon	+	2579	2	Intergenic	novelGene_46855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAGCTGTGCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609485	612479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_609986_610400
869047	contig_5189_pilon	-	2190	11	Intergenic	novelGene_34830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	963.322874222345	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	111	1049	244235	199237	FALSE	10	TCTAATGTTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	247751	198095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220303_228201_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
869048	contig_500_pilon	+	2474	10	Intergenic	novelGene_31031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	968.225639450272	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	196	735	1492663	1494615	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVPRQGRDGLGGTRAGQAQDCRPRRGGTRGVPESSSWGIGTPGRSVLS	1485755	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
869049	contig_12993_pilon	+	4434	5	Intergenic	novelGene_136750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_4	36.7856969486783	339	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	190	780	270495	342226	FALSE	35	CCAGGAGAATTCAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAADSSAPCAQPGLASACAAASGLGRRCIGLCAPHRRLRRSGRGGRRSGGVGGGGCGVGGPGAMAASVFCCLRCCRDGGTGHIPLKEMPAVQLDTQHMGTDVVIVKNGRRICGTGGCLASAPLHQNKSYFEFKIQSTGIWGIGVATQKVNLNQIPLGRDVHSLVMRNDGALYHNNEEKNRLPANSLPQEGDVVGITYDHVELNVYLNGKNMHCPASGIRGTVYPVVYVDDSAILDCQFSEFYHTPPPGFEKILFEQQIF	270305	345880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_270601_276716_276834_293679_293847_298103_298207_342128
869050	contig_5935_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_102721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAGAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072859	1075440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1072900_1075400
869051	contig_10246_pilon	+	2917	10	Intergenic	novelGene_46905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	192.10555226197	818	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	64	1263	144696	184738	FALSE	15	TAGGTTTGTAGGAGTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASQRERTQGPRRAARDNSSRMKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQTYPPTYNVKDMPVPTAVWNGGRDSLADVSDVSILLTQITNLVYHKYLPEWEHLDFIWGLDAPWRMYNELVNLMRKYQ	140736	186392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546_183619_184504
869053	SIRV6	+	1337	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	421	52	205	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	119	610	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1508	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869054	SIRV7	-	1908	3	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114754	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3158_114680
869055	contig_12965_pilon	-	3540	5	Intergenic	novelGene_65197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_4	251.472662530145	241	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	510	2570	313082	307208	FALSE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSRSRSDDGGEEASFQDHNHHENERRWQQERLHREEAYYQFINELSDEDYRLMRDHNLLGTPGEITSEELQQRLDGVKEQIASQPDLRNRENGTNTRDSEVPRESSNEDSLLEWLNTFRRTGNATRSGQNGNQTWRAVSRTNPNSGEFRFSLEIHVNHENREFEIHGEDYASIPLTDISRDHTRNRHQRSNSPVARRTRSQTSVNFSGNSSNTPRTRLGSRGQNSIEVSYSTLGRLRNGVRGSVGVPRTRTPRANSSDHTDQAGDGELRQREGQRFGAAHVWENGARTNVTVRNTNQRLEPIRLRSSFSSRSRSPIQRQSGTADHNSQRESRPSQRTIRRSARRRGITHGFLQHDRESRGTTYTPFSNSRLVSRITVEEGEESSRSSTAVRRHPTITLDLQVRRIRPGENRDRDSIANRTRSRVGLAENTVTLESNSGGFRRTISRLERSGIRTYVSTITVPLRRISENELVEPSSVALRSILRQIMTGFGELSSLMEAESESEIERSGQHLPEMHSDLGDLGTVNDSSPHNEGSSEDWQAQEDSTGMRGENDTMQPHAQNSDSRGDRQLRNANNLVETGTLPILRLAHFFLLNEGDDDNRSRGLTKEQIDNLSTRNYEHSSIDSELSKICSVCISDYVTGNKLRQLPCMHEFHIHCIDRWLSENCTCPICRQPVLGSSIANSG	315868	306237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_308971_311954_312060_312889_313102_314850_315064_315591
869058	contig_12427_pilon	+	2214	7	Intergenic	novelGene_40519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACTGCCGCCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504671	578098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_506130_507798_507927_510395_510617_520312_520440_522284_522346_546076_546158_577960
869059	contig_16620_pilon	+	3753	1	Intergenic	novelGene_156004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2305	2616	28437	28748	NA	20	TTTGCTCCATAATCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHQSEPIRNRRCLATTTDHSDRDHNRAFQTEQEKNVEQNSHSQQKTRLTGLTETGGTPETMAPRHPANSELKPLPKSTLQPKMRQTYKTNNNTREEHAS	26132	29885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_26100_29900
869060	contig_19564_pilon	-	2268	5	Intergenic	novelGene_29599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	770	1408	12839	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15688	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13039_13124_13259_13554_13666_13945_14055_15472
869061	contig_12873_pilon	+	1933	6	Intergenic	novelGene_27129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	1104.4616788282	1096	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	871	1362	17896	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15868	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_17096_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
869062	contig_8312_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_152898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTGTCAAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275745	277259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_275700_277300
869063	contig_6589_pilon	+	2590	8	Intergenic	novelGene_26115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3259.45007255982	178	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	491	919	1879232	1880585	FALSE	15	TTTAATGTGGTTTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876578	1882256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876901_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
869064	contig_3018_pilon	-	2332	15	Intergenic	novelGene_78841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	467.727970172442	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	442	2172	600079	561113	FALSE	15	TGTTCCTTGTACTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMDLI	625099	560952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561125_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
869066	SIRV6	+	1489	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	32	7	-5	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	30	GTTACGCTAGAAGACCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869067	SIRV6	+	952	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	575	1	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	40	ACACATATGACACGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869068	SIRV6	+	1070	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	18	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	144	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	197	688	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1148	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869069	SIRV6	-	1464	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9291	375	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	16	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGAGTCCATACGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11838	1169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
869070	contig_4486_pilon	+	2302	13	Intergenic	novelGene_38562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1384.67877341843	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	205	1230	343083	411298	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIGGLRCAGVGRGGGRGCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAEVSLRMRKQTGKLNNVY	311703	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411247_411318_412424
869071	contig_15063_pilon	-	1399	4	Intergenic	novelGene_13124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGTGGACACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36684	34606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35838_36146_36256
869072	SIRV6	+	1467	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	40	21	3	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	218	709	1733	10736	TRUE	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1127	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869073	contig_15047_pilon	+	1520	7	Intergenic	novelGene_52103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2827.28625285017	10	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	86	451	2194	3255	TRUE	40	TGAGGAATACTCAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGELPLPAVFLHRRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLLQPERRRVSHFPEDVWL	2108	21605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21005_21062_21232
869074	contig_1532_pilon	-	2183	8	Intergenic	novelGene_37370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_7	1182.69652118559	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	189	1382	32217	13113	FALSE	35	CTTACAAGCTACAGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	35519	12311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_35340
869075	contig_253_pilon	+	2926	1	Intergenic	novelGene_129779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCATCACCCTGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057983	1060909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_1058000_1060900
869077	contig_17440_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_7600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATATGTCTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3053	4008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
869078	contig_8617_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_73429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
869079	contig_17440_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_7616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
869080	contig_8617_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_73430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
869081	contig_17440_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_7623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3148	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
869082	contig_9706_pilon	+	917	1	Intergenic	novelGene_20812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTATCATATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2700
869083	contig_17440_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_7598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3052	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
869084	contig_17440_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_7621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3092	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
869085	contig_17440_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_7624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3151	4007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3200_4000
869086	contig_17440_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_7625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCATATTAGCCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3189	3974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3200_4000
869087	contig_17440_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_7626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3227	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3200_4000
869088	contig_8617_pilon	-	644	1	Intergenic	novelGene_73458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTATCATATTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62714	62070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_62700
869089	contig_6434_pilon	+	2979	12	Intergenic	novelGene_61906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1402.09478464331	6555	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	7	1434	918877	932005	TRUE	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDELYNQERPVPGEGHHAW	918870	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_931954_932078_932361
869090	contig_10377_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_115417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	462	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTCTGATTCTGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259152	261750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_259200_261800
869092	contig_16098_pilon	-	2797	10	Intergenic	novelGene_46035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1117.84820851668	14	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1621	2688	350768	348413	FALSE	15	GCTTTATTTTCTGGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354027	348303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_352352_353990
869093	contig_2377_pilon	-	4523	1	Intergenic	novelGene_67873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	190	534	24796	24452	NA	75	GGTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQAVKMARWHQTFLPNFRRGEENQNQSLGYLMLLQQKYREWMSFTKRSLFSHSPVSYKSKFRVSAPGEGFFSLSALEEGPGDTSVFPLSGSISAQEPQVQRMRSAPSTALLVV	24985	20462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_20500_25000
869094	SIRV6	+	1393	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	53	32	-52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	30	AGTCGATTATTGCCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869095	SIRV6	+	1362	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	1	337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869096	contig_8377_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_34938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTATTCTTTTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68095	69316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69300
869097	contig_4364_pilon	+	618	2	Intergenic	novelGene_751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	61908	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGAGGCTGGCAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532241	1532941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532343_1532424
869098	contig_3018_pilon	-	2692	14	Intergenic	novelGene_78839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_13	409.898934000413	100	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	446	2311	600079	561331	FALSE	15	TCCTTGTACTATTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMVSWEISSCLMLLLGLSDSCSSRSNCCCHYVDFYCSLSEVSTFESLMCH	625103	560949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
869099	SIRV6	+	1001	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	526	1	20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	110	34	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	45	AACAATGTAATGGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869100	contig_366_pilon	-	2405	11	Intergenic	novelGene_51590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_7	606.921279903745	194	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	456	1553	803057	757099	FALSE	35	TTTCTGTAAGGAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKCLESPVGKRKRSMTVSTSQDPSFSGLNQLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803512	756246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_774322_774407_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
869101	SIRV5	+	1141	13	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	7	3765	-4	3628	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACGGGAAGCGCGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	7226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826_6958_7144
869102	contig_12566_pilon	+	3389	20	Intergenic	novelGene_86005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_11	87.4273105273105	452	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	96	2438	47511	86354	FALSE	15	TGACCATATGCCTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEPKQDSSSCWCALLRPGEPVLPAERWNTQTMATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENVRRTTSPSSTVLQELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44366	87305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65210_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
869103	contig_12279_pilon	+	856	4	Intergenic	novelGene_50120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3417	junction_1	1235.80176403823	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	12	365	69434	77128	FALSE	25	AGCTGTATATTCTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	69422	77619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_69447_71633_71711_75031_75096_76928
869104	contig_19402_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_80845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTCCGCTGGGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146693	144730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_144700_146700
869106	SIRV6	+	1342	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	587	-13	371	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	59	550	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1674	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869107	SIRV6	+	1246	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	776	4	-422	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	139	471	2002	10736	TRUE	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1863	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869108	contig_17198_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_62396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062919	1061032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1061000_1062900
869109	contig_34_pilon	-	1567	8	Intergenic	novelGene_40018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	4	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	29	1414	247052	212049	FALSE	10	TGGCCACTCCCTGGCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247080	211895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
869111	contig_10930_pilon	-	2323	7	Intergenic	novelGene_37028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	128	1531	280211	268388	FALSE	15	ATGATTTTCCAGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280338	267595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
869112	contig_3095_pilon	+	1847	6	Intergenic	novelGene_75184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2004.05375177414	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	25	717	220513	226800	TRUE	60	AGATGTAAAAAGAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220488	245483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226219_226293_226409_226645_226824_244376
869113	contig_6364_pilon	-	2730	15	Intergenic	novelGene_51721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	949.010569606308	30	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	434	1792	472628	436151	FALSE	75	AGAAAAAAAAAAAATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521107	435212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_486627_486732_490716_490802_521045
869114	contig_401_pilon	-	627	5	Intergenic	novelGene_42847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAGTTTCCAGAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715979	1713636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1713702_1714019_1714096_1715076_1715232_1715417_1715484_1715714
869115	contig_15952_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_154064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGTTGTGATCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273828	272917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_272900_273800
869116	contig_2036_pilon	+	8088	1	Intergenic	novelGene_131849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACCCAAGTAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635342	643430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_635300_643400
869119	contig_6501_pilon	-	1917	2	Intergenic	novelGene_150579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	26	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGCTATGCATGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359055	354028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_-_355921_359030
869120	SIRV6	-	1291	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9223	-118	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGACTGTCGCTCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	1662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
869121	contig_2087_pilon	+	2651	3	Intergenic	novelGene_65551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	118	2977	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	238	927	39353	70191	FALSE	25	TTTCAAAGTGTTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSCAIHWSFPGSWFGFWVSCAHIPTAAKAAAGTGSNFAHITLPASAGSTGRSPTLRPGASAPPWARLHSRGIAGAAAAMPWRVCLPVARGSLAAWLLVGLWVWALGGLCGLGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39115	71915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994
869122	contig_9345_pilon	-	2150	7	Intergenic	novelGene_24347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	626.872927048749	16	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	396	1151	164438	142100	FALSE	10	TTCCCTCGTTCTTCATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPIVAATVVDSSIKRIKELASSMRIPSDFDSDPMSGFGATVAIGLTIFVFSVVTIIICFTCSCCCLYKMCRRPRPVVTTTTSTTVVHTPYSQPPSMPPSYPGPTYQGYHPMPPQPGMPAAPYPTQYPPPYPAQPMGPPAYHETFAGGAAMPYPASQPPYNPAYMDSPKAAPLSMPLPLWLPLSLCRVYMNGYADTVLFYPMVCVCVRVCVRACTRTHTLSVHVASSDADEVGNNPCQSGLGPNSVLFLT	176150	141100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_142414_142567_142781_142955_143072_148863_148948_164409_164528_173643_173789_175989
869123	contig_6059_pilon	-	3065	5	Intergenic	novelGene_44798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_4	266.292484873306	1052	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	324	1010	411475	403416	FALSE	30	CAATATAGTGCATTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYVFVNDSSQTNVPLLQACIDGDFNYSKRLLESGFDPNIRDSRGRTGLHLAAARGNVDICQLLHKFGADLLATEYQGNTALHLCGHVDTIQFLVSNGLKIDICNHQGATPLVLAKRRGVNKDVIRLLESLEEQEVKGFNRGTHSKLETMQTAESESAMESHSLLNPNLQQGEGVLSSFRTTWQEFVEDLGFWRVLLLIFVIALLSLGIAYYVSGVLPFVENQPELVH	416526	401360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_403633_409565_409725_411164_411508_415816_415920_416338
869125	contig_19564_pilon	-	2337	4	Intergenic	novelGene_29586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	140	1474	15529	12201	FALSE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15668	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
869126	SIRV6	+	1296	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	561	59	345	-58	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	85	576	1733	10736	TRUE	20	GGATTTAGTCGATTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1648	11766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869127	SIRV6	+	1194	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	845	-13	-353	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	70	402	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1932	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869130	contig_10134_pilon	-	1471	4	Intergenic	novelGene_16262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_2	648.783648238935	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGCAATCTGACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	33249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_39164_39594
869131	contig_4103_pilon	-	1810	18	Intergenic	novelGene_51915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	472.949685320004	1850	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	103	1185	87845	80996	TRUE	10	TTATCTTCTCTGTGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91328	77526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263
869132	SIRV6	+	1460	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	56	12	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869133	SIRV6	+	1175	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	830	21	-368	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	85	417	2002	10736	TRUE	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1917	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869134	SIRV6	+	1453	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	62	13	12	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	196	687	1733	10736	TRUE	45	AAGATAGTTACGCTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1149	11812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869135	contig_5947_pilon	+	3589	15	Intergenic	novelGene_101608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	438	junction_13	82.9048200267842	7	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	163	1527	983797	1000089	TRUE	40	TAATACAAGGAAGGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPQGQCLNDSSFGLANGALGQEDRGLSFLLKQEDREIQDAYLQLFTKLDVALKEMKQYVTQINKLLSTITEPTFSGSCDPPLAEEASSSLLVSEESEMDRVEHGGIKKVCFKVSEEDQEDSGHDTMSYRDSYSECNSNRDSVLSYTSVRSNSSYLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKQDKLHGCLEHLFNQVDSINALLKGPVLSRAFEETKHFPMDHSLQEFKQKEECTIRGRSLIQVSIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKGELRGAEWAPSGWAAERTRMSPLPSCISPHSSRECRGAATSRQPGLRGFAAGDQRSVPGEGSAVLSQTQGILPGTV	983634	1007412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_983826_985586_985794_987124_987214_988514_988598_988756_988848_990802_990932_992359_992402_993750_993972_995830_995931_998186_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737
869136	contig_8880_pilon	-	3810	2	Intergenic	novelGene_165753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	520	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2781	3098	21730	21413	FALSE	25	TGGTTATATGTCTAAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHHANRGKEVFPQRGSNDSGSSCKARSLASPCTAAYLPIQRLTLAPLFPYSHQKEVPNLRFEISHINPLQLQEINHEVHIQQLLTFLFSGLLPPCLLPFLPPGC	24804	20700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_22507_22800
869137	contig_9183_pilon	-	2241	8	Intergenic	novelGene_40306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	959	1957	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325974	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323282_323364_323834_325868
869138	contig_1275_pilon	+	3205	1	Intergenic	novelGene_108744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1659	2132	383819	384292	NA	60	AAAAAAAAAAGCAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKGDPTECGNYRISLISHASKILLKIFQKRLQQYVNKELLEIQAGYRRGRGTRDIIADVRWILAESREYQRDVYLCFIEYAKAFDCVDHNKSWVTLQRMGNPEHLIVLIRNLYTDQEAVVWKIKGILRAIKLGKVCIRVASFHYTYSICMLSK	382160	385365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_382200_385400
869141	contig_9673_pilon	+	1473	11	Intergenic	novelGene_119164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_10	641.190767244819	77	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	29	385	114479	145610	TRUE	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYLKDASKKMKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEKR	114450	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_145599_145856_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
869143	contig_12512_pilon	-	3502	7	Intergenic	novelGene_24181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	624	junction_4	257.968182792633	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	238	1293	599702	591081	TRUE	10	TTGTAAGTCTGGCTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQTPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLGLSLPERPEGNLIIHI	599939	586590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_591267_591594_591852_592236_592340_593331_593480_595423_595506_599422
869144	contig_6304_pilon	+	2748	11	Intergenic	novelGene_122238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	182.196706885717	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	67	1230	70293	180531	TRUE	10	TTTTCTCATCTGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPQFAVHPERSGLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGPPQQYSGQEDYYGDQYSHGGQGPPEGMNQQYYPDGNSQYGQQQDAYQGPPPQQGYPPQQQQYPGQQGYPGQQQGYGPSQGGPGPQYPNYPQGQGQQYGGYRPPQPGPPQPPQQRPYGYDQGQYGNYQQ	70226	182281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695_128850_132145_132368_161430_161599_162289_162395_167002_167126_168549_168684_180504_181818_182049
869145	scaffold_12124_pilon	+	2606	10	Intergenic	novelGene_22040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	374.666996177527	1535	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	163	720	836073	846649	TRUE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSL	829582	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869146	contig_6005_pilon	-	1984	2	Intergenic	novelGene_158884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGGAAGAAATGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308374	306352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_306646_306683
869147	contig_17427_pilon	+	6234	1	Intergenic	novelGene_30270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26794	33028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_26800_33000
869148	contig_2367_pilon	-	2189	4	Intergenic	novelGene_65311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	663.855908060376	3024	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	142	348	213194	193580	FALSE	40	AGAACTATATACCTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGHICSKTLNTFKIKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	230097	191738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208634_213107_213294_230055
869149	scaffold_12124_pilon	+	2385	11	Intergenic	novelGene_22057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	416.167802695019	7	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	104	943	836073	852375	TRUE	30	AACTGGCGTCTTCTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829641	858979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846578_846744_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869150	contig_2036_pilon	-	1646	6	Intergenic	novelGene_131832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.317285563828	61	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	112	1047	661441	616920	FALSE	50	AAAAAAATTTCATGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINTYVFVGNQLIPQPLDSEEDEKKKKS	661552	616320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_616934_617015_617232_631747_631872_636558_636731_647832_647936_661134
869151	contig_12019_pilon	-	1767	4	Intergenic	novelGene_87674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10202	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_6226_8298_8493_9215_9477_9999
869152	contig_2798_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_120068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCCAGCTGTAGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190310	188868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_188900_190300
869153	contig_10629_pilon	-	2771	16	Intergenic	novelGene_52915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	370.966209901776	907	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	400	1425	256957	247382	TRUE	25	CCAAATCTATTTGTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLMEHVELPRSRERSLSPKSISPPPSPEVWVDSRSPGIISQASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPAPERRGPEGEDGPGELPALCAGAEDLSL	267925	245858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247396_247692_247765_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588_254689_255094_255140_256066_256223_256591_256667_256939_256996_257083_257145_267625
869154	contig_15021_pilon	-	2450	5	Intergenic	novelGene_26947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	342.890197439355	1097	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2018	2323	240178	239873	FALSE	20	CAAGTGGTTCTGATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYYKKYCGALLICPFPVESLPAVKAVQAHWTVLPRFHDTVQRKSENVFADSVNRVYVQVLLRASCHPVLVMWGLEGLHCYTFKSLLFAAQFSIYTFAHR	279841	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243697_243801_267742_267864_269629_269660_279781
869155	contig_20293_pilon	+	1477	1	Intergenic	novelGene_153500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17107	18584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_17100_18600
869156	contig_401_pilon	-	2259	5	Intergenic	novelGene_42767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	939	junction_1	362.476550965714	8307	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	243	668	1083727	1079678	FALSE	15	CTGCTGCCTCAACCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYICAKFVSTPSLVRSTSQLLSRPLSAVVLKQPQALTDEGFSSLTAPHSLTSLIPSRSFQTTAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	1086786	1078086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1079793_1081571_1081766_1082304_1082383_1083688_1083759_1086575
869157	SIRV6	+	1033	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	256	750	1733	10736	TRUE	40	GGGGAAAGAGCAATCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2030_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869158	contig_5988_pilon	-	3181	11	Intergenic	novelGene_15849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	157.296408096307	3	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	242	1048	259768	251825	TRUE	55	TAAATGTTAAAGAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKDVVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTQKDAPAIGDLLTLYSGLMETALD	260600	241658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_250665_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259754_259979_260569
869159	contig_9183_pilon	-	2141	9	Intergenic	novelGene_40320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	439.341552780977	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	131	1270	323783	318262	TRUE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLTLFFFFFCSNWTASMSPYCTRRKGPALGSAWQEVWI	325948	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318374_318426_318531_320557_320727_322743_323282_323566_323834_325868
869160	SIRV6	+	1495	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	21	12	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	300	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	35	AAGTTTTTAAGATAGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869162	contig_6208_pilon	-	2696	5	Intergenic	novelGene_52974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_4	403.013880033926	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTGGACTGTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420648	354694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365218_374163_374268_376173_376260_420587
869163	contig_6047_pilon	-	2049	14	Intergenic	novelGene_24218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	599	943	122466	119849	TRUE	30	CTTATCTGCTACAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGINFKCFLLTRIITCRDVLARLVCLGLHDSLHIARPAILASHKSTWRLCQALRYHSLFNTLSLRALSFIQLSSGSNSFSIASRFSFVFSLSSNFTPSLATFWNLFPSNSGRA	123883	109391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_109511_114652_114763_115032_115153_115884_116002_117938_118077_118158_118239_118356_118423_119278_119547_119760_120014_120542_120675_122418_122498_122582_122738_122978_123100_123592
869164	contig_177_pilon	+	2439	3	Intergenic	novelGene_41825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	3	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	73	1149	417672	418748	TRUE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415658	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418986_419094
869165	contig_9436_pilon	+	4455	7	Intergenic	novelGene_60886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_4	95.0428266040572	1018	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	387	746	349921	350577	FALSE	20	ATGGGAACTGCCTCTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKSSPKKPRGRSIFKALFCCFRAQHVGQSSSSTELAAYKEETNTIAKSDLLQCLQYQFYQIPGTCLLPEVTEEDQGRICVVIDLDETLVHSSFKPISNADFIVPVEIEGITHQVYVLKRPYVDEFLRRMGELFECVLFTASLAKYADPVTDLLDRRGVFRARLFRESCVFHQGCYVKDLSRLGRDLRKTLILDNSPASYIFHPENAVPVQSWFDDMADTELLNLIPIFEELSGAEDVYTSLGQLRAP	344052	354286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_344196_346361_346401_346873_346976_347550_347608_349875_349969_350106_350293_350451
869167	contig_6589_pilon	+	3837	6	Intergenic	novelGene_26122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_2	2598.31137472013	206	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1746	2174	1879232	1880585	FALSE	15	GGTCTTGATTTAATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1877309	1882248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
869168	contig_7457_pilon	+	2787	11	Intergenic	novelGene_31322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_9	224.812277244816	1633	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	397	1743	281205	290630	FALSE	55	GAAACAAAAATGAACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280808	291674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
869169	contig_9995_pilon	-	2364	2	Intergenic	novelGene_47731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGCCAAAATCAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510332	507645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_509583_509905
869170	contig_12605_pilon	+	884	5	Intergenic	novelGene_64179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	384	746	4816	5980	TRUE	15	GAGAGGGGTGTGGGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGRPGLRGTGPSRSGQPSWCPLERSKDTHAVCSTRG	3868	6238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5873_6005_6124
869171	contig_3111_pilon	-	4165	23	Intergenic	novelGene_129952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_19	149.891448325085	897	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1023	3072	112	3183	100376	16585	FALSE	20	TGGGCCTGTGTGCAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQAGRAESWCCRSWGAGASFPAEPESELGSCERLRTKMFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYTAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYYAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGSAYQSPLPLSRGSLSTIARAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGKESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIREKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCNVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	113280	15602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22889_23185_23289_24064_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964_40056_40855_41003_41524_41680_48564_48681_63172_63276_65402_65595_100154_100403_113195
869172	contig_9266_pilon	+	3506	6	Intergenic	novelGene_178145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	445	junction_4	413.02183961626	833	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	203	910	10395	19552	FALSE	55	AAAAAAAAGAGGGAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPETLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPMGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV	4891	22148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9266_pilon_+_5025_10325_10515_12783_12907_15089_15228_15571_15690_19343
869173	contig_366_pilon	+	2696	11	Intergenic	novelGene_51584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2187	2492	802966	803271	FALSE	40	AACACAAAATGCCCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKEPEPIFRTSLYFPPTMNSALEPLLLAILRNEDGRLGPSPDTYEGRMGPLGLVHGAKLRRASGNGKWRSFLGVTEHRTGLGNLITAAQSGFFLPGRSL	755883	803475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_757106_764235_764347_765319_765429_768020_768099_769051_769129_770343_770482_774320_774407_776793_776893_780057_780183_802169_802276_802930
869175	contig_11117_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_148566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_0_1000
869176	contig_17427_pilon	-	2206	12	Intergenic	novelGene_30374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1252.3408626902	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	30	770	188879	181330	TRUE	30	TTTTTTGGTGGGAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSRACGKRAEWLAIWTLCRIGSSSPSTWPASPSSPHQFRLR	204690	177067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179188_179718_179843_181270_181449_182698_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
869177	contig_21013_pilon	+	4433	1	Intergenic	novelGene_38515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAAAAGAGTACCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20602	25035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_20600_25000
869179	contig_12873_pilon	+	2250	6	Intergenic	novelGene_27206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1310.00803050974	11	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1381	1872	17896	19855	TRUE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16037	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17257_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851_19951_20152
869180	contig_6059_pilon	+	2756	16	Intergenic	novelGene_44848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAGGGGAAGCACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567802	584868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569232_569830_569958_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572960_573170_573437_575784_575844_576074_576218_576549_576645_578184_578326_580594_580709_580919_581138_584201_584618_584674
869181	contig_9183_pilon	-	1957	6	Intergenic	novelGene_40298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	866	junction_1	213.916806258882	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	675	1673	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	323572	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743
869182	contig_7202_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_18067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	129	428	29682	29383	NA	10	CCCAGCTGTTGTCTTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAGGLLGLLLRGNPDSELLAPFSCSPGGRPVRQGPPLRTPLCGESNLLKPGIVIFAACKIKPAVRKVAFCTSIPPTAYYDVALGNGGEEVSLPSSRV	29810	27626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27600_29800
869183	SIRV6	+	1019	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	509	0	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	127	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869184	contig_15092_pilon	+	2056	3	Intergenic	novelGene_57803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	59	625	325159	351165	FALSE	10	AGGTTTTTTTTTTCGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325100	352596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
869185	contig_10500_pilon	-	2092	4	Intergenic	novelGene_41249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1036.14713669869	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAGAAAATTCTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640221	1626461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626985_1628551_1629573_1630546_1630728_1639854
869187	contig_7744_pilon	+	2358	11	Intergenic	novelGene_62560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	283.04409550457	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	197	766	882687	885326	TRUE	65	ATAAGGAAAAAGAAATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCEGVSVIRRPGTQAGAEAQAARSGVGRFTFQNIFILKSTPLSPAHPGSNSFTAFVLRGLSDHSSMSEGESQIVLSSGSDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQRNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKKIQLEHLNIVKFHKYWADTKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHSCDPPHHPWEPDL	879823	888751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_881536_881629_882666_882894_883079_883187_883441_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346
869188	SIRV6	+	1247	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	56	225	6	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	202	693	1733	10736	TRUE	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1143	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869189	SIRV6	+	1306	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	555	55	339	-54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	91	582	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1642	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869190	SIRV6	+	899	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	577	2	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	6	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869192	contig_10930_pilon	-	2148	6	Intergenic	novelGene_37018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	981.844875731396	28	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	504	1352	276835	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279833	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700
869193	contig_18145_pilon	+	2711	16	Intergenic	novelGene_37349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	476.245576240755	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	135	1643	86893	98416	TRUE	10	CTGAGTCCTGATCCCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELKKECVHHWRYQPA	86758	101271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97534_98373_98541_98826_98983_100326_100482_100638
869194	contig_15047_pilon	+	1543	7	Intergenic	novelGene_52107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	72	695	2194	4178	TRUE	35	ATGGAAGACCGGAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2122	21638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
869195	contig_5419_pilon	+	3959	10	Intergenic	novelGene_15487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.785077075808	2	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	355	1674	241897	249830	FALSE	35	CATATGACATCACAGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTSLWSVSVAVFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238721	252115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240592_240675_241836_241998_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
869196	SIRV7	+	1761	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGATATTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033	3112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996
869197	SIRV6	+	1126	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	372	-7	122	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	45	ATGTGGAAAAACATGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869198	contig_9981_pilon	+	1338	3	Intergenic	novelGene_121023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGTTCAGTAATACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10791	12285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10876_10936_11111_11205
869199	SIRV6	+	1469	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	55	4	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869200	contig_12624_pilon	-	1907	4	Intergenic	novelGene_61112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	6424	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	305	610	952979	948779	FALSE	15	TTTTACTTTTCTAATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955943	947481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955644
869201	contig_13201_pilon	+	739	1	Intergenic	novelGene_130872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTTTTCTTCGATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45056	45795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_45100_45800
869202	SIRV6	+	1415	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	408	-13	192	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	132	623	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1495	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869203	contig_4754_pilon	+	2420	15	Intergenic	novelGene_35938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_14	113.994472655118	2271	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	218	1987	380119	420387	FALSE	10	GCTGGTTGTCTGATCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCQENVIMTQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA	379901	420820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_380197_399457_399549_401368_401470_407588_407822_409293_409442_409548_409705_410232_410348_410461_410533_411004_411140_414446_414621_414900_414962_415742_415898_416938_417082_420159_420252_420370
869204	contig_11505_pilon	-	1685	2	Intergenic	novelGene_140911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTGGCCAAACTGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5422	3584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_5187_5339
869205	contig_9183_pilon	-	2312	6	Intergenic	novelGene_40309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	455.355421621397	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	247	2028	323783	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTQQGDPPAPLPAAQDPELPCRLRPPQRASQAEELVQNPCYSALNFGRQITITCDTQLLPCFCSLAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325979	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_320557_320727_322743_323919_325868
869206	SIRV6	-	972	7	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8784	-96	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	34	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAACAGTACTTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11331	1640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2621_2739_2828_3105_3164_10723_10825_11035
869208	SIRV6	+	957	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	548	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	20	ATTAGCCTGCCTAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869210	contig_11086_pilon	+	2856	14	Intergenic	novelGene_61187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.759669130163	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2490	223	2712	35087	52082	FALSE	15	TCAACCCAGTGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWDPNWDLKKGAVVCRQLECGTAVDASIRPHLGARIGFIQLTQFSCKGTEPTVNECSYFNHRYMINFDYVLPWNVGVVCSGFVHLAGGNGPCSGRVEIYTGTEWTPVSDRNFTFPTAHVICAELGCGKAVSVQQDMPLRDAYGQVWTEEFWCEGQESELHFCHRVPCPGGTCHHSGAVHVVCSEYTGLRLVSKDGSECEGRVEIQIFGDWRPLCDSLWDLAAANVVCQDLGCGVAIATPRGVPFQEGSGQVWKHKFHCSGTESHLWECPGTALGYPDCSQGGAASVICSGNQTQLLLPCNNSVSHPAGSAASEDSAANCSENRWLRLVDGGSPCAGRVEILHQGSWGNICDDNWDMNDAHVVCRQLGCGVAIKAIGSSHFGEGTGPIWLDDLKCTGQESHVWRCPSRGWGQHNCRHKEDAGVICSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNILAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGKKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFFPEEGHGTRYSQTDASIQLPREAANPRMEGKASSLVLGQGEDPGYDDVELSTM	24389	52226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_24535_35009_35331_42521_42831_42932_43251_45329_45423_45496_45812_46372_46688_47656_47699_47787_48103_48329_48363_48761_48900_49318_49418_50803_50951_51960
869211	contig_16098_pilon	-	1747	10	Intergenic	novelGene_46022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1172.43119780235	125	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	125	784	352350	350056	TRUE	30	GGTACCAGACTCTGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVREGSSP	354113	348291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349710_349955_350076_350232_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
869212	contig_10126_pilon	+	2491	6	Intergenic	novelGene_105749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1910.81902858434	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	104	733	162049	184341	FALSE	25	AGCACAGACCCAGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSDTPVQTKPIFIVVGLVCALLVALLIAVLYLLRIRQKKAKGSTSSTRLHEPEKNAREVTQIQDTNNMNNDITYAELNLPRGKKPAPQAAEPNNHTEYANIEASPPRRSEDTLTYANLDMVHLNQVPKDSAPKPEPSCSEYASVRIQRK	161945	186099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162153_162221_162305_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074
869213	contig_5039_pilon	+	1861	13	Intergenic	novelGene_65000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	94.5202432756544	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	58	1617	1698093	1710859	TRUE	40	AAAAGTCGTGTAGAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALKDGRVVTNGGRVLTVTAIREDLPSALEEAKKGLAAIKFEGAVYRKDIGRRALAFLQQPRGLTYKEAGVDIAAGDMLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPAGNHCLFVCF	1698035	1713430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1698121_1698338_1698425_1698648_1698818_1700933_1701166_1703149_1703245_1703623_1703734_1704337_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710860_1712083_1712222_1713176_1713262_1713409
869214	contig_5039_pilon	+	1650	9	Intergenic	novelGene_65012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	71.4838268421606	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	32	982	1704389	1713413	TRUE	50	ACAGCATAAGCAGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPADSPRVKVRNLMESMQINRSVLENSSLENHVSVQPPLHALLLSSPTKPQWLDWTKQRQLVFPPE	1704357	1718202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1710831_1712083_1712186_1713059_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
869215	contig_12644_pilon	+	1117	5	Intergenic	novelGene_44675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2951.17417310466	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATGTGGGACGTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2676959	2679561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677693_2678054_2678101_2678691_2678846_2679073_2679204_2679507
869216	contig_5495_pilon	+	4836	1	Intergenic	novelGene_157671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACAAAAAAAACCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551094	555930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_551100_555900
869217	contig_7412_pilon	-	2971	6	Intergenic	novelGene_76305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1504	junction_1	1051.23386551233	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	71	1411	377290	365711	FALSE	10	CGAGGTCTACTGGTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMGEPWQPGLTAQPVRGQREVPKM	377360	364150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
869218	contig_500_pilon	+	1773	11	Intergenic	novelGene_31004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1062.33257033756	19	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	663	1361	1495241	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLQGPQGAWGLWGVEAHGCPPVSLRSPPAHLSPVCRWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494483_1495185_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
869219	contig_12873_pilon	+	2286	5	Intergenic	novelGene_27162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1379	junction_1	767.731235524516	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1224	1715	17896	19855	FALSE	35	TAAGCCAAATTTGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15958	20426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_17021_17734_18014_18984_19264_19611_19703_19851
869220	contig_10904_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_22570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCACGCTTGGAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413406	412330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_412300_413400
869222	SIRV6	+	1057	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	471	0	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	40	AAATTTGTGAACGCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869223	contig_12120_pilon	-	3860	6	Intergenic	novelGene_21401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	595.968321305755	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2826	3164	21900	21562	FALSE	0	TCCTGGTTTGGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEFKK	119131	20865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_23109_23257_23750_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559
869225	SIRV6	+	865	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1651	74	222	61	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCGCAAAAATTATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2738	11751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869226	SIRV6	+	1109	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	864	53	-334	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	51	383	2002	10736	TRUE	30	AGTCGATTATTGCCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1951	11772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869228	contig_9400_pilon	-	2414	8	Intergenic	novelGene_146579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	523.515783439434	1161	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	115	540	135537	121571	FALSE	60	AAGGAGAAAAAAAGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNE	158630	119696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
869229	contig_9400_pilon	+	2153	5	Intergenic	novelGene_146580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCCAAAACTGGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119697	158571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_+_121577_125252_125295_132506_132594_135447_135561_158539
869230	contig_9400_pilon	-	1417	9	Intergenic	novelGene_146584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_2	491.266968536457	1171	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	114	572	135537	121571	FALSE	20	GCACTGTGTTAACACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE	158629	120725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
869231	contig_9183_pilon	-	2153	7	Intergenic	novelGene_40322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	434.760246828321	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	976	1872	322898	312131	FALSE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325972	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_320557_320727_322743_323419_323482_323834_325868
869232	contig_4426_pilon	-	2117	6	Intergenic	novelGene_15432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	409	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2031	87	2117	904546	820616	FALSE	40	GAGAAATCTTTCAGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKES	904632	820615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
869234	SIRV6	+	1110	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-30	8	13	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	40	GACTATGGGGAAAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869235	contig_11498_pilon	+	1368	6	Intergenic	novelGene_65499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_5	58.3486075240875	103	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	81	1367	139595	144725	FALSE	20	AGGTATGCATACCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVMEMACPGTPGSAVGQQKELAKAKEKAQTVGKNQSSMCKLKASEKSSVFCGKWDILNDVITKGTAKEGSEGGLAAISIIAQAECENSQEFSPTFSERIFIAGSKQYSQSDSLDQIPNNVAHATEGKMAPVCWKGKRRSKARKKRKKKSSKALAQAGVALAKPLPRTPEQESCTVPVQEDESPLGSSYVRNTPQFIKPLQEPSLGQLCFKKLGEGLRPALPRSEFHKLISPLQCLNHVWKLHHPQDVGPLPQPVHPFPYSRLPHPFPFHPLQPWKPHPLESFLSKLACADGQQPLPGPHLGKLACIDSQKPLPGPHQKPSCPSRGTCEKFSVEEYLVHALQGSVSSGQAHSLASLAKTWSAGGPRMQGPSPETEDSEGVLLNEKLKPVDYEYREEIHWATHQPRLGRGSFGEVHRMEDKQTGFQCAVK	116339	144726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_116400_139574_139851_141456_141527_142749_142961_143059_143675_144590
869236	contig_854_pilon	-	1496	2	Intergenic	novelGene_36375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGAACTTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977542	974698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976106_977453
869237	contig_14871_pilon	+	2905	11	Intergenic	novelGene_63694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_1	587.479735820735	1313	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	477	1904	201945	233218	FALSE	5	TCTGTGTGGCCGAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	194513	234219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
869238	contig_5033_pilon	-	2539	13	Intergenic	novelGene_29041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_9	3514.82857472768	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	29	1402	566787	532125	FALSE	15	CAGACCTGGGCCTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566815	530987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
869239	contig_12074_pilon	-	2199	14	Intergenic	novelGene_53766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	422.700741849081	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	635	1960	36661	30226	FALSE	50	ATTTTAAAAATACATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGEFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	46692	29986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32734_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_46464
869240	contig_5718_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_110320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	906	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTTTGCGTAACGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499326	496455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_496500_499300
869241	contig_9183_pilon	-	2246	8	Intergenic	novelGene_40316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	529.36288236378	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	285	1964	323689	312131	FALSE	30	GATATGAAATCCATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCCYSPMSTWVKKMGRRVTQMGPCQSWTLPMVLPKFTRQQTTASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325948	311848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323450_323556_323834_325808
869242	contig_8045_pilon	+	2058	3	Intergenic	novelGene_35352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1349	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGAGTGCAGTTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_118033_118153
869243	contig_14260_pilon	+	1170	1	Intergenic	novelGene_28887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	80	604	14906	15430	NA	55	CAAAAAAAGCCCACAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRKCSLASVGPSPQAAPKALVLSAIPYTPLPAITERFDQRFCRRSIITLNVNGLNAPIKRWRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTNSIIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLNNTEKRN	14826	15996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14260_pilon_+_14800_16000
869245	SIRV6	+	1116	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	892	18	-306	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	23	355	2002	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1979	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869246	contig_8729_pilon	+	2754	14	Intergenic	novelGene_40059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_11	174.592983991831	2068	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	76	1671	33998	43845	FALSE	5	TTTCCTGTGGTCTTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIITEGFEAAKEKALQILEQIKVSKEMDRQTLIDVARTSLHTKVHAELADVLTEAVVDSILAIKKQDEPIDLFMVEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVNKIIELKKKVCGDSNKGFVVINQKGIDPFSLDALAKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSLDDLNPDCLGYAGLVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAIRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAIAAALMKYKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKVQAEHSESGELVGVDLNTGEPMVAAEAGIWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG	33922	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_36925_37784_37959_38491_38596_39239_39351_40001_40162_40269_40353_40956_41054_41327_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
869247	contig_6304_pilon	+	2775	10	Intergenic	novelGene_122248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	190.475104494259	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	101	1111	128711	180531	TRUE	10	TTTTCTCATCTGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCQGAPVELCGREYPPLPFSNAQVQGQPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGPPQQYSGQEDYYGDQYSHGGQGPPEGMNQQYYPDGHNDYGYQQPSYPEQGYDRPYEDSSQHYYEGGNSQYGQQQDAYQGPPPQQGYPPQQQQYPGQQGYPGQQQGYGPSQGGPGPQYPNYPQGQGQQYGGYRPPQPGPPQPPQQRPYGYDQGQYGNYQQ	110475	182281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_110561_128695_128850_132145_132368_161430_161599_162289_162395_166204_166298_167002_167126_168549_168684_180504_181937_182022
869248	contig_5231_pilon	-	5238	1	Intergenic	novelGene_65897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAATATTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217379	212141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_212100_217400
869249	SIRV6	+	1445	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34569	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869250	contig_9594_pilon	+	2613	11	Intergenic	novelGene_73926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_10	395.189182544259	3198	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	313	1566	301335	322451	FALSE	50	CAATATATGAAAACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSNKLTLDKLDVKGKRVVMRVDFNVPMKNNQITNNQRIKAATPSIKFCLDNGAKSVVLMSHLGRPDGVPMPDKYSLEAVAVELRSLLGKDVLFLKDCVGPEVEKACADPAFGSVILLENLRFHVEEEGKGKDASGNKVKAEPAKMEAFRASLSKLGDIYVNDAFGTAHRAHSSMVGVNLPQKAGGFLMKKELNYFAKALESPERPFLAILGGAKVADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLKVLNSMEIGTSLFDEEGAKIVKDLMSKAEKNGVKITLPVDFVTADKFDENAKTGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKKYAEAVARAKQIVWNGPVGVFEWEAFARGTKALMDEVVKATSRGCITIIGGGDTATCCAKWNTEDKVSHVSTGGGASLELLEGKVLPGVAALSSV	301022	323498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_310433_310590_310705_310851_315249_315354_316198_316319_319365_319481_319723_319904_321480_321659_321936_322036_322410
869251	contig_12837_pilon	+	2867	2	Intergenic	novelGene_57362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGAAAACATGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272308	294521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_272602_291947
869252	contig_9696_pilon	-	3048	13	Intergenic	novelGene_68778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_12	400.176306631076	892	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	480	1352	240739	198460	FALSE	30	TGTGAAGATGCTGTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGRAVGAADAGRVRGPRWPGTNVSLCVSPTSPFLLVRWALPTPQEGLDDGPDFLSEEDRGLKAINVDLQSDAALQVDISDALSERDKVKFTVHTKSSLPNFKQNEFSVVRQHEEFIWLHDSFIENEDYAGYIIPPAPPRPDFDASREKLQKLGEGEGSMTKEEFTKMKQELEAEYLAIFKKTVAMHEVFLCRVAAHPILRKDLNFHVFLEYNQDLSVRGKNKKEKLEDFFKNMVKSADGVIVSGVKDVDDFFEHERTFLLEYHNRVKDASAKSDRMTRSHKSAADDYNRIGSSLYALGTQDSTDVCKFFLKVSELFDKTRKIEARVSADEDLKLSDLLKYYLRESQAAKDLLYRRSRSLVDYENANKALDKARAKNKDVLQAETSQQLCCQKFEKISESAKQELIDFKTRRVAAFRKNLVELAELELKHAKGNLQLLQNCLAVLNGNT	255784	196763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_198514_206411_206498_206589_206750_210595_210683_214715_214756_216376_216453_224243_224350_226518_226615_238468_238593_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599
869253	contig_14415_pilon	+	2151	4	Intergenic	novelGene_77617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	982	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	25	CATGATGTGTGGTGAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
869254	contig_9183_pilon	-	2487	7	Intergenic	novelGene_40338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	407.438918394184	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	156	1478	323783	318417	TRUE	40	TGTGGTACCATAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	325973	311884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318226_318531_320557_320727_322743_323834_325868
869255	contig_6062_pilon	+	1344	2	Intergenic	novelGene_5275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAGAAAAAAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694038	695820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_694531_694968
869256	contig_1532_pilon	-	2089	7	Intergenic	novelGene_37421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1335.53181250849	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	582	1346	27321	13113	FALSE	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32228	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_29045_29378_29505_32049
869257	contig_9578_pilon	-	4237	9	Intergenic	novelGene_68001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTGCGCGGCGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329307	1309242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1309461_1311493_1311819_1317334_1317598_1318292_1318358_1319387_1319809_1320952_1321080_1321484_1321545_1324878_1325041_1326711
869258	contig_9807_pilon	+	2846	15	Intergenic	novelGene_32880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	546.307143370796	21	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	96	1859	109130	158783	FALSE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109034	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154216_156624_156770_158676
869259	contig_7457_pilon	-	943	4	Intergenic	novelGene_31721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2104.51995054032	21	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAGAAAGATTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176882	1174497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175775_1175967_1176132_1176811
869260	contig_7457_pilon	+	1029	3	Intergenic	novelGene_31688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGCCGTTTCTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174113	1176037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1174971_1175539_1175642_1175967
869261	contig_5316_pilon	+	2255	10	Intergenic	novelGene_61217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_6	258.587378073187	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	262	1659	453918	550408	FALSE	60	AAAAAAAAAAATGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396098	551004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
869262	contig_17144_pilon	-	798	6	Intergenic	novelGene_29329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	189	737	179764	166129	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNLRNARGSSQSPIFLVSITPLHMSCLCGLGLPGNLHTLRMCSPTH	183270	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166265_174948_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
869263	contig_9924_pilon	+	2676	10	Intergenic	novelGene_175912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_9	186.57603619959	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	822	2466	211	2676	15841	129240	FALSE	65	GAAGAGGAAAAACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETGSPPRSAINQNTDKISGAGTNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSS	15630	129240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352_128405_128485
869264	contig_19459_pilon	-	1180	8	Intergenic	novelGene_59856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7530.19177195701	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	137	547	16240	10294	TRUE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSNTAEST	19100	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10314_11388_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
869265	contig_4486_pilon	+	2218	13	Intergenic	novelGene_38569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1254.17054262967	53	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	149	1303	343083	412464	FALSE	20	GTCACCATTCTGCATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRDPLLLRRGASTAAPWQQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311762	413379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342986_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
869266	contig_9183_pilon	-	2138	8	Intergenic	novelGene_40314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	856	1854	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	326000	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323097_323308_323834_325868
869267	contig_3721_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_123831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	407	1036	280244	280873	NA	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPGRSREYQKDVYLCFIEYAQAFDCVDHSKLWITLQRMGIPEYLIVLMRNLYIDQEIVVGAEQRATAWSKFRKGVCQCCVLSPYLFSLSAEQIIREAGLCEEERGITTGGRLINNLCYANDTSLLAESEEHLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTEIFTTGPINNIMINGENISVYLDPQSTPVEAAVKKSNDTSHWANLLQKTSLKC	279837	281480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_279800_281500
869268	contig_7457_pilon	+	2406	2	Intergenic	novelGene_31508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	857	junction_1	0	313	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGAGCGTGGCACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668765	671993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_668907_669728
869269	contig_8712_pilon	+	2145	3	Intergenic	novelGene_58814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	761	junction_2	326.5	2	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	92	412	315133	321793	FALSE	10	GCCGTTCTCATTCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	315041	323526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684
869270	contig_10252_pilon	-	446	1	Intergenic	novelGene_162916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATCCATAAATCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90382	89936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_89900_90400
869271	contig_9183_pilon	-	2201	8	Intergenic	novelGene_40312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	514.388362771848	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	919	1917	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325988	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323282_323364_323780_325868
869272	contig_3789_pilon	+	2615	9	Intergenic	novelGene_79845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	260.96309006256	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	518	973	464071	472341	FALSE	25	TTTTAGAAGCCATTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFNWICIVITGLAMDMQLLMIPLIMSVLYVWAQLNRDMIVSFWFGTRFKACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	445431	473983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_459243_459283_464035_464101_465169_465197_465816_465913_467056_467110_468585_468697_472202
869273	contig_8920_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_146053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTCTGTGGTGGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32757	33839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_32800_33800
869274	SIRV6	+	923	5	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1667	0	238	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2754	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869275	contig_1275_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_108795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGAATGATATGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487391	489540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_487400_489500
869276	contig_3797_pilon	+	3315	5	Intergenic	novelGene_120076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	168.968007326831	896	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	60	1016	317790	332908	FALSE	25	GTGCTTGCAGTATCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRASSYSSAGWLHRPVALAMAPWAGAELSTLNPLSAVWLTLAAAFLVTLLLQLVPAGLFPGCPLFQDLIRYGKTKGARPPRPAACQAFDIPKRYFSHFYIVSVVWNGFLLWCLIQPLFLGAPFPNWLHGLLRILGASQFQGGELALSAFLVLVFLWLHSLRRLFECFYVSVFSNAMINVVQYCFGLVYYVLIGLTVLSQVPMDGRNAYVIGKNLLMQARWFHILGMLMFIWSSAHQYKCHVILGNLRKNKAGVVIHCNYRIPFGDWFEYVSSPNYLAELMIYISMAVTFGFHNITWWLVVTYVFFSQALAAFLSHKFYKSKFVSYPKHRKAFLPFLF	317730	335207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318011_326308_326452_328171_328370_331619_331755_332648
869277	contig_2027_pilon	+	3230	25	Intergenic	novelGene_39898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	383.682049268083	10	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	971	2916	122	3037	122795	136487	FALSE	15	CAGATGTGGCATGCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAILGGPGSGEEEKEEGGGRAWLRLLEALAAARPGEPALMSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	117865	136680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127284_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
869278	contig_16594_pilon	-	4616	1	Intergenic	novelGene_53900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAGATAGATACACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249335	244719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_244700_249300
869279	contig_5538_pilon	+	1879	13	Intergenic	novelGene_23701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	348.654666380487	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	54	1784	47801	258901	FALSE	20	CGGTAAGGGCTGAGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAGPPRKDPQLLVKLRMSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETWL	44807	258996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811_225068_258888
869281	contig_2799_pilon	+	1954	2	Intergenic	novelGene_85509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGTCCCAAACTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604693	609741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_604832_607925
869282	contig_1244_pilon	-	2022	12	Intergenic	novelGene_37990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_11	825.592609599186	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	325	1596	946523	923211	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	947192	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_946964
869283	contig_14450_pilon	-	821	2	Intergenic	novelGene_48984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	125	496	1042760	1041965	FALSE	80	TGAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPIGRQRGRKSKRKPQKIKNKSPICFELPAIWFQHVRRFLMICGNISNLLIFFFSFLVWFSFLSFFFFFNLPLSFVFGPLRILFLKEIEAIELILTLSCFTKSFSFSEDKTEKAKMTVASSSLSETHTQARTHMREKTDAENKLCLLNCPSEKQSNPRNCNHC	1042884	1041639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042078_1042501
869284	SIRV6	+	849	9	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	18	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAGGTATAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
869285	contig_12357_pilon	+	1673	8	Intergenic	novelGene_6116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	844.529575610963	23	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	245	979	34261	53235	FALSE	15	TAGTATTTGATTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKNSIHTFVQHESHLAAREKANL	25962	53929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_34190_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759_52844_53169
869286	contig_854_pilon	-	2022	6	Intergenic	novelGene_36395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1455.3026626788	42	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	250	606	993124	977488	TRUE	45	CCTATATGTATTAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSRPCLAP	1001754	974806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976166_977430_977509_991172_991309_991918_992043_993048_993301_1001681
869287	contig_18163_pilon	-	1318	3	Intergenic	novelGene_35312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3000.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	6	665	11553	9401	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTQTGSHTFQWMFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11558	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10375_10652_11489
869288	contig_6960_pilon	+	3139	5	Intergenic	novelGene_60236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_4	20.6700266085944	901	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	71	490	271783	281043	FALSE	20	AATGGATCCTAGTTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPVGRGRRPQWRFLKGRAFSGKMPSAFSVDTFPVSIPAVITQTDWTEPWLIGLVVFHVLCLLLTCFSFQRYKVQIGHFLCLVILVYCAEYINEVAAMNWRLFSKYQYFDSRGMFISLVFSTPLLFNAMIIVILWVQKTVNAMTDLKASQEKRKGKKRRRKE	271712	283692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_271840_273209_273331_275959_276015_280758_280853_280950
869289	contig_8588_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_146502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	573	899	327745	327419	NA	75	AATAGGAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIPWNSRITSPSWKKYSQGAAWKQGWRDLSLVLWTCYQEGPVPDNIMPGKVEGQRKRERPSTRWTDTVAATTGSNVATIVRMVQDRAVFHYLVHRVTMSQKQLNDT	328317	327411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_327400_328300
869290	contig_9653_pilon	-	3133	16	Intergenic	novelGene_48301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1065.44578880809	1	155	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1300	1848	1015897	1007186	FALSE	40	GAAAGTGAGAATTTTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKKP	1075332	1005900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007821_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016023_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021056_1021102_1021159_1025286_1025426_1039825_1040050_1075283
869291	contig_3822_pilon	-	4371	4	Intergenic	novelGene_133297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1601	junction_1	787.124019594258	266	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1159	1503	281746	281402	TRUE	35	TAGAAAAATGTTTGCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCWQRILNILWTSRRTNKSVLEEVQLECSLETRMERLCLTYFGHVIRRDQSLEKDILLGEVGGQRRRGRPSTRWSDTLAATVDSNKTTIMRMAQDQAVFCCVTMSRNQLDGT	282904	274898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136
869292	contig_15029_pilon	-	2753	7	Intergenic	novelGene_128183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1209.0084665635	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	48	623	172327	163104	TRUE	25	CCTAATCTGATTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172374	160713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_161156_161415_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
869293	SIRV6	+	987	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	538	3	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	197	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869294	contig_9609_pilon	+	2689	23	Intergenic	novelGene_22976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_20	272.343153738863	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1582	2046	328876	331392	TRUE	10	TGTGTAGCCTATGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELRER	309917	333113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_320955_321040_321846_321908_322284_322351_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330301_331388_331487_331563_331694_332694
869295	contig_9609_pilon	-	1270	7	Intergenic	novelGene_23032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGTTTCTCCTTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333281	328416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_328435_328861_329063_329771_329955_330247_330301_331386_331485_331563_331698_332698
869296	contig_1301_pilon	-	5781	1	Intergenic	novelGene_47345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTGAGATCACCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304643	298862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_298900_304600
869297	contig_2069_pilon	+	3406	11	Intergenic	novelGene_23568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	410.55859508723	422	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	197	1708	2272988	2316188	FALSE	15	AACTTCTGTTTGTTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAASVPATSGSQLSNNLAEPSRSNGNMVRHSSSPYVVYPPDKPFLNSDMRRSPNKPTFAYPESNSRAIFSALKNLQEKIRRLELERIQAEESVKTLSRETSEYKKVLDEQIQERENSKNEESKHNQELTSQLLAAESKCNLLEKQLEYMRNMIKHAEMERTSVLEKQVSLERERHHDQTHVQTKLEKLDLLEQEYNKLTTMQALAEKKMQELEAKLREEEQERKRMQVKAAQLQTGLETNRLIFEDKTSPYVGSARRIRKKKSKPPEKRGSRNCFAAQPHYRLCLGDMPFVAGKSTSPSHAVVANVQHVLHLMKQHSKALCNDRVVNSVPLAKQASSRCCKSKNRPVTPSSSSTINEELSEVLQTLQDEFGQMSFDHQQLVKLIQESPTIELKEDLECELETLVGKMEAKANQITKVRKYQAQLEKQKIEKQRKELRATKKSLDEEGNSSSRSSGTTGTTNKKDFAKLRPGEKSRKNLQLLKDMQTIQSSLQSNSLSWDY	2272791	2317886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2273039_2286329_2286487_2298194_2298375_2298733_2298856_2301543_2301661_2302289_2302368_2305649_2305758_2306699_2306778_2313148_2313391_2313974_2314120_2315954
869298	contig_13780_pilon	-	4724	1	Intergenic	novelGene_149072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	909	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	2404	2994	659355	658765	NA	25	ACTCTCATTGTCTCCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRPCPVALMCIPRSPEPSPAVCPLPLNVLFPLLKRSCVVETACLGSRPSRKPCPHRPVRYSHLPQVASTSPSLGPSSAELVPFLSYHISLQSAGPHLSCEGLGQFCNLRDILRSTLYIGSFQSILVGRTKLSILLAGWDRESMCTGKRCGPPSAHPRGGFAIGLMLTMQKSVGSTVPTEASRYMHENLNRGLWQ	661758	657034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657000_661800
869299	contig_12425_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_46688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	752.959807839849	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	322	831	210324	204225	FALSE	20	ACTTGAAATTTGCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSCPRGEPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226623	203280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207321_210298_210389_211048_211200_226517
869300	contig_8712_pilon	+	3748	23	Intergenic	novelGene_58733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_7	133.666817803889	428	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	971	2916	121	3036	73618	103433	FALSE	20	TAGATGTCTCTAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASERAPRPLPPPAHFCTVARPPRGLPYRLPIKKVDVQGNMSNVSEERRKRQQNIKEGLQFIQSPLSYPGTQEQYAVYLHALVRNLFNEGNDVYRECDWNGSISQYTEALNIADYAKSEEIVIPKEIIEKLHINRIACYSNMGFHDKVLEDCDTVLSLNASNCKALYRKSKSLSDLGRYKEAYDAVAKCSLAVPQDEHVIKLTQELAQKLGFKIRKAYVRAELSLKSVPGDGATKALNCSVEDIEPDLLTPRQETVPVVSLPASSFPYEVGSELASVPIMPLTSILPLQVEESSLPSAVLANGGKIPFTMPDAFLDDGDMVLGDEIDDLLDSAPKTNEGVMPSALVRGPLPTTPSVSPSIFSASLLGTLPVGARYAPPRSFSELYPPLTSSLEDFCSSLNSFSMSESKRDLSTSTAREGTPLNNSNSSLLLMNGPGSLFAPESFLEISSQSRNDFGSFFGCAVTKPSPSGTPRHPLEGTHELRQACQICFIKTGPKLMDFTYNTNIDHKCKKDILIGRIKNVEDKSWKKIRPRPTKTNYEGPYYICKDVAAEEECRYLGHCTFAYCQEEIDVWTLERKGAFSRETFFGGNGKINLTVFKLLQEHLGEFIFLCEKCFDHKPRMISKRNKDNSTSCSHPVTKHEFEDNKCLVHILRETAVKYSKIRSFHAQCQLDLCRHEVRYGCLREDECFYAHSLVELKVWTMQNETGISHDAIAQESKRYWQHLEANVPGAQVLGNQIMPGSLNMKIKFVCAQCLRNGQVIEPDKNRKYCSAKARHSWTKDRRAMRVMSIERKKWMNIRPLPTKKQMPLQFDLCNHIASGKKCQYVGNCSFAHSPEEREVWTYMKENGIQDMEQFYELWLKSQKNEKSDDVASQSNKENGKQIHMPTDYAEVTVDFHCWMCRKNCNSEKQWQGHISSEKHKEKVFHTEDDQYCWQHRFPTGYFRTCDGFLNGTCTEGNSCKFAHGNAELQEWEERRDALKMKLNKARKDHLIAPNDNDFGKYSFLFKDLN	63504	104145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_63591_73583_73686_74519_74560_76374_76573_78085_78245_78486_78568_78657_78697_79379_79414_79861_80146_83638_83844_84378_84444_84967_85155_85944_86107_87288_87486_87972_88074_88547_88730_89380_89458_90060_90195_90593_90700_93512_93622_99333_99468_101391_101556_103243
869301	contig_7457_pilon	-	2857	1	Intergenic	novelGene_31699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGCTGGCTTGCCGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176972	1174115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174100_1177000
869302	contig_16103_pilon	-	2131	8	Intergenic	novelGene_118857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	7901	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	72	704	743628	733331	TRUE	10	CCCACCCTCTGACCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743699	722285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
869303	contig_9183_pilon	+	2122	7	Intergenic	novelGene_40307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	373	810	312219	315445	TRUE	0	CTTCCTGCCGTGGCTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQASSRVMPCMAELASCRISSPGWTVSLCSEAVPLNILLMVRGLSPWSEPFPPSRLKPSPAEVFSRVTVQTSAVESTEASLATEIEAEESVEEFRSGVSSKAGFLVTITACRGSRAWRRMARASVCVAPLRDFPLMDRTSLPF	311846	325976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_312324_314769_314891_315233_315491_318242_318347_320557_320727_322743_323682_325920
869304	contig_9183_pilon	-	1833	7	Intergenic	novelGene_40321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	442.674698722311	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	554	1552	322898	312131	FALSE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACCPGPGVALQTHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325948	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323415_325911
869305	contig_9183_pilon	-	2330	7	Intergenic	novelGene_40324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	166	2049	323783	312131	FALSE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325983	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
869306	contig_9183_pilon	+	2251	7	Intergenic	novelGene_40310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	495	806	314788	315445	TRUE	20	CCGTGGCTGGGGTAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRGLSPWSEPFPPSRLKPSPAEVFSRVTVQTSLESTEASLATEIEAEESVEEFRSGVSSKAGFLVTITACRGSRAWRRMARASVCVAPLRDFPLMDRTSLPF	311846	325983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_312323_314769_314886_315231_315491_318242_318349_320558_320726_322743_323808_325920
869307	contig_10241_pilon	+	1802	7	Intergenic	novelGene_142828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	55.2702954176613	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	113	676	92779	140032	TRUE	15	TGTTTTTCCATGTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNVGCHFLVWGLIAFLGLALVISLIFNISHYVEKQRQDKVYGYSDDYIPRDDEYFLEDIPIYGNLDDVVSEPTDENCYEQMKARPERSVNKRQEVAPPAQAATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	92666	141237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_130963_131026_133187_133277_139774_140535_140613
869308	contig_10241_pilon	+	2187	6	Intergenic	novelGene_142829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.2171316706064	2	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	170	610	105302	140032	FALSE	30	AACCAATTGTTCTGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSSIKYTGTLMTTFPEDIPIYGNLDDVVSEPTDENCYEQMKARPERSVNKRQEVAPPAQAATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	92698	141609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105219_105317_116154_116192_130983_131026_133187_133277_139774
869309	contig_5799_pilon	+	4035	17	Intergenic	novelGene_50297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	240.83389471532	124	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	1033	2259	667965	704733	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIDIQRRQIYTLGRYLDSSVRNSKSLKSDFYRYDIDTNTWMLLSEDTAADGGPKLVFDHQMCMDSEKHMIYTFGGRILTCNGSVDDSRASEPQFSGLFAFNCQCQTWKLLREDSCNAGPEDIQSRIGHCMLFHSKNRCLYVFGGQRSKTYLNDFFSYDVDSDHVDIISDGTKKDSGMVPMTGFTQRATIDPELNEIHVLSGLSKDKEKREENVRNSFWIYDIVRNSWSCVYKNDQAAKENPSKSLQEEEPCPRFAHQLVYDELHKVHYLFGGNPGKSCSPKMRLDDFWSLKLCRPSKDYLLRHCKYLIRKHRFEEKAQMDPLSALKYLQNDLYITVDHSDPEETKEFQLLASALFKSGSDFTALGKYSSVFTQTAFAIWEVGFWFLLNETSDEMFIHQTKKVSQLHA	560980	706509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_561117_599847_599918_605445_605589_606863_606953_612805_612916_619552_619746_631538_631617_633742_633809_650860_650978_667934_668148_671827_672050_674933_675064_687590_687739_689074_689190_691443_691584_699672_699776_704547
869310	contig_5020_pilon	+	1011	2	Intergenic	novelGene_27921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3049	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCTAGCCAGCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124466	126044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_125091_125657
869311	contig_10953_pilon	+	1366	8	Intergenic	novelGene_42579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9180	junction_7	13621.9918184545	52401	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	84	734	455261	463828	FALSE	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKEPLELEDLTSGLGLTKQGVGEVFI	455177	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463465_463529_463817
869312	contig_9668_pilon	-	3751	19	Intergenic	novelGene_58067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_18	257.29409243121	428	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	123	2270	79257	37061	FALSE	10	TATGTTGTCTTTTGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLSSTVQPQVTVPLSHLINAFHSPKNTPISVSVSVPQNQHRDVVTEHDAPSSEPVLNLRDLGLSELKIGQLDQLVDSLLPGFFKGKKISSHWRTSHVSAQSFFENKYGYLDIFSTLRSSCLYRQHPRTLQSICSDLQYWPVLIQSRGFKTLKSRTRRLQSTSERLAETQHIAPSFVKGFLLRDRGSDVESLDKLMKTKNIPEAHQDAFKTGFAEGFLKAQALTQKTNDSLRRTRLFLLVLLLLGIYGLLKNPFLSVRFRTTTGLDSAVDPVQMKNVTFEHVKGVEEAKQELQEVVEFLKNPQKFTVLGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVAGEADVPFYYASGSEFDEMFVGVGASRIRNLFREAKANAPCVIFIDELDSVGGKRIESPMHPYSRQTINQLLAEMDGFKPNEGVIIIGATNFPEALDNALIRPGRFDMQVTVPRPDVKGRTEILKWYLNKIKFDQSVDPEIIARGTVGFSGAELENLVNQAALKAAVDGKEMVTMKELEFSKDKILMGPERRSVEIDNKNKTITAYHESGHAIIAYYTKDAMPINKATIMPRGPTLGHVSLLPENDRWNETRAQLLAQMDVSMGGRVAEELIFGTDHITTGASSDFDNATKIAKRMVTKFGMSEKLGVMTYNDTGKLSPETQSAIEQEIRILLRDSYERAKHILKTHAKEHKNLAEALLTYETLDAKEIQIVLEGKKLEVR	79379	35579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_37205_40522_40610_41283_41358_41446_41574_42460_42613_43441_43598_44472_44586_45889_45953_47221_47355_48099_48253_50599_50691_58436_58520_60703_60788_61207_61359_63113_63224_64448_64548_67109_67273_72039_72172_79224
869313	contig_13697_pilon	+	5323	1	Intergenic	novelGene_165938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	4370	4726	340025	340381	NA	50	CAAAGTGAGGACCCAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPSLEKGKPGACPRLSTVLAGAWGERYSGERLLWRLQGFTGGVQRLRAPPIPTAQGLEYAPRKYIAPGKLPLSLPHLGLPDRGADAGSPGGNPTNFGSNRAGRRRKKPRVCVELLV	335655	340978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_335700_341000
869314	contig_8138_pilon	-	3548	1	Intergenic	novelGene_52483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298658	295110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_295100_298700
869315	contig_3410_pilon	-	4488	20	Intergenic	novelGene_58943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_18	133.802517066785	457	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	215	2488	238772	218815	FALSE	5	CCCTTTGTGGGGTTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFSRCNSIVTVKKDKRHMAEVNASPLKHFVTAKKKINGIFEQLGAYIQESTTFLEDTYRNAELDPVTTEEQVLDVRGYLSKVRGISEVLARRHMKVAFFGRTSNGKSTVINAMLWDKVLPSGIGHTTNCFLRVEGTDGHEAFLLTEGSEEKRSVKTVNQLAHALHQDEQLNAGSLVSVMWPNSKCPLLKDDLVLMDSPGIDVTTELDSWIDKFCLDADVFVLVANSESTLMQTEKQFFHKVSERLSRPNIFILNNRWDASASEPEYMEEVRRQHMERCTSFLVDELGVVDRAQAGDRIFFVSAKEVLNARIQKAQGMPEGGGALAEGFQVRMFEFQNFERRFEECISQSAVKTKFEQHTVRAKQIAEAVRLIMDSLHIAAQEQRVYCLEMREERQDRLSFIDKQLELLAQDYKVRIKQITEEVERQVSTAMAEEIRRLSVLVDDYQMDFHPSPVVLKVYKNELHRHIEEGLGRNMSDRCSTAITSSLQTMQQEMIDGLKPLLPVSVRSQIDLLVPRQCFSLSYDLNCDKLCADFQEDIEFHFSLGWTMLVNRFLGPKNSRRALMGYNDQVQRPVPLTPANPSMPPLPQGSLTQEELMVSMVTGLASLTSRTSMGILVVGGVVWKAVGWRLIALSFGLYGLLYVYERLTWTTKAKERAFKRQFVEYASEKLQLIISYTGSNCSHQVQQELSGTFAHLCQQVDITRENLEQEISAMNKKIEVLDSLQSKAKLLRNKAGWLDSELNMFTHQYLQPSR	246243	216814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_218885_220311_220447_221326_221524_222928_223085_223920_224142_224607_224711_224981_225087_225485_225613_228580_228703_228843_228912_229142_229297_230655_230764_230875_230985_231840_231966_233603_233767_235393_235530_238597_238777_243934_244071_244173_244218_246213
869316	contig_10722_pilon	+	1738	3	Intergenic	novelGene_70991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	547.5	165	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1297	1668	32043	32414	FALSE	40	ATAAAAAAATGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30288	32484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31137_31542_31871_31922
869317	contig_12292_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_166989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164594	163153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_163200_164600
869318	contig_10134_pilon	-	2104	4	Intergenic	novelGene_16211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	489.258849917119	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39728	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33627_34922_35178_38558_38828_39594
869319	SIRV6	+	1241	5	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1896	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	47	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATAGTTACGCTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7453_7814_7924_10724_10819_11026_11109_11205
869320	SIRV6	-	1256	6	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	68	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTAGCTCACTATACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11782	3117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_3160_7102_7451_7806_7923_10723_10817_11031_11122_11215
869322	SIRV6	+	1022	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	503	3	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	312	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	40	TGACTATGGGGAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869323	contig_12837_pilon	+	2539	8	Intergenic	novelGene_57296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2397.3136666541	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	382	825	129778	166049	FALSE	25	CATTTTAATATGTAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128463	167763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128714_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
869324	contig_12638_pilon	-	4522	1	Intergenic	novelGene_33187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATTCACTGCAGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260865	256343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_256300_260900
869325	contig_9183_pilon	-	1962	7	Intergenic	novelGene_40304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	431.597034280821	11	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	137	1678	323783	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325954	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320648_323006_323834_325868
869326	contig_7457_pilon	-	1837	3	Intergenic	novelGene_31691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_1	380.5	1230	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	115	492	1176842	1175459	FALSE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEVSSITSWYCAASGRSQILPSQFLLET	1176956	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1175642_1175967_1176132_1176811
869327	contig_15063_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_14043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	195	1433	34808	39515	FALSE	15	ATACTGCGTTCTTGTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34613	39769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
869328	contig_19534_pilon	-	1491	5	Intergenic	novelGene_151617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	418.755895480888	2	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	33	806	68652	62762	FALSE	40	CATGTAATAGTAAGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSAPGDTEEMPAAVGSRALLWIALLLFAPAGSLVATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDGEALQYWYENHNISIPKATLKDNGTYHCEGFVQKLHRISDSLNITVQAEQIKNYWPQFFIPLLVGILFTVDTALFFFTRQQFKLLLKIKRTRRGSRLLDPQPKTDPQKK	68684	62076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62950_64567_64823_66767_67023_68150_68172_68597
869329	contig_4105_pilon	+	2908	10	Intergenic	novelGene_21460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_9	102.059653338164	326	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	884	1690	63728	73266	FALSE	15	CTGCCGTGACAGGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSPDGLFPAVGMHSLGEEVRLHLNAELGHEDDSVMMVDSYEDEWGRLHDVRVCGTLLEYLGKGKSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	58728	74484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_58798_60509_60657_61699_61776_62287_62864_63712_63899_71022_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
869330	contig_13021_pilon	+	4654	3	Intergenic	novelGene_8254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCTGAGAAGACGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214133	236226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_218308_231603_231882_236024
869331	contig_10734_pilon	+	3207	1	Intergenic	novelGene_51160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1581	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	364	1095	131	1225	998765	999859	NA	25	CACATATTGTTTCGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNVLQKHGVFLEINHKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLQFVFGLLGNGLALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLALADFFLIICLPFLTDNYVRKWDWRFGDTACRLMLFMLAMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHAINKISNQTATIISSVLWGITIGLTGHLLSKGFLTPNNGAYLCSSFSICKGFGWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGEPDNNRSTSMELTEDQNTSRNAPEALMVNSSEPWSPQHLTPTSP	998634	1001841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998600_1001800
869332	contig_10082_pilon	-	3286	10	Intergenic	novelGene_63866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_9	252.045851207893	776	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	133	1467	260762	212085	FALSE	15	TGTGCGTGGAAATGTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAYDDSVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRLLVDKGPQYGTVEKAWTAVMVEAERVSELHLDVKAALMNEDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAYHAACKEEKLAISRESNSKADPSLNPEQLKKLQDKVEKCKQDVLRTKEKYEKSLKELDQSTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEVQKHLDLSTVASYKNIYRDLEQSIKAADAVEDLRWFKANHGPGMSMNWPQFEEWSADMNRTLSRREKKKAADGVTLTGVNQTGDQPLHDKHSSVSSYEKTQTYPTDWSDDESNNPFSVDANGDSNPFDEDTTSGMEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKIEDEDEQGWCKGRLDNGHVGLYPANYVEAIQ	317601	210265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_212198_214733_214928_218341_218464_221744_221866_224043_224220_228798_228955_230358_230595_232483_232641_260702_260842_317548
869333	contig_7593_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_127255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3341	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3300
869335	contig_12425_pilon	-	1991	10	Intergenic	novelGene_46698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	598.821641246115	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	74	1096	211174	204225	FALSE	45	TCAGTTTAACAAGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226565	203329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
869336	contig_7412_pilon	-	2238	8	Intergenic	novelGene_76306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1250.18654934504	255	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	418	1944	377290	364445	FALSE	10	CGAGGTCTACTGGTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	378177	364150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377315_377784
869337	contig_5698_pilon	+	2175	7	Intergenic	novelGene_55025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	920.569705852486	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7992_11146_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
869338	contig_12622_pilon	+	4191	21	Intergenic	novelGene_5864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	93	junction_19	114.050690484539	312	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	111	2273	1184229	1212133	FALSE	30	AGCTGAGACCTTGAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKLPLTSIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLYITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSSMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIMLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSSVTGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPVPKEPSSYDFVYHYG	1169906	1214051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1169960_1184171_1184307_1184595_1184637_1185105_1185179_1185536_1185588_1189822_1190005_1191869_1191970_1193172_1193325_1195670_1195750_1199073_1199125_1203275_1203399_1203770_1203906_1205405_1205511_1205604_1205714_1206107_1206245_1207494_1207659_1207776_1207890_1208088_1208197_1208982_1209066_1210649_1210728_1211932
869339	contig_5125_pilon	+	2591	8	Intergenic	novelGene_43419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	366	1499	35654	58893	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25957	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26090_26311_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
869340	contig_15031_pilon	-	7658	2	Intergenic	novelGene_138414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	376	junction_1	0	527	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACCCTCAGCAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161734	122098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_129599_161576
869341	contig_11370_pilon	-	807	3	Intergenic	novelGene_98729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20277	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCAGCGCTCGCACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148548	145691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
869342	scaffold_12124_pilon	+	2361	10	Intergenic	novelGene_22029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	538.288026989269	7	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	431	922	846536	852375	TRUE	35	ATAAACTGGCGTCTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829531	858976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836153_844280_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869343	contig_13702_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_102641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1057	1356	211071	211370	NA	25	CAGGGCTAAAGGGCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210014	212300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210000_212300
869344	contig_4301_pilon	-	3076	2	Intergenic	novelGene_65116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1053	junction_1	0	7	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTATTGTTGTGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543782	538015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202
869345	contig_12120_pilon	-	3464	5	Intergenic	novelGene_21408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	507	junction_1	470.621596933247	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	3133	3462	21900	21571	FALSE	65	GAAATAAGAAAACTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASESAPALILRLAQVLHLPHNSWDNRRSCGPFSPVHDFTLFFFSNLLYFLSLQGPTIAASVGVYLQGRPRLSSLARNHSAATRMPWLHSNHTVYKSPRQGSWEHASEF	156974	21568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_156911
869346	SIRV6	+	1178	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	861	-13	-337	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	54	386	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1948	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869347	SIRV6	+	1111	10	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	12	94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	38	4	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	403	735	2002	10736	TRUE	25	AGAGACCTATTCGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
869348	contig_2768_pilon	-	2943	4	Intergenic	novelGene_57482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTCCGAGCCTCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680959	656179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_656502_664568_664688_677122_677260_678594
869349	contig_7045_pilon	-	3690	4	Intergenic	novelGene_77492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	360	junction_1	51.406873729752	198	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	136	582	585475	577173	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEGKASENVYVN	591051	574064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_577365_581399_581531_585351_585486_590926
869350	contig_8106_pilon	+	2098	5	Intergenic	novelGene_139742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1337	1801	128898	132787	TRUE	40	CTAGAGAGGAAGAGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTITRETLGLRASGRGVQGCLFTLGPMLASSVVPLPWSLNLTEAAQTDAHGPRASPPLEPPCQRSRDRGARDLAAELRVILDEEVKQWLSCACKAASPKRGWQLGWLLLLLLRPLRPREAACSVSRSLPLSWYHSWAAVPVRVPLLCPLHTLH	127561	135078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_129017_130902_131036_131522_131685_132736_132894_134887
869351	contig_12566_pilon	+	3704	20	Intergenic	novelGene_85999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	66.4451119992077	538	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	457	2760	47511	86354	FALSE	20	TGGCCTATGACCATATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	44005	87298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44459_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
869352	contig_12638_pilon	+	4665	2	Intergenic	novelGene_33346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1628	1981	1385926	1386279	TRUE	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGPAPPSQLLLFEPTVATTVSIHLVTGLLLFRCPSILPSTMSFSRDWSLLIMCPKYVRQGLIILVSKGHSSCISSKTDLFVLLAAHGIFNILRNSKASILLRSSLFSVQLSHAYE	1384298	1392438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1387426_1390900
869353	contig_13787_pilon	-	3301	8	Intergenic	novelGene_40601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	60	junction_1	704.989130036335	129	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	306	974	205032	131430	FALSE	35	CTTAAGCCCCAAGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	205337	129102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
869354	contig_14882_pilon	-	4086	15	Intergenic	novelGene_115009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	319.088697604248	818	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	659	2086	317252	295835	FALSE	40	GCTTTACTTAGAATTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363724	293834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321739_363416
869356	contig_14722_pilon	+	5698	1	Intergenic	novelGene_110222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	114	440	98557	98883	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STQWCVHLLGINLQAQSTKDQGYILGIHTNSVKGLWQMLGIGSINICCSLLLHLPIQQKLERLYFPYSPAARVLHAIQVPPIRCLCRSSECTTLHEERRRAQRIHWAGVGHSRSSLVLEPAAVTQLPSLQRQSPDFGRNGVVLLP	98443	104141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_98400_104100
869357	contig_5988_pilon	+	2268	4	Intergenic	novelGene_16012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_3	73.1452132557027	1456	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	328	1677	779480	786813	FALSE	25	TGGCAAGGGCTTGGAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	779152	787404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_779483_783303_783527_783653_783803_785838
869358	contig_14925_pilon	+	1939	6	Intergenic	novelGene_55133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	752	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1302	1814	107895	108407	FALSE	25	CAAATCCACCAGCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNEVIQSPTEQTVGLGGEAMLLCTYKLEISNPDLFWYRMRPDHSFQFVLYRDNSRSKDADFTQGRFSVKHSQTQKTFHLVISLVRAEDSATYYCAYAPTVMQVPRKSAHKPLGHRPARRSNLSGEVIPLNMASFVLVILCPSLSFKPTKPNQLSSSQFQHTVTPCLPD	25789	108532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_26325_27016_27127_27995_28040_29568_29830_103148_103312_107706
869359	contig_15063_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_10892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3082.99140446418	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	233	745	34808	35888	TRUE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRNPANNHQYLRHPPILC	27136	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35384_35839_36158_36266
869360	contig_366_pilon	-	2207	10	Intergenic	novelGene_51591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	637.516264619438	5	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	987	1355	769115	757099	FALSE	35	TTTCTGTAAGGAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803574	756246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770413_776862_776893_780057_780185_802171_802279_802934
869361	contig_14322_pilon	-	1224	2	Intergenic	novelGene_116512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8150	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	584	934	672553	672203	FALSE	10	CGGCTTCAGCTTCGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWPGGPPRHPWSSGCFTGFPRRSLCSGGGAGFSPACWVLCYLLQDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQVGAPLPPGSEDG	674873	671912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_672934_674670
869362	contig_5951_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_153247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1614	2072	222212	221754	NA	10	CTACTTTTTGTTTCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKQLHRASSRRQNNPPTLLHPHSDSSASRSHSLLAGKHQLHPGVTWIPTAHTGWLPACHKLVSGVALIYLYRFLPYLSPPPPPFSLIPGSVAILASSWGAARHCSTVELLPGPCRCAGETLGAFCLFSFVLFVFFFFLSLRAPSGRAVPRG	223825	221518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_-_221500_223800
869363	contig_5389_pilon	+	3563	6	Intergenic	novelGene_143026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	139.333556618641	1016	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	34	888	437163	481772	FALSE	5	TTCTGTGACTTGGTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKREPGSGTESDTSPDFHNQENEPSREDPEDLDGSVQGVKPQKAASSTCSGGHHSSHSLLLKCGDKKSHFRKTTSDHLLCVIFSNRTAGRPRHGYNPSKLLTAFSPSWNECFPPEWLASTSSVIPIRNFASFYAESRTQVAFHMEAVNIWHFLCVLLFFYCCFYHLIFFWDFL	437129	484447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_475994_476158_481420
869364	scaffold_12124_pilon	-	2933	12	Intergenic	novelGene_22041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1622	1930	857198	847715	TRUE	20	AGCATCCTCCCCTGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWCWVLTFFWMSS	859629	829591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_829716_836043_836147_837228_837450_844268_844395_846512_846646_846714_846898_847601_847752_852322_852461_854702_854801_857162_857231_857788_858095_858346
869365	contig_13740_pilon	-	2255	11	Intergenic	novelGene_34644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	3809.3596955394	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	217	1242	165243	157474	TRUE	30	TAAATACTTGGTGTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165459	155097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
869366	contig_987_pilon	+	2809	6	Intergenic	novelGene_72339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_3	405.449183005713	1560	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	602	1936	1286769	1304627	FALSE	15	CCTAAGGTGGTGTACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTEGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTSCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNINRPLTMKKEGIQTRNRKMSSKSKKCKKVHDTLEDFPKSSSFNPAALSRHMSSLSHISPFSHSSHMLTTPTPMHPPSSLSFGPHHPSSMVTAMG	1285716	1305500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1285917_1286367_1287010_1289450_1289988_1295465_1295612_1300073_1300200_1304342
869367	contig_8866_pilon	-	2399	5	Intergenic	novelGene_77768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	545.443397613355	35	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	363438	349274	TRUE	15	TTTCAGATGTGTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQVSEKPGVGPKASSEEDIQLDREA	363438	340765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349340_356557_356636_361315_361406_363336
869369	contig_8712_pilon	+	2054	4	Intergenic	novelGene_58772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	589.359539387178	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	41	415	314974	318225	TRUE	25	CTCATGGTGTGAAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLG	286980	323268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318268_321671
869370	contig_9112_pilon	-	1218	4	Intergenic	novelGene_60223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCGGGTTGGAAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114669	108640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_-_108741_111551_112126_113623_113747_114248
869371	contig_17144_pilon	-	727	6	Intergenic	novelGene_29416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1566.78465654984	8	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	59	709	172736	166092	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTPPTSLLYLLPVILVS	173183	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_168207_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
869373	contig_11752_pilon	+	1756	7	Intergenic	novelGene_37638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_4	1174.99399525652	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	66	908	87165	105616	FALSE	30	AACCACACAAGCTCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQESDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84136	106464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_96442_96572_100956_100976_105597
869374	contig_5671_pilon	+	1196	7	Intergenic	novelGene_79429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2143.13714109843	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	214	636	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368839	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368904_369626_369751_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
869375	contig_11512_pilon	-	2455	3	Intergenic	novelGene_43271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	416	18	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTGGAACCTAGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409407	366008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368661_409314
869376	SIRV6	+	1231	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-150	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	187	519	1673	2560	TRUE	40	ACGAAGAAGCTAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1098	11540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869377	contig_12733_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_129608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGCAGAACAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394037	393234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_393200_394000
869378	contig_5302_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_81528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1712	2050	1503226	1503564	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKDHMSCGMTSRTSYMKKAKGHLKRQEREKRPKWMSEEKRPDLLVRQRLEKPKSVPPGNPLNSVLKSLPRFTLQPKIRQSYRANSNTCEECTLLFHHVYESKWAQQPKKQS	1501514	1503768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1501500_1503800
869379	contig_5253_pilon	-	2526	13	Intergenic	novelGene_61542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_10	144.856250584272	57	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	113	1648	413730	55151	FALSE	40	GCATCTATATTCTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDVLKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ	413842	54272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_55348_61449_61548_71439_71525_91665_91741_94234_94361_115128_115224_117780_117859_132364_132505_137262_137409_138485_138598_148041_148167_243872_244074_413672
869380	contig_3986_pilon	-	2847	12	Intergenic	novelGene_52683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_11	108.252078024832	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	356	1639	55958	35282	FALSE	25	ATATTTTCAATGTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153928	34073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_153684
869381	SIRV6	+	1269	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	0	-441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869382	contig_8317_pilon	+	605	4	Intergenic	novelGene_19239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11556.2888795091	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	239	604	14294	15134	FALSE	25	TTGAAGCTGGTATCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGE	13087	15135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092
869383	contig_1406_pilon	-	2269	6	Intergenic	novelGene_25531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	842	junction_1	345.068920652092	2835	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	236	1258	2159494	2137428	FALSE	65	AAAAAAAAACTGCTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGGPVVAERCPLLGLFSLLLISGSALGWNDADRILLRDIKALTLHYDRYTTSRRLDPIPQLKCVGGTAGCDSYTPKVIQCQNKGWDGYDVQWECKTDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGVYKLFLSDGQDSPPPYSEYPPYSQQYQRSTNSAGPPPPGFKSQFTGAQSTGDGGTYGFGSAFKGQQGYGNSGPGFWTGLGTGGLLGYLFGSNRAAAPSSDSWYYPSHPPSYSSTWNGPAYSPRRGGAGSYSADSSSDTGTRTASGFGGTRRR	2159729	2136416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139992_2140978_2141121_2143209_2143628_2147740_2147920_2159391
869384	contig_15063_pilon	+	1621	6	Intergenic	novelGene_14180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	131	1369	34808	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34677	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
869385	contig_5698_pilon	+	2257	7	Intergenic	novelGene_55026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	835.33339984038	1133	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7785_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
869386	contig_16110_pilon	+	4243	1	Intergenic	novelGene_126794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	192	515	91264	91587	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFTTYSARQLVVIIQVYKKREQRPGITTCLDVFLILVFLRLKKPLYFNHPHCFCWDRSIGKERKFILSSDKIHENKEDTDCKVQELKNTLLKKRKTETRHLPRTH	91072	95315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_91100_95300
869387	contig_5794_pilon	+	2437	5	Intergenic	novelGene_69759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	297.193960234726	1013	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	113	1936	695501	733994	FALSE	20	TTAGTTCTTCACGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAGEPEGATARAALSTLRQPGQGRRRGAPAHSPQLKMMDLELPSPELPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEEAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSESASYSQVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN	695388	734495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_695546_730261_730529_731318_731409_731978_732171_732764
869388	contig_8452_pilon	+	1729	2	Intergenic	novelGene_48033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1115	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	148	1233	432928	434013	FALSE	30	AAAACTTTGAGTATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423882	434509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909
869389	contig_13428_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_143448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1031	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACAAACACCTACGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84334	82365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_82400_84300
869390	contig_15063_pilon	+	1514	4	Intergenic	novelGene_13531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4366.62007608733	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	202	1044	34808	36333	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPGGQACTSRLPDATHPGAAESA	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36153_36266
869392	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	226	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27143	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
869393	contig_16622_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_48411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1023	1337	31951	32265	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVKPEKPRPRNQEAEAEKTRNTGSRVPQSQRVELLPLGPQRVELPLRWTSRMGPPKAEGAKLLSQWAQCPTGKAELTPRVEGPPLRIWRVWPIPRVEGRAII	30928	33414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_30900_33400
869394	contig_5967_pilon	-	2497	11	Intergenic	novelGene_44342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	496.434285681398	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	100	522	488569	424051	TRUE	40	AATAAGTATATGAGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYS	517601	387273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388576_388625_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430698_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
869395	contig_15974_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_164824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	720	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTAGACTGTCACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335362	332620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_332600_335400
869396	contig_6410_pilon	+	3055	7	Intergenic	novelGene_108623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	108.892403571395	557	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	129	677	300693	313081	FALSE	25	TATACTTTGTGAGTCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVPQMVTVGFTPTGSSRTVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLKFLQDIAGAEMYFIGLIYQPAEKRWRWINNSVFNGNVTNHRQNFNCVTIGLTNTFDAALCDINHRWICEKNAK	299803	315459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306345_306397_306809_306947_310261_310369_312966
869397	contig_10907_pilon	-	2510	9	Intergenic	novelGene_144897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_8	253.924416657792	1418	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	211	1215	41010	14797	FALSE	35	TGACTATGTACCAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVIVVGNPANTNCLTAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITTVQQRGAAVIKARKLSSAMSAAKAIGDHVRDIWFGTPEGEFVSMGVISDGNPYGVPDDLLYSFPVVIKNKTWKIAEGLTINDFSREKMDLTAKELTEEKENAFEFLSTA	41220	13501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_16700_16878_28331_28455_30318_30495_36029_36127_36951_37051_41007
869398	contig_5918_pilon	-	4004	4	Intergenic	novelGene_99552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	39.0412886854702	439	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	19	510	787355	782584	FALSE	0	TGCTTTTGTTTTGCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAHRFMAEMVDFFILFFIKATIVLSIMHLSGIKDISKFAMHYIIEEIDEDTSMEDLQKMMVVALIYRLLVCFYEIICIWGAGGATPGKFLLGLRVVTCDTSVLIAPSRVLVIPSSNVSITTSTIRALIKNFSIASFFPAFITLLFFQHNRTAYDIVAGTIVVKRNGVR	787373	779089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_782729_784518_784659_785189_785314_787272
869399	contig_15063_pilon	+	1786	5	Intergenic	novelGene_12273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	233	1642	28164	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27931	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
869400	contig_6954_pilon	+	3688	8	Intergenic	novelGene_64444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	121.178566165635	522	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	156	1112	503473	538707	FALSE	20	TAGTCTCAGCTAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAQSESRLGGACGSSLSQAQLARAALRPGQRRRGVGVVSGVRPEPGYRPVMETRYNLKSPAVKRLMKEAAELKDPTDHYHAQPLEDNLFEWHFTVRGPPDSDFDGGVYHGRIVLPPEYPMKPPSIILLTANGRFEVGKKVCLSISGHHPETWQPSWSIRTALLAIIGFMPTKGEGAIGSLDYTPEERRALAKKSQDFCCEGCGSTMKDVLLPLKSGSDSSQADREAKELARQISFKAEVNSPGKTITESDLNHSFSLNDLQDDIPTTFQGATASTSYGIQNPLAASLQQHTQPVAKNTSMSPRQRRAQQQSQRRSSTSPDVIQGQQPRDNHTDHGGSAVLIVILTLALAALIFRRIYLANEYIFDFEL	503317	541283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_503504_522187_522262_523165_523298_526001_526087_526368_526475_530986_531117_532197_532318_538428
869401	contig_14687_pilon	+	3946	5	Intergenic	novelGene_107895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTTTTTGCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415339	425910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_416249_416565_416696_421405_421585_422832_425488_425837
869402	contig_17603_pilon	-	1560	3	Intergenic	novelGene_152782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	166	877	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	221	340	55843	53743	FALSE	20	GCAGACCTACTGGATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWSLSQSGWGTNSWNQRQAAGPGSASKHLDDTEALGGGLWGGRRCAGGRAVLTQKRGKNLPQSRRHYPTTHTVMTMHPDFQRDNANMWSKNPDKRIQLVSTQLKISCFSFKT	59868	52522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_53776_55756_55877_59681
869403	contig_12327_pilon	+	2435	4	Intergenic	novelGene_140621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_1	667.980205960892	2626	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	134	550	168930	170470	FALSE	15	CATGAGCTTTTCAGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQVRTWACPSAA	148591	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312
869404	SIRV6	+	829	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	513	2	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	853	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
869405	contig_8310_pilon	-	6511	4	Intergenic	novelGene_75605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCTTTGGTACATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326084	315352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_322319_322890
869406	contig_6241_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_156411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	148.016890928029	11	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	498	929	195215	182261	FALSE	75	GAAGACAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSQCRRRCCCRRCCCHHSHWVNASTFPGSPNNSSIHGGSKHSENSHCRDLRCQLRPICCCSGHSHDRHTTEEHGSHRCCLWRICRLYTSGLPCCCYSGSHS	365500	181414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_189896_195084_195247_219946_220075_293626_293710_365087_365246_365403
869407	contig_366_pilon	-	2206	9	Intergenic	novelGene_51587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	683.035584267028	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	636	1346	780147	757099	FALSE	35	AGGAAATGAGATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803532	756238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802934
869408	contig_6361_pilon	+	3729	25	Intergenic	novelGene_23864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	609	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	884	1189	62654	75541	TRUE	5	CCACTCCTCCCCGGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWKGWPPERCGRENEAWFDSGTGAEGCCCSICDWGSPKGFMIGDVMGTGGIKFSGIPSSWVLCSKLEDHSTHSEDAVAVDKAVPGCAYDLEMWAAEQYLD	54673	119058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62823_64369_64427_75461_75584_79193_79368_81577_81752_84155_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_90692_90732_92886_92956_93894_94138_98473_98627_98819_98980_101422_101524_103070_103215_104334_104476_105426_105525_107167_107361_108687_108822_109535_109613_118989
869410	contig_14871_pilon	+	2352	11	Intergenic	novelGene_63691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	671.696873597012	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	118	1545	201945	233218	FALSE	25	ACTCGTGGCTGAAGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	193760	234025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_193813_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
869411	contig_16999_pilon	+	3683	1	Intergenic	novelGene_84963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	722	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50609	54292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50600_54300
869412	contig_11003_pilon	+	5758	2	Intergenic	novelGene_105457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	1179	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	728	1075	449515	451477	FALSE	35	CTCAGCAGTACAGACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVHEVSTIPSRSLGPVLFLLQICSSLLSDRAGILTHWDPNKDTELFIAFSMGLLRNQNFSHKRKKFYQGTPLRSSISQSSNQIQKDLLIYPAFCEQLILRSWVFQRLCGHEAL	448787	456160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_449795_451409
869413	contig_15063_pilon	+	1594	6	Intergenic	novelGene_14198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3706.2918071841	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	116	1351	34808	39515	FALSE	20	ATATTCTCCTTATACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34692	39758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
869414	contig_2100_pilon	-	1651	12	Intergenic	novelGene_50683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1000.51242243063	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	365	1318	1176402	1170252	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWACPLLSARLELLRRGCPCTVTLLTWLAIPKSSAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQASWCLIVLGRLRIPSLPTWWWDSALGRSRQVHLADLSAWPSTTRSSELKRSWAARLSLPARSSETPSPTKLWAV	1185504	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172420_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176294_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180274_1182769_1182822_1185420
869415	contig_8357_pilon	+	3403	10	Intergenic	novelGene_39696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATCGTACCGCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311980	333159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_312417_312758_312889_313936_314099_314379_314508_315072_315297_317970_318124_318966_319116_320102_321883_325429_325500_332988
869416	contig_4180_pilon	+	1283	7	Intergenic	novelGene_8335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1707.08881497777	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	81	737	865772	888134	TRUE	30	ATTACACTGCTAGCTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRLVVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865691	947644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888662_947625
869417	contig_4180_pilon	+	1091	7	Intergenic	novelGene_8388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1551.55725536207	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	61	597	875200	888134	TRUE	5	GCTTTGGAGCCGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVGKKRKETSSQGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874364	888713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888280_888364
869418	contig_4180_pilon	+	1052	5	Intergenic	novelGene_8395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	61	507	875290	888134	FALSE	55	AAATCCTGGGCAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875229	888679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
869419	contig_8697_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_83218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAAAGTGCTGATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50650	49810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_49800_50600
869420	contig_500_pilon	+	975	8	Intergenic	novelGene_31021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1090.885205057	27	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	62	313	1492663	1496842	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYCRDPGL	1485752	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494307_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
869421	contig_5935_pilon	+	5163	1	Intergenic	novelGene_102700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTCACAAAAAGTAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936264	941427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_936300_941400
869422	contig_8673_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_129941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTTCTTAGAGGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520613	519230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_519200_520600
869423	contig_10475_pilon	-	4336	8	Intergenic	novelGene_148737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_7	182.572769948124	266	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	154	981	266553	229159	FALSE	20	GTGTGGAATGTGCTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAPRAPPVHRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTKLYVMASVFVCLLLSGLAVFFLFPRSIDVKYIGVKSAYVSYDVQKRTIYLNITNTLNITNNNYYSVEVENITAQVQFSKTVIGKARLNNLTSIGPLDMKQIDYTVPTIIAEEMSYMFDFCTLISIKVHNIVLMMQVTVTTTYFGHSEQISQERYQYVDCGRNTTYQLGQSEYLNVLQPQQ	268729	225803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_229298_239076_239131_239831_239882_240127_240269_243988_244149_263189_263254_266333_266556_268578
869425	contig_14666_pilon	+	2511	5	Intergenic	novelGene_39600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1687.40636777274	7	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	310	1359	483256	485707	FALSE	35	TTTCAAATAGCTAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQETSAHSGDKAAVLAIKTPGRKRKSKQRKAKLKKHRALILISEESSF	477254	486859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479952_483205_483317_483861_484713_485569
869426	contig_6364_pilon	+	3604	4	Intergenic	novelGene_51791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	39.1606378338703	453	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	94	525	1360161	1373009	FALSE	25	CATCGCTCTCATTTCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMHFIFSNEVVLLFDFWSVHSPTGMALSVVVILLLAVLYESIKVGKVKLFHHALESLPARINKQLIEETDQESADSDLPPVCRTRLRWFLCHFGQSLIHVAQVIIGYFMMLAVMSYNTWIFLGVVLGSAVGYYLAYPLLNMV	1360067	1376088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1360167_1367550_1367618_1371567_1371758_1372840
869427	contig_5247_pilon	-	1689	5	Intergenic	novelGene_81817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_3	178.264550598261	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	609	911	342763	342461	FALSE	40	ATACGAATACGGAACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDERACMITELFKCKWKRFKLERLVSDVRMPACIPGNKRSGCKPFGKDVLRCKQLVPGKKKNGFMTTIMFNQTSWHCSPRWELFLAKWPTFTFETTSS	416628	341682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_342777_343454_343492_353558_353640_376192_376490_416448
869428	contig_6208_pilon	-	3075	9	Intergenic	novelGene_53032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	443	junction_5	320.379755134434	53	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	199	2463	513736	492858	FALSE	40	TTGAATAAATGTGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	532554	492245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
869429	contig_5485_pilon	-	2160	3	Intergenic	novelGene_37697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	394	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	656	1354	86314	85491	FALSE	20	GCAACCAACCTTGTGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	87378	84684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774
869430	contig_9345_pilon	-	1595	6	Intergenic	novelGene_24650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	142	594	955353	947889	FALSE	20	CTAAACTTCCTGTATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKEKIWVPCFVKPRCKHSPHAVNFEVLFINLSV	1001216	946887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947984_949525_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
869431	contig_10500_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_41211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCGTATCAATGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1536436	1534585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1534600_1536400
869432	contig_12566_pilon	+	3687	20	Intergenic	novelGene_85997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	45	junction_1	78.6337630923317	531	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	433	2736	47511	86354	FALSE	15	TGACCATATGCCTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATYLEFIQKNEEQDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLFTPLKERPDLPPVQYEPVLCSRPTCKAILNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYTGITEVNQPAELMPHFSTIEYVIQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSYEGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPTQQARPAQPQEHPFVSSRFLQPVHKIDMNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRAAANGHCVDIYACALDQTGLLEMKCCTNLTGGHMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFSKDFNGNFRMAFGATLEVKTSRELKIAGAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKVCGLDPTSTLGVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQFVTQYQHSSTQRRIRVTTIARNWADAQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIVIYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC	43991	87305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_44421_47507_47732_50024_50083_52264_52352_54030_54268_54373_54460_56423_56569_56968_57128_59040_59157_63025_63150_65089_65171_69040_69131_69733_69841_72484_72639_75404_75483_78929_79092_80113_80201_82709_82866_83210_83277_86264
869433	contig_3747_pilon	+	1665	3	Intergenic	novelGene_24959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	7595	junction_2	2002	7	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	253	579	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	203310	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203386_203498_203651_203768
869434	contig_3721_pilon	+	3488	10	Intergenic	novelGene_123793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_3	193.747321765639	40	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	173	1933	63499	102235	FALSE	20	ACTCTTTGTGTTGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEGWWVEPAREGWGAYVTPRAPLREGRPRLAPQNGSGSNAPAYRTPSPWRQSRREVRFSEEPPEVYGDFEPRVAKERSPAGRRTSPGEFRLDSATEEVKASAYYLRSRQRRQPRPQEATEMKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTAGKFRSGDSVESGDQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63326	103790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69505_69581_72136_72197_80561_80604_81608_81696_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
869435	contig_500_pilon	+	1487	10	Intergenic	novelGene_30973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	496.208463759107	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	74	1186	1452302	1480676	FALSE	0	TTTTTGGTTTTGTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANSPPRAGPDCPDPSFLSFENTKKMSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446897	1480977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
869436	contig_854_pilon	-	2861	6	Intergenic	novelGene_36150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	199.166663877266	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	59	592	483528	474385	TRUE	0	CTCGTGCCTGGGGCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTVSWGPLSATLALPLPTFPPSHHSSQLTEPGDPLRSFSPPPLPFYRWETEVQRQGGARPRFKAWPRLKDGSFSSQPRLSPHPPRLDRDWEDGFTPLRV	483586	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471554_471616_472061_473586_473742_474241_474756_476675_476788_483477
869437	contig_16098_pilon	-	2528	8	Intergenic	novelGene_46044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1178.69036629296	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	1384	2427	350530	348413	FALSE	30	ATAAAATGGCTTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352036	348311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350643_350765
869438	contig_854_pilon	+	411	1	Intergenic	novelGene_36402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCTTGAGCCCTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976542	976953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976500_977000
869439	contig_12644_pilon	+	1351	10	Intergenic	novelGene_44619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4894.06488123404	6869	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	300	1271	2678073	2680545	FALSE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677613_2678027_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
869440	contig_6109_pilon	+	3465	1	Intergenic	novelGene_160392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACTCTCTCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637431	640896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_637400_640900
869441	contig_7396_pilon	-	2005	15	Intergenic	novelGene_79621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3451.04378472393	5	45	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	242	1555	255163	246385	FALSE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257510	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
869442	contig_12915_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_148331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39524	38090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_38100_39500
869443	contig_6677_pilon	-	3959	1	Intergenic	novelGene_114155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	895	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCATTTGTTTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390912	386953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_387000_390900
869444	contig_15491_pilon	-	1632	6	Intergenic	novelGene_75982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_4	89.824272888791	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	46	879	91394	80831	FALSE	80	GAATTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91439	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
869445	contig_15491_pilon	-	1755	6	Intergenic	novelGene_75983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	211.969243051911	20	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	434	1003	86138	80831	FALSE	80	AGAATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91427	80078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87514_87753_91306
869446	contig_18145_pilon	+	2327	16	Intergenic	novelGene_37342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	485.896925512214	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	218	1834	86893	98924	TRUE	25	TTTTCATTCGAGCGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQAT	86675	100918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_97955_98919_98983_100326_100482_100638
869447	contig_6503_pilon	-	3532	6	Intergenic	novelGene_145749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_4	130.106725421863	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	121	711	134980	122640	TRUE	10	CTATAGGCTTCTTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAGKY	139866	118369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
869448	contig_3223_pilon	+	1275	5	Intergenic	novelGene_151830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_3	12.0286117237194	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	25	708	967295	1003577	FALSE	10	CATTTGTCTTTGCGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTPVFVPMKTHVMLHRMSGKGLAAHYYFPRQPCIFGDKMISVQITLNNTADRKIENIHIGEKKLPTGMQMHVFNPIESLEPEGSITVSVGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVSIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGMLTGMNETSTIIIAAPQNFTPTVILQKVVNVANVGVVPSGQDSIYRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG	967270	1004144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_967503_973414_973500_986171_986270_991371_991511_1003423
869449	contig_14441_pilon	+	3623	3	Intergenic	novelGene_100686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	364	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3014	3442	116728	117610	FALSE	15	GCTGCCTACGAGTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113714	117791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
869450	contig_6375_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_73045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1971	2396	500167	500592	NA	35	CAGAACCATAAGTCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRESSSSIPLSFPSPLSSVPDNIINSSLPSMSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498196	501217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498200_501200
869451	contig_366_pilon	-	2612	9	Intergenic	novelGene_51580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_8	582.23640763439	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	640	1386	780147	757099	FALSE	30	GGAAGTTTTTCTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803536	755872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802934
869452	contig_8866_pilon	-	2457	7	Intergenic	novelGene_77777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	453.453201064405	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	162	617	418087	349068	TRUE	20	TTTGGTTTTTAGCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPSGTGLAEPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVPQNHPEPPAQRQRMGVGAPQRKSRLERKWRRKNLQK	418248	340782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349180_352413_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
869453	contig_6497_pilon	-	5491	18	Intergenic	novelGene_35587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	103	junction_3	177.599175471137	477	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	998	2997	46	3042	426120	329987	FALSE	15	CTTCCATTTTGTCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISEGALHPRLARPAEDDFRRADCLQMILRWKGAKLDQGEYERAAIDAVDNKKNTPLHYAAASGMKTCVELLVKHGGDLFAENENKDTPCDCAEKQHHKDLALNLESQMVFSRDPEAEEIEAEYAALDKREPYEGLRPQDLRRLKDMLIVETADMLQAPLFTAEALLRAHDWDREKLLEAWMSNPENCCQRSGVQMPTPPPTGYNAWDTLPSPRTPRTTRSSVTSPDEISLSPGDLDTSLCDICMCSISVFEDPVDMPCGHDFCRGCWESFLNLKIQEGEAHNIFCPAYDCFQLVPVDIIESVVSKEMDKRYLQFDIKAFVENNPAIKWCPTPGCERAVRLTKQGSGTSGSDTLSFPLLRAPAVDCGKGHLFCWECLGEAHEPCDCPTWKNWLQKITEMKPEELVGVSEAYEDAANCLWLLTNSKPCANCKSPIQKNEGCNHMQCAKCKYDFCWICLEEWKKHSSSTGGYYRCTRYEVIQHVEEQSKEMTVEAEKKHKRFQELDRFMHYYTRFKNHEHSYQLEQRLLKTAKEKMEQLSRALNETEGSCPDTTFIEDAVHVLLKTRRILKCSYPYGFFLEPKSTKKEIFELMQTDLEMVTEDLAQKVNRPYLRTPRHKIIKAACLVQQKRQEFLASVARGVAPADSPEAPRRSFAGGTWDWEYLGFASPEEYAEFQYRRRHRQQRRRGDVHSLLSGPPDADEPSESTLDTPEGGSGHRPGASVVSSASVSVPHSSSLRDYAPASRSENQDSLQALSSLDEDDPNILLAIQLSLQESGFAIDEETRDFLSNEASLGAIGTSLPSRLDSVPRNTDNPRTALSSSELLELGDSLMRLGAESDPFSTDILSSHPLSEARSEFYPSSSDPDSAGQDPNINDNLLGNIMAWFHDMNPQSIALIPPATTEISADSQLPCVKDGSEDVRDVELVPPEEDPVFEDAVVSEGRGTQREENLLEENILAGEAVSQAGNSGNEAANKGDGSDVSSQTPQTSSDWLEQVHLV	426165	327537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_330728_331231_331366_332348_332464_339030_339083_339913_340093_341156_341303_343467_343535_343624_343712_344018_344154_350972_351104_355597_355687_365028_365196_366246_366392_377585_377675_378922_379132_405708_405827_412867_413051_425910
869454	contig_7151_pilon	-	2533	13	Intergenic	novelGene_40683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.552398164749	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	60	2435	65162	1989	FALSE	35	ATCACTGTAAAGTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPARRRPWIR	65221	1890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2015_4657_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
869455	contig_7151_pilon	+	1590	8	Intergenic	novelGene_40677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCCCTTCCTTCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1832	18279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2077_5155_5310_5946_6259_6347_6393_12491_12813_13368_13671_13782_13876_18160
869456	SIRV6	+	1018	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1419	33	-10	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGTTTAGAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2506	11792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869457	contig_1406_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_25669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2823149	2824703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2823100_2824700
869458	contig_233_pilon	-	1784	9	Intergenic	novelGene_14643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1680.3042460742	6	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	31	1296	101691	78640	FALSE	20	ATGGGGTGTCCTAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	101721	78151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92353_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673
869459	contig_1331_pilon	-	1548	4	Intergenic	novelGene_37810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	18	494	169924	160009	FALSE	15	AGTTTCTTGAGGCATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169941	158954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
869460	contig_5696_pilon	+	3569	10	Intergenic	novelGene_117550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	765	junction_9	433.884009077695	151	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1103	3312	47	3358	689252	716777	FALSE	45	ATTTATTATTATTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEGISQYILDDYSGV	684372	716988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624
869461	contig_11574_pilon	-	2245	11	Intergenic	novelGene_64091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	330.412181978813	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	96	1628	456525	450934	TRUE	40	TTTAAAAATGAATTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLKLLIPFKSYATAPCQGGSSDHLAKKEVPRKCLLLRTKLTNKSL	473954	449548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450246_450392_450808_451065_451137_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_473873
869462	contig_1331_pilon	-	2245	3	Intergenic	novelGene_37797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_2	1817	68	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATTGTTCTGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169974	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160949_166406_166534_169860
869463	contig_15047_pilon	+	1265	5	Intergenic	novelGene_52117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	276.926321428643	293	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	31	693	2194	21082	FALSE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQMCLSQLLKVRPWKA	2163	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4175_21039
869464	contig_4305_pilon	-	2541	14	Intergenic	novelGene_136691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	654.733669147076	643	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	207	1847	549728	528320	FALSE	30	TTTTTGTGTGTAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFEKFISEKDASVVGFFSDLFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNKYDDNGGGITLFRPSHLVNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLVAYYDVDYEKNTKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNDENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPNIVIAKMDATANDVPSPYEVRGFPTIYFSPANKKLTPKKYEGGRELNDFISYLQREATNPPCNSRRQTQEEEEGTGGPLKQPDRPLCERPLSPEMGNGLGACSLRGIILRGQNGYDLNPVQLSLKFFLAALFMKHQDQFMFLVLEKIICVGGNVVGVGGIQLGVIF	549978	527625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_528698_529051_529110_529457_529538_529853_529983_531020_531130_532180_532364_532962_533089_533404_533522_536851_536982_538239_538348_541824_541943_543486_543566_549702_549827_549870
869465	contig_6576_pilon	+	2302	3	Intergenic	novelGene_42400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	39	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	113	1459	1301228	1303925	FALSE	25	TTACCCCCAGCCCAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTENQSWKVSGDVCGAAVFVSSMNACACIHVFIFTHAICSMYISVSTLIPIRLYPSICAQTFVFTLVMLCSLHPHSVLLFPSPKKKEKISLYDLKCTFPSPSSPMNTGLSKCIYSCRLTKEGSYICPYMLDLFHLALCPPGPSIL	1295664	1304768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302144_1303494
869466	contig_14792_pilon	+	4154	1	Intergenic	novelGene_170495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1237	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAAGGGGCTCCTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101908	106062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_101900_106100
869467	contig_5023_pilon	+	3075	13	Intergenic	novelGene_7274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	2067.54061326495	25	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	73	1578	607279	631553	FALSE	35	AGTATAAAATAGTTCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRR	580856	633050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415
869468	contig_19579_pilon	-	2271	6	Intergenic	novelGene_59363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1118	junction_4	227.741432330615	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTATATGGGATCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13104	7164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012
869469	contig_19564_pilon	-	2260	4	Intergenic	novelGene_29587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1003.28659913307	3	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	279	1397	13615	12201	FALSE	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLSEPSCRRVRTSLLQPPGHVPSPQPAIRRDKIIYRSLAPHTIEASKKKTKINFHHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15700	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14002_15528
869470	SIRV6	+	1386	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	32	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	6	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	331	663	2002	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869472	contig_6217_pilon	-	2711	4	Intergenic	novelGene_109654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.3567425180312	742	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	449	1312	739958	739095	FALSE	35	TAAACGTATATATGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	811104	737695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739964_757179_757259_810654_810846_810931
869473	contig_9183_pilon	-	1820	7	Intergenic	novelGene_40302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	533.79159999219	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	853	1536	320566	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325942	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320728_322743_323301_325808
869474	contig_9183_pilon	-	2234	8	Intergenic	novelGene_40308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	952	1950	322898	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325976	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323615_323706_323834_325868
869475	contig_14030_pilon	-	2518	7	Intergenic	novelGene_62224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	772	junction_6	379.259658926294	2368	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	431	874	394370	337410	FALSE	20	AAACTTGTTCACCTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRIHKELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDREKYNRIAREWTQKYAM	394800	335765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_394346
869476	contig_4232_pilon	+	1000	4	Intergenic	novelGene_63197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	79	579	146362	149200	FALSE	10	TGGTCATAGCTGCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146283	149621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
869477	contig_4232_pilon	+	984	4	Intergenic	novelGene_63212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	72	572	146362	149200	FALSE	10	CCTCTCCCCTGGTCATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146290	149612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
869478	contig_4232_pilon	+	974	4	Intergenic	novelGene_63202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	78	578	146362	149200	FALSE	10	AGCTGGTTCCCATCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146284	149596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
869479	contig_12644_pilon	-	1171	8	Intergenic	novelGene_44689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATGACCTAAAATTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680626	2677592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677693_2678054_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
869480	contig_14030_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_62239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATGGTAAATTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340726	344077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_340700_344100
869481	contig_19769_pilon	+	408	3	Intergenic	novelGene_102332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3673	junction_2	89.5	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	210	374	88952	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87940	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_88040_88841_88958_89163
869482	contig_9653_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_48183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCTGTCTAATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173334	174419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_173300_174400
869483	SIRV6	+	1440	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	70	18	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	245	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869484	contig_5918_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_99578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGGAAGAAATACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1844534	1846540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1844500_1846500
869485	contig_8544_pilon	+	789	7	Intergenic	novelGene_55918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	361.56115972574	30	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	320	787	87302	120355	FALSE	25	TGAGTTTTAAACATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLQFRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQ	83412	120357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_87136_87322_90458_90625_91487_91586_92523_92618_120265
869486	contig_4114_pilon	+	4059	27	Intergenic	novelGene_15568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	45	junction_3	71.7727346823777	332	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1239	3720	22	3741	27287	44248	FALSE	0	GTGCTTCCTGTGTGGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEASVRPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDAAAKTSKLPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPLLSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSEKCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALCQCGVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEASDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGAQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKANEQIYGTSSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEIMDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLERKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGVAGAGPPGQPLGSVAGPELVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKAALSALPPLHVAKVSLPSREGPGSDVAAGALYHKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLLEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVFRETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQEDTVYVGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLCQLHSRLIS	27265	44566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_27515_27819_27899_28098_28134_34018_34211_34568_34767_34924_35130_35205_35285_35410_35571_35682_35788_35990_36183_36268_36386_36605_36759_37340_37502_37621_37791_38046_38116_38330_38394_38505_38656_38812_38975_39054_39187_39379_39506_39720_39864_40158_40326_42253_42388_42499_42693_42957_43038_43574_43665_44110
869487	contig_13224_pilon	-	4649	13	Intergenic	novelGene_104069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2385	2858	93336	89075	TRUE	15	CTTAATCTCCCCGCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPRRADQSAVSAARSHCWHPTAKGQKWMIHPQNTPGGCHHSLGFGKWHFWSVACKWVPQKMSVQDGTSRLVLQYHSGCRTSPSARFVRCCGFYRACRSQDSAEWYSPSENLCSLLAPKAGREASEKSPFLAPRRKHSPRFQPAPHHKEIQPKQL	95720	63667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_63771_70001_70429_72490_72673_75128_75220_79455_79649_79760_79853_82084_82200_82702_82931_86100_86253_86994_87171_89042_89260_90707_90918_93257
869488	contig_13633_pilon	+	2089	14	Intergenic	novelGene_15304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_12	439.543563687035	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	392	502	22853	28350	TRUE	35	TTCTGTGTGATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SILLVIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	5024	49448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_40032_40361_49019
869489	contig_15304_pilon	-	1686	4	Intergenic	novelGene_30635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	374.130399133184	2	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	499	519	103265	103245	TRUE	20	CGGTTTATCATGGAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	105942	101816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102484_102744_103329_103548_103680_105638
869491	SIRV6	-	934	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	11	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCCTGCTAAGTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11825	2745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
869492	contig_10003_pilon	-	3090	1	Intergenic	novelGene_88206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGTACCTTCTCAGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511107	508017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_508000_511100
869493	contig_6960_pilon	+	3104	4	Intergenic	novelGene_60235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	56.1664193862015	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGATCCTAGTTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271693	283693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6960_pilon_+_271840_273209_273331_280758_280853_280950
869494	contig_513_pilon	-	3645	10	Intergenic	novelGene_80158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	414.298067686646	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	148	1053	453421	450583	TRUE	90	AAAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGKILVEGLGTSPA	454719	446311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_447914_448785_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
869495	contig_7151_pilon	-	2470	12	Intergenic	novelGene_40716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	105.477270278741	12	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	825	2192	244386	236371	TRUE	15	CAGATGGCTCTTGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALWQCRHQEWGKHYCNHNEDAGVTCSDGSDLELRLIGGGSRCAGTVEVKIQNLLGKVCDRNWGLKEASVVCRQLGCGSVRKTSYQTYSKVKATNTWLFVSSCEGNETSLWDCKNWQWGGLPCDPYEEAKITCSAHREPRLVGGDIPCSGRVEVKLGDTWGTVCDSDFSLEAASVLCRELQCGTVISILGGAHFGEGSGQIWAEEFQCQGDESHLSLCPVAPRPDGTCSHSRDVGVICSRYTEIRLVNGKTPCEGRVEIKTLGTWGSLCNSHWDMEDAHVICQQLKCGVALSTPGGAHFGKGSGQVWRHMFHCTGTEQHMGDCPVTVLGASLCSAGQVASVICSGNQTQILPLCNSSSSDPTSSPIPEESAAGCVGSGQLRLVNGGGRCAGRVEVYHEGSWGTICDDSWDLSDARVVCRQLGCGVAVNATGSAHFGEGTGPIWLDELGCNGKESRIWQCRSHGWGRHNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSETSRQTCAGRLEVFYNGAWGSVGRSDMSPATVGVVCRQLGCADRGSISPASSDKTLSRPMWVDHVQCPKGPDTLWQCPSSPWNQRLASPSEETWITCASKIRLQEGTTNCSGRVEIWHRGSWGTVCDDSWNLEDAEVVCRQLGCGSALAALKEAEFGQGTGPIWLNEVTCKGTESSLWDCPARPWGHSDCGHKEDAGVRCTGIVETKESPNSTGHSFLIALGILGVILLALLIAFLMRPL	255646	231774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_232012_236329_236384_239488_239559_239753_239790_240225_240535_241535_241857_243308_243624_243704_243798_244175_244491_244587_244903_254600_254922_255562
869497	contig_9584_pilon	-	471	2	Intergenic	novelGene_178147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	64	471	82632	82110	FALSE	25	AGCAGCAGCGGCAGCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQRQQQQQQQRRQRQQRQRLLMQRQRRQQRQQRQQQQQRQRQRRQQQRRQQRQQRQQRQQLAAGSSSGGSGSSSSSSSGSSSSSGSCCWQQHAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAGSGSSSGGSSGGGGGGGGSSGGGG	82695	82109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9584_pilon_-_82515_82629
869498	contig_8866_pilon	-	2371	9	Intergenic	novelGene_77778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	456.722956916991	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	53	499	418087	349530	TRUE	10	GGGTTGGTTCTTATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLASKPWCHHFTAHLPLPVAPVCGLGPASQRRCPSALTSLLKVVICPVTIRCGHGAQ	418139	341085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_341946_342072_342354_348798_349552_352283_352426_352474_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
869500	contig_7321_pilon	-	2856	15	Intergenic	novelGene_53119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_7	167.631276610182	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	1135	1956	173630	114374	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEVLEPFSNKTPPHATQLEVLPDALQVEQTWDLTGMPSNMRSKNLLMLHLERKKLIPKETMIY	208397	113473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_173880_174031_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
869501	contig_15859_pilon	-	3531	6	Intergenic	novelGene_50191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	143.932484172267	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	13	1401	350018	341031	FALSE	25	TATTTTAAAGCTAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGVLMSWHQLDGVQQQFGREENGNADGEIVFLSSEMYRTKVGLKDRQQLYKLIISQLLYDGYISIANGLINEIKPQSVCAPSEQLLHLIKLGMENDDTAVQYAIGRSDTVAPGTGIDLEFDADVQTMSPEASEYETCYVTSHKGPCRVATYSRDGQLIATGSADASIKILDTERMLAKSAMPIEVMMNETAQQNMENHPVIRTLYDHVDEVTCLAFHPTEQILASGSRDYTLKLFDYSKPSAKRAFKYIQEAEMLRSISFHPSGDFILVGTQHPTLRLYDINTFQCFVSCNPQDQHTDAICSVNYNPSANMYVTGSKDGCIKLWDGVSNRCITTFEKAHDGAEVCSAIFSKNSKYILSSGKDSVAKLWEISTGRTLVRYTGAGLSGRQVHRTQAVFNHTEDYVLLPDERTISLCCWDSRTAERRNLLSLGHNNIVRCIVHSPTNPGFMTCSDDFRARFWYRRSTTD	350030	338900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_341291_344513_344905_346153_346352_346510_346789_349503_349705_349957
869502	contig_19730_pilon	+	2544	3	Intergenic	novelGene_142487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTCCATTTTGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115100	120507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_115195_117652_117740_118144
869503	SIRV6	+	1370	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	8	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	317	649	2002	10736	TRUE	20	GATTTAGTCGATTATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869504	contig_8044_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_132399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAAATGCCCTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581236	582214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_581200_582200
869505	contig_11292_pilon	-	5096	36	Intergenic	novelGene_109486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_23	40.7131929677918	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1398	4197	18	4214	534739	492156	FALSE	35	AATGATCTGTATACTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSFLEISGAERERPRHFREFTVYGVGTVNAVVGAVKYSESAGGFYYLESGKLFSVTRNRFIHWKTSGDTLELVEESLDVNLLNNAVHLKFQNCSILPGGVHVSETQNHVIILIVTNQTVHRLLLPHPSRMYRSELVTESQMQSIFTDIGRVDFRDPCNYQLIPTVPGLSPNSSTSAAWLSSDGEALFALPSASGGIFVLKLPPHDLPGMVSVVELKQSSVMQRLLIGWMPTAIRGDQGPSDRPLSLAVHCVEHDAFIFALCQDHKLRMWSFKDQMCLMVADMLEYVPVNKDLRLAAGTGHKLRLAYSPSLGLYLGVYMHAPKHGQFCIFQLVTTENNRYSLDHISSLFTSQETLVDFALTSTDIWALWHDAENQTVVKYINFEHNVAGQWNPVFMQPLPEEEVIIRDDQDPREVYLQSLFMPGRFINAALCKALQIFCRGTERNLDLSWSELKKEVTLAVESELQGNVTEYEFSQEEFRNLQQEFWCKFYACCLQYQEALSRPLALLLNPHTSMVCLLKKGYLSFLVPSSLVDHLYLLPDENLLTEDETAISDDVDVARDVICLIKCLRLIGESITMDMSVMMEMSCYNLQSPEKAAEQILEDMITIDIENVMEDICSKLQEIRNPIHAIGLLIREMDYETEVEMEKGFNPAQPLNIRMNLSQLYGSGTAGHIVCRGVCKIASTRFLICRDLLILQQLLLRLGDTVILGAGQLFQAQQDLLHRTAPLLLSYHLIKWGSQCLATDVPVDTLESNLQHLSVLELTDSSALMANKFVSSPQTIVELFFQEVARKHIIAHLFSQPKAPLSHTGMNWPEMVTAITNYFLQLLWPSNPSCLFLECLMGNCQYVQLQDYIQLLHPWCQVNVGSCRFMLGRCYLVTGEGQKALECFCQAASEVGKEEFLDRLIRSEDGEIVSTPRMQYYDKVLRLLDVVGLPELVIQLATSAITEAGDDWKSQATLRTCIFKHHLDMGHNSQAYEALTQIPDSSRQLDCLRQLVVVLCERSQLQDLVEFPYVNLHNEVVGIIESRARAVDLMTHNYYELLYAFHIYRHNYRKAGTVMFEYGMRLGREVRTLRGLEKQGNCYLAAINCLRLIRPEYAWIVQPAAGAVYDRPGASPKRNHDGECTTAPTNRQIEILELEDLEKECSLARIRLTLAQQDSSAIAVAGSSSAEEMVTLLVQAGLFDTAISLCQTFKLPLTPVFEGLAFRCIKLQFGGEAAQAEAWAWLAANQLSSVITTKESSATDEAWRLLSTYLERYKVQNNLYHHCVINKLLSHGVPLPNWLINSYKKVDAAELLRLYLNYDLLEEAVDLVSEYVDAVLGKGHQYFGIEFPLSATAPMVWLPYSSIDQLLQALGENSANSHNIALSQKILDKLEDYQQKVDKATRDLLYRRNLWS	534756	491273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_492252_493450_493556_494515_494642_496232_496375_497715_497818_498500_498625_499337_499449_500094_500156_501215_501377_506182_506289_506375_506473_506567_506663_506986_507083_508791_508912_509641_509741_510322_510393_511024_511185_512146_512218_513166_513301_515020_515182_515285_515414_515895_516062_516564_516665_517419_517591_518067_518152_518632_518702_520326_520412_522151_522250_523258_523337_524780_524940_525744_525860_526402_526482_528348_528572_528859_529071_534273_534386_534657
869506	contig_7870_pilon	-	5286	3	Intergenic	novelGene_108988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1563	junction_1	42.5	1155	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	240	392	496465	441644	FALSE	25	CCAGTGCCTTCCTAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKGTEHFIVLL	497931	436749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_441796_496464_496595_497821
869507	contig_5013_pilon	-	3652	2	Intergenic	novelGene_110088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	790	junction_1	0	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATCTGAATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178986	173834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215
869508	contig_14513_pilon	-	1208	3	Intergenic	novelGene_70355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	150	518	18880	11982	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19029	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
869509	contig_4964_pilon	-	1141	2	Intergenic	novelGene_157265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTATAAAATAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221704	189864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_-_190713_221411
869510	contig_9345_pilon	-	2071	6	Intergenic	novelGene_24607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	5	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	649	990	949643	947957	FALSE	5	TATCCTGGTGTTTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPQILCILLLSENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001313	946875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949717_952379_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
869511	contig_2078_pilon	+	2567	3	Intergenic	novelGene_100145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1564	1905	289475	289816	TRUE	65	GAAAAGAGAGAGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDRMHQNKIEEIHRVTVPKRIGQCSTISRGSIRPKNDGIERRSPSCTEGIDEKQGIKLRCFNKEMQRWKCSLVYAKKYGTELPGRSTRRDPYACSFQRMVVWTEFGNY	287189	301389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_287197_287918_290121_301031
869512	scaffold_12124_pilon	+	2360	10	Intergenic	novelGene_22046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	490.533446085377	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	448	1254	846536	857868	FALSE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKIVQKGQDRNVFLVPSSESNGEHSLQIRVRHRHSDIWSDWSETLHFGLPEQSHGDVAAILPVAGMSAVVLTVVLMLIFSRNSVRQTLFLPIPQVKSLLTPNAEIAWEGNHQPPDTQEPEFLIVEEMG	829604	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_846525_846646_846716_846899_847602_847737_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869513	contig_12357_pilon	+	2531	11	Intergenic	novelGene_6118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	550.609380595718	3	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	116	1504	26079	52894	FALSE	45	AGAAGAAATAGTATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPDVLTTGAGNPIGDKLNTITVGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHIGKRTPIAVRFSTVAGESGSADTVRDPRGFAVKFYTEDGNWDLVGNNTPIFFIRDALLFPSFIHSQKRNPQTHLKDPDMMWDFWSLRPESLHQVSFLFSDRGIPDGHRHMNGYGSHTFKLINANDEAVYCKFHYKTDQGIKNLSVEDAARLAQEDPDYGLRDLYNAIATGNYPSWTFYIQVMTFSQAETFPFNPFDLTKVWPHKDFPLIPVGKLVLNRNAVNYFAEVEQIAFDPSNMPPGIEPSPDKMLQGRLFAYPDTHRHRLGPNYLQIPVNCPYRTRVANYQRDGPMCMLDNQGGAPNYYPNSFSAPEQQRSALEHSTSCSGDVQRFNSADEDNVTQVRAFYKNVLNEEERKRLCENIAGHLKDTQLFIQKKAVKNFHDVHPDYGDSIQALLDKYNAEKPKVSPELLGCGRTECAWG	25963	53921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_26137_27419_27531_29523_29655_30217_30323_30933_31060_34122_34315_35038_35192_42111_42251_46436_46568_51130_51239_52759
869514	contig_5145_pilon	+	3054	6	Intergenic	novelGene_131373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.4123645639621	868	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	554	991	553862	554299	FALSE	30	GTTTTATTGAAGCACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLRSSVPDYFKNVFGTFRQPAQKVQVCGGWNNVLQDASGFPAMPFLSFRFVSKILSLRPLNWNAVHLRSVRSCDKITSLVDEKNILDCFIALESLFQQAFTRYLFLDIFLFLFNNHLFVYNCTGVFVIFTWGSEQIAWHVSVT	543043	556362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_543082_543783_544058_544138_544181_544683_544740_550233_550325_553809
869515	contig_12638_pilon	+	3116	20	Intergenic	novelGene_33089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	657.043478747022	48	68	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1792	2559	182987	194412	TRUE	60	AATAAAAATGTTAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAVVLWSYLQVPSVYISYISSAP	170775	199738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_176021_176961_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194347_194442_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199342_199415_199503
869516	contig_3424_pilon	+	2477	4	Intergenic	novelGene_55464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	25	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	214	2247	163695	170678	FALSE	25	GTGTCTCAAATATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	149790	170908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_168869_168919
869518	contig_7025_pilon	-	2294	6	Intergenic	novelGene_104373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	610.445607732581	2	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	47	442	63028	58815	TRUE	35	TAACTGTATTGATGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQDLLQTSKQSNRVIHVNQWKLRGFEAS	63074	47663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49317_54467_54607_58754_58896_59317_59442_59939_60080_62977
869519	contig_15047_pilon	+	1353	6	Intergenic	novelGene_52176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	221	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	596	709	4573	4686	FALSE	20	TCCAGAATCTGCATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRLPLPAVFLHRRRLHRPEREPAHLDGGGHGCSDHPAQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2170	21657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2588_3310_3498_4158_4434_4552_4687_21013
869521	contig_4732_pilon	-	2526	1	Intergenic	novelGene_75450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664288	661762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_661800_664300
869522	contig_14450_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_49043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	575	1126	1309576	1310127	NA	35	TTTTTTAATGGAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLERSKTLGEEVTADVVEIVRELEIEVEPEDVTELLYSYDKTLTDEELLLMDEQRKWFFEMESNPGEDAMNTVEMTTKDLEYYINLFDKSAAGFERTGSNFERSSTAGKTLSNSITCYREIFSERKGQPMWQTSLLSYFKKLPQSPQPSATTTLISQQPSPSRQDLLPAKRLRLTEGSDDG	1309001	1310644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1309000_1310600
869523	contig_7334_pilon	-	2565	3	Intergenic	novelGene_50568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1378	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1012	1347	121494	121159	TRUE	10	GCCAGTCCTCTCCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMCTDLKSCLGPSPWLTVFAQSFGMSRFAHSSPFHQGEVHGKDPIKPQRQFSLDKFEAPSQSQGAASSCLCQVRYWLGEQSCLPSRLVWLQITLAGSWLHLQGAESELHR	122505	116754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_-_117030_120097_120248_120365
869526	scaffold_16539_pilon	-	2003	12	Intergenic	novelGene_68357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_11	271.22519690843	1560	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	218	1693	502141	490096	FALSE	10	CAGCCTGGGCCTGAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKPKLMYQELKVPAEEPASELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLEFPNTSVDNPSTSQAWLSLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTRTQEPSAQQGEEILRQLQTLVPRGVNVRIAVSKPNGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRPYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLSVVDSARSFIYIAVMSYLPTMEFSHPRRFWPTIDDGLRRAAYERGVKVRLLVSCWGHSEPSMRAFLLSLADLRDNHTHLDIQVKLFVVPADEAQARIPYSRVNHNKYLVTERAAYIGTSNWSGSYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAVFVRDWDSPYSYELDASADSVGNACRLL	502802	489785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_490284_490391_490492_490968_491135_491820_491961_494567_494769_498735_498864_498948_499070_500548_500733_501688_501832_501917_501993_502111_502204_502647
869527	contig_7720_pilon	+	3887	4	Intergenic	novelGene_155765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	1768.54485068626	295	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCTATGGTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700351	709334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_701962_705016_705142_706264_706362_707279
869528	contig_5967_pilon	-	2149	7	Intergenic	novelGene_44363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	497.209770173068	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	276	1130	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDRDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517777	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
869529	contig_1443_pilon	-	2094	12	Intergenic	novelGene_28299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	446.341491766929	43	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	511	1434	776427	748649	FALSE	60	GAGAAAAAAAAAGAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809538	747988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_787303_787358_805197_805224_805505_805713_808690_808741_809399
869530	contig_6217_pilon	-	2610	20	Intergenic	novelGene_109613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_13	475.926639520195	68	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1815	794	2608	463971	422782	FALSE	70	TGAAAAGACCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDE	559465	422779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464355_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_506156_506286_559359
869531	contig_6593_pilon	+	3664	4	Intergenic	novelGene_49852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	473	junction_3	300.912316501373	1309	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAAAAAATTCGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237284	1279287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277315
869532	contig_11317_pilon	-	5118	16	Intergenic	novelGene_164076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_10	78.3410208993702	405	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	70	1434	116228	76184	FALSE	10	TATGGTCTGTGAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFRRAPAGAGVYLSHCGVATAASMAALSSAAALRLCATVILLDMVFSKSVVPDLDDSFKESRKDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGIEMKNMGSPVKVGKMDATSYASLAAEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKDDIIDFAHRVSGALIRPLPSKQMFEHVQRRHRVFFVYVGGESPLKEKYVDAASELIVYSYFFAASEDVVPESVVLREVPAVLVFKDDTYFIYDEFEDGDLESWITRERFQNYLTVDGFLLYELGDTGKLVVIAVIDEKNTSIEHTRLKSIIQEVAQDYRAHFRRDFHFGHMDGNEYINSLLMDELMVPTVVVLNTSNQQYFLLDRQIKNAKDMVRFIDSILNGTVEAQGGDSILQRLKRIMFDAKTTVVSIFKSSPLMGCFLFGLPLGVISIMCYGIYSADTDGGYIEEQYEISKSEMESQDLMEESREQQEPSDGESVVPPMHEPKDALEKKKD	116297	72499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_76445_77184_77254_78466_78597_85628_85686_86014_86069_86261_86320_88311_88411_91703_91771_92712_92791_93761_93862_96938_97020_98307_98354_105084_105209_106414_106455_115120_115176_116182
869533	contig_16103_pilon	-	1774	7	Intergenic	novelGene_118821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	37	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	109	747	743628	723303	FALSE	15	GACCTGCTTGACTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILREQHLRETEHSSANVFRSLL	743736	722275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723365_733559_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
869534	contig_16103_pilon	-	2122	9	Intergenic	novelGene_118849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3358.13939369705	39	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	109	741	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743736	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722784_722833_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
869535	contig_4315_pilon	+	3456	24	Intergenic	novelGene_46735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	167.21658866162	5	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	918	2757	101	2857	163968	225537	FALSE	20	TTTCTACAAGAGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFHKQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVWNWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPSEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESDVRGITGVDLFGTTDAVVKHVLETAIVICNRKLEALCNIHENIRVKSGAWDESGVFIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFKLALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEIALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMMKIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDPEKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGSIASKGKGGALAADIDIDTVGTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLDLPPELDVPTGAGGGAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVTEIGKDVIGLRISALQFR	163867	226136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_164008_168532_168647_168852_168927_172542_172624_174181_174259_175154_175265_180103_180214_192096_192240_207189_207353_207427_207575_214651_214842_214960_215057_216250_216340_216527_216652_218708_218799_218980_219091_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023_225219_225477
869536	contig_11656_pilon	-	3278	22	Intergenic	novelGene_54002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1473	1916	527523	523728	TRUE	15	CACTTCCTGCTCTGACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVCSAIIRSTRCFTSFSDSKLSLLTILLQVNLDAGFKEIQLGLELLRHGSHGILHLGQTAVIPEEIHHGSSLSLLQPVTIFLQGLDTVPDLSPHLPQVEEREILLGLLKDTADTFRLRPRGNLHLIGDFTVVKEKNEIHVQCAALI	537351	464938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_465085_465698_465821_484727_484823_485802_485921_489322_489394_507864_507938_508478_508567_510822_510911_513714_513842_520394_520502_521769_521900_522655_522851_523725_523843_524926_525051_525829_525982_527470_527581_527842_527891_527999_528100_528536_528687_531208_531335_535317_535410_536452
869538	contig_8581_pilon	-	3696	18	Intergenic	novelGene_22846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	522.482323669149	14	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	53	2452	386058	309318	TRUE	20	ACTGGAATCTCCCATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIERFAKFSTI	386110	306405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309343_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
869539	contig_6980_pilon	+	4470	8	Intergenic	novelGene_36049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_1	408.610787315024	105	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	2740	3372	364894	372790	FALSE	30	TTACTGTGTCATTGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346135	373888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
869540	contig_7870_pilon	+	2924	1	Intergenic	novelGene_109084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786882	789806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_786900_789800
869541	contig_10958_pilon	+	2399	5	Intergenic	novelGene_5399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	3	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	74	475	888255	894000	TRUE	45	ATCATATCTAAAACTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888181	901698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894051_895221_895855_900457
869542	contig_3529_pilon	-	1783	9	Intergenic	novelGene_105339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	482.464360730407	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	82	636	550554	529100	TRUE	35	AGTGTTATGTGAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621500	525021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_569553_569585_621477
869543	contig_3529_pilon	-	1526	9	Intergenic	novelGene_105341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	475.41835195436	1293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	256	810	550554	529100	TRUE	0	TTTGGTTTGTGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	571205	525452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_569430_569585_571131
869544	contig_3529_pilon	-	1497	8	Intergenic	novelGene_105344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_7	430.948029443961	68	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	229	783	550554	529100	TRUE	5	CATTTGGTTTGTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	571332	525454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_571131
869545	contig_3529_pilon	-	1450	9	Intergenic	novelGene_105345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	437.923348743818	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	182	736	550554	529100	TRUE	5	CATTTGGTTTGTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621486	525454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_613930_614025_621426
869546	contig_3529_pilon	-	1361	8	Intergenic	novelGene_105342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_7	434.112512454303	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	91	645	550554	529100	TRUE	0	TTTGGTTTGTGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	573439	525452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_573376
869547	contig_3529_pilon	-	1428	9	Intergenic	novelGene_105350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	486.758265851747	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	170	724	550554	529100	TRUE	20	AGTACATTTTCATTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	621448	525464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_620917_621045_621433
869548	contig_3529_pilon	-	1528	8	Intergenic	novelGene_105343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	419.50033446023	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	259	813	550554	529100	TRUE	5	ATTTGGTTTGTGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL	569661	525453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753_538898_540619_540761_541784_541842_544822_544892_550497_550582_569430
869549	contig_15899_pilon	+	4104	1	Intergenic	novelGene_128912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49723	53827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_49700_53800
869551	contig_17144_pilon	-	914	4	Intergenic	novelGene_29123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	195	812	12299	9893	FALSE	20	CAGCTGAGGCCCTTGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTLFLSFSLYQYLSVSVPYLFHSLSSAHLNTYLCRLLLLKQQSPPSETSHTWSQWPADSYPQGSFWMDSRTQSHGQTDLGVSQPDIQHHLTELSPSGLCWIVEG	13466	9790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10113_11651_11740_11989_12356_13328
869552	contig_8866_pilon	-	2924	6	Intergenic	novelGene_77773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	495.491109910158	128	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	203	1372	418087	342321	FALSE	20	GAATTTCAGATGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRSLKLGPWARAVPQPSGTGLAEPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVSPFHSPPSTPSSPSVWSRSSEPEEVPVSFDQPPEGSHLPCYNKVRTRGSIKRRPPSRQFRRSQSDCGDLGNFRAAESSQENGAKEENGDEVFTSKSKAPGPPPSSDSAVGKEVRRSLELDQKPPLRRTSSWTEKREEKGGSAEDTKQWEKAAVHSVEEERQSTAQEEATEPPRASSPKAENGCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	418289	340768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349552_352283_352488_356563_356636_363336_363439_418081
869553	contig_5770_pilon	-	3171	2	Intergenic	novelGene_74192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	14030	junction_1	0	63	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2376	2693	262703	262386	FALSE	50	AAGTAAAAGAAGAATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLGHLWNNHEKKTFLSNLIHLSYLAFVGLICSLTVTSKFVVVNASHLRMALPRCPQYFRHNVFKNGNYPHTPKEVVNLISANDHSRLSHEPGNDCRRFTFLHA	265783	261907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_264062_264766
869554	contig_15407_pilon	-	703	1	Intergenic	novelGene_123106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACGCTTTTAACTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600013	599310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_599300_6e+05
869555	contig_12079_pilon	+	2557	13	Intergenic	novelGene_67400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	154.865443387334	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	995	2236	535255	578891	FALSE	15	TAACCTGTGTCTCCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLSKSQNDMISDKHRLTTGHRQSAGRTERRSQSDTAINATRKVSSSDILISLNQEDPKHSPDPVLKQERVSSSPDVCPLFSGDLRHGSLISINSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIRYCFETHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKIYLLPDRSSQGKRKTRVQKNTTDPTFQETLKYQVDPAQLAARRLQVSVWHLGVLTRRVFLGEVLIPLATWDFGDSATQAFHWYPLRPKAEKCEDSTPHNNGELAVRAKLVLPSGPRKPQEAQEGTGDQPSLNGQLCLVVLGAKNLPVRSDGTLNSFVKGCLTLPDQQKLRLKSPVLKKQACPQWKHSFVFNNVTTSQLKQSSLELTVWDQAIFGMSDRLLGRARLGSKEEAAGGTDSCSPSLQWQKVLSNPNLWTDMTLILH	490655	579212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_491294_494619_494839_510897_510963_535182_535262_539080_539203_545523_545659_560105_560285_566065_566169_571771_571943_575144_575251_576396_576503_577602_577809_578784
869556	contig_6902_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_135601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	453	971	1423	489903	490355	NA	20	TATGATGGGGTTGATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTK	488932	490357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_488900_490400
869557	contig_13464_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_125252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCTAAAATGTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549485	547678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_547700_549500
869558	contig_7396_pilon	-	2760	15	Intergenic	novelGene_79550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2968.7359847145	2	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	114	1481	255163	246385	FALSE	25	ATTATTTATGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257100	245105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255123_255191_257014
869559	contig_5967_pilon	-	4393	1	Intergenic	novelGene_44347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391939	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_387500_391900
869560	contig_3386_pilon	+	2745	15	Intergenic	novelGene_34552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	616.790971108378	119	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	321	1655	476337	508362	TRUE	25	TAGTGGAAGTGTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470053	510193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231_508910_509650
869561	contig_15453_pilon	+	2142	5	Intergenic	novelGene_112481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	299.615899945247	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	32	493	6981	17260	TRUE	20	TTACTACTGTGGGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERLAGRRRKMAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLQSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6949	18948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103_17667_17705
869562	contig_7870_pilon	+	6882	1	Intergenic	novelGene_109058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	635	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	5622	5960	670094	670432	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASYTKQISNKWYVMKLLIFFSLLRSAQQMKNKLLHFFLFEKRMAKNEFISTLVFSGPTKGEKKKEVWEGIRQHFSKLQHKNTNHNSNENKTKKNTQNTKKYEASEHVEES	664472	671354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_664500_671400
869563	contig_7919_pilon	-	4190	1	Intergenic	novelGene_28139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCATTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1593662	1589472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1589500_1593700
869564	contig_15063_pilon	+	1360	4	Intergenic	novelGene_14240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3834.97451824071	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	43	1218	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34765	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266
869565	contig_4301_pilon	-	3289	10	Intergenic	novelGene_65072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_4	144.286751528568	531	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	59	1600	62379	42274	FALSE	25	AACGAATGGCTGTATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGGPSGQPALLSLLLAVVLPFFCLAISIDEARNELIKREKMMRLGGQLVLKKEEEEANGKLMTLKKAEITKAMKTQMFPPSMHFFQAKKLIEKSEVFHILKKMPKGAALHLHDFGIVDVDWLVKNVTYRPHCHVCFTPNGTLHFKFAHPTPPAPNQEDCSKWILLQQYRKELKNVTEFDNSLQKTFTLVTENPEVTYVDQNVIWTKFETIFLTISGLVHYAPVFKDYIFRGLEEFYMDNVIYLELRARLPPVYELNGETHDRKWCVKTYKEVAEAFAKDHPEFVGLKLIYSDHRSKDASLIKISVKTAMELRTDFPTTVAGFDLVGREDTGHTLYDYKEALLIPSLKGIKLPYFLHAGETDWQGTSVDGNLLDALILNSTRIGHGFALSKHPAVMEDLQKRDIPIEVCPISNQVLKLVTDLRTHPATAFMAVGYPMVISSDDPAFFGAKGLSHDFYEVFMGISGMDADLRTLKQLAINSIKYSALSPTEKKTAMKTWEKTWDKFIHDLSKK	65074	40584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_42368_42626_42830_43377_43536_46294_46404_48416_48508_50463_50592_59025_59237_60477_60704_62057_62388_65024
869566	contig_12414_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_59595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	585	917	374006	373674	NA	70	TAGGCAAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374590	372684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_372700_374600
869567	contig_11989_pilon	+	2826	25	Intergenic	novelGene_68423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	71.820329449413	413	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	555	2423	15442	44804	FALSE	25	CTTCAGAATGAGCCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKLGPEKRIFEEIQKIEDNEFHYQEQTDPVEYVENMCENMQLYPLQDFLTGDQLLFEYNPEVIGEALNQLVPQKANLVLLSGANEGKCELKEKWFGTQYNMQDIENSWAELWNSNFELNPDLHLPAENKYIATDFTLKAFDCPETEYPVKIVNTPQGCLWYKKDNKFKIPKAYIRFHLISPLIQKSAANVVLFDIFVNILTHNLAEPAYEADVAQLEYKLVAGEHGLIIRVKGFNHKLPLLFQLIIDYLADFSSTPAVFTMITEQLKKTYFNILIKPETLAKDVRLLILEYARWSMIDKYRALMDGLSLESLLSFVKEFKSQFFVEGLVQGNVTSTESMDFLKYVVDKLNFIPLEQEMPVQFQVVELPSGHHLCKVRALNKGDANSEVTVYYQSGPRSLREYTLMELLVMHMEEPCFDFLRTKQTLGYHVYPTCRNTSGILGFSVTVGTQATKYNSEVVDKKIEEFLSSFEEKIENLTEEAFNTQVTALIKLKECEDTHLGEEVDRNWNEVVTQQYLFDRLAHEIEALKSFSKADLVSWFKAHRGPGSKMLSVHVVGYGKYELDDDNTPSCEDSNSSYGEVMQLTTFPTSPLLADSTIPITDIRAFTSRLNLLPYHKIVK	5505	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_5630_8016_8075_9885_9960_11362_11433_13597_13675_15209_15331_15411_15471_15733_15789_27065_27171_28716_28841_29391_29479_30708_30829_31634_31687_32621_32773_35469_35598_37169_37333_39014_39047_39296_39436_41345_41394_41686_41740_42180_42265_42838_42930_43215_43333_44348_44439_44603
869568	contig_1516_pilon	+	2293	11	Intergenic	novelGene_49998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1240.45886671022	1	121	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	112	1713	347241	363092	FALSE	10	GCCACCTCCAGGCCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLIAPARLHPGSQAHQQSPALVEPRARVHGGRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEFPQYHAETIRNVRTATESFASDPIHYRPVAVALDTKGPEIRTGLIKGSGTAEVELKKGATLKITLDNAYMEKCDENILWLDYKNICKVVEVGSKVYVDDGLISLQVKEKGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335951	363672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_336050_347227_347395_347975_348068_352888_353030_353505_353693_354793_355065_356022_356171_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
869569	SIRV6	+	1341	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	575	0	359	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	71	562	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1662	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869570	contig_1867_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_54570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATATGACATCACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448000	449956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_448000_450000
869571	contig_6084_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_127044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCAGGTAAGTCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336368	338069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_336400_338100
869572	contig_4732_pilon	+	2737	5	Intergenic	novelGene_75429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	309.50070678433	2021	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	83	823	622515	629177	FALSE	55	GAAAAGTAAGATGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAADQPLPRLLGPWASRPEDVGLPVAMTTGDCCHLPGSLCDCSSSPAFSKVLEATGLGPPQYVAQVTSRDGRLLSTVIRALDTTSDGPFCRICHEGANGESLLSPCGCAGTLGAVHKSCLERWLSSSNTSYCELCHTEFAVEKRPRPLTEWLKDPGPRTEKRTLCCDMVCFLFITPLAAISGWLCLRGAQDHLRLHSRLEAVGLIALTIALFTIYVLWTLVSFRYHCQLYSEWRRTNQKVCLKLRDAEGFEGAQHSPLAAGLLKKVAEETPV	616907	631091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_616927_622451_622691_625119_625316_626689_626900_629018
869573	contig_610_pilon	-	1572	5	Intergenic	novelGene_76744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	1323.91361122998	5483	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTCAAAGTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252614	213498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235302_249275_249375_252475
869574	contig_7293_pilon	+	1820	2	Intergenic	novelGene_54250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAGATAACAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335638	338027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335816_336384
869575	contig_546_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_117236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTGTCAACTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153881	156461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_153900_156500
869576	contig_8866_pilon	+	820	8	Intergenic	novelGene_77818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	768.093372300158	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	152	592	558831	640870	FALSE	30	AGTGAAAATGCTTTGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWKVFVIMAVLQTQFPITEAQSFGMLDPKICYLLDGILFIYGVVITALFLRAQFSRSADVPAYQPGSNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGWDPEMGGKQQRRKNPQEGVYNALQKNKMAEAYSEIGLKGDNQRRRGKGPDGLYQE	558679	641098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558889_632461_632566_633657_633715_634879_634961_636551_636588_637577_637635_638570_638613_640864
869577	contig_14415_pilon	-	2059	5	Intergenic	novelGene_77598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	610	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	1640	2059	37869	25120	FALSE	50	CTGAAGAAATACTCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFAVPHAGFPTFPEVPPFVAVLFGAGLVFFSLESRLASSGFPVLTFDGPADSSGTCGFETASAALGFFAFLPSLALSLLSSILVFSNSTSSLVPLSTMTSSSWKAAPHWRVFRRQERLCFVRRLLSLAPCAFEGSDPV	39508	25119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_25203_33323_33444_35935_35991_36100_36196_37802
869578	scaffold_14128_pilon	+	2602	16	Intergenic	novelGene_169520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.0219677301085	108	24	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	240	1862	323604	496930	FALSE	15	GTTGTGGTAGTACCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAAESRDAAPGKQNEEKTYKKTASSAIKGAIQLGIGYTVGNLTSKPDRDVLMQDFYVVESVFLPSEGSNLTPAHHYPDFRFKTYAPLAFRYFRELFGIKPDDYLYSICSEPLIELSNPGASGSLFFVTSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCMQSGGINIRIVVMNNVLPCAMRMHYTYDLKGSTYKRRASRKEREKSNPTFKDLDFLQDMHEGLYFDTEMYNALMKTLQRDCRVLESFKIMDYSLLLGIHILDHSLKDKEEDTSQNVPDAKRPAMQKVLYSTAMESIQGSGKSGDGIITENPDTMGGIPAKSHKGEKLLLFMGIIDILQSYRLMKKLEHSWKALVYDGDTVSVHRPSFYADRFLKFMNSRVFKKIQALKSSPSKKRCNSIAALKASSQEIVSSISQEWKDEKRDLLTEGQSFSSLDEEALGSRHRPDLVPSTPSLFEAASLATTISSSSLYTGEHYPHDRPTLYSNSKGLPSSSTFVSEEGTIYLTSEPDAPETQDDNDSVLDVYL	118445	497670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_+_118471_316127_316218_317723_317848_323603_323673_371402_371534_385290_385409_391348_391502_393126_393427_424169_424382_425680_425765_425887_425937_430723_430809_434788_434945_437823_437969_479042_479161_496927
869579	contig_11338_pilon	+	2907	1	Intergenic	novelGene_6330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCAGCTGAGTTGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288732	291639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_288700_291600
869580	contig_8204_pilon	+	1919	4	Intergenic	novelGene_176999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_2	48.1109828071166	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	2	1009	19366	45115	FALSE	35	GGAGAGGGGAACTTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEGKRSSIHYIIPGSLTM	19364	46025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_45005
869581	contig_8377_pilon	-	1704	13	Intergenic	novelGene_34901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTCAGTTTTACCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173000	68043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68145_68225_68327_124717_124736_131425_131569_135046_135194_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164614_172898
869582	contig_15666_pilon	-	3986	4	Intergenic	novelGene_70197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	124.533797286787	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	95	748	132068	119624	FALSE	30	CTGAGAATCATGGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQVKEGRFAQSHMSQCSQ	132162	116385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_119674_130515_130795_131446_131711_132007
869583	contig_15666_pilon	-	2671	6	Intergenic	novelGene_70202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	135.115654163387	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	740	1573	132068	129088	FALSE	40	TTCTAGAAAGCCTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132807	127989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130018_130133_130515_130795_131446_131711_132007
869584	contig_16103_pilon	-	2094	8	Intergenic	novelGene_118856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	34	junction_6	3576.34660809386	7	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	36	317	743628	735957	TRUE	15	CCACCCTCTGACCTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSVSKSWVGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERYEGY	743663	722284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735973_737495_737630_743496
869585	contig_16103_pilon	-	1314	3	Intergenic	novelGene_118886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	564	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAATTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734116	723011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542
869586	contig_7020_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_57078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTGTGCTCCGCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104308	102619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_102600_104300
869587	contig_5023_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_7393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCACTGGACTTCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647574	647002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_647000_647600
869588	contig_5023_pilon	-	1434	8	Intergenic	novelGene_7365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	288	734	647301	643526	TRUE	5	TTGCTGCAGCCCGCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAY	647588	618639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_618665_622525_622618_629191_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643529_646857
869589	contig_500_pilon	+	1409	9	Intergenic	novelGene_31074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_7	904.238871924891	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	19	996	1492663	1498065	TRUE	15	CATGTTTGACTGTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1492644	1499587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
869591	contig_12301_pilon	-	2248	9	Intergenic	novelGene_110015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	298	junction_6	179.243375051911	1758	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	182	1234	136698	102891	FALSE	45	AGATTCAGTACCAATATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLVFLSLLVAGVLGNEFSILRSPGSVVFREGNWPIPGERIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFRRPRATVMVMVKGVDKLALPSSSIISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLFQENSILNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDEIGKRYGEDSEQFRGASRILVETLQKFADDMYNLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKTRTILEAKHMKNPPRPYNLAYKYNFEYSVVFNMVLWIMIALALAVIIISYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRMD	136879	101876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_103086_110665_110786_113599_113750_114873_114928_115790_115929_116083_116180_129132_129265_130605_130737_136661
869592	contig_9177_pilon	+	2036	6	Intergenic	novelGene_32676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_4	828.348139371364	2752	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	32	409	395377	408014	TRUE	25	TAATATCTTCCTCCAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGARHGDESRVFQKIRASLEGPCSTFVQPFCTDVQKREGLGPGLHSRKGGG	395345	416880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407588_407725_407998_408077_415315
869593	contig_2204_pilon	+	1955	7	Intergenic	novelGene_71664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	118.058483623819	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	30	965	13204	50221	FALSE	25	TTTTTAAAGGGCATCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
869594	contig_19851_pilon	+	1038	6	Intergenic	novelGene_29852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	172	687	53637	56177	FALSE	25	TAATTGTTCCGTGTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53465	56528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
869595	contig_19851_pilon	+	1065	6	Intergenic	novelGene_29821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	34	junction_2	3240.92686742543	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	205	711	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53432	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54070_54146_55650_55753_55840_55882_56006
869596	contig_854_pilon	+	1297	3	Intergenic	novelGene_36410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCACTGAGAATCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991304	995174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_992043_993048_993303_994869
869597	contig_12079_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_67418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3698	junction_1	0	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	92	328	581989	580996	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVNYHVQDNLQEEGTEYTGYSAELSSEGIMDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLTNELSQARDDNKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM	582080	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917
869598	contig_3424_pilon	+	3118	6	Intergenic	novelGene_55515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	63.2847532980891	296	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	575	1027	237586	243935	FALSE	40	AAGAAAACTTTGATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENFDIEAPNYLSKESEILLYAKQDSQCVDCFQAFLPVHYRYHRPHSKDGETFIVVNNPDLLMYCDQEFPILKCWAQSEVAAPCALRNKDICQWKNMKYKSVYKNVTLQVPVGLTLHTSLVCSVTLLITVLCSTLILIAVFKYGHFSL	219925	246026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_220288_223230_223295_232342_232485_237579_237794_241360_241462_243791
869599	contig_5728_pilon	-	3756	1	Intergenic	novelGene_126692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1037	1342	263584	263279	NA	70	AAAAAAAAAACCTGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNTMEGFNNRFKQVEEKISELEDKIVKIMEAKKQQVQRLKTGEQSLTELWDNIKRPSIHIMKIPEGDGKEQGIDRTFKEITTENFLNLMKEMNLHIQDAQ	264620	260864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_260900_264600
869600	contig_16098_pilon	-	1466	9	Intergenic	novelGene_46023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1248.30414963662	29	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	109	855	352350	349343	TRUE	30	TGGTACCAGACTCTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHLDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354097	348292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349493_349604_349677_350347_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
869601	contig_1813_pilon	+	2864	14	Intergenic	novelGene_105481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	345.722740093491	620	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	407	1171	128315	150078	TRUE	10	TTAGCCGTGGTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSEPLPIAESDKRKKKKRKARATDSLLGKFEDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPCGSAEYMAPEVVEVFTDEATFYDKRCDLWSLGVVLYIMLSGYPPLRRSLWG	102764	156298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_102831_106495_106653_113656_113838_128312_128415_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_152059_152225_153457_153502_154854
869602	contig_16098_pilon	-	1751	10	Intergenic	novelGene_45980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1282.60689396418	7994	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	126	1124	352350	349467	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKVVPSGRGWGRGGQERLGKDHGWRHLLVLILPLDLLPAGRQLYPVL	354114	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349343_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
869603	contig_9839_pilon	+	4210	3	Intergenic	novelGene_88479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2889	junction_2	671	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	189	488	49467	52219	FALSE	25	TGCTCTCAACTACTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCVSRVP	45252	55941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066
869604	contig_18898_pilon	+	2664	15	Intergenic	novelGene_77639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	399.543438418995	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	117	1193	56748	67356	TRUE	25	GTTGTATCTTGAAACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNHGWHLPWFPGPAPPSDW	56631	71241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66158_67304_67500_67957_68059_68476_68541_70078
869605	contig_3942_pilon	+	7381	1	Intergenic	novelGene_128851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	5214	5549	1406248	1406583	NA	30	CCACAGGGAGGCGGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGAVTHSAAGALQPPSTVNVLRSSLVCRSSIQASTQVSLPQIVDPSAPSPKIALMSAPLSHTGLVFSWFLHHYLRSHWVVQTVKHPPLAKRLAVQTHPEVLQEKGLAICF	1401034	1408415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1401000_1408400
869607	contig_7272_pilon	-	3919	1	Intergenic	novelGene_25332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	800	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	770	1075	580794	580489	NA	20	TAATGGCGATTTGGTCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHSNFLTRAVLIVKWRKRACSPFCYISRLLSLQPLYHSSCCSPNRCPNPIILHNIRRNSHMHWLRDRTFRTPLDLLRADGPSADCRAATTHQSCTIVSYL	581563	577644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_577600_581600
869608	contig_6513_pilon	-	1206	3	Intergenic	novelGene_117771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCACTTTTTTGCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203567	171129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_171982_199000_199157_203369
869610	SIRV1	-	463	3	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	21	6756	21	-1307	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTATATAGTGTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10765	7756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_7815_10282_10367_10444
869611	contig_14443_pilon	-	2815	6	Intergenic	novelGene_126662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	954.965465344166	8073	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	90	410	39405	33956	TRUE	5	TATCTTTTGTTTTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSRLRSWKVAAPLVRSSSILG	39494	27305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_27568_27616_29760_33955_34014_37689_37863_38988_39045_39371
869612	contig_6217_pilon	-	2665	3	Intergenic	novelGene_109653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	42.5	758	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	311	1174	739958	739095	FALSE	25	TGCAACATTTGGGTGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	811079	737603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739964_810688_810846_810931
869613	contig_2646_pilon	-	3379	1	Intergenic	novelGene_69536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576256	572877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_572900_576300
869614	contig_7887_pilon	+	2383	1	Intergenic	novelGene_124864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1732	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1701	2054	160914	161267	NA	45	CTGATCCTAACAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYKYFTSVAHSQRSVHIFLPHTSLLSIFQSCSSQVPDDPARPLATAHESVYNCTSGCFSFQAKTTQVHCWKFCPLRGFPFTTVLHGGITQYYANIFWKKEEKILPNSFYEAIIILI	159213	161596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_159200_161600
869615	contig_9183_pilon	-	2309	8	Intergenic	novelGene_40330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	499.366292292092	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1034	2032	322898	312131	FALSE	35	CATTTGATATGAAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325974	311853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323117_323184_323834_325808
869616	scaffold_12124_pilon	+	1599	11	Intergenic	novelGene_22351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3582.97105905141	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	99	428	1484002	1497011	TRUE	30	TGCGAAATGTGTGGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYSDTLGVTVSRGRLAGSWSLVFCFFLLQYDLMLPEQITAAKGRFPNKVTLTGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGVMMPCASFHS	1483903	1509559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496979_1497122_1506629_1506687_1508010_1508107_1508275_1508778_1509153
869618	contig_1706_pilon	+	2892	1	Intergenic	novelGene_155035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1417	1782	18092	18457	NA	15	ATGGTTTTGTAATGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRSGTDVGAASLRETFRNLKYKVRNKNDLTREEILELMCNVSEEDHGKTNRFIYVLLSHGDEGVIFGTDGPVDLKKLTVFFRGVNCRSLTGKSELFIIQDCRGTDLDCGIEADSGLMKT	16675	19567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_16700_19600
869619	contig_5445_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_135407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCCTACTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51576	53972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51600_54000
869621	contig_5136_pilon	-	3411	25	Intergenic	novelGene_126626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_8	426.729843548585	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	911	2736	89	2824	360194	254687	FALSE	70	TAATTTTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRSGAARSSSAATFLTSFAETYFLPVRAMLRVIVQSASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPIWNEILEFDLRGVPLDISSSLGIVVKDFETIGQNKLIGTATVPLKDLIGDQSRSLPYKLTPLLNERGQETGATIDLVIGYDPPSAPHPNDPSGTSMPGMEGEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDDFSSSGTGAASYTANTGETDVGFVPTFGPCYLNFYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELSTFLEKTAADKKLESISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAIFDGNFYYYLPWAYTKPVVTLTSHWEDISHRLDAVNTLLLMAERLQSNIEALKSGIQSKIPANQLANVWWRLIDEVTEDTRYTLPPLEGKSNVTILDTQIQKLRSRSLSQIHEAAVRMRSGDIDVKSALAEVEDWLYKLKQLTEEPQNSLPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEENNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMVRLLVSPTFPFGGVLLLFILGENVHIPNNNLHQHHHLKSHSKNLTLKG	360282	254099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_254966_257705_257862_258803_258997_261534_261642_267825_267951_269302_269481_274623_274741_276091_276217_277000_277040_279607_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_305916_306005_307058_307168_329056_329149_331432_331489_360106
869622	contig_9183_pilon	-	2572	7	Intergenic	novelGene_40340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	532.695973328126	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1659	2342	320566	312131	FALSE	35	AGCTTAATGATAATACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325966	311900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_321493_323344_323919_325808
869623	contig_18145_pilon	+	2500	15	Intergenic	novelGene_37347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	502.95007765408	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	182	2092	86893	100853	FALSE	30	AAAATGGAGTCTGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLTTLRKPCVLPAVLSVTMTSGSMRCLLRPFSRVGALAASDSLQGTKAELAPVRAAEAAQVAAYTQKTMMMTCTVKCWWPTSWPAEPCSLGWGRSPRRDQGCAHGLLHSSV	86711	101261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_97924_100366_100482_100638
869624	contig_10437_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_38170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162364	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_162400_164100
869625	contig_5485_pilon	-	2174	5	Intergenic	novelGene_37684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	555.917428670841	5	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	150	1364	87935	85491	FALSE	15	CCAACCTTGTGCTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQTGLFFILLLRTLFQMQVIPSLQLQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88084	84680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86484_86557_86774_87027_87794
869626	contig_6980_pilon	-	2987	1	Intergenic	novelGene_36074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCATATACAATACTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374138	371151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_371200_374100
869627	contig_1406_pilon	-	1864	3	Intergenic	novelGene_25471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.5	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	136	885	835192	834338	FALSE	45	AAAGAAGAATTTTTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDIEYGYNCMAPSLRRERFAFKISPKPSKPLRPCIQLSSKNETSGMVAPTVQEKKVKKRVSFADNQGLALTMVKVFSEFDDPLDIPFNITELLDNIVSLTTAESESFVLDFSQPSADYLDFRNRLQTDHVCLENCVLKDRAIAGTVKVQNLAFEKMVKIRITFDTWKSFTDFPCQYVKDTYAGSDKDTFSFDISLPEKIQSYERMEFAVCYECSGQTYWDSNKGKNYRIVQAEWPSYLGFEKLGPYY	841167	833358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_834383_834487_835221_841060
869628	contig_18592_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_114783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGACACAATTCCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	11964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_12000_12800
869629	contig_18592_pilon	-	819	1	Intergenic	novelGene_114784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAAAGGGTGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	11978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_12000_12800
869630	contig_18145_pilon	+	2676	17	Intergenic	novelGene_37321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	468.078902937315	2	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	261	1913	86893	98352	TRUE	50	TACAAAATAAAAGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVGKPCWPKLLLMSARPISSPSRVLSCSPCGLGNLRPMSGKSLIRLAKLPPAYYSLMSWIQLPRLVVVTLEMVVGLLTESSTKS	86632	100902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97469_97906_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
869631	SIRV6	+	1098	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	31	2	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	115	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869632	contig_14215_pilon	+	2419	20	Intergenic	novelGene_59345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	34	junction_1	112.040208453257	882	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	504	2081	22506	47528	FALSE	25	CAACATGAGTAGGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFLPIPLSKNQEVIIEVSFETSPKSTALQWLSPEQTSGKRHPYLFSQCQAIHCRAILPCQDTPSVKLTYSAEVSVPKELVALMSAIRDGEAPDPKDTSRKIYRFNQKVPIPCYLIALVVGALESRQIGPRTLVWSEKEQVEKSAYEFSETESMLQIAEDLGGPYVWGQYDLLVLPPSFPFGGMENPCLTFVTPTLLAGDKSLSNVIAHEISHSWTGNLVTNKTWDHFWLNEGHTVYLERHICGRLFGEKFRHFHALGGWRELQNTIKTFGETGPFTKLVIDLKDVDPDVAYSSVPYEKGFALLFYLEQLLGGPEVFLGFLKAYVKKFSYKSITTDDWKDFLYSHFKDKVDILNQVDWNAWLYSPGLPPVKPNYDMTLTNACIALSQRWIDAKEDDLNSFSAGDLKDLSSHQLNEFLAQMIQKAPLPLGHVKRMQEVYNLNAINNSEIRFRWLRLCIQSKWEDAIPLALKMATEQGRMKFTRPLFKDLAAFDKSHDLAIRAYQQHKASMHPVTAMLVGKDLKVD	5139	47866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_5412_8381_8514_22406_22538_26111_26233_28774_28844_30734_30840_32853_32907_35081_35155_35417_35559_36841_36866_37352_37424_38424_38537_39140_39286_40288_40393_40796_40868_41400_41456_43126_43223_45741_45825_46478_46584_47410
869633	contig_12624_pilon	-	1702	4	Intergenic	novelGene_61141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	803.172459687208	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	136	441	952979	948779	FALSE	65	TAAAAAGTTCGAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955773	947517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913_952985_955643
869634	contig_14811_pilon	-	2011	3	Intergenic	novelGene_74467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	165	3039	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	263	1042	375703	357434	FALSE	15	ACCCATGCTATTGCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386729	356464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375765_386528
869635	contig_10159_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_30893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996625	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_996600_997800
869636	contig_3789_pilon	-	2901	7	Intergenic	novelGene_79844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	719	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACTTCCTCTTCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474310	445425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_445761_457259_457371_464032_464101_465797_465911_467054_467110_468585_468701_472206
869637	contig_2204_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_71686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGTGAAAAGCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49242	51127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_49200_51100
869638	contig_2069_pilon	+	2933	12	Intergenic	novelGene_23566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	410.08447023421	327	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	498	1856	2286432	2316188	FALSE	35	AACCCTGAAACTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSPNKPTFAYPESNSRAIFSALKNLQEKIRRLELERIQAEESVKTLSRETSEYKKVLDEQIQERENSKNEESKHNQELTSQLLAAESKCNLLEKQLEYMRNMIKHAEMERTSVLEKQVSLERERHHDQTHVQTKLEKLDLLEQEYNKLTTMQALAEKKMQELEAKLREEEQERKRMQVKAAQLQTGLETNRLIFEDKTSPYVGSARRIRKKKSKPPEKRGSRNCFAAQPHYRLCLGDMPFVAGKSTSPSHAVVANVQHVLHLMKQHSKALCNDRVVNSVPLAKQASSRCCKSKNRPVTPSSSSTINEELSEVLQTLQDEFGQMSFDHQQLVKLIQESPTIELKEDLECELETLVGKMEAKANQITKVRKYQAQLEKQKIEKQRKELRATKKSLDEEGNSSSRSSGTTGTTNKKDFAKLRPGEKSRKNLQLLKDMQTIQSSLQSNSLSWDY	2272774	2317265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2273039_2273287_2273419_2286329_2286487_2298194_2298375_2298733_2298856_2301543_2301661_2302289_2302368_2305649_2305758_2306699_2306778_2313148_2313391_2313974_2314120_2315954
869639	contig_8696_pilon	+	4036	4	Intergenic	novelGene_153330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	30.9228430488243	394	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	135	773	953016	975364	FALSE	30	AATATAATATTTTTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSLNQEIKAFSRNNLRKQCTRVTTVTGKKIMETWKDARIHVVEEVEPSSGGGCGYVQDLSLDLQVGIIKPWLLLGSQDAAHDLDTLKKHKVTHILNVACGVENAFLSDFTYKSISVLDLPETNLLSYFPECFEFIEQAKMKDGVVLVHCNAGVSRAAAIVIGFLMNSEEISFTSAFSLVKNARPSMCPNAGFMEQLRTYQEGKERNKCDKI	952881	978627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_953242_959466_959514_968149_968303_975151
869640	contig_4232_pilon	-	4883	11	Intergenic	novelGene_63484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_10	359.044899699188	466	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2478	2942	616674	614837	TRUE	15	CACGGAGATCTCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWLNTQLKIQMIQKSSLGEQYYKDAMEQCHNYNARLCAERSVRLPFLDSQTGVAQSNCYIWMEKRHRGPGLASGQLYSYPARRWRKKRRAHPPEDPRLSFPSIKPDTDQTLKKEGLISQDGSSLEALLRTDPLEKRGRPRSPELTMTAWASFL	619151	607754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_613967_614816_614983_615283_615392_615783_615945_616624
869641	contig_366_pilon	-	2573	9	Intergenic	novelGene_51581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	595.228685044664	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	493	1347	803057	757099	FALSE	30	GGAAGTTTTTCTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEVTTWDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803549	755872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780120_802921
869642	contig_15047_pilon	-	1765	5	Intergenic	novelGene_52135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1033	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTCTGGCAGGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21659	2165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2250_2607_2828_3223_3495_4155_4683_20996
869643	contig_19179_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_142378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAGTTTTACAATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35122	32900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_32900_35100
869644	contig_7254_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_145859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCACACCACCATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265616	262872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_262900_265600
869645	contig_1335_pilon	-	6106	20	Intergenic	novelGene_166507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	170	junction_19	84.7023139852733	628	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	255	2972	517470	291076	FALSE	25	ATACTGTGGCCTACTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVMTRDTLLEMEEDDDEDGDIALENLEQTVVSNFGAHEIRTPEFEEFNGKPDSLFFNDGQRKIDFVLVYEDESRKENNKKGSNEKQRRKRQAYESNLICDGLQLEATRSVLDDKLVFVKVHAPWEVLCTYAEIMHIKLPLKPNDLKTRLSAFDSFNWFTKFLQVDETLIKPEQEFFTAPFEKDRMNDFYIHDRDAFFNPATRSRIVYFILCRVKYQVTGNISKFGIKKLVSSGIYKAAFPLHDCQFNHQSEDPSCPNERYLLYREWAHPRSLYKKQPLDLIRKYYGEKIGIYFAWLGYYTQMLLLAAVVGVACFLYGYFNQDNCTWSKEVCNPDIGGNIIMCPQCDRLCPFWKLNITCESSKKLCIFDSFGTLVFAVFMGVWVTLFLEFWKRRQAELEYEWDTVELQQEEQPRPEYEARCTHVEINEITQEEERVPFTTWGKCIRVALCASAVLFWILLIIASVIGIIVYRLSVFIVFSAQLPKHFNGTDPIQKYLTPQTATSITASIISFIIIMILNTIYEKVAIMITNFELPRTQTDYENSLTMKMFLFQFVNYYSSCFYIAFFKGKFVGYPGDPVYWLGKYRNEECEPGGCLLELTTQLTIIMGGKAIWNNIQEVLLPWIMNLIRRYHRVSGSEKITPRWEQDYHLQPMGKLGLFYEYLEMIIQFGFVTLFVASFPLAPLLALVNNILEIRVDAWKMTTQYRRMVPQKAQDIGAWQPIMQGIAILAVVTNAMIIAFTSDMIPRLVYYWSFSVPPYGEHTHYTMDGYINNTLSIFNIMDFKSERRENPYSGLGNHTTCRYRDFRYPPGHPQEYKHNIYYWHVIASKLAFIIVMEHVIYSVKFFISYAIPDVSKSTKSKIKREKYLTQKLLRENHLKDVTKNMGVIAEKMMGVVDNNLRPKSE	517724	287941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_291283_295451_295558_297275_297479_301594_301801_309903_310035_325101_325200_325392_325563_326838_327065_331912_331991_334664_334808_343489_343551_347352_347459_351631_351767_360975_361092_363622_363737_363948_364237_365218_365285_382238_382368_424212_424281_517403
869646	contig_1380_pilon	-	1645	9	Intergenic	novelGene_138884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	114.969289377642	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	603	1094	143670	132611	FALSE	20	CTTGTTACATTGACCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYVTQELPQLINASFPVDPQRMSVFGHSMGGHGALICALKNPGKYKSVSAFAPVCNPVLCNWGKKAFSGYLGSDQSKWKAYDATHLVKSYPGSQLDILIDQGKDDEFLSDGQLLPDNLIAACTEKKIPVVFRLQEGYDHSYYFIATFIADHIRHHAKYLNA	161991	132059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_132692_138023_138192_141553_141653_142466_142587_143646_143772_145515_145615_148555_148596_155063_155139_161704
869647	contig_9183_pilon	-	2151	8	Intergenic	novelGene_40323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	503.897017337504	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	162	1454	323783	315336	TRUE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQSPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITTECSQTGWPPRKGLFRRAMRSCPSTGSLSKGPRTPMPWPSSAKLGTHGKL	325979	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315489_318244_318347_320557_320727_322743_323130_323300_323834_325868
869648	contig_3866_pilon	-	2446	11	Intergenic	novelGene_112427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_10	67.2892264779437	1726	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	55	822	268685	242015	FALSE	25	GCCCAGCTCAAAGATGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTKGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM	268739	240390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_242060_242535_242601_243133_243202_248233_248281_250522_250589_251454_251528_253592_253667_253751_253854_257352_257477_265864_265948_268664
869649	contig_6199_pilon	-	1007	3	Intergenic	novelGene_126327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3	152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	353	850	31305	30808	FALSE	20	CTGTAAGAGCTGGGTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTWAGRLGHQGQRPSSWGQVRTSNFPGSPRAEPEPSIVLPFSCLAPLWRGFSFKKIPWLPQMTGIGGRIGPASSLWNFCFGTLQHLRHDLKIKTHTFADLCDSQHDWANIHCGGQAQSQNAQCHIREVQPVDAQRRQKLILPLGSGKASPGSALDLDFEGHSR	32682	30650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_31352_31962_32068_32481
869650	contig_17936_pilon	+	3598	11	Intergenic	novelGene_29901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_9	844.879405595852	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	67	1449	50646	119731	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKNYQSLLIPESEKRKAFPLGPVQYQESIQRSPCVL	50579	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_119628_121063_125766
869651	contig_5571_pilon	-	4785	1	Intergenic	novelGene_75510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	486	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAATGAATTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120968	116183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_116200_121000
869652	contig_6434_pilon	+	3067	1	Intergenic	novelGene_61914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930767	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_930800_933800
869653	contig_7644_pilon	+	2369	2	Intergenic	novelGene_64259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATAAAGCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185455	188156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_185970_186301
869655	contig_7720_pilon	+	654	1	Intergenic	novelGene_155799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAGCAAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849439	850093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_849400_850100
869656	contig_3948_pilon	-	2516	7	Intergenic	novelGene_53195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	7	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	45	851	866476	840803	FALSE	20	TGTCATGTCTTCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869612	839137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
869657	contig_14030_pilon	-	3309	3	Intergenic	novelGene_62220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	774	junction_1	539	29	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTCACCTTGTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345524	335762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002
869658	contig_10331_pilon	+	2008	19	Intergenic	novelGene_54144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	334.597145833613	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	1184	2008	542032	573480	FALSE	60	CCAAAAATAAAACACCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGDETNKDEDEDDEDAEEEDEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYDEWIKADKIVRPADKNV	409661	573480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_458994_459085_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_550874_551019_573425
869659	contig_16098_pilon	-	2612	12	Intergenic	novelGene_45762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_8	267.563014899572	431	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	629	1042	35038	31519	TRUE	10	CTGACTTGACTTGGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36310	29789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35113_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907
869660	contig_6364_pilon	-	2587	14	Intergenic	novelGene_51723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1053.15128691755	1	102	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	130	1656	490750	436151	FALSE	60	TTCTTTTAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSTSAPANGNDNKKFKGDRPPCSPSRVLHLRKIPNDVTEAEVISLGLPFGRVTNLLILKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521123	435219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439943_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_490725_490802_521045
869662	contig_8866_pilon	-	2200	7	Intergenic	novelGene_77770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	453.453201064405	119	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	182	586	418087	348825	TRUE	15	TTTCAGATGTGTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWARAVPQPSGTGLAEPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASKRERRGVAFLRQSATLRLALPSWRPVARP	418268	340765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348916_352443_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
869663	contig_11564_pilon	-	3844	2	Intergenic	novelGene_158556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	147	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCCCCAAATCTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52792	48740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_52078_52285
869664	contig_2043_pilon	-	6521	1	Intergenic	novelGene_169901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGTCTCCCATACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681223	674702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_674700_681200
869665	contig_5092_pilon	-	2208	4	Intergenic	novelGene_62294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	610.452837381125	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGCTCCTGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449453	443175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_445135_446111_446164_447835_447995_449415
869666	contig_8978_pilon	+	2965	14	Intergenic	novelGene_49455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.511805010229	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	948	2924	1749586	1772377	FALSE	75	AAAAAAAAGGAAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQVKHHVEPLTPPWHHNKKRYPPSYGPDGKPRPRFNNVQLSPTDEERDKAEEEVHLLNSTTL	1680785	1772418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1682927_1683025_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1770477_1770554_1772218
869667	contig_6795_pilon	+	3508	18	Intergenic	novelGene_27740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	325.362262833483	9	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	1573	2883	329792	332823	TRUE	45	TAAAAATCAGTATTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTPMRPSWLRISSTPCLTPPTASRSSTKARSPKTSSGWALGHRNLMTTTRST	326612	333734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_327243_327427_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332268_332602_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
869668	contig_13780_pilon	-	2290	11	Intergenic	novelGene_149124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1056.55479744309	38	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	424	1353	826505	822800	TRUE	20	GGCTCTGGATGACTTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRVSKLCLGL	827939	821147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827630_827825_827918
869669	contig_5033_pilon	-	2066	3	Intergenic	novelGene_28950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.5	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1409	1744	451758	451423	FALSE	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	456623	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_452688_452764_453116_456495
869670	contig_16492_pilon	+	4067	9	Intergenic	novelGene_100277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_5	80.4797140588857	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	2591	3313	86032	100411	FALSE	15	CACAATGGTGTGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76819	101165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
869671	contig_15327_pilon	-	2746	7	Intergenic	novelGene_70714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	294.112459594776	6	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	17	328	967479	963784	TRUE	5	CTACCTGGCTCTGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGG	967495	959473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960581_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_963928_965036_965146_967420
869672	contig_15570_pilon	-	7606	8	Intergenic	novelGene_137868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	104.315455641598	726	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	138	1046	803322	759521	FALSE	40	TTGCCAAAGCAATAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDEEKVKLRRLEPAIQKFIKIVIPTDLERLRKHQINIEKYQRCRIWDKLHEEHINAGRTVQQLRSNIREMETLCLKVRKDDLGLLKRMIDPVKEEASAATAEFLQLHLASVEELKKQFNDEETLLQPSLTRSMTVGGTFHSTETEASPQSLTQIYALPEIPRDQNAAESWETLEADLIELSQLVTEFSLLVNSQQEKIDSIEDHVNSAAVNVEEGTKNLGKAAKYKLAALPVAGALIGGVVGGPIGLLAGFKVAGIAAAVGGGVLGFTGGKLIQRRKQKMMEKLTSSCPDLPSQSDKKCS	804688	752960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_759761_760501_760589_768381_768433_768508_768625_780339_780566_794650_794717_803199_803386_804614
869673	contig_2027_pilon	+	2952	22	Intergenic	novelGene_39888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	408.246146460408	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	198	2771	122795	136487	FALSE	35	GAATTATTAACCCAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDGMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR	114032	136668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_114230_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126341_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073_136175_136351
869675	contig_5023_pilon	+	1708	4	Intergenic	novelGene_7376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2736	junction_3	376.273245867356	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	15	404	631542	646990	FALSE	5	TGCTGTATTTTTGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	631527	648294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_631550_639072_639197_643413_643539_646857
869676	contig_12057_pilon	+	2766	21	Intergenic	novelGene_131624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_1	39.1645247641281	359	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	105	2105	99524	161653	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRKPPRVRANHRDFQLRNLRIIEPNEVTHSGDPGSETDGRMAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99419	162314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_114853_114943_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
869677	contig_7057_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_123405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2265	2576	1312178	1312489	NA	10	TTATTTTTGTTGTGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKHCVSPMRSLSGVLAKLSAANHKVSGSNPPATPREKDVAVCFHKDLQPWKLYGAVLLCPMNQLDGSGFICAYIASCSNINTQVNDLVYFYRKIADTLYISL	1309913	1312696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1309900_1312700
869678	contig_10727_pilon	-	2934	2	Intergenic	novelGene_159655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	1115	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	68	892	102848	96537	FALSE	25	CTTGTAATTTGATGGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLRGGRKVVSVTGLVFGGAVAMLSVAARSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQASVPPTSEPPVLDLKRPFLSRESLSGQAAGRPLVASVGLNVPASVRYSHTDIKVPDFSDYRRAEVLDSTKPSKESSEARKGFSYLVTAATTVGVAYAAKNVVSQFVSSMSASADVLAMSKIEIKLSDIPEGKNMAFKWRGKPLFVRHRTQKEIEQEAAVEMTKLRDPQHDLERVKKPEWVILIGVCTHLGCVPIANAGDFGGYYCPCHGSHYDASGRIRKGPAPLNLEVPSYEFTSDDLVVVG	102915	94494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10727_pilon_-_97148_102634
869679	contig_9183_pilon	-	2251	8	Intergenic	novelGene_40329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	499.366292292092	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	191	1144	323783	320713	TRUE	35	CATTTGATATGAAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTPRKGHLQRHRPMKTQQQIVLLKHLPRTRGSRSTFQS	325948	311853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_322843_322942_323834_325808
869680	contig_14513_pilon	-	5493	5	Intergenic	novelGene_70223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCCCAGAATTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17238	8343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_8546_9057_10341_10441_12121_14012_14278_15174
869681	contig_3975_pilon	-	2403	8	Intergenic	novelGene_54806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_6	220.569948181561	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	226	1044	2021058	2016940	FALSE	15	CTATTTTCCTGTTTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKGGLGWART	2021739	2015580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001_2021144_2021599
869682	contig_13592_pilon	+	2728	15	Intergenic	novelGene_33706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	515	2443	256608	269322	FALSE	20	TTTCAAGAAGTCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249303	269607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
869683	contig_12019_pilon	+	1394	2	Intergenic	novelGene_87681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTTTCTCAAATAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5176	8643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_6226_8298
869684	contig_16103_pilon	-	1656	7	Intergenic	novelGene_118851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	236	589	735970	723350	FALSE	15	ACCCTCTGACCTGCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEGLSTFGNNI	743593	722282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
869685	contig_2069_pilon	+	1952	14	Intergenic	novelGene_23268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	330.732198284728	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	218	1060	333898	341321	TRUE	5	CCTGGCCTCCTTTATCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324085	344285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332216_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342621_343554_343652_343766
869686	contig_7963_pilon	-	1949	5	Intergenic	novelGene_58280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1215.48570538695	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCCATGCTCTTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43805	37061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40194_43736
869687	contig_7963_pilon	-	844	6	Intergenic	novelGene_58322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	412	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	66	386	48838	40037	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGPIWSIMETGPSRSW	48903	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40081_43638_43819_48741
869688	contig_15087_pilon	+	2020	21	Intergenic	novelGene_37191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	299	607	110940	114589	TRUE	10	GGGCGGGCTGGGGCGACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQSGLVMETGSQQGCASKLEILVLTTTDSQQGLQEVSGGVALNGLVERCVIFLNEFPPDIQQVDLTPGDHDPGESLLIRASALSWICKVCRQKKRGLFLTL	110641	181181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116908_118079_118173_118902_118919_126034_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133527_134810_134896_136587_136665_138314_138374_139527_139650_141726_141787_143036_143087_149652_149716_150479_150574_158909_158954_181067
869689	contig_6871_pilon	-	5408	8	Intergenic	novelGene_21593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	99.8132950941458	440	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	137	1456	366974	352338	FALSE	65	CAAAACAAAACAAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPPPPPPPPGPPPPPTFSQANTVQPKLSRDEQRGRGALLQDICKGTKLKKVTNINDRSAPILEKPKGSSGGYGSGAAALQPKGGLFQGGVPKLRPVGAKDVSENLAGKPALQASSSRAAAPRPPVSSASGRPQDDTDSSRASLPELPRMQRPSLPDLSRPNTTSSTGMKHSSSAPPPPPPGRRANAPPTPLPVHSSKTPAYNREKPLPPTPGQRLHSGREGPPAPPPVKPPPSPVNIRTGPSGQSLAPPPPPYRQPPGVPNGPSSPTNESAPELPQRHNSLHRKTPGPVRGLAPPPPTSASPSLQSNRPPPPARDPPSRGAAPPPPPPMIRNGARDAPPPPPPYRMHGSEPLSRGKPPPPPSRTPAGPPPPPPPLRNGHRDSITTVRSFLDDFESKYSFHPVEDFPAPEEYKHFQRIYPSKTNRAVRGAPPLPPILR	386370	348385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_352379_352603_352706_353354_353562_361109_361767_362343_362461_363149_363283_366911_367044_386303
869690	contig_11493_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_143723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTTAGTTTCTCATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337328	335796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_335800_337300
869691	contig_11171_pilon	+	4931	1	Intergenic	novelGene_48631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCATTATATTGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432234	437165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_432200_437200
869692	contig_5586_pilon	-	4045	5	Intergenic	novelGene_143568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1025	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTATTGACCCAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431580	389182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_391238_392797_392875_392971_393126_416879_417011_429952
869693	contig_13074_pilon	+	2393	3	Intergenic	novelGene_153424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_2	739	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	140	604	403694	451174	FALSE	35	ACACCTGAAGTTGTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403554	452963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002
869694	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_12104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_1	3406.65341647782	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27534	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
869695	contig_8658_pilon	-	1546	8	Intergenic	novelGene_55800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1298.57909788714	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	425	1195	34654	6049	FALSE	15	GCAGTGTGATGTCTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQQLLICCRSEHKIWSPLVTEEGKRHPYKMNLASEPQEVLHIGSAHNRSAMPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNAQKLPMCDKCGTGIVGVFVKLRDRHRHPECYVCTDCGTNLKQKGHFFVEDQIYCEKHARERVTPPEGYDVITVFPK	55581	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6236_6700_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34660_35886_36092_36512_36674_55528
869696	contig_11574_pilon	-	2687	12	Intergenic	novelGene_64072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.144136901477	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	236	2038	456525	449849	FALSE	20	TAGAAGGGCGCTGTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQVDVKEWNTRVEHRLCR	463690	449199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450246_450392_450808_450906_451025_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463503
869697	contig_7182_pilon	-	2767	5	Intergenic	novelGene_117097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	403.792876980266	52	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTCTGTAAACTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174134	90896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347_102457_173356
869698	contig_8330_pilon	-	3656	14	Intergenic	novelGene_71736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	38.2735405381504	30	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	482	1624	526197	515388	FALSE	30	ATTAACTGAACCTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSDWHLAVKLADQPLAPKSILRLPETELGEYSLGGYSISFLKQLIAGKLQESVPDPELIDLIYCGRKLKDDQTLDFYGIQPGSTVHVLRKSWPEPDQKPEPVDKVAAMREFRVLHTALHSSSSYREAVFKMLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGVLQDKDLFSVFADPNMLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	566386	513355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520379_520465_521229_521313_524730_524851_526013_526227_527956_528062_549835_550001_566111_566265_566357
869699	contig_6738_pilon	-	3720	18	Intergenic	novelGene_166135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_3	95.3121624164423	314	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	889	2670	354	3023	95744	54735	FALSE	50	CTAAAACTCAGCTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSLNDSTHISLQEENQPSVSHCLPDTSIITEEGLFSQKSFLILGFSNENETNIENIIRENAGKIVSLQSRTVADYAVVPLLGCEVEATVGEVVTNTWLVTCIDYQILIDPKSNPLFMPVPVMTGTTPLEDCVISFSQCAGAEKDSLTFLANRLGASVQEYFVRKSNAKKGMFASTHLVLKEPSGSKYEAAKKWNLPAVTIAWLLQTARTGKRADESYFLIENLPKEEQSLETEIMSGVNLNPNPAEHPDARLETHRRTAVTPLDMNRFQSKAFQAVISQHTGQVSDALTTGQPLQKEPSLHLDTPSKFLSKDKLFKPSFDVKDALAALETPRGLSQQKRKLSTPLSEVIVRNLKLALANSSRNAVTLSASPQLKDAQSKKEEVPKPLHKVVICVSKKLSKKQSELNGIAASLGADYRWSFDETVTHFIYQGRPNDTNREYKSVKEKGIHIVSEHWLLECAQEFKHLPESLYPHTYNPKMSLDISAVQDGRLCNSRLLSANSTTKDDEPDHLPLEEKDTNNMSITNKESAASNGSGKNDTKGALTQTLEMRQNFQKQLQEIMSATSIVKPQGQRNSLSRSGCNSTSSTPDSTRSVRSGRSRVLEALRQSRQTVPDINTEPSQNEQIIWDDPTAREERARLASNLQWPMCPTQYSELQVDVKKLEDSPFQEPLHDSEIAEQAVCDPGNLCVTEAPKHHLTSEELETPIKDSHLIPTPQAPSIAFPLANPPVAPHPREKVITVEETHEDLKKQYIFQLSSLNPQERIDYCHLIEKLGGLVIEKQCFDPNCTHIVVGHPLRNEKYLASVAAGKWVLHRSYLEACRTAGRFMPEEDYEWGSSSILDALTGINVQQRRLALAAMRWRKKIQQRQETGIVEGAFSGWKVILHVDQSREAGFKRLLQSGGAKVLPGHSVPLFKEATHLFSDFNKQKPDDSGVNIAEAAAQNVYCLKTEYIADYLMQESPPHVESYCLPEAVSFLQNNKELGPGLSQKRKVPTEKNKIKRPRVH	96764	54037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_54879_60311_60474_60653_60744_62317_62456_63256_63421_66376_66489_66724_66895_67713_67935_69268_69462_80068_80172_80289_80437_81038_81163_84765_84876_84968_85143_92060_92348_93655_93868_95625_95799_96465
869700	contig_5696_pilon	+	4395	1	Intergenic	novelGene_117586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTAATGGGCTACCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735199	739594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_735200_739600
869701	contig_13952_pilon	-	3437	8	Intergenic	novelGene_133256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_7	131.154061146051	799	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	511	1437	180960	162555	FALSE	35	AGAGAATTGATGAGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSSGHRLRDVEHHPLLTENENYDSSSSSSSEADTADRVWFIRDGCGMVCAVMTWLLVVYADFVVTFVMLLPSKDFWYSVINGVVFNCLAVLALSSHLRTMLTDPGAVPKGNATKEYMESLQLKPGEVIYKCPKCCCIKPERAHHCSICKRCIRKMDHHCPWVNNCVGEKNQRFFVLFTMYIALSSVHALILCGFQFFSCVRGQWTECSDFSPPITVILLIFLCLEGLLFFTFTAVMFGTQIHSICNDETEIERLKSEKPTWERRLRWEGMKSVFGGPPSLLWMNPFVGFRFRRLQTRTRKGGPEFSV	187355	160554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_162732_165769_165901_166964_167047_167521_167619_169525_169651_180645_180968_183053_183140_186938
869702	contig_16098_pilon	-	1520	10	Intergenic	novelGene_45982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1282.60689396418	1104	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	163	1395	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNICFHRFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354151	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349242_349622_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
869703	contig_12624_pilon	-	1439	8	Intergenic	novelGene_61045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1154.11406078694	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	168	428	903621	900246	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSEAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEK	903788	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874141_900242_900333_903447
869704	contig_13481_pilon	+	2230	6	Intergenic	novelGene_119562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	661.335618275623	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTCCTTATGTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569281	1587829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1569364_1576151_1576348_1576596_1576633_1576704_1576791_1578050_1578132_1586080
869705	contig_10930_pilon	+	2396	3	Intergenic	novelGene_37102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	16032	junction_1	1435	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTTTGTGTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339421	342107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803
869706	contig_7338_pilon	-	3638	1	Intergenic	novelGene_156802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACTGTTTTACAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284993	281355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_281400_285000
869707	contig_4364_pilon	+	3419	1	Intergenic	novelGene_4562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTAAGCTTCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534946	1538365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1534900_1538400
869708	contig_19179_pilon	-	3008	3	Intergenic	novelGene_142359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2420	2758	11041	8686	TRUE	55	AGAACAAATAAAATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALADEEGLILGCSHSRPTNGLLFILMEVSRLNVLPCLGTSGLGSNCEGNENGSECRLVNSLPAQGSPGLKEPTGTLGIGRGSHDSPRRLEGTGGSLSLEGQSPGVQGRGRL	13460	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_8484_8567_8947_10963
869709	contig_12964_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_131660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACTGAGAGGGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134614	135374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_134600_135400
869710	contig_12540_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_148091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAAAAAAAAAGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961279	960278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_960300_961300
869711	contig_16870_pilon	+	3535	1	Intergenic	novelGene_155493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	90	302	104553	104765	NA	10	CTGCACCTCTCTTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATFRPAPAFGATVLVFHLLAAPVAPEPAMSGPNGDLGMPVEAGAEGEDDGFGEAGDREGQLKLPLPLQGCPPGDGNWGQVWSLEGTEEPSSLPSLGEC	104463	107998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104500_108000
869713	contig_5039_pilon	+	3655	2	Intergenic	novelGene_65049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1059	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1817325	1823209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1820337_1822565
869714	contig_19185_pilon	-	6600	1	Intergenic	novelGene_163646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	341	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCACTCCTTTGATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123959	117359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_117400_124000
869716	contig_18869_pilon	-	149	2	Intergenic	novelGene_56471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTAATATTTGGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206003	205359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_205453_205947
869717	contig_17737_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_72907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCAACGTGTTCGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55386	51547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_51500_55400
869719	contig_5321_pilon	-	4672	1	Intergenic	novelGene_153871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54082	49410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_49400_54100
869721	contig_7695_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_41658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTACCAAATTCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867703	868298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_867700_868300
869723	contig_17171_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_147376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTTGTTTGGTGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305426	303857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_303900_305400
869724	contig_9183_pilon	-	2096	8	Intergenic	novelGene_40333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	512.697070124538	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	190	963	323783	322804	TRUE	35	CATTTGATATGAAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLLPQPRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLWPDPLQPQGRGTYNAIVQ	326007	311853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315278_315493_318244_318347_320557_320727_322743_322868_323073_323834_325868
869725	contig_17144_pilon	-	2153	12	Intergenic	novelGene_29390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2144.66761376996	2	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	432	1862	174965	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPIQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183202	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172661_174901_175001_175973_176271_181794_181850_183158
869726	contig_3942_pilon	-	927	7	Intergenic	novelGene_128700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	104	436	430070	429465	TRUE	25	GGACGCGGGGTGAAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIQKSLFKEFPFSTILRGARFLILGWDSESGLHGMCRSYPGAKSWQSKKWRQLGFYGRHWKQTSLWDLVPIWQTSGFSLTWYKWQTRLRSSSCSLMGFPLTTTQGTYLWGGCRASVSWALTCMSCVPRSPIAHSVMVSEDTSGA	430173	426582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426698_427973_428157_428244_428321_428491_428601_429456_429606_429797_429858_429938
869727	contig_10583_pilon	-	6223	26	Intergenic	novelGene_167909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	100	junction_1	83.9104284341345	351	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2880	388	3267	206694	119826	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSLSVYSEDGWDLPYVIHLWPAILLRNLLPYKIAYYIEGIEHRVFTLNEGCSAQICTAELDKAKLHLKLLDYLNHDWKSEYHIKPNQQDIGFINFTCVTEIEKTDLDIAVHVTDNTGQVVVAFHSPYWMVNKTGRMLQYKADGIHRKHPPNYTKPVLFSFQPKHFFNNNKVQLMVTDSELSDQFSIDTVGSHGAVKCKGLNMEYQVGVTIDLSSFNITRIVTFTPFYMIKNKSKYCISVAEEGNEKWLSLDLEQCIPFWPEDASNKLLIQVERSQGPPKKIYFNKQENCILLRLDNELGGIIAEVNLAEHSTVITFSDYHDGAATFLLINHTKDDLVEYKQSSLSKMEDFLPPGKAVFYTWADPAGSRKLKWKCGKSHGEVTQKDDMMTPINMGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPRVFKVTYESEKAELAEQEIVLALQNVGISLVNNYTKQEVAYIGITSSDAVWETKPKKKARWKPMSVKQTEKLEKEFKEYTESSPSEDKIIELDTNVTVHLTPSGSNMKILQPHVIAIRRSCLPALKVEYSTSAHQSSFRVQIYRIQIQNQIHGAVFPFVFYPIRPPKSVTMDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQISRIKYFKVLIQEMDLRLDLGFVYALAELMAEAEVTEKTEVDLFHKDIEAFQEEYKTVSLVDTSQVSLYEYFHISPIKLHLSVSLSSGREEAKDSNQGGGLIPVHSLNLLLKSIGATLTDVQDVVFKLAFFELNYQFHTTPELQSEVLRHYSKQAIKQMYVLILGLDVLGNPFGLIREFSEGVEAFFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGLKALVGGAVGGLAGAASKITSAMAKGVAAMTMDEDYQQKRREAMNKQPAGLREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFFKGVGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIKRATETSGEVESLRPPRFFNEDGVIRPYRLRDGTGNQMLQVIENGRFAKYKYFTHVMINKTDTLMITKRGVLFVTKGTFGQLTCEWQYSFDEFTKEPFIVHGRRLRIEAKERVKSVFHTKEFGKIINFKTPEDARWILAKLEEAREPSPSP	210286	116869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_119877_121728_121804_124675_124800_128330_128417_146013_146129_154280_154405_154501_154548_154861_155026_155107_155184_156200_156315_157203_157286_158507_158654_159945_160060_166459_166566_167431_167502_168165_168248_168447_168595_169111_169266_172626_172860_179017_179148_194976_195111_195499_195629_205327_205475_206197_206303_206568_206965_210169
869728	contig_10235_pilon	+	2226	7	Intergenic	novelGene_46423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	206.674462218566	4	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	20	739	210483	212152	TRUE	35	ATGAAAACGAATGTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHHIPTMALVLQLLLLSGTQGDPRAFLEGRPGDRVNLSCVGVSHPIRWAWAPSFPACKGLSKGRRPILWASASGTPTVPPAQPFAGRLRALDPGIRRLELLLSAGDSGTFFCKGRQEDESRTLLHVLEDGADCRPPHRPTYPQLLIPLLGAGLALGLGALGVARWLRRRSPPHQLRPLSRFAPLVKAVKAEPQRPIMKEEPKLPGDPDQEPSLLYADLDQMALRSPRRLSPAVPADASTIYAVVV	210463	213691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_210538_210706_211046_211193_211285_211662_211704_211834_211924_212047_213179_213230
869729	contig_5690_pilon	+	2448	10	Intergenic	novelGene_119723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_1	399.746586393597	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1251	2063	1078679	1105490	FALSE	35	TCTTTTCAAAAAATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELSQDNTGRVKRLPPIVRGGAIDRYWPTADGRLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044681	1105875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1078720_1086391_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
869730	contig_4654_pilon	-	1763	9	Intergenic	novelGene_103048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	467.308098982887	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	501	1472	430591	408221	FALSE	20	ACATATTTTCAGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQCDSPHVVKYYGSYFKNTDLWIVMEYCGAGSVSDIIRLRNKTLTEDEIATVLQSTLKGLEYLHFMRKIHRDIKAGNILLNTEGHAKLADFGVAGQLTDTMAKRNTVIGTPFWMAPEVIQEIGYNCVADIWSLGITAIEMAEGKPPYADIHPMRAIFMIPTNPPPTFRKPELWSDNFMDFVKQCLVKSPDQRATATQLLQHPFVKSAKGVSILRDLINEAMDVKLKRQEAQQREGDQDDEENSEEDEMDSGTMVRTVGDDMGTVRAASTVSDGANTMIEHDDTLPSQLGTMVINAEDDEEEGTMKSKILINYTKCSDKLYIF	440354	407929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_408461_409127_409257_414183_414322_415913_416082_424963_425129_428134_428250_430574_430704_434570_434652_440047
869731	contig_11370_pilon	+	3032	14	Intergenic	novelGene_98704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	63.9998150884903	134	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	6	2258	120655	130710	FALSE	5	GCCAGCCTCCGGCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMMMVGRNSRPRGLPHPHLHPLLHLHPHLPPLEPVGRAGRGEALFGGPGGASELEPFSLSSFPDLMGELISDDAASIPAPAPQLSPALSTITDFSPEWSYPEGGVKVLITGPWTEATEHYSCVFDHIAVPASLVQPGVLRCYCPAHEVGLVSLQVAGREGPLSASVLFEYRARRFLSLPSTQLDWLSLDDNQFRMSILERLEQMEKRMAEIAAAGQVPCQGPDTPPIQDEGQGPGFEARVVVLVESMIPRSTWRGPECLAHGSPFRGMSLLHLAAAQGYARLIETLSQWRSVETGSLDLEQEVDPLNVDHFSCTPLMWACALGHLEAAVLLFRWNRQALSIPDSLGRLPLSVAHSRGHVRLARCLEELQRQEASIEPPLAPSPPSSSPDTGLSSVSSPSELSDGTFSVTSAYSSAPDSSPPPVPLPASEITMEEMVPGQLSSGTPEAPLLLMDYEATNLKGPQPSPQPFPSAPEDGAAPEEADSLPTVDVIPVDMISLAKQIIEATPERIKQEDFVGLPEAGAPLRERTGAAGLSETMSWLASYLENVDHFPSSAPPSELPFERGRLAIPPAPSWAEFLSASASGKMESDFALLTLSDHEQRELYEAARVIQTAFRKYKGRRLKEQQEMAAAVIQRCYRKYKQFALYKKMTQAAILIQSKFRSYYEQKRFQQSRRAAVLIQQHYRSYRRRPGPPHRPTGTLPARSKGSFLTKKQDQAARKIMRFLRRCRHRMRELKQNQELEGLPQPGLAT	120649	131484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_120958_122291_122419_123463_123599_125564_125681_126328_126514_126818_126898_127098_127322_127520_127826_128911_129109_129361_129546_129742_129815_130096_130285_130470_130546_130646
869732	SIRV6	+	1428	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	18	32	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869733	contig_14441_pilon	+	1968	9	Intergenic	novelGene_100359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	316.36803627263	722	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	742	1788	26678	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTGAMLCGNQAQHFGEGTRLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	23051	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_23565_23796_25816_25950_26652_26781_26886_27189_113646_113711_116578_116963_117220_117344_117539
869734	contig_9871_pilon	+	327	5	Intergenic	novelGene_75707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2412	junction_1	937.54386564043	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	267	60	326	572939	582927	FALSE	45	AGGGCGAGAAAGAAATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLKKLQKCNSKS	572879	582928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_579914_579992_581756_581826_582912
869735	contig_3103_pilon	-	3048	2	Intergenic	novelGene_146199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCGAAAGAACACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143894	83006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_85722_143561
869736	contig_6589_pilon	+	1216	2	Intergenic	novelGene_25973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	19460	junction_1	0	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296199	1297585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1297096_1297265
869737	contig_5791_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_35839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAATTTTGTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042830	1044960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1042800_1045000
869738	SIRV6	+	1462	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	48	18	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	602	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869739	contig_10765_pilon	-	2402	5	Intergenic	novelGene_122840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	658	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1960	2259	18497	15716	FALSE	15	CAGGAAGGCCGGTTTCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLQQIRSFAFVPLRRTSSFEINGGYRDPIIPSFLLDSAEVSSSMMGENPGLLSWFQSFVVWSTDEFFSMTQGFHFHLSIRHLTLQLCIDLYLLIKTF	35451	15572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15765_18246_19515_28912_29038_32030_32126_34729
869740	contig_9921_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_23725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGAGATTGGAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113065	114287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_113100_114300
869741	contig_12019_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_87775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTCAGCGAACACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716025	718369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_716000_718400
869743	contig_8063_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_152437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCAACTTCGTGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666710	664377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_664400_666700
869744	contig_253_pilon	+	4280	1	Intergenic	novelGene_129629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	446	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	72	1481	167509	168918	NA	20	AATTTGGCCAGTGTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASNRKSSVGVKKNSKSRTLTRQSMSRIPASSNSTSSKLTHINNSRVPKKLKKPAKPLLSKIKLRNHCKRLEQKTASGKLEMGNLVLKEPKVVLYKNLPIKKDKEPEGPVQAGAAGGCLTRHAAREHRQNSARGARARAEGSPCSYVTRRAVRTRMSLKEASDLKPDPDGVDGLRDGAAAPRADGGEQPAPGLQEEDLAPESAQKGDTKCPKSDTGMSRKKSRQGKLGKQFAKMEESAPGRDSPGKDSVGPDVPGFHSDQGERSGPGGAPAGYTDCAPSPVGCSIVTSDSFKTKDSFRTAKSKKKRRITRYDAQLILENNSGIPKLTLRRRHDSSSKTNDQEKDGMNSSKISIKLSKDHENDNNLYVAKLNNGFSSGSGSSSTKLKIQLKRDEEGRGSYAEGLHENGVCCGDTLSLLESRMEVDDYSQYEEESSDESSSSGGGGEEGDYDDDFEDDFIPLPPAKRLRLIVGKDSIDIDISSRRREDQSLRLNA	167437	171717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_167400_171700
869745	contig_567_pilon	+	2913	6	Intergenic	novelGene_33954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1851	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCAACGGTCTCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306662	338345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_308951_309473_309604_312029_312080_313587_313708_331028_331099_338090
869746	contig_15991_pilon	-	903	6	Intergenic	novelGene_70878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2882.23707560638	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	7	834	105081	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQVSPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105087	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102234_103579_103703_104975
869747	contig_854_pilon	-	2392	2	Intergenic	novelGene_36133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1400	1972	471014	470442	FALSE	0	GCCTGGGGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	473939	470021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586
869749	contig_7748_pilon	-	4323	1	Intergenic	novelGene_101060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTACTTATACCTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187200	182877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_182900_187200
869750	contig_9243_pilon	-	2058	11	Intergenic	novelGene_60315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.307500959221	56	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	12	872	64617	20056	TRUE	40	AAAACACCACTTTTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64628	18818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_19505_19555_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
869751	contig_16934_pilon	-	4316	2	Intergenic	novelGene_132533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	0	116	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2175	2492	199344	199027	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLECSSLFNCISYFLDINLLVYICMLYWFCFCGEHSLRHTVTGNIGDGGCFISLGPGERRHEAEFLADSGQVARVILILYGRKRFLKLEEKCENEDRRPELSAI	208148	197202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_201390_208019
869752	contig_16098_pilon	-	1517	11	Intergenic	novelGene_45970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1469.42610906435	122	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	325	1392	350768	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIVLTRASSASLRLLQLLPPPPRLLPPPFGESLSSLGSSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352241_353990
869753	contig_12886_pilon	-	5605	11	Intergenic	novelGene_135501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_10	153.543348927917	1729	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	542	1774	626364	592899	FALSE	10	GATGTGATTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSQRQRDELNRAIADYLRSNGYEEAYSVFKKEAELDMNEELDKKYAGLLEKKWTSVIRLQKKVMELESKLNEAKEEFTSGGPLGQKRDPKEWIPRPPEKYALSGHRSPVTRVIFHPVFSVMVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHSGKLLASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSTISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHEHFVTSLDFHKTAPYVVTGSVDQTVKVWECR	659550	589067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_592973_594073_594231_596156_596259_597389_597619_598329_598433_600459_600629_605606_605814_607030_607106_607260_607346_626332_626554_659198
869754	contig_13633_pilon	+	1902	11	Intergenic	novelGene_15306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	452.436117037533	20	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	54	1166	20259	49038	FALSE	65	TTAAAAAAAAATTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLAGDPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRCRLTLYR	5025	49774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_49014
869755	contig_6589_pilon	-	3954	1	Intergenic	novelGene_26164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	948	1262	1888217	1887903	NA	15	TCAGCTCTTCAGGACGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFNQPPSRTDKDQEEAAETHRDEEHLGQVRFCPSPRNELQTGGGDLVPIPVLTPQRMKMNLNFSVNPTTFQEQSPPGPLKDPMSLVCEWEKITLFHLGWWQR	1889164	1885210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1885200_1889200
869756	contig_2438_pilon	+	1286	5	Intergenic	novelGene_112039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	66	665	310588	312871	FALSE	50	ATTTGAAATAAAGAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305100	313492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
869757	contig_9582_pilon	-	3927	4	Intergenic	novelGene_106842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_2	61.908534683569	887	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	80	475	444970	440554	FALSE	25	GAGAGTGCTACAGATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVAMETDDAGNRLRFQLELEFVQCLANPNYLNFLAQRGYFKDKAFVNYLKYLLYWKEPEYAKYLKYPQCLHMLELLQYEHFRKELVNAQCAKFIDEQQILHWQHYSRKRMRLQQALAEQQQQNNTSGK	445049	437101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_440747_443601_443699_443992_444071_444942
869758	contig_1107_pilon	-	3645	1	Intergenic	novelGene_126539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126490	122845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_122800_126500
869759	contig_20670_pilon	+	3684	1	Intergenic	novelGene_144834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGGGAAAGGGGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48765	52449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_48800_52400
869760	contig_10404_pilon	+	3016	1	Intergenic	novelGene_138695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACTTAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131947	1134963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1131900_1135000
869761	contig_12622_pilon	-	2368	13	Intergenic	novelGene_5967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2353.80519791299	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	20	1552	1590968	1586655	TRUE	35	CCTTCAGAAGCGAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTATLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPFSWPHGSPHCWPF	1590987	1583553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583857_1585365_1585470_1585553_1585697_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
869762	contig_5997_pilon	-	3996	1	Intergenic	novelGene_168621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340419	336423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_336400_340400
869763	contig_14680_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_132739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTATCTACTTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7071	5391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_5400_7100
869764	contig_7356_pilon	+	3370	3	Intergenic	novelGene_60386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1596	1895	434090	434389	TRUE	0	CGCCCCGCCCCGGCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQTKPVCLMELTCQVKAHVNLETEQLTAASNKSDRKLPSAFHYFLLGIKCSTSCLPHFPCESVSRTITLGYSFTKVNSTHKARIFLLLYFTHCSNLQH	432494	457955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_435620_437471_437532_457770
869765	contig_3747_pilon	-	751	1	Intergenic	novelGene_24982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTGGCAGCCAGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269299	268548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_268500_269300
869766	contig_5153_pilon	+	6882	19	Intergenic	novelGene_74335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_16	159.396130891593	619	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1041	3126	62	3187	633333	670172	FALSE	20	GAAGGTTTGGCGGATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLLLRHQKSRQSDPPGKLPMQPPLNSMSSMKPTLSHSDGSFPYDSVPWQQSTNQPPGSLSVVTTVWGVTNTSQSQVLGNPMANANNPMNPGGNPMASGMTTSNPGLNSPQFAGQQQQFSAKAGPAQPYLQQGMYGRPNYPGSGGFGASYPGGPNAPAGMGIPPHTRPPADFSQPAAAAAAAAVAAAAATATATATATVAALQETQNKDINQYGPVCSSFQMGPTQAYNSQFMNQPGPRGPASMGGSMNPASMAAGMTPSGMSGPPMGMNQPRPPGISPFGTHGQRMPQQTYPGPRPQSLPIQSIKRPYPGEPNYGNQQYGPNSQFPTQPGQYPTPNPPRPLTSPNYPGQRMPSQPSTGQYPPPTVNMGQYYKPEQFNGQNNTFSGSSYSNYSQGNVNRPPRPVPVANYPHSPVPGNPTPPMTPGSSIPPYLSPSQDVKPPFPPDIKPNMSALPPPPANHNDELRLTFPVRDGVVLEPFRLEHNLAVSNHVFHLRPTVHQTLMWRSDLELQFKCYHHEDRQMNTNWPASVQVSVNATPLTIERGDNKTSHKPLHLKHVCQPGRNTIQITVTACCCSHLFVLQLVHRPSVRSVLQGLLKKRLLPAEHCITKIKRNFSSVAASSGNTTLNGEDGVEQTAIKVSLKCPITFRRIQLPARGHDCKHVQCFDLESYLQLNCERGTWRCPVCNKTALLEGLEVDQYMWGILNAIQHSEFEEVTIDPTCSWRPVPIKSDLHIKDDPDGIPSKRFKTMSPSQMIMPNVMEMIAALGPGPSPYPLPPPPGGTNSNDYSSQVPPALLFGAPLARCECRPAPEANLLSPGVHRGSAGASEPALLGAQLPPLSWSFPGCCSRTHGPGALSPSLHGVFTAPVPAALPPTLGQSPGNNYQGHGNFDFPHGNPGGTSMNDFMHGPPQLSHPPDMPNNMATLEKPLSHPMQETIPHAGSSDQPHTSIQQGLHVPHPSSQAGPPLHHSGAPPPPPPPSQPPRQPPQAAPSNHPHSDLTFNPSSALEGQAGAQGASDMPEPSLDLLPELTNPDELLSYLDPPDLPSNSNDDLLSLFENN	633271	673867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_633386_644887_645003_645916_646135_647159_647359_648252_648544_651909_652093_654779_654858_655467_655643_656373_656516_659082_659294_660404_660511_661503_661665_662646_662715_662989_663059_663502_663748_663956_664227_664846_665014_668265_668533_670064
869767	contig_12638_pilon	-	2574	8	Intergenic	novelGene_33240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGAGCCACTGCCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755153	737183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_737349_737573_737686_739518_739558_745279_745387_746398_746524_750459_750674_751877_752019_753482
869768	contig_9982_pilon	-	3696	4	Intergenic	novelGene_55719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	58.0650975677778	84	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	3284	3694	254599	250701	FALSE	50	ATTTTTGTTAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNPESERRSVSDCRLVHKAHLKPGAVIVLVAELLYSLQWCEELDNPPAFLTEFCEMLQRMNITYRHLCALGDTSGLLKLIFSRSKANGTLWSLIIIKLVFSGSITSEDVKHHYRNSEDSFFPLTEGNLHTIQSLC	258295	250698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_250750_252711_252820_254345_256327_256739
869769	contig_19061_pilon	+	4092	1	Intergenic	novelGene_173499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATCTTACAGTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19598	23690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_19600_23700
869770	contig_5484_pilon	+	4929	1	Intergenic	novelGene_151112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	426	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGATAAAGTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342665	347594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_342700_347600
869771	contig_5686_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_45342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTTGCCCATAGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120505	117845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_117800_120500
869772	contig_7171_pilon	+	899	2	Intergenic	novelGene_101436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591342	1594779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1591949_1594486
869773	contig_17074_pilon	+	2989	11	Intergenic	novelGene_145204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_6	212.667369382329	1221	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	87	1490	841610	861409	FALSE	40	TCTTTTAATAAATATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLRYRRASQAWRESWGGSLGSGRPRATMDRRKKALDVTTSSLVDLKAELFRKQEEFKQEKLLKDSGVSGKPKTTHKKPSIWSKQNAGVSNRAEKDAEQKIEEQKTLDKAREKLEEKAKLYEKMTKGDFIDEEVEDMYLVDFTQKIIDKRKEMDTFSANRDSRKAEEREDEEENLSERDVPPPQDSSEEWVDYVDSLGRSRRCMKKDLPDLLEMDKNLQGRLFISPANEKTLLSEDMRKELQRQQWEEEEREALKRPMGPIHYEDIRENEARQLGVGYFAFARDKELRNKQMKTLEMLREQTTDQRTKRENIKEKRKAMLEARLAKLRQKKMKKSKEDGAEKENGDEDVIGHLPPEPEALPTPPTAAQSSKVEVIVQERKDTKPGVPHVREWDRGKEFSFGNWSKRQSALRAERDPEFAPPSDYFTGQKRTGPFGGQRWSRPGPAQSGLGPVSGQSHQPPSSHASSTPASDGPPQAPTITFETLDDMISYYKQVT	841523	862908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_841652_843132_843238_843963_844065_849757_849817_851928_852107_855183_855280_856366_856510_856977_857073_857795_857929_859871_860025_861110
869774	contig_8330_pilon	-	4229	1	Intergenic	novelGene_71876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTAACAGTTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959255	955026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_955000_959300
869775	contig_8122_pilon	+	1887	13	Intergenic	novelGene_40242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_3	1002.06948015372	982	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	124	1212	720281	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKQDPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKKSAVRPRRSEKTLKTREDIVALFPVPEGAPSVHHPLLTSSWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGKMRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720157	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720321_725248_725296_726997_727066_730176_730294_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
869776	contig_804_pilon	-	2883	5	Intergenic	novelGene_138779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	596.425760258559	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	260	613	36578	33688	TRUE	15	TATTACTGAGGTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIVRVKRYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAKSKSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQCCTTCVVQ	36934	21030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_22735_22996_23523_33647_33967_36503_36665_36761
869777	contig_5125_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_43484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTACCTCAGTTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151970	149235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_149200_152000
869778	contig_16411_pilon	-	4403	1	Intergenic	novelGene_77381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAACTCATCTTCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351165	346762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_346800_351200
869779	contig_9183_pilon	-	2156	9	Intergenic	novelGene_40297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	508.540558854454	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	145	1101	323783	320713	TRUE	20	TGAAATCCATGTTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCESPVARPPAAPRKGHLQRHRPMKTQQQIVLLKHLPRTRGSRSTFQS	325962	311844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_315391_315448_315493_318244_318347_320557_320727_322743_322868_322964_323834_325868
869780	contig_8057_pilon	-	5642	3	Intergenic	novelGene_176639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	14	169	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	955	1956	34486	33485	FALSE	50	AATAAAGATTGTAATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTNDTCSGPDEENTDFRYFIYAVTYTIILVPGLIGNILALWVFYGYMKETKRAVIFMINLAIADLLQILSLPLRIFYYLNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIYFLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQKYDIYVSIAGWLIICLACLLFPLLRTSVDIPGNRTKCFVDLPTKNVNLAQSVAIMTVGELIGFITPLLIVLYCTWKTVLSLQNKYPVAQDLGEKKKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVKSNKIKNCVARRVILIFHSVALCLASLNSCLDPVIYYFTTSEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKFFVSNHTTSTMTAELC	131036	29798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_35273_116415_116509_130961
869781	contig_366_pilon	-	2248	10	Intergenic	novelGene_51592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_7	698.853735204926	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	569	1399	780147	757099	FALSE	30	CTGTTTCTGTAAGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKCLESPVGKRKRSMTVSTSQDPSFSGLNQLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803465	756249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_774322_774407_776793_776893_780057_780185_802934
869782	contig_14754_pilon	+	3627	7	Intergenic	novelGene_174847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	9.30949336251263	220	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	122	1510	151457	161484	FALSE	0	TCTCCTTGTGTGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKANLKKEIISQFHCSAAEGDIAKLTAILSHSPSLLNETSENGWTALMYAARNGHPEVVQLLLEKGCDRSIVNKSKQTALDIAKFWGYKHIANLLANAKGGKKPWFLTNEVEECENYFSRTLLDRKSEKRNNSDWLLAKESHPATVYILFSDLNPLVTLGGNKESFQQPEVRLCQLNYTDVKGYLAQPEKITLIFLGVELEMKKELLSYAEEVPKEEEDGLVAWFALGIGQIAAEEFKQRHENCYFLHPPMPALLQLKEKEAGVVAQARSVLAWHSRYKFCPTCGSATRIEDGGYKRVCLKEDCPSLYGVHNTSYPRVDPVVIMQVIHPDGTKCLLGRQKRFPPDMFTCLAGFIEPGETIEDAVRREVEEESGVKVGHVRYVSCQPWPMPSSLMIGCLAVAVSTEIKVDKNEIEDARWFTREQVIDVLTKGKQQAFFVPPSRAIAHQLIKHWIGMNANL	148576	163601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14754_pilon_+_148692_151450_151663_152506_153097_156315_156484_157576_157691_160172_160373_161373
869783	contig_2733_pilon	-	5325	2	Intergenic	novelGene_128552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551825	546196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_546879_547182
869784	contig_8866_pilon	-	2235	4	Intergenic	novelGene_77782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	615.540051950769	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	814	1002	348954	342321	FALSE	10	TAGGGTTGGTTCTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLAPCAPRPSLARAGRSGEQGSRLKAVVSPFHSPPSTPSSPSVWSRSSEPEEVPVSFDQPPEGSHLPCYNKVRTRGSIKRRPPSRQFRRSQSDCGDLGNFRAAESSQENGAKEENGDEVFTSKSKAPGPPPSSDSAVGKEVRRSLELDQKPPLRRTSSWTEKREEKGGSAEDTKQWEKAAVHSVEEERQSTAQEEATEPPRASSPKAENGCGSPTEEITAGEEVETEESTEVKEEKAGNEEDKSEQTSQDTKKQEERATGEEHPPKPSGEMEGGNASEQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	418212	341087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349552_352283_352427_418139
869785	contig_2547_pilon	+	2524	4	Intergenic	novelGene_165457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_1	110.94443053469	915	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	41	661	6235	27503	FALSE	30	ACCAATAAACTTCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLHPLVKTLQQKMAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENVPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRADQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKMEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL	6194	29366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_6349_8410_8620_13687_13863_27380
869786	contig_5791_pilon	-	2387	9	Intergenic	novelGene_35861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	365.512995664997	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	365	1870	1088908	1079821	FALSE	30	AATTATTGCTGTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094508	1079303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1089007_1090618_1090729_1094352
869787	contig_9609_pilon	+	2514	8	Intergenic	novelGene_23047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_7	590.421364582196	45	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	36	959	435608	454062	TRUE	65	GAAAAAAAATACCAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRRPGRADGGMGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGVGAGPLGRGGACPK	435572	456266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454634_455282
869788	contig_9668_pilon	-	2245	12	Intergenic	novelGene_58179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	842.319230428947	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	147	1889	605373	503644	FALSE	20	TTTCCTGAAAGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKDLNLALPSPMVRFPRLHILLVLFSLRSRDRWNHPRITCQPLVTRTSKRPEPITFPSPASRRLHLYDDHQTPAAVRCYPPSPRVPPESSQPRQTIFCRPRRRRPWKRSISRSRLRLRPRIFTKHPRTLCLPHRLRLPGSWGLYCLLPRPHPPSPLNPGSCPTLSPESYPFHQRGKRTRVHPAGEKVGSKILCQIS	610490	503287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344
869789	contig_15087_pilon	+	2148	21	Intergenic	novelGene_37172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1471	1989	139580	148985	TRUE	15	GTTGCTCCGGGAGGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMSSSLRETMMRIRVLSRVPRPWKRTSGRTHSQHKLLKVPGQLPSDAGFDRLPCGLQIFVKHQPKMLLAAISQDVNELGLICSPFQFSCLVQVPGHPAVPSPRSRHRPSPWCPRQQDHKHLLEVARGVANDVGFQISFIGIFVCFHQLVDLLIGPGSQDLNEALLISTNA	110641	149669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114538_114591_116811_116908_118079_118183_126034_126086_126675_126762_127609_127667_132603_132727_133442_133520_134801_134896_136587_136665_138314_138366_139526_139662_143023_143133_144010_144105_145208_145275_146902_146977_147978_148069_148981_149099_149623
869790	contig_14530_pilon	+	3865	3	Intergenic	novelGene_108455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_2	51	429	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	106	540	59966	76215	FALSE	40	AAACATGAACTTGAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLWRRRYGKQSGPCVRVPAALRVLSPHFSAVNGGGMEHEGSGSSGGSAGLLQQILSLKLVPRVGNGTLCPNSTSLCSFPEMWYGVFLWALVSSLFFHVPTGLLALFTLRHHKYGRFMSVSILLMGIVGPITAGILTSGAIAGVYRAAGKEMIPFEALTLGTGQTFCVVVVSFLRILATL	59860	79540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_60099_72817_72989_76084
869792	contig_2537_pilon	+	2465	9	Intergenic	novelGene_33425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_8	266.216547194197	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1683	2441	232453	239846	FALSE	75	GAAAAAAGAAAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLAKCLRYYIADRLNNDPGWKNLTVILSDASAPGEGEHKIMDYIRRQRAQPNHDPNTHHCLCGADADLIMLGLATHEPNFTIIREEFKPNKPKPCGLCNQFGHEVKDCEGLPREKKGKHDELADSLPCAEAEFIFLRLNVLREYLERELTMASLPFTFDVERSIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDRLVNIYKNVVHKTGGYLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDENMWILYF	230770	239870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_232531_233323_233397_233548_233600_234070_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239822
869793	contig_11304_pilon	-	3190	2	Intergenic	novelGene_156688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGAAAACAATAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294678	284504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_284922_291905
869794	contig_9054_pilon	+	1648	2	Intergenic	novelGene_160682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGATAAGTAATATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510228	514855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_510616_513594
869795	contig_20727_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_152574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACTGTGTAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25703	24851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_24900_25700
869796	contig_546_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_117225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTTGGAGTTAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141940	142911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_141900_142900
869798	contig_7362_pilon	-	4216	7	Intergenic	novelGene_147547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	52.1837032883724	349	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	110	538	361604	350684	FALSE	30	GAAAGGACTTGTAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESLVVCDVAEDLVEKLRKFRFRKETNNAAIIMKIDKDKRLVVLDEELEGISPDELKDELPERQPRFIVYSYKYQHDDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNKLVQTAELTKVFEIRNTEDLTEEWLREKLGFFH	361713	347005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_350756_352538_352613_353836_353920_354566_354617_355284_355335_356980_357078_361601
869799	contig_6233_pilon	-	3633	8	Intergenic	novelGene_74796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_6	243.009028134969	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	311	1150	149777	143464	FALSE	30	TTCAGGACAAAACCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	140980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
869800	contig_14441_pilon	+	1131	7	Intergenic	novelGene_100590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	357.331623130236	12307	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	518	946	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111199	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112106_112154_112558_112665_113185_113209_116578_116963_117220_117344_117539
869801	contig_14441_pilon	+	1318	3	Intergenic	novelGene_100578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	756	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	386	646	116728	117123	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATSPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	111198	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_116535_116963_117097
869802	contig_14441_pilon	+	861	6	Intergenic	novelGene_100593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.223608922637	16	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	387	626	116728	117560	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATNEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGAVQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111200	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113162_113209_116578_116750_116888_116963_117220_117344_117539
869803	contig_1443_pilon	-	3191	15	Intergenic	novelGene_28253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	51.3436302509565	26	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	103	780	560906	556760	TRUE	10	GCACTGTTATCCTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYALTHPDTVEGLVLINIDPNAKGWMDWAAHKLTGLTSSAPEMILGHLFSQEELSGNSELVQKYRNIVVHAPNLENIELYWNSYNK	562611	553134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_554098_554339_554392_554555_554592_554842_554891_555155_555208_555499_556868_557043_557101_557335_557423_557984_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
869804	contig_14287_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_24055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	884	1261	22217	22594	NA	15	TCAATCCTCAGGGCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCILFLMFDEFLMHLTVVSTRLAVFRSTAFTTPSQWPVDKSLLALDFADNLFECSTMLVETLVIAAAVPSPIPVAESDRLTPAVTGARAKPRMVRTPEKALTELATTQEMVQSLCVLSTLSARA	21333	23621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_21300_23600
869805	contig_12866_pilon	+	2551	4	Intergenic	novelGene_174642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.892279039209	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	114	383	675032	684533	TRUE	20	CACCTTTGGGAATACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFHDKRAIDLLQWSKDTYSPDEHFWVTLNRIPDVPGSMPNASWTGNLRAVKWSDMEGKHGGCHGHYVHGICIYGNGDLKWLINSPCLFANKFELNTYPLTVECLELRLRERTLNQSETAIQPSWYF	637591	687745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_637691_675017_675111_684342_685460_686503
869807	contig_5649_pilon	+	2288	9	Intergenic	novelGene_82263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	90.1830603550356	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	646	1209	28327	34768	FALSE	25	CCACTGTCTACTAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQGFASGDGNRDAWAVRHFIEQGIDVCLCQSYAKNMGLYGERVGAFTVVCVDADTAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIASTILTTPDLRKQWLQEVKGMADRIISMRTQLVSNLKKEGSSHSWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGVTSSNVGYLAHAIHEVTK	12698	35847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_12868_21101_21259_23146_23276_25342_25403_25897_25999_28297_28451_28928_29095_33635_33787_34645
869808	contig_3721_pilon	+	3859	13	Intergenic	novelGene_123818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	184	junction_11	204.1361711919	399	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1140	3423	147	3569	160666	213144	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPRNSLSKDTVQDITTSWDALSQNKAALRHIENKLEVAPTSTAVFDSVMDTKKSSANATRKISRKDGRYLDDSWVNASTSKSSKSRKEKSRSPLRATTLESNVKKNNRVEFRDPLVSYREIHGVPSNLSSNHLESKLIYCVDANEEKTESGNRMIRDREEQNMCCCDFESSQSSVINDTVVRFLNDRPAIDALQNSECLIKMAAPLRTEEEKPNRSKGSENNLKASVSNMSHEVDPKVLRLTDSSPSSTSTSSSQRLDILKRRQHDTKLEKLKERIRKQWEHSEETNGQGQNLGHSDHPVVVVNVDSSVTAKVRKVATAPPAPAYKGFNPSETKIRTPDGKIWQEAEFQNMSRELYRDLALHFADDISIKEKPAEKSKEKKVVKPVRKVQKAMQLSSPECKTGSSRLISTSSWRDGQKLVKKILGPAPRMEQKERRTVSSDRSGRERTTKSGSHIGRAESDPRLDVSHRRLPQSSERSRSRARSENNIKKLAPSLPDNKQEEATALNKDFLPVEIRGILDDLQLDSVTQTTRQETGELQNQKLSAPGQAPRSHSPVKRKPDKITANEDPPVISKKRHYDTDEVRQYIVRQQEERKRKQNEEKKAQKEATEQKNKRLQELYRKQKEAFTKVKNVPPSEPSATRRLQETYSKLLLEKTLLEEPSHQQHATQETQARPGYQPSGESDKENKVQERPPSASSSSDMSLSEPPQPLARKDLMEPTWMQPDRLSPRVHHSQPQPLVGTAGNLLSHLLSLEHVGILNKDFESILPTRKNHNMASAPLTFTPQTYLTSPAAHPDALLKPSASQYKSKLDRIEALKATAASLSSRIESEAKKLAGANINYGSLWNTECDMQQAPQEDEPWTKAISPPVKEDTEDVFSARIQKMLGTCVSHATFDNDLPGVGNLSEFKKLPEMIRPHSAISSFRMRSPGPKPEGLLAQLCKRQTDSSSCDVQACSQDKAKMSHGSSTDSISEGPLLSEGSLSEEEGGRDGRPLLKVAEILKEKEFCAGERNTYEPIKEFQKEAEKFLPLFGHIGGTQSKGPWEELAKGSPHSVINIFTKSYQLYGKGFEDRLERGASALRPLNTIKTPLSSVSYEDDFVSSPESGTLTEKKSALEFTVGIQEEHSSRKSAYLSSVDVTSQHSSGAHSAASSRSSTSSKGKKGKKEKIERKWNSAWELDSLTTDFVVVI	157746	213434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_157786_158873_158918_160602_160718_161889_162050_165770_166394_171035_171150_175886_176001_179731_179879_181838_182501_183427_183550_197644_198706_211141_211293_212927
869809	contig_8594_pilon	+	4571	1	Intergenic	novelGene_140001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1105	3318	9	3326	74278	77595	NA	10	AGCTGTTATTGCTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIGVAGLSAAVSEKQEFYQLLKNLINPSCMVRRQAEEIYESIPGLCKTTFLIDAVRNRRAGYEVRQMAAALLRRLLSSGFEEVYPNLPPDVQRDVKIELILAVKLETHASMRKKLCDIFAVLARNLIDEDGTNHWPEGLKFLIDSIYSKNVVLWEVAIHVFWHFPGIFGNQERHDLDIIKRLLDQCIQDQEHPAIRTLSARAAAAFVLANENNVALFKDFADLLPGILQAVNDSCYQDDDSVLESLVEIADTVPKYLGPYLEDTLQLSLKLCGDSRLSNLQRQLALEVIVTLSETATPMLKKYTNIIAQAVPHILAMMVDLQDDEDWVNADEMEEDDFDSNAVAAESALDRLACGLGGKVVLPMTKDHIMQMLQSPDWKYRHAGLMALSAIGEGCHQQMESTLDEMVNSVLHFLQDPHPRVRAAACSTLGQMATDFAPSFQKKFHETVIAALLRTMENQGNQRVQSHAASALIIFIEDCPKSLLALYLDSMVKNLHSILVIKLQELIRNGTKLALEQLVTTIASVADTIEEEFVPYYNIFMPSLKHIVELAVQKELKLLKGKTIECISHVGLAVGKEKFMQDASNVMQLLLKTQSDLNNTEDDDPQISYMVSAWARMCKILGKDFQQYLPLVIEPLIKTASAKPDVALLDTQDVENMSDDDGWQFVNLGDQQSFGIKTSGLEAKATACQMLVYYAKELREGFVEYTEQVVKLMVPLLKFYFHDNVRVAAAESMPFLLECAKINGPKYLAQMWQFICDPLIKAIGTEPDADVLSEIMNSFAKSIEVMGDGCLNDEHLEELGGILKAKLEGHFKNQELRQVKRQEENYDQQIEMSLQDEDECDVYILTKVSDILHSLFSTYKEKILPWFEQLLPLIVNLICSSRPWPDRQWGLCIFDDIIEHCSPTSFKYVEYFRWPMLLNMRDDNPEVRQAAAYGLGVMAQFGGDDYRSLCSEAVPLLVKVIKCANSKTKKSVIATENCISAIGKILRFKPNCVNVDEVLPHWLSWLPLHEDKEEALQTLSFLCDLIENNHPVVLGPNNSNLPKIISIIAEGKINETINYEDPCAKRLANVVRQVQTDEELWLECVSQLDKEQQAALQGLLNFA	74269	78840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_74300_78800
869810	contig_9668_pilon	+	2615	6	Intergenic	novelGene_58103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	653	junction_3	218.78610559174	66	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	124	993	214129	342854	FALSE	25	CAGTACTTTGCAACATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIPGGRAGRRFVSGLRGARSLRGPCCRCLFNGRGSDAEGWKMAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPGTLFINPFLICIYELYDERLN	214005	344476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688
869811	contig_17373_pilon	+	2966	14	Intergenic	novelGene_177144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_11	80.3668364586218	295	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	318	1952	40691	75541	FALSE	35	AGGTTACGTGACCGAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKEHASQVLVRRRRANVLFEERKGGNLERECIEELCNKEEAREIFENDPETDYFYPKYLVCLGSFRAGLFTASRQSTNAYPDLRSCVTAIPDQCNPLPCNEDGYMSCRDGQATFTCICKSGWQGEMCEFDINECKNPANTNGGCSQICDNTPGSYHCSCKSGFVMLSNKKDCKDVDECVVKPDICGSVVCKNIPGGFECECPEGYRYSPVSKSCEDVDECSEHMCAQLCVNYPGGYSCYCDGKKGFKLAQDQKTCEVVPLCLPLNLDKNYELLYLAEQFVGVVLYLRFHLPEITRFSAEFDFRTYDSEGIILYAESLDHSAWFLIALRDGKIEIQFKNDETTKITTGGKVINDGLWNMISVEELEHSVNVKIAKEAVMNINKPGSLFKPTNGFLETKVYFAGLPRKMENALIRPINPRLDGCIRGWKLMNQGASGVKEIIQEKQNKHCLVTVEKGSYYPGSGVAQFSINYNNIANPEVWQINGTLNIRPSTGTGVIFALVSGETVPFALSLVDSTSGKFQDFQVSVENTVICWIQAINLCSSQQFHLEFKVNRHNLELWNPFEKDTFCSGDLQSQLAILDKAMKGTVFTYLGGIPDVPFGATPVNAFYNGCMEVNINGVQLDLDEAIFKQNDIRAHSCPSVLKNTDSS	23861	76555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17373_pilon_+_24020_27863_27889_38031_38119_40643_40767_40863_40996_44808_44935_46935_47058_49030_49147_56081_56272_61035_61204_62482_62652_66395_66545_69256_69483_75380
869812	contig_17427_pilon	-	2137	9	Intergenic	novelGene_30367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	948.620972781015	1	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	13	1056	188879	178046	FALSE	30	GTTAATACCAAACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEPLIAEVGYCLSPKPWYEEQEQSNCRSFTALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188891	176964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179928_184564_184613_186417_186496_188038_188140_188767
869813	contig_10339_pilon	+	2158	4	Intergenic	novelGene_125261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	80.3838015744189	782	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	255	1328	328740	329813	FALSE	55	GAAATAAAACTAAAGCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCGEIDHSINMLPTNRKTNESCSNTAPSLTVPECAICLQTCVHPVSLPCKHVFCYLCVKGASWLGKRCALCRQEIPEDFLDKPTLLSPEELKAASRGNGEYAWYYEGRNGWWQYDERTSRELEDAFSKGKKSTEMLIAGFLYVADLENMVQYRRNEHGRRRKIKRDIIDIPKKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292248	330643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292335_308602_308709_312115_312177_328738
869815	contig_7629_pilon	-	4506	7	Intergenic	novelGene_153572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_3	29.6516816086748	374	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	9	1922	330427	310507	FALSE	15	CCCATGATGTCAGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINRLDSICQTVLKGKWPSARRSCDTNTVASFYTTKLLDSPGAATEYSEPSAPTPPGAGVKEEHDQSPQMLKVKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDSEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLINFPKCTPVSGTSIQSTLGANGVILDNQPIVKKRRGRRRNVEGVDILFFNRNKPPNHVTIGITTSQISAGINPALSYTQPQGIPDMESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGEVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGISKAAAAAAAAAANATSVSGSPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPASLSSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEEKKGNDSKELEGKKERTESQNSENGGENSVSGSPSTSSSAALNTAAAANPLALNPLLLSNILYPGMLLTPGLNLHIPTLSQSNTFDVQKNKNSDLGSSKSVEVKEEDSRVRDQEDKGGTEPSPVNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSNED	330435	307922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_311392_313925_314031_319585_319715_323659_323882_324185_324326_329260_329430_330163
869816	contig_10930_pilon	+	152	1	Intergenic	novelGene_37053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGCATAGATGCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274152	274304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_274200_274300
869817	contig_500_pilon	+	1457	10	Intergenic	novelGene_31024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1119.73718256772	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	199	648	1492663	1496605	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWRSDRHPHHGAPRCPLGN	1485752	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1496547_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
869819	contig_16098_pilon	-	1676	11	Intergenic	novelGene_45953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1469.42610906435	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	166	1551	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352746	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_352582
869820	contig_5434_pilon	-	3335	12	Intergenic	novelGene_74657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.309715889479	396	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	121	1566	282075	258608	TRUE	40	TCTATAAAAGGTATAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAPTPQATSFPAEGRCGYYVEKKKRFCRMVVAAGKRFCGEHAGAAEEENARKRILCPLDPKHTVYEDQLAKHLKKCNSREKPKPDFFIQDINAGLKDETEIPEQLVPISFLSEEQLENLIKKLRKASVGLNSTLKDQIMSHPVLHDALNDPKNGDSATKHLKQQASILGNIEKLKLLGPRRCFVEFGAGKGKLSHWVDIALKDAEKVHFILVEKVTTRFKVDGKHRKKNSVFERLQIDIQHLCLNKVPLLIEEKLPVVGIGKHLCGVATDLALRCLLETYAASCEERNEEPLAKRIKNDKTETEINTLAKEGSEKNVPEKWTPVAGIVIALCCHHRCDWRHYVGKEYFRALGLGAVEFHYFQRMSSWATCGMRKTSLEASNITTKKKDNQNDEHEVHDDDGYRIADDSADSLPGFLTIGEKKKIGHLCKLLIDQGRVQYLQQKGFSPALQYYTDPLVSLENVLLTALPSHSSSPEAVA	282195	256519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_257654_257972_258804_259095_259529_262817_262893_273748_273822_275490_275659_276013_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
869821	contig_11258_pilon	+	1895	8	Intergenic	novelGene_67770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	203.008092731018	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	33	791	278958	291355	TRUE	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENAGGPAASVGGVLTGGLGNGAETDKIC	278925	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285691_285772_288195_288270_291348_291387_291794_291915_292450
869822	contig_13097_pilon	+	2192	20	Intergenic	novelGene_107695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_14	522.939120835038	105	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	239	2086	184733	264394	FALSE	45	AGTATAAAAAGGTAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGYIPRSGIAGSNGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184494	264500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_230747_230784_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
869823	contig_8848_pilon	+	2678	3	Intergenic	novelGene_140450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	26.5	650	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGATTGTCCACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49746	61163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_49895_56826_58825_60631
869824	contig_12677_pilon	+	263	2	Intergenic	novelGene_110876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGATTCGGGGAAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2953	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2961_3261
869825	contig_7426_pilon	-	2925	2	Intergenic	novelGene_27541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	221	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATATGTCAAAGATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089686	1085921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1087154_1087993
869826	contig_6048_pilon	-	3681	2	Intergenic	novelGene_73227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2263	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	713	1027	1784349	1784035	TRUE	15	GCGGAGGCTGCGACTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSCIILKSSQSQSLNLRKKKKIGFVIPVNHFQMLRGRTQHCSLGMEINQRKPHPPPTPHLFSSIACTSGFCNGTKAAKLPSTRSSGGVQLSGTFTLARGGAF	1785061	1755930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1756138_1781587
869827	scaffold_12124_pilon	+	2199	9	Intergenic	novelGene_22043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	547.052085614341	1520	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	264	755	846536	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829599	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
869828	contig_12869_pilon	+	3091	1	Intergenic	novelGene_75347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCTGCGTGGCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81569	84660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_81600_84700
869829	contig_14925_pilon	-	1674	5	Intergenic	novelGene_55333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
869830	contig_11631_pilon	-	823	1	Intergenic	novelGene_104171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTCATGATGGGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40398	39575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_39600_40400
869831	contig_8027_pilon	-	4146	1	Intergenic	novelGene_158837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCAGGATCCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256643	252497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_252500_256600
869832	contig_8978_pilon	+	2562	14	Intergenic	novelGene_49462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	230.028297718953	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1498	2331	1755032	1765143	TRUE	15	TTAGCCTGAGGGAGTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNG	1680826	1772373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1754683_1754906_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765144_1770477_1770554_1772218
869833	contig_18231_pilon	+	3524	1	Intergenic	novelGene_105883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATCATCAGGCCTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239493	243017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_239500_243000
869834	contig_17936_pilon	-	917	5	Intergenic	novelGene_29971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	58	435	126099	121018	TRUE	30	TTCAACTGCATAGCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVKGLLEKGRPSSVAQGKGVYRKPKLDPGSHAACSKQQS	126156	111002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_111170_114805_114932_118633_118823_121017_121060_125763
869835	contig_10003_pilon	+	957	2	Intergenic	novelGene_88143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTACAAGAATGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370758	372363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_370842_371489
869836	contig_3817_pilon	+	2196	6	Intergenic	novelGene_78297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	114.966081954636	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	259	1002	117223	130515	FALSE	40	CTGAATATTAAAACCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVTVLIVKADSRIRLLWCLLFLLAVEKHSPTAKHFFQLQTLQSENSNLRKQATTTIYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSARGSRPMSMYETGSGQKPYLPMGEVNHPEESRTRLQPFPAHIGRSALVTSSSSLPSFPSTLSWSRDESTRRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	116964	131709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_117328_119354_119445_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869837	contig_3817_pilon	+	2718	18	Intergenic	novelGene_78280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_14	481.219069019031	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	113	2008	77948	130515	FALSE	15	TCCATTTGGCCATGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	77835	131225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113197_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869838	contig_3817_pilon	+	2598	18	Intergenic	novelGene_78282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_14	480.026239190545	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	77	2017	77948	130515	FALSE	25	TAGCTACTCTATCCCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	77871	131096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869839	contig_3817_pilon	+	2640	19	Intergenic	novelGene_78284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_18	519.537187205005	2	32	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	38	2062	77948	130324	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQTLQSENSNLRKQATTTIYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSARGSRPMSMYETGSGQKPYLPMGEVNHPEESRTRLQPFPAHIGRSALVTSSSSLPSFPSTLSWSRDESTRRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDRNPSPTW	77910	130902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_117078_117328_119354_119445_123626_123710_124545_124735_130302
869840	contig_3817_pilon	+	2692	19	Intergenic	novelGene_78279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_15	491.446378773795	85	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	113	2302	77948	130515	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQTLQSENSNLRKQATTTIYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSARGSRPMSMYETGSGQKPYLPMGEVNHPEESRTRLQPFPAHASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	77835	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_117078_117328_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869841	contig_3817_pilon	+	2834	1	Intergenic	novelGene_78303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	2033	2503	130104	130574	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLLSQNASASLTRRTARLPVEKVHGKTASHCMEHTELFAEERLSLAFGCLPSSSWPMAVFLSLETQVRHGEDFPPFTDIQCLPPAVRVQEDPPWGPWLPHGHSASHSAGHPVRVRHCQGRQAAGHHHHQREQQLKSGALSLLSSRLFKVRFQI	128071	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_128100_130900
869842	contig_3817_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_78304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	384	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAAGAATTGAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128598	130889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_129819_130302
869844	contig_3817_pilon	+	2421	19	Intergenic	novelGene_78286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_14	494.871379348983	13	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	1	2031	77948	130515	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKIGRSALVTSSSSLPSFPSTLSWSRDESTRRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	77947	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_119354_119445_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869845	contig_3817_pilon	+	2369	18	Intergenic	novelGene_78285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	547.20369998142	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1303	1788	113140	130324	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKIGRSALVTSSSSLPSFPSTLSWSRDESTRRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDRNPSPTW	77934	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99439_100453_100561_110568_110712_113091_113242_119354_119445_123626_123710_124545_124735_130302
869846	contig_3817_pilon	+	2735	20	Intergenic	novelGene_78283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_17	495.98825493198	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	66	2345	77948	130515	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAFAVRGPLVPRGWEVGAMSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQTLQSENSNLRKQATTTIYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSARGSRPMSMYETGSGQKPYLPMGEVNHPEESRTRLQPFPAHIGRSALVTSSSSLPSFPSTLSWSRDESTRRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDDMGSSRKGRQRSTVWQGDSSAPNATEPHAAPSPSLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFPKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECRKTLPGDPGSPTDIQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTKENNN	77882	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_117078_117328_119354_119445_123626_123710_124545_124735_129754_129819_130302
869847	contig_3817_pilon	+	1048	5	Intergenic	novelGene_78300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.5307546792262	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119413	130903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_119446_123401_123545_123626_123710_124545_124735_130302
869849	contig_19352_pilon	+	4130	21	Intergenic	novelGene_122408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	15	junction_1	263.437938611734	521	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	13	2241	301821	413516	TRUE	20	ACGTATGTTTGAGTTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKLMCLRQCKFFRVLKNTLRTKKKFYLQDTKSSNGTFINSQRLSRGSEESPPCEILSGDIIQFGVDVTENTRKVTHGCIVSTIKLFLPDGMEARLRSDVIHAPLPSPVDKVAANTPSMYSQELFQLSQYLQEALHREQMLEQKLATLQRLLAITQEASDTSWQALIDEDRLLSRLEVMGNQLQACSKNQTEDSLRKELIALQEDKHNYETTAKESLRRVLQEKIEVVRKLSEVERSLSNTEDECTHLKEMNERTQEELRELANKYNGAVNEIKDLSDKLKVAEGKQEEIQQKGQAEKKELQHKIDEMEEKEQELQAKIEALQADNDFTNERLTALQEKLIVEGHLTKVVEETKLSKENQARAKESDLSDTLSPSKEKSSDDTTDAQMDEQDLNEPFAKVSLLKDDLQGAQSEIEAKQEIQHLRKELIEAQELARASKQKCFELQALLEEERKAYRNQVEESTKQIQVLQAQLQRLHIDIENLREEKDKEITNTRDELLSARDEILLLHQAAERAASERDTDIASLQEELRKVRAELERWRKAASEYEKEIVSLQNSFQLRCQQCEDQQREEATRLQGELEKLRREWKVLETECRSLRKENVSLSSELQRQERELHNSQKQSLELTSDLSILQMTRKELENQVGSLKEQHLRDSADLKTLLSKAENQAKDVQKEYEKTQTVLSELKLKYEMTEQEKQSITDELKQCKDNLKLLREKGNNPSILQPVPAVFIGLFLAFLFWCFGPLW	301808	416771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_301884_338292_338441_353879_353953_358378_358416_360032_360096_363527_363624_363867_363940_365721_365863_366778_366917_368028_368198_385251_385312_389173_389255_389539_389600_398844_398968_400345_400421_403190_403512_403960_404079_407221_407394_411413_411549_413432_413523_414888
869850	SIRV6	+	1033	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	0	164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869851	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	40	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869853	SIRV6	-	1070	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8770	405	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATCGCTGCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11317	1139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
869854	SIRV6	+	1074	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	14	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869855	contig_1443_pilon	-	2205	10	Intergenic	novelGene_28271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	579	junction_5	465.004128482934	2965	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	227	1150	776427	748649	FALSE	40	CAGCTGCAGAATGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809519	747593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805224_808694_808741_809399
869856	contig_11285_pilon	+	2109	13	Intergenic	novelGene_5580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	480.923041891551	2	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1044	1793	768710	769878	FALSE	15	AACTGTCTCTTGACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	763521	770194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766052_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768055_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
869857	contig_7230_pilon	-	2406	8	Intergenic	novelGene_52546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	407.230967909477	2479	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	115	681	177508	134622	TRUE	35	TCTGGGAATAATGAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCVIWWSQHLGKYLRFTFPAFRALPPPSRVGVPGRRCEMSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177622	132806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_133112_133201_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
869858	contig_11752_pilon	+	1511	9	Intergenic	novelGene_37602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	107	1225	84194	105616	FALSE	35	ATATAAAGATGTCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84087	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
869859	contig_9183_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_40337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	866	junction_1	213.916806258882	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	95	1093	322898	312131	FALSE	50	TACCATAAATAAAGTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	322992	311879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743
869860	contig_5586_pilon	-	3169	1	Intergenic	novelGene_143541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	397	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGGGTGGGGAGACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335306	332137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_332100_335300
869861	contig_2027_pilon	+	3085	22	Intergenic	novelGene_39896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	399.135630708009	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	195	2759	122795	136356	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAHSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVSAYTGPLIEDFLSGFQVVVLTNTPLQDQLRVGEFCHSRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDPNGEQPLSAMVSMVTKDSPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFSEVQGMIELNGNQPIEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYVRGGIVSQVKVPKKISFKSLQASLAEPDFVLTDFAKYSRPAQLHIGFQALHQFCVQHGRPPRPRNEEDASELVALAQSVNAQALPAVQQDNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPMNAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPVMQWLYFDALECLPEDKEALTEDKCHPRQNRYDGQVAVFGSDMQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKVLG	117792	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_117987_122794_122912_123038_123098_123198_123368_123462_123598_124591_124699_124919_125011_125121_125255_125769_125868_125966_126114_126258_126436_126592_126698_126785_126867_127222_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134465_136351
869862	contig_5485_pilon	-	3428	17	Intergenic	novelGene_37763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_15	60.5650476760318	363	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	136	3042	561200	527702	TRUE	60	AGTAGGATTAAAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRRAGSRERGPPRGPGSRERGLGRPDFGRDRGPYRPEPGDGGEKMYPYHRDEPPRAPWNHGEERGHEEFPLDGRNAPMERERLDDWDRDRYWRESEHEYQDDTIDQYNREDRFSAPPPRSHDGERRGPWWDDWERDQDMDEDYNREMDRDLDRDVDRIGRPMDMYDRNLDNEWDRDYGRPLDEQESQFHERDIPPIPSLPNLPPLPPLDRYRDDRWREERNRDHGYDRDFRDRGELRIREYPERGDTWREKRDYVPDRMDWERERLSDRWYPSDVDRHSPMAEHMPSSHHSSEMMGSDANLDSDQGLGGVMVLSQRQHEIILKAAQELKMLREQKEQLQKMKDFGSEPQMPDHPPPQESSRLQNTASRPGMYPPPGPYRPPPPMGKPPGSIVRPSAPPARSSVPVSRPPVPIPPPPPPPPPPPPPPVIKPQTSGVEQERWDEDSFYGLWDTNDDQGLNSEFKSENAAIPSGPVLPLPPVHPSIPPPGPMPMGMPPMSKPPPVQQTVDYGHGRDISTNKVEQIPYGERITLRPDPIPERPTFETEHTGQRDRYDRDRDREPYFDRQSNIMTDHRDFKRDRETHRDRDRDRGVIDYDRDRFDRDRRPRDDRTQSYRDKKDHSSSRRGGFDRPSYDRKSDRPAYEGPSMFGGERRTYPEERMSLPAPSLSHQPPPASRVEKKPESKNVDDILKPPGRESRPERIVVIMRGLPGSGKTHVAKLIRDKEVEFGGPAPRVLSLDDYFITEVEKEEKDPDSGKKVKKKVMEYEYEAEMEETYRTSMFKTFKKTLDDGFFPFIILDAINDRVRHFDQFWSAAKTKGFEVYLAEMSTDNQTCGKRNIHGRKLKEINKMADHWETAPRHMMRLDIRSLLQDAAIEEVEMEDFDANIEEQKEEKKDAEEEESELGYIPKSKWEMDTSEAKLDKLDGLRTGTKRKRDWEAIASRMEDYLQLPDDYDTRASEPGKKRVRWADLEEKKDADRKRAIGFVVGQTDWEKITDESGHLAEKALNRTKYI	561335	526997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_527348_527665_527849_538950_539082_544036_544089_547271_547353_549453_549538_549824_549909_549995_550173_550407_550528_550816_550880_551430_551586_552478_552598_553081_553278_553493_553587_553698_554117_557588_557713_560337
869863	contig_776_pilon	+	3416	5	Intergenic	novelGene_139916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_3	54.4167942826477	779	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	97	543	789262	831508	FALSE	55	AGAAGTTGTACAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFEQIPRKDWYSVLGADPSASVSDLKEKYQKLILMYHPDKQSADVPAGTVEECIQKFIEIDQAWKILGNEETKKEYDLQRHEDDLRNIGPVDARVYLEEMSWNKDDHSFSLSCRCGGKYSISKNEVEEVDLISCDTCSLIVELLHYS	788167	834381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_788228_789225_789370_813729_813869_826685_826755_831377
869864	contig_15304_pilon	+	1030	3	Intergenic	novelGene_30495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	2	592	52883	53680	TRUE	40	GAGCAAAGAAGACAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGHTGHGKGDSFLAWLLPWGPGQVVVLGQLLGPVPPAHQHVLGAESTHHACQCHQFVQRQLLRRWWQQVDLGWEAVPCRRENRYGAGWGGHSGCSLTVSGLSFHSVNWGGSPKPEELGWGKAWECALPTRAPAHLSFWKWWQIGSQPRGGWQCRRSSSHSSRAPCSQEGCWTRYSSHRSLAQVPSVRHLSHLRSAR	52881	54297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_52889_53095_53813_53991
869865	contig_15991_pilon	-	4740	2	Intergenic	novelGene_70956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	130	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	115	1179	182356	181292	FALSE	55	AAACTGAAATTCAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYTLQPNVTETDYYYPDVFSSPCDGELIQRGSNFLLAIFYCFLFVFSLLGNSLVILVLITRKKLKSITDVYLLNLALSDLLFVLSFPFLTHYRLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFFSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYAMKVRTASVGTALSLVVWLTAITATSPLLVFYQVASEDGSLQCYSSYNQQTLKWKIFTYFEINILGLLIPFTILIFCYISILHQLRGCQNRNKTKAIRLVLIVVIASLFFWIPFNVVLFLTSLHGMHILDGCVMSQQLIYATHVTETISFTHCCVNPVIYAFMGEKFKKHLSEIFQKSCSYVFVCIRKRVSKEGWERSSSFHQQSSRSSSIDYIF	183505	177730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_182371_183405
869866	contig_8589_pilon	-	3021	5	Intergenic	novelGene_107352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	54.2281061812046	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	43	540	16686	2831	FALSE	25	AGGAGAGTCTTGATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGEARAVAGAAGAMEPLYQQTHKQVHEIQSHMGRLETADKQSLHLVENEIQARIDQIFSHLERLEILSSKEPPNKRQSAKLRVDQLKYDVQHLQTALRNFQHQRCAREEQERQREELLSRTFTPNGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKRAFQDKYFMIGGMLLTCVVMFLVVHYLT	16728	349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_2993_8839_8973_9819_9929_11589_11655_16657
869867	contig_13707_pilon	-	3297	9	Intergenic	novelGene_43559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_1	537.30518271742	6	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	15	788	275268	272785	TRUE	35	ATATTTACAAAAGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEVGALLIWFRCIPYNNTDCPQIF	275282	269693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_271626_271738_271895_272363_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197
869868	contig_17144_pilon	-	592	3	Intergenic	novelGene_29187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	25	378	167257	166282	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLW	167281	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_166501_166843_167248
869869	contig_8866_pilon	-	2570	7	Intergenic	novelGene_77771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	453.453201064405	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	194	736	418087	349046	TRUE	20	ATTTCAGATGTGTGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKLGPWARAVPQPSGTGLAEPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVSPFHSCSAFSRGGAPEHSPGGGHRTTPSLQPKGREWVWEPHRGNHGWRGSGDGRIYRSEGGEGRK	418280	340766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349231_352399_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
869870	contig_5711_pilon	+	2672	12	Intergenic	novelGene_80257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_8	33.9072629290369	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	103	2067	52529	122172	FALSE	50	AAATAACTTGAATGAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALGSSSGSPSPAVAELCQNTPETFLEASKLLLTYADNILRNPNDEKYRSIRIGNTAFSTRLLPVRGAVECLFEMGFEEGETHLIFPKKASVEQLQKIRDLIAIERSSRLDGSNKSHKVELSQQPAASTQLPTTQSPSPVGLTQHPGNGQGQPSTPLSAPTVTANSIILKMLLSNIQHVLVYENLALQEKALACIPVQELKRRSQEKLSRARKLDKGTIVNDEDFLLLELLHWFKEEFFHWVNNILCSKCGGQTRSRRDSLPPSDDDLKWGANRVEDHYCDACQFSNRFPRYNNPEKLLETRCGRCGEWANCFTLCCRALGFEARYVWDYTDHVWTEVYSPSQQRWLHCDACEDVCDKPLLYEVGWGKKISYVIAFSKDEVVDVTWRYSCKHEDVISRRTLVKEELLRETINGLNKQRQLSLSESRRKELLQRIIVELVEFISPKTPKPGELGGRVSGSVAWRVARGEMGLERKETVFIPSENEKISKQLHLCYNTVKDGYIRVSDNNQAISGWENGVWKMESIFRKVETDWNMVYLARTEGSSSAYISWKFECGSVGLKVDSISIRTSSQTFQTGTVQWRLQSGATQVELTGDKKLRSYNDFSGVTEVILEAELSQGDGDVAWQHTQLFRQSLNDHEENCLEIIIKFGDL	52426	122777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_52660_61881_61997_69855_70102_87382_87549_98806_99030_101969_102092_105495_105642_107307_107419_108771_108937_113381_113568_121458_121637_121996
869871	contig_5718_pilon	-	3014	4	Intergenic	novelGene_110373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	60.1461183748008	386	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	587	1885	1159699	1144526	FALSE	65	ATATTATTTAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFREERRLTYTFLIICFLTLRLCTSQNCPTKSLEDVVIDIQSSLSKGIRGNEPIYTLTQKDCINSCCSTKNISGDKACNLMIFDTRKTTRQPNCYLFFCPSEEACPLKPAKGLMSYRIIRDFPPLTRTDLPRQELAQEDSLLLDRSSQAAASTPSHLTAHSKPPDTFWKDRVSQKFGSSDHLEKVFKIDQTSTQLPVYEEKGQSQSSQFSPKQKIVHLLLENVTVFPTTEAAVSPPTVFVTPNPTVLQPTIPSMRPALTSQPQLVTAPPPVTTITSQPPILVSTNLTQAMIPRQASMTTTAVPTTPFQAPKDLKVTSEVVPSREMSNLPLNVGDARNFTTLPRSNVDSSFANKTAAQENGKGSPGSSSQNNVPQSQSGFPFEKWLLMGTLLFGVLFLVIGLGLLGRMLSESLRRKRYSRLDYLINGIYVDI	1166137	1143396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1145461_1156414_1156556_1159476_1159800_1165651
869872	contig_2438_pilon	+	1339	5	Intergenic	novelGene_112016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	12042	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
869873	contig_13021_pilon	-	5556	17	Intergenic	novelGene_8112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	143.328239977333	109	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	3634	5388	160917	147970	FALSE	15	GTTACTGCTTTTGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPSVSMTSSARKLGEPIRSAIRLHPPHHPSEPRAPCPIGKEYCLSAGISTGEPATFSAEPDDSVFSTSKLPKNSKQEICSAQVQGPRTRRLPKGSRHENRSAVSSWGSPFPQRLRRTLTEQELHAVSEKLSQRLSELDWMLKSALGDRIKEKTEHEEEDAGAGNEEVENGEVESGSAETLSQYSDSIMDYGPKKLRPGLAVSRKPPYRSHSLSPSPVNRRKPCHRERTKQRKPKETDIRRFRAQAISEAFERELRRNKVQENIGPLGINDEQEETEKTYREAVHKGTPKPCQPWKIYSRKTTTPSPRGGFPKPNKEVPMKVNEQSLLPLMLEQFPFLSVSDQTLSKMWKQQIAQVKQLKKDAYGENRSKKKLQDEIEEALRRHDLLTALVKKEYEHNRRLQDFKDRINRQRLTQSKIKENRQQIVRARKYYDDYRVQLRAKMMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	171735	147801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_150265_151766_151842_151957_152128_152919_153050_154324_154418_155195_155336_157302_157478_158091_158222_158404_158518_160045_160225_160916_161046_163208_166565_169579_169688_171694
869874	contig_12019_pilon	+	741	3	Intergenic	novelGene_87650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	18	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	109	423	5225	8336	FALSE	55	ATAAACATGAAGTGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKALSPSGILS	5116	8654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8307
869875	contig_19579_pilon	-	1875	8	Intergenic	novelGene_59367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_6	692.203874650838	638	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	106	369	13090	12727	TRUE	30	ATCTATATGGGATCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTVSSSVLLPLSLCADSGPIALQRGG	13195	7164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12262_12648_12801_12900
869876	contig_16098_pilon	-	1430	10	Intergenic	novelGene_45976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_9	1434.2103518429	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	238	1305	350768	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHCLDKSILSEPPAPPAPSSSSSSSSSSIWGVTLISRQQTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354107	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_353990
869877	contig_13519_pilon	+	1939	13	Intergenic	novelGene_124631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	415.239514216394	24	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	121	1530	66179	114549	TRUE	50	TGAAAGAAAATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTTQFLWIRIQKQLS	57039	115610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102358_114507_114862_115513
869878	contig_8671_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_126233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTACTTCTCCCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12135	13460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_12100_13500
869879	contig_15732_pilon	+	2776	10	Intergenic	novelGene_88832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	305	junction_7	193.59758441509	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	160	2118	11208	349276	FALSE	70	AAGAGAAAAAACAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQGNVFVVFLIVCLFVCLGEELDFLKFFWWGMR	11048	349934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875
869880	contig_6217_pilon	-	2554	20	Intergenic	novelGene_109614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_11	443.389681851415	62	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	978	2552	458991	422782	FALSE	70	TGAAAAGACCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDE	559469	422779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_458988_459083_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_559359
869881	contig_14882_pilon	-	3150	14	Intergenic	novelGene_115010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	337.001518792778	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	601	1932	317252	295835	FALSE	20	ACCAGTGTTAGAGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGEFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYELSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKDDEGKEDYQFDELNTEILNSLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATAS	363666	294616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321739_363416
869882	contig_9535_pilon	-	2232	13	Intergenic	novelGene_124494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	89.9280576658673	1489	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	221	1789	635536	608023	FALSE	35	AATATCGATATTTTCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLLPLPAVGRVAALRLSVKRFWNRSFSAAEMTKGLVLGIYSKGKEDDVPQFTSAGESFDKSVSGKLRELLTISGPPLKVGKTRTFHGLHQDFPSVVVVGLGKKAAGVNDQENWHEGKENIRAAVAAGCRQVQDLEIPSVEVDPCGDAQAAAEGAILGLYEYDELKQKKKMMVSAQLHGSGDQEAWQKGVQFASGQNLARHLMETPANQMTPTRFAEIIEKNLKDANSKTEVYIRPKSWIEEQEMGSFLSVAKGSDEPPVFLEIHYKGSPNACEPPLVFVGKGITFDSGGISIKASANMDLMRADMGGAATICSAIVSAAKLNLPINIIGLTPLCENMPSGKANKPGDVIRAKNGKTIQIDNTDAEGRLVLADALCYAHTFNPKLIINAATLTGAMDIALGSGATGIFTNSTWLWTKLFEASIETGDRVWRMPLFEHYTKQVVDCQLADVNNIGKYRSAGACTAAAFLKEFVTHSKWAHLDIAGVMTNKDEVPYLRKGMTGRPTRTLIEFLLRFSQDEANA	635756	607579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_608219_608698_608809_611070_611151_617377_617481_618568_618658_620163_620289_623284_623444_626732_626898_628751_628912_630186_630293_630765_630821_632053_632170_635431
869884	contig_5003_pilon	+	3791	1	Intergenic	novelGene_120200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACTATACTTGGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88513	92304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_88500_92300
869885	contig_5480_pilon	+	2162	10	Intergenic	novelGene_107214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_9	122.654085506183	1276	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	125	1477	79527	103586	FALSE	40	AATACATCAAACGTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKTGKRPKANIIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKYDGYTSCPLVTGYNRVILAEFDYNGQPLETFPFDQSKERLSMYLMKADFMPFLYWNMMLRGYWGGPAFLRKLFHLGMS	53779	104271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_53887_79509_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89918_92258_92469_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
869886	contig_18272_pilon	-	2784	8	Intergenic	novelGene_6995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	499.041366736552	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	171	965	262678	122577	FALSE	25	TTCTTCTCTCAGAAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQQTCAGARAGRSRGTRREGLRRQEAAPGESAGATRAGCNRVNVWNIGGLGRRLRQMDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMRWPDAGGSGRASPT	262848	120757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122621_126363_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184551_262660
869887	contig_1452_pilon	-	2049	3	Intergenic	novelGene_115143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1147.5	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	50	376	715391	699935	FALSE	75	AAAAAAAAAATTAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFEKSRI	715440	698261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700539_700690_715232
869888	contig_6975_pilon	+	4352	22	Intergenic	novelGene_74288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	135.370609121991	430	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	1267	3039	465666	517377	FALSE	15	GGTGAACCATTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAARLLFHKLIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPFGTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVVHLLKLYKIGIPPSERRIFNSFLHTALKVLEILHRVNEKTGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYMNWIQQQAYGMLADIPVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIESVNPCLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNFTIVDLHFPLALYKKLLKKRPSLDDLKELVPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGANTAVNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLQLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWDVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQSTGGGEDYLPVSHTCFNLLDLPKYTDKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI	403280	518690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_403588_437079_437157_440405_440628_441781_441874_448648_448780_457496_457626_464105_464183_464466_464592_465445_465506_465619_465732_466248_466439_467794_467968_478934_479055_490701_490801_493420_493589_493986_494131_501867_502035_502651_502719_505449_505533_509085_509270_515806_515910_517168
869889	contig_8394_pilon	-	2220	4	Intergenic	novelGene_27312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	211.051863031078	1622	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	641	1885	35322	32466	FALSE	25	CCATTCATCTTCATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39937	32130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35523_38754_39154_39896
869890	contig_11815_pilon	+	2098	5	Intergenic	novelGene_50930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	123.151329672075	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	132	1922	294886	322920	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASSLLEQVFLGQPAARQRYLRPQRPKGQGNKVQNGSVHQKDGLNDDDFEPYLSPQARPNSAYTAMSDSYLPSYYSPSIGFSYSLGEAAWSTGGDTAMPYLTSYGQLSNGEPHFLPDAMFGQPGALGSTPFLGQHGFNFFPSGIDFSAWGNNSSQGQSTQSSGYSSNYAYAPSSLGGAMIDGQSAFASETLNKAPGMNTIDQGMAALKLGSTEVASNVPKVVGSAVGSGSITSNIVASSSLPPATIAPPKPASWADIASKPAKQQPKLKTKNGIAGSSLPPPPIKHNMDIGTWDNKGPVAKAPSQALVQNIGQQAIQGSPQPLGQQANNSPPVAQASVGQQTQPLPPPPPQPAQLSVQQQAAQPARWVAPRNRGSGFGHNGVDGNGVGQSQAGSGSAPSEPHPVLEKLRSINNYNPKDFDWNLKHGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDAAYRSMNGKGPVYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSAVDYNTCAGVWSQDKWKGRFDVRWIFVKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIASYKHTTSIFDDFSHYEKRQEEEESVKKERQGRGK	294754	323096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_294913_295364_295438_296009_296090_299063_300651_322896
869891	contig_12019_pilon	+	1823	4	Intergenic	novelGene_87631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.0693842672377	82	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_6226_8322
869892	contig_13074_pilon	+	2826	4	Intergenic	novelGene_153417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1380.10080147148	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	448	912	403694	451174	TRUE	25	GGGCTGAAGTTACAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403246	453319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002_451367_451597
869893	contig_13542_pilon	+	4615	23	Intergenic	novelGene_131547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_12	82.1431048197077	260	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	992	2979	18	2996	571860	597427	FALSE	15	GTCTGGCTGGAATTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALVSRFWLWALLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKLKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAALNSRTGEILWRHVDKGTPEGAVDAMLLHGQDAITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQALGLVGLQESVRYVAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFSHVNIVKFNMEDGEIVQQVRVSTPWLQSLTGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALETEWELRQIPLQSLDLEFESGFQPRILATQPNPVDPSRAQFFLQLSPSHYALLHYHQGVLSLLKNLPQTALVSFATTGEKTVAAVMTCRNEVKPSSSEDGSMGSISEKASPKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTMITFSLEQNGTRPERLFIQVFLKKDDSVGYRALVQMEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCLEMVDLPLTGAQAELEGEFGKKADGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTAHLWKMFYDARRPRSQIKNEINIDTLARDEFNLQKMMVVATASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFPHPPQCTLLIKDKETGMSSLYVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPIMDQDYAKVLLLIDDEYKVTAFPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAELGRLSGYRLRKDLTTELSWELTIPPEVQRIVTVKGKRSSEHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDMHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSLQKKAKGPVHIVHSENWVVYQYWNTKARRNEFTALELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPSSISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAERFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGLVFATMITKRLAQVKLLNHAWR	571842	599046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_571955_576437_576563_577298_577365_577608_577703_578443_578573_579453_579581_580091_580242_580561_580730_581236_581309_581710_581771_582584_582708_583740_583838_584087_584211_585902_586103_586262_586413_587071_587234_587582_587703_590270_590409_593662_593837_594412_594624_595741_595827_596937_597068_597247
869894	contig_4604_pilon	+	908	2	Intergenic	novelGene_19181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATGAATCTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378496	380714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_378504_379813
869895	SIRV6	+	935	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	32	-51	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	333	665	2002	10736	TRUE	20	TCGTCATTGTATATGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
869896	contig_8156_pilon	-	845	8	Intergenic	novelGene_98909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTCACACGCTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137710	117686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_117748_120090_120233_122253_122378_130233_130333_131343_131499_134094_134232_135578_135628_137632
869897	contig_8156_pilon	+	6613	24	Intergenic	novelGene_98913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	65	junction_19	181.674452814073	371	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1189	3570	50	3619	143251	320175	FALSE	15	TTGTTGGCTTCCCAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VICNLLPCELDFYVKGMPINGTLKPGKEAALHTADTSQNIELGVSLENFPLCKELLIPPGTQNYMVRMRLYDINRRQLNLTIRIVCRAEGSLKIFISAPYWLINKTGLPLIFRQDNAKTDAAGQFEEHELARSLSPLLFCYADKEQPNLCTMRIGRGIHPEGMPGWCQGFSLDGGSGVRALKVIQQGNRPGLIYNIGIDVKKGRGRYIDTSMVIFAPRYLLDNKSSHKLAFAQREFARGQGTANPEGYISTLPGSSVVFHWPRNDYDQLLCVRLMDVPNCIWSGGFEVNKNNSFHINMRDTLGKCFFLRVEITLRGATYRISFSDTDQLPPPFRIDNFSKVPVVFTQHGVAEPRLRTEVKPMTSLDYAWDEPTLPPFITLTVKGAGSSEINCNMNDFQDNRQLYYENFIYIAATYTFSGLQEGTGRPVASNKTITCAELVLDVSPKTQRVILKKKEPGKRSQLWRMTGAGMLAHEGSSVPHNPNKPSAARSSEGSAILDIAGLAAVTDNRYEPLMLRKPDRRRSTTQTWSFREGKLTCGLHGLVVQAKGGLSGLFDGAEVVLGPDTSMELLGTVPPEQQFINQKMRPGSGVLTIRVIPDGPTRALQVTDFCQRKSDRSSYEVDELPITEQELQKLRNPVTEQELEVLVKLEGGIGLSLINKVPEELVFASLTGINVHYTQLATSHMLELSIQDVQVDNQLIGTTQPFMLYVTPLSNENEAIETGPAVQVNAVKFPSKSALTNIYKHLMITAQRFTVQIEEKLLLKLLSFFGYDQAESEVEKYDENLHEKTVEQGGTPVRYYFENLKISIPQIKLSVFTSNKLPLDLKALKSTLGFPLIRFEDAVINLDPFTRVHPYETKEFIINDILKHFQEELLSQAARILGSVDFLGNPMGLLNDVSEGVTGLIKYGNVGGLIRNVTHGVSNSAAKFAGTLSDGLGKTMDNRHQSEREYIRYHAATSGEHLVAGIHGLAHGIIGGLTSVITSTVEGVKTEGGVSGFISGLGKGLVGTVTKPVAGALDFASETAQAVRDTATLSGPRTQAQRVRKPRCCVGPQGLLPRYSESQAEGQEQLFKLTDNIQDEFFIAVENIDSYCVLISSKAVYFLKSGDYVDREAIFLEVKYDDLYHCLVSKDHGKVYVQVTKKAVNTSSGVSIPGPSHQKPMVHVKSEVLAVKLSQEINYAKSLYYEQQLMLRLNENQEQLELDS	143201	323169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_143330_145529_145722_146025_146153_147749_147893_152479_152611_152836_153013_156877_157002_157838_158075_160153_160263_164877_165042_166087_166197_168526_168707_170472_170590_171419_171570_183984_184135_185082_185180_187525_187675_196099_196235_197795_197964_249753_249887_253635_253832_302853_302986_318169_318411_320043
869898	contig_1107_pilon	-	2550	16	Intergenic	novelGene_126543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_8	82.693006556379	357	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	152	2194	209508	160102	FALSE	40	AAAGGCTGTGGTATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSSSPNSCLSVGSTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSDLKFAMKCYTPLVYKEIIPCKPSDIKYSVLNSEEVHYIIKQLSKESLQSVDVLREEACEILDEMGHKLRLGAIRFFAFTLSKVFKQIYSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYIDFLMLSFLLYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYVKTMLRNGYAPVEFFLEGTRSRTAKTLTPKFGLLNIVMEPFFKRQVFDTYLVPISISYDKILEETLYVYELLGVPKPKESTTGLLKARKILSENFGNIHVYFGDPVSLRSLAAGRMDQSPYNLVPRYIPQKQSAEMHAFVTEVAYKIQLLQIENMVLSPWALTVTVLLQNLPSMNFDALVAKTLWLKGLTQAFGGFLTWPDNEPAEEVVQSSIFLHSNIASLVKDQVVLKTDSGESEVVDGLIFQHITLLTCSAYRNQLLNIFVRPSLVAVALQMTPGFRKEDVYSWFCFLHDVFSDEFIFLPGNILKDFEEGCYLLCKSETIQVTTKDILVTEKGNTVLEFLIGLFKPFVECYQIICKYLLKEEEDYFTEKQYLAGVRKFTSELLDQGTSKCYDVLSSDVQKNALAAFVRLGVVEKKKVNNDCILNVNEPATTKLEEMLGCKVPVGKPVTAKL	209659	159745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_160146_160736_160799_161588_161683_161767_161868_163079_163221_167332_167413_168867_169111_171900_172125_173594_173726_173846_173999_175290_175367_175674_175803_178789_178920_181370_181548_193461_193645_209430
869899	contig_9183_pilon	-	2202	9	Intergenic	novelGene_40313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	520.637769951432	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1019	1918	322807	312131	FALSE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTQQQIVLLKHLPRTRGSRSKLREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325999	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320719_322743_322952_323010_323286_323365_323834_325868
869900	contig_3627_pilon	+	1256	4	Intergenic	novelGene_78505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	5232.36290365601	11	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	151	615	626132	634316	FALSE	35	TTCAAATGTTACTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAASHLWLLSTRNVTSPNGDVCYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621300	634957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_626071_626199_630851_631000_634066
869901	contig_16125_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_155294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	85	393	233464	233156	NA	25	AACTTCATTCCCAGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFRLCLSLCLFSSFYKDTTLVGLRNPPPQTLQHGPMLTDNIFRDPISKQGPFSQVAGEKTSMYVFGQPSSVLLLLFCNIVPPPDVLPLVSTHSGAVEFRF	233548	231007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_231000_233500
869902	contig_14925_pilon	-	2247	8	Intergenic	novelGene_55319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1051.11569490786	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	831	1244	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322415	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113034_113213_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_130662_130951_321808_322113_322212
869903	contig_2487_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_148488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	839	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGGAGGGGGAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220291	218419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_218400_220300
869904	scaffold_2602_pilon	+	4200	1	Intergenic	novelGene_127706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATAGATACTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65377	69577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_65400_69600
869905	contig_8420_pilon	+	2528	13	Intergenic	novelGene_69333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_11	245.073614224153	1516	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	26	1300	10943	37060	TRUE	45	AACAAACAGATCATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEVRCLQELLFPFFCFVEYLRHFFLF	10917	59214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
869907	contig_4924_pilon	-	1998	10	Intergenic	novelGene_84681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	455.764179871917	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	179	1306	146100	65524	FALSE	65	TGTAAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252587	64831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_252438
869908	contig_4924_pilon	-	1950	11	Intergenic	novelGene_84689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1137.3320931021	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	839	1288	74819	65524	FALSE	10	TTTGTTGTTTTAGTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252518	64861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82444_114580_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
869909	contig_4924_pilon	-	2112	11	Intergenic	novelGene_84677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1137.3320931021	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	29	1408	252576	65524	FALSE	35	AAAGATTTAGAGATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCSTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252604	64819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82473_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
869910	contig_12950_pilon	+	3498	1	Intergenic	novelGene_114787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	717	2154	48	2201	102511	104664	NA	60	TTCTCTAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFRAALFFWVVASWAKGDEPPGETDKAGFQKCKNALNLRVLEVLPGGGWDNLRNVDMGRVMGLTYTSCRTTEDGQYIIPDEIFTIPQKQSNLEMNSEILESWVDYQSSTSYSINTELNTFSEVNGKFSAEFQRMKTLQVKEHSITTRVQVRNLVYTVKINPTLELSWGFRKDLMAISDCLENNQTRMATYLAELLVLNYGTHVITSVDAGAALIQEDSIRTSFLQDSQNSRIAVTLSAGITFQNIINFKFEDNYILQNALTKSYLSNRTNSRVQSIGGVPFYPGITLQTWQEGIANHLVALDRVGLPLHFFINPNMLPGLPGPFVKKLSKIVELAVRRYYDFNTYPGCTDFNSPNFNFQANTDDGSCEGRVTNFTFGGVYQECTQLSGNEAVLLCQNLEQKNPLTGDFSCPSGYSPIRLLSQIHEEGYNHLECQRRCTLLVFCKKVCEVVFQVAKAEFRAFWCVAHNQVPEYSGLLFGGLFSSKSINPLTNSQSCPAGYLPLRLFESLKVCASQDYELGYRFSVPFGGFFSCAVGNPLADSAISRDSGAPAVKKCPGGFSQHLALISDGCQVSYCVKSGIFTGGSLPPVRLPPYTRPPLMSQTATNTVMVTNMETSNSWIKDYETHQWKLGEPLELRKALKVTHEDEHGLSGGTAAGVIVGVITVLVAAITLAIYGTRKYKKRQYRAIEDEKQSLTQGTAATGDAPHQEPEQNPV	102463	105961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_102500_106000
869911	contig_10953_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_42611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465431	465949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_465400_465900
869912	contig_10331_pilon	-	2818	5	Intergenic	novelGene_54047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTTGTATAAACTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20985	6040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_6256_9048_9222_10154_10305_14105_14243_18842
869913	contig_7412_pilon	+	1779	7	Intergenic	novelGene_76319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2419	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	513	812	365790	370299	TRUE	15	GCGGCGACGTCAGCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSMSWLLFTLTRGIIRRVGWNLIISSFLKTALKTVGLRAFSMSSRRCFTCWGTRITKLRLWESCSRPTLAFKVGSVKWATGYFLLVIMGTFISEDLK	364198	377294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_364699_365777_365997_370206_370349_370542_370749_373395_373528_375276_375803_377240
869915	contig_19330_pilon	-	4763	23	Intergenic	novelGene_163692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1716	2033	70950	67270	TRUE	10	CCCAGCTCCCAGCCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLFWDPEFLRIASSSANRDDILVLSLVSSKSSTLKDVPLTQTMEDDSGLWSSDRVNALSCSSRERMRPSLFSSVRSRADFSKDRWQQHWRSLSNCDNMWTVLDL	77576	33087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_33138_33217_33322_35893_35979_45281_45349_47344_48347_48651_48767_49117_49283_50843_50972_52313_52394_54896_55010_56174_56327_59261_59366_63993_64178_64886_65040_65353_65445_66528_66612_67215_67351_68108_68279_69457_69517_70942_71097_71808_71898_73356_73427_76166
869916	contig_2480_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_63549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	610	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCCAGATTCACCGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291829	295412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_291800_295400
869917	contig_3018_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_78798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	101	53	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482285	478858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_478975_479809_479899_480125
869918	contig_10861_pilon	+	3184	1	Intergenic	novelGene_39193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	699	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342362	345546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_342400_345500
869919	contig_15353_pilon	+	4669	1	Intergenic	novelGene_151963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATGAAAAAAGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250237	254906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_250200_254900
869920	contig_9471_pilon	-	2047	8	Intergenic	novelGene_21822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417511	412445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414728_414804_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
869921	contig_9807_pilon	+	1798	7	Intergenic	novelGene_32913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	558.835594984985	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	102	821	140826	156743	TRUE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSVREQCFLRTPCEDRLPGLVPGQRALCLWWHGHDGVRLDPE	140724	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_140958_145115_145206_147126_147220_151711_151820_154095_154274_156624_156770_158676
869923	contig_15063_pilon	+	1406	6	Intergenic	novelGene_14322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3818.57823803572	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	295	1179	35271	39515	FALSE	45	TGAAATAAATGTGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	34867	39742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
869924	contig_11224_pilon	-	2202	3	Intergenic	novelGene_124442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	444	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGACAGAATTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22143	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_11377_19383_19520_20211
869925	contig_7308_pilon	-	4676	1	Intergenic	novelGene_159597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	479	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTTTTTAGTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489734	485058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_485100_489700
869926	contig_14450_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_49055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	626	937	1401019	1400708	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDLQSNRKTFLAKRLLNYRVIIGCWCLDTVKFSNFSSVPWLAQDCGRNQSSFVSAICRWWGSSMALGALRLTEPPWSSRLAQCMLRLGMFQSFTARWFSELG	1401644	1399370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1399400_1401600
869927	contig_10765_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_122965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAATATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394485	392017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_392000_394500
869928	contig_854_pilon	+	2490	2	Intergenic	novelGene_36318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2407	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560680	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_562405_563029
869929	contig_10140_pilon	+	4898	1	Intergenic	novelGene_148393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	413	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATTATTGAACAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197039	201937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_197000_201900
869930	contig_500_pilon	+	1462	12	Intergenic	novelGene_31013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1074.20079844129	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	201	824	1492663	1496717	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCVPGQC	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496627_1496697_1496730_1496821_1496898_1497870_1498018_1498882_1498974_1499277
869931	contig_18108_pilon	+	282	4	Intergenic	novelGene_33455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	309	junction_3	33.189690501051	47	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAACGAAATGTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103438	111072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_103528_108412_108449_110391_110458_110981
869932	contig_4105_pilon	+	2748	5	Intergenic	novelGene_21480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	131.584573563925	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1176	1532	72453	73266	FALSE	25	AACTGCCGTGACAGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVFFTRNGKIIGKKDAVVPSGGFFPTIGMLSCGEKVKVDLHPLSG	70126	74482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_71173_71624_71683_72381_72502_72595_72769_73131
869933	contig_10377_pilon	-	2466	2	Intergenic	novelGene_115351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	63	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGCAAAGAAATGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133781	131170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_131395_131539
869934	contig_18145_pilon	+	2819	17	Intergenic	novelGene_37330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	526.401922845082	5	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	229	1920	86893	98857	TRUE	10	GTCTGAGTCCTGATCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAALISLSTSHFLMRSPVLPSSRPICASPQLPRMLIWNSWLR	86664	101269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97441_97550_97824_97922_98443_98541_98826_98983_100338_100482_100638
869935	contig_10404_pilon	+	2313	1	Intergenic	novelGene_138627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCTCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24784	27097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_24800_27100
869936	contig_6344_pilon	-	4961	19	Intergenic	novelGene_157110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_18	350.380745285278	374	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1210	3633	140	3772	1132156	1083342	FALSE	20	TTATCATGGGGTTGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFNFRKIFKLGSERKKKQYEHVKRDLNPEEFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETNVLAAAKVIDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELERPLTEAQIQVVCKQTLEALNYLHDNKIIHRDLKAGNILLTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPALAQPSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWNTSQLLQHPFVTVDSNKPIRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDDDEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSEKTERDTAEDKFSSKLLDEKPTTDEPEKAVEGINEHTNDAHSEATIELQNRTTLIEENWREEKRRKLENLPDTEDQETMDINSVSEGKENNIVITLETNTEHNLKPEEERDQEKQPIFENKLIESEEIKDTIIQTVDLVSQETGEKEADIQAVDNEAKLTKEDTQEKLGKDDQTQKDVISDIGSVVGTNEAVDVDQRTVENKAEDAQRNDGKEVVEVNQELISQPKLGPETGGTEEVPIKEVVETNETDQKSLESKSKEQLVNSSGNILETNEEPGANEDESNSTEEIEVRSAVIHTDQKTLGSETGDAYKATTQIDTKQKEIPCKVPVKTEPEVTAASQPNEPQPFPIPSININSENAENKGVIDALSALSITNPTLLPEFENQKENDTDSGTGSTADNSSIDLNLSISSFLSKTKDSGSISLQETRRQKKTLKKTRKFVVDGVEVSVTTSKIVTDSDSKTEELRFLRRQELRELRFLQKEEQRAQQQLNSKLQQQREQIFRRFEQEMMSKKRQYDQEIENLEKQQKQTIERLEQEHTNRLRDEAKRIKGEQEKELSKFQNMLKNRKKEEQEFVQKQQQELDGSLKKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRAREAAIWELEERHLQEKHQMLKQQLKDQYFMQRHQLLKRHEKETEQMQRYNQRLIEELKNRQTQERARLPKIQRSEAKTRMAMFKKSLRINSTATPDQDREKIKQFSTQEEKRQKNERMAQHQKHENQMRDLQLQCEANVRELHQLQNEKCHLLVEHETQKLKELDEEHSQELKEWREKLRPRKKTLEEEFARKLQEQEVFFKMTGESECLNPSAQSRISKFYPIPSLHSTGS	1132698	1082152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1083489_1087917_1088032_1088920_1089047_1089607_1089797_1090332_1090458_1091084_1091215_1101045_1101226_1102487_1102612_1102825_1102957_1105559_1106934_1107787_1107917_1109235_1109318_1109862_1110058_1110211_1110285_1116351_1116502_1116818_1116868_1118615_1118781_1132006_1132244_1132646
869937	contig_5718_pilon	-	2910	4	Intergenic	novelGene_110372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	77.7788888809525	320	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	465	1763	1159699	1144526	FALSE	60	AAGACAACCTAGAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFREERRLTYTFLIICFLTLRLCTSQNCPTKSLEDVVIDIQSSLSKGIRGNEPIYTLTQKDCINSCCSTKNISGDKACNLMIFDTRKTTRQPNCYLFFCPSEEACPLKPAKGLMSYRIIRDFPPLTRTDLPRQELAQEDSLLLDRSSQAAASTPSHLTAHSKPPDTFWKDRVSQKFGSSDHLEKVFKIDQTSTQLPVYEEKGQSQSSQFSPKQKIVHLLLENVTVFPTTEAAVSPPTVFVTPNPTVLQPTIPSMRPALTSQPQLVTAPPPVTTITSQPPILVSTNLTQAMIPRQASMTTTAVPTTPFQAPKDLKVTSEVVPSREMSNLPLNVGDARNFTTLPRSNVDSSFANKTAAQENGKGSPGSSSQNNVPQSQSGFPFEKWLLMGTLLFGVLFLVIGLGLLGRMLSESLRRKRYSRLDYLINGIYVDI	1166121	1143378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1145461_1156414_1156556_1159476_1159800_1165757
869938	contig_754_pilon	+	3196	1	Intergenic	novelGene_161113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1272	1631	479249	479608	NA	35	AGTCATGGATTGAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVKRSLAILTSKEHSGCTSFKIDLFVLLAVHGIFNILCQHHNSNASIIRSSLLSVQLLHAYETIENTMAWVRCTLVLKVTSLLFNSLNKSLAADLLNAIHHLIS	477977	481173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_754_pilon_+_478000_481200
869939	contig_12841_pilon	+	3354	1	Intergenic	novelGene_55853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGGTATATATATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297833	301187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_297800_301200
869940	contig_11269_pilon	+	2254	3	Intergenic	novelGene_145814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCCTGTATTTGCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284950	299833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_286911_294697_294857_299698
869941	contig_5758_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_119076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTAAGCCTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105672	106715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_105700_106700
869942	contig_13863_pilon	+	1716	10	Intergenic	novelGene_42073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	262.794807998771	3	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	214	1407	474588	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455714	490588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478692_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
869943	contig_12622_pilon	-	2619	12	Intergenic	novelGene_5910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_4	1923.91011971982	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	12	1061	1590968	1588627	TRUE	20	TTTATATGTACATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSESECGVVARGGGAHHSQGPELWVLMPALPLVCDLRVTLLFSRPNVLISEVRREGLDYRQSVRLLTLSTSG	1590979	1583539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586407_1586528_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
869944	contig_3269_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_117032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCAGAACCCTCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180631	181963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_180600_182000
869945	contig_9895_pilon	-	1614	6	Intergenic	novelGene_144713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	34.7390270445216	515	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	179	655	492175	488899	FALSE	5	CTATTCTTTTTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTFHSSLSLTSLDFCLGQHRSTGGIIRHGAKLLYAFAEATVPKVTVITRKAYGGAYDVMSSKHLRGDTNYAWPTAEIAVMGAKGAVEIIFKGHENVEAAQAEYVEKFANPFPAAVRGFVDDIIQPSSTRARICCDLDVLANKKVQRPWRKHANIPL	534034	487939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_489021_490090_490191_491240_491340_491759_491862_492121_492230_533910
869946	contig_5189_pilon	-	2473	7	Intergenic	novelGene_34880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_6	619.345263609528	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	111	845	244235	218467	FALSE	30	GGTATCAGTTTAAGTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEVSFPGLELF	247751	216838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
869947	contig_7744_pilon	+	2250	15	Intergenic	novelGene_62518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_14	70.8574308749907	749	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	43	1665	825277	830740	FALSE	25	CAGCCTCTGGAAGCAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLACTLHFPACRGSCAPERTFHLPSHLLFQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825234	831325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
869948	contig_17427_pilon	+	3254	2	Intergenic	novelGene_30302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	259	junction_1	0	29	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	344	757	172183	172596	TRUE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALLPFLQGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEVRHCLGHNMPGDHRSKWRSNAASCWEHTFSPFHQPLCGAGVFHRRFINGSLRVVTPQKRMLNYVIVLSGEGSVIFIRFSNGPITQKRSEPLAPNL	171839	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_173669_175453
869949	contig_3426_pilon	-	3650	30	Intergenic	novelGene_57912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	175.171694269497	30	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	9	1508	244871	202933	TRUE	25	GTAAGTTAAATCTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIMDIKEIRPGKSSKDFERAKTVRQKEDCCFTIFYGTQFVLSTLSLAADSKEDAVKWLSGLKILHQEARNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLVNFKVSSAKFLKDKFVEIGAHRDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGSTDRPDASAIHLHDFQRFLLHEQQESWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENSIWDEKYDMVEMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSTEAYVRCLRMGCRCIELDCWDGPDGKPIIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEQHCSVEQQRYMAKVFKEVLDDLLLMKPTEASADQLPSPSQLREKVIIKHKKLGPRGDVDVNVEDKKDEHRQQGELYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTVEEELPQDTPPTELHFGEKWFHKKVEKRTSAEKLLQEYCAESGGQGRDFLGAGE	244879	145065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_145373_146395_146587_161924_162014_173635_173804_174821_174937_175930_176077_177889_178100_179596_179700_184278_184437_186428_186496_188361_188459_190681_190792_194647_194720_196403_196596_201307_201392_202899_203077_203772_203863_205426_205532_206870_207040_209112_209234_210469_210556_212649_212769_214096_214199_217057_217131_217970_218015_229166_229251_230844_230930_240192_240241_241006_241101_244735
869952	contig_1076_pilon	-	2596	15	Intergenic	novelGene_101086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_10	303.26667055479	106	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	206	1807	79519	50922	FALSE	45	GAATAAGCTTCAAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVLNEKKLQEVDSLWKEFETPEKANKIVKLKHFEKFQDTAEALAAFTALMEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKSEVKTYDPSGDSTLPTCSKKRKIEQVDKDEEITEKKAKKAKIKIKVEEEEEEEEEVLVVEEEESSVKKKKKKDKKKRIKEEPVSEEEPCTSTAISSPEKKKKKKKKRENED	79724	50132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_50973_51353_51503_51839_51974_53850_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231_66354_72921_72975_75351_75429_79474
869954	contig_15859_pilon	-	2598	2	Intergenic	novelGene_50221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATGGCTACTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380129	377370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_379217_379377
869955	contig_7019_pilon	+	4636	1	Intergenic	novelGene_149481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAAGTGAAGTGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389193	1393829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1389200_1393800
869956	contig_7004_pilon	+	3513	13	Intergenic	novelGene_126446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	47.8199022955459	268	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1113	1994	274729	281026	FALSE	40	ATCTTTATACAGAATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHRVPILATAIQEELEKGNPEPGPLNAVDDRHHSVLVSLLCAHLGLSSEDIVEMELCLADTQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYVDKHEENHRPLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSEALIREVANKVGVPLQDLMVRNDSPCGTTIGPILASRLGLRVLDLGSPQLAMHSIRETACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSLSHNLIVD	272495	282545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_272603_273022_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278333_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
869957	contig_9484_pilon	+	1609	11	Intergenic	novelGene_105630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	529.830774870618	10	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	36	1424	95848	104924	FALSE	15	TTTCTGTAGTTAGTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAHLGLRERSQNSQTQS	95812	105109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103555_104878
869958	contig_3956_pilon	+	1846	10	Intergenic	novelGene_14829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1586.75103261544	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	363	1349	1283943	1290491	FALSE	30	AATAAATTTGGTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWWWWTACLQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVRGCPRPRQTPGVSAFYCPAGADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1290988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1282863_1282913_1283793_1283976_1284065_1284333_1287475_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289568_1290400
869959	contig_8122_pilon	-	6008	22	Intergenic	novelGene_40187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	89	junction_21	132.231604690072	440	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	96	2987	116849	72295	FALSE	35	TGAGATGCCATCTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFSCLPPFFPRPAYPSFPRGPLPAGIIWSPAMDAPSAGCAFEYLIETLNDSSHKYFNIPKLGGTKYDALPYSIRVLLEAAVRNCDGFLMKKEDVMNILDWKTKQSNVEVPFFPARVLLQDFTGIPAMVDFAAMREAVKILGGDPKKVHPACPADLTVDHSLQIDFSKCAIQNAPNPGGGDLQKAGKLSPLKVQPKKLPCRGQTTCRGSCDSGELGQNSGKFSAQIENTPILCPFHLQPVPEPETVLKNQEVEFGRNRERLQFFKWSSRVFKNVAVIPPGTGMAHQMNLEYLSRVVFEEKDFLFPDSVVGTDSHITMVNGLGILGWGVGGIETEAVMLGLPISLTLPEVVGCELTGSSNPFVTSIDVVLGITKHLRQAGVAGKFVEFFGSGVSQLSIVDRTTIANMCPEYGAILSFFPVDNVTLKHLEHTGFDKAKLESIEIYLKAVKLFQNDQTSSGEPEYSQVIQINLNSIVPSVSGPKRPQDRVAVTDMKSDFQACLNEKVGFKGFQIAAEKQNDTISIQYEGSEFKLSHGSVVIAAVISCTNNCNPSVMLAAGLLAKKAVEAGLHVKPYIRTSLSPGSGMVTHYLSSSGVLPYLSKLGFEIVGYGCSTCVGNTAPLSEAVLNAVKQGDLVTCGVLSGNKNFEGRLCDCVRANYLASPPLVVAYAIAGTVNIDFQTEPLGTDPTGKNIYLHDIWPSQEEVHQVEEECVILSMFKALKEKIEKGNKRWNSLEAPDSVLFPWDLKSTYIRCPSFFDKLTKEPVALQPIENARVLLYLGDSVMTDHISPAGSIARSSAAAKYLTNRGLTPREFNSYGARRGNDAVMTRGTFANIKLFNKFIGKPAPKTIHFPSGQMLDVFEAAELYQKEGIPLIILAGKKYGSGNSRDWAAKGPYLLGVKAVLAESYEKIHKDHLIGIGIAPLQFLPGENADSLGLSGRETFSLTFPEELSPGITLNIKTSTGKVFCAIASFENNVEITLYKHGGLLNFVARKFS	116944	69273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_72406_74423_74610_77880_78004_78089_78238_78849_78993_79090_79196_81317_81443_81881_82039_82391_82477_83499_83636_84804_84965_86110_86228_88379_88481_90452_90625_94324_94465_94776_94961_95625_95696_97966_98186_99091_99230_101133_101300_114499_114587_116830
869960	SIRV6	+	858	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	21	-42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	33	6	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	344	676	2002	10736	TRUE	40	TATATGCGGTAAACGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1158	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1642_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
869961	contig_9099_pilon	+	3865	11	Intergenic	novelGene_149921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_3	90.3387513750329	795	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	270	1034	406985	428051	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNPSQLNAVEFLWDPAKRTSAFIQVHCISTEFTPRKHGGEKGVPFRIQVDTFKQNENGEYTDHLHSASCQIKVFKPKGADRKQKTDREKMEKRAAHEKEKYQPSYDTTILTECSPWPDTPTAYVNNSPSAAPTFTPPPPSTCSVPDSNSSSPNHQGDGVSQASAEQLQPSATIQETQQWLLKNRFSSYTRLFSNFSGADLLKLTKEDLVQICGAADGIRLYNALKSRSVRPRLTIYVCQEQLGSTPLLGQQQAAGSGGENGSGTPYVYHAIYLEEMLASEVARKLALVFNIPLQQINHVYRQGPTGIHILVSDQMVQNFQDESCFLFSTVKVENGGGIHIILK	405387	430882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_405462_406702_406856_406942_407054_412907_413012_414117_414173_414407_414502_417332_417424_418180_418300_419954_420098_420792_420845_428013
869962	contig_6102_pilon	-	3805	22	Intergenic	novelGene_32246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_15	179.686272326478	541	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	1147	2715	1308338	1301592	FALSE	50	AATTTTATTCCAAAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGPGTGAESSGEIINNTVPLENSIPGNCCCALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSTSFTLGPNKLPIQLQVLSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSETERVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPEPQMPAMVPTYDHGMAPDSSMSMQLGSDMVPQVYPPHSHSIPSYQALSPEESVNVLPAFQEPHLQMPPNLSQMSLSYDQPHPQGLLPCQPQEHAVPTPEPLLCSDVAMAEEGCLSQQVGGFPQGTWVSEDMFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGEPGGGPLGVQPLLQPSLYGQSGISLSHLDLRANPSW	1315017	1300501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1301782_1301869_1301999_1302084_1302151_1303242_1303336_1303530_1303642_1303754_1303819_1304033_1304181_1304506_1304644_1304739_1304835_1306035_1306243_1306604_1306698_1307617_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507_1311645_1314868
869963	contig_2100_pilon	-	4578	6	Intergenic	novelGene_50589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_2	97.5635177717573	792	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	558	1565	666536	663153	TRUE	25	CAACACTTGGGTGTTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAGSKLAKKREEAIEKAKREAEQKAREEREREKEKEKEREREREREREAERAAQKASSSAHEGRLSDPQLSGPGHMRPSFEPPPTTIAAVPPYIGPDTPALRTLSEYARPHVMSPTNRNHPFYMPLNPTDPLLAYHMPGLYNVDPTIRERELREREIREREIRERELRERMKPGFEVKPPELDPLHPATNPMEHFARHSALTIPPTAGPHPFASFHPGLNPLERERLALAGPQLRPEMSYPDRLAAERIHAERMASLTSDPLARLQMFNVTPHHHQHSHIHSHLHLHQQDPLHQGSAGPVHPLVDPLTAGPHLARFPYPPWHPPQPSAWTATP	667218	659282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_662086_662368_662550_663123_663272_664738_665463_666371_666595_666719
869964	contig_1301_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_47359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAGAAGCTAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539117	540409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_539100_540400
869965	contig_14711_pilon	+	2029	13	Intergenic	novelGene_68906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	389.312954303975	2	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	113	1789	83997	90570	FALSE	20	AGACCTCAGTTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLAPQRVRVTLRPGEPQRLRVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLEHVRQLGHDLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	83788	90810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_83833_83928_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88129_88737_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
869966	contig_11130_pilon	-	2116	6	Intergenic	novelGene_53087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.642333371231	11	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCATGGGTGTTTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55193_55636_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884
869967	contig_11130_pilon	-	1705	5	Intergenic	novelGene_53095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1141.42148218789	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTAACCTTGTCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66960	54268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55191_55633_56165_61269_61340_62521_62608_66864
869968	contig_18843_pilon	+	1018	10	Intergenic	novelGene_165611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	620.522440178784	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	20	1009	28527	46100	FALSE	65	CTTAAAAAAAAAAACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAVDKMSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERFGLLLACFLHYVLQAPQVIFWIVSFWFPFKFKKEIMY	28507	46109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31298_32877_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44357_45991
869969	contig_960_pilon	-	2198	10	Intergenic	novelGene_108210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	70.8108243103141	66	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	218	1537	335554	286400	FALSE	30	TGAAATAAGAGGGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCRLLGAGPQLSTFCVLQKLSGTMFILCMVIMGASAFTVQPEQHTVAARNCQFRGKHFKKYYRVEGEPVVLRCPQARSWLQTSASSHFNTTWHKNDSGRMVPGEEEKRLWVQDGALWILPALQRDSGAYVCTVRNASYCDEMSIELSVLENTEASLPFTSYLQIVTLSTLGLLSCPELSEFTRNKTGLNVQWYKDSVLLDQDNRKFLSLRGTTRLFIYNVSVEDAGYYSCGLPFSHNGTRYNITRNIKVRVNQKEEEPIPVIVSPHQTILASLGSRLTIPCKVFLGVGIKSTSTVWWTANDTIIDSAYPGGRVTEGLEKEYSENNENYIEVPLVFDPVIKEDLKTDFKCIVTNRMSLQTLRTTVKEASTFSWGIALAPLSLVFLVLGGIYMYRWCKHRPEKGYSLTTSTSGCEKLAPPGTPTGWMHVACCFFKKARE	335771	285738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_286493_292695_292818_294744_294888_296943_297080_304259_304323_306536_306712_310391_310573_315549_315815_316809_316938_335540
869970	contig_10861_pilon	+	2627	2	Intergenic	novelGene_39195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAGAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342490	345465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_343544_343891
869971	contig_8447_pilon	+	4668	1	Intergenic	novelGene_69392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	954	1280	9702	10028	NA	85	ATAAAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAEACCSVLESPPPSWGPESASWQSRGGDPDDWVSVRLPLPIFLGPAWVPGGTPLISLCNPGTHQRIASADLSPKQVPRLVGDSVCGSEQSGSTMRSSRVHRAKRGF	8748	13416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_8700_13400
869972	contig_10009_pilon	-	2330	4	Intergenic	novelGene_82737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAATAGCAATATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72558	54421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_55301_68605_68814_70217_70384_71481
869973	contig_1331_pilon	-	1873	2	Intergenic	novelGene_37817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8404	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	614	949	160998	160009	FALSE	30	GTGCTTCCTGATAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLIILLSFLSFFFSVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	161611	159084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867
869974	contig_1699_pilon	+	3555	3	Intergenic	novelGene_72833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	15	13	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1599	2501	116892	124907	FALSE	20	TTTTTAGTGGCTATTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLDDKLLGEKLQYYYSSSEDEDSDCEDKDRGRGALAGSLPAEAELAGEGISVNTGPKGVINDWRRFKQLETEQKEEQCREMERLIKKLSVTCRSHLDEEEEQQKQKDLQEKISGKMTLKDFAMMSEDQDDEEFLQQYRKQRMEEMRQQLHKGPQFKQVFEIPSGEGFLDMIDKEQKSTLIMVHIYEDGIPGTEAMNGCMICLAAEYPAVKFCRVKSSVIGASSRFTRNALPALLIYKGGELIGNFVRVTDQLGEDFFAVDLEAFLQEFGLLPEKEVLVLTSVRNSAACHSEDSDLEID	115293	125961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_117061_119340_119523_124355
869975	contig_8589_pilon	-	2669	7	Intergenic	novelGene_107354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.4315840632465	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	21	659	16686	2831	TRUE	5	GTTTGTGGGTCTTTACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAAGAMEPLYQQTHKQVHEIQSHMGRLETADKQSLHLVENEIQARIDQIFSHLERLEILSSKEPPNKRQSAKLRVDQLKYDVQHLQTALRNFQHQRCAREEQERQREELLSRTFTPNDSDTTIPMDESLQFNSSLYKVHHGMDDLIGGGHSILERLRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKRAFQDKYFMIGGMLLTCVVMFLVVHYLT	16706	765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_2486_2540_2993_6084_6226_8839_8973_9819_9929_11589_11655_16657
869976	contig_6084_pilon	-	2326	1	Intergenic	novelGene_127046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATATAACAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339430	337104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_337100_339400
869977	contig_20953_pilon	+	3607	1	Intergenic	novelGene_178149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	3013	3396	8013	8396	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLALVGFGPWGSRTGLLELLGHVVVADGVQAAVGIRQPGREVQGLGDHLLPGTAVQVRGIEQRQHHMQRQEAGHKHGQVRPDHAGGLLGGLHLGRVDCWPPGQAGHHLQGAEDQHGQRRVEAQQ	5000	8607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20953_pilon_+_5000_8600
869978	contig_9099_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_149894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260269	261571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_260300_261600
869979	contig_6270_pilon	+	2889	10	Intergenic	novelGene_99893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	141.247615515763	613	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	213	1730	1195735	1222846	FALSE	40	TATCTAGAGATCAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLNDLKCRLSKAGQEHLLQFWNELEEAQQIKLYEELQAMNFEELNFFFQKAIEGFNQSSDQEKVDARMEPVPREVLGSATRDQDQLQAWESEGLFQISQNKVAVLLLAGGQGTRLGVAYPKGMYDVGLPSHKTLFQIQAERILKLQQLAEKYHGNKCIIPWYIMTSGRTMESTKEFFAKHKYFGLKKENVIFFQQGMLPAMRFDGKIILEERSSVSMAPDGNGGLYRALAAQNIVEDMEQRGIWSIHVYCVDNILVKVADPRFIGFCIQKGADCGAKVVEKTNPTEPVGVVCRVDGVYQVVEYSEISLATAQKRSSDGRLLFNAGNIANHFFTVPFLRDVVNIYEPQLQHHVAQKKIPYVDSQGQLIKPDKPNGIKMEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRLKDANDVPIQCEISPLISYAGEGLENYVADKEFHAPLIIDENGIHELVKNGL	1187435	1224005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1187599_1195685_1196015_1205315_1205521_1208027_1208204_1209532_1209706_1214260_1214455_1215539_1215681_1216884_1217074_1221864_1221932_1222753
869980	contig_5669_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_86096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	114	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACAGTGTTGACATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269404	271368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_269400_271400
869981	contig_7253_pilon	-	4431	29	Intergenic	novelGene_140187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_11	133.642093607042	257	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1133	3402	124	3525	198515	144889	FALSE	10	TTTGCTGGTGTATACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTQWDFPVELCCRPMAFVTLTGLDVVYNAVHRAVWDAFCANRRADRVPISFKVLPGDHEYPKCRPKRTSYEWYIPKGILKTGWMNKHLNLVPALVVVFYELDWDEPQWKEKQSECATRVEIVRQSLQGRNTKVAVVLIQKKTPLPPGEDVIASERAAALCNACELSGKSLFVLPHTDHLVGYIIRLENAFYEHAQTYYYTEIRRVKSHKEFLNKTTHQLLFVRHQFKIAFFSELKQDTQNALKNYRTAYNLVHELRAHETNILEIKTMAGFINYKICRLCFQHNTPLDAIAQFRKHIDLCKKKIGSAELSFEHAAWMSKQFQAFGDLFDEAIKLGLTAIQTQNPGFYYQQAAYYAQERKQLTKTLCNHEATVIYPSPDPLETQTGVLDFYGQRSWRQGVLSFDLSDPEKEKVGVLAIQLKERSVVHSEIIITLLSNAVAQFKKYKCPRMKSHLMVQMGEEYYYAKDYTKALKLLDYVMCDYRSEGWWTLLTSILTTALKCAYLMAQLKDYITYSLELLGRASTLKDEQKSRIEKNLISVLMNESPDPEPDCDISAVKTAQKLWADRVSLAGSGIFTVGVQHFVPFVQCKTKFHAPSFHVDVPVQLDIYLKADCPHPIRFSKLCVSFNNQEYNQFCVIEEASKASEVLENLNQEKMCFVPGKTRKFLFKFVAKTEDVGKKIEITSVDLILGNETGRCVVLNWQGGGGDAASSQEALQASRSFKRRPKLPDSEVHWDSIVIQASTMIITRVPNISVRLRHEPPALMNEMYCLVVTVQSHEKTQIRDVKLTAGLKPGQDANLTQKTHVTLHGAELCDDSHPALLTDVPVGELHPGEQLEKMLYVRCGTVGSRMFLVFVSYLINTTVEDKEIVCRCHKDETVTIETVFPFDVAVKFVSTKFEHLERVYADIPFLLMTDILSASPWALTIVSSELQLAPSMTPVDQLESQVNRVVLQTGESASECFCLQCPSLGNVEGGVATGRYIISWKRTSAMGNTPVISTVIILPHVIVENIPLHVNADLPSFGRVRESLPVRYHLQNKTSLVQDVEISVEPSDAFMFSGLKQIRLRILPGTEQEMLYNFYPLMAGYQQLPSLNVNLLRFPNFTNQLLRRFIPTSIFVKPQGRLVDENSIAAA	198638	143982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_144934_147022_147191_148803_148938_154089_154182_157357_157470_161651_161809_161932_161999_165965_166086_169477_169600_170668_170818_170940_171129_172775_172932_175885_176017_178166_178300_178449_178512_178951_179098_179455_179511_179594_179674_179758_179839_181830_181925_183737_183886_184495_184630_187284_187382_188871_188946_189384_189485_194905_195021_196077_196149_196978_197149_198311
869982	contig_11422_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_99045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1875	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1900
869983	contig_1450_pilon	+	1962	15	Intergenic	novelGene_27375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	520.931881833128	10	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	50	1543	244426	354265	TRUE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQPGGSDIPGLHRLYVS	244376	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346505_354216_354330_355589
869985	contig_1274_pilon	-	3490	1	Intergenic	novelGene_137803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAACGCTAAATCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437737	434247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_434200_437700
869986	contig_1861_pilon	-	1999	16	Intergenic	novelGene_77653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	110.125907739984	1113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	801	1841	99858	87440	FALSE	35	AAAGGCTGGAGTTGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLGNYCRLGEVHTHICVGVVGLPNVGKSSLINSLKRSRACSVGAVPGVTKFMQEVYLDKFIRLLDAPGIVPGRSSEVGTILRNCIHIQKLADPVTPVETILQRCNLEEISSYYGISGFQTTEQFLTAVAHRLGKKKKGGIYSQEQAAKAVLADWVSGKISFYTLPPPTHTLPTHLSAEIVKEMTEVFDIEHTKQANEDTMECLTTGESDELLGDMDPLEMEMKWLHSPMMKIADAIENKTTVYKTGNLTGYCTNPNLHQVGWAKRSVDHCPKNYSMVDICPVDRRPVLQRIMETDPLQQGQALASALKNKKKMQKRTDKIASKLSDSMMSVLDLSGNADDSAGD	115249	87281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_-_87523_89416_89637_94311_94440_96224_96362_96684_96828_96914_97090_97636_97725_99791_99878_101740_101845_102825_102962_103130_103215_104761_104879_105620_105729_106881_106923_112515_112582_115124
869987	contig_8491_pilon	-	5174	2	Intergenic	novelGene_154224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATTGCAGCACTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284918	278916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_-_282766_283593
869988	contig_15087_pilon	-	2040	20	Intergenic	novelGene_37189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1018.43727445261	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	137	1669	158925	111013	FALSE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRLPEGLAGYLWW	181176	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111050_126703_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
869989	contig_2403_pilon	+	3191	1	Intergenic	novelGene_71018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	604	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGGTGTGTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168185	171376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_168200_171400
869990	contig_15732_pilon	+	2481	16	Intergenic	novelGene_88847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	244.141944140881	1	132	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	1100	2176	185097	395330	TRUE	45	ATTAAAATTGAATTCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYSKVCISR	11469	398708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11515_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126354_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_386711_386780_395311_395383_398197_398263_398520
869991	contig_8978_pilon	-	2333	6	Intergenic	novelGene_49324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_2	838.338929073439	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	79	618	194082	193127	TRUE	35	GCAAAAGAATGTCTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGIWKEGVKSPGILWGTGVYGVVLFHHKAT	194160	190420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_191357_191595_192444_192867_193398_193613_193768_193967
869993	contig_9272_pilon	+	4996	8	Intergenic	novelGene_125926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	768	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACATAAAGCCTAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326879	340377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_330962_331420_331531_336816_336977_337953_338125_338262_338367_338640_338792_338897_339032_340293
869994	contig_10324_pilon	+	1768	5	Intergenic	novelGene_7767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_2	272.175494855801	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	13	381	76067	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	76054	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
869995	contig_9995_pilon	-	3281	7	Intergenic	novelGene_47702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	746.321813964995	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	59	1942	328299	297529	FALSE	35	TGATGATATATTTTTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHDLRQKFPEVPEVVVSRCMLQNNNNLDACCAVLSQESTRYLYGEGDLNFSDDSGISGLRNHMTSLNLDLQSQNVYHHGREGNRMNGSRTLTHSISDGQLQGGQSNNELFQQEPQTAPAQVPQGFNVFGMSSASGASNSAPHLGFHLGSKGTSNLSQQTPRFNPIMVTLAPNIQTGRNTPTSLHIHGVPPPVLNSPQGNSIYIRPYITTPSGTARQTQQHSGWVSQFNPMNPQQVYQPSQPGPWTTYPTSNPLSHTSAQQPNQQGHQTSHVYMPISSPTTPQPPTIHSSGSSQSSAHSQYNIQNISTGPRKNQIEIKLEPPQRNNSSKLRSSGSRTSSSSSSVNSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARGPHFNPSAIHNFYDNIGFVGPVPPKPKDQRSTIKTPKNQDTEDDEGAQWNCTACTFLNHPALIRCEQCEMPRHF	328357	296189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297672_299626_299708_300994_301089_301628_301790_321093_321167_321271_322595_328290
869997	contig_8156_pilon	-	2387	6	Intergenic	novelGene_98938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	97.948966303887	4377	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	946	1467	441382	403585	TRUE	5	GCTTTTGTGAGTCCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKWLGALVVFPLQMIYLVVKAAVGLVLPAKLRDLSRENVLITGGGRGIGRQLAREFAARGARKIVLWGRTEKCLKETTEEIRQMGTECHYFICDVGNREEVYQTAKAVREKVGDITILVNNAAVVHGKSLMDSDDDALLKSQHINTLGQFWVRAVLCQSQPWVRQCSLRQG	442327	395205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395707_398419_398546_403291_403604_403839_404004_404665_404810_441187
869998	contig_16103_pilon	-	1495	7	Intergenic	novelGene_118822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	35	739	743628	723037	FALSE	10	CCTCTGACCTGCTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEGKRYEPALLRAEHSQGKDSPVGTLIGLYKAPAKPGR	743662	722280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723148_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
869999	contig_5917_pilon	-	2877	16	Intergenic	novelGene_122163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	224.741926069288	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	327	2114	759810	699492	FALSE	65	ATGAAAAAAAAAAAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENIRQEIGIMNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	793013	698728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739297_748629_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_792827
870000	contig_5981_pilon	+	2313	7	Intergenic	novelGene_35496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	316.372670543248	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	558	947	28523	37804	FALSE	35	AAAATGAAGGCCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23461	39170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25628_28120_28202_28458_28593_35629_35758_37612
870001	contig_10477_pilon	+	2197	3	Intergenic	novelGene_112486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_1	262.5	555	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	165	2153	243198	260754	FALSE	35	TTGTCCTAAGTGAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAPSVSCLLLAVLFSAGCKVITSSDQMCTEKEANKIYNCEYLGLSKIPDILPNTTEVLEFGFNFLPAIQNTTFSRLINLIFLDLTRCQINWLHEDTFQSHHQLNTIVLTGNPLIFMAETSLNGPKSLKHLFLTQTGISDLEFIPVHNLENLESLHLGSNHITSIEFPTNFPTQNLKILDFQNNAIHYLTRKDMDSLKPATNLSLNLNSNDIKGIEPGAFHSKIFQNLNFGGTFDLSVILKGLQNSTIQSLWLGTFEDKEDQDLSPAILQGLCEMSVESINLQQHHFSDFSSATFQCFTQLQELDLTATHLKELPSGIKGMNSLKKLVLNVNNFDQLCEISAASFPSLTHLYIKGNRKKLDLGAGCLERLENLQKLDLSHNGIEASDCCNLQLKNLPHLQCLNLSYNEPLGLQSQAFKESPRLELLDLAFTHLHVNVPQSPFQNLQLLQVLNLSYCLLDTSNHHLLAGLPNLRHLNLQGNRFQDGSIPKTNLLQTVGSLEILILASCDLLSIDQQAFHGLEKMCHVDLSHNSLTGDSISALSHLKGIYLNLAANNICIVSLHVLPTLSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWFKENLHKLEGLEETMCANPPPLKGVKLSDVKLSCGITAVGIFFLIVFLFLFTILLVFLIKFLLRWKYQHI	243033	260798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_243291_255104_255272_259025
870002	contig_20641_pilon	+	3747	1	Intergenic	novelGene_52876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3152	3466	56568	56882	NA	75	AATAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	53416	57163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_53400_57200
870003	contig_12638_pilon	+	2124	17	Intergenic	novelGene_33171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	193.616849408826	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	371	1924	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235651	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
870004	contig_12270_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_113133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14439	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14400
870005	contig_15326_pilon	-	2786	9	Intergenic	novelGene_157693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	287.851279960677	185	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	221	922	89535	15820	FALSE	85	AGTAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTVAEKVDTVKIIHIHSVIILRRSDKRKDRVEISPEQLSAASTEAEMLAELTGRPMRVVGWYHSHPHITVWPSHVDVRTQAMYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSEYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSVFTKNLCSQMSAVSGPLLQWLEDRLEQNQQHLQELQQEKEELMQELSSLE	93257	13955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_15972_19883_19928_20501_20634_65160_65217_66494_66584_81942_82029_83619_83742_89514_89576_93077
870006	contig_8375_pilon	+	3308	1	Intergenic	novelGene_141292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127969	131277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_128000_131300
870007	contig_8278_pilon	+	4665	1	Intergenic	novelGene_165302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAAAAAAAAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218007	222672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_218000_222700
870008	contig_4701_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_165434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGCAGACAGAGCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81687	80276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4701_pilon_-_80300_81700
870009	contig_7695_pilon	+	2378	16	Intergenic	novelGene_41602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1952	2377	524203	525583	FALSE	5	GCTTCCGGCTCCCCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQLVRVLSPEEAAEQGVDVGGLRRGLQQHCQAPIPGGPRQVVSIDALCGRQQVEGLTAVQARHTDVIGQDVLGVRHEYLEQEVILPVLFLLYCSSPGPTLTPLSFLRPSSLLSLPVLGQQSQRATEIESCSSCLVRKLIS	503906	525584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_504473_506190_506357_510465_510643_512049_512171_512294_512421_512505_512568_513891_513985_514281_514396_514584_514778_516930_516992_517069_517103_521091_521200_521994_522092_524168_524440_525012_525168_525549
870010	contig_9345_pilon	-	3259	10	Intergenic	novelGene_24523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_9	207.210455429996	482	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	153	2486	706868	673398	FALSE	30	CATGCTAGTGAACAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSLENTISFEEYIRVKARSVPQHRMKEFLDSLASKGPEALQEFQQTATTTMVYQQGGNCIYTDSTEVAGSLLELACPVTTSVQPQTQQEQQIQVQQPQQVQVQVQVQQSPQQVSAQQFSPQLTVHQPAEQPIQVQVQIQGQAPQPAAPSIQTPSLQSPSPSQLQAAQIQVQHVQAAQQIQATEIPEEHIPHQQIQAQLVAGQSLAGGQQIQIQTVGALSPPPSQQGSPREGERRVGTASVLQPVKKRKVDMPITVSYAISGQPVATVLAIPQGQQQSYVSLRPDLLTVDSAHLYSATGTITSPTGETWTIPVYSAQPRGDPQQQSITHIAIPQEAYNAVHVSGSPTALAAVKLEDDKEKMVGTTSVVKNSHEEVVQTLANSLFPAQFMNGNIHIPVAVQAVAGTYQNTAQTVHIWDPQQQPQQQTPQEQTPPPQQQQQQLQVTCSAQTVQVAEVEPQSQPQPSPELLLPNSLKPEEGLEVWKNWAQTKNAELEKDAQNRLAPIGRRQLLRFQEDLISSAVAELNYGLCLMTREARNGEGEPYDPDVLYYIFLCIQKYLFENGRVDDIFSDLYYVRFTEWLHEVLKDVQPRVTPLGYVLPSHVTEEMLWECKQLGAHSPSTLLTTLMFFNTKYFLLKTVDQHMKLAFSKVLRQTKKNPSNPKDKSTSIRYLKALGIHQTGQKVTDDMYAEQTENPENPLRCPIKLYDFYLFKCPQSVKGRNDTFYLTPEPVVAPNSPIWYSVQPISREQMGQMLTRILVIREIQEAIAVANASTMH	722256	672624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_673591_675089_675181_675486_675639_675997_676107_679449_679565_681692_681848_682531_682710_689142_690175_706559_706890_722125
870011	contig_14513_pilon	-	1161	2	Intergenic	novelGene_70360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	184	471	18880	11982	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGILRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12121_18731
870012	contig_12786_pilon	-	9444	1	Intergenic	novelGene_103440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	388	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGATTTCCCAGCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614077	604633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_604600_614100
870013	contig_11989_pilon	-	2518	23	Intergenic	novelGene_68441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_21	327.055862491536	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	435	2150	90274	46235	FALSE	50	ATATACATATATATACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	226888	45866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_191091_191143_226759
870014	contig_1443_pilon	-	2227	10	Intergenic	novelGene_28292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_9	467.188940550651	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	642	1565	776427	748649	FALSE	55	GAAAAAAAAAGAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809478	747986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_805197_805224_808694_809197_809399
870015	contig_10907_pilon	-	1949	9	Intergenic	novelGene_144899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_8	253.924416657792	1160	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	86	1090	41010	14797	FALSE	40	AACCAAACTCATTACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVIVVGNPANTNCLTAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITTVQQRGAAVIKARKLSSAMSAAKAIGDHVRDIWFGTPEGEFVSMGVISDGNPYGVPDDLLYSFPVVIKNKTWKIAEGLTINDFSREKMDLTAKELTEEKENAFEFLSTA	41095	13937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_16700_16878_28331_28455_30318_30495_36029_36127_36951_37051_41007
870016	contig_12624_pilon	-	3710	2	Intergenic	novelGene_61027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1250	junction_1	0	119	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATATACACAGGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865730	860733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770
870017	contig_2278_pilon	+	5959	1	Intergenic	novelGene_118087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAAAAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639801	645760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_639800_645800
870018	contig_2367_pilon	-	1614	4	Intergenic	novelGene_65322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	681.660880171039	1526	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	101	307	213194	193580	TRUE	35	AACATAATTTAAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	213294	192226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_192429_192474_193619_208552_208634_213107
870021	contig_6102_pilon	+	2330	12	Intergenic	novelGene_32262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	46.5053093920779	666	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	256	1770	1444370	1449029	FALSE	5	CGGCTGCTTCTGTTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFSFLWAARPLQRCSHLVRMATRAQHSKTAQTQTGEAARGWTGQESLLDSDPEMWKLLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGYPGKRYYGGVEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAAYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPKTGLIDYDQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADVVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVRAVDPKSGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLRNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVLELVSITANKNTCPGDQSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLNDLETRQRLADLRQRVEQFARAFPMPGFDER	1444114	1449589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1444403_1445518_1445717_1446169_1446250_1446429_1446631_1446941_1447024_1447182_1447306_1447414_1447555_1447907_1448074_1448238_1448339_1448424_1448581_1448676_1448785_1448901
870022	contig_6503_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_145777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAAAAAAAAAACAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254582	256424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_254600_256400
870024	contig_641_pilon	-	2352	10	Intergenic	novelGene_170142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	107.732178211629	34	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	94	951	106083	56580	FALSE	25	TCCAGGATGAACTACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAAPGSFGCGFRLRGCTDAKYSKNTSGRTHAMKDKADQKHKPPDVFDFPDDSAISSIDRLGENEQDEEPYEAFAPPLHSTAIYADEEEFSKQCGSSIPSTPQGKEARRSLNTSENEASESVKNHAKELGGKLKPVIDVSESTEKSDVTKDKPAEKRSTQQHEATPAMASSELSGKPAKLVTPKKTGPLNAQSSVENETQATESQQQKIQKKRKMSHGKGKKSRSKDVDSDSDIFDSAFIWCLEGKKTNDIMELGIVLSAFEKTLLEYKQRIESRVCKEAINEFYSIIKEELIKMIKEVQILKNLKRKNAKVSHLCD	109251	55178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_56649_56889_56969_70624_70740_72947_73018_87159_87397_87882_87938_95922_96029_103545_103664_106074_106124_109198
870025	contig_10196_pilon	+	1097	9	Intergenic	novelGene_132157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_4	223.494267264286	370	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	125	907	1038364	1050606	FALSE	0	CCCCTGCCTGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034585	1050796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
870026	contig_4924_pilon	-	1934	12	Intergenic	novelGene_84690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1136.55300240364	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	381	1331	137265	65524	FALSE	40	ATTTTAGGGTTCAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEEEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252484	64920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69155_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137293_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
870027	contig_4924_pilon	-	2062	12	Intergenic	novelGene_84676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1154.54564065854	3	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	24	914	252576	82377	TRUE	35	AAAGATTTAGAGATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRPTAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252599	64819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69180_74652_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_133061_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
870028	contig_4924_pilon	-	1187	7	Intergenic	novelGene_84683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1379.4667649333	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	19	639	252576	65386	FALSE	70	GATTAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKEDHIANFYQERRLFLH	252594	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65439_133082_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
870029	contig_7179_pilon	+	2275	6	Intergenic	novelGene_78060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	429	junction_1	183.801632201676	228	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1094	1735	397104	402057	FALSE	15	TAAGTCTGTGTTCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRYCPNSVLVIIDVKPKDLGLPTEAYISVEEVHDDGTPTSKTFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLRDIKDTTVGTLSQRITNQVHGLKGLNSKLLDIRSYLEKVATGKLPINHQIIYQLQDVFNLLPDVSLQEFVKAFYLKTNDQMVVVYLASLIRSVVALHNLINNKIANRDAEKKEGQEKEESKKDRKDDKEKEKDKEKSDVKKEEKKEKK	392269	402597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_392418_395399_395492_396250_397128_397713_397795_400662_400755_401612
870030	contig_12923_pilon	-	4005	13	Intergenic	novelGene_30094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	352.239975017033	19	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	572	1981	68226	51921	TRUE	20	TTTTTATGAGGTTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKVTWAWGTLGLFLETLQPACAPPTPAWEGRTSGFKTYFLVAFNDLFLLLFLRSTQQNIHEFNSFSVYNSATLITFFKLGNHPHPPFSKSFLPH	93699	45345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602
870031	contig_5280_pilon	+	2070	9	Intergenic	novelGene_52600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	718.613323961503	2	95	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	25	549	38343	41748	TRUE	30	TCTCACGTAGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCESEKIML	38318	79152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41079_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56213_56341_78032_78739_78823
870032	contig_3825_pilon	-	3032	6	Intergenic	novelGene_77969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	98.2637267764662	917	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	134	943	39691	27914	FALSE	20	GTATGCAGTGTGATCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPPPRTSSETGRALPVEAVRARAPSRPSAEQASEPASPRASAAAMGQNDLMGTAEDFADQFLRVTKQYLPHMARLCLISTFLEDGIRMWFQWSEQRDYIDSTWNCGYLLASSFVFLNLLGQLTGCVLVLSRNFVQYACFGLFGIIALQTIAYSILWDLKFLMRNLALGGGLLLLLAESRSEGKSMFAGVPTMRESSPKQYMQLGGRVLLVLMFMTLLHFDASFFSILQNIVGTALIILVAIGFKTKLAALTLVAWLFAINVYFNAFWTIPAYKPMHDFLKYDFFQTMSVIGGLLLVVALGPGGVSMDEKKKEW	39824	25824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_28181_29179_29367_30072_30117_30782_30860_31393_31581_39643
870033	contig_12057_pilon	-	2680	20	Intergenic	novelGene_131626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTGGCAGGCGCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162323	99443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_99554_114851_114940_121137_121269_135368_135431_136620_136726_140421_140510_140827_140974_142174_142274_143969_144052_145734_145944_147493_147584_148241_148293_149410_149470_149668_149749_152877_152937_154466_154537_155465_155641_156318_156395_157620_157720_161522
870034	contig_10042_pilon	-	4930	19	Intergenic	novelGene_79154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_16	247.81046744998	238	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	168	2213	701601	651768	FALSE	25	ATTCTTTAATTCTACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGYDSAGVGVDGGNDKDWEANACKIQLIKKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTRWATHGEPNPVNSHPQRSDKNNEFIVIHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKLVKYMYDNRESQDISFTTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEHKLSTDHIPILYRTGKDKKGSCNLSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDDVAAVVDGRLSIHRIKRTAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTMRGRVNFDDYTVNLGGLKDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLMCLRYCKERGALTVGITNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNAFQQVIARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE	701768	649050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_651813_652485_652648_653565_653734_654318_654447_654848_654964_664497_664656_665058_665180_667941_668040_670008_670105_671078_671243_675019_675126_678666_678747_679820_679883_680768_680904_681825_681885_685217_685344_693475_693584_695784_695893_701594
870035	contig_5482_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_144493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCAGGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537673	535875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_535900_537700
870036	contig_16098_pilon	-	1673	9	Intergenic	novelGene_46000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1209.05830478724	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	765	1550	350111	348413	FALSE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDLPPPFSCQEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352353	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350422_350512_350643_350765_350889_352152
870037	contig_12790_pilon	+	1560	8	Intergenic	novelGene_35212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_6	132.712055955434	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	213	965	307252	311112	FALSE	5	GGCCTGTGTTTCTGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPALSPCAVSSTLPDWRIPVEILPDSTSDLYNFQVSPMPSTSEAATDEDEEGKLPEDIMKVKPLPTWPHF	305931	311707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032_310166_310370_310494_311029
870038	contig_12528_pilon	+	3166	4	Intergenic	novelGene_81294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_3	220.142882894017	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTAACTGTGATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332290	346853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_333042_337048_337153_338090_338141_344592
870039	contig_6048_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_73125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933259	929420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_929400_933300
870040	SIRV6	+	1486	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	24	18	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
870041	contig_9955_pilon	+	2620	7	Intergenic	novelGene_21381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.3509902804525	381	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	200	1069	570882	580436	FALSE	45	AATAAAATTAGTAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASVTIPIWQNKPHGAARSVVRRIGTNLPLKPCPRASFEALLNISDLCLRDAPPVPTLADIAWIAADEEETYARVRSDTRPLRHTWKPSPLIVMQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAASASLTPDFLSPGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDLNRSLLKEEDPAVLISEVLRRKFALKEEDITRKGN	570535	581987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_570610_570756_570897_571397_571503_574376_574487_574747_574960_576188_576511_580330
870042	contig_9482_pilon	-	3170	2	Intergenic	novelGene_44219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1649	2431	209792	203095	FALSE	0	GCTTTTTGCGTCTGCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLNDPPNWNIRPNSRAEGGDGSRWNYALLVPMLGLAAFRWIWSRESQKEIEKEREVFHQRTAAFQRDLEAKYHAIISENRRAVAQLSLELEKEQNRTASYREALISQGRKLVEEKKLLEQERARVMQEKRQLQPLRSAYQSCLEREEDWQRRARLLLKEFEDALTERQNIYCSLVLPRSKRLEIEKSLLVRASVDPVAADLEMVTGLTDIFRHDTYCGDVWNTNKRQNGRLMWLYLKYWELIVELKKFKRVEKAILEK	211440	202355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_203757_209671
870044	contig_15003_pilon	+	3471	23	Intergenic	novelGene_137333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGAGGGAGGGCGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214711	313705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_216186_219570_219626_224438_224546_225456_225573_226785_226886_226984_227046_227150_227227_237548_237613_237739_237813_237892_237987_239529_239621_239916_240016_240106_240180_242389_242462_245918_246058_248537_248598_252632_252755_254119_254218_258574_258645_262502_262592_265856_265957_273246_273286_313506
870045	contig_14711_pilon	+	1887	4	Intergenic	novelGene_68944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	41.206795556073	26	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	137	517	133634	135401	FALSE	30	TCAATTATATTTTGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	133497	136771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_133699_133925_133978_134106_134197_135227
870046	scaffold_12124_pilon	+	2128	9	Intergenic	novelGene_22048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	556.579452998402	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	211	702	846536	852375	TRUE	35	AACTTGGATCTCTATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRFPLLNPQQPAGQRPGATPVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829615	858963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829679_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
870047	scaffold_12124_pilon	+	2474	11	Intergenic	novelGene_22049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	515.687734971465	2	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	548	1039	846536	852375	TRUE	20	CTCTATAAACTGGCGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829615	858972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837426_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
870048	contig_500_pilon	+	2018	10	Intergenic	novelGene_30946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_4	496.208463759107	438	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	202	1314	1452302	1480676	FALSE	30	TAACCATTTATTGAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSITQVSIYEVDKQDCRKFCTTGIDGAMTIWDFKTLESSIQGLRIM	1446769	1481380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446943_1452273_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129_1469324_1477837_1477929_1480637
870049	contig_5003_pilon	-	3116	24	Intergenic	novelGene_120179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_5	230.092732189496	296	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	293	2689	81162	3627	FALSE	15	TGTGGCTTCATTAATTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPRAAPQPYLGLVLEKLRRVVAALPEDMRPGPDPYGFPWELVTGAAIFGFFAVLLFLWRSFRSVRSRLYVGREKKLAVKLSTLIEEKCKLLEKFSLVQKEYEGLESSLKDGKESTEAQSLETTYEKLDRSKSELEDEILFLEKQLKEEKSKRSEKDELGMDISERIQSLEDESKSLKSQVAEAKMTFKIFQMNEERLKIAIKDALNANSQLQESEKQLLQEAEEWKEQLSELNKQKITFEDYKVHVEQVLSDKENQIKSLTEHLLKMKDWTAVLGEDVVDDDSLELEMKSESEYGTYLDDQPRGALKKLIHAAKLNASLKTLEGERNQIYIQLSEVDKTKEELTERIKDLQTEQSSLQSENAQFENENQKLQQKLKVMTELYQENEMKLHRKLTVEENYRLEKEEKLSKADEKLSHAAEELEIYRKRAKDLEEELERTILSYQGQITSHEKKAHDNWLAARTAERNLNDLRKENAHNRQKLTETEFKYELLEKDPYALDVPNTFGREHSPYGPSPLGRPSPETRAFLSPPTLLEGPLRLSPLLPGGGGRDSRGPGNLLDHQITNERGESSYDRLFGPHRAPSDTGSLSPPWEQDRKMMILPSGQLYPDPAFPPQRQDRYYSNSGRLSGPAELRSFNMPSLDKADGPMSSEMESSKNDPKDDLGNLNVPDSSLPAGNEATGPGFGPPPLPPVKGPLFPVDTRGPFMRRGPPFPPPPPGSMYGASRDYFPPRDFLGPPHPPLAMRNVYSPRGFPHYLPPRPGFYPQPQHPEGRSEFPPGLIPPSNEPATEHPEPQQET	81454	3199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_3794_5044_5280_5929_5989_10843_10967_26584_26744_30290_30420_32065_32146_33647_33716_38164_38201_39044_39106_40063_40166_43948_44088_46242_46334_47075_47123_48362_48484_50755_50879_56381_56487_60549_60622_61267_61379_63554_63618_66502_66592_66684_66707_71647_71780_81099
870050	contig_593_pilon	-	3228	1	Intergenic	novelGene_101967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTGTGTTGCTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112041	108813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_108800_112000
870051	contig_7426_pilon	-	1875	9	Intergenic	novelGene_27530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	264.720577921324	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	41	832	1102797	1087105	TRUE	40	TATGTCAAAGATGCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKSEVWRVLGVEMEESEYESVLCVKPEVHVYRIPPRATNRGYRAAEWQLDQPSWSGRLRITAKGQVAYIKLEDRTSGELFAQAPVDQFPGTAVESVTDSSRYFVIRIEDGNGRRAFIGVGFGDRGDAFDFNVALQDHFKWVKQQCEFAKQAQNPDQGPKLDLGFKEGQTIKLNIANMKKKEGAAGTPRARPASTGGLSLLPPPPGGKVSSLIPPPGEQLSVGVSPAQPAVVPSSGGATVSWPQPKPATADVWGDFTKSTGSTSNQTQPGTGWVQF	1102837	1085917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1086905_1087048_1087154_1087993_1088070_1090921_1091100_1093372_1093482_1094467_1094550_1094634_1094740_1100318_1100420_1102705
870052	contig_15304_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_30583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGCTCAGGGCACCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56175	54773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_54800_56200
870053	contig_3424_pilon	+	2147	4	Intergenic	novelGene_55482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.088738547009	6	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	103	1545	163695	170332	FALSE	10	TACAGCTTCTGGTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCSRGAWAPAEPRPWRGCAPPSRLGLREPAALEMELLPLWLCLGFHVLTVEWRNRSVMATAAAQGGCKSVGGVADCREQHLASVPSDLSPYSQTLILDANPLKTLWNHSLQHYPHLESLSLHSCHLECISHDAFQEQARLHSLALADNALSENYKETAAAFHSLQGLRRLDLSGNSLTEDMVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSPQLCRFQEYGVFEEPLSTGMWARDPTRLCVPGDPPHSLRPIQQLGDSECKHRPSPAYCPHVTGPVSQECGPQFQLHGVGLLWVWESEGLGSVRKFLVQFPQVWGQPVPTDPGSPQKLPHSPSPEGCI	149901	170934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149991_163681_163803_168701_169651_169946
870054	contig_16766_pilon	-	3023	1	Intergenic	novelGene_153357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGTAATTCAGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129419	126396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_126400_129400
870055	contig_1107_pilon	-	4709	1	Intergenic	novelGene_126540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	348	4361	4708	127003	126656	NA	35	GGAAGCAGGACGAAGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLIHLALQVGDLAGRLYELPVVLVHVALQVLRRLLRQRLDALPVLLEVPVPVRLLRELLHVQPRLEAARLQLPPQTARPAVRHRHRHFRPARGQSLSLSLPRSTPTPPLLRSRL	131363	126654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_126700_131400
870056	contig_2087_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_65568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1176	1517	71331	71672	NA	30	ATTTCAAAGTGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYAFPHLGLHLWSGLPGTRFHDLLVWLTSAYPSQLSSYFTLFGSCSQACVKSTWHLGHACLTILITLCDNFSLTGHWTLSSTVLAMSFVSTGTVFCLLFYPQHQASAWHTVP	70155	71914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_70200_71900
870057	contig_366_pilon	-	2462	9	Intergenic	novelGene_51582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	594.710420604011	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	872	1240	769115	757099	FALSE	40	AAAAGGAAGTTTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803360	755876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770482_779997_780185_802171_802279_802934
870058	contig_13216_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_47504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1660	2100	260572	261012	NA	15	TTAGTTTTGTGTTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTEGNPGEVENIEEVSSETEVVTIEEENTSDVVPGSPVTTIRRENSLHSSSNQSKPGSVTLNLYHSRNGSDSGLVESDSSLSDSEFPPGNKTEIKAEGQDSTTLRNTTTSFGYDKPHVLVELLVDGGGKESLIGYRLPADSKEFS	258912	261549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_258900_261500
870059	contig_9807_pilon	+	2028	9	Intergenic	novelGene_32850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	592.537129638304	72	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	134	799	109130	154138	TRUE	5	CCGTGCTCTGGAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTSTPTTSLRWWRYTLGVTWWPLGARTGMSTSTPSWAPR	108996	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128710_151746_151820_154095_154270_156624_156770_158676
870060	contig_11908_pilon	+	2519	16	Intergenic	novelGene_133225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_9	95.3598098432109	471	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	193	1830	692429	837058	FALSE	40	ACTCTGAAATATAATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVAAGAASVELVIGWCIFGLLLLAILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSHGLAALSFSISSLTLIGMLAAITYTAYGMSALPLNLIKGTRSAAYERLENTEDIEEVEQQIQTIKSKSKDGRPLPARDKRALKQLEERLRTLKKRERHLEFIENSCWTKFCGALRPLKIIWGIFFILVALLFVISLFLSNLDKALHSAGIDSGFIIFGTNLSNPLNMLLPVLQTVFPLDYILITVIIMYFIFTSMAGIRNIGIWFFWIRLYKIRRGRTRPQALLFLCMILLLIVLHTSYMIYSLAPQYVMYGSQNYLIENNTTYDDHKGNSTISVPKRCDADAPEDQCTVTRTYLFLHKFWFFSAAYYFGNWAFLGVFLIGLIVSCCKGKKSVIEGVDEDDSDLSDDEPSVYSV	692236	837747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_698010_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_752803_752878_783983_784110_788412_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_836668_836761_836941
870061	contig_3948_pilon	+	3267	1	Intergenic	novelGene_53184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784156	787423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_784200_787400
870062	contig_5153_pilon	+	2073	13	Intergenic	novelGene_74355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	260.277776295506	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	288	1358	1010261	1022174	FALSE	15	TTCTAGAATTTTTTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956550	1022889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956805_1010227_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
870063	contig_5698_pilon	+	912	1	Intergenic	novelGene_55050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGTTCAGTGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35623	36535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_35600_36500
870064	contig_3382_pilon	+	3082	1	Intergenic	novelGene_124112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCTAGTTCTTCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709043	712125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_709000_712100
870065	contig_11378_pilon	-	807	1	Intergenic	novelGene_112227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAACTATATCTATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299346	298539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_298500_299300
870066	contig_8921_pilon	+	4911	3	Intergenic	novelGene_161619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	23	607	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1788	2984	33857	35053	FALSE	15	GGCATACTTTTTTTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASFVKSCIFHVSGTGTSEEVGMDFPASSGLLPHQAAPSSEKPHSGIERGEAFHSGNRQYEWGECGSTFSHEHTLLQPQSFCTGEGLYRCNRCGHPTVSCKCRRGKGQRTGPQERPYECGICGQFFGQISILVKHQITHSAERPYECSECGKSFKRTAELIRHWRIHTGEKPYECSECGKSYTRSSNLVEHQRSHTGEIGYARYTCGICGKSFKQSSKLTLHKRVHTGERPYECDQCGKCFSQISNLMQHQSVHTGERPYDCAECGRSFSRRSNFIEHQKVHTGERPYECGECGKFFSRSSILSEHQRVHTEERPYECGECGKAYRRVSSLIEHQRVHTGERPYECSDCGKSFIRNSTLTRHRRVHTGEFSGEFAGDFTEEFTDEFAGDFSLENAL	14051	36980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_15422_17435_17561_33564
870068	contig_15849_pilon	+	2344	6	Intergenic	novelGene_176059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	38.9389265388762	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	9	656	89870	109637	FALSE	35	TAATAGATACCTTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMTCKTMATGVPSPAGPSSGQTCVLILIFTLLLQSLSVAVTYLYFTKELKQMQDKYSRSGVACFLKEDDSFGDPDDEDSMDNPCWQIKWQLRQLVRKMVMRIYEETTPTGQEKQQDSPYLGRERSLPRVAAHITGNSRRTSTFLPPSSGNEKALGQKIKTWESSRKGHSFLNNLHLRNGELVIHQTGFYYIYSQTYFRFQEKETVPTVSLEENRKM	89861	111325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_90020_97054_97193_100149_100193_106574_106680_108831_109034_109627
870069	contig_16098_pilon	-	2045	7	Intergenic	novelGene_45985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1244.97386184075	8	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	878	1921	350530	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	351407	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236
870070	contig_8075_pilon	+	2418	1	Intergenic	novelGene_42496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGACTGTTTTTCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688425	690843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_688400_690800
870071	contig_5718_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_110391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTCTTCTCTCCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240612	1239982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1240000_1240600
870072	contig_9807_pilon	-	2381	14	Intergenic	novelGene_32892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1672	2103	140308	122967	TRUE	25	CTCAGACTCGCCAAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIWPSALAVANLFPSGENLTQLTKRLWSSIVNLNLNGGPSKNAAQLSSLPVASRYGLVCLMSTLLMTLLCPVISPTEEPLSHRKTAPNFSLPSPTTAILLLSSVHAMSLIFPAKGWYSYFRRCSFCVVSQILSFPDTSPEAM	159622	109063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_109146_109556_109679_122892_122982_126621_126772_128536_128716_139397_139476_140298_140382_140723_140956_145113_145204_147121_147276_148957_149047_151709_151818_154093_154144_158747
870073	contig_5967_pilon	-	2303	8	Intergenic	novelGene_44344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	436.736085254316	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	151	1053	488569	388566	FALSE	35	CTGGGCAATGGTTAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAVIHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517652	387315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430757_488451_488583_517515
870074	contig_2054_pilon	+	1796	3	Intergenic	novelGene_51649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	603	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCTTAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	18585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890_18339_18408
870075	contig_6735_pilon	-	1197	12	Intergenic	novelGene_15804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1033.57405265131	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	173	703	564230	543312	TRUE	20	AAGCTCCTCGAGTGACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLRRSNGGEPRPSKVLGAQNTSTQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAS	568285	542478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543318_544968_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552906_564157_564232_564784_564869_568198
870076	contig_8674_pilon	-	3717	7	Intergenic	novelGene_102893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	188.720030733359	134	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1558	2232	158414	134760	FALSE	15	TATAGTTCTCAGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNISRYITDIKPLPPNIKDRLIKIMSMQGRITDSNISEILHPEVQTLDLQSCDISDTALLHLCNCRKLKKLNLNSSKEDRISITSEGIKAVASSCLYLHEAFLKRCCNLTDEGVLALALNCRLLKVIDLGGCLGITDVSLHALGENCLFLQCVDFSATQVSDSGVIALVSGPCSKKLEQIHMGHCVNLTDEAVEAVLTCCPQICIFLFHGCPLITDNPRSWTI	202281	133274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_134786_140502_140615_148677_148735_149048_149267_154628_154774_158297_158431_200740
870077	contig_5033_pilon	-	2116	14	Intergenic	novelGene_29062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3412.80304721108	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	24	1466	566787	532125	TRUE	35	TTGTCAGTCAACATCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	531104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531164_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
870078	contig_9183_pilon	-	2330	7	Intergenic	novelGene_40317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	2	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	165	2048	323783	312131	FALSE	30	GATATGAAATCCATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325982	311848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
870079	contig_14516_pilon	-	5649	1	Intergenic	novelGene_153956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	407	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429225	423576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_423600_429200
870080	contig_12502_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_178150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTTAATTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7404	8438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12502_pilon_+_7400_8400
870081	contig_4429_pilon	-	2674	11	Intergenic	novelGene_50801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	520	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGAAAAGTTGGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199362	165234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_165425_166679_166776_168309_168497_172182_172366_174811_174937_182069_182220_182827_182910_183985_184522_184661_184711_191593_191744_198436
870082	scaffold_6394_pilon	-	1020	7	Intergenic	novelGene_111024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	186	488	406094	405349	TRUE	20	CAGGATCAGGGAGGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSVSIRSSFTASAANRRIPSESFSTAIWSSLCSQRKAFSSRCTFSKSLAWALAESVGTSLLVSLSSSPSSLGETVRKSQPASALTSSVLRKEAPMTMVL	406279	402171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_402242_402863_402971_403237_403372_405024_405200_405302_405498_405717_405863_406085
870084	contig_2214_pilon	+	3515	11	Intergenic	novelGene_144265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	277.15800547702	103	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	115	1422	321953	332897	FALSE	30	CAAAAGGTATCATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTSSQDAQGKGDDVIVIDSDDEEEDDDENDGEHEDYEEDEEEDDDDEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGGESSQRAADSQNSGEGNTGAAELSFSQEISREQQPSSASERQTPRAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQMTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESATSDASEHASQSVPMVTTSTGTLSTTNETATGDDGDEVFVEAESEGISSEASLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSSVGKFLPLATIQLWYIKLVCKDAVLLVTIL	319342	334990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_319429_321924_322124_322967_323100_323302_323394_325277_325463_326544_326614_326727_326823_328632_328740_330463_330560_330691_330849_332692
870085	contig_13894_pilon	-	1930	8	Intergenic	novelGene_62195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_4	147.225496904495	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	105	1262	766610	750013	FALSE	25	GAGTAGCGGTGCCACGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGRTLADKGVSRGQRQPREWELEPKCPAPRDRPMLSSPQTPGTRKPMKTLAPDEFSFNFENLRLAHGRNTTFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	766714	749344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762299_763800_763958_766578
870086	contig_16098_pilon	-	2531	17	Intergenic	novelGene_45847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	312.232060133164	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	895	2448	214687	201500	FALSE	25	TTGCTACAGTTCCTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230490	201416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214784_214897_215040_215290_215395_215520_215649_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
870087	contig_8273_pilon	-	4357	14	Intergenic	novelGene_113076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_6	119.601013235106	332	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	155	1120	109068	80548	TRUE	45	GCATGGAAAGTAGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSRQVTCVSWVRCGVAKETPDKVELSKEEVKRLITEAKEKLQEEGGSDEEETGDPSEVGMQSARTQARPREPLDDGDPEDNRTLDDDELAEYDLDKYDDDGDPDAETLGESLLGLTVYGSNDQDPYVTLKDTEQYEREDFLIKPNDNLIVCGRAEQDQCNLEVHVYNQEEDSFYVHHDILLSAYPLSVEWLNFDPSPDDSTGNYIAVGNMTPVIEVWDLDIVDSLEPVFTLGSKLSKKKKKKGKKSSSAEAHTDAVLDLSWNKLIRNVLASASADNTVILWDMSLGKPAASLAVHTDKVQTLQFHPFEAQTLISGSYDK	109222	73184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_74697_75644_75751_77137_77260_77351_77443_79141_80614_81309_81407_94043_94106_94894_95026_96088_96200_100983_101081_101570_101657_105590_105776_105910_105970_108996
870089	contig_13787_pilon	-	4900	7	Intergenic	novelGene_40628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_2	376.954351789886	214	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	353	1216	205032	171575	FALSE	70	TTACAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIEVRCNLALLTLFIHSLVCSLIFITNIYSKPNKNQVLLKITGIPSAQIPAFLSVSLESEEGFTVLSVE	205384	167890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
870090	contig_9668_pilon	+	3817	1	Intergenic	novelGene_58222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCTGGAGTAGATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547131	550948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_547100_550900
870091	contig_2596_pilon	+	3069	3	Intergenic	novelGene_53512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	81.5	378	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1843	2364	1033998	1034883	FALSE	60	AAGCAATCTTAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQVTWASAPPNDSDPLLSSCTPASTPSPIINDIVSCFCTLSLR	1030872	1035588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1032701_1033983_1034157_1034520
870092	contig_10011_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_68124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATTTGAAAAGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347156	349295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_347200_349300
870094	contig_12624_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_61142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGATAAAAAGTTCGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949728	947520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947500_949700
870095	contig_9696_pilon	+	3057	14	Intergenic	novelGene_68779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	836	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGTGGCCCCCGCACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196774	255727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_198513_206410_206500_206591_206749_210594_210683_211286_211364_214715_214754_216374_216451_224241_224349_226517_226615_238468_238593_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599
870097	contig_15664_pilon	+	4523	11	Intergenic	novelGene_171501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	74.1437118034969	484	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	112	1422	22071	78745	FALSE	65	AATGTAAAATAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMMEKGPELLGKNRSANGSAKSPAGGGGSGASSTNGGLHYSEPESGCSSDDEHDVGMRVGAEYQARIPEFDPGATKYTDKDNGGMLVWSPYHSIPDAKLDEYIAIAKEKHGYNVEQALGMLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKSFHRIQQMLPDKTIASLVKYYYSWKKTRSRTSLMDRQARKLANRHNQGDSDDDVEETHPMDGNDSDYDPKKEAKKEGNTEQPVQTSKIGLGRREYQSLQHRHHSQRSKCRPPKGMYLTQEDVVAVSCSPNAANTILRQLDMELISLKRQVQNAKQVNSALKQKMEGGIEEFKPPESNQKINARWTTEEQLLAVQGTCPTGSSDSGSISSCPIIHSNTNSPYCHSEPASTTSSSSVACCPCSSPAASSTPAAGSVHPAPANFKSASTTSHPPC	21959	81846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_22237_22618_22676_30013_30092_33059_33113_35501_35664_37092_37218_37969_38049_53258_53478_59964_60043_69704_69763_78509
870098	contig_13707_pilon	-	2000	3	Intergenic	novelGene_43564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_2	156.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	505	972	271948	270728	FALSE	55	TGAAAAATATTTACAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAIQNFPSNFKEFFPFQPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFIEIKNHIFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPSDLRHFDPEFTEEPVPSSIGKSPDSILITASVKEAAEAFLGFSYAPPMDSFL	272452	269699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738
870099	contig_5782_pilon	-	7426	3	Intergenic	novelGene_162124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	118	junction_1	23	357	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1160	3483	512	3994	269282	265800	FALSE	20	ATGCAATTTCTCCGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHGEELGSDVHQDSIVLTYLEGLLMHQAAGGSGTAVDKKSAGPDEEDQNFNISGSVLPACQSNGPVRNTHTYQGSGMLHLKKARLLQSSEDWNAAKRKRLSDSIVNLNVKKEALLAGMVDNVPKGKQDSTLLASLLQSFSSRLQTVALSQQIRQSLKEQGYALSHDSLKVEKDLRCYGVASSHLKTLLKKSKAKDQKPDTNLPDVSKNLIRDRFVESPHPVGQSGTKVMSEPLSCAARLQAVASMVEKRASPATSPKPSVACSQLALLLSSEAHLQQYSREHALKTQNANQVASERLAAMARLQENGQKDASSFQLSKGVSGHLNDQARTSSSKPVASKSSATTFQSPMGIVPSSPQNSGYKNSLERNSVKQAASNSLLLHLLKSQTIPKPMTGHNHSERGGIFEDSSTPTTIDEYSDNNPSFTDDSSGDESSYSNCVPIDLSCKHRIEKPESDQPVSLDNLTESLLNTWDPKVPDVDIKEDQDTSKNSKLNSHQKVTLLQLLLGHKNEESVEKNTSSQGVHSDVTKFSSQSYTRTSVIESPSTNRTTTPLSTPPLLTPTKAESPINLSQQSLVIKWNSPPYACNTQSEKLMNTASNHLIDLTKNKESQAEKPVQNEGAQNSATFSASKLLQNLAQCGMQSSMSVEEQRPSKQLLTVKADQPIGMIDRLSSPRLSNKTNAVEENKAFSSQPAAPEPGLCGSEIENLLERRTVLQLLLGNPNKGKSEKKEKIPLRDESTQEHTDRALSEQILMVKIKSEPCDDLHSHNTNVHLSHDVKGGPFLGMAPATQRSTAALPASEDFKSELASPQDFSFSKNGLLSRLLRQNQESYLTDELGKSHRNSERTLVESKNLCMVPKKRKLYTEPLENPFKKTKTNIVDAANNHSAPEVLYGSLLNQQELKFSRSDLEFKYPTGHGSANESEQRSWTRDSKSFNVLKQLLLSENCVRDLSQHRSNSVVDSKKKGHKNNVTSSKPEFSISSLNGLMYNSTPPNSCIDNRTFSYPGVVKTPVSPPFPEHLGCAGSRPESGLLNGCSVPSEKGPIKWVITDVDKNEYEKDSPRLTKTNPILYYMLQKGGNSVTSQETQDKDVWRGPSCAESVSQVTVKEELLPVAETKASFFNLRSPYNSHRGNNASRPQSANGEVVYGLLGNVLTIKKESE	348231	262367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_269621_325402_325527_348182
870100	contig_13901_pilon	-	3963	13	Intergenic	novelGene_146638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	394	junction_1	186.283311711549	1215	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	214	1581	209975	157026	FALSE	0	CCGTGGGCTCTTTCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQSSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPGFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLELQVGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIEVFKKIANFTSDVEYSDDHCHLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVRVLFDEKKKCKWM	211113	154643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_157131_158312_158388_158480_158622_161336_161485_163875_164040_165269_165378_165477_165510_168717_168773_182381_182486_185157_185336_203281_203429_209864_210064_210988
870101	contig_4884_pilon	+	3497	22	Intergenic	novelGene_63788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	109.614475929657	342	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	298	1644	195448	258273	TRUE	35	TACATTCTAAAGGATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQFESSFELRKVGVKLSSLLGKKGNLEKLQSYWEVGFFLGASVLANDHLRVIQASEKLFKLKTPAWYLKSIVETILIYKHFAKLTTEQPVVKQELVDFWMDFLVEATKTDVTVVRFPVLILEPTKIYQPSYLSINNEVEEKTISIWHVLPDDKKGIHEWNFSASSVRGVSISKFEERCCFLYVLHNSDDFQIYFCTELHCKKFFEMVNTITEEKGRSAEEGDCESDSLEYDYEYDENGDRVVLGKGTYGIVYAGRDLSNQVRIAIKEIPERDSRYSQPLHEEIALHKHLKHKNIVQYLGSFSENGFIKIFMEQVPGGSLSALLRSKWGPLKDNEQTIGFYTKQILEGLRYLHDNQIVHRDIKGDNVLINTYSGVLKISDFGTSKRLAGINPCTETFTGTLQYMAPEIIDKGPRGYGKAADIWSLGCTIIEMATGKPPFYELGEPQAAMFKVGMFKVHPEIPESMSAEAKAFILKCFEPDPDKRACANDLLMNEFLKVSSKKKKTQPKLSAPSHHMQNILGVYPYRSLSWSKIRAAVVNMAQFHLTMS	187277	296256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_187315_194326_194487_195347_195502_204441_204550_211962_212013_214470_214567_218037_218120_228963_229098_234593_234722_235441_235579_236659_236766_242369_242528_245882_246061_258157_258356_258452_258622_265734_265921_271590_271697_284653_284898_290877_290991_292122_292236_294757_294835_295493
870102	contig_14727_pilon	+	4638	9	Intergenic	novelGene_56667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_3	60.4647366239199	564	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	382	918	352215	358112	FALSE	15	GCTAACTTTTCTTGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTQTSGKNAALYTGSSDHTIHCYSIKTRECVEQLQLEDRILCLHSRWRILYAGLANGTVVTFSIKNNKRLDIFECHGPRAVSCLATAQEGARKLLVVGSYDCTISVRDARNGLLLRTLEGHSKTVLCMKVVNDLVFSGSSDQSVHAHNIHTGELVRIYKGHSHAVTVVNILGKVMVTACLDKFVRVYELQSHDRLQVYGGHKDMIMCMTIHKSMIYTGCYDGSIQAVRLNLMQNYRCWWHGCTLIFGVIDHLKQHLLTDHTNPNFQTLKCRWKNCDAFFTARKGSKQDAAGHIERHAEDDSKIDS	348809	361832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_348888_351207_351325_352028_352221_352710_352774_353505_353626_354191_354264_355229_355302_357068_357216_358055
870103	contig_2027_pilon	+	2156	13	Intergenic	novelGene_39901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	197.518072309571	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	120	1652	127316	136178	FALSE	10	GATGTGGCATGCCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDRTSVATLLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAAVVGLVCLELYKVVQGHQQLESYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEVQGLQPNGEEMTLKQFLDYFKIEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQP	122839	136682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_122912_127268_127379_128871_129038_129182_129380_131171_131237_131481_131678_132419_132495_132618_132809_134368_134458_134744_134838_134960_135153_135868_135971_136073
870104	contig_19744_pilon	-	5606	1	Intergenic	novelGene_120385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162026	156420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_156400_162000
870105	contig_1734_pilon	+	3938	1	Intergenic	novelGene_164387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638468	642406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_638500_642400
870106	contig_2367_pilon	-	1511	4	Intergenic	novelGene_65318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	681.660880171039	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	101	307	213194	193580	TRUE	25	CATAATTTAAGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	213294	192224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_192541_192691_193619_208552_208634_213107
870107	contig_8866_pilon	-	2331	6	Intergenic	novelGene_77764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	495.111058248551	93	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	307	666	418087	342321	FALSE	40	ATAATACATGGTATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQVSVEFSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	418393	340655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348839_356546_356636_361315_361406_363336_363439_418081
870110	contig_14273_pilon	-	2911	9	Intergenic	novelGene_21135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCGCAAGCCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152166	127910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_128271_128776_128845_135359_135519_137933_138052_139057_139183_147780_148027_148889_148959_149075_149548_150872
870111	contig_6215_pilon	+	1848	1	Intergenic	novelGene_21249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTAAATGGAGGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601465	603313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_601500_603300
870112	contig_6489_pilon	-	2630	5	Intergenic	novelGene_128956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	306.889536315594	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	19	762	395604	389842	FALSE	35	AAAAGTAGGATGTTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRDGSMGLWEVTDDVLTKSDARHNVSRVPVYAHITHKALKDIPKEDTNPDNCKVRALAFNNKNKELGAVSLDGYFHLWKAENTLSKLLSTKLPYCRENVCLAYGSEWSVYAVGSQAHVSFLDPRQPSYNVKSVCSRERGSGIRSVSFYEHIITVGTGQGSLLFYDIRAQRFLEERLSACYGSKPRLAGENLKLTTGKGWLNHDETWRNYFSDIDYFPNAVYTHCYDSSGTKLFVAGGPLPSGLHGNYAGLWS	395622	387973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_392609_392773_393919_393986_395427
870113	contig_6576_pilon	-	2761	14	Intergenic	novelGene_42221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	91.0173271754002	23	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	232	1206	252452	229096	TRUE	5	CGCGTCCTTTCTTGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAATGQEVELCLECIEWAKSEKRTFLRQALEARLVSLYFDTKRYQEALHLGSQLLRELKKMDDKALLVEVQLLESKTYHALSNLPKARAALTSARTTANAIYCPPKLQATLDMQSGIIHAAEEKDWKTAYSYFYEAFEGYDSIDSPKAITSLKYMLLCKIMLNTPEDVQALVSGKLALRYAGRQTEALKCVAQASKNRSLADFEKALTDYRAELRDDPIISTHLAKLYDNLLEQNLIRVIEPFSRVQIEHISSLIKLSKADVERKLSQMILDKKFHGILDQGEGVLIIFDEPPVDKTYEAALETIQNMSKVVDSLYNKAKKLT	261359	227421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_228977_229095_229239_229527_229580_229840_229877_230378_230505_233906_233970_236073_236135_236941_237087_241841_242037_245903_245962_246362_246435_252428_252491_258779_258854_261240
870114	contig_5947_pilon	+	2398	7	Intergenic	novelGene_101535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	534	junction_6	149.23443525764	3	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	24	842	537742	544234	FALSE	20	TGAATGTTTGGTCATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPLSVCGRC	537718	545790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_537793_539875_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543545_543632_544218
870115	contig_11285_pilon	-	1042	12	Intergenic	novelGene_5698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	428.431677726261	60	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	93	1031	788506	784252	TRUE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	789150	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784072_784249_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133
870116	contig_15029_pilon	+	2814	7	Intergenic	novelGene_128190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2285	2662	163198	172225	FALSE	10	GTCAGTCCTTCCGTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLAASKVDFRPGRDVGVKVVFGVTDVGTVVEAVVEEGTVVVLAVELVGDGVAVGTEQSSVLFTAWQSLAVELCEQWLFSFFTFYPKAGSISTGYTVMVAFTGFWCCSGVRRGSRRVRWGYLGGL	160851	172377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_161575_161636_163273_165444_165500_166430_166467_168144_168217_169580_169654_172158
870117	contig_16122_pilon	+	2320	2	Intergenic	novelGene_134505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_1	0	2243	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	667	1362	134090	137601	FALSE	35	TTATCTAAGGCTTCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQMEAPGAPPRTLTREAMEQIRYLHKEFAESWSVPRLAEGFDVSTDVIRRVLKSKFVPTLEQKLKQDQKVLKKAGFAHSFWQTQASGSITKPLSAGHSVSGSLLMPEGEASSKGQSRSTALEVIELNSHSTHTPRKQKGRSEGIQSLERIKESFVPVAAALGHQKELQKNYASDCESTGGTVSDGLPNGEKLEELKTREPSDQNLNFSSKVVQRGREFFDSNGNFLYRI	133423	138559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_134161_136976
870118	contig_14333_pilon	-	3436	1	Intergenic	novelGene_49139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436181	432745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_432700_436200
870119	contig_2463_pilon	-	2160	2	Intergenic	novelGene_43030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1838	2149	522976	516959	FALSE	40	CCCCATCATCACAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRIGYFIFLSVARLSWSLDISGSYASMTSVPLWSKNLAMDLVNSASRCCFVLPLMKVSFRVYLSSYLLRLEDSCQISSGSIPVGSFLWATRKMLFSLYEV	524813	516947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_517070_522775
870120	contig_11574_pilon	-	1647	4	Intergenic	novelGene_64083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282.708723286393	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	651	1232	451360	449708	FALSE	25	ACATATTAGTTCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSLVPFLPHFEPVKRNKSSNYKLLCKK	453475	449292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449787_450857_451826_452780_452925_453434
870121	contig_500_pilon	+	1584	11	Intergenic	novelGene_30998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	921.99937093254	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	201	1178	1492663	1498065	TRUE	10	TTGCGGGCATGTTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
870122	contig_9708_pilon	+	2935	3	Intergenic	novelGene_67241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1168	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCACACTTGAAGTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17752	40219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_20428_24127_24246_40077
870123	contig_11563_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_142308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACTGGTCAACATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318657	318178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_318200_318700
870124	contig_15449_pilon	+	2864	1	Intergenic	novelGene_33634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGTTGGGAAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80323	83187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_80300_83200
870125	contig_21422_pilon	+	1254	10	Intergenic	novelGene_79082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_9	93.9481075572055	45	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	177	1253	28409	40493	FALSE	15	GCCTCTCCAGCCACATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTLIDLPGIARVAVGNQPADIGRQIKSLIKQYIHKQETINLVVVPSNVDIATTEALSMAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKSKVEDIKLEQEREAEKSIRLHFQMEQIVYCQDRVYRDALQKVREKEAEKEKNNKGNFTFCQQSSSEESSVEEIFQHLLAYHQEISN	27094	40494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_27172_28309_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_38751_38998_40481
870126	contig_7157_pilon	+	3846	1	Intergenic	novelGene_131297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAACAGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898920	902766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_898900_902800
870127	contig_4301_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_65128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCAATGGGAGGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544171	546234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_544200_546200
870128	contig_2480_pilon	-	2757	2	Intergenic	novelGene_63556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1236	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1869	2243	364351	363977	TRUE	5	GCCTCCGCCCCGGCCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPKAGDTQSTATALLCDTSLRGSQCPLALCPASPSLVPRQHRGALSHPALLWEQRTEPRPCSEPLLKRNFFLLILANLGPPSEDFSFPVITPHLVNFHLHGAQIDSPRTVCLTGQHSPGFSY	366219	344430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_344771_363802
870129	contig_5316_pilon	+	2251	10	Intergenic	novelGene_61201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	288.782801033648	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	347	1660	474083	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	394702	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_394857_453778_453961_474072_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
870130	contig_7106_pilon	-	3955	1	Intergenic	novelGene_148324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATACAAAAAAGGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651794	647839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_647800_651800
870131	contig_8322_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_143266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTCCCAGTAGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417875	419850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_417900_419800
870132	contig_16098_pilon	-	1420	10	Intergenic	novelGene_46049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1269.13421446315	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	259	1326	350768	348413	FALSE	50	AATAATAATAAAATGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352290	348318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152
870133	contig_10134_pilon	-	3654	1	Intergenic	novelGene_16261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTTCTCTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36886	33232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33200_36900
870134	contig_10134_pilon	-	1921	3	Intergenic	novelGene_16264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	536	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGACACAGGCCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39726	33656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_35178_38558_38817_39584
870135	contig_8075_pilon	+	2574	10	Intergenic	novelGene_42505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	281.515343967054	2	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	87	995	719960	794834	FALSE	30	AAAAGTCTTATCGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC	719873	796413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794825
870136	contig_18364_pilon	+	4934	1	Intergenic	novelGene_102593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATATCCATTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230273	235207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_230300_235200
870137	contig_20819_pilon	+	3127	5	Intergenic	novelGene_55612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	30.0780235387899	9	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	387	1646	22116	23648	TRUE	0	TTTCCTGTCTTTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDNNIIVLDDDDEDEAAAQPGPSHPPPNPASPRAEAPGSSEPCGAGGSSSSGGKKCYKLENEKLFEEFLKLCKMQTAEHPEVVPFLYNRQQRAHSLFLASAEFCNILSRVLSRARSRPAKLYVYINELCTVLKAHSAKKKLNLSPAATTSSEPSGNNPSTDPSLDPTNAETTASETPRTRGSRRQIQRLEQLLALYVAEIRRLQEKELDLSELDDPDSTYLQEARLKRKLIRLFGRLCELKDCSSLTGRVIEQRIPYRGTRYPEVNRRIERLINKPGPDTFPDYGDVLRAVEKAAARHSLGLPRQQLQLMAQDAFRDVGIRLQERRHLDLIYNFGCHLTDDYRPGIDPALSDPTLARRLRENRSLAMSRLDEVISKYAMMQDKSEEGERQKRRARLSQGTSSHSADPPRASSDSGEV	21729	25498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_22323_22476_23309_23427_24654_24809_25033_25245
870138	contig_9705_pilon	-	2406	5	Intergenic	novelGene_41702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	597	junction_1	317.15966010828	577	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	82	516	111292	99119	FALSE	15	TATGTTGTATGTTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALTEESSSSDSMWLSREQTLHTPVMMQTPQLTSTIMREPKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDYNRRGTSLMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIMDESVLGVSMF	111373	97228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_99143_103788_103867_104931_105059_108249_108440_111276
870139	contig_8772_pilon	-	1227	9	Intergenic	novelGene_21120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGATCCACCTGCCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23420	15845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16620_19031_19117_19197_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
870140	contig_8729_pilon	+	2368	6	Intergenic	novelGene_40100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	58.4622955416566	647	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	114	557	276603	322350	FALSE	40	TTGAGAAACGACGACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKDANSALLSNYEVFQLLTDLKEQRKESGKNKHSSGQQNLNTITYETLKYISKTPCRHQSPEIVREFLTAMKSHKLTKAEKLQLLNHRPMTAVEIQLIVEESEERLTEEQIEALLHTVTSILPAEPETEQQKRANDAAVDEEYPE	276489	324161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286999_292842_292938_306155_306214_322203
870141	contig_4797_pilon	-	1533	1	Intergenic	novelGene_6942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCAACTACCTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657729	656196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_656200_657700
870142	contig_9678_pilon	-	2868	20	Intergenic	novelGene_146359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	95.7133300603763	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	514	1722	249450	226027	TRUE	40	CACAGTCTCACAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQERERGITIQSAAVTFDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWKQADKYNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGLVDVISKEKLLWNPSSDDGKDFERKPLLELIDPELLKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLGEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTVAQTAVPVLCGSALKNKGIQPLLDAITMYLPSPEERNYEFLQWYKSDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIYSGTVKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAAHRAKREGEKKHGKNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSVAKQPDCLMWYGRVTH	257621	213273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_213837_214520_214704_219463_219580_222918_223099_225922_226062_232115_232306_236789_236890_236971_237113_238584_238734_240385_240467_243469_243650_243886_243948_244723_244813_249161_249251_249356_249483_250119_250325_251679_251778_252229_252288_255072_255158_257586
870144	contig_4180_pilon	+	2640	6	Intergenic	novelGene_8359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1648.86331756153	3	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	8	316	865772	882898	TRUE	25	ATTAGAACTTGGGGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSLPHKMDRLCLM	865764	890171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875351_882860_882931_886082_886135_886317_886472_888085
870145	contig_12019_pilon	+	1812	4	Intergenic	novelGene_87639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.0693842672377	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACATGAAGTGAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	8656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_6226_8298
870146	contig_10246_pilon	-	695	2	Intergenic	novelGene_46877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	0	246	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACATGGTAGAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45246	35667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_36235_45118
870147	contig_1301_pilon	-	1880	14	Intergenic	novelGene_47303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_4	639.413738509021	2	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	83	1879	322831	268651	FALSE	45	GTAAGAAGACCAAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENER	322913	268649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
870148	contig_7775_pilon	+	3230	1	Intergenic	novelGene_37501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTAACCATCACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284880	288110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_284900_288100
870149	contig_11335_pilon	+	1098	2	Intergenic	novelGene_104902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATACACAGCCCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295569	296782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_296089_296203
870150	contig_7513_pilon	+	2896	16	Intergenic	novelGene_88950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	357	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1229	2026	152268	164703	TRUE	5	GATGCGGTCTTTGCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENLLELPLRDAVAVEDDAGGLEARGLVELDEQLAHHGGQVLDDLLPVLLHPHGGAVTVGVGVHAAHDSGNGRLLPVPSGWVGDVGPQEDDWLLEYRRPALGEQDVVHAAQLDIDLQAEVGQGLRRGPLHVLHLHALRGHPQHRVSHPLHFSVDGGLARQDDHHQLQAGIGVLQVPEHGLHAVCALGVLAEARLALDGHAGVSGDLSELLREGLQVDFGALALGGEAGDGPHLDLDARVKLLVSHVPDTLHGGGNRFVPAPRRG	145963	170792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_146766_146950_147153_147984_148084_152142_152282_154234_154426_155877_155973_159538_159697_161074_161258_163894_164031_164682_164807_164928_165051_166134_166279_167530_167619_168451_168591_169675_169811_170653
870151	contig_16098_pilon	-	1632	11	Intergenic	novelGene_45956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1469.42610906435	8	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	122	1507	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354061	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352401_353990
870152	contig_14030_pilon	+	2608	2	Intergenic	novelGene_62219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1246	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1527	1901	337289	339149	FALSE	35	TTCTTTACTGAATGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTGEDEAWAHRKQSNGNQKDFLFQSSPIFICRGYPIISLITSHTSESIPELFCFTFLYLFCRSEQSQALKDHLDWDHTTENRWTRVLERKKLYKLADDKSKGLGEHEIPTHEKILRTYLYCSA	335762	339856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_337452_338937
870153	contig_20779_pilon	+	1905	4	Intergenic	novelGene_112361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_2	60.337937209244	381	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1863	41	1903	8301	94520	FALSE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENVECDNMNRFDRSDRNVRQSQEGFWKRSPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLS	8260	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_94359
870154	contig_4891_pilon	-	1505	5	Intergenic	novelGene_124595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	117	junction_4	451.173192909331	6397	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	13	339	964296	940000	TRUE	10	CAGCTCTGTGTGATGGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964308	937405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
870155	contig_9186_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_85357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCCAAAACAAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484353	486163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_484400_486200
870156	contig_1443_pilon	-	1566	10	Intergenic	novelGene_28316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	331.797722106499	23	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	359	1282	776427	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809532	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776478_808690_808741_809071_809197_809399
870157	contig_7806_pilon	+	3666	15	Intergenic	novelGene_157535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_9	207.595969938469	428	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	81	2123	231762	284739	FALSE	15	GATTTTGTGTTAAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFLNWFDERAWYPLGRIVGGTVYPGLMITAGLIHWILNTLNITVHIRDVCVFLAPTFSGLTSISTFLLTRELWNQGAGLLAACFIAIVPGYISRSVAGSFDNEGIAIFALQFTYYLWVKSVKTGSVFWTVCCCLSYFYMVSAWGGYVFIINLIPLHVFVLLLMQRYSRRVYIAYSTFYIVGLILSMQIPFVGFQPIRTSEHMAAAGVFALLQAYAFLQYLRDRLTKQEFQTLFFLGVSVAAGAVFLSVIYLTYTGYIAPWSGRFYSLWDTGYAKIHIPIIASVSEHQPTTWVSFFFDLHILVCTFPAGLWFCIKNINDERVFVALYAISAVYFAGVMVRLMLTLTPVVCMLSAIAFSNVFEHYLGDDMKRENPPVEDSSDEDDKRNPGNLYDKAGKVRKHVTEQEKTEEGLGPNIKSIVTMLMLMLLMMFAVHCTWVTSNAYSSPSVVLASYNHDGTRNILDDFREAYFWLRQNTDEHARVMSWWDYGYQIAGMANRTTLVDNNTWNNSHIALVGKAMSSNETAAYKIMRTLDVDYVLVIFGGVIGYSGDDINKFLWMVRIAEGEHPKDIRESDYFTPQGEFRVDKAGSPTLLNCLMYKMSYYRFGEMQLDFRTPPGFDRTRNAEIGNKDIKFRHLEEAFTSEHWLVRIYKVKAPDNRETLDHKPRVTNIIPKQKYLSKKTTKRKRGYIKNKLVFKKGKKISKKTV	226561	286282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_226627_231746_232035_245390_245457_246521_246622_263671_263771_265551_265699_267462_267512_269376_269532_271815_272028_273432_273621_274313_274486_275396_275571_277996_278111_281428_281642_284658
870158	contig_3948_pilon	+	2088	3	Intergenic	novelGene_53397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1012	1482	1860968	1861438	FALSE	5	GGGTCTGGGCTCTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVASELIISHSLLDLGFPSFHLHLLEPLRGHLWLIRDSGCLQRGRDQDLLPTSGLAKALQSHPGSSRGLRLEARPTQDGGLLLQEAPLPKEGWPLQFSTTPVPSSPLAPMTMTEGPAGPRTGAPELFMVSAASHPTGRSACGIFALDHCPWGRGA	1814311	1862044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1814520_1826780_1827051_1860434
870159	SIRV1	-	720	3	ISM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	2738	310	2738	-310	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGATAACCCAAACCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7628	1316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552
870160	contig_7720_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_155798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTGGTTTTGTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847069	847676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_847100_847700
870161	contig_14287_pilon	-	1725	4	Intergenic	novelGene_24056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.703794297863	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	350	1162	22710	21898	FALSE	70	CAAAAAAAATAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33897	21334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33461_33600_33780
870162	contig_233_pilon	-	1288	5	Intergenic	novelGene_14542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	931.41733395938	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	15	848	93945	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	93959	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764
870163	contig_3975_pilon	-	1435	6	Intergenic	novelGene_54809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_1	297.213324062028	47	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	683	1249	2018377	2016131	FALSE	15	TAGTAGCTGCCTTACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2019059	2015944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280
870164	contig_3397_pilon	+	2846	17	Intergenic	novelGene_154577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	282.900041699803	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	158	2605	126240	206594	FALSE	20	AATCTCTTGCTTGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNELKNLQAEGLTTLGQSLRTAFDLLNLNRLVTGIDNYGQGRNPFFLEPAIIITITDGSKLTTTSGVQDELHLPLNSPLPGSELTKEPFRWDQRLFALVLRLPGTMSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLPPRTSHPVVKFSCTDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQAKIESDRVIGSVGKKVVQETGIKVRSRSHGISMAYRKDFQQLLQGISEDVPHRLLDLNMKEYTGFQVALLNKDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	125633	206835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_125761_126209_126360_142138_142229_172322_172507_178078_178205_180374_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_190928_191145_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
870165	contig_4469_pilon	+	2865	1	Intergenic	novelGene_21937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGGCCTGGCAATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634870	637735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_634900_637700
870166	contig_4429_pilon	+	2279	9	Intergenic	novelGene_50803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	388.457989202179	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	122	1432	172238	198515	FALSE	25	CCTAGTTTTGTTAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	168430	199362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184520_184648_184714_191596_191746_198438
870167	contig_6375_pilon	+	3734	2	Intergenic	novelGene_73042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	1163	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	179	604	500167	500592	FALSE	15	CTTGATCTGACTTGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRESSSSIPLSFPSPLSSVPDNIINSSLPSMSFVTSREMKCVLHWFASWSGPQRERFLQDLVAKAVPGKLQPLLDGLEQLSLSGANRPPCIFECQLRLWDQWFRGWAEQERNEFVRQLEVTEPDFVAKFYQAVAATAGKD	498116	503722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_498294_500165
870168	contig_14925_pilon	-	2804	1	Intergenic	novelGene_55375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCAGAGCAGAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130944	128140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_130900
870169	contig_6434_pilon	-	3912	4	Intergenic	novelGene_61820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_3	90.2773504263389	1394	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	388	783	347897	335456	FALSE	35	TTTCTAATAAAACTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIKALVALSFSGAIGLTFLMLGCALEDYGVYWPLFVLIFHAISPIPHFIAKRATYDSDATSSACRELAYFFTTGIVVSAFGFPVILARVAVIKWGACGLVLAGNAVIFLTIQGFFLVFGRGDDFSWEQW	348284	332326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_335573_337777_337965_343386_343463_347881
870170	contig_12622_pilon	-	1108	11	Intergenic	novelGene_6053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	405.704091672736	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	182	1012	1689951	1685503	FALSE	10	CACGCCTCTGGGGGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGFSYSDDKYYVTNDTEVAQSNYEALKDFFCLFPEYKDNELFLTGESYGGVYIPTLAVLVMQDPSLNLQGLAVGNGLSSYEQNDNSLVYFAYYHGLLGNSLWSSVQTHCCSENKCNFYDNKDPECVTQLNEVSRIVGQSGLNIYNLYAPCAGGVPGHIRYEKNTMVVHDLGNIFTRLPLKRTWHQVLLQSGGRTRLNPPCINSTALSTYLNNPYVQKALHIPDQLPQWDLCNLLVNVQYRRIYQTMNTQYLKLLSSQKYRILIYNGDVDMACNFMGDEWFVDSLNQKIEVQRRPWLVGYGDSGEQIAGFVKEFSQALDTWSPPTSPRLPSPCSPAS	1690361	1685406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1685570_1685887_1685971_1686167_1686258_1686885_1686962_1687765_1687906_1687996_1688076_1688156_1688249_1688819_1688905_1689501_1689594_1689924_1690081_1690309
870171	contig_4812_pilon	-	2193	4	Intergenic	novelGene_103643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_3	5184.37179308052	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTAAGTATTGTCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82668	78705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_81739_82268_82343_82598
870172	contig_6031_pilon	-	2777	2	Intergenic	novelGene_56765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	107	469	257696	256773	FALSE	20	AGAGTTGCCCTGATGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKEPGKSLGACQEHSAHNNLAENTAASAYRNPGLAQSPAACASLGPTQCTHQPWGFFPLFPAGSCTWPSSMKRRH	257802	254464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_256992_257552
870173	contig_9485_pilon	-	3307	20	Intergenic	novelGene_103110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	46	junction_19	52.7051065348287	180	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	107	2038	268883	214811	FALSE	60	GTTAGACCACAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVAWFNESWLSRIKEDVGDNRRIKASNLKKVLQGIMSYYHEFLGQQISEELIPDLNQITECSDSVELGRLLQLILGCAVNCEKKQEHIQNIMTLEESVQHVVMTAIQELMNKEMLNSSTNDAVGELEQQLKRALEELQEALAEKEELRQRCQELDMQVTALQDEKNSLVSENEMMNEKLDQLDGSFDDPNTMVAKKYFHAQLQLEQLQEENFRLEAAKDDYRVHCEELEKQLIEFQHRNDELTNLAEETRALKDEIDVLRATSDKASKLESTVEIYRQKLQDLNDLRKQVKTLQETNMMYMHNTVSLEEELKKANAARTQLETYKRQVQDLHIKLSSESKRADTLAFEMKRLEEKHEALIKEKERLIEQRDTLKETNEELRCSKVQQDHLNQTDTSATKSYENLAAEIMPVEYREVFIRLQHENKMLRLQQEGTENERIEELQEQLEQKHRKMNELETDQRLSQERIRELQQQIEDLQKSLQEQDAKSEGETSSKLKQKLEAHMEKLTEVHEELQKKQELIEDLQPDVNQNVQKISELEAALQKKDEDMKAMEERYKMYLEKARNVIKTLDPKLNPASAEIMLLRKQLSEKERRIEILESECKVAKFRDYEEKLIVSAWYNKSLAFQKLGMESRLVSGGGACKDSGTCIPARSFLAQQRHITNTRRNLSVKVPATTSD	280177	213541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9485_pilon_-_214982_217512_217582_219867_219970_222833_222935_223568_223652_224189_224225_225964_226059_228187_228329_234395_234457_234566_234655_245973_246085_246928_247131_248228_248370_256183_256351_258598_258683_260771_260835_262176_262245_267135_267269_268865_268917_280104
870174	contig_12638_pilon	+	2720	18	Intergenic	novelGene_33094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	673.28537063523	1	117	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	805	1632	182987	198769	TRUE	45	TTGTAAGAACCACTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLRRRSWMGHRN	170783	200439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178115_178281_180794_180859_180957_181004_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198128_198736_198843_199335_199415_199503
870175	contig_11052_pilon	+	1050	3	Intergenic	novelGene_115450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2532.5	279	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	112	357	102902	103147	TRUE	15	TACTTCTCGACTTGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRSLLTEALVLTFPALLRCPFARLLVCSPTPPSQPAMAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQVGP	102790	107796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103148_106118_106461_107445
870176	contig_709_pilon	+	2127	9	Intergenic	novelGene_57628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.3672718585575	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	257	865	2691473	2698845	TRUE	40	AGAAATGCTTATTTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGDAGFVRDALSGIYVWDIEGRKYFDFLSAYSAVNQGHCHPKIVDALKSQADKLTLTSRAFYNNVLGEYEEYVTKLFNYHKVLPMNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALELS	2681021	2702328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698836_2698936_2701156
870177	contig_4857_pilon	+	4631	6	Intergenic	novelGene_48911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAATAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680915	1762739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1683575_1687923_1688206_1689513_1689615_1690542_1690704_1725585_1725684_1761409
870178	contig_15063_pilon	-	1490	4	Intergenic	novelGene_13871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.3137084989848	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	775	1101	35891	35108	TRUE	40	GGACCCAAGAGTGGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGAGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36783	34609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35836_36167_36284
870179	contig_18081_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_23826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGATTCCAACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199803	202049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_199800_202000
870180	contig_7293_pilon	+	2237	2	Intergenic	novelGene_54227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAAATGCTTCTCCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220430	223663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_221442_222437
870181	contig_3789_pilon	+	5459	28	Intergenic	novelGene_79824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_12	95.5895288443842	384	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1373	4122	76	4197	191527	240349	FALSE	25	AAATTTCCTCTCAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLRSSLELHSHSAASARDPLDLSSEFLSLEQIGRRRLRSAGAAEKSAVTATAAGDGSSVKEVKTYHQARTLRPLRKNAQNSSDSSFDKNMEVMEKHANGRHFTRQLARQQADKKKEECKEDKVIPVTRSLRTRNIIQTTEHVREENGDVEVRRSCRIRSRYSTVNQSVLFDKLITNTAEAVLQKMDDMKKMRRQRMRELEDLGVFNETQEGNLNMYTRGKQKRIQRTDEETTDNQEGSVESSEEGEDQEDEDDGEDEDDDEEDGEEDNQKRYYLRQRKATVYYQAPLEKPRHQRKPNIFYSGPASPARPRYRLSSAGPRSPYCKRMNRRRHAIHSSDSTSSSSSEDEQQFERRRKRSRNRAISRCLPLNFRKDELKGIYKDRMKIGASLADVDPMQVDSSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKRAAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWNPKPLDVFLEELAENCVGYCGADIKSICAEAALCALRRRYPQIYTTSEKLQLNLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSAIVKPLLQSTVHKILEALQRVFPHAEIGTHKALDSGISCPLLESDLAYSDDDVPSVYENGLSQKSFNKTKENFNFLHLNRNACHQPMSFRPRILIVGEPGFGQGSHLAPAVIHALEKFTVYTLDIPVLFGVSATSPEETCAQMIREAKRTAPSIVYVPHIHLWWEIVGPTLKATFTTLLQNIPSFAPVLLLATSDKPHSALPEEVQELFIRGYGEIFNVQLPGEEERTKFFEDLILKQAAKPPISKKKAVLQALEVLPVAPPPEPRPLTVEEVKRLEEQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLSDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFERLCEEIQESRKKRGCSSSKYAPSYYHVMPKQNSAPAGDKRSDPEQNEKLKMSSTPVACSTPAQLKRKIRKKSKWYLGTIKKRRKISQARDDSQNAVDDKIESDTEENQDTSVDHNETGNTGDSSMEENEKQQNVSESKMKLGSTNSSNCSIENELEESRKSMTCTELRKDNTACSGDTSGSQIIDNLDENEANEMCVLRMTRARRSQVEQQQLISAEKALAILSQPTPSLVVDHERLKNLLKMVVQKSQKYNIFQLENLYAVISQCIYQHRRDYDKTTLIQKMEQEIKKFNCSRS	191451	241611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_191695_201075_201225_205784_205835_206580_206747_207067_207171_207418_207507_208570_208718_209335_209454_212225_212334_217359_217469_217710_217827_218352_218528_219380_219470_223015_223176_223913_224005_224830_225146_225495_225629_225979_226167_227021_227208_228612_228749_229576_229774_230367_230528_232303_232427_232554_232699_233405_233802_236781_236916_239209_239339_240304
870182	contig_6446_pilon	-	2186	6	Intergenic	novelGene_149240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	32.7743802382288	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	71	631	659841	504681	FALSE	10	GGCCTGTGTTAGAGTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYIRIVGTHNTVNKIFHIVAFECMFTNKTFTLEKGLIVPTENVATISDCASVIEGVSRSRNALLNGDTKNYDWDSGYTCHQLGSGAIMVQLAQPYMIGSIRLLLWDCDDRSYSYYVEVSTNQQQWTMVADRTKVSCKSWQSVTFERQPATFIRIVGTHNTANEVFHCVHFECPEQQSGQKEENGEDPGTGDTSLAEAPRHSSQGSSLPL	659911	503125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_504725_510179_510277_530676_530756_591664_591773_621183_621374_659798
870183	contig_20324_pilon	+	1969	6	Intergenic	novelGene_100866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	43.1073079651235	217	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	84	674	7068	9228	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPQAIEFPGESPTRSPVVLLNRNIAPMASTMPLAMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQACISEVGKDGGSVCPVCRHKFLLRNIRPNRQLANMVNNLREMSQSAKEGAKGGQCGVHGEKLHLFCEEDGKILCWVCAQSRKHRNHSMVPIEEAVQEYQEKLQVELEKLRRRRELAEKLEVDVTEKRTAWKKRLRHRNQGFTQSLYSRKTFWLKKNRGS	5120	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_+_5156_7019_7476_7941_8037_9140_9372_12951_13078_13411
870184	contig_3787_pilon	-	3414	1	Intergenic	novelGene_102453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTAAAATATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755954	752540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_752500_756000
870185	contig_3277_pilon	-	2847	9	Intergenic	novelGene_74725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1746	2120	263633	258441	TRUE	0	TGGCTCTGCCGTCGCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFLGLLTPEYQAAARLVLTTTSTGTRSARALLEARIVRRIPFPAAIKRPLGPLKLSIHPGKGSFQLAPTIDGLTIATFSFAPSCCTTYSANAFVYMYVLGLSPINFGVISFTRPSSIHLDPKF	265378	188832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_188878_190984_191075_240765_240962_250533_250710_258220_258456_261126_261307_262360_262407_262555_262673_263616
870186	contig_9146_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_79514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCCCCTGATTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355506	354335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_354300_355500
870187	contig_10217_pilon	-	1459	10	Intergenic	novelGene_87416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	109073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
870188	contig_6980_pilon	+	1859	8	Intergenic	novelGene_36022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	749.557937747854	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	100	516	356720	370545	TRUE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRLTNPIVFTGPLNGLLPCIRIVLDMLVLSLKMEK	346083	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_364945_370443_370641_371430_371523_372735
870189	contig_10549_pilon	+	2948	1	Intergenic	novelGene_110600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	119	484	143289	143654	NA	35	CATATGGAACTTATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVPVFPHPCQCLLFSIVFIIAVLVCLKYLIVIVICISLTTNEVVKDFILLGSTINAHGSRSQEIRRRIALGTSAAEDLFKVLKSKDVTLRNKMHLTKAMVFSVASYACKSRTVNRRVKKG	143170	146118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_143200_146100
870190	contig_366_pilon	-	2177	9	Intergenic	novelGene_51585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	595.385326910229	183	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	418	1167	803057	764342	TRUE	35	GGAAATGAGATTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPCFPGP	803474	756237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764360_768039_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
870191	contig_5153_pilon	+	2055	14	Intergenic	novelGene_74356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	267.76382775801	2828	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	259	1332	1005526	1022174	FALSE	5	TTTTTTCCTGGTGCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGYPPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956550	1022897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005547_1010278_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
870192	contig_7963_pilon	-	2508	6	Intergenic	novelGene_58284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1608.70228445166	7758	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGAATCCATGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48901	37066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39786_40232_43546_43819_48741
870193	contig_3948_pilon	-	2539	7	Intergenic	novelGene_53192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	66	872	866476	840803	FALSE	20	TCATGTCTTCTGAAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869633	839135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
870194	contig_3233_pilon	-	3510	6	Intergenic	novelGene_56530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	101.205533445558	317	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	101	691	707850	702290	FALSE	20	TGAATTGTCGTGATGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFMYVLSWLSLFIQVAFITLAVAAGLYYLAELIEEYTVATSRIIKYMIWFSTAVLIGLFVFEHFPTYMIGVGLFTNLVYFGLLQTFPFIMLTSPNFILSCGLVVVNHYLAFQFFAEEYYPFSEVLAYFTLCLWIIPFAFFVSLSAGENILPSTMQPGDDVVSNYFTKGKRGKRLGILVVFSFIKEAILPSRQKIY	707950	699470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_702406_702578_702682_703401_703470_705474_705629_706764_706845_707780
870195	contig_5023_pilon	+	3246	16	Intergenic	novelGene_7192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2328.09402635623	3	140	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	593	1531	611804	631518	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSVNLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRRIVTMQWNWGRIKLSFPWLALLDKISMKETAL	580811	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614410_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630270_631419_631550_639072_639197_643422_643539_646857
870196	contig_1759_pilon	+	5907	1	Intergenic	novelGene_171348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACCCCACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100388	106295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_100400_106300
870197	contig_5331_pilon	-	3817	4	Intergenic	novelGene_112811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2919	3224	717282	716977	TRUE	10	TCAACGTCCGTCTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNLSQNHTEKRTWICEWHLKQFPISTLLCVMLENFGVKQTKTPKGLTLGGLDKMESISHARMSRIVKPVLVPSTVESTKQKVEGTLSDEAKRCKNQFDF	720200	711266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_711303_715043_715080_715219_715271_716506
870198	contig_13021_pilon	-	2340	6	Intergenic	novelGene_8277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.352601218755	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	123	1247	270418	250631	FALSE	15	CATCTCTTTCAAGCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYESMYKNQAGEDSFVSLIHSTLTCRMGPWETLPQLRWELRDKGQAPVPPSMSRESSSSEKPGIQLTENLRRDAKMYTSCTFFKLVSHSHEKPRFLQK	270540	249537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_250891_251055_251152_252257_252369_259754_260040_265837_266120_270327
870199	contig_13021_pilon	-	1821	3	Intergenic	novelGene_8279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	304.5	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	290	772	252384	250631	FALSE	45	CCCAAAGAAACATACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLPDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYESMYKNQAGEDSFVSLIHSTLTCRMGPWETLPQLRWELRDKGQAPVPPSMSRESSSSEKPGIQLTENLRRDAKMYTSCTFFKLVSHSHEKPRFLQK	252673	249581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_250891_251055_251152_252257
870200	contig_14811_pilon	-	1644	4	Intergenic	novelGene_74494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	421.842255930921	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	124	498	375703	375256	TRUE	45	TTAAAATTGGTTTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTCL	386590	356619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375271_375343_375765_386528
870201	contig_6451_pilon	+	3505	3	Intergenic	novelGene_173689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	101.5	38	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	13	306	12389	84839	FALSE	30	AACCGGTCTTCCATATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNGCLLSITSCMPDSSEEGEVTFNTVLRLT	12376	88038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_84753
870203	contig_10793_pilon	+	3093	9	Intergenic	novelGene_83440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3051.30537383183	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	167	544	160548	163940	TRUE	35	TTTATAAAATTTACTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	159597	168742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
870204	contig_3948_pilon	-	2534	7	Intergenic	novelGene_53206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	2	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	66	872	866476	840803	FALSE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869633	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
870205	contig_14618_pilon	-	2185	6	Intergenic	novelGene_136857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1020	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAAATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355332	1279756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327380_1344835_1344943_1348517_1348598_1350876_1351054_1353798
870206	contig_6291_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_164789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGAGGGGAGGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383878	382450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_382400_383900
870207	contig_13760_pilon	-	2550	2	Intergenic	novelGene_61306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	0	12	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	564	911	164646	164299	TRUE	15	ACTTTTATGACTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDSKNYYDSYAGFPLSVVACGQWPLQPLPGWLLTVWSLQITRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKGISPTLLCDLGQPAHRFQPSWAGKDSPSVDYEGLTEL	165209	161447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257
870208	contig_6048_pilon	-	2161	9	Intergenic	novelGene_73235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	310.506818564424	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	118	1071	1916833	1896861	FALSE	55	CGAAAAAATAAAGCAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTLIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1916950	1895770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899635_1900974_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
870210	contig_10864_pilon	-	7649	23	Intergenic	novelGene_107109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2281	2643	1147120	1146758	TRUE	30	CAACGGCAGCAGGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSLSLSCNFIFSSLKWLSLSFLYCCSLSSICDNNCFLMAAIFCSAFLFSSANFAALSNSSLSSNAFNSSSLLFTLELTCSNSFFLVSSSDFMDDTSFSSLKAFSSASITLLSFSSPNS	1188256	1060662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1060963_1075558_1075649_1089194_1089265_1095333_1095647_1098594_1098645_1100678_1100734_1109762_1109862_1110205_1110338_1111459_1111649_1113042_1113127_1115409_1115559_1127509_1127690_1131164_1131297_1134118_1134275_1143750_1147997_1148508_1148631_1149063_1149195_1155810_1155931_1158144_1158227_1160420_1160497_1174316_1174421_1179118_1179207_1187575
870211	contig_9666_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_178152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1296	1628	90737	91069	NA	45	AAAAAGGCAAACGATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMHMSIHVTALISVGYIPRSGIAGSFGISISSFLRKRHIIFQNGCSILYSHQQCIRVPVSPQPLQHLLFSNFLICATNARVRWYVIVVLICISLMASDQEHFLLCLLAA	89441	92155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9666_pilon_+_89400_92200
870212	contig_6735_pilon	-	837	7	Intergenic	novelGene_15757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	738.377876760192	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	27	635	554315	542190	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTIPLKAWGRVNIMKGVPSLSILSTLDKPQAVEWTSLLMDTYLVVLPHPP	554341	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542337_545887_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243
870213	contig_7333_pilon	+	2112	12	Intergenic	novelGene_142782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_9	108.726892671881	949	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	92	1036	218455	225101	TRUE	25	ATTTTAAGAGCCTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGFRKWSGFPGALLVAAVATFAVSRPATEMAGTAASAAVVPTLAPPLEQLRQFAGELRLLMPRVRVGEALETTEEFNREKFWSRLNEAAVTVAGEATTLTAAFSRLPLPSPQETQRFCESIRVATEAIIAVYYSLPKDQGITLRKLVRDAVLDIVDGMAQLVEGLFITPTQSPENKDLIFCNTVWAACQQVPRLPRDNKAAALLMLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPRPLESKLQTVEMAWRHQTF	218363	237998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_221833_221916_222679_222777_222951_223026_223598_223676_224012_224321_225043_225167_230329_230391_236788_236836_237095
870214	contig_10437_pilon	-	1963	3	Intergenic	novelGene_38271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTCACCCCTCCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424116	419831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_420486_421089_422272_423989
870215	contig_10011_pilon	+	4215	12	Intergenic	novelGene_68039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_5	138.858867646135	480	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	429	890	136184	140376	FALSE	25	ATTCTGGGACAGTTACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALYTNQTLLSLNLRENSINPEGAQALARALCTNSTLKNLDLTANLLRDQGAQAIAEAIRENRALTSLHLQWNFLQAESGQGPGTSTTAQQQPGQLGFTGERHRGRRSFRSGQGAEGKHGPHRPLPPGDLHRCLWGPGPGGSPGGEQNLGDS	131475	144402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_131551_131630_131715_133174_133259_134695_134780_135379_135438_136140_136225_136715_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139856_140292_140377_141077
870216	contig_7004_pilon	+	2980	15	Intergenic	novelGene_126444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_11	41.9810452855251	306	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	218	1633	273029	281026	FALSE	25	CTTATAATTGTTGCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGRARKEAVQAAARELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFCELKETDSWEIKPESKYFLTRNSSTIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRRSRRSQVGFHQVGVETYGGGIWSTWFDRDLTLAGRVIVKCPTSGRLEQRLVHVEQPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNLEMHLVPILATAIQEELEKGNPEPGPLNAVDDRHHSVLVSLLCAHLGLSSEDIVEMELCLADTQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYVDKHEENHRPLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSEALIREVANKVGVPLQDLMVRNDSPCGTTIGPILASRLGLRVLDLGSPQLAMHSIRETACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSLSHNLIVD	272409	282373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_272621_273022_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274147_274339_274471_274742_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278333_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
870218	contig_9571_pilon	-	2635	6	Intergenic	novelGene_136301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.066284702661	11	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	24	491	580967	568045	TRUE	15	ATTGCTTGTGTGTAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSQKWDEMNILATYHPADKDYGLMKIDEPSTPYHSMIGDDEDALSDSEATEAMNPDVLAQKLSAVEGSEPKYRLQEQESSGEEDSDLSPEEREKKRQFEMKRKLHYNEGLNIKLARQLISKDLNDDEDEEDEEMLEATDGEKMNTEESNQGSTTGDQLQNKS	580990	565666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_565876_566109_568083_570072_570247_577783_577879_578362_578441_580884
870219	contig_10037_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_148969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCAACTATCCTTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509470	508619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_-_508600_509500
870220	contig_13787_pilon	-	2596	9	Intergenic	novelGene_40602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.379683521758	59	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	322	990	205032	131430	TRUE	75	AAAATTAATAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVSGCLKYSMFIFNFLFWLSGLLILGVAIWVRVNQGNQEIFGHEDSHAQFRVSANIMISVGAIIMILGFLGCCGAIKESRCMLILFFIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	205353	129146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_130283_130959_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762_179838_183751_183890_189120_189184_204972
870221	contig_8476_pilon	-	2201	18	Intergenic	novelGene_121323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	227.537943145609	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	670	2136	209623	40454	FALSE	60	AGTGAAAAAGAAAATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGTSRARSPRSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRGAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYSFVQQLTERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRSKIYRGLEDLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQIQKAGGLKTSSIIIALTDGKLEGLVPSYAEKEAKTSRSLGARVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILDQSCTEILELRPSSVCVGEEFQIVLNGRGFMLGSRNGSVVCTYTVNETYTKSVTPVSVQLNSMLCPAPTLNKAGETLDVSVSFNGGKSVFSSSLIVTATECSNGIAAIIAILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPRPPPPPPKEKEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVTIPEETEEPIRPRPPKPKPTYQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEGRCINFSRVPSQ	210331	40388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_40493_104782_104864_106930_107099_113163_113257_114099_114145_130076_130173_144931_145011_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187519_188560_188630_188745_188854_189298_189381_206168_206241_208667_208740_209471_210125_210163
870222	contig_16703_pilon	+	2136	2	Intergenic	novelGene_72792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTTTGATTTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42634	44887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_43756_43872
870223	contig_10734_pilon	+	3609	14	Intergenic	novelGene_51211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	104	junction_11	33.636413067146	315	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	136	2286	1147081	1172828	FALSE	30	ATTTTTGTTAGGTAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVDFGDLELFEAFDHPEESIPKPVHTRFKDDDDDDDEEEEEENGVGDAELRERLRQCEDTIERLRAENQELKRKLNILTRPSGILVNNTKLDGPLLQILFMNNAISKQYHQEIEEFVSNLVKRFEEQQKNDVEKTSFNLLPQPSSIVLEEDHKAEEPCAITNNTEAFSVVGSVLYFTNFCLDKLGQPLLNENPQLTEGWEIPKYQQVFSQIVSLEGQEIQVKAKRPKPHCFNCGSEEHQMKDCPMPRNAARIYEKRKEFLDACGEANNQNFQQRYHAEEVEERFGRFKPGVISEELQDALGVTDRSLPPFIYRMRQLGYPPGWLKEAELENSGLALYDGKDGADGEAEAGEVQQNKSVTYDLSKLVNYPGFNISTPRGIPDEWRMFGSIPMQASQQKDVFASFLSSNFQTPSMRSGSKRSSSQSSPCSPKKQRKESSSEASPADMELDSDVELAHVSQSSDAFQFQPPLPPGTPPIFTPPLPKGTPPVTPSDSPQTRAASAAMDEDALTLEELEEQQRRIWAALEQAESVNSDSDIPVDTPLTGNSVASSPCPNEPDLPVPEGRPSEKQLPDEAKVPLEAEVPQEAEVPSTCTEKSQVEHSPASPDAEAPLLCQKEKEESAQVDSQGVLLNNGSVMSNCDISNGGSQNLLPPGASPSPATKTHSPIPDMSKFATGITPFEFENMAESTGMYLRIRNLLKNSPRNQQKNKKASE	1146945	1174151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1147292_1148784_1148828_1151370_1151446_1153410_1153517_1154923_1155002_1158640_1158745_1158861_1158928_1159501_1159563_1160095_1160239_1160513_1160657_1161944_1162067_1166243_1166331_1166598_1166717_1172034
870224	contig_1154_pilon	+	4158	1	Intergenic	novelGene_87119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430236	434394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_430200_434400
870225	contig_15039_pilon	-	1041	2	Intergenic	novelGene_110195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAAAAAAAAAAAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386003	384911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_385874_385924
870226	contig_1380_pilon	+	3286	2	Intergenic	novelGene_138873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	743	1063	69575	69895	FALSE	20	ATCCCAGCAAGGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVESWIMNKAEQRRIDAFELWCWQRTLNIPWTARRMNKSVLEEVHPECFLEVRMARLRLTYFGHVVRWDQSLEKDIMLGKVRVSEKEEDCQQDGLTQWLQQWAQT	66566	72118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_66636_68901
870227	contig_4742_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_131000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232277	233983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_232300_234000
870228	contig_4857_pilon	-	3293	6	Intergenic	novelGene_48639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	72.660856036796	456	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1608	1913	443315	441598	FALSE	25	TTTTCTGAAGAATTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448621	440217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443746_444432_444537_444997_445070_447620
870229	contig_19559_pilon	-	4503	14	Intergenic	novelGene_163433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_12	28.5613634004041	156	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	172	1602	94417	79836	FALSE	65	GACAAAAAATTACAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGEAFLIPTPYYGAITQHVYLYGNVRLVYVYLDSEVTGTDTRPFQLTVEKLEMALQGAHSEGVKVKGLILINPQNPLGDIYLPGELQEYLGFAERHKLHVIVDEVYMLSVFEESAAYSSVLGLERLPDPQRTHVMWATSKDFGMSGLRFGTLYTENQDVAIAVASLCRYHGLSGLVQYQMAQLLQDRDWINQVYLPENHARLKAAHTYVSEELRALRIPFLSRGAGFFIWADLRQYLSEGTFEEEMLLWRRFLDNKVLLSSGKAFGCKEPGWFRFVFSDKAHRLCLGMQRVRQVLEGKSQVAEDPPSSQTQEPSS	95967	76934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_79925_80050_80205_80321_80465_81870_82013_82126_82173_83811_83902_84589_84691_85656_85735_86258_86357_88369_88437_88896_88967_90108_90180_94135_94418_95796
870230	contig_16620_pilon	+	3640	1	Intergenic	novelGene_155999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15918	19558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_15900_19600
870231	contig_5832_pilon	+	4297	18	Intergenic	novelGene_134144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	400.35172252671	705	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	878	2637	75	2711	326617	347511	FALSE	15	TGCCTGGGCAGCAGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEMGKVIRSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHTDAISDPRAVNQDKKNTLFSGTNIASGKAVGVTVATGLHTELGKIRSQIAAVEPERTPLQRKLDEFGQQLSRAISVICVAVWVINIGHFADPVHGGSWLRGAVYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEAEAGARSCRLYEFTISGTTYAPEGEVRQGEKPVRCGQFDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTDLQALSRVERAGACNAVIKQLMQKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTCPGSAARGSKMFVKGAPESVIERCSSVRVGSRTVPLNTTSREQILAKIRDWSSGSDTLRCLALATRDAPPRKEDMQLDDCSKFGQYETDLTFVGCVGMLDPPRPEVAACIARCRQAGIRVVMITGDNKGTAVAICRRLGIFGDMEDMVGKAYTGREFDDLSPAQQRHACQTARCFARVEPAHKSRIVEYLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKSASEMVLSDDNFASIVSAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCSIFLTAILGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRNPREALISGWLFFRYLAIGVYVGLATVAAATWWFLYDAEGPHVTFYQLRNFLKCSKENPLFADDVDCKVFESRFPTTMALSVLVTIEMCNALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLAAVAMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWVVVLQISLPVILLDEALKYLSRNHMDEEKGQK	326351	349097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_326375_326565_326705_326980_327062_327150_327237_328815_329281_330931_331027_331178_331282_332491_332624_333014_333141_334749_334969_335082_335419_336792_337014_337925_338132_338702_338789_343171_343309_343766_343885_344414_344533_347491
870232	contig_513_pilon	-	2004	9	Intergenic	novelGene_80168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	269.751245363205	195	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	144	1319	453421	449687	FALSE	35	CCATGAAGCTGCAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSRYDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSRGAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY	454715	449001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_449998_450623_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
870233	contig_14287_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_24058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_2	16	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	215	1027	22710	21898	FALSE	30	TGCTGTGTATATTATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33900	21358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_33780
870234	contig_10093_pilon	+	3519	1	Intergenic	novelGene_147508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTAAAAAAAAAAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86873	90392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_86900_90400
870235	contig_12923_pilon	-	4652	38	Intergenic	novelGene_30136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	183.619533121492	706	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1520	4563	50	4612	201671	162599	FALSE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPASGPSLLLLLLTSLPLALGDPMYSMITPNVLRLENEETVVLEAHDVQEDIRVTVSVHDFPGKKQVLFSEDTQLTAANSHLSALPIKIPANKDLRSDRKNKFVVVQAAFRDVVVENVVLVSLQSGYLFIQTDKTIYTPGTTVLYRIYSVNHELLPVGRTVVTTIETPDGVPIKRDSLSSHNQFGILSLSWNIPELVNMGQWKIRAHYEDSPQQLFSAEFEVKEYVLPSFEVQVEPTEKFYYIYDPRGLEVTITARFLYGKNVDGMAFVIFGVQDGDQRISLTQSLSRVVIEDGYGEVVLSREVLLNGVKPSSPEALVGKSLYVSVTVILQSGSDMVEAERSGIPIVTSPYQIHFTKTPKYFKPAMPLDLMVLVTNPDGSPARQIPVVTKDNGVQSLTHNDGVAKLSINMPNSPTPQTITVRTKKDGIPEGQQASETMQVQAYSPPGNSNNYLHLSVPRLELKPGETINVNFHLRADPGLQARISYYTYLVMNKGKLLKVGRQGREPGQDLVVLPLTITADFIPSFRLVAYYTLIGANDQREVVADSVWVDVKDSCMGTLVVKGGEKDQKTYLPGQQMTLRIEGNRGARVGLVAVDKGVYVLNKKNKLTQSKIWDVVEKADIGCTPGSGKDYAGVFMDAGLALRTNKGLQTAQRADPECPKPATRRRRSVQLMEKRTDKAGQYQDKELRKCCEGGMRENPMGFSCEHRTQYVTGKSCIKAFLDCCLYITQLRIEHSRDSSLDLARSDLDEDIIPEEDIISRSQFPESWLWSIEELKEPEKNGISTKIMNVFLKDSITTWEILAVSLSDKKGGVQKEEITAADLSDQVPDTESETRILLQGTPVTQMVEDAIHGDRLKHLIVTPSGCGEQNMIGMTPTVIAVHYLDHTEQWEKFGLDKRQEALELIKKGYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQEAKDICEGQVNSLGGSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	201720	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172032_172190_172858_172958_174586_174747_175257_175334_175991_176196_177926_178014_183784_183871_184607_184717_190552_190751_190946_191019_191304_191435_192385_192545_193442_193650_193750_193961_196212_196360_196443_196560_196840_196968_197385_197489_197641_197733_197817_197901_198012_198108_199515_199587_199678_199842_200279_200473_201597
870236	contig_6440_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_161649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTTGTCCTCCATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7775	9142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_7800_9100
870237	contig_6885_pilon	-	5262	1	Intergenic	novelGene_83665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	4375	4818	199619	199176	NA	80	TGAAATAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKISGTLVKYIKQCSSGIAGYIFHIHLQSFCFSVLNSVHLVTSVPLNMVSCPSLIWQMLSTCCGQVVGLGRNWSVTGFLPSAGSALAEVPFSGSVLVSQCAVYSLVYIWQTTAAGHTRSIACFYSFLGTLLRSWLFISSVTVFAIK	203993	198731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_198700_204000
870238	contig_10990_pilon	-	3873	1	Intergenic	novelGene_7473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2919	3407	710709	710221	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	713627	709754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_709800_713600
870240	contig_5794_pilon	-	2104	12	Intergenic	novelGene_69786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	4589.55666848369	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	33	1100	749501	743712	TRUE	30	ATAAATGTAGTTCCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGRGESGLKMEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749533	739825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740739_740838_740913_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749495
870241	contig_500_pilon	+	1502	10	Intergenic	novelGene_31014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	998.429111834198	8	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	201	1178	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1499277
870242	contig_14441_pilon	+	926	4	Intergenic	novelGene_100388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.0555074137902	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	506	925	116728	117771	FALSE	25	TAAACACAGCCTGCTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAASGPSSCLTGPSPPTPSQCSEEQSSRPHSCWYPPSAHTPRHARPRPPTPGGPSKPEPPWTKP	47264	117772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47571_114110_114161_116578_116963_117586
870243	contig_7396_pilon	-	2063	17	Intergenic	novelGene_79639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3558.28116807733	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	405	1223	254680	248600	TRUE	40	TTTTTAAAATAAATTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGREI	257444	245959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246406_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248817_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257142_257294_257381
870244	contig_10431_pilon	-	3084	1	Intergenic	novelGene_117403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1645	2091	248649	248203	NA	30	TCCGTGGCAGAAAAGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKIEVVKDFILLGCTVNTHRSSSQEIKRHTALSKSAGKDLFKMLKSKDVTLKTMVRLMQAMVFSVASYACERWMMNKEDRRRIDTFELWCWRRILTIPWTAKRTNKSVLEEVQPECSLETRMARLRLIHFGHVSGGRRTSCLVK	250293	247209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_247200_250300
870245	contig_9272_pilon	+	3002	1	Intergenic	novelGene_125883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCCAGCTATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216073	219075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_216100_219100
870246	contig_4301_pilon	-	2981	9	Intergenic	novelGene_65080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_1	184.095041690427	1604	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	145	825	441884	420112	FALSE	35	AACAACCCTTATACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWAALSPGRNRKPGYKAESYAGFSSLHSAARFKPKLQLVAHWPSKAFAMALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDQETYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD	442028	417955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_420175_421107_421196_422457_422553_424140_424210_424761_424852_432023_432091_432714_432825_434847_434914_441851
870247	contig_14566_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_148835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	857	1285	90619	66800	FALSE	20	GCTCCAGTTACTCGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQPDARRGRRRAAAGAFFLHTCPPWWSPSARSDYKFNPFVFQPFFFLSLSLLHFFWQPLPNDESEEQSLISQFLTLWWLGRCCDIGSYATDISNTSRVTHGGQSSVELPDKERLGKSTWWSNSIKMKSSGFSPSLVASQR	125250	66769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_66855_70343_70518_88762_88947_90603_90935_94951_95061_99198_99306_108217_108325_118468_118578_125141
870248	contig_17106_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_127678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9471	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGCTATTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104797	106556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_104800_106600
870249	contig_12090_pilon	-	2222	15	Intergenic	novelGene_80474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	204.148905238809	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	57	1625	67556	51792	FALSE	35	CACGTTTCTACACAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESASIRPSRPCTDPAKVAMPENGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIMAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGVEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMRVIDPATADSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVANSGITRVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVVKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTMVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVLRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTTGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR	67612	51194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_51807_52003_52118_53381_53617_54231_54363_54465_54577_54657_54755_55718_55859_57076_57210_57565_57688_58926_59070_59837_59947_60899_60990_64357_64411_67429_67494_67544
870250	contig_6871_pilon	+	2259	11	Intergenic	novelGene_21522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	335.045743145619	102	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	66	1301	54514	72153	FALSE	30	CTAGAGTAGATTTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRPSYAPPPTPAPATQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTASSGITIPKPPKPPDKPLMPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	52512	73111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52532_54467_54521_54695_54740_57960_58066_63387_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
870251	contig_12000_pilon	+	2738	8	Intergenic	novelGene_43151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	479	junction_1	444.908016175415	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	109	840	417192	558606	FALSE	30	GCATATCCTCACGTAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416845	560504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472
870252	contig_4519_pilon	+	6278	28	Intergenic	novelGene_123746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	117.046471724738	229	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1053	3162	58	3219	1250893	1453302	FALSE	10	TCAAGTGTCTTTCTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAAGRGVSGAGVGAEATAMAFLKLRDQPSLVQAIFNGDPDEVRALIFKKEDVNFQDSEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVAHGAEVTCKDKKSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGANVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNKKDKFGRSPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSDTDGKCLEYLLRNDANPGIRDKQGYNAVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMETSGTDMLNDSDNRATISPLHLAAYHGHHQALEVLVQSLLDLDVRNNSGRTPLDLAAFKGHVECVDVLINQGASILVKDYILKRTPIHAAATNGHSECLRLLIGNAEPQNAVDIQDGNGQTPLMLSVLNGHTDCVYSLLNKGANVDAKDKWGRTALHRGAVTGHEECVDALLQHGAKCLLRDSRGRTPVHLSAACGHIGVLGALLQSAASMDANPAIVDNHGYTALHWACYNGHETCVELLLEQEVFQKVEGNAFSPLHCAVINDNEGAAEMLIDALGASNVNTTDSKGRTPLHAAAFTDHVECLQLLLSHNAQVNSVDSSGKTPLMMAAENGQTNTVEMLVSSASADLTLQDNSKNTALHLACSKGHETSALLILEKITDRNLINATNAALQTPLHVAARNGLTMVVQELLGKGASVLAVDENGYTPALACAPNKDVADCLALILATMMPVSSSSPLSSLTFNSINRYTNTSKTVSFEALPIMRNEPSSYCSFNNIGGEQEYLYTDVDELNDSDSETY	1250835	1456361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1250920_1335074_1335159_1368015_1368095_1391753_1391825_1398829_1399031_1400438_1400527_1405939_1406083_1411376_1411590_1416540_1416620_1417555_1417671_1419779_1419863_1421284_1421349_1422492_1422562_1425026_1425168_1428951_1429064_1430519_1430547_1431271_1431347_1434810_1435013_1437743_1437832_1438070_1438189_1438495_1438716_1445440_1445529_1445616_1445701_1446263_1446410_1447077_1447161_1447772_1447856_1448611_1448704_1453015
870253	contig_854_pilon	+	2134	2	Intergenic	novelGene_36443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	886	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCGTAACCTCCGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1451223	1455687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650
870254	contig_990_pilon	-	803	10	Intergenic	novelGene_76035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	88.8128841726341	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGGGTTATGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865936	848177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_848260_849297_849341_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
870255	contig_7207_pilon	-	1339	8	Intergenic	novelGene_72068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	216.652265350798	4	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	719	1291	696514	671691	TRUE	50	GTAAACTCAGGAGGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLYSRDGRLWKNGSYSCGCKFSNWNYLYLTWSWR	758013	666571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_666579_671649_671791_676116_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_757787
870256	contig_12019_pilon	+	755	3	Intergenic	novelGene_87656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
870257	contig_12464_pilon	+	3412	1	Intergenic	novelGene_68653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTGCCTCTATGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111129	114541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_111100_114500
870258	contig_299_pilon	+	2744	1	Intergenic	novelGene_129431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTCTTACAGAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867916	870660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_867900_870700
870260	contig_10134_pilon	-	1881	4	Intergenic	novelGene_16256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.05892005418	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAGCATTTGAAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39630	32508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558_38760_39427
870262	contig_14142_pilon	-	3833	15	Intergenic	novelGene_120590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	133.794542459088	20	116	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	1092	1979	591064	588286	TRUE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFNQARLDDSPRAPGQGSGHLAIGSAATLGCGGMARGREPGGVGHVAAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSPPKAPSMGPTPSSCIQDPQIEPIVQAPSLPTCPAFLS	592287	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585573_585651_585762_586213_586388_587233_587404_587508_587604_587720_588616_588714_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590745_590850_590947_591055_591101_591232
870263	contig_3386_pilon	+	2926	7	Intergenic	novelGene_34564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	634.435357008279	220	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2197	2541	488148	494572	FALSE	70	AGGAAAAAAAAAAAAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKVSTGRPG	470093	494957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_475713_475783_476271_476405_485246_485299_486417_488190_491949_492074_494393
870265	contig_15610_pilon	+	4009	2	Intergenic	novelGene_154290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	31	957	762534	766629	FALSE	10	CTGTTTGGCCTTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVMKNVLVKQGSSSSQLQSWTVQPSFEVISAQPQLLFLHPPVPSPISPCHTGEKKSDSRNYLPILNSYTKIAPHPGKRGLSLSPEERGESGMQKKICTERLGPSVSSGEPTKPDAVLPSPSTPAPPSAKLAEDSALQGVPSLVAGGSPQTLQPVSSSHVAKAPSLTFASPASPVCASDSTLHGLESSSPLSPLSANYSSPLWAAEHLCRSPDLFTEQRQSKHRRFQNTLVVLHKSGLLEITLKTKELIRQNQATQVELDQLKEQIQLFIEATKSRAPQAWAKLQASLTSGSSHTGSDLEAFSDHPDI	762503	769681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_762567_765735
870266	SIRV6	+	341	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	6	671	-1	-81	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATCGCACAAGTCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136	1869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
870267	SIRV6	+	397	3	NNC	SIRV6A	novel	574	4	NA	NA	1	-28	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCGATCAGCCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	1922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1736_1847
870269	SIRV6	+	490	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	7	521	0	69	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAGCACTAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
870270	SIRV6	+	128	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	227	-292	mono-exon_by_intron_retention	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAACCAGCCCCAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1530	1658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_1500_1700
870271	contig_15849_pilon	+	2544	5	Intergenic	novelGene_176058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48.4374596774026	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	26	340	89870	106601	TRUE	40	TAATGAATACCTAACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLASWQSLMTCKTMATGVPSPAGPSSGQTCVLILIFTLLLQSLSVAVTYLYFTKELKQMQDKYSRSGVACFLKEDDSFGDPDDEDSMDNPCWQIKWQLRQLVRKKSNKIVLT	89844	111251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_90020_97054_97193_106574_106680_108831_109334_109627
870272	contig_3948_pilon	-	2534	7	Intergenic	novelGene_53207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	66	872	866476	840803	FALSE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869633	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
870274	contig_709_pilon	+	3669	4	Intergenic	novelGene_57544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	31.689465477067	171	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1951	2283	1510372	1510704	TRUE	5	TATGTGGTTTTCCTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSRGWSLLTACPTYVRQSLAILASKEHSGCTYSKTDLFILLQSMVYSIFFVITIIQRHHFFFGLPYSLSSFRMHVRHTLVLKVTSLLVNTFKRSFAARLPNAMHLLIS	1508421	1523227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1511764_1511852_1512018_1515791_1515867_1523140
870275	contig_19564_pilon	-	2121	3	Intergenic	novelGene_29615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.5	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	166	1275	15529	12201	FALSE	65	ATGGGAAATGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15694	11354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13143_13943_14055_15472
870276	contig_9582_pilon	-	3087	11	Intergenic	novelGene_106852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_9	13.2664991614216	311	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	539	1438	815278	771024	FALSE	5	GGCTCCTTCGTGTCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCLEAVALVLLIALVPDPPRGAAEKHGEVAMGGPRSSWCEDVRYLVRNWSFVWSTFGVTAMTFVTGALGFWVPKFLFEARLVHGQQLPCLREPCNSQDSLIFGALTVVTGIIGVILGAEAARRFKKVNPRAEPLICASSLLATALCLYLALVLVPTTLLPFYVFLALGELLLSCNWAVVADILLSVVVPRCRGTAEALQITVGHVLGDASSPYLTGLLSSALRAGRPDSYLQHFLSLQQSFLCCAFVITLGGGCFLLTALYLERDQAQAGQPGTGTSDSKDVESQGLLSGAEGPLEGP	824392	769374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_771098_772219_772392_772508_772608_782168_782235_808680_808871_814266_814420_815132_815282_816477_816545_817240_817553_817921_818059_824373
870277	contig_500_pilon	+	1523	11	Intergenic	novelGene_31001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1062.33257033756	5	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	201	1112	1492663	1498065	TRUE	10	GGCATGTTTGACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494472_1495423_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
870278	contig_12092_pilon	-	5035	26	Intergenic	novelGene_163441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_25	622.684079128413	267	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1290	3873	94	3966	206516	124224	FALSE	40	AGAAATGCCACTTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQNRDQESTQPCLVHLWQKVRRKTSPLFFGMDTGSVGRLELTEQTPVLLGATAMATSLTNVGNTFSGPPNPLVSRSNKFQNSSVEDDDDVVFIEPVQPPPPSAPVVADQRTITFTSSKNEELQGNDSKTLSSSKELASQKGSVSETIIIDDEEDMEINQGQEKNSSNFIERRPLETKNRTNDVDFSTSSFSRSKTKTGVGPFNPGRMNVAGDVFQNGESATHHNPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSAQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSHKPAPKKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEFCSTSCLSLYEDKQNPTKGVLNKSRCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYRMANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQKRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRDHMQDSFLMQPEKCGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEPYCSTACMNSHKTKYAKSQSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQALSMQSSPNGQFVAPSDIQLKCNYCKNSFSSKPEILEWENKVHQFCSKTCSDDYKKLHCIVTYCEYCQEEKTLHETVNFSGVKRPFCSEGCKLLYKQDFARRLGLRCVTCNYCSQLCKKGATKELDGVVRDFCSEECCKKFQDWYYKAARCDCCKSQGTLKERVQWRGEMKHFCDQHCLLRFYCQQNEPNMTTQKGPENLHYDQGCQTSRTKITGSAPPPSPTPNKEMKNKAVLCKPLTMTKATYCKPHMQTKSCQTDDNWKTEYVPVPIPVPVYIPVPMHMYSQNIPVPTTVPVPVPVPVFLPAPLENSEKIPVAIEEIKSKVSSDPLDAELLTMTDMMNEDEGKPEAASINSVIIETDIIGSDILKNSDPETQSTMPDVPYEPDLDIEIDFPRAAEELDMENEFLLPPVFGEEYEEQPRPRSKKKGTKRKAVSEYQSHDDSSDNSECSFPFKYTYGVNAWKHWVKTRQLDEDLLVLDELKSPKSVKLKEDLLSHTTAELNYGLAHFVNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGSNRKDNIFIDPGYQTFEQELNKILRSWQPSILPDGSIFSRVEEDYLWRIKQLGSHSPVALLNTLFYFNTKYFGLKTVEQHLRLSFGTVFRHWKKNPLTMENKACLRYQVSSLCGTDNEDKITTGKRKHEDDEPVFEQIENTANPSRCPVKMFECYLSKSPQNLNQRMDVFYLQPECSSSTDSPVWYTSTSLDRNTLENMLVRVLLVKDIYDKDNYELDEDTD	229482	123154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_-_124417_126311_126433_126741_126994_127678_127794_141792_141945_142359_142529_144634_144730_146584_146711_149287_149460_150077_150194_150871_151002_154794_154830_155477_155644_162246_162420_164787_164939_166487_166605_169236_169353_169829_169981_177404_177477_194796_195010_195845_196012_197674_197961_205669_205764_206024_206527_228327_228396_229467
870279	contig_960_pilon	+	3744	1	Intergenic	novelGene_108223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	555	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAATCCAAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415510	419254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_415500_419300
870280	contig_6217_pilon	-	2990	20	Intergenic	novelGene_109612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_11	396.844953221667	76	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2448	543	2990	618165	422761	FALSE	55	AAAGAAGAGTGGGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKYGEHEAQPDDVQNEFSDIIKSRSDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDELEKTIKK	626317	422760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_618086_618258_625867
870281	contig_15021_pilon	+	2722	13	Intergenic	novelGene_26959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2090	2515	252040	263308	TRUE	45	TGTTGAAAAACAGATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNFIQNPFLQALPFLQREGVSLGDDRHDVHLIVNRFHECNIQGLQSVPERRDEVEAAVNPVVDDVPPVQATLIVQVPFKLLVDVGDDGLKAVSAVDGITVAGRVHHRQSQLHPTLFNLHGGGLDLDSFLPAAPGMTLSG	239756	269660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_241247_241749_241882_243697_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251401_251967_252064_260956_261075_261238_261377_262376_262482_263267_263362_267740_267864_269629
870282	contig_6418_pilon	-	6009	1	Intergenic	novelGene_81258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAAAATATGCTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489514	1483505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1483500_1489500
870283	contig_6364_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_51712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTGAATATATATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431314	433366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_431300_433400
870284	contig_848_pilon	+	3466	10	Intergenic	novelGene_83338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2577	2897	555067	556535	TRUE	40	GGAAGAAGAATGGGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESRTQGIFVAPRTKIPSLSTPTPCIWTRNSVLILRAASLSFSLLEAHKESISSMKIMEGLFSLASWNKFLTSFSLSPSHLETRSEEDSEKNVELFASVATALAK	547963	571584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_549439_551874_552965_555055_555142_555810_555957_556435_556593_559110_559229_563376_563448_566201_566360_567558_567673_571533
870286	contig_14637_pilon	-	2491	8	Intergenic	novelGene_114550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	223.20513124085	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	54	674	391450	363936	TRUE	20	TATTATATTAGTTGGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGGAGRPAGSERSRVRMDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLAIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFLKLDNWLNELETYCTRNDIVNMLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHSMLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLWESENQTKGVKLSHREEGHDGGACGGYCSVV	391503	362011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_362523_362629_364112_369328_369396_369469_369589_371424_371498_377829_377892_389892_389949_391382
870287	contig_7056_pilon	+	1862	8	Intergenic	novelGene_43703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	268.403442905014	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	20	1045	926284	937151	TRUE	15	CTCAAGGGTACCTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKRLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926264	938016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935514_937062_937611_937658
870288	contig_7378_pilon	-	2068	3	Intergenic	novelGene_120255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	569	925	417397	417041	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAVQGKEQSGTVSRGRHVCIPGSLCHLDGFCAKFQDRMQVWPCAWPRVFSTSPDPRGARYSLAFQVPCCPQTWPQGQDRPIHFFHGWKGYQISIPLLPSQPLMGGREVGHCPKLFL	423568	415897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_417412_417451_417978_423540
870289	contig_15092_pilon	+	2410	3	Intergenic	novelGene_57823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	149.5	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	557	976	342199	351165	FALSE	10	TTTTTTTTTTCGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNSKMRFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	341642	352599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_342228_348139_348358_350992
870290	contig_3975_pilon	+	2635	6	Intergenic	novelGene_54744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	59.8551585078513	462	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	91	342	1732342	1741111	TRUE	40	ACAAGGCAGATGTAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQGAESRAEVVSRSEVRQIKGGSRETNVVIMAQGGEDVRDYNLTEKQKAVKAKYPPVNRKYEYLDHTADVQLHAWGDTLEEAFEQCAMAMFGYMTDTGTVEPLHTVEVETQGN	1732251	1755375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1732439_1740689_1740715_1740981_1741411_1743744_1743798_1749928_1749966_1753471
870291	contig_10982_pilon	+	2348	8	Intergenic	novelGene_87880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	248.129574445058	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	66	998	145192	201769	FALSE	35	TGATAAAATTAAGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVTGEGAETRRQRGRRAGLIMEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	142249	203119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142309_145185_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
870292	contig_10982_pilon	+	2133	8	Intergenic	novelGene_87883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	248.616005855108	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	71	1003	145192	201769	FALSE	30	TCAGAGTATCATTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSLQSSGETNSKIITHTNKTLIMEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	142797	202899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142862_145185_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
870293	contig_5968_pilon	-	3118	4	Intergenic	novelGene_112182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	821	junction_3	145.753978409587	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2440	2952	635356	622680	FALSE	15	GTCTTGACTACTTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHRLKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	637795	622513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195
870294	contig_10581_pilon	+	2686	9	Intergenic	novelGene_41414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCAGCTCGAGCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613892	649722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_615345_618989_619082_619574_619758_620242_620396_627358_627549_628814_629036_632023_632160_633201_633383_649644
870295	contig_1288_pilon	+	2885	6	Intergenic	novelGene_147911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	60.7302231183124	254	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	166	2709	21657	28941	FALSE	75	ATAAAAAAACTCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDDIDWLHSRRGVCKVDLYSPTGQQDQDRKVICFVDVSTLNVEDKDAKDATGSSSEGDLNLENLEEKEIIVIKDTEKRDQSKTEGSVCLFKQAPSDPISVLNWLLNDLQKYALGFQHALSPSASSCKHKVGDTEGKYHKLPYGNCYSVYADQLNMDCVGNRPQSLRLEMAAAKNTNNNQSPSTPPAKSPSTQRAVISPDGECSMDDLSFYVNRLSSLVIQMARKEIKEKLEGGSKCLHHSIYPQTGDKGKNSPRSAVSKIASEMAHDAVEVTSAEMRGTGEEGREGGRKTFLYSELSNKNKGGDKQMCHRDSKEFADSISKGLMVYANQVASDMMVSVMKTLKVHSSGKPIPACVVLKRVLLKHTKEIVSDLIDSCMKNLHNITGVLMTDSDFVSAVKRNLFNQGKQNAADIMEAMLKRLVSALLGEKKETRSQSLSYASLKAGSHDPKCKNQSLEFSAMKAEMKGKDKGKMKPEQCKSLTSAEKVSEHILKESLTMWNQKQGNQGKVASKLCSNKEEKKEKLSLSTDSLAKDLIVSALMLIQYHLTQQAKGKDSFEDDSPGSTMGYMAQSAQYEKCGSGQSAKALSMKHLESRGVPGPSTSLKENQQLDSQKLDMSNIVLMLIQKLLSESPFNCDDLSEGENKRSESRTSKAASMSKKPDRGEEQCQENQELDFISGMKQMNRQFIDQLVESVMKLCLIMAKYSNNGAALAELEEQAALANNPNYQAGSSRCGHDAVVSQNYQDTPGPEVIVNNQCSTSSLQKQLQAVLQWIAASQFNVPMLYFMGDDDGQLEKLPEVSAKAAEKGYSVGDLLQEVMKFAKERQLDEAVGNMARKQLLDWLLTNL	19590	29117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1288_pilon_+_19756_21656_21753_22822_22874_23357_23460_25351_27491_28785
870297	contig_10196_pilon	-	4119	1	Intergenic	novelGene_132025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	500	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGTTCGCTGGCGTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315894	311775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_311800_315900
870298	contig_7151_pilon	-	2386	14	Intergenic	novelGene_40667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	158.76464662434	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	13	1107	65162	12783	TRUE	25	AACCCAATGTTTTTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWSPWPSGW	65174	1820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6092_6317_6390_12491_12807_13409_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_65077
870299	contig_11978_pilon	-	4610	1	Intergenic	novelGene_63002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	75	383	1531851	1531543	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHPHGTVKEWGAAGLSDSWFSENPMIFIQAPGHPWPLEFRCPLFKVGLPLGQEELEGTLDITGPWCFNGYFPLGKAPKLMGIHEVCALHPFTSSDLLPGALMCELLAGAELRAPRVPFAEIPLQAP	1531925	1527315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1527300_1531900
870300	contig_8330_pilon	-	3608	13	Intergenic	novelGene_71942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_12	85.9374368686637	335	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	5	1756	1448635	1359303	FALSE	20	CCCTTTTAGCTTCATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMAPELTPEEEQATKQFLEEINKWTVQYNVSPLSWNVAVKFLMARKFDVLRAIELFHSYRETRRKEGIVKLKPHEEPLRSEILSGKFTILNVRDPTGASIALFTARLHHPHKSVQHVVLQALFYLLDRAVDSFETQRNGLVFIYDMGGSNYANFELDLGKKVLNLLKGAFPARLKKVLIVGAPIWFRVPYSIISLLLKDKVRERIQILKTSEVTQHLPRECLPENLGGYVKIDLASWNFQFLPQVNGHPDPFDEIILFSLPPALDWESVHVPGPHAMTIQELVDYVNTRQKRGIYEEYEDIRRENPVGTFHCSMSPGNLEKNRYGDVPCLDQTRVKLTKRSGHTQTDYINASFMDGYKQKNAYIGTQGPLENTYRDFWLMVWEQKVLVIVMTTRFEEGGRRKCGQYWPLEKDSRIRFGFLTVTNLSVENMNHYKKTVLEIHNAEERQKRQVTHFQFLSWPDYGVPSSAASLIDFLRVVRNQQRLAVSSMGARSKAQSPEPPIVVHCSAGIGRTGTFCSLDICLAQLEELGTLNVFQTVSRMRTQRAFSIQTPEQYYFCYKAILEFAEREGMVPSSHNLLAVEGQ	1448639	1357450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1359518_1360338_1360547_1361015_1361167_1362354_1362434_1366365_1366433_1376016_1376111_1385799_1386129_1389241_1389353_1406778_1406885_1410931_1411057_1411774_1411865_1414976_1415121_1448602
870301	contig_8866_pilon	+	2321	7	Intergenic	novelGene_77783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	483	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCCGGTTCCACTCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341087	418223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_342356_348800_349256_352296_352490_356565_356636_361315_361406_363336_363438_418079
870302	contig_4797_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_6946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAGCCTGTTCCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656684	657603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656700_657600
870305	contig_10749_pilon	+	4023	1	Intergenic	novelGene_133429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGATAACTTAACCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135137	139160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_135100_139200
870306	contig_11292_pilon	-	4234	12	Intergenic	novelGene_109452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_4	72.4861913324483	74	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	68	1054	386035	372037	FALSE	10	TGTGCCATGTTTATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAASHMLLGSGITILSQPFMYVKVLIQVGYEPLPPTIGRNIFGRQVCQLPGLFCYAQHIASIDGKRGLFTGLTPRLCSGILGTVVHGKVLQHYQDSEKPEELGPGNVQKDVSSSFDRVIKETTREMMARSAATLVTHPFQVIALRSMVQFIGRETKYCGLCDSIVTIYREEGILGFFAGLIPRLLGDIISLWLCNSLAYLVNTYALDSGVSTMSEMKSYSQAVTGFFASMLTYPFVLVSNLMAVNNCGLAGGSPPYSPVYTSWVDCWCVLQKEVFFSLVLSGFVFLCFLKYCHWNPRLIFVAQPLAANTCTLYGVSYISLWHNNTM	386102	368856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_372275_373463_373532_374255_374304_375253_375348_376421_376482_376910_376963_377213_377272_378608_378672_378865_378893_382730_382838_383199_383285_385948
870307	contig_7751_pilon	-	4437	5	Intergenic	novelGene_174502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	29.8705540624877	46	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	282	2540	285724	276923	FALSE	20	AGTTCCCAGTCCTAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKREDKGVSSKDTDCPQEKKRKPTMLEPVTFEDVTVVFTEAEWERLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLLLEPKPELHPCSSCLLAFSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHVHPGHSSPGHQKQPEQQDSDQSFWRENTEGQGREEVSRPLCGRRGERGNSRGFSSPPETQSASPREGNTEVGVEPNSAQRVKSVERSQGLKELETSRFGAVSSREDEPDCSVKSDFITHQRSLLQEKPYVCSECGRGFHQKSLLLMHRRTYSGEEPYAHPESGRGFNRKANLITCKRTHSGENPYVCLQCGQDFNQESVFLTHQKTHSGQKPHVCKECGRGFNARLHLITHQRTRSGEKAYVCLECGRGFEREPRLLMPQRTHSGRNPYVCKDCGRGFTQKSSLLNHQRTHSGEKPYVCSECGRGFNQKLCLLKHQRTHSGEKSYVCRECGRSFTRKSDLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCKECGRGFSQKSGLLLHQGTHSEEKPHVCKECGRGFSHKSTLITHQRTHSGEKPYVCKECGRDFSHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNSKSTLITHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLLFHQRTHSWEKPHVCKDCGRAFSQKSGLLFHQRTHSGEKPYVCKECGRGFNFKSTLIRHQRTHSGEKPHTCKECGRGFNCKSNLVRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSHLLLHQGTHSVEKSHVEGIWARL	293972	275025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7751_pilon_-_278962_283067_283195_285449_285509_285690_285955_293921
870309	contig_408_pilon	+	1645	2	Intergenic	novelGene_84907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCTGATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131322	133078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_132474_132584
870310	contig_408_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_84912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGCACTTTCATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133077	131340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131300_133100
870311	contig_11259_pilon	-	2245	8	Intergenic	novelGene_144524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	175.71138208983	322	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	409	714	153679	139954	TRUE	25	TTCAGACTCATGGCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLKPCMQEGSGMT	156323	130594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_139870_139990_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_156095
870312	contig_9839_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_88532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACCACAAAGACTCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58955	61794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_59000_61800
870313	contig_7426_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_27533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATGTCAAAGATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088408	1085919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1085900_1088400
870314	contig_3410_pilon	-	1508	1	Intergenic	novelGene_58896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGAGCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15195	13687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_13700_15200
870315	contig_14553_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_125009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	372	746	21317	20943	NA	40	CTCAAATTAGACAGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVAIMLMRQDSIYKSRLCFKLISFEILKTEASRETWGPHTTRKAMLGAERILWTPGYCTKKLLDQWKIDDKDIPPELTERESPSLELELSIWISNLPDCDRINFFLLKPSTCSVSVIAALDN	21688	20046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_20000_21700
870316	contig_17968_pilon	+	4472	19	Intergenic	novelGene_154538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3004	3312	27785	30220	TRUE	55	GTCCCTAAAATAAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPANTASGLVLYLIHSISSSCGKLLNSPTIFHWVCRFAEPCIDIAANTAKTTAPGCALQKSHPNSCLEQIKEAVTHMCGVRKSFSLIIRMPRAAYASSCSA	9603	112616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_12407_16813_16935_27705_27807_28548_28724_30108_30229_30978_31004_36505_36558_38593_38664_46305_46411_52213_52294_52855_52923_54895_54979_62193_62273_64372_64463_75405_75499_91214_91273_108194_108288_109030_109150_112478
870317	contig_1037_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_84587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGACCTGCAGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68804	71150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_68800_71200
870318	contig_10765_pilon	-	2468	6	Intergenic	novelGene_122841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2038	2337	18497	15716	FALSE	25	ACGGTTCCCAGGCAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLQQIRSFAFVPLRRTSSFEINGGYRDPIIPSFLLDSAEVSSSMMGENPGLLSWFQSFVVWSTDEFFSMTQGFHFHLSIRHLTLQLCIDLYLLIKTF	35454	15584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15765_18246_19513_28911_29038_32030_32121_32462_32540_34725
870319	contig_2078_pilon	-	2657	11	Intergenic	novelGene_100168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	76.6234950912578	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	42	1838	535379	505518	FALSE	15	TATGGGTTGAATTGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISLTFGETDRQVSMRLCLLLLLILAPGGEQSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535420	504698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_534554_534576_535345
870320	contig_11656_pilon	+	2962	19	Intergenic	novelGene_54011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	139.191237573649	22	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	152	1882	465719	531251	TRUE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLARYVVLSVEAQIA	464953	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_531208_531337_535319_535411_536453
870322	contig_10451_pilon	-	4758	10	Intergenic	novelGene_138328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	99.0762270447967	363	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	1045	2841	563720	460351	FALSE	20	TGGACAGCCTCCGTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKVEPAGEDPGATPPAATFSPEEFPTFQHIRKGAFCDQYLSVPQAPCPWVKPKPLSPASYMSPSLPALDWQLPPHSGPYELRIEVQPKSHHRAHYETEGSRGAVKASAGGHPIVQLHGYLENEPLTLQLFIGTADDRLLRPHAFYQVHRITGKTVSTTSHEAILSNTKVLEILLLPENNMRAIIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPQPGGRTLSLQVASNPIECSQRSAQELPLVEKQSTDSYLVVGGKKMVLSGHNFLQDSKVIFVEKAPDGHHVWEMEAKTDREMCKPNSLVVEIPPFRNQRITSPVQVNFYVCNGKRKRSQYQHFTYLPANVPIIKTEPTDDYEPVQTCGPVTQGLSPLSKPYYSQQLLLPPDPGACLVAGFTSCQQRSTVMSPPPSTSPKLHDLSSATYTKCSPSTGHSHLGLQQPAGGAPTTQEVPRPRAVPSSAPHPSSHATLQPQVSQHLSSSCSLGYQQTLYPNSPSSPVPSVTQEPTYLQPCSPTSPSAVGHQQHQPPKVHRHESPTTQPLSLPELHEDSSHNLAPIPVTVKREPEELDQLYLDDVNEIIRNDLSSTNIHS	575186	458433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_460401_494608_495299_512712_512846_517614_517671_527495_527637_529154_529328_531209_531413_549533_549694_563529_564637_575058
870323	contig_2834_pilon	+	2881	2	Intergenic	novelGene_27965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1305	junction_1	0	3752	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	184	639	213515	213970	FALSE	15	GTGCAAGATGTTTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEGYPETQGNRNEVHNGQIRSPPDGMMAEELEVILKPAPRVQVSLEPVGLPPESLDEVSVEDLEAIPQRNPPNPADSLQRFRQFRYEDAAGPRDVLRHLQELAGQWLRPDIHTKEQIVEMLVQEQFQAVLPEELRARVQRYRPGVRITG	209506	216212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_209658_213482
870324	contig_17106_pilon	-	2568	10	Intergenic	novelGene_127675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_9	44.8800871458849	538	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	103	921	109585	91870	TRUE	20	AGGACTGTCCTTTATGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRARPCGSPRPSSRQQRPGVQIFARSLCARLVPMASYLRVLRPLCRAPGSGPAWTPAALTAPNLQEQPRRHYADKRIQVAKPVVEMDGDEMTRIIWQFIKEKLILPHVDVQLKYFDLGLPNRDQTNDQVTIDSALATQKYSVAVKCATITPDEARVEEFKLKKMWKSPNGTIRNILGGTVFREPIICKNIPRLVPGWTKPITIGRHAHGDQYKATDFVVDRAGTFKVVFTPKDGSGAKEWEVYNFPAGGVGMGMYNTDESISGFAHSCFQYAIQKKWPLYMSTKNTILKAYDGRFKDIFQEIFEK	109687	87664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_88691_89398_89492_89583_89682_89863_89977_91552_92011_93376_93521_93604_93766_95773_95940_96841_96934_109470
870325	contig_8775_pilon	-	4994	13	Intergenic	novelGene_166824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_10	186.413574702416	161	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1036	3111	742	3852	261767	95409	FALSE	30	TTGTTCCCAAGCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQRPWRVPSLLWAVLLVSTAAASQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILCSKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCSTDLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDETIIIALASVSALAVLIVALCFGYRMLTGDHKQGLHSMNMMEAAASEPSLDLDNLKLLELIGRGRYGAVYKGSLDERPVAVKVFSFANRQNFINEKNIYRVPLMEHDNIARFIVGDERVTADGRMEYLLVMEYYPNGSLCKYLSLHTSDWVSSCRLAHSVTRGLAYLHTELPRGDHYKPAISHRDLNSRNVLVKNDGTCVISDFGLSMRLTGNRLVRPGEEDNAAISEVGTIRYMAPEVLEGAVNLRDCESALKQVDMYALGLIYWEIFMRCTDLFPGESVPEYQMAFQTEVGNHPTFEDMQVLVSREKQRPKFPEAWKENSLAVRSLKETIEDCWDQDAEARLTAQCAEERMAELMMIWERNKSVSPTVNPMSTAMQNERNLSHNRRVPKIGPYPDYSSSSYIEDSIHHTDSIVKNISSEHSMSSTPLTIGEKNRNSINYERQQAQARIPSPETSVTSLSTNTTTNTTGLTPSTGMTTISEMPYSDETNLPATNVAQPIGPTPVCLQLTEEDLETNKLDPKEVDKNLKESSDENLMEHSLKQFSGPDPLSSTSSSLLYPLIKLAVEVTGQQDFTQATNGQACLIPDVPPAQIYPLPKQQNLPKRPTSLPLNTKNSTKEPRLKFGSKHKSNLKQVETGVAKMNTINAAEPHVVTVTMNGVAGRNHNVNSHVATTQYANGVVPSGQTANTVAHRAQEMLQSQFTGEDSRLNINSSPDEHEPLLRREQQASHDEGVLDRLVDRRERPLEGGRTNSNNNNSNPCSEQDVLTQGVPSTVTDPGPSKPRRAQRPNSLDLSATNILDGSSIQCESTQDGKSGSGEKIKKRVKTPYSLKRWRPSTWVISTEALDCEVNNNGSDRAVHSKSSTAVYLAEGGTATTMVSKDIGMNCL	262508	94266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_95657_97004_98282_100454_100628_107364_107502_113961_114110_116286_116448_120699_120815_122321_122553_124953_125046_125818_125930_152828_153000_154938_155110_261691
870326	contig_16865_pilon	+	3009	9	Intergenic	novelGene_178025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	35.5314561339667	302	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	116	1444	36954	59626	FALSE	40	GACTTTAAATCAAACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSARERVRLRRYSELPVWVAEDHQEVLPFIYRAIGSKHLPASDISFVHFDSHPDLLIPVNMPADTVFDKETLFGKLSIENWIMPAVYAGHFSHIIWLHPTWAQQIKEGKHHFLVGKDTSTTTIRVTSTDHYFLSDGLYVPEDQLENQKPLHLDVIMVKPYKLCNNQEGNDAVSSAKKPKLALEDAESTASPNCDSYSEGLEKDTVTQKSGQACLEPSCSCSESQECQTAVKTREVLEILKKGDAFVLDIDLDFFSVKNPFKEMFTQEEYKILQELYQFKKPGTNLTQEDLVDCVDTRTHQLEDLEATFADLCDCDDEDTIQRWASNPGMESLVPLIRSLKKRMAVPDYEMVHQAGLTCDYSELPHHVSTEQEIESLIQSVYCLLKHLPKPTLVTIARSSLDDYCPCEQVDSIQEKVLTVLRSLYGTLDIHLAYSADSSPS	36838	61191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16865_pilon_+_37035_38267_38414_40801_40952_44491_44919_46458_46522_46793_46916_53883_53951_56295_56436_59493
870327	contig_11338_pilon	-	1736	4	Intergenic	novelGene_6208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	157	573	13454	13038	TRUE	30	ACCAGCAGCTGCACGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGAVSTQAGTALEGSLPRDLAPDTSACSP	13610	10861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_10918_11045_11140_11263_11416_12176
870328	contig_13158_pilon	-	4881	16	Intergenic	novelGene_107285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	88	junction_10	97.0302129350556	184	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	187	1926	187708	98331	FALSE	50	TCAAAATTTGTACGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTQLSRSRDTTVAGAPAPVTDRRLAELCGSRLKVGPEAGRHGSPPQCPGGRLPRAPWAPRGIMSTASAASSSSSSSAGEMIEAPSQVLNFEEIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGTACDIQTHMTNNKGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQYSDEGQSNSATSTGSFMDITSTNTSNKSDTNMEQVPATNDTIKRLESKLLKNQAKQQSESGRLSLGASRGSSVESLPPTSEGKRMSADMSEIEARIAAATGNGQPRRRSIQDLTVTGTEPGQVSSRSSSPSVRMITTSGPTSEKPARSHPWTPDDSTDTNGSDNSIPMAYLTLDHQLQPLAPCPNSKESMAVFEQHCKMAQEYMKVQTEIALLLQRKQELVAELDQDEKDQQNTSRLVQEHKKLLDENKSLSTYYQQCKKQLEVIRSQQQKRQGTS	187894	95375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_98512_100237_100354_101048_101111_105959_106066_118706_118772_142578_142709_143230_143362_146672_146755_148989_149121_150868_150998_152899_153025_163259_163399_166274_166321_166841_166908_170883_170995_187588
870329	contig_11396_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_71347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTAAGAGGAAGGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496028	493832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_493800_496000
870330	contig_6589_pilon	+	2155	3	Intergenic	novelGene_26134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6874	junction_2	1866.5	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	95	490	1879633	1880585	FALSE	20	TCTTGATTTAATGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLKVFDGIPPPYDKVSLTRPYAVPTHLASVMFLDYLHCLILMRIALAEMPDLAVSPCLSCHSRPLSPLLPSQKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1879538	1882250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879819_1880150_1880274_1880498
870331	contig_12270_pilon	-	756	2	Intergenic	novelGene_113745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	423	755	14409	13854	FALSE	15	GTTATGCTGCTTATAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14831	13852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
870332	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
870333	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_94512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	74	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
870334	contig_50_pilon	-	4429	1	Intergenic	novelGene_122212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGAAACCCTGGTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53458	49029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_49000_53500
870335	contig_8866_pilon	-	2076	5	Intergenic	novelGene_77769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	546.971834283997	10	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	133	462	418087	348825	TRUE	15	TTTCAGATGTGTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKWRVATPQSRKKMRKRERRGVAFLRQSATLRLALPSWRPVARP	418219	340765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348957_361315_361406_363336_363439_418081
870336	contig_7775_pilon	+	6606	1	Intergenic	novelGene_37504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	392	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTACCCTATGTACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304025	310631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_304000_310600
870337	contig_10838_pilon	-	2227	8	Intergenic	novelGene_129156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1552	1851	19683	16118	TRUE	55	CTTAAAAAGAAAAAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEGSVLTDAFAMAEAMVLILSTESPLSDSSSLYLLGWLFIKKMSSVLPLSAVNVTSLPSSCEALSNSSTLSVTDPSLSCALDCSFKSPANKLWLR	29095	6498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_6562_7131_7344_16016_16142_17181_17313_19538_20366_20452_20580_23396_23542_28498
870339	contig_3132_pilon	-	2109	3	Intergenic	novelGene_127435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	94.5	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAAAGTTGTCTACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246148	237910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_239791_240290_240312_245940
870340	contig_6102_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_32223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACGAGGACTTTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897364	894991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895000_897400
870341	contig_12080_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_128357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGCACTGCACTATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81044	78534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_78500_81000
870342	contig_7860_pilon	+	3114	6	Intergenic	novelGene_147752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_5	76.5595193297346	487	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	149	763	22810	27543	FALSE	30	CCTGTCCCATCACCATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATSASDKPVCGELVSVAHALSLPAESYGNDPDIEMAWAMRAMQHAEVYYKLISSVDPQFLKLTKVDDQIYFEFRENFEKLRIDVLDPEELKSESAKEKWRPFCLKFDGIIEDFNYGTLLRLDCSQGYTEENTIFAPRIQFFAIEIARNREGYNKAVYTSAQDKEGEKRADKGGEKAKSGGERGADKGGEKEKKANKGDITPM	22661	29894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7860_pilon_+_22840_22927_22994_24606_24667_25168_25310_26911_27024_27337
870343	scaffold_19766_pilon	-	2872	6	Intergenic	novelGene_34246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	93.077602031853	18	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2548	2871	153215	152670	FALSE	20	TGCCTGACTGAGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVLSALQSPQEGLHTPMLRMVPAEGTMMPFAAKEVILGNPATGWFVETQGPLWNIVTWMPQMMLISSEPSTFPHLVSSVLKTVLSYTALRIFCMFSPTANKSTSPV	156230	152668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_154263_154454_154609_154706
870344	contig_9183_pilon	-	1947	7	Intergenic	novelGene_40326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	430.374029833999	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	926	1669	318415	312131	FALSE	35	ATTTGATATGAAATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCAHTHTHTHTHTHTFLFFLLQQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	323532	311852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743_323054_323201
870345	contig_15236_pilon	-	3627	2	Intergenic	novelGene_141632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_1	0	46	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAGTTTATATGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640747	636619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_637297_637797
870346	contig_11846_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_105933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	137	junction_2	47.5	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	678	995	251434	248626	FALSE	35	AGCCACAGAGTGTTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	252111	247978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_248713_250677_250855_251380
870347	contig_16703_pilon	+	927	5	Intergenic	novelGene_72774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1787.83128049042	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	23	568	27154	40627	FALSE	40	TAAGATGCAGAAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRWASALLSSTQSIGGCRAASLRSPIATTAPGWALPSSPQGMTWGRMMKMLL	27131	40986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_27265_28512_28688_29681_29789_38631_38758_40600
870348	contig_9183_pilon	-	2216	6	Intergenic	novelGene_40334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	441.224024731202	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	166	1944	323783	312131	FALSE	40	ATTATCATTTGATATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325923	311858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_315493_320557_320727_322743_323834_325808
870349	contig_10068_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_148698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCAAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38125	35789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_35800_38100
870350	contig_16103_pilon	-	1473	4	Intergenic	novelGene_118840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	69	452	743628	723303	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKETEHSSANVFRSLL	743696	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723345_735898_735975_737495_737630_743496
870351	contig_6277_pilon	-	3095	6	Intergenic	novelGene_80392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1379	1858	215262	208782	TRUE	55	GTTTGTATAAGAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLISGCEGGVGRRGAADVLQQIVPVSFIRHSDSQNSSIFLCRYFNMESIPWAEPQIFFSTSHSLSFACSSSIFMLQRTRALDSSSTTGLHEASSLIRTITSCVNVPGQNTWETSPLPHASCAVSFRPLSNISFADAPPIILGNITVEQPSGLCPKVV	216640	105438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_106106_201027_201285_202672_202846_208641_208855_213659_213804_214999
870352	contig_14970_pilon	-	8161	1	Intergenic	novelGene_45102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	763	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCTGCCTCTTCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263045	254884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_254900_263000
870353	SIRV6	+	1451	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	48	-8	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	596	45	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
870354	contig_8978_pilon	+	2660	13	Intergenic	novelGene_49482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_12	222.593550869941	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	652	2628	1749586	1772377	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQVKHHVEPLTPPWHHNKKRYPPSYGPDGKPRPRFNNVQLSPTDEERDKAEEEVHLLNSTTL	1721173	1772409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1770477_1770554_1772218
870355	contig_9436_pilon	+	3078	3	Intergenic	novelGene_60917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	773	1426	441998	443084	FALSE	20	AATATACTTTGTTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTAQHHSAVLPSGTQGEVEGSKGGRTSLERFWTPWRGNCSGGLRSQTRPGPLCPPHPESPKPGGNCSPALSAAAALSVPLQLPAPENIEENLLEVFRVFISQPARVLLSPFSPRSDNFDLNFTFCCESLPLQQLFHQPLDLFQLWVFPFHLEDSQILIGASVMEPGDPDPDSVLRILLLEGETHRETQSRAMTPGVRGPWWSQMVWAAILSQTRP	441225	444736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_442260_442545_442656_442802
870356	contig_8254_pilon	-	2919	1	Intergenic	novelGene_48373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1983	2510	52662	52135	NA	45	AAATAAGTTTCTCATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQSSQTILMIMGFIREVTGYNSGSGTLKDTVLPPGQPLPSCVHRHTSPQPSVSAQRHSAFSLCGLGSLPRRLLLLVSAAGSLLLGLFCQVSALASRALSLSWFQELLSTGILGPKDVLVLLPWWWMYLLFLTSGVAHFKPSRMAKLTNPFGGPQLPYLHSPAQSLGWELQDHG	54644	51725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_51700_54600
870357	contig_8153_pilon	-	3223	7	Intergenic	novelGene_34794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39675	26384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_26996_27082_27259_29108_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001
870358	contig_3004_pilon	-	1655	7	Intergenic	novelGene_127472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.617946637867	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	148	597	240486	229453	TRUE	35	TCTAGTTAGTAAATAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISLCHSSNDKKSQKSATEKQSPEDHLYVLEHNLHLLIREFHKQTLSSIMMPHPASAPFGHKRMRLSGPQAFDKNEINSLQSSEGLLEKIIKQAKHIFLRSRTAATIDSLASRIEDPQIQAHWSNINDVYESSVKVLITSQGYEQICKSIQLQLNIGVEQIRVVHRDGRVITLSHQEQELQDFLLSQVIVIRCMQFSS	241564	226871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_226999_227217_228026_229329_229481_232323_232450_235817_235956_240328_240514_241444
870359	contig_10134_pilon	-	1969	3	Intergenic	novelGene_16236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_2	302	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	372	602	34974	33552	FALSE	30	TTAAGTGTGTGTCTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSDWLLLQTPHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQGPANSPFFLFWYQITFILVMGLLFTVDTGLYLSLQRDLQSLMGNRNNYNVTWSKSPQDK	38726	32184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558
870360	contig_8615_pilon	-	3605	18	Intergenic	novelGene_165210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATAATTTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114629	25712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_25820_27074_27233_29227_29363_43082_43237_52423_52566_54992_55096_60415_60523_89001_89076_94891_95061_95390_95509_100246_100374_106273_106493_107366_107558_108892_109001_109440_109541_109780_109919_112618_112722_113277
870361	contig_11370_pilon	-	815	3	Intergenic	novelGene_98720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCGCACCGCCACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148548	145683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
870362	contig_3942_pilon	+	3795	19	Intergenic	novelGene_128845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	530	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1830	2147	1384948	1385639	TRUE	30	ACAGGGAGGCGGAAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGPKQKTVPTPCLERATLGRQGYVRAIPGPASQEAGQAGVGSILGLELHRGWAVRPRDEVVLWEAAGLNVVLEQLLREVLVHLGSLMCIHGIPTGFVQVSEQG	1383118	1408417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1385122_1385238_1385367_1385623_1385714_1388825_1388938_1389098_1389178_1389313_1389364_1390253_1390338_1391677_1391747_1391826_1391905_1392125_1392228_1392969_1393063_1393130_1393284_1394299_1394448_1394721_1394749_1396340_1396437_1397738_1397835_1398385_1398454_1398758_1398776_1408115
870363	contig_4531_pilon	+	2994	15	Intergenic	novelGene_47906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_10	295.529108687508	310	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	52	1629	371138	406716	FALSE	25	TTACCTTTCTTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGDGGSGRGGCGGSGPMRRRRRRDGFYSAPDVRDRETEDMAGVFDIDLDQPEDAGSEDELEEGGQLNESMDHGGVGPYELGMEHCEKFEISETSVNRGPEKIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAMIVRNAKDTAHTKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESIHDGTVTHTFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQSEEDVSQFDSKFTRQTPVDSPDDSTLSESANQVFLGFTYVAPSVLESVKEKFSFEPKIRSPRRFIGSPRTPVSPVKFSPGDFWGRGASTSTVNPPTPVEYPMETSGVEQMDVTMSGEASAPLPIRQPNSGPYKKQAFPMISKRPEHLRMNL	371086	408081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_371279_380831_380882_381713_381835_383013_383083_391432_391581_393649_393708_395138_395240_397264_397356_397538_397630_398158_398267_398552_398616_398792_398871_402240_402349_405389_405503_406478
870364	contig_14925_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_55112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	1481	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	197	454	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGKQAHLWDRNEAHHIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	72487	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_72443
870365	contig_610_pilon	-	2007	3	Intergenic	novelGene_76717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_2	1527	690	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	106	534	252557	214183	FALSE	10	TTCCCAGCTCCCCTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252662	212709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_252475
870366	contig_13048_pilon	+	3583	20	Intergenic	novelGene_138934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	20	junction_16	90.4310698452241	316	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	81	1844	488981	545507	FALSE	15	AACTACTGCTGGCGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTYEHLKLHTTPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLSVKKDVPPSAVTRPIFGILGTIHLVAGNYLIVITKKTKIGEFFNHVIWKATDFDILSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMINHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQPEVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSRASFVQTRGSVPVFWSQRPNLKYKPLPQINKVANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVILNLVNQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSEMIRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDKVAEMQDEFSYFLVDSAGKVVTNQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNGWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTQLGLIMDGWNSLVRYYRNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPKDWKFLALPVIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWAVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID	488900	547246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_489013_509055_509154_511903_511979_512895_513024_516728_516879_519452_519513_524355_524390_527775_527878_530178_530265_531069_531157_531658_531728_531834_531915_535937_536037_538508_538648_540635_540706_540828_540902_541647_541742_541844_541938_542747_542806_545370
870367	contig_15304_pilon	-	1379	4	Intergenic	novelGene_30641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	374.130399133184	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	3	533	105936	102665	FALSE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDHWDSLHHFCGPWPEE	105938	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102715_103276_103329_103548_103680_105638
870368	contig_366_pilon	-	1648	10	Intergenic	novelGene_51588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	546.431046783479	7	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	173	796	780147	757099	FALSE	35	TTTCTGTAAGGAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	802962	756246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770413_776845_776893_780057_780185_802171_802279_802934
870370	contig_14142_pilon	-	1504	12	Intergenic	novelGene_120540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	402.131161531135	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	9	1358	355495	349539	FALSE	50	GCAAAAGAAGGAACCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRTEPNPEERSSEAPGAHPAPGGRVHFAAQAGQLANCGWAGPLRGSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355503	349392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_354801_354931_355472
870371	contig_6654_pilon	+	2368	4	Intergenic	novelGene_85743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	160.009027523102	65	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	67	375	485684	495429	TRUE	35	CTAAGACTTTTTGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGGSERADGRIVKMEVDYSATVDQRLPECEKLAKEGRLQEVIETLLSLEKQTRTASDMVSTSRILVAIVKMCYEAKEWDLLNENIMLLSKRRSQLKQVSS	485617	504491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_485792_495141_495202_495288_497276_504344
870372	contig_7234_pilon	-	2530	13	Intergenic	novelGene_145924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_12	158.394264591732	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	93	800	481428	411977	FALSE	30	TGACAGGGATGCTGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	410246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_587318
870373	contig_20890_pilon	+	4003	2	Intergenic	novelGene_147044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCACTGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21151	32887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_21888_29620
870374	contig_15449_pilon	-	4128	9	Intergenic	novelGene_33644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.96590034228	358	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	60	1136	162916	131380	TRUE	25	GACTCCTTGAGCAACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLGNGERWTEAYIDAIRRNKYSEDRPPESHDPCGCCNCMTAQKEKKSENEWNQTRQGEGSATYTEEQLLGVQRIKKCRNYYEILGVSRNASDEELKKAYRRLALKFHPDKNCAPGATDAFKAIGNAFAVLSNPEKRLRYDEYGDEQVTFTAPQARPYNYYRDFEVDITPEELFNVFFGGHFPTGNIHMFSNVTDDIHCYRRHHRHERMQMRKEEEEDKPQTTYSAFIQLLPVLVIVIISVITQLLTANPPYSLFYKSTLGYTISRETQNLQVPYFVDKNFDKAYRGASLRDLEKTIEKDYIDYIQTSCWKEKQQKSELTNLAGLYRDERLKQKAESLKLENCEKLSKLIGLRRGG	162975	126013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_127723_130096_131505_136565_136739_138825_138936_139939_140050_140883_141070_145801_145948_161163_161351_162876
870375	contig_5549_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_81559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	30178	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	123	797	82155	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPRPAYSAAKGDRRFFSPELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82032	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
870376	contig_12414_pilon	+	3004	17	Intergenic	novelGene_59628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_11	352.869791628229	59	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	47	1684	653015	681304	TRUE	15	TTATACTTGTCTTTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAAAADPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPARHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGVRGLRALGVRDLSYRLVFLACSVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFTPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDIRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPVGGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTT	652968	696307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_653122_655641_655789_657540_657652_659047_659298_660104_660271_660567_660714_661518_661670_663739_663882_678045_678188_679840_679949_681136_681453_683109_683239_684738_684901_690260_690397_690966_691123_693031_693172_695858
870377	contig_500_pilon	+	1613	11	Intergenic	novelGene_30989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1003.51096157441	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	212	1189	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485739	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498071_1498866_1498974_1499277
870378	contig_15666_pilon	-	2314	5	Intergenic	novelGene_70212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	119.149066299321	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	736	1668	132068	129060	FALSE	30	AACTGCCAAGTGAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGHIRISSEHSSHLLSH	132803	128413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_130018_130298_130515_130795_131446_131711_132007
870379	contig_7898_pilon	-	3318	1	Intergenic	novelGene_47629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	413	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGCAGCCTCAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699486	696168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_696200_699500
870380	contig_9468_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_59484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264541	267148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_264500_267100
870381	contig_513_pilon	-	2221	14	Intergenic	novelGene_80134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	507.600784291177	4	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	23	1480	416603	304710	FALSE	40	AAATCCCTTAGCAAATCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSVQSSVMNPEERIVTWLISLGVLDSPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLVPGSVEKYCLEPQTKADCTNNINDFLKGCAALQVEVFDPDDLYLGVSFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCGRSSSLSAANSSQTNPQGAVSSTAPGLQRQSKAVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGEDIKTLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSSVLIMLSASPRMSGFIYQGKISIAGMVVTRLDEIEGNDYTFEITGNLTERLVVHCNNSQDLQEWLEQLCRLTRGPASCSSLSKTSSSCSAHSESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGTRKDSVPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTITEEKSLVDTVYALKDEVKELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRAESSSKTSILP	416625	303968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_304851_306469_306525_308605_308706_311806_311885_313014_313109_316906_317050_318376_318456_319441_319529_322046_322118_368690_368842_370350_370476_373327_373413_415123_415208_416438
870382	contig_513_pilon	-	1841	16	Intergenic	novelGene_80135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	551.934271449056	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	369	1148	336707	313081	TRUE	30	GCAAGAGGTGGTGGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGLETAPLTKNYYAVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEFTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLNLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDDLDQFMESQGASSPGILILTTSLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIIAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKTLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSSVLIMLSASPRMSGFIYQGKISIAGMVVTRLDEIEGNDYTFEITGNLTERLVVHCNNSQDLQEWLEQLCRLTRGPASCSSLSKTSSSCSAHSRNLCPYRSLVKVRKR	368699	304456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_304851_306469_306525_308605_308706_311806_311885_313014_313129_316906_317050_318376_318456_319441_319529_322046_322194_324191_324252_327391_327531_336630_336754_338178_338275_345090_345186_356920_356992_368639
870383	contig_11427_pilon	+	2560	3	Intergenic	novelGene_78959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	149	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	78	617	55005	55587	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICWVQLPRSLTHQWRLEKTVTGLSKMEHQTSSPMYDYIDYSASEPCQKLDLKQIAAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLINCKKLKSMTDIYLLNLAISDLLFLLTLPFWAYHAANGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVVVLVSLPGIIFTRTQQEEISIRL	49754	57530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_49821_54993_55526_55568
870384	contig_5286_pilon	+	2248	2	Intergenic	novelGene_157392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	111	518	676051	676458	FALSE	15	ATCATTGTTTCTTTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCAKKTKIPRTGPISNIMINGEKTEVVKDFSLLGSTINTHGSSSEEIQRSIALGRFAAKDLFKVLESKDVTLMTEVHLIQAMVFTIASYAYESWTMSKEDRRRIDAFELWCWRRILNIPWTARRKNKSLCLGRS	671787	678188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_671811_675963
870385	contig_10949_pilon	-	4931	20	Intergenic	novelGene_146682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3037	3438	59664	41940	TRUE	60	GAAAAGAAAAAATCGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSTSPGSRTRLGSEQGFARGNFRGNFGLIIRVVFSFPNLSSICSSSSESKSNSSSITCSVTSLALSAFFAILARRDLDKLFILLVLPLDINRASGLSFPSRSKSGESSSESFKQVPVMLNFAFWEEPVFSV	119812	14628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_14718_15101_15209_17515_17678_18635_18777_20303_20491_22137_22297_30666_30760_31127_31233_32515_32608_39741_39834_41673_41975_42751_42856_58888_59070_59582_59667_60155_60292_60907_61222_90797_90892_112692_112802_116483_116813_117760
870386	contig_9535_pilon	-	1884	13	Intergenic	novelGene_124493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	101.9567923191	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	386	1441	628780	608023	FALSE	35	AATATCGATATTTTCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVSAQLHGSGDQEAWQKGVQFASGQNLARHLMETPANQMTPTRFAEIIEKNLKDANSKTEVYIRPKSWIEEQEMGSFLSVAKGSDEPPVFLEIHYKGSPNACEPPLVFVGKGITFDSGGISIKASANMDLMRADMGGAATICSAIVSAAKLNLPINIIGLTPLCENMPSGKANKPGDVIRAKNGKTIQIDNTDAEGRLVLADALCYAHTFNPKLIINAATLTGAMDIALGSGATGIFTNSTWLWTKLFEASIETGDRVWRMPLFEHYTKQVVDCQLADVNNIGKYRSAGACTAAAFLKEFVTHSKWAHLDIAGVMTNKDEVPYLRKGMTGRPTRTLIEFLLRFSQDEANA	635497	607579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_608219_608698_608809_611070_611151_617377_617481_618568_618658_620163_620289_623284_623444_626732_626898_628751_628823_630186_630293_630765_630821_632053_632170_635431
870387	contig_9345_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_24711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1205	1528	987245	986922	NA	35	GTATGTATGTATTAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQGIWKKLLNYVNMLQAFDQDNMMEEIGGKIIHMARTLNLELDTTDVEQLIDHKEGGLTDQDLMDFEEERSAEEERNKKRKEKLSKIFTVKALAEVFSELNRALVA	988449	986647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_986600_988400
870388	contig_3627_pilon	+	865	3	Intergenic	novelGene_78500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	908	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	54	527	621315	634316	FALSE	15	GGCAGGCCATGCCTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621261	634654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
870389	contig_3627_pilon	+	1084	4	Intergenic	novelGene_78493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5920.69716240316	848	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	58	531	621315	634316	TRUE	45	GTATAACCAAAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621257	634984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066_634639_634753
870390	contig_3627_pilon	+	1199	3	Intergenic	novelGene_78494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	30	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	58	531	621315	634316	FALSE	45	GTATAACCAAAGATTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621257	634984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
870391	contig_7919_pilon	+	4569	15	Intergenic	novelGene_28050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	793.500549747119	1267	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	451	1668	974431	984965	FALSE	25	TAATCCTGAGTGACAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTLILLTFVSIVSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGHKAFGLVGKLAASGSVTMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALMNLEDTTGLWYLNGDYLVLLVSLVLILPLSLLRNLGYLGYTSGLSLLCMMFFLIVVICKKFEIPCPMEIALLINETINSTLTQPTFAPDVTFNMTEDDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILTFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSRISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVEAELLHTYSAVMAADILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSITQLLCAGKDFSWWRHSFITTSILGLTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAAAMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALLFLLSGIVVMTGSMTLIVLDWVHNAPGGGH	972464	987866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_972723_973932_974057_974362_974445_977857_977932_978020_978114_978244_978327_979793_979877_980315_980375_980476_980642_980948_981029_981137_981239_981791_981917_982269_982415_983745_983844_984866
870392	contig_11285_pilon	-	951	10	Intergenic	novelGene_5681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	351.722568840981	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	189	761	796157	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	796468	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785495_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415
870393	contig_4531_pilon	+	7439	31	Intergenic	novelGene_47927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	196.072381759617	349	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2173	6522	354	6875	608721	701172	FALSE	45	AATTAAAAAGTTGCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSFVPNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKRYVWQGPTSAPILFPVTEEDPILSSFSRCLKADVLGVWRRDQRPGRRELWIFWWGEDPNFADLIHHDLSDEEDGLWENGLSYECRTLLFKAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHLSCSFTFFLHGDSNVCTSVEINQHQPVYLLNEEHITLAQQSNSPFQVILSPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWKQFYPISSCLKEMSEEKQEDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSSVGSSHCSASCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSAQKWVKFSSVSDGFNSDSTSHHGGKIPRKLATHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLCEEETADKVASWDFVEVTQRTNCSCSRHKNLKPRNPGQQGQAPSLGQQQQVLPKHKTNEKQEKSEKPQKRPLTPFHHRVSVSDDVSMDTDSASQRLVMSAPDSQVRFSNIRTNDVAKTPQMHGTEIANSPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQSQHFYQMPTPDPLVPSKPMEDRIDSLSQSFPAQFQEAVEPTVYVGTAVNLEEDEANIAWKYYKVPKKKDVEFLPPQLPSDKFKDDPVGPFGQESVTSVTELMVQCKKPLKVSDELVQQYQIKNQYLSAIASDAEQESKIDPYAFVEGDEEFLFPDKKDRQNSEREAGKKHKVDDGTSSVTVLSHEEDAMSLFSPSIKQDAPRPTSHARPPSTSLIYDSDLAVSYTDLDNLFNSDEDELTPGSKKSVNGSDDKSSCKESKAGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSLEQHIMGFSPMNMNNKEYGSMDTTPGGTVLEGNNSNIGAQFKIEVDEGFCSPKPSEIKDFSYVYKPENCQVLVGCSMFAPLKSLPSQCLPPIKLPEECIYRQSWTVGKLELLHSGPAMPFIKEGDGSTMDQEYGPAYTPQTHTSFGMPPSSAPPSNGGAGILPSPSTPRFPTPRTPRTPRTPRGAGGPASAQGSVKYENSDLYSPASTPSTCRPLNSVEPATVPSIPEAHSLYVNLILSESVMNLFKDCNFDSCCICVCNMNIKGADVGVYIPDPTQEAQYRCTCGFSAVMNRKFGNNSGLFLEDELDIIGRNTECGKEAEKRFEALRATSAEHVNGGLKESEKLPDELILLLQDQCTNLFSPFGAADQDPFPKIGVISNWVRVEERDCCNDCYLALEHGRQFMDNMSGGKVDEALVKSSCLHPWSKRNVVDVSMQCSQDILRMLLSLQPILQDAIQKKRTVRPWGVQGPLTWQQFHKMAGRGSYGTDESPEPLPIPTFLLGYDYDFLVLSPFALPYWERLMLEPYGSQRDIAYVVLCPENEALLNGAKSFFRDLTAIYESCRLGQHRPISRLLTDGIMRVGSTASKKLSENLVAEWFSQAADGNNEAFSKLKLYAQVCRYDLGPYLASQPLDSSLLSQPNLVVPASQSLITPPQMTNTGNANTPSTTLASAVSNTMTLTSGGAMSSSVATANSTLTTTSASSSSSSSLNSGVSSNKLPSFPPFGSMNSSAAGSMSTQTTTVQNGQLGGQQASALQTAGISGESSLLTTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTDGDSHAITYPPAIVVYIIDPFTYENKDESTNSSNVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKSTVSVQIVPCQYLLQPVKHEDRQIYTQHLKSLAFSAFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALKSPDRPECIRLYTPPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLETCIINIDVPNRARRKKGSARRFGLQKLWEWCLGLIQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDWSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTSQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTENLDLAFNPNNDGIGIFDLLDTPDDLDPDIISILPASPTVSPVHSPGSHYPHGGDTGKGQGTDRLLSTESHDEVTNILQQPLALGYFVSTAKAGPLPDWFWSACPQAQYQCPLFLKASLHLHVPSVQSDELLHSKHSHPLDSNQTSDVLRFVLEQYNALSWLTCDPAIQDRRSCLPIHFVVLNQLYNFIMNML	608038	701736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_608298_608626_608787_610652_610888_620966_621136_635639_635786_636987_637186_638569_638765_639317_639481_639684_639796_648119_648804_660627_660842_661829_661912_664252_664375_666174_666266_666397_666613_666885_667083_667903_668821_681756_681925_684625_684850_686878_687069_688261_688725_689963_690184_690790_690983_691152_691377_693644_693788_694298_694458_694572_694759_696084_696225_697661_697836_700595_700697_701039
870394	contig_15327_pilon	-	2498	4	Intergenic	novelGene_70533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_3	78.2744459506989	2082	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	87	578	525384	513059	FALSE	5	CTCTGTATCTTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNV	525470	511138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_513245_513894_514064_517485_517609_525370
870396	contig_500_pilon	+	1286	9	Intergenic	novelGene_31015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	991.014600043814	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	201	1013	1492663	1499316	FALSE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLSLESALKDLKIK	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496889_1499277
870397	contig_8729_pilon	+	922	2	Intergenic	novelGene_40137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTTAACAACCAGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646282	664758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_646877_664430
870398	contig_12427_pilon	-	1870	7	Intergenic	novelGene_40541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.17543988105	18	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	211	834	522337	506035	TRUE	25	AAGATCATCTGATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578162	504675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_505540_505862_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
870399	contig_5482_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_144489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTGTACTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507523	508568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_507500_508600
870400	contig_1948_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_31144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCCTTGGTAGCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115569	113569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_113600_115600
870401	contig_7428_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_77716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	255	368	417251	417138	NA	60	CTGAAAGAACTGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLKRNGVAVTIKKNISRSILKYNTVSNRITESDNHIVYYSGNDNLKRNDTAFIIKKNVSRSILKYNTVSDRIISVRLQGRPVNMTVIQIYAPTIKAKGEETEDFYQLLQSEIDQTCNQMH	417505	416410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_416400_417500
870402	contig_5954_pilon	-	5959	1	Intergenic	novelGene_28797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGGCAGTTTCTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1425005	1419046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1419000_1425000
870403	contig_9415_pilon	-	3479	11	Intergenic	novelGene_109806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	349	junction_9	111.421945773712	787	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	169	1230	1819921	1755950	FALSE	20	CACTGATTTTTGGGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEPGARREDVLAAATGSAHAVQVRAPPPRALRDPRVTKSGSRGAAGASESPSLPKMPHRSLHAAAVLLLVILKEQPSSPAPLNGSKWTYVGPDGERSWSKKYSSCGGLMQSPIDLHSDIIQYDASLVPLEFQGYNVSANEQFILTNNGHSVKLSLTPNMYLLGLPFRYSATQLHLHWGDQSNPHGSEHTISGRHFAAELHIVHYNSDLYPNASTASNKSKGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQDVKYKGQEVPVPGFNVKELLPERPEEFYRYMGSLTTPPCNPTVVWTVFRNPVQISAEQLLALETALYYTHVDDPSRKEMVNNFRQVQKLDERLVYVSFRQDLTYEGLSVGIILSVVLAGILGICIVLGVFIWLFRRKKSKKGDSNKGVIYKRAIKKETEAHS	1820089	1753700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1756023_1756786_1756875_1757738_1757766_1770109_1770237_1771929_1772088_1772616_1772681_1773499_1773596_1776039_1776183_1777877_1778058_1811720_1811742_1819836
870404	contig_7157_pilon	+	5273	5	Intergenic	novelGene_131261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	106.611444038621	354	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	113	574	33634	44567	FALSE	35	TGCACTATTTTATATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEVDFTTGDAGASSTYPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDYQLICIQDGYLSLLTESGEVREDLKLPEGELGKEIEGKYNAGEDVQVSVMCAMSEEYAVAIKPCK	32863	49266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_32941_33598_33799_34517_34623_43826_43959_44507
870405	contig_8330_pilon	+	1354	5	Intergenic	novelGene_71824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	329.846460493364	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	74	448	853343	856687	TRUE	15	ACACCGCTGCCCAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853269	857807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853348_853839_854054_856423_856560_856667_856755_856968
870406	contig_6557_pilon	+	4393	1	Intergenic	novelGene_32970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCTTTAGAAAAATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386963	391356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_387000_391400
870407	contig_9505_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_121863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATATATGGCGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611691	610053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_610100_611700
870408	contig_7207_pilon	-	4545	2	Intergenic	novelGene_72096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	350	370	727332	727312	TRUE	20	GTGAATCCCAGCTCTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLVKLSSSLPTCLLLVHGTRQPHWSFFSLFNISNSFLPQDLPILCTGNVLPLYLLEAASLSLFWRVLKVTSDNVIPICLRYSDTLLSESSSSLRLCLSLNSIPLSSIYHFLEVDYMGKMDN	727681	722736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_726785_727184
870409	contig_815_pilon	+	6734	8	Intergenic	novelGene_175030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_6	39.0593478320008	376	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	119	1513	8432	23823	FALSE	40	ATTTACACATGGCAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGSPKSCFLFLGSILCEVNWVSVLSDAWNPNPRPETRSMIVCLLFMMILLAKEDQLVDQTDSPLLNLLGQTSSLSWHLVDIVSYQSVIGYFSSHYPPSIILAKESSAELIVKLLKVSAGLSIPADGQKHLDAVPKCRAFIHQMVQFLSALEQNGKITFAILEQQMSKLLDDIIIFNPPDIDSQTRHMALSSLFVEVLMMMNNATVPTAEFLRGSIRTWISQRVHGLGVLPLLTAACQSLASVRHMAETTEACIMAYFKEDSLSQNVGWGPILVSLQVPELTVEEFLQECLSLGSYLTLYVYLLQCLNSEQTLRNDMKVLLILSKWLEQVYPSSVQEEAKLFLWWHQVLQLSLIQTEQNDSVLTESVIRILLMLQGRQSLMAEERLSSGILGAIGLGRKSPLSNRFRVVARSMAAFLSVQVPADDQIRLKPGSELYLTLKAQQALNALESMTSNKQYIEYQDQISQAAQFIKHPGHCLQDGKSFLALLVNRLYPEVHYLDNIR	8313	29044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_815_pilon_+_8498_13318_13529_14274_14420_17173_17417_18715_18933_19421_19638_20565_20681_23640
870410	contig_10011_pilon	+	3301	9	Intergenic	novelGene_68081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_8	79.8545552864707	3	153	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	96	2105	322928	333031	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322832	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994
870411	contig_18850_pilon	-	3642	1	Intergenic	novelGene_142398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1215	1616	17865	17464	NA	30	TTATTTAGTACTTGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIPEPHHRLLNTHSGGQDQESAFQQAGRGVVAVMGKGTDPWHFFISVIPSKGPVLFINSLQSQLMALVDPCPPPWVQSTRVATSRLSSSPMLFPGAEAVGRSPSEQEMCPQLIMTTRPGQGQKPGIFHQAMA	19079	15437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_15400_19100
870412	contig_20314_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_125645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	545	940	7302	6907	NA	85	AATTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEPLRSWPYLLRRRQLGFFCSLSLQLLLPVASWPLGLMPAFALLGQVFQSSVAPLISARRHPTPPGSLLHIGTQLSRAPWVSSSAISHWTPGSAAVGSLPLPLLCCCRASAAAAPLYIHNFKTASTF	7846	5758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_5800_7800
870413	contig_3866_pilon	-	2664	13	Intergenic	novelGene_112437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	70	junction_12	43.0202633134149	885	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	349	1461	303826	280333	FALSE	15	TTTATTGAATGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVVIESVLCPSHFRETLARVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCNVDTSAAKEQSLPSVMGSIPEGVLEDIKVRTCFVSDLKRGLNIQAAKFNIDGKTERPTPPPNVDYPLDGEKILHVLGSIRDSVVEILFEQDNEEKSVATLMLDSLMQCPIDTRKQLAENLVVIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKALGSKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMMFDVGKAQPPLMKRAFSTEK	306340	279129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_280515_281901_282104_283220_283303_286371_286446_286525_286606_289280_289317_296309_296390_296662_296731_298513_298622_301032_301142_302814_302898_303817_303891_306056
870415	contig_9981_pilon	-	3230	2	Intergenic	novelGene_121045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_1	0	304	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAATACTTTGTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255057	249288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_250542_253080
870416	contig_854_pilon	+	2104	7	Intergenic	novelGene_36753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	29.9592315581618	355	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	322	1326	1739485	1745937	TRUE	10	TCTCCCCATTTTGGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSETQDIIEDVIEYLKNGISQEELQLLLSEDQDWERFQVEADLSRDEADILHEALNKLRMDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722258	1747198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722355_1722569_1722669_1737993_1738042_1739406_1739516_1743412_1743540_1745090_1746669_1747151
870417	contig_2069_pilon	+	2560	14	Intergenic	novelGene_23250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	303.41987624705	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1003	1719	341330	343975	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323994	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_333971_334011_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
870418	contig_9653_pilon	+	3645	2	Intergenic	novelGene_48242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	299	junction_1	0	41	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAACCCAGATCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824892	831864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_825879_829205
870419	contig_11227_pilon	-	5405	3	Intergenic	novelGene_163175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTCCAAGGATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121403	115593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_115700_115814_115920_116209
870421	contig_11285_pilon	-	2778	26	Intergenic	novelGene_5678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440.078109430587	1	96	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	401	2578	794634	784262	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVNAAASGLGGEGHSYLVDSGRRAGWSAAAHAAGPSHVEGRLLQAESPAPGRGR	796177	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785495_785700_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795507_795682_795746_796126
870423	contig_4531_pilon	+	2478	2	Intergenic	novelGene_47925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGAGACGGCGGCGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419866	423590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_422217_423462
870424	contig_13707_pilon	-	3865	6	Intergenic	novelGene_43527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	146.185635409229	4	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATAAGCTTTTAGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154195	143717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_145247_145948_146032_146441_146477_150930_151000_151514_152162_152693
870425	contig_16103_pilon	-	1334	4	Intergenic	novelGene_118834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	123	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	65	442	743628	723174	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKQLSEGNFSA	743692	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723202_735890_735975_737495_737630_743496
870426	contig_16103_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_118823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723377	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722300_723400
870427	contig_16103_pilon	-	1391	7	Intergenic	novelGene_118846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	675	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	71	919	743628	722754	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEGDSRRSLAKKKKKNLKSAVQVFSFKVSWSKVIFILFFFIRSDQTNMMRPLSETKPLSHPFSTPFPTTHRMDHGPLCWGDDLFALLPPFLKRPKRK	743698	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723041_733574_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
870428	contig_16103_pilon	-	2132	8	Intergenic	novelGene_118841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	496	junction_4	3407.48548741426	7	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	69	701	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESKCSELEEELKNVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743696	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734314_734391_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
870429	contig_16103_pilon	-	1463	4	Intergenic	novelGene_118853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	142	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	28	396	743628	723350	FALSE	15	ACCCTCTGACCTGCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSKSWVGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKGLSTFGNNI	743655	722282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_735901_735975_737495_737630_743496
870430	contig_3018_pilon	-	2051	15	Intergenic	novelGene_78842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	575.614667028177	3	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	557	1891	583440	561113	FALSE	15	TGTTCCTTGTACTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMDLI	625115	560952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561125_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580172_583417_583599_599993_600194_624772_624821_624965
870431	contig_7870_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_109041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	820	1191	618461	618832	NA	75	AATTAAAAGAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKSNDTGSIKRRWKEYTQTLYQKELVDIQSFQEVAYGQEPVVLTEEVQAAAKELAKTRLLELTEYQWKCFNNQMQRWKRPLIYAKKFRKQLPGQLTGRDPYLWPFQRKVIQQNAEIIKQYH	617641	619813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_617600_619800
870432	contig_9014_pilon	-	1765	15	Intergenic	novelGene_106746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	75.8282161688308	1482	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	445	1365	82349	78380	FALSE	25	TTCTCATTTCAAATCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTGDKILDTALSKIGEKSLFTKELEHALEKNEVDLVVHSLKDLPTMLPPGFTIGAVCKRESPYDAVVFHPKFVGKTLETLPERSVVGTSSLRRAAQLQRKFPHLEFRSIRGNLNTRLRKLDEQQEFSAIILAAAGLQRMGWQNRVGQILHPEECMYAVGQGALGIEVRSKDQDILDLVGVLHDPETLLRCIAERAFLRHLEGGCSVPVAVHTAVKDGQLYLTGGVWSLDGSDSMQETMQANVHIPAQYEDGPEDDPQLVGITALNVPRRAQLAAENLGISLASLLLNKGAKNILDVARQLNDAH	85926	77979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_78554_78650_78738_78878_78933_79339_79460_79699_79739_80124_80239_81023_81100_81220_81299_81726_81805_82158_82215_82304_82355_82653_82727_83091_83146_83319_83451_85745
870433	contig_4180_pilon	+	2303	10	Intergenic	novelGene_8297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_5	147.031952519608	18	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	906	1772	811833	821915	FALSE	75	TGTATAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733029	822446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810963_811213_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
870434	contig_5769_pilon	-	4132	19	Intergenic	novelGene_138749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	254.015486307332	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2295	74	2368	73916	18760	TRUE	30	TCTGCATTTTCCTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPAEAEKEGNEVEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKVVVDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTSVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQATNAILRGGTILAPTVSAKTIAEQLAEKINAKLNYVPLEKQEEERQDGGQNESFKRYEEELEINDFPQAMNTLKRQLQSEEHTSLLAKNPRKESGKFTWQLKVPMNWLCRKQRQKSRGS	73989	15659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_17344_17403_17464_18739_18814_26431_26530_26925_27149_28007_28185_35367_35518_35838_35977_37983_38178_45026_45190_45707_45873_64681_64765_66475_66555_68991_69114_70056_70233_70766_70888_71597_71764_72647_72762_73844
870435	contig_5954_pilon	-	923	1	Intergenic	novelGene_28818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAGAAATGTGCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1579235	1578312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1578300_1579200
870436	contig_12923_pilon	-	3342	28	Intergenic	novelGene_30134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	150.011531335453	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	1278	3302	176178	162599	FALSE	15	CCTGTCTGCCAGAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDAIHGDRLKHLIVTPSGCGEQNMIGMTPTVIAVHYLDHTEQWEKFGLDKRQEALELIKKGYTQQLAFKQPNSAYAAFQNRPASTWLTAFVVKVFSLAANVIAIDSLVLCGAVKWLILEKQKPDGVFQEDGPVIHQEMIGGFRNAAEKDVSLTAFVLIALQEAKDICEGQVNSLGGSINKAGDFLEANYLNLQRPYTVAIAGYALAQLGKLEGNHLNKFLGTAKENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLEESCTQFYHPEKEDGMLDKLCHKDTCRCAEENCFMHHVDDKVTLDERLDKACEPGVDYVYRTRLVRKELSNDFDDYIMVIEQLIKSGSDEVQVGQERRFISHIKCREALKLKEGKYYLIWGISSDLWGEKPNTSYIIGKDTWVELWPEADECQDDENKKRCEDLGAFTESMIVFGCPN	193903	162558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_164816_165666_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_172032_172190_172858_172958_174586_174747_175257_175334_175991_176196_177926_177948_179868_179994_183784_183871_184607_184717_190552_190751_190946_191019_191304_191435_192385_192545_193442_193650_193750
870437	contig_13481_pilon	-	1516	4	Intergenic	novelGene_119391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	67	360	536852	527468	TRUE	75	AATAAAAAAAAAAAATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIRFDPENPQTLRLEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536918	526094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
870438	contig_13984_pilon	+	2414	7	Intergenic	novelGene_130237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	1809.70556230074	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	210	854	9124	24829	FALSE	35	GTGGTAAATCTTTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNDIVQGAEDQGIQEEEGGAYERDNQHQGEAEEDTDNGHEPREQRPREDNPESEADRAAVEDINPADDPNNQGEDEFEEAEQVREENVPDENEEQKQSNQKPENAEMEEHLVMAGNPDQQEDNVDEQYQEEGEEEIQEDLTEEKKRGLEHNAEETYGENKENVWVDDKNNDGEERDIREDNRPKGREEHYEEEDEEEEDGAAVGEKSHRRAEM	8215	26389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_8403_9101_9185_11084_11195_14292_14461_14791_14861_23998_24086_24679
870439	contig_12864_pilon	-	1714	7	Intergenic	novelGene_76380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	413.068766134109	1702	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	167	709	223293	217842	TRUE	30	TCATTTTCATGAAATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223459	214619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215607_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
870440	contig_11227_pilon	+	3924	4	Intergenic	novelGene_163202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	52.083266666624	1548	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	16	612	303332	320251	FALSE	30	ATACACGTAATGTCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTPPMTVFKGNKRPYQKDCVLIINHDTGEYVLEKLSSSIQVKKTRAEGSSKIQARMEQQPARPPQPSQPLPPPPPPLMPFRAPTKPPVGPKTSPLKDNPSPEPQLDDIKRELRAEVDIIEQMSSSGSSSSDSESSSGSDDDSSSSGGEDDAPASPPQPSHQQAYNSRPAVANGTSRPQGSNQLMNTLRNDLQLSESGSDSDD	303316	323563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_303454_305501_305699_316506_316738_320204
870441	contig_6503_pilon	-	2193	7	Intergenic	novelGene_145754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	189.951748259043	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	834	1217	129868	121820	TRUE	20	TAACTATAGGCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAVFTTLLLSPSYK	130701	118372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_121641_121858_122650_122758_126273_126426_129781
870442	contig_8954_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_130316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCCAGCGTATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644368	645857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_644400_645900
870443	contig_500_pilon	+	1665	8	Intergenic	novelGene_31029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	812.635370198688	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	196	1017	1492663	1496936	FALSE	15	CTTCCCTCCTTCCTCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAVRMRGMGEEASS	1485755	1497584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821
870444	contig_4305_pilon	-	2970	1	Intergenic	novelGene_136717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTCATGTGTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815909	812939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_812900_815900
870445	scaffold_19766_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_34348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	818	1174	603005	603361	NA	20	TTGTTCTGTAAACCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVRLWDTETLIHCWWDCKMVQPLWKMVWCFLNKLEIEIPYDPAIPLLGIYPRDIRAVTRIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPKCPPTDKWINKSWYIHTMEHYAMVKNNDESVKHLKT	602187	604618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_602200_604600
870446	contig_8362_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_150683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAACAAAGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98471	96282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_96300_98500
870447	contig_5549_pilon	-	2044	10	Intergenic	novelGene_81674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_3	85.3885816520172	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	82	1758	551286	530509	FALSE	25	CTTGGATCCAGGGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVPKSISALPVNPHPVPPRGPTDLPPMPVTKPLQMVPRGSQLYPAQQADVYYQDPRGAAPPFEPAPYQQGMYYTPPPQCVSRFVRPPPSAPEPGPPYLDHYPPYLQDRVVNSQYGTQPQQYPPMYPPHYDGRRIYPAQSYTREEMFRESPIPIEIPPAAVPSYVPESRERYQQMEGYYPVAPHPTQIRPSYLREPPYSRLPPPPQPHPSLDELHRRRKEIMAQLEERKVISPPPFAPSPTLPPTFHQEEFLDEDLKIAGKYKGNDYSQYSPWSCDTIGSYIGTKDAKPKDVVAAGSVEMMNVDSKGMRDQRLDLQRRAAETSDDDLIPFGDRPTVSRFGAISRTSKTIYQGAGPMQAVAPQGAPTKSINISDYSPYGTHGGWGSSPYSPHQNIPSQGHFNERERMSMSEATSHGKPLPSAEREQLRLELQQLNHQINQQTQLRGLEREANTLAGQPQPPPPPPPPKWPGMISSEQLSLELHQVEREIGKRTRELSMENQCSLDMKSKLNTSKQAENGQPESQNKVPAEDLTLTFSDVPNGSALTQENISLLSNKTSSLNLSEDPEGGGDNNDSQRSGVTPSSAP	551367	530222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_530660_531619_531736_533276_533427_534949_535083_535203_535295_535677_535892_539397_539551_546164_546333_546788_547160_551156
870448	scaffold_12124_pilon	+	1882	11	Intergenic	novelGene_22037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	454.176133234674	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	172	1107	836073	852375	TRUE	25	AATTCGATGTCACCCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829573	858312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
870449	contig_3789_pilon	-	4319	2	Intergenic	novelGene_79830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2111	2473	282362	282000	FALSE	15	CTTTTGGTCCTTCAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLASPLSLANLSYSSGDGHCVRTNALLSMCNCSGDFLHILPVLTDLAAPDSSPGEASPASSLELPALLSSISVFSSLKAFDLFLSVNQVSISLLVSLVCALNLFNSSSVSTELLRKLA	287315	280153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_282877_285719
870450	contig_11720_pilon	+	2557	3	Intergenic	novelGene_44010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	544	junction_2	102	82	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	681	1001	270457	271346	FALSE	15	CCCAGCTTTGGCCACACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWAEGRQEVSPLKSPALPPLTKLPTLPTPQGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGW	269650	272902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_269907_270032_270700_271268
870451	contig_5758_pilon	+	3479	1	Intergenic	novelGene_119071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATGTTATAATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90794	94273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_90800_94300
870452	contig_2204_pilon	+	1333	5	Intergenic	novelGene_71650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	184.113246400144	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	30	719	13204	50221	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	50835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25702_49933
870453	contig_9121_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_134446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATCTTATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116824	114914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_114900_116800
870454	contig_14744_pilon	+	3933	1	Intergenic	novelGene_65924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTACTACCCAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140933	144866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_140900_144900
870455	contig_5018_pilon	-	1775	9	Intergenic	novelGene_47094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_6	478.152025380004	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	336	1223	1401907	1399645	FALSE	0	GTGTCTTCCTCCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGLAAAEPIVYFKEQFLDGDGWTDRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDQEKDKGLQTSQDARFYALSARFEPFSNKDKTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPEGLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKRKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDAAKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402764	1399092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1401446_1401873_1402078_1402260_1402363_1402701
870456	contig_8576_pilon	-	3814	5	Intergenic	novelGene_88810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.7666625534713	124	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	88	738	942808	934576	TRUE	5	GTTCTGGCTTTGTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSAARASEENFDYLFKIILIGDSNVGKTCVVQHFRSGVYTETQNTIGVDFTVRSLEIDGKKVKMQVWDTAGQERFRTITQSYYRSAHAAIIAYDLTRRSTFESIPHWIHELEKYGAANLVVMLIGNKADLRDQRHVLFEDACTLAEKYGLLAVLETSAKESRNIDEVFMLMAKELIARNSPHLCGEATLSSLPLDSSPVLMAQDPTAETHCAC	945928	929215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_931326_933609_934845_940341_940526_942610_942832_945864
870457	contig_9683_pilon	-	4879	3	Intergenic	novelGene_151288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_1	25.5	647	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCGAAGAAGCACCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515956	506540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_511297_513824_513894_515902
870458	contig_9468_pilon	+	2614	11	Intergenic	novelGene_59497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_10	175.986050583562	2337	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	121	750	347212	354782	TRUE	45	ACTAACCTCTCAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGDSEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQ	345171	357885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_345271_347190_347278_350685_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_355156_355530_355672_356054_356242_356378_356511_356854
870459	contig_7362_pilon	+	5394	5	Intergenic	novelGene_147541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	428	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAATAAAATTAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308693	323098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_312757_312819_313825_316104_316251_318886_318998_323029
870460	contig_7362_pilon	+	1957	6	Intergenic	novelGene_147542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	526	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1652	1957	318893	328358	FALSE	20	CGCAGGGCCCTCTGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICQEGHIETQCKPLCCTKKHDTEEGMDEVLWKYKRIQGITLVYRILVISLQFIKRYNVPDGEKDKRGSEQQRQHVAEGRERERHGRGGGAASSAGGSGERL	312118	328358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_312613_312819_313825_316104_316251_318886_318998_323029_323099_328226
870461	contig_10890_pilon	-	1571	7	Intergenic	novelGene_166784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	391.800402699583	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	326	508	149139	128020	TRUE	20	AGTTACTTAGTGTTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQGIGRAFAEALLHKGAKVALVDWNLEAGVKCKAALEELFEPQKTLFIQCDVADQKQLRDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNWEKTLQINLVSVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSIAGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAPSSNPLKKKKTWDNI	161011	125744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128068_130201_130279_149081_149179_156819_156927_160559_160684_160956
870462	contig_9177_pilon	+	3277	1	Intergenic	novelGene_32738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	51	398	1040297	1040644	NA	30	CTAGGTTGGAGCTAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFFDAGRSVPKTKSTVSKNDKQNPCVFLAKSSILQCNLHFLQILNVQRPLEGEKPGQHLPAGVRAKPELDSTLSPNMEAQRLGQRSKAQTMPGPHCLPPTLCWWLGAKGCPASS	1040246	1043523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1040200_1043500
870463	contig_12050_pilon	+	2787	5	Intergenic	novelGene_62716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	61.8991114637359	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	154	726	666343	679994	TRUE	35	TGCAGATGGTTTCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHYVVYSGLENIKKLTGGKLAAGHFDGKGEVEEYFRDIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSECPSWPVCAC	665973	683267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668370_679709_681768_682979
870464	contig_513_pilon	+	2831	3	Intergenic	novelGene_80133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATCAAGGCAGTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303966	310497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_304850_306468_306524_308604
870465	contig_9995_pilon	-	4218	1	Intergenic	novelGene_47819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896369	892151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_892200_896400
870466	contig_10286_pilon	-	2703	1	Intergenic	novelGene_98409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTGTGGGACCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387700	384997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_385000_387700
870467	contig_12958_pilon	-	2472	10	Intergenic	novelGene_136192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	208.487913022657	418	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	8	1888	70628	39829	FALSE	45	GTAATAAAGATGTGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRPIMTAPICLVENQKEQLTVNPKALKILNEIYQPVVVVAVVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGRNPKIQNSNLPRECIRHFFPKRRCFVFDRPTSDKNLLAHVEELPEEQLDCNFQMQAKNFCSYIFTHAKTKTLRQGIIVTGNRLGTLVETYVDAINSGAVPCLENAVTTLAQRENSAAVQKATDHYSKQMAQCLRLPTDTLQELLEVHAVCEREAITIFMEHSFKDENQEFQKQLMCTIEKKKEDFVLQNEEASEKYCQAELKQISEPLMETISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKVEQDYERLPRKGVKANEVLKSFLQSQVAVEESILQSDRALTDGEKAIAAERAKTEAAEKEKELLKQKQEEQQQKMEAQERSFKKNMEQLKEKMERERENLLQEQTMMLEHKLKVQEELLREGFEKKSEELNKEINQLKEEIETINKKRSGFSQFLDEAGNVLLVALPGAGKLFGAGMKLLSSHIK	70635	39244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_40048_40927_41122_41468_41572_50899_51113_52404_52686_61224_61471_63129_63327_63529_63640_65624_65753_70438
870468	contig_14333_pilon	-	2691	2	Intergenic	novelGene_49147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1902	2267	441570	441205	FALSE	65	AAAAAAAAAGATTTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSEFISTGSKLFFDIRPDYYFPSLEEMGLIGKPSLDFEFSAQVFLPCRLVMTCKQCCENQISTFSRVPNTKDSHQLVNCRSSFRTLSVFTLLYLWPFGTSGWTPQDEQMNVFSHVSFMT	446842	440780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_442280_445650
870469	contig_12964_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_131659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131605	132392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_131600_132400
870470	contig_15327_pilon	-	3770	7	Intergenic	novelGene_70408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2623	2958	29775	29440	TRUE	30	TGAGAGAGCGCAGGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRDITSQITPSGQWGACPQTPPLWSLFFWGLCLLFSQHSRARGAWEPAWLSPRLDRQHKVDTGVPAPPHFSLPLPELSPITATWLSETRCLPAARDLRGWDLSAGVSFL	34381	25210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_25339_28755_30510_30604_30657_31689_31756_32349_32408_32487_32566_32747
870471	contig_15449_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_33592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28631	30440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28600_30400
870472	contig_16110_pilon	+	2478	1	Intergenic	novelGene_126779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAACAAGAAGCTACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35009	37487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_35000_37500
870473	contig_5797_pilon	+	3229	16	Intergenic	novelGene_56921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	94.7140726373624	415	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	44	1960	197252	273501	FALSE	50	ACAGAGTACTTTGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVNSDISCHYKNYPMHVFAYRVHTHHLGKVVSGYRVRNGQWTLIGRQSPQLPQAFYPVEHPVDVSFGDILAARCVFTGEGRSEATHIGGTSTDEMCNLYIMYYMEAKHAVSFMTCTQNVAPDMFRTIPREANIPIPVKSDVIMTHGHHKETENKDKPSLPQQPKREEEEVLDQDFHVEEALDWPGVYLLPGQVSGVALDLKNNLVIFHRGDHVWDGNSFDSKFVYQQRGLGPIEEDTILVIDPNNAAVLHSSGKNLFYLPHGLSVDKDGNYWVTDVALHQVFKLDPNSKEGPLLILGRSMQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKEAEAVVETKMENIPTSELQKMQEKQKLIKDPGLGVSVVLITTLLVIPVVVLLAIAIFIRWKKSRAFGDSEHKLETGSGRVLGRLRGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	197208	274770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_197292_197612_197690_198193_198298_207428_207614_208950_209023_230464_230595_250787_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_269370_269572_272595_272650_273319
870474	contig_9807_pilon	+	2225	12	Intergenic	novelGene_32905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	560.886223196738	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	571	1566	140826	158956	FALSE	35	GTAAGTATAAAGCACCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQAGHNLPRRLRQRVDNHLLRPTPSDRPDQGLELHCSRTCSFSRCFCNTPHPCPASGRRAITSEILVSTGCPYLYMS	126643	159615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151738_154136_154270_156624_156770_158729
870475	contig_4059_pilon	-	2364	4	Intergenic	novelGene_140593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1023	junction_3	771.694239968137	12944	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	388	906	422646	398089	FALSE	50	ACTGTTTAAGAAAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKKAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDAYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	436678	396630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_398262_411046_411209_422462_422662_436306
870476	contig_6503_pilon	-	2928	5	Intergenic	novelGene_145753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	347	junction_4	49.3931928508373	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	443	799	129868	122640	TRUE	20	TAACTATAGGCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAGKY	130310	118372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_122758_126273_126426_129781
870478	contig_3627_pilon	+	1103	4	Intergenic	novelGene_78497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	51.5385508354884	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGATATCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621260	634938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_626071_626199_630851_631000_634240
870479	contig_15118_pilon	+	4242	2	Intergenic	novelGene_74541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	176	junction_1	0	405	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1470	2519	129085	130134	FALSE	35	CAATAAATGCTGCTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METNSSLPMNVSGGIQPESSSYAALNIFSQVVLGVTCVLGILGNGLVIWVAGFRMTHTVTTISYLNLAIADFSVTATLPFTMVSQAMRGQWPFGWFLCKLIYTVVDINLFGSVFLIAVIALDRCICVLHPVWAQNHRTVGLAKRVIIVPWILALLFTLPVIIRVTTISNEAGTFCKLDFSPWTTNRDEKKKVDIIMYTVRGIIRFIIGFSMPMSTVAICYGLVAAKIHRQGLIKSSRPLRVLSSVVVAFFICWFPYQLVALIATIRIRQRLLNMIQGLRIAINITVALAFFNSCLNPMLYVFMGHDFRERLIHSLPASLERALTEDSGQTSDTPANSTSPPSNAELKEM	125231	131857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_127711
870480	contig_4604_pilon	-	1488	7	Intergenic	novelGene_19161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTATATTGGTTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380704	365410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_365454_367055_367198_367287_367451_372054_372163_372785_372961_373587_373702_379961
870481	contig_4604_pilon	+	2799	12	Intergenic	novelGene_19158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1278.58752128541	3	153	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	873	1589	373631	379856	FALSE	25	AAGTTTTACTGATTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	364585	381066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_364619_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372161_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
870482	contig_10980_pilon	+	4253	2	Intergenic	novelGene_162572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0	445	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	15	566	360965	393447	FALSE	5	CTTCCCCTGGATTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIIRVKRYEKVPVILVGNKVDLEGEREVPSSEGRALAEEWGCPFMETSAKSKTMVDELFAEIVRQMNYAAQPDKDDPCCSACNIQ	360950	397134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_361279_393209
870483	contig_2444_pilon	-	3129	3	Intergenic	novelGene_83744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	4.5	49	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	31	1812	52642	50861	TRUE	70	GAGATGAAAAAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSRCGFTSTMLRISAFRLLGCIRYSRISLPQESGPRHYGSCPLGAHDEVRDGRAYFTTPIFYVNAAPHIGHLYSALLADALCRHRRLRVPVAAATRFSTGTDEHGLKIQQAAATAGLAPAELCDRVSAQFQQLFREAGIASTDFIRTTEARHRLAVQHFWEVLKARGLLYKGLYEGWYCASDECFLPEAKITWQQGPSGDACPVSLESGHPVSWTKEENYIFRLSHFREPLRQWLRDDPQAVIPQPFYHAVLQWLEEELPDLSVSRKSSHLHWGIPVPGDDSQTIYVWLDALVNYLTVIGYPDAEFKSWWPVTSHIIGKDILKFHAIYWPALLLGAGMSLPHRIYVHSHWTVCGQKMSKSLGNVVDPRTCLERYTVDGFRYFLLRQGVPNWDCDYYDEKVVKLLDSELADALGGLLNRCTAKRINPSGTYPAFCTACFPSKSGLVGPLVRAQAEDYALVSAVTALPQQVADHYDNFQIYKALEAVSSCVRQTNGFVQRHAPWTLNWESPVDAPWLGTVLHVALECLRVFGTLLQPVTPTLADKLLSRLGVSATERSLGELCFLPRFYGHPCPFEGRRLGPESGLLFPRLDQSRAWLVKAHRT	52672	46492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_47675_49494_49598_50828
870484	contig_1948_pilon	-	1886	2	Intergenic	novelGene_31143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGTAGCTGTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115565	113566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_114033_114145
870485	contig_9999_pilon	+	4150	11	Intergenic	novelGene_174665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	56.6219921938464	239	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	307	1260	223893	254871	FALSE	40	AGAGAAATGTATAGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDSQFYSVQVADSTFTVLKRYQQLKPIGSGAQGIVCAAFDTVLGINVAVKKLSRPFQNQTHAKRAYRELVLLKCVNHKNIISLLNVFTPQKTLEEFQDVYLVMELMDANLCQVIHMELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLARTACTNFMMTPYVVTRYYRAPEVILGMGYKENVDIWSVGCIMGELVKGCVIFQGTDHIDQWNKVIEQLGTPSADFMKKLQPTVRNYVENRPKYPGVKFEELFPDWIFPSESERDKIKTSQARDLLSKMLVIDPDKRISVDEALRHPYITVWYDPTEAEAPPPQIYDAQLEEREHAIEEWKELIYKEVMDWEERSKNGVVKDQPSDAAVSSNATPSQSSSINDISSMSTEQTLASDTDSSLDASTGPLEGCR	206579	257761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_+_206687_218878_219009_221379_221439_223882_224022_238670_238837_239913_239986_244768_244952_247757_247883_249439_249504_253051_253124_254728
870486	contig_6001_pilon	-	4063	11	Intergenic	novelGene_128046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	15.7213230995359	346	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	132	1931	758806	718416	FALSE	15	TTTGTAGTCCAGTCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDDSMKKEDCFDDDHSFEDIGLAAGRSQREKKRSYKDFLREEEEIAAQVRNSSKKKLKGSELYFLGTDTHKKKRKHSSDDYYFGDISSLESSQKKKKKSSPQSADTAMDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKPKKKNMSAYQVFCKEYRVTIVADHPGIDFGELSKKLAEVWKQLPEKDKLIWKQKAQYLQHKQNKAEATTVKRKASSSEGSMKIKASSIGVLSPQKKSPPSTILLPTSPAKAPETEPIDVAAHLQLLGESLSLIGHRLQETEGMVAVSGSLSVLLDSIICALGPLACLTTQLPELNGCPKQVLSNTLDNIAYIMPGL	763659	716283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_718461_718935_719059_725636_725807_728557_728664_729837_729903_730968_731051_755883_756834_757621_757701_757972_758122_758775_758875_763596
870487	contig_6509_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_145646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	569	931	130599	130961	NA	45	AAAGAATGTGAGACGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSISSKLNPYNKNSKVKGNHTLSCAAPISGMSTQHLLSITVLTSYPNMNICSSHCFCGWGMGMDLLGGSGSDVDFQGSSPAHLARWCWFWQKARVSSPVDRAFMGMSKRPHDMAAGNPE	130030	131895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_130000_131900
870488	contig_14441_pilon	+	1179	5	Intergenic	novelGene_100516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	17455	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	591	1139	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	110991	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111387_121192_121239_125517_125902_126159_126283_126514
870489	contig_17274_pilon	+	2216	19	Intergenic	novelGene_26461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	455.211323195537	1536	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	391	1959	26450	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDLHQPHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEDDGEETQEMASTQSIHEQDKVTTWTLESFNLEFKTWLLQSSVGERDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6960	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26474_27831_28001_30127_30212_31294_31349_36255_36337_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
870490	contig_10009_pilon	+	1860	6	Intergenic	novelGene_82736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	957	junction_4	116.645445689062	1	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTCTCTCTGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54421	71861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_55301_60319_60410_63219_63357_68605_68816_70219_70384_71481
870491	contig_9272_pilon	-	4488	12	Intergenic	novelGene_125986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_11	70.3282739422949	271	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	72	1094	766442	753212	FALSE	30	CTTTTTTACTAACGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLGAVVAVAASFFCASLFSSVHKIEEGHIGVYYRGGALLTSTSGPGFHLMLPFITSYKSVQTTLQTDEVKNVPCGTSGGVMIYFDRIEVVNFLVPNAVYDIVKNYTADYDKALIFNKIHHELNQFCSVHTLQEVYIELFDQIDENLKLALQQDLTSMAPGLVIQAVRVTKPNIPEAIRRNYELMESEKTKLLIAAQKQKVVEKEAETERKKALIEAEKVAQVAEITYGQKVMEKETEKKISEIEDAAFLAREKAKADAECYTAMKIAEANKLKLTPEYLQLMKYKAIASNSKIYFGKDIPNMFVDSAGGLGKQFERLADKLSFDLEEEEPLEAATEGN	767796	749817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_753416_753849_753930_756070_756161_757275_757368_757921_757981_758138_758213_760901_761028_761180_761243_762615_762663_764954_765037_766335_766458_767740
870492	contig_11413_pilon	+	2420	3	Intergenic	novelGene_103204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	11	538	651938	653729	TRUE	20	CTGAATTCTAGTCCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGISSTTAAAATTAHRRGSSTSCSRPTSLSCSLACKIDGMSMPSTTSWSGDDKTCAPQLPWVSSGFFFSQPQARVLCLSIPSPLSPLCALTPLVSGPQPDLKEKPVVTVCPSHPKSNWRLPCPRVAGRLPVSSIGPVNIVCYNFCSSAVFSFVFCIY	651927	655656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_652000_653263_653968_654012
870493	contig_11337_pilon	-	2830	17	Intergenic	novelGene_107186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_8	119.006761887718	303	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	70	2304	234464	174786	FALSE	25	GATTGCTTTGATTTAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLDIVEVNIAHQISLRSEAFFRAMTSQHELQDYLKKTSQAVKMLREKIAQIDKVMCEGSLHILRLALTRNNCVKVYNKLKLMATVHQTQPTVQVLLSTSEFVGALDLIATTQEVLQQELQGIHSFRHLGSQLCELEKLIDKMMIAEFSTYSHSDLNRPLEDDCQILEEERLVSLVFGLLKQRKLNFLEIYGEEMIITAKNIIKQCVINKVSQIEEIDTDVVMKLADQMRMLNFPQWFDLLKDIFSKFIIFLQRVKATLNIIHSVVLSVLDKNQRTRELEEEISQGKNAAKDNSLDTEVAYLIHEGMFISDAFTEGELTPTAVDATSQRNASPNSEPCSSDSVSEPECTTDSSSSKEQTSSSVTPGGVDIMVSEDMKLTDLELGKLANNIQELLYSASDICHDRAVKFLMSRAKDGFLEKLNSTEFITLSRLMETFILDTEQICGRKSMSLLGALQSQANKFVNRFHEERKTKLSLLLDNERWKQADVPAEFQDLVDSISGGKITLPEKKSGATEERRPAEVLIVEGQQYAVVGTVLLLIRIILEYCQCVDNIPSVTTDMLTRLSDLLKYFNSRSCQLVLGAGALQVVGLKTITTKNLALSSRCLQLIVHYIPVIRAHFEARLQPKQYNMLRHFDHITKDYHDHIAEISAKLVAIMDSLFDKLLSKYEVKAPVPSACFRNICKQMAKMHEAIFDLLPEEQTQMLFLRINASYKLHLKKQLSHLNVINDGGPQNGLVTADVAFYTGNLQALKGLKDLDLNMAEIWEQKR	234533	174259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_174892_181343_181439_183804_183913_194769_194851_194963_195086_195654_195743_196641_196748_199470_199535_207832_207946_208725_208908_209561_209692_212683_213028_217853_217951_220067_220124_222556_222665_223582_223710_234156
870494	contig_11525_pilon	-	2943	1	Intergenic	novelGene_171077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48726	45783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_45800_48700
870495	contig_11855_pilon	-	2723	12	Intergenic	novelGene_66883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	41.9612178285246	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	70	1287	642793	604768	FALSE	10	CTTCTGTTCTTTCCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKDKFSPQKKPVWVDEEDEDEEMVDMMNNRFRKDMMKNASESKLSKDKLQKRLKEEFQHAMGGVPAWAETNRRKTSSDDESEEDEDDLLQRTGNFISTSTALPKGILKMKNCQHANAERPTSARISSVQFHPRAQVVMVAGLDNAVSLFQVDGKTNPKIQSIYLEKFPIFKACFSANGEEVLATSTHSKVLYVYDMLAGKLIPVHQVRGLKEKIVRSFEVSPDGSFLLINGVAGYFHLLSMKTKELIGSMKINGRVAASTFSSDSKKIYASSGDGEIYVWDVNSKKCLNRFVDEGSLYGLSIATSRNGQYVACGSNCGVVNIYSQDSCLQERNPKPIKAIMNLVTGVTSLTFNPTSEILAVASEKMKEAVRLVHLPSCTVFSNFPVVRRKNISLVHTMDFSPRSGYFALGNEKGKALMFRLHHYSDF	642862	603331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_604793_606127_606271_614547_614723_625359_625484_629835_629927_630147_630249_634458_634634_634733_634860_636450_636540_639788_639857_641062_641162_642791
870496	contig_4271_pilon	-	2913	5	Intergenic	novelGene_171868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	15.7638827704344	40	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	669	1280	466082	465098	FALSE	20	CAACCCTGGGGTCTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDCSSMLGKICDSEDHNNQGRQVRRYAVESLCENKDGTVKKGEEGNQCGKTFSWIENLTMLKRTPAGVNSSEHCECGNAFMDHSSFKRHIRPHIGYKPYQCKQCGEACHCPFFLRPIGRNLIGDKHYKCKDWGKPHSSSSPLTKHIITHSGERPYERKECGKAFSRSLLLAKHIRSHSGERPYECKKCGKPLVCLHTSLDI	481675	463464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_-_465633_466005_466144_467139_467263_474492_474723_481421
870497	contig_8616_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_72613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	696	40	735	463158	463853	NA	30	CCCAAAGTGGACATTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKVKGTKVKTPEMIIQKPKISMQDVDLSLKSPELKGDIKISAPGIQGDVKGPQVAVKGPQVDIEAPSLEGAKLSGPSGKTGTCRISMADVDLNVAAPKVKGGVDVTLPKVEGKVKVPGVDVTGPKVDVSAPDVEVHGPEWNLNMPKMKMPKFRAPGVKGEGPELDVNLPKENVSIAGPKVSVEAPNVNIEGLGGRLEGSDIKLPEVSVKTSKISVPDLDLHVKGTKVKGEYDVTVPKLEGELKG	463118	463853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_463100_463900
870498	contig_15991_pilon	+	914	6	Intergenic	novelGene_70920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	721	813	103606	103698	TRUE	20	CTCCTTCATCTGCAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLFPSTSLLFSKITLCKGSLRPLGGGSHPLGGLSRGGCRPVFSCRLSTPVFCRELLNGHRGHLHALGPVCHLRLSSCKFRSRSSPFTLKFFLGHSLFSSRLLFLFNLFRISVEVEVRHDLPRVLPGNGATHAQDFPGQHPPHQTNRVRSLVVARDGNVHVAQRRVRVTQSNGGQVHVRRLCERLVVSPGVGHHQKTRLPEGCLDLVSEGSRSEAPGNGSGSSSSSKLQHRPTWPVFLEDMTLTSAGFSMATMARAANRSFSHVLFRFMM	100384	105072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100543_100885_101049_101159_101288_102023_102271_103581_103702_104974
870500	contig_11130_pilon	-	1975	6	Intergenic	novelGene_53096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	983.642333371231	524	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	253	366	62581	61286	TRUE	15	ATACTTGGGCCTGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYVFSHNPLGAVPTTKKKENEVFVSGTQTSQIICSHRAHQEQLLILKQQVYNFLLLWPKPPQDQENRLTHIFSEPGIIGIIFGVMVGIVGTVLSIAYCVRFLIKRTSVKAKPQSSIDADAA	76243	54579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884_66978_76150
870501	contig_7292_pilon	+	3685	1	Intergenic	novelGene_175357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGGCCCTATTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113904	117589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_+_113900_117600
870502	contig_10581_pilon	-	2700	1	Intergenic	novelGene_41443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	666	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCTTCTCCTGCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795028	792328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_792300_795000
870503	contig_12586_pilon	-	1855	12	Intergenic	novelGene_121789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_9	90.4463678350074	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1794	61	1854	33020	6698	FALSE	20	GTCAGTATTGTTTCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEERQNLHTFRNYVRKTLDPTYILSYMSPWFREDEMQYIQTEKNNKGTMEAASLFLNILEELKEEGWFRGFLDALKHAGYTGLYEAFENWDFQKIEKLEEHRLLLRRLQPEFKTRINPLDILPEISQCLINQECEEIIQVCSNKGMIAGAEKMVECLLRSDKENWPKVLKLALEKEEYNFNELWIVEKGVEDVETKDLQNDEMETSEVQIFYQEEPEYQNLGQSSCPPSSEVSYTNLYSPVKPRNYQLELALPAKNGKNTIICAPTGCGKTFVSILICEHHLKKFPQGQKGKIVFFAIQIPVYEQQKSVFSEYFERLGYTVAGISGATSEEVPVRQIIENNDIIILTPQILVNNLKNGTIPSLSVFTLMIFDECHNTSKHHPYNMIMFNYLDQKLDGSSDPLPQVVGLTASVGVGDAKNITEAVAYICKLCASLDTSVIATVKDNLEELEEVVYKPQKCFRKVETWTTNKFKCIISQLMMETENMAKNVFEELGTLTLENLSHIQSRKFGTQKYEQWIVAVQKACMVLQMPDKNEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARVKDALDYLKDFFANVRAAGFDEIEQDLTSRFE	33080	6696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_6833_7823_7982_9668_9789_11291_11455_13721_13981_14755_14910_15292_15401_17557_17684_18757_18906_19884_20067_23780_23916_32914
870504	contig_15498_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_42693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCGGAACTGCTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827332	826683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_826700_827300
870505	contig_12635_pilon	+	3537	15	Intergenic	novelGene_60874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	97.648369580002	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	171	1826	828107	862627	FALSE	30	TAGAAATGTGTCAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELKSKDISKTFRKIINKREGITAIGGTSSISSEGTQHSYSEEEKVAFVNWINKALENDPDCKHLIPMDPNNDSLFKSLADGILLCKMINLSEPDTIDERAINKKKLTPFTVSENLNLALNSASAIGCTVVNIGAQDLKEGKPHLVLGLLWQIIKVGLFADIEISRNEALIALLNEGEELEELMKLSPEELLLRWVNYHLTNAGWRTISNFSQDIKDSRAYFHLLNQIAPKGDRDGGPSIDIDMSGFNERNDLKRAEFMLKEADKLGCRQFVTPADVVSGNPKLNLAFVANLFNTYPCLHKPDNNNIDINLLEGESKEERTFRNWMNSLGVNPYINHLYSDLADALVIFQLYEMIRVPVDWNHVNKPPYPALGGNMKKIENCNYAVELGKNKANFSLVGIAGQDLNEGNATLTLALVWQLMRRYTLNVLSDLGEGEKVNDEIIIKWVNQTLKTANKKTSISSFKDKSISTSLPVLDLIDAIAPNAVRQEMIKRENLSDEDKLNNAKYAISVARKIGARIYALPDDLVEVKPKMVMTVFACLMGKGLNRIK	775887	864338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_775949_822663_822770_828103_828234_832898_833032_834373_834456_838922_839089_839169_839313_841154_841251_843524_843721_848396_848476_851752_851868_854412_854547_855241_855366_862116_862242_862491
870506	SIRV6	+	933	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	368	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	240	554	2021	10736	TRUE	40	TGGGGAAAGAGCAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1671	11328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
870507	SIRV6	+	812	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	770	4	-385	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	102	434	2002	10736	TRUE	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1900	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
870508	contig_9332_pilon	+	5991	5	Intergenic	novelGene_60744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	50	junction_4	36.1870142454445	202	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	4162	4617	612260	616729	FALSE	10	GTTGGGAGGTTTGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI	606188	618103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_610285_612194_612288_616018_616236_616337_616416_616596
870509	contig_11630_pilon	+	2830	5	Intergenic	novelGene_147172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.093198915624	39	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAAATTCAGACCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77618	145290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77694_96043_96137_97081_97254_131895_133585_144489
870511	contig_366_pilon	-	1807	7	Intergenic	novelGene_51583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	686.216296480603	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	45	452	780087	764329	TRUE	35	TACAAAAGGAAGTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKIPPI	780131	755879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764342_768049_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057
870512	contig_3948_pilon	+	693	1	Intergenic	novelGene_53268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	657	36	692	1390458	1391114	NA	20	CCATGGGTATGACCTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATHSAQKPHQCMYCDKMFHRKDHLRNHLQTHDPNKEALHCSECGKNYNTKLGYRRHLAMHAASSGDLSCKVCLQTFESTQALLEHLKAHSRRVAGGAKEKKHPCDHCDRRFYTRKDVRRHLVVHTGRKDFLCQYCAQRFGRKDHLTRHVKKSHSQELLKIKTEPVDMLGLLSCSSTVSVKEELSPVLCMASRDMMGAKAFPGMLPMGMYGAHIPTMPSTGMPHSLVHNTL	1390422	1391115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1390400_1391100
870513	contig_3948_pilon	+	4464	1	Intergenic	novelGene_53269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	851	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	9	533	1391124	1391648	NA	20	TGTGTTTGGAAGTTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYPLESSPISSPAQLPPKYQLGSTSYLPDKLPKVEVDSFLAELPGSLSLSSAEPQPASPQPAAAAALLDEALLAKSPANLSEALCAANVDFSHLLGFLPLNLPPCNPPGATGGLVMGYSQAEAQPLLTTLQAQPQDSPGAGGPLNFGPLHSLPPVFTSGLSSTTLPRFHQAFQ	1391115	1395579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1391100_1395600
870514	contig_7411_pilon	+	3390	5	Intergenic	novelGene_137040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	369	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1457	2182	806332	807057	TRUE	20	GTTCATGGGCAGAGTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFTFGFSEKPSGEKTSPANQSHLYLHLLSCLKKQTKTQQTLGFLSLPGTPSHNYHRRLSPFLAEPGCAGLFRQEPWSIKLEVSQATRPEILVFSFLSVFSFATSLREESSEPISVVNTSRFVNKPPCKRGFSAFQMRPRAMKARGACDKPPSPGDATHVQYPGGRVTWQHSNTCVVHKCKRLWSCISSPHPDRSVNMPAGSVAKALVSDHTSPGGAGEVHWLLSGIEVQAQALNPAGGMS	804875	812534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_807869_808660_808738_810996_811146_811780_811905_812487
870515	contig_8606_pilon	+	2962	1	Intergenic	novelGene_159400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTATACATGGATCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103137	106099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_103100_106100
870516	contig_5346_pilon	-	4503	2	Intergenic	novelGene_161847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	246	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAAAAATGTGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109468	101657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_106085_109392
870517	contig_3386_pilon	-	1691	7	Intergenic	novelGene_34522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	801.848489429269	33	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	118	441	409604	406724	TRUE	25	TTGTTTAACTTCAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRFT	412211	404156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_405466_406382_406735_407730_407838_409398_409607_412096
870518	contig_14219_pilon	-	3031	1	Intergenic	novelGene_54299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630831	627800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_627800_630800
870520	contig_6175_pilon	-	2208	11	Intergenic	novelGene_16300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGCCGGCGGGCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1523052	1444479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1444533_1466774_1466945_1471079_1471222_1478853_1479025_1481903_1482006_1484446_1484586_1488389_1488467_1489952_1490059_1491421_1491509_1493858_1493905_1521937
870521	contig_16882_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_148252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTCGGAATCGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571668	573300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_571700_573300
870522	contig_8420_pilon	+	2060	14	Intergenic	novelGene_69329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	273.554144224658	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	48	1700	10943	58549	FALSE	65	GAAAAAAATAAAGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLVLCRTVCPTWKQ	10895	58909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51145_51183_58546
870523	contig_12270_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_113542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	31	366	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14439	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
870524	contig_8020_pilon	-	2432	10	Intergenic	novelGene_114388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	58.0918812457185	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	664	1272	150417	148058	FALSE	40	TTTCTGAGAGACCAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	153347	146897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151258_151580_151708_153168
870525	contig_15407_pilon	-	1969	8	Intergenic	novelGene_123067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAAGCGAGAGCGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470951	449431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468305_470254
870526	contig_10451_pilon	-	3671	9	Intergenic	novelGene_138327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_8	65.459792048249	327	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	261	1703	563720	460398	FALSE	15	CAGCCTCCGTCTGAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPCNKRKYGLNGRQPSCSPHPSPTPSPQGSPRVSVTDDTWLGNSTQYTSSAIVAAINALSTDSSLDLGDGVPVKARKTTLEHTAAMALKVEPAGEDPGATPPAATFSPEEFPTFQHIRKGAFCDQYLSVPQAPCPWVKPKPLSPASYMSPSLPALDWQLPPHSGPYELRIEVQPKSHHRAHYETEGSRGAVKASAGGHPIVQLHGYLENEPLTLQLFIGTADDRLLRPHAFYQVHRITGKTVSTTSHEAILSNTKVLEILLLPENNMRAIIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPQPGGRTLSLQVASNPIECSQRSAQELPLVEKQSTDSYLVVGGKKMVLSGHNFLQDSKVIFVEKAPDGHHVWEMEAKTDREMCKPNSLVVEIPPFRNQRITSPVQVNFYVCNGKRKRSQYQHFTYLPANVPIIKTEPTDDYEPVQTCGPVTQGLSPLSKPYYSQQLLLPPDPGACLVAGFTSCQQRSTVMSPPPSTSPKLHDLSSATYTKCSPSTGHSHLGLQQPAGGAPTTQEVPRPRAVPSSAPHPSSHATLQPQ	563980	458429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_460401_494915_495299_512712_512846_517614_517671_527495_527637_529154_529328_531209_531413_549533_549694_563529
870527	contig_7593_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_127338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATAAATAAAACATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587642	588302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_587600_588300
870528	contig_4857_pilon	-	2674	3	Intergenic	novelGene_48710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1440	junction_2	31.5	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAAGCTTTATCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183125	1177368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112
870529	contig_7457_pilon	-	1272	4	Intergenic	novelGene_31686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1903.55667107654	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221182	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1175980_1220883
870530	contig_18869_pilon	-	2493	2	Intergenic	novelGene_56491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1182	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	90	314	379346	378085	FALSE	25	CACTGTCCAGTCCTGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKPPISASQHENHQTVSHLATGQPHFPNMAPDSHINHNGNPGTSNQIPANPLQHLVSGPNKEPEPRIQTDTLKQASKDRVGDFHKLKQSKNQLMNIMLERFI	379435	375905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_378300_379336
870531	contig_14838_pilon	+	1866	4	Intergenic	novelGene_151913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	633	932	109510	109809	TRUE	10	CAGCCACCTCGCCCCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLESNICWVSSGTVRARYCWLPRLVRGAKPGMKKCSRGKGTMFTASLRRSAFSWPGKRRQVVTPLMVADTRWLRSPYVGVVSFRVRKQMSYRASLSIE	108877	112892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_110128_110894_111006_111088_111460_112758
870532	contig_16109_pilon	+	3195	7	Intergenic	novelGene_80334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_6	66.6508314526783	199	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	291	866	282776	311651	FALSE	75	GGCAAAAAAAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNPPKQEHLLALKVMRLTKPTLFTNIPVTCEEKDLPGDLFNQLMKDDPSTVNGAEILMLGEMLTLPQNFGNIFLGETFSSYISVHNDSSQVVKDILVKADLQTSSQRLNLSASSGAVAELKPDCCIDDVIHHEVKEIGTHILVCAVSYATQSGEKMYFRKFFKFQVLKPLDVKTKFYNAEVSVGHLMGF	282485	313980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_282822_295728_295798_296330_296431_297467_297553_303593_303722_309356_309430_311576
870533	contig_6654_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_85747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCATGGAAAGGATAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509991	510856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_510000_510900
870534	contig_5423_pilon	+	1842	8	Intergenic	novelGene_85252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	792.578767089314	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	383	1111	542216	553550	FALSE	35	TTTTAAGTAATTACTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKIDMVHRNISEGFFLDASRHILEAPQHGLERRHLEANQNELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEHTHTHTHTHTHTIYSTLAMTFLRDGNKKCIYNGH	534722	554281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_548788_548903_551350_551465_553445
870535	contig_7342_pilon	+	3616	1	Intergenic	novelGene_71139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	533	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	299	703	245067	245471	NA	15	GCCCATTGTTGCAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTVYLLETAPRFQEYILVQKVICGVRPWKLFSQKLPTHKNVCLLYPGQREPKENTTQGFFCVSHSSENTYKPMRPALRKNTLENPGLQNTWKDALSIRRILHFLKEFFIVGTSFYEELSEVCGHPANVCGPKI	244768	248384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_244800_248400
870536	contig_13004_pilon	+	2731	8	Intergenic	novelGene_112681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	196.308066932709	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	12	629	681436	690483	TRUE	30	TTTAAATGCCTATGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKMAARAAIGAVCHRLWQGSGNFSVNNSKSGTARNGGFLLSTNMKWIQFSNLYVDIPKDLTKPTITISDEPDTLYKRLSVLVKGHDKAVLDSYEYFAVLAAKELGISIKVHEPPRKIERFTLLKSVHIFKKHRVQYEMRTLYRCLELEHLTGSTADVYLEYIQRNLPEGVAMEVTKTKLERLPEHIKEPIWETVPAEKEDSKSQNLS	681424	692712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_681484_684340_684406_684499_684573_686880_687018_687982_688092_689798_689889_690387_690795_690921
870537	contig_4426_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_15358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAACATACTTGTAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64426	65602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_64400_65600
870538	contig_1406_pilon	+	1619	3	Intergenic	novelGene_25561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCTGCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139023	2143718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2139992_2140978_2141120_2143208
870539	contig_11978_pilon	-	4676	17	Intergenic	novelGene_63135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_16	55.8849264113321	284	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1496	4488	189	4676	2008987	1985124	FALSE	70	AGGAAGCACAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQGEAEESEKLNKMSSLLERLHAKFNQNRPWSETIKLVRQVMEKRVVMSSGGHQHLVSCLETLQKALKVTSLPAMTDRLESIARQNGLGSHLSASGTECYITSDMFYVEVQLDPAGQLCDVKVAHHGENPVSCPELVQQLREKNFDEFSKHLKGLVNLYNLPGDNKLKTKMYLALQSLEQDLSKMAIMYWKATNASPLDKILHGSVGYLTPRSGGHLMNLKYYASPSDLLDDKTTSPIILHENTVPRCLGMNASVTIEGTSSMYKLPIAPLIMGSHPVDNKWTPSFSSITSANSVDLPACFFLKFPQPIPVSRAFVQKLQNCTGIPLFEAQPTYVPLYELITQFELSKDPDPIPLNHNMRFYAALPGQQHCYFLNKDAPLPDGRSLQGTLVSKITFQHPGRVPLILNLIRHQVAYNTLIGSCVKRTILKEDSPGLLQFEVCPLSESRFSVSFQHPVNDSLVCVVMDVQDSTHVSCKLYKGLSDALICTDDFIAKVVQRCMSIPVTMRAIRRKAETIQADTPALSLIAETVEDMVKKNLPPASSPGYGMTTGNNPMSGTTTPTNTFPGGPITTLFNMSMSIKDRHESVGHGEDFSKVSQNPILTSLLQITGNGGSTIGSSPTPPHHTPPPVSSMAGNTKNHPMLMNLLKDNPAQDFSTLYGSSPLERQNSSSGSPRMEMCSGSNKTKKKKSSRLPPDKPKHQTEDDFQRELFSMDVDSQNPIFDVNMTADTLDTPHITPAPSQCSTPPTTYPQPIPHPQPSIQRMVRLSSSDSIGPDVTDILSDIAEEASKLPSTSDDCPPIGTPVRDSSSSGHSQSALFDPDVFQTNNNENPYTDPADLIADAAGSPSSDSPTNHFFPDGVDFNPDLLNSQSQSGFGEEYFDESSQSGDNDDFKGFASQALNTLGVPMLGGDNGDTKFKGNSQADTVDFSIIAVAGKALGPADIMEHHSGSQSPLLTTGDLGKEKSQKRVKEGNGTSNSSLSGPGLDSKPGKRSRTPSNDGKSKDKPPKRKKADTEGKSPSHSSSNRPFTPPTSTGGSKSPGSSGRSQTPPGVATPPIPKITIQIPKGTVMVGKSSSHNQYTSSGSVSSSGSKSHHSHSSSSSSSASASGKMKSSKSEGSSSSKLSSSMYSSQGSSGSSQSKNSSQSGGKPGSSPITKHGLSSGSSSTKMKPQGKPSTLMNPSLSKPNISPSHSRPPGASDKLSSPMKPIPGTPPSSKAKSPISSGSGGSHISGTSSSSGMKSSSGLGSSGSLSQKTPPSSNSCTASSSSFSSSGSSMSSSQNQHGSSKGKSPSRNKKPSLTAVIDKLKHGVVTSGPGGEDQMDGQMGVSTNSSHSMSSKHNMSGGEFQGKREKSDKDKSKVSTSGGSVDSSKKTSESKNVGSTGVAKIIISKHDGGSPSIKAKVTLQKPGESSGEGLRPQMASSKNYGSPLISGSTPKHERGSPSHSKSPAYTPQNLDSESESGSSIAEKSYQNSPSSDDGIRPLPEYSTEKH	2009175	1985123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1988113_1989259_1989366_1989475_1989572_1991194_1991397_1993784_1993904_1994165_1994291_1994812_1994925_1999301_1999392_1999771_1999846_2000284_2000360_2000906_2000979_2003066_2003096_2003801_2003935_2004038_2004094_2004920_2005000_2006719_2006827_2008962
870540	contig_16303_pilon	-	1897	4	Intergenic	novelGene_34063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	520.90199547409	8	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	96	602	45428	34581	TRUE	25	ATATATGCATCACTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGKSFSSFGAVILKASVPSGLLARGCPQFLAAWASPNMTACFIKACKQRRQ	45523	32966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_33863_34724_40424_40731_45370
870541	contig_15508_pilon	+	5199	6	Intergenic	novelGene_177653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_2	36.9897283039495	475	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	103	1749	102436	107601	FALSE	25	GGGCCTCAAACGCTACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGGNTAAPAPGDAEDLEATRLSSEEAGDSGGVHKDPPDPGDGDLEETGSKAKDLLPSLLSSLPQPEAPSGTCGLWGPTAPGSSPKGGPENGPGGQGGDPSDEDWRNQRKHVFVLSEAGKPIYSRYGSVEALSATMGVMTALVSFVQSAGDAIRAIYAEDHKLVFLQQGPLLLVAVSRTPQSAAQLRGELLAVHAQIVSTLTRASVARIFAHKQNYDLRRLLAGSERTLDRLLDSVERDPGVLLLGAVRCVPLARPLREALGALLQRCTAPGLALSVLAVGGRLITAAQERTVLTECRLDPADLQLLLDWVGAPAFAAGEAWAPVCLPRFNPDGFFYAYVARLDAMPVCLLLLGTDREAFHAMAACRRLVEDGMRALGATRALAEVASLSNVPSASAPAYSVQAVGAPGLRHFLYKPLDIPDHHRQLPQFTSPELEAPYSREEEQHRLSDLYHCLHARLHSTSRPLRLIYHVAEKETLLAWVTSKFELYTCLSPLVTKAGAILVVTKLLRWVKKEEDRLFIRYPPKYSTPPATSVDQAPHNGFFTGL	101912	111051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15508_pilon_+_102005_102425_102584_103437_103768_104357_105178_105555_105704_107400
870542	contig_17059_pilon	+	2659	2	Intergenic	novelGene_166087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATTTGTCTATTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428605	431464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_428761_428960
870543	contig_6726_pilon	-	3593	11	Intergenic	novelGene_86206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	436.50452460427	639	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	20	913	76688	9238	FALSE	25	TTCCAGCTCAGCACCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGSVKMAKVSELYDVTWEEMRDKMRKWREENCRNSEQIVEVGEELINEYASKLGDDIWIIYEQVMIAALDYGRDDLALFCLQELRRQFPGSHRVKRLTGMRFEAMERYDDAIQLYDRILQEDPTNTAARKRKIAIRKAQGKNVEAIRELNEYLEQFVRDQEAWHELAELYINEHDYAKAAFCLEELMMTNPHNHLYCQQYAEVKYTQGGLENLELSRKYFAQSLKLNNRNMRALFGLYMSASHIASNPKASAKTKKDNMKYASWAASQINRAYQFAGRSKKETKYSLKAVEDMLETLQITQS	76707	6557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_9325_20192_20298_22595_22707_23629_23712_30526_30587_30747_30834_41431_41490_49977_50064_52417_52483_53014_53129_76648
870544	contig_14855_pilon	-	6363	40	Intergenic	novelGene_146026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_20	101.581187591915	343	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	100	2352	560793	545772	TRUE	30	GTTAAAGGGATAATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWTEIPTAITIKDYDSNLNASRDDKKNKFANTMEFVEDYLNNVVSEAVPFANEEKNKLTFEVVSLAHNLIYFGFYSFSELLRLTRTLLGIIDCVQGPPSMLQAYDDSGGKNVRRSIQGVGHMMSTMVLSRKQSVFGAPNLSPGTSAAEPLDRSKFEENENIVVMETKLKILEILQFILNVRLDYRISYLLSVFKKEFVEVFPMQDSGADGTAPAFDSTTANMNLDRIGEQAEAMFGVGKTSSMLEVDDEGGRMFLRVLIHLTMHDYAPLVSGALQLLFKHFSQRQEAMHTFKQVQLLISAQDVENYKVIKSELDRLRTMVEKSELWVDKKGSGKGEEVEAGAAKDKKERPTDEEGFLQPPGEKSSENYQIIKGILERLNKMCGVGEQMRKKQQRLLKNMDAHKVMLDLLQIPYDKGDTKMMEILRYTHQFLQKFCAGNPGNQALLHKHLHLFLTPGLLEAETMQHIFLNNYQLCSEISEPVLQHFVHLLATHGRHVQYLDFLHTVIKAEGKYVKKCQDMIMTELTNAGDDVVVFYNDKASLAHLLDMMKAARDGVEDHSPLMYHISLVDLLAACAEGKNVYTEIKCTSLLPLEDVVSVVTHEDCITEVKMAYVNFVNHCYVDTEVEMKEIYTSNHIWTLFENFTLDMARVCSKREKRLADPTLEKYVLTVVLDTINAFFSSPFSENSTSLQTHQTIVVQLLQSTTRLLECPWLQQQHKGSVEACIRTLAMVAKGRAILLPMDLDAHISSLLSSGVSCAVAAQRNASNYKAATRAFPPRHPHR	560981	531176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_-_531994_532472_532635_533802_533964_534665_534832_535720_535849_535935_536041_536512_536706_537413_537579_538192_538366_538922_539049_539277_539471_539547_539659_540354_540442_540528_540631_540752_540849_541359_541471_541604_541806_541936_542123_542287_542460_544087_544258_544367_544459_544624_544734_544857_545007_545734_545927_546677_546799_548781_548908_549031_549158_549434_549687_550766_550968_551046_551170_552472_552599_553041_553117_553199_553365_554894_555061_556515_556574_557166_557297_558409_558610_560003_560146_560706_560852_560940
870545	contig_8729_pilon	+	1705	3	Intergenic	novelGene_40062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	390	junction_2	72.5	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAATTCATTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36847	40063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_36925_37784_39351_40001
870546	contig_8729_pilon	+	1716	6	Intergenic	novelGene_40057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	211	junction_1	97.8562210592663	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	76	483	33998	36996	TRUE	50	AAGCTGAAAGAAAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFRPRLAGLGDSSGWVSSSSSAGPAMAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEVHVALMFWAFHVYRKYLSFIYSS	33922	40057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_34135_34549_34614_36789_37959_38491_38596_39239_39351_40001
870547	contig_18251_pilon	+	2306	7	Intergenic	novelGene_50144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	951	junction_1	870.320758239296	2577	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	191	943	35708	53991	TRUE	10	CTGGACCTTGTTTTTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRADNQEVQELELHGGAETGTERIKSTVKLSESRGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35517	56245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_37148_37242_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
870548	contig_11364_pilon	-	2564	1	Intergenic	novelGene_65190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258361	255797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_255800_258400
870549	contig_20013_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_174938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGAATGAAGATGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45760	47152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20013_pilon_+_45800_47200
870550	contig_14483_pilon	-	1711	4	Intergenic	novelGene_133761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	263	junction_3	173.989143978072	2197	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1028	1465	117857	111664	FALSE	10	GTTCCCTTCTCAGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHVRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQREKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEELIEKMQE	119290	111417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_111793_112557_112699_117689_117867_118272
870552	contig_15039_pilon	+	2785	1	Intergenic	novelGene_110200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTATGCTGGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417302	420087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_417300_420100
870553	contig_8377_pilon	-	3265	1	Intergenic	novelGene_35133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTACAACCACATCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183717	180452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_180500_183700
870554	contig_5084_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_64532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTAAAATTTCGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498048	495276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_495300_498000
870555	contig_6020_pilon	-	2608	6	Intergenic	novelGene_155559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_5	486.856200535641	664	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	388	885	349599	289990	FALSE	10	CTCTACTATTGCTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVILIEFLPKTPIFRPD	349986	288266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_290041_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
870556	contig_8729_pilon	+	2805	6	Intergenic	novelGene_40063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_3	240.277839177898	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1400	1729	42017	43845	FALSE	20	AGAAACCTTTCCTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKVQAEHSESGELVGVDLNTGEPMVAAEAGIWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG	40021	44921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_40162_40269_41476_41963_42098_42595_42699_43465_43539_43772
870557	contig_12250_pilon	-	3082	2	Intergenic	novelGene_80633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	552	junction_1	0	44	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2515	2820	376401	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSLSDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	378915	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266
870558	contig_4429_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_50816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTAGTTTTGTTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196289	199360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_196300_199400
870559	contig_11105_pilon	+	2514	1	Intergenic	novelGene_159812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210963	213477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_211000_213500
870560	contig_4071_pilon	+	3404	1	Intergenic	novelGene_151891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	1563	2111	338050	338598	NA	60	AAAAAAAAAACTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRRCFAVHSLNSLGRLISSLNSGIGQGSL	336487	339891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_336500_339900
870561	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_95754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	CTTGCACCTGTGGTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
870562	contig_16091_pilon	+	1545	3	Intergenic	novelGene_112350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	947	junction_1	33	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGACATAGACTCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28260	39126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_28479_29164_29278_37912
870563	contig_16091_pilon	-	2024	6	Intergenic	novelGene_112347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCACCACTACCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38449	13615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_-_14449_16002_16210_17699_17891_28335_28479_29164_29278_37912
870564	contig_8322_pilon	+	3017	6	Intergenic	novelGene_143253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_5	125.371448105221	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	441	875	301345	304580	FALSE	30	AAGTGAACATTTGTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	299017	306722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_299326_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
870565	contig_9871_pilon	+	3578	2	Intergenic	novelGene_75703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2412	junction_1	0	134	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	74	445	572939	575440	FALSE	15	TGTCCGTCTGAACCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPDRKRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRESKSESFSITFTFGGRMPGNPLTLSDQGSSRLSPLSHIAAALPIAWWMLRSVVMLPFTIIVKCVASKRKMYYCCSFLQNILLRGKRKCA	572865	578573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074
870566	contig_15087_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_37295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302312	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_302300_303700
870567	contig_1867_pilon	-	3998	5	Intergenic	novelGene_54600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	226	junction_1	133.645753767189	275	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	2164	2913	538456	517583	FALSE	30	TACAACAAATGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVCDLRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	540619	516497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245
870568	contig_2444_pilon	-	2005	2	Intergenic	novelGene_83754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACCCCCCTTGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212211	209821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_210800_211184
870569	contig_14923_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_157764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	362	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACAACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538707	541353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_538700_541400
870570	contig_3832_pilon	+	2574	10	Intergenic	novelGene_161428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGTAAGAAAGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63131	79821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_64120_64556_64683_65239_65350_68428_68853_68978_69105_69431_69467_73717_74006_74875_75098_78253_78400_79712
870571	contig_15459_pilon	+	1894	4	Intergenic	novelGene_106363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	321.702761360027	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9151	10958	TRUE	20	ATATTGTTTTATTACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKNFESTKAYKATWADGGDNSAKNVVSKQPGRVTNGQPQQAATGAASGGYIKRITNDAREDEMEENLTQVGSILGNLKNLALDMGNEIDAQNQQIPRIIEKADTNKDRIENANARAKKLIES	8161	12661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_8323_9122_9268_10892_11768_11948
870572	contig_7840_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_69024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGGGGACACAATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354193	353754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_353800_354200
870573	contig_8589_pilon	-	2669	5	Intergenic	novelGene_107357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	97.3123193639942	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTGTGGGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16718	767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_2993_6084_6226_8839_8973_9819_9929_16657
870574	contig_6533_pilon	+	829	3	Intergenic	novelGene_114615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	25	CTATGTGCTGAAATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
870575	contig_5196_pilon	+	2621	1	Intergenic	novelGene_38701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACATGTAGCTATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314593	317214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_314600_317200
870576	contig_5324_pilon	-	2455	3	Intergenic	novelGene_102070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	141	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	72	692	444540	443850	TRUE	55	TACCAAATAAATAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSFSLSAALISTPAADPEEPQTMSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQRDTTHRKL	444611	442046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443537_443576_443877_443946
870577	contig_1154_pilon	-	3010	3	Intergenic	novelGene_87094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCCTCACAAAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430493	334358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_337217_428888_428952_430404
870578	contig_6735_pilon	-	4143	4	Intergenic	novelGene_15811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	903.579671209032	378	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTATAGAAATCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568247	559642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_563579_564157_564232_564784_564869_568198
870579	contig_15118_pilon	+	2797	1	Intergenic	novelGene_74623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	2227	2739	398794	399306	NA	20	CACAGCCATGTTCATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISTSRASDHGRPGSPRTPTLSMQKSSSIEGLLGFRTGTQATEEGKETKRTGKMESKVSCFSSSKDGSSHLSFQHLEYIRLESPCSEKQGKDFPRKYPGIILANPSWSHGFSKVGGSLKMIKPGPSKLGPQTQSGPLPICLFLYHPRAKNVFTFEMVGKKKNRKKTNDS	396567	399364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_396600_399400
870580	contig_8978_pilon	-	2473	5	Intergenic	novelGene_49338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_1	800.627371190868	55	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	30	569	194082	193127	TRUE	30	ATAAGAATGTCTGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSLPLRPFLFLQLPLLGVGLNLTALTPNGNEDITTDFFPTSVSPGSLSFSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLRYWYKNSDNKVQECGHYLFSEEITSGCWFRKEEIHLYQTFVIQLQDPRKSKRQAVQMLKLQDLGIWKEGVKSPGILWGTGVYGVVLFHHKAT	194111	190470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_190959_191286_192444_192867_193398_193613_193768_193967
870581	contig_15720_pilon	+	879	2	Intergenic	novelGene_41973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	69	791	306856	307687	FALSE	5	CGTGCCGGTGCTGCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKFSGFFIFLCSFSDFSSNRVVAKCLSSVSLILCSIVSNLLLSPSMTLSISEMLLFIFWISNRCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSVFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSAFSSTGRSSAVLFWTPTGTIRSCFCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFIDCIFVCFVLLFCFIWLCLSRRAVCSLLFAHLWARYFSPPSPMGRVSHSGMVQQGRSN	306787	307775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_306877_306985
870582	contig_2312_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_160742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATAATTTTTCCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246474	244650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_244600_246500
870583	contig_5350_pilon	+	3053	7	Intergenic	novelGene_99333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_4	37.4584955502605	162	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	152	769	142324	223532	FALSE	15	CTTTATGTATGCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGMNKILPGLYIGNFKDARDAEQLSKNKVTHILSVHDSARPMLEGVKYLCIPAADSPSQNLTRHFKESIQFIHECRLKGEGCLVHCLAGVSRSVTLVTAYIMTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILGKYKEQGHVEAQPGTRRWSGFSNLAPLSCSDYTTET	142172	225816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_142345_177847_177882_184664_184748_208153_208204_220454_220530_222758_222931_223349
870584	contig_6740_pilon	+	5912	1	Intergenic	novelGene_142707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCAACTTAATGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664170	670082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_664200_670100
870585	contig_4305_pilon	+	2211	3	Intergenic	novelGene_136668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGCCTGCTTGGGTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511117	514670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_513258_513994_514043_514647
870586	contig_4305_pilon	-	692	3	Intergenic	novelGene_136674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	812.5	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514399	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514154
870587	contig_4305_pilon	-	387	2	Intergenic	novelGene_136673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514043	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513291_513987
870588	contig_7707_pilon	+	2970	8	Intergenic	novelGene_72148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	491.013196547377	6	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	2384	2968	236440	240658	FALSE	65	AGAAAATCAGAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPI	182711	240660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_190409_190457_200052_200124_200805_200901_213082_213179_233686_233973_234921_236993_240626
870589	contig_12427_pilon	-	1184	5	Intergenic	novelGene_40471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2487.69225387707	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	75	590	316061	314393	FALSE	30	ACATGGTGATGGCAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPRAASESPLLRVRSDAKEDITAAMSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325913	313798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315958_316079_325856
870590	contig_9468_pilon	+	1822	13	Intergenic	novelGene_59455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	319.551595555745	153	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	592	1386	189658	205780	FALSE	55	GAGAAATCAAAGAGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSKRTTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK	150481	206216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189609_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639
870591	contig_1331_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_37814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	14	490	169924	160009	FALSE	30	AGTAAATGCTGACTCCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEGKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169937	158995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
870592	contig_20175_pilon	+	5017	14	Intergenic	novelGene_142462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_12	16.6619717253135	152	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	2672	4540	83903	123392	FALSE	30	CAGAGTTAAGAGGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLSMELTIQKQNILYHLGEEWQKLIVWKFPPSKDTNSLESCLQTELHLCSEQSHKEEKTPVPPISSVFLAFSILGELHTKLKSFGKMLLKYILRPLASCPSLYAVIESQPNIVIFRFESVMTDLEHPSPSEVFAKIRLVLEVLQKHLLDLPLEADLENEKTSKIILAEMLGNIIWEDLSECLIKNCLVYSIPTNSSKLQQYEEIIQSTEEFENALKEMRFLKGDTTDLLKYARNINSHFANKKCQDVIVAARNLMTSEIHNTVKITSDSKISVPALPSPDKDDKLDIQKVAKAQYNEVGNLEPENTLDQHSFSLPTCRISESVKKLMELAYQTLLEATTSSDQCAVQLFYSVRNIFHLFHDVVPTYHKENLQKLPQLAAIHHNNCMFLAHHLLTLGHQFASRLAPILCDGTTTFVDLVPGFRRLGTECFLAQMRAQKGELLERLSSARNFLNMDDEENYSAASKAIRQVLHQLKRLGIVWQDVLPVNIYCKAMGTLLNTAISEIIGRITALEDISTEDGDRLYSLCKTVMDEGPQVFAPLSEESKNKKYQEEVPVFVPKWMSFKELMMMLQASLQEIGDRWADGKGPLAAAFSSSEVKALIRSLFQNTERRAAALAKIK	80882	123869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_+_83425_83620_83699_83851_84012_85782_85936_86356_86549_104396_104561_107787_107971_113608_113848_116006_116079_118197_118368_119171_119303_119841_119974_120775_120979_123271
870593	contig_11498_pilon	+	2668	11	Intergenic	novelGene_65495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_9	80.6935561243895	634	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	1027	1176	54400	54549	FALSE	30	CTTACTTTGACTAATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTLDKAGVLHRTKTVDKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAPNSLKQPSKLSTPEYTVQLKGASLAWAPKDKSSKKNVLELRSRDGSEYLIQHDSETIISTWHEAIAQGIQELSVDLPPEEESESCSPEFGSSERLGSWRDKEGDARPGAAGGQESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLRDRGYIKDQVFGCALAVLCERERSQVPRFVQQCIRTVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFCKFIAAIKLQDQAQRSRCVRDLVCSLPTPNHYTLRLLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPQTEEISMPMTMVFQNQVVELILQQCSYIFGPH	46314	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_46383_46692_46784_47287_47393_50748_50848_52976_53089_53212_53318_53388_53488_53685_53764_53857_53993_54158_54265_54371
870594	contig_11498_pilon	+	2312	16	Intergenic	novelGene_65494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_15	161.842255160868	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	239	1804	44746	54549	TRUE	25	AAAATGTGTGCTATTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTGRPYYYNPDTGVTTWELPFEAAEDAASPATSPASVGSSESLEAEWGQYWDEESRRVFFYNPLTGETAWEDELEGELEMQPDLSPRSPRDQRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVGSFSEPGPASPLDAPPGWFCHVGPDQQTLYTNHFTQERWVRLEDEHGKPYFYNPDDSSVRWELPQVPVPAPRNIRISSQNSDTSAQCSPPEEKIKTLDKAGVLHRTKTVDKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAPNSLKQPSKLSTPEYTVQLKGASLAWAPKDKSSKKNVLELRSRDGSEYLIQHDSETIISTWHEAIAQGIQELSVDLPPEEESESCSPEFGSSERLGSWRDKEGDARPGAAGGQESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLRDRGYIKDQVFGCALAVLCERERSQVPRFVQQCIRTVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFCKFIAAIKLQDQAQRSRCVRDLVCSLPTPNHYTLRLLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPQTEEISMPMTMVFQNQVVELILQQCSYIFGPH	44507	56024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_44788_45000_45184_45495_45577_45833_45918_46314_46383_46692_46784_47287_47393_50748_50848_52976_53089_53212_53318_53388_53488_53685_53764_53857_53993_54158_54265_54371_54995_55961
870595	contig_9199_pilon	+	3079	10	Intergenic	novelGene_65622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_9	49.8020774022555	18	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	22	1053	42527	57132	FALSE	10	TCAGCTGGACCTCTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIG	42505	59158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56245_56344_56407_57087
870596	contig_7593_pilon	-	1522	1	Intergenic	novelGene_127256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5149	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3396	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3400
870597	contig_11855_pilon	-	763	6	Intergenic	novelGene_66979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2134.29158270373	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	120	761	1087425	1084335	FALSE	50	GTATGTAAAACATTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKPGPGREAQQRAVGPRERPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRS	1101993	1084332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1084617_1084963_1085126_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1101936
870598	contig_8589_pilon	-	2553	2	Intergenic	novelGene_107353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	293	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGGGTCTTTACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6226	765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_3177_6084
870599	contig_5217_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_135783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGGGTGTCACATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	558275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558300_560400
870600	contig_9797_pilon	+	1763	6	Intergenic	novelGene_65586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	421.910227418108	774	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	352	978	183892	191368	FALSE	5	GTTCTGCGTTTTCCGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPRGSPYGQPPPNSYSAQQPGPYGQGPPPGGAPPSVDPEAYSWFQSVDSDHSGYISIKELKQALVNSNWSSFNDETCLMMINMFDKTKSGRIDVYGFSALWKFIQQWKNLFQQYDRDHSGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSRYGPRSANPSMQLDRFIQVCTQLQVLTEAFREKDTAVQGNIRLSFEDFVTMTASRML	172537	192153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_+_172570_175069_175176_183678_183989_188577_188734_189277_189422_191138
870601	contig_1154_pilon	-	1803	10	Intergenic	novelGene_87033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	403.490633544355	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	15	1001	68222	34336	FALSE	35	TGAATGTCTAAAGTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEEEMDDMDRDLGDEYGWKQVHGDVFRPSSHPLIFSSLIGSGCQIFAVSLIVIIVAMIEDLYTEGSMLSTAIFVYAATSPVNGYFGGSLYARQGGRRWIKQMFIGAFLIPAMVCGTAFFINFIAIYYHASRAIPFGTMVAVCCICFFVILPLNLVGTILGRNLSGQPNFPCRVNAVPRPIPEKKWFMEPAVIVCLGGILPFGSIFIEMYFIFTSFWAYKIYYVYGFMMLVLVILCIVTVCVTIVCTYFLLNAEDYRWQWTSFLSAASTAIYVYMYSFYYYFFKTKMYGLFQTSFYFGYMAVFSTALGIMCGAIGYMGTSAFVRKIYTNVKID	68236	33533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_34404_38846_38924_39049_39134_39653_39801_43010_43080_46021_46162_56156_56288_63325_63418_67264_67432_68210
870602	contig_15021_pilon	-	2258	3	Intergenic	novelGene_26957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	568	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1832	2137	240178	239873	FALSE	35	ATTAAACAAGTGGTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYYKKYCGALLICPFPVESLPAVKAVQAHWTVLPRFHDTVQRKSENVFADSVNRVYVQVLLRASCHPVLVMWGLEGLHCYTFKSLLFAAQFSIYTFAHR	248128	239751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_241882_243702_243801_248098
870603	contig_2733_pilon	+	1767	5	Intergenic	novelGene_128557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	442.510098754819	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCTATAATGAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570786	615281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_570861_571294_571531_578069_578182_611519_611589_614005
870604	contig_2733_pilon	+	1512	7	Intergenic	novelGene_128539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_6	296.072438583683	11	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1034	1339	571359	614101	FALSE	30	GACAGATTTTGGAGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGSQGGQQAGGGCC	504503	614274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_504816_544501_544574_560425_560494_570777_571388_578069_578182_611519_611589_614005
870605	contig_10263_pilon	-	4101	1	Intergenic	novelGene_135818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	434	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	2712	3233	152038	151517	NA	15	CTCGGGCCCAACGGACGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSECVGNGGGEGKMNRAGQEELVLPPSPDLLTVRHLPESQVEYLEAGQLRDALQAALGDSGTAVQVDTSELAQVLSNQLQALVRDAHTLSDVERAQPVHLPHHAVDAIIADVAGAKGKGLEAVQPLSYVGQTLVPHLVTEGHIQPRKAQAAHGQMHDARITDVVAGTQVKAA	154749	150648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_150600_154700
870606	contig_12050_pilon	-	2650	12	Intergenic	novelGene_62734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_8	142.410302348096	39	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	17	1462	719196	687356	TRUE	5	TTGTGGTCATTTCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARCSSRWVLVAVGTPRLPAAAGRGARPPREGVVGTSLGRKLSVTAFAPPLGARGPGALLTLRPGVSRTGVNSYPFVCTASFHTSSPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDAGASSSGHSYWRGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSSFGDFQSVFDPPQEYIMDLTFNQAAKGVNKEFTVNITDTCERCDGKGNEPGTKAQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGGSTMDSSAGGEARREAGEDKEGFLSKLKKMFTS	719212	685533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687342_687460_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696775_697799_697948_704917_705071_705672_705877_707622_707707_714837_714972_718985
870607	contig_11708_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_138976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAGAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297822	296410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_296400_297800
870608	contig_12756_pilon	+	3798	2	Intergenic	novelGene_153220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTTTGCTCACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164018	168943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_165501_166627
870610	contig_8487_pilon	-	5149	3	Intergenic	novelGene_111923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	10.5	209	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	339	1928	306048	298505	FALSE	30	TATGCTCACCGTCAATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMELRNRVQVSLTFEDVAVTFTQEEWGQLDLDQKTLYWEVMMEICSLFVSLGDCEKLQTTEPITCHPALSEEVSLQEQLSQGASRKSRLERAMDQEGSSNIQEGHLRPKIDAQKEMLPGNIRPERDSVWTDGRVCSGIIQEQVSSGVTLLKHDAGGPGKDPSVHKEKNPYKCKECGKVFNKNCLLVRHERIHSGVKVYECTEYRTTFSKSAHLHHLKVQVGEKSYEHIDYENALNHRSHLAQDLQFHTGVKLYKCIKCGKAFSRRSQLTRHHQIHTGEKPYDCTECGKAFKRRSHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKAFNNRSHLAQHQRIHTGEKPYECTVCGKAFNNRSHLAQHQRIHTEEKPYKCSECGKAFNQRAHLMQHQRIHTGEKPYECTKCGKAFSLRSHLAQHQRIHTGEKPYDCSECGKAFKNRSHLVQHQRIHTEEKPYECSECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKPYECSECGKAFTHRSTFVLHKKSHTGEKPFACKECGKAFRDQPGFIRHSIIHS	306386	295283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_299938_304985_305113_306018
870612	contig_11978_pilon	+	3585	1	Intergenic	novelGene_62812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCTTTGTCTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389365	392950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_389400_393000
870613	contig_6302_pilon	-	3150	2	Intergenic	novelGene_171707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAGGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231140	226755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_228433_229667
870614	contig_6510_pilon	+	3596	1	Intergenic	novelGene_173524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACTCGTTTCAAAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238633	242229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_238600_242200
870615	contig_7151_pilon	+	2106	11	Intergenic	novelGene_40670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCTTGGGGGCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1825	65213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_2085_3095_3248_4314_4398_4633_4734_5151_5299_5928_6268_13413_13611_18409_18482_18573_18879_40399_40716_65077
870616	contig_16846_pilon	+	1938	16	Intergenic	novelGene_82870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_12	354.896354196859	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	810	1685	211075	228852	FALSE	25	TTTTCTTAGAATACCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDTLPLLQPGCPLKICFLCSPFMKSPFLRVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQDGDVIAPLITPRKQQWNCPDLAQSSTHHQEAPKPRVRLFKD	179337	229105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_221596_221678_224514_224620_225189_225328_228726
870617	contig_16846_pilon	+	2408	17	Intergenic	novelGene_82862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_13	434.604377386779	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	202	2160	179165	228852	FALSE	25	GTCTATTTTCTTAGAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPEQVAICLQLLDFIAPRAELSVRLRSRPVGRQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVWTYKGRPKEKSFLYEIVANKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARVCEVDNKKHICTREKEVGNLYDMFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDTLPLLQPGCPLKICFLCSPFMKSPFLRVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQDGDVIAPLITPRKQQWNCPDLAQSSTHHQEAPKPRVRLFKD	178963	229100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_221596_221678_224514_224620_225189_225328_228726
870618	contig_16846_pilon	+	2140	15	Intergenic	novelGene_82864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_11	419.700652555011	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	165	1445	179165	218709	TRUE	15	TCCTTTAGTAGTCTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDFIAPRAELSVRLRSRPVGRQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVWTYKGRPKEKSFLYEIVANKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARVCEVDNKKHICTREKEVGNLYDMFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTGEL	179000	229090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_218698_218798_224514_224620_225189_225328_228726
870619	contig_16846_pilon	+	2101	16	Intergenic	novelGene_82866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_7	388.187835403887	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	103	966	179165	205951	TRUE	45	GAAACATTAAGTATTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVLHF	179062	229005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_205939_206048_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_218698_218798_224514_224620_225189_225328_228726
870620	contig_5247_pilon	-	2143	13	Intergenic	novelGene_81805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACACAAGAAAAGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161551	145729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_145847_146302_146568_147088_147294_148034_148151_154753_154907_155500_155670_155809_155966_156363_156488_157754_157901_158020_158153_158462_158560_160632_160730_161185
870621	SIRV6	+	660	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	17	731	17	125	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGAAATTTAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3122	11093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031
870622	contig_15063_pilon	+	1497	4	Intergenic	novelGene_14025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2820.88465241353	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	195	1364	34808	36661	FALSE	25	AGTTCACAAGATGCTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34613	36794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35034_35369_35834_36158_36266
870623	contig_8729_pilon	+	2259	6	Intergenic	novelGene_40096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	69.7968480663704	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAGAAATAAAAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276481	324135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899_286922_292856_292938_306155_306214_322203
870624	contig_10372_pilon	+	3896	9	Intergenic	novelGene_112504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	63.4171457493949	328	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	2042	3271	11639	14384	FALSE	10	CATGTACTGTGGCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSREAVAQAMVLEMFREEDYYNDDVLDQMGASILGVEGPRRHPDEPPEDEVFELFPMFMGGLLSAHNRAVLAQLGCPIKNLDVLENTQAIKKKLGKQGRQVLPPSELLDYLFFHYEFQNQRFSAEVLSSLRQLNLAGVRMTPLKCTVVAAVLSRGKHTLDEVNLASCQLDPAGLHTLKPVLLRARKLGLQLNSLGPEACRNLRDLLLHDQCQITTLRLSNNPLTAAGAALLVEGLAGNTSLTHLSLLHTGLGDKGLELLAAQLDRNQQLQELNVAYNGAGDTAALALAKAARGHPSLELLHLYFNELSSEGRQVLRDLGGTAEGGAQVVTSLTEGTAVSEYWSVILSEVQRNLNSWDQARVQRHLELLLRDLEDSRGATLNPWRKAQMLRVKGEVKALLEQLRGSGS	2912	15009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_2967_5422_5493_5964_6054_6757_7378_7751_8574_11252_12208_12486_12574_13338_13591_14062
870625	contig_20739_pilon	+	3333	15	Intergenic	novelGene_83175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_12	128.75758348976	582	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	272	2806	122793	197279	FALSE	5	ACTTGGTTCCCCTCTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLSFRARALDASKPLPVFRCEDLPDLHEYASINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAISAQQVYGEKRDNMVIPVPEAESNIAYYESIYPGEFKMPKQLIHIQPFSLDAEQPDYDLDSEDEVFVNKLKKKMDICPLQFEEMIDRLEKGSGQQPVSLQEAKLLLKEDDELIREVYEYWIKKRKNCRGPSLIPSVKQEKRDGSSTNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAVTILEMIKRREKSKRELLHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPVKPTYTIPIIPITNTNSNQFKHQEAMDVKEFKVNKQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATSQQTSPAALPVFNAKDLNQYDFPSSDEEPLSQVLSGSSEAEEENDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQTGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSMFRHLDLEMLSSPQHSPVNQFANTSETNTSDKSFSKDLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPSLHDSDNDELSCRRLYRSINRTGTAQPGTQTCSTSTQSKGSSGSAHFVFTAEQYQQHQQQLALMQKQQLAQIHQQQANSNSSTNTSQNLASNQQKSGFRLNLHHSHSIQGLERTLQGFVSKTLDSASAQFAASALVTSEQLMGFKMKDDVVLGIGVNGVLPASGVYKGLHLSSTMPTALVHTSPSTAGSTLLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPLNARHIPRTLSAVPSSALKLAAAANCQVTKVPSSSSVDSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT	122521	197806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_122946_166863_167024_179289_179436_179848_180056_180279_180429_181306_181473_183694_183872_183961_184052_184133_184283_185754_186108_193469_193589_193668_193756_194732_194875_194980_195345_197206
870626	contig_11986_pilon	+	2043	1	Intergenic	novelGene_69223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1650	1988	758275	758613	NA	10	GAGTGTGTTGCGGGGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSIFTLEFIHSVTVHEHWNQRTCRKPPFIGLQIYLFIKEEKKKRNRIKMQSGKSLIFSVEQSPLNTRQHKINKIKRHSVHGLELDIVKMPTLPKLTERNSIKIPATDKII	756625	758668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_756600_758700
870627	contig_11448_pilon	+	2995	2	Intergenic	novelGene_66441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGCAAATATTAGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655268	659513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_656801_658050
870628	contig_15084_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_116697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAACTACCCTAATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219891	222336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_219900_222300
870629	contig_6710_pilon	-	911	2	Intergenic	novelGene_92955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
870630	contig_5770_pilon	-	214	4	Intergenic	novelGene_74197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	6126.35407254774	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCAGTGTGTGCCGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265788	263981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_264062_264766_264808_264892_264969_265771
870631	contig_6497_pilon	+	3039	17	Intergenic	novelGene_35605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	137.774597962578	508	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	494	2704	505495	543016	FALSE	15	GCTTTTGGTATAACTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPENIEEAYVAVIRPKNTASLNSREYRAKSYEILLHEVPIEGQKKKRKKVLLETKLQGNSEITQGILDYVVETTKPISPANQGIRGKRVVLMKTFPLDGEKMGREAALFIVPSVVKDNTKYTYTPGCPVFYCLQDIMRVCSESSSHFATLTARMLIALDKWLDERHAQSHFIPALFRPSPLERIKTNVINPAYTTESGQTENSLHMGYSALEIKSKMLALEKADTCIYNPLFGSDLQYTNRVDKVVINPYFGLGAPDYSKIQIPKQEKWQRSMSSVTEDKERQWVDDFPLHRSACEGDSELLSRLLSERFSVNQLDSDHWAPIHYACWYGKVEATRILLEKGKCNPNLLNGQLSSPLHFAAGGGHAEIVQILLNHPEIDRHITDQQGRSPLNICEENKQNNWEETVKLLKEAINKPYEKVRIYRMDGSYRSVELKHGNNTTVQQIMEGMRLSQETQQYFTIWICSENLSLQLKPYHKPLQHVRDWPEILAELTNLDPQRETPQLFLRRDVRLPLEVEKKIEDPLAILILFDEARYNLLKGFYTAPDAKLITLASLLLQIVYGNYEGKKHKQGFLNEENLKSIVPITKLKSKAPHWTNRILHEYKNLSTSEGVSKEMHHLQRMFLQNCWEIPTYGAAFFTGQIFTKASPSNHKVIPVYVGVNIKGLHLLNMETKALLISLKYGCFMWHLGDTDTCFQIHSVENKMSFIVHTKQAGLVVKLLTKLNGQLMPTERNL	498169	543351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_498661_505492_505597_506525_506686_511501_511595_513830_513961_515107_515352_515517_515634_515850_515995_518627_518785_519312_519421_524818_524976_527351_527504_530834_531002_531626_531715_532311_532519_542305_542423_542947
870632	contig_8676_pilon	+	2764	6	Intergenic	novelGene_142225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	292	junction_1	236.212954767515	16	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	355	768	669421	671271	FALSE	10	GTGGCTGTTGAGTGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYQRAFDDFLERYKQLKNYRANVIANINNCLSFRASVEQRWQTLQDTHSHLLVPLNEIKTHGFDSLLQNLFLDLKPLFKRFTQTRWSAPVEILEEILATVSERLPEFSELQDSVRKELMEAVHLHLVKEYIIRLSKRRLILKTAEQQQQLARHILSNADLIHCFCTQNGSSANWLSLALPRLAEIICLQDLNAIKIEVATYVTWYPDFSKGHLNAILAIKGNLSSSEVRSIRSILDINTGPHESTHPLFSLIRVG	667204	673267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_667306_667814_667939_668983_669107_669414_669571_669677_669800_671129
870633	contig_7293_pilon	+	2779	2	Intergenic	novelGene_54231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAAATCTAAATGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220438	223656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_222006_222444
870636	contig_3789_pilon	+	6879	9	Intergenic	novelGene_79810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	48	junction_4	74.1514497498195	234	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	238	1305	81753	112302	FALSE	20	CACACCCAGGTGCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLGQDWRSPGQSWVKTADGWKRFLDEKTGSFVNDLSSYCNKEVYNKENLFNSLNYDVAAKKRKKDMLNSKTKTQYFHQEKWIYVHKGSTKERHGYCTLGEAFNRLDFSTAILDSRRFNYVVRLLELIAKSQLTSLSGIAQKNFMNILEKVVLKVLEDQQNIRLIRELLQTLYTSLCTLVQRVGKSVLVGNINMWVHRMETILHWQQQLNNIQITRPAFKGLTFTDLPLCLQLNIMQRLSDGRDLVSLGQAAPDLHALSEDRLLWKRLCQYHFSERQIRKRLILSDKGQLDWKKMYFKLVRCYPRKEQYGDTLQLCRHCHILSWKGTDHPCTANNPESCSVSLSPQDFINLFKF	81515	117876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_81869_88813_88927_89776_89827_91224_91318_104070_104165_104988_105174_110160_110344_111343_111488_112212
870638	contig_10050_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_119616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAACAACAATAACAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123972	122471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_122500_124000
870640	contig_4845_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_53627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	355	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACAGCCTCCTGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227792	225829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_225800_227800
870641	contig_5967_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_44364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCCAAACGACTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387550	388736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_387600_388700
870642	contig_8394_pilon	-	1714	4	Intergenic	novelGene_27306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.051863031078	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	437	1366	35322	32466	FALSE	20	TTAACCCTTTTCATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTLTVLKKVLKDFTSS	38990	32117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_32510_32824_33684_35295_35523_38754
870643	contig_1008_pilon	+	3896	1	Intergenic	novelGene_121623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATAATTGTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126471	1130367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1126500_1130400
870644	contig_12414_pilon	+	2477	18	Intergenic	novelGene_59670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATTAAAATAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835807	933647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_835967_838083_838188_868323_868474_871629_871789_886851_886974_890249_890546_896743_896895_902526_902758_902869_902921_903003_903040_905263_905360_905446_905556_909063_909203_909284_909346_916186_916267_917554_917672_931657_931866_933439
870645	contig_6691_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_60189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCCCCAGCAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519579	518363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_518400_519600
870646	contig_8589_pilon	-	2471	2	Intergenic	novelGene_107356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTGTGGGTCTTTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6226	766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_-_2993_5981
870647	contig_16369_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_98699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAACCAAATTCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16746	16315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_16300_16700
870648	contig_8921_pilon	+	4364	3	Intergenic	novelGene_161620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	25	553	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1237	2433	33857	35053	FALSE	15	TACTTTTTTTATGTGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASFVKSCIFHVSGTGTSEEVGMDFPASSGLLPHQAAPSSEKPHSGIERGEAFHSGNRQYEWGECGSTFSHEHTLLQPQSFCTGEGLYRCNRCGHPTVSCKCRRGKGQRTGPQERPYECGICGQFFGQISILVKHQITHSAERPYECSECGKSFKRTAELIRHWRIHTGEKPYECSECGKSYTRSSNLVEHQRSHTGEIGYARYTCGICGKSFKQSSKLTLHKRVHTGERPYECDQCGKCFSQISNLMQHQSVHTGERPYDCAECGRSFSRRSNFIEHQKVHTGERPYECGECGKFFSRSSILSEHQRVHTEERPYECGECGKAYRRVSSLIEHQRVHTGERPYECSDCGKSFIRNSTLTRHRRVHTGEFSGEFAGDFTEEFTDEFAGDFSLENAL	14051	36984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_14871_17435_17561_33564
870649	contig_8394_pilon	-	1960	4	Intergenic	novelGene_27309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.051863031078	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	885	1613	33194	32466	FALSE	25	ATTAACCCTTTTCATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39011	32118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33332_33420_33684_35295_35523_38754
870650	contig_7056_pilon	+	2446	16	Intergenic	novelGene_43668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	581.024245047772	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	130	1911	798314	810882	TRUE	15	GTATGTGGTTGTAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781802	812198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828_811236_812016
870651	contig_12312_pilon	+	888	1	Intergenic	novelGene_63983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301161	302049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_301200_302000
870652	contig_11386_pilon	+	1916	9	Intergenic	novelGene_82767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	272.15287523743	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	771	1400	17940	20925	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	7895	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11261_11370_11585_13558_13752_17844_18037_19625_20050_20816_21022_31990_32329_32374
870653	contig_5981_pilon	-	3830	2	Intergenic	novelGene_35506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	389	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	813	1262	51396	50947	FALSE	30	CTAAAATTTCCATGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	53084	48378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_52013_52888
870654	contig_14441_pilon	+	1305	5	Intergenic	novelGene_100685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	421.499332739685	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	691	1119	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113706	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_114070_114553_114732_116578_116963_117220_117344_117539
870655	contig_19269_pilon	+	1518	3	Intergenic	novelGene_175621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	376.5	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTCTTCTAATGGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794	12548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_904_7501_7587_11224
870656	contig_7707_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_72229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	7	348	962491	962832	NA	30	CCTTCTAGACTGTGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITMTKKKKKSVAAETPYVHPNTSWDLVPWFGGLGSWFHGTSQLTGLTMCLVLLLHLIVCCLVLGVLKASKAIQSTMIGIYSPGPTEEEGESGTGGGNRMAFFAMRPEELVPGYHY	962484	963494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_962500_963500
870657	contig_16578_pilon	-	2920	1	Intergenic	novelGene_148675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1682	2029	280036	279689	NA	25	CCAATGATGAGTTGTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKDILAPLKIRAGHAPKHVHHAQSPFSLCSTSSCCLDHSPQGRGPVLESDSLYGLASACGPSYARVLPNGSTHGQVVVDQILFSSPKAVQLERMQWSSNGPAAEEHKEREGLE	281717	278797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_278800_281700
870658	contig_5423_pilon	+	4023	1	Intergenic	novelGene_85190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGTTTTGTCACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201400	205423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_201400_205400
870660	contig_8712_pilon	+	2362	5	Intergenic	novelGene_58805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	589.814112666016	11	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	70	549	314974	321793	TRUE	35	ATCTAGACGTTGGAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCLRGSGYSLCAACLQARPVEVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	311680	324504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311744_314967_315188_318064_318222_321684_321974_322871
870661	contig_6938_pilon	-	2636	11	Intergenic	novelGene_69061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	336.874590908843	18	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	85	1026	169148	137993	FALSE	15	CGCTTTGGAGAAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGKLIENVDPEKAVQLYQQTANVFENEERLRQAVELLGKASRLLVRGRRFDEAALSIQKEKTIYKEIENYPTCYKKTIAQVLVHLHRNDYVAAERCVRESYSIPGFNGSEDCAALEQLLEGYDQQDQDQVSEVCNSPLFKYMDNDYAKLGLSLVVPGGGIKKKSPATPQAKPDGTTTTAAEEEEDEYSGGLC	169232	136382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138137_139249_139380_139953_140034_141959_142039_157629_157701_157886_157954_158074_158185_162374_162406_163983_164090_165469_165538_169092
870662	contig_34_pilon	-	1206	4	Intergenic	novelGene_40038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2126	junction_1	1160.59103716837	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	205	585	230337	224546	FALSE	25	CAATGGAGAATGTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	246986	223924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_224818_230228_230387_243214_243354_246970
870663	contig_11498_pilon	-	3635	1	Intergenic	novelGene_65500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2367	2693	120087	119761	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLYCSGQSTWPLCLSSYICKMGISRPVLSAYVNNITSYAVHLSSLFINKSKYPGLVKFKIDMFEGKKKKKKLYPSYPFMGKLAEKAVNQISILEKDIVFGKVGQRK	122453	118818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_118800_122500
870664	contig_14681_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_134209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1581	1901	68148	68468	NA	35	AATACATGGGAGGAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMCMRREAHSKLRPFSDLPQPLFFARFFHVSSARAHSLSLRSVWPTWVLLGLSYTRAQPQPGICLLQTQGISILRLVAPQVLPAFLPPICHFIISAAGCGGHSQP	66567	69531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_66600_69500
870665	contig_10196_pilon	+	3014	2	Intergenic	novelGene_132033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	2683	3012	406375	406704	FALSE	10	CTTTGGGCTCCCATAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLYPEGIHLHRAPVHSEYTSPVWDGAGGGPGDRLHGGGNAMWSCESVWGSQEDEAEWELHTEQRHQTKWVERAPAKAWTMPHLETTILCPGCRPTFRRSCLQLSCCKC	403570	406706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_404299_404420
870666	contig_9801_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_167569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	711	1130	102746	103165	NA	55	TAAGTTCAAAGAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLREVLFILSLLGLLSTHGKEGDSAKHIKLLFGSLHPSIRRYLGWGEECYIGILDLSTARFVSVDRAHVTVLCFGLLIIRIRTMFFFFFLIFRIHEKRPMTQIFRFSIIIIKISLFSLKNFVILLLFFFTALRRRGI	102035	103353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_102000_103400
870667	contig_2310_pilon	-	3769	12	Intergenic	novelGene_71605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCGAAACGAGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134648	106065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106687_106739_107847_108058_110701_110784_114929_114993_118096_118168_118358_118428_122874_123052_124479_126679_127455_127953_133365_133447_134438
870669	contig_10990_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_7514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGTAGGAAAGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751947	753853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_751900_753900
870671	contig_5643_pilon	-	2247	15	Intergenic	novelGene_38906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_8	408.169188860078	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2217	31	2247	278062	269741	FALSE	30	AAAGGTGGGTGTTTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRGVCGRPRPPLMGRSTRAVGPAHLPSLPPDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPAPPTEDGIKIEENSLKEEENTEGEKEVKSAVPEATVECTQPPAPASEDEKVLVDPPEGEEKVEKTEVKERTEEPMETESKGVADVEKMEEKSAIDLTPIVVED	278092	269740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_269809_270276_270407_270512_270611_270873_271040_271138_271284_271619_271754_271857_271947_272033_272386_274798_274975_275149_275388_275710_275836_276984_277103_277217_277350_277432_277575_277958
870672	contig_3004_pilon	+	3495	1	Intergenic	novelGene_127474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAATGTGAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235595	239090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_235600_239100
870673	contig_5643_pilon	+	1607	5	Intergenic	novelGene_38735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_1	263.88574705732	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1061	1411	156118	157107	FALSE	15	CACACGCTGCAGCTGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEARSIRPMQTLAHSRWLPAPARSTHWPSQRSLCSSDCIRIFVVLSGMLLVFTLGGVLFLHQQRKYGSNKRESPMEPAEPCAYSCPREEEGGAIPIQEDYRKPEPVIYPLEKVAL	152351	157303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_153040_155745_156206_156463_156584_156823_156945_157085
870674	contig_10331_pilon	+	3660	5	Intergenic	novelGene_54123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCGCCATCCCGCTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396710	409088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_397797_398048_398117_398573_400803_401970_402064_408904
870675	contig_12964_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_131733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	631432	631740	NA	40	CTATAGGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAPHPLHPEAVQGLSHHRSGGGIRPHAILPGKISCHVIPGILNHRLCSASVSKKTSVYKTARKELTVAGTQTYNSSANNSCLPPSDKNHTLTTSALLHKLS	631429	632492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_631400_632500
870676	contig_11816_pilon	+	2094	16	Intergenic	novelGene_98512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1157	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTCTCGCCGCGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985309	1125379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_985808_986054_986310_989422_989507_990795_990878_992054_992166_995414_995464_996350_996399_999064_999161_999284_999334_1000392_1000504_1015125_1015207_1017133_1017288_1027665_1027756_1033124_1033183_1086492_1086672_1125230
870677	contig_13097_pilon	+	2054	17	Intergenic	novelGene_107701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	578.168971300778	1	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	335	1843	186125	264394	FALSE	50	TCCAAGAAAGAATATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMKLKGQKKKMPGYANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184528	264605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186169_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
870678	contig_11292_pilon	+	4008	1	Intergenic	novelGene_109485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476872	480880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_476900_480900
870679	contig_12057_pilon	+	3123	1	Intergenic	novelGene_131615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	560	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCCAACTGTGCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4468	7591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_4500_7600
870681	contig_12799_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_173284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTCTGTCCATTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37444	35827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_-_35800_37400
870682	contig_2577_pilon	-	4111	1	Intergenic	novelGene_172074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGACCCTACAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261242	257131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_257100_261200
870683	contig_15498_pilon	-	1017	7	Intergenic	novelGene_42672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	162.933183305987	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	13	399	697708	689498	TRUE	30	GAAACGTTGCCCTCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSLCPIIGWARQPLPTPTLSPT	697720	688002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689561_692449_692509_697262_697374_697554
870684	contig_18933_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_177289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1357	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCATCTGTTCTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8914	10708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18933_pilon_+_8900_10700
870685	contig_8020_pilon	-	2691	11	Intergenic	novelGene_114384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	57.9262462101593	343	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	183	1514	152275	148058	FALSE	15	TAAACCCTGTCTCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPLPTSWGLSGVKQTSCLSPKPTSLPWRPADPRASHPSLHLAALAPVTGPPPACQALCIMQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQFWSAYVPCQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTPWAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	154191	146880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151258_151580_151708_152036_152321_154054
870686	contig_5696_pilon	-	3348	1	Intergenic	novelGene_117498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTTTCCCCCCAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275474	272126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_272100_275500
870687	contig_9243_pilon	-	2154	10	Intergenic	novelGene_60316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_5	128.232235310937	2002	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	60	920	64617	20056	FALSE	50	AAAAAAACACCACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSHGKGEVRWPPRFVARRKMADLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGSGKFLDPKNRICFKFDHLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64676	18821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34711_41470_41535_45071_45124_47702_47767_64578
870688	contig_12312_pilon	+	2849	8	Intergenic	novelGene_63929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	124	junction_7	117.560926453356	2	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	257	1168	201408	210473	FALSE	35	TCTGATTGGTAACTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIYRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNGFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT	200072	212154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_200257_201335_201508_205092_205231_206263_206350_207042_207177_208046_208255_209747_209893_210372
870690	contig_4659_pilon	-	3537	2	Intergenic	novelGene_118171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1345	junction_1	0	76	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTTCTTAGTAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91130	87483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_90924_91033
870691	contig_9183_pilon	+	2154	7	Intergenic	novelGene_40328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	366	800	312219	315445	TRUE	20	GTCCTGGGCAGCAGGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQASSRVMPCMAELASCRISSPGWTVSLCSEAVPLNILLMVRGLSPWSEPFPPSRLKPSPAEVFSRVTVQTSVESTEASLATEIEAEESVEEFRSGVSSKAGFLVTITACRGSRAWRRMARASVCVAPLRDFPLMDRTSLPF	311853	325931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_312324_314769_314888_315233_315491_318242_318350_320557_320669_322863_323835_325811
870692	contig_6102_pilon	-	3481	6	Intergenic	novelGene_32193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2000	junction_2	1035.63823799626	1475	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	163	1707	899605	898061	TRUE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPPSKGAPATPSPKDVPTPLPMIPHSKEAPTPSPVTPKGAPAPLPLTTPPTGAPAVPSTKGAPIPSPVTPPSSKGAPAAPSTKGVLTSPPVTPPPSKGASVLPPTTTPPKGAPPVPSTKKAPTPSPVTPPSSKGAPAAPSTKGVPTPSPVMTAPKGAPIPPPVTPPSSKGAPIPPPVTPPSFRGAPIPPPVTSPSSKGAPIPPPVTPPSSKGAPEIQSTKDVPTSLAVTPPKETPATPSPQSSPTPPASVTCPLEAIAPQPSKGLPTNKGPTAPKEALVAASPESASVITAPTQKGPSAKKGSVPSPSVCPDPAVKRGTGGPLSTVAAAPLLTVSSHSSPKTPKALPVSPTKGKDSVHAPNVPLALPPESKTSTPLATAASEKVLLKTGSVPVSPAPTPSVSLPLAPSAVPLLLPKQQFLPSSPGLVLESPCKPPAPADEDEMPPLIPPEPVSGGMPFQPVLVNMPIPKSAGIPAPAPSAKQPILKNNKGICLGVLCAWCVAHTPLGATHQY	899767	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888
870693	contig_7279_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_145990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAATATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90281	91773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_90300_91800
870694	contig_3410_pilon	-	3095	8	Intergenic	novelGene_58964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	402	1094	421081	419151	TRUE	25	ACGAGGCTATTTTTCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPQRGSLQDGREPHRECQAPCGAKSGPAKAWKPRSSLVAIVTWGWRPGLGEKGGRRGFLGESGLAGEEGGTQVAPAKDVRRLGDDRASVWLSFWSGPVEQLKGVLHHLPQAVVQWKLVVHQVYEEVVVVDVLDDHAGWGLLLVQLAPLLNPQGKGLILPEHEADGVYHCGLDDLSPREDAPSDCIGSQVGGVGDVFTLHVYNVVIDPELVSLQHLQQRFHGLAGSEEL	421482	414286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_415530_416259_416509_417021_417158_417307_417490_417817_418001_419142_419245_420161_420282_420602
870695	contig_12464_pilon	-	2492	5	Intergenic	novelGene_68692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	168.074388292803	2	133	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	459	1814	344529	337140	FALSE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQCIMAPKRSKTSASNSSSKRQRKSIDLEVKQKVIKQHEGGKSVNAIARDLGMSHSTITTILKNKEKILQAVKGSAPLKATRLTKMREGPISDMERLLMTWIEDQTQKQIPLSTSTITAKARSLFEMLKEKAGPDYNIEFSASSGWFMRFKQRFSLHNVKLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	346476	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_343318_343793_344406_344620_345552_345716_346271
870696	contig_10930_pilon	+	731	7	Intergenic	novelGene_37095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8600.61315643639	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTGTGTTTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339419	342108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339433_339580_339622_339803_340055_340505_340639_340994_341098_341522_341625_342020
870697	contig_12837_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_57339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTGCATTATAGCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163173	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_163200_166100
870698	contig_2043_pilon	-	2753	6	Intergenic	novelGene_169909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	366	junction_1	118.541806971212	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	1185	2612	693427	682042	FALSE	85	AAAAAAAGAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALDPSKRCTAEQALQCDFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTSTPQGVPPSSQLKSQGNSSVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQVPSQTVQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDLLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDVRMLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPGGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY	705344	681900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_682893_683464_683738_687031_687238_693329_694126_704762_704841_704936
870699	contig_12644_pilon	-	4356	1	Intergenic	novelGene_44458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGTAAATGTTTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926702	922346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_922300_926700
870700	contig_5153_pilon	+	2189	16	Intergenic	novelGene_74359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	308.364820013928	2	90	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	435	1646	1007835	1022324	FALSE	35	AAAGCCAGCCAGGTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISRGPSREPWPLSYTHPS	956585	1022867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005403_1005581_1007792_1007907_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022273
870701	contig_4519_pilon	+	6999	1	Intergenic	novelGene_123655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	4962	5264	50159	50461	NA	10	TTTGATCTTCATGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQGFESQTTSSVHCLWAVQLYCFLCVVCCGKGWKHCFEAYFIDPIAPSVPKNGGPEICQSVFGNRRFITSCYFGDILGAILLLFHLAVWQSAMTETAG	45197	52196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_45200_52200
870702	contig_19604_pilon	+	2307	6	Intergenic	novelGene_77243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	276.989097258358	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	354	713	273206	273988	TRUE	20	GAACAGCAGGTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	269904	275816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273577_273833_275045_275278
870703	contig_854_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_36358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGTGTTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977633	974687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976061_977471
870704	contig_15236_pilon	-	4245	2	Intergenic	novelGene_141555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_1	0	529	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	488	1633	330951	329806	FALSE	25	GCAGATGTGTATTTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMRMFVGSRRVKKWLFFQLLATCFILSLMCFWIPLDNHILSHMKSYSYRYLINSYDFVNDTLSVKRSSEDIPSFQYLINHDKKCRAQDVLLLLFVKTAPENYERRSVIRRTWGNEEYVRSQLKANIKTLFVLGTSSNPLKREELQRQLVREDKMYNDIIQQDFVDSFYNLTLKLLLQFSWANTFCPHAKFLMTADDDIFIHMPNLVEYLQSLEQIGVQDLWIGRVHRGAPPIRDKKSKYYVSYEMYQWPAYPDYTAGAAYVISNDVATKVYEASQTLNSSLYIDDVFMGLCANKMGIVPQYHVFFSGEGKTPYHPCIYDKMMTSHGHVQDLQKLWEDATDPKVKTISKGFFGQIYCRFIKIALLCKLSYVDTYPCRAAFV	350049	327193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_331225_349835
870705	contig_18800_pilon	+	1123	9	Intergenic	novelGene_110670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	121.9287061155	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	990	132	1121	47012	54558	FALSE	25	TATCCGGAGTGAGAAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSRDVVDLAPSAASCVDRALAWESGHFGSGPSPATHPVQPWAMACPEGWQTEEASSWPQVPLSSQDTGESDAEHLQDSATCALVPGPWGSPASSPELSSPESESRGPGPWPSPVSSQEGSPQLPCHHSGSIVPKRTLSASHLSLLETDGAEPSSVEKEKAREAPSSEEEVKSEDTVRTAEARAVQLDIHSTSTEGLPENPMPQVQSPEEGQRPQAGDKLANGVRTDKVAWNLASRLYHLEGFRKSEVAAYLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRGFLQALVLSGETQERERILYQFSKRFHHCNPGVFSSVDSVHTLTCAIMLLNTDLHGQNIGKSMSCQEFITNLNGLRDGGNFSKELLKALYW	46565	54560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_46694_47008_47088_47613_47996_50595_50773_51281_51363_51520_51634_51872_51932_52194_52285_54546
870706	contig_17075_pilon	-	3080	1	Intergenic	novelGene_131753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTATCTGTTTTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91073	87993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88000_91100
870707	contig_3449_pilon	-	3258	1	Intergenic	novelGene_73705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATCATACTACAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301232	297974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_298000_301200
870708	contig_16846_pilon	-	3712	7	Intergenic	novelGene_82994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_6	142.177901080145	339	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1304	2161	599134	575489	FALSE	40	AAATGAGGTAACGTGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETTSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDAGDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL	647871	573937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_575708_576521_576678_577456_577549_598743_599157_599687_599777_602407_602772_647043
870709	contig_10549_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_110642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	380	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	24	626	516236	516838	NA	55	TATGGATGAAAATAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEAAAAEMQRFSDLLQRLINGIGGCSSDSSCGEKRRRKSPGAGGGCSGGSSGNDSHQAATKSPRKAAAAAARLNRLKKKEYVMGLESRVRGLAAENQELRAENRELSKRVQALQEESRYLRAVLANETGLARLLSRLSGVGLRLTTSLFRDSPAGDHDYALPVGKQQQDLLEEDDSAGGVCLHVDKDKVSVEFCSACARKASSSLKM	516212	518926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_516200_518900
870710	contig_11601_pilon	+	2987	1	Intergenic	novelGene_141036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCAGTTGGTGGTCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100312	103299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_100300_103300
870711	contig_7580_pilon	+	4085	1	Intergenic	novelGene_108599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACCCACTTAGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96449	100534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96400_100500
870712	contig_7775_pilon	-	3173	1	Intergenic	novelGene_37489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211255	208082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_208100_211300
870713	contig_9375_pilon	-	3674	1	Intergenic	novelGene_136048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168335	164661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_164700_168300
870714	contig_10163_pilon	+	2640	14	Intergenic	novelGene_82628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	182.172133957234	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	137	1165	120881	152312	TRUE	5	TTTCTGTTTTACGTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWYTLIVGILLPRSLAHPGFFTSIGQMTDLIYTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWSEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQYFPNDEDQIGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHQSFLTVDDCFELGKVAYTEADYYHTELWMEQALKQLDEGEVSTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQRANGNLKYFEYIMTKEKDSNKSTSDDQSDQKTTLKKKGVAVDYLPERQKLLGDRKNSFAATMMETGILNLFSPQPSRRMSGTNLVLFASMILFLMQKLKLSKI	88244	186596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_88350_120849_120957_122443_122541_123475_123628_126725_126864_146584_146825_149650_149811_152146_152324_165096_165197_175174_175229_181219_181286_183288_183358_183871_183969_185518
870715	contig_14023_pilon	+	3301	1	Intergenic	novelGene_165388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTTTTGTCTCCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303990	307291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_304000_307300
870716	contig_8878_pilon	+	1476	7	Intergenic	novelGene_147858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	678	1031	228789	230644	TRUE	20	TGCCCGGAGACGCAGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRHVLISNSRCYIKHYNGTLGLDIIAISQSSKFFLTSCIPHVEFNRSSVSMEHKRMDLNTQGGYILLLKFTSQMTFHKRSFSSTTITNQYELLGYNFPSKNQLKTCFTNLESHSS	227828	231713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_+_228213_228311_228487_228670_228857_230277_230404_230484_230776_230872_231120_231646
870717	contig_10749_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_133497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGAAACCCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224539	226485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_224500_226500
870718	contig_6496_pilon	-	3578	1	Intergenic	novelGene_103499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTACTAACTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587015	583437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_583400_587000
870719	contig_6364_pilon	+	6414	1	Intergenic	novelGene_51862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3399	3707	2239598	2239906	NA	5	GATGGCCGTGTGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSGEEEKARLHFVVACPHLRLVCFTSKAQAKDHSIVEGGEGPSATPKTAVPSAMTGCSCPSTILPFPLPGSVSQACGNGMEGPPRKTHFCPYFLSGRFTV	2236199	2242613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2236200_2242600
870720	contig_7457_pilon	+	2940	4	Intergenic	novelGene_31661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_3	86.0400423575494	34	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1697	2050	1038857	1040226	FALSE	10	CTGGTGTCTCATGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1037160	1041116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
870722	contig_15899_pilon	+	3556	1	Intergenic	novelGene_128910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1108	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTTATGTCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31677	35233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_31700_35200
870723	contig_15787_pilon	+	1498	8	Intergenic	novelGene_143962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	689	junction_3	435.823358713137	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	59	1180	56204	111562	FALSE	15	ACCTTACCTTTCTCGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRKPSNASEKEKHQKPKRSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQEYISTLLLNGYETIEDLKDIKESHLIELKIENPEDRMRLLSAAENLLDEETIQEQENEPVSLSSSPNISLNKSQLDDCPRDSGCYTSSENSDNGKEDVESKNLPNMIQKMTITEPSD	56145	111880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_96021_98169_98321_111359
870724	contig_12915_pilon	-	3021	1	Intergenic	novelGene_148344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCATCAAGAAGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75276	72255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_72300_75300
870725	contig_13215_pilon	+	4509	1	Intergenic	novelGene_145893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAATCTTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141713	146222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_141700_146200
870726	contig_15118_pilon	+	2330	11	Intergenic	novelGene_74607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	257.729780972242	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	402	1706	392827	398743	FALSE	15	AGCCATGTTCATTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391989	399367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392288_392641_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
870727	contig_3529_pilon	-	3629	3	Intergenic	novelGene_105349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1182	junction_1	106	61	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTACATTTTCATTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541591	525464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_526140_529070_529187_538753
870728	contig_14722_pilon	-	2770	25	Intergenic	novelGene_110209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_22	128.55056695281	505	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	558	2270	137430	37838	FALSE	25	TTAGCTGAATGACCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWTSGSPVPPSPKLSHLVGELRALSEKIVSVLPRMKCPHQLEPHQIQGMDFIHIFPVIQWLVKRAIETKEEMGDYIRSYSVSQFQKTYSLPEDDDFIKRKEKAIQTVVDISDVYKPCRKYRRQRGAEELLDEESRIHATLLEYGRRYGFSRQSKTEKAEDKKTALSAGFSAGERAEAHEEDELRAAEEQRIQSLMTKLTATAAEESRLTASSVGQIVGLCSAEIKQIVSEYAEKQSELSAEDSPEKLGASQLHHRKIISLNKQILQKTKHLEELQASHANLQAKYSEAKKTLTELKSYSEKLDKEQAALEKIESKADPSILQNLRALVAMNENLKSQEQEFKAHCREEMTRLQQEIEALKAERAPGGDEKTPSSGEPHGALTSVMTCDEDLDRRYNMEKEKLYKIRLLQARRNREIAILHRKIDEVPSRAELIQYQKRFIELYRQISAVHKETKQFFTLYNTLDDKKVYLEKEISLLNSIHENFSQAMASPASRDQFLRQMEQIVEGIKQSRMKMEKKKQENKMRRDQLNDQYLELLEKQRLYFKTVKEFKEEGRKNEVLLSKVKAKAS	152083	37337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37892_45772_45887_47982_48068_49475_49514_51668_51752_58190_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_65720_65803_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93304_93356_93643_93737_96619_96657_105006_105108_120663_120721_127092_127192_136353_136466_137362_137624_140864_140960_142940_143055_151928
870729	contig_5605_pilon	-	3882	21	Intergenic	novelGene_143930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_14	68.4173040977208	186	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	745	2238	188	2425	290015	206816	FALSE	35	ATCCCAGACAAATTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEFVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQTILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDKLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDVESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA	313695	205358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_206948_207959_208077_209641_209744_213943_214147_219466_219534_224967_225046_225319_225473_226527_226615_226725_226855_227576_227637_228763_228872_230455_230581_235555_235719_238761_238873_238982_239080_255181_255265_258710_258817_275970_276066_276879_276983_289896_290038_313530
870731	contig_11512_pilon	+	3372	1	Intergenic	novelGene_43314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388741	392113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_388700_392100
870732	contig_14681_pilon	+	1885	10	Intergenic	novelGene_134192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	167.349563916999	756	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	409	1116	50409	71147	TRUE	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIALTTAVTSAFLLAKVILSKLFSQGAFGYVLPIISFILAWIETWFLDFKVLPQEAEEENRLLIVQDASERAALIPGGLSDGQFYSPPESEAGSEEEAEEKQDSEKPLLDL	23033	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_45548_45707_50350_50634_56129_56208_58505_58584_60561_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
870733	contig_5684_pilon	-	2188	13	Intergenic	novelGene_81004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	118.64943109851	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	244	2070	317651	299846	FALSE	55	AAAAACAAAATACATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIGISCLLPASWHFSISPVGCLRILNTNLRQIIVISILAATVSLLYFSVVIIRNKYGRLSRDKKFQRYLARVTDIEATDTNNPNVNYGIVVDCGSSGSRIFVYCWPRHNGNPHDLLDIRQMRDKSRKPVVMKIKPGISEFATFPEKVSDYISPLLNFAAEHVPRAKHKETPLYILCTAGMRILPESQQKAILEDLLTDIPVHFDFLFSDSHAEVISGKQEGVYAWIGINFVLGRFEHIEDDDEAVVEVNVPGSESSEAIIRKRTAGILDMGGVSTQIAYEVPKTEEIAKNLLAEFNLGCDVHQTEHVYRVYVATFLGFGGNAARQRYEDRIFANTAQKNRLLGKQTGLTPDTPYLDPCLPRDIKDEIQQNGQTMYLRGTGDFDLCRETIQPFMNKTNETQTSLSGIYQPPIHFQNSEFYGFSEFYYCTEDVLRMGGDYDAAKFTKAAKDYCATKWSILRERFDRGLYASHADLHRLKYQCFKSAWMFEVFHRGFSFPVNYKNLKTALQVYDKEVQWTLGAILYRTRFLPLRDIQQEIFRSSHTHWRGFSFVYNHYLFSGCFLVVLLSILLYLLRLRRIHRRTLRNGSAATLWMEEGLAAQKVAGTL	326614	299727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_300075_301353_301516_302452_302539_304368_304694_308102_308270_309997_310129_310411_310472_312163_312268_312910_313062_315407_315614_316151_316350_317643_317745_326464
870734	contig_18869_pilon	-	2134	2	Intergenic	novelGene_55979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	398	940	53041	52499	FALSE	20	TGATCATCTATGGTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59881	51304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_53330_59772
870735	contig_13123_pilon	+	2147	5	Intergenic	novelGene_136900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	3	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	120	608	434529	444679	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434409	446218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
870736	contig_13481_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_119314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGAAAATCTCAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260074	257885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_257900_260100
870737	contig_6823_pilon	+	4083	15	Intergenic	novelGene_131206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_11	52.771213937223	194	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	189	1754	102998	129629	FALSE	35	AGTTTAAATAGATTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNTVVGQTSWKPISNQSWDQKFTLELDRSRELEISVYWRDWRSLCAVKFLRLEDFLDNQRHGMCLYLEPQGTLFAEVTFFNPVIERRPKLQRQKKIFSIQQGKTFLRAPQMNINIATWGRLVRRAFLNHTGTFSPPASVPATVPVVDVRIPELAPPASDSAVTKLDFDFEPELPLAPLHASSLGEIDESTELRVLDTPRQDSATTFDIENDRNSILQKSQSEYELDIPQSGLDYSGIQEFEDRRSQQRFQFNLQDFRCCAVLGRGHFGKVLLAEYKHTNEMFAIKALKKGDIVARDEVDSLMCEKRIFETVNSVRHPFLVNLFACFQTKEHVCFVMEYAAGGDLMMHIHTDVFSEPRAVFYAACVVLGLQYLHEHKIVYRDLKLDNLLLDTEGFVKIADFGLCKEGMGYGDRTSTFCGTPEFLAPEVLTETSYTRAVDWWGLGVLIYEMLVGESPFPGDDEEEVFDSIVNDEVRYPRFLSTEAISIMRRLLRRNPERRLGASEKDAEDVKKQPFFRLIDWSALMDKKVKPPFVPTIRGREDVSNFDDEFTSEAPILTPPREPRILSEEEQEMFRDFDYIADWC	80313	131958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_80400_102895_103040_103358_103435_104169_104339_104564_104692_105329_105461_105547_105624_105699_105792_115564_115742_120621_120685_122169_122247_126563_126707_128943_129052_129256_129338_129425
870738	contig_10225_pilon	+	2065	14	Intergenic	novelGene_86793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	525.98218072276	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	97	1098	20776	42680	TRUE	55	AGGATAGATTATCAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20679	49257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46361_47078_47680_49228
870739	contig_11590_pilon	+	3365	1	Intergenic	novelGene_125566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTCCCAGCTTTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60618	63983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_60600_64000
870740	contig_9888_pilon	-	4081	1	Intergenic	novelGene_162280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAGGCCTTCCCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226459	222378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_222400_226500
870741	contig_11978_pilon	-	2678	8	Intergenic	novelGene_62861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	45.583294469508	463	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	279	1091	603912	600051	FALSE	25	ATGCAAAGTCCTGGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENQEQEEVITVRVQDPRVQNEGSWNSYVDYKIFLHTNSKAFTAKTSCVRRRYREFVWLRKQLQRNAGLVPVPELPGKSTFFGSSDEFIEKRRQGLQHFLEKVLQSVVLLSDSQLHLFLQSQLSVPEIEACVQGRSPMTVSDAILHYAMSNCGWVQEERQGSSHLAKGDQPKSCCFLPRSGRRNSPSPPPSEEKDHLEVWAPVVDFEAPSLESPTLPALSSPSHCDFARPDEGTSAGQPARRVMGGDQLASLSHAVPLDPGQLETVLEK	607187	598463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_600343_601085_601299_601508_601605_602843_602945_603271_603359_603888_603944_604905_604966_607000
870742	contig_11590_pilon	+	3750	6	Intergenic	novelGene_125585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_5	180.532102408408	357	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	411	1574	721633	750427	FALSE	45	ACATGGTTTTATGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAFLDKPKTEKHNAHGAGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVVGIPHGLEDWSFFAVYDGHAGSRVANYCSTHLLEHITNNEDFRAAGKSGSALEPSVENVKNGIRTGFLKIDEYMRNFSDLRNGMDRSGSTAVGVMISPKHIYFINCGDSRAVLYRNGQVCFSTQDHKPCNPREKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDYDYKCVDGKGPTEQLVSPEPEVYEILRAEEDEFIILACDGIWDVMSNEELCEFVKSRLEVSDDLENVCNWVVDTCLHKGSRDNMSIVLVCFSNAPKVSDEAMKKDSELDKHLESRVEEIMEKSGEEGMPDLAHVMRILSAENIPNLPPGGGLAGKRNVIEAVYSRLNPHRENDGGAGDLEDPW	670398	752603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_670795_721618_722479_730017_730136_737255_737368_737762_737821_750397
870744	contig_6027_pilon	-	3025	16	Intergenic	novelGene_74439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.6147536829353	8	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	491	2212	283869	263119	TRUE	10	CACTCTGTCTGTTCTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAVHLNSPEGEGTEETLERQADALAQAAGLLNAGRIGELHGHYLFVQPARHRQDQQVEAIRQQAEAVLARHEAVRWHSEQRLLKRSKRSIHFNDPKFPQQWHLNNRRSPGRDINVTGVWERNVTGRGVTVVVVDDGVEHTIQDIAPNYSPEGSYDLNSNDPDPMPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVMAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTESHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATQYEDRHADWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKVWTSVPYLASYVSPVLKENKAIPLSPRSLEVLWNVSRTDLDMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAKGTYRLIIRDVGDEPLQAGILWRWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDGFSLPCPPGLKIPEEDGYTITPNTLKTLVLIGCFTTFWTVYYMLEVYLSHRNVASDPVCRSGPCHWPQQSRKAREEGTELESVPLCANKDPDEVETESGGPPTASGPLTPDLLDQANWSLSQHIRSALDSPHQHLSPDLLQGKDEEQMC	288584	262064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_262640_262880_263491_263780_263899_264179_264274_265063_265159_265709_265867_275346_275450_275808_275917_276611_276780_279587_279689_280648_280788_281221_281277_282261_282353_283748_283915_284672_284808_288274
870746	contig_14925_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_55248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTGTATGTCCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100944	103253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_100900_103300
870747	contig_6823_pilon	-	3348	6	Intergenic	novelGene_131255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_5	129.037048943317	274	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	105	1058	486599	477800	FALSE	20	GCATTGAGTGAATTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPYCAAAPAAAAACTRVALRLRPAEPRAGARAAMSQAVQANGTQPLSKTWELSLYELQRTPQEAITDGLEIVVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCADCIITALRSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDALISKIYPSRDEYEAHQERVLARINKHNNQQALSHSIEEGLKIQAMNRLQRGKKQQIENGSGAEDNGDSSHCSNASTHSNQEAGPSNKRTKTSDDSGLELDNNNATVAIDPVMDGASEIELVFRPHPTLMEKDDSAQTRYIKTSGNATVDHLSKYLAVRLALEELRSKGESNQMNLDTASEKQYTIYIATASGQFTVSVQNHRLLKLGAH	521245	475509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_478017_478869_479143_481757_481974_482602_482764_486512_486602_521143
870748	contig_15400_pilon	+	3242	1	Intergenic	novelGene_175705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGAAGTTGACTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37326	40568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_+_37300_40600
870749	contig_5988_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_15981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	726	1049	653384	653707	NA	80	TTAAAAATAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELAVGASANFICKRKTKWPPIVNYLHKPISAAPQDRAAVPGPWDLTRAPEFNLPMTVGSRSTNTALGTCLPAPVSLKKVLKESSPPPMVLSLGIWPSGWMPCSKQ	652658	654846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652700_654800
870751	contig_10479_pilon	+	3502	13	Intergenic	novelGene_147093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_12	198.316595932419	327	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	664	1572	99841	155335	FALSE	5	TCTCTTCTCTGGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYSLSRKKIVHYTCFDQRKRANAAFLIGAYAVIYLKKTPEEAYRLLLSGSNCPYLPFRDASFGNCTYNLTILDCLQGIRKGLQHGFFDFETFDVDEYEHYERVENGDFNWIVPGKFLAFSGPHPKSKIENGYPLHAPEAYFPYFKKHNVTAVVRLNKKIYEAKRFTDAGFEHYDLFFIDGSTPSDNIVRRFLNICENTDGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYVMKHYRFTHAEIIAWIRICRPGSIIGPQQHFLEEKQASLWVQGDIFRSKLKNRPSSEGSINKILSSLDDMSISGNLSKIQNVERFGENNFEEDEDVEMKNGITQGDKLRALKSQRQPRSSPSCAFRLDDIKGQPRSASQPFRLSSSSQGSASSLKTSKGALSPSATAKRINRGSLSSGASVRSFSITSRLASSLGNLNAATDDPENKKTSPSSKPGFIASPFTNLLNGSGQPTARNYSELNNNQYNRSSSSSGSNMNSYPSPHGTKTEEHGSILRPSYTGLSSSSARFLSRSIPSLQSEYVHY	13877	157265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_13971_43646_43727_56852_56920_59896_59960_73277_73366_87722_87954_99799_99939_118371_118532_128741_128858_131539_131588_134286_134410_135148_135483_155305
870752	scaffold_880_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_121484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTTCTTCCCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494048	496000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_494000_496000
870753	contig_10253_pilon	-	1133	7	Intergenic	novelGene_76871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	347	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCTATCCTCTGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100309	46676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_-_46822_47120_47261_52946_53067_78972_79088_84015_84220_84983_85119_100035
870754	contig_3252_pilon	+	5827	1	Intergenic	novelGene_61480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1694	2011	178064	178381	NA	65	AAAAATAGAAACCAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTNRNLFSHSLGGWKSEFRAPTLGKGFLSLLALGEVLVTFQDPWARCSLEISMCLDINLPLGLGGSQHRHPRSKGRTSLPPLLGGSEVPPLSSRFSLLLSFIR	176370	182197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_176400_182200
870755	contig_13293_pilon	-	2045	2	Intergenic	novelGene_146432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	479	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCCCCCCTGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160953	155990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13293_pilon_-_157795_160712
870756	contig_16098_pilon	-	1570	11	Intergenic	novelGene_45963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1469.42610906435	23	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	378	1445	350768	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKSILSEPPAPPAPSSSSSSSSSVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354097	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352339_354026
870757	contig_9484_pilon	-	3765	1	Intergenic	novelGene_105666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	446	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTTATTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137433	133668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_133700_137400
870758	contig_3700_pilon	-	4717	1	Intergenic	novelGene_138084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3544	3882	261073	260735	NA	70	AGATGGAAAAAAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTSTCDCKRDTPAALQLGDLNGGVGRDLIMKKTEQGEVSPNGICFLSQCRECGLTITSVFFCQKNEFKMSWQRPHAKQWYLLSQTLCSKLEGCLSYTSHAKLGLTFCCCAH	264616	259899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_259900_264600
870759	contig_18420_pilon	+	2342	5	Intergenic	novelGene_109351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_4	39.717754216471	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2	439	101272	103753	FALSE	45	ACTAGAAAATTAGGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSPVVPQLVKKEKKKNKKDKKAKAALESGGELGDARKRESDSESDKETSQAVPQLVKKEKKNKKKDKKDKKAKAALESGGEPGDADSDTTKKKKKKKAKVSSE	101270	105656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_101313_101706_101756_102633_102775_103145_103296_103696
870760	contig_8598_pilon	-	8414	19	Intergenic	novelGene_22881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_8	109.417086259104	667	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	72	2645	88311	57188	FALSE	25	TAACTTCTAAGTTGTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLGPSRWTPKSPGRLTSARVYGMEAGSSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA	88382	51418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_57297_57536_57737_58050_58153_58757_58893_60788_60984_62044_62136_62335_62496_68255_68441_72099_72234_72364_72488_72814_72935_77816_77965_78635_78724_78868_79004_79220_79358_79750_79933_80406_80528_83019_83204_88286
870761	contig_11978_pilon	-	4205	1	Intergenic	novelGene_63126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1918719	1914514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1914500_1918700
870762	contig_5947_pilon	+	1254	2	Intergenic	novelGene_101500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	202	1026	401031	406182	FALSE	15	CCCTCTCTCCATCTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGNVCRQNCSLSRYLQLNLKHYCQQLQ	400829	406410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_401644_405970
870763	contig_501_pilon	+	7330	1	Intergenic	novelGene_134894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCTGCTTAGAGAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734075	741405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_734100_741400
870764	contig_7357_pilon	+	2443	14	Intergenic	novelGene_36873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	95.3085304489129	855	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	601	1803	250864	273311	FALSE	40	AGAGGAATCATTCCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHITINQYLQQVYEAIDSRDGTSCAELVSFKHPHVANPRLQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250263	273951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
870765	contig_9548_pilon	+	4075	5	Intergenic	novelGene_141082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	48.432298107771	664	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	103	1821	308859	321224	FALSE	30	TTTTAACAATGTTTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIYAHKVVLASISPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCHDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLCAVGGKSGLFTCLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIETNVLRAGITVRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDVWLDSAGMIYCRCNFGLTAL	296610	323478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_296713_308858_309758_317580_318028_319956_320166_321060
870766	contig_9363_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_6566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTTATATATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755588	753392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753400_755600
870767	contig_5643_pilon	+	4562	18	Intergenic	novelGene_38768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	18.2913748653202	366	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	28	2376	220203	228299	FALSE	20	CAATAGTTGTCCTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENDELVKQEMLVQYLQDAYNFSLKITEAIGIISTMMYESTTTVVQEVIEFFVMVSQFGVPQALFGVRRMLPLIWSKEPGVREAVLNAYRQLYLNPKGDSARAKAQALIQNLSLLLVDASVGTIQCLEEILCEFVQKDELKPAVTQLLWEQATEKIPRSPLERCSSVMLLGMMARGKPEIVGSNLDTLVSIGLDEKFPQDYRLAQQVCHAIANISDRRKPSLGKRHPPFRLPQEHKLFNRLREMVTKGFVHPDPLWIPFKEVAVTLIYHLAEGPDVICAQILQDCAKQALEKLEKSPSQEDLKETPMLPTYLLMNLLSLAGDVALQQLVHLEQAVSGELYRRRVLREEQEHKTKGPKEKNTNSDTTIEEELGLVGATADDTEAELIRSICEVELLDGKQVLAAFVPLLLKVCNNPGLYSNPDLSAAASLALGKFCMISATFCDSQLRLLFTMLKKSPLPIVRSNLMVATGDLAIRFPNLVDPWTPHLYARLRDPAQQVRKTAGQVMTHLILKDMVKVKGQVSEMAVLLIDPEPPIAALAKNFFNELSHKGNAIYNLLPDIISRLSDPEGGVEEEPFHTIMKQILSYITKDKQTESLVEKLCQRFRTARTERQYRDLAYCVSQLPLTERGLGKMLDNFDCFGDKLSDSAIFSAFLLIVGRLRRGAKPEGKAIIDEFEQKLRACHTRGGDVLEELETGQGGSQRAPSGTKKQSAVSRHQHVASAASDDDFVTPEPRRTARRHPDTQQQASKKKLKIVFSSDESSEEELSAEMTEDETPKKTTPIRRASTRRHRS	220175	230485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_220303_220613_220789_221121_221207_222886_223021_223375_223509_223606_223692_223768_223934_224281_224452_225200_225313_225387_225512_225592_225749_226087_226266_226351_226447_226947_227029_227190_227375_227565_227696_227797_227954_228213
870768	contig_20969_pilon	-	4316	2	Intergenic	novelGene_121250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	0	156	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1512	2180	12975	11367	FALSE	40	CCTACACAAATGAAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPQSVFIFAICILMITELILASKSYYDILGVPKSASDRQIKKAFHKLAVKYHPDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTNGKGQRDSGSPFEQSFNFNFDDLFKDFGFFGQNQNTRSKKHFENHFHTRQDGSSRQRHHFQEFSFGGGLFDDMFEDMEKMFSFSGFDSTSQHTVQTEKRFHGSSKHCRTVTQRRGNMVTTYTDCSGQ	14486	9230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20969_pilon_-_11819_12758
870769	contig_11396_pilon	-	1680	12	Intergenic	novelGene_71254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	446.688032464613	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	94	1563	155228	121478	FALSE	10	GTCAGGGTGGTGACTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAEGFCSFAAAAAAAAASVLPFPAFGITAAMNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARELWCAVSKDIANWQKKIGEVLVLVAARIKNTF	155321	121360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121574_138016_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144292_146250_146407_146608_146786_147254_147334_147886_148006_153256_153426_155157
870770	contig_11978_pilon	-	1689	10	Intergenic	novelGene_63121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_9	56.2522976211134	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	239	1069	1979308	1894713	FALSE	0	CCTTTTTGTGTCTCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGTHCPDLVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLR	1979546	1894092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1894848_1900191_1900267_1901514_1901642_1903702_1903799_1918757_1918827_1919301_1919397_1920809_1920885_1925532_1925588_1940593_1940656_1979266
870771	contig_6654_pilon	+	2730	6	Intergenic	novelGene_85707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCGCCCTAGAGCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163242	469179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_165372_194550_194642_242423_242498_281031_281128_307583_307733_468988
870772	contig_16703_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_72791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	118	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTGTCTTGAGTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42510	44831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_42500_44800
870773	contig_7179_pilon	+	2481	1	Intergenic	novelGene_78094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCCATATCTGGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597700	600181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_597700_600200
870774	contig_5253_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_61541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56858	54259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_54300_56900
870775	contig_6958_pilon	-	2176	5	Intergenic	novelGene_69947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	496.818062775499	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	158	1393	190008	149618	FALSE	15	CCGGGGGCAGTCTTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190165	148834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
870776	contig_9839_pilon	+	3125	6	Intergenic	novelGene_88505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1754.34621440581	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2597	3085	52079	58040	FALSE	40	AAAAACTACAGTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTCLYSFRFGRLGEGKGYERKGDYMAEINVLGFGIISQ	45345	58080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_49724_52202_54064_54122_57651_57850_57929
870777	contig_9440_pilon	+	3003	7	Intergenic	novelGene_59086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_5	38.7800063033632	569	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	133	1146	1663420	1694219	FALSE	15	CTGGAAGGTTGTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPWPPPGLWSLPRSEGEAEEESDLDVSPGSPRCSQLPGGGAQIYSHGIELACQKQKEFVKNTLACKWNLAEAQQKLGSLALHNSESLDQEHAKAHTAVSELRQREEEWRQKEEALVQRERMCLWNTDAISKDVFNKSFINQDKRKETEDEDKSKSFMQKYEQKIRHFGMLSRWDDSQRFLSDHPYLVCEETAQYLILWCFHLEAEQKGALMEQIAHQAVVMQFIMEMAKNCNVDPRGCFRLFFQKAKAEEEGYFEAFKNELEAFKSRVRLCSQSQSFQPMTVQNHVLQSGVGSIGLLESLPQNPDYLQYSINTALCSLNSVVHKEDDEPKMMDTV	1663287	1696076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1663552_1667568_1667851_1671830_1671925_1678463_1678580_1679330_1679454_1687803_1687969_1694117
870778	contig_10003_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_88203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1434	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTGATTTCATCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505259	502522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_502500_505300
870779	contig_5671_pilon	+	2485	6	Intergenic	novelGene_79433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2088.44123690373	8	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	82	534	370430	531072	FALSE	40	ATAAGTGATGATAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEVKVYIHNTKEIVQEFKLGLC	368843	533023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521364_531070
870780	contig_1443_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_28213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	153	145	297	344440	344592	NA	25	CTAATGAGTGAGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344295	344894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344300_344900
870781	contig_6595_pilon	-	4364	14	Intergenic	novelGene_122528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_1	74.6272789885225	107	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	686	3304	617546	323899	FALSE	55	TAATGCCTGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLIVKLRRSFRTLIVLLATFCLVSIVISAYFLYSGYKQEMTLIETTAEAGCADLKILPYRSMELKTIKPIDTSKTDPTVLLFVESQYSQLGQDIIAILESSQFQYHMVIAPGKGDIPPLTDNGKGKYTLVIYENILKYVSMDSWNRELLEKYCVEYSVSIIGFHKANENSLPSTQLKGFPLNLFNNLALKDCFVNPQSPLLHITKAPKVEKGPLPGEDWTVFQYNHSTYQPVLLTELQTEKSLPSLSSKTFYATVIQDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWLHKLIFIDAISFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNVKDVKALLETQNLLRTQVANFTFNLGFSGKFYHTGTEEEDEGDDLLLQSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKEFALEHGIPISMGYAVAPHHSGVYPVHIQLYEAWKKVWDIQVTSTEEYPHLKPARYRKGFIHNSIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYPGGPQELDKSIRGGELFLTILLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVQSWTNLRLQTLPPVQLARKYFELFPEQKDPLWQNPCDDKRHKDIWSREKTCDHLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLLMHPSIISNLPSPKTFEEVQFFNGNNYHKGIDWYMDFFPTPSNITSDFLFEKSANYFHSEEAPKRAASLVPKAKIITILIDPSDRAYSWYQHQRSHEDPAALRFNFYEVITTGHWAPPDLKTLQRRCLVPGWYAVHIERWLTYFATSQLLIIDGQQLRSDPATVMDEVQKFLGVTPLYNYSEALTFDPQKGFWCQLLEGGKTKCLGKSKGRKYPPMDPESRTFLSNYYRDHNVELSKLLHRLGQPLPSWLRQELQKVR	650052	322838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_324019_326320_326424_331729_331840_332778_332950_342380_342556_345485_345610_350494_350592_371356_371540_437508_437638_440561_440748_483005_483161_489062_489151_616568_617793_649613
870782	contig_10523_pilon	-	2595	7	Intergenic	novelGene_120923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.382466606375	41	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	278	1045	26656	15001	TRUE	5	CAGGTTGTGTCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39393	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13107_13828_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_39162
870783	contig_7840_pilon	+	4953	1	Intergenic	novelGene_68997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTAGCATTTTCAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261452	266405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_261500_266400
870784	contig_19012_pilon	-	2594	1	Intergenic	novelGene_159491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGCCAATATCATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94882	92288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_92300_94900
870785	contig_12425_pilon	+	2552	4	Intergenic	novelGene_46638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	209.933322747962	35	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	78	575	167145	198400	FALSE	40	TTGGGCATTAAATACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167067	200377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_175556_175636_198178
870786	contig_12425_pilon	+	805	3	Intergenic	novelGene_46630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	159	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	153	626	167145	198400	FALSE	20	CATTGCCCTCAGCAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVKCLGRPEEFYNLLRFQMGSIRKVIPQIDKVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	166992	198579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_190682_190836_198178
870787	contig_12425_pilon	+	865	4	Intergenic	novelGene_46631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.320851173921	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	304	675	190686	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167008	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167236_181752_181826_190682_190836_198178
870788	contig_12270_pilon	-	348	2	Intergenic	novelGene_113753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	16	348	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14424	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
870789	contig_5472_pilon	-	2820	11	Intergenic	novelGene_130032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	73.783195918854	209	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	445	2013	449344	417222	TRUE	20	ACTATATTTGGTATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKVAAVSTVVNKGVTPKAFVFRNYGHFPGINSHYLGGCQYKLWQAIRASSAAPGYFAEYALGNDLHHMDIQFCQHRLLKRLSFPHLMDFGPLSKIR	456345	401994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_417215_417312_421983_422179_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449664_456220
870790	contig_16385_pilon	+	1875	16	Intergenic	novelGene_86183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	341	junction_8	143.183735885827	1	90	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	49	1707	3004	36650	FALSE	40	TAATGATTAAAAGTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
870791	contig_16492_pilon	+	3694	9	Intergenic	novelGene_100278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_5	82.4378553820998	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	1627	3141	78509	100411	FALSE	55	AAAAATTAAAATATGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQEATNQLLDVNLFENQRFVKVTESGHRSESEHLEVTVGATVPTGFEQTAADEVREKLGSSCKISKDRGKIYFDISVESLAKVHCLRSVDNLFVVVQEFKDYQFKETKEEVLKDFEDLAGKLPWTDPLKVWKINTSFKKKKAKRKKVNQNSSKGKINNGQGEKIDERDVKKEFTSNAVEPHILDYYENPAIKEEISTLVGDDLASSKEEETDESSKEETDHRVLKFRVTCNRAGEKHCFTSNEAARDFGGAVQDYFKWKADMTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76882	100964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_78764_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99979_100104_100258
870792	contig_8020_pilon	+	2535	3	Intergenic	novelGene_114416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	883	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTAAAATACAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208631	302691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_208987_246161_246624_300973
870793	contig_614_pilon	-	2270	4	Intergenic	novelGene_132625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1664	1981	619462	619145	TRUE	25	CCAGAGGCTCTGAGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQPLYPSWKGPQFTGEDGQRKNSLEHQEQGHLGCTQGPCPGGEPQGWEEQAGPDGSCSTARAQTRAVMFVGEPAAECSMLTWHIGDTVALWCLMSSLRTGTGNL	641291	588663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_588747_618938_619690_619757_619989_640086
870794	contig_14876_pilon	+	4310	1	Intergenic	novelGene_170248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	324	975	49	1023	199451	200425	NA	35	CACCAAACGTAAGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDRTNIISKPVPQTLIMAYDYAKEVNSAEELEGLIADPDEMRMQALLIRERILGPSHPDTSYYIRYRGAVYADSGNFKRCINLWKYALDMQQNNLDPLSPMTASSLLSFAELFSFMLQDRAKGLLGTTVTFDDLMGILCKSVLEIERAIKQTQCPADPLQLNKALSIILHLICLLEKVPCTLEQDHLKKQTIYRFLKLHPRGKNNFSPLHLAVDRNTTCVGRYPVCKFPSLQVTAILIECGADVNVRDSDDNGPLHIAALNNHPDIMNLLIKSGAHFDATNLHKQTASDLLDEKEIAKNLIQPINHTTLQCLAARVIVNHRIYYKGHIPEKLETFVSLHR	199402	203712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_199400_203700
870795	contig_11448_pilon	+	5749	1	Intergenic	novelGene_66409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3976	4299	520913	521236	NA	70	AAAAAAAAAGAAGTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLLIFSPISHISNLLPLTDKLTFSSFLYSSCSCRRAAARRRSKIEAMNGQEIPLESMNLRQPVHFCPSVLFFKTQFHIHPLAHSPQCSTWNHLPLHLTNYSGKLI	516937	522686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_516900_522700
870796	contig_14727_pilon	-	4753	11	Intergenic	novelGene_56687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_9	33.5781178745921	94	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	124	1548	472609	449689	FALSE	45	CACACACAGATTAGTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLISCSGAKGSLVLADGKGDLKFHVTADPFKVDLVSEEDIVMSVNSLGQLYFEHLQISPKQRATKENEDDASVDTSQENQNDMGLWEEKFGKFVDIKANGPASIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDVYGYKIHDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTLGIFWLNASETLVEVNTEPTVEYTLTQMGSVAAKQKVRSRADVHWMSESGIIDVFLLMGPTPSDVFRQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDVMWLDIEHTEGKRYFTWDKKRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHVKVDPDYSVYAKAKEQGFFVRNREGGDLEGVCWPGLCSYLDFTNPKVREWYSGLFAFPVYQGSTDILFIWNDMNEPSVFRGPELTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFYQQMATAEGLIRRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGKEWLIIRPKTQVSNQSLWTIYGICCCCMPTLLVAIGQALDCRE	472732	446483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_449920_451013_451158_452628_452709_453637_453765_457077_457314_459642_459797_460006_460188_461275_461373_462774_462842_465012_465059_472547
870797	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_92135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657508	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657508	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
870798	contig_9609_pilon	-	1384	14	Intergenic	novelGene_23009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328311	314143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_314431_317882_317951_318438_318513_320953_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322761_323228_323360_323982_324070_324250_324327_324406_324476_325130_325224_325931_326020_328272
870799	contig_9304_pilon	-	2545	5	Intergenic	novelGene_177834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1932	2243	15331	1802	TRUE	15	CAGTTTTTTTTTGATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLSNITPDSRRLCSACWINFHIRSITVGGSGGSAVEFLPSMRENFLLTLHVHHGSATVLLLVFPSGPGMMEQPVSGTLLVVMLGLLGTLSLSGIVFEKRL	17262	1394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_-_1644_1748_1857_13630_13747_14773_14833_15249
870800	contig_4531_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_47945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGACTTGAGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758335	755786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_755800_758300
870801	contig_15491_pilon	-	2304	6	Intergenic	novelGene_75976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	179.978443153618	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	74	784	87711	80881	FALSE	45	ATAAACCATAATTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLILKSPPWLHHQLRNLTLHRNSSRKPVPIPVSHSGWGCLSENPTTRGSGKMVLLGCLICLDSRVLPRSTLQVPVRTYKGELFMQTTAF	91338	79360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81409_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
870802	contig_15384_pilon	+	3671	1	Intergenic	novelGene_85153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCAATGTCATAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121602	125273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_121600_125300
870803	contig_7457_pilon	+	2453	8	Intergenic	novelGene_31343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_6	255.825514516342	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	723	1814	285206	290630	FALSE	10	TGCACTGTTGGGTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	284483	291269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
870804	contig_7775_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_37464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGGTGAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78471	79961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_78500_80000
870805	contig_2450_pilon	+	5692	5	Intergenic	novelGene_160317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3933	4244	782195	782506	TRUE	15	GTGGAAGCCCCCGTGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKQNLSLNPFCILRLRRAVLVTTALGDGASSLNFERYSMFEVAKHPKATSSSFKLTCPKQMRPPNLKGSLHHSATFKYLWQASMSKTQVALVLVHFPSLLR	778262	847266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_783298_785500_785664_811299_811403_819135_819262_847001
870806	contig_4315_pilon	+	2738	1	Intergenic	novelGene_46822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	474	995	353132	353653	NA	35	AAGGAGTCCCAGTAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIMESQAGAVCCKRRCCVWDSLVLQQMKIQGLSYWRWSSCLEAPWASPKLGSTLSWSCGMSRPACTRPSKDSTWTWGGEGTCSINLDSGGWVLQTPTSATSTVLHEKLGLASGWGLSVNHREAGAGNRLYPWPWPGSPGEELCSIEFSVADFSKWNPHEFMDSKAHLLMSR	352658	355396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_352700_355400
870807	contig_3111_pilon	+	3382	20	Intergenic	novelGene_129957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	881	1384	16543	18964	TRUE	25	TGTGGTGGGCAAGTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGVGGRQLRPALCQVLEGIQVEGCVQEALQLCQVGLLVAGGWSSRRVPASIPDRPGAVDGCPEPGFHVVVVALVLVLLLAPGQLSIGVLLHLLQQEVKGERGELLDSCNGHLFHHVASCALSGEVIVGRAVFWDHPLEVGSWKHFIEVGSGFRVTQQGLWSEDD	15662	48624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_16709_16818_16971_17182_17254_17304_17346_18890_18965_20072_20202_20919_20991_21571_21749_21844_21975_22230_22381_22758_22892_23188_23288_24063_24209_24752_24953_37546_37674_39261_39443_39963_40058_40851_40999_41520_41682_48570
870808	contig_5718_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_110421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCACCTGGCAGTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1460259	1462749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1460300_1462700
870809	contig_7376_pilon	+	2365	6	Intergenic	novelGene_108081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	33.5654584357193	209	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	261	923	102857	112881	FALSE	50	TTTGGTTACTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVKKRTKTPTDIYPVETLVNMSLNPSRPSSSEVVELHVFYVPEGSWNYKLNTISKEVVNKFISAGFIRVSPQLTLQALRESLGEFLGEDAVAEKFLFLKCIGNNLAVVKAKQESELKLKSFAPPYALQPELYLLPIMDHLGNIYSASSTVALDGQQTNNGVTQADGTVHRPVSVTLSKEKPGTDPSLLENTLKELLNKNQEEGDFNWIGKERGYYSSF	79954	114323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_80138_102779_102959_104743_104851_108846_108965_112441_112496_112599
870810	contig_9833_pilon	+	1447	2	Intergenic	novelGene_68561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	485	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCTGAGTGAAAGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254260	257692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_254811_256795
870811	contig_7744_pilon	+	1912	14	Intergenic	novelGene_62530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	83.4968021922478	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	100	1386	825487	830740	FALSE	60	ACTGAAATAAGTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825387	831266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
870812	contig_854_pilon	-	2007	8	Intergenic	novelGene_36398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1459.45019001775	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	558	1007	980854	975852	FALSE	40	GTACATTCTAAAGTAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPPLEPSTRYWARVRVKPTLSSYNGIWSEWSEECSWDTEWVLPTWVLVFMLVLITLALLPMLRFCFVYGYRLNQKWKEKIPNPSKSHLFQNGSAGLRLPDSTSTFTSRSLLYKGPWDSHVPELEGVFPAHCGDSEVSPLTTENPHLL	1001725	974851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975870_978034_978087_978787_978892_979721_979780_980008_980100_980727_981244_993176_993301_1001681
870813	contig_7119_pilon	+	3617	12	Intergenic	novelGene_40861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	332.749800528965	3	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	33	1457	55132	112892	TRUE	25	AAACTCCTAGATCGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSFPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVRKNILDNKPTANKKCDLINVPKKTADMASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA	27610	115128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_27638_55126_55327_77981_78105_90791_90922_95067_95250_98276_98397_99516_99622_102234_102381_111479_111538_111632_111879_112772_113563_113638
870814	contig_7019_pilon	+	3568	14	Intergenic	novelGene_149470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	160.991087261111	246	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	130	1368	1302679	1386324	FALSE	30	TTTTATCTAGTCATCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPPPGEESQTAVLPPGWQSYLSPQGRRYYVNTTTNETTWERPSSFPGIPASPGPQRSALPPTVNGYHVSGTPAHPPETAHMSLRKSTGDSQNLGSSSPSKKQSKESTITINCVTFPHPDTMPEQQLLKPTEWSYCDYFWADKKDPQGNGTVAGFELLLQKQLKGKQMQKEMSEFIRERIKIEEEYAKNLAKLSQNSLAAQEEGSLGEAWSQVKKSLADEAEVHLKFSAKLHSEVEKPLMNFRENFKKDMKKCDHHIADLRKQLASRYAAVEKARKALTERQRDLEMKTQQLEIKLSNKTEEDIKKARRKSTQAGDDLMRCVDLYNQAQSKWFEEMVTTTLELERLEVERVEMIRQHLCQYTQLRHETDMFNQSTVEPVDQLLRKVDPAKDRELWVREHKTGNIRPVDMEI	1295294	1388524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_1295415_1302669_1302791_1331686_1331768_1341391_1341478_1353288_1353343_1360017_1360108_1362378_1362495_1365907_1365983_1371658_1371738_1379119_1379249_1381213_1381338_1383803_1383884_1385409_1385509_1386210
870815	contig_7513_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_89025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCACTCATGTAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686113	688747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_686100_688700
870816	contig_8978_pilon	-	2412	2	Intergenic	novelGene_49309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTTGTGTGGAGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136227	132758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_133581_134637
870817	contig_9730_pilon	-	2689	6	Intergenic	novelGene_150624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	15.1261363209512	428	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	63	1151	410322	375483	FALSE	40	TTACAAAATGCAGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFGRSRDHRLSPYGCSREIMTGKKSSREKRRKRSSQEAAAAVSAPDPVPILASSGSGSTSGCGSTSGCGSVTCCGNTSFSGSVTGGGSVGSCWGGSSVERSERRKRRSTDSSSSVSGSLQQETKYLLPSLEKELFLVEHSDLEEGGLDLTVSLKPVSFYISDKKEMLQQCFCIIGEKKLQKMLPDVLKNCSIEEIKKLCQEQLELLSEKKILKILEGDNGMDSDMEEEADDGSKTGSDLVSQQDICIDSASSQRENKQPEGLELKQGKGEDSDVLSINADAYDSDIEGPCNEEAAAPEVPENTVQNEAGQIDDLEKDIEKSVNEILGLAESSPKEPKAATLTVPPPEDVQPSAQQLELLELEMRARAIKALMKAGDVKKPA	410384	373944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_375830_389298_389373_403008_403085_404009_404095_404952_405154_410016
870818	contig_6316_pilon	+	3342	10	Intergenic	novelGene_134704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	138.461208187851	72	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	2708	3235	149302	157164	FALSE	35	CAGTTAAGTGTAAATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136294	157271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_145291_147170_148632_148750_148840_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
870819	scaffold_12124_pilon	+	1881	8	Intergenic	novelGene_22056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	506.002379602374	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	114	1025	836073	858123	FALSE	30	AACTGGCGTCTTCTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDNPMCYGIEPSLLGFSWL	829631	858979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847726_858070
870820	contig_16411_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_77298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAACAATAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86457	85825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_85800_86500
870821	contig_5261_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_102487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTAAAAACAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750325	749918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_749900_750300
870823	contig_3942_pilon	-	1610	1	Intergenic	novelGene_128611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	939	1304	139367	139002	NA	75	CTCAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLLCPALWGICGSVSDGVWVLWTCCGHPHCLQLQDHQSSQDLGCQGVYSWGCASAMRALNGCLEYNKRLIHSGCLYLCAWWVCLVGHLAGRECAGVFTQRGRGFSGVPPTHPESRSVPR	140305	138695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_138700_140300
870824	contig_20614_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_107539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATTTAAAAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88569	89391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_88600_89400
870825	contig_19352_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_122387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAATAAAATAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148403	146382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_146400_148400
870826	SIRV6	+	1029	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	21	38	14	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	194	685	1733	10736	TRUE	35	GTTGGTAACAATGTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1151	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
870827	contig_11815_pilon	-	3254	7	Intergenic	novelGene_50912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	222.214173465351	131	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	163	648	201922	190956	TRUE	30	AGTAGAACTGCCCCACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQFGPSALINLSNFSSIKPEPASTPPQGSMANSTTVVKIPGTPGTGGRLSPENNQVLTKKKLQDLVREVDPNEQLDEDVEEMLLQIADDFIESVVTAACQLARHRKSSTLEVKDVQLHLERQWNMWIPGFGSEEIRPYKKACTTEAHKQRMALIRKTTKK	217104	188254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_190538_190632_190992_192707_192797_196139_196255_199989_200068_201754_202007_217026
870828	contig_1596_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_131588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAAAAAAGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98032	95437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_95400_98000
870829	contig_12654_pilon	-	2764	1	Intergenic	novelGene_129337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAGAAGAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826634	823870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_823900_826600
870830	contig_19816_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_156457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTAACTCATCTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23072	24631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_23100_24600
870831	contig_9708_pilon	+	2509	3	Intergenic	novelGene_67240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCAGATCAAACCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17741	40141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_19689_19930_20428_40076
870832	contig_7744_pilon	-	2510	12	Intergenic	novelGene_62500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.5965628498657	5	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	483	1157	803744	801765	TRUE	35	ATTAAATATCTTCAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFEAPSGERPRRRAAQVALLYLQELAEELSTALPAPVSCPESSKLSSPTKLKKSQADADPQGGGGEDDTAQDEDFVLQVEAEDEEESEIPSESSSDPEPAVLAVPQVPTVSAVPQVPAVPEVSTVPAVPAVPRSAPRGSTSGKQKPHCRGVAPNGLPNHIMAPVWKCFHLTKDLREQKHSYWEFAEWIPLAWKWHLLSEIEAAPYLPQEEKSPLFSVQREGLPEDGTLYRINRFSSITAHPERWDVSFFTGGPLWALEWCPVPEGATASQYVALFSSPDMNETHSLSQLHSGPGLLQLWGLGTLQQESCPDNRAHFVYGIACDNGCIWDLKFCPSGAWELPGTPRKDPLLPRLGLLALACSDGKVLLFSLPHPEALLAQQPPGE	806689	795521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_796491_798219_798315_798409_798555_800374_800515_801760_801882_802094_802207_802379_802608_803112_803212_803357_803436_803703_803799_805487_805864_806637
870833	contig_13780_pilon	+	3102	2	Intergenic	novelGene_149013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	0	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTTCTGCTGCTTGCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288636	295834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_288683_292778
870834	contig_5732_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_119601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGCAGAAGACCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355240	357947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_355200_357900
870835	contig_14925_pilon	-	1004	5	Intergenic	novelGene_55107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	1545.02928774829	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	209	466	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGNKLIFGTGTLLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	67878	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_67822
870836	contig_6397_pilon	-	4330	12	Intergenic	novelGene_146258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_11	104.272449868855	356	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	261	1352	554772	463994	FALSE	40	CCTAGCAAAGTAAGCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQKFVEDDNYKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLLGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPPSPRNLIPHGHRKCHSLGYKSAFLNFIFQIFKLYII	601763	461015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_464182_467269_467338_473916_474008_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601589
870837	contig_854_pilon	+	1372	7	Intergenic	novelGene_36283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2810.57461503278	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	37	606	543600	562402	TRUE	35	AATATAACTTCAGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AITTATPQAPDTMQAIKCVVVGDGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543563	563793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545925_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
870838	contig_12977_pilon	+	1880	15	Intergenic	novelGene_122770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_13	575.526076999229	2404	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	466	1485	10887	57283	TRUE	0	TTTCTCCTTGGCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLQFKDAFWCRDFMAHVGYEVLLQRLLDGRKMCKDVEDLLRQRAQAEERYGKELVQIARKAGGQTEINSLRASFDSLKQQIEHVGTSHIQLALALREELRSLEEFRERQKEQRKKYEAVMDRVQKSKQSLYKKTMESKKTYEQKCRDADDAEQVFERISANGQQKQVEKSQNKAKQCKDLAMEADRVYKQNIELLEKVRVEWEQEHRTTCEAFQLQESDRLIILRNALWVHCNQLSMQCVKDDELYEEVRLTLEGCSVDADIDGFIQAKSTGTEPPAPVAYMNYYDREVAPSGSPNTQTSCGMIKRFSGLLHASPKMASTTAPAASRETPTPTPREE	10421	58796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_10920_37065_37167_38198_38274_46988_47024_47258_47366_48699_48763_49441_49541_50572_50619_51649_51730_52347_52447_53532_53630_54013_54102_56950_57007_57242_57378_58495
870839	contig_13850_pilon	+	2463	4	Intergenic	novelGene_141166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.8020978764505	310	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGTCTTGTTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31977	51249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_+_32002_44428_44466_46851_47063_49058
870840	contig_1867_pilon	+	1826	2	Intergenic	novelGene_54590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGAAGCGCTGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498262	503129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_500033_503073
870841	contig_1154_pilon	+	3209	8	Intergenic	novelGene_87213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	45.453272709454	181	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	132	2492	1626711	1658602	FALSE	10	TGTCACTCTGGTGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQDTEKCRVRARRPDMALYVPKARRGAVHSKAGDEEKSYGPPNSVVKEEQKEHFVSQKEMFRDRPEARRLDINPDRKEQNRREGKKSLTKLKKDKCLQERHKNKVYIKRGTTECKEILSQGHQQRVPNPEIISSVPLQKHFKPKKVECLEVETTDVTGHENLLLSQSCSEVSEAQVLTKPFQNVKLCDFSRHGLNGGMFEDRELESRIETDSKVVEIVSQFPGGFSSALKLEDMLAPPKLNSDSGLVQEDMQTSGEMLKISDGGITAISVLGSSDSIIDQTCVDFEVQTVGDMDNSTCFILSQKSMDSIPEAMGHSTYKMPIVSKLENTNGIFDPTMITECERNDSIADEICVKYGPSDTATLAHETYSDNGSNSVGDITSKVCVMDVTDVISENVTVDSPCVVTVRIVDEACSNTNSFSKHTEMSADTAPLHVAKSGNNTENSNNLTDCSDIYAESIPSSFTESTGKLIESLSDCASSLPIKKIAGINYNTCLDSELSMLNWTKVLSDSALGKDLDCAGHITETLHELRTAEEFKTKEEDDSENITFDVSFPDVESVSVETSMEPKATETSYMEGSTDTEESWESMFNDDGDCLDPRLLQELSGNVKSREGIQEPRFDYYNHEVPDIDLSDCEFPHVIEIYDFPQEFRTEDLLRVFCSYQKKGFDIKWVDDTHALGIFSSPVTARDALGSKHTMVKIRPLSQATRAAKAKARAYAEFLQPAKERPETSAALARRLVISALGVRSKQSKTEREAELKKLQEARERKRLEAKQREDIWEGRDQSAV	1569039	1659319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1569056_1588772_1588874_1626696_1628520_1642448_1642625_1648792_1648864_1649783_1649880_1650583_1650725_1658534
870842	contig_7527_pilon	+	3524	5	Intergenic	novelGene_139566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	902	junction_4	1108.41598689301	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1387	1983	86361	94676	FALSE	55	AAAAAAAGACTCATTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDAFLFLSFLREGPRYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKVILRVLFPLLSNSHTSFGKALAVCFWGI	80175	96217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_86519_89859_90038_94415
870843	contig_8464_pilon	-	3248	1	Intergenic	novelGene_125413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	266	801	378	1178	946725	945925	NA	30	CATGAAGTTTTTCTGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWRSDIFPLSTLLNNSNTSHPSHGLSVSLLGSVIHCSDHTEVTVTGFIRKVTGYHSGSGKTQDIVLRLAQPLLSRAAGRPLSGPWPLGPSARPLPCLGKCYEAPPVSAQRQPTLPGSLCLKVLSSLALWAGKPGSTDKCLEVPHSANKPPAQRFSALSLLGPGSPPHHLLLVSRFCLCCCFLPSPMLQVSLSPGSRRFLAQGSWVQRTCSAFSSSFLVMRSPFPLLAHFKPSGMAKLTNLLVRVPYTLFAWPHPSRGCHTPYLHY	947102	943854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_943900_947100
870844	contig_8322_pilon	+	2028	9	Intergenic	novelGene_143250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_4	409.027638888865	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	79	1074	292682	300333	TRUE	20	ATGTAGTCAGCACTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLAFAAN	292603	304984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_292713_293832_293992_294461_295076_295472_295648_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
870845	contig_8978_pilon	+	3408	1	Intergenic	novelGene_49310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCCCCGAGTCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132826	136234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_132800_136200
870846	contig_8773_pilon	+	6224	1	Intergenic	novelGene_74534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGCCAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145555	151779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_145600_151800
870847	contig_7410_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_106055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGGGAAGCAGAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105367	106231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_105400_106200
870848	contig_5050_pilon	-	2605	9	Intergenic	novelGene_110294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_8	180.095634316882	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	189	1415	716384	623071	FALSE	60	AGTAAAAAGTTGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRLPPARLSGVMVPAPIQDLEALRALTALFKEQRNRETAPRSIFQRVLGILKKSSHDIELACRDPSQAEHVASSLQLITECFRCLRNACIECSVNQDSIRNLDTIGVAVDLILLFRELQTEQESLLTAFRCGLQFLGNVASRNEESQSVVWAHAFPELFFTCLNHHDKKIVAYSSMIMFTTLNLERMNELQETLNIAISVIEAHQKQPESEWPFLVITDHFLKSPELVKAMYAKLTNQERVTFLDLMIAKIVGDDPLTKDDIPVFLSHAELVAATFVDDCRSVLKLTSEHQTEDEEVLAIIRLLDVLCEMTANTDLLTYLQGFPGLLERVIDLLRLVHVAGKDTTNLFATTGCVKAESDISSVADGFKSHLIRLIGNLCYKNKENQDKVRLFLSVYHTYMASFRI	716572	621880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_623295_625244_625354_635964_636131_646842_646924_671150_671310_673586_673684_681394_681478_690381_690574_716268
870849	contig_15031_pilon	-	3617	1	Intergenic	novelGene_138419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGGGAGAGAGTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147842	144225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_144200_147800
870850	contig_9272_pilon	-	4031	1	Intergenic	novelGene_125888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAATTCTAGGTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231257	227226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_227200_231300
870851	contig_2078_pilon	+	2636	1	Intergenic	novelGene_100159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	995	1450	389205	389660	NA	20	CCTCACAGTTTGTCCGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKEHGIRTGGRLINNLQYADDTTLFAESEEDLKHLLIKIRYYSIQYGLHFTMKKTKILTTAPISNVMINGEKIKVCKRFHFTWIHNECPWSSSQEIKQHITFGKSAAKNLFTVLKCKDVTYKTKVHLTQAMMFSIASYACESWKINNED	388210	390846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_388200_390800
870852	contig_1321_pilon	-	3585	15	Intergenic	novelGene_176541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_10	66.1014989487024	172	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	58	2040	114094	61145	FALSE	20	ATAGATGGATCGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APERGGQWLPAVPSVRGAVMQENLRFASSGDDIKIWDASSVTLVDKFNPHTSPNGVSSMCWSSNNNFLVTASSSGDKIVVSSCKCKPVPLLELAEGQKQTCVSLNSTSMYLVSGGLNKTVNIWDLKSKRVHRSLKDHKDEVTCVTYNWNDCYVASGSLSGEIILHSVTTNLSSTPFGHGNNQSVRHLKYSLFKKSLLGSVSDNGIVTLWDVNSQSPYHNFESTHKAPASGICFSPVNELLFVTIGLDKRIILYDTSSKKLVKTLVADAPLTAVDFMPDGATLAIGSSRGKIYQYDLRMLKSPVKTISAHKTSVQCIAFQYSVVLSKSSLNKGCSNKSMAVNKRTVNVSSTSGGVQNSGIVREATTTSVATVLPQPMTTVVGKGTVAVQDKAGLPRNINTDTLSKETDSGKNQDFSSFDDTGKSSLGDMFSPIRDDAVVNKGGEDPIVKGDGLDFLPQLNSVFPPRKNPVTSGTAVLHSSPLNVFMGSPGKEENENHDLTAESKKMYLGKQEPKDSCKQFAKLISSGAESGNLNTSPSSNQARSPEKFEKLEKEIETQLIYEPPINGSSTPNPNIASSVTAGVASSLSGKIADTIGNNRPNAPLTSVQIHFIQNMIQETLDDFREACHRDIVNLQVEMIKQFHMQLNEMHSLLERYSVNEGLVAEIERLREENKRLRAHY	116436	59599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1321_pilon_-_61250_61656_61724_68893_69051_70176_70334_71464_71668_72552_72601_74959_75089_80090_80287_80661_80864_82540_82771_102056_102198_105277_105395_111022_111118_113958_114103_116387
870854	contig_19459_pilon	-	2100	7	Intergenic	novelGene_59801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9185.94379866447	10	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	408	749	11335	7003	FALSE	35	AAGTAATATGGCTCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19130	5651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11416_12579_12704_16203_16265_18988
870855	contig_12570_pilon	-	2626	5	Intergenic	novelGene_79385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.2916483113033	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	42	782	300289	283433	TRUE	35	GAGGCTCAATAAATGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	300330	280025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281079_282641_283699_284049_284255_293908_294088_300198
870856	contig_4301_pilon	-	2334	7	Intergenic	novelGene_65117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	360.02241442567	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	248	850	551260	539500	FALSE	10	CGCTATTGTTGTGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQVSNGSVLPNEHITNILVFSFFKNCSNCNFRVELEVLGDELPVPAYLKEECDDELQTDGNRSSHLRLGRPEIRLEADSGSQEEVIQIIAEHLAQIGDEIESKVHPSLVQNLAMQFMNMNLSEAERSECLGTALEQAMQTCLMDMELEKKKLMLILLLAKKVANHKPSLLRDIFRTTVNFINQNLFTYLRNLARNEMD	575650	538015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_547294_547521_551248_551329_570758_570831_575543
870857	contig_5643_pilon	+	3729	3	Intergenic	novelGene_38722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	477	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31466	35358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_32076_32196_33139_33180
870858	contig_9727_pilon	+	4088	13	Intergenic	novelGene_86330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	66.138060566935	599	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	83	1687	409270	421380	FALSE	10	TCTGCTTGGCTTATGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGWLSTAGRHVRGERDASWSRRAPQQMGPTSSSPPFSSSHRRPQVGRSPAVGGSPGGSTAAPSGALDAAAAVAAKINAMLMAKGKLKPTQNASEKLQAPGKGLTSNKSKDDLVVAEVEINDVPLTCRNLLTRGQTQDEISRLSGAAVSTRGRFMTAEEKAKVGPGDRPLYLHVQGQTRELVDRAVNRIKEIITNGVVKAATGTSPTFNGATVTVYHQPAPITQLSPAVSQKPPFQSGMHYVQDKLFVGLEHAVPTFNVKEKVEGPGCSYLQHIQIETGAKVFLRGKGSGCIEPASGREAFEPMYIYISHPKPEGLAAAKKLCENLLQTVHAEYSRFVNQVNTAVPLPGYTQPSAISSVPPQPPYYPSNGYQSGYPVVPPPQQPAQPPYGVPSLVPPAVSLAPGVLPALPTGVPPVPTQYPITQVQPPASTGQSPLSGPFIPAAPVKTALPAGHQPPPPPQPPLPPQPQAQKRRFMEELPDERESGLLGYQHGPIHMTNLGTGFSSQSEIEGAGSKPASSSGKERERDRQLMPPPAFPVTGIKTESDERNGSGTLTGSHGE	408694	423781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_408765_409257_409477_412065_412195_412558_412639_413802_413856_414118_414283_415004_415217_415795_415857_416895_416954_417192_417447_419228_419403_420560_420674_421280
870859	contig_13894_pilon	-	2580	1	Intergenic	novelGene_62174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	999	1586	696390	695803	NA	80	AAAAAAAAATTTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSKPLSWQRGNRPREEDDFLQVSWLITRAAGARSWVGRGQKVGRGTDGQTDKHTQKSLTLGAILSTSPDTRLYPGKREREADTVRYAVSPTTTHRTVRPKGPQSQIPTADGCPPTHTHSLRTLQQILANLETLTFGCHMTTPDHHPYESTGGHPPKQLLEQKLGAAGPVSPCHAWGNRPGRGYARPEITVSQSW	697388	694808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_694800_697400
870860	contig_6576_pilon	-	3057	1	Intergenic	novelGene_42246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGACCTTCACTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297130	294073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_294100_297100
870861	contig_2547_pilon	-	3528	14	Intergenic	novelGene_165461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_13	93.8926114516318	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	88	921	455004	420206	FALSE	35	TTGTGATATTAGTAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEETTRFWREPASPFLIFSRPLTVDSWTEMHGHGGYDSDFSDEEQCGESSKRKKRTIEDDLLLKKPFQKEKHGKVAHKQVAAELLDREEARNRRFHLIAMDAYQRHKKFVNDYILYYGGKKEDFRRLGENDKTDLDVIRENHRFLWNEEDEMDMTWEKRLAKKYYDKLFKEYCIADLSKYKENKFGFRWRVEKEVISGKGLCQECSCKLNFHHRKKEVKLKNRKDKTKKDCEESSHKKSRLSSEKETSKKKDKGRSSSKKSEDSINRNSDEEEGASESELWKGPLPETDEKSQEEEFDEYFQDLFL	457223	417598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_420249_423244_423324_429422_429462_433504_433624_435592_435636_438887_438934_442963_443049_443837_443922_444971_445049_453095_453142_453269_453366_454927_455005_457002_457073_457206
870862	contig_8357_pilon	+	3078	1	Intergenic	novelGene_39693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTACTGAGATGACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242169	245247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_242200_245200
870863	contig_5093_pilon	-	3786	6	Intergenic	novelGene_135074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_5	113.565839934375	323	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	491	1945	535931	462749	FALSE	20	TTGATTGTTGAAGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGGGTQLEYTPPDGGWGWVVVGASFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQEIFNTSYSEIAWISSIMLAVMYAGGPISSVLVNKYGSRPVVIVGGLLCCLGMISASFSTNVIQLYLTVGFIGGIGLAFNLQPALTIIGKYFYKKRPMANGLAMAGSPVFLSTLAPFNQFLFNNYGWKGSFLILGAIFLHACVAGSLMRPIGPKQTKSKSKNKTDMRVDESGVKESRERKSIWERINKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDKGIDEYSAALLLSVMAFTDMFARPSVGLIANSKLIRPRIQYFFSFAIMFNGICHLLCPLAEDYTSLVVYAIFFGLGFGSVSAVLFETLMDLVGAVRFSSAVGLVTVVECCPVLLGPPLAGKLVDKTREYKYMYMACGAIVVFSSIWLLIGNAINYRLLDKEKKLEEARKKQIHTTESKESEPLNKLNSPDINVKISEAQATASERETNI	653332	460907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_463021_466970_467790_471231_471376_535711_535961_540726_540859_653003
870864	contig_5643_pilon	+	831	7	Intergenic	novelGene_39102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	919.104712327286	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGCAAGGCCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635221	641535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636469_640642_640729_641102_641244_641412
870865	contig_5643_pilon	+	1900	6	Intergenic	novelGene_39106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	925	junction_5	501.679738478643	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	642	1211	637802	640732	TRUE	10	TCCGGTCATTGTGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSK	637160	641590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_641244_641412
870866	contig_1939_pilon	-	3648	9	Intergenic	novelGene_144884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_5	156.058482627507	119	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	45	1871	965468	919928	FALSE	30	CAAATTTGAGTTTGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTVSGVLLVTPNNIMFDPHKTDPLVQENGCEEYGIMCPMEEVMSAAMYREILDSKIKESLPTEIEQLSVRDFCHLKKMSRSNPDEIDSRVRDIGNDSASTAPRSTEESFSEDVFAESELSPIREELISSVEPWQDKSSDVSSESVQTVSQTATERVAVISESASIPGHLKFNSGHSTNEVGTLSHKTDLNNVEMAIKEGYQVTDNFQEISGPEEQSTSIKGNGDQNVLLAENSLHQGEGEKKSMPYAEVTEFKQKQTVNKGKLGKEQNRDSETEVEELRKLWKTHTMQQTKQQRENIQQVSQKEIKHKIAAADGHVEGSALLKEKRRHRLHKFLCLRVGKPMRKTFVSQASATMQQYAQRDKKHEYWFAVPQERTDHLYAFFIQWSPEMYAEDTGEYTREPGFIVVKKIEESETNEDSTNEAAAKEWEITTRENINSKQVTPLKADLESESFRPNLSDPSELLQPDQIEKLTKHLPPRTIGYPWTLVYGTGKHGTSLKTLYRTMTGLDTPVLMVIKDSDGQIFGALASEPFKVSDGFYGTGETFVFTFCPEFEVFKWTGDNMFFIKGDMDSLAFGGGGGEFALWLDGDLYHGRSHSCKTFGNYTLSKKEDFFIQDIEIWAFE	965512	918150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_920064_929636_929711_932171_932268_934148_934302_935393_935520_949448_949612_954148_954318_961331_962099_965325
870867	contig_1275_pilon	+	878	2	Intergenic	novelGene_108853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	282	743	747507	747968	FALSE	25	CATGGTAGCATAATTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746568	748103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747287
870868	contig_8322_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_143214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATTAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46573	50878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_46600_50900
870869	contig_15787_pilon	+	3366	1	Intergenic	novelGene_143982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75533	78899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_75500_78900
870870	contig_1996_pilon	-	4589	1	Intergenic	novelGene_131871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	304	915	3153	4067	128856	127942	NA	10	TGCCCCACCCTGGAGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTQLPGPPAPRKALKTRDGAPARGVPTGGEVRLLTQRSVPDTAHLGKNLFASEPPPTRTCWMAPALKAASSKSPPLSLQLGSSLHWDLDGLDTEARLATALGVPQDPLPGVNAALLRVQDTDRVCTPRGHPEHTHAWGTCTESSWKQRSCTAPRPPYMPSHIPAAPTAPACNRSCQGQCTHRGDLHSQEALTTAPTLPRHGPRVRRGQVGPGLGAVATLNQAAELPCPGLTFGVIDRVHVPVDIALQVGVELGRGREEGQADGHELPAARQALKAEVLSGLPTELDVELIPQALHAPALGGHL	132008	127419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_127400_132000
870871	contig_7593_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_127296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGAAAATCAGCCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180446	178359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_178400_180400
870872	contig_6503_pilon	-	2420	7	Intergenic	novelGene_145757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	164.346179349161	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	98	715	134980	121820	TRUE	45	CCAACAGACCAGAACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIGGWCWWGKSDLSYQRARRETLVRDSHTYLRMPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAVFTTLLLSPSYK	139843	118665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_121858_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
870873	contig_18272_pilon	-	2800	8	Intergenic	novelGene_6993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	508.512035055138	2	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	187	1341	262678	122209	FALSE	35	TCAGAAATGATGACACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPAGSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY	262864	120749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_172640_172796_184338_184551_262660
870874	contig_3252_pilon	+	4091	1	Intergenic	novelGene_61483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201941	206032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_201900_206000
870875	contig_854_pilon	+	1536	2	Intergenic	novelGene_36393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974799	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976251_976333
870876	contig_7056_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_43595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTCTTCTTAACTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664922	662959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_663000_664900
870877	contig_5018_pilon	-	3821	12	Intergenic	novelGene_46945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	74.3347354374924	144	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	1848	3173	312555	301750	FALSE	15	GCTACTGTAGCTTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWVWEKVPDPAKSNSVQPHIEEGLQAQPLVDVPILEVQEIEPLPGMEPSQPPCRT	314484	301101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301855_301969_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312666_312747
870878	contig_7009_pilon	+	2756	1	Intergenic	novelGene_23654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	533	844	486640	486951	NA	30	CATCAGTCCCAACCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLEEIRLIFLRTEEASLHAVLFLIGQRWCFVLSCVFLYVLLLSLVGYKLPGVGDHCFFIRIIPSVAPTGLCTCTREVPELEITPQITAVWLIQRASISETY	486107	488863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_486100_488900
870879	contig_14030_pilon	-	3969	1	Intergenic	novelGene_62250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCCCTGCATACAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389441	385472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_385500_389400
870880	contig_7176_pilon	-	2859	16	Intergenic	novelGene_107878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	44.7380524088089	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	309	2717	739404	704340	FALSE	45	AAATGAAGTTTACATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIESVKLRRDSAADFYSHYEYLCALQDSVPLPAVRACLREGVLDFNADRLRVVDWAPLLNTLKVNKNLPLISIKSFFQPWLGDTVSDRSRVCRSRIPAVRSKDVSFQLCKALKGCLSVSGALKNLELNGLVLRERDLTILTKGLNKSTSLVHLSLANCPIGDGGLEIICQGIKNSITLKTVNFTGCNLTWQGADHMAKILKYQTMRRHEETWAESLRYRRPDLDCMAGLRRVTLNCNTLVGDLGASAFAESLSEDLWLRALDLQQCGLTNEGANAFLKALETNRTLVILDIRKNPLIDHSVMKAVIKKVIQNGRSAKSEYQWVTSPSVKESTKTARQKKKTIILGSGRKGKATIRIGLATKKPGNNGRKHTPGKEYYAPEPLPPGVSGFLPWRTAERAKRSRGFPLIKTRDVYNHLQQSNFPVTVTVESPSSSEIEEVDDSSESVHEVPEKTSVKQEAIQEKLEECLKQLKEERVIRLKADKRVNELECENAKLRNINFSLSEALHAQSLTSMILDDEGVLGSIENSFQKFHAFLDLLKDAGLGQLATMAGIDQADFHLLGRPQMNSTISHAPKEEMKALEEEEPESKQNALGQMQNIQVSICMQSAYNEGTLMKFQKITGDARIPLPINSFQVPVSTQEALVTSKDALDFPGTEERQESFEEFIARACSPPADAISGTGSQRKEEELSRSSRSSSEKVTKTGECSKKQSAKKQHGKDLHFCSNSTVNWQSKGIRGSSPLINEPIKSESLKRHISAKKEGGIVTASSRTNKSKPNPLEHSESDTLGSDFEFQESIHTLSHLT	739712	704197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_704904_705451_705500_705819_705992_706901_707069_709020_709099_719286_719416_720734_720781_722181_722318_726853_726966_727243_727309_729366_729481_731581_731757_734399_734504_735419_735493_735591_735765_739151
870881	contig_10990_pilon	-	585	4	Intergenic	novelGene_7492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722317	715662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_720157_720253_720420_720493_722230
870882	contig_10093_pilon	+	291	2	Intergenic	novelGene_147495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAAAAAAAAAACCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7742	27213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_7887_27066
870883	contig_3822_pilon	-	2662	5	Intergenic	novelGene_133301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_4	1281.35345923754	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	911	1501	283062	277069	FALSE	15	ACTTATGTTCATGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFGLSRCTRPNGRLLSGGKMRRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	283972	275907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_282994
870884	contig_8637_pilon	-	2737	13	Intergenic	novelGene_175180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_5	42.7849921766448	208	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	184	1335	317061	266736	FALSE	15	TAAAGTGGCTTCCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYFQPPGTWIQCALESRELLALCLKKLKAPLTKVRLVDAGFVWTEPHSKRLKVKLTIQKEVMNGAILQQVFVVDYVIQSQMCGDCHRVEAKDFWKAVVQVRQKTLHKKTFYYLEQLILKYGMHQNTLRVKEIHDGLDFYYSSKQHAQKMVEFLQFTVPCRYKASQRLISQDIHSNTYNYKSTFSVEIVPICKDNVVCLSPKLAQSLGNMNQICVCIRVTNAIHLIDPNTLQVADIDGSTFWSHPFNSLCHPKQLEEFIVMECSIVRNVKRSAGAGMISKKHTLGEVWVQKTSEMNTDKQYFCRTHLGHLLNPGDLVLGFDLANCNLNDDHVNKMNSDRVPDVVLIKKNYDRTKRQRRRNWKLKELARDRENMDTDNERQYEDFLEDLEEDEVIRKNVNIYRDSTIPVESDTDDEGAPRISLAEMLEDLHISQDATGEEGASMMT	332843	265333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8637_pilon_-_266867_267468_267540_273175_273283_274224_274298_274927_275041_303990_304137_305286_305405_307356_307454_308367_308447_316565_316657_316935_317065_317815_317897_332744
870885	contig_5019_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_109207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTGAAAAGTAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188087	188645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_188100_188600
870886	contig_8020_pilon	+	3194	3	Intergenic	novelGene_114459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_2	39.5	44	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGCCCAAACTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382271	391355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396
870887	contig_7119_pilon	-	2607	2	Intergenic	novelGene_40998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1015	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	990	1325	191857	191522	TRUE	20	TGAATCCTGAAGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGDVAWESGCWGHRTLLRAVGCVPHDKELPAPCPPGILFTLPVSGRPRSSGCPSSWPQSHLHTEGLGSNVEEILLYTGWNPPSLIPSPVSDTATVLDGHWLILHVPNLS	192846	187966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009
870888	SIRV6	+	860	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	722	4	-433	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	150	482	2002	10736	TRUE	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1852	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
870889	contig_2069_pilon	-	1386	6	Intergenic	novelGene_23427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	9857	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331542	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
870890	contig_2793_pilon	-	1186	8	Intergenic	novelGene_142863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_4	411.7412502323	1914	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	101	781	118367	79566	FALSE	10	TCCTAGACTGTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118467	79160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
870891	contig_11003_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_105437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGGCCCTCTTCTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62729	61050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_61000_62700
870892	contig_1150_pilon	-	510	3	Intergenic	novelGene_61448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAATGCAGTTTAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	309039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
870893	contig_2444_pilon	+	1875	2	Intergenic	novelGene_83798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1486	1812	279276	279733	FALSE	25	ACTGAAGCCGGTCGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAKNSTEKMESTSDRLAHKRNRRRLTAKRDDSPLHMRQGARNTNGGPSRDVETHQIKLSFTPKPLGFPTQQARRKLPSPRSPRCLLPDVPRRTLRRSRGSSRCRRL	277790	279796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_279369_279499
870894	contig_11850_pilon	-	2091	10	Intergenic	novelGene_125187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1067.98595496383	1372	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	420	1193	186097	181211	TRUE	15	CTATATATGTGTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGGPSQNWNQGYSNYWNQGYGNYGYNSQGYGGYGGYDYTGYNNYYGYGDYSNQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	198202	179134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182405_182553_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195775_197694_197784_197933
870895	contig_6241_pilon	-	3171	1	Intergenic	novelGene_156423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAGAAAACAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215517	212346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_212300_215500
870896	contig_10904_pilon	+	3251	9	Intergenic	novelGene_22522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1940	2278	349974	352049	TRUE	30	AAAATGTCCTCCCGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTIHSIRPLRILAYMFRGIVTVCCLGITPASGTHSCIPGPGTVASFSQQLSDNCTTGALNSEICPFWPLLSQTAAEESLHESLCPVLSSVLGGKEYRKREAIILSWRSSP	346753	362495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_347425_348705_350113_350832_350937_351953_352142_352532_352697_353957_354254_354559_354851_354961_355001_362404
870897	contig_7587_pilon	-	834	4	Intergenic	novelGene_163714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	21.6384431561566	1117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	49	702	200989	142457	FALSE	20	TGTTGTGCTATATTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPEWTEEDLSQLTRSMVKFPGGTPGRWEKIAHELGRSVTDVTTKAKQLKDSVTCSPGMVRLAELKSTAQNSRPIKTPVALPDDIITQREDAEGRVEEEEQEELEEGAGEQNEAGITETRPRKRKPARLLETVMRVEPEEKFRAKRQKDFEILEQNESSDEESQKKERTRATEEPWTQNQQKLLELALQQYPKGSSDRWDKIAKCVPSKSKEDCIARYKLLVELVQKKKQAKS	201037	142324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_142526_145105_145567_158260_158310_200914
870898	contig_12250_pilon	-	1530	8	Intergenic	novelGene_80651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	213.424077214109	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	754	1272	377548	375947	FALSE	25	GGAATCAGTATCTGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380563	375688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378353_378626_378758_379009_379194_379537_379760_380523
870899	contig_2730_pilon	+	3244	1	Intergenic	novelGene_135383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAGGAAAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326531	329775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_326500_329800
870900	contig_4964_pilon	-	3586	1	Intergenic	novelGene_157254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAACTATAGATGTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120511	116925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_-_116900_120500
870901	contig_5084_pilon	+	4426	1	Intergenic	novelGene_64567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTAGGGTTTCCAACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570901	575327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_570900_575300
870902	contig_2903_pilon	+	4016	1	Intergenic	novelGene_148973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTTTTGAGAATTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129890	133906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_129900_133900
870904	contig_1532_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_37375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	723	1076	13466	13113	NA	35	TAATGAGTATGTGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	14188	12363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_12400_14200
870905	contig_6191_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_107831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCAAGAAAAAAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86508	88543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_86500_88500
870906	contig_5236_pilon	+	2794	12	Intergenic	novelGene_100871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_1	157.189678545769	729	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	272	1294	26719	37858	FALSE	15	GCACTTGGAGGGGGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSVKTFLQDLARGIKDSIWGICTISKLDARIQQKREEQRRRRASSVLAQRRAQSIERKQESEPRIVSRIFQCCAWNGGVFWLSLLLFYRVFIPGLQSVTAHIIGDPSLHGDVWSWLEFFLTSVFSALWVLPLFVLSKVVNAIWFQDIADLAFEVSGRKPHPFPSVSKIIADMLFNLLLQALFLLQGMFVSLFPIHLVGQLVSLLHMSLLYSLYCFEYRWFNKGVEMHQRLSNIERNWPYYFGFGLPLAFLTAMQSSYIISGCLFSILFPLFIISANEAKTPGKAYLFQLRLFSLVVFLSNRLFHKTVYLQSALSGSASAEKFPSPHPSPAKLKAAAGH	24633	39358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_24742_26463_26556_26647_26761_30428_30575_31676_31738_32910_32978_34063_34189_34494_34615_35078_35191_35655_35768_36692_36768_37695
870907	contig_5799_pilon	-	1766	5	Intergenic	novelGene_50252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_4	71.1512473537885	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1401	1715	179948	179634	FALSE	75	TAATACTAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIQFSVLCPNALEFLTFQSVRSFEIMMEAMSHFSKKHPHTQTLTCIFRAFPDPVKLIHAPRSRMLASEGDLTMIPPLLSFPVNMIIKKRTPPGQKQVTVRGC	369213	179582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_180720_191025_191159_258752_258810_325686_325815_368902
870908	contig_5136_pilon	-	3009	2	Intergenic	novelGene_126647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTACCCAGAATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324021	320844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_322636_322803
870909	contig_19459_pilon	-	673	6	Intergenic	novelGene_59895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6441.90786646316	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	293	634	11335	7003	FALSE	20	CCTTGCTTCTGACATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15586	6963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
870910	SIRV6	-	779	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	290	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCCAATAACGTCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
870911	contig_8464_pilon	+	2899	17	Intergenic	novelGene_125392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_6	252.651308315928	464	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	510	2726	857221	892583	FALSE	40	TAAAAATTGCAATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEDPVEGGDLWHTRLPNHAVFLRLREGLKNQSPAETEKSASSSLPSPPPLLTRNLLFGLGGEIFLWDREGSSFLVVRLRSLSGSSEEPSLSQYQRLLCINPPLFEIYQVLLSPTQHHVALIGLKGLMVLELPKRWGKNSEFEGGKSTVNCSTTPIAERFFTSSTCLTLKHAAWYPSEMLDPHIVLLTSDNVIRIYSLREPQTPAKVIVLSEAEEESLILNKGRAYTASLGETAVAFDFGPLAAVSKNIFGQKGKDEVVAYPLYILYENGETFLTYVSLFHSPGNIGKLLGPLPMHPAAEDNYGYDACAILCLPCIPNILVIATESGMLYHCVVLEGEEEDDQTSEKSWDSRADLIPSLYVFECVELELALKLASGEDEPFDSDFSCPIKLHKDPKCPSRYHCTHEAGVHSVGLTWIHKLHKFLGSDEEDKDSLQELATEQKCFVEHILCTKPLPCRQPAPIRGFWIVPDILGPTMICITSTYECLIRPLLSTVHPASPSLLCTREDVEVAESPLRILAETPDSFEKHIRSILQRSVANPAFLKSSERDTAPPEECLQLISRATQVFREQYILKQDLAKEEIQRRVKLLCDQKKKQLEDLNYCREERKSLREMAERLADKYEEAKERQEDIMNRMKKVLHSFHSQLPVLSDSERDMKKELQLIPDQLRHLGNAIKQVTMKKDYQQRKMEKVLSPQKPTITLSAYQRKCIQSILKEEGEHIREMVKQINDIRNHVNF	856711	892756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_857512_858662_858833_859757_859884_864979_865067_867920_868098_869665_869853_870352_870501_872708_872808_884660_884752_887827_887930_889834_889994_890865_890989_891109_891176_891319_891401_891694_891822_891981_892101_892519
870912	contig_10523_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_120954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39521	37836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_37800_39500
870913	contig_6842_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_130732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGATAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534592	536055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_534600_536100
870914	contig_7088_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_159799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_2	82.9505877013539	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	809	1378	721455	717194	FALSE	20	TTGTCATTTCCTTTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRIKKQLREWDENLKDDSLPSNPIDFSYRVAACLPIDDVLRIQLLKIGSAIQRLRCELDIMNKCTSLCCKQCQETEITTKNEIFSLSLCGPMAAYVNPHGYVHETLTVYKASNLNLIGRPSTEHSWFPGYAWTIAQCRICASHIGWKFTATKKDMSPQKFWGLTRSALLPTIPDTEDEVSPDKVILCL	723584	716658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_717375_718590_718723_720117_720183_720632_720749_721379_721465_722785
870915	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTFGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121831	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
870916	contig_12570_pilon	-	2150	7	Intergenic	novelGene_79351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	270.130626837379	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	212	946	228467	190537	FALSE	15	GTTCTGTATAGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLIAAYSGVLRGTGSSILSALQDLFSITWLNRSKVEKQLQVISVLQWVLSFLVMGVACSVILMYTFCTDWWLITVLYFTWLVFDWNTPNKGGRRSQWVRNWAVWRYFRDYFPIQLVKTHNLITTRNYIFGYHPHGIMGLGAFCNFSTEATEVSKKFPGIKPYLATLAGNFRMPVLREYLMSGGICPVNRDTIDYLLSKNGSGNAIIIVVGGAAESLSSMPGKNAVTLRNRKGFVKLALRHGG	228678	189332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_190544_196195_196371_197886_198092_204946_205018_205425_205534_211349_211479_228427
870917	contig_10014_pilon	+	3874	1	Intergenic	novelGene_174563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34976	38850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_35000_38800
870918	contig_2834_pilon	-	3658	1	Intergenic	novelGene_28019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1821	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2829	3134	308263	307958	NA	20	GAACTGCCGCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSITGARLSLQCGLLLFSFSRTGQGLITPVFKNPQKSKSKPVAIKSIPTHSDPTGQSRTAPQGFQVAPGGFELRTFWLAAIALHHYGTRVSKNLQESPK	311091	307433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_307400_311100
870919	contig_6175_pilon	-	2803	1	Intergenic	novelGene_16349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGAACTTTTTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692121	1689318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1689300_1692100
870920	SIRV6	+	775	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10245	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
870921	contig_13740_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_34718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	531	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	129	398	165243	164974	NA	45	AAAAATTACAGCTACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCFSSSSSSHNSARTSPVRVRPRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEVTGLKSMSYWKGHGKAVGASVEVGHPPPWESGSEVGLLPKRLSLWYFCGRCYRRPDLYNASLFSLPAPFPFTGLGDGEFHMADAVPL	165371	163320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_163300_165400
870922	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
870923	contig_11492_pilon	-	3711	1	Intergenic	novelGene_152263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGAATCCAGTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425637	421926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_-_421900_425600
870924	contig_10982_pilon	-	2999	1	Intergenic	novelGene_87896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGGCTGTGCTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289158	286159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_286200_289200
870925	contig_7594_pilon	+	2483	10	Intergenic	novelGene_55399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	671	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTTTCCGGATCCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372681	397293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_372819_374976_375036_375397_375481_378389_378552_381785_381920_383012_383191_386856_387729_388187_388358_391785_392194_397013
870926	contig_10734_pilon	+	2014	4	Intergenic	novelGene_51044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_1	193.785104346714	1120	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	45	662	397040	413196	FALSE	20	CTTGCCAAGTGCCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPPLREEEEEGDGDEVGPEGALDKSPSQLTAEDVYDISYVMGRELMALGSDPRVTQLQFKIVRVLEMLEALVNEGSLEAEELRMERDSLRKELQALRREGPSAGGEVSLGPDKMVVDLTDPNRPRFTLQELRDVLQERNKLKAQLLVAQEELQCYKSGLIPPREDPGRRREKDALVARTSNASCNNEKTIIKKLFFFRSGKQT	396995	414548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_397364_401952_402105_409434_409546_413165
870927	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
870928	contig_2892_pilon	-	2645	2	Intergenic	novelGene_119028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	1	3	junction_1	0	60	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAATAAGCACATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298917	295152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_295321_296440
870929	contig_7229_pilon	+	3302	1	Intergenic	novelGene_39836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAGTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941056	944358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_941100_944400
870930	contig_12074_pilon	-	2414	16	Intergenic	novelGene_53739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	447.84959776941	3	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	295	2160	43217	30226	FALSE	15	ATTTAATGCCTGCTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTQAAVRLVRGSLRQTSWAQWGQRELRLGQLAPFTVLHKDKPLSDKRSELKRRLKAEKKVAEKEAKHKELNEKQLSQAVTATTNHTTDNGVSTEEESLDPNQYYKIRSQAVLQLKVNGEDPYPHKFHVDISLTHFIQEYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGEGVKLQIMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIPYEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKIITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAPELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDLMEITEKMLSGMVKHITGGYKVTYHPDGPEGQACEIDFTPPFQRISMVEELGKVLGVKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKFLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEVCNAYTELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMGIDRVTMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKESIAATDTLESTTVGTSV	45836	29971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_30325_30921_31066_32217_32345_32647_32722_33106_33193_33340_33515_33627_33791_34829_34950_35882_36009_36099_36287_36647_36742_40004_40171_41067_41228_43071_43252_44590_44780_45765
870931	contig_8866_pilon	-	1842	2	Intergenic	novelGene_77766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1501	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGATGTGTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349052	340765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798
870932	contig_9482_pilon	-	1153	1	Intergenic	novelGene_44242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTCTTCTAATTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269261	268108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_268100_269300
870933	contig_15732_pilon	+	1969	8	Intergenic	novelGene_88839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_7	338.53369289406	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	79	1149	11208	158242	TRUE	80	ATAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGESLWPRVPGFRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYLYVRTHGVDHHQSSLNATDLV	11129	185795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_158174_158245_184977
870934	contig_15732_pilon	-	2913	1	Intergenic	novelGene_88878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGTTGTGCAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188572	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_185700_188600
870935	contig_6047_pilon	+	2706	18	Intergenic	novelGene_24198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	583.974640393602	1	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	562	2337	109227	123010	TRUE	25	GTTCCCAAATACCCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKQGGRRTRRRT	105124	123872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107283_107809_107927_109178_109511_114652_114750_115079_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122977_123102_123594
870936	contig_10793_pilon	+	1342	14	Intergenic	novelGene_83409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3658.9880985493	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	175	1101	146975	163940	TRUE	10	TGGATGTCTCGAGTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130911	165138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_140211_140296_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054
870937	contig_10793_pilon	-	2315	3	Intergenic	novelGene_83444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	149	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCATCTCCTTCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168738	165350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_165373_166399_168010_168055
870938	contig_3948_pilon	-	2829	18	Intergenic	novelGene_53358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	288.412538540791	277	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	373	2565	1792685	1747427	FALSE	25	GAGATTGGGTTTAAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVTTSYSFDAPTDYINFTSLNDEEDNENVDSWFEEKANLENMFLRKNGTGGPFQGKTPLRKSNRQQAIVTPLRPVENTYYKETEKENQLEQSIPSNTCSSLEVGGNTSRNTPAHPLRRSVRLSAQKDLKQKHHVKMKAKRSVTPGITNEIPPSKKMKVSNNKKKPEEEGNAHRDTPEKAKSRHTIPCTPPVRQKVIKSTEEQELEKRTRMQQAVVEMRKKNEEFKKFALAGAGQLVKKSVSQVTKSVDFHFCTDERIKHHKNQEYKEVNFTSELRKHPPSPARVTKGGCTIIKPFNLSQGKKRTFDETASTYVPLAQQVEAFHKQTPSRYHLRSKKDDIGLLPSKSAVAKICRDPQTPVLQTKQRTRPVTYKSAADQEAELLEKLQQYKFKAQELDPRILEGGPILPKKPPVKPPTQPIGFDLEIEKRIQERELKKKPEEEHFEFHSRPCPTKILEDVVGVPEKKVLPITVPKSPAFALKNRVRVFSKEEEEEEEPVMIKAQPVPHYGVPFKPQIPEARTLEVCPFSFDSRDKERQLQKEKKIKELQKEEMPKFKALPLPHFDTINLPEKKVKSATQIEPFCLETDRRGALKTQTWKHQLEEELKQQKEAACFKARPNTVISQDPFVPKKEKKLVAVQEPFQLATEKRAQERQELEKKMAEIEAQKAQRLEEIKQQEEEQEKEELAQLRKELVHKANPVRKYQAVEVKSSDQPLTVPVSPKFSTRFHC	1801355	1747162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1747538_1749489_1749657_1750365_1750478_1755092_1755240_1755628_1755806_1757607_1757704_1770456_1770674_1771185_1771328_1774315_1774491_1775519_1775666_1776753_1776876_1778343_1778446_1779326_1779450_1785358_1785486_1789686_1789810_1792579_1792755_1797532_1797757_1801276
870939	contig_2033_pilon	+	2971	1	Intergenic	novelGene_71541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCATTGCCATTGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142480	145451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_142500_145500
870940	contig_13984_pilon	+	3053	1	Intergenic	novelGene_130233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	532	879	8569	8916	NA	55	AAAGAGACAACCAGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLLYPIVYGALVAQCLSAQLLTGRSEVRIHQALLRNSMGAVLLCPVESLSVGIDSTAMGSGNMYYTLHICIIWMPSGTVVKSYAANQKVSSLNPAATPWKPCGTVLLCPVGSL	8037	11090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_8000_11100
870941	contig_9177_pilon	-	1830	7	Intergenic	novelGene_32564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1366	junction_4	694.491760610272	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	633	1391	3704	2152	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	4336	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697
870942	contig_7285_pilon	-	3431	1	Intergenic	novelGene_143399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTTATACCTTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252243	248812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_248800_252200
870943	contig_5482_pilon	+	2192	1	Intergenic	novelGene_144477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483472	485664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_483500_485700
870944	contig_5935_pilon	-	4184	9	Intergenic	novelGene_102741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	158.716285790085	162	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	764	1264	1303704	1247804	FALSE	50	CAGACCAACCAAAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFFGILTITLTLQDHASWIPYLSIMCILAIIASFCIGPGGIPFILTGELFRQSERPAAFIIAGTVNWLSNFTVGFLFPFIQKSLDTYCFLVFAAICIAGAVYFYFVLPETKNRTHAEIRQDFAKRNKAYPPEEKIDSVLSDKINRSPEPGSSSTLDNYTKNRIV	1418921	1244883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1248056_1273070_1273199_1300025_1300102_1303659_1303762_1332491_1332603_1346591_1346781_1358530_1358664_1392215_1392362_1418794
870945	contig_10341_pilon	+	4872	1	Intergenic	novelGene_47233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAGAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98184	103056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_98200_103100
870946	contig_6069_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_8068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTCTAGAAGTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503211	504525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_503200_504500
870948	contig_7357_pilon	+	2299	14	Intergenic	novelGene_36876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	114.55656725213	318	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	634	1341	268191	272742	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMVYDLSVLILKQLFRIEFESLVALKLLKSPLLL	250817	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_253750_253841_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_265834_265918_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519
870949	contig_7412_pilon	-	1117	5	Intergenic	novelGene_76334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	753	junction_1	1025.18519668399	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	301	876	370310	364445	FALSE	10	CCATGGCTTCCTCTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	373451	364203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393
870950	scaffold_12124_pilon	+	1612	5	Intergenic	novelGene_22367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	838	1404	1508626	1509362	FALSE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYHPNTCIQILSFTLHTDTHLHPDTPSHPDTPLYADINLHPDTPSHPDTPLYADINLYPDTPCTQILPASSSPLHPHGCPVGECQIHESFVQYTRCQLLRCGSLVSPRGPLASHTF	1491908	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491986_1494270_1494316_1496979_1497085_1508015_1508848_1509017
870951	contig_5482_pilon	+	3427	3	Intergenic	novelGene_144446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAAAGATCCGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271634	277658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_271862_272266_272619_274810
870952	contig_5732_pilon	-	3535	1	Intergenic	novelGene_119592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285858	282323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_282300_285900
870953	contig_4924_pilon	-	3376	1	Intergenic	novelGene_84735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAATCCCAGGAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136224	132848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_132800_136200
870954	contig_9272_pilon	+	3862	6	Intergenic	novelGene_125966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_1	391.920706265949	237	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1275	3828	29	3856	619383	651627	FALSE	50	AGAATAAAGCACTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAASAGRSPGALWSPTHVQVTVLQARGLRAKGPGGTSDAYAVIQVGKEKYATSVSERSLGAPVWREEATFELPPLLASGVAPAAAATLQLTVLHRSLLGLDKFLGRAEVDLQELHRDQGRRKTQWYTLKSKPGKKDKERGAIEVDIQFMRNNMTASMFDLSMKDKSRNPFGKLKDKIKRKNKDSASDSASAIVPSVTPSADSDDESSTKDKRKKSKIKTLFSKSNLQKTPVSQSMSVLPTSKSDRVLLRPGDLPSRWEDDDNEDDSSSASDIMTHKRTPSADPKQLNQINFSLSKKEGLSFLGGLRSKNDTLSRSNVCINGNHVYLEQPESKSETKDSTPSSSPSPQGFNRKRLFSSTENLAPKSWKEPGEAGGVASDRQLSESSTKDPLKSMSLPSYRPVVSGDTGGNTAPGNLEAAKDTKESKKQENKKPSLLSLVTGKKDVAKGSEGESPPTIPAKEKEGALPEIKPREDGSEPVKDLMKKSEKDTSAVVSGWGKSLNPFEEMQTTEPAVEPEPKSEPKPPVFSARAPQTKAVKPRLEVSPEAQPKARLPSSPDLPLSFPALSSGSGQTPLPTELGNDSETQSSESPSVFSSSSPIVAPISTSTPIESWPYTDEGQASSEEPSLHLKAELQKESVTQVPNNTSSASGSLSKQPPDPVCKGTEVSPMGKTREVETEKNTSNEESENRLLEQPDVGQQEEELLRFSSSEQDYIPLSEEAQEKTFVLSVRSGRIESSVGKPQMGENKDFETQSRSLVENKVKEGEMTSAIKEVAPPLKMEESVPPLDSVTQKHEEMGLNPSKDQKKVKKRVSFSEQLFTEEEVEKSTGWIEEDRSNPQELTRGRATTESVCDREPSESPHTEDSEREGVAEPGLLDCGVLAPMADHEESFSEALMSEASSEKDTALIRTEEDDALMEQYQSKASDHEGLLSDPLSDLPCAADVKSLVMADLYLTLPSIPEVASDDERVDQVEGVRETVRVATLEVGASSLSILPPCPEKKKRPSGMGDGPAVPAESPCDFRSKAPKASVTTSSEQTAALGIHEPHLGKSSSLDKQLPGPGGGEEEKLEGNGRPSQPPGTSLDSPVSSPSLSEPCSATQSVPSSPHSNTHHISTAESPKKATAEGSAAKVDNSGKRKPPLQAWVSPSETQPVSAQPGTGTWSAKHRLHPVKPMNTTATKVANSTLGTATIISENLINEAMMKKHSPSDPTSAYSQLTHDELVQLVLQQKETISKKEFHVRELEEYIDNLLVRVMEETPNILCVPAQVGTKAGKM	619354	651633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_619760_637614_638058_639481_640284_641303_643182_644165_644275_651408
870956	contig_7720_pilon	+	4473	15	Intergenic	novelGene_155776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	449	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	586	1209	796338	796961	TRUE	15	GTTCCAGGGCCCCACACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPQHPCPHLTEVRGRAPESRTPSSLQYAWKKRTPQNSDLGHLHFSLGWEQVPVSLCLANTSLGWLWCGSWDAAAPTSGTTAIPGPSSYSVQGLGGIGWKGPRWSLMLRGETLACPGSCCPGLRAAAGPGRLSGHRRVHLGSRALQPSVMVGGGHRLGGSLPCPLGLSGARRGLGGENREEEDLTSGAQHQVGSGGRHALPAWWLS	795752	872311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_799079_800537_800625_801279_801400_802388_802484_802603_802728_804527_804615_809128_809212_810965_811011_811704_811753_813798_813841_816477_816559_821502_821540_822325_822370_860592_860723_872187
870957	contig_10629_pilon	-	1840	9	Intergenic	novelGene_52923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.882022649781	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	430	630	252400	247382	TRUE	45	AATTATATATATATATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASVQRTTGTPRTSLPHFHHPETSRPDSNIYKKPPIYKQRESVGGSPQSKTSEDLIIESSKFPAAQRPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASQKKEEEEEKDDDSEEERKAFRERQKEELSKVTSNLGKIILKEEMEKSLPIRRKARSLPDRTPFHTSLYPGTSKSSSLPTYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETGSPALDLSL	254652	245994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_247138_247314_247402_248129_248179_248344_248410_252333_252440_253096_253216_253749_253900_254170_254228_254588
870958	contig_15543_pilon	+	3020	1	Intergenic	novelGene_164336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29076	32096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_29100_32100
870959	contig_7457_pilon	+	584	1	Intergenic	novelGene_31349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290671	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_290700_291300
870960	contig_12270_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_113878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	23	352	14409	13857	FALSE	20	TATGGTTATGCTGCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQ	14431	13856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
870961	contig_15371_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_151442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCAGCCATAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133234	130672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_130700_133200
870962	contig_14684_pilon	+	2065	4	Intergenic	novelGene_99646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCCGCGGCTTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58704	64620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_58876_60118_61782_62889_63097_64596
870963	contig_8357_pilon	-	3327	7	Intergenic	novelGene_39770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_6	532.816233694966	53	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	265	546	891622	890608	TRUE	65	TAAACATAAAAATGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKD	891886	883754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885477_887179_887257_887410_887717_887787_890560_890614_891346
870964	contig_4857_pilon	-	2567	1	Intergenic	novelGene_48692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1241	1645	1135132	1134728	NA	15	GTTCGCTGGGTGATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELENNILTHTKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIRTAPQNKMGLMRHSSPGTRTRRQKKTRKLVIGNPRLSKDSVDMQWGC	1136372	1133805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1133800_1136400
870965	contig_15545_pilon	+	878	2	Intergenic	novelGene_120126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTTTGTCATTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9190	27801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
870966	contig_252_pilon	-	4086	6	Intergenic	novelGene_99920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	14.2211110677049	138	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2880	143	3022	228227	193764	FALSE	25	GAAGTAATTTCTCTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHTRGAPSVFFIYLFCFASAYITDENPEVMIPFTNANYDNHPMLYFSRAEVAELQLRAANTHEHIAARLTEAVHTMLSSPLEYLPPWDPKDYSARWNEIYGNNLGALAMFCVLYPENIEARDMAKDYMERMAAQPSWLVKDAPWDEVPLAHSLVGFATAYDFLYNYLSKTQQEKFLEVIANASGYMYETSYRRGWGFQYLHNHQPTNCMALLTGSLVLMNQGYLQEAYLWTKQVLTIMEKSLILLREVTDGSLYEGVAYGSYTTRSLFQYMFLVQRHFEINHFGHPWLKQHFAFMYRTILPGFQRTVAIADSNYNWFYGPESQLVFLDKFVMRNGSGNWLADQIRRNRVMEGPGTPSKGQRWCTLHTEFLWYDASLKSIPPPDFGTPTLHYFEDWGVVTYGGALPAEINRSFLSFKSGKLGGRAIYDIVHRNKYKDWIKGWRNFNAGHEHPDQNSFTFAPNGVPFITEALYGPKYTFFNNVLMFSPAVSKSCFSPWEGQVTEDCSSKWSKYKHDLAANCQGRVVAAVEKNGVVFIRGEGVGAYSPRLRLKNVQRNLILLHPQLLLLVDQIYLGEESPLETAASFFHNVDVPFEETVVDGVHGAFIRQRDGLYKMYWMDDTGYSEKATFASVTYPRGYPYNGTNYVNVTTHLRSPITRAAYLFIGPSVDVQSFSIHGDSQQLDVFIATSKHAYATYLWTGEATGQSAFAQVIADRQKILFDRSLAIKSTTVPEVKDYVAIVEQNLQRFKPVFQLLEKQILSRVRNTASFRKTAERLLRFSDKRQTEEAIDRIFAISQQQQQQQSKSKKKRRAGKRYKFVDAVPDIFAQIEVSEKKIRRKAQILAQKELPIDEDEEMKDLLGFADITYEKHKSGSLVRGQFGQARMVTTTHSRASSLSASYTRLFLILNIAIFFVMLAVQLTYFQRAQSLHGQRCLYAVLLIDSCVLLWLYSSCSQSQC	261438	192699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_195526_197770_197979_200147_200388_203656_203911_227811_228281_261349
870967	contig_5945_pilon	-	4702	1	Intergenic	novelGene_104590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGCACAGTTGGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328162	323460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_323500_328200
870968	contig_2892_pilon	+	4652	1	Intergenic	novelGene_119038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1926	2237	328533	328844	NA	35	AAAAAACAGGTGGGGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVVKSLLVVVGFLEPIHIYISRPPSAQRGIMIRYFCSVLFFFPCELLPLSAHRLNPKLVIVILLLRTQGCVAHLWLDLSVENRKHTALLDITSGRGTIAHCW	326607	331259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_326600_331300
870969	contig_2892_pilon	-	3866	1	Intergenic	novelGene_118984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCGCCATGCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41475	37609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_37600_41500
870970	SIRV6	+	1068	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	6	14	-1	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	367	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
870971	contig_5153_pilon	+	2030	15	Intergenic	novelGene_74373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	267.36053965248	3	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	221	1789	1007835	1022174	FALSE	10	GTTCTATTTCCTGTCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGTPGGSYPPGPPGGFGQPPSAQQPIPPYGMYPPPGGNPPSGMPSYPPYPGAPVPGQPMPPPGQQPPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAGVSPTSGPGLREGAVGPERRAVGPERRAVGPEQGAVGPERRAVGPERRAVGPERRAVGPERRAVGPERGALGPERRAGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956685	1022415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015506_1015737_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
870972	contig_10477_pilon	+	2614	1	Intergenic	novelGene_112491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	546	1641	945	2585	259114	260754	NA	30	AGGTGTTTCACAAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETSLNGPKSLKHLFLTQTGISDLEFIPVHNLENLESLHLGSNHITSIEFPTNFPTQNLKILDFQNNAIHYLTRKDMDSLKPATNLSLNLNSNDIKGIEPGAFHSKIFQNLNFGGTFDLSVILKGLQNSTIQSLWLGTFEDKEDQDLSPAILQGLCEMSVESINLQQHHFSDFSSATFQCFTQLQELDLTATHLKELPSGIKGMNSLKKLVLNVNNFDQLCEISAASFPSLTHLYIKGNRKKLDLGAGCLERLENLQKLDLSHNGIEASDCCNLQLKNLPHLQCLNLSYNEPLGLQSQAFKESPRLELLDLAFTHLHVNVPQSPFQNLQLLQVLNLSYCLLDTSNHHLLAGLPNLRHLNLQGNRFQDGSIPKTNLLQTVGSLEILILASCDLLSIDQQAFHGLEKMCHVDLSHNSLTGDSISALSHLKGIYLNLAANNICIVSLHVLPTLSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWFKENLHKLEGLEETMCANPPPLKGVKLSDVKLSCGITAVGIFFLIVFLFLFTILLVFLIKFLLRWKYQHI	258169	260783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_258200_260800
870973	contig_13744_pilon	-	4511	1	Intergenic	novelGene_77201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040950	1036439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_1036400_1041000
870974	contig_8538_pilon	-	3297	18	Intergenic	novelGene_4602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	95.0008923651405	503	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	119	2137	742030	688211	FALSE	10	ACGTGCATGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKERRIRREEIMECKVMWEPASKKNTQMDRFRAAVGASCGLALDNYDDLYHWSVKSYSDFWAEFWKFSGIVFSCMYDEVVDTSKGITDVPEWFKGSRLNYAENLLRHKDNDHVALYVAREGKEEIVKVTFEELRQQVALFAAAMRKMGVKVGDRVVGYLPNSMHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGGTLIQHLKEHILHGNMGSNDIILYYTTIGWMMWNWMVSALATGASVVLYDGSPLVPTPNVLWDLVDRIGITILGTSAKWLSVLEDRNMKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIVEAFEEVMDSLCVPQYNQDGEERVILFLKMASGHTFRADLVQRIRNAIRLGLSARHVPSLILETKGIPYTLNGKKVEVAVKQVIAGKSVEHRGAFSNPETLDLYQSIPELQDF	742148	687050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688349_692701_692905_693724_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928_697994_702430_702556_703455_703537_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672_724787_729514_729636_730740_730845_741897
870975	contig_19098_pilon	+	3557	3	Intergenic	novelGene_65849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_2	41.5	144	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	27	701	445644	448753	FALSE	20	CGGAACTGTGAGTGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVERTDELVREYLLFRGFTHTLRQLDAEIKADKEKGFRVDKIVEQLQQLMQVYDLAALRDYWSYLERRLFSRLEDIYRPTINKLKTSLFRFYLVYTIQTNRSDKAQEFFAKQAAELQNQAEWKDWFALPFLPSPDTNPTFATYFSRQWADTFIVSLHNFLSVLLQCMHILPALGWRGPSEAPMQSSQVPALREMPWGCCHGHVRAGQVMVFLVGSPWNHRS	445617	451609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_445767_447666_447847_448381
870976	contig_12951_pilon	+	3526	1	Intergenic	novelGene_68216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791616	795142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_791600_795100
870977	contig_12543_pilon	+	6663	4	Intergenic	novelGene_168392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_3	37.973675092095	182	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	193	2388	492661	509687	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFQESVTFKDVAVVFTEEELGLLNSAQKKLYQDVMVENFRNLVSVGGKNPRQMEIVPPAGAHEELSSSRIWQQIASDLTRCQDSVVHRSQFYKQSDSPSPVAGRLSIIHAGENIFQCKECTKTFSNVSSFELQQLHSEVKSLTCSECGKSFCYVSGCRNHQRIHVGKNCYQRDECGKVFSQHSHLQSHLNTPTVSKLYKCEECRKRFRHRTTFNVHCKGHTEGKPYNCEVCGRGFINLLHFQEHQRSHSREKTFKCDTRGKKFHHRAALNTHYMVHMGEKPYKCEECGKSFARNSYLYIHQRVHTGEKSSKCEECGKSFIHPLQFQAHLSVHTGEKPYKCNMCGKSFIYSSNLHSHQGVHTGEKPYECGVCGRVFSQSSYLKIHQKIHNVEKPYKCEECGQCFNWSSRLQVHQLIHTGEKPYKCEECGKGFRQAGNLLTHQRVHSGWKPFKCVECGKYFSSRSNLHTHRRIHTGEKPYKCEGCGKGFRQASYLQDHQRVHSGEKPFKCEECGKSFKWIENLNTHHRVHTGEKPYKCEECGKYFTHASSLQHHERVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFRQASHLLLHQRVHSGEKPYKCEDCGKSFCQNSHLQAHQRVHNEEKPYKCQECGKGFKWSKNLNTHQRVHTGEKPYKCGKCGKYFSQASSLQQHERVHTGDILYTCNVCGKVFNRSSQLQSHQRVHTGEKL	484570	513962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_484700_492597_492676_497769_497897_507633
870978	contig_3233_pilon	+	2492	1	Intergenic	novelGene_56522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAGAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250777	253269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_250800_253300
870979	contig_15185_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_99392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114645	117056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_114600_117100
870980	contig_18794_pilon	-	3022	11	Intergenic	novelGene_54644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47.1	652	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTCCCCTTCTGCTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172953	145068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_145347_152181_152266_156093_156250_159019_159078_160492_160592_163114_163243_166476_166598_166779_168036_168358_168453_169968_170123_172359
870981	contig_6552_pilon	-	2913	15	Intergenic	novelGene_163579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	249.230734829542	154	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	74	1663	115068	21367	FALSE	35	CTCAATAAATGTGCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSTYNTIQSIFCCCCCCSVQKRVRQVRTQISLSEDEELSEKYPSRHRPWPCESSTKKQSNRGHVKPSKRKPLPPLPIPEVAEEMIQVKALYDFLPREPCDLALKRTEEYLVLEKYTPHWWKARDRFGNEGLIPSNYVTENKLTNLEMYEWYHKNITRNQAERLLRQESKEGAFIVRDSRHLGSYTISVFVRARRSTEATIKHYQIKKNDSGQCYVAERHLFQSIPELIWYHQHNAAGLMTRLRYPVGLMGSCLPTTAGFSYEKWEIDPSELAFIKEIGSGQFGVVHLGQWRAHIQVAIKAINEGSMSEEDFIEEAKVMMKLSHSRLVQLYGVCIQRKPLYIVTEFMENGCLLNYLRERKGKLRKEMLLSMCQDICEGMAYLEKNCFIHRDLAARNCLVSSTCVVKISDFGMTRYVLDDEYISSSGSKFPIKWSPPEVFHFNKYSTKSDVWSFGVLMWEVFTEGKMPFENKSNLQVVEAISKGFRLHRPHLAPMSIYEVMYSCWHEKPKCRPTFAELLQVLTEFAETW	115141	20116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_21436_33337_33496_35060_35180_37276_37342_39318_39536_52830_53003_56385_56461_64968_65097_66596_66677_79200_79256_87528_87595_90606_90813_91777_91887_93691_93747_115052
870982	contig_7728_pilon	-	2113	9	Intergenic	novelGene_64698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	362.18909080755	130	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	35	853	752150	713693	FALSE	20	TGTTATGCATTTACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTAAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	752184	712432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716074_724856_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
870983	contig_8978_pilon	-	2670	14	Intergenic	novelGene_49470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	110	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGAAGGCTTTCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1772406	1684825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1684874_1696766_1696942_1743814_1743973_1745491_1745591_1747110_1747311_1749577_1749689_1750843_1751047_1753100_1753192_1754524_1755057_1758865_1759047_1762406_1762807_1764919_1765142_1770491_1770553_1772217
870984	contig_10311_pilon	+	2863	8	Intergenic	novelGene_50490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	62.6958970763166	280	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	228	1901	232199	251428	TRUE	20	TGGAAGTGTGTTTTGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSRVSRVEGTLQGASPDLALWGQEPSTSQSSLCPFGGAPRSSSCHFHRLVLLRTTLHHYPYAKKPFHTDVHRDNMDQSGVLLWVKAEPFIVGALQTPPPSKFSLHYLRKISAYVRTRATEGAYPRLYWSTWRHIACGKLQLAKELAWLYFEVFDSLVVRTPEERLEWSEVISNCTSEDEVEKQRNQLSVDTLQFLLFLYTQQLNKVSLRTSLIGEEWPSPRNRCQSPHVTEKSTCHDKNWNDYSHQAFVCDHLSDLLELLLEPEQLTTTFHSTHSSLVSREAVVALSFLIEGTVSRATKVYPFHELALWQPLHAESGFSKISKTFSFYKLEAWLRAHLTGNPFGTSACLKSGKKLAWAHQVEGTTKRAKIACNTHVAPRMHRMVVMSQVYKQTLAKSSDTLVGAHVKIHRCNEAFIYLLSPLRSVTIEKCRNSTFVLGPVQTALHLHGCDNVKVIAVCHRLSISSTTGCVFHILTPTRPLIFSGNQTVTFAPFHTHYPMLEDHMARTGLATVPNYWDNPMVVCRESSDTSVFRLLPPCEFYVFIIPFEMEGDTTEIPGGLPSVYQKALAQREQKIQIWQKTVKEARLTKDQRKQFQVLVENKFYEWLINTGHRQQLDSLVLPAAGSKQAAG	230061	255218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_230246_232155_232535_238596_238753_242425_242793_245763_245951_246100_246599_251298_251451_254278
870985	contig_16121_pilon	+	5845	1	Intergenic	novelGene_6872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	801	1256	42439	42894	NA	50	AACAAATAATCTGATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQPFTTSSSTRHSRFIPTTPSCLSKKIPFPFTIFIGSQSWACIRITLRDVLFEFFYKHRCLSSTSKQLTQLLEVVPWHLTAPQPIPVCNRPLTESLQLVRGLRQWLASLPHIRITWERFFQKTETTLGHYESESTGGHWVWFLSSRRLL	41638	47483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_41600_47500
870986	contig_6870_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_103950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTACATACATAGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256300	1257846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1256300_1257800
870987	contig_14322_pilon	+	457	3	Intergenic	novelGene_115641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376347	453133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_376514_404748_404839_452932
870989	contig_6007_pilon	+	1439	10	Intergenic	novelGene_87908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_2	33.8464214786967	7	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	28	1110	58259	80410	FALSE	75	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIIQRDESPMEKGLSGLRGRDFELSDVFYFSKKGLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	58231	80739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
870990	contig_12958_pilon	+	2267	9	Intergenic	novelGene_136193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCCAGAAGAGACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39798	70637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_+_40046_40925_41571_50898_51113_52404_52685_61223_61470_63128_63327_63529_63639_65623_65752_70437
870991	contig_12050_pilon	-	2136	7	Intergenic	novelGene_62736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	157.383466588951	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	264	950	697867	687356	TRUE	15	AATTGTGGTCATTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLQRNRTGQAEEESGDPRACRKQKRAGRPGLQTDGVGHTLEAQEELFLIEGLVFLTGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISVAQAILGGTARAQGLYETISVTIPPGTQTDQKIRMSGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRIPKRLTSRQQSLLLSYAEDETDVEGTVNGVTNTSAGGSTMDSSAGGEARREAGEDKEGFLSKLKKMFTS	698130	685535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687342_687460_693021_693120_694060_694177_695000_695130_696709_696882_697799
870992	contig_8823_pilon	-	2275	2	Intergenic	novelGene_53066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70277	66716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_67605_68890
870993	contig_13612_pilon	+	1763	9	Intergenic	novelGene_157295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	109.643099988098	2	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	153	1307	51083	57016	FALSE	40	GGGAGTAAGGGTCAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	50040	57472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56382_56881
870994	contig_19640_pilon	-	6058	20	Intergenic	novelGene_134853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_16	326.239965723786	248	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	70	2910	61278	23942	FALSE	30	TGGTTTTTTGATGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVIEPVGNREEKILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKHIYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKISHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLKLCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMDCFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGIYHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHCPLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWFSSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFNYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLRAICTRDPLSEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAMELLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNQLVRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILKQEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRSCAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDFLIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIAYIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN	61904	20793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_24213_24955_25108_25213_25332_25912_26084_38367_38447_39462_39585_40125_40233_43168_43341_45065_45170_45388_45554_45870_45953_46879_47005_51987_52123_52232_52386_52911_53018_55788_55875_57782_58029_59480_59732_61082_61293_61849
870995	contig_15236_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_141645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAATGTCGTATACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681002	679045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_679000_681000
870996	contig_15236_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_141643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCCGTGAACTCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679045	676187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_676200_679000
870997	contig_4315_pilon	+	2687	3	Intergenic	novelGene_46774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_2	30	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTGTGGTATGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291459	295154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_292076_292480_292598_293200
870998	contig_13481_pilon	-	2592	3	Intergenic	novelGene_119527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_2	440.5	109	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	230	544	1462670	1462356	FALSE	30	ATACTTGGTTTTAGAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKVAKPKEPITDVSVIIKSLGEEVPQDYVCIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLG	1501682	1460307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1462693_1473241_1473321_1501554
870999	contig_7919_pilon	-	3322	3	Intergenic	novelGene_28048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGCTCTAAGGCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977412	972454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_972721_973856_975381_975880
871000	contig_13016_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_178154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCTTCAGCAACTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442129	444358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13016_pilon_+_442100_444400
871001	contig_1331_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_37851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	557	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	478	1437	323	1759	194500	195936	NA	25	ACATGGATTTTTTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRSRRRAAAKWATVRANSGRTPADENEDDCELPPSPGDSSYYQDQVDDFHEARSRAALTMGWNELDSGDDEEDGEEEEEVLGLDIDDEDDEDGESVGDEEDGDDNDGGGSSVESETEASVDPSLSWGQRKKLYYDTDYAPKSRGRQSQQEVEEEEREEEEEAQLIQRRLTQALQEDDFGVTWVEAFAKPVTQVDEAETRVVKDLTKVSVKEKLKMLRKESPELLELIEDLKVRLTEVKDELEPLLQLVEQGIIPPGKGSQYLKTKYNLYLNYCSNISFYLILKARRVPAHGHPVIERLVTYRNLINKLSVVDQRLSSEIRHLLTLKDDTGKKELNLKVKSTKAKPKSVSETSAAASDVTDLSDDSNFDKEAALKYYKEIEDRQKLKRKKEESSTEEQALEDQNAKRAITYQIAKNRGLTPRRKKIDRNPRVKHREKFRRAKIRRRGQVREVHREVQRYSGELSGIRAGVKKSIKLK	194177	196377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_194200_196400
871002	contig_5894_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_83015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATAAGGGCAGCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268160	270652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_268314_268346
871003	contig_6710_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_98104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871004	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
871005	contig_12279_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_50121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGGTACCAGCATATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70854	69577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_69600_70900
871006	contig_4891_pilon	-	2005	13	Intergenic	novelGene_124514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.151427188454	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	196	1311	68026	30210	TRUE	35	ATTTATCAAGGTTAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92804	28978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_29132_29668_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
871007	contig_13558_pilon	-	7198	1	Intergenic	novelGene_123028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	6150	6449	498586	498287	NA	20	AAGCCATTTTTTCTGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPTPRGSLSGKQWHSQAAFENWALVLTQHWLSLTSQPMKRILKAGRDSDKANPFLSSQFQPTVTPCVTEQNCSIGFSWKSLWKQTGGALFRGTTGWV	504735	497537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_497500_504700
871008	contig_19352_pilon	+	4353	5	Intergenic	novelGene_122351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	663	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3902	4276	113293	123043	FALSE	10	GCGTCACCGCCGCCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTISPNFSLYRMVVLPAASNPTIKMRICFLPKRREKREEMVRPMAAAALAMGRSRRGFGRPRAFSFHTPGKLSQREEEELRKNESGRDCSPAGVSDEASGPGQKLAGRRPTRRLARQLRLQC	102300	123120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_106011_108444_108522_112803_112905_113279_113363_122738
871010	contig_10930_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_37116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339585	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339600_342100
871011	contig_16098_pilon	-	1430	9	Intergenic	novelGene_46028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1313.54758193223	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	349	1314	350452	348413	FALSE	20	TTTCTGGTACCAGACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352187	348296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350643_350765_350889_352152
871012	contig_4857_pilon	-	2787	7	Intergenic	novelGene_48638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	99.4977665857659	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	930	1364	443714	441598	FALSE	25	AGATTACTTGTTTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCGWISANPSPLLEKPLWNPKHGLNINLCGKTGQRCVSGFCMVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448342	440174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_443323_443592_443746_444432_444537_444997_445070_447620
871013	contig_15991_pilon	-	1090	6	Intergenic	novelGene_70864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3078.58314164162	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	72	512	105009	101983	TRUE	5	GTTGTGTTTGTTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	105080	100374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_101864_102271_103583_103703_104975
871014	contig_20951_pilon	-	1662	7	Intergenic	novelGene_43064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12436.9718145804	23	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	TRUE	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26922_27067_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
871015	contig_3956_pilon	+	2810	15	Intergenic	novelGene_15193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1082.03108333639	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	882	2649	1	2649	1282731	1290847	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1282730	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290377_1290624
871016	contig_5013_pilon	+	1877	9	Intergenic	novelGene_110078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_8	63.2879086003006	611	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	359	1456	26929	73947	FALSE	30	AAACTCTAGGATCTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIMDFNVKKLAADAGTFLSRAVQFTEEKLGQAEKTELDAHLENLLSKAECTKIWTEKIMKQTEVLLQPNPNARIEEFVYEKLDRKAPSRINNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIKCGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLKKAKTADTRASSEQELRITQSEFDRQAEITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQLTYYAQCYQYMLDLQKQLGSFPSNYLCNNNQSSIPPLPPASSNVVGPSAVASTSALVVTSPSNLSDLKECTGNRKARVLYDYDAANSSELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN	26570	74368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_27001_38458_38601_47358_47488_51196_51331_54379_54473_65168_65259_65641_65743_73234_73464_73839
871017	contig_7151_pilon	+	2719	6	Intergenic	novelGene_40720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2239	2556	266145	268467	FALSE	55	AAAAGAGAAGTCATTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPEPALELVQPVALITVGHPSCPQITETSSMSQPLLHTVPHSSLTFTSTLPVHLFSPATSLSCFSVSPREMVIKQALRSETRAIANGLKRTKHLLKSRRSRIFK	253441	268630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_254925_255565_255886_262717_263037_266028_266346_267398_267492_268443
871018	contig_7612_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_170368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219231	217975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_218000_219200
871019	contig_18081_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_23819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAATGGACCAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173388	174513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_173400_174500
871020	contig_5551_pilon	+	4551	2	Intergenic	novelGene_134256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1582	junction_1	0	130	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3404	3718	594233	594547	FALSE	45	TGATTTCTACTTACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFVSLFKKMSKTWPLPFETCYLDERTKKKLLLHAYPLLTSDFAVSASAGLICLSKSCPCSLGALPLQPSKTGIAGDKKYQLCLPSASLPSTFPFPVYQNQMS	587127	595380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_587333_591034
871021	contig_10019_pilon	-	1743	2	Intergenic	novelGene_86682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	191	430	261562	259667	FALSE	10	TTTGGTCTGACTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQRTAGSEPGRCEWQAQSPFPGARGAADCAGGRIRSSFRRGHHGSVDRLFQVLELRWVGESEMEVGAEAVVGEDGLRERRGLSEAGRQEQNRDVQPQSGSNMIPKHSYWLDVWLFILFDLVVFFFVFYTFCYHFGTVLNGE	261752	258353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_259716_261371
871022	contig_20199_pilon	-	941	3	Intergenic	novelGene_82557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	22752	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	198	533	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44184	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
871023	contig_15434_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_56709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAACAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37028	35765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_35800_37000
871024	contig_15899_pilon	+	3108	1	Intergenic	novelGene_128908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGGGACCGTGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27758	30866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_27800_30900
871025	contig_5698_pilon	+	2082	6	Intergenic	novelGene_55037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	910.591368287664	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCATTCATACTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7819	20807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8030_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
871026	contig_10904_pilon	-	2805	6	Intergenic	novelGene_22529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	518	junction_1	227.860834721547	410	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	480	1274	354975	352112	FALSE	35	CAAACCCACCCAGCAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362859	350580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_354962_354999_362403
871027	contig_7568_pilon	+	2441	1	Intergenic	novelGene_174007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCAATTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110655	113096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_110700_113100
871028	contig_4769_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_117974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAATCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427159	425316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_425300_427200
871029	contig_5628_pilon	-	2357	6	Intergenic	novelGene_157570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	183.923244860458	1768	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	41	982	282382	278863	FALSE	20	TAACTTGCGGCTTCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQGSCADALEVGMLLSKINSLAHLRAAPCNDLHATKLAPGKEKEPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGVRVADNLPVAIKHVEKDRISDWGELPSGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERSDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALPEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSPECQHLIKWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHSLSPEPNK	282422	277487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_279021_279775_279953_281469_281837_281925_281977_282079_282187_282300
871030	contig_20165_pilon	-	1346	7	Intergenic	novelGene_54470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_1	80.0888395609664	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	399	1049	58053	42201	FALSE	25	ACAGGCCCAGGACCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADGGRGAGRLDCRKPSSKTRREKERQSCKSCGETFNSITKRRHRCKQCSAVICGKCSEFKTENSRQSRVCKECFLTLSGEPTSPEVAVEPKKGTERPSAMDPQHSLLCGTLQLSEDGKAWSEVWASIPRTDPQALHLWGSSQDGQLPRTIPLPGCKVNAPDPAEKPDLRHLLKLHHAHLCLYLDTQTPELQQRWLEALSAAAHGDPVLPSPGTP	71245	41903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_42420_46775_46917_48370_48506_49897_50021_58020_58084_70009_70120_70987
871031	contig_11933_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_107247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAACCCAGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86442	88450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_86400_88400
871032	contig_5084_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_64538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATGGCATTACTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501484	499039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_499000_501500
871033	contig_19179_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_142372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAGCACACTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32699	35101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32700_35100
871034	contig_16934_pilon	-	3663	1	Intergenic	novelGene_132532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCCAGCATTATATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189547	185884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_185900_189500
871035	contig_7753_pilon	+	3872	1	Intergenic	novelGene_41506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	541	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231142	1235014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1231100_1235000
871036	contig_13571_pilon	-	4000	1	Intergenic	novelGene_128114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205240	201240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_201200_205200
871038	contig_6102_pilon	-	2290	7	Intergenic	novelGene_32211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_6	1584.45831087122	40	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	207	2189	899536	895000	FALSE	20	TTGGATGAACCCAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPHSKEAPTPSPVTPKGAPAPLPLTTPPTGAPAVPSTKGAPIPSPVTPPSSKGAPAAPSTKGVLTSPPVTPPPSKGASVLPPTTTPPKGAPPVPSTKKAPTPSPVTPPSSKGAPAAPSTKGVPTPSPVMTAPKGAPIPPPVTPPSSKGAPIPPPVTPPSFRGAPIPPPVTSPSSKGAPIPPPVTPPSSKGAPEIQSTKDVPTSLAVTPPKETPATPSPQSSPTPPASVTCPLEAIAPQPSKGLPTNKGPTAPKEALVAASPESASVITAPTQKGPSAKKGSVPSPSVCPDPAVKRGTGGPLSTVAAAPLLTVSSHSSPKTPKALPVSPTKGKDSVHAPNVPLALPPESKTSTPLATAASEKVLLKTGSVPVSPAPTPSVSLPLAPSAVPLLLPKQQFLPSSPGLVLESPCKPPAPADEDEMPPLIPPEPVSGGMPFQPVLVNMPIPKSAGIPAPAPSAKQPILKNNKGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	899742	894898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_898131
871039	contig_19352_pilon	-	1674	3	Intergenic	novelGene_122359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	438.5	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAGGATGTATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123120	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_113281_113363_122738
871040	contig_17274_pilon	+	1797	13	Intergenic	novelGene_26511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	140.471502645752	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1046	1507	121943	124457	FALSE	40	ATCTGAGAGAACTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVRYAGKGESCSAVTLVRDPIMRNVTSHLWKLRTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87749	124747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87870_95036_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_114494_114600_118530_118674_119766_119815_121902_122044_122741_122851_123427_123572_124349
871041	contig_6954_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_64449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCCCCTAACATGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537585	539362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_537600_539400
871042	contig_10159_pilon	+	3632	2	Intergenic	novelGene_30906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCTCATTATAGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009269	1016514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_1012872_1016484
871043	contig_3774_pilon	-	2956	10	Intergenic	novelGene_142036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	166	junction_8	118.716385755773	36	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	154	1143	210407	146363	FALSE	5	GCCTGTGTGTTGGACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWVVLLRRASCAGWNSLVLSLLLRGVRSFYRCRATPLPCPCWAQQSGIATPMAASLRGASLTSSSSTLSSDTDDDGVRGTCEDASLCKRFAVSIGYWHDPYIQHFVRLSKERKAPEINRGYFARVYGVSQLIKAFLRKTECHCQILNLGAGMDTTFWKLKDENLLPSKYFEVDFQMIVTRKIHNIKSKPPLSKPIVELHSEDTLHIDGHLLDSKRYAIIGADLRDLPELEEKLKKCQMNTQLPTLLITECVLIYMTPEQSANLLKWAANSFETAMFVNYEQVNMDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSM	210560	144549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_146469_152053_152146_153073_153176_167868_167990_175499_175603_191636_191699_193465_193543_198895_199018_200894_200987_210294
871044	contig_10126_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_105757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAGGCAAAACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165281	163835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_163800_165300
871045	contig_935_pilon	+	3213	1	Intergenic	novelGene_45563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAATAATTTGTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371567	374780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_371600_374800
871046	contig_5539_pilon	-	2454	3	Intergenic	novelGene_104779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACGTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302026	282431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_284498_287579_287921_301979
871048	contig_11574_pilon	-	2891	10	Intergenic	novelGene_64064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	302.043574650504	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	70	1560	456525	449652	FALSE	15	CATAGTTGTCGCGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIAEV	463696	448320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449660_451056_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
871049	contig_19737_pilon	+	2798	5	Intergenic	novelGene_158972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	590	junction_1	285.988636137872	819	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1217	1774	47207	50890	FALSE	10	TGCCTTATGTCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFSFLQVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFGSLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE	45990	51914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_47282_47575_47696_47781_47910_48698_48801_50757
871050	contig_500_pilon	+	1348	10	Intergenic	novelGene_31022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	840.965905563946	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	199	936	1492663	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485752	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496655_1497959_1498078_1498882_1498974_1499277
871051	contig_9436_pilon	+	2550	8	Intergenic	novelGene_60887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	145.505452594375	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	339	698	349921	350577	TRUE	25	AATGGGAACTGCCTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFCCFRAQHVGQSSSSTELAAYKEETNTIAKSDLLQCLQYQFYQIPGTCLLPEVTEEDQGRICVVIDLDETLVHSSFKPISNADFIVPVEIEGITHQVYVLKRPYVDEFLRRMGELFECVLFTASLAKYADPVTDLLDRRGVFRARLFRESCVFHQGCYVKDLSRLGRDLRKTLILDNSPASYIFHPENAVPVQSWFDDMADTELLNLIPIFEELSGAEDVYTSLGQLRAP	344100	354285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_344196_346361_346401_346873_346976_347550_347608_349875_349969_350106_350293_350451_351298_353153
871052	contig_15732_pilon	+	3318	1	Intergenic	novelGene_88924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTACAAAGTATGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388230	391548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_388200_391500
871053	contig_1452_pilon	-	2042	3	Intergenic	novelGene_115156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	65	ATCACTAAATACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
871054	contig_5316_pilon	+	2208	8	Intergenic	novelGene_61216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	357.809777304497	4	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	283	1212	453918	550408	FALSE	30	ATTAACATGCTTGTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396077	551404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_540954_550242
871055	contig_2069_pilon	+	1727	11	Intergenic	novelGene_23265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	353.384846873773	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	137	979	333898	341321	TRUE	15	ACTATCCCTGGCCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324050	344279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341467_343552_343628_343751
871056	contig_8106_pilon	-	1917	4	Intergenic	novelGene_139745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	125.867655363348	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	112	708	134968	128810	FALSE	50	ACCATAAGATTATTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCSQVKPPPQGTFQVLRGNGTSVGTVLLFHCPSGHQMGGSGLVTCAWKGSVAEWSSGTPTCKSVPPHETFGFRVAVIASIVSCAIILLMSVAFLTCCLMKCVKRTEKRHSDRTAQLWYQLRGKDLETLQAASLGLKGLNNNNNSHPSCQPRLGEAALQAHDNHCFTSDHGKGTTELASMGPSVNKHPWTPLPDALSPSVSRVMVHIESPAQTLPASGPTPEMPGMPGQVSANLG	135079	127600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_129015_131522_131688_132743_132892_134889
871057	contig_16846_pilon	+	5052	22	Intergenic	novelGene_82851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	60.246545614694	207	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1066	3201	11	3211	83344	144358	FALSE	45	GTATTGGAAAAAACTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEEEPHAEGAAVVATAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVIHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGVMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKFEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFDFCWTLFVYTKGNFHMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIICPNRRDLLNPSFKGLPPDFHTADFRASEEPPCIIAELCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTGDTPSGKLTARASVECNLQQHFEKKRTFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQGIVAGLKNAPSQQLINIFESCMRNPMENITKMVKGIGESFCQHYTQSTDDQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKMLETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGSIQGHLPMMPTSPIMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDLPKEMLMDKMITEGAKLKIAPSSSIITENISVSPGQSLLTMATATVTGTIGQKVTIPCHGIANDAEGITLIPTCMNTTQESKMESPVSLTAQSLIGASPKQNHLTKAQEVHPTGISKPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDISNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCSFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVTFNENINGDIEMTDCDLEDATKTPDCFSGSVREERGDLIKFYNTVYVGRVKSFALKYDLSNQAHMMEAPPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYVSPHKNGAGLTPRSALLYRFSGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRAITIDGDAESPAKRLCQENDDILLKRLQDVVSERAHH	83333	146199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_83500_86821_86956_94596_94798_95178_95244_95337_95467_95577_95739_97776_97827_98441_98629_102424_102592_105105_105219_105411_105516_108349_108488_110175_110335_116052_116186_126755_127023_130106_130319_134929_135107_136594_136667_138172_138264_140340_140490_142044_142210_144187
871058	contig_9668_pilon	-	6182	1	Intergenic	novelGene_58066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATGTATATCACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35215	29033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_29000_35200
871059	contig_3584_pilon	+	2345	10	Intergenic	novelGene_108151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.901044204948	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	273	1169	351589	366078	FALSE	10	GACTCTGCTTTCTCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESVDDINADKNVSSAQIVGPGSKPEASAKPPSRPADNYDNFVLPELPSVPDTLPTASAGAKTSASEDIDFDDLSRRFEELKKKT	341283	367254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341443_350949_351051_351576_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353469_354411_354619_355225_355319_356498_356548_365878
871060	contig_9909_pilon	-	3670	1	Intergenic	novelGene_42463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2974	3276	542360	542058	NA	35	CCTATGAAACTGGTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSWLKALTKCPEKQSSSQVKYRRMNVSSTLRKSLDWDGPWEGKVKEAKRKREETGGWGRQREGVGERVRAGSNKQLNMPLLSNYLPGTELARNRISQHR	545333	541663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_-_541700_545300
871061	contig_6488_pilon	+	4995	24	Intergenic	novelGene_44766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_20	49.4991168697833	153	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	1068	3353	217775	267711	FALSE	20	TAAAGGCCTCTTCTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPPVSGTFKFNTEAAEFIPREEKNSSLNCGTQRRLDCNRIGRRNYSSPPPCYLSRQVPYDDTSAVHQHSYHPSGSKPKSQQTSLQFPASNKSPKSHGPQSQPWQKSRSEKHQTRFKKAQGLTDQTSDTAGLESVAKSENGTNPREHSPSESEKYAVGADPRGAKPKKATQFVCSYGRGPKVKGKPKCEWGNRVTLKPEDARPENTKPGGVIHPDSLDASFRKGALDGYGARRSEQRRYPQKRPPWEVEGARPRPGRNPPKQEDQRHANTGLRNTAPILKDNLNERPAKSTCDNGHVAIVSKPSRRIDPEKRSVRRQDPLGASPFHRGKQNHVLKNVETHTGSLIEQLTTEKYECMVCCELVRVMAPVWSCQSCYHVFHLSCIKKWARSPASQADGQSGWRCPACQNVSAHVPNTYTCFCGKVKNPEWSRNEIPHSCGEVCRKKQPGQDCPHSCNLLCHPGPCPPCPAFMTKTCECGRTRHTARCGQAISVHCSNPCGNVLNCGQHHCAELCHGGQCQPCRIVLNQVCYCGSTSQDVLCGTDVGKSDGFGDFGCLKICGKDLKCGNHTCSQVCHPRPCQPCPRLPQLVRSCPCGQTPLSQLLELGSSGRKTCMDPVPSCGKVCGKPLPCGSSDFIHTCEKLCHEGDCGPCSRTSVISCRCSFRTKELPCTSLKSEDATFMCDKRCNKKRLCGRHKCNEICCVDKEHKCPLICGRKLRCGLHRCEEPCHRGNCQTCWQTSFDELTCHCGASVIYPPVPCGTRPPECTQTCARVHECDHPVYHSCHSEEKCPPCTFLTQKWCMGKHELRSNIPCHLVDISCGLPCSAMLPCGMHTCQRLCHKGECAVDEACKQPCTTPRADCGHPCMAPCHSNSPCPVTACKAKVELQCECGRRKEIMICSEASSTYQRIAAISMASKITDMQLGDSVEITLITKKEIHQARLECDEECSALERKKRLAEAFHISDDSDPFNIRSLGSKFSDNLKEDARKDLKFVSDIEKEMEALVEAVNKGKNIKKSHCFPPMNRDHRRIIHELAQVYGLESVSYDNEPKRNVVVTAVRGKSICPPTTLTGVLEREMQSRPPPPVPHHRHQTDKNSGSSNLQKIAKEPVIDYFDVQD	208720	269353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_208742_212297_213303_217733_217893_218715_218794_222423_222530_225902_225975_230494_230635_234102_234203_234286_234505_237027_237126_240726_240758_244236_244317_245212_245322_249870_249991_250674_250755_254482_254714_255654_255729_257566_257666_258586_258629_263447_263547_264155_264223_265391_265538_266260_266366_267638
871062	contig_19647_pilon	-	3160	3	Intergenic	novelGene_144007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	744	junction_1	161.5	1349	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCGTGACTGGTGTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90491	73378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284
871063	contig_5005_pilon	-	1981	5	Intergenic	novelGene_84317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	328.639144807797	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	108	419	539718	515683	TRUE	45	AAAATGCACGAATTGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSRLCCYSCCHFFVVGEHFSLG	539825	511516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520558_520621_521921_522041_539649
871064	contig_17281_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_105192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACATGGTACTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3500
871065	contig_11098_pilon	+	4024	18	Intergenic	novelGene_166678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_17	133.391714438974	739	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	52	2703	23788	64242	FALSE	20	GGTTAATGGTTTCAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFSPELIDYLEGKISFEEFEGRREERKNREKKSLQEKRKLSAEENKNDFEVPSSSGILSTKSQNKDVNDGETSDGVSKSVHKVFASMLGENEDDEEEEDEEEEEEETSEQPTAGDVFVLEMVLNRETKKMMKEKRPRSKLPRALRGLMGEANIRFARGEREEAILMCMEIIRQAPLAYEPFSTLAMIYEDQGDMEKSLQFELIAAHLNPSDTEEWVRLAEMSLEQDNIKQAIFCYTKALKYEPTNVRYLWERSSLYEQMGDHKMAMDGYRRILNYLTPSDGERFMQLARDMAKSYYEANDVTSAINIIEEAFSKHQGLVSMEDVNIAAELFISNKQYDRALEVITGFSGIVLEKRTTEEGTLEENKAGESVSCTIPDGVPIDITVKLMVCLVHLNILEPLNPLLTTLVEQNPEDMGDLYLDVAEAFLDVGEYNSALPLLSALVCSERYNLAVVWLRHAECLKALGYMERAAESYGKVVDLAPLHLDARISLSTLQQQLDRPEKALEALEPMYDPDTLAQDANAAQQELKLLLHRSTLLFSQGKMYGYVDTLLTMLAMLLKVAMNRAQVCLISSSKSGERHLYLIKVSRDKISDNNDQESANCDAKAIFAVLTSVLTKDDWWNLLLKAIYSLCDLSRYEEAELLVDSSLEYYSFYDDRQKRKELEYFGLSAAILDKNFRKAYNYIRIMVMDNVNKPHLWNIFNQVTMHSQDVRHHRFCLRLMLKNPDNHALCVLNGHNAFVSGSFKHALGQYVQAFRTHPHEPLYSLCIGLTFIHMASQKYVLRRHALIVQGFSFLNRYLSLRGPCQESFYNLGRGLHQLGLIHLSIHYYQKALELPPLVVEGIEVDQLDLRRDIAYNLSLIYQSSGNIAMAQKLLYTYVSI	23736	65563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_23890_24877_24990_28759_28948_29699_29824_31554_31747_32261_32428_34099_34248_35560_35634_39911_40016_40988_41161_43709_43913_44233_44336_45707_45844_48298_48537_49226_49418_58975_59101_62670_62824_64119
871066	contig_10000_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_139356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCGCCGCTCTCCTTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359152	361562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_359200_361600
871067	contig_500_pilon	+	2432	1	Intergenic	novelGene_30978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1010	1447	1458470	1458907	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVRKLLRPQTLHNELGDRTEARNKLLGQLSEMSHETMTLNRQTKEPNSIRFLVVHKQPQLLLFCCCHKYICHIAFPSSTFTGVQLIDSSCNNRLCNPTLNQCDFSITKTLIYLYIYTYIYDFYCSKYIGNKAFDISVVFTYTVQ	1457460	1459892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1457500_1459900
871068	contig_19210_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_168937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGGCAACAGGCACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214496	216891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19210_pilon_+_214500_216900
871069	contig_12157_pilon	+	7068	1	Intergenic	novelGene_135914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCATTTCCTTTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182839	189907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_182800_189900
871070	contig_18473_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_169647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTCTTTGTTGTAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93470	91847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_91800_93500
871072	contig_8357_pilon	-	2594	19	Intergenic	novelGene_39749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	223.340664611566	1	124	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	958	1968	790756	762891	FALSE	60	GAGAAAATAAATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDLLPIENDTYKYKTDEKEKEAVLEEDDDLWVRIRHRHIAVVLEEIPKLMKEISSTKKATEGKTSLSALSQLMKKMPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	818369	762264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647_784714_787909_787968_788105_788202_790715_790831_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135_802215_806917_806995_808080_808163_808646_808821_818245
871073	contig_19132_pilon	+	5279	1	Intergenic	novelGene_170001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAAAATTACATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389004	394283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_389000_394300
871074	contig_6270_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_99850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	278	652	431699	432073	NA	45	CAAAGTGACACATAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKTKILTTGPVNNIVINREKIEVVKDFILLGSTINAHGSSSQEIRRHIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQAIVFSVASYACESWTMNKEDRRIDAFKLCCWQRILNIPWTAKRTNKSVVEEVQPECSLEARMVRLHLTYFGHVVRRDQSLEKDIMFGKVEDQRKRGRPSARWIDTVAATMSSSITTIVSMAQDQAVFRSVVHRVTISRN	431421	432294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_431400_432300
871075	contig_5260_pilon	+	4262	1	Intergenic	novelGene_144355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	780	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3713	4033	100134	100454	NA	25	ATTGTTGAATGGTCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQHPVSFSLFKTLTTRAVAPDPRLPPRLGVSKQFIKLLHPLIPWPTLDDGVHKVCTVRQAREGSPGSFATVIVRHVLRGGSGHRLGSGCLERSCHRASAAGLGAG	96421	100683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_96400_100700
871076	contig_9049_pilon	+	1698	8	Intergenic	novelGene_83129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1469.82804769671	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	50	742	88356	112652	TRUE	40	ATTATCCTTTTAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88306	113801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112793_112985
871078	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657508	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657509	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871079	contig_2046_pilon	-	3100	17	Intergenic	novelGene_151557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	53.7686014324345	469	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	728	2038	43729	15125	FALSE	15	TCATATAGGTTCTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYFSTESEGCSPSHVTVLCRGRVFVFDVMHEGCLITPPEICRQLTYIHKRCHSEPDGPGIAALTSEERTQWAKAREYLIGLDPQNLTMLEKIQSSILVYGMSDGSPHVTPEDYSQVTAMILTGDPTVLWGDKSYNLISFSNGVFGCNGDHAPYDGMIIINVSRYVDEKIFENEGKWKGSEKVQNIPLPEELVFTVDEKVLNDIKQAKAQYLKQASDLDIVVYAFTPFGKKLTKKKMLHPDTFVQLALQLAYYRLHGRPGCCYETAITRYFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPYAHLHERRQKMLQAFAKHNEMMKDCSNGKGFDRHLLGLSLIAKEEGLPVPEIFTDPLFSKSGGGGNFVLSTSLVGYSRTRGLVVPMVHNGYGFFYNIRDDRFVVSCTAWKSCAETDAEKLVQLVFHAFHDMMQLMNTAQL	61914	14062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_-_15246_26067_26188_26314_26409_26499_26579_28131_28256_32938_33070_33607_33716_33796_33881_38541_38644_40137_40264_40376_40471_42474_42584_43710_43834_44005_44188_45848_45974_53544_53681_61734
871080	contig_11720_pilon	+	1641	9	Intergenic	novelGene_44001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_5	295.124549978479	2	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	362	1402	266216	272210	FALSE	55	AAAATCATTCAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	265854	272449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
871081	contig_6710_pilon	-	360	2	Intergenic	novelGene_98297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	3	359	657517	653571	FALSE	25	AGTGTTAGAGGGAGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRD	657519	653569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871082	contig_13349_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_161139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGCCTATATGCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395982	393842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_393800_396000
871083	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_96292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871084	contig_15039_pilon	+	3399	1	Intergenic	novelGene_110177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATAGGGCAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341835	345234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_341800_345200
871085	contig_15732_pilon	-	2041	7	Intergenic	novelGene_88829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACTGCTCAGGGGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185804	10996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_11276_53524_53924_97592_97748_110634_110774_126354_126489_153773_153880_184975
871086	contig_7963_pilon	-	1052	6	Intergenic	novelGene_58347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAACCAAGTTCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48917	38375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
871087	contig_6446_pilon	+	4386	1	Intergenic	novelGene_149199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	466	981	256778	257293	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLNADCRCVRSILLSLISCRVCHLAVQFDRHLCTKVLTAFQICLARLARIYSDTKMNLSRVLWFHDLLYNINLAAVLLSHFLSPLKLTLTFYYWVCSVPRLKHKGKNLPCHNIKINGRVSSTLLGKVESFWKNYDVNLFLYFLFVLVNRKAQLEYTYGWGYMFKVHKLF	256312	260698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_256300_260700
871088	contig_3948_pilon	+	2859	1	Intergenic	novelGene_53267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACCCACGACCCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387649	1390508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1387600_1390500
871089	contig_17074_pilon	+	3275	1	Intergenic	novelGene_145195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTGAAAGAAAAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639516	642791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_639500_642800
871090	contig_5999_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_45653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACTCATTGCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273151	275429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_273200_275400
871091	contig_19518_pilon	-	1798	6	Intergenic	novelGene_170734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	79.6768473271878	829	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	52	945	69018	61148	FALSE	30	TATGAAGTTAAGTGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPEYRKFLESYATDNEKMTSTPETLLEEIEAKNRELIAKKTTPLLSFLKNKQRMREEKREERRRREIERKRQREEERRKWKEEEKRKRKDIEKLKKIDRVPERDKLKDEPKIKLLKKPEKGDEKELDKREKPRKLDKENLNDERASGQSCTLTKRSDSELKDEKPKRPEDESSRDYRERERDYDRDQERILRERERLKRQEEERRRQKERYDKEKAFKRKEEEMKKEKEALRDKGKKNESTESIGNSEKTEKKEEVVKRDRIRNKDRPAMQLYQPGARSRNRLCPPDDSTKSADPAIEKKQESAISHRKEGGEE	69069	60294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_61298_63873_64169_64547_64709_66981_67165_67631_67676_68957
871092	contig_6217_pilon	+	2849	19	Intergenic	novelGene_109622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGCGGCGGCCGGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435505	626313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_435611_439645_439816_442454_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450487_451197_451380_452300_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464552_466578_466672_467011_467095_468432_468522_494615_494684_506159_506290_618089_618255_625864
871093	contig_8866_pilon	-	1679	2	Intergenic	novelGene_77776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCAGAATTTCAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348951	340774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342342_348839
871094	contig_9297_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_69895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	59	328	939250	939519	NA	40	AGATTTGTTCTGATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQPSPPPQPYPLRLVISKMAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKVSPAMAGAQLAGLVPSGSGSLTGPPFLRGTTAGCPVPSRRMAQCGTKLLGRTWRHAQSPGPRLP	939191	941584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939200_941600
871096	contig_3948_pilon	-	2836	17	Intergenic	novelGene_53360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	301.860629833952	25	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	386	2110	1792685	1755173	TRUE	30	TAAGAACTGAGATTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVTTSYSFDAPTDYINFTSLNDEEDNENVDSWFEEKANLENMFLRKNGTGGPFQGKTPLRKSNRQQAIVTPLRPVENTYYKETEKENQLEQSIPSNTCSSLEVGGNTSRNTPAHPLRRSVRLSAQKDLKQKHHVKMKAKRSVTPGITNEIPPSKKMKVSNNKKKPEEEGNAHRDTPEKAKSRHTIPCTPPVRQKVIKSTEEQELEKRTRMQQAVVEMRKKNEEFKKFALAGAGQLVKKSVSQVTKSVDFHFCTDERIKHHKNQEYKEVNFTSELRKHPPSPARVTKGGCTIIKPFNLSQGKKRTFDETASTYVPLAQQVEAFHKQTPSRYHLRSKKDDIGLLPSKSAVAKICRDPQTPVLQTKQRTRPVTYKSAADQEAELLEKLQQYKFKAQELDPRILEGGPILPKKPPVKPPTQPIGFDLEIEKRIQERELKKKPEEEHFEFHSRPCPTKILEDVVGVPEKKVLPITVPKSPAFALKNRVRVFSKEEEEEEEPVMIKAQPVPHYGVPFKPQIPEARTLEVCPFSFDSRDKERQLQKEKKIKELQKEERCPSSRHFLCRILTPLTCQRRR	1805537	1747170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1747538_1749489_1749657_1750365_1750478_1755092_1755242_1755628_1755806_1757607_1757704_1770456_1770674_1771185_1771328_1774315_1774491_1775519_1775666_1776753_1776876_1778343_1778446_1779326_1779450_1785358_1785486_1789686_1789810_1792579_1792755_1805221
871097	contig_6544_pilon	-	4071	9	Intergenic	novelGene_142103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	43.5500789321902	135	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	389	2125	144695	118152	FALSE	15	CATATTTTCTTTTCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEDSPFTSDKHAQFIMAQINRMRNGQHFCDVQLQVGKETFNVHRLVLAASSPYFEALFTGGMKESLKDTVQILGIEARIFRILLDFIYTGIVNIGVNNVQELIVAADMLQLTEVVNLCCEFLKGQIDPLNCIGIFQFSEQIACHDLLEFTENYIHVHFLEVHSGEEFLALTKDQLVKILRSEELSIEDEYQVFLAAMQWILKDLGKRRKHVVEVLDPIRFPLLSPQRLLKYTEGVSDFNLRVALQALLKEYCEVCKSSKENKFCSFLQTSKFRPRKKARKYLYAVGGYTRLQGGRWSDSRALSCVERFDMFSQYWTTVSSLHQARCGLGVAVLGGMVYAIGGEKDSMIFDCTECYDPVTKQWTTVASMNYPRCGLGVCVCYGAIYALGGWVGAEIGNTIERFDPDENKWEVVGNMAVSRYYFGCCEMQGLIYVIGGISNEGIELCSFEVYDPLSKRWSPLPPMGTRRAYLGVAALNDCIYSIGGWNETQDALHTVEKYSFEEEKWVEVASMKVPRAGMCVVAVNGLLYVSGGRSSSHDFLAPGTLDSVEVYNPHSDTWTEIGNMITSRCEAGVAVL	148082	116205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_118377_121580_121802_127951_128075_129165_129304_132503_132672_133185_133342_139669_140102_144421_144745_147743
871098	contig_6503_pilon	+	5383	1	Intergenic	novelGene_145762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCATGCGGAACCACCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134488	139871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_134500_139900
871099	contig_6375_pilon	+	3588	2	Intergenic	novelGene_72952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	0	773	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1040	1444	200866	201351	FALSE	20	GACGAGGCCAGTCAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAVLPITIHFPSVGNGTGAGSKSFHMALLLPSKLTRDATSEYLLFVLTQAVFMYWLSSNMFSLGQVACLRIPAVRTVLKIPQRVVHDPDKLAPREGFVKSFKRGWRNAEIAHQMQERERRMQNHLQLAARGK	199826	203495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_201182_201262
871100	contig_4519_pilon	+	2930	3	Intergenic	novelGene_123745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	3.5	190	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	230	478	811075	816355	FALSE	10	CTTGTTTTTATGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVSPSPSSAVSLVTATGHPFGLQARRCVIFCAPEAKIPALVHVENALPGGSHGKLGRRRRCETAGPTALLLDPVIMAVFHDEVEIEDFQYDEDSESYFYPCPCGDNFCITKEDLENGEDVATCPSCSLVIKVIYDKDQFMCGETVPAPSTNKELVKC	810845	818807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_811183_811643_811719_816289
871101	contig_11096_pilon	+	2671	1	Intergenic	novelGene_143480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTGTGGTGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266866	269537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_266900_269500
871102	contig_366_pilon	-	2263	10	Intergenic	novelGene_51586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_8	559.387186742204	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	657	1403	780147	757099	FALSE	35	AGGAAATGAGATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803471	756238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802196_802279_802934
871103	contig_2358_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_156105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAGCGACGGTACACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70784	73214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_70800_73200
871104	contig_6608_pilon	-	3633	17	Intergenic	novelGene_162533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_3	190.74754257919	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	34	1965	187948	143062	FALSE	45	AAATAAATAGCTTTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSKVSDVKRPDMDDIADRMRMDAGEVTLVNHNSVFKAHLLPQTGLPEDQLSLSDHQILPSRQGNLDRSFTCSTRSTASDPNYYSDSPSSDSFLGSGDLRTFGQSANGQWRNSTPASGSALQKSRNSRSLFLETRKTSSGLSNTFMGKSNHHCHMSAYEKSFPIKPVPSPSWSGSCRRNLLSPKKTQRRHVSTAEETVQEEEREIYRQLLQMVTGKQFSVAKPTTHFPLHLSRCLSSSKNTLKDSLFKNGNSCAAQIIGSDTSSSGSASILTTQEQLSHSVYPLSSYIPEVVPSGSKDSDSLHQSHHHHSLPYQPDNLPASNTQSEGSDSVILLKVKDSQAPASSPTFFQAELWIKELTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQRLQEHSAHDSVELHLRVPLEKEIPVTIAQETEKKGYKLTDSKDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDEVLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLKMAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACKILLQYLKQESFDKKREVFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINFTQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL	187981	141393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_143125_144128_144225_146706_146792_148226_148307_149187_149392_160000_160133_161048_161199_161382_161468_162420_162460_167786_167842_169360_169648_169729_169834_177784_177957_179571_179732_185007_185093_186343_186475_187944
871105	contig_3155_pilon	+	4597	3	Intergenic	novelGene_26439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2655	3005	312729	313079	FALSE	30	GGGTATTGAGGATGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFQVPSHSGFFPLCELQFLRFGWEGSLRTGSWPFWSLTSRVWDWTERCRTLQGYSTGPGPRVREESLRPIQVMEYLKVKMHYKVHHKIPIMDFFICFLTYLCSLLERRLKIPEV	308345	314671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_308499_309012_309115_310329
871106	contig_16492_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_100282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTCAGTACACAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97712	101155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_97700_101200
871107	contig_9463_pilon	+	1796	8	Intergenic	novelGene_83834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	123.814871679373	245	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1039	1407	222660	223028	FALSE	10	ATTTGTTTCCTATTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLHSSDKNVFPYSTPDHVCSEGLDAVGDSKQGAVSPSFALRQAAPSVLIFHPGIPIYQPHRIVARDSRPRASTLLLGNVPLAYLLSNNPMSPGTRPHCPTFPASETPIYSPARLDSDSCP	185952	223417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_185978_216045_216109_216587_216627_216769_216845_217424_217462_218620_218671_219238_219290_221961
871108	contig_10197_pilon	-	2834	9	Intergenic	novelGene_115294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	45.0742443086958	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	54	2204	1287201	1265795	FALSE	5	TGTGCCCCTTATTGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFCKEGGNRKFQEKDYMGAAVLYSKGVSHSRPNTEAISLCYANRSAALFHLGQYETCLEDIIRAQSHGYPERLQPKMMLRKAECLVTLGRLQEASQTISDLEGIFAARPTLAASHFQVLQRNLHHLKTKVQEKENISETFPAAPTKAFKDMDLMEESEQIPSASSSVSLCTDPLKGRYLIATKDILPGEILVKEDAFVSVLNPGEMPQLHHGLESKWDTRVTNGDLHCHRCLKHTLATVPCDQCSYAKYCSQECMQQAWELYHSVECPQGGLLLTLGVFCHIALRATLLARFEDSGKVIRKLCGEISNKDICLPESENMLKTLSCNLGENEENGKIVETPIPGCDINGKYENNYNAVFNLLPHTENHSPEHKFLCALSVAALCRQLEAASFWALKPDLKSSKPKAAVTPALSPELNIWGVVMLRHVLQLQCNAQAITTIQQTGSKESIITDSRQVRLATGIFPVVSLLNHSCSPNTSVSFISTVATIRASQQIGKGQEILHCYGPHESRMGVAERQQKLRSQYFFECNCPACHEEPRATAGPRWEAFCCHSCRAVMQGDDVLSCGNRSCMESVSRGHLVSRLQDLQQQVGMAQKLLRNGKLEQAIQQLLGCQRDAESFLSAEHTMVGEIEDDLAQAYAALGDWQKSATHLQKSLRVVEVRHGPSSIEMGHELFKLAQIFFNGRAVPEALNTIQKAEKVLSIHCDPWSDEIEELRKMRSCLLNLPPVPVGPSG	1287254	1265164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569_1268703_1269927_1270089_1270750_1270934_1280832_1281995_1283361_1283452_1287174
871109	contig_13004_pilon	+	4647	1	Intergenic	novelGene_112720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	353	652	886955	887254	NA	30	TGACCCAACAATTCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSASEKIIALEALWGSSTLSYRVTVSQNRPDGNRFGLVYIYISRSTWVVQTFKGWWFKSTQRMKDLVIYFQKNQPLKTLWSTVLLWHTWGCHESEWT	886602	891249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_886600_891200
871110	contig_10352_pilon	+	818	3	Intergenic	novelGene_49599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_2	59.5	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	514	816	16052	22760	FALSE	50	GATAACTAAAATACGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFLFTDNWAELMEVNHDDKVVMTEHFDLSQEMERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVS	15538	22762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_16264_21362_21430_22736
871111	contig_5727_pilon	-	2969	9	Intergenic	novelGene_7954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	2466	2969	171302	168183	FALSE	20	AGAGCTCCGACTCGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFFVCGVVCCGVVISSSASCRNPFLSVLPWGFPQELAVASGLGIVLRCTPTSSSVRRSTETRSTPFCNRTLHFGGLTTKNLQKNNINGWGGDGKGQMKNLHRELSSCHRSCLLRIRSSGTGKGKGRGTENKKRGREGGGRSRGRLETLSSEESLLQPPPGTRCHLH	175514	168182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_168382_169823_169946_170281_170348_171185_171328_171890_171992_172571_174120_174208_174300_174717_174862_174958
871112	contig_1575_pilon	+	1583	2	Intergenic	novelGene_45178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGATACAACTCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134320	136514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_135824_136434
871113	contig_10064_pilon	+	3035	8	Intergenic	novelGene_122707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	68.6677894366962	455	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1726	2286	268353	273630	TRUE	35	TGGTTCAAACACACCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCPDQKCLYTCQIKDGGLQPQFEIVPEDNPQNAIVSSSADVCHEELLKTIRASAGRLTPSLLPSGADFFGFSHPTIHNLIQSCPGARKCVNYQWVKFDVCKPGDGQLPQGLPENDAALSFEAFQRQTFEDQNDPILPGSLDLPELQPAAFVSSYPPMFLTHEPLVETHLQHLKSPVQCSPTRSSD	264402	338301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_264725_266181_266253_267020_268419_271806_271905_272159_272271_272657_272798_273484_274332_338253
871114	contig_13958_pilon	+	5964	1	Intergenic	novelGene_129540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	109	495	187484	187870	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGVGTRWCPVYGASWCRWRRGGRRGFPSSGLRSARMLPGLAAATAAHRCSWSSWCRLRLRCRAAARGSGYQQGEFPSPAATLRSPAGGPGRARCLALGQFASFPFLNPGTFLAGVRRCNSSCPVEGLFDWHLLTPVPPTVLTRPPGNTRAVAGRVGPKKHKTL	187375	193339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_187400_193300
871115	contig_1107_pilon	+	2749	1	Intergenic	novelGene_126529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTTTTAGTCCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38977	41726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_39000_41700
871116	contig_14882_pilon	-	3278	14	Intergenic	novelGene_115022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	347.596498031535	177	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	535	1410	317300	301744	FALSE	50	ATGAAAAAGGAGAAGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSRSLAFQE	363661	299875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_301766_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317321_320747_320816_321327_321410_321539_321642_321721_321739_363416
871117	contig_8866_pilon	+	2269	2	Intergenic	novelGene_77784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTTCCTGTAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341093	349807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_342356_348800
871118	contig_8138_pilon	-	2758	4	Intergenic	novelGene_52499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	200.110525016108	149	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGATGCTTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481960	460629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_463007_470224_470296_472816_472953_481786
871119	contig_2062_pilon	-	2870	3	Intergenic	novelGene_139027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_2	89.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	76	975	1183113	1168954	FALSE	25	TAATATTCTTCATCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEVKKCRPQNKPQKGLNHDLPRRHSMDRQNSQEKAVSAVAYGARSPCASPGQSPPTGYSILSPAHFSGPRSSRYLGEFLKNAIHLEPHKKAMAGGHVFRNAHFDYSPAGLSVHRAGHFDAPVQFLRRLDLSELLTHIPRHKLNTFHVRMEDDAQVGQGEDLRKFILAALSASHRNVVNCALCHRALPVFEQFPLVDGTLFLSPSRHDEIEYDVPCHLQGRLMHLYAVCVDCLEGVHKIICIKCKSRWDGSWHQLGTMYTYDILAASPCCQARLNCKHCGKPVIDVRIGMQYFSEYSNVQQCPHCGNLDYHFVKPFSSFKVLEAY	1183188	1167058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1169119_1174187_1174343_1182533
871120	contig_5945_pilon	+	3286	2	Intergenic	novelGene_104543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	749	1426	196496	197173	TRUE	75	ATAAAGTAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALLGLKPEVQDTCTSLGLMLSVVLFMGLARVIARQRLHSPKAHAFVLEFLATFQLCCCTHELLVLSEQDPANPTWPLTLIYFFSLVHGLTSVGTASNPCGVMMQMMLGGMSPELGAIGLLAQLISALCSRYCIGALWSLRLTKYHVSERSFACRNPIHVDLPKAVVIETIFSFIFHSALLHFQEIRTKLRIHLLAALITFLVYAGLLLPRNTWHVQNLYDMTL	195747	200716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_198649_200331
871121	contig_4908_pilon	+	2279	6	Intergenic	novelGene_117370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	111.550168085933	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	329	700	51458	60051	FALSE	25	CTGAAGACTAGTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWSRFYSTCHNYFIEDLGLPVWGSYTVFALATLLSGLLLGLCMIFVADCLCPSKRRRPQPYPSKKLLPESSQPLKKVEEEQETDEGDVSEEEAESEAGTKSGFSENALRQRSVGPSPRMEES	43762	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_43940_49589_49636_51352_51482_53724_53827_53950_54018_59872
871122	contig_13558_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_123020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	56	619	41097	41660	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	41041	41887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_41000_41900
871123	contig_3382_pilon	-	3976	12	Intergenic	novelGene_124031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	353.343066033635	23	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3451	3774	183973	176852	FALSE	15	CATTTGGCGTTCATTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGALHRDPEYWPQPEAFDPERFTAEARRQRRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLRVLRKFRFQACAETQVPLQLESKSALAPKNGVYIKIVPRQAGRPP	344851	176649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_186176_189061_189154_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_306326_306380_309848_309943_344645
871124	contig_12157_pilon	+	2724	1	Intergenic	novelGene_135883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTCATAGATCTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40243	42967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_40200_43000
871125	contig_8310_pilon	+	2247	17	Intergenic	novelGene_75571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	363.771944140488	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	37	1509	279605	313181	TRUE	35	CTAATGTCAGTAAATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVARPWSPRSAMSSRRSFSRLTWWVPAPGLQFPENLDLLPLTSLVPPRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFRLPTEGLFHRHPGAAAAHGGGLLEDDLGVEVPHNRDAD	279568	325037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311026_313065_313193_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
871126	contig_504_pilon	-	5384	39	Intergenic	novelGene_54456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	115.569159421613	145	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1452	4359	356	4714	546229	488565	TRUE	30	TTAAATCTCTGCGTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVDLGRVDSFKDSDYIMAYTPVTNTTQQIMNKVSSAPFMTDRAVMGLLDEESIEELSAMYPEEIVKVIFTNTFSYHLKFLLGHRIPIREEHRDHTAHCYEINGDIDCGISDFWKKGFVAFQAAINAAIIESTTNHSVMEELMSATGKIMKIYPFISQGGLMTDFFIFFCIFAFSPLTYYASINVTRERKKMKGLMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAAFIFIMAFFVTLIVKSSQFVVLTGFVVVFTLFLLYGLSLIALAFLMSVLVKKSFLTGLLVLLLTVLWGSLGFTVLYRHLPASLEWTLSIFSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPDSADGSNLIIATHFMLAFDIFLYLTLTIYFEKVLPNDYGHRYSPLFFLKSSFWSRQQKADQVALEDELDSDLSSNDSFEPVSTEFHGKGAIRIRNVTKEYKRKADNIEALKDLSFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLSETTNFENISKLTGVCPQSNVQFDFLTVKENLRLFAKIRGIFPQEVDKEVERVLLELEMKNIQDIVVQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHRIWNLLKECKKDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSKGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQVNEMCVQEKITALIKQHISDAKLSAESEGKLIYTLPLERTNKFPDLYRDLDMCPGLGIKNYGVSMTTLSEVFLKLEGKSAIDESDVGILGEVQAEGAGDTERLVEMEQVLSSLNEMKNTIGGMALWGKQVCAIAKVRLLKLKHERRALLSLLLILGIGFSPLLLEYIITKIYQKSYTWELSPHMYFLAPGQQPHDPLTRLLIINKTGASIDDFMYSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAITVSGNKKKYHFSLACNAKRLNCFPILMDIVSNGLLGMFKPSAHIQTDRSTFWGEEQNNPFEFLSFTMFWLILAASCSPYIAMSSIEDYKNKVRSQLRISGLFPSAYWFGQALVDVPLYCLIFLFMYLMDYILSSKETIFKIVNKIMQVPCAIGYATSLIFLTYIISFISRNGRKNSGIWSLCFHIITMFSVVGFLLESDGSGALLCITFFIPPATLIGCMFLSFRLFMFAVFSEKSAVEAYLVFLIPFLHFIIFVFILRCLEWKFGKKTMRKDPVFRISPRSSDVCQNPENPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNSDEKPVIIASCLRKEYTGKRKHCISKKKKKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKIVTGDTKPTAGQVLLQGNSRGDTTGFLGYCPQENTLWPTLTVKEHLDVYAAVKGLQERRRRCRHYAVSGCTQAAGPAEGAREGLVRGDKEEAVLRAEHPGGPGSGASGRAVHGNGPRRAAADVAGDPGHHQEHGPGCPPDHPLHGRGRGCVRPRGHPGVREAQMYRFHPTPEKQVW	560942	484707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_485142_485275_485332_486801_486882_488464_488607_488817_488938_490817_490913_491010_491087_491827_491990_495189_495282_495964_496083_497766_497888_499021_499114_499580_499644_500573_500694_502310_502425_502621_502796_504710_504819_507750_507889_508607_508742_508901_509069_510630_510830_515109_515230_517552_517693_520640_520732_521337_521477_521715_521836_522573_522750_524377_524489_526255_526315_529553_529723_533761_533910_535428_535615_535893_536036_538644_538872_539836_539941_541958_542124_546102_546308_547425_547528_560767
871127	contig_9437_pilon	+	3734	1	Intergenic	novelGene_141711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTCTTCCCGTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89648	93382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_89600_93400
871128	contig_5954_pilon	-	2545	11	Intergenic	novelGene_28708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	224.679238026125	3	100	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	1277	2140	970200	962496	FALSE	10	CATGTTGTTATGGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKQIMSDPAMRLILEQMQKDPQALSEHLKNPVIAQKIQKLMDVGLIAIR	975700	962090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962569_963008_963080_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_971026_971182_971325_972040_972251_975601
871129	contig_10490_pilon	+	3009	1	Intergenic	novelGene_169884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27366	30375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_27400_30400
871131	contig_19442_pilon	-	2238	3	Intergenic	novelGene_169607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	43	242	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	37	369	49059	32134	FALSE	25	TGTGTGTATATATGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAVLVAVYVSDFFKEKDSPFKERKEEDSHTTLHETATVGNHYRNNHQP	49095	30264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19442_pilon_-_32266_32813_32991_49035
871132	contig_13004_pilon	+	2690	2	Intergenic	novelGene_112709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCCTAGCCCCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841961	844910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_844450_844708
871133	contig_11370_pilon	-	772	3	Intergenic	novelGene_98736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACGCGCTGCCGTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148548	145730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148201
871134	contig_6710_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_96978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	45	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
871135	contig_4812_pilon	-	1032	6	Intergenic	novelGene_103629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_4	7324.60984899537	126	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	113	496	82626	79235	FALSE	10	GTATTGTCTGAGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82738	78698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81604_82268_82343_82598
871136	contig_9582_pilon	-	2734	4	Intergenic	novelGene_106843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	64.7199093530474	181	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	69	356	444970	442770	FALSE	40	TTAAATGAAAATTGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESIQRLRSGVVSTGGVLVPLLIMAAAVAMETDDAGNRLRFQLELEFVQCLANPNYLNFLAQRGYFKDKAFVNYLKYLLYWKEPEYAKYLKCDVLLQELVPPDNMSKVHEMKYRHPYF	445038	440391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_442855_443601_443699_443992_444071_444942
871137	contig_15029_pilon	-	1756	7	Intergenic	novelGene_128185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1209.0084665635	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	67	642	172327	163104	TRUE	25	CCTAATCTGATTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172393	160713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_160816_162091_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
871138	contig_9705_pilon	-	2943	1	Intergenic	novelGene_41701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAATAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99785	96842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_96800_99800
871140	contig_14513_pilon	-	1291	4	Intergenic	novelGene_70375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	187	603	18880	11982	FALSE	25	ACATTAGAACTCTGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
871141	contig_6215_pilon	+	2792	10	Intergenic	novelGene_21220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	130	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAATGGAGACAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226831	243059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228367_229714_229951_230071_230215_231669_231760_231861_232035_233716_233854_234069_234147_235190_235361_238588_238755_242994
871142	contig_12019_pilon	+	960	5	Intergenic	novelGene_87632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.2294734194974	71	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	288	611	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2164_2238_2300_5118_5400_6114_6226_8298
871143	contig_12019_pilon	+	863	4	Intergenic	novelGene_87625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	217	540	5225	8336	FALSE	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2154_5118_5400_6114_6226_8298
871144	contig_8106_pilon	-	2534	5	Intergenic	novelGene_139727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	80.6020316121126	205	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	119	811	85457	64191	FALSE	30	TCGATCTGCAGAATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLHRRGGAITGARGARPTDAWAGQTVPGTAERGAVAAAMTDQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDKIILQLNRYYPQILTNKEAEKFRNPRAALRVRLCNLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSCLPSRHALRPLGFLACLSVAAGLALLMYCCPPDSKVLPGARRVLGFSPVIIERHISRYLLTFLAEDLGGSLIRPWTLDFACRSAQRLPPASRLAYCHHPACSLPTLRGDQSVSFSKGFFLTIYHFCETHLDLAYEGA	85575	62467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_64508_65256_65329_66863_67018_69922_70066_85450
871145	contig_7321_pilon	-	2025	7	Intergenic	novelGene_53139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	154.036160978158	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	545	937	174706	169423	FALSE	25	TTGACCTTATCTACTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYGWTFCSTFLHITYCVLE	208390	168334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_169617_173563_173702_174645_174728_175746_175895_203985_204078_207655_207860_208311
871146	contig_17212_pilon	+	4902	1	Intergenic	novelGene_88613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTAAACCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93259	98161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_93300_98200
871147	contig_12958_pilon	-	3313	8	Intergenic	novelGene_136190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	176.777503416825	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	51	1319	65705	41431	TRUE	35	CTGAATAATACATGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGRNPKIQNSNLPRECIRHFFPKRRCFVFDRPTSDKNLLAHVEELPEEQLDCNFQMQAKNFCSYIFTHAKTKTLRQGIIVTGNRLGTLVETYVDAINSGAVPCLENAVTTLAQRENSAAVQKATDHYSKQMAQCLRLPTDTLQELLEVHAVCEREAITIFMEHSFKDENQEFQKQLMCTIEKKKEDFVLQNEEASEKYCQAELKQISEPLMETISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKVEQDYERLPRKGVKANEVLKSFLQSQVAVEESILQSDRALTDGEKAIAGTGAGLSPQRGG	65755	38556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_40048_40927_41572_50899_51113_52404_52686_61224_61471_63129_63327_63529_63640_65624
871148	contig_4469_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_21964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGAGTCTCCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755813	757509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_755800_757500
871149	contig_8270_pilon	-	2580	5	Intergenic	novelGene_143804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.7878123264057	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1964	2452	409593	380364	FALSE	10	TTGATGTCTCCCCTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFKKCLIFFHMPIFVTQLDRRREWEMMCRVQPDVVKDKETERNLQRIATRGVVQLFNAVQKHQKNVDEKVKEAGGSIRKRAKLISTVSKKDFISVLRGTDGSTNEKSSAGKKSKAKQTEVKSEESPGWNIFRDDFMMGASMRDWDKESDGSADSQPGATS	429503	380235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_380496_406158_406361_409438_410066_411666_413006_429351
871150	contig_6230_pilon	-	2314	7	Intergenic	novelGene_102116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	28.9506284713975	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	548	928	178669	174937	FALSE	20	CATCCCAGCTACCCCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKVR	182132	173550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_180772_180857_181156_181253_181942
871151	contig_9366_pilon	+	427	3	Intergenic	novelGene_166266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_2	486.5	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	126	425	1038885	1042591	FALSE	25	AGGAACCACTCCACCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGSITHQISRPNPPNFGPGFVNDSQRKQYEEWLQETQQLLQMQQKYLEEQIGAHRKSKKALSAKQRTAKKAGREFPEEDAEQLKHVTEQQSMVQKQLEQIRKQQKEHAELIEDYRIKQQQQQCAMAPPTIMPGVQPQPSLV	1036912	1042593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1036979_1038825_1039059_1042465
871152	contig_7356_pilon	-	2049	4	Intergenic	novelGene_60373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	42.7187182496021	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	253	801	435519	408051	FALSE	35	GAAGTGTGTAATATAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCVSDQDLDEACMVRTVKTGSAEKLVPAEHLVPAFLKGDLSYIKIFLGTYRTYATTQQVLDLLFQSPEPRPVPVVKVAQDISLPQELAPGTSHGVHSAPAPALELHSTPPITSPAPAPAPVGEHAGGVDSQPGSPPEPAPGPLADVDPAPAPTPELHTAPAIPSTAPALASEEPAGESDT	457916	406802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_408397_410435_410636_435516_435623_457767
871153	contig_16098_pilon	-	1527	11	Intergenic	novelGene_45786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_7	203.601694491966	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	853	1266	35038	31519	TRUE	5	TGGTCTGTAGCTCTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36310	31098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35603_35720_35749_35907
871154	contig_2367_pilon	-	1588	3	Intergenic	novelGene_65326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	673.5	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAACATAATTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213294	192231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208622_213162
871155	contig_7567_pilon	-	2690	7	Intergenic	novelGene_178155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_4	59.5270713392001	130	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	129	1016	99407	87782	FALSE	25	TTTCTAGGGTACAGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAGPCGAVLTPPIGAATATSRTVLFTVGSPPHSATAPTCTHMVLRTRTTSAGSSSSGGSLCSVSDHVCMGSPPGVCSGSSPPQAEAAPSLRYMPYGASSPSLEGLITFEAPELPEETLMEREHTDTLRHLNMMLMFTECVLDLTAVRGGNPELCTSAVSLYQIQESVVVDHISQLSKDWGRVEQLVLYMKAAQLLAASLHLAKAQIKSGKLSPSTAVKQVVRSLNEQYKFCITMCKKLTEKLNRFFSDKQRFIDEINSVTAEKLIYNCAVEMVQSAALDEMFQQTEDIVYRYHKAALLLEGLTKILRDPADIENVHKYKSSVERRLSTLCYSTVTM	99535	86107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7567_pilon_-_87841_89137_89274_91642_91801_92169_92289_92809_92989_96826_97036_99379
871156	contig_1867_pilon	-	2737	11	Intergenic	novelGene_54603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	197.489138941867	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	993	1652	538366	517583	FALSE	30	TACAACAAATGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566866	516497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885_551129_566772
871157	contig_10377_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_115338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGTCATTGGTGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12876	12312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_12300_12900
871158	contig_8289_pilon	+	3110	14	Intergenic	novelGene_171177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_13	372.277064855937	125	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	52	1548	197934	223052	FALSE	35	CTCAATAAATGTTAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKYTRQLTLSRQKQKVCMDETLWLQENIRDKLRPIPITASVEIQESSSRRRVNSLPEVLPILNSNEPKTVHTDVHFLKEGCGNDNICNSNLKLEYKFCTREGNQDKFSYLPISQKGIPELVLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTNDGDDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRSFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSSVTFYLILSTTEVTFDTTDLDINLKLETTSNQDNLASITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGGTVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLKNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVESKGLEKIACEPPSEINFLKLKESHNSRKKREIAEKQTDDSRKFSLFAERKYQTLNCSVNVNCVNIRCPLRGLDSKASVILHSRLWNSTFLEEYSKMNYLDVLMRASIDVTATAENIKLPNAGTQVRVTVFPSKTAAQYSGVPWWIILVAILAGILMLGLLVFLLWKKTGSAGSERHLIQPLEGGSAT	197882	224614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_197958_198161_198306_199808_199925_200043_200237_200327_200412_200507_200588_200739_200818_200905_201009_203309_203484_204936_205036_205134_205246_205336_205436_212521_212648_222986
871159	contig_4083_pilon	+	3378	1	Intergenic	novelGene_152332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGTAAGCCAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135200	138578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_135200_138600
871160	contig_6375_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_73034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	981	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTTTTTTCCCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475645	473273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_473300_475600
871161	contig_10848_pilon	-	2193	5	Intergenic	novelGene_133523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	23.847169643377	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	426	1199	44513	40251	FALSE	25	TCCTAAGTCTATTTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMLEVFASSLEEFQPDLVVLSGLHMMEGQSKELQKKRLLEVVTSISDIPTGVPVHIELASMTNRELMNNIVHQVFPAVTSLGLNEQELLFLSQSASGPHSSLSSWSGVPDVGMVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	49752	39256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40803_43630_43730_44390_44588_48151_48273_49522
871162	contig_8571_pilon	+	3524	3	Intergenic	novelGene_169162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	272	junction_1	52	646	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	253	648	374522	375030	FALSE	10	TGATTTGTTGCCTTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKTDHFLSCYPWFHGPISRVKAAQLVQLQGPAAHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGIAKHLRLSLSERGQCRVQHLHFPSVVDMLHHFQRSPIPLECGAACDVRLSSYVVVVSQPPGSCNTVLFPFSLPRWDSEPDLPHLGSPACPRGLGPEAPPGRSSPPEQIFHRVPSPEELADSLRLLETGPEVRARDSDYELDASSRRHLRAIDNQYTPL	374191	377906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_374372_374449_374622_374734
871163	contig_10063_pilon	+	5636	6	Intergenic	novelGene_127736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.9639931763613	231	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	63	2423	372109	453230	FALSE	20	TTCCCTTGAGTTTAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQKKEEEEEAAAAASVAMATEGGKTSEPENNNKKPKTSGSQDSQPSPLALLAATCSKIGTPGENQATGQQQIIIDPSQGLVQLQNQPQQLELVTTQLAGNAWQLVASTPPASKENNVSQPASSSSSSSSSNNGSASPTKTKSGNSSTPGQFQVIQVQNPSGNVQYQVIPQLQTVEGQQIQINPTSSSSLQDMQGQIQLISAGNNQAILTAANRTASGNILAQNLANQTVPVQIRPGVSIPLQLQTLPGTQAQVVTTLPINIGGVTLALPVINNVAAGGGTGQVGQPVTTADNGTSNGNQLVSTPTTTTASASTMPESPSSSTTCTTTASASLTSSDTLASSADTGQYASTSASSSERTLEESQTPAATESEAQSSSQLQPNGLQNTQDQSNSLQQVQIVGQPILQQIQIQQPQQQIIQAIPPQSFQLQSGQTIQTIQQQPLQNVQLQAVNPTQVLIRAPTLTPSGQISWQTVQVQNIQSLSNLQVQNAGLSQQLTITPVSSSGGTTLAQIAPVAVAGAPITLNTAQLASVPNLQTVSVANLGAAGVQVQGVPVTITSVAGQQQGQDGVKVQQATIAPVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRLRRVACSCPNCREGEGRGSNEPGKKKQHICHIEGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKRFECPECSKRFMRSDHLSKHVKTHQNKKGGGTALAIVTSGELDSSVTEVLGSPRIVTVAAISQDSNPATPNVSTNMEEF	372046	456443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_372116_372516_372639_373129_374685_415985_416215_425498_425699_452982
871164	contig_5515_pilon	-	3008	26	Intergenic	novelGene_52349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	67.2238767105855	277	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	35	2560	137157	114546	FALSE	5	TGACTCTGTGGTCTCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQALSEEEFQRMQAQLLELRTNNYQLSDELRKNGVELTSLRQKVAYLDKEFAKAQKALSKSKKAQEVEGLLSENEMLQAKLHSQEEDFRLQNSTLMAEFSKLCSQMEQLERENQQLKDGAAREGAAQAGSLVDGELLRLQAENTALQKNVAALQERYGKDAVRSPAISEGQGDPPGGPALTVLAPMPLAEVELKWEMEKEEKRLLWEQLQDLESLKQAETSRLQEELAKLSEKLKKKQESFCRLQTEKETLFNDSRNKIEELQQQKEADLKAQLSRTQKLQQELEAANQSLAELRDQRQGERLEHAAALRALEDQVSIQSADAQEQVEGLLAENNALRTSLAALEQIQTAKTQELNMLREQTTGLAAELQQRQAEYKELMGQKDDLNSQLQESLRANSRLLEQLQELGQEKEQLSQDLLEARKSAEKRKAMLDELAMETLQEKSQHKEELGAVRLRHEKEVLGVRARYERELRELHEDKKRQEEELRGQIREEKARTRELENLQQTVEELQAQVHSMDGAKGWFERRLKEAEESLQQQQQEQEDALKQCREQHTAELKGKEEELQGVRDQLQQAQEERDTHLKTISSLKQEVKDTVDGQRILEKKGSAALKDLKRQLHLERKRADKLQERLQDILTNSKSRSGLEELVLSEMNSPSRTQTGDSSSVSSFSYREILREKESSAVPARSLSSSPQAQPPRPAELSDEEVAELFQRLAETQQEKWMLEEKVKHLEVSSASMAEDLCRKSAIIETYVMDSRIDVSVAAGHTDRSGLGSVLRDLVKPGDENLREMNKKLQNMLEEQLTKNMHLHKDMEVLSQEIVRLSKECVGSPDPDLEPREAS	137191	114097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_114639_115724_115880_116739_116834_116962_117086_118265_118397_120043_120144_120246_120304_120410_120507_120607_120686_121644_121759_122547_122761_123096_123193_124055_124191_124946_125040_125253_125332_126682_126783_126927_126976_127083_127116_127778_127827_128013_128199_129126_129278_132538_132647_133614_133642_134705_134768_134908_134976_137115
871165	contig_9272_pilon	-	2790	16	Intergenic	novelGene_125947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	33.2719434692688	261	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	13	1899	475970	453257	FALSE	20	CTTGTCTTTGAATATGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAVMAAAGNGPGPGAGAGPGPTAAASAAAAEEGETKPVTAVAAAPTGEGTSAAPAAEPSSGEAESGDANLVDVSGGLETESSNGKDTLEGAGDTSEAMDTQAGSVDEENGRQLGEVELQCGICTKWFTADTFGIDTSSCLPFMTNYSFHCNVCHHSGNTYFLRKQANLKEMCLSALANLTWQSRTQDEHPKTMFSKDKDIIPFIDKYWECMTTRQRPGKMTWPNNIVKTMSKERDVFLVKEHPDPGSKDSEEDYPKFGLLDQDLSNIGPAYDNQKQSGAVSTSGNLNGGIAAGSSGKGRGAKRKQQDGGTTGTTKKARSDPLFSAQRLPPHGYPLEHPFNKDGYRYILAEPDPHAPDPEKLELDCWAGKPIPGDLYRACLYERVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDILGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP	475982	452365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_453365_453470_453531_454256_454356_455795_455889_458697_458892_459181_459350_462224_462443_463396_463491_465686_465763_466666_466763_467390_467487_470334_470430_470698_470788_474813_474960_475078_475146_475782
871166	contig_13481_pilon	-	1931	4	Intergenic	novelGene_119487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	854	1156	1313929	1313627	FALSE	30	CCACCACATCCTACACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVSLATKGKWGSNWRRTQSRVCVCVCESVCVKMEKILTFIYSLCSIHKFILALFLAVFTFYLDQGQLTTGQMSSFIETQPLSFIYVLSMVAFMLQWQS	1394143	1312851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1314685_1323448_1323459_1330282_1330340_1394112
871167	contig_6279_pilon	+	3709	1	Intergenic	novelGene_164769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATTAAAAAAAAAAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103164	106873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_103200_106900
871168	contig_11370_pilon	+	774	3	Intergenic	novelGene_98733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	114	536	145831	148303	FALSE	25	TAACAAAGTGCTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145717	148541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
871169	contig_10732_pilon	-	3991	3	Intergenic	novelGene_114713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	503	916	138380	137967	FALSE	10	CCCTCCCCGCGACTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPQGSSSWDTGTPLINSPLPVESPGDSTDALEECVHNGPRRLLLPLTKRPPFLAWLSTTLKPHFQGWQLQKAFLSLAGVPVCAPTPGSYLWGHHCLPVSCCPIIAQSGSRRHFLPDNSSQIYNSPYIHVQCPEQS	142697	134891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_138646_139287_139443_142615
871170	contig_2854_pilon	+	3067	18	Intergenic	novelGene_120890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_11	302.379731017315	272	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	185	1741	1134662	1334964	FALSE	25	ACAAAGTCTTTTGGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALHNVTAELFGAEAWGTVAAFGDFNSDKQTDLFVLRERNDLIVFLADQSAPYFKPKVKLSLMNHSALITSVVPGDYNGDSQMDVLLTYFPKNHANSDLGAVILWGQNQTLDSNNMTILNRTFQDEPLIMDFNGDLIPDIFGITNESNQPQILLGGNLSWHPALTTESKMRIPHSHAFIDLTEDFTADLLLTTLSASGSSQFEIWKNLDGNFSASSILEKPQNMVVVGQSAFADFDGDGHADHLLPGCEDENCQKSTVYLAKSGTKQWVPVLQNFSNKGTLWGFVPSVREQRPAEISIPLTLHIGDYNMDGYPDALAILRNTSGSNQQAFLLENVPCNNASCEGAHRMFKVYWDLSNLNQIRDAVVATFFDIYEDGILDIVVLSKGYTKNDFAIHTLKNNFEADAYFVKVIVLSGLCSNDCPRKITPFGVNQPGPYIMYTTVDANGYLKNGSAGQLSQSAHLALQLPYSVLGLGRSANFLDHLYVGIPRPSGEKTIRKQEWTAIIPNSQLIVIPYPHNVPRSWSAKLYLTPSNIVLLTAIALIGVCVFILAIIGVLHWQEKKADDREKRQEAHRFHFDAM	1132908	1336290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1133022_1134590_1134664_1140504_1140651_1141884_1141943_1143319_1143395_1161452_1161548_1203824_1203887_1210710_1210793_1239990_1240086_1243455_1243629_1271864_1272016_1273925_1274035_1290716_1290761_1302675_1302755_1327862_1327988_1328901_1328985_1331594_1331713_1334904
871171	contig_18735_pilon	-	3365	13	Intergenic	novelGene_132673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_3	181.964434864496	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	636	1784	86559	59686	FALSE	20	TTCTATATTTTTGCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTKEKDQLSKSIIMYRSLFEASKQLLDEMKCQVEEAKLKEAQLRNELKAHNIDIPATQQMTHIEALLKRKVTEQEELKKKPRRSCTLPNYTKGSADVLGKIAHLAQIEDDRAAMVISWHLASDMDCVVTLTTDAARRIYDETQGRQQVLPLDSIYKKTLPDWKRPLPHLRNGKLCFKPIGDPIFARDLLTFPDNKEHCETVFGMLLGDTIILDNLDAANHYRREVVKITHCPTLLTRDGDRIRSNGKFGGLQNKAPPMDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRIITKTDV	93454	58104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_59711_65767_65880_67037_67197_71407_71580_77769_77841_78099_78210_81403_81595_84587_84711_85317_85404_86459_86580_86748_86876_91897_92051_93119
871172	contig_6975_pilon	+	1078	2	Intergenic	novelGene_74316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	324	743	624601	625193	FALSE	55	AAGTAGAAAGAGAGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVKGLNAPIKRQRVADWIKKHDPSICCLQETHLRLKNTNKLKLKGWKKIYQANNNQKRAGVAILISDKIDFKVKSTAKDKEGHYIMIEGSIHQEDITIINIYTPSNRAPKYPPNRSQVYFLVQCTWNSLQNRPHIRP	624277	625528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_624940_625112
871173	contig_6497_pilon	+	2240	4	Intergenic	novelGene_35641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1178	1540	755514	757014	FALSE	30	GAGGTCAAGACGTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLCLMAASNSYIPAAVLQSHRRPSFLLVLCLALQSHAVSQLIHFPSFLDESHCIVLHVQNMNHQLQILPKSIQHVNNSILETFLRERDSSIKFHSKVHFKAPLVTGSLLVWQPTLLLM	751343	757714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_752207_754319_754519_755398_755551_756688
871174	contig_10734_pilon	+	3217	1	Intergenic	novelGene_51073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGGAAGAAGTGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469457	472674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_469500_472700
871175	contig_2257_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_122508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	621	852	1472	340152	340772	NA	55	CATCCAAAAAGAAGAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGSIHQEDLTIINIYAPNNRAPTYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPFPVKDRTSRKKLNKDTEDLNATVNQLDLIDIYRTLHPIAAKYTFFSNTYGTFSRGDYMLGHKASLNRIQSIEILQTISSDHKTIKVEVNNRKSKGKKKTNTWKLNNALLKNYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIPINA	339300	340774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_339300_340800
871176	contig_5075_pilon	+	3621	14	Intergenic	novelGene_174076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	525	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCACCTAACCAGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554028	605617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_556148_559405_559475_560845_560970_561746_561843_567051_567150_568383_568462_571593_571699_571809_571905_573313_573392_574270_574481_590587_590726_591268_591394_593105_593286_605511
871177	contig_5899_pilon	-	5266	3	Intergenic	novelGene_146961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	558	junction_2	356.5	178	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	218	535	53130	43096	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTE	84490	38364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_43192_52908_53140_84282
871178	contig_10176_pilon	+	1657	10	Intergenic	novelGene_72725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGAAAATGGCTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260638	275055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_261161_262993_263135_264216_264390_267070_267196_267804_267905_268536_268638_270346_270441_271915_272050_273754_273858_274891
871179	contig_11047_pilon	-	4324	1	Intergenic	novelGene_173956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3622	3924	112447	112145	NA	15	GAGAGCCGCGTTTCCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFITIHKLQLSKSHYNEFQEKKKKHLRLSKSLEVSKPEKSFSSNFLKCKFQERHRMVYMHLVGFHYSVGKEKKQPSRKILLNAISNKNSCHKQRAFLKSE	116068	111744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_-_111700_116100
871180	contig_8628_pilon	-	3112	10	Intergenic	novelGene_164444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	510	812	692317	689631	TRUE	35	TCTCCTGATAAAAGCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVSFKSVLKSALAVMYLSLMYSSNSLCFFLSLEENLIHRGSSLMIFFTSFQVDVKVIAEVSSRSCLKCSLFFLVSASMCSLKSFSFSSLSNKDPDSQR	693974	668958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_670497_671315_671405_677680_677800_682461_682613_686716_686882_687298_687483_689576_689757_690448_690533_692224_692325_693472
871181	contig_3862_pilon	+	5952	1	Intergenic	novelGene_137409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAAGGTCCTGGCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491071	497023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_491100_497000
871183	contig_10003_pilon	-	558	1	Intergenic	novelGene_88145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371775	371217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_371200_371800
871184	contig_13044_pilon	+	3856	1	Intergenic	novelGene_99991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101122	104978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_101100_105000
871185	contig_7730_pilon	-	5129	1	Intergenic	novelGene_156287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	4645	5025	365410	365030	NA	20	TTCATCCATTGTTGGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFKDWSLLMTRPNFVRQSLAILASKKHSGCTSSKTELFILLAIHGILNILRQHHNSKMSILLWSSLFIIQLSHVYEVTENTAWVRCILILKVTSLQKTFKEVFCSRFAQCNTSFDFLDCCFHGR	370054	364925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_364900_370100
871186	contig_6199_pilon	-	3956	5	Intergenic	novelGene_126363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	106.879312778479	273	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	158	919	185138	154010	FALSE	30	TAATCAAATTCTGTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAVGDPRRRLCCRVHSWGRFRGSRCTSGPAKIIACLGRTPPSSQAETSAGTMSAYSKNYNPFDDDAEDEGSRDACDLPDGPSAPADRQQSLRQEVLRRAEATAASTSRSLSLMYESERVGVASSEELIRQRGVLERTEKMVDKMDQDLKTSQKHINSIKSVFGGLVNYFRSKPAETPPEQNGILAPQPNSRLKEAITTSKEQESKYQASHPNLRKLDDSDSIPGVASAAVSSDAYPKNPHLRAYHQKIDSNLDELSVGLGRLKDIALGMQMELEEQDDILDQLTTKVDKLGVNIKSTEKKVRQL	185295	150972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_154168_160176_160276_167517_167604_172211_172409_184916
871187	contig_9297_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_69826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGATTTTTCTAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485401	484328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_484300_485400
871188	contig_18634_pilon	-	3795	1	Intergenic	novelGene_174235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGTTATAAACCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11763	7968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_8000_11800
871190	contig_11978_pilon	-	2071	13	Intergenic	novelGene_62886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	123.858201854648	7	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	9	671	729777	725391	TRUE	20	TATTGGCCATTACTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMQVADHHQHVPIDIQTSKLLDWLVDRRHCNLKWQGLVLTIREKINAAIQDMPENEEIAQLLSGSYIHYFHCLRIVDLLKGTEASTKNIFGRYSSQRMKDWQEIVALYEKDNTYLVELSSLLVRNVNYEIPSLKKQIAKCQQLQQEYNRKEEEGQAGAAEMREQFYHSCKQYGITGDNVRRELLALVKDLPSQLADIGAAAQSLGEAIDLYQACVGFVCER	729785	720811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_721163_721268_721441_721811_722045_723327_723417_724025_724105_724509_724621_725025_725532_725771_725951_726577_726627_726994_727096_727351_727484_729505_729555_729765
871191	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
871192	contig_16650_pilon	+	4922	1	Intergenic	novelGene_61981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2941	3288	258923	259270	NA	30	ATCCCAGAGATCAGTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEMLFRLTDSSDLWREIRQIILLANTLKSKCGTHLGKDFKYQQLNYFLYRIARICISWFLTEQPCWRHHTTHALSKDKLKFLRPLMTGTQPQRLNFLTSVLNVILQIKTVGLMC	255982	260904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_256000_260900
871193	contig_16650_pilon	+	1870	5	Intergenic	novelGene_61969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.76438020109	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	82	459	244670	254361	TRUE	35	CATCAAAGCTCCATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRCRPSGSRRLTPPRPSASLPPLYRAMPSEKTFKQRRTFEQRVEDVRLIREQHPTKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELIKIIRRRLQLNANQAFFLLVNGHSMVSVSTPISEVYESEKDEDGFLYMVYASQETFGMKSTV	244588	256005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_244710_251255_251312_252975_253083_254186_254648_254880
871194	contig_12624_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_60999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCCTTGGAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295746	296801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_295700_296800
871195	contig_9668_pilon	+	1502	6	Intergenic	novelGene_58071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTCGGGCAAGAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41532	48198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_41572_42458_42612_43440_43598_44472_44586_45889_45953_47221
871196	contig_9668_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_58076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGCAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48147	51252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_48100_51300
871197	contig_5916_pilon	+	1454	2	Intergenic	novelGene_158017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATATTTGAATATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202711	204271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_202844_202949
871198	contig_18251_pilon	+	2333	6	Intergenic	novelGene_50145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_1	1018.80530033957	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	181	840	35708	53991	TRUE	40	TCCTGAAAATTATAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35527	56375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
871199	contig_7050_pilon	-	2950	1	Intergenic	novelGene_153611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	703	1047	581205	580861	NA	30	ACTGTGAATTCCAAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLVLHSGNHAVHRHSPPRPAVISQRRAFGYKEHLMGGSKCVNVIPPFQRKRDPRAYPINTRSVSSTCHKHSINYETKFYLGGVIHIKKSEFLLVNLLEKLRRFSGLIFIGGI	581907	578957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_579000_581900
871200	contig_15327_pilon	-	2085	6	Intergenic	novelGene_70536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.340191774008	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	17	721	585509	512506	FALSE	10	TCACTCTGTATCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQIFLRDIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGSCHGQTGMFPRNYVTPVNRNVPALTLSSILSELETAWG	585525	511141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_512560_513061_513245_513894_514064_517485_517609_525370_525469_585431
871201	contig_5424_pilon	+	1854	2	Intergenic	novelGene_172812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGATGAAGACCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135063	140912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_135139_139133
871202	contig_16098_pilon	+	1509	10	Intergenic	novelGene_46003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	858	1277	350058	352226	TRUE	40	GACAATGAATGAGAAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTILLSYHSAFAGLDDAHTLVTAGGADEATVMAPVHAVDCVRVHVRAQRQHSRPSAHVPHQNHPSPWVSTTTHHDCAVLGATGDDIVIVWAPGNVQHGGCVATDSRHVLVHTSTPCPGAAPGKPLPHWPHRSGPQTWG	348289	354097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349493_349603_349712_349956_350075_350235_350411_350735_350887_352149_352351_353989
871203	contig_709_pilon	-	3611	1	Intergenic	novelGene_57618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	2847	3278	2428997	2428566	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAQLSPFYRQSNSPRVQGENLDLNPDGPAPRPVLPTWAPTCLSIPNASLKSPLEQLPYDPGTALLGIYPREMETYVHTKTSTRMFTAALFITIETWKQPRYPSIDEWLNRLIHPPHGIHSAVKRNQLEIHAMTWMNLQRTC	2431843	2428232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2428200_2431800
871204	contig_12881_pilon	+	5586	2	Intergenic	novelGene_176145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	368	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	131	1429	104712	106279	FALSE	10	TTTGCTGTGAGCTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCASSASKACAGPLPWGGPGQVTYTTPFQATSSSLEAVPFASMANVACGDEGKEGSHYFLCKKKGADVFDWGTSGPLCVSSKLSCSFNNGGCQQYCFDGGEGSFRCGCQPGFRLMDDLVTCTSRNPCSSNPCRGVATCKPDSLGKSYRCHCPPGYQLDPSELDCRDVDECQASPCAQECINTPGSFRCTCWVGYEPDEGTCRDLDECAPGRNPCAQACTNTDGSFHCSCEEGYKVAGEDGTQCQDVDECTGQGAGPCRDLCFNVPGSFRCGCLPGWELAPNGVSCILGHTSPGPPTEGPAPPTDRPAPQGEGQGSIAPSAITSSPPRGPEDTSEEAPTMGRPSLPSNILFTHAPPKLLASSGPPSNKVEPSTSRPTAAAGHAESADGDSMAKQNEGSTNGQKLLLFYILGTVVAILLLLALALGLLVYRKRKAKRAEKREKNTPSAADSYSWVPERAESRAKKNEYSPTPGTDC	104581	110436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12881_pilon_+_105986_106254
871205	contig_753_pilon	-	2690	9	Intergenic	novelGene_112960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_8	227.414510036189	781	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	722	2257	1192841	1181585	FALSE	30	TAGTAAGATTTGGTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCDEHIQKLGSCITDPGNRETSGNTMHTVFHRDKTKDAHPESCCSSEKGGQPLPWFEHRKNVPQFAEPTETSFGPDSGKGAKSLVELLDESECTSDEEIFISQDEIQSFMANNQSFYSNREQYRQHLKEKFNKYCRLNDHKRPICSGWLTTAGAN	1193562	1181151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1181789_1182478_1182728_1183227_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755
871206	contig_6217_pilon	-	2236	17	Intergenic	novelGene_109611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	440.406483936999	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2217	20	2236	559453	422719	FALSE	20	CAGCAGTCCTTGCCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPVTTTFRWKTYRFDLPGQVALQACRRLPDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDELEKTIKKKEEWVKHTPFSEPP	559472	422718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_559359
871207	contig_3942_pilon	+	3193	29	Intergenic	novelGene_128608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	59.6043395728731	273	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	350	1900	95207	111928	TRUE	15	TTCCTGCTCCAGGAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYFGEHFWGEKNHGFEVLYHSVKQGPVSTKELAEFIRERATIEETYSKAMAKLSKLASNGTPVGTFAPLWEVFRVSSDKLALCHLELTRKLQDLIKDVLRYGEEQLKTHKKSKEEVVGTLDAVQVFAGVNQLLPKSRENYLNRCMDQERLRRESTSQKEMDKAEAKTKKAAESLRRSVEKYNSARADFEQKMMDSALRFQAMEETHLKHMKALLGSYAHSVEDTHVQIGQVHEEFKQNIENVSVEMLLRKFAETKGTGQEKPGPLDFETYSAAALQEAVKRLRGAKAFRLPGLSRREPRAAVDSGEPDSGTCPEVDEEGFTVRSDVTQNSTVEPSCFSSSDSDFDDEEPRKFYVHIKPAPARSPACNPEAAVAQLRATAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRSAPRASSCTEKPQSDEQFSKSLFGPPLESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSPSHAAPGPSPDSWVHRPGTPQSLPGQRALPTECRGGAGPDA	89354	117849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_89408_94440_94548_94690_94779_95105_95234_100708_100801_102070_102146_103074_103217_105002_105156_105389_105495_106708_106808_106893_106991_108228_108274_108393_108467_109113_109139_109545_109604_110061_110241_110324_110350_110722_110775_111328_111421_111716_111991_113435_113549_113656_113730_113877_113987_114650_114807_115058_115192_115889_116090_116696_116753_117096_117262_117623
871208	contig_1594_pilon	-	4479	1	Intergenic	novelGene_138826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAGATGGGAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562740	558261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_558300_562700
871209	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871210	contig_12148_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_140332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACATATGTATTATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83303	82055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_82100_83300
871211	contig_14807_pilon	-	758	6	Intergenic	novelGene_124666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	110	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	17	661	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39789	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
871212	contig_9113_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_68599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	235	537	357158	357460	NA	50	AAAAAAACACTTCAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPLCSALIKFMKENFAYCFCYSCLLCLRNTNGSQEEAIPNHGKVSERSLDLYYECFPVLLGTALEIGFKKSSKSLFQLSNFMKSPIQWLLNISGYHRLV	356923	358714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_356900_358700
871213	contig_11417_pilon	+	6084	8	Intergenic	novelGene_103252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	4098	4592	205578	208354	TRUE	30	AGAAAAGTGCTCCTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLRGRSTWRSDFGRLAQIRVSDTMHKADVALQKRRSRKAGAVLRTIPTSVDLLDCVVVVADVFAQAIGGMEGLFTLATWVPLQRPTVALFHMGHIALPIRNPLLALLAGPASVPQPGPGFRPAVGFRPAPATGGQGAATSSHSSRWRLSGNSRARAAGGRVH	201480	222184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_205583_206962_207101_207773_207889_208117_208406_208519_208679_208924_209100_216202_216389_221263
871215	contig_6138_pilon	+	2511	16	Intergenic	novelGene_159682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACGAAAAACGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568743	615028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_+_569598_575309_575390_579209_579276_579911_579990_583601_583665_591384_591462_592700_592807_598577_598638_598726_598940_599038_599174_600628_600684_601111_601281_606576_606706_608024_608267_613332_613449_614960
871216	contig_6710_pilon	-	570	2	Intergenic	novelGene_92356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871217	contig_14744_pilon	+	1546	6	Intergenic	novelGene_66085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	4833.61475502548	21	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	3	728	1382976	1397607	FALSE	20	CATCCCTGTATATACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKELVSS	1382973	1398425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1397592
871219	contig_12626_pilon	-	4084	1	Intergenic	novelGene_80437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGACAAAAGGCCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139428	135344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_135300_139400
871220	contig_1274_pilon	-	3575	28	Intergenic	novelGene_137814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	62.8601775406255	230	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	935	2808	124	2931	562540	497059	TRUE	40	TTAAATTTCCCAAGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAGILNGKVVSAQIKERLKNQVTQMKEQIPGFTPGLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTATESEVLKCIISLNEDLTVHGFIVQLPLDSENPINTEAVVNAIAPEKDVDGLTSVNAGKLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIRETGVQIAGRHAVVVGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTANLDEEVNKGDIVVVATGHPEMVRGEWIKPGAIVIDCGINYVPDDTKPNGRKVVGDVAYDAAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLQKFKTGKWVIQYNSLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGNLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHQPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAHLHQNVFACVRQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLVPSVNGVRKFSDIQIRRLQRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRFLRKITIGQAPTEKGYTRTAQFDISVASEIMAVLALTSSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPISAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADRIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCLYSGLRPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLPKAYTEENLELVEKGFSNLKKQIENARLFGVPVVVAVNVFKTDTDAELDLIKRLAKEHGAFDAVKCTHWAEGGMGALALAEAVQRAAQAPSSFQLLYDLKLPVEDKIRIIAQKIYGADDIELLPEAQHKAEVYTKQGFGNLPICMAKTHLSLSHNPEQKGVPTGFVLPIRDIRASVGAGFLYPLVGTMSTMPGLPTRPCFYDIDLDPETEQVNGLF	562663	495035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_495676_497054_497149_499947_500101_501084_501193_511491_511670_512523_512625_515222_515265_517691_517832_517958_518071_518449_518519_519959_520101_521277_521355_523144_523248_524615_524691_524835_524944_525588_525636_527235_527373_528008_528183_528572_528671_529167_529296_533702_533815_535027_535165_537447_537549_537696_537834_539248_539303_539728_539789_549397_549483_562499
871221	contig_11681_pilon	+	2636	4	Intergenic	novelGene_102964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.90668171555645	450	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	513	2456	163993	165936	FALSE	20	TGATATGTTGTTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	111104	166116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_111175_118276_118504_161361_161445_163860
871222	contig_18794_pilon	-	1960	9	Intergenic	novelGene_54659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	103.334937823565	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	506	1249	349249	325647	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404573	324935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_351621_351940_353145_353212_404550
871223	contig_11978_pilon	+	3964	2	Intergenic	novelGene_62982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	0	949	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCAGAGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490288	1494844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1490349_1490940
871224	contig_3960_pilon	-	4790	1	Intergenic	novelGene_138015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCATATCAGGAGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385508	380718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_380700_385500
871225	scaffold_12124_pilon	+	4546	1	Intergenic	novelGene_22145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATTTGCTCTCTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957785	962331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_957800_962300
871226	contig_12000_pilon	+	1844	6	Intergenic	novelGene_43174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	496.036934108742	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	119	568	488478	558606	FALSE	40	CTTTTACACAGTTAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	417234	559882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417301_449720_449772_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472
871227	contig_10235_pilon	+	974	6	Intergenic	novelGene_46464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1725	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGCGACCAGGAAGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217918	222850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_218323_219303_219485_220089_220193_220350_220480_220676_220787_222803
871228	contig_10594_pilon	-	3092	1	Intergenic	novelGene_142312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTGTTAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239780	236688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_236700_239800
871229	contig_854_pilon	+	1600	2	Intergenic	novelGene_36306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7937	junction_1	0	297	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCACTGCCCCAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555481	557608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_557065_557591
871230	contig_16724_pilon	-	5193	1	Intergenic	novelGene_105271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGCATAAATTACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341005	335812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_335800_341000
871231	contig_9633_pilon	-	3453	11	Intergenic	novelGene_139602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_10	199.275588068383	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	219	929	471407	454734	TRUE	90	AAAAAAAGAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVLKTDSQDLVASFRVTTGTSNTTAIKSIEFARKGSCFLINTADRIIRVYDGREILTCGRDGEPEPMQKLQDLVNRTPWKKCCFSGDGEYIVAGSARQHALYIWEKSIGNLVKILHGTRGELLLDVAWHPVRPIIASISSGVVSIWAQNQVENWSAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIEDEDKSEPEQTGADAAEDEEVDVTSVDPIAAFCSRRPRRKPIWSPTGRSPDLLDG	482777	441223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_443563_450194_450273_454626_454798_455276_455347_456989_457108_457740_457813_457908_458063_458150_458271_459508_459619_471404_471578_482729
871232	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_95475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871233	contig_20610_pilon	+	2057	3	Intergenic	novelGene_67644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	159.5	157	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	272	457	49863	51570	TRUE	40	TAAGGGATACATGATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSTSPQSKATSGTPRITKQPSSTSGRIPLLTHPFRKQHACDRSFRAFDWWIRRAGLRRLVQRKSSHRRPRAHSFIRSYFPAGCSSCVGVMVDVMELPKSRVNASMLAQFINQPVCFVGKLEKIHPTGKMFILSDGEGKNGTIELMEPVKY	49591	53688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_49962_51483_52513_53030
871234	contig_15031_pilon	-	2449	1	Intergenic	novelGene_138425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156526	154077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_154100_156500
871235	contig_11601_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_141034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	466	819	96491	96138	NA	75	CAGAAAACGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQEAQCTVLSRSPGSAVAVSLPLLLAILHHLWCYSSLSLSPGSRGFSVQGPQVQRTRSILFLLLGGSVTPPATSGMAHFKPNRMAKLTNPLIRVPYTLFAWSHPSPQGCHTPYLHY	96956	94164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_-_94200_97000
871236	contig_8420_pilon	+	2828	16	Intergenic	novelGene_69357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_15	181.119359048728	326	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2277	550	2826	209757	336511	FALSE	30	GTAAATCTGTTTGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVSPSGLRCEHEPGKSQQWDPLICSSIFECKPQHVHKLIHNSQDPSYFACLIKEDAASQQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFAKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIERFNHISCSRKAEFDLLSQNSETANTVTGFSLTNKFRSVFQPVGHEEQGQRPMRKSFSQPGLRSLAFKKEFQDGSLRSSSFFSSFEENDIESHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEVYLISPDTKKIAFEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTSKAPTQLCEGCPVQGLHKLCERIEGMNTSKTKLELQKHLTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKDHVHIGEIKQTSQVVAENIGSDLPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKAKGLQEHSLSVDLDSSMSSTLSNTSKEPSVCEKEALPVSENSFKMLGSSDDLSSDSESRLLEEPAQLSPQQGFRRRANTLSHLPMESQEPLEPAEVSPGVSQRKLTRYHSVSTETPHERKDFETKANHPGDASGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSPSRYEDYPDLGELPPRSPLEPVCEDGSAGPVPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQYHLRHQFPSKQQPKDMPYKELLKQLTSHQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFIAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYDHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFGKS	109578	336513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_109798_209426_209946_213836_213927_216155_216261_216775_216909_223840_223933_228881_228993_236606_236736_238554_238642_245937_246219_251155_251296_302432_302619_308683_308846_316052_316212_332859_333105_336343
871237	contig_5832_pilon	+	2132	6	Intergenic	novelGene_134146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	473.800126635694	731	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	75	536	338056	347511	FALSE	15	GCAGACTGTGAGCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKPPRNPREALISGWLFFRYLAIGVYVGLATVAAATWWFLYDAEGPHVTFYQLRNFLKCSKENPLFADDVDCKVFESRFPTTMALSVLVTIEMCNALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLAAVAMSMALHFLILLDEALKYLSRNHMDEEKGQK	337981	349107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_338132_338702_338789_343171_343309_343766_343859_344481_344533_347491
871239	contig_10861_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_39194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTGTGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342484	345537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_343938_344671
871240	contig_9183_pilon	-	2274	7	Intergenic	novelGene_40335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	410.699978356735	2	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	129	1415	323783	318262	TRUE	40	ATTATCATTTGATATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKVASMSPYCTRRKGPALGSAWQEVWI	325946	311858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_315493_318244_318336_320553_320727_322743_323834_325868
871241	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_92630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871242	contig_15236_pilon	-	4019	1	Intergenic	novelGene_141634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCATTATTATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654216	650197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_650200_654200
871244	contig_10982_pilon	+	2624	3	Intergenic	novelGene_87889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	360	junction_2	161.5	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	864	1274	190787	201769	FALSE	35	TGATAAAATTAAGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	189923	203119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_190893_190980_191141_201624
871245	contig_10074_pilon	+	6109	1	Intergenic	novelGene_57125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	3205	3594	333310	333699	NA	75	AGAAAAAAGAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGDHRRSYTASLMKQTMICPLFLDYETDKAYMIPVLKTVWGRKRSYSGLLVRVSLERAVWHFQLKFRIVMSFDPAIPDLGIHPTLLVKVCSSICRMLIPTSVVTKSQKPPTCLSVGAESRKLQFICVM	330105	336214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_330100_336200
871247	contig_9415_pilon	-	2908	15	Intergenic	novelGene_109871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.9945650568554	222	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	17	2320	2049536	2027180	TRUE	5	TCCGAGCCTGGGCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTESGEVFSWGDGDYGKLGHGNSDRQRRPRQIEALQGEEVVQMSCGFKHSAVVTSDGKLFTFGNGDYGRLGLGNTSNKKLPERVTALEGYQIGQVACGLNHTLAVSADGSMVWAFGDGDYGKLGLGNSTAKSSPQKVDVLCGIGIKKVACGTQFSVALTKDGRVYTFGQDRLIGLPEGRARNHNRPQQIPVLAGVVIEDVAVGAEHTLALASTGDVYAWGSNSEGQLGLGHTNHVREPTLVTVLQGKNIRQISAGRCHSAAWTAPPVPPRAPGVSVPLQLGLPDAVPPQYGALREVSIHTVRARLRLLYHFSDLMYSSWRLLNLSPNNQNSTSHYNAGTWGIVQGQLRPLLAPRVYTLPMVRSIGKTMVQGKNYGPQITVKRISTRGRKCKPIFVQIARQVVKLNASDLRLPSRAWKVKLVGEGADDAGGVFDDTITEMCQELETGIVDLLIPSPNATAEVGYNRDRFLFNPSACLDEHLMQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPLVWKQLCCVPLSLEDLEEVDLLYVQTLNSILHIEDSGITEESFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLTFSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREGMSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVEVLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWRTLEEFSNEERVLFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQPVMAERLRYAINNCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY	2049552	2026548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2027001_2027043_2027366_2029894_2030201_2031414_2031568_2032050_2032304_2033088_2033166_2033971_2034138_2034385_2034556_2035744_2035915_2037808_2037948_2044478_2044649_2046276_2046380_2047124_2047248_2048593_2048750_2049404
871249	contig_10904_pilon	+	3746	3	Intergenic	novelGene_22793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	523	junction_2	100.5	253	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2510	2863	845659	847292	FALSE	25	GCAGCAGCCATCAGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGDQRSTDWSSQYSMVAGAGRENGMEAPMHENPEWEKARQALASISKAGAAGSSTKTSSNGAVANAQYVSQAEASALQQQQYYQWYQQYNYAYPYSYYYPMVSAESSGWPAGW	843149	848175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_845697_846559_846735_847151
871250	contig_12425_pilon	+	1767	8	Intergenic	novelGene_46653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	241.593181414796	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	12	1238	173781	193565	TRUE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEECVFCSKKERHTLSGLRIC	173769	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_193508_193683_198178
871252	contig_7622_pilon	-	2157	15	Intergenic	novelGene_132417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	194.277849105505	567	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	207	1904	297961	269125	FALSE	25	TAGGAAATGTTATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKEKGYATDESTVSSVQGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	306643	268871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276757_280542_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
871253	contig_14925_pilon	-	996	5	Intergenic	novelGene_55089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	1556.62927105332	986	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	201	458	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLIFGAGTRLAVHPYIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	34461	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_34413
871254	contig_1406_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_25662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGCTTTTGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2806047	2803481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2803500_2806000
871255	contig_7548_pilon	+	4238	1	Intergenic	novelGene_117637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210315	214553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_210300_214600
871256	contig_6825_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_155121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGACCCTATAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40123	42437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_40100_42400
871257	contig_10500_pilon	-	2268	2	Intergenic	novelGene_41170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTTATGCAGTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318292	1315933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1317645_1317735
871258	contig_6885_pilon	-	3637	1	Intergenic	novelGene_83649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142572	138935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_138900_142600
871259	contig_5423_pilon	-	3487	6	Intergenic	novelGene_85233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	252.386528959055	25	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	2320	3177	502766	497362	FALSE	40	ATGCAAAATATTGGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	505085	497051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610
871260	contig_3241_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_146424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAAGCAAATGTAAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975024	977633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_975000_977600
871261	contig_4982_pilon	-	1715	15	Intergenic	novelGene_172223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_9	118.47775990386	436	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1674	41	1714	80188	16406	FALSE	30	GTAAGTTGGGGACGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFLVALQTKNRTEANWARVDEQDLWQWGLTGIQLRSYQLEGVNWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLARRLNDEGPFLILCPLSVLGNWKEEIERFAPSLSCVVYTGDKEERAHLQQDLKQESCFHVLLTTYEICLKDASFLKSFPWSVLVVDEAHRLKNQSSLLHKTLSEFSVVFNLLLTGTPIQNSLQELYSLLSFVEPDIFSKEQVEDFAQRYQDIEKESESATELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSAMQKKYYKAILMKDLDAFENEMTKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEIGDHLIEASGKLHLLDKLLAFLYSRDHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQQPIFIFLLSTRAGGVGMNLTAADTVIFFDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIARDTVEEIVCRKASSKLQLTNMIIEGGHFTLGTQRPSANADLQLSEILKFGLDKLLSSEGSIIDEIDMESILGETKDGQWISDALPTAEEGSIEQEEG	80228	16404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_16571_17593_17748_18373_18489_23102_23214_24591_24666_34419_34517_35931_36025_36956_37113_37733_37897_39258_39341_43972_44005_44628_44744_54312_54420_63954_64068_80091
871262	contig_1009_pilon	+	3557	21	Intergenic	novelGene_121761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	124.800831327359	11	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	63	2753	287142	299568	FALSE	20	CCAGGTGTCTACCATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQFKRQRINPLPGGRNFSGAASTSLLGPPPGLLTPPVATDLSQNARHLQGGEKQRVFTGIVTSLHDYFGVVDEEVFFQLSVVKGRLPQLGEKVLVKAAYNPGQAVPWNAVKVQTLSNQPLLKSPAPPLLHVAALGQKQGILGAQPQLIFQHHRIPPLFPQKPLSLFQTSHTLHLSHLNRFPARGPHGRLDQGRSDDYDSKKRKQRAGGEPWGAKKPRHDLPPYRVHLTPYTVDSPICDFLELQRRYRSLLVPSDFLAVHLSWLSAFPLSQPFSLHHPSRIQVSSEKEPAPDTGAEPIPSDSDPGYSSKVLLLSSPGLEELYRCCMLFVDDMAEPRETPEHPLKQIKFLLGRKDEEAVLVGGEWSPSLDGLDPKADPQVLVRTAIRCAQVQTGIDLSSCTKWWRFAEFQYLQPGPPRRLQTVVVYLPDVWTIMPTLEEWEALCQQKAAEAALPPQESPVETESSEQAADASEQAADTSKQNAENPEVTAQQEMDTDLPEAPPPPLEPAVIARSDCINLSLHGIVEDRRPKERISFEVMVLAELFLEMLQRDFGYRIYKMLLSLPEKVVTPPEPEKEEPAKEEAVKEEEVVKEEVAKESKDEVQNEGAAAESDTPLKEDGLLPKPPSSGGEEEEKPRGEASEDLCEMALDPELLLLRDDGEEEFAGAKLEDSEVRSVASNQSEMEFSSLQDMPKELDPSAVLPLDCLLAFVFFDANWCGYLHRRDLERILLTLQYSRQEGMDGGLPEEVLCGNLDLLPPPGKSAKPSAAPMEHKGLVSHNGSLINVGNLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLEESHNRFSATEVTNKTLAAEMQELRNRLAEAEETARTAERQKNQLQRLLQDFRRRLTPLQLEMQRMVEKADSWVEKEEPAPTN	286196	300372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_286221_287103_287200_287469_287562_287919_288012_288218_288334_288502_288633_288805_288903_292593_292714_294427_294651_294739_294854_295169_295334_295810_295983_296068_296300_296397_296635_297293_297439_297569_297653_298140_298260_298521_298581_298681_298871_299020_299227_299523
871263	contig_5445_pilon	+	1495	3	Intergenic	novelGene_135403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2710	junction_2	128	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	946	1284	52520	53758	FALSE	5	CTCTCTCTTGCCTACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCFLPVIPLPVLFLSNTELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51574	53969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_52635_53127_53240_53646
871264	contig_6589_pilon	+	2289	14	Intergenic	novelGene_25938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	296.864800977097	116	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	45	1439	1228758	1257861	TRUE	30	CTTACTCATTATCGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGILPLWCRRDHAAMPSVGLRAALLLLPSLLLLLRTVLTVPLERGAPKKEESPATESPDTGLYYHRYLQEVINVLETDGHFREKLQAANAEDIKSGKLSRELDFVSHHVRTKLDELKRQEVSRLRMLLKAKMDAEQEPSEHDVQVDHLSLLKQFEHLDPQNQHTFEARDLELLIQTATRDLAQYDAAHHEEFKRYEMLKEHERRRYLESLGEEQRREAERKLEEQQRRHREHPKVNVPGSQAQLKEVWEELDGLDPNRFNPKTFFILHDINSDGVLDEQELEALFTKELEKVYDPKNEEDDMREMEEERLRMREHVMKNVDTNQDRLVTLEEFLASTQRKEFGDTGEGWETVEMHPAYTEEELRRFEEELAAREAELNAKAQRLSQETEALGRSQDHLEAQKRELQQAVLQMEQRKQQQQALNALAPAPGREGQLKFHPGTDGVPVPGAADDQKDRDTSEKKVPEQPPKLPQLDSQKL	1228302	1258896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1228336_1228746_1228890_1231854_1231963_1234419_1234562_1243544_1243649_1252638_1252825_1253089_1253181_1255860_1255920_1256161_1256255_1256334_1256428_1256753_1256925_1257394_1257498_1257748_1257897_1258081
871265	scaffold_9100_pilon	+	4449	1	Intergenic	novelGene_83302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTAATCTGCTGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759296	763745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_759300_763700
871266	contig_15236_pilon	-	3476	1	Intergenic	novelGene_141650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGAAAAAATTATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686353	682877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_682900_686400
871267	SIRV6	+	1096	6	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	4	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAGTTAAATAAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3109	11623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11034_11102_11205
871268	contig_9471_pilon	-	3017	12	Intergenic	novelGene_21859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	876.460443540328	1	160	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	255	1349	442814	434615	FALSE	25	TACACTTAGGTTTACAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEQNLITVDMQKHSLTFWWPVECWVSGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELVAEQAIKHLKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEGD	446575	432946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440705_442732_442914_445217_445292_446494
871269	contig_3018_pilon	+	2977	5	Intergenic	novelGene_78894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2500	2808	600066	624953	FALSE	0	CGGCGGCCGCGGCGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLMTFASGKFDYYGVLCIGIQNTGACQPQCSLQTSKCIHKSCDVHTADTRTPVICSTPRESLHTSAIRGPPIAVTADSGPGSTHPLPKQQRAASSPAIEE	578077	625122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600196_624774
871270	contig_20693_pilon	+	2129	14	Intergenic	novelGene_60254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	814.189603261532	4	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	22	408	14748	25936	TRUE	65	TAATTAAAAAAAATACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKHRKPGGT	14726	35136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_23963_25912_26022_26224_26288_26991_27064_27356_27523_27888_27975_28866_28998_29789_29968_32928_32987_34254
871271	contig_12250_pilon	-	2327	8	Intergenic	novelGene_80638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_5	132.621296039759	1506	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	794	2065	379717	375947	FALSE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNERGASWGANHSDTGSSNSNSPKPQEGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380510	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378540_378626_378758_379009_379194_379537
871272	contig_500_pilon	+	1428	10	Intergenic	novelGene_31045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1010.86348616137	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	184	906	1492663	1496884	TRUE	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAHHRK	1485767	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496868_1496898_1497870_1498078_1499277
871273	contig_12543_pilon	-	3606	6	Intergenic	novelGene_168381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1797	2150	370388	370035	TRUE	45	AAAAGATGGCAGGAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFKICSATEAFPTLFTFVRFLTSMDQLVNLKACTLIEALPTLLTFIRFLYAVALLMDFQIRTLAETLPTHVTFIGLFSCVDYQMNLIMNFHPEALPTLLTFVWFLSSVDALVGLKT	372184	351815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_351938_352316_352455_352529_352604_361837_361915_366078_366206_369116
871274	contig_709_pilon	+	4471	7	Intergenic	novelGene_57642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_6	55.5567777643336	131	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	759	2180	3031111	3065422	FALSE	10	CAGCTGTTGGCCTGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVMASYILSGVHQELLIPSPFHYGGFLSNPGVVDSEGPGDLKEHHHQPSVNNISYVKDYPSIKLIVNSITARIEFTTRQLPDLEDLKKQELHMFSVIPSKFLPNSKSPCWYEEFVGKNTTDPYLTNSYVLYSRRFRSTFDALRKAFWGQLSHTNGKHFRLRCLPHFYIIGQPKCGTTDLYDRLRLHPEVKFSAIKEPHWWTRKRFGIVRLRDGLRDRYPVEDYLDLFDLAAHQIHQGLQADSAKEQSKMNKIVIGEASASTMWDNNAWTFFYENSTDSEPPFLIQDFIHAFQPHAKLIVMLRDPVERLYSDYLYFASSNKSADDFHEKVAEALQLFENCVLDYSLRACVYNNTLNNAMPVRLQVGLYAVYLLDWLSVFSKEQFLILRLEDHASNVKYTMQRVFEFLNLGPLSEKQEALLTKSPASNVRRPEDRNLGPMWPVTQRILQDFYGPFNARLAQVLADEAFMWKKT	3030352	3067713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3031393_3032412_3032753_3035087_3035235_3040188_3040346_3058048_3058206_3063158_3063307_3065231
871275	contig_10549_pilon	+	4149	20	Intergenic	novelGene_110586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_13	667.613602645777	576	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	303	2261	109189	218147	FALSE	30	AACTGGGAAATTGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQSLTDRITAAQHSVTGSAVSKTVCKATTHEIMGPKKKHLDYLIQCTNEMNVNIPQLADSLFERTTNSSWVVVFKSLITTHHLMVYGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGLQGYDMSTFIRRYSRYLNEKAVSYRQVAFDFTKVKRGADGVMRTMNTEKLLKTVPIIQNQMDALLDFNVNSNELTNGVINAAFMLLFKDAIRLFAAYNEGIINLLEKYFDMKKNQCKEGLDIYKKFLTRMTRISEFLKVAEQVGIDRGDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGKKIKDSTAASRATTLSNAVSSLASTGLSLTKVDEREKQAALEEEQARLKALKEQRLKELAKKPHTSLTTAASPVSTSAGGIMTAPAIDIFSTPSSSNSTSKLPNDLLDLQQPTFHPSVHSMPAASQVASTWGDPFSATVDAVDDAIPSLNPFLTKSSGDVHLPISSDVSTFATRTPTHEMFVGFTPSPVAQPHPSTGLNVDFESVFGNKSTNVIVDSGGFDELGGLLKPTVASQNQSLPVAKLPPNKLVSDDLDSSLANLVGNLGIGNGTTKNDVNWSQPGEKKLTGGSNWQPKVAPTTAWSAATMAPPVMAYPATTPTGMIGYGIPPQMGSVPVMTQPTLIYSQPVMRPPNPFGPVSGAQIQFM	108886	220035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_109319_153259_153403_156833_156910_158182_158286_170667_170762_172779_172892_175137_175245_177504_177547_179869_179956_181215_181340_181741_181879_184646_184751_190961_191112_198903_199012_200636_200769_200865_200897_201057_201158_205106_205167_206938_207044_218132
871276	contig_7321_pilon	-	3174	2	Intergenic	novelGene_53114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_1	0	280	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTTTTTTCTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118357	112632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013
871277	contig_1694_pilon	-	1518	1	Intergenic	novelGene_144982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACACTATGTCAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636671	1635153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1635200_1636700
871278	contig_12092_pilon	+	3818	1	Intergenic	novelGene_163445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172057	175875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12092_pilon_+_172100_175900
871279	contig_16594_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_53896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAGAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238232	235633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_235600_238200
871280	contig_7571_pilon	+	2851	15	Intergenic	novelGene_106393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	425	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCGAGCAACCCTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84123	149081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_85003_86960_87062_89561_89724_89952_90077_91174_91390_92648_92806_92930_93044_115799_115989_119617_119810_121248_121332_125250_125392_128758_128821_129468_129542_136331_136487_148876
871281	contig_13894_pilon	-	2530	3	Intergenic	novelGene_62189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	593	junction_1	5.5	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1471	1860	751330	750013	FALSE	25	GTAGCGGTGCCACGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	752800	749342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107
871282	contig_14405_pilon	+	5199	6	Intergenic	novelGene_85620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_5	60.3344014638415	296	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	736	1242	338654	339160	FALSE	25	CTCACCCCTATTAGAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVISSHGLCWGGLQKSTRLNQLVWRRQCCQHRHIRVGDRAELSRTFTQRDVAVFAQLTGDANPLHLNEDFAKQTKFGKTIVHGVLINGLISALLGTKMPGPGCVFLSQEITFPAPLYIGEVVTAAAEVKKLKRFIALIAVSCSVVESRKTVMEGWVKVKVPDAPSS	332049	343117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_332281_334855_334954_335065_335151_337215_337293_337937_338017_338488
871283	contig_12293_pilon	-	3879	1	Intergenic	novelGene_165585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1497	1814	8682	8365	NA	60	TGGACTTACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFCKTNDVFIGNTFYQKHKQQLYTWTSSDGIHRNQIDYICGTRQWRSSISSVRTRPGADCGKDHQLLICKFKLKLKKIKQVHESQSMTLRISHLNLETISKQI	10178	6299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_-_6300_10200
871284	contig_6902_pilon	+	3078	1	Intergenic	novelGene_135587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	204	764	445032	445592	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLILFFPPTNNIFYLSPLKICILNRFLNWWLIAISLFNFSTCFISCSFSRTTTFTLKLQEFSQFKLELLQYFYFSNEYIMERINRLARLFCVFPNAVWNQFIDHFFQVICLHLLGHDFHHFLLDLADLLMLSIRGLLNQIVVFFFLTNTEQIKRITISLDINMNFSHGLSLEVGHTVFALNVLSN	444828	447906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_444800_447900
871285	contig_19564_pilon	-	2196	4	Intergenic	novelGene_29670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	61.1609897456431	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1590	2027	67326	66253	FALSE	45	GCTAAAGTGAATATATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLLYHPKVSFPSPSHRGRTWYILSLTLCRFLAWNYFAQLRLEVLQLTRHPENWTLQARWRLVGLPIHMLFLRFYKRDKDELYRTYDAYSTFYLNSNGLICRHRLDKLMPSHSPPTPVKKLLVGALVALGLSEPEPNLHLHAKA	70235	66083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_66367_66452_66523_67072_68689_70008
871286	contig_15084_pilon	+	7252	6	Intergenic	novelGene_116661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2705	3226	3990	4511	TRUE	10	CGGCCTAGGACGCCTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIAVELVPTHGLRCVQSRNVLHRVFVTVTFCGSRLPGLPPAVLLGGFKLATFSLEASHLGTFESSHRQYIKHEGGCVPVELYLEKQVVGWIWPVGHSLLTSELCFPSLFATQDLLADRILVLTNFSLCLTHTESQPSPVDDFLLKWKMICIYWCEFKKSISGAERRGESKAA	1285	19098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_7637_9076_9219_10397_10475_12466_12693_18370_18478_18749
871287	contig_4519_pilon	+	4021	1	Intergenic	novelGene_123727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGACCCAGCAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737962	741983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_738000_742000
871288	contig_7457_pilon	+	1751	2	Intergenic	novelGene_31510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTCTGAGAGCGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670132	671987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_670140_670243
871289	contig_19438_pilon	+	3912	1	Intergenic	novelGene_175896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAGGAATTGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16142	20054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_+_16100_20100
871290	contig_18173_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_160773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62490	59870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_59900_62500
871291	contig_7963_pilon	+	2968	1	Intergenic	novelGene_58294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACATCCATTGCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38227	41195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38200_41200
871292	contig_8476_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_121342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1993	2382	139603	139214	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTFSEHVLSAKRFTCAKYFIAIFHSHSPREDYKNQTKPISVKSIPTHSDPIGWSRTSPWGFQGAPGEFELLAFWLAAIALNRYTTRFSQQETITVTNFTDEKTEEQRPPVIFIACLCKHIKRRCFLY	141595	138493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_138500_141600
871293	contig_13780_pilon	+	923	7	Intergenic	novelGene_149126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	63	362	821480	822491	TRUE	15	GTGCAGAGTTTATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLLSDFTVSTLGTLAVFEYTFTSIFSSSSSSSPPEDSSSASFNHFINGSALTRISLASSFETYFLEAFSDQLMMTSSSKRSASYISFKIWGILEMS	821417	825215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_821549_821968_822108_822399_822566_822826_822989_823722_823881_824129_824274_825192
871295	contig_6175_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_16339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCAGGATTTATAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645501	1648396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1645500_1648400
871296	contig_19701_pilon	-	4521	1	Intergenic	novelGene_147883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCAGTAGACTATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45504	40983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_41000_45500
871297	contig_6217_pilon	-	2773	3	Intergenic	novelGene_109651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	88	junction_2	15	706	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	305	1246	810727	739095	FALSE	75	GAAAGAAAGAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQQEEEMDEEEVKEKTTRSQPQSKMKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	811117	737567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739964_810654_810846_810931
871298	contig_500_pilon	+	1902	8	Intergenic	novelGene_30965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	355.73052171782	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	156	1142	1452302	1469327	FALSE	30	ATCCACATATTTTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHQFLLEPITCHAWNRDRTQIALSPNNHEVHIYKKNGSQWVKAHELKEHNGHITGIDWAPKSDRIVTCGADRNAYVWSQKDGVWKPTLVILRINRAATFVKWSPLENKFAVGSGARLISVCYFESENDWWVSKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRVFSAYIKEVDEKPASTPWGSKMPFGQLMSEFGGSGTGGWVHGVSFSASGNRLAWVSHDSTVSVADASKSVQVATLKTEFLPLLSVSFVSENSVVAAGHDCCPMLFNYDDRGCLTFVSKLDIPKQSIQRNMSAMERFRNMDKRATTEDRNTALETLHQNSIT	1446851	1470087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1446962_1452256_1452366_1454482_1454588_1461325_1461549_1464029_1464138_1466069_1466283_1468833_1468910_1469129
871299	contig_5718_pilon	-	2722	2	Intergenic	novelGene_110427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGACGAAGAAGAAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539436	1536190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1537128_1537651
871300	contig_3155_pilon	+	1848	5	Intergenic	novelGene_26370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.50752120974	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	252	578	259780	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258082	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258167_259209_259329_259731_259978_261082_261782_261832
871301	contig_1986_pilon	+	2309	11	Intergenic	novelGene_64137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	486.46196151395	631	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	521	1561	368540	381302	FALSE	25	AAATCTATGGGATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNQAENELENGTTWQNPEPPLDVRIMEKDRAFCPFYSKTGACRFGDRCSRKHSFPTSSPTLLIKSMFTTFGMEQCRMDDYDPDASLEYSEEETYQQFLEFYDDVLPEFRNVGKVIQFKVSCNFEPHLRGNVYVQYQSEEECQAALSLFNGRWYAGRQLQCEFCPVTRWQMAICGLFETQQCPRGKHCNFLHVFRNPNNEFWEADRDMYLSPDRTSSSFGKNSERRERMSHRDDYYGRPRRRRSPSSDHSYKRNGKSERKRSSSHRGKKSHKHVSKSRERHSSRSRGRKRDHCRSRSRRSRSRSLRSRRNRTQSHRSRSQSSSRSRSWGGRRSSSRDRNTHSPRSK	353509	382050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_353562_353956_354037_359046_359135_363080_363190_365359_365480_368468_368564_369130_369250_375730_375945_377026_377083_377810_377921_380784
871302	contig_12638_pilon	+	3900	6	Intergenic	novelGene_33221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	120.600829184546	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	52	891	610544	614731	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRASFENNCEIGCFAKLTNAYCLVAIGGSENFYSVFEGELADTIPVIHASIAGCRIIGRMCVGNRHGLLVPSNTTDQELQHIRNSLPDSVQIRRVEERLSALGNVTTCNDYVALVHPDLDRETEEILADVLKVEVFRQTVADQVLVGSYSVFSNQGGLVHPKTSVEDQDELSSLLQVPLVAGTVNRGSEVIAAGMVVNDWCAFCGLDTTSTELSVVESVFKLNEAQPSAIATSMRDSLVDRYLGPLFSSAQGRVLTLPFEGRGRGWRLAWEPLYSYW	610238	617740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_610278_610531_610651_610784_610871_613329_613506_614064_614242_614437
871303	contig_7677_pilon	+	4102	3	Intergenic	novelGene_78272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCAGTAATTGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479246	489848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_+_479422_484998_485148_486070
871304	contig_1244_pilon	-	2079	3	Intergenic	novelGene_37974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1699	junction_1	144.5	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATGATGGGCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924785	922433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726
871305	contig_934_pilon	-	1293	9	Intergenic	novelGene_129016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	372	junction_4	210.799334379879	1395	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	355	672	153027	150570	TRUE	30	GCAGTGTAACTGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAEKKVLATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPDGVPVEGSRYAADRCRYRRGYYGRRRGPPRNADEIGEMKDGVPEGTQLQGPVHRNPTYRPRYRRAPPRPRPAPAVGEAEDKENQQAASGPNQPSARRGYRRPYNYRRRPRPPNAPSQDGKEAKAGEAPTENPAPATEQSSAE	171978	147847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153_151326_152947_153046_161354_161478_163597_163688_166796_166831_167819_167884_171953
871306	contig_934_pilon	+	2310	3	Intergenic	novelGene_129018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACTCAGGAGTCCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147857	152786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_+_148430_150530_150635_151152
871307	contig_934_pilon	-	1035	6	Intergenic	novelGene_129020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_5	330.442733313959	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	275	616	158890	150570	TRUE	10	TTTATTTTTCCCGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYAADRCRYRRGYYGRRRGPPRNYAGEEEEEGSGSSEGFDTPATDGQFSGAQSQLRRPQYRPQYRQRRFPPYHVGQTFDRRSRVFPHPNRMQADEIGEMKDGVPEGTQLQGPVHRNPTYRPRYRRAPPRPRPAPAVGEAEDKENQQAASGPNQPSARRGYRRPYNYRRRPRPPNAPSQDGKEAKAGEAPTENPAPATEQSSAE	161427	148049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153_151326_152947_153046_158884_159092_161354
871308	contig_1337_pilon	+	4091	5	Intergenic	novelGene_84232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	25.7621330638594	76	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	627	2672	154748	196339	FALSE	40	AAGTTTTGGTAAAAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLEEVNREVNMHSSVRYLGYLARINLLVAICLGLYLRWEKTANSLILVIFILGLFVLGIASILYYYFSMEAASLSLSNLWFGFLLGLLCFLDNSSFKNDVKEESTKYLLLTSIVLRILCALVERISGYVRHRPTLLTTVEFLELVGFAIASTTMLVEKSLSIILLVVALAMLIIDLRMKSFLAIPNLVIFGVLLFFSSLETPKNPVAFACFFICLITDPFLDIYFSGLSVTERWKPFLYRGRICRRLSVVFTGMIELTFFILSAFKLRDTHLWYFVIPGFSIFGIFWMICHIIFLLTLWGFHTKLNDCHKVYFTHRADNNSLDRIMASKGMRHFCLISEQLIFFSLLATAILGAVSWQPTNGIFLSMFLIVLPLESMAHGLFHELGNCLGGTSVGYAIVIPTNFCSPDGQPTLLPPEHVQELNLRSTGMLNAIQRFFAYHMIETYGCDYSTSGLSFDTLHSKLKAFLELRTVDGPRHDTYILYYSGHTHGTGEWALAGGDILRLDTLLEWWREKNGSFCSRLIIVLDSENSTPWVKEVRKINDQYIAVQGAEMTKTVDIEEADPPQLGDFTKDWVEYNCNSGNNICWTEKGRTVKAVYGVSKRWSDYTLHLPTGSDVAKHWMLHFPRITYPLVHLANWLCGLNLFWICKTCFRCLKRLKMSWFLPTVLDTGQGFKLVKS	149366	197758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_149816_154570_155828_184831_184975_187203_187479_195791
871309	contig_7412_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_76296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAACCCAGCTGTTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299349	297048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_297000_299300
871310	contig_9415_pilon	+	5151	1	Intergenic	novelGene_109846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	485	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1960804	1965955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1960800_1966000
871311	contig_5317_pilon	+	3486	10	Intergenic	novelGene_76635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	131.280399183871	178	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	18	1169	896896	922667	FALSE	10	TTGGGATGTTGTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKFIHGWLIMSSLMLLFLFTYIYLGEVLKTYNVAMDYPTLFLTVWNFGAVGMVCIHWKGPLMLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWSAWVILGAISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNEPIFPALIYSSAMVWTVGMAKPDLSSQGALQLPYDPEMEEDSYDSFGEPSYPEVFEPPPAWLPGGGAGGRGGKGREARPRGLHLLQRAGGQGGGHGQWGLEHHAGMLRGHPYSVNRSP	896878	924984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_896977_902552_902768_904319_904462_912335_912404_913224_913446_915044_915144_918155_918240_918631_918735_921985_922105_922647
871312	contig_15267_pilon	+	2303	8	Intergenic	novelGene_151067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	78.9044888922483	490	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	82	1389	39792	56066	FALSE	80	GAAGAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTTQLTWMQEKVLQNCFGGKQFSLLYKATIHGSSSGDLLQRCSNQGPTITVIYSETYIIGAYVQESYQQINKGSVILFSFQRTENSEFEIRRFKACTNNDVDGQRCDRNILYYGNRDLNINIYTCYISMSYNIMKEIGLPLGDICFQECEVFRCEDLLDQRKINMVTELSKSLSSDMRTYNPCRGLVHQIRILLLGPTGAGKSSFINSVKSVFRGRVTNQSVMGFDTKQFRTYSIKDGKDGNPLPFVLCDSMGLGEKEEGLCIDDIFYILKGHVPDRYQFNSIKPITPSHVNYIDCPLLKDRIHCVAFVLDANTVENLSQEMVAKIKRTRREVIKCGVVHVVLLTYVEDLHLITKADLVDPYRCMPVKFKIEAVHRELGFPLSDIFVVSNYTLEWELSLSKNFLILSSLKQMLRAADDFLEDLPPEETGRYTW	39469	56980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_39541_39781_40264_44366_44404_45099_45284_45437_45588_49399_49572_50781_50883_55874
871313	scaffold_7386_pilon	-	2221	10	Intergenic	novelGene_136590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_9	44.9174826422138	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	335	1405	308755	297334	FALSE	25	AACCAAGGGAGCCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTRSLPCLPTFTLSSWGAGQEEASRDPPRPLEAPNPAPLAPSVRTPAAGHTPRLRERAPIGLVNQGATCYLNSILQCLFFTPEFRKAVLELELPAAQPALCRDHGESSLVTQLQRLFLDLQDAQAPVTTRAITRCLGLRNVYEQQDVLECFQTLLTRMAVEKVELRQAFQMLTERVIQCQVCKDETRLEEARLFLMVTVLPGPEESVCSVAEAVQALFRKEQVTGDNQYFCEMCDRKEDASSELCLRALPSVLVIFLERFTFYRGAFWKLKNKVTVSEKLILPFPEKNCYNLFAVCHHFGDLTGGHYVADIMSFEKRCWYRFSDDHVEEIQPGPSESSTAYLLMYRRESLGPTR	309089	296517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_297386_297863_297890_298847_298980_304003_304133_305070_305167_305567_305697_306775_306856_307251_307374_308157_308285_308577
871314	contig_401_pilon	+	1308	8	Intergenic	novelGene_42758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	286	junction_5	289.057935016353	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	129	1037	985478	998753	FALSE	25	GATGACACCATTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPPASLVPRIHVILAQKLQHINPLLPACLNKEESKTFVSGFMSELSPVRAELLGFLTHALLGDSLAAEYLILHLISTVYTRRDVLPLGKFTLNLSGCPRSSTFTEHLYRIIQHLVPASFRLQMTIENMNHLKFIPHKDYTANRLISGLLQLPNNTSFVIDESLLEQGQLDTPGVHNVTALSNLITWQKVDYDFSYHHMEFPCSINVLITSEGRSLLPADCQMHLQPQIIPPNMEEYMNSLLSAVLPSVLNKFRIYLTLLRFLDYSISDEITKAVEDDFVEMRKNDPQSITADDLHQLLVVARFLSLSAGQTTLSRERWLRAKQLESLRRTRLQQQKCVNGNEL	984770	999024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_984885_985463_985588_986749_986868_987406_987573_988970_989105_990033_990199_998223_998313_998626
871315	contig_9706_pilon	-	4064	1	Intergenic	novelGene_21026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3329	3640	586698	586387	NA	30	CTCAACCCCTCATTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMELEPRGAPIGRRRGKISQSQGASISGKLLLIYLASSGTTGFSRMSFALIGSQENNNFISIFLPYALLSINVQLSSWVLKIPTPPRTNKKEKRKEKKRKRW	590026	585962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_586000_590000
871316	contig_15888_pilon	-	1096	6	Intergenic	novelGene_84442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1560.04687109074	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	143	502	253673	252475	TRUE	15	ACTCCACATTTCGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	254064	251604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251953_252060_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928
871317	contig_11896_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_88028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGGGCATGTTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150474	151552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_150500_151600
871318	contig_6228_pilon	-	2192	1	Intergenic	novelGene_164505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242938	240746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_240700_242900
871319	contig_3584_pilon	+	1420	4	Intergenic	novelGene_108177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	540.495040577514	2	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	895	1419	529553	530997	FALSE	5	ATGTGTCTGGTTGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPDLIALLAHVFSFVSGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVG	527067	530998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_529683_530602
871320	contig_18081_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_23853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	2134	2592	465565	466023	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLLQLSRRADQSCLHREKVPWELPRHTGSQRKAVSSSSNVTRTRNAKPIFRVRKATLHHPTNDVAVKRTGERGSSFPSSPSPLCRLIRVLTFRMDLQTHLASQSLTTLSGSLCPGRYFTFSWSLFMMSVSFLPLTVSSKTHILTVEANF	463431	466091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_463400_466100
871321	contig_19076_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_74215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCATTGTATGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112491	115284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_112500_115300
871322	contig_14516_pilon	+	2443	18	Intergenic	novelGene_153879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	110.284595667403	17	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	556	2130	36344	422819	FALSE	70	CGAAAAAAAAAAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGSTGRKPRIKLGRKRRCPRSHPRSPWRALTLGWEMQQITWDRCKRVQVATLLH	32005	423132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_36343_36417_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_416656_416690_422512_422614_422792
871323	contig_7640_pilon	-	4150	1	Intergenic	novelGene_177335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	845	2538	270	2807	145544	143007	NA	20	AACTTGGTATCTCCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSLIPFLCPERAPAEFIRFHPQYQEVNGTLPLIKFNGAQVNPKFKQCDVLQLLWTSCPILPEKATPLSIKEQEGSDLGPQEQLEQVLSMLSVNLDPPLDKVINNCRNICNITTLDEEMVKTRAKVLRSIYEFLSAEKREFRFQLRGVAFVMVEDGWKLLKPEEVVINLECESDFKPYLYKLPLELGTFHQLFKHLGTEDIISTKQYVEVLSRIFKNSEGKQLDPNEMRTVKRVVSGLFKSLQNDSVKVRSDLENARDLALHLPSQDGRLVKSNVLVFDDAPHYKSRIQGNIGVQMLVDLSQCYLGKDHGFHTKLIMLFPQKLRPRLLSSILEEQLDEETPKVCQFGALCSLQGRLQLLLSSEQFITGLIRIMKHENDNAFLANEEKAIKLCKALREGLKVSCFEKLQTTLRVKGFNPIPHSRSETFAFLKRFGNAVILLYIQHSDSKDINFLLALAMTLKSATDNLISDTSYLIAMLGCNDIYRISEKLDSLGVKYDSSEPSKLELPLPGTPIPAEIHYTLLMDPMNVFYPGEYVGYLVDAEGGDIYGSYQPTYTYAIIVQEVEREDADDCSFLGKIYQIDIGYSEYKIVGSLDLYKFSRPDESSHSRDSAPSTPTSPTEFLAPGLRSIPPLFPGRESHKTSSSKHHSPQKLKVHSLPEILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTFSTSASRFQSDKYSFQRFYTSWNQEATSHKSERQQQNKEKCPPAAGQTYSQRFFVPPTFKSVGNPVEARRWLRQARANFSAARNDLHKNANEWVCFKCYLSTKLALIAADYAVRGKSDKDVKPTALAQKIEEYSQQLEGLTNDVHTLEAYGVDGLKTRYPDLLPFPQIPNDRFTSEVAMRVMECTACIIIKLENFIQQKV	145813	141663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7640_pilon_-_141700_145800
871324	contig_8284_pilon	-	3458	1	Intergenic	novelGene_125672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTCCTTATGGATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256461	253003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_253000_256500
871325	contig_1472_pilon	-	1757	11	Intergenic	novelGene_86114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	853	1233	558424	382525	TRUE	60	CTAGAAGATTGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYPRKIFRSLLFLLCWNLFHFCSRSSWSWIKLVNKEAWKFVLFNKFHCFLKILICFSRKTTDDVCSNSYSRNFLFQKIHYSFEVSHTVFSFHFHEHSVRGRLDWYVQKGIDSGVIKDFCHFLQML	751323	87738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_87834_113736_113784_159867_159994_237311_237414_382370_382538_435496_435645_514443_514623_558383_558447_708520_708605_712299_712465_750742
871326	contig_5945_pilon	+	1962	4	Intergenic	novelGene_104542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	27.178422814186	1228	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	751	1455	196496	197866	TRUE	60	AATGAAAAAAATGAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALLGLKPEVQDTCTSLGLMLSVVLFMGLARVIARQRLHSPKAHAFVLEFLATFQLCCCTHELLVLSEQDPANPTWPLTLIYFFSLVHGLTSVGTASNPCGVMMQMMLGGMSPELGAIGLLAQLISALCSRYCIGALWSLRLTKYHVSERSFACRNPIHVDLPKAVVIETIFSFIFHSALLHFQEIRTKLRIHLLAALITFLVYADLRSSLYILNGTRKSKKQALYDKMCHFK	195745	209184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_197115_197780_197890_205293_205411_208817
871327	contig_1154_pilon	-	2878	1	Intergenic	novelGene_87051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	999	1421	102611	102189	NA	35	TATCATGTGATAAGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLFELRSSLFMSITLCLIVQSNLYLKSWLQEWFQFWANRESGGHVFRDPSSLRPLSLVFLLGFEFCTPLFFCSVRDSLLYSLSGWSLVVARHHLVLLVSGRQSLWFMWPFLSLGLMFSLCLWCSSFSFASYGLGPIDAS	103609	100731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_100700_103600
871328	contig_12019_pilon	+	678	3	Intergenic	novelGene_87684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	32	355	5225	8336	FALSE	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5193	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
871329	contig_5210_pilon	-	2531	14	Intergenic	novelGene_65479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	222.601695395384	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	10	2172	1204106	1101153	FALSE	40	TAAATTAACATGTTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRKKKVKEASESQSLAKKDAETSTSVSLKRKRKFEDAFIVISDSDGEQEPEEENGLQKTKMKQPSRAKCLAKRKIAQMTEEEQFALALKMSEQEAREVNSQEEEEEELLRKAIAESLNSCQPSDASATSSRPLAIGPSSQFHQEKTTDSGTTEGIWQLVPPSLFKGSHISQGNEAEEREEPWDHTENTEEEPVSGSSGSWDQSSQPVFENENVTCFDRCTGHLAEHTQCGKLQESTGRGCAQGRGDTSRHCLPTPADDRGFQSIGGTVHYFWGIPFCPAGVDPNQYTKVILCQLEVYQKSLKMAQRQLLKKKGFGEPVLPRPLSLIQNECGQGDQASEKNEGISEDMGDEDKEERQESRASVWLSEPKDFQESPIKSLKEKLLLEEEPTTSHGQSSQGLFVEETSEEGNSVPASQSIAALTSKRSLVLMPESSAEEITVCPETQLSSSETPDFEREVSPSSRETPDEVRIIMADQEVGNREDAEKEIPTYTFSSSTRVSCPLCNQGFPPTKIERHAMYCNGLMEQDTVLTRRQKEAKSKSKSDTGTAAQTSLDIDKSEKCYLCKSFVPFREYQCHVDSCLQLAKGDQGDGPSGSDSVCPVAEGKQQQRLRSTKEKGQNEGRLLSVLEQSEQQSADAEIKTTSSETGAFRVSSLGMEEAGCSREMQSSLAHLDINDSPIKSFVSISEATDCLVDFKKQFTVRPGSRARTKAGRGRRRKS	1204115	1100793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_1101364_1101907_1101951_1103094_1103159_1104556_1104729_1107304_1107390_1141824_1141979_1147997_1148102_1152584_1152662_1154692_1154758_1160900_1161623_1161930_1162037_1162767_1162893_1173672_1173761_1203959
871330	contig_14333_pilon	-	4752	1	Intergenic	novelGene_49163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	513	815	533274	532972	NA	75	AAAAAAAAAAACAGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTYIHMRRKYSKNLREYLWMVGPCLITVFRLFYILHIFYEEEDDNKDSDDDNNDDEGCYNEPDTLVSTNIKFIHSSKQHFRNRYDYYPHFTEEKNKVCK	533786	529034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_529000_533800
871331	contig_4364_pilon	+	1764	6	Intergenic	novelGene_168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	739.845118926928	2065	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	111	725	1268714	1270037	FALSE	10	GCCAGTGTCCCTCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQEPTAEQLAQIAAENEEAEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSTDPNVPNVVVTRLTLVCSTALGPLELDLTGDLESFKKQSFSLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGLKYIQQTYRKNVKIDKTEYMVGSYGPRAEEYEFLTPMEEAPKGMLARGNYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKEWKD	1266986	1271076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1267085_1268701_1268904_1269000_1269085_1269489_1269567_1269648_1269713_1269837
871332	contig_12151_pilon	-	2684	10	Intergenic	novelGene_54982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	234.044208127492	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	119	1963	1023634	986256	FALSE	65	AGGATAAATTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSAHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSGNRGKGTKKSPALQSLGGLLFCCCYCCFLIFSNIVDFIDGFKELILFPKYFVSSLIMT	1023752	985534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_986624_987392_987502_988025_988074_989445_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016743_1023563
871333	contig_16121_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_6874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCCGTAGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52981	50838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_50800_53000
871334	contig_20199_pilon	-	857	3	Intergenic	novelGene_82548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1345	42	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	160	333	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44146	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42125_43906
871335	contig_14441_pilon	+	1418	5	Intergenic	novelGene_100606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	140	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	830	1378	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111204	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_121197_121691_125517_125902_126159_126283_126514
871336	contig_10904_pilon	-	1914	5	Intergenic	novelGene_22762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	249.975373787099	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	263	1177	662171	660254	FALSE	20	CTCAGGAAAGGGTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSGEEPLMLSPLCSDGQFRALSPGGAPG	662743	659516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
871337	contig_5566_pilon	-	3741	17	Intergenic	novelGene_153648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	67	junction_10	56.5461302278945	227	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	93	1823	176330	161993	TRUE	55	AAAAATACATTTTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGGSRIIRRVSLRKRNRPSLGSVCAAPAAAELKPGNVEDEEMVAGSRRRKTVGVQPVEYDSEEDMFGDYDSFTENSFLAQVDDLEQKYMQLPEHRKHDTDLAIEDLCSESIKDSKLNITTVDNFTALKTDEPTKNQCGQEDVAIEPGTDLLYDVPSSQVLYFENLQNSSNDWGNQFTKEKDWNSSSHQTVNEELSHSCIEQPQQNDQSSSEVRTSSDTTRRKSLKDHLKSTMTGNAKAQTPVFSKTKQLKESLLSEEINVAKKTLESSSDDRGPFYSLPSKVRDLYVQFKGIEKLYEWQHTCLTLNSVQERKNLIYSLPTSGGKTLVAEILMLQELLCRRKDVLMILPYVAIVQEKISGLSTFGMELGFFVEEYAGSKGRFPPVKRREKKSLYIATIEKGHSLVNSLIETERISNLGLVVVDELHMIGAGSRGAVLEMTLAKILYTNKTTQIIGMSATLNNVEDLQEFLQAEYYTNQFRPVELKEYLKINDEIHEVDSKAENGITFSRLLNYKYSDTLKKMDPDRLVALVTEVIPNYSCLVFCPTKKNCENVAEMICKFLSKYVNIFKISFTRV	176422	131290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_131481_140998_141134_142158_142273_144562_144737_147385_147485_148382_148541_149896_150120_156087_156193_157205_157348_161414_162179_163516_163616_164783_164882_167749_167823_168362_168564_169131_169311_173166_173882_176150
871338	contig_5331_pilon	-	1800	5	Intergenic	novelGene_112775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	259.898537895079	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	14	805	253336	248930	FALSE	0	GTGTCTTTGTTCTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLTMVVVAGVPSPATGAPKMLLLSSKPSPAAAVGAPADRALSLMVPGQRGASPEVADGGPPQARKRQRLTHLSPEEKALRRKLKNRVAAQTARDRKKARMSELEQQVVDLEEENQKLLLENQLLREKTHGLIVENQELRQRLGMDALVTGEEVETKGNGARPVAGSAESAALRLRAPLQQVQAQMSPLQNISPWILTVLTLQTLSLISFWAFWITWTQSCSSAVFPQSLPAWRSSQKATQKDPVPYQPPLLHHWGRHQPSWKPLMN	253349	247934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_249117_249435_249582_250439_250569_251700_251798_253103
871339	contig_312_pilon	-	2089	9	Intergenic	novelGene_128321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGCTCTTCCGGGCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590433	572764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_572953_575398_575452_577850_577945_582290_582368_583775_583814_585375_585513_587218_587285_588795_589303_589504
871340	contig_6027_pilon	+	3998	1	Intergenic	novelGene_74431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAATCCGGGACCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233175	237173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_233200_237200
871341	contig_9843_pilon	+	3439	10	Intergenic	novelGene_114338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1060	1371	258839	259150	TRUE	15	TTCACTTCCTAGTTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSPVGYKSKFRAPAPGEGPLSTLKEGPCHQSSPVQELLRAGTSGPKDVLCSRHCFLGGMRFPCVSAHFSLLCLKRDWFKTLSNLADLISITSS	257779	305715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_259803_264922_265039_269035_269210_287661_287770_288384_288469_291039_291131_299061_299283_302276_302702_304403_304507_305621
871342	contig_7078_pilon	-	4186	18	Intergenic	novelGene_130153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_5	340.741253851254	644	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	299	1615	645721	581165	TRUE	25	AAGCTTAGAGGTTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRSGKIVPGQVYIEVEYDYEYDAKDRRIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVPRKALMPPVKQAVGQPNNSVKMIQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKSSSSVQGTGLIRDANQNFGPSCSPGQTVSLSLDLTHNNGKFNSDSHSPKVPSQNRTRLFGHFPGPEFSDIEKTGFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRASTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSAVPPLPGSPAVQINGEWETHKDISGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISKGDFQSSGDQELLSSEENYHSISYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWRKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKTLSRKQKEKLQTRRKYLQVIYPEKDLDPEYIKHSQNSTKNKQELKNGPRT	671159	540393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_541943_543085_543189_543419_543555_543657_543736_545054_545154_549447_549551_554026_554126_557188_557291_563348_563431_567317_567380_576651_576778_581131_581318_585712_585794_586942_587084_593930_594195_645043_645800_647333_647376_670981
871343	contig_5649_pilon	+	1568	1	Intergenic	novelGene_82468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGGCCTATGAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565928	1567496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1565900_1567500
871344	contig_6710_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_96944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
871345	contig_6842_pilon	-	1216	4	Intergenic	novelGene_130715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.886820773232	843	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	110	490	433953	429651	FALSE	35	CTAACCAGGACTATCGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTVSGWSMSRTGH	434062	428924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_429686_431763_431865_432547_432658_433818
871346	contig_8712_pilon	-	3429	1	Intergenic	novelGene_58841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	482	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGAGGAGACATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515973	512544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_512500_516000
871347	contig_5899_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_146962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42243	44373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_42200_44400
871348	contig_8259_pilon	-	4540	1	Intergenic	novelGene_148851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTGCTCGCGCCCGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57629	53089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_53100_57600
871350	contig_6677_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_114218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	456	947	626305	626796	NA	75	CAAAAAAAACAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLFSSLQCVQWVDEAKLNQMRREGIRYARIQLCDNDIYFIPRNVIHQFKTVSAVCSLAWHIRLKQYHPIVEAPQNTESTSNMDCGLTGKRELEVDSQCLRLKTESEETCTEMQLLTTSSCPSSSELNLPQDQMTQPIPALKVESRLESDQQHNLQEHSGTPV	625849	628146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_625800_628100
871351	contig_8020_pilon	+	3828	24	Intergenic	novelGene_114354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_4	38.1214356541396	365	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1126	3381	111	3491	60292	66641	FALSE	25	ATGGAATATGTGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIWCPFIPEESEDCSEEGSPTVALLHEDRAEVWDLDMLRSSHSTWPVDVSQIKQGFIVVKGHSTCLSEGALSPDGTVLATASHDGYVKFWQIYIEGQDEPRCLHEWKPHDGRPLSCLLFCDNHKKQDPDVPFWRFLITGADQNQELKMWCTVSWTCLQTIRFSPDIFSSVSVPPSLKVCLDLSAEYLILSDVQRKVLYVMELLQNQEEGHACFSSISEFLLTHPVLSFGIQVVSRCRLRHTEVLPAEEENDSLGADGSHGVGAVESAAGVLIKLFCVHTKALQDVQIRFQPQLNPDVVAPLPTHTAHEDFAFGESRPELSPEGLGSASHSSQPDLHRIVELPAPADFLSLSSETKPKLMTPDAFMTPSTSLQQITTSPSSSSSSNSGSGSLTAVSAISSTSAVDPSLPRPPEELTLSPKLQLDGSLTMSSSNLQASPRSLLPGLLSGPADKLTTKGSVQVPTAASALSLELQDVEPLGLPQASPSRTRSPDVISSASTALSQDIPEIASEALSRGFGSSAPEGLEPDSMASAASALHLLSPRPRPGPELGPQLGLDEGTGDGDRHSTPSLLEAALTQEAVAPDSQVWPTAPDITRETCSSLAEIPRNGLQEKHKSLAFHRPPYHLLQQHDSQDASAEQSDHDDEVASLASASGGFGTKVPTPRLPAKDWKTKGSPRASPKLKRKGKKDDSRDTAVGSRLTEHQVVEPPDDWPTIIWQQQRELAELRHCQEELLQRLCTQLEGLQSTVTGHVERALETRHEQEQRRLERALAEGQQRGGQLQEQLTQQLSQALSSAVAGRLERSIRDEIKKTVPPCVSRSLEPVAGQLSSSVATKLTAVEGTMKENISKLLKSKNLTDAIARAAADTLQGPMQAAYREAFQSVVLPAFEKSCQAMFQQINDSFRLGTQEYLQQLESHMKSRKAREQEAREPVLAQLRGLVSTLQGATEQMAATVSSSVRAEVQHQLHVAVSSLQESILAQVQRIVKGEVSVALKEQQAAVTSSIMQAMRSAAGTPVPAAHLDCQAQQAHILQLLQQGHLNQAFQQALTAADLNLVLYVCETVDPAQVFGQPPCPLSQPVLLSLIQQLASDLGTRTDLKLSYLEEAVMHLDHSDPITRDHMGSVMAQVRQKLFQFLQAEPHNSLGKAARRLSLMLHGLAAPSLP	60096	66978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_60186_60270_60376_60678_60789_60871_60956_61050_61147_61242_61346_61466_61648_61741_61815_61923_62016_62092_62281_62372_62480_62575_62727_63039_63474_63561_63667_63752_63906_63983_64024_64138_64317_64428_64585_64698_64815_64911_65078_65163_65351_65428_65649_66061_66226_66448
871352	contig_8594_pilon	-	1987	7	Intergenic	novelGene_140049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	230.207635745549	667	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	368	1189	496028	461703	FALSE	40	CATTGATGTCTATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLLLLSLGMQLWQTAAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	525415	460904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_495973_496216_525235
871353	contig_6503_pilon	-	2035	8	Intergenic	novelGene_145755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	155.744164892169	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	127	744	134980	121820	TRUE	35	ATAAATTTTTGGGATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAVFTTLLLSPSYK	139872	118390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121858_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
871355	contig_4674_pilon	-	2339	7	Intergenic	novelGene_174145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	133.412164196356	101	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	453	974	356875	310863	TRUE	50	TTAAAAATCTTAATCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREGSGTRLVAEVIKDRLCFAILYSRPKSASNLHYFCIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMIRKKIIHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRVLMFGDTSYIPFSQDPFDISNDISGSTASSESSLNFWPVDVLLQLLLNDLHQNFTWM	357327	309222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_310552_310826_310999_313985_314063_351305_351399_354635_354712_355292_355384_356826
871356	contig_5954_pilon	-	4028	1	Intergenic	novelGene_28455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAAGCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119834	115806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_115800_119800
871357	contig_3818_pilon	+	2862	7	Intergenic	novelGene_99261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_4	98.3965898234735	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	72	881	516085	528488	FALSE	40	GATTGATACAAAAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKQGLTPATCVVPVFLLSRSIDEMKRLEEMSGVFQSSGVEHHSPEPKSQTEGNEESGDRAQPWEMVMDKKHFKLWRRPITGTPLYQYRVFGTYTDVTPRQFFNVQLDTEYRKKWDALVIKLEVIERDVVSGSEVLHWVTHFPYPMYSRDYVYVRRYSVDQENNVMVLVSRAVEHPSVPESPEFVRVRSYESQMVIRPHKSFDENGFDYLLTYSDNPQTVFPRYCVSWMMSSGMPDFLEKLHMATLKAKNMEIKVKDYISAKPLDMGSEAKATTQSSERKNEGSRGPAQIEYA	516013	530469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_516281_516627_516678_519656_519768_519846_519930_520393_520494_527216_527302_528303
871358	contig_7356_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_60435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTGTTAAAAAGCAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536401	535870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_535900_536400
871359	contig_5229_pilon	+	2848	6	Intergenic	novelGene_117718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	287	junction_5	88.8180161904104	1348	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	282	923	658024	667261	FALSE	30	TGGTATAAACTGCAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKDSHEDRDTTENVDESNHDPQFEPIVSLPEQEIKTLEEDEEELFKMRAKLYRFASENELPEWKERGTGDVKLLRHKEKGSIRLLMRRDKTLKICANHYITPLMELKPNAGSDRAWVWNTHADFADECPKPELLAIRFLNAENAQKFKTKFEECRKEIEEREKKGLGKNDNAEKVAEKLEALSVKEENEEATGTKVSEGEEAKEKTEEKQ	657742	669186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_658039_660570_660705_662746_662905_664881_665011_666201_666268_667121
871362	contig_11978_pilon	-	4028	1	Intergenic	novelGene_63134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	602	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCCTCCAGAGCCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1984404	1980376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1980400_1984400
871363	contig_17274_pilon	+	2454	17	Intergenic	novelGene_26550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	239.542500143503	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	131	1114	181233	213531	TRUE	25	AAATAGGGCTTATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	179111	216904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439_215793_216071
871364	contig_19812_pilon	-	2150	19	Intergenic	novelGene_100982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	106.710537853058	1	107	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	168	1439	44592	24588	TRUE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQGDRGPLAECQPHGDHHETAEDQGAVSPGPP	46778	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22800_22950_23055_24570_24681_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710
871366	contig_7045_pilon	+	2505	5	Intergenic	novelGene_77444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_1	280.782389048886	176	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGATGTGTCAGGTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323174	365984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111
871367	contig_6283_pilon	-	1557	9	Intergenic	novelGene_100220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	162.376058503093	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	390	1061	614914	611758	TRUE	40	TCTTATAATAAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	615559	610886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_610936_611310_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_615143_615323_615452_615526
871368	contig_18096_pilon	-	2022	12	Intergenic	novelGene_58027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	882	1199	69547	62869	TRUE	35	ACAGCAGCCTCAAGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAKEVFLRGRRQCEGMPLQLGHLGALDKNVLSHLHLESLLLHLQLKGFERVSDHLCDDHFLLRSPKPDQPLTEIQEHGTHYPFPSLRRVPSKFWNWAFFYFPPV	79084	40308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_40427_42488_42584_44144_44256_53716_53800_57199_57353_59463_59657_62798_62927_66640_66734_69380_69637_70499_70661_71980_72102_78574
871369	contig_9121_pilon	-	3797	1	Intergenic	novelGene_134462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGCTCTTGACCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198351	194554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_194600_198400
871370	contig_1331_pilon	-	1254	5	Intergenic	novelGene_37796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	69	545	169924	160009	TRUE	15	GCATTGTTCTGTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169992	158943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159633_159988_160214_160867_160949_166406_166534_169860
871371	contig_16411_pilon	+	2412	3	Intergenic	novelGene_77318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1596	junction_2	502	35	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	639	977	142156	143258	FALSE	65	GAGAAAAAGGAAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQVSSSRHRLAL	134517	144693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_135147_142146_142314_143077
871372	contig_16103_pilon	-	1157	7	Intergenic	novelGene_118842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	855	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	69	665	743628	722774	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLLF	743696	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722783_733548_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
871373	contig_16103_pilon	-	1148	2	Intergenic	novelGene_118861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCTCTGACCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743692	722286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_743637
871374	contig_16103_pilon	-	827	5	Intergenic	novelGene_118854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3072.94683488016	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCTCTGACCTGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742845	722283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722670_735884_735975_737495_737630_737752_737917_742792
871375	contig_16103_pilon	-	1179	3	Intergenic	novelGene_118831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2514.5	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	50	424	743628	723037	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERCRYEPALLRAEHSQGKDSPVGTLIGLYKAPAKPGR	743677	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723142_737491_737630_743496
871376	contig_17171_pilon	-	2341	6	Intergenic	novelGene_147371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	35.7692605458933	467	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	35	760	270859	266475	FALSE	25	CATATTGGGTTGTGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPATALLLQLALLLHAAASAAQRPSTFRMSPLKVQGTLGKSVELECEVLLSNFASGCSWLFQRPDAATSPTFLLYISSSRPKPSSDRYSGSKTESRFKFTLHDFQVEDQGYYFCSVVSNHALYFSAVVPVFLPEKPVTTLAPRPPTPAPTKALQPKSLSPEVCRPSAGRPSAGGAVDSRGLGFSCDLYIWAPLAATCAVLLLSLIVAVICSHRNRRRVCKCPRPLVRPGGKPDLSEKYV	270893	264893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_266527_268720_268752_269338_269450_269671_269798_270365_270723_270810
871377	contig_11448_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_66338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	484	783	143595	143296	NA	35	AAAAAACTCTTCTGTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTHFLYIPTYIVYILYMDTCVYVHMYTHAHNKIRCSLQIQILHKQQQRKQGWTLETDHKKSKQPLAVTLVISECSQGMDCNKEKKELLVKEEKWAKPS	144078	141596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_141600_144100
871378	contig_15114_pilon	-	1674	8	Intergenic	novelGene_121130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	187.301786386765	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	49	1131	125261	100502	FALSE	25	TCTGTACGTGTTCATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQWPLWPDRLPSSDAAMARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRTLGHWTCLNSQRAIF	125309	99958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100554_100620_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212
871379	contig_10000_pilon	+	3937	1	Intergenic	novelGene_139319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGCTGCCAGATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186381	190318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_186400_190300
871381	contig_9706_pilon	-	3465	1	Intergenic	novelGene_20995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGTGTGTCACAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452479	449014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_449000_452500
871382	contig_5479_pilon	+	2849	1	Intergenic	novelGene_133600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305280	308129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_305300_308100
871383	contig_6445_pilon	-	2511	7	Intergenic	novelGene_77077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	486	923	740939	738589	TRUE	15	TCCCCAAGGTCCCACGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPVSVGGGGAIYIPSCISPLQPPSVPPVHLLELLIVIVISGLLVRGTLAVRRRPLRLWLLGVAYSQGPGFGFFFVSPYGGVELLMIKSVVLHIIHSHVGGHKGCLTVFLLILLLCQQSGLGILRGNNIFYFGTTGRKEPDHGLD	741424	727261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_727354_727706_727766_736267_736320_736468_737014_737748_738764_738856_738956_740775
871384	contig_5671_pilon	+	978	5	Intergenic	novelGene_79463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2316.8330081169	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	30	461	370430	531275	FALSE	35	ATTGCATATATATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSETMNPKPKKYLCSQFPEIC	370400	531792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370536_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531218
871385	contig_3584_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_108156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAACGGTTTGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366202	368895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_366200_368900
871387	contig_20890_pilon	-	1699	5	Intergenic	novelGene_147039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1129	junction_1	472.36446468802	832	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	162	677	42692	21744	FALSE	40	CATAATACTTGAAACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPFTDVVTTNLKLRNPSDRKVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDPGLTVTVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQTIFAPPNTSDMEAVWKEAKPDELMDSKLRCVFEMPNENDKLNDMEPSKAAPLNASKQDGPMPKPHSVSLNDTETRKLMEECKRLQGEMMKLSEENRHLRDEGLRLRKVAHSDKPGSTSAASFRDNVTSPLPSLLVVIAAIFIGFFLGKFIL	45633	20721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_21903_29614_29789_42125_42207_42590_42695_45474
871388	contig_5779_pilon	-	5436	2	Intergenic	novelGene_106414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	0	291	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	183	2534	50749	48398	FALSE	25	TATTTATTGAGTGCTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHALWILWALGAIITLSKGGSPDQAFLSCDPTGVCDGSSRSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNKIAYVGNTDLQLCVNLKALILKSSEINRIDEDAFLPLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWFRPLSSLQFLSLLGNLYKELGETSLFSHLTNLRVLKVGNIYTSKIQKKDFTGITFLKELEIDASNLQSYEPESLKSIQNISHLILHMRQPILLPATFVDLLSSLEYFELRNTDLHTLHFPELPISETNPLIKKFTFRNVEITDESFNEVMKLFSSASELSELEFDDCTLNGIGNFDSSVIEKIKDPGKVETLIIRKLHIPQFYLFNDLSSIYSLTGNLKRITIENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACKDAWPSLQTLILRQNHLTSLEKTGETLLTLKNLTSLDISKNSFKSMPENCWWPEKMKYLNLSSTQIHSLTYCIPQTLEILDVSNNNLNSFSLMLPQLRELYISRNKLKTLPDSTFLPMLLVMRISRNTINTFSKEQFESLQKLKTLEAGGNNFICSCEFLSFMQEQQALTKVLVDWPENYLCDSPSNVRGQRVQDTRLSVAECHRAALVSAVCCALLLFILLMGVLCHRLHGLWYMKMMWAWLQAKRKPKKAHNRDICYDAFVSYSERDSYWVESLMVQELENFDPPFRLCLHKRDFVPGKWIIDNIIDCIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPNDEAQQQGFWLNLRTAIKS	62227	45495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_50766_62061
871389	contig_9981_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_121024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAATCTTGTCTGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12077	13631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_12100_13600
871390	contig_9981_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_121025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAAGTTTTTGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12503	13556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_12500_13600
871391	contig_10078_pilon	+	1872	14	Intergenic	novelGene_159996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	562.630287343906	316	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	675	1442	211491	221204	TRUE	20	AAATCTTCTTGGTTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLWMCKIRNQKKLSPPVVETLPTVDLHEDSSSVVVNSENIENISGSSTSEITPVSKLDEIEKSGTIPIARPTETEQSETNCGDGEALDANAPAEQPSFVSPPESLVGQHIENVSSSHGKGKITNSEFESKVSASEQDGGDPKSALNASDNLKNESSDYKNPGEIDPSSVASPKDPEDIPTFDEWKKKVMEVEKEKSQSMHPSSNGGQHATKKVQKNRNNYASVECGAKILAANQHICYSYRKYGSLYVESLQH	164816	241757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_165294_209599_209709_211402_211514_215793_215950_217307_217446_217669_217821_218985_219110_220543_220658_221142_221211_235856_235965_237385_237511_240018_240075_240553_240646_241714
871392	contig_2770_pilon	-	1528	6	Intergenic	novelGene_107470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1768.04456957397	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	198	521	750561	744125	TRUE	35	TTAACTTAAAGTCGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVLMAMVTSVQQNYVTS	750758	742944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744579_744680_746600_746745_747765_747797_750558
871393	contig_7629_pilon	+	3823	1	Intergenic	novelGene_153568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACAGTACAAGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279028	282851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_279000_282900
871394	contig_1813_pilon	-	3166	1	Intergenic	novelGene_105510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	948	1403	417919	417464	NA	10	CAGACCTGCCTCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPILPFLPAVWLCQLAFCTVIQRQHLGLVVVLIKGYGLVSLLLKRRFCSFSVFILQDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSQTEEDCTEELFDFLHARDHCVSQPKSGGGRLMVAREDLLLTTFPPTNIYCGINICRGQC	418866	415700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_415700_418900
871395	contig_14666_pilon	-	1468	6	Intergenic	novelGene_39530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_5	944.435916301366	2901	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	295	906	458202	449808	FALSE	30	ATCTGCTTCTTTTGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	475191	449245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_475054
871396	contig_6589_pilon	+	1610	3	Intergenic	novelGene_26145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10963	junction_1	3346	148	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1045	1488	1886145	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGLLGIRVCLRGHTPCSLQKFPVRCSLNSLPYPVQAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885100	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886335_1886652_1886783_1887705
871397	contig_5059_pilon	-	3120	2	Intergenic	novelGene_140716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	388	junction_1	0	65	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214758	211094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_214187_214730
871398	scaffold_13505_pilon	-	3909	15	Intergenic	novelGene_111668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_1	441.956301515183	1435	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	896	2554	893574	871475	TRUE	5	TGAGGGCTTCGTGTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINEEISVKHLPSTEPDPHVVRIGWSLDSCSTQLGEEPFSYGYGGTGKKSTNSRFENYGDKFAENDVIGCFADFECGNDVELSFTKNGKWMGIAFRIQKEALGGQALYPHVLVKNCAVEFNFGQRAEPYCSVLPGFTFIQHLPLGERIRGTVGPKSKADCEILMMVGLPAAGKTTWAIKHAASNPSKKYNILGTNAIMDKMRVMGLRRQRNYAGRWDVLIQQATQCLNRLIQIAARKKRNYILDQTNVYGSAQRRKMRPFEGFQRKAIVICPTDEDLKDRTIKRTDEEGKDVPDHAVLEMKANFTLPDVGDFLDEVLFIELQREEADKLVRQYNEEGRKAGPPPEKRFDNRGGGFRGRGGGGGFQRYDNRAPPGGNRGGFQNRGGGGGGGGNYRGGFNRSGGGGYNQNRWGNNNRDNNNSNNRGSYNRTPQQQPPPQQPPPPQPPPQQPPPPPSYSPARNPPGGEQLQQKQQHPWLQRQYQHPHCQQLQPSTAELQPATLQPGRLHPGLHSPTTSTSATTCLQLRDIRRVQPGPLHPAATPRRTDLPSAQL	904670	869546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_870889_871461_871654_873243_873535_875048_875331_875867_876037_882556_882686_882774_882898_884099_884367_889852_889966_891947_892048_893568_893709_895241_895316_897067_897223_900568_900695_904264
871399	contig_614_pilon	+	2505	6	Intergenic	novelGene_132619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	14.560219778561	319	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTATGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588610	642238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_588748_618939_618994_619859_619971_621721_621753_634039_634064_640090
871400	contig_19352_pilon	+	3074	3	Intergenic	novelGene_122373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTTTACAAAGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103164	110469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_104089_105885_106011_108444
871401	contig_11115_pilon	+	2763	7	Intergenic	novelGene_102778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_1	51.0405612125189	366	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	368	2149	37347	42450	FALSE	15	CTGAGTCTTGATTTCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYASTECKAEVTPSQHGNRTFSYTLEDHTKQAFGIMNELRLSQQLCDVTLQVKYEDAPAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFAYTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCAELHQRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLTHCQLATLISRDDLNVRCESEVFHACINWVKYDCEQRRFYVQALLRAVRCHSLTPHFLQMQLQKCEILKSDSRCKDYLVKIFQELTLHKPTQVMPCRAPKVGRLIYAAGGYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYAVGGRNNSPDGNTDSSALDCYNPMTNQWSPCAPMSVPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSHGCIHHNSVERYEPERDEWHLVAPMLTRRIGVGVAVLNRLLYAVGGFDGTNRLNSAECYYPERDEWRMITPMNTIRSGAGVCVLHNCIYAAGGYDGQDQLNSVERYDVETETWTFVAPMKHRRSALGITVHQGRIYVLGGYDGHTFLDSVECYDPDTDTWSEVTHMTSGRSGVGVAVTMEPCRKQIDLQNCTC	35072	43064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_35165_36532_36668_37206_37893_39585_40272_41477_41684_41960_42138_42283
871402	contig_11752_pilon	+	2469	3	Intergenic	novelGene_37672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2803	junction_1	128.5	26	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTCTGGTGAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95446	106922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_96572_100956_100976_105597
871403	contig_16768_pilon	+	2639	21	Intergenic	novelGene_168319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	801.721165680438	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2289	349	2637	47459	69379	FALSE	55	TGAAAGAGAAAACATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQESINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDLPNAAQAQKEEQLKIDEAEPLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITL	28034	69381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_28111_32635_32803_44559_44610_47403_47528_48858_49015_49108_49241_50677_50747_52995_53106_54492_54720_56809_56932_57012_57166_59017_59151_61964_62114_62304_62425_63204_63316_63644_63759_64111_64235_64963_65097_68101_68221_68609_68823_69343
871404	contig_13707_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_43530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGTGTTATTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271466	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_269700_271500
871405	contig_7080_pilon	+	4228	11	Intergenic	novelGene_100095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	128.454038472911	42	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	83	694	488513	529428	TRUE	25	TATATTAAAGTTGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAQLTLTSSAEPGRAAAPPRPDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKAVSHPRRGRMLPDMCCESLGLTVGMLGSSPSAGHLLQFCRFGSWWPVIRAFSGW	460799	542179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_460865_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_530178_530849_531944_533648_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540921_541884
871406	contig_15744_pilon	+	2376	2	Intergenic	novelGene_83565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTAATCTTGTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20804	24161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_20958_21938
871407	contig_13894_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_62161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2544.72310215997	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	94	621	523580	526612	TRUE	30	AATATTTTCTAGTGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLVSNELSPPSL	523486	528158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526685_526819_526948_527459_527580_528072
871408	contig_7078_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_130147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCTGTCATTCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249568	251487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_249600_251500
871409	contig_8045_pilon	-	3204	10	Intergenic	novelGene_35316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	164.920706723482	39	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCCGTGTGGTTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300191	18308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_19991_72651_72769_98059_98115_100942_101059_102484_102764_232388_232502_235227_235597_235712_235932_286664_286746_300018
871410	contig_5954_pilon	-	3593	2	Intergenic	novelGene_28454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACAAGCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119446	115806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_117768_117814
871411	contig_2894_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_86532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1498	1863	134216	133851	NA	25	GAGAATGTGAGATTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEFYQKKKSRWPFSDECIPWEVWTVKVHVVALATEQERQICREKVGEKLCEKIINIVEVMNRHEYLPKMPTQSEVDNVFDTGLRDVQPYLYKISFQITDALGTSVTTTMRRLIKDTLAL	135713	133570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_133600_135700
871412	contig_6102_pilon	-	2673	4	Intergenic	novelGene_32178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_3	379.895014737259	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	302	613	867239	846062	FALSE	25	AAAATAGCTGTCTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKVGFFCLKV	867540	844001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_846188_846753_846824_846979_847094_867237
871413	contig_11292_pilon	-	1647	12	Intergenic	novelGene_109406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	263.026724595125	8	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	775	1572	165314	161842	FALSE	5	GCCACCTGTCTGTCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA	167655	161766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_161953_162126_162209_163014_163161_163372_163470_164397_164547_164662_164807_165245_165338_165642_165710_165803_165980_166293_166476_167109_167194_167413
871415	contig_5222_pilon	+	2908	20	Intergenic	novelGene_58978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_17	48.1547022237744	46	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	211	1950	40277	71744	TRUE	10	CCATTTCTGCGTGGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTASYLRPREVQVREFEVLRKLNHQNIIKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVVAGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLMGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFTPFGGPRRNKEIMYRITTEKPAGAIAGTQRRENGPLEWSYTLPITCQLSMGLQSQLVPILANILEAEQAKCWGFDQFFAETSNILQRVVVHVFSLSQAVLHHVYIHAHNTIAIFLEAVYEQTNVAPQHQEYLFEGHLCVLEPSLSAQHITHTTASSPLTLFSMASETPKGLAFRDPALDIPKFVPKVDLQSDYNTAKGVLGAGCQARRLAQALLDGQELMLRGLQWMAEMLQATCRRTLEVTRTALLFLSSSLGSERFTNTAARPEIQELNRATELRSKLRTLAEVLSRCSQNITETRMSLRNLSSELAKNRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMYLIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLLQVFQEECVQKYQAALVTHGKRMRMVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKVRVLQAPSLGGEPGQSDP	38009	75836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_38052_38958_39100_40249_40380_40976_41159_41864_42026_42908_43020_43573_43754_44369_44567_45282_45348_45430_45523_45683_45771_50617_50694_51007_51121_53998_54076_68292_68333_69123_69226_70544_70691_71736_71856_72116_72189_75061
871416	contig_10907_pilon	-	1939	9	Intergenic	novelGene_144898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_8	253.924416657792	1183	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	66	1070	41010	14797	FALSE	25	ATTACTGTCAAGTTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVIVVGNPANTNCLTAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITTVQQRGAAVIKARKLSSAMSAAKAIGDHVRDIWFGTPEGEFVSMGVISDGNPYGVPDDLLYSFPVVIKNKTWKIAEGLTINDFSREKMDLTAKELTEEKENAFEFLSTA	41075	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_15577_16100_16215_16700_16878_28331_28455_30318_30495_36029_36127_36951_37051_41007
871417	contig_5095_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_74936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCATATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127054	125372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_125400_127100
871418	contig_3113_pilon	-	3633	1	Intergenic	novelGene_175792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	479	1440	7	1446	26590	25151	NA	25	AAACCTGTTTTCTGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPILRWRRSLETHDKESIIMTTNHIFSRFTEIITNVRRQQRDYNPSDFYEILRMIEQEVTSASTEKSYTFTSRYKIDLSLCLFQRASENFKQMHMAFKTANDPVNYLESKKDDFFMSFKISCLGATSIKGFVDFLWHKLTPAISTTIWNKMSSKIAGDIRATFPAFSGNRANLEKHILISLAEEENFDNYWQYLHNPKYFFRNYIENNIQIYFSDKGGKKMKTSLKISLDDIKNVILSAIHESTAIAKDKRSTASEWLDLFCDYLGNNLIFPRKDLVSIEHQEIKDIEFFKEVMSEALDPAMEKVEQNCLCMPEKEMIPEIEKMLSEHLCGCWKQCPFCRAICTNTIPAHEGDHSVPFHRPQALDGWQWGTKISGKWYRTGQFNIDCCSSMVASDCSFILSDDSEIPFKNYRQAGGDYALWSITPDSSMQPYWKWFVCHFRSKLEEKYQKKFTDKGKIPNAWAKITKQDVLDDLKKQ	26596	22963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3113_pilon_-_23000_26600
871419	contig_8729_pilon	-	1827	9	Intergenic	novelGene_40089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_6	108.785267269975	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	460	831	219517	218098	TRUE	35	TAAGGAGTTGGCTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAEHEGGHLPFEVDISKLVQVGPLESCRITIAINNTLTPNTLPPGTILYKTDTSKYPKGYFVQDTNFDFFNYAGLHRPVLLYTTPTTYIDDITVTTGVDQDNGLVNYQASVQGSARFELAVRLLDAEGQVVAHHTGAQGQLQVPSAHLWWPYLMHSYPAYLYSLEVRLTAQTAAGPVSDFYTLPVGIRTVAVTNSQFLINGKPFYFHGVNKHEDADIRGKGFDWPLLVKDFNLLRWLGANAFRTSHYPYAEEVMQLCDRYGIVVIDESPGVGIVLA	220934	209545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_209918_212114_212251_213980_214158_216069_216155_217871_218281_218513_218667_219481_219670_220489_220633_220770
871420	contig_5951_pilon	-	3789	1	Intergenic	novelGene_153234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTGTCTTTTCGACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132429	128640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_-_128600_132400
871421	contig_2487_pilon	-	5680	1	Intergenic	novelGene_148483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATTTAACTTGCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209288	203608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_203600_209300
871422	contig_6445_pilon	-	2324	6	Intergenic	novelGene_76972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_2	295.307703929308	682	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	52	636	88578	77759	FALSE	60	ACAGTCAATTTAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKVWLSLHHRPALAYCPLHSPPCSGAVWPQH	96342	76070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
871423	contig_12425_pilon	+	1549	8	Intergenic	novelGene_46648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	197.735754408323	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	298	1359	174111	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173662	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_173796_173946_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
871424	contig_9127_pilon	+	2529	6	Intergenic	novelGene_103015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	682	junction_4	2179.16099451142	105	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	77	763	197612	216954	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIAFLQGERKGQENLKKDLVRRIKMLEYALKQERAKYHKLKYGTELNQGDLKMPTFESEETKDTEAPTAPQNSQLTWKQGRQLLRQYLQEVGYTDTILDVRSQRVRSLLGLSNSEPNGSVETKNLEQILNGGESPKPKGQEIKRPSGDVLETFNFLENADDSDEEEENDMIEGIPEGKDKHRMNKHKIGNEGLAADLTDDPDTEEALKEFDFLVTAEDGEGAGEARSSGDGTEWGKVIKKYGRGGGVSSPYR	197535	218720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_197641_198070_198145_201762_201845_207044_207219_215045_215176_216756
871425	contig_13542_pilon	+	1364	10	Intergenic	novelGene_131505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1057.49305224931	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	63	968	347813	505589	TRUE	0	CTTGGGGCTGGGGGTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSRRSLPFPLNCQLVRVGTADYGGASDQSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	347750	506033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_347903_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501_505905_505952
871426	contig_3382_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_124188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATCCATAACCCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980298	981350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_980300_981400
871427	contig_15361_pilon	+	3204	1	Intergenic	novelGene_167873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATATTACACATAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489232	492436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_489200_492400
871428	contig_4426_pilon	-	639	4	Intergenic	novelGene_15452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1022	junction_3	532.966749014941	115	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	85	639	904546	881693	FALSE	50	GTAAGTATGATACAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRD	904630	881692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_881836_887176_887378_889991_890139_904482
871429	contig_5753_pilon	-	4539	15	Intergenic	novelGene_174310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_5	64.4523633613008	299	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	50	1681	90493	38313	TRUE	45	CTTTCCATTCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGRYTVNSAYGDTIVMPCRLDVPQNLMFGKWKYEKPDGSPVFIAFRSSTKKSVQYDDVPEYKDRLSLSEDYTLSISNARISDEKRFVCMLVTEDDVLEAPTVVKVFKQPSKPEIVRKAPFLETEQLKQLGDCISKDSYPYGNITWYRNGRVLQDLEGVVNISFNKEMDPVTQLYTMTSSLEYKATKADIQMPFTCSVAYYGPSGQNTVYSEQAVFDIYYPTEQVTIQVLPPKNAIKEGDNITLKCLGNGNPPPEEFLFYLPGQPEGIRSSSAYTLTDVRRNATGDYKCSLIDKRSMIASAAVTVHYLDLSLNPRGEITKQIGDALPVSCTISASGNATVVWMKDNIRLRSSPSFSSLRYQDAGNYVCETALREVEGLKKRESLTLVVEGKPQIKMTKKTDPSGLSKTITCHVEGFPKPAIQWTITGSGSVINQTEESPYVNGKYSSKIIISPEENVTLTCTAENQLERTVNSLNVSAISIPEHDETDEISDENREKVNDQAKLIVGIVVGLLLAALVAGVVYWLYMKKSKTASKHVNKDLGNLEENKKLEENNHKTEA	90542	32984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_-_35820_38289_38401_56575_56694_56982_57022_58865_58999_61524_61659_61794_61931_64160_64274_66495_66629_68196_68325_73337_73521_73983_74072_75304_75370_86177_86398_90439
871430	contig_10299_pilon	+	2134	11	Intergenic	novelGene_79670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	66.5570432035558	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	16	1035	182394	185364	TRUE	70	CAAGAAAAAGAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRYQ	182378	187571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182397_182544_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185088_185253_185534_185714_185864_186084_186528_187233
871431	contig_500_pilon	+	1161	8	Intergenic	novelGene_31016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	866.183229897175	42	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	201	968	1492663	1499396	FALSE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVIPAAGEGGMRLSRFAECS	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1499335
871433	contig_500_pilon	+	1354	11	Intergenic	novelGene_31039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1092.47539560395	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	190	1128	1492663	1499316	FALSE	40	ATGAACTGCTTCAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDFCTTGMDGGMSIWDSLESALKDLKIK	1485761	1499542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1497946_1498925_1498968_1499277
871434	contig_3252_pilon	+	2524	12	Intergenic	novelGene_61505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	128.060935908594	13	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	773	1603	726470	739459	FALSE	45	ACCAAGTCTGAGAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSIQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI	535264	740380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_535331_561222_561330_563191_563388_595569_595737_596521_596642_604358_604433_726427_726479_730457_730569_731781_731964_732097_732204_733961_734097_739171
871435	contig_8357_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_39768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAATAATTGGAAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883673	885418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_884341_884645
871436	contig_5954_pilon	+	4595	1	Intergenic	novelGene_28793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTCAAGAGTAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1404877	1409472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1404900_1409500
871437	contig_7234_pilon	-	2000	14	Intergenic	novelGene_145925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	162.466018294878	472	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	307	861	463562	411977	FALSE	20	GCTTTTCTACCCAGGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	410837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463566_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
871438	contig_15327_pilon	-	2168	2	Intergenic	novelGene_70537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1486	1956	511827	511357	FALSE	10	TCTTCACTCTGTATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLAVTSPAQVSRRAVFKGELGCWSHFTAGCVCTAPLPFPPKNECSQEARFGGEGRVGKVKRRVHCKALCPSSISFSPCSHVSPPSPLPTTTKEAAYISLPQGWRGLGPTRSVGVSLNPSDVALDGTSAFEAPAGRGPLNRASCCLSPCASFPC	513962	511144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_513245_513894
871439	contig_8712_pilon	+	2947	1	Intergenic	novelGene_58833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2383	2793	331331	331741	NA	40	GCAGAACTAGCAGATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEHDLYMPEYTRGWLSWTVTGRLVGELSLLAGIESALTHDVQQNKTLPSPAPSSQSLMCLSPLLQPLCILSAFQPRGLVFQYYVRQCSFVIHKVFRGLFSEVARPAFLCSLSYSGSSAETCLASLTLLVFEIPVV	328948	331895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_328900_331900
871440	contig_12793_pilon	-	3319	1	Intergenic	novelGene_164108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTTTCTCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131636	128317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_128300_131600
871441	contig_12841_pilon	+	2920	3	Intergenic	novelGene_55874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	37.5	373	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	618	1259	457015	461679	FALSE	40	TCTCTCCCAGAACAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQSCSAYGCKNRYDKDKPVSFHKFPLTRPSLCKKWEAAVRRKNFKPTKYSSICSEHFTPDCFKRECNNKLLKENAVPTIFLCTEPHDKKEDLLEPQEPLPPPPLTPPVSQVDAAIGLLMPPLQTPDNLSVFCDHNYTVEDTMHQRKRIHQLEQQVEKLRKKLKTAQQRCRRQERQLEKLKEVVHFQKEKDDVSERGYVILPHDYFEIVEVPA	456397	463340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_457086_460350_460547_461304
871442	contig_1154_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_87096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGCAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346232	345011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_345000_346200
871443	contig_6740_pilon	+	2666	1	Intergenic	novelGene_142701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGATACAATTGCAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645518	648184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_645500_648200
871444	contig_15105_pilon	-	6600	7	Intergenic	novelGene_150965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	403	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4735	5034	608640	607583	TRUE	35	GGTCCTGTAAGGGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASLALLYLVPAPSYHNDQGPNHHSRRLSSFWLCGVAEDGEEGRESKVTSLIFSSPEFSERRRSRGGRLPERVLTRGLPHFSSVPLKMVLADCCSLVL	613374	572483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_572800_591478_591590_600000_600106_602593_602765_606304_606456_606870_607599_608356
871445	contig_11448_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_66416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGTAGAAATCTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542373	539535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_539500_542400
871446	contig_12837_pilon	+	2044	2	Intergenic	novelGene_57274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAATGATAACATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47287	49488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_49189_49345
871447	contig_3153_pilon	-	4094	1	Intergenic	novelGene_104662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2832	3242	186701	186291	NA	75	AAAAAAAAAAAGAATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWQKLCDRYIYNNYKRKVAAEAAYVQPNTSWDLVPWFGGLRLWFHGTSQLTGLIMCLELLFYLLVCCIVSGVLKAHKQPSKAQTIILYSPGTTEEEGESRIRGGLGRNGWQSTSEKSAIENPVEHSSSLTHMESP	189532	185438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_185400_189500
871448	contig_2054_pilon	-	3366	5	Intergenic	novelGene_51687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_3	41.1240501410063	105	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	298	849	150933	127124	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENVSNLPI	203913	124606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_127254_130938_131141_132268_132354_150798_150952_203634
871449	contig_12638_pilon	-	2478	12	Intergenic	novelGene_33345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_11	198.659183211802	156	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	179	589	1434492	1412238	TRUE	30	CTTAATTTCAGTTATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKRMYVKIIEIALNCFSGRDSYAKHAE	1463574	1380205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1458588_1458666_1463494
871450	contig_5640_pilon	-	3681	1	Intergenic	novelGene_27287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGCATCAGCAGAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242424	1238743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1238700_1242400
871451	contig_8570_pilon	-	5101	9	Intergenic	novelGene_120141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2439	2843	345176	344772	TRUE	5	GCTCTGCCGGGCCCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSCAMPLLFFIFSSSFWLLPFSSFSLSPKGCPVSGTLTGIIQAHPIKHVIWCDTSGNRAAISLIHRLPPQSWGQAYPSLRWTRRPATPVNAARRSPRVSGEVGRGGSCECFQNLFFPGALGAADREGTRRGL	361833	284297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_284406_306599_306684_321019_321061_322724_322781_323276_323375_325406_325557_332072_332206_343183_347375_361593
871452	contig_10861_pilon	+	3867	1	Intergenic	novelGene_39404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2973	3323	1911010	1911360	NA	45	AAAAAAAAGTTTCTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIDYTVGCEKSEQVCLGKNTARVLLGSEDVKTLSHILGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSRRWIDTMVATMDSSITTIVRMAQDWAVFRSVVHGVAMSWNQLDGP	1908037	1911904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1908000_1911900
871453	contig_15752_pilon	-	3719	1	Intergenic	novelGene_148791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCCAGCTATCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391918	388199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_388200_391900
871454	contig_10135_pilon	-	2344	8	Intergenic	novelGene_106611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	47.7728468688981	1	108	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	648	1481	88066	84786	TRUE	0	TCTCTGTTCTTGCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRLLERPCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPHDVYSNLSHLPGVPVAPGGPAAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFSPVPSLAEIVERNPRVELGGRYRPAGCEPRSRTAIIVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEEWDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLKMNGFPNEYWGWGGEDDDIATRWCAWLG	89570	83787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_84566_84700_84806_85943_86069_86198_86390_87014_87251_87804_88079_88500_89080_89514
871455	contig_20199_pilon	-	538	4	Intergenic	novelGene_82583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.5351414805183	8	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44138	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41064_42110_42171_43906_43951_44118
871456	contig_20199_pilon	-	706	2	Intergenic	novelGene_82589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44187	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41214_44045
871457	contig_20199_pilon	-	1070	3	Intergenic	novelGene_82536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	69	4	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	119	301	43987	41416	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQVSHCVPRVWLQVR	44105	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41418_42070_42171_43906
871458	contig_20199_pilon	+	776	3	Intergenic	novelGene_82524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGCCTCAGTGCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40646	44021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42173_43910
871459	contig_20199_pilon	-	791	3	Intergenic	novelGene_82579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	51	386	43987	41055	FALSE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44037	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
871460	contig_20199_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_82549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44146	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41104_44034
871461	contig_20199_pilon	-	744	3	Intergenic	novelGene_82587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44147	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41089_42110_42171_43902
871462	contig_16322_pilon	+	2754	4	Intergenic	novelGene_87553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	797.497892717522	1072	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGGCTTTGAAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109012	113397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_109063_109193_109295_109541_109618_110870
871463	contig_2867_pilon	+	3728	1	Intergenic	novelGene_135189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	922	1302	803773	804153	NA	30	GATGTTGTTAAACATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHRIRQQFLCILFFTNSNFQDGIFLVQQSPKCEVLSCFNYMSVRGLSSYTSTKTTQYECSRYHNVAVLLPKTSCHRVYYNSWRPHMFQSRTALHRVFNGCDLSEVDCQAFLLRRLWVDLHHQPFG	802851	806579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_802900_806600
871464	contig_10372_pilon	+	3603	9	Intergenic	novelGene_112505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	52.9575301538884	336	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	975	2928	49	2976	4817	14384	FALSE	5	TGTACTGTGGCCTCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWNCRLPRAFWGSGLGRAHQPPDDRIPFLIHWSWPRKGECPLGPSRAFTRHHGSSVGSAPPPGRHGQLFQSVSAAEAIQRHRQNLAEWFIRLPREEHQFGPTFALDAVHVDPVIRESTADELLHTPVELALEHQPPQPGLPTLALSQLFDPDACGRRVQTVVLYGTVGTGKSTLVRKMVLDWCHRRLPTFELIIPFSCEDLSSLGPAPASLCQLVAQRNMALKEVLPLMAAAGPRLLFVLHGLEHLNLDFQLAGTGLCSDPEEPKAPAAIIVNLLRKYMLPEASILVTTRPSAISRIPSKYVGRYGEICGFSDTNLQKLYFQLRLNQPDCGNSAGGAGVLATSAQRDNLVQMLSRNLEGHHQIAAACFLPSYCWLVCATLHFLHTPTPGSQTLTSIYTSFLRLNFSGEMLDSTDPSRVSLMAYAARTLGKLAHKGVTSRKTYFSEEDVRGCLEAGIETEKEFQLVHVFRRDALRFFLAPCVEPGHLGTYVFTVPAMQEYLAALYIVLGLHKTTLQRVSKDVAELVGRVGEDVSLVLGIVAKLLPLRVLPVLFSLLKVVPRVFGRVMGKSREAVAQAMVLEMFREEDYYNDDVLDQMGASILGVEGPRRHPDEPPEDEVFELFPMFMGGLLSAHNRAVLAQLGCPIKNLDVLENTQAIKKKLGKQGRQVLPPSELLDYLFFHYEFQNQRFSAEVLSSLRQLNLAGVRMTPLKCTVVAAVLSRGKHTLDEVNLASCQLDPAGLHTLKPVLLRARKLGLQLNSLGPEACRNLRDLLLHDQCQITTLRLSNNPLTAAGAALLVEGLAGNTSLTHLSLLHTGLGDKGLELLAAQLDRNQQLQELNVAYNGAGDTAALALAKAARGHPSLELLHLYFNELSSEGRQVLRDLGGTAEGGAQVVTSLTEGTAVSEYWSVILSEVQRNLNSWDQARVQRHLELLLRDLEDSRGATLNPWRKAQMLRVKGEVKALLEQLRGSGS	4768	15011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_+_4887_5422_5493_5964_6054_6757_7378_7751_8574_11611_12208_12486_12574_13338_13591_14062
871465	contig_6076_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_81761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCACAGATAACTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354080	355962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_354100_356000
871466	contig_8242_pilon	+	3550	1	Intergenic	novelGene_80209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAATCTAAAAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317349	320899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_317300_320900
871467	contig_9839_pilon	+	3059	7	Intergenic	novelGene_88544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	518	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	2716	3057	122057	124763	FALSE	25	CAATGTGCTCCAGATGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVFLLILKYRARSRQLFQRKGISNQSVFVLPPRNSSSFFKNVGHVYCGGHGAAFSGMGLSCRATSESSISDTLDCPCRFGRGRSALLVFSLSIFSSNSDEHYFYIRTWWTSS	109692	124765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_112053_115461_115565_116320_116481_118307_118364_122020_122156_122698_122822_124643
871468	contig_5566_pilon	-	2619	5	Intergenic	novelGene_153657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2787	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGGAGGCGGGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183765	176623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_176849_177660_177715_179685_179772_180771_180830_181569
871469	contig_20641_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_52869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCTCTGACAGAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24744	27472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_24700_27500
871470	contig_19918_pilon	+	1924	5	Intergenic	novelGene_172976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	32.8519405819504	381	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	40	591	403651	423947	FALSE	10	TCTGTGTGGAGCCCCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLSFVAVAGCLLVLPAQASKSSEDIRCKCICPPYRNISGNIYNQNVTQKDCNCLHVVDPMPVPGHDAEAYCLLCECKYEERSTTTIKVIIVIYLSVVGALLLYMAFLMLVDPLIRKPDAYTEQLHNEEENEDARSMAAAAASLGGPRANTVLERVEGAQQRWKLQVQEQRKTVFDRHKMLS	403611	425280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_403717_404933_405026_411525_411635_414236_414369_423794
871471	contig_15172_pilon	+	2607	7	Intergenic	novelGene_158758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	196.172259903269	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	8	448	243174	258481	TRUE	30	AACCAGCAATAGTCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKVGLVAGWV	243166	268815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_259309_260340_260392_267534
871472	contig_7080_pilon	+	2829	1	Intergenic	novelGene_100103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCAGGAACCAGAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463407	466236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_463400_466200
871474	contig_5878_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_145732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGGAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317965	319743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_318000_319700
871475	contig_414_pilon	-	5270	2	Intergenic	novelGene_115099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	311	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	77	1090	374079	373066	FALSE	20	GATAGTTTGTATTTAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAAAPFLEKEDEERRKRRGSQRATMEKSWMLWNFVERWLIALASWSWALCRISLLPLIVTFHLYGGIILLLLIFVSIAGILYKFQDVLLYFPEQPSSSRLYVPMPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	384066	368885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_374096_384006
871476	contig_3382_pilon	-	3393	1	Intergenic	novelGene_124111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCAGCAGCCACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704631	701238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_701200_704600
871477	contig_6523_pilon	-	4547	2	Intergenic	novelGene_164885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_1	0	149	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268720	263218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6523_pilon_-_267222_268176
871478	contig_1867_pilon	-	2936	12	Intergenic	novelGene_54605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_11	178.352793665433	313	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	847	1851	547888	517583	FALSE	30	TACAACAAATGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVCVWGYNGNGQLGLGSSGNQPTPCRIAALQGIRVQRVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566922	516497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547620_547729_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885_551129_566772
871479	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_95460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	657514	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657514	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871480	contig_5482_pilon	+	3793	2	Intergenic	novelGene_144505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	0	203	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	29	718	644963	664827	FALSE	5	TTGTGTTGTATTTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSLGRVGRMASEVESSLEASFSSSGTGSGTSRLLPPARSRIFKIIVIGDSNVGKTCLTYRFCAGRFPDRTEATIGVDFRERAVDIDGERIKIQLWDTAGQERFRKSMVQHYYRNVHAVVFVYDMTNMASFHSLPSWIEECKQHLLASDIPRILVGNKCDLRSAIQVPTDLAQKFADTHSMPLFETSAKNPNDNDHVEAIFMTLAHKLKSHKPLMLSQPPDNGIILKPEPKPAMTCWC	644934	667902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_645212_664386
871481	contig_5253_pilon	-	2983	1	Intergenic	novelGene_61610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAGATGTATGGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405241	402258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_402300_405200
871482	contig_5247_pilon	+	1964	13	Intergenic	novelGene_81792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	228.565757618143	138	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	753	1625	155578	161215	FALSE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	130154	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_130414_141035_141141_141772_141833_144123_144328_154859_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
871483	contig_7025_pilon	+	2250	3	Intergenic	novelGene_104409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	148.5	55	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAGAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344061	396606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_344312_353923_354090_394772
871484	contig_854_pilon	-	3341	1	Intergenic	novelGene_36544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629675	1626334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1626300_1629700
871485	contig_9653_pilon	+	2239	6	Intergenic	novelGene_48236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	88.3864242969473	1066	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	176	892	819546	830443	FALSE	40	AATTTTTTTGGTAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDLAKQLASYKAQLQQVEAALSGNGENEDLLKLKKDLQEVIELTKDLLSTQPSETLASSDSFASTQPTHSWKVGDKCMAIWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEGRKAKEDSGNKPMSKKEMLAQQREYKKKKALKKAQRIKELEQEREDQKVKWQQFNNRAYSKNKKGQVKRSIFASPESVTGKVGVGTCGIADKPMTQYQDTSKYNVRHLMPQ	818134	831790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_818310_819545_819666_824979_825123_825716_825879_829205_829360_830305
871486	contig_2100_pilon	-	1164	2	Intergenic	novelGene_50656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	0	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	192	530	1172488	1172150	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESCCLDFFLTFRCKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQVKNYMEEKVPLLLLSDLHFLGRPKTFRWWEVLLKLDEAHQKWALCLFILSSFRVPCSCHGLHA	1172679	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934
871488	contig_14219_pilon	+	4588	1	Intergenic	novelGene_54331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAATGCATCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755194	759782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_755200_759800
871489	contig_10103_pilon	+	7531	5	Intergenic	novelGene_86172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGTAGAGAAAAAGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666748	694518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_673252_683705_684352_685337_685524_686762_686861_694420
871490	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871491	contig_4531_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_47928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATTTACTCTGTAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616779	614568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_614600_616800
871492	contig_1443_pilon	-	2405	10	Intergenic	novelGene_28379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_3	27.3211354896616	247	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	208	1893	1052337	1037799	TRUE	40	ATTCAAATGTTATTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGRAMELGRECLNLWGYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVGVKGNPQGFNQGLDCDVIVAEVCFPRHPKLLHILSYQLPKSGVFFILSSLIWIINIMGRARIAILGNLKVARAFIF	1052544	1036658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1038033_1038153_1038263_1038441_1038481_1038886_1039075_1039300_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
871493	contig_1090_pilon	-	3155	2	Intergenic	novelGene_131105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	0	447	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAATTTGTGTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309443	304804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_307180_308663
871494	contig_9955_pilon	+	2876	8	Intergenic	novelGene_21380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	55.681308921983	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	525	1358	570882	580436	FALSE	50	ATGTGTATTATTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASVTIPIWQNKPHGAARSVVRRIGTNLPLKPCPRASFEALLNISDLCLRDAPPVPTLADIAWIAADEEETYARVRSDTRPLRHTWKPSPLIVMQRNASVPNLRGSEERLLALKKPGLPALSRTTELQDELSHLRSQIAKIVAADAGSSNVSSPLPCFGSSFHSTTSFVISDITEETEVEVPELPSVPLLCSASLECCKPENKATCSSSEEDDCISLSKASSFADMMGILKDFHRMKQSQDLNRSLLKEEDPAVLISEVLRRKFALKEEDITRKGN	567826	581954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_568129_570512_570610_570756_570897_571397_571503_574376_574487_574747_574960_576224_576511_580330
871495	contig_9366_pilon	-	4292	1	Intergenic	novelGene_166234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTTGATTTTACCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768371	764079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_764100_768400
871496	contig_11335_pilon	+	5683	4	Intergenic	novelGene_104939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGATTCAGGACCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436912	459593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_442234_451415_451539_459119_459279_459513
871497	contig_8254_pilon	-	4133	1	Intergenic	novelGene_48405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAAAGTTGACTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136152	132019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_132000_136200
871498	contig_1986_pilon	+	2228	10	Intergenic	novelGene_64139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	497.068318825739	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	183	1733	353826	381302	FALSE	25	TGTGATGGATTTCCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSKISPLITRTISCHCPVAEETGARAALQMRPLTRVCVSRCSSHRKYRAALKKEKRKKRRQELARLRDSGLSQKEEEEEEDAFIEEHQLEEEKLLETERQKLHQEWLLREQKAQEEFRIKKEKEEVARKRQEELERKLKAEWEEQQRKEREEEEQKLQEKREREEAVQKMLNQAENELENGTTWQNPEPPLDVRIMEKDRAFCPFYSKTGACRFGDRCSRKHSFPTSSPTLLIKSMFTTFGMEQCRMDDYDPDASLEYSEEETYQQFLEFYDDVLPEFRNVGKVIQFKVSCNFEPHLRGNVYVQYQSEEECQAALSLFNGRWYAGRQLQCEFCPVTRWQMAICGLFETQQCPRGKHCNFLHVFRNPNNEFWEADRDMYLSPDRTSSSFGKNSERRERMSHRDDYYGRPRRRRSPSSDHSYKRNGKSERKRSSSHRGKKSHKHVSKSRERHSSRSRGRKRDHCRSRSRRSRSRSLRSRRNRTQSHRSRSQSSSRSRSWGGRRSSSRDRNTHSPRSK	353643	381797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_354037_359046_359135_363080_363190_365359_365447_368524_368564_369130_369250_375730_375945_377026_377083_377810_377921_380784
871499	contig_6048_pilon	-	4364	2	Intergenic	novelGene_73297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	67	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTGTGTTGCCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049063	2001995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2006303_2049006
871500	contig_8330_pilon	-	2383	10	Intergenic	novelGene_71737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	41.2795348811006	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	404	1150	520455	515388	FALSE	20	AGTCCCCAGCACATCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNKESLDQIIVATPGLSSDPIALGVLQDKDLFSVFADPNMLDTLVPAHPALVNAIVLVLHSVAGSTPLPGADSSSRSMPSSVYRDMPGGFLFEGLSDDEDDFHPSTRSTPSSSTPSSRPASLGYSGAAGPRPITQSELATALALASTPESSSHTPTPGTQGHSSGTSPMSSGVQSGTPITNDLFSQALQHALQASGQPSLQSQWQPQLQQLRDMGIQDDELSLRALQATGGDIQAALELIFAGGAP	527605	514154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_515526_517905_518029_518617_518786_519044_519095_519351_519486_519763_519822_520379_520465_524730_524851_526013_526227_527544
871501	contig_9653_pilon	-	3739	3	Intergenic	novelGene_48228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_1	29.5	175	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	326	658	607763	607431	FALSE	80	AAAAGAAAAAATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLSYRPAYDQGSPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACTTHLHYKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKHFRLKEAFDYVKQRRSVISPNFGFMGQLLQYESEILPSMPTPQTPSCQGEVAGSSFLDHLQTLSSDVQGSYCTFPTSVLAQVPTHSTVSELRRSPVATATSY	615347	604349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_607838_610831_611052_615316
871502	contig_6871_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_21573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	324	446	129388	129266	NA	20	GCATGGTCAGCTTTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWELSSQAPGTVSAQTEQQNQIVPLNTWPAARHPCPHLLAFLIHSEVAERREIRIQGIPFFLGSFGPFPELESPLWSRPSLKAELQLTLTPGSECPLPTPYYPGPEVMVLGRSVCLPSFWCQPPWTRGGFLPRSSECVAMIEALSVS	129711	128802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_128800_129700
871503	contig_9535_pilon	-	3179	12	Intergenic	novelGene_124496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_3	71.965211981465	19	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1783	2838	628780	608023	FALSE	0	CTCTGGTGTGGCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVSAQLHGSGDQEAWQKGVQFASGQNLARHLMETPANQMTPTRFAEIIEKNLKDANSKTEVYIRPKSWIEEQEMGSFLSVAKGSDEPPVFLEIHYKGSPNACEPPLVFVGKGITFDSGGISIKASANMDLMRADMGGAATICSAIVSAAKLNLPINIIGLTPLCENMPSGKANKPGDVIRAKNGKTIQIDNTDAEGRLVLADALCYAHTFNPKLIINAATLTGAMDIALGSGATGIFTNSTWLWTKLFEASIETGDRVWRMPLFEHYTKQVVDCQLADVNNIGKYRSAGACTAAAFLKEFVTHSKWAHLDIAGVMTNKDEVPYLRKGMTGRPTRTLIEFLLRFSQDEANA	635530	607681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_608219_608698_608809_611070_611151_617377_617481_618568_618658_620163_620289_623284_623444_626732_626898_628751_630293_630765_630821_632053_632170_635431
871504	contig_6710_pilon	-	527	2	Intergenic	novelGene_97840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	657517	653562	FALSE	35	ATCATACTAATATTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657519	653402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871506	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_94592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871509	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871510	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_96737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871511	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871518	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_93250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871519	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
871522	contig_6710_pilon	-	531	2	Intergenic	novelGene_97442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	111	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657502	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657502	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871523	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871524	contig_6710_pilon	-	536	2	Intergenic	novelGene_97025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657818	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657818	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871525	contig_6710_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_98185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	653879	653562	NA	15	CCTATCCCTATTTCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653880	653470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_653900
871526	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_97015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	69	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871527	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871528	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
871530	contig_19469_pilon	+	3786	1	Intergenic	novelGene_134993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTTGGTTCAAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101495	105281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_101500_105300
871531	contig_11978_pilon	-	2849	5	Intergenic	novelGene_62894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	35.4153921339296	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	151	615	760226	755796	FALSE	15	GCTGTGCGTGATGCTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGPMRKNYRGDLEDSNPFASLVFYWEPLNRQVRVEGPVKKLPEEEAECYFHSRPKSSQIGALVSHQSSVIPDREYLRKKNEELERLYQEREVPKPEYWGGYVLYPRVMEFWQGQTNRLHDRIVFRRLPAGDSPLGTMTHRGEEDWFYERLAP	760376	753561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_755962_756175_756247_756550_756680_757157_757212_760181
871532	contig_6589_pilon	-	3289	10	Intergenic	novelGene_25821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2781	3287	817482	815092	FALSE	10	AGGGACCGCCCCTCGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLFNPSPLYRKRAISSGVFCSSSFSTKNWIPCLGSMLNFFLPIAIFRFRCKVLLPSLASRPSTSLMASLSSSRRRWISTSSSCFRRRMFSSSMRSSGVRSGGSRHRPPWRLGRPAGSPGRSRQSDWDPRWPAGSDEPAQTPREPPPPPQRQSSALKRLSLRLPTAPP	825374	815089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_815282_816113_816262_816350_816419_817381_819436_819683_819835_820307_820422_824104_824182_824425_824499_824588_824744_825117
871536	contig_11989_pilon	-	2263	22	Intergenic	novelGene_68442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	342.196009391602	3	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	418	2094	90274	46235	FALSE	0	CCTTTTTCCTCTTCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	226877	46065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_191097_191143_226759
871537	contig_12644_pilon	-	4205	1	Intergenic	novelGene_44508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCATAAGACAGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1106002	1101797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1101800_1106000
871538	contig_12852_pilon	+	6253	1	Intergenic	novelGene_141439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2187	2498	326647	326958	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSTCWSRAKNSAPARPGGSAGRTAQFGHAENPAALPHCSLPTARPPWLPCCSGNNVHLYQHFYPVIQKECDKKRSLQIACLTLSTENKGLLLLIPLLARPV	324460	330713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_324500_330700
871539	contig_7078_pilon	+	3244	1	Intergenic	novelGene_130167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1126	1425	626902	627201	NA	40	TCCCTAGACCAGAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIFTTTKSTVTEAAYVQPNISWDLFPGSGCLGSRFHGTAQLIELISCLVLLFYLPVQRIVPGVLKACKKPSKIQQLVSIHLEQEEEVSGIGEGYGTCS	625776	629020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_625800_629000
871540	contig_6533_pilon	-	2751	2	Intergenic	novelGene_114629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_1	0	400	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2170	2529	76892	75673	FALSE	15	GTTCTGCTTGTGGATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQIVLQWERVTSEAVKPRETSEPRMAAQHFYGKRSLTEAPVKCPLADTHMNTSEKLQFYKEKAPDCHGPLLKRETVLCQESKKRAFEDPEKEQNNSSQSSKQKYVCLAVEDWDLLNSY	79061	75450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_75939_76798
871541	contig_15146_pilon	+	1764	9	Intergenic	novelGene_116976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	133.056790037187	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	525	1628	624438	628786	FALSE	20	GAGGATGTGTCTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEQAGPPSKAVMALKQVQEFLKDGDDVIIIGVFQAESDPAYQQYQEAANSLREDYRFHHTFSTEIAKFLKVAPGTLVVMQPERFQSRFEPKSHVMDIQGSTEASAIRDHVVQHALPLVGHRRVATEAKRYTRRPLVVVYLSVDFSFDYRVATQFWRSKVLEVAKDFPEYTFAIADEDDYASEVKDLGLGESGEDINAAVLDEGGRRFAMEPTEFDADALREFVTAFKKGKLQPVIKSQPAPKNNKGPVKVVVGKTFEDIVLDPSKDVLIEFYAPWCGHCKQLEPVYTALGKKYRGHKGLVIAKMDATANEATSDRYKVDGFPTIYFAPSGDKQNPIRFEGANRDLEHLSQFIEEHATQLGRAREEL	618806	628922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_618860_620585_620698_621875_622015_623166_623373_624423_624583_625740_625893_626792_626950_627221_627456_628370
871542	contig_8866_pilon	-	3471	1	Intergenic	novelGene_77792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCTCTTTGTTGTTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380190	376719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_376700_380200
871543	contig_11978_pilon	+	2018	8	Intergenic	novelGene_62913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	93.9976117803435	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1179	1976	864093	866962	FALSE	5	TTGGCTATGTTGTCCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFSRDWSFLITCPKHVRRSLAILTFKEHSGRSSSKTDLLVLLAVHGVFSICQHHNSKTSVLQSPLFIVPLSDACEETGLIRLLRREIAAIFRDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGGCIDDTILSRQGFINYSKLPSLDLVQGELVRGLSFLTAQTHSLLQHQPLQLTALLDQYIRQQHEGDSVQPASRKLDPPDSVLDS	850251	867004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_850741_850841_851008_851099_851281_862874_863045_863920_864324_865281_865447_865690_865836_866705
871544	contig_8452_pilon	+	826	5	Intergenic	novelGene_48098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2416	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGACAGCCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962613	991162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_963082_968669_968752_972861_972935_981638_981737_991057
871545	contig_6710_pilon	-	485	2	Intergenic	novelGene_98072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	5	CCCCCTTCTCCTCTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871546	contig_10141_pilon	-	2520	9	Intergenic	novelGene_84625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	157.281395911913	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	178	1758	418151	400032	TRUE	25	AACTGGCGTGTCATCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAELGLQEDGSICPEPEVEEIASGSQAHTVPKKKKKKGKKKLEPSQGTTPKVPRKAKTWMPEMHDQKADVSAWKDLFVPKAVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIPMIHAVLQWQKKKPAPTPSNTRVPPGEAKAETGSPNKAGTESGTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQGEEDLDMWRGKEDRAWSLAPRRFMFTEVVELLVLPTKASA	418328	395263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_397233_397364_399918_400108_401115_401163_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835_409370_417973
871547	contig_11815_pilon	-	3289	1	Intergenic	novelGene_50940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTAATGTAAACCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323696	320407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_320400_323700
871548	contig_10531_pilon	-	2739	1	Intergenic	novelGene_114532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475450	472711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_472700_475400
871549	contig_12079_pilon	-	2835	1	Intergenic	novelGene_67555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866067	863232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_863200_866100
871550	contig_4857_pilon	+	5731	3	Intergenic	novelGene_48816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	618	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGAAGCGCAGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256430	1263945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1257479_1258566_1263052_1263747
871551	contig_6361_pilon	-	2224	6	Intergenic	novelGene_23891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	31.6126556935668	287	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTGGACTTCGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129208	121259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122886_123928_124009_126515_126587_128203_128256_128659_128816_128969
871552	contig_7138_pilon	-	2109	14	Intergenic	novelGene_120989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_11	57.963363250332	11	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	62	1573	215541	179975	FALSE	35	ATGTCTAATAAGGAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNITIDPDVKPGEYVIKSLFAEFAVQAEKKIEVVMAEPLEKLLSRSLQRGEDFQFDQVISSMSSVAEHCLPSLLRTLFDWYRRQNGTEDESYEYRPRSSTKSKGDEQQRERDYLLERRDLAVDFIFCLVLVEVLKQIPVHPVPDPLVHEVLNLAFKHFKHKEGYSGTNTGNVHIIADLYAEVIGVLAQSKFQAVRKKFVTELKELRQKEQSPHVVQSVISLIMGMKFFRVKMYPVEDFEASFQFMQECAQYFLEVKDKDIKHALAGLFVEILIPVAAAVKNEVNVPCLKNFVEMLYQTTFELSSRKKHSLALYPLITCLLCVSQKQFFLNNWHIFLQNCLSHLKNKDPKMSRVALESLYRLLWVYVIRIKCESNTVTQSRLMSIVSALFPKGSRSVVPRDTPLNIFVKIIQFIAQERLDFAMKEIIFDLLSVGKSTKTFTINPERMNIGLRVFLVIADSLQQKDGEPPMPTTGVILPSGNTLRVKKIFLNKTLTDEEAKVIG	215602	179438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_180152_180943_181031_184063_184173_184390_184495_190206_190309_191578_191678_195694_195788_195965_196135_199443_199525_199915_199996_207769_207867_208836_208977_211683_211738_215421
871553	contig_16400_pilon	+	898	3	Intergenic	novelGene_150898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	17	206	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	172	366	16949	36995	FALSE	25	CTACGATAGCAGTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQYNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVMYLKEILREIGIQNVKGTHKNTWELKPEYRHYQGEEKSD	3464	37527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879_17024_36875
871554	contig_14441_pilon	+	1711	4	Intergenic	novelGene_100628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	640.009895756829	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	458	1204	111703	117123	TRUE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRADCGLSSGK	111245	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_116578_116963_117097_117403_117566
871555	contig_13097_pilon	+	2506	17	Intergenic	novelGene_107715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_13	509.200994052201	28	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	146	1777	184733	263558	FALSE	55	ACAGGAGACACAAGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRRFAL	184587	264287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407
871556	contig_9053_pilon	-	5144	1	Intergenic	novelGene_87964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTTGGGTTATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387904	382760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_382800_387900
871557	contig_11338_pilon	-	2433	7	Intergenic	novelGene_6332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	226.230708201458	2	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	152	751	319426	295358	FALSE	35	ACCCACATGCTCACAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPSPRKGIYMELPWTSLCHLLC	323314	293675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300884_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
871558	contig_16328_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_178160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	78	530	128235	128687	NA	20	GGGTCAGACTGGACCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLARAIRQEIEGIQIEKEEIKLPLLMDGMILYTEKPKESTRKLLPLIEEFSKLAGYKVNEQKLVGFLYISNKKSEREIRKTIPFTIASKRIKYLYVKDLHNKNYNTLLKEIKEDLNKRKDVPFHGLADLMSLRCQYYSKQSQIQRNPNQNSNRLLYRSGKTNPPLSMERQQAPNS	128157	129777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16328_pilon_+_128200_129800
871559	contig_16110_pilon	+	3435	1	Intergenic	novelGene_126806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACAAGCCCATTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133715	137150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_133700_137200
871560	contig_6842_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_130765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGACTGGTGGCACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326112	1327758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1326100_1327800
871561	contig_10064_pilon	+	2843	9	Intergenic	novelGene_122710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	59.8319260512312	414	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	145	1377	264575	273630	FALSE	25	TGCTGTTCAATAAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLGGLASSPRAALQSSKARMKKLPKKSQNEKYRLKYLRLRKAAKATVFENAAICDEIARLEEKFLKAKEERRYLLKKLLQLQALTDGEAQATAPSHSSALPLTYGVASSVGTIQGAGPISGPSTGGEEPFGKKSKKEKKEKGKENNKLEVLKKTSKKKKMEGGARKLVQPIALDPSGRPVFPIGLGGLTVYSLGEIITDRPGFHDESAIYPVGYCSTRVYASMKCPDQKCLYTCQIKDGGLQPQFEIVPEDNPQNAIVSSSADVCHEELLKTIRASAGRLTPSLLPSGADFFGFSHPTIHNLIQSCPGARKCVNYQWVKFDVCKPGDGQLPQGLPENDAALSFEAFQRQTFEDQNDPILPGSLDLPELQPAAFVSSYPPMFLTHEPLVETHLQHLKSPVQCSPTRSSD	264430	275096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_+_264725_266181_266253_267020_267254_267831_267969_268271_268419_271806_271905_272159_272271_272657_272798_273484
871562	contig_5967_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_44403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACCTATCTGGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418207	419643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_418200_419600
871563	contig_7357_pilon	+	2103	13	Intergenic	novelGene_36874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	94.9846113267243	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	528	1640	250864	273311	FALSE	30	GATTGAATTTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHITINQYLQQLPSPEEKCQQVLEPPYDEMFAAHLRCTYAVGNHDFIEAYKCQTVIVHTSFLRAFQAHKEENWALPIMYAVALDLRIFANNADQQLVKKGKSKVGDMLEKAAELLMSCFRVCASDTRAGLEDSKKWGMLFLVNQLFKIYFKINKLHLCKPLIRAIDSSNLKDDYTTAQRVTYKYYVGRKAMFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	250336	273774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_250900_256778_256853_257939_258006_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269063_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
871564	contig_5770_pilon	-	604	6	Intergenic	novelGene_74175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2103.27348673443	61141	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	15	569	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264946	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
871565	contig_10765_pilon	-	2307	7	Intergenic	novelGene_122848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1830	2204	18689	15716	FALSE	25	ACTCCGTACGCAAGATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVCLVPSFTAFLFLRGLVNGAYKCFTCTIYPVVCGCYWETCILWNCNGGYRDPIIPSFLLDSAEVSSSMMGENPGLLSWFQSFVVWSTDEFFSMTQGFHFHLSIRHLTLQLCIDLYLLIKTF	35438	15612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15765_18246_18430_18546_19515_28912_29038_32030_32121_32462_32541_34727
871566	contig_10331_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_54072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAACACCCACAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87269	85792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_85800_87300
871567	contig_11285_pilon	-	1445	15	Intergenic	novelGene_5658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	412.109704039186	1	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	166	1242	796157	784262	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVSADAAASGLGGEGHSYLVDSGRRAGWSAAAHAAGPSHVEGRLLQAESPAPGRGR	796445	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785700_785807_786067_786182_787039_787166_793848_793958_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415
871568	contig_16525_pilon	-	2097	3	Intergenic	novelGene_133875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1149.5	9	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	54	314	181436	181040	TRUE	25	ACACAGCACCTGGAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKVPGWRTGVWVERRALETEMLKPLGVPGVRGPCRGEI	181489	179219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_180029_180065_181253_181388
871569	contig_14722_pilon	-	3900	18	Intergenic	novelGene_110210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_17	109.684006650372	33	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	2433	3560	93337	37838	FALSE	45	GCAAATATTAATTGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLTATAAEESRLTASSVGQIVGLCSAEIKQIVSEYAEKQSELSAEDSPEKLGASQLHHRKIISLNKQILQKTKHLEELQASHANLQAKYSEAKKTLTELKSYSEKLDKEQAALEKIESKADPSILQNLRALVAMNENLKSQEQEFKAHCREEMTRLQQEIEALKAERAPGGDEKTPSSGEPHGALTSVMTCDEDLDRRYNMEKEKLYKIRLLQARRNREIAILHRKIDEVPSRAELIQYQKRFIELYRQISAVHKETKQFFTLYNTLDDKKVYLEKEISLLNSIHENFSQAMASPASRDQFLRQMEQIVEGIKQSRMKMEKKKQENKMRRDQLNDQYLELLEKQRLYFKTVKEFKEEGRKNEVLLSKVKAKAS	102342	37497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_-_37892_45772_45887_47982_48068_49475_49514_51668_51752_58190_58300_61761_61825_63335_63390_64689_64762_65720_65803_67251_67326_71307_71371_78969_79087_92466_92554_93304_93356_93643_93737_96619_96657_100058
871571	contig_20241_pilon	+	2178	5	Intergenic	novelGene_159744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	44.7960656754586	18	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	145	579	239418	242163	FALSE	40	TAAAAAGGTATGTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRYVFNILILQLLFIYLPDGPLEYPVQEHKRSRELCDLFTIFLRT	235266	243762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235947_236036_239404_239481_240085_240220_241925
871572	contig_9183_pilon	-	2147	6	Intergenic	novelGene_40303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	447.322434045063	1	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	136	1350	323783	315431	TRUE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASHTHFSFFSSAAIGQHPCHHIAQGGRGRPWVQLGRRCGSRKQGDHGSPSVPKRVGRPGRDYSEGQ	325953	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314768_314891_315233_315493_318244_318379_322764_323834_325868
871573	contig_12019_pilon	+	752	3	Intergenic	novelGene_87678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	834	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5120	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5401_6114_6226_8298
871574	contig_15744_pilon	-	2159	5	Intergenic	novelGene_83626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	268.966889226165	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	190	324	208774	203130	TRUE	30	ACATTCAGGATTGATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCFGGGGGDCGRGGGWCCDSGLGGGSRGGEQVRRARPSGGRVGAASERTGWKQRSASRSSAETMAGGKAGKDSGKAKAKAVSRSQRAGLQILLCARQHGSHRGCRGE	208963	198645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_199266_199935_200066_202044_203184_204445_204524_208771
871575	contig_9995_pilon	+	5377	1	Intergenic	novelGene_47711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	3217	3633	353342	353758	NA	55	AAAAAACAAACCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRNCCRVKTPQSSVKQKESFTWHTFKEAKVGKWTSMLPQSCLSESKEYYRIGKNGKTDKHAVRAMSAELQGALQNHQYILTLPISKTTESFTFSETGYKLLNLHNSIFELSFLTITGTSSVTSVRRVLIGPTNLTIH	350125	355502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_350100_355500
871576	contig_11656_pilon	+	3398	8	Intergenic	novelGene_53984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_6	11.1849023606076	140	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	20	1276	350234	367140	FALSE	5	CCTCTATGTCGTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSVYRHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDNGFPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTITGSTNVGDQLPTGQLSVVPWRRTGVKYTNNEAYFDVIEEIDAIIDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNPRLLDDVSFHPCVRFKRWESERILSFIPPDGNFRLLSYHVSAQNLVAIPVYVKHNISFRDSSSLGRFEITVGPKQTMGKAIEGVIVTSQMPKGVLNMSLTPSQGTHTFDPVTKMLSWDVGKINPQKLPSLKGTMSLQAGASKPDENPTINLQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGIKYMTKAGKFQVRT	350214	369262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_350507_355135_355308_359040_359179_361902_361989_362303_362438_363763_363972_364263_364409_367039
871577	contig_12046_pilon	-	2747	11	Intergenic	novelGene_83472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_7	91.194791517937	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	216	992	345717	329082	TRUE	20	ACAGATTTTTTTCTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLTVLLHGGPRGRSPLLQRLMQEIRYMKRSYVVKPTLNEVVIVSAIRTPIGSFLSSLSSLPATKLGTIAIQGALEKAGIPKEEVKEVYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCTTINKVCASGMKAIMMASQNLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGATPYGGVQLEDLIVKDGLTDVYNKIHMGNCAENTAKKLNISRDEQDTYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTISVKGRGIMSQSRSNFYST	345932	319126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_319568_319937_320096_321962_322028_323275_323390_328104_329280_329920_330065_331755_331857_332089_332186_332477_332596_338465_338514_345645
871578	contig_10689_pilon	+	718	4	Intergenic	novelGene_118621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1784.12431056683	23	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	98	496	57608	61280	FALSE	40	GCAGCCTACAAAGAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGKSEITFNYKTGNGTFF	51264	61502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58403_61256
871579	contig_10689_pilon	+	1019	3	Intergenic	novelGene_118637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_2	116	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	18	536	57608	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	57590	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_57792_58211_58374_60928
871580	contig_6241_pilon	-	2549	8	Intergenic	novelGene_156415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	129.03029228259	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	570	2348	195215	182242	FALSE	25	TGTTCATACATTTCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPVFEAVGRIYELRLMMDFDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMKKREEILEEIAKVTEGVLDVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLMPGRIQLWGHQIAVDWAEPEIDVDEDVMETVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYQKAAKGGGGAEAATQQPSYVYSCDPYTLAYYGYPYNALIGPNREYFVKAGSIRGRGRGAAGNRAPGPRGSYLGGYSAGRGIYSRYHEGKGKQQEKGYELVPNLELSAVNPVAIKPGAVAIPAIGAQYPMFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365508	182040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193303_194092_195247_219950_220075_293626_293710_365019_365246_365403
871581	contig_16934_pilon	-	2549	4	Intergenic	novelGene_132523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.481914284983	29	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	70	312	201384	161011	TRUE	40	AAGTCTTGATAGGGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWWCCVRENISSPSGWSGPVSGLMKNLDILSRIWLKLGNAEIEDISMPVLEVPSNWFRLIATLCATEQNTAQSCVILTIVIMLELIVAATVSIHLVKGLPLFQ	208083	157363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_158957_160366_161170_201300_201390_208019
871582	contig_17_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_173978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTGTAGGTGTCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081916	1080681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1080700_1081900
871583	contig_4857_pilon	-	3402	5	Intergenic	novelGene_48650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	68.8962081685197	40	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2295	2600	443315	441598	FALSE	50	TTAAAGAAATGATGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSEVPNFSEPNPDYRGQQNKGAYSEQKNNSMNSNMGTGTFGPVGNGVQTGPDSRGYQFSYGGRSNGRGPINPQLPGTADNHTVMTTISNGRDPRRAFKR	448621	440795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_441768_442783_442851_443246_444537_444997_445070_447620
871584	contig_2892_pilon	-	2830	2	Intergenic	novelGene_119043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	126	533	344652	342717	FALSE	75	AAAAAAAAAAACTTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSNPGNCQIWPVKYFVKIKMWNQEADSKILAKTSLKGTFQAFLTVLKMKRGLFHYNSGRVMVTGCFDPLHLAQENQNQTHCRRVDSDYKYYLGLKVCKTKFFKNIPARDGAWLPSLTALTGITIEGPRQSQRKM	344777	340419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_342863_344390
871585	contig_12032_pilon	-	2485	9	Intergenic	novelGene_139262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_8	113.890023707083	547	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	158	1477	122315	96750	FALSE	40	ATACGTAGGAATATCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHVRARRFDGVAVRKRSWYCDSRGLGGSARVTRRVVSGELGLLLPKSRLRGHMAQPPGGSDPLQNSEHSSLQSNDPPSLAASSNQSSIQDEQLIDSFQGQAAQSDVRNDDSMPGPSQNVEAESVQYAVDVEEGTGFYPSEPMLCSETVEGQVPHSLETLYHAAGCSNASDALIVLIHLLMLESGYIPQGTEAKAVSMPEKWKSGGVYKLQYTHPLCNGGSAALTCVPLGNLIVINATLKINNEIRSVKRLQLLPESFICKEEPEENAAQMYKDLQKLSRLFKDQLVYPLLAFTRQALNLPDVFGLLVLPLELKLRILRLLDVRSVLSLSAVCHDLFIASNDQLLWRCLYLRDFRDSTARARDTDWKELYKKRHKQRKDAQRGRHMVFLPPSPHPIPFYPIPFPSSPLYPPGIIGGEYDVRPVLPFVGDPINSLIPGPGETPGQFPPLRPRFDPLGPLPGPNPILPGRGGPNDRFPFRPGRGRPTDSRLPFM	122472	95741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_97125_98346_98385_101195_101373_105048_105145_106744_106829_109043_109186_110302_110531_117401_117545_122278
871586	contig_11932_pilon	-	5552	1	Intergenic	novelGene_85435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTACAGCCTTGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499748	494196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_494200_499700
871587	contig_1275_pilon	-	2755	5	Intergenic	novelGene_108724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	7.76208734813001	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	76	510	281009	266579	FALSE	25	CTAAGGAAACTTGGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPPDRPALGLLAAVHSEEGSACGAMAVTLPAVVEELLSDMAAAVRETARIPDEHLLSLKFIFGSSAIQALDLVDRRSITLVSSPSGRRVYQVLGSSGKTYTCLASCHYCSCPAFAFSVLRKSDSLLCKHLLAIYLSQVMGTCQQLSVSDKQLTDILLTEEEQERKGTD	281084	264333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_266708_268022_268128_272552_272656_275765_275788_280933
871588	contig_10050_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_119631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249856	247956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_248000_249900
871589	contig_14300_pilon	+	3870	11	Intergenic	novelGene_133104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	90.6942666324614	225	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	242	2725	243795	266751	FALSE	25	TGTTTTTGTTTATTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLCSGLMFPMSCLILVWAAGSGSIKVLPKPTCFSDYTTTSICEWKMADPTNCSAELLLSYELLSYQQNLDPSENRTCVPENKEVMVCVCSMQTELLYAVDVYALRLWAGQQLLWEDHFRPSNHIKPRAPGNLMVHKNASDMLLLTWTHPYAPGDLLYSELTYLVNISNENDPSDFKVQEVTYKEPFLHLPARSLKSGAFYRASVKALAQGYNSTWSEWSHSNAWYNYYKKPLVQGLPLSVSISCIVILAICLSCYFIIIRIKKEWWDQIPNPAHSPLIAIIIQDSQVSLWGKPSRGQKPAKCPRWKTCLTKLLPCFLEHKKERDEDSPKAAGHGPFQGPGKSAWCSAELSKTVLWPESTNVVQCVELFEAQVEGEEEEVEEDKGSFCPSPESSGVSFQEGREGIAARLTESLFLDLLGGQDGVFGPQGLGESLLSPPSGSRNTQMPWVEVPSTEPKEATLQGKEPELTSQAFTEMPAVIADDPVYRSLGTFLSQSPGPGELDSDLQLAEHLGKVDSQASCAPQPLEQPTSLQPGLETWEQILRQSVLQHGAAPAPALAPASRAALAPASVPISGYREFVSAVKQGSTQDGQAVGFSPPGEAGYKAFSSLLANGATCPGICRVEASSREGGYKPFQNLLPGCPEASGPGLVPQFTFGLDMEPPHSLQSSLFPSASPEHLSLGPVLKGEDGQKPPLPSEQATDPLRDDLGSGIVYSALTCHLCGHLKQCHSQEEHGEAYTVAGPCCDCCCGDRSSPLLSPLRAPDPLPGGLRLEASLSSASPTPLDVSEESKSSLSIQPALSNAQSSGQPPKMVAMASTEPPCMRVT	218495	267896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_218602_243465_243580_243773_243865_246863_247018_248954_249107_250299_250452_255402_255560_259664_259765_261960_262040_264280_264331_265181
871590	contig_10990_pilon	-	1565	3	Intergenic	novelGene_7501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	288	710	744373	743951	TRUE	40	CCATACCTACTTCTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	744972	738165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_738952_743881_744386_744697
871591	contig_5669_pilon	+	3430	4	Intergenic	novelGene_86036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	31.4783876475414	5	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	641	1132	13248	19184	FALSE	5	GTTGTGGGGATGTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDERRFKMADKDGDLIATKEEFTAFLHPEEYDYMKDIVVQETMEDIDKNADGFIDLEEYIGDMYSHDGNADEPEWVKTEREQFVEFRDKNRDGKMDKEETKDWILPSDYDHAEAEARHLVYESDQNKDGKLTKEEIVDKYDLFVGSQATDFGEALVRHDEF	12607	21482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_13374_14081_14143_17622_17823_19079
871592	contig_11629_pilon	+	6272	1	Intergenic	novelGene_161202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATGTGTGGGGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433987	440259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_434000_440300
871593	contig_10171_pilon	-	2991	7	Intergenic	novelGene_178161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	12.801909579781	274	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	183	779	198904	190313	FALSE	15	TAATACGGTCCCGTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYSLSVLYKGESKAVLLKAAYDVSSFSFFQRSSVQEFMTFTSQLIVERSAKGSRASVKEQEYLCHVYVRNDSLAGVVIADSEYPSRVAFTLLEKVLDEFSKQVDRIDWPVGSPATIHYTALDDHLSKYQNPREADPVSKVQAELDETKIILHNTMESLLERGEKLDDLVSKSEVLGTQSKAFYKTARKQNSCCGIM	199086	188100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10171_pilon_-_190349_191683_191786_192867_192934_193254_193360_194575_194677_196472_196556_198800
871594	contig_10446_pilon	-	2142	6	Intergenic	novelGene_162446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_5	399.467445482107	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	167	535	233785	228913	FALSE	20	TGCCTATTAGCCTTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELFMECEEEELEPWQKKVKEVEDDDDDEPIFVGEISSSKPAISNILNRVNPSSYSRGIKNGALSRGITAAFKPTSQHYTNPTSNPVAASPVNFHPESRSSNSSVIVQPLSKPVSVSKITQ	260055	227305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_229080_229179_229246_233649_233797_235004_235074_235188_235234_260014
871596	contig_5532_pilon	-	2912	7	Intergenic	novelGene_175862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	34.0020424223147	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	716	1507	42273	29253	FALSE	10	AGGGATTTTTGTCTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRESFNPESYELDKSFRLTKFTELKGTGCKVPQDVLQKLLESLQENHFQEDEQFLGAVMPRLGIGMDTCVIPLRHGGLSLVQTTDYIYPIVDDPYMMGRIACANVLSDLYAMGVTECDNMLMLLGISNKMTDRERDKVMPLIIQGFKDAAEEAGTSVTGGQTVLNPWIVLGGVATTVCQPNEFIMPDNAVPGDVLVLTKPLGTQVAVAVHQWLDIPEKWNKIKLVVTQEDVELAYQEAMMNMARLNRTGIRGRGGLFCCKC	43180	27847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_-_29394_31725_31817_32957_33113_34163_34272_36309_36414_42080_42352_42543
871597	contig_6062_pilon	-	2350	7	Intergenic	novelGene_5244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_6	61.5710971154486	1937	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	314	1399	597983	541389	FALSE	30	TAGCATTTTTATTGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKNVSDSKPDLSLQLIFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLASKMASTLHPPGATRTNKLQGIDLLVLLDLIGAPNPTFLSFFPNSARWFNRLQAIERELHELRLLKHHSQERLYFRGNHYSSGIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMEDNEENLDEPTIDNLNKILQVFVLEYLHL	598296	540437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_541535_543999_544117_546484_546585_548605_548783_560804_561084_569595_569743_597863
871598	contig_7119_pilon	+	1975	14	Intergenic	novelGene_41016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	80.1858787314138	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	16	1797	198227	222261	FALSE	35	CCCCAGCAATAAATATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWRLKMATAAASSASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKYANMWLEYYNLERAHGDTQHCRKALHRAVQCTSDYPEHVCEVLLTMERTEGTLEDWDIAVQKTETRLARVNEQRIKVMMVFI	198211	222439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217142_217268_217328_218346_218457_221063_221177_222163
871599	contig_15031_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_138405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTTACTTTAGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86071	84127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_84100_86100
871600	contig_5403_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_87981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCCTGCTCCATTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436098	434948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_434900_436100
871601	contig_6364_pilon	+	3172	1	Intergenic	novelGene_51739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493253	496425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_493300_496400
871602	contig_8420_pilon	+	2073	14	Intergenic	novelGene_69341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	319.168279333245	1	121	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	480	1322	29058	39104	TRUE	65	GAGAAAAAAATAAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIALCSGQRWSQCRRH	10934	58907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21347_21444_26911_26997_29028_29103_29242_29437_33797_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39060_39172_41728_41918_51048_51183_58546
871603	contig_13888_pilon	+	2272	2	Intergenic	novelGene_151793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1610	junction_1	0	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	79	570	337589	338879	FALSE	30	TTTAATTGTGCTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVSICPIISLNYHFKGKEKTGILC	337510	340581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561
871605	contig_5794_pilon	-	1954	9	Intergenic	novelGene_69785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	5039.48326809158	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	69	731	746889	743712	TRUE	30	ATAAATGTAGTTCCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	746957	739825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740913_740996_741116_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807
871606	contig_15039_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_110147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGGCTTAAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188874	187020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_187000_188900
871607	contig_7870_pilon	+	4231	1	Intergenic	novelGene_109046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629811	634042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_629800_634000
871608	contig_1443_pilon	+	815	2	Intergenic	novelGene_28197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	51	515	344128	344592	FALSE	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPPFSVGAPTPRSEKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343698	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
871609	contig_11171_pilon	-	2576	6	Intergenic	novelGene_48579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1887	2195	105974	104208	TRUE	10	GTCCCGATGGGTGGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHWSQAWLWETEPPSSVPRTLWLPHCPTQSLILNSVGCVVTEAPEDLKSAFRMVSGSTSAGGLDEETEFTLRGSSLSFFTEGLSLSRLRMGWSEVITFPFM	107860	86238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_86279_90460_90591_91201_91278_93671_93797_104197_104251_105708
871610	contig_8263_pilon	+	1380	8	Intergenic	novelGene_83088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	171.72878474561	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	254	1327	140133	192899	FALSE	85	ACGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGEDFRPGKSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139519	192952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_139714_140073_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
871611	contig_6630_pilon	-	3162	1	Intergenic	novelGene_30742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACACAGCTTTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826168	823006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_823000_826200
871612	contig_7694_pilon	+	2932	15	Intergenic	novelGene_159936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	60	junction_14	174.13090314063	941	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	80	1576	234733	258914	FALSE	50	ACAGGGCTTATGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHHLQPFTWHEKIKKKDPKCIFACEEMTGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVESMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLVSKQPRCFILMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGISLDPRKPASQCVLDGVRGCDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKLEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHTEIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDHSYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQSSARSLVGSSLEGAVTPQASAWLPPTSAEREHPLSCVVTPQDGETLAQMIEENLNCLGHLSTIIREANEERGGSMMSLDWSWLAE	234483	260270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_234511_234680_234789_235607_235744_237564_237760_238982_239086_242729_242854_243220_243373_244528_244591_245781_245892_246567_246618_254753_254851_255144_255293_255851_255986_258026_258127_258884
871613	contig_9186_pilon	-	1381	12	Intergenic	novelGene_85340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	80.7646309954717	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	244	1257	302315	274201	FALSE	15	GCAGCAGCATTTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYIVNHLGRMGSQVIIPYRCDAYELMYLRPMGDLGQIIFLEWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETRNFDYDDVFVKIPQAIAQVSKEAGVERLIHVSHLNADIKSPSRYLRNKAVGEKEVRDAFPEVTIIKPSDIFGREDRFLNYFAGIRWFGGVPLVVLGLKTEKQPVYVVDVSKGIVNAIKDPDARGKTFAFTGPNRYLLFDLVQYVFAVIHRPFLPYPLPHFAYKLIARLFEISPFEPWTTRDKMERVHLTDMKLPHLPGLEDLGIQATPLEAKAIEVLRHHRAYRWLSSEMEDVKLTKTVNI	310861	274076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_274372_278835_278903_283187_283284_290178_290256_291445_291514_293314_293418_297474_297617_298974_299067_301351_301450_302215_302387_303448_303558_310798
871614	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_97464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	134	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871615	contig_6710_pilon	-	239	2	Intergenic	novelGene_98328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTAGCACATTGACGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657512	653683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871616	contig_6048_pilon	+	3470	17	Intergenic	novelGene_73120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_15	329.683347130243	21	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	4	1608	909094	1352677	FALSE	30	AGAGGGGAGGAGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDASKPLEVLLLEKNRSLQSENATLRISNSDLSGRCAELQVQVTEAAATVAEQRELIAHLEQDLSTIQTIQRPDAEGAAEHSLEKIPEPIKEATALFYGPSAPASGSLADDQVGSLLSIISSQRERFRTRNQELEAVSRPLPHPTTPCT	909090	1354539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258621_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1350868_1350997_1351717_1351785_1352522
871617	contig_6710_pilon	-	419	2	Intergenic	novelGene_98220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	20	TCTGGCCCCTTCCCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
871618	contig_3584_pilon	+	2114	3	Intergenic	novelGene_108186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1598	junction_1	931.5	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1158	1961	530578	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFLLSLTVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	528391	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_528477_528774_528877_529607
871619	contig_11708_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_138982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCATATGATTTCCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323220	325939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_323200_325900
871620	contig_3382_pilon	-	2944	7	Intergenic	novelGene_124145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	43.6631677987548	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	6	656	881386	869742	FALSE	20	TATTATGGTTGTGTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIAQQFFQLVGGSASECDTIPGRQCMASCFFLLKQFDDVLIYLNSFKSYFYNDDIFNFNYAQAKAATGNTSEGEEVFLLIQSEKLKNDYIYLSWLARCYIMNKKPRLAWELYLKMETSGESFSLLQLIANDCYKMGQFYYSAKAFDVLERLDPNPEYWEGKRGACVGIFQMILAGREPKETLREVLHLLRSTGNTQVEYIIRIMKKWAKENRVPV	881391	867453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_869854_871425_871560_874736_874844_875693_875764_879437_879522_879705_879795_881331
871621	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871623	contig_14450_pilon	-	2826	6	Intergenic	novelGene_48995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_5	470.952906350518	118	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	577	1080	1310917	1077383	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRTPTVNPPYSFSCLIFMAIEDSPTKRLPVKEIYNWILEHFPYFANAPTGWKNSVRHNLSLNKCFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQDPDIDAATAMMLLNTPPEIQAGCE	1502393	1075636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689_1311249_1379344_1379461_1502264
871625	contig_5590_pilon	-	4808	2	Intergenic	novelGene_163019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312467	303537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_303852_307973
871626	contig_2730_pilon	-	3008	1	Intergenic	novelGene_135378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTGAATGTCACCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316515	313507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_313500_316500
871627	contig_5967_pilon	+	1823	5	Intergenic	novelGene_44343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGACTAAGATGACGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387289	412582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_388584_388663_388933_389225_389308_403375_403477_412505
871629	contig_2476_pilon	+	7217	1	Intergenic	novelGene_157642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465855	473072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_465900_473100
871630	contig_1948_pilon	-	5302	1	Intergenic	novelGene_31147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAACTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122011	116709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_116700_122000
871631	contig_5696_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_117543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1540	1884	656906	657250	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSVAASACESWTINKEDRRRIDAFALWCWQRVLNIPWTTRRINKSLLEEVQPEFSLEMRMARICLTYSGHVIRRDQSLEKDIMLGKCMMSGIKV	655366	657661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_655400_657700
871632	contig_17198_pilon	+	4707	11	Intergenic	novelGene_62330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_3	99.5752981416576	427	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	87	1388	569822	726517	FALSE	70	CAAAAAAAGTTTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIFKPWKWRKKKSEKFKHTSAALERKISMRQSREELIKRGVLKEIYDKDGELSISNEDDSLENGQSLSSSQLSLPALSEMEPVPMPRDPCSYEVLQASDIMDGTDPGAPVKLPCLPVKLSPPLPPKKVMICMPVGGPELSLASYAAQKSGQQSMAQHHHTVLPSQIQHQLQYGGHGPHLPSSTGTLPMHPSSCRMIDELNKTLAMTMQRLESSEQRVPCSTSYHSSGLHSSDGVTKAGPLGLPEIRQVPTVVIECDDNKENVPHESDYEDSSCLYTREEEEEDEDDDSSLYTSSLAMKVCRKDSLAIKLSNRPSKRELEEKNILPRHTDEERLELRQQIGTKLTRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEQQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEELRERKILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKAAIRKELNEFKSTEMEVHELSRHLTRFHRP	458609	729836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_458676_569801_569883_604574_604743_627606_627929_658168_658411_660942_661100_708376_708433_715278_715341_720513_720655_725211_725289_726501
871633	contig_6076_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_81718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1066	1461	10760	10365	NA	10	CTGTGGCGTTACCATGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEIPAVLLPTAIPPAHPLPLPDGALCLARQNGPPLSESPLDLECPFPFALPSDLLLILFSYGLNITSPVKTSWMSLAECVIPTSEAPQHSINCPVMQHYSYFYSLIYVFNKRVIASLPCVRPWKQKDSGT	11825	8965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_9000_11800
871634	contig_14513_pilon	-	1161	3	Intergenic	novelGene_70316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19068	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12174_14952_14961_18801
871635	contig_17212_pilon	-	3544	1	Intergenic	novelGene_88624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGATAAATAAAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180339	176795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_176800_180300
871636	contig_10003_pilon	+	4042	1	Intergenic	novelGene_88186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCAAGCCACGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447623	451665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_447600_451700
871637	contig_16492_pilon	-	2920	3	Intergenic	novelGene_100284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	320	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTAAAAACTTCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112979	101766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_104502_108189_108265_112869
871638	contig_8045_pilon	-	8223	1	Intergenic	novelGene_35472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	407	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	422	1269	214	1482	587441	586173	NA	65	TCTAGAAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQWRRRHCCFAKMTWNAKRSLFRTHLIGVLSLVFLFAMFLFFNHHDWLPGKAGFKENPVTYTFRGFHSTKSETNHSSLRNIWKETVPQTLRPQTATNYNNTDLSPQGVTGLENTLSANGSIYNEKGTGHPNSYHFKYIINEPEKCQEKSPFLILLIAAEPGQIEARRAIRQTWGNESLAPGIQITRIFLLGISIKLNGYLQRAILEESRQYHDIIQQEYLDTYYNLTIKTLMGMNWVATYCPRIPYVMKTDSDMFVNTEYLIHKLLKPDLPPRHNYFTGYLMRGYAPNRNKDSKWYMPPDLYPSERYPVFCSGTGYVFSGDLAEKIFKVSLSIRRLHLEDVYVGICLAKLRIDPVPPPNEFVFNHWRVSYSSCKYSHLITSHQFQPSELIKYWNHLQQNKHNACANAAKEKGGRYRHRKLH	587654	579431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_579400_587700
871639	contig_9098_pilon	+	2353	2	Intergenic	novelGene_75862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGGCGCGCCCCGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352567	355551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_352639_353269
871640	contig_1535_pilon	-	1889	7	Intergenic	novelGene_127216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_6	554.291339359446	26	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	98	1102	52303	40062	FALSE	20	AATACTTAGTTTTCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGQCCGSWRSCAGESGCCCGGGGGSVKTAGMVGRETELSIHFLPGNCRLVEEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAAAIGAFLIYISSDYVFDGTNPPYREEDIPNPLNLYGKTKLEGEKAVLENNLGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52400	39274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_52240
871641	contig_4536_pilon	+	506	1	Intergenic	novelGene_175090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2	463	369437	369898	NA	55	AAAAAAAAAAATTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKAKKEAPAPSKTEAKVKALKAKKAVLKGVHSHKKKIRTSPTFRRSKTLRLRRQPKYPQKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESANKKIEDNNTLVFTVDVKVNKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVQLAPDYDALDVANKIGII	369435	369941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4536_pilon_+_369400_369900
871642	contig_5690_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_119667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATGTAAAACAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135714	133382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_133400_135700
871643	contig_7056_pilon	+	2689	1	Intergenic	novelGene_43672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789420	792109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_789400_792100
871644	contig_211_pilon	-	3578	17	Intergenic	novelGene_129854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_9	132.638474221283	348	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	52	2475	98758	78556	FALSE	15	TGTGTGAATTTATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTVVLDDVELREAQRDYLDFLDDEEDQGLYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYIGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIITKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERSYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKVKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDVQPSFSEDIPKIKKFSKTRSKDIFDQLARSLAPSIHGHEYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDSEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSVVDILATDDPNFNQEDQQDTQIYDKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKLVKPVLTQESAAYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRNEDESETEDEEEKSQEDHEQKKKRKKTRHSEAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKMTEPQETKESQKVELSESRLKAFKVALLEVFREAHAQSVGMNHLTESINRDTEEPFSPVEIQAALSKMQDDNQVMVSEGIIFLI	98809	77452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_78755_79997_80068_80522_80609_81082_81187_82164_82306_86086_86238_87063_87191_87563_87739_90156_90366_90931_91064_91417_91572_92394_92501_92983_93223_95861_95993_96865_97075_97505_97619_98680
871645	contig_7428_pilon	-	906	7	Intergenic	novelGene_77691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.6031598193473	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	251	880	242468	225895	FALSE	15	GCTGAGCTGTATGCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMPCGHLPLY	242718	225868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_225923_235618_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380
871646	contig_5779_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_106520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATTTATGGCCTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297342	299530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_297300_299500
871647	contig_18919_pilon	+	2145	3	Intergenic	novelGene_156021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	31	954	67795	68718	TRUE	60	TGAAAAAAAATGGCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCEYTFSVLGMAAGGRSNSFSSLMRLEKGLSELGLPSSSFLDRPPEADSPGEQPRPLTVPSSMRSDSPATESSSQVSLWPSASARWPRLCFSPRTWWKASLKCCMEPSTMPCMTSGRGAALVTHAHHRAPRAVLVVASRLQAQPEAVVHPVALGQLLLLLFLLFFLFLVVLLFLLVPVLRDQAGVVLALELGHHGLERAAGAAHQVAGARLRGAGGGEAVVGLDGHGGRLVHMRLHVALQLAGLRARVVAQVTLVRLLARVAAPVHHQVALKFERLAAELARLGLDRGLGGRRGGLQRREGGRRQEGRLATWLKWLQ	67764	167462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_69250_159880_160218_167139
871648	contig_16098_pilon	+	1534	11	Intergenic	novelGene_46014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	924	1250	350352	350892	TRUE	40	GACAATGAATGAGAAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPSVSTAAPVPTSHTRITLSQPALSSTFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSRRGSVKPPSGISHTMTVQSSEPLAMTLSLCGHQAMSSTGAVWPQTVGTFLSTRPV	348290	354097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349499_349614_349704_350009_350075_350235_350421_350511_350640_350762_350904_352186_352352_353989
871649	contig_12793_pilon	-	2592	1	Intergenic	novelGene_164113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1019	1318	140889	140590	NA	25	GTTATCTAGTGCTGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLFSHNPVGYKSKFRASAPGEHFLHWLWRKVHVISLPLVWELLCAGTSGPKDMLCSQHCFLGGMRFPCVSARFCLLYLKRDCIKTLILSTSSV	141907	139315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_139300_141900
871650	contig_1443_pilon	+	1706	2	Intergenic	novelGene_28372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994289	997996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_994337_996337
871651	contig_7179_pilon	+	4866	6	Intergenic	novelGene_78096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	57.2712842531054	279	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	355	1167	604240	626663	FALSE	40	CAAAAATTGTCATACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRRALIVLAHSERTSFNYAMKEGAVETLKRKGWEVTESDLYAMKFNPIISKNDIKGKLKNPENFQYPAESVLAYKEGRLSPDIVAEQKKLEAADLVIFQFPLQWFGVPAILKGWFERVLIGEFAYTYAAMYDKGPFRNKKAVLSITTGGSGSMYSLEGVHGDMNIILWPIQSGILYFCGFQVLEPQLTYSIGHTPLDVRIQILEGWKKRLENIWDETPLYFAPSSLFDLNFLMKKEIQDEQKTQKFGLSVGHHLGKSIPTDSQLKARK	603885	630362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_604247_621740_621906_622013_622145_624309_624424_625007_625110_626369
871653	contig_8823_pilon	+	2294	8	Intergenic	novelGene_53059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	39.0164800345407	118	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	684	992	84378	84686	FALSE	15	CCAATACCTGTGCGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	51781	85988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_67524_67642_76219_76301_76878_76985_77800_77899_80778_80833_84353
871654	contig_12353_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_165769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGACAGAGAGTGGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96804	93597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12353_pilon_-_93600_96800
871655	contig_14212_pilon	+	486	1	Intergenic	novelGene_178162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127876	128362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14212_pilon_+_127900_128400
871656	contig_9468_pilon	+	1608	13	Intergenic	novelGene_59456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	290.216908822809	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	162	1319	172913	205780	FALSE	75	AGAAAAAGCGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK	150486	206069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639
871657	contig_8156_pilon	+	1617	7	Intergenic	novelGene_98936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395200	441752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398544_403289_403537_403887_404006_404667_404810_441187_441420_441504
871658	contig_5769_pilon	-	6311	24	Intergenic	novelGene_138758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_22	204.253132546381	244	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1003	3012	453	3464	194927	141334	FALSE	30	CATACAGCGACTAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNTETPSLHSGPVSRMQPPASQNPAATPMPSGSFLPGVNLPSPPLNWQYNYTSTGSQTNRCPHVSSQPTVSGNTNLTANHQYISSGDPALQNSYIKSGSAPPLVNPPLPTTFQPGAPLGPPPTGGPPPVRALTPEKSSYGAVSQPSFNSAIKQEGGTSNTNNGSMVVHNSCDEIEGGGFLATPQLTNKNPKMGRSVGYSYPSLPPGYQNTTPTSTPGMPPSSLNYPSGPQTFTQTPLGANHLTASMSGLSLHPEGLRVINLLQERNVLPSTPLQPPVPNLHEDIQKLNCNPELFRCTLTNIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFKDLVQLPVVTSSTIVRCRSCRTYINPFVSFLDQRRWKCNLCYRVNDVPEDFMYNPLTRVYGDPLRRPEVQNSTIEFMAPSEYMLRPPQPPVYLFVFDVSHNAVETGYLKSVCQSLLDNLDLLPGNTRTKIGFITFDSTIHFYSLQEGLSQPQMLVVSDIEDVFIPMPENLLVNLNESKELVQDLLKTLPQMFNKTLETQSALGSALQAAFKLMSPTGGRMSVFQTQLPTLGMGALKPREEPNQRSSAKEIHLTPSTDFYKKLALDCSGQQVAVDLFLLSGQYSDLASLGCISRYSAGSVYYYPSYHHQHNPVQVQKLQKELQRYLTRKIGFEAVMRIRCTKGLSIHTFHGNFFVRSTDLLSLPNVNPDAGYAVQMSVEESLTDTQLVSFQSALLYTSSKGERRIRVHTLCLPVVSTLNEVFLGADIQAISGLLANMAVDRSVTASLSDARDALVNAVIDSLSAYRSSVLSNQQPGLMVPFSLRLFPLFVLALLKQKSFQTGTNARLDERIFAMCQVKNQPLVYLMLSTHPSLYRVDNLSDEGALNINDRTIPQPPILQLSVEKLSRDGAFLMDAGFVMMLWVGKNCGQNFLSQVLGVQNYASIPQTMTDIPELDTPESARTIAFISWLREQRPFFAILYVIREESPMKAAFLQNMVEDRTESALSYYEFLLHIQQQVNK	221712	138486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_141449_142085_142190_144479_144573_144873_144979_150300_150439_152527_152704_154068_154180_163332_163507_168639_168799_169117_169239_170163_170371_171427_171484_176203_176323_177862_177976_180713_180824_182748_182876_183609_183713_184797_184971_185257_185419_187008_187087_189385_189557_194629_194946_195038_195131_221370
871659	contig_10811_pilon	-	3967	1	Intergenic	novelGene_165792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAATGAGCTCATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215945	211978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_212000_215900
871662	contig_11816_pilon	-	2479	3	Intergenic	novelGene_98488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_1	24	387	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	62	469	494673	491366	FALSE	45	TAAAAAGAGGCATCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSATIVTIKNEDENKFVSRLMRENNNITMRVWLGLSQHSADQFWSWLDGSLVTFVKWENKNKSGGGKCSVLLASNETWKKVECSHGYGRVVCKVPLGPDHKAIAITLAVLSVLALFSALIWCLLQRKRLLWAGFSSVRYRQGANDDEIMLPSFHD	494734	489355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_491545_493187_493356_494612
871664	contig_6374_pilon	+	3344	2	Intergenic	novelGene_158421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	0	316	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	4679	17920	FALSE	30	AATTAAACTTTTTATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRGPTLRNPDASERVPPPPPPPLLFFGAAAAATTAARFRASRSLCAVPSVPGREEPGCTAPAVGPHHGDQTGGNSRQRLGRSLQPIYLAYSERGKRQCNPSVFSD	4678	20943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4934_17854
871666	contig_5918_pilon	-	4220	1	Intergenic	novelGene_99600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTTTTTAAGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2084286	2080066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2080100_2084300
871667	contig_14815_pilon	-	3783	2	Intergenic	novelGene_127201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	686	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2803	3135	18436	17106	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	21238	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316
871668	contig_4125_pilon	+	3309	1	Intergenic	novelGene_25207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2578	2955	1519836	1520213	NA	30	TTCCTGAAGAAGTAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSHLWHKLEFETPEKKKPRRAYRWRSRVAGDSWGRSCPAAWGPLKRVLFHKATSRQSSEHPGERVVVVVVSWLSVKKTKTSLKLAGPVLSRSCGLSRVQSCEAAGCCVEGAPTLHPARHRPVR	1517258	1520567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1517300_1520600
871669	contig_6576_pilon	+	2269	4	Intergenic	novelGene_42349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCTTTAAAAACCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723757	728896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_723957_725936_726022_726423_727748_728235
871670	contig_12079_pilon	-	1943	10	Intergenic	novelGene_67402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1143	1781	560191	491025	FALSE	10	GTTTTCTGACGTTTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSISPVTLALSKLPISVQVLLMLIKLPFSWKFLGSFLKEPLSTFYFHVSVLKAHGALPGAGLPQEHAALSAHAVAAAPAHSAPVQQEPQRSLAAGTRLPPAVLVCALHPLPSEVLQVRFQIPYPLFLYVLDLLVSVQDLENDLTLQFLEGIQIYFLGHFLFFPETPSLKCSLIHPKLLSCQWGSEQPAVHSSKPSSLKSSPVSLATGFWL	579138	490862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_491293_494618_494836_510894_510961_560103_560285_566062_566167_571769_571941_575142_575249_576394_576502_577601_577807_578782
871671	contig_7234_pilon	+	3970	2	Intergenic	novelGene_145953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTTGCCATTGAGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501980	506048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_503997_504094
871672	contig_5389_pilon	+	3500	11	Intergenic	novelGene_143001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_1	61.9067039988401	315	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	103	2367	94993	138103	FALSE	85	TAAACAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEHSPDDNIIYFEAEEDELTPDDKMLRFVDKNGLVPSSSGTVYDRTTVLIEQDPSTLEDEEDDGQCGEHLPFLVGGEEGFHLIDHEAMSQGYVQHIISPDQIHLTINPGSTPMPRNIEGATLTLQSECPETKRKEVKRYQCTFEGCPRTYSTAGNLRTHQKTHRGEYTFVCNQEGCGKAFLTSYSLRIHVRVHTKEKPFECDVQGCEKAFNTLYRLKAHQRLHTGKTFNCESEGCSKYFTTLSDLRKHIRTHTGEKPFRCDHDGCGKAFAASHHLKTHVRTHTGERPFFCPSNGCEKTFSTQYSLKSHMKGHDNKGHSYNALPHHNGSEDTNHSLCLSDLSLLSTDSELRENSNTTQGQDLSTISPAVIFESMFRNSDDTAIQEDPQQTAALIESFNGDPESVSDVPPSTGNSASLSLPLVLQPGISEPPQPLLPASVPSAPPPASSLGTGSQQAAFGTPPAVLQPPEVPVPHSTQFAANHQEFLPHPHTPQPIVPGLSVVAGASTSAAAVAATAVAAPPPPQSTTEPLPTMVQTLPLGANSVLTNNPTITITPTPNTAILQSSLMMGEQNLQWLLNGATSSPQNQEQNQQAPKVEKVFFTTAVPVASSTGSSVQQIGLSVPVIIIKQEEACQCQCACRDSAKERASSRRKGCASPPLPEPSPQPPDGPCLQLPPQTFSTLSAPLSSSSPLPSSHEQNRQAETPSDPQTETLSAMDMSEFLSLQSLDTPSNLIPIEALLQGEEEMGLTSSFSK	93262	139236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_93314_94941_95401_110879_111119_112137_112270_115680_115755_116218_116356_119669_119748_131467_131571_132277_132877_135580_135645_137672
871673	contig_4093_pilon	+	4361	1	Intergenic	novelGene_27646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	423	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56665	61026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_56700_61000
871674	contig_19647_pilon	-	3871	1	Intergenic	novelGene_144001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	116	379	77133	76870	NA	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLTKPIQSPALSPPYLCRCEADRQEGALIEGTWSQWGMVLGFTLREHCSSQPLSHFPGQAHRQLCLVHQSLELPWPKCRPCPSVGWAPVLLQPLDMPLSCPSDHWLPPSRAFLTRDEINGVIVT	77248	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_73400_77200
871676	contig_13498_pilon	+	5715	1	Intergenic	novelGene_176523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1761	2150	121930	122319	NA	20	GCACCGAGGTAGGGGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTSLLELPQATAGCWRAATVPRRPSVWWSTGKNVIRIPLSHSLKMQRISKSDTRAQIASWPLENISVVQSPLPLIITSSEHCGHLYLVCTTSNIHCMCKCASTCTHMRGPRPVNLPPHTLKGEVNWF	120169	125884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13498_pilon_+_120200_125900
871677	contig_8284_pilon	-	3780	1	Intergenic	novelGene_125721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2100	2447	443750	443403	NA	10	CCTCCCAGCCGCCCCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMPEPTVVATVSIHLVEGLPFFFSLSLYLIKHDVLLQGLVLPDNTSKVCEVRSHHPPFKGAFWLYFFQDRFVHFSGSPWYIQYSSPTPSFKGINSVFQISWHRRVSTSSAASVC	445849	442069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_442100_445800
871678	contig_2888_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_151486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATAGTATGTACTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48532	47820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_47800_48500
871679	contig_4486_pilon	-	4202	1	Intergenic	novelGene_38614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGCAAGATAAGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383665	379463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_379500_383700
871680	contig_1725_pilon	+	3898	7	Intergenic	novelGene_24319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_4	475.500321299109	42	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	3067	3585	251048	255543	FALSE	30	TAACTACATTGGAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	246604	255856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_246690_247022_247187_247639_247755_248345_251188_252129_252265_252711_252779_255366
871681	contig_16525_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_133827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCACCCCTGGGCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156820	158164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_156800_158200
871682	contig_5337_pilon	-	3241	3	Intergenic	novelGene_136560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	757	2100	322179	320836	FALSE	40	TAAAGGCTAAATTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKQSAGIVLWGAILFVAWNALLLLFFWTRPAPGRPPSDSALDDDPASLTREVIRLAQDAEVELERQRGLLQQIREHHAQWRQRLRVPTAAPPAPPRVPATPPPAVIPILVIACDRSTVRRCLDKLLHYRPSAEHFPIIVSQDCGHEETAQVIASYGSAITHIRQPDLSSIAVPPDHRKFQGYYKIARHYHWALGQIFHRFKFSAAVVVEDDLEVAPDFFEYFQATYPLLRADPSLWCVSAWNDNGKEQMVDSSKPELLYRTDFFPGLGWLLLAELWAELEPKWPKAFWDDWMRRPEQRQGRACVRPEISRTMTFGRKGVSHGQFFDQHLKFIKLNQHFVHFTQLDLSYLQQETYDRDFLARVYGAPQLQVENVRTNERKELGEVRVQYTSRDSFKAFAKALGVMDDLKSGVPRAGYRGIVSFLFRGRRVHLAPPQTWDGYDPSWN	357676	319694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_322308_339274_339712_357485
871683	contig_5482_pilon	-	4628	7	Intergenic	novelGene_144444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_6	168.727014895528	239	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	64	1668	302713	271235	FALSE	40	CCCAGCATAAACACAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSRSPVEVFVPPCVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDDDKSEACNEDLTAATDEKSIERVSLSAESLLKAATSVRGGKNSSPLNCSRAEKGVARVVNISSPGHDASSRSPTTTASVPATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAASPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQLAQCQLQTKSSLTGSGSINIVGTPLAVRALTPVSLAHGTPVMRLSVPAQQASGQTPPRVISAVIKGPEVKSEAVAKKQEHDVKTLQLVQDEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMKTEGLVTCEK	302776	268274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_271863_272267_272619_274810_275004_288090_288178_291323_291498_293196_293311_302655
871684	contig_4802_pilon	+	2696	15	Intergenic	novelGene_172218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	360.437772375624	22	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	196	1248	201746	490614	TRUE	15	AGTTTTTGTCGTTATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKQATSPFACAADGEEAMTRDLTSREKEEGSDQHVASHLPLHPVMHNKPHSEELPTLVTTIQQDADWDSVLSSQQRMESESNKLCSLYSFRNTSTSPHKPDEGSRDREIMTSVTFGTPERRKGSLADVVDTLKQKKLEEMTRTEQEDSSCMEKLLSKDWKEKMERLNTSELLGEIKGTPESLAEKERQLSTMITQLISLREQLLAAHDEQKKLAASQIEKQRQQMDLARQQQEQIARQQQQLLQQQHKINLLQQQIQVQGHMPPLMIPIFPHDQRTLAAAAAAQQGFLFPPGITYKPGDNYPVQFIPSTMAAAAASGLSPLQLQQLYAAQLASMQVSPGAKMSSTPQR	157865	573189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4802_pilon_+_158057_201741_201983_226326_226535_298332_298423_345203_345377_348413_348483_437339_437461_447171_447252_483352_483423_490609_490836_495026_495215_527056_527166_556965_557200_559794_560012_572710
871685	contig_17522_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_160816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAGAAAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96547	93639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_93600_96500
871686	contig_15112_pilon	-	2332	3	Intergenic	novelGene_124770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_2	304	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	7	303	77988	74063	FALSE	15	TGTTTTGTTCATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVMPSSFFLLLRFFLRIDGVLIRMNDTRLYHEANKTYMLREYTSRESKIANLMHVSPSLFTEPNEISQYLPIKEAVCEKLIFPERVDLNPADSQENKPVE	77994	72033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_74207_75804_75868_77898
871687	contig_13366_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_99781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTTCTACATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93367	91201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_91200_93400
871688	contig_3817_pilon	+	2714	7	Intergenic	novelGene_78364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	166.123113650355	4	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	94	906	612683	638773	TRUE	25	TGTTGGTGTGAAGAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATRTTSFKGTSPSSKYVKLNVGGALYYTTMQTLTKQDTMLKAMFSGRMEVLTDSEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDGAVPLPESRREIEELLAEAKYYLVQGLVEECQAALQQNKDTYEPFCKVPVITSSKEEQKLIATSNKPAVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDNMLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNILLYEAQDGRGPDNALLEATGGAAGRSHHLDEDEERERERIERVRRIHIKRPDDRAHLHQ	612589	640667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_612762_627206_627377_630759_630850_631177_631231_632474_632671_638548_639419_639504
871689	contig_15323_pilon	+	2661	2	Intergenic	novelGene_148501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCAGTGATATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19994	67624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_20081_65049
871690	contig_6446_pilon	+	6771	1	Intergenic	novelGene_149187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218702	225473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_218700_225500
871691	contig_1443_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_28199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	7	471	344128	344592	NA	30	GTGCATTCTAATGAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344121	344887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344100_344900
871692	contig_987_pilon	-	4583	1	Intergenic	novelGene_72358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	592	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAAACAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305500	1300917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1300900_1305500
871693	contig_8362_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_150687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGTTAAAACCATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105058	105663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_105100_105700
871694	contig_8865_pilon	+	2613	1	Intergenic	novelGene_164457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACGAAACCTGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394406	397019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_394400_397000
871695	contig_14362_pilon	+	820	7	Intergenic	novelGene_142507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	123	junction_3	76.6369507628156	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	409	612	10276	18437	FALSE	35	AAAATCAGCATTTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFAKNPKSKGTKRDTERNKDIAFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLHGLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYEDSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL	5467	18645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_5509_6338_6409_8660_8826_8930_9042_10254_10346_17259_17316_18359
871696	contig_15248_pilon	-	2077	5	Intergenic	novelGene_149159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	41.1240501410063	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	71	616	209849	194399	FALSE	85	AAGAATAAAAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEEPADGGQSLPPVYIYSPEYVNMCDSLAKVPKRASMVHSLIEAYALHKQMRIVKPKVASMEEMATFHTDAYLQHLQQVSQEGDDDHPDSIEYGLGYDCPATEGIFDYAAAVGGATITAAQCLIDGKCKVAINWSGGWHHAKNFSFLKAIAHKTQVLDVVRVLLPAFPIFSHPPPNVT	209919	192937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_194508_205024_205167_205881_206013_209143_209197_209738
871697	contig_11370_pilon	-	803	3	Intergenic	novelGene_98723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCAGCGCTCGCACCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148544	145691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
871698	contig_8286_pilon	-	2931	2	Intergenic	novelGene_139816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	111	794	227708	227025	TRUE	20	AACCTTATGCGTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQPGPGLGEPQQGPSEGAGSERALAEGTEVQHSLPMLLIPPEASTAPNGPCNDPRFPLGHQCCASTRSYSEEFMTCYSDLVLHRTPLFPRDLPLSSLQGNQLQDPAPAQRPLLDEVVAPSGSSGGQPLVTVPNQLCLTPGPQSPEAELEEATPGTDAVFPSASSEMDKLCERLSYLLRPPTLTGHPGGFPGPGVEEKGQPEHHMGPEPARAQTVGELGSGGLPRHPHIYNSPPALITSLQGGLEAPVPARRHHPGYGSLCCL	227818	224817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_225784_225853
871699	contig_20596_pilon	+	6326	3	Intergenic	novelGene_157232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	86	383	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	44	2050	81152	83838	FALSE	50	AAGGAAAAACTCTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPFSQFSLVKQHFMKMHAEKKHKCSKCSNSYGTEWDLKRHAEDCGKTFQCTCGCPYASRTALQSHIYRTGHEIPAEHRDPPSKKRKMENSMHSQKLSSKTTESLISKPNPRPDTQELETSEIKLVASFEDSCSSNARKQTLTTPPRYPQKLLLPKPKVALVKLPVMQLSPMPVFVPTADSSAQPVVVGVDHQGSATGAVHLLPLSIGTLVLGLDSEACSLKESLPFSKIVNPVAVEPISTGVQVNLGKSPSNTLQELGNTCQKNSISSINVQTDLSYASQNFMPSAQWAPPDSSVSSCSQTDLTFGSQVSLPISVHTQTFLPSSKVTSSIAAQTDAFIDACFQSSGISRETQTSGMPSSADNRVQMDQAVMCGDIFESVHSSYSVSTDHIISNSLVADTVTHGLLPQNNPKTLNQDMEKSAPVINFNAQNSMLPSQNMTDNQTQTIDLLSDLENILSSNLPGQTLDNRSLLSDANTGPDTQLPSGATQNPGIDFDIEEFFSASNIQTQTEESELSNMNTEPVLESLDIETQTDFLLADTSAQSYTCRENSNFLGLEMFDTQTQTDLNFFLDSNPHLPLGSILKHSSFSVSTDSSDTETQTEGISTAKNIPALESRVQLNSTETQTMSTGFETLGSLFFTSNETQTAMDDFLLADLAWNTMESQFSSVETQTCAELHTVSNF	80347	88114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_80385_81145_81346_82025
871700	contig_3134_pilon	+	3520	2	Intergenic	novelGene_178163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTTGCCCATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244127	247746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3134_pilon_+_245247_245345
871701	contig_10311_pilon	+	4437	1	Intergenic	novelGene_50491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1085	1402	234234	234551	NA	70	AGTAAAAATAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCHYPSVSLSCCGGLCVAMMVARFQQNFQTKKKGLMICFQKLANENPMDHNRIFSDIVLEDEPHRLEGTVVATTMDSDTLTTMKMVQDRAAFRSVVRGVDMSQS	233149	237586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_233100_237600
871702	contig_15613_pilon	-	3733	4	Intergenic	novelGene_147190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	13.9602610609146	51	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	3094	3630	59036	43757	FALSE	10	TTGCTCTTCCACTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHGIYDLSDTLALFYLDEFWFSDGSLSDKSKCTDPGLMPLPDTATGLDWSHLVDAARAFEDQRVASFCTLTDMQHMQDLEGAQELPLCVDPGNGKDFLDTTGERSPSTLTGKVNQLELILRQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFNSVDKKS	62129	43653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_43904_48094_48177_49092_49217_58852
871703	contig_7895_pilon	+	5442	9	Intergenic	novelGene_154449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3094	3423	712431	712760	TRUE	20	CGGTAGGAGCAGTGACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGTEKEACVPCARSAAGGGGPGCHHPVDAAQPLPDHVQQLLLLLLPLPRAGSPRAPWPGQCLRQKRSHSGCCTAPGVNGGAWGIGVHPGAPLLVHSGGLGSLKPLGK	709337	725116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_713532_714489_714604_716328_716480_717682_717766_718418_718586_720124_720313_721130_721259_723438_723626_724886
871704	contig_9363_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_6789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	304	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	512	1504	1575759	1576751	NA	45	TAGCAGAATAGAGGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVIPLRHGGLSLVQTTDFFYPLVEDPYMMGRIACANVLSDLYAMGITECDNMLMLLSVSQNMTEEEREKVTPLMIKGFRDTAEEGGTAVTGGQTVVNPWIIIGGVATVVCQPNEFIMPDSAVVGDVLVLTKPLGTQVAVNAHQWLDNPERWNKIKMVVSREEVELAYQEAMFNMATLNRTAAGLMHTFNAHAATDITGFGILGHSQNLAKQQRNEVSFVIHNLPIIAKMAAISKASGRFGLLQGTSSETSGGLLICLPREQAARFCSEIKSSKYGEGHQAWIVGIVEKGNRTARIIDKPRVIEVLPRGTTATTLVPDSFNASSEPTL	1575247	1577774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1575200_1577800
871705	contig_11071_pilon	-	3851	1	Intergenic	novelGene_131045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGAAATGCTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206549	202698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_202700_206500
871706	contig_1759_pilon	-	3008	1	Intergenic	novelGene_171329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATCAAGATACAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42484	39476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_39500_42500
871707	contig_5988_pilon	+	3735	7	Intergenic	novelGene_15883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	2565	3344	469824	472180	TRUE	15	GCGACGGCGACGGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHHQGSNWGTGLVMSTDRGGERVGDNGRQGSCWACGHYTQGPGHTCNGKERVGRQVCRGWVGQLDRAAWLSLLVFELIGQPVQAFVQPIPAGGTGGLNVPVAVTQGMQAQLVCDLSSIHSIRQILFVCEDKQHSIPELILRQHSHQLLPGLIYSLPVIAVHHKYQPLGVLEVMSPERPNLVLATNIPNCEANVLVFHCLHIEPNGGDGGDDLPQFQLVQDGGLSCSIQAHHQDAHLLLPNQALEKVSKDISHDHSSCF	467200	485541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_468057_468115_470201_470754_470877_471110_471222_472010_472251_474086_474239_485372
871708	contig_13995_pilon	-	2148	4	Intergenic	novelGene_164088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	10.6144555520604	21	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	462	2021	64090	62531	FALSE	35	TTATATACAATAGTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHATVVSEDSGTGEDNDDLELQPAKKRQKTIVEPQRVWTKRDLRPDFGSWTASDPHIEYLKSQELSPVGLFELFFDEGTINFIVNETNRYARQKNVNLGLTAQELKCVLGILILSGYISYPRRRMFWETSPDSHHHLVADAIRRDRFELIFSYLHFSDNNELNESDRFAKVRPLIIRMNCNFQKHAPLEEFYSFGESTCEYFGHRGSKQLHTGKPIRLGYKIWCGTTSRGYLVWFEPSQGTLFTKPDKGLDLGGSMVIKFVDALQERGCLPYHIFFDKVFTSVKLMSILRKKGVKATGTIREYRTERCPLKDPRELKKMKRGSFDYKVDESEEIIVCRWHDSNVVNICSNAVGIEPVRLTSRYLGAAKTRTQVHQPSLVRLYQEKVRGVGRMDQNIAKYKVKIRGMKWYSSFIGYVIDAALNNAWQLHRICCEDAQVDLLAFRRYVACVYLESNADTSSQGRRSRRLETESRFDMIGHWIIHQDKRTRCALCHSQTNTRCEKCQKGVHAKCFREYHIR	71616	62403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_-_64293_65478_65523_66701_66766_71465
871709	contig_8357_pilon	-	4804	5	Intergenic	novelGene_39764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_4	590.707626495545	4	176	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	3703	4752	884838	883484	FALSE	0	TTGCTTTTTTTTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIGEMLRSFLTKLEWFSTLFPRIPVPVQKNIDQQIKTRPRKIKKDGKEGAEEIDRHVERRRSRSPRRSLSPRRSPRRSRSRSHHREGHGSSSFDRELEREKERQRLEREAKEREKERRRSRSIDRGLERRHSRSRERHRSRSRSRDRKGDRRDRDREREKENERGRRRDRDYDKEKGNDREKERERSRERSKERRSRGEVEEKKHKDDKDDRWHRDDKKDSKKEKKHSRSRSRERKHRSRSRSRNAGKRSRSRSKEKSSKHKNESKEKSNKRSRSGSQGRTDSIEKSKKREHSPSKEKSRKRSRSKERSHKRDHSDSKDQSDKHDRRRSQSIERESQEKQHKNKDETV	889523	883431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885477_887179_887257_887410_887707
871710	contig_6227_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_49826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCTCACAGAGACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393468	1391053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1391100_1393500
871711	contig_5718_pilon	-	3485	2	Intergenic	novelGene_110315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486093	447990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_450349_484966
871712	contig_6102_pilon	-	445	3	Intergenic	novelGene_31787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7761	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGGAGTCCCGCCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361225	360094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_360121_360230_360282_360857
871713	contig_1516_pilon	+	2749	4	Intergenic	novelGene_50006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_3	1828.23636935223	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	133	471	347241	348330	FALSE	45	GGAAGTTAAGAACAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPGQTLLSSQRSVQVGPKSHPEPKKEHYVTGGPSPEDQRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHETPQLATSPQAEKTYFYFVIDCFSTDTYYHY	345050	350608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_345170_347227_347395_347975_348068_348237
871714	contig_13901_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_146664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271334	269618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_269600_271300
871715	contig_14441_pilon	+	832	4	Intergenic	novelGene_100450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	3	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	217	645	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCTSVPASPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82328	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_116535_116963_117220_117344_117539
871716	contig_5041_pilon	+	4426	1	Intergenic	novelGene_27020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTGGCTTCCATCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247774	252200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_247800_252200
871718	contig_5423_pilon	-	3332	1	Intergenic	novelGene_85210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTAATAGTACTGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329063	325731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_325700_329100
871720	contig_12622_pilon	+	2426	2	Intergenic	novelGene_5784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163862	179052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_166026_178789
871721	contig_17936_pilon	-	3229	1	Intergenic	novelGene_29972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGATCCAGTATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116810	113581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_113600_116800
871722	contig_9345_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_24445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTCTAATGTGGGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397200	399524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_397200_399500
871723	contig_3111_pilon	+	3164	2	Intergenic	novelGene_129977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCCTGCTCCGGCGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97313	113270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_100407_113199
871724	contig_13607_pilon	+	4988	1	Intergenic	novelGene_170212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAGAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332132	337120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_332100_337100
871726	contig_12250_pilon	+	2413	6	Intergenic	novelGene_80620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.4959404308901	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	330	2153	350196	354698	FALSE	50	AAGAAAAAGAATCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPFFLTWSVVNSVHWANGSTQALPATTILLLLTVWLLVGFPLTVIGGIFGKNNASPFDAPCRTKNIAREIPPQPWYKSTVIHMTVGGFLPFSAISVELYYIFATVWGREQYTLYGILFFVFAILLSVGACISIALTYFQLSGEDYRWWWRSVLSVGSTGLFIFLYSVFYYARRSNMSGTVQTVEFFGYSLLTGYVFFLMLGTISFFSSLKFIRYIYVNLKMD	349783	354958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_350096_350178_350544_351345_351968_352256_352443_353491_353766_354304
871727	contig_12638_pilon	-	2441	21	Intergenic	novelGene_33339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	252.850207632899	100	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	95	1753	1434492	1373065	TRUE	10	ATGTGGTTTTGGCAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFLGEEGLDYGGVAR	1463567	1359290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1359381_1359790_1359912_1369746_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373022_1373158_1374643_1374716_1375548_1375622_1378299_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1463494
871728	contig_3612_pilon	-	1905	12	Intergenic	novelGene_87801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	73.6360269352572	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	406	1296	821441	815098	FALSE	45	GAATTAGTTTTAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLGADQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTYGQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN	830944	814488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_815256_815341_815439_815532_815736_818129_818218_819092_819258_820136_820233_820631_820705_821430_821563_825044_825145_825858_825941_826555_826594_830880
871729	contig_8588_pilon	-	2228	12	Intergenic	novelGene_146515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_11	31.2259163394714	334	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	99	1388	547546	496837	FALSE	10	TTTTGTGCCATTCTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEQRPFHLVVFGASGFTGQFVAEEVAREQVDPQRSSRLPWAVAGRCREKLQRVLERAALKLGRPTLPSEVGIIICDIANPASLDEMAKQATVVLNCVGPYRFYGEPVVKACIENGTSCIDISGEPQFLELMYWKYHEKAAEKGVYIIGSSGFDSIPADLGVLYTRNKMNGTLTTVESFLTIHSGSEGLCIHDGTWKSAVYGFGDQDNLRKLRNESKVKPVPFVGPKLKIRWPISYCRELSNYAIPFLGADVSVVKRTQRYLHENLEESPVQYAAYVTVGGITSVIKLMFAGLFFLFFARFGIGRQLLIRFPWLFSFGYFSKQGPTQKQIDASSFTMTFFGQGYSQGLATDKNKPNIRICTQVKGPEAGYVATPIAMVQAALTLLNDTSDLPKTGGVFTPGAAFSRTKLIDRLNHRGIEFSIISSSEV	547644	495996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_496943_498000_498083_498586_498699_502485_502543_502635_502756_516302_516421_517139_517271_533930_533981_536836_536967_538621_538703_545529_545643_547356
871730	contig_3975_pilon	-	1954	9	Intergenic	novelGene_54861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_8	193.021371873687	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	113	1198	2066301	2063690	FALSE	15	TTCCCCAGCTATGTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGALLALLFPEPFPEGGVMHFPLVQHRGFLDELRGPLKTHP	2079253	2062933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
871731	contig_9668_pilon	-	2431	19	Intergenic	novelGene_58069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	285.001196661989	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	641	2200	61307	37061	FALSE	35	TGAAAACAGCTCGTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKNIPEAHQDAFKTGFAEGFLKAQALTQKTNDSLRRTRLFLLVLLLLGIYGLLKNPFLSVRFRTTTGLDSAVDPVQMKNVTFEHVKGVEEAKQELQEVVEFLKNPQKFTVLGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVAGEADVPFYYASGSEFDEMFVGVGASRIRNLFREAKANAPCVIFIDELDSVGGKRIESPMHPYSRQTINQLLAEMDGFKPNEGVIIIGATNFPEALDNALIRPGRFDMQVTVPRPDVKGRTEILKWYLNKIKFDQSVDPEIIARGTVGFSGAELENLVNQAALKAAVDGKEMVTMKELEFSKDKILMGPERRSVEIDNKNKTITAYHESGHAIIAYYTKDAMPINKATIMPRGPTLGHVSLLPENDRWNETRAQLLAQMDVSMGGRVAEELIFGTDHITTGASSDFDNATKIAKRMVTKFGMSEKLGVMTYNDTGKLSPETQSAIEQEIRILLRDSYERAKHILKTHAKEHKNLAEALLTYETLDAKEIQIVLEGKKLEVR	79091	36829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_37205_40522_40610_41283_41358_41446_41574_42460_42613_43441_43598_44472_44586_45889_45953_47221_47355_48099_48253_50599_50691_58436_58520_60703_60788_61207_61359_63113_63224_64448_64548_67109_67273_72039_72172_79006
871732	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657825	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871733	contig_3825_pilon	+	1172	6	Intergenic	novelGene_77948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1676	junction_5	646.555364992048	27	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	12984	13848	TRUE	15	TTTGTGGGGGTTGTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVSKQAF	12982	15691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
871734	contig_9937_pilon	-	2627	14	Intergenic	novelGene_129189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	186.53340199324	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	12	1901	117901	14456	TRUE	10	GTGATGTGGCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANLLKTVVTGCSCSLFNNLGSCKVLPGKKSFLRTFHTHQVLWCKAPVKPGIPYKQLTVGVPKEIFQNEKRVALSPAGVQALIKQGFNVVVESGAGEASKFSDDLATFISSVNIAGGFLVTQRMLDMFKRPTDPPEYNYLYLLPAGTFVGGYLAALYSGYNIEQIMYLGSGLCCVGALAGLSTQGTARLGNALGMIGVAGGLAATLGGLKPCPELLAQMSGAMALGGTIGLTIAKRIQISDLPQLVAAFHSLVGLAAVLTCIAEYIVEYPHFATDAAANLTKIVAYLGTYIGGVTFSGSLIAYGKLQGILKSAPLLLPGRHLLNAGLLAASVGGVIPFMMDPSFTTGITCLGSVSALSAVMGVTLTAAIGGADMPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVAMNRSLANVILGGYGTTSTAGGKPMEISGTHTEISLDNAIDMIREANSIIITPGYGLCAAKAQYPIADLVKMLNEQGKKVRFGIHPVAGRMPGQLNVLLAEAGVPYDIVLEMDEINHDFPDTDLVLVIGANDTVNSAAQEDPNSIIAGMPVLEVWKSKQVIVMKRTLGVGYAAVDNPIFYKPNTAMLLGDAKKTCDALQAKVRESYQK	117912	13615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_14199_14312_14606_17373_17490_20228_20348_44130_44213_45066_45227_57847_58028_59866_60028_61162_61397_63472_63669_65136_65283_66162_66196_111026_111189_117750
871735	contig_11656_pilon	+	5074	5	Intergenic	novelGene_53970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGGCCGGGGGGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160742	227404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_164577_165174_165290_169385_169499_223782_224704_227313
871736	contig_13481_pilon	-	3601	1	Intergenic	novelGene_119464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCCCAGCTGCTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226040	1222439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1222400_1226000
871737	contig_7338_pilon	+	4605	1	Intergenic	novelGene_156800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCTTCGACCAAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276777	281382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_+_276800_281400
871738	contig_11896_pilon	-	3637	1	Intergenic	novelGene_87994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	378	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACTATGAGTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52282	48645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_48600_52300
871739	contig_16122_pilon	+	3384	23	Intergenic	novelGene_134519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_8	42.929622399211	212	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	362	2215	142082	159993	FALSE	10	GATTTGTTTTCTTTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLDRIANVSILKQHEVDKLYKVENKPVLSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIANLVNTDKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDVDLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGSFPNCYGIGRCAKMSHELWRKLEEEEDGETKGRRPEIGHVFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGLVDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDRSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGFLSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLHIGACESIMKKKTKQDFQELIKTEHALLEGFNIRESTGYIEEHIDRQVSLIESLRLMCLLSITENGLIPKDYRSLKTQYLQSYGPEHLLTFSNLRRAGLLTEQAPGDTLTAVESKVSKLVTDKAAGRITDAFSSLAKRSNFRAISKKLNLIPRVDGEYDLKVPRDMAYVFSGAYVPLSCRIIEQVLERRSWQGLDEVVRLLNCSEFAFTDMTKEDKASSESLRLILVVFLGGCTFSELSALRFLGREKGYRFIFLTTAVTNSARLMEAMSEVKV	141720	161162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_142178_145557_145639_145991_146054_147636_147687_147885_147954_151912_151959_152789_152885_153184_153290_153655_153753_153975_154054_154264_154339_154658_154746_154915_155007_155255_155331_155590_155656_155789_155845_157040_157088_157684_157818_158440_158515_159013_159116_159311_159388_159494_159612_159913
871740	contig_3155_pilon	-	3302	15	Intergenic	novelGene_26343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	90.7677289142176	293	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	89	1585	201067	138424	FALSE	50	ACCTTGAAACCGAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWALKLPLADEVIESGLVQDFDASLSGIGQELGAGAYSMSDVLALPIFKQEESSLPPDNENKILPFQYVLCAATSPAVKLHDETLTYLNQGQSYEIRMLDNRKLGELPEINGKLVKSIFRVVFHDRRLQYTEHQQLEGWRWNRPGDRILDIDIPMSVGIIDPRANPTQLNTVEFLWDPAKRTSVFIQVHCISTEFTMRKHGGEKGVPFRVQIDTFKENENGEYTEHLHSASCQIKVFKPKGADRKQKTDREKMEKRTPHEKEKYQPSYETTILTECSPWPEITYVNNSPSPGFNSSHSSFSLGEGNGSPNHQPEPPPPVTDNLLPTSTPQEAQQWLHRNRFSTFTRLFTNFSGADLLKLTRDDVIQICGPADGIRLFNALKGRMVRPRLTIYVCQESLQLREQQQQQQKHEDGDSNGTFFVYHAIYLEELTAVELTEKIAQLFSISPQQISQIYKQGPTGIHVLISDEMIQNFQEEACFILDTMKAETNDSYHIILK	201155	136706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_138462_138898_138951_140758_140902_141336_141450_143143_143235_144166_144261_144644_144694_146560_146650_146905_147017_148602_148756_149824_149932_151723_151830_153295_153373_153857_154010_200945
871741	contig_10609_pilon	+	3612	11	Intergenic	novelGene_123940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	649	junction_4	296.27792695373	11	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	726	2045	422057	501496	FALSE	35	TGGCTTATCAATTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASVINGHTLCLRLLLEIADNPEVVDVKDAKGQTPLMVAVAYGHIDAVSLLLEKEAKVDAVDIMGCTALHRGIMTGHEECVQMLLEQEVSILCKDSRGRTPLHYAAARGHATWLSELLQMALSEEDCSFKDNQGYTPLHWACYNGNENCLEVLLEQKCFREFIGNPFTPLHCAIINDHESCASLLLGAIDSSIVSCRDDKGRTPLHAAAFADHVECLQLLLSHSAEVNAADNSGKTALMMAAENGQAGAVDILVNGAQADLTIKDKDLNTPLHLACSKVCKGI	421331	503063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_422149_426657_426770_477871_477944_486428_486631_490592_490681_491948_492067_493322_493540_497627_497716_498779_498864_500774_500921_501395
871742	contig_18800_pilon	+	3227	8	Intergenic	novelGene_110671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	40.5915443089784	576	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	128	1012	55057	63976	FALSE	0	GCCTGCGTGCGTGCGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFSKELLKALYWSIRSEKLEWAVDEENAARPEKARPSAPAGKMSSPLLQLAQDPTVPTYKQGILARKMHHDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMVLYFLKAEDHCPEGESLVGQMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIVRINLAAATHSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPMGPAQSSLEEQHRSHESCLDAASDDLLDLQRSLPERRGRSRDLEEYRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPTEDLDPWEEQLGREAGGTREPKPSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL	52259	66191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_52285_54546_54591_54998_55160_56373_56445_56556_56721_61003_61149_61398_61543_63718
871743	contig_1264_pilon	+	1986	13	Intergenic	novelGene_161311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAAAATGGCGGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135010	152895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_135294_136728_136923_140868_140929_141973_142036_142291_142403_143248_143427_143510_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148370_152545
871744	contig_18055_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_117799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACCCCACCGTACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39682	40240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_39700_40200
871745	contig_10930_pilon	+	1196	6	Intergenic	novelGene_37084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_3	7594.97984197457	97	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTTTTTGTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339416	342105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340055_340505_340639_340994_341625_342020
871746	contig_13780_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_149038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTAGGTTCAAATCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521067	523355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_521100_523400
871747	contig_5039_pilon	+	3771	1	Intergenic	novelGene_64755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1411	1731	112803	113123	NA	40	CAAAACGACCCAGCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQSIHASGPLKFENTTKMCVCWEWDGEDSGRRGEKSKSLSDSKLQIKGFPRAVLLAAEDILVKLNHVDGDESLWLPRCRPLSRDEGPGERLQTAPGGVSSRLLTS	111392	115163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_111400_115200
871748	contig_12270_pilon	-	359	2	Intergenic	novelGene_113789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	27	359	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14435	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
871749	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871750	contig_5316_pilon	+	4698	3	Intergenic	novelGene_61210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	321	348	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTCCCAGACAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396004	478341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052
871751	contig_8674_pilon	+	2848	3	Intergenic	novelGene_102890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	50	385	107480	107815	TRUE	35	AAAATGCAGCCACTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHYLWESCEASAEVAGMAITLNCELNQLNPFPILTRNILDLEQDNWDLVVLGDMFYDEDLADSLHGWLKKCFWTHTTQILIGDPGRPQFSGHSIQNHLHKVVEYSLPEPTRQENNGLTTSTVWDFQP	106793	110515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_106835_107471_108470_108706
871752	contig_6375_pilon	+	1299	9	Intergenic	novelGene_72965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCCCACTTGACATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202365	207695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_202486_202562_202855_203069_203254_203487_203640_204429_204529_204778_204879_205069_205190_206623_206783_207622
871754	contig_5423_pilon	-	2723	16	Intergenic	novelGene_85239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	226.169513615096	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	522	2417	532780	497362	FALSE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWAQEDQNLQELMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534604	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502736_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
871755	contig_4426_pilon	+	2799	1	Intergenic	novelGene_15375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	676	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1385	1687	168737	169039	NA	45	AAAAAGCCCAAACATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEDRPSNPLSLPIVENDPNVRRQRVSTTLRRGGLQPEPLAESWDESQDCPCLVQWEACPQITTEQSGQATRYKRTGPQPLNSETWATGPMSAIFFITF	167352	170151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_167400_170200
871756	contig_14441_pilon	+	1107	5	Intergenic	novelGene_100383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	61	921	30911	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTEVTQTPRQLVKARQQIARMDCVPIKQHVHVYWYRQKLREELKFLAYLKNEETIDGSGLPDKRFSAHCSKNSSCSMEIQSTELGDSAVYFCASSRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	30850	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_31136_111981_112040_116578_116963_117220_117344_117539
871757	contig_3424_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_55568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1021	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	13	42	301	342	1058160	1058201	NA	20	TGGCCACAAGGGGGCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRWAPVAWRCTPSCRRRARYCPRRCPPSLAPPLTTAQFLTPPSQHSYSSSPAENTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNISDWSEGISSPPTSMQSQIAHIPEAFK	1057859	1059950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1057900_1060000
871758	contig_2924_pilon	+	3764	1	Intergenic	novelGene_140276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1908	2246	244860	245198	NA	85	ACAGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELFPALCVSYEQPGKRGCPHPAPQGTGLQGKVGEALGLLPDSPQKWRTSVNWGGEGRTRIGQLLSQLSVGRSCSNSAVPKLEPASGSPGELVRNISGPHPWSFWLSKPGNF	242952	246716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_243000_246700
871760	contig_10990_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_7513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAGCACAAGACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753869	751898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751900_753900
871761	contig_16098_pilon	-	1426	10	Intergenic	novelGene_46020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1305.73547696402	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	131	745	352350	349639	TRUE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDAVPAGAGHEQWRPAALL	354119	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349692_350310_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
871762	contig_3335_pilon	-	4361	5	Intergenic	novelGene_165000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	10.0623058987491	67	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	132	893	229579	211400	FALSE	40	AAATTATTGTCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRISVCASVSFKDVAVELTQEEWQHMGPAQRTLYRDVMLENYSHLVSAGYCITKPEVIFKLERGEEPLSLEEFPSHGYRENCKADVCFKGSKRNEEKHMWEVISINNKILTREGEKILEKPFKPGTASFSSRKIRCKCNSCRISFPIVSELIISDRYSSGEKADYINICEKLHIDINNEETHAGEESYEFNTNVKGLSYKEDLSENQKFRVLEEAFEYNESEKGSYDKAACITPESSHTEGKSSKDDKFSKT	230254	207931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_211921_219737_219831_220078_220206_229558_229652_230195
871763	contig_8330_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_71955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAAAAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1505795	1503496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1503500_1505800
871764	contig_2455_pilon	-	3053	1	Intergenic	novelGene_119238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCAATGAGTTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482999	1479946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1479900_1483000
871766	contig_15899_pilon	+	2032	3	Intergenic	novelGene_128903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.5	24	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	113	523	13844	33720	FALSE	15	CGGATACCTTTATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNLGVTQGIITGIRGLCNGLGPALYGFIFYMFHVELTEMEPELNSNQAALQGAVIPGPPFLFGACIVLMSFVVALFIPEYSKASGIHKHSSSISGSLTNTPERGIEEDFEPLLQDSSIWELSSFEEPGNQCTEL	13731	35229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_13848_32671_32827_33468
871767	contig_5549_pilon	+	869	4	Intergenic	novelGene_81583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	1511.57144132265	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	62	589	82155	96749	FALSE	0	TTTGGCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82093	97029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_96620
871768	contig_14970_pilon	+	4579	3	Intergenic	novelGene_44978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	10459	junction_2	226	142	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	131	553	136145	182514	FALSE	20	TCCCAGCAGTGCAGTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASGWFQVDCLCFLGWLFATL	136014	186540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324
871769	contig_13282_pilon	+	597	2	Intergenic	novelGene_178165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	146	457	3866	96534	FALSE	35	GGAGTCAGGCACCCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRKKGKKKKQHLQPTNGTQRAARLVARNPSSRQPRVQSLRPREAEEQMNKGPEFSPARQPRPGSSLTPERSSTAPREGAKTPHAQTYPHSPAGKGKDSARNQAPEQKEGEAARGKRETKRSRKSNTSSQQTAPREPPARARGIQATIGPG	3720	96674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13282_pilon_+_3968_96324
871770	contig_6446_pilon	+	3326	1	Intergenic	novelGene_149177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATGCGAAAGCTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131293	134619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_131300_134600
871771	contig_3846_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_137143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGCCCCTTCAGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160769	158724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_158700_160800
871772	contig_6503_pilon	-	1718	9	Intergenic	novelGene_145750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	171.319146624071	605	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	122	739	134980	121820	TRUE	10	CTATAGGCTTCTTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRAVFTTLLLSPSYK	139867	118369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_121641_121858_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
871773	contig_15304_pilon	-	1146	4	Intergenic	novelGene_30672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	7	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	408	1004	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
871774	contig_9582_pilon	+	4120	26	Intergenic	novelGene_106850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_17	28.2337103477386	267	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	2168	4033	717589	723264	FALSE	10	TATGCTGCTGCCTTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRDDSDSEEEEKEEEESDVEEESDEEARDGDVDQGFREQLMAVLQAGKALGGADSEDEQEEELGDEAMMALDQSLASLFAEQKLRIQAKKDEKSKLQKENVLRRDFQIRVLDLVEVLVTKQPENPLVLELLEPLLTIIRRSMRTSSSKQEQDLLHKTARIFTHHLCRARHYCHDVGNHVEALHAQLERLVQQAGRQADSSVALYYFNASLYLLRVLKGNTANALPLKTPKKQKASAKAKVPEATSCLDLKRVTPVYSSALSSFLSKRNSPLTVPMFLSLFCRHPVLCKSLLPIMIQHVTGPVRPRQQAQACLLLQKALSMGELRPCFEHSEWEQLIGQVLAKVTENLRTLGKAEGKSEQQRELSSLELLVTLLKTIHVQKLTVDLTTILGLLQGLQPSLQQSLQQGAHSAGSNRLYDLYWQAMKFLGVQRPKSEKKDTKGIPSDTQSPISMKRKKKGFLPETKKRKKRKPEDATEQDAKPAAPGGNQPPSSGKKKRRRTKATASAQSQVNEKPAAKNPAPSTLITSPSTPATTTTSPSTPAKTPKLQKKQQKLSQVNGATLTESAGEKHQKRLPKKGVSGKSPQPTLPRKKPRLSLANGSPSLLRSGAKKKVQLKKGVKP	707491	723351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_707711_707894_707991_708710_708795_708890_708966_709083_709192_710340_710517_710826_710995_711117_711236_712655_712952_713215_713327_713992_714119_714296_714466_714552_714653_716623_716721_716828_716981_717437_717507_717585_717742_717834_718012_718121_718280_719544_719786_719972_720099_720176_720246_720967_721082_721249_721352_722406_722556_722687
871775	contig_18156_pilon	+	1865	13	Intergenic	novelGene_101447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	132.581081061951	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1040	1723	37589	64324	FALSE	45	GAACAAAACTTGTAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTAGTLNLKHPTEFTIETEGRTFQLTKDMVNVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFQVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGISHKVDDSSGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVICSLANGSITWADVEARYPLFEGQETGKKRYSGGVRTVLGTSDHLC	7349	64466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18156_pilon_+_7589_17530_17633_19319_19423_22028_22171_23411_23501_23893_23971_35598_35762_37464_37630_48928_49015_58942_59053_61696_61791_62683_62875_64162
871776	contig_3679_pilon	-	2889	6	Intergenic	novelGene_112132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGTGTGAAGCTGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094547	1079174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1079255_1084741_1084834_1086178_1086355_1089354_1089439_1092034_1094119_1094174
871777	contig_5136_pilon	+	3254	1	Intergenic	novelGene_126619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCTCAAGTTAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219678	222932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_219700_222900
871778	contig_1008_pilon	+	1857	5	Intergenic	novelGene_121604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_3	179.408751180092	353	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGGAACATTGTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750506	775556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_768733_768862_771060_771135_774631
871779	contig_11473_pilon	-	4799	1	Intergenic	novelGene_159258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1722	2063	139971	139630	NA	10	TGCCCTCAGACCTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNCHLQRITQSANYLQTCSSRYSPDSFTTSRDCSSMERLQKEPRPLWGNVRNLQVWGRMSSEKISLPWVMHRSKVKEGTAESKLGDTPKNFTQFRHTQTYKYPLVIPISNI	141692	136893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11473_pilon_-_136900_141700
871780	contig_5196_pilon	-	2880	7	Intergenic	novelGene_38675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	195.794677035806	668	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	59	1033	99661	84501	FALSE	30	TTATACTTAATTTTTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEPERPEEQDELARRCSCFMASPVTDLRELRGRPGDMKTKMELLIMETQAQVCQALAQVDGGASFSVDRWERKEGGGGISCVLQDGRVFEKAGVSVSVVHGNLSEEASKQMRSRGKMLKTKDGKLPFCAMGVSSVIHPKNPHAPTIHFNYRYFEVEEADGNKQWWFGGGCDLTPTYLNLDDAVHFHRTLKKACDQHGPDLYPKFKKWCDDYFFIAHRGERRGIGGIFFDDLDSPSKEEVFRFVQSCAQAVVPSYIPLVKKHCDDSFTPQEKLWQQLRRGRYVEFNLLYDRGTKFGLFTPGSRIESILMSLPLTARWEYMHSPSENSKEAEILEVLRHPRDWVH	99719	82653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_84589_85664_85770_90525_90745_93301_93444_94810_94922_95538_95683_99495
871781	contig_3380_pilon	+	3302	1	Intergenic	novelGene_60096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	378	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	149	607	385244	385702	NA	70	AAGAAAGAAAAAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNSQPVRLVHLPSGRGMSSISPTPGINCLNSFPVQSAFRARAGSLFVPWPLCLHSRLLSFPRKPAHGCRADPKARLEVKPTSSPFPTHPRLAHITQFQMMVSLGHLAKGASLDDLIDSCIQSFGELANCPHALKLLYYFVLPKKVLYRIAT	385095	388397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_385100_388400
871782	contig_4769_pilon	-	3527	1	Intergenic	novelGene_117956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTACCCAGGATTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391205	387678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_387700_391200
871783	contig_1516_pilon	+	2324	11	Intergenic	novelGene_49968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1080.57535137537	1	122	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	809	1690	354943	363092	FALSE	15	TGAAGCACCTGTTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335180	363726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353686_354793_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985
871784	contig_20429_pilon	+	2903	1	Intergenic	novelGene_169254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1752	2066	150749	151063	NA	60	TCACTTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPSFKEKISKFADDPKIGVRGNNEEQCNQIQKDLDCLGDWASRWQMQFSVDKCKIIILGTKNQSYSTLIRKKFVGYCRKTIETVNPVHSCSKKGKQETKLADG	148997	151900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_149000_151900
871785	contig_233_pilon	-	2259	8	Intergenic	novelGene_14688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	654	junction_6	1144.0370694722	40	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	99	1193	126907	101584	FALSE	25	CTCAGAACTCAGCACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEVSGVRYLGQHGWDFCHFSRMMTTPSVTIA	127005	100517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
871786	contig_5827_pilon	-	1695	5	Intergenic	novelGene_129795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	15.467708298258	995	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	165	494	461149	454800	FALSE	40	ATATTGCTTGAGAGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEVRVVPSAGLDPGQSGSAIRDRRSELTAPDHGSAPATRGINENTHSSVKTFTMKSEAKDGEEESLQTAFKKLRVDASGSIVSLSVGEGTSVRTSVRTTTDDAKPKTTCASKDSWHGLQIRVLTFLRLGQFENGDSTSLEEICDLSLINLRGGLQGSRHEEQ	464862	453598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_454832_454910_455018_458199_458314_461072_461190_464738
871787	contig_1301_pilon	-	1757	2	Intergenic	novelGene_47287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGTATTTTGACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244344	242535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_243619_243670
871788	contig_7728_pilon	-	5302	1	Intergenic	novelGene_64743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTCACTTAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884654	879352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_879400_884700
871789	contig_2903_pilon	-	3270	1	Intergenic	novelGene_148982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGATTTAGTATATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212545	209275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_209300_212500
871790	contig_9434_pilon	-	5418	11	Intergenic	novelGene_150497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	84.3004151828447	209	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	657	1667	321650	284964	FALSE	40	TTGTAAATGAGAGAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLAKPQPGAPSSSSSGGDQRLKEAANSVSGGGGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEVRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPVVLSTPAAKDAESAPLPSLLSDAPPEKTLPKSKRKRKCENEDDHREVKKTQTEKESASRLTASASNAVSANHCSVGISSLAIPINKNEKMLRSPVSPLSDASKHKYSNEDLNSSSRPNGNGLFTAASSNKKHKAENQLLSHAGDLAKAAHNNSENVLLHKSRPQTEPWSPVSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGNSVGSQGSLSTSSSLSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSTQLS	332339	281212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_285086_288043_288220_288413_288464_292998_293093_294704_294777_302208_302346_306109_306174_317583_317709_321479_321682_325889_326015_331839
871791	contig_10937_pilon	+	3979	9	Intergenic	novelGene_67294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	68.9401914705783	25	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	92	1078	35798	40808	TRUE	10	CCGGGTGTTGTCACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLVKRCTCLLREATCVVPAMSPAGRLRLARVAHRTLTSSATSPSSHFPASLTELVEREPVFTPYPGRQEVDWLIEKATRPEELLELIGGGHSLHQNHAAHILIQLSRLLSEKPENKASLTQDARFQQLLHLANSQITSIWHGTLVKLLRSLYALALPKTCKELRSVEQEVRWRMRRLKYKHLAFLAESSTTYMQEQDSQELLAELLVHLERRWTEIEDGRTVVAIMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELVEQFGPDDLRKVLLTLAAQNRRSVPLLRAISYHLVQKPFTLTKGTLMDLAYAYEANSTSTRPRYSSGWQPICCPTCPA	33191	45576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_33230_35744_36212_38929_39254_40254_40427_40731_42916_43276_43523_43895_44008_44133_44249_45255
871792	contig_15384_pilon	+	2603	5	Intergenic	novelGene_85116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	109.481733636255	470	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	239	1090	75617	79189	TRUE	30	AAACGGAGGCGAGTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVSVCFEGDSDGYINLVAYPYVESETVEQDDTPEREQPRRKHSRRSLHRSGSGSDHKEEKASLPLETSESSQEAKSPKMELHSHSDVPFQMLDGNSGLSSEKISHNPWSLRCHKQQLSRMRSESKDRKLYKFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMRHKHLDTGLPEVASPCGSSTSPEAGPSSPPKVDVRMIDFAHSTFKGFRDDPTVHDGPDRGYVFGLENLINIMEQMRDENQ	72008	82067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_72222_75591_75774_77964_78141_78670_79683_81047
871793	contig_14954_pilon	-	3589	11	Intergenic	novelGene_165176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_10	186.391228334383	724	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	97	2277	99611	76783	FALSE	10	CAGTCCGACTTGTGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEAVEAIVEESETFIKGKERKTYQRRREGGQEEDACHLPQNQTEGGEVVQDVNSGVQMVMMEQLDPTLLQMKTEVMEGAVAPEAEAAVDDTQIITLQVVNMEEQPINIGELQLVQVPVPVTVPVATTSVEELQGAYENEVSKEGLAESEPMICHTLPLPEGFQVVKVGANGEVETLEQGELPPQEDPSWQKDPDYQPPAKKTKKTKKSKLRYTEEGKDVDVSVYDFEEEQQEGLLSEVNAEKVVGNMKPPKPTKIKKKGVKKTFQCELCSYTCPRRSNLDRHMKSHTDERPHKCHLCGRAFRTVTLLRNHLNTHTGTRPHKCPDCDMAFVTSGELVRHRRYKHTHEKPFKCSMCDYASVEVSKLKRHIRSHTGERPFQCSLCSYASRDTYKLKRHMRTHSGEKPYECYICHARFTQSGTMKMHILQKHTENVAKFHCPHCDTVIARKSDLGVHLRKQHSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQKSHKNEKRFKCDQCDYACRQERHMIMHKRTHTGEKPYACSHCEKTFRQKQLLDMHFKRYHDPNFVPAAFVCSKCGKTFTRRNTMARHADNCAGPDGVEGENGGETKKGKRGRKRKMRSKKEDSSDSENAEPDLDDNEDEEEPAVEIEPEPEPQPVTPAPPPAKKRRGRPPGRTNQPKQTQPTAIIQVEDQNTGAIENIIVEVKKEPDAEPTEGEEEAQPAATDAPNGDLTPEMILSMMDR	130162	75470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_76965_78194_78357_83430_83567_84185_84369_85048_85210_85746_85897_86507_86629_92824_92959_98309_98481_98830_99621_130075
871794	contig_8354_pilon	+	3030	2	Intergenic	novelGene_24122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1630	1992	496283	496645	TRUE	35	GCACATTCCTCAAAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKHSKTCFTLVIIREIKIKTVMKCHFTLNQLAKILTVVNFKGCQGSEEGQCLYGAGGSVSWFNSLETNLVGFCKLNICIPYDPMMSLPGTDNGQPLAQVHQEVHIRNVHGSIVVIAKN	494653	499410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_497561_499287
871795	contig_5260_pilon	-	3771	1	Intergenic	novelGene_144376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAGAAAAATACTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303054	299283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_299300_303100
871796	contig_11846_pilon	-	3176	14	Intergenic	novelGene_105931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	87.5763065415277	1085	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	58	1530	263830	248626	TRUE	35	TTAAAATACTGGAATTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGDRGVQPAADGPDTYRSPLASRYASPEMCFVFSDRYKFRTWRQLWLWLAEAEQTLGLPITDEQIQEMKANLDNIDFKMAAEEEKRLRHDVMAHVHTFGHCCPKAAGIIHLGATSCYVGDNTDLIILRNAFDLLLPKLARVISRLADFAKERADLPTLGFTHFQPAQLTTVGKRCCLWIQDLCMDLQNLKRIRDDLRFRGVKGTTGTQASFLQLFEGDDQKVEQLDKMVTEKAGFKRAFIITGQTYTRKVDIEVLSVLASLGASVHKICTDIRLLANLKELEEPFEKQQIGSSAMPYKRNPMRSERCCSLARHLMTLIMDPLQTASVQWFERTLDDSANRRICLAEAFLTADTILNTLQNISEGLVVYPKVIERRIWQELPFMATENIIMAMVKAGGSRQDCHEKIRVLSQQAAAVVKQEGSDNDLIERIRADTYFSPIHSQLDRLLDPSSFTGRASQQVQRFLEEEVFPLLKPYESVMKVKAELYL	263887	245772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_246371_247577_248713_250677_250855_251380_251471_252081_252173_253141_253290_253421_253492_253969_254061_254607_254655_254824_254997_257438_257519_258037_258083_259908_260113_263659
871797	contig_13542_pilon	+	4214	1	Intergenic	novelGene_131475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTATTTAAATGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233944	238158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_233900_238200
871798	contig_7171_pilon	+	1638	10	Intergenic	novelGene_101351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	104.016499166072	972	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	67	1053	1321960	1328646	FALSE	35	ACAAGAGCCAACCAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGGLPGPPLWRPPDAYSRSSVRMAVPAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNKAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKMFTSGIDLMDMASVLLQPQGEDVARISWYIRNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1321893	1329231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1322012_1322446_1322655_1322799_1322889_1325399_1325525_1325604_1325654_1325844_1325910_1327718_1327790_1327883_1327956_1328211_1328363_1328541
871799	contig_6496_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_103505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTCTGTTGTGCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654767	652752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_652800_654800
871800	contig_5317_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_76644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCAAAAGAAAGAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969147	967220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_967200_969100
871801	contig_13868_pilon	-	2769	6	Intergenic	novelGene_172654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_5	50.3610960960939	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	96	845	98723	74161	FALSE	25	CTCTAAGCACTGATGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLWDARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKMKDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEAAIKFSGFDEKMFLKRGGKYVWSKADLKLDW	98818	72236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_74326_76205_76239_80320_80471_82044_82275_84692_84855_98713
871802	contig_13403_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_158097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	49	546	86554	87051	NA	35	CCTGGAACCCTGAACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVISRLLDWFRSLFWKEETELTLVGLQHSGKTTFVNVIASGQFSEDMIPTVGFNMRKVTNGNVTIKIWDVGGQPRFRSMWERYCRGVYMIDATDREKIEASQNELPNLLDQPQLQGIPVLVLVNKTHLPNASDGKQLIEKMNLSAIQDREFDAIQFLAKKRII	86505	87999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_86500_88000
871803	contig_8864_pilon	-	6967	2	Intergenic	novelGene_135997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	0	234	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	488	2842	688540	686186	FALSE	30	TCCACTTATGGTACCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVPDPLRSAKTSLIAASGKEEELGEVRSASSQHSPALLCKNTNGLSGAPTEPDLSHRAVAEALMQACEHETTQPDMSSSGIFSEVEKALPTVNSPGNTQQPGSSMPAAPAPCSAAGKDLTQAPFTMPANHCTNQAILADQLKASPSSVPEDTQVKSQRTSGGEQPEKSGCPAGDSHGSSKDQVPCDFPSQETVQGMVQTPKIATPVSSHSASPVGESEGERQQDLCDSEPRSCDSPAREFGYSENKQPFPTASDPQAVSSVAPQPSHLSSKSPTFPPDSKKVLLPAQHQGLRFKEVSTMTNQAESEIKDVTSRTRQDVEVQAVATVESRSVSTSPSILAAFLKENPAPKRFEQEQLRVICRGSGSRSHTLELSDGTLAPQEASQRYGIMPEVHVLAAGAGFTALQGESKLMSLPDEVLQASPISAASNNIQDMCKEDEKSAGMTPERKDLISKQLSGTNFGSLKANPIDQISICAGSQDEISHGLGEFQAKPSEFTVKTINGHRTDSDCKLPNSCVPAGKAGQSEKLDPTEKGGTGEQKPASPQIVKQPESAGTDTPGVNEKAEAKTLLFNPKPQESGGTELAGNPTPSSMRKNQESALEENKQTKAATSLSLPSDSMGDSSPGSGKRTPSRAVKASPRRGSRVSEFLKEQKLNVTAAAAQVGLTPGEKKKQLGADSKLQLKQSKRVRDVVWDEQGMTWEVYGASLDPESLGIAIQNHLQRQIREHEKLIKAQSSQSRRSISSDTSSNKKLKGRQHSVFQSMLQNFRRPNCCVRPAPSSVLD	761552	682060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_688655_761179
871805	contig_4388_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_161980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATACATTGTGTGAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1295082	1291243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1291200_1295100
871806	contig_13542_pilon	+	1574	8	Intergenic	novelGene_131513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_3	835.643415798477	1	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	35	817	417080	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	417045	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
871807	contig_14219_pilon	+	4901	1	Intergenic	novelGene_54341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806435	811336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_806400_811300
871808	contig_14711_pilon	+	2395	2	Intergenic	novelGene_68942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAGCAAACAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129778	136590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_132000_136416
871809	contig_11548_pilon	-	5125	1	Intergenic	novelGene_66759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGAGCAAAAATCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99206	94081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_94100_99200
871810	contig_8238_pilon	-	3773	19	Intergenic	novelGene_165239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	198.07637415906	137	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	891	2676	6	2681	437674	339742	FALSE	20	TGAAAACCTTTTTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMGVESDQEIVQMIGTEEHVMAAFGPSLEECQKAQIFTQMQALKYIGNKVRRQRMWGGGPKKTKIEEARELLASTILTHVPVKEFNFRAKCIYTAVMVRRVILAQGDNKVDDRDYYGNKRLELAGQLLSLLFEDLFKKFNSEMKKIADQVIPKQRAAQFDVVKHMRQDQITNGMVNAISTGNWSLKRFKMDRQGVTQVLSRLSYISALGMMTRISSQFEKTRKVSGPRSLQPSQWGMLCPSDTPEGEACGLVKNLALMTHITTDMEDGPIVKLASNLGVEDVNLLCGEELSYPNVFLVFLNGNILGVIRDHKKLVNTFRLMRRAGYINEFVSISTNLTDRCVYISSDGGRLCRPYIIVKKQKPAVTDKHMEELAQGYRNFEDFLHESLVEYLDVNEENDCNIALYEHTINKDTTHLEIEPFTLLGVCAGLIPYPHHNQSPRNTYQCAMGKQAMGTIGYNQRNRIDTLMYLLAYPQKPMVKTKTIELIEFEKLPAGQNATVAVMSYSGYDIEDALVLNKASLDRGFGRCLVYKNAKCTLKRYTNQTFDKVMGPMLDAATRKPIWRHEILDADGICSPGEKVENKQVLVNKSMPTVTQIPLEGSNVPQQPQYKDVPITYKGATDSYIEKVMISSNAEDAFLIKMLLRQTRRPEIGDKFSSRHGQKGVCGLIVPQEDMPFCDSGICPDIIMNPHGFPSRMTVGKLIELLAGKAGVLDGRFHYGTAFGGSKVKDVCEDLVRHGYNYLGKDYVTSGITGEPLEAYIYFGPVYYQKLKHMVLDKMHARARGPRAVLTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCLIGYGASMLLLERLMISSDAFEVDVCGQCGLLGYSGWCHYCKSSCHVSSLRIPYACKLLFQELQSMNIIPRLKLSKYNE	437679	338649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_-_339872_345423_345598_349023_349138_357450_357618_358359_358464_375912_376056_377551_377670_379378_379538_382349_382560_394171_394300_396848_396948_397512_397588_401196_401351_402609_402773_404613_404815_407906_408069_426876_427012_431161_431282_437554
871811	contig_5452_pilon	-	5019	7	Intergenic	novelGene_101017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	6.67499479816693	326	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	350	1510	463847	443315	FALSE	50	AAAAAGTAACAGTTAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSFELKPARLYVEDTFVFYVKTLFDTYLPNNTLASHPKVLSGGKQALPVQVRQHARALVNPVKLRKLVIQPVNLLVSIHASLKLYIASDHTPLSFSVFERGPVFTTARQLIHALAMHYAAGALFRAGWVVGSLEILGSPASLVRSIGNGIADFFRLPYEGLTRGPGAFVSGVSRGTTSFVKHISKGTLTSITNLATSLARNMDRLSLDEEHYNRQEEWRRQLPESLGEGLRQGLSRLGISLLGAIAGIVDQPMQNFQKTSETQASAGHKAKGVISGVGKGIMGVFTKPIGGAAELVSQTGYGILHGAGLSQLPKQRYQPSDLHADEAPNSHVKYVWKMLQSLGRPEVHMALDVVLVRGSGQEHEGCLLLTSEVLFVVSVSEDTQQQAFPITEIDCTQDSKQKNLLVVQLKQPRVACDVEVDGVRERLSEQQYNRLVDYITKTSCHLAPSCSSAQTPCPVVPVEPLPSTLKTYHYLVDPYFAQVFISKFTMVKNKALRKGFP	464196	439805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_443564_447272_447523_448163_448267_450591_450769_458357_458529_460508_460686_463813
871812	contig_8138_pilon	+	1988	5	Intergenic	novelGene_52405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	551.725475213897	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	237	689	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSLFLILQQASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280058	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288592_304952_305098_306364_306854_306940
871813	contig_12638_pilon	+	2070	11	Intergenic	novelGene_33056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCATAGCGTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13084	77499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_13305_17613_17795_19586_19992_23907_24102_26721_26826_38675_38856_39799_39966_40176_40294_40579_40754_51872_52152_77449
871814	contig_8866_pilon	-	2252	7	Intergenic	novelGene_77772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	453.453201064405	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	162	641	418087	348825	TRUE	20	GAATTTCAGATGTGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPSGTGLAEPQPTSPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKRSTPQNPLEKWRVATPQSRKKMRKRERRGVAFLRQSATLRLALPSWRPVARP	418248	340768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348982_352434_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
871815	contig_10930_pilon	+	1417	5	Intergenic	novelGene_37098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_3	7083.95666276975	87	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTGTGTTTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339420	342108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340505_341625_342020
871816	contig_13760_pilon	-	2847	1	Intergenic	novelGene_61359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATACCCCAGCATCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376344	373497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_373500_376300
871817	contig_5286_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_157336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATACACGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498984	501103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_499000_501100
871818	contig_14030_pilon	-	3005	4	Intergenic	novelGene_62227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	774	junction_1	470.668319166126	18	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTTAAACTTGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345316	335773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193
871819	contig_12326_pilon	-	5393	9	Intergenic	novelGene_177634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_8	15.9275704361965	108	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	343	1251	99683	66872	FALSE	35	TGCTATAACATTAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIIHKNGYSEQECMEFKAVIYSNTLQSILSIVKAMTTLQIDYVYPTSAEGQRQLCAIANTLEDGGMTPELAEIIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITAPGYVPNEQDVLHSRVKTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCASLSAYDMVLVEDEEVNRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDLFQEKVTKVPLSVCFPEYTGPNTFEDAGNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF	158163	62729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12326_pilon_-_67063_69104_69259_69433_69564_83244_83374_87907_88066_96230_96373_99678_99722_152605_152636_157889
871820	contig_8286_pilon	+	4740	1	Intergenic	novelGene_139804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGGGAGAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181025	185765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_181000_185800
871821	contig_5039_pilon	+	2932	2	Intergenic	novelGene_64861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350142	353173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_351596_351694
871822	contig_11978_pilon	+	2756	10	Intergenic	novelGene_62792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_8	59.5317116447866	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	141	1052	299759	556660	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAGDDGRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGMEDIIRGAQELDNIIKQGYLEKKSKDHSFFGSEWQKRWCVVSRGLFYYYANEKSKQPKGTFLIKGYSVRMAPHLRRDSKKESCFELTSQDRRSYEFTASNPAEARDWVDQISFLLKDLSSLTIPYEEEEEEEEEEEMYDDIDGFDTPNSGSQCRPIILPGSMGIKESAEEEEEEDIYEVLPDEEHNLDEDESGTRRKGGMRAL	299618	558364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907_380025_539032_539111_540004_540089_542949_543075_545621_545686_547581_547777_556592
871823	contig_8907_pilon	+	3450	20	Intergenic	novelGene_85784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_12	79.969246166323	411	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	265	2241	42324	106640	FALSE	35	TTAAGAAACTATGTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFTKEDSQCNGFCKACEKAGFKCTVTKEPQAVLSCFLDKHHDIIIIDHRHPRQLDADALCRSVRSSKLSENTVIVGVVRRGDREESSVMPLIAAGFTRRYVENPSIMACYNELIQLEYGEVRSQLKLRACNSVFTALEKSQEAVEITSEDHIIQYANPAFETTMGYQSGELIGKELAEVPINEKKADLLDTINSYIRIGKEWQGIYCTKKKNGDNIQQNVKIIPVIGQGGKIRHYVSIIRVCNGNNKAEKIAECVQSDSLTDTQTGKLIKDRRKDSLDVRSLSTRSSEVASQRRHSSLARIHSMTIDAPITKVINIINAAQESSPMPVTEALDRVLEILRTTELYSPQFGAKDDDPHANDLVGGLMCDGLRRLSGNDYVLSPKNLHQVSNRIINSISLHDIPPRIARIMENEEFWDFDIFDLESATHKRPLIYLGLKIFARFGICEFLNCSESTLRSWLQIIETNYHSSNPYHNSTHAADVLHATAYFLSKERIKQTLDPVDEVAALLAATIHDVDHPGRTNSFLCNAGSELAILYNDTAVLESHHAALGFQLTIRDDKCNIFKNMERNDYRMLRQGIIDMVLATEMTKHFEHVNKFVNSINKPLALLEENRETDKDQEAINTMLRTPENRILIKRMLIKCADVSNPCRPLEFCIEWAARISEEYFSQTDEEKRKGLPVVMPVFDRNTCSIPKSQISFIDYFITDMFDSWDAFVDLPDLMQNLDNNFKYWRGLDEMKLRSLRPPPQ	32521	107849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_32704_41407_41465_42298_42354_50984_51074_55029_55109_56710_56849_65216_65306_67123_67176_67275_67319_76622_76704_81163_81235_81509_81675_83087_83137_83309_83446_84958_85158_88793_89012_90860_90994_95958_96127_103602_103733_106533
871824	contig_20176_pilon	-	4488	1	Intergenic	novelGene_172710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACTACTCTCATTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64501	60013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_-_60000_64500
871825	contig_12964_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_131685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGAAGTAACGCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414095	415793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_414100_415800
871827	contig_8153_pilon	-	1837	7	Intergenic	novelGene_34795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	902	1210	29119	27107	TRUE	50	ACTTACCTATATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTLLLYQCWIINCKIWSHRWKAKHSNNGCNYICYNKTAIVIILQSVWSSYPHFVSCTKSEAVCLSRKKVAHCTLYFRALVNFSGFIFFHRRHFHTIIGNR	38151	26392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_26996_27082_27404_29107_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001
871828	scaffold_12124_pilon	-	656	2	Intergenic	novelGene_22136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	347	655	942777	942469	FALSE	30	CCAACATGTACTCCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERYLSKPDNATLQMLRSPTIAVVLPAVYSLVALISIPGNLLSLWVLCRHIGPRSPSIIFMINLSLTDLALALVLPFQIHYHCNRHHWVFGVLLCNVVTVAFY	987384	942467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_942805_987065
871829	contig_20375_pilon	+	3818	3	Intergenic	novelGene_105829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	179.5	499	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2055	2435	56254	56634	FALSE	15	TCTTTCTGACTTGGAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHLTCCPGCCRNCSRKLFRAMLPDKVWRLVLSALLRITSIKRDETRFSQLLSRFEALELCAAASYPLGLEHLASRSWLSGQICRLMHGLHPFLSILCPELCVVCGILCCGCPEVLLVTNVTESIL	43309	58017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_44904_46452_46553_55893
871830	contig_15325_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_157188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGACTTCAGGTTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97459	95695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_95700_97500
871831	contig_6364_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_51767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1009	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCGAAGAATGGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902059	931466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_903076_904266_904362_906461_906559_929808_929896_931215
871832	contig_12270_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_113285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	27	374	14409	13839	FALSE	20	AGCTGCTGGTACCACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGYAAY	14435	13838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
871833	contig_9871_pilon	-	2667	2	Intergenic	novelGene_75713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTTTCTGCCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585171	581415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_581817_582905
871834	contig_15752_pilon	-	4166	16	Intergenic	novelGene_148764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	22.8589880207618	82	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	82	1563	224640	203804	FALSE	25	TTTAGCGTCTCAGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLTALFRDSTQSHEESLSVLRSSNEFMRYAVSVALQKVQQLKEAGHVSGADGQNPDKVFQNLCDITRVLLWRYTSIPTSVEESGKKEKGKSISLLCLEGLQKIFDAVQQFYQPKIWQFLRALDVTDNEGEEAEVSVTQRATFQIRQFQRSLLNLLSSQEEDFNSKEALLLVSVLSSLSKLLEPSSPQFLQMLSWTSKICKENSLEDASFCKGLMNLLFSLHVLYKSPVSLLRDLSQDIHGQLGDIDQDIEVEKTNHFAMVNLRTAAPTVCLLVLSQAEKVLEEVDWLITKLKGQVSQEIISEEASSQAVPPNHPIEKAIIIQLGTLLTFFHELVQTALPSGSCVDTLLKDLCKMYTILTALVKYYLQVCRSSRGIPKNMEKLVKLSGSHLTPLCYSFISYVQNKKSNSLKSAGEKKKEKTAAVATAMAKVLRETKPIPNLIFAIEQYEKFLIHLSKRSKVNLMQHMKLSTSRDFKIRGNILDMVLQEEEENEEGTASEHGGQNEEPAKKKRKKETKCLS	225386	201200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_203885_204924_205027_205331_205428_207282_207358_211251_211312_211390_211445_212805_212994_213265_213360_213508_213578_213675_213804_214639_214692_218173_218291_219203_219281_219616_219784_224518_224699_225363
871835	contig_7718_pilon	+	2500	9	Intergenic	novelGene_129408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	76.9151318012262	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	557	1258	257538	284723	FALSE	35	GTGAATAAATGACTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGLLPPGLNESDVELNSEDEATSENSRLHFQEAKEDQMTRNTEISDFPTDGQKTETEANVNAYEECPSGISLHMWNKFQELHKKHSEQKTSTSGFRRKKRNRSRKGKLKNEETSCSEQSSNETQWKELTEYFGVNDRFDPPVKKKKIDKSGLEKSIDQAVEEWNIEKAEELSNHLATRELGVKIAKAIACHNFVKAKKEAENSQVVRKKKKLAWGFEAKKRWETKSNMGYM	252900	285965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_253384_254870_254936_257529_257772_258338_258427_258566_258598_258778_258879_271227_271318_284258_284366_284671
871836	contig_5628_pilon	-	4995	13	Intergenic	novelGene_157561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	34.6725756182029	118	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	140	1657	148866	73956	FALSE	75	AAAATAAATTATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASENSKQFWKRNAKLPGSIQPVYGAQHPPLDPRLTKNFIKERSKVSGVPLKNKKTSSFHEFARNTSDAWDIGDDEEEDFSSPSFQTLNSKVALATAAQVLENHSKLRVKPERSQSTTSDVPASYKVIKSSSDAQLSRNSSDTCLRNPLHKQQSLPLRPIIPLVARISDQNASGAPPMTVREKTRLEKFRQLLSSHSTDLDELRKCSWPGVPREVRPVTWRLLSGYLPANTERRKLTLQRKREEYFGFIEQYYDSRNEEHHQDTYRQIHIDIPRTNPLIPLFQQPLVQEIFERILFIWAIRHPASGYVQGINDLVTPFFVVFLSEYVEEDVENFDVTNLSQDMLRSIEADSFWCMSKLLDGIQDNYTFAQPGIQKKVKALEELVSRIDEQVHNHFRRYEVEYLQFAFRWMNNLLMRELPLRCTIRLWDTYQSEPEGFSHFHLYVCAAFLIKWRKEILDEEDFQGLLMLLQNLPTIHWGNEEIGLLLAEAYRLKYMFADAPNHYRR	149005	70617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_74085_93238_93335_93633_93762_96071_96148_96640_96748_112100_112216_115583_115650_117062_117192_118881_118953_119488_119669_124821_125130_133412_133470_148810
871837	contig_2596_pilon	+	2734	16	Intergenic	novelGene_53463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	52.9181338379283	41	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	190	984	644605	652900	TRUE	15	TCCATGTGTATGAGTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLDLLCYYGDQEPPADYHFQQTEKSKELEEATEEENEKSGKSGHQHGSTWRGKNNVERIFALMPEKNARSYCTVIRGMHRANEQALNLYTELLNNRLTADVYTFNALIEATALTGNDKFEEKWNKIQELLKHMVAQKVKPNLQTFNTILKCLRRFHIIGRVPALHTLREMKAIGIEPSLATYHYLIQLFYPTESSSKMSSLIIYDIMNELTGKKFSAKDLEDDMFFQSAMRVCSSLRDLELAYQVHDLLNTGDNRTFLGPAQRRHFYYYKFFNLLCLMEQIDVTLKWYKDLIPSVFFPRSQTLIDLLQALDVANRLEMIPQIWKVI	640921	656994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_641009_642805_642874_644570_644653_645004_645066_645334_645421_646135_646281_647122_647174_649069_649160_649452_649482_650907_651015_651657_651737_651829_651921_652892_653770_655372_655415_655821_655981_656314
871838	contig_6661_pilon	-	5545	1	Intergenic	novelGene_174110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATGGTATACTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399626	394081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_-_394100_399600
871839	contig_15970_pilon	-	4519	1	Intergenic	novelGene_144043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGATTAACCATCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135823	131304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_131300_135800
871840	contig_935_pilon	-	2670	7	Intergenic	novelGene_45508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	40.8968893139265	211	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	221	1174	27171	19993	FALSE	25	AGCATCCCTTTAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDCIKTIVCQERKKDPIEMFCSGRLVKVCAPMVRYSKLAFRTLVRKYNCDLCYTPMIVAADFVRSLKARDSEFTTNQGDCPLIVQFAANDARLLSDAARIVYPYANGIDINCGCPQRWAMAEGYGACLINKPELIQDMVKQVRNEVENPRFSISIKIRIHDDLTRTVDLCRKAEATGVSWITVHGRTVEERHQPVHYDAIKIIKENMSIPVIANGDIRTLKEAENVWQITGTNGVMVARGLLANPAMFDGYEETPLRCIWDWVDIALELGTPYMCFHQHLMYMMEKITSRQEKRIFNALSSTSAVLDYLTNHYGI	32233	18496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_20241_21260_21488_22450_22574_23645_23764_26040_26163_27055_27193_32034
871841	contig_6589_pilon	+	850	4	Intergenic	novelGene_25958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	14235	junction_2	3315.92383641254	1144	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	200	727	1296229	1297418	FALSE	40	CAAGCCTGGACCAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQIRQNYSSEAEGNVNLLVNLHLKASYTYLSLGYYFDRDDVALEGVEHFFRELAKEKREGAERLLKLQNQRGGRAVFQDVPKPPAKEWNGILDAMEAALALEKSLNQALLDLHAVATAHTDPHLCDFLENHFLDEEVKLLKKMGDHLTNVRRVASPQAGLGEYLFERLTLKHD	1296029	1297541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1296331_1296493_1296641_1296969_1297096_1297265
871842	contig_15859_pilon	-	4151	6	Intergenic	novelGene_50183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	64.517904491699	171	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	339	2672	328269	290069	FALSE	30	TCAACATCATTTGCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLAKALYDNPPDCADELAFCKGDILTILEQNVPESEGWWKCVLHGREGLAPANRLQVLTEAPADRPGPHLLGGLEAAPTSSEEAYWVASRLSPPPPGPVYEHMRSWVGAPPPSTAQVYEFPDPPPSARIVCERTLSLHKQTLLTLPRPTRASLPALPSQLYDVPTQSSVLLAVKMPEKQQLYDIPPSPQKAGPRPPVGQASKHSAPPVSPMVGRRSYSTLPNPQKSEWIYDAPVSPEKVSMRNMPLSSMYEEARPHSPPKLVPAFHGPSLDSSPSSLNQQLYKNVSRQKTLRLPEIPAYGLQAPRNTDALDEGVHYKVPSSFLIPHVEQQNTKPNIYDIPKAMANVPWGVRDLKKAGGATEPCVDHSSSWCSRPATSTSPEPDTLVVASSDSRRASMVSSCSSMSTDSSSSSSSEESAKELSVDLNVAKETVTALQHKVAGAVADLMLFVSRNWRFREYLEANIDKVHRAVDHVEESLREFLDFARWVQQTACHLTDSNLQARFKDQLQTISCSYQTLLETKESLDSCRWSLEILVTDKVQNSPDDLERFVMVARMVPEDIKRFASMVIANGRLLFKQNCEKEETLQLTPNAEFRLKKCIQLPQKENESHQRSSPFNKQKENGHSPELVKKNGTNVCGQNPGSLIPQPLSQQNLEKKIHLSEHCRLYFGALFKAIGVLTSSLSNGQPPETFITQSKLVILAGQKLVDTLCQETQERDARNEILGCSSHLCSLLRKLALATRDAVLQYPSPEALQHLQAEAKKLEQHTRQLRESLE	328607	288589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_290480_293331_294646_295993_296075_298689_298792_305615_306039_328266
871844	contig_4068_pilon	-	2955	24	Intergenic	novelGene_161694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_11	45.4522329709068	158	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2787	168	2954	113659	24675	FALSE	65	AAAAAGAAAAGAAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIFGFGSKKGESPLGSSTSPRRDSAGVGRENSKSVNSQPGYHIRDKDLGKIHKAASVGNVAKVQQILLLGKNGLNDRDKTNRTALHLACANGHPEVVTLLVERKCQLNVCDSENRTALIKAVQCQEEECATILLEHGADPNLMDVNGNTALHYAACGQNISIAAKLLSHNANIEARNKNDLTPLLLAVSENKQQMVEFLVKKEANIHAVDKAKSNRQLISEYKEEKRPKNSSQNNNPDIEIQESPRQISRRTESRKVDESSDEDSSSRLSKKPGVDDSWPTSDDEDLDLGIQNVAKPNLTKLITASQQSRKNIEEKPSIVRPEKRTLFEDSNSDSEDEDVVETLPKPSFTVQGFSHPAFPPSDPPLKPSLNFSAVPGVTKEGAAKPAVGKRENSIDIIESAPREQRNNDNLTYIDGAHKNNRSDMMSALGLGEEEDVESPWDSESVSESLAQKYVGHFSGATDEKGENIVNGQIEDSPEKYPHLKPIQPIIEMKDSTPDKAAERKDVQTSKSDLSAELDLEMTSEEERERLDERENNRPQVEEERKKFKSSELEVTENTYDPAIDNGANGFIKQGKSGKSDNQQFCIKENDDSDSSDPALHMKKVKKYDSKKWTSEESAITSVLQKANSLTGVLQVNDDSSLSEIDQDEGRPAKKTSDEESKVQKQINSMNDLDDLSQSSETASEDCALPNSNYKNSMLLIEQLGMDCKDSVSLLKIQDAILSYERLVELKKNHCELLTGKIKKMENKVSGLQKELSETKEIKSQLEHQKVEWEREICGLRFTLKQEEEKRRNADMLYEKIREQLRRKEEQYSKEVGMKQQLELTLRTLDMELRTVRNNLNQVVEERNDTQRQLSREQNARMLQDGILTSHLSKRKEIEMAQKKMMQNSEVSNSHEKEKDLLHKHHMLQDEIAMLTLEIDALKNQNQ	113826	24673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_24786_26537_26682_27264_27449_28917_29132_34322_34465_34756_34791_37125_37294_42831_42996_61062_61146_78188_78271_78366_78396_80957_81052_83468_83531_83831_83962_85997_86201_86292_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102902_108099_108274_109188_109304_113408
871845	contig_546_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_117216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGACAGACTTATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123559	126458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_123600_126500
871846	contig_20561_pilon	+	4053	1	Intergenic	novelGene_166365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAACAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45188	49241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_45200_49200
871847	contig_8138_pilon	-	2026	5	Intergenic	novelGene_52413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCACGCACGCCCGGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307938	280073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280347_288496_288615_304971_305096_306362_306622_306686
871848	contig_4845_pilon	+	2870	23	Intergenic	novelGene_53603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	86	junction_1	80.7033774012398	180	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	921	2763	106	2868	96050	138051	FALSE	25	TATCCTCCAGCAATTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDDSEWMKLPVDQKCEHKLWKARLSGYEEALKIFQKIKDEKSPEWSKYLGLIKKFVTDSNAVVQLKGLEAALVYVENAHVAGKTTGEVVSGVVSKVFNQPKAKAKELGIEICLMYIEIEKGEAVQEELLKGLDNKNPKIIVACIETLRKALSEFGSKIILLKPIIKVLPKLFESREKAVRDEAKLIAVEIYRWIRDALRPPLQNINSVQLKELEEEWVKQPTGAPKPTRFLRSQQELETKLEQQQSAGGDAEGGGDDGDEVPQIDAYELLEAVEILSKLPKDFYDKIEAKKWQERKEALEAVEVLVKNPKLEAGDYADLVKALKKVVGKDTNVMLVALAAKCLTGLAVGLRKKFGQYAGHVVPTILEKFKEKKPQVVQALQEAIDAIFLTTTLQNISEDVLAVMDNKNPTIKQQTSLFIARSFRHCTASTLPKSLLKPFCAALLKHINDSALEVRDAAFEALGTALKVVGEKAVNPFLADVDKLKLDKIKECSEKVELVHGKKAGLAADKKESKPVPGRSATSGAAGDKDMKDTSAPKPGPLKKAPATKTGGPPKKGKPAAPGGAGSTGTKNKKGLDTKEIVEPELSIEVCEEKASAVLPPTCIQLLDSSNWKERLACMEEFQKAVELMDRTEMPCQALVRMLAKKPGWKETNFQVMQMKLHIVALIAQKGNFSKTSAQIVLDGLVDKIGDVKCGNNAKEAMTAIAEASMLPWTAEQVMSMAFSQKNPKNQSETLNWLSNAIKEFGFSGLNVKAFISNVKTALAATNPAVRTSAITLLGVMYLYVGPSLRMFFEDEKPALLSQIDAEFEKMQGQSPPAPTRGISKHSTSTTDEGEEGDEPDEGGNDVVDLLPRAEISDKITSELVSKIGDKNWKIRKEGLDEVASIINEAKFIQPNIGELPTALKGRLNDSNKILVQQTL	71919	138053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_71988_96012_96107_100721_100916_102411_102619_105993_106166_106782_106916_107302_107404_109208_109323_114009_114115_117137_117228_117336_117502_118028_118158_119060_119244_122500_122615_122950_123062_124090_124184_125004_125191_125645_125741_128066_128125_128213_128340_128972_129113_137068_137244_138036
871849	contig_6325_pilon	-	2417	4	Intergenic	novelGene_143348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_3	106.780147967682	43	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	40	345	182776	128779	FALSE	75	ACCAAACAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQ	182815	126706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_128892_130009_130129_182201_182263_182763
871850	contig_10451_pilon	+	2522	7	Intergenic	novelGene_138299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	155.209177850051	888	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	182	898	103898	144661	TRUE	10	GTGTGCTTTGGCGTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQGLDWLLVPLQQLVSWGAAGAMVFGGVVPYIPQYQDIRRTQNADGFSTYVCLVLLLANILRILFWFGRHFESPLLWQSIIMILTMLLMLRLCTEVRVTNELNLKRRSFADFDLHHFWRWSSFSDYVQCVLAFSGVAGYVTYLCIDSTLFVETLGFLAVFTEAMLGVPQLCRNHRHRSTEGMSLSSDLIHQLLQPCEPAACGLTCQFGFVSPCSHVGREKPTPNQWIWDLLASATV	103380	153687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_103439_103774_104101_111508_111643_140302_140520_144498_144679_151800_151879_152158
871851	contig_5620_pilon	+	1769	10	Intergenic	novelGene_161326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCTCGTTCAGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77585	275752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_78235_80125_80432_81291_81464_95465_95603_116706_116765_162316_162398_179620_179697_189281_189368_214183_214310_275674
871852	contig_7816_pilon	-	1128	7	Intergenic	novelGene_66540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	290.024951033911	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	12	467	253065	249270	TRUE	50	AAAAAAGGACCACAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECTMVEKRVLALAWENPFLTHLFCTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEILCGLQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQ	253076	245743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246313_249177_249273_250053_250135_250283_250423_251947_252011_252582_252675_252987
871853	contig_9976_pilon	+	2317	13	Intergenic	novelGene_147903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	42.8689864587443	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	39	1250	15748	41085	TRUE	20	GGACAGTGTAGTTTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDVDTRKIIKAMLSYVWPEDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLGFHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVTLVSGVLYYKCGAQFALVTLGTLGAYTAFTVAITRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNEKYEAQRYDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSIGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTRIKDKAMAPPLLITPQTATVAFDNVHFEYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGNLKRVTFTLLVKIYKM	15709	57397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_15832_35332_35466_36345_36615_37643_37733_37824_37913_38811_38987_39936_40095_40674_40839_41033_41127_45612_45785_48336_48441_53683_53792_56755
871854	contig_9424_pilon	-	381	3	Intergenic	novelGene_143789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4531	junction_2	355	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	8	343	279584	277512	FALSE	15	CTTATGGTCTGAGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	279591	277473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552
871855	contig_10109_pilon	-	5361	1	Intergenic	novelGene_131344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTTTTGATAGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360256	354895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_354900_360300
871856	contig_3277_pilon	+	2186	9	Intergenic	novelGene_74715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	727.135035172285	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	536	1243	258281	265230	FALSE	30	TCCAGGTTGGAAATTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPR	188668	266173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618_263687_265054
871857	contig_6544_pilon	-	4333	1	Intergenic	novelGene_142077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGGAATGATAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66035	61702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_61700_66000
871858	contig_5643_pilon	+	3444	5	Intergenic	novelGene_38760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	158.490338822276	68	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	115	705	157978	159523	TRUE	20	TCCTCTGAGGCAAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEAWCLLLCLALSRAAEAKPPLTERQWRAVDVVLDCFLVKDGGHRGTLASNENRAKALLVLRQVPVLDDGSLEGFTDFQGGTLAKDDPPVIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEMSRYFLQARQDDTLETAAWFITNVQVSGGGPSISMVMKTFGDAKMGAVWHPTLNLPLSPQGTVRTAGEKMKSR	157863	163729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_158042_158841_159073_159227_161747_163000_163085_163297
871859	contig_15400_pilon	+	3938	3	Intergenic	novelGene_175704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_2	18	223	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	126	2537	25428	35564	FALSE	25	TATACATTTTTAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQTQRWCVSEISKGVDLLIEANSTYLIYFFYYISILLQAKVMITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKVEFNNRCAVPWDILKASMNVSSDRGAPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRPLTLSKSKVLLSSSGCSADVDSNKQSLPYPQPGLESASIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFALIITYVPYFLTYITLEIDCSIDVQAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVRNSQDKVELRLFMLNGLPDNVFELTEIEVLSLELIPEVKLPSTVSQLVNLKELHVSHSSLVVDHPALVFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEHLSTMQMEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLKENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLYLDHNNIENLPLQLFLCTKLYYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMSLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRSCLIVEEKLLNTLPLPVTERLQTCLDKC	22337	36965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15400_pilon_+_22437_25401_27567_35291
871860	contig_2730_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_135385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAACAATTTGCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333481	335029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_333500_335000
871861	contig_13456_pilon	-	1343	2	Intergenic	novelGene_153262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTCACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30503	15913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_17064_30310
871862	contig_7457_pilon	+	2395	4	Intergenic	novelGene_31467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAGGCTCCTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497685	512907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_499082_505783_505953_506246_506367_512197
871863	contig_10126_pilon	-	1526	2	Intergenic	novelGene_105755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165445	163757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_163997_164158
871864	contig_1154_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_87118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACGTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427142	430097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_427100_430100
871865	contig_11413_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_103173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	57	410	426305	425952	NA	15	ATGTCTACTGGGCAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISKLGNTEISTPKGCSVVHVAQVSSPGRTAFSGSLAHGTFQQSCEQTPGEYSTPVNASTLALAKPVKGPYCQIILADPGPSQPALLPLLYLLTTPSLQLLPPPAKALAPSCHRHN	426361	424353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_424400_426400
871866	contig_6403_pilon	+	5617	3	Intergenic	novelGene_139893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	657	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	1104300	1104626	TRUE	30	ATGAAGCTGCCAGCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRGSSVTAFGLEFGNPVFVETWGCQLSPEASTSLCLVFSPSHAGWGGLCGHFYPVHRYPIAVHFLSPIFTQAYAEPSSLPAAADSPKTSGAFLRAWLRKTASGQPALG	1104299	1136975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_+_1108555_1117200_1118343_1136755
871867	contig_10599_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_49876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGACTGCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127348	125529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_125500_127300
871868	contig_6230_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_102114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTCACATTATATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173376	170959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_171000_173400
871869	contig_12603_pilon	+	2619	7	Intergenic	novelGene_105807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCGATTTACTTTCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618148	628006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_618624_619319_619471_621987_622096_623812_623954_625011_625142_626301_627266_627356
871871	contig_5515_pilon	-	1172	4	Intergenic	novelGene_52323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.565175405668	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACAGTGTCTCCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99312	65881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_65941_68214_69069_89073_89139_99118
871872	contig_1008_pilon	+	1763	4	Intergenic	novelGene_121593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_2	80.3589170879969	363	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACATTGTTGCATATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750397	775561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_768733_768862_771060_771135_774631
871873	contig_3817_pilon	+	2392	3	Intergenic	novelGene_78366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	100	504	632491	638773	FALSE	30	TTTAAATGTTGGTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKIAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNILLYEAQDGRGPDNALLEATGGAAGRSHHLDEDEERERERIERVRRIHIKRPDDRAHLHQ	630809	640661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_630850_632431_632671_638548
871874	contig_13245_pilon	+	1114	2	Intergenic	novelGene_148812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	470	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	257	355	25673	25771	TRUE	20	GCGAGGGCAAGCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPTDNKFIKIVDLGISNGDFNLYPRLNTDGSDLLNDLRRTVQVNESLVDSHLETIPGLRTFATRSFPRSDSQSLQQKTKPTIYSFMLIFRKSAKPLLSNPQIYHHSSLHRGFQILPI	25416	26823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_+_26456_26748
871875	contig_15991_pilon	-	1010	6	Intergenic	novelGene_70925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3078.58314164162	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	35	595	105108	101267	TRUE	45	GAAATAAACATCGATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKCCWRCPFSNLDSCRERTRLV	105142	100397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101330_102024_102271_103583_103703_104975
871876	contig_6576_pilon	-	2152	10	Intergenic	novelGene_42275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_8	361.866696689319	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	839	2071	337927	322526	FALSE	20	TTAAGGCTTCATTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	338765	322444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921
871877	contig_5640_pilon	+	3349	8	Intergenic	novelGene_27296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1228	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1815	2279	1280097	1280561	TRUE	10	CCCCCTACTTCCGCCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKFTTQTVTESFITTRGNQRMLEATSGSCGSTGCVFRGRGQQVGTPSITSGQSPHQQVCLAWGRLAGLQLVTCFVCVCVCVCGSRSSVVLSSLPPGQNKGHEARTRGNNSCTDTALNGNKIRPITSLRAFHPDHKTRGRRQHWALLDSCSFR	1278282	1328336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1280785_1287165_1287223_1292659_1292809_1296423_1296460_1301984_1302099_1308667_1308729_1326858_1327222_1328269
871879	contig_9955_pilon	-	2509	6	Intergenic	novelGene_21331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	555	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAGCCGCCTCACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85037	67810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_67858_69952_70058_71904_73644_75467_75561_78448_78510_84573
871880	contig_6191_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_107839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTCATACTGGATGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131591	133067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_131600_133100
871881	contig_5758_pilon	-	4455	1	Intergenic	novelGene_119064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGAACTATGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77505	73050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_73000_77500
871882	contig_10863_pilon	-	2442	1	Intergenic	novelGene_59333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	638	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	873	1202	82186	81857	NA	60	CTGCTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKPEKVKKEFYCTKSVKASLQFTGILIQPGVTNNRMQEYRQSLHRVSAQCFGKTYSCQVKGRSDLRPVMHPGIWVTSSSTRTPQMSVTCCQGAHGARVIDFSDRKGT	83058	80616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_80600_83100
871883	contig_5602_pilon	-	4979	1	Intergenic	novelGene_132996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACGCTCCCAGCACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84962	79983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_80000_85000
871884	contig_15952_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_154058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTTAGGATTTACAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242098	241226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_241200_242100
871885	contig_16532_pilon	+	2396	13	Intergenic	novelGene_110035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	260.566836702004	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	534	1667	148487	185084	FALSE	10	TTTGGTGGATATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHSLMSMVEICFSLGNGVVIHLPGLFEEAEKNVQKGKGLEGWEKRLIISDRAHIVFDFHQAADGIQEQQRQEQAGKNLGTTKKGIGPVYSSKAARSGLRMCDLVSDFGGFSERFKVLANQYKSIYPTLEIDIEGELQKLKGYMEKIKPMVRDGVYFLYEALHGPPKKILVEGANAALLDIDFGTYPFVTSSNCTVGGVCTGLGMPPQNVGEVYGVVKAYTTRVGIGAFPTEQDNDIGELLQTRGREFGVTTGRKRRCGWLDLVLLRYAHMINGFTALALTKLDILDMFTEIKVGVAYKLDGEIIPHFPANQEVLNKVEVQYKTLPGWNTDISNARTFKELPVNAQNYVRFIEDELQIQVKWIGVGKSRESMIQLF	137827	185813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_138276_148401_148505_149514_149615_151217_151269_167915_167983_168227_168336_169389_169472_172265_172393_173580_173736_174902_175028_176253_176352_183467_183618_185031
871886	contig_8415_pilon	-	2216	12	Intergenic	novelGene_141695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTAGCGGCCGCCTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261401	232002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_-_232740_238825_238994_241140_241282_244867_245037_246302_246382_249578_249694_250515_250573_253232_253352_255462_255575_256796_256865_260792_260881_261038
871887	contig_16098_pilon	-	1244	9	Intergenic	novelGene_46004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1526.83045882639	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	189	1121	352277	348413	FALSE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTCGSHRPPGTVASVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354104	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350374_352231_352352_353990
871888	contig_12270_pilon	-	362	2	Intergenic	novelGene_113620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	27	362	14409	13851	FALSE	15	TATGCTGCTTATAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14435	13850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
871889	contig_10629_pilon	-	5511	28	Intergenic	novelGene_52931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	77	junction_27	228.399314608386	412	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1088	3267	20	3286	383003	344145	FALSE	55	ATTTCAAAGGCAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLTDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLVGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVHNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLKAALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQDHMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGVNSNDMMS	383022	341919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_344239_345250_345379_345999_346099_347062_347224_350140_350280_350502_350718_351177_351261_353159_353268_354225_354315_356287_356395_357347_357457_357911_357973_359037_359122_360253_360328_360849_360986_363537_363644_364297_364492_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372183_372258_372880_373047_374990_375096_377674_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
871890	contig_12654_pilon	-	1652	12	Intergenic	novelGene_129298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_9	455.774284429373	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	354	1061	764461	759069	FALSE	35	TGAACAGAAGTACTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788158	758477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_771768_771860_775941_775989_788041
871891	contig_1735_pilon	-	2911	8	Intergenic	novelGene_106883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACTCTGCACTCACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139782	126155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_126318_127267_127633_131561_131841_132234_132487_134144_134424_136628_136760_137648_137757_138447
871892	contig_8476_pilon	+	4360	1	Intergenic	novelGene_121331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGCCCCACAGCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103781	108141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_103800_108100
871893	contig_8017_pilon	+	3846	6	Intergenic	novelGene_65386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	97.7281944988241	520	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	226	2202	1626720	1651625	FALSE	30	GTTCTGGTAATTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMETTESEPDCVVQPPSPTDDFSCQMRLSEKITPLKTCFKKKPDQKRLGTGTLRSLRPILNTLLESGSLDEVFRPRNQSADESSLHESIVKKPLEINTPCPPTENSMSVLIPDGTSVGGQIPEAHPSADAPEQVVPIQGHSFPPETISGTVADSTAGHFQTDLLHPVSSDVPSSPDCIDKVMDYVPGVFQDNSFTIQYILDTSDKLSTELFQDKSEEASLDLVFELVNQLQYHTHQENGIEICMDFLQGTCIYGRDCLKHHTVLPYHWQIKRTTTQKWQSVSNDSQEHLERFYCNPENDRMRMKYGGREFWADLNAMNVYETTDFDQLRRLSTPPSSNVNSVYHTVWKYFCRDHFGWREYPESVIRLIEEANSRGLKEVRFVMWSHHYTLHNSFFRREIKKRPLFRSCFILLPYLQTLGGVPTQAPPPLEATSSSQIICPDGVTSANFYPETWVYMHPSQDFIQVPVSAEDKSYRIIYNLFHKTVPEFKYRILQILRVQNQFLWEKYKRKKEYMNRKMFGRDRIINERHLFHGTSQDVVDGICKHNFDPRVCGKHATMFGQGSYFAKKASYSHNFSKKSSKGVHFMFLAKVLTGRYTMGSHGMRRPPPVNPGCVTSDLYDSCVDNFFEPQIFVIFNDDQSYPYFVIQYEEVSNTVSI	1623775	1653269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1623960_1626678_1627640_1643821_1643991_1645275_1645437_1650265_1650545_1651177
871894	contig_6062_pilon	+	2489	3	Intergenic	novelGene_5266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34	12	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGTATCACCATCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660729	768429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999_662651_766883
871895	contig_4838_pilon	+	2660	4	Intergenic	novelGene_144784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	80.0791275343748	97	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	261	683	217868	241269	FALSE	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRWLIGGGREPQGLAEKSPLQTIGEEQTQNPYTELIVLKAHHDIVRFLVQLDDYRFASAGDDGIVIVWNAQTGEKLLELSGHTQKITAIIAFPSLESCEEKNQVILTASADRTVIISLNLEESEIAVVTQGATTYVINL	217607	243246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_217919_222263_222380_239648_239698_241062
871896	contig_12299_pilon	+	2424	1	Intergenic	novelGene_29747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAATGGAAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290202	292626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_290200_292600
871897	contig_7285_pilon	+	2403	11	Intergenic	novelGene_143381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	187.483759296639	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	80	1195	218772	324708	TRUE	45	AAAACAAAAGGTGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVDPFSFLLPPRVLPQRRGDYTAVGMPQLSGGGGGGGGDPELCATDEMIPFKDEGDPQKEKIFAEISHPEEEGDLADIKSSLVNESEIIPASNGHEVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	218692	343308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_218985_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_342106
871898	contig_3612_pilon	-	3454	8	Intergenic	novelGene_87813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	173.313447315574	17	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	10	375	881794	878879	TRUE	55	GTTCTTAAAGGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARTVLLPAARRWLRGFTERILVGGAAGRSLYFGGSRLRSTQAAAQVVLNVPETRVTCLENGLRVASEDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGHQKEIPVRSGT	881803	868775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_871307_872192_872337_872981_873095_874616_874816_878786_878917_879315_879404_880323_880465_881695
871899	contig_10475_pilon	-	3586	3	Intergenic	novelGene_148747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.5	159	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	162	389	266553	266326	TRUE	70	CTGAAAAACAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVCAAPRAPPVHRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGM	268737	261657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_264497_265967_266556_268578
871900	contig_5959_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_150191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1891	2295	212323	211919	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPVSPRAGLKEREIPLERNSIYVMNVENTSVRAQPLFFIKEFTVGRSPTDVLSAGKHSAEVPSLCNTRESILEKNLINVLNAGKPLARILGSLIIRESILGRNLMNVFSVGNRIVKAQIFLDIREDTMQKNF	214213	211897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_211900_214200
871901	contig_2799_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_85598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACCCTCCAAAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786312	784411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_784400_786300
871902	contig_12917_pilon	-	4446	16	Intergenic	novelGene_162887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_8	40.7274954900113	291	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	156	2681	71750	19664	FALSE	15	TCGTAATGCCGATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFSDLPVENVTIAVNMSTSLPETEVHGLNSTSDPPSMSVTRLFPALLECFGIVLCGYIAGRANVITSTQAKGLGNFVSRFALPALLFKNMVVLNFSNVDWSFLYSILIAKATVFVIVCVLTLLVASPNSRFSKAGLFPIFATQSNDFALGYPIVEALYQTTYPEYLQYIYLVAPISLMMLNPIGFIFCEIQKWKDSQNASQNKVKIVGLGLLRVLQNPIVFMVFIGIAFNFILDKKVPEYMENFLDGLANSFSGSALFYLGVTMVGKIKKLKKSAFVVLILLITAKLLVLPLLCREMVEILDKSNSGVNHTSLSNYAFLYGVFPVAPGVAIFATQFNMEVEIITSGMVISTVVSAPIMYVSAWLLTFPTMDPKPLAYAIQNVSFDISIISLVSLIWSLAVLLLSKKYKQLPHMLTTNLLIAQSIVCAGMMIWNFVKEKNFVGQILVFVLLYSSLYSTYLWTGLLAVSLFLLKKREMVQIPVGIIIISGWGIPAFLVGVLLITGKHNGDSIDSAFFYGKEQMITTAVTLFCSILIASISLMCMNRTTQARLYEGFDQSQNHKAAEPGNTASEESPVPISEPELFTSSIAERRYCSCSMGNGELHCPSAEPVADTSTSRAVTPSFEKNDHCVSRCNSPSCILAQEEEQYLQSGDQQLTRHVLLCLLLIIGLFANLSSCLWWLFNQEPGRLYVELQFFCAVFNFGQGFISFGIFGLDKHLIILPFKRRLEFLWNNKETTENRNSPVPEEIKMTCQQFIHYHRDLCIRNIVKQRRCGAKTSAGTFCGCDLVNWLIEVGLASDRGEAVIYGDRLVQGGVIQHITNEYEFRDEYLFYRFLQKNPE	75543	17898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_-_19872_22680_22819_37537_37603_39690_39787_42252_42390_43854_43960_47173_47385_48208_48300_48395_48481_57058_57177_57809_57894_59386_59543_60611_60778_62818_63219_71284_71782_75419
871903	contig_6048_pilon	-	2388	17	Intergenic	novelGene_73279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.570021814368	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	37	1875	2006298	1979135	TRUE	20	TTTGCCTGAGATTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQVNSPGRRRFMSNMGDSNVDTSATVSEAVTEEMSLFSMMDVILFSLIVGLLSYWFMFRKRKDEVPVFTKIQPATSSVTESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMAADPEEYDLADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYKTKTDRVNKGVATSWLRAKEPVEENGHQALVPIFVRKSQFRLPFKASTPVIMVGPGTGIAPFIGFIQERAWLKQQGKDVGETVLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHKDGALTQLNVAFSREQAHKRSMCSTY	2049038	1978451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978766_1978832_1978968_1979070_1979159_1979236_1979383_1979459_1979731_1980040_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1985881_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
871904	contig_7356_pilon	+	3030	1	Intergenic	novelGene_60347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCCAAAACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74583	77613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_74600_77600
871905	contig_7333_pilon	-	2856	3	Intergenic	novelGene_142739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	45662	45363	TRUE	10	AAGCGGGCGGTTGCGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVAQSPLRPSSCDFFSGLRFPLIFITKFELHKNSEEQLVATHLTNVYLLHCSRESPAITTDDCSVCFFWPPVITLKQQSQFQQQPVHFEIFAWILDSF	45662	27624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_27916_40197_40261_43160
871906	contig_366_pilon	-	3597	1	Intergenic	novelGene_51561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTAAGCAGCCAGGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640447	636850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_636800_640400
871907	contig_12958_pilon	-	2301	9	Intergenic	novelGene_136191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	207.496347859426	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	51	1694	65705	39829	FALSE	20	CCTATGAGGTACCTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGRNPKIQNSNLPRECIRHFFPKRRCFVFDRPTSDKNLLAHVEELPEEQLDCNFQMQAKNFCSYIFTHAKTKTLRQGIIVTGNRLGTLVETYVDAINSGAVPCLENAVTTLAQRENSAAVQKATDHYSKQMAQCLRLPTDTLQELLEVHAVCEREAITIFMEHSFKDENQEFQKQLMCTIEKKKEDFVLQNEEASEKYCQAELKQISEPLMETISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKVEQDYERLPRKGVKANEVLKSFLQSQVAVEESILQSDRALTDGEKAIAAERAKTEAAEKEKELLKQKQEEQQQKMEAQERSFKKNMEQLKEKMERERENLLQEQTMMLEHKLKVQEELLREGFEKKSEELNKEINQLKEEIETINKKRSGFSQFLDEAGNVLLVALPGAGKLFGAGMKLLSSHIK	65755	39221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_40048_40927_41122_41468_41572_50899_51113_52404_52686_61224_61471_63129_63327_63529_63640_65624
871908	contig_12624_pilon	+	2870	4	Intergenic	novelGene_61025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_2	758.972258313101	273	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	86	592	855587	858440	FALSE	15	GACCTGTGTATATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERYPNNSVFNEVYGKNLTTNSKAELNPSMVPQETSLYSLFEGTPWSPSLPASSDHSTPASQSPHSSNPSSLPSSPPTHNHNSVPFSNFGPIGTPDNRDRRIADRWKTDKPAMGGFGIDYLSATSSSESSWHSASTPSGTWAGHGPSMEDSSAVLMESLKSIWSSSMMHPGPSALEQLLMQQKQKQQRGQGNMNPPH	855501	860718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_855663_857295_857467_857585_857732_858326
871909	contig_7895_pilon	+	2185	8	Intergenic	novelGene_154455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	75.8018361739802	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	99	782	725295	781677	FALSE	30	AGGAATGGTCTATTCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRQRASSQRKPARIPSGKAGAESGFLMEVCVDSVESAVNAERGGAGRIELCSGLLEGGTTPSMGVLQVVKQCVQIPVFVMIRPRGGDFLYSDREIEVMKTDIRLAKLYGADGLVFGALTEDGHIDKELCMSLVAFDMVHDPVAALETLLTLGFERVLTSGCDSSALEGLPLIKRLIDQAKDRIVVMPGGGITDRNLQRILEGSGATEFHCSARSARDSGMKFRKRE	725196	783080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725356_728162_728235_731583_731644_736187_736398_739538_739673_744310_744339_759397_759504_781664
871910	contig_2450_pilon	+	4085	15	Intergenic	novelGene_160309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	38.9995421218543	201	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	18	1571	736867	772263	FALSE	10	TGTACTGTGCCTGTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPGAMALSELALLRWVQESRHSRKLILFIVFIALLLDNMLLTVVVPIIPSYLYSIEHEKNATETQTAKPGRMASTTGSFQSIFSYYDNSTMVTGNTTGGPELGQLHKTTTQHMVTNTSTAPSDCPKEDQDLLNENVQVGLLFASKATVQLLTNPFIGLLTNRIGYPIPMFAGFCIMFISTIMFAFSRSYALLLIARSLQGIGSSCSSVAGMGMLASVYTDDQERGNAMGIALGGLAMGVLVGPTFGSVLYEFVGKTAPFLVLATLVLLDGAIQIFVLQPSRVQPESQKGTPITTLLQDPYILIAAGSICFANMGIAMLEPALPIWMMETMCSRKWQLGVAFLPASISYLIGTNIFGILAHKMGRWLCALLGMIIVGVSILCIPFAKNIYGLIAPNFGVGFAIGMVDSSMMPIMGYLVDLRHVSVYGSVYAIADVAFCMGYAIGPSAGGAVAKAIGFPWLMTIIGIIDILFAPLCFFLRSPPAKEEKMAILMDHNCPIKTKMYTQNNIQSYPIGDDEESESD	736849	774777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_736988_738459_738812_747647_747707_747980_748065_748350_748444_749604_749695_749798_749843_749911_749973_752664_752761_761060_761140_761521_761574_762212_762277_763972_764093_764225_764360_772158
871911	contig_2311_pilon	+	4659	1	Intergenic	novelGene_169812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGATGCTCAATAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263247	267906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_263200_267900
871912	contig_11815_pilon	-	3954	1	Intergenic	novelGene_50924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTTCTTGCCCCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274748	270794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_270800_274700
871914	contig_20199_pilon	-	1050	4	Intergenic	novelGene_82580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	414.835978296108	14	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	109	381	43987	42004	TRUE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMSTT	44095	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42014_42164_42347_43906
871915	contig_20199_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_82537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	119	421	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44105	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906
871916	contig_1532_pilon	-	1137	3	Intergenic	novelGene_37419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1963.5	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	21	437	15867	13070	FALSE	35	AGGTAATAATGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSTRSSSSSGTTKPRASSFMEDSAPPKPCISLSEQDHLTV	15887	12369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13187_13352_13518_15732
871917	contig_11224_pilon	+	1996	3	Intergenic	novelGene_124453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	135.5	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTATTAAACTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19414	22137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_19520_20211_20814_20848
871918	contig_2078_pilon	-	3133	1	Intergenic	novelGene_100148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	195	566	306745	306374	NA	35	GGCACCATAGACAGATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSPIPLPESSSLPSSTLFWPISITHPDGSHSPLHRQMLPRSKVAFFWSAGLLTTQMTWVLTWLRGRLRLTILELGVGSCVPLFSRCPGRPLPNQVTVRFSVAPGVPHSRVKLHQPDVLDDE	306939	303806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_303800_306900
871919	contig_6102_pilon	+	403	3	Intergenic	novelGene_31817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360235	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
871920	contig_6102_pilon	+	873	2	Intergenic	novelGene_31802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12747	junction_1	0	2555	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360615_360864
871921	contig_6102_pilon	+	407	3	Intergenic	novelGene_31818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCTGTTATGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360235	361225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
871922	contig_6102_pilon	+	382	2	Intergenic	novelGene_31819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12747	junction_1	0	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360589	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360615_360864
871923	contig_6102_pilon	+	821	2	Intergenic	novelGene_31811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12747	junction_1	0	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCTTGTCTGTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360150	361221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360615_360864
871924	contig_15732_pilon	+	2888	1	Intergenic	novelGene_88861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67103	69991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_67100_70000
871925	contig_10466_pilon	+	2735	10	Intergenic	novelGene_173616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_5	64.3531920990197	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2616	120	2735	50216	80542	FALSE	15	GCATCTCTCTTGAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDSAMELLFLDTFKHPSAEQSSHIDVVRFPCVVYINEVRVIPPGVRAHSSLPDSRAYGETSPHTFQLDLFFNNVSKPSAPVFDRLGSLEYDENTSIIFRPNSKVNTDGLVLRGWYNCLTLAIYGSVDRVISHDRDSPPPPPPPPPPPQPQPNLKRNPKHADGEKEDQFNGSPPRPQPRGPRTPPGPPPPDDDEDDPIPVSVSGDKEEDAPHREDYFEPISPDRNSVPQEGQYSDEGEVEEEQQEEGDDDEDDVDVEEEEDEDEDDRHTVDSIPEEEEEDEEEEGEEDEEGEGDDGYEQISSDEDGIADLERETFKYPNFDVEYTAEDLASVPPMTYDPYDRELVPLLYFSCPYKTTFEIEVSRMKDQGPDKENSGAIEASVKLTELLDLYREDRGAKWVTALEEIPSLIIKGLSYLQLKNTKQDSLVQLIDWTMQALNLQVALRQPIALNVRQLKAGTKLVSSLAECGTQGVMGLLQAGVISGLFELLFADHVSSSLKLNAFKALDSVISMTEGMEAFLRGRQNEKSGYQKLLELILLDQTVRVVTAGSAILQKCHFYEILSEIKRLGDHLAEKTSSVPNHSEPDHDTDAGLERTNPEYENEVEASMDMDLLESSNISEGEIEKLINLLEEVFHLMETAPHTMVQPPVKSFPTMARITGPPERDDPYPVLFRYLHSHHFLELVTLLLSIPVTSAHPGVLQATKDVLKFLAQSQKGLLFFMSEYEATNLLIRALCHLYDQDEDEGLQSDGVIDDAFALWLQDSTQTLQCITELFSHFQRCTASEETDHSDLLGTLHNLYLITFNPVGRSAVGHVFSLEKNLQSLITLMEYYSKEALGDSKSKKSVAYNYACILILVVVQSSSDVQMLEQHA	50096	80542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_50279_59272_59389_63282_63370_64890_64940_66402_66572_68814_68938_70440_70714_74613_75755_78890_79383_80439
871926	contig_8310_pilon	+	2526	4	Intergenic	novelGene_75610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	185.733381191666	53	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCAGCCTGTGCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315900	327842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_316759_317718_317833_325628_326914_327573
871927	contig_6975_pilon	-	2709	1	Intergenic	novelGene_74289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAGGCTCAAAGTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408278	405569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_405600_408300
871928	contig_9682_pilon	+	2986	1	Intergenic	novelGene_125302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTCATGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30156	33142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_30200_33100
871929	contig_8934_pilon	-	2602	17	Intergenic	novelGene_167243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACCCGGATACAGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848831	628890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_629314_630044_630156_652763_652909_686643_686804_691862_691975_700517_700656_709476_709624_710266_710539_710852_710959_712063_712160_714020_714125_716252_716386_718987_719157_741219_741270_741397_741518_783537_783661_848638
871930	contig_5968_pilon	-	1250	8	Intergenic	novelGene_112179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_7	235.192322518038	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	14	1072	732362	622680	FALSE	15	TGCTCACTGGTTTCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAGQINTYCQNIKEFTAQNLGKLFMAQALQEYNS	732375	622501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_622778_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
871931	contig_5988_pilon	-	1469	8	Intergenic	novelGene_16055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_7	47.3312254009886	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	448	1371	1050018	1046251	FALSE	35	CATGGTAAGGGGGGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDSQGLLDSTLMASGAASRSEDEESLAGQKRASSQALGTIPKRRSSSRFIKRKKFDDELVESSLAKSSTRAKGASGVEPGRCSGSEPSSSEKKKVSKAPSTPVPPSPAPAPGLTKRVKKSKQPLQVTKDLGRWKPADDLLLINAVLQTNDLTSVHLGVKFSCRFTLREVQERWYALLYDPVISKLACQAMRQLHPEAIAAIQSKALFSKAEEQLLSKVGSTSQPTLETFQDLLHRHPDAFYLARTAKALQAHWQLMKQYYLLEDQTGNWPQELAEAGLHVYACMFVRASVRVYEVIWARLSSSAL	1052935	1046152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1046509_1046787_1046897_1047862_1047973_1048107_1048267_1048858_1048998_1049351_1049491_1050008_1050129_1052598
871932	contig_10904_pilon	-	2629	7	Intergenic	novelGene_22526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	245.788979049554	8	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	210	929	389774	352021	TRUE	20	GGACATCTTTAACCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTDLTASQGNNECLLELDLLILTVSCRIFTLSSMENSSRTR	396185	348583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_350113_350832_350938_351954_352140_388756_389054_389359_389651_389761_389798_395999
871933	contig_9461_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_178166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGGATGGCTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37224	35092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9461_pilon_-_35100_37200
871934	contig_13702_pilon	-	2676	9	Intergenic	novelGene_102608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	120.865563230392	487	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	416	1294	151513	144255	FALSE	10	TTGGCATGTAGGTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAALVENSQVICEVWASNLEEEMRKIREIVLSYSYIAMDTEFPGVVVRPIGEFRSSIDYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFTNEKGEYPSGINTWQFNFKFNLTEDMYSQDSIDLLANSGLQFQKHEEEGIDTLHFAELLMTSGVVLCDNVKWLSFHSGYDFGYMVKLLTDSRLPEEEHEFFHILNLFFPSIYDVKYLMKSCKNLKGGLQEVADQLDLQRIGRQHQAGSDSLLTGMAFFRMKELFFEDSIDDAKYCGRLYGLGTGVAQKQNEDVDSAQEKMSILAIINNMQQ	158864	142872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_144405_145835_145947_146644_146790_147360_147523_150195_150390_151396_151549_152566_152640_157337_157448_158667
871935	contig_12270_pilon	-	365	2	Intergenic	novelGene_113503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	27	365	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14435	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
871936	contig_11498_pilon	+	4431	1	Intergenic	novelGene_65525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	564	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCCCGCTTTGGGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241004	245435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_241000_245400
871937	SIRV1	-	1124	3	ISM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	2644	0	2644	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	38	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGAATCGATGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7722	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552
871938	contig_10861_pilon	-	5200	4	Intergenic	novelGene_39370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	8.2192186706253	168	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4272	4604	1641252	1640920	FALSE	20	GAGAACTGGCCGTGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLLPCTKHVRSSLVPRVMLCKTFVAWTLPAPQPRHSVPSPLLSASTHHLPFGPFLLVLPPHLHPPAPNTCSLFPFIGRVVKGRLPGFESQLCHFLQSSTVTSGKFLPS	1648985	1640323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1645107_1647289_1647387_1647494_1647631_1648801
871939	contig_12425_pilon	+	1533	6	Intergenic	novelGene_46652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	180.445448820412	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	38	1342	173715	198400	FALSE	25	CAACTTGGTACTTCTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGGRLRAPLGSMEEKPYAEPAILMAAAACSTKAMSLFKRTFALSPAAVPRGAGLGTPPRGCPYPPSAWPSKDWLRGEGSCGLLRSPTTAGRLPLPHSCSSTSPSSVCLLCPQDSLSNSLKTCYTYLNQTSRSFAAVIQGLDGEMRHAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPMLHNFHSYLYEPDWRFMESKQKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIVDICRKMGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	173677	198591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_174116_175556_175741_179208_179338_181626_181819_186767_186945_198178
871940	contig_2867_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_135250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCCTATGTGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286424	1285020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1285000_1286400
871941	contig_10711_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_118438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACTCACAAGGAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798254	800191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_798300_800200
871942	contig_1443_pilon	-	2031	10	Intergenic	novelGene_28385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	31.0141345713511	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	86	1789	1052337	1036946	FALSE	40	TTTTAAGGGTCCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGSYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVGVKGNPQGFNQGLDCDVIVAEVRSTSHKPDEIYGMIERLSPGTRKIELFGRPHNVQPNWITLGNQLDGIHLLDPDVVARFKQRYPDGIISKPKNL	1052422	1036703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1038263_1038886_1039075_1039300_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
871943	contig_15449_pilon	+	2505	2	Intergenic	novelGene_33626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1972	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62216	87182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788
871944	contig_2770_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_107410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	856	1317	169727	170188	NA	70	AAAAATAAAAAACAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVVAIPFETEAVLLPMFLESSASASWFLGLLAAQSSCPHLPCWGKCSKLCSSTDKCLEAPYSARKPPAHRHSALSLRGLAPVLSGAGLLLLLLPFLCCCRFSAVAGSLLLLLEVCAISGVQPSSFPSESSIHSQFQNRFHILGFG	168871	171082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_168900_171100
871945	contig_12886_pilon	+	2893	24	Intergenic	novelGene_135450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGTGAGGCACCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228593	483489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_229187_235297_235383_239325_239450_240137_240258_240515_240630_241878_241998_243643_243784_255196_255329_258972_259060_259811_259883_265912_266071_268274_268405_271026_271128_279558_279642_282916_282971_283783_283872_307007_307106_308666_308879_309225_309260_310477_310526_315020_315055_375623_375711_479087_479122_483342
871946	contig_8138_pilon	+	1746	6	Intergenic	novelGene_52402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	2240	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	377	859	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	279918	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306848_307346
871947	contig_5791_pilon	-	3031	3	Intergenic	novelGene_35872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90	36	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	101	1000	1090654	1088048	FALSE	50	TTTGGGAAAAAAAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIFLSNLMKSTNMSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGKKLNLITTKNIQYILHCKF	1094378	1086016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1088943_1090649_1090729_1094352
871948	contig_7182_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_117092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTGGTAATTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92468	90860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_90900_92500
871950	contig_9053_pilon	+	5071	1	Intergenic	novelGene_87920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATTAGCCCCTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74730	79801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_74700_79800
871951	contig_1443_pilon	-	2232	11	Intergenic	novelGene_28381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	26.0123047806226	156	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	208	1950	1052337	1036946	FALSE	50	AAAATATTCAAATGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTWSSIQAHKKQLDSLRERLQRRRKQDSGHLDLRNPEAALSPTFRSDSPVPTVPTSGGLKPSTASAVPELATDPELEKKLLHHLSDLALTLPTDAMSIRLAISTPDAPATQDGVESLLQKFAAQELIEVKRGLLQDEAHPTLVTYADHSKLSAMMGAVAEKKGPGEVAGTISGQKRRAEQDSTTVAAFASSLASGLASSVSEPTKEPAKKSRKHAASDVDLEIESLLNQQSTKEQQSKKVSQEILELLNTTTAKEQSIVEKFRSRGRAQVQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQWICCDIRYLDVSILGKFAVVMADPPWDIHMELPYGTLTDDEMRRLNIPVLQDDGFLFLWVTGRAMELGRECLNLWGYERVDEIIWVKTNQLQRIIRTGRTGHWLNHGKEHCLVGVKGNPQGFNQGLDCDVIVAEVRSTSHKPDEIYGMIERLSPGTRKIELFGRPHNVQPNWITLGNQLDGIHLLDPDVVARFKQRYPDGIISKPKNL	1052544	1036663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1037799_1037966_1038033_1038153_1038263_1038441_1038481_1038886_1039075_1039300_1039518_1040152_1040329_1041265_1041671_1041753_1041972_1052237
871952	contig_5039_pilon	-	3673	2	Intergenic	novelGene_64785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	167	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1335	1757	147608	147186	TRUE	20	GGGGTGGGGAATGAGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRLWSLLITCPKYMRQSLTILAFKEYSGCISYMTDLFVLLAVHSTFNILRQHHNLKAPILLWSSLFMKYYSAIKRNDILMHATTLMNLENIRLSERSQSQKDKDCMVSFIRNKQIHRNQSCLVVTRGGREKKGEASA	148942	144489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_146238_147017
871953	contig_14514_pilon	+	1595	2	Intergenic	novelGene_137462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_1	0	10	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTGTTTCTTCGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30104	36330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_30203_34833
871954	contig_6710_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_94680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653357	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
871955	contig_14868_pilon	-	3172	1	Intergenic	novelGene_150451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTGGTTCCATTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180580	177408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_177400_180600
871956	contig_7963_pilon	+	2241	12	Intergenic	novelGene_58553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	163.745064905761	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	498	2147	247365	253116	FALSE	20	TTATCACTGGTAGGGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246230	253210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246415_246568_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
871957	contig_4131_pilon	+	2716	7	Intergenic	novelGene_127866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_6	8.05536398239638	180	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	63	1151	198401	209649	FALSE	30	GTAACTGAATTAATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFPAQSGLEREGTTRRPSREMGAGARPALLLLMLLRAVAPQGRRPRSHSLRYLFMGASEPDLGLPLFEALGYVDDRLFVSYDHESRHANLRPLWVWNGASSQLRLQLSQNLKGWDHMFTVDLWTIMDNHNHSTESHTLQVILGCEVQEDNSTWGFWKYGYDGQDHLEFCPETLDWRAAEPGAQATKLEWEVNKIRAKQNRAYLERDCPEQLRQLLELGRGVLDQQVPPSLVKVTHHVTSEVTTLRCQALNFLPQNITMRWLKDKQPLDAKEVEPMDMLPNGDGTYQGWMAVAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLTATWEPSSPGTLVIGIISGIAVCVIIFFIGILFKILKKRHVSRRTMGDYVLAEVNLTQMKGKQQKTTY	198338	211214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_198477_203961_204226_204434_204711_205538_205818_205954_206069_207966_208000_209602
871958	contig_9516_pilon	-	2814	10	Intergenic	novelGene_106147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	35.9117574199266	315	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	276	1370	627217	597114	FALSE	15	TGCAAACTGCCTGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVMVVRKKVTRKWEKLPGRNTFCCDGRVMMARQKGIFYLTLFLILGTCTLFFAFECRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAVPQGQRPPPRIKNFQINNQIVKLKYCYTCKIFRPPRASHCSICDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTVLEVLICFFTLWSVVGLTGFHTFLVALNQTTNEDIKGSWTGKNRVQNPYSHGNIVKNCCEVLCGPLPPSVLDRRGILPLEESGSRPPSTQETSSSLLPQSPVPTEHLSSNEMPEETSTPEEIPPPEPPEPPQEVAEAEK	629741	595669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_597231_600556_600654_601051_601156_601801_601905_602620_602670_603803_603942_609228_609388_617435_617597_627050_627353_629601
871959	contig_15866_pilon	-	4441	1	Intergenic	novelGene_63611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATCTCAAAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370789	366348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_366300_370800
871960	contig_15304_pilon	-	1038	3	Intergenic	novelGene_30570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	25	TCGAATAAACTCCGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
871961	contig_1735_pilon	+	2122	8	Intergenic	novelGene_106890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	587.679073880933	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	73	1503	126256	137764	TRUE	10	CAACCTGTCCGGCTCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSK	126183	139775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137778_139169
871962	SIRV6	+	637	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	237	6	125	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGAAATTTAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
871963	SIRV6	+	627	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	252	1	110	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTAGATTGCGTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
871965	contig_12724_pilon	-	3436	4	Intergenic	novelGene_146861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	30.9443945740671	240	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	174	734	245098	205366	FALSE	15	GTTACGATGTATCTTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRPAAEAAAGARRGRKCRERRGPTAGLVDREHPALASAGRGEARTDPQPTPETPPRSMWKLSKSKVLLGSAPEEEEGLREGKPPPPPAAAAAAQVQGASFRGWKEVTSLFNRDDEQHLLERCKSPKSKGPNLRLKEELKTEKKSGFWDSLVLKQNSQSKKPDEIEGWEPPKIALEDAAADSSDTMSDQLSWPGWEDDTKGSTKYTTLASSGNSSRWSIKSAGKLVSIRRQSKGNLTDNWEELE	245481	202663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_205712_206961_207066_244987_245194_245403
871966	contig_366_pilon	-	2019	10	Intergenic	novelGene_51589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	604	junction_1	379.446217663011	4	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	154	1167	803057	757099	FALSE	35	TTTCTGTAAGGAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803210	756246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
871968	contig_9239_pilon	-	3233	1	Intergenic	novelGene_137175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1200	1499	167970	167671	NA	15	CCAAACTTTCTGTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALQFNRFTPTPRRFLFQGSSKGYTTTTGCVSNSLLQQTIFFKRKKDGFWVHRVWMHQHLFFISVTAELPLSQAVGLYQLIANLGGIFYRIMKITST	169169	165936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_165900_169200
871969	contig_10734_pilon	+	2450	4	Intergenic	novelGene_51164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.556349186104	16	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	302	823	999344	1000258	TRUE	40	GGAAAGAAAGCATCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDKHVKIKRAIRFITVVTIVFVICFLPSVVVRISIFWLLHTVGVQDCSLYRSVDLAFYVTLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPNFFSSMINRCLRKSTGLKMAMFPTFPLSRVRGIEKPIGTCDSLASLLHLPETWMVLSSWGNI	998696	1012133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_998844_999189_999723_1000115_1000686_1010933
871970	contig_7379_pilon	-	2731	2	Intergenic	novelGene_150035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	377	junction_1	0	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1695	2042	549865	547830	FALSE	25	TCCCAGAATATGTTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRVSTICLGKNYFIVSFFLYIYTHKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKVRCLT	551559	547140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_548008_549695
871971	contig_16999_pilon	+	3394	4	Intergenic	novelGene_85010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_3	96.0428145267631	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	41	544	224249	231112	FALSE	25	TGGCTCAGCAATATTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIGKKLL	224208	233962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_224291_224437_224618_229831_229977_230975
871972	contig_15498_pilon	-	5777	31	Intergenic	novelGene_42699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_20	133.168085098829	471	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1622	4869	49	4917	1040372	855089	FALSE	60	TTAAAAGAAAGTAAAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNAGPTTLVYPQAPQTMNSQPQTRSPFFQRPQIQPPRATIPNSSPSIRPGAQTPTAVYQANQHIMMVNHLPMPYPVPQGPQYCIPQYRHSGPPYVGPPQQYPVQPPGPGPFYPGPGPGDFPNAYGTPFYPSQPVYQSAPIIVPTQQQPPPAKREKKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGGGSRNPTPPIGRPISTPTPPQLPSQVPEHSPVVYGTVESVHLAASTPVTAASDQKQEEKPKPDPVLKSPSPVLRLVLSGEKKEQAGQTSELTAVESTPELPLPVSPTTVSPIARNTIASPISAALSSQPIFTTAVDDRCELSSPKEDTFPIPSPTSCTETSDPSPTDEIDDDICKKPCSVAPNDIPLISSTDLINEINGVGEKLPATESIVEIVKQEVLPLTLELEILENPPEEMKVECTPAPITPSTVPSFSPSPPTPPASPPPTPVIVPAAATTISTSSAPTTVQGVLEEDESVRTCFNEDGKEIPNKTEAEADGQTEETMDSQSLNSRKSPVPAQTAITAPKTWKKPKDRTRTTEEVLEAELEPKAEEELSGDKVLESEQDKVNQGFHPERDPSDLKKVKTVEENGEDAEPVRNGSESVSEGEGIDANSGSTDSSGDGATFPFKPESWKPADTEGKKQYDREFLLDFQFMPACIQKPEGLPPISDVVLDKINQPKLPMRTLDPRILPRGPDFTPAFADFGRQTPGGRGVPICKVQSRHGLPILEQGKALACTPLAMSHPPLKSLPLGVLNVASRRSQPSQRREPRKIITVSVKEDVHLKKAENAWKPSQKRDSQAEDPENIKTQELFRKVRSILNKLTPQMFNQLMKQVSGLTVDTEERLKGVIDLVFEKAIDEPSFSVAYANMCRCLVTLKVPMADKPGNTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKADDDVFEKKQKELEAASAPEERARLHDELEEAKDKARRRSIGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIVKERKTSSRIRFMLQDVIDLRLCNWVSRRADQGPKTIEQIHKEAKIEEQEEQRKVQQLMTKEKRRPGIQRVDESGWNTVQGAKNSRVLDPSKFLKITKPTIDEKIQLVPKAQLGSWGKGSSGGAKASETDVLRSSASSLNRFSALQPPAPSGSTSSTPLEFDSRRTLTSRGSMGREKNDKPLPPATARPNTFMRGGSSKDLLDNQSQEEQRREMLETVKQLTGGMDVERSITEADRNKTRESVAKPEIPATSAPDKPALSEEEMERKSKSIIDEFLHINDFKEAMQCVEELNAQGLLYVFVRVGVESTLERSQITRDHMGQLLYQLVQSEKLSKQEFFKGFSETLELADDMAIDIPHIWLYLAELVTPMLKEGGISMRELIIEFSKPLLPVGRTGVLLSEILHLLCKQMSHKKVGALWREADLSWKDFLPEEEDVHNFLLEQKLDFIESDSSCSSEALSKKELTAEELYKRLEKLIIEDKANDEQIFDWVEANLDECQMSSPTFLRALMTAVCKAAIIADCSTFRVDTAVIKQRVPILLKYLDSDTEKELQALYALQASIVKLDQPANLLRMFFDCLYDEEVISEDAFYKWESSKDPAEQNGKGVALKSVTAFFTWLREAEEESEDN	1040420	854228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_855271_857436_857584_859060_859143_863564_863712_866822_866922_869007_869090_872608_872735_887688_887862_892621_892741_893709_893931_895504_895623_896630_896725_900269_900365_904153_904287_905643_905749_909052_909290_909682_909830_924896_925095_937392_937564_942568_942680_943062_943183_944805_944940_947590_947838_953500_953590_984377_985218_993386_993493_1011552_1011676_1014077_1014176_1022100_1022216_1022805_1022986_1040342
871973	contig_6847_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_143884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTGATTGACCTAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114720	113484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_113500_114700
871974	contig_3588_pilon	+	2926	1	Intergenic	novelGene_72886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1047	1349	125850	126152	NA	25	ACTTATGGTGACCCCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLLKLEIKYQGLWRKWESSKEIGSCFIRSMGITAVYRQLSSYGQIFGCVFLHFYTKTCTMHRNQAYHFLFNTGSREEMTGGEVLRSPYVASLLLNYIF	124803	127729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_124800_127700
871975	contig_14925_pilon	-	1591	5	Intergenic	novelGene_55317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	214	408	115846	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILWLQLDLKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	302308	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116035_302283
871976	scaffold_13505_pilon	-	276	4	Intergenic	novelGene_111467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1521.22238859266	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547466	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540251_541297_541353_541848_541972_547427
871977	contig_11815_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_50948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1082	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGCCCAGTGATTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465011	466331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_465000_466300
871978	contig_10225_pilon	+	2212	14	Intergenic	novelGene_86788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	2	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	97	1098	20776	42680	TRUE	20	ATCCTAGACTTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20679	47751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46456_47123
871979	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_95416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
871981	contig_16103_pilon	-	1596	7	Intergenic	novelGene_118745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	100.52141839208	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	833	1246	315341	314512	FALSE	0	GGTGCTCGGTTTTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNPTRQPLALNVAYRRCLQILAAGLFLPGSVGITDPCESGNFRVHTVMTLEQQDMVCYTAQTLVRILSHGGFRKILGQEGDASYLASEISTWDGVIVTPSEKAYEKPPEKKEGEEEEENTEEPPQGEEEESMETQE	317382	314161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_314673_314804_314896_315104_315220_315294_315357_315757_316398_316881_316999_317322
871982	contig_13041_pilon	+	3031	1	Intergenic	novelGene_127735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATGGATGTTATTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284209	287240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_284200_287200
871983	contig_11719_pilon	+	2715	1	Intergenic	novelGene_154758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCCAGCTCTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37747	40462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_37700_40500
871984	contig_5878_pilon	-	3911	1	Intergenic	novelGene_145723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAACAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223280	219369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_219400_223300
871985	contig_9995_pilon	-	4808	1	Intergenic	novelGene_47833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCCAGCTGTGTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969126	964318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_964300_969100
871986	contig_3111_pilon	-	2499	17	Intergenic	novelGene_129956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.010437863579	1	56	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	99	2402	39413	15747	FALSE	30	TAATAACTTTCATTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCNVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTLLGGLRMEAEGAALPDLSSEDTPESGRVCLSRVLWCPLRGAGGLEPRMCTTRCPEAPRVPALGTLCPAYSSTSFLFLLAPPPTLLSFLHFPLTKWRLSDALFSLLCQSKSKGPEKGGR	40032	15649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16104_16653_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22889_23185_23289_24064_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964
871987	contig_2069_pilon	-	4462	3	Intergenic	novelGene_23553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	11	104	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	86	1111	1652270	1647027	FALSE	20	TCCTGAGAATTCTACGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSQPKYDLIREVGRGSYGVVYEAVIRKTSARVAVKKIRCHAPENVELALREFWALSSIKSQHPNVIHLEECILQKDGMVQKMSHGSNSSLYLQLVETSLKGEIAFDPRSAYYLWFVMDFCDGGDMNEYLLSRKPNRKTNTSFMLQLSSALAFLHKNQIIHRDLKPDNILISQSRLDTSDLEPTLKVADFGLSKVCSASGQNPEEPVSVNKCFLSTACGTDFYMAPEVWEGHYTAKADIFALGIIIWAMLERITFIDTETKKELLGSYVKQGTEIVPVGEALLENPKMELLIPVKKKSMNGRMKQLIKEMLAANPQDRPDAFELELRLVQIAFKDSSWET	1654560	1643675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1647768_1651985_1652288_1654492
871988	contig_12139_pilon	+	3580	1	Intergenic	novelGene_146478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1906	2346	161768	162208	NA	45	AGGCACACATAGACACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPTTLGSETLLASPARPWGQPGLQGAVVNAASPAQTHSPAHSISRSLGGKETKKSPSPPTFSTESKTPADGRGCSHNPKEWGFLSLPPRLRGSELEPAVSSVSQEAQSPWAPKLSHSLYINVHSSTIPKSQNSQKVPTTQLSISR	159862	163442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_159900_163400
871989	contig_10732_pilon	+	2813	7	Intergenic	novelGene_114711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	330.450702324366	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1247	1651	128145	138578	TRUE	25	TCCTTGAGTTAATACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFAQRYCQCNNGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGEWQGEDVEAALVHFDRQLPLLLRVHDG	126898	143555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_128203_130562_130712_131148_131265_136408_136486_138573_138646_139287_139443_142615
871990	contig_14745_pilon	+	2106	5	Intergenic	novelGene_147847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	11.2998893799895	1089	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	218	529	42040	49089	FALSE	30	TGAAAGCTGGTGTAACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHYKAADSKREQFRRYLEKSGVLDTLTKVLVALYEEPEKPNSALDFLKHHLGAATPENPEIELLRLELAEMKEKYEAIVEENKKLKAKLAQYEPPQEEKRAE	41822	50666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_42055_42252_42326_47055_47105_47479_47610_49044
871991	contig_10437_pilon	+	2129	7	Intergenic	novelGene_38260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_6	160.422012897926	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	561	1550	397110	407700	FALSE	30	TAACATATATTTGGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSENDGCRGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396549	408279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_397230_398632_398756_398840_398997_401337_401557_405379_405546_405816_405923_407600
871992	contig_5649_pilon	+	2313	8	Intergenic	novelGene_82306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	205.781239104411	72	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	114	755	180584	187023	TRUE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMKQAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHAIPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSRNSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLLVLKALQDGRAYGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLNYMAVAFAMQLVKILLVDERSAAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGCTSKES	180470	189618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_180590_181691_181884_182442_182586_183103_183213_183315_183486_187001_187251_188083_188248_188451
871993	contig_10765_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_122986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503996	506677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_504000_506700
871994	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_93833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
871995	contig_7247_pilon	+	4350	1	Intergenic	novelGene_176694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTCAACCCTCTCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152810	157160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_152800_157200
871996	contig_12098_pilon	+	4193	1	Intergenic	novelGene_160664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGATTGTTTCGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102394	106587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_+_102400_106600
871997	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_96851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	38	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
871998	contig_4654_pilon	+	4140	5	Intergenic	novelGene_103071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAAACTGTTAATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469166	482937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_469259_473478_473587_476102_476233_478958_479054_479222
871999	contig_18173_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_160770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAATAAAAGTGATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48436	50696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_48400_50700
872000	contig_11321_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_86659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	620	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	175	522	179189	179536	NA	20	GAAGAGCCTCTGATGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSAYFLLASSPSSHTPALLLQNHQTPGLLPPLWLHLREQLEWGCIRAWTAVLPLCPSRKAAGVDSGWAAGSSGTAQGRHSLMGHLAGLSGNSPLSSGWVGTAADTGKEGDPR	179014	181507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_179000_181500
872001	contig_9614_pilon	-	2273	4	Intergenic	novelGene_104425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	840	junction_2	272.962756922381	783	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	26	1603	155538	136322	FALSE	40	TGACCCAGCAAAGGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEVRKFKMAAAEIPSLREQPEIEDADNSEKSINEENGEVSEDQSQNKHSRHKKKKHKHRSKHKKHKHSLEDDKDKKHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPVINESRSRDRGKKSRSPVDLRGKSKDRRSRSKERKSKRSETDKEKKPIKSPSKDASSGKENRSPSRRPGRSPKRRSVSPKQRDKSRRSRSPLLNDRRSKQSKSPSRTLSPGRRAKSRSLERKRREPDRRRLSSPRTRPRDDILSRRERSKDASPINRWSPTRRRASRSPIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRDRGRRSRSRLRRRSRSRGGRRRRSRSKVKEDKFKGSLSEGMKVEQESSSDDK	155563	135651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_136482_140312_140490_145263_146464_155497
872002	contig_6829_pilon	-	4409	5	Intergenic	novelGene_123771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	19.765816451642	186	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	344	1534	71119	61265	FALSE	90	AAAAAGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEVSCQDCYLRIQGIHVLGSEHEMDVVKSFTKNKDSLSLGNEAELCSALANLQTSKPDSVEQMCVLESTEIALLNNIPYHEGFKMAMRKVLSSLTPEKLLQAMDMDTQCQSDEINSGSGQKENSVLSAPDPYYVLDVSEGFSILPIIAGTLGQVKPYSSVEKDQHRITLGLISEANHFPKEMLQFWLRHVEDESAMLQRPKSDKLWSIIILDVIEPSGLIQQEIMEKAAISRCLLQSGGKIFPQYVVMLGLLVESQILVEESAVQGTERTLGVNIAPFINQFQVPIRVFLDLSSLPCIPLSKPVELLRLDLMTPYLNTSSREVKVHICKSGQVTAIPFWYHVYLDEEIRLDTSSEASHWKQAAVVLDNPIQVEMGEELVLSVQHHKSNVSITVKQ	74200	58389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_-_61481_61820_61944_63351_63506_70421_71149_73886
872003	contig_8145_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_118647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	134.961105508217	4	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	105	524	735820	731044	FALSE	25	ATGATTTTCATGTATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELERIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKGANKGKK	756920	729346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_731203_733967_734024_734339_734407_735682_735830_756825
872004	contig_10405_pilon	-	1696	5	Intergenic	novelGene_165864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	7.92148975887743	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	152	1501	325403	307634	FALSE	75	CACCAAAAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELFCLEHGIQADGTFGVQASKANDDDSFTTFFSETGNGKHVPRAVMVDLEPTVVDEVRAGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTVGKESIDLVLDRIRKLTDACSGLQGFLIFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSLDYGKKSKLEFAIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLVTYAPIISAEKAYHEQLSVAEITSSCFEPNSQMVKCDPRHGKYMACCMLYRGDVVPKDVNVAIAAIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALEKDYEEVGTDSFEEENEGEEF	325554	307438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_307928_309540_310222_312037_312187_313695_313919_325400
872005	contig_8204_pilon	+	2992	1	Intergenic	novelGene_177001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTTTCCACTCGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28909	31901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_28900_31900
872006	contig_2377_pilon	+	5082	3	Intergenic	novelGene_67920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	783	1118	275434	275769	TRUE	20	GAAGTCGTCTTCACTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNSVLRNLRSTLSLELEGALGGYLALNTSVSRESGMTTRHWLTAYCVPETVRESLHHLLLPSTYGWNWLFPLPELLFPQIPVWLTPSTPSRLCSNVRFLVSPVLTNPLF	274651	342372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_278679_309073_310002_342245
872007	SIRV6	+	660	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	123	0	123	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10360	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
872008	contig_6550_pilon	-	2415	12	Intergenic	novelGene_110654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_3	83.6342885118061	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	113	1426	46545	16114	FALSE	25	CATGTGGATTTATTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLAEEYGERAVNKVKSVRDEVFHTDQDDPSSSDDEGMPYTRPVKFKAAHGFKGPYDFDQIKVVQDLSGEHMGAVWTMKFSHCGRLLASAGQDNVVRIWALKNAFDYFNNMRMKYNTEGRVSPSPSQESLNSSKSDTETGVCSGTDEDPDDKNAPFRQRPFCKYKGHTADLLDLSWSKNYFLLSSSMDKTVRLWHISRRECLCCFQHIDFVTAIAFHPRDDRYFLSGSLDGKLRLWNIPDKKVALWNEVDGQTKLITAANFCQNGKYAVIGTYDGRCIFYDTEHLKYHTQIHVRSTRGRNRVGRKITGIEPLPGENKILVTSNDSRIRLYDLRDLSLSMKYKGYVNSSSQIKASFSHDFTYLVSGSEDKYVYIWSTYHDLSKFTSVRRDRNDFWEGIKAHNAVVTSAIFAPNPSLMLSLDVQSEKSEGNDKDEDPEVLDPMPSGIMKTDNTEVLLSADFTGAIKVFINKRKNVS	47411	15124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_-_16209_22168_22304_22684_22813_23953_24070_24423_24526_24727_24920_26988_27112_30842_30957_43134_43200_44609_44749_46440_46593_47346
872009	contig_15118_pilon	+	2143	9	Intergenic	novelGene_74617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	242.390568092077	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	276	1535	392523	398743	FALSE	25	AATTTTGTTGGACCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTDPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	392247	399351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
872010	contig_9739_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_165102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATTATAACCACAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245781	247624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_245800_247600
872011	contig_10446_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_162490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAAAACCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809359	807190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_807200_809400
872012	contig_7416_pilon	-	6259	1	Intergenic	novelGene_134346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	232	552	941671	941351	NA	45	AAAAATGTGTAAGGCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIVFPTIVSNYKMLCQSYSKLQLIQDLLNQKAEITIICFGFNSTFNRKVEKYLEATSAFSEEGRGVQFISVEKSICIQPPSLAGSGKGGERGRPSVSSPLWGRKS	941902	935643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_935600_941900
872013	contig_13456_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_153281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATAAGAAATAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269903	270681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_269900_270700
872014	contig_11855_pilon	-	2687	1	Intergenic	novelGene_67010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	2	562	1402537	1401977	NA	35	AATTGAAATTAGTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTNFISGPSLDLPKGFPASHFTELLQSHHQADLFLGRPCRHPQTLTSSGTVLSWHLGSSVCPTASTRSSKHSYQFEGALRLGGNHVDKSLVEHSTPGQLGDQIHSFCIAGIGHIDLLSVADYPLFQGIQAFLLPQPHLQHTDQVSWTDSQVVHPRASGQTSHKDLGSGAKDEGSKSSTIGCLYY	1402538	1399851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1399900_1402500
872015	contig_10500_pilon	-	3906	1	Intergenic	novelGene_41192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAGCTATCTGGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378101	1374195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1374200_1378100
872016	contig_9290_pilon	+	583	2	Intergenic	novelGene_77515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAAACCCTTGTCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48816	50100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_49186_49886
872017	contig_16768_pilon	+	2489	18	Intergenic	novelGene_168315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	875.243827619177	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	711	2133	357	2489	28108	63743	FALSE	35	ACTATTGGGTACAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQESINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRK	23554	63743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_23839_28035_28111_32635_32803_44559_44661_46402_46504_47347_47528_48858_49015_49108_49241_50677_50747_52995_53106_54492_54720_56809_56932_57012_57166_59017_59151_61964_62114_62304_62425_63204_63316_63644
872018	contig_7839_pilon	-	5745	32	Intergenic	novelGene_45683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	33	junction_31	45.4325035952724	298	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	940	2823	127	2949	154505	110280	TRUE	40	CAAGAAGTGGTGTGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDQVNALCEQLVKAVTVMMDPSSTQRYRLEALKFCEEFKEKCPICVPCGLRLAEKTQIAIVRHFGLQILEHVVKFRWNSMSRLEKVYLKNSVMELIANGTLNILEEENHIKDVLSRIVVEMIKREWPQHWPDMLIELDALSKQGETQTELVMFILLRLAEDVVTFQTLPPQRRRDIQQTLTQNMERIFSFLLNTLQENLNKYRQVKTDTSQESKAQANYRVGVAALNTLAGYIDWVSMSHITAENCKLLEMLCLLLNEQELQLGAAECLLIAVSRKGKLEDRKPLMVLFGDVAMHYILSAAQTADGGGLVEKHYVFLKRLCQVLCALGNQLCALLGVDSDVETPANFGKYLESFLAFTIHPSQFLRSSTQMTWGALFRHEILSRDPLLLAIIPKYLRASMTNLLKMGFPSKTDSPSCEYSRFDFDSDEDFNAFFNSSRAQQGEVMRLACRLDPKTSFQMAGEWLKYQLSTSVDTGSMNSGTGEGSLCSIFSPSFVQWEAMTFFLECVINQMFRTLEKEEIPVTDGIDLLQMVLNFDTKDPLILSCVLTNVSALFPFVTYRPEFLPQVFSKLFSSVTFETVEESKPPRTRAVRNVRRHACSSIIKMCRDYPQLVLPNFDMLYNHVKQLLSDELLLTQMEKCALMEALVLVSNQFKNYERQKVFLEELMAPVASIWLSEDMHRVLSDVDAFIAYVGADRKSCDPDLEDPCGLNRARMRFCVYSILGVIKRTCWPTDLEEAKAGGFVVGYTPSGNPIFRNPCTEQILKLLDNLLALVRTHNTLYAPEMLAKMAEPFAKALDMFEAEKSAILGLPQPLLELNDSVVYKTVLERMQRFFCTLYENCFHILGKAGPSMQQDFYTVEDLATQLLSSAFVNLNNIPDYRLRPMLRVFVKPLVLFCPPEHYEALVSPILGPLFTYLHMRLSQKMASHQPEELAVWRR	154631	104383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_106537_106716_106882_107097_107236_107380_107489_107975_108059_109310_109374_110193_110292_110736_110785_111496_111595_112303_112441_113245_113343_114189_114291_121635_121818_123196_123297_123896_124097_124836_124927_125463_125506_127532_127689_133667_133787_135110_135240_136750_136842_137797_137924_138516_138601_139472_139573_141197_141275_141941_142128_142499_142527_146173_146357_146484_146623_151908_151982_153056_153179_154400
872019	contig_1996_pilon	-	1492	7	Intergenic	novelGene_131942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	391.688829160201	45	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGGACCCGGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511086	507987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_508505_508628_508761_508918_509039_509119_509242_509346_509513_509582_509660_510728
872020	contig_9848_pilon	-	3070	1	Intergenic	novelGene_79937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1924	2382	98183	97725	NA	75	CAAGATAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSILLGYNSGSGTTQDTVLQSGQLLGHAHRQASRPLGPLGPASALLRQVLQSSFAPLISAQSHPTLPASLLPKGTQRSHSVGWEAHHAISCWSPGSAVAGSLPRLPPLLVVSCCLQCYSSLSLCLLGLGGSQHRDSRSKECALLPVSSAWW	100106	97036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_97000_100100
872021	contig_10106_pilon	+	1982	2	Intergenic	novelGene_73885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGCTGAAAGGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141209	143533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_141724_142065
872022	contig_11978_pilon	-	528	5	Intergenic	novelGene_63017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5322.63254297157	186	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	30	392	1596982	1591984	FALSE	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYSGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1597011	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592055_1592237_1592304_1595890_1596020_1596304_1596389_1596969
872023	contig_13765_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_165872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAACAACAACAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17102	19401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_17100_19400
872024	contig_5023_pilon	+	4942	1	Intergenic	novelGene_7123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGGCCTCAGTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148173	153115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_148200_153100
872025	contig_4232_pilon	+	2815	10	Intergenic	novelGene_63243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	150.08178840178	16	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	1391	2179	306740	311150	TRUE	20	AAGCTGGCCAGAGCTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFQYLPDTDDRHRIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFNGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQPYTFTPSLSTINFEEFSPMIFSSGQIPSQAPAPVLAQPPAPAPAMASALAQAPAPVPVLAPSPAQAVGPPAPKTSQAGEGTLTEALLQLQFDADEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGVSMAPHAAEPMLMEYPEAITRLVTGSQRPPDPAPAPLGASGLANGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSQISS	302399	311909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_302484_303089_303117_303212_303365_303528_303678_305543_306336_306553_306768_309524_309606_309695_309771_310545_311444_311566
872026	contig_18081_pilon	+	2938	6	Intergenic	novelGene_23850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGCCCGCCGCCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443498	485264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_445784_448206_448317_454648_454788_456512_456655_465890_466072_485183
872027	scaffold_19766_pilon	-	3888	1	Intergenic	novelGene_34351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1520	1834	615274	614960	NA	65	TAAAAGTTTAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKRSKTSTRDSSSKRQRRSIDLEVKQKLIKQHEGGKLVNAIAHDLGISHLTVTMVIKNKEKILQSVKGQFPVKATKLMKMGQGPMSDMEKLLMTWIEDQAQK	616793	612905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_612900_616800
872028	contig_16098_pilon	-	1236	11	Intergenic	novelGene_45765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	133	junction_9	262.130139434595	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	409	966	35742	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPQIDTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36309	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35720_35749_35907
872029	contig_7229_pilon	-	3317	1	Intergenic	novelGene_39790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	422	730	805746	805438	NA	20	AAATATGGGTTTTTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFICQKPKIILISLWYEYNAQSQVYEDLETNPVVLLNDGNRGFTTRPFDLGIGDLGSLETSFYSAAGKLCDSRQAPWLWKIRTDLVPSAPTHRNMKTCL	806167	802850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_802800_806200
872030	contig_8626_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_174856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGCGAACGAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18330	15756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8626_pilon_-_15800_18300
872031	contig_7909_pilon	+	2950	19	Intergenic	novelGene_155902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_18	170.223382647626	75	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2715	234	2948	444983	542478	FALSE	25	ATCTTCTACTGGCGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVWPTLLDLSRDECKRILRKLELEAYAGVISALRAQGDLTKEKKDLLGELSKVLSISTERHRAEVRRAVNDERLTTIAHKMNLSLYLGERPSYSMSGPNSSSEWSIEGRRLVPLMPRLVPQTAFTVTANAVANAAIQHNASLPVPAETGSKEVVVCYSYTSTTSTPTSTPVPSGSIATVKSPRPASPASNVVVLPSGSTVYVKSVSCSDEDEKPRKRRRTNSSSSSPVVLKEVPKAVVPVSKTITVPVSGSPKMSNIMQSIANSLPPHMSPVKITFTKPSTQTTNTTTQKVIIVTTSPSSTFVPNILSKSHNYAAVTKLVPTSVIASTTQKPPVVITASQSSLVSSSSSGSSSSTPSPIPNTVAVTAVVSSTPSVVMSTVAQGVSTSAIKMASTRLPSPKSLVSAPTQILAQFPKQHQQSPKQQLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGTTTKITTIPMTSKPNVIVVQKTTGKGTTIQGLPGKNVVTTLLNAGGEKTIQTVPTGTKPAIITATRPITKMIVTQPKGIGSTVQPAAKIIPTKIVYGQQGKTQVLIKPKPVTFQATVVSEQTRQLVTETLQQASRVAEAGNSSIQEGKEEPQSYTDSSSSSTESSQSSQDSQPVVHVIASRRQDWSEHEIAMETSPTIIYQDVSSESQSATSTIKALLELQQTTVKEKLESKPRQPTIDLSQMAVPIQMTQEKRHSPESPSIAVVESELVAEYITTECTDEGTEVAFPLLVSHRSQPQQPSQPQRTLLQHVAQSQTATQTSVVVKSIP	442879	542480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_443074_444943_445053_451521_451622_453110_453186_454741_454784_458393_458570_460213_460367_462225_462486_496264_496542_511061_511317_516141_516292_517733_517905_524099_524237_526672_526847_528521_528721_536900_537066_538881_539038_540065_540108_542365
872032	contig_8330_pilon	-	3281	9	Intergenic	novelGene_71952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	20.3945458395131	168	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	35	1120	1485391	1460755	FALSE	25	GAACCCGGGGGAACCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELSQALASSFSVSQDLNSTAAPHPRLSQYKSKYSSLEQSERRRRLLELQKTKRLDYVNHARRLAEDDWTGMESDEDEDKKDDEEMDIDIGKKLPKRYANQLMLSEWLIDVPSDLGQEWIVVVCPVGKRALIVASRGSTSAYTKSGYCVNRFSSLLPGGNRRNSTTAKDYTILDCIYSEVNQTYYVLDVMCWRGHPFYDCQTDFRFYWMHSKLPEEEGLGEKTKLNPFKFVGLKNFPCTPESLCKVLSMDFPFEVDGLLFYHKQTHYSPGSTPLVGWLRPYMVSDVLGVAVPAGPLTTKPEYAGHQLQQIVAHKRSQREGTKEITHKASENGHYELEHLSTPKLKSPPRCPDHPGSLMEN	1487617	1458593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1461076_1462598_1462680_1474532_1474611_1476774_1476873_1478202_1478300_1478588_1478694_1482962_1483111_1485233_1485397_1487588
872033	contig_7979_pilon	-	3203	1	Intergenic	novelGene_125554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCAGCAATGTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133868	1130665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1130700_1133900
872034	contig_3721_pilon	-	3216	20	Intergenic	novelGene_123821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATCTCGGCCTCCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287005	198475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_198704_211139_211293_212927_213081_217753_217941_220762_220982_221373_221546_222205_222311_222692_222834_224099_224236_226526_226648_235200_235371_249098_249296_249889_250077_250552_250639_254704_254853_257744_257902_269732_269933_283529_283742_285727_285871_286904
872035	contig_8286_pilon	-	2824	2	Intergenic	novelGene_139814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	111	794	227708	227025	TRUE	30	ATAGTGTTGCAAACGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQPGPGLGEPQQGPSEGAGSERALAEGTEVQHSLPMLLIPPEASTAPNGPCNDPRFPLGHQCCASTRSYSEEFMTCYSDLVLHRTPLFPRDLPLSSLQGNQLQDPAPAQRPLLDEVVAPSGSSGGQPLVTVPNQLCLTPGPQSPEAELEEATPGTDAVFPSASSEMDKLCERLSYLLRPPTLTGHPGGFPGPGVEEKGQPEHHMGPEPARAQTVGELGSGGLPRHPHIYNSPPALITSLQGGLEAPVPARRHHPGYGSLCCL	227818	224795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_225777_225975
872036	contig_14158_pilon	-	2929	9	Intergenic	novelGene_136126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	113.32668485401	104	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	19	327	54234	51377	TRUE	35	CTAGCAAAATATTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLDEVMKKYGSLVPLSEKDVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVSSLLQQLFS	54252	27592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_29785_31038_31127_31921_31973_33428_33513_38101_38240_51327_51406_53534_53587_53862_54002_54145
872038	contig_7078_pilon	+	3600	1	Intergenic	novelGene_130161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTTACCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567979	571579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_568000_571600
872039	contig_11017_pilon	+	1240	11	Intergenic	novelGene_128085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	693.955762278836	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	151	783	259454	294618	FALSE	0	TTCTCTTTGTCTGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQRRTVHHRVFSGSRSPGLSSKPDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGARTDLRNNEKKLALDMATNAACASLLKKKQGTDAVRTLSNAEDYLDDEDSD	233856	295075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_233923_259260_259308_259416_259523_268803_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_285452_285552_294559
872040	contig_12425_pilon	+	1345	7	Intergenic	novelGene_46634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	206.016719925565	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	349	1155	179275	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGMAEFLNKHVTSEREWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASELEDSVVGEDIDLANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQEGREFWPQEVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167059	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_174017_174116_179208_179338_181626_181819_186767_186945_190682_190836_198178
872041	contig_20223_pilon	+	4705	5	Intergenic	novelGene_177227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGCCATGGCTTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28051	38575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_+_30119_30866_31007_33023_35349_36531_36664_38534
872042	contig_2834_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_27990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGACGTATTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247256	248730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_247300_248700
872043	contig_3942_pilon	+	958	2	Intergenic	novelGene_128775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	12810	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	413	715	793767	795263	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSPSLCPGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKYAPTHTVWAVWVGGVSALTALCAPFIV	793354	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793882_795075
872044	contig_11493_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_143706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTAAAAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259508	256522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_256500_259500
872045	contig_6102_pilon	-	2308	8	Intergenic	novelGene_32054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.018548965876	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	141	968	583515	581130	TRUE	25	AGCATTTCACCTTTGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECALSWSDFTKRESPPGKLPFWTWLDKILDLVHDHLKDLWNDDRIMGFVSRSQERRLLKKTISGTFLLRFSETSEGGITCSWVEHRDDDKVLIYSVQPYTKEVLQSVPLTEIIHHYQLLTEENVPENPLRFLYPRIPRDEAFGRYYQEKVNLQERRKYLKHRLIMVSNRQVDELQQPLEPKLEPGQESLDLGLALEPDLGLSLELGSLMDAGLDLGPALEPVLEPTLAMGPQTVPEPNLEPELESILESISQPVPEPDLPQDLKHLNIKEMEIFRNSSMKIEEIMINGDPPLPGPSTMDEVYSFCPSHFHTDGRWSPCDF	584381	579747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_580090_580131_581276_581579_581891_582702_582761_583000_583184_583385_583523_584131_584227_584343
872046	contig_8102_pilon	-	3374	1	Intergenic	novelGene_85334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155664	152290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_-_152300_155700
872047	contig_6227_pilon	+	2910	1	Intergenic	novelGene_49642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382455	385365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_382500_385400
872048	contig_6418_pilon	+	4585	1	Intergenic	novelGene_81134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	563	910	146629	146976	NA	40	TTAAACAAAGGAGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPTCFLDAGLLSCAAGVTLNLEIETIHMDHTLGQGKPQWINGLKVLRINDLNLTIFGDTGKITITLIRFSIPRQSKRSYLRADSFSFNSSEVISSSRKSFEVNASICPKIKYQT	146066	150651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_146100_150700
872049	contig_9400_pilon	-	1568	10	Intergenic	novelGene_146578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	532.40108337629	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	115	573	135537	121571	TRUE	50	GAAAAAAAGTAGATGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE	158630	119691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_120654_121537_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
872050	contig_9653_pilon	-	308	2	Intergenic	novelGene_48322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1851	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGCAGATTACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040051	1025343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1025426_1039825
872051	contig_6710_pilon	-	545	2	Intergenic	novelGene_96698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	871	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	25	AAAATGCCTTGCACCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
872052	contig_6551_pilon	+	6313	6	Intergenic	novelGene_155551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	48	junction_5	14.7918896696805	331	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	83	1324	341057	360432	FALSE	40	CCTTGATTGATTGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQVRLPHGEPCREGDILSLVCPDSSQAWCEIMNVSQLLVSPTLYTDPNSSITNFSISANTENKYSLYVGLVLAVSSSIFIGSSFILKKKGLLQLAKKGVTRAGQGGHSYLKEWLWWAGLLSMGAGEAANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNEHLNIHGKIGCILSILGSTVMVIHAPQEEEVASLHEMEMKLRDPGFISFAVIITVISLVLILAVAPKKGQTNILVYISICSMIGAFSVSSVKGLGIAIKELLEWKPVYKHPLVFVLLAVLVLSVATQINYLNKALDTFNTSLVTPIYYVFFTSMVVTCSAILFQEWYGMKAGDIIGTLSGFLTIINGIFLLHAFKNTDITWNQLTSTAKEEVPYLNGNEDKYTLLENMECSTLGYNDDHTLFSRTDGQSL	340974	365421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_+_341103_348754_349022_351741_351799_355044_355136_357538_357700_359812
872053	contig_19098_pilon	+	2845	6	Intergenic	novelGene_65807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	255.289639429414	261	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	804	1445	283786	311248	FALSE	35	TTCAACACTGATAGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEYEQKLLQELYKLNPNFLQLSTGSVDKNKNKVTPLQRYDTPIDKSSDSLSIGNGDNSQQISNRDTPSPPPGLCKSNPVIPISSSNHSARSPFEGAVTESQSLFSDNFRHPNPIPSGLPPFPSSPQTSSDWPTAPEPQSLFTSETIPVSSSTDWQAAFGFGSSKQPEDDLGFDPFDVTRKALADLIEKELSVQDQPSLSPTSLQNTSSHTTAAKSPGSGFLHPAAPANANSLNSTFSVLPQRFPQFQQHRAVYNSFSFPGQAARYPWMAFPRNSIMHLNHTANPTSNSNFLDLNLPPQHNTGLGGIPIADNSSSVENLNMKEWQDGLRALLPNININFGGLPNSSSPSNANHSVPPSNTATTDGLSWDSPGSWTDPAIITGIPASSGNSLDSLQDDNPPHWLKSLQALTEMDGPSAAPSQTHHSAPFSTQIPLHRASWNPYPPPSNPSSFHSPPPGFQTAFRPPSKTPTDLLQSSTLDRH	267851	312648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_267976_279915_279974_282009_282260_283414_283913_310045_310259_310946
872054	contig_2332_pilon	+	2644	4	Intergenic	novelGene_58628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_2	20.6074420214316	13554	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	84	515	6315	18688	FALSE	20	TGCCTGTTGTTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLAPEVIRKQPYDNTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYCRDVAEMYDNILHKPLNLRPGVSLTAWSILEELLEKDRQNRLGAREDFLEIQNHPFFESLSWTDLVQKKIPPPFNPNVAGPDDIRNFDAAFTEETVPYSVCVSSDYSIVNASVLEADDAFLGFSYAPPSEDLFL	6231	20817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_6330_8779_8936_12009_12100_18517
872055	contig_9653_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_48351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCAGTGGTTCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125194	1127439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1125200_1127400
872056	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
872057	contig_366_pilon	-	2390	9	Intergenic	novelGene_51598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1092	junction_2	302.430958030093	350	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	432	1442	803057	764196	FALSE	5	CCCCTTTCTGGGGCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKG	803488	763247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
872058	contig_14219_pilon	-	4291	1	Intergenic	novelGene_54317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695373	691082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_691100_695400
872059	contig_16643_pilon	-	1415	7	Intergenic	novelGene_158120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_6	1321.9472274725	1499	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	129	899	255574	231365	FALSE	20	GCCTAGTTGTATGCTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRRPLPRADPFRRPSLRRPGRLSPLRPRRGKLSLKRGEEGNMERRIHLELRNRTPAAVRELVLDNCKSNDGKIEGLTAEFVNLEFLSLINVGLISVSNLPKLPKLKKLELSDNRIFGGLDMLAEKLPNLTHLNLSGNKLKDISTLEPLKKLECLKSLDLFNCEVTNLNDYRESVFKLLPQLTYLDGYDREDREAPDSDAEVDGVDEEEEDEEGEDEEDEEDEDGEEDFDEEDEEDEDEDVEGEEDEDEVSGEEEEFGPDGEVDDDEEDEDEDEDEEEEESGKGEKRKRETDDEGEDD	255702	230848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_231433_232651_232722_234526_234649_237584_237775_243220_243344_247251_247402_255526
872060	contig_7622_pilon	-	2830	12	Intergenic	novelGene_132427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	201.490561270229	32	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	206	1372	297961	274465	FALSE	30	ACTAATCAATTTTTGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGEGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGM	306642	273006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_282438_282526_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
872061	contig_9099_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_149924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGCTGTTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416982	414410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_414400_417000
872062	contig_3916_pilon	-	3341	1	Intergenic	novelGene_141856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	616	978	40100	39738	NA	65	AAAGAAAAAAAGCAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSVSYWEVREVAFSYSLPEVIAGCVPVWQTLFSVSWQGTSILYLSSFSVFHQFLLPFGVRSSSLSLHLMLTVPGLTFVSILLSFSGLCWKGLAWCICLWHHIGSTSLLNILSKDSIEES	40715	37374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_37400_40700
872065	contig_9114_pilon	-	2148	6	Intergenic	novelGene_155177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	37.9652472664146	216	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	497	862	192731	16525	FALSE	40	GTCACAAGTAAATAGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCASAKHVATVQNEEEAQKGKNYQNGDVFGDEYRIKPVEEVKYMKNGAEDEQKIAARNQENLEKSASSNVRLKTNKEIPGLVHQPRANMHISESQQEFFRMLDEKIEKGRDYCSEEEDVT	306525	15238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9114_pilon_-_16564_43882_43944_53561_53639_154986_155082_192637_192862_306159
872066	contig_5758_pilon	+	3156	2	Intergenic	novelGene_119111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251772	266048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_252310_263429
872067	contig_7078_pilon	+	2855	1	Intergenic	novelGene_130150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537489	540344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_537500_540300
872068	contig_11629_pilon	+	4985	1	Intergenic	novelGene_161206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	2539	2931	502653	503045	NA	15	GTGGCCTCAGACCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAERCYKGATKPPSSYAQLSPQRNFPLLYFHFCYMSFFSLTMNHHPKVVLSISALCIINEDHRTLLSLPWPPGTPMLGLLPCFLVCSPTLLLPIFFWAAFSESPLRSCFWAFALADPSTSNAFLLSKPS	500114	505099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_500100_505100
872069	contig_4429_pilon	-	1910	2	Intergenic	novelGene_50825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1537	1869	241078	233883	FALSE	25	TATTGTCATTTTAGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIERGFDPVRSLSEGSYITLFITTEPQLVPGESVREKFDSQEDDKLLQATEKLQAECALKFPNRQCLTTVIDISGKTVFITRYLKPLNPPQELLNIYPSNPQATAVSIS	242614	233841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_234102_240964
872070	contig_3233_pilon	-	4526	2	Intergenic	novelGene_56602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCATAGTAAGAGGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946004	941148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_944964_945293
872071	contig_1443_pilon	-	2314	3	Intergenic	novelGene_28380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	4	61	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	42	545	1040199	1039061	TRUE	50	AAAATATTCAAATGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQEFCDYGTKEECMKASDADRPCRKLHFRRIINKHTDESLGDCSFLNTCFHMDTCKYVHYEIDACMDSEAPGSKDHTPSQELALTQSVGGDSSADRLFPPQVLVCSENSPQLMDLSPSSTAIYVGKQDIIRQSVLLMGIEWDRYVYKGVGKPVEKRVWGHESESEEREDDQIPPHAVDLL	1040240	1036663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1037058_1037685_1039518_1040152
872072	contig_602_pilon	+	3376	11	Intergenic	novelGene_134935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_9	60.5036362543608	212	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	93	1604	296691	391717	FALSE	35	AATGTGGCAACAGGAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEHAVTQTEHMATIEAHAVAQQVQQVHVATYTEHSMLSADEDSPSSPEDTSYDDSDILNSTAADEVTAHLAAAGPVGMAAAAAVATGKKRKRPHVFESNPSIRKRQQTRLLRKLRATLDEYTTRVGQQAIVLCISPSKPNPVFKVFGAAPLENVVRKYKSMILEDLESALAEHAPAPQEVNSELPPLTIDGIPVSVDKMTQAQLRAFIPEMLKYSTGRGKPGWGKESCKPVWWPEDIPWANVRSDVRTEEQKQRVSWTQALRTIVKNCYKQHGREDLLYAFEDQQTQTQATTTHSIAHLVPSQTVVQTFSNPDGTVSLIQVGTGATVATLADASELPTTVTVAQVNYSAVTDGEVEQNWATLQGGEMTIQTTQASEATQAVASLAEAAVAASQEMQQGATVTMALNSEAAAHAVATLAEATLQGGGQIVLSGETAAAVGALTGVQDANGLVQIPVSMYQTVVTSLAQGNGPVQVAMAPVTTRISDSAVTMDGQAVEVVTLEQ	233725	393489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_233812_296684_296914_302845_302961_304928_305056_314917_315059_342996_343156_343904_344103_344690_344793_353188_353347_360535_360661_391553
872073	contig_11978_pilon	-	3064	7	Intergenic	novelGene_62899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_6	40.0683443908308	241	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	46	1866	785886	769006	FALSE	35	AAATCTGCAACTTGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAVSPSDYLQPAASTTQDSQPSPLALLAATCSKIGPPAVEAAVTPPAPPQPTPRKLVPIKPAPLPLSPGKNSFGILSSKGNILQIQGSQLSTSYPGGQLVFAIQNPTVINKGSRSNANIQYQAVPQIQASSSQTIQVQPNLTNQIQIIPGTNQAIITPSPSSHKPVPIKPAPVQKSSTTTTPVQSGANVVKLTGGGGNVTLTLPVNNLVNTSDTGATTQLLTESPPTPLSKTNKKARKKSLSASQPPVAMAEQVETVLIETTADNIIQAGNNLLIVQSPGGGQPAVVQQVQVVPPKVEQQQVVQIPQQALRVVQAASATLPTVPQKPSQNFQIQAAEQTPTQVYIRTPSGEVQTVLVQDSPPATAVTTSTTTCSSPASRASHVSGSSKKHSAAILRKERPLPKIAPAGSIISLNAAQLAAAAQAMQTININGVQVQGVPVTITNTGGQQQLTVQNVSGNNLTISGLSPTQIQLQMEQALAGETPPGEKRRRMACTCPNCKDGEKRSGEQGKKKHVCHIPDCGKTFRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQCQKRFMRSDHLTKHYKTHLVTKNL	799971	767807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_769107_770596_770791_771032_771208_772542_772856_783579_784555_785823_785901_799940
872074	contig_20844_pilon	-	1418	14	Intergenic	novelGene_78605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_11	389.088998200553	4090	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	346	1308	209140	204834	FALSE	15	CTCCACGTGCTCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLAAGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKLKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQSKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN	227133	204723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20844_pilon_-_204850_205184_205292_205376_205514_205631_205740_206592_206783_206875_206981_207877_207938_208086_208176_208286_208371_208934_208982_209120_209254_225631_225723_226767_226885_227109
872075	contig_9189_pilon	+	2871	9	Intergenic	novelGene_165107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_8	97.3915261970979	302	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	179	1759	261715	610194	FALSE	35	AAGCAACCAATCCTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVRFYPPPAQPAAAPDAPCLGPSPCLDPYYCNKFDGENMYMSMTEPSQDYVPASQSYPGPSLESEDFNIPPITPPSLPDHSLVHLNEVESGYHSLCHQMNHNGLLPFHPQNMDLPEITVSNMLGQEGTLLSNSISVMQDIRNPEGTQYSAHPQMAAMRPRGQPADVRQQPGMIPHGQLTTINQSQLSAQLGLNMGGSSVPHNSPSPPGSKSATPSPSSSVHEDEGDDTSKINGGEKRPASDMGKKPKTPKKKKKKDPNEPQKPVSAYALFFRDTQAAIKGQNPNATFGEVSKIVASMWDGLGEEQKQVYKKKTEAAKKEYLKQLAAYRASLVSKSYSEPVDVKASQPPQLISSKPSVFHGPSQAHSALYLSSHYHQQPGMNPHLTAMHPSLPRNIAPKPNNQMPVTVSIANMAVSPPPPLQISPPLHQHLNMQQHQPLSMQQPLGSQLPMQVQSALHSPTMQQGFTLQPDYQTIISPTSTAAQVVTQAMEYVRSGCRNPPAQPVDWNNDYCSSGAMQRDKALYLT	261536	611306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_261817_427698_427765_446723_446967_545332_545615_564293_564525_583030_583112_601474_601862_609430_609583_610157
872076	contig_9272_pilon	+	4117	1	Intergenic	novelGene_125980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	2861	3517	665457	666113	NA	10	CATGTTTTCTTTGGCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRTLQLVELANETWLVTGRHPLPVITAAAFLAWQSLQPSGRLTCSLARFCKLANVDLPYPASSRLQELLTVLLRMAEQLAWLQILKLNKRSVVKHIGDLLQHRHTLVRKAFRDAAGEREAYERELQGQRQGEEEVGNSSLDLPVRKRPPSPALLLPPCMLKPPKQLRPTPAVCTVTGDENISDSEIEQYLRTPEEVRDFQRAQAASQAAKSVPNPL	662596	666713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_662600_666700
872077	contig_6059_pilon	+	3668	1	Intergenic	novelGene_44787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	389	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129746	133414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_129700_133400
872078	contig_3394_pilon	+	3479	1	Intergenic	novelGene_152689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAGAAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453368	456847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_453400_456800
872079	contig_6360_pilon	-	3698	1	Intergenic	novelGene_165882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1984	2310	79202	78876	NA	40	TGAATCCAGCACAACTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSIRVGCNILTQVTSLIQCKGSFPGVWPALPFILQETKGKGSEQRVGDLITTKKAAPGAEHLLWTWGSYVEKLLVQGKTDDKDLLPELIEKTFPWSWRPGFGFLAS	81185	77487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_77500_81200
872080	contig_19848_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_173821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAATGAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62037	59777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_59800_62000
872081	contig_5698_pilon	+	2225	7	Intergenic	novelGene_54995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	920.569705852486	2	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4078	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8020_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
872082	contig_3382_pilon	-	5012	10	Intergenic	novelGene_124100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_9	610.63484471511	542	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	298	1476	725157	673341	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDIASRDRDRNSRDRSPRDRDRKDKNRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI	725454	669804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_673519_677153_677346_685166_685197_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303_694415_696445_696545_712955_713051_725096
872083	contig_7571_pilon	-	2323	15	Intergenic	novelGene_106394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.6041594835362	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	81	1685	136475	87062	TRUE	30	TCAGCAATTGAAAGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGPSGSDSDIRAATAENGPAGQIINMHFQGFRLCLGLLLISVNAEFMDDGVEMEDFDENSEEIDVDEDELSSEIKYKTPQPIGEVYFTETFDTGRLAGWVLSKAKKDDTDAEISIYDGRWEIEELKENRLPGDRGLVLKSRAKHHAISAILSKPFIFADKPLIVQYEVNFQDGIDCGGAYIKLLADTDDLNLENFYDKTSYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKHPKTGVFEEKHAKPPDVDLKNFFTDRKTHLYTLVMNPDDTFEILIDQIVVNKGSLLEDVVPPINPPKEIEDPSDRKPDDWDERAKIPDPSAVKPDDWDESEPAQIEDSSIVKPDGWLDDEPKFIPDPTAEKPNDWNEDMDGEWEAPHIPNPACRVGCGEWKPPMIDNPKFKGVWRPPMIDNPNYQGIWSPRKIPNPDYFEDDHPFLLTSFRAIGLELWSMTSDIYFDNFIICSKKEVADHWAADGWSMKIMVANANEPGVLKQLMAAAEDRPWLWLIYLVTAGLPVVLITSFCWPRKVKKKYEDAEYKKTDIGKPQTKGALEQEVKEEKAALEKPF	148945	84465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_-_85003_86960_87068_89613_89722_89950_90077_91174_91391_92649_92801_92927_93042_115798_115989_119617_119811_121249_121332_125250_125393_128759_128819_129467_129542_136331_136485_148874
872084	contig_10953_pilon	+	2779	14	Intergenic	novelGene_42527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	189.805724407225	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	7	1389	126980	161785	TRUE	20	GATGAAGCTTGAGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRKCEHNLSKPEFNPTSIKFKIQLVAVNYIPEVRIMSIPNLRYLKESQVLLTLTNPVENLTHVTLLECEEGDPDNISSTAKVVVPPKELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFRKANKVGIFIKVTPQREEGEVTVCFKMKHDFKNLAAPIRPIEESDQGTEVIWLTQHVELSLGPLLP	126973	164168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408_145519_151635_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_161571_161798_162790
872085	contig_5640_pilon	+	933	8	Intergenic	novelGene_27274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	276.058925978214	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	76	804	951664	955989	FALSE	35	AGTCCTATAGTAAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGKNPDEVSYAGDNFVRYTGDTISMAQTQLFAWEAYDKGSEVHLQADPTKLELLYKSFKVKKEDFKEQQKESILEKTEDYVEYSRHGTVIKGQERAVACSKYEEDVKINNHTHIWGSYWKEGRWGYKCCHSFVKYSYCTGEAGKEIANAEECIPSDVTGEESMKKPQTLMEMHQEKLKEEKKKKKKKKHRKSSSDSDGEEKREKLKKALNAEEARLLHVKEIMQIDERKRPYNSIYETREPTEEEMEAYRMKRQRPDDPMASFLGQ	951417	956118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_951441_951611_951680_951814_951955_952892_953001_954372_954478_954630_954703_954816_954925_955809
872086	contig_12566_pilon	+	3351	7	Intergenic	novelGene_85984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	31.9917524093667	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2193	2693	18174	20878	FALSE	15	ACTCTGTGGCTCAGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYNLQPDRSVTGGAWYSDQDFESEFVEVLNQQCFKFLQTKAETARESKQNPMIQRNSSFASSHEVWKYICELGISKVELSMEDIETILNTLIYDGKVEMTIIAAKEGTVGSVDGHMKLYRAVSAIIPPTGLVRAPCGLCPVFDDCHEGGEISPSNCIYMTEWLGF	5601	21536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_5782_6777_6896_10514_12388_18152_18297_18516_18625_19493_19686_20800
872087	contig_5286_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_157378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAGTACTCAGCAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596879	598201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_596900_598200
872088	contig_14441_pilon	+	964	4	Intergenic	novelGene_100567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	13	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	376	924	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_125486_125902_126159_126283_126514
872089	contig_10299_pilon	+	1962	2	Intergenic	novelGene_79676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	0	31	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1295	1891	186309	187611	FALSE	20	CTTGATACATTCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIQQGREGYLHRRVFRPSSALFSGQAEEAAVEIARKLEKQEKKRLKKEKKRLAAIALTALENSSSTPEECEEMGERPKKKKKQKPQEVPQENGMEDSSSSVLPKPKKKKSFSKEELVSSDLEETAVSTSFSKRKKSFPKEEPASDPEEAGNSRSVPKKKKKLSSKEEPVSSGPEEAASSKSSSSKKKKKFKKTPQD	185014	187682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_186528_187233
872090	contig_5145_pilon	+	1851	7	Intergenic	novelGene_131372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	75.0986388395659	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGCTTATACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543043	555004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_543082_543783_544058_544138_544181_544683_544740_544996_545152_550233_550325_553809
872091	contig_11677_pilon	-	507	5	Intergenic	novelGene_85941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_4	14365.8301970335	143	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	253	465	595842	594927	FALSE	15	ACATATGCTTCTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598046	594884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_598027
872092	contig_6842_pilon	-	4311	1	Intergenic	novelGene_130789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACTATAAAGAATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401303	1396992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1397000_1401300
872093	contig_1516_pilon	+	3014	3	Intergenic	novelGene_49974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2826	junction_1	578	188	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	88	381	347241	348115	FALSE	70	AAAGGATGAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGATRPELAGLSCICIAAQAGPRRRTSEAMSKHHSEVGSAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCRLDIDSPPITARNTGIICTIGPASRSVETLKEMIKSGMNVARLNFSHGTHEVSPWEVWPPGQLVRK	335194	350748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975
872095	contig_15899_pilon	+	2634	8	Intergenic	novelGene_128902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_2	53.2640706714179	1124	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	15	1127	13746	33720	FALSE	25	AACGGATACCTTTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WYFAMISVSGVFSVTFSVIFAYVADVTQEHERSTAYGWVSATFAASLVSSPAIGAYLSASYGDSLVVLVATVVALLDICFILLAVPESLPEKMRPVSWGTQISWKQADPFASLKKVGKDSAVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQVIGFGSVKIAAFIAMVGILSIVAQTVFLSILMRSLGNKNTVLLGLGFQMFQLAWYGFGSQAWMMWAAGTVAAMSSITFPAVSALVSRNAESDQQGVTQGIITGIRGLCNGLGPALYGFIFYMFHVELTEMEPELNSNQAALQGAVIPGPPFLFGACIVLMSFVVALFIPEYSKASGIHKHSSSISGSLTNTPERGIEEDFEPLLQDSSIWELSSFEEPGNQCTEL	13731	35227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_+_13848_17860_18080_19730_19845_27640_27713_29168_29282_30855_30954_32683_32827_33468
872096	contig_15245_pilon	-	2507	4	Intergenic	novelGene_145211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1315	junction_1	454.16761467791	4829	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	80	406	131120	42989	FALSE	75	AAAAAAAAATTAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTASSALSSSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQAEILQESRMMIPDCQRRLEAAYTDLLQLLESEKELEEAEEYKEARSVLDSVKLEA	131199	40887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_43070_47639_47727_56801_56908_131067
872097	contig_165_pilon	-	2943	1	Intergenic	novelGene_117078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	159	317	437984	437826	NA	55	AAAAAAAAAGAGTAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLVNERAVPCPERLSTVTGCHTRKHTWCGQKFPLSQENPKSRFNNNNKLHFKMVFPLFNGLDLAKEHTGAGQVQVMPGASLEPVLGQPTIGFLHSHLAGVRAQN	438142	435199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_435200_438100
872098	contig_12993_pilon	-	3032	1	Intergenic	novelGene_136740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTCATTGCATATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141404	138372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_138400_141400
872099	contig_6424_pilon	-	1137	3	Intergenic	novelGene_109245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	458.5	175	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	79	393	9182	7733	TRUE	10	GCTGAGCTGTGTTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGEPALPLASSLHSLSWRGALSKPPSVSTRLTHRSSQ	9260	5696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7714_8039_9173
872100	contig_19564_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_29583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	35	475	12641	12201	NA	30	GAAACCTTTGCAAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	12675	11337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_11300_12700
872101	contig_6217_pilon	+	2965	1	Intergenic	novelGene_109677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2394	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	2546	2884	846468	846806	NA	25	GTAATGGTGTTTTTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRCFSMSWKFSAFVRGQSYHSSLLLVEKYLSFPSLTGFLLTQVPAFAGFAVYITKFLNITTDLITKALLKYQEAEELTMMDIRFFQDFKFLFDSLNLIIGSTYCQLFSLK	843922	846887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_843900_846900
872102	contig_9434_pilon	-	3375	1	Intergenic	novelGene_150503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTATCCTGCGCTACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352857	349482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_349500_352900
872103	contig_10404_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_138638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAACAAAAAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430897	433424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_430900_433400
872105	contig_15092_pilon	-	1839	4	Intergenic	novelGene_57773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	129.836649508356	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAGAGCATATTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298461	296064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248
872106	contig_4876_pilon	-	3454	1	Intergenic	novelGene_137879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTGTAAAATACACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28089	24635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_24600_28100
872107	contig_5569_pilon	-	2950	8	Intergenic	novelGene_86747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_4	91.0944788756852	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1246	1758	487345	467456	FALSE	40	AACAAAATTAATGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLKLRRNIVKLSLYRHFTNTLILAVAASIVFIIWTTMKFRIVTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVIMVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQKEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDLKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME	488590	466263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_467498_470108_470140_472360_472417_473103_473166_473929_474004_481688_481793_482544_482604_487260
872108	contig_5018_pilon	-	1212	9	Intergenic	novelGene_47029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_6	137.452207603225	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	5	1093	1397263	1392342	FALSE	65	CCAAAAAAAAAAAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397267	1392222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
872109	contig_2834_pilon	+	4848	1	Intergenic	novelGene_27967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	3947	4402	213515	213970	NA	35	ATAAAGTTTTGTCCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEGYPETQGNRNEVHNGQIRSPPDGMMAEELEVILKPAPRVQVSLEPVGLPPESLDEVSVEDLEAIPQRNPPNPADSLQRFRQFRYEDAAGPRDVLRHLQELAGQWLRPDIHTKEQIVEMLVQEQFQAVLPEELRARVQRYRPGVRITG	209568	214416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_209600_214400
872110	contig_8538_pilon	-	3525	15	Intergenic	novelGene_4608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.7734844548227	4	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	1041	2279	719044	688312	FALSE	25	TGCACACACCTATCCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGGTLIQHLKEHILHGNMGSNDIILYYTTIGWMMWNWMVSALATGASVVLYDGSPLVPTPNVLWDLVDRIGITILGTSAKWLSVLEDRNMKPVETHSLQTLHTILSTGSPLKAQSYEYVYRSIKSSVLLGSISGGTDIISCFVGQNVSIPVYKGEIQARNLGMAVEAWDEEGKAVWGESGELVCTKPIPCQPTHFWNDENGSKYRKAYFSKFPGVWAHGDYCRINPKTGGIVMLGRSDGTLNPNGVRFGSSEIYNIGTPCSTPSMARKWKWL	730423	687065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_688358_693720_693784_694501_694572_696235_696362_696886_697001_697666_697790_697928_697994_702430_702556_703455_703537_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672_724787_729514
872111	contig_8241_pilon	-	4248	9	Intergenic	novelGene_157494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	2812	3585	496708	478404	TRUE	15	CACCAGCTCTGCGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHASDELLQLPHAGPGLKVLYAWLPIGPNIDVELCLVSFGVHQAWLAGQDEWAQPDGVDLDVIVEGVQGLQHALHGHQHVLHHVVLFIQLAQGLALGQLQEGDLGRYHPTKEVAENGVVAEGDDVLELPEDAARVAVIVVPQGNVLQALLVSLQVVLHVLEEPRLVVVANAVQLAGLCFVRHDTRHDDGLIQGVEQPFHKVVLQPLGLAGELVTDILQAPHWLEPQPDVLLGRDDADLGGHQEAQCPTGPGHSIEQI	501182	464261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_464532_467588_467746_474528_474631_475326_475450_478392_478657_487429_487573_495998_496196_496527_496710_498372
872112	contig_4071_pilon	+	2063	2	Intergenic	novelGene_151892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	73	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	219	767	338050	338598	FALSE	45	AAAAAAACTATTTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALFLRRLTLQAIKTENNCIARCLEKHFLQKTAPAQLSVTVSVPRLPSLIHAKAFSVAEDAQDKKNKKKKTETALTSTGRKISERIIQVFDEKGNDLGSMHRADVIKLVDKRDLKLVKRNACTEPPVYQLMTGLQIHEERMRLREQDKAKPKTRRCFAVHSLNSLGRLISSLNSGIGQGSL	337266	339894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_337484_338048
872113	contig_2480_pilon	+	3282	1	Intergenic	novelGene_63499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	162	575	18102	18515	NA	30	AGGTAAGATCCTCCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNVHHRTHSGVKPYECNECGKSFYQNSALCRHQRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKSYECYECGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFYHKSAFNSHQRIHRKGNINVIDVERLL	17940	21222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_17900_21200
872114	contig_11160_pilon	+	2257	3	Intergenic	novelGene_168823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	1	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	294	560	318478	320734	FALSE	55	AAAAAGTTTTTAATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPPVRFPLIFIIFIIIIQKFHCC	318184	322431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319185_320667
872115	contig_6048_pilon	-	3119	1	Intergenic	novelGene_73185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTCTTCTGACCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337155	1334036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1334000_1337200
872116	contig_8954_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_130270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGGAGCTCTCAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112268	109354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_109400_112300
872117	contig_15092_pilon	-	2100	16	Intergenic	novelGene_57770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	113.782170054109	24	24	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	11	544	319745	304001	TRUE	35	TTTTTAAACTGAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENNMADGEEPMAVDGGCGDTGDWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQFLFRPKDVGRPKAEVAAEFLNDRIPNCNVVPHFNKIQDFNDTFYRQFHIIVCGLDSVIARRWINGMLMGGLKVLKEMPE	319755	295767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304040_304383_304449_304779_304824_310062_310144_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319725
872119	contig_10331_pilon	+	2072	2	Intergenic	novelGene_54128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_1	0	333	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	409493	410802	FALSE	60	AGATTAAAAGGAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGSDVCPSVESGVRSSGAGAERVSELELAATTATVWTFAPWELQRGLSPPSPGGQCDWGPGPPVQEGFFVFPLPPAREPERPPNKGAGESGVFEGIAAPES	409492	412568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752
872121	contig_9415_pilon	-	3142	25	Intergenic	novelGene_109711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	148.726538766063	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	151	1944	469696	449096	TRUE	20	TTCCAGCAACCCTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADVLHSRISGEIIELVLVKYQGKNWNGRFRISDTLPEFFLVCFSSDSAEVMTLDLSVHVRRVDSQMVLSVFSPYWLINKTSRVLQYRAEDTHVKHPANFRDIILFSFKKKNIFRKNKVQLKISTSAWSHSFSLDTVGSYGCVKCPANNMEYLVGVSIKMSSFNLSRIVTLTPFCTIANKSSLDLEVGEIVPDGSIPTNKWNYIASSECLPFWPERLSGKLCVRVVGCEESSKPFYYNRQDNGTLLSLEDLDGGILVDVNTAEHSTVITFSDYHEGAAPALIINHTPWDVLTYKQSGSQEEMELLPKQVRLFAWADPTGTRKLTWRYAANVGEHDLLKDGCGQFPYDANIQIHWVSFLDGRQRVLLFTDDVAVVSKARQAEEMEQADCELTLSLHSLGLSLVNNDSKQEVSYIGITSSGVVWEMKPKQKWKPFSQKQIILLEQSYQKYQVSGDRDWIKLDNNLEVNFGKVPMEMRLPVRCPIKRDFLSGIQVEFKQSPHQRSLRATLYWLQVDNQLPATVFPVIFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVIMRFNEYSKVLQFKYFMVLIQEMALKVDQGFLGAIVALFTPTTDPEAQRNRTKLIQQDIDALNTELMETSMTDISILSFFEHFHISPIKLHLSLSLGSGV	469846	425748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_425944_426277_426362_427729_427854_435521_435611_441090_441206_441717_441842_444547_444594_446110_446275_446895_446972_447788_447903_449028_449101_451200_451232_453010_453125_453247_453360_454143_454214_454332_454415_455172_455314_456371_456514_460019_460256_462550_462678_464335_464470_464744_464874_466631_466797_467514_467620_469495
872122	contig_5779_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_106515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	818	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAGGACTAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271043	273054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_271000_273100
872123	contig_6710_pilon	+	569	2	Intergenic	novelGene_95483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAAGAGCACAGTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
872124	contig_6365_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_134012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	315	948	120	1067	121179	122126	NA	20	GTGAATTGGTGATCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDHANHTWTQNFILAGFTTTGTLRSLAFLGTLCIYLLTLTGNRFIIVLVQADSGLSTPMYFFISVLSFLEFWYVSTMVSTLLHTLLHGHSPISSTLCFIQFYVFHSLGMTECYLLTVMALDRYLDICHPLHYHTLMSRQVQLWLAGATLAAGFSAALVPASLTATLPFCLKEVAHYFCDLALLMQLACVDIGWHSWVHIVVIGLINACNIVLILGLYGGILRAVLKLPSATSRAKAFSTCSSHMTVVTLFFGSAFIVYVGPPGIRAKGMDKFIALVYALFTPFLNPMIYNLCNKGVKEALRRVTQRIRAVLKGP	121059	122578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_121100_122600
872125	contig_8260_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_163249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163039	160927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_160900_163000
872126	contig_5549_pilon	-	3580	14	Intergenic	novelGene_81633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	616.775092552301	75	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	933	1301	448924	448556	TRUE	10	GAGTGTTGTCTGTGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGVNHHGCDLLCTTSIFSRRLILRPKPLLQIFSFDMYCSKNPNFILTPDPPVYYSCLHVPLSCSVDPKNGLPALYIRTLFNYLRTGGLLRGTQLPDIQHSTNLTSPVSLWSIMSWAKGAV	458828	438892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_439392_442018_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442936_443118_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_446410_446763_448045_448997_450981_451082_458068
872127	contig_5264_pilon	+	3327	8	Intergenic	novelGene_165052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	35	junction_1	145.267943849302	137	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	6	899	84216	299346	FALSE	15	TGTATCTACTTTGTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLIDGTNEVFMIDRDNSVFHVSNLEFPFRKDLRMHLSNTLLDGEMIIDKVNGQAVPRYLIYDIIKFNAQPVGDCDFNTRLQCIEREIINPRHEKMKTGLIDKTQEPFSVRNKPFFDICTSRKLLEGSFAKEVSHEMDGLIFQPPGKYKPGRCDDILKWKPPSLNSVDFRLKITRMGGEGLLPQNVGLLYVGGYERPFAQIKVTKELKQYDNKIIECKFENNSWVFMRQRTDKSFPNAYNTAMAVCNSISNPVTKEMLFEFIDRCATPSQGQKRKHHLDPDTELMPPPPPKRSRPLT	84210	301774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_84348_106357_106430_108835_109001_150369_150439_184831_184933_240710_240778_297604_297729_299182
872128	contig_7657_pilon	+	4094	3	Intergenic	novelGene_29996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.5	46	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTAAGTTCTTTCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57394	62981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_57481_57853_58158_59277
872129	contig_7457_pilon	-	1587	12	Intergenic	novelGene_31307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	538	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGCAAGAGGATAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195251	183054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_183194_183346_183478_186301_186467_187707_187764_188801_188957_189052_189171_189402_189537_189996_190062_190241_190334_190766_190822_192096_192192_194869
872130	contig_14796_pilon	+	4193	1	Intergenic	novelGene_159373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTCTGACAGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161506	165699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_161500_165700
872132	contig_20420_pilon	+	4135	1	Intergenic	novelGene_172479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCCCTATAAAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33501	37636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_+_33500_37600
872133	contig_1076_pilon	-	2217	11	Intergenic	novelGene_101102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	345.64496235299	6	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	854	1936	66339	53847	TRUE	15	CTGTATGTTTTTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKINKQLKRVLKKIVKEAHEPLAVADAKLGGVIKEKLNLSCIHSPVVNELMRGIRSQMDGLIPGVEPREMAAMCLGLAHSLSRYRLKFSADKVDTMIVQAISLLDDLDKELNNYIMRCREWYGWHFPELGKIISDNLTYCKCLQKVGDRKNYASATLSELLPEEVEAEVKAAAEISMGTEVSEEDICNILHLCTQVIEISEYRTQLYEYLQNRMMAIAPNVTVMVGELVGARLIAHAGSLLNLAKHAASTVQILGAEKALFRALKSRRDTPKYGLIYHASLVGQTSPKHKGKISRMLAAKTVLAIRYDAFGEDSSSAMGVENRAKLEARLRTLEDRGIRKISGTGKALAKAEKYEHKR	67192	51355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_51503_51839_51974_53846_53913_54272_54408_58874_59039_60172_60300_60972_61119_62029_62165_62596_62662_64378_64516_66231
872134	contig_960_pilon	-	3432	1	Intergenic	novelGene_108259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATAGACGGTACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607307	603875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_603900_607300
872136	contig_15732_pilon	+	1880	8	Intergenic	novelGene_88833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_2	375.417481897535	7	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	583	1059	97720	158242	TRUE	75	TAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYLYVRTHGVDHHQSSLNATDLV	11059	185796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53766_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_158174_158245_184977
872137	contig_15732_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_88880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTCCCAAGAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188637	190314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_188600_190300
872138	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	115	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
872139	contig_17198_pilon	-	3161	1	Intergenic	novelGene_62409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGTGTCAGTTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107878	1104717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1104700_1107900
872140	contig_2358_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_156095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACGTGTAAACATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42320	39956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_40000_42300
872141	contig_546_pilon	+	5220	1	Intergenic	novelGene_117197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCTGCACCACCCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83934	89154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_83900_89200
872142	contig_20882_pilon	+	3660	3	Intergenic	novelGene_178167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTATCTGACAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2276	6551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20882_pilon_+_2901_3054_3608_4068
872143	contig_9345_pilon	-	3216	8	Intergenic	novelGene_24521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_6	103.788835859063	449	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	507	1652	689727	675994	TRUE	30	CATGCTAGTGAACAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPQTQQEQQIQVQQPQQVQVQVQVQQSPQQVSAQQFSPQLTVHQPAEQPIQVQVQIQGQAPQPAAPSIQTPSLQSPSPSQLQAAQIQVQHVQAAQQIQATEIPEEHIPHQQIQAQLVAGQSLAGGQQIQIQTVGALSPPPSQQGSPREGERRVGTASVLQPVKKRKVDMPITVSYAISGQPVATVLAIPQGQQQSYVSLRPDLLTVDSAHLYSATGTITSPTGETWTIPVYSAQPRGDPQQQSITHIAIPQEAYNAVHVSGSPTALAAVKLEDDKEKMVGTTSVVKNSHEEVVQTLANSLFPAQFMNGNIHIPVAVQAVAGTYQNTAQTVHIWDPQQQPQQQTPQEQTPPPQQQQQQLQVTCSAQTVQVAEVEPQSQPQPSPELLLPNSLKPEEGLEVWKNWAQTKNAELEKDAQNRLAPIGRRQLLRFQEDLISSAVAELNYGLCLMTREARNGEGEPYDPDVLYYIFLCIQKYLFENGRVDDIFSDLYYVRFTEWLHEVLKDVQPRVTPLGYVLPSHVTEEMLWECKQLGAHSPSTLLTTLMFFNTK	706618	672624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_673591_675089_675181_675486_676107_679449_679565_681692_681848_682531_682710_689142_690175_706559
872144	contig_12270_pilon	-	356	2	Intergenic	novelGene_113999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	31	354	14409	13863	FALSE	15	TCAGTATGGTTATGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYY	14439	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
872145	contig_10341_pilon	+	1533	7	Intergenic	novelGene_47238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_2	31.228548192675	955	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	196	570	136498	156517	FALSE	40	TAATATTCAGGAATGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLKRFLYKKLPSVEGLHAIVVSDRDGVPVIKVANDNAPEHALRPGFLSTFALATDQGSKLGLSKNKSIICYYNTYQVVQFNRLPLVVSFIASSNANTGLIVSLEKELAPLFEELRQVVEVS	135965	157480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_136124_136460_136507_139287_139323_147431_147491_149233_149368_151628_151693_156443
872146	contig_19957_pilon	-	4231	1	Intergenic	novelGene_57723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTATTCCATGAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247042	242811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_242800_247000
872148	contig_1452_pilon	+	2282	4	Intergenic	novelGene_115119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGGTAATTTGCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86542	164055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_86875_88089_89388_99258_99685_163829
872149	contig_10134_pilon	-	2313	4	Intergenic	novelGene_16247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	790.073976845769	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATAAATGGATATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39862	32201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38565_38817_39584
872150	contig_14525_pilon	-	3326	23	Intergenic	novelGene_149796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_10	129.359044510595	141	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1093	3279	46	3324	740076	663948	FALSE	45	TGCTATGAAAAGACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNFLKSIKLVLEDKMTTAAERKYVNIRKRLDQLGYRQTLTVECLPLVEKLFSDLVHTTESLRKSKLSAVKAEKESANFDFVLEPYKVENARLCRENNELYLELMKLREQSGQQSKELKAALKKCARESDDLKFLNNQYVHKLKLLEKESKAKDEKIQLLQEKNLHAVVQTPGGKKRSIAFRRQRMQIDEPVPPSEVTSYPVPQPDDPYIADLLQVADNRIQELQQEVCQLQEKLAAMENGVRDYNKQIELREQEIERLSMALDGGRCSDILTLESRNKTNEKLIAHLNVQVDFLQQANKELEKHIQELMETKETVTTEVVHLSNKNEKLCQELTEIDQLAQQLERHKEEVLETADKEIGEAKKEIKRKLCEMRDLEETMSKLQLELDLCHKEKERLSEELLIKSDLETVVYQLEQEKQRLSKKVESFADKERELTLEVERMRLEHGIKRRDRSPSRLDTFLKGIEEERDYYKKELERLQHMIKRRSCSTNYFAREKVQVLKTPEKGDHNSEIHLIARERDELHCMLERFEKHMEEIQANVKLLTAERDKLSVLYNQAQEELSALRQESTQTTVSPNIVSLMEQEKERALSDLRRIMVEKEALREKLNTLQEKNLLGKSELEQTIEHLTCVNHQLENEKCELKSKVLIMSETVESLENKLKLQAQKLTHVAGDSSHQKTEMNSLRLVNEQLQRSLDDYQHRLSIKRGELESAQSQIKILEEKIDKLNLKVTSQDEETNVMKKTIGVIDKEKDFLQETVDEKTEKIANLEESLANKEKTIARMKITISEYDSSMNHLKDTLTNRDREISSLRRQLDAAHKELDEVGRSRDISLKENRRLQDDLTTMARENQEISLELEAAVQEKEEMKSRVHNYITEVSRWESLMATKEKENQDLLDRFQMLHNRAEDWEVKAHQAEGESSSVRLELLSIDTERRHLRERVDLLEKEIQEHINAHHAYESQISSMAKAMSRLEEELRQQEDEKAAVLNDLSSLRELCIKLDSGKDIMTQQLNSKNLEFERVVVELENVKSEADLLKKQLTSERHTIKNLESLLATNRDKEFHSHLSSHEKDTEIQLLKEKLTLSESKLTCQSRENTMLRTKVTQLQIDY	740121	663945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_664012_664938_665142_670997_671208_677498_677685_677949_678061_678897_679067_680357_680414_680962_681118_681207_681324_691176_691329_700829_700908_704983_705137_706028_706182_710927_711152_714085_714225_716350_716417_719802_720019_721332_721462_725878_725964_732383_732526_737125_737294_738286_738478_739963
872151	contig_11378_pilon	-	4504	1	Intergenic	novelGene_112236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGACTTCTCTATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330944	326440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_326400_330900
872152	contig_13496_pilon	+	2735	14	Intergenic	novelGene_107639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_11	312.24567402407	261	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	99	1841	343974	515244	FALSE	15	CCCCGGGCAAGACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLADESDSVDSADAEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSVIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFNLDDLQPWHPFGVDSVPANTENEGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPRGAPPLQDAAEWL	309331	516138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_309365_343908_344022_347585_347780_378499_378703_392486_392655_409208_409343_415282_415358_416490_416650_443901_444031_444828_444929_485013_485236_502185_502287_506201_506349_515181
872153	contig_7171_pilon	-	3313	1	Intergenic	novelGene_101323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2381	2707	1098924	1098598	NA	35	CAAAGCGAAGTTTCGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPFSTSSNWRVSQCPAARVASLLVSEARTRNGVSKGRGRSWAHALDRPRLGETAGPTPWHQLDFCSQPVSDWLQGPCSLHSCTSPLLQLPQELCAKTQFLGGYRAGN	1101304	1097991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1098000_1101300
872154	contig_7870_pilon	-	5785	2	Intergenic	novelGene_109016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	189	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3265	3573	539106	538798	FALSE	30	CCCAGCATATGCCAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQDKSSELIFFSKWEGGGDILRCEIVRSFLVFVHFPLMQIRRDHNSQGDPMGTKKRFIKSQLETEPHVGLTEGKTPETLHKTSWHLVEKHQLIVATLRIC	545480	536585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_541444_544553
872155	contig_12709_pilon	-	2275	7	Intergenic	novelGene_147394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_5	617.887642608985	104	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	78	920	59003	29115	FALSE	45	CAAGGACACTAAGGACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLVALTLLGVGLALIGERLWALRRRMNASREVEPVEPGNCHLIEGIDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59080	27759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_57378_57450_58929
872156	contig_11304_pilon	+	3227	3	Intergenic	novelGene_156735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.5	190	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1054	1527	555902	556375	TRUE	35	AATTAATTGATTGGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALETPWDSSALSCRDTMSRNRLDGKGFGFSLEEALYCLVRAVRAFSRRTAWLPLQSITTITTVTECPLCARHCFRRFNLRLFSHIILHSPLRFVFSVSSVKALRHRSTERLARVSEWKSQDSDAGRLSTAQPLYLQFVPYVVELGNNPPTHPKVS	554848	558773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_556650_557253_557668_557761
872157	contig_11978_pilon	+	2982	6	Intergenic	novelGene_62891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2361	2792	755898	759103	TRUE	30	CCGTAATCCACACGTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVGLALPELHHPRVQDIATPVFWLRHLSFLVEPLQFLILLSQILPIGDHRTLVADQSSNLAAFGAGVEVALGFLLRQLFHRSLHSHLLKDGSSFPFRLSTLVKKRKPSLPKPFSSNMRAEGFPSLVQVARHMALASPMSGH	753537	760301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_755961_756174_756249_756552_756694_757922_758022_759048_759180_760187
872158	contig_12740_pilon	+	1617	3	Intergenic	novelGene_159204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGCAAGAGTAAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29240	34568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_+_30009_31701_31859_33876
872159	contig_13349_pilon	+	3957	1	Intergenic	novelGene_161140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAGGAGTTGGTGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399491	403448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_399500_403400
872160	contig_383_pilon	+	212	1	Intergenic	novelGene_126078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGTGTACTAACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19356	19568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_19400_19600
872161	contig_16103_pilon	-	3846	1	Intergenic	novelGene_118893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	101	337	740645	740409	NA	20	GGAGCCCAGCAATCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIPFLPTCLSPLVKFKFPKDTVSPWVDTFVSTMNWSSPSLTEPKPNFSIALFRFICGFCLKRETPECLNARFRLIPSVLGPDLPQSTSALAVSCLKRWGVLGESLWNGRW	740745	736899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_736900_740700
872162	contig_4686_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_118545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCACAATATGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520101	522127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_520100_522100
872163	contig_12943_pilon	-	2842	1	Intergenic	novelGene_140364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAATAATGTACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88384	85542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_85500_88400
872164	contig_10734_pilon	-	2692	8	Intergenic	novelGene_51447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	71.5855418078146	13	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	642	1079	2222890	2217888	FALSE	10	CTTAATCCGTGTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEGGIIGIQIKWECNLDRAAALCLPSYSFRRLDNRDTKHNVSPGYNFRFAKYYTSPAGMEHRTLVKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINVGSGLALLGVATVLCDVIVLYCTRKRYYYREKKYKFVEDSEQVGHLLASRQA	2226433	2216274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2218017_2218269_2218336_2218455_2218550_2222650_2222788_2222878_2223204_2225534_2225632_2226095_2226169_2226275
872165	contig_12998_pilon	-	4231	9	Intergenic	novelGene_168964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_4	6.18339510301582	84	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	155	874	43998	24048	FALSE	40	TCCCCAACAAAGTACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCKDGLKGFTFSALRFIVGKEEIPTHSYSPEAAYAKVEQKREKHEEKPRRMNIIALVRKLVDSVCKHGPRHRCCKHYEDNCISYCIKGFIRMFSVGYLIQCCLRIPSAFRHLFTQPSRLFSLFYNKENFQLGAFLGSFVSIYKGTSCFLRWVRNLDDELHAIIAGFLAGISMMFYKSTTISMYLASKLVETMYFKGIEAGKVPYFPHADTIIYSISTAICFQAAVMEVQTLRPSYWKFLLRLTKGKFAVINRKVLDVFGTSASKHFQDFIPRLDPRYTTVTPELPIELS	46841	20690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_24181_25543_25612_28258_28358_32829_32907_33790_33855_37678_37847_41020_41091_43957_44105_46793
872166	contig_7182_pilon	-	1031	4	Intergenic	novelGene_117155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2351	junction_3	1797.04652756188	5	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	27	638	889282	887056	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889308	886662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168
872167	contig_7020_pilon	+	2277	2	Intergenic	novelGene_57070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	0	197	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	134	1483	102160	103509	FALSE	45	GAAAATAATCTTACATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98744	104303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106
872168	contig_2463_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_43016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1345	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGGCGGGGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440505	437617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_437600_440500
872169	contig_8671_pilon	-	2486	7	Intergenic	novelGene_126290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	17.9133717900592	502	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	116	1153	1006869	944195	FALSE	70	AGATTGAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGKLSTFRLPPLPTIREIIKLFRLQALKQLSQNFLLDLRLTDKIVRKAGNLTNAYVYEVGPGPGGITRSILNANVAELLVVEKDTRFIPGLQMLSDAAPGKLRIVHGDVLTFKIENAFPGSLKRQWEDDPPNIHIIGNLPFSVSTPLIIKWLENVSCRNGPFAYGRTQMTLTFQKEVAERLTASTGSRQRSRLSVMAQYLCSVQHLFTIPGQAFIPKPEVDVGVVRFTPLIEPVIAQPFQLVEKVVQNVFQFRRKYCYRGLGMLFPEAQRLESTGKLLQLAEVDPTLRPCQLSLTHFKSLCNVYRKMCDEDPQLFAYNFREDLKQNKSKNQNKEVHQESCGL	1006984	942861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_944439_947222_947351_974244_974365_986850_987003_988546_988656_1003442_1003595_1006736
872170	contig_9011_pilon	-	3564	14	Intergenic	novelGene_159260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAGGAAAAGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84662	16712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_16906_17159_17288_22859_23012_23216_23322_25060_25129_39754_39814_40827_40919_54160_54313_57340_57493_58682_58767_67683_67766_74081_74192_78329_78532_82676
872171	contig_12969_pilon	+	3470	2	Intergenic	novelGene_61658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTACTTCTGGGCCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145176	150200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_146670_148223
872172	contig_7426_pilon	+	1987	8	Intergenic	novelGene_27500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	336.550326769979	2233	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	150	992	952246	987945	FALSE	10	CCTTAGTCTGTGCGTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVGVSLRRRFPATTLGAACLQACRGAQTAAAVAPQIKKFAIYRWDPDKAGDKPRMQTYEIDLNKCGPMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIEDREKLDGLYECILCACCSTSCPSYWWNGDKYLGPAVLMQAYRWMIDSRDDFTEERLAKLQDPFSLYRCHTIMNCTSTCPKGLNPGKAIAEIKKMMVTYQEKKVSA	952096	988940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_952318_962052_962181_970075_970162_979923_980061_980784_980902_983658_983761_985081_985205_987867
872173	contig_5686_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_45428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAACACCACGCAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190230	188951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189000_190200
872174	contig_987_pilon	-	1612	14	Intergenic	novelGene_72288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	297.302746500807	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	408	1178	937261	916772	FALSE	45	TAAATATAAAAGCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEVIDKYTAVVKMIDSGDKLKLDQTHLETVIPAPGKRILVLNGGYRGNEGPFKRTQS	990634	916337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_916798_920124_920170_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_981633_981792_990589
872175	contig_5428_pilon	+	2965	1	Intergenic	novelGene_160425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242993	245958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_243000_246000
872178	contig_4852_pilon	-	2563	12	Intergenic	novelGene_153963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	71.0254290395203	122	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	59	1651	62078	26582	FALSE	15	GCTGTTGAGTTGATTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAGGCENISSQIAGPGVLMLLCSLLVIFAPVSEQSDWPTLLAPSSVFEGDSIVLKCQVKQNRKIKTMSYYKDGRELFLSTYVSNFLIQRALFNDSGQYHCAISGQFIFSWKKTSEAVKIKVQELFPPPVLTVSPSQLTEGTPVTLTCETWLPPQRLDTELQFFFFREDQSLGPGWSRSPELQIPTIWSQDSGSYWCEAQTVTHRVKKQSLKSHIHVQRVPVANVSLETQPPGGQAIEGGKLVLFCSVSEGTGNITFSWHKDATETSLGNKTQHSLSAELEILAVRESDAGKYYCRADNGHRPIWSEVNVTVRIPVSRPVLTLGLSGAQATVGDTVELHCEVRRGSPPILYWFYHEDVILGNSSASFGGGASFNLSLTSEHSENYSCEASNGLRAQRSHVVTLNVTGPDGYRRDLVIAKTLGGLFGVLGFVAVALLFYYWYQKTSGGSSAYNASRGPFSPGSQESTYSSPLPAVEELQLMYANDETTHPSPLTVTEELQPAYMNVGAADTDVVYSQVWCTQQTEGSANIRKTFLEIKDSSAIYSEVKKA	62136	25669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_26621_26715_26748_28559_28626_28870_29020_29871_29900_53855_53973_54425_54705_55148_55434_56315_56601_56835_57097_60689_60711_62047
872179	contig_3233_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_56502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	960	1325	62646	62281	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKIEVVKDFILLGSVINAHGSSSQEIKLCVALGKFAARDLFKALKSKDVTLRTKVHLTQALIFSVTSYAFESWTVNKEDRRGIDAFELWCWQRILNIPWTARRTNKCALEKYSQNAP	63605	60895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_60900_63600
872180	contig_19722_pilon	-	1688	3	Intergenic	novelGene_171900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_1	251.5	4906	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	32	403	157724	157353	TRUE	20	CCAAAGTTTTCTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKTFILRLENMRHLNNGNWILTGVFWEIGSTTLSCSSILLQFGNQFFRWIEDAIGLLVTDKATWGGAEMLQCTAFAEIMPALGDNWVLEGLATDETLEWYFLVIASHFIVFVIIDTIATLIKLTFDLPPMLVI	157755	149955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_150105_155354_155445_156306
872181	contig_12638_pilon	+	1940	17	Intergenic	novelGene_33180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	184.594815999123	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	226	1740	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	241235	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271073_271250_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
872182	contig_9807_pilon	+	2288	12	Intergenic	novelGene_32844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	697.844710282611	5	78	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	1	867	108990	140740	TRUE	10	CACCGTGCTCTGGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPATAPSPPGAVFRPVSGLGLASLSCSAVRANRPRALGERGGNKWRGCRSRSKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYALES	108989	159627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109558_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140728_140958_148960_149049_151711_151732_156624_156770_158676
872183	contig_12625_pilon	+	4773	2	Intergenic	novelGene_140483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	0	115	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	160	312	23327	23479	FALSE	30	GTAAATTCAATCTATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQVSCN	16759	27940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_16914_23321
872184	contig_12080_pilon	-	3756	1	Intergenic	novelGene_128360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCCTTGGGCAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95012	91256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_91300_95000
872185	contig_3825_pilon	+	2666	3	Intergenic	novelGene_78033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	37	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1492	2139	1939340	1939987	FALSE	15	CAGTGTGTGGTCTGCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPYIFGNRLGQDIIDLEQTATHLQLALNFTAHMAYRKGIILFVSRNRQFTHLIENTARSCGEYAHTRYFKGGLLTNAPLLFGPSVRLPDLIVFLHTLNNVFEPHVAVRDAAKMNIPTVGVVDTNCNPCLVTYPVPGNDDSPSSIHLFCRLFQTTISRAKEKRRQVEALYRLQGLQAAESRGPVDPPSPGTRTGVQSRDATALHLPDTDSSQASS	1935790	1940514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1935860_1936308_1937727_1939335
872186	contig_2033_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_71544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165954	168594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_166000_168600
872187	contig_11160_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_168845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328188	325842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_325800_328200
872188	contig_14516_pilon	+	4632	1	Intergenic	novelGene_153931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTATCCGTATAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301001	305633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_301000_305600
872189	contig_7843_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_152028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGCACATAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259567	261785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_259600_261800
872190	SIRV6	+	784	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16403	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10236	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
872191	contig_20058_pilon	+	2151	6	Intergenic	novelGene_109281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTCCTCCTTTCTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23469	41157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_+_23876_30512_30703_32764_32921_33553_33666_39196_39703_40376
872192	contig_7861_pilon	+	3415	1	Intergenic	novelGene_77415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2835	3152	138050	138367	NA	70	ACAGGAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTRRNLFSHSLVGYKSKFRASAPGQGFLCQLWMKVLVINLPMVWERLSTGTSGPKDALCCRCFFLNGMRSPILCFLPFPFISWEIKGGVGHTLGKLLYIGSGM	135215	138630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_135200_138600
872193	contig_4736_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_168635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_1	10.3387082795139	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	542	877	295424	292406	FALSE	15	CCATCCCAGCTTTCTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAREGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSNKTKKSKDPDICKLIKKIYF	299396	291601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_292512_293020_293179_295352_295431_298861
872194	contig_16098_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_46239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGCCCAGAATCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768125	767233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_767200_768100
872195	contig_16594_pilon	+	3512	1	Intergenic	novelGene_53864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAAATGGCAGTGGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137099	140611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_137100_140600
872196	contig_5018_pilon	+	3103	2	Intergenic	novelGene_46932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	9	junction_1	0	581	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1175	1543	208376	208744	TRUE	25	TTCTTGGAACGATCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCASPAGAGEGHLCSFCTTQRQKTKSRSNIETKNLSPFWHQVSVLSSWTPARRQSPSWGVYLTTCPRTRGLSLLPSPMAQGRHPHTQRCFCQDGCAVCPFEFLLLVYCFWDSGPGRLGFVPI	207201	210478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_208855_209028
872197	contig_12886_pilon	-	3255	13	Intergenic	novelGene_135453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	65	junction_1	80.4229703919637	125	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	1710	3071	268487	234310	TRUE	35	TGCAAGCACCTCACCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFGKLAPHHPFPLTLFLSWPLPCSTDSFRGGLDVMHGQTGVESVYTVFRDREIMFHVSTKLPFTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQAENPGTDTPSYKVSVTAREDVPAFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDDLHGHTQAMLGLGPEEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGSQKKQHSGGIPGSLSGGISHNSVEVTKTTFSPPVAAATAKNQSRSPIKRRSGLFPRLHTGSEGQGDSRTRSDSASSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEICPNKEKAFMKLKENGRANISRSSSSTSSFSSTAGEGEVMEECDSGSSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPGLGAAATPIIMSRSPDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSSAGH	270196	233031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_233186_234279_234319_235305_235383_239325_239450_240137_240256_240515_240630_241878_241998_243643_243782_255194_255330_258973_259061_259812_259885_265914_266071_268274
872198	scaffold_12124_pilon	+	1618	3	Intergenic	novelGene_22080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	483	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855688	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_856049_857165_857236_857793
872199	contig_6842_pilon	-	3358	1	Intergenic	novelGene_130782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2135	2545	1375808	1375398	NA	30	GTTTCAAAGGCCATGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALRPTRCLGRGGEDASLEIGHDCPHLTNEETEAQRLNAFPRLHHVSGRLGTPGLPRGVAAGGQPSGEESWFLRQKSMPSHLWLKEEIPSSSASPNLLSPNSLSPDASLSQTAGPTTARVTFWYKQLLFPLLAQP	1377942	1374584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1374600_1377900
872200	contig_14575_pilon	+	2962	9	Intergenic	novelGene_101908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	43.0724317284269	182	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	236	298	108519	108581	TRUE	20	TAGCAGCTTACTGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLVDAVLYEWESYFASVEEELETIDSQLEDKVDEVKSGTWVSEITKVLSLPVFDKTYWPDRDWRNPESTAPGHLFSSVMKSLPRFTLQPKIRRAHRTK	107179	117766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_107256_107681_107772_108449_108645_109654_109822_111287_111566_113159_113278_113464_113615_114719_114813_115971
872201	contig_19061_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_173512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	584	901	48352	48669	TRUE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRSLFSHSPVGYKSKFRASAPGECFLHQLRRKVHVINLPLVWEILCAGTSGPKDALCSQHCFLGGMRFLCASAHFSLLYLKRDCIKTLSNLVNLISIPSSQ	47768	49977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_49413_49567
872202	contig_6076_pilon	+	1860	2	Intergenic	novelGene_81739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTCTCTTGGCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53908	55865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_55407_55503
872203	contig_15114_pilon	+	1152	2	Intergenic	novelGene_121108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	29	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTCCCACCTCGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69081	78611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_69359_77736
872204	contig_9848_pilon	+	1585	11	Intergenic	novelGene_79915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	149.414858698859	1376	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	862	1320	85927	95315	FALSE	10	CAGTTTGGGAGCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIEKEKVRYTDDGLEAIIFTAQGDMRQALNNLQSTFLGFGFINSENVFKVCDEPHPLLVKEMIQHCVNADIDEAYKILAHLWHLGYSPEDIIGNIFRVCKTFQMAEYLKLEFIKEIGYTHMKIAEGVNSLLQMAGLLARLCQKTMAPVAS	58793	95580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_58920_75091_75162_77678_77721_78015_78123_79977_80080_81702_82046_85855_86014_86730_86797_88692_88774_90104_90219_95204
872206	contig_16098_pilon	-	1111	9	Intergenic	novelGene_45955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1526.83045882639	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	45	986	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354033	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350376_352297_352352_353990
872207	contig_2894_pilon	-	2785	2	Intergenic	novelGene_86563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	471	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	70	375	843031	842726	TRUE	45	CTCAATAAATGTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPTRAATARSRAPPDLSPPRSASLRGLVLSAEKDWTALATQKATGVVSRASGGSATCSARARRQRRAYAKSRRQLRWREKRSRAVSSAGARSQVCFSFAG	843100	839853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_842184_842645
872208	contig_18799_pilon	+	3270	1	Intergenic	novelGene_171416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTATTGTTATATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16713	19983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_16700_20000
872209	contig_14441_pilon	+	1004	5	Intergenic	novelGene_100340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.8608706276416	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	521	964	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5975	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6032_6644_6913_121824_121872_125517_125902_126496
872210	contig_8631_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_121957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTTTGTTTCTGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706544	708809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_706500_708800
872211	contig_9706_pilon	+	3139	1	Intergenic	novelGene_20914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTTAATCTCCATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120844	123983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_120800_124000
872212	contig_17427_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_30391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGTTATATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201110	198427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_198400_201100
872213	contig_7963_pilon	+	1241	6	Intergenic	novelGene_58571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	206	junction_1	135.080124370686	3398	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	172	1002	254707	257509	FALSE	10	TGAGTCTGTGTTGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLEVCGASRGQREDWALPGVGSRHRSDVGHYSFSKRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGDRERNVQIEMAHGTTTLAFKFQHGVIVAVDSRASAGSYIANLRVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMCQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNTYAYGVMDSGYWPNLSPEEAYDLGRRAIVHATHRDSYSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYRETNQ	254535	257748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_254854_255604_255753_255911_256024_256447_256578_256972_257178_257420
872214	contig_7362_pilon	-	2828	1	Intergenic	novelGene_147544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTATCTCCTAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318968	316140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_316100_319000
872215	contig_1406_pilon	-	3633	2	Intergenic	novelGene_25582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGAGATGCGGGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2183029	2173759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2173836_2179472
872216	contig_15105_pilon	-	3326	1	Intergenic	novelGene_150941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGTATTATAAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327463	324137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_324100_327500
872217	contig_3818_pilon	+	1688	10	Intergenic	novelGene_99246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_9	359.262344393015	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	15	1313	451023	455535	FALSE	10	TTTCTTCTGTCTTTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCTHDHFNAETVTKTVENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	451008	455910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_451044_451469_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
872218	contig_19778_pilon	+	2853	1	Intergenic	novelGene_143753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTGAAAAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8263	11116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_8300_11100
872219	contig_709_pilon	-	2131	8	Intergenic	novelGene_57650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	100.963723531711	100	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	82	1224	3772541	3760137	FALSE	10	TTCCCCAGCTCAGTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSNEFKLNQPPEDGISSVKFSPNTSQFLLVSSWDTSVRLYDVPANSMRLKYQHTGAVLDCAFYDPTHAWSGGLDHQLKMHDLNTDQDNLVGTHDAPIRCVEYCPEVNVMVTGSWDQTVKLWDPRTPCNAGTFSQPEKVYTLSVSGDRLIVGTAGRRVLVWDLRNMGYVQQRRESSLKYQTRCIRAFPNKQGYVLSSIEGRVAVEYLDPSPEVQKKKYAFKCHRLKENNIEQIYPVNAISFHNIHNTFATGGSDGFVNIWDPFNKKRLCQFHRYPTSIASLAFSNDGTTLAIASSYMYEMDDTEHPEDGIFIRQVTDAETKPNFCDATGSCSVPAAHGSPSELPKKVRLFHSLQSTGKGLLTLNSSQKRGGRAFLHWEF	3773034	3759229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3760309_3764736_3764954_3765207_3765386_3767119_3767279_3769806_3769959_3771705_3771776_3772346_3772542_3772953
872221	contig_10323_pilon	-	2745	6	Intergenic	novelGene_123566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	145.336024439916	455	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1673	1981	450817	447053	FALSE	30	AGAATTTAGCAATGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQRDANRQISDLKFKLAKSEQEITALEQNVIRLESQVSRYKSAAENAEKVEDELKAEKRKLQRELRSALDKTEELEVSNGHLVKRLEKMKANRSALLSQQ	453969	446288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_447164_448195_448301_449824_449905_450804_450923_452277_452328_452452
872222	contig_10451_pilon	-	4988	7	Intergenic	novelGene_138336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_6	67.878977272463	276	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	122	1237	563720	512654	FALSE	30	GCCTAAGTGCTAAGAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYTSSAIVAAINALSTDSSLDLGDGVPVKARKTTLEHTAAMALKVEPAGEDPGATPPAATFSPEEFPTFQHIRKGAFCDQYLSVPQAPCPWVKPKPLSPASYMSPSLPALDWQLPPHSGPYELRIEVQPKSHHRAHYETEGSRGAVKASAGGHPIVQLHGYLENEPLTLQLFIGTADDRLLRPHAFYQVHRITGKTVSTTSHEAILSNTKVLEILLLPENNMRAIIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPQPGGRTLSLQVASNPIECSQRSAQELPLVEKQSTDSYLVVGGKKMVLSGHNFLQDSKVIFVEKAPDGHHVWEMEAKTDREMCKPNSLVVEIPPFRNQRITSPVQVNFYVCNGKRKRSQYQHFTYLPANGNTVFLTLAAENERMGCFF	563841	508902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_512846_517614_517671_527495_527637_529154_529328_531209_531413_549533_549694_563529
872223	contig_10599_pilon	+	2167	12	Intergenic	novelGene_49905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	94.8061092288226	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	620	1627	329169	350466	FALSE	70	GAAAAAAAAAAACCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLLVYGSWFQPTIERVAINSKEPHVCLVRDISSCWAPKVETAITKVRTPVMNSEAKVLVPGIPGHCAVVKPVTPQAEELESKRKLGENEVSIEERLGAMDIDSKKGKDDLPQTNSFPVLLTQGLESNDFEMLNKVLQTRNVNLIKKTVLRMPLHAVIPLLQELTKRLQGHPNSAVLMVQWLKCVLTVHASYLSTLPDLVSQLRTLYQLLDSRVRTFQKLSHLHGKLILLITQVTASEKTKGMTCPGQKAKLVYEEESSEEESDDEIADKDSDDNWDEDEEEKESDKDEDVDEEHEEEDAEEKDEENGEDRDVTSEKELNGDSDLDSENESEEE	326453	351006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_326955_329050_329223_330609_330697_331544_331677_332440_332573_339955_340043_341748_341781_342815_342880_345408_345523_346239_346310_350123_350174_350280
872224	contig_9113_pilon	-	3318	1	Intergenic	novelGene_68596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352215	348897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348900_352200
872225	contig_7182_pilon	-	4551	1	Intergenic	novelGene_117091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGAATAGCAGCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94592	90041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_90000_94600
872227	contig_7182_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_117099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93767	91574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_91600_93800
872228	contig_11335_pilon	-	3184	1	Intergenic	novelGene_104926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCAGTTCAGCTGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410003	406819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_406800_410000
872229	contig_10734_pilon	-	2014	7	Intergenic	novelGene_51479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	649.111443949856	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	935	1525	2267149	2265543	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2281238	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2274372_2274510_2275750_2275885_2277109_2277191_2280839
872230	contig_401_pilon	-	4505	29	Intergenic	novelGene_42727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.1021422990076	349	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1216	3651	61	3711	156146	103473	FALSE	0	GCCTTTGTGTTCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSGRSFPVAGRRRGPGSASAMLPYTVNFKVSARTLTGALNAHNKAAVDWGWQGLIAYGCHSLVVVIDSNTAQTLQVLEKHKADVVKVKWARENYHHNSGSPYTLRLASADVNGKIIVWDVAAGVAQCEIQEHVKPIQDVQWLWNQDASRDLLLAIHPPNYIVLWNADTGTKLWKKSYADNILSFSFDPFDPSHLTLLTSEGIVFISDFSPSKPPSGPGKKVYISSPHSSPAHNKLAAATGAQKALNKVKILITQEKPSAEFITLNDCLQLAYLPSKRDHMLLLYPREILILDLEVNQTVGVIAIERTGVPFLQVIPCFQRDGLFCLHENGCVTLRVRRSYNSICSTSDEELDPDPVQELTYDLRSQCDAIRVTKTVRPFSMVCCPVNENAAALIVSDGRVMIWELKSTVCNRGSRNSSSGVSPLYSPVSFCGIPVGVLQNKLPDLSLDNMIGQSAIAGEEHPKGSILQEVHLKFLLTGLLSGLPPPPFAVRMCPPLTTKNIHMYQPLLAVGTSNGSVLVYHLTSGLLHKELSVHSCEVKGIEWTSLTGFLSFATSTPNNVGLVRNELQLVDLPTGRSIAFRGERGNDESPIKMIKVSHLKQYLAVVFKDKPLELWDVRTCTLLREMSKNFPAITALEWSPSHNLKSLRKKQLATREAMARQTVVSDAELSVAESSVISLLQEAESKSELSQNISAREHFVFTDNDGQVYHLTVEGNSVKDSARIPPDGSMGSITCIAWKGDTLVLGDMDGNLNFWDLKGRVSRGIPTHRSWVRKIRFAPGKGNQKLIAMYNDGAEVWDTKEVQMVSSLRSGRNVTFQILDVDWCTSDKVILASDDGCIRVLEMSMKSTCFRMDEQELTEPVWCPYLLVPRASLALKAFLLHQPWNGQCTLDISQVDYPENEEIKNLLQEQLNSLSNDIKKLLLDPEFTLLQRCLLVSRLYGDESELHFWTVAAHYLHSFSQDKSAAPRETVNNPLDICYDILCENAYFQKFQLERVNLQEVKRSTYDHTRKCTDQLLLLGQTDRAVQLLLETSADNQHYYCDSLKACLVTTVTSSGPSQSTIKLVATNMIANGKLAEGVQLLCLIDKAADACRYLQTYGEWNRAAWLAKVRLNSEECADVLKRWVDHLCSPQVNQKSKALLVLLSLGCFSSVAETLHSMRYFDRAALFVEACLKYGTMEVNEETDKLIFAVYADYARSLKNLGFKQGAVLFASKAEAAGKDLLNELECPKEERMDE	156206	102678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_103629_104959_105042_105765_105912_106335_106434_106920_107087_107606_107703_108434_108589_109388_109455_110558_110622_111749_111859_115173_115346_115719_115835_116262_116370_121185_121334_122008_122134_124024_124134_128831_128908_130918_131026_135687_135773_139311_139489_142805_142910_143205_143402_144457_144573_144953_145120_147371_147559_148926_149101_150029_150184_154922_155035_156060
872231	contig_11978_pilon	-	3194	5	Intergenic	novelGene_63049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	8.1967981553775	240	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2031	2372	1800665	1797886	TRUE	15	ACTGCTCATCTCTTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDIGGQEALRSTWNKYYSKTEFIILVIDSTDRDRLLTTREELYKMLAHEALRDASVLIFANKQDVKDSMTTVEISQFLTLSAIKDHPWHIQGCCALTGEGFHTLCQASVAYS	1802695	1796557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1797341_1797846_1797926_1798938_1799091_1799629_1799714_1800599
872233	contig_13901_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_146655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCTGATAAAGATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234391	236897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_234400_236900
872234	contig_15327_pilon	+	2136	1	Intergenic	novelGene_70547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTCATACCTTCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543517	545653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_543500_545700
872235	contig_10003_pilon	+	2772	1	Intergenic	novelGene_88225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1337	1651	602754	603068	NA	40	ATTGACTCAACAGCAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLYTLKWKLLIQYTKEKKEYKNKNLGKMYVCSFESLLVMHSITKWKLLGPNPHSRSKWPQECVRAAKEDLVAQWLKCSAHNRKVGGSNPPASAGEICGSLLP	601417	604189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_601400_604200
872236	contig_8452_pilon	-	2656	10	Intergenic	novelGene_47967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	400.937727993257	20	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	135	962	145829	85269	TRUE	45	TTTGAATAGTGAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIGCYITDKGHAKDACVISSEFHERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKRFHVRFLSSRSTQSRCLVLSWEGFCHLGVSLYSFSSF	145963	73769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85381_105921_106047_107383_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
872238	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_94080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
872240	contig_2414_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_158488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATTAAAAAGACAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298677	298068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_298100_298700
872241	contig_7962_pilon	+	5939	1	Intergenic	novelGene_149285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108566	114505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_108600_114500
872242	contig_9807_pilon	+	2551	13	Intergenic	novelGene_32862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	562.188481640178	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	106	1425	109130	149084	TRUE	15	AGCACCGTGCTCTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQVCGGLIFGWKR	109024	159625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149112_156619_156770_158676
872243	contig_1867_pilon	-	2882	1	Intergenic	novelGene_54622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATGGAAAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562634	559752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_559800_562600
872244	contig_16098_pilon	-	1599	11	Intergenic	novelGene_45969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1403.57257026489	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	117	926	352350	349639	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVRNPAGACSICIRGKDPDHRLQPHERAAGGAVGHEAPGGAAVPAGAGHEQWRPAALL	354105	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349243_349369_349493_349604_349710_349955_350055_350232_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
872245	contig_8720_pilon	-	3448	9	Intergenic	novelGene_173763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	121.540116833908	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	246	1595	24918	6253	FALSE	25	AATGGTTGCGTAGTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEGYFIRYVDVMANSSDEDFLHLRSLTLVIADGSEIQEETQSLVARNGKVPAGIFGTVCSTWVGTYEMKIGAITFQVATGDITKERADVIVNSTTRTFNLKSGVSKAILEGAGPAVENECAVRAAQGHQDFIVTRGGHLMCRRIIHVIGDNNVRKTVYDVLQECKKRQYASVCLPAIGTGNAGKNPATVADDTINGVGDFVGKHSTGSLKIVKVVILLPHLLNVFYNSMKKRESLMSPTFQFTFSGTASDVPEHWSDMNQQQPCLVQLQPRLSEYKTVMGKFNQTCHSYTIEKIERVQNTLLWKSYQLKKSHMDAKNGHIINEKLLFHGTDAGSVPHINQHGFNRSYAGKNAAAYGKGTYFAVDACYSANDAFSKPDENGRKHMYVVRVLTGLYARGHAGLLAPPAKNPENPTELYDSVTDDKHHPQIFVVFSDDHAYPEYLITFRC	35939	4399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8720_pilon_-_6543_7043_7219_8522_8657_12385_12593_16676_16845_19343_19407_20922_21073_24755_24950_35725
872246	contig_19918_pilon	+	2075	6	Intergenic	novelGene_172971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	44.2854377871553	845	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	432	902	36831	49125	FALSE	25	AGAACTCTGGTGTCCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCRKNLDSTTVAVHGEEIYCKSCYGKKYGPKGYGFGQGAGTLSMDKGESLGIKQEEAAGHRPTSNPNTSKFAQKIGGSERCPRCNQAVYAAEKVIGAGKSWHKSCFRCAKCGKGLESTTLADKDGEIYCKGCYAKNFGPKGFGFGQGAGALVHSE	26143	50298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19918_pilon_+_26463_36718_36832_42375_42545_43441_43572_48520_48615_49048
872247	contig_18392_pilon	+	4271	2	Intergenic	novelGene_143099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	0	90	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	19	2253	230586	248183	FALSE	45	TTCATTTAAATAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGLAIMEEELHHSHCVNCVSRRCMTRPEPGISCDLIGCPLVCGAVFHSCKADEHRLLCPFERVPCLNSDFGCPFTMARNKVAEHLETCPASVVCCTMEWNRWPVSYADRKSYENLSRDVDEVAQLDMALALQDQRMLLESLKVATMMSKTTDKVSEAREQISVKSSVPEVPHTNGLVSVHEESYGALYQATVETTRSLAAALDILNTATRDIGMLSTSLCVSQNEIDEEQNTREGLQDRNLKDQDPLYDYEIGVVGGIDHNDTNQNAQPEQNGSSDVLCDLDTRSHGTSALCNGFPLENICTQVQNQNLHGDSKQTNLTNGECVASDDASEPSSSLSVAAQLREVIPSNPLPNGTVQHILMPNDEDEGELCQRKVDLGDLRDMNVLPFGIHSFKFLSNSCWSKPKEDKAVDTSDLEVAEDPMGLQGIDLITAALLFCLGDSPGGRGISDSRMVDVYHIDFGTQTFSLPSAILATNTMVGEIASASACDHANPQLSNPSPFQTLGLDLVLECVARYQPKQRSMFTFVCGQLFRRKEFSSHFKNVHGDIHAGLNGWMEQRCPLAYYGCTYSQRRFCPSTQGAKIIHDRHLRSFGIQPCISTVLVEPARHCVLGLHSDHLSSLPFEVLQHIAGFLDGFSLCQLSCVSRLMRDVCGSLLQSRGMVILQWGKRKYPDGKSSWQIKEKVWRFSTAFCSVNEWKFADILSMADHLKRCSYNIVEKREEAIPLPCMCVTRELTKEGRSLRSVLKPVL	230567	250201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_+_232617_247979
872250	contig_5018_pilon	+	1743	3	Intergenic	novelGene_47155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_2	202	92	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	118	441	1498209	1498621	TRUE	10	CGAATCTGTGTCGGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGAAACAALTGPHTQHDLGKGRQKALLGALTRSGSQLSVMASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWYDGGREEGGVQLGPHLRARAV	1498091	1500521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1498312_1498400_1499588_1500185
872251	contig_3866_pilon	+	3531	1	Intergenic	novelGene_112422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTCTAGTTCATTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230740	234271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_230700_234300
872252	contig_6510_pilon	+	2952	14	Intergenic	novelGene_173520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_8	86.362933096426	163	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	79	1536	213632	237127	FALSE	35	TAATTTGGACCCAAAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQLDIKQLISKKIRLTVEAEQLKPFFMKEVGSHFDDFVTNLIERSTSLDSGGCALTSFSVLEGEKNNHRAKDLRAPPEKGKLFIMRRSLLDELFEVDHIRTIYHMFIALLIIFILSTLVVDYIDEGRLVLEFSLLSYAFGKFSVVIWTWSTMFLSTLLIPYFLFQHWASGYRKSSHPVLRSLVCGSLFMFFQIGGLGFGPTYVVLAYTLPPASRFIVILEQIRFVMKAHSFIRENVPRVLDSAKEKSSTVPIPRVSQYLYFLFAPTLIYRDSYPRTPTIRWGYVATQFAQIFGCLFYVYYIFERLCAPLFRNIRQEPFSARVLVLCVFNSILPGVLILLLTFFAVLHCWLNAFAEMLRFGDRMFYKDWWNSTSYSNYYRTWNVVVHDWLYYYAYNDFLWFFTKRFKSAAMLAVFAVSAIVHEYALALCLSFFYPVLFVLFMFFGMAFNFIVNDSRKRPIWNVMMWTSLFLGQGILLCFYSQEWYARQHCPLKNPTFLDYVRPRSWTCHYVF	205788	238543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_205849_213613_213766_214962_215023_216904_217013_217847_218131_219008_219088_219584_219667_222121_222168_223110_223241_224977_225076_233468_233568_234248_234385_234967_235114_237070
872253	contig_10000_pilon	+	1976	10	Intergenic	novelGene_139306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	372	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTGGTCAAACATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158966	236702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_159881_162494_162641_163709_163785_167964_168068_168529_168639_182893_182948_192584_192800_225788_226009_234052_234130_236639
872254	contig_16098_pilon	-	1368	10	Intergenic	novelGene_46050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1269.13421446315	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	209	1276	350768	348413	FALSE	60	AAAATAATAATAAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352240	348320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152
872255	contig_7870_pilon	-	3020	1	Intergenic	novelGene_109090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGACAGAAAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816114	813094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_813100_816100
872256	contig_19994_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_178168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAATGCTTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20980	18678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19994_pilon_-_18700_21000
872257	contig_11304_pilon	-	4420	1	Intergenic	novelGene_156728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2496	2879	472085	471702	NA	40	AGATGGTCTTGATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSSRETDTSPIHPPPPILQKECYCGDHPYQSHRLLKYQINGAMSVGILINFLKSSGYFSLVLGCRAFEYLFPKTQDTGEAALVRQFIWFMISFSPFPLWQNLREEEARLTTLGLPMPSHASTSAF	474580	470160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_470200_474600
872258	contig_1339_pilon	-	2995	1	Intergenic	novelGene_163119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1068	1376	339448	339140	NA	30	CCTCCCCAGGTCCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTLYLCTSSLQNWERIHFYCCKPPSLWYAVTAALGYSYRTHKWAWLPHSRSLTPKQTPGGPSHGEAAPPEVSLTHGTGESNVAHSHCHPPARACTEGWS	340515	337520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_337500_340500
872259	contig_5337_pilon	-	8210	2	Intergenic	novelGene_136570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	371	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	66	2783	384110	370407	FALSE	50	GGCTTAAGCATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGPSVLLSLRRPGIRGAATTMSHLKMRSTEDEESTEKYENFGNAESKWPKIEGLHKDYVQEPKVGETCDWDYKVENQLEKTEGKRMKEEKSVIREKIGKAKNMAHVKTEQENEASEKSLHLSSKYVVHNTVSVEQKNSERGKCMENINGNSYSSLQQKTTTVKKSHKCDECGKSFKYNSRLVQHKIMHTGEKRYECDDCGGTFRSSSSLRVHKRIHTGEKPYKCEECGKAYMSYSSLINHKSTHSGEKNCKCDECGKSFNYSSVLDQHKRIHTGEKPYECGECGKAFRNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDICGKTFSNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDECGKAFITCRTLLNHKSIHFGDKPYKCDECEKSFNYSSLLIQHKVIHTGEKPYECDECGKAFRNSSGLIVHKRIHTGEKPYKCDVCGKAFSYSSGLAVHKSIHPGKKAHECKECGKSFSYNSLLLQHKTIHTGERPYVCDVCGKTFRNNSGLKVHRRIHTGEKPYKCDVCGKAYISRSSLKNHKGIHLGEKPYKCSYCEKSFNYSSALEQHKRIHTREKPFGCDECGKAFRNNSGLKVHKRIHTGERPYKCEECGKAYISLSSLINHKSVHPGEKPYKCDECEKAFITYRTLINHKKIHLGEKPFKCDVCGKSFNYTSLLSQHKRVHTREKPFECDRCEKVFRNNSSLKVHKRIHTGEKPYECDVCGKAYISHSSLINHKSTHPGKTPFTCDECGKAFFSSRTLISHKRVHLGEKPFKCVECGKSFSYSSLLSQHKRIHTGEKPYVCDWCGKAFRNSSGLTVHKRIHTGEKPYECDECEKAYISHSSLINHKSIHRGEQPYNCECGKSFNYRSVLDQHKRIHTGKKPYRCNECGKAFNIRSNLTKHKRTHNGEEFLNVTYVGNHSSASQKRTLEGGNVLDGTRMRISL	384175	364979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_373124_384109
872260	contig_1443_pilon	+	714	2	Intergenic	novelGene_28172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	106	411	344287	344592	FALSE	25	TAATGAGTGAGAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSLNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343583	344895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343594_344191
872262	contig_9955_pilon	-	2981	8	Intergenic	novelGene_21363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	2591	2980	288033	276014	FALSE	5	TCCGCTGCGTCGTCCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRGDTFRVTFCSFFPLALAVATILLTAAADSSSPLGCSTSVMPKYLRLKSIPSSSVSRVSVQFSGSFRCRPAPPQLCLAMLGLRISARPADLSASMARSDCRGQNSVRKNFPPGPGGARSALSLPPRE	302820	276012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_276199_286696_286839_287970_288082_290373_290491_296338_296411_296790_296880_297407_297563_300711
872263	contig_14924_pilon	+	3058	12	Intergenic	novelGene_104160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_9	50.4457813846127	6	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	432	1259	45598	51296	TRUE	20	GTCTGAGCTGAAGTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSALQMAFFRQHGCTANDANTKYNSRAAQMYREKIRQMGSAALARHGTDLWIDNMSSAPSHSPDKKDSDFFTEHTQPPVWDAQATEPSETQQPAPPAKSSGLAQLEHGPNTDLLATSPKASLELKTSIIGKKKPAAAKKGLGAKKGLGAQKVSSQSFSEIERQAQVAEKLREQQAADAKKQAEESMVASMRLAYQELQIDRKKEEKKLQNLEGKKREQAERLGMGLVSRSSVSHSVLSEMQVIEQETPASAKSSRSQLDLFDDVGTFASGPPK	45166	54944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_45751_45838_45920_46743_46826_47099_47157_48219_48273_48758_48896_49018_49151_51163_51507_52532_52660_52817_52912_53029_53149_53695
872264	contig_3627_pilon	+	1968	15	Intergenic	novelGene_78567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	130.914288832076	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	150	1322	1299425	1307800	TRUE	20	TACAGATGGTGTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299275	1308534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301484_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665_1307864_1307951
872265	contig_12638_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_33336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGATTTTAAGAATACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332292	1334324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1332300_1334300
872266	contig_3382_pilon	+	1891	2	Intergenic	novelGene_124192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1245	1640	992705	993204	FALSE	0	TTTTGCTTTGCTGCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWRTLESRMGYRTVLPRVGTAPTLQDTCYPWLHPLNANNSPPDYETSNTPNNFQTTTQALGRKAWQFTFKRVKTLWSTVYSDARGVAMMPTQRQLVFFSFFYFHEVSRLSDPCLPNHRFLKYFAPCFVHF	991460	993455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_992880_992983
872267	contig_13048_pilon	+	3689	11	Intergenic	novelGene_138909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_9	26.6272416896681	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	98	1561	288389	344404	FALSE	30	AAGATCTTATTGGTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILAQTLGLSYSEVIETLPDGTERLVNSAEFTGMTRQDAFQALTQKARRKRVGGHVTSDKLKDWLISRQRYWGTPIPIVHCPACGPVPVPLEDLPVTLPSISSFTGKGGSPLATASEWVNCSCPRCKGAATRETDTMDTFVDSAWYYFRYADPHNTQSPFNTALADFWMPVDLYIGGKEHAVMHLFYARFFSHFCHDQKMVKHREPFHKLLAQGLIKGQTFRLPSGQYLQRDEIDLTGSVPEHSKTKEALEVTWEKMSKSKHNGVDPEEVVEQYGIDTIRLYILFAAPPEKDILWDVKTDALPGVLRWQQRLWSLTTRFIEARASGNVPRPQLLNNEEKAEARKLWEYKNSVISQVTAHFTEDFSLNSAISQLMGLSGTLSQASQQVLLHSPEFEDALCALMVMAAPMAPHITSELWAGLALVPQKLCAHYTWDADVLLQAWPAVDPKFLQQPDMVEMAVLINNKACGKIPVPQQVARDQDKVHKLVLQSELGVRLLQGRSIKKAFLSPRTALINFLVQE	285329	346532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_285418_288379_288664_292493_292593_295984_296123_312695_312797_317155_317339_319130_319301_320876_320955_322277_322390_337020_337149_344224
872268	contig_19518_pilon	+	1608	2	Intergenic	novelGene_170736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGAGCAATTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66994	69069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_67165_67631
872269	contig_10766_pilon	-	5604	1	Intergenic	novelGene_151195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1250	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAGTAAATCAAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133037	127433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_127400_133000
872270	contig_9049_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_83156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2524	junction_1	982.961172512255	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	87	410	104390	112652	FALSE	30	AATGTGCTTCACCAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	104303	112854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_104398_108616_108724_111558_111685_112569
872271	contig_8866_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_77895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTTCCTGTTTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1086719	1084444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1084400_1086700
872272	contig_10000_pilon	-	1641	7	Intergenic	novelGene_139303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	304.497628160804	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	35	487	283069	163749	TRUE	15	AAGAGTGTGGTGTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLHFNPLDLRRLHCLAVSV	283103	158965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163802_273268_273441_280591_280703_281388_281456_283019
872273	contig_5832_pilon	+	2456	2	Intergenic	novelGene_134168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	572	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGGAGGGCCCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562804	565446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_565173_565358
872274	contig_5791_pilon	-	3014	7	Intergenic	novelGene_35811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	2586	3014	328523	325668	FALSE	35	AAGAAGCTTAGCATGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSAYQSSRRLGSAIAGDFTLLEASVFRYRRCHPGGFSLLLHRHLPPSPAGRAGEPGKGVTVHRRPLSAGTRFPETAAGGEAESPAGTSVAQSGRHSLPDLLLVLLCLGQRWLLACRHCGSVSSGGDNADSVPPPPVTGSES	351579	325667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_326046_328472_328565_334696_334770_345642_345751_345835_345940_347549_347655_349425
872275	contig_17074_pilon	+	2212	10	Intergenic	novelGene_145205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_5	224.167320665437	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	1085	2203	849795	861409	FALSE	15	GCATTCTGACATGGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGDFIDEEVEDMYLVDFTQKIIDKRKEMDTFSANRDSRKAEEREDEEENLSERDVPPPQDSSEEWVDYVDSLGRSRRCMKKDLPDLLEMDKNLQGRLFISPANEKTLLSEDMRKELQRQQWEEEEREALKRPMGPIHYEDIRENEARQLGVGYFAFARDKELRNKQMKTLEMLREQTTDQRTKRENIKEKRKAMLEARLAKLRQKKMKKSKEDGAEKENGDEDVIGHLPPEPEALPTPPTAAQSSKVEVIVQERKDTKPGVPHVREWDRGKEFSFGNWSKRQSALRAERDPEFAPPSDYFTGQKRTGPFGGQRWSRPGPAQSGLGPVSGQSHQPPSSHASSTPASDGPPQAPTITFETLDDMISYYKQVT	841536	861418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_841652_843132_844065_849757_849817_851928_852107_855183_855280_856366_856510_856977_857073_857795_857929_859871_860025_861110
872276	contig_12709_pilon	+	2188	3	Intergenic	novelGene_147395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACCAAACAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28297	33842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_28326_30674_32595_33602
872277	scaffold_880_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_121479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATAGATTGCTAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490748	491535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_490700_491500
872278	contig_10437_pilon	+	2863	20	Intergenic	novelGene_38226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	79	junction_17	135.649703668173	105	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	139	2562	318795	390929	FALSE	65	TGGTTTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGTYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGDSSVGPVSMNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPTCTDMSNICQPTEFISRHNIEGTFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTTVKNSSQEPRSALSGTIQRPQLGPTANLSLEMGSGQLAPRQQQQTELEVVPGRDGLAGYNHPQVSVQPVTAPGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYSNISADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPSTPRPAENFRNSGLAPSVTIVQSSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPPWTPSTRPGFSAQQVASQATAKTRSPQFAVGNFQAPSSFSPMSLPGAPTTSPGAAYPSLTNHGSSFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWSQWQGQQPHQRSSSGEHHVQQPTAQQAGQPEVFQVRWRKELQRIRSWERRGQEEGHGRKQHGLRCLVESMYRKTEERRVEINVTDWKNYELRVMHSL	318656	391230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_349796_349909_355625_355671_360481_360527_366332_366547_369227_369442_371770_371874_373765_373832_374209_374296_375720_375798_376665_376801_379153_379229_380474_380627_387220_387332_387492_387563_387716_387841_388029_388133_388508_388657_389963_390124_390570
872279	contig_16625_pilon	+	3354	6	Intergenic	novelGene_171116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	37.8238020299388	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	285	824	69598	102316	FALSE	35	GTAAATTTGTAATCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLIFAKLWSLFCNQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFLMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVKNTHFLMWDIGGQESLRSSWNTYYSNTEFIILVVDSIDRERLAITKEELYRMLAHEDLRKAAVLIFANKQDMKGCMTAAEISKYLTLSSIKDHPWHIQSCCALTGEGLCQGLEWMTSRIGVR	69313	104846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_69644_90189_90251_92122_92271_99250_99335_100556_100709_102267
872280	contig_1107_pilon	+	1977	7	Intergenic	novelGene_126552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_2	31.503527139389	1067	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	437	1294	209781	233428	FALSE	40	GAAGGATATGAATGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEEGLTSSAPASSQTLLDALLQNLYDFGERKDETKQRIKKKRESKKRDLSTAAVLAEGPALPPDSLVRGQRKSASSFFKELREELHCAPAVTSTSFSSEPEVDSAVSHSLRNNRELVEVVEFHSRRQKRKLKPGQDEIPKTKTSVLEKDVVIQEFNLEKARLEVHRFGITGYGKGKERVLEQERAIMLGAKPPKNSYVNYKVLQEQIKEKKTAKEEEKRMAQDTDIFKKKKRNQQEDRKSQKKKSAPSILSSGRVGQVGKFKNGTLILSPVDIKKINSSRVAK	209344	234111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209869_210850_211189_230510_230568_231310_231407_231544_231632_232190_232244_233289
872281	contig_11370_pilon	+	778	3	Intergenic	novelGene_98732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2620	junction_1	1367	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	115	537	145831	148303	FALSE	20	CAAAGTGCTGTGTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRVPQALRLPPCPPVRGSPSSARGPSSSTESSPSSSTMAGWNAYVDSLMADGTCQDAAIVGYKDSPCVWAAVPGKTLANITAAEVAVLLSKDRSGIFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQEGENNMDLRTKSTGGAPTYNVSVTMTDRTLVLVMGKEGVHGGSINKKCYEMASHLRRAHY	145716	148544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_145963_147422_147616_148205
872282	contig_14441_pilon	+	996	4	Intergenic	novelGene_100520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	8	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	408	956	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111133	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_125497_125902_126159_126283_126514
872283	contig_6470_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_145607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGACTCATTTATTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025870	1027637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1025900_1027600
872284	contig_10938_pilon	-	4225	7	Intergenic	novelGene_171765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	67.8470502101766	235	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	84	1088	259220	159199	FALSE	20	AGTTCAGGTTTGTGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQQQAKRRLELGDSGHQYLSDGLKTPKGKGRAALRSPDSPKKKTRYDTSLGLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIHLIKKKSKNNVQWMGCSLSEDGGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLLTEDSENQRLAYVTYQDIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDPLESLQIHLASTQGPIEVYLCPEETETHSPMKTNNQDHNGNISKPTSKDLASTNSGHSDCSISMANLSPLASPANLLQQTEDQIPSNLEGPFVNLLPPLLQEDYLLSLGEEEGISDLFDAYDLEKLPLVEDFMCS	259303	156061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_-_159462_160635_160772_162029_162145_165934_166094_167723_167926_169164_169277_259202
872285	contig_8617_pilon	-	4055	1	Intergenic	novelGene_73371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2468	2869	12000	11599	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILPLDITAVLLFFGGEGATLHAGCTQQPPTQAQADGLTWAKPLPLLEAQGGWGGAASNNLHCIFIFFCKALPLSLRLIVWQGGMWKGMFKVTELLSKRARPSNYGPSILRSCLCYSFPRRFGSFPQGNEMK	14467	10412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_10400_14500
872286	contig_6544_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_142076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGCCCCAAACCAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61767	60231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_60200_61800
872287	contig_10882_pilon	-	3638	8	Intergenic	novelGene_172744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	36.2767142944341	273	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	405	1523	14933	4414	FALSE	35	ATCCTGGTAATTAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEREDQIDRLDFIRNQMNLLTLDVKKKIREVTEEVANKVSCAMTDEICRLSVLVDEFCSEFHPTPSVLKVYKSELNKHIEDGMGRNLADRCTSEVNASMLQSQQEIIENLKPLLPTGIQNKLHTLIPCKKFDLSYDLNCHKLCSDFQEDIVFHFSLGWSSLVHRFLGPTNAQRVLLGLSEPIFQLPRSLTSTPTASTNPTVPDNASQEELMVTLITGLASLTSRTSMGIIVVGGVIWKTVGWKLISVSLSMYGALYLYERLTWTTRAKERAFKQQFVNYASEKLQMIVSFTSANCSHQVQQEMATTFARLCQQVDITQRHLEEEIARLSKEIDQLEKIQNNSKLLRNKAVQLENDLENFTKQFLHSSNEES	15337	2298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_4493_6380_6516_9002_9200_10150_10304_13769_14000_14139_14243_14534_14640_14816
872288	contig_5586_pilon	+	4299	1	Intergenic	novelGene_143543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTCCCAACAATGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338306	342605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_338300_342600
872289	contig_11448_pilon	-	3282	1	Intergenic	novelGene_66447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGGAAAGAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694181	690899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_690900_694200
872290	contig_10352_pilon	-	3189	1	Intergenic	novelGene_49605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2784	3131	19423	19076	NA	65	AAATAACAGATCAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKWSFTFLPHSRTSTLPAILVMPVSFPFPVINSMSTPYFKTKILITPWSLFCYFQLCLSPLGPPPTKATSQMQCLRRCYTIRRKALRVVGNVSFEADRAKSSREEKTQTTTRG	22206	19017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_19000_22200
872291	contig_7593_pilon	+	3970	1	Intergenic	novelGene_127367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGCAGCTTTTCAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711345	715315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_711300_715300
872292	contig_6270_pilon	+	4423	8	Intergenic	novelGene_99886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	470	junction_1	198.75233280623	128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	137	1396	1115563	1138971	FALSE	80	AAAGGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVGEAAAGPSLRSRWSGGRGCDRGPCRPAPGVASAPVSVPSVYAMAGSGCAWGAEPPRFLEAFGRLWQVQSRLGSGSSASVYRVRCCGTPGSPPGALKQFLPPGTTGAAASAAEYGFRKERAALEQLQGHRNIVTLYGVFTIHFSPNVPSRCLLLELLDVSVSELLLCSSHQGCSMWMIQHCARDVLEALAFLHHEGYVHADLKPRNILWSAENECFKLIDFGLSFKEGNQDVKYIQTDGYRAPEAELQNCLAQAGLQSDTECTSAVDLWSLGIILLEMFSGMKLKHTVRSQEWKANSSAIIDHIFASKAVVNAAIPAYHLRDLIKSMLHDDPSRRISAEMALCSPFFSIPFAPHIEDLVMLPTPVLRLLNVLDDDYLENEEEYEDVVEDVKEECQKYGPVVSLLVPKENPGRGQVFVEYANAGDSKAAQKLLTGRMFDGKFVMATFYPLSAYKRGYLYQTLL	1115426	1141998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1115831_1117193_1117487_1118141_1118334_1120997_1121093_1127280_1127358_1127500_1127600_1134296_1134386_1138824
872293	contig_5083_pilon	-	2942	1	Intergenic	novelGene_151664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCCAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477092	474150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_474200_477100
872294	contig_15982_pilon	+	2729	1	Intergenic	novelGene_145974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	54	299	66315	66560	NA	40	TAGAAAAAGTTGGTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGWLRVRQAEVAGCWTMLTAACGRLVSAPLSAVARKWLHASVSQLSADRRGKAEESPRALDPVLLEFLVCPLSKKPLRWEFPGSRFPSRPPARGEGR	66261	68990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_66300_69000
872296	contig_9183_pilon	-	1677	6	Intergenic	novelGene_40318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	337.071268428503	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	214	651	322898	318417	TRUE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	323111	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743
872299	scaffold_6394_pilon	+	354	5	Intergenic	novelGene_111045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5071.80061713786	446	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	164	319	444288	444551	FALSE	10	TCTGTTGAGCATTCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSAIPPPSAKDIKKILDSVGIEADDDRLNKVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442095	444586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442107_442410_442494_443338_443388_444267_444367_444474
872300	contig_10766_pilon	-	3964	1	Intergenic	novelGene_151211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGGGAATAAATACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177497	173533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_173500_177500
872301	contig_8289_pilon	+	2698	4	Intergenic	novelGene_171181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	300.783790934433	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATGATTAGAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211292	220258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_211560_212521_212648_215756_215887_218083
872302	contig_7411_pilon	+	3568	3	Intergenic	novelGene_137028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355809	360654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_356800_357904_358359_358530
872303	contig_11912_pilon	+	2965	3	Intergenic	novelGene_177516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2599	2961	30909	32740	FALSE	45	TAAAATAACCCACATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILESFSTFTAFRRIFSSKSSFEPGKTCNLAEKFYTLITFFLFLFFPFFTFMETLICMPSYMPPLVVTLLFKAMEFTSFSNRGQVSEGFHHHISVEFPLSKIQQSPLFLGKVHGHILKHH	28310	32744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11912_pilon_+_31089_31426_31485_32615
872304	contig_14142_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_120550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	3	395	433947	433555	NA	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHFTLLLPYLSILFSNQSQLQPHVTQLLTDFSQLLANLSQLLSNLSKLLSNVSQLFSDFPELLADVTQLLTNLSQLLANVSQLLANISQLLADVTQLFSHLPQLLTDISKLFTYISKLLANFPKLLTHQP	433949	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433900
872305	contig_10074_pilon	+	1914	2	Intergenic	novelGene_57167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539619	588820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_539667_586953
872306	contig_20614_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_107609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAACAAACTAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472676	475589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_472700_475600
872307	contig_12923_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_30127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGGAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97302	94628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_94600_97300
872308	contig_3942_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_128843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTCTATGTGTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355863	1358074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1355900_1358100
872309	contig_13456_pilon	+	4121	25	Intergenic	novelGene_153323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_16	32.4743221210578	82	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1123	3372	219	3590	646656	686317	FALSE	15	CCTATTTCTATCTCCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSAASGLFIQAIQSRCENLSTPTTLRKTLQCLEGIHLSQSGAVLTLYVDRLLCTPLRVLARRVDTLACRRVEMLLAANAQSSMSQLPLEELNRIQEYLQSSGLAQRHQRLYSLLDRFRLSTVPESPSPSPPVTSHPLDRDGQMSLETVSPDKDWYIRLVKSQCWTRSDSALLEGAELVHRIPPSELGAFMMNPEFNLSLLAPCLSLGMSEISGGHRSHLFETARLVTLERMSSIVQQLPTTHQVFQPFLPAESSAYWSKLNDLFGDTALYHSMTTLARALAQYLMVLSILPGHLHLPTDKEQDAVKFVVMILEALSWHLIHEQMPLSLDLQAGLDCCCLALQRQGLWLVVSSPEFVSHACSLIHCVRFILEAIAVQPGDQLLSPERRTSAPKAIREDRVDSNTPHRQSITTACEMVAEMVEALQSVLALGHKRNSGMPAFLTSVLKNIVISLARLPLVNSYTRVPPLVWKLGWSPKPGGDFGTALPEIPVEFLQEKEVFKEFIYRINTLGWTSRTQFEETWATLLGVLVTQPLAMEQEESQPEEDTERTQINVLAVQAITSLVLSAMTVPMAGNPAVSCLEQQPRNKPLKALDTRFGRKLSVIRGIVEQEVQAMVSKRENIATHHSYQAWDPVPSLSPATTGALISHDRLLLQANPERELGNMSYKLGQVSIHSVWLGNNITPLREEEWGEEEEEEVDVPAPSSPPTSPVNSRKHRAGVDIHSCSQFLLELYSRWVLPSSSARRTPVILISEVVRSLLVVSDLFTERSQFEMMYATLTELRRVHPSEDEILIQYLVPATCKAAAVLGMDKAVAEPVSRLLESALRSSHLPSRIGALHGMLYVLECDLLDDTAKQLIPVISDYLLSNLKGVAHCVNVHSQQHVLLMCATAFYLIENYPLDVGPEFSASIIQMCGVMLSGSEESTPSAVFHCVLRGLERLLLSEQLSRLDAESLVKLSVDRVSVHSPHRAMAALGLMLTCMYTGKEKVSPGRSTDPTPAAPDSESVIVAMERVSVLFDRIRKGFPCEARVVARILPQFLDDFFPPQDVMNKVIGEFLSNQQPYPQFMATVVYKVFQTLHSTGQSSMVRDWVMLSLSNFTQRTPVAMAVWSLSCFFVSASTSPWVSAALPHVISRMGKLEPVDVNLFCLVATDFYRHQIEEELDRRAFQSVFEVVAAPGSPYHRLLTCLRNVHQGATG	646315	686848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_646381_646502_646680_646964_647042_648529_648669_649916_650040_656112_656327_656679_656826_659298_659477_660456_660553_662850_663039_665191_665319_667787_667889_669334_669490_669945_670086_671769_671853_674849_674981_675101_675232_676182_676339_680257_680449_681746_681862_682007_682222_682549_682656_684564_684728_685349_685511_686103
872310	scaffold_12124_pilon	+	1993	8	Intergenic	novelGene_22053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	523.874147528755	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTGGATCTCTATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829629	858963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_846515_846646_846720_846899_847629_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
872311	contig_11498_pilon	-	3087	1	Intergenic	novelGene_65493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATAAGGTGGGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37115	34028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_34000_37100
872312	contig_15084_pilon	+	5631	1	Intergenic	novelGene_116679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGTAAGCCCAGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144319	149950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_144300_150000
872313	contig_3223_pilon	-	1245	5	Intergenic	novelGene_151831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAGACAGGAGTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004135	967291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_-_967500_973411_973499_986170_986268_991369_991508_1003420
872314	contig_6710_pilon	-	575	2	Intergenic	novelGene_95553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657524	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872315	contig_7919_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_28100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAGTACTGTTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301068	1302761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1301100_1302800
872316	contig_5153_pilon	-	3333	2	Intergenic	novelGene_74397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCTCTGGGTGGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003572	998265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_998420_1000393
872317	contig_4071_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_151871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACACAGGACAGCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91744	89224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_89200_91700
872318	contig_13481_pilon	+	1620	5	Intergenic	novelGene_119448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	44.9131105580542	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	481	870	1091943	1093268	FALSE	20	CACATTTTGTTTATCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066922	1094018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1083899_1083990_1084549_1084701_1091839_1092052_1092987
872319	contig_4364_pilon	+	3111	10	Intergenic	novelGene_89	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	47	junction_8	48.4263472823536	883	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	157	1140	881960	900950	TRUE	15	TACATTTCTCCCTAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPLHGLRPPEGDAGSGSPHAPHPYLTHCEHLSAARLRHGERAESEYAAAPRCPCQRLFV	874392	906849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_874454_881864_881976_895570_895720_896926_897156_897383_897555_898158_898308_900243_900417_900853_900994_903962_904025_904983
872320	SIRV7	-	914	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	537	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
872321	contig_17936_pilon	+	4309	3	Intergenic	novelGene_29979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAAACACACACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160227	165697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_161506_161839_161929_162755
872323	contig_13528_pilon	+	3651	1	Intergenic	novelGene_66860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	36036	36332	NA	45	GAAAGAAATGTAATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKAFQIKLERLEKLCRALQTERNELNEKVEVLKEQVSVRAADVELVTPASQPCTAPESHKEPSQAGGGGVPRAPLAAEPEAAQETLWAGTVPSIDSVD	36035	39686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_36000_39700
872324	contig_10003_pilon	-	4238	1	Intergenic	novelGene_88184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGGATAATTTGCAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447975	443737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_443700_448000
872325	contig_5217_pilon	-	2198	4	Intergenic	novelGene_135753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_3	2230.68320376416	148	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTACCCTACCAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560393	557042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_558430_558674_558851_559273_559374_559858
872326	contig_5039_pilon	+	4421	1	Intergenic	novelGene_64824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGCGGGAGAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252006	256427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_252000_256400
872327	contig_854_pilon	-	2494	1	Intergenic	novelGene_36612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	465	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	221	601	1692829	1692449	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESRMPPSGPHLLLVVGDDAADEVGVGVPQRGHELGQLLLVELPHRAEHALASLEGPGQRRLRHAGHLVQADDAVHCGDDTQACEHRLVQLGAEQAGETDGHVDGKRGETVWNSRTLFAWTLHAC	1693049	1690555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1690600_1693000
872328	contig_11677_pilon	+	1995	3	Intergenic	novelGene_85963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	57.5	1187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	302	937	651345	660493	FALSE	20	GGAACTCAGCTGTGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVWAGHFLLSSPTRLSAFVREGESWQKRFRKTAVTEFREPSEGIGSNQSQPFPQATLAKGTIKPRTRPSSLPPLRCSAAASGSGEGAGFSSKIRTAYPVRMAVVPLLLFGGLWGAVGASDLAVVTCGSVVKLLNTRHNVRLHSHDVRYGSGSGQQSVTGVTSVDDSNSYWRIRGKTTTVCERGTPIKCGQPIRLTHVNTGRNLHSHHFTSPLSGNQEVSAFGEEGEGDYLDDWTVLCNGPYWVRDGEVRFKHSSTEVLLSVTGEQYGRPISGQKEVHGMAQPSQNNYWKTMEGIFMKPSELLKTEVHHVEL	651043	661551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_651496_654172_654370_660205
872329	contig_14322_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_115674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6339	junction_1	1263.02402491006	27	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2	400	674731	671886	TRUE	10	AGACCTGTGCTGCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAAPCRSSACTAAAATAARVPGSLSIAVVTWVQGLGGAPDVPHPPLKIPGGRGNSQRDHNLSANLFYSDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674732	671127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672416_672787_672934_674670
872330	contig_13740_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_34601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTATGATTTAATGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115574	116914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_115600_116900
872331	contig_12638_pilon	+	2069	17	Intergenic	novelGene_33172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	199.096151001846	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	228	1553	269238	273823	TRUE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGKSQKQNYPQHPGHCGCLPPSPAPSSPLWPYQLCTHHQPRSQVCSSGCTSKDCLAILRAAAADRWCCDRCGGHT	235651	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271774_273449_273584_273761_273999_274124
872332	contig_1275_pilon	+	4209	1	Intergenic	novelGene_108734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342183	346392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_342200_346400
872333	contig_11677_pilon	-	1157	4	Intergenic	novelGene_85923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	94	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	555	1112	597508	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEPLMHVWPGAPTAGIEAKSDRFLSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598062	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
872334	contig_18967_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_165312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	695	1090	35397	35002	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPLTIPVPVLRLPRGPDGSSRGFAPDGRRALLKPEVPEIQESPVVQESLESQEQRARAILRERYLRSLLAMAGRQVSFTLHEGVHVTAHFGATDLDVANFYVSQLQTPIGVQAEALLRCSDIIAYTFKP	36091	33398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_33400_36100
872335	contig_9720_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_116779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	503.881158828371	1675	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	374	778	391741	392457	TRUE	25	GAAGTCAATGCCTGCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAFSPVRSVRKNSLSDHNLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	388980	393990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_389044_391430_392089_392400_392465_393259
872336	contig_9440_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_59094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGACATTACTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1700147	1698662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1698700_1700100
872337	contig_19043_pilon	+	3953	6	Intergenic	novelGene_178170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	18.6440338982743	158	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	110	1099	26159	31353	FALSE	15	TCTGAGCATTTCTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATRYRSFNIHWVPVLPGNFTFRALQISSFVNSSWMRTDCLVWLGDLQTHSWKNDSDTVRCLLPWCHGNLSEQEWEKLQHLFWVYRISVKRDVQELVQMLHRAYPIELQISAGCEVRPRSGPESFLHAAYQGIEILSFQGTSWEPAPEAPSWVHTVTRVLNLDQGTRETVGSLLNDTCPQFVHGLVEAGKSDLEKQEKPEAWLSSGPSPGPGRLLLVCHVSGFYPKPVWVMWMRGEQEQLDTQQGDVLPNADRTWYLRVTLDVVAGEAAGLSCRVKHSSLGDQDIVLYWDESRVSVGLIILAVLVLLLLLIAGFFLWFKRHCSYEDIL	26049	34207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19043_pilon_+_26165_26419_26727_27101_27381_28406_28686_31134_31232_31331
872338	contig_13780_pilon	-	2978	16	Intergenic	novelGene_149071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	56	junction_3	1576.06045569325	99	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	44	1564	761485	676313	TRUE	20	CTCTCATTGTCTCCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFHARIVQESECRKMSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSVASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSVSTVELQRSHRPPGLSRQTVLLGAYVRL	761528	657033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676160_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_761434
872339	contig_12327_pilon	+	3378	2	Intergenic	novelGene_140636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2722	3366	161106	161750	FALSE	25	CAAGGGTGGCATGCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYIREVTGYSSGSGMLRIQFFDQDVSAVRLAGLPLASALVSQVLQSSFSSADEFPKAPHSASKSQPPAPWVGKPSSTKCLEAACSASRLPARQHSAFPLLDQEARRAVSCRSPASAATIFLPPLLSTFGVTAHLLTRFLSLLPSLPLDLLILGASRSFSVQGSQVQKMCSTPGSSFLLMVRSFFPISGMAHLKPSGMAKPTNPLVWVPYTLFA	158114	161762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_158348_158617
872340	contig_7234_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_145946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAATCAATAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456772	455456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_455500_456800
872341	contig_10494_pilon	-	2303	5	Intergenic	novelGene_102162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1605	junction_4	491.203369288119	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	23	505	912923	906260	FALSE	45	CAAATATTATGGATACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQIEWAMWANEQALASGLILITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERCGQKYMTSVVKMFGPLTRNYYIRAFLHLVLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLVSDVFLQLAPQPTHPWPLTASTSQLLCRLSQSPPGRS	912945	904461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_906456_907136_907221_907637_907713_908356_908427_912865
872342	contig_10494_pilon	-	1716	6	Intergenic	novelGene_102164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	898.536053811977	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	51	449	912923	905947	FALSE	15	CCCATTGCCTTTGAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQIEWAMWANEQALASGLILITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERCGQKYMTSVVKMFGPLTRNYYIRAFLHLVLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLVSGPPWGTC	912973	904679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_905977_906373_906456_907136_907221_907637_907713_908356_908427_912865
872343	contig_10494_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_102163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCAGCAGAGCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907213	904531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_904500_907200
872344	contig_5502_pilon	-	3434	1	Intergenic	novelGene_154979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	351	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCTAAGGTATGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369694	366260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_366300_369700
872345	contig_10331_pilon	+	4106	1	Intergenic	novelGene_54181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593266	597372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_593300_597400
872346	contig_8156_pilon	+	1626	6	Intergenic	novelGene_98933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	979	1284	403987	441413	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHSVPICRISSVVSFRHFSVRPHRTIFLAPRAANSRASWRPMPLPPPVMRTFSRDRSRSLAGSTSPTAAFTTRYIICRGNTTSAPSHFHTILRAAEPGRG	395199	441755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_395707_398419_398549_403293_403537_403887_403990_404732_404810_441187
872347	contig_4531_pilon	+	7036	1	Intergenic	novelGene_47914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	683	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAACAGTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403302	410338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_403300_410300
872348	contig_15629_pilon	+	4076	3	Intergenic	novelGene_122451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	62	221	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1656	2024	107871	108239	FALSE	5	GTTGTCTGGTCCTGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTHPEAPQKTGLTICFRNVKNQKTKPVAVESILTHRDPIRQQNDSLGFPRSTWWIRTADLLVMKRALNHCATATENPIECSSALHTWGRHESESTGGRQAATITTVHIFIFLYLKHVACH	97470	110291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_97711_103346_103515_106623
872349	contig_8210_pilon	-	3402	1	Intergenic	novelGene_30236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28123	24721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_24700_28100
872350	contig_2480_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_63552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAGTAGCAGAAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303153	305846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_303200_305800
872353	contig_6063_pilon	-	2843	13	Intergenic	novelGene_27590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_8	447.463988308929	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	17	523	70243	36261	TRUE	35	AGAAGATGATTCCTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRGKMAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKA	70259	17147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
872354	contig_11512_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_43321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATTTTTACGGATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408975	406963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_407000_409000
872355	contig_11378_pilon	+	3396	14	Intergenic	novelGene_112310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_12	140.894731781522	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	278	2623	1102410	1136469	FALSE	25	AAGCCTTGAATTGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNFTLKRTFKVENPGQLQIHVEAIEISGYSCEGYGFKVVNCQEFALSANTSKDIIILFTPDFTASRVIRELKFITTSGSEFVFILNASLPYHMLATCAEALPRPNWELALYIIISGIMSALFLLVIGTAYLEAQGIWEPFRRRLSFEASNPPFDVGRPFDLRRIVGISSEGNLNTLTCDAGHSRGFCGTGGSSSRPSAGSHKQCGPSVHPHSSHSNRNSADVESVRPKNSSSTSGRTSAQAASSQSSGKTSPLVLDSNAAPQSHTAGRKSRGAKQNQQSSQHHVHSPLEPHPPPPPAPTVPQHQEPQPERLSPTPLAHPAHPERASSTRHSSEDSDITSLIEAMDKDFDHHDSPPLEVFTEQPPSPLSKSKGKGKPLQRKVKTPKKQEDKEKRGRGKVQEDELKDSVADDDSSSTTTETSNPDTEPLLREDTEKQKGKQAMPEKQENEMSQVKPKSRKLLHVKKESPTDVKPSSLELPYTPTLEGKQRRNLPTKIPLPTTLTSGSKSRNSQKTKGTNKLLDTRPPALAKFLPNSQEPGNTSSSEGEKDSPPPEWDCMPVHKPGSSADSLYKLSLQTLNADIFLKQRQTSPTPASPSPPAAPCPFVSRGSYSSIVNSSCGSDPKTKQPSGSKHKLTKAASLPGQNGNPTFAAVTAGYDKSPGGNGFAKVSSNRTEFSSSLGISHTPVDSDGSDSSGLWSPTSSPGSPDFTPLNSFSAFGNSFNLTGEVFSKLGLSRSCNPAPQRGWSEFSSGPSYLWESPAMDSSPSWPASSGSPTTTAASILGSTSGLWYTTPFSSSIWSSSLSSALPFTAPANTLPGIGLMGPESSPAPPTASTSSPADDLGQTYNPWRIWSPTIGRRSSDPWSNSHFPHEN	1100906	1137242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1101078_1102303_1102490_1103300_1103460_1103855_1104455_1115104_1115281_1119044_1119173_1125431_1125557_1125760_1125911_1131129_1131296_1132570_1132693_1132776_1132874_1133982_1134081_1134910_1135072_1136184
872356	contig_16882_pilon	+	2702	7	Intergenic	novelGene_148215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_3	73.2772512827518	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1570	2025	206782	213521	FALSE	35	CAACTGTATAGCTTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFVVVYTDGCCSSNGRKRARAGIGVYWGPGHPLNVGVRLPGRQTNQRAEIHAACKAIEQAKAQNIDKLVLYTDSMFTINAITNWVQGWKKNGWRTSTGKEVINKEDFVELDTLTQGMDIQWMHVPGHSGFIGNEEADRLAREGAKQPGD	202151	214198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_203560_206620_206786_208805_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
872357	contig_9283_pilon	+	5965	1	Intergenic	novelGene_164398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	95	1054	10432	11391	NA	10	GAATGTGCTGTTGTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKESSFFANPVEVSPPYCSQVRQPTTSSDLRMETTPSKALRSRLQEEGHSDRGSSGSVSEYEIQIEGDHEQGDLLVRESQITEVKVKMEKSDRPSCSDSSSLGDDGYHTEMVDGEQVVAVNVGSYGSVLQHAYSYSQAASQPTNVSEAFGSLSNSSPSRSMLSCFRGGRARQKRALSVHMHSDLQGLVQGSDSEAMVNNPGYESSPRERSARGHWYPYNERLICIYCGKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCKFCGKKYTRKDQLEYHIRGHTDDKPFRCEICGKCFPFQGTLNQHLRKNHPGVAEVRSRIESPERTDVYVEQKLENDASASEMALDSRMEIHTVSDAPD	10337	16302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9283_pilon_+_10300_16300
872358	contig_10986_pilon	-	1913	13	Intergenic	novelGene_71456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	175.272387221211	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	577	1266	73964	67011	FALSE	35	ACTTCAGATGAACAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80428	66363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_73924_74006_74224_74259_74298_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
872359	contig_12151_pilon	-	2703	13	Intergenic	novelGene_54970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	209.838363720481	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	584	2254	1001903	975052	FALSE	25	TTTTGGCCAAAGCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	1016675	974602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011462_1011661_1016306
872360	contig_14023_pilon	+	5179	1	Intergenic	novelGene_165351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3100	3411	51021	51332	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQICRLNLKKNVIQPICKNWSRKVILLYFQFPTFFKKKKKKKSIGSNIPPCLGFLVTREILKCLNGSAYWIIAGIHPRVPHLGNRKILLTEGFSSPGASTT	47921	53100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_47900_53100
872361	contig_10331_pilon	-	4365	2	Intergenic	novelGene_54050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGGACCAATATCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30214	25112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_25781_26517
872362	contig_4531_pilon	+	3159	6	Intergenic	novelGene_47911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	90.5039225669252	80	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACAGCTGTGACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396382	407391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_398267_398552_398616_398792_398871_402240_402349_405389_405503_406478
872363	contig_10674_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_6422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATACACATATTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130392	128301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_128300_130400
872364	contig_5718_pilon	+	4161	2	Intergenic	novelGene_110336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	129	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2161	2691	571480	572010	FALSE	25	TCCCCAGCGTATAGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLCFCSLFVHLVITMFSWEEVTGKCMQGIWKKLPSYVNSLQTFDQDNRMEEADGKIVHMARMLNLELDMADVQQLIDHEEGELTDQDLMGFEEKEMLKQNEMRKKKERKLSKSLTVKGLAGVFSKLNQGLPLLESMDPNTDHFAKVDRQVRKAVRCYHEISEEKKERKEYTGNCH	569263	573480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_570844_570899
872365	contig_5324_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_102079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	62	661	444540	443941	NA	25	CTGCCCCAGAACCAGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLSAALISTPAADPEEPQTMSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444601	442357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442400_444600
872367	contig_7173_pilon	+	1936	3	Intergenic	novelGene_37531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	107	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTGATTGTTTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213009	225025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_213250_220273_220563_223618
872368	contig_7758_pilon	-	2832	1	Intergenic	novelGene_163532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAGCTAAACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125137	122305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_122300_125100
872369	contig_9901_pilon	+	2076	9	Intergenic	novelGene_126920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	135.156159682051	390	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	481	960	153410	171270	FALSE	55	GTAGAAAAAAAGAACGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNSALPRRQGSGAEPAAASEQLWRRRASRGLTTASAGLRPSLRGARCPCQPLYSSALVECEDHDPFNPDRNFDVESVKKEIHRGKKLKCTYCGERGATVGCDRKKCTKNYHFFCAKSDHAFLHVDEAQGIYKVFCQQHTPEFPIVTQIGDDSLPPNNISGMKRKKGKKKHLSTGICGLQPEAMAFNRLIRHMNEESGRHTDAVVKVAFLKKCKEAGLLNDLFEEILDKLHLIQERLVNETTSDSDYEEIGTSLLDCRLFEDTFVNFQAAIENKIHQSEQRQQQLKKEIELLQDLKQRLYLLQENRGLRSGSTSVSSLSS	107494	172386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_107648_126701_126810_130669_130804_143698_143749_153374_153464_154802_154870_157908_158041_168023_168096_171115
872370	contig_19564_pilon	+	1768	2	Intergenic	novelGene_29687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	78	junction_1	0	191	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	51	404	107178	107773	FALSE	20	TTAATACTTGTTCTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALVEEWVGAVDIAPTKALAEEWVGAVDIDPPMKALVEAWVEVVDIALMKVLDMGGPMATGLMMSLGTEATTIEGHPLMSTVAMMALAMEEGATEGMMEATAMEETCQNALFADIS	107127	109137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_107496_107737
872371	contig_3252_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_61492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTATTTAAAGGATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279114	281014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_279100_281000
872372	contig_3307_pilon	+	1808	8	Intergenic	novelGene_86883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_7	174.88398486787	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	3	923	118071	198323	FALSE	15	CTTACTGTGTCATCTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALAQLPPLPPQFKSIQHHLRTAQEHDKRDPVVAYYCRLYAMQTGMKIDSKTPDCRKFLSKLMDQLEALKKQLGDNEAITQEIVGSAHLENYALKMFLYADNEDRAGRFHKNMIKSFYTASLLIDVITVFGELTDENVKHRKYARWKATYIHNCLKNGETPQAGPVGIDEDNDVEENEDAGATSLPTPPPQPSSSTYDPSNMPSSSYTGIQIPPGAHAPANTPAEVPHSTGVTSNTIQPTPQTIPAIDPALFNIVSQGDIRLTPEDFARAQKYCKYAGSALQYEDVSTAVQNLQKALKLLTTGRE	118068	199208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_118183_145185_145281_149325_149454_150094_150171_173045_173155_176209_176384_186331_186413_198177
872373	contig_3307_pilon	+	2686	8	Intergenic	novelGene_86884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_7	174.88398486787	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	54	848	145200	198323	FALSE	55	AAGAAAATGAATCATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHDKRDPVVAYYCRLYAMQTGMKIDSKTPDCRKFLSKLMDQLEALKKQLGDNEAITQEIVGSAHLENYALKMFLYADNEDRAGRFHKNMIKSFYTASLLIDVITVFGELTDENVKHRKYARWKATYIHNCLKNGETPQAGPVGIDEDNDVEENEDAGATSLPTPPPQPSSSTYDPSNMPSSSYTGIQIPPGAHAPANTPAEVPHSTGVTSNTIQPTPQTIPAIDPALFNIVSQGDIRLTPEDFARAQKYCKYAGSALQYEDVSTAVQNLQKALKLLTTGRE	118143	200161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_118183_145185_145281_149325_149454_150094_150171_173045_173155_176209_176384_186331_186413_198177
872374	contig_16122_pilon	-	3018	5	Intergenic	novelGene_134490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	142.899440166853	94	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGTGTGTGACAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110603	104295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_104558_104828_107111_107189_107484_108757_108845_110510
872375	contig_11258_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_67855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATACCTACAACAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353629	351859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_351900_353600
872376	contig_12709_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_147406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGATCTGACAGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34064	35720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_34100_35700
872377	contig_7695_pilon	+	1932	12	Intergenic	novelGene_41640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	493	981	716662	720239	TRUE	5	CCTTCAGGGGTGTGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPLRCQLEELDVTPLNSIDGHSQHGLLLLGGADEAADALDDLALRVHLLLSRLLAQEDGGNFLILLFGDHSHGHGTRKLGLATVGQAGHLHRAEDTLEGVLGACVPLVAVPPPLTGVAQPVVHLEANDIPVRAVGAPHDGEGTAHGRGGGRGGCGISAHA	716169	739752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_716730_716884_717005_718112_718339_720164_720304_720518_720555_722021_722209_725250_725353_726130_726245_726429_726583_727247_727355_727942_728050_739671
872378	contig_20614_pilon	-	5184	5	Intergenic	novelGene_107519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12.5573683548744	45	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCGCCACCGACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68929	58091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_58202_58613_61857_64170_65805_67912_68043_68862
872379	contig_9668_pilon	-	2448	20	Intergenic	novelGene_58070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	8	junction_17	307.077629208171	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	812	2371	61307	37061	FALSE	0	GCTTTTTCCTCCTTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKNIPEAHQDAFKTGFAEGFLKAQALTQKTNDSLRRTRLFLLVLLLLGIYGLLKNPFLSVRFRTTTGLDSAVDPVQMKNVTFEHVKGVEEAKQELQEVVEFLKNPQKFTVLGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVAGEADVPFYYASGSEFDEMFVGVGASRIRNLFREAKANAPCVIFIDELDSVGGKRIESPMHPYSRQTINQLLAEMDGFKPNEGVIIIGATNFPEALDNALIRPGRFDMQVTVPRPDVKGRTEILKWYLNKIKFDQSVDPEIIARGTVGFSGAELENLVNQAALKAAVDGKEMVTMKELEFSKDKILMGPERRSVEIDNKNKTITAYHESGHAIIAYYTKDAMPINKATIMPRGPTLGHVSLLPENDRWNETRAQLLAQMDVSMGGRVAEELIFGTDHITTGASSDFDNATKIAKRMVTKFGMSEKLGVMTYNDTGKLSPETQSAIEQEIRILLRDSYERAKHILKTHAKEHKNLAEALLTYETLDAKEIQIVLEGKKLEVR	79394	36983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_37205_40522_40610_41283_41358_41446_41574_42460_42613_43441_43598_44472_44586_45889_45953_47221_47355_48099_48253_50599_50691_58436_58520_60703_60788_61207_61359_63113_63224_64448_64548_66653_66740_67109_67273_72039_72172_79224
872380	contig_14525_pilon	-	2003	9	Intergenic	novelGene_149773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	46.6710563411629	534	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	280	1557	187065	167778	FALSE	25	ACCCACTATATGGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSEVLNIGKKLYEGKTKEVYELLDSPGKVLLQSKDQITAGNAARKNHLEGKAAISNKITSCIFQLLQEAGIKTAFTRKCGETAFIAPQCEMIPIEWVCRRIATGSFLKRNPGVKEGYKFYPPKVEMFFKDDANNDPQWSEEQLIAAKFCFAGLVIGQTEVDIMSHATQTVFEILEKSWLLQNCTLVDMKIEFGVDVTTKEIVLADVIDNDSWRLWPSGDRSQQKDKQSYRDLKEVTPEGLQMVKKNFEWVAERVELLLKSESQCRVVVLMGSTSDLGHCEKIKKACGNFGIPCELRVTSAHKGPDETLRIKAEYEGDGIPTVFVAVAGRSNGLGPVMSGNTAYPVISCPPLTPDWGAQDVWSSLRLPSGLGCSTILSPEGSAQFAAQIFGLNNHLVWAKLRASILNTWISLKQADKKIRECSL	187344	167331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_167945_172038_172198_173325_173507_174605_174690_175360_175475_175577_175758_179338_179518_182727_182926_187049
872381	contig_9527_pilon	-	2832	19	Intergenic	novelGene_134028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	95	451	275052	274393	TRUE	90	CACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWHGLPGSEMFACTSKSLHRRWRVEKVTVLMGSCRLRVWACGPQGHRKDLTSTLARWGAVKGLRSLSTERPGCMLLPKYSLLCDEFLGFPMYLRMGFRFLSSKASFSFLELLLSSWS	275146	147129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_147868_217963_218052_218927_219030_222714_222765_223465_223526_224772_224950_225774_225845_234854_234978_237115_237161_237924_238002_239157_239299_264958_265033_265252_265354_267539_267642_268786_268829_269981_270079_270362_270524_274259_274407_274709
872382	contig_9653_pilon	-	4733	1	Intergenic	novelGene_48354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGGAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138879	1134146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1134100_1138900
872383	contig_11364_pilon	-	2304	9	Intergenic	novelGene_65163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	144.167816710249	59	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	693	1544	95308	85472	FALSE	45	AATACACACACACACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPIWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEEYYKASVTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDIYQMEKDIAMEQERNTRYRAPKILEPTAFQEPPPKPSRPKYRPPPQTNLLAPKLQFQVHIELEGWESSGAFFI	96847	84711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_85589_86482_86592_90472_90678_92018_92109_92225_92327_94548_94665_94952_95054_95295_95381_96227
872384	contig_5698_pilon	-	3004	1	Intergenic	novelGene_54993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCCAGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5224	2220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_2200_5200
872385	contig_7457_pilon	+	2363	9	Intergenic	novelGene_31502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	319.119785503814	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1261	1770	663260	668868	TRUE	15	CTGAGAGCGTGGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKEGGITFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPFIDAVWK	661610	671992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_661654_661789_663001_663253_663349_663458_663599_664102_664316_668470_668514_668843_668907_669728_670020_671728
872386	contig_9571_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_136291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAATGCAATAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504026	500838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_500800_504000
872387	contig_12270_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_113112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGCTTCAGCCTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14412	13826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_13800_14400
872388	contig_2027_pilon	+	2897	14	Intergenic	novelGene_39918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_10	169.198318567051	202	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	138	926	146413	148249	TRUE	20	GCCTGATTGCAAATCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGLDESGSGGGSDPGEAPTRAVPGETRSGRVLLSAAQEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNVINMHNVKVGVGQEAGAQVGPHLHTPPQRSPRNGLFPFGCFTGSSWRVLGPCLHLYGKVLGSFPVWEGEQCWLGVGLVDTP	145643	152088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_145758_146389_146524_146606_146733_146821_146879_146977_147093_147768_147864_147964_148399_148701_148823_148930_149029_149113_149220_149304_149348_149494_149586_150639_150718_150803
872389	contig_9484_pilon	+	3679	3	Intergenic	novelGene_105683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1508	junction_1	33.5	187	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199142	204975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_202618_202734_202823_204859
872390	contig_16255_pilon	-	2905	3	Intergenic	novelGene_176097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTTTAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31445	28389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_30661_30754_31278_31334
872391	contig_20694_pilon	-	3245	2	Intergenic	novelGene_141251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCACCCGGAAGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65179	59943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_-_60878_62868
872392	contig_12313_pilon	-	2256	13	Intergenic	novelGene_171848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	59.943202283495	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	518	1294	84299	73274	FALSE	60	AAAAAAAAGTGGGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	115449	72311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_92833_92951_100064_100114_100547_100590_115242
872393	contig_17753_pilon	-	3791	2	Intergenic	novelGene_105059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAACCGTCTGGCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78614	45488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_45683_75017
872394	contig_4469_pilon	+	3373	1	Intergenic	novelGene_21931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGTGGTACCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617326	620699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_617300_620700
872395	contig_2066_pilon	-	3163	1	Intergenic	novelGene_176529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1580	1951	89891	89520	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMEGSPNNGKGQIFSPFLSLQKEVLRYDQRTVLKVSQLPFNSCPFLSLTKREEKEPCNVYPFNSSYNDSSNVLHCSAIKIVWVTHIQSLNEEIFLTNGCFQTRLLNSLSERSACNLCSWLLF	91470	88307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2066_pilon_-_88300_91500
872397	contig_14426_pilon	+	3888	1	Intergenic	novelGene_170633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	389	706	207071	207388	NA	35	TGCATTCATTGAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHRKQKNATGSRRHYCHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALIIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCNMCGKAFRRSSHLLRHQRIHGGDKNIQDSEHGETWENQWENVEASVSYKCNECDRSFTRNRSLIEHQKIHTGEKPYQCDVCGKGFTRTSYLVQHQRSHVGKRILSQ	206682	210570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_206700_210600
872398	contig_1146_pilon	+	3252	1	Intergenic	novelGene_84840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGGTTCAGTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931468	934720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_931500_934700
872399	contig_6439_pilon	-	3084	3	Intergenic	novelGene_154235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	3	199	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	20	514	335031	328890	FALSE	45	CCCAAATAGCATAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPNRMYPPPPPALPSSAPSGPPPPPPPLSVAGSVAPPPPPPPPPPPGPPPPPGLPSDSDHQVPPPAGNKAALLDQIREGAQLKKVEQNSRPVSCSGRDALLDQIRQGIQLKSVSDGQESTPPTPAPTSGIVGALMEVMQKRSKAIHSSDEDEDEDDEEDFEDDDEWED	335050	326319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_328952_330390_330500_334707
872400	contig_5586_pilon	+	6479	13	Intergenic	novelGene_143611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_9	51.7515431868676	110	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2133	6399	79	6477	731000	786317	FALSE	20	TGAAGCAGCTGGTGTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLHGIFPYLYVPYDGYGQQPESYLSQMAFSIDRALNVALGNPSSTAQHVFKVSLVSGMPFYGYHEKERHFMKIYLYNPAMMKRICELLQSGAIMNKFYQPHEAHIPYLLQLFIDYNLYGMNLINLAAVKFRKARRKNDTVHATGSCKDRLPGNSLIGSLFRWEEDEIPSSLILEGVEPRSTCELEVDAVAADILNRLDIEAQIGRNPGLQAIWEDEKQRRRNRNETSQISQPESQDRRFVPATESEKKFQKKLQEILKQNDFSITLSGSVDYSDGSQEFSAELTLHSEVLSPEMLQCTPANMVEVHKDTALNKGHKVQEVLINEEAILNLMENSQTFQPLTQRLSESPVFMDSSPDEAVVHLLAGLESDGYQGGRNRMPFPCHSFGNSKTLQNSDDEENEPQIEKEEMELSLVMSQRWDSNTEEHCAKKRSLCRNTHRSSSEEDDSSSEEEMEWSDTSLLLANLSIPQLDGTADENNDNPLNNENSRTHSSVIATSKLSVKPSIFHKDAATLEPPSSAKITFQCKHTSALSSHVLNKEDLIKDLSQPNNIEKGLDRSVASFTNESTYSAKYPGSLNSTVHSENSHKESSKKDIFPVSSCENRIFDYEEDIPSVTRQIPSRKYTNIRKVEKDAPFIHMNRHTSESTLGKNSFNFSDLTHSKNKLSSEGNEKGNSTALSSLFPSSLTEDCELLSCSGENRTMVHSLDSIADESGLNKLKIRYEEFQEHKTEKPSLSQQAAHYMFFPSVVLSNCLSRPQKLSPVTYKLQPGNKQSRLKLSKKKLVGHQETSAKTGEIGSTKDNCIQNNSCNSNPEKDNVLASDLIKATRGTLENKTPTDTFIDCHFGDGTLETEQSFGLYGNKYTLRAKRKVNYETEDSESSFVTHNSKSSLPHPMEIGETLDGTLKSRKRRKISKKLPPVIIKYIIINRFRGRKNMLVKLGKVDSKEKQVILTEEKMELYKKLAPLKDFWPKVPDSPATKYPIYPLTPKKSHRRKSKHKSAKKKTGKQQRTNSGNLKRTLSFRKKRSHAILSPPSPSYNAETEDCDLNYSDVMSKLGFLSERSTSPINSSPPRCWSPTDPRAEEIIAAAEKEAMLFKGPNVYNSKTVNSRIGKNSRVRAQVKKSKTKLVNPSVVTKKRNRRNQTSKLVDDGKKKPRAKQKQKTNEKGTSRKHITLQDEQVKAQSGAEIKFVLKHRNVSEVSNSSGGSQLLFKRKDMSLAGSAIDHSLSAPLPSGINTQQKLSGCFSSFLESKKTVDLQTFSNSRDDLHSSVVCSSVGPGISKINVQRSRNQSTVFTLKESTLIQKNIFDLSNHLSQVAQNTQISSGIMSPKTEESADTQKNYLSSVGKLNECHNSLESKLDQPFAPNFLRCKDSQQYSMCMTEQSKHSESCSGNAASEESQLPNNRFVTSLRSPIRQIAWEQKQRGFILDMPNFKPERVKQRSLSEAISQTKALSQCKNQNVSATPSAFGEGQSGLAVLKELLQKRQQKAQNANIMQDPLSNKHQPNRNVSGSLEHKAVKRTRSVTSPRKPRTPRSAKPKEKIPRLLKVDSLNLQNSGQLDNSLSDDSPIFFSDPGFESCYSLEDSLSPEHNYNFDINAIGQTGFCSFYSGSQFIPADQSLPQKFLSDAVQDLFPGQTIEKNEFLSHDNQKCDDDKHHASDPASWIRSGTLSPELFEKSCIDSNENHRHNQWKHSFHPLTTRSNSIMESFCVQQAEDCLNEKSRLNRSSLSKEVFLSLPQQSNSDWIQGHTRKDMGQTLDSVNTSFTTILSSPDGELVDAASEDLEVYVSRNNDILTPTPDSSPRSTSSPSQSKNGSFTPRTAHILKPLMSPPSREEIMATLLDHDLSETIYQEPFCSNPSDAPKKPREIGGRLLMVETRLPNDLAEFEGDFSLEGLRLWKTAFSAMTQNPRPGSPLRSGQAVVNKGSSNSHKMVEDKKIVIMPCKCAPSRQLVQTWLQAKEEYERSKKLLKTEPTGVVKSAENFSSSVNPDDKPVVPPKMDTAPHILPTTAYTKEDVDNSQIALQVSTTECSRTTSESQMLPPVASANDLEKDEDDDDDFYVSYSSPDSPVIPPWQQPTSPESKALNGDGRASSPVEELCSLTVENFLKPIKDGTQKSPCSEPREPLVISPINVRARTGKRESLCFHSTPIIQRKLLERH	730921	786319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_731095_735261_735337_742418_742580_755639_755737_758540_758636_759209_759315_762128_762214_762299_762449_765040_765152_768317_768556_776792_776936_777820_781986_785437
872401	contig_5302_pilon	+	2553	1	Intergenic	novelGene_81517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1944	2261	1407290	1407607	NA	75	AAAAAAAAAAAACAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLIYTGTLFAKNTGSSNTNSWTDQTYTSRLAKRKVVRFQNTGLPRPGTKDRKGIQTHTYPFQYSTKQIKESLTEKLTGIHNSMPKDNFYHRKIIEKFTSIFGLN	1405346	1407899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1405300_1407900
872402	contig_2596_pilon	+	4242	1	Intergenic	novelGene_53534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110385	1114627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1110400_1114600
872403	contig_10444_pilon	+	5323	1	Intergenic	novelGene_139477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	31	651	898675	899295	NA	65	AAAAAAAAAAATTTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATISAPLPTMEYAVDPAQLQALQAALTSDPTALLTSQFLPYFVPSFSPYYAPQIPGALQSGYLQPMYGMEGLFPYSPALSQALMGLSPGSLLQQYQQYQQSLQEAIQQQQQRQLQQQQQQQQKVQQPKASQTPVPQGAASPDKDPAKESPKPEEQKNAPREVSPPPAETPPKSQKQKAKVRTPSTTPSLFQRCSTSWSAASARQASVTRRRRGAT	898644	903967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_898600_904000
872404	contig_13481_pilon	-	2008	10	Intergenic	novelGene_119480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	54.442857119718	4	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	494	1123	1326661	1308612	TRUE	15	CTAATGGGCATTTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGKLIDLAYTPFHAVLKCGHLTADVQVFPRPEPFVVDEEIDPIPKVINTDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISAQKQTQLCPECDCLDQTQWPADRCTEDFKKCKETT	1332908	1305485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309902_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1325725_1325869_1326653_1326746_1331267_1331445_1332676
872405	contig_12079_pilon	+	4715	17	Intergenic	novelGene_67383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_7	37.4841112172878	227	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	53	1474	405237	458194	FALSE	10	CTTACGGCTCTAGCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECRCRSCCAGPRARGAEMEPLAPMRLYTLSKRHFVLVFVIFFVCFGLTVLVGIKGPKVIQTSAANFSLNNSKKLKPIQIVSNPLSTYNQQLWLTCVVELNQSKETSVQTRFTMTVKVNGVAQDGTIMFIHNEVHNRTRTLTCAEKCAEIIVAHLGYLNYTQYTVTVGFEQLLIKEMNFTWKTYHPAFSQLEIWFRFVFVVLTFIVTCLFAHSLRKFSMRDWGIEQKWMSILLPLLLLYNDPFFPLSFLVNSWLPGMLDDLFQSLFLCALLLFWLCVYHGIRVQGERKCLTFYLPKFFIVGLLWLASVTLGIWQTVNELHDPMYQYRVDTGNFQGMKIFFMVVAATYILYLLFLIVRACSELHHMPYVDLRLKFLTALTFVVLVISIVILYLRFGAQVLQDNFVAELSTHYQNSAEFLSFYGLLNFYLYTLAFVYSPPKNALYESQLKDNPAFSMLNDSDDDVIYGSDYEEMPLQNGQAIRAKYKEESDSD	405184	461435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_405245_421006_421111_423247_423304_426831_426923_429608_429731_433416_433522_442844_442926_444681_444782_445741_445873_446101_446194_447188_447247_450624_450728_451941_451994_454911_454995_456280_456371_457682_457750_458115
872406	contig_6710_pilon	-	568	2	Intergenic	novelGene_92265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872407	contig_14441_pilon	+	3565	1	Intergenic	novelGene_100801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAGAAGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141310	144875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_141300_144900
872408	contig_10937_pilon	+	4153	1	Intergenic	novelGene_67324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	53	325	129973	130245	NA	30	CGCAGGCAGAGCAAAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIFGYQKAQFHSFSFKTMNWFPSMLQRTHPSAVILSSNAPPLASGSQDDALVSQAPCSATSPRSTAPFEWKCYFQIRSAHWGAHCFRVSLCCWDFPTQRVRKCVFCV	129920	134073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_129900_134100
872409	contig_13707_pilon	-	2690	5	Intergenic	novelGene_43567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1247	junction_4	283.766959845575	4	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAAAATATTTACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274010	269700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271895_272363_272460_272853_273839_273955
872410	contig_6164_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_121305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGGGGGATGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726285	724211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_724200_726300
872411	contig_7695_pilon	+	1820	4	Intergenic	novelGene_41525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	70.5265907300218	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	122	1201	350492	356939	TRUE	10	AGTATCTTTTTGTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPVDRTGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMGYGESMYYNDAYGALDYYKRYRVRSYEAVAAAAAASAYNYAEQTMSHLPQVQNTAVTSHLNSTSVDPYDRHLLPNSGTAATSAAMAAAAATTSAYYGRDRSPLRRTAAVLPTVGEGYGYGPESELSQASAAARNSLYDVARYEREQYVDRARYSAF	349710	360069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_349820_350479_350904_356271_356949_359459
872412	contig_14909_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_155711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTAAAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129281	128671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14909_pilon_-_128700_129300
872413	contig_14176_pilon	-	2181	14	Intergenic	novelGene_74836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	152.851631662129	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	149	937	229795	227664	TRUE	35	GGAACTGACTTTGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSLMEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIERTLSTPRSSTSKTED	230221	223032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_223762_223950_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227710_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_229930_230207
872414	contig_10015_pilon	+	2651	7	Intergenic	novelGene_170946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	272	junction_6	101.593416234627	403	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	800	2400	251	2650	22910	34099	FALSE	35	TAATGCATTTTGAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLDEYFEYDAEEFLVSLALLITEGRTPECSVKGRAESFHCPPAQFCYPVTTRHECSDKLAQCRQARRTRSEVTLLWKNNLPIMVEVMLLPDCCYSDDGPTTEGIDLNDPAIKQDALLLERWILEPVPRQNGDRFIEEKTLLLAVRSFVFFSQLSAWLSVSHGAIPRNILYRISAADVDLQWNFSQTPIEHVFPVPNVSHNVALKVSVHSLPRQSNYPVLTCSIHTNIGLYEKRIQEHELKTYQHRNSNEVEQCTNSSQHLCSKQTWTMAPESMLHAKNDTTPEYTTAVKNVKLYPGTGSKSDYGASQANILGFSGMEDVKSQTSVRTLKSFSLIDPSVPSHQSSWQSVGETNPLIGSLIRERQDVIARIAQHLIHCDPSASHVSGHPLNTQESSSLNLKLFQVSQENENVRKYKETFSISFGCPEFTSPEDTSEGKIRVKPETPQSESCISNRHSSRQSIGDTNPLIGCLLQQRQDVIARIAQHLEHIDPRASHIPRQSFSMCDSRLVPSKTCRSSYEDKNLLKKNKDDISVSISNPKFSLLEDSNERKNLIPDKSFSSFKCSGKLKSSLKPQIRGNQHQENPSEIIQTTFQETQNKATNLLTSSNVSPCKENNLDLSSRLENTLSGYQFKEQETSSEIDKQYSNCNSTDKQLCMNKYKEKMTINENCHPESFNSHQIDSKVKVTILEMSEYLHKHNNKCSNGDSKRPKTCEKDTQLNSTENYCNKDNEGFKCKKPDQLKNEQDKNEDSTDEKSRNFSERKGIRDCLSTCERLKSIEALQRSIPLKHSNVWQKHNFRSLDGTSTRAFHPQTGLPLLSSPVPQRKTQSGCFDLDSSLLHLKSLSSRSPQPCLNIEDDPDIHEKPFLSSSAPPVTSLSLLGNFE	20342	34100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10015_pilon_+_20530_22846_23050_23339_23466_24216_26042_29501_29622_33181_33262_33990
872415	contig_3817_pilon	-	3037	4	Intergenic	novelGene_78388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	66.0420741312351	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	136	642	1023723	1020048	FALSE	40	TAAAAATCAACTGGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTFVKQLKLGKLPQCLCIHLQRLSWSSHGTPLKRHEHVQFNEFLMMDIYKYHLLGHKLGQHEPKLNDGAGPALELQDGPAAPKPVLNQPGAPKTQMFMNGACSPSLLPTLPTPMAFPLPVVPDYSSSTYLFRLMAVVVHHGDMHSGHFVTYRRSPPSAKNPLSTSSQWLWISDDTVRKASLQEVLSSSAYLLFYERVLSRMQHQGQEYKSEE	1023961	1017652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1020313_1021632_1021754_1023602_1023823_1023925
872416	contig_6364_pilon	+	1737	6	Intergenic	novelGene_51766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	636	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTTTAACTGCCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901998	931424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_903076_904266_904362_906461_906559_929808_929896_930957_931128_931213
872417	contig_6241_pilon	+	3052	1	Intergenic	novelGene_156427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTAAATATTTCTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266872	269924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_266900_269900
872418	contig_10732_pilon	+	2284	4	Intergenic	novelGene_114715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_3	145.229320578028	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	916	1434	136273	142694	FALSE	15	GTCAGCATCTTTCCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVCHGPRVPSVPCPLAPLEKSALCVVGPREAWRLLSSVLSACSAGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEEWIKCIKAAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH	135357	143544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_136486_138573_138646_139287_139443_142615
872419	contig_10074_pilon	-	1967	2	Intergenic	novelGene_57189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCGATTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575831	573446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_574477_574894
872420	contig_12970_pilon	-	3988	23	Intergenic	novelGene_50516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	193.380389922586	312	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2760	58	2817	190748	104385	FALSE	20	TATGGTAGTCTTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGFVRERTLDKRWRVRKEAMMGLAQLYKKYCLHGEAGKEAAEKVSWIKDKLLHIYYQNSIDDKLLVEKIFAQYLVPHNLETEERMKCLYYLYASLDPNAVKALNEMWKCQNMLRSHVRELLDLHKQPTSEANCSAMFGKLMTIAKNLPDPGKAQDFVKKFNQVLGDDEKLRSQLELLISPTCSCKQADVCVREIARKLANPKQPTNPFLEMVKFLLERIAPVHIDSEAISALVKLMNKSIEGTADDEEEGVSPDTAIRSGLELLKVLSFTHPTSFHSAETYESLLQCLRMEDDKVAEAAIQIFRNTGHKIETDLPQIRSTLIPILHQKAKRGTPHQAKQAVHCIHAIFTNKEVQLAQIFEPLSRSLNADVPEQLITPLVSLGHISMLAPDQFASPMKSVVANFIVKDLLMNDRSTGEKNGKLWSPDEEVSPEVLAKVQAIKLLVRWLLGMKNNQSKSANSTLRLLSAMLVSEGDLTEQKRISKSDMSRLRLAAGSAIMKLAQEPCYHEIITPEQFQLCALVINDECYQVRQIFAQKLHKALVKLLLPLEYMAIFALCAKDPVKERRAHARQCLLKNISIRREYIKQNPMATEKLLSLLPEYVVPYMIHLLAHDPDFTRSQDVDQLRDIKECLWFMLEVLMTKNENNSHAFMKKMAENIKLTRDAQSPDESKTNEKLYTVCDVALCVINSKSALCNADSPKDPVLPMKFFTQPEKDFCNDKSYISEETRVLLLTGKPKPAGVLGAVNKPLSATGRKPYVRSTEAETGSNINVNSDLNPSTGNRSREQSSEAAETGVSENEENPVRIISVTPVKNIDPVKNKEINSDQATQGNISSDRGKKRTAAAAGAENIQQQTDEKVDESGPPAPSKPRRGRRPKSESQGNATKNDDINKPVGKGRKRAAVSQESPGSLEAVNAKAPKLQDIAKKALPAERQIDLQR	193085	103213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_104389_122220_122574_127370_127480_128783_128930_130260_130324_133188_133309_133853_133987_138783_138899_139387_139593_139877_140002_143032_143170_144529_144599_146878_147038_147876_148001_151989_152151_161060_161167_170831_170948_177779_177920_185708_185758_187207_187290_189286_189401_190617_190770_193049
872421	contig_14785_pilon	-	4686	16	Intergenic	novelGene_158413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	4314	4685	129098	66801	FALSE	20	CAGGGGAGGCGCGGCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTALKSASTSESSKLSSWGTFLFFNKCSSLLFFRSSTVTSFLCLRIVSTSRPLFLKLLMRWFSKPGFSAMAARGSVGGYSCGCGGGESRRGRGRWGRVEGREGEAGEEGTFRDASEREVAAA	168157	66799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_-_67027_117990_118034_128709_128811_129096_129162_129297_129396_132448_132535_134447_134532_134894_135066_136283_136329_146656_146791_149113_149241_161381_161484_161578_161657_161817_161979_164280_164377_165089
872422	contig_5620_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_161351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCCTCCTCAGTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352735	352044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_352000_352700
872423	contig_12142_pilon	+	3277	1	Intergenic	novelGene_147828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACGACAATAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146229	149506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_146200_149500
872424	contig_13051_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_140110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTTAAAAAGGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166354	163698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_163700_166400
872425	contig_12250_pilon	-	1926	7	Intergenic	novelGene_80723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	357.471988024547	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATTCTGTTACCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401292	398595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_401120_401200
872426	contig_366_pilon	-	2495	9	Intergenic	novelGene_51579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	783.619287345583	15	125	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	555	1280	780147	757088	FALSE	30	GGAAGTTTTTCTTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKVGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGFLSMN	803462	755872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764235_764350_765322_765430_768018_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802945
872427	contig_366_pilon	-	2175	10	Intergenic	novelGene_51594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	524.456755976018	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	412	1389	803057	757099	FALSE	10	GGGATTTTGTTTTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803468	756312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
872428	contig_6364_pilon	-	6149	1	Intergenic	novelGene_51779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTCCCACGCCGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087803	1081654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1081700_1087800
872429	contig_11994_pilon	-	944	5	Intergenic	novelGene_129350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGCCCTGCGCGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100380	93732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11994_pilon_-_93884_94953_95436_97356_97449_98564_98726_100322
872430	contig_10196_pilon	-	1238	7	Intergenic	novelGene_132231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_6	197.593578393181	1558	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	159	635	1442405	1433608	FALSE	10	GCCGGCAGCCGCGTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKLRMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELLNEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS	1448672	1433004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1433672_1436106_1436187_1436279_1436390_1440636_1440710_1442139_1442224_1442339_1442416_1448524
872431	contig_15888_pilon	-	1270	6	Intergenic	novelGene_84404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2504	junction_4	720.526307639076	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	201	560	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	254255	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198
872432	contig_7457_pilon	-	1173	4	Intergenic	novelGene_31700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	24	365	1176842	1174926	FALSE	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176865	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
872433	contig_5039_pilon	+	2350	11	Intergenic	novelGene_64990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	140.987375321339	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	550	1851	1688604	1701169	FALSE	10	CAGGTGTGGGTGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLVIGSGGREHTLAWKLAQSPHVKQVLVAPGNAGTACSEKISNAAVSVSNHAALAQFCKDEKIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLTSAGVRCFGPTAEAAQLESSKRFAKEFMDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALKDGRVVTNGGRVLTVTAIREDLPSALEEAKKGLAAIKFEGAVYRKDIGRRALAFLQQPR	1686538	1701668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687049_1688564_1688749_1691365_1691462_1692008_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648_1698818_1700933
872434	contig_1154_pilon	+	2995	1	Intergenic	novelGene_87101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAGGGTAAGAGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358198	361193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_358200_361200
872435	contig_2596_pilon	-	1434	7	Intergenic	novelGene_53520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.26058530567	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	105	818	1120571	1054786	FALSE	15	GGTCTTATTGTAGGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAASEDEEEEEALEAMQSCWVHAHSSEAAAVLCISCTTPPS	1120675	1054169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1054858_1054922_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
872436	contig_2069_pilon	-	1654	3	Intergenic	novelGene_23559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_1	37	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	80	475	2262407	2249764	FALSE	25	TCTGTGATTGCTTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFEHLLIFLLFCLTVFYFFLFSSSINQSADSGGTDNFVLISQLKEEVMSLKRLLQQRDQTILEKDKKLTELKADFQYQESNLRTKMNSMEKAHKETVEQLQAKNRELLKQVAALSKGKKFDKSGSILTSP	2262486	2248584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2249854_2258729_2258832_2262203
872437	contig_2703_pilon	+	2376	14	Intergenic	novelGene_101807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	36.5229926769814	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	118	1836	891517	1093511	FALSE	25	CCTACAATTATTTTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPALRPPPPPQSARALQQHLPSAPRVLPAPAQPPNCLPAMEPGAPRRRHTHQRGYPVTRNPHLNKDLAFTLEERQQLNIHGLLPPRFVSQHIQVLRVIKNFERLTSDFDRYLLLMDLQDRNEKLFYRVLTSDIEKFMPIVYTPTVGLACQQYSLVFRKPRGLFISIHDKGHIASILNAWPEDVVKAVVVTDGERILGLGDLGCNGMGIPVGKLALYTACGGVNPQECLPVTLDVGTENEELLKDPLYVGLQQRRVRGRAYDDFLDEFMEAISSKYGMNCLIQFEDFANTNAFRLLNKYRNQYCTFNDDIQGTASVAVAGLLAALRITGNKLSDQTILFQGAGEAALGIAHLIVMAMEKEGLPKEKAIEKIWLVDSKGLIVKGRASLTQEKEVFAQEHEEMKNLEAVVQKIKPTTLIGVAAIGGAFTEQILKDMAAFNERPIIFALSNPTSKAECSAEQCYKLTKGRAVFASGSPFDPVTLPNGQTLYPGQGNNSYVFPGVALGVVACGLRHIEDKVFLTTAEVIAQQVSDKHLEEGRLYPPLNTIREVSLKIAEKIVEDAYQEKTATVYPEPPNKEAFVRSQMYSTDYDQILPDCYSWPEEAQKMQTKVDW	891399	1094051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_891595_920477_920612_925472_925623_961796_961873_964306_964469_992657_992762_1045766_1045877_1058253_1058352_1060124_1060239_1077592_1077699_1078589_1078733_1082164_1082339_1089683_1089783_1093340
872438	contig_9121_pilon	+	4111	1	Intergenic	novelGene_134460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187908	192019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_187900_192000
872439	contig_5481_pilon	-	3369	1	Intergenic	novelGene_144566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAACTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80367	76998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_77000_80400
872440	contig_15118_pilon	+	2201	5	Intergenic	novelGene_74589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138.818901810957	376	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1239	1538	379462	379761	TRUE	5	TTGCTCTTCATTCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGGQRDRRASQPCPSGCLCFLSPRAFGQCHLIASPGGSVLKPVCDADSNTPTKLSWSWGSLTLSPSQALNPEVLELPQLLSGDGGKFTCQAHHLLGP	376620	380657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376995_377342_377385_378639_379782_379884_380022_380151
872441	SIRV6	+	769	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14505	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10251	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
872442	SIRV6	+	780	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10240	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
872443	contig_10976_pilon	+	2351	2	Intergenic	novelGene_155586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	788	1339	106229	110731	FALSE	85	AAACAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSPLLNLGFPVTSFPVPSCLLVLAPGWCAHLVLFCFIGFSNLWLKGEPRGFSRLCQTSKPSLFFFNFCELEFCSTTNERPDREHNRESLMEQQKDGVQNSNSSKTRLNGLTETGGALESIAPGLSLSPELKHFRGQLFRQGLDWTVGHKVILVKSVPLSQVDIRDQRGSFCPEVRWEGRES	105441	111743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_106455_110405
872444	contig_11631_pilon	+	2169	7	Intergenic	novelGene_104207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_1	452.345983610874	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1201	2013	260386	283438	FALSE	0	TTTCCTTTTGTTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS	259185	283594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_260572_261559_261689_262604_262671_264543_264630_273509_273622_281390_281540_283353
872445	contig_14191_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_153760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACACAAAGCTGATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19704	17572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_17600_19700
872447	contig_2798_pilon	-	1732	2	Intergenic	novelGene_120065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	0	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATAGGTGTGTCTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193493	188410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_189944_193294
872448	contig_11564_pilon	+	536	1	Intergenic	novelGene_158555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACTTCACCAAAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46014	46550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_46000_46600
872449	contig_14499_pilon	-	3181	2	Intergenic	novelGene_174022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	390	junction_1	0	168	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1005	1376	99204	96651	FALSE	50	CCAATTAATTAAATAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFYLCESVVDGTEISTGVTLLLDDFRYLEVEWEVKRKTHREFSKTSMVDLCPKVPKQDNSSDCGVYLLQYVESFFKDPIVNFELPIHLEKWFPRHVIKTKREDIRELILKLHLQQRKGSSSS	100208	94845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_-_96792_98973
872450	contig_12919_pilon	+	6320	1	Intergenic	novelGene_75897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	724013	724324	NA	25	TAAAACCCGTTGCTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKEGLAPNIQDFLSKDLIVPCTSCCNTPALPVKKPNNRGWIFVQDLHAINHIVIPRFPVVPNPHLLLSKVLSDATHFTVVDLCSTFFSILCILKINTCFYLGQ	724010	730330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_724000_730300
872451	contig_6445_pilon	+	2298	6	Intergenic	novelGene_77011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_1	817.128239629497	172	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	252	773	522296	614102	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEEYKYTSCKAFLSTLNEMNDYAGQHEVISENMTSQIMVELARYVQELKQERKSHFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKVR	522044	615627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_522320_579451_579568_597277_597335_598043_598192_613498_613562_613988
872452	contig_11364_pilon	-	1617	3	Intergenic	novelGene_65151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	200	junction_2	26.5	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	360	737	64396	61299	FALSE	5	CTTTGTGGTTTGTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVRAVLDLKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRMEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPTE	64755	60418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_61515_63980_64062_64315
872453	contig_4891_pilon	-	3402	2	Intergenic	novelGene_124520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	0	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	276	380	67986	67882	FALSE	65	AATTGAAAGAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPRSGPCGWRPSRVSPPPPPPYCLCEVRGERPPPLPLPPQLKKHSLKQGLRLPAASKVSDCWISKHQVQLCSPTCLTCRDPCQAGPEFTQMLIRTDPGNTGIMSHMWWNGGNCSCLLHYTRPKS	92844	64859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_68137_92719
872454	contig_14142_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_120560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	3	464	433343	432882	NA	35	GACCAAAAGTATTGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433345	432448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433300
872455	contig_7247_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_176689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	4	312	103276	103584	NA	15	TCATCTTGCTGGTGCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMDEWNFAIQTGKEKEQQVPWRKGVNIQEAGKRPAMRWGGGMAGERNLTHLRFLFFDYFHHVVQPSPVSTAKFSITINRYSMLPKQWFSFSPSLLPLVTTNKL	103272	105977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_103300_106000
872456	contig_9440_pilon	-	1514	4	Intergenic	novelGene_59109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	465.7068701328	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	86	649	1716626	1700693	FALSE	40	TGATGTTTAACAAGTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARCGRRERRESAQARLRPTFQRLLSARMGASARLLRAAIMGAPGSGKGTVSSRIIKHFELKHLSSGDLLRDNMLRGTGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1716711	1699827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1716475
872457	contig_10609_pilon	+	2836	11	Intergenic	novelGene_123912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.9974358131403	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	312	1745	290484	309992	FALSE	35	AGAAACTACTATGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSELMHSIVGSYLKPPERVFVPSFTPYETSQNCHPVNMEVTPPKMFYSPNNQAALILALKTLQDKIHRLELERTQAEDNLNILSKEAAQYKKALENETNERNLAHQELIKQKKDISIQLSSAQSRCALLEKQLEYTKRMVLNAEREKNIILEQQAQLQREKEQDHLKLHAKLDKLDVLEKECFRLTTTQKTAEDKIKHLEEKLKEEEHQRKLFQDKASELQTGLEISRILMSSVSNPKHSKGKKKSSKKTKCLQRGLPQESYLKFGAPPFVPGKLVSTSHSGNASVQNLLQMMRDCGPHTLQKHSKAPEPRCLHKPSTTPQCKAVPPDPEKSVSICDNLSELLMAMQDELDQMNMEHQELLNQMKETQSHSVCEDIESELEHLVKKMGIKAEQISKLKKHQNSVRELQQKLQNSKMSEASGIQQEDSNPKGSKNMKNSPRKCSHETSPLQKNSNFHPKRVRNLQMKLSKDDIMWEQ	255530	311083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_255839_290480_290644_294368_294552_295600_295723_299061_299179_300129_300208_300686_300774_305585_305664_305779_306022_307668_307814_309770
872459	contig_16303_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_34127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACTAGATAAAATGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57265	55739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_55700_57300
872460	contig_10667_pilon	+	4567	1	Intergenic	novelGene_137305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2978	3292	37444	37758	NA	10	CTACTCTGTCCTTTAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSHILAAKWRYFLQITKAPELCHFQLCCTRKSGLGRRRQKKNTLIRTFLFCLQGCDLAQQLQNCFHSDLYSFSCLTLFVKIADVRASLSLLKRLRYLCLKG	34466	39033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_34500_39000
872461	contig_8907_pilon	-	979	1	Intergenic	novelGene_85830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTCAATTTTTAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432488	431509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_431500_432500
872462	contig_6663_pilon	+	1159	6	Intergenic	novelGene_178172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	670.791353551907	10	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	586	1158	161673	169865	FALSE	40	TAAGTATTAACCTACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWKEVLRRRLATLNTGPNEKKSEQELKDEEMDLFTKYYSEWKGGRKNTNEFYKTIPRFYYRLPAEDEVLLQKLREESRAVFLQRKSRELLDNEELQNLWFLLDKHQTPPMIGEEAMINYENFLKVGEKAGPKCKQFFTAKVFAKLLHADSYGRISIMQFFNYVMRKVWLHQTRIGLSLYDVAGQGYLRES	161087	169866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6663_pilon_+_161731_165266_165395_167499_167605_168199_168313_168853_168952_169794
872463	contig_21232_pilon	+	1839	10	Intergenic	novelGene_165978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	773.757753905184	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	598	1083	19639	26084	TRUE	20	GTCGATTCCAATTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTYRLLISGNSSNPVENITGVGTTYATVCGLIPGSSYTVEIFAQVGNVTEGASSSASFCTDAAPVNFSCEPVPREPTLVLTWALPPGNNAGFKLEVSSGACDNMTCLENCSLENGTSCMAEVTHLNFCTSYNISITTLSCGKNASSVQKTCTTDSTGSFS	13481	28261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_13667_14912_15168_18091_18158_19547_19823_22219_22508_26070_26242_26445_26571_27267_27477_27592_27718_28121
872464	contig_3394_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_152709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	263	792	1317	2108	517814	518605	NA	35	TTAGTTTAAGCTTTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLWFSPVYLLTCFNSHFRHKLLRRCAAGPNRPPTISQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTTERQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTVLVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSDKRWHSYCLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKMEVNSESTALQR	516497	519290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_516500_519300
872465	contig_6870_pilon	-	3720	1	Intergenic	novelGene_103954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266168	1262448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1262400_1266200
872466	scaffold_7386_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_136600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	448	891	342224	341781	NA	80	ATACAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLAKLACLLWILHLAYHRLTSSSWDLSQRPAYDLLVLELDSPEACEPAAGRLTCQCWIHQPLKLRESREASSLAPDPRTRDLLAGFYIRVIHFLEINLSLSLFTCFTSLENPAEDRNQELPEVSGHLFRPLESRVVQTVKCSAAN	342671	340292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_340300_342700
872467	contig_2069_pilon	+	2702	10	Intergenic	novelGene_23567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	114.722639224424	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	684	1562	2302296	2316188	FALSE	25	TGCATTTTGAAATAGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELEAKLREEEQERKRMQVKAAQLQTGLETNRLIFEDKTSPYVGSARRIRKKKSKPPEKRGSRNCFAAQPHYRLCLGDMPFVAGKSTSPSHAVVANVQHVLHLMKQHSKALCNDRVVNSVPLAKQASSRCCKSKNRPVTPSSSSTINEELSEVLQTLQDEFGQMSFDHQQLVKLIQESPTIELKEDLECELETLVGKMEAKANQITKVRKYQAQLEKQKIEKQRKELRATKKSLDEEGNSSSRSSGTTGTTNKKDFAKLRPGEKSRKNLQLLKDMQTIQSSLQSNSLSWDY	2272784	2317328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2273039_2298194_2298375_2298733_2298856_2301543_2301665_2302289_2302368_2305649_2305758_2306699_2306778_2313148_2313391_2313974_2314120_2315954
872468	contig_10642_pilon	+	2100	4	Intergenic	novelGene_78664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1470	1853	172661	173044	TRUE	15	TCCCCGAGCACCATGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFNLLSLGGRFSSMSNSSSDSPSSKIWLRTGALFLDVRRLVTDGFRRKTTCVERDMGFLSSSSSSSSSSTLNRHLRPLAVGFKLAGGPADSACPASSGRSSFFAESHRPLLLWPLRTLSVARAGD	169172	181184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_170434_172452_173133_177951_178084_181157
872469	contig_11227_pilon	+	4284	1	Intergenic	novelGene_163188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAGCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196527	200811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_196500_200800
872471	contig_5236_pilon	+	3499	11	Intergenic	novelGene_100947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	103	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1467	1775	1007879	1008751	TRUE	15	CAGGCCACGATCGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLKPFSNNQKTLARLVDFPTPLTPQKVTTYGRWRRWASMMSRSMSTRRCGCRICTKDSCRACFTVDVTVLNVPITFPSNLLATDSQSWTAMSAATFLAMR	1005867	1011754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1006904_1007039_1007138_1007224_1007389_1007710_1007915_1008023_1008199_1008506_1008594_1008740_1008854_1008950_1009056_1009471_1010289_1010453_1010993_1011593
872472	contig_3584_pilon	+	2137	15	Intergenic	novelGene_108197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	113.744454899605	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	51	1733	554470	562364	FALSE	20	TATTGCACTTCAGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGKVDYRTEQKFADHMKKKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGSLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL	552865	562768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_552891_554444_554583_554968_555156_555304_555494_556602_556720_556936_557045_557457_557571_558259_558342_558671_558726_558981_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
872473	contig_8671_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_126256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGGAATCATCTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487601	485449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_485400_487600
872474	contig_11677_pilon	-	493	4	Intergenic	novelGene_85918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	236	448	595842	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597398	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
872475	contig_6418_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_81263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1452	1772	1556209	1555889	NA	85	AAAAAAAAAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLAKNIEYTMDFQRNEQICLGRSTPRMLLRSMDGENFVSGTLDMFSSPCIMLGTVEGQQERGRPSTRWVDIVAATVGSDIAKIVRMAQDWAVMSSVVLRATMNLK	1557660	1555430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1555400_1557700
872477	contig_9008_pilon	-	1798	9	Intergenic	novelGene_58616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	43.2722125041001	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	40	972	97159	66778	FALSE	40	TAACGGCCAACTCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDALEFIGKKTMDVIAEGDPGFKKTKGLMNRNSTLSQVLREAKEKEELWTCNEVTVETDKKTHYGLLFDEFQGLSHLEALEMLSRESEIKVKSILNSLSGEELETLKLELEQLKEVFSLAEFTEEEEEEKKGDEDFTKEITELFSQLHVSSKPEKLARARSTAYEWIATSLTKPLAEKEDGEKCLEVESTEQANKNSVEDIHSFAIRSLAELTACSIELFHKTAALVLHGQKQEVTAIERSRTLSQVTVVLCKELSALSKEFTTCLTTAGVKENADVLNPLITAVFLEASNSASYIQDAFQLLLPVLEISLIESKTESLQA	97198	65951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_-_66880_77229_77284_79700_79774_80835_80976_81679_81803_86239_86320_95629_95754_96410_96570_97081
872478	contig_11321_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_86657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160656	163035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_160700_163000
872479	contig_5640_pilon	+	2069	5	Intergenic	novelGene_27247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAAAGATCCAGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39860	138281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_41252_45444_45638_57925_58162_63300_63478_138209
872480	contig_5428_pilon	+	2757	7	Intergenic	novelGene_160411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAAGCGATGGGGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157259	177174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_158455_162056_162154_165148_165267_165363_165451_166173_166312_167472_167705_176284
872481	contig_14202_pilon	-	6301	17	Intergenic	novelGene_157140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_11	57.4031793544574	379	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2862	187	3048	154582	99673	FALSE	45	TATATGTAAATATGCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLTEEQRKKIEENRQKALARRAEKLAQQHQSTGSGSSITVNPSQSKQGSSQNPPRDSSKPVTRDVIFKQWNPTNSSNGDKRSHNSHKFRLSTPEPAEGIWKSQEEKPIACPSHRPPSQTTVTGVSPPLAQSSPEVPNQQHLGYKLGRGHAQASHKTKLTPFANTTHELLAVTVSSQETPASSPGQPPGDPELLAERVRPSTSGQTISDLHYGSGYVTPRTEGKRQQNLELSLHKEVSSQKGMCIQNGDRFQVKIGYNAELLAVFKSLPSRSYDPATKTWNFNMTDYSDLMKAAQRLPKVTLLPLERVSGTDSGAQASLPPARSLAFVKGQCMLISRARFEADIGYSEDLVALFKQLDSRSYDVKTRKWNFLLEDHNKLIERVRCLPQVQLDPLPKTIIQAFASQLEKTSLHLTVDAPEADLSGVDSKLVSSLMPFQRAGVNFAIAKRGRLLLADDMGLGKTIQAICIAAFYRKEWPLLVVVPSSVRFTWEQAFLLWLPSLTPDCINVVVTGKDHLRAGLVNIVSFDLLSKLEKQLKTPFKVVIVDESHFLKNSKTARCRAAMPILKVAKRVILLSGTPAMSRPAELYTQIIAVKPTFFPQFHAFGLRYCDAKRQPWGWDYSGSSNLNELKLLLEEAIMLRRLKSDVLSQLPAKQRKMVVVAPGRISARARAALDAVAKEMITKDKTKKQQKEALFLFFRRTAETKIPSVIEYILDLLESGKEKFLVFAHHKVVLDAITNELERKHVQHIRIDGSTPSADRDNLCEQFQLSERHAVAVLSVTAANMGLTFSSADLVVFAELFWNPGVLIQAEDRVHRIGQTNSVGIHYLVARGTADDYLWPMIQEKLKVLGEAGLSETNFSETTEAADYFYKDPKQQTIYDLFQKSFEEDRSDMELLEALESFDPGSASGTSGSSSQDMGDTLDESTFTASPSKKRRFEFFDNWDSFTSPM	155239	96419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_-_99913_104479_104577_105529_105631_107086_107270_112498_112602_116362_116434_122470_122690_126438_126580_132357_132424_135457_135617_137766_137918_142734_142922_147697_147749_149485_149702_152763_152815_153756_154641_155111
872482	contig_12119_pilon	+	3276	4	Intergenic	novelGene_88627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_3	93.8094996374153	554	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	342	521	70066	193636	FALSE	20	GTGTGTGTTTTAAGTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKCVSAKETLEADLYKRFILVLNEKKAKIRSLHKLLSEVQELEKNAEHDRETATCSQVSADRDAVYDESTDEESGNQPDPSVLSPATLREDDSIFSSPDVTDIAPSRKRRQQMQKNLGTEPKMASQEHQLQEKEKLDPSLPQTLKKEHSSAENMSLETLRNTSPEDLFDEI	22110	196391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_22265_23943_24051_69985_70134_193524
872483	contig_11855_pilon	+	1878	7	Intergenic	novelGene_67082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	169.521548941589	727	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	151	969	2279887	2287923	FALSE	10	GCGCAGCCTTATGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKVFESIGKFGLALAVAGGVVNSALYNVDAGHRAVIFDRFRGVQDIVVGEGTHFLIPWVQKPIIFDCRSRPRNVPVITGSKDLQNVNITLRILFRPVASQLPRIFTSIGEDYDERVLPSITTEILKSVVARFDAGELITQRELVSRQVSDDLTERAATFGLILDDVSLTHLTFGKEFTEAVEAKQVAQQEAERARFVVEKAEQQKKAAIISAEGDSKAAELIANSLATAGDGLIELRKLEAAEDIAYQLSRSRNITYLPHGQSVLLQLPQ	2278579	2288832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2278690_2279846_2279975_2281322_2281485_2283589_2283733_2283903_2284021_2286267_2286364_2287710
872484	contig_6871_pilon	-	2479	9	Intergenic	novelGene_21603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	175.898363764419	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	2	712	445800	425580	TRUE	15	ACTTGACTCCCTTCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAEGGGSGSLSSQRGGRAGALHLRRVESGGAKSAEESECESEDGIEGDAVLSDYESAEDSEGEEGEYSEDENSKVDLKSEANDAANSSTKEEKGEEKPDGKGTVTGERQSGDGQESTEPVENKVGKKGPKHLDDDEDRKNPAYIPRKGLFFEHDLRGQTQEEEVRPKGRQRKLWKDEGRWEHDKFREDEQAPKSRQELIALYGYDIRSAHNPDDIKPRRIRLPNQSPSSRHHLRL	445801	423333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_425044_425522_425587_425736_425777_430683_430851_431392_431545_431632_431792_444877_444916_445256_445285_445680
872485	contig_10749_pilon	+	1824	16	Intergenic	novelGene_133504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	37.5046071243995	261	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	39	350	288708	293091	TRUE	15	CGTACCAGACCTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLGLFPPPPPRDQVTLYEHNNELVTGNSYESPPPDFRGQWINLPVLHLAKDPLKTPGRLDHGTRTAFIHHRERVWKRCITTWRDMGLFGVLNEIANSEEEE	288669	301965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_288831_289428_289557_292839_292896_293086_293311_293490_293538_293798_293898_294233_294378_299644_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513_301599_301727
872486	contig_20561_pilon	+	4392	6	Intergenic	novelGene_166376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_5	24.003333101884	149	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	2262	2822	102961	122799	FALSE	10	GCATACTTTTTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVIQRELLERVKMQLASFLEDPQYQDQHSLHSEIIKTFGRVGPNAEPRFRDEFVIPHLHKLALVNNLQIVDSKRLDIATHLFEAYSALSCCFISEDLMVNHFLPGLRCLRTDMEHLSPEHEVILTSMIKECEQKVENKTVQEPQGSMSIAASLVSEDTKTKFLNKMGQLTTSGAMLANVFQRKK	100699	124369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_102985_104390_104530_108216_108334_113947_114037_116153_116225_122678
872487	contig_4442_pilon	+	2097	10	Intergenic	novelGene_127949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_5	219.063551295447	141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	200	649	303978	359739	TRUE	55	TAAATGATTATTAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CATAYILLAEEEATTIAEAEKLFKQALKAGDGCYRRSQQLQHHGSQYEAQHRRDTNVLVYIKRRLAMCARRLGRTREAVKMMRDLMKEFPLLSMFNIHENLLEALLELQAYADVQAVLAKYDDISLPKSATICYTAALLKARAVSDKSPVPTATSFLPTQRLQLGRAGPGLSQLPLWCLPAKHSSGVSPGCEILSRGCISAGAEHSRDERGRGHS	301539	392091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_301695_303933_304032_338421_338537_358121_358195_358957_359094_359667_359771_376872_377024_387347_387441_390152_390293_391058
872488	contig_7308_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_159623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	975	1286	598534	598223	NA	10	GCCCTTTTTTAGCTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSYERESPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAAASSRLISRSWDLSCQLVCRTWDSLICTACEREPCSPTCRSWACQLLQLCDLGEASTLIHRLGMF	599508	597221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_597200_599500
872489	contig_11631_pilon	+	2915	1	Intergenic	novelGene_104187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	765	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTGCAATCAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103802	106717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_103800_106700
872491	contig_960_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_108253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACGACAATATGTAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561831	564260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_561800_564300
872492	contig_20157_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_145867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCCAAATTTATATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42785	45116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_42800_45100
872493	contig_6159_pilon	-	2243	2	Intergenic	novelGene_128270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCCAAACATGACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314706	312315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_314421_314568
872494	contig_3424_pilon	+	3377	1	Intergenic	novelGene_55553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCATATCAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333768	337145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_333800_337100
872495	contig_7894_pilon	+	5781	1	Intergenic	novelGene_170779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCACCCAGCAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177787	183568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_177800_183600
872496	contig_17074_pilon	+	2051	8	Intergenic	novelGene_145206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_4	238.381104579218	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	65	649	841610	855283	TRUE	65	CAAAAAAAGATGAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQAWRESWGGSLGSGRPRATMDRRKKALDVTTSSLVDLKAELFRKQEEFKQEKLLKDSGVSGKPKTTHKKPSIWSKQNAGVSNRAEKDAEQKIEEQKTLDKAREKLEEKAKLYEKMTKGDFIDEEVEDMYLVDFTQKIIDKRKEMDTFSANRDSRKAEEREDEEENLSERDVPPPQDSSEEWVDYVDSLGRSRRCMKKDLPDLLEMDKNLQGRL	841545	857876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_841652_843132_843238_843963_844065_849757_849817_851928_852107_855183_856510_856977_857073_857795
872497	contig_5031_pilon	+	2615	7	Intergenic	novelGene_133213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1837	2154	105967	116613	FALSE	35	TCAATTTGAGGAAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQGADGGQAGSGRKVYDLVLETIILGKHDGAGPAAPFSTAKLGPAQPQLSSQVGQKCCFWVCIFLHHLLAIHKENQLVCYHCHGLGFPNSRHLTPRRHWQLSAV	97524	117074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_99111_102698_102764_103674_103799_105905_106016_107368_107466_110278_110335_116497
872498	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	100	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872499	contig_6576_pilon	+	3654	10	Intergenic	novelGene_42290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	23.449446543786	349	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	506	1159	347424	352651	FALSE	25	TCAAGGCAGTCATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDEKELESSEEGGSAEERRLELPPSSHYCLYSYRGSRLAQQRGDSDDGSGTNAETPSGDDFSLSLVDANLPSEVEPQLRSFIAKRLSKGAVFEGLGNVTSVELSSPGCRVGCYYCLFQQEKLLPEAATVDSEYKPSEYVVCFLGGSEKGLELFRLELDKYIQGLKNNMNCEEGGLENHIKSYLSSWFEDVVCPIQRVVLLFQEKLTFLLHAALSYTPVEVKESDEKTKRDINRFLSVASLQGLIHEGTMTSLCMAMTEEQHKSVVIDCSSSQPQFFNAGSNRFCEDWMRAFLNGAEGGNPFLFRQVLENFKLKAIQDTNNLKRFIRQAEMNHYALFKCYMFLKNCGSGDILLKIVKVEHEEMPEAKNVVAVLEEFMKEALAQSF	343062	355146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_343177_343944_344020_346051_346178_346983_347128_347377_347436_348683_348804_349465_349531_349672_349810_351781_351886_352435
872500	contig_10734_pilon	+	2826	8	Intergenic	novelGene_51403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_4	58.1216177422789	382	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	326	1702	2057496	2068426	FALSE	15	CCACTCTTGGACTTGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEAPRRRSDEHPKKVPPDGILRRKSDDVHLRRKRKYEKPQELSGRKRASTLPTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKSGKEDKLFRKKRRSWKNAEDRMALANKPLRRFKQEPEDDLPEAPPKSRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRKRRLPNKELSKELSKELNQEIQKTENSLANENHQPIKSEPESENEEPKRPLGFCERPHRFSKGLNGTPRELRHQLGSGLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDDGAAHVMHREVWMAVFSYLSHPDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCKSITPLMLSGIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLDVQWVEGLKDTQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS	2056175	2069550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2056318_2056518_2056633_2057312_2057352_2057465_2058146_2058778_2058943_2059030_2059193_2059968_2060188_2068244
872501	contig_8987_pilon	+	2852	1	Intergenic	novelGene_165860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	652	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGATATAATCAAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202511	205363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8987_pilon_+_202500_205400
872502	contig_7279_pilon	+	5220	1	Intergenic	novelGene_145984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATAATCCTTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68943	74163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_68900_74200
872503	contig_7816_pilon	-	1973	14	Intergenic	novelGene_66539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	308.307826654354	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	66	1562	260356	246154	FALSE	45	AAAAAGGACCACAGGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSALAFPPLLSHSASPATGPAMAPFLRIAFNSYELGSLQAMDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSSFDAHIYEGRVIQIVLMRAAEDPMSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKLSIRGEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKEFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTMFQKERFNIDMPHRFKVYNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCADCGMNVHHKCQKKVANLCGINQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFERDPSRRLGVTGNIKIHPFFKTINWTLLEKRQMEPPFKPKVKSPGDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQTAFAGFSFVNPKFEHLLEK	263502	245742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246313_249177_249307_249945_250135_250283_250423_251947_251977_254348_254414_255134_255265_255541_255628_256796_256829_256931_257095_257278_257340_258951_259152_260241_260376_263456
872505	contig_7207_pilon	-	3189	1	Intergenic	novelGene_72044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTTGCATATCTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517373	514184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_514200_517400
872506	contig_7357_pilon	-	3754	1	Intergenic	novelGene_36897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATCTACCTCACGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272230	268476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_268500_272200
872507	contig_16625_pilon	-	2749	1	Intergenic	novelGene_171123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103575	100826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_100800_103600
872508	contig_3161_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_84524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432020	430575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_430600_432000
872509	contig_7179_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_78127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAATATGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779595	777769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_777800_779600
872510	contig_2799_pilon	-	2935	2	Intergenic	novelGene_85558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	279	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2581	2910	729375	725729	FALSE	40	GCGTAAGAGGAAGCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTCTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFLPMFWSYESHCYEGCFMKTTPFYRHDSIPMPGNVLSQKEGLMPAGQS	731955	725703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_725871_729187
872511	SIRV6	+	360	2	ISM	SIRV6A	SIRV606	545	4	49	7974	49	274	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCAATGCCCTGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2334	2814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740
872512	contig_17108_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_109504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGGATGACAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22071	24267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_22100_24300
872513	contig_253_pilon	+	4678	1	Intergenic	novelGene_129772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCTCACCGGCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804453	809131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_804500_809100
872514	contig_10494_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_102219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	829	1353	1234576	1235100	NA	30	GGGAGAAAGATGTGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRNLFSHSLVGYKSKFRASAPGKHFPYQLWRKVHVINLPLVWELLCTGTSGPKDALCSWHCFLGDMRSPCVSAHFSLSYLKRDWLKTLSNLVDLISVTAANPSYYVMVIEFTTHKEITSDYKMVHNRTILGFMTQSSLTDTFGGHYSIHDSISLPPVCLWVYSGLFRTQK	1233747	1236168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1233700_1236200
872515	contig_6544_pilon	-	4548	1	Intergenic	novelGene_142078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGTACTGTTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70510	65962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_66000_70500
872516	contig_8357_pilon	+	3798	2	Intergenic	novelGene_39725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	0	58	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATGCTTCAACCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505003	510931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_507568_509697
872517	contig_14666_pilon	+	3183	5	Intergenic	novelGene_39528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	80.7848222130865	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2277	2777	447510	448893	FALSE	35	ATAAAAAAGTCTTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	445233	449299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
872518	contig_4519_pilon	-	2692	1	Intergenic	novelGene_123677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAAAAAAAAAAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75914	73222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_73200_75900
872519	contig_5084_pilon	+	1988	4	Intergenic	novelGene_64670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	716	junction_1	1304.28175211067	60	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	53	409	1751485	1754556	FALSE	35	ATTTTATAAAATGTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLESEQFLTELTRLFQKCRLSGSVFITLKKYDGRTKPIPRKGTVDSFEPSDNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMVSFWRSLCPPSQARVGIILTTGLRAGLRTISSASNPC	1751432	1756135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1751509_1751646_1751720_1752165_1752279_1754409
872520	contig_8554_pilon	+	3354	1	Intergenic	novelGene_160293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTCCAAAATTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130116	133470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_130100_133500
872521	contig_6445_pilon	-	2822	1	Intergenic	novelGene_76973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	606	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1063	1389	78085	77759	NA	40	ACCCAGCAAATGACCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPHGLHHLWGHSRRPPVTTGGLGPFPEGSSAAKGLEKPAAGPPSPDFLPCAQVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKVWLSLHHRPALAYCPLHSPPCSGAVWPQH	79147	76325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_76300_79100
872522	contig_9468_pilon	-	1552	6	Intergenic	novelGene_59470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAGCTAACAGAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206424	189545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_189701_189791_189930_200356_200571_201334_201503_203172_203264_205638
872523	contig_12080_pilon	-	2528	15	Intergenic	novelGene_128392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_2	87.042682469169	304	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	80	1972	204783	194427	FALSE	25	GGCTATCATTCATTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDFSAWNAAIEGAAGGGGTGLQEQQMSRCDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFVEDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKEVIGCLPWVNRRTLATLIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYVSVFDIDSDQIAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTKQVLEMRGTAAGTDLWVTFEIREHGELERPLHPKERVLDQALQWCQLPEPCSASLLLQKVSLAHAGCLFTGTRRESPRVGLLRCREEPPRLLGSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPEREWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQHDDQQPVVLRRRSSSDLARQKFGTMPLLPIRGDDSGATLLSANQTLRRLHNRRTLSMFFPMKSSQGSVEEQEELEEPVYEEPVYEEVGAFPDLTEDTSISSTTREWTAKPETLLTSQSSFDQFLLSKAGTLGQEERPPEPPPGPPSKSSPQAHGSLEEKLLQELSSLILRKAETTTGLASPSQPSSSHPPSPTGLPTQTSSFPMQPPCTSSLPSSQPLT	204862	193870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_194910_195407_195447_195651_195790_195898_195963_196103_196140_196235_196319_198087_198222_198307_198437_199916_200032_200120_200196_200886_200956_201268_201417_202856_202963_203237_203451_204722
872524	contig_9113_pilon	-	2261	4	Intergenic	novelGene_68576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.5941909605289	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAACCCAGTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128130	118103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_118733_119149_120617_127828_127889_128025
872525	contig_2069_pilon	+	1676	12	Intergenic	novelGene_23264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	336.891232416842	20	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	154	996	333898	341321	TRUE	35	GGTTTGCACCATTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324033	347024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_343519_343652_346706
872526	contig_10299_pilon	-	2075	7	Intergenic	novelGene_79761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.3018727863299	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	122	1687	593453	580210	TRUE	0	TGCTGTGGGCTTCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVINLCLPQFRPRIHCNKISADGYEVENLISEDLTKRSRGFRTEYFIKPPVYVTVSFPFNVEICRINIDLTAGGGHNVTGLEMYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLEQPGSSLGPECATCKRVFSPYFRKEPVYQLPCGHLLCRPCLGEKQRSLPMTCTVCQRPAASQDVLRVHF	622506	579643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_579933_580110_580419_584724_584790_584849_584887_591057_592259_593399_593495_622426
872527	contig_14029_pilon	-	3704	1	Intergenic	novelGene_151947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3280	3582	132140	131838	NA	20	CCGAGAGCTCCATTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRPQTRLERGLYKGTKRLRGQIRPGTCSWLCAGGNWGHNTVQDPLWGPGRASAPHSVQSEGQSPETSSSRGFPPLSRFRSSSPSAPPPRPIQLRAERLT	135419	131715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_131700_135400
872528	contig_9099_pilon	-	3027	1	Intergenic	novelGene_149919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2195	2515	404047	403727	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTIVIKRNEVLIHAAKWLNLENIMLREISQTPKDASCMIPLIQSISEVNRQHGASVWGADKVSVETVVMVTQHCAMKCTLKNGQFYGICILPQLKKKKKASRTK	406241	403214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_403200_406200
872529	contig_16970_pilon	+	4447	1	Intergenic	novelGene_157595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCCAAGCACATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34937	39384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_34900_39400
872530	contig_9900_pilon	+	3115	1	Intergenic	novelGene_159510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCCACGAGTTCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132687	135802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_132700_135800
872531	contig_5302_pilon	+	3119	1	Intergenic	novelGene_81466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAATGTCTCAATGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258751	261870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_258800_261900
872532	contig_863_pilon	-	2823	1	Intergenic	novelGene_176613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACACAGTGATGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5291	2468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_2500_5300
872533	contig_6446_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_149242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	19	384	509805	510170	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDLMKIEDPFSLLGDQPDLNKLRRTKQPLSVLGRKPALCPCFSSQVCSSLEVGVGGEGCGGSQQRSLLKEDIISCSCLGPTQVIPHLLPPFIGAAGGVSLRWSLGWRAGSCRWGPTGHVG	509786	511164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_509800_511200
872534	contig_8650_pilon	-	3103	1	Intergenic	novelGene_162614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48370	45267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_45300_48400
872535	contig_5189_pilon	-	3410	2	Intergenic	novelGene_34818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTAGATTAAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198068	194409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_196245_196493
872536	contig_18610_pilon	+	4373	1	Intergenic	novelGene_168057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	469	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGATACAGACACGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15839	20212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_15800_20200
872537	contig_8712_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_58821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTGTTTCTTGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319944	318287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_318300_319900
872538	contig_11269_pilon	+	3779	1	Intergenic	novelGene_145817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACCAGTTAAACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318268	322047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_318300_322000
872539	contig_1639_pilon	-	2985	10	Intergenic	novelGene_74913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	38.8056251490667	653	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	1077	1901	339160	331961	FALSE	15	GTGCTCCATGCTGATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTTVNIGSISTADGSALVKLGNTTVICGIKAEFAAPPTDAPDKGYIVPNVDLPPLCSSRFRSGPPGEEAQVASQFIADVIENSQIIQKEDLCISQGKLAWVLYCDLICLDYDGNILDASTFALLAALKNVQLPEVNINEETALAEVNLKKKSHLSIRNHPVATSFAIFDDTLLIVDPTGEEEHLATGTLTIVMDEGGKLCCLHKPGGSGLTGAKLQDCMSRAVTRHKEVKTLMDEVIQSMKPK	340236	330876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_332077_332460_332568_333095_333217_335007_335105_335826_335873_335959_336066_336879_336926_338135_338210_338868_338933_339112
872540	contig_6199_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_126377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCGTAAGATCACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266153	264649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_264600_266200
872541	contig_8320_pilon	-	1769	9	Intergenic	novelGene_152270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	48.002604096028	346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	545	1447	558034	539063	FALSE	20	TATAGCTCTATTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSNGAKQDSHNKARTSPYPGSKVERSQVPNEKVGWLVEWQEYNPVEYTAVSVLAGPKWADPQISESNFSPKFNEKDGHVERKSQNGLYEIENGRPRNPAGRTGLVGRGLLGRWGPNHAVDPIITRWKRDSSGNKITHPVSGKNILQFVAIQRKDCGEWAIPGGMVDPGEKISATLKREFGEEALNLLQKSSAEKREIEEQLQKLFSQEHLVIYKGYVDDPRNTDNAWMETEAVNYHDETGEIMDSLTLEAGDDAGRVKWVDISDKLKLYASHSQFIKLVAEKREAHWSEDSDPGCPGL	563526	538740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8320_pilon_-_539242_542124_542210_543282_543430_545318_545431_551376_551464_555377_555474_557837_558078_560097_560228_563155
872542	contig_20951_pilon	-	1111	3	Intergenic	novelGene_43080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3166	junction_2	9254	15	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	27	587	28019	27149	FALSE	20	TTGGTTGAGAAGCAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28045	26624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784
872543	contig_16999_pilon	+	5568	1	Intergenic	novelGene_84976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67929	73497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_67900_73500
872544	contig_4678_pilon	-	2898	7	Intergenic	novelGene_126052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_4	53.8477792794961	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1918	2655	573594	571931	FALSE	5	GCCTAGCCTGCCTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF	575511	571687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_572068_572239_572351_572466_572539_572636_572787_572923_573021_573153_573226_573495
872545	contig_4364_pilon	-	3502	1	Intergenic	novelGene_55	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	331	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625704	622202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_622200_625700
872546	contig_11752_pilon	+	1345	8	Intergenic	novelGene_37615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1372.84062722339	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	186	1049	87165	105602	FALSE	45	TGAAATATAAAGATGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKA	84090	105898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84189_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93015_94310_94410_96442_96572_105597
872547	contig_5023_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_7304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGCTTAGGTACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588015	585728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_585700_588000
872548	contig_14666_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_39647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTGATTTATATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485141	486787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485100_486800
872549	contig_8278_pilon	-	3563	2	Intergenic	novelGene_165300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	0	113	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGGTCTGTGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222891	217116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_217681_219892
872550	contig_10331_pilon	+	2034	2	Intergenic	novelGene_54054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	967	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1151	1588	37195	42865	FALSE	40	AACACTTTCATCACCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGPRKFSLAQTESLLVKMRSVASDELHMMMQRRMSQENPVRATETELAQRLQKLLVLAVNRIIYQEFNPDDIDILSTPENVTQSKNSVPQTEVSGENMHHEQPSVFNPFQKEMFSYLVEGFKVSIVSKLIHCEVFIHTKGLEA	36044	43311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_37397_42629
872551	contig_8156_pilon	+	2906	19	Intergenic	novelGene_98898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	172.233046254841	221	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2721	184	2904	20350	52907	FALSE	35	TTCTGACACTCAGATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLVAWVLNTYLGKYVNNLNTDQLSVALLKGAVELENLPLKKDALKELELPFEVKAGFIGKVTLQIPFYRPHVDPWVISVSSLHLIGAPEKIQDFNDEKEKLLERERKKVLLQALEEKWKNERQQKGESYWYSVTASVVTRIVENIELKIQDVHLRFEDGVTSPSHPFAFGVCIKNVSMQNAVNEPVQKLMRKKQLDVAEFSIYWDVDCTLLGDLPQVELQEAMGRSMESRNHHYILEPVCASALLKRNCSKEPLRSRHSPRIECDIQLETIPLKLSQLQYRQIMEFLKELERKERQVKFRKWKPKVAVSENCREWWYFALNANLYEIREQRKCCTWDFLLHRARDAVSYTDKYFNKLKGVLLSADDKEEMCRIEEEQTFEELKILRELVHERFHKQQELAESLREPQFDSPGDSPGDPETSGGSGMLQYLQSWFPGWGGWYGQQTPEGKPVEGLSAEQHEQWTPEEILGTDEFFDPTADASCLNTFTKRDHVFAKLNVQLQRGTVTLLHKEQGTPQVSESAFMQLEFSDVKLLAESLPRRNSSLLLVRLGGLFLRDLATEGTTFPLLVFPNPQKEVGRVSQSFGLQTTSSDRSDHYPAADQNDPVFEMLYERNPVHSHFERRLNVSTRPLNIIYNPQAIKKVADFFYKGKVHTSGFGYQSELELRVAEAARRQYNKLKMQTKAEIRQTLDRLLVGDFIEESKRWSVRLDISAPQVIFPDDFKFKNPVLVVVDLGRMLLTNTQDDSKRKSGDGSASEENQFSDDEYKTPLATPPNTPPPETSSSNGEKTPPFSGIEFSEEQLQAHLMSTKMYERYSLSFMDLQIMVGRVKDNWKHVQDIDVGPTHVVEKFNVHLQLERRLIYTSDPKYPGAVLSGNLPDLKIHINEDKISALKNCFALLTSSETK	16209	52909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_16317_20273_20447_29594_29673_32198_32390_32481_32563_34779_34897_37120_37226_39748_39920_40375_40477_41341_41511_43392_43495_43652_43855_44613_44794_45466_45598_46482_46559_47416_47588_48743_48875_50265_50399_52422
872552	scaffold_17541_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_175235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	837	1154	124450	124133	NA	25	TAAAGTTGGGTGGTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVLLLRNPASGRHMEMSGWEMNPTKTRAHHLHGVSVGSVIWSMLRYPFKLKDRATFHSAWHEKRCRRLGRHPTACLQEETEIASRKVPTRAQGGTHVSEHRSP	125286	122745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_122700_125300
872553	contig_7695_pilon	-	2345	10	Intergenic	novelGene_41638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	138.266605950199	7	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	225	1151	863143	716315	FALSE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSRLFSLTLKKLVMLKEMDKDLNSVVIAVKLQGSKRILRSNEIILPMSGLVETELQLTFSLQYPHFLKRDANKLQIMLQRRKRYKNRTILGYKTLAVGLINMAEVMQHPNEGALVLGLHSNVKDVSVPVAEIKIYSLSSQPIDHEGIKSKLSDRSPDIDNYSEEEEESFSSEQEGSDDPLHGQDLFYEDEDLRKVKKTRRKLASTSAITRQPNIKQKFVALLKRFKVSDEVGFGLEHVSREQIREVEEDLDELYDSLGTLLTPAPVPAHSPLLTPSLLLSFPLQAQGRSRPRAGWFCLLAPVSPWS	863367	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716464_749048_749131_750021_750082_753251_753333_753419_753512_753758_753904_758792_758919_759647_759738_791350_791439_863129
872554	contig_6027_pilon	+	2489	1	Intergenic	novelGene_74414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1490	1807	76935	77252	NA	65	GCTAAGATAAAAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEKNKVGRLTLPDFKTYYTATLIKTAWYWYNDRHIDQQKRIESPEISPHIYGQLSFGKGAKSVQWGKKSLFDKGRWENWRSTCKKMKTESMPHIIHKNKFKMD	75445	77934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_75400_77900
872555	contig_7695_pilon	-	3890	1	Intergenic	novelGene_41655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	140	301	851822	851661	NA	30	AGTTAAGAGCTCAGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQFIEHYVDIARPLSFYDFSLSFSISPIPTPINIFSNVLNIYPWICMYQGALAQWLKWAAAGRSAVVNPPAALREKDVAACFCKDYSLGSTLGQFYSVP	851961	848071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_848100_852000
872556	contig_1699_pilon	+	4351	1	Intergenic	novelGene_72811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	269	810	2	811	40099	40908	NA	20	AAGCTCTGGTATCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMEDSDIQIVKVESIGDVSEVRSKKDQNQFISPEPTALHSSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNYALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRVVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMHKLFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN	40097	44448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_40100_44400
872557	contig_12635_pilon	-	3280	3	Intergenic	novelGene_60851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	295.5	122	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATGCAGAAAACAGCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585318	581616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_581827_581957_584686_584976
872558	contig_8075_pilon	+	3948	4	Intergenic	novelGene_42488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	193.004317740994	2656	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGCAAATACGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663926	669561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_664078_665115_665148_665427_667782_668150
872559	contig_1452_pilon	-	3339	1	Intergenic	novelGene_115171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	229	726	716541	716044	NA	25	GGTTTTGCTTCACTAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIWEASGLGLLQTVLLIIFQYRSFDEYMCIFLLDIYSEVELLNHKVCISLAEVDTASFPKWLFSFTLSSAKHKSSDYFTSSPILSIFCFYPFRWVVEIFSFAFPNDHRRPWWCSDCLAANQKVRGLNSPAAPSKPNGAVLLRPTESLRVRINSTATVFLVLVND	716769	713430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_713400_716800
872560	contig_16907_pilon	+	2043	5	Intergenic	novelGene_87422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1838	junction_1	342.353618353889	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	307	1044	327210	363082	FALSE	50	AAATTACATTTTATAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRGRGDKRRASRSRGVGLRCWAGCGTYCLIVRSLLLLLLFVLFSYLATLGAPSRRPSRRLSRRALPDPGWFSLPSVPLPVSSPRPLPDRRRHPSPARRLSTMEKTELIQKAKLAEQAERYDDMATCMKAVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGGRRSAWRVISSIEQKTDTSDKKLQLIKDYREKVESELRSICTTVLELLDKYLIANATNPESKVFYLKMKGDYFRYLAEVACGDDRKQTIDNSQGAYQEAFDISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNNPELACTLAKTAFDEAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDSAGEECDAAEGAEN	326903	364081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_327504_358180_358305_359987_360152_361003_361100_363022
872562	contig_8823_pilon	-	1098	2	Intergenic	novelGene_53072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69100	66725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_67757_69033
872563	scaffold_12124_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_22403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAATGGCGTGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509577	1508455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1509103_1509342
872564	contig_14322_pilon	-	3242	5	Intergenic	novelGene_115635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2816	3199	465040	304682	FALSE	75	AAAAAAAACGAAAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSCSTSFRAWAMLLVADIVCHLLRPRRPESFLSFPAKHHFINLCTRLSCLSSDVRNPNKLSRQKAASENPTGPSRTLPDAVLEDEPLGWKALRIHSGCNHGLEQTDDGEDGAGPDSVLFCCAWGSP	471549	304638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_304876_357056_357116_431448_431486_464946_465064_468757
872565	contig_10074_pilon	+	2166	4	Intergenic	novelGene_57127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_3	103.240818800834	432	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	568	1542	341341	343546	FALSE	15	TCATTTGTTTACATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKDDEGATPVKRRRVSSDEEQGGDVCVGDVKTEAREALTPASASDNETRDSSIIDPGTEQDLPSPENSSMKEYRMEAPSSFSEEVAGARPQHLGEQSSSGRFEDCKEFKDLHCSKDSSLAEEESEFPSTSISAVLSDLADLRSCDGQALPSQDPEALSLSCGHSRGLFSHMQQQEILDTLCRTIESTIHVVTRISGKGNLATS	340773	344170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_341407_341507_341652_342585_342746_342941
872566	contig_9871_pilon	+	5284	6	Intergenic	novelGene_75699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	34.8344656913236	25	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	4130	4531	562018	562419	FALSE	75	GAAAACTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGAPGCSPIPAAPPPLSSPLSPPPGFIHQSSSCAVVHSCTGQCLPQLLSSCRRHWRVCRPGLGAYGLLAPGGYTWSESGLTNRAAAAMLPGTCTPSPHPVPRSSQSPSLAAGTAPAQPTATHLARRPPVSS	552250	563172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_552296_552830_552940_555670_555839_556798_556924_557753_561088_561669
872567	contig_15021_pilon	+	1905	11	Intergenic	novelGene_26984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	52.7564214100994	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	246	1508	346533	353345	FALSE	0	CGTTTGCCCTCTTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTKSFTVDIRAKPEYHKFLIGKGGGKIRKVRDSTGARIIFPTAEDKDQDLITIIGKEDAVKEAQKELEALIQNLDNVVEDYMLVDPKHHRHFVIRRGQVLREIAEEYGGVMVSFPRSGTQSDKVTLKGAKDCVEAAKKRIQEIIEDLEAQVTMECAMQENGDETAEGRGAKEADPSSPRRCDIIIISGRKEKCEAAKEALEALVPVTVEVEVPFDLHRYIIGQKGSGIRKMMDEFEVNIQVPAPELQSDTIAITGLLANLDRAKAGLLERVRELQAEQEDRALRSFKLSVTVDPKYHPKIIGRKGAVITQIRLEHDVNIQFPDKDDGSQPQDQITITGYEKNTEAARDAILKIVGELEQMVSEDVPLDHRVHARIIGARGKAIRKVMDEFKVDIRFPQSGAPDPNCVTVTGLPENVEEAIDHILNLEEEYLADVVDSEALQVYVKPPAHEESKAPSKGFVVRDAPWTANSSEKAPDMSSSEEFPSFGAQVAPKTLPWGPKR	346165	353742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_346390_346511_346731_346943_346969_349006_349144_349427_349533_349880_350016_350611_350756_351924_352111_352592_352710_352984_353114_353258
872568	contig_8464_pilon	-	2131	2	Intergenic	novelGene_125367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	75	junction_1	0	173	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	281	901	786512	785892	FALSE	20	CATGTTTGTAGCTTATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDPMTYEAQFFGFTPQTCMLRIYIAFQDYLFEVMQAVEQVILKKLDSISDCDISPVQIRKCTEKFLSFMKGRFDNLFGKMEQLFLQLILRIPPNILLPEDKSQETHSYSEEEFQLLQKEIEQLQRKYKTELCAKQALLAELEEQKIVQAKLKQTLTLFDELTNVGRDHGISDFRESLVSLVQNSRKLQNIRDNIEKEGERLKTS	792383	784661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_786545_792135
872569	contig_3822_pilon	-	3151	5	Intergenic	novelGene_133319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1343.10805596571	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2232	2576	281746	281402	TRUE	35	ACAGGGGTATGACAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCWQRILNILWTSRRTNKSVLEEVQLECSLETRMERLCLTYFGHVIRRDQSLEKDILLGEVGGQRRRGRPSTRWSDTLAATVDSNKTTIMRMAQDQAVFCCVTMSRNQLDGT	283977	277237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277996_280890_280939_281136
872570	contig_8242_pilon	+	3462	9	Intergenic	novelGene_80191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_5	438.241639252821	21	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2370	2831	33759	37065	FALSE	10	TACGGGCTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3446	37696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29108_29700_29854_30702_30760_31973_33804_33959_34062_35060_35185_36874
872571	scaffold_16539_pilon	-	4723	3	Intergenic	novelGene_68390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	24.5	105	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	186	2330	764272	752983	FALSE	15	GCCACTAAGTTTTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAFRDVTIDFSQEEWECLDPAQRSLYRDVTLENYSNLVSLGCSFPKPDVITLLEQEKEPWMVVKEGTRSWYTDLESKCVTKKLFPEQDIYEIHLSQWQTVEESKTYIDEDTIFRNGLQCKHEFETQEGHQMGCISQMIIRKHISLPLHQKIHIGEKLYECKECRKAFRQQSYLIQHLRIHTGERPYKCKECGKAFCRVGDLRVHQTIHAGERPYECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSRVRDLRVHQTIHVGERPYECKECGKAFRLHYQLTEHQRIHTGERPYECKVCEKTFRVQRHLSQHQKIHTGVKPYKCNECGKAFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECEECSKFFSFHAELTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFRLQTELTRHHRIHTGEKPYECKECRKAFICGYQLTLHLRTHTGEIPYECKECGKTFSSRYHLTQHYRIHTGEKPYGCKQCGKAFRLQAELTRHHRIHTCEKPYECKECGKAFIHSSQLISHQRTHTNENAFECMECGKVFSRHYNLTQHYKIHTGEKPYECKECGKAFRFQTEFTQHRRIHTGEKPYKCKECGKAFIRSNHLTQHHRIHTGEKPYECKECGKTFSRHYHLTQHHRLHTGEKPYICKECGNAFICSYQLTLHQRIHTGEIPYECTECGKTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYICKECGTTFRLQAELTRHHTVHTGEKPYKCKECGKAFSVNSELTRHHRIHTGEKPYKCKECGKAFIRSDQLTLHQRNHISEETL	766052	750589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_755091_764235_764332_765926
872572	contig_13894_pilon	-	567	5	Intergenic	novelGene_62165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCTGGTGACCCCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528172	525650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_525797_526475_526577_526847_526946_527457_527578_528070
872573	contig_4125_pilon	-	2283	11	Intergenic	novelGene_25083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_6	141.447693512478	414	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	49	1413	541161	534075	FALSE	5	CTGACTCGTGTGTGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENCLLPDDKLRFTPSMSSGLDTDIETGLRVVGCELIQAAGILLRLPQVAMATGQVLFQRFFYTKSFVKHSMEHVSMACVHLASKIEEAPRRIRDVINVFHRLRHLREKKKPVPLLLDQDYVNLKNQIIKAERRVLKELGFCVHVKHPHKIIVMYLQVLECERNQHLVQTSWNYMNDSLRTDVFVRFQPESIACACIYLAARTLEIPLPNRPHWFLLFGATEEEIQEICLKILQLYTRKKVDLTHLESEVEKRKHAIEEAKAQAKGLLAGGTQVLDGTSGFSPAPKLESPKEGKGNKPSPLSVKNTKRKAEASKKAKADSPVNGLPKGRESQSRSREQSPSRSRSGSVSPKRRKSDSGSTSSGSKSQSRSRSRSDSPPRQVRHGAPYKGSKVRSYTKSRDCKYPTQKPPKSRSRSSSRSRSHSQERAENPGKYKKKSHYYRDERRERSRSYERTGRRYERDHPGHSRHRR	541209	533204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_534430_534588_534676_534759_534869_535214_535357_535439_535545_535690_535791_538221_538287_539296_539418_540343_540454_540643_540719_541065
872574	contig_11656_pilon	+	1282	5	Intergenic	novelGene_54035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	175.754089568351	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	208	561	521815	536636	FALSE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGLRLSRSGPCYSDVPEIFGPQMGIR	513790	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_513843_520395_520515_521778_521902_522657_522846_536557
872575	contig_10642_pilon	-	1668	3	Intergenic	novelGene_78716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_2	29	1891	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGCGTCATAGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921494	915260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_916462_920788_920866_921104
872576	contig_17102_pilon	-	1282	11	Intergenic	novelGene_141704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGAGGGCTCACGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72465	45105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17102_pilon_-_45132_45263_45489_57536_57736_59116_59196_59498_59575_59866_59981_62604_62704_68355_68511_70086_70191_70489_70578_72348
872577	contig_11427_pilon	+	2597	2	Intergenic	novelGene_78960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	298	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	74	1123	55005	56054	FALSE	65	TGAAAAAAAAAAAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWVQLPRSLTHQWRLEKTVTGLSKMEHQTSSPMYDYIDYSASEPCQKLDLKQIAAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLINCKKLKSMTDIYLLNLAISDLLFLLTLPFWAYHAANGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVVVLVSLPGIIFTRTQQEESHHICGPAFPVKWKNLHTIMRNILSLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLDLTTFQEFFGLDNCDSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYISVFFRKHIAKHLCKQCPVFYGETADRVSSTYTPSTGEQEVSAGL	49758	57528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_49821_54993
872578	contig_15144_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_177777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGGATCTTGTTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26698	28090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15144_pilon_+_26700_28100
872579	contig_19098_pilon	+	2616	2	Intergenic	novelGene_65785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGGAGGGCCAGGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49985	63931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_52582_63911
872580	contig_10011_pilon	-	3819	6	Intergenic	novelGene_68071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	28.4857859291261	107	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1858	2592	281066	277516	FALSE	30	ACTACTTTCTTACCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSAELQSVGRSQDEEFWNTYRGLQEQPSRNTLKETEALYKKALPTPQTLALSEQTNTKDWTMAPNLILPESQSLLTFEEVAMYFSQEEWELLEPPQKVLYHDVMQENYETVISLALFVLPKPKVISCLEQGEEPWIQGPQEFKDSHVESPTGLKFKNDTGSHQPVSLPALEIEAPGDIVSKKARAKVPQKTTDKENQGDIHRVGKRHQDFPVKKRKKTFNLETRVAETYGSSQERPCRRKAF	284727	276288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_277791_277971_278083_279704_279832_280160_280253_280936_282712_284515
872581	contig_2204_pilon	+	3600	2	Intergenic	novelGene_71679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1916	2437	34110	34631	FALSE	70	AAAAAAAAAAGAATTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKQNGKIKKVEKAEPEEFVVEKVLDRRVVIGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSENESDDSNSKKKREAADKPRGFARGLDPEQIIDATDNSGELLFLMKWKDSDEADLVLAKEANVKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	32043	35794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_33641_33791
872582	contig_14326_pilon	-	2815	1	Intergenic	novelGene_120747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAATTTTTTAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536481	533666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_533700_536500
872583	contig_8304_pilon	+	3398	1	Intergenic	novelGene_153186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164227	167625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_164200_167600
872585	contig_8312_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_152904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTCCTACAGGGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295490	292973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_293000_295500
872586	contig_11335_pilon	+	1982	4	Intergenic	novelGene_104916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGGCACTGTTCTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332981	352312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_334223_346584_346880_349009_349313_352169
872587	contig_12503_pilon	-	3210	1	Intergenic	novelGene_143833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAGAAGATATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160785	157575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_157600_160800
872588	contig_9696_pilon	-	1907	8	Intergenic	novelGene_68826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	45.3129706168383	251	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	25	930	577481	534159	FALSE	70	CTAGTAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRADVCSKMEFCSGRRAVLQLLRAVAPADRPALLQWMRTTRDFDEFIQDNNDVMLKSIAEDLRNCLPLEAMLSSEHLALQKIQQQPEPTVHFDAFLYDEDFIDSLCEEGRMSRNYCMVCGSHQTAPLGFISHSFSLTELKFIYHHVLPDLSGKVLVDVGSRLGAVLYGGYLYSSALQLYGVEMNEDFCQLQEMVIKKYQFTDRVKVLHADICTQGSLLQNADVVIMNNVFEYFLNEAEQTRAWEYINHNVRKQGSLLVTVPSLEESLSGLQSNIQLSLWVEEVPLNYDVYPEKDIDREALEQIHLYKIL	577505	533181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_534276_537075_537167_544243_544351_547757_547869_549992_550115_552616_552756_564332_564455_577384
872589	contig_10434_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_82063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAAGCATGTTAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183269	181511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_181500_183300
872590	contig_3787_pilon	+	3542	1	Intergenic	novelGene_102448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAGCCAAAAGGTTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740066	743608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_740100_743600
872591	contig_11378_pilon	-	3191	1	Intergenic	novelGene_112274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACGACAGAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447982	444791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_444800_448000
872592	contig_6742_pilon	-	2832	5	Intergenic	novelGene_144553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGGGAGTGAGATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47953	25616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_-_26113_26785_26968_27397_27500_41064_41906_46742
872593	contig_11932_pilon	-	3274	1	Intergenic	novelGene_85402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTTGTGAAGTTAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241570	238296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_238300_241600
872594	contig_5779_pilon	+	2830	1	Intergenic	novelGene_106506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	507	875	211739	212107	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIRGSELSASGIVWLWSRLLMNSSNPFRLSRGKAECAPAVGGGSTKEQVGCIGGEGRGSGSGSLSSPSQRGRARGLIIGKPNESREQKLRNVVREKLPSPFLCLLQWQESFPKHSLAFWK	211232	214062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_211200_214100
872595	contig_11277_pilon	+	2095	7	Intergenic	novelGene_80314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	138.71243235157	1	122	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	183	767	256606	269500	FALSE	40	AAATCTTACTGTCTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	254766	270828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_254798_255953_256049_256549_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
872596	contig_4425_pilon	-	2041	2	Intergenic	novelGene_178177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	0	209	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197558	184422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4425_pilon_-_185999_197093
872597	contig_1331_pilon	-	1391	5	Intergenic	novelGene_37799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3239.07066147066	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	74	550	169924	160009	TRUE	15	GGCATTGTTCTGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169997	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159628_159850_160214_160867_160949_166406_166534_169860
872598	contig_14575_pilon	-	3715	1	Intergenic	novelGene_101938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTAGCACCATATGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468012	464297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_464300_468000
872599	contig_10930_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_37100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_3	8047.59626767521	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGAACAAAGGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339420	342155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340055_340994_341098_341522
872600	contig_9633_pilon	-	3703	1	Intergenic	novelGene_139611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGATTTCAGATTAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545498	541795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_541800_545500
872601	contig_1639_pilon	+	2842	5	Intergenic	novelGene_74901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_4	129.827529823224	99	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1226	1867	296150	309304	FALSE	60	AAAAAAAAAAAATCCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYLKLLNLVLICSYTFQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSQ	294924	310279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145
872602	contig_9098_pilon	-	4090	1	Intergenic	novelGene_75812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATGAGGCTAAGGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306003	301913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_301900_306000
872603	contig_15543_pilon	-	4500	1	Intergenic	novelGene_164344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53336	48836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_48800_53300
872604	contig_177_pilon	+	2290	2	Intergenic	novelGene_41853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCTTTTAATCATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423515	425950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_423525_423669
872605	contig_3602_pilon	-	2598	1	Intergenic	novelGene_60570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAAAACCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526352	523754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_523800_526400
872606	contig_3866_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_112414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	981	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAATTACACAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212676	215380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_212700_215400
872607	contig_7568_pilon	-	2770	13	Intergenic	novelGene_173996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	221.667669170665	64	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	1273	2451	93884	15487	FALSE	55	TTAGTAAAAAAAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDADDFVLVPDISSDHSYDMPVGTAGRCASHEFLVYGGQCQPTVSSHSETAAIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNLHGSPRSAVVRRSNTSPLGFRRLGSCTPVPADPVQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHPHVHESRSRNSSGSPVPQAQSPQSLLLGARLQSTPTLTDIYQNKQKLRKQHSDPVCPSHARAGYSYSPQPSRPGSLGASPTKHMGSSPRSSDWFFKTTLPTIIGSPTKTIAPFKIPKTQASSNLLALVTRQGPSEGQSRDGNDPRECSHCLPVQGGERQRAEQQNKTVFGRSVSTGKLSDQQIKTPLGGQLHQGSTDSLNTERPMDIVFY	113096	15167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_15498_16679_16790_18066_18255_18619_18907_20827_20909_28445_28592_50582_50721_64619_64681_93727_93897_97736_97860_103969_104059_104596_104645_112096
872608	contig_2917_pilon	-	1541	7	Intergenic	novelGene_147588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	208.525577967468	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	626	1237	109433	93080	FALSE	30	TTTCAACTGGAATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	113446	92775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_113212
872609	contig_8978_pilon	+	2994	5	Intergenic	novelGene_49391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	152.090433624209	10	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	76	894	339807	343516	FALSE	10	CTCTGCTTTAGGTGCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNKTFNLEKQNHTPRKHHQHHHQQHHQQQQQQPQPLPPPVPANGQQASSQNEGLTIDLKNFRKPGEKTFTQRSRLFVGNLPPDITEEEMRKLFEKYGKAGEVFIHKDKGFGFIRLETRTLAEIAKVELDNMPLRGKQLRVRFACHSASLTVRNLPQYVSNELLEEAFSVFGQVERAVVIVDDRGRPSGKGIVEFSGKPAARKALDRCSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEKLVIKNQQFHKYVFLTDSLLCVCLILRKFVKDV	331587	345616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_331654_339797_339964_340939_341134_342367_342670_343350
872610	contig_12977_pilon	-	3948	1	Intergenic	novelGene_122817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTAAGTGCTGAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88013	84065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_84100_88000
872611	contig_1239_pilon	-	4871	6	Intergenic	novelGene_150395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_1	90.9606508332037	234	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	35	1864	158068	150249	FALSE	35	TTGTGCTTAGGTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLDNSSGFLAMNFQGRLKYLHGQNKKGKDGSILPPQLALFAIATPLQPPSILEIRTKNFIFRTKHKLDFTPTGCDAKGKIILGYTDAELCMRGSGYQFIHAADMLYCAENHIRMIKTGESGMTVFRLLTKENRWAWVQSNARLVYKNGRPDYIIATQRPLTDEEGTEHLRKRNMKLPFMFTSGEAVMYEVASPIPPMMDPLPVRNKSSASAKDSATKSTADKDSVNPSSLLGAMIRQDESIYHYPASNTVPFERNFLNRSMNECSNWQDNITPMENDNILKHEQISQSQEMNLILSGGHAGLFPDNKNSELYSMMKNLGIDFEDIKHMQQNEEFFRADFSGEDDFRDIDMADEILTYVQDSLNESTFMCSGYQQQQPMALNSSCMVQEHLQLEQQQQLQHHQKQGVEQQQQLCQKMKHMQVNGMFANWNSNQSVPFSCPQQDLQQYNVFSDLHGTNREFPYKSEINIMPYTQNFIPCNQSVLPQHSKCTQLDFPIGNFEPSPYPSTSSSFEGFVHCLQGTENQEHGINPQSTVMTPQTCYAGPVSMHQCQPETQHTRLDQMQYNPAVLGPPTFLNENGGVLNETYPAELNNTQTTTHLQPLHHPSEAGPFPDLTSSGFL	159760	147241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_150381_153523_154770_156201_156344_157022_157133_157868_158072_159729
872612	contig_12644_pilon	+	3117	1	Intergenic	novelGene_44518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAGACTCTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1146676	1149793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1146700_1149800
872613	contig_8930_pilon	-	1283	10	Intergenic	novelGene_161213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_9	17.9195734076208	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	830	1282	163936	140507	FALSE	30	AAGCTTCTTTTCCACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNAQCDALHPKSAAEIVQEIENMEKTRMRLEASKLNETIMVFTKDQTEKEIDEIHSIYRKKHQNEFQLLVNQAKKGYKKNVEMSKKKVAKKEDESTEKLLPVCMGQEDNEMKFSDMTSITNQFPQSELGSPGKLVPDRSDDSSNCTDIQE	204577	140505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8930_pilon_-_140644_143492_143631_156972_157034_158510_158588_163896_164082_171647_171983_190051_190123_191811_191874_200510_200593_204443
872614	contig_4501_pilon	+	3325	5	Intergenic	novelGene_168983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1316	1678	70246	70608	TRUE	0	CGCCCCGGGGTCTCCGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAVLKTLTKNNLTTLGFIKEKIHRGRMPCDAATTIQGTSGVTRRQDRGMEQILPQSLRRNQHGYRSLSLQNCETINFCCLKHLHFVVFCCGSPRKLIQLISLIYKMVVQFLKN	68930	190065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_+_71758_145989_146122_179877_179964_185337_185436_189883
872615	contig_3948_pilon	-	3988	7	Intergenic	novelGene_53332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_6	387.231484027606	35	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	2840	3697	1485208	1468245	FALSE	50	TATTTAAATAAAATATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1488398	1467953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600
872616	contig_9995_pilon	-	2879	1	Intergenic	novelGene_47834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974394	971515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_971500_974400
872617	contig_8044_pilon	+	1940	12	Intergenic	novelGene_132372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	138.335142209953	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	954	1415	377102	386963	FALSE	20	CCACCACCAGAGTGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	365242	387488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_372094_372408_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
872618	contig_9133_pilon	-	5526	9	Intergenic	novelGene_109302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGTAAGATTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282903	262085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_262145_262282_262352_268572_268736_270421_270742_271794_272073_273303_273758_274334_274486_276287_276579_279162
872619	contig_6589_pilon	+	2563	5	Intergenic	novelGene_26078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	84.7536872354236	94	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2	466	1865919	1868041	TRUE	35	TTTAACCCAGTATCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVGPPLALLSLSRACHRHEGPRAEMTVLAPAWSPTTSLLLLLLLSPGLGGTPDCTFPQSPISSNFAVAFRKLSDYLLQDYPVTVASNLQDVSHRWEGPGMEVGARDSRSPPFRGPGRGLRGALAAGPGPALDDTPQDSGWVPDVHPAGGCGH	1865917	1870972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1866030_1866757_1866869_1867326_1867457_1867928_1868073_1868906
872620	contig_8357_pilon	+	2361	5	Intergenic	novelGene_39776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	468	785	884831	887781	FALSE	15	ATTTGTTCTGGACGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVITQPPPAFTSRSSSSSRKDSNQSHRSVGGCVYLIYINPRALIYGESVCVMRPITCLRVNFRVNNLYSRQKAVETIPPVPTPRTPPHIPVWPAVFLLPFSHGST	884058	889357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_884341_884645_884871_887116_887177_887255_887408_887715
872621	contig_675_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_136349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	1185	1787	211006	211608	NA	15	AGTGTCTACCTAGTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGLSDQTSILSNLPSFQSFHIVILGLDCAGKTTVLYRLQFNEFVNTVPTKGFNTEKIKVTLGNSKTVTFHFWDVGGQEKLRPLWKSYTRCTDGIVFVVDSVDVERMEEAKTELHKITRISENQGVPVLIVANKQDLRNSLSLSEIEKLLAMGELSSSTPWHLQPTCAIIGDGLKEGLEKLHDMIIKRRKMLRQQKKKR	209821	211942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_209800_211900
872622	contig_5231_pilon	-	2013	6	Intergenic	novelGene_65892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	121.78604189315	128	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	957	1727	213462	209128	FALSE	35	AGAATGTGGAAAACTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILFSFPGGDCGKGFFLVSLLVENAAASAIKEIPILFNAMQHQDQDALKKALGEITSCLCKAREVFKQIHTHVDPNEFFNVLRIYLSGWKGNARLPDGLLYEGVWDTPKQYAGGSAGQSSIFQCFDVLLGIQHNTGEKFAASFLQDMRQYMPPAHRDFLQSLEKQPSLREFVLSNGDPDLKAVYNDCVRAMVSLRKYHKTIVKSYIVKPGEEKRMQNQTSADPSEQENKGTGGTEVLSFLKAVLCTTEKCLLKED	217382	208841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_209484_210710_210860_211515_211568_212537_212656_213366_213467_216430
872623	contig_13542_pilon	-	4875	1	Intergenic	novelGene_131517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCATCATGTGTTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452357	447482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_447500_452400
872624	contig_16411_pilon	+	4523	2	Intergenic	novelGene_77346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTACCCAGCTCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232506	237961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_236357_237288
872625	contig_5039_pilon	+	2944	1	Intergenic	novelGene_64803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	639	947	191556	191864	NA	60	ATTGAAAAAAAAAAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGGSRECLALTFELLIYAKKKKKNFAHKDCDLQERCKTVYSICLRAKTKPGRIFLSSCGLWVIGDIPEPGHGNKSSILEACRLPSSHSQPGTSVLSVHWG	190917	193861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_190900_193900
872626	contig_7080_pilon	+	2276	5	Intergenic	novelGene_100118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	123.216273275895	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTTAGGCTCTGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533997	542337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_534614_536987_537033_538419_538540_540654_541095_541282
872627	contig_18544_pilon	-	3107	1	Intergenic	novelGene_152754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTCCTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55610	52503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_52500_55600
872628	contig_15500_pilon	-	2855	11	Intergenic	novelGene_128983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1665	2072	241376	233031	TRUE	50	AACCAAAAAATTAGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVVTADVDPASAAAGKPADTGASLQGTVMQKVAADTSTALKTVVDEVSAAAALQAAAYRHPEVVDAAVAAGGNEEAVNEVAAISNLPVVVAEVLYAAVEAAEGAPDPIKFLGHFQVSVLLLVCGYQIHPEQEL	248677	209317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_209461_212669_212795_215034_215115_219043_219179_227721_227826_229528_229607_232912_233074_239352_239546_240599_240698_241302_241486_247122
872630	contig_3476_pilon	-	1847	6	Intergenic	novelGene_134105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	329	junction_5	73.7628632849892	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	325	789	87600	72084	FALSE	35	GATCATGCCTAAGAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEQMQPLELSEDRLDKLDPRCSHLDDLSDQFIKDCDLKKKPRKGKNVQTTLNVESDQKKPRRKDTPALHIPPFIPGVLSEHLIRRYDVQERQPKNKMSPALHNTDLEQKKPRRKDTPALHMPPFAAGVRLLRDERPKVIMEDDEKDGDKIAI	108457	71025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3476_pilon_-_72164_81719_81873_83403_83557_87521_87640_94131_94378_108418
872631	contig_15327_pilon	-	1892	5	Intergenic	novelGene_70455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_4	969.623219348629	24	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	38	358	293006	291425	TRUE	0	TGCTGTGTGTCTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSPGSVKDPKMAGRKLALKAIDWVAFGEIIPRNQKTVANSLRSWNETLTSRLAAVPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKIPVPEDKYTALVDAEEKEDVSSRGSYLF	294789	289737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_289942_290094_291527_292481_292579_292884_293016_294761
872632	contig_15047_pilon	+	1428	5	Intergenic	novelGene_52237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	2	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	295	570	3242	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2551	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21181
872633	contig_8712_pilon	+	3052	1	Intergenic	novelGene_58878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGAAGAAGGCAGGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918570	921622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_918600_921600
872634	contig_11427_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_78961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	497	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCGAGTAGCAGATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58436	55643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_57086_57188
872635	contig_11816_pilon	-	1522	8	Intergenic	novelGene_98524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	32	junction_7	369.595697474736	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	77	799	1086647	999260	FALSE	35	TAAATTCCCAGCTTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNPGASSSCRTPSRKQQSLVPAHPMAPPSPSTTSSNNNSSSSSNSGWDQLSKTNLYIRGLPPNTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVSALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELENMLKPFGQVISTRILRDSSGTSRGVGFARMESTEKCEAVIGHFNGKFIKTPPGVSAPTEPLLCKFADGGQKKRQNPNKYIPNGRPWHREGEAGMTLTYDPTTAAIQNGYVIKINT	1125282	998536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_999335_1000393_1000501_1015122_1015203_1017129_1017288_1027665_1027758_1033126_1033186_1086495_1086672_1125230
872636	contig_2933_pilon	+	3912	1	Intergenic	novelGene_111348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1515	1862	841057	841404	NA	20	AGAACGGAGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPNTHTYPPTVLSFRQLFTSSSRFTNKNKERAKGKTTGCAHSSPSKSTKRALLDKCDGTITGSKCSPDVKWAAKSNHLSAKGATFLLEDGKWHTPEAPRDEYTDKSQPGIISH	839542	843454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_839500_843500
872638	contig_678_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_167783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGAATTGCCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24423	26708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_24400_26700
872639	contig_5935_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_102740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACACAGAAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241474	1244917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1241500_1244900
872640	contig_10176_pilon	+	2288	9	Intergenic	novelGene_72704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	275.07078634417	595	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	382	1575	244610	254018	FALSE	0	CCTGGGTTTTTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQAIKEGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGRMQRERRGKNVVHQLSVTLEDLYNGATRKLALQKNVICDKCEGRGGKKGAVECCPNCRGTGMQIRIHQIGPGMVQQIQSVCMECQGHGERISPKDRCKSCNGRKIVREKKILEVHIDKGMKDGQKITFHGEGDQEPGLEPGDIIIVLDQKDHAVFTRRGEDLFMCMDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIVITSHPGQIVKHEDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVNFPENGFLSPDKLSLLEKLLPARKEVEETDEMDQVELVDFDPNQERRRHYNGEAYEDDDHHPRGGVQCQTS	242903	254731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_243275_244599_244742_245088_245267_247647_247753_248407_248636_250956_251072_252581_252698_253015_253117_253799
872641	contig_9415_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_109841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	1939691	1940005	NA	15	TGTAGTATGTTGGTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVSSLAVHLCKSEALKSSVRGWDLFPAGFAVRSGRKPPFSLQEDAESLYGEFFLALFNCSAFLLGGVPVHLAADVWPSGCRTFHDSVVSSTVLPLALCCAGCP	1939688	1943993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1939700_1944000
872642	contig_15828_pilon	+	2232	10	Intergenic	novelGene_173241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_7	328.951195299377	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	4	1533	9245	38750	FALSE	20	AGAATTTTTGTCTCCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFNERDQELRDLGYQKHAFNMLISNRLGYRRDVPDTRNAACKEKSYPADLPVASVVICFYNEAFSALLRTVHSVVDRTPAHLLHEIILVDDDSDLDDLKGELDEYVQKYLPGKTKVIRNKKREGLIRGRMIGAAHATGEVLVFLDSHCEVNKMWLQPLLAAVREDTHTVVCPVIDIISADTLVYSSSPVVRGGFNWGLHFKWDLVPLDELGGPEGATAPIKSPTMAGGLFAMNRRYFNELGQYDSGMDIWGGENLEISFRIWMCGGKLFIIPCSRVGHIFRKRRPYGSPEGQDTMTHNSLRLAHVWLDEYKEQYFSLRPDLKTRSYGNISERVELRKRLGCKSFKWYLDNIYPEMQISGPNAKPQQPIFINRGPKRPKVLQRGRLYHPQTNKCLVAQGRPSQKGGLVVLKACDYGDPNQVWVYNEEHELVLNNLLCLDMSETRSSDPPRLMKCHGSGGSQQWTFGKNSRLYQVSVGQCLKVVDPLSQKGYVAMAICDGSSSQQWRLEG	9241	39449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15828_pilon_+_9367_10707_10875_19964_20091_23210_23461_28395_28514_29890_30044_33613_33833_36127_36233_38226_38365_38618
872643	contig_8775_pilon	+	4453	1	Intergenic	novelGene_166835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255347	259800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_255300_259800
872644	contig_5602_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_133009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485834	487257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_485800_487300
872645	contig_2069_pilon	-	706	3	Intergenic	novelGene_23502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1088	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	60	443	1509802	1508628	FALSE	5	CATTGTGTCTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPLSLPVGLSVLPSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQALRGGCGTKHTAGVPEVGLSQAHPWSPTGLRHHIPPSSPSPHQAMKDLVTNSLSYLTF	1509861	1508364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508806_1508952_1509111_1509754
872646	contig_9839_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_88541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCAGTCCTGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78556	79772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_78600_79800
872647	contig_9839_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_88539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGAACAATCTTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73175	73921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_73200_73900
872648	contig_8710_pilon	+	2082	14	Intergenic	novelGene_73522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	65.9453781504685	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	571	2052	398413	443681	FALSE	25	GCCCTGAAGAGAGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTLAGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNATGRLTLADIERIAPLAEGALPYNLAELQRQQSHGLGRPVWLQIAESAYRFTLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRGSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFTKRDGSIPLFAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVLRDLGLFGLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVYAHCKLLLADENGHVGGLNLLAAGALAGVPAASLVTPADVIKTRLQVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPSAFWKGTAARVFRSSPQFGVTLVTYELLQRWFYVDFGGLKPSGSEPTPKSRIADLPPANPDHIGGYRLATATFAGIENKFGLYLPKFKSPSIAVVQPKAAAATAQ	385868	443711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_386349_398322_398470_401126_401266_401941_402036_403627_403713_416879_416962_418229_418389_421453_421507_421746_421828_436144_436286_438049_438189_441520_441680_441813_441905_443479
872649	contig_6740_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_142729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTAGAAAAGAGATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753877	751672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_751700_753900
872650	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872652	contig_20719_pilon	+	2492	1	Intergenic	novelGene_140555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTACAACCCTTTGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133	2625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_100_2600
872653	contig_6823_pilon	-	2141	15	Intergenic	novelGene_131224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_13	24.0496934513112	149	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	445	1737	305740	248884	FALSE	15	GTTAGCCAGTTTCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSLASFFKMSLKLKNARRIEGLDSNMWVEFTKLAADPSVVNLGQGLPDISPPIHVKEELSKVAAIDGMNQYTRGFGHPSLVTALSCLYEKFYPNKINPNKEILVTVGAYGSLFSAIQGLIDEGDEVIIIMPFFDCYEPMVRMVGATPVFIPLRSKPVDGKKWSSSDWTLDPQELASKFSSKTKAIIVNTPHNPMGKVYTKEELQVIADLCIKYDTLCISDEVYEWLVYTGNKHFKIATFPGMWERTITIGSAGKTFSVTGWKLGWSIGPSYLIKHLQTVQQNTIYTCATPLQEALAQAFWIDIKRMDDPECYFNSLPKELEVKRDRMVRLLESVGLRPIVPDGGYFIIADVSLLDADLSEMNNNEPYDYKFVKWMTKNKKLSAIPVSAFCNSEAKLQFEKFVRFCFIKKDSTLDAAEEIFKAWKNQKS	325564	248479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_248947_257222_257310_257575_257650_265267_265455_269582_269673_282925_283003_288585_288707_288803_288930_291494_291582_296418_296569_303624_303770_305320_305380_305713_305907_320648_320750_325387
872654	contig_5918_pilon	-	2834	7	Intergenic	novelGene_99489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	204	junction_1	44.9987654151632	510	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	420	947	201698	192800	FALSE	20	TTTTGCGTGTGCAGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAINSLGAGIIEKIALQFPYRFWDNKVQGADFFGHVPPSASKRGLFAVFYDMDPQKKHSVLMSVIAGEAVASVKNLDDKQILQLCMAALRELFKEQDVPDPTKCFVTRWSADPWIQMAYSFVKTGGSGEAYDIIAEEIQGTIFFAGEATNRHFPQTVTGAYLSGVREASKIAAF	206135	190912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_192884_197847_198001_199308_199432_200844_200971_201656_201774_205155_205231_205866
872655	contig_14925_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_55227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTAAAGGAGAATTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38536	36297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_36300_38500
872656	contig_5338_pilon	-	3944	1	Intergenic	novelGene_114574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	801	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	222	669	72	740	381535	380867	NA	30	GTTTATATAAAACGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHWPEQEPSRAGTVSGGQHKDGSIKSFILPRSPHSSPKLCVAALEGLWKRPPYMGTCIICKQVRSWQRTGAQRPGHGGWGLKEEEQETDQIPDPYPRTAVSRTRARAAGTSSWGPHQGESARVEEEGREVGQRSRVLLTALHLQAAEEVMRYTSLQLRPPQSRVPSPGAPIKYSEVVLDSEPKAQALGPEPELYASVCSQTRRARASFPDQAYANSQPAPS	381606	377662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_377700_381600
872658	contig_6277_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_80398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	795	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAATGTTTAGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214890	216649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_214900_216600
872659	contig_3948_pilon	+	2534	8	Intergenic	novelGene_53231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_7	50.9773859427003	416	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	78	809	933984	966359	FALSE	40	TTCTCTTATAAATAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLYCTQDPVPEAVGGDMQQLNQLGAQQFSALTEVIFHFLAEPKEVERFLAQLSEFATTNQISLGPLRSTVKSLLLVPNGALKKSLTAEQVRADFITLGLSEDKATYFSEKWKQNSQTLAQWAIGQTLMINQLIDMEWKFGVTSGSSELDKVGSIFLQLKLVVKKGNQTENLYIGESRFPFEPFYVFHVLFNQWAHEVHHKSSLPEKKFITEPWSSYSIAFLLIKDNMRILNKPWAGRRHYS	933906	968084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_934068_940742_940797_940893_940997_964583_964641_964723_964762_965227_965319_965633_965684_966104
872660	contig_2924_pilon	-	2775	1	Intergenic	novelGene_140278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1291	1620	261615	261286	NA	70	GCTAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLHSKSSCRLKPPISAPNISKLACQTEENVTYVLETATLVLSRPKESKGQRPMLLTSKTYSTVYSGGGRNPPCLCETHTSLSPTLHPLATQAHNRTQMLNHSKRTRT	262905	260130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_260100_262900
872661	contig_5324_pilon	+	3825	17	Intergenic	novelGene_102042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	53.28428327143	306	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	806	2421	19	2439	13520	56273	FALSE	30	TAAGTATGTTGTGGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRCLLLPGRGGCRARGFPLLLLSGGSAGPSERPCLRTLYRYATTQAATSRNSLLTDVIAAYQRFCSRPPKGFEKYFPNGKNGKNASEPKEFMGEKKESKPANTPHSSGGGIGGGGRRGGKKDDSHWWSRFQKGDFPWDDKEFRMYFLWTALFWGGVMIYYLFKSSGREITWKDFVNNYLSKGVVDRLEVVNKRFVRVTFTPGKTPVDGQYVWFNIGSVDTFERNLETLQQELGIEGENRVPVVYIAESDGSFLLSMLPTVLIIAFLLYTIRRGPAGIGRTGRGMGGLFSVGETTAKVLKDEIDVKFKDVAGCEEAKLEIMEFVNFLKNPKQYQDLGAKIPKGAILTGPPGTGKTLLAKATAGEANVPFITVSGSEFLEMFVGVGPARVRDLFALARKNAPCILFIDEIDAVGRKRGRGNFGGQSEQENTLNQLLVEMDGFNTTTNVVILAGTNRPDILDPALLRPGRFDRQIFIGPPDIKGRASIFKVHLRPLKLDSALEKEKLARKLASLTPGFSGADVANVCNEAALIAARHLSDSIDQKHFEQAIERVIGGLEKKTQVLQPEEKKTVAYHEAGHAVAGWYLEHADPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPKEQYLYTKEQLLDRMCMTLGGRVSEEIFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMNEKVGQISFDLPRQGDMVLEKPYSEATARLIDDEVRILINDAYKRTVALLTEKKADVEKVALLLLEKEVLDKNDMVELLGPRPFVEKSTYEEFVEGTGSLDEDTSLPEGLKDWNKEREGKKEEPTDEKVASQIKGEMPF	13501	57659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_13637_19072_19173_19513_19592_21259_21367_21510_21664_25613_25689_30804_30930_32941_33216_34881_35020_39189_39344_43106_43215_43308_43435_45346_45458_48530_48647_51678_51880_52165_52361_56030
872662	contig_7051_pilon	+	3176	1	Intergenic	novelGene_64302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGTATCCATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193680	196856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_193700_196900
872663	contig_3975_pilon	-	3317	1	Intergenic	novelGene_54914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCACAATATGTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230351	2227034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2227000_2230400
872664	contig_14970_pilon	+	2932	1	Intergenic	novelGene_45064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGGAAGAAGTGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195503	198435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_195500_198400
872665	contig_1141_pilon	-	3295	17	Intergenic	novelGene_136915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1962	2300	376188	375850	TRUE	15	TTCAGCTGGCACTCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDAVVSGMFDSSAVLFGSAFAVADAVGVGVATAAAVTDAEFAAAVAAVVAGSVAAAVTVLTVAVAVAVAAAYVTVAEGHAVAGMAVAVAEGDAAAVEDATVAVETVAVAV	405737	361240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_-_361285_367096_367729_375530_376270_376757_376852_379758_379854_381133_381274_381983_382106_382577_382762_384098_384142_386503_386575_388157_388261_390575_390746_401655_401758_402949_403084_403175_403252_403346_403410_405254
872666	contig_15327_pilon	-	2626	6	Intergenic	novelGene_70511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	15.7657857400131	279	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	450266	449618	TRUE	20	TACTTGGAATCCTTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTDPAPSVPPKDTAGNSQWHLFQNEQADLDFFGPKPGPASHGSVDGSPFQPAAPPASSSQAPPLSPFPAPIVPASVPAPSPGSLFSTGLATAPDPKAELATPRVPWLSPG	450266	446495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_448242_448493_448605_448692_448863_449158_449368_449563_449882_450194
872667	contig_2062_pilon	-	3230	1	Intergenic	novelGene_139030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175245	1172015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1172000_1175200
872668	contig_9706_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_20968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAGATTTAGTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325153	327865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_325200_327900
872669	contig_12464_pilon	+	5632	1	Intergenic	novelGene_68737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	305	915	4716	5630	421103	422017	NA	45	TACATTTTTATATAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVIRLLGLPFIAGPVDIRHFFKGLTIPDGGVHIIGGEIGEAFIIFATDEDARRAISRSGGLIKDSYVELFLSSKAEMQKTIEMKRTDRTGRKRPGSGGSGAGSLSNFAGAVKEEASNSGYQDAEFHTNGTGRGDLKPRSTRPARAKNPYLFLRGLPYLVNEDDVRVFFAGLCVDGVIFLKLHDGRNNGDAIVKFASCVDASGGLKCHRSFMGSRFIEVMQSSEQQWIHCGGKQDEVPMRTEEHSPARGINDRHSRKRSHSKSSRRTRSRSPVGHYVHLKNLSLGISKRDLRNFFRDTDLTNEQ	416387	422019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_416400_422000
872670	contig_7080_pilon	+	1905	10	Intergenic	novelGene_100101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	118.920141271359	48	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	284	1096	488513	540726	TRUE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSFRALLHPKRSGCVLRDFGDTCLRDVKLARSSPFRGSQRKSSSRVLAWWLARSVSGGVCAPFLSPALESGDLGSSGSECRACIGASSDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQSKSEWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	461507	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_461774_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538419_538540_540654_540969_541772
872671	contig_776_pilon	-	2737	10	Intergenic	novelGene_139943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGCCTGTCAGAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157544	932242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_932516_953025_953062_974916_975038_1016452_1016586_1022958_1023098_1036263_1036353_1040812_1041001_1070128_1070240_1072799_1072906_1156003
872672	contig_12119_pilon	+	2959	1	Intergenic	novelGene_88666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314617	317576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_314600_317600
872673	contig_7056_pilon	-	4094	10	Intergenic	novelGene_43725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_6	31.8049611783375	277	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	31	1749	991255	969654	FALSE	35	TTCCTAGTACTTAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWFLTLFLSVMPFESAVIIVDCFFYEGIKVVLQVALAILDANMEQLLVCSDEGEAMTVLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLHALLTSGDDPPVEVDIFELLKVSYEKFSSLRANDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPGDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGGSCTAAIRRDPSLPYLEQYRIDASQFQELFISLTPWACGSHTPVLAGRMFRLLDKNKDLLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAARYFTEDSSSEEALPQEEQEGADNEDVREKRGEEKGTSPQDYRHYLRMWAQEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSVRAGRKSRDIACSGDHDRATAATVEVESPVPELHQDTAWEPQLSAAGDLQAKASGDTHLGKAPQESQVVGEGGSGEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLTDDTVLVGGEVSSHVAAAHCEGTVDADWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTSSDHEQSGVSG	991285	967308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_970374_972862_972970_973524_973588_976650_976723_986188_986255_986646_986888_988011_988081_989259_989359_989487_989618_991103
872674	contig_1337_pilon	+	4679	1	Intergenic	novelGene_84227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101675	106354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_101700_106400
872675	contig_20739_pilon	+	3903	1	Intergenic	novelGene_83179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTTACGGAAGTAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128910	132813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_128900_132800
872676	contig_5954_pilon	-	1397	8	Intergenic	novelGene_28596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	536.5065379901	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	374	1033	946886	945083	FALSE	5	TCCGTCCTTCTCTGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCRLASKGRTMADSSYASEVQAILAFLSLQRVGSAGSGNHSQGTDASTEGLNPYGLVAPRFQRKLKAKQLTPRILEAHQNVAQLSLSEAQLRFIQAWQSLPDFGISYFLVRFKGSRKDEILGIANNRLIRFDLAAGDVVKTWRFSNMRQWNVNWDIRQVAIEFDEHINVAFSCMSASCRIVHEYIGGYIFLSTRERARGEELDEDLFLQLTGGHEAF	960558	944718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_945263_945384_945527_946209_946335_946673_946902_947107_947205_947435_947506_959833_959941_960474
872677	contig_675_pilon	+	2773	15	Intergenic	novelGene_136342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_10	43.9087644079942	227	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	76	2049	95121	169941	FALSE	15	GGCTTTGTGTTGTGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQELYHAEFARAGKEAGLQVWRIEKLELVPVPKSAYGSFYVGDAYLVLHTTKASRGFTYRLHFWLGKECTQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQSRELQGHESTDFVSYFKEGLKYKAGGVASGLNHVLTNNLTAERLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGSSCNKYERLKASQVAIGIRDNERKGRSQLIVVEEGSEPRELITVLGKKPELPDGNDDDDTIADIANRKMAKLYMVSDASGSMNVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFIWKGKNANPQERKAAMKTAEEFLEQMNYSTNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGEVEIWRVESNGRIPINKNSYGEFYGGDCYIVLYTYPRGQIIYTWQGRNATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQVDVDGSSLNSNDVFVLKLQQKNGYIWIGRGASQEEEKGAEYLASVLKCKPTRIQEGEEPEEFWSSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFIIEEVPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEAERTESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSN	95045	170665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_95320_100498_100654_104953_105116_117932_118083_135058_135152_145323_145457_145861_145951_146769_146986_150571_150694_155237_155329_163073_163252_163527_163650_167494_167573_169105_169167_169816
872678	contig_4974_pilon	+	3109	1	Intergenic	novelGene_161394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCCAGCACACACGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20938	24047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_20900_24000
872679	contig_7327_pilon	+	3213	1	Intergenic	novelGene_172120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCCCAGTCCTGCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117342	120555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_117300_120600
872680	contig_2768_pilon	+	2061	2	Intergenic	novelGene_57492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	740	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAACCTCACTGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677052	680447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_677264_678597
872681	contig_18919_pilon	+	3472	1	Intergenic	novelGene_156017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGCCCGTGTGGCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63967	67439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_64000_67400
872682	contig_11130_pilon	-	1800	6	Intergenic	novelGene_53098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	983.642333371231	589	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	253	366	62581	61286	TRUE	35	CTAAAACTCTGTGACTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYVFSHNPLGAVPTTKKKENEVFVSGTQTSQIICSHRAHQEQLLILKQQVYNFLLLWPKPPQDQENRLTHIFSEPGIIGIIFGVMVGIVGTVLSIAYCVRFLIKRTSVKAKPQSSIDADAA	76243	54754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_56165_61261_61340_62521_62608_64167_64208_66884_66978_76150
872683	contig_9888_pilon	-	3405	2	Intergenic	novelGene_162276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	0	143	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTCAAACATGCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227378	220400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_221269_224841
872684	contig_3942_pilon	+	3763	7	Intergenic	novelGene_128871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	17.1367052453693	136	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	235	597	1492877	1499848	TRUE	20	GCTGAAATTGCTTTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPEMQVKGKKVTDKFTESVYVLANEPSVALYRLQEHVRRSLPELAQHKADMQRWEEQSQGAIYTVEYACSAVKNLVDSSVYFRSVEGLLRQAISIRDHMNASAAQGHSPEEPPPLSSA	1492263	1503239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1492350_1492728_1492914_1495128_1495242_1495613_1495679_1498449_1498564_1499814_1499888_1500112
872685	contig_2733_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_128565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGAAAAAACATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590018	591829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_590000_591800
872686	contig_6710_pilon	-	488	2	Intergenic	novelGene_98112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CGTCCCCCCTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
872687	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657824	653562	FALSE	5	CCTTGCACCTGTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657826	653361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
872688	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_95639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
872690	contig_3382_pilon	-	2691	4	Intergenic	novelGene_124025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	218.99822424445	120	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2164	2487	183973	176852	FALSE	10	TTTGGCGTTCATTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGALHRDPEYWPQPEAFDPERFTAEARRQRRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLRVLRKFRFQACAETQVPLQLESKSALAPKNGVYIKIVPRQAGRPP	186260	176647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_183905_184468_184591
872691	contig_15991_pilon	-	787	5	Intergenic	novelGene_70876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3264.76147673915	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	5	625	105081	100538	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEVSCIWA	105085	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_101140_101289_102024_102271_103583_103703_104975
872692	contig_13608_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_52391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGAAAGCTTATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449138	446324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_-_446300_449100
872693	contig_7338_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_156792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGGTGCTTATTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250691	248125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_248100_250700
872694	contig_12635_pilon	-	3353	16	Intergenic	novelGene_60864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_8	455.517873780309	327	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	81	1964	656018	622268	FALSE	50	TCGAAAATAATGCTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPKFYRWISERYPCLSEVVKEHQIPEFDNLYLDMNGIIHQCSHPNDDDVHFRISDDKIFTDIFHYLEVLFRIIKPRKVFFMAVDGVAPRAKMNQQRGRRFRSAKEAEDKIKKAIEKGETLPTEARFDSNCITPGTEFMARLHEHLKYFVNMKISTDKSWQGVTIYFSGHETPGEGEHKIMEFIRSEKAKPDHDPNTRHCLYGLDADLIMLGLTSHEAHFSLLREEVRFGGKKTQRVCAPEETTFHLLHLSLMREYIDYEFSVLKDKISFKYDIERIIDDWILMGFLVGNDFIPHLPHLHINHDALPLLYGTYITILPELGGYINESGHLNLPRFEKYLVKLSDFDREHFSEVFVDLKWFESKVGNKYLNEAAGAAAEEAKNYEEKKKSKGEENVCWAALDKNESEAATSKDNLEDETEDDDLFETEFRQYKRTYYMTKMGVDVVSDDFLADQAACYVQAIQWILHYYYHGVQSWSWYYPYHYAPFLSDIRNISTLKIHFELGKPFKPFEQLLAVLPSASRNLLPACYQHLMTSEDSPIIEYYPPDFKTDLNGKQQEWEAVVLIPFIDEKRLLEAMESCNHSLKKEERKRNQHSECLMYWYDRDTDFTYPSPWPEKFPDIQRCCTR	656098	620878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_622442_630735_630856_632346_632504_633115_633206_637473_637580_637793_637858_639632_639771_640324_640393_641193_641363_641445_641534_642489_642573_643853_643965_644061_644172_645359_645458_649680_649914_655943
872695	contig_12943_pilon	+	4000	1	Intergenic	novelGene_140357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACACAGAGAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31614	35614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_31600_35600
872696	contig_14970_pilon	-	4070	2	Intergenic	novelGene_45151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	86	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAGAGATAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315653	311440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_315469_315611
872697	contig_13461_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_146608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGAGTTGATGTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77735	79815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_77700_79800
872698	contig_7079_pilon	+	1413	2	Intergenic	novelGene_129246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	823	junction_1	0	330	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	902	1210	350370	350678	FALSE	5	TTGTTGCTGTGGTTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKNSPRTMEERIPLEQEKEGACPRFPLILEFLHYSTPTLAGQAPSMSIESRKGLSGINYPLPTPAETLEIQCSKTSPSLLALGPFLGLQTGRHHTTSESP	348654	350881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_348706_349519
872699	contig_10711_pilon	-	2657	1	Intergenic	novelGene_118464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACATTGGTTCCAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884910	882253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_882300_884900
872700	contig_16098_pilon	-	1159	9	Intergenic	novelGene_45988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1781.95601359153	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	169	1035	350353	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLPPPPRPAVLSRLDVWTRTCLLSVATQPPCWSCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354061	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350829_350908_354039
872701	contig_8712_pilon	-	1490	2	Intergenic	novelGene_58842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGTTGCTTTTGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515589	513485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_514216_514829
872702	contig_8260_pilon	+	3024	1	Intergenic	novelGene_163254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGAGAGCTAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194113	197137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_194100_197100
872703	contig_10732_pilon	-	3115	1	Intergenic	novelGene_114675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2683	3081	54640	54242	NA	25	ACAGGTGGCTGGGACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNTHCRHQKQASGTHLLLINMQNKRLSFLTELLPVHSASETRSDCQEATTDHCSFRQAASCSYRRCPHKAALPPCHYGPTPCNARLTAVSPSTNHRVHSPLRASSPPRPPCFRAAHLTTRKPGQTPAQPQ	57322	54207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_54200_57300
872704	contig_2069_pilon	-	3561	3	Intergenic	novelGene_23168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	4	212	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	70	1269	25904	19208	FALSE	30	CGAAACCGATTGCTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWSPRAAPLWDLVLGVLGTAAFLLDLGTDLWAFVQYVLSGRYLWAALVLALLLLASVALQFFSWVWLRADPADLHGSQPSGRCLALLHLLQLGYLYRCVTGLQQGLLVWRQEVPSEFDMAYADFLSLDISMLRLFETFLETTPQLTLVLAIVLQSGQAEYYQWLGICTSFLGISWALLDYHRALRTCLPSKPLLGLGSSVVYFLWNLLLLWPRVLVVALFSALFPRYVALHFLGLWLVLLLWVWLQGTNFMPDPCSEWLYRATVATILYFSWFNVAEGHTRGRATIHLVFLLSDSCLLVVTWVTHNTWLPRGIPLQMLLSVGASSFLLGLVLRLVYYRWLHPSCRWEPDQVDGARGLLSLEWCQLPQNRRMNQLAQNFFPKAKDETVSSGKGEVNGVI	25973	16915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_19918_22762_22960_25611
872705	contig_5009_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_119254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAATCACATTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45544	43096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5009_pilon_-_43100_45500
872706	contig_5921_pilon	-	5667	1	Intergenic	novelGene_142253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	4209	4535	395777	395451	NA	30	GACACTTAGCAAATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTQPLSALAIIYLLLKIDLFFREPCWILNSCGPLPDHLLMSWKKWQGLYQCLSLRERQCEKRQDSSILCSDQQVSESVLCASDFDTFFFHFTFFSFFSFPEYQLCI	399985	394318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_394300_4e+05
872707	scaffold_880_pilon	-	3280	1	Intergenic	novelGene_121471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCCCCTTCCCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468848	465568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_465600_468800
872708	contig_11816_pilon	+	925	2	Intergenic	novelGene_98581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGGAAGACCCTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336055	1337906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1336797_1337722
872709	contig_12427_pilon	-	3520	1	Intergenic	novelGene_40578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAGAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547852	544332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_544300_547900
872710	contig_15114_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_121143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	129350	129045	NA	35	GGCATACACCCAACCGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYFQEVVKWGKGGSQEKKGKIQQVSHGRSGQQCLVSGVPPSCVSQQAPGECSKGADKEVTREDLRRAEEATREGTGTGTWRGQGGPAAGAGRSSGDWFCD	129352	127236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_127200_129400
872711	contig_13300_pilon	+	3043	1	Intergenic	novelGene_125832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAATGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134820	1137863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1134800_1137900
872713	contig_14353_pilon	-	2194	8	Intergenic	novelGene_82140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	201.861136347111	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	117	1211	419972	402843	FALSE	65	AAAAAAAAAACAACTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSRTIGELLAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVFLWNMDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420088	401859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_405650_407877_407979_414146_414413_415277_415447_419968
872714	contig_20739_pilon	+	2580	6	Intergenic	novelGene_83190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_3	98.923000358865	358	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	775	1278	194808	197279	FALSE	35	TGACAAACTAATGTGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFKMKDDVVLGIGVNGVLPASGVYKGLHLSSTMPTALVHTSPSTAGSTLLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPLNARHIPRTLSAVPSSALKLAAAANCQVTKVPSSSSVDSVPRENHESEKPALNNIADNTVAMEVT	184222	198581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_184283_185754_186108_193469_193756_194732_194875_194980_195345_197206
872715	contig_6612_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_148165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGATAATCATTTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30207	31799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_30200_31800
872716	contig_16098_pilon	-	1032	13	Intergenic	novelGene_45771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_12	228.837399818202	114	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	61	762	36010	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLQAGGWAPEERRRGVEARMETAVVVSTVLGLLLLPLLIVLLAVLCLRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36355	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907_36011_36295
872718	contig_7513_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_89002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATAAAATATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624948	627554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_624900_627600
872720	contig_13305_pilon	+	2333	19	Intergenic	novelGene_146776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	47.9396482730444	142	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	93	2207	138570	184637	FALSE	5	GCTTTTGGTCCTCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKTVARSTPSLPPSPDPPASFRPGEAHDVDMPEIRLRHVVSCSSQDSTHCAENLLKADTYRKWRAAKAGEKTISVVLQLEKEEQIHSVDIGNDGSAFVEVLVGSSAGGGGEQDYEVLLVTSSFMSPSESRSGSNPNRVRIFGPDKLVRAAAEKRWDRVKIVCSQPYSKDSPYGLSFVRFHSPPDKDEAEASSQKVTKLGQFRVKEEDEGGSSLRPGALFFSRVNKTSPATASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSPLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKLSAQSSPPVLKRPKSTASDQAGPSYAAVTLQASSAASSSSLASRAVGSTSKPQESSKGKRKLDLNQEEQKTPSKPSAQLSPPVLKRPKLPTPAHTPAMAPVPAPACGTEPGKPQREGTKPKGPRTSPQELGKILQGVVVVLSGFQNPFRSELRDKALELGAKYRPDWTPDSTHLICAFANTPKYSQVLGLGGRIVRKEWVLDCHRMRRRLPSRRYLMAGPGSSSEDEGDSHSGSSGDEAPRLPHKPPQTTTKPPQAAGPSSPKRSPAPEETKPATPGAQEDSDAEGEPSEGQDNGAEDSGDTEDELRRVAKQRQQRQPPGQENEEDPYAGSTDENTDTEERPGSPTLPVPELPDFFQGKHFFLYGEFHGDERRKLIRYVTAFNGELEDYMSDRVQFVITAQEWDPSFEEALMDNPSLAFVRPRWIYSCNEKQKLLPHQLYGVVPQA	138477	184763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_138621_139031_139125_154914_155026_172847_173007_173987_174063_174163_174270_174485_174596_174671_174784_175278_175389_175464_175577_175968_176228_176565_176683_180626_180721_180885_181019_181600_181656_181737_181875_183844_183936_184340_184417_184523
872721	contig_17158_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_141157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATTCACAACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175947	175042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_175000_175900
872722	contig_10848_pilon	-	2342	3	Intergenic	novelGene_133525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	25.5	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	694	1467	44513	40251	FALSE	35	TAAGAGCCTCAGGATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMLEVFASSLEEFQPDLVVLSGLHMMEGQSKELQKKRLLEVVTSISDIPTGVPVHIELASMTNRELMNNIVHQVFPAVTSLGLNEQELLFLSQSASGPHSSLSSWSGVPDVGMVSDILFWILKEHGRSQSRASDLTRIHFHTLVYHILATVDGHWANQLAAVAAGARVAGTQACATETIDASRVSLQAPREFTTSHSEAGSRIVLNPNEPVAEWHREGISFHFTPVLVCKDPVRTVGLGDAISAEGLFYSEVHPHK	45206	39375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_-_40803_43630_43730_44390
872723	contig_5423_pilon	-	3170	1	Intergenic	novelGene_85227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTATTTGAGGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488669	485499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_485500_488700
872724	contig_10437_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_38371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCAAATGCAAGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561812	562647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_561800_562600
872725	contig_10801_pilon	+	1731	7	Intergenic	novelGene_74057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	107	junction_6	416.809875389514	272	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	23	727	352635	363942	FALSE	45	AGATAAAGTTCCCAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHMPLEDRQEMETQIGALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDASHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLSVSPFCDRQSESIANIQIGNYTYLDTAG	352612	364946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_352660_354573_354675_356986_357119_357317_357410_361966_362112_362717_362815_363829
872726	contig_13481_pilon	-	4213	3	Intergenic	novelGene_119500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	640	junction_2	89	88	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	322	1434	1398813	1397701	TRUE	30	CATCTCAACATCAGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWGNRNRNLSGGVLMGLVLNRINQEANPGDIVEKLGADAKILSNVVSKSTRPNSLDIGKPPLRSKRDSLEKESSDDDTPFDGSNYLVDKVESPVIFDLEDLDNETDRSKARYFASQNPKRIQRMSSSLSVKPFEKTDVATGFDPLSLLVAETKQQQKEEEEEDEDDDKSVSTPTTRRDLAEEIVMYMNNMSSPLTSRTPSIDLQRTCDDKLTSKKSPTLVKAGRRSSLPPNSPRPPRLTKSKSYTKSDDRPRDRLWSSPAFSPTCPFREESQDTLTHSSPSFNLDTLLVPKLDVLRNSMFTAGKGVAEKASKWYSKFTMYTTSSKVSFFWYLLLLFFLLNLPPAPKKSRLLARMFILTILLKYSCIKKT	1399134	1389498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1389846_1391337_1391433_1395363
872727	contig_11003_pilon	+	1986	8	Intergenic	novelGene_105418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_5	150.212638398684	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	490	1872	56015	70266	FALSE	50	AATTCACTACCCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAVLLFLLGMLGALAERCEMPEVDSKLVEMLGQHLLPWMEQLSQEKLNPSIYVGLRLSSLQAKGKEALYLHSLKLHYQQSLLGSASSDGDDNSNFQAKPSMGQLALYLLALRANCEFVGGHKGDRLVSQLKRFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLAILALCVHQKRVHDSVVGKLLHAVEHDHPLHQGHLSVDTVAMAGLAFTCLKRSNLNPEQRERITLAIRTVRENVLRAQTPEGYFGNIYSTPLALQLLMTSSVSRVGLGTACHKARAALLARLQDGTFQNALMISQLLPALNHKSYVDLISPDCLATRAMLEPATETHLQTQVPEYIRVMLKVSSVLPPYKHSIPVPAGSSLEDVLKKAQELGPFTYETQASLSGPYLISVMGKKVGKREFWQLLQAPDTPLLQGESGGLPPLDVSLTQSCSSNQALPNSPQFSLNLPGPWLHKITSDQG	55525	70380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_56079_60015_60209_60874_61051_62751_62914_64474_64648_64778_64966_66252_66425_70010
872728	contig_16110_pilon	-	3396	1	Intergenic	novelGene_126802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGGCACAGCGCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115178	111782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_111800_115200
872729	contig_14704_pilon	+	3357	1	Intergenic	novelGene_82680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTACTACACAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21812	25169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_21800_25200
872730	contig_15327_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_70545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGATTTTTACCTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529959	532511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_530000_532500
872731	contig_16098_pilon	-	1589	11	Intergenic	novelGene_46030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1533.06591182506	2	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	112	1473	352350	348413	FALSE	20	TTTCTGGTACCAGACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTVTLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354100	348296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349688_349951_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352158_352352_353990
872732	contig_13481_pilon	-	2564	5	Intergenic	novelGene_119287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	15.2807067899361	229	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	200	730	190444	184858	TRUE	35	CAGAATTTCTGAATGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKTALGKSWAPWKASRYRPSWVAANHKPLGVDGQTGAARSPELSSPHPRDWFGEHGVEPMGAAALESRWRAREGDPYKLWREIRFRILVPFNILGWGPVRNFYILSLPVSIWCGLRQTGPQAPTEKWWLLEPPGRCLAPPPLPLTPRRRRHGKLKISMQEGIQFVFAQFPNGKKE	190643	177601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_179342_184763_184927_187277_187359_187641_187998_190419
872734	contig_8330_pilon	-	2425	2	Intergenic	novelGene_71851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_1	0	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	639	1040	896868	896249	FALSE	20	AAGTCTGGTCCTAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEAWLLTGQELLAHRAQCCQEMSRWWVGHSCRLERSPLTPALASSSLCSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	897506	894863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601
872735	contig_12106_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_83739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACCACGGTTGGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147520	150328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_147500_150300
872736	contig_11292_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_109442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	666	980	1645	326133	325468	NA	10	GGATATGTGTGTCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKCNNATVDWEWCAPLPRDRLQHTLVSVPGKDAIYSLGGKTLQDTLSNAVIYYRVGDNVWTETTQLEVAVSGAAGANLNGIIYLLGGEENDLDFFTKPSRLIQCFDTETDKCHVKPYVLPFAGRMHAAVHKDLVFIVAEGDSLVCYNPLLDSFTRLCLPEAWSSAPSLWKIASCNGSIYVFRDRYKKGDANTYKLDPATSAVTVTRGIKVLLTNLQFVLA	327112	324709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_324700_327100
872737	contig_11816_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_98511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	645	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATGGATCACAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985236	983243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_983200_985200
872738	contig_14275_pilon	-	3227	6	Intergenic	novelGene_162877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	59.0030507685831	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	111	1241	484731	462189	FALSE	50	AGAAAGGTAAGAGTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGAAGRQPIGAPPAGNSWHFSRTMEELVHDLVSALEESSEQARGGFAETGDHSRSLSCPLKRQARKRRGRKRRSYNAHHPWETGHCLSEGSDSSLEEPSKDYRENHNNNKKDPSDSDDQMLVAKRRPSSNLNNNVRGKRPLWHESDLAVDNLGNRTLRRRRKVKRMAVDLPQEVSNKRTVTQPLEGCRDQDMDNDRAYQYQEFTKNKVKKRRLKIIRQGPKIQDEGVVLDSEEISQINKDKMEYEEQKVSDELMSESDSSSLSSTDAGLFTNDEGRQGDDEQSDWFYEKESGGACGVTGVIPWWEKEDPTELDKHVPDPVFESILTGSFPLMSHPGRRGFQARLSRLHGIPSKNMKKSGGTPTSMATNWTSEIPL	484841	460202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_462222_462348_462429_462901_463085_466326_466389_471856_472574_484675
872739	contig_11427_pilon	-	2894	1	Intergenic	novelGene_79030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAATTGAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838136	835242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_835200_838100
872740	contig_10331_pilon	+	1682	10	Intergenic	novelGene_54188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	43.7766497316594	799	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	19	303	604724	605125	TRUE	20	CATGTGTTCAGTTTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKCGFMCRSSVGSLGIRMALEVRNKRKKKKNAEQRENPDDSFRGNLTGDYLVGQVANSLFHSKRLSRGNTDRLASLFSSFESPVKPVYVPVPKVSHWIL	604705	620220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_604813_604929_605501_608971_609213_610659_610720_613927_613972_615773_615858_616002_616067_617716_617757_618144_618264_619868
872741	contig_500_pilon	-	3932	1	Intergenic	novelGene_30976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTTGAACCACCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455558	1451626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1451600_1455600
872742	contig_19709_pilon	-	2811	11	Intergenic	novelGene_108661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	73.9848633167623	19	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	382	1164	71909	64663	TRUE	25	GCTGAAGTAAACGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIDHKGQVCVMIHSGSRGLGHQVATDALVAMEKAMKRDKIIVNDRQLACARIASTEGQDYLKGMAAAGNYAWVNRSSMTFLTRQAFAKVFNTTPDDLDLHVIYDVSHNIAKIEQHVVDGKERTLLVHRKGSTRAFPPHHPLIAVDYQLTGQPVLIGGTMGTCSYVLTGTEQGMTETFGTTCHGAGRALSRAKSRRNLDFQDVLDKLADMGIAIRVASPKLVMEEAPESYKNVTDVVNTCHDAGISKKAIKLRPIAVIKG	80613	62784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19709_pilon_-_62997_63188_63450_63488_64771_67456_67577_68946_69058_69748_69938_70456_70633_71830_71949_73968_74127_78145_78303_80586
872743	contig_5201_pilon	+	2254	2	Intergenic	novelGene_82165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTTTCAAGTGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202542	206056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_203962_205221
872744	contig_2504_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_166860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCACAGGGTTTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415653	413663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_413700_415700
872745	contig_2646_pilon	+	1972	5	Intergenic	novelGene_69535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_3	88.6012838507434	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	650	973	569631	573396	FALSE	30	TAGAAAACTCGCTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	568981	574395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
872746	contig_7368_pilon	+	3548	10	Intergenic	novelGene_158805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.0277640127705	122	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	126	1379	179319	203509	FALSE	20	AATGTGAGTGTCACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPNPEARLRRSKPRGSEEQTPLVEPHTPHNDVILHGIDGPAAFLKPDTQDLETKLHVLSVGSSAMEEDTEESFDGESMLDTASKPDLQEILQKHGISGSLNFDEEETDGEEEEGKKLRSHSPNSETGRPSSASSQKSTTDTGASGTATQQADNQLGEVENLEEFAYSPAPRGITVKCRITRDKKGMDRGLFPTYYMHLEKDENRKIFLLAGRKRKKSKTSNYLISTDPTDLSREGESYIGKLRSNLMGTKFTVYDHGVSPTKAQGLVEKAHTRQELAAICYETNVLGFKGPRKMSVIIPGMNMNHERIPFRPRNDHESLISKWQNKTMENLIELHNKAPVWNDDTQSYVLNFHGRVTQASVKNFQIVHENDPDYIVMQFGRVADDVFTLDYNYPLCALQAFAIGLSSFDSKLACE	106433	205678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_106511_179270_179431_180356_180534_186954_187089_187465_187664_189565_189679_200356_200472_202097_202197_202625_202798_203375
872747	contig_5917_pilon	-	3572	7	Intergenic	novelGene_122153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_6	42.1531598920993	342	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	49	813	643198	535235	FALSE	45	AAAACTGTAATTTTATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATAATKGNGGGSGRAGASEASGTRKKKGPGPLATAYLVIYNVVMTAGWLVIAVGLVRAYLAKGSYHSLYYSIEKPLKFFQTGALLEILHCAIGIVPSSVVLTSFQVMSRVFLIWAVTHSVKEVQSEDSVLLFVIAWTVTEIIRYSFYTFSLLNHLPYLIKWARYTLFIVLYPMGVSGELLTIYAALPFVRQAGLYSISLPNKYNFSFDYHAFLILVMISYIPLFPQLYFHMIHQRRKILSHTEEHRKFE	643246	532475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_535318_540656_540836_542744_542867_570104_570194_622355_622375_639793_639912_643043
872749	contig_8286_pilon	+	4346	13	Intergenic	novelGene_139780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	63.1032553307144	327	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	12	1490	24913	45595	FALSE	15	GCTTACACTTTTTGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVEKKLLLGPNGPAVAAAGDLTSEEEEGQSLWSSILSEVSTRARSKLPSGKNILVFGEDGSGKTTLMTKLQGAEHGKKGRGLEYLYLSVHDEDRDDHTRCNVWILDGDLYHKGLLKFAVSAESLPETLVIFVADMSKPWTVKESLQKWASVLREHIDKMKIPPEEMRELERKFVKDFQEYVEPEEGCQGSPQRRGPLTSGPDEENVALPLGDNVLTHNLGIPVLVVCTKCDAVSVLEKEHDYRDEHFDFIQSHLRSFCLQYGAALIYTSVKEEKNLDLLYKYIVHKTYGFHFTIPALVVEKDAVFIPAGWDNEKKIAILHENFTTVKPEDAYEDFIVKPPVRKLVHDKELAAEDEQVFLMKQQSLLAKQPATPTRASESPARGPSGSPRTQGRGGPASVPSASPGTSVKKPDPNIKNNAASEGVLASFFNSLLSKKTGSPGSPGAGGVQSTAKKSGQKTVLTNVQEELDRMTRKPDPMVTNSSTENEA	24901	48451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_25020_25182_25257_27228_27346_30592_30824_36463_36634_37616_37711_38634_38771_40928_41041_41775_41836_42590_42633_43035_43154_44008_44126_45494
872750	contig_12626_pilon	+	3712	1	Intergenic	novelGene_80450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGGCAAGTTAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159167	162879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_159200_162900
872751	contig_14687_pilon	+	4632	1	Intergenic	novelGene_107923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGGGTTTAGGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458226	462858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_458200_462900
872752	contig_3612_pilon	-	2675	5	Intergenic	novelGene_87841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	426	junction_1	85.6066586195256	342	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	809	1402	995319	982776	FALSE	40	CCAGGATTTATGATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDSPNHSIKEKALNALNNLSVNVENQDIIKIYISQVCEDVLSDPLNSAVQMAGLRLLTNMTVTSDHQHMFNSYMTDFFHVLLTGNGNTKVQVLKLLLNLSENPAMAEGLFGAQVDSSFLSLYDGHVAKEILLRVLTLFQNLNNYVKKDGHLVNRSTSTFHKGSLFSLLYGQECAQKMRALVHHPDVDVKEKVVIIT	998182	981502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_983028_983936_984009_988336_988514_995226_995362_997416
872753	contig_10500_pilon	+	2612	15	Intergenic	novelGene_41145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAAACCTACGGCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143205	1232851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1143935_1146044_1146185_1177662_1177840_1191620_1191817_1197870_1197985_1206044_1206208_1208236_1208345_1208454_1208541_1212811_1212930_1217971_1218131_1224614_1224803_1226729_1226855_1229882_1230006_1231355_1231412_1232721
872754	contig_15135_pilon	-	3749	1	Intergenic	novelGene_119842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAAGTTGACTTGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12734	8985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_9000_12700
872755	contig_10324_pilon	-	4227	1	Intergenic	novelGene_7867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTCAAAGCTATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495869	491642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_491600_495900
872756	contig_5718_pilon	-	5633	1	Intergenic	novelGene_110395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	329	990	1979	2968	1282709	1281720	NA	30	TATGAGAAAGGACCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSPPCAHSATSEAAGQRPVHPASLPSIQPALLEDSPLVQALNGLHLSSDKLEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAASLHGFSSSEDALEYYKPPSALDGTNKLCQFSPVQEVSEQTPEASPDKEEASISKKPQTSRPSDSQSKRLHSVRTNNSGATQRSVLSPLHRSGSVEDNYRTNFLFGLSTSQQHLTKSAAGLGLKGWHSDILAPQTSTPSLTNSWYFATESSHFYSASAIYGGNASYSAYSCSQLPTCSDQVYSVRRRQKPSDRADSRRSWHEESPFEKQFKRRSCQMEFGEGIMSENRSREELGKVGSQSSFSGSMEIIEVS	1284687	1279054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1279100_1284700
872757	contig_7963_pilon	+	2371	7	Intergenic	novelGene_58587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	171.03281036755	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	102	1607	260459	265827	FALSE	15	AGTTCACGTCTCTGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQVGVAGTEDFRAQRLTEDLWSCSPQAASGSAMPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFVSEEPALAAFFPVFFTLAFWALGFTCSLFKKKTSFCYGEFQAYAKKKREGNVMNYHLVSWLSSAAVTEIPQVDGFNR	259794	266591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464
872758	contig_4845_pilon	-	4084	12	Intergenic	novelGene_53709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	57.9890271752102	136	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	17	1798	1043666	1019365	TRUE	20	GCAAAGCTGTGCTGTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVVTAAAAALAPAPSIDGASSVHWFRKGLRLHDNPALLAAVRGARCVRCVYILDPWFAASSSVGINRWRFLLQSLEDLDRSLRKLNSRLFVVRGQPADVFPRLFKEWGVTRLTFEYDSEPFGKERDAAIMKMAKEAGVEVVTENSHTLYDLDRIIELNGQKPPLTYKRFQAIISRMELPKKPVGSVTSQQMESCRAEIQENHDETYGVPSLEELGFPTEGLGPAVWQGGETEAMARLDKHLERKAWVANYERPRMNANSLLASPTGLSPYLRFGCLSCRLFYYRLWDLYKKVKRNSTPPLSLFGQLLWREFFYTAATNNPRFDRMEGNPICIQIPWDRNPEALAKWAEGKTGFPWIDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWVSWESGVRVFDELLLDADFSVNAGSWMWLSCSAFFQQFFHCYCPVGFGRRTDPSGDYIRRYLPKLKGFPSRYIYEPWNAPESIQKAAKCIIGVDYPRPIVNHAETSRLNIERMKQIYQQLSRYRGLCLLASVPSCAEDLSNPVAEPSLSQAGSMSSAGPRPLPSGPASPKRKLEAAEEPPGEELSKRARVAKLPSPELPSKDV	1043682	1006498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1008783_1019362_1019505_1020671_1020765_1021078_1021282_1021405_1021558_1021794_1022107_1023223_1023365_1029004_1029094_1029982_1030168_1031750_1031894_1034399_1034509_1043451
872759	contig_5039_pilon	+	3178	5	Intergenic	novelGene_64757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	348.432920373492	156	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	31	900	111570	369205	FALSE	85	CCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQKSAFQEEAMASDSIFESFPSYPQCFMRDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQAKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNRASVNHAAAFNPQPQSQIQGKYQPQTWQPDQLGHLLDAQGVDLGPAAPQGLEAH	111539	371483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_111628_305373_305628_311423_311581_334767_334873_368909
872760	contig_8357_pilon	-	1539	6	Intergenic	novelGene_39773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_4	511.993203079885	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAGAAATGCAGGAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891841	883804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_887117_887179_887257_887410_887717_887787_891346
872761	contig_10104_pilon	-	4125	1	Intergenic	novelGene_160131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATTAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408381	404256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_404300_408400
872762	contig_5588_pilon	+	2548	2	Intergenic	novelGene_172852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAATCCACCTGTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067301	1071134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_+_1069794_1071078
872763	contig_7898_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_47581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	840	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGAATTCTTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485697	487531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_485700_487500
872764	contig_8673_pilon	-	2652	3	Intergenic	novelGene_129905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	8	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	24	395	121736	116263	FALSE	25	CCCAGAATTCTGAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNVTAQAMQSNNGRGEDEEEDDDDWDEEVLEETALEGFSTPLDLDNSVDEYQFFTQALLTVQNRDAAWYQLLVAPLSEDQRRALQEVYTVAEHRRSVAEAKKKIEQQGGFTFENKGVLTAFNFGSVPSNN	121759	114005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_116361_117263_117381_121579
872765	contig_8452_pilon	+	2793	2	Intergenic	novelGene_48063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	0	269	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	968	1963	496680	497675	FALSE	55	GCATTAACTAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPNYQYQPVASKSLYPEEYKIAALVFYSCIFIVGLFVNVTALWVFSCTTKKRTTVTIYMMNVALLDLIFILTLPFRMFYYAKGEWPFGEVFCQILGALTIFYPSIALWLLAFISADRYMAIVQPKYAKELKNTCKAVLACVGIWVMTLLTTIPLLFLYEDPDKASNPATCLKISDIIHLKAANMFNFTRLIFFFLLPLFIMIGCYLVIIHSLLHGRTSKLKPKVKEKSIRIIITLVVQVLVCFTPFHICFAFLMLAGEENSYSPWGAFTTFLMNLSTCLDVILYYIVSKQFQARVISVMLYRNYLRSMRRKTFRSGSSRSLSNINSEML	493138	498505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_494072_496645
872766	contig_6946_pilon	+	3673	1	Intergenic	novelGene_59771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	3157	3585	404317	404745	NA	20	GATGATGGGAACCTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDIVEQQLSIVVIYYVTSHSSHKPQDIPPMTYPVPFLPEVTSVSSPLPPSSCPTRLLKQPGLLLNGIKVGFLTSTNSWSADLTMPCPLGLSSSDCYVLPPLSFYPTCLFPSKLSPACLSLLCDQPPLVPPHPMSAPRGPN	401160	404833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_401200_404800
872767	contig_7446_pilon	+	1998	12	Intergenic	novelGene_101940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAAAGCACATTAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155971	260429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_+_156442_163491_163593_165969_166061_166683_166841_168390_168531_178288_178367_185011_185329_185568_185656_186937_187053_193588_193708_206814_206878_260169
872768	contig_9739_pilon	-	3534	2	Intergenic	novelGene_165094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	583	903	208490	208170	TRUE	20	CCGGCAGCGAGGCCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFLKSRTEARKVGSEHCQSCSLIVQDVSRQAALNVHLPLGLALPQPTGFYSTCLGAGRPSEASEPWHGQAGDHLHPQLLLYTSTHFICPTILRQRCRDADEGVG	209072	204068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_204670_206139
872769	contig_19459_pilon	+	1110	9	Intergenic	novelGene_59828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGGGTTAGCTAGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6665	19075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_6934_7778_7945_10267_10330_11327_11426_12584_12707_14887_14943_15510_15700_16201_16265_18988
872770	contig_15114_pilon	-	1693	8	Intergenic	novelGene_121128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.301786386765	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	67	1071	125261	100551	FALSE	30	TAATATTTCATAAGGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRARSRQWPLWPDRLPSSDAAMARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLVRGTRAPNKGREPLSKPQL	125327	99928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100610_100705_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212
872771	contig_17108_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_109512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGGATCAACGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36110	34381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_34400_36100
872772	contig_9571_pilon	-	4756	4	Intergenic	novelGene_136285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	545	junction_3	464.368627517215	76	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	218	532	528898	463881	FALSE	20	ACACCCAGCTGTCCATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDSGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTVSVSKWVLL	529115	459656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_463965_465848_465969_479402_479461_528845
872773	contig_12528_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_81293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	482	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAGTCTAAGGCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334254	332139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_332100_334300
872775	contig_15219_pilon	-	3073	15	Intergenic	novelGene_40840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_11	25.2635092170344	115	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	52	2328	44396	30623	FALSE	20	ACTGCACATTCTGTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSKRSTRSLRGSDKVQKDKAGQTSEPRQGSRMGKLLGFEWTDLSSWRRLVTLLNRPTDPANLAVFRFLFGLLMVLDIPQERGLSSLDRRYLDGLDVCRFPLLDALRPLPLDWMYLVYTIMFLGALGMMLGLCYRISCVLFLLPYWYVFLLDKTSWNNHSYLYGLLAFQLTFMDANRYWSVDGLLSARKRNAQVPLWNYTVLRGQIFIVYFIAGVKKLDADWVEGYSMDSLSRHWLFSPFKLVLSEEMTSLLVVHWCGLLLDLSAGFLLFFDASRPAGLFFVSYFHCMNSQLFSIGMFSYVMLASSPLFCSPEWPRKLVSHCPKRLQELLPLKASPQPSASCVYKRSRAKGGQKPGLRHQLGAAFTLLYLLEQLFLPYSHFLTQGYNNWTNGLYGYSWDMMVHSRNHQHVKITYRDGRTGELGYLNPGVFTQSRRWKDHADMLKQYATCLSRLLPKYNVTEPQIYFDIWVSINDRFHQRIFDPRVDIVQAAWSPFQRTPWLQPLLMDLSPWRAKFQEIKSSLDNHTEVVFIADFPGLHLENFVSEDLGNTSIQLLQGEVTVELVSEQKNQTLREGEKMQLPAGAYHKVYTTSPSPSCYMYIYVNTTELTLEQDLAYLQELKEKVENGSETGPLPPELQPLLDGEVKGGPEPTPLVQTFLRRQQRLQEIERRRNTPTHERFFRFLLRKLYVFRRSFLMTCISLRNLALGRPSLEQLAEEVTYANLRPFEPAGELSHSDMDSSNPNLPESNSDPVHSEF	44447	29877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_30816_31255_31452_31617_31766_32103_32235_32415_32586_32998_33151_34288_34421_34587_34854_35194_35359_38457_38565_39027_39107_41044_41211_41516_41676_43805_43977_44353
872776	contig_20875_pilon	+	1843	9	Intergenic	novelGene_153102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	190	junction_8	158.033570405152	159	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	738	1601	61344	64097	FALSE	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEEPAEGRKSEDDGIGKENLAILEKIKKNQRQDYLNGAVSGSVQATDRLMKELRDIYRSQSFKGGNYAVDLVNDSLYDWNVKLLKVDQDSALHNDLQILKEKEGADFILLNFSFKDNFPFDPPFVRVVSPVLSGGYVLGGGAICMELLTKQGWSSAYSIESVIMQISATLVKGKARVQFGANKSQYSLTRAQQSYKSLVQIHEKKRLVHTPKGRWLTPERHPILLPRRHWTNYLLNAVFGSHAASVVPSLGFPGRDSSACCRTVTAILNAKEKTHTQLSQVLQTD	60606	64339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_61458_61638_61724_61984_62046_62249_62341_62451_62511_62609_62659_62895_62992_63311_63380_63856
872777	contig_4068_pilon	+	3925	8	Intergenic	novelGene_161711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAACAGGAAACCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84831	113768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_87837_94686_94722_96362_96420_98713_98789_102797_102904_108101_108276_109190_109303_113407
872778	contig_9014_pilon	+	617	5	Intergenic	novelGene_106804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2554.00933582867	41	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCTTCTTACTAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150643	156222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151087_151554_151763_152234_152334_156111
872779	contig_5758_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_119091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTCATTCTAGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175671	172783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_172800_175700
872780	contig_15720_pilon	+	3633	3	Intergenic	novelGene_41934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGGCGTGGTCCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289444	297733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_291677_296272_297389_297448
872781	contig_4388_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_161978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	118	429	906075	906386	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNKELPPPSTVLPLRNSRAWEGCISIIAAAACPHWKLRMKTRPGPCGRSARGWSRSGLASSPAKSGLPQGSHTHPPRVRTQLPMLDPFQSYDPEGFHVPLTQISQGKGNKSSHNRVKDVKYQWETGNSRGRGTVSLLGGLG	905957	907298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_906000_907300
872782	contig_4952_pilon	+	2737	20	Intergenic	novelGene_145536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	128.901151760594	166	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	89	1570	501121	530535	FALSE	15	GCTTCTAGTTCCAGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRTKGDEEEYWNSSKFKAFTFDDEDDELSQLKESKRAVNSLRDFVDDDDDDDDLERVSWSGEPVGSISWTIKETAGNSGSTHEGREQKSRNNFSSYGQLSKPVSTYSLSSLFKGRTRFGSFQSLSDALSDTSAKSYAPELGRPKGEYRDYSNDWSLSDTVRRLRKGKVCSLERFRSLQDKLQLLEEAVSMHDGNVITAVLIFLKRTLSKEILFRELEVRQVALRHLIHFLKEIGDQKLLLDLFRFLDRTDELALSHYREHLNIQDPEKRKEFLKTCVGLPFSAEDSAHIQDHYTLLERQIIIEATDRHLESAGQTEIFRKHPRKASILNMPLVTTLFYSCFYHYTEAEGTFSSPVNLKKTFKIPDKQYVLTALAARAKLRAWHDVDALFTTKNWLGYTKKRAPIGFHRVVEILHKNSAPVQILQEYINLVEDVDIKLNLATKFKCHDVVIDTCRDLKDRQQLVAYRSKVDKGSAEEEKIDATLNNLHIRWKN	497420	531702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_497509_501120_501214_501846_501953_505086_505231_505649_505689_506072_506138_506891_506949_517384_517478_517959_517994_518502_518606_520241_520270_522897_522972_524600_524677_525323_525459_526120_526163_526484_526575_527637_527725_529164_529255_529673_529779_530514
872783	contig_15866_pilon	+	4382	1	Intergenic	novelGene_63579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCCCTCCACACCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167213	171595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_167200_171600
872784	contig_5039_pilon	+	2449	12	Intergenic	novelGene_64989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	142.397244378575	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	662	1963	1688604	1701169	FALSE	40	AAACGATTAACTACAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLVIGSGGREHTLAWKLAQSPHVKQVLVAPGNAGTACSEKISNAAVSVSNHAALAQFCKDEKIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLTSAGVRCFGPTAEAAQLESSKRFAKEFMDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALKDGRVVTNGGRVLTVTAIREDLPSALEEAKKGLAAIKFEGAVYRKDIGRRALAFLQQPR	1686538	1701655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687049_1687989_1688102_1688564_1688749_1691365_1691462_1692008_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648_1698818_1700933
872785	contig_9706_pilon	+	3311	1	Intergenic	novelGene_21050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGATTAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708614	711925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_708600_711900
872786	contig_2342_pilon	+	3496	1	Intergenic	novelGene_132753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	359	1080	297	1376	157826	158905	NA	55	GATAAAAATAGTATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQAKLVYQLNKYYTERCQARKAAIAKTIREVCKVVSDVLKEVEVQEPRFISSLSEIDARYEGLEVISPTEFEVVLYLNQMGVFNFVDDGSLPGCAVLKLSDGRKRSMSLWVEFITASGYLSARKIRSRFQTLVAQAVDKCSYRDVVKMIADTSEVKLRIRERYVVQITPAFKCTGIWPRSAAQWPMPHIPWPGPNRVAEVKAEGFNLLSKECYSLTGKQSSAESDAWVLQFGEAENRLLMGGCRNKCLSVLKTLRDRHLELPGQPLNNYHMKTLLLYECEKHPRETDWDEACLGDRLNGILLQLISCLQCRRCPHYFLPNLDLFQGKPHSALESAAKQTWRLAREILTNPKSLDKL	157529	161025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_157500_161000
872787	contig_5482_pilon	+	3174	1	Intergenic	novelGene_144473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAACTAGGGAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380402	383576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_380400_383600
872788	contig_12864_pilon	-	3893	1	Intergenic	novelGene_76453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTCTCTGTGCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252131	248238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_248200_252100
872789	contig_18272_pilon	-	9078	1	Intergenic	novelGene_7039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	284	640	255244	254888	NA	35	TCTGTCTTAAGCATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSRGWEGETFFREISYKCAYPFYSFKRVFYARVLGISQRVVQLAHLSWATILVPFRMSQQIVIEKRQKGKVVSLKLKSYFYGNSEGSDILSRTDPQLEILTFYTSKPKTQSYLHCSK	255527	246449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_246400_255500
872790	contig_9406_pilon	-	1791	2	Intergenic	novelGene_136139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAAGGAGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35520	33287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34567_35008
872791	contig_10000_pilon	-	2674	8	Intergenic	novelGene_139325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_4	198.046479805285	84	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1002	1671	2672	262978	233906	FALSE	25	AGCTGGATTTAGCCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATGHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMVMLQKMATADTCLFPSAPSSINARCLQPACPGRTSFLKPGPFFQLRGRR	272488	233903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_234131_236640_236869_244288_244453_255345_255513_260138_260186_262201_262289_262894_263003_270842
872792	contig_11224_pilon	+	254	1	Intergenic	novelGene_124452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17003	17257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_17000_17300
872793	contig_19558_pilon	+	3017	1	Intergenic	novelGene_164742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTAAAATACAGTAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7288	10305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_7300_10300
872794	contig_11285_pilon	-	2865	5	Intergenic	novelGene_5732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	23.123310749112	286	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	14	688	1058973	1047096	FALSE	25	TTAAAGAATTTTTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDPKMAAPSEVAAAGSAEGDGGGSGFGMWLDGRLEALGVDRAVYGAYILGVLQEEEEEEKLDALQGILSAFLEEDSLLNICREIVERWSETQNVVTKVKKEDEVQAIATLIEKQAQIVVKPKMVSEEEKQRKAALLAQYADVTDEEDEADEKDDSGATAMNIGSDKSLFRNTNVEDVLNARKLERDSLRDESQRKKEQDKLQRERDKLAKQERKEKEKKRTQKGERKR	1058986	1044918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_1047284_1049271_1049331_1050568_1050705_1051878_1051967_1058769
872796	contig_10857_pilon	+	2571	6	Intergenic	novelGene_160919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_5	128.569669829241	1	144	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	280	645	467726	469527	FALSE	15	GCCATCCATTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSSGGQRVAFFVSCSFCDQQRSSEVLAL	463696	471453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469445
872797	contig_12964_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_131648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATTGTAAGATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88577	86058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_86100_88600
872798	contig_8375_pilon	+	3504	1	Intergenic	novelGene_141289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCACCCAGCTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119651	123155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_119700_123200
872799	contig_9389_pilon	-	4928	1	Intergenic	novelGene_84137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3063	3362	1709756	1709457	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPPYPATSSRICRIQNRSQEEEGQDGGTDSSALTIPTTMTKQKPAKLAILELWTRSEGLENQAEHQIRGDLKWGLQGGGIRGPSRPYLLPSWVWSF	1712818	1707890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1707900_1712800
872800	contig_16098_pilon	+	2718	5	Intergenic	novelGene_46187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_4	84.0446310004393	413	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	358	831	666319	668688	FALSE	30	CATAGAGATTTCCATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGENVFLFVPNLIGYARIVFAIISFYFMPCCPLTASSFYLLSGLLDAFDGHAARALNQGTRFGAMLDMLTDRCSTMCLLVNLALLYPRATLLFQLSMSLDVASHWLHLHSSVVRGSESHKMIDLSGNPVLRIYYTSRLALWVFSAWASGSLPPLRC	665961	670575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_666362_666456_666592_667323_667478_667951_668034_668628
872801	contig_15104_pilon	+	1812	3	Intergenic	novelGene_163363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	31.5	566	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	122	439	662456	662888	FALSE	55	CAAAGGGAAAATGTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVEKGKKIFVQKCAQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQSPGFTYTDANKTKGITWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKAERADLIAYLKKATNE	661427	664261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_661541_662447_662625_662739
872802	contig_7020_pilon	+	2231	3	Intergenic	novelGene_57068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	321	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	164	1432	102241	103509	FALSE	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	98727	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_98825_102106_102162_102229
872803	contig_10037_pilon	+	5018	6	Intergenic	novelGene_148946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	209.776452444024	126	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	124	645	115453	378598	FALSE	20	CTGGTTCCTGGGAGATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTASTRRVTFEADENENITVVKGIRLSENVIDRMKEASPSGSKSPRHSGGYGASVSEEELKRRVAEELALEQAKKESEKQKQLKQSKELDQESAHEQLTRAILRERISSEEERSRAKHLIKQLEEKDRVIKKQDEFYKQQLARLEERSAEFYKVTTEQYQKATEEVEAKFK	115329	382971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_115534_128019_128108_186798_186881_236069_236182_332381_332466_378523
872804	contig_4000_pilon	+	5477	4	Intergenic	novelGene_176081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.29983164553722	165	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTCCCCAGCACGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266638	278785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_+_270544_271014_271135_276214_276341_277459
872805	contig_11708_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_138971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTCCTGACCAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272904	275258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_272900_275300
872806	contig_11708_pilon	-	2789	15	Intergenic	novelGene_138951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	123.859470236825	307	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	142	1992	236888	220056	FALSE	40	AAATATTTTGACTATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGRLCSESLDSALNVLARALENNKDNPEIWCHYLRLFSKRGTKEEVQEMCETAVEYAPDYRSFWTFLHLESTFEEKDYVCERMMEFLMGATKQETSDTLSFQLLEALLFRVQLNIFTGRCQNALAILQNALKSANDRIVAEYLKTSDRCLAWLAYIHLIEFNILPPKLYDPSNANPSRIVNTEPFVMPWHAVQDVKTNPDMLLAVFEDGVKACTDESLTVEERTEVCLPLYTNMIALHQLLERYEDAIKLCKCLLESCPVNCQLLETLVALYLQTNQQDKARAVWLTAFEKNPQNAEVFYHMCKLFILQNRGDNLLPFLRKFIASFFKPEFENYSNLDLFRYLLNIPGPLDIPAHLCKENFNDEMFNHQIPYLWLIYCLCHPLQSSIKETGEAYEAALGVAMRSDIVQKIWMDYLTFANNRAAGSRNKVQEFKIFTDLVNRCLITVPARYPIPFSSADYWSNYEFHNRVIFFYLSCVPKTQHSKTLERFCSIMPTNSGLALRLLQHEWEESNVQILKLQAKMFTYNIPTCLATWKIAIAAEIVLKGQREVHRLYQRALQKLPLCASLWKDQLLFEASEGGKTDNLRKLVSKCQEIGVSLNELLNLNSNKTESKNH	237029	219258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_220194_220322_220386_220642_220683_221450_221553_223217_223319_224497_224664_224798_224904_225167_225279_228362_228458_229025_229225_229307_229414_232871_233110_233696_233886_235390_235578_236877
872807	contig_11285_pilon	+	2512	3	Intergenic	novelGene_5514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	73	339	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	704	1639	634410	636847	FALSE	10	TGTGGAGCCTCCTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDPVSSQTMELSDVTLIEGVGNEVTVVAGVVVLILALVLAWLSTYVADSSNNQLLGTIVSAGDTSVLHLGHVDHLMASQGTPEPTELPHSSEGNDEKAEEAGEGGGDSTGEPGAGGGVEPSLEHLLDIQGLPKRQAGPESGSPESPLRSEDSTCLPPSPGLINVRLKFLNDTEELAVARPEDTVGALKSKYFPGQESQMKLIYQGRLLQDPARTLRSLNITDNCVIHCHRSPPGSAVPGPSASLAPSTTEPPSLGVNVGSLMVPVFVVLLSVVWYFRINYRQFFTAPATVSLVGVTVFFSFLVFGMYGR	633706	637720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_634415_635674_636242_636483
872808	scaffold_9100_pilon	-	2939	5	Intergenic	novelGene_83299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_2	135.23937111655	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	2130	2813	774519	746337	FALSE	30	TCAATAATATATTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	776648	746210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274_749478_768983_769076_774460
872809	contig_6102_pilon	-	1835	7	Intergenic	novelGene_32152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	724.106729395298	4	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	295	306	847019	847008	TRUE	20	ATCTTTGAGCCGTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNVIVLKTVKMLM	867507	838828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_841177_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847040_867233
872810	contig_6270_pilon	-	4009	3	Intergenic	novelGene_99901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216955	1208315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1209704_1214258_1214778_1214853
872811	contig_5711_pilon	-	3155	2	Intergenic	novelGene_80287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	277	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTGTTGAAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211846	208279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_210436_210847
872812	contig_8571_pilon	-	2402	2	Intergenic	novelGene_169190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	137	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	71	514	547574	528909	FALSE	35	CATCACAGCAGCCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGVATGRQAEDALPPPTEPSLPETKPLPPSQPPTPVAAPQPQQSPAPRPQSPSGVKEEENYSFLPLVHNIIKCMDRDSPDVHQDLNTLKTKFQEVRKAIGTMPGIHLSPEQQQQQLHSLREQVRTKNELLQKYKSLCMFEIPKD	547644	527020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_529126_547347
872813	contig_10734_pilon	+	3093	1	Intergenic	novelGene_51433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2376	2720	2212914	2213258	NA	10	GGGAATCTTCTGTGGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKATAVGKGEELLGAAFSGGREDASVSPLAGSPVGPIWCEQPVANTKAWKEAHVLTPFPLPLPVHSAAWPGLPTKPCEPCCGHSGRRGTSPLARAPVLQPLWNKENPRAGPHL	2210538	2213631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2210500_2213600
872814	contig_10734_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_51394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCTGGCAATTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1999050	2001285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1999000_2001300
872815	contig_16126_pilon	+	3083	18	Intergenic	novelGene_141879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGCAGAACGCTCAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47082	106808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_47270_48545_48675_48939_49200_50842_50883_51362_51849_54828_54973_60299_60443_63163_63327_64113_64199_64397_64645_65260_65393_79464_79568_79850_79978_81808_81911_82095_82260_95664_96136_104564_104635_106778
872816	contig_8284_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_125675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATATGAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259112	257638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_257600_259100
872817	contig_7318_pilon	+	2082	9	Intergenic	novelGene_152227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	68.8920124179865	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	90	1100	277723	311758	TRUE	10	TTTTAGTGTTCTTTTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQALALLREMSRLEAPLEELRALHSVLQAVPLSELREQVAEMHLGPLFSLLNQNHREQTALCVSILERLLQAMEPVHMARNLQVDLQRGLTHPDDSVKILTLSQVGRIIENSDAITEILNNSELLKQIIYCIGGENLSIAKAAIRSLSRVSLTQAGLEALFESNLLDDLKSVMKTNDVVRYRVYELIVEISSVSPESLNYCTTSGLVTQLLRELTGEDVLVRATCVEMVTSLAYTHHGRQYLAQEGVIDQISNIIVGADSDPFSSFYLPGFVKFFGNLASMDSPQQICERYPVFVEKVFEMTESQDPTMIGVAVDTIGILGSSVEGKQVLQKTA	277633	315497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_277896_291587_291733_292820_292935_293282_293412_304922_305033_306903_307047_307796_307989_311753_311895_314651
872818	contig_11855_pilon	+	6766	6	Intergenic	novelGene_67085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	156.908125984603	413	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	339	2162	2374934	2387032	FALSE	20	CAATGTTCCTGAAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHVASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVPSTFYHGANQELDLSTKVYKRESGSPYSVLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRSVSDVHAVKEDGENSDDTEEEEDEEVSYKREQIIVEVNLNNQTLNVSKGEKGVSSQSKETPVLKTSSEDEEEESEEDATDDSSDYGENERQKKKEKIVEKVSVAQRRRRRAASVAAATTSPTPRTTRGRRKSVEPPKRKKRATKEPKAPVQKAKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCEKNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTPTTPTPPINMNPVSTLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDSFLRHLAEKNSSAQHH	2328908	2391636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2328992_2374678_2375837_2378270_2378419_2378737_2378854_2379309_2379455_2386520
872819	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	34	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
872820	contig_10331_pilon	-	2331	1	Intergenic	novelGene_54148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424801	422470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_422500_424800
872821	contig_10015_pilon	+	3313	1	Intergenic	novelGene_170945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCCAGCTTAAGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911	5224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10015_pilon_+_1900_5200
872822	contig_14526_pilon	+	4072	3	Intergenic	novelGene_111210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3361	3699	331644	331982	TRUE	15	GTGCTTCGACCCGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQGGEPDLEPAEVARCKQLFLLPLRTASAGERGWQEHRSKYRYKMLPVPTSQGGEKGRVNTCFRSSHQVLGVLISEMGCCEGEMRTVPGPWSVLAACLLLLLFLNISIVD	328283	408581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_332146_408218_408396_408548
872823	contig_21412_pilon	+	2379	5	Intergenic	novelGene_142854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGGAACCTCAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30378	46471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_32207_37215_37441_38946_39103_41565_41629_46364
872824	contig_7446_pilon	-	1498	3	Intergenic	novelGene_101955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	1.5	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	80	304	260350	210451	TRUE	20	GTACCTATTTGGTGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTSQSDVSSLPPVPSSTDLEVGETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTVSAQALLASSSAESPPSTSLLSSSDSEQRQSVEASGHHTHHQSGPLKSWVAGSCLE	260429	205762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_206875_210368_210492_260166
872825	contig_11548_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_66779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	101	691	112832	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112731	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
872826	contig_8681_pilon	+	9308	1	Intergenic	novelGene_157198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	476	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTGTGTTTATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109111	118419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_109100_118400
872827	contig_18869_pilon	-	2653	1	Intergenic	novelGene_56487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341739	339086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_339100_341700
872828	contig_7580_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_108610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAACCCTGTAAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110047	107378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_-_107400_110000
872829	contig_8452_pilon	-	2391	17	Intergenic	novelGene_47978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	320.31993284059	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	126	2054	145829	75102	FALSE	45	ACAGTTGATTGTAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRLPASSPPRWPRLLLLSLLLLGAAPGPRRGDAFYLPGLAPVNFCEEEKKNGECKAEIELFVNRLDSVESVLPYEYTAFDFCQASEGKRPSENLGQVLFGERIEPSPYKFKFNKEETCTLVCTKTYHTEKAEDRQKLEFLKKSMLLNYQHHWIVDNMPVTWCYDVEDGQRFCNPGFPIERDTFYIFNHVDIKIYYHVVETGTMGARLVAAKLEPKSFKHTHVDKPDCSGPPMDISNKASGEIKIAYTYSVSFQEDKNIRWASRWDYILESMPHTHIQWFSIMNSLVIVLFLSGMVAMIMLRTLHKDIARYNQMDSTEDAQEEFGWKLVHGDIFRPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGTIGFFACFWFVTKIYSVVKVD	145954	74764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78845_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544_94678_100092_100202_101016_101097_104699_104812_105921_106034_107433_107514_116460_116589_124568_124663_126936_127005_145658
872830	contig_11396_pilon	+	1080	7	Intergenic	novelGene_71428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	464	junction_3	401.664626550836	3622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	148	894	1782334	1789745	FALSE	15	CAGAATGGCTTCCTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782186	1789931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787363_1787834_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
872831	contig_8978_pilon	+	2501	8	Intergenic	novelGene_49418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	191.024092934982	106	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	72	1445	426151	435210	FALSE	25	ATGAATATTTTGTCTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEAGRVKELCKSLQGDGCFYFRSMGPGWDLLRPAVAVGSAVAIMSDSDSDEDSAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGTLITELTANEELTGTDGALVNDEGWIKSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPVLIKKDKDQDTIASEKVDFSSSSDSESDMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVDSEVNQKSLWNYDYAPPPPPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKCRMIEDFRKLEESSGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGVLPC	426079	436266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_426331_427385_427501_427646_427764_431918_432039_433190_433370_433781_434001_434422_434642_434985
872832	contig_5428_pilon	-	3093	1	Intergenic	novelGene_160415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTACTGTTTTGGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177208	174115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_174100_177200
872833	contig_5317_pilon	-	3302	8	Intergenic	novelGene_76569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_5	71.6926546774067	319	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	163	1389	148305	131648	FALSE	15	ACTTGTTGGTGTTTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAEEARRLELHWGFGLEELYGLALRFFKEKDGKAFHPTYEEKLKLVALHKQVLMGPYNPDTCPEVGFFDVLGNDRRREWAALGNMSKEDAMVEFVKLLNRCCHLFSTYVASHKIEKEEQEKKRKEEEERRRREEEERERLQKEEEKRRREEEERLRREEEERRQIEEERLRLEQQKQQIMAALNSQTAVQFQQYAAQQYPGNYEQQQILIRQLQEQHYQQYMQQLYQVQLAQQQAALQKQQEVAVAGASLPPSSKVNAAVPGDMMSVNGQARTHTDSSKKELEPETAEEALENGPKDSLPVIAAPSMWTRPQIRDFKEKIRQDADSVITVGRGEVVTVRVPTHEEGSYLFWEFATDNYDIGFGVYFEWTDSPNTAVSVHVSESSDDDEEEEENITSEEKAKKNASKPLLDEIVPVYRRDCHEEVYAGSHQYPGRGVYLLKFDNSYSLWRSKSVYYRVYYTR	170332	129734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_131860_137001_137287_139195_139383_142872_143048_144981_145141_147442_147584_148237_148380_170244
872834	contig_9895_pilon	+	6006	34	Intergenic	novelGene_144681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_30	114.400613893182	301	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1258	3777	225	4001	96967	479716	FALSE	35	AAATAAGGCTTGTGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSLGEKSRVEAGTRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKGRPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTTIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGEQIQEPETEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEDDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF	62175	481721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_62319_96885_96996_109898_110002_148541_148707_194344_194442_231902_231980_286123_286329_313536_313689_315521_315596_329843_329968_341053_341153_341643_341724_348606_348715_355619_355735_363507_363626_380022_380127_393038_393132_393233_393324_393490_393695_394691_394763_395957_396046_425315_425397_440256_440350_442330_442506_444232_444373_448985_449088_451664_451814_452504_452634_461769_461976_465210_465386_476469_476581_477129_477245_479523_479605_479692
872835	contig_5643_pilon	-	2240	10	Intergenic	novelGene_39147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	78.3498012634665	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	56	1060	708267	658287	TRUE	20	CTAACTGCTTTCTGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAAEGDVGTVVELVRLLRSGFEELSLNKLATSLGASEQALRLIISIFLGYPFALFYRRYLFYKDSYLIHLFHTFTGLSIAYFNFGNQLYHSLLCVVLQFLILRLMGRTITAVLTTFCFQMVYLLAGYYYTATGNYDIKWTMPHCVLTLKLIGLAIDYFDGGKDQNSLSSEQQKYAIRGVPSLLEVAGFSYFYGAFLVGPQFSMNHYMKLVQGQLTDMPGKTPNSIIPALKRLSLGLVYLVGYTLLSPHITVLSNLASTTALQPFFYLVQQTIHWLFMGYSMTAFCLFTWDKWLKVYKSIYFLGHIFFLSLLVILPYLHKAMVPRKEKLKKME	708322	656254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_657423_658274_658404_658503_658635_660752_660833_661998_662178_662608_662647_662798_662893_663452_663560_664488_664597_708116
872836	contig_2278_pilon	+	4584	2	Intergenic	novelGene_118100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	262	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	51	365	696456	699388	FALSE	20	TACAGTTGTACCTGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKQEKLLASRLEELFPVQRQPCLHGCPLSPPPPLKVSPSCPMGSPEQGVQRLLLLSWVEVFPVRLLLPHYSLSPAIGPRQGTQMPTCLHEQLPSCQVNVTGC	696405	703607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_696483_699100
872837	contig_4686_pilon	-	2036	5	Intergenic	novelGene_118496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_4	60.5903251352887	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	386	1006	375532	369649	FALSE	50	ACCCCAAGTGTAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVLSPQPSSNPSLSLAQPLRSERSGRDTPASVDSIPLEWDHDYDLSRDLESAVSRTLHSEDEESQEDKDFYLRGAVGLSGSHGALESRIRQLDKALDDSHFRIQQTENIIRSKTPTGPELDASYKGYMKLLGECSGSIDLVRRLEHQLKEEEESFPGFVNLDSTETQTAGVIDRWELIQAQALSKELRMKQNLQKWQQFNSDLNNIWAWLGETEKELERLQRLELSTDIQTIELQIKKLKELQKAVDHRKAIILSINLCSPEFTQADCEESRDLQDRLSLMNGRWDRVCSLLEEWRGLLQDALMQCQVSGASGGQCAAVQHFQFSSLLIEHAS	381525	368618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_369931_373540_373753_375405_375533_377529_377673_381283
872838	contig_4180_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_8318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777700	775753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_775800_777700
872839	contig_8712_pilon	-	4180	11	Intergenic	novelGene_58870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	109.925247327445	751	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	85	1038	917856	881196	FALSE	15	TTTGCCTCATTTCTAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLHLQYFGHVIRRDQSPEKDIMLGSVGPPYAKEQKSWLHNVVTQERLEEKMSICQHHRGSGQCAAMELGTLQGGYLELLNSNADPLQLYHFYDQKDLAGEEEIELCLEPDTDTINCDQFSRLLREMEGDEETREAYANIAELDQYVFQDSQLEGPSRDIFIEHMGSEEVIGDSLEASTEAGQKSQKRPFPEELPVDLKHRKIAEPSTGLTVTGSFLVGLESASSALSCLQLPLLLNQEPAPDPTQLEETVHMPVPPSRPLFSCLNLPAGSIQIIPTLTLPQGLCQISGAGAGVSGILIYHGECEACLSTWSSHVC	927964	878053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_881228_901673_901830_902235_902389_903784_903830_906284_906366_906526_906590_911737_911834_912066_912214_915885_915991_917780_917891_927914
872840	contig_4131_pilon	+	3007	7	Intergenic	novelGene_127867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	8.86472409798147	183	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	63	1175	198401	209649	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFPAQSGLEREGTTRRPSREMGAGARPALLLLMLLRAVAPQGRRPRSHSLRYLFMGASEPDLGLPLFEALGYVDDRLFVSYDHESRHANLRPLWVWNGASSQLRLQLSQNLKGWDHMFTVDLWTIMDNHNHSTVMRLGVLSESHTLQVILGCEVQEDNSTWGFWKYGYDGQDHLEFCPETLDWRAAEPGAQATKLEWEVNKIRAKQNRAYLERDCPEQLRQLLELGRGVLDQQVPPSLVKVTHHVTSEVTTLRCQALNFLPQNITMRWLKDKQPLDAKEVEPMDMLPNGDGTYQGWMAVAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLTATWEPSSPGTLVIGIISGIAVCVIIFFIGILFKILKKRHVSRRTMGDYVLAEVNLTQMKGKQQKTTY	198338	211481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_198477_203961_204226_204410_204711_205538_205818_205954_206069_207966_208000_209602
872841	contig_11427_pilon	+	4004	2	Intergenic	novelGene_79017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTTCAGACATGGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774523	781154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_778331_780957
872842	contig_5649_pilon	-	3399	4	Intergenic	novelGene_82377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	125	junction_2	42.9262934186807	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2394	2729	1071447	1069132	FALSE	10	CTTCCTGTTGCGTAGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1073840	1068461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357
872843	contig_10235_pilon	-	2765	21	Intergenic	novelGene_46547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	85	420	429441	428804	TRUE	20	CCCGCAACGGGCGGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRSSVAAVSILAPSTGSPTRRAAPRSERHISARRWMQRTTRPSGVPESPANSEKGLPRAHSYTTSTSPKFSSPTNSSTVWFRPQATWTSPIRLATARTRSTPCLRVLGS	429525	418360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_418446_418524_418630_419184_419294_419374_419492_419590_419707_419821_419896_420190_420247_420345_420535_420698_420828_421031_421179_421548_421696_421834_421919_422111_422220_422550_422706_422781_422870_423047_423263_423343_423456_425689_425856_428660_428825_429034_429178_429269
872844	contig_3584_pilon	+	2893	11	Intergenic	novelGene_108115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	3	659	188123	197911	TRUE	15	CTTGTTTTCATCCTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLGDRSCSWNVFGTAAWKTKSVMSSSVLLEACIVITVTLGLVFDRSKVNSIFKPFLLYAVMEGMPEVMSLKRGCDESPSNKKGGWDICGTEAGAGAAAGAPVRLMSPSKSRSSPPAEAGLLVGAVGITGVMSFPPNKSNKSLAWLVGCGPEGGGLVSSGAGSVSPFVCTISVGPFVVTFSMTGILSSRADLIWSYFLKSALYSTALCWSSTSMLLP	188120	207051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_188161_191148_191309_191438_191545_196409_196539_196717_196859_197828_197936_199888_200012_201128_201224_201404_201527_204448_204502_205234
872845	contig_2438_pilon	-	4111	1	Intergenic	novelGene_112000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTTTGTTGTCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193259	189148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_189100_193300
872846	contig_12799_pilon	+	3713	6	Intergenic	novelGene_173279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.49526197637537	43	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	301	1089	26844	28913	FALSE	25	ATGAGAACCTTTTGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGAGNRRGLRRRAVGVRQWKLHETLEHLRKEQEEAWKLEVGERKRTANWKIQVETRKQSIIWEFEKCRRLLKKKQTPSQQLEVEAAAALASLEQEEGETMQKLELNRNKLVQQSGVLWRMIAELEERSQRPVRWMLQGIQEVLNRSKTWSLQRPEPVSLELKTECRVLGLREILKTYAADVCLDPDTAYSRLIVSKDRKSVCYGDTKQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGQHYWEVEVGNRSEWGLGVCKENVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPLLSLSVPPRRVGIFLDYEGHDISFYNVTDNGSHIFTFPHYPFPGRLLPYFSPCYSIGANNTAPLTICNLDGED	10424	31537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_+_10482_25781_25878_26696_26958_27399_27423_28064_28166_28362
872847	contig_6083_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_177121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACTTGGCTAGGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59016	59962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6083_pilon_+_59000_60000
872848	contig_4531_pilon	-	3625	7	Intergenic	novelGene_47910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	225	539	406676	402345	TRUE	25	CACCTTGGTGATTAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKACFLYGPEFGCRIGSGADASPLIVTSICSTPLVSIGYSTGVGGFTVLVEAPLPQKSPGENLTGLTGVRGLPINLRGDRIFGSKENFSFTLSSTDGATYVKP	406900	395242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_397356_397538_398263_398548_398614_398790_398870_402239_402346_405386_405501_406476
872849	contig_4952_pilon	-	2031	1	Intergenic	novelGene_145524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373292	371261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_371300_373300
872850	contig_5954_pilon	+	2525	1	Intergenic	novelGene_28543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	411	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGGGTGACACCAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533676	536201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_533700_536200
872851	contig_709_pilon	+	2668	10	Intergenic	novelGene_57566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	80.0755815803551	86	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	178	1155	2162347	2205279	TRUE	15	TTAGCGTTCAGTGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVDKHKVKRQRLDRICEGIRPQIMNGPLHPRPLVALLDGRDCTVEMPILKDLATVAFCDAQATQEIHEKVLNEAVGAMMYHTITLTREDLEKFKALRVIVRIGSGYDNVDIKAAGELGIAVCNIPSAAVEETADSTICHILNLYRRNTWLYQALREGTRVQSVEQIREVASGAARIRGETLGLIGFGRTGQAVAVRAKAFGFSVIFYDPYLQDGIERSLGVQRIYTLQDLLYQSDCVSLHCNLNEHNHHLINDFTIKQMRQGAFLVNAARGGLVDEKALAQALKEGRIRGGSPGCARVRAFQLRSRPAERRTKSHLHAAHGLV	2091638	2208792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2091718_2162248_2162405_2196944_2197100_2197377_2197523_2200369_2200577_2203904_2204120_2204549_2204682_2205213_2205342_2205810_2205929_2207459
872852	contig_10319_pilon	-	3166	15	Intergenic	novelGene_147236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	50.1778469698592	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	349	2934	250190	37254	FALSE	15	AATACTTGTTGTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDCSTSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPIDLLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAVLQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPRYGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFTEDESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDSRRSIFNMANKKNNAGTQEAGTENKGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDAKQKTVDIAEGTLCPKDHRHLYIDNSYNSDELNPQLAQPGDAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKPQESPRGAKVSFIFGDLALDDGMSPPTLGYERLLDESPEMLEKQRNLYISSANDMKNLDLTPDAEGIQFVANSVYANIGDVKNFGATEGIEEPLLHDICYAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEIDQPPILNLAGSSDDIIDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGFRDSSDEEDSQSQAASFCEDKEQGSNLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLEALEALSVSEEQQTSDNSGSFMIVTFIH	251689	37021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_38351_44263_44406_46664_46848_47681_47772_50320_50448_52732_52870_59106_59227_63369_63502_67769_67878_71419_71525_79991_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
872853	contig_11227_pilon	-	2915	5	Intergenic	novelGene_163210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	3.60555127546399	45	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	946	1560	449095	438653	FALSE	40	TGACTAAGTTATACTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYYTVFYHVQEQLPRDCFVVSEGANTMDIGRTVLQNYLPRHRLDAGTFGTMGVGLGFAIAAALVAKDRHPGQRVICVEGDSAFGFSGMEVETICRYNLPIILLVVNNNGIYQGVDASSWKEMLNFREAAAMAPPFCLLPNSHYEQVMTAFGGNGYFVQTPEELRKSLRQSLADTAKPSLINIMIEPQAMRKAQDFHWLTRSNM	450040	437297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_438686_442909_443097_446712_446821_448206_448366_448967
872854	contig_9548_pilon	-	3276	6	Intergenic	novelGene_141078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	25.4039367028026	74	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	951	2853	423	3275	295913	254869	FALSE	25	AATCACTGACTTCTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCLAAGLGLEVVCQGGDEEDTRLLQLFRAAPDPSEAFQALQAALPRRGGRLGFPRRKEVLYRALGRVLVEGGSDEKRLCLQLLSDVLRGQGEAGQLEEAFSLALLPQLVVSLREENPALRKDALQILHICLKRSSGQVLRTLIQQGLESTDAQLRASTALLLPILLTPEDLLHGLDLTEVIISLARKLGGQEIEEAAETAFSALQQIGERLGQERFQSYISRLPSALRRHYNRRLESQFGSQVPYYLELEASGFPEDPLPCAVTLSNSNLKFGIIPQELHSRLLDQEDYKNRTQAVEELKQVLGRFNPSSTPHSSLVGFISLLYNLLDDSNFKVVHGTLQVLHVLVIRLGEQVQQFLGPVIAASVKVLADNKLVIKQEYMKIFLKLMKEVGPQQVLCLLLEHLKHKHSRVREEVINICICSLLTYPSEDFDLPKLSFDLAPALVDSKRRVRQAALEAFAVLASSMGSGKTSILFKAVDTVELQDNGDGVMNAVQARLARKTLPRLTEQGFVEYAILMPSSAQGRSSHLAHGADTDWLLAGNRTQSAHCHCGDHTRDSMQIYGSYSPTICTRRVLSAGKGKNKLPWENEQPGIMGENQTSNAKDIEQFSTCDFIPSPKLKPSQGMPVNDDLCFSRKRVSRNLFQNSRDFNSDSLPVCAGTTGTHQTNLSGKCGQLGFSQIGGKTGSLDSDLQFLGTANSHQDKVCTSLNFGSKTQQTFGSRTEQTLSYSGPNPSPGAFILPSYPLSSPRTSPKHISPLTGSPKKCQDNSINFSNSWPLRSFEGLSKPSPQKNLVSQKASDFTGENSQGKPSPVQLTPALVRSPSSRRGLNGIKPVPPIPRGISLLPDRADLSTVGHKKKEPDDIWKSEKDSLTIDLSELNVKDKDVDQEEMQSSLRSLRNSAAKKRAKLSGSTSDLESPDSAIKLDLTMDSLSRSSSPNITSYNESGVYSQ	296335	254867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_255052_257865_258129_259919_260217_263390_263526_266626_266781_294092
872855	contig_15500_pilon	-	3002	1	Intergenic	novelGene_128976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1598	1912	164468	164154	NA	55	AAGAATCACATTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHSISWRVYHTYNWRFITTKKDINKETHRMRSGRGSSAEIPCPLRIRDSPKSRCSHQPGSSSEPPYSRLSAFPHGHDRLPPHNKLHYRPALSNILPVKFKSHM	166065	163063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_163100_166100
872856	contig_4736_pilon	-	5126	26	Intergenic	novelGene_168633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_25	75.6307239156151	135	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	991	2976	52	3027	402380	276145	FALSE	25	TAGTGGGGTGGGATGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGAAAGSSAYPAVCRMKIPAALPVAAAPYPGLTEAGVVGTLSGGASYAPGLLGAGGATAGVAGAAAPGPGGDMALTKGTTSLPAETLGPGGGFPPLPPPPQLPTFGAGLGTVDEGDSLDGPEYEEEEVAIPLTAPPTNQWYHGKLDRTIAEERLRQAGKPGSYLIRESDRRPGSFVLSFLSQTNVVNHFRIIAMCGDYYIGGRRFSSLSDLIGYYSHVSCLLKGEKLLYPVAPPEPVEDRRRVRAILPYTKVPDTDEISFLKGDMFIVHNELEDGWMWVTNLRTDEQGLIVEDLVEEVGREEDPHEGKIWFHGKISKQEAYNLLMTVGQVCSFLVRPSDNTPGDYSLYFRTNENIQRFKICPTPNNQFMMGGRYYNSIGDIIDHYRKEQIVEGYYLKEPVPMQDQEQVLNDAVDGKEIYNTIRRKTKDAFYKNIVKKGYLLKKGKGKRWKNLYFILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAREGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSNKTKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREINMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLAHLLNILSELVEKIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPETTDHSRTDLSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR	402431	274045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_276229_277793_277929_280795_280874_282310_282400_283924_283993_286746_286834_287679_287796_289155_289299_290404_290565_290900_291074_292434_292512_293020_293179_295352_295431_298861_298950_304460_304618_305353_305475_311001_311081_315018_315170_317912_317966_322089_322122_325687_325806_332998_333070_333701_333838_334824_334978_401967_402220_402261
872857	contig_5945_pilon	+	1717	3	Intergenic	novelGene_104544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	42.5	1242	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	627	1442	196496	208897	FALSE	45	ATTGTTAACTCCAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALLGLKPEVQDTCTSLGLMLSVVLFMGLARVIARQRLHSPKAHAFVLEFLATFQLCCCTHELLVLSEQDPANPTWPLTLIYFFSLVHGLTSVGTASNPCGVMMQMMLGGMSPELGAIGLLAQLISALCSRYCIGALWSLRLTKYHVSERSFACRNPIHVDLPKAVVIETIFSFIFHSALLHFQEIRTKLRIHLLAALITFLVYAGGSLTGAVFNPALALSLHFKCFDEAFSQFFIVYCLAPSLGILFMVLMFSLFLPRLYNNHIINKKE	195869	209172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_197115_205293_205411_208817
872858	contig_6825_pilon	-	3800	1	Intergenic	novelGene_155118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1487	1855	31733	31365	NA	65	CCCTGCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLRMLLSPPILQVLLTVTDGNMNSSHHHALLLSSGTFSSLVEFHPTHMQIILSQRPEGTPLQICGALSEQLTFLWYSALQILATLGSPKSLSPQLRETAGLYLGSSTLHCIGNSPGCNLG	33219	29419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_29400_33200
872859	contig_12201_pilon	-	2821	8	Intergenic	novelGene_159971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_3	236.747605207378	811	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	253	1122	138975	110501	FALSE	30	ATGCATAATTGACGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLTVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFLFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLENDPGSNEDTDIPKGYMDLMPFINKAGCECLNESDEHGFDNCLRKDLTFLESDCDEQLLITVAFNQPVKLYSMKFQGPDNGQGPKYVKIFINLPRSMDFEEAERSEPTQALELTEDDIKEDGIVPLRYVKFQNVNSVTIFVQSNQGEEETTRISYFTFIGTPVQATNMNDFKRVVGKKGESH	139227	108801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_-_110531_117214_117320_120742_120916_122310_122381_124329_124453_130805_130980_132873_132971_138877
872860	contig_9919_pilon	-	5224	1	Intergenic	novelGene_137979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATCCCAGCTGAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620472	615248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_615200_620500
872861	contig_10477_pilon	+	2079	4	Intergenic	novelGene_112489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	331.512024249834	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	117	2030	243198	260720	FALSE	45	GAGAAGGCAAATAAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAPSVSCLLLAVLFSAGCKVITSSDQMCTEKEANKIYNCEYLGLSKIPDILPNTTEVLEFGFNFLPAIQNTTFSRLINLIFLDLTRCQINWLHEDTFQSHHQLNTIVLTGNPLIFMAETSLNGPKSLKHLFLTQTGISDLEFIPVHNLENLESLHLGSNHITSIEFPTNFPTQNLKILDFQNNAIHYLTRKDMDSLKPATNLSLNLNSNDIKGIEPGAFHSKIFQNLNFGGTFDLSVILKGLQNSTIQSLWLGTFEDKEDQDLSPAILQGLCEMSVESINLQQHHFSDFSSATFQCFTQLQELDLTATHLKELPSGIKGMNSLKKLVLNVNNFDQLCEISAASFPSLTHLYIKGNRKKLDLGAGCLERLENLQKLDLSHNGIEASDCCNLQLKNLPHLQCLNLSYNEPLGLQSQAFKESPRLELLDLAFTHLHVNVPQSPFQNLQLLQVLNLSYCLLDTSNHHLLAGLPNLRHLNLQGNRFQDGSIPKTNLLQTVGSLEILILASCDLLSIDQQAFHGLEKMCHVDLSHNSLTGDSISALSHLKGIYLNLAANNICIVSLHVLPTLSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWFKENLHKLEGLEETMCANPPPLKGVKLSDVKLSCGITAHSVSFFN	243081	260769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10477_pilon_+_243291_255104_255272_259025_260656_260696
872862	contig_7009_pilon	-	4022	5	Intergenic	novelGene_23597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	259.117733858569	80	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2660	3049	424924	424535	TRUE	20	GCCATCCACTTATGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKILNILWTAKIMNKSVLEVQPDCSLEARMTRLCLAYFGHGIRRDQSLEKDIMLDKVEGQQKGERPSARWTDTVVEIMASNIAIITRMVQDQATFCSVMRRVSTNWNRLDDMAPTNKQCSGLALLS	427583	415575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_415783_415969_416095_418563_418848_423185_423469_424460
872863	contig_8660_pilon	-	1033	3	Intergenic	novelGene_136494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	1352	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	315366	308633	FALSE	35	TTACTAAATTGAAAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPKGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315366	307980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
872864	contig_19459_pilon	-	1265	8	Intergenic	novelGene_59840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	144	929	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19131	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16241_18988
872865	contig_3822_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_133294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGGAGCTAAGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263994	261451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_261500_264000
872866	contig_6710_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_97666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	50	ATATTTGTGGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872867	contig_8453_pilon	+	6596	1	Intergenic	novelGene_125117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	4893	5273	117120	117500	NA	30	ACACCTTGAGTCCAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKKNHQIVQKASDVIKKTGLDGYNSVKICKLSLRVLLSPVAHHVFLGLILIPPAPLQTPAITTSGRLLFQSLPFLLISVTTSRSRPLPTFTWSTQLPRLTPAQICSLQMAKVICLNRKPDHYWA	112227	118823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_112200_118800
872868	contig_5013_pilon	-	1800	5	Intergenic	novelGene_110082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	659	junction_2	49.7242395618073	2423	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCTGTCTTGTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216629	173544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933_187998_205757_205926_216282
872869	contig_15407_pilon	-	4207	1	Intergenic	novelGene_123079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAATCCTGAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461160	456953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_457000_461200
872870	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_94095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	40	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
872871	contig_8606_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_159402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCAACATGACACTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109884	112518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_109900_112500
872872	contig_987_pilon	+	1265	10	Intergenic	novelGene_72296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_9	389.915597071348	2246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	124	1020	945420	967663	TRUE	30	ACATGCTATTGTAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRASLAGVSAWALQPQWTQVRNMATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD	945296	968568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945476_956426_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_967656_967694_968353
872873	contig_13428_pilon	-	2785	1	Intergenic	novelGene_143441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60395	57610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_57600_60400
872874	contig_9433_pilon	+	4402	2	Intergenic	novelGene_168508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	49	junction_1	0	56	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21058	83027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9433_pilon_+_21140_78706
872876	contig_4732_pilon	+	2025	4	Intergenic	novelGene_75417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	190	junction_1	245.66779737415	459	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	68	520	596758	607400	TRUE	0	CCTGCGCCTTTGTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAGEQVGPS	596690	609494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604218_607183_607907_608495
872877	contig_7234_pilon	+	1731	6	Intergenic	novelGene_145915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	46.2756955647346	1211	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	101	916	274878	282039	FALSE	20	AGCCCCAGCATTCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRWARVSTSHNKRPLAATSWEDMKKGSVEGTSQSLPKGKQLEAKRLSLRNDTLQTKHKKNKKKKEYLNEDVNGFMEYLRQNSQTAHNGEMIATASQEIREEIAIALKKDSRREGRRLKRQAAKKNAMVCFHCRKPGHGVADCPAALENQDTGTGICYRCGSTEHEITKCKAKVDPALGEFPFAKCFVCGEMGHLSRSCPDNPKGLYADGGGCRLCGSVEHYKKDCPESKNSDKIVTVGRWAKGMSADYEEILDAPKPQKPKTKIPKVVNF	272352	282854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_272427_274851_275262_278167_278319_278545_278639_280560_280630_281920
872878	contig_12886_pilon	-	3227	1	Intergenic	novelGene_135524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2793	3146	810017	809664	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQLRDIKSPNHKPIGAGPWPPHCLSVPGGLLAQQCSLDSLLSRQQQHKLPFPQEADWLLELAKSPSWGFPGSVSVLDSWATLPKWLHQMAGSLSFPQIYTSSCIYLGKMTDLRIF	812809	809582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_809600_812800
872880	contig_5479_pilon	+	4527	1	Intergenic	novelGene_133566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCACCCAGCAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92661	97188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_92700_97200
872881	contig_6059_pilon	-	3294	1	Intergenic	novelGene_44807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1530	1850	435701	435381	NA	70	AGGAAACATCAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLEQTLKECRTARQPNRGRAYQAERKASAEAEVEAHQSCWRTSREASESEQSEGRRNEVKEVMGPGQDFGFYSESGERSLESFEQRSDVIQLNVLKGLFWLLC	437230	433936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_433900_437200
872882	contig_10163_pilon	-	5011	1	Intergenic	novelGene_82642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACGATCCAAACTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158673	153662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_153700_158700
872883	contig_709_pilon	-	2810	2	Intergenic	novelGene_57591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAAGTTGCCCTTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2243950	2240990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2242385_2242534
872884	contig_3601_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_132930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTTGTCAGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362787	364263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_362800_364300
872885	contig_11720_pilon	+	1550	5	Intergenic	novelGene_43999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	427.234127850292	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	1099	1548	266216	268023	FALSE	20	GGGGAGGGAGATGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAVRQTFPTRPHPCLPPHTPLASSAGNSGNVLPCTPGTG	264371	268025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_264427_264816_265816_266171_266240_266453_266610_267753
872886	contig_3942_pilon	-	4747	10	Intergenic	novelGene_128841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	141.042503006438	442	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	66	1604	1300812	1290904	FALSE	5	TGTTGGCTGTACTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDVIVLSDGEQPASPRVNGLMKVALTETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAKLVLLKKLRQSQIQKETTAQKPPGSSASSVSTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQASSARMPGSVIPPPLVRGGQQVSSKPGPQPNAQVVMPPLVRGAQQIHNIRQHSGTGPPPLLLAPRASVPSVQIQGQRIIQQGLIRVANVPNAGLLVNIPQASPASLKGTTATSAQTGTTTTGTAATAAPGDSPASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMSFLPSAANNEFIYLVGLEEVVQNLLETQAGKVSAATALLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCETCMTSSQKRALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEMEQRLLQQGAPTQAKAEPTTAPHPTLKQVIKPRRKAAFRSGEARNWTNGAELQASSQLSRGPAATPRSVLHTFSQSPKLQNAAAALATRTGKHSERVVGSSKGSATAGWKKAALSAGGALAFVSPGLAVHKASSAVDRQREYLLDMIPPRSIPQSATWK	1300877	1287760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1291035_1293054_1293245_1293538_1293614_1294179_1294479_1295607_1295888_1297962_1298131_1298250_1298383_1298938_1299029_1300490_1300623_1300770
872887	contig_1309_pilon	+	1492	8	Intergenic	novelGene_73976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	238.667388742114	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	310	1056	294293	311149	FALSE	25	TTTGAATCGCTTGAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGGGRASRRGSGCARSKRRALGWLPPARCPAVRRECPGNSCGSPTPQILRVKLCGNLKYYLSPLYSTVVPPDEITVNYRYGLPLITLPLPSRRERCQFVVKPMLSTVGSFLQEIQNEDKGVNTVAVFTADGSKIPASTLMGILLMNDFKLVINKITYDVQCPKQEKLSSEHATEMETMMSLVHRLFTAIHFDEYRKKKENHLLEKIDRLKKQLQPLEQLKARVEGRCEASISRLLWTGLALLSVQGGALAWLTWWVYSWDIMEPVTYFITFANTMVFFAYFLVTRQDYTYSAVSGRQFLHFFYKKSKRDHFDVEQYNKLKDDLDEAKEALKRLRHILYFRLPVEELNDKS	209403	311585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_209548_293631_293708_294203_294375_300418_300524_306112_306274_308166_308371_309390_309508_311071
872888	contig_6740_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_142700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCTATAAGTCAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643275	645348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_643300_645300
872889	scaffold_16539_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_68304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_2	185.5	90	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	44	1057	104412	98524	TRUE	25	CTCAGAGCTGCACTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSSSEPLEPGRARMGVESYMPCPLLPSYHCPGVPGEASAGTGTPRATATSTTTSPLREGFGGQDGGELRPLRSEGAAALVTKGCQRLAAQGARPEAPKRKWAEDGGDAPAPSKRPWARQEHQEAEEEGGRACGSGSGEASAGLREDVLPTALERLALDYIVPCMRYYGICVKDSFLGPALCGHVLAEVEALKRAGRLCDGQLVSQRAIPPRSIRGDQIAWVEGHEPGCRSIGALMAHVDAVIRHCAGRLGGYVINGRTKAMVACYPGNGLGYVRHVDNPHGDGRCITCIYYLNQNWDVKVGCRVGGVRHSLHFPLPTRILRFSCPQHTGGGAICWLFLGNGTSSSFLADW	104455	96913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97890_98114_98800_103674
872890	contig_4402_pilon	+	3327	1	Intergenic	novelGene_140806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAACTTTATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250637	253964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_250600_254000
872891	contig_6266_pilon	-	2705	2	Intergenic	novelGene_170985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATGGTCTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305174	301874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_301956_302550
872892	contig_15752_pilon	-	3123	1	Intergenic	novelGene_148792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACCAAAAGGTCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402500	399377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_399400_402500
872893	contig_18231_pilon	+	2966	1	Intergenic	novelGene_105878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACAGTGTGTGCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227534	230500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_227500_230500
872894	contig_14925_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_55369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129481	128111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
872895	contig_14142_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_120561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	433959	433555	NA	35	GACCAAAAGTATTGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLLPHFTLLLPYLSILFSNQSQLQPHVTQLLTDFSQLLANLSQLLSNLSKLLSNVSQLFSDFPELLADVTQLLTNLSQLLANVSQLLANISQLLADVTQLFSHLPQLLTDISKLFTYISKLLANFPKLLTHQP	433961	432448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_434000
872897	contig_205_pilon	+	2965	1	Intergenic	novelGene_144321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTCCAATACAAGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299579	302544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_+_299600_302500
872898	contig_3426_pilon	+	6122	1	Intergenic	novelGene_57979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTTTCTCTTTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584568	590690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_584600_590700
872899	contig_9535_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_124473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	355	1068	12	1079	266613	267680	NA	40	AACTTTCATTAATGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESLMHQFTIVSFHPSRRLHRNREDYVERSAEFADGLLSKALKDIQSGALDINKAGILYGIPQKTLLLHLEALPAGKPASFKNKTRDFNDSYSYKDSKETCAVLQKVALWARAQAERTEKSKVNLLETSELKFPTASSYLHQLTLQKMVTQFKEKNESLQYETSNPTVQLKIPQLRVSSVSKPQPDGSGLLDVMYQVSKTSSVLEGSALQKLKNILPKQNKIECSGPVTHSSVDSYFLHGDLSPLCLNSKNGTVDGTSENTEDGLDRKDNKQPRKKRGRYRQYDHEIMEEAIAMVMSGKMSVSKAQGIYGVPHSTLEYKVKERSGTLKTPPKKKLRLPDTGLYVTDSGTGSCKNSSKPV	266601	268850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_266600_268800
872900	contig_16635_pilon	+	4286	1	Intergenic	novelGene_153132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49784	54070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_49800_54100
872901	contig_12756_pilon	-	3448	7	Intergenic	novelGene_153217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_6	220.896657587509	34	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1950	1497	3446	169353	162564	FALSE	25	CCCAGCATCAAGATTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIVKNVGREYLTAFTKNLVATFICVFEKVDENTRKSLFKLRSTWDEIFPLKKLYALDVRVNSLDPAWPIKPLPPNVNTSSIHVNPKFLNKSPEEPSTPGTVVSSPSISTPPIVPDIQKNLTQEQLIRQQLLAKQKQLLELQQKKLELELEQAKAQLAVSLSVQQETSSLGPGSASKLHVPQIPAMAVKAPHQVPVQSEKSRPCPSLQIQDLKGTNRDPRLNRMSQHSSHGKDQSHRKEFLMNTLNQSDVKTSKTIPSEKLNSSKQEKSKSGEKITKKELDQLDSKSKSKSKSPSPLKNKLSHTKDLKNQESENVRVSDMSKRDPRLKKHLQDKTDSKDDDVKEKRKATEKKDKDEHMKSSEHRLIGSRNKIINGIVQKQDTVTEESEKQGTKPGRSSTRKRSRSRSPKSRSPIIHSPKRRDRRSPKRRQRSMSPTSTPKAGKIRQSGVKQSHMEEFTPPSREERNAKRSTKQDVRDPRRIKKTEEERPQETTNQHSTKSGTEPKENVENWQSSKSTKRWKSGWEENKSLQQGDEHSKSPHLRHRESWSSTKGILSPRAPKQQHRLSVDANLQIPKELTLASKRELLQKTSERLASGEITQDEFLVVVHQIRQLFQYQEGVREEQRSPFNDRFPLKRPRYEDSDKPFVD	170849	162561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_162653_163580_163672_163793_163975_164382_165498_166624_166820_167174_167364_169263
872902	contig_9363_pilon	+	2816	9	Intergenic	novelGene_6841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_4	48.5019329511722	534	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	238	1977	1633190	1642643	FALSE	5	TGTTGTACCTGGGCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKPETTVASGVTARASAVTPGQVTSGHGAAASTSASAGPVPEDPSGPGTGPPGTNEALVAVVTVTPALEPAENSQDLGSMSSLGPGIPGPRGQAPDTLSYLDSVSLMSGTLESLADDVSSMGSDSEINGLALRRTDKYGFLGGSQYSGSLESAIPVDVARQRELKWLEMFSNWDKWLSRRFQKVKLRCRKGVPSSLRAKAWQYLSNSKELLEQNPGKFEELERAPGDPKWLDVIEKDLHRQFPFHEMFAARGGHGQQDLYRILKAYTIYRPDEGYCQAQAPVAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICDKYLPGYYSAGLEAIQLDGEIFFALLRRASPLAHRHLRRQRIDPVLYMTEWFMCIFARTLPWASVLRVWDMFFCEGVKIIFRVALVLLQHTLGSVEKLRSCQGMYETMEQLRNLPQQCMQEDLLVHEVTNLRVTEALIERENAAQLKKWRETRGELQYQPSRRLHGSRAIHEERRRQQPPLGPSSSLLSLPGLKSRGSRAAGGAPSPPPPARRASAGPAPGPVVTAEGLHPSLPSPTGNSTPLGTSKEARRQEKERQKQEKESEKERQKQEKEREKQEKERQKWEKEQEKEQQKQEKERQKQEKERQKQEKERQKQEKKAQGRKLSLRRKADGPPAPQDGGDRSSASEARQDAYF	1632952	1643482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1633402_1636546_1636647_1636951_1637060_1637157_1637265_1640657_1640773_1640898_1640965_1641167_1641358_1641713_1641869_1641956
872903	contig_7457_pilon	+	1708	10	Intergenic	novelGene_31344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	293.356059725682	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	39	542	285206	286909	TRUE	25	TAACTGCCCAGAGGTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSENQRL	284504	291255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286845_286891_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
872904	contig_10163_pilon	-	4367	1	Intergenic	novelGene_82624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3901	4212	87835	87524	NA	25	CACGACTGGGCAGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGGRKNQLGDSFSGRNIQESHGPGAGTEAAAASTVGGADSGEGGKGSREKGIQASGAPRVVGRWARGRVFGEERTEAAVVNWKTPAPKPSHLRGWGRTATAV	91735	87368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_87400_91700
872905	contig_6654_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_85735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429216	426948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_426900_429200
872906	contig_5400_pilon	+	2625	1	Intergenic	novelGene_162821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATGAAAACCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264548	267173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_264500_267200
872907	contig_4891_pilon	+	3329	7	Intergenic	novelGene_124562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	544.229935066257	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	98	700	701017	752695	TRUE	5	GCCGGTCTCCCACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWTPLNTSRCSYLRGVRD	700919	756979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_752643_754766_755867_756027_756579
872908	contig_6048_pilon	-	2589	2	Intergenic	novelGene_73349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	9	350	2975508	2975167	TRUE	15	TGGTTTGTGTCAGACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMSTAMNFGTKSFQPRPPDKGSFPLDHFGERRTPAVRARRSRPNSEVQALVCRRRKLRPRRACGPRAGPQPGPHPPQVLARTPSPSPGPRAQARSQGRAPRPPSACSGRILIPR	2975516	2967993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2968735_2973668
872909	contig_1596_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_131604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGGGTTTTATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139494	137090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_137100_139500
872910	contig_11702_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_142010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	56	415	524066	523707	NA	25	GTAGGTGATTTAGAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESESIPLENGNQTRMPFITTLIQHCIGSPSWSSKARKGNKGIQTGKEEVKLSLFTDDMILYIENPNDSTRKLLELIEGFGKIAGYEINVQKSVGFLYIKKENFKKENNTICNVVVRCH	524121	521649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_521600_524100
872911	contig_11338_pilon	-	2130	17	Intergenic	novelGene_6292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.262401165187	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	79	1953	250534	196726	FALSE	15	TTTCTCTTTGCTATGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	250612	196548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207335_207394_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_250509
872912	contig_17344_pilon	-	3192	1	Intergenic	novelGene_169595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTCTGATAGTATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85592	82400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_82400_85600
872913	contig_1867_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_54556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1324	1632	432333	432025	NA	30	TTTTTATGGGCAATAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPPVSVRPLSLVFLLEFEFGTPLFLFSIRDSLLYSLSGWSLAVAGHLGCNLYGSRLTGFSSTAPPGESKLPTFHSVIKHKLFVLPRDLCYDTVAIKTV	433656	431276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_431300_433700
872914	contig_5019_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_109214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	113.623281065106	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	186	554	307180	357746	FALSE	35	CTAAGGTAAGGTTGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIFIRNRNILHLRRTYILDRPKSQQVRTSSTIRRTSSLDTITGPYLTGQWPRDPHVHYPSCMKDKATQTPSCWAEEGAEKRSHQRSASWGSADQLKEIAKLRQQLQRSKQSSRHSKEKDRQSPLHGNHVAISHTQATGSRSVAMPLSNISVPKSSASRVPCNVEGISPELEKVFIKENNGKEEV	235939	357747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_235994_307048_307201_326512_326600_353157_353272_357599
872915	contig_11413_pilon	+	3719	1	Intergenic	novelGene_103162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1056	3171	347	3517	371663	374833	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKKKKPKQKRYSQPRAGGLWDDDSADEPKSHSFAADPQKSGVLPSQSTTMGTEYGPVSKENLKKECVVDSRAAKLIAENFVSESLKVPLCPSEEPLKSELNSQPRLRVESEVKGNKSVPLSQDKKLLQQDECKPQPVPQLKTPVPKSQEINSFNLKGPLSEISAHHLETPLEIRPKEGHSPVLNQEVKGSMSRPTTAKELPNLIPTLTANNPLESILQEGDDESKMTKLQNIKQEQFSEGAEEVKELKKEAFPKQKQEISVFVSEQLQGKVLDQIPELGNEPFKRIAGDGKSRKGRGSSGKVRANSGKVRARPELSCPIDSQKYSMADLVPSEPALKPEQMAAGGKNEELGLDSSKQPGTMADLIEAVVMGEPKEKTDPMVPLIPLGNQSGITQISGGSTERGAVAIDMGVSNQSKEGKCPWMDSEAAPWISEKPKKRGNEGKNKKFKNSYSIQPARMESKAEILRPPFEGNDGAAGSSPHKNKELGLSFPKMRDPLFSDTSSTPTVELVDRKGRNVEASSFELGALSENKTSTVKDCAVTQSAAMVTDVSCQDQIQGVEFIPLVLSEESKTDAAKEQTAVADKPNKRSDDGKSKKVKNNFPQKHILENKIDAAKIHVPMETTEDHRIEGLGYVDENRNITFTCPRIPPGLMNKSAPLEAMESAANEKLPISTPQVVKEGDFFPDTLAESGQEAAPAQISKLVVVDDCSKDGVPDQERPKAPSTVMPSTNTGVALIFPAAIETVGSHGNHYSKNKGELAYPMKNEEGINGGHVVGKSESVHSGASEHLIEKTTEPAKGHVLPRAPEDHSLPGEVRVLEACADRGNFPACPVKKEKETEEGSAPAQIPGLLGDKAQKPSSCEDQNAECRDSKDSDSLNKGVDVTLLPAKSKKDELKEMSLACKITELEYASLVTRDLQSNFLCGEVEAPPSGMVDELVVTAPKGLQLPEPKDKILEAPLKRTEISEPVALGEGKKENKSRMAEPVKGYMRPTKSRGLTPLLPKSTIQERERSKQRKSIGMNQPLLGKCVCLRLLSQHQKGRKLVPWFHSNSNHPC	371316	375035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_371300_375000
872916	contig_5136_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_126611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAACGTGTGTTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189258	187566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_187600_189300
872917	contig_602_pilon	+	2789	1	Intergenic	novelGene_134974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGGCAAAGTCCAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583268	586057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_583300_586100
872918	contig_12965_pilon	-	3016	2	Intergenic	novelGene_65198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1458	2054	307804	307208	FALSE	60	CTTGGAGACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFGELSSLMEAESESEIERSGQHLPEMHSDLGDLGTVNDSSPHNEGSSEDWQAQEDSTGMRGENDTMQPHAQNSDSRGDRQLRNANNLVETGTLPILRLAHFFLLNEGDDDNRSRGLTKEQIDNLSTRNYEHSSIDSELSKICSVCISDYVTGNKLRQLPCMHEFHIHCIDRWLSENCTCPICRQPVLGSSIANSG	315882	306245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_308971_315591
872919	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_96234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
872920	contig_5698_pilon	-	2028	7	Intergenic	novelGene_55040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAATTTAAAGGAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20873	7894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_8025_11129_11209_11790_11869_17145_17219_18789_18851_19227_19271_19309
872921	contig_10511_pilon	+	3438	3	Intergenic	novelGene_126899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCCCACCACCATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139287	158964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_+_142383_147095_147250_158775
872922	contig_8254_pilon	-	4363	1	Intergenic	novelGene_48378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTATAAGTTAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68589	64226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_64200_68600
872923	contig_13224_pilon	-	3410	20	Intergenic	novelGene_104120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_17	230.07913849869	155	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	12	2918	387941	370411	FALSE	25	AAATTCAGTGGCTGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTLTATEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPSHPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALELLTQEFGIPVERLYVTYFGGDEATRLEPDLECKQIWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAYLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNRETDGILKPLPRKSIDTGMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGTGARPYTGKVGADDADGIDMAYRVLADHARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRYSHEKLNANRGFFATLVDVVIQSLGDAFPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILDRKIQSLGDSKTIPGDTAWLLYDTYGFPVDLTGLIAEEKGLVVDMDSFEEERKLAQLKSQGKGAGGEDLIMLDIYAIEELRSKGLEATDDSLKYNYHSDSSGSYVFENAVATVMALRRDKMFVEEVFTGQECGVVLDKTCFYAEQGGQIYDEGYLVKVDDSSEDKAEFTVKNAQVRGGYVLHIGTIYGNLKVGDRVRLFIDEPRRRPVMSNHTATHILNFALRSVLGEADQRGSLVAPDRLRFDFTAKGAMSTEQIKEAEEIANQMIEAAKPVYTQDCLLAAAKAIQGLRAVFDETYPDPVRVVSIGVPVSELLEDPSGPAGSLTSVEFCGGTHLQNSSHAGTFVIVSEEAIAKGIRRIVAITGAEAQKALRKAESLKKSLSVIEAKVKAQTTPNKDVQREIADLGEALATAVVPQWQKDELREHLKSLKKIMDDLDRASKADVQKRVLEKTKQLIDSHPNQPLVILEMESGASAKALNEALKLFKTHSPQTAAMLFTVDSEAGKITCLCQVPQNAANQGLKASEWVQQVSGLMDGKGGGKDASAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQLHLGDLKN	387952	369918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_370597_371043_371158_371535_371623_371752_371873_373081_373196_373800_373910_375324_375510_376018_376226_377135_377250_377836_378016_378879_379025_379676_379802_380898_381050_381210_381320_381918_382065_382412_382558_383096_383289_384757_384904_385250_385440_387797
872924	contig_5419_pilon	+	5226	4	Intergenic	novelGene_15532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	85.7217721598324	285	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383909	396617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_384067_384571_384735_388326_388441_391825
872925	contig_9146_pilon	+	502	3	Intergenic	novelGene_79487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	180	323	502	142828	143584	FALSE	45	AAAGTCAGGACCACAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHVKKKLYYFYNSHLCFLARCLRSRCFLGWGFLALLSFWRPSLLSWSFLLLACCLFFLGRSLLACSGHLLCWNLCSSCCCSCSCSLCSSCFFGRSFQESCPLKLLNFMLYYSVPHFLCLHDFITIKIRHLGFLFSGFNLLGPSCGCPFCTDICLLPGLSDILLAGTR	142505	143584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_142849_143321_143378_143481
872926	contig_4769_pilon	-	4792	1	Intergenic	novelGene_117987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	394	720	845828	845502	NA	30	TTGAAAGCAATGGCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVGAVIKPRPFHSLFQVTDTAPVPFEGKEFSKQATKRTWPESPAHRLKMPQTLLLKTEKPDHPPQGSSIPCHNWATAKALLFIPSFQNKTAWLIPVTCLDFLCVKL	846221	841429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_841400_846200
872927	contig_9070_pilon	-	3303	2	Intergenic	novelGene_171947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCTCTTTTGAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125586	122102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_-_124875_125055
872928	contig_7887_pilon	+	2085	2	Intergenic	novelGene_124913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3975	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGGTGGGAGCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543177	545347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_545015_545099
872929	contig_2704_pilon	-	3231	27	Intergenic	novelGene_75292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_26	95.1771938273664	235	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1038	3114	117	3230	125845	8114	FALSE	5	GTGAGTGTGCCCTCCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQVTLEDALSNVDLLEELPLPDQQPCIEPPPSSLLYQPNFNTNFEDRNAFVTGIARYIEQATVHSSMNEMLEEGQEYAVMLYTWRSCSRAIPQVKCNEQPNRVEIYEKTVEVLEPEVTKLMNFMYFQRNAIERFCGEVRRLCHVERRKDFVSEAYLLTLGKFINMFAVLDELKNMKCSVKNDHSAYKRAAQFLRKMADPQSIQESQNLSMFLANHNKITQSLQQQLEVISGYEELLADIVNLCVDYYENKMYLTPSEKHMLLKVMGFGLYLMDGSVSNIYKLDAKKRINLTKIDKYFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHYEENKSRWTCTSSSSSPQYNICEQMIQIREDHMRFISELARYSNSEVVTGSGRQEAQKTDAEYRKLFDLALQGLQLLSQWSAHVMEVYSWKLVHPTDKYSNKDCPDNAEEYERATRYNYTSEEKFALVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNHAIRHTVYAALQDFSQVTLREPLRQAIKKKKNVIQSVLQAIRKTVCDWEAGREPFNDPALRGEKDPKSGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLEGPTILDIEKFHRESFFYTHLINFSETLQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEASMMEYVLYSLDLYNDSAHYALTRFSKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKVMAGSLLLDKRLRSECKNQGATIHLPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRVSAAVYKSLELAIGRFESEDLTSIVELDGLLEINRMTHKLLSKYLTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNYDFLPNYCYNGSTNRFVRTVLPFSQEFQRDKQPNAQPQYLHGSKALNLAYSSIYGSYRNFVGPPHFKVICRLLGYQGIAVVMEELLKVVKSLLQGTILQYVRTLMEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIVEYAELKTVCFQNLREVGNAVLFCLLIEQSLSLEEVCDLLHAAPFQNILPRVHVK	172983	8112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_8186_12969_13101_14254_14346_15920_16065_40247_40336_53030_53231_64555_64676_68675_68785_69183_69261_70418_70516_71791_71949_72952_73107_75626_75775_77159_77327_79110_79237_79948_80072_92225_92344_95190_95283_110732_110838_112491_112621_112699_112797_122580_122763_123583_123686_124104_124183_125550_125641_125728_125853_172874
872930	contig_987_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_72305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1093	1455	967900	968262	NA	20	TTTTTATCTTTTTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHKEINIEDRDLVTILKILNIHWLRVVVLKLYGLRTPFMLLMSDLIEDSWILIYFCSNSAMMSCIMCPLENPLYASENKTNTNTIMKIVLTSLTHERVHGPKFQNHWCTVTFYNVNSVH	966807	970193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_966800_970200
872931	contig_9505_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_121830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	476	781	440231	440536	NA	55	ATAAATGGAGAAAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPKNGDPTECGNYPTISLISHTSKILLKIIQKRLQQCIDRELLEIQAGFRRECRTRDIIADIRWILAKSREYQKDVYLCFTDHAKAFDCVDHSKLWITL	439755	440929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_439800_440900
872932	contig_10437_pilon	-	2864	11	Intergenic	novelGene_38383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	180.992707035394	79	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1647	1217	2863	668641	648146	FALSE	40	CCAGCAGTACAAGATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVDVCSTETLKCLKDKTGGKKFSKEFEEASSKLEEFVNGLDKQVKNGPSLTEALENAGIFYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSVDAPSPTGSESPFQGMGGEDSPSPTVESEKSATPEPATDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPVEKPAVSTAAPTKPTESVSKGPSSTAAPVTVAVTPPLPKPVSTSLLSSSPALALPNLANVDLAKISSILSSLTSVMKTTGVSPASRPSPGAPTSPSSLPSGLKTSAPATTASHNPLANILSKVEITPESILSALSKTQTQSAPALQGLSSLLQSVTGNPVPASEAASQSTSASPANTTVSSVKGRSLPSNPQTFISKSFSYSPNSSASEVSSTSASKPSIGQSPGLPSTTFKLPSNSLGFPGPHNSTSPVVPPAEVAMCQSSEISKPKLESESTSPSLEMKIHNFLKGNPGFSGLNLNIPILSSLGSSAPAENHPSDFQRGPPSTSMDNTDGTPVRDERGGTPTQDEVMDKPTSSSVDTASLLSKIISPGSST	753757	648144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_648826_652003_652205_653739_654001_655241_655525_665487_665664_668595_668723_669284_669338_670627_670706_671546_671652_701291_701422_752988
872933	contig_16211_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_150077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1478	1939	168649	168188	NA	20	TCTAATTTTATTATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGEKHSSCQGFHFTWIHSKCPWKQQSRNQTMYCTAAKDLSKVLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSIASYACKSWSMNKEDQIRIDCFELWCWRRILTIPWTARRTNESVLEDVQPECSLEARMVRVCLTHFGHVIRRDQSLQKDIMLGKAEGQ	170126	167894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_167900_170100
872934	contig_2009_pilon	-	3970	1	Intergenic	novelGene_165449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACATAGGAGTTGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48352	44382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_44400_48400
872935	contig_16109_pilon	+	3790	4	Intergenic	novelGene_80336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_3	44.2141254452566	60	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	288	608	282776	297573	FALSE	65	GTGTACTACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNPPKQEHLLALKVMRLTKPTLFTNIPVTCEEKDLPGDLFNQLMKDDPSTVNGAEILMLGEMLTLPQNFGNIFLGETFSSYISVHNDSSQVVKDILVKVSDIVV	282488	300755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_282822_295728_295798_296330_296431_297467
872937	contig_6633_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_143168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAATCCTGATACCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82125	80922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_-_80900_82100
872938	contig_3270_pilon	+	3903	2	Intergenic	novelGene_104457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	497	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	81	596	83472	87262	FALSE	20	CAGGGAGTCCGTCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTLASAGSRAPAPRRVLAACHDDSSMAGSELRAELEQRLAALAIRTEVVEHPEVFTVEEMMPHVQHLKGAHSKNLFLKDKKKKGYWLVTVLHDRQINLNNLATQLGVGRGNLRFADEAAMRETLKVGPGCATPLALFCDTGDVTFVLDSMFLEGGHEKVYFHPLTNAATMGLSPEDFLTFVKTTGHDPIILNFDKN	83391	90569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_83556_86830
872939	contig_18919_pilon	+	1729	4	Intergenic	novelGene_156010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACACAAAACATGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58622	167556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_59457_69108_69250_159880_160218_167139
872940	contig_8914_pilon	-	836	6	Intergenic	novelGene_112868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2707.4539331261	12	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	111	794	268130	264566	FALSE	20	GATGCTGTGCTTCTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQSARTSALQKVAKKEPRKKVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268945	264523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075_268180_268884
872941	contig_4125_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_25226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTGGCATTGAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710490	1712197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1710500_1712200
872942	contig_6344_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_157109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTGGCAAGCAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082228	1079794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1079800_1082200
872943	contig_4364_pilon	+	3089	9	Intergenic	novelGene_88	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	44.994270468583	890	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	26	1180	874378	900950	TRUE	15	TACATTTCTCCCTAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPLHGLRPPEGDAGSGSPHAPHPYLTHCEHLSAARLRHGERAESEYAAAPRCPCQRLFV	874352	906849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_874454_881864_881976_895570_895720_896926_897156_897383_897555_898158_898308_900243_900417_900853_900994_904983
872944	contig_11677_pilon	-	2463	3	Intergenic	novelGene_85949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	7750.5	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	549	881	597508	597176	TRUE	20	TTCACCACATATGCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEPLMHVWPGAPTAGIEAKSDRFLSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKSVLPPYTWRNV	598056	594890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714
872945	contig_8866_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_77842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCACCTTTGTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629010	626462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_626500_629000
872946	contig_6227_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_49783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	67	417	1234863	1235213	NA	0	CTCCTGGGTGCTGCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCIFLIKPIVISLIGALKVRYKMQSSSLEAFNYSHHVLLMPEQGSHARPCNGHTLTHTHTRALWRDPSAERSTWNYQCSEQGGAENTAPTWRPHKQLHTVSQPMEMQLQNVFLNREKLESDNRVVTCARESRTDLHPE	1234796	1236434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1234800_1236400
872947	contig_14029_pilon	-	2834	3	Intergenic	novelGene_151951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2435	2737	132140	131838	FALSE	20	ATCTGGAAGCCTTTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRPQTRLERGLYKGTKRLRGQIRPGTCSWLCAGGNWGHNTVQDPLWGPGRASAPHSVQSEGQSPETSSSRGFPPLSRFRSSSPSAPPPRPIQLRAERLT	135611	131740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14029_pilon_-_133296_133405_134317_135243
872948	contig_3789_pilon	+	1928	4	Intergenic	novelGene_79843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	162.406896405294	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	192	647	445610	472341	FALSE	10	CAGTGTTTTCCATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQACYLPWVILGFNYIIGGSVINELIGNLVGHLYFFLMFRYPMDLGGRNFLSTPQFLYRWLPSRRGGVSGFGVPPASMRRAADQNGGGGRHNWGQGFRLGDQ	445418	473622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_467056_467110_468585_468697_472202
872949	contig_16098_pilon	-	646	5	Intergenic	novelGene_45946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1567.21305188542	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	169	645	349429	348289	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGAWIDWRRQSRPSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFSG	349998	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348452_348888_349062_349172_349231_349346_349551_349951
872950	contig_19155_pilon	+	3162	2	Intergenic	novelGene_173362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGCTCATTTAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378479	386820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_378668_383846
872951	contig_6031_pilon	-	3593	14	Intergenic	novelGene_56772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	42.346835039585	73	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	165	2405	505260	406372	FALSE	10	CTTTCTGTCCATGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGPARCVALCSLGIWICEELVHESHHPQIKEALNVICVSLKFTNKTVAYVACNMLHMLVHYVPRLQIYQPDSPLKIIQILIATITHLLPSTEASSYEMDKRLVVSLLLCLLDWIMALPLKTLLQPIHTTGTENDKTEKSVLNCIYKVLHGCVYGAQCFSNPKYFPISLSDLASVDYDPFMHLESLKEPEPLHSPDSERSSKLQPVTEVKTQMQQGLISVAARTVITHLVNHLGHYPMSGGPAMLTSQVCENHDNHYSESPELSPELFESPNIQFFVLNNTTLVSCIQIRSEESMPGGGLSAGLASANSNVRIIVRDLSGKYSWDSAILYGPPPVSGLSEPTSFILSLSHHEKPEEPPTSNECLEDTTEKDGVSLQFKGRFRETVPTWDTIRDEEDVLDELLQYLGVTSPECLQRTGISLNIPAPQPVCISEKQENDVINAILKQYTEEKEFVEKHFNDLNMKAVEQDEPTPQKPQSAFYYCRLLLSILGMNSWDKRRSFHLLKKNEKLLRELRNLDSRQCRETHKIAVFYVAEGQEDKHSILTNRGGSQAYEDFVAGLGWEVNLTNHCGFMGGLQKNKSTGLTTPYFATSTVEVIFHVSTRMPSDSDDSLTKKLRHLGNDEVHIVWSEHTRDYRRGIIPTEFGDVLIVIYPMKNHMFSIQIMKKPEVPFFGPLFDGAIVNGKVLPIMVRATAINASRALKSLIPLYQNFYEERARYLQTIVQHHLEPTTFEDFAAQVFSPAPYHHLPSDAGAYPEILPSETPTATQVDGADLASPMSPRTSKSRMSMKLRRSSGSANKS	510267	405183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_406521_415190_415316_438289_438418_439797_439957_452243_452400_459530_459655_470770_470843_472477_473343_479477_479662_480082_480218_502397_502467_505185_505297_506623_506733_510248
872952	contig_2799_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_85554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGGAAAAATGAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716474	714629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_714600_716500
872953	contig_13760_pilon	-	2382	7	Intergenic	novelGene_61310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	255.267452336216	27	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	106	1476	194443	168840	FALSE	40	AATTCTTTGAAAGATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSERAAGEPEAGGDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDTTLQCPTRIYTKNLPVELLMSTYLWLVHSTMIC	194548	167933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_168946_169072_169199_170851_171307_172482_172612_180114_180155_191857_192336_194406
872954	contig_9995_pilon	-	4379	2	Intergenic	novelGene_47788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777482	764092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_766914_775924
872955	contig_383_pilon	-	3048	7	Intergenic	novelGene_126146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	58.9484237844123	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	153	1178	385190	350143	FALSE	30	ATTACTGTACTGAGTATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLESLETKATLTSTPIRGAGDGMETEEPHKSIEATSGVQSIKRHILQSPQKKAVASESLGVLHLGKILTEKAVEVEAVRILVPKAAITHDIPNKNAKVKSLGHHKGESLGHSEGVVEPRKELSEVKHVLEKLKNSERRLLQDKEGLSNQLRVQTEVNRELKKLLVASVGDDLQYHFERLAHEKNQLILENEALGQNTARLSEQLERMSIQCDVWRSKFLASRVMADELTNSRAVLQRQSRDAQSAIQDLLSEREQFRQEMLATQKLLEKLLVCLQWGREQSYYPNAQPHSTAELALTNHKLAKAVNSHLLGNVGANDQKKIPSTDSTHFGSCCLYRELT	386658	348272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_350190_353544_353724_359666_359796_361353_361554_363254_363695_385159_385241_386556
872956	contig_6654_pilon	+	2237	5	Intergenic	novelGene_85757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	236	junction_1	69.8905394170055	83	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	135	515	600138	616896	FALSE	50	TTGACAAGACTAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRRAEKSCEQACESLKRQDYEMALKHCTEALLSLGQYSMADFTGPCPLETERIKIESLLYRIASFLQLKNYGQADEDCRHVLGEGLAKGDGAFRAVLCCMQLKGKLQLVSSILAKSLTGESLVH	574442	618618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_616762
872957	contig_5894_pilon	+	1540	4	Intergenic	novelGene_83050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_1	54.3098108591399	171	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	102	497	515388	577288	FALSE	20	CAGTCAAGTGTCTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCDSSINLTLHKSQVAVDELFTLLRDIAGARDLMKQFKSVYVPGSHTHQASYKPLLKQVVEEIFNPERPDPVDIEHMSSGLTDLLKTGFSMFMKVSRPHPSDHPILILFMVGGITVSEAKMVKDLVLSLKPGTQVIVLSTRLLKPLNIPELLFATDRLHPDLGF	515286	578331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_515436_539821_539957_561205_561326_577195
872958	contig_10629_pilon	+	1505	11	Intergenic	novelGene_52928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGCCTGAAGGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246560	256216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_247140_247320_247402_248128_248175_248335_248410_252333_252438_253094_253212_253746_253900_254170_254230_254591_254691_255096_255142_256068
872959	contig_5316_pilon	+	2460	8	Intergenic	novelGene_61236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	356.211700411713	2	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	294	752	453918	521517	TRUE	15	CATGCTTGTGTATAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGMSS	450438	551409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453775_453972_474052_474257_521316_521560_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
872960	contig_10958_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_5386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865112	867796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_865100_867800
872961	contig_5815_pilon	+	2772	2	Intergenic	novelGene_141219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1145	junction_1	0	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTATGAATTAAGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565739	572239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_568014_571741
872962	contig_11678_pilon	+	2536	2	Intergenic	novelGene_160841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	97	junction_1	0	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	88	369	235648	248274	FALSE	30	TCATTCCAAAATTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRPRSSAVFPRRLVQASAPLAPVWLNQRMMGVLGVRRGLEWLLGVYFLSHIPVTLLIDLQALLPRELYPIELRNLQQWYAKEFKDPLLQDPPTWFKSFLLCELVFQLPFFPFATYAFFKGW	235560	250441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_235777_248121
872963	contig_4519_pilon	+	2838	1	Intergenic	novelGene_123661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACAGAACAATCGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64180	67018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_64200_67000
872964	contig_12620_pilon	+	3493	21	Intergenic	novelGene_98801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_20	55.417055136483	93	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1138	3414	78	3491	165660	422469	FALSE	65	CACAAGATTAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLTGALRSFSNVTKQDNYNEEVADLKTKRSKLYEKNLDLGLTWKKIVKFLNENLDKNEVQTVNEDLKDILQAAKQIVGMENGREAVESGAAFLFKTFYLKNFVGHKETKAIKQMFGPFPSSSATAACNATSRITSHFSEVNLTALVRMTEEENREGVLFGKNIAFSFDMHDLDHFDELPINGDAQKIISLDYQKFLNERFQERCTPEVKPVEKANGSFLWCEVEKYLNATLKGMTEAPRIEDLCCTLYDMLASVKSGDELQNELFELLGPEGLELIEKLLQNRIMIVDRFLNSSNDHKLQALQENCKKILGENAKHNYGCQVTIQSEQEKQLMKQYRREEKRVARREKKAGEDGEVSGEGLMCFDPKELRMQREQALLNARSFPVLSRPREMGIEKIRYPHVYDSQAEAMKTSAFIAGSKMILPEGIQRDNNKIYEEVKIPYSQPMPVGFEEKPVYIQDLDEIGQLAFKGMKKLNRIQSIVFETAYNTNENMLICAPTGAGKTNIAMLTILHEIRQHLQQGVIKKNEFKIVYVAPMKALAAEMTKYFSRRLEALGIVVKELTGDMQLSKSEILRTQMLVTTPEKWDVVTRKSVGDVALSQIVRLLILDEVHLLHEDRGPVLESIVARTLRQVESTQSMIRILGLSATLPNYLDVAMFLHVNPYIGLFYFDGRFRPVPLGQTFLGIKSANKVQQLNNMDEVCYESVLKQVKAGHQVMVFVHARNATVRTAMSLLERAKNNGHIPFFLPTQGPDYGHAEKQVQKSRNKQVRELFPDGFSIHHAGMLRQDRNLVENLFSNGHIKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTQIYAAKRGSFVDLGILDVMQIFGRAGRPQFDKFGEGIIITTHDKLSHYLTLLTQQNPIESQFLESLADNLNAEIALGTVTNVEEAVKWISYTYLYVRMRANPLVYGISHKAYQMDATLEKHREQLVIEVGRKLDKARMIRFEERTGYFSATDLGRTASHYYIKYSTIETFNELFDAHKTESDIFAIVAKAEEFDQIKVREEELEELDTLLNNFCELSAPGGVENSYGKINILLQTYISRGEMDSFSLISDSAYVAQNAGRIVRALFEIALRKRWPAMTYRLLNLSKVIDKRLWGWASPLRQFSVLPPHI	156618	422471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_156661_165624_165750_168525_168677_184216_184777_238339_238461_249886_250095_250788_250931_251701_251828_283081_283283_283739_283881_319915_320081_334713_334891_337499_337572_384995_385131_404345_404538_404847_405073_412035_412156_415189_415355_417976_418064_418909_419087_422310
872965	contig_13004_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_112658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545426	547781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_545400_547800
872966	contig_15039_pilon	-	2086	2	Intergenic	novelGene_110111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	0	194	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	95	316	169493	163591	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPLGLRFSLTARAEPSPAHCPPPAALLALASMSFIPVAEDSDFPIHNLPYGVFSTKTNPRPRIGVAIGDQILDLSVIKHLFTGPVLSKHQDVFDQVGHCLMAGP	169587	161820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_163732_169412
872967	contig_7416_pilon	+	3166	1	Intergenic	novelGene_134342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCTGGCAATTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918431	921597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_918400_921600
872968	contig_10196_pilon	-	3732	1	Intergenic	novelGene_132191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1	489	1143687	1143199	NA	10	CTTGTATGTGCCCATCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGGEGAGSSEARGSGILHVSGASTYGLSGRLGVTETEAEFTAVERRPRAACPLQRDQEPDLSRNTDGWGSLHKTSPLDPGASHPSGARSCSGAHRCCTQLSLHCYPGVLFCCTQLSLHCYPASCSAAPSCPSLLPQRLVCSFLESSGVRLPGSFQPKPKRCI	1143687	1139955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1140000_1143700
872969	contig_10549_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_110596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTCCGCAATCCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128338	132327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_128300_132300
872970	contig_13004_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_112682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2216	2575	682580	682221	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSRRGGLSGSVCFSSKTSTLNTICLCLRKAALKWGLRTSGGSLRHFQEAWGIKTIFIIIPRSYLELFHSHKCTVKFSRGCRTVIQQHTERITERKIQLSSIKEICKNVKHCHSSD	684795	682060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_682100_684800
872971	contig_1275_pilon	+	782	7	Intergenic	novelGene_108766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATAATTTTCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400795	456914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411522_440362_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870
872972	contig_2878_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_176497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACACAGTGGCTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211531	210514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_210500_211500
872973	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	196	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	193	741	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121195	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
872974	contig_4604_pilon	-	2344	9	Intergenic	novelGene_19163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAATCCTAATAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381085	367331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_367452_372056_372163_372785_372963_373601_373701_374804_374926_377353_377531_378438_378604_379368_379463_379800
872975	contig_9548_pilon	+	3937	4	Intergenic	novelGene_141081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	55.6197407001827	334	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	103	1461	308859	318040	TRUE	75	TCAAAAAAAAAAAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIYAHKVVLASISPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCHDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLCAVGGKSGLFTCLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIETNVLRAGITVRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNRYLT	296610	321411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_296713_308858_309758_317580_320166_321060
872976	contig_3529_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_105363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGCACTATCAGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564634	563095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_563100_564600
872977	contig_7870_pilon	-	4359	1	Intergenic	novelGene_109040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCTCAATTGACAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617417	613058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_613100_617400
872978	contig_15092_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_57820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTTTTCTCCCATGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338252	335962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_336000_338300
872979	contig_11572_pilon	-	2759	1	Intergenic	novelGene_100037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTGGGTGTTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141790	139031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_139000_141800
872980	contig_12638_pilon	+	762	4	Intergenic	novelGene_33069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGTGCTGCGCACCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95885	150524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_96307_97538_97709_128449_128567_150470
872981	contig_12019_pilon	+	2595	1	Intergenic	novelGene_87646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAAAAGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	7711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5100_7700
872982	contig_1618_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_141787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTATTTGGTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205158	207315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_205200_207300
872983	SIRV6	+	712	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	921	336	-317	-156	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACGGTATCCCAATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9920	10632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_9900_10600
872984	contig_5260_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_144350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	657	1019	77246	77608	NA	25	ATCGTCAATCATACCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVRRNLTILASKEQSGCTSSRTDLFVLLAVHGIFNILHQHHNSKASVLLWSSLFIVQLSHAYEAIENTMVWVRCTLVFKVTSVLFNTLKRAFAADLPNAICHLIS	76589	79058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_76600_79100
872985	contig_15937_pilon	-	3764	14	Intergenic	novelGene_143141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	47	junction_1	46.0826373752156	245	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	108	1526	47182	38442	TRUE	10	CCCACTTGTGGTACTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPSSSPAFRLETSDGSQEDGTKGDKGNLGHGDGPAPMESPFQGEDRDFSPQIKVNLKYRKGSGACQPDLDRFDRDRLFSVVSRGALEELAGLPEYLRRTSKYLTDSEYTEGSTGKTCLMKAMLNLREGTNACILPLLQIDRDSGNPQPLVNAQCTDEYYRGHSALHIAIEKRSLPCVKLLVENGADVHARACGHFFQKRSQEACFYFGELPLSLATCTKQWDVVTYLLENPHRPASLQATDSLGNTVLHALVMIADNSAENSALVTGMYDALLQAGARLCPSVQLEDIPNLQGLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSGQWQPLSRKFTEWCYGPVRVSLYDLASVDSWEENSVLEIIAFHCRSPHRHQMIVLEPLNKLLQRKWELLTPKFCFNFLCYLLYVIIFTTVAYHQPALEKQAFPPLKATAGNSMLLLGHILLLLGGAVPPFGSAVVLLAAPSVHLDLLPGQLL	47289	31513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_32967_34679_34760_34979_35108_36082_36418_36513_36581_37760_37927_38432_38504_39304_39405_40179_40336_40805_40980_42263_42563_43203_43498_44887_45022_46982
872986	contig_8354_pilon	+	5856	1	Intergenic	novelGene_24166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAGAAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580622	586478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_580600_586500
872987	contig_15087_pilon	+	1534	1	Intergenic	novelGene_37228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAAATACTCTGGGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140218	141752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_140200_141800
872988	contig_1450_pilon	-	2930	4	Intergenic	novelGene_27407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2410	2868	352512	349047	FALSE	5	TCCGTCAGGGCCTGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLSVLHAGVKYLGVVANIITQADEAGFELLGTQRAGVILGPRCARQRAMRCQGGGAVRGGGGPCPKQRGRVWGTHKVMRMDRVRVERWGRRDERLLDELVVTLQLVDLWLVVDNALLVLPQVAELVLQGPVHLNGDSSDLPPSSSGSRAL	356181	348984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_349079_350344_350492_352232_354328_355587
872989	contig_20064_pilon	-	3045	15	Intergenic	novelGene_175635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_6	89.0584536316756	318	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	24	1862	84384	65256	FALSE	25	CCCACCCAGATCCAGCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASVLRRSHFLRGTKCCECGASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEHITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASAHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHIGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHNPHDTLGHGSGPEHSPLDSPAHTPGGEASSVARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPAAQRKDLGRSESLRVVSRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLWGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKTVVVADFGLARLMVDEKTQPEDLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPSCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFLKLEQWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYRHGESGLPAHPEVPD	84407	64072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20064_pilon_-_65419_65866_66025_66283_66340_67978_68136_70354_70421_70701_70762_71197_71330_71585_71673_72650_72835_73844_74012_74115_74222_79717_79925_80448_80559_80849_80989_84337
872990	contig_5302_pilon	-	2659	1	Intergenic	novelGene_81461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	692	1102	216565	216155	NA	25	AGCCTTAGCTGTGATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAVVVVGWGGDCRNLDMKTCHSGQGSMSGQTLHQNPDSPRPQGPCGVKVHHNPECGLLSHLRRALSSLNLICLLGCPHSSRKPSLTALHHNSHVSETLAPGTSTWPDVSTRWQTPLQQIMGAATSLLDSKCSLL	217256	214597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_214600_217300
872991	contig_3942_pilon	+	518	5	Intergenic	novelGene_128765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	17	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	38	424	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792277	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
872992	contig_10050_pilon	+	2363	2	Intergenic	novelGene_119608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	74	523	100426	107276	FALSE	35	ATGAGATAATCTATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPRASAFLPLRPFSRLPLSSGSAEVSAAAILLLAAPHGTVRTKNNIQRYFGTHSVIYNKKDEQSIPTHEISEETSKSQDSVKENTKKDLLNIIKGMKIELSTVNVQTTKPPNRRALKNLEATIGRLQKATENTTKKRYIELKLEFFFC	100352	109116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_100551_106951
872993	contig_1443_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_28335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAGTGGAAAACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776835	778289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_776800_778300
872994	contig_10904_pilon	-	2037	2	Intergenic	novelGene_22508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGTAACCACTAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336479	333208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_334490_335723
872995	contig_8138_pilon	+	1427	5	Intergenic	novelGene_52412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	43	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	222	677	280295	306552	TRUE	15	TATCCTTCTTAGTAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280073	307931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306729_307357
872996	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
872997	contig_7753_pilon	+	2592	5	Intergenic	novelGene_41511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	3	497	1238134	1244610	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAGACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFSSCPFFLLLSSSVTISLSEGHGCFTILGLPLGFGILTSVAAGRPLFGLTFRLTDVTAVVTTPGSSVSTCFSAFLFLPLLAAFGVVTSIALLTSSLLAFSSWSVSSFETLVSFSSASTSDDAFDCLAETCEQSRLLVSQIKVLPPTLKLSTHEKLKSLSIKT	1238131	1246705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1238184_1240519_1240597_1241690_1241787_1243638_1243702_1244401
872998	contig_7457_pilon	+	3531	2	Intergenic	novelGene_31662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	640	junction_1	0	17	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGGTGTCTCATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037227	1041114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1038956_1039311
872999	contig_13744_pilon	+	4120	4	Intergenic	novelGene_77156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	134	junction_3	5.31245915016974	148	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	15	539	171218	186002	FALSE	40	TCACAAAAGAGAAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWPGMMDELSELREFYDPDTVELMNWINSNTPRKAVFAGSMQLLAGVKLCTGRVLTNHPHYEDKSLRERTRAVYQIYAKRSPEEVHALLRSFGTDYVILEDSICYERRHRRGCRLRDLLDVANGHMMDGPGANEPDLKPAGHPRFCEEIKRNLPPYTAHFTRVFQNKTFHVYKLTRNK	171203	189583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_171289_181069_181203_183820_183980_185840
873000	contig_16098_pilon	-	841	6	Intergenic	novelGene_45971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1655.50625489607	128	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	255	716	349429	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCLDKSILSEPPAPPAPSSSSSSSSSSIWGVTLISRQQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349680_353990
873001	contig_16098_pilon	-	708	5	Intergenic	novelGene_46006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1334.57041309179	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	125	586	349429	348413	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349665	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604
873002	contig_16098_pilon	-	686	5	Intergenic	novelGene_46039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1334.57041309179	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	119	580	349429	348413	FALSE	15	ATGGCTTTATTTTCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349659	348306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604
873003	contig_16098_pilon	-	1039	8	Intergenic	novelGene_46026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1493.6512037177	2	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	258	920	349988	348413	FALSE	30	CTGGTACCAGACTCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354104	348293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_349993_352212_352352_353990
873004	contig_16098_pilon	+	1598	10	Intergenic	novelGene_45966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	92	439	348379	349061	TRUE	30	AATGAGAAGCGCCGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVLLKALDSSTWSGLSPPIYPSASVAPALWPGASSSPPPAGTRPGSATGIRRCPPAPSVQAPVDPQLPTLWGYIAILEGNEEGPSIPTPEPLLSCERRVRPCSRRIQIFLEQV	348287	354104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348515_348849_349064_349176_349233_349348_349499_349608_349704_349950_350075_350235_350416_350499_350644_352055_352355_353995
873005	contig_16098_pilon	-	1445	10	Intergenic	novelGene_46016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1474.01922194613	3	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	118	1323	352350	348413	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349695_350275_350422_350518_350643_350765_350889_352152_352352_353990
873006	contig_16098_pilon	-	1529	11	Intergenic	novelGene_45965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1780.81837647751	1	98	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	409	570	350768	350368	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLTRASSASLRLLQLLPPPPRLLPPPFGESLSSLGSSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGTWALGRLC	354103	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349058_349169_349231_349359_349493_349604_349695_349973_350076_350236_350397_350512_350643_350765_350889_352170_352346_353990
873007	contig_17470_pilon	-	3394	15	Intergenic	novelGene_110492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_14	89.1304936481291	65	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	435	2366	194551	184860	TRUE	40	CAAAAGAAACTCTCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDTPESLMALCTDFCLRNLDGTLGYLLDKETLRLHPDIFLPSEICDRLVNEYVELVNAACNFEPHESFFSLFSDPRSTRLTRIHLREDLVQDQDLEAIRKQDLVELYLTNCEKLSAKSLQTLRSFSHTLVSLSLFGCTNIFYEEDNPGGCEDECLVNPTCQVLVKDFTFEGFSRLRFLNLGRMIDGVPVETLLRPLNSLAALDLSGIQTSDAAFLTQWKDSLVSLVLYNMDLSDDHIRVIVQLHKLRHLDISRDRLSSYYKFKLTRKVLSLFVQKLGNLMSLDISGHMILENCSISKMDEEAGQTSIEPSKSSIMPFRALKRPLQFLGLFETSLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAIEAYTEHRPEITSRAINLLFDIARIERCNQLLRALKLVITALKCHKYDKNIQVTGSAALFYLTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVLNGMESYQEVTVQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNELLLSILNPTRQDESIQRIAVHLCNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVTMLKLIQKKLLDKICDQVMEFSWSALWNITDETPDNCEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAEVKELRPQLMTSQFISVFRLISPFSLFALAARMFRVLVCFSNSP	210852	179219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_179524_181354_181458_183189_183288_184336_185055_185744_185865_186031_186074_187132_187349_190267_190442_190817_190965_191133_191249_191780_191958_192291_192729_192918_193070_194393_194645_210511
873008	contig_2890_pilon	-	1299	11	Intergenic	novelGene_60287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	779	junction_10	336.290484551674	9263	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	100	969	370865	336651	FALSE	15	CTCTGTTTAGGGTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGFSSEERAAPFTLEYRVFLKNEKGQYISPFHDIPIYADKDVFHMVVEVPRWSNAKMEIATKDPLNPIKQDVKKGKLRYVANLFPYKGYIWNYGAIPQTWEDPGHNDKHTGCCGDNDPIDVCEIGSKVCARGEIISVKVLGILAMIDEGETDWKVIAINVDDPDAANYNDINDVKRLKPGYLEATVDWFRRYKVPDGKPENQFAFNAEFKDKDFAIDIIKSMHDYWKALVTKKTDGKGISCMNTTVSESPFKCDPDAAKAIVDALPPPCESACTIPTDVDKWFHHQKN	370964	336320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_336683_337286_337330_338549_338620_341426_341513_341986_342115_351451_351579_352504_352592_355560_355681_356537_356592_368254_368314_370801
873009	contig_3382_pilon	+	2950	16	Intergenic	novelGene_124198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATGAAAAGGACAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378833	1446857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1379615_1380460_1380607_1382389_1382468_1391044_1391179_1392175_1392503_1393795_1393972_1395002_1395079_1397718_1397853_1400313_1400490_1401193_1401362_1407078_1407253_1417135_1417256_1436152_1436297_1439432_1439548_1443313_1443427_1446769
873010	contig_14933_pilon	+	3058	14	Intergenic	novelGene_165043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	73.9442457483335	207	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	272	1831	18539	49725	FALSE	30	CTGAAAATGTGTCACGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELTQRALHHHPLPERLGEISSTNDSHEKDTCSQSESDITQESPITSADTGNSRSAFLSYTGTGISTEGSSDFSWGYGELDQNATEKVQAMFTAIDDLLYEKKLSIHTKSLQEECQQWTSSFPHLRILGRQIIAPSEGYRLYPRSPSAASASLEATLPQERDSTIFGIRGKKVHFSSSYAHKASSIAKSPSLCSMEREEEKDCVIFSEGIIEEYLAFDCTDMEEEFHGTKSEVAAEKQKLGYPPIAPFYCMKEDVLACVFDNVWSKVLGCMEELIRNHWEGYVSDDESNVAVTRPDSGSPCVLSEPQPLVLPRVPQSKVLPITSNPYSLPRYRRQTKVRRKQSRVSLWTSLKMPISCRRLMSLVTSWMSLCQAASSHQPNMNGLLVHGMPLQPRNLSLMDKLLDLDDKLLMRPGSSTILSTRNWPNRALELSTSSLSHTVQSVRRRNPPPRTLHPISTSHSRAGTPRPVEDLLRGTRVPAAADSLSSPSPMPLSRNNLLPPIGTAEVEHLSAVGPQRQMKPHSDSSRARSAVVDEPNHQQPQERLFLPDFFSRPNTTQSFLPDAQCHRSCAVEYPHQARPGRGSAGPQLRGSTKAQSRGGPVSRTRQGP	8035	50952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_+_8141_9883_10014_18502_18646_19714_19832_30860_31032_36413_36602_37750_37876_38636_38760_39877_39985_44024_44250_45721_45846_46085_46212_48389_48463_49651
873011	contig_7362_pilon	+	2875	1	Intergenic	novelGene_147546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	459	2416	2874	327855	328313	NA	25	GAGGAGGCGCAGCGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAPVTSSRGMRGRRPVRANCGTAGPARIAAAPPSQGGAAVRGAYAGALRVHPSDDRKPGSSCSPPACGRKARVPLSRGQRCPRSAASRIAPTPGTAAAPTANPRREEAAQLPGPPSPGPATHVPDGEKDKRGSEQQRQHVAEGRERERHGR	325439	328314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_325400_328300
873012	contig_12019_pilon	+	735	3	Intergenic	novelGene_87657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5381_6114_6226_8299
873013	contig_5696_pilon	+	2724	17	Intergenic	novelGene_117524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	160.815111230257	127	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	83	2212	439152	482909	FALSE	35	TAAAACGTTGAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPESELYFNILQIICYGWELSKFIMSKTFLRPKLSSTKVADWVDPSFDDFSENTNISTTLTASSLGVNNSSYRRKNVPSTLENRFPARKKGKLSSLEQICGLENSKDYLPENEPWVDKYKPETQHELAVHKKKIEEVETWLKAQVLERQPKQGGSILLITGPPGCGKTTTLKILSKEHGIQVQEWINPVLPDFRKDDFKEILSPESSLHIFPYQSQMAVFKEFLLRATKYNKLQMVGDDLRTDKKIILVEDFPNQFYRDSQILHEILRKYVQIGRCPLIFIISDSLSGDNNQRLLFPKEIQEECSISNINFNPVAPTIMMKFLNRIMTIEANKCGGKIIVPDKASLESLCQGCSGDIRSAINSLQFSFSKGEKNLWPRKKGVSSLKSDVMLSKSKRRKKPDGIFENQEIQAVGGKDVSLFLFRALGKILYCKRTSLTELDSHRLPSHLSEYERDTLLIQPEEVVEMSHMPGELFNLYLHQNYIDFFVEIDDLVRASEFLSFADILSGDWNTHSLLREYSTSISTRGVIHSNKARGFAHCQGGGSSFRPLHKPQWFLINKKYRENCLAAKALFSDFCLPSLCLQTQLLPYLVLLTIPMRNQAQISFIQDIGRLPLKRHFGRLKMEALTDREHGMIDPDSGDEVQLNGGQPAEEAQDAPPQTAEPEAWSLPPSQNSGSELPASQPQPFSALGDMEEEDMIIEDYESDET	439069	483421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_439168_440564_440669_442021_442280_442985_443070_450686_450844_452268_452406_459650_459704_459787_459914_460007_460078_464403_464516_466265_466452_467608_467695_467830_467978_469257_469408_470622_470744_480288_480347_482644
873014	contig_1867_pilon	+	2444	3	Intergenic	novelGene_54525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11620	junction_1	1696.5	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	263	469	218856	219622	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGNAF	215617	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_215811_218786_218898_219457
873015	contig_8286_pilon	-	4597	5	Intergenic	novelGene_139795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	105.092816119847	461	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	142	474	123934	119089	FALSE	30	GAAAGGAAACTCTGGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RETERERHAGGLSFITFVSYLASLETTFFTAPLLEFLLALFFLFADAMQLNDKWQGLCWPMMDFLRCVTAALIYFAISITTVTKYSDGASKAAGVFGFFATIVFAIDFYLIFNDVAKFLKQGDSTDETQAGTRCSLPKWPEEEGDKAVEEDSDCDSD	128528	114965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_119118_122099_122263_122722_122819_123889_124046_128498
873016	contig_7457_pilon	+	1927	12	Intergenic	novelGene_31340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	274.377401907821	14	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	1	1347	281205	290630	TRUE	15	CTGCCCAGAGGTGCACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPKTSSSTMQVSFVCQRCSQPLKLDTSFKILDRVTIQELTAPLVATPQVKPGETQEEEANSGEEPFIETRQDGVSRRFIPPARMMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	281204	291258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281332_283506_283575_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461_290700_290747
873017	contig_7457_pilon	-	1744	9	Intergenic	novelGene_31341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1025	1330	288319	285836	TRUE	10	TAGGCCCCTCCATCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQQHRLAPSSINLIPFHRNTGQATQSEVIDCAKLSTVPDVEGCIKDVGFLQLVQLHLGITHLVFYTLQLIIQLQLLAFKFTVFPLISASSQVSQPRPGPS	291247	281217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_281237_284482_284616_285412_285529_285689_285865_286765_286925_288201_288353_289034_289096_289580_289719_290455
873018	contig_15732_pilon	-	4217	1	Intergenic	novelGene_88872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCAATGGCTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136979	132762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_132800_137000
873019	contig_6364_pilon	+	2763	6	Intergenic	novelGene_51839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	359.140863728983	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	176	784	1705128	1732268	FALSE	30	CTCCCAGCTGAGGAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTVQTMKGHGNYQNCTVMRPHTPHSSYGTYVTLAPKVLVFPVFVQPLDLCNPARTLLLSEELLLYEGRNKAAEVTLFAYSDLLLFTKEDEPGRCNVLRNPLYLQSVKLQEGSSEDLKFCVLYLAEKAECLFTLEAHSQEQKKRVCWCLSENIAKQQQLAASPTESKKLHPYGSLQQEMGPVNSTNATQDRSFTSSGQTLIG	1704952	1734247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1705266_1708166_1708251_1714424_1714537_1719467_1719512_1727359_1727483_1732160
873020	contig_6364_pilon	+	2601	6	Intergenic	novelGene_51842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	362.530329765663	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	461	535	1732194	1732268	FALSE	30	CCCCAGCAGGGGAATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAVKHRTRASVFLFPFWVLCPLDLCNPARTLLLSEELLLYEGRNKAAEVTLFAYSDLLLFTKEDEPGRCNVLRNPLYLQSVKLQEGSSEDLKFCVLYLAEKAECLFTLEAHSQEQKKRVCWCLSENIAKQQQLAASPTESKKLHPYGSLQQEMGPVNSTNATQDRSFTSSGQTLIG	1707920	1734334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1707985_1708166_1708251_1714424_1714537_1719467_1719512_1727359_1727483_1732160
873021	contig_5947_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_101501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAGGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402473	405178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_402500_405200
873022	contig_9609_pilon	+	1880	9	Intergenic	novelGene_23056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	781.712503098166	9	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	16	1158	435659	455537	FALSE	65	GTAGAAAGAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLFLALPAIPPQLQRLGGGVATGLPNRSPPLSEVPGTASVTPFLGVCSGF	435643	456259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454586_455387
873023	contig_5718_pilon	+	5907	1	Intergenic	novelGene_110319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTTTAAGTGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482618	488525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_482600_488500
873024	contig_9429_pilon	-	3347	1	Intergenic	novelGene_155093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGAGTTGATTCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39562	36215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_36200_39600
873025	contig_405_pilon	-	2125	5	Intergenic	novelGene_135288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_4	29.978117018919	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	290	907	190847	138031	TRUE	20	CTCTTTCATTGATTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDQALQQMLDRSCWVCFATDEDDRTAEWVRPCRCRGSTKWVHQACLQRWVDEKQRGNSTARVACPQCNAEYLIVFPKLGPVVYVLDLADRLISKACPFAAAGIMVGSIYWTAVTYGAVTVMQVVGHKEGLDVMERADPLFLLIGLPTIPVMLILGKMIRWEDYVLRLWRKYSNKLQILNSIFPGKALKCGCNIHATLILLFRNI	191136	135897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_136879_137793_138280_150337_150469_165723_165927_190812
873026	contig_1301_pilon	+	2649	1	Intergenic	novelGene_47412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823936	826585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_823900_826600
873027	contig_15456_pilon	+	2918	1	Intergenic	novelGene_139497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGATGCCACATACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110458	113376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_110500_113400
873028	contig_21388_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_136616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1149	1484	8987	9322	NA	30	ATTTGATACTGCTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGSCAEHAQGPHGVEDHGFQGASSPKLVGFSPPVLIGLAGEEEKGGNANSEPSWSREGHTFAAVGMPLNCLWRHWLRFIRELSVRNGCEHLSSVFWTPRMVCTSPANVS	7838	10365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_+_7800_10400
873029	contig_11417_pilon	+	2959	6	Intergenic	novelGene_103263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_4	64.6114540929083	908	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1685	2224	284496	333747	FALSE	20	CATTAGTGTTGCTGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLDFLDDVRRMNKRQLYYQVLNFGMIVSSALMIWKGLMVITGSESPIVVVLSGSMEPAFHRGDLLFLTNRVEDPIRVGEIVVFRIEGREIPIVHRVLKIHEKQNGHIKFLTKGDNNAVDDRGLYKQGQHWLEKKDVVGRARGFVPYIGIVTILMNDYPKFKYAVLFLLGLFVLVHRE	282811	334482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_284547_315001_315112_319751_319902_327166_327287_333430_333489_333696
873030	contig_7286_pilon	-	496	4	Intergenic	novelGene_108671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3158.41028929991	8	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290800	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289299_289422_290754
873031	contig_10627_pilon	-	612	4	Intergenic	novelGene_59932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTTCCGGGCCACAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109322	107887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_108138_108452_108570_108959_109003_109120
873032	contig_16103_pilon	+	1965	13	Intergenic	novelGene_118929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_12	397.986695408555	2	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	65	1621	789233	799889	FALSE	15	TTAGCTAACTCTGGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	789168	800233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
873033	contig_12340_pilon	-	2475	2	Intergenic	novelGene_122097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	203	junction_1	0	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	974	1345	5540	3862	FALSE	25	AGACATCTTGATGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFGGFFAAFRMENLKCRGETVTQEISEAMKSLPTLIEQADGFSQVLKMQPVIQLQRIHQEVFSGCSRKTDVKPESFITQIETTPTETAGRKSTDMVLRRKRTKECPQRRWYPLRPKRINLDA	6513	2731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_4141_5447
873034	contig_20727_pilon	+	5198	2	Intergenic	novelGene_152568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	0	51	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	15	680	4145	14243	FALSE	15	TTTCTCCCAGCGCTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVIGMTPDKRAETPGAEKFAGLSQIYKMGSLPEAVDAARPKATLVDSESADDELTNLNWLHESTNLLTNFSLGSEGLPIVSPLYDIEGDDVPPFGPSCYQDPEKKSATSKPPYSFSLLIYMAIEHSPNKCLPVKEIYSWILDRFPYFATAPTGWKNSVRHNLSLNKCFQKVERSHGKVNGKGSLWCVDPEYKPNLMQALKKQPFSSALTFYTPPASPQR	4130	18761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_+_4682_14114
873035	contig_15629_pilon	+	2320	4	Intergenic	novelGene_122448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	92.5646920927317	205	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1930	2298	107871	108239	FALSE	20	TATTCATAGTGTTCCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTHPEAPQKTGLTICFRNVKNQKTKPVAVESILTHRDPIRQQNDSLGFPRSTWWIRTADLLVMKRALNHCATATENPIECSSALHTWGRHESESTGGRQAATITTVHIFIFLYLKHVACH	97343	108261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_97711_102174_102322_103346_103515_106623
873036	contig_10079_pilon	-	3259	8	Intergenic	novelGene_175824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	32	junction_6	24.2831931464492	82	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	353	1366	268005	190988	FALSE	40	TTAAATTTTTAAAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	268357	189094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10079_pilon_-_191179_195911_196066_197174_197305_204743_204873_208268_208427_210564_210707_210803_210847_267938
873037	contig_13878_pilon	-	4376	6	Intergenic	novelGene_165745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1940	2251	537959	537648	TRUE	30	TTAAAAGCATCACCTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVQTGIMSGHQHSDDLSEQSRDQFPICCVDYIHCNWGKNKSQRRWSLRKENRQRQSLGLCLPDRQQMVTHSLWSEEERVRKKNVYTSYWQKKKKKKNCCTN	539898	464956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_464979_476426_476583_495687_495920_501383_501540_533390_533584_536281
873039	contig_17753_pilon	+	1645	5	Intergenic	novelGene_105050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.8272014064607	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	945	1448	131420	137949	FALSE	25	TCTCTGCTTTGAAGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLR	45449	138146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45536_45657_45684_74923_75173_130836_131726_137751
873040	contig_7870_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_109015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTTTTAATCTACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529654	532160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_529700_532200
873041	contig_6929_pilon	+	2725	2	Intergenic	novelGene_139401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9749	junction_1	0	34	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	759	1076	126919	127236	TRUE	40	ATGGAGCGTACCTAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNDFRRVRRQQMLQALVEFQCKAVNMQQTVTIIDVIHVVGVLHAITSRITRIVRVGKRTRDRRVLLKARPNSAGLTAGDGSHLTTCGDPMGVDHSIPTLLCREK	126160	129347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703
873042	contig_11677_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_85940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	18267	junction_1	12134.4878846296	30	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	236	448	595842	594927	FALSE	15	ACATATGCTTCTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597398	594884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212
873043	contig_3700_pilon	-	2368	3	Intergenic	novelGene_138083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	17.5	279	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATTTTAAGTGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266451	258828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_260927_264736_264850_266294
873044	contig_15118_pilon	+	1923	3	Intergenic	novelGene_74626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	102.5	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGATTTGATTATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430768	432894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_432307_432391_432527_432644
873045	contig_13245_pilon	-	503	4	Intergenic	novelGene_148828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	35	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	117	476	26752	25454	FALSE	25	AGTTGGTAAATTTTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26868	25426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
873047	contig_15491_pilon	-	3613	3	Intergenic	novelGene_75985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	5.5	81	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	83	406	87711	85950	FALSE	65	CACATTAAAAAAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGTVGR	91347	82742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_86213_87650_87753_91306
873048	contig_9706_pilon	+	2924	1	Intergenic	novelGene_20903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1218	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92315	95239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_92300_95200
873049	contig_12790_pilon	+	2020	16	Intergenic	novelGene_35179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	47.324694047259	204	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	125	1486	33979	74747	TRUE	60	TTAAAAACTCATAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSFNEPPKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAVPELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGVDGNMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISESEEEDDEEGEVGEDGEKRKKRRDKQVKRKFLQIRWLKCKQKLMRRGKHLKQSLTWRKKKEIRLELS	33854	102753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_33985_37500_37775_49893_50039_50191_50277_51802_51909_58332_58473_60780_60979_61298_61474_67082_67182_74613_74779_75372_75554_75904_76016_76377_76504_77795_77850_78204_78213_102730
873050	contig_12969_pilon	+	1587	3	Intergenic	novelGene_61671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGCTAAAAGAATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337440	421018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_338445_347661_348020_420793
873051	contig_2646_pilon	+	278	1	Intergenic	novelGene_69530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTACTAGTCTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560336	560614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_560300_560600
873052	contig_5718_pilon	+	2519	2	Intergenic	novelGene_110454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	0	21	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATTTTTACAAGATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1627421	1631575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1629346_1630980
873053	contig_15264_pilon	-	7626	1	Intergenic	novelGene_158870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCACCCAAAGAAACTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97048	89422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_89400_97000
873054	contig_9177_pilon	-	5272	12	Intergenic	novelGene_32699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	50.6738069493876	152	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	157	2325	496626	467157	FALSE	65	AAGAAAAAATAAATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DESSTCVAELRKPRGGSRPACFLALGLALGSEARWQRLELYFKTLSKRKKQVMEKNGNNRKLRVCVATCNRADYSKLAPIMFGIKTEPEFFELDVVVLGSHLIDDYGNTYRMIEQDDFDINTRLHTIVRGEDEAAMVESVGLALVKLPDVLNRLKPDIMIVHGDRFDALALATSAALMNIRILHIEGGEVSGTIDDSIRHAITKLAHYHVCCTRSAEQHLISMCEDHDRILLAGCPSYDKLLSAKNKDYMSIIRMWLGDDVKSKDYIVALQHPVTTDIKHSIKMFELTLDALISFNKRTLVLFPNIDAGSKEMVRVMRKKGIEHHPNFRAVKHVPFDQFIQLVAHAGCMIGNSSCGVREVGAFGTPVINLGTRQIGRETGENVLHVRDADTQDKILQALHLQFGKQYPCSKIYGDGNAVPRILKFLKSIDLQEPLQKKFCFPPVKENISQDIDHILETLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEVVKKYTQFNPKTYEERIDLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCLCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLANHYIHIVKDVIRQQALPSVQDVDVVVSDLMDPALLGAASMVLDYTTRRIY	510628	464209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_467393_468114_468232_471058_471242_474017_474240_474610_474741_478094_478306_479083_479172_485371_485585_487893_488047_491911_492364_496462_496669_510514
873055	contig_13244_pilon	+	4226	10	Intergenic	novelGene_86975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	41.1528316833187	94	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	39	1844	319692	351380	FALSE	20	ATTGAATTTTTTACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVARVDAALLPGEGSVVNWSGQGLQKLGPNLPCEADIHTLILDKNQIIKLENLEKCRRLIQLSVANNRLVRMMGVAKLTQLRVLNLPHNSIGYVEGLKELIHLEWLNLAGNNIKAMEQINTCTALQHLDLSDNNIAQIGDLSKLVSLKTLLLHGNIITSLRMTPAYLPRNLAILSLAENEIRDLNEISFLASLSELEQLSIMNNPCVMATPSIPGFDYRPYIVSWCLNLRVLDGYMISQKESLKAEWLYSQGKGRAYRPGQHIQLVQYLATVCPLTSTLGLQTAEDAKLEKILSKQKFHQRQLMNQSQNEELSPLASIETRSPLVPEHSSPVQDCQIIQESEPIIQVNSWVGISNKDDQLYAVKNNFPGSVHTTRYSRNDLHLEDIQTDEDKLNCSLLSSESTFMPVASGLSPVSPTVELRLQGINLDLEDDDVANESVKGLENQDLDKEEEKALWAAKGNSVKIMQSEISAEVNEKAGLLPCPEPPILSAVLKDDKHSLTSFLQSVGHSVFHTQPDSEETMSQTALEKIPCRISTQRSVALGQDKVAIQKLNEAATKLQAFWRGFYARNYNPRARDVRYEIRLRRMQEHIVCLTDEIRR	319653	353762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_319735_322259_322403_323030_323190_324315_324418_325858_325973_326526_326694_341827_341993_342755_342890_343290_344066_351376
873056	contig_9995_pilon	-	3106	1	Intergenic	novelGene_47817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891100	887994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_888000_891100
873057	contig_6503_pilon	+	4563	1	Intergenic	novelGene_145793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTATAGAGAGGCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915991	920554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_916000_920600
873058	contig_14405_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_85658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAAAAATTATTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727561	725139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_725100_727600
873060	contig_12886_pilon	-	1338	3	Intergenic	novelGene_135461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCCCTTCTCCCGCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274743	261850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_262043_264275_264332_273653
873061	contig_1141_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_136919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTGTTCCCCTTTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386620	389289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1141_pilon_+_386600_389300
873062	contig_4151_pilon	-	4141	1	Intergenic	novelGene_65257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	670	972	580720	580418	NA	40	TTCAGCAACCAAGCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGIKMPPRLGLDEMRVIEKSKTRGRADFGKEGIKMPIPMERSPGGILVKHSAAKQKIGASNAPVALQEKDMAVCFHRLPIAVKSILTHSDPIGDSRIVP	581389	577248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_577200_581400
873063	contig_10159_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_30838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTAGCCTTTGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592760	595279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_592800_595300
873064	contig_10642_pilon	+	3095	9	Intergenic	novelGene_78665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1243	1626	172661	173044	TRUE	25	TCATAATACCGAGCGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFNLLSLGGRFSSMSNSSSDSPSSKIWLRTGALFLDVRRLVTDGFRRKTTCVERDMGFLSSSSSSSSSSTLNRHLRPLAVGFKLAGGPADSACPASSGRSSFFAESHRPLLLWPLRTLSVARAGD	169176	241350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_170371_172612_173133_177951_178084_181157_181371_185224_185367_222007_222703_225746_225808_237046_237104_241269
873065	contig_4059_pilon	-	3335	1	Intergenic	novelGene_140585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTTGTAAAGCTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175854	172519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_172500_175900
873066	contig_16098_pilon	+	3624	2	Intergenic	novelGene_46181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	39	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	175	663	623746	625523	FALSE	35	CAACACATGGCATCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGPCGHYEAKGQCRRVAAACERGDRPLWLRGRHYGVFGSGPQGAERASDRRLPPLPGMSAEASGPAAAADPSLEVPKPSGIESGSAAYGLSPLSPNSKYVKLNVGGSLHYTTLRTLTGQDTMLKAMFSGRVEVLTDAGGWVLIDRSGRHFGTILNYLRDGSVPLPESTRELGELLGEARYYLVQGLIEDCQLALQVRAPSLPPERHPYAHVPGRATHCH	623571	628484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_623990_625278
873067	contig_12841_pilon	-	2650	22	Intergenic	novelGene_55855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	272	junction_20	361.739053541559	313	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	163	2319	418821	302395	FALSE	45	GCCAATAATTGATACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVESVERVELCESLLTWIQTFNVDAPCQTVEDLTSGVVMAQVLQKIDPVYFDENWLNRIKTEVGDNWRLKISNLKKILKGILDYNHEILGQQINDFTLPDVNLIGEHSDAAELGRMLQLILGCAVNCEQKQEYIQAIMVMEESVQHVVMTAIQELMSKESPVSVGNDAYVDLDRQLKKTTEELNEALSAKEEIAQRCHELDMQVAALQEEKSSLLAENQVLMERLNQSDSIEDPNSPAGRRHLQLQTQLEQLQEETFRLEAAKDDYRIRCEELEKEISELRQQNDELTTLADEAQSLKDEIDVLRHSSDKVAKLEGQVDSYKKKLEDLGDLRRQVKLLEEKNTMYMQNTVSLEEELRKANAARSQLETYKRQVVELQNRLSEESKKADKLDFEYKRLKEKVDSLQKEKDRLRTERDSLKETIEELRCVQAQEGQLTTQGLMPLGSQESSDSLAAEIVTPEIREKLIRLQHENKMLKINQEGSDNEKIALLQSLLDDANLRKNELETENRLVNQRLLEVQSQVEELQKSLQDQGSKAEDSVLLKKKLEEHLEKLHEANNELQKKRAIIEDLEPRFNNSSLKIEELQEALRKKEEEMKQMEERYKKYLEKAKSVIRTLDPKQNQGAAPEIQALKNQLQERDRLFHSLEKEYEKTKSQREMEEKYIVSAWYNMGMTLHKKAAEDRLASTGSGQSFLARQRQATSTRRSYPGHVQPATAR	418983	302063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_302536_307880_307953_308110_308216_310581_310683_311271_311355_318707_318743_331788_331877_337271_337413_342195_342266_346272_346361_347060_347172_351222_351425_353030_353172_358155_358320_365469_365554_367367_367431_378171_378240_384082_384216_388868_388920_392187_392261_408511_408598_418764
873068	contig_8122_pilon	+	5144	1	Intergenic	novelGene_40232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTAGCCTCAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595418	600562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_595400_600600
873069	contig_8829_pilon	-	2650	15	Intergenic	novelGene_140949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	21	junction_6	92.5255618293493	171	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	162	1655	169766	82673	FALSE	65	AAAAAAAATTAACTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFDPEVFFNILLPPIIFHAGYSLKKRHFFRNLGSILAYAFLGTAVSCFIIGNLMYGVVKLMKIVGQLSDKFYYTDCLFFGAIISATDPVTVLAIFNELHADVDLYALLFGESVLNDAVAIVLSSSIVAYQPAGLNTHAFDAAAFFKSVGIFLGIFSGSFTMGAVTGVVTALVTKFTKLHCFPLLETALFFLMSWSTFLLAEACGFTGVVAVLFCGITQAHYTYNNLSVESRSRTKQLFEVLHFLAENFIFSYMGLALFTFQKHVFSPIFIIGAFVAIFLGRAAHIYPLSFFLNLGRRHKIGWNFQHMMMFSGLRGAMAFALAIRDTASYARQMMFTTTLLIVFFTVWIIGGGTTPMLSWLNIRVDVEEPSEEDQNEHRWQYFRVGVDPDQDPPPNNDNFQVLQGDGPDSARGNRTKQESAWIFRLWYSFDHNYLKPILTHSGPPLTTTLPAWCGLLARCLTSPQVYDNQEPLREEDSDFILTEGDLTLTYGDSTVTANGSSGSHTASTSLEGGQRTKSSSEEVLERDLGTEDQKVSSRGTRLVFPLEDNA	183104	81677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_82925_89409_89516_91602_91686_103423_103488_113228_113289_126972_127127_139460_139573_141881_141996_142088_142178_143533_143640_145653_145796_146160_146267_169660_169774_174546_174624_183027
873070	contig_6233_pilon	-	3805	1	Intergenic	novelGene_74783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1991	2290	138498	138199	NA	30	GCCACAAAGCTTTGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAGQFYLSQMALMAEVSWQIGDCLVPDGLSIQWLGQQGQWATHSEDLIILARVSLHDVGFQKQQERASLNVQVVFKLLLVSCLVRFYCGEVVKSYSC	140488	136683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_136700_140500
873071	contig_17432_pilon	-	3080	1	Intergenic	novelGene_159004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATAAGGCCCCAGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27166	24086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_24100_27200
873072	contig_10103_pilon	+	1951	10	Intergenic	novelGene_86148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCGCCCGGAGCGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441184	484836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_441558_444375_444633_448236_448349_449627_449756_452759_452965_453612_453690_460365_460462_474367_474630_475632_475905_484667
873073	contig_3560_pilon	+	2153	8	Intergenic	novelGene_149499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	384	941	197241	197798	TRUE	15	TCGCCGGAAGTCGGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERTRGCVNPRRQYPGSDVNSRVTRERKLHPEFLRKAGPEPRGDHEQPAGCRSRTRSSPHLFSNITCRPHPSPADRSCPNLRLLTSTSDELLFLGGPSLPAMGTLRPPGEIPWTAWFIEDTVFCPSALSSIYISDSQEVGRKRSIFSKEGEFPAMWLLPFGEGPPLAPDEPAPLSARGTDRGAVC	196857	211221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_+_198211_199031_199084_199800_199861_203205_203317_206571_206702_207914_207964_209276_209348_210894
873074	contig_10734_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_51517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTTTGCAGCTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2269514	2267702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2267700_2269500
873075	contig_19744_pilon	+	3042	1	Intergenic	novelGene_120377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAATAGAGAGTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149553	152595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_149600_152600
873076	contig_10626_pilon	-	2896	11	Intergenic	novelGene_138185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_10	93.8008528745874	614	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	151	1341	197995	10495	FALSE	60	AAACTAAGTGAAAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSAAAAVVRAARRRGGLALSLLLPPGLPLPAVLIFRCRWDPESSPVPSTMPPKKGGDGIKAPPIIGRFGTSLKIGIVGLPNVGKSTFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESRVPVPDERFDFLCQYHKPASKIPAFLNVVDIAGLVKGAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTRAFEDDDITHVEGSVDPIRDIEIIHEELQLKDEEMFGPIIDKLEKVAVRGGDKKLKPEYDIMCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKWLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSALPKIIKAGFAALQLEYFFTAGPDEVRAWTIRKGTKAPQAAGKIHTDFEKGFIMAEVMKYEDFKEEGSENAVKAAGKYRQQGRNYIVEDGDIIFFKFNTPQQPKKK	199479	8939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_10597_13875_13999_16072_16170_16855_16997_59101_59200_59499_59581_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
873077	contig_16882_pilon	-	3513	1	Intergenic	novelGene_148257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604610	601097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_601100_604600
873078	contig_5954_pilon	-	2447	13	Intergenic	novelGene_28713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	204.574405779413	16	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	989	2137	971201	962413	FALSE	10	TGGGCGTGGTTACATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARLAERKFMNPFNMPNLYQKLEGDPRTRALLSDPSYRELIEQLRNKPSDLGTKLQDPRIMTTLSVLLGVDLGSMDEEEEVATPPPPPPPKKETKPEPMEEDLPENKKQALKEKELGNDAYKKKDFDTALKHYDRAKDLDPTNMTYITNQAAVHFEKGDYNKCRELCEKAIEVGRENREDYRQIAKAYARIGNSYFKEEKYKDAIHFYNKSLAEHRTPDVLKKCQQAEKILKEQERLAYINPDLALEEKNKGNECFQKGDYPQAMKHYTEAIKRNPRDAKLYSNRAACYTKLLEFQLALKDCEECIQLEPTFIKGYTRKAAALEAMKEYTKAMDVYQKALDLDSNCKEAADGYQRCMMAQYNRHDSPEDVKRRAMADPEKG	972905	962102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_962422_963085_963182_963385_963490_963688_963726_966990_967116_967267_967365_967974_968096_968344_968448_968539_968667_970053_970223_970883_971026_971182_971325_972040
873079	contig_3602_pilon	+	2877	1	Intergenic	novelGene_60629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1303	1632	958537	958866	NA	15	GACGGCAATGGGTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEAGKSQIRGSGSRLEASPDSRDCKGRQIKNLQLRQQAEGFSCPKNWKSEDDDTDIGSKRASFARTSVYIVNAGHVPKETPLPTDWLLTSGHKMGRYVVSAKPLRIII	957234	960111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_957200_960100
873080	contig_14727_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_56621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32676	30429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_30400_32700
873081	contig_9888_pilon	-	5836	1	Intergenic	novelGene_162274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCCATTGGCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217395	211559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_211600_217400
873082	contig_4105_pilon	+	2165	4	Intergenic	novelGene_21484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_3	13.5728487143349	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	257	523	72453	72813	FALSE	35	TAAAGATGGAGTTTCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSIVDVGLAQARHPLSTRSHYFEVEIVDPGEKCYIALGLARKDYPKNRHPGWSRGSVAYHADDGKIFHGSGVGDPFGPRCYKGDIMGCGIMFPRDYILDSEGDSDDSCDTVILSPTARAVRNVRNVMYLHQEGEEEEEEEEEEDDGEEIEQEHEGKKVVVSRESLGLDWGSWV	71045	74455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_71173_71624_71683_72381_72502_72595
873083	contig_8357_pilon	+	6207	10	Intergenic	novelGene_39730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_8	36.4186900870188	946	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	1057	2676	597142	613014	FALSE	65	GGTTAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSLLLCECLLLIAGYAHDDDWIDPTDMLNYDAASGTMRKSPQANYDVAEKKDVSPDLSHADEMSECYRRLDSLTHKIDECEKRKREEYESQSNPVFRRYLNKILIEASKLGLPDENRGDMHYDAEIILKRQTLLEIQKFLNGENWKSGALDDALSNILINFKFHDFETWKWQFEDYFGVDPYDVFMVLLCLLCIVVLVATELWTYVRWYTQLRRVLFISFLISLGWNWIYLYKLAFAQHQAEVAKMEPLVSACAEKMDWAGSFFEWFRSKWSFQDDPCQKYYELILVNPIWLVPPTKALAVTFTNFVTEPLKHIGKGTGEFIRGLMKEIPVLLHIPLLIIMALAVLSFCYGAGKSVGVLRHIGGPERDSPWALHSGDRRRQEEIDYRPRGGAGDADFYYRGQIGPREQGPYDKADEGRRDALREKDVHLRFQTGNKSPEVLRAFDTAETREHPKVVPSHKSPVLDTKPEIGEIPGESTLTEGSQSAKPVSGQEMSGSVEGLPAVEEAQHRTDAQGSPKEGSPDSPACGKEADGGLCG	596085	616545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_597274_597829_597932_602336_602445_604253_604476_604723_604865_606302_606397_608168_608267_608533_608681_610958_611295_612774
873084	contig_2069_pilon	-	3320	1	Intergenic	novelGene_23469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1366	1800	1463644	1463210	NA	30	TCACACCCAGACAGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLGPQYPPTLVPPQNQGPTLLPAPKPSSVMLLSHSFFHTRILKNTYVAHTYSSMSTEIPQVCADRHTDRYAHSTRGCTDIHSRHKHTNTNSHPSSHILTDTGLPHLLHDRHLCLLKGRRSVGTQTYTHTHRNKCTHLCATMW	1465009	1461689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1461700_1465000
873085	contig_15236_pilon	+	1451	2	Intergenic	novelGene_141589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	450002	450343	TRUE	20	GAAGTGTTCTTGTCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLFAYLINEEIARLSELPSVTQLVRSGIKTQPQICLTPAAHGLPTLACCLVRQHHTSPTVTVTVLFSLLVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	450001	452550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_451185_452282
873086	contig_11816_pilon	-	4272	1	Intergenic	novelGene_98539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGACACTTGACTAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060775	1056503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1056500_1060800
873087	contig_7057_pilon	+	1892	8	Intergenic	novelGene_123259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_4	17.67968971932	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	164	679	542770	569191	TRUE	5	CTCTGCTTGCCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVKVKVEKSDMEMAKARNQLDAVLQCLLEKSHMDRERLDEEAGKTPSDTHNKDCSIAATGKRPSARFPHQRRKKRREMDDGLAEGGPQRSNAYVIKLFDRSVDLAQFSENTPLYPICRAWMRNSPSAREREHSPTSPLPPLPEDEEVGWGVGSGWTSLRDYLLNPRLVE	542606	570577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_542804_566866_566943_567100_567152_568676_568707_568785_568872_568952_570203_570293_570368_570449
873088	contig_8138_pilon	+	1838	4	Intergenic	novelGene_52460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	538.343962743358	3	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	105	452	288530	306552	FALSE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWRENVGTTSKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280121	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280204_288507_288566_304973_305098_306364
873089	contig_11883_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_163775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGATACCTATAATATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88888	90380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_88900_90400
873090	contig_8045_pilon	+	1599	10	Intergenic	novelGene_35426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGCCTACTTCCCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379379	434732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_380051_388098_388199_390871_390985_392295_392396_399311_399379_401390_401523_401905_401968_402049_402178_414825_414887_434567
873091	contig_20727_pilon	-	2657	2	Intergenic	novelGene_152573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25609	22904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_23830_23877
873092	contig_8696_pilon	+	4128	21	Intergenic	novelGene_153325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_17	150.269582750469	159	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	309	2120	638845	675347	FALSE	50	AAGAGGCCACTGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLRKKYDKYGEKGLADNQGGGQYESWNYYRYDFGIYDDDPEIITLDRREFDAAVNSGELWFVNFYSPGCSHCHDLAPTWRDFAKEVDGLLRIGAVNCGDDRMLCRMKGVNSYPSLFIFRSGMAAVKYHGDRSKEDLVSFAMQHVRSTVTELWTGNFVNSIQTAFAAGIGWLITFCSKGGDCLTTQTRLRLSGMLDGLVNVGWIDCATQDNLCKSLDITTSTTAYFPPGATLNNKEQSGVLFLNSLDAKEIYLEIMNHLPDFELLSADTLEDRLAHHRWLLFFHFGKNQNSNDPELKKLKALLKNEHIQIGRFDCLSAPDICSNLYVFQSCLAVFKGQGTKEYEIHHGKKILYDILAFAKESVNSHVTTLGPQNFPSSEKEPWLVDFFAPWCPPCRALLPELRKASKHLYGQLKFGTLDCTVHEGLCNMYNIKAYPTTVVFNQSNIHEYEGHHSAEQILEFIEDLTNPSVVSLTPSTFNELVKQRKHDEVWMVDFYSPWCHPCQILMPEWKRMARSLTGLINVGSVDCQQYHSFCAQENVQQYPEIRFFPQKSNKAYEYHSYNGWNRDAYSLRSWGLGFLPQVSIDLTPQTFSEKVLQGKNHWVVDFYAPWCGPCQNFAPEFELLARMIKGKVKAGKVDCQAYAQTCQRAGIRAYPTVKFYPYERAKRNTWGEQIDVRDAKEIAALIYKKLEMLQNQGKRNKDEL	631241	677355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_+_631347_633002_633054_635505_635589_638775_638908_639463_639558_640858_640937_642474_642519_643621_643760_651312_651403_652120_652235_653802_653918_657784_657913_658200_658318_662391_662494_663645_663802_664733_664868_665807_665862_666119_666268_669990_670111_674019_674125_675335
873093	contig_5602_pilon	-	1369	2	Intergenic	novelGene_133006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGCAAGTGGAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485400	483776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_484397_484651
873094	contig_16846_pilon	-	3255	2	Intergenic	novelGene_82931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTATGGAACAGTGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518396	511257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_514427_518310
873095	contig_990_pilon	+	2292	4	Intergenic	novelGene_76089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	54.2361093327642	418	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	30	620	1156554	1171316	FALSE	70	CCAAATAAGAAGAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWWQVLSRAARRYPWPTNVLLYAALYSAGDALQQRLRGGPADWRQTQRVATVAVAFHANFNYVWLGLLERALPGRAPRAILAKVLYDQVLGAPVAISAFYAGMSILQGKDDIFLDLKEKFWNTYKSGLLYWPFVQLTNFSLVPIHWRTAYIGLCGFLWATFICFSQQSGDGTLKSAFSFLRIKEANAVKRPQEK	1156524	1172988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1156864_1160148_1160220_1171025_1171056_1171136
873096	contig_7753_pilon	+	1840	3	Intergenic	novelGene_41510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTAGGCCATGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235014	1260662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1235022_1255067_1255171_1258932
873097	contig_4536_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_175091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	2	454	369446	369898	NA	55	AAAAAAAAAAATTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKEAPAPSKTEAKVKALKAKKAVLKGVHSHKKKIRTSPTFRRSKTLRLRRQPKYPQKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESANKKIEDNNTLVFTVDVKVNKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVQLAPDYDALDVANKIGII	369444	369941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4536_pilon_+_369400_369900
873098	contig_7056_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_43749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAAACAAATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165159	1166327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1165200_1166300
873099	contig_3394_pilon	+	4154	1	Intergenic	novelGene_152671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCACTTTGATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394105	398259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_394100_398300
873100	contig_19061_pilon	+	1412	4	Intergenic	novelGene_173509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGATGCTGGGCTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38923	93336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_39974_43793_43913_44038_44181_93235
873101	SIRV6	+	756	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	20	7	20	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTATGGGGAAAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10257	11323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
873102	contig_7410_pilon	+	2826	1	Intergenic	novelGene_106127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACCCAAATCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644687	647513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_644700_647500
873103	contig_9931_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_134841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	1257	1955	364058	364756	NA	30	TGTTTCAAATTGATTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	362801	364850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_362800_364800
873104	contig_5539_pilon	-	3311	1	Intergenic	novelGene_104755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCAGTTTCTGCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74319	71008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_71000_74300
873105	contig_9668_pilon	-	1961	2	Intergenic	novelGene_58230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAGAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570735	562410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_563444_569807
873106	contig_6740_pilon	-	3497	1	Intergenic	novelGene_142710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAATTGAGGCCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683403	679906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_679900_683400
873107	contig_11003_pilon	+	3933	1	Intergenic	novelGene_105444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGACTCCAAGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362741	366674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_362700_366700
873108	contig_3147_pilon	-	5525	1	Intergenic	novelGene_142282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCATGCTGTGTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212668	207143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_207100_212700
873109	contig_753_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_112984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGGTGGTTCGAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202757	1200682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1200700_1202800
873110	contig_1443_pilon	-	3084	7	Intergenic	novelGene_28374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2669	3004	1028185	1019678	TRUE	15	CTGGACTCGGAATTTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSLGKPDNTLPLTMVKPPLRSPPPCSIKPWVMPTGMSNVWTPYWAEKLPSCEEDGSARSSKWPTTSETASEGSESKEIGGISNSSSPKLGVWNVSAPDRKGCEGPVIVR	1034951	1019387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1019446_1019655_1019725_1027896_1029337_1029697_1029928_1032305_1032388_1032763_1033508_1034490
873111	contig_20944_pilon	+	2975	1	Intergenic	novelGene_167532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	538	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAGTTTAATTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11988	14963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_12000_15000
873112	contig_5954_pilon	+	660	4	Intergenic	novelGene_28433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	1626.09969627395	108322	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	47	385	97851	98756	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVSESVSGVLRCLLSQLSQAP	97533	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98637
873113	contig_8773_pilon	+	2822	1	Intergenic	novelGene_74520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34318	37140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_34300_37100
873114	contig_8898_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_137252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332903	330700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_330700_332900
873115	contig_12786_pilon	+	3601	1	Intergenic	novelGene_103410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAAAAAAAAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590848	594449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_590800_594400
873116	contig_5770_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_74162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGACTCATTCTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256580	254091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_254100_256600
873117	contig_6873_pilon	+	2806	26	Intergenic	novelGene_129803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_25	76.182874716041	62	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	825	2478	137	2614	56261	268513	FALSE	20	GGCCAATGACTCCCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNVHLAPETDEDDLYSGYNDYNPTYDTEELENDTAFQQAVRTSHGRRPPITAKIPSTAVTRPIATGYGSKISLTSSMGRPMTGPIQDGVTRPMTAVRAAGFTKAALRGSAFDPLGQSRGPAPPLEAKNEDSPEEKIRQLEKKVNELVEESCIANSCGDLKLALEKAKDAGRKERVLVRQREQVTTPENINLDLTYSVLFNLASQYSANEMYAEALNTYQVIVKNKMFSNAGRLKVNMGNIYLKQRNYSKAIKFYRMALDQIPSVHKEMRIKIMQNIGVTFIKTGQYSDAINSFEHIMNMAPNLKAGFNLILSYFAVGDREKMKKAFQKLIAVPLEIDEDDKYISPSDDPHTNLVIEAIKNDHLRHMEHERKAMAEKYIMTAAKLIAPVIETSFAVGYDWCVEVVKASQYVELANDLEINKAITYLRQKDFNQAVETLKMFEKKDSRVKSAAATNLSFLYYLENEFAQASSYADSAVNSDRYNPSALTNKGNTVFANGDYEKAAEFYKEALRNDSSCTEALYNIGLTYKKLNRLDEALDCFLKLHAILRNSAQVLYQIANVYELMEDPNQAIDWLMQLISVVPTDCRALSKLGELYDSEGDKSQAFQYYYESYRYFPSNIEVIEWLGAYYIDTQFCEKAIHYFERASLIQPTQVKWQLMVASCFRRSGNYQKALDTYKDIHKKFPENVECLRFLVRLCTDIGLKEVQEYATKLKRLEKMKEIREQRIKSGRDGSGGSRSKREGSAGSDSGQNCSASSKGERLSARLRALPGTNEPYESSSNKEIDASYVDPLGPQIERPKTAAKKRIDEDDFADEELGDDLLPE	44029	268705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_44160_56254_56351_60382_60446_78981_79039_80192_80247_80868_80933_81660_81731_82282_82374_87152_87258_88729_88833_89952_90068_98684_98917_100247_100319_110338_110426_145151_145252_157444_157532_165726_165914_168549_168659_170368_170520_172084_172201_180266_180320_182168_182235_208530_208638_238005_238073_268035_268147_268391
873118	contig_14882_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_115005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTACGCTAGTTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267285	264608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_264600_267300
873119	contig_4301_pilon	-	3791	4	Intergenic	novelGene_65120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_3	375.550558809626	44	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACTTGATTTCGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550091	538870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699_543840_547294
873120	contig_14882_pilon	-	2094	17	Intergenic	novelGene_115015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	320.868493068032	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	467	1597	317300	297490	TRUE	85	AAAAAAAAAAAGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSHEFKIKGRKASKPISDSREVSNGLEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPPLDKESISENPTLDLPCSIGRTEGTAHSSNTSDVDFTGASTAKETTSSSISRHYETQT	356749	295741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_296193_297443_297503_297683_297789_297900_297954_298070_298177_301960_302132_303713_303782_310073_310198_311232_311302_312366_312463_316351_316501_316882_316984_317224_317318_321323_321410_321539_321642_321721_321739_356505
873121	contig_366_pilon	+	2690	3	Intergenic	novelGene_51562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	232.5	190	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	991	2391	644788	649345	FALSE	15	TCTCAAACTTCTGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSRNCWRRDASAFSTACSLSWAGVGLWTVTSGSMWVIGELVVTQQSQFVQPGLMGLRTAHPSLGAVPSGERSHHSQRMGKGSWPASSPLHMQKRWQVPGRPPGYGDPIVGGQPKELSARGPQLCVSPRIYKYQAHGYAFSGVEELLYSLGESAFVNMTQRSVAESLLQVGVTQRFIDDVISAVLRASYGQSAAMPAFAGAMSLAGAQGSLWSVEGGNKLVCSGLLRLTKANVIHATVTSVTLHSTEGKALYQVGYENEAGHGSDFYDIVVIATPLHLDNSSSNLTFEGFSPPIDNIQGSFQPTIVSLVHGYLNSSYFGFPDPKLFPFASILTTDFPSFFCALDNICPVNISANFRRKQPQEAAVWRVQSPKPLFRTQLKTLFRSYYSVQTAEWQAHPLYGSHSTLPRFALHDQLFYLNALEWAASSVEMMAVAAKNVALLAYNRWYQDLDKIDQKDLMHKVKTEL	643797	649644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_645386_647843_647985_648683
873122	contig_7933_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_164710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5362	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	121	297	234460	233326	FALSE	35	ACATACTGGAGCGTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	234580	233160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430
873123	contig_9871_pilon	+	2472	3	Intergenic	novelGene_75691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_2	222	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1521	2105	537705	540638	FALSE	25	TTATACTTTCTTCATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNIYVISLDTLKLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	536184	541005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_537936_539747_539984_540520
873124	contig_3465_pilon	-	4934	1	Intergenic	novelGene_173400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2276	2575	797114	796815	NA	35	TCCAGACTTAAAGTCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLYLYPGANRVCCPFPSSLRLLFLRVEASGWGFVLFLQQCPSLFCKPAPLREAFSHLSPCFFFFFKLSVHGLADTLNSDLCLQNYERTDFFCKPPSFW	799389	794455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_794500_799400
873125	contig_6076_pilon	-	1772	2	Intergenic	novelGene_81738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAGTGCTGAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55872	53797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_55365_55667
873126	contig_6076_pilon	+	1827	1	Intergenic	novelGene_81740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTGGCTCCAGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54043	55870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_54000_55900
873127	contig_1107_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_126593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAACCAACGTGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855338	856341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_855300_856300
873128	contig_4640_pilon	-	4797	3	Intergenic	novelGene_147962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2200	2505	131213	130908	TRUE	25	ACCCTACCACGCACACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHINLHQQIRLSGMLCCLGGALVVQWLRARLLTKRLAVQIHHCSLETLWGSSTLSYRVAMSQNRLDGNGFGFFFSYFRLFLGISRILSIRRQRIIGKMKPH	133412	124901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_125862_127753_127882_129703
873129	contig_6137_pilon	+	2706	2	Intergenic	novelGene_59199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACTCTGGGTCTTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302183	1305081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1304800_1304991
873130	contig_16303_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_34121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGGGGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44674	42598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_42600_44700
873131	contig_593_pilon	-	2556	12	Intergenic	novelGene_101987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCCCAATGAGGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482458	259002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_259059_300048_300534_383570_383643_385614_385717_386469_386568_388564_388637_398706_398808_420090_420159_471622_471775_479014_479089_480191_480287_481277
873132	contig_8122_pilon	-	2137	11	Intergenic	novelGene_40216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_10	33.4408432908023	183	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	37	1137	426714	410811	FALSE	30	TCACCTTCCCCAAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPAWISKVSRLLGAFHNPKQVTRGFSGGVQTVTLIPGDGIGPEISAAVMKIFDAAKAPIQWEERNVTAIQGPGGKWMIPPEAKESMDKNKMGLKGPLKTPIAAGHPSMNLLLRKTFDLYANVRPCVSIEGYKTPYTDVNIVTIRENTEGEYSGIEHVIVDGVVQSIKLITEQASKRIAEFAFEYARNNHRSNVTAVHKANIMRMSDGLFLQKCREVAENCKDIKFNEMYLDTVCLNMVQDPSQFDVLVMPNLYGDILSDLCAGLIGGLGVTPSGNIGANGVAIFESVHGTAPDIAGKDMANPTALLLSAVMMLRHMGLYDQAAKIEAACFATIKDGKSLTKDLGGNAKCSDFTEEICRRVKDLD	426750	409810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_410895_412594_412748_413862_413948_415255_415321_415463_415567_416413_416548_417054_417243_418138_418254_420284_420369_422474_422538_426687
873133	contig_5423_pilon	+	2406	8	Intergenic	novelGene_85258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	796.39032579534	9	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	214	975	542216	553344	FALSE	40	ATTCATTTATATTAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKIDMVHRNISEGFFLDASRHILEAPQHGLERRHLEANQNELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	534799	554775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_534942_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_548788_548903_551350_551465_553206
873134	contig_8420_pilon	+	3240	11	Intergenic	novelGene_69348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	372.793253694323	5	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1654	2418	14610	29440	TRUE	30	AATTTCCAGCATTAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIIIFISVRIIVGLYVIYISDTSSFYSPGCIWCICISVLQNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHR	12956	41856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29453_33816_33985_35313_35430_36804_36986_37080_37168_39046_39177_41728
873135	contig_9921_pilon	-	4116	1	Intergenic	novelGene_23716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59527	55411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_55400_59500
873136	contig_1450_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_27449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	390	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCACACACACCTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787489	786480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_786500_787500
873137	contig_14838_pilon	+	4702	12	Intergenic	novelGene_151901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	450.973382513355	237	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	296	2302	31822	68483	TRUE	15	ACTCTATCGCTTAGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDDIKMKSTDFLQTAHLDSGGFGKVSLCCHRLHGLVILKNVYTGPKRTEYNESLLEEGKMMHRLNHNRVVKLLGVIIEDGNYSLVMEYMEKGNLMQVLKGEVSIPLSVKGRIILETVEGMCYLHGEGVIHKDLKPENILVDDDFHIKIADLGVASFKTWSKLTKEEHNEQRKVNCTSKRNGGTLCYMAPEHLNDVNAKPTEKSDVYSFAIVLWAIFANKEPYENAICEQQLIICIKSGNRPNVEDIIEHCPKEIISLMKHCWEANPEVRPTFAGIEENFKDFYLEQLEKDVEEDVKSLKEEYPDQNPIIKKMQSLQIDCVALPPSRSNSATEQPSSLHSSQGLRMGPIEESWFGPSSEYQQEENQPSLQSKLQEEANYHLFGSRMDRKEKWQPRQNVAYNREEERKRRVSHDPFAQQRPYENTQNPGVKGLAYPTATSHTDVFPQLSGLTSQPQVPYWNNGLYNSPHGSGARPLDPGIAGPRPWYGPNPSHMPSLHKTPVPETSLLVNTPTIPFISFPSTDESFRYNIYNSTGVQIGNYNYMEVGRMSVPPQDSTNTNFKEEPASKYQEIFDNITSLTDKHLDPVRENLGRHWKKCARKLGFTEPQIDEIDHDYERDGLKEKVYQMLQKWLMREGNKGATVGKLAYALYQCSRTDLLNYLVRVSQN	18030	71253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_18259_31754_31974_32785_32943_36205_36344_38003_38233_40014_40165_55110_55188_61446_61538_63046_63620_65569_65723_68196_70383_70752
873138	contig_5758_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_119138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACTACAGGATTAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648447	646118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_646100_648400
873139	contig_10437_pilon	-	2089	3	Intergenic	novelGene_38387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_1	19.5	111	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	551	1021	753193	671516	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGGGGSSKASSSSASSAGALESSLDRKFQSVTNTMESIQGLSSWCIENKKHHSTIVYHWMKWLRRSAYPHRLNLFYLANDVIQNCKRKNAIIFRESFADVLPEAAALVKDPSVSKSIERIFKIWEDRNVYPEEMIMALREALSKCLFFTKSKI	753743	670447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_671652_701291_701422_752988
873140	contig_5196_pilon	-	1857	4	Intergenic	novelGene_38664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	399.672365819805	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	220	654	11848	9642	FALSE	35	AAATACTTAATTGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAALGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	14424	8438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9854_10035_10174_11763_11875_14231
873141	contig_10958_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_5342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTTTCCAATGGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592903	595092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_592900_595100
873142	contig_15236_pilon	+	3206	6	Intergenic	novelGene_141540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGCACATCTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105465	114052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_106609_110949_111179_111382_111508_111609_111686_112144_113603_113877
873143	contig_1335_pilon	+	4349	1	Intergenic	novelGene_166520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGCTTTAGGACTCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511956	516305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_512000_516300
873144	contig_8656_pilon	+	3165	7	Intergenic	novelGene_162358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	116.896915651735	212	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	45	749	621302	639545	TRUE	60	AAAAAAAAACAAGTTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLPGCGSEVRFRCMVYPAKRFCLVPAMEGVRWAFSCGTWLPSRAEWLLAVRSIQPEEKERIGQFVFARDAKAAMAGRLMIRKLIAEKLNIPWNNIRLQRTAKGKPVLAKDSLNPYPNFNFNISHQGDFAVLASEPELQVGIDIMKTSFPGRGSISEFFHIMKRKFTKKEWETIRSFKDEWIQLDMFYRNWALKESFIKAIGVGLGFELQRLEFDISPLNLDIGQVYKETRLFLDGEEEKEWIFECEI	621257	648974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_621485_623112_623339_633811_633934_634549_634712_639533_639985_644687_644760_647069
873145	contig_8310_pilon	-	4495	6	Intergenic	novelGene_75616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	27.2132320755915	129	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1429	4290	50	4339	351568	339894	FALSE	25	ATTTCTGTAAACTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPQRTNVCPDSIKRSEMVFEEAKLGEKPETLDVIDKILLPTKQEVEVEDISQKPSKQKPKPGETLAALKTWLKAPNVSPELLEDLCSKKDRTPTPESPRKSISGDVPRKIWKTTKCTPESREMTRMSPRLWRNPCASLELRENLTGMNDHMRTLKSPGESISNEKVHTEIQKTPKRTPKSGKTSRKALSLLRNTSASPELVEDLASMKDQTPTPESLGEPSGDDHREIQKTPKSTPKSGETPRLSLRLLRDPTASPELAEDLAGIKDQTPTPKSPGESISNEEVHREIQKTPKQTPKSGETSRKSLRLQRNPSASPGLVEDLASVKDQTPILESPGESVSGDDHKKIQKTPKCTPKSGETPRMSLRLLRDPIGSPKLVEDLSGMIDSTPALESGAESISNEEVHREIRKTPKYTPKSRETPRMSLSLLRNPSASPKLVEDLAGIKDQTPTAKSPGVSISCDDHRKTQKTPKHTLKSGETPRMSPRLCKDPNATLELVEDLASMKDHTPTPREPDEPESLVSPIGKSLLRPPLKIKPEPVEALTLNLLKTPPQTVPPEHQAVNTKLGAAPREESEPLTGVRKHLRNSTKKIAPVEEPTGIKTPVRTPKRSYEWMGNLSGLKSLMKTPRVRPEEDSTHIAKFLTESDSGILTSPEKLQESQVLRRPVTKGSPVEDLEPPKLMEVASAAFEETSDSATKNKDGPGGSQENPSCNPCEDEFQTNASEKNMEDSGINQRTRYALRNKGGPELQESKHLPHQTEKVESETNVKTTEPSIQANLRQGTSLRSRRRCKADTEVQESQLLPSTETIQINKGEMKTLKSSQKKTSEDGPRKEKAVTLRSRGRSKTGINLPETESLASLAEVIYTEEDDKPMESLQEKIKPTSEEKIVLRSRKKTNSNFGLVTRSNKIFPAKTEEPDVSSSTAARVSVSNDEKTVTHSLDKVFTEKIATRGLRSRCGPGTINPGSEACHSPLSTTEKADSGEVGKTRGRKHQKCKETALKEEARVKTRHQRTHLGEETQHSHSLPAPREEVSTDKEMALKQEARVKTRHQRKHLGEETQHSHSLPAPREEVSTDKEMALKEEARVKTRHQRTHLGEETQHSHSLPAPREEVSTDKEMALKQEARVKTRHQRKHLGEETQHSHSLPAPREEVSTDKEMALKQETRVKTRHQRTRVKTRHQRTRLGEETQHSHSRPVPCEEVSADKEAARRQETRVKTRHQRTRLDEETQHSHSLPTPREEVSTDKDREDKRMLNHTVPPQDGRGLRSRSRNKVSTDPEGLQSVASSTETKRTKKVTKMSVKKSRQQEAAAATEAIPCSRPGRRNKVPVTTTKMQGSDPEPSTENTLEKSAEDPSGKLSEDRVTVPGIPPSRLRSRNQTKSVAELCSKEIPTKEPSHKESDIKSLQRATRASKRGISEETATKNPKQDKNIIPTKRMRTRRYQGNEDA	351617	339737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_339960_343683_345810_346144_346197_347105_348005_350326_351428_351522
873146	contig_15570_pilon	-	2721	8	Intergenic	novelGene_137828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCCCCGCCGCTCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464631	445894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_446066_449889_450079_451301_452021_452389_452629_454133_454246_460703_460943_461702_461839_463715
873147	contig_12886_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_135512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAAAGCAAGTCTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620424	622450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_620400_622400
873148	contig_9706_pilon	-	3551	18	Intergenic	novelGene_20899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1607	2119	688775	423668	TRUE	10	CTCTATCCCGTGCCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRAFGETEGWGNLQNRARLEVFLVHPLRLANLQDLGVAQVLQFALELVQGARLGCKGSHNLLLHHLHYLVEVFRSGPHFLPRLVQELDTDAEKLLKGSVMGEEHRVEVVAGLTRQLAHFQYLTQHLGQLYTAATKGTFMLVFSAAVLKHNPDVGILMVLSEVEHIVQG	690381	91237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_91364_111975_112072_231532_231686_261971_262011_262965_263038_300315_300369_313340_313511_324271_324307_337117_337217_346563_346720_350064_350139_357498_357552_363661_363785_365683_365817_423617_423724_455988_456099_555500_555636_688563
873149	contig_6199_pilon	-	2706	8	Intergenic	novelGene_126408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_6	312.971342497184	219	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	174	965	727793	689922	TRUE	15	CCTGGGACAGCCCAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYRS	727966	683027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_684760_689912_690039_692076_692187_710722_710855_711153_711269_717750_717868_725503_725694_727782
873150	contig_14744_pilon	-	1443	1	Intergenic	novelGene_66022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATCTGACGCCGACCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970036	968593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_968600_970000
873152	contig_5463_pilon	+	2686	1	Intergenic	novelGene_144780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAAAATATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47974	50660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_+_48000_50700
873153	contig_3612_pilon	-	1974	7	Intergenic	novelGene_87802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_6	40.2385249343075	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	51	737	830950	820041	FALSE	45	AAATGTTCAGCAAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDYLGADQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTYGQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHVSGLLSLLHFEFLCIKMLQRFVYSALKLPIY	831000	818803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_820233_820631_820705_821430_821563_825044_825145_825858_825941_826555_826594_830880
873154	contig_2062_pilon	+	2550	20	Intergenic	novelGene_139057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	78.8925072540544	149	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	721	2379	1439874	1485745	FALSE	45	CAATAAAAGGGCCAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDAEQKYYSDLFSYCDIESTKKVAANGRVLELFRAAQLPNEVVLQIKELCGAKRLGYFGRSQFYIALKLVAVAQSGLPLRVESINTVKELPLPRFVASKNEQESRHAAPYSSDSENQGSYSGVIPPPPGRGQVKKGSISHDAVQPRTSTDQQEPASPVVSPQQSPPASPHPWRKHNRHPSGGNSERPLTGPGPFWSPFGEAQSGSSAADTVWSGHSPPPPQENWVSFADTPPTSTLLAMHPASVQDQTTVRTVASATTANEIRRQSSSYDDPWKITDEQRQYYVNQFKTIQPDLNGFIPGSAAKEFFTKSKLPILELSHIWELSDFDKDGALTLDEFCAAFHLVVARKNGYDLPEKLPESLMPKLIDLEDSADVGDQPGEVGYSGSPAEAPPSKSPSMPSLNQTWPELNQSSEQWETFSERSSSSQTLTQFDSNIAPADPDTAIVYPVPIRMTPSKIHMQEMELKRTGSDHNNPTSPLLVKPPDLSEENKLNSSVKFASGNTVADGYSSSDSFTSDPEQIGNNVNRQRSHSGTSPDNTAPPPPPPRPQPSHSRSSSLDMNRTFTVTTGQQQAGVVAHPPAVPPRPQPSQAPGPIVHRPVDADGLITHTSTSPQQIPEQPNFADFSQFEVFTASSVNEEQDDEAEKHPEALPVEKSSDPASSLRGAKTESKIEEKTAASAPANVSKGTTPLAPPPKPVRRRLKSEDELRPEVDEHTQKTGVLAAVLASQPSIPRSVGKDKKAIQASIRRNKETNTVLARLNSELQQQLKDVLEERISLEVQLEQLRPFSHL	1407618	1485916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1407760_1436628_1436753_1438369_1438567_1438697_1438852_1439769_1439895_1440410_1440574_1440869_1440934_1442122_1442278_1457814_1457937_1461764_1461846_1467831_1467920_1471350_1471453_1473690_1473764_1475077_1475197_1476070_1476136_1478133_1478320_1479438_1479535_1481454_1481604_1482965_1483072_1485676
873155	contig_9578_pilon	+	1102	5	Intergenic	novelGene_68006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	117.597565876169	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	119	709	1319409	1321548	FALSE	35	TCATCCAGATCTCAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REIKHFDADVLCLQEVQEDHYGTEIRPSLESLGYHCEYKMRTGRKPDGCAVCFKHSKFSLLSVNPVEFYRPDIPLLDRDNVGLVLLLQPKIPCAASPAICIANTHLLYNPRRGDIKLTQLAMLLAEISSVAHQKDGSFCPIVMCGDFNSVPGSPLYSFIKEGKLNYEGLAIGKVSGQEQSSRGQRILSIPIWPPNLGISQNCVYEVQQVPKVEKTDDNLTQTQLEETEVIVTPEK	1317565	1321941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1317594_1318288_1318359_1319388_1319811_1320954_1321082_1321486
873156	contig_2058_pilon	+	2503	7	Intergenic	novelGene_171560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	133.638401001442	296	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	225	866	83426	108702	FALSE	45	TTCCCCAATAGTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITQFRLFKVCTCLATVFSFLKRLICRSGRGRKLSGDQITLPTTVDYSSVPKQTDVEEWTSWDEDAPTSVKIEGGNGNVSTQQNALEQLEPDYFKDMTPTIRKTQKIVIKKREPLNFGIPDDSTGFSSRLAATQDMPFIHQSPELGDLDTWQENTNAWEEEEDAAWQAEEVLRQQKIADREKRAAEQQRKKMEKEAQRLMKKEQNKIGVKLS	70567	110339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_+_70777_83410_83509_86335_86415_87345_87505_89155_89264_103066_103159_108581
873157	scaffold_17541_pilon	-	3917	6	Intergenic	novelGene_175237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	120.205490723178	281	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	132	956	153441	129971	FALSE	20	CTGAGGGAGCATTTACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTVSTQRGPVYIGELPQDFLRITPTQQQQQIQLDAQAAQQLQYGGALGTVGRLSITVVQAKLAKNYGMTRMDPYCRIRLGYAVYETPTAHNGAKNPRWNKVIQCTVPPGVDSFYLEIFDERAFSMDDRIAWTHVTIPESLKQGCVEDEWYSLSGRQGDDKEGMINLVLSYTPLPAAMMMPPQPVVLMPTVYQQGVGYVPITGMPTVCSPGMVPVAMPPPAVPVQPRWNEEDLKAIQDMFPNMDKEVIRSVLEAQRGSKDAAINSLLQMGEES	153572	127009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17541_pilon_-_130186_132843_132935_133644_133798_136000_136184_138379_138530_153408
873158	contig_5201_pilon	-	2872	5	Intergenic	novelGene_82160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	0.82915619758885	141	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	37	561	164256	150768	FALSE	35	GACCCTATAGGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAVPAPQRASGMSAAEADRWAWLLVLSFVFACNVLRILLPSFSSFMSRVLQKDAEQESQMRAEIQGMKQELSTVNMMDEFARYARLERKINKMTDKLKTHVKARTAQLAKIKWVISVAFYILQAALMISLIWKYYSVPVAVVPSKWITPLDRLVAFPTRVAGGVGITCWILVCNKVVAIMLHPFS	164292	148456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_150842_152593_152709_154054_154123_154807_154974_164154
873159	contig_19185_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_163676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCGCTGTGAGAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184829	182743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_182700_184800
873160	contig_8140_pilon	+	2860	16	Intergenic	novelGene_86454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_12	28.155915107763	77	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	142	1512	842417	907746	FALSE	20	AGTTTTACCCCAGCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPCGTVNAERGWFVSAQQPEEAEAEESSPLLSNELHRQGSSGVSFGFSVFNLMNAIMGSGILGLAFVMANTGILGFSFLLLIVALLASYSVHLLLSMCIQTAVTSYEDLGLFAFGLPGKMVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAISEFLAGDYSGSWYLDGQTLLIIICIAIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMVFFALVVIIKKWSIPCPLPLNHIEEYFQISNATVDCKPKLFHFSKESAYAIPTMAFSFLCHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAVALSFLLYFISALFGYLTFYDKVESELLQGYSKYLPHDVIVITVKLCILFAVLLTVPLIHFPARKALMMIFFSNFPFSWIHHSLVTLALNIIIVLLAIYVPDIRNVFGVVGASTSTCLIFVFPGLFYLKLSREDFLSWKKLGACVLLIFGILVGSFSLALIIFDWINK	842275	909094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_842522_843683_843815_846153_846228_865395_865449_868628_868669_881391_881471_888214_888298_888758_888818_892629_892696_892905_892960_895088_895169_895520_895622_905636_905762_907127_907273_907391_907487_907665
873161	contig_14288_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_153830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGGACCAAGCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414212	412312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_412300_414200
873162	contig_5988_pilon	-	4012	1	Intergenic	novelGene_16153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCTAACTAGAACCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1959969	1955957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1956000_1960000
873163	contig_3233_pilon	-	3239	1	Intergenic	novelGene_56612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1586	1909	984826	984503	NA	50	AAAGAGAAGATAGGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEFLHILDSIWCYHYFFTLAILIHVYYLHQLLMSVLTWFFFLFPLSTFPFLKRELSVPLNAMEHFKYTWSHCFLKSLAELTCRGRLGLVLFTGEITPDFKKLNKQR	986411	983172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_983200_986400
873164	scaffold_17542_pilon	-	3843	10	Intergenic	novelGene_139219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	37.2290209379726	87	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	53	769	268598	254211	FALSE	50	AGTTCTATTCTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYHGKLLDGFLIRPFYKMMLQKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQRELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLADVDVNDWREHTKYKNNYSANHQVVQWFWKAVLMMDSERRIRLLQFVTGTSRVPLNGFAELCGSNGPQSFTVEQWGTPDKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD	268739	251136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_254314_254808_254882_260572_260670_261350_261459_261545_261606_266320_266382_266672_266747_267074_267171_268553_268625_268713
873165	contig_6612_pilon	-	3385	3	Intergenic	novelGene_148174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	514	junction_1	37	167	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	24	635	72745	67444	FALSE	30	GTCCCCAGCTCAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEVIFFSSSFPPFSSA	72768	64693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_67657_71390_71525_72480
873166	contig_15838_pilon	-	3223	2	Intergenic	novelGene_174329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACCAAAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116010	112595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_114820_115011
873167	contig_7580_pilon	+	1328	6	Intergenic	novelGene_108591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	350.459469839238	65	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	210	932	104065	109647	FALSE	25	TATATTTTCATGGGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGLFHFALGGLLMIPIGIYAPICVTVWYPLWGGTMFIISGSLLVAAEKNPRNSLVKGKMIMNSLSLFAAISGIILLIMDIFNITLSHFFKMESLQFIKGTKPYVNIYSCESDKNSEGSSLATQYCHGIRSVFLGIFAVMLIFSFFQKLVAAGIAENDWKRLCSRPKANVVLLSAEEKQEQTTEIKEHVIELTEISSQSKNEEEIEIIPVQEEEEEEAEINFPEPPQDQESSPIENDSAP	96433	110043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7580_pilon_+_96631_104052_104173_105320_105378_106952_107190_108145_108248_109428
873168	contig_10042_pilon	+	2944	14	Intergenic	novelGene_79221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_5	159.025694771735	250	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	158	1738	1094897	1139987	FALSE	20	GAGGCTTTCTTATTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLSSRVLRHRGRTQVQPEPGSGAVGSARGPRTGGDTPGHGFCYCPGSLKRKRSSGAFCYCHPDSETDEDEEEGDEQQRLLNTPRRKKLKSTSKYIYQTLFLNGENSDIKICALGEEWSLHKIYLCQSGYFSSMFSGSWKESSMNTIELEIPDQNIDIEALQVAFGSLYRDDVLIKPSRVIAILAAACMLQLDGLIQQCGETMKETINVKTVCGYYTAAGTYGLDSVKKKCLEWLLNNLMTHQNVELFKELSINVMKQLIGSSNLFVMQVEMDVYTALKKWMFLQLVPSWNGSLKQLLTETDVWFSKRRKDFEGMAFLETEQGKPFVSVFRHLRLQYIISDLASARIIEQDSLVPSEWLSSVYKQQWLAMLRAEQDSEVGPQEINKEELEGHSMRCGRKLAKDGEYCWRWTGFNFGFDLLVTYTNRYIIFKRNTLNQPCSGSVSLQPRRSIAFRLRLASFDSNGKLICSRTTGYQILTLEKDQEQVVMNLDSRLLIFPLYICCNFLYISPEKRIENNRHPENPEN	1094739	1141193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1095157_1105095_1105220_1107155_1107253_1108989_1109088_1111263_1111377_1111998_1112065_1115829_1115915_1117491_1117583_1118643_1118782_1129053_1129124_1131831_1131908_1135430_1135577_1136612_1136701_1139858
873169	contig_14925_pilon	+	3816	1	Intergenic	novelGene_55243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3388	3747	84282	84641	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAVKHSYTELLSVAHRRVGFFPGRVKLSPGDSALTLLAIVASVIGSRLTVTGSHVPQLSSATTSLHNSRTLSELPIASFRVRRALFSYLFQREEKNKKTPLMSKGALSSLTGRHFIM	80894	84710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_80900_84700
873170	contig_9481_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_149678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAGCACCCAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447734	449689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_447700_449700
873171	contig_6327_pilon	+	2512	2	Intergenic	novelGene_147489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAATATATTTGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68350	70984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_68708_68829
873172	contig_12620_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_98809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACAACTGAACGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366693	364122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_364100_366700
873173	contig_18859_pilon	+	3933	1	Intergenic	novelGene_150565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTAAAGAGCCGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281075	285008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_281100_285000
873174	contig_7057_pilon	-	2855	6	Intergenic	novelGene_123370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	16.0573970493352	87	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	746	2203	1064401	1062944	FALSE	50	TGTTATAATAAAAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMGNHSSILTKRQLILESNPIIQVGRLSVIMKCLFSIRRWKLQHSHLDIMNMRSLSLKRGGLITHNRAYRGGNPSEYSKRRRATNIEKKHTCTECGKSFCRKSVLILHQGIHTEEKPYQCHHCGNAFRRKSYLVDHQRTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGERSYECSECRNAFRLKSHLIRHQRTHTGEKPYECNECGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKPYICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICNECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYICSECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECSQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCNECGKCFRQKTNLIVHQRTHTGEKPYICNQCGKSFSYKRNLIAHQRTHKGENTEVQ	1093105	1062291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1064663_1068397_1068485_1071545_1071673_1089797_1089872_1092086_1092185_1093007
873175	contig_10013_pilon	+	2032	18	Intergenic	novelGene_125081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	209.929746033992	619	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	885	1970	474427	479307	FALSE	10	GTCCGCAGCCATCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEHDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWMELRHMHIADVSKKVTELLRTFCDSKRLTTDKANIKDLSHILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDAMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHCSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGPSSRLERKERLEPTYQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRKLWPFVSDPAPTPSSQAAVSARFGHWHKNKAGVEVRAGPRLIVYVVGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKTLDQKLEDIPLP	470348	479369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_470387_471683_471734_471973_472056_472615_472693_473247_473327_473411_473516_473893_474315_474393_474525_474618_474727_475078_475137_475264_475331_475428_475510_475838_475978_476437_476548_477338_477435_478243_478330_478470_478629_479221
873176	contig_10777_pilon	-	3992	2	Intergenic	novelGene_101170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTCTGAAAATGGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41534	36061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_39631_41111
873177	contig_19402_pilon	+	4180	6	Intergenic	novelGene_80864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2	44	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTTTTCTTCTTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167864	186078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_167937_168202_168300_170803_170984_174695_175194_182078_182257_182923
873178	contig_5260_pilon	-	3101	1	Intergenic	novelGene_144388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413506	410405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_410400_413500
873179	contig_14666_pilon	+	405	2	Intergenic	novelGene_39507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2093	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCAGAATTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321192	321724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_321500_321626
873180	contig_11898_pilon	+	1398	3	Intergenic	novelGene_144289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	9	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	168	503	240209	242117	TRUE	20	TAAAGCTGCCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESGSLTTEDCSRRPSEVRKGKEDGMRTAWAESGNKVEAPGSPSTSRGRIQPLRSVRTAENIWESLPVVLPTDLGIHQSLQPESESPALGPADLGFTSPCSCVTQEKPLS	240041	245628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_240406_241978_242154_244769
873181	contig_1813_pilon	-	2589	2	Intergenic	novelGene_105471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	610	1038	99254	98826	TRUE	55	AAAAAAAAGGGTTTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLISSPFWLSILASRHGGSGTARPCSCLGFPTNGSGHGGDSNGVLNEHPSLFVDGWDLRSTRLECLRDDWEEGRYLQGTGSLGLEESIHQLQTLQCPRMGEKTLEFPNPSSGGNLGWKIILCWASDPGRQVCRFWELYWSI	99863	96816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_97445_97902
873182	contig_5482_pilon	+	1907	2	Intergenic	novelGene_144464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	146	406	334534	334794	TRUE	50	TGAGAACTTAAAAGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQNILQKSQTGSTFFFIQLKLAQAALVVQWLSAQLLTERSEVQTHQRKMWLHGRKMWQSASIKITALETLWGHSTLSFRVTISQNRLNSNGVGVWFKLAHFCVCVLLVTVVFNYTPIIKSVTMSTPKYHHTYYV	334388	350119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_336063_349886
873183	contig_10765_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_122933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTCTGTAAAGATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210873	209707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_209700_210900
873184	contig_7171_pilon	-	1927	13	Intergenic	novelGene_101384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	89	junction_12	916.903950349581	127	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	261	1631	1372066	1363653	FALSE	20	TAACTAGAGCGCTTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYGGGSEGGRAPKRLKTDNAGDQHGGGGGGGGGAGAAGGGGGENYDDPHKTPASPVVHIRGLIDGVVEADLVEALQEFGPISYVVVMPKKRQALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQKISRPGDSDDSRSVNSVLLFTILNPIYSITTDVLYTICNPCGPVQRIVIFRKNGVQAMVEFDSVQSAQRAKASLNGADIYSGCCTLKIEYAKPTRLNVFKNDQDTWDYTNPNLSGQGDPGSNPNKRQRQPPLLGDHPAEYGGPHGGYHSHYHDEGYGPPPPHYEGRRMGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1374672	1363356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233_1367306_1370596_1370670_1370754_1370850_1371654_1371743_1371841_1372080_1372690_1372810_1374544
873185	contig_19821_pilon	+	3533	1	Intergenic	novelGene_176222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1	579	113225	113803	NA	15	GAACGCCTGGGGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNISSNISAFQSLHIVMLGLDSAGKTTVLYRLKFNEFVNTVPTIGFNTEKIKLSNGTAKGISCHFWDVGGQEKLRPLWKSYSRCTDGIIYVVDSVDVDRLEEAKTELHKVTKFAENQGTPLLVIANKQDLPKSLPVAEIEKQLALHELIPATTYHVQPACAIIGEGLTEGMDKLYEMILKRRKSLKQKKKR	113224	116757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19821_pilon_+_113200_116800
873187	contig_6589_pilon	-	2455	8	Intergenic	novelGene_25808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.46813224152673	8	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	272	1597	707962	674861	FALSE	30	TAAGTTTGGATGAATAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVARGVWGSKVRVLPAFLGPPRALSSLAAKMGEYRKMWNPKEPRNWAQQYREHFIPFSKQQLLRLLIQEFHSSPTEKAALEEFLAHVEFCTLFHYHEILDRLQALYDPINPDRETLDQPSLTDTQRLSNEQEVLEALKPLLIQANFSQLSEDTLAYALVVHHPQDGVQVTINLDQYVYMHFWALGQRVGQMPQKSSVGSKRGFFTRSPPAERRYFKRVVLAARTKGGHLVLKSFKDTPLEGLEQLLPELKVRTSTLQRALLNLILIVSGLVFFVNVGMVVVSDLKVGTSLLLLFFAVFMGLRASKMFGQRRSAQALELAHMLYYRSTSNNSELLTALTLRAQDEHAKEALLARSFLARLPGGASRPPQETSKWLQSEVESWLLTQSGCEVTFNGARALAHLQALTPSIGLYPPPGFPKLDQLTSITSEIPQATPRSDNP	708578	674002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_675076_675820_676011_681294_681575_688960_689092_691117_691313_702986_703092_707752_707985_708329
873188	contig_11115_pilon	+	3334	14	Intergenic	novelGene_102863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	63.321664034473	339	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	4	1344	173602	184234	TRUE	35	AAGAAAGCAAGGCTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAADVSVTHRPPLSPEAEAEAGDASERRVPEEELPPLDPEEIRKRLEHTERQFRNRRKILIRGLPGDVTNQEVHDLLSDYELKYCFVDKYKGTAFVTLLNGEQAEAAISAFHQSCLRERELSVQLQPTDALLCVANLPPSLTQQQFEELVRPFGSLERCFLVYSERTGHSKGYGFAEYMKKDSAARAKSDLLGKPLGPRTLYVHWTDAGQLTPALLHSRCLCVDHLPPGFSDVDALRRALSAVHTPTFCQLAYGQDGQLKGFAVLEYETAEMAEEAQQRADGLALGGSHLRVSFCAPGPPGRSMLAALIAAQATALNRGKGLLPEPNILQLLNNLGPSASLQLLLNPLLHSNAGGKQGLLGAPPSHATAERASPVHGAAAAGPAVPGSEEAWHPGRLSPGPPPAWGPAGQPPPWRAVCRGGPAPGAATPEREAATPAAATAWPLWK	173598	188142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_173815_175397_175465_177747_178218_181927_182120_182301_182432_182782_182879_183801_183890_184149_184362_184457_184552_184624_184765_185565_185641_186134_186268_186633_186718_186805
873189	contig_8631_pilon	+	3014	1	Intergenic	novelGene_121939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTTAAGCACCTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645041	648055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_645000_648100
873190	contig_12624_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_60985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGCAAGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84415	82304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_82300_84400
873191	contig_2311_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_169811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAAATATCTCACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265159	263238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_263200_265200
873192	contig_5018_pilon	-	2696	11	Intergenic	novelGene_47114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_6	40.0754288810488	237	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	108	1424	1434602	1429090	FALSE	20	CCTCTTAGATTTCTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRGVSTRLLSPCPGLRVLRLWGSVAAQTEKDGKTQNRAAKSSRPEFDWRDPLVLEEQLTADEILIRDTFRTYCQERLMPRILLANRNEVFHREVISEMGELGMLGPTIKGYGCAGASSVAYGLLARELERVDSGYRSVMSVQSSLVMHPIYAYGSEKQRQKYLPRLAKGELLGCFGLTEPNHGSDPGSMEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAGAFGCLNNARYGITWGVLGAAEFCLHTARQYTMDRIQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGKAITGIQAFKAGK	1434709	1427817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1431777_1432207_1432425_1432505_1432636_1433362_1433534_1433804_1433868_1434048_1434193_1434388_1434425_1434511
873193	contig_6079_pilon	+	1715	1	Intergenic	novelGene_160121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATAGCACAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506725	508440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_506700_508400
873194	contig_6079_pilon	+	1997	4	Intergenic	novelGene_160082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	166.681999294732	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	474	950	439366	507353	FALSE	30	AGTGCACTATAATTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNQRREGRRCQECSLSLPRESFETKRYSRIHEENKGRYHQRDPQLLPSFRQNETINKRFCERDSSSEPLEVPEVGKHADDTGLQVNNSVQKPPATCDDGADNLEVCRICHCEGDEESPLITPCRCTGTLRFVHQSCLHQWIKSSDTRCCELCKYDFVMETKLKPLRKWEKLQMTTSERRKIFCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGNDNGVLEWPFWTKLVVVAIGFTGGLVFMYVQCKVYLQLWRRLKAYNRVIFVQNCPDTAKKLEKNFSGNANTDIKDAVVVPVSQTGTSAPPPAEGGPPEVVPV	395814	508400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_396137_439214_439396_484540_484689_507054
873196	contig_14441_pilon	+	921	5	Intergenic	novelGene_100403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.603391243885	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	118	456	67440	122173	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTEVTQTPRQLVITTKQRATMDCVPIRQHNRVYWYRQKLGEELKFLTYLQNKEALDKSGLPDGRFSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSGMYFCASSPCCAPVLLRAALRPGH	67322	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67732_122126_122188_125804_125902_126159_126283_126514
873197	contig_11816_pilon	-	3272	1	Intergenic	novelGene_98573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGGAGATTGTAATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284594	1281322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1281300_1284600
873198	contig_8762_pilon	-	2806	1	Intergenic	novelGene_145285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGCCTGTGGTTTGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67242	64436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8762_pilon_-_64400_67200
873199	contig_3155_pilon	-	5178	5	Intergenic	novelGene_26338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	33	692	119659	119000	TRUE	35	GTCCTTTCTAAACAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFIAENETAVMHLQSAEELERLKAEEDSSGSSASLDSSIESLGVCILEEPLAVPEELCPGLTAPILIQAQLPPGSSVLCFAENSEHPTASTVNNPSYLNSGPLVYYQVEQRPVLGVKGEPGTEEAPPPFPKEKDLSVFSLPVTSLVACSPTDPAALCKSEVGKTPTLEALLPEDCNPEDPENDDFHSSWSPSSLPFCVDNEEGCGVEKTSQQSEDRSPEDSAVELPLTV	119691	112690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_112745_112861_112965_113063_113218_113902_113999_114920
873200	contig_990_pilon	+	2486	10	Intergenic	novelGene_76105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	134.700490801712	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	208	615	1394324	1420111	TRUE	10	TTAGTTGGTGGTGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSGKKTFSSEEEEANYWKDLAMTYKQRAENTQEELREFQEGSREYEAELETQLQQMETRNRDLLSENNRLRLELESIKEKFEMQHSEGYRQISALEDDLAQTKAIKDQLQKYIRELEQANEPQSCLWKTLSSA	1384834	1427784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1384889_1389389_1389501_1394281_1394410_1398793_1398948_1403513_1403641_1420070_1420208_1421750_1421931_1423458_1423551_1425254_1425407_1426433
873202	contig_3942_pilon	+	2428	3	Intergenic	novelGene_128753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2075	37	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	42	398	793521	794048	FALSE	45	CCTAACAATAAATCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKGTRGAKQGLGRSGTLDSALAASLAPGRHLNTIVGWGRSRGSSAFFFKIYTTRLLI	792273	796078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794
873203	contig_7410_pilon	+	2607	13	Intergenic	novelGene_106119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	85.7588673743615	164	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	292	1605	625081	648710	FALSE	15	TTCTTTCTTCAACTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRETYEEDQEYESQAKRLKTEEGEIDYSAEEGENRREATPRSGVDGGSGRSFSQPEAGGSHHKVSVSPVVHVRGLCESVVEADLVEALEKFGTICYVMMMPFKRQALVEFENIDSAKECVTFAADEPVYIAGQQAFFNYSTSKRITRPGNTDDPSGGNKVLLLSIQNPLYPITVDVLYTVCNPVGKVQRIVIFKRNGIQAMVEFESVLCAQKAKAALNGADIYAGCCTLKIEYARPTRLNVIRNDNDSWDYTKPYLGRRDRGKGRQRQAILGEHPSSFRHDGYGSHGPLLPLPSRYRMGSRDTPELVAYPLPQASSSYMHGGNPSGSVVMVSGLHQLKMNCSRVFNLFCLYGNIEKVKFMKTIPGTALVEMGDEYAVERAVTHLNNVKLFGKRLNVCVSKQHSVVPSQIFELEDGTSSYKDFAMSKNNRFTSAGQASKNIIQPPSCVLHYYNVPLCVTEETFTKLCNDHEVLTFIKYKVFDAKPSAKTLSGLLEWECKTDAVEALTALNHYQIRVPNGSNPYTLKLCFSTSSHL	605433	649712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_605599_620495_620615_625073_625312_627085_627172_629060_629158_629244_629318_633743_633816_638644_638863_641517_641640_642130_642333_642997_643056_643148_643248_648654
873204	contig_8122_pilon	-	3466	5	Intergenic	novelGene_40181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	61.0670737795745	109	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	267	1400	57283	45194	FALSE	15	TATTTCCTTCACTGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGDDQQSQALAKPAFSEVQASSLVESVFGLKVSEVQPLPSYDDQNFHVYISRTQDTADGPTEYVLKISNTESSKNPDLIEVQSHSIMFLQAAGFPTASMCHTKGGNITSLMSIDNGSEIKSYLVRLMTYLPGRPIAEISVSPQLLYEAGRLAAKLDKTLEKFHHPELSILHRENFIWNLKNVPLLEKYLYTLDQNQNPEIIKQVIQLFKDEVMTKLNHFRECINHGDLNDHNILVEPSSNSASGDTVYQVSGILDFDDMSYGYYVFEVAIMIMYMMIESKTPIQVGGHVLAGFESIIPLTALERGALFLLVCSRFCQSLVMAAYSCQLHPENKEYLMITAKTGWKHLQQMFDMGQKAVEEIWFETAKSYESGISL	61687	43127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_45658_46077_46262_55246_55387_56937_57289_61426
873205	contig_299_pilon	+	4973	1	Intergenic	novelGene_129417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAAAACCAGAAGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830268	835241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830300_835200
873207	contig_12644_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_44515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	865	1323	1123673	1123215	NA	10	TTTCAGTTTTGGGGATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLGKVIV	1124537	1122268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1122300_1124500
873208	contig_16724_pilon	+	2756	1	Intergenic	novelGene_105287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGCTGAAATCTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540335	543091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_540300_543100
873209	contig_19098_pilon	-	3926	28	Intergenic	novelGene_65790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	87.2711115637944	226	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1207	3624	109	3732	109395	69807	FALSE	50	CAAAGCAAGACAAATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLLRDYEPQLEDFVDQFVELQGEEIIAYKPPGFSLMYHLLNESPMLELALSLLEEGVKQLDTYAPFPGKKHLEKAVQHCLALLNLTLQKENLFMDLLRESQLALIVSPLEQLLQGINPRTKKADNVVNIARYLYHGNTNPELAFESAKILCCISCNSNIQIKLVGDFTHDQSVSQKLMAGFVECLDSEDTEEFVRLEEGSESEKKLAVIHHETRIHILHLLITSLERSPPNLALYLLGFELKKPVSTTNLQDPGVLGCPRTCLHAILNILEKGTEGRTGPVAVRESPQLAELCYQVIYQLCACSETSGPTMRYLRTSQDFLFSQLQHLPFSNREYEISMLNQMSWLMKTASIELRVTSLNRQRSHTQRLLHLLLDDMPVKPYSDGEGGIEDENRSVSGFLHFDTATKVRRKILSILDSIDFSQEIPEPLQLDFFDRAQIEQVIANCEHKNLRGQTVCNVKLLHRVLVAEVNALQGMAAIGQRPLLMEEISTILQYVVGRNKLLQCLHAKRHALESWRQLVEIILTACPQDLIQTEDRQLIIRDILQDVHDKILDDEAAQELMPVVAGAVFTLTAHLSQAVRTEQKQPLVSAPGEAHYAFMLDGSFTSPPSAESPMVGFASIGDSSLHIILKKLLDFILKTGGGFQRVRTHLYGSLLYYLQIAQRPDEPDTLEAAKKTMWERLTAPEDVFSKLQRENLAIIESYGAALMEVVCRDACDGHEIGRMLALALLDRIVSVEKQQQWLLYLSNSGYLKVLVDSLVEDDRTLQSLLTPQPPLLKALYTYESKMAFLTRVAKIQQGALELLRAGVIVRLAQCQVYDMRPETDPQGMFGMRDPPMFIPTPVDRYQQILLPALQLCQVILTSSMAQHLQAAGQVLQFLISHSDTIQAILRCQDVSARSLQELALLTGIISKAALPGILSELDVDVNEGSLMELQGHIGRFQRQCLGLLSRFGGSDRLRQFKFQDDGVEGDRVSKKDEIELAMQQICANVMEYCQSLMLQSPPTFQHAVCLFTPSLSETMNRDGPRQDVQAPVVPYWRLPGLGIIVYLLKQSASDFFSYYDSHRRSVNKLQNVEQLPPDEIKELCQSVMPAGVDKISTAQKYVLARRRLVKLINNRAKLLSLCSFIIETCLFIFWRHLEYYLLHCTPTDSQDSLFASRALLKSRRLQDSFASDTSLDFRSGLTVVSQHDIDQLQADSINAFGESLQKKLLDIEGLYSKVRSRYSFIQALVRRIRGLLRISRN	109855	69612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_69960_72299_72374_73492_73622_74106_74231_75841_76009_79316_79444_79636_79766_81961_82039_86113_86241_87945_88085_89664_89787_90476_90669_91664_91814_92772_92872_92957_93226_94267_94460_95430_95512_96044_96203_96938_97011_97589_97740_99236_99352_101994_102120_102458_102624_102913_102996_105173_105295_106776_106967_109298_109437_109788
873210	contig_15353_pilon	+	2849	12	Intergenic	novelGene_151961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	43	junction_11	53.9277140912485	191	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	181	1680	219996	244714	FALSE	5	CACCTGCCTGCTGGGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLTVNKAVDYPPVANAGPNQVITLPQNSITLFGNQSTDDHGITSYEWSLSPSSKGKVVEMQGVRTPTLQLSAMQEGDYTYQLTVTDTIGQQATAQVTVIVQPENNKPPQADAGPDKELTLPVDSTTLDGSKSSDDQKIISYLWEKTQGPDGVQLENANSSVATVTGLQVGAYVFTLTVKDERNLQSQSSVNVIVKEEMNKPPIAKITGSVVITLPTNTAELDGSKSSDDKGIVSYLWTRDDGSPAAGEVLNHSDHHPILFLSNLVEGTYTFHLKVTDAKGESDTDRTTVEVKPDPRKNNLVEIILDVNVSQLTERLKGMFIRQIGVLLGVLDSDIIVQKIQPYTEQSTKMVFFVQNEPPHQIFKGHEVAAILKSELRKQKAEFLVFGALEINTVTCQLNCSDHGHCDSFTKRCVCDPFWMENFIKVQLRDGDSNCEWSVLYVIIASFIIVVALGILSWTMICCCKRQKGKPKRKSKYKILDATDQESLELKPTFRAGIKQKGPMLSSSLMHSESELDSDDAIFTWPDREKGKLLLGQNGSVPNGQTPLKARNPREEIL	219815	245883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_220002_221296_221421_222033_222167_223913_224063_225123_225276_225641_225781_227282_227443_231273_231417_232260_232384_232956_233048_234390_234483_244526
873211	contig_6710_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_98351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCCATGTAACCCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662805	660634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_660600_662800
873212	contig_3469_pilon	+	3204	1	Intergenic	novelGene_34170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2818	3123	427268	427573	NA	25	AAATGCCAGGCCCTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKQHSKVAQFRMQQEHANCSLSCHDKLKHTGDTAAQTYKYNASTVTALIRIALGTANLIRRASLRFPECEDIPGWRPQALVQSVAKEVWISPEGKARRS	424450	427654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_424400_427700
873213	contig_13571_pilon	-	2948	9	Intergenic	novelGene_128111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATTAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117619	101582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_102548_103314_103453_103653_103792_104486_104570_107836_107961_108769_108861_115191_115255_116212_117257_117317
873214	contig_9161_pilon	-	3030	3	Intergenic	novelGene_160648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGAAGGCGAGAAACGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100522	94262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_94549_94633_94717_97861
873215	contig_11126_pilon	+	4534	10	Intergenic	novelGene_138146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	22.464787260659	135	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	6	1283	797362	868347	FALSE	70	AAAATTAAAAACAGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMKIGTQMQVVTELKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDADKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQSTQGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKVNELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIPSAITGTLSPQGIVVPASALQQGNVTMATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQALSPGTVRIQNSQLQLQLNQDLSILHPDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINARRRILQPMLDSSCSETPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIASGVVQAPPSELTMSEGAVVTITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSAEDDGGELTTTHISGLVLENSDSLQ	797356	871598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_797380_836544_836673_843212_843385_845647_845819_848308_848409_849853_849952_853140_853270_857671_857749_861482_861656_868135
873216	contig_16411_pilon	+	3122	3	Intergenic	novelGene_77395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	4.5	100	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAGTGCCAAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408218	418235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_409866_414404_414519_416874
873217	contig_7644_pilon	+	3022	1	Intergenic	novelGene_64238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTGTTCTTAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145516	148538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_145500_148500
873218	contig_6958_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_69965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAACCACAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274635	275984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_274600_276000
873219	contig_6533_pilon	+	822	3	Intergenic	novelGene_114609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	40	TGAATAACTATGTGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
873220	contig_1009_pilon	+	3685	21	Intergenic	novelGene_121759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	117.727343892572	372	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	923	2772	110	2881	287142	299568	FALSE	20	CCAGGTGTCTACCATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQFKRQRINPLPGGRNFSGAASTSLLGPPPGLLTPPVATDLSQNARHLQGGEKQRVFTGIVTSLHDYFGVVDEEVFFQLSVVKGRLPQLGEKVLVKAAYNPGQAVPWNAVKVQTLSNQPLLKSPAPPLLHVAALGQKQGILGAQPQLIFQHHRIPPLFPQKPLSLFQTSHTLHLSHLNRFPARGPHGRLDQGRSDDYDSKKRKQRAGGEPWGAKKPRHDLPPYRVHLTPYTVDSPICDFLELQRRYRSLLVPSDFLAVHLSWLSAFPLSQPFSLHHPSRIQVSSEKEPAPDTGAEPIPSDSDPGYSSKVLLLSSPGLEELYRCCMLFVDDMAEPRETPEHPLKQIKFLLGRKDEEAVLVGGEWSPSLDGLDPKADPQVLVRTAIRCAQVQTGIDLSSCTKWWRFAEFQYLQPGPPRRLQTVVVYLPDVWTIMPTLEEWEALCQQKAAEAALPPQESPVETESSEQAADASEQAADTSKQNAENPEVTAQQEMDTDLPEAPPPPLEPAVIARSDCINLSLHGIVEDRRPKERISFEVMVLAELFLEMLQRDFGYRIYKMLLSLPEKVVTPPEPEKEEPAKEEAVKEEEVVKEEVAKESKDEVQNEGAAAESDTPLKEDGLLPKPPSSGGEEEEKPRGEASEDLCEMALDPELLLLRDDGEEEFAGAKLEDSEVRSVASNQSEMEFSSLQDMPKELDPSAVLPLDCLLAFVFFDANWCGYLHRRDLERILLTLGLRLSAEQAKQLVSRVVTQNICQYRSLQYSRQEGMDGGLPEEVLCGNLDLLPPPGKSAKPSAAPMEHKGLVSHNGSLINVGNLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLEESHNRFSATEVTNKTLAAEMQELRNRLAEAEETARTAERQKNQLQRLLQDFRRRLTPLQLEMQRMVEKADSWVEKEEPAPTN	286149	300372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_286221_287103_287200_287469_287562_287919_288012_288218_288334_288502_288633_288805_288903_292593_292714_294427_294651_294739_294854_295169_295334_295810_295983_296068_296300_296397_296635_297293_297439_297569_297653_298140_298288_298468_298581_298681_298871_299020_299227_299523
873221	contig_11363_pilon	+	3644	1	Intergenic	novelGene_160481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTACCCAGTATTGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126348	129992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_126300_130000
873222	contig_4982_pilon	-	2157	3	Intergenic	novelGene_172221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	11	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1730	2155	18477	16403	FALSE	25	GTTGGGGACGAGAGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTAADTVIFFDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIARDTVEEIVCRKASSKLQLTNMIIEGGHFTLGTQRPSANADLQLSEILKFGLDKLLSSEGSIIDEIDMESILGETKDGQWISDALPTAEEGSIEQEEGS	20206	16400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_16571_17593_17748_18373
873223	contig_9434_pilon	-	4712	1	Intergenic	novelGene_150517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	3571	4044	451328	450855	NA	75	AACAACATAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKLIKLEREIDKSTIIVGDLNTPAINTTTKQKMSNDVEELKNTIKQQDLIDIYRTLHPTTAEYTFFSRPRGIFIKIGPILGHKINLNKLKIICSMRSNHNGIKLEISGKKTTGKFPNTWKLNNTLLNNLWSKKKFLKYKELNENENITSRFVGYS	454898	450186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_450200_454900
873224	contig_8330_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_71953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTTCACCTCACTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458594	1476831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1459504_1460668_1461074_1462596_1462680_1474532_1474611_1476774
873225	contig_3975_pilon	-	1399	9	Intergenic	novelGene_54808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_1	257.150460577071	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	83	952	2021058	2016131	FALSE	15	TTGCAGCCTGGCCCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFRPVISKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2021140	2015683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2019869_2021001
873226	contig_2100_pilon	-	2432	18	Intergenic	novelGene_50591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	222.585468208146	233	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	195	1523	960877	672172	TRUE	10	GGGCAGCCCCAGCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTADKDKDKDKEKDRDRDRDRERDKRDKAREGENSRPRRSCTLEGGAKNYAESDHSEDEDNDNNSATTEESTKKNKKKPPKKKSRYERTDTGEITSYITEDDVVYKPGDCVYIESRRPNTPYFICSIQDFKLVHNSQACCRSPTPALCDPPACSLPVASQPPQHLSEAGRGPVGSKRDHLLMNVKWYYRQSEVPDSVYQHLVQDRHNENDSGRELVITDPVIKNRELFISDYVDTYHAAALRGKCNISHFSDIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNSTQGEIRVGPSHQAKLPDLQLFPSPDGDTVTQHEELVWMPGVNDCDLLMYLRAARSMAAFAGMCDGGSTEDGCVAASRDDTTLNALNTLHESGYDAGKALQRLVKKPVPKLIEKCWTEDEVKRFVKGLRQYGKNFFRIRKELLPNKETGGINHLLLLLEENP	1009999	667856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_668077_668332_668447_668938_669101_670290_670491_670926_671020_672051_672217_742541_742623_781491_781591_813557_813658_814882_815008_822281_822331_847790_847896_868566_868664_870263_870370_918244_918371_927444_927516_960552_961022_1009949
873227	contig_5551_pilon	-	5395	10	Intergenic	novelGene_134275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTCTCCGTCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786575	752398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_752529_753906_754172_757146_757411_759606_759743_762322_762452_762888_763044_770591_770688_771588_771758_780215_780379_782687
873228	contig_3386_pilon	-	1687	6	Intergenic	novelGene_34537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	860.131710844333	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	102	476	409604	406808	TRUE	35	GTAGAGATGAACTTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412195	404256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_406366_406842_407702_407838_409398_409607_412096
873229	contig_10627_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_60060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254752	1256857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1254800_1256900
873230	contig_7025_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_104386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCAGCAGTGGCACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53046	50364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_50400_53000
873231	contig_6175_pilon	+	3106	1	Intergenic	novelGene_16343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGTGACAAAGTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1666028	1669134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1666000_1669100
873232	contig_11601_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_141035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCTGGCTTAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100287	98185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_-_98200_100300
873233	contig_9415_pilon	-	1340	3	Intergenic	novelGene_109768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	81	255	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	66	386	1599184	1597383	FALSE	0	TCCTCTTTTTTTCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLARDLLHPSLEDEKKKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGTRQLLSLPAKQQITNGACQRFYFYEQVLND	1599249	1596428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1597589_1598231_1598341_1599178
873234	contig_9415_pilon	-	488	4	Intergenic	novelGene_109769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_3	375.916066281941	2373	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	61	315	1599184	1596606	FALSE	15	CAAATCCTCTTTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSLRVSLYFCTRWTAESVTMPLARDLLHPSLEDEKKKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFRRKQH	1599244	1596432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1596635_1597477_1597589_1598231_1598341_1599178
873235	contig_7066_pilon	-	2986	12	Intergenic	novelGene_42203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	29.6374790643411	194	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	123	1481	1045467	1041061	TRUE	0	TTCTTGGTTTTTGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLPALSHSEGEEDEEEEEEEGKSWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFMQRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQIGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHDLERARLLVELIRKREKLKREMIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMGIDFETGMHIPHSLAGDEAPHHTEDAAEEERLVLLENQKHLPVEEQLKLLLERLDEVNASKQSVGRSRRAKMIKKEMTALRRKLAHQRETGRDGPERHGPSNRGSLTPHPAACDKDGQTDSAAEESSSQETSKGLGPNMSSTPAHEVGRRTSVLFSKKNPKTAGPPKRPGRPPQKPGEPDDPQPWRQSCGAPPTSHHGLPPSAQAG	1045589	1037213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1038094_1038822_1038978_1039352_1039473_1039574_1039712_1040359_1040508_1040995_1041282_1041596_1041921_1042244_1042555_1043350_1043480_1043880_1044013_1044410_1044574_1045387
873236	contig_18364_pilon	+	4016	1	Intergenic	novelGene_102562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111029	115045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_111000_115000
873237	contig_14219_pilon	-	4220	1	Intergenic	novelGene_54322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGACTAGTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719338	715118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_715100_719300
873238	contig_9345_pilon	-	4497	27	Intergenic	novelGene_24556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_22	90.8138742886438	259	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1318	3957	179	4135	743365	734158	FALSE	25	AGACTTAGTGACTGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARARRGLVVAASLGCGFLAGEFGHRVAKIAGPGRKRRSPDPDAVADPGALWLSTKRLKMSGGASVTGPRRGPPGLEEATSKKKQKDRANQESKDGDPRRASTREEQTKEELLLDWRQSADEVIVKLRVGAGALRLEEVDAAFTDTDCVVRLPDGRQWGGVFYAEIESSCTKVQARKGGLLQLALPKKVPLLTWPSLLKKPLGTQELVPGLRCQENGQELSPVALEPGPEPHRAKQEARNQKRAQGRGEVGAGAGPGTQAGPSAKRAVHLRRGPEGEARRDGPGPRGDAPPFLAESATQAVAEEQLRVPLLTPQTCLLGSDESQEKAVSPRNDPVSPATARSRDTGKSDCPKEEVAVAADAATLVDSKDPESMVSLAFVKNDSYEKGPDSVVVHVYVKEICRDTSRVLFREQDFTLIFQTRDGNFLRLHPGCGPHTIFRWQVKLRNLIEPEQCTFCFTASRIDICLRKRQSQRWGGLEAPAARGAVGGAKVAMPTGPTPLDSTPPGSAPHPLTGQEEARAVEKEKPKVRSEDTGLDGVAARTPVEHVAPKPEPHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGLVNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWKGTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSDGRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIVDLFQGQYKSKLVCPVCTKVSITFDPFLYLPVPLPQKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSPELAKERVVVLEVQQRPQVPSIPISKCAACQRKQQSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLTQLLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMALESQGPGCTSLFSTTSLEAGDSERDPIQPPELQLVTPVAEGDTGIPRAWSAPDRGPLPSTSGVSSEMLASGPIEIGSLPAGERVSRPEAAIPGYQHPSEAMSAHTPQFFIYKIDASNREQRLEDKGEAPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLGPTAEAAASQGLGPGQAPEAAPPRTAPDRFAPPVDCPAPTYSNMEEVD	745033	733795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_734275_735785_735965_736045_736207_736307_736461_736543_736761_736884_736996_737107_737422_737529_737668_737891_738011_738106_738248_738963_739066_739149_739261_739722_739834_739918_740078_740187_740322_740404_740601_740684_740906_741005_741122_741235_741308_741406_741564_741687_741896_742009_742313_742382_742517_742609_742739_742903_742934_743241_743500_744989
873239	contig_8322_pilon	+	3720	26	Intergenic	novelGene_143213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	17	junction_1	106.586423150418	170	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	99	2168	65543	252315	FALSE	45	AAGTTATTAAAAATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSSGGFSGVGSEPTRERRGYRRRSPGLDSVTMAQTEKRGGLLRKSSASKKPLKEKVVLMYDEIFMTEDPSKCSPRFWEELFLMKVNLEYLEGKLESLDGEELMKIKDNINCLFQHCIQALGEEHPIRVVNALQTLCALIRGVHQKNKSTSGFDIINMLMGFDKAELCMKNLMESLDSLLCAEGSESLKSLCLKLLLCLVTVTDNISQNTILEYVMINSIFEAILQILSHPPSRREHGYDAVVLLALLVNYRKYESVNPYIVKLSIVDDEATLNGMGLVIAQALSEYNRQYKDKEEEHQSGFFSALTNMVGSMFIADAHEKISVQTNEAILLALYEAVHLNRNFITVLAQSHPEMGLVTTPVSPAPTTPATPLGTTPPSSDVISSVELPLDADVQTSNLLITFLKYSSIVMQDTKDEHRLHSGKLCLIILTCIAEDQYANAFLHDDNMNFRVNLHRMPMRHRKKAADKNLPCRPLVCAVLDLMVEFIVTHMMKEFPMDLYVRCIQVVHKLLCYQKKCRVRLHYTWRELWSALINLLKFLMSNETVLLAKHNIFTLALMIVNLFNMFITYGDTFLPTPSSYDELYYEIIRMHQSFDNLYSMVLRLSTNAGQWKEAASKVTHALVNIRAIINHFNPKIESYAAVNHISQLSEEQVLEVVRANYDTLTLKLQDGLDQYERYSEQHKEAAFFKELVRSISTNVRRNLAFHTLSQEVLLKEFSTIS	46322	253867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_46410_65531_65645_68469_68527_68645_68793_71004_71113_76380_76474_77245_77321_77441_77529_80760_80818_81914_81959_83001_83063_84678_84726_85243_85320_88109_88204_91406_91509_99898_99958_101645_101712_102627_102698_103726_103788_118418_118508_134781_134865_135829_135957_149505_149582_215572_215652_249714_249832_252222
873240	contig_2987_pilon	-	3316	1	Intergenic	novelGene_125860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTGTCTGTGCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536606	533290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533300_536600
873241	contig_2204_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_71639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	372	1090	1461	1858	1487	NA	40	GGAACTGCTGACAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKIDKKLEEFRMMMQEQNAKINLQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTQRII	2947	1484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_1500_2900
873243	contig_3269_pilon	+	2891	19	Intergenic	novelGene_117025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	2219	2890	188229	238428	FALSE	15	GCCGAGCTCCGAGCGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGNLFWSQRFAWQHSEVPREVFILVVYHMPICAVGFNTLFDKQTLGSFLSIFWYCRLHCSTLPTYHRDGYIFHWKHKQVSERITVNLGFSLGDNILIVQGLHNFGLFQHHGAPHGLRHALPELGRRARLAEPLGEFAHFGHGSGGQVSVGAFTAPDPDGRDRGCSLCLHAGRPATSHSVAAALLLLLPPAAAPPSSRLPSFYRSLGSPAHSPAPRQRRLPRLK	135802	238429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_136214_138376_138472_140687_141031_145524_145601_145784_145909_148350_148434_149948_150074_156410_156620_157846_157990_165525_165610_166881_166964_167351_167528_170005_170138_187437_187536_188191_188263_191236_191320_191725_191816_191896_192013_238079
873244	contig_16951_pilon	+	2748	1	Intergenic	novelGene_98614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGATATGATTGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14342	17090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_14300_17100
873245	contig_6048_pilon	-	1329	3	Intergenic	novelGene_73348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.5	1141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTGTCTCTGGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2975795	2967890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2968735_2973668_2973785_2975426
873246	contig_7820_pilon	-	2623	1	Intergenic	novelGene_159916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2191	2526	32213	31878	NA	70	AAATGAATAAATGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPRIMQSTNSRARIQNHLFNSKAPSHYNFSAVENYPPVKVTEVLLNLPFSWFNQLVFLRVFFCAHSVLSVEYTDSSSPLMSTCFTGSYLARILSTGRFYLFPVDSYDFG	34403	31780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_-_31800_34400
873247	contig_13565_pilon	-	3790	1	Intergenic	novelGene_162373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	1787	2338	96644	96093	NA	40	CAAAACTGGTCATTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLKYISDKLYSPLCFKSRRIRYFFLRKHTSVASCLLTSIAFLGGHWSLNNKRSLTPAGALQQSVPFMSYTKARDCYEAEPYPESAWWGPTLGSASLDLKEPNTHTHLHTTLLKHHIHTHSYTLTPTLTHHIHTLKHHTDIHTYTLTHHSHTQTPHTHSHICLQTPHTLTYHTYTTTLIHIH	98430	94640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_94600_98400
873248	contig_14326_pilon	-	2498	5	Intergenic	novelGene_120688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	86.9511357027612	240	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	35	1033	177336	161605	FALSE	10	CCTATTCCTGGAGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAANSNGIAGSMQPEEEAARAAGTAIASQASLPVLPGVDRLPMVAGPLSPQLLTSPFPNVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSMFGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPISEDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMSYHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQTCNASFATRDRLRSHLACHEDKVPCQVCGKYLRAAYMADHLKKHSEGPSNFCSICNRGLQAPGAHPEWGSSVPLRQDLWQQRRPEMLTSGSD	177370	160139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_161639_162988_163062_169072_169245_175279_175344_176680
873249	contig_11678_pilon	+	5735	16	Intergenic	novelGene_160849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	38.4594447293365	294	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	162	1112	261570	266159	TRUE	5	CGGCCAGGCGGCGTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDTCLCPASGAKPKLSGFKGGGLGNKYVQLNVGGSLYYTTVRALTRHDTMLKAMFSGRMEVLTDKEGWILIDRCGKHFGTILNYLRDDTITLPQNRQEIKELMAEAKYYLIQGLVDMCQSALQDKKDSYQPVCNIPIITSLKEEERLIESSTKPVVKLLYNRSNNKYSYTSNSDDHLLKNIELFDKLSLRFNGRVLFIKDVIGDEICCWSFYGQGRKLAEVCCTSIVYATEKKQTKVEFPEARIYEETLNVLLYETPRVPDNSLLEATSRSHSQASPSEDEETFELRDRVRRIHVKRYSTYDDRQLSHQSAHRD	257933	276895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_257981_261455_261775_262390_262561_262975_263066_263141_263195_264009_264206_265922_269743_270321_270402_270948_271094_272116_272262_272724_272832_273069_273147_273287_273387_274088_274186_275278_275361_276687
873250	contig_20739_pilon	-	3015	2	Intergenic	novelGene_83176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCGCTCTTCAGCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169484	122551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_122945_166862
873251	contig_753_pilon	-	3519	5	Intergenic	novelGene_112982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_4	109.814616513468	67	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	285	815	1210648	1196902	FALSE	40	TCACTGAAGCATGATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLG	1211409	1194197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210749_1211225
873252	contig_165_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_117064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGTCCAGCATAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58130	56757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_56800_58100
873253	contig_11098_pilon	+	2045	7	Intergenic	novelGene_166680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_6	124.31869887064	50	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	35	1102	23788	34283	FALSE	60	CAAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFSPELIDYLEGKISFEEFEGRREERKNREKKSLQEKRKLSAEENKNDFEVPSSSGILSTKSQNKDVNDGETSDGVSKSVHKVFASMLGENEDDEEEEDEEEEEEETSEQPTAGDVFVLEMVLNRETKKMMKEKRPRSKLPRALRGLMGEANIRFARGEREEAILMCMEIIRQAPLAYEPFSTLAMIYEDQGDMEKSLQFELIAAHLNPSDTEEWVRLAEMSLEQDNIKQAIFCYTKALKYEPTNVRYLWERSSLYEQMGDHKMAMDGYRRILNYLTPSDGERFMQLARDMAKSYYEANDVTSAINIIEEAFSKHQGLVSMEDVNIAAELFISNKQYDRALEVGTFTCFCVRF	23753	35226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_+_23890_24877_24990_28759_28948_29699_29824_31554_31747_32261_32428_34099
873254	contig_3449_pilon	+	4881	1	Intergenic	novelGene_73738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGACACTGTTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501603	506484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_501600_506500
873255	contig_11396_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_71327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	681	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCACCGTGTGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471297	473247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_471300_473200
873256	contig_2036_pilon	-	477	4	Intergenic	novelGene_131830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_1	292.383690075596	38	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	22	357	636612	614437	FALSE	20	GTAATTTCAGTTAGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINT	636633	614316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_614441_617077_617232_631747_631872_636558
873258	contig_8330_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_71956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1089	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	702	1004	1506646	1506948	NA	35	TGGGCCAATGAAAGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPWKTRVPLAFQIEVITLLIVLQHVPLDLGRVHPGDEVLHAARDKESGVGYHVRPYAHVALLHESHGSLEVLRHAQLEKYGGQAAAAEGRSRHEIAELE	1505944	1507329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1505900_1507300
873259	contig_6885_pilon	-	5178	1	Intergenic	novelGene_83660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	1218	1727	187286	186777	NA	25	TATCCCCAGCTGGACTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRVTVTGCWGKEAGGRQQPGFYPMCIIQHESTGKETVCVSSLPNLPLLTLPVLQTPACCKPSASCLESPGLLQAYSIEGLNHNVAFVSRYLVRISLVLHKLVAIELILTLGNPMCVRVELCSVGFSVALGGLEPPTFQLAAALLTVSFTLGLLVLHTAQQYETFFRF	188503	183325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_183300_188500
873260	contig_14526_pilon	-	2874	15	Intergenic	novelGene_111221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.0275165545165	47	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	3	1814	456338	377158	TRUE	20	TAACCCTCGATTGTCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAPTPKYNSHSLENESIKRTPRDGINRELSEAVPRLPGETRITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSALILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHDWRVTFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNRQISKLTIYDARPNVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHADADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLITILDHLYSCRFGTFLYNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQINNSAKISDPPTSPASPSQMMPHVQTHF	456340	375578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_376544_377062_377326_381447_381625_384951_385066_386093_386187_390941_391149_393457_393644_398981_399171_403582_403733_405946_406031_427855_427958_433561_433673_449990_450086_451807_451881_456275
873261	contig_1939_pilon	+	3820	1	Intergenic	novelGene_144888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939077	942897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_939100_942900
873262	contig_11816_pilon	-	4565	7	Intergenic	novelGene_98448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.23606797749979	64	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCGCCGTTAAGGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445391	400501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_400655_420881_421047_429946_430137_430904_431075_432830_433937_437136_437306_442779
873263	contig_9011_pilon	-	2335	7	Intergenic	novelGene_159342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCAGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740864	706074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_706751_716215_716381_719254_719495_722079_722187_731967_732132_733840_733941_739981
873264	contig_16205_pilon	-	1319	11	Intergenic	novelGene_156853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	125.410685350173	995	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	414	1319	70684	16181	FALSE	40	GTAAGAACATAAACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAGPATPQRFFRSLSDALIDEDPQAALEELTKALEQKPDDAQYYCQRAYCHILLGNYCDAVADAKKSLKLNPNNSTAVLRKGICEYHEKNYVAALETFTEGQKLDDADDNFIVWIKRCQEAQNGQNQSLSQRTHQSKIKYDWYQTESQVIITLMIKNVQKNDVSVEFSEKELSALVKLSSGEDYNLKLRLLHPIIPEQSTFKVLSTKIEIKMKKPEAVRWEKLEGEGDVPKPKQFIADVKNLYPSSSHYTRNWDKLVGEIKEEEKNEKLEGDAALNKLFQQIYSDGSDEVKRAMNKSF	71097	16180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_16363_19567_19659_29159_29268_30233_30331_32170_32217_37674_37729_42368_42440_47378_47449_48102_48194_70506_70565_70646
873265	contig_8554_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_160292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTAGCATCTGTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119818	121937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_119800_121900
873266	contig_12123_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_144619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2255	2608	176649	176296	NA	35	AAAATATGTGTCAACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSEESKGRNNLSYLLGDRGPALLPVALQHLHHYKYPQKSSGNCHPPPKNKQNKKQEVKDSKDQSFLKASQLGTYFLSMENTFIYSCPYKTRSSSLVIESVPLIIRLSRRRKFGALS	178903	176077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_176100_178900
873267	contig_709_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_57668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	729	1077	1805	3925803	3926531	NA	35	CAGACAATATCCTTTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHTGEKPYKCELCSFRCSDRSNLSHHRRRKHKMVPIKGTRSSLSSKKMWGVLQKKTSNLGYSRRALINLSPPSMVVQKPDYLNDFTHEIPNIQTDSYESMAKTTPTGGLPRDPQELMVDNPLNQLSTLAGQLSSLPPENQNPASPDVVPCPDEKPFMIQQPSAVVSAVSAGIPQSSSPTSPDPRPSQSQRNYSPVAGPSSEPSAHTSTPSIGNSQPSTPVPTLPVQDPQLLHHCQHCDMYF	3924726	3926532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3924700_3926500
873268	contig_7697_pilon	+	3962	1	Intergenic	novelGene_128288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTTTCAGGCTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249352	253314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_+_249400_253300
873269	contig_5623_pilon	-	3368	3	Intergenic	novelGene_154850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_2	275	131	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	2726	3367	218410	217769	FALSE	25	ACTTTCCACCAGGCAAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLVIGKGAPAGGSHRLGWACQTPCADPASSCLSGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPAARGWGTGTLRVPNRVLLVNVKFEGSEVSPTSPPSPGRCCGFCWGCFPMTPQIHLPPVASVGICETSVHVRAQP	275904	217767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_221000_239340_239459_275886
873270	contig_4951_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_122122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCGCGCGCAAGCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37370	39791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_+_37400_39800
873271	contig_3818_pilon	-	2248	4	Intergenic	novelGene_99316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	126.388290596875	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACTTGTCTTCAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114518	1097881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1099428_1103682_1103806_1106298_1106467_1114107
873272	contig_17885_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_177951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATGTTTAAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22519	20901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17885_pilon_-_20900_22500
873273	contig_14683_pilon	+	2806	1	Intergenic	novelGene_166043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	451	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCAATTCTACTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139562	142368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_139600_142400
873274	contig_15905_pilon	+	1991	14	Intergenic	novelGene_154712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCGAGAGGGGGTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268029	294472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15905_pilon_+_268441_270132_270195_270500_270624_271712_271866_278198_278271_278399_278597_280806_280937_281364_281424_282957_283078_287581_287686_288831_288894_289789_289900_289979_290132_294236
873275	contig_9939_pilon	-	1928	14	Intergenic	novelGene_158604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	42	junction_1	30.7186122097772	213	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1923	5	1927	397689	342176	FALSE	25	GTAAGTGTGTTTGTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMKQRVLQLQSSPLPPPPPERSSPDTPARKMEHGARKHIIQMTGFKMEEKEALGKLLLKLDCIFIKSEKYKDCTHLIAERLCKSEKFLAACAAGKWVLTKDYVIHSAKSGRWLDETTYEWGYKIEKDSHYSPQMQSAPKRWREELKRTGAPGAFHRWKVVLLVRSDKRSDSLVRVLEAGKANVILPKSSQSGITHVIASDARIKAEKEKDNFQAPFYPIQYLGDFLLEKEMQNHDEDINISSILTEHPKKEKFRDSSKDLKFVKTRNSMGRHTSGNQKEVKNYEDIQRSYILRKRCKKEKEQEEDSTKDVERDKIKSTLRKYLYRDQKEVKNSVFADYTKKVKTKVIKTDVEIMEVKNALKKHIYRAQAVRYSCIIADKQPLYNVEVKNAEFPRGVLNLIESLIEGQFFKEAIEELSSLQAHYIPPVCLLHALLENILQDNMGTFSGRYFHILSALLHLHPPWKSLAMSRYYLELFQCPTCMKGAWSLVEVLIRSCLFNENFCHQISENIIGSKVLHLTLLKFFFNLVESEVRHLTQKLYDWSDSQSLKITGKAILLELFWSGSETSALLTKPVNMLLEWTIYSHKEKYKSNDVFKHELAYLLTGILGAAVDYWIFLGLKMGRNVMRHMSDDLGSYVSLSCD	397693	342174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_342323_351451_351618_352216_352349_356934_357099_358156_358316_359328_359383_364273_364397_365258_365409_366289_366437_378362_378526_385775_386017_387093_387170_387327_387442_397602
873276	contig_12841_pilon	+	2314	2	Intergenic	novelGene_55875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	210	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTTCAGAAGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456431	462964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_457086_461304
873277	contig_7943_pilon	+	4608	1	Intergenic	novelGene_173137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132038	136646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_132000_136600
873278	contig_4852_pilon	-	2409	9	Intergenic	novelGene_153972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	68.3391130685788	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	107	403	94053	90889	TRUE	30	AATTCTTCTAAAAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLQTTDSQLQYRFVRNGWPLRLAWSSSPKLQIPSMWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFCSSVSPSPHHQGYWGPGCGGGYGRASL	94159	83236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86248_86278_86872_86945_87165_87249_88776_88805_90256_90374_90697_90971_91302_91424_93959
873279	contig_2463_pilon	+	3296	12	Intergenic	novelGene_43000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	54.8619605076578	153	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	113	1495	192109	239872	FALSE	20	GGAGAAATCTGGTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLYLENIDEFVMDQNKIVTYKWLSYTLGVHVNQAKQMLYDYVERKRKENSGAQLHVTYLVSGSFIQNGYSCHKVAVVREDKLEAVKSKLAVTASIHVYSIQKAILKDSGPLFNTDYDILKSNLQNCTKFSAIQCAAAVPRAPAEFSSSEKLEQSNLQASSETQANNELTTNGHGPPAAKQVSQQPKGIMGMFAAKAASKTQDTNKESKTEAKEASLVGSKAPGKGNVMSNFFGKAAINKVNLDSEQAVKEEKIVEQPPVSVTEPKLAAPAGLKKSNKKAEPVKMQQKEKKRGKRVDLSDDETKETTNVKKKRRRIKLPESDSSEDEVLPDSPGTNEAESPSPPPPASPPLEPVPKIEPEPPSTKGSSGENKRKRKRVLKSKTYVDEEGCIVTEKVYESESCTDSEEEFKMKTSSVYRPPAMTVKKEPKEERKGPKKGTAALGKANRQVSITGFFQRK	191996	241673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_192169_193463_193520_201009_201113_206085_206126_207367_207501_215758_216015_217236_217310_222096_222257_224763_224871_231667_231781_233573_233653_239669
873280	contig_12179_pilon	+	3580	1	Intergenic	novelGene_128012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGGGAAGAAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535699	539279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_535700_539300
873281	contig_8377_pilon	-	3542	1	Intergenic	novelGene_35100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATCATACAAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153307	149765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_149800_153300
873282	contig_3602_pilon	+	1604	2	Intergenic	novelGene_60555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATTGACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451257	452909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_451765_451812
873283	contig_2799_pilon	+	3427	1	Intergenic	novelGene_85487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCACACGATTAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519211	522638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_519200_522600
873284	contig_12603_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_105785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548702	551219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_548700_551200
873285	SIRV7	-	912	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42153	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
873287	contig_9400_pilon	-	4362	1	Intergenic	novelGene_146593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTCATCTTTATTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130308	125946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_125900_130300
873288	contig_14676_pilon	-	1467	4	Intergenic	novelGene_175163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	61.7215971565509	1015	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	94	1107	56785	43825	FALSE	20	GAACGGATTTGGTTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGCPQVPGPTAASEGPVVGPAGVLPCLELPTYATACALVSSRYSCLVAGPHRRHIALSPRYLNRKRTGIREQLDAELLRYSESLLGVPVAYDNIKVVGELGDIYDDQGHIHLNIEADFVIFCPEAGQKLVGTVNKVSSSHIGCLVHGCFNASIPKPEQMPAEQWQTLEINVGDELEFEVFRLDSDAAGVFCIRGKLNTTSLKAKCSEVSEEVTETITEEAVEKPPKRKKKRKEDQYTCGSILVEDGTAELLDVTTKEETDLQTNNNVDGLWVEESKKKKKKRKHQEDQDQDPVFQGSDSSGYQSDHKKKKKKRKHSEEAEFTPILEHSPKKKRKK	56878	43464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14676_pilon_-_44234_45545_45755_51319_51462_56531
873289	contig_14034_pilon	+	1950	5	Intergenic	novelGene_72636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	8.347903928532	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	126	515	153844	157240	FALSE	40	TTCACAAGAAAAACTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKENRVRTTVSCSTLTEYVSSHWQDLIQFFKVEKRLKAFPIRSVPTVADFRTRSLGNLSGCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152574	158675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_154464_154595_156941_157012_157102
873291	contig_19957_pilon	-	4242	1	Intergenic	novelGene_57707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAATCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186051	181809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_181800_186100
873292	contig_6710_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_97966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	653882	653562	NA	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653882	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
873293	contig_10490_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_169887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1232	1663	33437	33868	NA	30	TACAGCTGGAGGACGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYPTSHPTHRFLLFNFAAKPPAYRASSSQKLLESFERIHGALQPHHTLSLPETLFLQKDKRCLLLRETRPSLQKCGPFGFPGRWAEASSDFQGMPSKTWESSSSEGEADFSRIFLKSAKGRPREDPLPQSPFPSPPYPPRC	32205	34598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_32200_34600
873294	contig_10159_pilon	-	3866	1	Intergenic	novelGene_30808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCACCCAGCAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411858	407992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_408000_411900
873295	contig_9982_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_55776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGTAGGGCTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620735	619040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_619000_620700
873296	contig_9580_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_167745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGGAACAATGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114325	1111767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_1111800_1114300
873297	contig_5643_pilon	-	3109	4	Intergenic	novelGene_38763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	22.7596133534821	244	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	144	497	171146	167047	FALSE	20	TAAACTGACTTGGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPAQPLAQGEEGAAPGGGPPGPPPNMTSNRRLQQTQAQVEEVVDIIRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFESSAAKLKRKYWWKNCKMMIMLGAICAIIVVVIVSKYR	171289	164434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_167113_167826_167982_168199_168331_171144
873298	contig_7657_pilon	+	613	6	Intergenic	novelGene_30041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	418	junction_1	368.457867333566	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	121	612	264903	274607	FALSE	30	AAATTTTGTTTTTGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTSQPGATLPNGHSSLSLRSHPLRGEKKGDGDLSCINGDMEVRKSCRSRKNRFESVNQSLLFDQLVNSTAEAVLQEMDNINIRRNRRSGEVERLRMWTDTEFENMDMYSRVKRRRKSLRRNTYGIQNHHEVSTEGEEEESQEEDGDIEVEEAEGEENDRPYNLRQRKTVDRYQAPPIVPAHQKKRENTLFDIHRSPARRSHIR	264414	274608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_264467_264834_264989_266973_267077_268682_268792_271571_271689_274530
873299	contig_11896_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_88027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGAGTAATTAGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152565	150067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_150100_152600
873300	contig_6740_pilon	+	3294	1	Intergenic	novelGene_142709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAGGGTCTTTATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675914	679208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_675900_679200
873301	contig_8354_pilon	-	2853	19	Intergenic	novelGene_24076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	120.225046177554	24	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	37	1824	198044	117752	FALSE	15	AATTTTCTGGACTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDFCCENYQWHFMMGDILAHESELLALVREYLDFAEFQDTLKTFSKECKIKGKPLSKAAGGAFRDSTSLIIQKDLIAAFDSGDQKTFFHLWKEHVPTSIRDGDALAQKLEFYLHIHFAIYLLKHSIGRPDKEELDERISYFKTYLETKGAALSQTTEFLPYYALPFVPNPMVHPSFKELFQDSWTPELRLKLEKFLALIFKASNTPRLLTLCKENGQSNKEMLQQLHQQLLEAERRSMTYLKRYNKIQADYHNLIGVTAELVDSLEATVSGKMITPEYLQSVCIRLFSNQMRQSLAHSVDFTRPGTASTMLRASLVPVRKLKDVPLLPSLDYEKLKKDLVFGSDRLKAFLLQALRWRLTTSHPGEQRETVLQAYISNDLLDCHSNNQRSVLQLLHSQSEVVRQYTARLINAFASLAEGRLYLAQNTKVLRMLEERLKEENKDVITRENVLGALQKFSLRRPLQTAMIRDGLIFWLIDILKDPDCLSDYTLEYSVALLMNLCLRSAGKNTCAKVAGLVLKVLSDLLGHENHEIQPYVNGALYSILSVPSIREEARAMGMEDILRCFIKEGSAEMIRQIEFIIKQLNSEELLDGVLESDDDEDEDDEGD	198080	116722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_117761_118879_118936_123405_123497_128310_128386_132891_132969_134289_134430_140151_140276_141483_141575_148518_148612_150588_150704_151641_151677_165443_165543_169664_169823_180117_180143_187891_187985_189565_189722_190261_190433_195734_195861_197990
873302	contig_7887_pilon	+	1917	8	Intergenic	novelGene_124886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_7	175.3286127504	165	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	579	1571	288965	293116	FALSE	15	CCCCCATCCCTGGAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRTQQKPLLPTCRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFFTRLRAEPPNAKLWDSSRDISR	288386	293462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_289126_289884_290052_290799_290895_291549_291680_291780_291864_292048_292129_292310_292402_292930
873303	contig_8020_pilon	+	2523	9	Intergenic	novelGene_114456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	39.0398434295016	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	157	1203	387453	414317	FALSE	30	CAAAAGCTTTCTCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFCGRANPTTGSVEWLEEDEHYDYHQEIARSSYADMLHDKDRNVKYYQGIRAAVSRVKERGQKALVLDIGTGTGLLSMMAVTAGADFCYAIEVFKPMADAAVKIVEKNGFSDKIKIINKHSTEVTVGPDGDMPCRANILVTELFDTELIGEGALPSYEHAHRHLVQENCEAVPHRATVYAQLVESRRMWSWNKLFPIHVQTSLGEQVIVPPLELERCPGAPSVYDIQLNQVSPADFTVLSDVLPMFSVDFSKQVSSSAACHSRQFEPLVSGRAQVVLSWWDIEMDPEGKIKCTMAPFWAHSDPEGLQSTPAGLKSAFMEDCGLPTASFAVASKSTCSSSLENGQRT	382255	415637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_382321_387361_387548_388396_388434_401951_402102_403939_404049_406635_406749_413007_413250_413715_413897_414197
873304	contig_12050_pilon	-	2240	12	Intergenic	novelGene_62671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	177.185712910223	17	60	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	211	762	486455	453328	TRUE	20	ATATCCTGTCCTGTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDELNFDLDRGRVSGDRPPSAKRTKRSSQRTRTPLPR	511548	446059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_447025_447102_447397_448651_448697_451585_451676_452504_452548_453286_453396_471215_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
873305	contig_5539_pilon	-	3124	1	Intergenic	novelGene_104792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGAAATACTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390108	386984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_387000_390100
873306	contig_6842_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_130833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1800601	1802833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1800600_1802800
873307	contig_3861_pilon	+	2844	2	Intergenic	novelGene_57879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	5	1531	56145	57744	FALSE	5	TCACCTGTTTTGGGGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLAEVASLNDIQPTYRILKPWWDVFMDYLAVVMLMVAIFAGTMQLTKDQVVCLPMLPTPVNSKAHDVTTDIPKTEAATDQDQDGRATNDISFGTSAVTPDVPLRATYPRTDPTVPSQEARKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSSNFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVSTSSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVEDSDLIYKLYVVQTVIKTAKFIFILCYTANFVNAISFEHVCELKVEHLTGYEVFQCTHNMAYMLKKLLISYISIICVYGFICLYTLFWLFRIPLKEYSFEKVREESSFSDIPDVKNDFAFLLHMVDQYDQLYSKRFGVFLSEVSENKLREISLNHEWTFEKLRQHVSRNAQDKQELHLFMLSGVPDAVFDLTDLDVLKLELIPEAKIPAKIFSAIT	56140	59057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_57652_57724
873308	contig_11677_pilon	-	805	5	Intergenic	novelGene_85927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_4	17815.3485371463	2059	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	296	760	597768	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPELKAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598063	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_597749
873309	contig_19076_pilon	+	1865	5	Intergenic	novelGene_74213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	361.943624753911	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	498	878	152334	155254	TRUE	65	AAATGTACAAAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	102907	156462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_103079_146309_146503_152200_152398_154937_156163_156383
873310	contig_9366_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_166262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1986	2318	1010321	1010653	NA	45	CTTGCAAGAGCAATAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISMDTEKALDKIQHPLLMKTLRKFGIDRKFISMIQGMFEKPTANIILNGERLRAFPLKLEIRQCYLLSCPGSRVVKSLAANQEVSSSNPPAAPWKPYGAVLLCLRGLL	1008335	1010730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1008300_1010700
873311	contig_3111_pilon	-	2500	17	Intergenic	novelGene_129955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	204.646102683999	10	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	581	2062	24175	16088	FALSE	30	TAATAACTTTCATTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLALSFWVD	40009	15649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16112_16590_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22838_23185_23289_24064_24218_24768_24953_37546_37676_39263_39444_39964
873312	contig_11978_pilon	+	3132	1	Intergenic	novelGene_62831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCAAAAAAACAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458477	461609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_458500_461600
873313	contig_13015_pilon	-	1075	1	Intergenic	novelGene_165557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGTATGGCCCCCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373695	372620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_372600_373700
873314	contig_9848_pilon	-	3021	1	Intergenic	novelGene_79995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAAACTAAGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145926	142905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_142900_145900
873315	contig_7380_pilon	+	2720	8	Intergenic	novelGene_157517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	65.09083135535	32	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	73	978	139473	167228	FALSE	45	ACAGAGGAGGGACAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFAPQEAYSHLKNILEQINALTGALFTSKVLEERAERETESQGNSSSEQGEQVYDWSTGLENTDDSHLYFSPDQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFAEIYSQKIGIKKEVLLKTLWGDYYINMKAKRIMKVDQVMLPMSLLIDSHILAL	138634	168970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_155567_155702_157165_157304_159811_160027_167053
873316	contig_6217_pilon	-	2921	22	Intergenic	novelGene_109610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	445.769354554928	2	95	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2580	340	2919	468498	420650	FALSE	50	GAAAACACTGAAGGATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDELEKTIKKKEEWVKHTPFSEPPQQSLPSLKDSCQRELTNLLGLHPKIEMLLASCLALKSQLSAPDFVQKSLDSFLGRYQALQRDLEDRQQQLENELKSQPGREYLET	559498	420647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_420688_422340_422522_422682_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494667_506156_506286_559359
873317	contig_12120_pilon	+	3567	6	Intergenic	novelGene_21406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCGCCCCCACGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20880	156974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_23661_24245_24355_32300_32405_63560_63901_118559_118731_156911
873318	contig_2733_pilon	+	3021	9	Intergenic	novelGene_128571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_2	108.490711007901	507	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	887	2661	360	3020	770500	872344	FALSE	30	ACTTTGCACGCAGCACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQSSLHHPSTNQNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMGSAPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGGGQMGVYPGLQNERHGQSFVDSGSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQQPPPQPAPSGPPTQGHPPHMQQMGSYMARGDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQQSPSMAPSLRHSVQQFHHHAPTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGTVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGMPMEVGSYPNIPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRNLQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLADPQAIQERLLPGQQHPGQQPPFQQLPTCPPMQPHPGVHHQSSPPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQKVPVRQHSPSEPFLEKPGLDVTQVSGPNTQLGKSEDYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIVAEDSSKSFGKDDFPGGVDNQELSRNSLDGSQDEKKKKKKPKAKQDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKVPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLEKTPPPSPPPEEDDDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGRDSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEVEEFYVKYKNFSYLHCQWASVEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIM	704904	872345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_705090_770325_772162_821548_821980_836603_836746_841930_842069_843113_843180_849424_849481_862505_862621_872293
873319	contig_16322_pilon	+	4287	1	Intergenic	novelGene_87567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGCAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184466	188753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_184500_188800
873320	contig_16622_pilon	-	1651	6	Intergenic	novelGene_48492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_1	1239.86973509317	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	186	671	115540	112952	FALSE	15	AGCTAGCTTTCTCTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVWWWCFWRTDQRQGKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121425	111971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
873323	contig_7887_pilon	+	2954	11	Intergenic	novelGene_124920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_10	37.8502311749876	298	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	181	1437	563600	567985	FALSE	45	GGGAAATAATCTTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGAPRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGATPGAARPTPPGAQTPSHLGATLPVGQPAVGDPEVRKQMPPPPPCPAARELFDDPSYVNVQNLDKVRQAGGGGGPPNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQLVSMAEQLREEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL	563419	569502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_563668_564182_564247_564400_564521_564739_564794_564960_565013_565209_565337_566076_566276_566362_566433_566512_566648_566805_567045_567856
873324	contig_13267_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_146614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	105	404	156282	156581	NA	35	CAGAAAACTTCCCTGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTEQQGEGKTVQKQPGIARPEPVEISSLQAGSACMVRQAVAFRICFPHWETPSSSLFKPLEPVKRGAQSTKDKYIRLTYCPDQKTHCLGRTSLLFTCSLPALHWNRACRLHQMQASFIKCRMPWAGSRTPHLP	156177	157963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_156200_158000
873326	contig_12793_pilon	-	3966	1	Intergenic	novelGene_164116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAACTCCACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195014	191048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_191000_195000
873327	contig_16123_pilon	+	2509	3	Intergenic	novelGene_164286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_2	17.5	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGCTTAACACTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241862	256528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_+_241903_252534_252621_254145
873328	contig_4769_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_117949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTTAGTCTCTCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309652	312178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_309700_312200
873329	contig_8044_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_132377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCAAGTCTGAGTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377471	380061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_377500_380100
873330	contig_2027_pilon	+	2415	18	Intergenic	novelGene_39884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	65	junction_4	265.324218978348	178	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	28	2214	94949	103591	FALSE	20	AGTCTGCAACTTGCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNILGQKVSMHYSDPKPKINEDWLCNKCGVQNFKRREKCFKCGVPKSEAEQKLPLGTRLDQQTLPLGGRELSQGLLPLPQPYQAQGVLASQALSQGSEPSSENANDTIILRNLNPHSTMDSILGALAPYAVLSSSNVRVIKDKQTQLNRGFAFIQLSTIVEAAQLLQILQALHPPLTIDGKTINVEFAKGSKRDMASNEGSRINAASVASTAIAAAQWAISQASQGGEGAWATPEEPAVDYSYYQQDEGYGGSQGTESSLYAHGYLKGTKGPSITGTKGDPAGAGPEASLEPGADSVSLQTFSRTQPGAAPSIYQQSAAEASGSQGTAANSQSYTIMSPAVLKSELQSPTHPSSALPPATSPTAQESYSQYPVPDVSTYQYDETSGYYYDPQTGLYYDPNSQYYYNAQSQQYLYWDGERRTYVPALEQSADGHKETGASSKEGKEKKEKHKTKTAQQIAKDMERWARSLNKQKENFKNSFQPISSLRDDERRESATADAGYAILEKKGALAERQHTSMDLPKLASDDRPSPPRGLVAAYSGESDSEEEQERGGTEREEKLTDWQKLACLLCRRQFPSKEALIRHQQLSGLHKQNLEIHRRAHLSENELEALEKNDMEQMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRRKYGGMSAASVDFEQPTRDGLGSDNIGSRMLQAMGWKEGSGLGRKKQGIITPIEAQTRVRGSGLGARGSSYGVTSTESYKETLHKTMVTRFNEAQ	94921	103792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_95003_97199_97261_97413_97591_97958_98120_98315_98414_98498_98587_99240_99428_99533_99677_99771_99890_99990_100083_100191_100357_102039_102190_102289_102356_102438_102628_102714_102790_103049_103157_103233_103364_103465
873331	contig_3469_pilon	-	735	5	Intergenic	novelGene_34216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	1008.71486927674	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTACAACAGTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659439	545545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_546000_550259_550362_550975_551066_590930_590992_659411
873332	contig_12638_pilon	-	4053	1	Intergenic	novelGene_33362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATATTGGTTGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456673	1452620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1452600_1456700
873333	SIRV6	-	699	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACGAATTTCTATGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
873334	contig_2450_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_160326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	214	534	837519	837839	NA	35	TTATGACCTTGAGAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTYRSIFWITFIIYSHPITKKRDRPPLYIESCITVKVGGLNPQVTLLEENVAVCVCKDYSLGNSMGQYYFVLQGGCESESTQQQWKKKKQSLPYHLQFYLPEGK	837305	839498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_837300_839500
873335	contig_10549_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_110615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATAAAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209949	207711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_207700_209900
873336	contig_12626_pilon	-	3299	2	Intergenic	novelGene_80464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189943	182936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_183918_187625
873337	contig_15991_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_70926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3078.58314164162	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	72	488	105009	101267	TRUE	45	ATGAGGTTGACGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCSRERTRLV	105080	100409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101293_102032_102271_103583_103703_104975
873338	contig_17796_pilon	+	2045	11	Intergenic	novelGene_33803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	451.647971322799	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	128	1045	53527	110256	TRUE	35	AACTTTGCAGATATGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWTVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLVISSRIFSFH	53399	121251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75724_96322_96509_96831_96892_110233_110283_113849_113911_117874_117961_120424
873339	contig_13542_pilon	-	445	1	Intergenic	novelGene_131573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACACTCACAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726675	726230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_726200_726700
873340	contig_10732_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_114691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTCAGGAGAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87318	89098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_87300_89100
873341	contig_10296_pilon	+	4426	1	Intergenic	novelGene_168888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	294	596	917090	917392	NA	20	TTACTTTTTATCCCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLSVHYERFFPRTVTICCVVYLYFLLTQNLFFLKMIAGLNFSNSFVPKIIFNGKGAGLLSYIKYFLFLRKVIYSWLVHSQDAEPLKSFLESDFECTVL	916796	921222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_916800_921200
873342	contig_12790_pilon	+	2124	9	Intergenic	novelGene_35176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_8	25.385773574977	32	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	152	1264	8971	14950	FALSE	15	GTGTTTGGAATTTCTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAEPESRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGETGIGKSTLMNTLFNTTFETEEASHHEECVRLRPQTYDLQESNVQLKLTIVDAVGFGDQINKDESYRPIVDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNAHLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHSRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVKETELELKEKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQAFHATSQQPLRKDKDKKKS	7523	15810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_7646_8941_9138_9488_9676_10725_10888_11495_11593_11832_12002_12213_12347_12489_12681_14943
873343	contig_1380_pilon	-	4222	1	Intergenic	novelGene_138888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTACAATAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148301	144079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_144100_148300
873344	contig_11978_pilon	+	2983	1	Intergenic	novelGene_63035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCTGGTTGGTGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635860	1638843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1635900_1638800
873345	contig_14357_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_121676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACCAGCTTTCCTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535328	537300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_535300_537300
873346	contig_1331_pilon	+	3461	1	Intergenic	novelGene_37889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCTGATGCCTAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486163	489624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_486200_489600
873347	contig_5201_pilon	+	10385	17	Intergenic	novelGene_82186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_15	108.447279818352	457	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1280	3843	21	3863	326780	374746	FALSE	15	CATGTATTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLRDQELVKIVGIRYEVGPPTLCCLKLGFIDPATGKLMDKSFSIRYHDMPDVIDFLVLRQFYDEARQRNWQCCDRFRSIIDDAWWFGTVLSQEPYQPQYPDSHFQCYIVRWDNTEIEKLSPWDMEPIPDNVDPPEELGASISVTSDELEKLLYKPQDGEWGQKSRDEECERIISGIDQLLNLDIAAAFAGPVDLCTYPKYCTVVAYPTDLYTIRMRLVNRFYRRLSALVWEVRYIEHNARTFNEPESVIARSAKKITDQLLKFIKNQDCTNISELTNTSETDEQNAEDLDDSDLPKTSSGRRRVHDWKKRRNKATSYVESNWKKQCKELVNLIFQCEDSEPFRQPVDLVEYPDYRDIIDTPMDFGTVRETLEAGNYDSPLEFCKDIRLIFSNAKAYTPNKRSKIYSMTLRLSALFEEKMKKISSDFKIGQKFNEKLRRSQRFKRRQNCNRVSQPNKSIRSVKQNRVKSQRKVIPELAGSPTQSTSSRAAYSASYKRSASISSGITSHDSSDSEGSVERMRRNRPVTLKTGSTLSESEMEDSSATSSSSSASDSSEESKDSSRPRESSLRSGLSRSSSLRVTRTRAAQRKTGPVSLENGCGRKATRKRVYLSDSDDNSLQTGDSIKARAGNNRKVLRKCAAVAANKIKLMSDVEENSSSESVCSGRKLPHRDASAAAKKKLLHNSEDDQSLKSDIEEELKNQHQPSPVPTFHVVRKTVRESENGDSESESDLRVARKNWHTNGSKSQTPTTSKAKFLKIESSEEDCKSHDSDNEHKRTACPSTSGQKLKAGNGSEEEEEKDFEPGKREGRKYNTCHKNATFFKKTKFLSDSEDFESEQDDREDGRCHKVKTNLISGNLKCQPVAGSQCSSEHVSETDMDSDDNKVKGKLNNFMKDSTSQDNGHSHKVSKKRVCSSESDSNSKVVKKSLKVKTGLLRIARRCATSAANKIKLMSDVEDVCLENMCTRSKNGRKKPLHLACTTTKKMLSDSEGDTNCEVPNEQYAYEGKPPEADSEGSTKSISQSFNGDSESESILNSKHKNRHINSHKTNVASSKTKNSLIESSEDDSKSHIPGGKIGRKFSSESTSVQKAPAENNFEEELNYGLRRWNGRRLRTYGKAPFSKTKVIHDSQEAGETETKRKRRHPELENVNISETAGSSKFGPDTSRPKSDSDLGSVTESDIDCSDNTITKKRKTKGKAKVVRKGKTFTATISKSVRQQRQSKRPRLNVDDNDWEDLDCAKSKRVVRRSKIKTRNQGRRTVRYHDGDDDRSLENVLDDCTL	326759	381268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_326792_330958_331084_331766_331850_335800_335913_336540_336603_343018_343175_343393_343515_344511_344638_346249_346323_353650_353693_355020_355168_355828_355982_358410_358578_367670_367898_371102_371271_371660_372570_373586
873348	contig_3602_pilon	+	3068	4	Intergenic	novelGene_60538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	18.5711843695788	149	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAAGAGGTTGTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260141	269592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_260607_266002_266420_266707_266922_267620
873349	contig_7549_pilon	+	2328	3	Intergenic	novelGene_164521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	82.5	159	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	239	1105	692328	702012	FALSE	25	CCTTTGATGTGTTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLENDGAPSESIFDLDYASWKIRLTLGIAGFFFYLGVFVVCHQLSSSLTGTYRALAAKEKVFWNLAATRAVFGVQSTVAGLWALLVDPVLHADKAVNQQNWCWFNVATATGFFFFENVAVHLSNLFFRTFDLFLAVHHLFAFLGFLGSAINLKAGHYLAMTTLLLEMSTPFTCVSWMLLKAGWSDSLFWKLNQWLMIHMFHCRMILTYHMWWVCFWHWDGLINSLYLPHFILFLVGLALLTLIINPYWTHKKTQQLLNPVDWNFAQPEAKSCQPERTNGQIPQKKKQ	679614	703235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_679727_692201_692871_701688
873350	contig_5826_pilon	-	4839	1	Intergenic	novelGene_71529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	191	316	233827	233702	NA	30	AAAAATCAGGTGTTTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIHFIFFNRKNKINITFFTYYKGKHWRTDGISHVIYNSEDKLVTFNLETFGPVTLIQDAHINMPYQSWELRPLAVNKVLLTVTTVFTELQIQIKVNYCYIKVI	234017	229178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_-_229200_234000
873351	contig_16999_pilon	-	2760	1	Intergenic	novelGene_84979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCTTTACAGAAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81795	79035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_79000_81800
873352	contig_15434_pilon	-	1907	3	Intergenic	novelGene_56710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_2	21	224	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	340	1389	67606	40848	FALSE	25	GTTGAACAGTTGATTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEVKSRKKSAPKAAPAEPGKRSEGGKIPEARAAGGKGWADPRTGLSLLSLGTCLGLAWFVFQQSEKFAEVENQYQLLKIETNEFQGLQSKISLISEKCQKFEALMEQLKSFQIIVHLKHLQEEMHEVKTWSNRITEKQGILNNNLTTLSQEVTKVELSTTSMAKDVALKITTVKTDVRRISGLITDVTSLTDSVQELENKIEKVEKNTVKNIGDLLSSSIDRTAVLRKMASENSQRINSVKKTLSELKSDFNKHEERFLSLESDRAKVLKTVTFANDLKPKVYNLKKDFSRLEPLVDDLTLRIGRLVTDLLQRQKEIAFLNEKISNLTTVRAKIKDMKDEITHISDMD	67945	40329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_41604_55687_55806_67430
873353	contig_7839_pilon	+	1970	2	Intergenic	novelGene_45737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	893	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTGAAGGATTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952672	954754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_953482_953593
873354	contig_5479_pilon	-	2962	1	Intergenic	novelGene_133578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAATTTGGAAATAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158195	155233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_155200_158200
873355	contig_10475_pilon	-	3002	4	Intergenic	novelGene_148740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	127.059915875237	90	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	155	448	266553	240259	FALSE	50	CACATTCTGAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAPRAPPVHRAESANACAPTPAPGTAGFVTQPRACPRRSSPGLRSAPRADMGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTTR	268730	237704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_240269_263189_263254_266333_266556_268578
873356	contig_16492_pilon	+	3730	1	Intergenic	novelGene_100317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGTCTGTGATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177940	181670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_177900_181700
873357	contig_10968_pilon	+	1510	8	Intergenic	novelGene_84299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_5	151.509008286097	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	3	854	167443	177921	FALSE	25	TGCCTTTATATAATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	167440	178577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
873358	contig_987_pilon	-	4045	1	Intergenic	novelGene_72333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3566	3886	1175297	1174977	NA	20	TTTCCAAGGAGCAGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIWLVKTLYAGKINVDSSLKTNKKTWTPMFTAALLTIAKTWKQKKCPSTDKWINKIWYIHTMEYYSVIKRNEVLIHATIRKNLENIMLSEISQSQKDKYHMNSFI	1178862	1174817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1174800_1178900
873359	contig_1008_pilon	+	4308	10	Intergenic	novelGene_121626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	39.7308848363152	120	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	448	1770	1176364	1194229	FALSE	5	TCTTTGTTCTTTCTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHNSLLDLLVTENFCLLTDSAVWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAALQLWVNIVNGDICDSTRSDLYEYVVDFLTYCLDHELVWKYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPEDVISCLKKYPKALVRYLEHLVIDRRLQKEEYHTHLALLYLEEVLQQRPSANGKGAEVTEMQAKLRSLLQKSDLYRVHFLIDKIQGTGLHMESAILHGKLEEHEKALCILVHELKDFAAAEDYCLWSSEGRGDPYRQRLFHTLLAIYLRGDPSDCELVVPAVDLLNHHATEFDAAEVLQLLPDTWSVQLLCPFLTGAMRHSIHTKRMTQVALGLAKSENLIYKYSKMKLKGSSVQLSDKKLCQVCQNPFCKPVFVKYPNGGLVHTHCAANRHTNQNSPSPGNRT	1157834	1196767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1157886_1162220_1162376_1172293_1172377_1176205_1176567_1182201_1182260_1184098_1184243_1187614_1187762_1188354_1188515_1191338_1191773_1194052
873360	contig_3832_pilon	-	3043	4	Intergenic	novelGene_161466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	52.1621403787161	120	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	4	762	518024	377891	FALSE	75	AAAAAAAAAATCCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMSSSTMKFNGYMRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGYQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTKQKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTAGTSDTFEGWVDLEPEGKVFVVITLAGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQGAMRRRVHQINGHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQGKKSFFETMFNLVPVLTMMIPRENRKHSVNIVINNSLCVSWIPWWHSG	518027	375609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_378072_380931_381083_447700_447765_517661
873361	contig_12603_pilon	-	2489	10	Intergenic	novelGene_105783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	284.256926036992	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	14	1051	543680	523691	FALSE	10	CTCTTCTAGTGTGTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIHMLLFGNIWLSMASLVIFMQLRYLFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEARFAVATPEELAVNNDDCAICWDSMQAARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADNSRVREDHQGENLDENLVPVAAAEGRPRLNQHNHFFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGITQASNSQLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQLTRSVEITTDNVLEGRIQVPFPTQRSDSIRPALNSPVERPNSDQEEGEASTQTERVPLDLSPRLEEALDFSESADERQRMLVQRKDDLLQQARKRFLNKSSEHDSASESYLPSEGTSSDPVTLRRRMLAAAAERRLQKQQTS	543693	522252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_523839_524716_524782_524841_524902_527234_527319_529031_529167_534723_534828_536501_536693_541021_541133_541991_542126_543674
873362	contig_9940_pilon	-	6552	1	Intergenic	novelGene_125348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGTCTTAACTCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164345	157793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_157800_164300
873363	contig_3948_pilon	+	4269	1	Intergenic	novelGene_53342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494269	1498538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1494300_1498500
873364	contig_4213_pilon	-	3827	3	Intergenic	novelGene_124831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_2	34.5	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2525	2830	179092	177526	FALSE	65	GAAAATAAAAGTAGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLIAASEKQGLLYIYPQGWFNTYFLCTFFKVFLKRYVGRTEHWIGLTNETGQTWKWSNGNEFNNWFNMSGSKNCAFLNSTHVITAECQKPLHWICSKPSN	185354	176528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_177635_178895_181472_185209
873366	contig_5260_pilon	-	3469	1	Intergenic	novelGene_144368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254821	251352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_251400_254800
873367	contig_12327_pilon	-	1596	2	Intergenic	novelGene_140639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCACACGCTCCCGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172351	170356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_170446_170844
873368	contig_12570_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_79379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAGGGATTCTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281426	279998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_280000_281400
873369	contig_1734_pilon	-	4671	14	Intergenic	novelGene_164372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	168.533107382566	235	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	232	1722	617366	516709	FALSE	30	TTATTCTTATGAAAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTESGSCSAARQAKQKRKSHSLSIRRTNSSEQERTGLPREMLEGQDSKLPSSVRSTLLELFGQIEREFENLYIENLELRREIDTLNERLAAEGQGIDGAELSKGQLKTKASHSTSQLSQKLKTTYKASTSKIVSSFKTTTSRAICQLVKEYIGHRDGIWDVSVARTQPVVLGTASADHTALLWSIETGKCLVKYSGHVGSVNSIKFHPSEQLALTASGDQTAHIWRYMVQLPVPQPIADTSQQISGEDEVEFSDKDEPDGDGDVSSDCPTIRVPLTSLKSHQGVVIAADWLVGGKQAVTASWDRTANLYDVETSELVHSLTGHDQELTHCCTHPNQRLVVTSSRDTTFRLWDFRDPSIHSVNVFQGHTDTVTSAVFTVGDNVVSGSDDRTVKVWDLKNMRSPIATIRTDSAINRINVCVGQKIIALPHDNRQVRLFDMSGVRLARLPRSNRQGHRRMVCCSAWSEDHPICNLFTCGFDRQAIGWNINIPALLQEK	645552	513759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_516841_521378_521494_521991_522127_580629_580772_582198_582440_588211_588289_590492_590538_597079_597152_598595_598732_602350_602416_602746_602843_612425_612523_617228_617407_645361
873370	contig_9424_pilon	-	1461	3	Intergenic	novelGene_143773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4531	junction_2	355	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	821	1156	279584	277512	FALSE	5	TGTTCGTGTTGTGTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280404	277206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552
873371	contig_6576_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_42344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGACTGGAGGTATGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718261	715325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_715300_718300
873372	contig_5429_pilon	+	2758	2	Intergenic	novelGene_127776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAATATGCCTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109708	115141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_111282_113956
873374	contig_17796_pilon	+	4701	1	Intergenic	novelGene_33838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAGAGCAATGTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113483	118184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_113500_118200
873375	contig_13292_pilon	-	3634	1	Intergenic	novelGene_142919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2801	3118	31870	31553	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNFFSHSLGGSKSEFRVSASGEAFLFFVGSQGKSLLPIFPSRGASQHRDPRSKGCTILLALVSWWCEVPMSLFLLLSFISQKRLAQDTIQYCRLSPASLT	34670	31036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_31000_34700
873376	contig_15939_pilon	-	1964	11	Intergenic	novelGene_160251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	115.122934291999	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	148	1281	112544	30441	FALSE	15	GTCTTGGACTTTTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLLKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISSNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDASPAQPKHIGSIDPTCNVAEVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDQGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTL	112691	29757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_30472_35009_35150_40035_40147_41066_41169_42441_42519_50601_50680_65097_65188_67243_67429_69162_69235_73118_73261_112438
873377	contig_6710_pilon	-	577	2	Intergenic	novelGene_95579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
873378	contig_9484_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_105697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACCTGTTGCTGTCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280447	269751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_270282_272116_272241_276848_276995_280407
873379	contig_6871_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_21652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCATTACTTCCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748852	746479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_746500_748900
873380	contig_7815_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_134356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTATTTGGATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131440	133071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_131400_133100
873381	contig_12733_pilon	+	4348	1	Intergenic	novelGene_129603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTAATGCAGAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381153	385501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_381200_385500
873382	contig_14871_pilon	-	4836	1	Intergenic	novelGene_63738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300755	295919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_295900_300800
873383	contig_11525_pilon	+	3187	1	Intergenic	novelGene_171072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCCAGTTTTAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23416	26603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_23400_26600
873384	contig_13428_pilon	+	2724	4	Intergenic	novelGene_143446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	384.194684444691	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78707	84319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_80115_82148_82839_83582_83873_83982
873385	contig_5515_pilon	-	2004	8	Intergenic	novelGene_52328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_2	405.06981005798	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	22	1071	89081	68158	FALSE	10	CCTGAGCGGCTCTGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGFIIKQMKEDGACLFRAVADQVYGDQDMHEVVRKHCMDYLMKNADYFSNYVTEDFTTYINRKRKNNCHGNHIEMQAMAEMYNRPVEVYQYSTEPINTFHGIHQNEDEPIRVSYHRNIHYNSVVNPNKATIGVGLGLPSFKPGFAEQSLMKNAIKTSEESWIEQQMLEDKKRATDWEATNEAIEEQVARESYLQWLRDQEKQARQVRGPTQPRKASATCSSATAAASSGLEEWTSRSPRQRSSASSPEHPELHAELGIKPPSPGTVLALAKPPSPCAPGTSSQFSAGADRATSPLVSLYPALECRALIQQMSPSAFGLNDWDDDEILASVLAVSQQEYLDSMKKNKVHRDPPPDKS	89102	67224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_68280_68671_68786_68873_69076_71003_71208_75498_75648_75735_75893_75979_76045_89044
873386	contig_3942_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_128708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1425	1820	429158	429553	NA	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVEGTAYTAALRKVKGCRSGLRAEGKRDGEESSLHLCLEGLHSSVYFKHPLFMGILACCRANCPFFPWLGDQWGTVREITGRKLKQHPTYPPSCTRSACRSMPRRCPQTPSQSAQWGTAAHSSCTSTPS	427733	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_427700_430200
873387	contig_17382_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_165188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGAATACATGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28323	26810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_-_26800_28300
873388	contig_11337_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_107182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCTCATCTTGTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170449	173184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_170400_173200
873389	contig_2487_pilon	-	3586	1	Intergenic	novelGene_148478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	482	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186180	182594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_182600_186200
873390	contig_15353_pilon	-	3573	10	Intergenic	novelGene_151964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_6	54.4585015866368	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	410	1450	278814	260812	FALSE	35	ATTGTGTAAAATTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQTSEQELFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSELKQFSKGETEQDLEADFPSESFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVSVEPRSLIQGAFQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGAEHASSSPCSDRLGNAQDHALSQGSSEPGSRVRSVKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGIQQYLFENGRIDNIFTEPYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAYSPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVSEHLKLSFAHVMRRTRTLKYSTKMTYLRFFPPLQKHESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRSDVFYLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD	282044	258688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_261020_261985_262116_265090_265340_266674_266787_274979_275132_278441_278538_278720_278893_280891_280987_281406_281587_281988
873391	contig_11417_pilon	-	3798	2	Intergenic	novelGene_103344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	111	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGTGTGAGTGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682855	678106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_681845_682795
873392	contig_10003_pilon	+	4825	1	Intergenic	novelGene_88188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	395	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTTTCTATTTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454294	459119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_454300_459100
873393	contig_12965_pilon	-	3355	3	Intergenic	novelGene_65201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	562	junction_2	158	37	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	2791	3354	313118	308741	FALSE	40	TTACAGATATTAGCAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCLDRKPGDLSMNQSRSRSDDGGEEASFQDHNHHENERRWQQERLHREEAYYQFINELSDEDYRLMRDHNLLGTPGEITSEELQQRLDGVKEQIASQPDLRNRENGTNTRDSEVPRESSNEDSLLEWLNTFRRTGNATRSGQNGNQTWRAVSRTNPNSGEFRFSLEIHVNHENREFEIHGEDYASIP	315908	308739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_-_308971_311954_312060_312889
873394	contig_13292_pilon	+	3558	1	Intergenic	novelGene_142933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCATCTCATGTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159184	162742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_159200_162700
873395	contig_6552_pilon	-	3181	1	Intergenic	novelGene_163613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2476	2781	198973	198668	NA	20	TTCTGTATGTTGAGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGLQFVHSPPVFKRKTVERLSIDLVAVIPSFLRDNQVWYNIPLYFIKTLINHNLRRSSFPCSLDPSCLNMMGNKAFIEFLPITYNLLCFSKYTEKSCSR	201448	198267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_198300_201400
873397	contig_11968_pilon	+	3418	1	Intergenic	novelGene_172510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCTTCCAAAACAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61051	64469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_+_61100_64500
873398	contig_6100_pilon	-	2967	1	Intergenic	novelGene_168117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAATTTCTTCACTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478625	475658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_-_475700_478600
873399	contig_233_pilon	-	2229	4	Intergenic	novelGene_14489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	359.590816839857	1752	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGGCGTTCCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49351	40592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_41728_41783_42793_48419_48467_49313
873400	contig_20614_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_107552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGATAGTTTGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154784	155188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_154800_155200
873401	contig_7057_pilon	-	3549	1	Intergenic	novelGene_123205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTTAATATAAGAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425755	422206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_422200_425800
873402	contig_9415_pilon	-	4019	1	Intergenic	novelGene_109810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2569	2880	1765753	1765442	NA	35	CACCCAGCAGCACTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPPWMVIWLLTSLSTQQTTSGRTAGKRGWAESWDYLCTLAPADLSSIISPGHPSMPSRPLPHQTAGPPLNIAGALKAFYTRFPFGMPLYVFHLENSLKTQL	1768321	1764302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1764300_1768300
873403	contig_14711_pilon	+	2788	15	Intergenic	novelGene_68938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_12	54.4284308209657	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	43	1137	119007	133964	TRUE	20	TTATATTTTGTTGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPEQRPAQKDFVLMADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGWSSGDGVFCPGGSISNIYAVNLARYQRYPDCKQRGLRALPPLALFTSKECHYSIKKGAAFLGLGTDSVRVVKVDERGKMIPEDLERQISLAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHKRLLAGIQRANSVAWNPHKLLTAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVPGGGNKEEGRI	118707	136775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_118739_118995_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120557_120993_121110_121814_121895_122196_122252_132403_132521_132596_132662_132953_133036_133498_133589_133925_133978_134106_134197_135227
873406	contig_13148_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_162936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGATTAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224274	222825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_222800_224300
873407	contig_5649_pilon	-	5271	11	Intergenic	novelGene_82326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	493	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCTGCCCGCGGCCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456080	418638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_418714_419523_419635_429909_430014_432329_432380_442598_442661_446989_447071_447882_447992_448256_448360_448876_448981_449809_449957_451755
873408	contig_1331_pilon	-	2672	10	Intergenic	novelGene_37877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	114.059438695601	179	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	82	1170	356415	346656	TRUE	35	TAATAATGGTTAATGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKTTYLEDLPPLPEYELAPSKLGEEVDDVYLIRAQGLPWSCTVEDVLNFFSDCRVRNGENGIHFLLNRDGKRRGDALIEMESEQDVQKALEKHRMYMGQRYVEVYEINNEDVDALMKSLQVKPSPVVNDGVVRLRGLPYSCNEKDIVDFFAGLNIVDITFVMDYRGRRKTGEAYVQFEEPEMADQALLKHREEIGNRYIEIFPSRRNEVRTHVGSHKGKKMASSPTAKYITEPEMVFEEHEVSEDIRPMTTFESEKEIELPKDMSEKLPEAVDFGTTPSLHFVHMRGLPFQANAQDIINFFAPLKPVRITMEYSSSGKATGEADVHFDTHEDAVAAMLKDRSHVHHRYIELFLNSCPKGK	356496	344014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_345494_346632_346706_347059_347196_348341_348464_349599_349785_351403_351540_352156_352301_352796_352953_354006_354164_356412
873409	contig_10711_pilon	+	2840	2	Intergenic	novelGene_118440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1449	1805	804748	805104	TRUE	20	ACAGACCTTCCCTCCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLHRCEDLPSAFIHVLLFHIWWCVCSCLLALATLPTLSTQLTLILPIWLKAHAFCLTPADPDLSFFLSPLLVGTLNMKSVSKLGDSNNSSDRFPQTVAVELIPTHSNPIGQSRTAS	803299	806277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_806118_806255
873412	contig_10331_pilon	-	3165	1	Intergenic	novelGene_54204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAGGCACAAGTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647248	644083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_644100_647200
873413	contig_5896_pilon	+	2794	5	Intergenic	novelGene_159244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	3.57071421427143	94	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	439	2385	129052	135268	FALSE	30	AATTAATTTATTTCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYGHVASLGFPLLKPTMISQLEGGAELWGPLPVPTGVGTGPQGLWTDIDIQTDNNLTKEMCEEKDSTSFKLQRNFPQEADFPEAYILEKQQEVHSVGSVKKEDSSFIDRTVKDETSPVEEYFFSQSPNLYHCHTVSTGEQLPECTGSGKAFSADRELIQHEIIDTGERPFKCEELVETYRCDSQCNQHQDIDTGEKPYQCKECGKAFSVNAKLIWHQRLHSGDKPFKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKVCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECIDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKGFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKAFHSNAKLIQHQRIHTGEKPYECSECGKAFSVKGKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFRCNSQLRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPFECNECGKCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECGKAFSCSSDYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSYSSDCIIHQTVHTWKKPYVCNVCGKAFRFSFQLIHHQSVHSEGKS	125147	135677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_125378_126769_126835_128908_129086_130274_130389_133469
873414	contig_5005_pilon	-	2831	5	Intergenic	novelGene_84322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	326.052430599743	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	91	519	539718	520380	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIVSNHPICIQK	539808	511962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_519245_520621_521921_522041_539649
873415	contig_10734_pilon	+	1933	1	Intergenic	novelGene_51311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAAAAAGTTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1379215	1381148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1379200_1381100
873416	contig_9516_pilon	-	2078	2	Intergenic	novelGene_106162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	8	352	825540	825196	TRUE	20	TTTCCTGGTGGTTGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGMLTGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSQNQSLMGNQTFSPPSRPTVGLTPVAELELSSGSGSLFMAEPSVTTSGSLLARSPTPAPFSPFNPTSLIKMEPHDI	825547	823404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_824503_824567
873417	contig_15327_pilon	-	2723	9	Intergenic	novelGene_70797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.0988546083276	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	57	929	1244592	1231238	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPAVPPLHVLGDSHLSGMLPSYGSDGHLPPVRTLSPLDRLSDCSSQGLKLKKSLSKSVSQNSSVLHEEEDERSCSESETHLSRRRSAQYLREEYGDTPESENLTLSSSGAVDQSSCTGTPLSSTISSPEDPASSSLAQSVMSMASSQSQHSQISTDTISSMSGGSYIPPGPEEEGEALPSPQAARRAPSEEGEVLPLESPDVNFVGHPAEEQDAEGNDVPEEEDGSPTQEDGQRTSAFLGMEYDNNNDFDIASVKALDNKLCSEVCLPGTWQADNNAVGQRKTCRRSSSSSLEDPEDGTCVWGPLAV	1244648	1228702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1230064_1230804_1231357_1237043_1237155_1238882_1238932_1239958_1240025_1240296_1240488_1240880_1240993_1243630_1243740_1244476
873418	contig_15327_pilon	-	2197	2	Intergenic	novelGene_70483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCCCAGCCCGGTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377019	372772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372840_374889
873419	contig_2444_pilon	-	3058	1	Intergenic	novelGene_83746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	593	1782	50	1831	52642	50861	NA	20	ACTTTATTCAGACCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSTATALSRCGFTSTMLRISAFRLLGCIRYSRISLPQESGPRHYGSCPLGAHDEVRDGRAYFTTPIFYVNAAPHIGHLYSALLADALCRHRRLRVPVAAATRFSTGTDEHGLKIQQAAATAGLAPAELCDRVSAQFQQLFREAGIASTDFIRTTEARHRLAVQHFWEVLKARGLLYKGLYEGWYCASDECFLPEAKITWQQGPSGDACPVSLESGHPVSWTKEENYIFRLSHFREPLRQWLRDDPQAVIPQPFYHAVLQWLEEELPDLSVSRKSSHLHWGIPVPGDDSQTIYVWLDALVNYLTVIGYPDAEFKSWWPVTSHIIGKDILKFHAIYWPALLLGAGMSLPHRIYVHSHWTVCGQKMSKSLGNVVDPRTCLERYTVDGFRYFLLRQGVPNWDCDYYDEKVVKLLDSELADALGGLLNRCTAKRINPSGTYPAFCTACFPSKSGLVGPLVRAQAEDYALVSAVTALPQQVADHYDNFQIYKALEAVSSCVRQTNGFVQRHAPWTLNWESPVDAPWLGTVLHVALECLRVFGTLLQPVTPTLADKLLSRLGVSATERSLGELCFLPRFYGHPCPFEGRRLGPESGLLFPRLDQSRAWLVKAHRT	52691	49633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_49600_52700
873420	contig_16098_pilon	-	1419	10	Intergenic	novelGene_45787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	369.152516240799	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	784	1158	35013	31519	TRUE	5	TGGTCTGTAGCTCTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVSVENEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36343	31098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34991_35113_35215_35749_35907_36011_36295
873421	contig_17144_pilon	+	2751	2	Intergenic	novelGene_29140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGTAAAACCTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70404	74774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_72374_73992
873422	contig_3111_pilon	+	3555	23	Intergenic	novelGene_129958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	114	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1145	1624	20980	22767	TRUE	80	GGACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWTHALHAMGQQQHNAVLPHPLGLSWADELVDDALGCVVEVTKLGLPEDQGVGAGHGKAPTHPGLRTQTGSCCRQCRGPDWARGGSWGCRSSCPRSGRAAHGVVSHLKVPRSTSWPLSRMWIPSFRREPKAMYSARAQSTVLFFTSSPRVFRIRLSPP	15663	100404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_16115_16593_16709_16818_16971_17182_17346_18890_18965_20072_20202_20919_20991_21571_21742_21838_21971_22222_22381_22758_22892_23188_23287_24061_24221_24775_24953_37546_37669_39253_39440_39955_40058_40857_41000_41520_41682_48566_48681_63171_63276_65402_65595_100154
873423	contig_10930_pilon	+	816	7	Intergenic	novelGene_37103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_3	8177.3082775854	8755	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGAACAAAGGTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339421	342155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340055_340505_340639_340994_341098_341522_341625_342020
873424	contig_5317_pilon	+	1942	13	Intergenic	novelGene_76589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTGTCTTTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355246	384153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355763_356222_356341_356923_356986_357962_358095_361104_361167_375289_375427_375693_375762_376057_376301_377191_377330_379072_379220_381030_381209_381934_382051_384128
873425	contig_10940_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_49290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACATTCCGAGTCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964418	967315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_964400_967300
873426	contig_15135_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_119856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAAGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26510	27478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_26500_27500
873427	contig_7056_pilon	-	1830	7	Intergenic	novelGene_43710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1017	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCCTCATCACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937906	928638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_928688_929209_929440_929533_929676_930554_930634_935326_935552_935850_936041_936991
873428	contig_8174_pilon	-	4507	1	Intergenic	novelGene_160048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAAATCCTCACAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231146	226639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_226600_231100
873429	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_96308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
873431	contig_8954_pilon	+	2453	1	Intergenic	novelGene_130296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCCCCTTTTTAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173730	176183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_173700_176200
873432	contig_7915_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_42990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144745	142159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142200_144700
873433	contig_3382_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_124217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496111	1493221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1493200_1496100
873434	contig_12638_pilon	-	1861	12	Intergenic	novelGene_33132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCATATATAAGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199665	177669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_178281_180794_180847_180962_181013_182933_183055_183466_183602_185482_185628_188450_188508_191148_191368_191748_191804_198037_198149_198734_198849_199474
873435	contig_8153_pilon	+	2634	7	Intergenic	novelGene_34807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	264.633551664687	209	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	1756	2634	153036	167617	FALSE	55	GAAATAAGGAAATTCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTEDHKTGVGAVIWAEGKSRNCDGTGALYFVGCGYNAFPVGSEYADFPHMDDKQKDR	138310	167617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680_150123_153002_153181_158353_158924_164642_164693_167503
873436	contig_1856_pilon	+	2631	3	Intergenic	novelGene_84897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3	93	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	845	1213	588932	589300	FALSE	15	GTTTCCTGTGATAGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQDYIQYTVPLDEGMYPLEGSRSYCLDSSSPMEVSAVPPPGGGSSFPEDESQVDQDLGAAPDVFADQPVSGLLIGTTGVLLQSPRARHEDVPPTLTIATSNAESSNPKELQRTPWDRCPCI	558925	590718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_559066_588160_588786_588852
873437	contig_2069_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_23271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTAGACTTTGTGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327408	329924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_327400_329900
873438	contig_10627_pilon	-	3215	1	Intergenic	novelGene_59982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGATCTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256793	253578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_253600_256800
873439	contig_5019_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_109206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	296	829	187005	187538	NA	70	GTCAAAATAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPHPEPGRSAPCPVKVKCTHLTHCTPLPLVLEAHGAPPTSLTQYPHTHNHGPVAPTTALSPELGTHRLAVPAPLLSHLGWGPVDWWCPHLCPTTSTGGACGMAAPTSLGHQCQEPGDQQHPLLPSQLCRGLRTRGDHSYTQPPAAGARRQVTPATPSRHLQQGPEDQQHTFPHFAL	186709	188119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_186700_188100
873440	contig_16525_pilon	-	472	5	Intergenic	novelGene_133855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	235	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	95	415	181180	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181410	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
873441	contig_16411_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_77287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTACTCTCCAGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47016	48941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_47000_48900
873442	contig_299_pilon	-	2984	1	Intergenic	novelGene_129524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAGTTGGAAAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736332	1733348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1733300_1736300
873443	SIRV6	+	679	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	88	16	88	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10325	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
873444	contig_10629_pilon	-	3964	16	Intergenic	novelGene_52937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_15	247.629346672266	391	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	32	1921	383003	359022	FALSE	35	ACCCAGTTTACTAGCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLISRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYPFLR	383034	356978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_359122_360253_360328_360849_360986_363537_363644_364297_364492_366612_366786_367556_367704_370336_370457_372183_372258_372880_373047_374990_375096_377674_377741_378776_378944_379783_379878_382303_382451_382982
873445	contig_2768_pilon	+	3804	1	Intergenic	novelGene_57475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579758	583562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_579800_583600
873446	contig_5954_pilon	+	1867	8	Intergenic	novelGene_28515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	682.563385708759	20	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	815	1699	438796	443062	FALSE	35	GAGAGAGAGAGAATTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPRHLVPPA	437981	443230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441346_443037
873447	contig_18184_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_123859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCAAAACTGTTCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47170	47642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_47200_47600
873448	contig_10980_pilon	+	4557	7	Intergenic	novelGene_162553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_4	194.92883316739	135	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	799	1884	168079	300170	FALSE	10	TGTCATAGTTTTCCTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVGPAIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLHYQQALTGAQLPQHAAFIPTDNSEVINRNGMECQESALRITKHCYCTYYPVSSSIELPQTAC	104688	302843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_104880_167471_168253_232331_232497_251109_251311_255998_256263_264401_264556_300042
873449	contig_16156_pilon	-	3477	2	Intergenic	novelGene_137064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGTGTTTCTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29987	26339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_28506_28676
873450	contig_1107_pilon	+	1890	8	Intergenic	novelGene_126558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_7	56.0655592924525	44	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	549	842	231392	233428	TRUE	45	AAAACAATGATTATTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSSAPASSQTLLDALLQNLYDFGERKDETKQRIKKKRESKKRDLSTAAVLAEGPALPPDSLVRGQRKSASSFFKELREELHCAPAVTSTSFSSEPEVDSAVSHSLRNNRELVEVVEFHSRRQKRKLKPGQDEIPKTKTSVLEKDVVIQEFNLEKARLEVHRFGITGYGKGKERVLEQERAIMLGAKPPKNSYVNYKVLQEQIKEKKTAKEEEKRMAQDTDIFKKKKRNQQEDRKSQKKKSAPSILSSGRVGQVGKFKNGTLILSPVDIKKINSSRVAK	209796	234952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209869_210850_211189_230510_230568_231310_231407_231544_231632_232190_232244_233289_233580_234055
873451	contig_3942_pilon	+	2902	5	Intergenic	novelGene_128722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	22.1627502805947	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	41	670	572987	597678	FALSE	10	CACCCCACGGTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGWARVGGGSQRAMEQPKKAVVVTGFGPFGEHTVNASWIAVQELEKLGLGDSVDLHVYEIPVEYQTVQRLIPALWEKHSPQLVVHVGVSGMATTITLEKCGHNKGYKGLDNCHFCPGSQCCVEDGPESIDSIIDMDAVCKRVTMLGLDVSVTISQDAGRYLCDFTYYTSLYQSHGRSAFVHVPPLGKPYNADQLGRALQAIIEEMLDVLEQSEGKINCRHKH	572946	599910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_573021_575142_575196_592014_592132_594750_594984_597485
873452	contig_3942_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_128723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1377	1820	601438	601881	NA	5	TGACTTCTTGTGTGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRREPAFVSPPLCLRTPHKELVLSCILHSPRPVVSPARLDTTAGHIRAKRSGVCLTPAQAVPGVFLGLPQHLRCLSCPIFLSRKKSFLLKVASSLSPKEGLTPPAGAQRLPNPTECLQVPCPEPLVWDPEEAGEGLPDFAWGSGGT	600061	601921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_600100_601900
873453	contig_5280_pilon	+	2611	5	Intergenic	novelGene_52609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	639.236800802332	313	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	12	716	38343	43002	FALSE	20	CCACCCTAATCCCCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQGKTK	38331	44897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902
873454	contig_5467_pilon	+	1423	13	Intergenic	novelGene_111947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_5	241.31462864899	515	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	83	424	23057	25035	TRUE	15	AGTGGCATTTCGTGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVAAETRPVAVAAAAAAAAAATAAAAMAQYKGAASEAGRAMHLMKKREKQREQMEQMKQRIAEENIMKSNIDKKFSAHYDAVEAELKSSTVGLVTLNDMKAKQEALVKEREKQLAKKEQSKELQLKLEKLREKERKKGG	22974	33008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_23168_24279_24365_24459_24560_24989_25137_30854_30932_31075_31143_31294_31357_31570_31648_31878_31934_32051_32101_32177_32249_32418_32530_32679
873455	contig_5649_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_82288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141220	138709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_138700_141200
873456	contig_7379_pilon	-	1451	4	Intergenic	novelGene_150033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	105	junction_2	123.159336723702	160	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	115	495	553324	547830	FALSE	20	TCCCATTGGTGAATTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKVRCLT	569940	546873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_548008_549695_549784_553209_553328_569829
873457	contig_7379_pilon	-	1577	4	Intergenic	novelGene_150032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_3	133.972634021529	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	109	621	569807	547830	FALSE	20	TCCCATTGGTGAATTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRVEGVLSGRFGVCFIRPGSVAARRIERSGPSVWVMALVARLWHFLPLGRGTVLGLRLLMGASGSRGRCGLWRLRGFEVMGNPGTFKRGLLFSALSYLGFETYQVISQAAVVHATAKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKVRCLT	569915	546873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_548008_549695_549784_553209_553328_569678
873458	contig_7379_pilon	-	1476	5	Intergenic	novelGene_150034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	147.8383830404	109	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGATATAATAAACATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569928	546904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_548008_549695_549784_551754_551823_553209_553328_569829
873459	contig_5965_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_154671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATTCTGGGAGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222543	223549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_222500_223500
873460	contig_11989_pilon	+	1676	5	Intergenic	novelGene_68425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	19.8163442642683	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	350	616	35533	37371	FALSE	50	GAAGAGTAAGAACAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEYPVKIVNTPQGCLWYKKDNKFKIPKAYIRFHLISPLIQKSAANVVLFDIFVNILTHNLAEPAYEADVAQLEYKLVAGEHGLIIRVKGFNHKLPLLFQLIIDYLADFSSTPAVFTMITEQLKKTYFNILIKPETLAKDVRLLILEYARWSMIDKYRALMDGLSLESLLSFVKEFKSQFFVEGLVQGNVTSTVSVRCSVAVRQV	30745	38431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_30829_31634_31687_32621_32773_35469_35598_37169
873461	contig_9972_pilon	-	3031	1	Intergenic	novelGene_162804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358360	355329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_355300_358400
873462	contig_8122_pilon	+	2802	1	Intergenic	novelGene_40235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1815	2135	607762	608082	NA	20	TTTTTTCCCCCATAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCIGCPLCSDLRGQSVAASGGSTSLVQKRPKYKPTNLLLGLQAASYAPVLEFLCPFVHSLSKRDSQPAWGGPTLPTRRSDFSPPGGVCARSALLPPACPLAGRSP	605947	608749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_605900_608700
873463	contig_7707_pilon	+	1438	8	Intergenic	novelGene_72152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	44	junction_3	481.225730901448	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	557	1438	233929	240667	FALSE	60	CAGAAAAAAGTTAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHLKNDYRRRFCRPSRAPDINVEQGQNILEILQDCFEEKSLANDFSANSTKSVPYSTPKIKDTCIQSPNKERQKSHPKALPPSSRKKEGCLQLVVEPNEDVSKSVQAHEVYQKILATDVGSENTAHLKNVSSRKQNDHHNEADEEFYLSVGSSSVVLDSKTSLSQNAVPSIAQKRETYTSENSLNMLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPIKEN	190408	240667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_190457_200052_200124_200805_200901_213078_213179_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626
873464	contig_5153_pilon	-	3627	1	Intergenic	novelGene_74410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCCAAGGCTGGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028796	1025169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_1025200_1028800
873465	contig_6441_pilon	-	3335	4	Intergenic	novelGene_172885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	271	junction_1	120.676795155029	160	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTTCCATAAAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294187	273182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_276269_278835_278950_281681_281750_294120
873466	contig_9995_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_47721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACATGTTATGTAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376111	374908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_374900_376100
873467	contig_5013_pilon	+	1667	8	Intergenic	novelGene_110077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	129.440239146117	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	517	1314	47445	73947	FALSE	30	ATATCAGCGACTCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDAGTEFGPGTAYGNALIKCGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLKKAKTADTRASSEQELRITQSEFDRQAEITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQLTYYAQCYQYMLDLQKQLGSFPSNYLCNNNQSSIPPLPPASSNVVGPSAVASTSALVVTSPSNLSDLKECTGNRKARVLYDYDAANSSELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN	26570	74300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_+_27001_47358_47488_51196_51331_54379_54473_65168_65259_65641_65743_73234_73464_73839
873468	contig_7870_pilon	-	2854	1	Intergenic	novelGene_109032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTTTCTTAAAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589537	586683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_586700_589500
873469	contig_5145_pilon	+	2936	22	Intergenic	novelGene_131400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	67.0433237260492	86	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	371	2446	718851	802610	FALSE	25	TACAAACGCGAGGCTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESAGRWRRRLYPFPSRSPLEIHYTNLITSRCLTCRYPGRKVLSGVVLPLQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDITLGKIWDLADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHDVSLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMAAVPPAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPAVLPPSLVPPAKRKKTVFPGAVPVLPASPPPRDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHGVKQAQPVVSWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVKDIFMHSGLTQSLLAHIWALADTRQMGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGLDPPQVLSPDMVPPSERGTPVQDGSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTNEVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSLKMQIQSQESDLRSQEDDLNRAKAELGRLQQEEAQLEQSIQAGRAQLETILKSLASTQDEINQARSKLSQLHESQQDARRGLPPTEEVLNGAPGLTDLTERGGFGATVQDDPFKNKALLFSNNAQDLHPDPFQAEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQAASTDPFGGDPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKGSDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKFGNEEQQLAWAKRESEKAERERLARLRRQEQEDLELAIALSKADMPAA	693502	803100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_693554_715248_715291_715751_715903_716421_716470_718772_718869_719044_719108_724140_724267_725568_725629_726482_726717_729680_729839_733079_733237_733632_733719_735692_735766_745681_745844_748661_748860_750477_750616_755172_755297_757458_757510_758761_758899_773745_773807_774669_774753_802463
873470	contig_2332_pilon	+	2755	11	Intergenic	novelGene_58687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	156.202560798471	339	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	118	1581	426955	520711	FALSE	35	ACTATGCCAGGCAAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRKFFGVIPSGKKLVNETVKKNEKTKSTEETLKAKKGIKEIKVNSSCRDDDFKQKQPNKKKRIIYDSDSESEETVQVKNAKKQPEKMPLSSKPGKILRKDPVTYISETDEEDDLMYKKTAFKSKDNGGSANSYLGESNMKKNEENTKTKNKPLSPVKLTPTSVLDYFGTGSIQRSDKKMVASKRKKPSKNTDDFRLNDEAIAKQLQLDEDAELERQLHEDEEFARTLAMLDEEPKTKKIRKDQEEKETSLSVQANLSKTEKHKYPHKVKTEQFSDERKNCSPKKQTKCESSKESEQHSKLSAHRRGEPSPTKASSKLALLKKKEKSSYQEAEPMGSKKKENAIELKGETKTPKKTRSSPTKKESTSPEDSEKKRTNYQAYRSYLNREGPKALGSKEIPKGAENCLEGLIFVITGVLESIERDEAKSLIERYGGKVTGNVSKKTNYLVMGRDSGQSKSDKVGPAVFSTRRNSLLTLGSSDITFTQS	426837	521885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_426958_462517_462647_469677_469754_471303_471427_504089_504323_505189_505268_511257_511336_512570_512659_513550_513838_516407_516516_520450
873471	contig_12958_pilon	-	1835	10	Intergenic	novelGene_136187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	10.6458129484475	47	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1647	188	1834	11880	1414	FALSE	30	TATGCAGCAATTGTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLARKNKGFPLGSTVQSNTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSANFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSNSKPKTLSGGITVNGPRLESLVLTYVNVISSGDLPCMEDTVLALAQIENSAAVQKAIAHYDKQMSQKVQLPTEAHQELLALHRASERRAIEVFMKSSFKDVDQKFLKDLQIQLEAKQKNFCKQNLQASSDRCSALLQDIFSPLEEEVNQGIYSKPGGYRLYILKMERLKKNYYQKPRKGIEADKTLQKYLMSKESVSDAILQTDLTLTAKEKELKEARLKAEAAQAEARRLEEIERQNQLMMEQRERLHQEQVRQMERDRANWLAEQQRAQERKIQ	15973	1412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_1596_1871_1975_2864_3078_3790_4072_6702_6946_7401_7599_9954_10065_11040_11169_11690_11901_15806
873472	contig_18545_pilon	-	2361	6	Intergenic	novelGene_161883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1775	2230	249304	248849	FALSE	15	GTGGGGTACGATGCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTAAGASSHRPWSLRTLGFRGVARSPPRAGPICSWFLSPTPRLLFHPSQGGRHTPRPGSALCLFHNFRGIGRQCTFSFCFALGLQVWSLGSSGGRLHPPSLGHLRRPLALLVHLDQDQRRERVSKIPQEKAAGSSEAERLGQTVFPDDL	309796	248717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_249341_257582_257716_301888_301970_303364_303496_305299_305356_308459
873473	contig_12837_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_57354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATTTCTTCCTTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259623	261585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_259600_261600
873474	contig_10523_pilon	-	2572	8	Intergenic	novelGene_120922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	481.987170631191	1513	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	5	988	39240	15001	TRUE	5	CAGGTTGTGTCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQGRRGNSLDRRPQGGPHLSGAVGEEIRPSMNRKLSDHPPPMPPQYHQHQQPAPQYSAATQPPPQQRYLQHHHFHQERRGGSLDINDGHCGLGVGSEMNAALMHRRHTDPVQLQVAGRVRWARALYDFEAQEDDELGFRIGEVVEVLDSSNPSWWTGRLHNKLGLFPANYVAPMIR	39244	12728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13215_13902_15181_15883_16007_18204_18427_20928_21098_26582_26703_31045_31138_39162
873475	contig_8866_pilon	+	2525	7	Intergenic	novelGene_77779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCGCTCCTTCCCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341085	418154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_342356_348800_349542_352296_352490_356565_356626_361318_361406_363336_363428_418071
873476	contig_5253_pilon	-	2728	1	Intergenic	novelGene_61545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACAGAAGCTTTCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103699	100971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_101000_103700
873477	contig_5389_pilon	+	2252	4	Intergenic	novelGene_143006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	14.9666295470958	323	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	245	922	255025	261863	FALSE	10	GATTTTTTTTTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDRPLLAVQEALQKCFPVVEEQQGLWRSTLSDCQPLLASLSNLAEQLQAAQNVRFEDVRSLRAFPDLKERLRRKQLSAGDIVLDKLGERLASLLKVRDTVSSHVEQVFQVYEQHANTVDIDAVLQPSVVSPSLADMLEWLQDIERHYRNSYLKRKYLLSSIHWGDLANIQALPKAWDQISEDEQDLVQGTGFRLSHDLSSPILLCVPHFWKHLKRLSQPLCLL	254596	263193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_254838_255021_255300_259067_259248_261640
873478	contig_3193_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_126313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTCAAATCCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88468	86052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_86100_88500
873479	contig_5690_pilon	-	4413	2	Intergenic	novelGene_119663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2821	3120	105790	104017	FALSE	30	TCCCCAGCGGCACCACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLTQAMVFSVASYEWESGTMNREDCRRTDTFESWCWQRIFIPQTARRMNKPVLEEVQPECSLEARMVRLCLTYFGHVLLQQLLTVNDVSKACEPMFC	108610	102723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_104083_105556
873480	contig_3700_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_138100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAAAAGATTCAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384477	382156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_382200_384500
873481	contig_401_pilon	-	2293	14	Intergenic	novelGene_42793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	135.093130270025	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	1422	2291	1118655	1114875	FALSE	25	TGACAAGGATGCCCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELHRSRLEVAEVNGRLAELSLHLKEEKSQWSKERAGLLQSMEAEKDKILKLSAEILRLEKAVQEERTQNQVLKTELAQEKDSSLVQLSESKRELTELRSALRVFQKEKEQLQEEKQELLEYMRKLEARLEKVADEKWNEDAATEDEEAAAGLSCPAVLTDSEDESPEDMRLPPYGLCERGDPGSSPTGPRESSPLVVISQPAPIAPHLSGPAEDSSSDSEAEDEKSVLMAAVQNGGEEANLLLPELGSAFYDMARGFAVGSLSEASTGGPVIPPWKECPICKERFPAE	1131672	1114872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1114975_1115937_1116045_1116407_1116608_1116836_1116946_1117319_1117416_1117939_1118066_1118523_1119177_1123169_1123261_1124943_1125093_1125501_1125661_1127487_1127675_1128468_1128572_1128903_1129084_1131641
873482	contig_401_pilon	-	4020	3	Intergenic	novelGene_42762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_2	11	154	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	1509	2903	1005694	1002291	FALSE	40	GTGACAATATGTATGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSSGSLGPEPTLFGKPKFSCMRLHYKCKETSGYFHTLRAVMRNPEEDGKDTLQCIAEMLQITKQAMGLNVPIIEKKLERKSSKPHEDIIGIRSQNQGSLAQGRNFLMSKFSSLNQKVKQTKSNVNIGNLRKLGNFTKPEMKVNFLKPNLKINPWKSDSSLETMENTGVMDSKDQAESDGDMSSDNDSYHSDELLTNSKSDEDRQLANSLENVGPVDYVLPSCGIIASAPRLGSRSQSISSTDTSIHVPSEVTATHGSGLGKGHESPLKKSPSADHIQILTGFAKPVDIYCHTFVRDAQNKMTQPSETRSLSQQGTEEGNQVTSQVSNEETQPKAMEQTPSRPSQLEVSFSAKGPQFLSVESGHSVLSQKTPDSGSTMLDFESGLNVTPSPSEGSSSRAVSPFAKIKSSMVQVANITQAGLTHGINLAVAKVQKSPAEPEVVNEVQQNELKNMFTQCQTRIIQI	1007202	1001173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1003447_1004539_1004628_1005543
873483	contig_6795_pilon	-	2388	4	Intergenic	novelGene_27714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29.9777695412228	52	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCTTTGTACAGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154288	136195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_138112_147312_147424_148236_148360_154050
873484	contig_11751_pilon	+	2577	4	Intergenic	novelGene_150292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	33.8755893757667	78	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAATAAAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115175	158401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_116203_117994_118159_144201_144306_157119
873485	contig_11933_pilon	+	1699	5	Intergenic	novelGene_107243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	88.533538842633	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	82797	89168	FALSE	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRLKNKLRQKRQSWQKLGVVLADSNASRERCGVPFSCCTKDPAEDVINTQCGYDARQKPEVDQQIVIYTKGCVPQFEKWLQDNLTIVAGIFIGIALLQIFGICLAQNLVSDIEAVRASW	82796	90504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_82867_82995_83058_85042_85091_85207_85325_89102
873486	contig_3817_pilon	+	2512	4	Intergenic	novelGene_78387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGGGGTGGGGGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017646	1023824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1019277_1019779_1020314_1021627_1021754_1023602
873487	contig_3956_pilon	-	1723	9	Intergenic	novelGene_14739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618536	592339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_593152_601351_601471_603947_604116_604312_604483_605540_605654_613369_613500_614364_614427_616448_616552_618490
873488	contig_567_pilon	+	2039	9	Intergenic	novelGene_33971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_8	22.6977421784635	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	34	1434	338793	415678	FALSE	45	ATTATATAAATCATATACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLFSTPKLVSAVASARSLSGCMSRSQRKYSLQPILERKIPNRYLGQPSPLTHPHLLRPGEVTPGLSQVEYALRRHKLMSLIQKEAQGQRGTDQTVVLLSNPTYYMSNDIPYTFHQDNNFLYLCGFQEPNSILVLQSLPGKQLPSHKAMLFVPRRDPSRELWDGPRSGTDGAVALTGVDEAYPLEEFQHLVPKLRAETNMVWYDWMRPPHAQLHSEYMQPLTEAKARSRNKVQAVHQLVQRLRLIKSPAEIEQMQNAGKLTSQAFIETMYSSKVPVEEAFLYAKFEFECRARGADILAYPPVVAGGNRSNTLHYVNNNQLIKDGEMVLLDGGCESNCYVSDITRTWPVNGRFTAPQAELYEAVLEIQSACLTLCSPGSSLENIYSMMLTLIGQKLKELGIVNNKKNDAFKAARKYCPHHVGHYLGMDVHDTPDVPRSLPLQPGMVITVEPGKGMCWQPLTPGDTE	338759	416283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338857_358266_358384_370301_370710_373193_373397_388166_388230_389101_389216_400932_401019_413934_414113_415510
873489	contig_16098_pilon	+	1587	4	Intergenic	novelGene_46219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	1012	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	342	740	766291	767278	FALSE	15	TCTTTATTGTATCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	764902	768125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766596_767184
873490	contig_6842_pilon	-	2537	2	Intergenic	novelGene_130828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCCTTCTGTCAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1820055	1783463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1783854_1817908
873491	contig_6885_pilon	+	3205	1	Intergenic	novelGene_83704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	424	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2272	2589	297687	298004	NA	35	AAGGGCCAGACAGAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLLSLFLLYYSSSSNISTHGSPRYFQGASQMLPFHKMPSRIATGHLPTPHVCLPTCLPFHRPKCGCQSKASSSPSSSILSLQTPELWPERMVRLLPPLSLLPL	295415	298620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_295400_298600
873492	contig_4418_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_98369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCCTGAAGTACAACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767226	765355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_765400_767200
873493	contig_12993_pilon	+	3411	1	Intergenic	novelGene_136736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATATCATTACCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119901	123312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_119900_123300
873494	contig_12793_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_164135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1486	1878	306639	306247	NA	80	AAAAAAAAAACGGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNNNNNTSLDPQKHLRPKLHFQTLRMKKLRHGENSSFTKAPQLLKGRTRISVRVPAPATTLCGYDLMRQIKPGRRGSGTTWFWCVHENECVTQRFLTARPSGLCCQGLSTFQLPDSGDLNSITELAGS	308124	305451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_305500_308100
873495	contig_13021_pilon	+	3967	1	Intergenic	novelGene_8089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAATCATATGGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32927	36894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_32900_36900
873496	contig_2892_pilon	-	2867	1	Intergenic	novelGene_118988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATTGTAAGGAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60399	57532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_57500_60400
873497	contig_8656_pilon	+	2861	6	Intergenic	novelGene_162357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	98.5239057285084	421	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	85	1014	621302	647234	FALSE	35	CTAACACTTATTATGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARREKGGGGTFASPPSLPGCGSEVRFRCMVYPAKRFCLVPAMEGVRWAFSCGTWLPSRAEWLLAVRSIQPEEKERIGQFVFARDAKAAMAGRLMIRKLIAEKLNIPWNNIRLQRTAKGKPVLAKDSLNPYPNFNFNISHQGDFAVLASEPELQVGIDIMKTSFPGRGSISEFFHIMKRKFTKKEWETIRSFKDEWIQLDMFYRNWALKESFIKAIGVGLGFELQRLEFDISPLNLDIGQVYKETRLFLDGEEEKEWIFEESKIDEHHFVAVALRKPDGSKHQDVPSQDDSKPTQRQFKILTFNDLIASAVPMTPEDPSFWDCFCFTEEIPIRNGTKS	621217	649081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_621485_623112_623339_633811_633934_634549_634712_644687_644760_647069
873498	contig_8674_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_102909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTCCATAGTCTCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186237	183866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_183900_186200
873499	contig_15172_pilon	+	2629	7	Intergenic	novelGene_158774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	11.1504857891185	103	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	96	497	279714	283953	TRUE	25	GCCTCTAGAGCTGTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETRNLPPPLPPRLDWFVHTQAGQLAQAGVPTWFHGAISREAAENLLEPQPLGSFLIRVSHSHVGYTLSYKAHGCCRHFMVKLLDDGSVMIPGERAAHTSLDALVTFHQQEPLWPYGELLTQPCGQGVVCVI	275991	288801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_276068_279694_279839_282065_282156_283386_283553_283932_284361_285285_285373_287163
873500	contig_1275_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_108748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392273	394880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_392300_394900
873501	contig_11253_pilon	+	3531	20	Intergenic	novelGene_126827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGCAAAGTGATCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148225	229282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_148278_155134_155346_160223_160378_168355_168584_169822_170092_170630_170772_173596_173723_174676_174929_176019_176257_191806_191987_196120_196190_198368_198554_206213_206468_206956_207196_208255_208399_214821_214993_216665_216857_220976_221135_227987_228180_229203
873502	contig_7707_pilon	+	4282	1	Intergenic	novelGene_72124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46228	50510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_46200_50500
873503	contig_11677_pilon	+	482	4	Intergenic	novelGene_85917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	334	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGGCAGGGGCTGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594881	597385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_594942_595166_595242_595717_595891_597211
873504	scaffold_4805_pilon	-	3114	1	Intergenic	novelGene_161029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAAAAGAATGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498813	495699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_495700_498800
873505	contig_12622_pilon	+	3564	1	Intergenic	novelGene_5852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	1992	2492	951749	952249	NA	55	TTCTAATTAAGACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYFLIAGISAPVVFFVDYASNCLYMEEIEGSVTVRDYIQSTMETEKTPQSLSCLAKAVGQVLARMHDEDLIHGDLTTSNMLLKPPVEQLNIVLIDFGLSFISALPEDKGVDLYVLEKAFLSTHPNTETVFEAFLKSYSSSSKKARPVLKKLDEVRLRGRKRSMVG	949757	953321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_949800_953300
873506	contig_9202_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_168942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATATTCTGCTGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264770	262404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_-_262400_264800
873508	contig_14034_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_72644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAGTAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217009	219037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_217000_219000
873509	contig_9915_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_174171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCCTGTAGAGTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684338	681776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_681800_684300
873510	contig_9482_pilon	+	764	3	Intergenic	novelGene_44233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	167	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	81	356	263283	268793	FALSE	35	TGACATGTTAAAACTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRPRQRRKWSHRFFSPSRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGPGLQWLTPGRAWCPCDSMGTGLWTLVYGVPGLRSTASPLC	263202	269201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_268668
873511	contig_5623_pilon	-	1159	5	Intergenic	novelGene_154815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	465.193172241382	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	348	884	220970	206216	FALSE	30	GTTATGTCTCCACTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQRQALTVGLVSQRQEEAPCSGRWLAPAASATSSVSVTQNTWLIQSRQMTSLPECVLKLIVPPC	280017	205940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_206405_218242_218450_220829_221000_239340_239459_279817
873512	contig_15114_pilon	+	1950	4	Intergenic	novelGene_121200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_2	32.0138858761146	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	344	1129	785166	794099	FALSE	35	AAGCCCAGCAAGACTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLHVKRGDESQFLLQAPGSSELEELTVQVTRIYNGRLKVQRLCSEMEELAEHGVFLPPNMQGLTDDQIEELKLKDEWGEKCVPSGGSVFKKDDVGRRNGQAPNEKMKQVLKKTTEEAKAIISKKQVGANVCVTMEMVKDALDQLRGAVMIVYPMGLPPHDPIRMELENKEDLAGTQVCGSPCSGGGPHSQRADTCHTGLASRGAVFAPPPAFRRCCPACASAHFWVHKGTLRGGTCGCGVGPTRRETIERFVRPPIRSN	784822	794920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_785305_789237_789406_791308_791377_793688
873513	contig_9482_pilon	+	2854	5	Intergenic	novelGene_44316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1361	2032	1240303	1240974	FALSE	40	CTTTTGATTCTGAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTEQNCSTGFPWLPSLWKIARPFSSTALLQKAQSANLSVTSRVQAVCATRGSFRAGVVGRAGTAPAPGNCAASRRHQCTSAFRTNHFEASDFLPLRLPVPFNVFSPLRFITLTVSKRKELACAVHTTRSHTGSIKTATQTSATDAFSHHRSELRTPSRFNATGNYTKTYLLDHLFKLLLLILLEGFVIFHGGHVQLMLRLWFRWLKRTGENRDLGILHFLW	1236143	1241796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1237439_1238170_1238310_1238915_1239102_1239796
873514	contig_17414_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_156943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCAGAATTGGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70246	67949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17414_pilon_-_67900_70200
873515	contig_14142_pilon	-	1500	14	Intergenic	novelGene_120598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	142.512949686695	440	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	176	1408	598441	584636	FALSE	30	CTTCATAAGTAATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTCLLESGRHYLAAGRAFIVGICDLGRLGPPEPMMAECLEKFTESLTNKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRAFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGSQENATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGAQDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL	598616	584543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586340_590687_590754_590850_590947_591055_591101_591232_591417_592007_592067_592149_592204_592411_592532_597758_597817_598388
873516	contig_11681_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_102970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	775	2325	69	2393	132144	134468	NA	30	ACATTAGAGCTGCTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDKEPIVRNFNFVCVMALLVGSKIQFSDESKFAVDVSKTGLTQIPKDLPPKTRVLDMSHNYISELQFPDISFLSDLEVLILSHNKIQQLDFSVLRFNQGLEYLDLSHNQLWKMSCYPVVSLKHLDLSFNDFDTLPICREFGNSMQLDFLGLSATKLQQLDLLPIAHLHLSYILLDLEDYNVKGNEIESLQILNTKKLHLVFHPNRLFSVQVNISVNTLEYLELTNVKLNDENCHVLMNFLSELTRGPSLLNLTLNHVETTWKCLVTIFRFLWPKPVEYLNIYNLTIIENIRKEYLTYCNTALKALKIEHITNRVFIFSQNALYTVFSEMNILMLTISDTPFIHMLCPGKPSTFKFLNFTQNVFTDSVFENCSTLDRLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKGMPSLEILDVSQNSLEFNRYERNCTWVESIVVLNLSSNILTDSVFRCLPPRVTVLDLHNNRIKNIPKQITKLEALQELNVAFNYLTDLPGCGAFSSLSALTIDHNSISYPSTDFFSSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSISQISGEVVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTMLLIVTIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNIQFHAFISYSEHDSAWVKNELVPCLEKEDIRICLHERNFVPGKSIIENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFHEGSDNLILILLEPISQNSIPSKYHKLKALMTKRTYLEWPTEKSKRGLFWA	132075	134469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_132100_134500
873517	contig_8663_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_57990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAGCCATAAAAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48280	47017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_47000_48300
873518	contig_13021_pilon	+	2944	15	Intergenic	novelGene_8106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	116	junction_7	122.021347245773	164	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	389	1912	120012	141630	FALSE	55	ATGAAAAAGGAAAAATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLDLCKLGPNDNDTVRGQIVVSLQSRDRIGTGGQVVDCSRLFDNDLPDGWEERRTASGRIQYLNHITRTTQWERPTRPASEYSSPGRPLSCFVDENTPVSGTNGATCGQLSDPRLAERRVRSQRHRNYMSRTHLHTPPDLPEGYEQRTTQQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRVPRDLSNINCEELGPLPPGWEIRNTATGRVYFVDHNNRTTQFTDPRLSANLHLVLNRQNQLKDQQQQQVVSLCPDDTECLTVPRYKRDLVQKLKILRQELSQQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQVMKMRPKDLWKRLMIKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLSHEMLNPYYGLFQYSRDDIYTLQINPDSAVNPEHLSYFHFVGRIMGMAVFHGHYIDGGFTLPFYKQLLGKSITLDDMELVDPDLHNSLVWILENDITGVLDHTFCVEHNAYGEIIQHELKPNGKSIPVTEENKKEYVRLYVNWRFLRGIEAQFLALQKGFNEVIPQHLLKTFDEKELELIICGLGKIDVNDWKINTRLKHCTPDSNVVKWFWKAVEFFDEERRARLLQFVTGSSRVPLQGFKALQGAAGPRLFTIHQIDACTNNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAIEETCGFAVE	113886	142662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_113952_115568_115654_117781_117866_119857_120061_123562_123648_124809_124969_127554_127751_128780_128885_131318_131434_133239_133419_134181_134320_135859_135981_139424_139627_140911_140988_141530
873519	contig_1380_pilon	+	3122	2	Intergenic	novelGene_138870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAACTTGACACCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54152	59281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_56195_58201
873520	contig_19012_pilon	+	3088	1	Intergenic	novelGene_159486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCCCAGAAATTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84425	87513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_84400_87500
873521	contig_10299_pilon	-	4511	12	Intergenic	novelGene_79788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	65	junction_3	86.364784681361	192	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	90	1292	752093	707634	FALSE	20	CAAGGACCGTCGGTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIVTGLPGCHASELCAFLVTLHKEYGRWMVYRQLMDSSECFHAAHFQRYLSSALEAQQNRSARQSAYTRKKTRLLVVLQGYTDVIDVVQALQTHPDSNVKSSFAIGAITVCVEPLSCYMEHRFLFPKCLDQCSQGLVSNVVFTSHTTEQRHPLLVQLQSLIRAANPTAAFILAENGIITRNEDIELILSENSFSSPQMLRARYLKYPGWYEGKFDSGSVFPLMVQICVWFGRPLEKTRFVAKCKAIQSSIKPSPFSGNIYHILGKVKFSDSERTMEVCHNTLANSLSIVPVLEGPTPPPDSRSTPQDNSGQQECYLVFIGCSLKEESVKDWLRQSAKQKPQRKALKTRGMLTQQEIRTIHVKRHLDPLPAGYFYNGTQFVNFFGDKTDFHPLMDQFMNDYVEEANREIEKYNRELEQQEYHDLFEQKP	753709	704414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_707747_708407_708502_709633_709700_710770_710977_714083_714159_714544_714652_718408_718496_720606_720743_733017_733056_745855_745982_751938_752098_753624
873522	contig_5727_pilon	+	3066	1	Intergenic	novelGene_7986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAAAAAACTAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455093	458159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_455100_458200
873523	contig_3818_pilon	-	2273	4	Intergenic	novelGene_99315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.3402362634576	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCTTCAATGCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116735	1097877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1099428_1103682_1103792_1106320_1106467_1116267
873525	contig_6446_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_149203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAGCAATAAGCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276653	279372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_276700_279400
873526	contig_18919_pilon	-	3252	1	Intergenic	novelGene_156033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTATAGAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138778	135526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_135500_138800
873527	contig_6375_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_73038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCTCAGTGAAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484733	487080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_484700_487100
873528	contig_12638_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_33140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTTATAAGGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195487	192812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_192800_195500
873529	contig_16110_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_126799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGGAAAAATGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104189	106339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_104200_106300
873530	contig_12050_pilon	-	2812	15	Intergenic	novelGene_62669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.997377702831	11	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	215	1168	486455	454979	TRUE	15	TATCCTGTCCTGTACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGEKFDTPHPEGYLFGENMDLNFLGNRPVQFPYVTPAPHEPVKTLRSLVNIRKDSLRLVRYKDDADSPTEENEKPRVLYSLEFTFDADARVAITIYCQATEEFLNGTAVYSPKSAALQSETVHYKRGVGQQFSLPSFKIDFSEWKDDEVDRVSYLLQEIYGIENKNTRETKPADDENSDNSNECVVCLSDLRDTLILPCRHLCLCNSCADTLRYQANNCPICRLPFRALLQIRAVRKKPGALSPVSFSPVLAQSVDHDEHSCPFKKSKSHPASLASKKPKRETVRQRPTRLRAHLPARGTQWPAGRLPCHPLSAPL	511552	446058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446957_447024_447389_451585_451676_452504_452548_453286_453411_454853_455077_456696_456767_458809_458920_461651_461812_465467_465537_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511364
873531	contig_12580_pilon	+	3070	10	Intergenic	novelGene_172899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	28	junction_1	78.617373131037	158	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	131	814	135963	173322	FALSE	45	AATATTTTATAAATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAGAAKLVVAVAVFLLTFYVISQVFEIKMDASLGNLFARSALDTAARSTKPPRYKCGISKACPEKHFAFKMASGAANVVGPKICLEDNVLMSGVKNNVGRGINVALANGKTGEVLDTKYFDMWGGDVAPFIEFLKSIQDGTIVLMGTYDDGATKLNDEARRLIAELGSTSITSLGFRDNWVFCGGKGIKTKSPFEQHIKNNKDTNKYEGWPEVVEMEGCIPQKQD	124236	175578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_+_124324_135919_135976_140630_140736_147934_147965_148648_148773_160457_160517_161720_161772_163871_163957_172500_172628_173232
873532	contig_10163_pilon	-	2921	8	Intergenic	novelGene_82662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	40.2593632156622	139	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	8	1060	483114	278372	FALSE	45	ATAAATACTCAATTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGRSLLLLLSSRGAGGGASGCGALTVGCFPGLGGSRHRQQQHHRTVHQRLSSWQNLGVVYCSTVVPSDDVTVVYQNGLPVISVRLPSRRERCQFTLKPVSDSVGVFLRQLQEEDRGIDRVAIYSPDGIRVAASTGIDLLLLDDFKLVINDLTYHVRPPKRDLLSHENAATLNDVKTLVQQLYTTLCIEQHQLNKERELIERLEDLKEQLAPLEKVRIEISRKAEKRTTLVLWGGLAYMATQFGILARLTWWEYSWDIMEPVTYFITYGSAMAMYAYFVMTRQEYVYPEARDRQYLLFFHKGAKKSRFDLEKYNQLKDAIAQAEMDLKRLRDPLQVHLPLRQIGEKD	483121	276510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_278450_281223_281341_288214_288419_289986_290148_304388_304494_305613_305785_335806_335877_482967
873533	contig_6726_pilon	+	988	8	Intergenic	novelGene_86242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	653	junction_4	636.647405058206	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	42	845	308170	333034	FALSE	15	TCTTATTGTGAATTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	308128	333177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
873534	contig_8487_pilon	-	4602	3	Intergenic	novelGene_111919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	7	141	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	373	2325	282418	273586	FALSE	30	AAGCTGCTGTGAAGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATTLTNRVQDSVTFEDVFVYFSREEWGLLDEAQRLLYRNVMLENFALVASLGCWHEAEEETPEQNVSVEGVSQVRTTQKAHPCERCDPILEDIVQLTQHQGSHPTQKPYTCGPSGRDFLSGANSDQQQEQHRGENPFRKNDGQASLVKSCAGNMSRWPFKYREEGMDVLDSPGLFQQQTTHTGVSPSKRTECVESFPLSSTLGQHQGAHTGQMVFRYNNYGEAFLKTFALLNNWIAQTEERPFRCFTCGNAFKEKSAFIKHRKTHSRETAHVCKECGKAFTHLFHLRTHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGERPYKCGECGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCNKCGKAFSSKDTLVQHQIIHTGVRPYECSECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECSECGKCFSHNSSLNLHQRVHTGARPYMCSECGKTYISSSHLVQHMKVHTGARPYECSECGKFFSRNSSLILHRRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHKKVHSRERSHECNNFGDPLAASL	282790	271308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_275379_279540_279668_282385
873535	contig_10861_pilon	+	2334	6	Intergenic	novelGene_39439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	36.1718122299671	159	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	673	1299	2433965	2478785	FALSE	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFVIRTPRVQNSPQKKDPGAKMYKQATIESLKRVVVVEDIKRWKTILELPDQTKENLVEALQELKKKIPSREVLKSTRIGHTVNKMRKHSDSEVACLAREVYTEWRTFMEKHSDRPSIEVRSDPKTEMFRKNAQKLLSEALELKMDHLLVENIERETFHLCSRLINGPYRRTVRALVFTLKHQAEIRAQVKNGLLPVSTFVKNHKK	2432462	2479820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2432592_2432824_2433325_2433921_2434067_2451185_2451328_2469337_2469532_2478596
873536	contig_6084_pilon	+	4541	1	Intergenic	novelGene_127047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3615	3938	352091	352414	NA	50	TTAAAGACAGAATAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALQFMVLILMEIVNLVNVLLHGTEGKPAFNKELPEDAKQTNKQKRPFQTKGQNGRVESTGFGLKQTWVQLSLLPLCDQGKSLNPSDPLFPPKLTEAHSTCLVKFL	348476	353017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_348500_353000
873537	contig_3866_pilon	+	1043	5	Intergenic	novelGene_112377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	102.721407213881	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCACAATCCTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101644	128928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_101767_104947_105038_126561_126627_127157_127254_128258
873538	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
873539	contig_15498_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_42722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCTGATCCTCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062056	1063280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1062100_1063300
873540	contig_1624_pilon	-	2070	1	Intergenic	novelGene_138374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1027	1341	106939	106625	NA	75	GGTAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYVITPMMKSAEWYQRGWGLWQITTLSASSLCLLPVTACLLTLPKFLACSRLSSCLLSSHLRFLGLELAACLSILELIDLHSLRARVLFPDLQILGSPAFAAM	107965	105895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_105900_108000
873541	contig_7587_pilon	+	3213	10	Intergenic	novelGene_163707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	48.2595861391391	190	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	219	1511	102373	119423	FALSE	20	ATAACTCTTTGCCATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPISSSHLPQQSSGHLQQVGALSPLATSSATTAVATTQANTLSGSSLGQVPSHMYGSRLNPNSSMATLIAQSENNQTDQDLGDNSRSLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQPGNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTITTNPSPSHQIHAFSTQTAPTTDSLNSSKSPHLGNSYLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALSTPPPAGQSPAQQGSGVSGVQQVNGVPVGALASGMQTVTSTIPAVPGVGGIIGALPGNQLAINGIVGALNGVIQTPVTISQNPAPLTHTTVPPNATHPMPASLTNSASGLGLLSDQQRQILLHQQQFHQLLNSQQLTPEQHQALLYQLMQQHHHQQHHQPELQQIQIPGPAQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNTSQKVTRLSDKTGPVAPEKS	91029	121125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_91203_102327_102446_103846_103920_106985_107141_109054_109244_109645_109735_109867_110230_111319_111417_117108_117319_119378
873542	contig_6063_pilon	-	2015	5	Intergenic	novelGene_27571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_4	293.704783754027	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1254	1583	20191	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	25181	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_23946
873543	contig_3789_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_79862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTCAGGTCCAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474417	472449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_472400_474400
873544	contig_11186_pilon	-	2556	6	Intergenic	novelGene_98872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_1	103.38781359522	323	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	179	1051	285822	235837	FALSE	20	GTTAAGCTTATTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKEGSGGFRKRKHDNFPHNQRREGKDVNSSSPVMLAFKSFQQELDARHDKYERLVKLSRDITVESKRTIFLLHRITSAPDMEEILTESEIKLDGVRQKILQVAQELSGEDMHQFHRAITIGLQEYVEAVSFQHFIKTRSLISMDEINKQLIFTTEDNGKENKTPSSDAQDKQFGAWSLKVTPVDYLLGVADLTGELMRMCINSVGNGDIDTPFEVSQFLRQVYDGFSFIGNTGPYEVSKKLYTLKQSLAKVENACYALKVRGSEIPKHMLADVFSVKTEMIDQEEGIS	286000	234331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_236215_239957_240086_266595_266727_280493_280609_285290_285396_285806
873545	contig_7398_pilon	+	4470	1	Intergenic	novelGene_166181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACTCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315751	320221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_315800_320200
873546	contig_4857_pilon	-	2352	2	Intergenic	novelGene_48717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1503	junction_1	0	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTGAGCAATATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183937	1178602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948
873547	contig_8631_pilon	+	6136	1	Intergenic	novelGene_121974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTTAAAAAGAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794054	800190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_794100_800200
873548	contig_3789_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_79878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545086	542310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_542300_545100
873549	contig_6364_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_51713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGTTCAAGTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431338	433284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_431300_433300
873550	contig_12125_pilon	+	2473	11	Intergenic	novelGene_76192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	145.924672348441	13	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	1781	2473	69301	82863	FALSE	25	TTCCTAGCTATATACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGISFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFIAKISDFGLARASEKFAQTVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDMKMNDIDSSSVETVYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVLNFYAYLKSEGDGVSSF	56158	82863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_56228_63996_65169_66245_66392_67191_67375_67884_68046_69251_69309_72014_72130_73130_73241_78372_78557_79720_79784_82650
873552	contig_14219_pilon	-	1738	6	Intergenic	novelGene_54389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	62.7171427920628	253	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	329	748	1116288	1107875	FALSE	35	CTCCCCAATACCACCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRILIDTGEPAIPEYISCLKQALTEYNTAIQEIIVTHWHHDHSGGIRDICKNISDDIAYCIKKLPRNPHKEEIIGNGEQQYVYLKDGDLIETEGATLRVIYTPGHTDDHMALLLEEENALFSGDCILGEGTTVFEDLYDYMNSLKELLKIKANVIYPGHGPVIYNAEAKILQYISHRNIREQQLLAIFRENFEKSFTVTELVKIVYKGIPENLHNMAKNNVSLHLKKLEKEGKIFSNKDPDKKWKAHL	1133848	1106884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_1107919_1108569_1108652_1114015_1114165_1116143_1116323_1122717_1122845_1133681
873553	contig_19730_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_142493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGGGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141989	144359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_142000_144400
873554	contig_5881_pilon	-	2349	1	Intergenic	novelGene_129056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAAGACAATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538895	536546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_536500_538900
873555	contig_9668_pilon	+	4317	2	Intergenic	novelGene_58146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAGAAATGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344764	349182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_344812_344912
873556	contig_6938_pilon	+	1663	3	Intergenic	novelGene_69069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAATATATACAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156912	158882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_157701_157886_157953_158073
873557	contig_10627_pilon	-	2330	7	Intergenic	novelGene_60014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_3	109.872653558563	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	207	1235	402038	373138	FALSE	20	GAGAGTCCTGCTTGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHGKRKEIYKYEAPWTVYAMNWSVRPDKRFRLALGSFVEEYNNKVQLVGLDEESSEFICRNTFDHPYPTTKLMWIPDTKGVYPDLLATSGDYLRVWRVGETETRLECLLNNNKNSDFCAPLTSFDWNEVDPYLLGTSSIDTTCTIWGLETGQVLGRVNLVSGHVKTQLIAHDKEVYDIAFSRAGGGRDMFASVGADGSVRMFDLRHLEHSTIIYEDPQHHPLLRLCWNKQDPNYLATMAMDGMEVVILDVRVPCTPVARLNNHRACVNGIAWAPHSSCHICTAADDHQALIWDIQQMPRAIEDPILAYTAEGEINNVQWASTQPDWIAICYNNCLEILRV	402244	372042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_373311_375715_375834_376928_377139_380441_380561_380960_381073_381786_381946_401900
873558	contig_11709_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_168211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTGATTGTGGGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38308	40117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_38300_40100
873559	scaffold_880_pilon	-	1815	4	Intergenic	novelGene_121439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAACGGGTTTTACCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579549	417179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_417201_440117_440155_513457_513597_577931
873560	contig_8594_pilon	+	3729	1	Intergenic	novelGene_140038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGTCAGTTCTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387982	391711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_388000_391700
873561	contig_9871_pilon	+	1604	4	Intergenic	novelGene_75689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.84447196547	3421	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	421	684	539838	540638	FALSE	30	CAGAATACAGTAGTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGEDGGGGHRGLALGRGAAPLGAAGSLWERAWAIPDVLAGAACAKLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	533394	541558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_533529_537739_537936_539747_539984_540520
873562	contig_9995_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_47713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGATCAAAAACAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364069	360868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_360900_364100
873563	contig_5649_pilon	-	3525	1	Intergenic	novelGene_82307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCAAGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185169	181644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_181600_185200
873564	contig_2689_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_100833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAAGAGGACTTGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222529	223859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_222500_223900
873565	contig_12142_pilon	+	1777	9	Intergenic	novelGene_147811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	43.7691029723023	3	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	1198	1776	112362	135891	FALSE	50	GCAGAAGTAAAGCAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSK	106948	135892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_106992_107580_107694_108532_108833_109514_109589_111111_111725_112307_112405_121926_121986_128255_128331_135489
873566	contig_10176_pilon	-	2992	5	Intergenic	novelGene_72698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	259.954803764039	11	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	2108	2872	223226	214602	FALSE	25	TTACAAAGCTTGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNELYPYIVEFEEETESPGLETHRKRKRSGDSDSIERDVAQEGEPGTGLDPRSSPTQCSVPAKKGEDASTKKESLGHWSQGLKISMQDPKMQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	225333	214481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223007
873567	contig_8273_pilon	+	2029	8	Intergenic	novelGene_113079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	856	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTCATTCGGACGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92977	109227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_94108_94895_95025_96087_96200_100983_101080_101569_101657_105590_105776_105910_105968_108994
873568	contig_9895_pilon	-	3010	1	Intergenic	novelGene_144698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATATATGTAATGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322758	319748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_319700_322800
873569	contig_2414_pilon	+	4191	4	Intergenic	novelGene_158527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	9.03081145609604	108	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAATAAAGAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119779	1149784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_1119941_1124052_1124198_1127051_1127225_1146072
873570	contig_15021_pilon	+	4479	4	Intergenic	novelGene_26923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	31.7944789057611	155	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	131	742	78749	86412	TRUE	35	GAATATTATCACTGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARVTLLQCGGGAHSGGVPGVSAGAPLSCLLSRFNAFHPDTRKPMHRECGFIRLQPDTNKVAFVSAQNTGIVEVEEGEVNGQELSIASHSIARISFAKEPHVEQNKNEIRLHTRSSFFAANSARAVELALLTCPAQRHSARSQGCAAVTALQTWGLRRPRQEPHFLASGDLCLSPELPAMGVSCKWSPTVGALCVWLLSLSIVFSRTVQIVLTDNCCNPLFSLTKSWTSALSRTPPLIIQGDCMAAP	78618	90609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_78825_79743_79848_85980_86695_87154
873571	contig_10404_pilon	-	3727	1	Intergenic	novelGene_138679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCCCTGGAAACCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095562	1091835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1091800_1095600
873572	contig_8312_pilon	-	2883	1	Intergenic	novelGene_152907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	420	1263	4	1266	1497903	1496641	NA	20	CAGTCTTGGAATTTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKLDQKLPVANEYLLLSGGVREGVVDLDLDELNVYARGTDYDMDFTLLVPALKLHDRNQPVTLDMRHSALCHSWLSLRLFDEGTISKWKDCCTVVDHINGATNYFFSPTKVADWFYESISIVLSEIQKKPQRGMPKVEKVEKNGTIISIILGVGSSRMLYDIVPVVSFKGWPAVAQSWLMENHFWDGKITEEEVISGFYLVPACSYKGTKDNEWRLSFARSEVQLKKCISSSLMQAYQACKAIIIKLLSRPKAISPYHLRSMMLWACDRLPANYLAQEDYAAHFLLGLIDDLQHCLVNKMCPNYFIPQCNMLEHLSEETVMLHARKLSSVRSDPAEHLRTAIEHVKAANRLTLELQRRGSTTSIPSPQSDGGDPNQPDDRLAKKLQQLVTENPGKSISVFINPDDVTRPHFRIDDKFF	1497906	1495023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1495000_1497900
873573	contig_10341_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_47243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACAGGAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139789	142240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_139800_142200
873574	contig_4486_pilon	+	1442	8	Intergenic	novelGene_38636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	394.345337106906	70	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	211	798	1016066	1037335	FALSE	40	AGCAAATAGTTGTGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRTDFREPNAEVPRPIPHIGADYIPTEEERRVFAECNEESFWFRSVPLAATSMLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQVKVNKYGDTWDE	1014086	1037979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029856_1037297
873575	contig_5791_pilon	+	4040	1	Intergenic	novelGene_35816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATAATCTTTTGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356844	360884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_356800_360900
873576	contig_6137_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_59150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCACAACACATCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111623	1109778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1109800_1111600
873578	contig_6020_pilon	-	1908	7	Intergenic	novelGene_155562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.550284369783	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	329	826	349599	289990	TRUE	30	CTTCATTAATTTATATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVILIEFLPKTPIFRPD	349927	288614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_288898_289190_290041_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
873579	contig_5375_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_169229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132869	136270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_132900_136300
873580	contig_8954_pilon	+	3389	1	Intergenic	novelGene_130259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTCTGTTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59281	62670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_59300_62700
873581	contig_10104_pilon	-	4749	1	Intergenic	novelGene_160145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAGGAAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567010	562261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_562300_567000
873582	contig_7914_pilon	+	3583	6	Intergenic	novelGene_165036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	32.0287370965513	122	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	176	1969	227172	319724	FALSE	45	TATCAAAAATGTCTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVSDGPDNEPIVCNRNNVTTHLSFRSVIEVVNKFAFVASEYPLILCLGNHCSLPQQKVMVQHMKKIFGNKLYTEAPLPSESYLPSPETLKRKIIVKGKKLPSDSDILEGEVTDEDEEAEMSRRMSVDHNEEQKQIWLCRELSDLVSICKSVQYRDFELSMKSQNYWEICSFSETEASRIANEYPEDFVNYNKKFLSRVYPSAMRIDSSNLNPQDFWNCGCQIVAMNFQTPGPMMDLNTGWFLQNGGCGYVLRPSIMRDEVSYFSANTKGIVPGVSPLALHIKIISGQNFPKPKGACAKGDVIDPYVCIEIHGIPADCSEQRTKTVQQNSDNPIFDETFEFQVTLPELAMIRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFECLQPGYRHVPLRSFVSDIMEHVTLFVHIAITNRSGGGKAQKRSLSVRMGKKVREYTMLRNIGLKTIDDIFKLAVHPLREAIDMRENMQNAIVSVKELCGLPPTASLKQCLLTLSSRLISSDNTPSVSLVMKENFPYLEPLGMIPDVQKKMLAAYDLMIQENRFLIEMADTVHEKILQCQKTGMEFHEELHNLGAKEGLKGRKLNKATESFAWNITVLKGQGDLLKNAKNEAIENMKQIQLACLSCGLSKTPSSSADAKSKRSLEAIEEKESGPRGCVEECQE	226996	321338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_228381_230766_230971_244244_244321_246949_247060_316700_316861_319689
873583	contig_12624_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_61085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886255	883466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_883500_886300
873584	contig_7870_pilon	-	1802	2	Intergenic	novelGene_109057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAAAGATAAGAAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663407	661256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_661878_662226
873585	contig_17106_pilon	+	3567	1	Intergenic	novelGene_127659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20360	23927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_20400_23900
873586	contig_7106_pilon	+	2269	2	Intergenic	novelGene_148322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	423	725	643125	643427	TRUE	55	CACATGAAAAATACCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWLSEVEVSIFYKHIVIANMLHSYAWTWKVYNLEFTAAILPVLALQYRHPYGQHATQFGRKSKTTTTKKRKKGLCTVLYIFPYFFKTKTSPVHHKLSTT	642702	645420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_644912_645360
873587	contig_753_pilon	-	2540	15	Intergenic	novelGene_112963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	267.727397148057	210	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	293	2515	1210648	1181585	FALSE	40	GTGAAACACTCAAGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGEGSSSSVSSEKLSTDKRSSEDHRKDSKCRIIFHYGPFQGTARGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGYERRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCDEHIQKLGSCITDPGNRETSGNTMHTVFHRDKTKDAHPESCCSSEKGGQPLPWFEHRKNVPQFAEPTETSFGPDSGKGAKSLVELLDESECTSDEEIFISQDEIQSFMANNQSFYSNREQYRQHLKEKFNKYCRLNDHKRPICSGWLTTAGAN	1211417	1181559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1181789_1182478_1182728_1183227_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188199_1188410_1192755_1192870_1192996_1193123_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210749_1211225
873588	contig_10609_pilon	+	3578	3	Intergenic	novelGene_123961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	74	108	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	92	595	574055	585091	FALSE	60	GAGTAAAAAGGTAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALLGFRSGAGDQWFSGAGSPGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKVKDKHAYQ	573963	588074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888
873589	contig_15543_pilon	+	2515	1	Intergenic	novelGene_164335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGACACCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24706	27221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_24700_27200
873590	contig_8552_pilon	+	1890	12	Intergenic	novelGene_80062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_11	379.724018964448	189	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	364	1683	385286	447433	FALSE	30	GTAATTTTAGGCGCAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDSTQHVPSETSEDPEVEVTIEDPFRIMPGIKRKSYTADFKLKVVARAEETSNRVAASEFDVGESSIREWRKEKKELEKMNPRKRARRGPKAKWPELENDLKEWIISRREQNQAVSTVAIQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRNGLSLRVRTTVGPQLPDD	354701	447640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167_438225_440288_440352_446996
873591	contig_14684_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_99655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260306	262434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_260300_262400
873592	contig_835_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_152155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTATGGAAACCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226928	228855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_226900_228900
873593	contig_9753_pilon	-	1045	6	Intergenic	novelGene_41330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	54	junction_2	388.752672016541	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGTTTATGGGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93361	69996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70876_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93282
873594	contig_5485_pilon	+	3174	1	Intergenic	novelGene_37732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	581	1743	1431	3173	319727	321469	NA	60	AGAGAGGAGAAGAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKCLSDEVQAKLRSGLAISSLGQCVEELTLNSIDAEAKCVAVRVNMETFQVQVIDNGFGMGSDDVDKVGNRYFTSKCNSVQDLENPRFYGFRGEALASIADIASAVEISSKKNRMMKTFVKLFQNGKALEACEADLTRPSAGTTVTVYNLFYQLPVRRKCMEPRLEFEKVRQRIEALSLMHPSISFSLRNDVSGSMVLQLPKTKDICSRFCQIYGLGRSQKLKEIKFKYKGFELSGYISSEAHYNKNMQFLFVNKRLILRTKLHKLIDFLLRKESIICKPKNGSASRQMNSSSRHRSNPELHGIYVINVQCQFCEYDVCMEPAKTLIEFQNWDTLLVCIQEGVKMFLKQEKLFVELSGEDIKEFSEDNDFSLFAATLQKHVSSDEKCDQISFQEACNNILDSYEMVNMQSKAVKRKATMEETKTHNSRGSEVIRKKTNDLFLPSCEPDGPGNSKIMGLSLQKKDNCCSESRLVEQETVKASESEENEKHKKTCLELNSPENPCRASSVLFASPFQAPHHFENSGKDLEIQKVSTATVDGMAANILKNNVIQSQLERLKDATEVGCQPLPFEAILLRANGT	318296	321470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_318300_321500
873595	contig_2341_pilon	+	3167	6	Intergenic	novelGene_84357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	45.5121961676208	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	532	1008	129589	157640	TRUE	60	AAAAAAAAAGTTAATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEPQTTGYTNVQDTPAMPWWKDKFWIFLAGAIIVTSVSLGLILYCVCRRLFRQGKKLKTAKPLKQNEDEEMTYENVLNQSPGKLPPLPPRDLPSLEDASPADTQSEPPAAYSSIHKVKKAKRVSIPSYIEPEDDYDDVEIPTTTGKHHIKTKVSHF	129057	159879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129631_147326_147451_149686_149748_155756_155831_157464_158815_158894
873596	scaffold_19766_pilon	+	2233	4	Intergenic	novelGene_34377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.55902608401044	81	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	997	1794	726532	727329	FALSE	25	ACTTCTACTTGATTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKRGNLHPLRDPNPPQLHVVPSGAGPRAQTLDPNALFHPAPTVANGRHQMSSPTSSDLESSSFIQWGLAWLDSVFDLVLVAEYFDESLVLLADALCWGLDDVVGFMHNAQAGGEQGLSAAREGRWTDEEQQLAAQARTWNNLDWALYVHFNRSLWTRIEKYGQSRLESAVAELRARREALAKLCLVGGEALDPKYITDQRFRPFQFGSAKVLGYILRSGLSPEDQEECERLVTPELQYKDKLDAKQFPPPVSLPLKPSRLLSP	722581	727768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_722731_723435_723738_723925_724236_726296
873597	contig_3818_pilon	+	3199	5	Intergenic	novelGene_99197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2522	2863	24884	29049	TRUE	20	GGTGCTTCAGCAGATGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGHLKRGLEGRGQMAGAMPSLPLAPHLLIHSPDLGLLGKKLNSWGRVPSRAFLCRVAWSAVVGPCHCSCPVAEQPGLAARDDLEVHALGGRRRVLGSGSQECIEVLQPRSP	22362	30073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_25080_28527_28661_29036_29179_29592_29689_29962
873598	contig_9011_pilon	-	3487	1	Intergenic	novelGene_159290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTGTAAAATCAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345597	342110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_342100_345600
873599	contig_6691_pilon	+	3828	1	Intergenic	novelGene_60153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAAATTGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331646	335474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_331600_335500
873600	contig_13048_pilon	-	3764	1	Intergenic	novelGene_138945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1722	2039	534093	533776	NA	50	TATTGAAAAGAAATGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFLQTPSPVPLAFLPSYPTAILSCRASGRTGAGNPGAPLAWCCLCVWPPFTSRREQRARAVQLSFPEVTRKPSLRERMLCSRYHHACRLINAQNSWIVDFLLLL	535814	532050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_532000_535800
873601	contig_14985_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_169093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAAATAAAAAATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16118	13908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_13900_16100
873602	contig_7066_pilon	+	2034	9	Intergenic	novelGene_42177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.617644512791	148	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	683	1114	950138	954480	FALSE	25	TTTGAGTATACCAGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGSGCALVQLQPLTVFPSQLQVHMILQLCPVLGDHTYSARVSTVLGQRFLLPAERTKPQKQVLDEALIRCLRLTPSQAAQLPLHLHLHCLLLPGPRPQDTPIELLAPLPPLFLQDPTVPGAPPTIVIPLSLMPTGREAGDL	946297	955400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_946427_946652_946793_947711_947757_947892_947993_949560_949669_949754_949840_950062_950187_953289_953430_954237
873603	contig_7933_pilon	+	2825	1	Intergenic	novelGene_164672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAATACAGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126654	129479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_126700_129500
873604	contig_11816_pilon	+	2956	1	Intergenic	novelGene_98541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTTTACAGTTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061705	1064661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1061700_1064700
873605	contig_16951_pilon	-	4072	1	Intergenic	novelGene_98618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCTTGTAACATCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36605	32533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_32500_36600
873606	contig_5445_pilon	-	1356	7	Intergenic	novelGene_135439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_5	223.126832392102	132	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	80	685	182235	170031	FALSE	35	TTTAAATGTATCTGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRRAAWLSYSLFSAGFGGSAPRPLVMSDSGSYGQSGGEQQSYSSYGNQGNQGYGQTPQSYSGYGQTTDSSYGQNYGSYSGYGQNQSGYSQSYSGYENQKQSSYGQQSYNNQGQQNTESSGGQGGRAPSYDQSDYGQQDSYDQQSGYDQHQGSYDEQSNYDQQHDSYNQNQQPYHSQRENYSHHTQDDRRDMSRYGEDNRGYGGSQGGGRGRGGYDKDGRGPMTGSR	182314	169359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_170156_171151_171346_173249_173353_173435_173521_173608_173661_175154_175195_182228
873607	contig_7775_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_37472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTCTGAATTTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106112	104093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_104100_106100
873608	contig_13888_pilon	+	1958	4	Intergenic	novelGene_151810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	613.001540690469	216	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATATGGCTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354218	361986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_355887_358600_358687_361679_361707_361809
873609	contig_5556_pilon	-	2257	14	Intergenic	novelGene_173269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1628	1981	177553	152483	TRUE	15	GCTCTGGAGCCGCGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQPPVHRMFIVFPLFIKIYSPLLHAGDNESQVCAHLLFVCIFLLNALANWALPVTTAVSKPELIRQTLGMIHTKTQVTYQHLSRQMAFKTIPVMILCFPVNLISWQPISFLFNTSF	189505	41111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_41142_102723_102861_152373_152534_163577_163738_176930_177010_177489_177582_179810_179899_180495_180552_181686_181767_183150_183268_186754_186963_187375_187447_188210_188482_188797
873610	contig_15029_pilon	-	2240	18	Intergenic	novelGene_128210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_13	187.658970671152	521	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	115	2064	239530	233629	FALSE	35	ACAAACAAGGCTCATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHGARLLLGLVGDCLVEPFWPLGTGVARGFLAAFDAAWMVKRWAEGAEPLQVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAVTPNQVRDLYDVLAKEPVQKSDKTDAGKLATAGTQEALLHWCQEQTAGYAGVHVTDLSSSWADGLALCALVHRLCPGLLEPSDLQGVGALEATSWALKVAEEELGITPVSSAQAVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKDKPHSPGPVSQGSPGTSSAVLFLGKLQRTLQRTRAQENREDAGGKKPRLEVEAETPSTVPEPSAPLTPPSQHQEAGARDLCALCGKHLYILERLCVNGCFFHRSCFCCHVCEATLWPGSYGQHPGDGHFYCLQHLPQPGHKEDSRDIGSESPELPAPGNDSLPAAPLMPTVPQEEANPAPSPSRPARRLIRLSSPERQRLSSLNLTPDPEMEPPPKPPRSCAALARQALEGSFVGWGVPAQGPQGLPSSALVALENEESPPSSEEEEEEEQEDVTLDEDTKQALLTFAKNSGTMDKYPTWRRNLLRRAKEEQMKRFHKAQAIQRRQNEIEVSLKELEAEGTKLELALRSQSTSPEQQKALWLEQLLQLVQKKNSLVAEEAELMITVQELDLEEKQWQLDQELRGYMNREETLKTAADWQAEDRILKKLLDVVHQRDALIRFQEERRLSELASGMAAQG	240168	233452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_233778_234224_234299_234399_234500_234712_234807_234933_235048_235333_235447_235595_235873_236124_236202_236533_236691_236806_236879_237118_237161_237297_237387_237572_237764_238234_238377_238940_239020_239166_239294_239477_239594_240117
873612	contig_12626_pilon	+	2299	11	Intergenic	novelGene_80431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	606	junction_5	251.211882680736	40	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	448	1053	155638	157613	TRUE	35	CTGCTTCTGCAGAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRCDW	118628	163256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637_155785_156281_156450_156973_157111_157459_158057_160817_160929_161302_161393_162654
873613	contig_7396_pilon	-	1913	4	Intergenic	novelGene_79521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	73	junction_3	19.3045763140937	255	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	286	1311	208571	194786	FALSE	30	TCTTAAAGCTGGAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGILTPRESAKFIAENSQDVFIDGAGVQRVAELLLAKAAGPELRVSGWKTLHELNPKAADEAAVNWVFVIDTLNFSFWSEHDEHKCLVAYRGKTYSGYWSLCAAVNRALDEGIPITSASYYATVTLEQVQHIFRSDTDVPMPLIEERHRILNETGKILLEKFEGSFLNCVRKSEQSAQKLMHLVVESFPSYRDVTQFEGKRISFYKRAQILVADTWSVLEGQGDGCFKDISSITMFADYRLPQVLLHLGALRYSDELQKKLLKGEMLSYGDKQEVEIRGCSVWCVELIRDCLLELIEKKGEKISGEINSILLDYYLWDYARDHRADMNGIPFHHTRCIYY	208856	194183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_195019_201889_202086_207475_207736_208234
873614	contig_6710_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_90671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	653867	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653868	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
873615	scaffold_19766_pilon	+	547	4	Intergenic	novelGene_34342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCAGAAGCCCAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596420	605191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_596747_596918_596973_597196_597249_605076
873617	contig_20610_pilon	-	4703	11	Intergenic	novelGene_67653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_7	57.3784802866022	198	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	208	2835	107635	83902	FALSE	35	TTAATAAAAGTGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTKPDILWAPHQVDRFVVCDSELSLYHVESTVNSELKAGSLRLSEDSAATLLSINSDTPYMKCVAWYLNYDPECLLAVGQANGRVVLTSLGQDHNSKFKDLIGKEFVPKHARQCNTLAWNPLDSNWLAAGLDKHRADFSVLIWDICSKYTPDIVPMEKVRLSAGETETTLLVTKPLYELGQNDACLSLCWLPRDQKLLLAGMHRNLAIFDLRNTSQKMFVNTKAVQGVTVDPYFHDRVASFYEGQVAIWDLRKFEKPVLTLTEQPKPLTKVAWCPTRTGLLATLTRDSNIIRLYDMQHTPTPIGDETEPTIIERSVQPCDNYIASFAWHPTSQNRMIVVTPNRTMSDFTVFERISLAWSPITSLMWACGRHLYECAEEENDNSLEKDIATKMRLRALSRYGLDTEQVWRNHILAGNEDPQLKSLWYTLHFMKQYTEDMDQKSPGNKGSLVYAGIKSIVKSSLGMVESSRHNWSGLDKQTDIQNLSEERILALQLCGWIKKGTDVDVGPFLNSLVQEGEWERAAAVALFNLDIRRAIQILNEGASSEKGDLNLNVVAMALSGYTEEKNSLWREMCGTLRLQLNNPYLCVMFAFLTSETGSYDGVLYENKVAVRDRVAFACKFLSDTQLNRYIEKLTNEMKEAGNLEGILLTGLTKDGVDLMESYVDRTGDVQTASYCMLQGSPLDVLKDERVQYWIENYRNLLDAWRFWHKRAEFDIHRSKLDPSSKPLAQVFVSCNFCGKSISYSCSTVPHQGRGFSQYGVSGSPTKSKVTSCPGCRKPLPRCALCLINMGTPVSSCPGGSKSDEKVDLSKDKKLAQFNNWFTWCHNCRHGGHAGHMLSWFRDHAECPVSACTCKCMQLDTTGNLVPAETVQP	118957	82033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_83999_84836_84967_90774_90980_92707_92861_95615_95775_96862_96929_100261_100432_102643_102899_105924_106024_106341_107684_118798
873618	contig_6929_pilon	+	2985	1	Intergenic	novelGene_139403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	533	850	126919	127236	NA	75	CAAAAAAAGAAAAATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNDFRRVRRQQMLQALVEFQCKAVNMQQTVTIIDVIHVVGVLHAITSRITRIVRVGKRTRDRRVLLKARPNSAGLTAGDGSHLTTCGDPMGVDHSIPTLLCREK	126386	129371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_126400_129400
873619	contig_5018_pilon	+	1405	4	Intergenic	novelGene_47191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	443	junction_3	165.493873669759	4329	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	783	1088	1591791	1592871	FALSE	10	GCCTTCCTCTGCAACCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDPRRPNKVLRYKPPPSECNPALDDPTPDYMNLLGMIFSMCGLMLKLKWCAWVAVYCSFISFANSRSSEDTKQMMSSFMLSISAVVMSYLQNPQPMTPPW	1591008	1593188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1591826_1591943_1592050_1592607_1592706_1592804
873620	contig_7919_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_28056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	648	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATAAAACCAAAGATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985038	982414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_982400_985000
873622	contig_12644_pilon	-	2694	10	Intergenic	novelGene_44703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	48.2465376484337	335	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	200	1102	2744160	2688092	FALSE	40	AAAATACCCACTACATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNLEALQKKLEELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCHVEGDAAETPPRPRTPGRPLSSYGMDSRPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHGFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLNQPSTPTHAAGV	2744359	2686499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2688206_2688958_2689005_2689437_2689500_2692222_2692288_2696495_2696698_2699472_2699598_2725426_2725479_2726059_2726138_2742731_2742879_2744148
873623	contig_9666_pilon	+	4864	8	Intergenic	novelGene_178151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	101.154559452153	247	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	101	1363	84134	102736	FALSE	30	AATACAACCAGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPRRPDGFDGLGYRGGSRDEQGFGGGGAFPARSFTSASDLSHWVTTPPDIPGSRNLHWGEKSPLYGAPAASTPLEGPAEEPFPSGGGGGVPGQSSEQLNRFAGFGIGLASLFTENVLAHPCIVLRRQCQVNYHAQNYHLTPFTVINIMYSFNKTQGPRALWKGMGSTFIVQGVTLGAEGIISEFTPLPREISHKWNPKQIGEHLLLKALTYMVAMPFYSASLIETVQSEIIRDNTGILECVKEGIGRVIGMGVPHSKRLLPLLSLIFPTVLHGVLHYIISSVIQKFVLLILKRKTYNSHLAESTSPVQSMLDAYFPELIANFAASLCSDVILYPLETVLHRLHIQGTRTIIDNTDLGYEVLPINTQYEGMRDCINTIKQEEGVLGFYKGFGAVIIQYTLHAAVLQITKIIYSTLLQNSI	84033	106237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9666_pilon_+_84423_86934_86978_88301_88360_92998_93077_95345_95447_98592_98650_99879_99938_102157
873624	contig_5727_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_7989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1564	2076	498639	498127	NA	50	AAACAGCTACAAGATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNQLDGNRFGLPFYGTLPCYSSRAKPHMITSFSLGISLVHPASICCILPEQPAFQTSFSIALCTYITLLYVIGLFGSECLLSILFAVGIKGNYILAHISKRTVSELEVCYLLLILKGFGSLYVTLNRIVEMINIIHCSMSHENKSRLQGWHLSRPVLSLYFYLGLKQS	500202	497861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_497900_500200
873626	contig_2364_pilon	-	2651	1	Intergenic	novelGene_170825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGGACATCAAAATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35502	32851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2364_pilon_-_32900_35500
873627	contig_2933_pilon	+	3777	1	Intergenic	novelGene_111327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2589	2921	542227	542559	NA	5	TCCACTTGTTTTCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLGKTRTHREGHVLLNGTPWLLSESPVSSWRHPQRLAVPSPGPGASRLGVGTAQCLVFSGLSSLHHLPRPITGSSESSSHQRAVPPSAFHVCPPQKGYQNSVQRKLVT	539638	543415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_539600_543400
873628	contig_3575_pilon	-	3026	1	Intergenic	novelGene_141104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1738	2076	389914	389576	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGERLKSCEMAGGFSREACTSLHSRGFSERSACGKFKFCFLELPPSPQIFNSRLVESGNSVPEPMDTESRLYKQILPVGTPFCQRSPAFVCNVGGSFIYKPAISSEVAVQ	391651	388625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_388600_391700
873629	contig_10892_pilon	+	3380	1	Intergenic	novelGene_116741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAGAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113520	116900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_113500_116900
873630	contig_5794_pilon	+	2926	1	Intergenic	novelGene_69736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1615	1920	399696	400001	NA	40	CAAAAGGTGAGTGGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVICVKIWCVYIYQDDIHLSRRHDNYKYFCTQCQGSKIYNKKNSNRIEERSRPTIIVGDFNTTLLTTDRTTRKTINKDTEDLNNQLDLRDIYRTHPLTAE	398081	401007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_398100_401000
873631	contig_4156_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_88097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGGTTTCAATGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294982	296524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_295000_296500
873632	contig_5947_pilon	-	2364	16	Intergenic	novelGene_101559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_12	80.8526780976088	76	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2205	158	2362	674240	650168	FALSE	40	GCATACGATTGCAACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPDSGAPGKRLIDRIVETICSCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSPHIEIHEGTILHTVRTCYNIYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFTRMENQVLQEARELEKPIQSKPQSPVIQVVATSPKSGRLKQSQAQSKPTTPEKTDLTNGDHARSGSGKVGPENGDTLRERGPSLSGMDEMPMDGAQEVVKEILEDVVTCAVKEAAEKHSVMEPERVLGGPECQESAVPPGVDENSQTNGIADDRQSLSSADNLESDTQGHQVAAKFSHILQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGPVFRTHEMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKEIFLNILETSTSSFEHRWMVIQTLTRICADAQCVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRSGHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLLDQEMGDGKGLDMARRSSVTSTESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKRGIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDSVRFNKEVMYAYVDQLDFCEKEFVSALRAFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETK	681784	650165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_650306_650411_650497_652500_652707_653247_653360_655222_655407_656287_656397_657553_657694_658391_658492_659516_659752_661149_661281_663265_663418_665356_665438_672370_672606_672977_673158_674123_674272_681658
873633	contig_5121_pilon	-	1871	4	Intergenic	novelGene_170747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	9.46337971105226	1064	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	214	600	460953	442691	FALSE	80	AAAACAATAAAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVTVYHGKISRETGEKLLLATGLDGSYLLRDSESVPGVYCLCVLYQGYIYTYRVSQTETGSWSAETAPGVHKRFFRKIKNLISAFQKPDQGIVIPLQYPVEKKPSAKSTQGTTGRRENPDVCLKAP	461166	441419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_442732_444488_444634_449398_449463_460816
873634	contig_5698_pilon	+	3474	20	Intergenic	novelGene_55047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	29.7203960111263	92	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2445	215	2659	25127	47577	TRUE	10	GCCTCCATGTCTCCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKFSCRQLRETGQCFESFLVVRGLDMETDRERLRTVYNRDFKISFGTPAPGFSSMLYGMKIANLAYVTKTRVRFFRLDRWADVWFPEKRRMKLGSDISKHHKSLLAKIFYDRAEYLHGKHGVDVEVQGPHEARDGQLLIRLDLNRKEVLTLRLRNGGTQPVTLTHLFPLCRTSQFAFYNGDQELPCPLGPGEYYELHVHCKTSFVGYFPATVLWELLGPGEPGSEGAGTFYIARFLAAVAHSPLAAQLKPTTPFKRSRIAGNPVVTNRIEEGERPDRAKGYDLELSMALGTYYPPPRLRQLLPILQGTSIFTAPKEIAEIKAQLETALKWRNYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLESVPMTWDPVDQNPRLLTLEVPGVTESRPSVLRGDHLFALLSSETNQEDPVTYKGFVHKVELDRVKLSFSMSLLSRFVDGLTFKVNFTFNRQPLRVQHRALELTGRWLLWPMLFPVASRGVPLLPSDVKLKLYDRSLESNPEQLQAMKHIVMGTTRPAPYVIFGPPGTGKTVTLVEAIKQVVKHLPKAHILACAPSNSGADLLCQRLRVHLPSSIYRLLAPSRDIRLVPEDIKPCCNWDAKKGDYVFPAKKKLQEYRVLITTLITASRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHSMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGGQLVLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGHSLLERLLSYNSLYKKGSSGYNPQFITKLLRNYRSHPTILDIPNRLYYEGELQACADVVDRERFCRWEGLPRQGFPIIFHGVMGKDEREGNSPSFFNPRRGCHSDFLLEAAPGPLL	24912	50421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_25264_39245_39450_39733_39970_40159_40419_41732_41865_42546_42716_43499_43655_44102_44280_44398_44547_44980_45140_45364_45469_45636_45735_45831_46049_47110_47229_47445_47640_47896_47972_48928_49055_49135_49225_49872_49995_50080
873635	contig_753_pilon	-	3631	1	Intergenic	novelGene_112938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	420	764	732154	731810	NA	50	ACAGCGGGAGAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGMLALTTGTEAGSGLLYFQRPKTLAYCDFFFFFKCQSPTLEINQPMELIYSIENRHTGREWERALAQLLHSCTSGLNGNLVPGSFSLFFKYRQVQENIWKLNYIPLHPMSD	732573	728942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_728900_732600
873636	contig_678_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_167815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120208	122518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_120200_122500
873637	contig_11171_pilon	-	4335	1	Intergenic	novelGene_48580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1425	1805	91276	90896	NA	65	AAATTCTGAGAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSVTRGCRLFTVILVPSRGLRTGCHTDKSVTRDQRTGVCSHKQNSFLVSDHRGPEERIMEGPSQEGPWDLSPPHPHHPRLRKRTPHFILGPFRPLLSASAWNAAHVSRPTQLQWYFLLEASPFC	92700	88365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_88400_92700
873638	contig_10078_pilon	+	4054	1	Intergenic	novelGene_160003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCCGTAATTAGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181462	185516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_181500_185500
873639	contig_8310_pilon	+	2393	4	Intergenic	novelGene_75556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	12.675435561221	49	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	96	476	272460	279883	FALSE	10	GTTGCCGTCCCTGCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQGAVTRAGRGLGAAGCTLPPRAGRASCCCLSF	215095	281800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714
873640	contig_12626_pilon	-	2025	4	Intergenic	novelGene_80466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGGGGCAAAGTACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196497	186216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_187700_187865_187968_191970_192171_196257
873641	contig_6958_pilon	+	4896	1	Intergenic	novelGene_69956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGCATTGTATCCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178736	183632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_178700_183600
873642	contig_17753_pilon	+	2860	1	Intergenic	novelGene_105101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	6	21	320	340	125859	125879	NA	50	CACCCAGAGCAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTWGLVFTVSKGETATLSPGNDRETRHWLTSPGGQGHLSSQDQVSLRWCFLEGTGSSLTRGREILQVGPNLLDSATEYLCQLRAGGAELERGEDDGGNKARDTGLLMCEVRP	125539	128399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_125500_128400
873643	contig_9995_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_47684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGGTGAATGGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264300	266250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_264300_266200
873644	contig_4392_pilon	-	3225	1	Intergenic	novelGene_117285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCAACTCCAACCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37390	34165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_34200_37400
873645	contig_14142_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_120578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	14	433	526719	527138	NA	40	TGGGAAGAATAAGTGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTAMAASGAVFRRLGALSGAGALGLASYGAHGQGTGAGTGIVDIPGTTFGVWCRGGAYGKCPISHRPGSPRRLKPFKVPHPGPVGSQNCPMCVSTNQKPLLIPTWVPRERGRPGLAVGLGVHPNLCLSSLQVPSSGMPTERR	526705	529574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_526700_529600
873646	contig_13481_pilon	+	5438	20	Intergenic	novelGene_119462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCACAAGTAGGTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202746	1260698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1204772_1208131_1208243_1208787_1208934_1210153_1210305_1211538_1211692_1215912_1216051_1220595_1220735_1221017_1221171_1223945_1224024_1227500_1227665_1228481_1228658_1229330_1229432_1230264_1230323_1231350_1231484_1232893_1233005_1235388_1235558_1236543_1236717_1252578_1252693_1257048_1257318_1259822
873647	contig_1939_pilon	+	2466	9	Intergenic	novelGene_144856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_7	308.626366947155	207	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	448	1941	194082	469157	FALSE	15	CAGCAGTGTCCTCTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRNPENGGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTDQYNPNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQIQQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDALKEEKEKLQGLVTRQTYIIQELEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNLCTKEVLLKGGKREEEKPFRDCADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFGNPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYTLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLILHGADFSTKDADHDNCMCKCALMLTGGWWFDACGPSNLNGMFYTAGQNHGKLNGIKWHYFKGPSYSLRSTTMMIRPLDF	193634	469682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_194379_371026_371183_376345_376468_393212_393443_411106_411235_421380_421483_430156_430324_455036_455168_468996
873648	contig_12464_pilon	-	2225	3	Intergenic	novelGene_68711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	68	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	413	973	357758	356959	FALSE	40	GTAATTTTTTTAGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPGKCLVILNILILHQVKNT	376429	355706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_357109_357347_357838_376096
873649	contig_5452_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_101038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATAAGGCAGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639891	641324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_639900_641300
873650	contig_8145_pilon	-	3765	3	Intergenic	novelGene_118664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	491	junction_1	19.5	66	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	55	420	870030	867277	FALSE	25	TTTACGTTTTGAAGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFKKLDLDNSGSLSVEEFMSLPELQQNPLVQRVIDIFDTDGNGEVDFKEFIEGVSQFSVKGDKEQKLRFAFRIYDMDKDGYISNGELFQVLKMMVGNNLKDTQLQQIVDKTIINADKDGDGRISFEEFCAVSTKELVLH	870084	863931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_867492_868849_868910_869939
873651	contig_9345_pilon	-	2920	4	Intergenic	novelGene_24423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_3	24.3903441732356	358	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	50	448	221088	211720	FALSE	20	TAGCTCTTGCAGGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WELGRQPSSPAQPGAGMASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPVLHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLNWIGVPTREFNVGQYRRDMVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALCDVRRFLSEEGGHVAVSVTSW	221137	209247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_211808_214946_215044_215211_215329_220991
873652	scaffold_13553_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_73749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26340	28467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_26300_28500
873653	contig_2770_pilon	+	4794	17	Intergenic	novelGene_107401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	28	junction_1	67.0493055519593	159	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	160	2565	73613	257100	FALSE	30	CATCCTCACCCTACTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSESCGQSGKASRLCVRVQELQHPSSRGAVRGQTSAGFWVSLVATPRDRKREKMEEEGGSGGRAAGTSGDGGGGGGGEQLLTVKHELRTANLTGHAEKVGIENFELLKVLGTGAYGKVFLVRKISGHDTGKLYAMKVLKKATIVQKAKTTEHTRTERQVLEHIRQSPFLVTLHYAFQTETKLHLILDYINGGELFTHLSQRERFTEHEVQIYVGEIVLALEHLHKLGIIYRDIKLENILLDSNGHVVLTDFGLSKEFVADEAERAYSFCGTIEYMAPDIVRGGDSGHDKAVDWWSLGVLMYELLTGASPFTVDGEKNSQAEISRRILKSEPPYPQEMSALAKDLIQRLLMKDPKKRLGCGPRDADEIKEHLFFQKINWDDLAAKKVPAPFKPVIRDELDVSNFAEEFTEMDPTYSPAALPQSSERLFQGYSFVAPSILFKRNAAIIDPLQFDMGVERPGVTNVARSAMMKDSPFYQHYDLDLKDKPLGEGSFSICRKCIHKKSNQAFAVKIISKRMEANTQKEITALKLCEGHPNIVKLHEVFHDQLHTFLVMELLNGGELFERIKKKKHFSETEASYIMRKLVSAVSHMHDVGVVHRDLKPENLLFTDENDNLEIKVIDFGFAHLKPPDNQPLKTPCFTLHYAAPELLNHSGYDESCDLWSLGVILYTMLSGQVPFQSHDKSVTCTSAVEIMKKIKKGDFSFEGEAWKNVSQEAKDLIQGLLTVDPNKRLKMSGLRYNEWLQDGSQLSSNPLMTPDILGSSGAAVHTCVKATFHAFNKYKREGFCLQNVDKAPLAKRRKMKKTSTSTETRSSSSESSHSSSSHSHGKTTPTKTLQPSNPTDSSNPETLFQFSD	73453	259329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_73722_138477_138550_161047_161267_196462_196579_199607_199716_217266_217351_220415_220520_230390_230542_233561_233724_234924_235051_235457_235592_236301_236396_240231_240403_243462_243655_251448_251609_255270_255435_256860
873654	contig_15939_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_160258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	763	1131	100195	100563	NA	20	CCACTGCACCACCAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLCAATWYVVHITNNKMYQKKKKNKENQSVLSEVCHNLYTPQVRNYLYPWVNHLLPGKVLLLLLAAMESAPIHGEPMHNRRKCCLVPCHLHDRLRSIVIHRVFIGWFSEIDHQAFIPSLS	99432	101297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_99400_101300
873655	contig_13051_pilon	+	3947	13	Intergenic	novelGene_140140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	2386	3330	502739	514461	TRUE	5	GCTTTGGGGAGGGGCGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMPWPTRIRMAMPVSSFATSLFRWLALVKASLSSGDPVWVLVGVSDVFPLVTADTLRADLQPHDQGVVDRLLHGPILLLDPVHHVSVDFGKDERCIVLGAQVTFLDGTNWNRATAVCPFTLFLRRGVKGLPPLVSWLQVWPGHPRLHPAVEVPDHLALVTLDLPELVAEVLDEQVAVLVMGRVIVGHHASGDAKAPKHGAGHSSEDPALAILNLLAAIVLPAPQDVHAANPEHGADAILVVVVPASQQHALVIIAVDHAAHHPAHVYRATAAGAVAVGILQELGVDIEELQADVQDPVFKLPKVPRQAVDELG	492285	531215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_494214_494954_495090_496056_496218_502577_502853_504510_504752_506846_506951_507710_507848_511487_511664_512757_512891_514421_514541_519667_519911_527333_527513_531099
873656	contig_5445_pilon	+	1898	2	Intergenic	novelGene_135408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2966	junction_1	0	149	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCCTACTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51581	53972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_52635_53127
873657	contig_12644_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_44500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACTATTTCTGTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048505	1050286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1048500_1050300
873658	contig_7806_pilon	+	2645	8	Intergenic	novelGene_157544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_5	179.000399041854	63	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	80	1243	263758	275624	FALSE	70	GAAGAAAAAGAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGVFALLQAYAFLQYLRDRLTKQEFQTLFFLGVSVAAGAVFLSVIYLTYTGYIAPWSGRFYSLWDTGYAKIHIPIIASVSEHQPTTWVSFFFDLHILVCTFPAGLWFCIKNINDERVFVALYAISAVYFAGVMVRLMLTLTPVVCMLSAIAFSNVFEHYLGDDMKRENPPVEDSSDEDDKRNPGNLYDKAGKVRKHVTEQEKTEEGLGPNIKSIVTMLMLMLLMMFAVHCTWVTSNAYSSPSVVLASYNHDGTRNILDDFREAYFWLRQNTDEHARVMSWWDYGYQIAGMANRTTLVDNNTWNNSHIALVGKAMSSNETAAYKIMRTLDVDYVLVIFGGVIGYSGDDINKFLWMVRIAEGEHPKDIRVRNKIILVCERQLTVAT	263678	277026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_263771_265551_265699_267462_267512_269376_269532_271815_272028_273432_273621_274313_274486_275396
873659	scaffold_19766_pilon	+	3958	3	Intergenic	novelGene_34407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAACAACTTCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826355	830531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_827143_827263_828079_828175
873660	contig_3111_pilon	-	2954	3	Intergenic	novelGene_129973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	1.5	95	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	125	568	100376	65373	FALSE	20	CCAGCCTTTCAGCCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSTPEQAGRAESWCCRSWGAGASFPAEPESELGSCERLRTKMFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYTAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYYAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGSAYQSPLPLSRGSLSTIARAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQVRQVQTLPK	113293	62986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_65595_100154_100403_113195
873661	contig_15897_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_49584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTTTCACATCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860012	861981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_860000_862000
873662	contig_8452_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_48049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	368	685	426749	426432	NA	40	TATTCTGTAAAATAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFLHDWISGRIPSVNALGLATLSYLHAFECPVFSHNSVPLGHTFLCLMPPFPILVASAPTFFQDLARNQLLLKLPLIFTLSCSLSSTRRKAVWHVLVLERCAL	427116	425009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_425000_427100
873663	scaffold_13505_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_111577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1154	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACCGGTGTTCGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620824	622483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_620800_622500
873664	contig_3822_pilon	-	4042	13	Intergenic	novelGene_133283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	749	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1974	2312	269750	260357	TRUE	5	GCCATCTTCTCCTCGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVSIQCVNSLFSAESVYPFLGSLYSLAFLGKRHHFPGQLKIRKAARIFLVVIRYSEDGAIKFIIAKLLESHSGCDRGKHRYIYFYWKAWRKLHLNKFSKLVKVLEGSYYF	271723	148022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_148772_195218_195260_199349_199457_204090_204182_204461_204501_210471_210539_214471_214617_221454_221592_224170_224331_255390_255473_256813_256913_260343_260441_269495
873665	contig_7056_pilon	+	3398	1	Intergenic	novelGene_43585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATAAAAGTAATTGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61278	64676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_61300_64700
873666	contig_19416_pilon	-	3001	1	Intergenic	novelGene_175525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	515	826	42683	42372	NA	20	ACTCATGGCGACCTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQITEDESETEAQTPGTMGCGPRLSQPNPTGAVVPCLFCGPSASLLMQRVIKLWSDPRGRLRSSISRPFPKNLGVFVHFQPHRSLFVPVNSFLSLTHCLDFS	43197	40196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_-_40200_43200
873667	contig_4686_pilon	+	3228	1	Intergenic	novelGene_118576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2008	2328	755876	756196	NA	35	ATTGAGATGTAAGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTHSDTIGQSRTAPQGFQGAAGGFELSTFRLAAQLLTIALPGLLQKISGSQSVVPRAAAAASPGNLLEMQNLGPHLRLSESETKKVGPSSLFQQTFQVILRHVDV	753868	757096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_753900_757100
873668	contig_5640_pilon	-	5773	1	Intergenic	novelGene_27288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACCATTTAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248120	1242347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1242300_1248100
873669	contig_7151_pilon	-	3484	5	Intergenic	novelGene_40642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.6053022732208	40	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	609	1175	12529	5138	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKRSSSHHLCRPVTGSAAAFPDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRGGP	13137	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_5287_5683_5717_5943_6291_12491
873670	contig_5947_pilon	+	2456	2	Intergenic	novelGene_101476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAAACTTTGGTGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91894	94489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_93063_93201
873671	contig_1715_pilon	+	2028	7	Intergenic	novelGene_127183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	171	368	251397	252441	TRUE	30	CACTTAAATCTCTTATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEGGTLFCLILDLDLSVSCSIGGTWEELLSESLFDKIIDGSVETAGGRVLVGWLFLMSTSVDSLVLMVFKEKAFSCFGRALEVFAGSSSLISFSNSSVSCARELSSPCFFFFFFFFLDFPA	248985	270725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_249143_251383_251524_252370_252480_256575_256701_262484_262583_267997_268236_269564
873672	contig_6217_pilon	-	2862	1	Intergenic	novelGene_109592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTAGTACTTTCTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276273	273411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_273400_276300
873673	contig_11656_pilon	+	3353	1	Intergenic	novelGene_53980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213811	217164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_213800_217200
873674	contig_3584_pilon	+	1946	4	Intergenic	novelGene_108148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9.62635271879577	104	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAACGGTTTGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341251	368895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341443_350949_351055_351472_351630_367402
873675	contig_9706_pilon	+	3623	1	Intergenic	novelGene_20982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATAAAACCACAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377448	381071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_377400_381100
873676	contig_6946_pilon	+	2856	1	Intergenic	novelGene_59773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATGAAAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410211	413067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_410200_413100
873677	contig_5041_pilon	-	2850	1	Intergenic	novelGene_27081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTTTTACTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532940	530090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_530100_532900
873678	contig_3081_pilon	+	4741	1	Intergenic	novelGene_133902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15803	20544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_15800_20500
873679	contig_11656_pilon	-	3719	1	Intergenic	novelGene_53992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAATAATAAATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375950	372231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_372200_376000
873680	contig_14744_pilon	+	3328	1	Intergenic	novelGene_65913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	64	372	69629	69937	NA	80	TGAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFIIIFLVDTRQPYGAQFCSGTYGVTMSIYGDNQFLYKSRSPVAEVVKRLTANQKIDSSNPPGAAWKPYGAVLLCLVGSLRVLVGFTAAGLVFLVFSYR	69565	72893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_69600_72900
873681	contig_3789_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_79886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTAAAGGTTACAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574849	572623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_572600_574800
873682	contig_504_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_54416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	220	756	140020	140556	NA	40	TCCTATGTTGATATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIQFFHQDSFFSAMPAGTPLSGPLASALLGQVLQSSFSFTNKCSEAPYSASKPRLKTLHGLTNPAPPSAERHPPPPSSLLPRGTQLYCSVGWKAHRTISCQSLPWVPPAAIYLPPLLCHCFLPASGLQRSLSLFQSPGSRSFSAQGSQVQRTCSALGSSFLVLVRSSLSRLWDGSF	139800	140967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_139800_141000
873683	contig_5084_pilon	-	2653	25	Intergenic	novelGene_64676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	60.8313783932456	119	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	48	2438	1804360	1756873	FALSE	5	TCTGCTGCTTTTTCATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FREILDGLAYIHEKGMIHRDLKPVNIFLDSDDHVKIGDFGLATDHLAFPADGKQDDQAGDHLIKSDPSGHLTGMVGTALYVSPEVQGSTRSAYNQKVDLFSLGIIFFEMSYRPMNTASERIFVLSQLRDPTSPKFPEDFDDGEHTKQKSVISWLLNHDPAKRPTATELLKSELLPPPQMEESELHEVLHHTLANVDGKAYRTMMAHIFSQHISPAIDYTYDSDILKGNFSIRTAKIQQHVCETIIRIFKRHGAVELCTPLLLPRNKQIYEHNEAALFMDHSGMLVMLPFDLRIPFARYVARNNISNLKRYCIERVFRPRKLDRFHPKELLECAFDIVTSTTNSSLPTAEIIYTIYEIIQEFPVLQERNYSIYLNHTTLLKAILLHCGIPEDKLSQVYIILYDVVTEKLTRREVEAKFCNLSLSSNSLCRLYRFIEQKGDLQDLTSTINSLIKQKTGVAQLVKYGLEDLENVVGLLKKLGVKLQVLINLGLVYKVQQHSGIIFQFVAFMRRRQRAVPEILAAGGRYDLLIPRFRGPQALGPVPTAIGVSIAIDKISAAVLNMEEPVTISSCDLLVVSIGQMSMSRAINLTQKLWTAGITAEIMYDCSQSQEELQEYCRHHEIPCVALVSDKEGSHVKVKSFEKERQTEKRVLEADLVDHMLQKLKTKVSDERNIREASDNLAVQNLKGSFSNASGLFEIHGATVIPNVSVVAPEKLSASTRRRYETQVQTRLQTALASLHQKSSEIEILAVDLPKDTILQFLSLEWDADEQAFNTTVKQLLSHLPKQRYLKLVCDEIYNIKVEKKGVCAIPV	1807399	1756657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1756897_1757452_1757573_1759069_1759115_1759649_1759719_1760961_1761060_1762013_1762073_1765638_1765752_1772727_1772815_1774485_1774615_1775040_1775149_1779146_1779282_1779775_1779947_1782038_1782105_1784729_1784847_1786836_1787006_1788097_1788148_1790965_1791088_1791510_1791587_1793585_1793823_1796483_1796538_1798568_1798671_1801771_1801852_1802377_1802436_1804258_1804364_1807355
873684	contig_10734_pilon	-	4011	1	Intergenic	novelGene_50961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGCTAACAACAACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10203	6192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_6200_10200
873685	contig_16999_pilon	+	2909	2	Intergenic	novelGene_84975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	152	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66297	73505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_67778_72076
873686	contig_12414_pilon	-	3257	1	Intergenic	novelGene_59636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694753	691496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_691500_694800
873687	contig_5403_pilon	+	2498	18	Intergenic	novelGene_87971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACGGACGAGGGCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424186	458233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_+_424718_425193_425301_428395_428474_430941_431048_431141_431243_431423_431502_431859_431998_432084_432251_433250_433415_434618_434717_435797_435935_436923_436973_438891_439012_439918_440038_441201_441323_449836_450040_453795_453875_458130
873688	contig_1034_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_175515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGGAGTCTGTAGTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5581	7938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1034_pilon_+_5600_7900
873689	contig_5200_pilon	-	3187	1	Intergenic	novelGene_140167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGATTTCAAATTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397042	393855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_393900_397000
873690	contig_91_pilon	-	2403	10	Intergenic	novelGene_127143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	271.776460431076	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	342	1730	1224567	1199198	FALSE	20	TAAACTGGTTTTGTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRRTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSNFKRFHGRAFSDPFIQREKENLSYDLVSMKNGGVGIKVMYMDEEHLFSVEQITAMLLTKLKETAENNLKKPVTDCVISVPSFFTDAERRSLLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQDLPGLDEKPRIVIFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKVLGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCAEFKTKYKLDTKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMDDKDVSGKMNRSQFEELCADLLQKIDAPLRALLEQTQLRVEDVSAVEIVGGATRIPAVKEKIAKFFGKDVSTTLNADEAVARGCALQCASLSPAFKVREFSVELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNADKKEEDLEGKSNFGAEPPRQNGDCYPNEKSSINMDLD	1224908	1198524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1199405_1210654_1210700_1212325_1212555_1213435_1213681_1214074_1214209_1215818_1215919_1217854_1217978_1219029_1219171_1221436_1221495_1224460
873691	contig_3174_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_144067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCATCATAATCAGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2823	1391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3174_pilon_-_1400_2800
873692	contig_10951_pilon	-	4343	6	Intergenic	novelGene_61642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	293	junction_5	131.01541893991	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1402	4206	136	4341	315866	292933	FALSE	30	GGCCCCAGCATTGAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEMTENETPTKKQHRKKNRETHNAVERHRKKKINAGINRIGELIPCSPALKQSKNMILDQAFKYITELKRQNDELLLNGGNNEQAEEIKKLRKQLEEIQKENGRYIELLKANDICLYDDPTIHWKGNLKNSKVPVVIPSDQVQKNIIVYSNGSQPGGNSQGAAVQGITFNVGHHLQKQTANVVPVQRTCNLVTPVSISGVYPSENKPWHQTTVSALAANQPIPLCLPATISAQNILELSTSESESSVLGATSGSLIAVPVGPEPHQHHSLHTSLNDQNSSENKNGQESPQLLKKMVPCTSDIPSSSSAAAAQVQQGSKPWLSTQDLRSDLHNTLIVSVTTTVCSQPPRLAGGSSPVGISKGTDSTNGTAVVAPSVPGVGKTATPVSTLSANPLDSGWTLSCSLPSSSVSTSDLKNINSLTRISSAGNTQTTWTTLQLAGNTIQPLSQTPSIAVTPVLNDSGPSPTTTNDSRHVATGISLNNSFPADGQAVEQVVVTLPSCSSLPMQPLIAQPQVKSQPPKNILPLNSAMQVIQMAQPVGSAINAAPANQNVIILQPPSTTPCPTVMRAEVPSQTVGQQIVIIQTASQNPLPLLSAPPPGSVRLPINGASAIIGSNNSVQNASTPQTFGGKHLVHILPRPSSLSTSNSAQTFSVAMSNQQQPQTISLNGQLFALQPVMSSSGTTNQTPMQIIQPTTSEDPNTNVALNTFGALASLNQSISQMAGQSCVQLSISQPANPQTAANSQTTSANCVSSTTTVAPPVTTDNSATLPGTYHLVTAPSVNTVACLPPNVKSKRVNKKPVAKKHLAANKSACPLSAVREVGKLDCPSGEGSAEPSCNDVLLDSFPVALPSVAMSQASSVNVSGSHSLEVLNSEPVSKCKSTKESNSPSQESVTSEHNATAPAKSKDSTPVLQRETSQDKPATSLALSDAAKSCSSANVLIPSPNDPHILASQVSGLSSTTNTTSTDCVSEVEIIAETCRIEQDSSDTTQTTGLLKGQGLTALLSDLAKDPQKTSLSVQVDHPDFSENSKIVDSSVDLHPKQELLLLNSDGRDPPQHHSCIPDPEVINGSLFTSRQADSPMSTSSGSSRSFSVASMLPEATREDMTSSATTNTCDSCTFVEQTDIVALAARAIFDQENLEKGRAGIQADIREATSKPSETSSLEGDQPFKSQIPKENGTGQAEVVPNEFNSQDSVEAPVDRPLEKPSCSVGIKTSDASLQVSASQSPSVTSLSVNNLIHQSSISHPLVSCAGLSQSSEQTTVSAAVNLTVSSSSYGSQPPGPSLMTEYAQEQLNTMTSTIPNSQIQEPLLKPSHESRKDSAKRTVQDDLLLSSAKRQKHCQPAPLRLESMSLMSRTPDSISDQTQVMVSQIPPNSSNSVVPISNPTHGDGLTRLFPPGNNF	317283	292930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_296883_299856_299954_311735_311819_314510_314540_315819_315885_317166
873693	contig_1150_pilon	-	539	3	Intergenic	novelGene_61447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTGTTGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311054	309011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
873694	contig_6795_pilon	+	4598	12	Intergenic	novelGene_27717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	12.5579647769391	149	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	94	1548	235154	260013	FALSE	5	CCAGTTTGCCCCTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPISSVHQDADLWASHTKMLAEPLRDSDIEVYNIIKKESNRQKVGLELIASENFASRAVLEALGSCLNNKYSEGYPGQRYYGGTEFIDELEVLCQKRALQVYNLDPQCWGVNVQPYSGSPANFAVYTALVEPHGRIMGLDLPDGGHLTHGFMTEKKKISATSIFFESMPYKVNPATGYINYDQLEQNARLFHPKLIIAGVSCYSRNLDYSRLRKIADDNGAYLMADMAHISGLVAAGVVPSPFEHCHVVSTTTHKTLRGCRAGMIFYRRGVHSVDPKTGKEILYNLESLINAAVFPGLQGGPHNHAIAGVAVALKQAMTPEFRAYQHQVVANCRALSQALMELGYSIVTGGSDNHLILVDLRSKGTDGGRAEKVLEACSIACNKNTCPGDKSALRPSGLRLGTPALTSRGLLEKEFQQVAHFIHRGIELTLQIQKDIGAKATLKEFKEKLAGDEKHQNAIRALREDVENFASLFPLPGLPDS	226135	263063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_226210_235134_235250_237991_238138_249903_250020_250373_250535_252198_252281_252760_252974_254501_254619_256397_256521_258603_258721_259296_259408_259840
873695	contig_3241_pilon	+	3426	1	Intergenic	novelGene_146406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAAGGAGTAAGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847170	850596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_847200_850600
873696	contig_2636_pilon	-	1263	3	Intergenic	novelGene_52045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGTGAAGGGACAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46515	34057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_34132_35877_35971_45419
873697	contig_4486_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_38616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGACCATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395096	392810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_392800_395100
873698	contig_5286_pilon	-	2743	2	Intergenic	novelGene_157363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557725	553559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_554037_555459
873699	contig_5502_pilon	+	3116	16	Intergenic	novelGene_155011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_9	68.8781210222488	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	91	2412	496420	538556	FALSE	20	TATTCCAAACTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDLEVLVLKLESDPKNRGSVNHHPHKTNSPMKPAEEGISNETSHLESDDFVMCQKPMELLGEKSKQSGVSVTLESTGLTDEKIKYFHVQHLLYRRFAPDISSYVLPDDIKLHSLQLLPIYHTGSLSSNGKNSSQEKELLSLFCFYSLPHVGYLYMVVKSVELMSIYQYPEKSQQAVLTPQFLHVITSNNLQCFTVRCSAAAAREEDPYVDTTLKACPPVSMDVCALRIQLFIGLKAICHFKNHIILLSKADPEAIPERRESPKRLLSRRDTSVKLQTPPVAEAGWNLYIVNTVPPVQLYKEMVDYSNSYKTVKTQSCIHLLSEAHLLVRAALMDAHQLEPGEKAELLEAFKESCGHLGDCYSRLDTQHAHLALPYYKMSGLSMAEVLAQVDWAAEDGSQKYERGLIFYINHSLHENLDEDLSEELAAKVVQMFHVAEPKQLPYILCSPSMKNINPLTAMNYLRKLDTSGFSSILVTLAKAAMALKIGDLETHRKEMKSHSEMKLVCGFILEPRLLIQQQKGQIFPTELAVHLKETQPGLLVASILGLQKNNKMGIEEADSFFKVLCGKDEDMIPQLLVDFWEAQLVACLPDVVLQELFFKLTSHYIWRLSKGQPPDSTPLRTSEDLINACSHYGLIYPWVNILISYDSSADKNYTEDLSKLQSLICGPSFDIASIIPFLELLSEDTAAGLSVHVLCRTRLKEYEQCIDTLLERCPEAVIPYANHELKEENRTLWWKKLLPELCQRIKCGGEKYQLYLSSLKETLSVVAVELELRDFLNVLPEDGTAAFFLPYLLYCCRKKSLT	496329	539260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_496439_497093_497266_497365_497452_503646_503840_506878_506961_511433_511589_513238_513348_523694_523877_525604_525786_526910_527145_528390_528577_528931_529121_530137_530246_532858_533066_534043_534135_538428
873700	contig_1301_pilon	+	4416	1	Intergenic	novelGene_47299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCACTCCTAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263948	268364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_263900_268400
873701	contig_854_pilon	+	5056	5	Intergenic	novelGene_36114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	964	1641	135175	137696	FALSE	20	CTAACATCTCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLNAGSSVPEGGCSLTFMTLGTADWKTMLRMGWGAVLSMDTTTTSTSERPGSGSRAKWKRMRKPCWSYTVTGKMLLGLMDSRGTVMLASESSVGVGCCGGAGGSGDTVWRRLVAPELGELQLLWFCRSRSVSRGAGCCFSHRTCWDSGGSDCCRRIFPRRSRSSRPLLAGWGVCVGGRLSVLGAGAGGSAPSDDCWAYKGCRWVGLCQKGVSPGAAWRPLPLCR	134121	141111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_135032_135121_135236_135446_135614_136723_136918_137440
873702	contig_10756_pilon	+	4896	1	Intergenic	novelGene_170676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGATTGAAGCCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372412	377308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_372400_377300
873703	scaffold_15027_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_163570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCCCAAAACTTCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72268	69434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_69400_72300
873704	contig_10943_pilon	+	3288	1	Intergenic	novelGene_168267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTGGGAAAATGCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44148	47436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_+_44100_47400
873705	contig_7342_pilon	-	1883	5	Intergenic	novelGene_71124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_4	88.6256170641423	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1195	1848	76903	76155	FALSE	50	TAAAGCCACAAGAGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	79233	76119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77890_78711_78784_79008_79050_79138
873706	contig_11816_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_98553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATATCTCGTTAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1157626	1156279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1156300_1157600
873707	contig_4654_pilon	-	1982	12	Intergenic	novelGene_103067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	265.369039778056	101	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	89	1471	480875	462229	FALSE	15	ATCTGTCTCATCTCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVCDERGSRGFGFVHFETHEAAQQAISTMNGMLLNDRKVFVGHFKSRRDREAELRARAMEFTNIYVKNLQVDVDEQGLQDLFSPFGKLLSVKVMKDSNGHSRGFGFVNFEKHEEAQKAVMDMNGKEVSGRLLYVGRAQKRVERQSELKRKFEQMKQDRLNRYQGVNLYVKNLDDSINDEKLRKEFSPYGMITSAKVMTEGGHSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIIGTKPLYVALAQRKEERRAILSNQYMQRLSTMRALGIPILGSSQQPTSYFLPAVPQPPARPAYYGSGPVAPIRPAPRWTAQPPRPSSAYPPTASMVRPPATPRRPLAHLSTVRQASTQVPHPVPHTQRVANIGTQTTGPGGAEGCTSGRPLLPCRYSSAAHNTHRVLESPLHRQEPLTASMLAAALPHEQKQMIGERLYPLIYGVHAQLAGKITGMLLEIDNSELLLMLESPESLHAKIEEAVAVLQAHQAMEQPRADLH	480963	461717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_462298_462770_462902_464284_464373_465654_465762_466269_466399_467014_467106_469052_469320_473483_473580_476095_476234_478959_479055_479223_479364_480843
873708	contig_9119_pilon	+	1427	8	Intergenic	novelGene_169737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	215.792511833162	231	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	62	946	45433	118092	FALSE	35	ATGTTGGAAAAAGTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSLWLALRCLRPPDPALGPMAPWSSSSRGRRVCCCVLIGLGVLVLGAAVTAGIRRWLQPSGHKQWEGAGTTAHISEIFLGRCFTYTQIIHPELRDKNCQKIWNAFKNSFISKDTCNITEEDYQPLIKLTTQTLPCNQTLFWSKTNVLVHRYTKAQKELFTLEDTLLGYMADDLIWCGSSGNSEMNYQSCPSRMENCSNSPVFVFWKTVSKKFAEAACGVVHVMLNGSISRAFVRNSIFGSIEVMNLHQERVHSLRAWVMHDIGGDFSDSCSGSSINDLRSIMREKNIPFTCQDDYKPVRYIQCVSHPEHSSCP	45371	118573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_+_45657_83909_84040_87323_87460_95183_95270_99104_99179_101764_101858_102869_102957_118037
873709	contig_15326_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_157698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTTTTCGACAAGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16699	14351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_14400_16700
873710	contig_2924_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_140263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGGAAATAAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90968	93294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_91000_93300
873711	contig_9363_pilon	-	3667	5	Intergenic	novelGene_6475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	10.4253297309965	43	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	978	3236	336945	317887	FALSE	40	TAAAGAGAAGACTCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESREVIDLDPPAQTSQEQEDLRIVKVEEEDCTWMQEYSPPTFETFYQRFKHFQYHEASGPREALSQLRVLCCEWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPEEFQIWVREHHPESGEEAVAVVENIQRELEERRQQIVACPEVLPQKMVPPGAVQESSSEQLLSTDSQPRQEPQQPHLLEENDYESRNENMELIVEQNSDEAESHWMTSGSTERNVPQSPEFAEVSDLKGMVERWQVNPPVGKSRQNPSEKRDLGINRKQNTNGERGHKCNDCGKFFLQASNFIQHRRIHTGEKPFKCGECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYKCQVCGKAFRVSSHLVQHHSVHSGERPYGCNECGKNFGRHSHLIEHLKRHFREKSQRCSDKRRKNIKLNIKKKISEFPEADMELSGRIQRNVSQVQDFGEDSEHQDKLDRNQGIPMKAILGQPPSKRINFSEVTYAHKKSSTGERPYKCNECGKSFIQSAHLIQHQRIHTGEKPFKCDECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYTCHLCGKAFRVRSHLVQHQSVHSGERPFKCNECGKGFGRRSHLAGHLRLHTRDKSHQCHECGEIFFQYVSLIEHQVLHMGQKNEKNGICEEAYSWNLTVFEDKKIELQEQPYKCDICGKAFSYGSDLIQHYRTHTEEKTYECDTCRENVGQCSHLKHQKIYSSTKSYQCNECGRGFTLKSHLNQHQRIHTGEKPFQCKECGMSFSWSCSLFKHLRSHERTDLINV	338275	317455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_319002_321410_322008_332906_333046_336537_337882_338234
873712	contig_9113_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_68615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGAACAAGAGAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600528	603173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_600500_603200
873713	contig_5690_pilon	+	1171	7	Intergenic	novelGene_119718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	434.047488441325	14	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	74	427	1044729	1086424	TRUE	45	TCCCATTAAAGTTACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHLPAARSLPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLLNKVEERMKELSQDNTGRITTHSSRRGH	1044655	1105947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1078654_1078712_1086391_1086556_1103515_1103632_1105450
873714	contig_11850_pilon	+	2261	2	Intergenic	novelGene_125203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCCTTCTCAGACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197820	200119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_198665_198702
873715	contig_8161_pilon	-	4131	1	Intergenic	novelGene_156774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1674	1991	402907	402590	NA	20	ACCTGCACTTCCCAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSCWHSLFKNEKACVTFSLHDRCSNMYLNIQLYVPLTTVMREVFCIREVWEAEYTFKIFLLTKGNVHFSLLVFLYLNSLADAMPCLKFYWTPSTASLNRNQSF	404580	400449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_400400_404600
873716	contig_11816_pilon	+	4103	5	Intergenic	novelGene_98456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_1	491.851095353055	118	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	132	1754	420896	433942	FALSE	65	CCTTTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSSAATGGSTSDSAHGGINTGITGILPGSLFRFAVPPALGSHLTDNVMITVDIIPSGWNSSDGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKER	400537	436291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830
873717	contig_1154_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_87115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	121	444	417256	416933	NA	70	AGAAGGAATAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYQLKRLTTSNVDKVQRTGTLMLLMGMQNGSVTLENRMLVFHKVKHTIYNPNPLPWSRLPLIATLQDRAQLPHSVSVAANLYGSRLPHLLPQSSWWVQTANFLVSK	417376	415710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_415700_417400
873718	contig_4136_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_161239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAGGATTTCCAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38446	40639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_38400_40600
873719	contig_15112_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_124773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAATACACTTAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74824	72738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_72700_74800
873720	contig_11978_pilon	-	2218	1	Intergenic	novelGene_62840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGTGTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480113	477895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_477900_480100
873721	contig_1154_pilon	+	2463	2	Intergenic	novelGene_87052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAACAAACAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100731	103609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_102071_102485
873722	contig_18272_pilon	+	4071	2	Intergenic	novelGene_7033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGAATCAGTCAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230452	237098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_234469_237043
873723	contig_2854_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_120795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	289	870	527	1396	58429	57560	NA	5	TTTTCTGTTTGTTCCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGFRYIPCCTVLMRAYPIEVGPHRSMQRCKAFKVRGPLMPVPRQRGCACLSSQLRRAGRFFFLIVNLFPLQSLENGSGSMTGPTSGPGWGAAITEAGPGLGAEEGGREQVNGKELFPKSGGGLIRAVCYTHVLIFCQPSTASCCSGGLSRLSATRSLPVWKTPPECHCLPHCVCHLIQPAECGCWPGQVWQPLTASEPFLLPPAAQSDSSTLSLMFRAPRLSYTIDSLVFFLVFVIRGTSGNIVTTLPSWPCLCIPQILICCIFIQFNVFFKFPLRLPLRPIDNLEV	58955	56344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_56300_59000
873724	contig_9482_pilon	+	1841	2	Intergenic	novelGene_44244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	477	junction_1	0	95	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCGGGGTTTGCTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287630	290386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_288944_289858
873726	contig_10986_pilon	-	1607	13	Intergenic	novelGene_71478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	200.169563537184	10	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	714	1391	72941	67011	FALSE	15	TTTCCCCGTAAGCTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGCSLLTGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI	80420	66794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_67028_67210_67339_67434_67543_70645_70762_71489_71629_72178_72321_72913_73007_73924_74006_74224_74358_74985_75049_75476_75544_76171_76245_80189
873727	contig_1301_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_47266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209706	207424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_207400_209700
873728	contig_13457_pilon	+	1816	12	Intergenic	novelGene_118347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_9	55.663392127506	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	137	1648	60777	71127	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVIPLPSPLILPFLTSHTLLPGG	59274	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761
873729	contig_12216_pilon	+	2008	2	Intergenic	novelGene_175040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCATGTGCGTTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165166	167461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12216_pilon_+_165999_166285
873730	contig_13664_pilon	+	3661	1	Intergenic	novelGene_144196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22457	26118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_+_22500_26100
873731	contig_2987_pilon	+	2331	13	Intergenic	novelGene_125843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	650	1081	470634	476464	TRUE	40	AATAATTCCACCTGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCCGTPPRWLGHPPAAAPPPAGTALAPSHCACRGSSSQVPGGIPPGLTVSLFCLQRDRCPDGLPGLNGSRGPHPHKDPRLAPPREFSFLSASKLREVMAMACWSFRAEDLLWEQGLGGCRQEGLPAAPGLRSGWAPQERRE	466842	494514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_466929_466977_467320_469905_470013_470519_470653_476051_476962_477764_477857_478784_478823_483983_484064_486394_486490_488193_488310_488727_488834_492797_492944_494434
873732	contig_6635_pilon	+	3812	2	Intergenic	novelGene_127011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGTACTTTTATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348800	358633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_352067_358087
873733	contig_854_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_36123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGGCTGTGTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305499	307588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_305500_307600
873734	contig_12951_pilon	+	2401	2	Intergenic	novelGene_68239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819067	821993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_819991_820515
873735	contig_6283_pilon	+	2501	14	Intergenic	novelGene_100201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	73.8747540770244	3	46	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	41	1390	565474	588236	FALSE	45	CTCAAATATGACAACTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPDRGHDTERSLMTTLRRWVSERCLLALNRVALWAPQWFPKTLIFDSPREPAMAFLHLQQPSFLLASLKADCVNKPFAQRCQDLVKVIEDFPAKELHAIFPWLVENIFGSLDGVLIGWNLRCLQGRVNPVEYSIAMEFLDPGGPMMKLVYKLQAEDYKFDFPVSYLPGPVKASIQERVLPDSPLYHNKVQFPPSGGLSLNLALNPFEYYIFFFALSLITQKPLPLSLHVRTSDCAYFLLVDRYLSWFLPTEGSVLPPLFSSPGGSSPSPAPRTPAMPFASYGLHHTSLLKRHISHQTSVNADPASHEIWRSETLLQVFVEMWLHHYSLEIRPWSTFARYSDSVKPSWPSSHLPWGQRRTRMGRSRSQIALWERTGWCSPLWAAIRSSMACGGLRSSTRVTQSCSPFGAMRSLAWSVCSSGCPPPSTADLQARWQPCVPGLTFWVASAATTSLSLRWPTGIC	565433	589347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_565549_568334_568419_570594_570682_571550_571694_571836_571913_572480_572590_572742_572796_573522_573675_576600_576734_577535_577577_587179_587213_587530_587663_587830_587960_588133
873736	contig_14637_pilon	-	3758	1	Intergenic	novelGene_114546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTGACAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355680	351922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_351900_355700
873737	contig_5469_pilon	+	3270	9	Intergenic	novelGene_176243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	11.4017542509914	105	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	244	1410	62895	83289	FALSE	10	GTTCATTGTGTATTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIPGCLLYTKTGSAPHLTHHTLHNIHRLPAMAQLTLSSLAEHHEVLTEYKEGVGKFIGMPESLLYCSLHDPVSPCPAGYVTNKSVSVWGAGGRVEMTASKFMAIQQALQPDWFQCLSDGEASCAEVTSIKRARKSVDRSLLFLDSCLQLQEKSEVLQKSLIIGVIEGGDVMEERLRSARETAKRPVGGFLLDGFQGNLMATEIGLHLLSSVTAELPEDKPRLICGVSRPDEVLECVERGVDLFESFFPYQVTERGCALTFSFDFQPNPEETLWQQNGTQEEIKYLDQTEKIKTTDCTQEMTSFEINLKEKKYQEDFDPLVRGCPCYCCKNHTRAYVHHLLVTNELLAGVLLMMHNFEHYFGFFHSIREALKSDKLAHLKELILRQAF	53555	85149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5469_pilon_+_53697_62792_63014_64204_64261_66787_66865_68406_68620_73172_73373_75687_75840_77937_78056_83057
873738	contig_7045_pilon	+	3812	10	Intergenic	novelGene_77484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTACCACGCCCCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543841	591051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_546295_552563_552713_568440_568551_569433_569568_569765_569993_572057_572247_577204_577364_581398_581533_585353_585486_590926
873739	contig_9548_pilon	-	3423	6	Intergenic	novelGene_141047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATATTTCTTCTGGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58963	44885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_44959_45721_45878_47913_48065_53128_53217_55838_55892_56061
873740	contig_612_pilon	-	5020	7	Intergenic	novelGene_155627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	74.4880676499412	158	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	101	1093	267314	160884	FALSE	40	GAAAGAAAGCTAAGCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRSRGINTGLILLLAQIFNVGINNIPPVTLATLALNTWLFLNPVKPLYDSCISVEKCYQQKDWQRLLLSPFHHVDDWHLYFNMASMLWKGINLERRLGSRWFAYVITTFSLLTGVVYLLLELSLAAFLDEPDFQRNCAVGFSGVLFALKVLNNHYCPGSFVNVLGFPVPNRYACWAELVAIHFFAPGTSFAGHLAGILVGLMYTQGPLKKIMETCAGIFSSGIGYPRQQDYFNNSGNSGYRDHYPPGRPGYPGYQDHYPHGRPGYYEEAPRNYDAYTAGLSEEEQLERALRASLWDQGNTSNNPPLCEFGLSPEEEMRRCRLRRFDGQ	293193	156956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_-_160979_224868_225055_233411_233469_235732_235822_265561_265695_266881_267396_293174
873743	contig_15188_pilon	-	3856	1	Intergenic	novelGene_163087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	283	504	181964	181743	NA	75	TGAATGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLCVCVVGRYIYAVAGRDYHNDLNAVERYDPATNSWAYVAPLKREVNTPLQKRPISGCFPSLGCGKGEAQVSRPMPVPGQGTGPVSRVCIPQRPCTEGLLGKLLRLICWEEKSSSCPDSVPQNLTPFSRLTCETLVPINCFNLVVQR	182246	178390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_-_178400_182200
873744	contig_6397_pilon	-	2679	7	Intergenic	novelGene_146274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_6	60.0740284057003	236	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	202	714	554772	520139	FALSE	20	TGTGTGTTGAAGAGGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWAVSNLHKLMKG	601764	518173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
873745	contig_6914_pilon	+	5135	31	Intergenic	novelGene_151759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_8	39.1152144312159	136	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1495	4488	502	4989	302692	325494	FALSE	30	TTCACATACCTTTCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSWHEVLEPCLNCLSGPSSDSEIVQELVCFLHRLASMHKDYAVVLCCLGAKEALSKVLDKHSAQLLLGCKLRDLVTECEKHAQLYSNLTSSILAGCIQMVLGQIEDHRRTHQPINIPFFDVFLRHICQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASRLTDRNPKTYWESNGSAGSHSITLHMHRGVLVRQLTLLVASEDSSYMPARVVVLGGDSASCISTELNTVNVLPSASRVILVENLNRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRVRGVEVLGPKPTFWPLFREQLCRRTSLFYTIWAQAWSRDIAEDRRRLLQLYPRLNKVLRHEQNFADRFLPDEEAAQALGKTCWEALVSPLVQNITSPDAEGVSSLGWLLDQYLEQRENSRTPLSRAASFASRVRRLCRLLVHVEPPPGPSPEAYPRPFSKNSKGRDQSPGPSAVLPSSSLRNITQCWLNVVQEQVSRFLAAAWRAPDFVPRYCELYERLQRTSSELFGPRAAFTLALRSGFSGALLQQSFLTTAHMSEQFARHIDQQIQGSLIAGAPGVEMLGRLQRQLEPIMVLSGLELATTFEHFYQHYMADRLLGVGPSWLEGAVLEQIGPCFPNRLPQQMLQSLNTSEELQHQFHLFQLQQLDKLLLEQEDEEEQRLEEEEEEEKEEDNENELFAEDPSPTVSVLVLSPRCWPVSPLCYLHHLRKCLPTGFCDALDRFSNFYSQSQNHPVLDVGPHRRLQWTWLGRAELQFGDQTLHVSTVQMWLLLNFNQTEEVSIEALLKNSDLSPELLLQALTPLTSENGPLTLYEDQDFPHRGILKLREPGPRPSEEALWLIPPQTYLNVERDEGRTLEQKRNLLSCLLVRILKAHGEKGLHIDQLVCLVLEAWQKGPNPPGSLGRTISGCVACTSTDVLSCILHLLGQGYVERRDDQPQILMYATPVPTGTCRGQADIPFCGSQSTENPKPSPEAVAVLASLQLPAGRTMSPQEVEGLMEQMVRQVQETLNLEPDVAQHLLAHSHWGAEQLLQSYSDNPEPLLLAAGLCVPQAQATPARPDQCPVCISPVEPEDDLPSLCCMHSCCKSCWNEYLTTRIEQNLVLNCTCPIADCPAQPTGAFIRAIVSSPEVISKYEKALLRGYVESCSNLTWCTNPQGCDRILCRQGLGCGTACSKCGWASCFSCSFPEAHYPASCGHMSQWVDDGGYYDGMSVEAQSKHLAKLISKRCPSCQAPIEKNEGCLHMTCAKCNHGFCWRCLKSWKPNHKDYYNCSAMVSKAARQEKRFQDYNERCTFHLQAREFAVNLRNRVSAIHEVPPPKSFAFLNDACRGLEQARKVLAYACVYSFYNQNTEYMDVVEQQTENLELHTNALQILLEETLLRCRDLASSLRLLRADCLNTGMELLQRIQERLLAILQHSTQDFRVGLQSPSSLEAQEAKGSNMPGSQPQGSSGLEVDEDEEEEDDEDEDDVPEWQQDEFDEELDNDSFSYDEESENLDRETFFFGDEEEDDEAYD	301275	325640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_301495_302324_302573_302657_302764_303322_303551_303835_303927_304071_304244_305649_305756_306016_306113_306396_306573_306873_307008_307372_307553_307739_307850_307951_308135_308277_308439_308720_308950_309045_309236_314365_314512_314668_314799_314949_315150_315559_315811_317190_317537_321297_321439_321584_321750_321978_322143_322492_322587_323113_323189_323312_323424_323588_323707_324100_324235_325128_325206_325286
873746	contig_16382_pilon	+	2491	16	Intergenic	novelGene_160216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	557	1015	67053	72234	TRUE	10	TTCAGTCCCCTAGTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLMKVSETVDLTDSMELLYWKQSDTSKSSTVTMSWMVCRVASIVFLTSSFSIFRVDKRDCSCWHLCTSSLWTGCWAQSWEAMSPMWGWNSNFIGGQKTLLYISMRRCLSLVASRFSTAFSMASRPSCFDCSRFNSAERKVRRARFRLAW	10867	303466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_10974_12774_12909_13860_13939_28759_28824_37058_37096_40048_40138_67004_67197_68220_68327_72025_72254_82669_82797_83390_83599_91710_91777_164620_164786_195381_195574_300958_301569_303377
873747	contig_11742_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_166533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	0	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAGAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72732	117581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_72827_115621
873748	contig_15236_pilon	-	4052	2	Intergenic	novelGene_141580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	709	1089	425845	425465	FALSE	45	TCACAAGAGACCAGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSREFLSLCGLLGCQTWKWWQLFERRCGRLSSLLLTFCEALGWWVAGEKAWPARWLVQWAGDHRCLPETLSLSVGCYSAKLLQIRKQSCHTLLVSPHPFLIFVHEKLTHIYLDVGEIHKDITMR	428226	422501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_426336_428008
873749	contig_8866_pilon	-	2097	6	Intergenic	novelGene_77774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	496.607128422458	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	118	549	418087	342321	FALSE	30	AGCAGAATTTCAGATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQEKDEEKREEGSGVLETKCHPETGPTQLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	418204	340772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348928_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
873750	contig_12000_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_43192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586399	588448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_586400_588400
873751	contig_6488_pilon	+	2051	8	Intergenic	novelGene_44758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	400	junction_1	336.463419487262	2003	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	176	835	193685	203836	FALSE	10	CTGTATAGTTTCTCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRFFGKAKPKAPPPSLTDCIGTVDSRAESIDKKISRLDAELVKYKDQIKKMREGPAKNMVKQKALRVLKQKRMYEQQRDNLSQQSFNMEQANYTIQSLKDTKTTVDAMKLGVKEMKKAYKQVKIDQIEDLQDQLEDMMEDANEIQEALSRSYGTPELDEDDLEAELDALGDELLADEDSSYLDEAASAPAIPEGVPTDTKNKDGVLVDEFGLPQIPAS	193509	205052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_193754_194625_194731_196117_196165_197384_197479_197611_197684_199944_200054_201539_201653_203785
873752	contig_7521_pilon	-	4707	2	Intergenic	novelGene_160533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCATCAGAACAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38661	11639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_11750_34064
873753	contig_15354_pilon	-	2765	4	Intergenic	novelGene_65728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	48.196357630934	998	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	83	583	590816	572396	FALSE	40	CAGAGGGTTTATATATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTTVFSAVARVLALSRRSLAFPLLSVTSFRHFYRGDSPTDSQKDLIEIPLPPWQERIDESIETKRARLLYESRKRGMLENCILLSLFAKEHLHHMTEKQLNLYDRLINEPSNDWDIYYWATEAKPAPEIFENEVLALLRDFAKNRNKEQRLRAPDLEYLFEKPR	590898	570213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_572527_589605_589716_589799_590024_590780
873754	contig_9647_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_127385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCAACTGCTAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85064	86312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_85100_86300
873755	contig_13481_pilon	-	2876	10	Intergenic	novelGene_119267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_8	228.773055911554	52	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	527	1579	102105	33268	FALSE	65	GCAATCACAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRSAHCSRPSGSSTSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTNEYVAIKLEPIKSRAPQLHLEYRFYKQLGSAGEGLPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDLFDLCDRTFTLKTVLMIAIQLLSRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRQGNKKEHVIHIIDFGLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGSLPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRNTPIEALCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYEYLRTLFTDLFERKGYTFDYAYDWVGRPIVSIFFLPCHFLPQTSIAPSHYLPVFLLKSMETFL	174301	31970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_33522_33796_33882_35757_35844_38516_38752_40090_40243_69962_70033_75727_75769_101975_102376_121611_121661_174094
873756	contig_5039_pilon	+	3798	9	Intergenic	novelGene_65011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	64.4911573395919	4	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	58	417	1703196	1705718	TRUE	15	ATTTCCCAGGCAGTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALR	1703138	1718558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1703245_1703623_1703734_1704337_1704532_1705711_1706343_1710623_1712222_1713013_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
873757	contig_14684_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_99657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACTACCTACCCCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268528	270945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_268500_270900
873758	contig_6837_pilon	-	846	7	Intergenic	novelGene_149830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	37	468	73222	70776	TRUE	20	CAGGTTCACAGCTGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWRAARACKVGSTDLSNRSRSPCMSRKVDEMKSRMLRHPCWESGAKGLGVFSSSGLRDRSPVFPGGGGILNILSIWSTCSRRREAPCSAMNFSIPSVQPESVTSLGFTFGNIKFVVCRRTPTKRHLEFTCCQKSCLATFINL	73258	68933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_69036_69518_69671_69848_69936_70738_70872_71179_71240_72095_72254_73104
873759	contig_15114_pilon	+	4292	1	Intergenic	novelGene_121079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	3407	3889	19179	19661	NA	65	AACTGAAAAGGAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLKSGMKEGTLLLTLQKIKSIIREYYKQLHASKLGQLDEKEKLLDRHKLPKLTQEEIEYMNRSITIKLIELVLRNLPAKKKSPGPGDFAGEVHQMFKEELKLILHKLLQEIEEEGTLPNSFHKASITLTPKPDEDITRKKTTDKYPLRILMQKSSTKH	15772	20064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_15800_20100
873760	contig_15236_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_141578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	299	86	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	74	871	419232	427024	FALSE	35	ACGTCCCAGCAGAACCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESFL	419158	428223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_427015
873761	contig_15123_pilon	-	2628	14	Intergenic	novelGene_110919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_13	292.641145836819	39	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2277	351	2627	250047	229348	FALSE	25	AGAAGGCTGGGCGCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLHATRAAALLTWVNSLRVANPVEAVLQLQDCSIFLKIIDSIRGTEEGQQIMKQPVPERWDFVCSFLQKNRKHPSSPECLVSMQKLMEGSELEMAKITMLLLYHFTMGSKSLRDWDQFEYKIQAELAVILKFVLDHEDGLNLNEDLESFLRKAPVPSTCSSTISEELSPPSHQTKKEIRFLELQNVASSSSGNNFLVGSPASPMGDILHTPQFQVRRLKKQLADERNNRDELELELAENRKLLTEKDAQIALMQQRIDRLALLNERQAASPPETRELEELRGKNESLTMRLHETLKQCQDLKTEKSQMDRKINQLSEENGDLSFKLREFASHLQQLQGALNELTEEHGKATQEWAEKQAHLEKELSTTLQDKKYLEEKNEILLGKLSQMEEHSTQLQKNPPQEKGEVLGDALQLEALKQEAATLAANYAQLQAKVGELETERGQQEAKLLAERGHFEEEKQQLAGLIADLQSSISNLTQAKEDLEKASQAQNAELTAQVATLTSELTTLNATLQQQDQELTGLKQQAEKEQAQLAQTLQQQEQASQGLRHQVEQLSSSLKQKEQQLEEAAKEQEATKQDHAQQLATISKKQEATLRERNTALQQLEALEKENAAKLEILQQQLQAANEAQDSAQTSVTQAQREKAELSQKVEELHACIEAARQEQREAQVQVTELEAQLRSEQQKATEREGVAQEKDQLQEQLRALEESLKAAKGSLEEEKRQAADAREEQQRCISELEAETRSLAEQRKQEQKELEE	256054	229346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_230383_230531_230655_231604_231746_232065_232184_232275_232394_232678_232837_233351_233476_234790_234879_236236_236318_236895_236979_238060_238141_244656_244743_250005_250076_255732
873763	contig_6325_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_143364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGTTATTTCTCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413996	416835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_414000_416800
873764	contig_10642_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_78657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATATGGTTCTAGTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152854	154163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_152900_154200
873765	contig_11448_pilon	-	3173	1	Intergenic	novelGene_66432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAGTTTTTGAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626094	622921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_622900_626100
873766	contig_9505_pilon	+	4799	1	Intergenic	novelGene_121879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCTGGGTGGTACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683957	688756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_684000_688800
873767	contig_4962_pilon	-	2865	1	Intergenic	novelGene_107389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCCCCCAGCCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263491	260626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_260600_263500
873768	contig_2414_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_158502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTTGCCAGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400253	399030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_399000_400300
873769	contig_6058_pilon	-	1479	8	Intergenic	novelGene_172403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	460.832609390385	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	681	1337	390928	385415	TRUE	0	TTCCTCGGTTTGGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	398030	384749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_384812_385334_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395721_398008
873770	contig_10583_pilon	-	2700	14	Intergenic	novelGene_167918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_1	301.801808080977	94	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2664	36	2699	254653	219863	FALSE	75	GAAAAAAGAAAAAACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YITGKEVFSFKMVSYMDATAGSAYTDMNVADVQVNLTVGCIEVVFVTKFLYSILAFIDNFQAAKQALTEATVQAAGMAATGVKELARRSSRMALDVNIKAPVVVIPQSPVSENVFVADFGLITMTNTFHMIAESQSNPPPVIDLITVKLSEMRLYRSQYINDAYQEVLDILLPLNLEVVVERNLSWEWYQEVPGFNVNAQLKPMEFILSQEDITTIFKTLYGNIWYEKGDSASPAVIKDQSSVTSGVTNASHHSGGTTVVTAAVVEVHSYASQVKTTINMSFKTDYLTMVLYSPGPEQTSFTDVRDPSLQLAEFRLENIISTLKMYTDDSTFSSFSLKNCILDDKRPHVKKATPRMIGLTVGFDRKDMMDVRYKRVRDGWVSDLVFQEMYICASVEFLTTVANVFLEAYSTGTAVETSVQAWSSKEEVPVGQSEKWEINTMIKNPEFVFVADMTRNDAPALVITTQCEICWKGELENNTMTAAIKDFQVKACPFLPVKRKDNVTTVLQPCDLFYQATQMGTGPQVIDMSVKSLTLKVSPVIINTVITITSALFTAKETIPKETTSSAAQLWEKKDTKDLKMWFLEEPDEAENTAPTTELVPKGEMIKMNIDSIFIVLEAGIGHRTVPMLLAKSRFSGEGKNWSSLINLHCQLKLEVHYYNEMFGVWEPLLEPLEIEQTEDFRPWNLAFKMKKKTKKAIVESDTEEENYRVPEYKTIFTFYSKDQLNITLSKCGLVMLNNLGKAFTEAATGSSDVFLKDLAPFMIINSLGLTISVSPSDSFSVLNVPMAKSYTLKNKESLSMDYVRTKDNDHFSAMTSLSSKLFFILLTPVNHSTADKIPLTKVGRRLYTVRHRESGVERSIVCQIDAVEGSKKVTIRSPVQVRNDTFFTWGHIMHICVL	254688	219861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_220078_225928_226185_226363_226523_227822_227925_229686_230044_230500_230594_231487_231721_232437_232656_233274_233445_233833_233962_239293_239445_242384_242533_252778_253084_254524
873771	contig_13718_pilon	-	2654	3	Intergenic	novelGene_142882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_2	2.5	60	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	595	909	92287	91973	FALSE	15	CATTTTTGTGCATGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTGTGQNASKQVKFPLTREVILLILSRWTIRLTKTIKFSEIRNPLSEGAVYRVFHSITPRTITRGRVTGKGQGFLKFLCLWVEENKSTSTYFLPDAGYILPH	106072	90227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_92547_98358_98559_105937
873772	contig_13145_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_116641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150400	151719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_150400_151700
873773	contig_20293_pilon	+	3784	1	Intergenic	novelGene_153531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101216	105000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_101200_105000
873774	contig_14441_pilon	+	805	4	Intergenic	novelGene_100678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	411.860008578967	9	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	197	625	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEKLFFGSGTKLSVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	113161	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_113209_116578_116963_117220_117344_117539
873775	contig_8712_pilon	-	2947	1	Intergenic	novelGene_58750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122191	119244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_119200_122200
873776	contig_10500_pilon	-	3638	1	Intergenic	novelGene_41195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTAATGGCCTGGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389935	1386297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1386300_1389900
873777	contig_10500_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_41197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGTCGTTAGTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391573	1390813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1390800_1391600
873778	contig_10135_pilon	-	1530	7	Intergenic	novelGene_106643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCCTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114598	111532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_112464_112696_112809_113076_113153_113341_113420_113529_113616_113892_114019_114477
873779	contig_20890_pilon	-	2909	1	Intergenic	novelGene_147037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTGTAAATAAATGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20299	17390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_-_17400_20300
873780	contig_12019_pilon	+	2357	9	Intergenic	novelGene_87781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_8	14.3260034552558	124	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	46	1359	755336	762686	FALSE	25	TGTCTTATTAGAAGCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPLLLQLPRLCQRNLMSLLMAVRPSLPENRLLPVLQIAQQDPDPWLRALGELLQRDLGVGVSTEGASPLSKRCQRQLQGLCMRLGQGGRKLKLLQNPDPTEKEVDKEEEHEDSQKLGKRRKDPEEEPASPEGERAPKRFRCLEREEEEDHEEEKTERESLETLADGGGASPIKNQTVVRTETNEAGQNLADAKGLVENVELPKAVQDQLPRLQQLLKTSGEGLEGTPPVELQLLHECSPSQVDLLCAQLQLPQLSDTGLLQLCSWLLALSPDLSFSNATVLTRSLFLGRILSLTSSASRLLMTALTSFCAKYTYPVCRALLGPVLQAPGTGPAQTELLCCLMKALEPDTQVLMLGQILELPWKEETFLVLQSLLEQQVEMTPEKFSVLMEKLCEEGLAATTSMAYAKLMLTVITKYQASITEIQRLSLAKALELNTTFLRKSLQAALRHLTS	755290	763684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_755909_756471_756517_756801_756862_757159_757304_757900_758025_758262_758336_759739_759807_760952_761079_762584
873781	contig_15045_pilon	+	3130	1	Intergenic	novelGene_130068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1652	1966	160023	160337	NA	30	CTGAACTACTTGGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLIMRWDYKTIVSALADPPSNNIFQDLDFTGQLLSSSKCKAIFFSYYLNSENILIPIPSSCNLALLFSFLHPLLPHFRNFSEHCHYVLPSALGFSFFVFKLL	158371	161501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_+_158400_161500
873782	contig_20223_pilon	+	5546	1	Intergenic	novelGene_177225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	887	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	735	1226	21455	21946	NA	25	GGAGTGCAAACTGGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACPELPQRSFFKRHPGKKPAQDGGKKTGVTHKSQKTRKRKCLSNSYHPLLLDQSHQTWTWTSELMRALGWCVCVFNSLMNVALTVRWRNHTHTHRHTPSHSLISPSVYIEECTNESLSFTELYTSKQHGQGVRWREDGEKCEEVLEVQKTGEDGVLNACWL	20720	26266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_+_20700_26300
873783	contig_11720_pilon	-	1649	10	Intergenic	novelGene_43879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_3	64.1135181523877	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	502	972	110844	109250	TRUE	30	AGAGACATGTATGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLLKVWQVDTKEEVWSFEAGDLEWMEWHPRAPVLLAGTADGNTWMWKVPNGDCKTFQGPNCPSTCGRVLPDGKRVVVGYEDGTIRIWDLKQGNPIHVLKGTEGHQGPLTCVATNQDGSLILSGSVDCQAKLVSATTGKNASGCCWLPGWDLGHL	113326	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_108266_108866_109022_109209_109301_109767_109884_110000_110085_110367_110513_110769_110910_111440_111562_112526_112686_113170
873784	contig_10990_pilon	-	4506	6	Intergenic	novelGene_7412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1727	2089	608083	607721	TRUE	25	CAACTCCGTCCAGACCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFTLTRGTHESWGDVIKTLMQVSAQVGTPTPGHFPWSTVAAGGVLLAEVHHLENWGRGVRSEMLELFLPGGKGPEKLLHIDPQHQAYTNFLLTHLQGATERNSLVPGSTCVSFHKLPS	609809	541724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_542100_590664_591332_604786_604988_605603_605860_606340_606468_606929
873785	contig_5039_pilon	+	603	5	Intergenic	novelGene_64933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	384	junction_1	265.173881632411	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	285	533	1366503	1368757	FALSE	25	CCATATTAAGTGTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRYATALYSAASKQKKLDQVEKELLRVAQLLKDPKVSLAILNPYVKRSIKVKSLKDITAKERFSPLTSNLINLLAENGRLNITPGVISAFSTIMSVHRGEVPCTVTTASPLDSASLSELKTVLNSFLRPGQVLKLEVKTDPSILGGMIVRIGEKYVDMSAKSKIQKLSKVMRETA	1363930	1368827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1364020_1365540_1365671_1366437_1366551_1368233_1368321_1368643
873786	contig_10855_pilon	+	2463	1	Intergenic	novelGene_124384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTACTCAGAATTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806094	808557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_806100_808600
873787	contig_11846_pilon	-	1407	4	Intergenic	novelGene_106012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	47	junction_1	148.845184298616	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGGGAGCAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557981	453935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_455004_467816_467906_476996_477072_557806
873788	contig_16870_pilon	+	3096	2	Intergenic	novelGene_155477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	176	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	176	1315	21662	22801	FALSE	15	CTACTTTGTAGAGTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGPGDMDDTGDCSGGRYNDWSDDDDDNSENKGVIWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTILSPLELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKIYMNQVCDDTVTSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEHQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENQDIILKLLIIFENINDNFKWEENEPTQNHFSEGSLFFFFKEFQACADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE	21203	24582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_21233_21515
873789	contig_10106_pilon	+	1811	2	Intergenic	novelGene_73886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	218	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTGAGTGGTGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141346	143498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_142532_142872
873790	contig_9981_pilon	-	5237	1	Intergenic	novelGene_121074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAATAAAAATATTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508783	503546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_503500_508800
873791	contig_6825_pilon	-	2106	4	Intergenic	novelGene_155116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.6045783161301	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	149	1063	26633	24241	TRUE	45	AATGCAACAATTCTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKFSLFGDISVLQQQGSLSNTYLSKADPDGKKIKQIQQLFEEILSNSRQMKWLSCGFMLEIVTPTSLSSLSNSIANTMEHLSLLDNNIPGNSTLITAVELERFVNLRSLALDFCDFTAEMARVLTDSNHMPLQRLSLLVHNVSVMHKSLDNMPNDEHWKALSRKSTSLRVYIMAFDIKSEDMLKILKPSIPLERIHFDSYITCVSGAIIDLISRQYDKFLSHFILMNDVIDTSGFPDLSDNRNEDPLVLLAWRCTKLSLLAIHGYTVWAHNLIAIARLRGPDLKVLEVTEESIDFDQGELADQDVDPVHNLIEQVSLGLGQPWHAVMDIESLSVFTEPNRHFYREMQSFSEGI	27348	22424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_23223_23995_24513_25990_26677_27243
873792	contig_8303_pilon	-	2224	6	Intergenic	novelGene_154916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	447	junction_4	98.6217014657525	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	231	878	51496	29167	FALSE	15	GCAAGTATTGTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGATRPNGPNTGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEFQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54810	27820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36329_51333_51593_54676
873793	contig_10436_pilon	-	1080	5	Intergenic	novelGene_108483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2150.76769724208	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	147	500	103480	102032	TRUE	35	TATTCGATGGAATGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103626	101406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_101975_102019_102098_102535_102655_102788_102868_103390
873794	contig_7457_pilon	+	1206	6	Intergenic	novelGene_31551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	364.74177166867	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	170	820	840844	844700	FALSE	40	ACTCAGCAAGAGCATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGTPLGGEERSLSEPRRRVTPPPRSRLGDPLATKCLFAKLRPPAPTLTGTTTEGRAMAGRGGAARPNGPASGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFARAKNWVKELQRQASPNIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYADDNSLLFMETSAKTAMNVNEIFMAIAKKLPKNEPQNAAGAPGRNRGVDLQENNPASRSQCCSN	820284	845086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_820365_840754_841010_842546_842699_842968_843092_843987_844082_844584
873795	contig_10753_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_105158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGGTGCTCGCTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411314	409166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_409200_411300
873796	contig_3130_pilon	-	2657	7	Intergenic	novelGene_103588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	609	junction_1	173.680421720149	13	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1807	2355	188450	185023	FALSE	30	CAGTGGATGGTGGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILSGLKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFSKNVHSTRFVTYFCEQVLPNLSSLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDMEKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSFHQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIR	202659	184720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_185209_186380_186471_187649_187755_188282_188490_189699_191106_192189_192352_202460
873797	contig_5253_pilon	-	2463	1	Intergenic	novelGene_61589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAGAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337909	335446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_335400_337900
873798	contig_7027_pilon	+	1732	2	Intergenic	novelGene_164326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	63	359	6071	33347	FALSE	35	CTATAAGCCAAGGACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQVGNKLIKMSVCERLDILLLETLSSKLLSLHSY	6008	34720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_6174_33153
873799	contig_10082_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_63856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187377	185258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_185300_187400
873800	contig_5954_pilon	+	3521	3	Intergenic	novelGene_28538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2281	2619	508525	512856	FALSE	30	GCGAAGCTTCCAGGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSGSLSACVSRCVTEGERAWAPPHAHFLFPGFSRDELLGQGQALTLVSVAPVCRWPSFFPCSVDKACVFSRAGLSSGCPEQLWPPPLKHPQTQRWEKAALSQRAEETRAT	506244	513758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_508589_509211_509332_512701
873801	contig_15267_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_151074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTTCTCAGAGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55149	56962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_55100_57000
873802	contig_15267_pilon	+	1567	2	Intergenic	novelGene_151073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAATCAAATGTATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55149	56945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_56050_56278
873803	contig_14341_pilon	-	984	6	Intergenic	novelGene_111888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_1	623.105576928982	4465	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	247	915	729247	727088	FALSE	20	GCTCTGAAGACTCTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLFGRRKTPEELLRQNQRALNRAMRELDRERQKLETQEKKIIADIKKMAKQGQMDAVRIMAKDLVRTRRYVRKFVLMRANIQAVSLKIQTLKSNNSMAQAMKGVTKAMGTMNRQLKLPQIQKIMMEFERQAEIMDMKEEMMNDAIDDAMGDEEDEEESDAVVSQVLDELGLSLTDELSNLPSTGGSLSVAAGGKKAEAAASALADADADLEERLKNLRRD	730767	727018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_727216_727382_727445_727533_727665_727839_728020_729079_729290_730563
873804	contig_6375_pilon	-	4096	1	Intergenic	novelGene_72937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1527	1868	22634	22293	NA	30	AACAGACCTTGTAAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGIPMVSRHVSIEVTNSSSAPSGSLGNAGLELRPKPSRSKVCSVRRALSESMLRIQRPTPPPNPCTITSGVRSFISGLTVTVQILFWFGRDTYRARNLFWRPGEGRIPGQIS	24160	20064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_20100_24200
873806	contig_1443_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_28333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTAAATTTCAAGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774872	776932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_774900_776900
873807	contig_5917_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_122148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261164	258393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_258400_261200
873808	contig_9375_pilon	-	3794	1	Intergenic	novelGene_136067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2687	3049	412650	412288	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWTLLITCPKYVRLRLAILASKEHSGCTSSKTGLFVLLAVHGIFNILCQHHNSKASILLWYSLFIVQLSHTYEVTENTTAWVRCTSGLRVTSLLFNTLKRSFAADLPNAIHRLIS	415336	411542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_411500_415300
873809	contig_7593_pilon	+	4923	1	Intergenic	novelGene_127308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCCCAGCGACATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202252	207175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_202300_207200
873810	contig_6083_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_177120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39549	41053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6083_pilon_+_39500_41100
873811	contig_12638_pilon	+	2537	1	Intergenic	novelGene_33313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGAGCCAGAGTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297734	1300271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1297700_1300300
873812	contig_10627_pilon	+	4770	1	Intergenic	novelGene_60065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTCAACTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303257	1308027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1303300_1308000
873813	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_91983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657181	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
873814	contig_3004_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_127510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGGAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307249	309068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_307200_309100
873815	contig_13823_pilon	+	3975	1	Intergenic	novelGene_145268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTTGCAATACTTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278325	282300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_278300_282300
873816	contig_5640_pilon	-	3628	1	Intergenic	novelGene_27289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATTTGCAAGATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251839	1248211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1248200_1251800
873817	contig_16098_pilon	+	3263	22	Intergenic	novelGene_45823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	84	650	157873	159293	TRUE	25	AAGCGCCGCGAGGCGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGWVQQHHLGRVGSPRVRGRGCCDSSLDMGLGDVSHVGEAVGQLLVSMDGIHSGWLGEAALRGLGRRSRWQRRRCACQGPWVVQILLWLSTAQVWGLPRLVLDGTRGRVLGLRLAPSRRGSWLRLVGMELRGMVWIGLVNSGVKGLGGGLLCRRVLRRRGRHNGLRMATRRQHAGVALKHGGKHRL	157789	169275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_157968_158149_158366_158529_158650_158772_158906_159290_159478_159570_159641_159766_159918_160468_160537_160878_161176_161354_161426_161661_161734_161820_162016_162839_162949_163119_163297_163922_164120_164584_164689_165743_165869_166286_166436_166818_166890_166973_167029_167239_167279_168796
873818	contig_610_pilon	+	2179	9	Intergenic	novelGene_76823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.053558622652	1	121	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	66	875	350011	363918	TRUE	40	CACAGTTGCACAAAGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMAAPPSPSSVSAELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVASKSLQRTNSGGDSGGDTGGVGHPVPDSPGQSGHRESCLDV	349945	376010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360719_361083_363029_363229_363794_363988_364042_364137_366340_366597_368139_368266_373412_373745_375583
873819	contig_3948_pilon	-	2785	1	Intergenic	novelGene_53308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470708	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1467900_1470700
873820	contig_7271_pilon	+	3729	1	Intergenic	novelGene_159958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553568	557297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_553600_557300
873821	contig_152_pilon	+	3479	4	Intergenic	novelGene_162650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	226	junction_3	187.02109209629	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTTATTTCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722990	731663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_723050_724850_724951_726442_729514_731414
873822	contig_9150_pilon	-	2387	2	Intergenic	novelGene_140898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1770	2210	21280	20718	FALSE	10	AGGGGCGGGGGCGGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRSSKRYFLESRSWGRSSERSISGRSSGRSSSGKNSSSSEDCSSEDSSSSSSSSSLGECFSGGCSTGGGSSVVFGALCGSSSFSLHGFSMLRVFFFKHSYSERLSGSPEPAASLPVPPGHPFLPFFPKSHHFPSRLCHRPRPPL	23049	20540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_20847_20968
873823	contig_10197_pilon	+	3249	3	Intergenic	novelGene_115255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	967	1311	1050105	1050449	FALSE	35	AATTATCCTGAATGGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQYEPQRFTPFLFSSAKSCILGTEQVSVSSLGPGEEAREDQASRTPCQQEGITLQSLPRHAYCVPLTTALLRSSGSSGAATQAGRASRSNVTTQWSAREALKFAGSGFKSQL	1047760	1052387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1047851_1048628_1048741_1049340
873824	contig_9440_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_59028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGCCACCGAGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257190	255616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_255600_257200
873825	contig_8060_pilon	-	2973	7	Intergenic	novelGene_104826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1708	2043	242058	241723	TRUE	15	GAGGCAGTGCAGCGCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTCACTHARLRPPGISSNSTVYHTGKIAGCTSRQGMENWEGWWLGGGQEDKKWAFSFSGYVKFFSRLFKPTLFQSKQNSVSSVVPIFPFRSDPHACRLHDRNYKRYKNIP	243765	158221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_-_158359_201355_201580_203634_203707_212182_212241_214996_215236_219452_219601_241670
873826	contig_8616_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_72402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213199	210665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_210700_213200
873827	contig_19825_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_59690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTTAGGGGAATAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46391	43778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_43800_46400
873828	contig_11130_pilon	-	1375	2	Intergenic	novelGene_53092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTCCAGTCATGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66980	53911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11130_pilon_-_55191_66884
873829	contig_13917_pilon	-	2612	6	Intergenic	novelGene_175613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_5	9.01110426085505	100	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	70	1860	219824	163016	FALSE	60	AGAGGGAATTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKDEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSMMISKHDRLFPKDAELQSKPQDGVSNNNNEIQKKATMGQLQNKENNNSKDSPGRQCSWDKSESPQRSGMDNGSPTALSVSKTNSPRNSVHKLEVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRTSSLKGSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNTDTLGNPMNGRGMSWLPNGYVTLRDNKQKEQGGESGQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSVDSATWSTSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDFYSGNFEDPVLDGPPQDDLSHPGDYENKSDRRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNNTSSHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRSERGNTIWIQ	219893	162263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13917_pilon_-_163260_170468_171547_184869_184992_187475_187550_190673_190807_219684
873830	contig_13201_pilon	-	6200	1	Intergenic	novelGene_130885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATATTCAGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214278	208078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_208100_214300
873831	contig_5791_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_35854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAATATGAGTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077748	1075762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1075800_1077700
873832	contig_2646_pilon	+	2178	4	Intergenic	novelGene_69691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	29.6010510323911	6	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1545	2039	2347142	2351504	TRUE	40	AAGAAAGGCAAGGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVHMIKRKPAGPHIKIEMKNATLAWDSSHSSILNSPKLPPRTKKDKRAARGKRDKERQPRRVEHQAALAEQKGHLLLDSDERPSPEEEEGRHIHLGHLRLQRTLYNIDLDVEEGKLVGICGSVGSGKTSLISAILGQFKQFALRKKGCHGANGLLSREFIGV	2345597	2351841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2347487_2349544_2349617_2351426_2351526_2351723
873833	contig_501_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_134897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750889	753151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_750900_753200
873834	contig_2933_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_111307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGGGTACCCCGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266710	265721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_265700_266700
873835	contig_6217_pilon	-	2207	17	Intergenic	novelGene_109621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	470.484553246703	3	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2016	190	2205	494644	435501	FALSE	50	GAAGCTGAAGGTAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELK	559507	435498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468489_494637_494686_559359
873836	contig_9195_pilon	+	1055	6	Intergenic	novelGene_155684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	55.0977313507553	420	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	44	322	318842	319545	TRUE	10	GCTGAGGTGGTTTCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPPPGAPWAPVCTMVLQYTAQISSSRQTQPVLQSQVESLLGRTYSRWRSRNPALGGAVGPSVTEIPWDDFLALCIDHKLRDWVPPPAPPHLRSTEQRWSDMCVFF	317973	325762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_317994_318818_319078_319502_319633_321695_321903_324276_324425_325471
873838	contig_6691_pilon	+	3984	12	Intergenic	novelGene_60158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.8709960172174	2	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	219	1253	380649	408909	FALSE	30	CTTTTAAACTGTTGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPCSTMAYHHDSRRIFVGQDNGAIMEFHVSEDFNKMNFIKTYPAHQNRVSAIIFSVATEWVISTGHDKCVSWMCTRSGSMLGRHFFTSWASCLQYDFDTQYAFVGDYSGQITLLKLEQNTCSVITTLKGHEGSIACLWWDPVQRLLFSGASDNSIIMWDIGGRKGRTLLLQGHHDRVQSLCYLQLTRQLVSCSSDGGIAVWNMDVNREEAPQWLESDSCQKCEQPFFWNLKQMWDTKTLGLRQHHCRKCGQAVCGKCSSKRSSYPIMGFEFQVRVCDSCYDSIKDEDRTSLATFHEGKHNISHMSMDVARGLMVTCGTDRVVKIWDMTPVVGCSLATGFSPP	360436	411640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_360594_380587_380656_385552_385627_389195_389251_392238_392390_394037_394151_396243_396371_399448_399555_403137_403240_406509_406641_407926_408036_408849
873839	contig_6361_pilon	-	3365	2	Intergenic	novelGene_23894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_1	0	222	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTCTCTTATTTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125676	121268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_122886_123928
873840	contig_14326_pilon	-	2642	15	Intergenic	novelGene_120662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1395	1736	103959	101822	TRUE	5	CGGTGGCTGCTCCCCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLANLTFCCQGNGSTLRRKSFSVPPSMYSVSRFSFLSLYSTPMNLSTLGWSRLRITFTSVRKVFCVSSSHRINSFMTITLPVALCAHLDGLPEEALPQDLPVDEVTWPENLL	112758	54928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_54987_96068_96204_96882_96992_97584_97776_99062_99169_99478_99672_101707_101908_102779_102858_103543_103677_103914_103972_105793_105858_106990_107168_107860_107911_109995_110158_111829
873841	contig_14704_pilon	-	1211	9	Intergenic	novelGene_82699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	349.75455679662	2264	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	74	826	116413	78683	TRUE	50	AGTAAAAATTCTACCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSAALRAGAAGLTAPWGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRAQKNRLLGLMAECEAQSQMGLKRYELNKFFS	116486	77327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_78663_78780_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_116359
873842	contig_8820_pilon	+	2611	17	Intergenic	novelGene_79280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	196.800650643614	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	1209	2411	128775	133364	FALSE	50	GTTTTGAAATAAAACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSIYGGRVDNEFDQRLLNTFLERLFTTKSFDSEFKLACKVDGHKDIQMPDGIRREEFVQWVELLPDTQTPSWLGLPNNAERVLLTTQGVDMISKMLKMQMLEDEDDLAYAETEKKARTDSTSDGRPTWMRTLHTTASNWLHLIPQTLTHLKRTVENIKDPLFRFFEREVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRSWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERVKQLQSISLAAASGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQANSWSLEELCLEVNVTTSQGATLDACSFGVTGLKLQGATCSNNKLSLSNAISTILPLTQLRWVKQTNAEKKASVVTLPVYLNFTRADLIFTVDFEIATKEDPRSFYERGVAVLCTE	121194	133564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_121281_121899_122047_122133_122285_122429_122684_122776_122915_122999_123095_123227_123253_125984_126070_128313_128487_128720_128939_129050_129155_130145_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132604_133235
873844	contig_5316_pilon	+	2377	2	Intergenic	novelGene_61264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	84	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGGGGAGGTACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555267	559637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_557354_559346
873845	contig_13283_pilon	+	2586	1	Intergenic	novelGene_154007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8600	11186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_8600_11200
873846	contig_5770_pilon	-	532	6	Intergenic	novelGene_74195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7662	junction_5	2256.6835489275	30	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	37	531	264932	262777	FALSE	60	AGAAGAAAAAGGTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVA	265794	262775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
873847	contig_5770_pilon	-	767	7	Intergenic	novelGene_74188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5372.26326452207	79	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	367	738	263708	261935	FALSE	40	GTAAAAGAAGAATGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRRPSFSSQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265793	261905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263824_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
873848	contig_5770_pilon	-	432	6	Intergenic	novelGene_74196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7662	junction_5	2256.6835489275	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	31	432	264932	262870	FALSE	40	CGAATTAACCCATACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHG	265788	262869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
873850	contig_12923_pilon	-	2128	18	Intergenic	novelGene_30144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_2	170.990114852183	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	508	1590	231778	225749	FALSE	20	TATGGGTCCCAGGCCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSERRGLARGSPVEWGPRLLLLLLLAGCSGRIHRLTLTGEKRADIQLNSFGFYTNGTLEVDLSLLQLGPQKTEEKTPLVGFSLTRVRSGSVLSYSPQEPYDCPLQKNSSNLLVLFLINTKDLQVQVRKYGDQKKLFIFPGLLPEVPSNPGPPKPGPSATPKVDSVAPSMINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVMIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236114	225210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226259_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
873851	contig_7870_pilon	-	3974	1	Intergenic	novelGene_108882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACACAAATATACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144837	140863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_140900_144800
873852	contig_10345_pilon	-	1051	11	Intergenic	novelGene_158372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGAGCCGTTCACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24380	4385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_4425_11655_11736_11829_11868_14652_14743_16894_16975_17171_17230_18807_18895_20415_20515_21586_21646_23044_23167_24081
873853	contig_5125_pilon	+	4047	1	Intergenic	novelGene_43487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCACCTGCACATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171852	175899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_171900_175900
873854	contig_5083_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_151665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATAGCAACCCCATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477084	479336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_477100_479300
873855	contig_817_pilon	-	3021	1	Intergenic	novelGene_132492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764161	761140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_761100_764200
873856	contig_2596_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_53532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTAGAAGTTCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100371	1101210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1100400_1101200
873857	contig_9053_pilon	-	3831	1	Intergenic	novelGene_87958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGCTTCAAGAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318860	315029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_315000_318900
873858	contig_6028_pilon	-	5808	1	Intergenic	novelGene_156598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCCAGCTAATACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344856	339048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_339000_344900
873859	contig_11937_pilon	+	3365	1	Intergenic	novelGene_171581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40303	43668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_+_40300_43700
873860	contig_5718_pilon	-	4129	1	Intergenic	novelGene_110392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2077	2442	1265892	1265527	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTVDLDKPGSNCCFLIIFLVFSIVLYACESWTLNKEDQRRIDTFELLCWQRILNIPWTARRRNKSVLEEVQPECSLEARVVILHLTYFGQVIRRDHPLEKDITSGKAESQGKRKTLSVMD	1267968	1263839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1263800_1268000
873861	contig_5899_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_146991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGGGGTAAAGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518485	520076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_518500_520100
873862	contig_5586_pilon	+	2358	9	Intergenic	novelGene_143588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	25.9636163698357	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	130	1821	508601	546014	FALSE	50	ATACTAGATAAATGTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSIPVEVDESEPYPSQLLKAIPEYSLEQDSEPPAPNIRNMAPTSLSALQTPYCSSGDFTWAHPPLKLANHQWPVSEQATCLRNKVLEESEDSFCRRHPDPGKDFPLGPSAASEPESESVVGPLLPEHQFSFTEKRNQWLGSQLSAASPDTGHNSDKSDQSSPNASADSSGSSQETLQRPRPHRNPGAPDLPTIDTGYDSQPQDVLGIRQLERPLPLTSVCYPQDLPRPLRSREFHQFEPQRYPACAQMLPPNPSPHAQWNYYYHCPGGPDHQVPYGHDYPRAAYQQVIQPAVPGQPLPGATMRGLHPVQKVILNYPSPRDQEERPAQRDYSSPGPPRDQLYNQTPKRAGALEESLERPADLRPQGPQAPSPAGIPRPSSIPPVRGTLKTSNLPEELRKVFITYSLDTATEVVKFVNFLLVNGFQTAIDIFEDRIRGIDIIKWMERYLRDKTVMIIIAISPKYKQDVEGAESQLDDDEHGLHTKYIHRMMQIEFIKQGSMNFRFIPVLFPNAKKEHVPTWLQNTHVYSWPKNKKNILLRLLREEEYVAPPRGPLPTLQVVPL	492506	546551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_492628_508592_509430_521551_521739_526283_526463_529648_529738_537556_537626_538710_538828_543261_543337_545867
873863	contig_20951_pilon	-	950	3	Intergenic	novelGene_43082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3166	junction_2	9254	25	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	28	477	27908	27149	FALSE	5	CTTTTTTGGTCCCCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	27935	26675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784
873864	contig_3132_pilon	-	2304	6	Intergenic	novelGene_127460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	283	junction_5	133.749915887824	1322	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	465	863	440124	438445	TRUE	55	TAAAAAACAATAGCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIGEAWAKDSGLVRCPECNQAYNQKPGLEKNLKLTNIVEKFNALHVEKPPAALHCVFCRRGPPLPAQKVCLRCEAPCCQSHVQTHLQQPSTARGHLLVEADDVRAWSCPQHNAYRLYHCEAEQVAVCQYCCYYSGAHQGHSVCDVEIRRNEIRKMLMKQQDRLEEREQDIEDQLYKLESDKRLVEEKVSQLKEEVRLQYEKLHQLLDEDLRQTVEVLDKAQAKFCSENAAQALHLSERMQEAKKLLSSLQLLFDKTEDVSFMKNTKSVKILMDRTQTCTGSSLSPP	450050	436654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_438019_438367_438485_438615_438648_439474_439709_440031_440128_449589
873865	contig_5041_pilon	-	3529	1	Intergenic	novelGene_27026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283744	280215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_280200_283700
873866	contig_15720_pilon	+	3892	1	Intergenic	novelGene_41974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1568	1903	318199	318534	NA	20	CACTGGGCCACCGCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQHPEQCPAYSRCSKVEYPNVKEASQTSPHSNSVFTTSLLLSGHIKLCPGPLLDPDLWAFAPVLLLPQALSSPSSLGQFLLMLQVVAQVSLPPGSPPDSRPGLVRKVAT	316631	320523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_316600_320500
873867	contig_5711_pilon	-	2314	2	Intergenic	novelGene_80253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	864	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	807	2183	44104	40751	FALSE	40	TAACATGTGTTTATATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYLQNFLKITSHRLLYSRLCLQLRSKRFFGTVPTSSLRRRVVITGIGLVTPLGVGTQLVWDRLIRGESGIVSLVGEEYKRIPCSVAAYVPRGCDEGQFNEQNFVSKSDTKSMSSPTIMAIGAAELALKDSGWYPQSEADQAATGVSIGLGMVPLEVVSETALMFQTKGYNKVSPFFVPKILVNMAAGQVSIRYKLKGPNHAVSTACTTGAHAVGDSFRFIAHGDADVMVAGGADSCISLLSLAGFSRARALSTNSDPKLACRPFHPKRDGFVMGEGAAVLVLEEHEHAVQRGARIYAEILGYGLSGDASHITAPDPEGDGALRCMAAAVKDASIQPEEISYVNAHATSTPLGDAAENKAIKRLFRDHAYALAVSSTKGATGHLLGAAGAVEAAFTALACYYRKLPPTLNLDCTEPEFDLNYVPLKTQEWNSEKRCIGLTNSFGFGGTNATLCIAGM	44910	40619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_41154_43130
873868	contig_8631_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_121971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTGGTGCAAACATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784477	786580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_784500_786600
873869	contig_8420_pilon	+	1796	6	Intergenic	novelGene_69339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	342.557206901271	77	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACCCTTCTCTTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10928	59806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14798_39135_39177_41728_41918_51048_51183_58546
873870	contig_8453_pilon	+	4901	1	Intergenic	novelGene_125149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACAGGGTTTCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328142	333043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_328100_333000
873871	contig_5758_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_119128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576063	573528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_573500_576100
873872	contig_7179_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_78112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTATCTGCCACTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695734	693392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_693400_695700
873873	contig_11816_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_98487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481706	479330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_479300_481700
873874	contig_7019_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_149460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTAACCACTGCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524778	522667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_522700_524800
873875	contig_12626_pilon	+	3543	1	Intergenic	novelGene_80468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCGATAGAAGCCTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194979	198522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_195000_198500
873876	contig_8447_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_69446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137359	139690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_137400_139700
873877	contig_14341_pilon	-	5105	1	Intergenic	novelGene_111799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	639	1190	394688	394137	NA	30	GTAATGCTTAAGCACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHECGKAFSQSASLSKHQRVHTGEKPYVCVECGHAFSQSSCLAKHQRMHTGEKPYACSECGRAFSESSYLTQHMKFHSGDKPYRCAECRKRFSSSSALVLHQRSHTRERPYTCRECGKAFSQAKFLMQHQRIHTGEKPHVCSDCGKAFMQSSSPRPPSEDALGGRSRTSAISVARPTSSCHT	395326	390221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_390200_395300
873878	contig_6020_pilon	+	4041	3	Intergenic	novelGene_155574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCGGGAGTGCGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314909	349950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_+_318424_318548_318606_349480
873879	contig_10733_pilon	-	2928	20	Intergenic	novelGene_109969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	16	junction_2	29.4106468746352	104	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	914	2745	112	2856	323479	306944	FALSE	0	TGCCTCTGCTTCCTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAASALDFTVENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWHFSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKISRYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVLTRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQAEDSPVDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTSRLPQYRKGLVRASLAVECGAVFPLLEQLLQQPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQLEVPLQDCEALIQAAFAALQDSELFDSSVEAIVNAISQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQEQLRQAVQNGDMETSHGICRIAVALGENHSRALLDQVEHWQSFLALVNMIMFCTGIPGHYPVNETTSSLTLTFWYTLQDDILSFEAEKQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYGFWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLGAELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEALLYGFQSIAETIDVNYSDVVPGLIGLIPRISISNVQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINSVLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAANIVAVSQDVLMKQIHKTSQCMWLMQALGFLLSALQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKLAEEIPNPSNKLAIVHILGLLSNLFTTLDVSHHEDEHEGPELRKLPVPQGPNPVVVVLQQVFQLIQKVLSKWLNDAQVVEAVCAIFEKSVKTLLDDFAPMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLVHIFAHEPAHFPPIEALFLLVTSVTLTLFQQGPRDHPDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCERLDVKAVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGFFTELLPRCGEVEPVGKVVQEDGRMLLVAVLEAIGGQASRSLMDCFADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFPSARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKEMVKEFTLLCRGLHGTDYTADY	325363	306871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_-_307041_307136_307319_307608_307699_307841_307901_307991_308059_310206_310260_313133_313231_313411_313550_314099_314181_315522_315667_315830_315966_316155_316183_316266_316449_316874_317023_317108_317230_317434_317602_317705_317848_317958_318100_322805_323543_325315
873880	contig_5434_pilon	-	2481	1	Intergenic	novelGene_74694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATAAAAAAATGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402737	400256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_400300_402700
873881	contig_6898_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_35715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	117	302	59668	59853	NA	20	CCAGCCTTTCTTAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTVSARGGCRRPRGALAGPCGLLLMAKSLARHSPPPKHRDLSRGGEGAGVGSLSGVPFG	59551	62261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59600_62300
873882	contig_19518_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_170737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAGATATAGAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69069	67058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_67100_69100
873883	contig_20610_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_67636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGACAGCTTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21021	23028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_21000_23000
873884	contig_6137_pilon	+	2871	11	Intergenic	novelGene_59143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_10	55.7605595380821	842	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	126	1628	975077	985968	FALSE	30	ATGATATGTCTGATTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAGEQSGPQPSQPPQAGDHRICDGDFVVLKREDVFKAVQVQRRKKVTFEKQWFYLDNVIGHSYGTTFEVTSGGSLQPKKKKEEPTSETKEAGVDNRNIIDDGKSQKLTQDDIKALKDKGIKGEEIVQQLIENSTTFRDKTEFAQDKYIKKKKKKYEAVVTVVKPSTRILSVMYYAREPGKINHMRYDTLAQMLTLGNIRAGNKMIVMETCAGLVLGAVMERMGGFGSIIQLYPGGGPVRAATACFGFPKSFLSGLYEFPLNKVDSLLNGTFSSEMLSSEPKDSASVEESNGIVEEKQTSEQENEDSVAEAPESTLPEEQETMEIVSEDPDYKEPKERGSKKDYIQEKQRRQEEQRKRHLEAAALLNERNADGLIVASRFHPIPLLMSLLNFVAPSRPFVVYCQYKEPLLECYTKLRERGGVINLRLSETWLRNYQVLPDRSHPKLLMSGGGGYLLSGFTVAMDNPKADTSLKPSTSTLDLKKTEEPAAKKRKCPESDS	974951	987211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_975214_978940_979069_980780_980891_981412_981505_981603_981688_981960_982086_982714_983074_983442_983529_984141_984245_984347_984435_985776
873885	contig_2867_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_135157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTTTTAGAGGGTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493557	492337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_492300_493600
873886	contig_3942_pilon	+	1436	5	Intergenic	novelGene_128739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	268.232525059882	691	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	318	851	785130	790398	FALSE	20	GGGAAGGTTGCCTATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPDSASRVFCSRVLSMVNADDVNAIILAQKNMLDRFEKTNEMLLNFNNLSSARLQQMNERFLHHTRTLIEMKRDLDSIFRRIRTLKGKLARQHPEAFSHIPEASLLEDEDEDPIPPSTTTTIATSEQSTGSCDTSPDLISLPLSPGFEDLSQARPGSPTINGHGPTDDDEETPGE	779419	790983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_779716_785108_785231_786164_786318_789060_789108_790165
873887	contig_13952_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_133276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTCCTGGCTCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221384	223511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_221400_223500
873888	contig_8651_pilon	+	444	4	Intergenic	novelGene_168189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3160.6362580271	149	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	34	405	185122	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185088	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_187011_189168
873889	contig_8453_pilon	+	3050	1	Intergenic	novelGene_125139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252689	255739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_252700_255700
873890	contig_2817_pilon	+	3943	7	Intergenic	novelGene_104361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.2175845407765	972	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	23	733	878924	941105	TRUE	20	TTTTCCCAGGTCTACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVVSAGSGYFFWCVYVSGVCVWVCVLGVCRGAERRAGPRGRKEAAEPVPFPHDALAGPGIPRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPGSKSPISQLDCLNRDNYIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDAKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGPGQHRALLGPA	878901	947449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_879065_939336_939547_939883_940132_940993_941143_941887_942039_942954_943032_944504
873891	contig_12638_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_33217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544061	541440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_541400_544100
873892	contig_9955_pilon	+	3153	11	Intergenic	novelGene_21353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	81.9829860397875	313	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	203	2197	145304	212450	FALSE	20	AAGCTGCGGTTCTAGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRNADCSKLRRPLKRNRITEGIYGSTFLYLKFLVVWALVLLADFVLEFRFEYLWPFWLFIRSVYDSFRYQGLAFSVFFVCVAFTSNIICLLFIPIQWLFFAASTYVWVQYVWHTERGVCLPTVSLWILFVYIEAAIRFKDLKNFHVDLCRPFAAHCIGYPVVTLGFGFKSYVSYKMRLRKQKEVQKENEFYMQLLQQALPPEQQMLQKQEKEAEEAAKGLPDMDSSILIHHNGGIPANKKLSTTLPEIEYREKGKEKDKEAKKHNLGINNNNILQPVDSKIQEIEYMENHINSKRLNNDLVGSTENLLKEDSCTASSKNYKNASGVVNSSPRSHSATNGSIPSSSSKNEKKQKCTSKSPSTHKDLMENCIPNNQLSKPDALVRLEQDIKKLKADLQASRQVEQELRSQISSLSSTERGIRSEMGQLRQENELLQNKLHNAVQMKQKDKQNISQLEKKLKAEQEARSFVEKQLMEEKKRKKLEEATAARAVAFAAASRGECTETLRNRIRELEAEGKKLTMDMKVKEDQIRELELKVQELRKYKENEKDTEVLMSALSAMQDKTQHLENSLSAETRIKLDLFSALGDAKRQLEIAQGQILQKDQEIKDLKQKIAEVMAVMPSITYSAATSPLSPVSPHYSSKFVETSPSGLDPNASVYQPLKK	145101	213406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_145384_169269_169412_170907_171035_174867_174992_176532_176712_177888_178391_200551_200711_202366_202550_204703_204825_207527_207703_212247
873893	contig_10437_pilon	+	1862	4	Intergenic	novelGene_38311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	917.669996361558	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	145	606	439767	444012	FALSE	30	AGTTGAAGTATACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMVRHKEMFCADP	431123	445268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748
873894	contig_11986_pilon	-	1222	2	Intergenic	novelGene_69139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	854	1189	272469	270471	FALSE	30	AGTCCAACGGGCAACCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACFCSFDVKAKLLALQNHPGFLEIVSEEELLWSMVKFEASFSEYLFGVNENESVFLSSVQENQVRFPASAPQAQPPHARHWRAVWLGCCTGFSGASRLRRSRKKGLASYL	273322	270437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_270633_272295
873895	contig_19744_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_120403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGAAAGCCTGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223044	220848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_220800_223000
873896	contig_9471_pilon	+	3710	18	Intergenic	novelGene_21752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	131.546510516493	182	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	280	2010	323796	363877	FALSE	25	ATAGAAGTCTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLELKEDKMLEVRFVGDDDVLNHILDREGGAKLKKERTQLLVNAKKIIKKPECDLEEDDQEVLKDQKYVEVLGRDVQESLKNGSAADGGNKVYSFQNRKHSEKMAKLASELAKTPTKNVSCNVKDDPEVTNIPQSSKGHSASDKVQLKNSDKSEFLSTTSSGPRKRLIVPSSHSDSESEYSASNSEDDERVAQEYEEDSNEVILSQKIQTQNRVVSAPVCKVTPSKKMKRDKTSDLVEEYFEAHSSSKVLTSDRTLQKLKRAQLDQQTLCNLLSKVSPSFSAELKQLNQQYEQLFHKWMLQLHLGFNIVLYGLGSKRDLLERFRTTMLQDSVHVVINGFFPGISVKSVLNSITEEVLDHVGTFRSVLDQLDWILNKFKEDSSLQLFLLIHNLDSQMLRGDKSQQIIGQLSSLRNIYLIASIDHLNAPLMWDHAKQSLYNWLWYETTTYSPYTEETSYENSLLVKQSGSLQLSSLIHVLRSLTPNARGIFRLLIKYQLDNEDNPSYIGLSFQDFYQQCREAFLVNSDLTLRAQLTEFRDHKLIRTKKGTDGVEYLLIPVDSGTLTDFLEKEEEES	319443	365577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_319664_322783_322833_323785_323890_324349_324494_329877_329968_331504_331595_332270_332303_334879_334941_336925_337120_341456_341556_344422_344533_346699_346833_351127_351225_355106_355254_355741_355914_360853_360916_361558_361678_363790
873897	contig_5125_pilon	-	1472	2	Intergenic	novelGene_43407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1147	junction_1	0	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAAGCCATCCCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26033	23070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_23313_24803
873898	contig_16148_pilon	-	2829	4	Intergenic	novelGene_50355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	585	junction_1	253.888864575734	37	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1955	2500	75454	59018	FALSE	25	TTGCAAAGCTTCTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	77408	58688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358
873899	contig_9705_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_41716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAATATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142062	139654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_139700_142100
873900	contig_10434_pilon	-	2299	10	Intergenic	novelGene_82041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	544	junction_6	128.398203902672	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1434	2219	137443	132856	FALSE	55	TACAAAATGTTATAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	140716	132775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_137572_139146_139201_139465
873901	contig_16122_pilon	-	2485	14	Intergenic	novelGene_134555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	44.2538401369181	1	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	145	1185	289120	285885	TRUE	10	CTGAGTGCTTGGCATGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTFSDRNLSGQLLWKSPAGPLLEDKLGCAACLDIRTSPRLHQGQKSSMSWGPLPHTDLFSPQTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQARRKYQEASKGLWFPLLAGMHLNPKPVLTNPWVPREGVCPGQYAVTCTPPFTRADKDRDRAKDKYVRSLWKLFAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLMLPSLLQSLQEILQEYLEISSLVQDEVMAIHQEMAAAAARIQPEAEYEGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGELLEPGELQLNELTVESVQHTLTAVTGDLAEATETVLSRQKVVTQLQYELQNEEQNTHPRERVQLLSKKQALQEALQGLQVTQCNQAKLQAQQELLQTKLEQLGPGEPPPVHLLQDDRHSTSSSEQEREGGKDAHPGDA	289264	280586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_281504_282123_282282_282524_282649_283182_283302_284184_284239_284662_284786_285120_285331_285847_285933_286052_286240_286371_286495_286657_286778_286852_286987_288691
873902	contig_14519_pilon	-	2708	4	Intergenic	novelGene_66843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406214	392700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_394380_401744_401887_403070_403432_405688
873903	contig_15825_pilon	-	3676	1	Intergenic	novelGene_160203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCCCTTCACAATCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122793	119117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_119100_122800
873904	contig_6576_pilon	+	3150	1	Intergenic	novelGene_42348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAATTTGTGAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722930	726080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_722900_726100
873905	contig_1641_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_172793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTGCACCCATTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4710	6886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_+_4700_6900
873906	contig_5013_pilon	-	3193	2	Intergenic	novelGene_110096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	718	junction_1	0	262	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	39	335	216357	205704	FALSE	15	TGTTTCTGAATCCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPARDLQKKLAMALRPGEYFWPAFGLRLLLMTMFQAVSAFGAEFSSEACRELGFSSNLLCSSCDLLGQFSLLQLDPDCRGCCQEEAQFETKKVLFSSISLPLDGLIEIR	216395	202845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_205926_216282
873907	contig_8122_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_40183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACAAAGAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55338	52724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_52700_55300
873908	contig_8712_pilon	-	3000	1	Intergenic	novelGene_58757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATATTCCCAATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182949	179949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_179900_182900
873909	contig_10235_pilon	-	3327	7	Intergenic	novelGene_46281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	321.511879856544	55	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2608	3156	17621	14151	FALSE	60	TTTAACAAAACTAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR	22578	13979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14168_14491_14640_14781_14927_15025_15136_17492_17625_18878_19755_20850
873910	contig_3018_pilon	+	2991	1	Intergenic	novelGene_78904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAATACTTTTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604939	607930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_604900_607900
873911	contig_5732_pilon	+	2253	3	Intergenic	novelGene_119583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTGGGCGTAAACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147852	150194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_148070_148111_148971_149017
873912	contig_12520_pilon	+	4013	1	Intergenic	novelGene_161078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGAATCAGAATGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536438	540451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_536400_540500
873913	contig_4496_pilon	+	2589	8	Intergenic	novelGene_66669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	192.263106291395	3	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2340	249	2588	911498	998124	FALSE	30	CTTCACCAGATGCCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTEPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMT	859287	998125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_891913_891995_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996168_996282_996564
873914	contig_1532_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_37443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGATATTTTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30899	33066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_30900_33100
873915	contig_15219_pilon	+	1986	6	Intergenic	novelGene_40837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_5	283.830230948009	1	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	83	859	23353	25321	FALSE	10	TTGTATTCTGGGGTATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGRDSFPWEVPKKLKY	23188	26448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24588_25218
873916	contig_17281_pilon	+	757	2	Intergenic	novelGene_105188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGTAATGTTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2289_2387
873917	contig_17127_pilon	+	1694	6	Intergenic	novelGene_168301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTGAGAATCTCTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58019	65623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_58078_59192_59408_60397_60564_62032_62627_64564_64712_65109
873918	contig_1521_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_145451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCAGATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170123	171632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_+_170100_171600
873919	contig_5083_pilon	-	2709	1	Intergenic	novelGene_151675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1290	1718	576816	576388	NA	5	ACCGTTTTTTTTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNTEYTMDCQKNKQICLGRSTRMLLRNKNGETSSHVLWTCYQERLVPGEGHHAWTSRGSSRKRKTLKEMDRHSGYNNGLKHNNCEDGTGPCSVYFCCTQGRYELGPTPGHLTQQQVAKFNIIEFFFSLIIMLKAYYNL	578105	575396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_575400_578100
873920	contig_3410_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_58965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2045	2392	426147	426494	NA	60	AAAAGAAAACCTAACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSASVKITALETRWGGSTLSCRVTMSQNGLSAFGFGFGFGFGILRILGEADHLRNIPLGMLQCGVEVTGALCPSTTCPQTAMQCHFLSLVFIVAAVSLLQGHQALITICCCQN	424102	426625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_424100_426600
873921	contig_16870_pilon	+	1506	2	Intergenic	novelGene_155490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_1	0	3960	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	160	411	104553	107688	FALSE	30	TGAGATCTTCCTTGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRDLDLQAASRPLVPLFRPGVLPTAATFRPAPAFGATVLVFHLLAAPVAPEPAMSGPNGDLGMPVEAGAEGEDDGFGEAEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQQQLGEASSDATH	104393	108783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104632_107515
873922	contig_9579_pilon	+	673	6	Intergenic	novelGene_150592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_2	124.427649660355	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	287	673	809221	816755	FALSE	30	ACTTACAAGTGAGTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVPSAKALTFGDLCVLTFQLQQEIKDWSRSHAELSEQIKVFEKSQKDLETALTHKNDNIDALTNCITQLNRLDCESESEDKNRGGSGSDELANGEMGGDRSEKMKNQIKQMMDVSRTKTAISVVEEDLKLLQIKLRASMSTKCNLEEQIKKLEEDRNSLQLTKAGLEDECKTLKQKVEILNELYQQKEMALQKKLSQEEYERQEKEQRLSAADEKAILAAEEVK	808837	816755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_809019_809115_809228_810379_810436_810525_810617_810789_810929_816661
873923	contig_10734_pilon	+	978	9	Intergenic	novelGene_51540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	28.4561065502644	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	780	198	977	2341979	2371700	FALSE	40	AGCCAATTGAAGGCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWLRLTQRSTFRQGLVIGSKPVIYPVLHWLLQRTNDLKKRAYLARFLIKLEVPSEFLQDETVADTNKQYEELMEAFKTLHKECEQLKTSGFSTAEIRRDISAMEEEKDQLIKRVERLKKRVETVQNHQRMLKIARQLRVEKEREEFLAQQKQEQKNQLFHAVQRLQRVQNQLKSMHSAAADAKPESLMKRLEEEIKFNSYMVTEKFPKELENKKKELHFLQKVVSEPAMGHSDLLELESKINEINTEINQLIEKKMMRN	2338852	2371701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2338911_2341839_2342005_2343155_2343337_2348647_2348738_2352309_2352376_2352690_2352802_2354904_2354990_2369511_2369676_2371643
873924	contig_12638_pilon	+	2111	13	Intergenic	novelGene_33134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	640.18453828217	2	110	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	365	1108	182987	198080	TRUE	50	GGAATAGGAAATGCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVICKPDFPSRLKLQL	178091	200279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191802_195520_195554_198068_198151_198736_198856_199465
873925	contig_11594_pilon	-	4918	4	Intergenic	novelGene_80891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	63.2051334061474	67	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	731	1165	105099	96868	FALSE	40	TTCAGTGCCTATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVNIHQSGIKTESPVLMTPDKAESCQGDLSTLASVVTSLANLGKTKDISQNSNEISMIESLSNSDTSLCEFHQEIQTNGDVSRAFDTLAKALNPGESTACQSSEGVEGSVHLIAGDASINYIEKEGPLLSDSHVAFRVFPVYI	105926	93114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_97052_98584_98770_105033_105125_105221
873926	contig_14528_pilon	-	3772	3	Intergenic	novelGene_111288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	19	493	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2367	2837	250227	247022	FALSE	15	CCACGGTCTTCTTGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQFRSYVWDPLLILSQIVLMQTVYYGSLGLWLALVDGLVRSSPSLDQMFDAEILGFSTPPGRLSMMSFILNALTCALGLLYFIRRGKQCLDFTVTVHFFHLLGCWFYSSRFPSALTWWLVQAVCIALMAVIGEYLCMRTELKEIPLNSAPKSNV	252593	246086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_247263_248485_248554_250065
873927	contig_7457_pilon	-	2811	1	Intergenic	novelGene_31528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	127	528	712145	711744	NA	35	CCCTGTAGGACAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWILEFTVNRHVTGIHHIGTNDPFVCKQRPRGQLRTLLLRCIWQCLWKNNKEQFRVKMKTLSVNTVSTRIILPSWKNTYHHLHKLKKKKKNIKRFSIKKTRVHFGIQRNMSFKETKCDSAKLQLCVPLPHSG	712271	709460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_709500_712300
873928	contig_7234_pilon	-	1503	14	Intergenic	novelGene_145931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	210.70400450583	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	93	935	481428	411977	FALSE	20	TTGTGTCTGATGCAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESRTLTVKEQNGNRLTVFLSFHGTITSQFAANQSLFSVLILRLQKLSYSPSMTMSV	587404	411408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_419812_419948_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_587318
873929	contig_7840_pilon	-	3136	1	Intergenic	novelGene_68991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTATTGGTTCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234978	231842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_231800_235000
873931	contig_17311_pilon	-	496	5	Intergenic	novelGene_57834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	878	junction_1	7340.73046007684	462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	24	422	126865	118871	FALSE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKKE	126888	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
873932	contig_7594_pilon	+	4097	2	Intergenic	novelGene_55410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGTGCCTAAGACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468589	474722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_469972_472007
873933	contig_12603_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_105794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGTATCTAACACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586778	584331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_584300_586800
873934	contig_11986_pilon	-	1865	4	Intergenic	novelGene_69146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGTTAGCATCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303970	301804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_302196_302340_302577_302680_303449_303500
873935	contig_9239_pilon	+	3701	1	Intergenic	novelGene_137176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGAAAGGTAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169794	173495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_169800_173500
873936	contig_1719_pilon	+	3328	2	Intergenic	novelGene_87293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	54	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2541	2849	390339	390647	FALSE	30	ATGTCCCCACATCCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLHLYSILSFPPVTLQSVLLANQKTKPIAVKLIPTHGDPIGQRRTAPWGFQGAAGGFELLTFWLAVERLTTRALLLAKATPIYQCTDFHPLPHTQGLPHPP	382313	391126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_382715_388199
873937	contig_821_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_149416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATGAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251172	253047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_251200_253000
873938	contig_11978_pilon	-	1824	4	Intergenic	novelGene_63005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	32.355662392986	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	300	536	1558611	1557862	FALSE	30	CTGTTTAAAGAGCGACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGVHGLKNHSRSRSSSHSPPRHASKKSTREAGSRDRSSRSPGRRSRSPRPSKLHNSKGNRRERGRTTSPSPKKEVHQRRHASGYTRKLSAEELERKRQEMMENAKWREEERLNILKRHMKDEEQEQRLEKLNSQDGKFIHRMKLESASTSSLEDRVKRNIYSLQRTSVALERNFMKR	1562156	1556573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1557977_1558489_1558652_1561324_1561424_1561996
873939	contig_11825_pilon	+	2579	3	Intergenic	novelGene_155424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	115	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1446	1826	131012	132403	FALSE	30	TAACTGCTTCTCAAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGPQSYTTRTLQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTMFDRDQFSPDDFLGRTEVPVAKIRTEQESKGPTTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKNQL	129566	133156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_131061_131499_131674_132245
873940	contig_4876_pilon	+	2811	1	Intergenic	novelGene_137910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATTAGGTCAGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618356	621167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_618400_621200
873942	contig_19701_pilon	+	5131	1	Intergenic	novelGene_147887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTACAAGCAAGACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76822	81953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_76800_82000
873943	contig_6488_pilon	-	2823	1	Intergenic	novelGene_44710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGCCAGGATTAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23925	21102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_21100_23900
873944	contig_8631_pilon	-	2323	1	Intergenic	novelGene_121956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTATTTCACTCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703216	700893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_700900_703200
873945	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_94763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	TGCACCTGTGGTTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
873946	contig_10197_pilon	+	1157	6	Intergenic	novelGene_115290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_2	46.7529678202358	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	2	1045	1258096	1263353	FALSE	30	AGAGATTTAGCTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAANVLMSPLSVATALSALSLGAGQRTESTIHRALYYDLINNANIHSTYKELLATVTAPQKNLDSAFRIMFERKLRIKTSFVSPLEKSYGTRPRFLTGNPHVDLREINNWVQAQTKGKIASSTREMPNGISILLLGVAYFKGQWVTKFDTRKTSLADFHLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLNCKIAQLPLTGSMSIIFFLPQKPTQNLTMIEESLTSEFVHDIDRELKTVQAVLTIPKLKLSYEGEVTKSLQEMTLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTAPSPGGQPARLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGT	1258094	1263465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1258166_1258884_1259041_1259455_1259660_1260794_1260938_1261911_1262123_1263093
873947	contig_6980_pilon	+	2760	3	Intergenic	novelGene_36026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_1	319.5	101	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTCAGTTAAAATATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346090	363763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146
873948	contig_4759_pilon	-	2878	3	Intergenic	novelGene_106346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCTGCCAGGAAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883017	875655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_875822_875941_876114_880477
873949	contig_12512_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_24176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAACCAAACCCGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582284	584544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_582300_584500
873950	contig_2036_pilon	-	1204	1	Intergenic	novelGene_131822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGGGCCCTTTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607637	606433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_606400_607600
873951	contig_6048_pilon	-	2193	5	Intergenic	novelGene_73312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	10.1334840997556	269	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1168	1674	2104826	2102483	FALSE	10	TGACTGTGGTGTTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRISVFKYISGSSAERRAAQSRKLNPVPGSYPTQSCHPHLSTGHPVTQMQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2122119	2101963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102919_2104755_2104871_2118903_2119684_2120026_2120150_2121899
873952	contig_5059_pilon	-	1520	13	Intergenic	novelGene_140699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	74	junction_3	104.619515653417	795	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	264	1274	231713	166409	FALSE	25	ATGAAACACTTGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEHVLHCQFSAWYPLFRSLTIKSVILPLPQNVKDYLLDDGTLVVSGREDPPTHSQPDSDDEAEEIQWSDDENTATLTAPEFPEFTTKVQEAINSLGGSVFPKLNWSAPRDAYWIAMNSSLKCKTLSDIFLLFKSSDFITRDFTQPFIHCTDDTPDPCMEYELVLRKWCELIPGAEFRCFVKENKLIGISQRDYTQYYDHISKQKEEICRCIQDFFKKYIQYKFLDEDFVFDVYQDSRGKVWLIDFNPFGEVTDSLLFTWEELISGKNLKADISEGDALEQDSPAFRCTNSEVTVQPSPYLSYRLPKDFVDLSTGEDAHKLIDFLKLKRNQQEDD	231976	166162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_166436_167075_167214_171565_171695_185164_185194_186507_186631_188017_188094_191644_191694_204290_204398_206935_207032_214153_214187_214730_214789_226820_226893_231639
873953	contig_9753_pilon	-	941	7	Intergenic	novelGene_41325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	420.534448318116	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTATGGGGTACATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93341	69992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_70667_70876_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93261
873954	contig_10341_pilon	+	2831	1	Intergenic	novelGene_47245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGCTATGCACAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155008	157839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_155000_157800
873955	contig_16328_pilon	+	3355	1	Intergenic	novelGene_178157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTCTAATGAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72084	75439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16328_pilon_+_72100_75400
873956	contig_12079_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_67369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1322	1741	299137	298718	NA	25	GGCAAAGGAGGTAGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKKGVGGIRAVKSRTCHAVGAIVVVGATEEVGTQSSPLIPTRGRSWDLLLGALPARAGAQGVLSPAGLAVLFPLGPFSQNSSSFKWNFSKLNFELSPFGLPAVDTETSLVTILVRESHMQASNQTERCASASTFLSF	300458	298222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_298200_300500
873957	contig_12919_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_75882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTCTAAAAAGCCTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657098	659219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_657100_659200
873958	contig_7707_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_72180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTATCCTTTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540745	538884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_538900_540700
873959	contig_3130_pilon	-	2515	8	Intergenic	novelGene_103573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_1	131.027649364396	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	19	1080	167769	128369	FALSE	30	TGTAGTATATTGTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRGSKMAAAVGVRGRCELPPCSGPGWLLSLSALLSVAARGAFATTHWVVTEDGKIQQQVDSPMNLKHPHDLVILMRQETTVNYLRELEKQLVAQKIHIEENEDRDTGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRGVQERVNLSTPLLPKEDPVFTYLSKRLGRSIDDIGHLIHEGLRKNASSWVLYNMASFYWRIKNEPYQVVECAMRALHFSSRHNKDIALVNLANVLHRAHFSADAAVVVHAALDDSDFFTSYYTLGNIYAMLGEYNHSVLCYDHALQAKPGFEQAIKRKHAVLCQQKLEQKLEAQHR	167787	126933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_128513_128962_129108_129921_130032_133509_133642_133929_134042_134805_134976_143287_143378_167610
873960	contig_11386_pilon	+	1649	6	Intergenic	novelGene_82813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_1	110.66634538106	691	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	70	738	137770	141706	TRUE	55	AGAAACAGAAATAAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCPQRSAVSLHRQAPELTSPCLAMGPNLLLLLLLTLAGQGSVGSLPEVLQVPVGGSILVQCHYRLQDVKARKVWCRFLLEGCQPLVSSAVDRRAPEGTRMFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKGNRLAACGGF	137700	142964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_137813_137981_138315_140637_140759_141029_141170_141674_141728_142074
873961	contig_4884_pilon	-	1557	2	Intergenic	novelGene_63822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTCTATAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617944	567770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_569266_617882
873962	contig_3601_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_132885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179197	177542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_177500_179200
873963	SIRV6	+	652	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	222	6	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
873964	contig_11258_pilon	-	1764	4	Intergenic	novelGene_67829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.4991582276861	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTTTTAGCTCAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360587	329389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_330660_354751_355099_358490_358581_360530
873965	contig_6102_pilon	-	2641	9	Intergenic	novelGene_32243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_4	10.5445483544816	62	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	524	1345	1261243	1254485	FALSE	15	TACTCATTCTGCCCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFCGDVLSRSQIFYYSTGMSVGIVASLLIIIFIVSKFMPKKSPIYVILVGGWSFSLYLIQLVFKNLQEIWRCYWQYLLSYVFTVGFMSFAVCYKYGPLENERSINLLTWALQLMGLCLMYSGIQIPHIAFAIIITALCTKNLEYPIQWLYITYRKMCKATEKPLPPRLLTEEEYRIQGEVETQKALQELRGFCRSPDCSAWKTISRIQSPKRFADFVEGSYHLTPNEVSVHEQEYGLGSILIQNEFYEDTSSEEENSDPCCPSITQNNLLA	1279346	1253188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1254666_1255369_1255544_1256940_1257167_1257869_1257985_1258449_1258544_1261211_1261285_1262665_1262887_1264037_1264163_1279210
873966	contig_10766_pilon	+	3999	4	Intergenic	novelGene_151183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	499.072027756404	44	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	491	967	114181	115021	FALSE	10	GGATTCTGTGTTTGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEARRGVGPRAAAVPEVVMLLLCLGVRIGRPYNVDTESALLYRGPAGTLFGYSVVLHRHGTNRWLVVGAPTDNWLANPSVINPGAIYRCRIGKNPNRTCEQLQLGELAPGAGVNDTPFTLVNPTIMQVLEKLLPSVTSSLKHMVFTLNSTPSSLLI	110691	118053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_110898_112934_113148_114109_114378_114741
873967	contig_15122_pilon	+	2231	8	Intergenic	novelGene_162693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	39.4259833519128	141	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	130	1986	131763	155177	FALSE	35	TTGAAGAAGCCTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVPRSLKIKRNANDDSKGCVAKKTKSQAEDLQLDEGRDAAEVLVTKEASTLDRPSPESGLFPSPGDQLAEVCLVGSEQGTKDSDLSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPVCVICGRYGEYICDKTEEDVCSLECKAKHLQVKEKEEKGKLSSPQKADSESESLFSAFYIYKEHPFILNLQEDQIEHLKQQLGIVVQGQEVTRPIIEFEHCGFPEALNHNLKKSGYEVPTPIQMQMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIIRALLEDRTPSALILTPTRELAIQIERQAKELMSGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLRQRVKVIIATPGRLLDIIKQSAVELCNIKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENVPNDCQTILVSATIPTSMEQLASQLLHNPVRITTGEKNLPCSNVRQIILWIEEPSKKKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCRLGADLLSEAVQKITGLKSISVHSEKSQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLINVKLVVNFDMPSSMDEYVHQVGRVGRLGQRGTAITFINNNSKRLFWDITKRVKPTGTILPPQLLNSPYLHDQKRKEQQKVKQTQSNLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK	129806	155422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_129925_131751_132564_134036_134205_140324_140415_147077_147330_150563_150717_151460_151590_154913
873968	contig_19132_pilon	-	2447	2	Intergenic	novelGene_170003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434638	431730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_432513_432973
873969	contig_9455_pilon	-	3454	1	Intergenic	novelGene_161838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2812	3153	292194	291853	NA	15	TCCCCTCTATCCCTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLWKSYRKRSLMNDLSPYCQPQQPEHFHPLSYWTALLHFRTEGCSQFLKGNRHFFQAVTLFNLLFHWPVLLHGLLLHSIPLNHYWSPGSPLPPMVPLIYTLPSTSSSACYI	295005	291551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_-_291600_295000
873970	contig_4496_pilon	-	2909	1	Intergenic	novelGene_66643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678340	675431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_675400_678300
873972	contig_755_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_119784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCACTAGGAGGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558569	555205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_555315_556298
873973	contig_7379_pilon	+	2400	3	Intergenic	novelGene_150036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTCTAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547152	552180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_548008_549695_549893_550832
873974	contig_8452_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_47981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	64	606	78034	77492	NA	60	TACTGGGGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPCCCISAWLASGADSQILDETSWWEDCVCWFYMIELLESTAVDLNKWSVKQQWPAKQRITAVFVHLYLCVHKCIYGIIYSRPMHKKTMILVNICCLPRHVVVRCCQVSSDSQRPCVQQNETLPGPGPSLQPLLCLSPLLQPLCQSILLRVFLFFTDPVLYQAWIKKMTVQAQPKFYCS	78097	75790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75800_78100
873975	contig_16492_pilon	+	2039	11	Intergenic	novelGene_100273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	104.190018715806	24	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	740	1495	86032	100411	FALSE	50	ATCTGCCTTAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFDVEVLLNIHDNEIVVGIALTEESLHRRNITHFGPTTLRSTLAYGMLRLCAPQPSDIIVDPMCGTGAIPIEGATEWSNCYHIAGDNNPLAVNRAANNILSLLTKNQIQESKSWGLPIDAVQWDICSLPLRTGSVDIIVTDMPFGKSKCFTHWNLFYRMGSKKRNWNLYPACLQEMSRVCRPGTGRAVLLTQDKKCFTKALSRMGHMWRKVHTVWVNIGGLHAAVYLLKRTSQGFVHPSEQDEEKGTPW	76793	100955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_76859_78475_78571_78830_78873_79866_79945_85572_86053_88344_88476_93885_93956_96278_96395_99245_99354_99946_100104_100258
873976	contig_15897_pilon	+	3571	1	Intergenic	novelGene_49527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	500	1503	22	1524	327688	329190	NA	20	GAATCTTTGGCAGATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSSFREMDGQPERKGCGEEEGQEISNGALAVTPLDTAEPSKSPKPSNGASVPNGAFRSPHLWKKSNMLTSSRLAASEEESGSSSSKRFLRSCSASCVPHGARDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPALPRKRASENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFRDTAESSPGSSPPSLTPKLVRRQVMMAPSSGLPHKEEAGKSSALGTPVTAEPVPPTSRAGSGSSGGASKAPAEESRVRRHKHPTESPGRDKGKLSRLKPAPPPPPLASVGKVGKASQSPSHEAAGEAGASTKAKSMALGVDAVSIDAAKPNQLGEGIKKPVLLSVPKPQSSAKPSGTPATLAPTSSSLPSAPSSLGVDQQSSTAFIPLISTRVSLRKTRQLPERIASGTITKGVVLDSTNALCLTISKNSEQMASHSAVLEAGKNLYTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSVKEISDIVQR	327666	331237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_327700_331200
873978	contig_10930_pilon	+	1063	5	Intergenic	novelGene_37096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_3	7360.72385621822	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTGTGTTTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339419	342108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_340055_340994_341625_342020
873979	contig_835_pilon	+	3121	1	Intergenic	novelGene_152152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210648	213769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_210600_213800
873980	contig_3111_pilon	+	2093	3	Intergenic	novelGene_129984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	16	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	160148	160483	TRUE	35	AATTTTATTTAAGGTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAARRLPEMGLSALLMLALCAAGARALYFHIGETEKRCFIEEIPDETMVIGQAGVRVERALLSLLPCSGAPSSPLGAGRVTVLPGDLACCSLSSAPDGALRKSDQRAV	160146	162899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_160734_160956_161505_161941
873981	contig_7898_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_47625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGACTACCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597365	599928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_597400_599900
873982	contig_7410_pilon	+	2884	13	Intergenic	novelGene_106129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_12	38.2494553338127	112	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	22	1773	890039	940095	FALSE	25	TGAAACTTGTGATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEEVSRRQQPHQGLRRRRRTSDPSIGVNHVSSTTSLGENYEDDDLVNSDEVMKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALEQILLQEHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGHNEPLTGFTWRGGCERETTGIQVWNEVFVIDRPDGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQVYNLSQNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQFLEKRLQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKDIDEDFKRELRNLVPLLLAPENLVEKEISGSKVTCRDLVEYFKAYIKIYQGEELPHPKSMLQATAEANNLAAVAGARDTYSKSMEQVCGGDKPYIAPSDLERKHLDLKEVAIKQFRSVKKMGGDEFSRRYQDQLESEIEETYANLIKHNDGKNIFYAARTPATLFAVMFAMYIISGLTGFIGLNSIAVLCNLVMGLALISLCTWAYVKYSGEFREIGTMIDQVAETLWEQVLKPLGDNLMEENVRQSVTNSIKAGLTDQVSHHARLKTD	890017	941206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_890157_913387_913633_925098_925234_925500_925606_928657_928709_928987_929045_930558_930652_933158_933298_934106_934235_935350_935408_936330_936403_937491_937924_939975
873983	contig_16622_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_48518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGTACCGATCAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225196	226876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_225200_226900
873984	contig_19957_pilon	-	2878	2	Intergenic	novelGene_57687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAGAAAAGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89523	86596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_88476_88524
873985	contig_1076_pilon	+	3893	22	Intergenic	novelGene_101122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_21	15.9212916669682	81	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	828	2487	70	2556	671438	704248	FALSE	20	TGAGGTTGTTTCATGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLYKNQELLQDLSEVNDENTQLMEILNTLFFLPIRRLHNYAKVLLKLAACFEVTSPEYQKLQDSSSCYESLALHLGRKRKEAEYTLGFWKTFPGKMTDSLRKPERRLLCESSNRALSLQHAGRFSVNWFILFNDALVHAQFSTHHVFPLATLWAEPLSEEAGGVNGLKITTPEEQFSLISSTPQEKTKWLRAISQAVDQALRGTSDLPPYGSGSSIQRQEPPISRSAKYTFYKDPRLKDATYNGRWLSGKPHGRGVLKWPDGKMYSGMFRNGLEDGYGEYRILNKALNKEDHYVGHWKEGKMCGQGIYSYASGEVFEGCFQDNMRHGHGLLRSGKLTSSSPSMFIGQWVMDKKAGYGVFDDITRGEKYMGMWQDDVCQGNGVVVTQFGLYYEGNFNLNKMMGNGVLLSEDDTIYEGEFSDDWTLSGKGTLTMPNGDYVEGFFSGEWGSGIKITGTYFKPSLYESDKDRPKVFRKLGNLAVSADEKWKAVFDECWRQLGCEIPGQGEVWKAWDNIAVALTTSRRQHRDSPDILSRSQTQTLESLEFIPYHVGAFSVEKYDDIKKYLIKACDTPLHPLGRLVETLVAVYRMTYVGVGANRRLLQEAVKEIKSYLKRIFQLVRFLFPELPEEGSTIPLSAPLPTERKSFCTGKSDSRSESPEPGYVVTSSGLLLPVLLPRLYPPLFMLYALDNDREEDIYWECVLRLNKQPDTALLGFLGVQRKFWPVTLSILGESKKVLPTTKDACFASAVECLQQISTTFTPSDKLKVIQQTFEEISQSVLATLQEDFLWSMDDLFPVFLYVVLRARIRNLGSEVHLIEDLMDPYLQHGEQGIMFTTLKACYYQIQREKLN	671368	705585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_671531_675402_675535_675922_676052_676898_676970_677365_677433_677770_677974_678087_678154_679056_679156_679694_679860_680907_681020_681237_681316_684338_684473_685552_685721_697076_697195_698283_698442_700233_700357_700867_701045_701975_702022_702243_702306_702868_703019_703821_703919_704209
873986	contig_8377_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_35009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAATAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68194	69356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68200_69400
873987	contig_2854_pilon	-	4239	2	Intergenic	novelGene_120859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_1	0	133	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	83	598	356512	347726	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVNPIQIPSRLPLLLTHEGVLLPGSTMRTSVDSARNLQLVRSRLLKGTSLQSTILGVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQVSCLYLPFSLVPLLP	356594	344084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_348009_356279
873988	contig_16411_pilon	-	2811	8	Intergenic	novelGene_77271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGGGGAGAAAAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45393	18705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_18809_20429_20513_21949_22080_26145_26187_30828_30983_35168_35237_41191_41247_43216
873989	contig_3942_pilon	+	705	4	Intergenic	novelGene_128651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1240.75093749265	37	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	27	563	176987	179974	FALSE	25	GATGATGGGGGCCCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKASGTLREYKVVGRCLPNPKCKTPPLYRMRIFAPNHVVAKSRFWYFVSQLKKMKKSSGEIVYWLRYDSRSGTHNMYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHVSVQVPWGLEEGGDGSFREADGGSHTSVALEEVQRPLAGYSPRLLLLFP	176960	180116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178482_179089_179177_179714
873990	contig_7513_pilon	-	2471	13	Intergenic	novelGene_88951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	99.8419236704813	7	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	604	1629	169694	146994	TRUE	80	AAAGAAAAAAAAAAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVLDFKSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQESGQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASFNTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSILYGGQEQSDCHPRAGCLGHEKQAVSHGHRDQGVGHRLLRPPAPVHRSPPEVLHGAAQKDLPRRRHAHPGPAVLLQVRPGRRQRGAHVPAPEEHLCRPAAGGGHPAWQDPRLRCVTPMCAARARCPSLHRLTTLTW	185683	145966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147067_161074_161260_163896_164031_164682_164807_164928_165049_166132_166281_167532_167621_168455_168591_169675_169813_170651_170838_176153_176275_185505
873992	contig_6227_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_49812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACTTAGCTTTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327675	1325051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1325100_1327700
873993	contig_4812_pilon	+	2659	16	Intergenic	novelGene_103694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_12	51.2625485992346	49	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	120	1934	247841	299702	FALSE	55	GGCTTTAGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPRRRCRAGSPRSPGSGPPPYRGPLHPTPAEGRGAAAMAEAALLLLPEAAAERDAREKLALWDRRPDTTAPLTDRQTDSVLELKAAVENLPVPTELPIEDLSSLSSQSLPISLTSVVPESTEDILMKGFTSLEMEEERIETAQQFFSWFAKLQTQMDQDEGTKYRQMRDYLSGFQEQCDAILNDVNSALQHLESLQKQYLFVSNKTGTLHEACEQLLKEQSELVDLAENIQQKLSYFNVLETINTKLNSPTLSVNSEGFIPMLAKLDDCITYISSHPSFKDYPVYLLKFKQCLSKALHLMKSYTVNTLQNLTNQLLKRDPSSVPNADNAFTLFYVKFRAAGPKVRTLIEQIEQRSEKMPEYQQVLNDIHQCYLDQRELLLGPSITCTVTELTSQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEEIAQSLKEEQKKVPSEASFSDVQLEEAESNSLTKSGSTESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKV	247721	300427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_248015_262508_262656_264352_264415_265584_265751_266428_266504_267603_267697_268733_268860_270334_270416_274401_274446_274901_275029_276398_276491_277571_277712_279166_279328_287773_287880_296906_297032_299606
873994	contig_17769_pilon	+	2463	3	Intergenic	novelGene_124254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	107	junction_2	10	442	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTAAGTAGGAGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84409	89517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_84478_84577_84688_87232
873995	contig_7870_pilon	+	1724	2	Intergenic	novelGene_108992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATAGGATACAGTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446491	450871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_446904_449559
873996	contig_14796_pilon	+	1521	1	Intergenic	novelGene_159372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATGTAAATTGTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153748	155269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_153700_155300
873997	contig_3601_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_132959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	897	1283	1127379	1126993	NA	15	CATGACAGTCTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLGIGCHLVIFCVILSFSALELWSQWSKQKKSWRKPRPRSKRWPRPFCSRLRLRAWWTPSTQETRSPLGHCGVWASRRPQAGHREHKGERVDIYGVDTDQMVTVRRMLIISKKKTQLEAQDLIVFF	1128275	1125869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1125900_1128300
873998	contig_11498_pilon	+	1333	8	Intergenic	novelGene_65497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	61.1361812109754	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	633	782	54400	54549	TRUE	35	AATAAAATGTGTGCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSPEFGSSERLGSWRDKEGDARPGAAGGQESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLRDRGYIKDQVFGCALAVLCERERSQVPRFVQQCIRTVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFCKFIAAIKLQDQAQRSRCVRDLVCSLPTPNHYTLRLLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPQTEEISMPMTMVFQNQVVELILQQCSYIFGPH	53007	56021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_53089_53212_53318_53388_53488_53685_53764_53857_53993_54158_54265_54371_54996_55916
873999	contig_6102_pilon	-	1639	8	Intergenic	novelGene_32248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.49094761447	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	285	899	1303810	1301592	FALSE	25	CAACGTGTCTATTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPEPQMPAMVPTYDHGMAPDSSMSMQLGSDMVPQVYPPHSHSIPSYQALSPEESVNVLPAFQEPHLQMPPNLSQMSLSYDQPQEHAVPTPEPLLCSDVAMAEEGCLSQQVGGFPQGTWVSEDMFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGEPGGGPLGVQPLLQPSLYGQSGISLSHLDLRANPSW	1304635	1300851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1301782_1301869_1301980_1302095_1302151_1303242_1303336_1303530_1303642_1303754_1303819_1304033_1304181_1304506
874000	contig_14151_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_171838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTCCTCTGCCGGTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160352	162467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14151_pilon_+_160400_162500
874001	contig_9290_pilon	-	5083	15	Intergenic	novelGene_77517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	59.014180239903	167	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1499	4500	271	4770	238147	134901	FALSE	40	GAAGCAAGCACAGAGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHECGYSISELNEDDRRKVEEIKAKLFGHRRTTDLSQGLQSPQGIGCKPEAVCSHIIIESHEKGCFRTLTTQQTQLDSHPCVFRSDEPEEMIREQQGPSSWRARHINLSKSVDQNNPRFKVWNSLQLRSHSPFQNFTADNFKISKDLRVPFHEKTDPWLSELVEPACVPPEEMDFHSSSQMLPPEPVKKLTTSITFSSHRHSKCISDSSVFKVGVTEGSTGAPVGVFNSHFTEEQNPIRDQKQKTSSSSSVKMYSHSPDTDLTVLAESDRQSQKLPVDFEHSHQEEKLLEVSDFKVSHSEPSPIANCSNFISMGRLSSTLGVKEKNVTITPDLPSLIFLEQRELFEQCKAPHADNHYIRKNHSPPPQHQDYVAPDLPSRIFLEQRELFEQSKASHVDYQMREYHSPIPQGQDCIALDLPCDIFLEQRELFEQSKDPCVDHHVKKHHSPFPQDQECVVEKDNQHKPKSHSSNMVNVEAKFNNTISQSFPNHCTPPSNRKALSCVRITLSPKTPSKLDSGTLDKRLHSLDSVCKSRMNREFNSELQTISSRSLEPTSESKSSLDVQVVHFPLTDCSTITQDLKIRPQNSQIVTSRQTQVNISDLEGYFNPEGTPVSADRPPEEIVTPFSAFPEKLSSDAVTQITTESPEKTSFSSEIFINTEDRERKIPESHPQQVYKVPIRFASSSSVQQITTSRGTEAQPSLLPYKPSGSTKMYYVPQLEKIPQFPDAKSDTTLESSHSGSDDAIAPDFPAQVLGTRNDDLSDTVNIKHKEGIYSKRAVTEPSWSVGKKPFQKDTAVQVSITGDEDLSDKKLTKPTSPEEKDSAGCSAAKEHSAEVQDRKIENLPDIKAIKQKEEICSKRTVPKTALTKETESLQMDTAESRCHSEFENTTHSVFRSAQFYFHHPVHLPNDQDFCHESLGRGVFMRHSWKDVFQRHPDKHKELSCLSPHCQTVDKTKMDYTRIESLRIDVNLGNKEMMHTTKSQARDHLKYNRQINDLKRDHKVTPEPTTQGTVSLNELWNRYQERQRQQKPPEFGDRKELSLVERLDRLAKLLQNPITHSLQASESTYDGSREERDVKEWSSSRQQQQKSKLQEKKRYKGLEKCRKNVGDLKKSNILSTHQAEGPNQIKFEHIKFNKYILRKQPGFNYISNTSSDSRPSEESELFTDTTTNIFSTTTSPVESEYLTQTDKEVAMHERSSSISTIDTARLIQAFGHERVCLSPRQVKLYSTITNQQRRCLEKRCKQSKKAVNTGHFHVTAEYTGRKNIQMEDQMISSDSVSSSASSFWSSSPILCGKQNVQMLNKGVQAGNLEIVNGARKHTRDVGVTFPTPSSSEARLEEDSDVSSSLSEEKHEEKRFLASYPLDKKLRKNKPNCCEGISWFVPVENLKSGPKKENLLKSYGPGISWFEPITNAKPWREPLREKNWQAQRMDCRGCLADPCRGECVHPLKPFVRASLQESLQFHRPDFISRSGERIKRLKLIVQERKLQNVLQSERDALFNTGRDCQGCQDRMCPPPRPGFLAAQKSRTIGKKEMIQRSKRMYEQLPEVQKRKEEEKRRSEYKSYRLRAQLYKKKVTNELLGRKVPWD	243020	134587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_134946_136024_136125_140379_140444_141333_141518_143084_143327_143626_143834_147206_147328_178328_179498_186273_186439_189193_189278_195021_195193_208607_208734_216440_216683_236567_238307_242909
874002	contig_1150_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_61390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	35420	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309918	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
874003	contig_5039_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_65053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTGTGGACTCGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1823489	1825596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1823500_1825600
874004	contig_4686_pilon	-	3676	1	Intergenic	novelGene_118583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGAATAGCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782906	779230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_779200_782900
874005	contig_1986_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_64157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398515	400950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_398500_401000
874006	contig_6228_pilon	+	3432	1	Intergenic	novelGene_164492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGGACAGAGTAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189566	192998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_189600_193000
874007	contig_8259_pilon	-	2991	9	Intergenic	novelGene_148867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	45.661629132128	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	82	1218	167682	148681	FALSE	20	TATGTTTAGTATGTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNKDEAERCISIALKAIQSNQPDRALRFLEKAQRLYPTPRVRTLIESLSQKPQPAGDQPQPTGTTCATRRKASGPEVPSANGEAGGGESTKGYTAEQVAAVKRVKQCKDYYEILGVSRGASEEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATEAFKAIGTAYAVLSNPEKRKQYDQFGDDKSQAARHGHGHGDYHRGFEADISPEDLFNMFFGGGFPSSNVHVYSNGRMRYTYQQRQDRRENQGDGGLGVFVQLMPILILILVSALSQLMVSSPPYSLSPRPSVGHVHRRVTDHLNVIYYVADSFSKEYTGSSLKTVERNVEDDYIANLRNNCWKEKQQKEGLLYRARYFGDTDMYHKAQKMGTPSCNRLSETMKSLENLW	167763	146907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_148711_149820_149919_150404_150578_151958_152069_153140_153221_153351_153538_155598_155745_156985_157167_167549
874008	contig_17198_pilon	+	3895	1	Intergenic	novelGene_62370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	617	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCGCCCGTCTGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818531	822426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_818500_822400
874009	contig_21388_pilon	-	2503	4	Intergenic	novelGene_136619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	99	503	20174	19770	TRUE	5	CGGGTCGGCTCCTCTCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGNWARGHQWESLGHEDGGRTEAAGPLPASGHQAAAEAGTGRDCDLPAAAGQELLQGAETETEASELAGAAQGSISGVETQAGASPPGGPLLLFVTSPVPELAEEPRLARKQPHHRGSRKLMIATTAKTSRK	20272	16531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_16613_16992_17077_17452_17554_18035
874010	contig_6677_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_114174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434454	436571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_434500_436600
874011	contig_4754_pilon	+	3046	4	Intergenic	novelGene_35880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.6846079563875	1117	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	165	1790	9354	206880	FALSE	20	CCACACCTCGCACTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVSQEKKKMVKAQESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLYWDVMLENYSNLMSIGYQVTKPDALSRLRRGELPWSILDEIDSRNFLEIWKADDHLPGHSQNEWVNRMEKCHEHNAYEYIFNQHKSHFTLHQNDGMFDLLGKTIKSNLSLISHSRSYGVKNSAELNGDEKTFPHANHEQFHMEIKFSESQKSNSMKSQLIKHKRTHKIEKSHVCSECGKAFIKKSWLTDHQIIHTGEKPHRCNLCGKAFSRKFMLTEHQRTHTGEKPYECTECGKAFLKKSRLNIHQKTHTGEKPYTCSECGKGFIQKGNLIVHQRIHTGEKPYICSDCGKGFIQKTCLIAHQRFHTGKTPFVCSECGKSCSQKSGLIKHQRIHTGEKPFQCSDCGKAFATKQKLIVHQRTHTGERPYGCTECGKTFAYMSCLVKHKRIHTREKHVDSVKVEAPSAVRHSSSHTSDLMQDENPVNKATIQMPSVAAQTSVDISGILPNRNIVIVRQPVARCEPSGDNREFVQERNIMNAVNVVVPSVINYILYYVTENP	9189	208136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_9399_65961_66089_168552_168649_205522
874012	contig_4211_pilon	-	3765	1	Intergenic	novelGene_80241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	505	804	1128964	1128665	NA	20	AGATTTCTGTTGGATGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYETFAVKLTHIKSLGMIKRKGYIFMESSAQGVTGCSNQEKREGSRGKGRGKKGGRERGRSSVERKGGHLQLSHMSGTCSRTTKQINISPHELYTKSKY	1129468	1125703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1125700_1129500
874013	contig_16650_pilon	-	2286	2	Intergenic	novelGene_61958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	764	1150	242153	241767	FALSE	35	AGAAAACTGATGTTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLCCSRLHRQLLNHSKPVGSPGSDCWDYQKQSQERKESPFLCLQELGLCSSISCFWLNTLFRAGTIWKRLPNQEEALPGNTVHCFQAKESWLLNPGLMTHSHTVTLGSLCIPSRVLSLHLGTTYHC	243568	240630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_-_242167_242818
874014	contig_8476_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_121343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1811	2122	142318	142007	NA	0	CTGCTTCTCTTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRQLNIYLLERGLDWRYKLGQSSQPNSTRIACRRSEQGGKECQRKVLYLWGNQDKLGLKGRTGLKQGERMGKHITNKFQVVLGCVWSVEEIMNRPIWLKWK	144128	141692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_141700_144100
874015	contig_14142_pilon	-	2958	21	Intergenic	novelGene_120432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	249.2693523079	26	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	966	2898	60	2957	50693	41739	FALSE	30	TCAACGAGATCTGGCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKASGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASTTNSPCTSKPATPAPSEKGDGIRTPLEKDEAENQEEKPEKESRIGEKMETEPDAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPGVPGEMETEPGYPGDREKSAEDVKGDRELRPGPPRDEPRSNGRREEKAEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGK	50752	41737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_41792_42170_42303_42706_42843_42947_43070_43193_43357_43521_43667_44236_44371_44525_44612_45096_45163_45630_45809_46300_46468_46784_47017_47208_47334_47556_47675_48311_48444_48666_48809_48945_49120_49255_49378_49654_49793_50171_50373_50561
874016	contig_20759_pilon	-	4175	11	Intergenic	novelGene_163721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	66	junction_8	37.0836891368699	273	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	204	1007	32795	21713	FALSE	10	GACTTCTGGGTTTTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STQGIQELLDVAKQEIPFDFWKVTPLVLKATAGLRLLPGEKAQKLLQKVEEVFKASPFLVREDCVSIMNGTDEGVSAWITVNFLTGSLKAPGRSSVGMLDLGGGSTQITFLPSLQGTLQTSPASYITLLQMFNRTYQLYSYSYLGLGLMSARLALLGGVEGQPATDGKELVSPCLPPGFRGEWEHAEVTYRISGEKAAANPHELCASRVSEILRGKVHRTEEVKHMDFYAFSYYYDLAAQVGLIDAERGGSLVVGDFEIAAKYVCRTMETHTQTNPFVCMDLTYVSLLLQEFGFPGNKVLKLTRKIDDIETSWALGAIFHYMDSLSRPKGPANE	34543	18544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20759_pilon_-_21815_22035_22149_23194_23252_25427_25569_27098_27201_28722_28788_29585_29666_30994_31084_32070_32107_32776_32853_34397
874017	contig_10523_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_120957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTAGCCAAGTTGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54670	58071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_54700_58100
874018	contig_17042_pilon	+	2760	1	Intergenic	novelGene_140178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATAGGGAAATGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1436	4196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_1400_4200
874019	contig_990_pilon	+	1383	3	Intergenic	novelGene_76040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	172	441	849937	850206	TRUE	55	GAGTATTACAATAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLQQPRRSRIWNPHGVSCKREPEQTRQWPLSRCVQLPSIHVTSRLSWKNKNLKESQMQMSICPMLMFNFEVRDPPDNTMNTPRRIYKILLILLEDSRISPETHAWSNPRFRTPALETAFVWAFPRSKTKFLSYAFEDQKNDKSRA	849765	853026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_850717_851834_851904_852663
874020	contig_10324_pilon	-	2693	10	Intergenic	novelGene_7852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_7	31.5735472965723	290	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	123	1067	348024	343617	TRUE	10	TTGAGCCACCGCCGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAADELTFHEFQEATDLLAETPDAVTTSKNDQPTPQGHVAVAMGLGGSYGAEEEVEEESDKAALLQGEKQQPGFWTFGYYQSFFDVDTSQVLDRIKGSLLPWPGHNFVRHHLRSRPDLYGPFWICATLAFVLAITGNLTLLLAQRRDPSIHYSPQFHKVTVAGITIYCYAWLVPLALWGFLQWRKGVRERMGPYTFLETVCIYGYSLFIFIPTVVLWLIPVPWLQWLFGVLALALSAAGLVFALWPVVREDSRLAAAALLSTVVLLHTLLALGCKLYFFQPLPPEHMAPPPQATSLHPHTLLPPTLPRSITAS	348288	341914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_343522_343597_343734_343821_344005_344089_344257_344348_344466_345789_345878_347257_347339_347429_347591_347993_348055_348196
874021	contig_10424_pilon	-	2205	21	Intergenic	novelGene_56809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	176.932324632895	2	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	17	1480	347192	312412	TRUE	25	AGAGTCTTGATGATGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKTPGGSQKASSKTRSSDVHSSGSSDAHMDSSGPSDSDLPSRTRPKSPRKHNYRNESTRENLCDSPHQNLSRPLLENKLKAFSIGKMSTAKRTLSKKEQEELKKKEDEKAAAEIYEEFLAAFEGSDGNKVKTFVRGGVVNAAKEEHETDEKRGKIYKPSSRFADQKNPPNQSSNERPPSLLVIETKKPPLKKGEKEKKKSNLELFKEELKQIQEERDERHKTKGRLSRFEPPQSDSDGQRRSMDAPSRRNRSSVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQARGFSN	347208	305678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312502_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319758_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323828_324272_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
874022	contig_854_pilon	-	1850	18	Intergenic	novelGene_36111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	150.035497529855	94	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	100	1791	128373	116529	TRUE	15	CCAGCAACCGCTCCTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPGPAALRAEAGWAGGCCALTPTPIRSPQPGPKMMKRQLHRMRQLAHTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRASHNVHKRLQACLQGQSGADMDKRVKKLPLMALSAAMAESFKELDPDSSMGKALEMSCVIQNQLACIVAEFEMALEKDVLQPLSRLSEEELPAILKRKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQAAKNSGGGQVLGGVPGSYSHITTANKVETLKEEEEELKRKVEQCKDEYLADLYHFATKEDTYANYFIHILEIQADYHRKSLSSLDTALAELRENHSQADPSPSMMAAPFSRVYGVSLGIHLQEQGRDIALPIEACVVMLLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPCSLGEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFDLYDDWMRAASLKEPGARLEALRKVCSRLPYENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTPSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQNADTLFPGDINFNISGLFSALAPQDKVSNRPASEELPAVAVPTPATTLAPALAPALAPAPAPTPASVATKERTESEAPPQTSLPPRSTGAPQRQLPQQRT	128472	115017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_115068_116519_116617_117827_118018_118347_118446_119175_119293_120021_120103_120185_120268_120644_120757_122278_122425_122865_122957_123125_123195_123749_123895_124290_124368_124458_124571_124821_124899_126524_126630_127064_127108_128314
874023	contig_205_pilon	-	5077	1	Intergenic	novelGene_144325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2234	2545	306729	306418	NA	20	CCCCATAGTGTTCTTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFEIKCTNSVCGMKEHLGMRQKERTRRPFPSSFFFFWVVLTSVLKKEGSSLPMSEQGLLNNTYSKMGAMMVQWLSIWLVTIRSAVQIHQPLLGNPMGQFYSL	308962	303885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_303900_309000
874024	contig_2236_pilon	+	2376	15	Intergenic	novelGene_98680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	64.6103312014355	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	71	1588	41032	69291	TRUE	65	AACACTGATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVLLPQFLAASHGVPVALSPGKMAAPEQPLPKSRGCQSSASFSPPRGDRTLLVRHLPAELTAEEKEDLLKYFGAQSVRVLSDKGRLKHTAFATFPNEKAAIKALTRLHQLKLLGHTLVVEFAKEQDQVHSLLSSSNTEKKKRSDDPVEDDKEKKEFGCLTIENGIAPNHGLSFPLNSCLKYMYPPPSSTILANIVNALASVPKFYVQVLHLMNKMNLPTPFGPITARPPLYEDYMPLHAPLPPASPQPPEEPPLPDEDEELSSKESEYESSDDEDRQRMTKLMELANLQPKRPKTIKQRHVRKKRKIKDMLNIPSSASHSNLHPVLLPSDVFDQPQPVGNKKIEFHISTGMPATFKKDLEKEQNCEEQNYGFGKIFPAPNLNITEEMKEDSDEMPSEFISRKELKKGRISREEMETLSIFRSYEPGEPNCRIYVKNLAKHVQEKDLKFIFGRYVDFSSETERIMFDIRLMKEGRMKGQAFIGLPNETAAAKALKEANGYVLFGKPMVVQFARSARPKQDSKEGKRKC	40961	71205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_41224_43195_43244_49203_49323_50578_50663_52493_52606_53481_53551_54643_54787_57723_57850_61109_61262_63817_63944_64983_65079_65166_65226_67930_68064_69231_69298_70423
874025	contig_12292_pilon	-	2791	1	Intergenic	novelGene_167012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	218	319	334117	334016	NA	45	AGACCCAGTAAGAGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALEVLWGNSAVSCRVVTSQNRLDGNGLFGLFNLHYVGKGIIISFRVQWNFTNCFEFPNAKRYACLGRSTTRMLLRSKDGKPTSHTLGVLSGGISPWRKTLCLVK	334334	331543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_331500_334300
874026	contig_266_pilon	+	4840	18	Intergenic	novelGene_166294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	36.43603676426	193	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	976	2931	88	3018	477087	652274	FALSE	15	CATCTCTGTTGTTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLKAKFRKTDINEWNKNDDRLLQAVENGDTEKVASLLGKKGASATKQDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMVTHGVDVTAQDTAGHSALHLAAKNSHHECIKKLLQSKCPAESIDGSGKTALHYAAAQGCLQAVQVLCEHKSPVNLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEVCRFLLDHGADVNSRDKNGRTALMLACEIGSSNIVEALIKKGADLNLVDSLGHNALHYSKLSENAGIQSLLLSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPAQLSDVSSPRSITSTPLSGKGSVFFTEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLVLLQAKVASLTLHNKELQDKLQAKTPKEADADSYHSTQTDLAPCVGTPSETSSPDYKSPPPALTQSLGKSTTDSDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAEKKQLQTELQSRGTELVCFNNAEISENGSNLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMTLGLVSPEGVESYPHLHELRVTEEEIVVLKQDLQNALEENERNKEKVRELEGKLEERDKSVVIKPTAEEFEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFGKYQEAQEEIMKLKDTLKSQTAQEASDETEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELEDYRKRKSLEDVTADYIHKVEHEKLLQMTNVSRAKAEEALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTTAKEMEDKTSSLKEQLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTEAMVPRSSYEKLKSSLESEVSVLASKLKDSVKEKEKARSEAAQIRSEVSQIKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQSQEELAEMKRSSESSSKLEEDKDKKINEMAKEVTKLKEALNSLSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK	444708	654096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_+_444748_477038_477123_573833_573965_598450_598540_609413_609479_614767_614826_616720_616792_619947_620055_621178_621358_621571_621601_622653_622741_623875_623963_629912_629968_636636_636756_637798_639323_641786_641937_651328_651395_652196
874027	contig_5669_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_86107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTCTCTTGGGAGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420292	426255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_421935_425669
874028	contig_11364_pilon	+	2993	22	Intergenic	novelGene_65164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	91	573	84806	85288	TRUE	15	CGGCTCAGGGGCTCGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIYLGWACLGTGAPPWGERHDHGVTAFCKEHQTVFVSIVWDAPFLSCNSELRNAREGKRGGWGPYDLDARETRTQMFCDRDIQRWYDGGRKKAQMEPLFTGHPDSGPEPLHGTPGRNSMLWGTLTVPKPLGFLLRGLCSGQGPTGRPWTWRLKLQAGT	84715	148582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_85591_86484_86592_90472_90678_92018_92115_92229_92326_94547_94667_94954_95054_95295_95381_96227_96324_96998_97052_97849_97899_98275_98314_98863_98984_99697_99799_100387_100461_101040_101184_101804_101857_102055_102119_113990_114074_115473_115557_116110_116292_148406
874029	contig_12886_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_135529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1410	1832	834858	835280	NA	20	TGAGATGAGCTGCCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGKEWPVRSPPSRPPGGRRPEARTQPNAAIPSHLLDAFLQLQPPPPDTLILGGAGFHDSSLVTKAERDGQDCHPGNREALASLPLPTVLFTAPCTLRPVPEQNCRASPSGLHRYLIRPAPCCTPPWPASSGASKSSAE	833448	835995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_833400_836000
874030	contig_3161_pilon	-	2694	6	Intergenic	novelGene_84514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	550	junction_1	36.2965563104821	71	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	22	750	421224	374198	FALSE	80	ACCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEVGTVDKFHLLMYFYSLQYISSILIVYTYFFLGDIQELAF	421245	372253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_374413_390456_390565_391487_391597_409839_409951_411483_411547_421101
874031	contig_6710_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_96782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	25	GAAAATGCCTTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
874032	contig_6823_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_131259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCAGTACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511774	508503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_508500_511800
874033	contig_821_pilon	-	2884	1	Intergenic	novelGene_149414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCATTGGAGCAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246431	243547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_243500_246400
874035	contig_9843_pilon	-	2378	6	Intergenic	novelGene_114329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGAGACCAGCGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121892	107328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_107446_108429_108503_111440_111502_111583_111710_117712_117881_120059
874036	contig_6589_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_26093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	1875806	1875453	NA	5	CTCTCTCCCTGGGTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLHSELTFLSPAYNCPSFPSSPWSNSKVCSPCYLAPADLFSLFCHCPLLLPSPPHGHSALATLSYSLFFLQALHVCHFSLENSLPATLFLKNSHSSKSRVLSSREPHCPSQTRSGTS	1875806	1873125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1873100_1875800
874037	contig_17042_pilon	+	2772	1	Intergenic	novelGene_140185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48919	51691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_48900_51700
874038	contig_2043_pilon	-	3944	1	Intergenic	novelGene_169916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705952	702008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_702000_706000
874039	contig_13481_pilon	+	4380	1	Intergenic	novelGene_119373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGCAAGCCACAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486214	490594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_486200_490600
874040	contig_10197_pilon	-	4118	30	Intergenic	novelGene_115251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	33.6032315415597	169	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	46	2937	1028025	1014287	FALSE	15	GCATTGGTGTCTTGTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKKLLQFYAETCPAPARGGAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALNVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLIRLLGVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVAKINRSLASKDTESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTIKHHPHFLTHKMADQRTRKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSENPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFRMSLLQLVEILKSKEPAYIRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLMENLRVRRAGFAYRRKYEVFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLLVKRSATCIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAETIRRLIRGFILRHAPHCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNILDTSWPTPPPALHEASELLRELCMKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPKVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRPRQLLLTPSAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQREDNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSADRVNNININQGSITFAGGPGRDGIIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR	1028070	1013105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1014314_1014730_1014831_1014941_1015040_1015135_1015207_1015283_1015420_1015566_1015623_1015712_1015807_1016500_1016585_1016870_1017031_1017125_1017211_1017306_1017376_1017668_1017746_1017818_1017933_1018531_1018650_1018750_1018857_1021229_1021311_1021442_1021490_1021569_1021665_1023075_1023168_1023432_1023514_1023611_1023718_1023932_1024016_1024130_1024251_1025018_1025091_1025177_1025292_1025476_1025576_1025659_1025840_1027014_1027096_1027174_1027374_1027978
874041	contig_6488_pilon	+	2188	7	Intergenic	novelGene_44774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	68.8565336204359	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	68	505	254660	267670	FALSE	20	TAAAGGCCTCTTCTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAVDEACKQPCTTPRADCGHPCMAPCHSNSPCPVTACKAKVELQCECGRRKEIMICSEASSTYQRIAAISMASKITDMQLGDSVEITLITKKEIHQARLECDEECSALERKKRLAEAFHISDDSDPFNIRSLGSKFSDNLKEDARKDLKFVSDIEKERILGAVIYRK	254592	269353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_254714_255654_255729_257566_257666_258586_258629_263447_263547_264155_264194_267638
874042	contig_16506_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_166555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	600	1256	31979	32635	NA	30	AAGGGATTACTTTTATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRCGGRLINNLHYADNTTLLAESEEDLKHLLMMIKDYSFQYGLHLNIKKAKILTTGPKSNIMINGEKTEVVKDFILLGSTVNTHGSRSQEIKRHIALGKSAAKDFFKVLKSKHVTLKNKVHLTQAIVFSIASYACKSWTVNKEDQRIDAFELCYWRRTLNIPGTARRTNKSVLEEVQPECSLEARMLRVCLTYFGHIMRKDQSLEMDIMLDKVEGQ	31379	33565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16506_pilon_+_31400_33600
874043	contig_7165_pilon	-	2107	9	Intergenic	novelGene_116826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	390	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAACTAACTTCCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257210	231751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_232049_233709_233872_238291_238413_239902_239988_245487_245599_254161_254310_255044_255138_255598_255653_256174
874044	contig_10892_pilon	+	2798	1	Intergenic	novelGene_116762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGAATACATAAGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185330	188128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_185300_188100
874045	contig_6552_pilon	-	2459	18	Intergenic	novelGene_163598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	155.67811259289	24	74	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	392	1252	151597	129462	TRUE	35	GAAACAAGAGCTGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKYHPKFWADGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNIFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPPEEEDNSEEVVVAMYDFQALEKNDVHWWRARDKYGREGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGMYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIVEYHKHNAAGLATRLRYPVSVKVKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKTIREGAMCEEDFIEEAKLMM	201673	117967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_118640_120607_120766_120845_120965_123920_123986_129130_129320_129457_129638_130619_130695_131249_131384_132497_132578_136022_136078_140430_140497_147956_148005_148052_148133_149263_149305_151491_151621_152328_152404_157736_157842_201485
874046	contig_15236_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_141659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAATACCTATTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717992	715829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_715800_718000
874047	contig_15413_pilon	+	1781	2	Intergenic	novelGene_176954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGATTTGAACTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66989	73289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15413_pilon_+_67870_72388
874048	contig_17885_pilon	-	2491	4	Intergenic	novelGene_177952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	4.10960933531265	137	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	142	1683	28384	24073	FALSE	60	TCCCAACAAACAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRALSTLVTQDPQEQELIVVKVEEGLSWGQKSKQDGSAQSCQEMFRQQFRKFCYKETPGPREALGRLHELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQVWLQQQSPKSGEEAVTLLEDLEREFDDPRQQVPASLQGPAVPWKDLTSLGASQESTNVQLQPLKTQLKSWEPCLSLRSDCENKESATKEEVLGEKSQGLTLEPSFQEVSEHENHLEWQQGSATGEKLRRSPSQGNSFSQVVFTHDSLGKRDHHDNPQRSMILSTNSVAYQKVHTEERPYRCDICGHSFTQHYTLTQHQRIHTGEKPYKCNQCGKAFSLSSYLIIHQRIHSGEKAYKCSECGKAFNQRSALIRHRKIHTGEKACICNECGKAFSQSSYLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSLSSNLIRHQRIHSGEEPYQCNECGKTFSQNSDLIIHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSLSSNLIRHQRIHSGKEPYQCNECGKAFKRSSALTQHQRLHSGDAAYTYI	29802	23264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17885_pilon_-_25059_27557_27700_27970_28475_29751
874049	contig_15114_pilon	-	2089	9	Intergenic	novelGene_121145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_8	210.513509067708	97	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	171	1703	154964	129689	FALSE	65	GAGAAAAAAGGAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSQNASAIRPLNLYPWVYISLVFGASLALPDKACTFKVALQNFQTIFSWELKNHSIVPTHYTLWYTIMSKYEDMKIVEDCTNITRLFCDLTGLWDNMPETYIPRVVGFKGNTVLVSCIDSVFLPMNMTLEPPDFEIVGSADHINVIVKFPSRAPKTIDVERLQHHFYLIIEQRSEEMVKKHKPRINGNITGDFIYVMDKLIPNTNYCVSIYFEPKNLGTITKSPLKCALLPGQEPESSESAKIGGIITAFLIATVFISSVVTLKRTGYLCLRLDLPSALNFSNRPTRIFLELPPLEAVDTVEVIYVSRKKKVWDYNYDESDSEEEATPTTSAGGYTRHGLILQPLTQASTSSPDSEESQFTDPDVDEPDLPEDEAEPLLVPGPRAEQSEPASGPCERRASPLQDPFSKKDSSATEGSEDRIIFNVNLNSVFVQALDDDGDVSPMLPEETVDLEDPSEMESSFLIAREDGMPPPFPSPSEECLGSEDASSEESDTSESDADIRDGYIMR	204716	129302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_130379_137049_137181_141879_142046_147669_147831_150654_150828_152061_152177_153332_153375_154909_155006_204587
874050	contig_7695_pilon	+	2740	3	Intergenic	novelGene_41573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTCCTCCCCAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388146	397106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_389016_389790_391259_396703
874051	contig_15628_pilon	+	3527	2	Intergenic	novelGene_147707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	46	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACCACTGTGCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189752	195207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_190019_191946
874052	contig_8541_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_105582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCCTATGTTTAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550700	547840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_547800_550700
874053	contig_14925_pilon	+	2657	1	Intergenic	novelGene_55367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGTCCCAGCCCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125520	128177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_125500_128200
874054	contig_9188_pilon	+	4034	1	Intergenic	novelGene_175724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2422	2730	10311	10619	NA	35	CTTCTGAAAAATCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLSPWLLCSSFLLLLQLCQAPGSTPPPSTQPLRPEWSKAGNLPPLRAPEGFTISFGLYYLPASLYISLLGDPVQSSLLSVPTVSWSCQDGDSRYHGVPPK	7889	11923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9188_pilon_+_7900_11900
874055	contig_16525_pilon	-	630	5	Intergenic	novelGene_133842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	53	493	181436	178157	FALSE	10	CCCTTATCCAGTCTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181488	178019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
874056	contig_6873_pilon	+	3251	1	Intergenic	novelGene_129825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATAACCTTACTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451096	454347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_451100_454300
874057	contig_960_pilon	+	2791	1	Intergenic	novelGene_108258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	786	1118	598385	598717	NA	35	AGGTGTAAGAAGAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIDEAFLSQQPRMVSSLRLALRSPRVPVSFWSEEVFLITIASWIKRGSRFIWSPGGSGVKSLAANQKAGSSNPPATPWKRYGAALFCPAGSRGVEIDLMAMDFVCLFV	597599	600390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_597600_600400
874058	contig_18055_pilon	+	2653	2	Intergenic	novelGene_117834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAGCGAGTAAAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86406	90270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_87191_88401
874059	contig_16211_pilon	-	4228	3	Intergenic	novelGene_150053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	314.5	35	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTCGAAAGCATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84135	73420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73517_79619_80001_80384
874060	contig_3382_pilon	+	1976	1	Intergenic	novelGene_124193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGCTTTGCTGCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991479	993455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_991500_993500
874061	contig_17198_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_62335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCAACCTTTTGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523475	503217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_503936_510932_511028_523459
874062	contig_4686_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_118486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	993	1301	354115	353807	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFELFVLILLSGPQKVASIPPFLSLSQLSPAEPSCSESSEQLFPSNFSCCSSSGSPALSRCQRKTTVVPSPTTLLDHSTPCSDTQMDLLHYKTSRCHLWKCW	355107	352942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_352900_355100
874063	contig_5549_pilon	+	549	5	Intergenic	novelGene_81566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1622.04043953904	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	190	426	86768	96795	FALSE	20	AAATTTTCTTGGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLLDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGSSHLARSTSATLPSLECLWEVGAGAARLAQ	82072	96918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82084_82177_82250_86661_86819_91687_91781_96702
874065	contig_1331_pilon	-	2194	4	Intergenic	novelGene_37885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAAAGGGCAGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483993	466495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_467464_476544_476676_479879_480045_483063
874066	contig_2463_pilon	+	1203	1	Intergenic	novelGene_43032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAAACATTTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521858	523061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_521900_523100
874067	contig_14405_pilon	+	2941	1	Intergenic	novelGene_85682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAAATTCCTATAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986958	989899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_987000_989900
874068	contig_5210_pilon	-	2596	6	Intergenic	novelGene_65414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_2	114.281407061691	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	377	1213	439927	431502	FALSE	25	TCAAATGTGGACAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPIGMYRRAFSYDDALEDPTPMTPPPSDMGSIPWKPVIPERKYQHLAKVEEGEASVSATDSMDKVPVVKAKATHVIMNSLITKQTQESIHRFEQQAGLRDAGYTPHKGLTTEETKYLRVAEALHKLKLQSGEITKEEKQPASAQSTPSSSPHSSPKQKSRGWFTSGSSTALPAPNSSTMDSGSGDKDRNPSDKWSLFGPRSLQKSDSGGFATQAYRGAQKPSPMELMRVQATRMAEDPVAFKPPKMDIPVIEGKKQAPRTHNLKPRDLNVLTPTGF	440303	430118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_431711_431819_431963_432153_432261_434307_434433_436556_436660_439777
874069	contig_13048_pilon	+	2856	1	Intergenic	novelGene_138932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	478	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGATGATGTTTACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478339	481195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_478300_481200
874070	contig_7657_pilon	+	3748	1	Intergenic	novelGene_30049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGTTAAAGAAAGATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323047	326795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_323000_326800
874071	contig_6740_pilon	+	1363	6	Intergenic	novelGene_142639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_3	35.4818263340544	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGCTACACAACTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10143	46945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_10227_11303_11447_16264_16565_19527_19605_44182_44288_46290
874072	contig_7758_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_163536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGTCACTCCCCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147017	145888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_145900_147000
874073	contig_10882_pilon	+	3942	1	Intergenic	novelGene_172754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31528	35470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_31500_35500
874074	contig_16870_pilon	+	5102	21	Intergenic	novelGene_155539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_2	60.443444640424	192	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	368	2716	368019	402023	FALSE	15	AAGTTTTTGTGTGGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDTVNVRRSVRVKTKVPWMPPGKSSARHVGCKWENPPHCLEITPPSSEKLVSVMRLSDLSTEDDDSGHCKMNHYDKKIDSLMNAVGCLKSEVKMQKGERQMAKRFLEERKEELEEVAQELAETEHENTVLRHNIERIKEEKDFTMLQKKHLQQEKECLMSKLVEAEMDGAAAAKQVMALKDTIGKLKTEKQMTCTDINTLTRQKELLLQKLSTFEETNRTLRDLLREQHSKEDSERLMEQQGALLKRLAEADSEKARLLLLLQDKDKEVEELLQEIQCEKAQAKTASELSKSMESMRGHLQAQLRCKEAENSRLCMQIKNLERSGNQHKAEVEAIMEQLKELKQKGDRDKETLKKAIRAQKERAEKSEEYAEHLHVQLADKDLYVAEALSTLESWRSRYNQVVKDKGDLELEIIVLNDRVTDLVNQQQTLEEKMREDRDSLVERLHRQTAEYSAFKLENERLKASFAPMEDKLNQAHLEVQQLKASVKNYEGMIDNYKSQVMKTRLEADEVAAQLERCDKENKILKDEMNKEIEAARRQFQSQLADLQQLPDILKITEAKLAECQDQLQGYERKNIDLTAIISDLRSRIEHQGDKLEMAREKHQASQKQNKQLSLKVDELERKLEATSAQNIEFLQVIAKREEAIHQSQLRLEEKTRECGTLARQLESAIEDARRQVEQTKDHAASKERAAQNKILDLETQLSRTKTELSQLRRSRDDADRRYQSRLQDLKDRLEQSESTNRSMQNYVQFLKSSYANVFGDGPYTTYLTSSPIRSRSPPA	363536	404409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_363639_366640_366732_367563_367720_368000_368127_373398_373570_374562_374724_375607_375738_376276_376409_379903_379976_381128_381201_381324_381442_382288_382475_382992_383103_384936_385073_393643_393755_393929_394035_395000_395160_396495_396597_398121_398285_398721_398848_401834
874075	contig_7895_pilon	+	2851	9	Intergenic	novelGene_154453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_7	63.3017327961881	160	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	130	951	725295	760427	FALSE	45	GGAGGAAGAGAAGAGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRQRASSQRKPARIPSGKAGAESGFLMEVCVDSVESAVNAERGGAGRIELCSGLLEGGTTPSMGVLQVVKQCVQIPVFVMIRPRGGDFLYSDREIEVMKTDIRLAKLYGADGLVFGALTEDGHIDKELCMSLVAICRPLPVTFHRAFDMVHDPVAALETLLTLGFERVLTSGCDSSALEGLPLIKRLIDQAKDRIVVMPGGGITDRNLQRILEGSGATEFHCSARSARDSGMKFRNFCVSMGASLSNSEYSLKVTDVTKVRTLNAIAKNSLV	725165	762327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725356_728162_728235_731583_731644_736187_736398_737188_737225_739538_739673_744310_744339_759397_759504_760312
874076	contig_7644_pilon	-	6719	12	Intergenic	novelGene_64263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_7	87.0801853333234	241	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	133	1962	266298	210276	FALSE	25	TTCACCAGTTTAGAGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASKPVEAAVVAAAAPGSGSGVGGGGGTAVPGTGGLPRWQLALAVGAPLLLGAGAMYLWSRQRRRRDTGGRGDAGGLKRNSERKTPEGRASPAPGSGHPEGPGAHLEMNSLDRAQAAKNKGNKYFKAGKYEQAIQCYTEAISLCPTEKNVDLSTFYQNRAAAFEQLQKWKEVAQDCTKAVELNPKYVKALFRRAKAHEKLDNKKECLEDVTAVCILEGFQNQQSMLLADKVLKLLGKEKAKEKYKNREPLMPSPQFIKSYFSSFTDDIISQPMLKGEKSDEDKDKEGEALEVKENSGYLKAKQYMEEENYDKIISECSKEIDAQGKYMAEALLLRATFYLLIGNANAAKPDLDKVISLKEANVKLRANALIKRGSMYMQQQEPLLSTQDFNTAADIDPQNADVYHHRGQLKILLDQVEEAVADFDECIRLRPESALAQAQKCFALYRQAYTGNNSSQIQAAMKGFEEVIKKFPRCAEGYALYAQALTDQQQFGKADEMYDKCIDLEPDNATTYVHKGLLQLQWKQDLDKGLELISKAIEIDNKCDFAYETMGTIEVQRGNMEKAIDMFNKAINLAKSEMEMAHLYSLCDAAHAQTEVAKKYGLKPPTL	266430	205518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_210430_213132_213256_214264_214363_216360_216478_217833_217942_219230_219366_221804_222013_224417_224567_240999_241110_242596_242724_245056_245231_265971
874077	contig_7840_pilon	-	2099	3	Intergenic	novelGene_68967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTACCTCGGCCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239946	130676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_130707_183030_183150_237996
874078	scaffold_880_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_121454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTCCCCATGACCCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450771	448831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_448800_450800
874079	contig_12728_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_155808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACATTTATTTAGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189228	192127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_+_189200_192100
874080	contig_12635_pilon	-	1097	8	Intergenic	novelGene_60820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	348	junction_6	303.849049526174	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	22	942	219727	180623	FALSE	15	TTAATGAGCCTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSRYVFFQG	219748	180467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680
874081	contig_1867_pilon	-	1844	2	Intergenic	novelGene_54567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	190	297	449733	449626	TRUE	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSHNTAGNCGKRLSSASANTLRNSVGTFKRHFCSPPSGIHCRNTKKENLTQKEQEANENKLGMLKSLKLCTGKQSKIDNFNLNIPELKETLILEHLP	449922	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448484_448561
874082	contig_13558_pilon	+	1241	3	Intergenic	novelGene_123006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.5	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	160	999	40701	41660	FALSE	40	AAAACCTGCAATATTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36703	41902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655_41158_41277
874083	contig_6445_pilon	-	4589	33	Intergenic	novelGene_77135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	32.3997853966658	142	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	2468	4150	1497436	1490860	FALSE	20	CTGTTTATAGACAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTKAKVFSAFITVLQMKEMRVSDIPQYSQLVFNVCETLQEEVIALFDQTRHSLASGNTTEDKDSMETDDCSRPRPKDQRDGVCVLGLHLAKELCEVDEDGDSWLQVTRRLPILPTLFTTLEVSLRMKQNLHFTEASLHLLLTLARTQQGATAVAGAGITQSICLPLLSVYQLSTNGTVQTPSTSRKSLDAPSWPGVYRLSMSLMERLLKTLRYNFLTEALDFVGVHQERTLQCLNAVRTVQSLACLEEADHTVGFILQLSNFMKEWHFHLPQLMRDVQVNLGYLCQACTSLLHSRKMLQHYLQNKNGDVIPSAVAPRVQRPPTAAPAAPAAPAAPTCSASSKQPTADTEASEQRALRTVQYGLLKILSRTLAALRHFTPDVCQILLDQSLDLAEYNFLFALSFTTPTFDSEVAPSFGTLLATVNVALNMLGELDKKKEPLSQAVGLGTQVEGTRTLKSLLMFTMENCFYLLISQAMRYLRDPAVHPRDKQRMKQELSSELSTLLSSLSRYFRRGAPSSPATGVLPSPQGKSTSLCKVSPESQEPLIQLVQAFVRHVQR	1519041	1490420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1491037_1491138_1491269_1491406_1491481_1491743_1491876_1492003_1492259_1492346_1492422_1493234_1493373_1493733_1493893_1494971_1495065_1495258_1495460_1496906_1497089_1497369_1497514_1497782_1497869_1498163_1498242_1499980_1500177_1500582_1500651_1501040_1501111_1501784_1501955_1502056_1502264_1503225_1503327_1504169_1504304_1504635_1504765_1505371_1505439_1505547_1505669_1507990_1508106_1508840_1508918_1509010_1509099_1509375_1509503_1509692_1509846_1512956_1513084_1513657_1513778_1514701_1514768_1518951
874084	contig_5586_pilon	+	2553	1	Intergenic	novelGene_143506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTTTTTTAATATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216519	219072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_216500_219100
874085	contig_13021_pilon	-	3644	3	Intergenic	novelGene_8284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2719	3033	257621	257307	FALSE	45	AGTCATCAAAAGACTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWLSSAAITEILQVDGFNKQKFILSQARTLEVQIQGTRSWGKLSLSALEKEPSHQPSPGLGASQHRDPESKGHTLLTLLSWWYEVPMFLCLLLFSIFQKRLA	266077	256695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_260040_265584_265645_265837
874086	contig_19006_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_145590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2217	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCATGTGTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93489	94323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_93500_94300
874087	contig_10749_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_133490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTAATTGGTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200783	202660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_200800_202700
874089	contig_16532_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_110059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	655	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACGCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581003	577886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_577900_581000
874090	contig_14740_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_174686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTTTTTTTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309219	310754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_309200_310800
874091	contig_9471_pilon	-	4379	1	Intergenic	novelGene_21769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1429	1935	407480	406974	NA	25	ATCTGGAATTTTGCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSCLHPAAILQLGQGGRRRRGRQHGARGASGRPLLECRAWPSPTAQEALLPLSTANNSRDPRHLAKTIITPWQLSGESRFQDKLAARGSAKQGRGARYLCAARGRAGKSSYRRLLAQTSKKEGAALLRHRRRTLTPSPLLQLLTVLAKESKPTETKLATRSRKTPS	408908	404529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_404500_408900
874092	contig_11829_pilon	+	2197	4	Intergenic	novelGene_128142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	162	506	170894	171238	TRUE	15	ATGCCACTTGGTGGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISQKSVSLRCRVLVKNKRLVVFWLLIKMHVFIAGVKSRRMHLFLLQVSIFKHSKPHAPFLSLNRRQFAILSSSGSGSDVGDQHLPLPMAYGTHVLHESGYLPNKTHSNTAGK	170732	177994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_171334_173970_174155_176307_176421_176695
874093	contig_5799_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_50275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAAGTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279946	278130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_278100_279900
874094	contig_5479_pilon	-	2733	2	Intergenic	novelGene_133615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGCCACCAGGGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390443	387185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_387940_388464
874095	contig_8712_pilon	-	3472	4	Intergenic	novelGene_58891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	1.63299316185545	61	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	267	1106	1306971	1299726	FALSE	55	AAAGTTCCAAAAGAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSLNYPYPQIYWVDSSTSSPLAPPASVLPCPSSVPGRPGQMRPPPPPPPPLPSRPQPPLPPFPPSLLKKRRNHNTGLCLLVMFFMVLVALVGLGLGMFQLFHLQKELAELRESTRQRPIAPSLEKQIGQPSLPSEKREVKKVAHLTGNPNLRSIPLEWEDTYGIALVSGVKYKKGGLVINDTGLYFVYSKVYFRGRSCNNQPLNHKVYMRNSKYPQDLVLMEEMMMNYCTTGQMWARSSYLGAVFNLTIADHLYVNVSELSLVNFEESKTFFGLYKL	1307237	1297359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1300121_1301385_1301443_1306020_1306067_1306629
874096	contig_6418_pilon	-	2833	1	Intergenic	novelGene_81225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGGGCATTTCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396275	1393442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1393400_1396300
874097	contig_987_pilon	-	2696	1	Intergenic	novelGene_72322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGCCTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043120	1040424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1040400_1043100
874098	contig_567_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_33969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	123	junction_1	0	102	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATACACATATACGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338711	360077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338857_358266
874099	contig_6975_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_74256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACGCGGGAATTCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160436	158709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_158700_160400
874100	contig_2365_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_103741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATAAAGTTTAACCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171574	173880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_171600_173900
874101	contig_6795_pilon	+	3264	11	Intergenic	novelGene_27728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_10	28.3689971623954	138	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	472	1284	301606	308474	TRUE	0	GTCCTTTTTTGCCTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARNYLDVYPYDHWSDKTIPIYERGSCFQPSTVEMVDGETCPPQLLTEADLISLMEKHGIGTDATHAEHIETIKARMYVGLTADKRFLPGHLGMGLVEGYDSMGHEMSKPDLRAELEADLKLICEGKKDKCVVLRQQVQKYKQVFIEAVAKAKKLDEALSQYFGEGAEVPQQEEIYPAMPEPIRKCPQCDKDMVLKTRKNGGFYLSCMGFPECRSAMWFPDSVLEASRDESVCPVCQPQPVYRLKLKFKRGSIPPDHATGVSWLHQRV	291046	311432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_291097_295821_295905_297536_297746_301476_301663_301864_301995_303465_303580_303649_303816_304869_305014_307081_307205_308395_309092_310069
874102	contig_7513_pilon	-	1598	9	Intergenic	novelGene_88928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_5	69.1681601244388	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	104	1597	87692	7808	FALSE	15	GTGAGTGAACTGGGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAEPGSGCRGSPPRLPPGRWLWLRAGLPAVDFRMSVPDYMQCAEDHQTLLVVVQPVGIVSEENFFRIYKRISSVSQISVRDSQRVLYIRYRHHYPPENNEWGDFQTHRKVVGLITITDCFSAKDWPQTFEKFHVQKEIYGSTLYDSRLFVFGLQGDIAEQPRTDVAFYPTYDDCETVEKRIEDFIESLFIVLESKRLDRATDKSGDKIPLLCVPFEKKDFVGLDTDSRHYKKRCQGRMRKHVGDLCLQAGMLQDSLVHYHMSVELLRSVNDFLWLGAALEGLCSASVISHYPGGTGGKTGARRVQGSSLPAEAANRHRPGAQEVLIDPGALTTNGINPDTSAEIGRAKNCLSPEDIIDKYKEAISYYSKYKNAGVVELEACVKAVRVLAIQKRSMEASEFLQNAVYINLRQLSEEEKIQRYSILSELYELIGFHRKSAFFKRVAAMQCVAPSIAEPGWRACYKLLLETLPGYSLSLDPKDFNKGTHRGWAAVQMRLLHELVYASRRMGNPALSVRHLSFLLQTMMDFLSDQ	91720	7806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_7951_18751_18969_36741_36868_43663_43786_57076_57104_66270_66400_71522_71669_87108_87703_91627
874105	contig_1090_pilon	+	1473	7	Intergenic	novelGene_131096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	92	junction_1	83.8106331095418	877	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	108	683	148314	208273	FALSE	40	ATTAAAATGCTTATGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGTWGGVWPRLPGWAGPVWGGVCERALGPRPTEDMDEDGLPLMGSGIDLTKVPAIQQKRTVAFLNQFVVHTVQFLNHFSTICEEKLADLSLRIQQIETTLNILDAKLSSIPGLDDVTFEVSPVSVTNGPQSEAASEQSQQNSIQDSGPQESEVAAENILTVAKDPRYARYLKMVQVGVPLLAIRNKMISEGLDPDLLERPDAPVPNGEGEKNTEESSDSESSFSD	148206	209063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_148365_148927_149027_157265_157332_172355_172455_176731_176843_197723_197789_208188
874106	contig_1406_pilon	-	1152	3	Intergenic	novelGene_25555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	421	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1	387	2143615	2137423	FALSE	40	TCTTATATTAAAATGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLDIAYRFGKTVVSCEGYESSEDPYVLRGSCGLEYDLDYTEAGLKKLRESGKNRGFNSFSNYHNKLYSPDSCGVSGLITIVVLLAIAFGWSCLLTTSWRRRELFSRFKLRYRNQDSIGIWWYQKTIR	2143615	2136657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2137454_2139836_2139923_2143345
874107	contig_12624_pilon	-	2991	1	Intergenic	novelGene_60997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACATCTTTTGGCCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137263	134272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_134300_137300
874108	contig_15134_pilon	-	2413	14	Intergenic	novelGene_140231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	56.9401221880749	305	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	62	1339	327600	317854	FALSE	70	AAAAAATTTAAAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSETPARTLPFTTGLFYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADRSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQGKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAADEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPPPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNKVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDAWVPRVPGADPEEVEAVAALASLSVGILAEERPSEQLVEEEEPMNL	328945	316779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_317900_318033_318173_319368_319454_319719_319854_320754_320874_322275_322374_322617_322738_323500_323589_323767_323824_325062_325171_326510_326561_326823_326945_327486_327621_328904
874109	contig_7775_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_37492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGTAGAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235005	232569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_232600_235000
874110	contig_17198_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_62357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1316	1618	727330	727028	NA	30	ATCTTTACGGAAGCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLLTSMDAMPYKYLSNGWLCVQDHLGCLAFLTWVGQLIGTEKMTTFSSKPKLPGPGGQDGRSAPASPLLEPTHSKTNNQLGSPRSGLFLFLFTVWMMV	728645	726110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_726100_728600
874111	contig_9858_pilon	+	2852	5	Intergenic	novelGene_140527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_4	39.6389959509572	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	23	724	213461	224321	FALSE	50	TCATTAAACCAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNPFINIAEPLDPAQPGKKFFNLNKLEDSRYGHLPFSIRVLLEAAIRNCDEFLVKKNDIENILNWNVMQHKNIEVPFKPARVILQDFTGVPAVVDFAAMRDAVKKLGGDPEKINPVCPADLVIDHSIQVDFSRRADSLQKNQDLEFERNRERFEFLKWGSQAFRNMRIIPPGSGIIHQVNLEYLARVVFDQDGYYYPDSVVGTDSHTTMIDGLGVLGWGKCSSRFLLTYMLF	213438	226449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_+_213558_215389_215559_216738_216877_223898_223969_224093
874112	contig_18393_pilon	+	3468	15	Intergenic	novelGene_167463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	93	junction_9	121.715375581975	214	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	124	2634	81570	100535	FALSE	35	AAAAATAACTGTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDSCSLHEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVRCHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPITPGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMNLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQEEDVTSKAFTGREFDELSPPAQRDACLTARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKSEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKDDNPDFDGVDCAVFESPYPMTMALSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNLTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPAARPCSLSACTDGISWPFVLLVVPLVVWVYSTDTNFTDMFWS	79909	101369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_+_79959_81495_81582_82773_83239_86344_86434_86884_86988_88016_88149_93428_93552_93646_93866_95083_95420_96803_97025_97479_97683_98986_99073_99372_99507_100051_100170_100265
874113	contig_13014_pilon	-	2146	4	Intergenic	novelGene_169326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	115	junction_2	158.211532098292	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291946	282557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_285401_285460_288244_288358_290339
874114	contig_10341_pilon	-	3039	2	Intergenic	novelGene_47223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTTTCCTCTGGCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90364	67359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_67505_87470
874115	contig_11161_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_175649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280371	283090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11161_pilon_+_280400_283100
874116	contig_13780_pilon	-	2301	16	Intergenic	novelGene_149076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_9	1585.83628691265	1	61	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	789	2105	686159	657588	FALSE	0	CGCCCTTGTCTGGTCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	761528	657391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686561_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_761434
874117	contig_2069_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_23195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCCATTATGTACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86530	88025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_86500_88000
874118	contig_12464_pilon	-	4628	1	Intergenic	novelGene_68639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAGCAGTAACCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89698	85070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_85100_89700
874119	contig_15752_pilon	-	3898	1	Intergenic	novelGene_148790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTCCTGCAATTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387856	383958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_384000_387900
874120	contig_5551_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_134269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1611	1922	634862	635173	NA	65	TTTTAAAAAAGAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFGYCVLSLPCPSLPVLICVVSFCTFLCAYVNTRKCSVSALLCCVFFFNRKPSYDTETDPSEGLMNVLKKIYEDGDDDMKRTINKAWVESREKQAKGDTEF	633251	635842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_633300_635800
874121	contig_7230_pilon	-	3763	6	Intergenic	novelGene_52560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_3	231.923608112671	1858	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	145	636	177508	150891	FALSE	40	TGAACAAATCCCAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQVSSHIHH	177652	147763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
874122	contig_16103_pilon	-	2099	2	Intergenic	novelGene_118760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCCCTAGCCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439109	436873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_438811_438947
874123	contig_3252_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_61474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATCCATTTTCCCAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146805	149606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_146800_149600
874124	contig_7457_pilon	-	2936	4	Intergenic	novelGene_31489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2146	2526	643713	642701	TRUE	15	AGGATCCGGTTAGGGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSFGFVTLSLVLCYNVLIFFKRGGAKRMHYIFRKKQSYFHCMKKKTPQTPISTLEDSLHPNAHITATASLYTRKAYLQQCFVSSQVSPGLQWLQFGGGVTLPTGTGPQFGQSPLASQDICSEGTA	645858	612260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_612390_641605_641758_642571_642716_643347
874125	contig_15838_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_174331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	892	1200	129796	130104	NA	45	TTAGAACAAAATTCTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGHLFNLVLKSFLRFALQPKIRRAHKTNNNTRTSTTYTRLNRHTNAGARTRRQEGTGNLDKWKWGTQGQEGESADKSWGWQSMSQNNMYINCLMRNLFAP	128904	130370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_128900_130400
874126	contig_4845_pilon	+	2780	1	Intergenic	novelGene_53698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGTAGCTCTTGCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917709	920489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_917700_920500
874127	contig_8651_pilon	-	2098	3	Intergenic	novelGene_168178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_2	59	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1056	1361	176108	173502	FALSE	55	AAAGTGCCAAAAATTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAFHAALRNSPVNTKNQAVKERAQGVVLKVLTNFKSSEIEQAVQSLDRNGIDLLMKYIYKGFEKPTENSSAVLLQWHEKALAVGGLGSIIRVLTARKTV	177163	172764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_173565_174900_175078_176042
874128	contig_12148_pilon	+	3775	11	Intergenic	novelGene_140325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	288.591337361328	411	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	173	1546	57850	115853	FALSE	20	ATTTAGATGTACTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDEGAKNNGESPAAAVAERGEDITSKKDRGVLKIVKRLGTSEETPMIGDKVYVHYKGKLSNGKKFDSSHDRNEPFVFSLGKGQVIKAWDIGVATMKKGEICHLLCKPEYAYGSAGSVPKIPSNATLFFEIELLDFKGEDLFEDGGIIRRIKQKGEGYSNPNEGATVEIHLIGRCGGRLFDCRDVIFIVGEGEDHDIPIGIDKALEKMQREEQCILYLGPRYGFGEAGKPKFGIEPNAELIYEVTLKSFEKAKESWEMDTKEKLEQAAIVKEKGTVYFKGGKYMQAVIQYGKIVSWLEMEYGLSEKESKASESFLLAAFLNLAMCYLKLREYTKAVECCDKALGLDSANEKGLYRRGEAQLLMNEFESAKGDFEKVLEVNPQNKAARLQISMCQKKAKEHNERDRRIYANMFKKFAEQDAKEEASKAIGKKTLEGVTDEKGTEGQAMEEEKPEGRV	45423	118082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_45572_57825_57955_61794_61940_73099_73243_74185_74301_96330_96488_101544_101636_104084_104169_110367_110554_114742_114983_115745
874129	contig_1996_pilon	-	2313	2	Intergenic	novelGene_131953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAACGGAGGCAGCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521735	519215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_519502_519708
874130	contig_15866_pilon	-	2726	1	Intergenic	novelGene_63607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1471	1782	343538	343227	NA	35	CACATGACCACATAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQINVITNKQKTTAVELIHSNPGGQSTTATQGFQGATGGFKLLTFWLAAGPLHYQRPRCKNSRRKISGMMHLCKAVLHMMSSVLKSMSKKGSRRERVDMLWGC	345008	342282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_342300_345000
874131	contig_11719_pilon	-	2951	2	Intergenic	novelGene_154743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAGCGATAGGACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17554	13545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_14381_15438
874132	contig_7327_pilon	+	2399	10	Intergenic	novelGene_172107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	131.401937336565	198	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	43	1404	46718	81624	FALSE	35	AAGATGAAAGAGGTCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSRSHLSPAAAAAMGSSQSVEIPGGGTEGYHVLRVQENSPGHRAGLEPFFDFIVSINGSRLNKDNDTLKDLLKANVEKPVKMLIYSSKTLELRETSVTPSNMWGGQGLLGVSIRFCSFDGANENVWHVLEVESNSPAALAGLRPHSDYIIGADTVMNESEDLFSLIETHEAKPLKLYVYNTDTDNCREVIITPNSAWGGEGSLGCGIGYGYLHRIPTRPFEEGKKISLPGQMTGTPVTPLKDGFTEVQLSSVNPPSLSPPGTTGIEQCLSGLSISSTPPAVSSVLSTGVPTVPLLSPQVNQSLTSVPPINPATTLPGLMPLPGGLPNLPTLPNLNLPAPHIMPGIGLPEIVTPGLPPLPSLPPRNLPGIAPLPVPSEFLPSFPLVPEVSSAVGSGELLPSLPLPGNPPSDPIPTTAKADTASSLTVDAMPPTSKAPTAVEDRVSEPTPSSEKPVSVVMDANASESP	46675	82619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_46781_66284_66366_67569_67774_68227_68315_69266_69398_71900_72034_73763_73888_78184_78272_79529_79641_81283
874133	contig_6062_pilon	+	3493	7	Intergenic	novelGene_5298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2911	3222	784804	791337	FALSE	15	GGGGGCGGGGACTGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHIISLMAGLVKTSLMYSATVMGPVDLILYIRCRNIGVTGLFSPSSFPELKHFPLQRQGMTMKKQTHQTEAIKNYEYLHVQGSLNAFKAASLNLNHAPTQER	769816	791608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_770347_770835_771011_772255_772404_774629_776511_783036_783152_784742_784826_791047
874134	contig_15449_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_33657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	215	538	191181	191504	NA	30	AACATTATCGTCATTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLDLQLLKKVPVQNLGDHLRLRQGDSGSQKTSVRRGRGCSMPLMRSLGSWDSEEVLGEEGLGTTEVPTLPTVTSSLSSCRRCRRISWDSEKLLPSADSGRGVWGE	190966	192762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_191000_192800
874135	contig_8594_pilon	-	2495	1	Intergenic	novelGene_140058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	987	1286	463756	463457	NA	25	CTGTGCCCAGCTTATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGQLNGLGVPGSSCSVAFQPGLVLTISRCPCLGEQRWCQLYSPRLIIQSWSVCIPQQSPWVVQLTCSAGNQKVRGSSPPRGALEERPGDLLLKKISH	464742	462247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_462200_464700
874136	contig_15049_pilon	+	3562	1	Intergenic	novelGene_160718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	369	3193	3561	225327	225695	NA	10	GGTCTGTGACTGACCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQKQLQEERLQRAQARAQAEIKKKVGGPPWGGKAPKLGIRCCKGLRDPAALYPTPPPFGITEALLGRWKQASHTQALGSTLLLELASSQEYRLLESSSASGVGLLALPAKGPQAPSPSSAHS	222134	225696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_222100_225700
874137	contig_11364_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_65156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	921	1382	61215	60754	NA	40	ACTAAAATTGTATAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVFSGGRPRGVLPLPLCTTPIFPPPPLLRLQLDTGDPGLWMLGDGREGSEEELRLPATPSSHLLAPSMGALLDVTMEPGAAAWTRQADLRTKLFFLLPLWPSEDPCCTEGLGRGFFWEAVADEARDGPNFVYSVHWNLFNVSLVWTDSCVPS	62135	60437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_60400_62100
874138	contig_16594_pilon	+	2745	1	Intergenic	novelGene_53876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGAGGTGCCATCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167416	170161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_167400_170200
874139	contig_11978_pilon	-	2791	1	Intergenic	novelGene_62883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2322	2669	718179	717832	NA	35	AGGAAATACAGGGCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTITGGCIEAENSLSAPGSPPPMPHSGLARKLWSPTQLEPGPIASAGTGIIHITQTKNLTHLKENLLQRRTGLELRTKEEHFIHCQELIVAKAVDPLLSLSLIPLRLHTQFLP	720500	717709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_717700_720500
874140	contig_5331_pilon	+	2995	1	Intergenic	novelGene_112802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1771	2181	607714	608124	NA	30	GTTGTAGAAACAGTGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPGASTRYFRTGLRPLGWKQGNPVAVTSEVWALGQDSNQPETHRDQSTHECSCPGRQANLWGMPRYSRTPTFAQHQVRSRPDRACGPATVGQAVPTPTGPRGLSPSPHESWGTAHLVFQALRSGQPTMTTNKCLK	605943	608938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_605900_608900
874141	contig_16766_pilon	+	1073	1	Intergenic	novelGene_153367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTAAAAAAGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150716	151789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_150700_151800
874142	contig_2757_pilon	-	1810	7	Intergenic	novelGene_164578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	70.1793337734756	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	438	1154	174814	171697	FALSE	20	TATTTTTTTATTGTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSAFLERSVSLYGSPLMPNAEPPLDFSLRYSPGMDTYHCLKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHIHSQGTPARSSPALSLALPGGEAPPAPDPLGPRFLRQERSFECQMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFTCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK	182357	171040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_171876_172751_173017_173937_174076_174679_174881_175960_176099_176312_176433_182244
874143	contig_10953_pilon	-	3042	1	Intergenic	novelGene_42530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCTGCCGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157232	154190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_154200_157200
874144	contig_2358_pilon	-	4852	3	Intergenic	novelGene_156106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	48.5	67	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79357	73411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_78081_78564_78662_79271
874145	contig_15405_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_112102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCATCTGTTTAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97820	96077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_96100_97800
874146	contig_6361_pilon	+	3133	6	Intergenic	novelGene_24034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACGCAAAAAGATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669554	689295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_671990_674119_674310_676138_676270_678988_679076_681269_681390_689125
874147	contig_1397_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_174405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	445	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	1951	2364	48022	48435	NA	5	AGCCGCCGCGCCTCGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIHIQHLPHRQQFRVPGPCPILSSSDDKLPHVPLDQGAKVVEMISDVVHRLFPQLSVEALVSVHRLADRSVEAIAVGNDVKSVLIPLSQVLVLLLHLRQVQGQFLVSGIRPGDDPRLRRASRGGLATPRGGRLGLQI	46071	48436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1397_pilon_+_46100_48400
874148	contig_12485_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_147276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAATTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66986	65654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_65700_67000
874149	contig_5538_pilon	+	3259	12	Intergenic	novelGene_23700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	452	junction_11	246.183731696605	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	70	1881	47801	225161	FALSE	75	AAAAAGAAAAAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHTPAESAAGPPRKDPQLLVKLRMSSETSATTFGGRRSVPPNNSNAAEDDLPTVELQGLVPRGISLQDYLNVMNVHLFKERWDSNKVDHHTDKYDNNKLIVRRGQSFHIQIDFNRPYNPNRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPVVPELQRGKWGAKVVMREDRSVRLSVQSSPECIVGKFRMYVAVWTPYGIIRTRRNPETDTYILFNPWCEEDAVYLDDEREREEYVLNDIGVIFHGEVKDIKNRSWSYGQFEDGILDVCLYIMDKAEMDLSGRGNPIKVSRVGSAMINAKDDEGVIVGSWDNIYSYGIAPSAWTGSVDILLEYRSSESPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARVVTNYFSAHDNDANLQMDVFLEEDGSVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMKRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAVKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLVYITAKKDGTHVVEGVDSTHIGKLIVTKQVGRDGMQDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKAISTEGILKPRSDVDMDFEVENAVLGKDFKITITFQNNSSNHYTISAYLSGNIVFYTGVSKAEFKKETFDVTLGPLSCKLKGVVLSRISHLAPSLPW	44791	226539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_44843_47782_47934_60548_60738_103160_103413_135702_135822_139111_139220_156863_157039_160178_160318_206295_206400_207987_208077_216811_216966_224811
874151	contig_7057_pilon	+	3879	15	Intergenic	novelGene_123177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	39	junction_1	63.140917875844	225	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	259	2775	17976	27569	FALSE	45	TATAAAACAATATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLFGPSLLLLEYLAFSDSSTWNIDHPDTLYSWEGACVWIPCLYRIPAYSKSLDSLTLYHNFTYDSITKNFIGNILYSSKNATTVPERVQFLGDHKSNCSLRIEPVHVTDSGQLGLRMVSGTQKWMEKINLSVSEKPPPLHIQLPPEIQEHREVTLTCSLKFACPGYQIKLQWSMESPAVTSTSLGTKILSTESKLTFQPQWTHNGQNLTCQLKDLTTEKILSQETVRLNVKHRPKLEIKLEEATVKVGESVTITCHVISSNPEHQNISWFKDNTELRVQEPTRLTLSAVSKEDSGKYHCHTFNDVGSSDSKDVVLQVQFTPEPSTVQINPLPAKEKEMVELTCISVACPPPTNYTWYHNGKKLEGRTEKNFQIPNILLSNAGNYSCSAENILGSGKVGSEAELDVQYPPKGVTTVIQNPTPIREGDDVTLVCNYNSSNPGVTEYKWSTHVFKNESFPNVSMIRKVPWNAKTIACEACNGWCSKSPSIKLDVHYAPRDVKVLKISPQTEIHSGNLVLLQCNFSSSRPTDVHFFWKKNGGLLEEGRNLSFASISPEDAGHYSCSVNNSIGETTSAAWILQVLYAPRRLRVSIDPQDRVMEGKNAVLTCESDANPSVSQYTWFDWNNQKLYQAGQMLKLEPTKVEHSGAYRCQVANRLGVSMSPPSTLTVYYSPKTMGKRAAVGIGACLSILILAVWGVKLCRRWKKIRSQQELQENSSGQSFFVKNKKVRRVCLSEGPHSQGCYNPAMEDGISYAALRFPVGETDIPGAGDVGTSASAPDMEDMVTYSVVQKRHVGDYENVPSAVPEDEEGIHYSELVHFGTGERPPAPEGVEYVTLKP	14615	28673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_14654_17322_17521_17953_18010_18268_18638_19628_19923_21560_21822_21975_22240_23131_23390_23595_23860_23939_24204_25816_25914_26047_26124_26299_26425_26983_27060_27434
874152	contig_4202_pilon	+	2918	8	Intergenic	novelGene_147071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGCAGTGGTCTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40250	187856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_+_42369_83250_83440_94027_94121_111115_111280_115479_115544_116485_116552_127349_127481_187763
874153	contig_5316_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_61223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	410	718	418472	418780	NA	45	AAAAGACCTACCATACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHIQVYVRGDSTVVLVIFKKVALGSILTHGNSVYVRVDPCSKGFSLVGLSEVDHQTFLPRSFWVDLNHQPFDHTLQGQNYKSVNLLVPAIRQLYIDKPDFS	418062	420469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_418100_420500
874154	contig_6673_pilon	-	993	4	Intergenic	novelGene_164013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	39.7324384686702	259	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGTAAGGCCAGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100122	56433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_56515_68208_68318_93275_93340_99383
874155	contig_9614_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_104426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAAGACTAAGGTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142064	141639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_141600_142100
874156	contig_10236_pilon	+	2751	1	Intergenic	novelGene_169126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	1785	2387	258766	259368	NA	35	CCCTCAGGAAAACACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGRAHRRLVRASGGDGGGRGRNLGAPAQSHPWRDVRRALLGLAPPPPGSVHVCLCAHPRQGGLAWGSGQQCAHRKPKREGTSPHGDPQSLEPHPILPGSTAFFLKPASRCWPGKLRGVLVFGMMPPTGGGGRTRWPNRLAKEWRGARTKVYLATSLPGANYQQRVLAMVGSLLPPPHPIPKLSSPQLPLTLQLLGSAL	256981	259732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_257000_259700
874157	scaffold_12124_pilon	-	4115	1	Intergenic	novelGene_22164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	2168	2776	1020939	1020331	NA	40	AACTGGGTTGACAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGEVNLELSGTHLQDVREATELDGLAIQAGEEGLHQALVLHLALEADEIHGALGDAQRGELVTVHHALEPLHHLPVGDGLSRLLQLWQGHADGHLCDGLEVQAVRGAQLHRLRCVVHNGSRCHRRSTGPETQSAGSQGAVPGLRVPKPASTSKLGDKIGHRNWPLTHKRQHQLSFSKSLNLGILVVQCLSVQLLTGRLAV	1023106	1018991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1019000_1023100
874159	contig_8452_pilon	-	3710	1	Intergenic	novelGene_48062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGGAAGAACACACCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496000	492290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_492300_496000
874160	contig_8476_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_121335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGCTTACACTTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115033	117402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_115000_117400
874161	contig_12427_pilon	+	938	2	Intergenic	novelGene_40416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_1	0	6922	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	302	835	209839	210372	FALSE	25	TCTAAGCTCAGAGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAWGALFLLWAVVETTKDCPKQCACHSLETMGLWVDCSGQGLTEMPALPARTRHLLLANNSLHKVPPGAFDHLPQLQTLHVAQNPWHCDCSLTYLRLWLEDHAPEDLGYVLCASPSLAAGRPLSQLTGYELGNCGWQLQASWASSGTWWDIALVAVALLGLVLLVGLLCITTRPWH	208661	210475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_208743_209618
874162	contig_17274_pilon	+	3561	4	Intergenic	novelGene_26513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_1	92.7805056152542	67	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	268	552	96348	100467	FALSE	15	AGTTGCAGTTTTGGCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQAGKAG	95033	103476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_95181_96227_96397_98273_98349_100306
874163	contig_6837_pilon	+	1611	7	Intergenic	novelGene_149835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	18.0408487112503	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	188	961	88139	91925	FALSE	15	TCTTAAGTGCAGCCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTLLEHSGPVSAAAVSDTSGLLLTASEDGSVRLWQVPEEADDTYVPKNPAAITAVAWAPDGSMAVSGSQTGELILWQEAKAVATAQAPGRISALIWYSAHTFFVLSADEKVSEWQVELQRGSTSRNFSLHLNRILQEDIGVLIGLGLAPDGQSLILAKAELELLHMMPGNDPSVIWGCYMEDGLTVLSTHKEYGVFVLQSMAPKGLYLLRQKELGEFEEFLEFNLNLENPSGAVIWVTQAKPESESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKVSLREG	87828	92575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_87951_88073_88211_88372_88498_89574_89719_89856_89957_91500_91607_91698
874164	contig_12864_pilon	-	844	3	Intergenic	novelGene_76438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	922	junction_2	50.5	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAAAGAGTTGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244747	242239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598
874165	contig_14322_pilon	-	3858	1	Intergenic	novelGene_115616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTGTAGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84880	81022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_81000_84900
874167	contig_6020_pilon	-	3541	1	Intergenic	novelGene_155572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATAGTAAACCACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305973	302432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_302400_306000
874168	contig_12837_pilon	-	2461	2	Intergenic	novelGene_57383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAATACTATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385931	380775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_381341_384035
874169	contig_4783_pilon	-	2555	2	Intergenic	novelGene_108387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGCACCTTATTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227905	224224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_225474_226599
874170	contig_12810_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_145700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATAGGCTCACTATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302565	304647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_302600_304600
874171	contig_12148_pilon	-	3369	1	Intergenic	novelGene_140321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTAATCACTGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40268	36899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_36900_40300
874172	contig_7657_pilon	+	4705	2	Intergenic	novelGene_30023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	219	557	318516	318854	FALSE	65	GGTAGGAAAAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEAHRAISCRSPVSSVAGSLPCFLLRLAILRHIQCYSSLSPVSRRFSAQGPWVQRMRSAPCSSFLVLMKSPLSASGLAHFKPSTIAKLINSLVRVPYALFAWSHPPTRVP	171637	323002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_171755_318414
874173	contig_8588_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_146510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGATTCCTAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397886	395696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_395700_397900
874174	contig_12464_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_68710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAACAGACTAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355124	353341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_353300_355100
874175	contig_10523_pilon	+	3045	1	Intergenic	novelGene_120967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATAGCTTATACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88895	91940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_88900_91900
874176	contig_10042_pilon	-	1476	2	Intergenic	novelGene_79255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACAAATCTGTCCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213862	1212081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1212813_1213117
874177	contig_9366_pilon	+	3209	1	Intergenic	novelGene_166256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTAAGAAGGAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956785	959994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_956800_960000
874178	contig_2455_pilon	+	4011	4	Intergenic	novelGene_119241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.9814733091416	118	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	189	959	1505627	1516457	FALSE	20	TTTAACTATTAGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLWKFTEILDDGSSYTSQSSTEYYCVTPVTGPYYTTQTLDTRARGRRRSKKQNVSTSNSGSMPNLAQKDSLRNGVYPKSQEQPSSSYYIAGYTPYAECDLYYSGSYVYENDTEGQYSVNPSYRSSAHYGYDHQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAVTKSEHITKNIHKALVAEHLRGWYQRASGQKDQGHSPQTSFDSDRGSQRCLGFPGLQVPCSPSSRASSYSSVSSTNASGNWRTQITVGLSDYEAPAHSPYTSCYGNMYNPLPSPSRQYTETNQLDSTDGNRLEDSLGSSEQRLFWHEDSKPGTLV	1491558	1519509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1491578_1505457_1506144_1512180_1512314_1516336
874179	contig_14871_pilon	+	1527	11	Intergenic	novelGene_63699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	700.852937498303	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	128	1378	201945	233218	FALSE	15	AATTTCATCCTGTCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDFQ	194862	233367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230272_233205
874181	contig_4496_pilon	+	4404	1	Intergenic	novelGene_66617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTTTATACTGTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579527	583931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_579500_583900
874182	contig_16109_pilon	+	2533	11	Intergenic	novelGene_80320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_9	184.482085851174	170	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	10	1944	205566	232725	FALSE	15	TTGGTTTTGTATGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEGGSDSQLKRRRRRDHEKPENTELSGRELTVVVAQENDEDNEERWVGPLPVEATLAKKRKVLEFERVYLDNLPSASMYERSYMHRDVITHVVCTKTDFIITASHDGHVKFWKKIEEGIEFVKHFRSHLGVIESIAVSSEGALLCSVGDDKAMKVFDVVNFDMINMLKLGYFPGQCEWIYCPGDAISSVAASEKSTGKIFIYDGRGDNQPLHVFDKLHTSPLTQIRLNAVYKAVVSSDKSGMIEYWTGPPHEYKFPKNVNWEYKTDTDLYEFAKCKAYPTSICFSPDGKKIATIGSDRKVRIFRFLTGKLMRVFDESLSMFTELQQMRQQLPDMEFGRRMAVERELEKVDAVRLINIVFDETGHFVLYGTMLGIKVINVETNRCVRILGKQENIRVMQLALFQGIAKKHRAATTIEMKASENPVLQNIQADPTVVCTSFKKNRFYMFTKREPEDTKSADSDRDVFNEKPSKEEVMAATQAEGPKRVSDSAIIHTSMGDIHIKLFPVECPKTVENFCVHSRNGYYNGHTFHRIIKGFMIQTGDPTGTGMGGESIWGGEFEDEFHTTLRHDRPYTLSMANAGSNTNGSQFFITVVPTPWLDNKHTVFGRVTKGMEVVQRISNVKVNPKTDKPYEDVSIINITIK	205556	233314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_205756_209612_209716_211699_211801_211975_212097_213624_214073_219108_219300_222762_222953_227808_227991_229211_229294_231070_231254_232581
874183	contig_13894_pilon	-	1868	8	Intergenic	novelGene_62188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	226.43564657716	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	109	741	762268	750854	TRUE	25	AAAGGTTGGGGGGGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFLCFQVETKAPPSLNSPDSGIFQNQDHCPSHHHAEMVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTCHRGRHDLQRF	763878	749045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751138_751283_751376_753097_753240_761484_761600_762021_762299_763800
874184	contig_5967_pilon	-	2641	1	Intergenic	novelGene_44408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTGACAGGATTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428898	426257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_426300_428900
874185	contig_17912_pilon	-	3148	1	Intergenic	novelGene_177348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1119	1484	89938	89573	NA	70	CATAGTATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAIKDQTNLYVTQECIKRFKGKNTSSPSINWKPTSIEEIKAFMSVHMMGIHILLACKHFQSSDPCLGVVWIQEIMGKGRFIKLIENYIVMTIQKLWQEENWAITGCTNCARLSVHSVVA	91056	87908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17912_pilon_-_87900_91100
874186	contig_16411_pilon	+	3330	1	Intergenic	novelGene_77380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAAGATTATGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343171	346501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_343200_346500
874187	contig_13403_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_158085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	3	148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACATAGATACTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48819	76683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_49160_63069_63215_75081
874188	contig_7318_pilon	+	3718	6	Intergenic	novelGene_152220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2132	2566	275931	276365	FALSE	15	CCAGGTATCGCGAGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFKSIPCADSVIFFNFINSRKTYIIIHNILPKFPPSFIKSSWFYIIHFFFYNYQSIGYVVMLPCFFQSLRQRFSSIPSANGQTYAWCNTPESFNYTLIQGLKKASAFQREKQNYQHYDEQSIMSPGDWDLFPQLATLRFFSVK	258849	277517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_259882_263193_263248_263502_263544_265172_265234_269789_269947_275144
874189	contig_6595_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_122561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTCGGTAGGTCAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731672	733745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_731700_733700
874190	contig_6233_pilon	+	1666	1	Intergenic	novelGene_74776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134668	136334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_134700_136300
874191	contig_13607_pilon	-	3700	1	Intergenic	novelGene_170225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGCATGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472792	469092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_469100_472800
874192	contig_12157_pilon	-	4868	1	Intergenic	novelGene_135908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCCAGCATCTGACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162537	157669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_157700_162500
874193	contig_9527_pilon	-	3066	1	Intergenic	novelGene_134036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATATAACTCAAAGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278300	275234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_275200_278300
874194	contig_15570_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_137839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGGTTGGCGGTTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485570	482927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_482900_485600
874195	contig_12638_pilon	+	2913	5	Intergenic	novelGene_33292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	28.0446073247603	241	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	69	2390	1109671	1136352	FALSE	25	CATAAAGGTATGTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDQQGLNPTTLKAIGQAPSNLTMNNPSNFAAPQTHKLDSVVVNSGKQSNSGGTKRASPSNSRRSSPGSSRKTTPSPGRQNSKAPKLTLTSQTNAALLQNVELPRNVLVSPTPLANPPVPGSFPNNSGLNPQNPTMPVAAVGGVLEDNKESLNVPQDSDCQNSQGRKEQVNIELKAVPTQEVKMVVPEDQSKKDGQPLDPNKLPSVEENKNLVSPAMREAPTSLSQLLDNSGAPNITIKPPGLTDLEVTPPVVSGEDLKKVSVIPTLQDPPSSKEPSGSLNLPHSNEPCSTQVHPELSEVSSNVAPSIPSVMSRPVSNSSISTPLPPNQITVFVTSNPITTSANTSAALPTHLQSALMSTVVTMPNVGSKVMVSEGQSAAQSNARPQFITPVFINSSSIIQVMKGSQPSTIPAAPLTTNSGLMSPSVAVVGPLHIPQNIKFSSAPVPPNAPSSSPASNIQTGRPLVINSRATPVQLPSPPCTTSPVIPAHLPVQHVKELNPDEASPQVSTSADQSTLSCSQSTTMVSPLLTNSPGSSGNRRSPVSSSKGKGKVDKIGQILLTKACKKVTGSLEKGEEQYGADGETEGQGLETTAPGLMGTEQLSTELDSKTPMPPAPTLLKMTSSPVGPGSTSAGPSLPGGALPTGVRSIVTTLVPSELISTAPTTKNNHGGMTSEPLAGGLVEEKVGSHPELLPSIASSQSLTPKETPVTALQGSVARPELEANAAIVSGQSSEPKEIVEKSKTPSRRNSRTEEATVASESVENGHRKRSSRPASASSSTKDITSAVQSKRRKSK	1109602	1136875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1111694_1114916_1114986_1117732_1117770_1123271_1123421_1136308
874196	contig_2278_pilon	+	2485	1	Intergenic	novelGene_118108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1193	1561	769907	770275	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARKAQVIKLDFLQFKEEGGLFLGKTKYCWQKEYAFLRPEELDGAWLPPMTTLTENTIQSLMEQEKGGVQNSNSSKTTRLNGLTETGGTLESMAPGFSISPEVKQFPRPTLQTGIGLDCGT	768714	771199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_768700_771200
874197	contig_9871_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_75629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337471	336010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_336000_337500
874198	contig_6418_pilon	+	1928	12	Intergenic	novelGene_81211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	187.97551273618	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	342	1844	1375762	1444680	FALSE	55	TAATAAAATACATTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341089	1444764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
874199	contig_19957_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_57686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATTAAAAAAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83934	81094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_81100_83900
874200	contig_7171_pilon	-	1987	15	Intergenic	novelGene_101264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	53.5160189636177	248	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	432	992	911210	906293	TRUE	15	GACACGGCCCTTGGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QELRQLQICHLVRYWLTRHPQAVHQEPQLEEVIGRFWATVDQEGGSAQRNLGGSSNLLSPGGPGPPPTTSSPGLGKKRKVSLLFDHLETEELAEHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVFQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPAQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTAWLLQPRGADGLPAPGQCRLLPAGPGLPAHLP	915073	899210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_899382_901155_901269_901388_901524_901626_901665_902352_902498_905383_905503_905646_905752_905828_905910_906204_906392_908204_908481_909890_910008_911141_911316_914111_914266_914383_914516_915033
874201	contig_854_pilon	+	3666	1	Intergenic	novelGene_36560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTCACAGTGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657762	1661428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1657800_1661400
874202	contig_3948_pilon	-	3411	1	Intergenic	novelGene_53424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2257	2676	1968580	1968161	NA	75	ATGTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCFITSLYYNSLFTCKSPCLPACELIHFCTQYCYTGYKLNFWMCTEWVRNLSESHSTWLPKAETKTWERRGKEGNPTSQCQYCSPTCLYRSAKLPESDSHRVASGDGGKGAAFQPWAWATSAVWIGVWFRASPLTSP	1970836	1967425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1967400_1970800
874203	contig_7840_pilon	-	5283	1	Intergenic	novelGene_68998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAGAGATAACAGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271643	266360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_266400_271600
874204	contig_2646_pilon	+	3833	2	Intergenic	novelGene_69562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAAGGTCGGCCTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867613	871864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_869523_869940
874205	contig_7635_pilon	-	3324	2	Intergenic	novelGene_171369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	210	596	112350	111964	TRUE	30	ATACATTAGGAGCCCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCKVCMIRNSTHESFYHSEMLEHFDSKRGKVINYYLINSVISQLSPGLNLCLGHRTGNCWLTGLEQNGLKLSKHPSLPSMIYSRMQQMSTMTEVPFQEYRNVQSQKNKVSALKESISERVSDRVSS	112559	109076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_109084_109242
874206	contig_6674_pilon	+	3436	1	Intergenic	novelGene_148008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1610	1960	173120	173470	NA	60	CAAAAAAACAACAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLMCLSWGKWLLMKGLKWYVENTNQELMMQPLQCTISKLCSTVLPMPWVHGLSFMSSVGTQVKESYLPPPPLYPETGLGVRDLDSLARVLDVRLLCLYFSGFITDLEEQENSAY	171510	174946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_171500_174900
874207	contig_1239_pilon	+	3363	1	Intergenic	novelGene_150408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTTTCTGCCTTTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629378	632741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_629400_632700
874208	contig_5696_pilon	-	2723	1	Intergenic	novelGene_117592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTTTTTGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754875	752152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_752200_754900
874209	contig_6576_pilon	+	5763	1	Intergenic	novelGene_42352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCTGTATGTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733851	739614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_733900_739600
874210	contig_1150_pilon	-	574	4	Intergenic	novelGene_61406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30584.16143838	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309280_309324_309385_309812_309927_311002
874211	contig_11171_pilon	+	1064	4	Intergenic	novelGene_48610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	604.826329526823	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	371	448	239275	249997	TRUE	15	AGATGGCTCCACCTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRETDTGSREAASPEMPGPEIGQQLQEASIRFHLHGPAAP	235061	251953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_235394_239236_239336_249980_250068_251407
874212	contig_17470_pilon	-	4069	7	Intergenic	novelGene_110502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	31.2569992161756	192	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	847	1494	259024	256564	TRUE	30	CAGACCTTGTGAACACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKGPGALGRFPRPLLSAHSAALQSQGRPSSEGLPPQPLLVLPPPPIRIFSYPEKEEKKKWKDLRLMKKLERQRAQEEQAKRQEEEAAALQREDQGRPYTLSVALPGSILDNAQSPELRTYLAGQIARACAIFCVDEIVVFDEEGQDTKTVEGEFMGVGKKGQACVQLARILQYLECPQYLRKAFFPKHQDLQFAGKAWWALPPFPVDHPHPRH	259870	252264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_253023_254045_254194_254365_254469_254997_256673_256766_256857_257050_257211_258735
874213	contig_5770_pilon	-	1447	6	Intergenic	novelGene_74181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2103.27348673443	1701	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	858	1412	264932	261935	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265789	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
874215	contig_9440_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_59065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATTGGAAAAAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527810	525850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_525800_527800
874216	contig_6871_pilon	+	1730	5	Intergenic	novelGene_21625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	357.198124295187	727	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	100	561	623952	625553	TRUE	0	TCCCCCGTCTGGCCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSCKQRPPPPPLGASLGPSTSGPTGTASERGGRMNVGTAHSEVNPNTRVMNSRGIWLSYVLAIGLLHVVLLSIPFVSVPVVWTLTNLIHNMGMYIFLHTVKGTPFETPDQGKARLLTHWEQMDYGVQFTASRKFLTITPIVLYFLTSFYTKYDQIHFVLNTVSLMSVLIPKLPQLHGVRIFGINKY	620560	627035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_620635_623926_624126_624865_625018_625417_626258_626570
874217	contig_12080_pilon	+	3216	9	Intergenic	novelGene_128414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	99.1191675459394	120	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	255	1679	538806	555715	FALSE	50	AATAAAAGAAATTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLSPTQLSALCKHLDNLWEEHRGSVVLFAWMQFLKEETLAYLNIVSPFELKMGSQGKVQRRAAQALPNTELDFRGAAVSDVDQEEVVDERAVQDVESLSSLIQEILDFDQAQQKKCFNSKLFLCNICFCDKLGSECMYFLECRHVYCKACLKDYFEIQIRDGQVQCLNCPEPKCPSVATPGQVKELVEAELFARYDRLLLQSTLDLMADVVYCPRPCCQLPVMQEPGCTMGICSSCNFAFCTLCRLTYHGVSPCKVTAEKLMDLRNEYLQADEANKRFLEQRYGKRVIQKALEEVESTEWLEKNSKSCPCCGTPIEKLDGCNKMTCTGCMQYFCWICMGSLSRANPYKHFNDPASPCFNRLFHAVDVNGDIWENEIED	531721	557252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_531784_537435_537612_538789_538960_539988_540141_543369_543898_544556_544786_552069_552243_553428_553560_555657
874218	contig_8907_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_85796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2	331	175915	175586	NA	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFCCGSLLDPSVTDLVSLTKNCVASHILGKHFRTCVLSLYNRIFQIFKFCFHFAQFILKSISFLSHFTVSGKETPRGPFKILLRNLSQIQVLPFHQTFEHNSDRFFATA	175916	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173300_175900
874219	contig_8822_pilon	-	2142	6	Intergenic	novelGene_117924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	139.906540233114	54	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAAATATTGTACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103771	49962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_51598_57093_57174_60739_60836_61525_61653_77031_77173_103708
874220	contig_3602_pilon	+	3541	1	Intergenic	novelGene_60546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	136	345	299967	300176	NA	40	GAGTCAGAATTGATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGSVVDERGFVWEKAVEGDFFRVQYSESNHLHVDLWPFYPRNGVMTKDTWMDHRQDVEFPEHFLQPLVPLPFAGFVAQAPNNYRRFLELKFGPGVIENPEYPNPALRSLAGGG	299831	303372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_299800_303400
874221	contig_10103_pilon	-	5031	1	Intergenic	novelGene_86179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACACAGCAATAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715525	710494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_710500_715500
874222	contig_8286_pilon	+	883	1	Intergenic	novelGene_139792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88702	89585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_88700_89600
874223	contig_11292_pilon	+	4560	1	Intergenic	novelGene_109436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAAGGGGGCCTCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287610	292170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_287600_292200
874224	contig_10051_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_175596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	53	421	241962	241594	NA	50	GAATATATCCTAGAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMDRKTQPVKMSVLPKVIYRYNAIPIQIPTAFLNEIEKLITNFIWKGKRPRISKALLKKKNKAESLTLPNLRTYYTTTVVKTAWYWYNDRHTDQWNRIKNPDVSLSTHGQLIFYKGPKSIK	242014	240879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_240900_242000
874225	contig_12931_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_166766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAACAAACAGAAGGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93960	91636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_91600_94000
874226	contig_19851_pilon	+	2519	4	Intergenic	novelGene_29871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_3	673.890363651405	3	154	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	63	350	53637	54149	TRUE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAVQVQGLGPQREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKGNAAAGRGRDKSGASHPPRGQHCVPFCRFVRRWFRRAPLLPLSGCRSAQGALDSGR	53574	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_55753_55840_55882_56006
874227	contig_3241_pilon	+	2701	1	Intergenic	novelGene_146400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTACCCAGCAGCTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824217	826918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_824200_826900
874228	contig_50_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_122207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19261	16824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_16800_19300
874229	contig_6418_pilon	-	3574	1	Intergenic	novelGene_81161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1977	2345	308117	307749	NA	70	TGCCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLCCFSQQQSKGSRAQQACQCFLLQALNTWAVSGGPRKREVQKAEQGRPSPAFLQFRVESGKTDPIGIAVVDEEANLPPLTQQLQPLPFMEDGGVTSSSVTDVMPGAAGTAANAEQRLSL	310093	306519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_306500_310100
874230	contig_7411_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_137029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAAGTACCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357957	360664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_358000_360700
874231	contig_4891_pilon	-	4323	2	Intergenic	novelGene_124611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	0	199	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	61	747	1073827	1071536	FALSE	10	CCCACTTTGTGGTGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGASEQRNDNEWQVLQPEGPMLVAEGETLLLRCTVVGSWIDDMIKWIRVRNQDQQEIYNFKHGFFPGVMPLAQWTLKSLNWDYSIHIPHVTKEDAGTYHCVRFDGLSQHLEKTLDEGTSVLVKGAGDPEPDLWIIQPQELVSVTTGDTVFLNCTVIGNGPLGPIRWFRGTGVSREAIYNFEGISHPNVTAVRASNNDFSILLEGISIEDAGTYYCVKFQRRLNRQYLSGQGTRLRVKGETRNTVSWDM	1073887	1067959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1071913_1073517
874232	contig_8487_pilon	-	4658	1	Intergenic	novelGene_111916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	487	1464	712	2175	197567	196104	NA	25	CCAGACTTTAGCTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEQVAVHQGTHPTKKPYTCGTCGKGFWFHANLHQHQKLHAGEKPFRREESRVSVLKSCRVHLSEKPIQYREGRKDILISSNLPKHQGTHSGHETVSSECGEAFHTGKKHHKCHECGKAFSQKYLLVQHQRIHTGEKPYECSECGKSFSNKSNLHIHQIIHTGERPYDCSECGKSFSRNADLLQHRRVHTGEKPFKCSECGKPFRHNSTLVQHQRIHTGVRPYKCSECGKFFSHNSSLMKHQRVHTGEKPYDCRECGKAFIHKSSLIQHQKLHSGEKPFKCNECGRFFSENSSLIKHWRVHTGAKPYECSECGKFFRHKSSLANHRRIHTGEMPYECSDCGKSFSQSFNLIQHQRVHTAEKPFTCSECGKPFRHNSTLVQHQRIHTGVRPYECSECGKFFSNTSSLMKHQRVHTGVRPYECSECGKFFSHNSSLMKHQRVHTGEKPYDCRECGKAFSHKSSLINHCRVHTGAKPYECSECGKFFRHNSSLAKHRRIHTGEMPYECSDCGKSFSQRFHLIQHQIVHTGEKPYDCRECGKAFSHKSSLINHWRVHTGERPYECSECGKSFSQNSTLIQHRKIHTGEKPFKCNECGRFFSENSSLVKHWRVHTGAKPYECSECGKFFRHNSSLARHRRIHTGEMPVGAATVGNPLVSNSTSCNTREFTVEKSLLSVANVGNPLGTTPCLLGTRGFTLEKGLNAANAGKSLATPPASSTLESSHWRKAL	198278	193620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_193600_198300
874233	contig_13760_pilon	-	1239	6	Intergenic	novelGene_61290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	195.610838145538	10	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	41	802	194443	161870	FALSE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLLPQGSAQLARMTEGPRKASKKFKFFKFKGFGSLSSLSRSFTLRHSSSPISIQSHLQPNTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSFAAVMGALDMAQVLRGPVEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEGPPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPAEGPEPWDNTEHGVEVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	194483	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164506_165315_165377_192148_192336_194406
874234	contig_19957_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_57689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	19	330	97206	96895	NA	35	AAAACTTTTGAGTCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEIKCMILSVVVTCFELKISEKSLIILPSKGFFVTASYRTGGAASAPAWPSVIRDNGQEKVPPLLTPQHEAPLFTSTLCLEFDLESLIRYQGHRHGRTTKRIPTWSQA	97224	93941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_93900_97200
874235	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
874237	contig_6589_pilon	+	1856	4	Intergenic	novelGene_26173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.161959912091	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	84	731	1901836	1903971	FALSE	70	CTAAAGCACAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSEPRPWGLRVLLLFLPGTLGADSHLSLLYHLTAVSSPTPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNNLRAEAEPCGAWVWENQVPWYWEKETTDLRNKEKLFLEALKVLGGGDSQTLQGLLGCELGPGNVSVPTAKFALNGEEFMTFDPKAGNWSGDWPEVDTISSQWRKQAEAVNKERVFLLSSCPQRLLGHLERGRGNLEWKGEEPLNRSHLFHSLP	1901015	1905096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1901085_1901821_1901909_1903195_1903448_1903648
874238	contig_7179_pilon	-	2523	1	Intergenic	novelGene_78196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	672	1031	1294563	1294204	NA	70	TGTTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYSRSFPLLSFHFLYIMEASTLAGEKVLGSLRREITLRRMVLGEPESAQSRALSACPLDTGAGGHDILTYVFTLGELWGDQAPCTHPTSVSSWVPGAEPPHLTFWVGFHCSEGSSPI	1295234	1292711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1292700_1295200
874239	contig_7004_pilon	+	1454	6	Intergenic	novelGene_126487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	35.8195477358383	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	403	1311	406323	408168	FALSE	30	TCCAGAGACAGTACCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPERIWVQFQEIPLGPLPAPSPKMMLGPLTLHLDGSLLAFLDFLCPQGPIRSILPMTFEAVKQDHGFMLYRTHLVNTFTEPTSFWVPNNGLHDRAYVMVNGVFQGVLERNIKHRLFLTGKMGDKLDVLVENMGRLSFGSNSSDFKGLLEPPLMGHVVLTQWLMFPLKIDNLVKWWFPIQLPKRSQPSTPSGPTFYSATFPILGLVGDTFLYLPGWSKGQVWINGFNLGRYWTKRGPQQTLYVPKPLLFPRGTFNKITLLELENVPPRPQIQFLDRPILNSTLYRTYLYSLSAGEQMELSGH	405920	408311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
874240	contig_7744_pilon	-	2159	4	Intergenic	novelGene_62463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	776.278443744396	19707	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCTGCTATGGACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437742	431505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_432396_435759_436697_437311_437450_437548
874241	contig_8571_pilon	-	2645	15	Intergenic	novelGene_169164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_14	120.33060326298	244	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	287	2065	418224	379107	FALSE	45	AAAGTTTTAAAAACTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPAASPTPASPASNRAVTPSTEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPSETSPSFSKAENKGVSPIVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSDSVDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSTKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNSEHKRGPEVTSQGVQTSSPGCKPEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAVPNMPQQRQDQHHQSTMMHPASAAGPPIVATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVPSSATQFGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPTAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSVQAHHQQQL	420496	378526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_379136_379964_380134_382304_382533_383145_383292_389502_389557_393535_393669_393989_394175_406983_407045_407394_407548_408131_408196_409255_409561_417312_417384_417656_417765_418151_418350_420335
874242	contig_2100_pilon	-	4013	1	Intergenic	novelGene_50632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACAGCAATTCTCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917131	913118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_913100_917100
874244	contig_1813_pilon	-	3348	1	Intergenic	novelGene_105517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCCTGGGAGGGCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431147	427799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_427800_431100
874245	contig_8375_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_141297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATAATGTAACCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148013	145588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_145600_148000
874246	scaffold_880_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_121490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATTCTTTTCGTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511235	513065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_511200_513100
874247	contig_4742_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_130991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGCTGCTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203951	201714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_201700_204000
874248	contig_7887_pilon	-	5150	1	Intergenic	novelGene_124865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCATGTTAACTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166711	161561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_161600_166700
874249	contig_1275_pilon	+	923	2	Intergenic	novelGene_108835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	52	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	88	777	747279	747968	FALSE	20	AATTGTGTCTGTCGTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746549	748114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
874250	contig_1239_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_150398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATAATTCCATTAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170538	172058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_170500_172100
874251	contig_1337_pilon	-	3068	1	Intergenic	novelGene_84246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTTATATAACTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431793	428725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_428700_431800
874252	contig_12948_pilon	-	2509	5	Intergenic	novelGene_126211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1304	junction_4	123.454445039456	66	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	29	847	261199	256124	FALSE	25	ACTTAAATTTCCTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETLKGLHKMDDRPEERTIREKLKATCMPAWKHEWLERRNRRGPVVVKPIPIKGDGSEMSNLAAEPQAEGQMSAASPVPKGRRSPSPGSSPSGRTVKSESPGVRRKRVSPVPFQSGRITPPRRAPSPDGFSPYSPEETNRRVNKVMRARLYLLQQIGPNSFLIGGDSPDNKYRVFIGPQNCSCGRGTFCIHLLFVMLRVFQLEPSDPMLWRKTLKNFEVESLFQKYHSRRSSRIKAPSRNTIQKFVSRMSNSHTLSSSSTSASSSENRLVLFKELKALIQC	261227	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_256316_256684_256802_257404_257606_259249_259451_261091
874253	contig_11815_pilon	-	4510	1	Intergenic	novelGene_50955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACATTCCACTGTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490937	486427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_486400_490900
874254	contig_13542_pilon	-	5081	4	Intergenic	novelGene_131482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1852	2283	467536	467105	TRUE	5	TCCGGGTCAGCGCCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPACSYLGGPCTPALCWTRARWLLPDARPQLCHFLLERPSTTTLLKAASHSLSRSHCSSDLSIHLLSVLPQWEHHGGRDLVWHVRSCNLRTEQVSPQMSVKKMSKFWTLELENGGFISQLHHLLALPSWTSYLTSLNMLTHF	469387	346537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_346639_417044_417134_453981_454101_464615
874255	contig_6434_pilon	-	1570	1	Intergenic	novelGene_61834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGGTGAAGGACGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701755	700185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_700200_701800
874256	contig_16882_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_148233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCACCCCAGCCCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384050	381868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_381900_384000
874257	contig_17127_pilon	+	2279	5	Intergenic	novelGene_168290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTTGCCCCCCATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3684	41512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_3804_36808_36898_36980_37120_39221_40908_41266
874258	contig_10197_pilon	+	4112	1	Intergenic	novelGene_115192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGGGCTCTGGTAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527792	531904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_527800_531900
874259	contig_12935_pilon	+	3450	7	Intergenic	novelGene_165721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_1	62.8826066748367	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	47	853	161610	260050	FALSE	70	GTGAGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTPGRANPIPASTAAMSSNSFAYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMMAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAAADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEVSVEQS	161563	262647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_161738_199297_199374_221271_221347_244806_244903_245525_245687_251086_251154_259846
874260	contig_10627_pilon	+	4248	1	Intergenic	novelGene_60067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGTCCATAAAGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313473	1317721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1313500_1317700
874261	contig_8156_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_98941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	549	884	396860	396525	NA	60	CAGGAATGAAAAATAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKPKFPSGCHGHSEEPLQQSVGTGNFVTEGKASFSPFSFRRPTVEGWEGVPGHLDTPSCPQSILTVVLRHSLAASLSPPWVSRDSCPHGGPASHQGRCLEAFQNILEKH	397408	395230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_395200_397400
874262	contig_5302_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_81458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	65	334	204969	205238	NA	40	GATACAGACCACTGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGDSLGLGSGHRSGEVRRLEMCLEGSPCACQSPLVLQLSHNSAAFRTLLSVLVLHSPGQDSSAGTHQPGPCDSSPLARAWFGLYSFVSSSQLGTPRGSTWFWSIWVPRV	204904	207923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_204900_207900
874263	contig_9437_pilon	-	3705	25	Intergenic	novelGene_141728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_13	49.9195011716085	267	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	853	2562	27	2588	427981	228592	FALSE	15	CCCTGAAAGTGTGGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGRKELVMLLLEYNADTTVVNGSGQTAKEVTYDKEIRNMLEAVERTQQRKLEELLLAAAREGRTAELTALLNRPNPPDVNCSDQLGNTPLHCAAYRAHKQCALKLLKSGADPSRKNKNDQKPLDLAQGAEMKHVLVGNKVIYKALKRYEGPLWKSSRFFGWRLFWVVLEHGVLSWYRKQPDAVHHIYRQGCKHLTQAACTVKSNDSCLFFIKCFDDTIHGFRVPKNSLQQSREDWLEAIEDHSAYSTHYCSQDQLTDDEEEDTVSTVDLKESLEKAQSCQQRLDREISSFLKMIKECDMAKEVLPSFLQKVEVVSEASRETCVALSDCLNLFTKQEGVRNFKLEQEQEKNKILSEALEALATEHHELEQSLVKGSPPLSILSEDEFYDALSDSESEQSLSRLEAVTTHSFEEEGEHLSSRKARMSERKDCGGGDSVSNGIKKHRTSLPSPMFSRNDFSIWSILRKCIGMELSKITMPVIFNEPLSFLQRLTEYMEHTYLIHKASSFSDPVERMQCVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELVRDDLGFRLISEQVSHHPPISAFHAEGLNNDFIFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPKGTITLELLEHSEAYTWTNPTCCVHNIIVGKLWIEQYGNVEITNHKTGDKCVLNFKPCGLFGKELHKVEGYIQDKSKKKLCALYGKWTECLYSVDLATFDAYKKNDKKNTEEKKNSKQMSTSEESDEMPMPDSESVFVIPGSVLLWRIAPRPPNSAQMYNFTSFTMVLNEVDKEMESVIPKTDCRLRPDIRAMENGEIDQASEEKKRLEEKQRAARKNRSKSEEDWKTRWFHQGPNPYNGAQDWLYSGSYWDRNYFNLPDIY	444351	227474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_228695_230260_230352_231837_231962_232590_232708_235758_235886_236962_237053_237637_237746_239415_239599_240993_241092_242091_242227_256123_256200_301578_301736_318732_318896_355845_355953_384627_384710_395838_395962_397201_397301_403937_404002_404112_404187_405261_405307_405407_405470_422515_422661_423968_424055_427878_427991_444334
874264	contig_13607_pilon	+	3830	1	Intergenic	novelGene_170228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACATGTTGGAGTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476639	480469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_476600_480500
874265	contig_3277_pilon	+	1818	13	Intergenic	novelGene_74726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	681.050230648714	1	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	143	1420	240775	278442	TRUE	30	GTGTGGAGTAAATTATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRYMRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPRMMKAITRLHKAMMFLEYFTSNSWVWNTDNVNMLMNQLNPEDKKANI	188834	280326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262684_263618_263687_265054_265227_272438_272573_278434_278563_280048
874266	contig_6589_pilon	+	357	5	Intergenic	novelGene_26099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4048.43642657261	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	73	333	1879768	1880585	FALSE	5	ACTGGCCTGGCCTGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876574	1880609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876584_1879530_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
874267	contig_4531_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_47854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAGTAACACCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139206	141838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_139200_141800
874268	contig_10857_pilon	-	1899	2	Intergenic	novelGene_160864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1	528	22149	21622	TRUE	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELQRQKERHPPEWRARFQEDHLPRHAQLATCLPAPESPALARRPGVSIALWLNGPWPLTPWPRPPAAPPAPQDRGHSPPPPWASLSSGGVLRLNPGVRVCVRVRWPPGASRAGRLGASTPSLVSLPPSGLQVEVWSKWGSGWVLLLIYCCKRTKPPSGNVKQVAGAWGCPAGAG	22149	20183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21545_21611
874269	contig_6451_pilon	+	1617	4	Intergenic	novelGene_173695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_2	73.5859286065542	855	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	850	1176	278328	278654	FALSE	35	ACACATAAGCACGTAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWWGLRDPPVDFPDTAFLCPQGVATGSPLWAEMAARRRAAVQPAWCHVLGPGDLCAGKRHGLEAQAPGCHQTDPAFQCLLSCKREVVMAAVPETGWSRRPRLCCII	12376	279095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231_153334_277800
874270	contig_715_pilon	-	3002	3	Intergenic	novelGene_167545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	17.5	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	128	1855	155315	26980	FALSE	35	ACAAGTGTTTCCATATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVETVKQNPVEVTSERESTSGSSVSSSVSTLSHYTESVGSGEMGAPTVVVQQQQQPALQGVAPQQMDFSSTGPQSVSAASIPQSVLQSQISQVQLQSQELSYQQKQGLQPVPLQTTVSAATGIQPLPVNVVGVTSALGQQPSSLAHPHLPYSQTAPPVQTPLSGAPPQQLQYGQQQPAVSTPMAPGHGKSVTQNPTSEYGHVQQQPILQTAVSSGQPSSAGVGAGATVIPVAQPQGIQLPVQSTVVQAQPAGASGQAIGQAQTAVSAVPTSSQIANIGQQANIPTAVQKPSTQVTPSVQQGAPPSSQVVPPAQTGILHQGVQTSASSLPQQLVIAPQSTLLTVPPQPQGVESVTQGVVSQQLPAVSPLPSASSISVTNQVSATVPSAMPSAPTNVVPPQNIAQTPATQNGNLVQGVSQPPLIATNISLPLAQQVPLSSAQFSAQSLAQAIGSQIEDARRPVEPSLVGLPQTISGDSGGTSAVSDGSSSSLAASASLFPLKVLPLTTPLVDGEDESSSGASVVAIDNKIEQAMDLVKSHLMYAVREEVEVLKEQIKELIEKNSQLEQENNLLKTLASPEQLAQFQAQLQTGSPPATSQPQGTTQPPAQPASQGSGPTA	155442	25832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_715_pilon_-_27238_28363_28416_153897
874271	contig_13481_pilon	+	2458	5	Intergenic	novelGene_119498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTTTGATCTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388222	1398478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1389579_1389671_1389844_1391335_1391435_1395365_1395559_1397840
874272	contig_7744_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_62588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCGTCAAACAAAAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028313	1030411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_1028300_1030400
874273	contig_6488_pilon	+	3515	1	Intergenic	novelGene_44763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCCTAGCACATAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194383	197898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_194400_197900
874274	contig_6175_pilon	-	3079	3	Intergenic	novelGene_16326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1192	1527	1495447	1493858	FALSE	90	AAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSSFLYPCSVSSSVTKKAAFSTASRDCLFFPRAKYAWRHLAQGTLSRSECRQLRFSRLGLRWIVQNPLYLLLDLPGLQQPAVMVEPDLEVAPSVVHNNVLAVFYVLDGI	1499632	1492305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1494054_1495307_1495497_1498490
874275	contig_9471_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_21693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAATGTCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61862	60330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_60300_61900
874276	contig_4486_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_38642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGCTCAAAATGACCGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1016303	1014114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1014100_1016300
874277	contig_8138_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_52488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307397	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_307400_307900
874278	contig_6027_pilon	+	4234	1	Intergenic	novelGene_74448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAAGGATGTTCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269298	273532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_269300_273500
874279	contig_14326_pilon	+	3502	4	Intergenic	novelGene_120756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGCATCTTTACCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565465	613206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_565504_582907_582981_606617_607143_610340
874280	contig_14326_pilon	-	2215	2	Intergenic	novelGene_120746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAACTTTCCAGGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537855	533644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_534836_536831
874281	contig_1331_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_37850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	478	1437	327	1763	194500	195936	NA	20	GCTTATGCTTTTTGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRSRRRAAAKWATVRANSGRTPADENEDDCELPPSPGDSSYYQDQVDDFHEARSRAALTMGWNELDSGDDEEDGEEEEEVLGLDIDDEDDEDGESVGDEEDGDDNDGGGSSVESETEASVDPSLSWGQRKKLYYDTDYAPKSRGRQSQQEVEEEEREEEEEAQLIQRRLTQALQEDDFGVTWVEAFAKPVTQVDEAETRVVKDLTKVSVKEKLKMLRKESPELLELIEDLKVRLTEVKDELEPLLQLVEQGIIPPGKGSQYLKTKYNLYLNYCSNISFYLILKARRVPAHGHPVIERLVTYRNLINKLSVVDQRLSSEIRHLLTLKDDTGKKELNLKVKSTKAKPKSVSETSAAASDVTDLSDDSNFDKEAALKYYKEIEDRQKLKRKKEESSTEEQALEDQNAKRAITYQIAKNRGLTPRRKKIDRNPRVKHREKFRRAKIRRRGQVREVHREVQRYSGELSGIRAGVKKSIKLK	194173	195949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_194200_195900
874282	contig_16882_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_148255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGTCTGCTTCCGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590441	592642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_590400_592600
874283	contig_7870_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_109042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCCCTCACCATAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622806	620184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_620200_622800
874284	contig_12427_pilon	+	3011	16	Intergenic	novelGene_40404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	31.3165912718624	94	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	63	1214	6250	55773	TRUE	15	TAATTTGTGCTTACCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVFPFPEVDQEELNEINQFMGPVEKFFTEDVDSRKIDQEGEIPKETLEKLKSLGLFGMQVPEEYGGLGLSNTMYARLGEIIALDTSITVTLAAHQSIGLKGIIIAGNEEQKTKYLPRLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRTRATLSEDKKHYILNGSKIWITNGGLADIFTVFAKTQIVDSNNLIKDKITAFIVERNFGGVTNGKPEDKLGVRGSNTCEVHFENTKVPVENVLGEVGGGFKVAMNILNSGRFSMGSSVAGMLKKLIEMTAEYACTRKQFNKNLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMAYLTAGLLDRPGLPDCSVEAAIVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYMRDYPYERLLRDARILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRVLTSRIK	6187	60535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_6284_33630_33733_36185_36293_37394_37496_39300_39380_43868_44044_46431_46506_48983_49060_50697_50769_51046_51167_52617_52747_55689_56703_56999_57078_57996_58126_58843_58917_59947
874285	contig_1034_pilon	-	439	2	Intergenic	novelGene_175513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	682	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	99	437	1726	1276	FALSE	30	TGTGTCCACAGTGTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPIVIGFIVLCLLSAGSFDAEVTQTPRHLLKGKGQKVKMDCVPIKGHSYVYWYQQIPAKEFKFLISFQNEKIFDGNEMPKERFSAECPQDSACSLEIQLEALQDLALYLCAS	1824	1273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1034_pilon_-_1566_1677
874286	contig_8260_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_163256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTTACCCGATTTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202774	204406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_202800_204400
874287	contig_1867_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_54623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGGAAAAAAAATACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566721	564394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_564400_566700
874288	contig_5854_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_68865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAGGAAATAACTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403954	401564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_401600_404000
874289	contig_12479_pilon	-	2755	18	Intergenic	novelGene_56821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCGGCCAATCGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220525	76329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_76421_78773_78934_92940_93066_95742_95834_95978_96082_96398_96578_110724_110897_119057_119113_163895_163985_164073_164162_165732_165810_195306_195414_209147_209318_212818_212967_213173_213343_213528_213644_216918_216999_219789
874290	contig_5039_pilon	+	3009	1	Intergenic	novelGene_64873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401545	404554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_401500_404600
874291	contig_5799_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_50270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264296	266649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_264300_266600
874292	contig_6205_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_160339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59838	58035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_-_58000_59800
874293	contig_6137_pilon	-	2708	18	Intergenic	novelGene_59139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	97.1563502885122	35	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	441	2660	961692	916623	FALSE	25	TTTAATACGTCCTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEYRGRGFGHGRFQSWKRRRGGGNCSGKWRERECRPDLSKTTGKRTSEQTPQSLLLQSTLDQFIPYKGWKFYFSEVYSDSSPFIEKIQAFENFFTRRIDLYDKDEIERKGSILVDFKELTKDDEITNLIPNIANELRDTPEKTLACMGLAIHQILTKDLERHAAELQAQEGLPSDGETMVNVPHVHARVYNYEPLTQLKNVRANYYGKYVALRGTVIRVSNIKPLCTKMAFLCAACGEIQSCSLTDGKYNPPTKCPVPACRGKSFTALRSSPLTVTVDWQSIKIQELMSDDHREAGRIPRTIECELVHDLVDSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSVSNSKGQKTKTSESGSKHGTLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLTLALFGGSQKYADDKNRMPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFTLEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEDHDHLLSEHVIAIRAGKQRAVSSATVARYSQDSNTSVLDVVSDKPLSERLKVAPGETTDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTDAAQVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTEARARLELREQATKEDAEDIVEIMKYS	974812	916574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_916627_917441_917519_918808_919019_919305_919523_921675_921872_928492_928635_930458_930600_931359_931391_936359_936556_936784_936937_941886_941973_955838_956038_956812_956917_958799_958950_959361_959445_961182_961267_961544_961698_974377
874294	contig_15491_pilon	-	3222	1	Intergenic	novelGene_75990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCCAAAATGGGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155364	152142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_152100_155400
874295	scaffold_19766_pilon	-	1079	6	Intergenic	novelGene_34330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	445.866975677724	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	211	858	622205	596625	FALSE	25	GTACCTAGAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLLLLLLLLPALPQADNNSYGVKQQKQLLAPKGGSIHIPFFFYYPWESIDVSISWRLEHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGQDTDPKLDHKDDGIVYASLILSSPASPGAPPRQPPHGIPQAETLYSVLKA	622415	596403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596748_596919_596952_597196_597247_598328_598360_621454_621815_622153
874296	contig_14516_pilon	+	4564	2	Intergenic	novelGene_153940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1321	1773	330029	330481	FALSE	20	ATTAATTCTTTTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELKSSNYGVGEEYWVYHARRTNKSVLEEVQPECSLEVKMASLRLTFFGRVIRRDQPLEKDIMLGRVEDQRKRGRPSMKWIDTVAATMGSSITTIMRMVQDRAVFRSVIHRVAMSPNQLSGTYNNNSRVTSAIYFDNFRVFISLYSANI	328663	333272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_329816_329860
874297	contig_7457_pilon	-	1190	5	Intergenic	novelGene_31671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2219.61723896261	4	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	145	468	1176842	1174926	TRUE	10	CTGGCTTGCCGATTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEDQLKVHGF	1176986	1174110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174507_1174599_1174953_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
874298	contig_14450_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_49070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTGCCGAAGACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500780	1498240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1498200_1500800
874299	contig_6958_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_69998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732620	730475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_730500_732600
874300	contig_9074_pilon	+	3168	15	Intergenic	novelGene_156617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCTGCCAGCTGCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58788	82970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_60330_62805_62886_63084_63265_64800_65003_67448_67536_70246_70309_70812_70954_71843_71951_76157_76237_76325_76498_78722_78844_78927_79017_79639_79791_80067_80138_82884
874301	contig_17522_pilon	+	2810	3	Intergenic	novelGene_160794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_2	52.5	666	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	25	375	57911	65627	FALSE	15	AATTTCATCCTTTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAVAAGAMVGGEAAAAVEELVSGVRQAADFAEQFRSYSESEKQWKARMEFILRHLPDYRDPPDGGGRLDQLLSLSMVWANHLFLGCSYNKDLLDKVMEMADGIEVEDLPQFTTRSELMKKHQS	57886	68062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_58150_59690_59791_65615
874302	scaffold_12124_pilon	-	1414	3	Intergenic	novelGene_22079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTATCAGACTGCGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858981	854647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_854801_857162_857231_857788
874303	contig_10324_pilon	-	3369	1	Intergenic	novelGene_7790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAATCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131597	128228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_128200_131600
874304	contig_8866_pilon	-	1896	6	Intergenic	novelGene_77765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	556.047695795963	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	337	342	342326	342321	TRUE	15	TCTGTCTATCTTTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQVSLETSGEALSRGAILEGEDDTPVRDTKM	363426	340695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_341936_342006_342354_348798_348850_356557_356636_361315_361406_363336
874305	contig_11428_pilon	+	2317	2	Intergenic	novelGene_138504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	8	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1463	1783	205685	207057	FALSE	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKDNILVSGNADSTVKIWDIKTGQCLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGERGSCVADQSLEHKAGVCSWESKRD	204222	207591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_205782_206833
874306	contig_12000_pilon	-	3393	1	Intergenic	novelGene_43180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAGCCATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506640	503247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_503200_506600
874307	contig_5575_pilon	-	2203	2	Intergenic	novelGene_122060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAATATCGTGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213304	210930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_-_211488_211658
874308	contig_11986_pilon	-	2970	1	Intergenic	novelGene_69115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	121	306	104044	103859	NA	55	AAAAAAAATCCGACTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGTLSQKYYRLQNGLSCTIASLGERKLPPLFCLPGPKHMHLIGGSSSVASVLAVGRLGSVTEAPPRLRSWSGCHVLIHHIHHSALLAPPHIGRLQIITG	104164	101194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_101200_104200
874309	contig_3269_pilon	-	2054	8	Intergenic	novelGene_117007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1084.76893053455	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	66	1196	65626	50674	FALSE	30	ATGAATTGTCAATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMKEDAGMMDVHYSEEILLELLEQCVDGLWKAERYEVISEISKLIIPVYEKRREFEVGNLNKLTQIYRTLHGAYTKILEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDKVNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERNTEFERNHNITRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPINYEQQIHLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSPADVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPLAYARTFLNDSQASKYPPKKVNELKDVFRKFIQACSVALDLNERLIKEDQIEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQASIRVVENETMIWGP	65691	49815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_50861_52711_52813_53479_53671_53949_54161_55787_55935_56458_56573_61048_61187_65584
874310	contig_9463_pilon	-	2948	11	Intergenic	novelGene_83853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_3	17.2362989066679	127	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	471	1457	679294	674002	FALSE	25	TACAAGGCAGGCGTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQVALKSEEATATQQHLEEAKKEHTYLLESNRQLQRVLDELRARKLELESQVELLQTQSQRLRKRLSGLEAEAQKKQDRLNESAVESNASPCFEPDLHVEDLRKSLGTNQTKEVSSSLSQSKEETDLSLDSVRHYLSAEGIALRSAKEFLVRQTRSMRRRQTALKAAQQHWCHELASAPEAAKDPSGTRVLEDVRKNLEEETKHLDEMKSAMRKSQDLLKKKEEKLNQLESSLQEEASDEDTLRGASTKKVVTFDLSDMEDMSSESSESSPLPQIKLTPSPTFPNKIHYLSSSLQRISSELNGVLSMLGSLNTQPPPPLFTSTPAKFSPLASKGTPVPTYPSLPRVPAPAPDTPMSTRWAWDPGLGPRLSSSVAQTVDDFLVEKWRKYFPTGVPVLSSGPAPLENRLGYVSASEQLRLLQHPHSQLPEAGSANFQGMIEANRKWLEHFKNDPKLRPFSVPKPTARSGLLQLGLDENNRLKVYHY	681620	672510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_674096_674260_674384_675354_675422_676279_676628_677219_677335_677993_678102_679162_679371_679837_679906_680147_680272_681057_681234_681594
874311	contig_5302_pilon	+	1528	7	Intergenic	novelGene_81476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.020761372077	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	286	675	328325	337399	FALSE	5	TCCTTCTTCTGTTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSALWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSAKVNNSSLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA	306686	338252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306698_319879_319962_320055_320109_328185_328414_333908_334060_336232_336291_337307
874313	contig_4678_pilon	+	3948	11	Intergenic	novelGene_126004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	293.141604007347	269	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1225	3675	273	3947	159532	286635	FALSE	40	ACCCATCAAAGGAGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKTRTALSDDPDSSTSTLGNMLELPGTSSSSTSQELPFCQPKKKSTPLKYEVGDLIWAKFKRRPWWPCKICSDPLINTHSKMKVSNRRPYRQYYVEAFGDPSERAWVAGKAIVMFEGRHQFEELPVLRRRGKQKEKGYRHKVPQKILSKWEASVGLAEQYDVPKGSKNRKCVRSSIKLDSEEDMPFEDCTNDPESEHDLLLNGCLNSLAFDSEHSADEKEKPCAKSRVRKSSDNPKRTSVKKSHMQFEAHKEERRGKISENLGLNFISGDVSDKQASNELSRIANSLTGSNTAPRSFLFSSCGKNTAKNEFETSNCDSLLGLPEGALISKCSGEKKKPQRGLVCSSKVQLCYIGAGDEEKRSDSISICTTSDDGSSDLDPVDHSSESDNSVLEITDAFDRTENILSMQKNEKIKYSRFSATNTRVKAKQKSLITNSHTDHLMDCTKTAEPGTETSQVNLSDLKVSTLVCKPPSDFRNDSLPPKFNTSSSISSENSLIKGGTTNQSLLHSKSKQPKIRSIKCCKHKENPVVVEPPITNEDCNLKCCSSDTKGSPLASISKSGKVDGLKLLSNMHEKTRDSSDIETAVVKHVLSELKELSYRSLNEDVSDSGTSKPSKPLLFTSASGQNHIPIEPDYKFSTLLMMLKDMHDSKTKEQRLMTAQNLVSYRSPGLADCSANSPAGASKVLVSGASTHNSEKNGDDTQDSAHPSPSGGDSALSGELSTSLPGLVSDRRDLPASGKSRSNCITRRNCGRSKLSSKLQDGFSAQLGKNTVNQKALKTERKRKLNRLPGVTLEAALPGDRESGGSASVSSRGGREDPGKEEPLQLKGHLTSEDCSHFSDIHFDNKVRQSDPDKIPEKAPSFENRKDPELDSEMNSKNDEHNGVHQVVPKKRWQRLNQRRTKPRKRTNRFREKENSKGAFGVLLPGDPVQKGSDFPEHRPPTSTNVLEDAVTDPNCAGHLDSAGPRLNVCDKTNASIEEMEKEPGIPSLTPQSELPEPAVRSEKKRLRKPSKWLLEYTEEYDQIFAPKKKQKKVQEQIHKVSSRCEEESLLARCRPSVQNKQVDENSLISTKEEPPVLEREAPFLEGPLAQSELGGGHAELPQLTLSVPVAPEISPRPALESEELLVKPSGNYESKRQRKPTKKLLESNDLDPGFMPKKGDLGLSKKCYETGHLGNGITESCAATHSKEFGEGATKMFDKPRKRKRQRHATAKMQCKKVKND	158117	286636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_158306_159447_159562_160301_160392_229297_229434_251050_251224_253131_255707_274403_274529_277577_277849_279510_279621_284391_284468_286546
874314	contig_6189_pilon	-	5528	1	Intergenic	novelGene_164965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	2068	2619	206796	206245	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQVS	208863	203335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_203300_208900
874315	contig_5815_pilon	+	952	6	Intergenic	novelGene_141214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	228.370751192004	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	31	729	561980	571884	FALSE	25	TATTGGTGTAAGAGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	561949	572107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_567037_567804_567990_571741
874316	contig_5815_pilon	+	1154	6	Intergenic	novelGene_141208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	319.49209692886	18	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	64	786	561980	571884	FALSE	25	GCTTTATAGTTACATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	561916	572252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_567037_567804_568014_571741
874317	contig_12050_pilon	+	3401	28	Intergenic	novelGene_62754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	49	junction_14	100.111186473163	310	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	868	2607	8	2614	737090	797495	TRUE	10	CACCTCTGGTGCTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRFKVSKFRHMEARLPRREAWINDIRAGTTPSCGNQIKSSCSVIAFNSDRPGVLGIVPLDGQGEDKRHVTHLGCHSDVVTDLDFSPFDDFLLATGSADRTVKLWRLPAPGQALPTVPGLVLGPETLQVEVLQFHPTADGVLASAAGVAVKVWDVARQQPLTELAAHGDLVQSTVWSRDGALLATACKDKQLRVFDPRAQAEASQSTQAHENCRTSRLVWTGTQEHLMSTGANQMREREVKLWDTRHLSSALASLTLDTSPGSLMPLLDPDSGLLILAGKGESQLFCYEVATLQPALSPVNQCILESTLRGAALVPRRALAVLNCEVLRVLQLSDTAIMPISYRVPRKAVEFHEDLFPDTTGCVPASEPQAWWAGSNQQVQRVSLNPARRPHNSFTSPLLPPMELPPVPAQLVEMLVEDTDPSEGFSSPPSSLASPSTPSSLGPSRSSTSGIGTSPSQRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPGESDGFCANRLRVAVPLLSSGGQVAVLELRKPGRLPDSALPTLQNGAAVTDLAWDPFDPHRLAVAGEDARIRLWRVPPEGLEEVLTTPEATLTGHREKIYSLRFHPLAADVLASSSYDLTICIWDLQAGAERLRLQGHREQIFGLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYDPRSGPEPLQEGPGPEGSRGARIVWVCDGHCLLVSGFDSRSERQLLLYAPEALAGGPLAVLGLDVAPSTLLPSYDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPEAPFFLECNSFTSPDPHKGFVLLPKTECDVREVEFARCLRLRQTSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVSWEPVLSAEAWLGGANGQPRLLCLQPPRHDPSKPGPT	737082	799009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_737150_740130_740228_741152_741228_743693_743765_744393_744578_748281_748359_759970_760022_767552_767640_768123_768207_790403_790459_790926_790985_791067_791214_791295_791389_791523_791656_792174_792302_792818_792995_793463_793573_793676_793764_793840_793984_794064_794170_794236_794323_795331_795474_795582_795673_796583_796701_796969_797107_797476_797569_798040_798128_798382
874318	contig_1009_pilon	+	1734	10	Intergenic	novelGene_121751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	40.0327026810658	532	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	188	1258	260614	272389	FALSE	20	CTACTGGGTACAGAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTVDVVGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVTERGKAEAADLRPGDIIVAINGESVEGMLHAEAHSKIRQSPSPLRLQLDRSRAASFGETNGERSLELLATRFQGSVRTHTDSQSSLRSSYSSPASLSPRPGSPFSPRPATSPHTLTGEGVISRSFQSLALTPGPAADHLSYGGRPGSRQAGLSRAGDSAVLVLPHSPGPQSSSPRLSVDSEGGRHLLEEDSEVFKMLQENREGRVAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQASLSTGRALATPPKLHTCEKCSTSITNQAVRIQEGRYRHPSCYTCADCGLNLKMRGHFWVGDELYCEKHARQHYSASSTLSSSQA	260231	272865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_260417_260611_260707_261459_261612_263744_263815_263909_264062_264225_264302_268833_268917_269119_269266_270765_270884_272208
874319	SIRV6	+	729	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	54	0	54	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10291	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
874320	contig_4845_pilon	+	4479	1	Intergenic	novelGene_53643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAAAAGAGATTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310917	315396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_310900_315400
874321	contig_233_pilon	-	2245	6	Intergenic	novelGene_14689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	654	junction_4	946.913174477998	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	120	965	126907	105369	FALSE	15	CCAGTGGGGACGCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPVRLPPPRSLIPPTGSLRGGVGPLTLPRTSF	127026	104088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
874322	contig_20356_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_159549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAGTTTGTATTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132964	131248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_131200_133000
874323	contig_8330_pilon	-	3708	1	Intergenic	novelGene_71951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1455976	1452268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1452300_1456000
874324	contig_2204_pilon	+	1941	7	Intergenic	novelGene_71657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	155.253556051598	1	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	226	957	14864	50221	FALSE	35	GTTAAATTTTTAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSECTGCCPYLNDLLKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVSMSELYPLQISPVSSYAESESTDSVPSDEESTEGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15430_15470_25596_25715_38679_38845_48669_48717_49912
874325	contig_5238_pilon	-	3639	4	Intergenic	novelGene_176257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1979	2329	100907	100557	TRUE	20	CTCTCACGGTCTTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVGLRATGGSFRSILVSPHSSPLQRGCVRWLVTRQFHFYYKCDFKLYQKPLITQPGVQIHYLETQNAKSHLSTLASFLSISPFHKQTSFVLLIFFKKEVGWEGIKEGSKEEKIDN	102885	66060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_66280_69257_69435_70845_71093_99889
874326	contig_10988_pilon	-	4239	1	Intergenic	novelGene_104730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2440	2754	94607	94293	NA	85	ATATAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRLPLTPQFSLFPFSVTFQKHKIGFRERKTRASNYRMLKLSCCIGRVQCSGIALQPHLCSEEVWKSLVLNTERLRRAEPRLHDSKVDGSLRLLTEECRKANL	97046	92807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_92800_97000
874328	contig_992_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_164297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCGTATAGCGCATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362141	358953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_359000_362100
874329	contig_15866_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_63599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGACCAGACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263908	266398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_263900_266400
874330	contig_10801_pilon	+	2917	1	Intergenic	novelGene_74051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAATAATAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325558	328475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_325600_328500
874331	contig_20165_pilon	-	2546	14	Intergenic	novelGene_54473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_13	93.585830617181	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	93	1931	102709	49894	FALSE	35	CCTGCATAGAGCAGTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGNTLIGKFEGARSPPLSLPRGLANSAVRMESDVGSSVRSGPVTALGGLDSGPGSSSQEKAKAGECQPLESQLTDLRIPQELPICGDHAVMSPGIQAAAGNGDSLLDTGPTGEQSGNGKVPNRDSGIDSPSCSVAGESFPGEESSEAVQGPAMLGLHPGTDTQEAPQDTASDVDKGSSEAGQGPAMLGLHPETDSQDASQDTASDVDEGSSEGPDPGTILQTGGVEAGMAKSPKPQQLFNIAQELLHTEEAYVKRLHLLDQIFCTRLSEAGIPVEVTTGIFSNISSIYRFHRQFLLPELQARIVDEWDVNPRLGDILQKLAPFLKMYGEYVKNFDRAMELVGVWTQRSVLFKDIVHDIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLKRLPADAPDQRDAEKSLELISTAANHSNAAIRKMEKMHKLLEVYERLGGEEDIVNPANELIKEGHIQKLSAKNGTTQDRYLFLFNSMVLYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDIVKPNAAHTFVITGRKRSLELQTRTEEEKNEWIQVIRTTIEKHKQNSETFKAFSGPLGWNEDSTPPLQTHLWWVPAPWSPLWRPMAAEVLEGSTAESLPLKRGVRRRGRAARAAGRPSTPSPRGGTAASSAAQ	104030	49278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_50021_58020_58084_70009_70120_70987_71019_72217_72298_75017_75111_75354_75502_77719_77779_78298_78438_89208_89366_92258_92396_92999_93090_102103_102759_103987
874332	contig_2757_pilon	-	1938	7	Intergenic	novelGene_164580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	63.8983567863838	164	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	201	1292	176412	171697	FALSE	25	GATTCATTTATATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTDREKKKEKYLFVQSVTKLTEWRLFPRESFPRERRQGSHRRTLWELGGEHRQAEPLPTGVGCTLRMPRSFLVKSKKAHTYHQPHIQEDELAWPPALTPVAGDQVLSNGPVLSTLFTNQCLDWTSLKREPKPELDRSLTRMASAPEGPVVMSRAQDGDSPPSDSPPFYKPSFSWDALASSYGHSYRQAASTMQSAFLERSVSLYGSPLMPNAEPPLDFSLRYSPGMDTYHCLKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHIHSQGTPARSSPALSLALPGGEAPPAPDPLGPRFLRQERSFECQMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFTCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK	182424	171050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_171876_172751_173017_173937_174076_174679_174952_175960_176099_176312_176433_182244
874333	contig_11574_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_64052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATTATCATGTCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433454	434820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_433500_434800
874334	contig_3571_pilon	+	2180	5	Intergenic	novelGene_88704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	696	1127	30399	31536	TRUE	50	GCTACAGAATAAAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHGGHKCPAVCLWVIHLHRAEVRLSIITPHSIQAPAAGHKGDATPTCVHGDYQAPLVCHRAVHLGNAEEARAVVAPADEHLASQGGSAVPAALVEHACCRVPGGRVVVVVLTHTVEDLQAVVASRHIYPALKDRNPSSTAI	29703	39324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_+_30738_31443_31560_33381_33490_36653_36875_38623
874335	contig_11677_pilon	-	678	5	Intergenic	novelGene_85921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	17833.5356141176	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	76	633	597508	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEPLMHVWPGAPTAGIEAKSDRFLSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598058	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597553_598027
874336	SIRV6	+	698	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	85	0	85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10322	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
874337	contig_3575_pilon	+	2658	1	Intergenic	novelGene_141108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAAACACACTTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400384	403042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_400400_403000
874338	contig_3601_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_132945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	24	395	437490	437119	NA	85	CCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVRINLMAMGLVFGYTFTMCYLRIFSSCNVNTGLFYKRMLCYTTSYFDFLNYINAITQCCHQISVEFESNFQIVLCSGCQEQETKNIFMYHEVDQILIHLFTDNPNRKTGQFVAMIRYILAKCESLFVC	437513	434910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_434900_437500
874339	contig_16578_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_148640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAGATAGGAGATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140024	142458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_140000_142500
874340	contig_7171_pilon	-	1884	16	Intergenic	novelGene_101412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_13	24.9924433023709	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	5	1540	1463113	1451349	FALSE	10	GCTTTGTGGATCTGATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAASMVRRLWPLLASRGLWSRGGCACNQSARKNFATKRQDRNLLYEHAREGYSALPQLDMEHLCACPEEAARALELRKGELRPADVPAIISMWQELTQLGEQIQRLEEEKGAVAEAVRALLENQDKDQVQQHPQYQSLRARGREIRKQLNSLYPKEAQLKEQFYLRALRLPNQTHPDVPVGDESQARVLHVVGDKPAFSFQPRGHLEIGEKLDIIRQKRLSHVSGHRSYYLRGAGALLQHGLVNFTLNKLVQRGFIPMTVPDLLRGAVFEGCGMTPNANPSQIYNIDPSRFEDLNLAGTAEVGLAGYFMDHTVAFRDLPVRMVCSSTCYRAETDTGKEPWGLYRVHHFTKVEMFGVTGPGLEQSTQLLEEFLSLQMEILKELGLHFRVLDMPTQELGLPAYRKFDIEAWMPGRGRFGEVTSASNCTDFQSRRLHILFHTDDGELRFAHTVNATACAVPRLLIALLESYQQKDGSVLVPPALQPYLSTDRITAPAHVPLRYIGPNQPRTPSS	1463117	1451004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1451472_1451554_1451621_1452054_1452148_1452232_1452327_1453350_1453461_1453537_1453626_1453710_1453757_1454009_1454119_1454324_1454373_1455041_1455148_1455380_1455445_1456373_1456429_1456508_1456650_1457388_1457419_1458123_1458220_1462846
874341	contig_18393_pilon	+	3298	8	Intergenic	novelGene_167465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_3	83.6620997750804	164	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	430	1542	93737	99510	TRUE	55	CAGAGAAAAAAATAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMNLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQEEDVTSKAFTGREFDELSPPAQRDACLTARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKSEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKDDNPDFDGVDCAVFESPYPMTMALSVLVTIEMCNALNR	88027	101362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_+_88149_93428_93866_95083_95420_96803_97025_97479_97683_98986_99073_99372_100170_100265
874342	contig_6441_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_172883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	18	308	257158	256868	NA	15	GTTAAGCTGTTGCCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFKSNMLMKRKYSNSTGKFTIKCFLSTLSVSLLIGTLQFLLYSEMVGYTHGICMYLSLVTRMDVPFPPFGLSIKFRDLSKSPYGDLLFINGYIVFHFNDAQ	257175	254599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_-_254600_257200
874343	contig_14682_pilon	-	2639	1	Intergenic	novelGene_139095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGTATGGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79989	77350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_77400_80000
874344	contig_6724_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_167975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAGGCAGCAAAGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349461	345622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_345600_349500
874345	contig_7119_pilon	+	3381	3	Intergenic	novelGene_41031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	13	185	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	91	1209	410161	411279	TRUE	15	CAAACTGGCTGCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEDYNASIAYDDAYPDDFSSIMILEEMSPQLQARVARIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIITTFKMKKTVNTIWFLNLAVADFLFNVFLPLHIAYTAMDYHWVFGMAMCKISSFLLIHNMYTSVFLLTVISFDRCVSVLFPVWSQNHRGIRLAYVACTVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANQHGRITCFNNFSLSAASSSLQSAHVLSDHVGYTRHMAVTITRFLCGFLVPILIITACYLTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLYLLELYHTAMPGSIFSLGLPLATAIAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSVNERCSMHERETSMV	377894	414526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_377982_410157_412437_413511
874346	contig_12622_pilon	+	1659	9	Intergenic	novelGene_5767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCGCTGTGGAGGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94709	194578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_94852_95807_96383_99903_100008_100177_100365_100739_100912_102622_102726_103190_103365_104265_104370_194480
874347	contig_6735_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_15830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGACCTCCGGTTCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665310	663647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_663600_665300
874348	contig_8019_pilon	+	1584	10	Intergenic	novelGene_126981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	21.1869981094276	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	967	1416	231796	242466	FALSE	40	TTAATTATACCACAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACQKIHTTLQEQLTAKERQEEDAKRRISLAENELEIMKTLLNQTKEEVVTLKNERELMLISHQKRVKQLQETLTQKLLSDDNWREKTPPECLLLEQQRDLSCLCLCRSCPSLHSHPARGFQILLTGEEVSVFRSCSSTPAHRGLVLRC	91617	242634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_91636_97772_97863_152433_152554_195244_195431_215116_215199_216292_216648_231345_231424_231758_231963_240500_240595_242277
874349	contig_4604_pilon	+	2090	7	Intergenic	novelGene_19186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	66.2998240319435	804	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	91	768	526638	548080	FALSE	5	TTTCTTGTATTGCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTGLVAGEAVVDALPYFDQGYEAPGVREAAAALVEEETRRYRPTKNYLSYLTAPDYSAFETDIMRNEFERLAARQPIELLSMKRYELPAPSSGQKNDITAWQECVNNSMAQLEHQAVRIENLELMSQHGCNAWKVYNENLVHMIEHAQKELQKLRKHIQDLNWQRKNMQLTAGSKLREMESTWVSLVSKNYEIERTIVQLENEIYQIKQQHGEANKENIRQDF	526547	549402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_526731_526840_526934_535549_535621_540751_540914_545202_545254_545868_545950_547953
874350	contig_10341_pilon	+	930	5	Intergenic	novelGene_47213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	859	junction_2	130.746653876877	6501	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	170	556	63271	64998	FALSE	20	CTTAGCTGTGTTATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGKAGKDSGKAKTKAVSRSQRAGLQFPVGRIHRHLKSRTTSHGRVGATAAVYSAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDSLIKATIAGGGVIPHIHKSLIGKKGQQKTV	63101	65372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_63274_63681_63760_64039_64154_64484_64615_64936
874351	contig_11978_pilon	+	4304	1	Intergenic	novelGene_62806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGAATGGGTGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339572	343876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_339600_343900
874352	contig_4876_pilon	-	3369	13	Intergenic	novelGene_137903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_12	124.162416034626	58	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1119	3357	12	3368	525487	420452	FALSE	45	TGAAAAATAAAGCTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARMVTGGGAAPPGTVTEPLPSVIVLSAGRKMAATASAPGCSSGAGAAGVSEWLVLRDGCMRCDADGLHSLSYHPALNAILAVTTRGTIKVIDGTSGATLQASALSAKPGGQVKCQYISAVDKVIFVDDYAVGCRKDLNGILLLDTALQTPVSKQDDVVQLELPVTEAQQLLSACSEKVDISSTEGYDLFITQLKDGLKNTSHETAANHKVAKWATVTFHLPHHVLKSVASAIVNELKKINQNVAALPVASSVMDRLSYLLPSARPELGVGPGRSVDRSLMYSEANRRETFTSWPHVGYRWAQPDPMAQAGFYHQPASSGDDRAMCFTCSVCLVCWEPTDEPWSEHERHSPNCPFVKGEHTQNVPLSVTLATSPAQFPCTDGTDRISCFGSGSCPHFLAAATKRGKICIWDVSKLMKVHLKFEINAYDPVIVQQLILSGEPSSGVDSRRPTLAWLEDSSSCSDIPKLEGDSDDLLEDSDSEEHSRSDSVTGHTSQKEAMEVSLDITALSILQQPEKLQWEIVANVLEDTVKDLEELGANPCLTNCKSEKTKEKHQEQHNIPFPCLLAGGLLTYKSPATSPISSNSHRSLDGLSRTQGESISEQGSTDNESCTNSELNSPLVRRTLPILLLYSIKESDEKAGKIFSQMNNIMSKSVHDDGFTVPQIIEMELDSQEQLLLQDPPVTYIQQFADAAANLTSPDSDKWSSVFPKPGTLVQCLRLPKFAEEENLCIDSLTPCADGIHLLVGLRTCPVESMSAINQVEALNNLNKLNSALCNRRKGELESNLAVVNGANISVIHQESPADVQTPLTIQPEQRNVSGGYLVLYKMNYATRIVTLEEEPIKIQHIKDPQDTITSLILLAPDILDNREDDCEEPVEEMQLTSKNGIQREKKSDVSTLGHLVITTQGGYVKILDLSNFEILAKVEPPKKEGTEEQDMFVSVIYCSGTDRLCACTKGGELHFLQIGGTCDDIDEADILVDGSLSKGLESSSEGSKPLSNPSSPGISGVDLLVDQPFTLEILTSLVELTRFETLTPRFSATVPPCWVEVQQEQQQRRHPQHLHQQHHGDAAQHTRTWKLQTDSNSWDEHVFELVLPKACMVGHVDFKFVLNSNITNIPQIQVTL	525498	420450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_420576_422008_422235_424113_424264_457705_459101_468377_468437_470055_470217_470293_470517_474897_474981_478150_478263_482787_482982_487253_487392_489501_489684_525177
874353	contig_9272_pilon	+	1867	7	Intergenic	novelGene_125924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	99.5569351342905	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	178	852	322791	327365	FALSE	30	TTTTTCTCGTATGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLYRNPYVEADYFPTKPMFVIAFLSPLSLILLAKCLKKADTADSRQACLAASLALALNGVFTNTIKLIVGRPRPDFFYRCFPDGQAHPDLMCTGDKDVVNEGRKSFPSGHSSFAFAGLAFASFYLAGKLHCFTPQGRGKSWRFCAFLSPLLFAAVIALSRTCDYKHHWQDVLAGSMIGLTFAYVCYRQYYPPLTDAECHKPFQDKLVLPTVQKKPGDPYHFDV	322436	328380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322565_322741_322851_323324_323416_323879_323944_324411_324537_325357_325529_327201
874354	contig_17470_pilon	+	3336	1	Intergenic	novelGene_110545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	299	454	292557	292712	NA	60	TTGGTAACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRAETRAYSSPSSPAATSATHPLWALPVFGKHGALGLEWPDGCPELQVPQGTRRAGWHLCWTRTEANQSHSLRARARSQDWPSLWGLAGQGWCVQCTGGMCAWVGLWQKSEHYVVCSVESVLLLYILRACLGPGRKQIPSEEGGGLEPRL	292258	295594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_292300_295600
874355	contig_10003_pilon	-	3767	1	Intergenic	novelGene_88196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCAGTAATGGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480356	476589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_476600_480400
874356	contig_10940_pilon	+	3244	5	Intergenic	novelGene_49198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2056	2466	432293	443679	TRUE	20	CTCGCGAGACCGCACTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPAAPCNLPSSSVRSLVQLVLSFTFLKWGCFSLSPVSKTATLTLAPVYPICQSTSACRVWATCRGMALSSRLLECLPVACQNPEPRERLARRRGRDDCHFWLHLVSLHGTRGSDSAYLRERKTFRWGVTRLMFG	430237	458364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_432432_434197_434405_443614_443873_444579_445066_458265
874357	contig_8020_pilon	+	2800	8	Intergenic	novelGene_114442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7.40656079818041	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	330	1355	321966	331625	FALSE	20	ATGCTGTAAGGTACCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNPALAGALGAQQLSTWLLTERLIYNGTSRATQFPDGVDVRVPGFGQTFSLEFLDPSKSSVGSYFHTMVENLVGWGYTRGEDVRGAPYDWRRAPNENGPYFLALRKMIEEMYQLYGGPVVLVAHSMGNMYTLYFLQQQPQAWKDKYIHAFVALGAPWGGVAKTLRVLASGDNNRIPVIESLKIREQQRSAVSTSWMLPYNHTWSPEKVFVRTPTTNYTLRDYHQFFQDIGFEDGWLMRQDTEGLVDAMVPPGVRLHCLYGTGVPTPDSFYYESFPDRDPKIYFGNGDGTVNLQSVLQCQAWHGRQEQQVSLLALPGSEHIEMLVNTTTLAYLKRVLLGP	317344	333070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_317497_321514_321672_321945_321991_322110_322157_328276_328396_328645_328745_329219_329445_331113
874358	contig_10451_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_138333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTCTGAAAGCAGTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486059	484045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_484000_486100
874359	contig_5770_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_74145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCATTTCCCTAGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64635	66414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_64600_66400
874360	contig_8587_pilon	+	2505	13	Intergenic	novelGene_159156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_10	63.9921870231046	332	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	15	1388	545201	579255	FALSE	10	TCTTGGGCAGTCCCCGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNYTFQQVQEHTDQIWKFQRHDLIEEYHGRPPAPPPLILLNHLQLLVRRVILKIPPKRHKQLKNKLEKNEEAALLSWEIYLKENYLQNQQYQLKRRPEQRVQDIGNKVDTMVELLDVDRMKRSGSLEQRLASLEEQMAQIARALHWIVRALRDGGLGSEADAPAPAPQKAPEEQDLTPGSRQKVEDGDDLYHVNARHLLYPSCPVTRFPVPDEKVPWETEFVIYDPPFYTAERKDKAIVDPVGSSLELLSKISYNTVDGLVDRRSFHGPYTVCDGLPLNPMGRTGLRGCGSLSCFGPNHALHPVVTRWRRNQDGAICRKSIKKVLEVLVVKHLWSEHWALPGGSREPGETLPRKLKRILRQEFWPSFESLLKQGVEVYRGYVDDPRNTDNAWIETVAISVHFQDQNDVELKRLNSHLYSCDPEVSFRWQVVDRCIPLYANHKTILQKAAALFEAYY	545186	580372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_545209_548953_549136_549518_549652_559815_559904_561794_561883_562535_562694_563564_563642_564506_564609_571193_571281_572496_572603_574211_574314_578357_578475_579129
874361	contig_4686_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_118504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATAAGAGGAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395214	393145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_393100_395200
874362	contig_2380_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_117904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTTGCCGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505125	502978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_503000_505100
874363	contig_13004_pilon	+	3216	2	Intergenic	novelGene_112670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1373	1702	653332	653661	TRUE	5	GTGGTTGTGATTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGLHFLPFLLGNGSLWELKSQGLECKTEFEEWRWDTYRAPNPTHLLYSGPFQQGFSKHHPQTPRSISSLPCCYGFHIQRCPGLQNVWKICLQLGMNWKAVFLLEVKR	651959	676455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_654031_675310
874365	contig_2358_pilon	+	2083	2	Intergenic	novelGene_156107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	158	1093	86551	87486	FALSE	30	CAGGCCCCCCAACACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTGPSGLPRDSKLKVAELRELGGEEESRTCGRLGSRELTPFVRSFSKHEGRGGQVISGPSGKAVREAASPCSTGLSAASIWISGQVFSMETSRRVSVSVPGSSSPSAPSIPSNPSPSLASRAWEPPSAHKASRILSESKLPGVMSMMVSFPSSESGDSSSESSHKNRGPRVSGCRKRDELLPTFLSSGMPLESPSTASWPSSTSGVGPEGPSGSLQYSSAGAATGEAALNSGRLSTSTISGRDVGTEGCSRALARQSGSNSSAGSSLALEKMPTRTRWIQSGSDSLPISGKITLQVMSSTTTWRPVRVSK	83939	88476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_84014_86467
874366	contig_11525_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_171074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAACTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31607	29784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_29800_31600
874367	contig_8310_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_75534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGTTAAGAGCTCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157985	155777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_155800_158000
874368	contig_2646_pilon	-	3053	15	Intergenic	novelGene_69675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	82.5847740080409	219	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	27	1565	2215518	2209692	TRUE	5	CTCCGTTTCTTTCCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVAGRVNKRGGGGPGGGGGGGGGPRGTEEEPPPPLQAVLVADSFNRRFFPISKDQPRVLLPLANVALIDYTLEFLTATGVQETFVFCCWKAAQIKEHLLKSKWCRPTSLNVVRIITSDLYRSLGDVLRDVDAKALVRSDFLLVSGDVVSNISITKALEEHRLRRKLEKNVSVMTMIFKESSPSHPTRRHEDNVVVAVDSATNRVLHFQKTRGLRRFSFPLGLFQGSGDGVEIRYDLLDCHISICSPQVAQLFTDNFDYQTRDDFVRGLLVNEEILGNQIHMHVTTREYGARVSNLHMYTAVCADVIRRWVYPLTPEVNFTDSTIQSCTHSRHNIYRGSEVSLGHGSILEENVLLGSGTVIGSNCSITNSVIGPGCHIGDNVVLNQAHLWRGVRVAAGAQVCQSVLCDNAEVKERATLKPRCVLTSQVVVGPDITLPEGSVISLHPPDAEEDEDDSQFSDDSGAGREEEKAKLKGYNPAEVGVAGPGLPLESCRCECGGRGGATAKSVGT	2215544	2207240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2207599_2207748_2207860_2208216_2209048_2209335_2209423_2209590_2209699_2209859_2209963_2210068_2210211_2210454_2210601_2211490_2211804_2212072_2212151_2212425_2212507_2212592_2212771_2212859_2213046_2213913_2214039_2215338
874369	contig_10801_pilon	+	3891	1	Intergenic	novelGene_74056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAAAGGAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350418	354309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_350400_354300
874371	contig_16578_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_148625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATCTATTTTCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110024	107419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_107400_110000
874372	contig_756_pilon	+	3927	1	Intergenic	novelGene_134777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAATACAATACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181493	185420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_181500_185400
874373	contig_14450_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_49064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCTCAGCGGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1479383	1477644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1477600_1479400
874374	contig_7229_pilon	-	2990	1	Intergenic	novelGene_39838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGGAAAACTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953314	950324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_950300_953300
874375	contig_11846_pilon	-	3059	1	Intergenic	novelGene_105925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1052	1399	171533	171186	NA	30	TGGTAACCCAGCTAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIESQGICVPVLGSTNCFWCDTGYGCSLGVIFFCRQRVCPPPRTPVRISETESALNQGGALSKVFTAGGTVCTKTEMLLWKKGLAIYFHKITLIETNGVQFYSETHGVTMNWT	172584	169525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_169500_172600
874376	contig_12638_pilon	-	2830	9	Intergenic	novelGene_33287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	965	1420	1101512	1098993	TRUE	30	TGAAGTCTTTATCATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRHHLWALLGKHLLGWGHPLGRGPKILALRVHNHLALWHKLGPRKDHGILRVQSSLLLDHLALGGHNLLVHAHQLRWWALLGLALDVAHVHLWNPRTTSLLVVHVAMNSHEAGLHHTWWSVGHLHLVLRRTRPLTTCMLDILICLQLRSS	1108849	1079888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1079939_1082939_1083099_1089647_1089768_1094874_1095004_1096002_1096852_1098889_1099037_1101100_1102220_1105197_1105318_1108712
874377	contig_756_pilon	+	2736	9	Intergenic	novelGene_134775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_1	154.662485351167	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	63	1424	177389	204241	FALSE	50	AAGGAAAAAGCTGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFLEDPSVLTKEKLKSELIANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLAASANSKGPPDFSSDEEREPTPVFGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRLEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYGVNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEDSTVELKLEKREPLKGRAKIPVTLKQRRVEHNQSYSQAGITDTEWTSGSSKSGPLQALTRESTRGSRRTPRKRVETSEHFRIDGAVISESTPIAETVMASSNETLVVNRVTGNFKHAAPILPITEFSDIPRRTPKKPLTRAEVGEKTEERRIERDILKEMFPYEASTPTGISASCRRPIKGAAGRPLELSDFRMEESFSSKYVPKYVPLADAKSEKTKKGRSIPMWIKILLFVVVAVFLFLVYQAMETNQGNPFSRFLPDSTESK	177326	205553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_177668_186009_186137_187913_188073_193805_193904_201392_201513_201611_201708_202141_202253_203248_203338_203958
874378	contig_3817_pilon	+	1086	2	Intergenic	novelGene_78334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATCTGTGTGCTGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204380	205550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_204612_204695
874379	contig_3424_pilon	-	4836	1	Intergenic	novelGene_55509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1215	1532	174597	174280	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHSLHNPKTSRTRWSPATTTYCSAWDYNRGSQTEQEKNVAQKIKFTKKTRLTGLTETGGTSKTMVPGHSSNSELKPLPKFTFQPKIKTKQNPLLLSRFRLIAML	175811	170975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_171000_175800
874380	contig_10104_pilon	-	2689	1	Intergenic	novelGene_160141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCACCAGCTACTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541285	538596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_538600_541300
874381	contig_12624_pilon	-	1287	2	Intergenic	novelGene_61088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGCTCCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888866	886362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_886725_887941
874382	scaffold_12124_pilon	-	2286	2	Intergenic	novelGene_22204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAGTACAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1365487	1361240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1361293_1363253
874383	contig_10074_pilon	+	2942	6	Intergenic	novelGene_57148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	49.5217124098107	42	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	154	792	467237	518575	FALSE	30	CTCACCCAGCAACAGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSSSLRVVGEGEAARSEVRVRTVRGRVEAAGRLPLAGAAFSKERIQLFSMFPLIAENKRVAWLLLSTGTCPRCIFRFCAVDFHAPYKLPYKELLDELQKFLETEKDTLIMEVPNPPLKKIRLEESEDAIDNLNQNGEGRISVIGDGSIASKNSNINVCNVCLGILQEFCEKEFIKKVCRKVEASGFEFTNLVFSVSFPPQLSVREHAAWLLVKQEMGKQSRSLGRNDIVQLKEAYKWITHPLFSEELGVPVDGKVSGHQPC	464050	520725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_464189_467221_467363_478322_478578_479301_479389_514040_514076_518439
874384	contig_11590_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_125598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAGAATACATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733754	736300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_733800_736300
874385	contig_13744_pilon	+	3297	1	Intergenic	novelGene_77143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAGGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88262	91559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_88300_91600
874386	contig_10855_pilon	+	2189	10	Intergenic	novelGene_124317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCCGGAGGCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319526	401198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_320325_325496_325584_329068_329256_331358_331486_344246_344369_344948_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381035_401136
874387	contig_14618_pilon	-	2827	4	Intergenic	novelGene_136780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.4220013439989	163	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	968	2170	26198	24996	FALSE	15	CTCAGGCTGTGTTACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQRTHAGEKPHMCKECGQGFRWKSGLLIHYRTHSGEKPHVCKECGLSFNQESSLLLHERTHSGEKPHVCEQCGRGFNHQSALIRHQRTHSGEKHYLCLECGRGFSRKSGLFLHQRTHSGEKPHMCKECKRSFRRKSDLLIHQRTHSGKKPHVCKDCGQGFNWESSLPLHQRIHTGEKPHVCKECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLIGHQWKHTDKKPYVCSECGKGFTQKSSLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFTQKSVLLNHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHLRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSILLTHQGTHSGEKPYLCKECGRGFNRESSFLLHQRTHSG	36096	24338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_26716_32011_32139_35599_35659_35832
874388	contig_14142_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_120557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	3	776	433655	432882	NA	35	AAAGTATTGTGCATCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433657	432443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433700
874390	contig_10163_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_82636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGCTTAAAAATTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129400	127462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_127500_129400
874391	contig_5033_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_28976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	61	330	529951	529682	NA	5	GTCCTGTCTGGGTTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHTSEASPYSHNSVISRGLSMITSRSLCRGVDLADSVRALRSKALASAAVSVSSERPKPFWSSSGRLLRSVVSSVPVLPCTTWIPSGPLNSMGGLWRKAQAALARAVLP	530011	529360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_529400_530000
874392	contig_934_pilon	-	634	5	Intergenic	novelGene_129022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	592	junction_2	152.444252105483	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	202	543	158890	150570	TRUE	60	AAAAAAAAACCATGACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAGEEEEEGSGSSEGFDTPATDGQFSGAQSQLRRPQYRPQYRQRRFPPYHVGQTFDRRSRVFPHPNRMQADEIGEMKDGVPEGTQLQGPVHRNPTYRPRYRRAPPRPRPAPAVGEAEDKENQQAASGPNQPSARRGYRRPYNYRRRPRPPNAPSQDGKEAKAGEAPTENPAPATEQSSAE	159091	148377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_148435_150535_150636_151153_151326_152947_153046_158884
874393	contig_9177_pilon	+	3382	1	Intergenic	novelGene_32772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACCCCAGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359798	1363180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1359800_1363200
874394	contig_7379_pilon	-	4395	25	Intergenic	novelGene_150009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTCCTGCGGCGGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528739	385616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_385658_426885_426984_433205_433296_446705_446846_447357_447485_468532_468671_468758_468823_472610_472801_480784_481122_490034_490131_492827_493003_495564_495620_495701_495787_495897_496024_499154_499235_499341_499414_501379_501469_505083_505244_508708_508843_508929_509074_514433_514554_517842_517948_520612_520711_521135_521209_527181
874395	contig_11476_pilon	-	3159	1	Intergenic	novelGene_170502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAGCTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45950	42791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_42800_46000
874396	contig_10494_pilon	-	2892	5	Intergenic	novelGene_102214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	24.1816045786875	154	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	103	840	1103915	1102094	FALSE	55	ATTAAGAGAAACCACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVHGSRQEEVIDHRLTDREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWLWRYSDTEDLKKGPPPSARPLSSSAEGLPADAHREFVPRTLSGYMPEEIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELISTERAKMERALAEAKRQASEDALTVVNQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHKDWEKHHHVCGQGLQGPEAMGTDPIPRQSDDAAASLGTSLPMGSTSPSEAGSTGPSRPCSPGPPGPLDAAPR	1104901	1100041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1102397_1102694_1102886_1102992_1103062_1103740_1103931_1104814
874397	contig_8676_pilon	+	6590	1	Intergenic	novelGene_142199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTGGAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214318	220908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_214300_220900
874398	contig_4686_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_118560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGAAGACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630206	631883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_630200_631900
874399	contig_16882_pilon	-	539	5	Intergenic	novelGene_148206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4018	junction_4	583.05124131589	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	17	508	188737	181967	FALSE	25	ATATTCTGTCTTAGGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	188753	181935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187625_188683
874400	contig_4364_pilon	+	2340	8	Intergenic	novelGene_97	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	34.2839285249232	39	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	80	1333	970644	1012684	FALSE	30	CATGATCCGTTTGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLRHHEEAISQAFPSSEIQQLQEQNMSLRNAIAQMRREMEALSDQILPSAHFGEKTSDTNQPNPNAAADTATPDYVLALEAEIRNLKHKFKTLEEQLEDILEPSKMSSFAEVQPDVCAADSAAGEGPILWGAPPQAEVAPTVLACRKLAGRVRLLDCLVSRLRQKVLQKPPEMDAVRLQLPHEVDQAHVEVLELGKQVAELEKHLGTTRKEGGEAVGGTPETTATRRQGPAGGEPTGTGDQGPQATQRSLELRLQRKLRAAAKSILRLQQEKEQLVEASNRLRAGLGRPRDTAGTPPGPSPIPVLEARSPGELPRPPLDCSLPLGQVQPRFTAQSQLRISTATCKSTHQKENRSPKPPQAQELHEENGPHTQRSLSLASSSLQDTWKLLDLGSSPSGPTSQDDSTPETGVLQTLEAVAASEARSHPVAASALLPSGPFPSVT	970564	1013691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_970789_972294_972466_973946_974051_976683_976873_981481_981669_1004892_1005024_1011113_1011331_1012574
874401	contig_2209_pilon	-	2305	12	Intergenic	novelGene_141000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.770318096587	31	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	18	665	248781	126653	TRUE	60	CTCTAAAATTAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAACAMCAHNPGTEFDLSWISNIQVNQPAVLRRAEQIQARRTVKKEWQAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVVINRTLVLTGQWEALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAVEV	248798	117466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_117756_117862_118776_120817_120974_122030_122181_125972_126086_126633_126664_184487_184617_202235_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248750
874402	contig_7870_pilon	-	2774	1	Intergenic	novelGene_108994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAATGTTTTTTAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461120	458346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_458300_461100
874403	contig_10135_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_106675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTATATTAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231916	233499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_231900_233500
874404	contig_8487_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_111912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTAAAAACAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136399	135451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_135500_136400
874405	contig_13348_pilon	-	1651	2	Intergenic	novelGene_162680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	328	402	74623	74549	FALSE	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGAIELVLTHNDPVYNRTKHCLVLHHHSGCSDGLKDNSYSEDGSRPGSVSFCCTQGCYELESTRQHLPTTIFREACFVLITVVSAIGKPVCSCRRVILLFFVPAFSPIMVGSLLSHVHIMVSTQLWSCLHPT	77904	73299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_74869_77822
874406	contig_13348_pilon	-	1887	7	Intergenic	novelGene_162681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	55.972215329473	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	59	1240	106149	73947	FALSE	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAQKAAARGGGCGSGCGLMDELVHDLASALEQTSEQNKLGELWEEMALSPRQQRRQLRKRRGRKRRSDFTHLAEHTCCYSEASESSLDEAIKDCREVAPVTNFSDSDDTMVARRHPALNTIVKSKQHSWHESDSFTENAPCRPLRRRRKVKRVTSEVAASLQQKLKVSDWSYERGCRFKSAKKQRLSRWKENTPWTSSGHGLCESAENRTFLSKTGRKERMECEADEQKQGSDENMSECETSSVCSSSDPGLFTNDEGRQGDDEQSDWFYEGECVTGFTVPNLLPKWAPDHCSEVERMDSGLDKLSDSTFLLPSRPAQRGYHARLNRLPGAAARCLRKGRRRLIGKETSISTLGTERIGHIISDPRQKEKNKALASAFPHISTCAHEVRFPVPYAILIFLEGSYARIFDSH	108414	73299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_74077_81903_81972_84730_84811_86601_86779_92543_92609_105487_106160_108366
874407	contig_6576_pilon	+	2173	3	Intergenic	novelGene_42311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAAGTCACTAGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523367	536475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_525343_526610_526702_536368
874408	contig_7234_pilon	+	3312	1	Intergenic	novelGene_145957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAAACCCAAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522725	526037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_522700_526000
874409	contig_9753_pilon	-	955	7	Intergenic	novelGene_41332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	363.371901622689	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	106	426	93294	70810	TRUE	30	AACCTTTGATTCAGACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRRRRNYFLA	93399	70008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_70667_70838_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
874410	contig_13421_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_166803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1114	1560	151968	151522	NA	30	GTTGCATTGAGCATGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPGGTQWLRAQLLTKKVGSLNPPATPWKPYGAVLLYPVGSLRVGIDSMAMGLSFFWYRIIQPVSLGGHSKKSLLVFSPSDLLTIPWKGDTKESLPRSLDLLWVFFFFFFNFLAGTYCKYLQSRADSCDLEALFLSGEISLSKCTRH	153081	150167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_150200_153100
874411	contig_10235_pilon	+	1857	9	Intergenic	novelGene_46586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	43.0041785760407	224	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	258	1169	567174	581650	FALSE	10	GTGTAGCTTGGTTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLLWPRLPPAGVLFLLPLLPLLLLPATPSPHRATYKPVIVVHGLFDSSYSFRHLLEYINQTHPGTVVTVLDLFDGRESLRPLWEQVQGFREAVAPIMAKAPEGVHLICYSQGGLVCRALLSVMDDHNVDSFISLSSPQMGQYGDTDYLKWLFPTSMRSNLYRICYSPWGQEFSICNYWHDPHHDDLYLNASSFLALINGERDHPNATAWRKNFLRVGHLVLIGGPDDGVITPWQSSFFGFYDANETVLEMEEQLVYLRDSFGLKTLLARGAIVRCPMTGIPHTAWHSNRTLYEDCIEPWLS	566729	582338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_566979_567165_567360_567602_567757_568225_568322_568409_568518_569300_569385_569503_569589_581262_581318_581506
874412	contig_12486_pilon	+	1656	3	Intergenic	novelGene_175831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	36	434	6918	11022	FALSE	15	GTCATGCTGACTCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGLQSMPGEYVARGGPMGVSMGQPSYTQPQMPPHPAQLRHGPPMHTYIPGHPHHPTVMMHGGPPHPGMPMSASSPTVLNTGDPTMSGQVMDIHAQ	6882	12244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12486_pilon_+_6943_8143_8234_10738
874413	contig_16883_pilon	+	3888	1	Intergenic	novelGene_161747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAATTAATATCATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367463	371351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_367500_371400
874414	contig_16525_pilon	-	550	5	Intergenic	novelGene_133859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	120	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	53	493	181436	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181488	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
874415	contig_14034_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_72668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGTATAAGATTGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383398	380989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_381000_383400
874416	contig_20939_pilon	-	2144	10	Intergenic	novelGene_172444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	51.3075933542246	313	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	81	968	102283	82224	FALSE	20	TATGGAGTCAGCTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPYHHDQLDRIFNVMGFPADKDWEDIKKMPEHSTLMKDFRRNTYTNCSLIKYMEKHKVKPDSKAFHLLQKLLTMDPIKRITSEQAMQDPYFLEDPLPTSDVFAGCQIPYPKREFLTEEEPDDKGDKKNQQQQQGNNHTNGTGHPGNQDSSHAQGPPLKKVRVVPPTTTSGGLIMTSDYQRSNPHAAYPNPGPSTSQPQSSMGYSTTSQQPPQYSHQTHRY	139784	81047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20939_pilon_-_82350_85431_85591_85710_85790_86517_86616_89137_89211_89905_89976_92361_92476_99758_99891_102246_102305_139725
874417	contig_2114_pilon	-	779	1	Intergenic	novelGene_104282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGAGCCCTGGTGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667082	666303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_666300_667100
874418	contig_11677_pilon	+	3002	14	Intergenic	novelGene_85967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	39.6627797144194	104	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	106	1800	681472	687940	FALSE	20	GATGGTGGGGTGACTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTESSPTEQDSRQLWLEVKNIEEHRQRSLDSVQELMESGQAVGGMVTTTTDWNQPAEAQQAQQVQRIISRCNCRMYYISYSHDIDPELATQIKPPEVHENQEKEDLLKKQEGAVDTFTLIHHELEISTNPAQYAMILDIVNNLLLHVEPKRKEHSEKKQRVRFQLEISSNPEEQRSSILHLQEAVRQHVAHIRQLEKQMYSIMKSLQDDSKNENLLDLNQKLQLQLNQEKASLQLESEELNILIRCFKDFQLQRANKMELRKQQEDVSVVRRTEFYFAQARWRLTEEDGQLGIAELELQRFLYSKVNKSDDTAEHLLELGWFTMNNLLPNAVYKVVLRPQSPCQSGRQLALRLFSKVRPPVGGISVKEHFEVNVVPLTIQLTHQFFHRMMGFFFPGRSMEDDEVGDEEDKSKLVTTGIPVVKPRQLIATDDAVPLGSGKGVAQGLNRSSGVRRSFRKVPEHPVDDIDKMKERAAMNNSFIYIKIPQVPLCVSYKGEKNSVDWGDLNLVLPCLEYHNNTWTWLDFAMAVKRDSRKALVAQVIKEKLRLKPAAGSEVRGKLETKSDLNMQQQKEEEKARLLIGLSLGDKNLGKKSIFGRRK	679378	689142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_679430_681417_681518_681801_681985_682565_682688_683180_683337_683422_683545_684787_684969_685838_685926_686012_686124_686259_686396_686494_686626_686809_686912_687205_687341_687757
874419	contig_14023_pilon	-	5441	1	Intergenic	novelGene_165384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	417	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	991	1320	287915	287586	NA	15	CAGAGTGGCTCTTCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILNRSAGPGESSRFCAPSNGGQTSVPTTKCLSGITSCHKEPLNVYEVITELEGNADISKQTSLYRRSNPTPKPKATQPVRGTEKEVTPPCSSKQVFHYVALTISTFI	288905	283464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_283500_288900
874420	contig_16125_pilon	+	6997	2	Intergenic	novelGene_155245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAGCTATTTTCCATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130418	137878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_135168_135630
874421	contig_10793_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_83420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAGTTCTCATTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141168	143403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_141200_143400
874422	contig_13800_pilon	-	3495	1	Intergenic	novelGene_153744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGATTGTATTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158395	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_154900_158400
874423	contig_12671_pilon	-	2915	17	Intergenic	novelGene_19198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_15	179.036265530199	194	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	439	2796	144027	91552	FALSE	40	TTGCACTGAACTCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENNSSESSFADSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENEMKRASPEPELHLRSYQMEAAKPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKKKKDSEPGKVIVLVNKVPLVEQLFCKEFKPFLKKWYRTMGLSGDTQLKISFPEVVKSYDVIISTAQILENALLNSEKGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNKEEVYNNIMRRYLKQKLKNNKLRKENKPAIPLPQILGLTASPGVGGATKQEKADEHVLKICANLDAFTIKTVEENIGELRAQIKEPCKKFAIADDTREDPFKEKLLEIMTKIQTFCQMNPMSDFGTQHYEQWAIQMEKKAARDGDRKERVCAEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYNHLETFYNDEREKKFAVLEDDSDESGDGDDDGDKDEDDEKKPWKLDGTDRFLMTLFFENKRMLKKLAENPEHENEKLMKLRNTIMEQYTRTEGSARGIIFTKTRQSAFALSRWITENEKFSEVGVKAHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKFRTGKINLLIATTVAEEGLDIKECNIVIRYGFVTNEIAMVQARGRARADESTYILVAPSGSGVIEREIVNDFREKMMYKAIDHVQNMKPAEYAHKISELQMQSIMEKEMKIKRSNAKHYKENPSLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNTTPEFKELYIVRENKALQKKFADCQTNGEIICKCGQAWGTMMVHRGLDLPCLKIKNFVVSFKNKSPKKQYKKWVELPIAFPDLNYSEYCLFSDED	197035	91432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_91732_91829_91921_92893_93085_96827_96990_107094_107245_111669_111930_112292_112569_113294_113419_115097_115215_116395_116614_117672_117884_122538_122760_128635_128741_143975_144123_147798_147968_195197_195309_196972
874424	contig_3382_pilon	-	2425	4	Intergenic	novelGene_124023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	567	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175488	169811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_170852_171889_172021_172923_173076_174386
874425	contig_4469_pilon	+	3245	1	Intergenic	novelGene_21936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631622	634867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_631600_634900
874426	contig_10940_pilon	-	1865	5	Intergenic	novelGene_49255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1110.34251472237	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAACAGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917122	874040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874758_875092_875505_875554_875675_893147_893306_916664
874427	contig_2114_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_104255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGAGTTGTTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447926	445358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_445400_447900
874428	contig_5690_pilon	+	2258	3	Intergenic	novelGene_119735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	365	junction_1	137	92	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	44	397	1044729	1077829	FALSE	30	GATCCAGCTAGAGAGCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSVGFLLLLSNLRILKSAYFNDVVKILSLNC	1044685	1079690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645
874429	contig_9272_pilon	+	2876	5	Intergenic	novelGene_125922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	118.27800936776	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	296	631	323369	324168	TRUE	35	CCAGCAGTCATCACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEGRHSRQQTSLLGCQPCPGSERCLHQHNKTDSGEVRISHPCICLSLFRREQLMALHHMDFSFILSLIFLIQHFLLSLYPSPAGGTCALCLEQHFPWTTTADSVLISTP	322422	328086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_322565_322741_322851_323324_323416_323879_325529_327201
874430	contig_15676_pilon	+	2847	5	Intergenic	novelGene_178178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_3	17.2699160391705	84	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	2395	2847	8113	14043	FALSE	35	GTTATAAATATTTACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSLELLLPLFKDTIEKISFESANLSASELKEISKQKEILTKELDTFKRVKQTLEHLLRKTEYKQIGDRLSSMFSEKLSENERGNANLKKKVLEKETYIQELSSLFQNEKANALKAHRFSQSVKVVHERLQLQINKKEAENDKLKEYIK	5718	14043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15676_pilon_+_8185_8879_9009_13068_13132_13259_13332_13926
874431	contig_1276_pilon	+	3547	19	Intergenic	novelGene_159754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_12	66.279826735582	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	61	2034	65604	214689	FALSE	20	TCTTTTTAGAGCAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGSGEVVAVPASGGANSLSNGASGNSAQTSNPLSRKLHKILETRLDNDKEMLEALRALSTFFTENSLRTRRNLRGDIERRSLAINEEFVSIFKEVKEELESINEDVQAMSSCCQDMTGRLQAAKEQTQDLIVKTTKLQAESQRLEIRAQVADAFLSKFQLTPDEMSLLRGTREGPVTEDFFKALGRVKQIHNDVKVLLRTNQQTAGLEIMEQMALLQETAYERLYRWTQSECRTLTQESCDISPVLTQAVEALQDRPVLYKYTLDEFGTARRSTVVRGFIDALTRGGPGGTPRPIEMHSHDPLRYVGDMLAWLHQATASEKEHLEALLKHVTTQGVEENIQEVVGHITEGVCRPLKVRIEQVIVAEPGAVLLYKISNLLKFYHHTISGIVGNSAATLLTTIEEMHLLSKKIFFNSLSLHASKLMDKVELPPPDLGPSSALNQTLMLLREVLASHDSSVVPLDARQADFVQVLSCVLDPLLQMCTVSASNLGTADMATFMVNSLYMMKTTLALFEFTDRRLEMLQFQIEAHLDTLINEQASHVLTRAGLSYIYNTVQQHKPEQGSLANLPNLDSVALKAAMVQFDRYLAAPDNLLMPQLNFLLSATVKEQIIKQSTELVCRAYSEVYAAVMNPVSEYKDPENILHRSPQQVQTLLS	65543	216202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_65757_70758_70903_73415_73488_84114_84174_106761_106874_108659_108743_109573_109645_112601_112696_119825_119955_120031_120124_129499_129565_139795_139888_146572_146691_174558_174691_175016_175185_179009_179118_180234_180289_201297_201378_214541
874432	contig_3797_pilon	-	5230	3	Intergenic	novelGene_120098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGTGACTCCTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392004	379367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_379575_386441_386627_387166
874433	contig_361_pilon	-	2289	2	Intergenic	novelGene_166612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	415	972	985239	984093	FALSE	35	TAAACATTGGTGTTTCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKFHENNEGNHCGKLSQLPKLTVFKRTPTEVNPECLECGRAFIDHSSHRHCIRSGCKNTCQCKKCGEACSCPYLSAPVNNLSREKPYECNQCGGDFCSVPSFQTHVRGQKGEYKEYWRICPSSLTLHKKVHNGDKPYECKECGKAFRHSSALITHIRTHSGEKPYECKECGKAFIISQISLNI	985653	982775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_984122_984710
874434	scaffold_6394_pilon	-	347	5	Intergenic	novelGene_111043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	512	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGCGCCGGCGCAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444567	442094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_442104_442398_442498_443340_443387_444266_444361_444468
874435	scaffold_6394_pilon	+	575	5	Intergenic	novelGene_111046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5911.93187545323	28	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	229	540	443252	444551	FALSE	10	TCTGTTGAGCATTCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQCGAPETGPALPPEVSVVTAGSGSLLQVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442097	444586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443201_443388_444267_444367_444474
874436	scaffold_6394_pilon	+	566	5	Intergenic	novelGene_111040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5911.93187545323	85	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	233	544	443252	444551	FALSE	10	GCCTTTTTACGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQCGAPETGPALPPEVSVVTAGSGSLLQVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442093	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443201_443388_444267_444367_444474
874437	scaffold_6394_pilon	+	351	5	Intergenic	novelGene_111042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5071.80061713786	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	164	319	444288	444551	FALSE	15	GTATCTGTTGAGCATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPSAIPPPSAKDIKKILDSVGIEADDDRLNKVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442093	444583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442103_442408_442494_443338_443388_444267_444367_444474
874438	scaffold_6394_pilon	+	536	6	Intergenic	novelGene_111039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	6829.38565319019	21792	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGAGCATTCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442092	444586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443338_443388_443771_443865_444267_444367_444474
874439	scaffold_6394_pilon	+	345	5	Intergenic	novelGene_111041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5071.80061713786	102	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	168	323	444288	444551	FALSE	10	GCCTTTTTACGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLWAIPPPSAKDIKKILDSVGIEADDDRLNKVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442093	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442107_442408_442494_443338_443388_444267_444367_444474
874440	scaffold_6394_pilon	+	1301	4	Intergenic	novelGene_111048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10205	junction_3	2549.22942605538	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTTACGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442101	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443338_444367_444474
874441	scaffold_6394_pilon	+	555	5	Intergenic	novelGene_111047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5911.93187545323	301	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	228	539	443252	444551	FALSE	30	GATAAAGCCTTTTTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQCGAPETGPALPPEVSVVTAGSGSLLQVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442098	444567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443201_443388_444267_444367_444474
874442	contig_6914_pilon	+	2941	5	Intergenic	novelGene_151754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	42.4286165223426	653	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	126	644	269575	272137	FALSE	15	CACAGATGGTGGGGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPITNYLAPVSASVSPSAVSSANGTVLKSTGSGPVSSGGLMQLPTSFTLMPGGAVAQQVPVQAIQVHQAPQQASPSRDSSTDLTQTSSSGTVTLPATIMTSSVPTTVGSHMMYPSPHAVMYAPTSGLTDGSLTVLNAFSQAQSTMQVSHSQVQEQGGVPQVFLTAPSGTVQIPVSAVQLHQMAVIGQQAGSSSNLTELQVVNLDATHSTKSD	269449	274434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_269609_270045_270166_271172_271365_271744_271822_272041
874444	contig_16148_pilon	-	2540	4	Intergenic	novelGene_50380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_3	189.485854060109	116	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACGTAGGTGAACAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153083	87956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_89311_111370_111491_150789_151734_152961
874445	contig_11677_pilon	-	524	5	Intergenic	novelGene_85934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_4	14365.8301970335	551	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	11	481	598052	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598062	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_598027
874446	contig_5210_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_65464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACACACACACACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659009	660268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_659000_660300
874447	contig_5945_pilon	-	2813	2	Intergenic	novelGene_104536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_1	0	97	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTATGACCCAACATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55895	29623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_32246_55704
874448	contig_3018_pilon	+	3742	1	Intergenic	novelGene_78811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATGAATTGAAGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532449	536191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_532400_536200
874449	contig_12327_pilon	-	1749	10	Intergenic	novelGene_140691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_9	203.775717910345	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	99	1448	1155014	1144568	FALSE	30	ACAATTGTTCTTAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFCLLSASGVSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALVSKEKRRSIIKKIT	1155112	1144266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
874450	contig_13481_pilon	-	2942	1	Intergenic	novelGene_119541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAGAAGCTTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487806	1484864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1484900_1487800
874451	contig_14426_pilon	+	3101	4	Intergenic	novelGene_170617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	21.1397466609439	139	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1564	2838	71246	76430	FALSE	30	AACATTGCTGCTGTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDLKEVLSLDIQAPEVWDGLPKRKVEAESLQRQESRLKRNNPLAREIFRRRFRQLCYQETPGPREALIQLRELCCQWLRPHVSTKEQILELLVLEQFLTILPEELQGWVREHCPESGEEAVTLLEDLERELDESQHEMVAHRCRQEVLFKERVPLGEQTSLSLQSQPKERQLTCDHAQEPHPVGETEKFLFSKPVVISQLKEGEPWSNNRGGLRDTYPGGVTKTEDRELMLRKDCSEILEPHGKIFHGQNGLSYQGPRHGEAGKHKSQIERKWGNTLGDGQHKCDECGRSFAQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKTFSRSSGLFNHRGIHNMQKRYHCKECGKAFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYHCSQCDKSYSRRSFLIEHQRSHTGERPHQCNECGKSFNRHCNLIRHQKIHTLAQLV	69682	76693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_71663_71845_71994_74081_74178_75816
874452	contig_4114_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_15620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTATTTGTTCGGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396844	398933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_396800_398900
874453	contig_960_pilon	-	2407	2	Intergenic	novelGene_108212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	18	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	470	802	295873	295541	TRUE	50	TTAAAAAATAGGACTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGRGLLRDWSSGNSLLLNMQMSYWPRRRFPKTRHFYSHYWFLFGCLSKVLKNGFSIIQTKLVTLSSYCNTSPTTVISIFYDTLAFRIGLKILPGSNKYASICSQLDAS	296342	292008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_292818_294744
874454	contig_1244_pilon	-	2160	9	Intergenic	novelGene_37936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_2	20.1866292381863	127	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	99	1217	870512	721357	FALSE	5	CCCCTGGCTGTGACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSEQAEQPSQPNSAPGSENVLPREPLIATAVKFLQNSRVRQSPLTTRRAFLKKKGLTDEEIDLAFQQSGTAADEPSSLGRATQVVPVQPPHLLPQPYSPVGSRWRDYGALAIIMAGITFGFHQLYKKYLLPLIVGGREDRKQLERMEASLSELSGSVAQTVTQVQTTLASVQELLIQQQQKVQELAHELAAAKATTSTNWILESQNINELKSEINSLKGLLLNRRQFPPSPSAPKIPSWQIPVKSPSPSSPAAANHHSSSDISPVSNESTSSSPVKESHSPEGSTYHLLGPAEEGAGVLDVKGQVRMEVQGEEEKREDEEDEEDDDVSHVDEEDCLGVQREDRRGGDGQINEQVEKLRRPEGASNEHERD	870610	720413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_721799_723587_723680_727655_727754_728925_729029_732208_732295_755798_755928_813306_813392_851591_851640_870476
874455	contig_13004_pilon	-	2950	1	Intergenic	novelGene_112595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAGTATAGGGGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67948	64998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_65000_67900
874456	contig_6842_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_130817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGTGAACACATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1745192	1747740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1745200_1747700
874457	contig_9272_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_125889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGATCCATAGGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234644	236697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_234600_236700
874458	contig_14563_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_135059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATTGGTTATGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160052	157342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_157300_160100
874459	contig_4469_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_21969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908880	910055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_908900_910100
874460	contig_2715_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_173178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTGCCCCACCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142791	141173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_-_141200_142800
874461	contig_14467_pilon	-	3593	2	Intergenic	novelGene_138225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	263	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAGAATAAAAAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125469	120813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_121517_122579
874462	contig_4604_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_19141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCAATCCTCTGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347107	344232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_344200_347100
874463	contig_3602_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_60694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	450	1819	2268	1364729	1365178	NA	15	GAGTGAGTGTCCTCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCSSPRARSWSCGCFPAAASGTPSCAGPSLRLPLCSQHRACLLLAQKGVWVRSWAALSPALGASPFRWGPGVSLETSQSVLGCRCDGSAAARMGEAFWAAGGLRPCLSVLPLPDLKKRTKGQKKSLLLRKPLRIDLTLENTSKVPAPK	1362910	1365178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1362900_1365200
874464	contig_10890_pilon	-	3121	4	Intergenic	novelGene_166790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	691	junction_3	202.590446193518	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	82	552	161049	149032	FALSE	50	AATAGCAAGTGGATATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGARRGPERLRQRRDAELAHLRSSGRAMHVNGKVALVTGAAQGIGRAFAEALLHKGAKVALVDWNLEAGVKCKAALEELFEPQKTLFIQCDVADQKQLRDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNWEKTLQINLVSVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSIAGKDDYNVIINIFLSVI	161130	146462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_149179_156819_156927_160559_160684_160956
874465	contig_6137_pilon	-	5507	1	Intergenic	novelGene_59172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGGCTCTTTGTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246555	1241048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1241000_1246600
874466	contig_9535_pilon	-	3107	1	Intergenic	novelGene_124459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGGGGTACACACCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94606	91499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_91500_94600
874467	contig_6048_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_73295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTGTCTATTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992807	1990868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1990900_1992800
874468	contig_7426_pilon	+	1935	12	Intergenic	novelGene_27456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	52.6960722735372	379	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	442	1320	588102	599404	FALSE	20	AATCTGCCATTCCCCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VITEPEHTKERVKLEGSKCKGQLLIFGATNWDLIGRKEVPKQQAAYRNLGQNLWGPHRYGCLSGVRVRTVVSGSCAAHSLLITTEGKLWSWGRNEKGQLGHGDTKRVEAPKLIEGLSHEVIVLAACGRNHTLALTETGSVFAFGENKMGQLGLGNQTDAVPSPAQIMYNGQPITKMACGAEFSMIMDCKGNLYSFGCPEYGQLGHNSDGKFIARAQRIEYDCELVPRRVAIFIEKTKDGQILPVPNVVVRDVACGANHTLVLDSQKRVFSWGFGGYGRLGHAEQKDEMVPRLVKLFDFPGRGASQIYAGYTCSFAVSEVGGLFFWGATNTSRESTMYPKAVQDLCGWKIRSLACGKSSIIVAADESTISWGPSPTFGELGYGDHKPKSSTAAQEVKTLDGIFTEQVAMGYSHSLVIARDDGETDKEKIKKLPEYNPRTL	574830	600019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_574867_580631_580726_584568_584713_587527_587660_588066_588156_589545_589661_592327_592495_593846_594028_594304_594411_595386_595460_598442_598521_599299
874469	contig_5317_pilon	+	797	4	Intergenic	novelGene_76534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	311.598388242872	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACAATGCCAGCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33709	43631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36677_36834_43197
874470	contig_6206_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_168156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGAGAATTAATGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182252	180332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_180300_182300
874471	contig_10500_pilon	-	3366	7	Intergenic	novelGene_41280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	922.786435506914	1	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	420	875	1635143	1629460	TRUE	40	CTATGAGGAAATAAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640226	1626879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626983_1627071_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635533_1639881
874473	contig_3382_pilon	+	2979	1	Intergenic	novelGene_124150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	482	781	931459	931758	NA	40	GATTTACGTTTTCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQR	930977	933956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931000_934000
874474	contig_8673_pilon	-	2278	13	Intergenic	novelGene_129911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_8	33.1029538796095	40	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	587	1921	225872	210026	FALSE	15	GCACCTTCAGTGTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQPVSSSSTLPKDPVLRKEKLQDLMTQIQGTCNFMQESVLDFDKPSSAISSSQPPSTTPGSPVASTEQNLPSQNEFLQEPLQVFNVNAPLPPRKEQEIKESPYSPGYNQSFTTASTQTPPQCQLPAIHVEQTVLPQETAASYPDGTIQVSNGSLAFYPAQTNIFPRPTQPFVNNRGSLRGCARGGRLLTNSYRSPGGYKGFDTYRGPPSIANGNYSQLQFQAREYSGTPYSQRENFQQCYKRGATSGGPRANSRAGWSDSSQVSSPERDNETFNSGDSGQGDSRSMTPVDVPVTNPAATILPVHVFPLPQQMRVAFSAARTSNLAPGTLDQPIVFDLLLNNLGETFDLQLGRFNCPVNGTYVFIFHMLKLAVNVPLYVNLMKNEEVLVSAYANDGAPDHETASNHAILQLFQGDQIWLRLHRGAIYGSSWKYSTFSGYLLYQD	243531	209668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_210595_212144_212209_214099_214201_215095_215279_215969_216139_223384_223441_224483_224566_225761_225885_230094_230139_231672_231841_234831_235071_239890_239978_243495
874475	contig_5758_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_119057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACAATACATGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51664	53216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_51700_53200
874476	contig_11028_pilon	+	3831	12	Intergenic	novelGene_163959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_3	75.7356210611669	123	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	610	2805	864128	919794	FALSE	25	ACAATGTGTGTCATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISQHQFYLDRKQSKSKIHAARSLSEIAIDLTETGTLKTSKLANMGSKGKIISGSSGSLLSSGSQESDSSQSAKKDMLAALKSRQEALEETLRQRLEELKKLCLREAELTGKLPVEYPLDPGEEPPIVRRRIGTAFKLDEQKILPKGEEAELERLEREFAIQSQITEAARRLASDPNVSKKLKKQRKTSYLNALKKLQEIENAINENRIKSGKKPTQRASLIIDDGNIASEDSSLSDALVLEDEDSQVTSTISPLQSPHKGLPPRPPSHNRPPPPQSLEGLRQMHYHRNDYDKSPIKPKMWSESSLDEPYEKVKKRSSHSHSSSHKRFPSTGSCAEAGGGSSSLQNSPIRVLPHWNSQSSMPSTPDLRVRSPHYVHSTRSVDISPTRLHSLALHFRHRSSSLESQGKLLGSENDTGSPDFYTPRTRSSNGSDPMDDCSSCTSHSSSEHYYPAQMNPNYSTLAEDSPSKARERQRQRHKSAGNLVSSNSGSMPNLAARNSAGPHGVYLHSQSQPSSQYRIKEYPLYIEGSATPVVVRSLENDQEGHYSVKAQFKTSNSYTAGGMFKESWHGDEGDALRLTPSRSQIIRTPSLGREGAHDKGRAAVSDELRQWYQRSTASHKEHSRLSHTSSTSSDSGSQYSTSSQSTFVAHSRVTRMPQMCKATSAALPQSQRSSTPSSEIGATPPSSPHHILSWQTGSYSDSCFLDSSLYPELADIQWYGQEKAKPGTLV	858090	920820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_858609_864036_864176_870587_870730_887714_887849_891949_892073_896438_896668_898678_898736_902102_902341_903191_903360_904996_905854_908685_908783_919691
874477	contig_11117_pilon	+	4119	1	Intergenic	novelGene_148600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98161	102280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_98200_102300
874478	contig_7171_pilon	-	4442	6	Intergenic	novelGene_101268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	22.7279563533548	161	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	513	1430	909974	902245	FALSE	45	AAATTAAATTTATTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCHKSLLPSPFKAPLVVEWAPSVTPKPDRVTLAQHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDFERLSGSFPFACHGLHPPPCQGPGSFSREELTGYLLRASAVCSKLGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFVSTLPCPLERPNCPQPGPRKPALPQDNSRQSSRLK	910486	899232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_902498_905383_905503_905646_905752_905828_905910_908204_908481_909890
874479	contig_18039_pilon	+	3637	6	Intergenic	novelGene_171240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	10.0598210719674	37	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	987	2964	267	3230	79599	100029	FALSE	30	ATACTTGGATTGATATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPQELLTFRDVAIEFSQQEWECLEPAQRALYRDVMLENYRNLISLGISPSEMNIISILKKGTEPWTVKKKMKLAKNSDVLSPCVIKELSAKEIIDKGELFQRVMLERNESHGTGDFNFGQVRENVHEFESQWGKDERNNKGVITPRNKIFTSRRDQRVKRDAGNKYMTCFKNTIELTFQSHKAEMQKFHTGEKMYECHQVESSVNNASSIPSLQRTHPSVQSNISNERGEVFMPSSWFLQHQKTHSREKSYTCNECRKSFSQRSTYTHDQRIPCMQRPYEGSEGVKTIYSGSDLMKHHRIHTREKPCKCNVYGQVFSLQLRLRTHQRFHTVKNPYKCKECGKEFMRHSYLWGHKRIHIGKKPYKCNECGKTFNHDSHLSMPHRVRITHQRLHNGQKPDRCNICGKVFSLSSSLITHQRIHSGEKPYKCIECGRAFSYRSNLGKHQRIHSGEKPYQCNECGKAFVRKLSLVEHQRIHSGEKPYKCNECGKTFSSRSVFWKHKVIHTGEKPYKCVECGKAFSGRSRLVEHQRIHSGEKPYKCNECGKTFNLGSGLTKHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFSRRSGLTRHQTIHSGKKPYKCSECSKSFTQKSGLVEHQRIHSGEKPYKCNECSKSFTQKSGLVEHQRIHSGEKPYKCNECGKAFSSRSVFRKHKRIHSGEKPYKCIECGKAFPGRSSLMEHQRIHSGEKPYKCNECDKAFTRKSGLLEHQQIHSGKKPYKCNECGKAFTRKSGLLEHQQIHSGEKPYKCKECGKSFTQKSGLLKHQHIHSGEKPYKCNECGKAFTRKSDLLKHQQIHSGEIPYKCKECGKAFTRKLGLLKHQKIHSGEKPYQCDECGKAFSQRSYLVLHQRIHSGEKPCKCNECGKAFSSPSILWDHKKIHTGEEKYRCNECGKTFKWGSNLARHQRIHTGEKRYKCNTCDKGFSHRESLTNHQRIHTGENNYRYTDCGKSFNWDSKLSKHQRIHTVEKP	75678	100436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_75707_78494_78662_79527_79614_83285_83413_84652_84749_97303
874480	contig_4640_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_147976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAGAAAAGAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480126	482317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_480100_482300
874481	contig_401_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_42801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTTCATACCAGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633178	1630638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1630600_1633200
874482	contig_12920_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_166335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	121	456	165016	164681	NA	35	AACTATTTGTTCTACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWNSFHTSCTTLPQVITDRITVTIDQLTFSMNRIPVASFLQYIYFEIHPCHCINSSFLFIAEYYSSYTLSLWGHYESESTRWQGVVVLLYSVVNIWVVSSFQQSQTKLL	165136	162466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_162500_165100
874483	contig_1107_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_126570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504044	501306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_501300_504000
874484	contig_13680_pilon	-	1921	15	Intergenic	novelGene_149594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	198.217271534783	532	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	388	1635	390890	373091	FALSE	35	TTTAGAGTCCAGACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTAHKEKYKCILPLVTGGDEEEEKDYKGPNPRELLEPLFKQSSCSYRIESYWTYEVCHGKYIRQYHEEKETGQKVNIHEYYLGNMLAKNLLSDKDQEAEEREKSKEIPTKNIEGQMTPYYPVGMGNGTPCSLKQNRPRSSTVMYICHPESKHEILSVAEVTTCEYEVVILTPLLCNHPKYRFRASPVNDIFCQSLPGSPFKPLTLRQLEQQEEILRVPFRRNKEEDLQSTKEERFPAIHKPIAVGSQPTLTVGTTHISKLTDDQLIKEFLSGSYCFHGGVGWWKYEFCYGKHVYQYHEDKDSGKTSVVVGTWNQEEHIEWAKKNTARAFHLQDDGTQTVRMVSHFYGNGDICDITDKPRQVTVKLKCKESDSPHAVTVYMLEPHSCQYILGVESPVICKILDTADENGLLSLPN	396789	372804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_373163_374990_375067_375277_375356_376956_377082_380016_380077_380902_381065_385130_385261_385352_385577_388075_388111_388790_388855_388993_389072_389620_389702_390827_390933_393465_393503_396481
874485	contig_20378_pilon	-	2407	15	Intergenic	novelGene_159572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_14	171.991872138286	13	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	1551	2405	103213	80200	FALSE	50	TAGAGAGCAAGATGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPETLEEDQQFILKKCPALLQEMVNVICQLIIMARSREEREFRAPTLTSLENCMKLSQMTVQGLQQFKSPLLQLPHIEEDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHNLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGGDANKNRTKGGWQQKSKGPKKTAKSKKKKPLKKKPTPVPLPQSKQQKQKQANGVIGSEAVVKEDEEEVSDKGSDSEEEETNRDSQSEKEDGSDRDS	145608	80197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_80317_87955_88127_88323_88384_91611_91695_94354_94503_97707_97863_98618_98712_103185_103512_106403_106513_107631_107683_109115_109794_122404_122518_123909_124025_124765_124866_145522
874486	contig_13428_pilon	+	2847	1	Intergenic	novelGene_143424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTGCCCAGTCTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22962	25809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_23000_25800
874487	contig_1964_pilon	-	2400	1	Intergenic	novelGene_130904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCATCACAGCAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125377	122977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_123000_125400
874489	contig_12977_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_122819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAACCAGACAGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152716	149720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_149700_152700
874490	contig_5429_pilon	+	3252	1	Intergenic	novelGene_127795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTAGCTACTGATGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199148	202400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_199100_202400
874491	contig_9609_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_22959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1640	1954	233246	233560	NA	80	TTCAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLGIQKWEKKRPLFPYTPLIWGSCFRITSVHGQLAGALALLVSWAIPSVTPVPPFLPGWSVLAWAKQFCKGPFLTPNSCSVRLVGLFCFEPNPFVLFEQKFN	231606	233854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_231600_233900
874492	contig_7179_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_78163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	594	1001	1059092	1058685	NA	10	GCCCCCTGAGTGTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKPRCSHLPITFSLGFRNLRLPVPTPNTDWQPLQPVKLPFWFQVSGPSRTNPSIMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMDVPSDKLLEPVVCMVSDQWGERTAQSPENWGLDPRIKINFSPFLSWAAMALQNRDFL	1059685	1057299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1057300_1059700
874493	contig_7376_pilon	-	536	3	Intergenic	novelGene_108073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1792	junction_1	73.5	6897	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTTTGTTTATTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79843	72016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_79674
874494	contig_8820_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_79260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTATATGCAATTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67691	65009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_65000_67700
874495	contig_5083_pilon	+	2055	5	Intergenic	novelGene_151619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_4	29.5719461652425	153	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	181	390	170658	328086	FALSE	15	GGAGGCTGGGCTAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSRIAYSDEVRNELLGDDGNSSENQRAHLLDNTERLERSSRRLEAGYQIAVETEQIGQEMLENLSHDREKIQRARERLRETDANLGKSSRILTGMLRRIIQNRILLIILAIIVVITILMAIILYVKRH	28411	329751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_28490_39652_39738_170640_170712_171824_171887_327992
874496	contig_12340_pilon	-	2446	2	Intergenic	novelGene_122114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTTTCTTAGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131435	127508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_128177_129657
874498	contig_10523_pilon	+	1715	1	Intergenic	novelGene_120959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGAAAGAAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63458	65173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_63500_65200
874499	contig_5590_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_163044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	699	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	105	437	374514	374846	NA	5	TACCCTCCTGTGCCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPGRPEGSEGHRACLPYRCRTHGCAQSTPPTSTSCRTPGRGLLAKCPHRVHMTPLPPLRQSSVHKNGTPGRLACRSPSHSATPPGSPGQAHELGALGEAHPPPALTLP	374409	376971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_374400_377000
874500	contig_4305_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_136710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTTTTTGACGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800327	803037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_800300_803000
874501	contig_3380_pilon	-	3827	1	Intergenic	novelGene_60115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	3166	3546	437532	437152	NA	25	TCTAGGTAGTTGGATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQWNSSPLAFTSSWNSSIVLVKLASILNMIQNSVIQYLQERSLKKKHHPKPKPETCTLVGSYRNLLPRKGLRQRLLCSVISFKELGLGYQGRKPRTGHLLPPHSKCFDRIMCIIIQGAMMKMSA	440697	436870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_436900_440700
874502	contig_7378_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_120230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACATTTCTCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45956	48172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_46000_48200
874503	contig_7753_pilon	+	3424	1	Intergenic	novelGene_41513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTTGGCAAGTAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240061	1243485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1240100_1243500
874504	contig_11978_pilon	+	2831	1	Intergenic	novelGene_62944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1	456	995090	995545	NA	20	TGCAGTCCACCTCAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHWDLCTSNTSHTLRGRTRPVGFCAQSLQNLQKKKNQFLTLFEHIFPTTPLRSVSPEFLQNENKKVTKGRCSIFRCSKDPASVPTQFPWLQSLKTKLTNLASKWNSPSLTPHISTQGRKLAVRGGSIKRQHGVGTKFNSQAPVIQRKAAQS	995089	997920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_995100_997900
874505	contig_4103_pilon	-	2358	4	Intergenic	novelGene_51941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	21.3541565040626	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAACTGCTTTGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98205	94674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360_95529_96288_96384_96524
874506	contig_9363_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_6845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATATGTGGTCTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650774	1652935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1650800_1652900
874507	contig_3787_pilon	-	3417	5	Intergenic	novelGene_102454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_2	77.8925542012842	237	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	11	628	1127548	1122604	FALSE	35	CTTAATGTGAAAATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVHKALQILRNKVDLQHFCGYVTMLNASSQLANRKLSDASDERGEPDLASGSDVNGSTESFEMVIEEVTIDSTTKQNSVATIEADWVPLELCFGIPLFSSELNRKVCKKIATHGLCRQESLQNLLHSSRKLSLQVLNFVHSFQEGASTLDIHTEASFPSLFSQSSYADMGVPLPAKNLIFKDGILSEWSGRSPSSLRIANLHLQ	1127558	1119814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_1122790_1124206_1124277_1126199_1126324_1126808_1126914_1127415
874508	contig_12622_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_5856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGTAGTGGTTAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098391	1100647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098400_1100600
874509	contig_9468_pilon	+	1572	5	Intergenic	novelGene_59471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	406.512838050657	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	988	1287	201435	205780	FALSE	70	AAACAGAAAAAGCGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK	192194	206065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_192871_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639
874510	contig_6028_pilon	-	1504	10	Intergenic	novelGene_156580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	192.272825709128	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	271	696	332055	317429	TRUE	35	CAATATGTCCAGTATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKI	353989	309396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353771
874511	contig_12886_pilon	-	1693	10	Intergenic	novelGene_135503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	212.999217525949	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1004	1585	598349	592899	FALSE	25	TTATTCTGGATGTAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEVQTGYCVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWAPESSYSTISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVLFHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNAHEHFVTSLDFHKTAPYVVTGSVDQTVKVWECR	659530	592790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_592973_594073_594231_596156_596259_597389_597619_598329_598433_605606_605814_607030_607106_607260_607346_626332_626554_659198
874513	contig_4803_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_150716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCGGCAGAATAAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31340	32273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_31300_32300
874514	contig_8628_pilon	+	3895	1	Intergenic	novelGene_164411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379159	383054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_379200_383100
874515	contig_10864_pilon	+	2851	1	Intergenic	novelGene_107099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981375	984226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_981400_984200
874516	contig_6533_pilon	+	826	3	Intergenic	novelGene_114611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	30	TAACTATGTGCTGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	25824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
874517	contig_10074_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_57199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTGGTAAGTAATGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590954	593973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_591000_594000
874518	contig_2214_pilon	+	2550	3	Intergenic	novelGene_144256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	501	junction_1	129.5	122	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	184	558	277956	281731	FALSE	70	AAAAAAAAAATCAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASTEFDFPGSRRGSLRRAGTREPPSEATEATAQTPGFSWSSSFLSTSAPSAAAAPAPADMAAVLQQVLERTELNKLPKSVQNKLEKFLADQQSEIDGLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSHSQERLVNETRECQNLRLELEKLSSQLKAVTEKNKELEIAHDRSIAIQVKNIIPVDKTNYNT	277772	283723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_278107_279612_279718_281612
874519	contig_15420_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_175294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCACCTGCCTCCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143797	145593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_+_143800_145600
874520	contig_8122_pilon	+	3491	1	Intergenic	novelGene_40250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726430	729921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_726400_729900
874521	contig_11816_pilon	-	2756	2	Intergenic	novelGene_98474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2080	2388	454325	454017	FALSE	20	AGCTTAAGGAGCTCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLCAPQNAVCAPQNAILAICVVLSPTCSFVFSFSDNHILISALVIASTVILTVLGAILWFLYKRNSDSGFTTVFSTAPQSPCNDDCVLVVAEENEYAVQID	456851	453648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_455391_455837
874522	contig_8594_pilon	-	3955	2	Intergenic	novelGene_140045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468514	443763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_444634_465429
874523	contig_240_pilon	-	4714	1	Intergenic	novelGene_173801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGTAAAAAGGGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676426	671712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_671700_676400
874524	contig_9668_pilon	-	3031	1	Intergenic	novelGene_58120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2059	2418	216277	215918	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFKSTSKLRDGGMKEKRKGSERKKKCLYNIQLSEKETVDRLKHVFSYQLLPTCSSYHTIYLSDFPICKTKRSLPFMKYLSTDFCREEMTFLECGQFHFLRSPSFKIFKIFSKIGSPQF	218335	215304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_215300_218300
874525	contig_817_pilon	+	2824	1	Intergenic	novelGene_132488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAACCCTGAGATGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754195	757019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_754200_757000
874526	contig_16882_pilon	-	2801	8	Intergenic	novelGene_148229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	43.5721311418767	22	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	18	1184	434555	318844	FALSE	10	TTGTTGCGGAGAGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTPPQMVQPSPSLSKFFGDTTNTNSLASDFFDSFTTSTFISVSNPNAGSSVPEKLSSLTTQGGDKSPDSADPSYSPGIDRSESGISTASLEISQSPKPFSQIRAVFAGSDDPFATALNMSEMDRRNDAWLPSEETRNVLISVATQQYSTVFIDKENLTMPGLKFDNIQGDAVKDLMLRFLGEQAAAKRQVLNANSVEQSFVGLKQLINSKNWRAAVDLCGRLLTAHGQGYGKSGLPTSHTTDSLQLWFVRLALLVKLGLFQNAEMEFEPFGNLDQPDLYYEYYPHVYPGRRGSLVPFSMRILHAELQQYLGSPQESLDRLHRMKTICSKILTNLEQGLAEDGSMSNITQENRKGLCACRGCLSFGYQILPRARASAAEWDWTHFSSDWRHKNG	434572	317226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_318867_338463_338563_349446_349520_368818_368932_384027_384167_386096_386211_414223_414341_434066
874527	contig_5482_pilon	-	3031	2	Intergenic	novelGene_144516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	0	52	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGTTTGGAAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769349	756940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_759924_769301
874528	scaffold_16539_pilon	-	2377	5	Intergenic	novelGene_68300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	179.505396854802	687	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	308	1477	104505	97808	FALSE	15	GCTGCACTTAACTTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPCQPQPLSQALPQLPGSSSEPLEPGRARMGVESYMPCPLLPSYHCPGVPGEASAGTGTPRATATSTTTSPLREGFGGQDGGELRPLRSEGAAALVTKGCQRLAAQGARPEAPKRKWAEDGGDAPAPSKRPWARQEHQEAEEEGGRACGSGSGEASAGLREDVLPTALERLALDYIVPCMRYYGICVKDSFLGPALCGHVLAEVEALKRAGRLCDGQLVSQRAIPPRSIRGDQIAWVEGHEPGCRSIGALMAHVDAVIRHCAGRLGGYVINGRTKAMVACYPGNGLGYVRHVDNPHGDGRCITCIYYLNQNWDVKVHGGLLQIFPEGRPVVANIEPLFDRLLIFWSDRRNPHEVKPAYATRYAITVWYFDAKERAAAKDKYQLGTCF	105825	96907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_97890_98114_98252_98679_98800_103674_104741_105753
874529	contig_9995_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_47747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTCTGAGGTGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607011	608319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_607000_608300
874530	contig_10793_pilon	+	4112	1	Intergenic	novelGene_83421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTTTGCGATCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145023	149135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_145000_149100
874531	contig_20610_pilon	+	1176	4	Intergenic	novelGene_67645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	102	junction_1	134.289074594903	1960	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	258	623	49863	53113	FALSE	30	TTGAGCTTTAACTAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQSKATSGTPRITKQPSSTSGRIPLLTHPFRKQHACDRSFRAFDWWIRRAGLRRLVQRKSSHRRPRAHSFIRSYFPAGCSSCVGVMVDVMELPKSRVNASMLAQFINQPVCFVGKLEKIHPTGKMFILSDGEGKNGTIELMEPLDEEISGIVEVVGRVTTKATIMCSSYVQFKEDNRPFDLGLYNEAIKITQEFPQFFPLGVVQYD	49605	53666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_49962_51483_51559_52403_52513_53030
874532	contig_5832_pilon	+	3417	25	Intergenic	novelGene_134114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	57.4233184342389	30	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1133	3399	18	3416	28124	124211	FALSE	45	ATAAATGCTCAACCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEEVAKLEKHLMLLRQEYVKLQKKLAETEKRCTLLAAQANKESSSESFISRLLMIVADLYEQEQYSDLKIKVGGRHINAHKFVLAARSDSWSLANLSSTQELDLSDANPEVTMTMLRWIYTDELEFKEDDVFLTELMKLANRFQLQLLRERCEKGVMSLVNVRNCIRFYQTAEELNASTLMNYCAEIIASHWDDLRKEDFSSMSAQLLYKMIKSKTEFPLHKAIKVEREDVVFLYLIEMDSQLPGKLNEVDHNGDLALDLALSRRLESIATTLVSHKADVDMVDKNGWSLLHKGIQRDLFAATFLIKNGALVNAATLGAQETPLHLVALYRSKKHSADVMSEMAQIAEALLQAGANPNMQDSKGRTPLHLSIMARNEYVFNQLLQCKQLDLELKDHEGSTALWLAVQYITVSSDQSVNPFEDTPVVNGTSFDENSFAARLIQRGSNTDAPDTVTGNCLLQRAAGAGNEAAALFLATSGAHVNHRNKWGETPLHTACRYGLANVTAELLQQGANPNLQTEAVLPLPKEAASLTSSADSVYLQTPLHMAIAYNHPDVVSVILEQKANALHATNNLQIIPDFSLKDSRDQTVLGLALWTGMHTIAAQLLGSGASINDTMLDGQTLLHMAIQRQDSKSALFLLEHQADINVRTQDGETALQLAIRNQLPLVVDAICTRGADMSVPDEKGNPPLWLALENNLEDIASTLVRHGCDATCWGPGPSGCLQTLLHRAIDENNESTACFLIRSGCDVNSPRQPGANGEGEEEARAGHTPLHLAASWGLEETVQCLLEFGANVNAQDAEGRTPVHEAISNQHSVIIQLLISHPDIHLNVRDRQGLTPFACAMTYKNNKAAEAILKRESGAAEQVDNKGRNFLHVAVQNSDIESVLFLISVQANVNSRVQDAFKLTPLHLAVQAGSEIIVRNLLLAGAKVNELTKHRQTALHLAAQQDLPTICSVLLENGVDFAAVDENGNNALHLAVMHGRLNNIRVLLTECTVDAEAFNLRGQSPLHILGQYGKENAAAIFDLFLECMPEYPLDKPDAEGNTVLLLAYMKGNANLCRAIVRSGARLGVNNNQGVNIFNYQVATKQLLFRLLDMLSKEPPWCDGSNCYECTAKFGVTTRKHHCRHCGRLLC	28106	124212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_28134_47435_47629_54905_55025_79881_80018_84538_84663_86752_86903_88212_88379_98151_98354_100624_100694_100911_101112_105309_105408_108653_108883_110011_110111_110425_110580_111340_111510_112497_112617_113307_113465_114342_114544_116125_116303_118632_118781_119241_119333_119639_119765_121798_121946_123456_123548_124186
874533	contig_1964_pilon	-	2831	4	Intergenic	novelGene_130897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	8.17856276425687	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	2	856	44023	40824	FALSE	15	ACACTGGTGGTGGTCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAGALPDITLSHRTPSTWKDTWLLTIMPTAPEPTSTETIATSILPAVEGREEGGSVRLTKLEPSLTVQEEETSHPPSETTQHPTTHRVSTARASTAQAPATTHAPKDVQPGHHETSAPIGRDHAYPHDPSLEEGGPSATEGAAEGAAEDGDSSQLPVGEGSGEQDFIFETPGDTTVVAAVEPDERNQAPEDEGATGASQGLLDRKEVLGGVIAAGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQKPTKQEEFYA	44024	38848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_40994_41179_41316_42423_42909_43959
874534	contig_3233_pilon	+	1900	5	Intergenic	novelGene_56578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	288.978372893198	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1188	1775	741808	747909	FALSE	25	ACCCACTCCCCAATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	740620	748034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_741902_742724_742836_743705_743819_746936_747016_747718
874535	contig_8576_pilon	+	2954	2	Intergenic	novelGene_88742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	0	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	670157	680429	FALSE	50	CAGAAAATGTAAAGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDSLQQREQQLLESLGDGAEFSVSSSASTDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVSRTNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVSQLLT	670154	683036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_670217_680144
874536	contig_3132_pilon	-	2407	1	Intergenic	novelGene_127466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1601	1954	518875	518522	NA	80	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKADRRRVDTFELWCWQRILNLPWTARRTNRSVLEEVQPEFSSEVRMARLCLSYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVDGQRKRGRPVMRWTDTGCNNGLKRSKNCEDGAGLGSVSFCCT	520475	518068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_518100_520500
874537	contig_13944_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_175285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	664	984	62221	61901	NA	10	CTGGATCCCCCTGGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGQWLTNTRVHQNHLGGLVRTQCAGPARRSSDSADLGWDLRICISYRLQGDDAGPGPHFEKHCPQCVFSDTGATRHMWLFKLKKNFLYIALSPQLLVTTNSPLS	62884	60894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13944_pilon_-_60900_62900
874538	contig_13267_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_146610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTTAACCGTTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127846	125019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_-_125000_127800
874539	contig_8059_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_111119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAGGTATAATTAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291953	294305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_292000_294300
874540	contig_14575_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_101857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACAGGGAGGCTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14471	16486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_14500_16500
874541	contig_14985_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_169094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGGGAGAAAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19830	20864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_+_19800_20900
874542	contig_1719_pilon	-	2603	6	Intergenic	novelGene_87381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	373	junction_2	256.026248654313	37	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1271	1813	851446	848543	TRUE	40	GACTGCAAATTTTGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVIQFFIEHFKVSILHIYIKPLETL	852716	846984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392
874543	contig_15821_pilon	+	2886	1	Intergenic	novelGene_25017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTCATCACCACAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114814	117700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_114800_117700
874544	contig_8017_pilon	-	4174	6	Intergenic	novelGene_65353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_5	69.6178138122708	100	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	51	1700	935326	911261	FALSE	45	GTGACCACATATAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRPGPPQTGLCIISEMSPTVAHKDSSRQRRPGTFSLSLEVKSGSLPPDGWDDGPDSAGGEGDGEALLQDTGPGGASRVVRSCRAELSSVLLLLFLYVLQGIPLGLAGSIPLILQSKNVSYTDQAFFSFVFWPFSLKLLWAPLVDAVYFRNFGRRKSWLVPTQYILGLFMIGLSTRVDHLLGNGEGRTPDVLALTVTFFLFEFLAATQDIAVDGWALTMLSRENVGYASTCNSVGQTAGYFLGNVLFLALESPDFCNKYLRIQPQPRGIVTLSDFLFFWGTIFLITTTLVALLKRENKEVSLVKEETQGITDTYKLLFSIVKMPAVLTYCLLILTAKIGFSAADAVTGLKLVEEGVPKEHLALLAVPMVPLQIILPLIISRYTAGPQPLNVFYKAMPYRLLLGLEFALLVWWTPKVEHQGGFPIYYYIIVLLSYALHQVTLYSMYVSIMAFNAKVSDPLIGGTYMTLLNTVSNLGGNWPSTVALWLVDPLTVKECVGASNQNCRTPDAVELCKKFGGSCVTALDGYYVESIICVFIGFGWWFFLGPRFKRLQDEGTSSWKCKRSN	935376	908786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_911429_912527_912744_914906_915025_915281_915467_919630_919822_934554
874545	contig_9517_pilon	+	1903	9	Intergenic	novelGene_178179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	5.16599457994296	103	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	41	781	176172	216239	FALSE	15	TGGGGTATGTTATGGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSDGEEEGGDTEMMQQETAPVPAPSKKTKQPKECFLIQPKETKEEATKTRRRKKKKITDVLAKSERKPGTPENLQKLMKDYYSSNRSVIELEELNLPDSCFLKANDLTHSLSSYLKEICPKWAKLRKNHSEKKSVLMLIICSSAIRALELIRSMTAFKGDSKVMKLFAKHIKIQEQVKLLEKRVVHLGVGTPGRIKDLVKQGALNLNPLKFLVFDWNWRDQKLRRLVDIPEIRKEVFELLEMGVLSLCKSESLKLGLF	176131	217361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9517_pilon_+_176226_196008_196081_197899_198030_202435_202496_203641_203745_209687_209749_210207_210296_214544_214634_216155
874546	contig_7457_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_31543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAGAGCTCTGCCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770084	767224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_767200_770100
874547	contig_414_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_115103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	337	1014	512	1525	374079	373066	NA	10	TGATGGTGTTTTATTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSWMLWNFVERWLIALASWSWALCRISLLPLIVTFHLYGGIILLLLIFVSIAGILYKFQDVLLYFPEQPSSSRLYVPMPTGIPHENIFIRTKDGVRLNLILIRYTGDNSPYSPTIIYFHGNAGNIGHRLPNALLMLVNLKVNLLLVDYRGYGKSEGEASEEGLCLDSEAVLDYVMARPDLDKTKIFLFGRSLGGAVAIHLASENSHRISAIMVENTFLSIPHMASTLFSFFPMRYLPLWCYKNKFLSYRKISQCRMPSLFISGLSDQLIPPVMMKQLYELSPSRTKRLAIFPDGTHNDTWQCQGYFTALEQFIKEVIKSHSPEEMAKTSSNVTII	374590	372615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_414_pilon_-_372600_374600
874548	contig_7945_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_161615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGAGGGATATGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521109	523626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_521100_523600
874549	contig_987_pilon	+	2579	3	Intergenic	novelGene_72345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	104	62	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	257	1195	1286769	1295626	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTADQPRWVSHHHPAVLNGQHPDTHHPGLGHSYMDPAQYPLPEEVDVLFNIDGQGNHVPSYYGNSVRATVQRYPPTHHGSQVCRPPLLHGSLPWLDGGKALGSHHSASPWNLSPFSKTSIHHGSPGPLSVYPPASSSSLSAGHSSPHLFTFPPTPPKDVSPDPSLSTPGSAGSARQDEKECIKYQVSLPDSMKLESSHSRGSMTTLGGASSSAHHPITTYPPYVPEYSSGLFPPSTLLGGSPTGFGCKSRPKARSSTEGRECVNCGATSTPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLVSSP	1286512	1297010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1287010_1289450_1289988_1295465
874550	contig_9527_pilon	+	1983	6	Intergenic	novelGene_134061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_5	194.881502457262	1348	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	27	656	480180	482156	FALSE	20	TATTGGATTCTGACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWPARIDEMPEAAVKSTANKYQVFFFGTHETAFLGPKDLFPYEESKEKFGKPNKRKGFSEGLWEIENNPTVKASGYQSSQKKRRVEEPEPEPEPEATEGDGDKKGNAEGSSDEEGKLVIDEPTKEKNEKGTLKRRTGDLLEDSPKRPKEAEDPEEEEKESGTLEGERPLPVEMEKNSTPSEPGSGRGPPQEEEEEEEEEEAAKEDAEAPGIRDHESL	473973	483483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_473991_480170_480248_480411_480551_481218_481411_481734_481959_482149
874551	contig_1996_pilon	+	1550	12	Intergenic	novelGene_131909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	22.358092439219	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1311	240	1550	280789	283100	FALSE	60	ACATAACACAAGGAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIDSFAPFHNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKVPLRCTAHYVAYHVESKVYAVATSTNASCTRIPRMTGEEKEFETIERDDRYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIELEEWEHVTCMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEPGQPLTKNKFKVLYEKEQKGPVTALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSLRASELTGMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFMVDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLPEAKESFGGMRLLRRADFHVGAHVNTFWRTPCRGAAEGPSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAGLNPRAFRMLHVDRRILQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERGELAKKIGTTPDIVSDPPARPPPAALSHGPHHHPCTHRSWTTCWRRTASPLTSSFAGDATAPIPILLHPFC	279637	283100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_279709_280528_280646_280737_280829_281037_281123_281198_281341_281418_281572_281823_282001_282079_282147_282224_282273_282345_282502_282583_282714_282787
874552	contig_4301_pilon	-	2032	2	Intergenic	novelGene_65130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTTTCTCCTTTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570469	550065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_551425_569796
874553	contig_10003_pilon	-	3548	1	Intergenic	novelGene_88273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1947	2294	805036	804689	NA	25	TCACAATTGTTGATATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKHLLFSALAACSGMLLHPQSHNMAAGSPAIASIFWQEETGKQGTKEIVLAKMGPFKEYFLKPHPVTFFTYILSATPRYMSEKCSFGLEQFGVPDKVWILVLRKKRRIVTEKL	806982	803434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_803400_807000
874554	scaffold_16539_pilon	-	1831	11	Intergenic	novelGene_68391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.6055863742488	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	27	1364	800534	794701	FALSE	30	CATGTGACTTCTAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKNLKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDMWPGQIRFLELISTPSVRRVECWPSGRTATLFWPRTSRKHIRPSSRRMSRNMSFTSDPPPTFPPPATGVQTSLTSLGTSVPKPGPLLSSSRVGLFNKYRRSNPASFLLRSLTPLESLGLEQYPLCPS	800560	794233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_795029_795183_795240_795602_795639_795760_795838_795923_796092_797272_797367_797467_797578_797658_797806_799277_799465_799588_799688_800498
874555	contig_9363_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_6492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	789	1121	396656	396324	NA	25	CTTCTGCACGTGGAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNYKCGSFAGECFGIFIFTTIKKKKVEDKLGGHCNDFQGTLLDRMECELQQFDYIASVPVFRGIVKFCMVYFSCFICSFSLTAKEFAHKRVQCSFFPPFFLYMLFSVH	397444	395158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_395200_397400
874556	contig_15062_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_162285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATACCTTAAATATTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14422	12927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_12900_14400
874557	contig_16948_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_166411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCCTCCCCCAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327428	325338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_325300_327400
874558	contig_4924_pilon	+	4368	1	Intergenic	novelGene_84779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACAATAAGAAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395852	400220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_395900_400200
874559	contig_10953_pilon	-	1946	12	Intergenic	novelGene_42612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	58.8082751246837	303	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	276	521	484591	476927	TRUE	25	AGGGGCACAGAGTGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRRPQEEDSESSEEESDSEEEAPAQVKPSGKASQVKAASASTKGSPGKGAPPAPPGKTGPAAIQAGKPEEDLESSSEEESDSEEETSAAVMPAQILSPRKEDNCKPARSKTLAPASPEKKAEGSSESSEEELPSGQSGWPSCYPRASPGCERPKEGPGLGEHSQELLRERG	485068	467066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_467105_467850_467949_469549_470102_472071_472253_472807_472891_473138_473377_473806_473918_475531_475618_476888_477035_482497_482624_484579_484787_484988
874560	contig_7171_pilon	-	2525	13	Intergenic	novelGene_101269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	33.9537062287266	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	162	1913	916504	902245	FALSE	15	GCCGGGGTGAGTAGGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGDRGAGPAPTGPPSQDLPQPPREISKVMASMALGVLNDRGCSEDELLEKCIQSFDSAGNLCHGDHVLNMVLAMHSWVLPSAHFAARLLTLYQEATGNTQELRQLQICHLVRYWLTRHPQAVHQEPQLEEVIGRFWATVDQEGGSAQRNLGGSSNLLSPGGPGPPPTTSSPGLGKKRKVSLLFDHLETEELAEHLTYLEFRSFQAITPQDLRSYVFQGSVRGCPALEGSVGLSNSVSRWVQVMVLSRPGPAQRAQVLDKFIHVAQRLHQLQNFNTLMAVTGGLCHSAISRLKDSHAHLSPDSTKVLLELTELLAADNNYSCYRRTWAGCTGFRLPVLGVHLKDLVSLHEAQPDRLPDGRLHLSKLNSLYLRLQELAALQGQRPPCSANQDLLHLLTLSLDLFYTEDEIYELSYAREPRCHKSLLPSPFKAPLVVEWAPSVTPKPDRVTLAQHVEQLVESVFKNYDPEGRGTISQEDFERLSGSFPFACHGLHPPPCQGPGSFSREELTGYLLRASAVCSKLGLAFLHTFHEVTFRKPTFCDSCSGFVSTLPCPLERPNCPQPGPRKPALPQDNSRQSSRLK	919886	901632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_902498_905383_905503_905646_905752_905828_905910_908204_908481_909890_910008_911141_911316_914111_914266_914383_914516_915033_915096_915221_915329_916332_916520_919740
874561	contig_12635_pilon	-	4766	1	Intergenic	novelGene_60801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATAATGTTGGCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178054	173288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_173300_178100
874562	contig_15304_pilon	-	1359	5	Intergenic	novelGene_30592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	200.968125582143	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	631	1221	65241	64554	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPGKRLPPEIYLFPPPEKQGDKDRLTLTCLVQNFFPPDISVQWLCNKVPVPSDQVYTTEPQPTSGRTRAFFTFSLLEISKSDWEQQKTFTCYVVHEALPETRIQEKSVSKGSGN	66401	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64892_64988_65310_65396_65489_65547_65721_66104
874563	contig_8920_pilon	-	2616	4	Intergenic	novelGene_146064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.0388511535855	157	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2	424	94926	92547	TRUE	25	TATGCCATTAGATTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFASPGGGGTWQRVTEVPVPRGDQGSWGGRVCFVFFCLQSRFSPTPRGLRALPSGPGDCTLIDGHCSPEQGWRKCWSRKQQDHQGSSFSLWTPSLRVCPQSLSSYRRPTWNRDPLGLHLFPRYLLFPTREAQETRQLHS	94927	90124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_-_91700_91929_92619_93782_93946_94738
874564	contig_14415_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_77596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAGGAAGAAGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25592	22754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_22800_25600
874565	contig_20600_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_137106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	292	627	71797	71462	NA	65	GAAAAATAAATAAATACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLYVNCCLYVKHCCNCKLHNVTYMVTTEKSQRKSIQKKEESKKAHHKKAAKYKQNPKNQNKKKNKEHTKHSKNKQRNGGGRHFVFCDNLKRKQSKHPCKRQRGRMDKRT	72088	70853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_-_70900_72100
874566	contig_8729_pilon	-	3669	1	Intergenic	novelGene_40109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296473	292804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_292800_296500
874567	contig_9696_pilon	+	2083	2	Intergenic	novelGene_68762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGGAGAGCCAGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135157	138838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_136382_137979
874568	contig_3948_pilon	+	3126	1	Intergenic	novelGene_53270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	987	1436	1399591	1400040	NA	60	AAAAACCAACCAGAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFALHHGLLLTVKVCTMPHQHPAITFQMSFAQATIIPVPDPWSTRTSGTTFGPWWATYQCTGELQHPPRPAPPRNSARLAYLGTCSRQGQRQDPFQEPTFLGPSHWTHTASRPSASVFSSCQAGGAGKRCFWSGGLSIPAQKQKTHTHN	1398604	1401730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1398600_1401700
874569	contig_9696_pilon	+	2130	15	Intergenic	novelGene_68838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	164.339447734355	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	215	1639	596936	626143	FALSE	35	AGCCAGTACATGTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRSSSWWKLGVAVLCTGTLVYIGREVDCGVAPVCLLLGFPGFSSSAWGLAKESRALWATVLVPDFAVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPMKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKMGGIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDPRVLHHMGGMAGLQSMMRQFQQGAAGNMKGMMGFNNM	577969	626634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_578172_596923_597016_597960_598046_602199_602305_603101_603169_603247_603306_606704_606856_607977_608127_608413_608515_609029_609117_613858_613933_614134_614244_618819_618991_624292_624389_626051
874570	contig_5728_pilon	+	2904	13	Intergenic	novelGene_126694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	739	1218	282581	289085	TRUE	20	GATACTGTCCTGCTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFYLSSQLLQFIQPDHLLLREAIIGAFNFYQLNAMILGAPHHQVGEAASAVSEVSSQAPAHSAEDTAAQAGDEILSLLKRSKAVPADYGSQSAFLSLPRSCQPGAQGLGRGSMDELQPGLDGRFSACKEAVCIQVQGEGLVGVPEDIRNPIHEDDIP	281842	327316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_282680_287434_287563_288178_288377_289030_289132_298477_298628_299470_299637_309531_309652_310806_310917_312773_312903_319374_319612_322257_322460_324698_324840_326931
874571	contig_5686_pilon	+	3606	2	Intergenic	novelGene_45408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAATATTTGTCCTTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175850	181528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_177709_179780
874572	contig_14048_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_146346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1462	1812	629644	629994	NA	55	GTTTACATCTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCGKQINPTTEEICYMNWESKKKESLAYCLRLGSLEKQNLKHINMYRDLCQGNDSCSCRAWNDPSLWVRLEASPDSHSRRSWQTEIQAGKIAGKLLAQVPRTGGQANRSQPQDPE	628182	630613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_628200_630600
874573	contig_3233_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_56501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59566	57260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_57300_59600
874574	contig_10734_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_51077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487285	484700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_484700_487300
874575	contig_12050_pilon	+	1324	6	Intergenic	novelGene_62714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	63.1613806055567	861	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	304	1212	666343	683159	FALSE	40	GATGGTTTCCAAAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHYVVYSGLENIKKLTGGKLAAGHFDGKGEVEEYFRDIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSLPMGDIPMDGMAVADLGPVVLSLLKAPEEYVGQNLGLSTCRHTVGEYTTLLTKHTGHAVHDAKTTPEEYEKLGFPGAQELANMFRFYAMKPDRNIELTLKLNPKARTLDQWLEQHKGDFAHL	665823	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666069_666284_666392_668130_668370_679709_679960_681576_681768_682979
874576	contig_13481_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_119360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTATTTCTATGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444215	442876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_442900_444200
874577	contig_13481_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_119359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAGAAGCAATAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442826	441013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_441000_442800
874578	contig_13093_pilon	+	3954	4	Intergenic	novelGene_105215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	3010	3480	59053	59523	TRUE	10	GCTCTCGCCCACACTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLDLLLNSRPHSLHTCGFWPECVLWCVMRFDLQLKPRPHSMHTYGFSPECVLWCLMRVDLSLKPRLQSMHTYGFSPECVLWCLMRVDLSIKPCPHSMHTYGFSPECVLWCLTRVDLSLKPRPHSMHMYSFLSECVLWWRRRPDFWLKPRPQSRHM	55673	60082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_57815_57932_58630_58881_59933_60017
874579	contig_13878_pilon	+	2988	13	Intergenic	novelGene_165738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	43.417466403383	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	268	1836	278043	538744	FALSE	50	AAAGTCCAATTTCCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRAKEYESLMETKNSGSDSPYKAKLQRLAKDLLKQLQVQDSGSWANNKVSALDRTLGEIARILEKENVADQIAFQVAGGLTALEHILQVVVPVTNVNTVSRIPPKSLCNAISVYNLTCNNCSENCTDVLFSNKITFLMDLLIHQLTVYVPDENNAILGRNTNKQVFEGLTTGLLKVSAVVFGCLIANRPDGTSRPATPKISTQEMKNKPAQGDAFNSRVQDLISYVVNIGLINKLCGCFLSVQGPVDENPKMATFLQHATGLLHAVCTLCFAVTRRSYSIFDNNRQDPTGLTAALQATDLAGVLHMLYCVLFHGTVSDPGTASPKESYAQNTVQVAIQSLRFFNSFAALDLPAFQSIVGAEGLSLAFRHIASSLLGHCSQVSCESLLHEVIICVGYFTVNHPDNQVIVQSGRHPTVLQKLCQLPFQYFSDPRLIKVLFPSLIAACYNNRQNKIILEQEMSCVLLATFIQDFAQAPGQADNQSYQPKGKCLGSQDSLELANRFPQQAWEEARQFFLKKEKK	270826	539896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_270968_277916_278054_290351_290418_315603_315731_383521_383638_423752_423877_464747_464981_476428_476585_495689_495928_501392_501543_533393_533586_536283_536336_538640
874580	contig_8561_pilon	+	2986	4	Intergenic	novelGene_161640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.29983164553722	13	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	22	882	122302	136245	TRUE	35	TTCTCAAAAAGTGTACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLCVACWWLGLLTTAGAAAGQEDGFEGAEEGTQSEFIYLNRYKRAGESSDKCTYTFIVPQQRVTGAICVNSKEPEVLLENRVHKQELELLNNELLKQKRQIETLQQLVEVDGGIVSEVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNALELSQLENRILNQTADMLQLASKYKDLEHKYQHLATLAHNQSEIIAQLEEHCQRVPMARPVPQPPPATPPRVYQPPTYNRIINQISTNEIQSDQNLKVLPPPSAHHAYSHQPPILHRQAVGPMERLPAGPGGWP	122280	142739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_123120_136202_136397_138124_138396_141057
874581	contig_15105_pilon	-	3190	1	Intergenic	novelGene_150973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	555	902	617880	617533	NA	75	TTCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQLNGRLIEPPPAGSLPLPHLQRDVSQNVVGQLRVHEPQTHNGLQLAQVGRVLQVEDCRLTVPLLILLTEAPAFMVPHHGQMHLPHRVQYWPRCLGGRSQARGPPSQPAEGGD	618434	615244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_615200_618400
874582	contig_11932_pilon	-	2807	19	Intergenic	novelGene_85409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	46	junction_1	52.403585778734	118	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	910	2730	77	2806	284056	261735	FALSE	45	ATTTGGTGAATAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVCDYGGAGSEIERCLPCRAGDPNMALEESFPRGGTRKAHKSEIAFQQSVEQDNLFDISTEEESTKRKKSQKGPAKTKKLKIEKRENIKPVKEKFEILSVETLCEGMRILGCVKEVNDLELVISLPNGLKGFVQATEICDAYTKKLNEQVAQEEPLKDLVCLPEIFSPGMLVRCVVNSLGITEKGKKSVKLSLNPRNVNGVLSAEALKPGMLLTGTVSSLEDHGYLVDIGVSGNRAFLPLQKAQEDTQQKNKGAKLKVGQYLNCVIEEVKGNGRVVSLSIGHSEVSTAIATEEQNWTLNNLLPGLVVKAQVQKVTPLGLTVNFLSFFTGLVDFMHLEPKKTGTYFSNQAVRACILFIHPRTRAVRLSLRPVFLQPGRPLTRLSCQHLGAVLDDVPVHGFFSKAGATFKLKDGALAYARFSHLSNSKDVLKPEIFKPGNTHKCRIIDYSPMDELALLSLRTSIIEAQYFSYHDVKPGAVVKGTVLTIKPYGMLVKVGEQIKGLVPPMHLADVLMKNPEKKYRIGDEVKCRVLVCDPEAKKLMMTLKKTLVESKLPAVTCYADAKPGLQTHGFILRVKDCGCIVKFYNDVQGLVPKHELSAEYIPAPETVFYSGQVMKVVVLNCEPAKERMLLSFKLLSDPEAKKEHEGGSQKKRRAVHVGQLVDVKVVEKTKDGLEVAVLPYNIPAVLPTPHLSDHVPNGPLLYHWLQAGDILHRVLCLQSEGRVLLCRKPALVSTVEGGQDPKSFSEIHPGMLLIGFVKSIKDYGVFVQFPSGLSGLAPKAVMSDKFVTSPSDHFVEGQTVVAKVTNVDEEKQRMLLSLRLSDCTLGDLGTTSLLLLSQCLEELQGVRSLMSNRDSVLIQTLAEMTPGMILDLEVQEVLEDGSVVFSGGPVPGLVLRASKYHRAGQEVESGQKKKVVILNVDMLKLEVHVSLCQ	285396	261733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_261824_262240_262391_263214_263435_263571_263743_264708_264901_265411_265553_266141_266394_267514_267662_268310_268372_269079_269205_270013_270221_271177_271286_277050_277233_277729_277854_279314_279477_281539_281708_282950_283083_283957_284068_285331
874583	contig_14450_pilon	-	3346	1	Intergenic	novelGene_49027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGACCCAGCAGGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227562	1224216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1224200_1227600
874584	contig_10569_pilon	-	2854	1	Intergenic	novelGene_44081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	417	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACTTAAAAAGTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339699	336845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_336800_339700
874585	contig_10017_pilon	-	2863	22	Intergenic	novelGene_157001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	44.9040296865011	5	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1544	2740	371551	359979	FALSE	35	AGACGTGGGTAATAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLLGASMDIHGGGFDLRFPHHDNELAQSEAYFENDCWVRYFLHTGHLTIAGCKMSKSLKNFITIQDALKKHSARQLRLTFLMHSWKDTLDYSSNTMESALQYEKFMNEFFLNVKGLLRAPVDVTGQFEKWEEEEAELNKNFYDRKAAVHEALCDNVDTRAVLEEMRALVSQCNLYMAARKAARRRPNRALLESVARYLTHLLKIFGAIEEDSTLGFPVGGHGAGLDVEATVMPYLQALSEFREGVRRIAREKKVPEVLQLSDTLRDDVLPELGVRLEDHEGLPTVVKLVDRATLLTEREEKRRGEEERRRKKEEAARKKREHEAAKLAKMRIPPSKMFLSESDKYSKFDDTGLPTHDAEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLHQEYLQTVQNGSVQ	414363	359855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_360114_360435_360520_361207_361268_362791_362860_363404_363486_367782_367865_368899_368969_369696_369887_370272_370371_370796_370901_371003_371134_371455_371585_372135_372249_381993_382116_385023_385477_391388_391539_392560_392660_392825_392923_394200_394291_395116_395209_403794_404044_414318
874586	contig_3612_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_87817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAGAAAGCAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878897	876624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_876600_878900
874587	contig_8954_pilon	-	2742	2	Intergenic	novelGene_130284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACACTCAGCTGCTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156875	153466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_156183_156849
874588	contig_10861_pilon	-	571	6	Intergenic	novelGene_39366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1362.63823518937	26	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	19	555	1585418	1581171	FALSE	60	AAAAAGCCAATAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1585436	1581154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584525_1584677_1585412
874589	contig_14704_pilon	-	3140	1	Intergenic	novelGene_82676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11882	8742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_8700_11900
874590	contig_10801_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_74053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTCTGACAAATGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339295	341941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_339300_341900
874591	contig_17311_pilon	-	166	2	Intergenic	novelGene_57859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTATGGGTCATCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123401	121532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344
874592	contig_8260_pilon	-	3726	1	Intergenic	novelGene_163232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTTACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84337	80611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_80600_84300
874593	contig_5999_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_45597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10080	12943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_10100_12900
874594	contig_17311_pilon	+	4572	25	Intergenic	novelGene_57865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	53.2516953303419	23	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	998	3190	174356	199758	FALSE	5	GCTTCCTTCCTACCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLSNRGFSIGIGDVTPGQGLLTAKYELLNAGYKKCDEYIEALNTGKLQQQPGCTAEETLEALILKELSVIRDHAGSACLRELDKSNSPLIMALCGSKGSFINISQMIACVGQQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLPAAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMAGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDLTVRSSTGDIIQFIYGGDGLDPAAMEGKDEPLEFKRVLDNIKAVFPCQNEPALSKNELTLTMESIMQKDEFLCCQDSFLQEIKKFIKGVSEKIKKTRDKYGINDNGTTEPRVLYQLDRITPTQIEKFLETCRDKYMRAQMEPGSAVGALCAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIINASKAISTPIITAQLDKDDDADYARLVKGRIEKTLLGEISEYIEEVFLPDDCFILVKLSLERIRLLRLEVNAETVRYSICTSKLRVKPGDVAVHGEAVVCVTPRENSKSSMYYVLQFLKEDLPKVVVQGIPEVSRAVIHIDEQSGKEKYKLLVEGDNLRAVMATHGVKGTRTTSNNTYEVEKTLGIEAARTTIINEIQYTMVNHGMSIDRRHGEVLGITRFGLAKMKESVLMLASFEKTADHLFDAAYFGQKDSVCGVSECIIMGIPMNIGTGLFKLLHKADRDPNPPKRPLIFDTNEFHISLVT	148327	201140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_148422_148776_148914_151893_151998_152649_152792_166725_166867_170942_171013_171944_172077_172286_172426_174317_174483_177643_177817_179172_179285_180604_180724_182329_182468_184254_184426_185346_185461_189334_189422_189501_189585_190121_190293_191458_191553_191739_191833_194036_194202_194689_194855_195093_195193_196411_196545_199609
874595	contig_6191_pilon	-	3162	1	Intergenic	novelGene_107846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTTTCATTAAACGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163499	160337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_160300_163500
874596	contig_4426_pilon	-	2665	2	Intergenic	novelGene_15398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTCAGATTTGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856158	723693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_723799_853598
874597	contig_5947_pilon	+	3827	3	Intergenic	novelGene_101541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	785	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCTTTAGATGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559342	564902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_559874_560648_560882_561839
874598	contig_13525_pilon	+	4492	1	Intergenic	novelGene_145092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTGATGAACCCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93815	98307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_93800_98300
874599	contig_14191_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_153757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3958	6993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_4000_7000
874600	contig_1154_pilon	+	2250	9	Intergenic	novelGene_87091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	240.132125089501	1	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	609	1910	439267	445998	FALSE	15	GTTATATTTACCTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGRPGRPSQYRPDGLRSGDGVPPRSLQDGTREGFGHSTSLKVPLARSLQISEELLSRNQLSTTASLGPSGLQNHGQHLILSREASWAKPHYEFNLSRMKFRGNGALSNISDLPFLAENSAFPKMALQAKHDGKKDASHSSPVDLKIPQVRGMDLSWESRTGDQYSYSSLVMGSQTESALSKKLRAILPKQNRKSMLDAGPDSWGSDAEQSTSGQPYPTSDQEGDPGSKQPRKKRGRYRQYNSEILEEAISVVMSGKMSVSKAQSIYGIPHSTLEYKVKERLGTLKNPPKKKMKLMRLEGPDVSVKIELDPQGEAAQSANESKNE	330772	446338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330870_331888_331963_388054_388163_389032_389099_389755_389836_434841_434975_439216_439505_442410_442505_445028
874601	contig_12042_pilon	+	2182	12	Intergenic	novelGene_170442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	58.7155912953027	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	3	1070	194251	210031	FALSE	20	TATATATTTACTCCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAGWAGLLGPPGDFAKRLLVTGGAGFIASHVIVSLVEDYPNYMIINLDKLDYCASLKNLETISTKQNYKFIQGDICDSHFVKLLFETQKIDIVLHFAAQTHVDLSFVRAFEFTYVNVYGTHVLLNAAYEAQVEKFIYVSTDEVYGGSLDKEFDESSPKQPTNPYASSKAAAECFVQSYWERYKFPVVITRSSNVYGPHQYPEKVIPKFISLLQHNRKCCIHGSGLQTRNFLYAADVVEAFLTVLQKGKPGEIYNIGTNFEMSVVQLAKELIQLIKETNSESEMDNWVDYVNDRPTNDMRYPMKSEKIHGLGWKPKVPWKEGIKKTIEWYRENFHNWKNAEKALEPFPVQSACV	194248	211143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_194337_196693_196761_198510_198580_199736_199828_202096_202240_203663_203763_204748_204809_206042_206087_206674_206841_207484_207544_208232_208331_209945
874602	contig_10427_pilon	-	1561	6	Intergenic	novelGene_142183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	35.1602047775607	147	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	217	1422	61284	51109	FALSE	30	ATGAAGTTCATGTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDILRELLCVAEKAANIARACRQQEALFQLLIEEKKEGEKNKKFAVDFKTLADVLVQEVIKQNLENKFPGLGEKISGEESNEFTNDLGEKIILRLCSTEAETVKLLSKVLNGNKLASEALAKVVHQDVSFTDPALDSIRINIPQNILGIWVDPIDSTYQYIKGSADIKPNQGIFPCGLQCVTILIGVYDIQTGMPLMGVINQPFVSQDPNTHRWKGQCYWGLSYMGTNIHSLQLHIPKRNGSETLSQLTENTSSEAESHGFSAVISTSEKETVKAALLHVCGDSIFRAAGAGYKSLCVVQGLVDIYIFSDDTTFKWDSCAAHAILRSMGGGMVDLKECLERNPEKELNLPQLVYHVPNEGASGVDQWANKGGLIAYRSRKQLETFLSLLIQHLVPADTNT	82718	50969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10427_pilon_-_51674_53327_53503_55182_55384_58531_58593_61080_61348_82565
874603	contig_6489_pilon	+	4286	28	Intergenic	novelGene_128937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	708	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1771	2082	218884	224211	TRUE	25	ATGTGCCTCTTACAAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWLCSNGGTPWGRLGGALPEVTKGAALVLLLGALAVVPPRQRLFTVFMLLGRLTPEEVALEAEVAAVEKVAEDWREGVLSTLACVCDVLEESAACAEERLL	213110	359249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_214049_214142_214335_214417_214485_214638_214746_214830_214931_215275_215482_215693_215774_218459_218509_218852_218944_219553_219751_224156_224227_225052_225237_227284_227325_234239_234454_235509_235680_236313_236589_238585_238797_241742_241933_245007_245076_248262_248322_256263_256363_258074_258130_270716_270796_272185_272343_277001_277115_279197_279273_308007_308149_359190
874604	contig_13760_pilon	+	2566	14	Intergenic	novelGene_61325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	956	1291	237398	238246	TRUE	20	CTCAGGGTCCACAGGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFRCMETTLWTSRDQVLGLRPMVQLRVPALGVGTMYPRRRKLKRRSPSGLGGSRLTQLPLAAWFWMSSTVSASGPKSRWQLSSWNTSSETSGDTLTCTKPCCPSSMVLEA	235398	264701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_236239_236367_236469_237383_237435_237594_237845_238197_238320_238852_238887_239122_239267_244781_244928_245161_245336_245784_245914_246248_246413_247117_247284_250125_250268_264598
874605	contig_6576_pilon	-	2094	4	Intergenic	novelGene_42295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	54.5221667458903	123	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	670	1104	459204	445221	FALSE	15	CTGTGTACTGTGATCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRIPCLIVAAKSDLHEVKQEYSISPADFCRKHKMPPPQAFTCNSADAPSKDIFVKLTTMAMYPHARLRCMCTCNRCTFCICQNFLNSDLLQSIKNKIFTAVLNRHVTQADLKSSTFWLRASFGATVFAVLGFAMYKALLKQR	460867	444230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_445339_456083_456207_459010_459214_460207
874606	contig_14513_pilon	-	1140	2	Intergenic	novelGene_70377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	138	602	18880	11833	FALSE	30	AACATTAGAACTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKREETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19017	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18735
874607	contig_9981_pilon	+	2255	5	Intergenic	novelGene_121072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	25.1097590589794	11	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	168	740	408875	411855	FALSE	80	AGTAAAAAAAGAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRATRGSGRAYGLPFPVSHRRADRKPGLPSRPSSIFTAERTEGRGRKSRRDDDQMMLFGKISWQFCGLKKLPWSCDSRSFWGWLNAVFNKVDYERIRDVGPDRAASEWLLRCGAMVRYHGQERWQKDYNNLPTGPLDKYKIQAIDATNSCIMNIGFDHMEGLQHVEKIKLCKCHYIEDTCLERLGQLENLQKSILEMEIISCGNVTEKGIIALHHLSHNKYSMETVSGNQTTYCIGQIYCKRPL	402086	413370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_402249_408869_408982_410426_410636_411180_411353_411770
874608	contig_11328_pilon	+	1929	8	Intergenic	novelGene_88445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	208.458286337716	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	96	1352	830591	849070	FALSE	15	GATCAGTTTTATGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVWVVRAGGAESPDSFLFFAVGRLLLYQGRKMGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLVGPFYP	829356	849647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758
874609	contig_13097_pilon	+	2768	5	Intergenic	novelGene_107733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_4	553.291514484001	18	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1438	2025	245536	264473	FALSE	45	ATAAACTTAATAGCAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPFRTLLVLLLRGLVWWTPASSGTITPEERKTEIEKETETESEIVIVTENESAPERESESAIIVLHQAFSTVMKSDTDTGNMQKEGMSVIEQAERKKNGIEKDGTERKRKPDTSHLEAIVDVAMKVKKETVTGDTSTKNQKEAKKEKKLAMSLPLNRRAPKLHLRNRQGFGPLCILVPEVESINLVIFLDNV	242548	265216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
874610	contig_6079_pilon	-	3261	1	Intergenic	novelGene_160103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	177	335	454961	454803	NA	20	TTCACGTGAGGATCTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPQHPRCQDGCRFFNRNGCFTNQIVTLPRPVPGSYSIFCFARCSDFPVSGAIKGQRGMVGRKDSAFGSPFFTFLPSPTRIFQSLPYLFLHIKNKPLLQNNFRIKEKFQR	455137	451876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_451900_455100
874612	contig_10627_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_60068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACCGGACTGCCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348415	1351058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_1348400_1351100
874613	contig_13244_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_87008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTGTTGCAGCCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482897	480309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_480300_482900
874614	contig_13004_pilon	-	2504	2	Intergenic	novelGene_112683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1985	2344	682580	682221	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSRRGGLSGSVCFSSKTSTLNTICLCLRKAALKWGLRTSGGSLRHFQEAWGIKTIFIIIPRSYLELFHSHKCTVKFSRGCRTVIQQHTERITERKIQLSSIKEICKNVKHCHSSD	684795	682060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_683268_683498
874615	contig_1379_pilon	+	2461	2	Intergenic	novelGene_134602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480372	483131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_481756_482053
874616	contig_992_pilon	-	3239	1	Intergenic	novelGene_164299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGATTAATTTTCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369161	365922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_365900_369200
874617	contig_5253_pilon	+	4196	1	Intergenic	novelGene_61584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	231	572	309879	310220	NA	35	CTCTAACTAGGGGGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLCITLLYGFLKVQIIIKLILYTFAVWLRGSTPYVCLFFSPLLYFLTLSCLKDSCSHISFNLPSSPHLTTCGDVQQWRAGCYLLPGACRLQRHVPRTQREKDSLRNLTGAPL	309648	313844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_309600_313800
874618	contig_16970_pilon	+	3349	1	Intergenic	novelGene_157600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2535	2840	83608	83913	NA	15	CTGATTCTCAATTTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQLANSDLSKFRLEPCPCLQCSLMIHIKELPPSEPYLTHGNDVARSTIGVDVIMCLLMLLFSDALTHANLMYNRTRHCLALRHLHDLWYCCGYCVSPSH	81073	84422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_81100_84400
874619	contig_1154_pilon	-	3663	1	Intergenic	novelGene_87133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGTAGGACTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730265	726602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_726600_730300
874620	contig_8106_pilon	-	2278	3	Intergenic	novelGene_139729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	59.5	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	351	473	66813	66691	TRUE	15	AGAGGGTGTTCTCTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDKIILQLNRYYPQILTNKEAEKFRNPRAALRVRLCNLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSCLPSRHALRKSLHPGPHQALLCLLSMPWQPSAVRGPVCVRQVRAVGCFCPLPTVKCAPRVNVSVE	70068	64136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_64508_65256_67018_69922
874621	contig_3233_pilon	-	3384	1	Intergenic	novelGene_56503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGCTAAAGAAGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67075	63691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_63700_67100
874622	contig_9696_pilon	+	4066	1	Intergenic	novelGene_68753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTAAGGCTCCTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62018	66084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_62000_66100
874623	contig_14405_pilon	-	2821	1	Intergenic	novelGene_85644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAAATATTTTCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457463	454642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_454600_457500
874624	contig_9471_pilon	-	2476	4	Intergenic	novelGene_21703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	126.888402411988	24	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1716	2369	79153	73850	FALSE	25	CACCCATCCACCCATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMKEGVMEAAVYRMNRKHRGHCVIVNNHTFTSMKARPGTHKDAESLKCVFQWLGFAVRIYDDVTKGGLEEALQEYKSHSGHADGDCFVCCILTHGKFGAVYSADGALIPIRDIMSHFTAQQCPGLAHKPKLFFIQACQGDEIQPSVTIEADALNPEKVPSAPREVNLRESIPVEADFLLGLATVPGYVSFRHLEKGSWYIQSLCNHLKDLVPRLEF	80913	73742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_74371_74919_75029_79129_80457_80501
874625	contig_11476_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_170509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCAACTAGCTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230683	232523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_+_230700_232500
874626	contig_2367_pilon	-	1571	3	Intergenic	novelGene_65330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1347	junction_1	90.5	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	101	307	213194	193580	FALSE	50	GTCAAAATCAACATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	213294	192315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208634_213107
874627	contig_11017_pilon	-	4446	1	Intergenic	novelGene_128086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTCACTGTCTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239946	235500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_235500_239900
874628	contig_7457_pilon	-	1284	4	Intergenic	novelGene_31709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1903.55667107654	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2	478	1176982	1174926	FALSE	25	CAGAAACAGCTGGCTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLSRRRGLSSLPLEPPRFPTFRPPCPPSPAAAFRRPFPPRKRNRIVCPLSRTSTLSFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176127_1176811
874629	contig_19267_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_126974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25684	23065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19267_pilon_-_23100_25700
874630	contig_2757_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_164579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	82.9646845886181	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	459	1076	174814	171697	FALSE	20	TTCATTTATATTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSAFLERSVSLYGSPLMPNAEPPLDFSLRYSPGMDTYHCLKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHIHSQERSFECQMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFTCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK	182378	171048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_171876_172751_172918_173937_174076_174679_174881_175960_176099_176312_176433_182244
874631	contig_1082_pilon	-	3230	1	Intergenic	novelGene_170429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTCCATTAGTTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50753	47523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_47500_50800
874632	contig_5916_pilon	+	4847	1	Intergenic	novelGene_158030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGAAACACCTGACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279139	283986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_279100_284000
874633	contig_16541_pilon	-	3040	1	Intergenic	novelGene_126753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436711	433671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_433700_436700
874634	contig_8375_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_141288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTAACTGAAGACACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118243	116422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_116400_118200
874635	contig_12151_pilon	-	2773	14	Intergenic	novelGene_54978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	212.85734312142	4	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	137	2419	1023634	976317	FALSE	40	CTAAAAACTACATGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAMLISAGLPPLKASHSHTGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWYAHLLLKVFVSIFLRMESDMLQ	1023770	975962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_976557_980039_980231_983414_983538_986431_986624_987392_987502_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016_1000236_1001759_1001920_1011466_1011661_1016306_1016513_1016569_1016743_1023563
874636	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_94438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
874637	contig_504_pilon	-	1927	3	Intergenic	novelGene_54444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248575	240324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_241471_244791_245048_248050
874638	contig_15628_pilon	+	1825	13	Intergenic	novelGene_147684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	95.3354822018889	181	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	544	1716	52016	116664	FALSE	55	TTATAAAAAGAGAGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLGIDLQKISDHNGTFEKSTVLQLGIRMLDVLEYIHENEYIHGDVKAANLLLGYKNPDQVYLADYGLSYRYCPNGNHKQYQENPRKGHNGTIEFTSLDAHKGVALSRRSDLEILGYCMLRWLCGKLPWERDLKDPLAVQTAKTNLLDALPESVLKWAPPGSSCCEIARFMECVHSLAYDEKPNYQMLQKILNPGGMPLGPLEFSTHRHGVRVHPPDNPKVDSRKAATKQVNPMQNRLIEKKVHSERRAESCATRRRGQGEEKLSELTDSGAAQGSTRRRQKYHEPQEHWNEVKSSLQKSSCIQPLNSFYKYHQDFTTPDINNKSASANWYTYDTSTVGTRVTELESSLGCWPTISQFTLSEEMKTSVYFYSLLILFLLMLIFLALYFL	26854	116773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_27025_29114_29256_47265_47316_48279_48350_49743_49840_51999_52106_53308_53402_83282_83416_92163_92285_94797_94857_99444_99612_105797_105960_116316
874639	contig_6807_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_84568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCCCGTGGAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114610	115811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_114600_115800
874640	contig_8045_pilon	-	3488	1	Intergenic	novelGene_35344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	118	336	115779	115561	NA	20	TTTGGCTAATTTAGCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPTKGLASKGAADVGRPGFVRTQATTRGCCGSTQGLFPMSRRRRPLPRRAAGGIEVCAGAVRPPARAGIRIGRRRGRGACASRSHSGGEMIRGQRKVICCKPECSRCISS	115896	112408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_112400_115900
874641	contig_6199_pilon	+	1737	4	Intergenic	novelGene_126388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	147.691119119149	49	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	15	479	461129	513685	FALSE	30	TTGACCTTAGAATTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRSKMAASRRLMKELEEIRKCGMKNFRNIQVDEANLLTWQGLIVPDNPPYDKGAFRIEINFPAEYPFKPPKITFKTKIYHPNIDEKGQVCLPVISAENWKPATKTDQVIQSLIALVNDPQPEHPLRADLAEEYSKDRKKFCKNAEEFTKKYGEKRPVD	461114	514943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_461156_478402_478499_501226_501414_513530
874642	contig_9646_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_117431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170870	173208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_170900_173200
874643	contig_13112_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_98849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTACTAACTGAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688987	685659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_685700_689000
874644	contig_8050_pilon	+	2696	1	Intergenic	novelGene_114856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATTTTCACTGAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383974	386670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_384000_386700
874645	contig_17470_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_110543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284717	282707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_282700_284700
874646	contig_6544_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_142064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	359	1080	491	1570	15088	16167	NA	75	ATTCAAAAAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNHVEEAREELREQVYDAMGEKEAAKKTEDKSLVKPETDKEQETETEKSGREDMDLSEPTEELRATPDQLTDITKEAKGVAAPGLNEAEVTSEKPEQEAPDAEEGKSVPGTHIQEEEHREKGGQEKQGEVIVSMEEKPKEASEEQSVATLEEQGSAVEVEAEPGDPTVKPLDLGGEEPNEQVATSENEPGNVVLEEQFVGQEVPLAEESPEVGTEAAEAGSEVSEKPGQEVKVPPKDGAVSGLSAAGDQTPFKPQMSAEGPTEAKDGSGVEKVRAELVPSQVETKLSVEESEAAGDGVETRVAQGATEKSPEDKFKIAANEETQEREEQMKEGEGNRDICKSCSGWSTFWIWLTNHG	14597	16706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_14600_16700
874647	contig_19712_pilon	+	3266	22	Intergenic	novelGene_178180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_3	62.7405122874062	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1046	3138	127	3264	118853	160157	FALSE	40	AGAAGAGCCAGGCAGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLPKETIMESSGPKLLETAEEIQNRRQEVLDRYKRFKELVAERGQKLEESYYYQVFRRDADDLEKWILEKLKTLEDKSYEERANIQGKYQKHESFQAEVQAKSKVLPELEEIRESRFPEGHSAHKDTKEHLEELRRLWELLLEMTQEKGFLLLQVLSLQQYLQKCADILEWIGDKEAIVKSKELGEDWERTEVLRKKFEEVQADLEVLKSRVDEVNQYANKCAEENHPELPLIKLKQDEVNTAWKLLHSLALQRQKTLSDATDFQRFKRDVNEAIQWIEEKEPLLTSEDYGKDLVSAEALFHSHKGLERNLAVMEDKVKELCAKADKLEVSHPSDAPEIQQMKRDLVSNWEHIRALATSRYAKLQASYGYQRFLSDYDELSGWMEEKTALINADELPVDVAGGEALLDRHQQHKHEIDSYDDRFQNADETGKELLDANHEASEEVKEKMTALDNNWTALLELWEKRQHQYEQCLDLHLFYRDSEQVDSWMSRQEAFLDNEDLGNSLGSVQALLQKHDDFEEAFTAQEEKITNLDKTATKLIDRDHYDSEKIAAIRDTLLARRDALRERAATRRKMLEDSLLLQQLYQDLDDLKNWINKKKKLADDEDYKDTQNLKSRVQKQLVFEKELADNEFLLKKLEKTGQKMIEDGHYASDNVAARVREAVSLWKELLEAMAQKGTQLHEASQQLQFENNAEDLNRWLNEVEQQVTSEDYGKGLADVQNLLRKHGLLESNVAARQGQVGTLTNLAAYFEEMGHPDAGDIRSRQESLVSRYEALKQPLATRKKKLIDLVSLQQICRDTEDEEAWIQETEPSAASTYLGKNLIASQNLLNRHQVILADIASHEPHIRMITERGNKMVEEGHFASEDVASRVKSLNENMKYLQARAARRQNDLEANVRFQQYLADLREAEAWIREKEPIVNNTNYGADEEAAGDLLKKHEAFLVDLKAFGNSIQALQDQAEACQQQQAAPVEEAGREARVVALYDFEACNPLGVTMKKNDVLTLISSINKDWWKVEADDDQGFVPAVYVRKLARDEFLKLPWRR	118726	160159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19712_pilon_+_118877_120618_120859_122312_122439_123833_123975_124746_124894_126700_126835_127392_127538_129394_129550_131214_131351_131439_131542_133018_133157_133763_133875_135486_135565_135712_135869_136245_136451_138669_138852_143758_144003_145337_145461_147452_147671_148517_148611_150333_150472_160055
874648	contig_9995_pilon	+	1635	2	Intergenic	novelGene_47780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742108	745348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_742695_744299
874649	contig_15744_pilon	+	2533	11	Intergenic	novelGene_83567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_9	56.0424838849957	259	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	23	1654	39564	46137	FALSE	5	CCTCGTGTGGGCTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PANPTPPMTPSSSVPYMSPSQDVKSPFLPDLKPNVSSLHTSPGNGPCDELRLTFPVRDGVVLEPFRLQHNLAVSNHVFQLRDSVYKTLMLRPDLELQFKCYHHEDRQMNTNWPASVQVSVNATPLTIERGDNKTSHKPLYLKHVCQPGRNTIQITVTACCCSHLFVLQLVHRPSVRSVLQGLIKKRLLPAEHCVTKIKRNFSSGTIPGTPGPNGEDGVEQTAIKVSLKCPITFRRIQLPARGHDCRHIQCFDLESYLQLNCERGTWRCPVCNKTALLEGLEVDQYMLGILIYIQNSDYEEITIDPTCSWKPVPVKPDLHLKEEPDGPVLKRCRTVSPAHVLMPSVMEMIAALGPSAAPCAPLQPSSGPAPSDYPSQGSSFLGPGNFPDSFPPTTPSSTPALPEFTPGPPPISYQSDIPSSLLTPEKPASCLPGQMAPVGHLDPAHNPGPQGLHNPNLGAPPGPQLHHQNPPPPPRPPLGQAGAGPGSELAFNPTTGVMGPTSMSAAGEAPEPALDLLPELTNPDELLSYLGPPGLPTNSNDDLLSLFENN	39541	47016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_39670_40694_40840_41020_41232_41876_41983_42139_42298_43122_43191_43433_43503_43730_43976_44542_44716_44812_45056_46029
874650	contig_18420_pilon	-	1395	10	Intergenic	novelGene_109356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.055698763759	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	62	1111	127614	109233	FALSE	5	GTGGCCTTGTGACTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQNRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFVTGDIVQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASVAQSAPSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPAPYTTRPPKKGEEDGKDYHFISTEEMTKNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQDKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRSQYAHYFDLSLVHNGVDETLKKLQLCAPHLRIWNSISLALKTNRVTPASFVCQLPALCSYPN	127675	108948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_109350_109431_109549_110723_110799_110956_111160_112317_112399_112601_112683_118233_118341_119704_119902_124360_124430_127611
874651	contig_5445_pilon	+	834	4	Intergenic	novelGene_135401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1376.78909867206	35026	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCCTACTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51554	53972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53244_53573
874652	contig_14326_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_120758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	995	1408	590019	590432	NA	45	ATGGCTTCAACAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNVTPPPLCIFWAYSFNKANLPCPGSLHKHHHFCPFSLQMWASELNAFFSQFGLAPAAVTCIVPPLRYFSLLLFHLSSPLPINGVSLIKAQNNSYMFLHFFDTIIRQERIIILLFLSMVEIFTSTFDIKSFNSCRR	589024	590825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_589000_590800
874654	contig_9656_pilon	-	5447	10	Intergenic	novelGene_121902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	26.6708330078634	138	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	174	2000	192169	158538	FALSE	20	TCAAAATGTTTGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKAKGKGQIKEEENNNQKQLKRPTQGKRQNPRGTDIYLPYTPPSSESCHDGYQHQEKMRQKIKEVEEKQPEVKTGFIASFLDFLKSGPKQQFSTLAVRMPNKTRRPGTQIVRTLCPPPLPKTLSTTPMSLVSETGVNSPSEKVDNELKNLEHLSSFSSDEEDPGVCSHDIYKSISTTLTALDATSDKKKKTVSEALQVATASPTASTTGTATTSCTTVGVVKQEPLYSTSSTVNIPENINSAEPSKHVEHDGLPSNQFAKGQDTVAIEGCTDEENTESGGEGQYRERDEFVVKIEDIEIFKEALKSGKEPPAIWKVQKALLQKFVPEIRDGQREFAATNSYLGYFGDAKSKYKRIYVKFIENTNKKEYVRVCSKKPRNKPSQTIRTVQAKLSSSSKTSDPPTPKATATKAPSMKPKVKQLKVKAEPPPKKRKKWKEEFSSSQSDSSPEVHSSSSDDEEFDPPAPFVTRFLNTRAMKETFKSYMELLVSIALDPDTMQALEKSNDELLLPHMKKIDSMLNDNRKRLLLNLHLDQSFKNALESFPELTIITRDSKAKSGGSAISKIKMNGKAYNKKTLRTSKTTSKSAQEFAVDPEKIQLYSLYHSLHHYKYHVYLICKDEISSVQKKNEDLGQEEIVQLCMKNVKWVEDLFEKFGELLNHVQQKCS	192342	155090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_158679_159715_159812_161004_161158_163908_164007_167170_167309_171363_171582_172921_173056_173634_173752_174866_175196_191766
874655	contig_5482_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_144462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1307	1756	324566	324117	NA	35	AAGACGTACAGCCAGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLNLGLKHRVAKANGRNDEVKELNRRFQRVVQEDKVKYYNEMCTDLELENRKGRIRLVFLKLKEPKKKFKPRVAKLKDSMGIVLNDAGRIKRRWKEYTVTIPKSGNPGGVVVQSSATNQKVGNSNPPGAPWKPYGAGLLCPVGLL	325872	323167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_323200_325900
874656	contig_1516_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_50004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGAGCTCTGCCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342541	339485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_339500_342500
874657	contig_846_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_136097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATACTCATCTTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128561	130681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_128600_130700
874658	contig_17829_pilon	-	3159	3	Intergenic	novelGene_157038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	346	junction_1	18	29	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	620	1060	41494	41054	FALSE	30	TCCGGCTACACATTAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVDDFPNVMLTIVIVERTVINSGLPSSLAHFPLCSALSLCSSSWLLLLSLSFSPSAPLDVQPSHLLFCPFLTSWSGSFSPLGVFIYIPWIWKYHSHFISVMCQCNVIKIIYA	43821	38954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_41700_42845_42904_43465
874659	contig_13947_pilon	+	1958	2	Intergenic	novelGene_173104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	785	1144	29885	30244	TRUE	20	AATCCAATGCGGTCGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFRIKNNSGYSSSNRPSGTLPLGSAQASVTKLFSSTNKGLGASAEVSCLKAISSLTPWVIMPTVAACFVGWEAHYAMRHRYPVEPPTYAFFLNSICIKNYPNFFKVNVQVLYHHIST	29100	31212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_+_30910_31063
874660	contig_5586_pilon	+	2840	1	Intergenic	novelGene_143550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	73	456	361944	362327	NA	70	AAAGCATAATAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPALGKWRPAKREVNDGSRKHATSECRPSVALPVTLQNPGCLLGAVRSKDELCLRAVTSSCPPELVSETKELTLLKLKLFIVSFTFLPPASPPVPVSLCVSGESHLLVQKISSGVFFLLGISAAHT	361871	364711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_361900_364700
874661	contig_7426_pilon	+	2806	1	Intergenic	novelGene_27459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	118	426	590441	590749	NA	20	CTGCATGACCTTGGGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGEEWAPSAGSLAVSTCQFSGSPHLSGLLGLDVIKSRQMENCINRMRSISLALKLGNSDFVKLNIPQVRSEQERAAPYAHSVLVAGELSEIVGETVSMTTGTLGIPALGNTGSAFLGCFLKCVAPLLPLASPDLQTSSSP	590323	593129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_590300_593100
874662	contig_12638_pilon	+	3514	12	Intergenic	novelGene_33281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	16	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	755	1087	877484	878418	TRUE	75	AACAAAAAAAAAAAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKAFEEVPTADAHQVGSLVSTLGAVSLSLLLSLLLLELHVAKVQEGAHDLVAGTLLIRAEAQDAHGMLSGNELLPIIHVIHRDDTLAAEVVVVGVHGQQQHVLQLWLLP	874932	882221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_874997_875080_875212_875305_875488_876898_877075_877191_877334_877424_877546_877840_877985_878109_878212_878393_878497_879595_879660_879771_879863_880027
874663	contig_9571_pilon	+	2896	2	Intergenic	novelGene_136303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	169	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1902	2288	573763	574149	TRUE	25	AAGCATCTTCTTCTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCKFCAAIATNYQIQQRRRVPWEGQLVSELIKRLESGDMSDLHLKGISFGLTGILISPPEFQQRLTPQHFSRVGETVPLGWLAMRMKKCEGEDWINLHILGTGFPPFLTMQLEIKVEFAPYLMHDTQ	571861	579460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_574566_579268
874664	contig_14034_pilon	-	1251	2	Intergenic	novelGene_72654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	155	301	337174	336723	FALSE	20	CATTTGTACGTAGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACAPQPAPSWLASSPGFLRSSRDEGRLDFLSRREKAGGDGAEPEENKGWDMEHLRLLHNKPIGRGQGQARTRVSWRPRAVERIASQFAMRKPKPGRRK	337328	335772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_336766_337070
874665	contig_4845_pilon	-	2823	2	Intergenic	novelGene_53701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1205	1585	943978	943598	TRUE	5	CTCTTGCTTTGGATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPSVIICIRIMHKSHESVRYYTNITYLCSTGTVYGTKTDLTGLSLLGNLVRLGGEAEDGCSLSPHRKHILGIASAGFPPLTLARDAKVFLAHLTRPLSRYCPAAGQLTVASGWGILSETCIRGH	945182	941877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_941940_942421
874666	contig_4103_pilon	-	3569	1	Intergenic	novelGene_52004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTACAAAGAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251983	248414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_248400_252000
874667	contig_8864_pilon	-	3468	1	Intergenic	novelGene_135995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	498	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAATAAAAGTTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680880	677412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_677400_680900
874668	contig_14047_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_176586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCCTGAAGGGTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51791	54196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_51800_54200
874669	contig_11396_pilon	-	2754	12	Intergenic	novelGene_71418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_11	248.147983041578	67	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	182	1516	1689836	1662084	FALSE	25	AGGGGGCGGGCCAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEEEFFDAVTGFDSDHSGEFSEANQKVTGGLGSDTSKSQGIGKTEARPPQENGVQTHRTSLPAPMFTRSDFSVWSILKKCIGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHKASRQAHPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPVSAFYSEGLNQDFIFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLQQNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGDKCVLHFKSCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGVDPASYESFKKQERRGEHLKKTKPETSSEKADSDVADNVPETQETMQVIPGSRLLWRINMRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELQAGMEEILPPTDCRLRPDIRGMENGHMGMCAARPPHPWPPHALPLCGDRRDGLLAV	1706302	1660845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1662297_1663036_1663166_1667761_1667886_1669438_1669529_1670179_1670288_1671109_1671293_1678224_1678323_1680165_1680301_1686029_1686106_1689328_1689471_1689799_1689971_1706255
874670	contig_9186_pilon	+	510	4	Intergenic	novelGene_85352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	782	junction_3	806.627960503891	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	126	509	461710	469688	FALSE	25	GTAAGTATTGTTTTATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEIKVQPSQFRESVEANGRIYEEQRKLEESFTIHLGAQLKTMHNLRLLRADMLDFCKHKRNHRSGVKLHRLQTALSLYSTSLCGLVLLVDNRINSYSGIKRDFATVCQECTDFHFPRIEEQLEVVQQVVLYARTQRSSKLKESRDSGNRNGGSDDKTKNTDRNYLNILP	461213	469689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_461322_461692_461891_462735_462865_469614
874671	contig_5196_pilon	+	2724	1	Intergenic	novelGene_38705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACATCATGCTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333045	335769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_333000_335800
874672	contig_10304_pilon	+	3584	2	Intergenic	novelGene_166498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	83	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	41	355	162676	164805	FALSE	25	TCATACCATCTGTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGPSASQRGESFMKPEKPSTSHHRPLRSLARFSSRSKSVEKSDEELQFPKELMEDWSTTEVCIDCKKFISEIISSSRRSLVLANKRARLKRKTQSFYVSSPGPSEYCPSERTINEI	162635	168034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_162732_164546
874673	contig_6418_pilon	+	2361	2	Intergenic	novelGene_81151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	378	707	249121	249450	TRUE	20	AGCAGCAGCTGCCGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAAAISCQGAALGDGSTKVTMEAHTSLPSYISQTSSKIQRPLLLTSWGGRGQAAYFILLILREGRLRKQKDRTFFFFFFPSYLHLVIQNCEPWRDYHRNEKFKIPFK	248743	317799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_250996_317690
874674	contig_13504_pilon	-	2915	21	Intergenic	novelGene_157954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	23.6293779012483	116	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	673	2028	61466	36800	TRUE	35	TACTGTTCACATTGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGDVRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPPQHGQHAALWRRWPKEDPSHRSRDPRGNQGWGRKNRSNDC	144815	26991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13504_pilon_-_27661_28386_28490_33701_33796_36778_36888_38456_38547_39405_39557_40943_41051_42270_42518_44932_45083_48503_48622_49787_49881_57280_57361_59078_59237_61080_61123_61434_61474_62827_62899_63685_63837_64555_64682_70260_70390_111364_111438_144700
874675	contig_6102_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_31827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTCCCCAACTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367935	370317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_367900_370300
874676	contig_14954_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_165178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	469	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCAGGGCAGTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85048	84120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_84100_85000
874677	contig_15732_pilon	+	3738	1	Intergenic	novelGene_88921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATTGGTTAACAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374103	377841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_374100_377800
874678	contig_10064_pilon	-	3117	3	Intergenic	novelGene_122735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	11	49	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	1626	2615	432830	426921	FALSE	30	CTTAGCTACTACTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYPQEDWGNHSQDLHGYPTDQELDEIPVPKRTLKIKQESSEEAQKRDIMQNIVQILESVQLKWELFQSWTDFSRLHLSNKLAIFGIGYNTRWKEDIRYHYAEISSQVPLGKRLREYFNSEKPEGRIIMTRVQKMNWKNVYYKFLEITISEARCLELHMEIDWIPIAHSKPTGGNVVQYLLPGGIPKSPGLYAIGYEECIERPLSPHMEQRSLDPGKEGRVDLETLSSQASLQVEMEPARIIYCYLGIAEVRTLQQCLFLHFQANTKTFSKDWVGINGFLSQNCIVDPGVSPKSIYIKFVEVERDFLSAGSLVECLEKAIGYPLKFNN	434455	426418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_427774_431199_431261_432754
874679	contig_11171_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_48615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAATCAGCGTCTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242235	243939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_242200_243900
874680	contig_19990_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_30751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41565	39515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_39500_41600
874681	contig_6189_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_164946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106226	108474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_106200_108500
874682	contig_20716_pilon	+	4068	2	Intergenic	novelGene_176138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATAGTTTCCTTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128124	132491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_130261_130559
874683	contig_19098_pilon	+	2518	3	Intergenic	novelGene_65860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	7	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	941	1405	483958	486390	FALSE	10	GTTCTACTTTGTCAGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVQSGNKNRILPAWMTAQEVEKRGVSAEAPKRRRTAVVKASAARLPTTGTVYCMNEAEVVDVALGILIEDHKQEKPLEQKALAGADKLELSPTRSRSPCSPGGRSEDKDNGEDTLPPTLGASQELGGSDSTHSQSQKEEEDALKYVREIFFS	483017	487503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_484095_485036_485113_486138
874684	contig_14516_pilon	+	3182	3	Intergenic	novelGene_153953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_2	30.5	51	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2533	2838	421611	422609	TRUE	70	CGAAAAAAAAAAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	419078	423132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_421780_422472_422614_422792
874685	contig_11258_pilon	+	2861	1	Intergenic	novelGene_67759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1166	1510	150336	150680	NA	25	AGCCTGGGAGTAGCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRSQGGTTKVQVGLVWPGPGRLDSLKPTSHDKQCEVDSISSNAVCLWAPLGECPPHLPSSCGFNHGAGLPASWFLFLCSLVEKAAFCRLWGKQEMTGKTPSKLVRPSWESRQ	149170	152031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_149200_152000
874686	contig_3588_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_72901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1947	2309	148330	147968	NA	45	AACCAAACAAACTGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQVLSIFLLCHVHSAYHSSWSLLADVATSSRRRASSANVSLSISLSLDPSSTFPFSFHWPDLHHMRMPTAATAKGNGTAKTSGTAKTSLDQSEFTDGDGERITSNEVKLCHQEEEGSGC	150276	147815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_147800_150300
874687	contig_3426_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_57953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	376	774	385496	385894	NA	55	GTATCTAAGAAAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPVSGWIRAERLKATAQTQHLFLLYFLRALYLCGCGCARGVCVCACVRVCAHTRVCARVRVSEFGRNSTSTPAPAVIAERERERETKAFVFHSPPHPQKRAERRLISFGSEGRFSAGAADSDTQLITIPPR	385120	386775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_385100_386800
874688	contig_14868_pilon	-	3360	1	Intergenic	novelGene_150437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	2004	2708	110350	109646	NA	45	CCACAGCAATAGAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFFPCLLCDFFLCPGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKAQATEKHQDQAVVSQTAFMIAFFDEDNPRKRLSYSFTQSAGISCQETIYSTPHTKLEKANSPTADAKVVSLSLQTSSAHHRGGHGVPHGKLLKQKSEEPSVSIPFLQTALLRSSGSLGHRSSQEMDKMLKNQATSATSEKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEARKMIDKVNN	112353	108993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_109000_112400
874689	contig_11512_pilon	-	3252	1	Intergenic	novelGene_43322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	198	809	412756	412145	NA	75	GAAAAAAAAAAAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGVFVCPAPQPPDTESSPGQRSLGLPRIYTQGPWWRASPAKVQVFVFFADPEHTRPLTLTKLLGWNPTCPSPALLPVPMWTQDIWRPAPLPLLAPSCPRSFFVSFGALMQVIVPSTRSYTPSGSSDTSFRLNLCILSLSVPQPRLYTKEVCKKFLLSSVIQQICNGHCVWCWALGDREKGYLAVSSLRVGFCLLPSTVPET	412953	409701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_409700_413000
874690	contig_6445_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_76990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2116	2436	428239	427919	NA	30	AGCCAAGCTCTTAACGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQYLESLRNSAKQCFPNDECMMLYNHAWVKDAFRVQDRQVDFNVTEYEIFIDTVSHSPPHSSVRNYHLSSFSVESNHLPLSEKSCICVRLYFFHILHPKQPFTTD	430354	427674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_427700_430400
874691	contig_16999_pilon	-	3519	2	Intergenic	novelGene_84971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCTGCTCTGCTACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54262	50687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_52097_52152
874692	contig_6724_pilon	-	2650	1	Intergenic	novelGene_167977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTTTGTTATTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360823	358173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_358200_360800
874693	contig_6031_pilon	-	1544	8	Intergenic	novelGene_56782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	94	junction_2	26.2266416968295	76	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	222	1391	583421	527723	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGTVTADHARNSSWAKNDTYQDALHNASEEATEQNIRAGTQAVLQVFIINSSNIFLLEPANEIKSLLDEHTDMCKRILNIYRFMVVQVSMDKKTWEQMLLVLLRVTESVLKMPSQAFLQFQGKKNMTLASRLAGPLFQTLIVAWIKANLNVYISRELWDDLLSVLSSLTYWEELATEWSLTMETLTKVLARNLYSLDLSDLPLDKLSEQKQKKHKGKGVGHEFQKVSVDKSFSRGWSRDQPGQAPMRQRSATTTGSPGTEKARSIVRQKTVDIDDAQILPRPTRVRHFSQSEDTGNEVFGALNEEQPLPRSSSTSDILEPFTVERAKANKEDMSPKLPPLNSDIGSSSANVPDLMDEFIAERLRSGNASTMTRRGSSPGSLEIPKDLPDSLNKQSQMRPIDDPGVPSEWTSPASAGSSDLISSDSHSDSFSAFQYDGRKFESKYLFLFEQYAFCRLFSVQD	590237	527569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_528002_529587_529713_532908_533077_573917_574080_575103_575342_577095_577226_583353_583503_590097
874694	contig_10404_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_138703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCATTTGGGAATGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200658	1201807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1200700_1201800
874696	contig_14643_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_99136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAAGTAGTTTGGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99741	101748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_99700_101700
874697	contig_6576_pilon	-	2875	13	Intergenic	novelGene_42366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_12	118.221425958054	126	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	134	1735	1140951	1103579	FALSE	10	CCTTAGTCTTCCATCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPPAPGSQGSEVPGPTFADGELISREPGFFPEDKEEVMTLAPPEELDMDSPMESAQSLEGSVGSPAEEKDGGLGGLFLPEDKSLGHTPSMTTSDLSTHSTTSLISNEEQFEDYGEGDDVDCAPSSPCPDDETRTNIYSDLGSSVSSSAGQTPRKMRHAYNSELLDVYCSQCCKKINLLNDLEARLKNLKANSPNRKISSTAFGRQLMHNSNFSSSNGSTEDLFRDSIDSCDNDITEKVSFLEKKVTELENDSLTNGDLKSKLKQENTQLVHRVHELEEMVKDQETAAEQALEEEARRHREAYSKLEREKSTEIELLNTRVQQLEEENTELRTTVTRLKSQTEKLDEERQRMSDRLEDTSLRLKDEMDLYKRMMDKLRQNRLEFQKEREATQELIEDLRKELEHLQMYKLDCERTGRGRSSSSSLGEFNARAREVELEHEVKRLKQENHKLRDQNDDLNGQILSLSLYEAKNLFATQTKAQSLAAEIDTASRDELMEALKEQEEINFRLRQYMDKIILAILDHNPSILEIKH	1141084	1102438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1103696_1104292_1104437_1105607_1105767_1105842_1105981_1106486_1106569_1108529_1108671_1109762_1109867_1110155_1110256_1111471_1111508_1111835_1111971_1112553_1112749_1115574_1115796_1140921
874698	contig_19954_pilon	-	3764	3	Intergenic	novelGene_173750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.5	70	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	262	420	105396	105238	TRUE	45	GGCTTAATTTAAAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQHSHLEQEVISNIGRAQQILRNACEGLDFLWLYKVEKPLYLRLKGGLQKRLRFANASIGLAGVTCRGWRGGVNTAEPHELRSGKRMVPQGKSEIPFYCLYFRLFYVRLCSAYRLFSELCCLISGTRQNKPEEEYTQN	107766	100613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_-_103414_104693_105542_107650
874699	contig_7357_pilon	+	3831	9	Intergenic	novelGene_36892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	92.5417979888007	3	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2921	3373	270199	273311	FALSE	40	TTAAAGATTGAATTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	256384	273769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268224_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
874700	contig_4305_pilon	-	2342	3	Intergenic	novelGene_136666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	814.5	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTAGCCAGATTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514695	511089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514006_514632
874701	contig_8712_pilon	-	1852	2	Intergenic	novelGene_58877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCTGGAGGGCCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921656	906559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_907408_920652
874702	contig_500_pilon	-	4451	27	Intergenic	novelGene_30918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1	609	1062602	1056871	TRUE	45	ATTTCCTAATAGAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDAAPVGQVVGHDGQPVPPGLHHCLHVVETVVPPQVGRLQTCIYLGSFLKLNDLLGCLEKGCVHVGHDVGQPPPLTDGQAAGHLHQPLDETELLLLGVTDGQVTSVHVHLPGHLLGTTYFYLEHQRLLHGSPVRDPPGTLQDEVWVYVALGLAILRQGLPLVQLFRAHRIQWSSQSWYSGKIAGDAVLLSCSFLALSIAFS	1062602	1027217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1027331_1027739_1027861_1028490_1028655_1028743_1028928_1029140_1029338_1029748_1029879_1031128_1031406_1032744_1032941_1033714_1033874_1033973_1034108_1035580_1035690_1036700_1036849_1038403_1038619_1039258_1039380_1041317_1041468_1042533_1042734_1043338_1043460_1045108_1045324_1046883_1047064_1048485_1048637_1054790_1054909_1055605_1055891_1056055_1056203_1056863_1056978_1057191_1057322_1057618_1057815_1062426
874703	contig_6871_pilon	+	3696	21	Intergenic	novelGene_21584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.7276280144373	211	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	64	2595	255338	272068	TRUE	10	AGCCCGTTGATTGCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SITKVCLGTSTSKEAKEYFADMKRHRIQFKYSGPEDDAAISLAFSKKQIDDRKEWLTHFMEDRRQRKLLGLPEDYLYGQTTAYLTYNDFINKELILFSNSDNERSIPSMVDGLKPGQRKVLFTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSSYHHGEMSLMMTIINLAQNFVGSNNLNLLQPIGQFGTRLHGGKDSASPRYIFTMLSPLARLLFPPKDDHTLKFLYDDNQRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWSCKIPNFDVREVVNNIRRLMDGEEPLPMLPSYKNFKGTIEELASNQYVISGEVAILNSTTIEISELPIRTWTQTYKEQVLEPMLNGTEKTPPLITDYREYHTDTTVKFVVKMTEEKLAEAERVGLHKVFKLQTSLTCNSMVLFDHVGCLKKYDTVLDILRDFFELRLKYYGLRKEWLLGMLDAESAKLNNQARFILEKIDGKIIIENKPKKELIKVLIQRGYDSDPVKAWKEAQQKVPDEEENEESDNEKETEKRDSVTDSGPTFNYLLDMPLWYLTKEKKDELCKLRNEKEQELETLKRKSPSDLWREDLAAFIEELEIVEAKEKQDEQVGLPGKGGKGKGKKAQMAEVLPSPSGRRVIPRVTIEMKAEAEKKIKRKIKSENTEGSPQEGSAEPESLKQRLEKKQKREPGNKTKKQTNLPFKPVKKGKKRNPWSDSESDMSDNESNFDLPPRETEPRRAAKSKFTIDLDSEEDFSDFDEKAQDEDFVPSDVSPPKSKTSPKYTNKKLKPQKSAKSVMDIDADDAKDNVLPSSSSPTADLPAETEIINPVSKKNVTVKKTAAKSQSSTSTTGTKKRAAPKGTKKDSGLNSDVSQKKPGPAKSKNPPQKEAIHF	255187	273499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_255204_255290_255401_255650_255744_256326_256442_256544_256667_258279_258429_260073_260306_260475_260611_260739_260941_261122_261319_262939_263032_263133_263299_263431_263516_264965_265149_265755_265847_270194_270345_270558_270683_270808_270853_271338_271480_271916_272121_272450
874704	scaffold_13505_pilon	-	992	5	Intergenic	novelGene_111450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	273.662543107383	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	310	585	532469	531050	FALSE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLGEDARGSRAPPSSACDSLPPLLALCRWPGYWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535611	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532892_535512
874705	contig_12790_pilon	-	2790	6	Intergenic	novelGene_35293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	6.67532770731145	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	82	837	546670	525111	FALSE	35	TATAGAAAGATGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIPESPRWLISQGRFKEAEDIIKKAAKMNSITTPEVIFDSMESQELKPLKQQKVFILDLFRTWNIAIITIMSLLLWMLTSVGYFALSLNTPNLHGDAYLNCFLSALIEIPAYITAWLLLRSLPRRYIIAGVLFMGGGVLLLIQVVPEDYYILSIGLVMLGKFGITSAFSMLYVFTAELYPTLVRNMAVGITSMASRVGSIIAPYFVYLGAYNRVLPYIVMGSLTILIGIVTLFFPESFGTTLPETFEQMQKVKGFRLGKKTRESMETEENPKVLITAF	546751	523157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_525187_526608_526745_532407_532591_535585_535801_538603_538705_546625
874706	contig_9058_pilon	+	3350	4	Intergenic	novelGene_149355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	313	junction_3	283.214877198686	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	56	838	41923	52010	FALSE	35	GAAAATGGATAGTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFLLQEELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNGKLPLFCPPQALANSL	41867	54522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47502_51837
874707	contig_5896_pilon	+	4506	2	Intergenic	novelGene_159245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	295	2601	345940	348246	FALSE	60	AATACCTTTAAAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKKPPVHQIASPETFSPDVLADIFELFAKNFSYGKPSNNEWQLPDPSEIFTCNHVEFNSFLDLKNSLNEVKNLLSDKKLDEWHEHTAFTNKAGKIISHVRKSVNAELCTQAWCKFHEILCSFPLIPQEAFQNGKLNSLHLCEAPGAFIASLNHYLKCHRFPCDWSWVANTLNPYHEANDNLMMIMDDRLIANTLHWWYFGPDNTGDIMTLKYLTGLQNFISSMATIHLITADGSFDCQGNPGEQEALVSSLHYCEVVTALTTLGNGGSFVLKMFTLFEHCSINLMYLLNCSFDQVHVFKPATSKAGNSEVYVVCLRYKGREAIHPVLSKMMLNFETEMGSKALFPHHVMPESFLKRHEECCMFFHKYQLETISENIRLFGYMGKEEQAKLNNLRDCAAQYFMQKFQLKPLPRNNWLVKRSNIGCSTNTKWFGQRNRYFKTYNERKMLETLSWKDKVAKGYFNSWAEEHAVYHPGQSSLLEGAGSNLECHLWHILEGKKLPKVKCSPFCDGEILKTLNEAIEKSLGGALNVDSKYRPKQQYYCSCHVFSEELIFSELFSLTKCLQDEHVVGPSNQIKCLLVGLPALYDIKMNVPLEVQFLESAELMTFSCSLLHDGDPKYQQSFLNCLLHSLQQLHTGDVLILPILSCFTRFMAGLIFVLNSCFRLITFSCPTSSEPLRSCAVLLCVGFQDIPSPVFQYLQNVNELLSALVNTDAPQQVLQFVPMEVLLKGALLDFLWDLNAAIAKRHLHLIIQAEREEIINGLQL	342002	350151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_342278_345920
874708	contig_13145_pilon	+	3455	1	Intergenic	novelGene_116655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAAAAAAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228513	231968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_228500_232000
874709	contig_8587_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_159144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	281	613	496418	496086	NA	35	GACAAAGACCTTCCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGRLYSCSLFPVRDYTHILWPQDTQWLPVGDRLPYPIVGLDRGPALFNGMQAGRTTTTSEHSEFTPNFFAPLPLPQEQQVPSKICSSGPCPQLRKYMGWSCSPDPQPLP	496698	494189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_494200_496700
874710	contig_15838_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_174334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTTTTATGTGAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170477	168870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_168900_170500
874711	contig_9335_pilon	-	3009	1	Intergenic	novelGene_147438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	491	892	278789	278388	NA	15	TTGGATGGGTCTGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGDSASFYQWALQTRLVTNVKIAGSWESCNLGLWVRQETGFSALWWGAGSLKGTMTPLSVVLGKSVLEQAEVEKQGRGKETYLPPGAPAAKGLDSKTQRGLLNQVTARQEVVWHSLWNQAGPGWGLRGLGLS	279279	276270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_276300_279300
874712	contig_3832_pilon	-	3021	1	Intergenic	novelGene_161475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTTCCTTCATCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428078	425057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_425100_428100
874713	contig_10042_pilon	-	3216	4	Intergenic	novelGene_79223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	2631	3215	1105125	1094768	FALSE	20	CCCCAACCGTTGCAGCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLDVLFNFFLSRARPLFAGWGAPHLPSAPGARLVPRPGRGSTRRWRTVAQQVRERASVGASPQVPSRGVEEPLLLVPFLFILVRLGVGVTVAEGPAAPLALEAARAVTEAVAGCVAACPGPTGRAHCPGTRLRLDLGSPPVAQHSAAQRAHGRRLPGTSGSAPQGAQQRGSPAMVRSRRPLPSSSAYTATLSRA	1111428	1094766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1095321_1105093_1105220_1107155_1107251_1108987
874714	contig_12793_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_164126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1191	1685	252911	252417	NA	55	AAAAAAAAAATGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHGECHWIVPESLCHSLLCSRLCLSGPFLSTCGMPSLTARFCVTCVSCVLLLYPIIPLTKSPWVVQMVTCLIASKRCCSNPLRGTLEDRAGDLLPRVHSLENPMEHFYSARMESPGVRINSTATNSSIPLMCRSHYPRLIVFLPCLTVSCVRACLSLYPWSLA	254101	251907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_251900_254100
874715	contig_8631_pilon	+	4902	1	Intergenic	novelGene_121970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATTCCTTATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775466	780368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_775500_780400
874716	contig_4385_pilon	-	2609	5	Intergenic	novelGene_141499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.2941707368003	467	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1256	1567	305775	302357	FALSE	40	CTATATAATGTCAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPRFPVPVYTQQAPEQQLRPSPPNKPLPELKPKQVIRPTAAPPKPPAKPSAEGSTPFQAMKPTAAPPAPSTKLKPALTQGGWCKGCPEAPPSRGGDGSRSS	307488	301314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_302426_302905_303041_305403_305458_305721_305789_306246
874717	contig_6837_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_149846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTGGAAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184747	180570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_181392_183487
874718	contig_7004_pilon	+	3211	8	Intergenic	novelGene_126515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	76.537305829729	1210	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	131	1411	461306	464958	FALSE	30	GGCATTTGTAGTTATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAGLLLDEEGTFSLSGFQDFTFLPGHQKLSARLRKRLYYGWDWEADCSLEELSSPVADIAVELLQKAAPSPIHRLQKKYVAHVSREACISPCAMMLALVYIERLRHRNPDYLQHVSSSDLFLISMMVASKYLYDEGEEEEVFNDEWGAAGGVAVPTLNALERGFLSAMDWHLYTDPREIFEVLSWLESCVAEQQGRRRGWYTYTDLCVLLEQPAWQLALGSLCQQLAKLSCLLAMAYVSSVALAVASVAVIHQSLGLSCSPPPGPPDLRLASRCLLESCIPSPVPQCLPSPANISSCLEGDIGLRSLWGSLLASLTAPPLPSPDPPALPTLLHKCPLCQKLQRDSPTCRACHHTNHTVSTGPPSTWYHTHGLAPPLVLEPDAPSTPPAPAMFPFQCHGAGPPQVFHFPRLGKALRNALRGLGSP	461175	466758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_461375_461792_461902_462444_462527_462690_462812_462896_463026_463583_463646_464013_464132_464367
874720	contig_10968_pilon	-	3279	1	Intergenic	novelGene_84284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAAAATAATCTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127925	124646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_124600_127900
874721	contig_14691_pilon	-	3390	2	Intergenic	novelGene_146795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30516	23656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14691_pilon_-_24145_27614
874722	contig_19352_pilon	+	2325	1	Intergenic	novelGene_122378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113980	116305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_114000_116300
874723	contig_9177_pilon	-	688	4	Intergenic	novelGene_32630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_3	2089.34923414498	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	118	489	26442	25571	FALSE	50	GAAGATGGAGAAACTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGKGS	28451	25371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_25715_25971_26070_26312_26476_28367
874724	contig_2487_pilon	-	5214	1	Intergenic	novelGene_148471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGTCCTCCTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166011	160797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_160800_166000
874725	contig_6228_pilon	+	3237	1	Intergenic	novelGene_164508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATAAGATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252593	255830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_252600_255800
874726	contig_7870_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_109080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGATTCATATTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770628	768619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_768600_770600
874727	contig_10023_pilon	+	2677	1	Intergenic	novelGene_123460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCACTTGTGATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37096	39773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_37100_39800
874728	contig_7004_pilon	-	2212	3	Intergenic	novelGene_126489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	804	1241	410049	409612	TRUE	10	CTGCACTTGTGCTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGTLDLREFEVLPKQSRKKRNKKERSRNLEAGAHRTLPQQPQEDEALTESALADTTPLGPLLDEAKAPGHPELWDVLLAACRAGNTGMLKLQLAASLTDPGVTSLLSAPLGSGGFTLLHAAAAAGRGSVVRLLLEAGADPTVQ	410852	408280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_408611_408831_408916_409054
874729	contig_9266_pilon	+	1711	2	Intergenic	novelGene_178144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1482	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	203	403	10395	10595	FALSE	60	CAGGTTAGAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPETLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPMGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKVSLCFYWEEGTKKLRLLVLLLICMFY	4891	11903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9266_pilon_+_5025_10325
874730	contig_6870_pilon	-	3743	10	Intergenic	novelGene_103959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_9	33.9476721505974	81	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	141	1127	1313131	1288572	FALSE	25	TTTGTACTTACTGTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVLRAGLCPGLTQEIVQLLRSRGIKTVVDLVSADLEEVAQKCGLSYKALVAVRRVLLAQFSAFPFNGADVYEELKTSTAILSTGIGRLDKLLDTGLYTGEVTEIVGSPGSGKTQVCLCVAANVAHSLQQNVLYIDSSGGLTASRLLQLLQARTQDEEEQAGALQRIQVVHAFDVFRMLDVLQDLRGTVAQQVISSSGTVKVVVVDSVTAVVSPLLGGQQREGLALMMQLARELKTLARELSVAVVVTNHVTRDRDSGRLKPALGRSWSFVPSTRILLSVGEGAGTSGSERMVCLTKSSRQPTGIQEMIDIGIWGTPEQRPVLEAYQT	1313271	1285955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1288656_1289028_1289194_1291029_1291101_1291225_1291317_1294395_1294492_1295233_1295369_1295612_1295695_1312324_1312444_1312640_1312703_1313049
874731	contig_3120_pilon	+	1948	10	Intergenic	novelGene_178182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	4.34897462017354	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	77	1066	4817	37226	FALSE	30	GAAGTGAAGAGGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSAACGYGFTLLSSKTKDVTKVWGMGLNKDSQLGFHKSWKGSGYEYVLEPSPVPLPLDRPQETQVLQVSCGRAHSLILTDGEGVFSMGNNSYGQCGRKVVENEIYSQSHKVHRMQDFDGQVVQVACGQDHSLFLTDKGEVYSCGWGADGQTGLGHYNISSVPTQLGGDLAGVNIIQVATYGDCCLAVSADGDVFGWGNSEYLQLASTTDSTQVNVPRYLPFSGVGKVKQAACGGTGCAVLNGEGHVFVWGYGILGKGPNLVETALPEMIPPTLFGLTELSPEIQVSRIRCGLSHFAALTNKGELFVWGKNIRGCLGIGRLEDQYFPWRVTMPAEPVDVACGVDHMVTLAKSFV	4740	38108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3120_pilon_+_4866_7313_7443_8129_8197_8737_8790_10509_10595_14185_14368_19994_20083_20904_21079_23414_23501_37148
874732	contig_1331_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_37872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	132	299	336403	336236	NA	20	TTCCTAATGTGCTTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVPRTLKPQLHQVTGQTFGITTLSQAVTLPRRQDLSNNLSSRMFPPQNSKPVADLYLFGLNWYRSRHMLHNQNSTVRFFPSLALPLFPPKGFLLRDV	336534	334175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_334200_336500
874733	contig_12532_pilon	-	2725	1	Intergenic	novelGene_111149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATTCAAATATTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87967	85242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_85200_88000
874734	contig_6278_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_119807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	339	746	336974	336567	NA	25	GTTAAGTCCCCAAGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLISVGSVVISPISFLTRVICFFSCFSFVSLANGLSILLIFSKNQLLVLLTLSIVFLFSISFNSALILFISFLLAPEGFFCCSLSACSSCGVNVLIMAFSSFWMCAFIAINGPLSTAFGASKEVLVGCVFILV	337312	335466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_335500_337300
874735	contig_10299_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_79731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352247	349906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_349900_352200
874736	contig_854_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_36594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	659	973	1683939	1683625	NA	25	ATGCCCACTTCCTCAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSAWGAGTPAGGREIRYKEPSLKLSCLLPPSFPFWGPSQRNNPKYGEEASCTNMFTTVLFIVIQNCNRLNIQQYGYSKLTHLQRSFFFFLNKMLGHTDVFTE	1684597	1682559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1682600_1684600
874737	contig_12173_pilon	+	4454	3	Intergenic	novelGene_172958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	9.5	86	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	291	719	157889	160160	FALSE	35	AGGGAGACAAAGGCTAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANPLLCSTARFHCKNGLCIDKSFICDGQNNCQDNSDEESCESSQEPGSGQVFVTSENQLVYYPSITYAIIGSSVIFVLVVALLALVLHHQRKRNNLMTLPVHRLQHPVLLSRLVVLDHPHHCSVTYNVNNGIQYVASQAEQNASDVGSPPSYSEALLDQRPAWFDLPPPPYSSDTESLNQADLPPYRSRSGSVNSASSQAANSLLSVEDAGHSPGQPGPPEGTAEPRDSLPSQGTEEV	25059	163895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_+_25195_157733_158080_159922
874738	contig_6102_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_32324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCATAGGAAATGGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681871	1680686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1680700_1681900
874739	contig_9706_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_21022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAACCAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573819	571417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_571400_573800
874740	contig_1380_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_138890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158691	156391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_156400_158700
874741	contig_1618_pilon	+	3486	5	Intergenic	novelGene_141774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	15.3195136998535	104	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	26	1051	79971	239403	FALSE	50	CTTACAAGAGATCAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLAWKFPRTRLPVGASALCVVVLCWLYIFPVYRLPNEKEIVQGVLQQGTAWRRNQTAARVFRKQMEDCCDPAHLFAMTKMNSPMGKSMWYDGEFLYSFTIDNSTYSLFPQATPFQLPLKKCAVVGNGGILKKSGCGRQIDEANFVMRCNLPPLSSEYTKDVGSRSHLVTANPSIIRQRFQNLLWSRKTFVDNMKIYNHSYIYMPAFSMKTGTEPSLRVYYTLSDVGANQTVLFANPNFLRNIGKFWKSRGIHAKRLSTGLFLVSAALGLCEEVAIYGFWPFSVNMQEQPISHHYYDNVLPFSGFHAMPEEFLQLWYLHKVGALRMQLDPCENTSLQPTS	79945	241838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_80162_153687_153833_194002_194113_202112_202206_238916
874742	contig_6325_pilon	+	3227	6	Intergenic	novelGene_143337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2612	2971	101805	113927	FALSE	20	TGTTCCATAAGTGTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKQIVTCSQFKGHACSAPNVSRSIIARSYQNFQGAILPRLNIFSKMFVHPTGISKISNLHLELFCIFWFKRINKKISSSGFCTFIVQWSIMFLLLLVFTRYLCPNAFLKLADVLVYI	93985	114183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_96478_98228_98322_101778_101846_108424_108534_113340_113441_113817
874743	contig_8576_pilon	-	2298	3	Intergenic	novelGene_88746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAAAATGTTAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697550	690290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_690853_694840_694985_695958
874744	contig_5461_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_156825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCAGTCCCTTCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294337	295536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_294300_295500
874745	contig_15543_pilon	-	2947	1	Intergenic	novelGene_164332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGTCATTTCGCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15379	12432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_12400_15400
874746	scaffold_13505_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_111677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAGAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888312	891178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_888300_891200
874747	contig_12969_pilon	-	3118	8	Intergenic	novelGene_61652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	60.8802772929403	65	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	594	2459	141980	127797	TRUE	35	AAGATCATTGGTAGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQKKMVKESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLYWDVILENYSNLVSIGYQVSKPDVLSRLELGEQPWTILYERHSGIFSEIQKGDDHLLGHLQKERRLDVMEQCCEHNALENIVHQHKIQFPLRENHGMFDLYEKTMKSSLTLPAVNQRKSNEIKNFPEPNGDENTFLHADHEQFCNEMQFPESQKSNSAESQLIKHQKTHKIERRHVCSECGKTFIRKSLLIEHQVIHTGEKPYRCSLCGETFFKKFKLIEHHHTTHKGQKPYKCTECDKAYLHKSQLNKHQKTHMAEKPYICCECGKGFIQKTHLTIHQRTHTGEKPYICSQCGKGFNQKGSLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGDLTIHQRTHTGEKPYICSECGKGFNQKGSLIIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKSYLIAHQRFHTGKIPFSCSECGKSYSQKATLIRHRKIHTGEKPFQCNECWNVFETKPKLIVHQRSHIGEKPHGSNGRGQTFVYASNFYSHKRKHKREKHVDSIKVENCPTTSHGSSHTSDLMQVKSPVNISTLQMPSVAAETSVNIRGLITNRDIVLVGQPVARCEPSGDNREFVEQRNLTNSVNVVVPSLINYVLFYVT	150213	38065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_38344_114452_114829_127791_129410_136064_136161_136417_136545_141950_142152_146307_146672_150155
874748	contig_11507_pilon	-	1292	7	Intergenic	novelGene_103356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	309.470919473866	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	311	1291	96311	85625	FALSE	55	AAAGAGAGAAAGACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTKLEIQKALAEDATVYEYDSIYDEMQKKKEESNPKLLLGKDRKPKYIHNLLKAVEIRKKEQEKRMEKKIQREREMEKGEFDDKEAFVTSAYKKKLQERAEEEEREKRAAALEARLDVTKQKDLSGFYRHLLNQTVGEEEVPKCSFREARSGIKEEKSRGYSDEVSLENRIPHEKCILQTGMKAEENPDADSEFDAKTSEDDEIEENNKVNCRREKGTKFSENDPKHHRNQTHSRSSSEERGHSAKRHTKSSKSRGHEKREDEHQERQSRDQENCHTDRDYRKERKDSHRHREASHRDSHWKRHEKEDKRRGRDHRGREGNDREW	124779	85623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_86151_88088_88198_89141_89350_90254_90384_96302_96360_110585_110758_124689
874749	contig_3584_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_108155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTGTTTGGTGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365784	367266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_365800_367300
874750	contig_3584_pilon	+	2464	10	Intergenic	novelGene_108150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	122.901044204948	89	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	398	1294	351589	366078	FALSE	20	GTTAAAGACTCTGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESVDDINADKNVSSAQIVGPGSKPEASAKPPSRPADNYDNFVLPELPSVPDTLPTASAGAKTSASEDIDFDDLSRRFEELKKKT	341262	367248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341443_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353469_354411_354619_355225_355319_356498_356548_365878
874751	contig_5794_pilon	-	3863	1	Intergenic	novelGene_69771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	416	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTCCTTTTCTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725484	721621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_721600_725500
874752	contig_9752_pilon	+	2487	23	Intergenic	novelGene_122020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	396.913734200133	234	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	826	2478	10	2487	124393	241554	FALSE	55	TATAGGAAGAAAAGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVAAAAASSEAPAATATAKPEAGDEDSRDVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPNKMRDCFCTVNLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGIETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITDNGTVCQQLVVHIKACHGLPLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEEDIEKLEIRIDLWNNGNLVQDVFLGEIKVPVNVLRNDSSHQAWYLLQPKDNGNKPSKTDDLGSLRLNICYTEDCVLPSEYYGPLKTLLLKSPDIQPISASAAYILGEICRDKNDAVLPLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQEANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTLKPILDEICESSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKVFSTIIESSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTVRTLTLISKTIQTLGSWGSLSKSKSSFKETFMCEFFKMFQEERYIRAVKKFLDEISSTETKESSGTSEPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHRQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLRRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQEASENTLGCKPSTAGVPADIRIDIDEDRETERIYSLFTLSMLKLQKMEEACGTIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLSEPHEK	124383	241554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_124523_153344_153463_158602_158707_165525_165621_177497_177575_192635_192720_194309_194383_198978_199056_200022_200125_217236_217394_217658_217808_218674_218790_219180_219256_219969_220094_222352_222460_228053_228138_228558_228637_231174_231249_231733_231844_238813_238897_239543_239753_240550_240655_241405
874753	contig_9673_pilon	-	1023	8	Intergenic	novelGene_119172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAATCACAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184251	145595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_145854_149479_149545_151564_151671_162521_162606_164186_164228_181401_181485_183783_183911_183992
874754	contig_14577_pilon	+	3030	1	Intergenic	novelGene_164627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTTTTATACCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41619	44649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_41600_44600
874755	contig_11378_pilon	+	3442	1	Intergenic	novelGene_112223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280581	284023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_280600_284000
874756	contig_6165_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_167427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1	363	582799	582437	NA	40	TCAGCCAAGCTGACACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSHQLSFLPSFLSFLLCLPTLFFSGFESFSTSKILNPLSGFHSPLLVKVKKKTHNPDFSKRNSTQTVLQLHDFNNEVRSESRKIHVSSSQGDKDDSHVQRESPDCSYLENTLTEVFFQD	582799	580774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_580800_582800
874757	contig_11448_pilon	-	3186	2	Intergenic	novelGene_66359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1264	1566	206881	206579	FALSE	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDGSESGVIVGSREPQEALSVQTIGNLKGARDSGTRQKLGSTGFRDQGGQLLALTECKVREENIKVLRSKIKHLIYHEEKEKKVTFRGTEWSSILYSAE	208239	204958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_207852_207946
874758	contig_5019_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_109222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGAATACTAGACAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331780	328908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_328900_331800
874759	contig_5551_pilon	-	2958	1	Intergenic	novelGene_134288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814532	811574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_811600_814500
874760	contig_987_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_72274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATCATTTTGCAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902147	899741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_899700_902100
874761	contig_11292_pilon	-	2764	7	Intergenic	novelGene_109460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	24.2515749774914	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1154	1888	427046	413126	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTFGGSTLGSKRDTHFTIEDLKSLGYHVCDTLLDFCDPDQTKFTQCLAELKELLQQEIHKKFSELGQDMDLEGSWSDISLSDIESSTSGSDSSLSDGLPIHLLNIADELKQKKMYKKKKKKQLQTRKQRNEQYQRNNLMRELKLTEDASERTGFASALQKQPTFFKNSENPSSTTMKNDKPRFNESKKLTFTVSCSPKRNTNTSQEPAPGMKPDWSRSRYPVAKRSRATMPTYPSLHVYTYP	428199	412249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_413300_421833_421942_422384_422508_423701_423769_424968_425100_426114_426216_427015
874762	contig_12852_pilon	+	3649	1	Intergenic	novelGene_141435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAAATTTCCCTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313510	317159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_313500_317200
874763	contig_13481_pilon	+	3028	1	Intergenic	novelGene_119261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTGGCTTGGCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18924	21952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_18900_22000
874764	contig_17074_pilon	+	1287	3	Intergenic	novelGene_145183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	869	junction_1	625	29	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	344	955	610974	616520	FALSE	40	TGTCTGAAAATGAAACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWE	610630	616852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_611203_612787_612923_616272
874765	contig_8464_pilon	-	5259	16	Intergenic	novelGene_125403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_6	119.730066770586	466	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	91	2427	942591	895654	FALSE	25	AACAAGCCTCAGCCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLKRQNAVLQAAQDDLGHLRTQLWEAQAEMENIKAIATVSENTKQEAIDEVKRQWREEVASLQAVMKETVRDYEHQFHLRLEQERTQWAQYRESAEREIADLRRRLSEGQEEENLENEMKKAQEDAEKLRSVVMPMEKEIATLKDKLTEAEDKIKELEASKVKELNHYLEAEKSCRTDLEMYVAVLNTQKSVLQEDAEKLRKELHEVCHLLEQERQQHNQLKHTWQKANDQFLESQRLLMRDMQRMEIVLTSEQLRQVEEMKKKDQEEDEQQRLNKRKDNKKTDVEEEVRIPVVCALTHEESSAQLSNEEEHLDSTHGSVHSLDADLLLPSGDPFSKSDNDMFKDGLRRAQSTDSLGTSGSLQSKALGYNYKAKSAGNLDESDFGPLVGADSVSENYDTASLGSLQMPSGFMLTKDQERAIKAMTPEQEETASLLSSVTQGMESAYVSPSGYRLVSETEWNLLQKEVHNAGNKLGRRCDMCSNYEKQLQGIQIQEAETRDQVKKLQVMLRQANDQLEKTMKDKQELEDFIKQSTEDSSHQISALVLRVQASEILFEELQQGFSQAKRDVQEQVAVLMQSREQVSEELVRLQKDNDSLQGKHSLHVSLQQAEDFILPETIEELRELVLKYRENIVNVRTAADHVEEKLKAEILFLKEQIQAEQCLKENLEETLQLEIENCKEEIASISSLKAELERIKVEKGQLESNLRERSQQLESLQEMKNTLEEQLKKESAAKVTTEQLMFEEKNKAQRLQTELDVSEQVQRDFVKLSQTLQVQLERIRQADSLERIRAILNDTKLTDINQLPET	942681	892821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_895756_896582_896700_897743_897843_900807_900864_901435_901626_903328_903470_906986_907086_920098_920216_923277_923383_924622_925091_929301_929434_931647_931827_935510_935647_938661_938782_941543_941705_942476
874766	contig_4782_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_73656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAATACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528632	527406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_527400_528600
874767	contig_253_pilon	-	3710	3	Intergenic	novelGene_129655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	481	948	309950	309278	FALSE	10	GCCTGCGGGCAGGGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAIEDDLEHQEIGCVGAPWRAPLRALLLLLLIMRVLVVLLGHPGDVVAHGGPKGHNGHAQGDGRGHECIVALPVVGGDKEGVDAHGQEHHPLGAKKPAGSRKDAGTPGHLDCPGLRPAMATSGPSSPGHGAWPRSQGPVRWSLSRYRLAVWPK	310781	306515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_309610_309814_309951_310301
874768	contig_9027_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_156347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGGACTCCAACTCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24352	21328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_-_21300_24400
874769	contig_9121_pilon	+	3557	1	Intergenic	novelGene_134470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTGTCTTATTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254285	257842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_254300_257800
874770	contig_12837_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_57396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	518	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGCAGTTCTACTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420770	422276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_420800_422300
874771	contig_13409_pilon	-	2944	3	Intergenic	novelGene_128448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	970	junction_2	86	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1259	1753	62744	58635	FALSE	60	TTAAAAAAAACAAAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQVRIFKYCYFVVKQNSTNIYFSYQMKMAQCFNILFRSSFWLMVH	64002	57443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_58930_60929_61119_62733
874772	contig_11590_pilon	+	2701	1	Intergenic	novelGene_125603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCAGGGCTCCCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760818	763519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_760800_763500
874773	contig_11574_pilon	-	3824	1	Intergenic	novelGene_64099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGGGTTCAAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461087	457263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_457300_461100
874774	contig_1107_pilon	+	2024	11	Intergenic	novelGene_126545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATCTTAAGCAGGACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163048	209659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_163220_167331_167412_168863_169115_171903_172125_173594_173995_175286_175367_175674_175803_178789_178923_181400_181548_193461_193647_209431
874775	contig_11982_pilon	-	2515	3	Intergenic	novelGene_100263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_2	265	57	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	36	368	132917	130054	FALSE	45	GGCTCTGATAGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGQRARRWRRMAQKKYLQAKLTQFLREDRIQLWKPPYTDENKEVGLALKDLAKKYSDKLECCENEVEKIIEEIRCKAIERGTGNENYKTTGIATIEVFLPPRLRKVSNFSRFMYVHHLMM	135927	127906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_130270_132800_132919_135893
874776	contig_6724_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_167973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAGAAATTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312992	315384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_313000_315400
874777	contig_2933_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_111312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324439	327302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_324400_327300
874778	contig_13542_pilon	+	2917	22	Intergenic	novelGene_131552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_21	298.496641351221	25	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2766	150	2915	610526	653582	FALSE	15	TGCATTGACATCCCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELPQLVASVIESESEILHHEKQYEPFYSSFVALSTHYITTVCSLIPRNQLQSVAAACKVLIEFSLLRLENPDEACAVSQKHLILLIKGLCTGCSRLDRTEIITFTAMMKSAKLPQTVKTLSDVEDQKDLASPVSPELRQKEVQMNFLNQLTSVFNPRTVASPPISPQTLAEGENDEQSSTDQASAIKTKNVFIAQNVASLQELGGSEKLLRVCLNLPYFLRYINRFQDAVLANSFFIMPATVADATAVRNGFHSLVIDVTMALDTLSLPVLEPLNPSRLQDVTVLSLSCLYAGVSVATCMAILHVGSAQQVRTGSTSSKEEDYESDAATIVQKCLEIYDMIGQAISNSRRAGGEHYQNFQLLGAWCLLNSLFLILNLSPTALADKGKEKDPLAALRVRDILSRTKEGVGSPKLGPGKGHQGFGVLSVILANHAIKLLTSLFQDLQVEALHKGWETDGPPAVLSIMAQSTSIQRIQRLIDSVPLTNLLLTLLSTSYRKACVLQRQRKGSMSSDASASTDSNTYYEDDFSSTEEDSSQDDDSEPILGQWFEETISPSKEKVAPPPPPPPPPLESSPRVKSPSKQAPGEKGNILASRKDPELFLGLASNILNFITSSILNSRNNFIRNYLSVSLSEHHMATLASIIKEVDKDGLKGSSDEEFAAALYHFNHSLVTSDLQSPNLQNTLLQQLGVAPFSEGPWPLYIHPQSLSVLSRLLLIWQHKAGAQGDPDVPECLKVWDRFLSTMKQNALQGVVPTEMEDLNIEHLQLLLLIFHNFTEKGQRAILTLFVQIIQELSVNMEAQMRSVPLILARLLLIFDYLLHQYSKAPVYLFEQVQHNLLSPPFGWASGSQDSSSRRVTIPLYHGFKEVEENWSKHFSSDAVPQPRFYCVLSPEASEDDLNRLDSGACDVLFSKLVKYDELY	610376	653584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_610567_617196_617295_618543_618648_619421_619552_619666_619807_621471_621575_621695_621838_621980_622106_625115_625241_625882_625943_626035_626227_630429_630530_630653_630792_635523_635642_636207_636396_637544_637705_637820_637907_649377_649548_650778_651062_651916_652053_652938_653019_653534
874779	contig_15084_pilon	+	3613	1	Intergenic	novelGene_116690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGCTAACGCACCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180273	183886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_180300_183900
874780	contig_8631_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_121977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1131	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGCCATAGTTACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806918	803866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_803900_806900
874781	contig_1154_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_87063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCCTTAATTTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157464	159171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_157500_159200
874782	contig_1154_pilon	+	1634	2	Intergenic	novelGene_87061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTTGCAATCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155870	157759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_157411_157665
874783	scaffold_12124_pilon	+	1575	12	Intergenic	novelGene_22014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_9	172.708037206444	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	81	857	800112	810473	TRUE	5	GAGCTTGTTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGGSGK	800031	815412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647_810745_813529_813765_813915_813998_815122
874784	contig_10235_pilon	+	2386	2	Intergenic	novelGene_46563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	113	junction_1	0	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	67	417	432382	432880	FALSE	50	ACACACACACACACAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKRHRLVSETFGLKRRREREDGEVDPLRGESGSARAAVAELVRLFPRGLFEDALPPIALRSQVYSLLPDRTVADRQLVRGVGVIDGESSPASLPLWRLPRHSDARLVRQPFSKR	432315	434849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_432482_432629
874785	contig_3601_pilon	-	2267	2	Intergenic	novelGene_132960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_1	0	229	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGTCTACTTGCGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130153	1125899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1127319_1129305
874786	contig_5039_pilon	+	3481	1	Intergenic	novelGene_64923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGGCACTGTTGATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156762	1160243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1156800_1160200
874787	contig_8412_pilon	+	2770	19	Intergenic	novelGene_118361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	54	junction_1	61.2126429287364	169	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	654	2303	459392	543274	FALSE	20	GCAAACCCTCACCTCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNDKLYEKRKVAALEIEKLVREFVAQNNTVQIKHVIQTLSQEFALSQHPHSRKGGLIGLAACSIALGKDSGLYLKELIEPVLTCFNDADSRLRYYACEALYNIVKVARGAVLPHFNVLFDGLSKLAADPDPNVKSGSELLDRLLKDIVTESNKFDLVGFIPLLRERIYSNNQYARQFIISWILVLESVPDINLLDYLPEILDGLFQILGDNGKEIRKMCEVVLGEFLKEIKKNPSSVKFAEMANILVIHCQTTDDLIQLTAMCWMREFIQLAGRVMLPYSSGILTAVLPCLAYDDRKKSIKEVANMCNQSLMKLVTPEDDEPDEPKLVVKRQAEPNPDNSQAKQEGTASGGPDGSCDSSFSSSISVFTPASAERAPVTLHLDGIVQVLNCHLSDMVIGMMTRIAVLKWLYHLYIKTPRKMFRHTDSLFPILLQTLSDESDEVILKDLEVLAEIASSPAGQTDDLGPLVGPDLRVGHSELQVPTPGRAGLLHIPGTKGLECSPSTPTMNSYFYKFMINLLKRFSSEQKLLETRGAFIIRQLCLLLNAENIFHSMADILLREEDLKFASTMVHTLNTILLTSTELFQLRNQLKDLKTLESQNLFCCLYRSWCHNPVTTVSLCFLTQNYRHAYDLIQKFGDLEVTVDFLTEVDKLVQLIECPIFTYLRLQLLDVKNNPYLIKALYGLLMLLPQSSAFQLLSHRLQCVPNPELLQTEDSLKAAPKSQRTNTPSIDYAELLQHFEKVQNKHLEVRHQRSGRGDHLDRRIVL	432915	543741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_432971_456415_456567_456885_457054_457896_457960_458453_458562_459283_459394_459671_459779_460774_460910_461413_461567_473348_473413_480431_480577_480846_480913_494288_494446_502975_503109_533031_533207_534562_534682_536046_536127_538126_538278_543111
874788	scaffold_19766_pilon	-	3265	6	Intergenic	novelGene_34468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_3	49.9223396887606	97	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	160	1851	931921	925141	FALSE	30	AGCGTAACAAGATGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSSLQETPPPDPEIFRQRFRHFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLTRGMVPLDPVQESSSFELHPEAAQSHFKHSSRKPRLLQSRALPASHVPAPPREGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLNRDNRQETYGNMFSQGCGNRNENEESTSKTKVAEDSASHGETTGKVQKVFGEKREQQGRITERQQRNSEEKNGREKRDLGPATVKGKKPTTGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFNTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECNECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHTRERASDYSPASLDAFGAFLKSCV	940239	923726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_926034_928535_928663_928968_929061_931111_931266_931495_932000_940158
874789	contig_9505_pilon	+	2051	10	Intergenic	novelGene_121835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	233.357353261018	4	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	52	705	482124	597995	TRUE	35	ACGACAACGCAGGGTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDESFLGKLGGTLARKKRAKEVSDLQEEGKNAINSSLSPASVDIHPEDTLLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLIDWVNDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLGDCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHELLRPHGWVLRWNVDAIHGKNLVAILHLLISLAMHFRAPIRLPEHVSVQVVVVRKREGLLHSNHITEELTTTSE	482072	622085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_482194_555856_555947_560338_560410_577832_577936_589574_589716_593382_593499_597932_597996_614970_615049_617657_617727_620886
874790	contig_12993_pilon	-	3709	3	Intergenic	novelGene_136743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	7	156	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	268	1494	169138	167912	FALSE	30	GGGCATTTTTCACAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLEEDLTCPICCSLFDDPRVLPCSHNFCKKCLEGLLEGNVRNSLWRPSPFKCPTCRKETSATGVNSLQVNYSLKGIVEKYNKIKISPKMPVCKGHLGQPLNIFCLTDMQLICGICATRGDHTKHVFCSIEDAYAQERNAFESLFQSFETWHRGDALSRLDTLETSKRKSLQLLTKDSDKVKEFFEKLQHTLDQKKNEILSDFETMKLAVMQAYDPEINKLNTILQEQRMAFNIAEAFKDVSEPIIFLQQMQEFREKIKVIKETPLPPSNLPTNPLMKNFDTSQWEEIKLVDVDKLSLPQDTGTFISKIPWSFYQLFVVLLLLGLLIAFGPALSLEWSLFDKFAAWKEHLSNFSSCYLTKSAHFLEQSVFYWEQVTDGIFIFSEKFKNYTLMVLNNVAEFVCKYKLL	182342	165696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_169145_181524_181617_182173
874791	contig_5210_pilon	+	3299	1	Intergenic	novelGene_65454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2502	2861	622279	622638	NA	10	CCCAGCCGTCAGCTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPARLTACVCGERLATNRPARQAPLPSCLCITHLPPKGDSSPATHIVTTGEGDIPTSFHSFLCLWKIKMKNLHEPATAATPEDLLLLLEKKGREGTKQGCSLNFSQFMSNFEFFCVTL	619777	623076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_619800_623100
874792	contig_13214_pilon	+	2698	1	Intergenic	novelGene_175714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCTTCAGTCAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15191	17889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_+_15200_17900
874793	contig_16948_pilon	+	7148	6	Intergenic	novelGene_166420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_1	52.6459875014231	253	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	683	1807	389794	405910	FALSE	75	AAAAACAAAATAAACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWSDFSLPTPSSLKIYDIQTGNKLLTLFNPDLANNYKRNCATFNPTDDLVLNDGVLWDVRSAQAIHKFDKFNMNISGVFHPNGLEVIINTEIWDLRTFHLLHTVPALDQCRVVFNHTGTVMYGAMLQADDEDDLMEERMKSPFGSSFRTFNATDYKPIATIDVKRNIFDLCTDTKDCYLAVIENQGSMDSLNMDTVCRLYEVGRQRLAEDEDEEEDQEEEEQEEEDDDEDDDDTDDLDELDTDQLLEAELEEDDNNENAGEDGDNDFSPSDEELANLLEEGEDGEEEDSDADEEVELILGDSKYRADHQAKPGQRPGEAPSLGPAQLRGQHSRVLCPWLRTLHSQPLEEKQAVISDPLLAHPMCKQLAVTCYL	389111	411251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_390073_390728_390823_391220_391326_391539_391614_392145_392248_405439
874794	contig_6870_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_103958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	1280586	1280278	NA	20	GTGGTGCAGTGGTTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARLPEASAARIRPRPSPPSQVRAGRAAAAGEEATELGSVGRLAWGGVQEKDRGYASASRPARLWSGGASSVQGAAWDSPWDGESPFLSGIFLIQGSPHLSH	1280588	1277900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1277900_1280600
874795	contig_14133_pilon	-	2127	10	Intergenic	novelGene_119971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	52.7849117985457	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1355	1966	217268	213631	FALSE	30	TTTGCAGAGATAAATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSIAPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEAISFNRVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVRQFGMAPSIGPVSFPDAQESPTGIGRRPFSQGLQHLMDHEAKLLVAKAYRHTEQVLQDNLDKLQVLANALLEKEVINYEDIEALIGPPPYGPKKMIMPQRWADAEREKQDSGDEEAAQQPPLRGEEPDKEPS	223026	213469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_213835_214371_214450_214570_214738_215414_215572_217262_217379_219300_219412_220057_220161_220401_220587_221852_222027_222355
874796	contig_17198_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_62401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTCAGCGGAAAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095276	1097675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1095300_1097700
874797	contig_4151_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_65276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCCAGCCTCTCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641821	644069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_641800_644100
874798	contig_12139_pilon	-	4429	1	Intergenic	novelGene_146466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	3941	4396	86123	85668	NA	65	ACGAAAACAAAACAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFVLRDKLAGVILTLQLVNLSSGRAALESTSAPAAGAALHPGQHSRATPASALLQLCAGEMGTPSGGRGNSHCPLQALPTAPKLLLSLESVLGDGYPVWGQRKFTLPSTGPSLHPHLVCRNQQASGGDLGVAAFEGHPSSPGLERRTAHI	90063	85634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_85600_90100
874799	contig_17042_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_140183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCCAGCATTCACCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8932	10708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_+_8900_10700
874800	contig_7334_pilon	+	3213	2	Intergenic	novelGene_50560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCACAGGCATTAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42601	55657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_+_45737_55579
874801	contig_7230_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_52514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	19.600701518058	2376	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	11	469	2651	8648	FALSE	35	CACACAGTGACCACATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAKMTVLSKEYGFVLLTGAASFIMVTHLAINVSKARKKYKVEYPTMYSTDPENGHLFNCIQRAHQNTLEVYPSFLFFLAVGGVYHPRIVSGLGLAWIVGRVLYAYGYYTGEPRKRNRGGVSFIALIALMGTTVCSAFQHLGWVKTGLGSGSQHCH	2640	9345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_2768_4000_4075_5588_5647_7543_7617_8511
874802	contig_8978_pilon	-	2703	14	Intergenic	novelGene_49354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1135	1473	204359	203730	TRUE	35	GCGGCCCAGAGACAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILTRPQSKNSVTKRVKRVAEVRALKTMAVQYFQSMQHPSNGKACSGFLALIKRPANLNCLSSFLDLLFNLPQLCTDLLREGTVALRHGQVGRGNRQVVKRRASLNSAISQ	206678	200461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_200640_201166_201272_201483_201676_201809_201971_202458_202639_202826_202942_203048_203303_203684_203831_203992_204095_204223_204361_204696_204829_205192_205994_206346_206430_206561
874803	contig_1244_pilon	+	3109	20	Intergenic	novelGene_37905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_11	32.8990733983636	109	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	169	2184	236462	255526	FALSE	35	AAAACATGTATACGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NITNTTTAATTAATAAATATSTEGSNSESEAESTENSPTPSPLQKKVTEDLSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALVEGVKAIQIDTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKSTTTARHNAANKILKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRISKQLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPNQPIIRIQSIAPSLQVITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLSIQRYAVIPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALIRDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTLMQKVEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRHPSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITCHTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDGVELGEPAHKKTGTTVPESIHSFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDFSHDETLDVPIQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW	235623	256451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_235771_236440_236542_237880_237978_238255_238355_238660_238784_238977_239161_239945_240081_240290_240466_242090_242227_243088_243237_243847_243971_245541_245625_246756_246830_247322_247398_247780_247917_248609_248676_251909_251991_252262_252344_254745_254852_255510
874804	contig_6885_pilon	+	3358	1	Intergenic	novelGene_83658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGACAATTGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177871	181229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_177900_181200
874805	contig_9982_pilon	+	2212	4	Intergenic	novelGene_55748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	76.5520882943256	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	34	492	317347	323792	FALSE	15	TTATCTTGCTGTCTAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQVSILPPWYFISHLH	317313	325512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_317446_318517_318614_322719_322851_323659
874806	contig_7593_pilon	-	2163	9	Intergenic	novelGene_127359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_7	154.056604856786	452	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	357	1178	738232	695591	FALSE	40	TTTAAAAGAAATTTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMTMNLGNSTALLNRLERIFEACFPSVLVPDAEEEVTSLKHLLEASTWPGKTNETSAESGELLDVWTELQDIHDAHGLRYQWGGSHSNKKLLCSLGIDTRNILFTGNKKQPVIVPMYAAGLGMLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQESLPPVQFDWSSSGLTNPLDGVDPELYELTTSKLEISTSSLKVTDTFARLMSTVEKTSTSTRKPKREEHLSEEAIKVIASLPDLTFMHAKVLMFPATLTPSTGSQEKTDW	768603	694605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_711220_711282_717511_717635_720455_720513_720925_721053_725079_725232_738202_738329_768343
874807	contig_14101_pilon	-	4790	1	Intergenic	novelGene_122766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTCCGCAGTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272338	267548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_267500_272300
874808	contig_15888_pilon	-	3076	14	Intergenic	novelGene_84393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_6	343.94297380637	49	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	99	1694	49714	37821	FALSE	25	CTTTGAATAAATTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGSLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYAEPVSAQHAKLSLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKVLFNKKENALVQMADGSQAQLAMSHLNGHKLHGKPVRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	49812	36438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38722_38798_38892_39322_39357_40759_40909_41880_42056_42149_42261_42376_42548_42626_42774_42847_43021_43145_43222_46483_46515_49706
874809	contig_7521_pilon	-	4945	1	Intergenic	novelGene_160565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1816	2115	371227	370928	NA	20	AGACCTGGCAATCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSADCHPAAPEVTAHTPGEKMTGLFLSHLSNVLLTCSAIYLLSPLQEALGENRKGHPRGGKRPPPPALTQPPLSMSSSPPVLLLPKLLESPDSNFCHSL	373042	368097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_368100_373000
874810	contig_16103_pilon	-	3251	1	Intergenic	novelGene_118775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAAACTTCACAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508923	505672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_505700_508900
874811	contig_4783_pilon	-	3253	1	Intergenic	novelGene_108368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGCCTATGATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154019	150766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_150800_154000
874812	contig_1694_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_144986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTATGGCAACACCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1665866	1663518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1663500_1665900
874813	contig_9668_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_58221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTGTTCTAAAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546581	545613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_545600_546600
874814	contig_5832_pilon	+	4018	2	Intergenic	novelGene_134167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	173	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAATGTGTCCTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556273	562634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_556313_558655
874815	contig_7457_pilon	+	1382	10	Intergenic	novelGene_31308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	61.5990620419211	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	102	872	183157	189512	TRUE	20	TTAATTTGGGCCTTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLCQRDSYAREFTTTVVSCRPAELQTEGSNGKKEVVNGFHVVLEDTLLFPEGGGQPDDRGTINDIDVLRVTRQGSQADHFTQMPLAPGSQVQVQVDWERRFDHMQQHSGQHLITAVADDLFGWKTTSWELGRLRSVIELDSPSVTAEQVAAIEQSVNEKIRDRLPVNVRELSLDDPEVEQVRGRGLPDDHAGPIRVVTIEGVDSNMCCGTHVSNLSDLQVIKILGTEKGKKEQNQPGISGWEPGAEVDGEKSRN	183055	195198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_183196_183348_183481_186304_186465_187706_187765_188802_188960_189055_189173_189404_189537_189996_190064_190243_190336_194871
874816	contig_1535_pilon	+	3012	1	Intergenic	novelGene_127229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGACAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52653	55665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_52700_55700
874817	contig_7078_pilon	+	3378	1	Intergenic	novelGene_130121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAAATCTTCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47263	50641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_47300_50600
874818	contig_14954_pilon	+	4361	21	Intergenic	novelGene_165184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	331	669	149172	149818	TRUE	5	CCTGGTCGCGCCGCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGPKMRGRASSDSSSRRWADCPSSLPHCCRLCRAASRTDSVSVWHRYTRGSMPSAVTLMQPKARHPATRVCTSSSSSWSRKHRRALSRKAGPSDRLRSWVLTAAMTLLLP	148841	165940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_149248_149387_149481_149559_149650_149738_149937_150086_150248_150500_150662_150778_150916_151184_151314_152195_152316_152411_154134_154215_154346_154419_154571_155727_155856_155931_155976_156071_156133_156230_156384_156513_156579_157387_157463_157593_157747_157852_157980_165883
874819	contig_5918_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_99590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	1560	1874	1992845	1993159	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSCLRKIVPSSHQARCSALCGIEETWPSRPFQSLLKNRTKPIAGKSVLTHCNPTCVRVELCSIRFSMADFSEVDHLAFLQRPFWVDSQHQPFSQELFATPPQK	1991285	1993161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1991300_1993200
874820	contig_7593_pilon	-	5080	1	Intergenic	novelGene_127371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTCAGCTATTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735031	729951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_730000_735000
874821	contig_9297_pilon	-	1427	6	Intergenic	novelGene_69892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCGAAGCCGGAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971351	939176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_939323_964901_964968_966035_966178_968982_969063_969256_969469_970570
874822	contig_13026_pilon	-	1422	12	Intergenic	novelGene_146293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	76.4901549328598	2	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	626	1036	14211	6494	FALSE	10	CCTGGACCAGGCCTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28118	6107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
874823	contig_13026_pilon	-	1347	12	Intergenic	novelGene_146302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	112.895768501103	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	609	1019	14211	6494	FALSE	15	GACTGGTGCAGACTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28147	6165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14249_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22288_22359_22971_23006_28000
874824	contig_10855_pilon	-	3607	4	Intergenic	novelGene_124393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	73.1406559688629	110	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	134	1675	930068	914023	FALSE	5	TTTTTTTGTGTATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDLAVNFTQEEWALLHPSQRDLYKDVMVETFRNLASVDCCTQVKTTGSSPQQDILGNEITTEEKISSLRNDSWYNLVEKGKLNNMENQHQIQERHSRERVSSHKGQKIPACEVCGKTFMHSSSLKLHLRRHSGEKPYECKECGKAFSCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFSFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTCYSSLHGHEKTHNEQKTYECKQCGKGFSCPKYFRIHVKMHSGEKPNECKQCGKVFICPKYFRKHVKMHSGEKPYECKECGKAFMVLSYLESHVRTHTGEKPFECKQCGKAFNWPTSLQAHMRTHSDEKPYECNQCGKAYKCSKYFQIHVKMHSGETPYVCKECGKAYSFPSSLREHMRTHSNKKSYECKQCGKAFSCSKSFRIHKKMHSGEKPYVCQECGKAYSFPSSLREHMKTHTGEKLFDIKKRPYECKQCGKAFMFPSCFQRHARTHSKEKPYECMHCGKAYKCLESLQGHLRKHTGEQP	930201	912090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_915257_915606_915785_916972_917100_930065
874825	contig_15277_pilon	+	2841	1	Intergenic	novelGene_175422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTGAGTTAAAGCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206921	209762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_206900_209800
874826	contig_5669_pilon	+	3252	14	Intergenic	novelGene_86041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	49.6519245293418	87	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2880	148	3027	57700	76382	FALSE	15	TGAGAGTTTGTGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREKEIELKEIEQELHLAQTEIRTLRQAAEDSATEHESDIASLQEDLLRMQTELDDMERIRGEYELELSSLRAEIEMKNSDLSSSLTVSDISDMQEELEQLRERCRYLNEEYQALQESNSSLTEQLAHLESERTRRATERWLESQTLRSMTSTESQTSEMDFLEPNPETQLLRQQLLGAEEQMHDMKSKCKELCCELQELQHQRQASEEEQRRLQRELKCAQNEVLQFQMCYSVTQNEELKTKLCALQEKYDASQNEQNELLKVQLQLQSELRQLKVTKPTVIESHNDKELLCRLQRLQHQYQNIMCDKEKLLEVQQQLQEDLRCHEAEVQRLKDIEASFEESSEKNEEMHAQLQEMKKLYQASKDEQEQQKHMYDKLEQDFSLCQMELKQLKNTQSFPEDKGKCATKCDELLSRLTELQEKYKASQKEMGQLQMEQCELLEDQRRMQEEQGQLQEELHRLTFPLPKSGLVHKSQELLTKLQDLCELQLLCQGIQDEQKKLIENQGALLKEQVELHEELRFCRESHFQEVLEKPKNSKLSKSSKCNHSKSKELIDKIQGLQILYQAGEAEQELLQQEQGRLLEERRRLQADLQLCLEEMQLLQLQSPTIKMSLESYKKSNDSMPALDENCHKSYDSTTDDTESYQKSYGSTLTSNESFLKSYESNTHNSEISNKSHHSSSSSSVTYKKSYGSTNSSDIDNDTAEPEDLEHFEEMVAQVLIKLQAVQAMYRISQEEHNIVQEEMKKLLEKQKELKAELDTCEKEFKECMECLEKPPTSQNDKNEIKELQTKLRDLQLQYQASMDEQGRLLAIQEQLEGQLQCCQEELHQLKEKRSSVSKDTKGKNGNKNMNKNANGVKNRKPSLEKCEGSLETRKKSLEVVLYYKASQRELEELAREQEKEEECKEEKKEETRKESWRELPSELSDIIEVDSAEDLEEYEAFQDLENKEDEDSDDPCPETTEENPLKLSESKKNMFGMWKPVVFLAIAAVALYLLPNMRPQETEFCLME	57552	76607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_57839_60017_60130_60912_61082_61340_61482_61822_61982_62267_62439_62857_63044_64817_65013_65510_65739_67148_67629_68008_68231_69298_69575_70267_70559_76271
874827	contig_9363_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_6842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	86.3069457743054	790	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	105	1103	1645884	1647514	FALSE	5	CTTTGGACTCCCCTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKRKVTFQGVGDDDENEISVSKKKLVDPVAGAGGPGSRFKGKHSLDSDEEDDDEEGSSKYDILASEDVEGQEAATLPSEGGVRITPFNLQEEMEEGHFDADGNYFLNRDAQIRDNWLDNIDWVKIRERPPDQRQTSDSEEDSLGQTPMSAQALLEGLLELLLPRETVAGALRRLGARGGKGDSKGPGRPSSPQRLDRLSGLADQMVARGNLGVYQETRERLAMRLKGLGCRTQGSHDPSPPPSLDMFAEEVAEGELETPTPAQKGEAESPGDGLVDVMWEYKWENTGDAELYGPFTSAQMQTWVNEGYFPDGVYCRKLDPPWWSVLQLQTH	1645240	1647724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1645314_1645852_1645959_1646176_1646313_1646456_1646615_1646715_1647146_1647227_1647335_1647421
874828	contig_18990_pilon	-	3302	2	Intergenic	novelGene_177450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	12	junction_1	0	92	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCCATCAAGAAATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20065	2782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18990_pilon_-_5990_19970
874829	contig_641_pilon	-	1855	4	Intergenic	novelGene_170144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	168.171209056591	237	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	114	350	106083	95919	FALSE	25	GATTCCAACCCATGGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAWQARRAAPGSFGCGFRLRGCTDAKYSKNTSGRTHAMKDKADQKHKPPDVFDFPDDSAISSIDRLGENEQDEEPYEAFAPPLHSTAIYADEEEFSKQCGSSIPSTPQGKEARRR	109271	94413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_-_96029_103545_103664_106074_106124_109198
874830	contig_7378_pilon	-	2298	2	Intergenic	novelGene_120293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACCACTGCAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617684	604463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_606092_617014
874831	contig_15084_pilon	-	2812	1	Intergenic	novelGene_116681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	286	693	160812	160405	NA	85	CCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLNITFTRISASFIIEGALLFFFPNLPPKLNFPVLPSIPFIWLPGRFVYWMQSSLLDAKEGGRWEAAGSKHLQGPGKLSPSPPPTLSPPAQISESSRHLQLYPKGMDFPQKITRHTLDFNPRKPTQHPLDTGQR	161097	158285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_158300_161100
874832	contig_7157_pilon	+	3410	6	Intergenic	novelGene_131291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	44.777673007873	70	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	255	1016	876922	893289	FALSE	25	AAGAGACGTTTCTGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASVIKSPSDPSHASVPPPPLLLPAAATRNSSTSVPSSIHNIENRPPQAIVKPQILTHVIEGFVIQEGLEPFPVSRSSLLIEQPMKKRPLLDNQVISSVCVQPELHNNTKHVDNSSDTEMEDMIAEETLEEMDSELLKCEFCGKMGYANEFLRSKRFCTMSCAKRYNVSCSKKFALSRWNRKPDNQSLGHRGRRPSGPDGAAREHILRQLPITYPSAEEDLASHEDSVPSAMTTRLRRQSERERERELRDGRIRKMPENNDLLPVAQTEPSVWTVDDVWAFIHSLPGCQDIADEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKLGPALKICARINSLKES	873689	895683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_873911_876888_877049_882893_883009_887150_887284_887375_887608_893134
874833	contig_7379_pilon	-	1872	7	Intergenic	novelGene_150029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	108.014916665349	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	1144	1872	549865	537341	FALSE	55	GTAAAACACCTCTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRVSTICLGKNYFIVSFFLYIYTHKVEEILEQADYLYESGETEKLYRLLISYKESEDAELLWRLARASRDIAQLSRTSEEEKKRLVYEALEYAKRALEKNESSFAAHKWYAICISDVGDYEGIKVKIANAYIIKEHFEKAIELNPKDATSIHLMGIWCYTFAEMPWYQRKIAKMLFATPPNSTYEEALSYFHRAEQVDPNFYSKNLLLLGKTYLKIQNRKLAAFWLLKAKDYPAHTEEDKQ	551008	537340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_537475_539495_539527_540870_540959_542465_542522_544762_544853_547847_548008_549695
874834	contig_14326_pilon	+	3202	7	Intergenic	novelGene_120647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.4776300712102	3	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	457	873	35571	48402	FALSE	15	TTTTGAGCTGTAGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPLLVTCLQWLETRPNRQVCPVCKAGISRDKVIPLYGRGSTGQQDPREKTPPRPQGQRPEPENRGGFQGFGFGDGGFQMSFGIGAFPFGIFATAFNINDGRPPPAVPGTPQYVDEQFLSRLFLFVALVIMFWLLIA	17905	50731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_18002_20231_20376_35354_35593_40597_40722_42118_42174_45858_45977_48304
874835	contig_7694_pilon	+	1893	13	Intergenic	novelGene_159930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	39.0515151221221	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	75	1073	185836	210000	TRUE	15	TTTTCTGTGGTTGAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFRGARVRVLDSQCLSEPRLLGSMAQKPLRLLACGDVEGKFDVLFNRVRAIQKKSGNFDLLLCVGNFFGSTPSAEWEEYKTGIKKAPIQTYVLGANSKETVEYFQDADGCELAENITYLGRKGVFTGTSGLQIVYLSGTESLNELVPGYSFSPNDVSSLRTMLCSASQFKGVDILLTSPWPKDVGNFGNSSGEVDTKKCGSALVSSLAVVLKPRYHFAALEKTYYERLPYRNHIVLQENAQHATRFIALANVGNPDKKKYLYAFSIIPMKLMDAAELVKQPPDVTENPYRKSGKDTTIGKQTPAPEEESACQFFFDLNEKQGRKRSSTGRHGKSSPHPKQPCKPLLPCSGQRRLV	185761	217793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_185859_191858_191944_193508_193588_194121_194224_197101_197317_199227_199347_200220_200306_201896_202038_202967_203083_209965_210176_213862_213983_214447_214546_217366
874836	contig_12019_pilon	+	491	2	Intergenic	novelGene_87658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5327_8378
874837	contig_8820_pilon	-	1529	6	Intergenic	novelGene_79325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_5	36.5403886131497	417	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	437	808	423448	414635	FALSE	35	CAAAAGCCTGCTTTGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCEELQATLDGLTKIQGKMEKLTSTTKGICDLENYHYGEESQRPPLFHTWPTAHFYAVSRRLSDMYRKELLLKRTIVEELAHSSDHDLALSYLSMWLHQPYVENASQLLLEGMLLETGHRTL	429400	413913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_414838_416487_416618_423409_423540_425402_425572_428319_428433_429337
874838	contig_15092_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_57822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTGCACTCACTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340959	343445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_341000_343400
874839	contig_8286_pilon	+	4374	4	Intergenic	novelGene_139784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	137	junction_3	18.7794213613377	153	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38717	45718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_42633_43035_43154_44008_44126_45494
874840	contig_1009_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_121743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTGCCGTCGAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205733	203399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_203400_205700
874841	contig_4093_pilon	+	2625	2	Intergenic	novelGene_27650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	117	314	67085	67282	TRUE	5	CTGTGTCCGGAGTGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNTLSVNIKFSERKLKISSTAGLILPYLLYKYLSIPYMFRDMNNAKTSKRVLLLRRLRLEAKALEFSSLLYVKKLRFNLSKFSKWEFHLDFVRSQRYSKEHG	66968	72435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_69257_72098
874842	contig_6059_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_44791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	768	1121	378522	378169	NA	30	AATATGTGTATTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCGDPISVVKKVVWGKKSYFIRKIPRSHKYLFAADESKFTGNLRGLSPFIPLPPPQQLGCQSRWRHEWFWHFLRRLPHSPRVITEMCFLWFSFNLPPAWAPLFPGSLGSWRPTSLL	379289	377016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_377000_379300
874843	contig_14970_pilon	+	3655	1	Intergenic	novelGene_45137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAAAAATTGCTAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271642	275297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_271600_275300
874844	contig_9014_pilon	+	1910	8	Intergenic	novelGene_106744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	13.5194493306525	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	362	1267	71057	75056	FALSE	45	CCAAACAGAACATGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFLGFADDVLNLRWRHKLLLPTAASLPLLMVYFTNFGNTTIVVPKPFRPILGLHLDLGILYYVYMGLLAVFCTNAINILAGINGLEAGQSLVISASIIVFNLVELNGEYRDDHIFSLYFMIPFFFTTLGLLYHNWYPSRVFVGDTFCYFAGMTFAVVGILGHFSKTMLLFFMPQVFNFLYSLPQLLHIIPCPRHRMPRLNTKTGKLEMSYSKFKTKSLSFLGTFILKVAESLRLVTVHQSESEDGTFTECNNLTLINLLLKVFGPMHERNLTLLLLLLQILGSAVTFSIRYQLVRLFYDV	70064	75699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_70403_71033_71232_71415_71563_73262_73348_73955_74145_74502_74591_74756_74913_74990
874845	scaffold_13505_pilon	-	2030	19	Intergenic	novelGene_111428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	392.995731607518	337	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	109	1263	523539	510002	TRUE	15	CTATGGAGAGGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGARKREPGRRTGDRRARPRVPRRSPPSADTSPAEPMQAEDMARGAASGPPRPGLVPVSIIGAEDEDFENELEMNAEEQNSQFQSLEQVKRRPVHLIALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGTLGPKEAKKAFADFYHSFLEKTAVLRVPVPPHIAFELDRTRPEVISEDVQRRFVQEVVQSQQATISRQLEDFRSKRLMGMTHWEQHVAHLEAWVGREPTSYEARERHTAEQLLGQFEEMQSNTSADEEKSAAVVSAISLYMRHLGVRTKSGDKKSGRNFFRKKNRRPDEPPKTKKGLSSILDAARWNRGDPQVPDFRHLKVEAEAEKQGSTERKGSLAVPSRDRNVGAIGQDTFGVSLHPPSGDSPGGPDIRAGGADSVRAEELVRPHHRDRRISEGPRPCLPPQIPAQPEQHSRTTA	529117	507167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507544_508911_509005_509098_509263_509766_509854_509954_510023_510277_510365_510522_510573_517482_517609_517745_517782_517860_517949_518091_518192_518540_518571_519079_519327_519535_519579_519812_519912_522807_522922_523339_523424_523509_523553_529022
874846	contig_9437_pilon	+	3642	1	Intergenic	novelGene_141721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAAGACGAATATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185281	188923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_185300_188900
874847	contig_1984_pilon	+	4112	12	Intergenic	novelGene_173202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	33	junction_11	35.0359909401322	111	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	281	2296	241595	269551	FALSE	20	TCATTCAGATCTTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPINCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAMDAWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQPSQKRAAMLCRKRFTAGTFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERAFCEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENVVLTGQKEKKVRFHPTSVLSQPQYKKIPPVNGQAAAIQALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTVLVFCGPARLASNALQEPSSFKVDGIPNDSSDSEMEDRTTANLATLKLDEWLNFKLDPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAVIAVLSTEEQSAGLQQPSGIGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTDFSDESTTAERVLMKSPSPALHPPQKYKDRGILHPKRNTDDRSDQSSVKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPIRYFIMKSSNLRNLEISQQKGIWSTTPSNERKLNRAFWESSMVYLVFSVQGSGHFQGFSRMSSEIGREKSQDWGSAGLGGVFKVEWIRKESLPFQFAHHLLNPWNDNKKVQISRDGQELEPQVGEQLLQLWERLPLGEKTTTD	241314	271367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1984_pilon_+_241640_243180_243301_243622_243896_246012_246140_247167_247374_247773_247970_253138_253249_254626_254920_260055_260234_267128_267333_268084_268268_269470
874848	contig_16999_pilon	+	1554	8	Intergenic	novelGene_84964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	76.159338875539	144	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAGGAGACAGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50609	83619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_53404_53556_55616_55692_56118_56155_73925_74018_79797_79986_81568_81688_82921
874849	contig_16098_pilon	-	1528	9	Intergenic	novelGene_46032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1371.61964024288	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	116	1048	352350	349366	TRUE	20	ATTTTCTGGTACCAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTVSAKTGSRGLPGGPTCRATALSGTLRSLPRPRSCTFSPCSAPRSPSVAWATCPNVAWR	354104	348298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349320_349505_349917_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
874850	contig_12120_pilon	+	4168	1	Intergenic	novelGene_21415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	915	1244	46273	46602	NA	20	TCCTTGGAAACCTTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTHSLCPPLLHCHSLFQVPTAIQLIRGSLLPYLLPVLQPSSPINILCPVSRYTFPKYKYGHVTHQFEIPQQLSKHSDKSKHSTAQAVAFGVLSTSLVSSFTTCFLVF	45358	49526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_45400_49500
874851	contig_1516_pilon	+	2481	15	Intergenic	novelGene_50034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	16.9018776882261	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2295	187	2481	609485	654125	FALSE	30	GTAAGATGCAGGAGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETLGTALTLDINREARKYHISGDQVVASLNTDSSNTVLEKLEKLNTEKEERQKQLQRQNEKEMMKQIRQQTNILEKERKAFKTIEKSRTGESFPVPSFHQLKQTVERPSSLILNIPNKGESSVPGPPSVTVKDAALAPKDTPCAHVPLKDRPITLLFERKGSPCQSKELSKTDRTGPQLNVARKLSNNHISKREYLRPAQSYSHKSDDPSREGTTGAIFFVPKDNMSVPLVSKESLKCGNPEHHKQDEPTWKPVKSAGLGQRETSQRFSSVDEQAKLHKTMSQGEITKLAVGQKPTDSDTRPQRAKMRFWAKGKQGEKKTTRVKPATQSEVSALFAGSDVLPVHQFPDELVQYHPAPPLSPELPGSCRKEFKENKEPSPKVKRKRSVKISSVALESMHWQNDSVQIIASASDLKSMDEFLLKKMNDLDNEDSKKDTLVDVVFKKALKEFRQNIFSFYSSALAMDDGKSIRYKDLYALFEQILEKTMRLEQRDWSESPVRVWVNTFKVFLDEYMNEFKTSDCITTKVPKTERKKRRKKETDLVEEHNGHIFKATQYSIPTYCEYCSSLIWIMDRASVCKLCKYACHKKCCLKTTAKCSKKYDPELSSRQFGVELSRLTNEDRTVPLVVEKLINYIEMHGLYTEGIYRKSGSTNKIKELRQGLDTDAENVNLDDYNIHVIASVFKQWLRDLPNPLMTFELYEEFLRAVGLQERKETIRGVYSVIDQLSRTHLNTLERLIFHLVRIALQEDTNRMSANALAIVFAPCILRCPDTTDPLQSVQDISKTTTCVELIVVEQMNKYKARLKDISSLEFAENKAKTRLSLIRRSM	609298	654125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_609988_614274_614375_623275_623389_626248_626392_629269_629494_629950_630068_631690_631880_634019_634068_641686_641799_643910_643973_647699_647893_649404_649534_651824_651931_653105_653238_654001
874852	contig_8823_pilon	+	3496	1	Intergenic	novelGene_53080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	395	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1886	2194	84378	84686	NA	15	CCAATACCTGTGCGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQEHLRQFYSLKKKPPQTGAPCLPVPHQVPTPLASSVPFSAHLSPWCEHPPGLCALSGPSAAPSAGSPPPPAASGWCPHPGSAGTVPAPSSASPPPWHVWR	82492	85988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_82500_86000
874853	contig_8954_pilon	-	1950	1	Intergenic	novelGene_130294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTCTATACAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166051	164101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_164100_166100
874854	contig_299_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_129436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881226	883453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_881867_882653
874855	contig_4982_pilon	-	1601	14	Intergenic	novelGene_172224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	127.084792082681	139	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	861	740	1600	37008	16406	FALSE	30	GTAAGTTGGGGACGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAMQKKYYKAILMKDLDAFENEMTKKVKLQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPFEIGDHLIEASGKLHLLDKLLAFLYSRDHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHLAIKNFGQQPIFIFLLSTRAGGVGMNLTAADTVIFFDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIARDTVEEIVCRKASSKLQLTNMIIEGGHFTLGTQRPSANADLQLSEILKFGLDKLLSSEGSIIDEIDMESILGETKDGQWISDALPTAEEGSIEQEEG	80228	16404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_16571_17593_17748_18373_18489_23102_23214_24591_24666_34419_34517_35931_36025_36956_37113_37733_37890_39258_39341_43972_44005_44628_44744_63954_64068_80091
874856	contig_6506_pilon	-	3090	1	Intergenic	novelGene_153487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGGAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171617	168527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_168500_171600
874857	contig_6501_pilon	+	2308	6	Intergenic	novelGene_150577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_1	49.6531972787252	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	709	1608	327340	375470	FALSE	30	AGGGAATTATGTCACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSESFISLEECRGHKRARKKTSMETAFALEKLFPKQCQVLGIVTPGIVVTPMGSGSNRPQEIEIGESGFALLFPQIEGIKIQPFHFIKDPKKMTLERYQLAEVGLLDNPELRVVLVFGYNCCKLGASNYLQRVISTFSDMNIILAGGQVDNLSSLTSEKNPLDIDATGVVGLSFSGHRIQSATVLLNEDVKDEKTAEAAMQRLKAAGIPEENTFGFMFACVGRGFQYYGAKGNVEADAFRKFFPSVPLFGFFGNGEIGCDRIVTGNFILRKCNEVKDDDLFHSYTTIMTLIHLGSSK	317003	376170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_317679_327306_327395_328503_328600_349816_349982_371292_371459_375052
874858	contig_11978_pilon	-	1511	11	Intergenic	novelGene_62789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCGCAGGGCGTGGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589568	299610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_299806_335600_335720_379900_380024_539031_539114_540005_540089_542946_543073_545619_545685_547580_547774_556589_556642_564819_564931_589206
874859	contig_20175_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_142461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGAAGGATGTGGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83696	80882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_-_80900_83700
874860	contig_7904_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_160037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGGTTAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546404	549080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_546400_549100
874861	contig_6876_pilon	-	3260	10	Intergenic	novelGene_147014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	20.9873565701464	86	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	85	984	82167	64447	FALSE	15	AGGATTTGGCTGTGTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLNDHHQNEVINYMRFARSKRGLRLKTVDSCFQDLKESRLVEETFTIDEVSEVLSGLQAVVHSEVESELINTAYTNVLLLRQLFSQAEKWYLKLQTDISELENRELLEQVAEFEKAEFTSSNKKPVLDVVKPKLAPLNEGGTAELLNKEILRLQEENEKLKSRLKTIEIQATNALDEKSELERALRDLQLDQGNQKDFIKAQDLSELENTVAALKSEFQRTLSDKTENQKSLEENLATAKHDLLRVQEQLSLAEKELEKKFQQTAAYRNMKEILTKKNDQIKELRKKLAKYEPED	82251	62170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_64466_65504_65609_66413_66591_68803_68882_68967_69034_70588_70661_72517_72579_73830_74026_75707_75833_82164
874862	contig_10158_pilon	-	1739	2	Intergenic	novelGene_150773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTGAAAATAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107471	97785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_98612_106558
874863	contig_20324_pilon	+	1105	3	Intergenic	novelGene_100865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	23	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	97	630	7068	13962	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESEIRSPPQAIEFPGESPTRSPVVLLNRNIAPMASTMPLAMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQACISEVGKDGGSVCPVCRHKFLLRNIRPNRQLANMVNNLREMSQSAKEGAKGGQCGVHGEKLHLFCEEDGKILCWVCAQSRKHRNHSMVSFYNVTDHGSLIYTFSECDFAGPLRPFFNLGFNDRGQNMAPLILRPLRLGW	5107	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_+_5156_7019_7443_13803
874864	contig_17106_pilon	-	3149	2	Intergenic	novelGene_127658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACTTGGGCATATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20059	16850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_17070_17129
874865	contig_4125_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_25115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	136	303	809583	809416	NA	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPPPTQIGSKGERVHTDARRPSSSTASGQCSLTGFQKDVWFRVAMPLRLAPRVALWSIKWTEEEGARPPIPGQAELGKATILARPSSCRSELSSTCSKV	809718	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809000_809700
874866	contig_6980_pilon	-	2088	4	Intergenic	novelGene_36085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_3	54.3016267405192	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1248	1667	396289	393062	FALSE	65	GAAAACATAAAGAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQWQRGHLSNYQYLLHLNNLADRSCNDLSQYPVFPWIINDYYSSTLDLSNPETFRDLSKPVGALNKERLERLLTRYREMPEPKFMYGSHYSSPGYVLFYLVRIAPEYMLCLQNGRFDNADRMFNRFVINTSLFLVIHV	397536	392640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_393169_393261_393353_394801_394882_396147
874867	contig_6418_pilon	-	3398	3	Intergenic	novelGene_81177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAGAAGGCTCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125366	1104941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1105672_1108268_1108975_1123404
874868	contig_7157_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_131302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	337	1014	1100	2113	909543	908530	NA	60	CAAAGCAACAAAATTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLSSENCSSQYQVHQTHQPLNVSSLLFLITFGKTLLNILTLGMRRKNTYQNFMGYFCISLAFIDLFLLVNISIISYFRDFVLLGIRFTKYHICLLTQIISFTYGFLHYPVFLIACIDYYLNLSKTTKLPYKCQKLFYFFIVILIWISVLAYVLGDPAISQSLNAQNAYPYQCPFYISVQSYWLSFSMVIILSVVLITTWSEVVTLVQAVRVTSYMNEAILYFPFSSQSSTMSCKKLLLPKLLICFLSTWLPFVLLQIIILVLKVQIPAYMEMNIPWLYFVNSFLIATVYWFNCHKLNLRDITLPVDPFVSWKYCFIPLRIHNLEKIEKPISIIIC	910642	908054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_908100_910600
874869	contig_7294_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_172600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	148	402	179501	179247	NA	20	TACTGAGCACCTTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSSSEHAAETSHLLLANNRGGRKLSACLSGIRKPPSLLGNTFALLGCLMSRLDGRPDTPFSAWLIEVSFKTAPLPLWHLFWQEVPGVVLFFANRSLGQDLGVWLSAFACKVHRGRPVLRFWSATFEIKSPTG	179648	176044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_-_176000_179600
874870	contig_6228_pilon	+	2014	5	Intergenic	novelGene_164511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	28.3670142947755	97	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	56	523	255748	273824	FALSE	25	TTTATAGCCACAGTGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLEGTEAGKKAISLLSKLRNELQTDKPIVPLVEKFVDTDIWNQYLEYQQSLMKESDGKPRWFHSPWLFVECYMYRRIHEALTQSPPIDDFDVFKELKEQNFFESQESIISLCTYLQELMRTIEELDEDQLKNEFFKFLQISLWGNKCDLSLSA	255692	275315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_255760_256073_256319_272093_272260_273190_273231_273819
874871	contig_14397_pilon	+	3255	3	Intergenic	novelGene_134651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACGTGAACATTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99637	126703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_+_102517_102603_102860_126583
874872	contig_2161_pilon	+	2840	1	Intergenic	novelGene_114958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCTCCTCCAGCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002748	1005588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1002700_1005600
874873	contig_17964_pilon	+	3192	1	Intergenic	novelGene_33914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAGGCCCTGGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392109	395301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_392100_395300
874874	contig_6842_pilon	+	2150	5	Intergenic	novelGene_130798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	50.8969547222621	237	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	165	782	1654859	1676059	FALSE	25	AGTTACCTCTAGTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVAAMVWRRVLRKRWVLALVFGLSLVYFLTSTFKQEERAVRDRNLLQVQDHDQPIPWKVQFNLGNSSRPSNQCRNSIQGKHLITDELGYVCERKDLLVNGCCNVNVPNTKQYCCDGCLSNGCCSAYEYCVSCCLQPNKQLLLERFLNRAAVAFQNLFMAVEDHFELCLAKCRTSSQSVQHENTYRDPIAKYCYGESPPELFPA	1654694	1677427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1654970_1670080_1670238_1673461_1673614_1673979_1674094_1675975
874875	contig_15866_pilon	-	3276	1	Intergenic	novelGene_63591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATACTTACTATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229539	226263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_226300_229500
874876	contig_3137_pilon	+	3656	3	Intergenic	novelGene_167746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGGTCCAGACACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219830	253373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3137_pilon_+_223228_233554_233696_253255
874877	contig_5039_pilon	+	1907	11	Intergenic	novelGene_64991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	133.672884310918	157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	107	1408	1688604	1701169	FALSE	10	CAGGTGTGGGTGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLVIGSGGREHTLAWKLAQSPHVKQVLVAPGNAGTACSEKISNAAVSVSNHAALAQFCKDEKIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLTSAGVRCFGPTAEAAQLESSKRFAKEFMDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALKDGRVVTNGGRVLTVTAIREDLPSALEEAKKGLAAIKFEGAVYRKDIGRRALAFLQQPR	1687254	1701668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687322_1688564_1688749_1691365_1691462_1692008_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648_1698818_1700933
874878	contig_16622_pilon	+	3743	1	Intergenic	novelGene_48517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCCCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219787	223530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_219800_223500
874879	contig_19737_pilon	+	3382	4	Intergenic	novelGene_158974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	590	junction_1	201.019070405439	23	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2086	2388	48631	50890	FALSE	40	CAGCATTTAATAAAGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLDFLPVSGIGNPALAYFHFRTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE	46165	51884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_47282_47575_47696_47781_48801_50757
874880	contig_5033_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_28968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGAGTAGAACCACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466141	467282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_466100_467300
874881	contig_6881_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_164830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTTAACTTCCTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64932	62412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_62400_64900
874882	contig_18671_pilon	-	3013	9	Intergenic	novelGene_150006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_8	70.28291044059	226	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	20	1021	172836	139175	FALSE	15	CTCTTCTTTTGGTATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGAGVMAASTLGSAWGSLRPHVPSLCRRRPPQDLCARSRRLPELAVSGRSLAAASGRGASGTDLYCMELLRKRDYEGYLCSLLLPAESRSAAFALRAFNVELAQVKDSVSEKTIGLMRMQFWKNTVEDIYCDNPPQQPVAIELWKAIKRHNLTKRWLMKIIDEREKNLDDKAYRNIQELETYAENTQSSLLYLTLEILGVKDLHADHAASHIGKAQGIVTCLRAAPYHGSRRKVFLPMDIFMLHGVSQEDFLRKNQDKNVRDVIYDIASQAHLHLKHARSFQKSVPVKAFPAFLHTVALEDYLKKIQQVDFDIFHPTLQQKNTLLPLSLYIQSWRKRY	172855	137182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18671_pilon_-_139304_148261_148319_152874_152977_153690_153825_154870_154974_156816_156874_161745_161869_166425_166526_172639
874883	contig_19974_pilon	-	4221	1	Intergenic	novelGene_130451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAGAAAAGAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65079	60858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_60900_65100
874884	contig_4857_pilon	-	2491	1	Intergenic	novelGene_48780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAGTGTAATAAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221876	1219385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1219400_1221900
874885	contig_5515_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_52321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCATCAGAATAAGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59960	60354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_60000_60400
874886	contig_14483_pilon	-	3114	4	Intergenic	novelGene_133748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1927	junction_3	81.773399641258	6011	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1913	2212	52067	51768	FALSE	20	TCAGATATATGTTCTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLSPKATSMSLNIGHLRKQNHGTNAGGYCRCIKMPQTLSPDHVGKCDSSAAVYPILQVRTCSTLSLGVRLKPSQCPPWTMVMNLLSSSPQLGNVFGS	96521	50865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_53621_62296_62425_87781_87830_96338
874887	contig_8362_pilon	-	492	1	Intergenic	novelGene_150684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCATGGTGACCTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99048	98556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_98600_99000
874888	contig_19237_pilon	+	2664	1	Intergenic	novelGene_162967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTAATTTCTTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101802	104466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_+_101800_104500
874889	contig_16382_pilon	-	2899	1	Intergenic	novelGene_160220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2433	2783	63346	62996	NA	75	GAGGAAAAATCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPASDQNKEPENVLEEDRAMEIPVKQFERLIYTALQESREKTKPRKDKQIEEFGKTVQEQSDKINKQLETIQKQQLEIQMINNIISELDNSIEGPKPTAIESVLAHSDPIGFPRL	65778	62879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_62900_65800
874890	contig_12793_pilon	-	2025	2	Intergenic	novelGene_164123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGAGTAGATCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251205	247745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_248335_249769
874891	contig_1372_pilon	+	2040	11	Intergenic	novelGene_140512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	33.5529432390066	26	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	617	1573	457535	484809	FALSE	70	AAATAAAACAAAAACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451498	485276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_454521_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
874892	contig_16594_pilon	-	5840	1	Intergenic	novelGene_53923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGTTAAATAGAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302667	296827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_296800_302700
874895	contig_2703_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_101746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538041	540195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_538000_540200
874896	contig_7171_pilon	-	2877	18	Intergenic	novelGene_101209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_4	64.701978491861	292	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	28	1968	193000	177226	FALSE	25	AGGGCTCAGCACCGCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLIVDYSCALQREILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAIQICTESEKHFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHECYGSELGLTSEDEDYVCPSQLNGLGSPKEVGEVIALSDITPSGAADHSQEPSPVGSRRGHITPNLSRASSDADHGAEEEKEEQRASQPDINSSQTVTPAAEPSSTEPTQPDGPTSLGPLDLLPSEELLTDTSNSSSSTGEEADLTALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSAFLQGFLQQCKFTDLTLSPWSGDSKSHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSEVLTQGIPYQDYFYTAHRYCILGLARDKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYFHHLERELAKAEKLSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRGHGDGPQHPDPDPCTRPGMHTSGSLSSRFSEPPMDQGPGAGVPNALVFISVVLIILMALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQTAAEWAEILALQKQFHSVEVHKWRRILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDSQPRPDDSFS	193112	176316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_177319_179322_179444_179525_179634_180768_180857_180949_181124_181219_181324_183188_183332_183505_183625_186414_186559_187510_187710_188263_188415_188586_188700_190530_190612_192003_192100_192174_192279_192417_192503_192982_193004_193088
874897	contig_6946_pilon	+	1209	2	Intergenic	novelGene_59796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTGTTTGTCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452779	454077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_453384_453472
874899	contig_8461_pilon	-	3531	1	Intergenic	novelGene_163929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAGAGAAACAAAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441273	437742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_437700_441300
874900	contig_3787_pilon	-	2150	14	Intergenic	novelGene_102363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	550920	548021	TRUE	5	TGCGCTCCCGGGGACGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCQTPAAQPPGHHSQRNNRNLKLGRGWCPRSSTGWWSGCCNRWSTAASPGCSSVCRAGGSVSEPGPAPHRAASPHQAWWRPTRSCSAASGPPRQLLRVLRLWEQVLLHRAPARASLCGAAGCSPEAGRRAQA	550922	360139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_360721_395744_395808_401340_401415_515230_515315_517943_518036_518972_519049_532497_532656_533804_533911_535277_535376_540164_540374_546538_546736_548009_548190_548543_548706_550852
874901	contig_5549_pilon	-	1385	10	Intergenic	novelGene_81638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_9	640.306138200536	139	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	59	304	446541	444492	TRUE	25	ATAAGTACTTTGTACCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTVGTGGVRAVRGRIGNGMGSATPLLEWLWSALGSVGRGAKCHRGTREERGVRRRPRERALRNSAGHGYNVAFDGIFQPVTCQRMRTVDKVLKSLKLRP	446599	441740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_442091_442271_442315_442504_442535_442879_442936_443118_443683_443958_443989_444483_444522_444722_444755_444949_445003_446410
874902	contig_11378_pilon	-	2009	9	Intergenic	novelGene_112315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	116.689692668204	654	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	183	875	1169877	1154567	TRUE	10	TGTGAGCGCCTTCATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDPAAHLPFFYGSISRSEAEDHLKLAGMADGLFLLRQCLRSLGGYVLSLVHDVRIHHFPVERQLNGTYAIAGGKAHCGPAELCEFYSRDPDGLPCNLRKPCNRPPGLEPQPGVFDSLRDAMVRDYVRQTWKLEGEALEQAIVSQAPQVEKLIATTAHERMPWYHSDLTREEAERKLYSGAQTDGKFLLRPRKEQGTYALSLIYGKTVYHYLISQGRRSLSAMWLSCCTR	1179452	1151954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1152689_1153987_1154101_1154188_1154330_1154420_1154614_1161114_1161198_1168494_1168656_1169475_1169922_1179105_1179172_1179380
874903	contig_8880_pilon	+	2549	3	Intergenic	novelGene_165754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTTCACCCCTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25461	33477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_+_27286_32614_32660_32797
874904	contig_6195_pilon	+	3057	18	Intergenic	novelGene_71020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	135.882836770211	117	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	1038	2771	111019	137437	TRUE	35	TATTGTAACAGTAGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQPYFKELYVRSSLANCNTVAESEEPKTEIIKVDRSSSEDITYRSLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSCLQERDEDIKTLQEKISEIQKCTQEQLEEKSSQLDVVIEKLERHNERKGKLKQQLKEKEEELEEIRNAYSTLNQKWHDKGELLSHLETQVKEVKEKFDDKERKLKEERDKSIEMQKCTRKASEYG	94274	140354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_97122_97329_97627_97694_102785_102954_104900_105077_105171_105382_111005_111154_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_131449_135278_135488_135574_135713_137406_137541_140171
874905	contig_7677_pilon	-	2383	10	Intergenic	novelGene_78271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	354	junction_6	130.444065871114	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	59	1324	524311	479264	FALSE	20	CAGACCTAGTCAGCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDPDNYIAYYRRATVFLAMGKSKAALPDLTKVIELKMDFTAARLQRGHLLLKQGKLDEAEDDFKKVLKSNPSENEEKEAQSQLRKADEMQHLRSQALYAFESADYTAAITFLDKILEVCVWDAELRELRAECFIKEGEPRKAISDLKAASKLKNDNTEAFYKISILYYQLGDHELSLSEVRECLKLDQDHKRCFAHYKQVKKLNKLIESAEELIRDGRYADATSKYESVMKTEPSVSEYSIRSKERICHCFSKDEKPVEAIRICSEVLQIEPDNVNALRDRAEAYLIEEMYDEAIQDYETAQEHNENDQQIREGLEKAHRLLKQSQKRDYYKILGVKRNAKKQEIIKAYRKLAMQWHPDNFQNEEEKKKAEKKFIDIAAAKEVLSDPEMRKKFDDGEDPLDAESQQGGGGNPFHRSWNSWQGFNPFSSGGPFRFKFHFN	524369	478204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7677_pilon_-_479422_484998_485148_486070_486204_494728_494850_494938_495045_503107_503228_503609_503792_505647_505801_521580_521656_524242
874906	contig_3787_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_102353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1268	1606	78515	78853	NA	75	AAAATAAAATTAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKNRASANLCCQELEQSWEYKIDAGSIFQFSNFLLSFKSKCLGISAHSSSFISLAEFSKMLLCQIFPMFCHLKCIFIFFINRYFLSTRHVLGSADTAIRDRQTLFLELTF	77247	79452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_77200_79500
874907	contig_12543_pilon	+	2334	1	Intergenic	novelGene_168384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGTCCTAGCATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363444	365778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_363400_365800
874908	contig_9414_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_131082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAATTAATAACCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393753	392035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_392000_393800
874909	contig_12425_pilon	+	800	4	Intergenic	novelGene_46643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	283.653936259583	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	20	610	167205	198400	FALSE	20	GCAACTTGGTACTTCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLRFQMGSIRKVIPQIDKVWSRYVKKLSDFAKPENIDLAVHCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAVPQVMAIATLAACYNNQQVFKGVVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPKSDPSSNKTRQIISTIRTQNLPTCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQYLSTLSQVTEDYVQTGEH	167185	198590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_167244_186767_186945_190682_190836_198178
874910	contig_3787_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_102434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTTTATTAAAACTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641149	639578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_639600_641100
874911	contig_17432_pilon	+	1891	1	Intergenic	novelGene_159015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCCTTCAAGATTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124149	126040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_124100_126000
874912	contig_6048_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_73181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGAGGATGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292910	1293738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1292900_1293700
874913	contig_15084_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_116696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATTTTCGGCACAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217535	215671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_215700_217500
874914	contig_5097_pilon	+	4034	2	Intergenic	novelGene_178183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGTATTCCAGGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125335	130766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5097_pilon_+_126267_127663
874915	contig_11816_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_98489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	31	336	491671	491366	NA	40	TAAATAAAAGTGTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFYLCLDESNMKITTVGTLLSKEGDILSSMYKIINNYHFCIASSNVKSFPIPGPDHKAIAITLAVLSVLALFSALIWCLLQRKRLLWAGFSSVRYRQGANDDEIMLPSFHD	491701	489466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_489500_491700
874917	contig_6199_pilon	+	1772	21	Intergenic	novelGene_126402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	198.836484328204	1	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	383	1231	575956	592948	TRUE	15	TATCCCCTCTGCTGAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMLMVRRLAVLPGGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAIKTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559489	603923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559590_564006_564057_565838_565885_568957_569021_570040_570093_574879_574932_575936_575999_585652_585745_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754
874918	contig_13014_pilon	+	1662	6	Intergenic	novelGene_169356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_5	38.0893685954493	229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	37	582	425603	432765	FALSE	30	TTTAATAAGTCATACGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVFLLQTVEQASMEDIPGRGHKYRLKFSVEEIIQKQITVNCTAEVLYPPVGQDTAPEVNFTFEGEIGKNPDEEDNAFYQRLKATKEPLVAQNIPDSFGNVPPEMKPVRHLAWVACGYIIWQNSTENTWYKMVKIQTVKQVQRNDDFIEFDYTVLLHDIASQEIIPWQMQVLWHPQYGTKVKHNSRLPEEAQLD	425566	433845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_425609_427816_427880_428923_429102_429413_429551_432338_432402_432666
874919	contig_5964_pilon	+	3085	1	Intergenic	novelGene_80376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATATTTTTCAGTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403765	406850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_403800_406800
874920	contig_2036_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_131815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	696	1055	585523	585882	NA	25	AATCTCCTGCATCAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWENSSASGGGAGGDEGCCWVDPRWGVVAGCGSQGRQIPGPNRVEGNHLQERWVLQLWEALDSQRQMQSAQKLLSIANLLFRQHKANTHFPKVASVAHFLSAPNLKLAPSYPFEVPVD	584827	587374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_584800_587400
874921	contig_14618_pilon	-	2592	4	Intergenic	novelGene_136811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	15.3260852434302	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	113	682	570184	565368	FALSE	40	TGACAAATGGAACTCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAPIDPGKKGDLEQKILQVLQEAGSPVKIAQLVKKCQVSKKELNHVLYRMKAVTCTGPATWCLGGDGTRDVVPTEPAEPGPSCGYRPSEEAAQKSLQNAATIPQSTGSPLGEQRQKAIYTLLAANGPRDALSIARALGMKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPGRPSPNARSWTRAGV	570296	563457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_565589_566228_566298_567306_567553_570150
874922	contig_5569_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_86728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194310	197063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_194300_197100
874923	contig_3721_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_123786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCCATATAGTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44269	41968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_42000_44300
874924	contig_15859_pilon	-	2320	3	Intergenic	novelGene_50218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	477	30	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	146	352	380433	380227	TRUE	15	TATGGCTACTTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPEKQQSKSQQLRKIFKEYGAVGVSVHIGISLVSLGIFYTVVSSGVDMSALLLKLGFKESLVQSKLAAGTSTFVVAYAIHKLFAPVRISITLVSVPLLVRYFRKVGFFKPPAAKP	381158	377367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_378178_379068_380444_381023
874925	scaffold_9100_pilon	-	3539	1	Intergenic	novelGene_83316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841706	838167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_838200_841700
874926	contig_7816_pilon	+	919	7	Intergenic	novelGene_66543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCCCTTTTGCCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246142	253125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_246313_249177_249309_249947_250135_250283_250428_251953_252009_252580_252680_252992
874927	contig_6241_pilon	-	3463	1	Intergenic	novelGene_156426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGGCGCAGTTGTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264363	260900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_260900_264400
874928	contig_7359_pilon	-	2309	21	Intergenic	novelGene_139869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	53.6547062241515	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	47	1606	393543	363372	TRUE	60	TTTAAAAGGCTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSSCRPSAGVAEASMGRKVTVATCALNQWALDFEGNLQRILKSIEVAKNKGARYRLGPELEICGYGCWDHYYESDTLLHSLQVLAALLESPVTQDIICDVGMPVMHRNVRYNCRVIFLNRRILLIRPKMALANEGNYRELRWFSPWSRSRQVDEYFLPRMIQDVTKQETVPFGDAVLATWDTCIGSEICEELWTPHSPHVAMGLDGVEIFTNASGSHHVLRKAHARVDLVSMATTKNGGIYLLANQKGCDGDRLYYDGCATIVMNGSVFAQGSQFSLDDVEVLTATLDLEDVRSYRAEISSRSLAASRVDPYPRVKVDFALSSRDDLLLPLSEPIEWKYHSPAEEISLGPACWLWDYLRRSQQAGFFLSLSGGVDSAATACLVFSMCCQVCEAVRNGNQQVLADVRNIVGQVTYTPQDPRDLCGRLLTTCYMASENSSQETCERARDLAQQIGSHHIGLSIDPAVRAVVGVFSLVTGKRPLFAVHGGSSRENLALQNVQARIRMVLAYLFAQLSLWSRGIRGGAPRAWICQCG	393589	352887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_353080_354571_354749_355960_356090_359775_359846_360730_360863_363368_363477_364586_364723_365802_365972_368904_369008_370009_370059_371576_371702_373383_373459_377131_377264_379218_379337_379644_379734_382097_382150_384172_384263_386369_386424_387790_387908_391168_391230_393458
874929	contig_401_pilon	-	1434	5	Intergenic	novelGene_42850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	163.534973323751	54	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGTGGTTAAGCACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728595	1713881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1714795_1717187_1717364_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
874930	contig_12046_pilon	+	4966	2	Intergenic	novelGene_83465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	0	37	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247250	265652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_247396_260831
874931	contig_4923_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_109331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCATTAATAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482657	480639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_480600_482700
874932	contig_10549_pilon	-	2756	2	Intergenic	novelGene_110640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	727	1062	488981	488646	TRUE	30	GTAGAAGGGAGGGAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLNLSLFKFLGPCNQKSTCRLILTCYVIFFNRQRVSISVHIVRFLRSVSTCLDVFSGGASGLWAHLEIPAISSVLRGSVASIQVLGESTIFFQRATSSEVESIQSTSVP	489707	485457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_487142_488635
874933	contig_11720_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_43911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCCCAGCAAAGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132550	131189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_131200_132600
874934	contig_12654_pilon	-	2731	8	Intergenic	novelGene_129251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	144.540369334477	242	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	273	1232	53099	34525	FALSE	15	TGTTTTCTTATATGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAATVDHSQRICEVWACNLDEEMKKIRQVIRKYNYVAMDTEFPGVVARPIGEFRSNADYQYQLLRCNVDLLKIIQLGLTFMNEQGEYPPGTSTWQFNFKFNLTEDMYAQDSIELLTTSGIQFKKHEEEGIETQYFAELLMTSGVVLCEGVKWLSFHSGYDFGYLIKILTNSNLPEEELDFFEILRLFFPVIYDVKYLMKSCKNLKTFPTFNKSISDTHSLVFPRLHKAYLYVLRPVYVLGGLQEVAEQLELERIGPQHQAGSDSLLTGMAFFKMREMFFEDHIDDAKYCGHLYGLGSGSSYVQNGTGNAYEEEAHTQS	54820	33025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_34654_35801_35913_35991_36094_38380_38526_40931_41094_50708_50903_52982_53194_54642
874935	contig_500_pilon	-	5550	12	Intergenic	novelGene_30925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	73.1018761559555	227	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	799	2469	1119646	1099212	FALSE	10	GAGCTGTGCGTCTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPAPYTDGTGAAAGGGNCRFAESPSHDQRLQVQRLRNPEVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPRDLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRLHHIMNHQCQLKEPSQPLPLPSEGSVEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRIEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAVFHGHYINGGFTVPFYKQLLGKAIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPVLDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSNIVRWFWQAVEAFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE	1120444	1096130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1099312_1100545_1100631_1103146_1103349_1106896_1107018_1107764_1107903_1108896_1109076_1109968_1110084_1113950_1114055_1115745_1115945_1117073_1117221_1118852_1118938_1119450
874936	contig_15070_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_164896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTATAAAATTTCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486252	484532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_484500_486300
874937	contig_10312_pilon	+	3752	13	Intergenic	novelGene_159018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_10	69.060510906499	169	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	109	1377	41742	211967	FALSE	40	AACAAGTATGTTTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEYQLNRIILFDRLLKAYPYKKNQIWKEARVDIPPLMRGLTWAALLGVEGAIHAKYDAIDKDTPIPTDRQIEVDIPRCHQYDELLSSPEGHAKFRRVLKAWVVSHPDLVYWQGLDSLCAPFLYLNFNNEALAYACMSAFIPKYLYNFFLKDNSHVIQEYLTVFSQMIAFHDPELSNHLNEIGFIPDLYAIPWFLTMFTHVFPLHKIFHLWDTLLLGNSSFPFCIGVAILQQLRDRLLANGFNECILLFSDLPEIDIERCVRESINLFCWTPKSATYRQHAQPPKPAPDSGVRSSASYFSTECPEPPKTDLSRESISLNDLKSEVSPRISAEDLIDLCELTVTGHFKTPTKKTKSSKPKLLVVDIRNSEDFIRGHISGSFNIPFSTAFTAEGELTQGPCTTMLQSFKGKVIVIVGHVAKHTAEFAAHLVKMKYPRICILDGGINKIKPTGLLTVPSPQI	40541	214342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_40590_41681_41781_43518_43582_44095_44223_45421_45473_46854_46939_61101_61188_86699_86737_87741_87904_117720_117894_161532_161709_174827_174988_211856
874938	contig_5286_pilon	+	3046	1	Intergenic	novelGene_157338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTCTACTCAGAGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502364	505410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_502400_505400
874939	contig_14727_pilon	-	2506	9	Intergenic	novelGene_56673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	114.338040476475	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1099	1731	368738	363131	FALSE	5	TGGTTTCACTGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACCMCPDGGGPSKDKGKLRLHSPRPHTSNTDQESEEQQLFQNIFRQIAGDDMEICADELKNVLNTVVNKHKDLKTQGFTLESCRSMIALMDTDGSGKLNLQEFHHLWNKIKTWQKIFKHYDTDHSGTINSYEMRNAVNDAGFHLNNQLYDIITMRYADKYMNIDFDSFICCFVRLEGMFRAFNAFDKDGDGIIKLNVLEWLQLTMYA	369836	362355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_363158_363557_363617_363864_363982_364214_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365112_365488_365567_368657
874940	contig_7446_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_101948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTAGGACTTTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173710	171272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_171300_173700
874941	contig_10892_pilon	+	2882	1	Intergenic	novelGene_116744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAATGAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130489	133371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_130500_133400
874942	contig_4364_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	245	370	992334	992459	NA	25	TCCAAAGACTGGCTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYSQSSATINPVNFRTFSSPQKETPDPSSVTPFPSFPSLWQPAVCLLSLWICLVWTFRKLNHEICPFVSGFFHSACSQGSSMFQRGSQLRSFLWLINILLYGWTTVCVFIYQLMAIQMISAL	992089	993101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_992100_993100
874943	contig_15185_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_99377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTCCCAGCCACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42354	41096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_41100_42400
874944	contig_10367_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_169464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTCAAACAAGCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138383	136404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_136400_138400
874945	contig_11986_pilon	-	1672	4	Intergenic	novelGene_69207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	870.463095139593	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	667	1350	738330	734311	FALSE	40	TAAAGAAAAAGGTGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTGALRFEVELMSAPDACSRRHGRVTECICAVSRWLPVSRLQGPEDGPFSLSLSLSLSVCVSDGDFADSCKENASPDSPHLPRDVGRALNCCHFPQPQSGDLVFFKLIEKWRCFIPKECNEPFRAESTSRHRR	738996	733988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734708_736211_736275_736942_737122_738285
874946	contig_6410_pilon	-	3794	10	Intergenic	novelGene_108657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	25.086516962969	221	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	228	914	524059	500082	FALSE	25	CCCAGCACAGACTATCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTGILRRVDEATFSKIPIGFIPLGQTSSLSQTLFAESGNKVQRITDATLAIVKGETVPLDVLQIKGEKEQPVFAMTGLRWGSFRDASVKVSKYWYLGPLKTKAAHFFSTLKEWPQTHQAAISYTGPTERPSSEPRESPPRPSLYRRILRRLAAYWAQPQDASPQEVHPEVWKEVQRSTIELSITTRNRQLDPVSTEDFMTICIEPDTLSKGDFITIGSKRMRDPTLCPAGTERLQASKCTLRLPQGAGGSFSIDSEDYEAMPVEVTLLPRKLHFFCDPRRREQVLRGPVQERTEPEGPGPAL	538833	497201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_500256_502377_502463_504661_504733_513813_513912_514698_514847_518904_518963_524006_524087_530041_530112_537091_537187_538798
874947	contig_12709_pilon	-	2539	6	Intergenic	novelGene_147404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_5	522.276938031922	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	130	747	57442	33604	FALSE	40	TGAGAAGACCCAGCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNASREVEPVEPGNCHLIEGIETGSEDIDILPSGLAFISSGLKYPGMPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNK	59051	31811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_33809_37396_37524_41999_42166_49294_49351_57378_57450_58929
874949	contig_17344_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_169598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTATATATGTCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108086	110073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_108100_110100
874950	contig_1863_pilon	-	852	5	Intergenic	novelGene_156522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	22.0042609510067	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	158	487	56971	49514	FALSE	60	ATAAAACAAAAAATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQLYRNTTLGNSLQESLDELIQSQQITPQLALQVLLQFDKAINSALAQRVRNRVNFRGSLNTYRFCDNVWTFVLNDVEFREVTELIKVDKVKIVACDGKNTGSNTTE	62717	49148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_49540_51778_51906_56340_56446_56899_57021_62609
874951	contig_6175_pilon	+	1337	5	Intergenic	novelGene_16293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_4	17.7482393492988	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGAGACGGGGTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396943	1403457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1397851_1399127_1399292_1400927_1400981_1401374_1401479_1403348
874952	contig_9127_pilon	-	3472	1	Intergenic	novelGene_103017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204359	200887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_200900_204400
874953	contig_10734_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_51261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288786	1290842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1288800_1290800
874954	contig_16205_pilon	+	4406	1	Intergenic	novelGene_156871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATACTCTGAACGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82575	86981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_82600_87000
874955	contig_9199_pilon	+	2848	8	Intergenic	novelGene_65655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGAAGAGAAAACAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172569	186138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_173872_174308_175230_175573_175719_179452_179503_180727_180795_181306_181414_181936_182058_186003
874956	contig_9981_pilon	+	1917	5	Intergenic	novelGene_121069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.92787604642	343	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	219	821	408875	413375	FALSE	25	TTTCTATGATACAGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRCGGRSLAPSLRLSDAVSRRGRPRATRGSGRAYGLPFPVSHRRADRKPGLPSRPSSIFTAERTEGRDQMMLFGKISWQFCGLKKLPWSCDSRSFWGWLNAVFNKVDYERIRDVGPDRAASEWLLRCGAMVRYHGQERWQKDYNNLPTGPLDKYKIQAIDATNSCIMNIGFDHMEGLQHVEKIKLCKCHYIEDTCLERLGQLENLQKSILEMEIISCGNVTEKGIIALHHLRNLNYLLLSDLPGVREKEKIVQAFQISLPSLKLKLDLK	402011	414471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_402225_408869_408982_410426_410636_411180_411353_413260
874957	contig_5566_pilon	-	1680	10	Intergenic	novelGene_153666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	24.5135387132685	91	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	712	1425	200661	187916	FALSE	50	AGAAGTTAATATGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQLGYKTVSGSCMSTGFNRAVKTHSSEFFKEDGSLKEVHKINEMYASLQEELRSICKKVEHSERAVEKLLEDVNRLKQEIKKRKQAQIQVAGEKNVPEEPQENTFLCQALQTLFPDSEFLHSCVISLKNRHISKSCCNTNHHLDMVDRLTLMVEYTDVPESSQACTQQIIKRKALDMGDGWQFKKSRLLEIQNKQSKTDTDSSNQEKASTVSSPETDEDIEKMKGSGEYPQSPTF	213002	187660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_188350_188806_188922_191213_191299_200581_200702_201229_201327_201469_201664_203509_203577_207285_207323_209857_209949_212817
874958	contig_9609_pilon	+	2932	19	Intergenic	novelGene_22957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_7	65.2725529823946	71	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	282	2816	215572	300464	FALSE	25	TGATTATTTTTTGTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGRDGSHADFRGRDLSDLDFRARDQSRSDFRNRDVSDLDFRDKEGTQVDFRGRGSGPTDLDFRDRDTPRSDFRGRHRSRTDQDFRGREVGSCMEFKDREMPPVDPNILDYIQPSTQDREHSGMNVNKREESTHDHTTERPAFGIQKGEFEHSETREGETQGAAFEHESPSDFQNSQSPLQDQDMSQLSGGEQQSSDAGLFKEESGLDFLGRQDTDYRSMEYRDVDHRLPGNQIYDYGQNKSFPEGKTARDAQWDLQDQDYRTGPSEEKPSRLIRLSGVSENTTKEEILNAFRTPDGIPIKDLQLKEYTTGYDYGYVCVEFSLLEDAIGCMEANQGTLMIHDREVTLEYVPSPDFWYCKRCKANTGGLQSSCSFCKGPREEVKQELISYPQPQKTSVPALSEKQPNQPPRSADKEPESKKWEEGQEPRLGHQKREAERYLPPSRREGLAFRRDREKEPWSGETRQDGESKTIMLKRIYRSTPPEVIVEVLEPYVHLTTANVRIIKNRTGPMGHTYGFIDLDSHAEALRVVKILQNLDPPFSIDGKMVAVNLATGKRRNDSGDHSDHMHYYQGKKYFRDRRGSGRNSDWSSDSNRQGQQSSSDCYIYDSATGYYYDPLAGTYYDPNTQQEVYVPQDPGSPEEEEIKEKKPTSQGKSSGKKETSKRDGKEKKDRGVTKFQENASEGKAPPEDVFKKPLPPTVKKEESPPPPKVVNPLIGLLGEYGGDSDYEEEEEEEQTPAPQPRTAQPQQREELTKKENEEDKLTDWNKLACLLCRRQFPNKEVLIKHQQLSDLHKQNLEIHRKIKQSEQELAYLERREREGRFKERGNDRREKLQSFDSPERKRIKYTRETDSDRKPVGKEGIDNSSKGGCVQQATGWRKGTGLGYGQPGLASAEETEGRVRGPSVGTAGRTSKRQSNETYRDAVRRVMFARYKELD	215290	300580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_216064_220027_220118_221346_221417_239663_239738_282831_282907_286501_286563_288244_288515_288892_289054_289840_289939_290639_290683_290875_290958_291206_291293_291832_291980_293113_293210_293842_294104_295731_295807_296549_296648_299503_299634_300338
874959	contig_5954_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_28434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97539	99909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97500_99900
874960	contig_9439_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_176911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	39	311	167418	167146	NA	55	TTATACAAGGAAAACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSASCPAAPSSMWTTSLVQPRWPPTCSSSTATRLSTAATSTGAGATRCTSPPFGTNPGAGSARLCRRLGTGPRAYTTWPTGLSDEAAFPWVRPRKVKSSAF	167456	165046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_165000_167500
874961	contig_1009_pilon	-	2883	1	Intergenic	novelGene_121741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTTTGTTCGTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197149	194266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_194300_197100
874962	contig_17753_pilon	+	4034	1	Intergenic	novelGene_105030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCAAAAACGCAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9504	13538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_9500_13500
874963	contig_14666_pilon	-	1190	5	Intergenic	novelGene_39532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1014.08292930115	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	463	768	451982	449808	FALSE	15	CTGAGCCTGAGTGTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWGERGWMRIVTSTYKGGKGDSYNLAVEKSCTFGDPIV	458427	449385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_449919_450765_450929_451950_452102_453686_453850_458247
874964	contig_10549_pilon	-	2220	2	Intergenic	novelGene_110580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	67	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGTCTCCTATATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22999	18111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_20024_22691
874965	contig_50_pilon	+	4525	1	Intergenic	novelGene_122226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTATTTGTACAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95701	100226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_95700_100200
874966	contig_4626_pilon	+	1592	5	Intergenic	novelGene_158823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	18.4983107336859	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	3	461	66639	85488	FALSE	65	CATATTAAAAAATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPEEKTYYIELWDVGGSVGSASSVKSTRAVFYNSVNGIILVHDLTNKKSSQNLYRWSLEALNRDLVPTGVLVTNGDYDREQFADNQIPLLVIGTKLDQIHETKRHEVLTRIAFLAEDFNAEEINLDCTNPRYLAAGSSNAVKLSRFFDKKSS	66636	86619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_66748_69645_69761_77296_77448_81518_81591_85476
874967	contig_10063_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_127740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGGTTAAGCACTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384540	382068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_382100_384500
874968	contig_5574_pilon	-	3646	1	Intergenic	novelGene_155828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTACCATAATAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64356	60710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_60700_64400
874970	contig_5145_pilon	+	1614	13	Intergenic	novelGene_131444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	56	529	916049	917142	TRUE	25	ACATGGCGGCGGCGGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNSNSATPPRSQQSQRALVAGGGRWHVQPASGKCILIFLVPGSHTAEQSVSDLPSWTKRGRDKMSQTRLCLPPRVLEAEWSPRGGPGGLGRAPGPDSRLNPAAWQVLPGSRCGPSLGPKLVISVLGDVADPGQGLVAALLNDLQVAHPWMPEVVK	915993	946987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_916420_916540_916618_917116_917214_923297_923474_923897_923973_924433_924574_925544_925676_936153_936235_936279_936297_937356_937494_939098_939164_941152_941304_946946
874971	contig_7416_pilon	+	3134	1	Intergenic	novelGene_134329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGGTTTAAAACAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856737	859871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_856700_859900
874972	contig_18364_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_102587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATATAGTTTTCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197470	195169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_195200_197500
874973	contig_5549_pilon	-	3011	1	Intergenic	novelGene_81684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAATAAGAAAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606699	603688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_603700_606700
874974	scaffold_13505_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_111676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885168	887432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_885200_887400
874975	contig_8600_pilon	+	2773	1	Intergenic	novelGene_125737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102320	105093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102300_105100
874976	contig_5797_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_56942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAGAAAAAAAATAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322286	324661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322300_324700
874977	contig_7378_pilon	+	3984	1	Intergenic	novelGene_120296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATTTTCAACATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614991	618975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_615000_619000
874978	contig_18859_pilon	-	2841	9	Intergenic	novelGene_150553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2010	2321	252283	216894	TRUE	20	CAGCAGCGCGATGTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKQVRVNHVEDRVAPENSRRRISFSIPLIKSANLAIAIPTTQPPTMDQNPIQPASTWLTRTGVKIKSRTPDQPANTPSGMAYAKAIIKNLKLLNNLQKLRR	280533	170489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_170550_180656_180749_212609_212875_216790_216922_241781_241891_249112_249181_252176_252305_268011_268195_278728
874979	contig_13697_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_165918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	954	1304	161746	161396	NA	10	TGTTTACATCTTTTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSKKNKPHMNLTQAKVFSVGSHACERWTMNKKDQRRTDAFELWCWQRILNIPLPARRTNKSILEEVQPESSSEVRLERLQLMYFGHVILRDQSLEKDIMLGEGSAKKRKTVNEMD	162699	160868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_160900_162700
874980	contig_2463_pilon	-	1169	2	Intergenic	novelGene_43028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	845	1156	522976	516959	FALSE	40	CCATCATCACAAAATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRIGYFIFLSVARLSWSLDISGSYASMTSVPLWSKNLAMDLVNSASRCCFVLPLMKVSFRVYLSSYLLRLEDSCQISSGSIPVGSFLWATRKMLFSLYEV	523820	516945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_517070_522775
874981	contig_361_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_166615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCAGCACAAAGCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001888	1000002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1e+06_1001900
874982	contig_6270_pilon	+	3446	3	Intergenic	novelGene_99865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50.5	474	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	341	760	1035280	1035699	FALSE	0	TTTGCTTGTTTTGTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISSQPVLSNLEYGTELSLGLPQDSPSSTLAPREFAPADTSQLEVTMEMAEKGEALPNGEVSLSVPDLIHKDSQGESKLKMTEWRRASSPDLMERNGLKLSLSPISLAEPPEDGSPPSQARTSSLDNEGPHPDLLSFE	1027843	1038385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1027962_1032320_1032457_1035193
874983	contig_5649_pilon	+	1885	7	Intergenic	novelGene_82413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	76.257604356695	285	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	166	579	1311814	1325479	TRUE	60	CTTTAGAAAAAAAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPILLPKCEWPNQVSPALFGGTGFSSVSGGRKRAADWATLPEAGRNFAAATSCSIMDGGDDGNLVIKKKFVSEAELDERRKRRQEEWEKVRKPEDPKECPEEVYDPRSLYERLQEQKDRKQQEYEEQFKFKNMVRGLDEDETNFLDEVSRQQELIEKQRREEELKELKEYRIISTRLEFLQKIRKKWRRNWL	1301287	1341814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1301438_1311798_1311941_1312515_1312615_1313018_1313142_1325414_1325547_1333754_1333820_1340640
874984	contig_12239_pilon	+	3370	1	Intergenic	novelGene_170475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	353	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60756	64126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_60800_64100
874985	contig_6488_pilon	+	2578	1	Intergenic	novelGene_44721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1667	1981	37950	38264	NA	15	CTTCTACCTTTTGGTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFQHTMAEGNLFWEAPTRGPPQGSPLWVSALTNSHVPRSVKTVIALTLPSLTSSIHKALPYTCSHPDWNSHLMLLSNSLGITKIMALYLGGKSGPQRPVIGP	36283	38861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_36300_38900
874986	contig_7594_pilon	-	2507	1	Intergenic	novelGene_55392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTCATGATCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360796	358289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_358300_360800
874987	contig_13937_pilon	+	3116	1	Intergenic	novelGene_167358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	79	429	64731	65081	NA	40	TGCTTAAGTAACAAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPGWVEAFGADQRARADRLAGERREMEKRGRLGKPPSSHTPPATQAVPRKERRPSMFEKEAVSAETARARNSLFGPAPVTAPNQRIYPRDPSLRPDTIGSPFSRVLRFVLVKDIEPDIAECLPAPCRFSKSHVALYRNRRV	64652	67768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_64700_67800
874988	contig_20402_pilon	+	2141	10	Intergenic	novelGene_72839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_9	47.326290555861	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1014	1128	2141	137058	170960	FALSE	30	CAGCTGAGAGAGAGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLAIPDKLTVMTYLYQIRAHFSGQELNVVQIEENSSKSTYKVGNYETDTNSSVDQEKFYAELSDLKREPEQQPASGAVDFLSQDDSVFVNDSGVGESESEHQTPDDHLSPSTASPYCCRTKSDIEPQKSQQSSGRTSGSDDPGMCSSVDSTQAQVLLGKKKLLKAEILDLSDLYVSDKKKDVSSPLICEETDEQKLQTPEVNSNLEQEKLENSRPSECRSDPESPIRKPSLSPTSKLGYSYNRDADLAKKKRMSLRQTESDLDADRATVNHADHSTKSVQHRMLSRQEELKERARILLEQARRDAALKAGNKQNTSAATPLSNRQLSDQQDEERRR	34281	170960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_34464_38213_38354_50573_50664_54307_54550_76635_76826_132084_132265_132897_132947_137003_137904_144218_144363_170936
874989	contig_7031_pilon	-	1072	2	Intergenic	novelGene_132802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTTCTCTCAATATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345428	343668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_343798_344485
874990	contig_12402_pilon	-	3154	2	Intergenic	novelGene_133349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAATAATTCATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313832	286088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_286751_311340
874991	contig_10003_pilon	-	2618	1	Intergenic	novelGene_88304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGATGCAGTAACTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967459	964841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_964800_967500
874992	contig_19647_pilon	-	1613	2	Intergenic	novelGene_144002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	744	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGACTGGTGTGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86105	73377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271
874993	contig_12837_pilon	+	2364	3	Intergenic	novelGene_57319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3248	junction_2	248.5	46	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAATATTGATCGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129509	155989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_153829_153894_153981
874994	contig_10531_pilon	+	4374	9	Intergenic	novelGene_114521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	125.845142933687	142	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	257	1300	466144	492870	TRUE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPLQWARYHWQRLIGGANRDDNERPYNYSSLLACGGKTSQTPKLAGKHRVVVPHLQPFKDEYEKFSGAYVNNQIRTTKYTLLNFVPRNLFEQFHRAANLYFLFLVVLNWMPLVEAFQKEITMLPLVVVLTIIAIKDGLEDYRKYKIDKQINNLVTKVYSWKEKKYIDRCWKDVTVGDFIRLSCNEVIPADMVLLFSTDPDGICHIETSGLDGESNLKQRQVVRGYAEQDSEVDPEKFSSRIECESPNNDLNRFRGFLEHSNKERVGLSKENLLLRGCTIRNTEAVVGIVVYAGHETKAMLNNSGPRYKRSKLERRANTDVLWCVLLLIIMCFTGALGSCNLVKQV	429098	496076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_429318_466106_466434_467898_468094_481531_481737_485780_485867_491937_492045_492311_492444_492841_492971_493102
874995	contig_13952_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_133267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACAGGGCACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203137	204840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_203100_204800
874996	contig_7171_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_101326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAACGACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128246	1129527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1128200_1129500
874997	contig_14973_pilon	+	4214	2	Intergenic	novelGene_171227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTTAAGTCATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198167	202478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_199673_199769
874998	contig_10286_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_98436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGAGAAAAAAAAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488167	485855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_485900_488200
874999	contig_13067_pilon	+	2410	2	Intergenic	novelGene_141347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAACGCTTACACTTCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51606	75390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_53716_75089
875000	contig_7389_pilon	-	1897	7	Intergenic	novelGene_171909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	2.70801280154532	7	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	522	992	385811	382541	FALSE	40	TAAAAGTTGGTTTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCELFFNSFQGFFVSIIYCYCNGEVQSEVKKMWSRWNLSIDWKTAPPCGSHRYGSVLTTMTHSTSSQSQMAASTRMVLISSKVAKTVSRQPDSHVTLPGYVWSNSEQDCLPPSIHEDAKEGNGNQGDDIPMKESSKPLEFSLDAEGSKGEMEDAL	419265	381635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7389_pilon_-_382937_383705_383748_385778_385918_389317_389413_399663_399731_409104_409166_419073
875001	contig_9415_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_109809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1080	1448	1758875	1759243	NA	55	AAAAAAAAACCCAGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVWLTPQEPSALHPFSTVVFCNLIRRLRSLAGPGLGPGRRWSGLPRWPQPVGRMSSVAAEKSCARRPGWPVRPALACHQQQPIASRVADRVVSLARFIAQTPSHKLNTRSSLWLGRMLRT	1757795	1760032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1757800_1760000
875002	contig_6975_pilon	+	3087	1	Intergenic	novelGene_74310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGCACAAAATTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533098	536185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_533100_536200
875003	contig_5039_pilon	+	3318	1	Intergenic	novelGene_64874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAAATACCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404815	408133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_404800_408100
875004	contig_18055_pilon	-	2235	2	Intergenic	novelGene_117828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTGCCTTTTAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79260	76328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_77234_77930
875005	contig_5799_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_50241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTTGTACTCATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157567	156302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_156300_157600
875006	contig_2757_pilon	-	1623	6	Intergenic	novelGene_164581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.635566420122	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	134	988	176412	171697	FALSE	45	ATAAAGACACAGATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRLFPRESFPRERRQGSHRRTLWELGGEHRQAEPLPTGVGCTLRMPRSFLVKSKKAHTYHQPHIQEDELAWPPALTPVAGDQVLSNGPVLSTLFTNQCLDWTSLKREPKPELDRSLTRMASAPEGPVVMSRAQDGDSPPSDSPPFYKPSFSWDALASSYGHSYRQAASTMQSAFLERSVSLYGSPLMPNAEPPLDFSLRYSPGMDTYHCLKCNKERSFECQMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFTCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK	182357	171061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_171876_172751_172918_174679_174952_175960_176099_176312_176433_182244
875007	contig_18185_pilon	-	4435	1	Intergenic	novelGene_177210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACGACTGTAGGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4751	316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18185_pilon_-_300_4800
875008	contig_19990_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_30764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70630	67903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_67900_70600
875009	contig_12414_pilon	+	2993	22	Intergenic	novelGene_59668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATTAAAATAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821021	933647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_821313_822251_822336_822760_822844_830402_830549_835796_835866_835913_835967_838083_838188_868323_868474_871629_871789_886851_886974_890249_890546_896743_896895_902526_902758_903003_903040_905263_905360_905446_905556_909063_909203_909284_909346_916186_916267_917554_917672_931657_931866_933439
875010	contig_11328_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_88467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCATGCACACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895476	894219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_894200_895500
875011	contig_11512_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_43310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGACAAGAAGGAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381780	378846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_378800_381800
875012	contig_3822_pilon	-	3504	1	Intergenic	novelGene_133289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGATCATTTTTAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203621	200117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_200100_203600
875014	contig_8045_pilon	-	1702	7	Intergenic	novelGene_35331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	177.666744840508	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAGATATAGAATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115829	82710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_83606_86593_86663_98059_98115_100942_101059_102484_102764_104136_104201_115605
875015	contig_1275_pilon	+	1060	9	Intergenic	novelGene_108765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTCCATAAGTCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400702	459359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448522_456870_456973_457653_457707_459283
875016	contig_1275_pilon	-	1091	11	Intergenic	novelGene_108783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	667.456672751123	6	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	212	898	485958	456962	TRUE	60	GAAAAAGATGACAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRSRGEDARLGRVVLLKSGGAQGLTLRQFPDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQEVYPASKKLWSDCILLGKEECF	546871	448422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448525_456870_456973_457653_457709_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_546777
875017	contig_16578_pilon	-	3990	1	Intergenic	novelGene_148677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTCAGTTAAAACAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289475	285485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_285500_289500
875018	contig_13026_pilon	-	3152	1	Intergenic	novelGene_146305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2106	2405	19581	19282	NA	80	TAATAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQGPIPSTHASPPPTPLVLHHSSGHQLLQGKVSPARHSGLGRGTGSPSLLTLRAEDSAICGGSSKFRRVWTPLPAVPSACCGPSPGSKVWWAPSERC	21686	18534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_18500_21700
875019	contig_7165_pilon	-	4377	8	Intergenic	novelGene_116811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3309	3665	29938	29582	TRUE	40	AAGTGGATAAATTTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLRSKGKPDWRNSSIVLSSVDSFFIKIPSLEWEKEFGIPRSVLEELVLPVRSSSGVQFSCFLTAGLSSIPWDKTTESIVKLVIVDMDGSLAIFSSFFNCEGEKTLARLSDEVVHRR	124586	25169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_25276_28975_31078_81032_81133_85380_85561_99113_99235_102701_102827_104656_104827_123113
875020	contig_14559_pilon	+	1790	2	Intergenic	novelGene_83720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242248	246166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_242946_245073
875021	contig_9415_pilon	+	2454	2	Intergenic	novelGene_109867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	165	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGAAAGGGGCGTGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026518	2029016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2027011_2027054
875022	contig_11720_pilon	+	3756	1	Intergenic	novelGene_44048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCCATGAAAGACTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588836	592592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_588800_592600
875023	contig_8452_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_47992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1082	1558	135464	135940	NA	20	CACATTTGGTCCTCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSPLVSLLGSCHCFTTRLPAWACWLCHLGTRLSFGIMSSHRFTTRHCLEVLPVLLQHQTPHLGAVPVADSPPDSLSGSGSYVDSPQDSLPGSAGYGASVLDPSAGSSSCNRLSTREHQLCRSSSRLPTWKWQLLQIHCQIPHPEALAIAVSLTDSL	134382	136453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_134400_136500
875024	contig_14450_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_48987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCTTAAACGGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045396	1047597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1045400_1047600
875025	contig_408_pilon	+	3068	1	Intergenic	novelGene_84922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCCCACAAGGGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144904	147972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_144900_148000
875026	contig_2646_pilon	-	5377	33	Intergenic	novelGene_69617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_30	297.319167730572	228	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1047	3144	193	3336	2058889	2049181	TRUE	15	GGTAAGGGGGGGGGCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKAPQPTGPPPAPSPGLPQPAFPPGQTAPVVFSAPQATQMNTPSQPRQHFYPSRAQPPSSAASRVPSAAPARPGPAAHVYPAGSQVMMIPSQIYQASQGAYYVPGQGRSTYVVPTQQYPVQPGAPGFYTGASPTEFGTYAGAYYPAQGVQQFPAGVAPAPVLMNQPPQIAPKRERKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGARTASTPTPPQAGGGLEPQANGETHQAAVVLRTDDRPQGAIIGGRPGPPGPEHSPSESQPSSPSPTPSPPPVLGPGSEPNLEVLSIPGDTVTTGTIQMSVDELTPMPREAGEPYRLSAEPTGLSEPILEVEVTLSKPVPDPEPSSSPLSPPSPLTSHEVEVPHEPNGVVPPEGLEPEVEPSPELAALPPPACPPEPPVPVAPTVQSEELLNGAPSPPPVDLSPVSEPEEQAEEATASVALPTVLAAAPAVAPPAPSPAQAEEMEEEEQEEEEAAEGEKGGEEPLPQENTPAPAHLSQNLEAAAAPQVAVSVPKRRRKMKELNKKETVGDLLDAFKEVNPAVPEVENQPPVDNSPGPEPEGSSVPPRSEEADETWDSKEDKIHNAENIQPGEQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFLFASMQKPEGLPQISDVVLDKANKTPLRPLDPTRLPGINCGPDFTPSFANLGRPALSARGPPRGGPGGELPRGPQAGLGPRRSQPGPRKEPRKIIATVLMTEDIKLNKAEKAWKPSSKRTAADKDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERLKGVIDLIFEKAISEPNFSVAYANMCRCLMALKVPTTEKPTMTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKDDDEVFEKKQKEMDEAATPEERGRLKEELEEARDIARRRSLGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIIKEKKTSSRIRFMLQDVLDLRRSNWVPRRGDQGPKTIDQIHKEAEMEEHREHIKVQQLMAKGSDKRRGRPPRPTHQPWSSTCG	2060126	2039844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2040417_2043103_2043245_2043361_2043444_2043804_2043940_2044042_2044142_2046209_2046292_2046645_2046772_2047051_2047225_2047327_2047447_2047584_2047815_2048040_2048144_2048381_2048485_2049104_2049206_2049401_2049563_2049680_2049786_2050286_2050524_2050739_2050887_2051543_2051742_2051924_2052114_2052277_2052437_2052555_2052690_2052784_2052972_2053064_2053154_2053434_2054254_2054534_2054602_2054790_2054884_2055658_2055772_2056835_2056936_2057168_2057343_2058440_2058528_2058829_2058924_2059147_2059205_2060025
875027	contig_294_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_166744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTGAAGGTTTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130458	127827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_127800_130500
875028	contig_6873_pilon	+	3106	1	Intergenic	novelGene_129824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACCAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445083	448189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_445100_448200
875029	contig_15152_pilon	+	4601	1	Intergenic	novelGene_126955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCCAGCTATCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81364	85965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_81400_86000
875030	contig_12050_pilon	-	2663	5	Intergenic	novelGene_62603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	127.865163355779	36	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	111	848	313276	310744	FALSE	40	AAAGAAGGCTTATTTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEEKERHKVEALARKFEEKYGGKKRRKDRIQDLIDMGYGYDESDSFIDNSEAYDELVPASLTTKYGGFYINSGTLQFRQASESEDDFIKEKKKKSPKKRKVKEGGEKMRKKKKDDTQDKEKRSRKSKFPKAGFTALNASKEKKKKKYSGALSVKEMLKKFHKEKEAQKRRDEEHKPVAVSSAEAQSLRALESASDPLLSLFGSTSDNDLLQAATAMGSLTDLDLERLLSESPEGSPFHDMDDESASLGLGSDPEFRQPSSLPEGLPTPLEKRIKELAQVW	313879	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_311192_311928_312033_312739_312875_313225_313322_313814
875031	contig_18081_pilon	-	3285	1	Intergenic	novelGene_23854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTCAGACTCACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478080	474795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_474800_478100
875032	contig_11294_pilon	+	2115	9	Intergenic	novelGene_50039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_5	5.13413819447821	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	379	1575	134228	169951	FALSE	15	GGATATGTTGCACTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGNLDQQDGTSQKVAVKTMKLDNFSQREIEEFLSEAACMKDFSHQNVIRLLGVCIEVSSQGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLDTGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRADPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPHVQDKADVIYINTQLLGSCEGQAEGPAFAQLDMDINPDSVIASCTPSCAVNMVTAEVHENKPHEGRYILNAGSEEWEDLASATPATVTSGKDCVLPEDRLVRNGVTWSHSSTLFMGSTSPDELLFADTSLEDQEVLM	131410	170491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_131676_133444_133541_134210_134292_137745_137839_139139_139259_157417_157528_159704_159865_161917_162055_169437
875033	contig_6842_pilon	+	912	8	Intergenic	novelGene_130754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_1	319.439560250544	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	60	704	1306076	1377191	FALSE	25	TAATGAGCATGGAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAHSASEEVRELVGKTGFSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMEPDQVYEGITFEDFLKIWQGIDIETKMHVRFLNMETMALCH	1306016	1377399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306134_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1374425_1374474_1377113
875034	contig_9571_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_136276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGAGAGATGGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432110	429656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_429700_432100
875035	contig_3789_pilon	-	2355	2	Intergenic	novelGene_79887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	102	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATAAAAGAGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578904	576323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_577552_577777
875036	contig_10054_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_171209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCACCTCTTAACCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68235	70046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_+_68200_70000
875037	contig_3476_pilon	-	2263	6	Intergenic	novelGene_134101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	386	junction_5	52.7924236988604	1435	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	380	844	87600	72084	FALSE	45	CAGAAAATCATCTCAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTEQMQPLELSEDRLDKLDPRCSHLDDLSDQFIKDCDLKKKPRKGKNVQTTLNVESDQKKPRRKDTPALHIPPFIPGVLSEHLIRRYDVQERQPKNKMSPALHNTDLEQKKPRRKDTPALHMPPFAAGVRLLRDERPKVIMEDDEKDGDKIAI	115146	70664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3476_pilon_-_72164_81719_81873_83403_83557_87521_87640_94131_94378_115052
875038	contig_6735_pilon	-	2321	2	Intergenic	novelGene_15810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAATAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566507	557544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_559059_565700
875039	contig_15991_pilon	+	2614	1	Intergenic	novelGene_70934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCACAGCGACACTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111043	113657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_111000_113700
875040	contig_7022_pilon	-	3780	14	Intergenic	novelGene_142161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_12	30.4879450422525	112	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1118	3357	217	3573	360986	302890	FALSE	55	CAGAATCAAAAAGATTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQDILSNISLNGKADAALIGKVSSHLVLRSLGSYLYLKLTLDLFQRGHLVIKSASYKVVPVSLSELYLLQCNMKFMTQSSFERALPILNVALASLHPMTDEQIFQAINAGHIQGEQGWEDFQQRMDALSCFLIKRRDRTRMFCHPSFREWLVWRADGENTAFLCEPRNGHALLAFMFSRQEGKLNRQQTMELGHHILKAHIFKGLSKKTGISSSHLQALWIGYSTEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYRTEVLNNAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGMSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLAKKGARVDHLDKKGQCALVHSALRGHSDILRYLLTCEWSEGPQQPGTLRKSQALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEIEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLEHGAVVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQIVRLLLECGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACLKGHRTVVQYLVEEGASIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTSVVVTLLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKMKEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGMAEEFASKALELKPKSYEAYYARARAKRNSRQFVAALADLREAVKLCPTNQEIRRLLARVEEECKQLQRSQQLKQQCPPPAPPNDSDNEEDASAPGLNDHFHLEEAKEEETSPQEESTSLTPRPQPSSSVPSPYIRTLQEGLQSKVRPTSPQNRPAISKPLREPVAQPGLIMQPTKQAQIVKTNQHLGSGQSGIRNGSTKIQVPSQNPPPSPMPGRIPATPAGNKTQHLEGTSTFTVGASSGPFGDRLGPGHNVQLQRNESGTAYPLPSKIKTAERLLSHASVAVDVAPPNQGGPASCSDMRHPASLASSGSSGSPSSSIKMSSSTSSLTSSSSFSDGFKVQGPDTRIKDKVVSQVQSGTGEHRPRNTPFMGIMDKTARFQQQSNPPNRTWHCQVAEGLLTNTSSAAGLQSTNSEKLSRKQVGGYNKAKICSASTVGGSVHNGAQVKELEEKKCQIPVHCQDSRVTKTVSHLYQESISKQQPPISSEAHRSHLTSAKPKRSFIESNV	361202	302682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_304322_304791_304893_305829_305977_307711_307804_309508_309642_311295_311472_311775_311900_313690_313825_339568_339648_341845_342032_345732_345970_353903_354027_355483_355593_360702
875041	contig_10594_pilon	-	2761	1	Intergenic	novelGene_142316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGGTAATTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248073	245312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_245300_248100
875042	contig_1264_pilon	+	2730	1	Intergenic	novelGene_161323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145468	148198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_145500_148200
875043	contig_6710_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_97124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATACACAGTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
875044	contig_14807_pilon	-	2986	16	Intergenic	novelGene_124720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	376.229268162675	12	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1009	1851	55483	47595	TRUE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTKPSKVKAFGPGLQGGNAGSPARFTIDTKGAGTGGLGLTVEGPCEAQLECLDNGDGTCSVSYVPTEPGDYNINILFADTHIPGSPFKAHVVPCFDASKVKCSGPGLERATAGEVGQFHVDCSSAGSAELTIEICSEAGLPAEVYIQDHGDGTHTITYIPLCPGAYTVTIKYGGQPVPNFPSKLQVEPAVDTSGVQCYGPGVEGQGVFREATTEFSVDARALTQTGGPHVKARVANPSGNLTETYVQDCGDGTYKVEYTPYEEGLHSVDVTYDGSPVPSSPFQVPVTEGCDPSRVRVHGPGIQSGTTNKPNKFTVETRGAGTGGLGLAVEGPSEAKMSCMDNKDGSCSVEYVPYEAGTYSLNVTYGGHQVPGSPFKVPVHDVTDASKVKCSGPGLSPGVVRANLPQSFQVDTSKAGVAPLQVKVQGPKGLVEPVDVVDNADGTQTVNYVPSREGPYSISVLYGDEEVPRSPFKVKVLPTHDASKVKASGPGLNTTGVPASLPVEFTIDAKDAGEGLLAVQITDPEGKAKKTHIQDNQDGTYTVAYVPDVTGRYTILIKYGGDEIPFSPYRVRAVPTGDASKCTVTGAGIGPTIQIGEETVITVDTASLFLVFRSQG	56915	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45623_45932_46137_46219_46439_46550_46728_47474_47608_48158_48182_51657_51717_53836_54027_54398_54556_54644_54769_55120_55292_55377_55539_55619_55783_55863_56038_56121_56720_56897
875045	contig_8843_pilon	+	2257	1	Intergenic	novelGene_156663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATCTTAGAGTCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122607	124864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_122600_124900
875046	contig_10642_pilon	+	3313	1	Intergenic	novelGene_78648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAATCACTATTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102908	106221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_102900_106200
875047	contig_13740_pilon	-	1225	12	Intergenic	novelGene_34762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_1	218.197726692751	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	136	1218	873748	687607	FALSE	30	GGGTAAGTACATTTTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873883	687599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
875048	contig_14536_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_69323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278866	276273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_276300_278900
875049	scaffold_13505_pilon	-	2240	2	Intergenic	novelGene_111624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_1	0	103	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	160	372	732744	732532	TRUE	15	AGTATTGTCTGTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTSGQAWVAAGKRQGGVSFYLSVRGWGWTFVSRVEVRLQKEPKHRRPADSPWRMNFGTPLSASLGPAWLPFTPSTRSSSSGWLTLDPATSCSLWPLLRGYGAVEAVEAGQACIPGTGPTPRGP	732903	729978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_731746_732430
875050	contig_8122_pilon	+	3117	10	Intergenic	novelGene_40226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_2	208.785908421894	8	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	28	2229	533609	599685	FALSE	50	CAAACCCAGCACCCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKWDSRTSPTPGDFPKGLVARDNTDLIYSHPNASAEKARNVLAVETAPGELVGEQAASQPAPGHPNSINFSLKQWGTELKNSMSSFRSGRGHNDSRKSVFYTTEEWELIDPSPKDLEESMVQEERKKQTPEGSKGITGSGFPFDFGRIPYKGKRPLKDMIGSYKNRHSSGDPSAEGPSSGGSISKLSSEMQLQVQSQQEELERLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCDGVPKDTLELLHQKDDQILGLTSQLEKFNLEKENLQQEVRKLKSKVGEVNEQLGMLMETIQAKDEVIIKLSRQLSECEGNPSSPAALPGSPSTTLASRDQLELDRLNDNLQGYKTQNKFLNKEILELAALRRNAERREKDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEEQGPTRDVIAQLLEDALQVESPEQPEQAFIKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDLHTRKFKDSTEPGYFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHTHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVGLPSWGCFQIDTLGDPGQR	533581	600573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_533685_544121_544288_573639_573804_576937_577171_577889_578286_583377_583489_584468_584663_589124_589620_592243_592362_599436
875051	contig_16594_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_53884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCCAGCACCTAATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210393	208797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_208800_210400
875052	contig_1666_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_160583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCAGGGTCCTATAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687089	685724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_-_685700_687100
875053	contig_9673_pilon	+	1566	11	Intergenic	novelGene_119153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_10	635.506483051117	556	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	288	1217	59036	183902	FALSE	10	TTTGTGTGTGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGVDCGDGLRARQYVFLLPEYLKDASKKMKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEIDSKKYYKYSKEKTLKWLEKKVNQTIVALKTNKINVGARVQSAAFFPGDQASSDKEEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKKIKLSDEPVEAKEDYTKFNTKDLKTEKKNSKMTAAQKALAKVDKSGMKSIDSFFGAKNKKKDLKL	58748	184251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_181403_181485_183785
875054	contig_4114_pilon	-	3719	9	Intergenic	novelGene_15646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_4	84.062476765796	26	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1903	3177	592330	567115	FALSE	40	CAGGAAGTATTATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDHGDVSLPPEDRVRALSQMGSAVEVNEDIPPRRYFRSGVEIIRMASIYYEEGNIEHAFILYNKYITLFIEKLPKHRDYKSAVIPEKKETVKKLKEIAFPKAEELKAELLKRYTKEYTEYNEEKKKEAEEFARSMAIKQELEKEKQRVAQQKQQQLEQEQFHAFEEMIRNQELEKERLKIVQEFGKVDPGLGGPLVPDLEKPSLDVFPTTPPSSTQPSDCNTRVRPAKPPVVDRSLKPGTLSNSESIPTIDGLRHVVVPGRLCPQFLQLASANTARGVETCGILCGKLMRNEFTITHVLIPKQSAGSDYCNTENEEELFLIQDQQGLITLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQMMLPESIAIVCSPKFQETGFFKLTDHGLEEISSCRQKGFHPHSKDPPLFCSCSHVTVVDRAVTITDLR	594232	566572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_573450_575259_575385_579647_580015_580715_580812_581250_581327_592127
875055	contig_1910_pilon	-	2709	3	Intergenic	novelGene_168281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43	34	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	21	335	81525	56810	TRUE	45	CACCAAAGAACCGAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLKAAMIELVERLKFKSSDPKVTRDQMKVFIQQEFKKVQKVIADEEQKALHLVDIQEAMATAHVTEILADIQSHMDRLMTQMAQAKEQLDTSNESAEPKAEVKENAHNY	81545	53987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1910_pilon_-_55752_56199_57077_81477
875056	contig_12644_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_44493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACAGTACAACTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028647	1031091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1028600_1031100
875057	contig_5021_pilon	+	3946	5	Intergenic	novelGene_167104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	30.7936681803256	56	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	377	2029	404191	462816	FALSE	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLKSGKRASWQQEPRAGFKLCSTYGCGGEMTCAHNPGQLINWFVCSLCVPRVCKLWSSRRPRTRRNLLLGTACAIYLGFLVSQVGRASPQHGRTPEKGQHQRRDAAEAPFPEIPLDGTLAPPESQGNGTTLQANVVYITLRSKRSKPANIRGTVKPKRRQKHAVASRAPGQEALAGPSLQPQEVAKVAGAEAPGYAWGGNLAKDGERPWRLVWGPGVRAGGQDFQLPKTRESNIRIYSESAPSWLSKEDIRRMRLLADSAVVDLRRVSSNSGARLLVLGKSPAGSVPRCGPSPCGLLKQPLDMSEVFAFHLDRILGLNRTLPSVSRTSEFIQDGRPCPIILWDSSLSPTNNETHSSLKLTWGTYQQLLKQKCWQNGRVPKPEWGCTEIHHHEWSKMALFDFLLQIYNRLDTNCCGFRPRKEDACVQSGRRPKCHDQDSVALAHIVQRQHDPRHLVFVDNKGFFDRSEDNLNFKLLEGIKEFPESAVSVLKSQHLRQKLLQSLFLDRVYWESQGGRQGIERLIDVIEQRANILLTYINAHGAKVLPMNE	403115	464733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_403347_404045_405194_432438_432654_458829_459057_462608
875058	contig_16775_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_107797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATGGTTAAAGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198784	199422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_198800_199400
875059	contig_7345_pilon	-	4745	6	Intergenic	novelGene_159180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_5	17.1160743162677	498	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	9	701	209857	178189	FALSE	35	CATTGCTTTCATTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAMGSVLSSDSGKSAPASATRRGLERRGSPALPVTSFDCSVCLEVLHQPVRTRCGHVFCRSCIATSLKNNKWTCPYCRAYLPSEGVPATDVAKRMKSEYRNCTECDTLVCLSEMRAHIRTCQKYIDNYGPLRELGETRCVCPFCERELDEDSLLDHCITHHRSERRPVFCPLCRLIPNENASSFNGSLIRHLQVSHTLFYDDFIDFNIIEEALIRRVLDQSLLEYVNHSNTT	209865	174144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_178276_180259_180368_182944_183036_185505_185595_189178_189333_209693
875060	contig_8464_pilon	-	3086	2	Intergenic	novelGene_125389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTCTCTGCTCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853609	848315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_848460_850667
875061	contig_3818_pilon	+	2176	9	Intergenic	novelGene_99203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	23.9866499328272	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	86	1057	104065	131596	TRUE	15	CTTCTGACTCGATATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLGSGQGPRQVGAGQTFEYLKREHSLSKPYQGVGTGSSSLWNLMGNAMVMTQYIRLTPDMQSKQGALWNRVPCFLRDWELQVHFRIHGQGKKNLHGDGLAIWYTKERMQPGPVFGNMDKFVGLGVFVDTYPNEEKQQERVFPYISAMVNNGSLSYDHERDGRPTELGGCTAIVRNLHYDTFLVIRYVKRHLTIMMDIDGKHEWRDCIEVPGVRLPRGYYFGTSSITGDLSDNHDVISLKLFELTVERTPEEEKLHRDVFLPSVDNMRPPEMTAPLPPLSGLALFLIVFFSLVFSVFAVVIGIILYNKWQEQSRKRFY	103979	133100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_104177_105296_105416_109008_109127_109882_109966_125832_125995_126082_126198_131001_131122_131453_132366_132750
875062	contig_14441_pilon	+	1781	4	Intergenic	novelGene_100363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	69.2066149696368	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	510	1016	26678	27290	FALSE	65	AAAAAACAAGGAATAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTVLHVSCSWNTNASWPRSGNRWDMRLAGSNGNPT	23053	28055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_25816_25950_26652_26781_26886
875063	contig_12427_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_40435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGCTTCAGCTCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236198	237249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_236200_237200
875064	contig_5758_pilon	-	3531	2	Intergenic	novelGene_119104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	0	360	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2389	2760	241710	241339	FALSE	25	TAAAAACTTTTTTGTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWWGGISAQESGWFKPSTTLKVGSGFWSEEALLPPHFLMLHTSLAMGMCSFLLPCQGDSGVNQGKLFGPVNNGTVSVSPEWGLVRKRSGSVQLWSPHEHAWQVALRKNTKSGSSMWQLCIGR	245765	240567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_244034_245700
875065	contig_7308_pilon	+	2102	2	Intergenic	novelGene_159593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATACAAACATCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268864	271004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_269379_269416
875066	contig_11615_pilon	+	3445	1	Intergenic	novelGene_151260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCCTTTCATTAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55289	58734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_55300_58700
875067	contig_6673_pilon	-	1828	6	Intergenic	novelGene_164001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	61.1247903881887	298	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	499	921	11168	5486	FALSE	60	CAAGCTTTACAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVSYQVDERTCIQFAMKLFYFLLSALALIVCVLAVAFAAHHYSQLTQFTCETSLNSCQCKLPSSEPLSRTFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLLIQMILNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGIRMCSLTTSEGQQQKA	160361	4578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_5852_11111_11199_11975_12068_56429_56515_68208_68318_160179
875068	contig_17074_pilon	+	2177	2	Intergenic	novelGene_145200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCAGCACACTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657113	660290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_657530_658529
875069	contig_678_pilon	+	3564	1	Intergenic	novelGene_167836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCATAGCAGATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406334	409898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_406300_409900
875070	contig_10235_pilon	-	1950	9	Intergenic	novelGene_46541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_8	25.6487694636604	378	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	60	938	417693	414415	TRUE	20	GGTCTTTGCAGACATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARALPEIVGLRLPPPSGVTMLVIPPGLSEEEEALQKKFNKLKKKKKALLALKKQSSSSTANQGGVKRSLSEQPVVDTATATEQAKQLVKSGAISAIKAETKNSGFKRSRTLEGKLKDPEKGPVPTFQPFQRSISADDDIQESSRRPQRKSLYESFVSSSDRLRELGPDGEESEGPGAGDGPPRSFDWGYEERGSARSSASPPRSHSRDRSRERNRDRDRERERDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDRERDRDRDRDREGPFRRSDSFPERRAPRKGNTLYVYGEDMTPTLLRGAFSPFGNIIDLSMDPPRK	418175	412040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_412521_413882_414564_414689_415016_415194_415233_415339_415415_415912_416059_416159_416230_417618_417702_418124
875072	contig_854_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_36184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACCCTGAGGCTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479423	481969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_479400_482000
875073	contig_14341_pilon	-	2521	1	Intergenic	novelGene_111793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385056	382535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_382500_385100
875075	contig_10176_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_72711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACTTTGCCCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251416	254180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_251400_254200
875076	contig_16724_pilon	-	6583	8	Intergenic	novelGene_105285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	769.861583106247	124	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	311	967	569099	541872	TRUE	35	TATTCAACAAGCACCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575965	521920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_527535_541869_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
875077	contig_7157_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_131296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATGAAAATAAATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898568	895975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_896000_898600
875078	contig_5041_pilon	+	1451	1	Intergenic	novelGene_27099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGCAGACTAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574475	575926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_574500_575900
875079	contig_13780_pilon	+	3069	1	Intergenic	novelGene_149095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAGAATTCATAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702364	705433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_702400_705400
875080	contig_17194_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_155360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78655	77435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_77400_78700
875081	contig_1863_pilon	-	1961	1	Intergenic	novelGene_156527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGGTTCCACTCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60178	58217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_58200_60200
875082	contig_8269_pilon	-	4126	1	Intergenic	novelGene_106232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2875	3180	297902	297597	NA	75	TGGGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSTLGGRHRKRSKLGRGDSKFPLELAGLEVPTRYQRRGVMSWQLDVWSSWMSRSEAPEWKGLCGEEKGREPGTGTWEIPISKDTWGEELAKLAGKEPPS	300776	296650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_296600_300800
875083	contig_1262_pilon	-	4517	1	Intergenic	novelGene_133556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTCATCACCCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290108	285591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_285600_290100
875084	contig_14202_pilon	+	4172	1	Intergenic	novelGene_157142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGATTAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105891	110063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_105900_110100
875085	contig_2917_pilon	+	1857	11	Intergenic	novelGene_147603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	179.770103187377	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	61	1857	196969	242669	FALSE	45	GTAAGTGAAAATTTAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPGPPPQTWSAAAAASLSKMKVTLSALDTYETSFTPLVVIELAQDVKEETKEWLKNRIIAKKKDGGAQLLFRPLLNKYEKETLENQNLYLVGASNIRLLLGAEALGLVKECNDNTMRAFTYGSRQNFKGFDDNNDDFLTMAECQFIIKHELENLRARDEKMIPGYPQAKLYPGKSLLRRLITSGVVIQVFPLHDNEALKKLEDTWYTRLTLKYQPIDNIRGYFGETIALYFGFLEYFTFALIPMAVIGLPYYVFVWEDYDKYVIFASFNLIWSTVILEVWKRGCATMTYRWGTLVMKRHFEEPRPGFHGVLGINPVTGREEPLYPSYKRQMRIYLVSLPFVCLCLYFSLYVMMIYFDMEDWALGLHENSESEWTSVLLYVPSIIYAIVIEIMNRLYRYAAEFLTSWENHRLESAYQNHLILKVLVFNFLNCFASLFYIAFVLRDMKLLRQSLATLLITSQILNQIVESFLPYWLQKKHGVQVKRKLQALKADIDATLYEQVILEKEMGTYLGTFDDYLELFLQFGYVSLFSCVYPLAAAFAVLNNFTEVNSDALKMCRVFKRPFSEPSANIGVWQLAFETMSVISVVTNCALIGMSPQVNALFPDSKADLILIVVAVE	176234	242669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_176281_196954_197108_203222_203421_205017_205153_216137_216258_218511_219082_220662_220719_228801_228877_229375_229559_237414_237607_242540
875086	contig_12479_pilon	-	2703	1	Intergenic	novelGene_56897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612950	610247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_610200_613000
875087	contig_5253_pilon	+	3362	1	Intergenic	novelGene_61548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112857	116219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_112900_116200
875088	contig_6608_pilon	+	2898	22	Intergenic	novelGene_162539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.8407302651172	69	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	1103	2500	236038	244895	FALSE	15	CTTTTGGTTCTCTTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQMTKDVTRAMNEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHIRPPMSKAFSHTIAVMNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEKISANITKFNIHGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQYDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFTVGADTALNTICMTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEDPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWISGKIKESYRNGRVFANSPDSGCVLGMRKRALVFQPVTELQDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHISQKRSGETPV	218810	245293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_218893_222010_222102_230156_230231_231091_231170_232619_232810_233291_233458_234171_234217_234626_234905_235158_235248_236028_236155_237310_237376_237858_237923_238859_239010_239456_239528_239882_239971_240056_240210_240703_240869_242279_242342_242582_242695_244222_244323_244402_244509_244750
875089	contig_5799_pilon	-	4237	3	Intergenic	novelGene_50250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	107.5	132	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1030	1344	179948	179634	FALSE	30	TCCCAGCATTTCATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIQFSVLCPNALEFLTFQSVRSFEIMMEAMSHFSKKHPHTQTLTCIFRAFPDPVKLIHAPRSRMLASEGDLTMIPPLLSFPVNMIIKKRTPPGQKQVTVRGC	242569	176740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_180720_191025_191159_242444
875091	contig_5482_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_144460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318879	320254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_318900_320300
875092	contig_9909_pilon	+	3258	1	Intergenic	novelGene_42466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTAATTTTGGTATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548015	551273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_548000_551300
875093	contig_15371_pilon	-	3471	2	Intergenic	novelGene_151460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTTCCCTCTACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189340	180479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_181081_186470
875094	contig_13542_pilon	+	2166	13	Intergenic	novelGene_131469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	25.4856986039883	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	122	1726	56319	158102	FALSE	30	CTCATTTAATATTTACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWERPSQRLPQQQPQAAEPATEGNPSLPTGRELAEANRFAYAALCGISLSQLFPEPEHSSFCTEFVMGLVKWLELSETVLPTMTAFASGLGGEGADVFVQILLKDPILKNDPLVITQDLLTFSLKDGRYDARARVLICHVTSLLQVSLEQLDILEETFLESLKETKEEESETAEASQKKKENLRKWKRYLLIGLATVGGGTVIGVTGGLAAPLVAMGAATIIGSAGAAALGSVAGIAVMTSLFGAAGAGLTGYKMKKRVGAIEEFTFLPLTEGRQLHITITITGWLASGKYRTFIAPWAALARSREQYCLAWEAKYLMELGNALETILSGLATMVAQEALKYTVLSGIVAALTLPASLLAVANVIDNPWGVCLHRSAEVGKHLAHILLSRQQGRRPVTLIGFSLGARVIYFCLQEMAQEKDCQGIIEDVVLLGAPVEGEAKHWEAFRKVVSGRIINGYCRRAPMSAATSWAPTHWAAPTVPARPRGPAQDWTDPRTATELSSQSSLCSPLAPPSAPQMSSEGTEFPEVPFLR	55458	158542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_55572_56310_56501_69679_69855_70687_70716_87829_87963_97444_97543_98788_98933_99790_99911_106490_106656_107573_107711_111055_111141_137725_137844_157882
875095	contig_19377_pilon	+	1675	4	Intergenic	novelGene_174102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.7082522694727	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	178	450	4708	4980	TRUE	65	TAATAAAATAAAATTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVCSNPEFFSYGVEAYEACKKRTLARDIIDEQKKVQEADLVIFQFPLYWFSVPAILKGWMDRVLCQGFAFDIPGFYDSGFLKVCALAPGLLWAKVCMHVCARAYVCMYVCVCVRVCVCACVCMYVVHMCTRVCACVCECMVCVRVCVSL	2409	8277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19377_pilon_+_2542_4662_5165_5207_5997_8025
875096	contig_16870_pilon	-	3527	14	Intergenic	novelGene_155528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	15.2827396162309	119	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	1636	2610	246599	236869	FALSE	20	AGCACCTGGGGAGATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAGLARLHGLFATYKPPGLKWKHLRDTVEMQLLKGLNAGKPPAPEQRVRFLLGPMEGSEEKELTLTATSVPTLTKHPLVCGPEFTSLKVGVGHRLDAKASGVLVLGVGRGRRLLTDMYNAHLTKDYTVRGLLGRATDDFCEDGRLVEKTTYDHVTREKLDRILAVIQGSHQKALVMYSSVDLKTQEAYEMAVRGLIRPMNKSPMLISSIRCLHFAPPEFLLEVQCMHETQKQLRKLVHEIGLELKTTAVCSQVRRTRDGFFMLDDALLRTQWDLHSIQDAIQAAAPRVVAELEKSLRPVLGTQQLADPGQPGTPQGQTPPGG	261916	235951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_237174_237973_238111_239745_239819_241762_241845_243124_243187_244337_244413_245950_246083_246490_247083_247170_247303_251279_251373_251885_251996_259952_260079_260707_260807_261324
875097	contig_6546_pilon	+	511	4	Intergenic	novelGene_140979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	5169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	125	469	597703	599657	FALSE	15	GCTGTTGATTTTACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597578	599699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
875098	contig_5947_pilon	-	4072	1	Intergenic	novelGene_101595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1195	1635	897688	897248	NA	30	AGGTAGCCCTCCAAAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPHRNPRPCWLVPRCSHRPISTAGDRGSGACLLRVHTGQCKQLPGQESKPTAGFITVSLQLLVVLALVSLLSWESRAQESCQTKLWPQGGEQGLEPPQASCQELVYPYMQVQPKWLKYVAEATAPSLCWDPPTSPRSRNQTVDT	898882	894810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_894800_898900
875099	contig_9696_pilon	-	3064	1	Intergenic	novelGene_68791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251380	248316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_248300_251400
875100	contig_15277_pilon	-	3031	1	Intergenic	novelGene_175425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAGCAACGCAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243029	239998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_-_240000_243000
875101	contig_7322_pilon	+	1481	2	Intergenic	novelGene_164909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGAACTCTGCATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188639	191245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_189054_190178
875102	contig_15114_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_121248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAGGAAAGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1757986	1757281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1757300_1758000
875103	contig_2403_pilon	+	3185	1	Intergenic	novelGene_71003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCCTCTGTGCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115809	118994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_115800_119000
875104	contig_2093_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_152993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTTCTTGAAATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392618	1390523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1390500_1392600
875105	contig_6740_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_142708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAAAAAAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675060	672358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_672400_675100
875106	contig_15236_pilon	-	2683	2	Intergenic	novelGene_141658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAGTAAAAAATAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718768	715814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_717706_717976
875107	contig_2854_pilon	+	2822	5	Intergenic	novelGene_120899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_2	35.2446804496792	58	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	22	468	1243579	1302768	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHIGDYNMDGYPDALAILRNTSGSNQQAFLLENVPCNNASCEGAHRMFKVYWDLSNLNQIRDAVVATFFDIYEDGILDIVVLSKGYTKNDFAIHTLKNNFEADAYFVKVIVLSGLCSNDCPRKITPFGVNQPGPYIMYTTVDANGYLKNGSGKTG	1243557	1305122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1243629_1271864_1272016_1273925_1274035_1290716_1290761_1302675
875108	contig_6434_pilon	-	3576	1	Intergenic	novelGene_61838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTCTGATAATGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713489	709913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_709900_713500
875109	contig_1918_pilon	+	669	5	Intergenic	novelGene_168324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.48746859276655	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	99	668	9498	36685	FALSE	35	AACCTTGGTAAGTAAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPARLPTLFQTGAGSGAESGCLLGLGDWSRQMERGRRTQRRMHAIAKTPRKKDGESVWQSCLALSQFPAEEGQFLMPGLISGSGWQLQKKQGGFHSRGESNEAFGQEGEATRFNPGDLAFCIVLTQPSAYQKGPQCIYLWSQSTAAEDFQPEKGVGKECFQPLRTWDDAPSRSMPIYLNQQSQSSFLLPPNYRVPGSGTMWPLAGLVKTQVQSWLHHSIAA	8467	36686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_8544_9475_9641_11157_11244_14102_14367_36608
875110	contig_4315_pilon	+	1279	2	Intergenic	novelGene_46834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	116	436	504305	628664	FALSE	30	AAGTCTCTCTGAAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCAESTEFTNTLSTPCTLFLLFLTPRISIDAFAAINEPMLTHYYETLWGSSAQSHVVTVRQNQLNGTQRKRKSPRHVISSLFLPSEVLMVGLTWWVGIQSVPMLYVSVQLCRSFCICKVPVVCSLPPYGDQIPYVKCSLSFFFF	504189	629507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_504323_628361
875111	contig_12644_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_44454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	362	859	364032	364529	NA	20	TCCCAGGGAGGCAGCGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSKQGKHGLTCAYSVNNFTTDDLVSLLAHPALCGALSSCSPPWRQGDGLNDSTGELSGWCGCFVLFGLFSPPGQSPAEGTTLPCLAVPKKQRAFPPLGLGFLVISATSRSQPCLSHLIFDLAPDSAASPGRKCRNSGDSRDPTTQTVNSHLGGSEKPQGFPRAA	363670	366074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_363700_366100
875112	contig_8879_pilon	+	3541	1	Intergenic	novelGene_158997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	845	2538	17	2554	414682	417219	NA	20	GGGCCATGAACATTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGVVLMAIPVFGISSCSFDRGIALYRFCNLTTVPQVPNSTERLLLSFNYIRTVTSTSFPFLEQLQLLELGTQFTPFTIDKEAFRNLPNLRILDLGKSQIHFLHPDAFQGLPHLFELRLFFCGLSDAVVKDGYFRNLESLTRLDLSKNRIRSLHLHPSFRELNSLKSIDFSFNQISVVCEDELKPLQGKTLSFFSLATNNLYSRVSVDWGKCMNPFRNISLETLDVSDNGWTVDITENFSNAISGSQIFSLVLDHHIMGSGFGFHNIKNPDQNTFAGLARSSLVRLDLSHGFIFSLNFRLFETLKELKLLNLAHNKINKIVEGAFYGLDSLQVLNLSYNLLGELYNSNFNGLPKVRYIDLQNNHIGIIQDQTFKLLENLYTLDLRDNALKTIYFIPSIPNIFLGGNKLVTLPNINLTSDFIQLSENRLENLADLYFLLQVPHLQILILNQNRLSSCSQRHTPAQNLSLEQLFLGENMLQLAWETGFCWDIFKGLSHLQVLFLNSNYLNFLPPGVFSDLIALRELYLGSNRLMVLSPGDLPANLKILDVSRNQLLSPDPSLFASLSAVDITNNNFFCECELSAFINWLNQTNVTLLGSPKDIYCMLPEAVSGVSLYSVSMEGCDEEEALQSLKFSLFVFFTVMLMLFLMTVLIVTKFRGFCFLCYKRAQRLVFKDHRQGLEADTYKYDAYLCFSSKDFEWVQNALLKCLDVQYSDQNRFSLCFEERDFVPGENHIINIQDAIWSSRKIVCLVSRHFLQDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSVLIMVVVGSLSQYQLMKHQPIRGFMQNRQYLRWPEDLQDVDWFLNKLSQQILKKEKEKKRDNSVALQTVTTNS	414665	418206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_414700_418200
875113	contig_8476_pilon	-	2495	1	Intergenic	novelGene_121337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAATGAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123717	121222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_121200_123700
875114	contig_7549_pilon	+	2086	4	Intergenic	novelGene_164524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_3	85.7321409974112	186	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	153	1019	692328	702012	TRUE	50	CCAACAAATGCAGAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLENDGAPSESIFDLDYASWKIRLTLGIAGFFFYLGVFVVCHQLSSSLTGTYRALAAKEKVFWNLAATRAVFGVQSTVAGLWALLVDPVLHADKAVNQQNWCWFNVATATGFFFFENVAVHLSNLFFRTFDLFLAVHHLFAFLGFLGSAINLKAGHYLAMTTLLLEMSTPFTCVSWMLLKAGWSDSLFWKLNQWLMIHMFHCRMILTYHMWWVCFWHWDGLINSLYLPHFILFLVGLALLTLIINPYWTHKKTQQLLNPVDWNFAQPEAKSCQPERTNGQIPQKKKQ	679700	766218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_679727_692201_692871_701688_702110_765248
875115	contig_11846_pilon	-	5215	1	Intergenic	novelGene_106014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAGAAAAAGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508685	503470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_503500_508700
875116	contig_10706_pilon	+	3674	1	Intergenic	novelGene_175160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTACTCAGCGCGACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8559	12233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10706_pilon_+_8600_12200
875117	contig_266_pilon	-	3053	1	Intergenic	novelGene_166309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGTAAGAAAAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726407	723354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_723400_726400
875118	contig_15360_pilon	-	3038	1	Intergenic	novelGene_171263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211305	208267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_-_208300_211300
875119	contig_15384_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_85119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCAGACGTCTCGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74521	72221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_72200_74500
875120	contig_6674_pilon	-	4026	1	Intergenic	novelGene_147990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGGAACTAGAATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91980	87954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_88000_92000
875121	contig_7629_pilon	+	1570	1	Intergenic	novelGene_153564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACAAATATGGGAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247890	249460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_247900_249500
875122	contig_7165_pilon	+	1365	2	Intergenic	novelGene_116841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTCCCAGAAGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268927	277587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_269223_276517
875123	contig_5551_pilon	-	2797	1	Intergenic	novelGene_134238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAACAGATTAAGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401608	398811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_398800_401600
875124	contig_3394_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_152690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCACTTGTGTTCAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456870	459331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_456900_459300
875125	contig_3866_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_112375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTCTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100989	98855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_98900_101000
875126	contig_3270_pilon	-	3241	14	Intergenic	novelGene_104449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_13	77.5394535956072	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	217	1326	68067	57151	TRUE	15	CTTAACGCCTTGCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRKMLKLKSLLRLHTVCRQLHGLAAGRTLVQQRHVSSSGYPAWMAPLHTRPWQTDALIRAALSQRRPLVTKKEGRPWKSQLSLTKSKKEVEVWIGMTAEELARAMGKDLDCVHEALLNTDININSLEENPQLEEVCIKEVIKKAGMKLKWSKLKQDKVRANKDAVRRPQADPALLTPRSPVVTIMGHVDHGKTTVLDKLRKTQVAAMEAGGITQHIGAFLVSLPSGEKITFLDTPGHAAFSAMRARGAQVTDIVILVVAADDGVMKQTVESIQHARDAQVPIVLAINKCDKAEADPEKVKKELLAYDVVCEDYGGDVQAVHISALTGNNLMALAEATIALAEMLELKADATGPVEGTVIESFTDKGKG	78132	48811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_49013_50386_50528_53677_53843_54874_55016_55516_55770_56136_57280_60145_60286_62342_62520_63662_63824_64260_64433_67348_67461_67848_68088_70709_70822_78048
875127	contig_4783_pilon	+	2314	2	Intergenic	novelGene_108415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1164	1493	394972	395301	TRUE	30	TCCATTGCATTAAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHALTQFVFKAKRVVSKVTRNEELSPQCGRGEEDRERHSAVCRFTSAASKRRNTQSGSRMLSADFYRGPGPPTWFICIKFIILKEPRRSIGSMHPTVFCKSVYLPEQS	393808	396552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_395720_396149
875128	contig_5260_pilon	+	3235	1	Intergenic	novelGene_144416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTGGGAGCCGCGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512393	515628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_512400_515600
875129	contig_5523_pilon	-	2492	3	Intergenic	novelGene_169102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	190.5	126	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	253	1314	410975	409260	FALSE	55	ACCTGGAAAATACAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMMKLLIILIFSGLITGFRGNSSYSLPPKLLLVSFDGFRADYLQNYEFPHLQNFIKEGVLVEHVKNVFITKTFPNHYSIVTGLYEESHGIVANSMYDVITKKHFSDLNDKDPFWWNEAVPIWVTNQLQGNRSSAAAMWPGTDVLIHNTTPSYFMNYNSSVSFDERLNNITMWLSNSNPPVTFATLYWEEPDAGGHKYGPEDKENMRTVLKEVDDHIGDLVHKLKVLGLWENLNVIITSDHGMTQCSKERLINLDTCISHTSYTLIDVSPVAAILPKINRTEVYNKLKICNPHMNVYLKEDIPARFHYQHNDRIQPIILVADEGWTIVQNKTLRKCKYLFRIFLLYPRDKSQL	420841	408081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_409487_410140_411000_420613
875130	contig_6837_pilon	-	2983	6	Intergenic	novelGene_149834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	217	303	91182	91096	TRUE	20	GACTCAGGGTCCCACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFLFELQLRYSKVYKIFSVHLNESVHTYNPCNHSPDQDVEHFHHPRRFSPCLFRQYQSTSPKAKYYSDFYCRMLVLPVTELHLSGVTEHVLFVSGFFHPT	91398	86845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_87529_87632_87709_87813_87948_88070_88207_88367_88496_89572
875131	contig_3503_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_174464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTAGCCCTCACTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26388	27802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3503_pilon_+_26400_27800
875132	contig_5585_pilon	-	3290	12	Intergenic	novelGene_143074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_11	36.6515871822109	54	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	65	1399	497788	405328	FALSE	90	AAAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLSGHPTLPCNVLKFKSTTIMLDCGLDMTSTLNFLPLPLVQSPRLSNLPSWSLKDGNAFLDKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQVMK	497852	403436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_467045_467107_497723
875134	contig_9871_pilon	-	2976	1	Intergenic	novelGene_75712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACACAACACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582842	579866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_579900_582800
875135	contig_4783_pilon	-	3222	1	Intergenic	novelGene_108349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84081	80859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_80900_84100
875136	contig_8357_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_39767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACCTCCGTGGACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883670	884307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_883700_884300
875137	contig_13565_pilon	+	3171	2	Intergenic	novelGene_162395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	414	junction_1	0	95	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197207	200467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_199589_199677
875138	contig_12750_pilon	+	5217	21	Intergenic	novelGene_172632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_12	26.464882391577	79	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1185	3558	220	3777	146407	197325	FALSE	55	AATTTACATAAATAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLFGVICAHVGEAQRLLILEQLLDSIKHTKGARQQVVQLHVISSFSSFLKYVAGSKRSLCPEKIRRPALTLVMGALESPNPLLRCAAAEAWARLAQVMDGGAFTAGLAQVSFDKLKSARDVVTRTGHSLALGSLYRYIGGISSSQHLDSCVGILYTLSQDSTSPDMQTWALHSLSLIIDSAGPLYYVHVEPTLSLIIMLLLNVPPTHAEVHQSLGRCLNALITTLGPELQGNSTSVSTLRTSCLLGCAVMQDNPDCLVQTQAISCLQQLHMFAPRHVNLSSLVSCLCVNLCSPYLLLRRAVLACLRQLVQREAAEVSEHAILLAKDNREGLTPDANMREVGLEGALLTLLDKETDQKLCRDIKETLNHMLTSMAVGKLSFWLKLCKDVLAASADFTAITYVDTMQEEEGDKGDDASVLTTRNDEKFHPFTNPRWATRVFAAECVCRIINQCENADSAHFDIALAQEKKKRDSRNDFLVLHLADLIRMAFMAATDHSDQLRLSGLETLLVVIRRFATIPEPEFPGHVILEQYQANVGAALRPAFTSETPPDVTAKACQVCSAWIASGVVSDLNDLRRVHQLLVSSLTKIQAGKEALSHLYNESASTMEILAVLKAWAEVYIIAVERQKKYKQPLKTATCSEESGRNGSFSSDGLLDLVHTDLGTLSRLWLAALQDFALLTLPSEFASQLPVEGGAFYTAETGENAKLHYYNSWALILHATALWLTSTGFVVADPDEGASNLSRPVTPTSMCQGSSSGATVKSPEDVYTDRFHLILGISVEFLCSLRSDATMESITACLHALQALLDVPWPRSKIGSDQDLGIELLNVLHRVILTRESPSIQLASLEVVRQIICAAQEHVKEKRRSAEVDDGAAEKETLPEFGEGKDTGGLVPGKSLVFATLELCVCILVRQLPELNPKLTGSSGVKATKPQMLSEDGSRLVSAALVILSELPSVCSPEGSISILPTILYLTIGVLRETAVKLPGGQLSSTVAASLQALKGILSSPMARAEKSHTAWTDLLRSALTTILDCWDPVDGTHQELDEVSLLTAVTIFILSTSPEVTTIPCLQKRCIEKFKATLEMKDPVVQIKTYQLLLSIFQYPNPAISYPYIYSLASSILEKLQEIDERRPEDTTELQIFQEGIKVLEALVAVAEEKHRSQLVACLLPILISFLLDENTLGSATPIMRNLHDFALQNLMQIGPRYSSVFKSLMASSPALKARLEAAIKGNQESVKVKIPTPEHTKNPGNNSSIQLKTNFL	134452	198765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_134500_143295_143402_146340_146532_147772_147933_151175_151366_152507_152678_157494_157634_160202_160383_162683_162924_165606_165789_167273_167343_172518_172699_176363_176587_179437_179687_180867_180996_184700_184849_185715_185989_188332_188558_194003_194159_196451_196666_197017
875139	contig_16116_pilon	-	2025	5	Intergenic	novelGene_177882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	29.129023327259	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	92	1009	83281	64961	FALSE	35	TTCAACAATATCAGGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYTSRGSPLSPQSSIDSELSTSELEDDSISMGYKLQDLTDVQIMARLQEESLRQDYASTSASVSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQEYDRYSLEDEEEFDHLPPPQPRLPRCSPFQRGIPHSQTFSSIRECRRSPSSQYYPSNNYQQQQYYSPQAQTPDQQSNRSNGDKLRRSMPNLARMPSTTAVSSNVSSPVTVRNSQSFDSSLHGAGNGISRIQSCIPSPGQLQHRVHSVGHFPVSVRQPLKATAYVSPTVQGSSNMPLSNGLQLYSNTGIPTPNKPAASGIMGRSALPRPSLAINGSNLPRSKIAQPVRSFLQPPKPLSSLSTLRDGNWRDGCY	83372	63944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16116_pilon_-_65037_67371_67655_71558_71715_80785_81128_83220
875140	contig_1146_pilon	+	2076	1	Intergenic	novelGene_84839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGCCCTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920133	922209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_920100_922200
875141	contig_6677_pilon	+	2746	1	Intergenic	novelGene_114189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATCAACAAACAGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552542	555288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_552500_555300
875142	contig_5690_pilon	-	2857	1	Intergenic	novelGene_119668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1384	1707	141401	141078	NA	15	CAGGCACTGTGCGGGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPREPLVRQMERKCGREAGGHQEWIPQLRSLDAILYAVGSHQKVFSEGVDRIRLRLDYTIITWSVLENHLLPNFCKRYTHDLCVIRNVDNVQNNKHHDMPVAVCNY	142784	139927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_139900_142800
875143	contig_6544_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_142109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCACCAATACCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308542	310711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_308500_310700
875144	contig_7292_pilon	-	2186	3	Intergenic	novelGene_175370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	286	junction_1	4	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	36	443	266479	202229	FALSE	75	AAAGAAAAAAAAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEEQPPPPLANMADLEAVLADVSYLMAMEKSKATPAARASKKIVLPEPSIRSVMQKYLEERKEITFDKIFNQKIGFLLFKDFCLNEINEAVPQVKFYEEVRSNCFINVLISKAYLNCTLKNIMITNAILQIFRNSLEVISSTKYSM	266514	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_202447_241754_241832_266366
875145	contig_14142_pilon	+	1427	11	Intergenic	novelGene_120619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_9	213.734040339858	813	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	123	1106	617485	619797	FALSE	35	CAGGTTTGATTTTAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGFLQPGGALSLQKQMEHANQQTGFSDSSSLRPMHPQALHPAPGLLASPQLPVQMQPAGKSGFAATSQPGPRLPFIQHSQNPRFYHK	617167	620118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619167_619267_619348_619435_619532_619713
875146	contig_3382_pilon	-	1675	11	Intergenic	novelGene_124034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	323.511112637572	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	92	1087	344734	224870	TRUE	5	TTGCTTGTTGCATTTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLFLPPCAARGSSKASLSLEDPVLWSGGPMEDLGFLQRVESVPLVTVTLLVALVALLKWYSTSAFSQLEKLGIRHPKPSPFIGNLTFFHQGFWESQLELRRRYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIRQVLVENFSNFSNRMASSLESKPVAKSVLFLRDTRWEEVRGVLTPAFSPEKLSEVTPLISQACDLLLTHLERYADSGAPFDIQRCYCCYTTDLVAGVAFGTQLDSREAPEHPFVTHCRRFFEFCIPRPILVLILSFPSVMVPLARILPNRNLEELTGFFNNLIRNVAAVRSQQAAGERRTDFLQMILDARCSASSVGVDSFDIVRQVLPLGRLPTASSPATRAPSTVEAPCPWMR	344825	176659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_176945_181453_181617_224729_225047_229630_229762_231318_231468_234090_234180_254700_254818_272863_272961_306326_306380_309848_309943_344645
875147	contig_2215_pilon	-	2785	1	Intergenic	novelGene_163840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGCCACAAATATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117360	114575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_114600_117400
875148	contig_7327_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_172129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCACCATTTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226885	224643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_224600_226900
875149	contig_5482_pilon	+	3873	2	Intergenic	novelGene_144488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAAGGAGGTTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504084	512015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_507886_511943
875150	contig_12761_pilon	-	3311	1	Intergenic	novelGene_164056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAATAAAAACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227453	224142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_224100_227500
875151	contig_18822_pilon	+	2004	1	Intergenic	novelGene_111718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTTGTATTTACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127828	129832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_+_127800_129800
875152	contig_3233_pilon	+	2861	1	Intergenic	novelGene_56497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	613	1134	35140	35661	NA	30	ACACAGCGGTCTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTPHLCKQGVCPFAVLFSPVFTSWSADFSSQSHRITPADRVLDRVLNAPQRQKAAQVISGKEGRICWPVPGIPHGAVLRKSFFLRWLKSTWLNFSSGLLRLLGRRKNKLITVGQTPVSLRKQTGDRNLEIASASVTGFSLRQLGLGPNSAGPISEEKLLKLLSVPKKARKAH	34527	37388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_34500_37400
875153	contig_16930_pilon	+	4198	1	Intergenic	novelGene_139139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCATGAAAAAGAAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22379	26577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_22400_26600
875154	contig_12327_pilon	-	1132	2	Intergenic	novelGene_140696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAAGAAGAAGTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148735	1147475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1147629_1147756
875155	contig_16917_pilon	+	2728	7	Intergenic	novelGene_161920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_3	46.1952378498044	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2421	307	2727	22585	96891	FALSE	40	CCCGCCAAGAATACCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLKRSQTERPVATERASVVGTDGTPKVHSDDFYMRRFRSQNGSLGSSVMAPVGPPRSEGPHHITSTPGVPKMGVRARIADWPPRKENVKESSRSSQEIETSSCLESMSSKSSPVSQGSSVSLNSNDSAMLKSIQNTLKNKTRPSENMDSRFLMPEAYPSSPRKALRRIRQRSNSDITISELDVDSFDECISPTYKTGPSLHREYGSTSSIDKQGTSGESFFDLLKGYKDDKSDRGPTPTKLSDFLIAGGGKGSGFSLDVIDGPISQRENLRLFKEREKPLKRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFDLNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLGMDQGDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAVLEVPKENLVMHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREKPEEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVIPELNVQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESASPAFEEFLQLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCTDSVCYSVAVTRSRDVPSFGPPIPRGVTFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATR	22278	96892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_24083_47876_48008_53297_53487_69591_69767_80945_81050_84059_84218_96725
875156	contig_10312_pilon	-	2910	4	Intergenic	novelGene_159028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	3.85861230093008	177	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	22	360	449616	443270	FALSE	20	TGAAAATTTCTCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACGVATDMVIEHCIKMRASFVTCPCCYGFIQSTSKFNFPKSEQFKETLSYKEHMILCRFADQTAVQLPLQRRLIGKQCMCLVDLDRARAAEERGYSVQVISMEPESCSPKNNMIVGVPI	449637	440719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_443407_445961_446032_449340_449372_449515
875157	contig_6228_pilon	+	3085	2	Intergenic	novelGene_164486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	0	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	242	1324	152295	154394	FALSE	55	AAAAAAATTTGACCATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPTQVNEEELEDKTAVTISEELSEQPVQTVKGTVVDGENEVTSFEESSPPRLVQEETVSTEIQVQSSDVSLTVAAVEEEMVGETIKISETGTESLESADAHLVPEEESSEKDEDATAQSGEDTVPAGTESQAESIPVIVSAPAEKGGSSDLEGDETTSQKWKPDEDHEQVVCQEVKVSVTQEEDSKAENEILGIESESSKLVQNIIQTAVDQLVSTEEAATEMFAPDSQAQDQVIIADNQEAGQEPEKEPSELQASTQDETQTVVTREKSELATVEHTRSDSSKGDSEVAEKMMTAEVESPCVSDQQQLEVVVPPSAEKGDAVGTESVPENDDSATVGESIEKSPFESKGAEKGDSVDYPENQNSALEDTDASGDLTKESPDTNGPKLKKKDDVEGVEFQEGKVHSESENEMKTQPREEIHKQEKESAKSELTESSDIV	152053	156155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_153374_154390
875158	contig_12923_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_30203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	880	1344	641322	641786	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLENSSQILIDHYFHNILTNFIFYTVKCKKPKTRVRVETCQRRKKIFSTKTRNRKVVTEPCHSWKLSKTGKNKAVPLSSNSHSFHCIISHTHTHTHTHTHTHTHKLQKSIRKCKCPQIAKMFQGIRHEGLSKHMIHKYFYVYIFTVEPWWRSG	640442	642357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_640400_642400
875159	contig_6631_pilon	+	4858	17	Intergenic	novelGene_174299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	32.1149668184477	178	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	78	1943	1060367	1097098	FALSE	20	AAAGCCATGGCTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVPVKQFVKHIGELYSDNQHGFSEDFEEVQRCTADMNITAEHSNHPDNKHKNRYINILAYDHSRVKLRPLPGKDSKHSDYINANYVDGYNKAKAYIATQGPLKSTFEDFWRMIWEQNTGIIIMITNLVEKGRRKCDQYWPTENSEEYGNIIVTLKSTKVHACYTVRRFSVRNTKVKKGQKGNPKGRQNERVVIQYHYTQWPDMGVPEYALPVLTFVRRSSAARIPEMGPVLVHCSAGVGRTGTYIVIDSMLQQIKDKSTVNVLGFLKHIRTQRNYLVQTEEQYIFIHDALLEAILGKETEVSSNQLHSYVNSILIPGVGGKTRLEKQFKLVTQCNAKYVECFSAQKECNKEKNRNSSVVPSERARVGLAPLPGMKGTDYINASYIMGYYRSNEFIITQHPLPHTTKDFWRMIWDHNAQIIVMLPDNQSLAEDEFVYWPSREESMNCEAFTVTLISKDRLCLSNEEQIIIHDFILEATQDDYVLEVRHFQCPKWPNPDAPISSTFELINVIKEEALTRDGPTIVHDEYGAVSAGMLCALTTLSQQLENENAVDVFQVAKMINLMRPGVFTDIEQYQFVYKAMLSLVSTKQSGTGPMTVDKNGAVLIADESDPAESMESLV	1050618	1100013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_1050640_1051175_1051227_1060361_1060454_1067995_1068093_1071526_1071610_1071802_1071938_1072905_1073041_1074907_1075081_1076571_1076708_1077282_1077430_1079245_1079340_1080159_1080237_1080733_1080863_1084504_1084652_1085267_1085411_1096239_1096376_1096951
875160	contig_20614_pilon	+	3708	1	Intergenic	novelGene_107596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCGCGCAAGGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298366	302074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_298400_302100
875161	contig_4783_pilon	+	3430	1	Intergenic	novelGene_108414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCACTTTCTCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388777	392207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_388800_392200
875162	contig_6599_pilon	-	172	1	Intergenic	novelGene_175993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCGTGAAACCGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262481	262309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262300_262500
875163	contig_5848_pilon	+	1980	15	Intergenic	novelGene_163803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	230.759979995117	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1947	33	1979	115919	261656	FALSE	25	GAAGTGCAGGTAACTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCFRDSGGKMSSLPRRAKLKTAASKDECSFLSELSSSSEEDDKEDSAWEPQKKVPRSRKQRVPKESKPKRMPRVKKHTPKISDGLEGMVVKEELNSSVAIADVNLEERKNEPNTVQTEKTAKTKRKNSAQSPLVRRTKKLKVEETSKDTNVEDENNSTEMPSTSTMWESTCKKEKNEVDFTFGQSPLKKMKTEMCPQGQPVKLPANASSIKEEVEMNWDIVQVLSERTNIELWVCANIIRLFNDDNTIPFIIRYRKELINNLDADSLREVQQTLEELRTVAKKVHSTIQKIKKDGKMSECLFKALLNCKTFEELEHVSAPYKTGSKGTKAQRAKQLGLEGAARTLLENPGALNLLSSIKPNVKGLSTLQDIETGVQHILADMIAKDKDTLDFIRKLCQNRHICIQSCLAKVSSKKVNEKDVDKFLLYQNFSCSIRNIHHHQILAINRGENLKILTVKVNIPDGVKNEFCRWCIQNRWRPRGFARPELMKILHNSLDDSFKRLIYPLLCREFRAKLTSDAEKESVMMFGRNLRQLLLTSPVPGRTLMGVDPGYKHGCKLAIISPTSQILHTDVVYLHSGQGFREAEKIKRLLLNFNCSTVVIGNGTACRETEAYFADLIMKNYFAPLDVVYCIVSEAGASIYSVSPEANKEMPGLDPNL	109022	261657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_+_109055_115918_115993_119252_119434_124367_124752_127956_128124_129669_129788_133052_133192_153261_153359_156964_157101_170876_170981_183492_183601_189043_189202_191259_191351_192013_192122_261574
875164	contig_5649_pilon	-	1618	6	Intergenic	novelGene_82382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_4	45.9756457268411	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	595	978	1072982	1069132	FALSE	60	TAAAAGCAACAATAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPYIEHWPRALSILMLPHNIPPSLNLLTNMVDEMWHYAGDQSTDFNWYTRRAMLAGIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLEHRINDAMNMGHTAKQVKATGEALVQGLMGAAVTLKNLAGLNQRR	1077001	1068491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1069168_1069505_1069560_1069899_1070056_1071357_1071463_1072949_1073451_1076875
875165	contig_11281_pilon	+	1540	2	Intergenic	novelGene_125441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGCGATGATCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797310	802933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_798780_802862
875166	contig_12689_pilon	+	3951	3	Intergenic	novelGene_145044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8	815	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	150	755	146587	147982	FALSE	25	TAGCACATCTTACAGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANPELVLSEDRRSVRRGDLRQALPDNPERFDPGPCVLGHSRFTTGRHYWEVEVGERANWALGVCRENVNRKETGELSAGNGFWILVFLGSYYNSPERAFVPLRDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSASDGSLLFIFPETSFSGTLRPLFSPLSSSPTPLTICRVKGGAGDAPVP	140984	151178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_141072_146524_146648_147437
875168	contig_7416_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_134337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGGAAAAATAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881317	883477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_881300_883500
875169	contig_5643_pilon	+	1791	5	Intergenic	novelGene_38991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_3	79.7351083275115	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	392	1282	619388	621718	FALSE	15	AGATGGCTGCGACTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFNKHLDRGFNSCARSDLYFVPLEGSKLAKKRADLVEKVRREAEQRAREEKEREREREREKEREREKERELERSVKLVQEGRAPVECPSLGPVPHRPPFEPGSAVATVPPYLGPDTPALRTLSEYARPHVMSPGNRNHPFYVPLGAVDPGLLGYNVPALYSSDPAAREREREARERDLRDRLKPGFEVKPSELEPLHGVPGPGLDPFPRHGGLALQPGPPGLHPFPFHPSLGPLERERLALAAGPALRPDMSYAERLAAERQHAERVAALGNDPLARLQMLNVTPHHHQHSHIHSHLHLHQQDAIHAASASVHPLIDPLASGSHLTRIPYPAGTLPNPLLPHPLHENEVLRHQLFAAPYRDLPASLSGPMSAAHQLQAMHAQSAELQRLALEQQQWLHAHHPLHSVPLPAQEDYYSHLKKESDKPL	618622	622227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_618849_619222_619920_620829_620974_621321_621503_621684
875170	contig_5947_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_101484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCCCTGTCTCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388364	386003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_386000_388400
875171	contig_4838_pilon	-	2517	5	Intergenic	novelGene_144792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCCAAAATGTTCCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279435	266598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_268383_273281_273407_274220_274314_275549_275681_279051
875172	contig_1009_pilon	+	2563	15	Intergenic	novelGene_121760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	144.725443794907	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	77	1714	287142	299204	TRUE	65	TAAACCAAAGTCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQFKRQRINPLPGGRNFSGAASTSLLGPPPGLLTPPVATDLSQNARHLQGGEKQRVFTGIVTSLHDYFGVVDEEVFFQLSVVKGRLPQLGEKVLVKAAYNPGQAVPWNAVKVQTLSNQPLLKSPAPPLLHVAALGQKQGILGAQPQLIFQHHRIPPLFPQKPLSLFQTSHTLHLSHLNRFPARGPHGRLDQGRSDDYDSKKRKQRAGGEPWGAKKPRHDLPPYRVHLTPYTVDSPICDFLELQRRYRSLLVPSDFLAVHLSWLSAFPLSQPFSLHHPSRIQVSSEKEPAPDTGAEPIPSDSDPGYSSKVLLLSSPGLEELYRCCMLFVDDMAEPRETPEHPLKQIKFLLGRKDEEAVLVGGEWSPSLDGLDPKADPQVLVRTAIRCAQVQTGIDLSSCTKWWRFAEFQYLQPGPPRRLQTVVVYLPDVWTIMPTLEEWEALCQQKAAEAALPPQESPVETESSEQAADASEQAADTSKQNAENPEVTAQQEMDTDLPEAPPPPLEPAVIARSDCINLSLHGIVEDRRPKERISFEVGAPDPSAA	286182	300350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_286221_287103_287200_287469_287562_287919_288012_288218_288334_288502_288633_288805_288903_292593_292714_294427_294651_294739_294854_295169_295334_295810_295983_296068_296306_299180_299227_299523
875173	contig_9668_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_58255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	8	367	620888	620529	NA	30	TACCAGTATTTACTCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLMLNHVCIPGMNPSWSLSQSSSAALTEIPQVGGFSKEKFILSQSSRLQVQIQGVSSRGTLSPSALDEGPYHQSSFSLGASLHRNLSSKGHALLPALLSWWYEVPTCLCSILSFISQKRLH	620895	618579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_618600_620900
875174	contig_7753_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_41474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTACAGTCTTGTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944647	942521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_942500_944600
875175	contig_3004_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_127513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCCCATCTGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311104	309410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_309400_311100
875176	contig_6299_pilon	+	4306	1	Intergenic	novelGene_172944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1497	1895	960622	961020	NA	25	CAACCAAATGCTCTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAASQYMWGVQDTDLVLRKALFSTLKETDTRNFKFRWQLESLKSQEFVETGLCYDTRVCFVPPLSLYWLSSMVDKGKLRPSPCLQGAYNLQGHVNLVKQSVLSRKHQEISCGINLGYLLLLRGLQAVDPFT	959125	963431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_959100_963400
875177	contig_18272_pilon	+	1503	3	Intergenic	novelGene_7012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGACAGTTAACCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171703	262859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_172795_184337_184550_262659
875178	contig_5935_pilon	-	3295	10	Intergenic	novelGene_102690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_9	124.83124411049	223	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	306	1214	854225	807110	FALSE	20	GCTTCTATTCTGGTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCCWTQCFGLLRREAGRLQRVGGGGGSKYFRTCSRGEHLTIEFENLVESDEGESPGSSHRPLTEEEIIDLRERHYDSIAEKQKHLDMKIQKELALQEEKLRLEEEALYAAQREAARAAKQRKLLEQERQRVVQRYHLSNNGEYQSSGPEDDFESCLRNMKSQYEVFRSSRLSSDATVLTPNTESSCDLMTKTKSTSGNDDSTSLDLEWEDEEGMNRMLPMRERSKTEEDILRAALKYSSKKTGSNPTSASDDSNGLEWENDFVSAEMDDNGNSEYSGFVNPVLELSDYGIKQSDADQQNR	854530	805028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_807376_810889_811019_811816_811891_812592_812652_814695_814795_815951_816049_818318_818345_822258_822286_827928_827978_854142
875179	contig_13607_pilon	-	2813	1	Intergenic	novelGene_170221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	454	795	448586	448245	NA	55	TAATCAAAAGAGGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPEQKKPEIAYNQQTCRLVGAREEKLRMDGSLPRVLGKFVFVYSDLTDSKRAVKEAGEEISQSDLSKALKRFPFPLDESIEHGGRNCWRSCGVGGRLGHSCGPCSKESKGEF	449039	446226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_446200_449000
875180	contig_5649_pilon	-	2924	11	Intergenic	novelGene_82428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	68.1193071015846	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1345	2331	1430841	1421450	FALSE	35	TATGAGTGAGGAATGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLGPNPSNSRSSPGLLSSSLSHLPLGGWSLDMLTRGLSHMAFLQRLTLSGNGIDDCCQLSETLRDATSLQELDLSHNQLGDAGAQLLAAVLPGLPELRKLDLTANGISPVGGVQLANSLSFCRRLEDLRLGYNALGDPTAQVLACGLPPQLRVLRLPSSRLGPEGALSLGRALDGCPQVIEISLAENSLAGGLPQFSEGLPLLRRINLISCEIDSQTAKSLAASLVLCPALEEILLSWNLLEDEAAAELARVLPRMGRLKRVDLEKNWITACGARHLVEGLAQGPGIQVIRLWNNCIPPDMAQHLQSQEPRLDFAFFEDKPQTPQST	1432185	1420856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1421562_1424782_1424867_1425199_1425284_1426423_1426508_1426795_1426868_1426952_1427037_1427778_1427857_1427992_1428077_1428411_1428496_1429326_1429405_1430698
875181	contig_10434_pilon	-	1553	5	Intergenic	novelGene_82045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_4	131.476946648452	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	944	1498	134852	132856	FALSE	35	ATTGCATTAATAAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	135795	132800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777
875182	contig_11823_pilon	+	1551	5	Intergenic	novelGene_171019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	227	junction_3	17.066048165876	257	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	221	508	29162	30106	FALSE	25	TTTTTAAAATCTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNGSSAPASVSVYNGDLEKILLDAQHESGRSSSKSSHCDSPPRSQTPQDTARASETETHSNGEKNSSQSEEDYMERRKEVESILKKNSDWIWDWSSRPENVPPKEFLFKHPKRTATLSMRNTSVMKKGGIFSAEFLKVFLPSLLLSHLLAIGLGIYIGRRLTASASTF	22136	31149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_22257_22912_22998_29146_29254_29330_29481_30060
875183	contig_14441_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_100354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATTGTATTCAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22984	21823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_21800_23000
875184	contig_4847_pilon	+	2003	3	Intergenic	novelGene_156158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	20	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1275	1760	90138	92768	FALSE	35	TATTGTCATTTCAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKYYNIIALVGSKDLLCQYFYPRVKDILSFEIPEHHVIVTASSDGFLKMWKLNHDKEAPPSLLCEVNTKARLTCLGVWLDRVTDAKESLPPAAEPSPVSKGEPSKIHRKESGDEVQEEERQSKPTAEKGGLTGDGEKPEKESRLVSKKRRMAKMLEKKNI	88863	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_90309_92290_92415_92577
875185	contig_17753_pilon	-	2507	1	Intergenic	novelGene_105099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1549	1857	119804	119496	NA	20	TGTGGACCACATGGCCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPGDLPELVPGSMGGSGWKIRKNTGKPGRRGPARESRQQRPGVTWSRGGGCGGIPGAWGNRGSREGRLPGNRGTQSQEMRSQGISFAPTAEPWGNAGRCL	121352	118845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_118800_121400
875186	contig_12864_pilon	-	1647	4	Intergenic	novelGene_76373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_1	13.0213499897497	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	693	1328	195001	187886	FALSE	65	AGTAGAACAAAAAGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFPHAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTETYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSGKDMSPAFPRNVVVKICFI	195693	187566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_188120_191141_191256_191350_191452_194814
875187	contig_11978_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_62828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGAGCAGGTGGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446343	444119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_444100_446300
875188	contig_7887_pilon	+	2032	13	Intergenic	novelGene_124919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_12	37.3700526268473	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	146	1570	562813	567985	FALSE	25	TCTCCTAGGTCTGAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNEKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGAPRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGATPGAARPTPPGAQTPSHLGATLPVGQPAVGDPEVRKQMPPPPPCPAARELFDDPSYVNVQNLDKVRQAGGGGGPPNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQLVSMAEQLREEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL	559191	568447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_559334_562809_562978_563596_563668_564182_564247_564400_564521_564739_564794_564960_565013_565209_565337_566076_566276_566362_566433_566512_566648_566805_567045_567856
875189	contig_12427_pilon	-	3882	1	Intergenic	novelGene_40583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTACTGCAGTACACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561707	557825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_557800_561700
875190	contig_11855_pilon	+	2367	13	Intergenic	novelGene_66894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_12	62.2402937546624	153	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	122	1708	694133	727434	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTCWGDISENVRIEVPNTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFENDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDFSQKVSESMQYPFKTCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESEDRTDDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDTPPHLFAKVKEVDQSGEWFKEGMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHATSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQSSRESQSGSSKQKKKAKSQQYKGHKKKRKIPVGKKPISLSSLPMTGGVRRSFSGDEELTPPPYRTLPAQTAPEAFPPPSTSREFSPSLKTVTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQESNGSANFYIKQEP	691615	728093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_691731_694126_694245_711191_711327_711601_711691_711906_712142_712738_712795_713127_713233_716703_716852_717594_717678_718075_718311_718797_718876_722557_722750_727315
875191	contig_9389_pilon	-	3319	7	Intergenic	novelGene_83955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	174.146490059375	48	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	33	875	215498	209282	TRUE	40	TATTTAGAAAACAGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQVGTCGRAHVAHPGSGRLFATALTASLLVLRLNNVPHFPSWRSSLCGPLLRAAPFPVWPPPCAGPLLRAVPLPCVALLPVRAPSSVRPPFPVWPPPACGPPSSARPDRVGFTQGTPTPTGKGGCTRFCLGALGHLPWFWVGGYWVGPSGWPTGQVPVWAPSVRWE	215530	205499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_207215_207854_207936_208221_208301_208414_208474_208771_209893_213629_213805_215441
875192	contig_7840_pilon	+	3776	3	Intergenic	novelGene_68951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1133	1468	48511	54047	FALSE	25	TTATTTGACTATATGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTPGKGPGSGGRKSVARTRPARTGSLRTPVGRKSRSCTVRPRTRRGSGSWPSSTSSATAKGVCTSRFTSRSKGFSGSRAQMSPMGSRPAKLPPSAGARASSSSPSMSAQ	44844	56355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_45810_48343_48542_53742
875193	contig_5780_pilon	+	1763	4	Intergenic	novelGene_29792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	237.916418563794	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	152	634	107519	110295	TRUE	40	AGCAATAAAGCATTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	107367	113701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_107549_109432_109581_109990_110811_113087
875194	contig_3243_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_147538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATTTGTGTCAGAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44608	43018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_-_43000_44600
875195	contig_12841_pilon	-	2167	7	Intergenic	novelGene_55848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	96.9891173734914	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	3	857	289372	257950	FALSE	35	TCGTAGAGGAACAGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEGVGEGAQDSDPGQPEQPPPQPHPPPPQQQQQQEEEMAAEAGEAVASPMDDGFLSLDSPTYVLYRDRAEWADVDPVPQNDGPNPVVQIIYSEKFRDVYDYFRAVLQRDERSERAFKLTRDAIELNAANYTVWHFRRVLLKSLQKDLHEEMNYITAIIEEQPKNYQVWHHRRVLVEWLKDPSQELEFIADILNQDAKNYHAWQHRQWVIQEFKLWDNELQYVDQLLKEDVRNNSVWNQRYFVISNTTGYNDPVVLEREVQYTLEMIKLVPHNESAWNYLKG	289374	256639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_258017_263353_263503_267711_267839_273718_273824_275596_275712_286368_286455_289166
875196	contig_8020_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_114423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAAACCTTCACCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238605	241640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_238600_241600
875197	contig_15273_pilon	-	2650	1	Intergenic	novelGene_140443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAACATGGAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165624	162974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_163000_165600
875198	contig_8017_pilon	-	1985	3	Intergenic	novelGene_65381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_2	73.5	73	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	28	498	1511273	1502984	FALSE	50	AAACCGAAGGCACACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVPGSRSAMAPKGGSKQQSEEDLLLQDFSRNLSAKSSALFFGNAFIVSAIPIWLYWRIWHMDLIQSAVLYSVMTLVSTYLVAFAYKNVKFVLKHKVAQKREDAVSKEVTRKLSEADNRKMSRKEKDERFDTFLKAFMVIDEGGTVKKVSFWPRLRERGYCDRLS	1511300	1501496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1503195_1509748_1509876_1511140
875199	contig_6445_pilon	-	2698	1	Intergenic	novelGene_77068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1320	1628	676068	675760	NA	40	AAAACCCAAACCAGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPSRGGSAEARRRREEAHLSSRWLIRVRAPDFSLLRTPPWGITRAGSAVVQSAPSCSLPHWRLAPFILCSSNSRGFCNLRDHFSFNKGGGANLNTTPVPA	677387	674689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_674700_677400
875200	contig_8027_pilon	-	2842	1	Intergenic	novelGene_158850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCTTACCGTTCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442699	439857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_439900_442700
875201	contig_1091_pilon	-	1462	10	Intergenic	novelGene_168772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_7	30.0903987804321	101	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1284	178	1461	545609	517493	FALSE	20	GTAAGTATGGATTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYNEQIRDLLVNSGPLAVREDAQKGVVVQGLTLHQPKSSEEILQLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQEKTASINQSVRIAKMSLIDLAGSERASATSAQGIHFREGTNINQSLLALGNVINALADAKRKNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSMFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLKSNVLSLNNHITQYVKICNEQKKEILMLKEKLKAYEEQKTFADENSKAKLMMSNPQEKEIKRFQENLNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKTYHEQQCHKQIEMISSEDKVEKATCKRDHRLAMLKNRRCYLEKKKEEELKQFDENTNWLHRVENEISLLDENGHIPKELDKDLQYHHLYLQTKDLKAQIEHMMDLANLQEQQYRQTEIVLNALLPAFKKQYCALKEAGLSNAAFESDFKVIQHLVERKKMVAWADQTTEYPKQKDLPGVSVLMTFPQLGPVQSTC	546266	517491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1091_pilon_-_517725_521170_521293_523991_524157_532585_532749_537437_537551_537771_537847_539404_539582_543378_543577_545570_545682_546161
875202	contig_13542_pilon	+	1614	9	Intergenic	novelGene_131497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1059.13228045415	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	72	857	346638	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346566	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487939_488024_499871_499938_500886_500964_505501
875203	contig_513_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_80157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448516	446310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_446300_448500
875204	contig_12464_pilon	-	3037	1	Intergenic	novelGene_68708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTTTTAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351079	348042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_348000_351100
875205	contig_5916_pilon	+	3880	1	Intergenic	novelGene_158026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTTTGTATGTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254603	258483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_254600_258500
875206	contig_16757_pilon	+	2359	6	Intergenic	novelGene_175584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	30.7219791029159	54	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	18	665	146428	153161	FALSE	30	GCATTTCAAGTGAGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCNLIKLVDVEEMNYMAAKGEGEVCVKGPNVFKGYLKDPAKTAEALDKDGWLHTGDVGKWLPNGTLKIIDRKKHIFKLAQGEYIAPEKIETIYVRSEPVAQVFVHGESLQSFLIAIVVPDVETLCPWAKKRGLEGSLEELCRNKDVKKAILEDMVRLGKDSGLKPFEQIKGIALHLELFSVDNGLLTPTMKAKRPELRNYFRSQIEELYSTIKV	146410	154855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16757_pilon_+_146500_147132_147250_150412_150557_152142_152245_152358_152431_153020
875207	contig_13786_pilon	+	2868	1	Intergenic	novelGene_174568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	85	498	55923	56336	NA	65	AAAAAGAAGAAGAAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGFNVQKFIFSQFRRLEVQIQGASSRGKAFSLCWLWRKDLVSDFLLLGDLHVGWHLSLPFSASCRLAFNLLCSGSLWFKMSDFRTTLTCPLMLCKFAFTLKWLNQPLLKTKSSSQSPSLAACAASKSLKSLRLFLH	55838	58706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_55800_58700
875208	scaffold_8345_pilon	-	1453	5	Intergenic	novelGene_106997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGAACCCTTCTGGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196610	181024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_181097_182267_182495_183019_183243_186115_186326_195889
875209	contig_15453_pilon	+	1244	5	Intergenic	novelGene_112482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	322.785822953859	1921	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAAGCAGAGCCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6951	17917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_7920_8017_16200_16324_17103
875210	contig_5574_pilon	+	2871	1	Intergenic	novelGene_155854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAGGAGCTGGGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162963	165834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_163000_165800
875211	contig_11396_pilon	+	3045	2	Intergenic	novelGene_71388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	32	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	377	703	1134570	1135173	FALSE	20	GGGTCCCCAAGACTACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVPLHQQQNKCTTLVKNKTAAATTALQFTYPLFTPNACSAAGSSNLSQTQSSGNSCSILEAAKHQDIGLPRAFSFCYQQEIESTKQTLGGRNKALPEQVWIKVGGKM	1134193	1137515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1134723_1134999
875212	contig_7870_pilon	+	1356	1	Intergenic	novelGene_108907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTTGCAACCCCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207977	209333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_208000_209300
875213	contig_7428_pilon	-	995	9	Intergenic	novelGene_77696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	74.3034319530397	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	58	993	242468	234357	FALSE	15	CCCTTTCCAAGGTCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVD	242525	234354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380
875214	contig_16724_pilon	+	1753	4	Intergenic	novelGene_105329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGCCCCTTCCAGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566477	575972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_567765_568917_569142_571072_571148_575805
875215	contig_15570_pilon	+	3820	1	Intergenic	novelGene_137855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGTAATAATGAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667802	671622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_667800_671600
875216	contig_9319_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_154643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTCCTGGTTAGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79349	77377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_77400_79300
875217	contig_12644_pilon	-	3220	1	Intergenic	novelGene_44575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2041992	2038772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2038800_2042000
875218	contig_20878_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_173436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6454	5292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_5300_6500
875219	contig_4736_pilon	+	2398	1	Intergenic	novelGene_168637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCCCAGGCCCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310663	313061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_310700_313100
875220	contig_19402_pilon	+	3954	3	Intergenic	novelGene_80865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168225	178393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_168300_170803_170984_174693
875221	contig_10235_pilon	-	2691	1	Intergenic	novelGene_46370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	641	1276	151992	151357	NA	15	TTTTGTGATCTATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPSLITFTPASDSSDLWKDGQQQQQQPQPKEPEPALDGSAVRAFYESLIGSESSPPEPQRSQSEPARERNRKKRRLMREAVAAVAAAASGGRGQEGSLEAEDKMTQWILRAAQEGDLAELRRLLEPREAGGAGGNINTHDAFWWTPLMCAARAGQGAAVRYLLGRGASWVGVCELGGRDAAQLAEDAGFPEVARMVRESHGETRSPENR	152632	149941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_149900_152600
875222	contig_935_pilon	-	2921	1	Intergenic	novelGene_45520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCATAAAGATTATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32102	29181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_29200_32100
875223	contig_15687_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_129149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATGAATGGATACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191736	189321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_189300_191700
875224	contig_13224_pilon	-	3696	18	Intergenic	novelGene_104109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	859	1284	315886	314881	TRUE	25	CAGCAAGGCTACGGCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEGAEGVELGLGLEPVPRNINLILSPVDEICCHHLLLPSVLGKVVHKAQAHVALQGEAIGTAGGFANIPPVSVNGLSPPRPKVQVCVVVIQNKHREALIHPVLLLLQQGIPTDEIHPTFSNFTRNSRPHSRGVVQVFKS	316744	283430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_283614_291299_291584_293357_293494_299265_299350_299443_299607_300337_300459_301169_301290_302030_302180_303321_303520_304332_304454_307015_307170_307378_307514_307875_308023_310601_310717_311865_311960_313480_313571_314762_314951_315530
875225	contig_11337_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_107202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCTAGCAAGCATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356657	354370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_354400_356700
875226	contig_13265_pilon	+	2208	5	Intergenic	novelGene_146008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_2	50.1566296714602	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	349	1038	79293	113433	FALSE	50	GCAAATGTGCAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAEKLNFLKSKETNWFNLISSKMISHGIKLSQKQRKMIAVTTKENNSGMNSMETVLTTPSKSPKPVNAWAFSLHSVSSKSFWDFSLDEKKSVTGHSSGDHVKKICFKGIESSQDPKVIRYPTQGTPGEGNHISDLPLQDSANPWLSSSLTGPSVAPVTFASIVEEELQQEAALIRSREKPLALIQIEEHAIQDLLVFYEALSNPDEFVIVERTPQGPLAVPMWNKHGC	78944	114603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_79502_97722_97873_111915_111985_112372_112503_113301
875227	contig_9940_pilon	+	2888	1	Intergenic	novelGene_125343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAATCTCAAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138572	141460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_138600_141500
875228	contig_7593_pilon	-	1394	2	Intergenic	novelGene_127262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTGAATTTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3314	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_2230_2272
875229	contig_11492_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_152264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1454	1888	434746	435180	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPAWCLAPGGFSANTHFFSLACLVVGQLLGFLRLAWVGLHCQSFKCRLPEESVSPQGLAQNSPPLHTLLVGRHWREVFQGLPNLAEKRDLDTKPESKLYLLSTLFCTRNPGDAVVKALAANRKVGGSNPQPLCGERCGNLLL	433292	435926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_433300_435900
875230	contig_12208_pilon	+	2688	5	Intergenic	novelGene_178185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	19.8368344248774	166	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	589	1164	149681	157245	FALSE	35	AATAAATGAGTCTCGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKRIQKELQALDDMVSTDIGILRNRIDQASLDYSYARKRFDKAEAEYVTAKLDLQRKTETKEQLTEHLCTIIQQNELRKAKKLEELMQQLDVQADEETLELEVEVEGLLQEQETEAGKQMAHLEKSCHPSGDRVTLGFSRENKKHQEQTASPEIDEQCENSNSSSLHSQNCQNQDIKTTVGDISAALPT	134394	158769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12208_pilon_+_134494_144938_145301_147317_147420_149655_149797_156785
875231	contig_14618_pilon	+	2088	3	Intergenic	novelGene_136812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGAAGGGGTGTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564970	570296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_565589_566228_567552_570149
875232	contig_3151_pilon	+	2886	14	Intergenic	novelGene_139178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	117.540475214325	16	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1272	1614	2885	104632	140953	FALSE	20	GTAAGACCATTTTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCFQEHWDCPFLITACFLLADGIETRRQFSGKKTSADASEYYENYIEELKKQGFLLRENFTPEATQLASEKLQALLLEEVINSDTLSQEVSDLVEMIWAETLGHLEHTLLKPVNKISLNDVSKAEGILLLVKAALKNGETAEQLQKMLTEFYRVIPHKGPTTEEVNLRLLSKKEDLCQLIRDMVNVCESNLYKPNPPSLAKYRALRCKIEHVEQNTEEFFSVMKEVLQNNHSRSPVNILQIYRVGRVNEATEFLSKLGNVKSLLHGSPARNIVGILSRGLLLPKVVEDHGVKRTDVGNLGSGIYFSDSLRTSIKYSHPGEIDGTRLLVICNVALGKCMDLYKKDFSLTEAPPGYDSVHGVSQTATVITDFEDDEFVVYKTDQIKMNYIIKFCIPGDQIKDFHPCGNTELEEYVPEFSSFPKAE	39955	140954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_40028_42107_42228_95053_95187_97004_97207_102805_103853_104592_104707_107291_107442_120607_120746_122029_122204_125852_126014_127305_127444_135600_135697_140405_140590_140797
875233	contig_12622_pilon	-	3081	1	Intergenic	novelGene_5836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAACCCATTTTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451617	448536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_448500_451600
875234	contig_13740_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_34734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCCGATAAATGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178062	177130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_177100_178100
875235	contig_2168_pilon	-	3458	8	Intergenic	novelGene_147265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2516	2815	289809	285879	TRUE	35	AGAGATCCTTTAGATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWLTSFLLESSPLAAFMSFRKFSTVFFMFFNSPGCGVARLRSVLVSLSSSSFSSSRNRIALTLFTARSFQASSETSFTKLSSAPQRGRFSWQAGSEGS	292324	261434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_-_261468_264785_264931_267676_267795_269408_269494_279344_279461_285732_285906_287653_287792_289674
875236	contig_8330_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_71939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTCTGTAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343391	1341088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1341100_1343400
875237	contig_19957_pilon	-	3870	1	Intergenic	novelGene_57700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGGAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142856	138986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_139000_142900
875238	contig_11898_pilon	+	2990	2	Intergenic	novelGene_144307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCTGATTTGTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357058	362866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_359680_362497
875239	contig_10324_pilon	-	3097	23	Intergenic	novelGene_7862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	811	1344	477123	472408	TRUE	30	TGCAAGAGGTAGGCCAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHEGELVLLHQARLPLRVAGLLTPAVEVHALDEQIKLLFVPGNHLVDGFIIGDFVFFLVLLLVLEDGLQERTPLVAGGLLVEHAGLDHLLVDIELVLGGGQNLLLHTVDRAEAEHPHLVLLPDAVGSVLRLQVLVGIPVTVENDHSVGRLEVQPKPPCTSAEQENEVLGAGLIEGF	501613	427132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_427228_427315_427367_432382_432515_432693_432751_446753_446878_448140_448290_450006_450170_458176_458245_459549_459662_462315_462559_464659_464774_465501_465610_467730_467818_468649_468698_469774_469944_472374_472536_475365_475596_476199_476279_477026_477243_482685_482945_497671_497782_498128_498233_501395
875240	contig_13305_pilon	-	2186	2	Intergenic	novelGene_146787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	609	914	266844	266539	TRUE	55	AAAAAGCACAGGATCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAEEPLEWSWSSPLTGRFPTLLRSWWPAAPPAKVGPFSWEASGSAFFSSGGVWLAGAGLGLVVEEVVGGAGVDVVTEVVRAGVVGWEAVIRTRGGIRGAK	267452	264474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_265601_266392
875241	contig_7318_pilon	+	2574	4	Intergenic	novelGene_152236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	49.6006272361774	158	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTTTTCTTTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341798	355148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_343432_345626_345714_346358_346529_354464
875242	contig_11678_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_160848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCGGCCCACGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240915	239441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_239400_240900
875243	contig_16701_pilon	-	4205	1	Intergenic	novelGene_177601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACACCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98840	94635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_94600_98800
875244	contig_6278_pilon	+	3220	1	Intergenic	novelGene_119824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGCTGAAAGCATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518693	521913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_518700_521900
875245	contig_11227_pilon	-	3245	19	Intergenic	novelGene_163169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	12	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTTGTGTGACAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123788	96644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_96721_99009_99079_101021_101225_103560_103647_105402_105533_106912_106999_108262_108360_109078_109228_110359_110465_111206_111328_115553_115700_115814_115920_116209_116346_116904_116977_119561_119710_120814_120877_121453_121583_122371_122466_122557
875246	contig_10496_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_59444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGAGGCTGACTCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223321	221331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_221300_223300
875247	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	338	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
875248	contig_14790_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_127917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	1820	2155	196504	196839	NA	10	CCTCCGGGCCCACCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPTEGCWSCCVISSSCPARFKTARVDRLPREEVFTEATGSPSTSRRPRSGKAPFLDEALGGTKEEEEQGVQRTNYTGEGGRKGSPMPSLGGALAPLSTKALSGTKPRWLG	194684	196841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_194700_196800
875249	contig_5758_pilon	-	4007	21	Intergenic	novelGene_119115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_20	173.166827077244	136	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1056	3171	67	3237	437788	347925	FALSE	25	TTGTACATGAGCAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQQFPRLGTPSTGLGQAPSQISNSGSAGLINPTATVNDEPSRDAEVTAREHLGPSSSLQSREEKQEPVVVRPYPQVQMLSTHHAVASGTPVTVTAPPAHLTPAVPLSFSEGLMKPPPKPTMPSRPIAPAPPSALSLPPKVPGQVTVTMESSIPQASAIPVATISGQQGHPSNLHHIMTTNVQMSIIRSNAPGPPLHIGASHLPRGAAAAAVMSSSKVTTVLRPTSQLPNAATAQPAVQHIIHQPIQSRPPVTTSNTIPPAVVATVSATRAQSPVITTTAAHATDSALSRPTLSIQHPPSAAISIQRPAQSRDVTTRITLPSHPALGTPKQQLHTMAQKTIFSTGTPVAAATVAPILATNTIPSATTAGSVSHTQAPTSTIVTMTMPSHSSHATAVTTSNIPVAKVVPQQITHTSPRIQPDYPAERSSLIPISGHRSSPNPVAMETRSDSRPSVPVQFQYFLPTYPPSAYPLAAHTYTPITSSVSTIRQYPVSAQAPNSAITAQTGVGVASTVHLNPMQLMTVDASHARHIQGIQPAPISTQGIQPASIGTQGIQPAPIGTQGIHSAAPINTQGLQPAPLGTQQPPPEGKTSVVLADGATIVANPISNTFSAAPAATTVVQTHSQNASTNAPAQGSSPRPSILRKKPATDGMAVRKTLIPPQPPEVASPRVESSMRSTSGSPRPAGAKPKSEIHISMTTPVTVSVEAVSNQSNDQPTIAVPPTVQQPTPTIPTMIAAASPPAQPAVTLSAIPGAVHITPPITTIASAPPPSVAVGGSLSSVLGPPVPEIKVKEEVEPMDIMRPVSAVPPLATNTVSPSLALLANNLSIATSDLPPGASPRKKPRKQQHVISTEEGDMMETNSTDDEKSTAKSLLVKAEKRKSPPKEYIDEEGVRYVPVRPRPPITLLRHYRNPWKAAYHHFQRYSDVRVKEEKKAMLQEIANQKGVSCRAQGWKVHLCAAQLLQLTNLEHDVYERLTNLQEGIIPKKKAATDDDLHRINELIQGNMQRCKLVMDQISEARDSMLKVLDHKDRVLKLLNKNGTVKKVSKLKRKEKV	439629	347154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_348084_348327_348442_349017_349122_360549_360676_360867_361117_366643_367003_378299_378405_384245_384421_385798_386102_387929_388052_390054_390197_394656_394762_394964_395056_395222_395371_404772_404898_406662_406788_411191_411304_415178_415338_416056_416293_437676_437795_439569
875250	contig_14450_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_48990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	67	315	1058016	1057768	NA	25	AGTCCGAGGTGTAATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFVPPDNVQSKQDKVLPSLLLMSILAVLPQGQICCSSSSPWYIQSSIASILLQSSFFIVQLLRAYEVIEKTMAWIGIHLYFIPKIQVDLDWISWKMLGRTVNS	1058082	1055809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1055800_1058100
875252	contig_6488_pilon	+	2058	2	Intergenic	novelGene_44720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	627	1058	36907	54194	FALSE	30	TAGTCTTGAGGAACATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHWNEVHVAKHKAVVIIIFQGLLKTNVEELSTIEHGVSILVDNIDAIVQLLALQDWVQVIQPVLEVLLPVAEWNNDGHLVRGDTVLGGIAAAHLHLWVLLCHTLQVHSHVKLDHHGANWRSEGKEKLAGHRALCSTGRSVG	36280	55194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_37033_53888
875253	contig_21277_pilon	+	3170	1	Intergenic	novelGene_159201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAATCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13895	17065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21277_pilon_+_13900_17100
875255	contig_6498_pilon	-	767	1	Intergenic	novelGene_177512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAATGAATGAACATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417650	416883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6498_pilon_-_416900_417600
875256	contig_10629_pilon	-	1997	6	Intergenic	novelGene_52886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	13.9341307586803	92	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	821	1414	115228	110750	FALSE	15	TATCCTGTGCCAGATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDIESQPECAYDHLEVYDGRDAKAPVLGRFCGSKKPEPVLATGNRMFLRFFSDNSVQRKGFQASHSTECGGQVHAEVKTKDLYSHAQFGDNNYPSGVDCEWVIVAEEGYGVELVFQTFEVEEETDCGYDYMELFDGYDGTAPRLGRYCGSGPPEEVYSAGDSVLVKFHSDDTITKKGFHLRYTSTKFQDTLHSRK	122960	110166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_110885_112825_113077_115020_115235_115636_115765_118881_119008_122400
875257	contig_6505_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_175693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTCCTAGAATTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95333	96985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_95300_97000
875258	contig_5777_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_173313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCCACACTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39547	37004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_37000_39500
875259	contig_4125_pilon	+	1654	6	Intergenic	novelGene_25222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	88.6891199640632	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	114	536	1708054	1710864	TRUE	35	AAACCATTTTATTGTACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSAWPPLPPGSYAPAPP	1703905	1712178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1703970_1708004_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710817_1710920_1711115
875260	contig_6523_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_164884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTCTCCCAAATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260481	258113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6523_pilon_-_258100_260500
875261	contig_17214_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_153468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAGAACAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33502	30961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_-_31000_33500
875262	contig_3975_pilon	+	2653	2	Intergenic	novelGene_54906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGGATCCCTGGCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2137523	2141757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2138991_2140571
875263	contig_8829_pilon	-	3190	2	Intergenic	novelGene_140946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCTCGGCTAAGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78152	33214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_33381_75128
875264	contig_2646_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_69602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGAGAGATTGACACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498285	1497036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1497000_1498300
875265	contig_5549_pilon	+	3188	1	Intergenic	novelGene_81661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAGTGAATCATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460784	463972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_460800_464000
875266	contig_13868_pilon	+	2999	1	Intergenic	novelGene_172649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTGAACGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65700	68699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_65700_68700
875267	contig_8330_pilon	-	1173	5	Intergenic	novelGene_71871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	500.359058576938	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCGGTTTCATGGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962714	947064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_947288_950736_950861_953221_953344_955449_955567_962127
875268	contig_9909_pilon	+	1791	10	Intergenic	novelGene_42474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	32.6636430951435	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	115	1098	663123	682981	TRUE	60	AAATAATTAAATTGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRFFARRGRLVRPAASASAPGLGGAAVLPFRPSNAARMASQSSYRIEYDTFGELKVPNDKYYGAQTVRSTMNFKIGGVTERMPAPVIKAFGILKHAAAEVNQDYGLDPKIANAIMKAADEVAEGKLNDHFPLVVWQTGSGTQTNMNVNEVISNRAIEMLGGELGSKKPVHPNDHVNKSQSSNDTFPTAMHIAAATEVHEVLLPGLQKLHDALDAKSKEFAQIIKIGRTHTQDAVPLTLGQEFSGYVQQVKYAMTRVKAAMPRIYELAAGGTAVGTGLNTRIGFAEKVAAKVAALTGLPFVTAPNKFEALAAHDALVELSGAMNTAACSLMKIANDIRFLGSGPRSGLGELILPENEPGSSIMPA	663008	688945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_663126_667925_668061_673977_674089_675268_675446_677306_677490_679713_679880_681361_681566_682976_683177_685476_685631_688601
875269	contig_4782_pilon	-	1972	9	Intergenic	novelGene_73605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	483	806	257267	250962	TRUE	45	AAAAAAAACTACTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKKSTLMQLKTSFDYSCKERYVLHIKTNIHRSNIIFIRLPDFLHYLFLSFGTCFNTAFNCYGAFRIIQRQFLQRRYCDFSVCVLFDFFKVSSFFTNKSAYKVIMG	257749	134290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_134783_136247_136309_189645_189695_233392_233445_233541_233608_243963_244242_249344_249486_250934_251060_257041
875270	contig_8376_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_153776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAATGAACTTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191561	193133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_+_191600_193100
875271	contig_8330_pilon	+	1454	8	Intergenic	novelGene_71806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	733.971750554642	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	190	888	852673	857242	FALSE	10	CACCGCTGCCCAGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTWMPPRGPPSCSSVSSLNTSKPTSCTCDHPPLPRLWACGDWTWRDCGPGAPAHWAQN	837624	857808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837687_838848_838908_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855062_857071
875272	contig_12427_pilon	+	4373	1	Intergenic	novelGene_40514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTTAGGGACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500111	504484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_500100_504500
875273	contig_5779_pilon	-	3168	1	Intergenic	novelGene_106524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTTTTCCCTGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318419	315251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_315300_318400
875274	contig_6898_pilon	-	1622	4	Intergenic	novelGene_35675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	871	1497	114674	59656	FALSE	20	AGCTTCCTGCTAACGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSEQHDMVLRQALMERSRSDSPCVTRIDQPWASALSGQGKGSQGAPLPLGQQLVPSQVARLVHLFIEVTVLGLDSIGGQQHGSLRWAVNIIIENALLHLQEEQALGDVLDQFLGYILRVKFGPELEEQGAFLPYILGSHLLIEFQPGGEALSVLVLQTKKPNFPQANSFHHLVKQLLAGGVGLDGKLQFCIHGGHTHIDRLGHGGG	115544	59530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104633_112966_113065_114249
875275	contig_1274_pilon	-	3558	1	Intergenic	novelGene_137793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2688	2987	118324	118025	NA	60	GGTTTAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHFTNKGTQAPRVYFKVAQSHRGLVASKGCYFNYLILLLPPRTGPKQARSGLSALGGHASVSQEVMQGWPLLSGASAMTLIHVVYHPPQRGLGLVLLD	121011	117453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_117500_121000
875276	contig_5419_pilon	+	1329	4	Intergenic	novelGene_15551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.94392028877595	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	83	529	463226	478079	FALSE	20	AGTCTGTAATTCACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMNKTIKPRSARKGWSCCPENWVMSNTSCYFISSELNNWTESEKNCAGMGAHLLVINAEEEQLLILQILEREFAYYVGLSDPKGTCQWQWVDQSPYNRSITFWHPGEPNKHDERCVFINSRKGIWGWNDAFCVETQKSICEMMKTYL	463143	478879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_463263_476057_476210_476921_477038_477937
875277	contig_12866_pilon	+	3194	4	Intergenic	novelGene_174640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.892279039209	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	246	1454	636766	684533	TRUE	20	CTATGTGTCTGACACGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFWRYSLFAFTVFSVVVFVIVYNSRLSLPKSYEQLNISGERYFRIQACDSISEERSTFLWEKPLVSPLGSVPCEDYLTQSHYITSSLSEEEAAFPLAYVMVIHKDFDTFERLFRAVYMPQNVYCVHVDEKAPATYKESVGQLLSCFQNAFIASKIEPVVYAGISRLQADLNCMRDLVASKVPWKYMINTCGQDFPLKTNKEIVQYLKGFKGKNITPGVLPPEHAIKRTKYVHREHIGKYGSFVQNTNILKTSPPHQMTIYFGTAYVALTREFVNFVFHDKRAIDLLQWSKDTYSPDEHFWVTLNRIPDVPGSMPNASWTGNLRAVKWSDMEGKHGGCHGHYVHGICIYGNGDLKWLINSPCLFANKFELNTYPLTVECLELRLRERTLNQSETAIQPSWYF	636520	686703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_637691_675017_675111_684342_684918_685347
875278	contig_5059_pilon	+	2348	11	Intergenic	novelGene_140733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTTAAAAATAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262648	290303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_263755_266441_266520_267448_267643_269914_270113_270418_270577_271556_271717_275958_276067_276480_276612_283550_283631_288493_288562_290236
875279	contig_4783_pilon	-	3470	1	Intergenic	novelGene_108342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAGAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46625	43155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_43200_46600
875280	contig_15666_pilon	-	1526	5	Intergenic	novelGene_70183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	778.089446978945	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	191	634	110619	108177	TRUE	25	AGGGAAAGTGATGTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVTFILSAKQMDTPYS	110809	107156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108224_109098_109138_109948_110246_110558
875281	contig_10323_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_123632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGATTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503038	500558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_500600_503000
875282	contig_12411_pilon	+	3674	1	Intergenic	novelGene_145685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGGGAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421843	425517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_421800_425500
875283	contig_6397_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_146268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATCCATGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494777	492931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_492900_494800
875284	contig_4125_pilon	+	1625	7	Intergenic	novelGene_25058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1204	1599	367705	371380	FALSE	10	CGCTGCCATATTTCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISFLRLLRGSESSSNSSRALPRKTSWWNSLLRCPSISIFTPFRWSGGRISFSSLLVALSRTAEWLAGRVDTFARRSMPRSQRQHRALLQGEASQVAITRQDITVGQDCTRTAHRCGQSPRSKEQSHERP	355516	371406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_356170_356703_356832_357155_357315_359788_359902_360789_360932_367696_368065_371344
875285	contig_3789_pilon	-	1401	5	Intergenic	novelGene_79818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	33.0331273118365	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	62	634	179382	155029	FALSE	30	ACTGGCATACAGCACTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDGPAAAASWYQPASPPREACVYSSCYCEENVWKLCDYIKNHDQYPLEECYAVFISNERKMDYHVVLLHVSSGGQSFIYDLDTVLPFPCLFDTYVEDAFKSDDDIHPQFRRKFRVIRADSYLKHFASDRSHMKDSSGNWREQPPPYPCIETGDSKMNLNDFISMNPEVGWGAVYTLSEFVHRFGSKNY	179443	154261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_155139_159879_160005_164514_164664_172991_173092_179293
875286	contig_8992_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_174432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCCCCGCACCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326172	324197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_324200_326200
875287	contig_10596_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_173586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTATCAGGTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793032	791393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_791400_793000
875288	contig_3252_pilon	-	3017	1	Intergenic	novelGene_61478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCAGCTGCTCAGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166507	163490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_163500_166500
875289	contig_10481_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_170528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATACAAAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71230	70330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_-_70300_71200
875290	scaffold_4805_pilon	+	2828	11	Intergenic	novelGene_161044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_10	29.2479059079449	43	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	57	1151	913662	957168	FALSE	10	GCTGTTTTCTTTGGTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRRYFILDTREDSFVWYMDNPQNLPSGSSRVGAIKLTYISKVSDATKLRPKAEFCFVMNAGMRKYFLQANDQQDLVEWVNVLNKAIKITVPKQSDSQPHSDNLSRQGEYPCAKKQVSYRTDIVGGVPIITPTQKEEVNECGESIDRNNLKRSQSHLPYFTPKPPPDSAVIKAGYCVKQGAVMKNWKRRYFQLDENTIGYFKSELEKEPLRVIPLKEVHKVQECKQSDIMMRDNLFEIVTTSRTFYVQADSPEEMHGWIKAISGAIVAQRGPGRSASSEHSTCPAESEHALRPASGSAAPSHSTATRSSSLVSSFAMEKRGFYESLAKVKPGSFKIQTVSPREPASKVTEQALLKPQSKNGPQEKDGGPVDLDDASLPVSDV	913605	958845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_913677_918666_918724_921331_921378_933049_933148_940086_940219_944681_944826_945792_945862_951609_951675_952258_952323_954154_954245_956853
875291	contig_12257_pilon	+	2908	14	Intergenic	novelGene_152085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	63.7215651865401	167	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	928	2787	68	2854	105115	117531	FALSE	15	AAGGTGCCTCTGCTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRGLERQVRAEIEHKKEELRQMVGERYRDLIEAADTIGQMRRCAEGLVDAVRATDQYCARLRQAGPGAPRPPRTPEPQQASQEKFYSMAAQIKLLLEIPEKIWSSMEASQYLHATQLYLLCCHLHRLLHLDSSGSPHSPVLSRFPILIRQVAAASHFRSTILHESKMLLKCQAVSDQAVTEALCSIMLLEESSPRQALTDFLLARKAAIQKLLNQPHQGVGTKAQICSLVELLATTLNQAHALFYTLPEGQLPDPSLPCGLLFSTLETITGQHPNGKGISVLQEEMKLCSWFRHLPASIVEFQPALRTLAHPISQEYLKDTLQKWIHMCNEDIKSGLTNLLTYVKNIKGLAGIRDAMWELLTNESTNHSWDVICRRLLEKPLLFWEDLTQQLFLSRLQTLMKEGFDSISSSSKELLVSALQELESSANSSTPNKHVHFEHNMSLFLWTESPNDLPPDAAWVKVANRAQFASTGLSMKAHAVSPCVQSFCSALDSKLKVQLDDLLAYLPSDDASLPKDASPKNSAFDRYADAGTVQEMLQMHSVACIQHITARICAELQSIEEVVHRQLGVLTGVKLHAVLFMARLCQSLGELCPHLKQCILGKSGSSEKPAREPRALKKQGKGKAQELMPLQTKWQEVKGLLLQQSVTAYRVWSSAVVQVLVHEFTQSLLSDDAGSVLATATSWDELEIQEETESGSSVTSKIRLPVQPSWNVQSFLFSLCQEVSRAGGHALPKVTVQEALRSCVVQVAAAYEKLAEEKQTKKEGAFPVTQNQALQLLYDLRYLSIILTAKSEEAKSGRSKQDSRTEKVIDYLEGLIDPFDLDVFTPHLNSNLSRLVQRTSVLFGLVTGTENQFTPRSSTFNSQEPHNILPLATSQIRFGLLPLSMTSTRKARLTSRGAETKAQVVPPALSRADDPTHPGSLFRQLVNEEEDTSTPSLFKLGWLSSMTK	105047	117585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_105280_107806_108052_108199_108382_108491_108663_109648_109806_110332_110544_110943_111727_112555_112703_113443_113606_114688_114817_115486_115596_116043_116154_116234_116314_117393
875292	contig_14450_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_48997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAGCAATTCCTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083545	1080671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1080700_1083500
875293	contig_9940_pilon	+	5655	4	Intergenic	novelGene_125339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	5142	5459	166732	167049	FALSE	60	TGAAAGAGAGGGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNGSSCFMVALIMFSSSRSLMGGTDILVSSLNSSCSSGSISCSPGSSPYLLEKMFSWVMWPSICLLQDRVSPGSFFTSFKPMLNIPLPGECVLCDRVLVFLRGA	50492	167245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_+_54232_59501_59614_68903_69108_165645
875294	contig_14519_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_66830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTTTGTGACATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348460	351142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_348500_351100
875295	contig_11281_pilon	+	1677	7	Intergenic	novelGene_125414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_5	66.9993781065665	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	49	999	2116	44101	FALSE	40	ATCAGGGTATATTAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGFGLLWGHFLQIRATQSVFISTCLSLSSTPLVSRFLVGSARGDKEGDIDYSTVLLGMLVMQDVQLGLFIAVMPTLIQAGAGTYSSIFMEILRILVLIGQILFSLAAVFLLCLVIKTYLMGPYYRKLHMESKGNKEILILGISAFIFIMLTITELLDVSMELGCFLAGALISSQGHMVTEEIMSYIEPIRDFLAIIFFASIGLHVFPTFVIYELTVLMFLTLSVVVLKFVLAVLVLSLILPKSSQYIKWIVSAGLAQVSEFSFVLGSRARRAGIISREVYLLILSVTTLSLLLAPVLWKAAIMKCVPRPERRSSI	2067	44779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_2258_15878_15997_26231_26428_36470_36622_41902_41983_43086_43237_43987
875296	contig_6272_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_160456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTGTTCTTCTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175196	172737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_172700_175200
875297	contig_6795_pilon	-	3109	2	Intergenic	novelGene_27713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTACAGAATAAAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144202	136190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_139044_143946
875298	contig_4812_pilon	+	2644	23	Intergenic	novelGene_103692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_10	53.236743199094	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1329	1316	2644	276420	319126	FALSE	35	TCCATGGAACAGGTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEEIAQSLKEEQKKVPSEASFSDVQLEEAESNSLTKSGSTESLNPRPQTTISPADLHGMWYPTVRRTLVCLSKLYRCIDRAVFQGLSQEALSACIQSLLGASESISKNKTQVDGQLFLIKHLLILREQIAPFHTEFTIKEISLDLKKTRDAAFKILNPMTVPRFFRLNSNNALIEFLLEGTPEIREYYLDSKKDVDRHLKSACEQFIQQQTKLFVEQLEEFLTKVSALKTMASQGGPKYTLSQQPWAQPAKVSDLVSSAYKTIKAKLPLTLRSMSLYLSNKDTEFILFKPVRNNIQQVFQKIHALLKEEFSPEDTQIIACP	247720	319126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_248015_262508_262656_264352_264415_265584_265751_266428_266504_267603_267697_268733_268860_270334_270416_274401_274446_274901_275029_275869_275949_276398_276491_277571_277712_279166_279328_287773_287880_296906_297032_299606_299697_302680_302802_305704_305794_305902_306038_312841_312918_317651_317780_319039
875299	contig_383_pilon	+	2406	3	Intergenic	novelGene_126088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	650.5	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	128	406	69445	79441	TRUE	45	TACCAAGAGCTACTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAAVTATRSLRALTAEDSSGARRALPRSPGAAAGRRREGAMFADCPRFWVLVVLGTSWAGWGSQETQAAQLRQFYVAAQVISWNYCPQPTDPSLNTSETFFKKIVYREYEAYFKKEKPRSSISGKLEICIHF	69317	83747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_69603_79320_81068_83373
875300	contig_9121_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_134480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCTCGGAAGGCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288624	286271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_286300_288600
875301	contig_12086_pilon	+	1343	9	Intergenic	novelGene_74712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_8	7.24461006542105	109	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGGCAGGAGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40072	75542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_+_40451_49664_49750_50609_50783_51207_51388_52814_52923_53265_53382_61402_61537_72289_72359_75442
875302	contig_9414_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_131077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_4	97.6534049585574	112	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	165	1058	370409	396291	FALSE	30	CTTTGGGTAAAGGTTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEEQFVNIDLNDDNICSVCKLGTDKETLSFCHVCFELNIEGVPKSNLLHTRSLRGHKDCFEKYHLIANQDCPRSKLSKSTYEEVKTILSKKINWIVQYAQNKDLDADSECSKNPQHHLFNFRHKPDKKLLPQFDSQVPKYSAKWIDGTTGGLSSCTQRILEQRENTDFGLGMLKDSGTSLCHNSILWSHSHNQSQKKEETVSNPEAIVQTQHPHYSREELNSMTLAEVQQLNAKLRQQIQEVFEELTHQVQEKDSLASELHVRHVAIEQLLKNYSKLPCLQVGRTGMKSHLPINN	369484	397243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_369642_370401_370536_392719_393257_394244_394308_396124
875303	contig_15449_pilon	+	2544	3	Intergenic	novelGene_33635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	807	junction_2	652.5	8	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1217	1591	84815	88945	FALSE	15	AGCTGATGGTTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSNLNPNAKEFVPGVKY	83598	89898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_84953_86000_86181_88888
875304	scaffold_13505_pilon	-	438	7	Intergenic	novelGene_111478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5625.57460768824	2027	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	34	399	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548328	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_541942_542013_542033_547363_547465_547734_547806_548295
875305	contig_211_pilon	-	4459	1	Intergenic	novelGene_129888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	865	1272	366371	365964	NA	20	TGTTAGATTTCACCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRALPISFISSHLTPLPVTGPSPTLLISAPLTLLAIPVPGLCTSGVLGSNGPPPAIPGPLPSCHPSLHPSRQPSPQSPPLPHLYVLHSAHFSGGFLLTRVCSVVSSTRPCVSREQALWSQLYPWCSAWCMLSPR	367235	362776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_362800_367200
875306	contig_16722_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_118305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAACTAAACTGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160716	158515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_158500_160700
875307	contig_8921_pilon	+	2353	3	Intergenic	novelGene_161632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.5	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	810	1610	253629	254429	FALSE	15	GCCATCTACTTGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTGEKPYKCVECGKGFNRSSYLTQHQRIHTGEKPYACTECGKHFTHHSNLVQHHRTHTGEKRFLCKVCDKAFCDSSSLNRHKKIHADKKPYECTECGKVFAQLCAFVGHQRTHSGETPFECKECKKTFCYKFSLTQHMWLHTGEKPFECSECGKTFSLRVRLSQHQKIHTGEKPYECHECGKAFTFSSKLSRHRRIHTGDKVFVCKRCGKAFGQRDYLNRHQVTHREERPFECNHCGKSFGWENRLIRHLRIHTEEKSHYVSLL	247794	255172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_248011_251144_251241_253131
875308	contig_9436_pilon	+	2085	10	Intergenic	novelGene_60912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_5	111.825260513396	47	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	112	657	420868	429997	TRUE	20	CGAGCCCTCAGCACTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAQRQLAVAAVRAEVRRHEVTKQALSRLRKLTERVGDPELRDSIQASLDSIQEAVVNSQEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQHKKDMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGRPGPGTGGDTR	420756	432428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_421028_427395_427455_428096_428185_428349_428436_428568_428718_429993_430129_430451_431377_431461_431567_431981_432145_432324
875309	contig_4271_pilon	+	1569	15	Intergenic	novelGene_171869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76.9317216492545	214	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	501	1568	514288	584362	FALSE	25	TAGGTGGCATTGTCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPHPGGTWRRRASALGSRHLRVGEGSTRARSPPRPNCPVCEAGLNITHICLPPDSGEDEIIDEILKINEDTRVHGLALQISENSFSNKVLNALKPEKDVDGVTDINLGKLVRGDAHECFVSPVARAVIELLEKSGVNLNGKKILVIGAHGSLEAAVQCLFQRKGSMTMSCQWETPQLQSKLHEADIVVLGSPKPEEIPLSWIQPGTTVLNCFHDFLSGKLECGSPKVHPSGLIVEDDVSLLAAALRIQNVVSSGRRWLREQQYTRWRLHCLKLQPLSPVPSDIEISRGQTPKAVDVLAKEIGLLADEIEIYGKSKAKVRLSVLERLKDQADGKYVLVAGITPTPLGEGKSTVTIGLVQALTAHLNVNSFACLRQPSQGPTFGVKGGAAGGGYAQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLLAAAIDTRILHENTQTDKALYNRLVPLVNGVRAFSEIQLARLKKLSIHKTDPSMLTEEEISRFTRLNIDPSTITWQRVLDTNDRFLRKITIGQANTEKGFSRQ	495708	584363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_495837_505600_505655_510305_510431_512770_512872_514195_514333_536291_536404_552324_552417_553966_554065_557444_557619_568440_568578_570677_570725_575161_575270_576131_576207_577887_577991_584285
875310	contig_19640_pilon	+	2441	1	Intergenic	novelGene_134880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAACTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117161	119602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_117200_119600
875311	contig_8140_pilon	+	1499	15	Intergenic	novelGene_86453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_13	29.0355166044931	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	170	1243	842417	907415	TRUE	70	ATAAAAATTAATAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPCGTVNAERGWFVSAQQPEEAEAEESSPLLSNELHRQGSSGVSFGFSVFNLMNAIMGSGILGLAFVMANTGILGFSFLLLIVALLASYSVHLLLSMCIQTAVTSYEDLGLFAFGLPGKMVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAISEFLAGDYSGSWYLDGQTLLIIICIAIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMVFFALVVIIKKWSIPCPLPLNHIEEYFQISNATVDCKPKLFHFSKESAYAIPTMAFSFLCHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAVALSFLLYFISALFGYLTFYDKVESELLQGYSKYLPHDVIVITVKLCILFAVLLTVPLIHFPVPAHQHV	842247	907850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_842522_843683_843815_846153_846228_865395_865449_868628_868669_881391_881471_888214_888298_888758_888818_892629_892696_892905_892960_895088_895169_895520_895622_905636_905762_907391_907487_907665
875312	contig_11448_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_66444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCACCAAAGCCTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670501	672894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_670500_672900
875313	contig_211_pilon	+	2512	2	Intergenic	novelGene_129865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	1205	2305	142945	144494	FALSE	20	CAGCTAATGTTTGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQEGTSPGLPTMASALTPPGRVPAGSQAPQQDPAGVHWAPAEIRHLLAIMEEPAIKRRLKTVRRNTSVYEDVARRLQEHGYVRHPHQCRTKFKALKVAYKKAHMAVLHSGAAPQGCPFYEEMGRVLQTKGSTSPDNFREQTQPGDLDHHNWPTQRRELEDRPEGHSLQQLQQDGSELEMEMETEHQFKLEVEVLELPSDLSPESLTGTQAEKTTETEISPAAQGTGAEVQRRPESLDRNQPQKETPSSAPRVLGVSTVPPRARVGRVRRPQPRARNRRCYQPATAMIASEMAENRRLASELARESAAQLQRFLDQHNAHMAALVQVARDSYAQRQEVVAILQDVADDIHEGVALLRSSVGRLSQE	141740	144701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_143630_144078
875314	contig_5331_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_112843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAAATAAGTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796092	798047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_796100_798000
875315	contig_8269_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_106218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCTACTACCCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253322	250777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_250800_253300
875316	contig_18843_pilon	-	2577	2	Intergenic	novelGene_165606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCACAGGAGGAAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33580	28500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_-_28583_31085
875317	contig_10225_pilon	+	3037	1	Intergenic	novelGene_86768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	407	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGAGACAGGAAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20646	23683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20600_23700
875318	contig_2537_pilon	+	4299	1	Intergenic	novelGene_33424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	579	938	230960	231319	NA	85	AGAAAAAAAAAACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPEYPRKIYVHVEEKYLMGSFTLINKLAHFQTLRLKGNLRIKGGDSIKKSRLETPLRVNAALQLAFVNQYNENTFMVFCVGVTFSSCQSWNACLFLGLERRGVSEQTRDALSHICSL	230381	234680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_230400_234700
875319	contig_14814_pilon	-	2653	1	Intergenic	novelGene_137737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	244	699	390864	390409	NA	10	GCACTTTCCTGAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPPTCSHAYSCEPSAIYWLPCSGGALLRGGPSIPHSHLTGRTTQLSLTPDDTLSPGSALLHMNSQKSWQKTALRVTGTTCLWVVKWPFSPPRADSEFSTQIIQQVPPEHLLCAGYRWRCWRGSSQHRHRSPICWVVSPLSMMSLKHKSF	391107	388454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_388500_391100
875320	contig_10756_pilon	+	4641	1	Intergenic	novelGene_170668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAGGTTATTTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91968	96609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_92000_96600
875321	contig_7342_pilon	-	1435	3	Intergenic	novelGene_71178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	110	junction_2	222.5	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTTTACAGGTATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482469	476296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_476762_480882_481479_482095
875322	contig_10003_pilon	-	3873	1	Intergenic	novelGene_88274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	491	868	810736	810359	NA	65	ATGTGGAATCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIAVFGGNHADLGWFIRITWLNTFKKLAWDLNLLTTCCVSFRNFDILKLQIYLRVSKFRNTYQEIFHAMTFSLPMRYTWTQLFCCFIKSEVIHSAGENSLSIMADRTLVEILSLLFNLKCTFLQ	811226	807353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_807400_811200
875323	contig_3721_pilon	-	3812	1	Intergenic	novelGene_123779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCAGTTGACTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11572	7760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_7800_11600
875324	contig_10235_pilon	+	1010	6	Intergenic	novelGene_46320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1236.94161543704	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	619	945	92983	93309	FALSE	25	TCTCCTCCTTACCAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSAWWSQRKRTEPRGTRRPQNSGVLFLTSFPWATSSRYHVTEPMAGLPWLALKKQGREVVAPSWVRISGGWITQRAQDPGGQKEDPEKYLHSYTKVKGRDSLESDI	89953	93374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91627_91825_92537_92671_92894
875325	contig_8394_pilon	-	1880	5	Intergenic	novelGene_27332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	2.8613807855649	87	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	290	595	182135	177722	FALSE	45	CAGAAAATCACCCAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPAQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKLEQGEDPWIIKKDISNWIYPDENQADGRQGKCNISLFVFLID	183823	176436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_177886_178131_178259_182120_182180_182871_182989_183695
875326	contig_8273_pilon	-	878	2	Intergenic	novelGene_113082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAGAAAAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96860	94919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_95026_96088
875327	contig_2757_pilon	+	3112	1	Intergenic	novelGene_164593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	136	435	259443	259742	NA	10	GGAGTCTGCTGCTTGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKIPRPGSSGSRGGGGSSSSSSEISTPEKPPNQRAGPFSIRWETAMGEPSTSIPMTVGSLPSSKSFLGMKARELFRNKSESQCDEDGMTISSLSETLKTELGKDSGVEAKTPLNLDGPHPSPPNLDSVGQLHIMDYNETHHEHS	259307	262419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_259300_262400
875328	contig_8161_pilon	-	3250	6	Intergenic	novelGene_156769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4.8	75	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	220	2196	354813	334002	FALSE	10	GCTTCTCCCACTGCGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSVLQAVDQGPLRSKPDLADYINGGERRRDAGEGALHRLAGELHRWVLPPPPPRNSERKCRACGNRLKQQRPMEAKAPPNPRILQELGAACGVEGLLAEPHSSGGLSSPVRFLLAEPGLHADWIRETHIGDILPPAEVDSTLDSTSDSCRTDSEEAGTSQPSRARGRIRGSRPRGGHRWSRKLQHGVDHVEVGDEPKEGRGHTPAGTLCSREDAVPKPPALESKRASLGSQWQPGPGLGNCPAHLPDSPPPCRTAYAMTSSMKFGLSGPGRQAQVIESHESLETASTSSLQQSHAEPSAPNQAQQPTASLSSEGRVPTPPSSRKTASSPVPHRKAAPAGPHRPGDQPDPGDTPLPPSRSVVPRTCEHTPPQTQSCSPQVTHPLLALSTNCNNSVALELQEPWGEAIPESRVEGGLCSQEPELPLENSREGGLQGFPSPAAVGTISSTGTTLSLASEEPEGGPQRTELRSGGRVPSGASPGVSAGPSLPSATPSERNKKSSSSIASTLGLKKFFAALGQSTRPKLGKSRSYSVEQLQSPAPNPVSHTSTPKVKRTPSLQSLHLVSSSHQHRKAASFQNLHSLLRSKVDRSSLYLIGEPEDHSATGRPAKAPPRRALSVEDVGAPSLARTVGRVVEVYPDGTSQLQLQRSPEGTFGFCVASGNGRRDSGFYVQEMADASTAKLYSGLLGVGDELLEVNGAKVAALGLAHIKELLAHAESLSVRVLRQRPVPR	355032	332947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_334196_340224_340410_341698_341827_345840_346100_350977_351117_353741
875329	contig_5878_pilon	-	3941	1	Intergenic	novelGene_145737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379398	375457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_375500_379400
875330	contig_17108_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_109518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGATTTTAAGATACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48465	50449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_48500_50400
875331	contig_4364_pilon	-	1480	5	Intergenic	novelGene_197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	61	399	1271013	1270675	TRUE	15	CCCCAGCAGAGCCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGVYSRSEGEAGTGPLLSQMPKAQQTGRHDRGKGAEGHRRRLPTLCLVPVCPGWVRGEGGLPMGGGPESGVEVAEGRPGRTQKTAQMKTINTDRPGTRLRPGQVGQVRLGHWLCLSRGCLVAVGEFRRWPR	1271073	1268884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1268901_1268997_1269083_1269487_1269565_1269646_1269713_1269837
875332	contig_14167_pilon	+	923	2	Intergenic	novelGene_105538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	542	922	55388	64527	FALSE	50	CTACAGAAGGCAAACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSSLVWKFKVMISWDIPVTWPNNVFSASVLSPSSLRSTWGLKSFQVAIRGTTIGLYSPGSRHMNLQHSLGSLRYCWQPCGRSQRAATHISGSPPWQVQLRHRSSPLGVKENPSSTTLSLMSTHV	54846	64528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_55562_64320
875333	contig_10451_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_138309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATGCTGTGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144082	145977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_144100_146000
875334	contig_9706_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_21044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGGCCTTGGGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680916	678535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_678500_680900
875335	contig_151_pilon	+	3036	1	Intergenic	novelGene_132578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249668	252704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_249700_252700
875336	contig_6102_pilon	-	2625	1	Intergenic	novelGene_32286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTTGGATCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463282	1460657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1460700_1463300
875337	contig_4754_pilon	+	3009	2	Intergenic	novelGene_35925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGTAAAACTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263575	271640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_263701_268756
875338	contig_12050_pilon	+	2655	7	Intergenic	novelGene_62689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	51.7958063510508	157	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	466	1092	611491	613184	FALSE	45	AAACTATTAAATTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNEPPPPYPGGPTAPLLEEKSGTPSTPGRASPPVMQPPPAMPLPPADIGPPPYEPPSHPMPQPGFVPPHVNPDGAYVPPGFYPPPGPHPAMGYYPPGPYPPGPYPGPGGHTATVLVPSGAATTVTVLQGEIFEGAPVQTVCPHCQQAITTKISYEIGLMNFVLGFFCCFMGCDLGCCLIPCLINDFKDVTHTCPNCKAYIYTYKRLC	590261	614747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_590368_610256_610508_610776_610865_611470_611576_611801_611958_612642_612917_613072
875339	contig_5041_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_27013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGAATAATGGTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203260	205850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_203300_205800
875340	contig_9505_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_121841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATGCATGAGAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519061	520797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_519100_520800
875341	contig_4232_pilon	+	2882	1	Intergenic	novelGene_63237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATACGTTGACCAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268080	270962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_268100_271000
875342	contig_18545_pilon	-	2492	4	Intergenic	novelGene_161887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	50.6776303927307	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	3	476	350015	323071	FALSE	45	AGATTATTATAGACAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKPPAFKKSSSPGTTSSGSSRLPQPSSTNKSVVGVPSGKVSSVSSSLGNKLQSLSPSHKGIASPNVGANIKSRSSTPPSLARNPASGVPTSKRKTYTESYISRPDGDYLSSLNGGNIKSSEGNSSGHLPKFCHECGTKYPVEWAKFCCECGIRRVVL	350017	321054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_323237_328260_328369_349215_349316_349915
875343	contig_12970_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_50555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATGTATTAATGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592527	594491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_592500_594500
875344	contig_12765_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_106558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111575	109597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_109600_111600
875345	contig_10711_pilon	+	2648	10	Intergenic	novelGene_118413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_9	635.406742484735	66	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	437	2365	228192	235426	FALSE	35	CGTATAGTAAGCAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSVTTVTKTHQELQEFLLKLPKELSSETFDKTILRALNQGSLKREERRHPDLEPILRQLFSTSSQAFLQSQKVHNFFQSISSESLHSLNNLQSSLKTSKILEHLKEDSSEASSQEEDVLQHTIIHKKHTGKSPIVNTVGTSCSPMDGLTMQYSEPNGIVDWRKQSYTTIQHPEHCVTLADQHSADKWSLSSINKKKGKPQIEKEKSKKTDNRLNSRINGIRLSTPQHVHDGSVKDVNLDIGSGHDTCGETSSESYSSPSSPRHDGRESFESEEEKDRDTDSNSEDSGNPTTTRFTGYGSVNQTVTVKPPVQIASLGNENGSLLEDPLNSPKYQHISFMPTLHCVVHNGVPKPEVVVPPPKSVDGKTIGMLVPSPVAISAIRESTNSTPVGILGPTASTGESEKHLELLASPLPIPSTFLPHSSTPALHLTIQRLKLPPPQGSSESCTINVPQQSAGSLSVGSPNTAFIPVHNPGSFPGSPVATTDPITKPASQVVGLNQMVPQVEGNTGTIPQPTNVKVVLPAAGLSAAQPPASYPLPGSPLATSVLPNQSSNVLNTAAASTQPASAGLSQVQPTVPPAVPTHTPGPAPSPSPALTHSTAQSDSTSYISAVGNTNANGTILPPQQMGSGPCGSCGRRCSCGTSGNLQLNSYYYPNPMPGPMYRVPSFFTLPSICNGSYLNQAHQSNGNQLPFFLPQTPYANGLMHDPVMGSQANYGIQQMAGFGRFYPVYPAPNVVANTNGSGPKKNGNVSCYNCGVSGHYAQDCKQSSMEANQQGNHDNSQRTCF	203659	235709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_203721_207021_207135_221143_221239_224239_224324_226053_226112_228166_228303_229386_229452_229837_229933_230567_230697_233897
875346	contig_8760_pilon	+	2425	19	Intergenic	novelGene_175043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_10	42.7714281001745	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2421	5	2425	62575	130121	FALSE	65	GAAGAAGAAAGAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFTLLGNANGATCAFPFKFENKWYADCTSAGRSDGWLWCGTTTDYDTDKLFGFCPLKFEGSASLWNKDPLTSIYYQINSKSALTWHQARKSCQQQNAELLSITEIHEQTYLTGLTSLLTSGLWIGLNSLSFNSGWQWSSGSPFRYLNWLPGSPSAEPGKSCVSLNPGKNAKWENLECVQKLGYICKKGNTTLDPFVIPSERDVPTNCPSQWWPYAGHCYKIHREEKKIQRGALIACRKEGGDLASIHSIEEFDFIFSQLGYESNDELWIGLNDIKIQMYFEWSDGTPVTFTKWLRGEPSHENNRQEDCVVMKGKDGLWADRACEQPLDYICKMKAQTQAPGIVEVETGCRKGWKRHGFYCYLIGHTLSTFTEANQTCGNEKAYLTTIEDRYEQAFLTSLVGLRPERYFWTGLSDVQTKGTFQWTIEEGVHFTHWNADMPGRKAGCVAMRTGIAGGLWDVLKCDEKAKFVCKHWAEGVTRPPEPTTTPEPKCPEDWGTTGKSSLCFKLFTKGKHDKKTWFESRDFCRALGGDLASINNKEEQQAIWRLITSSSSYHELFWLGLTYGNPSEGFSWSDGSPVSYEHWAYGEPNNYQNVEYCGELKGDPGMFWNDINCEHLNNWICQIKKGQTPKPEPTPAPQDNPPVTEDGWVIYKEYQYYFSKEKETMVNGREFCKRNFGDLVSIQSESEKKFLWKYVNRNEAQSAYFIGLLISLDKKFIWVDGSKVDYVAWATGEPNFANDDENCVAMYSNSGFWNDINCGYPHAFICQRHNSSINATVLPTTPPVKGGCEEGWKFYNNKCLKIFGFI	62570	130121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8760_pilon_+_62747_67384_67550_76271_76386_79229_79377_85608_85795_90781_90940_93523_93635_110263_110380_113711_113861_116194_116395_121133_121262_121749_121838_123211_123357_125050_125093_125825_125990_127281_127350_128781_128883_129554_129698_130097
875347	contig_1624_pilon	-	4113	1	Intergenic	novelGene_138385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	2	505	425258	424755	NA	35	TAAATAGAGTTCACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKNLDAIHDVTVAYPHNIPQTEKHLLNGNFPEEIHFHVRRYPIDTLPTSKEDLQLWCHKRWEEKEERLRSFYQGEKNFYFTGRSVIPPCKSELRVLVVKLLSILYWTLFSPAVCLLIYQYSLVRWYFIITIVIFVLQERLFGGLEIIELACYRFLHKQPHLNSKKNE	425259	421146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_421100_425300
875348	contig_14220_pilon	+	3139	1	Intergenic	novelGene_159846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGCACTTAATATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254362	257501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_254400_257500
875349	contig_10367_pilon	-	1290	4	Intergenic	novelGene_169458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	119.30074042799	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	125	769	135038	131866	FALSE	25	ACCAATTCGGTGACTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWHSVRDSEGQRLLVGVGPEGISICTDDFNPINRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAASCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	136255	131344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133642_134055_134895_135061_136153
875350	contig_12257_pilon	+	3360	3	Intergenic	novelGene_152111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	66	junction_2	66.5	49	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	247	1227	152301	157632	FALSE	45	AAACTTTAACCTAGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKSLDVPVDYCSSPINLNNELKTVRTSLSSSKRNSKPRDHLSEVPTDVRSSETQEENTQSLILGPRVSPFSKIPVEESEEVMYGMRANGLHLGVEVHGVKGNAEKSLSVRETQDWPPRSNGYKKNSGTDDSVAEKQSQDERPSFNLSTPRGTTRNEFLSVSQSSNQSLTSLAIKCLHEEKAKARSHNPGSGIQTLVEGEEQASLEPRSAHHCQALHAGPSQWPLNPAWHHTSKTPFTSQVDAAGRRALPRSMGLEWFPELYPGYLGLGVLPGKPQYWNAMAQKPQLMSPKEERLSPVPLLERRSTDRRILEPLTRLTTSSFSLMRLLGALQKGWTRCSSTVKGSGVGSITMLFTGYFVLCCSWSFKHLSKPFCIFSLYYRSHPIIGTSNGFSGRLFILQFCSVWHAP	152054	159765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_152947_156678_156787_157405
875351	contig_3601_pilon	+	1643	3	Intergenic	novelGene_132926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.5	90	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTCAGTTTTAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355913	364267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_355968_360612_360870_362935
875352	contig_7045_pilon	+	2570	7	Intergenic	novelGene_77448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_6	236.040250804815	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	126	1064	323324	389167	FALSE	20	GCTATATTCTGAAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFSEAALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHSRPIVTVWERELRKAKPNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTKDFAPVIVEAFKHVSSETDESCKKHLGRVLSIWEERSVYENDVLEQLKQALYGDKKPRKRTYEQIKVDENENCSSLGSPSEPPQTLDLVRALQDLENAASGDAAVHQRIASLPVEVQEVSLLDKITDKESGERLSKMVEDACMLLADYNGRLAAEIDDRKQLTRMLSDFLRCQKEALAEKEHKLEEYKRKLARVSLVRKELRSRIQSLPDLSRLPNVTGSHMHLPFAGDIYSED	323198	390673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_358372_358503_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364288_389017
875353	contig_9011_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_159284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	293	610	316729	316412	NA	15	ATTTTGTATCAGGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDPPPAAERVGEKCARIACSAPCFGSLLPPRGRVCPRPLGSQMDVPGCGSLAASELGRFAKSGKTGRLELPFGIATPRTGPYRISPTETTELKRKVCSPGAIS	317021	314523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_314500_317000
875355	contig_13966_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_158154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	322	519	430682	430879	NA	60	AAAAAAAAAAGGGCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARLLPGLLFSQHLSGGAARLRTPGAAKVRPLLTGLCCFCRRRLGSGVAPFPRGAWTEAASARSAGSSSCRLLSPPGFPAALASFLVHPRRSYSTEEQQPQPRQKTKMIILGVSNPVNWIRTRIYSFLIWAYFDQEFSIREFSEGAKQVCLFPWLTCPPRMHSAITHRSVKW	430360	431995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_430400_432000
875356	contig_57_pilon	+	2264	5	Intergenic	novelGene_44883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	182.570534314823	181	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	137	664	66895	87228	FALSE	65	AAAATTTAAAAGTTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWR	66758	88828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099
875357	contig_19769_pilon	+	1484	4	Intergenic	novelGene_102343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	20.0388511535855	378	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGTTGATTCTTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200275	202728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_200694_200909_200995_201126_201274_201894
875358	contig_7271_pilon	-	3164	1	Intergenic	novelGene_159951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATGATAAAACTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468351	465187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_-_465200_468400
875359	contig_10434_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_82061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATCAAAAATAATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175168	172731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_172700_175200
875360	contig_7411_pilon	+	2837	8	Intergenic	novelGene_137003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	36.9621980086771	265	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1504	2121	251665	263836	FALSE	40	AAAGACCATCGGATGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRPRLLVSQQPRTTCAQPRGSHAVCTCCFQPMPDRRAEREQDPRVAPQQCAACLQPFCHLYWGCTRPGCFGCLAPLCELSLGDQCLDGVLNNNSFESDILKNYLAARGLTWKNLLTDSLAALQRGAFLLSDYRITGNTVLCYCCGLRSFRELAYQYRQNIPASELPVAVTSRPDCYWGRNCRTQVKAHHAMKFNHICEQTRFKN	250161	264552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_251698_252455_252574_256377_256462_256934_257006_257905_257994_260152_260261_261659_261733_263793
875361	contig_14142_pilon	+	1965	2	Intergenic	novelGene_120443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	188	370	86910	87092	TRUE	5	TCTGGGCCCTTCTCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVKCVRLVINLAPNALGSSATATGGYKPGGDRPLSQVPGILGPHYIINFGILLLRAFIVIYMCMYYFKGRELSHFENLMEILAPFSKIIYTYVSTCVCMHTHMCTHTFGNSFRRSRLRIHL	86722	90133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_88005_89450
875362	contig_7622_pilon	-	2265	13	Intergenic	novelGene_132430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	214.707342807729	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	205	1611	297961	274465	FALSE	40	GTGAGAAAAAACCCCCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKEKGYATDESTVSSVQGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGM	306641	273810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_274674_276552_276721_280542_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
875363	contig_5316_pilon	+	3264	1	Intergenic	novelGene_61253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACCAAGTCCCAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495035	498299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_495000_498300
875364	contig_10627_pilon	-	1657	9	Intergenic	novelGene_60070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	36.9991553957655	285	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	5	1201	1364009	1349383	FALSE	20	TGGATGTTTTCCTGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMADSYSEGVPAVRNGKREQFGSRFLSDPARVFHHNAWDNVEWSEEQAAAAEKKVRENSAAPRVPQEKQGAPEGALDGIYSYGTREQIDYEINAHKYWNDFYKIHENGFFKDRHWLFTEFPELAPSQNQNHLKGLLSEDKRNEIPACRSSEDGPGLTAEEQHKCSSSSLRDKTQVSSVEKNVTQELSHLRICADEFPGSSATYRILEVGCGVGNTVFPILQTNNDPGLFVYCCDFSSTAVELVQSHSEYDPSRCLAFVHDLCDEDQSYPVPRDSLDIIILIFVLSAIVPDKMQKAINRLSKLLRPGGMMLLRDYGRYDMAQLRFKKGQCLSENFYVRGDGTRVYFFTQDELDTLFTAAGLEKVQNLVDHRLQVNRGKQLTMYRVWIQCKYRKPLLSNTG	1364013	1348926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1349538_1350439_1350506_1352336_1352444_1354139_1354280_1356035_1356097_1360070_1360121_1361234_1361594_1363533_1363683_1363899
875365	contig_11396_pilon	+	1205	7	Intergenic	novelGene_71438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	504.807361497653	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	706	1191	1787748	1789745	FALSE	10	TTTGCTTGTGGTGATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVWGCRWYFLWLVWGLAPMLTRLVCRQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLAIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS	1782256	1789759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1782430_1786125_1786253_1787237_1787271_1787375_1787958_1788432_1788553_1789201_1789265_1789652
875366	contig_8594_pilon	-	2804	1	Intergenic	novelGene_140022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGTTAATTGATGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192189	189385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_189400_192200
875367	contig_8594_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_140069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGACAGGACAGAATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522827	525041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_522800_525000
875368	contig_6361_pilon	-	3973	1	Intergenic	novelGene_23949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGAGATAACCACCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368216	364243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_364200_368200
875369	contig_2646_pilon	+	1888	3	Intergenic	novelGene_69676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	157	333	2207400	2207576	TRUE	30	CAGAATCCATACTTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVAPLIINKHKWQGGLEAVLWPSSHCSACPAPPPGGGFLPATFPHPDSPARMGGTRLLAVGRLLWLQPLLLSVSAWMAVTSFCTESLPALAQGCHCDFSHLQKIPLLPL	2207243	2209638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2207599_2207748_2207857_2208213
875370	contig_1009_pilon	+	2464	13	Intergenic	novelGene_121718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	115.595649427938	34	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	295	1293	99747	185109	TRUE	30	CTTTGGAAAACTGTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSAQLSTTERVIKAVPFPPTQRLTLKEVFENGKPKIDVLKSHLVKEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECRIKYSEDVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITCLDDIKKLDRFKEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGSEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKESATHSFDYPQWWQIFVL	99452	205703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_99796_142330_142529_143089_143215_169778_169891_179433_179580_181526_181667_183899_183978_184062_184158_185053_185169_188479_188606_189335_189411_204164_204247_204874
875371	contig_5352_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_177068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGGTTTTGTGTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168837	171546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_+_168800_171500
875372	contig_12355_pilon	-	874	3	Intergenic	novelGene_172104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	28.5	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	94	309	242712	233315	FALSE	30	AGTATATTTTATCACTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFVETLDKCFENVCELDLIFHVDKVHNILAEMVMGGMVLETNMNEIVTQIDAQNKLEKSEAGLAGAPARAVSAVKNMNLPEIPRNINIGDISIKVPNLPSFK	259519	232749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12355_pilon_-_233444_242625_242734_259447
875373	contig_5643_pilon	-	1756	9	Intergenic	novelGene_38911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	56.6960095597565	232	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	213	587	326588	324162	TRUE	40	ACAATAAATACATGTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLQDGCGDVFGTLPGQDRLRRRQCWNYRKVYDKIWNPKRKKVTRRREDGVNFCRGIENLPFELQRNFQLMRDLDQRTEDLKAEIDKLATEYMSSARSLSSEEKLALLKQIQEAYGKCKEFGDDKVQLAMQTYEMVDKHIRRLDTDLARFEADLKEKQIESSDYDSSSSKGKKKGRTQKEKKSCPCSLQREKLR	333043	322358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_323273_323382_323445_323709_323858_324116_324227_324394_324510_324687_324855_326560_326633_327713_327830_332991
875374	contig_5954_pilon	-	2780	6	Intergenic	novelGene_28540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGCGCCCGAGCCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550188	521969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_522060_540468_540642_541386_541828_546793_547182_547398_547604_548705
875375	contig_8978_pilon	-	2594	22	Intergenic	novelGene_49446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	157.053567706218	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1908	686	2593	1661905	1538125	FALSE	35	AAGAAGTGGGTATGGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKYVRIQKIGEGSFGKAILVKSKEDGRQYVIKEINISRMSSRERDESRREVAVLANMKHPNVVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGILFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTIQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYEMCTLKHAFEAGNMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYELRSLLSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLPPQLIAEEFCLKTFQKLGAQPVPAKRPASGQSLASVVPAQKITKPAAKYGVPLTSKKYGEVPKKLHEKKPLQKHKQAHQTAVKKVKPGEQRRKMFEEAANKARLEFTEKEKKQKDQVSLLKAEQTKRQEKERLERINRAREQGWRDVLSAGGGGEVKAPFLVSGGPVAPSCSPRGQYEHYHAIFDQMRQQRAEDNASKWKGEVHGRGLQERQKGQLSVERAKQVEEFLQRKREALQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFNERQQIRAKLRGEKKEADNFEGQEGSEEADMRRKKIEAFKSQASARAAILKEQLERKRKEAYEREKKVWEEHLVAKGVKNSDMSPPLGQRESGGSPSKQQMTSVISMTSAL	1670232	1538123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1538242_1565745_1565842_1566395_1566474_1566920_1567005_1599169_1599273_1605846_1606008_1612654_1612730_1614047_1614096_1614189_1614250_1614508_1614569_1634665_1634824_1638349_1638411_1640785_1640987_1642964_1643020_1645322_1645410_1645544_1645613_1649210_1649295_1653712_1653811_1661209_1661307_1661788_1661938_1669123_1669185_1669640
875376	contig_9981_pilon	+	1051	2	Intergenic	novelGene_121021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	151	678	10529	11056	TRUE	30	TATTGCTTAATCAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVLSKIFGNKEMRILMLGLDAAGKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS	10378	11507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_11123_11200
875377	contig_10626_pilon	-	1825	12	Intergenic	novelGene_138190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_6	128.966393213552	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	781	1416	59574	10495	FALSE	25	CAAAACCAGCCTTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKVKSWVVDQKKPVRFYLDWNDKEIEVLNKHLFLTSKPMVYLVNLSEKDYIRKKNKWLIKIKEWVDKYDPGALVIPFSGALELKLQELSAEERQKYLEANMTQSALPKIIKAGFAALQLEYFFTAGPDEVRAWTIRKGTKAPQAAGKIHTDFEKGFIMAEVMKYEDFKEEGSENAVKAAGKYRQQGRNYIVEDGDIIFFKFNTPQQPKKK	199479	10085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_10597_13875_13999_16072_16170_16855_16997_59101_59200_59499_59581_82222_82298_84160_84337_168572_168701_169711_169856_197894_197996_199329
875378	contig_15120_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_108008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTGCGTCTCTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175966	173198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_173200_176000
875379	contig_755_pilon	+	1769	5	Intergenic	novelGene_119777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_4	90.020483780082	87	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	219	1247	527565	547870	FALSE	70	TATAGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSHRKLIFHIYIGFYCSAITLPKICVCSQFSTPFINQFSKDPEAFPVTTNGEPFPWRDLRLPHMAIPLHYDLLVHPNLTSLDFAASEKIEILVREATQFIILHSKDLEIMNATLHSEEDLRYKKPGKELKVLSYPAHEQIALLVPEELIADVRYYVAINFQAKLADGFEGFYKSTYRTSGGETRTIAVTDFQPTEARMAFPCFDEPLFKANFTIKIRRESRHIALSNMPKVRTIELKEGLLEDHFEATVKMSTYLVAYIVCDFNSVSGTTLSGVKVSIYASPEKWSQTHYALDTSLKLLDFYENYFHISYPLPKLGRFKFHTIAFIFAYRTCFDFFPLYM	525118	548392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_525220_527447_528122_542025_542165_546317_546453_547672
875380	contig_13800_pilon	+	4008	1	Intergenic	novelGene_153730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTTGGAAATTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129256	133264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_129300_133300
875381	contig_8204_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_177003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTTTTGTTTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66860	65257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_-_65300_66900
875382	contig_165_pilon	+	2000	12	Intergenic	novelGene_117061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	209.845949005573	72	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	44	838	45144	62225	TRUE	5	CCTTGTGGAGTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLQQEEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKK	45100	72441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62243_63670_63758_64905_65069_69639_69716_71622
875383	contig_5479_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_133589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1449	1841	253489	253881	NA	55	GGAGAGAAAAAAAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWTSHCTSLSLSLLICKWYMSHRDILRINACKSLQIVPGMSSKCLINVNSHSSNIYWALSLCQVQYMGAIEQAEYPHVAHSQVCKRHKHVNLRGRDIYFFFVSRLQLVCKFRESRHFVSIVHSCIPSG	252040	254712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_252000_254700
875384	contig_8571_pilon	-	2110	6	Intergenic	novelGene_169169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	83.2259574892353	23	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	26	1180	394127	379678	FALSE	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDQHHQSTMMHPASAAGPPIVATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVPSSATQFGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPTAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQAHVQSGMVPSHPTAHAPMMLMTTQPPGGPQAALAQSALQPIPVSTTAHFPYMTHPSGEACVCRGRRGTQSILLAQGEGQAGPVLHPPRRRASKTRSSAHSRDCDGQLSVRARGSRSLVCVLWSPGFGLMRNSSSSLGGWRMPRTQLAFFVC	394152	378747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_380134_382304_382533_383145_383292_389502_389557_393535_393669_393989
875385	contig_7272_pilon	-	2532	16	Intergenic	novelGene_25284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_15	179.39768362186	113	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2349	183	2531	465448	310299	FALSE	50	AGTCGAAGAAAAATGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLFGGARSLAPEVEREGGASLTPAGAVRLAAAAPDPALSASLRIDALLLTVRRRRRRRKMGLLGVLILLLSWAPGLEGQYGNPLSKYIRHYEGLSYDVDSLHQKHQRAKRAVSHKDQFLHLDFHAHGRHFNLRMKRDTSLFSDDFKVETSGRVLDYDTSHIYTGHIFGEEGSFSHGSVIDGRFEGFIRTLGGTFYVEPVERYIRGRSLPFHSVIYHEDDISYPHKYGPKGGCADHSVFERMRKYQVTGVEEVTLMPQREHAANGPELLRKKRTTSAERNTCQLFIQTDHLFFKYYGTREAVIAQISSHVKAIDTIYQNTDFSGIRNIRFMVKRIRINSTADEKDPTNPFRFPNIGVEKFLELNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVLGLAWVGAPSGSSGGICEKSKLYSDGKRKSLNTGIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVGHNFGSPHDSGTECTPGESKNLGQKENGNYIMYARATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVLEKKRNSCFVESGQPICGNGMVEQGEECDCGYSDQCKDDCCHDANQAEGRKCRLRPGKQCSPSQGPCCTAQCVFKSKSEKCRDDSDCAKEGRCSGLTALCPASEPKPNLTDCNRQTQVCISGQCTGSICEKYSLEECTCASTDGKDDKELCHVCCMKRMDPSSCASTGSVQWNKYFRGQTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRCRLVDADGPLARLKKAIFSPELYENIAEWIVAHWWAVLLMGIALIMLMAGFIKICSVHTPSSNPKLPPPKPLPGTLKRRRPPQPIQQPPASAAPGELPDGTHATLTTALPWFFLVPTVGTSLQRETCYVSIPKRHPHKQ	465630	310297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_310496_312147_312275_321794_322016_322485_322595_323335_323520_324316_324468_329979_330164_338294_338459_350414_350599_352567_352661_355368_355519_359148_359250_388965_389125_390999_391119_418355_418507_465393
875386	contig_13966_pilon	+	4042	3	Intergenic	novelGene_158145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGCATGTTAAATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411384	417939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_413100_415228_415339_415722
875387	contig_10569_pilon	+	3674	1	Intergenic	novelGene_44065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCACGGTTGGTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235270	238944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_235300_238900
875388	contig_401_pilon	-	2214	11	Intergenic	novelGene_42744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	82.6668010751596	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	31	861	949257	924833	TRUE	35	TAATCCTAAATGGGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERKPNGGSGGASTSSSGTNLLFSSSATEFSFNVPFIPVTQVAASPASLLLPGEDSTDVGEEDSFLGQTSAHTSTPQTFSYFSQVPSSGDPFGNIGQSPLTTATASVGQSPFSKPPAALPFTTGSQDVLNAFSPSVSKAQYGAPPMPQMGVNAYLPSQQSGLPPAHFGSPPPGAPQQGYNPYRHTPGSSRANPYITPPQLQQCQTPGHPTQLPPPGPPVQMYQMPPGALPPSPPSVQSALPPPAQQQVLARPAGPSVQAPPPFLLQNQYEPVQPH	949287	896815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_897219_905174_905277_906024_906188_906895_907082_918591_918695_919074_919231_920654_920853_924790_924834_940620_940755_942397_942931_949094
875389	contig_5083_pilon	+	2161	2	Intergenic	novelGene_151702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640412	1650324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1641272_1649022
875390	contig_5423_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_85285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATTGTAAAAAGAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566934	565466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_565500_566900
875391	contig_6677_pilon	+	3237	19	Intergenic	novelGene_114222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_15	29.0421150132776	76	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	164	2455	633938	678206	FALSE	25	AAGCGTTAATAGTTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNERDAISWYQKKIGAYDQQIWEKSIEQTQIKGFKNKPKKMGHIKPDLIDVDLIRGSTFAKAKPEIPWTSLTRKGLVRVVFFPLFSSWWIQVTSQRIFIWLLLLYLMQVIAIVLYVMMPLVNVSEVLGPLCLMLLMGTVHCQIVSTQITKPSGNNGNRRRRKLRKTVNGDGNRENGNNSSSDKVRGVETLESIPRISGFWGTLFGNRTKRVKLISNKGTETENDTSCLHPIIKKRQCRPEMRMWQTRESAKFSDGDKSRRETFRHLGNGISDDLSSEEDGEAQTQMILLRRSVEGASSDNGCEVKNRKSIFPRHLNSQVKKTPSRWCHLVRDSDSVAESEFESAAFSQGSRSGTNGGSRNLTMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECRSSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDFKEDVFQQNHLFWLQNSSPASDRVSAIIWEGNECKKMDMSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLGNVVTIGLAFFPFVHRLFREKSLDQLKSISTEEILTLFCGAPPVIPIIVLSVINFFERLCLTWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARKARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYLKRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQGHKTFLNDAYNWEFLIWEMALLLFLLRLASLGSETNKKYSNVSILLTEQINLYLKMEKKPNKKEQLTLVNNVLKLSTKLLKELDTPFRLYGLTMNPLIYNITRVVILSAVSGIISDLLGFNIRLWKIKS	633487	678988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_633621_633907_633983_634611_634669_641585_641656_642180_642340_650517_650675_652591_652730_653671_653832_655165_655340_655449_655540_656498_656721_663960_664090_664499_664773_665537_665670_666343_666431_674556_674713_676994_677091_677531_677658_678185
875392	contig_9696_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_68759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGGAAAATAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134391	131711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_131700_134400
875393	contig_19778_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_143760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGTTTAGGCGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24860	27066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_24900_27100
875394	contig_3525_pilon	-	2223	6	Intergenic	novelGene_135137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_2	54.6054942290609	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	878	1672	608593	591940	FALSE	15	AAGCCCAGCTTTGCGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVWVADRGNKRIQVFDKDTGEWLGAWDNCFTEEGPSSVRFTPDGKYLIVAQLNLSRLLLLEAPPVGSIGSCSVVSTIQLADQVLPHLLDVDRKIGAIYVAEIGAKQVQKYVPLKSYFLSLGS	609750	591388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_592193_592762_592876_602693_602786_605990_606192_608457_608606_608885
875395	contig_11855_pilon	-	950	7	Intergenic	novelGene_67154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	281.55915107763	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	479	922	2718660	2713545	FALSE	65	AGAGAAAAGGAGAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTARPELRPIKKTE	2719962	2713516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2713580_2716006_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583
875396	contig_14326_pilon	-	5610	19	Intergenic	novelGene_120707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_9	71.1080077447828	144	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	986	2961	87	3047	310769	254011	FALSE	15	GGGGGCTTCCGGGAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRSVGETENGDAFLDLKKLPSSKSPHRYTKEELLDIKERPHSKQRPSCLSEKYDSDGVWDPEKWHASLYPASGRSSPVESVKKEFDTDRPSLVRRIVDPRERVKEDDLDVVLSPQRRSFGGGCHVTAAVSSRHSGSPLEKDNDGLRLLGGRRIGSGRIISARNFEKDHRLSDKDLRDLRDRDRERDYKDKRFRREFGDSKRVFGERRRNDSYTEEEPEWFSAGPTSQSETIELTGFDDKILEEDHKGRKRTRRRTASVKEGIVECNGGVAEEDEVEVILAQEPAADQEVPRDAVLPEQSPGEFDFNEFFNLDKVPCLASMIEDVLGEGSVSASRFSRWFSNPSRSGSRSSSLGSTPHEELERLAGLEQAILSPGQNSGNYFAPIPLEDNAENKVDILEMLQKAKVDLKPLLSSLSANKEKLKESSHSGVVLSVEEVEAGLKGLKVDQQVKNSTPFMAEHLEETLNAVTSNRQLKKDGDMTAFNKLVSTMKASGTLPSQPKASRNLESHLMSPAEIPGQPVPKNILQELLGPPVQRPASSNLLSGLMGRLEPTASLLGQRAPTPPSSQVFQSRAASADYLRPRISSPIGFTPGPQQLLGDPFQGMRKPMSPVTAQQISQLELQQATLEGLALPHDLGMQTANFYQPGFSKPQVDRTKDGFRNRQQRVTKSPAPVHQGNSSSPAPSASITSMLSPSFTPTSVIRKMYESKEKSKEEPASGKAALSDSKEDTHKASEETLLSANSVPTADRDSSPTTNPKLSTVQRSSCSTPLSQTNRYTKEQDYRPKATGRKTPTLASPVPGAPFLRPVHQVPLVPHVPIVRPAHQLHPGLVQRMLAQGVHPQHLPSLLQAGVLPPGMDLTHLQGISGPILGQPFYPLPAVSHPLLNPRAGTPLHLAMMQQQLQRSVLHPPGSGSQASAVSVPTNPQNVPSRSGLPHMHSQLEHRSTQRSSSPVGLAKWFGSDVLQQPLPSMPAKVISVDELEYRQ	311819	251447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_254253_255179_255345_255633_255979_257117_257251_258392_258478_261197_261341_261669_261750_262954_263139_263598_263671_266208_266442_267805_267986_268195_268332_273576_273753_280015_280218_280484_280772_281238_281367_288112_288187_310673_310797_311760
875397	contig_16865_pilon	+	3804	7	Intergenic	novelGene_178026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	37.5618009271239	102	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	113	949	36954	44951	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSARERVRLRRYSELPVWVAEDHQEVLPFIYRAIGSKHLPASDISFVHFDSHPDLLIPVNMPADTVFDKETLFGKLSIENWIMPAVYAGHFSHIIWLHPTWAQQIKEGKHHFLVGKDTSTTTIRVTSTDHYFLSDGLYVPEDQLENQKPLHLDVIMVKPYKLCNNQEGNDAVSSAKKPKLALEDAESTASPNCDSYSEGLEKDTVTQKSGQACLEPSCSCSESQECQTAVKTREVLEILKKGDAFVLDIDLDFFSVKNPFKEMFTQVNKVFLKYRS	36841	60177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16865_pilon_+_37035_38267_38414_40801_40952_44491_46916_53883_53951_56295_56436_59493
875398	contig_1964_pilon	+	3380	1	Intergenic	novelGene_130914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAACAGAACCAGGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174479	177859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_174500_177900
875399	contig_8954_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_130277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTGTGGATTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121233	120128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_120100_121200
875400	contig_9516_pilon	+	4319	11	Intergenic	novelGene_106158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	42	junction_8	28.4787640181241	181	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	131	2479	776609	814801	FALSE	10	TTGAGGGGTTTTGCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGPEESENHLCSDSTPKVESPQGACGLKLAGDTKPKNQVLATYMSHELVLATPQNLRKMPELPLLPHDSHPKELILDVVPSSKRGSSTELSQLGSQVDLGRVKMEKVDGDVVFNLATCFRADGLPAAPQRGQAEVRGKAGQARVKQESVGVFACKNKWQPDDMTESVLPKKVKCGKEKESEEQQPPQPKPIVRSSHGPKCRKPPSDPQEPTKKSPRGPSDSGKEHSGVRVKHKHRKPTKPESQSPGKRADGHEEDRPQALTRCAGLEKDPHGSSEKKAKSSFRDFIPVVLSTRTRSQSGSICSSFAGMADSDMGSQEVFPTEEEEEVTPTPAKRRKVRKTQRDTQYRSHHAQDKTLLSQGRRHLWRAREMPWRTEAARQMWDTNEEEEEDEEEGLVKRKKRRRQKSRKYQTGEYLTEQEEEQRRKGRADLKARKQKTSSQSSEHHLRNRNLLLPNKAQGISDSPNGFLPNNLEEPACLENSEKPSGKRKCKTKHMANISEEAKGKGRWSQQKTRSPKSPTPVKPTEPCTPSKSRSAGLEEASESPTARQIPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLGYKDVVLYCLQKDSEDVNHRDNAGYTALHEACSRGWTDILNILLEHGANVNCSAQDGTRPVHDAVVNDNLETIWLLLSYGADPTLATYSGQTAMKLASSDTMKRFLSDHLSDLQGRAEGDPGVSWDFYSSSVLEGKDGFACDLLHNPPGSSDQEGGDVEEDDFMFELSDKPLLPCYNLQVAVSRGPCNWFLFTDVLKRLKLSSRIFQARFPHFEIATLPKAEFYRQVASSQLLTPAERPGGLADRSPPRLL	776478	816641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_777077_783480_783698_784681_784763_786875_787266_790607_790832_795657_795880_798926_799094_800018_800165_809799_809878_811171_811326_814599
875401	contig_19604_pilon	-	1876	5	Intergenic	novelGene_77230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	52.1296460759135	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGGCTGTGTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259191	255631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257454_257635_257677_258354
875402	SIRV6	+	435	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	421	0	248	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1551	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470
875403	contig_14366_pilon	+	3074	10	Intergenic	novelGene_177666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	4.73755680118397	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	29	1030	7966	88364	FALSE	20	TTCATATATTTTTGGGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GANEKEIALMNGLTVNLHLLLLSFFKPTPKRYKILLEAKAFPSDHYAVESQLQLHGLNVEKSMRIIKPREGEETLRMEDILEVIEKEGDSIAVILFSGVHFYTGQLFNIPAITKAGQAKGCFVGFDLAHAVGNVELHLHDWGVDFACWCSYKYLNSGAGGLAGAFVHEKHVHTIKPALVGWFGHELNTRFKMDNKLQLIPGANGFRISNPPILLVCSLHASLEIFNQATVKALRRKSILLTGYLEYMIKHYYNKDKAESKKPIVNIITPPHIEERGCQLTLTFSAPVKYVFQELEKRGVVCDKREPNGIRVAPVPLYNSFHDVYKFVSLLISILDAAETKNS	7937	90408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14366_pilon_+_8002_9543_9616_10931_11007_19775_19923_44309_44409_45845_45920_77819_77873_79769_79856_86482_86714_88235
875404	contig_6434_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_61859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTCATAGCTACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811949	813117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_811900_813100
875405	contig_2933_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_111338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGGACAGGCTTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686445	684505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_684500_686400
875406	contig_16204_pilon	-	2999	1	Intergenic	novelGene_154496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	681	980	254074	253775	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGHYPWYRLLTFVKSQFVCTLTTGQALCLALSRVSSHGILMTYQTGGVRKTEKVLELNSFGKLWPHPLNVAYGTSRAGQSSQLLSKCHLACPTSRLLK	254754	251755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_251800_254800
875407	contig_5083_pilon	-	1794	5	Intergenic	novelGene_151656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCGGAGATTATTGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547255	461281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_461967_462226_462294_462499_462627_474733_474802_546408
875408	contig_1301_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_47383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACAGACTGCTTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698875	696687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_696700_698900
875409	contig_2550_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_135698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1197	1505	1664097	1664405	NA	25	TTGGTTTAAGAAACTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPQGYGLIHCEIPNAWHPVSMKILNKWRHTPLSEVQGSFCLSLPYMSIILIEFRKQGNLWNQPQSSESHSLLADLYQKATGNHSLIQRYYCPQKKIKFQI	1662900	1665463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1662900_1665500
875410	contig_7593_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_127269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGAAAATAAAATCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3162	1906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3200
875411	contig_6479_pilon	-	2899	1	Intergenic	novelGene_160607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGACATGAAATAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106304	103405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_103400_106300
875412	contig_7356_pilon	-	2687	1	Intergenic	novelGene_60403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATTTTATCCACATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465113	462426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_462400_465100
875413	contig_11989_pilon	-	2710	23	Intergenic	novelGene_68437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	355.550582817901	2	141	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	15	947	226870	66064	TRUE	10	CCTTTTTTTTTTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHFLDTQQLGK	226884	45612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48297_53542_53670_53798_53867_54141_54253_54940_55010_56307_56480_59328_59415_65761_65856_65998_66092_71215_71370_74969_75069_76359_76451_80408_80448_90247_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
875414	contig_9406_pilon	+	4064	1	Intergenic	novelGene_136164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	3240	3803	67807	68370	NA	45	TCATAACCAACTACACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSSEAQGWESAKHQALGPLLLRLLPRFGPSSVRPACDQPEGPQRNAESAQHQKQTSSGTRPFFYVTTRSRVYCTNCCPYNRHPDPFVILSPELQKWPGKPTGNPYRTFPRPVTVLWTPEICLNNRKAVPWKQGQGEVMQDHGSTPALNMGELQAPCPPFSGYSSHHGTEGELRAKGSRVLDLCLY	64567	68631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_64600_68600
875415	contig_1244_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_38052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGTCTAAATGGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009255	1006418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1006400_1009300
875416	contig_13481_pilon	+	590	1	Intergenic	novelGene_119411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	644319	644636	NA	15	TGTGCTGGGGGCAGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTEGKTCMANKHLKTCSASLAFRQMQTSTIMNAILHRFDWQKLKRLTIQRSGRTWIMRSLIHSCWKYKLAHPLEKQFGIFLSSCAYIYPEVGCIIIPILQM	644318	644908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_644300_644900
875417	contig_1244_pilon	-	2397	2	Intergenic	novelGene_37908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260831	247143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_249214_260504
875418	contig_11815_pilon	-	2708	2	Intergenic	novelGene_50945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	13	junction_1	0	240	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTCCTCCGCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462988	457656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_460192_462815
875419	contig_8138_pilon	+	1437	4	Intergenic	novelGene_52440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	538.343962743358	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	198	569	280295	306552	TRUE	25	TGATGATCAAATCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDVSPLILQQASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280097	307507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280339_304957_305098_306364_306854_306940
875420	contig_10074_pilon	+	2135	4	Intergenic	novelGene_57110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	461	junction_3	209.673290833356	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1825	2133	246136	249203	FALSE	15	GCAGGAGTCGTGGACTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMAFQSISDEQNNDGLNWKELLKIKSAHKLLYALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLEIFNSGILEPK	244311	249205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_246172_248293_248417_248550_248635_249137
875421	contig_15236_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_141670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	728297	728647	NA	85	AAAGAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGLSAFAPHPLCAVEAGAAVGLSTESAPSGPLLSSSCCRSVGALCPVWATLSPPQANAQSEVGVTEDYRQGSPVWGSVKSSKRITQPSSKSHLELWECWPLSDFERGAATPLCLV	728296	730710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_728300_730700
875422	contig_15866_pilon	-	3368	1	Intergenic	novelGene_63602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGAAGACAGAATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301838	298470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_298500_301800
875423	contig_12701_pilon	-	3149	1	Intergenic	novelGene_169547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2061	2396	27301	26966	NA	35	AATGGCAATGTGAGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVTWRAEAGGGVSHMDVKGSVQRPLPPPMLCLLLPLHSCSRSVRNDAGGVLGCNSVHVCLSGVCEEKDHSGISLARRSEEPWHLILSVVLERKICALTYARGNYSSHIK	29361	26212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_26200_29400
875424	contig_821_pilon	-	2592	1	Intergenic	novelGene_149425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	467	769	433737	433435	NA	50	AAAAATACCAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFLKISPGSIPGPSHKLFTSNSIAPRSGSFSSLYLSFGSLQNPITWLSLNSTICHQVDLQLSQFLLLLVTVDSAPNSRRPRTQQNRVLPGPTRGHKRTV	434203	431611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_431600_434200
875425	contig_6842_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_130698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATATGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385959	384702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_384700_386000
875426	contig_5231_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_65878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1933	2271	104771	104433	NA	65	AATTTCAAAAGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDYMPPSHKAFTEEIQSAPSLRDYTLSSGNCQLLTAYNQCTEALAELRSYHITVVTKYLITAAVKAKVRRPSHLPGPPQALEERGTGGTAVLSFLKSVRDKTLESVLHLTG	106703	104106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_104100_106700
875427	contig_11998_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_175784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAACTTTGCTCAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25621	27481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11998_pilon_+_25600_27500
875428	contig_12644_pilon	-	1621	1	Intergenic	novelGene_44535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGTTCCAAACAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1442177	1440556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1440600_1442200
875429	contig_11396_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_71321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	41	126	278	403	460579	460454	NA	80	CAAATTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTTSSRRKKSQLPSALPHCAHRPQPCPSSRLVPAPPLFRVSLNVWLLSVKSTALRPRGAGPHSAHLPVHSQHPCSCSRQLPYTLTWTHFTLMPGHTNFLQIRLALLSPQVMGYTTSASRLSSSSATFTSHRC	460856	458704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_458700_460900
875430	contig_10016_pilon	+	3123	12	Intergenic	novelGene_117839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_4	197.429975032472	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	490	1317	226856	237705	FALSE	20	GAGAAGGAGTTTCTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAHMFKDKDVWGNKQDHRGAFLIDRSPEYFEPILNYLRHGQLIVNDGINLLGVLEEARFFGIDSLIEHLEVAIKNSQPPEDHSPISRKEFVRFLLATPTKSELRCQGLNFSGADLSRLDLRYINFKMANLSRCNLAHANLCFANLERADLSGSVLDCANLQGVKMLCSNAEGASLKQCNFEDPSGLKANLEGANLKGVDMEGSQMTGINLRVATLKNAKLKNCNLRGATLAGTDLENCDLSGCDLQEANLRGSNVKGAIFEEMLTPLHMSQSVR	206182	239511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_206253_216753_216876_218680_218725_226100_226195_226696_226884_227081_227211_229310_229379_229465_229562_230482_230633_234770_234877_235638_235773_237588
875431	contig_9646_pilon	+	4448	1	Intergenic	novelGene_117456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310888	315336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_310900_315300
875432	contig_10734_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_51381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	304	junction_1	0	672	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	133	858	1896094	1883189	FALSE	25	CCTTTTTGAAGAGTCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTTSGSRRSRRHSGDGEPPGSPPPPPPPVVTYPDWIGQSYSEVMSLNEHSMQALSWRKLYLSRAKLKASSRTSALLSGFAMVAMVEVQLDADHDYPPGLLIAFSACTTVLVAVHLFALMISTCILPNIEAVSNVHNLNSVKESPHERMHRHIELAWAFSTVIGTLLFLAEVVLLCWVKFLPLKKQPGQPQPTSKPSDGGGALNVSGSSPEGITPGQAAAIASTTIMVPFGLVFIVFAVHFYRSLVSHKTDRQFQELNELAEFARLQDQLDHRGDHPLTPGSHYA	1896226	1882138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1883801_1895980
875433	contig_19865_pilon	+	3341	4	Intergenic	novelGene_170161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	67.7954439636044	53	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1695	2594	67491	80344	FALSE	30	CTTGAACCTAGTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHCMYTPFGSPCACVRVCACVRACARALWERWSLRAPNEGACLGKLGLRRISGLQQKAMPSACSPLAGTAFSLAVSGCELRDTRTSHAASPKHSLVSGT	65796	81091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_67713_72650_72735_79191_79369_79927
875434	contig_8980_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_74005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAATCAAGCAGGTCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619753	621682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_619800_621700
875435	contig_3789_pilon	+	2501	1	Intergenic	novelGene_79856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448065	450566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_448100_450600
875436	contig_1008_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_121586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	334	720	696325	696711	NA	40	TTATCCCTTCAGAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNNLSGLNHKRFAQSFPLSVGTGNRLTLLESKTANKPTKLLRSWVFFGFLFSFRTTNDSLTREFTKQKGNQTDLFHCLNILLTKSSTSTIGVINKSTRILKIPITKDLSGNLVVVAVGFHQVSSYS	695991	697667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_696000_697700
875437	contig_10054_pilon	-	2810	2	Intergenic	novelGene_171214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	62	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	56	1090	157241	148041	FALSE	30	CCCAGCCAGAAATCCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPFYRCHNITSVEKGNSATMGGVLFSAGVLGNLLALGLLARSGLGLHLPRQSPSVFFVLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLSGLLPASGSLLCQAFAFFMSFFGLASMLQLLAMALQCWLSLGHPFFYRRHITLRRGVLVAPVVGAFCLAFCALPFAGFGEFVQYCPGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYASLMALLVLATVLCNLSAMRNLYAMHRRLPRRPRCGTRGCPEPGAGEREASPQPLEELDHLLLLALMTGLFTMCSLPLIIRAYYGAFKAINEKNRTSEEMEDLRALRFLSVISIADPWIFIIFRTSVFRMFFHKIFIRRVMYRN	157296	146320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_148239_156404
875438	contig_15326_pilon	-	1421	9	Intergenic	novelGene_157702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	74.1312181203034	8	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	515	856	66566	19846	FALSE	25	TACCAGATTACTCTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQMMDQGFVGLIFSCFIEDKNTKTGRVLYTCFQSIQAQKSSEYERIEIPIHIVPHVTIGKVCLESAVELPKILCQEEQDAYRRIHSLTHLDSVTKIHNGSGKVFFLSVSSDP	93243	19280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_19928_20501_20634_65160_65217_66494_66584_68560_68641_81942_82029_83619_83742_89514_89570_93089
875439	contig_10494_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_102152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	275	706	858326	857895	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRRKKAEGESLEPWLTGSPLLAERTPQVQATKRKESPVHDKVWLVPMSQRGQSSSTCETQREQDYCHPTYVLKNEHFICRKRTARTVKKDFRFLYCLSAHIVFIIKKNKKREKEDSPGNGSKNKDLLVSKLYGSLLLGETL	858600	856783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_856800_858600
875440	contig_5039_pilon	+	3785	1	Intergenic	novelGene_64842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAATTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309640	313425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_309600_313400
875441	contig_12123_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_144607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTTAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135351	138214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_135400_138200
875443	contig_3018_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_78835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGACATATACCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550968	553534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_551000_553500
875444	contig_1143_pilon	-	2876	1	Intergenic	novelGene_86604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAGTTCTAGCAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213467	210591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_210600_213500
875445	contig_3654_pilon	-	5154	7	Intergenic	novelGene_174988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	19.2844208854943	89	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	1173	2468	461284	451875	FALSE	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVANAVLQAVSLGWLRTLSVRGKPSRFGGDDIQPGCESNSEPDHVILRAATLVLIKSLEIKFQNCTSPNEIQADLQGFMSELLTFLKPHLQPSLQSHSPCQWLSGVFIEQDDDMLEAAKALLGIYLRLTRECREATESSAQEKEMWNRHTHENGYNPHCIFLFFLKNIRFDSTVLLDFLISSETCFLEYFVRYLKLLQKDWHNFFTICKCFDAAESEDSISICGHIPSPVQARSTNQTEPHYWTALDSHVDACASASWASDASSEPLKRQHDTQAMMSKETHSRLQVASLSSSPASQSLVNYDSSDDSEVESTDQCLANSKQTSLHQEAIKKIQDTSGTSRGETELTLGLQSRPLVPEEPNSSFSIDCEVALNSIVSEVGISYRTVKCFEELQGAIYRLQKKNLFPYNPTALLKLLKPIEAKYKSMSPL	498123	449188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3654_pilon_-_452776_454932_455105_461061_461654_462090_462233_463622_463713_463805_464278_498024
875446	contig_8729_pilon	+	3625	1	Intergenic	novelGene_40125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTGAGTTGTAAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523092	526717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_523100_526700
875447	contig_16103_pilon	+	3692	29	Intergenic	novelGene_118751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	5	junction_28	30.3613232415781	115	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	967	2904	79	2982	371557	402372	FALSE	10	TGTTTGAGTCCCCGTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTYAKVPPQHEEICLGLFTLVLTEPAQAQKCYRDLALVSRDGMNIVLNKINQILMEKYLKLQDTCRTQLVWLVRELVKSGVLGADGVCMTFMKQIAGGDVTAKNIWLAESVLDILTEQREWVLKSSILIAMAVYTYLRLIVDHHGTAQLQALRQKEVDFCISLLRERFVECLMIGRDLVRLLQNVARIPEFELLWKDIIHNPQALSPQFTGILQLLQSRTSRKFLACRLTPDMETKLLFMTSRVRFGQQKRYQDWFQRQYLSTPDSQSLRCDLIRYICGVVHPSNEVLSSDILPRWAIIGWLLTTCTSNVAASNAKLALFYDWLFFSPDKDSIMNIEPAILVMHHSMKPHPAITATLLDFMCRIIPNFYPPLEGHVRQGVFSSLNHIVEKRVLAHLAPLFDNPKLDKELRAMLREKFPEFCSSPSPPVEVKIEEPVSMEMDNHMSDKDESCYDHAEAAFSDDEEELNSKGKKREFRFHPIKETVVEEPVDITPYLDQLDECLRDKVLQLQKGSDTEAQCEVMQEIVDQVLEEDFDSEQLSVLASCLQELFKAHFRGEVLPEEITEESLEESVGKPLYLIFRNLCQMQEDNSSFSLLLDLLSELYQKQPKIGYHLLYYLRASKAAAGKMNLYESFAQATQLGDLHTCLMMDMKACQEDDVRLLCHLTPSIYTEFPDETLRSGELLNMIVAVIDSAQLQELVCHVMMGNLVMFRKDSVLNILIQSLDWETFEQYCAWQLFLAHNIPLETIIPILQHLKYKEHPEALSCLLLQLRREKPSEEMVKMVLSRPCHPDDQFTTSILRHWCMKHDELLAEHIKSLLIKNNSLPRKRQSLRSSSSKLAQLTLEQILEHLDSLRLNLTNTKQNFFSQTPILQALQHVQASCDEAHKMKFSDLFSLAEEYEDSSTKPPKSRRKAALSSPRSRKNAAQPPNAEEESGSSSASEEEDTKPKPTKRKRKGSSAVGSDSD	371478	403082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_371565_372376_372462_378161_378276_378491_378577_379879_379947_382978_383124_384053_384184_386406_386505_387976_388169_389075_389164_389600_389681_390087_390180_390528_390636_391377_391498_391835_391966_392446_392502_392740_392845_393303_393349_393532_393653_396726_396881_398748_398818_399118_399195_399514_399629_399920_399970_401031_401200_401532_401634_401767_401841_402030_402188_402294
875448	contig_14563_pilon	+	2507	1	Intergenic	novelGene_135057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154305	156812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_154300_156800
875449	contig_5018_pilon	-	2636	3	Intergenic	novelGene_46985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	1	43	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1469	2011	639146	637994	FALSE	50	AATAAAATATGATTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPTGVIRSLHRLGRLECAFCTETRPYNQGARLTAFELVYEQIPATLITDSMAATAMAHRGVSAVVVGADRVVANGDTANKVGTYQLAITAKYHGIPFYVAAPSSSCDLRLETGQDIVIEERPGQELTDVNGVRIAAPGIGVWNPAFDVTPHDLITGGIITELGVFAPKELRAALGTTIS	640614	637368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_638122_638653_638879_638956
875450	contig_5891_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_151579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAAAATTTCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114080	115868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_114100_115900
875451	contig_6902_pilon	+	2282	2	Intergenic	novelGene_135610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1236	junction_1	0	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530353	532990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_530472_530826
875452	contig_12485_pilon	-	4434	3	Intergenic	novelGene_147300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAATGAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787952	781898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_783810_784212_784659_785875
875453	contig_10434_pilon	+	2101	2	Intergenic	novelGene_82065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTCCTAGCTGTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187764	190577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_189465_190176
875454	contig_5758_pilon	-	934	6	Intergenic	novelGene_119107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_5	51.6937133508515	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	249	932	250807	247381	FALSE	30	TACAGCCACATACTTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRRCVPPLEPKLAAGCCGVKKPKLSGSGTHSHGNQSTTVPGSSTGPLQNHQHVDSNSGRENASDLTLGPGNSPITRMNPASGALSPLPRPNGTANTTKNLVVTAEMCCYCFDVLYCHLYGFPQPRLPRFTNDPYPLFVTWKTGRDKRLRGCIGTFSAMNLHSGLREYTLTSALKDSRFPPLTREELPKLFCSVSLLTNFEDATDYLDWEVGVHGIRIEFINEKGIK	267748	247378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_247432_248067_248183_248761_248873_250400_250846_265838_265948_267647
875455	contig_10432_pilon	+	1665	10	Intergenic	novelGene_171309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	38.1229330546767	209	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	5	1435	128819	140927	FALSE	15	TGGCAGGGCCACCTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPGASARALLLTTAPGPGRKRRARAAGAATSKQQVLDEEEYIEGLQTVIQRDFFPDVEKLQAQKEYLEAEENGDMERMRQIAIKFGSALGKMSREPLPPYVTPATFETPEVHTGPGMVGNKPRPRGRGPEDGEAGEEEEKEPLPSLDVFLSRYTSEDNASFQEIMEVAKEKSRARHAWLYQAEEEFEKRQEDSLALPSAEHQAIESSQAGVETWKYKAKNSLMYYPEGVPDEEQLFKKPRQVVHKNTRFLRDPFSQALSRSQLQQAAALNAQHKQGKVGPDGKELIPQESPRVGGFGFVATPSPAPGVNESPLMTWGEVENTPLRVEGPETPYVDRTPGPAFKILEPGRRERLGLKMANEAAAKNRAKKQEALRRVTENLASLTPKGLSPAMSPALQRLVSRTASKYTDRALRASYTPSPARSVHLKTPAGGPQTPTSTPAPGSTTRTPLIQDPASITDNLLQLPARRKASDFF	128814	141157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_+_128954_130247_130417_130503_130600_133521_133692_133808_133927_134295_134430_135202_135306_136927_137038_140016_140133_140647
875456	contig_9177_pilon	-	2159	2	Intergenic	novelGene_32739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043358	1040249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1041212_1042161
875457	contig_8330_pilon	+	2514	1	Intergenic	novelGene_71867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTTCACCTGCTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931543	934057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_931500_934100
875458	contig_9871_pilon	-	1664	15	Intergenic	novelGene_75663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	85.65596230007	44	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	493	1470	430511	420502	TRUE	45	AAATAGAGTTCATGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYSRPEILKVPNSRTKVPVTVQSIVVQSLNQTLTRLEDTQVNLQPAFVSAGNLNVCTNVVLEVKYSLTYTDAGEITRAGLSLLLGTVSSGVVPIQQKFEIHFIQRNTKPVPLSGNPGYVVGLPLVAGFQPQKGSGIIQMTYRYGQFTILHSTTEQDCLAIEGIRTPVLFGYNMRSGCKLRLTRAIPCRLAMQKVKSLLKGQGFPDYVAPFGNSRAQDVLDWVPVHFLTQSSNMKDSCQVPAALVIVVKWTKYGSLVNPQAKIVNVTANLISSSFPEADSGNERTILISTAVTFVDVSAPAEAGFRARPTINARLPFNFFFPFV	444791	419437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_419583_420031_420080_420500_420646_421082_421209_423848_424012_425489_425631_426214_426301_426669_426796_427330_427469_429422_429444_430478_430589_432207_432296_435562_435694_437613_437736_444717
875459	contig_9839_pilon	+	1423	4	Intergenic	novelGene_88580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	101.844107449681	460	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	149	904	331370	336298	FALSE	25	CCAGCTACCCATCACAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRQLARASAPLLRVPLSGSWAASPASAGLKTLLPVPTYEDVSIPEKPKLRFVERAPLVPKVKRERKNLSDIRGPSTEATEFTEGNFAILALGGGYLHWGHFEMMRLTINRSMDPKNMFAIWRVPAPFKPITRKGVGQRMGGGKGAIDHYVTPVKAGRLIVEMGGRCEFKEVQGFLNQVARRLPFAAKAVSRETLEKMQKDQEERERNNQNPWTFERIATANMLGIRKVLSPYDLAQKGRYWGKFYMPERV	331221	336817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331425_331783_331850_334831_334981_335812
875460	contig_13952_pilon	-	3110	1	Intergenic	novelGene_133271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATGCTAACCAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211630	208520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_208500_211600
875461	contig_2161_pilon	-	3014	1	Intergenic	novelGene_114916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCCAAAATTTCTACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792850	789836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_789800_792800
875462	contig_7870_pilon	+	4164	1	Intergenic	novelGene_108961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGTCCATTGAACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354493	358657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_354500_358700
875463	contig_10734_pilon	+	2447	6	Intergenic	novelGene_51290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	309.183440695002	156	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	36	557	1368595	1380408	FALSE	60	CATTAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLRPAYARRGMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTE	1368559	1382298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1380403
875464	scaffold_9100_pilon	-	2492	2	Intergenic	novelGene_83315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_1	0	106	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843161	838162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_839161_841667
875465	contig_17796_pilon	+	3297	1	Intergenic	novelGene_33846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	124	555	187351	187782	NA	55	AAAAAAAAAAGGGCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNPRSASAAGVKPSLKGQNQGGGHRHPGPSGWADKLLGLRSGKSLCNQRLAPAEVMLTASLTINLVHLGLAWLTTGRPPRSYSFAKFSAVPSHPNDSALRVHFKFTRGQTERSGTCREKICPHVTLSLSTEVSGPGEQKT	187227	190524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_187200_190500
875466	contig_8044_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_132382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCCATGTTGTATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463843	461452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_461500_463800
875467	contig_7457_pilon	+	2753	14	Intergenic	novelGene_31667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	69.5221219741384	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	745	2238	126	2363	1111144	1125474	FALSE	20	GGAGGGAGCCGCCATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALARVRSGRRPSAPISVRCPRRPLPWPDPDPAQPGSHTAATMEVMNLIEQPIKVTEWQQTYTYDSGIHSGANTCVPSVSSKGIMEEDDACARQYLLKKTTTYTQGVPQNQGDLEYQMSTTARAKRVREAMCPGVTGEESSLLLATQVEGQTTNLQWLAEPSQMLKSAIVHLINYQDDAELATRALPELTKLLNDEDPVVVTKAAMIVNQLSKKEASRRALMGSPQLVAAVVRTMQNTSDLDTARCTTSILHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVRMLSSPVESVLFYAITTLHNLLLYQEGAKMAVRLADGLQKMVPLLNKNNPKFLAITTDCLQLLAYGNQESKLIILANGGPQALVQIMRNYSYEKLLWTTSRVLKVLSVCPSNKPAIVEAGGMQALGKHLTSNSPRLVQNCLWTLRNLSDVATKQEGLESVLKILVNQLSVDDVSVLTCATGTLSNLTCNNSKNKTLVTQNSGVEALIHAILRAGDKDDITEPAVCALRHLTSRHPEAEMAQNSVRLNYGIPAIVKLLNQPNQWPLVKATIGLVRNLALCPANHAPLQEAAVIPRLVQLLIKAHQDAQRHVAAGTQQPYTDGVRMEEIVEGCTGALHILARDPMNRMEIFRLNTIPLFVQLLYSSVENIQRVAAGVLCELAQDKEAADAIDAEGASAPLMELLHSRNEGTATYAAAVLFRISEDKNPDYRKRVSVELTNSLFKHDPAAWEAAQSMIPINEPYADDMDVTYRPMYSSDVPLDPLEMHMDMDGDYPIDTYSDGLRPPYPTADHMLA	1098935	1125864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1099053_1111135_1111352_1112440_1112701_1112950_1113190_1113929_1114132_1114989_1115135_1115259_1115364_1116478_1116818_1119723_1119880_1120215_1120336_1121688_1121840_1121944_1122067_1125009_1125050_1125322
875468	contig_13707_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_43529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAACCTTGAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180647	182312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_180600_182300
875469	contig_6599_pilon	-	121	1	Intergenic	novelGene_176001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCCCGCGGTGGGGCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262713	262592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262600_262700
875470	contig_9995_pilon	+	2270	1	Intergenic	novelGene_47685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	952	1284	271329	271661	NA	50	AGTTCTTAACCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPECSLEVRMVRLRLTYFGHVIRRDQFLEKDIMLGKAEGQQKRGRPLMRWTDTAAARMGSSRARIVRMPQDQAVFCSVVHGVIMSRNQLNSTQQQPPPPSTPKGWLVSI	270377	272647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_270400_272600
875471	contig_6217_pilon	-	2623	1	Intergenic	novelGene_109693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945829	943206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_943200_945800
875472	scaffold_12124_pilon	-	1141	6	Intergenic	novelGene_22183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	82.0112187447547	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	92	898	1333065	1229338	FALSE	10	GCACCTGAGCGTGGGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVILAGNNDRRSQEAVRRIQEETLNDKVEFLYCDLASMSSIWQFVGHFKAKNIPLHVLVNNAGVMMVPQRTTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGRCARVITVSSATHYVGELNMEDLQSSHSYSPHGAYAQSKLALVLFTYHLQRLLASSGSHVTANVVDPGVVNTDLYRHVFWGTGLVKKLLGWLLFKTPNEGARTSVYAAVAPELEGVGGCYLYNEKATKSLQTTYDEKLQRQLWARSCEMTGVLDVTQEGLLM	1333156	1229094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1229542_1242214_1242423_1253571_1253780_1260053_1260156_1323601_1323671_1333049
875473	contig_6445_pilon	-	2470	17	Intergenic	novelGene_77070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_13	138.944627010187	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	88	2157	693895	680231	FALSE	40	CTAGGAAATATATTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLVSEVWHKKRPSYVVPTSLSHGIKLVNPMFRGYAQQDTQEFLRCLMDQLHEELKEPEVAVATAAAVTEARDSDSSDTEEKREGDRSPSEDEFLSCDSSSDRGEGDGQGRGGGGSQAETELLIPDEAGRAISEKERMKDRKFSWGQQRTNSEQVDEDADVDTALAALDDQHVETLPPSPCSASPCRTPEPDNDAHMRSSSRPCSPIHKLSSTPPRASPVRMGPSYVLKKAQVLTTGSRRRKEQRYRSVISDIFDGSILSLVQCLTCDRVSTTVETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSAIYQNVPAKPGTCGDSYASQGWLAFIVEYIRRFVVSCTPSWFWGPVVTLEDCLAAFFAADELKGDNMYSCERCKKLRNGVKYCKVLRLPEILCIHLKRFRHEVMYSFKINSHVSFPLEGLDLRPFLAKECMSQITTYDLLSVICHHGTAGSGHYIAYCQNVINGQWYEFDDQYVTEVHETVVQNAEAYVLFYRKSSEEAVRERQQVVSLAAMREPSLLRFYVSREWLNKFNTFAEPGPITNHTFLCSHGGIPPNKYHYIDDLVVILPQNVWEHLYNRFGGGPTVNHLYVCSICQVEIEALAKRRRIEIDTFIKLNKAFQAEESPSVIYCISMQWFREWEAFVKGKDNEPPGPIDNSRIAQIKGSGHIQLKQGADYGQISEETWNYLNTLYGGGPEIAIRQSVAQLPDPESLHGEQKIEAETRAV	695328	679917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_680392_680854_680927_682276_682380_683406_683516_684735_684818_684908_685079_685522_685650_685732_685914_686965_687012_687227_687262_688012_688108_688778_688952_689212_689329_689665_689789_690253_690708_693871_693951_695296
875474	contig_9707_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_175100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169211	166598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9707_pilon_-_166600_169200
875475	contig_16382_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_160235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTCTACTCCTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276650	278675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_276600_278700
875476	contig_12603_pilon	+	2489	2	Intergenic	novelGene_105780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTGGAGGCACACAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517656	520703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_518187_518744
875477	contig_8286_pilon	-	2451	9	Intergenic	novelGene_139809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTACAAAAGAAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222594	196632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_196667_199668_199743_200988_201042_203600_203692_205642_205719_217000_217093_217599_217682_219965_220523_221202
875478	contig_6735_pilon	-	2454	4	Intergenic	novelGene_15822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	51.4414445969611	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	123	551	633176	629157	FALSE	40	AAAGGTTCCAAGTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQVGV	645387	627253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_629301_632682_632836_633044_633198_645286
875479	contig_14720_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_164983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATAGCTGTTTGATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177376	175482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_175500_177400
875480	contig_15104_pilon	+	2203	15	Intergenic	novelGene_163365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.4575739523167	88	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	457	1707	894804	946721	TRUE	25	AGGGGCTCCCTTCCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEKNLGVSQKLVSPSRSTSSCSSKQGSRQDSWEVVEGLRGEMNYTQEPPLQKGFLLKKRKWPLKGWHKRFFYLDKGILKYAKSQTDIEREKLHGCIDVGLSVMSVKKSSKCIDLDTEEHIYHLKVKSEDGFDEWVSKLRHHRMYRQNEIAMFPHEVNHFFSGSTITDSASGVFDSISSRKRSSISKQNSFQTGSNLSFSCGGETRVPLWLQSSEDMEKCSKDLAHCHTYLVEMSQLLQNMDVLHRTYSAPAINAIQGGAFESPKKEKRSHRRWRSRAIGKDAKGTLQVPKPLSGPLRLHSSNPNLSTLDFGEEKNYSDGSETSSEFSKMQEDLCHIAHKVYFTLRSAFNTLSMEREKVKHLMEQDVTSSPSAQVIGLKHTLSSALAQNADLKERLRRIHAESLVLDPPGCCQVG	791867	961101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_792177_894656_894897_921582_921700_921851_921906_923006_923121_927555_927724_928346_928471_930502_930607_930810_930904_932193_932351_943499_943631_946625_946735_953526_953662_954761_954856_960847
875481	contig_7915_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_42957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59283	57113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_57100_59300
875482	contig_20670_pilon	-	828	3	Intergenic	novelGene_144839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_1	221	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAGGAAAAGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57587	52348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_53013_56700_56793_57515
875483	contig_18108_pilon	-	2437	19	Intergenic	novelGene_33514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	453.133479912138	1	104	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	160	1272	297156	276397	TRUE	20	GTTAGCCAAGTGTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPPNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAASIFTVQLDDHLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGVKYKKGGVASGFKHVVPNEVVSFNTGDCFILDLGNEIYQWCGSESNSFEKMKATQVSKGIRDNERSGRARVHVTEEGSEPEAMIQVLGAKPDLLPGTEDSAKEDTANRKLAKLYKVSNGAGTMVVSLVADENPFAQGALRSEDCFILDHGTDRKIFVWKGKQANMEERKAALRTASDFISKMGYRKQTQSFLRVVRPHCSSSSSRTGGTQTRRMAQAWPTSPATLLMWSGCLSTLPRCTPPLPWPPSTAWMTMDLEN	316741	266700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_267074_267666_267728_269574_269653_269897_270009_271262_271423_272032_272204_273835_273927_276276_276411_277891_278085_278281_278371_282718_282852_284892_284983_287437_287588_289291_289334_289402_289454_296016_296172_296960_297166_298632_298709_316667
875484	contig_10962_pilon	+	4347	2	Intergenic	novelGene_103904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3036	3413	341124	341501	FALSE	60	ATTTCCAAAAGAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNDSVAVGLVWSPGGTVVKCLAAYQKVCSSNPPAAPWKPYGAVLLCPIGSLSRNQFDGNGFGCFGFPGILQVLSLPSLLRTVMILSIAVGLFSFLVRVTNILGFPGPERFPDTRTRDFATLKS	337924	342435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_339956_340119
875485	contig_1867_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_54549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCACAATAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396032	398512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_396000_398500
875486	contig_14341_pilon	+	2430	17	Intergenic	novelGene_111878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	144.059978285956	642	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	175	2277	720606	725884	FALSE	10	CCTTGGACTTCGCTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRLLPCLHSACSACLGPAAPTASNSSGDGGAAGDSAVVDCPVCKQQCFYKDIVENYFMRDSGSKAATDTQDANQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRSTGPAKTRDGERTVYCSVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEPHGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAERSGTNSTGPAPMAPPRAPGPLSKQGSGSSQPMEVQEGYGFGSDDPYSSAEPHVSGVKRSRSGEGEVSGLMRKVPRVSLERLDLDLTADSQPPVFKVFPGNTTEDYNLIVIERGGAAAAAGQPGTAPPGAPGAPPLPGMAIVKEEETEAAIGAPPAAAEGPETKPVLMALAEGSGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGASAPSGGPGALDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLNLDESDTTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKADVQSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPPPLSLPGAGLGAPELPGGPSDGL	720161	726037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_720274_720543_720657_720898_721032_722779_722916_723004_723122_723219_723335_723435_723583_723681_723797_723874_723982_724071_724109_724205_724252_724338_724592_724679_725000_725083_725208_725290_725378_725467_725606_725707
875487	contig_5881_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_129052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484713	485639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_484700_485600
875488	contig_4783_pilon	+	2623	1	Intergenic	novelGene_108403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTCAATATGATGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288590	291213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_288600_291200
875489	SIRV6	+	774	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	3	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	32	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
875491	contig_10718_pilon	-	3083	7	Intergenic	novelGene_164615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	34.8317384004876	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	111	908	114129	98590	FALSE	45	GAAAATACCAATCTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIITFHPQELSQEELCVQKETVKEFFTKGPGAVCDLTSLYFQESTMTHCSHQQSPYQLLFGEPHIFEDLLDLKIRISPDAFFQVNTAGAEMLYRTVGELSGVNSNTILLDICCGTGVIGLSLARHTSKVLGIELLEQAVEDARWTAAFNGITNCEFYAGRAEKILPQLLKSKNDGQLIVAVVNPARAGLHYQVVRAIRNCRAIRRLVFVSCKPHGEATRNFIDLCCPPNSAKKLLGEPFVLRQAVPVDLFPHTAHCELVLLFTR	114239	96414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_-_98717_109981_110082_110314_110435_111574_111677_111842_112058_112392_112488_114090
875492	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
875493	contig_5083_pilon	+	3365	4	Intergenic	novelGene_151618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_2	7.40870359029762	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	181	300	170658	171890	FALSE	40	TCCTCGGTATATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRSRIAYSDEVRNELLGDDGNSSENQRAHLLDNTERLERSSRRLEAGYQIAVETEQIGQEMLENLSHDREKIQRARERLRETDANLGKSSRILTGMLRR	28411	174955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_28490_39652_39738_170640_170712_171824
875494	contig_3612_pilon	-	1971	2	Intergenic	novelGene_87837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGCTACAGTTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978851	968723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_969848_978004
875495	contig_6576_pilon	+	2720	1	Intergenic	novelGene_42455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	253	762	255	1016	1339347	1340108	NA	65	TTGAAAAAAAAAAAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFKLSLITLLFMFVDNISGTSPTLTTSNPTTTITLTITTNTKILTSTPRMASIPQITPNSKTTLNFLTTLNPKMTVNANMTLTPQMTSTPQMTPNSKTTPTFLMTLNPKMTTNANTTVTPQMTPNSKTTPNSKITLNSKMTPNAKTTPNFMMTLNPKMTLKANTTLTPKMTPNSKTTPNSKITLNSKMTPNAKTTTNAKMTSSSKTILKTAMTPKITTMNTKKRTSDSTILNPMDSIHFFFYIFLLFCVHLG	1339092	1341812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1339100_1341800
875496	contig_15084_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_116695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGACCAAGACAGAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210543	209141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_209100_210500
875497	contig_4505_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_176041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAAGGTGACCCTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191736	189367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_-_189400_191700
875498	contig_4079_pilon	-	3209	1	Intergenic	novelGene_167475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGTTCTGATACGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127439	124230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_124200_127400
875499	contig_1535_pilon	+	1435	5	Intergenic	novelGene_127239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	39.2300904918661	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTGCAAGTTCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116134	122104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_116328_116550_116688_118207_118257_118642_118795_121200
875500	contig_13699_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_158318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTGTTAGAAAAGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60555	62816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_60600_62800
875501	contig_6885_pilon	+	3299	1	Intergenic	novelGene_83656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACACCACGTGTATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168918	172217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_168900_172200
875502	contig_1339_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_163152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATACACAGCAAAACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627218	629897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_627200_629900
875503	contig_14289_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_110568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAAGGAGCGGCTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53803	54581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_+_53800_54600
875504	contig_6654_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_85763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTAAGAGCACTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586252	584624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_584600_586300
875505	contig_4103_pilon	-	1031	6	Intergenic	novelGene_51882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	304.287101271151	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	383	754	43906	40734	FALSE	5	CTCCCCCTGCATCTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	45576	40456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_41930_42374_42449_43898_44023_44978_45224_45555
875506	contig_15087_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_37256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAGAGACAGGGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253968	256623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_254000_256600
875507	contig_6215_pilon	-	3311	1	Intergenic	novelGene_21181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTACTGGAGGTCCTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226615	223304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_223300_226600
875508	contig_11677_pilon	-	708	5	Intergenic	novelGene_85947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_4	17815.3485371463	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	207	671	597768	594927	FALSE	20	TCACCACATATGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPELKAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	597974	594889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_597749
875509	contig_5988_pilon	+	2154	5	Intergenic	novelGene_16039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_1	48.8185415595345	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTAATTTTACTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877129	988248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_877211_953848_954119_981234_981315_984813_984923_986634
875510	contig_12299_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_29741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1326	1682	133500	133144	NA	60	AAAAACACACCACCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSTLLGDFAVVLSWITSAVKGHLCYSWGGGQLNRCEGFGYSNSRKAATVVSTEMGFTDSGVACVVLSLLDSYLSKRRIATLETSESYMPSIHAVLQKQDITEAFVSSRNRCSSLLL	134825	132579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_132600_134800
875511	contig_5423_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_85300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCCCTCATATTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620123	617983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_618000_620100
875512	contig_4659_pilon	+	4142	1	Intergenic	novelGene_118216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTTTCTCTGCTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597324	601466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_597300_601500
875513	contig_2987_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_125867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGCTCCATAGGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549582	550740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_+_549600_550700
875514	contig_7428_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_77717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	127	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	144	341	426207	426010	TRUE	15	TCATGTGTTGTAAGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRHKNKFRPPQPPAQAPALAPTEEAEAPPAPRPDSHEARAGALRARMAQRLDGARFRYLNEQLYSGPSSAAQRLFQEDPEAFLLYHRGFQNQVKKWPLQPVDRIIRDLRQR	426350	424046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_425090_425312
875515	contig_9833_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_68486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	43	417	192631	192257	NA	25	ACATTCTTTTCAAGTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQIEGGADDTGGTQMEHFRALLCVTVLQACSPHWWKRSDPECWPFPFSFAHKNRACTPPLPSQYTHTPIYTSSPLSSPGPFTDVIRMGLNVIIRESSMVESRGFGALQNQVQIPPLPLTGSMIMSNLLNLSDVCFFNL	192673	190170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_190200_192700
875516	contig_7816_pilon	-	3964	7	Intergenic	novelGene_66549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCCCAGGAACAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345872	323203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_323356_325274_325372_328837_328979_336282_336360_340271_340324_341296_341426_342556
875517	contig_15327_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_70543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACGCTCCCAAACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523723	525686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_523700_525700
875518	contig_10352_pilon	-	1716	2	Intergenic	novelGene_49612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	44	361	44174	39625	FALSE	20	CATGGTGGACAGGTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAGEDAVSRVAVAMARDVRPPGGAGGGPEHRGAAGAEPAVCCAARTEPGVDGNHFQHPADNHDPYGILCLQAHSAPVTASKQVLLRFVNRIHCVAHGPVEKLESELSCLEMTFGLDSW	44217	38269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_39836_44067
875519	contig_9706_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_20971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330623	332935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_330600_332900
875520	contig_13481_pilon	+	2346	14	Intergenic	novelGene_119259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGGAGGGGCAGCGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4589	174245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_5190_12427_12535_21691_21805_32615_32724_33372_33524_33798_33881_35756_35844_38516_38752_40090_40241_69960_70036_75730_75765_101971_102374_121609_121660_174093
875521	contig_4519_pilon	+	3011	1	Intergenic	novelGene_123721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATGTAACCAGTACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689786	692797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_689800_692800
875522	contig_7272_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_25358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	679	junction_1	0	39	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGAGATCATTCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606057	603928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604814_604922
875523	contig_18406_pilon	-	4844	3	Intergenic	novelGene_88052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_2	3	68	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	117	422	61017	57002	FALSE	25	TAGTTACTTGGAAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLALRNELVVDKTKRKKRRELSEEQKQEIKDAFELFDTDKDEAIDYHELKVAMRALGFDVKKADVLKILKDYDREATGKITFEDFNEVGVYPNSFCNQQL	61133	52579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_-_57155_58991_59128_61000
875524	contig_12626_pilon	+	2067	8	Intergenic	novelGene_80449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	840	junction_1	260.575736179933	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	767	2065	157850	171240	FALSE	40	GTGAGACATATACTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVYQFFPPHRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEM	156734	171242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_157111_157459_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_171116
875525	contig_7870_pilon	+	3298	1	Intergenic	novelGene_108989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGACACCATGTGAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440765	444063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_440800_444100
875526	contig_678_pilon	+	1151	2	Intergenic	novelGene_167802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	714	1019	125257	125562	FALSE	85	AAAAAACAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIGSLRLVSGTLSRELNLTRELDRELRSGLVSDKPGMSSIFVGVTMNRTEAILEVVSGGCIFLFFLFKDKEERKPPPPQIFSPMLATFDCKNRKDNLYI	57920	125694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_58551_125173
875527	contig_10159_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_30894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGATCTACCTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998699	1001426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_998700_1001400
875528	contig_10750_pilon	-	3574	1	Intergenic	novelGene_172605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2889	3200	57302	56991	NA	20	ACAAGTGGGTGGTATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLLTLLSKNYCILQDRGNSFQPRQRQEEELNQSSLRMKQSHLQRQLSSCLQSFPLLQYKKSERNWVRGVDDHSGPFQHRLSVRWSKGSHLPPSHTATRSVN	60190	56616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_56600_60200
875529	contig_12638_pilon	-	1303	2	Intergenic	novelGene_33326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAAAATGCTTGTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300271	1298317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1299322
875530	contig_817_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_132482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	331	906	733896	733321	NA	35	AACCTGCAGCGAGGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTEGAAQCQLWGRVRTGGYRHSWTSVVRSGQRALGSVSCGEGQNKRVETRLDFHGQEWTEDAGQCQLWGGSGQEGTDTAGLPWSGVDRGRWAVSAVGRARTRGYRHGWTSMVRSGQRALGSVSCGEGHDRKVQTRLDFHGQVWTEGAGQRQLRGGSGQEGTDTAGLPWSGVDRGCWAVSAVGRVRTGGYRHSWTSMVRYGQRALGSVSCGEGQDRRVQTQLDFRGQEWTEGTGQCQLWGGSGQEDIDTAGLPWSGMDRGHWAVSAVGRVGTGGCRHVWGRLWTLEERRREKGPEDRVGSAD	734226	731995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_732000_734200
875531	contig_6048_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_73344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	80	502	2918626	2918204	NA	20	GACCCAGCCCCTGGTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPTPPHGKMQKSPTEQGPRERGNAGLGKAPQNRGAVWVRQSLLHRSYAVMSRNVPELEAAQRGCWAHGDTVLEAPLGAIWCPRAVGNGGSQCWGSSKSFMGGVGMPHTCHVLGPSDPRAEHGLPDTGLQKPMPSDLPK	2918705	2916610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2916600_2918700
875532	contig_18081_pilon	-	3335	2	Intergenic	novelGene_23852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2652	2960	456726	456418	FALSE	35	CAGTAAGTTTGTACACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLVFSLGYNIKVTISSLSPLQIAVSNLNEAVQDADLLVFVIPHQFIRRICDEITGRVSEKALGITLIKVTRVQTRGGRTSPTVGSRDVSFPSLSVCLWS	459420	456042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_457574_457616
875533	contig_5910_pilon	-	3612	3	Intergenic	novelGene_168417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	22.5	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	71	730	109136	105366	FALSE	80	GCAAACAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPTSSFMDDSAMHIPPGLKPHPERMPPLIADSPKARCPLDALNTTKPKPLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNTYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLVDNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVPPRLGSHTMDFFEMCASLITTLAR	109206	102483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_105605_107160_107288_108842
875534	contig_12635_pilon	-	3001	1	Intergenic	novelGene_60863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAGAAAAATTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620716	617715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_617700_620700
875535	contig_10482_pilon	-	2398	6	Intergenic	novelGene_152803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCTGATTCTGGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124261	77224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_77345_116178_116257_117242_117313_118595_118654_119567_119710_122331
875536	contig_15327_pilon	-	3390	1	Intergenic	novelGene_70405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCATATGTGTGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8549	5159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_5200_8500
875537	contig_6302_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_171710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAAGATAAAGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234149	232247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_232200_234100
875538	contig_9038_pilon	+	4367	1	Intergenic	novelGene_143327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGATGTCTTCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390029	394396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_390000_394400
875539	contig_14822_pilon	-	2874	2	Intergenic	novelGene_145398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	39	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1803	2105	114013	113711	TRUE	0	TGCCTTCTTCCCTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIGLGTWKSEPGQVRDGGMRGELLEPLSGKRQDLGEGLCIFPDRLPTSYSTSCRDDPGGQWEEEREEGTISESLAPPAAFTFPAHSEEGLRGPVGPRA	115815	57437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_57657_113160
875540	contig_9937_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_129211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152861	155013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_152900_155000
875541	contig_10549_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_110648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1667	1975	527453	527145	NA	60	AAAAAAAAAAGGCTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLGEREKFLFFPTHRYLLEHGSTYVGLNAALCGLIANSLFRRVLNVTQGRLAASLPMAVIPFLTAQISYKGFVSLPLSTGKFCYTITIKSAVVYIVCNLN	529119	526944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_526900_529100
875542	contig_11448_pilon	-	4192	1	Intergenic	novelGene_66384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGGAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390713	386521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_386500_390700
875543	contig_8616_pilon	-	1884	16	Intergenic	novelGene_72535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAGAGGACGCTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407457	401258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_401439_401780_401873_403509_403627_403739_403806_403988_404108_404418_404522_404701_404802_404970_405161_405259_405333_405456_405515_405684_405791_405911_406054_406291_406521_406653_406740_407128_407255_407360
875544	contig_3130_pilon	-	2991	7	Intergenic	novelGene_103572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_6	106.422768031825	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	7	1023	167769	128864	FALSE	35	AGCCCAGCACACCATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAVGVRGRCELPPCSGPGWLLSLSALLSVAARGAFATTHWVVTEDGKIQQQVDSPMNLKHPHDLVILMRQETTVNYLRELEKQLVAQKIHIEENEDRDTGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRGVQERVNLSTPLLPKEDPVFTYLSKRLGRSIDDIGHLIHEGLRKNASSWVLYNMASFYWRIKNEPYQVVECAMRALHFSSRHNKDIALVNLANVLHRAHFSADAAVVVHAALDDSDFFTSYYTLGNIYAVNTTFCFMSQMSCYFLSFFFNNVSFFSFQFCI	167775	126895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_129108_129921_130032_133509_133642_133929_134042_134805_134976_143287_143378_167610
875545	contig_7207_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_72102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTTTCTATTTACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753819	756164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_753800_756200
875546	contig_9436_pilon	+	1360	6	Intergenic	novelGene_60900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_5	103.696480171701	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	75	488	413494	414144	TRUE	10	GATATGGTCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATARTDRETKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPVETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRK	413265	415376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_413336_413489_413626_413730_413899_414030_414447_414574_414711_414942
875547	contig_9335_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_147448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCCTGCCTTATCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405847	407389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_405800_407400
875548	contig_17753_pilon	+	592	3	Intergenic	novelGene_105055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	134.5	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAATTTATACATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45480	96369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134
875549	contig_7870_pilon	+	2515	1	Intergenic	novelGene_109002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCGCTAGACAAACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483126	485641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_483100_485600
875550	contig_10003_pilon	-	4430	1	Intergenic	novelGene_88241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	516	950	676194	675760	NA	30	CTCAGCAAATTTGCAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLLRATSQPPGQIPSRPWGLQPLAQPGHFPLPESGHLDHHAAACSAWTSACTDPGCSCFPFTELPAPLATSCLEVPSSAPWANSLPTAILTAAGCKSHAPAPAHASPILSAAAPLLGLFTDAATGPRLALFCVISLLLQPFY	676709	672279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_672300_676700
875551	contig_8712_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_58791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295788	298227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_295800_298200
875552	contig_6513_pilon	+	4299	1	Intergenic	novelGene_117751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATAACCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78424	82723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_78400_82700
875553	contig_6101_pilon	-	1818	1	Intergenic	novelGene_114275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182024	180206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_180200_182000
875554	contig_7356_pilon	-	2380	10	Intergenic	novelGene_60355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_9	34.5350063944784	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	252	1439	158503	104301	FALSE	60	AAAGAAAAGAAAGTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPPLLLAALVACIIVLGFNYWIASSRSVDLQTRITELEGRVRRAAVERGAVELKKNEFQGELEKQREQLDKIQSSHNFQLASVNKLYQDEKTVLVNNITTGEKLIRTLQDQLKALERDYGKQQQDVLQFQKNQSNLERKFSYDLNQCINQMKEVKEQCDEQIEKISRKGNEAIASRDLNEKRDQSQQHHFLSEPQARLQDAGLLQAEVPQEKGNVLSNAQRQTPAPNSEIALDLKRQAEKEETNEIQVVREEDTQRLGLGLPQEPGQAPAAKDDKLVEGKGVGGARELGQTPQLPAALLASQENIETDGPERDQLVIREDQEEEHGADEQGRNQQKLGGDDAYNTDENEAESETDKQAAFLGNDKSLNIFNAEDKKRDTINLLDQREKRNHTL	174315	103359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_104378_108410_108525_110142_110413_111107_111268_115505_115636_120875_120979_123711_123767_155710_155891_158404_158555_174115
875555	contig_20875_pilon	+	2332	6	Intergenic	novelGene_153089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	36.6791493903553	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	694	2292	4981	10311	FALSE	45	AAAAGACATAGCTCATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGCSLNKCRPPPVQGYEQSKLRHPGPGSQPNSFQLRQIEFLKGRLPEVPLTGKQTPSPPVFLPGLQPRFPGPPARDRQLQIWNIPRGVSLGSQGLQRGFQHPSPWRGVDRLTSRFQELNISQDQEKRILKLLEELEEGKTTTAYDLAKKLGVPKKEINRVLYSLEKKGKLHHEAGNPPLWRIAVPVHAAKQQSKAVRADSHRQAAPRSDPSLETEDRNPASGLEDCPVLFDMAEIKEKICDHLFHVSNSSALNLAKNIGLTKARDVNAVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERMQIKRNSSSVRETTPAATPETERNVELPTYNLPVSGASNNVTMGKVANGQEPVTKLENRPEATPGPVKLKPPVHDNGPSKPGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIHSAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNLIEQSGPPHEPRFKFQVVISGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTVLLEEARAKDGGRSEDSYHCSPEKGSERTAESQPTTPSATSLFSGKNPVTTLLECVHKLGSSCEFRLLSREGPAHDPKFQYCVAMGPHTFPTASAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEATNSTPSDDQPGGANTESLDNLESIMPSKVRRIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLVDQSGPPHEPKNGSPRGTVVKSLAANQKVGSSNPQAGLVIRSTSAVILLVLYFSAYTRSIVCSIHFQSEISGPWVMCTFLKC	4287	10351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_5694_7509_7694_8230_8380_8903_9049_9190_9382_10094
875556	contig_3426_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_57955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCGGATCAGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418303	417283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_417300_418300
875557	contig_7165_pilon	-	3103	6	Intergenic	novelGene_116922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.06421535489973	30	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	42	761	1265314	1253286	FALSE	80	CACAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRVPPSTSTTTLSSTTTKTVAATTRAPGTTAHSPTYHNHSTETPSLATSVWSSVSVPRAPSISPSTASPATSNHSQHYGNEGGKMGSTVTAAVIGIIVPMAVIALLCTSGYLIWRNWKRKNTKSMNFDNPVYRKTTEEEDEDELHIGRTAQIGHVYPAAISSFDRPLWAEPCLGETRELEDPAPALKELFVLPGEPRSQLHQLPKNPLSELPVVKCKRVALSLEDDGLP	1265355	1250943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1253325_1256480_1256658_1257650_1257824_1261741_1261811_1264154_1264380_1265277
875558	contig_1723_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_165528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAAAAGGCAAGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31086	32643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_31100_32600
875559	contig_16492_pilon	+	2993	3	Intergenic	novelGene_100307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	273	junction_1	43.5	14	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	2638	2991	167398	168802	FALSE	35	CAACCTTGATCAAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEV	160111	168804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_160182_164830_167499_168549
875560	contig_7753_pilon	-	4254	1	Intergenic	novelGene_41457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522434	518180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_518200_522400
875561	contig_13565_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_162393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAACAACAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193580	195928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_193600_195900
875562	contig_8122_pilon	-	2764	1	Intergenic	novelGene_40231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTCATCGCAAATTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594173	591409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_591400_594200
875563	contig_11816_pilon	-	2945	1	Intergenic	novelGene_98467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAGAAGAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430102	427157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_427200_430100
875564	contig_9415_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_109908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATCTTGGCAATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2111469	2113891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2111500_2113900
875565	contig_15108_pilon	+	2398	2	Intergenic	novelGene_131189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1312	1704	169272	169664	FALSE	55	GGGAACAAAGAGAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVREGRLRETLFCECCQGRFSAPSLTSSSSPSSPHHNNHHNKTIAAAAQKPDSGPAVQSSNEDLLVAFKLAPTHGDPMHDKTKRCPVLRHLHDRRTYARVHCCGHCVLNAFQPGRLIFQRYKKPLPWSQF	151496	170358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_152441_168904
875566	contig_7513_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_88970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCTCAGCATGTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241063	239274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_239300_241100
875567	contig_10196_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_132196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATAATTGTTTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1163852	1161231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1161200_1163900
875568	contig_10774_pilon	+	816	4	Intergenic	novelGene_158682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACATTCAGGTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25497	56401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_25611_38731_38893_42281_42460_56037
875569	contig_7720_pilon	-	3606	6	Intergenic	novelGene_155748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	4.9152822909778	58	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	775	3282	302917	295053	FALSE	45	AAAAAAGGAACATGCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLSTHLLGLQLSLACCCWALACQEVESSPDFSLPGDYIIAGLFPLHGESPGVRRKPEVTLCDRPNNFSGHGYHLFQAMRLAIEQINNSTSLLPNVTLGYELYDVCSESAVVYAVLSVLTPRGMRHIEIHQNLSYFSPKVVAVIGPDTTSHAATAAAMLSPFLVPVISYEASSMMLSAKRQYPSFLRMIPSDKNQVKTMVLLLQRFGWVWISLVGSNGDYGQLGVQELEEQASRKGICIAFKGIMPYSARAGDEKMRGMIHDLAQVRTTVVVVYAGRQLAKVFFESVVLAKLTDKVWVASADWAISSHITEMPGIRDIGTVLGVAIQQRVVLGLKDFEEAYVRADKGVLRSCPQGSWCSSNQLCRKCWTFTRDKMPTLGTFSMSSAYSSYRAVYAVAYGLHQLLGCPSGACSVGLVYPWQLLQQIQKDNLTFNNHGNLLGGYDIITWDWSGPEWSFRVIGSSTWSPVRLDINKTKIQWHRKNNQVPKSVCNKNCSKGYRRMVTGVHHCCFTCVSCEAGTFLNESDLYHCQPCGKEEWAPQGSQTCFPRTVVFLTWHNPISWVLLAANTLLLLLLGGTAGLFAWHFDTPVVKSAGGRLCFLMLGSLAVGSCSLYCFFGEPTLSTCLLRLAPFALGFTIFLSCLTIRSFQLVFIFKFSAKVPTFYHAWVQNHGAGLFVVLSSMAQLLICLSWLVVWTPLPTREYEHFPQLVVLECTQANSLGFILSFAYNGLLSVSAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLLNFVSWITFFTTASVYQGRYLPIVNVLAVLSSLCGGFSGYFLPKCYVILRRPDLNSTEHFQASIQDYTRRWGST	303691	294728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_295985_296875_296997_297291_297484_297912_298675_300610_300918_302723
875570	contig_7839_pilon	+	2883	11	Intergenic	novelGene_45689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_5	14.1523849580203	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	295	2445	158740	190093	FALSE	70	GGTAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSYPGQDRVVALVDMDCFFVQVEQRQNPHLRNKPCAVVQYKSWKGGGIIAVSYEARAFGVTRYMWADDAKKLCPDLLLVQVRESRGKADLTKYREASVEVMEVMSRFAVMERASIDEAFIDLTSAVQERLQKLQGQPISADLLPSTCIEGLPQGPTAAEGTVQKEEMRKQGLLQWLDSLQINNTASPELQLTMGAVIVEEMRAAIERQTGFQCSAGISHNKVLAKLACGLNKPNHQTLVSHGSVPQLFSQMPIGKIRNLGGKLGASVIEILGIEYMGELTQFTESQLQSHFGEKNGSWLYAMCRGIEHDPVRPRQIPKTIGCGKNFPGKMALATREQVQWWLLQLAQELEERLTKDRNYNDRVATQLTVSIRVQGDRRLSSLRRCCALTHYDAHKMSHDAFAVIRNYNASGIQTEWSPPLTMLFLCATKFSASAPSSCTDITIFLSSDPSSLPKVPVTSSEAKTQGSGPSVTPTKKATSSLESFFQKAAEKQKVKEASLSSFIATTQAPMAKSPSKPSLPFQASHTKGIQPFFKQKSLEALKQKQLNNPSVSFPPQNPWSNPKGLPDHFPTGNPDCAHACEEVLKPESSKATPAVMALAQSSSSRLASLSSKSALDVAQKAATTPSLLDAEDQVSCEKCGSLVPVWEMPEHTDYHFALELQKSFLQPLSPKPHVVPAISPQGKRNPKSPLASSNKRPRPEGMQTLESFFKPLTH	154802	190531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_155093_158735_158886_159125_159261_162161_162380_176213_176384_177961_178066_179410_179531_181032_181157_181687_181754_187147_187318_189195
875571	contig_14142_pilon	+	2516	16	Intergenic	novelGene_120504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_11	35.0747772623006	200	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	192	1916	327468	333867	FALSE	0	TTCCTGGCTTCCTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLPPPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLERLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFILSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQALLEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYTTDESSSSSLHTTRTYGGRGRGRRTGGPAYAPSSDPSTASETESEKREEPNRAGPGDRDPPTRGEESRRRPVAGRGRGPPPAPRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRRNRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPALERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKGPSENGELSAPLELGSLVNGVS	326495	334467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_326536_326881_326976_327410_327483_327593_327743_327949_328044_328524_328642_330582_330754_330955_331035_331386_331497_331724_331812_332121_332333_332540_332739_332831_333033_333124_333221_333371_333473_333771
875572	scaffold_19766_pilon	-	620	5	Intergenic	novelGene_34338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.041322078337	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	33	350	621659	596963	TRUE	45	AAAAGTACCTAGAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHFHGKFFYNMTPPFTHEDYKGRLFLNWTKGQTNGSLRISDLQSKDESNYFCRIQMNTRHHGVQQWQAIEGTRLIITSGRETKAKTSVRGPFQNTEEKYENTGNKGCHSPDSSTP	621691	596407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_596635_596919_596995_597196_597247_598328_598360_621454
875573	contig_14341_pilon	+	375	3	Intergenic	novelGene_111850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	349.5	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	67	375	548758	550141	FALSE	20	ACTGGCGAGGTAGTGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLL	547749	550141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940
875574	contig_6102_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_32031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCTTCAGGCAGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532499	534998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_532500_535000
875575	contig_13740_pilon	+	3543	1	Intergenic	novelGene_34750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669254	672797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_669300_672800
875576	contig_5643_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_39155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672374	670081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_670100_672400
875577	contig_12464_pilon	-	2802	1	Intergenic	novelGene_68671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAGCTATATCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160975	158173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_158200_161000
875578	contig_17198_pilon	+	1743	4	Intergenic	novelGene_62344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	80.8675185445649	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	254	907	627678	661103	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGALLSQDPSAKPVLLLPPKKPAAFSGDHEETPVKQLSLLKQPPALPPKPIARIANHLTDPGAPVKLPCLPVKLSPPLPPKKVMICMPVGGPELSLASYAAQKSGQQSMAQHHHTVLPSQIQHQLQYGGHGPHLPSSTGTLPMHPSSCRMIDELNKTLAMTMQRLESSEQRVPCSTSYHSSGLHSSDGVTKAGPLGLPEIRQVPTVVIECDDNKENVPHESDYEDSSCLYTREEEEEDEDDDSSLYTSSLAMKVCRKDSLAIKLSNRPSKRELEEKNILPRHTDEERLELRQQIGTKLTR	607663	661939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_607846_627606_627929_658168_658411_660942
875579	contig_8452_pilon	-	1785	8	Intergenic	novelGene_47973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	257.723392300302	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	20	868	94608	78835	TRUE	15	GTCTTCCTTGCATCATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPRKGMLLSVFLGSGTQILIMTFVTLFFACLGFLSPANRGALMTCAVVLWVLLGTPAGYVAARFYKSFGGEKWKTNVLLTSFLCPGIVFADFFIMNLILWGEGSSAAIPFGTLVAILALWFCISVPLTFIGAYFGFKKNAIEHPVRTNQIPRQIPEQSFYTKPLPGIVMGGILPFGCIFIQLFFILNSIWSHQMYYMFGFLFLVFIILVITCSEATILLCYFHLCAEDYHWQWRSFLTSGFTAVYFLIYAVHYFFSKLQITGTASTILYFGYTMIMVLIFFLFTGKY	94627	74483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_75170_78603_79018_84145_84258_85258_85411_85909_86070_91579_91638_93810_93931_94544
875580	contig_960_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_108286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCAGTTGTCCCAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020681	1023145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1020700_1023100
875581	contig_11677_pilon	-	554	5	Intergenic	novelGene_85938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17855.9332576038	56	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	299	511	595842	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYEDGAESEEGSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598063	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597426_598027
875582	contig_11677_pilon	+	802	5	Intergenic	novelGene_85935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGCCTTTCTCTCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594883	598062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_594933_595159_595242_595717_595890_597210_597397_597749
875583	contig_11677_pilon	-	599	5	Intergenic	novelGene_85943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	17855.9332576038	5	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	12	557	598052	594927	FALSE	15	ACATATGCTTCTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEGAPTAGIEAKSDRFLSPVPSFSSLPAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598063	594884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597472_598027
875584	contig_11677_pilon	-	479	4	Intergenic	novelGene_85946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13801.1356779071	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCACATATGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597388	594889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597208
875585	contig_8866_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_77904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACACGAATAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128617	1127683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1127700_1128600
875586	contig_5889_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_133682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93211	95704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_93200_95700
875587	contig_11017_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_128095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	892	1191	293252	293551	NA	55	AAAATACAAGAAATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLESIPNHCLDPFFHELLQNDDTLILSLLSGLLAGTLYKEKIPSSSCLVTQRNSLCSRSRIIFLPLFKSFQNNELVPYHSPNGTNKFFFVYTETFDVF	292360	295019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_292400_295000
875588	contig_9014_pilon	-	3160	16	Intergenic	novelGene_106770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	106.481589436338	1	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	20	1984	98081	90663	TRUE	20	GATTTGGGGTTTCAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYLQWRRFVFFDKEVVKEPLGNDGAAPGAAPASGPAASKFLCLPPGITVCDSGRGSLVFGDMEGQIWFLPRSLQLTSFQAYKLRVTHLYQLKQHNILASVGEDEEGINPLVKIWNLEKRDGGNPLCTRIFPAIPGTEPTVVSCLTVHENLNFMAIGFTDGSVTLNKGDITRDRHSKTQILHKGNYPVTGLAFRQAGKTTHLFVVTTENVQSYIVSGKDYPRMELDTHGCGLRCSALSDPSQDLQFIVAGDECVYLYQPDERGPCFAFDGHKLIAHWFRGYLVIVSRDRKVSPKSEFTSRDSQSSDKQILNIYDLCNKFIAYSTVFEDVVDVLAEWGSLYVLTRDGRVHALQEKDTQTKLEMLFKKNLFEMAINLAKSQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYSKGNHDGAVQQYIRTIGKLEPSYVIRKFLDAQRIHNLTAYLQTLHRQSLANADHTTLLLNCYTKLKDSSKLEEFIKTKSESEVHFDVETAIKVLRQAGYYSHALYLAENHTHHEWYLKIQLEDIKNYQEALQYIGKLPFEQAESNMKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGQSEREALGCRANSEEFIPIFANNPRELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWARQREAARRGHLPAEKWALL	98100	88469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_88967_89139_89363_89985_90158_90287_90491_90581_90722_90967_91113_91219_91409_91539_91687_92358_92546_93138_93291_93687_93890_94584_94833_96286_96451_96776_96913_97006_97152_97890
875589	contig_11417_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_103323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCGTTCAGACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568703	566784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_566800_568700
875590	contig_12179_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_128004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAACTTTCTTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518415	520492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_518400_520500
875591	contig_10962_pilon	+	2931	1	Intergenic	novelGene_103876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAACAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126806	129737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_126800_129700
875592	contig_1143_pilon	+	4008	1	Intergenic	novelGene_86642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACGTTAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373403	1377411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1373400_1377400
875593	contig_14525_pilon	+	1262	2	Intergenic	novelGene_149789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247021	248355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_247767_247838
875594	contig_7271_pilon	+	3076	6	Intergenic	novelGene_159944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_5	36.635501907303	108	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	3	1004	327475	460037	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGCCGVKKQKLSSSPPSGSGGGGGASSSSHCSGESQCRAGELGLGGAGPRLNGLGGLTGGGSGSGCTLSPPQGCGGGGGGISLSPPPSCGVGTLLSTPATATSSSPCSSSAASSLLPGSRKMVVSAEMCCFCFDVLYCHLYGYQQPRTPRFTNEPYPLFVTWKIGRDKRLRGCIGTFSAMNLHSGLREYTLTSALKDSRFPPMTRDELPRLFCSVSLLTNFEDVCDYLDWEVGVHGIRIEFINEKGSKRTATYLPEVAKEQGWDHIQTIDSLLRKGGYKAPITNEFRKTIKLTRYRSEKMTLSYAEYLAHRQHHHFQNGIGHPLPPYNHYS	327472	462109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_327948_390351_390463_442056_442172_456186_456278_457670_457768_459922
875595	contig_12886_pilon	-	5726	1	Intergenic	novelGene_135516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	795	1154	640824	640465	NA	40	AAGCCAAGAAGTGATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPPATKKNPPLCNCDLSIKLFFQIFIPIASILLQAPDFYFQPFFALTVLYITSRTITIKHQFQDIAPLLKNCMISVLSEFLWAVCISIHHYLGLKNKTKKPHKTFMSSIVCTLGSIM	641618	635892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_635900_641600
875596	contig_5189_pilon	-	3131	1	Intergenic	novelGene_34817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCCTCAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194484	191353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_191400_194500
875597	contig_8676_pilon	+	2884	1	Intergenic	novelGene_142196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2299	2673	163237	163611	NA	70	CTTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNQVVSMQCSPYLTYLSQETHFITLLFEIYLTSRKRYQHSPTRPLTSASTTLSILHLVSVACLLFLDHCWICFCLRAFALILLLAVLSPPSKSVWLTALFLSHLHQNVTFSVRLLLVSLSKI	160938	163822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_160900_163800
875598	contig_6418_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_81158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTATTCCCAACAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301058	298789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_298800_301100
875599	contig_385_pilon	+	2723	2	Intergenic	novelGene_177045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	15	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1425	1760	274230	274565	FALSE	30	TTCAAACATGGAGGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQDQPRSSIISLSDFLSFPLSFSISSFPLSCFLSLSTLSSYHDFLKLLQNTRAANCFQCFRRLETFHDNSRGLKASTRLVIEGHTKYVSSNPDRGNVCEKAKKHCTAPHF	260933	275528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_261005_272876
875600	contig_14333_pilon	+	2810	1	Intergenic	novelGene_49126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1895	2278	405607	405990	NA	65	AAAAAGAAGGATTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEPGFHGAGFPRRLELEHPLQNARDLFLMSCLFIFYFSGRAGNVASLLLMTLPSATSSVNRFVVALGPFREVMETGRLMSTHPHELFLSRGVGTHTDFKGTSVLSPSLLHAHLYSDIKVALTSFML	403712	406522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_403700_406500
875601	contig_7452_pilon	-	2061	2	Intergenic	novelGene_109168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAACAAAAGCACATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424523	390269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_390754_422946
875602	contig_19228_pilon	-	6421	19	Intergenic	novelGene_174409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	23.1324687638633	64	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	1899	3629	195061	6583	FALSE	25	TATGTGTATACTTCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALSTGSGSDTGLYELLAALPAQLQPHVDSQEDLTFLWDMFGEKSLHSLVKIHEKLHYYEKQSPAPVLQGAVALADDLAEELQSKPLNSEIKELLQLLSKPSVKALLSVHDTVAQKNYDPVLPPMPDDIDDEEDSVKIIRLVKNREPLGATIKKDEQTGAITVARIMRGGAADRSGLIHVGDELREVNGIPVEDKSPEEIIQILSQSQGAITFKIIPSIKEETPPKEGKMFIRALFDYDPNEDKAIPCKEAGLSFKKGDILQIMSQDDATWWQAKHEGDANPRAGLIPSKHFQERRLALRRPEILVQPLKVSNRKSFGFRRSFRLSRKDKKTNKSMYECRKSDQYDTADVPTYEEVTPYRRQTHEKYRLVVLVGPIGVGLNELKRKLLISDTHHYGVTVPHTTRARRSQESDGVEYIFTSKHLFETDVQNNKFIEYGEYKNNYYGTSVDSVRSVLAKNKVCLLDVQPHTVKHLRTLEFKPFVIFIKPPSIERLRETRKNAKIISSRDDQGAAKPFTEEDFQEMIQSAQIMESQYGHLFDKIIVNDDLTVAFNELKTTFDRLETDTHWVPVSWLHS	236162	3790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_6763_8325_8470_10094_10204_11344_11439_19222_19304_36162_36334_79572_79638_80101_80299_80501_80577_83390_83477_84950_85033_86604_86737_110872_110954_113269_113348_160020_160140_195024_195185_224954_225053_234185_234242_234541
875603	contig_9839_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_88589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	688	1131	335855	336298	NA	25	CCAGCTACCCATCACAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTINRSMDPKNMFAIWRVPAPFKPITRKGVGQRMGGGKGAIDHYVTPVKAGRLIVEMGGRCEFKEVQGFLNQVARRLPFAAKAVSRETLEKMQKDQEERERNNQNPWTFERIATANMLGIRKVLSPYDLAQKGRYWGKFYMPERV	335167	336817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_335200_336800
875604	contig_3111_pilon	-	4171	23	Intergenic	novelGene_129951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_22	167.559191465667	861	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1023	3072	115	3186	100376	16585	FALSE	20	GCCTGTGTGCAATATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYTAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYYAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGSAYQSPLPLSRGSLSTIARAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGKESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIREKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCNVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	112905	15599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22889_23185_23289_24064_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964_40056_40855_41003_41524_41680_48564_48681_63172_63276_65402_65595_100154_100403_112817
875605	contig_5918_pilon	+	3045	1	Intergenic	novelGene_99492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAAAAAAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192807	195852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_192800_195900
875606	contig_11615_pilon	-	3417	1	Intergenic	novelGene_151265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGGCATAATTAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73346	69929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_-_69900_73300
875607	contig_8823_pilon	-	4074	1	Intergenic	novelGene_53076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	3053	3514	72278	71817	NA	15	GAGTTTACCCTCATGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKAFTLLKPSFPCSPSSFEGNRPGEGGHGHDSLPEAAEESARAGAGEEEAASATGEARAAGQQESPGARRGCQPSERASGYWDQSRSSSLLPGLAWQGVTPWDYAGIGFQRIVSILCWSPLSHLCKCPISPQLDRSQIPSAPRAKDFHWRS	75330	71256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_71300_75300
875608	contig_500_pilon	-	3380	1	Intergenic	novelGene_31110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	249	359	1558877	1558767	NA	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPRASLSAVPRGLSLLSARSVLGIWRQFLPFTGGHFYRINQRPCVHRTIRPQLAAVRPQQGRGGVANIQLSLKTSLFEDGLMSPTPTFLHYLGASGAVTQHCLESPQASVAPRPGCI	1559125	1555745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1555700_1559100
875609	contig_3602_pilon	+	921	1	Intergenic	novelGene_60524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170211	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170200_171100
875610	contig_6269_pilon	+	2931	13	Intergenic	novelGene_170533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	58.9611453981914	65	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	373	1731	161817	191882	FALSE	10	CTTTTGACTTCTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIANYLPNRTDVQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSVIAKHLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKTSWTEEEDRIIYQAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNAIKNHWNSTMRRKVEQEGYLQESSKASQPTVATSFQKNSHLIGFPHAPPSAQLPPTGQPSVNNDYSYYHISDAQNVPGHVPYPVALHVNIVNVPQPAAAAIQRHYNDEDPEKEKRIKELELLLMSTENELKGQQALSTQNHTCSYPGWHSTTVADHSRPHGDSAPVSCLGEHHSTPSLPVDPGSLPEESASPARCMIVHQGTILDNVKNLLEFAETLQFIDSFLNTSSNHENLDLEMPSLTSTPLNGHKLTVTTPFHRDQTVKTQKENTIFRTPAIKRSILESSPRTPTPFKHALAAQEIKYGPLKMLPQTPSHLVEDIQDVIKQESDESGIVAEFQENGLPLLKKIKQEVESPTDKAGNFFCSNHWEGESLNTQLFTQSSPVADMPNILTSSVLMTPVSEDEDNVLKAFTAPKNRALASPLQPCSGAWESASCGKTDDQMTASGQARKYVNAFSARTLVM	157777	193082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_157799_159355_159449_159698_159920_161779_162015_163922_164004_164643_164749_166093_166349_169154_169298_170398_170514_170600_170727_171451_171563_172726_172835_191765
875611	contig_10197_pilon	+	3638	22	Intergenic	novelGene_115177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_13	78.3133713166796	35	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	832	2499	69	2567	383793	526459	FALSE	35	CTTAAACACCAGGCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEEEELEFVEELEAVLQLTPEVQLAIEQVFPSQDPLDGADFNAVEYINTLFPTEQSLANIDEVVNKIRLKIRRLDDNIRTVVRGQTNVGQDGRQALEEAQKAIQQLFGKIKDIKDKAEKSEQMVKEITRDIKQLDHAKRHLTTSITTLNHLHMLAGGVDSLEAMTRRRQYGEVANLLQGVMNVLEHFHKYMGIPQIRQLSERVKAAQTELGQQILADFEEAFPSQGTKRPGGPSNVLRDACLIANILDPRIKQEIIKKFIKQHLSEYLVLFQENQDVAWLDKIDRRYAWIKRQLVDYEEKYGRMFPREWYMSERIAVEFCHVTRTELAKIMRTRAKEIEVKLLLFAIQRTTNFEGFLAKRFSGCTLTDGTLKKLESPPPSTNPFLEDEPAPEMEELTMEKGDLDQPKKPKAPDNPFHGIVSKCFEPHLYVYIESQDKNLGELIDRFVGDFKVQGLPKPNTDEGGAVLPSCADLFVYYKKCMVQCSQLSTGEPMIALTTIFQKYLREYAWKILSGNLPKTTSSSGGLTISSLLKEKEGSEVAKFTIEELCLICSILSTAEYCLATTQQLEEKLKEKVDVSLIERINLTGEMDTFSTVISSSIQLLVQDLDAACDPALTAMSKMQWQNVEHVGDQSPYVTSVILHIKQNVPIIRDNLASTRKYFTQFCIKFANSFIPKFITHLFKCKPVSMVGAEQLLLDTHSLKMVLLDLPSIGSQVVRKAPASYTKIVVKGMTRAEMILKVVMAPHEPPVVFVDNYIKLLTDCNTETFQKILDMKGLKRSEQSSMLELCRQRLPTPPSGAEGPSSLSLMAPTPEQESSRIRKLEKLIKKRL	383724	527530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_383880_387697_387779_396878_396929_400177_400245_419509_419597_423922_424039_425888_426009_446214_446294_448878_449023_449467_449611_451568_451711_463997_464100_471198_471294_480303_480547_483399_483548_490649_490733_491930_492010_505361_505511_509509_509580_524080_524219_525674_525780_526288
875612	contig_6533_pilon	+	2850	18	Intergenic	novelGene_114660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	34.9898650674656	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	8	2032	266627	320393	FALSE	40	AGTGAGAGAAAAAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAASRPSAGGSRDILWRVLGWRIVASIVWSVLLLPICTTIFIIFSSIDLFHPIQWLSDSFSDLYSSYVVFYLLLLSVVIVIINIFNVEFYTVVPCIPCSRLALIGKIVHPQQVLHSFIHASMGMVMAWCAAVITKGQYSFLVVPCTGTESLDSPAAQTCLNEYHLFFLLAGAFMGYSYSLLYFVNNMNYLPFPIIQQYKFLRFRRSLLLLVKHSCVESLFLVRNFCILYYFLGHIPKAWISTAMDLRKDKQLHPLDTVSGLLNLSLLYHVWLCGVFLLTTWYVSWILFKIYATEAHLFPVQPSFAEESDECLPKVLNSNPPLIIKYLALQDLVLLSQYSPSRRQEVFSLSQPGGHPHNWTAISRECLSLLNDMTQKLVFYQEAAATNGRVISSSYPMEPKKFNSPEETTFQTPKSSQMTRPSVPPLVKTSLFSSKLSTPDVAGSLGTPFGSSVMNRMAGIFDVNTCYGSPQSPQLIRRGPRLWTSASDQQMTEFSNSFPSTSVSAEGKTVGQPSMIYSWIQNKREQIKNFLSKRVLIMYFFSKHPEASIQAVFSDAQMHIWALEGLSHLVAASYTEDRFGVVQTTLPAILNSLLTLQEAVDKYFKLPHVSSKPPRISGSLVDTSYKTLRFAFRASLKTAIYRITTTFGEHLNAVQASAEHQKRLQQFLEFKE	266619	321211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_266684_268648_268770_271042_271145_272992_273168_275315_275455_280732_280842_282723_282776_285309_285443_286585_286679_288578_288661_290546_290706_295201_295448_295544_295661_298248_298300_300838_300903_301637_301739_317139_317301_320329
875613	contig_9706_pilon	-	3101	1	Intergenic	novelGene_21052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCTATAATCTTCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724757	721656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_721700_724800
875614	contig_987_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_72334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGACAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204862	1206873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1204900_1206900
875616	contig_7357_pilon	-	3668	19	Intergenic	novelGene_36858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	228.603543819674	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	34	1626	249442	206610	TRUE	45	GATGACATTAATAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADETPKKGNFSALVGHTNGLTKPASLAAAAAVTTKPGGGSGSKKLVIKNFRDRPKLPDNYTQDTWHKLHEAVKAIQSSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKVSPTLYKQLRQIMIRSIFLFLDRTYILQNSMLPSIWDMGLELFRNHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERNGEAVDRSLLRSLLSMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLTQMYQLFSRVKGGQQILLQHWSEYIKTFGTTIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHIIEVCFQKNEKFINLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERILDKIMIIFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQYMQNQSDPGSIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEWSKTSVANYFGACCFKSRV	249475	195832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_197437_199280_199434_204278_204452_204644_204753_206605_206670_213683_213792_214172_214259_214367_214479_214796_214902_216660_216854_220279_220399_223589_223658_227155_227239_228379_228470_229094_229258_233562_233637_240209_240270_247801_247918_249285
875617	contig_6946_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_59767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTGCAGAAAAATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386477	388694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_386500_388700
875618	contig_9527_pilon	+	3957	4	Intergenic	novelGene_134022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	54.8351063543137	145	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	53	490	46999	49316	FALSE	50	AGCATATGTAAAAACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEETGPKTDRAGERRVKMKAGCSIVEKPEGGGGYQFPDWAYKTESSPGSRQIQLWHFILELLQKEEFRHVIAWQQGEYGEFVIKDPDEVARLWGRRKCKPQMNYDKLSRALRYYYNKRILHKTKGKRFTYKFNFSKLVMPNYPFINIRSSGKMQTLSMGNEL	45035	52783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_45078_46988_47045_47642_47881_49162
875619	contig_14618_pilon	-	2460	7	Intergenic	novelGene_136805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	18.6993761036743	68	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	574	1200	565517	559577	FALSE	30	AATGAGTTGACTCTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPEDSGRKNQFTKNIYQQSTVNMFIQTGPSGTISITNSKGIQIGSANMMQKHTASGKSGSTAPPRPPPVAPDDPSMQEAPAGDWGPRDIHVVHCRQVQLGHHNTMTLHGPLDKSPVCTPTGSPPDAGFARCDSDFPGDVGQAAPGIITTLSSQMDTLSFGREDPTPAENRAPTEGN	570256	558316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_559735_562212_562411_563700_563869_565414_565589_566228_566379_567306_567553_570150
875620	contig_7380_pilon	-	2188	11	Intergenic	novelGene_157522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1476	1919	256004	169645	TRUE	25	TGATGCCAATTTTTTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANYTVLQISAQSLVGLLFLPHFLEVPPLDLPVLFPSEGTSFPEYNMPCEVLGAGHQVEPRSLMLPWLILRQSLSINCKHFGNKDNNWSSVFTSTFHKSCFQCLGFWWKRVKRLRSCTHQFLHSLSCNIKGTRKFLTHHTKNSMGYG	299765	167097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_167177_168702_168781_169532_169671_170632_170753_173426_173533_193990_194122_255943_256076_259675_259826_268341_269326_280005_280189_299678
875621	contig_13108_pilon	-	2272	12	Intergenic	novelGene_135867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	28.5746810427381	531	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	51	1175	39671	19865	TRUE	15	GCCTGTGTGCGTGCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDQQSVTFGTKSRVGMGGMEAKVKAALWALQGGTSVVIANGTHPKVSGHVITDIVEGKKVGTFFSEVKPAGPTIEQQGEMARSGGRMLATLEPEQRAEIIHHLADLLMDQRDEILLANKKDLEEAEGRLAAPLLKRLSLSTSKLNSLAIGLRQIAASSQDSVGRILRRTRIAKNLELEQVTVPIGVLLVIFESRPDCLPQVAALAIASGNGLLLKGGKEASHSNRFLHLLTQEALSIHGVKEAVQLVNTREEVEDLCRLDKMIDLIIPRGSSQLVRDIQKAAKGIPVMGHSEGICHMYVDSEASVDKVTRLVRDSKCEYPAACNALETLLIHRDLLRTPLFDQIIDMLRVEQVKIHAGHRPHPQVRQLPHGCHCHRERENSRVLPPARR	39721	15716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_16755_19805_19902_21384_21446_21555_21572_23336_23459_23559_23756_26112_26251_28849_29071_36579_36674_37853_37928_38650_38796_39650
875622	contig_8865_pilon	-	3099	1	Intergenic	novelGene_164456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCTGATGTGAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393861	390762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_390800_393900
875623	contig_15245_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_145225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	691	1044	91556	91203	NA	25	CTAGAGAACCCTGTGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKIWYSGKILGVEIISFLYPLSNKQTKTKLVAVKSIPTHSDPIRRSRTAPYGFQGAAGGFKLLTLWLAARLLTTMPPITDHLYSSFLKCWCFTNISVKRSNCAYIDICVSFLGLP	92246	90536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_90500_92200
875624	contig_10196_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_132313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	420	851	2362682	2362251	NA	45	TAACAACACATCATAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKIRDQKLDSNYNLPLTHRSLKSVKQGEWVTNTRPAPHANTAGCPHSAALTGRSGRSPYTQGRLVLVPAECHPNGLSGSSDPSQQPVSLGEEPSLSEHPKQRGDSLTFSISRQRNLGTASKLPQVESGCKDPVFQAPQRRI	2363101	2360828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2360800_2363100
875625	contig_6975_pilon	-	2326	2	Intergenic	novelGene_74304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATCCAATGGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517923	514338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_515910_517168
875626	contig_12125_pilon	+	1145	2	Intergenic	novelGene_76229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5003	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAACGAACCAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384628	386709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_384767_385702
875627	contig_2596_pilon	-	1696	10	Intergenic	novelGene_53479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_9	74.1646483287583	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	99	1274	722501	674920	FALSE	10	TTCTCGCCTTCCTTGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEIAGAKPHITAAEGKLHNMIVDLDSVVQKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSKYN	722599	674497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
875628	contig_9594_pilon	+	1664	5	Intergenic	novelGene_73927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	379.140063169273	104	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2	340	301039	301377	TRUE	30	AAACATTTTAGGCAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLEAARLSCPIPDRQLLRAIAGLQPLWAPSNGGCSSPRALRDGPGKGGAEGGAWRSPLVLACALRSIFQTRAQHTSTIAVAVRCRCVIPEPLASAVLPRCLFLTSLLWTSWT	301037	323508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_301400_307478_307530_321604_321659_321936_322036_322410
875629	contig_3380_pilon	-	1663	5	Intergenic	novelGene_60081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	96.112889354134	880	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCATAAAAATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325088	59965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_61224_84891_84950_154422_154544_226563_226680_324978
875630	contig_14925_pilon	-	1021	3	Intergenic	novelGene_55196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAAAGGCTGTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28378	25796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
875631	contig_9919_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_137964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557194	559569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_557200_559600
875632	contig_10000_pilon	-	3587	1	Intergenic	novelGene_139352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAACTGGGTTCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350894	347307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_347300_350900
875633	contig_9121_pilon	+	3187	1	Intergenic	novelGene_134453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCATTAAAAAATTACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146355	149542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_146400_149500
875634	contig_6361_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_24026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCACAGTATATGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436343	433435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_433400_436300
875635	contig_5947_pilon	-	3192	5	Intergenic	novelGene_101473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91796	80142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_80266_81258_81382_82207_84408_90146_90249_91152
875636	contig_10074_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_57168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGACAACTTGGACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545075	543894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_543900_545100
875637	contig_11337_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_107188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGACTTACACAGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177139	179579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_177100_179600
875638	contig_5344_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_125333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCAAGCTCTTCACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44734	47076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_+_44700_47100
875639	contig_11378_pilon	-	3503	3	Intergenic	novelGene_112219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACATATTAACTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296185	262174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_263526_291895_292060_294197
875640	contig_500_pilon	-	1135	3	Intergenic	novelGene_31111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_1	79.5	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	7	474	1566543	1559991	FALSE	5	TGCGTGGTGTCTGACTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKMASVVPLKEKKLMDVKIGELPSWILMRDFTPGGIFGAFRRGYDRYYNKYVNVKKGSIAGISMVLAAYVVFNYCRSYKELSECLLDCLNFSGVPVRGWHWFTVRFGHPPLTGQLRDLKDVPYLCSHLKGLQGLIRTQYNTWDFILSEDIVGKERIR	1566549	1559329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1560338_1562150_1562259_1566530
875641	contig_5799_pilon	+	3385	1	Intergenic	novelGene_50279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299520	302905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_299500_302900
875642	contig_15219_pilon	+	2684	3	Intergenic	novelGene_40843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1663	2058	40948	41343	TRUE	25	CCGACACTTCAGCACATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGQIQGPQWVPVAGNHPDPANPPFCPPRLIPVAICIHERQLKSQQTIQIGVVVPRRLVQEKHIPVWQQEQHTAYPVAQAQHHAQCPWDLWEKGLRGQRVTTGPAPLEHALGGIKKSHQAFYNQLKLTKN	39285	44476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_41675_43804_43977_44353
875643	contig_8270_pilon	-	2436	5	Intergenic	novelGene_143799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_1	37.7392368762274	313	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	72	848	429421	380364	FALSE	40	TACCAAAAATTGTTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATIQDSRASAGKKLKNSLKKKKKMKVIARATSSKLEDEDKDAADGGGSVGSCGLEEDDFSSDNKAIDADNEEEVEPCDRGNENAAESSVGTDPGWADAMAKILNKKTPKTKPGILMKNKELEKEKETLKRERLEKRKQLDRRREWEMMCRVQPDVVKDKETERNLQRIATRGVVQLFNAVQKHQKNVDEKVKEAGGSIRKRAKLISTVSKKDFISVLRGTDGSTNEKSSAGKKSKAKQTEVKSEESPGWNIFRDDFMMGASMRDWDKESDGSADSQPGATS	429492	378775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_380496_406158_406361_409438_409537_412730_413006_429351
875644	contig_960_pilon	-	2973	2	Intergenic	novelGene_108265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGTTGTAACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637983	634653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_635901_636257
875645	contig_10882_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_172753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGCAGCAGGCTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29925	31556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_29900_31600
875646	contig_16532_pilon	-	2689	1	Intergenic	novelGene_110074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATGAAGTTAACGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593911	591222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_591200_593900
875647	contig_15120_pilon	+	3962	13	Intergenic	novelGene_107998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_10	15.6015935795746	107	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1177	3534	146	3679	116469	146962	FALSE	15	TTTTGATACATTCTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPTGKPLSCEEKEKLKQKLAFLKREYSKTLARLQRAQRAEKIKNSIKKTVEEQSCLLQQEIAPRLNHSEPKNKVSPFEKLQISTHLDDETGEKTCITLDIEPESFNLGDGPVEESHLQRTDGIQEHFPYRVSDPDGEKRQNKLPGRGKQQQKRTFISQGRESSFDCDSLILSGKRIKEQEKINRENPQTPVSEIKTHLSSPKHEIPDSPALVTETNERNVLIPPTAKPERDTHGLLRGNNFPRATTLHLHTPSDTSRGQQLEHIPPKANCELANISTTSPVNLEAQGKKMTVFVNNPVVNKNVSAGDQVPGSHNLVADNSCFVNELTYNNLLASENQNLKERNHIEKSLKPPSNIPDGRNESLLENEVLNQSKSFSLESVSPVSTEDQTYSCTMLEGLLFPAEYYVRTTRSMSNRQRNVALEAVNQSHLDVKKKGFKNKETTENLNLSYEETDQSEIRVSDTWTGQPSSRSPQKIVSLTEVSRPTRPAKDNDFFRKSVAQPSSRRNRGKRKSTCTPILDDHELILPTSGTSGVTRSKEEVTLHKYQNEKEIHGKDGRGQKENSLLSRDKAYSLALDRDAFNPLFHKDEMLSLKFLSSFFKITDFQLPDDDFGLLKLQKLKSCSEKMIESFALKTCAERHLKEGNCTVWEELIPKQIDTEKEVLEKELIVLPGKAHPKMPNLESQSKKGLSSSILLFTPSNTVAPDDNDRPTADMCSPAFPILGTTPAFDSQAHYENVSAEVVGHTCYIPQLSQSKDTVSLANDNKQCNSSISPSKLDTTLHVSDRKGQPNCDSGSQPAPLPMESLTAKGNQLRGSTRLELCNESVKQAEIADLPTCDSLNPGSLQLISKLKNPSGSCSVDVSTTWWEIAGCKEPCIITACEYVVSLWKPLDTWQWKKVYTWHFTEVPVLQIVSVPDVCNLVCVALGNLEIREIRALLCSSNDGSEKQLLLKSGNIKAVLGLTKRRLVSSSGTLCDQQVEIMTFAEDGGSKEKQFLMPPEETILTFAEVQGMPEALLGTTIMNSIVIWNLKTGQLLKKMHMGDSCQASVCHKAYSEMGLLFVVLSHSCAKESEWLGSPVFQLIVINPKTTLSVDMMLYCLPQGKAGRFLEGDVKNNFAAAVLTSGTIAIWDLLLGHCTALLPPVSDQNWSFVKWSDTDSYLLAGQKDGSIFVYRCL	116323	147245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_116517_119207_119268_119407_119511_124032_125485_127373_128198_128558_128631_130410_130573_132850_132937_133188_133351_135260_135378_141542_141631_144338_144488_146751
875648	contig_15741_pilon	+	4459	1	Intergenic	novelGene_159680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	53036	53392	NA	15	CATCCCTGGGCTTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCTCSLPLAPVTSWHLPGVRTHHSLTPWFRATEARPSHPLLPSRHSALRVGKQQQAQLLPHTPHAHSLLLLPGRLLQEVSVEGRETHAGPTSLTTGLGLAPGGIWEGGQGALSRVGRW	53034	57493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_+_53000_57500
875649	contig_8866_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_77803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTGCAGCGAAGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414566	416931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_414600_416900
875650	contig_5278_pilon	+	1480	5	Intergenic	novelGene_139772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	45.8911756223351	293	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	100	654	194722	207979	FALSE	10	TAGGTGGGACTTTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDCALCSLVEELIPRETKVGFRMAKEEPQSISKDLQELQKKLSLLIESIQTNSKVVAFMTSPVGQYLDRHPFLALTLLMFIAMSAVPVGFFLLLVVLTSLAAFVGVILLEGLVISVGGLSLLCILCGLAFVSLAMSGTITVSYMVVSSLISYWFSPSSLAQQNPSGNCRLSMKSTDFEGLYQE	191772	208805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5278_pilon_+_191845_194694_194887_200452_200622_201964_202104_207897
875651	contig_12123_pilon	-	2626	3	Intergenic	novelGene_144578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_2	4.5	123	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAAATGTCAGTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62463	37880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_40012_40535_40604_62036
875652	contig_9233_pilon	+	2383	1	Intergenic	novelGene_78246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCCAGCTATAACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584178	586561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_584200_586600
875653	contig_2414_pilon	+	2877	1	Intergenic	novelGene_158480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	181	615	246767	247201	NA	45	CCAGCATGAGGTAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARAVTTVFPFVTSGVTWRVTATFSDEETKDLWTTSPQPQAAWACYSDPYRNGPDGRHSWQKAAPHPNGDRPSGPLSGHQVYPSCTSRSLSVSAPTAWRHTLAISPPKTSCPKFKTIFLGTRTLQLVCFMHCLFLNTAAHYNVA	246586	249463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_246600_249500
875654	contig_5921_pilon	-	3867	3	Intergenic	novelGene_142255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_2	13.5	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	34	822	425216	403229	FALSE	20	AAGCTGGATCTTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLKDSSSQENMVEDCLYETVKEIKEAGATADLGKGPSGKSKSTTTLKELPGPQTQDKAEFAEYASVDKNKKCRLSANSEIVLGSSCDPEEEVPPPVPVKLLDENENLQENEERLADEEGATEGTTETNKRFSSLSYKSREEDPTLTEEEISAMYSSVNKPGQSVNKSTQLLRVLESTYTGIQDGAPQRSPSSCNDLYATVKDFERAPASVSTPPPAERPSKEPEPDYEAIQTLNREEEKATQETDNLDGLFSEENDYENIGDLEQCRDITRL	425249	400183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_403601_416545_416606_424859
875655	contig_19640_pilon	+	1158	3	Intergenic	novelGene_134850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_1	4	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACATTTCTCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9385	15789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_9580_13104_13304_15024
875656	contig_9440_pilon	-	2051	2	Intergenic	novelGene_59106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGGAAGAAAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702370	1699801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1701331
875657	contig_8942_pilon	+	3001	7	Intergenic	novelGene_143197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTATTTGAAGCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339680	514094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_341747_347653_347799_356788_356929_385117_385285_392208_392475_513044_513147_513979
875658	contig_12671_pilon	-	1846	11	Intergenic	novelGene_19200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	227.705094365497	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	840	1005	1844	116548	111760	FALSE	50	TGAAAATGAAAAATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRYLKQKLKNNKLRKENKPAIPLPQILGLTASPGVGGATKQEKADEHVLKICANLDAFTIKTVEENIGELRAQIKEPCKKFAIADDTREDPFKEKLLEIMTKIQTFCQMNPMSDFGTQHYEQWAIQMEKKAARDGDRKERVCAEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYNHLETFYNDEREKKFAVLEDDSDESGDGDDDGDKDEDDEKKPWKLDGTDRFLMTLFFENKRMLKKLAENPEHENEKLMKLRNTIMEQYTRTEGSARGIIFTKTRQSAFALSRWI	195309	111757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_111930_112292_112569_113294_113419_115097_115215_116395_116614_117671_117884_122538_122760_128635_128741_143975_144123_147825_147968_195197
875660	contig_13211_pilon	+	3093	1	Intergenic	novelGene_123144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATTCGACGGCAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233076	236169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_233100_236200
875661	contig_14333_pilon	+	2856	1	Intergenic	novelGene_49080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCTGCGTAATAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249045	251901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_249000_251900
875662	contig_8954_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_130250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAATACAGCAAGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9591	6953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_7000_9600
875663	contig_8145_pilon	-	2917	1	Intergenic	novelGene_118667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTGAATGGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883840	880923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_880900_883800
875664	contig_6241_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_156441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTCTATGTCTAGCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353532	355786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_353500_355800
875665	contig_14682_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_139121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAGCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128099	126347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_126300_128100
875666	contig_6557_pilon	-	1638	2	Intergenic	novelGene_32974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	79	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432914	430436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_431764_432603
875667	contig_14450_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_48951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCATTCTGCTGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562070	563856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_562100_563900
875668	contig_9668_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_58167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGTCAGTCCTAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482994	485079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_483000_485100
875669	scaffold_19766_pilon	-	3735	15	Intergenic	novelGene_34412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	12.9624654369484	152	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	93	698	843430	841852	TRUE	30	AATACATTATGTGCTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGQPTRVLLFRGSRAGQAEVSQSCLLSRTAMISQFFILSSKGDPLIYKDFRGDSGGRDVAELFYRKLTGLPGDESPVVMHHDDRHFIHIRHSGLYLVATTSENVSPFSLLELLSRLATLLGDYCGSLGQETISRNVALVYELLDEVLDYGYIQTTSMEMLRNFIQTEAVVSKPFSLFDLSSVGLFGAETQQSKVAPSSAASRPVLSSHSDQNQKNEVFFGCGREIVCTDSI	843522	837347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_839853_840030_840143_840281_840333_840567_840613_840899_840995_841095_841203_841526_841581_841682_841750_841850_841915_842139_842221_842313_842425_842576_842674_842752_842860_843181_843271_843372
875670	contig_9955_pilon	-	2867	1	Intergenic	novelGene_21357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCCTAGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156542	153675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_153700_156500
875671	contig_6497_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_35609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTGACCTTTCAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511479	509950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_510000_511500
875672	contig_11590_pilon	-	2805	2	Intergenic	novelGene_125576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAAAAAGAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426233	419161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_419468_423734
875673	contig_12021_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_172204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGGTTACCAAAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277835	275719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_275700_277800
875674	contig_15543_pilon	-	4742	1	Intergenic	novelGene_164339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCCAGCACCTAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41968	37226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_37200_42000
875675	contig_6914_pilon	+	2071	15	Intergenic	novelGene_151748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	19.5729926382331	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	58	1674	158855	169723	FALSE	40	AGGATCAGGTAAACACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALHSEHQAVLQSLSHTIECLQQGGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQEEKEGDATKDSLDDLFPNEEEEDPSNGLSRGQGTQPGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEAVERYYRRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAEILYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSQHRDGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRKQGTDPISQTKVAELLGEGDGRRTSQESPGSVKFEGGEDVSVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGNEPRPSSSNMKRAASLNYLNQPNAAPLQGSRGLSASTMDLSSSS	156976	170120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_157010_158830_159113_162201_162284_162874_163086_163550_163639_165457_165560_165775_165950_166274_166375_166573_166627_166835_166907_167096_167206_167762_167901_168470_168587_168934_168999_169672
875676	contig_8354_pilon	+	3499	1	Intergenic	novelGene_24171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606268	609767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_606300_609800
875677	contig_804_pilon	-	1099	4	Intergenic	novelGene_138787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	96.1491896308371	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	114	608	204639	169516	FALSE	15	CTATCTAGTGTGTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMLKF	204752	169024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_183049_183287_184285_184478_204585
875678	contig_2940_pilon	-	2869	1	Intergenic	novelGene_81961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1444	1986	1006545	1006003	NA	30	TCAGTTCTTCTATAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGLSSFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNISNLKDSLEEGQVEDGGKTLGVISNFQSSPKYGSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEHYQRDYSLIMQALQEERYR	1007988	1005119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1005100_1008000
875679	contig_18303_pilon	+	2935	2	Intergenic	novelGene_146801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATATACTGGGCCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22099	26103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_+_24891_25959
875680	contig_13697_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_165909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGGAATATACGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72199	70190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_70200_72200
875681	contig_16103_pilon	-	3435	3	Intergenic	novelGene_118761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	228	53	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1234	1608	444621	443740	FALSE	30	AAATGGGTAGGCAGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPGAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKPVSTTRSL	446832	441912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_444088_444594_444767_445744
875682	contig_987_pilon	+	4113	1	Intergenic	novelGene_72280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATATGATGTAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910935	915048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_910900_915000
875683	contig_4783_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_108419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAAGACACAGGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407200	404695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_404700_407200
875684	contig_6102_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_32298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCAGACTGCCTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1493254	1495738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1493300_1495700
875685	contig_6102_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_32299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496532	1497486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1496500_1497500
875686	contig_7867_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_162746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTAAACTTTATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252583	250448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_250400_252600
875687	contig_10367_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_169452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	109	420	126609	126920	NA	10	GCTCTCTTCTCTATGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTNKDLTVAFTCSSNQTLYSSSQASLWPGSIFLLSSLSYPLPLSRGLFHVLMLCFPSHQCKFCTHFKTKTTPLRLKAFLEIYHLDRNGQYHQDISFLQIKT	126500	128526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_+_126500_128500
875688	contig_5331_pilon	-	2425	16	Intergenic	novelGene_112763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_15	31.6026721795624	78	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	168	1844	191618	144670	FALSE	20	TGTATTTTGTGTAACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREVDMECQQSQGSVSSQSQGTTSSQPTTSSWQSHSGFLQSHGLSSQPHGSSQSQSMSSSSSGTVPTSSQSSHSSSGTLSSIDTVSTQELYSIPEDQELEEPTPAPWARLWALQDGFSNLECVNDNYWFGRDRSCEYCFDEPLLKRTDKYRTYSKKHFRIFREMGPKNSYIAYIEDHSGNGTFVNRELVGKGRRLPLNNNSEIALSVWSNKVFVFFDLTVDDQSVYPKELRDEYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKRKFAIGSARDADPALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDRVVGNRRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQKEDCLIKITDFGQSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSFGTGGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHKTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKERFTTEDALRHSWLQDEDMKTKFQELLLEENKSTPVPQLPTQPTTSRKRPREGEAEDADTPKRLAVYAAVS	194132	144088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_144760_146136_146218_150465_150552_151750_151867_152084_152249_153253_153341_155843_155944_158261_158324_164592_164647_166914_167024_175942_176034_180046_180195_180312_180438_191254_191625_193026_193135_194079
875689	contig_12292_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_167000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAACAAATCCCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253541	251105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_251100_253500
875690	contig_7898_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_47580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGACCTGAGAATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485697	487521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_485700_487500
875691	contig_3077_pilon	+	2815	1	Intergenic	novelGene_26851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATACCACTGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728212	731027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_728200_731000
875692	contig_753_pilon	+	1929	2	Intergenic	novelGene_112998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTTTCCTACCGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257049	1259096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1258878_1258995
875693	contig_13702_pilon	-	2981	1	Intergenic	novelGene_102621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1359	1724	203710	203345	NA	25	GGGAAATGGGGCATTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPLETPLPAAFSLCLSLASCSWFCKYYYYSHFSDEMKAEMGLEAGQAPCIPDRDPWVAFRYLEKAVYSQVDIPVQPSSPLYKLQGLLRPHVVQLHWISPQYQKGSQPGSCLSGLLPNFL	205068	202087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_202100_205100
875694	contig_11744_pilon	+	2571	11	Intergenic	novelGene_176856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	58	junction_3	45.9944561876755	95	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	7	1188	131589	146519	FALSE	35	ATGGAATTTAGCATTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCCLQVTFQACSISEARYLYDQLATICPIVMALSAASPFYRGYVSDIDCRWGVISASVDDRTREERGLEPLKNNNYRISKSRYDSIDSYLSECGEKYNDINLTIDKEIYEQLLQEGIDRLLAQHVAHLFIRDPLTLFEEKIHLDDANESDHFENIQSTNWQTMRFKPPPPNSDIGWRVEFRPMEVQLTDFENSAYVVFVVLLTRVILSYKLDFLIPLSKVDENMKVAQKRDAVLQGMFYFRKDICKGGNAMVDGYGKAQNSAELAPEEYTLMSIDTIINGKEGVFPGLIPILNSYLENMEVDVDTRCSILNYLKLIKKRASGELMTVARWMREFITNHPDYKQDSVITDKINYSLILKCNQIANELCECPELLGSSFRKVKYSRSKTDSSN	131582	147902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_+_131610_137097_137173_137614_137732_138672_138812_139264_139378_139859_139953_140265_140371_144758_144841_144917_145022_145095_145217_146307
875695	contig_3147_pilon	+	2504	1	Intergenic	novelGene_142288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGAACCAGAAGGTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289349	291853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_289300_291900
875696	contig_4626_pilon	+	3473	5	Intergenic	novelGene_158815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACTGATAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10460	40232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_12258_15748_15993_23916_24118_36760_37245_39485
875697	contig_1008_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_121573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGCTGTTCAGCACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659691	657509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_657500_659700
875698	contig_11678_pilon	+	3023	11	Intergenic	novelGene_160824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_9	50.5137605014713	170	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	207	1286	131812	219300	FALSE	30	AAAAGAGGTGTCATCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPGPAAAAPAQVQAATAATVKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRPIGYGAFGVVWSVTDPRDGKRVALKKMPNVFQNLVSCKRVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVTELMQSDLHKIIVSPQPLSSDHVKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLKICDFGLARVEELDESRHMTQEVVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGRRILFQAQSPIQQLDLITDLLGTPSLEAMRTACEGAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQATHEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKDALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFEPVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEIIHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQPSEMPPSPLVWE	31502	221037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_31663_131765_131896_141936_141993_178683_178791_180215_180302_184124_184335_188793_188896_207668_207756_215038_215238_216159_216254_219245
875699	contig_15067_pilon	-	3382	1	Intergenic	novelGene_154337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCCCAGCAAGAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130567	127185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_127200_130600
875700	contig_8241_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_157505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATAAACACTCAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737915	735567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_735600_737900
875701	contig_5316_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_61220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTCTCTGAAACGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409143	407256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_407300_409100
875702	contig_2403_pilon	+	3560	1	Intergenic	novelGene_71006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCCCCAGACCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126822	130382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_126800_130400
875703	contig_6557_pilon	-	2199	7	Intergenic	novelGene_33006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	5.58022301426107	97	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	174	1226	554624	552316	FALSE	15	GACAGTTGTGTTATCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDVPAPGVDVLPVLFAEEPGLVLEVQEPNLAHVLKCYQEAGLHCLELGHTGDAGPHAMVRVSVNGAVVLEEPVGQLRALWEETSFQLDRLQAEPLCVAQEEQGLRERTGPSYCLPPTFPKASVPREPGGPAPRVAVLREEGSNGDREMADAFHLAGFEVWDVTMQDLCSGAIKLDTFRGVAFVGGFSYADVLGSAKGWAAAVTFHPKAGAELRRFRKRPDSFSLGVCNGCQLLALLGWVGGDPNKEAGEMGRDPWPAQPGLLLRHNLSGRYESRWASVRVGPGPALMLRGMEGAVLPVWSSHGEGYMAFSSPELQAQIEARGLAPLHWADDDGNPTEQYPLNPNGSPGGVAGICSPDGRHLALMPHPERTVRPWQWAWRPPPFDSLTTSPWLQLFINARNWAQEEGC	555136	551342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_552627_552724_553049_553863_553979_554063_554156_554282_554491_554621_554768_555106
875704	contig_19986_pilon	+	2763	3	Intergenic	novelGene_159222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	34	47	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGTCATCGCTATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2858	22124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_+_3016_9334_9483_19666
875705	contig_16525_pilon	+	1952	14	Intergenic	novelGene_133816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	381	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	183	773	141509	142282	TRUE	30	GAAGAGTTCCGGACGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVPAWRPGTQSLSLSASLESEGAASLPSSWGECSLPLGKGLALRLCWPPPSLPLSESLSLPRARPLSSSSESASSSESASLPKISSLSRAARASSSLLSSSPLPLLSLASSLSPSSRSLSLPERSSSLPSFSLLLPFSRSSSEPPASFSSVSISSSSSSSGSWFSSWAFRASWASNSFSFMSRCLTTSRALVPD	141326	146203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_141939_142015_142106_142211_142318_143319_143443_143526_143654_143739_143841_143956_144029_144114_144218_144299_144408_144503_144564_144657_144784_145246_145335_145436_145472_146002
875706	contig_15114_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_121115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	170	556	91593	91979	NA	10	GTGGTGGCTGCTCACGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDLCIVTYSRRLQFTIFYYLLIQQVFLSSTYPCTTVHTGDTKINTLSVLGTSQSGWEEGHDSKPTTVWPDNVTAEAALQSTVTVITAWLLDRCFYEPQFLHLEDGVRRHNLKDYYEDLESLDGIKC	91423	93185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_91400_93200
875707	contig_8284_pilon	-	2414	2	Intergenic	novelGene_125662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTGGCTTCTGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194115	189062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_191399_194037
875708	contig_8138_pilon	+	1532	5	Intergenic	novelGene_52439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	201	656	280295	306552	TRUE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280094	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306848_307357
875709	contig_8415_pilon	+	2779	1	Intergenic	novelGene_141689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTGAAACTTAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220137	222916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_220100_222900
875710	contig_5988_pilon	+	2728	2	Intergenic	novelGene_16098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3433	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	827	1207	1218314	1219126	FALSE	45	AAGGGAAAACAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLPVLDSSEWRLCATDAGTMNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQVRAIFSPGCYGTDHVRKKPTQQSTLSLCPCLILISTLEPELSQQLNQDI	1217487	1220647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1218436_1218867
875711	contig_6079_pilon	+	3535	1	Intergenic	novelGene_160078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	311	936	434	1369	395322	396257	NA	50	TTTGCATAGATTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFFSIPISHPLPAALSRSAILHDMSEDAFEHYTPVVVLSPARKESGKKPLKQRPRRRKRASERYEHADEQMKGRRNDCHLQISNPRWSELHTDSSGSSSTDESHWIQAKRRAQVKFRLSRRRRINNNKPCGNLDGSSTPNRIELADLGTKATKQQEQIQCESCSFNQRREGRRCQECSLSLPRESFETKRYSRIHEENKGRYHQRDPQLLPSFRQNETINKRFCERDSSSEPLEVPEVGKHADDTGLQVNNSVQKPPATCDDGADNLEVCRSVTTEKDLMSYKYISFCYELGVCLTPILQAKHVSILLFV	394888	398423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_394900_398400
875712	contig_11386_pilon	+	2668	6	Intergenic	novelGene_82796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	178.790827505216	34	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	83	1072	71390	86721	TRUE	25	GTAAATGCCTCATTAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPASAWSPNLGFLGCAGPCDCPQLDGAMAPTFLLLLLWLQGGISGPPAQDTYTKVQHWEGETLSVQCPYKNRKNRVEGKVWCKVRRKKCEAGFTRVWAQRPHYLLQDDIQAKVVTITMAALRRQDSGRYWCMRNSSQILYPLMGILLEVFPAPTTERNTPLTHLSNILKGGIVLATGRTPTSDPDAPFTTGMTVFTPGLLTLASILPSTAPETTGPTPMARHSFTGTTPTTTGRRRTTGSQTVTESPSSSWTSSVVPVRISTESMPPSTRSPTTGMCHTGRSLLNKLPPIRHQDSDPTVLAVVLALLPVPVLLVIFYGLWKRRHVGSYSLCNGPARHWRDAPGPEPPWKLTWPETT	71307	88836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_71442_82443_82765_84450_84869_86229_86337_86629_87921_88439
875713	contig_567_pilon	+	3638	4	Intergenic	novelGene_33987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_3	173.363458920526	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	14	313	442621	452722	TRUE	30	AAAACAGATGCTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVSKMAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNVRKHLYLSAWLVNLLPLFLLCQS	442607	458812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_442699_444625_444705_452579_455862_458626
875714	contig_4931_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_138358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTGGCACTTTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235621	238237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_235600_238200
875715	contig_9705_pilon	-	2089	10	Intergenic	novelGene_41708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_5	676.068774352374	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	77	1378	122872	103774	FALSE	45	GAATAAATCATTTAAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFILDHVFIEQDDDSNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALTEESSSSDSMWLSREQTLHTPVMMQTPQLTSTIMREPKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDYNRRGTSLMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIMDESVGLI	125580	103062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_103867_104931_105059_108249_108440_111276_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624_118765_122724_122900_125531
875717	contig_7870_pilon	+	2837	1	Intergenic	novelGene_109088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGAAAGTTTGCAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807981	810818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_808000_810800
875718	contig_5020_pilon	+	2217	5	Intergenic	novelGene_27784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	13.1244047484067	103	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	601	1584	22345	66283	FALSE	20	ATTCTGCGCACAAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGTSRSQASRHEEHVQNIRRFHESLHQGDAVLTSDDKLTTSPLSSNTSLLTSLRRNLSELDQIQQYFSQKLTKPFLPLSPQTQTTILQCQESHRDHTGQGASSLDPESQCILEKSNNLVLQVSSLITDLQTITRNSQASLSSHRARSRSKEVTTLPDAQDTEAIRERSRTPDHPLARAPDGGTNSLPPHTVEETSGGRRMLHKALGHTASKNDAESLVFTRMQNSEDTEAGLAYSDEDYEEDIIEPRTLNEITTVTDKTSPWSSFVSDTSEVISLQPNEVQRESPSCPSEPSPREELQVKSSFLSSPERAVNPHLPRQGSPSQSRVPCEGGTSKARAKEPASANPQLIPRLTLSGTQQSNTFVEWSSSRTGEEMEPKPDPQTENEAASSELSDSTDSFEKLSVYLASQTRRENHKGPPINGPDIKQKQVTTESEVSTRQNLLLPEPIVVPNFFLPPQQLEASLRMLSLSAALPPPTTADQDKSETTSGALSQRPCRPRLNLLPPNLPEEETRRIARIFSSQYSQKD	8840	66916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_9005_19066_19288_22129_23076_26371_26484_66142
875719	contig_6497_pilon	+	2883	15	Intergenic	novelGene_35577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	62.1722836732161	86	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	865	2598	30	2627	202603	232916	FALSE	25	AATAATTCTGTTTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGSDRLLGAGGGGVAVTVAFTNARDCFLHLPRRLVAQLQLLQNQAIEVAWGHQPTFLSWVEGRHFSDQGENVAEINRQVGQRLGLSNGGQVFLKPCSHVVSCQQVEVEPLSADDWEILELHAASLEQHLLDQIRIVFPKAIFPVWVDQQTYIFIQIVSLLPSAIYGRLETDTQLLIQPKTREAKDNTNSKADDAQGKYHNYGRDQERMAKVLQTKQLQSNTVGVTGSSGTDPGLTVDSSTPSLWTIIGSIFSFGSEKEQETSWGLTEINAFKNMQSKVVPLDNIFRVCKSQPPSVCNTSATSTFQKHCAIHVFPWDQEYFDVEPSFTVTYGKLVKLLSPNQQQSKTKQNILSSEKEKQMSEPLDQKQISSDHSQEAGKTCVLKVVWNGLEELKNVIKYTKNIEALHLGKVWIPDDLRKRLNIEMHAVVRITSVEITPKIPRSLKLQPRENLPKDVSEEDIKTVFYSWLQQSTTTTLPLVISEEENIKLGIKDVGLTEFSLNIVHSWEKENDKAKNIFLLSTSLLQKTTIQVLLDPIVKEENSEEIDFVLPFLKLNSLGGVTSLGTSSMEHIIHSLLGCPLSRQLMSLVAGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDTLDAHVEVVDCKALRGKRLENIQKSLEVAFSEAAWRQPSVVLLDDLDLVVGLPALPEHEHSPDAVQSQRLAHALKNMIKEFISMGSLVALIATSQSQHSLHPLLLSAQGIHIFQCFQHIQPPNQEQRCEILHNIIKNKLDCDMNKFTDLDLYLIAKETEGFVARDFIVLVDRAIHSCLSLQSISTKEELVLTTLNFQKALHGFTPTSLRNVNLHKPRDLGWDKIGGLHEVRQILMDTIQLPAKVL	202573	233172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_202732_210096_210241_217101_217186_217387_217503_217818_218583_220879_221000_224330_224455_224697_224811_225686_225770_227363_227497_228273_228371_229568_229740_230990_231146_232334_232525_232740
875720	contig_11264_pilon	+	1778	10	Intergenic	novelGene_154202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	7.63681790108426	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	24	1274	16313	80648	FALSE	30	TAACTAACTCAGTCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDAGWKMSPSLFLHGMEEGNNLYKDIWKNKDESWNFPQDYDPELIKEEKRKELESEIRVQVDELMRQELKNLKLAVDREKELPVKGGKKRGGKKRKKGKKGKKGKRGKKVKDLTANRSIESLYKELVEEGLLIQALKVNLSDYIGEYSYLGTTLRQVSIEPMPSLLDVRQLITLYGILPLGSPTVHEKAPLVKSLLLAGPSGVGKKMLVHAICTETGANLFNLSASNIAGKYPGRSGLQMMLHVVFKMEPKRLKKQLPRILKLLKPDDRVLIVGTTQRPFDAELQSFCKVYQKIILVPRPDYASRYVLWKQIIQRNGGVVTNALNISCLAKVTDGFTQGHIVQVVRGVLTDRRIRQQIHKPLRAVEFISAIASMDPVYQEEEDSFKDWYAKTPLGRKRALALTGGEAEKEKDKGKKKEKKKK	16289	81152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_16368_23716_23824_24006_24109_27323_27392_32007_32091_38872_38981_39354_39555_69855_70034_77437_77677_80537
875721	contig_4125_pilon	-	3429	8	Intergenic	novelGene_25041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	143.810249130937	202	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	18	665	200651	197303	FALSE	5	TTTGGAGCTTTTCTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCQDMALPHVILLAGVLVEVAGTSTESVVQQPECCVEVADANATCPGTGLCGPGCYRHRAENGSISCLQCHNTTFPATTTNSSRCRSPSGRGGPFPMNRSTGTPGLPGSGGPWVVASLFLGTLFISSSLILTVAVFFYLKRASKLPDVCYGRNKVPALQPSEAAAMIPPPQSSGNTTQLVPAHPSLGVTHARPNPKTKNPNSLPMSRFRLIVTL	221803	194538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_197459_197547_197574_197715_197851_198085_198152_198331_198434_199225_199302_200564_200652_221786
875722	contig_6785_pilon	-	3258	12	Intergenic	novelGene_132586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.42234774444986	111	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	58	1278	592196	563535	FALSE	25	TTCCTTATACGTAAGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNEIHQGTNLRCCSDGVFAMSGCPFLGNNVECAFKKLSVEGREEGKSQNGVNKASKGGLIYGNYLHLEKVLNAQELQSEIKGNKIHDEHLFIITHQAYELWFKQILWELDSVREIFQNGHVRDERNMLKVVTRMHRVAVILKLLVQQFSVLETMTALDFNDFREYLSPASGFQSFQFRLLENKIGVLQSMRVPYNRRHYRDNFKEEDNELLLKSEQEKSLLQLVEAWLERTPGLEPHGFNFWGKLEKNIIKGLEDEFTRIQAREESEEKEEQMAEFQKQKEVLLSLFDEKRHEHLLSKGDRRLSYRALQGALMIYFYREEPRFQVPFQLLTYLMDIDTLMTKWRYNHVCMVHRMLGSKAGTGGSSGYQYLRSTVSDRYKVFVDLFNLSTYLVPRHWIPKMNPIIHKFLYTAEYCDSSYFSSDESD	592253	561554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_563689_565172_565264_565937_566018_567135_567194_568472_568585_578700_578809_580068_580256_586760_586889_588125_588197_590844_590936_591842_591949_592161
875723	contig_8866_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_77794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATTTATACAGTTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384370	386717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_384400_386700
875724	contig_8020_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_114361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCAATACCCCCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104123	101776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_101800_104100
875725	contig_8696_pilon	-	3024	20	Intergenic	novelGene_153329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	26	junction_2	193.530602703618	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	7	2220	849601	804047	FALSE	35	AGACTGTATCACATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKKSADDFIDKHIAELIFYMEELRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQVEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLSLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLVETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDRSLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGEPEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEIRFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQHLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDISEMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALFKRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKVAMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNVMSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETDKTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTASG	849607	803242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_-_804164_805108_805199_806395_806506_807129_807247_810996_811091_812797_812879_813502_813586_817190_817285_821188_821287_821597_821729_821945_822165_825561_825694_826563_826704_832425_832546_837162_837296_839098_839245_844614_844674_845787_845870_848696_848830_849566
875726	contig_15982_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_145976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGTGGTCCAGACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74025	71249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_-_71200_74000
875727	contig_3878_pilon	-	4282	1	Intergenic	novelGene_174806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCTTCCAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622901	618619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_618600_622900
875728	contig_10437_pilon	-	1416	6	Intergenic	novelGene_38437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	67	375	866796	866488	TRUE	20	TCAGGCCCTCAATTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLKTNDLSHVRICSPKKKAFTRMALNLLEAIFPSKIKSYQPPGLKRFRSLHKLHELYCWIQPLLFYFYFPGNSCDKEAPKYPKQKKCHCLQTKDLWVISKKITNSSFKRLLSFRITANCDFVSL	866862	858410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_858512_858974_859092_859808_859979_861102_861268_865317_865378_866059
875729	contig_854_pilon	-	1194	10	Intergenic	novelGene_36417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	134.066963183642	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	313	1023	1074160	1064774	FALSE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1081721	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075836_1075892_1081657
875730	contig_3956_pilon	+	2702	10	Intergenic	novelGene_14768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_2	38.1685669913456	298	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	136	1242	919044	963818	FALSE	0	GGTTGCTGTGTCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVAGLKKQFYKASQLVSEKVGGAEGTKLDDDFKEMEKKVDVTSKAVTEVLARTIEYLQPNPASRAKLTMLNTMSKIRGQVKNPGYPQSEGLLGECMTRHGKELGGESNFGDALLDAGESMKRLAEVKDSLDIEVKQNFIDPLQNLCDKDLKEIQHHLKKLEGRRLDFDYKKKRQGKIPDEELRQAMEKFEESKEVAETSMHNLLETDIEQVSQLSALVDAQLDYHRQAVQILEELAEKLKRRMREASSRPKREYKPKPRETYDLGELEQSNGGFPCTTAPKITASSSFRSSDKPVRTPSRNMPPLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDVITLTNQIDENWYEGMLNGQSGFFPLSYVEVLVPLPQ	918908	965278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_919089_955713_955783_956187_956261_957088_957233_958028_958163_959286_959446_959715_959820_962747_962873_963074_963132_963621
875731	contig_4151_pilon	+	2578	5	Intergenic	novelGene_65227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_1	13.2382022948737	178	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	551	685	521851	521985	FALSE	15	ACTTTTTAGCATGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFGIVDADGYLSLYQTNWKCCTVTGSIPKPYLTWQCHNKTANDFVFVSSSSLIATAGLSTDNRNICLWDTLVAPANSLVHAFYCHDSGATVLAYAPKHQLLISGGRKGFTCVFDLRHRHQRQLFQSHDSPVKAIAVDPTEEYFVTGSAEGNIKIWSLSTFSLLHTFINEHARQSIFRNIGTGVMQIETGPANHIFSCGADGTMKMRILPDQFSPLNEVLKNDVKFML	514597	523878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_514695_516307_516400_517495_517549_518838_519057_521760
875732	contig_15697_pilon	-	1941	4	Intergenic	novelGene_173301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_3	145.849999047728	65	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	301	999	47853	37741	FALSE	45	TGGTACAAAGGCAACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMFDPVPVKQEAMDPVSVSYPSNYMEPMKPNKYGVIYSTPLPDKFFQTSEGLSHGIQMEPVDLTVNKRSSPPSAGHSPSSLKFQSSHRRTSPGLSVPSSSPPMKKYSPPPAGVQPFSVPLSMPPVMAAALSRHGIRSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMDNSNSSMQVPVIESYEKPILQKKIKIEPGIEPQRTDYYPEEMSPPLMNSVSPPQALLQE	63896	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_37896_38505_38993_47796_47893_63635
875733	contig_6488_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_44734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTGTGGACATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59996	57591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_57600_60000
875734	contig_10331_pilon	-	2916	1	Intergenic	novelGene_54152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAGAACACCTAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443101	440185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_440200_443100
875735	contig_9345_pilon	-	1396	3	Intergenic	novelGene_24578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1159	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGCCCTTATTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945710	943877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_944781_944941_945115_945390
875736	contig_8594_pilon	+	2565	1	Intergenic	novelGene_140023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193343	195908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_193300_195900
875737	contig_15410_pilon	-	2074	10	Intergenic	novelGene_130585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	103.918890498644	1	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1044	1430	56848	55183	TRUE	25	AGCTCACTCACTTCCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVALVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVCPLPPTPGPGKHKAWHFICSVYHQCTSE	59415	54134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55270_55355_55436_56111_56207_56333_56440_56829_57564_57674_57870_59282
875738	contig_14118_pilon	+	2998	1	Intergenic	novelGene_177176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCATGCAAAATGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101487	104485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14118_pilon_+_101500_104500
875739	contig_13966_pilon	+	1955	13	Intergenic	novelGene_158157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_3	405.259176330407	491	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	320	1954	518847	536559	FALSE	45	CAGAAATAGATGAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAIREVGVWRQTRTLLLKNYLIKCRTKKSSVQEILFPLFFLFWLILISMIHPNKKYEEVPDVELNPMDKSILSNLILGYTPVTNITRNIMQKVSTDHLPDVIITEEYTNEKELIASSLSKPTNFVGVVFKDFMSYELRFFPDKIPVSSIYMDSRAGCSKSCEAAQYWSSGFTALQASIDATIIELKTNVSLWKELESTIAIIMGEAAVVEIDTFPRGVILIYLVIAFSPFGYFLAIHIVAEKEKKLKEFLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFLMSLLMAVIATATSLFPQSSCFVIFLLFFLYGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGIVEFLVTVAFGFIGLLIVLMESFPKSLVWLLSPFCQCTFLIGIAQVMHLEDFNEGALFSNLTEGPYPLIITLTMLALNSIFYILLAVYLDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYWSKSKRNYKELPEGNVNGSISFSEIVEPVSSEFLGKEAIRISGIQKTYRKKSETVEALRNLSFDIYEGQITALLGHSGTGKSTLINILCGLCPPSDGFACIYGHRV	482694	536560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_482999_518831_518949_519963_520169_522514_522677_524119_524209_525984_526215_527515_527658_528631_528821_529830_529979_531825_531995_533142_533202_535003_535115_536530
875740	contig_10988_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_104723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTATCCACATTAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54405	52373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_52400_54400
875742	contig_4232_pilon	-	1413	11	Intergenic	novelGene_63158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_7	115.712574943262	909	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	195	1178	49254	41741	FALSE	35	CACCTCGAATGTAGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVVVRADDLLPLGGQTQDGDFGSRLRGRGRRRVPEADEAPEEEEKEKELVPQPPQSDDTRVENMDISDEEEDRGPRAGSPEVLEEDEAELELQKQLEKGRRLRQLQQLRDSGEKVVEIVKKLESRQRGWEEDEDPERKGTIVFNATSEFCRTLGEIPTYGLAGNREEQEELMDFEQDEEHSANGGSESDGEENIGWSTVNLDEEKQQQDFSASSTTILDEEPIVNRGLAAALLLCQNKGLLETTVQKVARVKAPNKSLPSAVYCIEDKMAIDDKYSRREEYRGFTQDFKEKDGYKPDVKIEYVDETGRKLTPKEAFRQLSHRFHGKGSGKMKTERRMKKLDEEALLKKMSSSDTPLGTVALLQEKQKAQKTPYIVLSGSGKSMNANTITK	49528	41505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_41760_41882_42005_42077_42168_42781_42918_43025_43117_43697_43786_44094_44206_44301_44476_49020_49155_49235_49373_49452
875743	scaffold_880_pilon	-	3401	1	Intergenic	novelGene_121428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2286	2630	408035	407691	NA	25	TCCTTATTTCCGCTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWNTLVIVNMALDQAACCSVAHAVTMSQSGLNGNQQQQGHLQLKKRERVSKLQACTHCMIPDSGYMTFQKRQNYSDERLPGARAWERRPTSKGHWGLFRVKELFCILIVGEVK	410320	406919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_406900_410300
875744	contig_11677_pilon	-	2450	1	Intergenic	novelGene_85891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1557	1862	412314	412009	NA	70	TAACAAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIGKSIDKKLSLGGTVVKSLAANQKVGSSNPPVAPWKSYGGSSTLSYRVAMSWNRLNGSGVGFCRAKAVGVGGSNGQRLLKGTGFLFLYFFKTVVKYVT	413870	411420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_411400_413900
875745	contig_12619_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_73575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGCTGGAAACTTCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855246	857300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_855200_857300
875746	contig_13992_pilon	-	4474	1	Intergenic	novelGene_147632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGACTGGTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416565	412091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_412100_416600
875747	contig_10196_pilon	-	1401	9	Intergenic	novelGene_132070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_4	48.5075702854719	240	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	621	1196	805000	803007	FALSE	10	TTTATTTGACTTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRPRPGRSQVLWTGSVPPGRPQARRAGPAALPSTRAHCPAAPRVPHTACGPEATPSLTRSSCAGARQWRGDASKSRAAASNAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESFERSVQLLDQIPSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGKLIELKDCQPDKVYLGGLDVGGEDGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDGDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVIITPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDCNLPFVARQMALHANMASQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRHRIREEAHYLNPSLPLVHVHPPAHGKAPAEPTPAYETGQRKRLISSVDDFTEFV	806727	802801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_803166_803495_803595_803676_803769_803843_803923_804583_804724_804993_805181_805980_806068_806181_806258_806450
875748	contig_15326_pilon	-	3457	1	Intergenic	novelGene_157709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCCGGCAACCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96872	93415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_93400_96900
875749	contig_1146_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_84796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAATGAAATTACCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187204	188311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_187200_188300
875750	contig_7612_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_170362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACGTGCCTATTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161868	159571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_159600_161900
875751	contig_14314_pilon	+	1510	8	Intergenic	novelGene_176836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1084	1437	125146	132258	TRUE	30	AGGTAGTTGGGACTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQMNTSISKANASKSTCQVHIRPGFKVIRISDSPLQILSNDLQRMHCPNVADWVAALVCWPADGIGRAGTPQVIGEGSVGLQGMAKHIKATVSHHSVRHVESVQRINQSQCGFDGS	113729	133615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_+_114231_121927_122090_124006_124086_124804_125150_129575_129677_131409_131561_132160_132269_133552
875752	contig_14314_pilon	+	3126	5	Intergenic	novelGene_176839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTCCCCGAGTCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132626	155736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_+_135541_135725_135781_137543_137591_139783_139822_155664
875753	contig_7165_pilon	+	2856	1	Intergenic	novelGene_116868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564437	567293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_564400_567300
875754	contig_7165_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_116855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCAAAGAAAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344967	342031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_342000_345000
875755	contig_5018_pilon	+	339	1	Intergenic	novelGene_47014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1074	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACATATTTTTGTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259892	1260231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1259900_1260200
875756	contig_9363_pilon	-	6873	25	Intergenic	novelGene_6717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_24	67.2583637921709	104	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1108	3327	858	4184	1332985	1322783	TRUE	70	AGTAAAAAAAAAAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKEERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQTEKYSDLLSQSLNQPLASSKAGSSPCLGSSHTGSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEEEEDDEETIEVEEQQEGNDAETQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLGGPSSPSETPSSHDSDTRDEPEEGGEEETSRVLKGKPPPSSVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEDEAEDEEDTIAAEEQLEGEVDHAMELSELAREGELSVEELLQQYAGAYASDTSAPGSGSSEEEEEEEEVEANSSDCEPEEGTEAEEAPQEDSSSQSDSAEEQSEDEEDEHSEEEETSGSSESEESESEDSEEAQSRSQADEEEKEDEDFGVEYLLAQDEEQSEADGGSGPPTPGPTTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRILLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNSPRTPLGPVPVRPPSGPELSAQLTPGSTPPVLPAPLMVSASTTGPPLIPASRPPGSVLLPPLQPNSGPLPQVLPSPLGVLGGTSRPATPTLSLKPAPPAPVRLSPAPPPGSSSMLKPLTVPPGYTFSPPAATTSATAATATTTAVPAPTPAPQRLILTPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVASAGGKQTSHLPNPGQQADFDWCPGAPACCGAAPPAANATNHGE	1339060	1316314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1317305_1320725_1322180_1322537_1322805_1323475_1323642_1324169_1324455_1324657_1324924_1325304_1325475_1325854_1326042_1326126_1326264_1327596_1327790_1327910_1328081_1328307_1328445_1328703_1328882_1328984_1329314_1329406_1329599_1330240_1330331_1330470_1330565_1331194_1331470_1331584_1331817_1332552_1332694_1332922_1333110_1334820_1335073_1336393_1336654_1337604_1337688_1338922
875757	contig_5217_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_135795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	173	598	686937	686512	NA	10	GCTGATGCCTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGDSNKRPGRGLLCPDQRPRVISLGPRQPQLDAALFSLPGPPLRGWPGGLILATPSTQEPACLPAREAACASSAWAERTQGLAHRTDAGDMAAGPGAHVGKPVAHCVTQAFPALLQGAKKLCPQCNTITAPGDLRRIYL	687109	685586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_685600_687100
875758	contig_12201_pilon	+	1809	12	Intergenic	novelGene_159988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	111	junction_1	23.4263396293521	52	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1584	224	1807	183641	209580	FALSE	40	TTGATTATAAAAGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNSLVLPIVLWGRKAPTHCISALLLTDDGATIVTGCHDGQICLWDLSVELEVNPRALLFGHTASITCLSKACASSDKQYIVSASESGEMCLWDVSDGRCIEFTKLACTHTGIQFYQFSVGNQREGRLLCHGHYPEILVVDATSLEVLYSLVSKISPDWISSMTIIRSHRTQEDTVVALSVTGILKVWIVTSEISGLQDTEPVFEEESKPIYCQNCQSISFCAFTQRSLLVVCSKYWRVFDAGDYSLLCSGPSENGQTWTGGDFVSADKVIIWTENGQGYIYKLPASCLPASDSFRSDVGKAVENLIPPVQHSLLDRTDKEQLLICPPVTRFFYGCKEYFHKLLIQGDSSGRLSIWNISDTLEKQEDEEGLKMTTSISLQEAFDKLNPCPAGIIDQLSVIPNSNEPLKVTASVYIPAHGRLVCGREDGSIVIVPATQTAIVQLLQGEHMFRRGWPPHRTLRGHRNKVTCLLYPHQVSARYDQRYLISGGVDFSVIIWDIYSGEMKHIFCVHGGEITQLLVPPENCSV	156257	209582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_156468_183627_183800_188582_188690_190583_190663_196995_197171_202830_202908_203686_203807_204150_204297_204633_204737_207967_208113_208348_208598_209356
875759	contig_10750_pilon	-	2201	12	Intergenic	novelGene_172602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGCGCAGAGGCACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163870	40878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_41024_79959_80130_118099_118278_118763_118847_120862_120955_129713_129929_132565_132663_135155_135283_154528_154597_159185_159226_159925_160071_163029
875760	contig_11304_pilon	+	3194	3	Intergenic	novelGene_156733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	84.5	25	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	767	1198	535384	542679	FALSE	65	CTAAAAAAAAAAAGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVPQTATGSVLDGVNVGRGYGLVEGDDRRQFEITSVSVDVWHILEFDYSRLPKQSIGQFHEGDAYVVKWKYMVSTAVGSRQKGEHPMRVAGKEKCVYFFWQGRHSTVSEKGTSALMTVELDEERGAQVSPKGELLHRVKEK	534235	544675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_534960_535341_535619_542482
875762	contig_13014_pilon	+	1336	6	Intergenic	novelGene_169337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	298.258545560727	542	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	272	661	390014	401964	FALSE	50	ACGTGTTAAATGGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRAGSPSALRVLDAVQEGRARINPNKGCRVDVAFTTELYNPKEGAERLGRCSAQVFFRNQKSRPSVNVTCTRLIEKKKRQEEDYLLYQQMNQLKTPLGDISIPDCHGYIDPSLRPIWDLAVLGSSYVMWEKTSQFLYYYVVQLSSMVQWKTDNEAIDFDYTVLLHEFPTQEIIPCRIHLVWYPGKPPKVKYRCQELQTPEEASETEGSAAAPTDFSIV	370054	402639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_370122_387080_387144_389872_390057_394821_394959_401673_401737_401817
875763	contig_5718_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_110430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTTAAATAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540261	1541905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1540300_1541900
875764	contig_9578_pilon	+	3361	1	Intergenic	novelGene_67975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTCACACACTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075922	1079283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1075900_1079300
875765	contig_3866_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_112433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCCTTTGTAAGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247719	246562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_246600_247700
875766	contig_8330_pilon	-	2356	9	Intergenic	novelGene_71855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	267.827340603979	4	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	512	976	901522	896249	FALSE	30	CAGACAAGTCTGGTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	916177	894868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900798_901515_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916059
875767	contig_7179_pilon	-	3454	1	Intergenic	novelGene_78192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1707	2129	1260048	1259626	NA	65	CAAAAAAAAAAAAATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSHYSLTMDLQGSSSPAPWKAAAVISVSMAVSSIQHVLQPQTFCSSLLQCTAPLTCMHHSAWNRNAAWGLGICLASYSPQCCTVPCWQGSGLFSAHAAKHIGKCRVNAATFTISTGKGFTHLLFEGSSPIVPPHRSLY	1261754	1258300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1258300_1261800
875768	contig_3161_pilon	-	3547	1	Intergenic	novelGene_84516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCCTAGGTAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381666	378119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_378100_381700
875769	contig_5429_pilon	+	3051	1	Intergenic	novelGene_127801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAGTTTGCCCAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427781	430832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_427800_430800
875770	contig_9468_pilon	-	2606	1	Intergenic	novelGene_59500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGGGCCCCTTATAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348772	346166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_346200_348800
875771	contig_1406_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_25458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562589	560664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_560700_562600
875772	contig_9345_pilon	+	4134	6	Intergenic	novelGene_24483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	2.41660919471891	137	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1118	3357	92	3448	652351	659101	FALSE	5	TAGTGTCTCTCCCGGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAHEDYVWPRATSELILLPVTGLECVGDRLLAGEGPDVLVYSLDFGGHLRMMKRVQNLLGHYLIHGFRVRSEPDGDLESQAMVAVFGSKGLRVVKVSWGQGRFREVWRSGLWSMSDWIWDTRWLEENVAVALGHNSVVLYDPMVGRTLQEVHCTDRCTLSSARLIGNTWRELTMVAGAISNELLVWYPAATLENEPVAPDRRVSGHVGVIFSMSYLESKGLLATASEDRSVRIWKVGDLRVPGGRVQNIGHCFGHSARVWQVKLLENYLISAGEDCVCLVWSHEGEILQAFRGHQGRGIRAIAAHEQQAWVITGGDDSGIRLWHLVGRGYPGSGVSALCFKSHSRAGTLKAVTLAGSWRVLAVTDTGALYLYDLEVKCWEQLLEDKHFQSYCLLEAAPGPEGFGLCAMANGEGRVKVVPINTPTAAVDLTLFQGKVHSLSWALRGYEELLLLASGPSGVVACLEISAAPSGKAIFVKERCRYLLPPSKQRWHTCSAFLPPGDFLVCGDRRGSVLLFPSRPGLLKAPGVGGKAGAGVLGVSGGSGGEGSTSAEWGPVSILPSLHGKQGVTSVTCHGGYVYTTGRDGAYCQLFVRGGQLQPVLRQKSCRGMNWLAGLRMVADGSVVILGFHANEFVVWSPRSHEKLHIVNCGGGHRSWAFSDTEAAVAFAYLKDGDVMLYRALGGCTRPHVILREGLHGREITCVKRVGTITLGPEFEVPNLGQPDHLEPGSKGPGLIDIVITGSEDTTVCVLALPTATGAAHALTAVCNHISSVRAVAVWGTGTPGGPQDPRPGLTAHVVSAGGRAEMQCFSIMVTPDPSTPSRLACHIMHLSSHRLDEYWDRQRNRHQLVKVDPETRYMSLAVCEPDRPGPGPLVAAACSDGAVRLFLLQDSGRRLQLLAETFHHKRCVLKVHSFTHEASNRRRKLLLCSAATDGSLAFWDLTTVLDHGSTALEPPAEPGLPYQLGTPCLTLQAHSCGINSLHTLPTCEGRHLVASGSEDGSLHVFVLAMEVPELEEAAGEAELRPQLRVLEEYSVPCAHAAHVTGLKILSPNLMVSASIDQRLTFWRLGHGEPTFMNSAVYHVPDVADMDCWPVSPEFGHRCALGGQGLEVYNWYD	652259	659787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_652451_655476_657950_658051_658136_658225_658343_658423_658543_658637
875773	contig_5947_pilon	+	2806	1	Intergenic	novelGene_101596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1025	1348	903901	904224	NA	25	CCCAGCAGTGTCACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFCSAAWGSFSLLGFLGLPDVFRFLIFFFKVVVGFLSSSSFASCCCPGYVWCMGTPEWEAQERSQLGEITVSFLSLDGGAWGRRLCEQRQKMECRISSSLELAGSP	902876	905682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_902900_905700
875774	contig_12635_pilon	+	1136	8	Intergenic	novelGene_60821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTCTCTGTCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189581	262761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_189751_192585_192742_197106_197174_201014_201162_206834_207067_219592_219804_227343_227444_262707
875775	contig_15354_pilon	+	2285	5	Intergenic	novelGene_65745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1397	1876	632815	638543	FALSE	5	CGGGCCGGCCATGCCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEVDQASLEDEGVEEHEENDDDVEEDCNILDDEEHQLDDGSHSEELREGIDKEVIGQQQELQREHQAVVTGLEHLPSALLGLQGHIPQFSRKQPPDFSSALRERHLVPPNQNCFSCTKARASKSRPRLPWGHRPGFRKPVLSPGSRWGTRAPSASFY	630029	638952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_631280_631547_631622_632742_632915_633995_634266_638433
875776	scaffold_12510_pilon	+	2778	18	Intergenic	novelGene_151368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGCGGCTCCGCGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198681	300597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_199444_206082_206221_206837_206955_208015_208129_208631_208683_219766_219815_221545_221694_222107_222159_236701_236779_240037_240190_243068_243188_244011_244109_252206_252314_253485_253625_256443_256547_262904_263033_264951_265097_300314
875777	contig_987_pilon	+	4109	1	Intergenic	novelGene_72244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTACTCTGACACACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238286	242395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_238300_242400
875778	contig_10437_pilon	-	2253	17	Intergenic	novelGene_38376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	15.3499541937427	149	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	948	2081	630645	622563	FALSE	10	GGTACGTGTCTTCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFIRAEYTRRGFSEVKTPMLFSTKLWEQSGHWEHYREDMFALQPPGPDRPASSPSDHPTLALKPMNCPAHCLMFAHRPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCAPDQLEAEIRGCLDFLRSVYSVLGFSFRLALSTRPPGFLGESRLWDQAEHVLQQALKAFGEPWDLRPGDGAFYGPKIDVHLQDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFGLRYRGQAGALERPVLIHRAVLGSVERMLAVLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGPEQEGYAREVQQSLQAAGLVGDLDADSGLSLSRRVRRAQLAHYNFQFVVGQKEQSRRTVNIRTRDNRRLGERSLTEAVGRLLELQNTRVSNAEEML	636502	622390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_622712_623594_623710_624262_624336_624510_624613_624789_624891_628568_628647_628825_628964_629511_629675_630162_630363_630630_630730_630908_631056_632199_632279_632727_632846_633400_633526_634961_635086_635389_635587_636429
875779	contig_14638_pilon	-	420	1	Intergenic	novelGene_71588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTAGAGGCCAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268320	267900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14638_pilon_-_267900_268300
875780	contig_10855_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_124309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	526	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGACCCCAGCCTGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314451	312915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_312900_314500
875781	contig_11171_pilon	+	1113	4	Intergenic	novelGene_48601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	553.028831878492	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	76	588	212165	251427	FALSE	15	CAGATGGCTCCACCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSPRRDLASVAVGPPGPRHPSGPLMTSRLLGLLLFSWTLQLGGGQSVTHTGPPIVVSLANKSVSFGCKITYLYTAEYKSFTVSYFYVDGQGKSSTKKHVNCQLNQGTENQTHTVECQVTPLLQDVSATGTYYCSVRWPHTTKNGTGTFILVRDSGYQEPPRGFQDALLFGFTSLLTVLSVLGTALLFWKKTAQI	212089	251952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_212220_235063_235394_236868_236982_251412
875782	contig_8242_pilon	-	2420	8	Intergenic	novelGene_80207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCGGGCGGAGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317345	233214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_233563_292516_292757_293834_293928_294774_294935_308787_308960_310449_310566_315811_315936_316178
875783	contig_10734_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_51103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACATGAACTGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597201	600236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_597200_600200
875784	contig_5794_pilon	+	2678	16	Intergenic	novelGene_69739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCCCGGACCGCTGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421410	559036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_422538_424919_424993_431768_431881_433524_433600_440236_440295_454592_454716_465514_465628_470373_470497_485105_485187_487957_488037_489563_489637_492478_492552_492644_492770_497217_497303_510013_510111_558775
875785	contig_3277_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_74731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205660	204476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_204500_205700
875786	contig_6063_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_27597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAAAAAAAAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48115	45837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_45800_48100
875787	contig_9440_pilon	+	3891	16	Intergenic	novelGene_59025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2294	2662	285517	295354	TRUE	15	GGGGAGGGGCGGGGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALESQPSRLFAKFRMAWVKAPKNGSKDVGDENLHQSLVHPMVTVTHPFQDRLMFAQSYQLCFRKSTFYFTQIARLSHGSAVCWGRGRIAPECLPQFFYQAKLKIHNNVQYCLTVLSIKTLQ	236580	547018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_238284_243067_243111_268214_268371_276053_276260_282018_282168_285480_285585_289762_289915_290379_290495_295320_295437_297210_297327_308713_308838_312895_313081_342567_342827_367977_368072_410977_411107_546778
875788	contig_7420_pilon	+	4122	10	Intergenic	novelGene_85867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	46.5212018570267	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	224	2380	354300	388367	FALSE	35	AAGTGTAATTATTCAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDGSDSLVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSVCHKCVKELLLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLLSPSLDKIDRINRPGWKRSSLTPRTTTFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPVQESTKSCMDCSASYCNECFKIYHPWGTVKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCKRPVCHLCKLGGNHSNHRVTTMSTAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITSFEKLFEILEERKSSVLKAIDASKKLRLEKFQTQMEEYQGLLENSGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTTKQTELLGEWSFFSSGIDVPEINEEQSRVYNNALINWHQPGKNDKADSYVLEYRKINRDEEMLSWNEIEVCGTSKVVGDLESNSHYVFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLTAERVQVGYYTSLDYIIGDVGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMKKFFIPKSPTSSNEPENRVFPMPTSIGIFLDYDKGKVAFYDMDHMKCLYERQVDCSNTMYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM	354076	390109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_+_354327_356414_356650_365957_366284_368470_368618_376391_376488_380621_380876_381111_381237_383578_383873_386335_386634_388012
875789	contig_20739_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_83169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102659	104899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_102700_104900
875790	contig_10431_pilon	+	2987	1	Intergenic	novelGene_117391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATGCTCCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31224	34211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_31200_34200
875791	contig_15548_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_173487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAGCAGGCACTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285698	284081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_284100_285700
875792	contig_16503_pilon	-	3157	7	Intergenic	novelGene_162064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2370	2828	143250	131770	TRUE	15	GCTCAGTCACTCCGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPPLPSRYTLSGIHRHQGRSDPGTRVQRPQYSDTHRPASLSLSRPSPSPSPCLPYLCLYVVPRILRAVVVAAVVVPDELHHDVAHLLLHLARFEVEDGASNHLDNEDQEEEGKVHPQQAADLVDGTNAAQEAHEHGEGPHAHEDVGPHPE	145619	92061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16503_pilon_-_92144_115697_115772_123396_123483_126886_126960_131755_131880_132015_132090_142975
875793	contig_7753_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_41458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAGAAATATTAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527937	525707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_525700_527900
875794	contig_987_pilon	+	3414	16	Intergenic	novelGene_72241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	9	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTTGACACCAACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217708	352837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_219319_231098_231225_232155_232425_232937_233103_237240_237413_249092_249209_265714_265849_269939_270017_272171_272216_274867_274973_291678_291815_298056_298144_311456_311601_316299_316403_344639_344741_352812
875795	contig_17833_pilon	-	2663	9	Intergenic	novelGene_174600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGAACAAGGCGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79995	44143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_44196_55926_55986_56934_56997_59322_59496_62493_62637_68731_68876_69042_69209_72894_73038_78274
875797	contig_14744_pilon	-	3342	1	Intergenic	novelGene_66157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTCCTTAACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1685304	1681962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1682000_1685300
875798	contig_15689_pilon	+	2669	6	Intergenic	novelGene_164165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2132	2488	220124	225755	FALSE	15	GCCTCTCGTGACGTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCFQSSCRGRKRLLPLLFWFDLKQPQLPPLPGREAFGFPSLLLALPASEVLQDDGLALQLVLEGLLAHAGHAALQEGLHEGLGLLGSHRLNIELLCLLLRKAMVDHTLHSRIASGAL	216101	225936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_218140_219863_219923_220089_220165_221446_221676_223383_223435_225719
875799	contig_10779_pilon	-	1297	8	Intergenic	novelGene_165517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	1209.61739607942	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1248	48	1295	78334	52843	FALSE	15	ACCTGGGAAGGGGCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYSSEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHISSATQNQKQHDTSSKTHSSSQQGTSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLDTPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPALLPEGLGSTEPPQHHQDSKGKGSGDSSSTASHEHSESKDPAPKSSSKTTRIPSEGPHPGKRSGPKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASTQADLRASLQVESEPGLLPYGSKDQTSKDKPKVKTKGRPRAGENKEPKPAVPTPSERKKHKSTPPAPSKVLSAPEPTKDNVEDRSPEHFALVPLTQSQGPPNSGRGSRTSGCRQAVVVQEDRQKDKLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQ	84319	52840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_53668_59425_59583_61847_61886_62009_62065_74901_74954_76889_76927_78250_78338_84275
875800	contig_12427_pilon	+	2409	3	Intergenic	novelGene_40570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCCCCGCTCCCACTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518270	578140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_520440_522284_522345_577960
875801	contig_7057_pilon	+	2086	5	Intergenic	novelGene_123374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	84.9058301885094	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	396	1829	1130430	1146320	FALSE	45	AAATGAAAACAATCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRGVRGGWCPDLVSRCEPKKLSPKRDIYETVSSQWAIMEQLKNLSPERSIFRDIWECKSHFERQQGQQEGCFRQFMINHENMSIFSPHTLLTQEFFNRVKISECKQCRENFSCHLFFSHHKITHSKAKLYECKECTEIVNTSYLVKQWRTQNNDKYNEYKECWKAFIHCSQFKQHLRINNCEKRYECKECGKAFNYGSEHTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQHQRLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKQCGKTFRHRSHLTIHQRIHTGEKPYECKECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKPYECNECGKAFCDGLQLNLHRRIHTGEKPYECKECGKTFRQCSHLKRHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYECRECGKAFSYQSSFSHHQIIHSRKKPYECGKPFNRGSQHNPHQTLHPGEKPIKFSLLPPRCGLVP	1119064	1146577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1119183_1121265_1121357_1129312_1129440_1130370_1130467_1144923
875802	contig_2867_pilon	-	4231	8	Intergenic	novelGene_135217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	35.867670622977	139	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	96	1295	1057221	1029979	FALSE	30	AGGAGGAGAGAGATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPCSTSQAPPPQPLSPAPRPGRAELDRARAMLLTVYCVRRDLSEVTFSLQVDADFELHNFRALCELESGIPAAESQIVYAERPLTDNHRSLASYGLKDGDVVILRQKESADPRPPAQFPNLPRIDFSSIAVPGTSSSWQRQPPGAQQPHSSPGEIASSPQGLDNPALLRDMLLANPHELSLLKERNPPLADALLSGDLEKFSRVLVEQQQDRARREQERIRLFSADPFDLEAQAKIEEDIRQQNIEENMTIAMEEAPESFGQVVMLYINCKVNGHPVKAFVDSGAQMTIMSQACAERCNIMRLVDRRWAGIAKGVGTQKIIGRVHLAQVQIEGDFLACSFSILEEQPMDMLLGLDMLKRHQCSIDLKKNVLVIGTTGSQTTFLPEGELPDCARLAYGAGREDLRPEDIADQELAEALQKSVEDAGIWKG	1057316	1027042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1030186_1031858_1031963_1035957_1036087_1038491_1038620_1042160_1042288_1043926_1044164_1047637_1047768_1057083
875803	contig_5765_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_141358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGAACCTGACGTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366002	363501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_363500_366000
875804	contig_5643_pilon	+	2824	12	Intergenic	novelGene_39164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_7	8.49987846291331	65	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	312	2381	736803	745408	FALSE	15	CATTCTGACTGACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWYIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPNEIEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIELSENCAYDSVQIMSRGLQEGILCGQRTNKNRSSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEEHFTGFAAYYVAIDVNECTDFAYAPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMESCGVNCSGDVFTTPTGEIASPNYPNPYPENSRCEYQILLEEGFQVVVTVRREDFDVEPADSEGNCPDSLVFVAGDQQFGPYCGNGFPGPLNIETKSNAVDIIFQTDQGGEKKGWKLRYHGDPIPCPKEFVANSVWEPEKAKYVFKDTVKITCQYGFEVLEGNVGLTSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCGAPEPIRNGKAEDPGDTLFGSVTHYTCEEPYYYMEKEGSGEYHCTGNGSWVNEVLGTELPKCVPVCGVPSETFTEKQRIFGGQPAKIENFPWQVFFSSPWAGGALIDEHWVLTAAHVVEGNQDPIMYVGSTLVRTSVLENAQMITAERVFIHPDWEFMDVPETRKNFDNDIALVRLKDPVKMGPTVSPICLPGTTPEYNPSVTDLGLISGWGRTRKQNHVIKLRGARLPVAPLAKCQEVKPTDSKVVTGRYVFTDNMICAGGEKGVDSCEGDSGGAFAIQDPNEENPKFYVAGLVSWGPQCGTYGIYTKVKNYIDWITKTMQENSTPSTD	735596	745851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_735733_736627_736808_737061_737270_737665_737844_738693_738820_739278_739479_739680_739835_740200_740317_740724_740804_741341_741471_743136_743212_744608
875805	contig_10801_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_74037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253210	254847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_253200_254800
875806	contig_11924_pilon	+	3383	3	Intergenic	novelGene_128027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	301	junction_2	3	18	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCAGCAATGTGTCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55776	64798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_58762_61408_61476_64467
875807	contig_13004_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_112718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGTACAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876588	873818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_873800_876600
875808	contig_10795_pilon	-	2050	9	Intergenic	novelGene_171284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGCGCCCCGTCCCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81703	16696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_-_16964_23212_23321_37984_38101_40984_41128_42819_43090_67875_67955_70191_70271_78124_78189_80779
875809	contig_9609_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_22925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACCTACTCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37144	39776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_37100_39800
875810	contig_15092_pilon	+	2598	1	Intergenic	novelGene_57778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298460	301058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_298500_301100
875811	scaffold_2602_pilon	+	2480	8	Intergenic	novelGene_127688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	511.682578582161	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	203	1447	25608	47310	FALSE	65	AAAAAAAAAAATGAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGKNKSNFNI	25405	48343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172
875812	contig_7079_pilon	+	1147	7	Intergenic	novelGene_129239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	539.162519303987	94	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	22	534	342490	348688	TRUE	30	CCTAAAATCGAGGTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPANEEEK	342468	350115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344803_344900_345004_345095_345138_348677_348706_349519
875813	contig_5728_pilon	+	1539	9	Intergenic	novelGene_126703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	341	814	355361	368954	TRUE	10	GGTCCGTGGACGCCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIAWSKCRVSSRRLFSGLFCAVTSPRSCHGFFSNNSFSKDAIFSFITFSCLFSKDDFTSSEFFFTFEVFVSSVSSSFGKAKVTLFKHSLCCLLSSLSSRSLSSSISKTLSSSSSAISSSSFEPSSSRSLAMSSSVSIGSKKSLYFRFLEFLPDLSF	346850	371295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_+_346874_350347_350457_353444_353578_354439_354513_355358_355500_367722_367898_368201_368349_368941_369621_371236
875814	contig_6551_pilon	-	3441	22	Intergenic	novelGene_155543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_18	42.5110363154885	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	246	2741	218043	153685	FALSE	30	TATTTATGAGCAATATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWRQVVGGRGRARGRATAAPSSGNGVRLRGAGGGREKGSVGAARPGPSHGGTVAAAAAGGSAGNGPGGSEAPQASVVRELMSQRKFEEIKKANQAAARKLVEEHFNSSSEDEGDDEGKQGKIIANTFITYTTQTDGDTRELERTKQYVNEAFQAGAMTCLICIASVKRNQAVWSCSGCFCIFHMPCIQKWAKDSQFLVSSPLTDDDFGKRDYPWPCPKCRFEYKRSETPNRYYCYCGKVEDPPLDPWLVPHSCGQVCEREFKPSCGHKCLLLCHPGPCPPCPKMVTTTCYCKKAKPIPRRCSAKEWSCQLQCGRKLLCGQHKCENPCHAGNCQPCPRVSRQKCVCGKKVAERSCASPLWHCDQVCGKTLPCGNHTCEQICHVGACGECPRSGKRFCPCQKSKFSLPCTEDVPTCGDSCDKVLECGIHRCSQRCHRGPCETCRQEVEKHCRCGKHTKRMPCHKPYLCETKCIKMRDCQKHQCRRKCCPGNCPPCDQNCGRTLGCRNHKCPSVCHRGSCYPCPETVDVKCNCGITKVTVPCGRERTTRPPKCKELCSRPPTCHHTSQEKHRCHFGSCPPCHQPCQKVLEKCGHLCPASCHDQALIKQTGRYQPTGPWEQPSEPTFIQTTLPCPPCQVPIPMECLGKHEISPLPCHAVGPYSCKRVCGRTLDCKNHTCMKECHKVTVIDGCPDKNKAGTECFQCEEGCSKSRPLGCPHPCVLPCHPGECPPCVQMLRIKCHCKITSLYVECRKITTADINEKNLLSSCKNQCPKELPCGHRCKEMCHPGECPFNCNQKVKLRCPCKRIKKDLQCNKVRENQVSIECDATCKEMKQKASEIKEAEAKAALEEEKRRQQAELEAFENRLKGRRKKNRKRDEVAVELSLWQKYKYYLLPVCGVVLVVFAWSIARDAD	221422	152984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_153859_159582_159637_160417_160505_164184_164290_171746_171817_174107_174275_177877_178019_178902_178925_188428_188521_189256_189417_189640_189762_202980_203072_206540_206664_207461_207587_208760_208876_210093_210195_210296_210459_210692_210872_214114_214249_215561_215672_217880_218049_221182
875815	contig_4388_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_161958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGCCTTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435028	437333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_435000_437300
875816	contig_3817_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_78391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAGAAAGAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048476	1047450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1047400_1048500
875817	contig_4519_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_123656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGACACTTGCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54777	52623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_52600_54800
875818	contig_5981_pilon	-	3326	5	Intergenic	novelGene_35510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.7845357515765	19	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2189	2638	51396	50947	TRUE	30	AAACATTTTGCAGCGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVRAVVYGLDRMPGWSLAALGLRPSSEVLQGMGGCEPASKLNAVSTLELCSSGGHPAHTEGLGCQGHWDMLRLGLPSEKSLWTQGACPEIAPLCGGILPGDRSVLGLFLSLYAHSPLPPSGSSRDNKRLKIVSFKLFQTGFNPFLSS	56750	49977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_50450_50730_52013_52888_53002_54269_54426_55447
875819	contig_12119_pilon	+	1081	4	Intergenic	novelGene_88628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	133.958534214468	50	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	342	431	70066	196961	FALSE	70	GAGAAGAACAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKCVSAKETLEADLYKRFILVLNEKKAKIRSLHKLLSEVQELEKNAEHDRETATCSQVSADRDAVYDESTDEESGNQPDPSVLSPATLREDDSIFSSPDVTDIAPSRKRRQQMQKNLGTEPKMASQEHQLQEKEKLSCEEH	22110	197611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_22265_23943_24051_69985_70134_196939
875820	contig_12871_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_140374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26118	27821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_26100_27800
875821	contig_12402_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_133376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	21	66	259	324	619950	619885	NA	70	GAGAAAATAATAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVFLLCRQSCLAVVLFLREVGVVSLGVFPGPILLSQGLKALLPVSCAVLASSPSLGCSRAARLRVAALCPGPPAATARSKNSATSPMPSWTAVVFCTAWAVLCLSVH	620208	617827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_617800_620200
875822	contig_12635_pilon	-	2513	1	Intergenic	novelGene_60826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1798	2148	212933	212583	NA	30	AATGGCTCAGCAATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFAECGQGEKLMWSLDAEKNHLTKLFILVKSQISNRREFNTKKTIDKDREQTACKLSKAFNMGSKTRIPASPLLFSIVLETVVSTVSQEAKKKKRFFFLFNDYKGRSKICAICR	214730	212217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_212200_214700
875823	contig_5047_pilon	+	2584	1	Intergenic	novelGene_158001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	341	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1385	1738	1266963	1267316	NA	45	CAGAGAAACCAAACTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTRRFPLQRCPPARQDKRQLSRVVHGPRDRMAAGKAAVSGLNASLLVGGQQLPGSRQWPPVSPETRAAPAHTVEDMQCMALPGTTGSGTVSLPARGLREEGSQGCCVALGPSVLPP	1265578	1268162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1265600_1268200
875824	contig_5093_pilon	+	3281	1	Intergenic	novelGene_135103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGGGAGTGAAAGAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645829	649110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_645800_649100
875825	contig_13481_pilon	+	2540	1	Intergenic	novelGene_119439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGCAGTCCTAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958144	960684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_958100_960700
875826	contig_4952_pilon	+	3576	1	Intergenic	novelGene_145538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504167	507743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_504200_507700
875828	contig_8702_pilon	+	3424	1	Intergenic	novelGene_157731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52931	56355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_52900_56400
875829	contig_17935_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_170596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCATCCAGTTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47185	45014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_-_45000_47200
875830	contig_19737_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_158975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	751	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTATGTCATCTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49800	51916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_49800_51900
875831	contig_1450_pilon	-	1374	2	Intergenic	novelGene_27340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTGCCCTCCACGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221296	219085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_219157_219993
875832	contig_4418_pilon	+	2941	1	Intergenic	novelGene_98371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1016	1336	771644	771964	NA	25	TACTTTAGGTGAAGGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIHTPAAIMHAHAHTQSPTHTPSSVHNWIYISPVSRDPAHKACMPPFFQYFPFHGFDLEWKGKVRLERIDFIRLVERPEINLWVSTIKVQLIIKFSDRFTFSPHK	770628	773569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_770600_773600
875833	contig_10792_pilon	-	3300	1	Intergenic	novelGene_161010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTCTGGCTTGTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211638	208338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10792_pilon_-_208300_211600
875834	contig_11224_pilon	+	2198	3	Intergenic	novelGene_124445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	92.5	4	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	151	456	19401	20398	FALSE	25	TTATTAAACTTGATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPEC	11243	22140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211
875835	contig_12201_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_159986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGCGAAGGAAGCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137224	139177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_137200_139200
875836	contig_10424_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_56788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	32	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	161	334	66749	66922	FALSE	20	GTACGATTGTGTTGGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLKPILTHSGPPLTTTLPEWCSPISRLLTSPQAYGEHLKEDDVECIVNQDELAMNYQEQVSSPCSTPARLGLDSNASPQTPSKENIYEGDLGLGGYELKLEQTPGQSQLN	64649	68541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_64756_66694
875837	contig_2854_pilon	-	1977	16	Intergenic	novelGene_120872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	45	junction_15	295.802787155376	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	139	1587	1130219	1013478	FALSE	35	AAATCATTTTATTACTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPDAVIFPPAFLRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGIWERGSKYNNGSTELHSSSIGLAKAALEAVNGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDAALLPCISYPAFALDDEVLFGQTLDKVVRKLKGKYGFKRFLRDGYRTSLEDPNRRYYRPAEIKLFDGIECEFPIFFLYMMIDGVFRGNPKQVKEYQDLLTPVLHHTTDGYPVVPKYYYVPADFVELEKRKPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWGQALYVIAKLLVDELISPKDIDPVQRYVPLQNQRNVSMRFSNQDQKD	1132518	1013087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1013493_1013998_1014094_1022720_1022880_1030218_1030297_1030833_1030892_1034447_1034646_1035630_1035727_1043761_1043826_1066039_1066156_1076127_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1130167_1130278_1132438
875838	contig_10437_pilon	+	2101	2	Intergenic	novelGene_38415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACACACACACACGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781867	784611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_782780_783422
875839	contig_5566_pilon	+	1324	6	Intergenic	novelGene_153656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_5	138.097936262639	2905	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	190	615	176759	181788	FALSE	25	AATCTGTTATCAGTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVGCALGRRKLTHLVTAAICLTDSGTPSVLWRRACSQYKQATSNEDLPIPMENPYKEPLKKCLLCGKRVDYKNVQLLSQFISPFTGCIYGRHITGLCGKKQKEITKAIKRAQIMGFMPVTYKDPAYLKDPKVCNIKYRE	176569	182497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_176850_177661_177718_179689_179774_180773_180832_181571_181632_181711
875840	contig_10594_pilon	-	1690	8	Intergenic	novelGene_142315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	196.344033756661	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	345	743	250681	245965	FALSE	25	TACAGTGAATTGTCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENRDAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV	298249	245017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_246080_248490_248631_249627_249742_250651_250716_257917_258014_265849_265957_268039_268127_298229
875841	contig_15273_pilon	+	2045	5	Intergenic	novelGene_140430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	206.601518629462	4	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	29	487	95964	146076	TRUE	40	TATCTATTAAAATTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPNSGSDKMAGLPRRIIKETQRLLAEPVPGIKAEPDESNARYFHVVIAGPQDSPFEGGTFKLELFLPEEYPMAAPKVRFMTKIYHPNVDKLGRICLDILKDKWSPALQIRTVLLSIQALLSAPNPDDPLANDVAEQWKTNEAQAIETARAWTRLYAMNNI	95935	147722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_95994_144775_145023_145197_145339_146035_146237_146324
875842	contig_14273_pilon	+	3530	2	Intergenic	novelGene_21144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_1	0	122	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCAGTGGACTCAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127917	131953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128272_128777
875843	contig_18604_pilon	-	3288	5	Intergenic	novelGene_173854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	42.3106074170532	65	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	62	1150	58228	7788	FALSE	30	AATTGAGACTCTCAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGIKILQNAIIRQDKRLAEAMVGDGSFHVTLLVMQLLNEDEVNTGIDALLELKPFIEEILQGKHLTLPFQGVDNFRNQVGFVKLAEGDHINPLLEIAETAERTFQAKGILAGESRSFKPHLTFMKLSKAPWLRKKGVKKIDPELYEKFISHRFGEEMLYRIDLCSMVKKKQSNGYYHCESSIMIGGSFAAAVGMETSAPRAGSQLVATTARHPTSHHAETLWVASQDELTDMAASSQGNFEGNFESLGLVEFAENQPRWRKLFRQESGPSARKYSAATQLLTGSITGWCTGFIFQKVGTLAATAVGGGFFLLQLANHTGYIKVHWQQIEKDMKKAKEQRKICEGNQVPSELKSKAEEVVSFVKKNVLVTGGFFGGFLLGMAS	58289	5649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18604_pilon_-_8384_11831_11980_34871_34985_52197_52359_58157
875844	contig_13780_pilon	-	3772	21	Intergenic	novelGene_149129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	50.3203736075161	161	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	380	2089	882468	852229	TRUE	15	TTGGGTTATGCTTCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNKNSQSFLSVLLNINHGLVAVFTDVKQDNGDLLENKHGEFWLEINSGSLFCVTRYEGFDDKHYICLHSSSFSLYHKGIVDGVIPLTETRLPSSARPHWLEPTIYSSEEDGLSRSPSDGVGGDSLNMLSVAVKILSDKSESNTKESLVAVGLKGATLQHRMPPSGLSWHEQMLNFLNIADEPVLGYNPPASFTTFHVHLWSCALDYRPLYLPIRSLLTVETFSVSSSVALDKSASTLRIILDEAALYLSDKCNTVTINLNRDYVRVMDMGLLELTITAVKSDSEVEQTEPHFELHCSSDVVHIRTCSDSCAALMNLIQYIASYGDLHGPHKAEVRPGAPQRKTKVDSSRRTSSRGAVLPEADQQILRALMSDAMEEIDTQQAASSVKPQANGVLDEKSPLQEPCCSDLFLFPDESGNVSPEPGPASASFTHHLISDALAAVPSENDDFCILFAPKATVQEKEEEPVVKIMVDDAIVIRDDYFSLPVKKTDASKAPLRFPVPVIRYVVKEVSLVWHLYGGKDLGTVPPSSPAKSYISPHSSPSHTPTRCGRNTVCAGRGRNHDFLMEIQLSKVKFQHEVYPLCKPACDSSLVEHPVSRQVFIVQDLEIRDRLATSQMNKFLYLYCSKEMPRKAHSNMLTIKTLHVRPESGRSPQECCLRVSLLPLRLNIDQNLDSRQKFLFDLIITANTCRWIRVH	884244	845026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_846197_849664_849815_850610_850766_850984_851120_852155_852239_852770_852839_868083_868186_868806_869002_869920_870030_872557_872785_873667_873871_875645_875788_878132_878304_878579_878657_879270_879342_879868_879962_880119_880227_882175_882257_882414_882615_883542_883694_884162
875845	contig_8594_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_140070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTTTCTTTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558106	556006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_556000_558100
875846	contig_7455_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_168651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGATCATTATTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374990	373012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7455_pilon_-_373000_375000
875847	contig_16578_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_148611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	1648	2172	27414	27938	NA	80	ACCTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSGQVFYIHLSLCRSMRDPVPSIWKQIIEVGLVRCHMVPAHVQETEEVTVCPEQGEAFSNKKGLGEGERPNSQSPYQRRFRARGLYLGSLDGNRRGRLFPQHLCYFVFNRSLLISFDNKEGADLRLELLLELKVFCFHCINSHPYLSSSASDTGFPFEVVKLSFKINVSRLK	25766	28470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_25800_28500
875848	contig_935_pilon	+	3356	1	Intergenic	novelGene_45590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	144	485	839364	839705	NA	50	GTAAATAAATTTTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRRLGLRGRCVLYCLPAQGLRREETAGPAGEVPFLPNPRLRRLQDYRADPFSPFWTLPHWSGSPLKKSLFFQRNLVSCLCNKARFYFLFILPSVFFLTATPLSGRNLEHIL	839220	842576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_839200_842600
875849	contig_8020_pilon	-	1054	1	Intergenic	novelGene_114428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATCCCCAGTTCTGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275755	274701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_274700_275800
875851	contig_10324_pilon	-	1679	3	Intergenic	novelGene_7871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1369	1677	500368	500060	FALSE	35	ACACCCAGCAAGTGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKKKIPRTKQQMGHAVLGGRPRAAVPTRNPHDPPALQKRKLRLKKRSDLPGFQSWGEPGVRARNRVRVPGHRLTCAPAPRLLGPHVTSQETLQSPCLYPAQ	502215	500057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_501148_501352_501603_501876
875852	contig_401_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_42756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGATCTGCAAAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979864	976993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_977000_979900
875853	contig_9895_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_144688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCTTGTTTTAGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126735	124545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_124500_126700
875854	contig_16882_pilon	+	1876	8	Intergenic	novelGene_148218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	78.5828563118092	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	757	1212	206782	213521	FALSE	45	AAACCACACGAGACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEFVVVYTDGCCSSNGRKRARAGIGVYWGPGHPLNVGVRLPGRQTNQRAEIHAACKAIEQAKAQNIDKLVLYTDSMFTINAITNWVQGWKKNGWRTSTGKEVINKEDFVELDTLTQGMDIQWMHVPGHSGFIGNEEADRLAREGAKQPGD	202185	214185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_202665_203443_203560_206620_206786_208805_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
875855	contig_18184_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_123874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATATTTCTTGTCCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258548	260662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_258500_260700
875856	contig_11285_pilon	-	3517	11	Intergenic	novelGene_5526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	15.0016665740844	141	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	431	1864	689699	684115	FALSE	20	GTAGCTGCCTTGTTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSELLISTAVQGIIFTLLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFYSFCEENKLEYIVGRVWIGFWLILLVVLVVAFEGSFLVRFISRYTQEIFSFLISLIFIYETFSKLIKIFQEHPLQKYYEANVTMDPKPLRPLPNTALLSLVLMAGTFFFAMMLRKFKNSSYFPGKLRRVIGDFGVPISILIMVMVDFFIEDTYTQKLKVPKGLMVSNSTARGWVIHPLGLYSTFPIWMMFASALPALLVFILIFLESQITTLIISKPERKMVKGSGFHLDLLLVMGMGGVAALFGMPWLSATTVRSVTHANALTVMGKAGTPGAAAQIQEVKEQRISGLLVSVLVGLSIFMEPILSRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLFDRILLLFKPPKYHPDVPYVKRVKTWRMHLFTGIQIFCLVALWVVKSTPASLALPFVLILTVPLRRFLLPLIFWNLELQCLDADDAKVTFDEQEGRDEYDEVPMPV	690521	682461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_684196_684844_685019_685099_685270_686257_686512_687009_687177_687699_687790_688172_688347_689282_689478_689570_689720_689883_690092_690319
875857	contig_12486_pilon	+	1429	4	Intergenic	novelGene_175829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.35702260395516	81	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGCAAAAAGGACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6882	11921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12486_pilon_+_6943_8143_8234_8537_8634_10738
875858	contig_20324_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_100869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGATGAAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8959	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_-_6700_9000
875859	contig_14196_pilon	-	1383	6	Intergenic	novelGene_169965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_3	25.8658075458703	183	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	717	1382	114010	17876	FALSE	40	TAAGAGTGATGAAGATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFLPTVSTMGDVGGELSSGDDSGDVDESPQSPETEASRSLTELFEKAAAHLQGLIQVASREQLLYLYARYKQVKVGNCNTPKPSFFDFEGKQKWEAWKALGDSSPSQAMQEYIAVVKKLDPGWNPQIPVKKGKEANTGFGGPVVSSLYHEEIIREEDKNIFDYCRENNIGHITKAIKSKNVDVNMKDEEGRALLHWACDRGHKELATVLLQYRADINCQ	114726	17874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_17966_36878_36985_52120_52204_103247_103345_106756_106822_113785
875860	contig_11631_pilon	+	3826	1	Intergenic	novelGene_104184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGCACAGGCTGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93216	97042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_93200_97000
875861	contig_6048_pilon	+	2906	1	Intergenic	novelGene_73200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	2583	2906	1498301	1498624	NA	20	CGACTGCCTCTTCAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVAEPHQSPSGQGWGAGPHTPQERRSHRGSGPAVPSPTAGTCGSGASTGCPPGSRNTLPTASQVEATFSKRNSILIFNFLVLQLGGSEESEVQCSWQYLCSCQPRGD	1495718	1498624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1495700_1498600
875862	contig_7513_pilon	+	1262	3	Intergenic	novelGene_88941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	62	620	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	167	565	127733	130909	FALSE	65	AAATACAAAAAGAAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLAAAPLNTTTPTGQRDSGFPGPTLFAGRLAVGVSCGVLAVGPAAAAARGAGGGEMAEVVVGKEKGGEQRLVSLPLSRIRVIMKSSPEVSSINQEALVLTAKATEFFVQYLATYSYKHGSGKEKRALTYSDLSNTAEESETFHFLSDILPKKILASKYLKMLKEEKREDEEEGENGSDEGDNDEAES	127566	131606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_127880_130026_130154_130784
875863	contig_13718_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_142890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAAGACGAGCCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137534	135470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_135500_137500
875864	contig_14925_pilon	-	4283	1	Intergenic	novelGene_55245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAACTCTGATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91538	87255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_87300_91500
875865	contig_12951_pilon	-	1844	13	Intergenic	novelGene_68255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	19.3266870759924	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1605	239	1843	922498	852016	FALSE	15	CCCCGCTCCGGGAACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAMSVRVRFLSPGDAGAVGTVGRSASFAGFSSAHSRRIAKSINRNSVRSRMPAKPSRMYGTLRKGPVCLDPKPQQVKKIFEALKRGLKEYLCVQQAELDYLSGRHKDTRRNSRLAFYYDLDKQTRSVERHIRKMEFHISKVEELYEGYCIQCRLRDGASNMQQAFSRCLPSRASRESLQELGRSLHECTEDMWLIEGALEVHLGEFHVRMKGLVGYARLCPGDQYEVLMRLGRQRWKLKGRIESDDSQTWDEEEKAFVPTVHENFEIKVTELRGLSSLAVGAVTCDITDFFTTRPQVIVVDITELGTIKLQLEVLWNPFDADSFLVSPSPMGKLFVGSRKGSLYNWTPPSTPSFRERYYLSVLQQPPQQALLLGGPRATSILSYLSDNDLRGPGLQSRSQELPEMDSFSSEDPRDTETSTSASTSDVGFLPLALGPNTSIEEEACEDPSSLGLLPEMAQLAGGSFVEQPGWRDLGVESPNLSRGSPMYNCMIPGSREGQDEGETEDGVDGTGMALEQPLQEVLELLRSTAPTQ	922736	852014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_852535_854801_854932_855939_856086_856170_856297_856468_856513_856817_856882_856987_857138_857878_857933_858229_858254_861336_861416_864892_865040_872883_873003_922495
875866	contig_5999_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_45664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTAGAAAAGGTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301998	304117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_302000_304100
875867	contig_14483_pilon	+	2560	1	Intergenic	novelGene_133767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAACCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136385	138945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_136400_138900
875868	contig_9698_pilon	-	2504	1	Intergenic	novelGene_82484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	1777	2331	133766	133212	NA	20	CGAGCTTCCTCCGCGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFDWPQPAPLRGFQSLNPSGLSPCSADSEGGCVPGFQAYLALCRVLTGGGTGRDPRTTKNASRTRGIDADAWSPQGPSRWDLGARGRAHLPWARLRASGEVAAAPVPSAPLAARRGALMGEGNGVGGTHRATPPPPPAAATAELKVPGTIFCRRLVLGGGYQPPIRLCQPTQPSASQHSAAGE	135542	133038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_133000_135500
875869	contig_6189_pilon	-	1851	4	Intergenic	novelGene_164964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_2	67.8101926130742	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	79	780	206538	201932	FALSE	70	CAGAAAAAAATCTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDVSKKLTEQKITNKVNITCTNSICTWSLTVFIIHF	206616	200860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_202154_202625_202743_202820_202899_206253
875870	contig_9915_pilon	-	3719	1	Intergenic	novelGene_174172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGGAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691603	687884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_-_687900_691600
875871	contig_9415_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_109746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590759	592657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_590800_592700
875872	contig_12689_pilon	-	3749	1	Intergenic	novelGene_145052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	1691	2242	268103	267552	NA	20	CCTCATCCTGAGCCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGPQPGKAGAYCPTRPGIWPRRDQEDTPVANQPQRSGWAQRQVPGSPHRALGAFRLPFTCVSPSAPHLAHRPPLSFSTCPGCLPGTCSRAVPTPPPVPQWAGHLAGRAHSWLALVCGAIRFIHTALLRAFRPLCVPLPHSFPGPLVGIAPGVCWLPVPPKAGPALRPLGIFQRHAGSAVD	269793	266044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_266000_269800
875873	scaffold_12124_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_22155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCTGAGCAAAATGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977375	979914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_977400_979900
875874	contig_5039_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_64851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1	435	329684	329250	NA	20	ACCTGTTCAGCCTCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVNLIIIKDIKDVKDKLDSFRKDREWQQILQRGAGGGVAAGVGCCELGVGISVGQVSAEGAATGPSPLEIPATEEAGCRGQQAGPWNGAEGPTRTASISSTSSRLPAVGDLCKIQLGWTNGLHKHTGPNAPPGHVSSPQTPLC	329684	328451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_328500_329700
875875	contig_12951_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_68142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCGTCTTCCATTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148222	145853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_145900_148200
875876	contig_12078_pilon	+	4713	1	Intergenic	novelGene_74092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTAAGCAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184690	189403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_184700_189400
875877	contig_6356_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_126427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAACATATTTGGGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39515	38665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_38700_39500
875878	contig_17989_pilon	-	1819	5	Intergenic	novelGene_150832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCACGCGGCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266427	261811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_261868_261977_262012_262085_262156_264161_264269_264875
875879	contig_11304_pilon	+	2918	1	Intergenic	novelGene_156714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	2271	2777	410667	411173	NA	25	GTGTATTGCTGGGAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYWNALIMNLRPKGKETSFMREGWCTATGSMWHDSALTKEGISPKGAGVRGTTACVLEMWTCLHAHGLPSQLRRDCKDTLVNIVDKEVSGLVLERVLWQQWASLGGGELRGSVWQQRQEGHNPQFRVKGEARRAMRSAGRRVACCVPQMPQQNANKCCDLRSSQCHP	408396	411314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_408400_411300
875880	contig_6433_pilon	-	2014	4	Intergenic	novelGene_162764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	9.84321537348893	27	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	580	1989	298061	281201	FALSE	25	AAGTCAGTCTTATCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKAENYNLENGKEPWMFEGKKTKSSYSDWEARPESKESTSVQDFSKEESCQVAIIDRLTRNSVYDSNLETTFDGENWLENQQGNQERHLREMFTHMNPLPREKAHEHDIYWKNFSQKPVLITEDRVPKGSYAFNKLEKKLKQKSNLMKRQRNYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFECRECKKTFIESSSLAIHQRIHIGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPYRCNECGKSFKCSSSLIRHQRIHIEEP	304164	281175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_282430_296805_296899_297973_298089_303612
875881	contig_2062_pilon	-	1584	3	Intergenic	novelGene_139050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	15	2000	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCCCTAGTTCCCGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1325331	1312868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1313896_1319148_1319216_1324841
875882	contig_6020_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_155576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACCTCCTTTTCCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345563	344375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_344400_345600
875883	contig_7357_pilon	+	1585	3	Intergenic	novelGene_36899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	245	junction_2	26	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	736	1122	271433	273311	FALSE	30	GATTGAATTTAATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRNSSCTSFPSLNPSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	270697	273774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_271606_272519_272644_273221
875884	contig_2940_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_81980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1328	1765	1111800	1112237	NA	40	CAACTAACACGATTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEYQAKISQPSKWPASSATTSRSSLIIVWRGRGGSDAMKSGFDSPSTFKPQFKPEERRCERLHFIHSTFGLRLYLVLTYSRSAIKFSYIVLEFMHVYSLEYILRNEIPETQGRHHSALVDSIKQFSTAVVPIYTLTGNIWKF	1110472	1112595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1110500_1112600
875885	contig_9653_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_48244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCCCAGTGATTGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832692	835058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_832700_835100
875886	contig_3382_pilon	-	2022	10	Intergenic	novelGene_124199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	117.939825627885	1	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1067	1459	1382427	1379406	FALSE	65	GAAAAATCAGGAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYTKPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLDSYFEELLKSLYPERRFPTAEFGDEPEDNLSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLR	1401228	1378842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1379613_1380458_1380609_1382391_1382467_1391045_1391179_1392175_1392476_1393790_1393972_1395002_1395069_1397716_1397853_1400313_1400488_1401191
875887	contig_5967_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_44428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTAGAGATTTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584562	586949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_584600_586900
875888	contig_5013_pilon	-	2358	3	Intergenic	novelGene_110090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	659	junction_2	65.5	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTATCTGAATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189362	173836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933
875889	contig_9011_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_159345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	310	627	715474	715157	NA	70	TGAGAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSFLLLLLFSPNSSPLSPQAISSPCHFPPSRISLSPKQITDLKCYTGKSHREALSETVLSTGKNYPQYTCMAGRLSQETILKGNLDKQDGHSRTDLRSSTTSRD	715783	713041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_713000_715800
875890	contig_12951_pilon	-	1030	2	Intergenic	novelGene_68150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193708	192305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_193222_193594
875891	contig_7816_pilon	-	1908	14	Intergenic	novelGene_66541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	236.566464883957	2	29	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	5	1498	257047	246154	FALSE	50	AAAAAAGGACCACAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKEFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTMFQKERFNIDMPHRFKVYNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCADCGMNVHHKCQKKVANLCGINQKLLAEALNQVSQRSSRRSDSGSSEPVGIYQSFEKKPGVSGDDGPDNGTYGKIWEGSTRCTIENFTFHKVLGKGSFGKVLLAELKGKREFFAIKALKKDDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEILCGLQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFERDPSRRLGVTGNIKIHPFFKTINWTLLEKRQMEPPFKPKVKSPGDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQTAFAGFSFVNPKFEHLLEK	257051	245743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246313_249177_249307_249945_250135_250283_250423_251947_252011_252582_252675_253098_253162_253381_253480_253687_253785_254312_254414_255134_255265_255541_255628_256796_256829_256931
875892	contig_20234_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_174324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGCATCGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157226	159272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_+_157200_159300
875893	contig_14522_pilon	+	2657	1	Intergenic	novelGene_147335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTCCACTTAGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152802	155459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_152800_155500
875894	contig_4469_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_21975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTGTCCGACTTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932853	934772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_932900_934800
875895	contig_12884_pilon	+	1841	4	Intergenic	novelGene_104977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	96	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	618093	618614	TRUE	10	GTATTGTCCGTGGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCARRGSVTASSQLQVAQAGCEFCTSLWASPWGPERVTEGPDGPTTRAATPSFHFHVAGGKPGSRGEEGAVSQDSYVYPRRGPEAPALHTAGVRFCRWKGGIACCSSESE	618090	624703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_618204_618389_618641_619243_619451_623433
875896	contig_12050_pilon	-	1815	2	Intergenic	novelGene_62662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1155	1520	435646	435281	FALSE	15	TTTCTGTTGTCAGTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPDATQRHCTGRVSSPVPTRPRALSIVHCIIYWVGSGVGVHTPAAAAAALHVTVVDGGGDVPVAEALLFHRVLITAVEGDIALWRHLLCVQKGAGKPRRTRREMQAPLQGSRCWRRPGA	438468	434985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_436508_438175
875897	contig_6097_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_174440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTACAAACACAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151273	149277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_-_149300_151300
875898	contig_14142_pilon	-	2042	5	Intergenic	novelGene_120562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.7125337719983	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	59	1609	435154	432882	FALSE	35	GACCAAAAGTATTGTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNLGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	435212	432448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_433962_434216_434294_434457_434572_434695_434883_435061
875899	contig_9871_pilon	-	2872	3	Intergenic	novelGene_75665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	6.5	28	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2010	2342	434401	430437	FALSE	10	TTGTGAAGGGCCCCTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTSGGFAPNADSDVSSTTRLDSPNTSAKYEYGVPLQTLDSFLRFPSPLTSSLCTDDNPAAFLVNQAVKCTRRINLEQCNETEALKMASYSRPEILKVRIILNWFVRYDF	436410	429906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_430589_432207_432296_434308
875900	contig_15559_pilon	+	3160	2	Intergenic	novelGene_141896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCGCCAATGTTTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174221	179233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_174750_176601
875901	contig_12923_pilon	+	2568	10	Intergenic	novelGene_30184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	47.5651599854814	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	863	1243	446447	449424	FALSE	20	CATTCCCACTTTCCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSFNTTCTNTPGSFFCTCHPGFAPSNGELSFTDQGVECIDIDECFQDPSPCGPNSVCTNALGSYNCSCMVGFRPNPEGSWKNGNFRCKRVPFKCQEDVIPDNEQVQRCQGTAAMEPEFVSIFKCP	367699	450749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_367755_381816_382065_391929_392057_393141_393203_431983_432047_441778_441926_443638_443780_446426_446568_446652_446800_449311
875902	contig_15326_pilon	+	4175	4	Intergenic	novelGene_157710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.09901951359278	107	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1730	2053	99710	100220	TRUE	35	CTGAATTTGAAAATTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEDVGAPPDHLWVHQEGIYRDEYQRTWVAVVEEETSFLRARVQQVQVPLGDAARPSHLLTSQLPLMWQLYPEERYMDNNSRLWQIQHHLMVRGVQELLLKLLPDD	97980	102430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_99815_99924_100096_100172_100225_100312
875903	contig_593_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_102028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAACCCATCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514132	516496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_514100_516500
875904	contig_177_pilon	+	2276	14	Intergenic	novelGene_41773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	688	1092	175820	176224	TRUE	10	CCCGGAAGGCTCCTTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSRSDVKAPPLTCTWAGTTCRPEEGAAGTPAWRDLRCWAWYMGPSFSRSKPKPLSRRSSSRFSSGLRATGALEGPGTGSSVLSVLVEAVELPESLLTDSVCSTWLGVAERVGRVVLTAPVLPCRESFFFTLA	175132	238855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_176267_213720_213841_214997_215062_217221_217356_217935_218008_218243_218307_218752_218862_223262_223349_224931_224995_225413_225534_226671_226732_229379_229549_232425_232475_238822
875905	contig_1918_pilon	-	2770	14	Intergenic	novelGene_168334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_13	4.83821082877427	56	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1442	1933	57973	55898	TRUE	20	TTATGCCTCTGAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLQVVPQLVQILRTLVTLRYCTEHGISGISDPFLQVQILHLLRIWGRNHEESSETTNDLLAQVATDTETSRNAGSAVLLETVLTIMDICSAAGLRVLAVNILGCFLLNSDKNIRYIALTLLLRLVQSDHSAVQRHWPTVVECLQETDAFLSRRAPMCRMMQ	60001	52631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_-_52983_53068_53168_54267_54356_54434_54555_55466_55554_55805_55929_56465_56580_56731_56788_56954_57054_57360_57442_57862_58414_58535_58678_58828_59657_59970
875906	contig_4782_pilon	+	2169	9	Intergenic	novelGene_73597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	373.84614148069	446	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	756	1304	78030	90707	FALSE	15	ACTGTATTGTCTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRRRHTGSRANPDPNTCLGVFGLSLYTTERDLREVFSRYGPLSGVNVVYDQRTGRSRGFAFVYFERIDDSKEAMERANGMELDGRRIRVDYSITKRAHTPTPGIYMGRPTHSGGGGGGGGGGGGGGGGGRRRDSYYDRGYDRGYDRYEDYDYRYRRRSPSPYYSRYRSRSRSRSYSPRRY	64190	91572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_64367_75492_75805_76086_76221_77896_78063_83391_83581_88900_89017_89974_90107_90471_90540_90696
875907	contig_5324_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_102071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCCATGAATTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443597	442094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442100_443600
875908	contig_5324_pilon	-	1603	2	Intergenic	novelGene_102061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGGCATAGGCCCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443076	441419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442451_442504
875909	contig_1076_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_101113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	196	516	79519	79199	NA	30	TAAGCGCTAGACTGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLFETSVGYAIFKVGEIEPLEERERRPLLSRRGRERPDERTRLFRIAWVPLCAQTLKGRERLQAWVAHVSVNTWPRSLGSRYCVRGFGALAEWTEAVLSRLFIL	79714	76526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_76500_79700
875910	contig_8063_pilon	+	1139	2	Intergenic	novelGene_152447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAGTCCTCAGAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827179	828389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_827413_827483
875911	contig_5039_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_64951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTCTACCCAGCAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626530	1628504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1626500_1628500
875912	contig_17108_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_109553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGACACAAGGGAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423559	421539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_421500_423600
875913	contig_6885_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_83645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGCAATTATCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132827	131276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_131300_132800
875914	contig_6062_pilon	-	2685	3	Intergenic	novelGene_5282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATTTAAAATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741999	734984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_735111_738367_738446_739518
875915	contig_11681_pilon	-	2659	14	Intergenic	novelGene_102961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	11.7448213439953	34	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	93	1769	84235	15054	FALSE	35	CCACCCAGCAGAATCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSASPPALPTWRGGTRRALPRALGCLSDIKMSDHGSDTLATGVKAEITEKPSIDSLPDDAEVHCDSATISNEPTPADPREDVHENATVQGAETADTRHPEQPTEPAFNGEVTEDTLAECVDSVSLEAEPGSEIPLKEQNNPAVDSPLHGGGWAGWGSWGKSLLSSASATVGHGLTAVKEKAGATLRIHSANSGSSDGAQPDTEGDVPQIADAGTDQSPTECPPTSPSSGSRGMLSAITNVVQNTGKSVLTGGLDALEFIGKKTMNVLAESDPGFRRTKTLMERTVSLSQMLREAKEKEKQRLAQQLTAQRTAHYGMLFDEYQGLSHLEALEILSNESESKVQSFLASLDGEKLEILKNDLISIKDIFAAKELENEENQEEQGFEERGEEFASMLTDLLFEIHVAATPDKLSKAMKKAYDWVEEDQTVVSVHIAKESEDGPKEEEKEEQAENPEEGTKEERKMKTVEEVYMLCIESLAEVTARCIEQLHKVAELILHGQEEEKPAQDQAKVLIKLTTAMCNEVASLSKKFTNSLTTVGGNKKAEVLNPMINSVLLEGCNSTTYIQDAFQLLLPILQVSHIQTSCSKAQP	97268	14163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_15156_18600_18655_22812_22886_23565_23706_24548_24711_26708_26801_34140_34265_35851_36005_39319_39455_42375_42483_42607_42722_68918_69007_83902_84244_97184
875916	contig_11056_pilon	+	2411	6	Intergenic	novelGene_130348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	9.43186089804128	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	428	2020	16819	31061	FALSE	50	CAATAACATAAAGTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQLLITLPTEASTWVKLHHPKKAKEGMPLWEDVTKIFEGALLSEDADETQGESIENKVIPGPPTAEYQELLTFKDVSVEFTQEEWRQLAPAHQNLYREVMLENYGNLVSVGYQLSKPGVISQLEKGEEPWMSEREISGGPVSDLENETETKESTLKNDISWKELHHGLMMERSTKGSTLYSTLGKVSKCDKFKSHQENQGMGEVQVLLIRKKTLTQERGQESNRFEKSIHGSSKATPGPLRKRDPKYDTSGKRSRYDLDLINHTRSYAKVKSFECSICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHRRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHLRIHSGEKPYECGVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFICKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHSGLKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHLRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNDT	15593	31452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_15702_16499_16943_19172_19259_22389_22517_22777_22874_29901
875917	contig_3397_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_154590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCATATACCATCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174997	172885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_-_172900_175000
875918	contig_4402_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_140814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386304	389015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_386300_389000
875919	contig_4780_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_65403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATTTTATGAATTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428920	425934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_425900_428900
875920	contig_10766_pilon	+	2452	12	Intergenic	novelGene_151190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	771.557670993829	130	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	720	1661	143906	175022	FALSE	60	AGAAAAATGAGGAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTIREEGRVFVYINSGVGAVMIEMGTELIGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLRGAIYIYNGRVDGISPAFSQRIEGLQISESLSMFGQSISGQIDADDNGYVDVAVGAFQSDSAVLLRTRPVVIVKASLNHSESVNRTKFDCIENGLPSVCIDLKLCFSYNGKQVPDHIVLFYNVSLDVNRKAETPSRFYFSSDGTSEVITRSIQLSSGGVYCTAHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGHHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIIKTTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLK	114095	175813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_114378_114741_114864_142316_142398_143671_143963_147221_147334_153839_153935_155162_155254_155835_155882_156261_156417_161131_161287_172722_172873_174941
875921	contig_10331_pilon	+	2934	1	Intergenic	novelGene_54163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509180	512114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_509200_512100
875922	contig_10003_pilon	+	1646	1	Intergenic	novelGene_88202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTAGTAGCTGACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499966	501612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_5e+05_501600
875923	contig_8269_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_106215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGAAACTCAGTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233286	235500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_233300_235500
875924	contig_20634_pilon	-	3203	7	Intergenic	novelGene_173427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	23.9443799947573	39	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	459	1193	223207	181353	FALSE	5	CTCTGGTGGTTGTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTQAGERTAIYCLTQNEWKLEVATDNFFQNPDSFYKESMRNSVDKKKLEQLYNRYKDPQDENKIGIDGIQQFCDDLNLDPASISVLVIAWKFRAATQCEFSKKEFVDGMTDLGCDSTEKLKALLPRLEQELKDTMKFKDFYQFTFTFAKNPGQKGLDLEMAVAYWNLVLSGRFKFLDLWNKFLLEHHKRSIPRDTWNLLLDFGNMIADDMSNYDEEGAWPVLIDDFVEYARPVVTGGKQSTF	232010	179342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20634_pilon_-_181433_189187_189285_191692_191776_211324_211456_219776_219946_223032_223433_231777
875925	contig_3948_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_53343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGTGCTGAGAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498903	1503208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1498900_1503200
875926	contig_12915_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_148352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTTTGTGGTAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116128	113769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_113800_116100
875927	contig_3081_pilon	-	2204	3	Intergenic	novelGene_133940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATGACTATTACCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240820	229457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_229593_230518_231099_239331
875928	contig_14219_pilon	-	2862	2	Intergenic	novelGene_54335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTTACAGTATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794412	791077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_793217_793689
875929	contig_3081_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_133906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAGGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47293	45109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_45100_47300
875930	contig_8452_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_48116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTCCATTTGGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980517	978406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_978400_980500
875931	contig_9739_pilon	-	3016	1	Intergenic	novelGene_165100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1851	2159	224098	223790	NA	30	GATTTTTCATAAGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLKLWAERLRAARWQHRQTVGWREGAPGGRPVRRLAWLAKVTQICSASSGARHSLEKITHYIGLLDQEEKTVIQSEWVKSCQRDLLSLTPNWLVAIVFSI	225948	222932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_222900_225900
875932	contig_14970_pilon	+	4463	1	Intergenic	novelGene_45020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1078	1410	153567	153899	NA	20	TGCCCAGCACATGGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVWKPGDPVQPGLIWPFPSLFEQFCELNQSTIDGFQMIYLFIQHVFIEHLPRARCSARLWEYNLNKRDTVRLCCHGAYGLSGKTDIKQRIMPLLDYTVISAMEETYRVL	152489	156952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_152500_157000
875933	contig_11396_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_71311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCTGCTGAATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439119	436442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_436400_439100
875934	contig_6427_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_162576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCGGGTTTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900858	898864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_898900_900900
875935	contig_5864_pilon	+	1043	8	Intergenic	novelGene_162773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_6	43.1173055839106	227	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	113	1027	79500	105629	FALSE	45	TAAAATAAGAATTTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGGAGVFTVWKLLLSAWLVSRGSRLSAREREAPDGVMDFENLFSKPPNPALGKKPATDSDERIDDEIDDTEVEETHEEKIKLECEQSPPKCRHFGNSMISQKSLQHRKSRSKDYDAYSDDNDVCSQGSEDNFAEELKRYIQAKEMANTAQPSLFPVESVMKERAKGTQQTVKQKNKNFKAGHKNGKQKKMKRKWAGTGNKESSALLRKNGSQEEDGKPKEKQQCVKMSQGFINQHTVERKGKQICKYFLERKCIKGDQCKFDHDAELEKKKEMCKFYVQGYCNRGENCLYLHSEYPCKFYHTGTKCYQGEHCKFSHAPLTAETQELLAKVLDTEKKSSCK	79387	105645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_79577_96694_96780_100000_100239_101154_101289_102939_103063_103454_103567_104614_104725_105593
875936	contig_18735_pilon	-	2542	3	Intergenic	novelGene_132679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	338	48	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1558	1938	71480	65731	FALSE	45	CTCACCCAGAAAATCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRSVHCDLVAIIG	73037	65126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_65880_67037_67197_71407
875937	contig_7446_pilon	-	1417	2	Intergenic	novelGene_101954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	80	364	260350	206774	FALSE	40	CTAAAGAAATAGGCGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTSQSDVSSLPPVPSSTDLEVGETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTVSAQALLASSSAESPPSTSLLSSSDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQGACNRRCAMPIHP	260429	205720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_206875_260166
875938	contig_7652_pilon	-	1992	13	Intergenic	novelGene_170949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	480	824	79629	49386	TRUE	50	CAACATAATCAAAGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSDASGGPFHSLLCTGSWTSFSNCRVPWAGSRIHHTLGAILPAFYLGDEEVGRPLQCGNILGYRALAWAFTESRDGTRNTAPRCRVPVSESWRIRTGTYGLCLGRTVQRES	80108	16368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7652_pilon_-_16448_44375_44420_44641_44709_44978_45052_47506_47697_47806_48119_48612_48733_48895_49030_49144_49253_49344_49459_49589_49722_79100_79207_79595
875939	contig_6506_pilon	+	3063	2	Intergenic	novelGene_153490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_1	0	169	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTTTATTATTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215952	221256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_+_215993_218233
875940	contig_3193_pilon	-	2858	5	Intergenic	novelGene_126309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	60.0374882885685	13	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	147	1811	97870	78890	FALSE	70	ATAAAAAAAAATAGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIKLVFVFDGIVEQDKRDEWVKRRRKNSREISRIFQYIKSHGEQPGRHMFFIPPGLAVFTQLALKALGQEAHCSLQEADYEVASLGLQDGCLGVLGEDTDYLIYNTCPYLSIRELCLDTLDTVMLCREKLCESLCLSVTDLPLLACLLGNDVIPQGMFESFRYKCLSAYTSVKENLNKRGNVILAVADHIAKVLRLHQGEKKLEEMLPLGPNKALFYRGVASYLLPGQKSPWFFKKSKAVTTLDKQILSMSSDSESKQEVAMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVSMCTDPESKQEVPMCTDPESRQEVPMCTDPESRQEVPMYTDPEFKLEVPMCTDPDIKQVTMSSDPEIKQQVTPCSDPEIKHEVTMVSDPEILEVARAHHVWGESYLVYNVMSRGEIECSNTLEDELDQALPSQAFVYRPVRQRIYALLLGDGEDGTHSLAREVKEWFVYAGNPLKHPDLVRPLPMSVPGGTPSLKVLWLTQGPDVQARRFDVLLASFNLSSMQEDLQAVEGPLRALCCLLIYLFVQVDTLGLEDLQALIAQALCLQGKSTAQLVDLQVQTVWHGTLVLVRAWGPCSALPTPCSWGVSISQGRSQSKWG	98016	77842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_79109_80133_80307_81725_81831_94139_94321_96883
875941	contig_3787_pilon	+	2756	1	Intergenic	novelGene_102400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	232	657	503514	503939	NA	35	AAAAGACACCTGGCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFYTSGCICSAGVCWCPGASESWLQWPMRRRQTLVVGVQGDRCQAFPGDTPTMLFIQAPFHWERRPRKLPAGMRSLLIRFPHSVNVSVFLCFHITVLALLLKQQQRKRNTGLCACQNLAFAGPKLPDGGGIVCGFVSFAF	503282	506038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_503300_506000
875942	contig_11590_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_125561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATAGGAGCCCTGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37255	38865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_37300_38900
875943	contig_10297_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_112549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577898	580479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_577900_580500
875944	contig_12079_pilon	+	2647	2	Intergenic	novelGene_67375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	145	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	133	507	363791	366189	FALSE	20	TGTCGATAGAAGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGREKKKVKSQKDQLKSKKLNKTNEFQDSSESEPELFISGDELMNQSQGSKKGWKSKRSLRTAGELEEFKCRKANEREEGRLGSQGFVYVMANKQPLWNEATQVYQLDFGGRVTQESAKNFQIELEGRQVMQFGRIDGNAYILDFQYPFSAVQAFAVALANVTQRLK	363658	368329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_364049_366072
875945	contig_2854_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_120848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAGGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295219	294304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_294300_295200
875946	contig_9505_pilon	-	3258	1	Intergenic	novelGene_121882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTTGTGTTCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984328	981070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_981100_984300
875947	contig_12671_pilon	+	1396	7	Intergenic	novelGene_19230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_4	268.87274974522	6	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1	495	200377	212313	FALSE	50	AAAATAATAAGTTTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSPFSLETCRLMIAMLDRDYTGKMGFNEFKELWAALNAWKQNFMAVDQDHNGTVEPHELSQAIAAMGYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	200376	213214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_200410_203720_203791_206727_206772_207057_207206_210609_210724_211053_211113_212286
875949	contig_12804_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_178186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1180	2424	23327	22083	NA	20	TAGTTTGTTCTGGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLINNLNLAHSLFQQNALANPALSSYFTCVAIPLAVLKVSVSECQLSQIPMCEEGRKLFKANGVYVVSGGLSGLGFETVKFIVQKGGGSVVILSRQNPTSQQLKEMQLLENQNEGCRIVSLRCNVGFHSEVEKAVNSIKKIFPKSEIKGVFHSAAVLDDGPLEALNVSRFEKVLSPKVAGAVNLHLVTRGQELDYFVCYSSVSSFLGNATQANYAAANSFLDIFCHYQRNCGLAGQSINWGALNLGLLLNKHHLHSALATKGILLLQIPEIHEYLEKCLLLNNSQQTVVKLDFRKLQEFFSQVPSHRIHFFRISEEEFDSLEDSRVAFTHSLSKISTDEYITSLVSEFKNTNVKAITMSTSLTSLGIDSVSAMTIQSKLFHDLKVQIPLIKLLDPDATLQTLKLFLEEQAKKI	24506	21679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12804_pilon_-_21700_24500
875950	contig_10494_pilon	-	2893	1	Intergenic	novelGene_102239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2247	2576	1303805	1303476	NA	90	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYGASTPLQGQHSQTGGGTEGESWSGSGTCLCPRAAHSPTFELPSQRHGEVGMPLHTGRSQAVSSSVTQSCTDRDPRTTGSGCCNEPSNQVGKEDSGQSVFLDNVTSR	1306051	1303158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1303200_1306100
875951	contig_11171_pilon	-	2887	4	Intergenic	novelGene_48557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2265	2639	88455	85996	TRUE	15	GACTAGCAGCTTCCGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWRKLPEAVNFICLLGMGAVTSSSSSRSYKFWMVLVSFSAGVTVPMGGLMKAAGEFRFKLIFSRASATWRGFWGTVLCCLREFSISLASCTFPLIRNRASFCKSFSRASLTPSLSRASERPIF	92673	70496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_70635_85885_86273_88357_88456_90409
875952	contig_11056_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_130383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGATAATGTAGAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368735	370774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_368700_370800
875953	contig_11815_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_50892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGCCCACCATATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122714	124472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_122700_124500
875955	contig_11719_pilon	-	3172	1	Intergenic	novelGene_154773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2108	2425	135982	135665	NA	40	AAAACCAATCAGGGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKNRHDVQNPGAPQNPSATENSTSFNNSGVGQSLLLSASVQSLQVTALTGSIHVTEKYFLGTVHLPDPKMPSAIKTGLLGWYIVTPAQYKHLQTIKKCRNYY	138089	134917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_134900_138100
875956	contig_14698_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_168139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186989	184778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_-_184800_187000
875957	contig_14637_pilon	+	3305	1	Intergenic	novelGene_114556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGCAGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371782	375087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_371800_375100
875958	contig_13700_pilon	+	3222	1	Intergenic	novelGene_68261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCATCTCCCTCCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14217	17439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_14200_17400
875959	contig_6199_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_126357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1790	2095	115712	116017	NA	10	GTCCGCCACCCCCCACTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDRGSNHHPPHSLAPRESACPISNLIRKREGFVPGRGLNEGGRIQVVNLVELQQGRQVVKLLVPDLKATVGQRVDDVVGDPRVLGHRQHVVPGAGGGVAD	113922	116607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_113900_116600
875960	contig_3601_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_132895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACAGAGTCCTGTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184824	183327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_183300_184800
875961	contig_3727_pilon	+	2699	14	Intergenic	novelGene_146757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_12	44.667343749468	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	42	1046	374363	392019	TRUE	5	CCATTTTGGCTTCCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIHQSTYGKSLAIMTEAQLSTAVIENPEMLKYQRRQQQLDQKSAVAREMGSATSVAVNGESLEDIRKNLLKKQVETRTADGRRRITPLCIAQLDTGDFSTAFFNSIPLSGSLAGTVLSSHSSPQLLPLDSSTPNSFGASKPSTEHMAAVGAKPVGESVSKDSVTATSASAASSPSVLTTPSKIEPMKAFDSRFTERSKATSGAPAMTSVTPTAVERLKEQNLVKEIRPRDLLESSSDSDEKVPVTKPSSLSKRKLELEAETVEKKKKGRPRKDSRLMPVSLSVQSPASLTAEKDALCLSAPALALKLPIPGPQRAFTLQVSSDPSMYIEVENEVTAVGGCEAEPFEM	374321	424837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_374525_375492_375579_383816_384015_386031_386194_389796_390002_390386_390492_391932_392083_394263_394426_395090_395150_395489_395596_396942_397066_397717_397882_400000_400090_423950
875962	contig_9945_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_104815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCCTAGGGAAAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91576	89767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_89800_91600
875963	contig_13283_pilon	+	1210	6	Intergenic	novelGene_154012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_1	109.609488640354	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1164	45	1208	26942	78552	FALSE	25	GGTAACCCACTCTCAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVPTKGEAKKDTCMKTELLKDDVPMAADEGLAEKQGGEAHTAADGETNGSYENSDASSHPNAAKHSQENAKASPQEGTNKLARIAENGISERDVEAGKQNHVRAEELTQTAVVGSNGFFLAKPALQGQPLRTSGPSAPPLPGHAAKTLPGGAGKGRTSGGFSQLQATVPARLGEGSRDAEDKTPPAPGPDVKVHRARKTMPKSVLGLHAASKEPREVREARDHKELKEEINRNVADFGRQQLLPPFPSLHQSLPQNQCYVATAKSQTAAAVSRKKKRRMGTYSLVPKKKTKVLKQRTVIEMFKSITHSTVGSKGEKDLGDSTLHVNGESLEMDSEEDDSEELDEDDEHAAEQAAAFPTEDSRTSKESMSETDRAQKLDGESEEEPESADTGDEEEDGDESD	26897	78554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_26967_52898_53456_54824_55006_59181_59319_60071_60261_78477
875964	contig_5896_pilon	-	1892	2	Intergenic	novelGene_159233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	358	1527	20653	19484	FALSE	50	CAAGGTAACCACAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLPKQSRLLLFLISQVVIFALFFQLYSYNPSSLPSEEDPKPVHVLILSSWRSGSSFVGQVFGQHPDVFYLMEPAWHVWMSFTQSTALRLHMAVRDLVRSVFHCDMSVFDAYMQPGPRRQSTLFQWETSRALCSPPACNVIPRGRIISQAHCKILCNQQPFEMVEKTCRSYNHVVLKEVRFFNLKSLYPLLTDPSLNLYIVHLVRDPRAVFSSRERTTSELETDSRIVLGEKWQQLKEEDRPYHLMQTICKSQQEIFEAIQLLPKALQQRYLLVRYEDLVRAPQAQTSQMYDFVGLKFFPWLQTWVQNITQGKGMGDHAFHTNARNALNVSQAWRWTLPFKKVIRLQKICSDTMNLLGYRHVMSEQQQRNLSLDTLSTWLFSKQDSLKG	28553	19118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_20672_28214
875965	contig_7357_pilon	-	4058	3	Intergenic	novelGene_36914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	41.5	62	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	163	576	543060	481676	FALSE	75	AAGTATCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSLLSLLYKDLAELWLFLKRNTDEIMHQDIVPLCAADIKDQLKKRFAYLSGGRGQDGCPVITFPDYPTFSDIPDKEFQNVMTYLTSIPRYVVVQRPKGGAHVALLFFRAVYTISLSSPSNFLMELKPLLRKEIVT	543222	478193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_481933_510787_510872_542987
875966	contig_5084_pilon	+	2527	7	Intergenic	novelGene_64503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347988	353700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_348126_348371_348483_349383_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383
875967	contig_11855_pilon	+	1544	1	Intergenic	novelGene_67039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCCAGCAAAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1968714	1970258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1968700_1970300
875968	contig_1055_pilon	-	2999	10	Intergenic	novelGene_149720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	73.8933164922392	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	183	1547	97107	22166	FALSE	25	CAGTGTTATTATGGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQWDRLTDEQEEAVNRSESVKFDARSMTALIAQNPKNGPTLQEKLKSFKAALIVLYLLVFALLIPVIGIVAAQLLKWDMKNCTAGSINTNGISTSLTGKENDSKGETRFREIVMEHMSILEKRIHYIADTETNLIDSEHFQNFSVTTDQRFNDVLFQLSTLVSSVHGHGNAIEEISKSLMSLNTTLLDLLLRTETLNGKVQENTFKQQEEIRKLEEHVYNASAEIMSMKEEQVHLEQEIKGEVKLLNNITNDLRLKDWEHSQTLRNITLIQGPPGPRGEKGDRGLTGERGPPGIPGPMGPPGLKGDQGAIGFSGSRGLPGPSGRTGRPGNSGQKGQKGEKGSGSTLTPDKTVRLVGGSGPHEGRVEIFHNGLWGTICDDYWEARSGQVVCRSLGFRGILTVHKAARFGQGTGPIWLNEVFCFGRESSIEECKIKTWGSRTCSHNEDAGVTCTL	108974	20713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_-_22300_39443_39633_59241_59296_69383_69474_75880_75962_82675_82863_84653_85067_95486_95601_97004_97112_108796
875969	contig_5485_pilon	+	3983	7	Intergenic	novelGene_37786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_6	16.750621879003	174	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	825	1520	688882	695091	FALSE	50	TAAATCTTTAAAAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQIPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML	688057	697554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_688894_689066_689193_690974_691105_691191_691251_694221_694312_694710_694887_694988
875970	contig_17198_pilon	-	1319	6	Intergenic	novelGene_62403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	292	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTCTCGAGGCGAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1103964	1100165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1100467_1100541_1100603_1101268_1101331_1102662_1103298_1103375_1103457_1103785
875971	contig_10404_pilon	-	2861	1	Intergenic	novelGene_138629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTTAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33065	30204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_30200_33100
875972	contig_15897_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_49593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCCTGGATATGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889052	887322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_887300_889100
875973	contig_5941_pilon	-	2991	1	Intergenic	novelGene_84546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCATTGTTGAATCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135232	132241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_132200_135200
875974	contig_6076_pilon	+	1702	2	Intergenic	novelGene_81774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATTAGTAGAAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498004	500224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_498117_498634
875975	contig_1964_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_130907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTACATATGCACACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138410	140567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_138400_140600
875976	contig_7158_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_163726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGTCTACAATGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053776	1051174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_-_1051200_1053800
875977	contig_5346_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_161855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151385	149944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_149900_151400
875978	contig_9049_pilon	+	862	6	Intergenic	novelGene_83150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_2	1760.51453842336	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	21	335	89372	104397	TRUE	30	CACCAAAGCTGTGGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTKETFYLPSKHNSRQGQDTDLNHIMHSKVRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKAHGENNHPLCGHHQSRRSPREICGVGFIHLLESIGYG	89351	112863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569
875979	contig_6871_pilon	+	1327	10	Intergenic	novelGene_21524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	379.409775543248	1	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	334	1263	64471	72153	FALSE	15	AATGGTGTTATGTGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	54467	72217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_54521_54695_54740_57971_58066_63387_63456_64396_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
875980	contig_11428_pilon	+	2535	3	Intergenic	novelGene_138503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	24	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1418	2005	203677	207057	FALSE	85	AAAAGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTVKIWDIKTGQCLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGERGSCVADQSLEHKAGVCSWESKRD	202259	207587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_203830_205570_205782_206833
875981	contig_5988_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_16147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACAACAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871711	1869222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1869200_1871700
875982	contig_11017_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_128092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGTCCTGCCTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274162	272109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_272100_274200
875983	contig_9195_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_155699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATTCTATGGGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822201	820130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_820100_822200
875984	contig_10104_pilon	+	3319	1	Intergenic	novelGene_160137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCTGGAAAGATTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443126	446445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_443100_446400
875985	contig_11250_pilon	-	2139	8	Intergenic	novelGene_127159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	1777	2139	210867	180032	FALSE	35	GGCGGCAACAGCGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFMVHPPHNRPKTVFRSSARLTNFITNIQNEAPVLSSIHLTGCFLNILIEGIGGKERHLHCVPRCPQGLPLDTTGVRVRREKEDSSGKKQQLRRTPKGPRQPLLSPTPSNRCCSSGDGG	225540	180031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_180254_191176_191262_210811_210889_210983_211078_214406_214554_221027_221119_223003_223197_224310
875986	contig_8674_pilon	+	3560	1	Intergenic	novelGene_102928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1124	1423	439464	439763	NA	40	TACACTGGTGAGCAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAHCSPYTIWYLNTQSSLLCRHLSLRDSWSFLVQREISGTDPGIYCLFLESDLCPLKPHLPLVWWGAIGAGHGLPQYNRSIFVKFFLFMCVCKILIFP	438340	441900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_438300_441900
875987	contig_11681_pilon	+	2641	2	Intergenic	novelGene_102973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	152	2518	163570	165936	FALSE	25	AATGTGTGCTTTCAGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	161360	166059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_161445_163502
875989	contig_1009_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_121756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTAACATAGTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265857	268314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_265900_268300
875990	contig_5485_pilon	+	3330	1	Intergenic	novelGene_37714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1281	1613	180525	180857	NA	80	AAAAAAAAAAGAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPGSGAVEAASGERVSGTMSGVSGLLAQRGPCPLALLLLLLLGPSSVLAISFNLPLNSRKCLREEIHKDLLVTGAYEVTDQSGGAGGLRTHLKVRHWAARGREGRLQA	179244	182574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_179200_182600
875991	contig_5669_pilon	-	2184	3	Intergenic	novelGene_86091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_2	162	65	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGACCTGTTTAGGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214366	208517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_209599_212408_212550_213404
875992	contig_8273_pilon	-	991	8	Intergenic	novelGene_113083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	193.539849822686	62	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	155	487	109068	101657	TRUE	80	CAAAAAAGAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSRQVTCVSWVRCGVAKETPDKVELSKEEVKRLITEAKEKLQEEGGSDEEETGDPSEVGMQSARTQARPREPLDDGDPEDNRTLDDDELAEYDLDKYDDDGDPAYAFL	109222	94923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_95026_96088_96200_96398_96507_100983_101081_101570_101674_105590_105776_105910_105970_108996
875993	contig_4974_pilon	+	2622	1	Intergenic	novelGene_161414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGTCACCCCGGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105267	107889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_105300_107900
875994	contig_9995_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_47670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGACAAAGACATGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192025	194494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_192000_194500
875995	contig_5389_pilon	-	3150	3	Intergenic	novelGene_143002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCTCAGGGACTCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150911	145657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_145742_145858_145982_147968
875996	contig_12689_pilon	-	2536	1	Intergenic	novelGene_145027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	34385	34008	NA	45	TTTATAAAATTATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVYRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	34385	31849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_31800_34400
875997	contig_14546_pilon	+	1067	4	Intergenic	novelGene_157428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2318	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGAGCCCGCCCCCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468361	484444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_469092_472845_473018_476181_476259_484356
875998	contig_14822_pilon	-	540	4	Intergenic	novelGene_145424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	94	297	190137	186548	TRUE	30	ACCAATCACTTGGCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KERLPSPTPAEKAYTYSHIRSQPSIRLCILCMKRSTKGFCSQGCPLQAGTKMAQRSLLLGEILFAFLDIRLDGITARLPASWAHFPVFVRELEGLNKS	190230	185702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_185737_186101_186223_186459_186592_189977
875999	contig_10861_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_39376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCTCACGCCTGCAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687450	1685836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1685800_1687400
876000	contig_15293_pilon	-	866	2	Intergenic	novelGene_146523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1235	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCCAGAGCTGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95224	92216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_92990_95131
876001	contig_11631_pilon	+	2145	4	Intergenic	novelGene_104173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_3	153.504252565053	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	52	351	49034	49553	TRUE	75	AAATAAAACTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFLYILETSTSSFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRGSQELGMSNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGKGTF	48982	55189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_49068_49180_49321_49427_50456_54297
876002	contig_8587_pilon	+	2554	23	Intergenic	novelGene_159132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	64.1581207861477	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	29	1690	404791	433863	TRUE	30	ATCCTGACTGTGGAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVDLEKLRMSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLISEGYEGLVEGGENINQANWLSVSNIIQLGGTVIGSARCAAFTTREGRLAAAYNLVQRGIANLCVIGGDGSLTGANIFRSEWGSLLAELVKEGKISESTAQTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDGWENFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAVDRNGKPITSSYVKDLVVQRLGYDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRVLSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVSLSGNQSVRLPLMECVQMTKLVQKAMDEKRFDEAIQLRGRSFENNWKIYKLLSHQKISKEKTNFCLAILNVGAPAAGMNAAVRSAVRSGISQGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHHVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKSYMEKIVENIRTYNIQALLVVGGFEVSLRGSAAAGGGTRALRGTLHCHVRHSGHHQQQRARHRLQPGLRHRRQRCHGEL	404762	437139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_404876_413962_414037_416692_416771_417444_417635_419894_420061_420612_420658_421121_421231_424186_424283_424778_424872_425281_425408_427055_427121_427926_427991_429753_429901_430803_430875_431831_431924_432896_433050_433855_434021_434554_434617_434891_435004_435678_435779_435861_435968_436623_436827_437015
876003	contig_12512_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_24192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATGAGTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646130	647174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_646100_647200
876004	contig_10734_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_51456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAGAAAAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2256860	2255013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2255000_2256900
876005	contig_10863_pilon	+	3040	1	Intergenic	novelGene_59344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGGACCATAAGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136675	139715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_136700_139700
876006	contig_10861_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_39255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	566	940	1114729	1114355	NA	10	TCCCTGTTCAGTCCCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPHNAIAYLFRNHLLDIDYVPGPGRELRGMRRQSLLGSCLPGTESLGENKIRKLSKLNKVNRPLVRAGKVWWYCRGGKGHSGLEYAAGESGKLQGGGGKFILSLSLFFNKYNCLSTSFPLFF	1115294	1112883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1112900_1115300
876007	contig_6361_pilon	-	630	6	Intergenic	novelGene_23996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4521.2031584524	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	63	401	420979	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436327	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411103_411158_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
876008	contig_12125_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_76211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGGGGTTCACAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179619	181082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_179600_181100
876009	contig_6589_pilon	+	696	7	Intergenic	novelGene_26104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2648.0702197806	14	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	50	490	1878483	1880179	TRUE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGNCRRWRRGRSWYLMAEAISWVAWRPLWPSRCCWAGRWWSCAVRASTFLAISTGTSVSLIRQGVSCSLLSTVKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKVSLTRPYAVPTHLASSPVCLPGTPRS	1876577	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879030_1879160_1879305_1879498_1879630_1880143_1880274_1880498
876010	contig_4857_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_48903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAGTAGAATCTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484593	1482595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1482600_1484600
876011	contig_8027_pilon	+	4388	1	Intergenic	novelGene_158831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGCTTATTTTTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230116	234504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_230100_234500
876012	contig_5429_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_127811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAAAATCCTATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442210	440821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_440800_442200
876013	contig_10734_pilon	+	2099	4	Intergenic	novelGene_51212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	29.4089933334837	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	101	439	1147081	1147419	TRUE	20	TTTTAGTGTAAGTTTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVDFGDLELFEAFDHPEESIPKPVHTRFKDDDDDDDEEEEEENGVGDAELRERLRQCEDTIERLRAENILPARGPCHTGVWSGLSSGSGAAEIPTGPEFQVVPLAPQAD	1146980	1154994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1148828_1151370_1151446_1153410_1153517_1154923
876014	contig_14341_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_111792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAGTCTACTTGCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381092	379336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_379300_381100
876015	contig_160_pilon	-	3565	1	Intergenic	novelGene_156317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCACTAAAAAGGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45333	41768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_41800_45300
876016	contig_15888_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_84461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCTTAGAACTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544781	542576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_542600_544800
876017	contig_2646_pilon	-	3821	1	Intergenic	novelGene_69726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAGTAATCAGAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2629249	2625428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2625400_2629200
876018	contig_5280_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_52631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCCAGCTTCATTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50304	48220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_48200_50300
876019	contig_5201_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_82188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAGTGACCCTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338484	341089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_338500_341100
876020	contig_5260_pilon	-	3925	3	Intergenic	novelGene_144412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGTTTTCGGTAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493481	487306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_487584_489281_491663_492214
876021	contig_2487_pilon	+	3858	1	Intergenic	novelGene_148440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGTTAGCTGATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79362	83220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_79400_83200
876022	contig_11360_pilon	-	1361	7	Intergenic	novelGene_174252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	70.0795183266045	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	41	973	269424	16152	FALSE	25	TCAATATCTTGATTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFANQSDDDQVFVMGFHFFGGSRVTLLASKTSQRYRIQSEQFEDLWLITNELILRLQEYFEKQGIKDFACSFSGSVPLQEYFELIDHHFELRINGEKLEELLSERAVQFRAIQRRLLTRFKDKTPAPLQHLDTLLDGTYKQVIALADAVEENQDNLFQSFTRLKSATHLVILLIGLWQKLSADQVAILEAAFLPLQQDTQELGWEETVDAAISHLLKTCLSKSSKEQALNLSSQLNMPKDTSRLKKHITLLCDRLAKGGRLCLSTDAAAPQTMVMPGGCTTIPESDLEERSVEQDSTELFANHRHLLAETPMPEASSLHGVSD	269464	15763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11360_pilon_-_16184_16400_16512_96842_97066_128979_129163_251669_251823_253906_254080_269366
876023	contig_12032_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_139261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTCATCGGGTCGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94553	93413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_93400_94600
876024	contig_10346_pilon	+	1460	5	Intergenic	novelGene_161219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAGTTCTGCCAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266633	276191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10346_pilon_+_267087_267226_267362_268337_268535_269327_269525_275713
876025	contig_17563_pilon	-	3353	25	Intergenic	novelGene_175678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGGGGGGAATAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116694	5891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17563_pilon_-_5981_8408_8496_17022_17095_19112_19192_20059_20132_32536_32711_38721_38848_40728_40827_42246_42355_56788_56897_57627_57766_58132_58191_69662_69725_71065_71167_74644_74747_76980_77054_82050_82097_83567_83726_85017_85124_106125_106268_107702_107784_107875_107982_111631_111723_112509_112565_115673
876026	contig_11823_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_171018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTAACCAAAGGCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20768	18712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_18700_20800
876027	contig_17074_pilon	+	2757	1	Intergenic	novelGene_145179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCATGCATGTGCACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592262	595019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_592300_595000
876028	contig_16411_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_77360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	442	831	299088	298699	NA	10	TATCTGGTTTGGCAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFVFDRGCTRFAFLNWRAVLKSVIGSICIYITALPGTQESRRSTSWKGALFPGKLAKERFCRIQANHLQSNPSVHLPTPPTMCTCVSGIQGNVNFVFIWEIVHRNILFSLVHLLIVYNDICTSMQNT	299529	298634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_298600_299500
876029	contig_12250_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_80728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGGATCAATTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408362	407144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_407100_408400
876030	contig_2161_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_114949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959600	957508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_957500_959600
876031	contig_9429_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_155089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1161	1469	19170	19478	NA	40	GTCAATGTGTAAATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVNDQNKTPGDLMLEDKALKLPHREFETLIFKVLQQMKESADKNKEKIYKIMEKTDKTMEQFRKIIKEQNVKINKQREVIQKQQVEIQKISEMDSTKKRF	18009	20231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_18000_20200
876032	contig_16594_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_53927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAGGAAGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312382	310641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_310600_312400
876033	contig_9437_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_141727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATTAAAAAAAAACCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227414	229565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_227400_229600
876034	contig_12299_pilon	-	3501	7	Intergenic	novelGene_29746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	57.7946556544999	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	697	1620	354891	275506	FALSE	40	TCCCTGGAAACTTAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDFISISMLSLAMLVGCYVAGIIPLAVNFSEERLKLVTVLGAGLLCGTALAVIVPEGVHALYEDILEGKHHQTSETQNVIASDKAAEIPVVHEHEHSHDHTQLHAYIGVSLVLGFVFMLLVDQIGSSHVHSTDDPETARSSNSKITTTLGLVVHAAADGVALGAAASTSQTSVQLIVFVAIMLHKAPAAFGLVSFLMHAGLERNRIRKHLLVFALAAPVMSMVTYLGLSKSSKEALSEVNATGVAMLFSAGTFLYVATVHVLPEVGGIGHSHKPDTTGGRGLSRLEVAALVLGCLIPLILSVGHQH	355587	273624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_275737_277431_277567_278093_278180_281081_281151_289529_289728_324112_324222_354795
876035	contig_6488_pilon	-	3984	1	Intergenic	novelGene_44741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2377	2685	77781	77473	NA	5	TTTCCTCTTTTTTTCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHGINKNFKAETNWVLKQAPKPPRCTVRKRFCRQDVEAGPNETAPTLPLEFLLPVLGLLDPGVAVSAAPALRCTLPPLPINALPQRGLTTLSAFASSLHI	80157	76173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_76200_80200
876036	contig_12915_pilon	-	2966	2	Intergenic	novelGene_148349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112559	105282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_107690_112000
876037	contig_9995_pilon	-	2659	1	Intergenic	novelGene_47795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCCAGCAGAGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801742	799083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_799100_801700
876038	contig_2414_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_158467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1232	1543	192838	192527	NA	55	AAAAAAAAAAATCTGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSSLSSLCSVTTAPGVNSHMGYVLKSDTQDSPRLSDVESGDARWPSSECPFTAGSVQGNPESATLPPPSTHSPRTAHPLNCTVSSFRGDTVSFPFIPCGYT	194069	192020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_192000_194100
876039	contig_19094_pilon	-	2450	1	Intergenic	novelGene_177782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCAAATTCCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9218	6768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19094_pilon_-_6800_9200
876040	contig_20004_pilon	-	2075	10	Intergenic	novelGene_167529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCCCCAAGTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71141	53115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_53399_57186_57272_57649_57724_59003_59082_59162_59198_60479_60524_63270_63323_63418_63501_63916_64072_69954
876041	contig_5260_pilon	+	3309	1	Intergenic	novelGene_144389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAATATTTGGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414370	417679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_414400_417700
876042	contig_13428_pilon	+	4597	5	Intergenic	novelGene_143444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	261.769459639584	39	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	226	921	61940	73970	FALSE	10	GCTAATGTGCTCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEVRAVQ	61714	77646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_62034_66264_66387_70359_70503_73404_73503_73731
876043	contig_4674_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_174148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCTGTCAGCTTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342415	343265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_342400_343300
876044	contig_953_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_129999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2128	2445	264192	263875	NA	30	TACCATCTTACCCCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLILSTKTNSKWIEDLNMKPKTIKIMEEKIWTMLGALIHGINRIQTITNNAQTPEDKLNNWELLKSKHLCLSKDFIKRVKIEPTNWEKFFGYDVRQGSNL	266319	263726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_263700_266300
876045	contig_7157_pilon	-	1873	6	Intergenic	novelGene_131271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_5	47.1915246628036	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	9	1175	639906	620076	FALSE	30	AATTTTATGCAGCAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGMFAPQTFVMHSHRSPDKRTCHWGFESAKWHCYLHVNQKYLGTPEEKKLKIILEEMKEKFSMRNGQRTQSKTDTSSGMELQSWYPVIKQEGDHVSQTHSFLHPSYYLYMCDKVVAPNVSLTSAVSQCKEIPKTEACKSMPRQSEKPHSTGKHQKPVSYPDVSLEEQEKLDLKTSRELCSRFDPSIPNNSTSEKKPESATSNLVRDTSKVGIGHDAAASSPLLVKDVICEDDKGKIMEEVMRTYVKQQEKLNSILQKKQQLQMEVEMLSSSKAMKELTEEQQNLQKELESLQNEHAQRMEEFYVEQKDLEKKLEQVMKQKCTCDSNLEKDKEAEYAAQLAELRERLDHAEADRQELQDELRQEREARKKLEMMIKELKLQILKSSKTAKE	639914	619377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_620235_620903_621129_621455_621698_624613_624847_626525_626624_639696
876046	contig_11631_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_104183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCCCTGCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82732	84770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_82700_84800
876047	contig_10940_pilon	+	6420	1	Intergenic	novelGene_49295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3771	4088	1001535	1001852	NA	10	TGGACATTTTTTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSPLPVGPSPQLYWSFLRFTFLISTQGHLLRLYILIRESQNYFRDEIPADVKSIPTRNDPVGQSRTAPCGFQGCNFYGSRLPHLSPVERLVGSNHRPFDWQLT	997764	1004184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_997800_1004200
876048	contig_14768_pilon	+	2591	14	Intergenic	novelGene_115086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	127.878455606423	30	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	863	2589	3	2591	241249	260446	FALSE	20	GTGAGGAAAGGGGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGVAGLQMTLAELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGILEQVEAYQTEAREALASLPSSPGLLQSLLERGQRLGVEVPEDQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKARAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPNPLSSSTTASSATSICVCGQVPAGVGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRSSPISSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLRRLAELHQWVQAEPRPEEPPTYPSVPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPGEGLDLELLSSLLPQLTGPMLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGKPPDLERIRTLLE	241246	260446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_241285_248693_248814_248923_249119_254073_254256_254343_254469_254594_254743_255371_255469_256182_256542_257164_257304_257843_258024_258367_258506_258721_259322_260037_260108_260246
876049	contig_10930_pilon	-	2392	1	Intergenic	novelGene_36961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTCTCTGTCCGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258130	255738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_255700_258100
876050	SIRV4	-	414	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	200	3	-200	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	178	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTCAACAACTTGGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
876051	contig_2414_pilon	+	2846	1	Intergenic	novelGene_158468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTATAAATGGAAGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197365	200211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_197400_200200
876052	contig_8487_pilon	-	3472	1	Intergenic	novelGene_111907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTCCCAGCAACCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50480	47008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_47000_50500
876053	contig_11115_pilon	-	1433	9	Intergenic	novelGene_102874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	17.8356209591929	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	587	1237	237119	231015	FALSE	25	CCAACAAGCTCCTGCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADCHVFLPMSSWLDILHQVAIWQKNFRRISYAKTKTRAEVQGGGRKPWPQKGGGRARHGSIRSPIWRGGGIAHGPRGPTSYYYMLPMKVRVLGLKVALTVKLAQDNLHIVDSLELPTPEPRYLTELAQYRRWGDSVLLVDLAHEEMPQNVVSATSRLKTFNLIPAVGLNVYSMLKHETLVLTLRTIVFLEEKLLWHDSRYTPLYPFHLPYGDFP	238707	230818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_231161_232360_232438_232516_232627_232713_232821_233965_234084_235282_235335_237078_237292_238207_238359_238444
876054	contig_9919_pilon	-	87	1	Intergenic	novelGene_137949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGAGAGGGCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533973	533886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_533900_534000
876055	contig_8576_pilon	+	1682	8	Intergenic	novelGene_88784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	366.077832696596	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	17	1465	893619	915551	FALSE	35	TTTGTAATATGAATTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893602	915768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
876056	contig_5236_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_100873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCAGTTCGAATCCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32911	31012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_31000_32900
876057	contig_10734_pilon	+	2531	1	Intergenic	novelGene_51432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	14	310	2203037	2203333	NA	60	TCTAAAAAAAAAAATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFEDMPLLGAQMLAPSLAASHPSLLLPHTLLLPNWSLRGGASSYLPPPCLGPLHDLPVKAHLCHFSSSAPPPTATTPCTVVGMAASSDAQCPSWVLLFPALS	2203023	2205554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2203000_2205600
876058	contig_8418_pilon	+	3102	5	Intergenic	novelGene_166065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	14.1840579525043	51	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	134	622	1169770	1216768	FALSE	25	AGAATTAGGCCCCCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVARAIELLEKLQESGEVPVHKLQSLKKVLQSEFCTAIREVYQYMHETITVNGCPEFRARATAKATVAAFAASEGHSHPRVVELPKTDEGLGFNVMGGKEQNSPIYISRIIPGGVAERHGGLKRGDQLLSVNGVSVEGEHHEKAVELLKAARDSVKLVVRYTPKVLEEMEARFEKLRTARRRQQQQLLIQQQQQQQQQQTQQNHMS	1127775	1228432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1127897_1169757_1169830_1172273_1172484_1216549_1216769_1225952
876059	contig_3627_pilon	-	3442	1	Intergenic	novelGene_78456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCAAAAACATCACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306575	303133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_303100_306600
876060	contig_7057_pilon	-	3437	1	Intergenic	novelGene_123434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCCAGCATTCTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650149	1646712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1646700_1650100
876061	contig_10569_pilon	+	3166	9	Intergenic	novelGene_44087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATCCTGTTCAGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374118	400451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_375805_379971_380055_384081_384171_388065_388151_388909_388988_391573_391658_392388_392474_396092_396177_399559
876062	contig_8453_pilon	+	2274	1	Intergenic	novelGene_125129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCTTCATTAACTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208741	211015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_208700_211000
876063	contig_18391_pilon	-	3576	1	Intergenic	novelGene_174096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTATTTTTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104441	100865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_100900_104400
876064	contig_8161_pilon	-	4971	2	Intergenic	novelGene_156765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTATTTTCCATTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322563	317468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_317729_317852
876066	contig_7157_pilon	-	3618	1	Intergenic	novelGene_131290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTAACAATTTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874467	870849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_870800_874500
876067	contig_13201_pilon	-	4389	11	Intergenic	novelGene_130883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATCTGATCCTATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208041	175629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_175839_183532_183777_185857_186091_191445_191548_192304_192456_198740_198974_199891_200165_201808_202013_203101_203551_203990_204132_205891
876068	contig_7057_pilon	+	1494	5	Intergenic	novelGene_123401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	57.9973059719156	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	375	1493	1292729	1308852	FALSE	35	ATGAATGTAAGGAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLLAGIQPHSHALAGPSGLHRHLLQRCGGLCYFGSLESLRSAFFQKRGLEEDWSLSANIEAMAQESVMFSDVSIDFSQEEWECLNEDQRDLYRDVMLENYSNLVSMAGCSFSKPDVISFLEQGKEPWLVDRELTRGQWPDLESRCETKKLYLKKESYEIESSQWEIMERLTHHLQCSSFRDDWECNSQCEKRCGSQEGHFSQLILTHEDMPTFSQHPSFTLHQIFKNKEKFCDTKEYGKAFRRGSQLTTHQIIHTIEKPYECKECGKAFRHLSRLTHHQKIHTGKKPFKCTECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKP	1292354	1308853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1292854_1296828_1296902_1302634_1302762_1303067_1303167_1308157
876069	contig_5718_pilon	+	3122	3	Intergenic	novelGene_110377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	83	junction_1	17	12	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	258	791	1173669	1235406	FALSE	65	ATAGAGAGAGAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEQSSEAESRPNDLNSSVTPSPAKHRAKMDDIVVVAQGSQASRNVSNDPDVIKLQEIPTFQPLLKGLLSGQTSPTNTKLEKLDSQQVLQLCLRYQDHLHQCAEAVAFDQNALVKRIREVTYCGEVTLLTHDCGSLCLLSLFLLGSTASHPSFMGSGYFVTKTRYVSALFGEDCVS	1173411	1237737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1173727_1176500_1176645_1235074
876070	contig_9548_pilon	+	2434	2	Intergenic	novelGene_141094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCCTGTCACGTAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334573	338052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_336519_337563
876071	contig_3602_pilon	+	3288	1	Intergenic	novelGene_60573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGTAAAAAACCAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565105	568393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_565100_568400
876072	contig_11326_pilon	+	1843	4	Intergenic	novelGene_173910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_3	9.80929264637478	162	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	81	527	9002	43398	FALSE	35	AAACATTGGGGTTGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLVRLMTHVDLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSEDEDTDTEEYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVSMLDKLSREELLKPMGLKPDGTITPLEEALNQYSVIEETSSDTD	8921	44714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_9072_17440_17586_28619_28740_43286
876073	contig_7292_pilon	+	2449	1	Intergenic	novelGene_175366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATCAGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173557	176006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_+_173600_176000
876074	contig_7230_pilon	+	572	5	Intergenic	novelGene_52516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	19.600701518058	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	8	466	2651	8648	FALSE	25	CCTCCTGACTATATAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLSKEYGFVLLTGAASFIMVTHLAINVSKARKKYKVEYPTMYSTDPENGHLFNCIQRAHQNTLEVYPSFLFFLAVGGVYHPRIVSGLGLAWIVGRVLYAYGYYTGEPRKRNRGGVSFIALIALMGTTVCSAFQHLGWVKTGLGSGSQHCH	2643	8754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_2768_4000_4075_5588_5647_7543_7617_8511
876075	contig_13026_pilon	+	3077	1	Intergenic	novelGene_146303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTGGGCTCAATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15072	18149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_+_15100_18100
876076	contig_9871_pilon	+	2675	7	Intergenic	novelGene_75719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	94.4927980794774	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	82	1095	598042	610993	FALSE	10	TGCTACATGCCTGTTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILESSLRSFYRLFVSLPPLPAAFPGRMNVIDHVRDMAAAGLHSNVRLLSSLLLTMSNNNPELFSPSQKYQLLVYHADSLFHDKEYRNAVSKYTMALQQKKALSKTSKVRPSTGNSASTPQSQCLPSEIEVKYKMAECYTMLKQDKDAIAILDGIPSRQRTPKINMMLANLYRKAGQERPSVTSYKEVLRQCPLALDAILGLLSLSVKGAEVASMTMNVIQTVPNLDWLSVWIKAYAFVHTGDNSRAINTICSLEKKSLLRDNVDLLGSLADLYFRAGDSKNSVLKFEQAQMLDPYLIKGMDVYGYLLAREGRLEDVENLGCRLFNISDQHAEPWVVSGCVWPFAFLLVFPRVFGKLWFLLDRV	597960	612573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_598143_602106_602294_603275_603396_606551_606664_608257_608412_609136_609280_610796
876077	contig_8954_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_130310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	955	1311	620327	619971	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSCREFSIKSSTVKPVKARPACLPCFSGSHKFSDFDRVQCYSFSITRFSAKYLHFPSLTGFHLTQVLAFTDFTVLSLKIFSILRNQLFFKIDLLMRLCILFGHVLYPVQCFFSLPP	621281	619187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_619200_621300
876078	contig_9995_pilon	-	2428	1	Intergenic	novelGene_47706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320018	317590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_317600_320000
876079	contig_9995_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_47759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1602	2075	670179	670652	NA	65	TAGAGAATAAAGAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPCTAERNAAWSCAIPMISWGLDHKQITRTCLSSLEPPPKPVWHHSNPRASTVRWLVAVHEGQWLGMKPRSPTWKVRMLPPNHHRLPLKTTHIQLSSVTSLCFIFFKAFIITYNYLAYLFTYLLPAFPTECQLLEIRDFVLVPAVSSALSTVRGT	668577	671022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_668600_671000
876080	contig_19737_pilon	-	2318	8	Intergenic	novelGene_158968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAATGAAATCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50863	37284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_38931_40061_40171_41150_41207_47230_47280_47573_47694_47779_47910_48698_48799_50755
876081	contig_6418_pilon	+	2145	3	Intergenic	novelGene_81204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	102	40	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341078	1377554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717
876082	contig_1521_pilon	-	1141	4	Intergenic	novelGene_145439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_2	99.3523471735262	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	21	1139	191760	160443	FALSE	25	TAAGGTTTCTGACACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREETKGKRDREKDTREERDYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDTRDARDRRELRDSRDMRDSRDMRDYSRDSKDSRDPRDSRSTRDAHDYRDRESRDAHRKEETYQEESRSYGRNHLREESSRAEVRSDSRNESRSEIRNDRMGRSRGRGPELPEK	191780	160440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669_163981_179059_179258_191614
876083	contig_15384_pilon	-	2174	2	Intergenic	novelGene_85110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	1857	2174	66814	65285	FALSE	10	CTGAGTGACCGGCCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHPLYEASAALQRATVARPETPTPAHNHLDSSSGISATKDCGQGVEKDNFTEVPTGDRVPGNQGYTLSQPPSFLPVSGVYHFPTGHGRLARETPAHCHHPAAPQ	68670	65284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_65301_66512
876084	contig_9373_pilon	-	2712	4	Intergenic	novelGene_162718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_2	37.9151098581496	67	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	278	802	202308	196011	FALSE	55	CCCAATTTTAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIFPKRGEISNFQYLMHLNTLAGRSYNDLMQYPVFPWILADYDSEEVDLTNPKTFRNLAKPMGAQTDERLAQYKKRYKDWEDPNGETPAYHYGTHYSSAMIVASYLVRMEPFTQIFLRLQGGHFDLADRMFHSVREAWYSASKHNMADVKELIPEFFYLPEFLFNSNNFDLGM	202585	194100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_196173_197718_197826_198895_199014_202170
876085	contig_8616_pilon	+	1841	6	Intergenic	novelGene_72393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_5	57.9019861490087	25	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTGTAGTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196169	199039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_196212_196479_196640_196862_197881_198085_198588_198825_198858_198952
876086	contig_20819_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_55670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	160	600	63050	63490	NA	45	GAAAGTAAAGAGGGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKWICCSQRGPLCQAWERRSWGCSTPSAPLLWPQTHSAVKPGYYPTPQDAQDSLEPGAEGCSPFSIRAVHQFPGLLHLPGVQSVGCQQEFSITAPVQGVVGGTSQLDTVGQGEASSAGTHPHKDILQWQKGNLTGHPQDELHSRS	62890	64190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_62900_64200
876087	contig_10437_pilon	-	2622	5	Intergenic	novelGene_38340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1893	2261	517818	510598	TRUE	30	AACACATCAGCTTCCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKRKFCFSVVRMPFSTRFFAIRSRTFLSWYCSLKGFQVSPVSSSIHVWTVSVGSVALMCLRVSSSKTSPVGLSDFTSTFLSSSLFLRMVRGSKEIRPRMASSIRMPPRRPEEMQSFQKDV	519710	486456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_486616_488428_488630_510596_510723_511442_511562_517693
876088	contig_19990_pilon	-	2990	1	Intergenic	novelGene_30749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	640	975	34784	34449	NA	60	AGAAAAATAAAACCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCIFGEAGLAIYLSIHPSILYLSLTLVLISSVILGKLLMHISPTEKWRNNSLIMQWREFSKNYHLLGTNNPCQALEEDLYINLLMASSEYPMNELIPLPPFYKWVSQGSV	35423	32433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_32400_35400
876089	contig_9463_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_83843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCAGCAGGGCAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217482	219004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_217500_219000
876090	contig_19721_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_99151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTTCCCAAAGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137773	140089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19721_pilon_+_137800_140100
876091	contig_10331_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_54173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGCTCTCAAGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546346	544289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_544300_546300
876092	contig_11448_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_66383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAACCCTGGTGGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383700	385642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_383700_385600
876093	contig_4857_pilon	+	1250	1	Intergenic	novelGene_48875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACATAGACAATATACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375497	1376747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1375500_1376700
876094	contig_8879_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_158994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385154	383178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_-_383200_385200
876095	contig_8616_pilon	+	738	2	Intergenic	novelGene_72439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	179	361	253483	253665	TRUE	40	TAAGGAGGGAGAGAGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKSFNILVQKQPQDEKWLSPRFPCGRKTGFRHQWGCKGAGRLQALGQGCRKQSGYSSGMGTVRPKESICLRAPLGVPLLQRPVWGGFQLPLHNLAHQDHTPQYQIHPRRDLWETRAGV	253304	254223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_253909_254089
876096	contig_8814_pilon	+	2877	2	Intergenic	novelGene_167754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229309	232928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_+_229337_230078
876097	contig_9471_pilon	-	3435	1	Intergenic	novelGene_21706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAATTCAGCCCAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81026	77591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_77600_81000
876098	contig_2487_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_148464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	645	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAATTAATATGCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142173	143128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_142200_143100
876100	contig_5057_pilon	+	3335	1	Intergenic	novelGene_151506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCCAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366955	370290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_367000_370300
876101	contig_7898_pilon	-	1208	2	Intergenic	novelGene_47582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487531	485697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_486413_487038
876103	contig_3948_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_53422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCATGGAGCTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1954961	1956321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1955000_1956300
876104	contig_12622_pilon	-	1717	3	Intergenic	novelGene_5824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	540	869	420359	420030	TRUE	35	AGCAGCCAGATAACATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSWGKKTSALESWCDEPKRPEGFLAISVHFQERPPACLLGTLFSFFVPLTARRRALVALWLSTQLLTKTSGVQTHQPLHGWKMWQSASIKIYSLGNPTGQFYSVLQVG	420898	412098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_412135_413371_413486_419331
876105	contig_5549_pilon	+	3460	17	Intergenic	novelGene_81627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	85.9342044822666	36	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	485	2449	396586	433091	FALSE	35	ATTTATGAATCAGTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCRGGLNLLYKGLSRPIGRTTKPVWGSLSRSLVLSPQWRIPEFNSFVARTNTCGELRSSHLGQEVTLCGWIQYRRQNIFLVLRDFHGLVQVVIPQEESAASLKKMLCEAPVESVVQVSGTVISRPPGQENPKMPTGEIEIKVKTAELLNSCKKLPFEIKDFVKKTEALRLQYRYLDLRSSQMQYNLRLRSQTVMKMREYLCNLHGFVDVETPTLFKKTPGGAKEFVVPSREPGKFYSLPQSPQQFKQLLMVGGLDRYFQVARCYRDEGSRPDRQPEFTQIDIEMSFVDQTGIQSLIEGLLQYSWPKDKDPVVVPFPSMTFAEAVSTYGTDKPDTRFGMKIVDISDVFRNTKIGFLQDVLSKPQGTIKAICIPEGAKYLQRKDIETIRKFAGEQFNQEVLPLLLKANRNWNSPVAKSIMEEERLGLIRLLEIQEEDTVLLTAGEHKKTCSLLGKLRLECADLLEARGVVLRDPSLFSFLWVVDFPLFLPKEENPGELESAHHPFTAPHPSDIHLLYTEPEKVRGQHYDLVLNGNEIGGGSIRIHNAELQHYILASLLKEDVKLLSHLLQALDYGAPPHGGIALGLDRLICLVTGAASIRDVIAFPKSFQGHDLMSNAPDYIPPEDLKPYHIQISRPTDSEAEKSSLNHPAHPES	396101	434102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_396713_398464_398565_400134_400202_402804_402907_403311_403408_405061_405186_405885_405933_406652_406760_407559_407630_408345_408526_409516_409625_411662_411726_421104_421258_425448_425668_425883_425995_432105_432182_432876
876106	contig_10451_pilon	+	900	2	Intergenic	novelGene_138311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGTGTGCTTTGGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152349	153683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_152824_153257
876107	contig_7629_pilon	+	3218	1	Intergenic	novelGene_153573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGTGGCCCCCTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308543	311761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_308500_311800
876108	contig_12644_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_44564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCGCCAGGGGCGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1998917	1996609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1996600_1998900
876109	contig_15760_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_131063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGAGATATCCTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427102	429554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_427100_429600
876110	contig_4832_pilon	-	2152	10	Intergenic	novelGene_163400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	73.8353189265656	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	231	1793	329835	297657	FALSE	15	CTTTTGCCTATGTGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTFNPRECKLSKQEGQSYGFFLRIEKDTDGHLVRVVEKGSPAEEAGLQDGDRVLRINGVFVDKEEHMQVVDLVRKSGNSVTLLVLDGDSYESAIKKQVDLKELGQSQEPGLSNKEPPAVRNGETETWTQPRLCYLVKEGNSYGFSLKTVQGKKGVYMTDITPQGVAMKAGVLADDHLIEVNGENVENASHEEVVEKVKKSGSRVVFLLVDKETDKRYSEQKIQFKRETTSLKLLPHQPRVVEMKKGSDGYGFYLRDGPMQKGGVGQIIKDIDSGSPAEEAGLKNNDLLVAVNGESVEALDHDSVVEMIRKGGDKTSLLVIDKETDNMYRLAHFSPFLYYQSQELPNDSVKEVPATTPAPLEVTSSDTAEEVDQKPKLCRLVKGENGYGFHLNAIQDLPGSFAKEVQKGSPADLAGLEDEDIIIEVNGVNVQDEPYEKVVDRIQSSGKNVILLVCGKKAYDYFQAKKIPIVASMADPLDAPPDSKEKTLAESEDNSHTAKEQAHSTASHSSSSSEDTIM	371854	297297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_297711_298812_299104_299805_300028_308428_308635_324493_324690_326754_326892_328621_328869_329625_329838_369837_369998_371786
876111	contig_7357_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_36954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTCCTGTGCTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245592	1243029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_1243000_1245600
876112	contig_4364_pilon	+	1564	7	Intergenic	novelGene_152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	33.8969025133566	235	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	209	583	1221901	1222950	TRUE	20	CTCATCGTCACGAGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPEELRRKVKELASAVRNSKYLVVYTGAGISTAASIPDYRGPNGVWTLLQKGRSVSATDLSEADPTLTHMSIACLHEQKLVRHVVSQNCDGLHLRSGLPRTAISELHGNMYIEVCTSCIPNREYVRVFDVTERTALHRHQTGRACHRCGAQLRDTIVHFGERGTLGQPLNWEAATAAASKADTILCLGSSLKV	1219875	1225022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1219973_1221672_1221744_1221860_1221934_1222412_1222512_1222707_1223184_1223345_1223453_1224381
876113	contig_9995_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_47750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAGCCTGGCGATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630095	628319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_628300_630100
876114	contig_5797_pilon	-	3254	1	Intergenic	novelGene_56936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGAGGTATGAGGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280792	277538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_277500_280800
876115	contig_13051_pilon	-	2899	7	Intergenic	novelGene_140119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	12.6414222125343	72	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	194	2287	368746	338960	FALSE	20	GTATCATGATGTGCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVESAGPLLKALVGLVNDESPEVQAQCDKVLRHFADQKVVVGNRAFADILSENLHSLATSLPRLMNSQDDQGKFSTLSLLLGYLKLLGPKVNFILNSVAHLQRLSKALIQVLELDVAGIKVVEERCWNSDDLSASPKASAARPWNQIQRRYFRFFTDERIFLLLRQICQLLGFYGNLYLLVDHFMELYRESVVYRKQASMIVNELVAGAAGLEVEDLHKKHIQTSPEELREIVTSVLEEYTSQENWYLVTCIEAEEMGEELTMKQSSLQAITSNAHTCQVTSSPALSKPSPTVCSMNSNIWQICIQLEGIGHFAYALGNDFRLLLMSALYPVLEKAGDQTLLISQAATSTMMDMCHACGYDSLQHLINQNSDYLVNGISLNLRHLAQHPHTPKVLEVMLRNSDASLLPLVADVVQDVLATLDQFYDKRATSFVSVLHALLAALAQWFPDRRQLQEQSLGKEGSHLSQRPATLQKGLENTTTAKDIEQFLLNYLKEKDVADGNVLDFDSEEEEPSVPPEVGKSDTRPDVEPPLPLQIQIAKDVMERCIHLLSDKNLKIRLKVLDVLDLCVVVLQSHKNQLLPLAHRAWPSLVHRLTNDDPLAVLRAFKVLRTLGGKCGDFLRSRFCKAVLPKLAGSLVTQAPISARAGPVYSHTLAFKLQLAVLQGLGPLCESLDLGEGDLNKVADACLIYLSAKQPVKLQEAARSVFLHLMKVDPDSTWLLLNELYCPEQFTPPHPSLCPVQLRGGNGAAEPIHSQCAALT	368939	338347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_339132_351608_351697_351984_352190_354180_354322_359248_359398_362781_362983_367608
876116	contig_6102_pilon	+	2953	14	Intergenic	novelGene_32071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_13	118.18769547185	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	156	1379	727522	775956	TRUE	25	GCTCCCACCTACCCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSVTSRPGIPTFGYNKNNKKPYVSLAQQMAPPSPSNSNPSSSSGSNGNDQLSKTNLYIRGLQPGTTDQDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPSAAQKAVTALKASGVQAQMAKQQEQDPTNLYISNLPLSMDEQELEGMLKPFGQVISTRILRDTSGTSRGVGFARMESTEKCEAIITHFNGKYIKTPPGVPAPSDPLLCKFADGGPKKRQNQGKFVQNGRAWPRNGDMSGMALTYDPTTALQNGFYPAPYNITPNRMLAQSALSPYLPSPMSSYQRVTQTSPLHVPNASWMHHQSYLMQPSGSVLTPGMDHPLSLQPASMMGPLTQQLGHLSLSSPGAYMPTAAAMQGAYISQYTPVPSSSVSVEESSGQQTQVTVDTPSDHGIYSFQFNK	727366	778276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_727588_750009_750177_761458_761518_762418_762511_763896_764055_767616_767697_767829_767940_768210_768258_770262_770357_774252_774331_774670_774782_775401_775483_775875_775963_776708
876117	contig_12038_pilon	-	3338	1	Intergenic	novelGene_165819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2675	3022	429157	428810	NA	25	GGACTGAACCTGCAGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGSAWCQSTPGGARQPCAACSQMEKCNTRPKMALSIARRWCSVTAQPHPEKWSAQMVELCILLGADRPPPGVLYVLFGSCNTSWEGDALPRYPHPRSFPSLVARTRRKRPRSLV	431831	428493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_-_428500_431800
876118	contig_4496_pilon	+	3998	1	Intergenic	novelGene_66630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAGAAAGATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622329	626327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_622300_626300
876119	contig_13740_pilon	+	2522	7	Intergenic	novelGene_34736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	101.329084340743	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	149	754	321880	356270	FALSE	60	ACATTAAACATGAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPEQQKEEFVSVWVRDPRIQKEDFWHSYIDYEICIHTNSMCFTMKTSCVRRRYREFVWLRQRLQSNALLVQLPELPSKNLFFNMNNRQHVDQRRQGLEDFLRKVLQNALLLSDSSLHLFLQSHLNSEDIEACVSGQTKYSVEEAIHKFALMNRRFPEEEEEGKRENDIDYDSESSSSGLGHSSDDSGSHGCKTSTALQES	245113	358038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_245239_321856_321904_342727_342815_346415_346517_346886_346986_355528_355742_356188
876120	contig_9480_pilon	-	2394	8	Intergenic	novelGene_177206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.73619909446343	64	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	243	1265	374488	301209	FALSE	30	ATTTACTTCTAAAGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADDSGVSLTSQVSRSAPSGKECAVNGAPAILSTYTIQHYDEVSQPVPGRAGDQAADSSTGSVQLDVRSNKAPGNKAPSENMALPVAAAAGPGPDKTSGQTPAEAEATSASWGPVPLPTESRGAAPSKRKDTSFFDKLFKVDKGHEEAPVDSQPETQRAERQEAVEIAGLSSASDDVPAEQDLVDSKEKEEQEITTLSSSVPEAPEELVIAKENPQATVTTENNNSIMSFFKTLAFKVSPNEAEPKKDPQDTGAEKSPPTAADPTSDKANFIPQETQGAAKNPKGSNPPGHVPSAASPEMAKEGTKEKAGPTSLPLGKLFWKKTSDSTEKASTPPEPEPELATAGQKGREGSSKDKKSPAEMSKQKSNKQEAKEPAPSVEQCVVEVDSLQNGDKPQKKTQEGAAVPWGLPEGPGTKADVGR	396491	300079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9480_pilon_-_301235_308901_309173_338166_338380_347684_347739_348683_348843_374188_374605_396033_396113_396444
876121	contig_9185_pilon	+	2629	1	Intergenic	novelGene_166901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1305	1769	306814	307278	NA	65	AAGAAATGTGAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYRFNAILIKILAAFFTEMEKLILNFTWEGKSPQTAKVILKKIKVGALTLPNFKTYYTATVIKMVWYWFSDRHIDQWNRTEIPEINLYIYGQLIFDKVVKSIQWGRISLFNKWCWQNWISTCRKMKQNLYHFYQKSKKTTYRLGKNLREPHSR	305509	308138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_305500_308100
876122	contig_7695_pilon	-	2698	2	Intergenic	novelGene_41690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	869	1240	1130876	1130505	FALSE	25	GAACTGCCAACCTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVVVEAAKSQLPGSGVGFSQPTWLQELMTQTSNSNYRVLAHKFAEAGESSHVIGRWSKGLWRPVNPRIGRSDSRHLERLVDHQPDTKSRCRERASPGHTPRKGVTLVRVGLEYMLFWKSGT	1134207	1129046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1131269_1133731
876124	contig_5918_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_99514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGAGCTTCCATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507984	509682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_508000_509700
876125	contig_253_pilon	+	1013	1	Intergenic	novelGene_129754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	3	332	701682	702011	NA	35	CGCACAGACGTGCACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWQRGLCCYHFGRVWSSLSSGLAPSSPPPTGLRGEESLRLGYRDRPGRLGLQDQKAGAVLSLPLQRGAECKCAVYCFSALATGCCYGRLLIHLNIDPPKISDLSFFFFF	701679	702692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_701700_702700
876126	contig_253_pilon	+	579	1	Intergenic	novelGene_129755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCACGTGGGCAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701832	702411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_701800_702400
876127	contig_9366_pilon	-	1238	10	Intergenic	novelGene_166258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTAATTGACTCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022056	979091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_979237_986836_986966_996450_996572_998921_999054_1001880_1002066_1005404_1005504_1006879_1007019_1007199_1007232_1007331_1007453_1021921
876128	contig_11318_pilon	+	4407	12	Intergenic	novelGene_48166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_11	33.6641163150427	84	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	619	2952	87797	151996	FALSE	20	TGAATGTGGACTGTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQTNPAEKGRNPGLSCQESYACSGTDEAVFECDECCSLQCLRCEEELHRQERLRNHERIRLKPGHIPYCDPCKGPNGHSPGVRQRAAVRCQTCKINLCLECQKRTHSGGNKRRHPVTVYHVTKVQESLEEEEMDEETKRKKMTEKVVSFLLVDENEEIQVTNEEDFIRKLDCKPDQHLKVVSIFGNTGDGKSHTLNHTFFYGREVFKTSPAQESCTVGVWAAYDPVHKVAVIDTEGLLGATVNLSQRTRLLLKVLAISDLVIYRTHADRLHNDLFKFLGDASEAYLKHFTKELKATTARCGLDVPLSTLGPAVIIFHETVHTQLLGSDHPSEVPEKLIQDRFRKLGRFPEAFSSIHYKGTRTYNPPTDFSGLRRALEQQLENNTTRSPRHPGVIFKALKALSDRFSGEIPDDQMAHSSFFPDEYFTCSSLCLSCGAGCKNSMNHGKEGVPHEAKSRCRYSHQYDNRVYTCKACYERGKEVSVVPKTSASTDSPWMGLAKYAWSGYVIECPNCGVVYRSRQYWFGNQDPVDTVVRTEIVHVWPGTDAFLKDNNNAAQRLLDGMNFMAQSVSELSLGPTKAVTSWLTDQIAPAYWRPNSQILSCSKCATSFKDNDTKHHCRACGEGFCDSCSSKTRPVPERGWGPAPVRVCDNCYDARNVQLDVAEAQVDDEGGTLIARKVGEAVQNTLGAVVTAIDIPLGLVKDAARPAYWVPDHEILHCHNCRKEFSIKLSKHHCRACGQGFCDECSHDRRAVPSRGWDHPVRVCFNCNKKPGDL	85857	153451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_86036_87356_88280_119956_120462_125279_125495_142554_142662_145542_145652_146207_146306_146395_146514_148214_148386_149278_149460_150048_150163_151763
876129	contig_7695_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_41582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGAAATTTTTTTGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396100	393632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_393600_396100
876130	contig_19606_pilon	+	1092	5	Intergenic	novelGene_148283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	16.9170771707172	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	996	95	1090	150722	172884	FALSE	25	TGATCTCAAGATCCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKAFEENRYPWQESFENVAVCLPFRCPRCGDHTRFRSLSSLRAHLEFSHSYEERTLLTKCSLFTSLRDTDLVTSSEPLKQGKLQSSGNVVKQKPSYVNLYSISHEHSKDRKPFEVVAERPVSYVQTFTAMDLRADSLDGPRSSPGLPTSDTKAAFEAHVREKFNRMVEAVDRTIEKRIDKLTKELAQKTAELLEVQAAFVQLTQKKQEVQRRERALNRQVDVAVEMIVALRQRLTESEEELLRKDEEVVTFNHFLEAAAEKEVQGKARLQDFIENLLQRVELAEKQLEYYQSQQAAGLCRDITEHVLTDISSNRKPKCLSRGHAHSVCNH	148750	172886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_148833_150709_151465_165111_165293_171874_171913_172850
876131	contig_4315_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_46719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAATTCTGAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69081	71158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_69100_71200
876132	contig_7887_pilon	+	2551	3	Intergenic	novelGene_124855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	134	52	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	154	1005	100083	124513	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQRPSESTHCSPTRKRSSSESTSSTVNGVPSRSPRLGASVDDSVDSLLQRMVQHEDQEPMEKNTDAVVATASAPPSSSPGRSHSKERVLGKPDSLLVPAVPSDSCSNNDISVISDKLPSSCSPHHIKRSVVEAMQRQARKMCNYDKILATKKNLDHVNKILKAKKLQRQARTGNNFVKRRPGRPRKCPLQAVVSMQAFQAAQFVSPELNEEEGDALHLGPDTVTDVIEAVVQSVKLNPEHKKGLKRKSWLLEEQSRKKQKPLPEEEQENNKSFTEAAAVETASPPETPEKPPEPESTLQPVLSLIPREKKTPRPPKKKYQKAGLYSDVYKTTE	84149	126059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_84229_100008_100748_124326
876133	contig_13680_pilon	+	3893	2	Intergenic	novelGene_149575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	0	70	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAGAAAAGAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266083	271394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_269193_270610
876134	scaffold_13505_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_111394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	94	555	190804	191265	NA	45	AAATTATTGGCATGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSWNPGCLLTGYKLASTVVAPQFPHFESGFVGGRQSYLQWTPWQSEVRGYTSAVSHPRDPLYFFPQVFKSRTPPEAIALCSSLLEYTPSSRLSPLEACAHSFFDELRCPGTQLPNNRSLPPLFNFSPGGEGAAWDPKIVEKSLVVKTGVGS	190710	192876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_190700_192900
876135	contig_1009_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_121764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1261	1596	294835	294500	NA	55	AATACGTAACACATAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWRLPRLSHVIHKQHTTTIQFLQSRGREQQYLCRGGTKANSQEPSSTPIGGIKQQNPRKLTLELYPGSLSEGIGSAPVSGAGSFSEDTWIRLGWWREKGWLRGKADSQLR	296095	294086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_294100_296100
876136	contig_13945_pilon	+	2805	1	Intergenic	novelGene_173451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTTTGAAAGAAACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48595	51400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_48600_51400
876137	contig_5125_pilon	-	1195	3	Intergenic	novelGene_43403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	565.5	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26401	23060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_23313_24803_25670_26324
876138	contig_10331_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_54162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATTCATTTATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505025	507086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_505000_507100
876139	contig_7707_pilon	-	2585	9	Intergenic	novelGene_72135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	52.1122586346054	445	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	35	883	165221	97196	FALSE	50	CTAAAATCTCAAAACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRREDMMAKKPPKPAPRRIFQERLKLTALPLYFEGFLLVKRPEYQEFKHYWTELRGTTLFFYTDKKSTIYIDKLDIIDLTCLSDQNSTEKNCAKFTLVLPKEEVQLKTENTESGEEWRGFILTVTELSVPQHVSLLPGQVIRLHEVLEREKKRRIETERLPSTSVEKEKETTEDYVDLLNPMPACFYTVSRKEATEMLEEKPSWGNMILRPGSDSRNYSITIRQETEIKHYKVTSIGKNYTIELEKPVTLPNLFSVIDYFVKETRGSLRPFIYSTDDKVVV	165255	95493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_97204_122192_122290_132319_132381_138299_138429_140066_140240_144963_145021_147676_147791_152032_152105_165083
876140	contig_5965_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_154675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	751	1050	235222	235521	NA	10	GGGGACTGTATGTTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVPSSVMAVEESMVPFRGRSSIKQYMPMKPVKCRYKVLCLADSETDFVTNFDIYCGEKDITNDSSLFLGDCVVLGLCQPWFGTQRLIAFDNFFLHPIN	234471	235580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_234500_235600
876141	contig_15244_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_118055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTATACTACGGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584731	581871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_581900_584700
876142	contig_11978_pilon	+	4058	1	Intergenic	novelGene_62963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAACAGAATCTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128180	1132238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1128200_1132200
876143	contig_6163_pilon	-	1610	10	Intergenic	novelGene_103861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	6.60153367889464	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	160	1275	514256	508435	FALSE	20	GATGTTTCTTGGTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRKVNIIILVLAIALFLLVLHHNFLGLSSLLRNEVSDSGIVGLQPIDFIPNAPRHAVDGSHEEIPVVIAASEDRLGGAIAAINSIQHHTRSNVIFYIVTLNDTVDHLRSWLNSGSLKNIRYKIVNFDTKLLEGKVKEDPDQGDSVKPLIFARFYLPILVPSAKKAIYMDDDVIVQGDILALYNTPLKPGHAAAFSEDCDSTSTKVVIRGAGNQYNYIGYLDYKKERIRKLSMKASTCSFNPGVFVANLTEWKRQNITNQLEKWMKLNVEEGLYSRTLAGSITTPPLLIVFYQQHSTIDPMWNVRHLGSSAGKRYSPQFVKAAKLLHWNGHFKPWGRTASYIDVWEKWYIPDPTGKFSLIRRHVEISNIN	520763	508099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_508626_508765_508879_508972_509140_509470_509584_509737_509823_510060_510179_511969_512184_514021_514121_514240_514295_520642
876144	contig_11003_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_105453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCACCTCTTCAGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441363	443411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_441400_443400
876145	contig_3382_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_124212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTTGATGCATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475468	1473734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1473700_1475500
876146	contig_5571_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_75512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCCCAAAAAAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121086	124719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_123067_124642
876147	contig_10312_pilon	+	2626	1	Intergenic	novelGene_159029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAACCCAGCCAGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544938	547564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_544900_547600
876148	contig_6020_pilon	-	1112	7	Intergenic	novelGene_155560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.550284369783	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	213	803	349599	288790	FALSE	25	AAACTAGGATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVILIEFLPKTQIHTHTHIFFFLFVVHISIHFKTLKISQWAMCKFFVL	349811	288480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_288903_290009_290041_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
876149	contig_13966_pilon	+	3391	2	Intergenic	novelGene_158144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	107	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	432	1244	404853	405665	FALSE	5	GTCTGTTTGGGTGTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHPENYQWENWSLENVATILAHRFPSSYIWVIKCSRMHLHKFSCYDNFVKSNMFGAPEHNTDFGAFKHLYMLLVNAFNLTQNSQLSKKNVNVLNKDSKASNCRSSSSHTTNGCQGEKERTCEKSDESAMSFYPPSLNGASFTLVGFSKGCVVLNQLLFELKEAKKDKNIDAFIKSIRTMYWLDGGHSGGSNTWVTYPEVLKEFAQTEIIVHTHVTPYQVRDPMRSWIGKEHKKFVQILGEFGMQVTSQIHFAKEAPSIENHFRVHEVF	398885	407812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_+_399302_404837
876150	contig_7630_pilon	-	3064	20	Intergenic	novelGene_133631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_19	45.316736954457	90	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	39	2612	357045	337037	FALSE	25	GGTTCTAGGCTCATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFHGNSTVRFTCMEATNLIIIHSRNLNYTSQGHPVTLRGVGGSSPPEIDKTELVVLTDYLVVHLKGDLVVGSQYEMDSEFVGELADDLAGFYRSEYMDGDVKKVVATTQMQATDARKSFPCFDEPAMKAIFNITIVHPKNFTALSNMLPKGPSVPFDGDPTWNVTEFEPTPRMSTYLLAYIVSEFTSVQKETPNNVQISIWARPSATTEGHSNYALNVTGPILDFFSQYYNTSYPLKKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTVAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPSWNLKDLMVVNDVYKVMAVDALASSHPLSSPASEVNTPAQISEQFDTIAYSKGASVLRMLSSFLTEDVFRKGLVSYLHTFAYNNTNYLDLWEHLQKAVDDTPSLNLSTSVRNIMDRWILQMGFPLITVDTNTGTISQKHFLLDPESNVTRPSEFNYLWFVPISSVKNGKEQAQYWLQGTEEAQSALFQTTNDDWVLLNINVTGYYQVNYDDNNWRKIQNQLQSNSSAIPVINRAQIIYDSFNLASAQIVPVTLALNNTLFLIQEKEYMPWQAALSSLNYFKLMFDRSEVYGPMQRYLRRQVQPLFDYFKNVTKNWVERPQTLMEQYNEINAISTACTNEIKECGELALNLFTEWMSHPDNNTIHPNLRSTIYCNAIAQGGEEKWNFAWEQFQKATLVNEADKLRSALACSKEVWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTINSIASNAVGQTLVWDFIRSNWKKLFEDYGGGSFSFSNLIQTVTRRFSTEYELQQLEQFKQDNMDTGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVNQNKEEVLRWFTENSIVS	357083	336584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_337196_341296_341379_341651_341793_343398_343567_343700_343812_344269_344362_348917_349066_350203_350260_350385_350520_351833_351914_352179_352356_354153_354220_354363_354430_354560_354705_354811_354926_355083_355239_355320_355448_355831_355972_356084_356228_356773
876151	contig_9527_pilon	+	1891	1	Intergenic	novelGene_134050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1220	1561	417090	417431	NA	20	TTCTGTAAGCCTTCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKAMGGASLWGGEMRSSVCTVGDVHLTSKQRCQVGSWHIRVWSLGQRYGLERNTWELTSCRLDSKALRKGEITRGMSVDRKEMKTKPPEFQVCRNEEELTKEIEKKQPEREE	415870	417761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_415900_417800
876152	contig_7428_pilon	+	2218	2	Intergenic	novelGene_77677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATGGGCATCCTAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59699	62055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_59752_59889
876153	contig_4461_pilon	-	1315	9	Intergenic	novelGene_177924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	261	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	929	1297	90888	88597	FALSE	25	CCGAACTCGAGATCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSVVSLDSSGLPPNPTVPSHCSLSHTAQPLSTASRVEPPDTNVLQAASVAFLKGQVLTTRGKGLELRTSAGPSRNGTRSRRRFDFRAMAARRREGRLGAVPADLRSVPGFTTRSREGTSR	99585	88578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4461_pilon_-_88820_90742_90899_91603_91716_92615_92730_93944_94067_94642_94719_96263_96371_97607_97743_99333
876154	contig_15105_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_151000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821900	824334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_821900_824300
876155	contig_6871_pilon	+	4069	1	Intergenic	novelGene_21647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1269	1568	715079	715378	NA	55	CTAGAAGACAGATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLSGFSSLKVVGLRPSFPRWKLTRNHLQFPAIWASLACFIRKTCKNHQRESSNKMKSQPFYNLITEVTSHHFCHVLLIRSKSLRSSLHSRGRDYTRV	713810	717879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_713800_717900
876156	contig_8330_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_71946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396702	1394463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1394500_1396700
876157	contig_7361_pilon	-	2295	6	Intergenic	novelGene_163386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	10.0279609093773	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	129	860	329351	309867	FALSE	45	AAATCATTGTAATACCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTISASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKKPKGPALEDFSHLPPEQRRKKLQQRIDELNRELQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMDIHKNEAWLSEVEGKTGGRGERRHSSDINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQHGHHNEFDDEFEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARRQNGEEGYVPTSYIDVTLEKNSKGAVTYI	329479	308431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7361_pilon_-_310046_311473_311623_315606_315702_316075_316209_320343_320454_329285
876158	contig_3942_pilon	-	2550	8	Intergenic	novelGene_128885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	6.55588223176215	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	365	1033	1562889	1559008	FALSE	15	ACTTTTTCTACTGCTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRVVPYAAIQFSAHEEYKRVLGRYYGFCGEDLPPWPRLLAGALAGTTAASLTYPLDLVRARMAVTPKEMYSNIFHVFIRISREEGLKTLYHGFTPTLLGVIPYAGLSFFTYETLKSLHREYSGHRQPYPLERMIFGACAGIIGQSASYPLDVVRRRMQTAGVTGFPRTSIVRTMGTIVRKEGAVRGLYKGLSMNWLKGPIAVGISFTTFDLMQILLHRLQG	1585752	1557490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1559316_1561604_1561757_1562228_1562346_1562797_1562965_1563526_1563553_1564467_1564574_1568209_1568318_1585703
876159	contig_21083_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_58022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTCTACAGCTTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50791	48112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_-_48100_50800
876160	contig_6027_pilon	-	2002	4	Intergenic	novelGene_74457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	646	1017	336838	336333	TRUE	15	CCTTTGTTATGCTTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVIWALLHCGNRASSLSRIFSSLSTGWGRGDSVEALTPPKPGGGGMEAAGGMCGPWGPTREPKPGLFLPWEPGRGGEGWLGWERAGVRIGKDKERGSALGITMGIVTCPMEKGIRGGREGLG	337696	335154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_335823_336015_336687_336820_336952_337164
876161	contig_10297_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_112552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATATCCTGAGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604586	602370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_602400_604600
876162	contig_6689_pilon	+	1926	2	Intergenic	novelGene_175255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_1	0	321	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	434	1276	18204	23358	FALSE	30	TTTAATAAAGGGAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQQQQQLYSSAALLTGERSRLLTCYVQDYLECVESLPHDMQRNVSVLRELDNKYQETLKEIDDVYERYKKEDDLNQKKRLQQHLQRALINSQELGDEKIQIVTQMLELVENRARQMELHSQCFQDPAESERASDKAKVDSSQPERSSRRPRRQRTSESRDLCHMTNGIEDCDDQPPKEKKSKSAKKKKRSKAKQEREASPVEFAIDPNEPTYCLCNQVSYGEMIGCDNEQCPIEWFHFSCVSLTYKPKGKWYCPKCRGDNEKTMDKSTEKTKKDRRSR	17770	24008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6689_pilon_+_18376_22687
876163	contig_15888_pilon	-	1052	10	Intergenic	novelGene_84397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	375.016180720871	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	97	693	49714	38097	TRUE	15	CACCTTCTAACCTTGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQAAGSPSPAWLGQGTRSSWLATSTQRVTPQSLQELPEHLPALGHSAPLQHPAFHI	49810	37657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38562_39335_39355_40759_40831_42626_42774_42847_43021_43145_43222_46483_46515_49706
876164	contig_5286_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_157334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATGCGTATGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495396	496715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_495400_496700
876165	contig_15087_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_37167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACCCAGCACCCACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107703	105676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_105700_107700
876166	contig_14450_pilon	-	3486	1	Intergenic	novelGene_49046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCCATCTCAACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327164	1323678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1323700_1327200
876167	contig_4114_pilon	+	2846	1	Intergenic	novelGene_15595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTACCTACTTTTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250640	253486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_250600_253500
876168	contig_16635_pilon	+	1621	4	Intergenic	novelGene_153137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	230	junction_3	361.69692653749	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	174	560	86080	89848	FALSE	20	GTATGTACTGTGATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGMAFPTKG	53052	90909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_87773_89822
876169	contig_4884_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_63804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAACATCTTACTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262543	264543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_262500_264500
876170	contig_5018_pilon	-	2594	12	Intergenic	novelGene_47173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	620	1231	1560417	1558463	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSISEYFIPFTRMGINLDQMRGQDFLADGLLGQRQPELAGLEGHVLIVVLGPLQHVLDNAVHVRDKPVDPHFQQHHQSAAHVLPHLRVVIHGQGKQVLDEGVNVVHQSLGSVHDELVHTGNGMGPDLGAAVLEELQELGDHDVEGPVEGIAVQKLRRVFADLLQGSKGSLHREGKGDGHGSQFPASAPAGAGCSLSPTSQVL	1563161	1553447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1553540_1554934_1555963_1556044_1556196_1558370_1558698_1558776_1558857_1558932_1559055_1559153_1559276_1560364_1560425_1560521_1560686_1560858_1561016_1562663_1562888_1563094
876171	contig_10003_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_88256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTAAAAAATAGAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746072	743562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_743600_746100
876172	contig_11047_pilon	+	3432	1	Intergenic	novelGene_173952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGATGTGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79237	82669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_79200_82700
876173	contig_18610_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_168059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTATACTCCATAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21449	20541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_-_20500_21400
876174	contig_15353_pilon	+	2286	2	Intergenic	novelGene_151997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0	24	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGTTGTACATCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541693	544848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_543881_544749
876175	contig_5811_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_177401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTAAACTGGGAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36501	37793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5811_pilon_+_36500_37800
876176	contig_11986_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_69251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACATAAAATATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816265	818722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_816300_818700
876177	contig_8330_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_72000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGGGAGAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2113518	2111147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2111100_2113500
876178	contig_16525_pilon	+	457	4	Intergenic	novelGene_133850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAAGGCGGTGGGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178095	181486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_178303_178427_178478_178589_178695_181391
876179	contig_12964_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_131730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACAGGGATTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619629	621249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_619600_621200
876180	contig_5590_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_163031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352738	354889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_352700_354900
876181	contig_10868_pilon	+	4072	1	Intergenic	novelGene_173901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	760	2283	109	2391	499365	501647	NA	35	TACACTTCCCAGCCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQPLYSPVCTNGERFLYLPPPHYVSPHIPSSLASPMRLSTPSASPAIPPLVHCADKSLPWKMGVSPGNPVESHAYPHIQNSKQPRVPSAKAVASGLPGDTALLLPPSPRPSPRVHLPTQPAADTYSEFHKHYARISTSPSVTLSKPYMTVSNEFPTARLSNGKYPKAPEGGEGAQPVPGHARKTAVQDRKDGGSPPLLEKQTVTKDVTDKPLDLSSKVVDVDASKAEHMKKMAPTVLVHSRGGSGLVLSGSELPKETLSPPGNGCAIYRSEIISTAPSSWVVPGPSPNEENNGKSMPLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVVSNVSGSVSSAGRPASASPAPNANADGTKTSRSSMDTTPSVIQHVGQPPTTPAKHSGSTSSKGAKASNPEPSFKANENGLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAISPLSLHGKGPVYPHPVLLPNGSLFPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEISKEEKPERRSRSHERARYEDPTLRTRFSEMLEASNTKLHPEVPTDKNPKPNPSWNQGKTVVKSDKLVYVDLLREEQDTKTDTNVSKPGFAAESVGQSTEPTKPPADPGLQQHRDFIALREELGHISDFNEAYAFKQAPGQSVFSLSKENVPAGTNKENLGLPVATSFLEPTLGGDGPAITFGKTQEEPKPFCVGSAPPSSVDGTPPTYTKDGSDDAESNDGKVLKPKPSKLAKRIANSAGYVGDRFKCVTTELYADSSQLSREQRALQVSPPHPNFNPFTSCQFFNV	499256	503328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_499300_503300
876182	contig_5005_pilon	+	2925	1	Intergenic	novelGene_84329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACAGCAGTCAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532661	535586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_532700_535600
876183	contig_6343_pilon	-	3239	1	Intergenic	novelGene_175945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288642	285403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6343_pilon_-_285400_288600
876184	contig_8286_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_139793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGAGAGACCCAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95036	94065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_-_94100_95000
876185	contig_9706_pilon	+	1919	2	Intergenic	novelGene_21059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732390	734456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_733506_733652
876186	contig_12393_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_147119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAGCTGTGGCAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16651	14095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12393_pilon_-_14100_16700
876187	contig_6724_pilon	-	3137	1	Intergenic	novelGene_167965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGAAGCTGTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255203	252066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_252100_255200
876188	contig_16578_pilon	-	2550	2	Intergenic	novelGene_148676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289293	285469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_285809_287082
876189	contig_1785_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_175099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGATTTGTTTTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390466	392858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_+_390500_392900
876190	contig_19990_pilon	+	3280	1	Intergenic	novelGene_30767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCTACTCAGCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80023	83303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_80000_83300
876191	contig_15897_pilon	+	3254	1	Intergenic	novelGene_49541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAAGATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629713	632967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_629700_633000
876192	contig_7840_pilon	-	2867	1	Intergenic	novelGene_69050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415840	412973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_413000_415800
876193	scaffold_19766_pilon	-	1108	6	Intergenic	novelGene_34384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	114.177756152414	2085	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	204	503	737601	734524	TRUE	70	ACTAAAAAAAAAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSALTQGLERIPDQLGYLVLSEGAVLASSGDLENDEQAASAISELVSTACGFRLHHGINVPFKRLSVVFGEHTLLVTVSGQRVFVVKRQNRVREPIDI	738011	733698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_734035_734254_734622_735124_735243_737002_737084_737598_737761_737967
876194	contig_12042_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_170444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGTATACTCACCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202173	200201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_200200_202200
876195	contig_7171_pilon	+	2617	13	Intergenic	novelGene_101332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	248	junction_4	230.883252725027	240	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	42	1895	1156386	1171702	FALSE	80	AGCCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNCWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKQRDYETATLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQRICDQWDALGSLTHSRREALEKTEKQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADKEREAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDQALLEEQSKQQSNEHLRRQFASQANIVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLDHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKDHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQGDAEFNRIMSVVDPNHSGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQGPDAVLGALDYKSFSTALYGESDL	1156344	1172424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1156416_1158263_1158495_1159643_1159792_1163553_1163705_1166391_1166501_1166701_1166843_1166923_1167107_1167194_1167330_1168339_1168520_1169379_1169527_1170295_1170377_1171269_1171429_1171543
876196	contig_678_pilon	+	1253	3	Intergenic	novelGene_167856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTACCACTGGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573737	585880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_573834_576042_576106_584786
876197	contig_1008_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_121559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATAAAATAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552989	554791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_553000_554800
876198	contig_15732_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_88850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGACTGAATTATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19731	18568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_18600_19700
876199	contig_11543_pilon	+	2949	3	Intergenic	novelGene_175758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	4.5	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGTGCTTCTGTAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204785	211300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11543_pilon_+_204863_208105_208152_208474
876200	contig_9995_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_47798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACTGCTGGAAATGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861073	805918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_807355_861055
876201	contig_3161_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_84522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCAGCTTATGGAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413852	415766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_413900_415800
876202	contig_19735_pilon	+	3169	7	Intergenic	novelGene_167893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	173.795537597744	30	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	1852	3108	177915	191094	FALSE	30	GAATATTGTCAAAGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHVLLYLVKRIYIKKVQKFPEYRVPTDPKIDRKIIRMEQEKAFNMLKKNLMEAGGVLRWYVQLPTQQAHQYHELETPCLSSSPSPFPVSSLEEEENAIRDENCALPSRLHPQVAYKIRELVSQGIEQVYAVRKQLRKFVERELFKPDEVPERHNLSFFPTVNDLKNHIHEVQKSLRNGDIVYNSEIIPATLQWTTDNGNILRETVTVTFAEGNSSGESVTTKVEANQTRSSLFPEPAQRLSSLSSFQPRIFAQLQGLQLQPRFTSPDESPALISVNNHLSSSPSRLLDSLGSTEMNNNSLLLDQSHSFQTDTCLTQNNSTASAMSNPPEPDQNIVTMDQLVEVGDVEDTESLEGSVPQILLGDVQTIPIRIIDSHPTLIEETPEGTVSVSQVKQEPKEPALSVEAKKHLDCKKLFAT	176063	191155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_+_178091_179583_179818_181429_181593_182579_182644_187490_187622_188493_188864_190975
876203	SIRV6	+	654	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	118	11	118	-11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGATGACTATGGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10355	11319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
876204	contig_18607_pilon	+	1389	7	Intergenic	novelGene_175113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	84.1990036890118	29	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	579	1202	277191	293461	TRUE	5	TTTTTGTTTTTCTCCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVDFTLEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASVGEICKLYGVEDHYKHQGRKVRKRAVENLCESNESNQCGKTFGWISILTEHKRVPPEVNPVCLECGKAFMDHSSLKHHFRFYTVRDTYQCKECGGACSCLSHLTTSMRTLTGQKPWKYKVRRKGFVCISPLKNHATIFTGKKLYECNEGGKCFCSFSSFQIRERS	275060	295672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_275410_276961_277194_290349_290477_291573_291635_293028_293530_294243_294350_295659
876205	contig_8198_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_178071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGGACAGAAAAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77029	78980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8198_pilon_+_77000_79000
876206	SIRV4	-	508	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	106	3	-106	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	615	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAAAAACTAACCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
876208	contig_3161_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_84518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTCAGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388004	389825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_388000_389800
876209	contig_12312_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_63976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAATTTATTTTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268932	270211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_268900_270200
876210	contig_17198_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_62414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	694	1005	1117516	1117205	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRVRYQQLLFIRHCPPFSKVVKDPLVLLAEVDPGQLRRQLCGGSQAAVERMIHFGRELQAMSEQLRRECGKGTANKKMLKVSALSLEKLKYVRGALKLFIQH	1118209	1115639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1115600_1118200
876211	contig_9272_pilon	+	1810	4	Intergenic	novelGene_125939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	36.7362975210561	265	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	300	701	422182	432083	FALSE	20	AGATCCAGGCTATTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYMPGTASLIEDIDKKHLVLLRDGRTLIGFLRSIDQFANLVLHQTVERIHVGKKYGDIPRGIFVVRGENVVLLGEIDLEKESDTPLQQVSIEEILEEQRVEQQTKLEAEKLKVQALKDRGLSIPRADTLDEY	421882	433192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_422228_426318_426388_427642_427759_431912
876212	contig_13421_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_166805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCCAGGTGATTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177464	179544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_177500_179500
876213	contig_9883_pilon	-	2733	1	Intergenic	novelGene_87596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGCTATGCCCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103123	100390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_100400_103100
876214	contig_8475_pilon	+	1974	3	Intergenic	novelGene_171095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGTCGCGCTCGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9491	20008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8475_pilon_+_11334_14031_14134_19978
876215	contig_4156_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_88091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTGTGCCATTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248452	245660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_245700_248500
876216	contig_16110_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_126801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCACATATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109756	108801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_108800_109800
876217	contig_5918_pilon	+	1671	2	Intergenic	novelGene_99480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGCAGCCACCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162703	165637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_163698_164960
876218	contig_2878_pilon	-	2965	7	Intergenic	novelGene_176494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236758	105173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2878_pilon_-_105807_169943_170124_182578_182604_208699_208793_218341_218421_221765_221821_234858
876219	contig_11538_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_152308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAACTTTCCAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280076	277258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_277300_280100
876220	contig_1551_pilon	+	3197	2	Intergenic	novelGene_173419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	625	1185	394101	395939	FALSE	10	TTTCCCCCCTTGAGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAYGALPALSGQASEEQGKIIQVTVKEEDHIWDQGSCLQRNLSHIREFSRQRFRQFCYQETPGPREALSQLRKLCCQWLSPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHNPESGEEVVTLLEDLERELDEPRQQKVSKQRGLQAPQKHAGDKISASEHKRRKALTIEEKLEIIEHFERTL	393476	397951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_394521_395798
876221	contig_11126_pilon	+	1586	12	Intergenic	novelGene_138106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.8864092734452	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	97	927	118054	145090	TRUE	65	AAAAAAATTAAGATAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFFLHSSHTDLPSNATQIPGCKANLSNCGQEEMAAGETQLYAKVSNKLKSRSTSLLLEPLLALGFPAHTALKALAATGRKTAEEALDWLHCHCNDPSLDDPIPQEYGLFLCPTGPLLEKLQEFWRESRRQCAKNKAHEIFPHVTLCDFFTCEDHKVECLYEALKRAGDRILGSFPSVIPLVLHSSVSYLGFFIHDSSADIIREFAMSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQSKDDSVSVNNNDNCCHFPAQILAWDMKRLFLFSRP	117717	187436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_117769_118008_118167_121480_121535_133242_133430_137634_137834_143405_143576_144982_145293_158694_158822_162964_163065_167736_167860_169695_169789_187422
876222	contig_19402_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_80752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_6	2038.68277871331	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	10	1224	23458	65521	FALSE	30	GAACAACTGGCCTGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRFSVSFSTERNQGSLKKCLIPGLRTGTYR	23448	66020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_65433
876223	contig_14970_pilon	-	1315	6	Intergenic	novelGene_45049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111.144950402616	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	389	979	291083	191187	FALSE	65	ACATAAATGCAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLKDLKQQLKRILAPTGKIYLQIHEELGFPSKGQISSV	315786	190850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_191299_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
876224	contig_3068_pilon	+	2676	2	Intergenic	novelGene_137637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	27	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACAAAAAACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252390	255298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_254143_254374
876225	contig_5018_pilon	-	2340	13	Intergenic	novelGene_46950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.7583406023319	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	426	1649	312555	301797	FALSE	25	TATAGCTACTGTAGCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCQFYYRRCQEEAWTLLEPELKSIPLTPVEIQDLELATGYEMSGRCRMQVEEDLWGEWSPILSFQTPPSAPKDMWVSGNLCGTTAEQEALLLWKAPGPCVQMSYRVQFRVEGRELLQEGIPCCNSSIPAQAEWAGVSAVNARNQEIFTNLSLACSGSAPHDVAVSSTSDSKELLVTWQQGAGELWEHVVDWARDGDPPENLSWVWLPPGNLSVLLPGNFEKGVPYQIRVTTVSPWGLSPAPSVWGFVEELAPLMGPELWRLQDAPSGIPTIAWGEVPRHQLRGHLTHYTLCVKSETRSLVCLNVSGGTQNVTLPNLHWGTCELWMTASTIAGQGPPGPSIQLHLPDNTLKWKVLPGVLLLCGVPLMGLVLATSGRCVHLWHKVLPHWRRGSRPSPLWTCPSWRCRK	315536	301105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_301857_302026_302064_302239_302328_302728_302855_305684_305844_305914_306017_308073_308257_308356_308541_309845_309920_310009_310170_312504_312621_312747_313051_315479
876226	contig_4604_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_19125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTCAATATTTTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305738	307467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_305700_307500
876227	contig_6340_pilon	-	3017	10	Intergenic	novelGene_176637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	35.3682566752577	38	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	388	1521	107119	104625	FALSE	15	CAGTGTGGACTCCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICTQNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSMIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSECPSGQSCVPILDDQCFVRPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDSCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPVKSKTDFLVPLLSSVLTVAWICCLVTAFYWCVRKRRKPSSHTHSASEDTTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYENKNSKMSKIRTHNSEVEEDDVDKHQQKARFAKRPAYTLVDREEKPPQRHAGKAPKLDKQTGQQRPGKCPKLEPDGVHRIADSGCCRLADTTLRVVVKGTLGL	110883	103128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6340_pilon_-_105155_106029_106181_106358_106491_106707_106942_107032_107143_107991_108106_109497_109584_110066_110095_110587_110705_110864
876228	contig_17753_pilon	+	2914	2	Intergenic	novelGene_105039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCAGTAAAATCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31544	36555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_32828_34924
876229	contig_5965_pilon	+	2624	1	Intergenic	novelGene_154672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTGTGTCTTGTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229272	231896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_229300_231900
876230	contig_3978_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_173862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	268	729	42793	42332	NA	25	ACTACCAGGGCCCTGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAAHFWLQNHGLWAPAHTDTPSVVNRGGASSVLPSPQSDGFLSAPLFLSASRLMGPSGGFFFSLVGLYRSQIGHILPLISLLLGLCFSWYYKGINFPHLTSPSIAQVTDILISFWSRFLSIGLLQIAPAAITVYSLPTSWRLMLVITTMYI	43060	40549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3978_pilon_-_40500_43100
876231	contig_15893_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_128505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGCTGCTGTTCTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40480	37975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_38000_40500
876232	contig_7707_pilon	+	3155	1	Intergenic	novelGene_72174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTGAAACTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531514	534669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_531500_534700
876233	contig_15839_pilon	+	3983	1	Intergenic	novelGene_136412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTACTTATAATTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74515	78498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_+_74500_78500
876234	contig_2093_pilon	+	1271	2	Intergenic	novelGene_152994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCTCAGATCCCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390916	1467896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1391206_1466914
876235	scaffold_16539_pilon	-	2663	7	Intergenic	novelGene_68322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	7.63216876123687	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	549	1397	165256	153849	FALSE	5	GCTTTGTGGACTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFRKHYPWVQLSGHAGNFQAGEDGRILKRFCQCEQRSLEQLMSDPLRPFVPAYYGIVEQDGQTFNQMEDLLAEFEGPSIMDCKMGSRTYLEEELVKARERPRPRKDMYEKMVAVDPGAPTPEEHAQGAVTKPRYMQWRETMSSTSTLGFRIEGIKKADGTCNTNFKKTQELEQVTKVLEDFVDRDRRILKKYVARLEELREALEKSPFFKTHEVVGSSLLFVHDHTGLAKVWMIDFGKTVALPDHQTLSHRLPWAEGNHEDGYLWGLDNMIRLLQGLAQS	170969	152582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_154053_156038_156111_157009_157112_159448_159654_160576_160791_165204_165305_170469
876236	contig_7898_pilon	+	752	2	Intergenic	novelGene_47572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	259	420	484224	484385	TRUE	20	GAATTGAATTCTTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQNGGGGWVTGLWAAASVPATARAAYGEQRSRRGGLRYCGWGRRGGSQPSLGEAGRNRDLGLRPWGETAGASHKSGLSGCVLPAARMWKTLTYFVALPGVGLSMLNVFLKSHHGEEERPEFIAYPHLRIRSKVRPWRLF	483965	487531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_484454_487267
876238	contig_6361_pilon	-	1306	2	Intergenic	novelGene_23921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAAAAATAAAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241360	236920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_237671_240804
876239	contig_5023_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_7129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAAATTGTTTCCTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324160	322091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_322100_324200
876240	contig_489_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_165712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCCAGGTCTTCAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230236	228086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_489_pilon_-_228100_230200
876241	contig_11428_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_138506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAGTGGAAAAGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205886	207578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_205900_207600
876242	contig_6440_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_161668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	680	1078	49160	48762	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGYQIHMAVAGEEKDGGPPPLSVAKPCPPFEAGPVFSAPLLVGLENDAATVENSLVVPQKFKQNYHMTQEFHLKSRVSSRYLYTNVYCSNSQKVEKNSTDKWINKMWYIHTIKYYSAINRNEVLIMLQHE	49839	47991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_48000_49800
876244	contig_13481_pilon	+	2633	1	Intergenic	novelGene_119364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCAAAACTTCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459889	462522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_459900_462500
876245	contig_4924_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_84636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTTGTGTGTAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59253	57754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_57800_59300
876246	contig_8865_pilon	+	3249	1	Intergenic	novelGene_164462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTTAGGGGGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416028	419277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_416000_419300
876247	contig_12964_pilon	+	1584	3	Intergenic	novelGene_131650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	758	1087	101970	102299	FALSE	90	AAGACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETRLRATGNEHVPWEQWYRQHCPVREASLLLICVLCCCGLGLGTGVSEATSCGLQPAQQPPPLGQLSQATDSGGTPGPALPRGQRTLLNSGTRRISSSHPTATPDFI	90076	102796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_90352_100410_100482_101558
876248	contig_3942_pilon	-	2796	14	Intergenic	novelGene_128853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	60	332	1427236	1426964	TRUE	0	GCTCCGGCGCCGTCTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPQFNKCSGAHAGHRPTAMGSRLPEGRSPAGRYLGQVWGMKSPGRCPTTWGSGKRCVLGAPTSRAAHPADLRKGWALPAGAFPASSWPRCGPGKARSQRAQPDPSLLC	1427295	1408729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1408774_1411368_1411536_1415919_1416022_1416886_1417113_1418077_1418206_1418442_1418540_1419425_1419552_1421497_1421867_1423250_1423366_1424120_1424300_1424663_1424770_1425212_1425361_1425979_1426107_1426433
876249	contig_13744_pilon	-	2439	1	Intergenic	novelGene_77162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	597	1007	308703	308293	NA	25	TCTATGTGTACAATTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKPNQTSCHLVDSNSGRPKVFRRRTALHRVVNGRFFKSRSQAFLPRCLWSGSELPTFQLTAKHLTLCTTQGLCSCCFCCCAVESIPTHSDPTGQSRAAPRGFLSCHLYGSRPTCVVESFAATRAKLSVGKEKKM	309299	306860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_306900_309300
876250	contig_3380_pilon	+	3597	1	Intergenic	novelGene_60111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	1764	2282	428720	429238	NA	65	TTACAAAGGAAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTVVTCGLNRSTELFLKRSMHNYRAFPFYERRKISAARSAGPLRFIIHVTPKVTFLKREWGRPPLQSLHKAQAKFHALSAADKGPPSLTPACPSCLILDLSQKPLPSALNFSTHQTGQVLLQFMCLECLCLLLCLADSLFFRPLFEAFSDYSRPPPFKKHIESNPWHTRL	426956	430553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_427000_430600
876251	contig_6102_pilon	+	3626	1	Intergenic	novelGene_32241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	297	894	2458	3351	1201981	1202874	NA	15	CTCCTATGAAGTTGCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHSGVSVLEVGLTDLAVACQQVHMVPSMLPDQLNVGLQNFLAHLARHGLILPVVILSKSQFILTVVTQLNHLLGCAYLFIGVFKLQIIISEVLQLELIHLPKAWIFGMLTIAQTGVAPSGNVYCIVRSEEAVFTEVSIALNFVRLAGAHAGLDAHADSAQAWLGYRTGNGREGSRGIMVFCLWRQLWQRQAMVSVTGDISLFLFIASSSITGQHIVSVRSKVLPATSEFSKGMGGFCRGTTRGTRVALTAARQGLGHSSALQVREGGVTGPKEVLHAQTLRHFIDDPNIDQVGKQL	1199523	1203149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1199500_1203100
876252	contig_9091_pilon	+	3008	1	Intergenic	novelGene_32431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36232	39240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_36200_39200
876253	contig_2114_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_104257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAATGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450314	447863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_447900_450300
876254	contig_15371_pilon	-	2944	1	Intergenic	novelGene_151456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTGTCCCACATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172546	169602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_169600_172500
876255	contig_2689_pilon	-	1995	6	Intergenic	novelGene_100825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	161.88143809591	1	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	44	469	158549	153572	TRUE	60	ATTCTGTGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSHGNTAVLGCTLMASSSSLNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVCGFGGPYGETVATGAYRAFRVAAAAGHSGAFSGNDNSRTSKLQGGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	158592	143054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135_157251_158528
876256	contig_11498_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_65491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAACAACAGTTCAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24226	23209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_23200_24200
876257	contig_1008_pilon	+	1154	4	Intergenic	novelGene_121603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	81.6714284326056	280	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTGGAACATTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750506	775554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_768733_768862_771065_771135_775119
876258	contig_7410_pilon	+	2538	9	Intergenic	novelGene_106060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	31.3226655155656	73	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	32	2062	270469	285592	FALSE	50	AAGTACTATGAAGGAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAGRLQVKMSSSVRRKGKPGKGGGKGSSRGGRGGRSHSSKSHGGGGGGGSGGGGSGNRKASSRIWDEGDDFCIFSEPRRSSRPSSGSVSKGESRPKRRPEAKVPLQTLHMTSENQEKVKALLRDLQEQDADAGSERGISGEEEDDEPDYCDDEQYWSAGREASLVPDPNPLEFTGPALVEPHIPEFTFSPFAVQKLSRYGFNTERCQAALTICGGDVGASLEYLLTQCFSETFGERMKTSEAVAHISLDECVEQRQEEAFALKSICGEKFVERIQNRVWTIGLELEYLASKFCKSKQRGSTKNMQETSLETCKFYLKGNCKFGSKCKFKHEVPPNQIVGRIERSIVDDSHLYEDASFLYELEIRFSKDHKYPYQAPLVAFYSTNKNLPLACRLHISEFLYGKALTSAETSEPVVYSLITLLEEESEIVKLLTNTHHKYSVPPKNFLPAPSGTRMNNLTCCKPVIPNKSFISNQIAEVEKESEPEEEADEDEGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENAKICKQFRIKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILKLLSKHQVLVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLNGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGITHIIVDEVHERTEER	263749	286068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_263775_270462_270690_276212_276372_278639_278829_279157_279994_281543_281723_283194_283317_284680_284877_285463
876259	contig_11709_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_168224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAGTAAAGTCATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71334	72890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_71300_72900
876260	contig_14868_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_150434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAGAGAAGTTTTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99646	101353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_99600_101400
876261	contig_9345_pilon	+	3752	1	Intergenic	novelGene_24576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	3249	3668	919101	919520	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLPAALILGTGNRSPLPCLRVSLKSGRARPGKADSRLPESTDASQAQVCHASFFPQSPLGTDCGCNSAYRPSTSLHSTSVTNTVITGMPDKHRQSTICSTAKLTQKTLVSKFQIPDAISKQYPISFHSIYQSKTQNR	915852	919604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_915900_919600
876262	contig_1154_pilon	+	737	1	Intergenic	novelGene_87062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACCTCTTTTTGGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157429	158166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_157400_158200
876263	contig_3818_pilon	-	2187	4	Intergenic	novelGene_99314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	126.388290596875	126	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	20	481	1127242	1099365	FALSE	45	GTCACATCCAGAATAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRDAPPATSYAPSDVPSGVSFFLSMPFAFFLPELVFGFWVWILVAATQVANPLLQGWVIYVSLTSFLISLMLLLSYLFGFYKKYDSWTVLDSLYHGTTSILYMSAAVLQAHATIISESQDLHNYYINVAASFFAFITALLYILHAFRIYYH	1127261	1097658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1099428_1103682_1103806_1106298_1106467_1127134
876264	contig_6098_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_145459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGAAAAACGCAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14783	12372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_12400_14800
876265	contig_1719_pilon	+	2888	4	Intergenic	novelGene_87307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	15.7973274814304	31	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	2490	2888	415052	422015	FALSE	30	AGACCAGACCTCTATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLKHGSPVKMMESYIAVLTKGICQSEENGSFLSKDFDARKAYLAGSIKDIVSQFGMETVILYTALMLKKRIVVYHPRIEAVQEFTRTLPALVWHRQDWTTLHSYVHLSGDELEALQMCTGYIAGFVDLEVSN	412562	422015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_415200_416229_416342_417989_418091_421977
876266	contig_9706_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_21028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590863	592719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_590900_592700
876267	contig_6217_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_109595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	317	664	280636	280983	NA	20	TTCATATCTTCCCCCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQFYSVTLAGYESESTQQHTTTTKETICPGVHTVQSRQVRCSKSFCIWHCSPLNLSLHTFSELIKPRVSRETKRRQYLNDQEGVYFQARGAMLIFSMIHITGVSWLSVKSENWP	280319	282490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_280300_282500
876268	contig_10962_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_103894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTCCCCAGCTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296275	298291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_296300_298300
876269	contig_12689_pilon	-	2256	3	Intergenic	novelGene_145060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1831	2211	352577	319185	FALSE	35	TAAGGAGTGCGAACCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVARSTDEVMLSRASSCLSSSVSVSKARLFSFLRICVSSWASSSEMKGSLICSWLCPPGLPEGSRGLTRSISPGAACQVEQPFSAGEEALVLLSIKASSKNSIFLLNCTSKIGITSGIFADIKW	354407	319139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_319334_329280_329400_352464
876270	contig_16211_pilon	-	3404	1	Intergenic	novelGene_150069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGAGTTGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92811	89407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_89400_92800
876271	contig_6677_pilon	-	1930	3	Intergenic	novelGene_114178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_2	20.5	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	229	807	473323	471566	FALSE	30	GTAACTAGTGTCATTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVLIPHTPIAVDFWSLRRAGSARLFFLSHIHSDHTVGLSSTWARPLYCSPVTAHLLHRRLQVSKQWIRALEVGESHVLPLDEIGKETMTVTLIDANHCPGSVMFLFEGYFGTILYTGDFRYTPSMLKEPALRLGKQIHTLYLDNTNCNPALILPSQQEATHQIIKLIRKYPQHNIKIGEWFLFLFLTHSQ	473551	470442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_471790_472260_472427_473134
876272	contig_7057_pilon	-	1947	2	Intergenic	novelGene_123182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCAAACCAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238818	236834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_238131_238167
876273	contig_10377_pilon	-	1194	10	Intergenic	novelGene_115380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.612379191081	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	139	483	256858	240350	TRUE	40	ACAAAGGCTACCCCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREDKDTGWALFQSFSGVRIEVGGVTITGHFGHDGGLQSSVWDPFPVHSSEPPMTFHVICSVLHVSESSCSVHHKQLPDEVFDIEIQMSGEIYSGCKNFLINSKRIIIEKWREP	256996	209082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_209211_219443_219613_227485_227749_235975_236010_240232_240353_245158_245257_251691_251748_252535_252616_255018_255112_256843
876274	contig_11281_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_125497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931395	932834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_931400_932800
876275	contig_1008_pilon	-	3509	5	Intergenic	novelGene_121619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	76.4215283804243	1	174	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	20	496	1126350	1118723	TRUE	40	GTAAAAAGTCTTTTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDVGGRSCTDSELLLHPELLSQEFLLLTLEQKNIAVESDVRINKDGLTDLYVQHAIPLPQRDLPKNRWGKTMEERREHHEIERETKRNTAVDGVRKRPLIVFDGSSTSTTIKVKKTENGDNDRLKPPPQEKSFGPCEAATIVPWWNYFSEVKASCS	1126369	1113433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1116428_1118703_1118807_1118952_1119080_1123561_1123729_1126251
876276	contig_14829_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_163819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGCTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111813	114134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_111800_114100
876277	contig_17796_pilon	+	3074	1	Intergenic	novelGene_33782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2648	2968	37892	38212	NA	10	TTGTCTTCTCAGTCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSGLREEMQGNKIHFIHWSVPPWRCVGRMLRLNPASTLCVVPRDRRLLIGISAMLLLALGILLQLPTKLNIALNLPQISRMLIVLMLTHTKLGEPICFRLISHY	35244	38318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_35200_38300
876278	contig_14450_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_49060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTTGCTTTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449503	1447338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1447300_1449500
876279	contig_17158_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_141163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209956	208014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_208000_210000
876280	contig_7293_pilon	+	778	3	Intergenic	novelGene_54249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	5562	25	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGCAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335638	336667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335983_336110_336241_336363
876281	contig_15326_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_157706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCCAGCTCCCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90918	89607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_89600_90900
876282	contig_9177_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_32718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGATTTCAAATGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609602	611921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_609600_611900
876283	contig_6079_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_160096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426388	428343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_426400_428300
876284	contig_5260_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_144403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTTCCCAGCAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469589	467478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_467500_469600
876285	contig_8552_pilon	-	2692	8	Intergenic	novelGene_80103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_7	41.4241376937827	59	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	83	2143	574430	549691	FALSE	15	CTTTTTTCTGATGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGPIKVKTEPTEESGSHHSSSSNEVIEMELPMEDSPQPVPSETSKDAEAEVKIEGSTNSSGITNSAAGVEDLNIVQVAVPDNEKERLSSAEKIKQLREQVNELFSRKFGEAIGVDFPVKVPYRKITFNPGCVVVDGMPAGVAFKAPGYLEISSMRRILDAAEFIKFTVIRPLPGVELSNVGKRKIDQEGRVFQEKWERAYFFVEVQNIPTCLICKQSMSVSKEYNLRRHYQTNHSKHFDQYTEKMRDEKLHELKKGLTEYLLGSTEIVCPEQNQVFANVSPAENAVVQPVEDVAGNLWEKLREKIKSFVAYSIAIDEITDTNNTTQLAIFIRGVDENFDVSEELLDTVPMTGTKSGNEIFLRVEKSLKKFNIDWSKLVSVASTGTPAMINVNDGLVTKLKSKVAMSCKGSNLKSVCCIIHQESLCAQKLKMDHVMDVVVNSVNWICSRGLNHREFTTLLYELDNQYGSLLYHTEIKWLSRGLVLKRFFESLKEIESFMLSKGKPVPQLSSKDWIKDLAFLVDMTMHLNTLNISLQGHSQIVTQMYDLIRAFVAKLCLWETHLARNNLVHFPTLKSVSRDESDGLNYIPKIAGLKTEFQRRLSDFKLYESELTLFSSPFSMKIDSVHEELQMEIIDLQCNTVLKTKYDKVGIPEFYKYLWSSYPKYKHHCAKILSMFGSTYICEQLFSIMKLSKTKYHSQLKDSQWDSVLHIAS	591207	549141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_551295_552868_552898_554566_554751_555842_555927_556820_556899_571703_571767_574411_574469_591163
876286	contig_15787_pilon	+	1227	2	Intergenic	novelGene_143983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATTAGGGGTAAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75841	82347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_75849_81127
876287	contig_4071_pilon	-	899	2	Intergenic	novelGene_151875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	0	1871	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	120	509	133299	131920	FALSE	35	GACAGACTGGTTGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDQELERKTHGLKTSVAEGERKTALEMVQAAGTDRHCVTFVLHEEDHTLGNSLRYMIMKNPEVEFCGYTTTHPSESKINLRIQTRGGLPAVEPFQRGLNELMNVCQHVLDKFEASIKDYKDQKGKQK	133418	131529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_132284_133273
876288	contig_990_pilon	+	2652	1	Intergenic	novelGene_76006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTGTTGGTAAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236318	238970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_236300_239000
876289	contig_13000_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_176933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTCTTTGTATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58096	115298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13000_pilon_+_58288_72566_72859_113711
876290	contig_11115_pilon	+	3882	12	Intergenic	novelGene_102784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2788	3141	68951	70507	TRUE	30	GAGAAGTTGCTGCGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKSARRVMCLDMSVASTMSMTILRRLCRWRLLRFWKMSQLSSCSSLKPTARWWFSSTDSSLYMSASSESGVDKELVGDPRVVHIVDGSREEGSEDLQVREHGIQRRCGQEHMGGL	62797	78486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_65331_68313_68499_68881_69004_69198_69359_69443_69542_70464_70630_70723_70823_71633_71862_74123_74218_77475_77587_77763_77817_78452
876291	contig_20378_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_159562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAAAAACTCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13922	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_11700_13900
876292	contig_11227_pilon	-	2790	7	Intergenic	novelGene_163198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_2	39.4236251785934	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	242	811	297894	285075	TRUE	35	GTGAAGAAAGCTTTATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQRKGLQARILSFEEEEKLKRDQALVSDFKQQKLEKEAQKNWDLFYKRNSTNFFKDRHWTTREFEELRSCREFEDQKLTVLEAGCGVGNCLFPLLEEDLNIFAYACDFSPRAVEYVKQNPSYNTERCKVFQCDLTKDDLLEHVPSESVDVVMLIFVLSAIHPDKMHLVLQNVYKTRKQIQRDEITC	299125	279120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_279476_283267_284832_285014_285114_291670_291842_296562_296698_297669_298045_299034
876293	contig_8597_pilon	-	1828	2	Intergenic	novelGene_158725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAGAAAAAGAAAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136890	133745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_134759_136075
876294	contig_9113_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_68606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGAGTATTGTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388587	389829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_388600_389800
876295	contig_10523_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_120952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCTCCCCCCACTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37903	35947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_35900_37900
876296	contig_14446_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_160714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	1	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACAATTCTGCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284901	288960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14446_pilon_+_285879_287226_287391_288134
876297	contig_4426_pilon	+	2280	5	Intergenic	novelGene_15359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACCCGCGCTATTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69536	171539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_71432_72709_72783_97613_97695_110144_110221_171384
876298	contig_7292_pilon	-	5010	21	Intergenic	novelGene_175358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_8	89.3818214180042	65	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1084	2055	155997	120833	FALSE	50	CGTAAAAATAATGAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDSSADWFSLGCMLFKLLRGHSPFRQHKTKDKHEIDRMTLTVNVELPDTFSPELTSLLEALLQRDVSKRLGCHGGGAQEVKKHCFFQGIDWQHVYLQKYPPPLIPPRGEVNAADAFDIGSFDEEDTKGIKLLDCDQELYKNFPLVISERWQQEVAETVYEAVNADTDKIEARKRAKNKQLGHEEDYALGKDCIMHGYMLKLGNPFLTQWQRRYFYLFPNRLEWRGEGESRQNLLTMEQIVSVEETQIKDKKCILLRIKGAKQFVLQCESDPEFVQWKKELIETFTEAQRLLRRAPKFLNKPRSAVVELSKPPLCHRNSNGL	266466	117877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_120995_122914_123029_125437_125575_128358_128522_133469_133566_134593_134661_135453_135555_136024_136092_155932_156041_161028_161125_163565_163697_166249_166329_171853_171954_176034_176127_178299_178352_180138_180201_184951_185027_187054_187157_202372_202447_241754_241832_266366
876299	contig_8420_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_69361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTCCACCCAGAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137961	139533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_138000_139500
876300	contig_7391_pilon	-	2308	12	Intergenic	novelGene_112145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_8	64.8473095333878	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	616	1986	341704	316481	FALSE	10	TCTCCACCTGTGCACGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLPFDSLIVNLLGISLTVLFTLLLVFIIVPAIFGVSFGIRKLYMKTLLKIFAWATLRMERGAKEKNHQLYKPYTNGIIAKDPTSLEEEIKEIRRSGSTKALDNTPEFELSDIFYFCRKGMETIMDDEVTKRFSAEELESWNLLSRTNYNFQYISLRLTVLWGLGVLIRYCFLLPLRIALAFTGISLLVVGTTMVGYLPNGRFKEFLSKHVHLMCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKYDPQFGDAFWNSSKYGMVTYLLRMMTSWAIVCSVWYLPPMTRETDEDAVQFANRVKSAIARQGGLVDLLWDGGLKREKVKDTFKEEQQKLYSKMIVGNHEDRSRS	342319	316158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316590_322885_322966_323053_323183_326974_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206_330297_331310_331386_332334_332636_332814_332885_341539
876301	contig_8017_pilon	-	4289	8	Intergenic	novelGene_65352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.4801564274256	147	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	53	1243	934867	911261	TRUE	10	GTTCTTGTTTTCATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRKSWLVPTQYILGLFMIGLSTRVDHLLGNGEGRTPDVLALTVTFFLFEFLAATQDIAVDGWALTMLSRENVGYASTCNSVGQTAGYFLGNVLFLALESPDFCNKYLRIQPQPRGIVTLSDFLFFWGTIFLITTTLVALLKRENKEVSLVKEETQGITDTYKLLFSIVKMPAVLTYCLLILTAKIGFSAADAVTGLKLVEEGVPKEHLALLAVPMVPLQIILPLIISRYTAGPQPLNVFYKAMPYRLLLGLEFALLVWWTPKVEHQGGFPIYYYIIVLLSYALHQVTLYSMYVSIMAFNAKVSDPLIGGTYMTLLNTVSNLGGNWPSTVALWLVDPLTVKECVGASNQNCRTPDAVELCKKFGGSCVTALDGYYVESIICVFIGFGWWFFLGPRFKRLQDEGTSSWKCKRSN	934919	905913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_906586_907522_909869_911232_911429_912527_912744_914906_915025_915281_915467_919630_919822_934554
876302	contig_8059_pilon	+	2751	1	Intergenic	novelGene_111123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAGAGAGAAGCTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348837	351588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_348800_351600
876303	contig_5640_pilon	+	3994	1	Intergenic	novelGene_27229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGGATGTTTCACTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5088	9082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_5100_9100
876304	contig_9653_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_48239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTCAAAAGGAAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821129	818195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_818200_821100
876305	contig_16999_pilon	+	2518	2	Intergenic	novelGene_85012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCATACTCTCCTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234903	238333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_235242_236153
876306	contig_12746_pilon	-	3549	11	Intergenic	novelGene_152179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_10	115.290285800669	300	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	14	1105	647602	464391	FALSE	25	TGATGATGACTTTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERTVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYVD	647615	461946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_464505_466127_466174_474494_474644_478967_479046_495152_495281_506077_506130_508585_508706_528706_528827_560218_560394_594460_594564_647595
876307	contig_3123_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_162974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTAACTTGCTGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133164	130289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_130300_133200
876308	contig_6418_pilon	-	2630	1	Intergenic	novelGene_81128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAACATAATTATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111818	109188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_109200_111800
876309	contig_12046_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_83508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCCCAGCCACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028907	1031281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_1028900_1031300
876310	contig_10432_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_171316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGCGCGCGTGCGCGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209003	207183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_-_207200_209000
876311	contig_2892_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_119041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAGAAAAAAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334697	336399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_334700_336400
876312	contig_5718_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_110450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATACAGTCCTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623277	1621360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1621400_1623300
876313	contig_5799_pilon	-	3396	1	Intergenic	novelGene_50280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTTCATGTAGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311265	307869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_307900_311300
876314	contig_10324_pilon	-	3131	6	Intergenic	novelGene_7809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	2798	3130	218541	169064	FALSE	5	GGTTGCCCATGGCGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLVPVTLSVSASISCRTSSKSVNFLDLQCRNSAYSVFEKMSCRMRGRRVTIPEPRGRKSLPTKFSSTELLPALWPPTTAICGRSRWQLWPMELKASCSLLTSGISSSIP	230969	169062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_169212_200102_200176_218429_218582_219689_219893_222703_222804_228515
876315	contig_9363_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_6707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGGGAGAGCGGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289681	1288100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288100_1289700
876316	contig_11846_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_106006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCAACCCCATGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428198	430297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_428200_430300
876317	contig_8712_pilon	-	2505	5	Intergenic	novelGene_58890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	5.3851648071345	56	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	176	1015	1306971	1299726	TRUE	80	AGTAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSLNYPYPQIYWVDSSTSSPLAPPASVLPCPSSVPGRPGQMRPPPPPPPPLPSRPQPPLPPFPPSLLKKRRNHNTGLCLLVMFFMVLVALVGLGLGMFQLFHLQKELAELRESTRQRPIAPSLEKQIGQPSLPSEKREVKKVAHLTGNPNLRSIPLEWEDTYGIALVSGVKYKKGGLVINDTGLYFVYSKVYFRGRSCNNQPLNHKVYMRNSKYPQDLVLMEEMMMNYCTTGQMWARSSYLGAVFNLTIADHLYVNVSELSLVNFEESKTFFGLYKL	1307146	1294987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1295908_1299155_1300121_1301385_1301443_1306020_1306067_1306629
876318	contig_12042_pilon	-	2400	8	Intergenic	novelGene_170435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	33.8176381946053	50	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	6	530	190427	163394	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMGGLRLLAVALTCCWWPHGSQGKTLRGHFSSAAARDAQGQSIGHFEFHGDHALLRVRISNIATAVGKEAKLYLFPAQEWLKLQESSHGYSCSEKLSKALLTMTVNQTEHNLTVSQIPHPQTWHVFYADKYTCKDDFENSQVEDIQFEMMLLNPDAEGNPFDHFSAGESVTPKME	190432	153074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_154487_155465_155544_157074_157267_159636_159795_163363_163414_178308_178510_186908_187068_190282
876319	contig_16846_pilon	+	2742	16	Intergenic	novelGene_82865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	355.47980720898	6	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1315	2034	211075	225378	FALSE	40	AGGAAAGGGTAGCCCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQVGGYYSHTSHNFSFVN	179037	226086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179369_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_205939_206048_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_224514_224620_225189
876320	contig_15114_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_121211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATAGATAGAGCGACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915857	916653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_915900_916700
876321	contig_10372_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_112522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86633	84446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_84400_86600
876322	contig_6102_pilon	+	1616	2	Intergenic	novelGene_31766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3839	junction_1	0	9	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGCATGTTAAGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296426	298519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_297942_298418
876323	contig_6031_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_56778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACTGTAAGGGGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474121	476107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_474100_476100
876324	contig_7471_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_161283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGCTAAAATGGCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20984	18686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_18700_21000
876325	contig_740_pilon	-	1872	5	Intergenic	novelGene_158938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	15.8271917913444	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	578	1477	110057	106027	FALSE	30	CATTTCATTTTGCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQPLVSDCVLARSAPSGVGRTLTTHKAGPHRGGTQAASGLDTAHLPPARSIPATHRPAGRSDVGAMNPAGPIGLLILPLVLLGTALRGAAQAPAGNNAEICLLPLDEGPCRARIPSYYYDRYTQSCRQFMYGGCEGNANNFETLAACDEACWRIEKVPKICRLEVSEKQCEESRQEYFFNLSSMTCEKFLSGGCHNNENRFLDEATCRGFCTPKRSPSFCYSPKDEGLCSANVTRYYFNPRHKICETFTYTGCGGNDNNFVSIQDCKKVCAKALKKKKKKIRKFVLASRSLKLQKKQL	110634	105631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_-_106107_106458_106630_108198_108379_109304_109488_109771
876326	contig_3382_pilon	+	2702	5	Intergenic	novelGene_124227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	57.2581871875106	47	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	110	589	1963153	1966739	FALSE	25	TGCTCAGCAGTAGAGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VESCSTENLELRKKVEVLENTNRTLLQQLQRLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVIALCFAVAFGSIFQGSGPYPSATKMAVPSQHSMPEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPLEEPSSTASPGELGAWDRGSSLLRASGLESRPDVDLPQFILSNETSLDKAVLLELQQHLVSSKLEGNETLKVVQLDRRVNATF	1947078	1968852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1947148_1963112_1963213_1963449_1963577_1964921_1965139_1966663
876327	contig_3382_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_124102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAATAAATACAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674724	672385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_672641_672717
876328	contig_3774_pilon	+	2905	6	Intergenic	novelGene_142051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTCCGCCTATTAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173337	210576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_+_175616_191646_191699_193465_193542_198894_199017_200893_200985_210290
876329	contig_14225_pilon	+	3811	12	Intergenic	novelGene_52734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2708	3040	158854	214828	TRUE	40	AAATATTAACTCTCATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCCETICSALGVGGKTEVSFSVTFPVGPLFGELGPDPGELLLTEDSVTSNIRFLNEVTTFPSFRLSKGLLLLSATFCFNLDRTFKLGSEAVFRRGKSSFASCAPGKVYL	133712	334979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_135891_154600_154822_155301_155512_158755_158879_169017_169132_175367_175503_214769_214888_216232_216360_217342_217495_221790_222033_334549_334613_334851
876330	contig_9931_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_134821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCAAACCCTGGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300355	298185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_298200_300400
876331	contig_16977_pilon	-	3736	1	Intergenic	novelGene_169603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATGTACATCCTGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65291	61555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_-_61600_65300
876332	contig_18919_pilon	-	1574	6	Intergenic	novelGene_156011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	88.837829779886	525	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	708	1166	159997	59358	FALSE	0	GGTGGTGTTCGCTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVLHTPPFGVVPRELKMCGSFRMEAREPLSSEKI	167479	58949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_59460_69111_69255_74958_75061_159885_160216_163872_164022_167139
876333	contig_6102_pilon	-	4550	29	Intergenic	novelGene_32064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_23	26.9099736839981	71	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1204	3615	143	3757	637747	625856	FALSE	15	CTATGCATTGGCCTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGKAAAGVLRSSGSAGILRTRGERTSSLLSPLSPSSLPLCWLAYCCMDLYMMNCELVATCSALGYLEGDTYHKEPDCLESIKDLIRYLRHEDETRDVRQQLGATQILQSDLLPILIQHHQDKPLFDAVVRLMVNLTQPALLCFGSVPKEPSFRHHFLQVLTYLQAYKEAFASEKAFGVLSETLYELLQLGWEERQEEDNLLIERILLLVRNILHVPADPDQEKSIDDDASVHDQLLWAIHLSGLDDLLLFLASSPAEQQWSLHVLEIISLMFRDQNPAQLAGVGQGRVAQERSTDVAELEVLRHREMAEKKTRALQRSNRHSRFGGSYIVQGLKSIGERDVIFHKGLHNLQNYSSDMGKQRRRVPKCRQAARELSSERRSALNVRLFLRDFCSELLENCYNRLMGSVKDYLLREKAQQHDETYYMWALAFFMAFNRAAAFRPGLVSETLSVRTFHFIEQNLTNYYEMMLTDRKEAVSWARRMHLALKAYQELLATLNEMDMSSDEAVRESSRIIKNNIFYVMEYRELFLALFRKFDERCQPRSFLRDLVETTHLFLKMLERFCRSRRNLVVQNKRKKRKKKKKVLDQPVASDNVPCSPEELEAMWPALTEQLQCCAQAPELSLDSVVPFDAASEVPVEEQRAEAMVRIQDCLLAGQAPQALSLLRSAREVWPEGDVFGCQDISPEEEIQLLKQILSAPLPRQQEPEEQGAEEEEEEEEEEEELQVVQVSEKEFSFLDYLRRFACSTVVRAYVLLLRSYKQNSAHTNHCVVKMLHRLAHDLKMEALLFQLSLFCLFNRLLSDPAAGAYKELVTFAKYILAKFFALTAVNPKAFVELLFWKNTAVVREMTEGYGSLDGGSSSRKPTMWSPEEEAQLRELYLAHKDVEGQDVVDAILAHLPTAPRTRKQIIHHLVRLGLADSVKDFQRKGTDIVLWTEDQELELQRLFEEFQDSDDVLGHIMKNITAKRSRARIVDKLMALGLVTERRELYKKRRKKLAPSSLPSGEESLKDFCQEDIKEEESLSEENCEDEEEEGLGVDQAQGSSVLPTEDLGQNLLQEGFSAPLLWLQNCLIRVADDREEDSCSQSVPLVPLTEENEEAMENEQFQQLLRKLGVRPPASGQETFWRIPAKLSPTYLRRVAASLSQRREEEKLHPELELEAPGEQGPDEEHRAQALRALLLARKKKAGLASPGEEGATDGKEQLKAAPKKRQLLDSDEEQEEDEGRNKAPELGASGIQKKKRFHIEDEDESD	655539	625062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_625930_626068_626174_626303_626518_627811_627931_628036_628106_628187_628360_628569_628713_628945_629029_629117_629236_629325_629412_630085_630232_630496_630699_630804_630926_631010_631109_631781_631934_632033_632169_633704_633875_634008_634113_634329_634548_634934_635112_635391_635480_635850_635985_636211_636368_636550_636653_636946_637010_637104_637220_637341_637496_637650_637814_655463
876334	contig_9965_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_176466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	337	1014	616	1629	54171	53158	NA	35	AAGCATTTGTTTATGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKSSRIRSAKPQTTVFRGMIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELGPDGEFHASSKVFRYDPRQNCWLRMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTRDETFYSTERYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSKQVCVFDPSKEGTIEQRTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYNPDTDQWTILASMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLCYNGHYSDSILTFDPEENKWKEDEYPRMPCKLDGLQVCNLHFPEYVLDEVRRCN	54786	53122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9965_pilon_-_53100_54800
876335	contig_3948_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_53425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1112	1447	1972711	1973046	NA	30	CTAATCCATGTGCAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPLPVLPAELSPIPAEVTAVSSRSISAFNLVGRSLVCFSLVTVSSGRAGLGLLCPCTPGSQPSPAQAQSRHPNPLAKGLYTNLMGSYCSGRDSLPLGRMNKIVLPLFSR	1971599	1974074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1971600_1974100
876336	contig_3163_pilon	+	2483	15	Intergenic	novelGene_168068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAATGAAAAGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184102	755189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_+_184487_186062_186281_192726_192901_195906_196016_213782_213924_224545_224729_252521_252674_293649_293732_315537_315659_398244_398318_403560_403731_414063_414156_519527_519730_586466_586707_755047
876337	contig_4845_pilon	+	2655	14	Intergenic	novelGene_53708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	16.5768784579089	104	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	43	1056	974309	980227	TRUE	20	CAGCAAAGGCTTGGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFCRLVGLSVRRGSMEKLRLLGLRYQEYVTRHPAATAQLETAVRGLSYLLAGRFADSHELSELVYSASNLLVLLNDGILRKELQKKLPVSLSQQKLLTWLSVLECVEVFMEMGAAKVWGEVGRWLVIALIQLAKAVLRMFLLIWFKAGLQTSPPIIPLDRDTQARPPDGDPSPGSQEQLYVGKRSSRVVRTLQNTPSLHSRRWGAPQQREGQHQQQQREELSVTPTPLGLQETIAESLYIARPLLHLLSLGLWGQRSWTPWLLSGVVDVTSLSLLSDRKGLTQRERLELRRRTILLLYYLLRSPFYDRFSEAKILFLLQLLADHVPGIGLITRPLMDYLPTWQKIYFYSWG	974266	984315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_974421_974624_974661_975483_975561_975939_976074_976204_976306_977090_977172_977307_977464_977567_977641_977999_978120_979528_979594_980168_980981_982645_983268_983931_984006_984165
876338	contig_3818_pilon	-	2746	2	Intergenic	novelGene_99199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	65	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	154	372	47512	46985	FALSE	15	TCTTGGTGAGTCTACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPSYPLSRSASLSYPDRTDVTSSSPIAGSSVQFGSSILAQYISDFSVRALMDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENCPQFPMDGCATYSENFSEKSELPVVDETTTLLNERNSSLHRTSHESAI	47665	44610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_47183_47491
876339	contig_6489_pilon	-	1328	2	Intergenic	novelGene_128964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	246	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTGGGAGTCCTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395622	392852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_393986_395427
876340	contig_15236_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_141618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTACTTAATATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610136	612390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_610100_612400
876341	contig_6199_pilon	+	3463	1	Intergenic	novelGene_126376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTCACAGCAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258293	261756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_258300_261800
876342	contig_1076_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_101143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACCAATAAAATAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974699	973135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_973100_974700
876343	contig_990_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_76149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAATTCTGACTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1763902	1764933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1763900_1764900
876344	contig_14980_pilon	+	1877	7	Intergenic	novelGene_78219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	16	junction_1	67.8325143275701	190	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	244	1143	257088	288706	FALSE	50	GGAAAACTGTGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLIPTHHFRDIERKPEYLQPEKCIPPPYPGPVGTMWFIRDGCGIACAIVTWFLVLYAEFVVLFVMLIPSRDYVYSVINGIVFNLLAFLALASHCRAMLTDPGAVPKGNATKEFIESLQLKPGQVVYKCPKCCSIKPDRAHHCSVCKRCIRKMDHHCPWVNNCVGENNQKYFVLFTMYIALISLHALIMVGFHFLHCFEEDWTKCSSFSPPTTVILLILLCFEGLLFLIFTSVMFGTQVHSICTDETGIEQLKKEERRWAKKTKWMNMKAVFGHPFSLGWASPFATPDQGKADPYQYVV	240590	289440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_240810_257063_257394_273716_273842_280644_280742_281423_281506_285723_285855_288547
876345	contig_5457_pilon	-	3114	6	Intergenic	novelGene_139003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	43.2823289576705	5	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1666	2571	122504	119330	FALSE	50	ATAAAATTCTAAGCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILEDSDDYQAVKDIINETSDSDATSDNETIYDIKVSDFMETTDYFETTDNEITDISESLCDSESPDHNKSPNDETTDNNESADDNETTNNESANDESPSNNSENSDDNSENPEDNNKNANDNENPNNNNESLDDNDENADGNCNKNLNGNDESPEGGNQNNDGNNQGSGDSDNEGDIEGSDDEDNDGNEGDNEGSDDDGNEGDNEGSDDDDDGDIEGYENDFADPDQNQDNSNNQNDNEDEVEDISEEESEEEEEEGNEEGSEQEGEDSDDEAGGKDSDIGEVLQAQNSWVNLGKWGKPR	126081	118786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_119452_121720_122952_123081_123228_123297_123410_123530_123622_125212
876346	contig_18916_pilon	+	2424	1	Intergenic	novelGene_136884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGTAACAAGCTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84785	87209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_84800_87200
876347	contig_3414_pilon	-	4108	2	Intergenic	novelGene_80981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	525	junction_1	0	36	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAAAAAAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96725	92402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_95212_95426
876348	contig_9653_pilon	+	2928	1	Intergenic	novelGene_48350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACAATTTAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121208	1124136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1121200_1124100
876349	contig_9363_pilon	+	2174	6	Intergenic	novelGene_6698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	6.14491659829489	32	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	156	509	1284441	1284794	TRUE	25	CACCGTGAACACCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQKSSQWLGLRKQSELELPSELQREPEKDFSSVGESATRMGTGVRTESGTATSVEVDDDPGASLFPVRAKRSGLLRNVRGFPGREPPIIMFTNVKDVSRATLGTTPVVNMLINSN	1284285	1288033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1285898_1286482_1286554_1286775_1286893_1286979_1287041_1287116_1287207_1287810
876350	contig_14980_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_78222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTAAAATAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291113	293700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_291100_293700
876351	contig_15559_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_141898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAGTCCCAGCTGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179989	181134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_180000_181100
876352	contig_5958_pilon	-	2393	2	Intergenic	novelGene_140079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1239	1622	104080	102387	FALSE	25	TAAGCCAGTAAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVDSKDPTLGMSCPPPAFVDQAFLQNVKSILTSEGVFILNLVCRDLELKDSVLAGLKLVFPLLYVRQIEGEVNEILFCQLHPEPKLATPELLETAQALEQTLRRLGRGWDDTYVLSDMLKTVKIV	105318	101615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_102662_103971
876353	contig_12142_pilon	+	2440	6	Intergenic	novelGene_147831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_5	5.81033561853358	87	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	6	830	182427	188995	FALSE	85	AAAAAAAGAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDKGSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLKSDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGDTHGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQRDAFLRIDMYAMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPAIKDHWLKHPGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPPKESSI	182421	190605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_182523_183406_183556_185222_185338_186203_186343_186428_186560_188800
876354	contig_7004_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_126438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAAGAGTCTGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71510	69193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_69200_71500
876355	contig_15105_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_150958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAAAAATATGTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442893	444538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_442900_444500
876356	contig_12074_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_53783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATACATTTGTTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76196	74229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_74200_76200
876357	contig_4202_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_147075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTATCAGTCATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187851	186136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_186100_187900
876358	contig_11525_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_171087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGCCACAGAAGAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62636	60977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_61000_62600
876359	contig_7815_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_134418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAACCTGGGGACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945085	942596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_942600_945100
876360	contig_15327_pilon	+	2537	1	Intergenic	novelGene_70546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCCGTACAATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540534	543071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_540500_543100
876361	contig_11751_pilon	+	2627	6	Intergenic	novelGene_150293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	17.8818343578057	87	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTGTAAACAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115266	158395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_116203_117994_118159_118859_118931_121068_121145_144201_144306_157119
876362	contig_12622_pilon	-	2500	1	Intergenic	novelGene_5776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117873	115373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_115400_117900
876363	contig_2312_pilon	+	2165	6	Intergenic	novelGene_160747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	15.0651916682132	216	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	255229	266448	FALSE	25	TAAATTCCTGGCCCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPQDVHVRICNQEIVKFDLEVKALIQDIRDCSGPLSALSELNTKVKEKFQQLRHRIQELEQSAKEQDKESEKQALLQEVENHQKQMLSNQTSWRKANLTCKIAIDNLEKAELLQGGELLRQRKTTKESLAQTSSTITESLMGISRMMSQQVQQSEEAMQTLVNSSRTILDANEEFKSMSGTIQLGRKLITKYNRRELTDKLLIFLALALFLATVLYILKKRLFPFL	255217	267915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_255313_258066_258160_260590_260683_262104_262207_262984_263104_266251
876364	contig_11756_pilon	+	1427	5	Intergenic	novelGene_106028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	15.188400179084	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	248	547	17463	59025	TRUE	50	TGTGTATAAAAATAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLRPRTQADPEIELFVKAGSDGESIGNCPFCQRLFMVLWLKGVKFNVTTVDMTRKPEELKDLAPGTNPPFLVYNKELKTDFIKIEEFLEQTLAPPRF	17215	60698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_+_17520_24801_24912_25037_25164_59018_59201_59993
876365	contig_15120_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_108016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220101	222222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_220100_222200
876366	contig_5499_pilon	+	1041	8	Intergenic	novelGene_57023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.180220257473	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	17	832	818258	840037	FALSE	25	TCTCTGGGTAAAGTTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLLAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	818241	840246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_818274_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
876367	contig_5981_pilon	+	2446	4	Intergenic	novelGene_35533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	97.1836748979306	39	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAAAATTTAACCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289069	298785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_289117_294391_294491_296426_297041_297099
876368	contig_5758_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_119130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCTAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582410	583732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_582400_583700
876369	contig_7078_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_130158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGAGGTCCAGGTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561364	567422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_563433_567318
876370	contig_7345_pilon	-	965	2	Intergenic	novelGene_159173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATTGTTTTAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113621	110365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_110552_112842
876371	contig_9440_pilon	-	1487	5	Intergenic	novelGene_59107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	30	junction_4	400.742747906933	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	16	615	1723142	1700693	FALSE	70	TAACAAGTACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGAGGMITWEWPSFSAAREPGRGSIRPEIGVLAKTFIDQGKLIPDDVMTRLVLHELKHLTQCSWLLDGFPRTVPQAEALDRVYQIDTVINLNVPFEVIKQRLTARWIHPASGRVYNIEFNPPKTVGVDDLTGEPLVQREDDKPETVIKRLKAYEAQTEPVLEYYRKKGVLETFSGTETNKIWPHVYAFLQTKVPQTNQKASVHP	1723157	1699820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375_1706549_1709277_1709398_1723075
876372	contig_15371_pilon	-	3985	1	Intergenic	novelGene_151462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCCTCAGAAGAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184896	180911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_180900_184900
876373	contig_6302_pilon	-	968	10	Intergenic	novelGene_171681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_6	219.217801385846	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	624	343	966	104349	30292	FALSE	50	GTAAGTAACGAAGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQSLTRYSSTEIVEGTRDPLFLTGVTFPSEYPIYEETKIKLTVYDVKDKSHDTVRTSVLPEHKDPPPEVGRSFLGYASFKVGELLKSKEKLLALSLRTSDGGKVVGIIEVSVVKMGEIEDGGADHITTEVQGQKCALVCECTAPESVSGKDNLPFLNAVLKNPVCKLYRFPTSDNKWMRIREQMSESILSFHIPKELISLHIKEDLCRNQEIKELGELSPHWDNLRKNVLSHCDQMVNMYQDILTELSKETGSSFKSSSSKGEKTLEFVPVNLHLQRMHVHSPHLKDALYDVITVGAPAAHFQGFKNGGLRKLLHRFETERR	257637	30289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_30399_46855_46961_47367_47499_75594_75743_90572_90646_104289_104402_147045_147126_158490_158542_255425_255543_257595
876374	contig_10734_pilon	-	3203	1	Intergenic	novelGene_51056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAAATCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422120	418917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_418900_422100
876375	contig_1472_pilon	-	2174	2	Intergenic	novelGene_86132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586012	582059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_584095_585873
876376	contig_10494_pilon	+	2094	13	Intergenic	novelGene_102138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.3758259791675	2	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	270	1787	361794	438185	FALSE	30	TGCTATGGTGTTTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAKLQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRCVVPQTTVILNNDRQNAIVAKMDDPLSNRAPDSLENIISNAVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHNEDGESGSEASDSVSNCGQSGSQNIGNNVTLITLNSEEDYPNGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYGIRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPSSSSYSTSETILSTPQPASEIPQPQPQALHYTLANAQQVQIHQIGEDGQVQVIPQGHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQVLQGAQLIAVASSDPTAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAPVTDHTAAAQTAESLQPSMQPEMQLEHGAIQIQ	360738	438492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_360921_361706_361861_366496_366589_369323_369524_379614_379732_381404_381581_393361_393602_396402_396571_403615_403747_405670_405743_408172_408212_437785_437930_438113
876377	contig_5586_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_143515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAGAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253619	254921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_253600_254900
876378	contig_5023_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_7115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATTTTTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110547	109269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_109300_110500
876379	contig_240_pilon	-	2470	5	Intergenic	novelGene_173802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_4	44.1616349335031	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	994	1218	677888	677664	FALSE	60	AAAGAAAAGAAAAGCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEYICNCSRVGSLDVNRCNQTTGQCECHPGYQGLRCETCQEGFYLNHTYSSGLCLPCDCSPDGALSILCNSSGKCQCKVGVTGSTCNQCQDGYYGFSKSGCLPCQCSNRTASCDALTGACLNCQGNSKGDHCEECKEGFYQSPDAPKECLRCPCSAVTSTGSCIIKLGELEPKCVQCKDGYTGWNCNKCENGYYNSDSICIKCQCHGHVDPVKTPKICKPESGECINCLHNTTGFLCENCLEGYVRDLEGSCIKKEVIVPTPEGSTILVSNASLTTSVPTPVINSTFTPTTLQTIFSVSSSENSTSALADVSWTQFNIIILTVIIIVVVLLMGFVGAVYMYREYQNRKLNAPFWTIELKEDNISFSSYHDSIPNADVSGLLEDDGNEVAPNGQLTLTTPMHNYKA	754086	676411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_678116_679690_679961_694678_694823_713285_713426_753874
876380	contig_13806_pilon	+	3482	1	Intergenic	novelGene_173656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGTTTGAAACCGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94679	98161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_94700_98200
876381	contig_4640_pilon	-	2048	2	Intergenic	novelGene_147963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAGTCCACTGAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129156	125213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_125861_127755
876382	contig_8628_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_164443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCATACGGTCTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662892	664810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_662900_664800
876383	contig_11248_pilon	-	3187	1	Intergenic	novelGene_142532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATGTGGGGGAGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121437	118250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_118200_121400
876384	contig_7452_pilon	+	2713	2	Intergenic	novelGene_109159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGAAGGAAAGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184226	189019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_185342_187421
876385	contig_4301_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_65074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCACCCAGCACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56095	57808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_56100_57800
876386	contig_13188_pilon	+	2570	11	Intergenic	novelGene_176785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	43.1508980207828	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	324	1358	167992	204430	FALSE	5	CTAGCTGTCCGTGTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVETKHPGDPQRGFKTKTRTPEERPKWPQEQVCNGLEQPRKQQRSDLNGPIDNNNIPETKKVASFPSFVAVPGPCEPEDLIDGIIFAANYLGSTQLLSERNPSKNIRMVQAQEAVSRVKASEGDAQTLTEVDLFISTQRIKVLNADTQETMMDHALRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRSASQDCIETTPGAQEGKKQYKMICHVFESEDAQLIAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDIINTQEMYNDDLIHFSNSENCKELQLEKHKGEILGVVVVESGWGSILPTVILANMMNGGPAARSGKLSIGDQIMSINGTSLVGLPLATCQGIIKGLKNQTQVKLNIVSCPPVTTVLIKRPDLKYQLGFSVQNGIICSLMRGGIAERGGVRVGHRIIEINGQSVVATAHEKIVQALSNSVGEIHMKTMPAAMFRLLTGQETPLYI	111841	205642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13188_pilon_+_111937_147846_147928_149087_149125_167881_168028_172396_172484_180208_180395_188039_188220_189260_189474_191089_191210_200326_200468_204358
876387	contig_18364_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_102575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142815	145115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_142800_145100
876388	contig_6175_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_16364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGGTTAGCAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1762911	1764988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1762900_1765000
876389	contig_9293_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_175191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42132	44700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_+_42100_44700
876390	contig_16860_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_155338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGGATTAACCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88970	91933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_89000_91900
876391	contig_21386_pilon	-	3790	1	Intergenic	novelGene_177022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCATCCCTGTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17675	13885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_13900_17700
876392	contig_3960_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_138053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAATAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731164	728923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_728900_731200
876393	contig_12626_pilon	+	2606	5	Intergenic	novelGene_80470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_4	9.85837207656518	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	104	1258	225482	248118	FALSE	55	AAAGGGTATTAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRKKTKNEVSKPAEVQGKYVKKETSPLLRNLMPSFIRHGPTIPRRTDICLPDSNPNAFSASGDGVVSRNQSFLRTPVQRTPHEIMRRESNRLSAPSYLARSLADVPREYGSSQSFLTEVNFAVENGDSSSRFYYSDNFFDGQRRRPLGDRVHEDYRYYEYNHDLFQRMPQNQGRHASGIGRVAATSLGNLTNHNSEDLPLPPGWSVDWTMRGRKYYIDHNTNTTHWSHPLEREGLPPGWERVESSEFGTYYVDHINKKAQYRHPCAPSVPRYDQPPPVTYQPQQTERNQSLLVPANPYHTAEIPDWLQVYARAPVKYDHILKWELFQLADLDTYQGMLKLLFMKELEQIVKMYEAYRYALLAELDNRKHRQQWYAHQHGKNF	225378	249466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_225576_227805_228250_241897_242169_243823_243968_247916
876394	contig_13215_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_145881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAATAATTTTACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29776	27257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_27300_29800
876395	contig_9099_pilon	-	2915	1	Intergenic	novelGene_149925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTAGTAAGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420269	417354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_417400_420300
876396	contig_7707_pilon	-	2191	17	Intergenic	novelGene_72108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAAGGGGGCGGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75858	7328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_7443_14657_14722_38975_39071_39607_39720_42241_42323_53084_53210_54824_54948_59054_59160_60840_60902_61682_61761_62214_62281_64331_64477_66895_66963_67651_67733_69943_70024_73498_73576_75141
876397	contig_7622_pilon	-	2376	7	Intergenic	novelGene_132428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	216.945781757153	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	216	920	282522	274465	FALSE	40	AAACTAATCAATTTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRPSSTRGPEKEKGYATDESTVSSVQGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGM	295572	273008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_274674_276552_276757_280542_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549
876398	contig_9578_pilon	-	2374	1	Intergenic	novelGene_67981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAACTGAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1130917	1128543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1128500_1130900
876399	contig_16072_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_175852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAGAAAATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18948	21681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_+_18900_21700
876400	contig_2093_pilon	+	2617	3	Intergenic	novelGene_152961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	8.5	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTATAAAAATATGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089702	1112961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1089759_1109424_1109822_1110797
876401	contig_343_pilon	-	2650	17	Intergenic	novelGene_163905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTTCTAAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552782	139280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_-_139341_151416_151504_157468_157597_160312_160670_162852_162993_164466_164595_202249_202437_231043_231215_235967_236101_242189_242289_249749_249868_290994_291040_348554_348760_349504_349742_448456_448569_486978_487281_552641
876402	contig_854_pilon	-	527	4	Intergenic	novelGene_36099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1704	junction_1	1106.20462242149	27463	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	67	474	94569	91429	FALSE	5	CGAGCCTCGTGTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACGLVASNVNLKPGECLRMRGEVAPDAKSFVLNLGKDSNNLCLHFNPRFNAHGDVNVIVCNSKDGGAWGAEQRESAFPFQPGSVTEVCISFEEADLSIKLPDGYTFKFPNRLNLETINYLEAEGDFKVKCVAFE	94635	91375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_91576_91870_92043_93127_93208_94560
876403	contig_6958_pilon	-	3129	1	Intergenic	novelGene_70026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTATAATAACTCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836398	833269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_833300_836400
876404	contig_12993_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_136728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCAACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87426	85319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_85300_87400
876405	contig_366_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_51620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCAGCATCTTTAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181006	1184704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1181000_1184700
876406	contig_16999_pilon	+	1606	10	Intergenic	novelGene_85008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	227.72351657218	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	124	993	224081	235155	TRUE	30	TTACATAATTTTAGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLDGDFFVAASLATTLTKVALRYVALVQEKKKQNSFVAEAMLLMATILHLGKSSLPKKPITDDDVDRISLCLKVLSECSPLMNDIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIVSSSGRWKIIILSHGIDGSFKQFMMSLEQQVTEIVWSSVISTLTSWTISSLQLARMLNSVKCGPNLNGKTK	220717	237159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_220823_224062_224291_224437_224618_229831_229977_230975_231096_234168_234234_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
876407	contig_13015_pilon	+	2770	4	Intergenic	novelGene_165547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAGGCTACAAGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345666	369663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_346662_351800_351866_351966_352130_368116
876408	contig_91_pilon	-	4455	14	Intergenic	novelGene_127091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	691	1104	306707	306294	TRUE	15	GGTCATTCAGCAGCGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRVAARTVAALSWGLVSSQVLQARKHREPNHRPEPQCPASGLDSFRNTERGQYLIPESFLTSGGRSFLVPPVLSRLLSDQSLGDRGQVHCSFTSPGCLSCLQGAVDASVPTCVCRAFHSSASLTGCGLSLSPSLE	307397	235481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_235529_236188_236277_237869_238004_274036_274117_279603_279843_283670_283803_288816_288884_289124_289216_291668_291750_291828_291945_292379_292545_298260_298367_298908_299063_304442
876409	contig_5945_pilon	+	2557	1	Intergenic	novelGene_104585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAGCAATCAATCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282208	284765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_282200_284800
876410	contig_9202_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_168950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAGAAACACTTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283755	286250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9202_pilon_+_283800_286200
876411	contig_6503_pilon	+	1866	2	Intergenic	novelGene_145741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	205	708	23663	24166	FALSE	45	ACCCATGGAGAATAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAEPLTALSRWYLYAIHGYFCEVMFTAAWEFVVNFNWKFPGVTSVWALFIYGTSILIVERMYLRLRGRCPLLVRCLIYTFWTYLWEFTTGFILRQFNACPWDYSQFDFDFMGLITLEYAVPWFCGALIMEQFIIRNTLRLRFDKDAEPGEPGSPLALANGHVKTD	13954	25324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_14138_23641
876412	contig_13823_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_145279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAGCTAGTTCCTAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335465	337389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_335500_337400
876413	contig_7057_pilon	-	1320	6	Intergenic	novelGene_123290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	66.8807894690247	650	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTCTACTTTTCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898474	895627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_895950_896981_897084_897306_897359_897464_897540_897628_898000_898076
876414	contig_11399_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_172300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	17	346	45034	44705	NA	25	TGTGTGCATCCACTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMKNTEYTMDCQKSQQVCPGRSTARMLLRKEDGETLSYILWTCYQEDQSLEDITLGKAEDQRKRGRPSTTWIDTVAATMGSNIVMIMRMVQDRAVFHSVVRGITMSWK	45050	44333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11399_pilon_-_44300_45000
876415	contig_6241_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_156452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAAAGGGGCAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606910	607871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_606900_607900
876416	contig_6062_pilon	-	355	3	Intergenic	novelGene_5313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	9	350	816057	814668	FALSE	65	AAAATAAAAAGCATACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGMPSPSSSNTSINVPPSSSMSANSSFILPKETSSSSRLLKSSSLPSESSSGLSLAPFVFFFTLPAKSRSSLPEVKQLSSSNVSIIFSNSSSSTSSILSSSACRFCFSLAIATFL	816065	814662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_814765_815501_815560_815870
876417	contig_9177_pilon	-	3673	1	Intergenic	novelGene_32765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1333320	1329647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1329600_1333300
876418	contig_16109_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_80321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1200	1508	207185	207493	NA	55	GAAATGCTAGAAAAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYKSLYDLISPYLPSHIFHFFLSSLLCAPAILNHLRISHVLFLLRCLPKYHVSLPGIIFLILFTGLPFVQPLVLSSAVTSGKPMTSPVWAGLLRHLHITLK	205985	208094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_206000_208100
876419	contig_6595_pilon	-	3263	12	Intergenic	novelGene_122529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_11	83.7891884384468	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	1355	2779	483032	323899	FALSE	25	CTTATTTTTTGAACATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNKEFALEHGIPISMGYAVAPHHSGVYPVHIQLYEAWKKVWDIQVTSTEEYPHLKPARYRKGFIHNSIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYPGGPQELDKSIRGGELFLTILLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVQSWTNLRLQTLPPVQLARKYFELFPEQKDPLWQNPCDDKRHKDIWSREKTCDHLPKFLVIGPQKTGTTALYLFLLMHPSIISNLPSPKTFEEVQFFNGNNYHKGIDWYMDFFPTPSNITSDFLFEKSANYFHSEEAPKRAASLVPKAKIITILIDPSDRAYSWYQHQRSHEDPAALRFNFYEVITTGHWAPPDLKTLQRRCLVPGWYAVHIERWLTYFATSQLLIIDGQQLRSDPATVMDEVQKFLGVTPLYNYSEALTFDPQKGFWCQLLEGGKTKCLGKSKGRKYPPMDPESRTFLSNYYRDHNVELSKLLHRLGQPLPSWLRQELQKVR	617794	323414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_324019_326320_326424_331729_331840_332778_332950_342380_342556_345485_345610_350494_350592_371356_371540_437508_437638_440561_440748_483005_483161_616568
876420	contig_11986_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_69147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	187	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGTTAGCATCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304093	301804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_302190_302947
876421	contig_21013_pilon	-	3014	1	Intergenic	novelGene_38517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATTATTTATTACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35973	32959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_33000_36000
876422	contig_5297_pilon	-	3687	1	Intergenic	novelGene_175667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGACACGGAATGTCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75853	72166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_72200_75900
876423	contig_10235_pilon	+	1017	6	Intergenic	novelGene_46321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1240.76631159941	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	587	913	92983	93309	FALSE	40	AAATAGTTTTTCAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSAWWSQRKRTEPRGTRRPQNSGVLFLTSFPWATSSRYHVTEPMAGLPWLALKKQGREVVAPSWVRISGGWITQRAQDPGGQKEDPEKYLHSYTKVKGRDSLESDI	89961	93413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91651_91825_92537_92671_92894
876424	contig_12125_pilon	+	2889	2	Intergenic	novelGene_76244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1	411	569920	570330	TRUE	30	ACTACAGTGAGATCCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLPSCALPAPTGAEREQGVRKSSTFPRTGYDAVRLCSPTARALSRSDAASVCSVSSLGTELSATLSVSNEDLLDLVTSSSSAIVALENDDDPPFTDVTLGSTKEASGPAQQDGAEEPEEGSKSGLLGPLSHFLAR	569919	572848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_570757_570796
876425	contig_13780_pilon	+	1893	2	Intergenic	novelGene_149031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAGAATTAGCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478523	480496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_479413_479492
876426	contig_1443_pilon	-	1880	5	Intergenic	novelGene_28353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_4	252.220513638364	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	89	754	937429	914522	FALSE	60	CTTAAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGFRGRERVVEPGPRVILGTRGGAASGAMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEVKWEGRVFLLF	937517	913395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
876427	contig_8866_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_77793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	677	1228	382993	383544	NA	25	CTAGGCTGTAATCTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQINQPPPTALLSRHLYLPLLHKNSAPGVGIWADDSQDEMVFFSTVESWAGQAVLYPITWHRLPPTATSELPPENQDGGCTAFRGKGAAFVEPPSSTPGALSLLHRQRGPGIAKGPPESKEQKWYSFPAQSQHGAGNGVRLVPAGPSVISLEPKPGLAGMKREWVTWSQSCRAVVPELPLTAV	382316	384138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_382300_384100
876428	contig_5918_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_99566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	134	586	1728328	1728780	NA	20	GAGTGGACCCGTGTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPEVGVSLTAAGDCQKLMLVLHLKGVIEFRIVTSQPTNPPVAIKSILTHSDPKGQSRTAPIWFPKSAWWIRTSHLFLLAAVALNHCSIRVSTVTKRIMYLGMVGGGLGGLRGKRVEKYQMLFFFFFFLANFPNHSCHVCLLLGYLNLN	1728194	1730226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1728200_1730200
876429	contig_2758_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_166429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACTCTACCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22615	20612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_-_20600_22600
876430	contig_9297_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_69819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGGCAACTGGCATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431537	429284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_429300_431500
876431	contig_6870_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_103998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATGTGCTTTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1518102	1520903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1518100_1520900
876432	contig_11328_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_88462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAATAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851272	853719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_851300_853700
876433	contig_8712_pilon	-	4030	1	Intergenic	novelGene_58882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	85	465	1007197	1006817	NA	25	CCAAAACTTCTCCAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPVSTPAKGLGLLCDVLFPRDRSTELASVMHACNMTPSTGSWNVTFSGGAWVCREAARGGCRGQGSGVDGFAPEPWCSDFICQGMRNTKLSEPGQEEQPYVPRRQPGGWLHGGTGRKEAVVSAL	1007281	1003251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1003300_1007300
876434	contig_7963_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_58529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAGCACTGCAGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233184	235489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_233200_235500
876435	contig_4924_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_84741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAGAAAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150766	148576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_148600_150800
876436	contig_16532_pilon	+	1548	2	Intergenic	novelGene_110062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTTCAAAAGAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582232	586140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_582752_585111
876437	contig_11396_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_71371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACATCTGAGGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038235	1040328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1038200_1040300
876438	contig_11109_pilon	+	2015	5	Intergenic	novelGene_165196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	20.7665596572952	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	32	523	10975	29899	TRUE	40	ATTATATGACATCTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPEIHGKTKPMITYVGDSTVLACKCQDCFPLNWSWYSSNGSVQVPVNIQMSNKFYVINGTYSNETKLKIMQLSEEDRGPYWCHAVFQLGESEILIELVVLSYLVPLKPFLAIVAEVILLVAVILLCEMYTQKKKNEPDDGKEFEQIEQLKSDDSSNGIENNAPRHRKNSVTSK	10943	32064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11109_pilon_+_11074_13625_13909_14669_14704_29823_29915_30587
876439	contig_5954_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_28736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	277	351	1207687	1207613	NA	10	TTCAGCTGCCCGGATGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQRTVGLRQEPGRPGPQTQPPTVSAASLGSQVSFSATGFPTAPRPSPQHTHLDRWSVYTHLYERAEILGLGSGWFQRRRCRRRLRRSAVTEIMGGACAETPGSKRALASRIFVDLQ	1207963	1205704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1205700_1208000
876440	contig_6505_pilon	+	2707	10	Intergenic	novelGene_175691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_6	104.853336724313	72	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	348	1442	74966	116376	FALSE	20	GTTGGATTGGATAGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHLRHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAGARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTEIQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSDLKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQNGNRNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHGHGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPSGNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAEGGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAEAMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCGTSWTYNPAAVSKVASAGSAISNASGERLSQLLKKLFETQESGDLNEELVKAAANGDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDILKLLLKQNVDVEAEDKDGDRAVHHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNKGHLQVVKTLLDFGCHPSLQVKPLKKYILQILLGSY	59369	117641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_59485_61504_61635_74863_74969_78043_78111_79437_79643_93642_93827_101542_101688_103277_103412_111852_111961_116127
876441	SIRV6	+	706	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	61	16	61	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10298	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
876442	contig_1694_pilon	-	4516	1	Intergenic	novelGene_144990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAAATGATTTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1683790	1679274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1679300_1683800
876443	contig_17753_pilon	-	1847	2	Intergenic	novelGene_105043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACCCAGCCAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44560	41862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_42393_43243
876444	contig_9484_pilon	-	1769	8	Intergenic	novelGene_105607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	10.0549510598673	101	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCAGTTTTCTCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88538	79545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_79846_80846_80895_81139_81212_82034_82101_82473_82598_84270_84406_85752_85837_87598
876445	contig_753_pilon	-	2286	2	Intergenic	novelGene_112911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTCCCCCAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301690	298100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_299379_300682
876446	contig_8600_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_125742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGAAGCACATCACACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118617	116932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_116900_118600
876447	contig_7078_pilon	-	3583	2	Intergenic	novelGene_130143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239384	231891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_232197_236106
876448	contig_5083_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_151622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAGTGCTTCTTATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51535	53958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_51500_54000
876449	contig_19098_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_65873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCCCAGCATTTCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501747	499853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_499900_501700
876450	contig_4519_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_123684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGAAGTTCAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88547	91035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_88500_91000
876451	contig_5039_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_64897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAAAGCTGACTCTCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594550	596005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_594600_596000
876452	contig_17797_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_177283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30542	32745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17797_pilon_+_30500_32700
876453	contig_14047_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_176591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGCTAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75664	77782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_75700_77800
876454	contig_11564_pilon	-	2481	9	Intergenic	novelGene_158588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_4	253.879400503467	4	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	150	1343	195486	164718	FALSE	20	TGAATCCCATTTCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQMPAEERIFGVVLLFSWTVYLWETFLAQRQRRIYKTTTHVPLELGQIMDSETFEKSRLYQLDKSTFSFWSGLYSEIEGTLILLFGGIPYLWRLSGRFCGYAGFGPEYEIIQSLVFLLLATLFSALTGLPWSLYNTFVIEEKHGFNQQTLGFFMKDAIKKFIVTQCILLPVSSLLLYIIKIGGDYFFIYAWLFTLVVSLVLVTIYADYIAPLFDKFTPLPEGKLKQEIEVMAKSIDFPLTKVYVVEGSKRSSHSNAYFYGFFKNKRIVLFDTLLEEYSVLNKDIQEESGMEPHRDGEGDSEEIKAKVKNKKQGCKNEEVLAVLGHELGHWKLGHTVKNIIISQMNSFLCFFLFAVLIGRKELFAAFGFYESQPTLIGLLIIFQFVFSPYNEVMYNL	195635	163579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_164880_167495_167601_172246_172432_178147_178290_179798_179952_180361_180479_188507_188595_193267_193415_195390
876455	contig_6589_pilon	+	1702	10	Intergenic	novelGene_25986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	262.96730304191	624	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	222	1541	1365208	1383930	FALSE	15	GATAGTGGCCATCTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQFLPPNLLALFAPRDPIPYLPPLEKLPHEKHHNQPYCGIAPYIREFEDPRDAPPPTRAETREERMERKRREKIERRQQEVETELKMWDPHNDPNAQGDAFKTLFVARVNYDTTESKLRREFEVYGPIKRIHMVYSKRSGKPRGYAFIEYEHERDMHSAYKHADGKKIDGRRVLVDVERGRTVKGWRPRRLGGGLGGTRRGGADVNIRHSGRDDTSRYDERPGPSPLPHRDRDRDRERERRERSRERDKERERRRSRSRDRRRRSRSRDKEERRRSRERSKDKDRERKRRSSRSRERARRERERKEELRGGGGGGDIAEPSEAGDAPPDDGPPGELGPDGPDGPEEKGRDRDRERRRSHRSERERRRDRDRDRDREHKRGERGGERGRDEARGGGGGGGQDNGLEGLGNDGRDMYMESEGGDGYLAPENGYLMEAAPE	1364268	1384091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1364480_1365197_1365355_1367252_1367316_1367432_1367488_1371811_1371877_1372042_1372106_1373899_1373982_1377082_1377185_1383102_1383191_1383275
876456	contig_10581_pilon	+	2092	3	Intergenic	novelGene_41447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	417	1310	797526	798581	FALSE	15	TCTAATTGTCTTCTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLRAAMPQVPYRVLGRMFWREENAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVVFKPPTSDAEFLERLHLFLAREGWTVQDVARVLGFHNPAPAPGPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKKLTLFSGRDIPGPGEEAFDHWLEHTNEVMEEWQVSDLEKRRRLVESLRGPAADVIRILKTNNPAITSAECLKALEQVFGSVESSRDAQVRFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVEEEAKEEEEEAEAALLQLGLEGHF	796702	799363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_796827_797233_798345_798506
876457	contig_5643_pilon	-	1149	7	Intergenic	novelGene_38914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	59.388551085205	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	252	1136	347245	344742	FALSE	75	TTAAAAGAAAAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESHFNSNPYFWPSIPTVSGQIENTMFINKMKDQLLPEKGCGLAPPHYPTLLTVPASVSLPSGISMDTESKSDQLTPHSQASVTQNITVVPVPSAGLVTPGVSCSQRWRREGSQSRGPGLVITSPSGSLVTTASSAQTFPISAPMIVSALPPGSQALQVVPDLSKKVASTLTEEGGGGGGGGGSVAPKAPRGRKKKRMLESGLPEMNDPYVLSPEDDDDHQKDGKTYRSEGNCGTGNGQSLGLMDSVPGSTTNLLCDPGQVLFPSLGLSFLICKMGRILFMPPICWEYISDKI	354821	344728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_344941_345818_346153_346356_346405_346639_346878_347179_347251_353699_353760_354635
876458	contig_13937_pilon	-	2773	2	Intergenic	novelGene_167360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTCAAAAAAGCTGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100949	97050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_98084_99209
876459	contig_14341_pilon	+	2866	2	Intergenic	novelGene_111812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	164	1150	491933	492919	FALSE	10	GTCTGCCCTCCCTACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPGRVASTHSGELDSSGAPQFLEWDPGPEPAEASCNQSNSEESQSSDVVTKIFMGDVSLGPAFRDACEHEDSSERRAGLSGETWTKSVTQQMDFRKTSGPHKDASTDQPSCDYGVSRNSPNMWPNFASGEKAPSEEKFDSLDGYRTESPCMYPELKFSKCGNCGKTFRSPLALEAHQKSHSRKTPYACSECGKAFSRSTHLAQHQVVHTGLKPHECKECGKAFSRITHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGERPYECEKCRKAFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCNVCGRAFSDYSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRTHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALMVHLKIHITVLQ	486755	494635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_486827_491840
876460	contig_10023_pilon	+	5751	2	Intergenic	novelGene_123479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGATTAAAAAAAAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143653	155407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_144470_150472
876461	contig_13464_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_125240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAGGGGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241776	243858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_241800_243900
876462	contig_9727_pilon	-	2056	13	Intergenic	novelGene_86378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	246.621786457635	3	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1513	1824	582378	578319	FALSE	45	TTATAATATGGAAAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622866	578086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584610_584739_584833_584956_585066_590071_590168_591628_591752_598023_598078_622824
876463	contig_11416_pilon	-	345	5	Intergenic	novelGene_145342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	864	junction_3	97.7304967755715	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGTAGCCCCTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124631	122842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_122927_123031_123079_123169_123228_123308_123404_124570
876465	contig_9482_pilon	-	1685	9	Intergenic	novelGene_44257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.5696948478108	1280	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	56	964	773701	738759	FALSE	0	TGTGGCCGCTCTTGGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKAEWRSSYEDYADKPLEKPLKLVLKVGGSEVTELSGSGHDSSYYDDRSDHERERHREKKKKKKKKSEKEKHLDDEERRKRKEEKKRKREKEHCDTEGEADDFDPGKKVEVEPPPDRPVRACRTQPAENESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHLAST	773756	738037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738774_754824_754886_757436_757553_758161_758273_759819_759965_769312_769374_771772_771906_772970_773186_773649
876466	contig_12312_pilon	+	1736	3	Intergenic	novelGene_63994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_2	23	108	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	94	390	477005	490486	FALSE	80	ACCAAAAAAAAAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSSSCSLGRAAVTVHRRRRGLHRRVRLPASMATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIGKCSCVELLGYFVGGGENRDPLLFL	476911	491832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349
876467	contig_10148_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_172876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGAATGCCTTACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340666	342458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_340700_342500
876468	contig_2380_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_117886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAAGAGCCTGGGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90373	88056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_88100_90400
876469	contig_14514_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_137453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGACCACCCCTAAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20714	19454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_19500_20700
876470	contig_3822_pilon	+	3233	15	Intergenic	novelGene_133337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	55.083609918311	47	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	7	1815	320969	381260	FALSE	40	ATACTACATGGTCATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLKGAAGWDPRAGFRAERRECTTSVPQGLLKAARKSGQLNLSGRNLSEVPQCVWRINVDIPEEANQNLSFGATERWWEQTDLTKLIISNNKLQSLTDDLRLLPALTFLDIHDNQLTSLPSAIRELENLQKLNVSHNKLKILPEEITYLRNLKGLYLQHNELTCIPEGFEQLSSLEDLDLSSNRLTTVPASFSSLSSLVRLNLSSNQLKSLPAEISRMKRLKHLDCNSNLLETIPSELAGMESLELLYLRRNKLHSLPQFPSCRLLKELHVGENQIEILGAEHLKHLNSILVLDLRDNKLKSVPDEITLLQSLERLDLSNNDISSLPYSLGNLHLKFLALEGNPLRTIRREILNKGTQEVLKYLRSKIRDDGPTQSDSVTETAMTLPSESRINVHAITTLKILDYSDKQTTRIPDEVFDAVKSNIITSINFSKNQLCEIPKRIVELKEMVSDVNLSFNKLSFISLELCMLQKLTFLDLRNNFLNSLPEQMESLIRLQMINLSFNRFKILPEVLYRIPTLETVLISNNQVGSVDPQKMKMMENLTTLDLQNNDLLHIPPELGNCVNLRTLLLDGNPFRVPRAAILMKGTAAILEYLRDRIPT	320962	382678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_321120_327731_327914_328517_328592_330479_330610_332858_332983_334535_334679_335935_336109_340835_340924_341019_341066_350770_350880_356379_356488_360079_360191_362213_362292_379492_379679_381154
876471	contig_11304_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_156687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGACCTTATAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282002	284034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_282000_284000
876472	contig_9195_pilon	+	4287	1	Intergenic	novelGene_155676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCCTGAGGGGCGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109924	114211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_109900_114200
876473	contig_10861_pilon	-	1731	18	Intergenic	novelGene_39461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	299.250285821106	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	454	1476	2666327	2618180	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPIPPGFFQGPPGSQPSPHAQPPPHNPSSMMGPHSQPFMSPRYAGGPRPPIRMGNQPPGGVPGTQPLLPNSMDPTRQQGHPNMGGSMQRMNPPRGMGPMGPGPQNYGSGMRPPPNSLGPAMPGINMGPGAGRPWPNPNSANSIPYSSSSPGTYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSSDNIYTMINPVPPGGSRSNFPMGPGSDGPMGGMGGMEPHHMNGSLGSGDIDGLPKNSPNNISGISNPPGTPRDDSELGGNFLHSFQNDNLPPPPLRDAERAGIAGGKMPEIMQEEVRCHYPGAGRGAPPRSPQPFHHPPPHPSPSPILVSCNKKAELFIP	2803773	2617924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618396_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2627217_2627289_2628638_2628694_2629212_2629249_2629939_2629989_2630666_2630732_2638316_2638394_2638507_2638575_2642392_2642453_2643377_2643459_2666291_2666384_2799029_2799115_2802236_2802299_2802522_2802596_2803596
876475	contig_12694_pilon	-	612	2	Intergenic	novelGene_171991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCCCAGCAGACTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382118	376167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_376691_382029
876476	contig_13224_pilon	-	2228	14	Intergenic	novelGene_104121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	277.123004752968	97	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	80	1255	387941	373092	TRUE	15	ATTCACAGCCCTTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLRPGWYRRGVSARLQEQLSRVTFKMDSTLTATEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPSHPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALELLTQEFGIPVERLYVTYFGGDEATRLEPDLECKQIWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAYLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNRETDGILKPLPRKSIDTGMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGTGARPYTGKVGADDADGIDMAYRVLADHARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRYSHEKLNANRGFFATLVDVVIQSLGDAFPELKKDPDMVKDIINEGPDHAKQGRAAGNS	390276	369954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_370597_371043_371158_371535_371623_371752_371873_373081_373136_380988_381050_381210_381320_381918_382065_382412_382558_383096_383289_384757_384904_385250_385440_387797_387963_390218
876477	contig_10347_pilon	-	2862	9	Intergenic	novelGene_177658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGCATTTCCCTCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1687540	1649315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10347_pilon_-_1649371_1652220_1652291_1655453_1655651_1663863_1663979_1671876_1671956_1672063_1672149_1674086_1674288_1681557_1681642_1685564
876478	contig_5878_pilon	+	571	2	Intergenic	novelGene_145729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275321	277164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_275360_276631
876479	contig_12157_pilon	+	2948	1	Intergenic	novelGene_135930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATGGCATTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286716	289664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_286700_289700
876480	contig_5968_pilon	+	1585	4	Intergenic	novelGene_112198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACTTGGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625817	637807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_625909_631643_631765_635195_635348_636586
876481	contig_7898_pilon	-	2117	6	Intergenic	novelGene_47627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTACCACCTCCCACCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695572	684140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_684209_684394_684514_690856_691034_691615_691795_691901_691969_694065
876482	contig_5728_pilon	-	3209	1	Intergenic	novelGene_126691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTGTATTTCAGGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253432	250223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_250200_253400
876483	contig_960_pilon	+	3207	1	Intergenic	novelGene_108270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGATATCAAGGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666939	670146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_666900_670100
876484	contig_9272_pilon	-	1338	3	Intergenic	novelGene_125960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	48.5	509	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	45	401	522653	491086	FALSE	50	ATTTGCCTATAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGSSCSQTPSRTIPTTRRVVLGDGVQLPPGDYSTTPGGTLFSTTPGGTRIIYDRKFLIECRNSPVAKTPPQDLPTIPGVTSPASEAPPMEARQNHLQNSPEDKPVCGEESQFEMDI	522697	490148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_491118_493350_493531_522508
876485	contig_9440_pilon	-	1450	4	Intergenic	novelGene_59108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	472.545823762686	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGTTTAACAAGTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716691	1699827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1700814_1705391_1705511_1706375_1706542_1716512
876486	contig_7234_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_145958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGAAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529809	527754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_527800_529800
876487	contig_6189_pilon	+	2412	1	Intergenic	novelGene_164963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAACACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196749	199161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_196700_199200
876488	contig_9320_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_176699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAAGCCTGCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249408	247926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9320_pilon_-_247900_249400
876489	contig_12837_pilon	+	2581	15	Intergenic	novelGene_57348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	108.019296273152	5	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	784	2382	256709	340234	FALSE	10	TCTAGGTGTTTTACTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLFKLDEDLNIEKSAKVYFRTVELIEEPIEGSSGLSFYFKINGFPIFLKGSNWIPADSFQDRVTSDLLRLLLQSAVDANMNALRVWGGGIYEQDEFYELCDQLGIMIWQDFMFACALYPTDRSFMDSVSAEVAYQIRRLKSHPSIIIWSGNNENEAALMTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVTQAQCVKIETEFYRRSRSEIVNGEGHTMGALYWQLNDVWQAPSWSSLEYGGKWKMLHYFAQHFFAALLPVGFEDHDVFYVYGVSDLHSECRVTLTVRVHTWSSLEPLCSHVTGHFVINSGEAILIYKEPVPSLLRRCWNCTRQSCVVSFYLSADSKPLGPTNYHFLSSPKEAVGLQKAHITVSTSHVESPWPRRASTFASCKFPIGTKLT	213151	340433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_213330_232120_232216_234965_235072_237989_238161_255572_255749_256651_256763_282716_282869_285252_285371_286821_286909_289906_290075_302652_302872_310874_311040_329876_330022_338912_339056_339886
876490	contig_10003_pilon	-	4045	1	Intergenic	novelGene_88231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAATGAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638511	634466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_634500_638500
876491	contig_5799_pilon	+	2987	1	Intergenic	novelGene_50268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGATGACAGGAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250686	253673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_250700_253700
876492	contig_2062_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_139054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	994	1401	1324463	1324056	NA	85	AAAAAATAAAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVPPGQELCSAGGGCGSVRSWQGTGGDPRGLGPFSSLSLGSRSRYAQVRSSRWAARAAGRRRASCRDKGFRNAVLPGEAAHSPLAAPQQPESCARQLCIGAVVTVGWPAGEGSWDPFREASQTWSKDDQIWSV	1325456	1323286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1323300_1325500
876493	contig_7056_pilon	-	3786	1	Intergenic	novelGene_43681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACACACACACACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825483	821697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_821700_825500
876494	contig_11281_pilon	-	1304	7	Intergenic	novelGene_125469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1175	junction_6	951.336194809992	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	43	630	972015	853748	FALSE	75	AACAAAAATAAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKNLPTYPGPNKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIRKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLEMRLSEVITDTGVVCHKLATRIFECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPYRSEAKKTKVKKKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIR	972057	853073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_853829_859558_859632_860043_860125_886942_887020_900630_900726_925832_925937_971938
876495	contig_2236_pilon	+	1265	7	Intergenic	novelGene_98686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	34.3899210040772	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	477	1046	61201	69291	TRUE	10	TGGTGTTAATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATFKKDLEKEQNCEEQNYDLPDAEVDTSNVGFGKIFPAPNLNITEEMKEDSDEMPSEFISRKELKKGRISREEMETLSIFRSYEPGEPNCRIYVKNLAKHVQEKDLKFIFGRYVDFSSETERIMFDIRLMKEGRMKGQAFIGLPNETAAAKALKEANGYVLFGKPMVVQFARSARPKQDSKEGKRKC	60724	72096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2236_pilon_+_61262_63781_63944_64983_65079_65166_65226_67930_68064_69231_69304_71889
876496	contig_15410_pilon	-	2059	11	Intergenic	novelGene_130638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	6.11228271597445	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	55	1173	240628	234173	FALSE	35	CACTGGACAATCACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNPRPAKPLAPSLALSPSLGPSPSWRAAPKASDLLGPRGPGETFQGRDLRGGAHASSSSLNPMPPSQLQLPTVPLVMVAPSRARLGPSPHSQALLQDRPHFMHQFSTVDAHARTPVLQVHPLESPAMISLPPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWLSREPALLCTFPSPGVPGKDSTPMPQSSYPLLSNGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQKEMVQSLEQQLVLEKEKLGAMQAHLAGKMALTKAPSAASSDKSSCCIVAAGTTGSAFPAWPGPGEAPNGLFAVRRHLWGSHGNSTFPGHPGGSREAADTQRDLPLVHTHVRLLQKPPCHLEECHPPQPEPAQVLRAGGK	247322	233286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_234229_234420_234523_236640_236792_237458_237540_237697_237786_238880_238980_239052_239141_239552_239692_239791_239897_240418_240651_247290
876497	contig_3601_pilon	+	3144	2	Intergenic	novelGene_132883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173500	184955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_176472_184782
876498	contig_14034_pilon	-	1170	2	Intergenic	novelGene_72653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGTACGTAGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337285	335772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_336770_337112
876499	contig_14034_pilon	-	1108	2	Intergenic	novelGene_72655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACCACCAAATTAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337249	335929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_336797_337008
876500	contig_14034_pilon	-	812	3	Intergenic	novelGene_72656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	175.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAATGTATCATATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337316	336099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_336493_336699_336797_336994
876501	contig_854_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_36561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGGGCCTCCTTCTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663170	1666065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1663200_1666100
876502	contig_12292_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_167031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	485	826	499877	499536	NA	80	AGAAGGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVDLRNKGRCRGGVPFEELLMCTVPLSRLHLPVPPFISSVPIQRGVTKYVLSQLKDLLMFLTGLFKLRNHLHIGIQYKIIFKVNFSSRHDAILMDLFDRAVSVDSGICLHCL	500361	498201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_498200_500400
876503	contig_11719_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_154770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAAAAAAAAGGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124682	122348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_122300_124700
876504	contig_15929_pilon	+	982	2	Intergenic	novelGene_172471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAAGAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83969	86197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_84489_85734
876505	contig_11126_pilon	-	2687	10	Intergenic	novelGene_138135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	8.37987005998436	68	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	46	1143	714861	689243	FALSE	80	GGCAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSAGLSLCGQALVVRGGSRFLATTIANSDDDSLFTYDCSTAEEKPQENKGTVVRRCTALTFTASEEKVLVADKSGDVYSFSVLEPQGRGKLELGHLSMLLDVAVSPDDRYVLTADRDEKIRVSWSAAPHSIESFCLGHTEFVSRIFVVPDHPELLLSTSGDGTLRLWEYRSGRELHRCPVPSLQEPDAPQREKRFAASRITYCRQDGWVALLCDSIPVVCIFQLDVPRHLLVYRQQLSFQHRVWDVAFEETQRLWVLQDCQEAPLVLYQPVQGQWQSVSEDDVLKKVSSHLRGNWAMLEGSAGVGDSFSSLYKASFDNMATYLHKKEERLQQQLEKRQRRKSSQPGPNGHAKKLKSGDASSGC	714906	687698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_689437_689941_690012_690862_691047_692648_692714_695613_695713_696288_696350_698964_699078_701628_701786_713054_713121_714772
876506	contig_15084_pilon	-	2371	1	Intergenic	novelGene_116664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCAGCTACCACCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9204	6833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_6800_9200
876507	contig_1062_pilon	-	4197	1	Intergenic	novelGene_171379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1861	2241	120445	120065	NA	65	CCAAGGAAGAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRLAEFRAARKRAGLAAGLNTSNQISQTSGEKAEASPGWLKRFLVWKARPASPRAQPSHAQVRRGKPHPYDLGFCATVMAPLKTPAEAPPPTGERPPLHHVTARRPRPNFSGAGPSVSGNRCQH	122305	118108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1062_pilon_-_118100_122300
876508	contig_6946_pilon	-	2804	1	Intergenic	novelGene_59768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTGGGCTCACCACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392936	390132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_390100_392900
876509	contig_6076_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_81730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGGACGTCTGGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46625	48660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_46600_48700
876510	contig_10323_pilon	-	2267	2	Intergenic	novelGene_123567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	51	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAACGGCAAAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449593	446301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_447136_448160
876511	contig_7530_pilon	+	2122	4	Intergenic	novelGene_141841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGGGGAGGAAGGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189211	197943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_189735_191528_191682_193856_194021_196661
876512	contig_15236_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_141666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGCCAAAAAAGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727544	725552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_725600_727500
876513	contig_5600_pilon	-	1445	11	Intergenic	novelGene_174951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.9242108657248	146	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	449	1144	212951	197203	FALSE	10	GCCCTCATTGGTCATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALVSKGLATVIRYRQDDDQRSSHYDELLAAEARAIKNGKGLHSKKEVPIHRVADISGDTQKAKQFLPFLQRAGRSEAVVEYVFSGSRLKLYLPKETCLITFLLAGIECPRGARNLPGLVQEGEPFSEEATLFTKELVLQREVEVEVESMDKAGNFIGWLHIEGANLSVLLVEHALSKVHFTAERSSYYKSLLSAEEAAKQKKEKVWAHYEEQPVEEVVPVLEEKERSASYKPVFVTEITDDLHFYVQDVETGTQLEKLMENMRNDIASHPPVEGSYAPRRGEFCIAKFVDGEWYRARVEKVESPAKVHVFYIDYGNREVLPSSRLGVLPPAFSTRVLPAQATEYAFAFIQVPQDEDARTDAVDSVVRDIQKHCPRISPS	412063	196901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_197231_199978_200029_201571_201686_202859_202930_203791_203916_206927_207070_212783_212973_296652_296763_356450_356593_394481_394555_411961
876514	contig_12626_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_80427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGCCGGTACCCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114822	117373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_114800_117400
876515	contig_12886_pilon	+	2035	10	Intergenic	novelGene_135520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	21.9342451684828	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	782	1813	781878	803500	FALSE	35	GGTGGTTATCAGCAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGELEFVKRIIHDSLQLKKRLRWYSCMLGKKCSLAPLKEELRVQGVPKVTFTEFCQGRTMRWALAWSFYNDVTVPSPPSKRRKLEKPRKPITFVVLASVMKELSLKASSLGSETVEGIVVVTTWIEKILTDLKVQHKRVPCGKEEISLFLTAIENSWIHLRRKKRERVRQLREVPRAPEDVIQALEEKKSSPKESGNSQDLAQGPRESAPCGPAVQEGESLTVEGHCPNQHSLSQEEKPETMEDERSEEKGGIEVLESCKGSSNEPQDLEASEQFGNPVAEKGKHLQGAAGHYLFKCLINVKKEVDDALVEMHWVEGQNRDLMNQLCTYIRNQIFRLVAS	739987	803722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_740113_743925_744055_775538_775739_779911_780053_781230_781348_781808_781952_791386_791457_792531_792622_802581_802756_802876
876516	contig_10962_pilon	-	2253	2	Intergenic	novelGene_103875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	305	1192	61605	60718	FALSE	30	CTAAAGTTTATGTGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTMNLSSEHCNISDWLRLEATVKASIYVVAFSFATFITIIVIAIVSQNLKLRKEIRYILLCHHLLCVSSYCGLGIVFQGMRALLANSPLLICWVVFGAQLSVGEGILFTLALMAVNTYLAICWPLRSLSLVSSVKYRILAGTWTTIILKNVCLFLMEGTSPTAVAVLQSEPLCPVILNGTPARVIGIVLLFLLLSVILVSYSLIYQEGKRAGHFNRSNIKARKTVFIHLVQMGLHVVPTLVFIGLGKMCGVFFFALNLVLFGIFAFAQCFNPLIYGLRNRELQSRLHRWMCCQL	77873	59656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_61619_77582
876517	contig_11896_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_87992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCTGAGAAGTCAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46040	43597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_43600_46000
876518	contig_15092_pilon	+	3645	16	Intergenic	novelGene_57757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAAGGAGACGGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205611	250249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_207781_208362_208463_209463_209590_212821_212883_218667_218739_219223_219313_219452_219519_219840_219937_228240_228342_232379_232488_236392_236503_239555_239647_242281_242391_243221_243324_245251_245474_250225
876519	contig_3233_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_56515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCACCCTTCCTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140703	137795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_137800_140700
876520	contig_15420_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_175301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170038	171055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_+_170000_171100
876521	contig_9871_pilon	-	1500	13	Intergenic	novelGene_75662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	89.0968184367745	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	145	1083	435650	421159	TRUE	30	TAGAGTTCATGATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSPTQCDVNCCCDPDCSSTDFSVFSACSVPVVTGDSQFCSQKAATYSMNFTADPPQRVFKLVDKINPSIFCVHITNYKPALSFINPEVPDENNFDKFMKTSGGFAPNADSDVSSTTRLDSPNTSAKYEYGVPLQTLDSFLRFPSPLTSSLCTDDNPAAFLVNQAVKCTRRINLEQCNETEALKMASYSRPEILKVPNSRTKVPVTVQSIVVQSLNQTLTRLEDTQVNLQPAFVSAGNLNVCTNVVLEVKYSLTYTDAGEITRAGLSLLLGTVSSGVVPIQQKFEIHFIQTDQSYPMSARHAEGEEPAQRPGLPRLCGSFRKFPGPGCAGLGACPLPHPVIQHEGFMPGPRGFGNSSEVD	444818	419434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_419583_420031_420080_420500_420646_421082_421209_423848_424012_426669_426796_427330_427469_429422_429444_430478_430589_432207_432296_434308_434464_435562_435694_444717
876522	contig_18108_pilon	-	3693	1	Intergenic	novelGene_33527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	3275	3676	281977	281576	NA	45	ATAACAGGTAGAAACTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTITAKIQSLFEMLKEKAGPDYSIEFSASFGWFKCFKQHFSLHNEKVSGEPVSAAVKAAEESVETLDKLMVEGGYLPQQIFNMDETSLFWKQMPERTFIHNMVLAQHNPNHINILFHSTYCGCSVMHDSISF	285251	281558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_281600_285300
876523	contig_9482_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_44283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTTTAGAGAAATCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1232596	1234875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1232600_1234900
876524	contig_835_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_152160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCGCAGTGGTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237527	238791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_237500_238800
876525	contig_4392_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_117345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTACTTGTGTTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654204	656212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_654200_656200
876526	contig_20819_pilon	+	1251	3	Intergenic	novelGene_55651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTGTGGGTGTGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40445	43574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_40526_41299_41404_42507
876527	contig_11386_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_82829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTTGAATAGCAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216587	215051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_215100_216600
876528	contig_19957_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_57706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCACTTAATGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180574	177640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_177600_180600
876529	contig_13412_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_80018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACCTTTGATTATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417072	414361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_414400_417100
876530	contig_3878_pilon	-	2364	3	Intergenic	novelGene_174802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	8.5	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	505	840	597614	597279	FALSE	55	TTTTCAAAAAGAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLEDAVVPRALYEELLRNYQQQQEEMRHLQQELERTRRQLVQQAKKLKEYGALVSEMKELRDLNRRLQDVLLLRLGSGECPRRPYCPTGGTLCAAPLPGGQGDRTGQVP	624002	595754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_597844_600129_600264_623861
876531	contig_10324_pilon	-	2752	2	Intergenic	novelGene_7789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAAAAATCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131578	128228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_129524_130121
876532	contig_14525_pilon	+	1777	2	Intergenic	novelGene_149781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATGCTTCAGATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234617	237198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234709_235512
876533	contig_5899_pilon	-	3870	1	Intergenic	novelGene_146958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACTTTTTCCTTACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19008	15138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_15100_19000
876535	contig_13014_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_169357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAAACTGTGCCATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425990	427413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_426000_427400
876536	contig_11816_pilon	-	3172	1	Intergenic	novelGene_98449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCGCCGCCGTTAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403677	400505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_400500_403700
876537	contig_10494_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_102118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145142	143051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_143100_145100
876538	contig_20610_pilon	-	2524	1	Intergenic	novelGene_67634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTAACATTTTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15249	12725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_12700_15200
876539	contig_12145_pilon	-	3114	23	Intergenic	novelGene_172319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	14.2883527669703	64	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	2092	2646	113001	109359	FALSE	0	CCTTGTTGTGGTTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWLQICEPAEKDKGKYTFQIFDGKDTHQRTLDLSGQVFDAAFAEFQQLKAAAIAEKNRGKVVGGLPDVVTIMEGKTLNLTCTVFGNPDPEVVWLKNDRDIELSDHFSVKVEQAKHVSMTIKGVTSEDSGKYSISVKNKYGGEKIDVTVSVYKHGEKIPDVSPPQEAKPKLIPASASALAKEKK	163402	108890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_109686_111095_111152_111767_111791_112593_112631_112889_113054_124140_124248_133192_133232_133770_133859_134048_134163_138356_138425_140316_140377_140488_140634_146281_146419_146980_147030_149605_149713_149804_149962_152090_152206_153622_153802_156057_156185_158638_158831_160548_160671_162299_162475_163344
876540	contig_7612_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_170373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAGAATTAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334180	336728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_334200_336700
876541	contig_5145_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_131415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACAGAAAAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820739	823030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_820700_823000
876542	contig_17074_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_145155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAACAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280534	278385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_278400_280500
876543	contig_6375_pilon	+	1070	8	Intergenic	novelGene_72928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	261.172552234756	16	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	258	902	22477	30210	FALSE	30	CAGTGATGATGTTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWFQVQLRGSV	16548	30378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_19403_19435_20907_20975_22463_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28080_30176
876544	contig_9177_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_32785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGCAATTCTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419586	1420865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1419600_1420900
876545	contig_13740_pilon	-	3824	1	Intergenic	novelGene_34765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGCTTTTAAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707143	703319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_703300_707100
876546	contig_2933_pilon	-	2442	4	Intergenic	novelGene_111376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.4142135623731	98	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	263	733	1074744	1061506	FALSE	20	CTCCTTCATCTTGCATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTRLYTLVLVLQPQQVLLGMKKRGFGAGRWNGFGGKVEEGETIEEGAKRELWEESGLTADTLHKVGQITFEFVGNPERMDVHIFCTDHVQGTPTESDEMRPQWFQLDQIPFDDMWPDDSYWFPLLLQKKKFLGHFQFQGQDTIVAHMLCEVDQF	1077108	1059796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_1061679_1061922_1062069_1074592_1074758_1076859
876547	contig_5050_pilon	+	2165	3	Intergenic	novelGene_110244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	3	124	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1314	2024	74691	75401	FALSE	25	CAGTCCGTTTTTGGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTRGKLWPGRPAASPVLGPEGSQGPSGQPLHGALGDSCGPGQDATELEAVVPGFIPGLCLQPGELSRPACSSNGQTQDKHLASPAQALQGSSSAEDPGALGVAGPRAQRPWDSSCPEREAQAGLLVLPLPGAGGRGLASRPSGLSADPHMGLEVLCSLHVHPSNTGSPPLLPLLCWLEDAAVGRQRPLLTVWCGRPRVVLGGRRPIVGAKMRMAHQEGARGRWWGEMAEPVMLSL	69015	75542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_69112_71359_72492_74605
876548	contig_6509_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_145659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAACTTTTGTTTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209434	208226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_208200_209400
876549	contig_4244_pilon	+	3784	1	Intergenic	novelGene_175901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	315	731	52982	53398	NA	40	AGGAAAAAGTTATATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLKDTGKGNTENRPDRQEAQGNRRSRAGRVGVLGHVTRGEEYQRGSGRMLKPGLAHFADRLRSPLFDITISRHTWQSLSFIEQFPCAELKLRCSLPFIQMLDTPKSPESLILLGHNQNHSWEEGGEEMWEWGHLVG	52667	56451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4244_pilon_+_52700_56500
876550	contig_6434_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_61856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805559	803892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_803900_805600
876551	contig_10938_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_171770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACCCGAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240072	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10938_pilon_+_240100_242200
876552	contig_12622_pilon	+	1154	6	Intergenic	novelGene_6057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	8.70402205879558	202	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	85	1038	1718004	1728437	FALSE	15	TACCACTGGAGCGGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPQALEDRQEGDDPPGDLRSVLVTSVLNLEPLDEDLFRGRHYWVPITQRLFGGQIVGQALVAAAKSVTEDFHVHSLHCYFVRAGDPKVPVLYQVERTRTGASFSVRSVKAVQHGRPIFILQASFQQIQPSPLQHQFSMPAVPPPEELFDHRTPIDQYLRDPNLYKKYQVGLNRTAAQEVPIEIKVINPPTLSQLQRQEPKQMFWVRAQGYIGEGDMKMHCCVAAYISDYAFLGTALLPDQWQHEVLSVTSLDHSMWFHTPFQADHWMLYECESPWAGGSRGLVHGRLWRRDGVLAVTCVQEGVIRVKPQKSESKL	1717919	1728553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1718123_1719338_1719476_1722850_1723077_1726108_1726267_1726785_1726981_1728318
876553	contig_6871_pilon	-	2156	8	Intergenic	novelGene_21637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCGGAGTTAGAGCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764737	668971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_669158_700065_700120_701759_701862_737471_737734_738629_738798_741211_741327_753692_753810_763585
876554	contig_13844_pilon	-	1890	11	Intergenic	novelGene_79400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_4	31.244999599936	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	84	1790	97790	62235	FALSE	40	AGCTGCTGAGAAGGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGEPAAVNSFYCPASVSSVWASLRLREMVRSGPRPGQVLSSGRQTGPAKLTNGKRGTHFRKVSRFNADSGYPTHSDLENQIETVQGLDGCASLLRDILRNEDSGSEAAYLENRHKFNCRPLEGKIHGSKKKVPEKHTIPSAVWKEILSSDNKKQIPDEASARNERDSSDIAQNRLLQDHYRMYSPIIYQALCEHVQTQMSLMNDLASKNSSSGIPVIPCHTVSASESQATPRSSYGLPTSTPVQSPQRPSCPPVVHSDVQTDSDNQFASEGKTVSVSSTDAPRGSFNTSPGAPRSLPKSDKSAIPVYPQLGLADGILPQQADLLNVSKDADLLKCLQTYMSLLRCHGKETHSDSQTHRSPARTQPAFLATNEKKCARENTGEATSEGKELNIRLREARTVKDAQKAKNVNQTTDKARTIKYLLGELKSLVVEQGDSEIQRLVTELEACMSLLPAISGNTNIQVEIALAMQPLRSENAQLRRQVRILNQQLREGEKSQKTSGSLGCNLKLLSLRALNVSLQNRLQESLETQESLQRKNEELLKVIENQEDENKKFASIFKEKNQTILENKQQFDMETTRMKIGIYLDYSYGHIFKK	97873	62134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_-_62498_64767_64851_74544_74687_77622_78152_79083_79179_79290_79528_89995_90125_90219_90290_90833_90907_91194_91251_97760
876555	contig_6871_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_21580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTTTGTGAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138557	139523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_138600_139500
876556	contig_6740_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_142655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAACCAGGCCTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40175	37437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_37400_40200
876557	contig_15146_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_116961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	175	585	563159	562749	NA	40	AACTTGACTAAAATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRRAHASERPFRCTQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGVDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCADCSKSFMRKEHLLNHQRLHTGERPFPCVHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCTHCGRSFRYKQTLKDHLRSGHGGSCAGDGDPSTQPPDPPGPLITELETPGLGVNEASRWYGEGSGGGGL	563333	561261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_561300_563300
876558	contig_20718_pilon	+	2427	1	Intergenic	novelGene_169146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCTCATTAAGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44377	46804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_+_44400_46800
876559	contig_4769_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_117996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1566	1865	885486	885187	NA	70	CTGAAAAAAAAAAAAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGHHIGPRSSGLLALGMVALAEGENAGFSLLVRTKEEAQRACALAEPKSVSECGAVPGVPATANAKFSSLSYPATLSEHQQGARPQPRASANTLFFFS	887051	884984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_885000_887100
876560	contig_18419_pilon	+	2157	10	Intergenic	novelGene_141470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	18.3208711852809	55	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1023	1487	71204	72857	TRUE	35	GAGAGAACTCCCAAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGHGVPQIEPTKVEVNPVPASPHLKHKVSSPVQSPQIKSPPCLPAEGVAIEELVSERLKPETQEKPPLSCCQGCANTKAEHWPQAACCPPSPSKEAIFPAPPPRTQGPEDVVQAFISEIGIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECPPLAPADSLAVGNSGVDTPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWKPLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAARLQEGVHGPSPVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKTPALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAVPLPPCTVASKEPLDHRTSNEQADPPAPCLAPSALLSPEASPCRNDMNSRTPPASSAKQRSMRCYRKACRSASPPKPGLAGPSRPQQPFCQLWVQRDQRSIFLLILIVVFLIPFSVQVPLPPHTRGGEGPAAVPLGVPEDALPLPPPHHPLRLPHPPHPVLAADPVPHPPAGEVTGGGGTALTVRMTITKGRECCRRSVQ	67168	74057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_67532_67832_67887_68829_68888_69669_69738_70724_71451_72417_72568_72674_72742_72856_72979_73222_73375_73660
876561	contig_8174_pilon	-	3511	2	Intergenic	novelGene_160047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGGTGGGGGTGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235333	223003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_225998_234816
876562	contig_6552_pilon	+	1062	4	Intergenic	novelGene_163592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	13.9602610609146	247	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACGTTGGTGGTTCGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105297	115901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_105350_109452_109504_110271_110384_115054
876563	contig_20596_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_157234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCTCCAGAGTAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90552	88035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_88000_90600
876564	contig_1107_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_126599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAAGCTAGAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866504	868642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_866500_868600
876565	contig_5918_pilon	-	3495	1	Intergenic	novelGene_99610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCATTGCCGTCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2104194	2100699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2100700_2104200
876566	contig_2799_pilon	-	3089	1	Intergenic	novelGene_85526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGGTAAAATGCAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644132	641043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_641000_644100
876567	contig_19816_pilon	+	1342	3	Intergenic	novelGene_156462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	16.5	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	35926	36578	TRUE	50	AAAGGAGAGGAAAATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRPGRRAGRWDGGLSRFSPPGSHSLRYFETAVSRPGGGEPRLISVGYVDDTQFVRFDSDRDSANRRKQPQAPWIQQERPDYWDRNTRVYEHTAQTFRVGLRILRGYYNQSDAGLLPSR	35924	39125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_36266_36558_36834_38399
876568	contig_8269_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_106228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGTAGGATCTACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276398	274567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_274600_276400
876569	contig_4783_pilon	-	3142	1	Intergenic	novelGene_108425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAGAATGAAACCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439781	436639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_436600_439800
876570	contig_11337_pilon	+	2792	1	Intergenic	novelGene_107198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATGAATCAAGGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229986	232778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_230000_232800
876571	contig_17_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_173981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTTATTGTATGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088830	1086531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_1086500_1088800
876572	contig_20165_pilon	+	3384	2	Intergenic	novelGene_54485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	25	327	115127	115429	TRUE	20	CTCCAGGTTTGAACTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVEVCYFTMFPLQKGRFRLWSVPAGLSVSSQSDLLTSCHEVGSGDISHWSVSVPPHAELNRDVAHVCQERQPPRKGVAQCTDMDAAAAGLPLQPDFLGSNPRPGPRSL	115102	128132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_118458_128103
876573	contig_19957_pilon	-	2570	6	Intergenic	novelGene_57682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_5	50.4602814102339	28	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1962	608	2569	115131	42789	FALSE	30	GACGGCGCAGCAAGAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDEKPDSPMYVYESTVHCTNILLGLNDQRKKDILCDVTLIVERKEFRAHRAVLAACSEYFWQALVGQTKHDLVVSLPEEVTARGFGPLLQFAYTAKLLLSRENIREVIRCAEFLRMHNLEDSCFSFLQTQLLNSEDGLFVCRKDTACQRPHEDHENSAGEDEEEEEERMDSEMAKMACARDQMLPDPISFDAAAVPVAEKEEALLPESDVPTDIKESSEKDALTQYPRYKKYQLACTKNVYNASSHSTSGFASTFNEDNSGNSLKPGLAMGQIKSEPPSEENEEESITLCLSGDEPDVKDRGGDIEMDQKQPSPAPTAATAPPTPAGAACLDRSRSVSSPSCLRSLFSITKSVELSGLPSTSQQHFARSSACPFDKGITQGDLKTDYTPFTGNYGQSHVSQKDVSNFTMGSPLKGPGLEALCKQEGELDRRSVIFSSSACDQVSTAVHAYSGVSNLDKDLSEPVPKGLWVGAGQSLPSSQAYSHGGLMADHLPGRMRPNTSCPVPIKVCPRSPPLETRTRTSSSCSSYSYAEDGSGGSPCSLPLCEFSSSPCSQGARFLATEHQEPGLMGDGMYNQVRPQIKCEQSYGTNSSDESGSFSEADSESCPVQDRGQEVKLPFPVDQITDLPRNDFQMMIKMHKLSSEQLEFIHDV	426588	42787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_42903_55398_57004_114888_115144_196361_196511_325487_325596_426250
876574	contig_6496_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_103546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAGACATAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178291	1176470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1176500_1178300
876575	contig_14157_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_171786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAATCCACTGGGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311459	313413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_+_311500_313400
876576	contig_7035_pilon	-	2953	3	Intergenic	novelGene_83562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTGACTTTTAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972956	968656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_970010_970658_970838_971535
876577	contig_3130_pilon	-	2286	2	Intergenic	novelGene_103574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	590	junction_1	0	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	134924	133762	FALSE	60	GAAAAAAAAAGTGTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRVSRELWEFSFFTLFKIFISAYKNCFSSLLSKAVGRREERKIVFISKRSNIFINIF	134926	131876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_134042_134805
876578	contig_2940_pilon	+	3267	1	Intergenic	novelGene_81874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAAGCATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323645	326912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_323600_326900
876579	contig_5690_pilon	+	3728	20	Intergenic	novelGene_119699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_2	20.2749794634611	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	338	2617	867653	891787	TRUE	45	TTCTATTATATAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLEIKELKETGSQLRSPRGYSSPTEKAALDAQAPDPSLVSRETQNEGAASPVFSVAEEARSPSAGQASLYSFEINEIYSGCLDVGDNKEEEPPGSVSSLEEERPTQVDDLQSMEEELDKMEKEACCLCDEDDSSLEAETELSFEDWDWENGSLSSPNIHEPTREAKGNVSNRSMTEEYISKCVLNLKIAQTLMHQNADLLRTTQQKIDKIQLIQREQEEHRSLWVTSREFVPLALGPPSLCYIPPVMLLSGDQQLDTSGNSRSLVRSPRTVRDFQGGHFGKRSRKRSDFGWKPFTPFTQDSEESPGDQSENSHQLPTLCGSGKQNRGEQPPPTQGAKDSLDRSRNPDTDSHGRPRESSAQAKVTQLSSALFTVSSHLQGHPGTPSPGRDSTGINMEFVSSEIYHPESRNHEVEELHLKWKTEVKEMAERAAAGQLTVPPWHPQSGVALESEAGKEPDPLLQPPTRNPEGVDWQQVVEYPRENDKPGGNSKCDKTDKSDQPGEQPGPRSFTSARHLSLRKNEQPEHSEAFQASSDTSVVIEKSYSDQSVQSTCSPESSEDITDEFLTPDYEYFYSSTAQENLALETSSPIEEASGGIQDKEKFQMKGRVLGKSEILSKSQFQPIQSAEGEQEETLKEPPKERKEKDISLMDIQDLSSISCEQDSSFKEASRKTPKINHAPTSVSTPLSPGSISSSASRYKDCLGSITFQVKTASTSCWNSQESLRTSSDKFTTVREKARSLDSLLTSSEMSPSRLTDLKRLSVFTGSGSPSTAKASGTSLPTTQRRSLPKELVEAISQRHIDELPPPSQELLDEIEHLKQQQSSPTVSGENTASDAGRSTDGTRWWLHRSPSPHRVPAGLSEMAYAKCLAYI	866114	902008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_866147_867347_868259_870493_870601_872938_873065_873269_873356_874369_874640_875447_875549_877277_877398_879456_879497_881123_881206_883629_883693_884159_884288_885044_885251_886431_886529_887843_887919_891614_892318_897799_897893_899826_899937_901209_901262_901682
876580	contig_12427_pilon	+	2500	18	Intergenic	novelGene_40497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	232.423935542682	4	124	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	653	1372	404919	413460	TRUE	25	TGACAGCTGCTTCTACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTNNPSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGVHPWFGEGSAAVYSRTIGKTFRPQVCSPGHRTHCRAENRKHPYHNSQAA	401118	420321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_401145_401423_401517_401946_402028_403295_403440_403535_403670_404744_404967_407156_407253_410177_410422_411285_411362_412480_412585_413043_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419879
876581	contig_15456_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_139490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGCTATAAGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79056	80784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_79100_80800
876582	contig_16098_pilon	-	2709	1	Intergenic	novelGene_45916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTCCGGGCGCCACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297809	295100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_295100_297800
876583	contig_10104_pilon	+	2658	2	Intergenic	novelGene_160128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	43	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	313	1101	240915	241703	FALSE	20	TCAACCATTGTCCTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDEISQVREEESWVPDIQEPQEPQETEILSFTYTGDQSEDEEEYLEQEDPSLEDLQRSILDDPEIHETPDWEIVFEDNPGRLNERRFGTSISQINSFTNLRETMPLHPLLGRHHDCPVCGKSFTCNSHLVRHLRTHTGEKPYKCMECGKSYTRSSHLARHQKIHKMGTSYKFPLSRKNVDETSPLIQAERTPPIEKPYRCDDCGKHFRWTSDLVRHQRTHTGEKPFFCTICGKSFSQKSVLTTHQRIHLGGKPYLCGECGKDFHDHRRYLAHRKTHATEELYLCSECGRCFNHSAAFAKHLRGHASVRPCRCNECGKSFSRRDHLVRHQRTHTGEKPFMCPTCGKSFSRGYHLIRHQRTHSEKTP	240058	243260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_240165_240708
876584	contig_5479_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_133575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATTTTATGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139662	142210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_139700_142200
876585	contig_13051_pilon	+	3458	7	Intergenic	novelGene_140124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	26.5685695679856	188	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	421	1401	389473	453563	FALSE	25	ATCCTCCCAAAGTGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSESALEKKLSELSNSQQSVQTLSLWLIHHRKHAGPIVSVWHRELRKAKSNRKLTFLYLANDVIQNSKRKGPEFTREFESVLVDAFSHVAREADEGCKKPLERLLNIWQERSVYGGEFIQQLKLSMEDSKSPPPKVTEEKKSLKRTFQQIQEEEDDDYPGSYSPQDPSAGPLLTEELIKALQDLENAASGDATVRQKIASLPQEVQDVSLLEKITDKEAAERLSKTVDEACLLLAEYNGRLAAELEDRRQLARMLVEYTQNQKDVLSEKEKKLEEYKQKLARVTQVRKELKSHIQSLPDLSLLPNVTGGLAPLPSAGDLFSTD	389052	455620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_389624_402645_402776_410940_411075_419906_420020_422064_422192_427709_427886_453413
876586	contig_14744_pilon	+	3878	26	Intergenic	novelGene_66105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_14	243.207565671794	30	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1248	3744	134	3877	1508384	1534538	FALSE	30	CCCAGCTTCTAGAAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVQLVLYTSQTALLLKTQSPVFAEVGCSPCGASDQKGRLFPDERMLEEKEEPGFLTGLKIPAPWAAGKTVETVHPVRDNYKFKETVHIPGARCLYLRFDSRCSSQYDYDKLVIYAGPNTNSRKVAEYGGNTLGYGSRSVLGTGWPKDLVKVEGDTVTFSFEMRSGREHNTPDKAMWGFACTVRAQESSEDVSGGLPFLVDLALGLSVLACSMLRILYNGPEITREEEACQELLRSKLLQRCQWQVEANGVISPALTPSPSPLPLTIEEDREFTYPSDVLVPPVGNYFDLPRIRLPPGIMIKLREISGRARPQFRPSIKEVIQPDVMEEMVVSCVIKHLNLVDALQSLINFQYQEEHAEEYDLLCKIMGETFKKLNAMERQLQSVAELEQKWQSEVDDAMQGKLENNMPFFYDYHFNENKMKELELLCSMKEVSFDGNDLENMVLSLREKFLQEVNSLIQKPSHPLAKTKTLVKSLMNRAELLLHVTIAAQSGLTRSISGTPAETPACKSASETKVISHAVRQPVFLRSMSAPSDLEMIGNEDLEFTRANQRRRHVTSHRSSSFTLLQSLAIEDSRDKPTYSVLLGQLFAFIGTNPDQAVSSSSFLLAAQTRWRRGNTRKQALVHMRELLTAAVRVGGVTHLVGPVTMVLQGGPRIEELTCGGMVEQVQEAFGETMTSVVSLCARYPIACANSIGLLCTIPYTRSEEKCLVRSGLVQLMDRLCSLSSQTESSSSEKQTKKQKVATMAWAAFQVLANRCVEWEKEEGGSTEAVHSGLARQVSSLLTNHLARATECCGNQAAGNDALQDVLSLLNDLSRSHIGKAILSQPACVSKLLSLLLDQRPSPKLVLIILQLCRAALPLMSVEDCGNVELPPWSYSVPSLNSEQEDPSDPASKIASLLLAKLADYVVPGCQTVLSPTASEPDTALTKTSPKNSLKGDKDPGEESEAVDGKLSIFIHKREDQSSHEVLQPLLSSSEGRPFRLGTGANMEKVVKMDRDMTKGGCCEVITEEAVAALRKATKWAQSGLIVSVGPPVESVNPETVSGLSTGDKKKTAQTSICRERNSELARTDPVRPFISGHVANSMAAEVIALLHSLLMAPESNAAQIWTTTAEKVLSRALMYIPQLGKYAESILENGSSSGRKLAKLQRIARQAIAALCALGGFKETIKIGSEVQVLGRGISGSVGVVASINEQEGIATVRFPPIDCRKTSSQASDTLTIPLSRLCVPRSEALPLHKLSITEKVVQAVQSMLLPQEGSLSIHTSLPATGDGSAPVMAVVRLLAEIRTRACLVM	1505231	1534539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1505263_1505793_1505895_1508382_1508582_1510787_1510908_1511942_1512048_1512982_1513147_1513727_1513962_1515150_1515344_1515715_1515821_1516775_1516865_1517253_1517430_1519251_1519388_1519506_1519649_1519745_1519913_1521995_1522143_1523045_1523231_1524608_1524763_1526057_1526339_1526561_1526752_1527993_1528076_1530260_1530464_1531196_1531333_1532149_1532333_1532865_1533034_1533441_1533612_1534522
876587	contig_15559_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_141897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGGAACAGCGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176385	174845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_174800_176400
876588	contig_6291_pilon	-	2641	2	Intergenic	novelGene_164775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGGAGAAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350140	339291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_340948_349155
876589	contig_3700_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_138088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272593	274468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_272600_274500
876590	contig_6076_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_81719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGCAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13209	15066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_13200_15100
876591	contig_12528_pilon	-	3385	1	Intergenic	novelGene_81357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAAGCTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013339	1009954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_1010000_1013300
876592	contig_19848_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_173819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAACTCACAAAATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50151	48065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_48100_50200
876593	contig_5954_pilon	+	735	4	Intergenic	novelGene_28562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	331	junction_1	64.1681818002938	4800	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	215	559	862074	862710	FALSE	15	GCGGTTTCTTTTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGVGPRGFPLRLQATEVRINPVEFNPEFVARMIPKVEWAALLEAADTLHLVEVPKGPTEGYERDEQFLRKMHHVLLEVDVLEGTLQCPESGRLFPISRGIPNMLLNDEETET	861859	862886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_862119_862204_862307_862431_862522_862602
876594	contig_12635_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_60847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTGGCCCTATCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547071	548031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_547100_548000
876595	contig_18392_pilon	-	3586	17	Intergenic	novelGene_143087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	237	539	73998	69115	TRUE	30	GTCAAGGAGAACGCGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMPAKPLRAQTSCRCASSHSVPHFFCRDVSSSSIVMVLFWSGKNSPRTACGWQQACLSLSSGYRMEVTVRLSRLLSFRAQSEIFLSFATASWQHTSCWR	98957	32901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_33105_45576_46248_48960_49091_49713_49934_52193_52271_53101_53257_57851_57963_58616_58872_60639_61298_62528_62785_63561_63639_68756_68923_69046_69302_73882_74005_94374_94467_96541_96631_98908
876596	contig_12540_pilon	+	1795	14	Intergenic	novelGene_148140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	900	1454	1350412	1352682	TRUE	30	AAAGCAGAGGTGTTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLLPHRVQVPVDGFCPFLGLPDLDSDIGVTGTCLVLCLQALGTDHGDADLGRPFGRPVQHALLDRLHLLRVRRLGHGEDLLNELEDLGLVALPDLHAVLEHHDDVLRAVLRPVLRALLRRPLQAVGVEQVLALLMALDAALRAAHALPRDAPQQPLTLVAVGGRGGRPHLEVVRCRARDGVD	1345826	1358936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1345961_1346162_1346255_1346932_1347002_1347291_1347442_1347847_1348013_1349311_1349433_1350102_1350269_1350409_1350552_1351350_1351578_1352494_1352719_1352956_1353028_1353786_1353863_1357953_1358003_1358827
876597	contig_13015_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_165545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCATTAAAATGACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347143	344858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_-_344900_347100
876598	contig_14666_pilon	+	3093	1	Intergenic	novelGene_39477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAAAGATTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26023	29116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_26000_29100
876599	contig_10158_pilon	-	3089	1	Intergenic	novelGene_150771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAATAAAATATAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58116	55027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_55000_58100
876600	contig_13014_pilon	-	649	4	Intergenic	novelGene_169370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	48	junction_1	33.3199973322661	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	403	423	539017	538997	FALSE	40	ATAAAATATCCGTGTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAGEALKAKERNEEEAERRKEEDQATLVEQVKRVKEIEAIESNSFVQQTFRSSKEVRKSVEPSEVKLAAAASGPASGAADPPSVEKEADPSCIPTAIKYQDDNSLAHPNLFIEKAEAEEKWFKRLIALRQERLMGSPVA	608878	538770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_539090_539739_539893_546952_547060_608808
876601	contig_12512_pilon	+	2430	4	Intergenic	novelGene_24172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.43650214343336	100	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTGACATAAGATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509606	513444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_511365_511487_511644_511745_511773_512955
876602	contig_9297_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_69903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTAATATCTAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971291	970246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_970200_971300
876603	contig_6635_pilon	-	1420	3	Intergenic	novelGene_127013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	112.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	268	774	377299	356355	FALSE	75	GAAAAGAAAATATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANYIHVPPGSPEVPKLNVTVQDQEEQRCREGALSLLQHLRPHWDPQEVTLQLFTDGITNKLIGCYVGNTMEDVVLVRIYGNKTELLVDRDEEVKSFRVLQAHGCAPQLYCTFNNGLCYEFIQGEALDPKHVCNPAIFRLRSLTNSEINSKLLAQVPRTGGETTRGSC	377566	355708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_356446_361649_361910_377143
876604	contig_1274_pilon	-	2166	8	Intergenic	novelGene_137817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	101.883687184385	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	246	749	520067	515190	FALSE	5	TTTTTCCCAGCTGTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSDIQIRRLQRLGIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRFLRKITIGQAPTEKGYTRTAQFDISVASEIMAVLALTSSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPISAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADRIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCLYSGLRPHVVVLVATVRALKMHGGGPTVTAGLPLPKAYTEEVTLIISDYLS	524647	513772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_515265_517691_517832_517958_518071_518449_518519_519959_520101_521277_521355_523144_523248_524615
876605	contig_11677_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_85890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTTGTTTATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408745	411109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_408700_411100
876606	contig_6062_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_5289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCACTGTCAGCAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755520	758433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_755500_758400
876607	contig_5999_pilon	+	2623	1	Intergenic	novelGene_45600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGCTAACAAATGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16039	18662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_16000_18700
876608	contig_5769_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_138760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141974	144054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_142000_144100
876609	contig_11096_pilon	+	2250	3	Intergenic	novelGene_143488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94.5	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTAAGGTGGCAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294741	298244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_294800_294880_294977_296148
876610	contig_8362_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_150681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2308	2691	90960	91343	NA	25	CCCAGCCCCCCGTGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANQKVGSLNPPGAPWKLYGGSSILSYRVAMSWNQLDGNGLGVGFTQDQAHGGERDPGIAWLNVYVVSKTSSKQQLCLARGCEAQNSARPGNQPEIVFQPNFEHEEEVGLRTWPLLSLRKDQRLVL	88652	91415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_88700_91400
876611	contig_992_pilon	+	3144	6	Intergenic	novelGene_164293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1231	1749	48358	72211	TRUE	10	GCTCGCAGGGGTGCCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISNSRSSLSSAWGISSITRNSSGFRMWSMSSKIGCKSQGSRRTCRNTVSFFSLVIKEPVLLSAEEPLDVESQRRSGSDSSTKKPLFLSWGEGSTVRRVEFSSFVLGLGMGLGLSGPGLVGRASLSVSSWAVSSISPRIFSTTSLRRCWRRALINWARLASGPRMVQCCRAA	47127	124366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_+_48515_50217_50449_72080_72343_98670_99170_100666_101323_124257
876612	contig_14341_pilon	+	2356	4	Intergenic	novelGene_111790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	10.6562449087639	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	90	1805	366147	375566	FALSE	30	AATAGAGTAGTGTGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPEEEAAAVTMAVGPPAARLQEPVTFRDVAVDFTREEWGQLDPAQRTLYRDVMLETFGHLVDVGPELPKPDVISQLEQGAELWVAERGLAQGCCPGWETRAEGQASSKGQGLPEEKPPCVMEREGFPRGALWPATLGEKWACEGQSEGLKKDQDDLKQLEFGLKEAPTQDRGSESLRLGQNCILSSGLNPLQEIPRGKHFSNYDSQVKSLEHNSSLINQQTGSSGKQPFGNSDCSKSFSQGVEVMQLGKIQIQDKPYKCTDCGKSFNHNAHLTVHKRIHTGERPYMCKECGKAFSQNSSLVQHERIHTGDKPYKCAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQYCGRAFNQNSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVCGKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQRKHVGEKPYECRQRLIFEQTAALVKQEWSEALGCSPPLSQDVRDDRPFKCSQCGKCFIQSSHLIRHQITHTREGPRGRNRREPTCSRSSHRIRHQYTHSVENTGGGTKARQPASRALALFDIHEIMQEKNPVHVIGVEEPSVGTSVLFDIKEST	366057	376117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_366213_371859_371987_372288_372385_374139
876613	contig_13051_pilon	+	1817	16	Intergenic	novelGene_140096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	101.674425933412	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	775	1710	145255	245480	FALSE	5	TTCCTGGGCTGGCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFDANKLYCSEVLAILLQDNDENRELLGELDGIDVLLQQLSVFKRHNPSTAEEQEMMENLFDSLCSCLMLSSNRERFLKGEGLQLMNLMLREKKISRSSALKVLDHAMIGPEGTDNCHKFVDILGLRTIFPLFMKSPRKIKKVGTTEKEHEEHVCSILASLLRNLRGQQRTRLLNKFTENDSEKVDRLMELHFKYLDAMQVADKKIEGEKHDMVRRGEIIDNDIEDEFYLRRLDAGLFVLQHICYIMAEICNASVPQIRQRVHQILNMRGSSIKIVRHIIKEYAENIGDGRSPEFRENEQKRILGLLENF	60148	245587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_60224_99795_99985_103695_103803_112338_112472_124640_124741_133403_133498_136172_136243_145248_145322_145547_145607_147308_147458_173374_173557_212571_212670_214758_214840_233732_233871_234075_234149_245391
876614	contig_13456_pilon	+	2742	1	Intergenic	novelGene_153280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCAGACAAGTTGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266949	269691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_266900_269700
876615	contig_10404_pilon	-	2323	5	Intergenic	novelGene_138651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	123.627211810345	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	183	911	823587	810785	FALSE	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRTSTVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLVQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQVILRGGILITDRKRTEFSTKDIYQDLNRLLKAKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDFNQYMKLDIAAVRALNLFQGSLEDTSGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQNCYQVYQGINQLPNVIQALEKYEGMERIFVCFFSFILTVYQANVPSLKS	823769	809372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_811065_818548_818683_819141_819292_821791_821939_823569
876616	contig_13014_pilon	-	3436	2	Intergenic	novelGene_169358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433504	426020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_427052_431099
876617	contig_17108_pilon	+	3204	2	Intergenic	novelGene_109538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	271	726	150984	151439	TRUE	80	AAAAAAAACAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEIGYVGLEIQLCCSCLCFLGKFLNLPVLLQRQWSNRAVKALALHQPTSVSLCVCVSRGVCLSRLRADQIPGWTPGLPCLLPRSTWSLQWNLALYGQDRDGPVTLLWRVIRGISHQRQFEVYECYTEENRTIVLSSKNVSVTFRKNINI	150713	160029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_153733_159844
876618	contig_12622_pilon	-	2947	1	Intergenic	novelGene_5781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150638	147691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_147700_150600
876619	contig_15120_pilon	+	2948	18	Intergenic	novelGene_108014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_12	98.282588122351	96	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	70	1986	219611	249224	FALSE	30	GCAAATATACTTTGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRAVAAAERRGSSCGYSSGARSMAATAVAAGSGPAEGTEVAEGPPGPAAALELWLNKATDPSVSEQDWLAIQNFCEQVNTDPKGSTHAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLETCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLGSWTTEKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPMDRILPPPSPWPKSSIFDADKEKSKLLTRLLKSSHPEDLQAANRLIKDLVKEEQEKSEKVSRRVSAVEEVRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQAVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNTVTSPVEDIPVSRVFQNPAGCMKNCPLIDLEVDSRSEQAGTLAPSLLHQDLAALGINDAAVTNELLHAHEAIEDTMDWVRRSLVLKVARQNCCKERRNPTPSTLPDGGVQSPSAERNLLDLLSPQPSPGPLNYVPQKSIPKEVPPGTKSSPGWSWEASSLVSTPSSQNTPLAQVFVPLESVKPSSLPPIVVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTATQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFNPLTPPAMISQMLLLENPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDLAVLGAA	219541	250186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_219711_229926_230012_230843_230920_231828_231928_232647_232772_234612_234717_236088_236170_236671_236810_237009_237092_240432_240559_241361_241485_241794_241824_242266_242333_242740_242875_244531_244690_247280_247451_248501_248613_249113
876620	contig_1154_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_87065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATATATATTTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164438	162243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_162200_164400
876621	contig_11986_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_69116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAAATACATTGTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107005	104846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_104800_107000
876622	contig_6375_pilon	-	540	5	Intergenic	novelGene_72999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	84.3130328003921	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTGCCACTTGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325861	320523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_320673_320803_320852_321338_321513_322127_322205_325769
876623	contig_6412_pilon	+	1837	3	Intergenic	novelGene_149955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAATAGAGAGAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222184	242298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_223830_225670_225763_242198
876624	contig_12178_pilon	+	4116	4	Intergenic	novelGene_156543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	30.0259147330361	190	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	145	1710	200569	215461	FALSE	20	TTTGATTTGCTAACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTPGSAGSGDASSVDIMDICESILERKRHDSERSTCSILEQTDIEAVEALVCMSSWGQRSQKGDLLKIRPLTPVSDSGDVTTTMHVDTAASELPKDFHSLSTLCMTPPQSPDLMEPSTGAPVPSQVTDSKACTVTAIAPASAVAAKVLSGKAGSGLPGSKPEMLEPAPGPPCRAVVTSVVTSVIRHTGESPAPAHIPAAQSQEQGLLDNRGEAQFLGPCAALQDTHLADSLLSTKSVSCQPCSDNSGGLIPTDKGQQAGWPVAVQNCSPKNYENYLPRKATHLISVPVPSPPVLCQMIPMSGQSSVIPAFLKSPPPLSAGTVKPILPQTTPVAQPVFMGPPVPQGTVMLVLPQAALPQPATCPSSVMAVGNTRLLPLAPAPVFIASSQNCAPQVDFSRRRNYVCNFPGCRKTYFKSSHLKAHLRSHTGEKPFNCSWDGCDKKFARSDELSRHRRTHTGEKKFVCPVCDRRFMRSDHLTKHARRHMTTKKIPGWQAEVGKLNRTALAEKPGSPLGTMPVSA	200424	217867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_200611_202315_202586_203924_204898_215180
876625	contig_12257_pilon	+	1824	8	Intergenic	novelGene_152087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	77.6916983982201	157	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	105	1346	111073	115500	TRUE	5	GGTGCCTCTGCTCATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSSSKELLVSALQELESSANSSTPNKHVHFEHNMSLFLWTESPNDLPPDAAWVKVANRAQFASTGLSMKAHAVSPCVQSFCSALDSKLKVQLDDLLAYLPSDDASLPKDASPKNSAFDRYADAGTVQEMLQMHSVACIQHITARICAELQSIEEVVHRQLGVLTGVKLHAVLFMARLCQSLGELCPHLKQCILGKSGSSEKPAREPRALKKQGKGKAQELMPLQTKWQEVKGLLLQQSVTAYRVWSSAVVQVLVHEFTQSLLSDDAGSVLATATSWDELEIQEETESGSSVTSKIRLPVQPSWNVQSFLFSLCQEVSRAGGHALPKVTVQEALRSCVVQVAAAYEKLAEEKQTKKEGAFPVTQNQALQLLYDLRYLSIILTAKSEEAKSGRSKQDSRCPTPSTVLSRACSPKAISPFSEATKEKSASHCTLCLNSQCSCYQQELRK	110968	117587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_111727_112555_112703_113443_113606_114688_114954_115486_115596_116043_116154_116234_116314_117393
876627	contig_2332_pilon	+	271	4	Intergenic	novelGene_58677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3327.57692957236	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAAATATATCCGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331269	333012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331285_331431_331494_332053_332150_332914
876628	contig_12485_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_147286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGTAAAAATGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129463	131112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_129500_131100
876629	contig_829_pilon	-	2983	1	Intergenic	novelGene_168925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1115	1444	70332	70003	NA	80	GAAAAAAAAAAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDSNQQQQSLALLCAEASHHILCRWWWCLAHRSSCLWVGDGQLVSYGAGCNKARGLVAQWLRPWLLTKRSAVQIHQPLVGNPMGQFYSVLWGRFVFKSTRQQRV	71446	68463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_-_68500_71400
876630	contig_7272_pilon	-	3422	19	Intergenic	novelGene_25408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_13	193.417095520293	113	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	72	2417	879441	805318	FALSE	10	CCTTGCTCTTCCATGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFPAYLLGINQERLKEKLTSRQMDSKWGGKSESIHVTLNVEQACYTRDALAKALHARVFDFLVDAINKAMEKDHQEYNIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKTEQEEYVQEGIRWTPIEYFNNKIVCDLIENKVNPPGIMSILDDVCATMHAVGEGADQTLLQKLQMQIGNHEHFNSWNQGFIIHHYAGKVSYDMDGFCERNRDVLFMDLIELMQSSELPFIKSLFPENLQADKKGRPTTAGSKIKKQANDLVSTLMKCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEESRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGYAYRRIFQKFLQRYAILTKDTWPSWRGDEKQGVLHLLQSVHMDSDQFQLGRSKVFIKAPESLFLLEEMRERKYDGYARVIQKSWRKFVARKKYVQMREEASDLLLNKKERRRNSINRNFLGDYIGMEEHPELQQFVGKREKIDFADTVTKYDRRFKGVKRDLLLTPKCLYLIGREKVKQGPDKGLVKEVLKRKIEMERILSVSLSTMQDDIFILHEQEYDSLLESVFKTEFLSLLAKRYEEKTQKQLPLKFSNTLELKLKKENWGPWSAGGSRQVQFHQGFGDMAILKPSNKVLQVSIGPGLPKNSRPTRRNTIQNKGYSGGIQNTNYPTRVAPPPPGYHQNGVIKNKFAPHPHGPGNQRSNQKSLYTSMARPPLPRQQSTGSDRVFQTPESLDFLKVPDQGAAGVRRQTTSRPPPAGGRPKPQPKPKPQMPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI	879512	804312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_805395_809326_809497_821617_821820_824906_825000_827440_827599_829283_829431_839631_839778_841118_841289_841501_841617_845993_846139_852875_852975_859447_859555_867136_867219_869751_869838_871081_871250_872253_872341_875405_875493_875795_875877_879315
876631	contig_3394_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_152700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506237	504002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_504000_506200
876632	contig_20948_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_178188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGCCCTCACGTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20017	18024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20948_pilon_-_18000_20000
876633	contig_14450_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_49020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	929	1339	1193182	1192772	NA	35	GCAGGTTATATAAGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRDVECILFVVALISKNNLLDVNRDKKHPMFIIFFFYITFFFVTTSPVPTESITGNLASQEAPLSCLHCSGAQVPLKAGHLGFTCQRHCSTWSSGSAGRSVVTRGCKPISVPFQWNFLLHTKLLQASCKQAGVC	1194110	1192255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1192300_1194100
876634	contig_9554_pilon	+	2033	3	Intergenic	novelGene_170677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3.5	88	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	208	819	9088	10782	FALSE	25	AGACCAGGCCTTCAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKFPCGRTVKRKLSSLKHDVDQVDPRLVNGKLTKWGESPWQVLLLDSKKKLACGAVLIHPSWVLTAAHCMEDARKLIVRLGEYDLRRWEKWEVDLDIGNVFIHPNYSRSTTDNDIALLRLARPATLSQTIVPICLPDSGLSERELTQVGQEVVVTGWGYRSEIKRNRTFVLNFIKIPVVARNECIRAMHNMVSENMLCAGILGDPRDACDGDSGGPMVTSFRGTWFLVGLVSWGEGCGRLHNYGIYTKVSRYLNWIHSYLGAKDTALQVQVP	8057	11996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_+_8181_9003_9122_10204
876635	contig_12125_pilon	+	2155	12	Intergenic	novelGene_76223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_9	78.9457392901359	203	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	81	1943	360400	374094	FALSE	0	GGTCCTGTTTCTGTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLRWAVSEVQHHDAITGTESPKVRDMYKEHLVTGMLGVWKLIATIVLAGPEVEEKRAAPAADSGPEGHSAVVYNPLAWAVTTIVTLTVSFPRVRITDESGHPVPAQIQNSTSTPSTYDLHILTTIPGLSYRHYSITPTVGAQEGIQEPAAALASTVQFGRRPRRRSSHRGRRLVPVVNDCYTVLLDRDTNLMHSIRESWSNRTVHVTQEFLEYHANGDVKQGPISDNYLFAPHEAAVPAWGAVGMEIVAGKLLTEVRQYFYRDPADKEHMYAIHSRLAHVPPRGSEGELLCGRIEQEYRVGPLELNREAVLRTSTDLDSQQVIHTDDNGYQMQLRPPLVHTDNSIARSYYPMVQAAFIEDHRSRLVLLSERAHGVSSQGSGQVEVMLHRRLWNNLQWDLGYNLTLNDTSAVRPVLWLLLGPQAVTAALRPRGGLALQHRPVVLYGELAGPRQQAAVTLPPSLHLQTLSIPGWKYSSNHTEHMQSLQEGRRGEVEANLRRVLLRLHHLYEAGEDPLLSQPMTVDLQAVLRGLGTVVAVEERSLTGTSDVRTLRRWSWRTRTRRHHGGGSSSPPRTPRRSHCHSPPEGNPHILHSLPREVSRRRCRGLRDSTEQNRTREGAGRPSICPRGHYQSSWLISGVGQLGPW	359214	374306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_359244_360348_360515_361563_361692_364458_364734_365731_365924_366906_367163_368081_368193_368272_368466_370160_370278_371608_371722_372430_372552_373852
876636	contig_8059_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_111122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339921	342012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_339900_342000
876637	contig_10855_pilon	-	2416	7	Intergenic	novelGene_124340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	49.2803769826851	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	1025	1732	560283	548089	FALSE	20	CCTGTGATTTCTTAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGGLRSKRGPKAGPQGSLLRSYLSHLERITEEGYIPTAQDVLRSRMPTTGIKEYCFSVQKTNLRIVDVGGQKSERKKWIHCFENVIALIYLASLSEYDQCLEENNQENRMKESLALFGTILELPWFKSTSVILFLNKTDILEEKISTSHLATYFPSFQGPKQDAEAAKRFILDMYIGMYMGCAEDAIGSKKCPRSRRLFSHYTCATDTQNIRKVFKDVRDSVLARYLDEINLL	575640	547404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_548316_554345_554500_557699_557830_560086_560533_561145_561301_562179_562365_575205
876638	contig_12672_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_141488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAGGAAGTGAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188716	190770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_188700_190800
876640	contig_10324_pilon	-	1233	2	Intergenic	novelGene_7730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55610	54176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_54808_55008
876641	contig_10734_pilon	+	3787	1	Intergenic	novelGene_51109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	826	1125	668511	668810	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLMCCRKGRRGSWCFILPLRSASTGGQSGVGTLPPWSVAGIRGGGYFKFTSEHSTSGVERAAQEELALEEEWLASLRFPVSPECLTPAPSPPCLLQR	667685	671472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_667700_671500
876642	contig_8866_pilon	-	3200	1	Intergenic	novelGene_77851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAACTAAAAACCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654631	651431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_651400_654600
876643	contig_500_pilon	+	1881	6	Intergenic	novelGene_30923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_3	66.6483308118065	815	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	51	1205	1079995	1089765	FALSE	20	AGGATTTATCGTCCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFSAQTAEVEIPGEFLMPKPTHYYIKIARFMPRVEIVQKHNTAARRLYIRGHNGKIYPYLVMNDACLTESRREERVLQLLRLLNPCLEKRKETTKRHLFFTVPRVVAVSPQMRLVEDNPSSLSLVEIYKQRCAKKGIEHDNPISRYYDRLATVQARGTQASHQVLRDILKEVQSNMVPRSMLKEWALHTFPNATDYWTFRKMFTIQLALIGFAEFVLHLNRLNPEMLQIAQDTGKLNVAYFRFDINDATGDLDANRPVPFRLTPNISEFLTTIGVSGPLTASMIAVARCFAQPNFKVDGILKTVLRDEIIAWHKKTQEDTSSPALRCRAAGEHGQPAAGLPGPEGGDRHCDAPAQPGAVRGWGEQGEHPGGRGQQPGQPVPHGPRLAPVAVTPCAAHPGM	1079944	1090441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1080033_1081309_1081528_1083490_1083676_1086058_1086263_1086347_1086543_1089450
876644	contig_14925_pilon	+	3691	1	Intergenic	novelGene_55226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGACCCACAATAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30779	34470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_30800_34500
876645	contig_9656_pilon	-	736	1	Intergenic	novelGene_121906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	651	86	736	193045	192395	NA	45	AGTGTTAAGATTGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKDHFNETNQHDSKNQFVSLGSICFPEAMLLSDERNILSNVDDILAATAAACGVTPSEFSKSTSNETIQSIEEGDSKSHFQQALDVRHVTSDFNAITATVGKPQNINEISLNGSQIAINLSPVPTLQSKMTLDQKHIETPDQSTASKVTSSVVGTSHEGQEQSSGSVKKYSSTNHESEENSEVPIDNTLNNNRNQEFVSSSRSISGESATSESEFTLGGDDSGVSGNPTRSALVLLAMAQPGDAI	193130	192394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_192400_193100
876646	contig_7708_pilon	-	3494	2	Intergenic	novelGene_61527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCACGTTACCCTGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253972	249520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_-_249662_250619
876647	contig_9919_pilon	-	2383	13	Intergenic	novelGene_137984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_1	31.3983147106125	31	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	323	1543	817991	766672	FALSE	40	TAAATCTTTATTGAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYMQLLTVTVIVRLLYLRCTRKSGPDQSALCAACCLLTSLCDTVGAILARQLTIQVFTGAYLAAIDLVNFMFILFPVCGSKFKSHSGRGSRERKRRQRLKATIFALALPLSLGPGWALWASVPKASGPVQGPQRRLLGSLLQENIEIFGYLLGGIAAFGSWASQIPTLSRICQGKAFPSLHLWMRFLLALGCLLYASAIVAHSQQPEYLLRATPWFLTSLGRAALDLAVIFLSCVMKSKMRRVLGLATEARESPDTQALLTCAEKDEEGSQEVQSKKKFSRSFIFMNPDWVPLTTLPNYKSLRTMGVISHYMEMTIEPVQQAGCSATRLPDDQQMSTGDVSLQEPPSYPPVQVIRARVSSSSSSEVSSINSDLEWDPEDVHLERSKDNMEMLRSQAHRGSMSQWT	826058	765831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_766768_785412_785572_791906_792012_793650_793675_794571_794722_797090_797262_803342_803430_803628_803796_807290_807385_809633_809761_817950_818050_823980_824186_825999
876648	contig_1154_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_87184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAGAAGATAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988588	989809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_988600_989800
876649	contig_1150_pilon	+	2884	2	Intergenic	novelGene_61372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCGTTCATCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257639	261963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_257812_259251
876650	contig_12125_pilon	+	2587	14	Intergenic	novelGene_76241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	90.9742144363319	70	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	113	2146	569653	650223	FALSE	35	TCAGCAGCAGCTCATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRDGRLGSHLPSLPSLNLKASRSLSLPEHGPKLPLGTAEDQHSLESVDSGIPTLEIGNPEPVPCSVAHTQRKPSEPEAIPERASQSACPLPSCALPAPTGAEREQGVRKSSTFPRTGYDAVRLCSPTARALSRSDAASVCSVSSLGTELSATLSVSNEDLLDLVTSSSSAIVALENDDDPPFTDVTLGSTKEASGPAQQDGAEEPEEGSKSGLLGPLSHFLARNLLARKQNARLDKQNDLGWKLFGKVLLRENAQKDSKKVQKENEDKVGQPSRPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVAQARKRELKEAQRRRRQLEERCRLEESIGHAVLTWNNEILPNWETMWSSRKVRDLWWQGIPPSVRGRVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTGGPDGESEDAGLPVADREASLELIKLDISRTFPSLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTALGVLRLFQDVLAKMDFIHMAQFLTRLPEDLPPEEFFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMERGGPSPRH	557803	650664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_557854_569590_570327_605400_605522_627473_627593_628526_628610_630174_630293_630834_630942_635518_635600_636714_636810_641978_642051_642864_642994_646465_646576_647175_647435_650157
876651	contig_14516_pilon	+	3845	2	Intergenic	novelGene_153941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATCTTGATATTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342435	346709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_345709_346137
876652	contig_13093_pilon	+	2122	2	Intergenic	novelGene_105230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGTGGAGAAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78274	80572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_80122_80297
876653	contig_7996_pilon	-	1973	10	Intergenic	novelGene_165150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	74.7669630614491	339	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	203	1579	263312	212693	FALSE	25	AGCTAATCCTATTGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGGPCPAGAGGGSGGASCAVGVSPGGVSMFRWLEVLEKEFDKAFVDVDLLLGEIDPDQADITYEGRQKMTSLSSCFAQLCHKAQTVSQINHKLEAQLVDLKSELTETQAEKVVLEKEVHEQLLQLHSVQLQLHAKTGQSVDSGTIKAKLSVPSVEELERELEANKKEKMKEAQLEAEVKLLRKENEALRRHIAVLQAEVYGARLAAKYLDKELAGRVQQIQLLGRDMKGPAHDKLWNQLEAEIHLHRHKTVIRACRGRNDLKRPLQAPPGHDQDSLKKSQGVGPIRKVLLLKEDHEGLGISITGGKEHGVPILISEIHPGQPADRCGGLHVGDAILAVNGVNLRDTKHKEAVTILSQQRGEIEFEVVYVAPEVDSDDENVEYEDESGHRYRLYLDELEGGGNPGASCKDTSGEIKVLQGFNKKAVTDAHENGDLGTSSETPLDDSDSKLDDLHSVF	263514	212298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_212704_216581_216687_218813_218995_222166_222332_223835_223932_226681_226848_227937_228114_230982_231007_232763_232929_263024
876654	scaffold_17306_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_175321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTGATTCCTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204683	202515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_202500_204700
876655	contig_7057_pilon	+	2169	9	Intergenic	novelGene_123176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	83.8570211729465	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	267	1886	17976	27970	FALSE	30	AGAACCTGTGAATTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLFGPSLLLLEYLAFSDSSTWNIDHPDTLYSWEGACVWIPCLYRIPAYSKSLDSLTLYHNFTYDSITKNFIGNILYSSKNATTVPERVQFLGDHKSNCSLRIEPVHVTDSGQLGLRMVSGTQKWMEKINLSVSEKPPPLHIQLPPEIQEHREVTLTCSLKFACPGYQIKLQWSMESPAVTSTSLGTKILSTESKLTFQPQWTHNGQNLTCQLKDLTTEKILSQETVRLNVKHRPKLEIKLEEATVKVGESVTITCHVISSNPEHQNISWFKDNTELRVQEPTRLTLSAVSKEDSGKYHCHTFNDVGSSDSKDVVLQVQFTPEPSTVQINPLPAKEKEMVELTCISVACPPPTNYTWYHNGKKLEGRTEKNFQIPNILLSNAGNYSCSAENILGSGKVGSEAELDVQYPPKGVTTVIQNPTPIREGDDVTLVCNYNSSNPGVTEYKWSTHVFKNESFPNVSMIRKVPWNAKTIACEACNGWCSKSPSIKLDVPWSFSTLLPYPELYDSPCPSPAICTICPQTPFPVLFLVLPLSYLFDS	14609	28253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_14654_17322_17523_17953_18010_18268_18638_19628_19923_21560_21822_21975_22240_23131_23383_27823
876656	contig_16110_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_126790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAATAAAATAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81184	83171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_81200_83200
876657	contig_1399_pilon	+	2951	4	Intergenic	novelGene_166669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	31.2089730686545	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	218	862	456891	536895	TRUE	30	TGTTTAGTTTACAGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACRAPQGTQLTDRRRARLTTPSAAEAARAVHDFQFPPQPRGRGGAACVQCAQSVPANSPAAHVGLGTKHQGTMVCKTLFALCIFTAGLRVQSLPTSTLLPVSPSSTITLPTSIWITSPQNTAAATASLTSGTHNNSLLPVTSSSQTSPHPKITSTETREEEFTTPASTWEGTSADPSPPGFSPTSGGVRLTPTPAEHSSGTSETSVPPTGSQSPAESPTLISSQAPASSPSSPSTSLPEVPSASVTSDHSSAVTSTKPSGTPTPAESTAEERTSGHTPTLHATTGR	456673	573068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_456934_536293_537019_553570_553650_571181
876658	scaffold_13505_pilon	-	415	6	Intergenic	novelGene_111482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6158.2052255507	85	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	36	308	547805	541339	TRUE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAATSAEAPRAWPAGSSKPWRGSKWWRRTKMGAAN	548330	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_541936_547363_547465_547734_547806_548295
876659	contig_15867_pilon	+	3400	2	Intergenic	novelGene_170889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	0	17	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3085	3390	72641	72946	FALSE	35	AAGTGAGATTCGGTGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPGERSYSLPEDMVWDTVRSCTAASLRQKVADFYSLPVEKIEIAKYFPEKFEWIPISSWVKSGAFSDNLGLLAQQTQGGRGALLETHWTLLMSVTGYSN	69178	72956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_69310_69687
876660	contig_6589_pilon	+	690	8	Intergenic	novelGene_26100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2504.32698197601	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	25	489	1876599	1880184	TRUE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKVSLTRPYAVPTHLASKKRMVVPAALKVVRLKPTRDASLMR	1876574	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879630_1879758_1879814_1880161_1880274_1880498
876661	contig_10765_pilon	+	1598	5	Intergenic	novelGene_122843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	198.772954649268	349	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	149	661	15747	34929	FALSE	20	ACTTCCGAGGTCTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCRVRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRWGGPLGSHGHIDVTNDC	15598	35866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727
876662	contig_15888_pilon	-	1113	8	Intergenic	novelGene_84412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1801.2557411145	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	37	693	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSWPRLRPPPDPSGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259762	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251731_252020_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254099_254630_254685_259659
876663	contig_14338_pilon	-	1326	7	Intergenic	novelGene_174828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2.80871659105879	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	400	783	21806	18272	TRUE	40	TCTCAATAACCCTTACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLALHQPAPPSLLQDLICTSRHTPTLLVVRMSPGRLTPDRESGISASAIVPPSSCASQDLLRAGSDQLSFMTSRLWQTGPPCAERLQERWHCAGEHQAPGPKVCQLIVMKIPGSVVLALQGEAGP	23462	13793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_-_14142_14243_14346_16377_16461_18261_18344_19978_20184_21699_21859_23115
876665	contig_12079_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_67366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGAGACCTCCAAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290202	287764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_287800_290200
876666	contig_10235_pilon	+	2083	10	Intergenic	novelGene_46571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCAGGAGTTCCCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537164	541389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_537424_537595_537824_538325_538409_538547_538660_538882_538955_539167_539249_539462_539577_539726_539906_540346_540442_540529
876667	contig_7378_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_120258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	367	684	428358	428041	NA	30	ACACCTTCAAGACGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSYDESLKMQKQTLIPTCSEPHPPIPQGTYTEHRIQFENHSCKGKGMSSFRDRYQNQLPKSFPTHADSMCVRVELCFIGFSVADFLEVDCQAFLLRLLFVDSNL	428724	426815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_426800_428700
876668	contig_5727_pilon	-	2110	12	Intergenic	novelGene_7991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_8	310.365207430651	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1791	319	2109	544040	506170	FALSE	20	AGGCTGGCTCCATCACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSAPGSAEMPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKEAKERELQRELAEQKSVETVKRKKSFKMIRSQSLSLQMPTQPDWKGPTTTSPVMSPMTPVVTGTPQLMPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITVEDYEQAAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRTTAQYLGHGRADTAPPEEGLPDFHPPPHPQEDPYCLDDAPPNLGYLVHMQGGIFFVYDNKKMLQRQEPHSLPYPDLETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKELKSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKWGRKITLRQVFDSLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASELRDLYLKTENYLGGEYFARMVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPKEWPNLARWFIQHKVYSPNMRWIIQVPRIYDIFRSKKLLPSFGKMLENIFLPLFEATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKHSDHMFSDKSPSPEIWTSEQNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCG	544358	506168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_506213_507359_507524_510432_510560_511304_511469_511984_512117_513045_513241_518678_518809_521247_521468_524118_524282_529193_529396_539591_539818_544015
876669	contig_19737_pilon	+	2218	13	Intergenic	novelGene_158957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	334.512694909409	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	122	1207	16052	50890	FALSE	15	TACGTTTGTATTTTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DATSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFGSLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE	15855	51901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_15866_15940_16055_21809_21912_35434_35528_37367_37499_38872_38933_40063_40173_41152_41207_47230_47282_47575_47696_47781_47910_48698_48801_50757
876670	contig_6163_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_103864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTTTTTCAAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510172	508112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_508100_510200
876671	contig_7707_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_72160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAGGAGCAGCTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245166	247561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_245200_247600
876672	contig_3948_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_53341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATGACAGGTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1494167	1490979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1491000_1494200
876673	contig_15732_pilon	+	2661	1	Intergenic	novelGene_88896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCAAGTTTGTCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235704	238365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_235700_238400
876674	contig_11378_pilon	-	709	4	Intergenic	novelGene_112331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_2	196.350593468814	404	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	108	497	1247699	1245998	FALSE	40	AAACGATGTTGATAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLLRGAGALAAQALRARRPNGVAAVRSMASGGGVPTDDEQATGLEREVLLAARKGLDPYNILPPKAAAGTKEDPNLVPSITDKRIVGCICEEDNSAVIWFWLHKGEAQRCPSCGTHYKLVPHQLAH	1247806	1245785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1246111_1246712_1246813_1246991_1247066_1247596
876675	contig_11563_pilon	-	2769	13	Intergenic	novelGene_142303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	5.65869537378832	75	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	41	1969	342339	158887	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIMKLHRHFQRTVILLATFCMVSIIISAYYLYSGYKQDNELSEMASEVDCGDLQHLPYRLMEVKTTKPFDASRTDPIVLVFVESQYSSLGQDIIMILESSRFQYHIEIAPGKGDLPALIDKTRGKYILIIYENILKYINMDSWNRSLLDKYCIEYGVGVIGFHKTSEKSLQNFQLKGFPFSIYGNLAVKDCCVNSHSPLLRVTKSSKLEKVPLPRTDWTVFQTNHSAYQPVIFAKVKTPENLSPPISKGAFYATIIHDLGLHDGIQRVLFGNNLNFWLHKLIFIDAVSFLSGKRLTLSLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMNTNDVKALLDTQNLLRAQIINFTFNLGFSGKFYHTGTEEEDEGDDCLLGSVDEFWWFPHMWSHMQPHLFHNESSLVEQMILNKKFALEHGIPTDMGYAVAPHHSGVYPVHVQLYEAWKKVWNIKITSTEEYPHLKPARYRRGFIHKNIMVLPRQTCGLFTHTIFYKEYPGGPKELDNSIQGGELFFTVVLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFVNLANFVQSWTNLRLQTLPPLQLAHKYFELFPEQKDPLWQNPCDDKRHRDIWSKEKTCDRLPKFLIIGPQKTGTTALYLFLVMHPSILSNSPSPKTFEEVYGFFPCSI	342379	133398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_133670_137598_137702_153464_153575_154937_155109_158741_158917_163052_163133_169723_169821_172035_172219_230209_230339_235872_236059_261279_261435_275654_275743_341358
876676	contig_6058_pilon	-	3183	1	Intergenic	novelGene_172373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATGTAGGTATGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264350	261167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_261200_264400
876677	contig_3942_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_128717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	858	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGAGCTGCTTTGGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525524	523940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_523900_525500
876679	contig_6048_pilon	-	2034	9	Intergenic	novelGene_73342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	93.0482905538839	289	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	234	836	2910414	2903745	FALSE	10	CTCCAGAGTGGTCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSDCQLLREQWIRAKYERNEFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNKNDAKEPKAIMKIEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFVYHEDAKEIVDWFNALRAARFHYLQVAFPGASDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMDDRRLMYFKDPLDAFARGEVFIGSKEGGYSVLEGLPPTTQGHHWAHGVTIVTPDRKFLFACETEADRREWVAAFQSVVDRPMLPQEYAVEAHFKHKP	2929515	2902546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2903774_2903965_2904195_2904364_2904437_2904916_2904980_2905544_2905629_2910288_2910436_2910925_2911039_2924515_2924599_2929499
876680	contig_5988_pilon	+	2222	13	Intergenic	novelGene_16037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	7.29678391865592	48	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	751	2088	843481	845894	FALSE	10	CTTCTAGTTTTCTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLVQKPPFSIHRPLVGTAGPRPKTTHQSERSVESPQLRKPLEELTLSPGEQNVGPGPPPPTEAPGAIEFVADPAALATILSGEGVKSCHLGRQPSLAQRVLVRGSQRSTLQRGQGARASAYLAPRTPNHRLGLARASCFSRLEGPGPRGRTLYPQRLETLIPPSERSFHSSTRPNFLELRRVTGGSNRTSVSQASGLPVETPSQPASCLPEGEREVVTHSDKGRGGPLCLAQRVPLRETHTKDSRDSHLMPSPAPVAQPMPGRMVPPTVTRPSPFGWAQRVPSPHLSAPTSYSVLRHLAIHPKTQFTPIPRVKQSRWVSGLSPQSCPEPEEPVLPWEQIAVQLFDQESSMRLQEEPAKPPVAPNELPPNRTPNLQELKMQRISILQQLLRQEVEGLAGDKYAALNGDLSLDMVELHPLLAEISRTLNAPEHNSGTSRLPRLSQHSDLQKPCLPEECGEPQPCPPTEPGVPDSCYKRESEIPETSPQQQPGVLEPCSPAEPEVPDSCYRRESEIPEPSLQQQSGVPEPCPPAEHGPHQHSPQGKTGFPQPHPRVEPGAPEACPREPGSPESIQQPHNNNQCAPVPTSLIFTSQHPLFTSPPIHSLQSLRPLPGQSGPRSLAPRTLALRQRLKACLTAIHCFHEARLDDECAFYTSRAPPPGPTRVCTNPVATLLEWQDALCFIPVGSAASQGSPS	839799	846028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_839987_840514_840673_840761_840900_841088_841172_841624_841678_842123_842234_843459_843601_843707_843783_843938_844005_844262_844395_844506_845210_845478_845673_845846
876681	contig_2342_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_132751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGTATTAAAACCAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112220	110115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_110100_112200
876682	contig_3601_pilon	-	3288	1	Intergenic	novelGene_132981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTTTTTGTGTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186337	1183049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1183000_1186300
876683	contig_11396_pilon	-	1639	6	Intergenic	novelGene_71372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	161.010558659984	326	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	309	950	1044553	1042235	FALSE	20	TGGCCTCTAAGGAAGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLNNLHIQRADMNRLIMNYLVTEGFKEAAEKFRMESGVEPSVDLETLDERIKIREMVLKGRIQEAIARINSLHPELLDTNRYLYFHLQQQHLIELIRQRETEAALEFAQTQLAEQGEESRECLTEMERTLALLAFDSPEESPFGDLLNTMQRQKVWSEVNQAVLDYENRESTPKLAKLLKLLLWAQNELDQKKVKYPKMTDLSKGVIEEPK	1048235	1041545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1042409_1042609_1042808_1043103_1043301_1044480_1044611_1047579_1047777_1048181
876684	contig_7396_pilon	-	2894	4	Intergenic	novelGene_79523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	36.7090663944965	133	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1581	2504	208996	194786	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKQEQNGGAAASLGVGQVRAGPSGPETGQCENRQGHLPGNACGPRLGARPSSLRGFGPSECLGSERSRRPPAPSTQGIPITSASYYATVTLEQVQHIFRSDTDVPMPLIEERHRILNETGKILLEKFEGSFLNCVRKSEQSAQKLMHLVVESFPSYRDVTQFEGKRISFYKRAQILVADTWSVLEGQGDGCFKDISSITMFADYRLPQVLLHLGALRYSDELQKKLLKGEMLSYGDKQEVEIRGCSVWCVELIRDCLLELIEKKGEKISGEINSILLDYYLWDYARDHRADMNGIPFHHTRCIYY	210576	194395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_195019_201889_202086_207475_207736_208761
876685	contig_3825_pilon	-	1848	2	Intergenic	novelGene_78031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGAACAAGGAGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1914664	1912721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1914456_1914550
876686	contig_3410_pilon	-	3045	9	Intergenic	novelGene_58954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.2075107727802	105	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	23	961	381567	374722	TRUE	5	GCCTTTTGTCTCCACGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLMVAKWTGDFFNKGIYDIHVGLRGVPLLEWETEVEMDKLRASDIMEPNLTYVYPHTRIQSLVSILRTTVHHAFPVVTENRGNEKEFMKGNQLISNNIKFKKSSILTRAGEQRKRSQSMKSYPSSELRNVCDEHIASEEQAEKEDLLQQMLERRYTPYPNLYPDQSPSEDWTMEERFRPLTFHGLILRSQLVTLLVRGVCYSENQSSASQPRLSYAEMAEDYPRYPDIHDLDLTLLNPRMIVDVTPYMNPSPFTVSPNTHVSQVFNLFRTMGLRHLPVVNAVGEIVGIITRHNLTYEFLQARLRQHYQSI	381589	371909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_372399_373126_374803_377582_377709_377864_377973_378665_378823_379003_379162_380016_380204_381358_381466_381552
876687	contig_12008_pilon	+	2788	12	Intergenic	novelGene_25013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	99.7823250715988	82	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	888	1952	76307	78661	FALSE	10	TGAGATGGGCTGGGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLEESKYQNAELRLSIYGRSRDEWDKLARWAVMHRVHSPNVRWLVQVPRLFDVYRTKGQLANFQEMLENIFLPLFEATVYPASHPELHLFLEHVDGFDSVDDESKPENHVFNMESPLPEAWVEEDNPPYSYYLYYTFANMAMLNHLRRQRGFHTFVLRPHCGEAGPIHHLVSAFMLAENISHGLLLRKAPVLQYLYYLAQIGIAMSPLSNNSLFLSYHRNPLPEYLSRGLMVSLSTDDPLQFHFTKEPLMEEYSIATQVWKLSSCDMCELARNSVLMSGFSHKVKSHWLGPNYTKEGPEGNDIRRTNLPDIRVGYRYETLCQELALITQAVQSEMLETIPEEAGLTPSPGPQ	73912	79497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_74024_74322_74467_74576_74667_74874_75005_75169_75576_76300_76465_76729_76857_76933_77098_77397_77519_77800_77975_78180_78292_78451
876688	contig_20610_pilon	+	2689	1	Intergenic	novelGene_67641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATTTAACTATGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45688	48377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_45700_48400
876689	contig_10404_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_138639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACACAAACAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448985	446540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_446500_449000
876690	contig_6227_pilon	-	1086	1	Intergenic	novelGene_49693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTCATGATAGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938053	936967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_937000_938100
876691	contig_6137_pilon	+	2191	6	Intergenic	novelGene_59312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	156.418668962499	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	458	817	1679112	1682065	FALSE	40	AAAGATTAACTTCTCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVISCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTSNVDKEEEAVTIEMNEPVQLTFALRYLNFFTKATPLSPTVTLSMSSDVL	1677200	1683439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1677571_1678870_1678932_1679085_1679154_1679889_1680085_1681848_1681966_1682059
876692	contig_4754_pilon	-	2204	2	Intergenic	novelGene_35919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTACTTTTTGACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232908	219033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_219085_230755
876693	contig_14682_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_139132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGTAAGAGGAGACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156258	158740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_156300_158700
876694	contig_10734_pilon	-	3810	9	Intergenic	novelGene_51316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_6	69.0181135644839	43	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	75	1259	1466514	1460594	FALSE	10	CCCCGGCTTTCTGAAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITTHPPTPSASSCGLALSSVIQPPMVGPCQPHLTFVPPKPVSLTGGRPKHPPKIVPAPKPEPVSLVLKNACITPAAFPGQPQAVIMTSGPLKREGMLASTVSQSNVVIAPATIARAPGVTEFHSSILVADLGHTPGSQPPISRLFSPGTVPDTLVKGEQGPMHGGGPQLPSAGPSRECPSSGQASPCASEQSPSPQSPQNNCSGKSPADPKNVAVLKNRQMKHISAEQKRRFNIKIGFDTLNSLISNNSKLTSHAITLQKTVEYITKLQQERSQLQEEARRLREEIEALNATIISCQQLLPATGVPVTRRQFDHMKDMFDEYVKSRTLQNWKFWIFSIIIKPLFESFKGMVSTSSLEELHRTALFWLDQRCSLPILRPMVLNTLRRLSTTTSILTDPAQLPEQASEAVTRIGKRMGES	1466588	1458042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1460716_1461599_1461730_1462689_1462814_1462960_1463089_1463225_1463328_1463928_1464057_1465494_1465673_1465808_1465931_1466363
876695	contig_8354_pilon	-	2712	2	Intergenic	novelGene_24067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	159	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	35797	35444	TRUE	25	ACCATCATCTGGCTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWAAGELLGWKCGSWHSCPTPQPGKLLPHRGPEEALVSPGAAWPPLPCVQAAQGQGAFAGANGGNDTPGAGGCRPHSKAQHGPGWPGSLAQRVGDLCVLSSCQQHSPSDPHHASCFL	35797	32961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_35297_35420
876696	contig_10638_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_164311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACCCCGGCAGAATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501211	498681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_498700_501200
876697	contig_3155_pilon	-	2052	8	Intergenic	novelGene_26347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_3	50.4692268332184	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	45	782	149923	143092	FALSE	30	TCCAGTTGGAACTAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNRPGDRILDIDIPMSVGIIDPRANPTQLNTVEFLWDPAKRTSVFIQVHCISTEFTMRKHGGEKGVPFRVQIDTFKENENGEYTEHLHSASCQIKVFKPKGADRKQKTDREKMEKRTPHEKEKYQPSYETTILTECSPWPEITYVNNSPSPGFNSSHSSFSLGEGNGSPNHQPEPPPPVTDNLLPTSTPQEAQQWLHRNRFSTFTRLFTNFSGADLLKLTRDDVIQICGPADGIRLFNALKGRYVISVKIFVRLDFKWI	151759	141821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_143235_144166_144261_144644_144694_146560_146650_146905_147017_148602_148756_149824_149932_151723
876698	contig_6048_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_73150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1432	1851	1048701	1048282	NA	35	GATACAAAGACTCTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHPSPSSRSPLLLNPASIKCCQENSYIPPYPTTIHTYPKRENTKKTEKETEISTFSLLLMIKYFTCHICSVAEIKMSYPQLKNPDRSPSTFRNRCTRQTVDLQFSFFLLSDKCNAISNNLKDTCPWHLASRSCNQQEN	1050132	1047790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1047800_1050100
876699	contig_2867_pilon	+	1778	2	Intergenic	novelGene_135187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTAAACAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797140	800235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_798075_799391
876700	contig_19402_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_80869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTCCTCACCCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193288	191516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_191500_193300
876701	contig_15687_pilon	-	1304	13	Intergenic	novelGene_129134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	495	863	134414	126006	TRUE	55	CAAAGAGAAAGCAAACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFFCLREYIFSWFICSQAWFSFSFLNDIALSTEVQCCFHIVFCFLQTNKYFFNIFTFKFFTHFDIAGESIFYKTVFNKSWSIGYKSRDKGLRTLFSSSPLGALAIISVSLSKVSKGSAALA	137057	113903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_113975_114116_114214_122618_122781_125894_126043_129922_129989_131779_131880_133299_133374_134249_134330_134402_134472_134887_134954_136363_136441_136526_136736_136972
876702	contig_1275_pilon	+	2716	1	Intergenic	novelGene_108803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	3	428	547079	547504	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QASFLSRGAPGPLISPRGLAGAARCPPGSRLSRPPRAHPGRPPRLEPYPRRGKRKGSRPCLGPCDPSTVQRDGGGLLTPGAAEREAESPCSWEPEGCTSTYLKLFARAQAVIHTKTSLKCRARPLYHDLAPYSKVIPERSL	547076	549792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_547100_549800
876703	contig_16768_pilon	-	272	2	Intergenic	novelGene_168322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAATATTGTATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62425	61962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_62112_62302
876704	contig_13267_pilon	-	2408	19	Intergenic	novelGene_146616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	52.5852629216895	102	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	82	1857	254158	182683	TRUE	50	CCAGAAAGAAACTGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRETFVQAVSKEFVEDFLQFVQLHKDASDPFNLNELLDELSRKQKEELWQRLKNLLTDVLLESPVDGWQMVEIKCEDDMEIEHDSKMKKNIEIIHAVTSVIITCVSVINENENYEALLECAAILNGVLYALPESEQKLRSSVQDLCVTWWEKGLSAKEDMGKTAFIMLLRKSLETKTGADICRLWRIHQALYCFDYDLEESREIKDILLECFISVNYIKKEEGRRFLSSLFNWNINFIKMIHGTIKNQLQGLQKSLMVHIAEIYFRAWKKASGKILETIENDCIQDFMYHGINLQRKSPVHSKVREVLSYFHHQKKFRQGVEEMLYRLYKPILWRGLKARNSEVRSNAALLFVEAFPIRDPNFNAVEMDSEIQKQFEELYSLLEDPYPVVRSTGILGVCKITSKYWEMMPPTILIDLLKKVTGELAFDTSSAEVRCSVFKCLPILLDNKLSHPLLEQLLPTLKYSLHDNSEKVRVAFVDMLLKVKAVRAAKFWKICPMEHILVRLETDSRPVTRRLVNLVFSSFLPVNQPEEVWCERCVTLIQMNHAAARRFYQYAHEHTACTNIADSCYPSLLKCLHPQSNKRVSRGG	256769	174390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_-_174518_175417_175572_176990_177062_178955_179130_182657_182757_182989_183213_185182_185336_189045_189226_218052_218179_218883_218980_227780_227868_235925_235996_238004_238100_239811_239947_245509_245665_247282_247398_247772_247962_254080_254201_256730
876705	contig_10196_pilon	+	1209	2	Intergenic	novelGene_132347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	112	297	2476343	2480608	FALSE	50	TAAATACTGTTAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQCELESRRTPATSSRGGCRESGAGLGGRNRPDSAAMLLFCPGCGNGLIVEEGQRCHRFACNTCPYVHNITRKSRVPNVNILVPTSCSFRLALLMSP	2476231	2481520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2476454_2480533
876706	contig_12520_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_161054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCCACTTTTAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315517	313607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_313600_315500
876707	contig_13958_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_129545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCAGGGCTTCCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267585	236231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_236270_249599_249666_257281_257359_260346_260429_264504_264568_266567
876708	contig_6182_pilon	+	3356	1	Intergenic	novelGene_171656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAAAAGGTGGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272317	275673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_272300_275700
876710	contig_2414_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_158462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATTATATGTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170471	172656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_170500_172700
876711	contig_9415_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_109943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGTTTACTCAGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2470598	2468509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2468500_2470600
876712	contig_6278_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_119803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGATGCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325989	323413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_323400_326000
876713	contig_12078_pilon	+	2679	2	Intergenic	novelGene_74108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTGATTGGCATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285716	288895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_287575_288074
876714	scaffold_17542_pilon	+	3185	1	Intergenic	novelGene_139231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACACACAGGAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357801	360986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_357800_361000
876715	contig_9995_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_47720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373228	374956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_373200_375000
876716	contig_14666_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_39475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTCAGGACAAGACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25189	22754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_22800_25200
876717	contig_13780_pilon	-	2154	2	Intergenic	novelGene_149077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_1	0	16	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCGGGAGCGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667404	657454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729
876718	contig_3822_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_133291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAAATACTATTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208644	210329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_208600_210300
876720	contig_9578_pilon	-	2813	1	Intergenic	novelGene_67978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGATTTTAACTAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112502	1109689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1109700_1112500
876721	contig_10437_pilon	-	3053	5	Intergenic	novelGene_38414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	433.279932607085	7	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1305	2276	786617	782609	FALSE	30	TGGAATCACAAATCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRETTLLYFGFPQEVFGDDSEISKESSGVKKRRIPRFEEVEEEPEVIPGPPSESPGMLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPAAQAKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTYFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTKLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDL	787921	781831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_782780_783426_783734_784334_784556_784800_784885_786428
876722	contig_6842_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_130819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCCCAGGGTATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1761365	1763650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1761400_1763600
876723	contig_15323_pilon	+	3095	1	Intergenic	novelGene_148537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCAGCAAGTATCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161391	164486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_161400_164500
876724	contig_4232_pilon	+	2776	8	Intergenic	novelGene_63468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.3908463611752	43	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	258	1298	577865	582012	FALSE	30	TTAAGATGGTTAATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEEFVAGWISGALGLILGHPFDTIKVRLQSQNKYRGILDCAVQTYQHESILGFFKGMSFPIVSIAIVNSVLFGIYSNVLLVLTSTTHQERRSQPPSYTNVFIAGCTGGFVQAYFLAPFDLVKVRLQNQTEPRAQLGSLQPRYRGPLHCVSSILRKEGPQGLLRGSGTLMLRDTPTLGIYFVTYEWLCRQYTPKGQNPSSATVLVAGGCAGIASWVAATPLDVIKCRMQMAGLKGQVYHGVLDCMVSSARQEGPGVFFRGLTINSARAFPRERRHLPQLRVPPPLLVMSLAGPCQPPPHQACHLLLPPDVRLKAPSLQCKCRRLSPLSPPPRPIKGHPTHWTGAG	572188	583490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_572296_573972_574076_577817_577902_578819_578864_578993_579066_579334_579521_581161_581421_581569
876725	contig_3382_pilon	+	2505	1	Intergenic	novelGene_123999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACCCCCCACCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100370	102875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_100400_102900
876726	scaffold_12124_pilon	-	2819	2	Intergenic	novelGene_22143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGAGGAAGGATCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957533	954544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_957188_957357
876727	contig_8196_pilon	-	3029	4	Intergenic	novelGene_168767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTAGATTTTGCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528491	427513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_-_429018_472722_472979_526692_526781_527310
876728	contig_9955_pilon	-	2500	12	Intergenic	novelGene_21371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	1991	2500	424445	359500	FALSE	10	CTTCTGCGGCAGCCGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVALPGKLHHHLLNFLPLGSHLALGLFALIGPRPQHGVAETTPERIEVKAKRDAPLPGPEGCDAIAPNRCDLLPGPGGARAPRPPIPAGVIGPVAGVVLARGRRGGGWVGRRLLLSDRRVANDISHHLQAGLLDPGGQEEALEARGVGQQEEGPEAQGDQAREEEKEEE	528212	359499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_359976_424411_424509_480674_480791_483979_484060_494728_494825_502833_502960_506684_506779_516214_516331_521866_522095_524708_524877_526254_526370_527424
876729	contig_7839_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_45712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1630	1938	812034	811726	NA	30	GAGATTTTTATAAGGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNHMWVCDTKYIILLIFQVQIMGTFQLPSKHQWCRFFLSAFPAYSLLLKLAQMSSLCMSGPPNHWEPEERAQVNHQPSKHGASLEPEDELLINFIHLTNIH	813663	810727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_810700_813700
876730	contig_14450_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_49050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	356	439	1359333	1359250	NA	30	ACCCAGCAAGTCCACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRFSHFSQLIYVSLYQAAPGTRRLLAGIFLPGALLSGSSIGALVRFFKAPKGIYVHTAEPHLASKFSYLQCQPEVGKEQKKILEDEIQNQKNELPSSCLTHGDPVCVRVELCTIGFSMADFLDVDRQAFLLRCLWVNLNFQPFG	1359688	1357003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1357000_1359700
876731	contig_5145_pilon	-	3246	10	Intergenic	novelGene_131363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_6	36.4539283053128	113	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	148	2055	347523	338819	FALSE	20	GCCAAGAGGCCTCTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLLRMAPEDQDKFRLDDCLGGASEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPATAVPVVLKRLKAKEEEWREAQRGFNKVWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPASEPHLIFLYEDRQILEDAAALVSYYVARQPAIQKEDQATIQQLLHQFVPSLFFSQPLDPGASEESADEDREGARGPGTEPGEHKRPGAPGGPPEEKGPPGDGLAAGPQPAPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCARLLKLYRQAQKQLLEYRAEKEREQLLCEGRRERGGDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGNIDPTQYEDTLREMFTIHAYIGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRASRETSYQWRAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTDDPVEVQHLSSYVEQYVGTEGTASSPSEGFLLKPVFLQRNLRKFRRWQCAQVRALRGEAKGAWKRLVGVESACSVDCRFRLSTHKMMFIVNSEDYMYRRGALGRAKQVQPLVLLRHHQHFEAWHGRWLEDHVPVEAASLVQDWLMGEEDEDLVPCKTLCETVRVHGLPVTRYRVQYSRRPASP	349042	337627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_339050_339216_339422_340284_340380_340538_340632_340869_341044_344330_344501_345199_345789_346128_346313_347356_347596_348967
876732	contig_6005_pilon	-	382	4	Intergenic	novelGene_158902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3340.99888589559	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCAAATGGCTTTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367548	364491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862_366967_367316_367391_367472
876733	contig_8357_pilon	-	2422	3	Intergenic	novelGene_39674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_2	4	22	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	19	708	74079	72302	FALSE	30	AACGTCTAAATGGAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWPDTAMQPLEVGLVPAPAREPGLTRWLRRGSGILAHLVAFGFTVFLSVLSRPGTSLFSWHPVFMALAFCLCMAEAILLFSPEHSPFFFCSRKARIRLHWVGQTLAILCAALGLGFIISSRIRSELPHLVSWHSWVGTLTLLATGCQALCGLCLLCPHAARVSRVARLKLYHLTCGLVVYLMATVTVLLGMYSVWFQAQIKGAAWYLCLALPLYPALVIMHQISSSYLPRKKLEM	74097	70587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_72806_73372_73411_73931
876734	contig_11026_pilon	+	1898	5	Intergenic	novelGene_167642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_2	105.26721949401	40	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	54	758	43170	103939	FALSE	70	TTTGAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKR	43116	105079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750
876735	contig_10126_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_105766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGGTGGTGGACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175928	178694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_175900_178700
876736	contig_6724_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_167972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTGTAAAGATTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313047	310985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_311000_313000
876738	contig_8195_pilon	+	5102	1	Intergenic	novelGene_170066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGTAAGATCTAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499864	504966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_499900_505000
876739	contig_17470_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_110466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTATCTGCCTGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40125	41855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_40100_41900
876740	contig_13901_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_146660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	650	961	258551	258240	NA	70	GTCTAGATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSCTMEQNSAQSMFGWGLDHGNPQGFHWLMIGSRLPGLLVRLSLEVPLKPVQPHSSMQASTDRWMVAACEVHWLGIQPGSLTWKARVLPLNHYCPHEIASIN	259200	257572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_257600_259200
876741	scaffold_12124_pilon	-	1479	2	Intergenic	novelGene_22203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCTCCTCAAATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356128	1353942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1355320_1356026
876742	contig_7758_pilon	+	2289	3	Intergenic	novelGene_163526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	160	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	559	903	113199	113543	TRUE	30	GTATGTAATTTTACCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPPTPKPRPPRPLPVAPGSSKTEADSEQQGQY	99610	115410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_99787_112816_114888_115368
876743	contig_4125_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_25062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	56	631	372260	372835	NA	15	GTAAGCTCCTCTCAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPALRDSYENLTAKVLGMLTWLDEHVAFEFVLKADDDSFARLDALVAELRARDPPRRRRLYWGFFSGRGRVKPGGRWREGAWQLCDYYLPYALGGGYVLSADLVHYLRLSREYLRAWHSEDVSLGAWLAPVDVQREHDPRFDTEYKSRGCSNQYLVTHKQSLEDMLEKHQTLIHEGHLCKEEVRLRLSYIYDWSAPPSQCCQRKEGIP	372204	374272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_372200_374300
876744	contig_10159_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_30814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGCCAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450921	448675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_448700_450900
876745	contig_401_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_42805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGTAGAGTCCAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1697608	1699105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1697600_1699100
876746	contig_7411_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_136978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTGACTGTTTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136958	138921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_137000_138900
876747	scaffold_8345_pilon	+	873	9	Intergenic	novelGene_107010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_6	328.42443480198	169	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	461	871	599909	612535	FALSE	25	GGTATATTCAAGTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAQTQGSFQLNLFVIIVSGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELRSYSSLMKVENMSSN	570431	612537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_580076_580125_583891_583932_591070_591123_598125_598202_599737_599970_602217_602322_602543_602747_612492
876748	contig_11978_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_62889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACGAAGAGATTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729743	727387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_727400_729700
876749	contig_3797_pilon	+	3160	15	Intergenic	novelGene_120073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAAGTAGCCAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20783	44055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_22437_24458_24542_25254_25356_31569_31724_32997_33101_33505_33612_33864_33977_34118_34243_37218_37311_39630_39792_40770_40859_41430_41546_43007_43118_43478_43610_44028
876750	contig_5799_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_50332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTCCAGCATCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701843	703834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_701800_703800
876751	contig_8377_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_35039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTGAGTAAATTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80846	79817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_79800_80800
876752	contig_18184_pilon	-	2537	1	Intergenic	novelGene_123866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTTAAAATAACAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104609	102072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_102100_104600
876753	contig_13215_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_145886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAGAAAGGTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108052	106691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_106700_108100
876754	contig_5988_pilon	+	2431	7	Intergenic	novelGene_15898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	579	950	557950	558450	TRUE	10	CACTTCCCGCTCATCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVWPLLELGAEMPAWGPVAGKRVVPGAQGGLGLGPSAPASCSRGSGQPAAPDLGPGSGCYHSSPSSLSGKRLGVGRLPCLVASKLLSSSISDNSRLHSGRGSCADRPQSQTDSHRSAPLL	557371	563327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_558308_558436_558553_558660_558728_558963_559249_560961_561096_561192_561329_562570
876755	contig_16204_pilon	-	2421	14	Intergenic	novelGene_154478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_13	103.101547001405	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	149	1420	164286	156318	TRUE	40	AAATGAGGTATTAGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLICSISNEVPEHPCVSPVSNHVYERRLIEKYIAENGTDPINNQPLSEEQLIDIKVAHPIRPKPPSATSIPAILKALQDEWDAVMLHSFTLRQQLQTTRQELSHALYQHDAACRVIARLTKEVTAAREALATLKPQAGLIVPQAVPSSQPSVVGAGEPMDLGELVGMSPEIIQKLQDKATVLTTERKKRGKTVPEELVKPEELSKYRQVASHVGLHSASIPGILALDLCPSDTNKILTGGADKNVVVFDKSSEQILATLKGHTKKVTSVVFHPSQDLVFSASPDATIRIWSVPNASCVQVVRAHESAVTGLSLHATGDYLLSSSDDQYWAFSDIQTGRVLTKVTDETSGCSLTCAQFHPDGLIFGTGTMDSQIKIWDLKVGHGRLPPEAQGQSAYGSTVLIKCLWHLALGCPEGGETLALGM	164434	155173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_155846_155988_156536_156776_156847_157064_157221_158814_158925_159082_159159_159501_159577_159703_159746_160659_160723_160841_160916_160998_161141_161890_161968_162149_162300_164267
876756	contig_3270_pilon	+	1879	12	Intergenic	novelGene_104452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCATCTTCCGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50427	68047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_50523_53672_53842_54873_55015_55515_55770_56136_56342_57154_57279_60144_60286_62339_62522_63663_63826_64335_64424_67341_67463_67850
876757	contig_6496_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_103541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCCGGGGACGCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1161329	1163279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1161300_1163300
876758	contig_12120_pilon	+	3535	1	Intergenic	novelGene_21422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73932	77467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_73900_77500
876759	contig_5894_pilon	+	1744	2	Intergenic	novelGene_83049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACCCAGCAACATTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515286	541416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_515436_539821
876760	contig_14620_pilon	-	1748	1	Intergenic	novelGene_178189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	423	1324	1746	29056	28634	NA	25	GCTAAAGGAACTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLQVFYATLDQVYHGKLHQRRSTTDILKETQEKYYGLSYISNTAWQLRFSHLVSYGAKCYSYLMSRAVASMVWKECFLQDAFNRAMGERYPWEMLVHGGGKESMLMVQGMLQKCPSIDGFASALVSDLDLDFETFFMDSE	30379	28631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14620_pilon_-_28600_30400
876761	contig_5445_pilon	-	866	2	Intergenic	novelGene_135435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_1	0	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	52	732	156755	154749	FALSE	15	CTTTTGTACGTTAGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVETEVATVETEVGPDMVETEVAAVATEEIEVGVAMVETEVGVAMAGTEEAAMAGTEEAAMAETEAAVMAETEEAAMAETEEAVMVETEEAMAEIEEAAIVAIEEVVMVETEEAMVEIEEAMEETEVGGATEETVEVATVETEVEAMEETEVVAAMEETEVGATEETEVAMEAKWEEETTTEMISATDHTDDCFECSFVSDMIHSEIARVLPAAFLVASSWVVKLSDIWIFIWVGGLGQFFF	156806	154614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_154946_156271
876762	contig_2209_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_140999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTAAAGAAAAATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119657	117460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_117500_119700
876763	contig_6410_pilon	-	2633	16	Intergenic	novelGene_108614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	10.9231660042112	47	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	242	1624	167839	151086	FALSE	30	ATTTACACGAGATTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAISGNETQPYRAFTRGLENDVFIKDPNGDIVWGKVWPDFPGVVVNDSLDWDSQVEQYRAYTAFPDFFRNSTIEWWKREMKEMHTNPLNPEKSLKYDGMWIDMNEPSSFVNGAVPPGCKDSTLNHPPYMPALESRDSGLSSKTLCMESQQVLPDGSLVRHYDVHSLYGWSQTRPTYEAVQEVTGERGIIITRSTFPSSGRWAGHWLGDNTSAWNQLKKSIIGMMEFSLFGISYTGADICGFFQDAEYEMCVRWMQLGAFYPFSRNHNTIGTRRQDPVSWDAAFEDYSRSVLQTRYALLPYLYTLMLKAHVEGSTVVRPLLHEFVSDQVTWDIDGQFLLGPAFLVSPVLEPNARNVSAYFPRARWYDYYTGVDINARGEWRTLPAPLDHINLHVRGGYILPWQEPAQNTQLSRQKFMGFKVALDDQGTANGCLFWDDGYSIDTYENGEYYLAHFSVSQNTMKSHIMVDNYFSGTNSLKLGYLEIWGVGSVPITTVSVSANDTVITPAFNYNSTTQVLTINITSDNINLHNFSSLTWTSTL	172510	150076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_151164_153385_153557_154150_154201_155632_155722_157365_157491_160355_160413_161297_161383_162924_163074_163585_163703_163795_163831_163952_164087_165087_165227_166001_166090_167773_167909_172060_172124_172401
876764	contig_4068_pilon	+	2221	2	Intergenic	novelGene_161710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCGACATTCTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84030	86343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_86201_86292
876765	contig_10426_pilon	+	1835	3	Intergenic	novelGene_144674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	11	156	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	96	395	105791	107439	FALSE	35	ACGTTATATATATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKCCSAIGCASRCLPNSKLKGLTFHVFPTDENMKRKWVLAMKRLDVNAAGIWEPKKGDVLCSRHFKKTDFDRSAPNIKLKPGVIPSIFDSPSHLQVCS	104749	108879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_+_104822_105767_105871_107219
876766	contig_7342_pilon	-	3165	1	Intergenic	novelGene_71157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1340	1687	381423	381076	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQPLVFKTARRPCMELTVLMGRKGGKTTLVTEMVAVPLPESARMELLPQQGRGHRSFKPLKNAGKGSWPSAPFLPTREGGEAGREDELTRVHPAPLPLTCLNLRSSSTSLPH	382762	379597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_379600_382800
876767	contig_7057_pilon	-	1072	7	Intergenic	novelGene_123289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	61.2955046385042	1050	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	334	711	898135	897021	TRUE	25	GTACCTCTACTTTTCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE	898468	895627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_895950_896981_897084_897306_897359_897464_897540_897628_897703_897944_898000_898076
876768	contig_8801_pilon	-	1468	6	Intergenic	novelGene_66280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_5	71.4982517268779	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	211	1050	460296	445841	FALSE	15	TGGCCTTGGAGATCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKLVYFEPKDITAEEEEEEVESLKSIRKYLTSNVAYGSTGIRDVHLELKDLTLCGRKGNLHFIRFPTHDMPAFIQMGRDKNFSSLHTVFCATGGGAYKFEQDFLTIGDLQLLKCDELDCLIKGILYIDSVGFNGRSPCYYFENPADSEKCQKLPFDLKNPYPLLLVNIGSGVSILAVYSKDNYKRVTGTSLGGGTFFGLCCLLTGCTTFEEALEMASRGDSTKVDKLVRDIYGGDYERFGLPGWAVASSFGNMMSKEKREAVSKEDLARATLITITNNIGSIARMCALNENINQVVFVGNFLRINTIAMRLLAYALDYWSKGQLKALFSEHEGYFGAVGALLELLKIP	460506	445422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_445892_449288_449415_451005_451130_455180_455358_456383_456638_460188
876769	contig_8671_pilon	+	3537	1	Intergenic	novelGene_126270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGGATAACATTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536475	540012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_536500_540000
876770	contig_11896_pilon	+	957	6	Intergenic	novelGene_87986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_2	192.457371903495	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	87	956	8606	16606	FALSE	50	TACTTAATTTATAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHMFVLRERPETVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSISASSQSSSVNSLPDASDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDSRTRATDPQSPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMTLENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQASMEKEAKVMANEEKKFQQHIQAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKE	956	16607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_1040_8602_8771_10504_10709_12386_12522_14505_14743_16477
876771	contig_3163_pilon	-	2435	15	Intergenic	novelGene_168067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	6.61360687661183	28	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	143	2290	586705	184184	FALSE	40	ATAGACCTCAGCCTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRPASPYGEADGEVAMVTSRQKVEEEESDGLPTFHLPLHEVDGNKVMSSFAPHNSSTSPQKAEEGGRQSGESLSSTALGTPERRKGSLADVVDTLKQRKMEELIKNEPEETPSIEKLLSKDWKDKLLAMGSGNFGEIKGTPESLAEKERQLMGMINQLTSLREQLLAAHDEQKKLAASQIEKQRQQMELAKQQQEQIARQQQQLLQQQHKINLLQQQIQVQGQLPPLMIPVFPPDQRTLAAAAQQGFLLPPGFSYKAGCSDPYPVQLIPTTMAAAAAATPGLGPLQLQQLYAAQLAAMQVSPGGKLPGIPQGNLGAAVSPTSIHTDKSTNSPPPKSKDEVAQPLNLSAKPKTSDGKSPTSPTSPHLPALRINSGAGPLKASVPAALASPSSRVSTIGYLNDHDAVTKAIQEARQMKEQLRREQQVLDGKVAVVNSLGLNNCRTEKEKTALESLTQQLAVKQNEEGKFSHAMMDFNMSGDSDGSAGVSESRIYRESRGRGSNEPHIKRPMNAFMVWAKDERRKILQAFPDMHNSNISKILGSRWKAMTNLEKQPYYEEQARLSKQHLEKYPDYKYKPRPKRTCLVDGKKLRIGEYKAIMRNRRQEMRQYFNVGQQAQIPIATAGVVYPGAIAMAGMPSPHLPSEHSSVSSSPEPGMPVIQSTYGVKGEAPHIKEEIQAEDINGEIYDEYDEEEDDPDVDYGSDSENHIAGQAN	755189	184038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_-_184488_186063_186281_192727_192902_195907_196017_213784_213931_224552_224731_252524_252672_293647_293734_315539_315661_398246_398316_403558_403732_414064_414152_519525_519737_586579_586707_755048
876772	contig_20487_pilon	-	3425	1	Intergenic	novelGene_154381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	1970	2494	9752	9228	NA	25	CAGTGTGTTGCAGTAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRPEPFSGSPVLRTKHRHAGTAFKPFHSVATASPSYIFPGIPVFMHAVLVPNHDSLFPKLALLFYIIVPLLRSFYSMECLSPSLNSTLSQDQLKCHLLSEAFPDSTTSLHWVTQPVLQHDSIVHCLKNRYVHVHLPHMLVKASKAGTLVVTLVSPAARALLAHSYSISTCDWI	11721	8296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20487_pilon_-_8300_11700
876773	contig_11512_pilon	-	3581	1	Intergenic	novelGene_43397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCATGCAGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615977	612396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_612400_616000
876774	contig_6825_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_155119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAATAAGTAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33189	35302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_33200_35300
876775	contig_15453_pilon	+	2110	2	Intergenic	novelGene_112478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	306	470	7390	7554	FALSE	15	ATAGTGGGGTCTGGCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWFSCLRLGSEVRASVSRAGGGRWRWSHASPRRKLRRSRRSRSIGRRHARCCCGSSPPITAATIEWTSSPAETCPPASCKSTLGERPRAAGGHWGLRTPFMHLHLELIPFASEELFLISTSPFHSGPLGVTLGRLEVVACTVERDLPILSCFYC	6907	9194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229
876776	contig_9112_pilon	-	1327	6	Intergenic	novelGene_60221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAATTCCTGCAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114793	108545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_-_108741_111551_111740_111806_112126_113623_113747_114248_114389_114431
876777	contig_3463_pilon	-	924	7	Intergenic	novelGene_61985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAGCAAAACAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170161	71149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_71262_83060_83325_126618_126807_129254_129345_141647_141723_142357_142495_170103
876778	contig_4769_pilon	+	1671	2	Intergenic	novelGene_117976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTGCGCGAAATGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432554	437509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_434061_437344
876779	contig_2371_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_176555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	566	901	256659	256324	NA	25	AAACCCTATGGGGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRRSLTILTSKEHSGCTFSKTDLFVFLAVRGIFSILCQHCNSNVSVLLSVFLFHVQLSYAFEVIEEIEAWVRHTLVIRVTSLLFRTLKRPFAADLPNVIRCLISWLLLP	257224	256110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_-_256100_257200
876780	contig_12312_pilon	-	1683	4	Intergenic	novelGene_64032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	74.3385648383275	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	91	519	592287	589230	FALSE	70	ATCAAGAAATAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNQSAPPVPPYGQPQPVYPGYHQSSYGGQPGSAVPPTPYGTSYNGPVPGYQQTPPPGVSRAPPSSGPPPVSTAQAPGGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRLQVAGAADVQPSGLLTQLSGWVLLRVLPFCELEVFFLD	594185	588065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_589348_589505_589642_592112_592316_594123
876781	contig_1435_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_115495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1587	1985	504638	504240	NA	10	CAGTGCAGCTTTGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPHPQNKIQSPQTGKQGTSEPASTLPFQSRFPPLLQPQHNTLRSNWFSRYTRTPSSPLCLCGFLSTNLNTYIYPPPPSISSCPSTQTPNSSLLVSRAYFQISLLFCSLPCALFRLSSPLPLMVQIPSLPL	506224	504055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_504100_506200
876782	contig_6058_pilon	+	3548	2	Intergenic	novelGene_172365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGGGGCCAAGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141632	145572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_141656_142047
876783	contig_11702_pilon	+	1287	9	Intergenic	novelGene_141970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_8	24.4945784817784	99	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	16	1008	364854	366920	FALSE	25	GAAAACGCCCAGCCTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWRSGMAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLIPRLHHGGTITQSLAQSCRSGENTPMLEDSEEGGLRLWHLVKATEEPEGTKPRRSSLRERERERARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVNRPVPIGIRYLFDFLDGLAEKHGIEDPETLHIWKTNSLLLRFWVNTLKNPQFIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTVSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVEKYYKDIRQGSPASYQEMNSALAELSGSYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKMQLACRLQQIAALVENKVTHL	364838	367199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_364944_365046_365141_365398_365578_365669_365831_366038_366187_366301_366367_366440_366517_366617_366693_366815
876784	contig_11563_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_142302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAACCAGTTGTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133201	131624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_131600_133200
876785	contig_11448_pilon	-	3099	1	Intergenic	novelGene_66379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTGAACTGCCAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315280	312181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_312200_315300
876786	contig_9053_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_87947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAACATCAGAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280920	278318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_278300_280900
876787	contig_3068_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_137616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1655	2005	175877	175527	NA	35	CCCAGCAATCTGACAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTRRRSAGRKRPPVPLGTNPEPHPTVWKSFPAGAGIAGDDDAETAGVFPYRLLYSSNPLPHLETRPSPSSVAPQPTADSCKRFTVGYTVPMENVRPFPANSFLRSATNFCLIFSF	177531	175395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_175400_177500
876788	contig_1694_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_144944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603033	601348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_601300_603000
876789	contig_9195_pilon	+	976	1	Intergenic	novelGene_155689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	14	45	500	544	372786	372830	NA	10	CTGCTTTTCCTTACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWLPLCCSRGPGPSPAVRPLAFLAPSLPGLPECCPHSPGTRLPRGVCSSCPSTAPLPVPACVDLPWTCGSNRVHRWPVSSTQQVPGERTLLGHLETGLSEGIVLEPLKPVSLRLHLLLTPPPQLGQQDREGRASPRHQRLPTHDHVTIQNIFSRKEIKFAFVLRLQMGKCYQSQRHDQLP	372286	373262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_372300_373300
876790	contig_11846_pilon	-	2376	10	Intergenic	novelGene_105917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	200	748	191721	186217	TRUE	25	AGAAGGGTCCCCTTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAVGQWEGTWVGGRLWQEQGQEAGRGGHWCGLRQPGFLLHHHSLGCNSRGASVCVVGSGDSQAGAEGVCGARWQLAKLTAGEAALLLHSSGNSANGGRGRAGARLLGPLLLLQLQPQPLHQLLLLPEHARQLLNLLVLLLQHLVLVAPLQLSPRPWAQAAGAGPWALLFHEDLQWRGLQC	191920	148499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_148677_173729_173785_176058_176134_177092_177256_180799_180973_181529_181682_184015_184272_184606_184777_185809_186687_191642
876791	contig_2043_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_169930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCACAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825258	827057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_825300_827100
876792	contig_3397_pilon	+	3211	1	Intergenic	novelGene_154579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGATTTTGTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128829	132040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_128800_132000
876793	contig_6870_pilon	+	2799	1	Intergenic	novelGene_103983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTGTGGTATTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467721	1470520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1467700_1470500
876794	contig_14474_pilon	-	3578	1	Intergenic	novelGene_144205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37060	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_-_33500_37100
876795	contig_12654_pilon	+	2849	10	Intergenic	novelGene_129256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	74.9681413816711	4	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	261	1157	55203	84535	FALSE	10	TGGTTTAGGGTGCTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWLFPLTKSASSSAAGSPGGLTSLQQQKQRLIESLRSSHSSIAEIQKDVEYRLPFTVNNLTININILLPPQFPQEKPVISVYPPIRHHLMDKQGVYVTCPLVNNFTMHSDLGKIVQSLLDEFWKNPPVLAPTSTAFPYVSQLTDMNEQEEILLEQFLTLPQLQQVITDKDDLVKSIEELARKNLLLEPSLEVKRQTVLDKYELLTQMKSTFEKKMQRQHELSESCSASALQARLKVAAHEAEEESDNIAEDFLEGKTEIDDFLSSFMEKRTICHCRRAKEEKLQQAIATHSQFQAPL	54942	87724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_55328_66352_66428_68316_68432_69086_69188_79173_79302_79386_79446_79525_79595_83260_83405_84454_84536_86032
876796	contig_7308_pilon	+	3050	1	Intergenic	novelGene_159595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATATTTTTCTGCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287777	290827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_287800_290800
876797	contig_11932_pilon	+	1369	7	Intergenic	novelGene_85405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246629	251115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_246647_247155_247313_247908_248076_248803_249057_249253_249401_250264_250388_250610
876798	contig_5954_pilon	+	2955	3	Intergenic	novelGene_28808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	16	28	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTATGAATTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462482	1466880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1462764_1462919_1463027_1464313
876799	contig_5515_pilon	-	2319	4	Intergenic	novelGene_52313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	4.89897948556636	97	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	11	1192	57622	51512	FALSE	15	AGTCCACGTGCAGCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVGAGGSTAAPGPGVISAGTLEPGTASATHRRLKYISLAVLVVQNASLILSIRYARTLPGDRFFATTAVVMAEVLKGLTCLLLLFAQKRGNLKHLVLFLHEAVLVQYVDTLKLAVPSLIYTLQNNLQYVAISNLPAATFQVTYQLKILTTALFSVLMLNRSLSRLQWASLLLLFTGVAIVQAQQAGGGGPRPLDQNPGVGLAAVVASCLSSGFAGVYFEKILKGSSGSVWLRNLQLGLFGTALGLVGLWWAEGTAVARRGFFFGYTPAVWGVVLNQAFGGLLVAVVVKYADNILKGFATSLSIVLSTVASIRLFGFHVDPLFALGAGLVIGAVYLYSLPRGTAKAIASASASASGPCMHQQPPGQPPPPQLSSHRGDLITEPFLPKSVLVK	57632	50384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_52268_53369_53522_55798_55982_57531
876800	contig_89_pilon	-	2842	2	Intergenic	novelGene_176383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	87	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGACCTTAATCATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133164	98559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_89_pilon_-_101261_133023
876801	contig_2455_pilon	-	2973	1	Intergenic	novelGene_119222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	113	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAGTAAAACCTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394678	1391705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1391700_1394700
876802	contig_11823_pilon	+	2012	3	Intergenic	novelGene_171030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	2.5	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGCTGGACTGCAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79268	87316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_79686_81595_81742_85867
876803	contig_3068_pilon	-	839	1	Intergenic	novelGene_137634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAACGATTGCAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245137	244298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_244300_245100
876804	contig_18231_pilon	-	4068	3	Intergenic	novelGene_105899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	15.5	79	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	8	1384	318166	308246	FALSE	70	TTATTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRHWGPIYVKLTECGYLQLYYEQGLEKPFREFKLEVCHEISEPRLQSYDENGRIHSLRIDRVAYKEKKKYQPKPAVAHTAEREQVIKLGTTSYDDFLSFIRAVQDRLMDLPVSSMDLSTVGLNYLEEEITVDVRDEFSGIVSKGDNQILQHHVLTRIHVLSFLSGLAECRLGLNDVLVKGNEIVSRQDIMPTTTTKWIKLHECRFHACVDEGVFSNSRIILFNPLDACRFELMRFRTVFAEKTLPFTLRTAASISGAEVEVQSWLRMSTGFSSNRDPLTQVPCENVMVRYPVPSEWVKNFRRESVLGEKSLKAKVNRGASFGSTSVSGSEPVMRVTLGTAKYEHAFNSIVWRINRLPDKNSASGHPHCFFCHLELGSDREVPSRFANHVNVEFSTPTTSASKAAVRSISVEDKTDVRKWVNYSAHYSYKVEIEQKKSLKPDFEGDEMENPRECGVQ	318173	305561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_308330_310045_310249_317076
876805	contig_9443_pilon	+	1811	3	Intergenic	novelGene_167133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGATAAAACAGGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153812	253593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_155288_158712_158871_253415
876806	contig_14219_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_54344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCAGACAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820740	819526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_819500_820700
876807	contig_6410_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_108658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATTAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519935	518097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_518100_519900
876808	contig_9468_pilon	-	3356	1	Intergenic	novelGene_59479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTGTAATCCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257905	254549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_254500_257900
876809	contig_15066_pilon	+	3079	13	Intergenic	novelGene_149563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1202	1747	119904	120949	TRUE	45	AGACCCAGAGACCTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLVQGQLGPSAAHSTHHQLCYIPRVPVPGLLQAVAGVAQAKLSTGHHGFQCPPVIPADEAPAKGPRSSNLHLNSPLISTAAPTESDLGLHPSVGQVASDPSILAMGAVLSCDVLVGAIPEGRFLSRASHFTQVDGTHALPHAGTTQSLSSTPEAQLPTHHAGCQEIPLAVTDCAPCASL	118051	134874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_118574_118745_118862_118966_119102_119178_119297_119397_119641_119836_119999_120135_120307_120534_120687_120821_121002_121226_121454_131535_131743_132445_132614_134196
876810	contig_7810_pilon	+	3619	1	Intergenic	novelGene_144220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGACTGCACCAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355856	359475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_355900_359500
876811	contig_3426_pilon	-	1228	7	Intergenic	novelGene_57942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	299.132449296666	33	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	26	571	443332	367481	FALSE	15	TGAGTCATTGATGGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGPSPFHMAEEEHLRKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQRYVASTSLTTHPPHPPPNVTTAT	443357	366823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367551_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_443308
876812	contig_12886_pilon	+	954	1	Intergenic	novelGene_135528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCCATGGCTTGGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830335	831289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_830300_831300
876813	contig_16322_pilon	-	2877	1	Intergenic	novelGene_87525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAGTTACCACCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76030	73153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_73200_76000
876814	contig_13878_pilon	+	2554	21	Intergenic	novelGene_165735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	49.4245890220647	105	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	111	1820	98612	215283	TRUE	25	TGTGGTTGAAAGTGCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGRSELPRTALDRQGSHTPWVHVVKELLDTEENCGMMASFQRSNSHDKVRRIVAEEGRTARNLIAWSVPLESKDDDGKPKCQTGGKLKRTIQGTHKTTKQNTAVDCKITLSTTGDKHFDKSPTKTRHPRKIDLRARYWAFLFDNLRRAVDEIYVTCESDQSVVECKEVLMMLDNYVRDFKALIDWIQLQEKLEKTDAQSRPTSLAWEVKKMSPGRHVIPSPSTDRINVTSNARRSLNFGGSTGTVAAPRLTPTGVSWADKVKAHHTGSAAASDVASAQSCPPTTVQKSSRKNERKDAEGWETVQRGRPVRSRSTAVMPKVSLATEVLRSKDDSDKENVCLLSDESIQRGEFVGDGPSNTVESRSKDSLHSCEHPLAERTQFTVSTLDDVRNSGSGFLQDNSVRTSEIPAVHIDTECVSITQQADIPPLQTNEDRFPAEKARIENEMDPSDISNSMAEVLAKKEELADRLEKANEEAIASAIAEEEQLTREIEAEENNDINIETDNDSDFSAGMGSGSVTFCGLSMDWNDVLADYEARESWRQNTSWGDIVEEEPARPPGHGIHMHEKLSSPSRKRTIAESKKKHEEKQMKAQQLREKLREITSC	88516	277951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_88566_98550_98618_113504_113623_124174_124246_147922_148121_172999_173101_174239_174357_180833_180995_199884_200148_203107_203327_210202_210374_211121_211198_211604_211723_211995_212067_215263_215352_229111_229257_232944_233088_240931_241014_242343_242497_243651_243760_277916
876815	contig_14973_pilon	-	2841	5	Intergenic	novelGene_171218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3.49106001094224	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	327	893	167151	64476	FALSE	35	TATAAATTTCAGATGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIENVTFHHEGFFWRCWFNGIVEENDSNIWKFWYINQPPSKNCTHAYLSPYPFMRGENNSTSYDSAVIYRGFWAVLMLLGVVAVVTASFLIICAAPFASHFLYKAGGGSYIAAGILFSLVVMLYVIWVQAVADMESYKNTKLKACLDFTPSVLYGWSFFLAPAGIFFSLLAGLLFLVVGRHIQIHH	167477	62527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_-_64697_91847_91986_129553_129653_131409_131510_167142
876816	contig_8235_pilon	+	3784	1	Intergenic	novelGene_175744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	375	1128	1269	2396	195822	196949	NA	35	TATGTATTATAACTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKKRKLELGGGGEGGEGTEEEDGGEREAVPPRPRRTKRERDQLYYECYSDVSVHEEMIADRVRTDAYRLGILRNWSALRGKTVLDVGAGTGILSIFCAQAGARRVYAVEASAIWQQAREVVRLNGLEDRVHVLPGPVETVELPEQVDAIVSEWMGYGLLHESMLSSVLQARTKWLKEGGLLLPASAELFVAPISDQMLEWRLGFWSQVKQHYGVDMSCLESFATRCLMGHSEIVVQGLSGEDVLARPQRFAELELARAGLEQELETGVSGRFRCSCYGSAPMHGFAIWFQVTFPGGDSEKPLVLSTSPFHPATHWKQALLYLNEPVQVEQDTDISGEITLLPARDNPRRLRVLLRYKVGDQEEKTKDFAMED	194553	198337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8235_pilon_+_194600_198300
876817	contig_1154_pilon	+	2372	3	Intergenic	novelGene_87203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.5	135	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1265	1672	1124896	1126526	FALSE	15	CTGATTTCGGTGTTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISKSKGTSSVRDLGVDHEAGGSHSPKRRKVSGARVNSWPSLWEVCILLSCGDSQSLVVPFSPGPQFPWLATPFRLGPAEGFRVFNMCRGRSGRANCFCSATSLHSGFHTIHGRTKMDEDSFCLNPRGFLIPLVL	1122921	1127226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1122982_1123691_1125028_1126250
876818	contig_19476_pilon	-	1867	12	Intergenic	novelGene_116806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_9	25.6028149278825	24	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	92	1339	173625	142635	FALSE	40	TCGTCGTAAAAAGAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NERLHIQFFEADEQHKHVEAELRNQLAALEMEATQHQAVVDGLTRKYMETIEKLQSEKAKLEVKSQALEKEAKECRLRTEECQLQLKNLHEDLSGRLEESLSIINEKVPFNDTKYSQYNALNVPLHNRRHQLKMRDVAGQALAFVQDLVTALLNFHTYTEQRIQIFPVDSAIDTISPLNQKFSQYLHENASYVRPLEEGMLHLFESITEDTVTVLETTVKLKTFSEHLTSYICFLRKILPYQLKSLEEECESSLCTSALRARNLELSQDMKKMTAVFEKLQTYVSLLALPSTEPDGLLRTNYSSVLTNVGAALHGFHDVMKDISKHYSQKATIEHELPTATQKLITTNDCILSSAVALTNGAGKMAAFFSNNVDYFIASLSYGPKAATGFISPLSAECMLQYKKKAAAYMKALKKVCELLLTFKSEENPEIIPENGNSCSTVDIV	174826	142106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_142881_146517_146646_150618_150712_158915_159053_162554_162644_162732_162835_165540_165691_167205_167259_172251_172347_173328_173388_173529_173695_174804
876820	contig_6914_pilon	+	3121	8	Intergenic	novelGene_151768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGCTCGTCATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426526	443917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_426937_427235_427354_428226_428328_428794_428983_434753_435061_438449_438546_441101_442551_443465
876821	contig_8310_pilon	+	3275	3	Intergenic	novelGene_75617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2834	3205	351082	351547	FALSE	15	TCTTTCCCTGGAGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRFSLSSRLAQGFLHNLGDILVISLDSGVHFVVFQIFLGTSPLIDLRGDSGVGVRSFLLHRSSKSSGLTLGAFSHVFKAARVSPGFGFCFEGFCEMSSTSTSCFVGSSILSITSQSFRFFS	347887	351617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_347971_348331_351430_351523
876822	contig_3153_pilon	+	3259	3	Intergenic	novelGene_104705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCTATGAAAGAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473880	523593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_473963_474388_474542_520569
876823	contig_817_pilon	-	1505	6	Intergenic	novelGene_132494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGGAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774327	761357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_761652_762303_762432_764832_764996_766194_766302_770873_770916_773556
876824	contig_6327_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_147492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACACCTTTCTCCTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75847	74118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_74100_75800
876825	contig_1694_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_144966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGAAGTGCTTAAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568747	1571143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1568700_1571100
876826	contig_8587_pilon	+	2836	17	Intergenic	novelGene_159109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_10	98.1897875290501	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	869	2607	230	2836	137185	161153	FALSE	35	CCCAGCAAGGAAGACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLDLRSYLFSRQCTLLLFLQRPWEVAQRALELLHSCVQELKLLEVSVPPGALDCWVFLSCLEVLQRIEGCCDRAQMDSNIAHTVGLWSYATEKLKSLGYLCGLASEKGPNSEDLKRTVDLLAGLGAERPETANTAQSPYKKLKEALSSVEAFEKHYLDLSHATIEMYTSIGRIRSAKFVGKDLAEFYMRKKSPQKAELYLQGALKNYLAEGWALPVTHTRKQLAECQKHLGQIENYLQTSSLLASDCHLTDEERKYFCQEILSFASQQTDSPGHKIVLPMHSFAQLKSLRFDPSNAVVHVGGVLSVEITLWSQMPVPIHVEQIAANVHFSIEKNNHRKTAEWLTKHRTSNGIITFPQEPAPFPASQNSLPALELSEMSERSPSDHSLHSTGIICKNVHMLLRRQESGSSLDVPSGLALEDGAHALRCSRVTLEPGPNKVLFRTQAREPGTYTLRQLCASVGPVWFVLPHVYPIVQYDVYSQEPQLHVEPLTDSLLAGIPQKVKFTVTTGHYTVKNGDSLQVSNAEAMLILCHAENRAVIYSNTGEKSSDASLRVQSSGRVTSISLPAAPAYHLIEFELDVLSPPSAPAARGNSDQPAQRGARWSCPEKPTASHCMVTTDHKLSIDCPWSIYSTVIALTFSVPFQTTHSLLSAGTRKYIQICVQNLSELDFRLSDSSLVDTGGGADLQLVPLNTQSQQRVHSRQSVFFVWELKWTREPPPALHCRFSVRFTPASEEQLSVSLQPYTYEFQVENFFTLYKVKAEIFPPLGMEYCKTGSLCSLEVSITRLADLLEVDKDEALTESDEYFTTKLMYEVGDNSSNWAVCGKSSGVLSMPVAAQATHRVHMEVMPLFAGHLPFPDVRLFKYLPHHSAHSSQLDADSWIENDSLSVDKHVDDAVDSSSVKSRGCVHSAASTEHRGLPMPRLQAFPPGQVFNSSTGMQVFVI	122469	161153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_122606_137091_137239_137778_137894_138730_138808_139599_139692_141780_141922_142372_142486_144577_145093_145815_145958_147341_147501_148304_148535_149794_149896_151202_151330_152406_152578_156699_156878_160479_160675_160956
876827	contig_10549_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_110587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	399	1655	2053	109292	108894	NA	25	GCTGCAGGAAAATGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISWVVALHTVLDTAEPVTLCWAAVIRSVKLWPDISAAPLLPPPLPLGSRRGLGPSSAGGSPPPTSPPTPHRLLPRLPAWGGAQGRALPPSPERTDSCHPRSRARVRALPCPRLSSAHPFPWSAEAGQGKRDR	110946	108891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_108900_110900
876828	contig_15327_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_70509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	956	1432	444706	445182	NA	25	TGGATGATTATTATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQTICSVIIPDSQAVWCLRFPTWLWSFPECVLSLCDLHLIGSWACRQLVVWLVWSLLFRARVTSVGVSWGPLRHVEVIWCCLFSTGKYREFHRLYGEKRFVDGASLLLSLMTSQIAPRSFWMTLLTDALPLLEHKQVTLNPRGSSLCFCRPCQCGA	443750	446322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_443800_446300
876829	contig_12923_pilon	+	2712	11	Intergenic	novelGene_30142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	607	921	195419	195733	TRUE	25	GGAGTGAGAAGGGGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMYKLQSPSQQASDCSVRWKKLHAPAEPLSRYLGGPQHASESSVHLHVNPAKQISDPSVQTTGPLCARGELLHTSVRTPLCQERVPLWKRKDPTVQLRPPLCN	194812	201719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_196362_196444_196559_196839_196968_197385_197491_197643_197733_197817_197901_198012_198108_199515_199587_199678_199842_200279_200471_201595
876830	contig_14637_pilon	-	1142	3	Intergenic	novelGene_114562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	231.5	101	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAACAAGTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391509	385921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_386881_389892_389949_391382
876831	contig_6175_pilon	-	4127	22	Intergenic	novelGene_16283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	8.81814250214911	82	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1215	1847	1175006	1169319	FALSE	35	CAATAAACTCCTGAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLVNMLIVFRFLRIIPNIKMMAVVANTLLDLVRNMRAFAGILVVVYYIFAIIGINLFRGVIVAPSGNSSRSTVNGSEPCGSFEQLEYWANNFDDFAAALITLWNVMVVNNWQVFLDAFRRYSGPWSKVYFVSWWLVSSVVWVNLFLALILENFIHKWDRRDHPQHSLGAPEASYHSPVELMFREVLEEPVEEDLLEKLRRHPHLELCR	1190234	1167038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1169398_1170124_1170220_1170596_1170679_1170894_1170978_1171467_1171550_1171684_1171762_1172912_1172985_1174943_1175044_1176280_1176331_1177094_1177224_1177860_1177921_1178087_1178207_1181888_1181976_1182100_1182183_1183703_1183805_1185022_1185088_1185546_1185613_1186400_1186501_1186748_1186822_1187675_1187783_1188796_1188914_1190213
876832	contig_7229_pilon	+	2594	4	Intergenic	novelGene_39821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	108	686	887679	896505	FALSE	10	CTGTTCCACGCCTTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGCKVVVCGLLSVGKTAILEQLLYGNHTIGMEDCETMEDVYMASVETDRGVKEQLHLYDTRGLQEGVELPKHYFSFADGFVLVYSVNNLESFQRVELLKKEIDKFKDKKEVAIVVLGNKLDLSEQRQVDAEVAQQWAKSEKVRLWEVTVTDRKTLIEPFTLLASKLTQPQSKSSFPLPGRKNKGNSSSEN	878407	898413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_878498_887661_887773_890361_890604_896262
876833	contig_5696_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_117529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473121	470894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_470900_473100
876834	contig_14838_pilon	+	1274	3	Intergenic	novelGene_151920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTTTCCTAACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148821	151853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_148995_149354_149755_151152
876835	contig_4125_pilon	-	1218	5	Intergenic	novelGene_25095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	216.657563911348	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	233	502	661037	632406	TRUE	35	TCACAAAGACCCTGGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGVSRILCLRSRVKGSGPARRRPRSTCRRATSPPPRFRVVDFRPPLRPFWSRGSPAAGWESRRGGVAVAADGAAAAMPSSPLRVAVVCSSNQNRSMEAHNILSKRGFSVRSFGTGTHVKLPGPAPDKPNVYDFKTTYDQMYNDLLRKDKELPGQKGSRTAKTCSI	661269	630561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_631117_631681_631801_632363_632452_648777_648922_660957
876836	contig_10135_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_106583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATGTAATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26082	27942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_26100_27900
876837	contig_6048_pilon	-	3072	1	Intergenic	novelGene_73357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	2729	3070	3006577	3006236	NA	10	TTTCCCTTGCGTATTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGRTRLVRVGLGSSQLGLSIFGEVVQTDLLKKGSHLLHPTTPFTRTEMGSVSPGRLGESCSPGLPPATTQHREGPTSGVGGPNLIHQLQSCGWSSDWLLPWFLSRYITACPI	3009305	3006233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3006200_3009300
876838	contig_18967_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_165332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	45	365	140445	140765	NA	35	TTAGGATATTTTTATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKVCRLPGFRPLLWRMGIKILTSSWQNLWEVALVYTEPHRGGVPVSLLQRPQGPNPAYLGPGLGRFRALRTSSLSEPLLGFGRLQPGPAALTSACTSPHPFHHY	140400	142374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_140400_142400
876839	contig_2969_pilon	-	2606	1	Intergenic	novelGene_157066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAATATTAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851446	848840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_848800_851400
876840	contig_12078_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_74088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTTGACTGTGGAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166588	164838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_164800_166600
876841	contig_8674_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_102884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42544	44769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_42500_44800
876842	contig_9406_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_136177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTCGGCTGCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145847	147301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_145800_147300
876843	contig_6837_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_149827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATGAAGTGTCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13901	15972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_13900_16000
876844	contig_5981_pilon	-	2645	1	Intergenic	novelGene_35512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTATGGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57700	55055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_55100_57700
876845	contig_5059_pilon	+	1368	4	Intergenic	novelGene_140762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_3	127.625319675299	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	111	524	519001	546797	FALSE	25	TCTAGAATCTTTTCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGSDDDDEGEEEEEENTDYLTDSNKENETDEENTEVMIKGGGLKHVPCVEDEDFIQALDKMMLENLQQRSGESVKVHQLDVAIPLHLKSQLRKGPPLGGGEGETESADTMPFVMLTRKGNKQQFKILNVPMSSQLAANHWNQQQAEQEERMRMKKLTLDINERQEQEDYQGIT	518586	547641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_518691_518994_519094_522752_522921_546644
876846	contig_8972_pilon	+	3825	10	Intergenic	novelGene_167625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_9	13.4081235740792	74	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	537	1550	257995	270190	FALSE	5	ACCTGGCGCCTGGTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAAFRAGLRLSRVSCGCSGVEAAPPGLVRALAAFGPGGTGPGGRKRGGWGPRADERRARAWDGDPEDADSEGEEEEEEEALLSREPLLPAGVQRVFLIHPDVKWGARKPQLTRAEWQVAEARSLVHTLDGWSVVETVVVPTKTPDSKLVFGRGHFERLTETIRGSPEVTSVFLNVERMTLLTKKELEAAWGVQVFDRFTIVLHIFRCNARTKEARLQVALAEMPLLRSNLKNNDSHLDRQGGGSRYIMGSGETFLQVQQRLLKEKEMKIKKALEKLRKKRHLLWRQRQRQELPVIAVVGYTNCGKTTLIKALTRDAAVQPRDQLFATLDVTAHAGSLPSRVTVLYVDTIGFLSQLPHTLIESFAATLEDVAHADLIVHVRDVSHPETELQKSSVLSALHGLHLPAPLLGSVMEVHNKVDLVQGYSPTDPDALAVSALLGQGLEELKARLEAAVLRATGRRVLTLRVQLAGAQLSWLHREATVQEVDVIPEDGAADVTVIISNAAYGKFRKLFPE	255675	272465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_256021_256638_256777_257941_258013_258236_258368_259026_259098_261059_261219_262233_262443_266742_266892_267482_267636_270066
876847	contig_12357_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_6139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAATAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31149	33621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_+_31100_33600
876848	contig_12841_pilon	+	1973	4	Intergenic	novelGene_55886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.63299316185545	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	144	806	887020	889953	FALSE	35	CTGACAGTAGTACAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVFLLGLGWFCSPLGALILDFNNIKSSVDVQGAQKGSQCLTDKDCNTRKFCLRPHEKPFCATCRGLRRRCQRNTMCCPGTLCINDVCTTMEDVTPISERQVDDQDDIDTKGTTEHPIRENKPKRKPNTKKSQGSKGQEGESCLRTFDCGPGLCCARHFWTKICKPVLLEGQVCSRRGHKDTAQAPEIFQRCDCGPGLLCRDQVIGNRQHARLRVCQNI	886876	891120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_887131_888129_888278_888714_888868_889702
876849	contig_3382_pilon	-	3398	1	Intergenic	novelGene_124195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAAAAATGGGAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012841	1009443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1009400_1012800
876850	contig_11340_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_173920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGGCCTGGTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202057	202877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11340_pilon_+_202100_202900
876851	contig_3975_pilon	-	3422	3	Intergenic	novelGene_54681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTCTCTCCTCCTAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052329	1046301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1048111_1049808_1049938_1050845
876852	contig_8210_pilon	-	3623	12	Intergenic	novelGene_30253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_1	25.3174881576267	33	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	29	1339	139515	81794	FALSE	40	CAAAATAAAATGTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE	139543	79509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_81906_96471_96585_97601_97688_100499_100615_101385_101533_102685_102816_106732_106832_108650_108804_122862_122977_124692_124814_135314_135425_139504
876853	contig_8182_pilon	-	1439	2	Intergenic	novelGene_173266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGGGTTTTCTTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417636	416110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_417229_417315
876854	contig_10765_pilon	-	2896	15	Intergenic	novelGene_122957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_1	157.779424953875	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	7	1857	417426	363163	FALSE	20	GTAATTACTGCGTATGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLMERRDLAIDFIFSLVLIEVLKQIPLHPVIDSLIHDVINLAFKHFKYKEGYLGPNTGNMHIVADLYAEVTGVLAQAKFPAVKKKFMAELKELRHKEQSPYVVQSIISLIMGMKFFRIKMYPVEDFEASLQFMQECAHYFLEVKDKDIKHALAGLFVEILVPVAAAVKNEVNVPCLRNFVESLYDTTLELSSRKKHSLALYPLVTCLLCVSQKQLFLSRWHVFLNNCLSNLKNKDPKMARVALESLYRLLWVYMIRIKCESNTATQSRLITIVTTLFPKGSRGVVPRDMPLNIFVKIIQFIAQERLDFAMKEIIFDFLCVGKPAKAFSLSPERMNIGLRAFLVIADSLQQKDGEPPMPVTGAVLPSGNTLRVKKTYLSKTLTEEEAKMIGMSLYYSQVRKAVDNILRHLDKEVGRCMMLTNVQMLNKEPEDMITGERKPKIDLFRTCVAAIPRLLPDGMSKLELIDLLARLSIHMDDELRHIAQNSLQGLLVDFSDWREDVLFGFTNFLLREVNDMHHTLLDSSLKLLLQLLTQWKLVIQTQGKVYEQANKIRSSELIPNGSSHRTQSERGPHCSVLHAVEGFALVLLCSFQVATRKLSVLILKEIRALFIALGQPEV	417432	362123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_363352_365288_365548_380015_380124_384544_384678_386692_386865_395418_395506_398272_398382_399140_399245_406278_406381_409381_409481_409575_409669_411812_411982_416687_416769_416856_416937_417360
876855	contig_9054_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_160681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAATTTGTAGGCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504602	506589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_504600_506600
876856	contig_15123_pilon	+	3037	14	Intergenic	novelGene_110894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	69.5276540274171	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	65	2761	34860	69677	FALSE	45	AATCCCCCAAAGAACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTKKLKTAPVPPAGQTTPFQMALNGKPAPPPQSQSPEVEQLGRVVELDSDMVDITQEPVLDSMLEESMPEDQEPVSASIHIASSLGINPHVLQIMKASLLTDEEDVDMALDQHFSHLPSKADTSQEICSPRLPISASHSSKPRSLVGGLLQSKFTSGAFLSPSASVQECRTPRASSLMNIPSTSPWSVPPPLTSVFTVPSPAPEVLLKTVGTRRQPGLVPLEKSVTYGKGKLLMDMALFMGRSFRVGWGPNWTLANSGEQLSGSHELENHQIADSMEYGFLPNPVAVKSLTESPFKVHLEKLSLRQRKLDEDLQLYQTPLELKLKHSTIHVDELCPLIVPNPGVAVIHDYADWSKEASGDLMEAQIVKHWSLTWTLCEALWGHLKELESQLDEPSEYIQILERRRAFSRWLSHTAAPQIEEEVSLTRKDSPVEAVFSFLTGKRISEACCLAQQSGDHRLALLLSQLVGSQSVRELLTMQLADWHQLQADCFIQDERLRIFALLAGKPVWQLSEQKQINVCSQLDWKRSLAVHLWYLLPPTASISKALSMYEEAFQNTSEGDRYACSPLPSYLEGSGCIAEEEQDSRRPLRDVCFHLLKLYSDRHYDLNQLLEPRSITADPLDYRLSWHLWEVLRALNYTHLSEQCEGVLQASYAGQLESKGLWEWAIFVLLHIANSSMREKAVRELLTRHCQLSETPESWAKETFLTQKLCVPAEWIHEAKAVRAHMESDKHLEALYLFKAGHWNCCHKLVIRHLASDAIINENYDYLKGFLEDLAPPERSSLIQDWDTSGLVYLDYIRVIEMLHRIQQVDCSGYELEQLHTKVTSLCNRIEQIQCYNAKDRLAQSDMAKRIANLLRVVLSLQHAPDATSDSTPDPQRVPLRLLAPHIGRLPMPEDYALEELRSLTQSYLRELTVGSQ	34795	69953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_34896_41609_41793_42506_42664_44268_44699_45987_46218_47964_48232_49990_50149_50952_51097_51845_51989_53381_53604_63748_63991_64482_64638_69229_69342_69459
876857	contig_5467_pilon	+	1789	13	Intergenic	novelGene_111965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	962	1672	128108	140079	FALSE	30	GGGGAAGAAAGGCTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRHSICRRWFCITSLDDPKLIEVAPTALSAEGLLEGEDHAGDVVPVPDGPKDPVGKPQHHEVLDHLLAQVVVDAVDLVLAEQGGDVVGQPVGALQVLPKGLLHNDAVPACLAHAGLADVLGDSLVDSGGQGQVEEAVGRGALVEGVHVAVEALVGGWVIILASHVGVAGKELLQLQLLLWGGLERLALFADVGHCEARAGIAHNEGVFRQKAISEQPPDGRIDLLLCQVALRRP	125705	140196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_125916_126304_126417_126492_126588_126700_126776_126883_127119_127539_127726_128059_128159_128425_128552_128775_128933_129359_129582_129952_130058_130151_130189_140066
876858	contig_9995_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_47680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCTCTGTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248965	251254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_249000_251300
876859	contig_4736_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_168641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396494	398773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_396500_398800
876860	contig_11115_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_102872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGGTGCCCCACGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232427	229749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_-_229700_232400
876861	contig_5649_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_82293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTAGTGTTAACTATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149789	147940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_147900_149800
876862	contig_9436_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_60884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245392	243277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_243300_245400
876863	contig_17518_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_117355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAACGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96081	93411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_93400_96100
876864	contig_12265_pilon	-	2392	1	Intergenic	novelGene_149437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGTCGCTGAACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21998	19606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_-_19600_22000
876865	contig_3818_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_99265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCACTCCTAGGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540574	538808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_538800_540600
876866	contig_6375_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_73067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	734	1120	691637	692023	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPETQSWSVAGSWGGGSLTCSGQTRPVVFKLLGRAPKFPRGFFRSPWGDGVGAEQAGLLALKQNSSLYNCLTYRVQGKILFELRGLLLKKVGKPLTRPSIQNWSLCTPRFGADSSSHPLPQDAYPC	690903	692881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_690900_692900
876867	contig_4759_pilon	-	3681	6	Intergenic	novelGene_106345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1360	1806	869784	865950	TRUE	20	GCACAGCTTAGGCGTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNPEDACGGFHHAKVVAFINEKMTGHVKGPEFYLENMSLSWEEVEDKLRAILEDNDVPSEAKEACAWGGLALGVRFARRQSQLQGRRVQRLHDFAKLHRSAAQALAADLKELTAQQELERKEAAFQLQLLQASFRSLILQYGLHSA	871143	837992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_838039_857447_857520_858639_858681_861849_863518_865901_865992_869379
876868	contig_8538_pilon	-	2507	6	Intergenic	novelGene_4616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	107.945541825496	24	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	51	680	719044	707298	FALSE	45	TAAACAAAAGCACGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHALEAMLAVASIGAIWSSTSPDFGVNGVLDRFSQIQPKLIFSVEAVVYNGKEHNHMDKLQQVVKGLPDLKKVVVIPYVACREKIDISKIPNSVFLDDFLASGKGEQAPQLEFEQLPFSHPLFIMFSSGTTGSPKCMVHSAGCLSSCPPRSSLFSYCTLASSSDSGKLTQKRHRHLRYSPYSDLASSPVTSCVALRLHCMRLSCVFSVL	724705	705470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_707502_708375_708524_713849_713932_714368_714484_718963_719062_724672
876869	contig_6228_pilon	+	1293	2	Intergenic	novelGene_164506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTCATAAGATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252589	255827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_252737_254681
876870	contig_13697_pilon	-	1773	4	Intergenic	novelGene_165914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAAGCCCCGCCCCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130501	123926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_124068_126212_126286_126564_127839_130216
876871	contig_4769_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_118022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCAGCCCTTCCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158436	1160821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1158400_1160800
876872	contig_9363_pilon	-	1815	1	Intergenic	novelGene_6712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTTTGTGTGATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299294	1297479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1297500_1299300
876873	contig_8269_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_106217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGCAGTGAACCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249139	247389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_247400_249100
876874	contig_11978_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_62807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAACAGCAATTAATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346661	344360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_344400_346700
876875	contig_7428_pilon	-	1251	4	Intergenic	novelGene_77674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	4.32049379893857	122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	179	1096	63012	56635	FALSE	10	ATCTCTGTTCTGTGCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEEEELGSGRLAGGVGGGPGHLPPSQLNGVPGPWPEGAKKVRRVPEEGAGELLEGTSEGMAGLEGFGQELQELEVALSNGGAGSEPPLEPLLPLEEEEAYESFSCPPEPPGPFLSSPLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGLVAQLACHPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKKYLIARGKLDWPEGPAAGPVPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGRDGAGLGLGGGSPGASTPVLLPRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHAVTSPFLLDTSEEGSGSPVSGFGPLNP	63190	56479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_56997_59587_59751_59903_60083_62798
876876	contig_6946_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_59781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432684	435080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_432700_435100
876877	contig_5515_pilon	+	1155	4	Intergenic	novelGene_52320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	399	785	60106	60952	TRUE	20	GCCAGCGCCAACGCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVSRDPLWGAVHPCPIKVSVGFIMKQGTGPKINEFDTAPAEVHQDVFVLDVTVDNSTGMAVPNGCHYLGKEAAASALTQWALLCDVVKEILGRQRPLEDQHDALWCLKPVKQANHTRVPTTCTHLP	59609	64020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_59881_59978_60155_60614_61098_63795
876878	contig_14676_pilon	-	1169	3	Intergenic	novelGene_175164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	70	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	334	819	51396	43825	FALSE	40	TATCATTAAAGAACGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDTFILTLKQILLFSALKQGKSLCLKAKCSEVSEEVTETITEEAVEKPPKRKKKRKEDQYTCGSILVEDGTAELLDVTTKEETDLQTNNNVDGLWVEESKKKKKKRKHQEDQDQDPVFQGSDSSGYQSDHKKKKKKRKHSEEAEFTPILEHSPKKKRKK	56799	43474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14676_pilon_-_44234_51319_51462_56531
876879	contig_5854_pilon	-	681	5	Intergenic	novelGene_68866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.9059551857638	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	143	679	476446	406041	FALSE	35	TACTGGAGAGAAATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSQASVSFKDVAVELTQEEWQHMGPAQRTLYRDVMLENYNHLVSVGSCFTKPELIFRLEQGEDPWLLKEEFLNRSTPENCQHDELLEKTPENQGKHLWQVLFTNRTLPTEQENISGKQCNPGINTFASRKIPCECDTTGPPYEGLRSLSSRCKNSIEKADEFNVYEKWLLTIKDDRT	477117	406038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_-_406340_413278_413375_448210_448338_476431_476491_477019
876880	contig_19730_pilon	+	1363	2	Intergenic	novelGene_142481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGCCAGTAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93046	94466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_93660_93716
876881	contig_7919_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_28032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCTCGGCTGCGAACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170003	171189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_170000_171200
876882	contig_2480_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_63551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	971	1279	302216	302524	NA	60	ATTAAAAAAAAGGGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKWVLKNQMLWSQFQLMALRCSKISLPEARSPAEASSLERFTCEGLQDNWHNLILTEILLPIINCYKSVTVKKVSPLRTSKSWQNLIATKMLLPYLFATNL	301245	303245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_301200_303200
876883	contig_5502_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_154991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGAGAACATTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411959	410251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_410300_412000
876884	contig_11105_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_159814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1051	1407	244245	244601	NA	60	GCACAATAAAATAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKTPQVSRVNGQWDTRAHPNPCCASSTSSSSFPSSWLHSPTQQLCSHSLLMQGSTGQRLPRTLMKAPARPRALVDSRLQVTAAAAHDQKVAAPTGQQQPGLPPPAMLPAPTYSLPA	243194	245298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_243200_245300
876885	contig_4999_pilon	+	3196	11	Intergenic	novelGene_177519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1.61245154965971	31	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	430	1803	185992	203110	FALSE	5	TTTGTTTTATTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLCTNGQCINTMGSFRCFCKVGYTTDISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYVLQEDGKTCRDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGAKGICQNTPGSFSCECQRGFSLDATGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQWNQCVDENECSNPNACGSASCYNTLGSYKCACPSGFSFDQFSSACHDVNECSSSKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLAVDAEADEENALSPEACYECKINGYAKKDGRQRRSVYEPASTAVKQISLESVDMDSPVKMKFNLSGLGSKEHILELMPAIEPLNNHIRYVISQGNDDGIFRIHERSGLSYLHTAKKKLVPGTYTLEITSVPLYKKKELKKLEDSNEDDYLLGELGEALRMRLQIQLY	172785	204503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4999_pilon_+_172860_183349_183476_184908_185116_185969_186098_188375_188499_189821_189939_190826_190956_194051_194172_199132_199365_200623_200796_202735
876886	contig_5361_pilon	-	3035	1	Intergenic	novelGene_167225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCAGTGTCCTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675193	672158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_672200_675200
876887	contig_2933_pilon	-	1130	2	Intergenic	novelGene_111365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACTCATGGCGACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870733	869211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_869483_869874
876888	contig_12923_pilon	-	1187	9	Intergenic	novelGene_30145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.523902897012	348	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	39	956	236117	225444	FALSE	25	TATATGGGTCCCAGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETVSEEAAAPEMAVSERRGLARGSPVEWGPRLLLLLLLAGCSGRIHRLTLTGEKRADIQLNSFGFYTNGTLEVDLSLLQLGPQKTEEKTPLVGFSLTRVRSGSVLSYSPQEPYDCPLQKNSSNLLVLFLINTKDLQVQVRKYGDQKKLFIFPGLLPEVPSNPGPPKPGPSATPKVDSVAPSMINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVSGRDGSPYLPPKDRAPCPHLGPPRLLTSSCGIMTSLFCYPFLAFVRVWVKGAEVTWTI	236155	225212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225612_231369_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232054_232753_232837_233022_233074_234497_234618_235997
876889	contig_12884_pilon	-	2623	21	Intergenic	novelGene_105025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_1	182.989999726761	48	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	850	2550	72	2621	1258336	1248540	FALSE	25	GCCCCCACCCAACCAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQHRFRVPEPQGLGQQRTSSEDNLYLAVLRASEGKKDERDRVQKKTFTKWVNKHLIKAQRHISDLYEDLRDGHNLISLLEVLSGDSLPREKGRMRFHKLQNVQIALDYLRHRQVKLVNIRNDDIADGNPKLTLGLIWTIILHFQISDIQVSGQSEDMTAKEKLLLWSQRMVEGYQGLRCDNFTSSWRDGRLFNAIIHRHKPMLIDMNKVYRQTNLENLDQAFSVAERDLGVTRLLDPEDVDVSHPDEKSIITYVSSLYDAMPRVPDVQDGVKANELQLRWQEYRELVLLLLQWIRHHAVAFEERKFPSSYEEIEILWCQFLKFKETELPAKEADKNRSKGIYQSLEGAVQAGQLKIAPGYHPLDVEKEWGKLHVAILEREKQLRREFERLESLQRIVSKLQMESGLCEEQLNQADALLQADIRLLAAGKAPQRSGEVERDLDKADGMIRLLFNDVQTLKDGRHPQGEQMYRRVYRLHERLVTIRTDYNLRLKAGASMTQSVSRPPDHELESSTLRYLQDLLAWVEENQRRVDGAEWGVDLPSVEAQLGSHRGLHQSIEEFRAKIERARADEGQLSPVTRGTYCDCLGRLDLQYTRLLNSSKARLRALESLHGFVAAATKELMWLSEKEEEEVGFDWSDRNANMATKKESYSALMRELELKEKKIKQIQNTGDRLLREGHPARATVESFQAGLQTQWSWMLQLCCCIEAHLKENTAYFQFFSDVREAEEQLQKLQETLRRKYTCDRSITVTRLEDLLQDAQDEKDQLNEYKDHLSGLAKRAKAIVQLKPRNPAHPVRGHLPLLAACDYKQVEVTVHKGDECQLLGPAQPSHWKVLSSGGSEAAVPSVCFL	1258407	1248537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_1248654_1248759_1248913_1249968_1250095_1250342_1250439_1250709_1250815_1250978_1251141_1251226_1251305_1251383_1251682_1251770_1251926_1252563_1252658_1252968_1253097_1253173_1253270_1253345_1253466_1253541_1253649_1254033_1254150_1254788_1254956_1255829_1255923_1255998_1256077_1256993_1257084_1257548_1257611_1258224
876890	scaffold_880_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_121468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTGGGAGACACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462614	461500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_461500_462600
876891	scaffold_880_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_121469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTCAAGTCCACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464109	462570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_462600_464100
876892	contig_1637_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_142386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTGCTCGCTGTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503829	501634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_-_501600_503800
876893	contig_11056_pilon	+	2852	19	Intergenic	novelGene_130386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	13.2465928533424	287	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	147	1922	600912	626573	TRUE	20	AGACATGCTTTGCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYILVTGGVISGIGKGIIASSVGTILKSCGLHVTSIKIDPYINIDAGTFSPYEHGEVFVLDDGGEVDLDLGNYERFLDIRLTKDNNLTTGKIYQHVINKERKGDYLGKTVQVVPHITDAIQEWIMRQALIPVDEDGLEPQVCVIELGGTVGDIESMPFIEAFRQFQFKVKRENFCNIHVSLVPQPSSTREQKTKPTQNSIRDLRGLGLSPDLVVCRCSNPLDTSVKKKISMYCHVEPEQVICVHDVSSIYRVPLLLEEQGVVDYFLRRLDLPIERQPRKMLMKWKEMADRYDRLLETCSIALVGKYTKFSDSYASVTKALEHSALAINHKLEIKYIDSTDLEPSTLQEEPVRYHEAWQKLCSAHGVLVPGGFGVRGTEGKIQAIAWARKQKKPFLGVCLGMQLAVVEFSRNVLGWQDANSTEFDPKTSHPVVIDMPEHNPGQMGGTMRLGKRRTLFQTKNSVMRKLYGDPEFLEERHRHRFEVNPVLKKCLEEQGLKFVGQDVGGERMEIVELEDHPFFVGVQYHPEFLSRPIKPSPPYFGLLLASVGRLPHYLQKGCRLSPRDTYSDRSGSSSPDSEITELKFPSINHD	597139	629043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_597273_600898_601078_602806_602978_606647_606749_607544_607662_610769_610854_611357_611439_614095_614248_616058_616192_617428_617518_618478_618574_619283_619347_621450_621495_623445_623543_624693_624750_624852_624950_625493_625639_626488_626584_628123
876894	contig_12128_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_132000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	74	325	562276	562025	NA	30	ATCAGTTCCATCAATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIQNADLYGQYAHATSDYALQTPGMNRFLGLYGEDDDSWCSSSSSSDSEEEGYFLGQPIPQPRPQRYAYYTDDLSSPTSALPTPQFGQRTTKSKKKKGHKGKNCIIS	562349	559877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_559900_562300
876895	contig_20398_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_155194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAATAGTTTTTCTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37182	34739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_34700_37200
876896	contig_3193_pilon	-	3461	1	Intergenic	novelGene_126307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	93	464	60672	60301	NA	50	ACAAGGAGAAAAAGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVCQHAVLPGPRVPEPGVYTEVCVCSQRCSGTRGRISARGLGEESRVDGRSWKGAYWEAQEPRQEPVGVARARGVGGRRSRLLLPELESYPLCARIRAVESFKQMRNSIRPGLWIIIQIQAK	60764	57303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_-_57300_60800
876897	contig_8866_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_77799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGAAAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407067	404768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_404800_407100
876898	contig_9199_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_65623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	516	827	47339	47028	NA	55	AAAAAAAAGTGAAACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLWCLPATGLVAWVTFHLSTPDYSCHAGKETSCLQSYKWEKDAEKGEATDSRAQVVNWWPILAQRRVLFGPQSIVLKTAALRYNSPSMQFTRLKCIIRWFLV	47854	45593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_45600_47900
876899	contig_5586_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_143535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGCACAGGAAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315130	317840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_315100_317800
876900	contig_9683_pilon	-	3356	5	Intergenic	novelGene_151278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	4.65698400254929	107	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	396	2420	486025	482321	FALSE	40	AAAAAAAATTTTTTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLLRGGSPFRTLLPLRGEWMGRRGVPRSLVPGPPRRRYRKEALPALDVPVLPVTATDIRQYLRTHGIPFQDGHSCLRAPSPFAGASQHKDHAGGTTSFSLFIDKTTGRFLCMASLAEGSWEDFQASVEGRGDATKEGVLLSKAPEPVDSEEVRRIWDRAVPLWELPDPQEAQLARVMFGLSKVTDDTLKRFSVRYLRPARSLVFPWFSPGGLGLRGLKLVGAEGQGDGVHYVETTIPRPGAFHNLFGLPLINRRDVEVVLTSRELDSLALNQSMGLPTLALPRGIACLPPALLPYLEQFRRIVLWLGDDLRSWEAAKLFARKLNPKRCSLVRPGDQQPRPLEALNQGLNLSRILRSALPAWHRSIVSFRQLREEVLGELSNVEQAAGVRWSRFPDLNRLLKGHRKGELTVFTGPTGSGKTTFISEYALDLCTQGVNTLWGSFEISNVRLARVMLTQFAVGRLEEQLDKYDEWADRFEDLPLYFMTFHGQQSIRTVIDTMQHAVYVYDICHVVIDNLQFMMGHEQLSTDRIAAQDYIVGAFRKFATDNSCHVTLVIHPRKEDDDKELQTASIFGSAKASQEADNVLILQDRRLVTGPGKRYLQVSKNRFDGDVGVFPLEFNKSSLTFSIPPKSKARLKKIKDDNGLVAKKPSSGKKGAVSQNSETCLDQAPNA	486420	481384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_482612_483536_483679_483996_484105_484348_484590_484782
876901	contig_935_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_45535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAGGTGCTGTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285518	284217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_284200_285500
876902	contig_8616_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_72522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGATGTGTGTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347973	349498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_349089_349173
876903	contig_9199_pilon	+	3194	1	Intergenic	novelGene_65614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGTATATAACAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42466	45660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42500_45700
876904	contig_3948_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_53423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961155	1963762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1961200_1963800
876905	contig_7129_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_169312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAATAGATTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946439	948166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_946400_948200
876906	contig_5039_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_64820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTGGAGGCTTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240237	237808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_237800_240200
876907	contig_4232_pilon	-	1163	3	Intergenic	novelGene_63152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	56	2602	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCAGGTGCCGTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17332	14910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_15581_15866_16006_16978
876909	contig_4769_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_118029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	73	420	1229669	1229322	NA	30	CACCAGGTGTGTATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLGTDGKRVSETFPKEIRAPAVNVDPVVWNQYTAMLNGGLALKTNEISVIQSGGIPTLPVSLGASSVVNNTTASKMDGSQSSLSADVEKPGATDSVPTHQFPHFLEENKIAVS	1229741	1227685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1227700_1229700
876910	contig_5084_pilon	-	815	3	Intergenic	novelGene_64499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	247	357	318925	318815	TRUE	25	AGGGCCTGGATAGACGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSYPGLGGLGKSKVYLVCPVPKEGVISKVILHFQHRPSEAPDPELQLSGYNVGLTLLHRRSNDPPLGRQAFCSFVSCPRAAPMSCQVGRSLGEPQEKAAISPSVAAILGFGPSSLEYP	319171	318138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_318423_318539_318598_318698
876911	contig_12622_pilon	+	1821	1	Intergenic	novelGene_6062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1752278	1754099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1752300_1754100
876912	contig_11978_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_63133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAGGTCTCTCAAACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1976153	1978796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1976200_1978800
876913	contig_15093_pilon	+	2151	7	Intergenic	novelGene_143299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_5	77.843860815524	14	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	188	1213	93382	99600	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPYTPLEKKAVDNTDDETLTEEWTLDQPVFQTRTTAIVEVKGTVDIVLTPLVAEALDRYIEAMVHCASNWHPAAIVDDLHAKVLREAVQNSKTTFSENLSSKQDVRGTKTEHPTLGTTNQGQAQTNLTMKQDNVTIKGLQANVSIPKVNLCLLQASVEESPATAPSRSVTHVSLVALCFDRIATQVRMNRGVVEETSNSAEPGRTSNFDRYAHATKMQPQSSGSLRSNAGAEKGKEIAAKLNIHRVHGQLRGLDTTDIGTCAITAIPFEKSKVLFTLEELDEFTFVDETDHQAVPDVTRIGPSQEKWGWIMFECGLESLTIKGGRQSGAVLYNTFGIMGKANVTERGGVLTSNNSSDSPTGSGYNTDVSDDNLPCDRTSPSSDVNGNSVSDEQVGEFLIIIML	92370	100538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_92545_93368_93490_94536_94684_95094_95223_95566_95767_98345_98544_99355
876914	contig_15031_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_138418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATCTTTACAGTAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142363	140271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_140300_142400
876915	contig_990_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_76171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATACAGCAATGATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1932285	1930395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1930400_1932300
876916	contig_5255_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_171551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	920	1249	11100	11429	NA	45	GGAAAAAGGGGTGGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASWFLFYAVDYIVCYCPYFYVQSVPIWPAGARLSWFLCPFAMSPLFFEPFLALGPSFTFPALILESAISSRSHFTPLHTLFSLIWVWLHILGHRPRFLPVDALLTLLG	10180	12508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_10200_12500
876917	contig_2455_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_119225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGTTTAGTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1408702	1410674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1408700_1410700
876918	contig_10399_pilon	+	3275	1	Intergenic	novelGene_114476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	590	925	123265	123600	NA	15	CCGCCACCCACATTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHLLQMSPPTALAYPGIKSGLLNQPSQSRDRTPAYTSRSSPPINSLPSMLWTKWGSPSSSVPLHGTPPLAPRPPQRSRFAWCLPHRQDCGFGVHGLRLSCSLLCAWGPP	122675	125950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_122700_126000
876919	contig_6589_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_26195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGATTCTGATGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1993703	1995262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1993700_1995300
876920	contig_2414_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_158500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGTAAAAAAATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381921	379892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_379900_381900
876921	contig_6163_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_103819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTCTGTATTGTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88691	86452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_86500_88700
876922	contig_1172_pilon	+	2198	6	Intergenic	novelGene_162039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	14.8108068652589	120	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	104	901	669282	671742	FALSE	25	AACCCCACAGGTCAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRDPQFQGLFQYLLRTKAGGITKRLAPLHRLLQPMASCARVVQCAEAVPTLLQVFFAAVTQVADGALTAQLALVLLERSNFLFQVPQYEAQVHRVMSSQFLALCRLRPALVVELARDLLDFVGSVSGIHSRERMFTAVVWAVGEYLAVSYDRRCTVEQVNRFFESLEALLFEVTQSRRSATLPPCPPQVVTVLMTTLTKLASRSQDLIPRVSLLLSKLRALPQGPAMGSAPRDEDTDTIRTRATELTNLLKMPSVAQFVFTPGTEASTPRFHRDANTALPLALHTVSRLMDREAGLPVA	668421	673039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_668494_669250_669363_669937_670036_670786_670920_670999_671215_671471
876923	contig_8801_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_66318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGATCTGGTAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733151	731019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_731000_733200
876924	contig_5424_pilon	-	2358	1	Intergenic	novelGene_172813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACAAAAAATTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146515	144157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_144200_146500
876925	contig_12599_pilon	+	3075	15	Intergenic	novelGene_176969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	29.9151862328641	63	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	553	1959	125354	153587	TRUE	35	CAGCGAGAAATGTGTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKCETSPPSSPRSLRLDRLHKGALHTVSHEDIRDIWNSTGSQDGHVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQMGKESLGQAGASETDNSSPDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLDEARRQGLPFAQWDGPTVVVWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEAVSLTSPSAPPTARTTLAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNYDRKELERKREESQNEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLVESGVHGALVALDETFDFNALALLLQIPTQNIQARAVLEREFSNLLVVGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGSAAGSAETLPANFRVTSSMSSPSMQPKKMQMDGDVSGTQRLDSATVRTYSC	112956	155569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_+_113013_118277_118502_120234_120468_125314_125467_126637_126811_127865_127960_137817_137900_138004_138206_146540_146717_146804_146903_148598_148775_150082_150152_151124_151291_153528_153600_154465
876926	contig_720_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_155167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCCAGAAAATGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168883	167301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_167300_168900
876927	contig_15689_pilon	+	1700	2	Intergenic	novelGene_164155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCGTGCAATGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147384	150230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_147923_149068
876928	contig_9373_pilon	-	3049	19	Intergenic	novelGene_162723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_14	99.7032015286456	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1012	3036	12	3047	289081	242609	FALSE	40	GTTAGAGGTAAGGACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPEMRSSMITSMEGLGSDNVFSLHEDNHYRISKSLVKSAEGSTVPLTRVKCLVSMTTPHDIRLHGSSVTPAFVEFDTSLEGFGCLFLPSLAPHNAPTNNAVTTGLTDGAVISGIGSGERLFPPPSGLSYSSWFCIEHFSSPPNNHPIRLLTVVRRANSSEQHYVCLAIVLSAKDRSLIVSTKEELLQNYVDDFSEESSFYEILPCCARFRCGELIIEGQWHHLVLVMSKGMLKNSTAALYIDGQLVNTVKLHYVHSTPGGSGSANPPVVSTVYAYVGTPPAQRQIASLVWRLGPTHFLEEVLPPANVTTIYELGPNYVGSFQAVCMPCKDTKSEGVIPSPVSLVPEEKVSFGLYALSVYSLTVARIRKVYNKLDSKAIAKQLGISSHENATPVKLIHNSAGHLNGPARTIGATLTGYLGVRTFVPKPVATTLQYIGGAAAILGLVAMASDVEGLYAAVKALVCVVKSNPLASKEMERIKGYQLLAMLLKKKRSLLNSHILHLTFSLVGTVDSGHETSIIPNSAAFQDLLCDFEVWLHAPYELHLSLFEHFIELLTESSEASKNAKLMREFQLIPKLLLTLRDMSLSQPTIAAISNVLSFLLQGFPSSNDLLRFGQFISSTLPTFAVCEKFVVMEINNEEKLDTGTEEEFGGLVSANLILLRNRLLDILLKLVYTSKEKTSINLQACEELVKTLGFDWIMMFMEEHLHSTTVTAAMRILVVLLSNQSILIKFKEGLNGGGWLEQTDSVLTNKIGTVLGFNVGRSAGGRSTVREINRDACHFPGFPVLQSFLPKHTNVPALYFLLMALFLQQPVSELPENLQVSVPVISSRCKQGGQFDLDSIWTFIFGVPASSGTVVSSIHNVCTEAAFLLLGMLRSMLNSPWQSEEEGSWLREYPVTLMQFFRYLYHNVPDLASMWMSPDFLCALAATVFPFNIRPYSEMVTDLDDEVGSPAEEFKAFAADTGMNRSQSEYCNVGTKTYLTNHPAKKFVFDFMRVLIIDNLCLTPASKQTPLIDL	289092	242606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_242834_244216_244397_246269_246405_247643_247880_252015_252234_252427_252549_254935_255031_258317_258480_258566_258641_263499_263653_264874_265066_266576_266689_270239_270401_271734_271967_273997_274180_282744_282964_283119_283221_284529_284762_289074
876929	contig_6589_pilon	-	2532	17	Intergenic	novelGene_26277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1370	1708	2250837	2249855	TRUE	20	CCTTTTCCGGGTAAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRYPCSSEFLRSCSGLTDFHCSFMRKYSSVFSRTWALCSSAEPSQLRYPRRNFQASRLRLGLRPPEKIRAFSSGTCCRQPSGPTWRAHSSSVTGRARSTAGRGPSSTCKK	2256999	2243943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2243998_2244561_2244660_2244866_2244941_2246164_2246290_2247110_2247319_2249259_2249372_2249701_2249866_2250218_2250349_2250466_2250572_2250744_2250839_2251913_2252031_2252118_2252219_2252302_2252404_2254926_2255024_2255195_2255313_2256075_2256164_2256251
876930	contig_11335_pilon	+	2359	1	Intergenic	novelGene_104907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	764	1090	310966	311292	NA	35	TGCCAAGCAAAATTAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIVHERLLFFTSLFRCYIVLWGEFAFRILPIVRKFVLFTGILKCHTALLTFYHFYPLLPKWYLLTFPPKESIYSYKHILNSHYSFHKSFRVNVVGKAGNKQGKEYT	310202	312561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_310200_312600
876931	contig_8676_pilon	-	4837	36	Intergenic	novelGene_142214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	53.0606891652745	55	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1588	4767	5	4771	538634	459135	TRUE	25	CCCCGTCCAACAGCTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDCQWITTLHYAFQDENYLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSREHRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESSFSDRGSLRNMMQSSTLTKDEDVQRGLENSLQIEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHSSARALGNSNRDKEIKKLNEEIERLKNRMADSSRLERQREDAAVLRQEHEDSAQRLKGLEKQYRVARQEKEDLHKQLVETSERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRSQKQKVSRQLRDKEEELEVAMQKVDSLRQEMRRSEKSRKELEAQLEDAVAEASKERKLREHSENFSKQMESELEALKVKQGGRGSSATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVRKEVHDSESHQLALQKEILMLQDKLEKTKRERHNEMEEAVGTVKDKYERERAMLTEENKKLTAENDRLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQALASKMTEELETLRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEELRKVKDANLSFESKLKDSEAKNRELLEEMEVLKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPLTHDLTFRTGSAGEQEAHAPKPEVSPSLSVPTGIDQQEDMARALPRTAAVPLPTTPALTLAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVACKDSAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGYVKIPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKSTQPGVVASQVLDLRDEDFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGSPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPQEAYDSSLPLIKAILAAAIVDGDKIAVGLEEGLYVIELNRDVIVRATDCKKVHQIALVPREKVVVLLCGRNHHVHLYPWSALDGAEGSFDIKLPETKGCQLIATATLKKSPSTCLFVAVKRLVLCYELHRTKPFHRKLGELAAPGTVQWMAVLGDRLCVGYPSGFALLSTQGDGQALNLVNPADPSLAFLSQQSFDALCAVELRSEEYLLCFSHMGLYVDPQGRRSRMQELMWPAAPVACSCSPSHVTVYSEYGVDVFDVNTMEWVQTIGLRRIRPLNPEGSLNLLSCEPPRLIYFKSSFSGTVLNVPDTSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSALPSTQEERPGPVPASLSRQPPPRNKPYISWPSSGGSEPGGGPCR	538638	456045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_456074_459096_459170_459251_459358_459644_459763_460436_460555_460699_460785_460866_460965_464582_465180_466390_466454_466868_467086_468378_468461_469178_469319_470509_470647_471612_471719_473204_473283_473641_473732_477934_478015_480104_480200_480966_481116_486382_486489_486962_487088_487454_487561_487662_487908_490011_490123_492603_492847_494140_494275_495154_495275_495353_495521_497407_497488_499298_499548_501771_501973_504401_504496_520848_520998_525974_526071_531505_531590_538571
876932	contig_13740_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_34768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAGTTAATGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727756	725351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_725400_727800
876933	contig_7286_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_108668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTAGCATGTTGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283270	285277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_283300_285300
876935	contig_6164_pilon	+	1858	10	Intergenic	novelGene_121299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	15.1543499031682	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	38	1270	654707	669724	FALSE	40	TAAAACTTTTTAACATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPYCQIATEKGQMEEQYWRSVMFHNYLDYLAKNGYEYEESTKDQAIREQQELLMKMLALSCKLEREFRCVELADLMTQNAVNLAIKYASRSRKLTLAQRLSELAMEKAAELAVTQEEEEEEEEEGFRKKPNAGYYNTASEWSQPRLRNQVEEDAEDSGEADEVEEKPEIHKHRQNSFSKSANSSDMPPVKSGAVISSNQGQANPFKVSVSSKEPATSVNTARSTNILDNMNKSSRKSTALNRAASNDKSPVIKPLIPKPKSKQASAASYFQKRTSQAGKTDEVKEENPKNLSSETPAVSPQNTENQRPKTGFQMWLEENRSNILSDNPDFSDEADIIKEGMLRFRVLSAEERKAWTDKAKGGTASDGAETKKRKRLIDENNETERTESQKEETKENLNLPKKRKPLDLSTNQKLSAFAFKQE	654669	670312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_654713_655350_655483_658510_658735_658835_658955_659137_659195_661358_661403_661808_661980_662581_662713_665488_665628_669514
876936	contig_7173_pilon	-	1462	6	Intergenic	novelGene_37550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGCCTGAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608532	592094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_592186_594816_594918_603796_603910_605086_605235_607405_607510_607627
876937	contig_18859_pilon	+	3227	1	Intergenic	novelGene_150547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAAAATTATTTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117354	120581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_117400_120600
876938	contig_10549_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_110595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCATTATGATGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126060	128101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_126100_128100
876939	contig_11258_pilon	+	2215	2	Intergenic	novelGene_67753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5543	junction_1	0	51	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCAGTGTCTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50724	53623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_52872_53555
876940	contig_13481_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_119321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCACCTGCTGAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295609	293559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_293600_295600
876941	contig_3825_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_78035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACATTTAATAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1941883	1943335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1941900_1943300
876942	contig_6048_pilon	-	1624	1	Intergenic	novelGene_73311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	744	1103	2102842	2102483	NA	10	ACTGTGGTGTTTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTSGQKLSPWPTCSPGHMHTLPPYQPASGLCYVQDHFGPTPNSAGVYPASAGASLGVQPPRPPQLPWHSVFWVPEHPGVCWHQGVLKGPNSLIEGISREVTSRLGLLKKVFSEIFLI	2103585	2101961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2102000_2103600
876943	contig_10013_pilon	+	1648	12	Intergenic	novelGene_125064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10.7787670065652	74	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	302	1480	341051	352191	FALSE	25	AATAAGCGCGTTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGSDDTFAAYTREQLYQAIFYAVDQYLVLPDVSLGQYAYVRGGGGPGANGSALALCQRYYHRGHVDPANDTFDIDPMVVTDCIRVDPLERLPVSPSEDLALSDGGSSYRNLTLKFHKLINVTIHFQLKTINLQSLINNEIPDCYTFSILIIFDNKAYSGRIPISLETQAHIQECKHPSVFGHGNNGFRLLFDVVVMLTCALSFLLCARSLLRGFLLQNEFVRFMWRQRGRVISPWERLEFINGWYILLVTSDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDICSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHKYNILIATLRVALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFATFAMMQAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGAGGEESELQAYIAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDAEEHSLLVN	340670	352359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_340819_340897_341064_342034_342144_342384_342482_342652_342753_344809_344917_344990_345141_345240_345343_348786_348910_349422_349639_351924_352053_352157
876944	contig_10861_pilon	-	1824	4	Intergenic	novelGene_39460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	292.814313554208	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2621062	2617917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884
876945	contig_1262_pilon	-	2524	1	Intergenic	novelGene_133553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATCAAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259831	257307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_257300_259800
876946	contig_12622_pilon	+	2314	4	Intergenic	novelGene_5762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87500	91521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_87588_88811_90430_90531_90788_91168
876947	contig_11386_pilon	+	1012	5	Intergenic	novelGene_82837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_4	29.7100572197362	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGTTTTGTGCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231197	245133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_231264_231608_231685_233457_233517_234770_234884_244435
876948	contig_10241_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_142832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGAAGCAAAAAAGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92721	94690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92700_94700
876949	contig_501_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_134882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATATAATGTGTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16894	15068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_15100_16900
876950	contig_11656_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_54026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTTTATCTGGGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483793	481909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_481900_483800
876951	contig_12570_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_79362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAATTGACTCAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206628	208709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_206600_208700
876952	contig_9389_pilon	+	1938	11	Intergenic	novelGene_84016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	121.689810584124	449	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	78	1178	561665	577709	FALSE	5	CTCACGTGTGTCTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDWSTTQETLRSYFSQYGEVVDCVIMKDKTTNQSRGFGFVKFKDPNCVGTVLASRPHTLDGRNIDPKPCTPRGMQPERTRPKEGWQKGPRSDNSKSNKIFVGGIPHNCGETELREYFKKFGVVTEVVMIYDAEKQRPRGFGFITFEDEQSVDQAVNMHFHDIMGKKVEVKRAEPRDSKSQAPGQPGASQWGSRIVPNAANGWAGQPPPTWQQGYGPQGMWVPAGQAIGGYGPPPAGRGAPPPPPPFTSYIVSTPPGGFPPPQGFPQGYGAPPQFSFGYGPPPPPPDQFAPPGVPPPPATPGAAPLAFPPPPSQAAPDMSKPPTAQPDFPYSQYAGYGQDLSGFGQGFSDPSQQPPSYGGPSVPGSGGPPASGSGFGRGQNHNVQGFHPYRR	560967	578469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_560992_561611_561779_561999_562066_563624_563736_565084_565134_568519_568603_571356_571511_573502_573533_573729_573871_575052_575230_577533
876953	contig_10431_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_117387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	408	824	1231	13896	13489	NA	25	CTGGAAGAGGGTATGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSLGCVKEPKESIAIPEKAPISPKKRVRFKRKWRGKKTPTPEASHEEEPLEGTGAIEETETLTKLTVSLGKEEGVGGVEHPPSDILLPGDSAPNSGMGDHGMIVQVKERFQGEVQTAHLLLKNESSVAGGVWDS	14719	13488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_13500_14700
876954	contig_2027_pilon	-	1002	3	Intergenic	novelGene_39878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_2	62	3833	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	491	901	55814	53400	FALSE	20	CTAGCTAGTGTTGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLPAVHVRWESTASRTVVAPPAITGKRPREPIIRWQEDPDPEDENLYEKNPDSHGYDKNPVVDLWNMRVVFFFGFSIVLVLGSTFVAYLPDYRMREWARREAERLVKYREANGLPIMESNCFDPSKIQLPEEED	56304	53298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_53527_53703_53835_55661
876955	contig_15548_pilon	-	2097	2	Intergenic	novelGene_173479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	0	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	873	1229	239343	238659	FALSE	65	TTAAAAGGGAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLVSSARGANTDFLFAFFVLLSPQKYVQWSLPFIVFGATGLASGLLSLLLPETLNSPLLETFSDLQVYSYRRLGEEALSLQTLDPPQSADKESTSGSESEEEEEFYDANEETQMLK	240215	237790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_238749_239076
876956	contig_7873_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_169570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCAAGAATTTTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63387	65735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_+_63400_65700
876957	contig_12090_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_80497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTTACTGTTCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234599	236994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_234600_237000
876958	contig_20739_pilon	+	1639	7	Intergenic	novelGene_83189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_3	67.074585350936	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	439	1587	180041	186157	FALSE	85	AGAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLSRAVTILEMIKRREKSKRELLHLTLEIMEKRYNLGDYNGEIMSEVMAQRQPVKPTYTIPIIPITNTNSNQFKHQEAMDVKEFKVNKQDKADLIRPKRKYEKKPKVLPSSAAATSQQTSPAALPVFNAKDLNQYDFPSSDEEPLSQVLSGSSEAEEENDPDGPFAFRRKAGCQYYAPHLDQTGNWPWTSPKDGGLGDVRYRYCLTTLTVPQRCIGFARRRVGRGGRVLLDRAHSDYDSMFRHLDLEMLSSPQHSPVNQFANTSETNTSDKSFSKDLSQILVNIKSCRWRHFRPRTPSLHDSDNDELSCRRLYRSINRTGTAQPGTQTCSTSTQSKGSSGSAHFGTFICYYVRFYRNVIF	179602	186209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_180056_180279_180429_181306_181473_183694_183872_183961_184052_184133_184283_185754
876959	contig_11525_pilon	+	3082	1	Intergenic	novelGene_171076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGCGGGGCGGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42369	45451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_42400_45500
876960	contig_5145_pilon	+	1874	7	Intergenic	novelGene_131396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	24.0237151350262	79	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	63	851	651321	654253	FALSE	20	TTACTTTTTAAACCCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHDDPSLVPNVPYFDLPAGLMAPLVKLEDHEYKPLDPKDIRLPPPMPPSERLLAAVEAFYSPPSHDRPRNSEGWEQNGLYEFFRAKMRARRRKGQEKRNSGPSRSRSRSKSRGRSSSRSNSRSSKSSGSYSRSRSRSCSRSYSRSRSRSRSRSRSSRSRSRSRSRSRSKSYSPGRRRRSRSRSPTPPSSAGLGSNSAPPVPDPRLGEENKGHQMLVKMGWSGSGGLGVKEQGIQDPIKGGDVRDKWDQYKGVGVALDDPYENYRRNKSYSFIARMKARDECK	651258	655276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_651339_651914_652049_652581_652669_652929_653074_653156_653274_653751_653847_654059
876961	contig_5916_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_158036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTCTTTCTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326651	324885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_324900_326700
876962	contig_10126_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_105744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAGAAAGGCCTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158110	159111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_158100_159100
876963	contig_18976_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_174896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAACAGCTCGCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18689	19833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_+_18700_19800
876964	contig_12157_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_135912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACAAAAGCTTTTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172711	175452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_172700_175500
876965	contig_18919_pilon	+	1747	4	Intergenic	novelGene_156022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	219	308	68441	68530	TRUE	60	AAAAAGAGAGAGAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPFSGIRPGSFSLLNLATTDLSALLALPTRSLVPGSGELAVERPSSDLTVMGDDLCICVFMWRFSLLACVHAWSHRLHL	68222	167420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_69251_74954_75063_159887_160218_167139
876966	contig_3233_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_56510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGCCGGTAGTGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95987	94849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_94800_96000
876967	contig_8823_pilon	+	1266	6	Intergenic	novelGene_53056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	37.917805843693	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	218	460	76251	77887	TRUE	40	CAGAAGGCAAACATGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPVVLRLRRQADCVILNCSQHCASCSGRNQEPRLSFLEEHSSLVEVLTSACRQSHTQTSGCFFPIPGFFRLMEGRENAGDLREEKAKRGGTRGWEEEKDLLQAIVSRARTWVCRLPLLLHSQVVCHSLKERTGKNVSPCDAGQRKDFFCGV	51763	81180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_72945_73072_76219_76301_76878_76985_77800_77899_80385
876968	contig_1274_pilon	-	2990	1	Intergenic	novelGene_137809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGTCAGTTGGTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474089	471099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_471100_474100
876970	contig_5954_pilon	-	3012	1	Intergenic	novelGene_28810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAATCTTTTATTAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504342	1501330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1501300_1504300
876971	contig_3382_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_124093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCAGCCGCGGCGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578326	576924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_576900_578300
876972	contig_11816_pilon	+	1409	7	Intergenic	novelGene_98567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTTTTTCTTCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266331	1303084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1266525_1266610_1266721_1280175_1280348_1284823_1284965_1286533_1286668_1288268_1288356_1302512
876973	contig_4580_pilon	-	2402	12	Intergenic	novelGene_173382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTGCAAAACAGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149574	34523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4580_pilon_-_34711_113933_114003_121140_121187_121899_122015_123900_124021_125214_125334_126494_126545_128748_128879_129970_130048_132035_132176_140933_140980_148271
876974	contig_9363_pilon	+	2312	2	Intergenic	novelGene_6714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	88	351	1305560	1305823	TRUE	40	TTTTTCTTCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STKKGFYYKTNYNKIRPGLQPCFSAEALQMGWGNMRWWVLKEQSGLTSSHQSQLVPSSYKGPEQLFSKLLGRDTILPARQGPLLALYPSKAALQDPRSLSRPSAEATQGHSAWAMA	1305472	1309063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1305963_1307241
876975	contig_9571_pilon	-	2040	1	Intergenic	novelGene_136273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAACCAACCATGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419940	417900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_417900_419900
876976	contig_19744_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_120364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAGTTAGCTATAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107770	108811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_107800_108800
876977	contig_6938_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_69074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGAACCTTTAAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164669	165917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_164700_165900
876979	contig_15323_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_148503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGGGGAAAAAAAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24721	26792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_24700_26800
876980	contig_8322_pilon	-	1821	11	Intergenic	novelGene_143279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	30.9433353082695	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	832	1464	557039	541539	TRUE	15	GCCAGAATCTCTCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYVVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR	569059	538786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_539113_541507_541701_551795_551875_554777_554889_556241_556361_556877_557128_558577_558697_559171_559310_559974_560030_564992_565192_568827
876981	contig_9363_pilon	-	1797	9	Intergenic	novelGene_6704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	34.5811997333811	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	294	1514	1298867	1288377	FALSE	10	GAGAGCGGGTGCCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDVGPEDELPDWAAAKEFYQKYDPKDVIGRGVSSVVRRCVHRATGSEFAVKIIEVTAERLSPEQLEEVREATRRETHILRQVAGHPHIITLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILRCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGRYQFSSPEWDDRSNTVKDLISKLLQVDPEVRLTAEQALHHPFFERCEGSQPWNLTPRQRFRVAVWTVLAAGRVALSTHRIRPLTKSALLRDPYALRPVRRLIDNCAFRLYGHWVKKGEQQNRAALFQHRPPGPFPITGPEEEGDSAAVPEDEAMLVMG	1299160	1288093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1288671_1288767_1288894_1288965_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291499_1292774_1292830_1293102_1293279_1298772
876982	contig_7914_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_165025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTTCTGGGAGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116058	118176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_116100_118200
876983	contig_10531_pilon	-	2530	5	Intergenic	novelGene_114538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTAGCGCAAGGATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501818	491182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_492043_492309_492442_492840_492969_493100_493355_500662
876984	contig_10800_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_152615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAATCATCAAAGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57989	59550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_58000_59600
876985	contig_8866_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_77900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGGCTGCTTAGTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115218	1113233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1113200_1115200
876986	contig_11572_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_100083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAGTTTATAAGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411387	409361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_409400_411400
876987	contig_15752_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_148782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACAGATTACTGTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352122	350296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_350300_352100
876988	contig_14219_pilon	-	2546	1	Intergenic	novelGene_54339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGGATCGCATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804946	802400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_802400_804900
876989	contig_3382_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_124043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	480	1184	206865	206161	NA	40	TGCATTCCACAATTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRKCCLWPMMLQGNSSWRPVAPLPACHPHPLCSLAPSSPATLEGPGFVMAFSVIPLLLRGPFSGLLSPLSSWPTQGKMKCTRQPLPGPLSHLCRTIPEASPCRSPLYSSIQPSWCLSSPSLVKLTLAPFTTGSSPPATLGCHSLTCSSLWLIFTVFFLKEHSVGRLAAACPDPAHHGPAGHALLSRGPSLWREVTVVSVEGAPWEMAGNGKQPRTPRLRSLSLPLTLLGTAH	207344	204189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_204200_207300
876990	contig_5316_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_61252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCATGATCTCCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492794	495006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_492800_495000
876991	contig_8461_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_163912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	402	180	581	102688	103089	NA	25	AGTGAGTCCTTTTATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTSLFSFTSPAVKRLLGWKQGDEEEKWAEKAVDALVKKLKKKKGAMEELEKALSCPGQPSNCVTIPRSLDGRLQVSHRKGLPHVIYCRVWRWPDLQSHHELKPLECCEFPFGSKQKEVCINPYHYKRVESPG	102508	103090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_102500_103100
876992	contig_13481_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_119502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCAGCTTTAACAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395967	1393833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1393800_1396000
876993	contig_1275_pilon	-	2548	2	Intergenic	novelGene_108735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_1	0	29	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1484	1783	349532	349233	FALSE	35	GTCCTCAAATGTCACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLSYSALGKNTDVMVSFGISALMPHLSRTEFLRSVDPSNGSRQSVLVAPTDFLYLPAHIQISVQHSSSKLLSPPSKIITSIIVANTYVAPTVCQALF	352737	348467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_350238_351959
876994	contig_7839_pilon	+	2493	6	Intergenic	novelGene_45694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1500	1838	194440	194991	TRUE	30	TGCCTCAGAGAAGGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSHLVYCRDGNRTVPAWGSSEAHVGLGLSCCNGLHISDMADALGDTLPEQQLGAHLQVLWVFQEAETYHCLLPCPQLVLGMDLFHHCCLTYVANMYCHLEASPEGGGMEE	192940	197265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_194679_194891_195057_195500_195674_196265_196323_196459_196600_197045
876995	contig_7357_pilon	+	2232	14	Intergenic	novelGene_36950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_13	27.7087557990068	18	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	285	1781	1156250	1188908	FALSE	30	TATACTGTTTCTTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRQRREADVALFSELHRKLHSQGVLKNKWSILYLLLSLSEDPRKQPNKVSSYATLFAQALPRDAHSTPYYYARPQTLPLNYQDRSTQSAQNSGSMGSSGISSISMYALNGPTPTPQSLLPGQSHQAPGVGDCLRQQLGSRLAWTLTANQPSLQTTTSKGIPNAVARNMTRSRREGDTSGTVEITEAALVRDILYVFQGIDGKIIKMSNTENCYKAEGKANLNKSLRDMTIRLAELGWLHNKIRKYIDQRSLDRSFGLVGQSFCVALHQELKEYYRLLSVLHSQLQLEDDQGVNLGLESSLTLRRLLVWTYDPKIRLKTLAALVDHCQGRKGGELASAVHAYTKTGDPYVRSLVQNILSLVSHPVLSFLYRWIYDGELEDTYHEFFVASDPTVKTDRLWHDKYTLRKSMIPSFITMDQSRKVLLIGKSINFLHQLCHDQTPAAKMIAATRSAESPKDAADLFTDLENAFQGKIDAAYFETSKYLLDVLNKNYSLLDHMQAMRRYLLLGQGDFIRHLMDLLKPELVRPATTLYQHNLTGILETAVRATNAQFDSPEILKRLDVRLLEVSPGDTGWDVFSLDYHVDGPIATVRLF	1148260	1189359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_1148329_1155143_1155222_1156111_1156330_1158769_1158943_1159317_1159437_1160209_1160336_1162252_1162322_1162685_1162819_1166928_1167096_1181519_1181631_1181953_1182063_1185221_1185412_1187642_1187779_1188824
876996	contig_11104_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_112459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATAAAAAGCAATTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326156	327196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_326200_327200
876997	contig_14744_pilon	+	1831	1	Intergenic	novelGene_65906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAATGTTGTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38959	40790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_39000_40800
876998	contig_12429_pilon	-	2395	21	Intergenic	novelGene_136208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	67	junction_8	39.4441377139874	29	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	772	2316	78	2393	228860	150818	FALSE	30	AACTTCAGCCTTATCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAGLQGSLQQLQQYLSAVDRGTAAMAGYQLIRGLGLECLLGASPAALALQTSLVFSRDFGLLVFVRRSLSIEEFRDCREEVLKFLFIFLEKIGQKITPYSLDIKNTCTSVYTKDKAAKCKIPALDLLIKLLQIVRSSRLMEEFKVRELFSKFYGELALKTKLPDTVLEKIYELLGVLGEVHPSDMVNNSEKLFRAFLGELKTQMTSTVREPKLPVVAGCLKGLSSLMCNFTKSMEEDPQTSREIFDFARKAICPQIDLKRYAVPSAGLRLFALHASQFSTCLLDNYVSLFDLLSKWCGHTNAELKKAAHAALEAFLKQVSFMVARDAERNKSTLQYFMKQFYEIIRNTDSSNKELSIAIRGYGLFAGPCKAISAENVDWMYVELIQRCRQMFLTQTDTSDDHVYQMPSFLQSIASVLLYLDTVPEVYTPVLEHLMVVHIDSFPQYSPKMQSVCCRAIVKVFLALVDKGPVLWNCIGTVVHQGLIRICSKPVVLQKDAVAEAEDLRASGEVRTGKWKVPVTKDYLDLFRSLMSCDQMMDSLLAEEAFLLVNSSLQNLNHLIYDEFIKSVLKIVEKLDLTLEKQNAGEQEDENEATGAWVIPTSDPAANLRPAKPQDFSAFINLVEFCREILPEKHMEFFEPWVYSFAYELILQSVRLPLISGFYKLLTVIVRNAKKMKYFAGISPKSLKHSSEDAEKYSCFALFVKFGKEVSVKMKQYKDELLASCLTFVLSLPHDIIEIDMRAYVPALQMAFKLGLSYTPLAEVGLNALEEWSVNIHRYVIQPYYKDILPCLDGYL	228937	150815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_150959_151337_151458_152353_152441_153162_153323_153672_153789_155554_155708_168962_169089_170517_170568_170935_171105_172051_172217_173672_173820_192074_192233_192868_192900_192983_193040_222237_222338_222436_222550_223004_223114_224264_224340_225800_225894_225999_226077_228790
876999	scaffold_9205_pilon	-	1319	5	Intergenic	novelGene_161100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	20.079529376955	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1116	203	1318	232567	181436	FALSE	30	TGAGCACAACTGTAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIESANYGRTDDKICDADPFQMENTDCYLPDAFKIMTQRCNNRTQCIVVTGSEVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYIFVCPGTLKAIVDSPCIYEAEQKAGAWCKDPLQAADKIYFMPWTPYRTDTLIEYASIEDFQNSRQTTTYKLPNRVDGTGFVVYDGAVFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIINYANYHDTSPYRWGGKTDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGMIVISQLNPYTLRFEATWETVYDKRAASNAFMICGVLYVVRSVYQDNESETGKNAIDYIYNTRLNRGEYVDVPFPNQYQYIAAVDYNPRDNQLYVWNNNFILRYSLEFGPPDPAQVPTTAVTITSSAELFKTTVSTTSTTSQKGP	289542	181434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_181525_188022_188824_194926_195037_232451_232666_289438
877000	contig_13349_pilon	-	3551	1	Intergenic	novelGene_161137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATATTCTGCAGACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372916	369365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_369400_372900
877001	contig_1948_pilon	+	587	2	Intergenic	novelGene_31190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1301	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATTTTAGGACTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552204	554587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_552394_554189
877002	contig_8017_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_65365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGACTGTCAGGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008220	1006118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_1006100_1008200
877003	contig_12622_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_5757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	69	362	69937	70230	NA	15	GTCTAATGCACTGCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIQQTFIKNINLDPCWLLERKKMNTFSRGLAFCWGQQSIVGSLFPVWSKQDDVIQPQGGRGQHSIQWGQGQPLQRHLRRIWKSSSPPCENVEGWHSRRSEVETSSEMSEEQKRTQCSWF	69868	72119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_69900_72100
877004	contig_12148_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_140337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAAATGTTGTTTTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91696	93560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_91700_93600
877005	contig_9319_pilon	+	1498	3	Intergenic	novelGene_154634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	13	22	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	184	309	37857	37982	TRUE	35	AATTTATTTACTTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYVVSNLEPSGRCRGVRKRSRNTGAFCKAALIISPRPPDVRAPPSWFCGRSHTTQKPPPWMQTSSLAIPSRGDRGAVKRRAPGAGLRSARTKATPDAPDSA	37673	50697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_38127_43253_43335_49733
877006	contig_13760_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_61272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	997	1509	51173	51685	NA	65	AGAAAAGAAATAAATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGHLFPLFSVLDPYSHMCLVFPNPETPCFTLSKVDTSSVLPCWEKDSHLVVSIGGRDLGANCSSSTFLPMCSIPPLTLWYLVLPVPETLKSFMYISLVFRFAYCWFRIPLRMHSAFSGLLSSVNHSSTVVQNKTTDPEFKNKTLSYIRTTLWEGRRGVATIQRLGTTTP	50176	52279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_50200_52300
877007	contig_1516_pilon	+	2216	13	Intergenic	novelGene_50025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_12	40.5900918397034	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2163	53	2215	471015	555057	FALSE	45	ACATTCAGAGAAAAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISDGGRRRFEDNEHTLHIYPGAISEGTIYCPIPARRNSTAAEVIDSLINRLHLDKTKCYVLAEVKEFGGEEWILNPTDCPVQRMMLWPRMALENRLSGEDYRFLLREKNLDGSIHYGSLQSWLRVTEERRRMMERGFLPQPQQKDFEDLCSLPDLNEKTLLENLRNRFKHEKIYTYVGSILIVINPFKFLPIYNPKYVKMYDNHQLGKLEPHIYAVADVAYHAMLQRKKNQCIVISGESGSGKTQSTNFLIHHLTALSQKGFASGVEQIILGAGPVLEAFGNAKTAHNNNSSRFGKFIQVNYQETGTVLGAYVEKYLLEKSRLVYQEHNERNYHVFYYLLAGASEEERLTFHLKQPEEYHYLNQITKKPLRQSWDDYCYDTEPDCFTVEGEDLRHDFERLQLAMEMVGFLPKTRRQIFSLLSAILHLGNICYKKKTYRDDSIDICNPEILPIVSELLEVKEEMLFEALVTRKTVTVGEKLILPYKLAEAVTVRNSMAKSLYSALFDWIVFRINHALLNSKDLEQNTKTLSIGVLDIFGFEDYENNSFEQFCINFANERLQHYFNQHIFKLEQEEYRTEGISWHNIEYIDNTCCINLISKKPTGLLHLLDEESNFPQATNQTLLDKFKHQHEDNSYIEFPAVMEPAFIIQHYAGKVKYGVKDFREKNTDHMRPDIVALLRSSKNAFISGMIGIDPVAVFRWAVLRTFFRAMVAFREAGKR	470962	555058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_471855_483198_483294_490734_490798_496164_496265_497839_497897_504306_504405_507094_507222_513800_513891_520558_520676_533158_533294_542698_542821_549272_549415_554880
877008	contig_10432_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_171311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	44	400	153775	154131	NA	20	TTATTCCTCCCCCTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGESAARGDTWFRMLPPSSGFMPASQPWQLLGCKAVALSLLSLRCCTREVLSTEAGPEEVLGVREASCTGSKLPQDPLTRCLAAVSLELEQCQALRCALFMPRMIKCFWNSPRSLCSYEPVVENQKASDNF	153731	156378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10432_pilon_+_153700_156400
877009	contig_14986_pilon	+	2701	1	Intergenic	novelGene_59714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69262	71963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_69300_72000
877010	contig_16124_pilon	+	2150	16	Intergenic	novelGene_175387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_15	40.2168566095805	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2070	79	2148	34231	592378	FALSE	10	TAGGTGTTGCTCTCTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEKLENNFDDIKHTTLGERGALREAMRCLKCADAPCQKSCPTNLDIKSFITSITNKNYYGAAKMIFSDNPLGLTCGMVCPTSDLCVGGCNLYATEEGPINIGGLQQFATEVFKAMNIPQIRNPSLPPPEKMPEAYSAKIALFGGGPASISCASFLARLGYSDITIFEKQEYVGGLSTSEIPQFRLPYDVVDFEIELMKDLGVKIICGKSLSVNEMTLSTLKEEGYKAAFIGIGLPEPNKDRIFEGLTQDQGFYTSKDFLPLVAKGSKPGMCTCHSPLPSIQGAVIVLGAGDTAFDCATSALRCGARRVFIVFRKGFVNIRAVPEEMELAKEEKCEFLPFLSPRKVIVKGGRIVAMQFVRTEQDETGNWNEDEDQIVHLKADVVISAFGSVLSDPKVKEALSPIKFNTWDLPEVDPETMQTSEPWVFAGGDIVGMANTTVESVNDGKQASWHIHKYIQSQYGASVSAKPELPLFCTPIDLVDISVEMAGLKFTNPFGLASATPATSASMIRRAFEAGWGFAVTKTFALDKDIVTNVSPRIIRGTTSGPMYGPGQSSFLNIELISEKTAAYWCQSVTELKADFPDNIVIASIMCSYNKNDWMELSKMAEDSGADALELNLSCPHGMGERGMGLACGQDPELVRNICRWVRQAVQVPFFAKLTPNVTDIVSIARAAKEGGADGVTATNTVSGLMGLNADSTPWPAVGVGKRTTYGGVS	34152	592380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16124_pilon_+_34236_130217_130306_151555_151718_172885_173083_178732_178815_186558_186647_310879_310988_313083_313254_329698_329910_363126_363312_387808_388025_452019_452185_521903_521973_532747_532832_591133_591255_592259
877011	contig_9011_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_159296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386547	388616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_386500_388600
877013	contig_15866_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_63615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	389338	389006	NA	40	CAGGGGAAAGATAAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPQNFKSKPNLLDPKCISIAYEASLVFALLVDDIPIHLIFQSRILCHPCLLPHPSHPEPPRPAWIPPNVPQTHSSFRHSPSPTDVLASETAPSPQFLSTLAHSPLDSQSW	389339	386769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_386800_389300
877014	contig_10003_pilon	+	2397	1	Intergenic	novelGene_88132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACTAGCAACACCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366219	368616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_366200_368600
877015	contig_11096_pilon	+	2623	14	Intergenic	novelGene_143465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	202.276072404661	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	79	876	198818	227814	TRUE	30	TTGATGCAATAATGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAGGRGVGAAGRWERKRLRGGEGARMATPSRRTSTPSSQASKRVLPRDPSSEVPSKRKSSAPSTLPPTPLLPPPLQSSGPFVEGSIVRIAMENFLTYDICEVSPGPNLNMIIGANGTGKSSIVCAICLGLAGKPAFMGRADKVGFFVKRGCSKGMVEIELFRASGNLVITREIDVAKNQSFWYINKKSTTQKVVEEQVAALNIQVGNLCQFLPQDKVGEFAKLTKIELLEATEKSIGPPEMHRYHCELKNFREKEKQLETSCKEKTEYLEKMIQRNERYKQDVERFYERI	198739	253798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_199027_204496_204639_211137_211191_220210_220374_221956_222092_226127_226216_227806_227969_231688_231761_237416_237673_239714_239870_243982_244097_247397_247498_252250_252346_252997
877016	contig_10855_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_124363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTATCTGTTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695980	694526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_694500_696000
877017	contig_6227_pilon	-	2240	1	Intergenic	novelGene_49700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGTAACTTGGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119135	1116895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1116900_1119100
877018	contig_15236_pilon	-	1791	1	Intergenic	novelGene_141537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAAAAGGAGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96445	94654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_94700_96400
877019	contig_9161_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_160638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTTTACTTTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58913	56657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_56700_58900
877020	contig_5484_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_151106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	425	733	308827	309135	NA	35	CCGTGACTAGAAAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVSLSSPTTPSPTARSLLPGLSCHHLQDYSSLALLVSWFQELLSTGILSPVFSAPGCSSLVVVGSSLSHLWDGSPQAQGDGKTDQSLWWATVTLSHSPAQ	308402	309155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_308400_309200
877021	contig_9649_pilon	+	2372	1	Intergenic	novelGene_160685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTGCCAACCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15429	17801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_+_15400_17800
877022	contig_15029_pilon	+	1962	2	Intergenic	novelGene_128207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	0	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	1456	1962	232757	233263	FALSE	45	GAGGACAGAGCTGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLYVRHSPLQHSPSPTHGESPHPFPWLLTPSRQPLHADPLSPAPMPCLVLGAAEMSPLITVLKEAWTELGLGMAQAHRWAAFASCVIGLGLLLLVLLCALVARGKTSEVTLLLLSPSVGLMLGAGAVYLFHVKEVKGLCRARAELLHMLRRARDAEDLGSVSQPAQQ	231138	233263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_231447_231609
877023	scaffold_15568_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_122580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGAGCTCAGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60824	59480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_59500_60800
877025	contig_3380_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_60105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGGTTAAGAGCCCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414715	412914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_412900_414700
877026	contig_2278_pilon	+	1988	13	Intergenic	novelGene_118148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	195.215746034996	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	38	1828	1458359	1498570	FALSE	40	TAAAAGACTAGTAGGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAQTSRPESPGMTSPSPRIQIISTDSAVASPQRIQIVTDQQTGQKIQIVTAVDASGSPKQQFILTSPDGAGTGKVILASPETSSAKQLIFTTSDNLVPGRIQIVTDSASVERLLGKADVQRPQVVEYCVVCGDKASGRHYGAVSCEGCKGFFKRSVRKNLTYSCRSNQDCIINKHHRNRCQFCRLKKCLEMGMKMESVQSERKPFDVQREKPSNCAASTEKIYIRKDLRSPLIATPTFVADKDGARQTGLLDPGMLVNIQQPLIREDGTVLLATDSKAETSQGALGTLANVVTSLANLSESLNNGDTSEIQPEDQSASEITRAFDTLAKALNTTDSSSPPSLVDGIDTSGGGSIHVISRDQSTPIIEVEGPLLSDTHVTFKLTMPSPMPEYLNVHYICESASRLLFLSMHWARSIPAFQALGQDCNTSLVRACWNELFTLGLAQCAQVMSLSTILAAIVNHLQNSIQEDKLSGDRIKQVMEHIWKLQEFCNSMAKLDIDGYEYAYLKAIVLFSPDHPGLTSTSQIEKFQEKAQMELQDYVQKTYSEDTYRLARILVRLPALRLMSSNITEELFFTGLIGNVSIDSIIPYILKMETAEYNGQITGASL	1458321	1498730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1458431_1467703_1467905_1469542_1469646_1472446_1472627_1474719_1474868_1475631_1475726_1477983_1478118_1479129_1479308_1480575_1480698_1484685_1484826_1486625_1486764_1487630_1487737_1498395
877027	contig_10855_pilon	+	2245	4	Intergenic	novelGene_124378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	27.6526068692749	5	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	45	992	782136	787695	TRUE	35	AGCTGCTATTCCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLDRSQRTLYREVMLETYRNLASLDWRTQLKTKESTSKQDIFGESMFKGMKMAPTHPGKRPCQYSQFGKAVRRSLGLTWPPGSPPGEKPYRCEECGKGFRHLSSLRRHARTHTGESPFACRHCGSAFCHQSSLKTHVRTHTGEKPYTCSQCGQRFSTRSYLTVHTRIHTGEKRYACADCEKAFSRSSYLRVHQRTHTGEKRYTCGDCGRVFGHPSNLRRHVRTHTGEKRYRCGRCGKAFVQSSSLVVHSRTHTGEKPYPCVKCGKAFIDTSSFRKHVRTHSREKPHKCMQCGEAFSHNAPLVVHKRAHAEGALRSVVDVKLPLSSSLS	782091	789891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_782170_785798_785882_786864_787941_788883
877028	contig_7753_pilon	+	2770	1	Intergenic	novelGene_41490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAGCAATACCTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066332	1069102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1066300_1069100
877029	contig_152_pilon	+	1901	5	Intergenic	novelGene_162652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	147.292863031445	16	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	192	458	728104	732861	FALSE	40	AATGCAAACTTTTAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPTVYVDGSCKNNGRDGAKAGCGVFWGPNNPLNVSERVSGRQTNQTAELRAAHKAIEQAKSLNMDKLIIETDSKFVIQGVTKWMDNWKQNGWKTASGRDVVNRSDFEKIDQASRGMDIQFNSDAQLASCFVNYVIGYICQKHFQEPSAVLT	724853	734304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_152_pilon_+_724951_726442_726498_728064_728150_729388_729510_732761
877030	contig_11396_pilon	-	1276	9	Intergenic	novelGene_71360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	67.3586482940387	170	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	552	950	737346	736642	FALSE	10	AAGTCCGCGTGTTCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATLAEGKEWSLELSPAQTWNPPQPKTPLPTAHRAAGQPQSVTASSDKAFEDWLNDDLGSYQGCRVCFTPRAQENRYVGFGHTVPPPRRDGDLLNSAVSSLYSGWSSFTTGASRFASAAKEGATKFGSQASQKASELGHSLNENVLKPAQEKVKEGRILDDVSSGVSQLASKVQGVSSKGWRDMTTFFSGKTEESSDRPPEGSGYQNSSRDHVQGSTIDQSFWDTFGSAEAPRVRQSPSSGSWTCVDNSTERKSSDSWDVWGSGAGSNHRNSNSDGWENWEGGWEGAGGEGRARAVQKAAPPPAPAEEGWDNQNW	746578	736315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_736997_737302_737380_737975_738036_738932_738990_741226_741260_742028_742086_744971_745093_745477_745565_746475
877031	contig_15456_pilon	-	1284	6	Intergenic	novelGene_139495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	84.266244724682	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	185	778	129171	108264	FALSE	60	TTAAAATAGTTAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDNDIKRLLYAHLLCIFSVILSTFIPSLFLERFSILETHLTWLCICSVFVTAVNLVLYLVVKPNAPSKRSSLSHKVARFLKCCIYFLMSCFCFHVIFVLYGAPLIELVLETFLFAVILSTFTTVPCLCLLGPNIKAWLRVFSRNGVASIWENSLQITTISSFIGSWLGAFPIPLDWERPWQIRKQTQMLSDLAKVR	131121	107757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_108312_115593_115703_126116_126234_127751_127844_128943_129193_130958
877032	contig_5033_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_29087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGTGGATTATGGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674119	676552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_674100_676600
877033	contig_15185_pilon	-	1732	5	Intergenic	novelGene_99397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.3072792493137	93	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	722	1051	171550	170451	TRUE	15	TATTATTGTGTTTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPKECEEWVGSAYLFVESSVDKVILSDTYANPQKKVAVYSALRTALAESSGSPDQLQMLKIHRSDPQLILQLRFCGRQPCDRFLRAYREGGRCAPRCRGAWRRHLP	175166	169128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_169709_170349_170630_171399_171559_172800_172999_174651
877034	contig_7887_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_124943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTTTACAGCAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802453	804405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_802500_804400
877035	contig_9049_pilon	-	1357	7	Intergenic	novelGene_83164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	3.97562014729219	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	77	790	139375	121096	FALSE	15	ATTTCTTTATGGTTTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDLLPNKIRRNDIELYISVAKCLLEMTDDNINRVAQITKSNIEKAAFVKLYLISQGRFPLMHLSDVLSVAVQHQERETLAWMILHSLYQARIVSHANTGVLKRMEWLLEMMGYIRSVAYQSTSVQNVALDKALDFLLLIFAAAVVAWADHAAPLLLGLSASWLPWHLGSAGSAPSFLGRSPMHRVILEEVLTLLPSSMPLLLQKEPWKEQTQKFIDWLFNIMEAPKEALSAKSRNLLKATLLSLRVLPEFKKKAVWTRAYGW	140112	120528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_121170_123103_123180_125187_125434_132300_132399_134724_134903_139333_139424_140084
877036	contig_7318_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_152225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTCCCAAAGTTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274359	276017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_274400_276000
877038	contig_9297_pilon	-	3095	1	Intergenic	novelGene_69833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATCTCCATCCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622991	619896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_619900_623000
877039	contig_6975_pilon	+	660	7	Intergenic	novelGene_74231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	113.630126091436	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	128	460	15471	41062	TRUE	75	CTCAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRVKVLLQAHNHHYKHLGVFSTLRAVPQKEGYLGLYKGNGAMMIRIFPYGAIQFMAFEQYKTLITTKLGVSGHVHRLMAGSMAGMTAVICTYPLDMVRVRLAFQVKGEHTYSGIIHAFKTIYAKEGGFLGFYRGLMPTILGMAPYAVTLLT	10214	42378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_10271_15399_15534_16982_17047_29372_29495_29744_29812_41045_41115_42230
877040	contig_2577_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_172070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATAAGCCATAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230693	232918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_230700_232900
877041	contig_11816_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_98508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACCCAGTAAGTCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966963	968599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_967000_968600
877042	contig_7171_pilon	-	1556	1	Intergenic	novelGene_101270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGTAAGGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908148	906592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_906600_908100
877043	contig_18919_pilon	+	1203	4	Intergenic	novelGene_156016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	22	363	59037	59378	TRUE	50	AAGAGAGAGAGAGAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRDWEFMLLSTTRVSRLAGSKRAGHRSGQRGSRSPFCGTDSLSNVGLFFCFYFLLKNINKMALQAQAGRTLQDSVITQRLRGNYGRKTSQTSRLTDQGLMSAGRHASTPPLGASNFLRT	59015	167423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_59462_69113_69250_159880_160218_167139
877044	contig_2069_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_23174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATGTAACCTAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45233	46792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_45200_46800
877045	contig_12635_pilon	+	3198	1	Intergenic	novelGene_60869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	266	601	653767	654102	NA	20	TTTAAGTTTTTCATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLVSGFGLDCSSCLGLFYSGLFTQPILERIKPLSFNYCYQIDWQQFSVNTCQLFGSSVLRSTRRCPIASSLFFSHRCQYNSDLQVLVVCPYVFVFWSLQGHQYILALL	653501	656699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_653500_656700
877046	contig_5918_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_99535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATAGGGTGGGCTTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703116	704201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_703100_704200
877047	contig_8878_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_147872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231077	229608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_229600_231100
877048	contig_6050_pilon	-	2318	5	Intergenic	novelGene_123121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.9268604418766	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	183	491	391484	389438	TRUE	10	GTTTACATTGTTGTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVIPLLWASVFSSVKWSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSGLIAQLEEKQQQPTRELLQVRHGALC	392521	376265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377883_381741_381818_389303_389693_391430_391650_392504
877049	contig_11709_pilon	+	3128	1	Intergenic	novelGene_168227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGGAAGCGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216888	220016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_216900_220000
877050	contig_9713_pilon	-	2563	16	Intergenic	novelGene_170252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	37	junction_3	463.39208260632	55	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	160	2247	267903	242224	FALSE	60	AAAAAAAATCAAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPLELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLSWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPAEREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLNTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPESSSCEGDNDEEEPSKLKGEHRGISVTGLQSPDRDLGLESPLMSSKPQARSLVTSGKSEVDDFFVTDRPFAKEQHADGTLKEVGVNYQIIVPDLHFPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQLGLTERSTQEDWQHFPRSRTASQGVQADGGIQNSENSKAYHPGEGQMPFRTGAGDTSACCSPRTSTESSAPPDSVVLASQDSQASNIVVMDHVDMTPEMPTTEPEGGLDESGEHFFDAHEAHSDDNPSEGNGAIKKEEKDVNLHISGNYLILDGYETVQESSTDEEVVCSLALQPMAGIPTINSTYQQQHSPQNAHSDGADSPFTPEFLVQQRWGALEDSCFEIQSPSCADSQSQIMEYIRKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS	269279	241907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_242235_242825_242896_244156_244471_245992_246464_248872_249107_249366_249447_249766_249854_250491_250580_251594_251763_252247_252324_253439_253518_258483_258585_259997_260113_262731_262858_267834_267921_269137
877051	contig_14289_pilon	-	706	4	Intergenic	novelGene_110552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	114.432901251733	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTCCTTATGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66633	51307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14289_pilon_-_51713_51945_51964_64635_64754_66468
877052	contig_12950_pilon	+	2042	3	Intergenic	novelGene_114793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTCTGTCTGGCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104649	106788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_105122_105176_106434_106475
877053	contig_6189_pilon	-	4099	21	Intergenic	novelGene_164934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	134.624329153389	104	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1160	3483	142	3624	91827	42159	TRUE	35	ACAAGTCTCCAACGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCERKEEFIERIKQLDIETQAGIVAHIQEVTHNQENVFDLQWLELPDMAPEELEALSRNMVFHLRRLIDERDECSELIVDLTQERDYLQAQHPPSPLKSSSADSTPSPTSSLSSEDKQHLAVELADTKARLRRIRQELEEKTEQLVDARHEVDQLALELQKVKQENIQLAADARSARAYRDELDSLREKANRVERLEMELVRCREKLHDVDFYKARMEELREDNIILIETKAMLEEQLTAARARSDKVHELEKENLQLKSKLHDLELDRDTDKKRIEELLDENMVLEMAQKQSMNESAHLGWELEQLSKNADLSDASRKSFVFELNECASSRILKLEKENQSLQSTIQGLRDASLALEESSLKCGELEKENQQLSKKIEKLQTQLEREKQSNQDLEILSEELIKEKEQLQGNMEVLKAGRARQIKDLEQERDHLNQVVWSLRERSQVSSEARMKDVEKENKVLHQTVTETSSKLNQLEFEKQQLHKDLEQAKEKVERAEELEKELHRLEKENERLAKKAASLKTVSEKADALEHESRGLELENRKLRKSLDTLQNVSVQLEGLELDNKQLDEENLELRKMVETLRFTSAKVAQMERENQELQREKEELRKNVELLKALGKKSERLELSYEGVSAENLRLQQTLESSMQKSQALERELQELEMENQALQRDLEALRLSNKQLERFEQDKKALEQEVAQLEKDKKLLEKEAKRLWQQVELKDAVLDDSTAKLSAAERESRALDKELARCRDAASKLKELEKDNRDLTKQVTMHTRTLTTLREDLVLEKLKSQQLTSELDKLSQELEKAGLSKELLLQDDGPNHDTKYKILEGRNESALKTTLAMKEEKIVFLEAQMEEKVSLNHQLQNELQMVKKECELLRQNQDEDKHLHNSFKHPVGKLAASHQGQETWGPSHKEATMELLRVKDRAIELERNNAALQAEKQLLKEQVQHLESQNVAFSSQILTLQKQSAFLQEHNTTLQTQTAKLQVENSTLSSQSASLTAQYTLLQNQQTAKETENENLQKQQEQLATAYEALLQDHERLGALHEHQSVEYEALIRQHSCLKTLHRNLEMEHKELGERHSDMLKHKAELDELEKVLKTEREALQQEQRTNAVAVDENQRLREELDRVSFLHHQLKAEYEELHAHTKELKTSLNNSQLELNRWQARFDELKEQHQSMDISLTKLHTHCESCFPVSRGTWRKKTITS	94451	33332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_33385_37173_37413_38789_38880_42064_42213_44847_45035_46870_47015_50944_51223_54739_54902_56573_56763_57582_57725_58443_58572_62112_63184_64747_64886_69316_69502_74546_74692_76064_76212_89668_89828_90160_90243_91101_91287_91740_91882_94364
877054	contig_5408_pilon	+	1365	3	Intergenic	novelGene_173961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	72.5	308	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	136	543	34561	44809	FALSE	10	CTAGCTCGTGTATGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHQLFSQHYRATIGVDFALKVLNWDSRTLVRLQLWDIAGQERFGNMTRVYYKEAVGAFVVFDLSRSSTFEAVLKWKNDLDSKVHLPNGSPIPAVLLANKCDQKKDSGQNPPQMDQFCKEHGFSGWFETSAKDNINIDEAARFLVENILVNHQSFPNEENDVDKIKLDQDPLTGESKSQCC	9939	45631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5408_pilon_+_10055_34540_34819_44659
877055	contig_14353_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_82131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272594	271654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_271700_272600
877056	contig_222_pilon	-	1332	2	Intergenic	novelGene_178190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGGAAAAAGAGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192963	35471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_222_pilon_-_35650_191809
877057	contig_9375_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_136046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTAGTGAAGTATAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153329	155153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_153300_155200
877058	contig_10629_pilon	-	3219	13	Intergenic	novelGene_52888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_5	12.4554762610223	92	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	62	1363	129104	119431	TRUE	25	CCAATATCCTGTGCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCVWRISVTPGEKIILNFTTMDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGGKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDNGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPPMRPARPPGPFVTQEPHLGWNGTGVSVPTPPTSALPFRPASWPDRTGALLFSPVPPHMDRGPSLPHPLPF	144364	110170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_110885_112825_113077_115020_115235_115636_115765_118881_119724_124158_124340_124666_124828_125625_125752_126649_126846_126963_127110_127378_127496_129022_129126_144324
877059	contig_13004_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_112609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGTGTTCTAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162930	165258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_162900_165300
877060	contig_2161_pilon	-	2698	9	Intergenic	novelGene_114904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.6583509089027	9	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	347	1309	791304	766513	TRUE	35	ATGGCTCTAGAATAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGRRGPSRQQLSRSALPSLQTLVGGGCGNGTGLRNRNGSAIGLPVPPITALITPGPVRHCQIPDLPVDGSLLFEFLFFIYLLVALFIQYINIYKTVWWYPYNHPASCTSLNFHLIDYHLAAFITVMLARRLVWALISEATKAGAASMIHYMVLISARLVLLTLCGWVLCWTLVNLFRSHSVLNLLFLGYPFGVYVPLCCFHQDGRAHLLLTDYNYMVQHQAVEESASTVGGLAKSKDFLSLLLESLKEQFNNATPIPTHSCPLSPDLIRNEVECLKADFNHRIKEVLFNSLFSAYYVAFLPLCFVKPGWWSSAASGMH	792843	760110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_760593_763652_763774_765726_766552_766656_767006_773463_773619_778784_778869_782626_782850_791191_791379_792571
877061	contig_7753_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_41512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAATTCCTAATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240066	1238570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1238600_1240100
877062	contig_10456_pilon	-	770	2	Intergenic	novelGene_163451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGAAAGAATAGATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34237	12072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_12153_33547
877063	contig_8357_pilon	-	1820	13	Intergenic	novelGene_39688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGGTCAGCTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240656	213754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_213870_217829_217976_218789_218945_228432_228540_230387_230492_231201_231372_231950_232142_234300_234488_237462_237582_238192_238301_239737_239845_240128_240253_240469
877064	scaffold_880_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_121456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTCAAAGGTGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453410	452287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_452300_453400
877065	contig_5419_pilon	+	968	1	Intergenic	novelGene_15523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATATGTGTGGGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265726	266694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_265700_266700
877066	contig_7207_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_72097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCTCAAGCCTCACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728603	731147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_728600_731100
877067	contig_15762_pilon	+	3802	1	Intergenic	novelGene_177358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATGTAAGCAGAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228093	231895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15762_pilon_+_228100_231900
877068	contig_3386_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_34476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTTTCCTACACTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79357	77361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_77400_79400
877069	contig_12250_pilon	+	1767	13	Intergenic	novelGene_80629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	69.9274922091924	5	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	510	1400	356113	357789	TRUE	20	TCTTGCCTACCTGAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQSETELAHQITHSQSSWAPSKPLSPVSQLGKDPVPTSGGFLSWLPQGSWASMCGGGYWRGMWEVSPVCRHSVRLSLAQLTATIFRKEGLEAWPQLMQLLQHSTHSPHVPEREMGLLLLSVVVTSRPEAFRPYHRELLHLLNETLGAVGNPGLLFYSLRTLTTMATYLGTDDVPLARMLVPKLIVAVQTLIPIDEAKACESLEALDELLESEVPIITPHLSEVLAFCLAVAGNTALGDAVRVRILCCLTFLVKVKSKALLKNRLLPPLLHTLFPIMAAEPPLGPVGSRGPGFGR	355312	358886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_355393_355472_355560_355683_355764_355850_356458_356543_356724_356991_357058_357168_357271_357351_357436_357675_357842_357941_357997_358153_358264_358567_358677_358845
877070	contig_2834_pilon	+	2056	6	Intergenic	novelGene_27975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2608.0455977609	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	105	557	274763	290627	FALSE	20	CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLALRKA	238704	292126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285699_290613
877071	contig_5482_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_144454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCCAGCCATATAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295911	299204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_295900_299200
877072	contig_3103_pilon	+	2661	1	Intergenic	novelGene_146217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	1073	1687	527118	527732	NA	30	GTGCAGGCAGCAGAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYWIRAVVLHSPVFLWGWPPTPFLEACSERPVSPKSIFFSLEGLLEPLEPLGLVWKSLPRSSCHSRMICFVSQSSGQNGIHWGSAPRLTCASLGSVGGGWGQSACECPRAWSVGQMRARGPQFFRDLPSQMRLSGLTHSEKHCFPGLGCESGTWRTQSWTPQMTGPSLPTAVSSFWVVTSQLVAGQVSDCAGAIGTPLSSRAP	526045	528706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_526000_528700
877073	contig_5586_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_143504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATTTTCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206567	204227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_204200_206600
877074	contig_4213_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_124839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAACTAAAAATAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266180	268418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_266200_268400
877075	contig_6958_pilon	-	2853	1	Intergenic	novelGene_69963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAGGAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246775	243922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_243900_246800
877076	contig_10009_pilon	+	3062	1	Intergenic	novelGene_82730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTACTTCTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49553	52615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_49600_52600
877077	contig_1076_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_101109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGTGAGTAGCATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54953	53854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_53900_55000
877078	contig_12312_pilon	+	2584	12	Intergenic	novelGene_64016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	51.6893134406614	123	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	1017	2093	542525	544786	FALSE	30	ATAAACATCCTTATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLSNYGNDRLGLYTFESLVRFLQCWTRLRLQTLPPVPLAQKYFELFPQERSPLWQNPCDDKRHKDIWSKEKTCDRLPKFLIVGPQKTGTTAIHFFLSLHPAVTSSFPSPSTFEEIQFFNGPNYHKGIDWYMDFFPVPSNASTDFLFEKSATYFDSEVVPRRGAALLPRAKIITVLTNPADRAYSWYQHQRAHGDPVALNYTFYQVISASSQAPLALRSLQNRCLIPGHYSTHLQRWLTYYPSGQLLIVDGQDLRTNPAASMESIQKFLGITPFLNYTRTLRFDEDKGFWCQGLEGGKTRCLGKSKGRRYPDMDSESRLFLTDFFRNHNLELSKLLSRLGQPVPSWLREELQHSSLG	540530	545277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_540843_541043_541132_541459_541615_541800_541987_542249_542696_542788_542886_543248_543373_543511_543687_543883_544055_544151_544262_544460_544564_544660
877079	contig_9839_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_88533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCCTTCCAAAACCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62067	63705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_62100_63700
877080	contig_8631_pilon	-	3706	1	Intergenic	novelGene_121981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAAACTAGGTGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830677	826971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_827000_830700
877081	contig_7513_pilon	-	1834	6	Intergenic	novelGene_88956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.00086956193	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	422	811	154415	148015	TRUE	85	AGAAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERGWKKRKHSSRHNRGHENHPPDGV	156288	145973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146766_146950_147151_147983_148087_152144_152280_154232_154428_155879
877082	contig_9242_pilon	+	2633	3	Intergenic	novelGene_155080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTCAGAAGCCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756557	872246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_758798_761825_762070_872097
877083	contig_1575_pilon	+	1843	17	Intergenic	novelGene_45159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	369.753544396467	3	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	1018	1842	167873	190541	FALSE	30	GAGGTAATGCCATTTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGL	40077	190542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167823_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_183574_183665_185018_185124_190388
877084	contig_4125_pilon	-	642	2	Intergenic	novelGene_25265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCGACTTGACAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3069864	3067368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3067575_3069428
877085	contig_14516_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_153932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCACAACTGAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316726	315850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_315800_316700
877086	contig_5041_pilon	-	2719	1	Intergenic	novelGene_27012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	2127	2558	200378	199947	NA	25	CTTTCAAATTTGCCAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTMFQSHGSSICLFLEQANLFYLRAFALAAPLLRTSFKDSFSHHSGLRINFPSSDGPSLTLINVAPPATPQYAYTTARLYRSHCLFYSLLALGLSEMLPCSLFVYLCIICLPYWSISFVKAGVSSLAQGVHTMHRNCLVWG	202504	199785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_199800_202500
877087	contig_567_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_33968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGATCTCTTTAACCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338666	340498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338700_340500
877088	contig_9185_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_166873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCAGCTGTGCTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20151	21799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_20200_21800
877089	contig_9815_pilon	-	606	3	Intergenic	novelGene_164245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1233	junction_2	1105	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAAACAAATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77349	73937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_73989_75764_75981_77010
877090	contig_12050_pilon	-	2922	2	Intergenic	novelGene_62776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	211	318	931088	930981	TRUE	40	CGGGCAACAGGAATTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGNGVDAKEVLVGLTVGKIKFADIGLCQDGLEDVEFIRIFYDVLKDQFSITEEGHFVLVSLQIAVNQEGMDADPDSVLADEGNLILQPVLNHLVQVFQEGDLFF	931298	928120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_928238_928493
877091	contig_15042_pilon	-	3128	1	Intergenic	novelGene_115433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	150	470	27645	27325	NA	35	GCATATAAGCAGTTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSFHHTAQNPSMVPVSHERKSMSKAESSVWPGLAGQLVGLHLLQASGLVRAELLTLVKHVCSLGPHRCLFFSLCLECTPRLSLPVTLLASWSGEFCSSFRVNFSN	27794	24666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_24700_27800
877093	contig_7933_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_164690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGTCCACGGCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185660	186045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_185700_186000
877094	contig_7356_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_60345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68715	66779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_66800_68700
877095	contig_4701_pilon	-	730	7	Intergenic	novelGene_165433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_3	111.456518676817	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	173	316	84036	81722	TRUE	10	AGTCCCTGGGTCTGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEHIFCISSRDLCPADITGNYCPEGWSPCLSAGSWHLPRAFKPDIHLPQLPVPGAHGMPIVPMPLPAAVILDSLLCQGRTSLTASQRFVQISSVVNPYVYLVET	85436	75292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4701_pilon_-_75474_75812_75891_75999_76047_81613_81767_83937_84128_84337_84389_85406
877096	contig_8354_pilon	-	2006	3	Intergenic	novelGene_24155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	449	6	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	199	552	578686	558256	FALSE	55	CATTTTAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEVGSQFLSFQKQNPTRSRFPCILSL	618812	556801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_558496_578572_578731_618658
877097	contig_7004_pilon	-	3757	15	Intergenic	novelGene_126495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1987	2472	419970	419311	TRUE	45	CATTAAAAGGAGGCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLANIHLSKGAGISNANNLHSEIAEEVYNLQGPWAEAEDEDEGCNNGAQQLLQDEHCLVLEELGKLVPGLRAVGITLPVVRHVVDVSEDHAEQLLRAEYQVLVRDEGPAHGHGDPQECDGGEDVLHSQHIFIVDGEGNENGQDGASEEGTILGQQCQQR	423932	415772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_415909_416314_416463_416561_416603_417112_417178_417981_418141_418330_418474_418717_419467_419548_419705_419796_419974_420368_420619_420824_421004_421108_421225_422012_422239_422432_422579_422866
877098	contig_1301_pilon	-	1565	7	Intergenic	novelGene_47385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_6	101.235149802603	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	77	793	746763	703495	FALSE	20	GAGTGCCTACTATATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNDKEATEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLKYVQEDSCQRGICGKLVCTDFKIAFLGDDESALNNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGVFDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFHFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKRLFLFSYATASQNSTATDTKNHTVMFNTLKDWCWELERTKGSMKYKAVSVNEDYKVCER	746839	702722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_703629_710363_710458_712730_712862_713946_714020_715057_715201_717955_718017_746682
877099	contig_4364_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_99	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	28.4901298698339	290	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	720	860	1036363	1036503	FALSE	15	TGAGCACCTGGGGCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAHVEVLELGKQVAELEKHLGTTRKEGGEAVGGTPETTATRRQGPAGGEPTGTGDQGPQATQRSLELRLQRKLRAAAKSILRLQQEKEQLVEASNRLRAGLGRPRDTAGTPPGPSPIPVLEARSPGELPRPPLDCSLPLGQVQPRFTAQSQLRISTATCKSTHQKENRSPKPPQAQELHEENGPHTQRSLSLASSSLQDTWKLLDLGSSPSGPTSQDDSTPERPAPVAAGSPGPPQSCTMTQGKVAVEGKKVEAQPKPTRPPRASPAKPRGRGQPPRIRNYNVKD	976741	1036612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_976873_981481_981669_1004892_1005024_1011113_1011331_1036309
877100	contig_1781_pilon	+	1492	2	Intergenic	novelGene_168569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157769	160488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1781_pilon_+_157877_159103
877101	contig_10848_pilon	+	1981	14	Intergenic	novelGene_133520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	29.0883168559955	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	443	1504	11742	20884	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAGATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEFAILEKQNWLIHLHYIRKDYEACKAIIKEQLQETQGLCEYAIYVQALIFRLEGHIQESLELFQTCAVLSPQCADNLKQVARSLFLLGKHKAAIEVYNEAAKLNQKDWEICHNLGVCYIYLKQFNKAQDQLHNALQLNRHDLTYIMLGKIHLLEGDLDKAIEIYKKAVEFSPENTELLTTLGLLYLQLGIYQKAFEHLGNALTYDPTNYKAILAAGSMMQTHGDFDVALTKYRVVACAMPESPPLWNNIGMCFFGKKKYVAAISCLKRANYLAPFDWKILYNLGLVHLTMQQYASAFHFLSAAINFQPKMGELYMLLAVALTNLEDVENAKRAYAEAVRLDKCNPLVNLNYAVLLYNQGDKRGALAQYQEMEKKGNLFKHSSSLELDSEMVEMAQKLGAALQVGEALVWTKPVKDPKSKHRTTSASKPASFQQPLGSNQALGQAMSSAAAYRKLPAGAGGTPQLTKPPSLPLEPEPTVAASPADATFSTEASEQIREK	1010	21361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_+_1093_2463_2528_7265_7378_8363_8437_9861_9916_11684_11813_14088_14144_15155_15225_16164_16318_16411_16584_18403_18474_19304_19447_20006_20209_20756
877102	contig_4857_pilon	+	1074	8	Intergenic	novelGene_48836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	85.3159793153112	44	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTACTATACAGACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1410084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1336704_1336828_1404985_1405090_1405453_1405556_1407013_1407076_1407599_1407777_1408210_1408464_1409988
877103	contig_6902_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_135565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGCCACCCTCATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291296	292931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_291300_292900
877104	contig_2100_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_50607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGGAACAAAGAGACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728705	731066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_728700_731100
877105	contig_6578_pilon	+	3134	4	Intergenic	novelGene_162234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	928	1407	126565	127044	TRUE	40	CATTAAAATCCATGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNLTACFHCAYTCISQSIPTTNIPSLTQERETGSEGVPSTEDTKSIDLRRTHLDLTPCLILPPSGKVMTATPSLLLVCSVTIPESRPYMNILAPTPTVRMWEPSSFDTQSKCTKCFIFGIRHLSLLKNASDLLYTNRLLSTLTLESSTLPTLTKSSR	122746	133940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_122852_125742_127417_129311_129541_132814
877106	contig_5881_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_129059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGGAATGCCAGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565117	563526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_563500_565100
877108	contig_15114_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_121225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTGCACCTCCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673715	1671631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1671600_1673700
877109	contig_12250_pilon	-	2082	14	Intergenic	novelGene_80731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	127.507373031973	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	361	1995	416521	409037	FALSE	15	TTCTGGCATTGGACTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRNSSSAGSGSGDPSEGLPRRGAGRRLSEEEEEEDEDVDLAQVLAYLLRRGQVRLVQGGGAGNLQLIQALSDSEEEHDSAWDGRLGDRYNPPVDATPDTRELECNEIKTQVELATGRLGLRQAAQEHSFPRMLHQRERGLCHRGSFSLGEQSRVMSHFLPNDLAFTDTYSQKAFCGIYSKDGQIFMSACQDQTIRLYDCRYGRFHKFRSIKARDVGWSVLDVAFTPDGNHFLYSSWSDYIHICNIYGEGDTHTALDLRPDERRFAVFSIAVSSDGREVLGGANDGCLYVFDREQNRRTLQLESHEDDVNAVAFADVSSQILFSGGDDAICKVWDRRTMREDDPKPVGALAGHQDGITFIDSKGDARYLISNSKDQTIKLWDIRRFSSREGMEASRQAATQQNWDYRWQQVPKKAWRKLKLPGDSSLMTYRGHGVLHTLIRCRFSPTHSTGQQFIYSGCSTGKVVVYDLLSGRIMKKLTNHKACVRDVSWHPFEEKIVSSSWDGNLRLWQYHQAEYFQDDMPESRECLSAPAPHLSTAFSSPQ	416881	408949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_409166_409263_409371_410568_410722_411491_411646_412088_412275_412371_412430_412787_412857_413209_413265_413474_413622_413855_413957_414264_414330_414605_414734_414989_415118_416366
877110	contig_15929_pilon	+	845	6	Intergenic	novelGene_172461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	296.517520561602	146	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	368	706	87373	110645	FALSE	15	TGTGTCAGTTGGTAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKVTL	82243	110784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_83363_83512_84400_84489_87310_87623_89766_89844_110633
877111	contig_1154_pilon	-	1344	2	Intergenic	novelGene_87046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	806	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTAAGCTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74242	71855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_72874_73916
877112	contig_14341_pilon	+	2673	1	Intergenic	novelGene_111902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	495	1488	75	1562	753918	755405	NA	10	TGGATTTCTGCCACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRANSQAATPVSATQLTRCRSVVMGHMERLLSLWIEEQKRQNLPVSTLLIQDKARRLFAELQREQGEGAQAETFGASNGWFARFKARHNVLLTDEPAVADAQAAARYPEVLRGILEEGRYSPQQVFNVDETGLFWKRLPERTLLALEGAAGPAPKASKDHLTLLLGGNAAGDFKLKPLLVYPSENPRALKGCSKASLPVVWRSNRNDWLTPSIFQEWFTGCFCPAVESYCAQRGLPHRALLLLDGAPCHPAHLDSLSAHVRVEFLPKNTSALIQPMNQGVIAAFKAHYLRRTLSQLVQETAGEDRPSVWEFWRSYTVMSAVDNIAEAWAELRPATMNGAWRKLWPECVPDGAPEPDAVAQLRRSIVALASHVGLGDLAEADVACLLQAHGEPLPHSRPQDADDGDVGCSGPPWEEEKGLASKRSEQELTEAREGAGAKEAGVGRLSPEHLTQALSHFATGLRILVDNDPNRERSLRVSRGVHSALACLRELHRDRRRQARVASAARELTGGLSSPQDT	753843	756516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_753800_756500
877113	contig_9629_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_171600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	244	732	124	855	62162	61431	NA	35	AGATCAAAGTGGGACGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPRVLPGSTLIQSPPVQSPVAGGGPATTSTPARAPGGPHLLDGAVLRHSEFLLLLRGLHGDFHDLGLYRGSGRRGAGTFGCGGTVLGARRAAAFTTLGHGGGDSGEQGGSGRARGSQETPQPTGLDSGKRRARRLSGNGRKAALAGEGPRSWVWALAQVRFRRSAAVVFRRRWLTATPAAAAAFSSPPLPPRPSACAARGTSGNAAGGGAESFLLVAAASSGGFPFPPPLYYPKCKRVQSGRI	62285	61430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_-_61400_62300
877114	contig_13067_pilon	+	4324	1	Intergenic	novelGene_141346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGTCGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46157	50481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_46200_50500
877115	contig_9828_pilon	+	3816	27	Intergenic	novelGene_172243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	210.702712692776	230	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1036	3111	190	3300	11612	122684	FALSE	30	TGCCCTAATTGTGGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRLQLEKAAWRWAETVRPEEVSQEHIETAYRIWLEPCIRGVCRRNCKGNPNCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLELRQALYLCPSTCSDYMMGDGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGLDTGQQQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTDCISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHKGGGYVYELSAVLIHRGVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEPSKSQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPSTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAEPYEFVSLEWLQKWLDESTPTKPIDNHACLCSHDKLHPDKISIMKRISEYAADIFYSRYGGGPRLTVKALCKECVVERCRVLRLKNQLNEDYKTVNNLLKATVKGNDGFWVGKSSLRSWRQLALEQLDEQDGDADQSNGKMNGNTLNKDESKEERKEEEEELNFNEDILCPHGELCISENERRLVSKEAWSKLQQYFPRAPEFPSYKECCSQCKILEREGEENEALHKMIANEQKTSLPNLFQDKNRPCLSNWPEDTDVLYIVSQFFVEEWRKFVRKPTRCSPVSSVGNSALLCPHGGLMFTFASMTKEDSKLIALIWPSEWQTIQKLFVVDHVIKITRSEVGDVNPSETQYTSEPKLCPECREGLLCQQQRDLREYTQATIYVHKVVDNKKVMKDSAPELNVSSSETEEDKEEAKPDGEKDPDFNQSNGGTKRQKISHQNYIAYQKQVIRRSMRHRKVRGEKALLVSANQTLKELKIQIMHAFSVAPFDQNLSIDGKILSDDCATLGTLGVIPESVILLKADEPIADYAAMDDVMQVCMPEEGFKGTGLLGH	11422	123200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_11746_31742_31864_33434_33592_36224_36353_47555_47681_48217_48327_50781_50916_51644_51728_62088_62269_67130_67260_67971_68122_72226_72425_73697_73813_74774_74906_78654_78727_98198_98324_98475_98599_98891_98954_99231_99343_100648_100780_101121_101229_107420_107526_113008_113165_117109_117236_119339_119389_121559_121587_122661
877116	contig_8921_pilon	-	2464	4	Intergenic	novelGene_161633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAGACCATGACGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255165	247803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_-_248011_249072_249198_251142_251238_253128
877117	contig_14838_pilon	-	2693	2	Intergenic	novelGene_151916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	0	55	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1626	2531	109967	109062	FALSE	50	TCTACACTAATAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEEEGEDEA	112892	108899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_111461_112760
877118	contig_5210_pilon	-	1077	5	Intergenic	novelGene_65437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	49.711668650328	122	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	164	799	503549	479627	FALSE	20	CTCTTTTTACACTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDFGFFSSSESGAPEAAEEDPAAAFLAQQESEIAGIENDEGFGAPAGGQVAPAQLGPASGAGSEDMGTTVNGDVFQEANGPADAYAAIAQADRLTQEPESIRKWREEQKKRLQELDAASKVMEQEWREKAKKDLEEWNQRQSEQVEKNKINNRASEEAFVKESKEDTPGTEWEKVAQLCDFNPKSSKQCKDVSRLRSVLMSLKQTPLSR	503712	479348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_479799_486555_486668_487013_487132_498198_498246_503362
877119	contig_6842_pilon	+	3479	1	Intergenic	novelGene_130848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATCAGATTAAGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2120370	2123849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_2120400_2123800
877120	contig_12125_pilon	+	2691	1	Intergenic	novelGene_76247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAATAGAGGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610365	613056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_610400_613100
877121	contig_593_pilon	+	1406	1	Intergenic	novelGene_101990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTTGTGAAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270498	271904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_270500_271900
877122	contig_4388_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_161955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414004	412495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_412500_414000
877123	contig_9415_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_109819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	623	961	1808563	1808225	NA	5	GGGCTCGGCGTTCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRAALNWGKFNQMPRAGVPRLQNSASLQADTTESSCSRGLPLSEHMVEFLEVHGKGSLSPIPSSTLSHQAEVRDGPGVDYPTGKVSTVLTVLTRSSGVNNFTFSSHQRLCF	1809185	1807407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1807400_1809200
877124	contig_17059_pilon	+	1678	2	Intergenic	novelGene_166075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGATTTGGGTGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375794	378881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_376010_377418
877125	contig_12127_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_130106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGACTTACTTCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95829	97478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_+_95800_97500
877126	contig_3787_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_102349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGTGGTTTTGGTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27783	25299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_25300_27800
877127	contig_14970_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_45022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCTGTCTTCCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165159	167708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_165200_167700
877128	contig_2596_pilon	+	4814	4	Intergenic	novelGene_53464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	50.334437073991	263	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGTATGAGTTTCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649838	656996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_653770_655372_655415_655821_655981_656314
877129	contig_15120_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_107986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	321	683	70925	71287	NA	45	ATAAAATACGTAAGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILWEWRKIFQPMNRESPSHFTPFLLLLPRTGSLHCRDTQPTQLPWAHRQAQIPTPLLWAHCQAQIPTPLLWAHCQAQIPTPLLWAHCQAQIPTPNSALPHLHSAHLEEVDLHTAIAEV	70604	72546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_70600_72500
877130	contig_7165_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_116873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629253	631743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_629300_631700
877131	contig_3004_pilon	+	1546	10	Intergenic	novelGene_127548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	69.7367182805673	15	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	97	651	802247	825969	TRUE	55	AATTTAATACTTGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVPHGPLRLGVASQAKAGERVPRRQRPGDPGEMEAASPTAAESAGREELDMDVMTPLINEPNFDGTSDEEREQELLPVQKHYQLDDQEGISFIQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCQRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWGCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQCFTFW	802150	837673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989_814114_815278_815370_817376_817466_818526_818623_820752_820838_825951_826063_827930_828159_833489_833589_837198
877132	contig_13954_pilon	+	2845	1	Intergenic	novelGene_130056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATATACATGTCAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87553	90398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_87600_90400
877133	contig_8978_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_49475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAGCAATATCACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713592	1715083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1713600_1715100
877135	contig_17194_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_155376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACAGTTTATCTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272984	271762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_271800_273000
877136	contig_17194_pilon	-	2356	6	Intergenic	novelGene_155358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	746	1075	261216	260887	TRUE	15	GCCCGGGACTCGCCGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQSNTVILVTSLPYTPHNIMISIFMSISGLRRYIYDMFKLLVRLRAVQSERTYLAATMTKCGCSTCDLQNRSFREPLNSICISRNRPIISSYSNNTSCYCKINQLTV	261961	75854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_75943_190806_190994_232837_233042_256434_256575_259309_259521_260435
877137	contig_2100_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_50639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTTTTCCCCACTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951730	954107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_951700_954100
877138	contig_3789_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_79882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGGGCTCAGAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551761	554343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_551800_554300
877139	contig_9646_pilon	+	3281	1	Intergenic	novelGene_117449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAAAAGGAAGTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245987	249268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_246000_249300
877140	contig_5222_pilon	-	3865	1	Intergenic	novelGene_59011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGTTAAGTTAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326393	322528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_322500_326400
877141	contig_15044_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_174968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCATGGATCACAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113958	113130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_-_113100_114000
877142	contig_3584_pilon	+	2567	9	Intergenic	novelGene_108106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGAGTACTGCCGTCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126242	146087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_126373_129157_129359_131479_131636_132936_133033_136393_136454_139423_139627_141215_141450_142675_142822_144746
877143	contig_14814_pilon	-	3615	1	Intergenic	novelGene_137755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCAGCTGATGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412454	408839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_408800_412500
877144	contig_11751_pilon	+	2352	7	Intergenic	novelGene_150291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	29.8184320327023	88	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTTGAAGGCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115156	157925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_116203_117994_118159_118859_118931_121068_121145_144201_144306_148935_149021_157119
877145	contig_11751_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_150287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4218	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTGCTTCATATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113029	112667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_112700_113000
877146	contig_859_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_132819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	200	652	94720	95172	NA	15	GGACTTGGAGACCCTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGARGLRATYHRVLDKVELMLPEKLRPLYNHPAGNDARMTPTEIFSSSPSRMLVLPTDNSAAGGIILSSNLFPQMNPSTLPTSVFHLLSQTCGSKVSVLPRLYCIPLLRTTQTRAEFADLIHLSFCPHEGIWAATKPSFSPFPFMNC	94520	96716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_94500_96700
877147	contig_14333_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_49143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAGGTGTGGTACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439207	437831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_437800_439200
877148	contig_14618_pilon	-	1783	5	Intergenic	novelGene_136807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	15.9275704361965	46	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	138	818	570184	559577	FALSE	25	ACACGGACACTGAGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAPIDPGKKGDLEQKILQVLQEAGSPVKIAQLVKKCQVSKKELNHVLYRMKAVTCTGPATWCLGGDGTRDVVPTEPAEPGPSCGYRPSEEAAQKSLQNAATIPQSTGSPLGEQRQKAIYTLLAANGPRDALSIARALGMKTAKDVNPDLYAMRSKHLLTLDQNSKSWAVYRPDAGFARCDSDFPGDVGQAAPGIITTLSSQMDTLSFGREDPTPAENRAPTEGN	570321	558611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_559735_565414_565589_566228_566298_567306_567553_570150
877149	contig_6418_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_81148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAAAACTCGATGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242394	241359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_241400_242400
877150	contig_9727_pilon	+	1361	1	Intergenic	novelGene_86368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGAAAAAAAAAAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573562	574923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_573600_574900
877151	contig_12250_pilon	+	1699	3	Intergenic	novelGene_80685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	34	166	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	305	496	396673	396864	TRUE	20	TGGAGAACCATGGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKRQGFPSASWGRGKAELSSAGCSLDLLLGPAGGGYRRRGLPEPAGCLLAESASRTHLSRACHGGGGDLIPGLREDVPARRPVPARCCEPAVAGARAAVRGMPVPHSVPLFHSHLALSVMLEVALNQVQLLDASRLPRMPLKPLAQAHPWLLAVGRTHRARSTI	396228	398155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_396405_396544_398016_398103
877152	contig_10064_pilon	-	2407	1	Intergenic	novelGene_122711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	349	738	268276	267887	NA	40	AAGACGAGCAATTTCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICNKDSPNLGLRPLENVEVQVTVVASRATLELQRVTQITERETERTQVVEQMKLTWSPRDWRFSGVVWISKGLLLTGTGREGSTPFPYFSDSPLYTSLVSLTSPRLYTVRPPSPMGNTGRPEGSRAMG	268624	266217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_266200_268600
877153	contig_18859_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_150541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	739	1107	97671	97303	NA	20	TTGGGACTAATTGACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEQPHSQNLTTGTVKQEAASPFGPDLVPVMPSSEEPSTERGRIFESDGNSLDGEHFGKSHCTKRQRMMYKSKNAIVEQIASNSTVAPSQTFISTDDLLDCLVNPQVTRIVAQLLIQGRTL	98409	96452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_96500_98400
877154	contig_7728_pilon	+	4015	3	Intergenic	novelGene_64745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	2	412	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	476	826	885057	913861	TRUE	10	ATCTGTGTTCTTTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQPQPPQPQQQQGPQPQAQPHQVQPQQQQLQNRWVAPRNRGAGFNQSNGAGNENFGLGVVPVSASPSSVEVHPVLEKLKAINNYNPKDFDWNLKNGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYSIWCSTEHGNKRLDAAYRSLNGKGPLYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSVVDYNAYAGVWSQDKWKGKFEVKWIFVKDVPNNQLRHIRLENNDNKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIATFKHTTSIFDDFAHYEKRQEEEEAMRRKMFLSICYHHQSAEST	884581	917608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_885357_913810_913917_914474
877155	contig_11816_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_98464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCATTCTAAATCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415997	417753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_416000_417800
877157	contig_5125_pilon	-	705	4	Intergenic	novelGene_43406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	522.212600384173	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCCTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26401	23062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_23313_24803_24905_25392_25670_26324
877158	contig_14288_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_153832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	590	985	421011	421406	NA	50	CCCATCTAAACAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVYKAHLLLNVSGGSSKLIPNLWALSQENHCKICLFYPGITECEREQENVDWETEKENIIKLYCIHILAQVQSSDYPRLTWGRTRADRRQDRWWWGVVYAAPTIRLDGQSIRKEKDQKVRICLSNQRAI	420421	422627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_420400_422600
877159	contig_1406_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_25454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACTGTCCCAATCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528612	530770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_528600_530800
877160	contig_11227_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_163203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCTTAGAAGTGGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306747	304288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_304300_306700
877161	contig_11566_pilon	-	2605	10	Intergenic	novelGene_166705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_9	67.0207264790362	15	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	222	1340	246031	194651	FALSE	55	TTCGAATTTGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHRIKSFDSLGSQSSHSRTSKSFQGQYRSLDMTDNTNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFTKGDIIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREIKSSEKPVSPKSGALKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSAYLRPLQTSEKLSSANTSYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEVTQLRRVLETASDASLGWLHVNRVRETLKEHQGHLLNFVVVPVSKLFSPKLLKCLE	259300	193385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203342_223964_224061_224290_224386_234704_234794_245832_246035_255113_255245_259213
877162	contig_17198_pilon	-	759	9	Intergenic	novelGene_62435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_8	111.761394832921	98	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	285	746	1290823	1283478	FALSE	25	TAAAGAGCTCTCCATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNKMQQEITLQQIMSQIANVKKDMIILEKSGFSALRAENEKIKLELLQLKQQVMDEMMKVRTDTKLNFNLEKSRVKELFSLNERKLLEMRTEVVALNAQQDQALTQTDRKLDTEVAGLKTMLESHKLDNIKYLAGSVFTCLTVALGFYRLWT	1301035	1283464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1283534_1284290_1284406_1285594_1285649_1287539_1287612_1288402_1288445_1290225_1290328_1290802_1290907_1294371_1294492_1300954
877163	contig_12512_pilon	+	3303	2	Intergenic	novelGene_24188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTACAAAGACGGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592707	599927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_595506_599422
877164	contig_4783_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_108424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGATGAGAAAAGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430726	429575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_429600_430700
877165	contig_4876_pilon	-	2963	12	Intergenic	novelGene_137901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	142.597219265134	25	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	72	1742	418701	372750	FALSE	15	ATTTTTCTCCAGCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKEDILCGPVWLASGLDLSGHAGMLTLTSPKLVKGMAGGKYRSFLIHVKAVHERGPDEICNGGIRPVVRLTSLKHQSNKGYSLASLLAKVAAGKEKSSNVKNESASGTRKSENLRGCDLLQEVSVTIRRFKKTSVSKERVQRCAMLQFSEFHEKLLSTLCRKADDGQITEHAQSLVLDTLCWLAGVHSNGPGSSKEGNESLLSKTRKRLSDIVRICFFEAGRSMAHKCARFLALCISNGKCDPCQPGFGSVLLKALLDNMSFLPAAATGGSVYWYFVLLNYVKDEDLAGCSTACASLLTAVSRQLQDRLTPMEALLQTRYGLYSSPFDPVLFDLEMSGSSCKNVYNSSIGVQTDEIDLSDVLAGNGKVSSCTAAEGSFTSLTGLLEVEPLHFTCVSTSDGTRIERDDAMSSFGVTPAVGGLSSGTVGEASTALSSAAQKAKLEAKLHQTTAAAAAAASAVAPVHSSVPSNPVAAPGFFIHPSDVIPPTPKTTPLFMTPPLTPPNEAVSVVINAELAQLFPGSVIDPPAVSLAAQNRNSNKSRMNSLGSGLALAISHASHFLQPPPHQSIIIERMHSGNL	418772	371528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_372861_373083_373399_374437_374527_386279_386415_395664_395799_396689_396838_398319_398418_399106_399239_399331_399494_400238_400373_415193_415373_418667
877166	contig_11337_pilon	+	2258	2	Intergenic	novelGene_107173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTGAAGGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110074	114069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_111557_113293
877167	contig_17066_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_130945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAACAAACAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98563	96342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_96300_98600
877168	scaffold_880_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_121446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCAGTCTGAATGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430368	432473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_430400_432500
877169	contig_12765_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_106551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAAAGGCATTTAACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46284	44299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_44300_46300
877170	contig_12031_pilon	+	3011	1	Intergenic	novelGene_137578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAAGAAAGGCCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400238	403249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_400200_403200
877171	contig_15042_pilon	-	2087	7	Intergenic	novelGene_115423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	167.691184423432	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	138	1091	35339	10047	FALSE	45	CAATAAATAGCATGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHSRVKLQNTENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRVVEKESVKCAQYWPTKDEQEMLFKETGFSVKFLSEDVKSYYTVHLLQLENTNSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPEHGPVVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLILMEKGNDINIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKFIKGDSDIQKRWKELSKEDLSPAFDHSPTKAVTERYNGNRIGLEEGKLTGDRCTGLPSKMQDTVEEKSESALRKRVRDDRKANTAQKVQQMKQRLNETERKRKRWLYWQPILTKTGFVSVLLVGAFVGWTLFFQQNVL	43086	9050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15042_pilon_-_10255_14811_14994_21541_21695_23613_23824_31311_31450_35276_35376_42985
877172	contig_9415_pilon	+	3456	1	Intergenic	novelGene_109742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCAAAAAAAAAAATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577483	580939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_577500_580900
877173	contig_16999_pilon	-	2496	11	Intergenic	novelGene_85001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1058	1402	212198	210097	TRUE	25	CGTGGAACAGGGTGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRTNSKTSAAAASLLSLRNSINTGITFAAISGNRTEQECNVRTRSCLYLSVSSCSDTLFVLITSFFRTITSSSTFLEDTRSSANCRVFLRTSKSGVLNTLRMSITRSCRTRS	213255	194817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_194912_195594_195743_199223_199455_199863_200034_201656_201772_202988_203082_204892_205036_209996_210113_211340_211450_211526_211675_212126
877174	contig_3789_pilon	+	1199	1	Intergenic	novelGene_79907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATTTACAATCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679827	681026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_679800_681000
877175	contig_5718_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_110324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACCACATTAATAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526460	527896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_526500_527900
877176	contig_3825_pilon	+	2596	1	Intergenic	novelGene_77997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	832	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	219	650	1009557	1009988	NA	15	CATTGTCATCCAGCTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWGLSQVNWPLCIVVPSLGPGHHPYLCLRPLESSICQWGFLDGGQQGGWPSGPQGVLSNSWLCSAAPHQPAFSGLGPWDGVEGCFPIWCRGALWGPPQAQKGRALAAGEAGFQALGRGKCPYSTCQASLRGSQDISFCRAPA	1009338	1011934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_1009300_1011900
877177	contig_8269_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_106231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCCAAAGCATTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290837	293061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_290800_293100
877178	contig_8544_pilon	+	1393	2	Intergenic	novelGene_55929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTGTTTTATGACATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120263	153960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_120357_152660
877179	contig_504_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_54401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24824	25833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_24800_25800
877180	contig_14575_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_101912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGAATCTCTTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186483	184130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_184100_186500
877181	contig_2342_pilon	-	1520	1	Intergenic	novelGene_132780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACTGACACACAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625545	624025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_624000_625500
877182	contig_709_pilon	+	2125	10	Intergenic	novelGene_57575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	90.8172768683238	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	252	1154	2196962	2205279	TRUE	35	ATACCCTCTGATGATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGPLHPRPLVALLDGRDCTVEMPILKDLATVAFCDAQATQEIHEKVLNEAVGAMMYHTITLTREDLEKFKALRVIVRIGSGYDNVDIKAAGELGIAVCNIPSAAVEETADSTICHILNLYRRNTWLYQALREGTRVQSVEQIREVASGAARIRGETLGLIGFGRTGQAVAVRAKAFGFSVIFYDPYLQDGIERSLGVQRIYTLQDLLYQSDCVSLHCNLNEHNHHLINDFTIKQMRQGAFLVNAARGGLVDEKALAQALKEGRIRGGSPGCARVRAFQLRSRPAERRTKSHLHAAHGLV	2170062	2208250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2170272_2170822_2170848_2196944_2197100_2197377_2197523_2200369_2200577_2203904_2204120_2204549_2204682_2205213_2205342_2205810_2205929_2207459
877183	contig_709_pilon	+	2083	9	Intergenic	novelGene_57576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.5081515960998	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	356	1096	2197402	2205279	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYHTITLTREDLEKFKALRVIVRIGSGYDNVDIKAAGELGIAVCNIPSAAVEETADSTICHILNLYRRNTWLYQALREGTRVQSVEQIREVASGAARIRGETLGLIGFGRTGQAVAVRAKAFGFSVIFYDPYLQDGIERSLGVQRIYTLQDLLYQSDCVSLHCNLNEHNHHLINDFTIKQMRQGAFLVNAARGGLVDEKALAQALKEGRIRGGSPGCARVRAFQLRSRPAERRTKSHLHAAHGLV	2170090	2208266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2170272_2196944_2197100_2197382_2197523_2200369_2200577_2203904_2204120_2204549_2204682_2205213_2205342_2205810_2205929_2207459
877184	contig_19974_pilon	+	3038	1	Intergenic	novelGene_130465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAGTTAATCCTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143722	146760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_143700_146800
877185	contig_9895_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_144686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCCCTTGTGTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115700	117286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_115700_117300
877186	contig_7894_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_170797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	359	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGGAAACACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327200	325284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_325300_327200
877187	contig_6838_pilon	-	1135	11	Intergenic	novelGene_171787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAACAAAACAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112297	13205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_-_13274_62303_62389_62756_62804_64089_64211_72603_72671_73569_73672_75144_75251_76168_76279_80372_80482_105482_105620_112114
877188	contig_2414_pilon	-	1444	5	Intergenic	novelGene_158478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_3	48.483889076682	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	143	766	243163	232833	FALSE	30	TCACGTGAGGGAAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGIKVHRTVQQSGQFVVCFPGSFVSKVCCGYSVSETVHFATTQWTSMGFETAKEMKRRHIAKPFSMEKLLYQIAQAEAKKENGPTLSTISALLDELRDTELRQRRQLFEAGLHSSARYGSHDSSSTVADGKKKPRKWLQLETSERRCQICQHLCYLSMVVQENENVVFCLECALRHVEKQKSCRGLKLMYRYDEEQIVSLVNQICGKVSSKNGSIENCLSKPTPKRGPRKRATVDVLSSRLSSSSSKSAPSSS	243305	232154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_233013_237977_238086_240802_240987_242492_242624_243142
877189	contig_10855_pilon	-	1727	11	Intergenic	novelGene_124322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_10	61.5279611233787	1	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	31	1653	392415	320212	FALSE	55	CTTTTAAAAAAGGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPLNGSGQLKMSSHCISAQMLTPLPPGLPRLALPPAAKPTTTSEGGATSPASPTYSTPGTSPANRSFMGLGPRGASGHLSGTVLVSGITKVSFPRPSSFVPGLLEGSPAGPQPTFSVES	392445	320137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320325_325496_325584_327549_327704_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_392385
877190	contig_10855_pilon	-	2310	11	Intergenic	novelGene_124318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_10	60.793420696651	225	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	50	1645	401138	320212	FALSE	25	GTCTCTATGCAATTAACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPLNGSGQLKMSSHCISAQMLTPLPPGLPRLALPPAAKPTTTSEGGATSPASPTYSTPGTSPANRSFMGLGPRGASGHLSGTVLVSGITKVSFPRPSSFVPGLLEGSPAGPQPTFSVES	401187	319546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320325_325496_325584_327549_327704_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
877191	contig_10855_pilon	-	1866	11	Intergenic	novelGene_124320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_10	60.793420696651	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	50	1645	401138	320212	FALSE	5	AGGGCCGGCCGGGCGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPLNGSGQLKMSSHCISAQMLTPLPPGLPRLALPPAAKPTTTSEGGATSPASPTYSTPGTSPANRSFMGLGPRGASGHLSGTVLVSGITKVSFPRPSSFVPGLLEGSPAGPQPTFSVES	401187	319990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320325_325496_325584_327549_327704_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
877192	contig_16798_pilon	-	2120	8	Intergenic	novelGene_172263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	28.2683929648703	35	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	369	2021	242925	36019	FALSE	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTKMGMIQLQNPSHPTGLLCKANQMRLAGTLCDVVIMVDSQEFHAHRTVLACTSKMFEILFHRNSQHYTLDFLSPKTFQQILEYAYTATLQAKAEDLDDLLYAAEILEIEYLEEQCLKILETIQASDDNDNEATMADGGAEEEEDRKARYLKNIFISKHSSEESGYASVAGQSLPGPMVDQSPSVSTSFGLSALSPTKAAVDSLMTIGQSLLQGTVQPPAGPDDPTLAGGGRHPGVAEVKTEMMQVDEVPSQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRAMGEQCSVCGVELPDNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHPYECEYCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKPEEIPPDWRIEKTYLYLCYV	246567	35919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16798_pilon_-_36249_38467_38636_44018_44190_102541_102629_139230_139329_241657_241795_242163_243016_246289
877193	contig_6509_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_145648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146814	144699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_144700_146800
877194	contig_9505_pilon	+	1632	8	Intergenic	novelGene_121883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_1	15.0604225216497	47	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	13	1110	1179095	1211521	FALSE	25	CGCATCCACATCATCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLKFMSSPTLSDLGKREPAAAAADERGTQQRRACANATWNSIHNGVIAVFQRKGLPDQELFSLNEGVRQLLKTELGSFFTEYLQNQLLTKGMVILRDKIRFYEGQKLLDSLAETWDFFFSDVLPMLQAIFYPVQGKEPSVRQLALLHFRNTITLSVKLEDALARTHARVPPAIVQMLLVLQGVHESRGVTEDYLRLEALVQKVVSPYLGTYGLYSSEGSFTHACILEKRLLRRSRSGDVLAKNPVVRSKSYNTPLLNPVAEHEAEGAAGSSAGIRRHSVSEMTSCPEPQGFADAAPYSGPCPSRLYPPAQAAEQGLDPTHSSPPTSSPENLVDQILESADSDSEGIFIDFSRGGASGKFEGAGGRQSVM	1179082	1212043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_1179205_1194938_1195020_1197622_1197672_1199466_1199525_1205756_1205849_1207112_1207254_1208779_1208916_1211090
877195	contig_160_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_156319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCAATTGTAAACAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68161	65732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_65700_68200
877196	contig_6770_pilon	-	2095	12	Intergenic	novelGene_178134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	49.1053850710409	94	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	406	1908	56252	42998	FALSE	15	ACCCTGAATCTTCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTFTIEIKDGRGQASTGRVLLPTSSQRAEVSLGLRAPPTLLSTSSGGTSTVTHVSSPGTPARLGSVTHVTSFSHASPGSRGGCSIKMEPEPAQPPSAAVEAANGAEQARVDKAPEQRSPLSPEELMAIDDEGVLDKMLDQTTDFEERRLIRAALRELRQRKRDQRDKERERRLREARARPGESRGNTATKTTTQQSQRAADGSAVSTVTKTERLIHSNDGSRMARTTTVESSFVRRSENGSGSTMVQTKTFSSSSSSSKKMGSIFDREDEARRGCVAALEKRQAEKKKELMKAQSLPKTSASQARKAMIEKLEKEGAAGSPGGPRIAVQRPTGFGVPNANSIKQMLLDWCRAKTRGYEHVDIQNFSSSWSDGMAFCALVHNFFPEAFDYGQLSPQNRRQNFEVAFSSAETHADCPQLLDTEDMVRLREPDWKCVYTYIQEFYRCLVQKGLVKTKKVLTPVWGSTDAGGLRAPSGGGGHDDHGQETRPQVRLHLRTVAL	56657	42810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6770_pilon_-_43103_45896_46063_47018_47171_47708_47827_48062_48231_50180_50254_50508_50572_50674_50840_51981_52058_52145_52299_55798_55972_56161
877197	contig_405_pilon	+	2622	3	Intergenic	novelGene_135333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609881	615741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_612059_613938_614048_615405
877198	contig_10902_pilon	+	1333	9	Intergenic	novelGene_65684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	373.100773920398	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	515	1333	196281	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	160622	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160816_178811_178871_189008_189182_196150_196186_196226_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
877199	contig_8865_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_164453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGACCCACAGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379375	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_379400_380700
877200	contig_11294_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_50074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGAAATTTTAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346536	344605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_344600_346500
877201	contig_5145_pilon	-	1137	5	Intergenic	novelGene_131458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	370.379535071796	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	9	344	956111	949748	TRUE	15	TTAAATGTGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVMEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVEDFNRHLDTLTEHYDIPKVSWTK	956119	948699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949119_949373_949817_952957_953012_955790_955930_956037
877202	contig_10506_pilon	-	3725	1	Intergenic	novelGene_125181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94576	90851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_90900_94600
877203	contig_12543_pilon	-	1525	11	Intergenic	novelGene_168356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.2784697014109	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	8	1111	36937	23018	FALSE	40	ATAAATATTGTCATGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMGTAAPAAMDPVVGQAKLLPPERMKHSIKLVDDQMNWCDSAIEYLLDQTDVLVVGVLGLQGTGKSMVMSLLSANTPEEDQRAYVFRAQSAEMKERGGNQTSGIDFFITQERIVFLDTQPILSPSILDHLINNDRKLPPEYNLPHTYVEMQSLQIAAFLFTVCHVVIVVQDWFTDLSLYRFLQTAEMVKPSTPSPSHEPSSSSGSDEDTEYYPHLVFLQNKARREDFCPRKLRHMHLMIDQLMAHSHLRYKGTLSMLQCNVFPGLPPDFLDSEVNLFLVPFMDSEAESENPPRAGPGSSPLFSLLPGYRGHPSFQSLVSKLRSQVMSMARPQLSHTILTEKNWFHYAARIWDGVRKSSALAEYSRLLA	36944	22603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_23097_24292_24438_24814_24944_25102_25211_25965_26073_28421_28508_28912_29009_31872_31985_35225_35339_36707_36806_36906
877204	contig_401_pilon	+	2729	12	Intergenic	novelGene_42944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGGAAGCGGAAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2224665	2262055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_2225622_2232153_2232250_2233392_2234156_2236355_2236562_2238749_2238848_2239117_2239156_2239859_2239913_2240741_2240789_2247440_2247487_2248390_2248606_2257654_2257703_2261892
877205	contig_2596_pilon	-	2653	11	Intergenic	novelGene_53456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	26.6497654773921	32	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	654	1742	550308	540482	FALSE	30	GAAAAAGACTTGGGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESIRKKNIKASAFRSVNTRRATQQDLDNAGESRRNREQENDEEEEGHIVDAEAEEGDADASDTKRKEKQEEEVDYESEEEEDNEVGENEDEDMQEEGNVSGEGTQEQNEEVGPSPEEDEALTRPQKPTRGQGPQGAEAAERRIQAVCESHTFIEDYKYDTEESLWCEVTVKLPLMKINFDMSSLVVSLAHSAVVHATKGITRCLLNETTNKMNEKELVLNTEGINLAELFKYAEVLDLRRLYSNDIHAMADTYGIEAALRVIEKEIKDVFAVYGIAVDPRHLSLVADYMCFEGVYKPLNRFGIRSNSSPLQQMTFETSFQFLKQATMMGSHDELRSPSACLVVGKVVKGGTGLFELKQPLR	559733	539570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_540583_541261_541427_542030_542149_543281_543483_544646_544932_548734_548843_550197_550326_557424_557583_558014_558151_558785_558954_559559
877206	contig_3787_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_102436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	439	1320	93	1412	647756	646437	NA	10	ACTGTGCTGCTGTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEGRKPGAVVAVVTEPCFTQQYRVYLEKQQLLDRRHRVEKMPDGTVALPVLGKTLPDQHLKELRTRVAPGSTCMLTQLLHPVPSKAAQGCSPAQRLRLEVSRWVEGRGVTWSAELEADLPKSWKRHGNLLLLSEDCFQAKQWKSLEPELWETVAAALGVQRLARRGRVSPDGTRTPAVTLLLGDHGWVEHVDNGIRYKFDVTQCMFSFGNITEKLRVASLSCAGEVLVDLYAGIGYFTLPFLVHAGAAFVHACEWNPHAVVALRTNLEINGVADRCQIHFGDNRKLKLSNIADRVNLGLIPSSEEGWLVACQVLRQDAGGILHIHQNVESFPGKNIQPPGSSGMEEERWPYPQQIISKQGKNRTTRDSGGEMLAGAPKPEWKKWAESAETRIAALLEQVHGKPWKTQILHIQPVKSYAPHVDHIVLDLKCCPCPLVG	647848	645814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_645800_647800
877207	contig_5623_pilon	-	1825	2	Intergenic	novelGene_154869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	142	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAGGTACAACAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275938	267432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_269206_275886
877208	contig_10857_pilon	-	622	3	Intergenic	novelGene_160894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGAGGGTTTCAGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66898	56426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_56559_58199_58344_66552
877209	contig_2703_pilon	-	2888	19	Intergenic	novelGene_101822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_12	46.0263276778212	121	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	869	2610	21	2630	1173430	1146058	FALSE	40	CAAAATACACCCTGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPEENETGFDFVVSDLEHINPHQPMTSLQYLHAQPITCQGMFLCAVIRALHQHCACKMHPQWIGLITSSLPYMGKVLQRVVVSVTLQLCRNLDNLIQQYKYETALSDSRPLWMASVIPPDMILTLLEGITAIIHYCLLDPTTQYHQLLVNVDQKHLFEARSGILSILHMIMSSVTLLWSILHQADSSEKMAVAASASVTTINLGATKNLRQQILELLGPISMNHGVHFMAAIAFVWNERRQNKTTTRTKVIPTASEEQLLLVELVRSISVMRAETVIQTVKEVLKQPPAIAKDKKHLSLEVCMLQFFYAYIQRIPVPNLVDSWASLLVLLKDSIQLSLPAPGQFLILGVLNEFIMKNPSLENKKDQRDLQDVTHKIVDAIGAIAGSSLEQTTWLRRNLEVKPSPKIMVDGTNLESDVEDMLSPAMETSNITPSVYSVHALILLSEILAHLFDMVFYSDEKERVIPLLVNIMHYVVPYLRNHSAHNAPSYRACVQLLSSLSGYQYTRRAWKKEAFDLFMDPSFFQMDASCVNHWRAIMDNLMTHDKTTFRDLMTRVAVAQSSSLNLFANRDVELEQRAMLLKRLAFAIFSSEIDQYQKYLPDIQERLVESLRLPQVPTLHSQVFLFFRVLLLRMSPQHLTSLWPTMITELVQVFLLMEQELTADEDISRTSGPSVAGLETTYTGGNGFSTSYNSQRWLNLYLSACKFLDLALALPSENLPQFQMYRWAFIPEASDDSGLEVRRQGIHQREFKPYVVRLAKLLRKRAKKNPEEDNSGRMLGWEPGHLLLTICTVRSIEQLLPFFNVLSQVFNSKVTSRCAGHSGSPVLYSNAFPNKDMKLENHKPFSSKARQKIEEMVEKDFLEGVIKT	1173450	1145799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1146364_1151389_1151520_1153715_1153881_1154788_1154845_1155706_1155844_1156984_1157138_1158828_1158891_1159033_1159184_1159440_1159551_1159957_1160038_1160166_1160312_1160547_1160615_1161492_1161598_1162911_1162968_1165741_1165877_1169471_1169598_1171590_1171774_1171882_1171995_1173098
877210	contig_10904_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_22778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTTACAGCAACCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725854	723815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_723800_725900
877211	contig_9333_pilon	-	3019	20	Intergenic	novelGene_120334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	169	519	549911	537591	TRUE	40	AGAAGAATTGAAGTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLKNTRSLPSSSVRRNDCSTICSTRMRGLTGKASSAQKGLSHSSRSSEETNSSLFSTLARTAATTPSRTWSGSCGPPRSALPPLNAEIIFLIAVCTISLGEMPRGPTATSSSC	590552	394016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_394050_400943_401057_411034_411149_418627_418741_420424_420586_421455_421544_442668_442839_449225_449335_449855_449982_462102_462179_462572_462712_478784_479017_482121_482232_491669_491920_493370_493705_535025_535245_537477_537682_539753_539844_549741_549938_590410
877212	contig_18303_pilon	+	1562	1	Intergenic	novelGene_146804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTGTATGGTATGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40081	41643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_+_40100_41600
877214	contig_3269_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_117012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAAAGACTGGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68394	65891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_65900_68400
877215	contig_8050_pilon	+	1663	3	Intergenic	novelGene_114860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	731	junction_2	138	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	632	1117	389366	390861	FALSE	25	TATCATGATTAGGTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWRQGIYLNWSPEAYCLVGSEVLDYHPESFLKITVPSCRKGCILLGQVVDHIDSLMEEWFPGLLEIDICGEGETLLKKWALYSFNDGEEHQKILLDDLMKKAEEGDLLINPDQPRLTIPISQIAPDLILADLPRNIMLNSDELEFEQAPEFLLGNYFLLV	388734	391407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_389490_389633_389826_390691
877216	contig_5690_pilon	+	1619	8	Intergenic	novelGene_119698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	9.55969429961235	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	515	1159	851109	858346	FALSE	5	TCCAGTGTCGGGGGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFMQRCAVHMQAIIQGFSYDLLRKIDSPQRFVGSPPRFGSLMQGNPTGSPNRLLKAGVVSAPNIYSFGFGKFCLTGRKQLAYLGSLPVIGEKEVIQADDEPTFSFFSGPYMVMTNLVWNGSRVTVKELNLPTHAHCSRLWLADLLIAEQEHSSKLRHPHLLQLMAVCLSQDLETTRLVYERISVGTLFSVLHERVGGCLRDCCPPHFPLPQL	847467	858806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_847701_848199_848315_850115_850282_851108_851246_854282_854365_855781_855913_856999_857114_858165
877217	contig_6102_pilon	+	430	4	Intergenic	novelGene_31760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4208.18680933038	21	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	22	423	296199	298470	FALSE	50	AGAGGAGCAAACCTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLASKMTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCARCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEASVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIHSKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAVSILKRRMWKPEGVLLHDLHQSPCKDLSP	296177	298477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296202_296425_296604_297810_297980_298418
877218	contig_6102_pilon	+	897	3	Intergenic	novelGene_31761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3497	junction_1	3324.5	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	22	375	296199	297983	FALSE	35	TGGAAATTACATTTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLASKMTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCARCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEASVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIHSKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAVSILKRRMWKPEG	296177	298505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296202_296425_296604_297810
877219	contig_10460_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_157475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	614	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGATTGATTGCTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111951	111520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_111500_112000
877220	contig_6102_pilon	+	285	2	Intergenic	novelGene_31767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	10146	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGGTTTAGACCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296429	297921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296604_297810
877221	contig_6102_pilon	+	768	4	Intergenic	novelGene_31763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1734.7396218325	54	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTTGCCAATTCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296179	298655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296202_296425_296604_297610_297942_298418
877222	contig_16883_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_161762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTAGAAAAAAAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573278	575546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_573300_575500
877223	contig_567_pilon	-	2264	10	Intergenic	novelGene_33974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGTCAGGAACGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418201	338776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_338850_358259_358382_370299_370541_373192_373394_388163_388228_389099_389214_400930_401016_413931_414111_415508_415628_417135
877224	contig_9189_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_165123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	247	321	382618	382544	NA	25	GGATTGCAACCCTAGCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKQINESSVVILLVNFINHSNHETITYADTIKYLLTILNYIPIAIRSIPTHSDPIGLSRTAPTGFPRSSRWIRTADVLVSSQMFNHCATRTLLNYMGNNNSGVFCQ	382864	380317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_380300_382900
877225	contig_11816_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_98534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGGAAAATAAAGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033353	1030777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1030800_1033400
877226	contig_5954_pilon	-	1455	5	Intergenic	novelGene_28754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	5.53962995154008	68	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	232	879	1331047	1320983	FALSE	25	TTATTAAGAGAGTTCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAEIRCPSADTARTHILEQHPHTLDLSPSEKSNILEAWSEGVALLQDVQAEQPSPPSSDSGRDVDPDPDPDPDPARMPAEIVVLLDSEDNPSLQALPKRTRPRGLRPLELPAAPATEPANKKSRGQRWKEPSGEEPVRKKRGRRMTKNLDPDPDPPSSPDSPTETFAAPAEVRHFTDGSFPPGFVLQLFSHTQLRASENKDSPIEGNVGEGGFSQLQSPSPAPPPGLRGTLDLQVIRVRMEEPPAVSLLQDWSKHPPGTKGVGAGDTRDWPAVLSESSTPVRGEPEAGSGV	1331355	1320406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1321195_1330274_1330479_1330690_1330817_1330941_1331101_1331177
877227	contig_2062_pilon	+	1134	9	Intergenic	novelGene_139056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_5	50.7455355179153	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	108	1027	1134	1442244	1457888	FALSE	40	ATGCCATCACTAAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSDAEQKYYSDLFSYCDIESTKKVAANGRVLELFRAAQLPNEVVLQIKELCGAKRLGYFGRSQFYIALKLVAVAQSGLPLRVESINTVKELPLPRFVASKNEQESRHAAPYSSDSENQGSYSGVIPPPPGRGQVKKGSISHDAVQPRTSTDQQEPASPVVSPQQSPPASPHPWRKHNRHPSGGNSERPLTGPGPFWSPFGEAQSGSSAADTVWSGHSPPPPQENWDQTTVRTVASATTANEIRRQSSSYDDPWKITDEQRQYYVNQFKTIQPDLNGFIPGSAAKEFFTKSKLPILELSHIWELSDFDKDGALTLDEFCAAFHLVVARKNGYDLPEKLPESLMPKLIDLEDSADVGDQPGEVGYSGSPAEAPPSKSPS	1407618	1457888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1407760_1436628_1436753_1438369_1438567_1438697_1438852_1439769_1439832_1440410_1440574_1440869_1440934_1442122_1442278_1457814
877228	contig_10732_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_114723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCCCGTCTTTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359166	357619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_357600_359200
877229	contig_7078_pilon	-	2224	5	Intergenic	novelGene_130154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_2	63.7710749478163	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	516	863	543489	541768	FALSE	55	AGAAAACTATAAGAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIKQLPKPNQDTMQILFRHLKRVIENGEKNRMTCQSIAIVFGPTLLRPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR	545426	540406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_541943_543085_543189_543419_543555_543657_543736_545054
877230	contig_5253_pilon	+	2550	7	Intergenic	novelGene_61549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCTCAGAGCTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116210	413850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_117859_132364_132505_137262_137405_138481_138598_148041_148167_243872_244074_413672
877231	contig_11096_pilon	-	2564	1	Intergenic	novelGene_143477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTACTTGCTTTTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259387	256823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_256800_259400
877232	contig_15653_pilon	+	3196	1	Intergenic	novelGene_176960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATTTAAGATTATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14099	17295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15653_pilon_+_14100_17300
877233	contig_7056_pilon	-	3544	1	Intergenic	novelGene_43728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCCAGCAAGCGCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008960	1005416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1005400_1009000
877234	contig_15114_pilon	-	2462	13	Intergenic	novelGene_121222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1381	1833	1661483	1658403	FALSE	50	GAAACGTTCATTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNLLNTRLFHFHFLLMCFLCKWFILCLERSLERWLYRWSWRYDRLSHRRKRRCRKKPKSWHLSIRRKWNLMVHWLLLYSHHSRWKLIHILMLCISWLLHAITRKSEWCLWRRRSSRGGRSGDGSSGRRSGGSRRGCGDSGGSSSVFFL	1687457	1657773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1658534_1658908_1659016_1660772_1660941_1661436_1661523_1666703_1666896_1667821_1667924_1668580_1668692_1669367_1669525_1671567_1671727_1672745_1672912_1672994_1673082_1673229_1673426_1687286
877235	contig_3789_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_79883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	627	849	1475	557210	556584	NA	85	AAAGCAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLLLLLPPKPVLPPGSQGRNLGGCQIPGSCHPAPHPHCHSDSGPLAPYLVPSRSLWFPSTSENTFYPKARLIFENAGLIKCLTCFKPFPCPHWLSVSPGCPGLPSLVIGPPISSLSPPRLTSHPRTGSLPKLVCPHFLNTPHPSASAFCLSAHMPFFRSLVYLSTFCLHFKTQLRNPLLREVNHRGKNQNQGKGWRELIIILLFSH	558058	555989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_556000_558100
877236	contig_500_pilon	+	3225	2	Intergenic	novelGene_30917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTGTTCAGCAATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023887	1027220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1025977_1026084
877237	contig_8160_pilon	-	2607	1	Intergenic	novelGene_136403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATTTTAGGGAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58370	55763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_-_55800_58400
877238	contig_11386_pilon	+	1583	5	Intergenic	novelGene_82835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_4	43.0726131085635	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	891	1349	231646	244538	FALSE	25	AACCAGATAGTTGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPNEDSEGSRITYIKGDLFACPKTDSLAHCISEDCRMGAGIAVLFKKKFGGVQELLSQQKKSGEVAVLKRDGRYIYYLITKKRASHKPTYENLQKSLEAMKSHCLENGVTDLSMPRIGCGLDRLQWENVSTMIEEVFEATDIKITVYTL	230755	244772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_231685_232027_232173_233457_233517_234770_234884_244435
877239	contig_14509_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_168563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACGGGCGCAAACAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275282	276973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_+_275300_277000
877240	contig_14333_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_49086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCCCTACTGCTTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277142	275646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_275600_277100
877241	contig_11677_pilon	-	1993	13	Intergenic	novelGene_85959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.414953438626	10	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	215	1723	632370	615929	FALSE	10	CTTGCCGCACCCTGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRQVLRQTFQERAKLNIAPTKKGRKDVDEAHYAYSFKYLKNKPVKELRDDQFLKICLAEEEGLLTIDISIDMKGVEGYGNDQTYFEEIKQFYYRDEFSHQVQEWNRQRTMAIERALQQFLYVQMAKELKNKLLAEAKEYVIKACSRKLYNWLRVAPYRPDQQVEEDDDFMDENQGKGIRVLGIAFSSARDHPVFCALVNGEGEVTDFLRLPHFTKRRTAWREEEREKKAQDIETLKKFLLNKKPHVVTVAGENRDAQMLIEDVKRIVHELDQGQQLSSIGVELVDNELAILYMNSKKSEAEFRDYPPVLRQAVSLGRRIQDPLIEFAQVCSSDEDILCLKFHPLQEHVVKEELLNALYCEFINRVNEVGVDVNRAIAHPYSQALIQYVCGLGPRKGTHLLKILKQNNTRLESRTQLVTMCHMGPKVFMNCAGFLKIDTASLGDSTDSYIEVLDGSRVHPETYEWARKMAVDALEYDESAEDANPAGALEEILENPERLKDLDLDAFAEELERQGYGDKHITLYDIRAELSCRYKDLRTAYRSPNTEEEEEDENESGTVLYSAPYKPFRASAPT	632767	615658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_616010_624703_624806_625310_625519_626645_626774_627299_627468_627544_627683_627975_628112_628414_628492_630986_631105_631227_631368_631726_631923_632353_632509_632691
877242	contig_12278_pilon	+	1687	4	Intergenic	novelGene_152580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	290	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTCGCAGGGAGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106718	110929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_107859_108919_109157_109697_109822_110743
877243	contig_4151_pilon	+	1687	9	Intergenic	novelGene_65214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	91	junction_3	81.3049813972059	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	177	1685	409806	425169	FALSE	30	ATGTTCTTTGGGACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NITWDPTGSRLLTGSSCLQLWSNTLEKPSENENPDKTDLNFGDWRCIWHCKTASQVHLMKFSPDGEFFATAGKDDCLLKVWYNVENWRTAVTSPDRSSEKQSQGEIDFSFVYLAHPRSVNGFSWRKTSKYMPRASVCNVLLTCCKDNVCRLWVETFLPNDCLLYGGDCNHWTEPVSLTNNFKRNASSKERVQSALEVNLRHFRRGRRRSLALVAHTGYLPHQQDPHHVHRNTPLHANALCHFHIAASINPATDIPLLPSITSLSLNEDEEKSGPFVVHWLNNKELHLTLSMEVFLQQLRKSFEQPSSEASVEDCNQADVKSDEETDDGVDDLKINHGKKELGSDKMVPNSSLPSAAIDHQIEVLLSEWSKNADMLFSIHPMDGSLLVWHVDWLDEYQPGMFRQVQVSFVSRIPVAFPTGDANSLCKSIVMYACTKNVDLAIQQGKQKPSSLTHSTSMLISSSHSKSTNSLKLSIFTPNVMMISKHADGSLNQWLVSFAEESAFSTVLSISHKSRYCGHRFHLNDLACHSVLPLLLTTSHHNALRTPDVDNQKQPYDGVSTE	395818	425171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_395843_402859_402990_409783_409851_411465_411645_415823_416014_417043_417213_418225_418439_424348_424594_424701
877244	contig_8069_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_136777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACTCACCAGCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416590	419429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_+_416600_419400
877245	contig_12050_pilon	+	2236	11	Intergenic	novelGene_62593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.73447481891037	91	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	7	1743	161966	175134	FALSE	15	GGAGCCAGCAGGTGGTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASMGRWLLFLALLGSLPEASGGFGSGVSRDDDLLLPYPRTRVRSARDCTPVHTGRREHESWPPAPAPPGAVSPSVRNFFSYFAGRAVGGHLTRAAAPLRTFSVLEPGGPGGCASRHRATVEETARTVRCRVAQNGGFFRMDTGECLGNVVSDGRRVSSSRGLQNAQFGIRRDGTLVTGYLSEEEVLDTENPFVQLLSGVVWLIRNGSVYINESLATECDETQETGSFSKFVNVLSARTAVGHDQKGQVVLFHADGQTEQRGVNLWEMAEFLLQQGVVNAINLDGGGSATFVLNGTLASYPSDHCKESMWRCPRRVSTVVCLHEPRCQPPDCSSHGTCVQGSCQCMGRFWRGAACNELDCGPSNCSGHGLCTETGCRCKAGWTGSNCSEACTNGSFGENCAQKCQCRNGAACDPVRGTCSCPPGFTGDICTQECPHGWYGPGCQSPCKCEHQCPCNPRTGNCSLSWTPAMTSLTSQVNRCFPSPEATLRARELSYFTGTTWLVLTLTLVFLLLLSMAVNVTLLRGSRTERNRHLDGGYVYHPLREVNGELQQRRRSSWETLTALSRTEASVCPDGLS	161959	175627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_162049_162155_162612_163590_163731_164877_164987_165844_165974_168535_168742_168830_168879_172023_172153_172655_172788_173361_173426_174893
877246	contig_16382_pilon	-	1401	1	Intergenic	novelGene_160217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51294	49893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_49900_51300
877247	contig_10629_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_52949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTTTTTAGGCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435476	432928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_432900_435500
877248	contig_11081_pilon	-	1923	8	Intergenic	novelGene_167073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	152	358	25956	22491	TRUE	10	CTCCTCATCCTTGCCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKLSLLCDALVEGHIQKPALRPLLSVLDQSRGLPSACKCHNFYDLERFHLMIQNQLLFICKLDSCFLAWPNRWFLFNFCDLSTGILLKIQAIENVVVNPIADVNSLLPHGVEKHSYAV	27986	15856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_16421_18869_19471_20831_20965_21064_21201_22359_22550_25433_25529_25903_25997_27875
877249	contig_7366_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_164973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAATGGCTGGTGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63340	65949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7366_pilon_+_63300_65900
877250	contig_10811_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_165811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTGACGACCCTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433152	435678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_433200_435700
877251	contig_1863_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_156528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1687	2001	60981	60667	NA	70	GGCCAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELYQLRWKRFQVELVSTQLDPGVNTGERSALVCDWKSSAGVFKAVRLNVITKECYHNKQPLSRILSCDSKSSERRGLTKKGCWEGGSSEIRGQSKKHGVPEAK	62667	60543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_60500_62700
877252	contig_5302_pilon	+	2635	1	Intergenic	novelGene_81457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	1047	1784	187996	188733	NA	40	AGCTCAAATGATACCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSGLGAVTLLLCLQREWPGFLGELRRLKSLLSLPLALTPGKIVADLECMWEMRVGRGVWWNVGSLGPRVAGKVKRSGPGQLWGGVWTHVHPAYTEYLPHARRCAVYFASPISLPPGYKQIVISAICNFPSYHLMSSCLVQQRCPLTLPLVLSSHPPLYPAQSLAPSLHWLACVQVPSDFYTAEFSGQFSSSFYLTSREHQTQLLSPSSLKQLVHLALRSPNLPGFPPASRLLLSLVSGSLSSS	186949	189584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_186900_189600
877253	contig_13481_pilon	-	1565	4	Intergenic	novelGene_119520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1044	junction_1	285.370324704974	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	125	628	1437297	1427706	FALSE	50	ACGTAAAGAGAGAGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQNLGPENAVTLLVFAVTEHKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYFDLYDPPPDVSCIDLDTNTISQTGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPRDDGLMDLAMNDYDFHSGKRLHMIDLEIQEAFLCFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDATSLFALQGE	1437707	1426768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1427933_1430770_1430872_1437121_1437298_1437583
877254	contig_4426_pilon	+	2474	3	Intergenic	novelGene_15387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTTCCTTGGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433765	438336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_435068_436929_437054_437288
877255	contig_299_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_129479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAATTTTCATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387395	1385260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1385300_1387400
877256	contig_846_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_136106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCACAAAACGTGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212340	211439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_-_211400_212300
877258	contig_5423_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_85202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATGTAAAGCAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281956	280136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_280100_282000
877259	contig_9484_pilon	+	2333	6	Intergenic	novelGene_105690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_5	46.9399616531586	32	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	232	1569	232977	238554	FALSE	20	CACATGGCTAGTGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVRPPRRAKAKASRTKAKEKKKCETLQREESDEVSLPKTSREQKIPPPVCEIEGDHLKVSADSQLKNDASEQNESEMSDVPLTSLTVSNDESLSRNTETLKGGGEIRACVEEEEIKPKVDPGDNVGTKVETPENFTEVKENKLVQCGPSESTLQSDFSHTQQEVGNLHVRETHNRTEDKQAQGLSLEVLHSVGLQSSCEATDVFQPPRVKKLYPQLPAEMTGEEPTLVAVKPSFRNERLYPELPSQPELVPFTKEQLKIFEPGSWLENVESYLEEFDSMAHQDRHEFYELLLNYSRCRKQLLLAEAELLTLTSDCQNAKSRLWHFKEEQVSVQGICADQVKVPGHHRYQTVEMNENALGELKKLFDAKSEHLHQTLALHSYTSVLSRLQVESYIYALLNSSAVLRSLAIHQQGPVSKQTESIPSDLCQLKECISVLFMFTRRVNEDTQFHDDILLWLQKLVSVLQRVGCPGDHFFLLNHILRCPAGVSKWAVPFIQIKVLNNPSGVFHFMQSLALLMSPVK	221448	239318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_221506_232802_233748_235038_235283_236464_236602_237467_237576_238476
877260	contig_10811_pilon	-	2065	1	Intergenic	novelGene_165795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTAGGACAACTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338208	336143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_336100_338200
877261	contig_14720_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_164985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAACACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190300	189860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_189900_190300
877262	contig_9195_pilon	-	1169	9	Intergenic	novelGene_155683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTGTCACCACCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317671	310250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_310281_311610_311765_312095_312293_312858_312926_313001_313140_314710_314865_316059_316322_316643_316738_317598
877263	scaffold_12124_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_22419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCGTTTCTGTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632460	1631228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1631200_1632500
877264	contig_2209_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_141014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATTCATTTTCTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168404	170015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_168400_170000
877265	contig_9706_pilon	+	3593	2	Intergenic	novelGene_20986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTAGCAATCTTACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394145	398203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_396565_397029
877266	contig_8570_pilon	-	1743	2	Intergenic	novelGene_120151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTAAAGTGGGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327051	323276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_323375_325406
877267	contig_4751_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_173728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACTATTTGTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304423	306614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_304400_306600
877268	contig_5084_pilon	-	2630	10	Intergenic	novelGene_64614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	5.00616903380836	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	408	1427	1077026	1056728	FALSE	20	TCCTAAATCTCTGTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQMQLEANADTSVEEESFGPQPISRLEQCGINANDVKKLEEAGFHTVEAVAYAPKKELINIKGISEAKADKILTEAAKLVPMGFTTATEFHQRRSEIIQITTGSKELDKLLQGGIETGSITEMFGEFRTGKTQICHTLAVTCQLPIDRGGGEGKAMYIDTEGTFRPERLLAVAERYGLSGSDVLDNVAYARGFNTDHQTQLLYQASAMMVESRYALLIVDSATALYRTDYSGRGELSARQMHLARFLRMLLRLADEFGVAVVITNQVVAQVDGAAMFAADPKKPIGGNIIAHASTTRLYLRKGRGETRICKIYDSPCLPEAEAMFAINADGVGDAKD	1080476	1055524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1056852_1057555_1057678_1057895_1058026_1058385_1058500_1063022_1063118_1067465_1067558_1069001_1069120_1075403_1075542_1076939_1077045_1080087
877269	contig_5954_pilon	-	107	2	Intergenic	novelGene_28444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAGTGGTCAGGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98952	98138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_98149_98855
877270	contig_6102_pilon	-	1832	2	Intergenic	novelGene_32391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	129	413	1743430	1742196	FALSE	35	ACAACCATTCCAGGCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPPPLSLPTPYPGTRTQPVPCPNTGLGSTEALVTQPHLAAAMADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAVRLCAASGLLWTLTYLPQAGPFPSLASHSNKWVCQPQPRWYVGCRACKGLTGPTAINEQ	1743558	1740776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1742445_1743394
877271	contig_14575_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_101929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGACACCTAATTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417595	414777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_414800_417600
877272	contig_7753_pilon	-	2731	3	Intergenic	novelGene_41501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	39	11	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTTTATGAAACTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228195	1224009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1225210_1225505_1225708_1226866
877273	contig_4797_pilon	-	485	6	Intergenic	novelGene_6910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGGACGGTGGAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371750	368345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_368394_368540_368589_368762_368846_369894_370024_370912_371016_371676
877274	contig_8276_pilon	+	3050	5	Intergenic	novelGene_174476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	54.2332923581079	19	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATAACTGAATTTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139800	154954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_140984_141664_141790_148646_148715_153182_153286_153383
877275	contig_9363_pilon	-	1365	6	Intergenic	novelGene_6541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	8.40476055578028	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	113	619	701764	700081	FALSE	55	GAAAATGATTACCAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQVAVWTDIEVLQLQNMSVSCPSDKIEPTESDFLTHIQKNPVLDCSIAVCKRFHCDIQSFDIQEELDFILKGNLSFGWVSQTLQKKILVVSVAEITFDRAMYSQHPGQEAFMTAQIETVLEKYDVYNPIFLIMGGSVGGLLLLALIAATLYKVGFFKRQYKEMLEEARGENAPENGKSNSLVAK	701988	699334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_700180_700738_700850_701119_701222_701364_701479_701683_701768_701879
877276	contig_2703_pilon	+	3297	1	Intergenic	novelGene_101842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	2263	2886	1303303	1303926	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHGEKIEVVKDFILLGSTINTHGSGSEEIKRLIALGKPVAENVFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSVASCACKSWTMNKEDRRIDAFELWCWRRILNIPWTAKRTNKSVLEDVQPECSLEARVTRLCLRYFRHVIRRDQSLEKDIMLGQVEGQRKMGRPPTRWIGTVAATMDSCMTTIVRMAQDRAIFHSVVHKVAMSWNQLDDT	1301040	1304337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1301000_1304300
877277	contig_16951_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_98653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGTTAACATGCTCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90454	88551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_88600_90500
877278	contig_15039_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_110161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCATGGCTTATCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246229	247444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_246200_247400
877279	contig_6233_pilon	-	3723	1	Intergenic	novelGene_74810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAAGCCCCTTAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183359	179636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_179600_183400
877280	contig_18113_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_137516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAGGGCTTCAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50027	48482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_48500_50000
877281	contig_10986_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_71511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGACAAAATAAGCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182126	184166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_182100_184200
877282	contig_15882_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_144800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	221	697	37939	37463	NA	70	ATGTGAAGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEDQRNIDTFQLWCWRRTLNARRTNKSILEESQAECCLEARMTRLCLAYFGHIIRRDQSLEKYIMMSWIEYQIQKIRMSLLMAQTKAHSLFENLKEQQGEDYLEYCNANKGWFRYFRCRFGLYNAPVTREAGSTDVETTKKFRDELDEIVQDEEEG	38159	37307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_37300_38200
877284	contig_4418_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_98391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	991	1296	892556	892251	NA	50	AAGGAAAGAGAGACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDFNVHVNNPPTLISQFPIANTLLSHSTLAIHSLGHILDCVITRDGAISGISSSTIPLFYHHLLYFQFTCPRLSSTIELTEILQSIDPTTESLTINPTA	893546	891006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_891000_893500
877285	contig_1996_pilon	+	2474	21	Intergenic	novelGene_131906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	22.4064722792322	72	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2370	104	2473	266975	283134	FALSE	20	GTGTGCATTCATTGCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVYKQAHPPTGLEFSMYCNFFSNTERNLVVAGTSQLYVYRLHRDAEALTKNDRSTEGKAHREHRERLELVASFSFFGNVMSMASVQLAGAKRDALLLSFQDAKLSVVEYDPGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAVMLTYGTRLVVLPFRRESLAEEHEGLMGEGQRSSFLPSYIIDVRALDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWPGRVAVRQDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTNLPFDCTQALAVPKPIGGVVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRIQEGVRITLDCAQAAFISYDKMVISLKGGEIYVLTLITDGMRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKLQEPPASAVRETADKEEPPTKKKRVDAAVGWSGGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLATYSFEVCDSILNIGPCANATMGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGYGKNGALSVLQKSIRPQVVTTFELPGCYDMWTVIATVRKEEDETPKGEGAEQEPSTPEAEEEGKRHGFLILSREDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIPVDLGSPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHVGPAHASHAARGPAHPAECCAQCPGRGAAQPVPLPQHHGARRAGQEDRHHARHHPGRPVGDGPRHRSLLVSRVMPLPPSPSSSTLFVHNTRKTICLEK	266871	283135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_267119_272135_272164_272249_272393_272570_272652_272791_272944_273030_273178_273326_273467_273581_273693_275411_275506_275607_275696_275769_275893_275961_276014_276103_276199_276268_276344_276423_276505_276605_276696_277008_277120_277194_277337_277407_277608_282787_282927_283000
877286	contig_15744_pilon	+	2855	1	Intergenic	novelGene_83630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1809	2117	249585	249893	NA	15	CGCAGCCACCGGGCCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLINYIIFYFLSLAPPLLLLHCHLERSSKKSSLDKRTLVGCGRPVREAARFNPHPPPRLQTHLHRRCPRVFHKAYPSAAPGFLSSHLHTGKRRLRTCPKP	247776	250631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_247800_250600
877287	contig_9363_pilon	-	915	1	Intergenic	novelGene_6781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGCAGCCACTCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513744	1512829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1512800_1513700
877288	contig_16310_pilon	+	1888	11	Intergenic	novelGene_70035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	641	1024	57142	58873	TRUE	0	TTCCTTTTGCTGGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLAAFASSSLLKSTKPNPLDEPVSRSVTILARTDPSNDSFNVSSVVSSDRPLTNRVLDGWLLALGDPLDPCNSNLIALPSISLLLQEFKASLASSNEANSINAYPLDLPFWFWGTLIAVAFSNTS	56152	62232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_56631_56979_57197_57597_57727_58458_58590_58804_58930_59407_59567_59985_60111_60991_61124_61556_61695_61891_61983_62069
877289	contig_5643_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_39139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAGCCGGAAGGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649478	651587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_649500_651600
877290	contig_4769_pilon	-	2348	2	Intergenic	novelGene_117997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1860	2159	885486	885187	FALSE	35	TATCTTTACACGTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGHHIGPRSSGLLALGMVALAEGENAGFSLLVRTKEEAQRACALAEPKSVSECGAVPGVPATANAKFSSLSYPATLSEHQQGARPQPRASANTLFFFS	887429	884997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_885770_885853
877291	contig_8242_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_80206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATATGATGCCACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222995	225302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_223000_225300
877292	contig_8674_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_102911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATAACTTGTTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189508	191433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_189500_191400
877294	contig_10940_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_49303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	873	1202	1057839	1057510	NA	15	CCACCAGCATTCCCCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVILRSERRACGIGLQQVHAAVVQEVGCALGRWLHHLVLGDHLDRLVVDAEPAVQTDLEDVCCVMATCRTVPVMVDHCKRGQGRDQRRGAAHTNVLQAPTGLPPKTKR	1058711	1056391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_1056400_1058700
877295	contig_5033_pilon	-	859	2	Intergenic	novelGene_29090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	325	351	707158	707132	TRUE	5	TTTCCACTTGGTGGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKTLTRSSLENWLLQASVPILSPLSSPYPRSPSFGDLPALPAFGGGVGGVVPNRTGLPWGESPSLLLSFTVQGLSGNQPDSQLKQARLWEGVTQGWRGLYGSGPDHDLMLASLSTI	707482	697276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_697293_706639
877296	contig_5779_pilon	+	5338	14	Intergenic	novelGene_106493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCGCAGCGCTCGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182494	358756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_186494_192963_193120_193833_193935_195522_195632_195921_195981_197652_197805_197995_198073_225515_225626_226484_226602_227920_228045_232245_232317_349588_349632_357794_357867_358608
877297	contig_16103_pilon	+	1635	2	Intergenic	novelGene_118764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444802	446862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_445169_445593
877298	contig_11720_pilon	-	3402	7	Intergenic	novelGene_44038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_6	47.6783202537822	7	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1104	3312	91	3402	492981	478714	FALSE	30	CCCAGATCAGACTCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPVFDSQPANSTGEMDGLCSELLLIPQPLSNCGILEPVQSPCPSGNPTPLPTDPSCLLVEATATEEGAGNMEIIVEAVAGNLSPDAPGDAQGVLVKVVEVYFCERCEQSFAEPTLLALHQCPEALVQPVQGLSSSPCSLELPPSNLTLPVPLQGRSPPDSPLPCPVCRQEFAQPQALKSHFKIHRGSPDTFSCPESGCVFSSEDRKGLQHHLRQSHKTVPVPCSFRGCPLLFGSQQSMELHRQAHYPFHCSRCSFMGSNVKLFQQHQRSHGAGTQRELSAVQGRPSQELLRAPKLPPGEGEPSEEASAPLPGQESVEEEEVEEEEKSGSQKDSQKALEKGQGAQHLEGEVASGTESLFKTHMCPECKRCFKKRTHLVEHLHLHFPDPSLQCPNCQKFFTSKSKLKTHLLRELGEKAHRCPLCHYSAVERNALNRHMASMHEDISNFYSDTYTCPVCREEFNLSQALKEHLKSHTAAAAAEPLPLHCFQEGCSYAAPDRKAFVKHLKEAHGVRAVECRHHSCPMLFATAEAMEAHHKSHYAFHCPHCDFACSNKHLFRKHKKQGHPGSEELRCTFCPFATFNPVAYQDHVGKMHAHEKIHQCPECNFATAHKRVLIRHMLLHTGEKPHKCELCDFKCRDVSYLSKHMLTHSNAKDYMCTECGYVTKWKHYLSVHMRKHAGDLRYQCNQCSYRCHRADQLNSHKLRHQGKSLMCEVCAFACKRKYELQKHMASQHRPGIPAPLYPCRYCSYQSRHKQALLSHENCKHTRLREFHCALCDYRTFSNTTLFFHKRKAHGYVPGDQVWQLRYASQEPEGSRQFPTPSPDSEPLNQLSAQPEGLGLDSGTVVDPSLGQALPETSEEDGAGKQDGREAPQGDDLVGSPSPAEVDEGSCTLHLEALGVELESVAEPPPEDITESTPVELRPLGPSGPLGLEGPDGTLTELSSFEGVGPSGLGAEEEPILEKPVPEAPRCPPFSEEPPNSWVGIFKATPPAETAPLPQFPESESLLKALRRQDKEQAEALVLEGRVQMVVIQGEGQAFRCPHCPFITRREKALSLHSRTGCQGRREPLLCPECGASFKQQRGLSTHLLKKCPVLLRKNKGL	494691	478713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_479975_480717_480896_485409_486235_487164_487333_488396_488997_492701_493016_494635
877299	contig_9945_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_104822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCGGTTTGACTTACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125937	124391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_124400_125900
877300	contig_6837_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_149817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAGATTGATTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11613	13225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11600_13200
877301	contig_4305_pilon	-	414	4	Intergenic	novelGene_136678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	681.361545404168	551	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514706	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513111_513201_513298_513934_514044_514648
877302	contig_6488_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_44727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48473	50518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_48500_50500
877303	contig_19730_pilon	+	2164	21	Intergenic	novelGene_142490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAAAGACAGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125447	176027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_+_125539_126912_127035_127352_127538_127958_128100_129432_129482_129577_129678_129954_130123_132678_132780_134662_134744_134878_134946_135059_135152_135686_135777_137003_137083_142770_142842_146275_146344_152133_152308_155556_155682_159327_159394_163465_163596_164441_164506_175927
877304	contig_3426_pilon	-	1486	5	Intergenic	novelGene_57988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	37.4866642954531	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	20	589	701545	677606	FALSE	80	TTAAAAAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQPDLTMVRKIGCYAAMKKKIYAMGGGSYGKLFESVECYDPRTQQWTAICPLKERRFGAVACGVAMELYVFGGVRSREDIQGGEMVTCKSEFYHDEFKRWIYLNDQNLCIPASSSFVYGAVPIGASIYVIGDLDTGTNYDYVREFKRSTGTWHHTKPLLPSDLRRTGCAALRIANCKLFRLQLQQGLFRIRVHSP	701564	676708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_677788_677874_677985_698504_698634_700458_700596_701533
877305	contig_1154_pilon	-	2613	5	Intergenic	novelGene_87032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	547	junction_1	298.869954997153	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	929	1369	43075	34336	FALSE	45	TAAAATAAAATTTCCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAVIVCLGGILPFGSIFIEMYFIFTSFWAYKIYYVYGFMMLVLVILCIVTVCVTIVCTYFLLNAEDYRWQWTSFLSAASTAIYVYMYSFYYYFFKTKMYGLFQTSFYFGYMAVFSTALGIMCGAIGYMGTSAFVRKIYTNVKID	44003	33091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_34404_38846_38924_39049_39134_39653_39801_43010
877306	contig_16930_pilon	-	3549	1	Intergenic	novelGene_139137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTAATTTTCATGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13492	9943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_9900_13500
877307	contig_4232_pilon	-	2548	18	Intergenic	novelGene_63260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	54.1435360070755	155	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	296	2416	440776	429751	FALSE	15	ATTTCACACCCCCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFARDPVRDFPFELIPEPAEGSPPGLWALHRGRKKATGSPVSIFVYDVKPGADEQTQVAKAAFKRLKTLRHPNILAYIDGLETDKCLHIVTEAVTPLGMYLKAQVEAGGLKELELSWGLHQIVKALSFLVNDCSLIHNNVCMAAVFVDRAGEWKLGGLDYMYSAQGDGGGPPHKGFPELEQYDPPEVADGSGRAIGEKWSADMWRLGCLIWEVFNGPLQRASALRNPGKIPKSLVPHYCELVGANPKVRPNPAHFLQNCRAPGGFMNNRFVETNLFLEEIQIKEPAEKQKFFQELSKSLDAFPEDFCRHKVLPQLLTAFEFGSAGAVVLTPLFKVGKFLSAEEYQQKIIPVVVKMFSSTDRAMRIRLLQQMEQFIQYLDEPTVNSQIFPHVVHGFLDTNPAIREQTVKSMLLLAPKLNEANLNVELMKHFARLQAKDDQGPIRCNTTVCLGKIGSYLSANTRHRVLTSAFSRATKDPFAPSRVAGVLGFAATHNLYSMSDCAHKILPVLCSLTMDPEKSVRDQTFKAIRSFLSKLESVSDDPTQLAEVEKDVHAASSPGMGGAAASWAGWAVTGVSSLTSKLIRAHPTAAPAETNAPQRPMPEGLPAPAPTPVPAAPTTSGHWETQEEDRDTAEDGSSADKWDDEDWGSLEQEATSVLAQQDEWSTGGQAGRAGQAANTDHKSPDSDWSNWEAEGSWEQGWQEPSAPEPPPEGTRLASEYNWGAPEPSDKGDPFAGLTTRREMGAQLRLDSWGDHNWEALDTDRQAKAELARKKREERRREMEAKRAERKVAKGPMKLGARKLD	441605	429618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_429876_429990_430043_430126_430340_430421_430494_431005_431149_431387_431553_431827_431904_431998_432188_432712_432869_435359_435474_436242_436351_437203_437363_439637_439794_439883_439975_440395_440623_440701_440825_441022_441164_441499
877308	contig_15410_pilon	+	1818	3	Intergenic	novelGene_130615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	910.5	57	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	145	351	145617	146849	TRUE	40	TCAATGTGGATAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGDSLPSSPWGSFPVRRQALRLGVQRPQTRGQASRSPASPGTPVHAMADSERLSAPGCWIACTNFLRSRKGILLFAEIPREASKFETPSALGAYQGPLSGVIPPDIVPGDYDLL	145472	148545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145713_146738_147842_148070
877309	contig_3181_pilon	-	2575	13	Intergenic	novelGene_136926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGCGCGCCCCCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309482	266734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_267107_280197_280338_280745_280978_283489_283570_283964_284084_286901_286980_298283_298431_300059_300202_301734_301877_305386_305557_307564_307747_308052_308276_308934
877310	contig_9177_pilon	+	2044	9	Intergenic	novelGene_32639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	53.2863725543408	88	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	262	1437	50312	53454	FALSE	15	CTTTTTAGTCTGATGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAARSLSRRTRPSRIGRRVPLAGVRGTLRPGSGPWEGDPRRPDRRAPSGPAIRRFRPEGAQSGCRREVPPLPRRRRQGFRRSDSGAAMIEVVAELSRGPVFLAGEALECMVTVTNPLPPTATSACSEALAWASAQIHCQFHASESRVALPPPDSSQPDVQPESQTVFLPHRGERGQCILSTPPKILFCDLRLEPGESKSYSYSEVLPIEGPPSFRGQSVKYVYKLTIGCQRVNSPITLLRVPLRVLVLTGLQDVRFPQDEAVAPSSPFLEEDEGGKKDSWLAELAGERLMAATSCRSLHLYNISDGRGKVGTFGIFKSVYRLGEDVVGTLNLGEGTVACLQFSVSLQTEERVQPEYQRRRGTGGVPSVSHVTHARHQESCLHTTRTSFSLPIPLSSTPGFCTAIVSLKWRLHFEFVTSREPGLVLLPPMEQPEPATWTGPEQVPVDTFSWDLPIKVLPTSPTLASYAAPGPSTSTITI	49628	54061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_49871_50292_50428_50800_50938_51231_51316_51415_51566_51829_51977_52188_52317_52532_52723_53230
877311	contig_5050_pilon	-	1144	9	Intergenic	novelGene_110237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	19.8871818013513	19	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	233	850	29111	13345	FALSE	70	AAAAAAAAAAATCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVISNGLLLIGTGTSVRLSPELAQALKVMVEISETQPLTQRERLHVSAVETFAKGNLPKACDFWEQILRDHPTDMLALKFSHDTYFYLGYQEQMRDSVARVYPFWTPDVPLSSYVKGIYSFGLMETNFYDQAEKLAKEALSINPTDAWSVHTIAHIHEMKAEIKDGVEFMQGSESNWKDRDMLACHNYWHWALYLIEKPLTDL	33446	13050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_13363_13601_13662_17712_17833_22169_22246_28222_28397_28941_29114_30025_30112_32193_32272_33380
877312	contig_11378_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_112301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAATAGCTGACCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045010	1042827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1042800_1045000
877313	contig_5279_pilon	+	4403	1	Intergenic	novelGene_105574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGGAGCTCCTCGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389269	393672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_389300_393700
877314	contig_12078_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_74130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTTCATTCTACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665121	667239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_665100_667200
877315	contig_253_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_129760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	22	69	365	433	716461	716393	NA	15	TGCAAGGTGTGCATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEAARAEGSLGAWAALCSAGSLQGSSRAALPRCSGRFQNVQVKRDFPEADSLTPSAQLLIQKTKQRRWGNFNQEPRQLLSDETQGQAGGRQPFLVWGVVCDCGGCVSAKRRKNCLLGWSRTMLCDFWWSSRHCTCSSPGGMCF	716825	714130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_714100_716800
877316	contig_9694_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_177823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCCACTGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41289	42890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9694_pilon_+_41300_42900
877317	contig_15350_pilon	+	2293	2	Intergenic	novelGene_164261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1403	1810	254333	254740	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRIRAAIKFRSTLSSSIICKTFTVLAEYLSELNRHNKTRGKDYVVYYDKVSCDLNCYKILILNSTCNWGNILWREENHWVIAFESQTAPFSWSTRCAVLQLNMHKDNPCFGLVVQPLGSHFQTHYTYLLRSSLT	252930	259214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_254858_258848
877318	contig_13014_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_169329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCAGTCTTTTCCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297584	295688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_295700_297600
877319	contig_17108_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_109524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAGGTAAATACATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56384	55024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_55000_56400
877320	contig_12299_pilon	-	3378	9	Intergenic	novelGene_29755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	11.9157196593408	25	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	103	1962	569547	533671	FALSE	20	TGGCCCAGCAGCAGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQHTVALTVTTLLGVAVGGFVLWKGIQRRRSKTSCVTQQQQKGPGSRELPPPEEIQLHSSAPRASWEERILEAKVVTVSQEEEWDQIQPLLKSELEDFPVLGFDCEWVNLEGRISPLSLLQMASPSGLCVLVRLPKLIHGGKTLPRTLLDILADGTILKVGVGCSEDASKLLQDYGLVVKGYLDLRYLAVRQRNNLLCNGLSLKSLAETVLNFPLDKSLLLRCSNWDAENLTEDQVIYAARDAQISVALFLHLLGYPFSRNSTLEENSGCTGWREVLEKCQDVVDIPFRSKGIIRLGEDINGEATESHQKSRNKKSKMDAMVPGSQQGRDPRKHKRKPLGVGYSARKSPLYDNCFLHAPDGQPLCTCDRRKAQWYLDKGIGELVSEEPFVVKLQFEPAGRPESPGDYYLMVKENLCVVCGKRDSYIRKNVIPHEYRKHFPIEMKDHNSHDVLLLCTSCHAISNYYDNHLKQQLAKEYRAPTGSEEGLRLLEDPERRQVRSGARALLNAESLPADRKEELLQALREFYNTDMVTDEMLQEAASLETRISNDNYVPHGLKVVQCHSEGGLRSLMQLERRWRQHFLDTMQPRHLPQQWSVDHNHEKLLRKYGEDLLIKLS	581739	532254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_533888_536009_536367_537919_538056_538304_538412_539563_539896_545408_545536_551684_551942_569220_569594_581683
877321	contig_11281_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_125482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCGAGTCGATTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881173	883583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_881200_883600
877322	contig_16067_pilon	+	2100	2	Intergenic	novelGene_169847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	598	junction_1	0	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	661	1044	66573	68410	FALSE	30	TTTTTTAAGAGTTTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRKELNALIGLAGDSRRKKPKKGSGHRLLRTEPPDSDSESSSEEEEEFGVVGNCSRFVKGDYLRCCKICYPLCAFVILAACVVACVGLVWMQIALKEDLDALKEKFRTSKWLLFSECNIGIFSRF	65912	69466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_+_66755_68208
877323	contig_16122_pilon	-	3014	1	Intergenic	novelGene_134566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1849	2202	556985	556632	NA	35	CCCAGCAGTCTGGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEHLIVLMKNLYLDQEAVVQTEQGDTAWFKVKKGVHQGCILSPYLLNLYAEQIIQKVGLYEEERGIRIGGRPINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKHLLMKIKDHSLSVDYTST	558833	555819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_555800_558800
877324	contig_9673_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_119170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGCTGCACTGTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145196	146304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_145200_146300
877325	contig_16071_pilon	-	3513	17	Intergenic	novelGene_166001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_11	45.6725779324969	124	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	835	3231	83022	67547	FALSE	15	AATTTTTGGTTGTCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFVRLQGASSKDSDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKDEWKGRTAALCENDNEDKASGESSSEPMPTGRVVGILQKNWRDYVVTFPAKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAEALQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIRDLEGEIATILVENSISVVPFSEAQMCEMPVNTPENPWKVSPEEERERKDLRRTHLVFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSILSADLCSLLGGVDRYAVSVMWELDKITYEIKKVWYGRTIIRSAYQLFYEAAQELLDGNVSIIEDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHIRAKRDRCGALELEGVEIHVQLDEKKNIHDLISKQPLEVHEMVAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFLELRECAKAKGFSIDTRSNKTLADSLGNAHDPSDPVVNRLLRSMATQAMSNALYVSTGSGAEAEFYHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIEENLFSNKDLEELCRHINNRNRAAQHSQKQSTELFQCMYFKDRDPETEERCISDGVIYSIRTNGVLVFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVLSCGPDSRSEWKPGSLQRFQNKITSATTGGDSLTFHLFDHVTVRISVQTSRCHSDTIRLEIISNKPYMIPNTELSHQSPLLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQDVKVNTIQEEYQEYCQTKGRSLYMLLEEIRDLALLDVSDDHGT	97627	67264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_67856_68115_68291_68847_68994_70475_70655_70757_70913_72702_73237_74986_75080_75620_75869_78382_78545_79653_79824_81883_82064_82976_83056_85337_85516_88672_88809_91970_92100_95476_95631_97423
877326	contig_5928_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_40381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGAGCGTAGGGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290477	291718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_290500_291700
877327	contig_15629_pilon	-	2633	2	Intergenic	novelGene_122445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93375	90650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_91694_91785
877328	contig_7622_pilon	+	1176	6	Intergenic	novelGene_132407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	94.6078220867598	954	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	136	486	252116	256445	FALSE	30	GGTTATTTTTGACATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTVVAVGLTIAAAGFAGRYVLRAMKHVEPQVKQVFQSLPKSAFSGGYYRGGFEPKMTKREAALILGVSPTANKGKIRDAHRRIMLLNHPDKGGSPYIAAKINEAKDLLEGQAKK	251980	257135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252974_253027_253105_253180_254141_254222_255063_255135_256374
877329	contig_3424_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_55555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	337	1011	485	1495	376941	377951	NA	15	TATGCATTCTCCTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWSRQLRYFQCRKKVRPIQKTWIQDESLFAKTKSNVAAPNVSTFSSKVKRKGTEQFVSSSRTILELQSEKLLSLAKNSDHEYGGERSLLKAGADLPANSVLGQASGRRPRTEPHASDFPMKFNGESQNPGESGTIVVTLSSHKRKRFCYGCCQGLEHHRNGGPLIPKKFQLNQHRRIKVSPLMMYEKLSMIRFRYRILRSQHLRTKRKICKQKKSQQSWVQKVTGDYQETFRENCEGGSCSLFPSPEPKDSSCRHPPYFPDMDSDAVVKEKNSPAPDGHSKGSPFLGKELSLGEAFPDQQNGSATYTWDQSSSSSPKWECTELIHGTPLPEHHSSNVFISETERDSMTLGQDSQTSDVDDGRVKLSVSGADKSLGCMDGPVSEETVQNESSYQMEEDGSLKQNILSSKLLDHPYCKSPLEAPLMCGGLKLENQVGGGKNGQKASPVDDEQLAVCLS	376456	377953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_376500_378000
877330	contig_12080_pilon	-	2555	4	Intergenic	novelGene_128388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.79271573232759	112	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGACCATGTGTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184761	180063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_182384_182523_182580_183412_183501_184670
877331	contig_14925_pilon	-	1678	5	Intergenic	novelGene_55262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	77	490	116065	114666	TRUE	10	CTTTGGCTTGATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129477	112089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
877332	contig_1348_pilon	+	3935	7	Intergenic	novelGene_174368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.45969605341988	58	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	47	796	499853	512224	FALSE	45	GAATAAACTCAATTTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRKIGTVAGARSGDRMLTRSVVAKATALRPDSEVLSYKMIEDELGQFDKSINEFWNKFINTVSDTSCQMVGLRDAYKDSMKAFAEKLSVKLKEEDRMIEMFLEYQNQICRQNKLIQEKKDNLLKSVAEVKCKKQEIEVLAANIQALKEEYAKKKETISTANKAIEERLKRLQKSEDLYKSRLGLEIRKIYGDKLQFIFTNIDPKHPESPFVFSLHLNEARDYEVLDSSPHLECLAEFQENLRKTNNFSAFLANVRKAFMAMVYN	499806	515363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_+_499908_500543_500697_500798_500865_505040_505188_506224_506330_509969_510069_512099
877333	contig_2380_pilon	-	3809	5	Intergenic	novelGene_117887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_4	9.5524865872714	171	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	4	1098	98174	94095	FALSE	50	AATTTAATTCAGCAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMQALSSQKREAHNRSPVSFREGRRASDTSLTQGIVAFRQHLQNLARTKGILELNKVQLLYEQIGSEADPNLASAAPQLQDLAGSCPQEEVSQQQESVSGLPNSMHPQLARRQSLETQYLQHRLQKPSLLSKTQNTCQLYCKEPPRSLEQQLQEHRLQQKRLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPHQESPPPPQQPPPFSLAQPLSPVLEPSSEQMQYSPFLRQYQEMQLQPLPSAPGPRAPPPLPTQLQQQQPPPPPPPPPQQPGAAPPPLPFSYQTCELPSAASPEPDYPTPCQYSMDGAQPSGIAVPDCPRSSGLQEAPSSYDRLALSELPGLFDCEMLEAVDPQHSGYVLVN	98177	91383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_94726_95941_96034_96954_97066_97769_97934_98077
877334	contig_10734_pilon	+	2491	3	Intergenic	novelGene_51379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	37	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	53	331	1876147	1878803	FALSE	35	TAAAGAGACTGTGTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDIYEGQWLNDKHHGEGMLRLKNGNRYEGYWQRGMKNGPGRFFHLDHGQLFEGFWVDSVAKCGTMIDFGRDEAPEPTQFPIPQVKILDPDGVLEEALAMFKKTEEEGGD	1876094	1880963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1876160_1878343_1878529_1878722
877335	contig_19727_pilon	-	2917	1	Intergenic	novelGene_169004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAACTTCTTTTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35109	32192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_32200_35100
877336	contig_6365_pilon	-	1134	5	Intergenic	novelGene_133996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	75.7805219037188	290	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	232	825	12349	10077	FALSE	25	CTATGAGTTCCAAGGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKVAKKIKEKTKTPRKSSNQGRSCPVTSTTATQEGQKRKNTVKEKPVTKKQKVSQEQSQPPCPSGASTSATMDHPSPPQISSSSSSFISLTEEESERDAASTPVQENTAV	17672	9767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_10134_10366_10535_11092_11194_12081_12368_17459
877337	contig_11396_pilon	-	1345	10	Intergenic	novelGene_71315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	358	1344	468227	441755	FALSE	20	CCGCGGCGCCCAAGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSSWWNSWMTSSSSPASFSPRQKANVSSPMDVVQSPGSSQVSIVMVAGEPFTSAAAGVSGIYSADVGLLRDTRAPDRSILVLRQVLEQTLSCWKKSSSPESMIFLSMMPFMRMARFQSFRVDLPARWTNSFGLMTCSSYWTHFTLMPGHTNFLQIRLALLSPQVMGYTTSASRLSSSSATFTKTASLSCEEAVKAAAAAAAAFSVSMLSSVRSPPCGARLVVTSTVFTSSTPSPAVSGVVTTTTSSMCTLTSGVAMAQPKRTPGDRGATPPGSQVQGLRINSADINESISRQDDTAFRTAPQPSAAGRASRGWQGRPRPAAHLPPA	470190	441753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_441907_453231_453415_459306_459404_460468_460597_464819_464924_465821_465981_467960_468032_468134_468273_468443_468567_470001
877338	contig_6496_pilon	+	3017	1	Intergenic	novelGene_103509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTATAATTGTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735096	738113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_735100_738100
877339	contig_8415_pilon	+	1971	14	Intergenic	novelGene_141687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_4	54.5849319217255	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1794	178	1971	149448	177365	FALSE	30	GACCTTAATAACCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPSTPSPIESTKSFSVQPDKESGNTNDTGFSDDFSLFESQERCEEELLQLLTNILNYVMCKGLEKSDDDTWIERGQVFSALTKPGISSELLRPSDEIKLILLQKMLECAVLENREAKTNPGTAKNAFQLMLIIQDFLQSEGLVNSNMWTEKLLEDIMLLFDCLSIWYSESPKLMELSQIQIQLLLGFIGKGNLQVCAMASAKLNTLLQTKVIENQKEACYILGKLENVLSQSIKEQTEIYSFLIPLVRTLVSKIYELLFMNLHLPSLPLTNGSSSFFEDFQEYCSSNEWQVYVEKYIVPYMKQYESSTFYDGREKMALYWKDCYEALMVNMHKRDREGGESKLKFKESFVEPFNRKARQENLRYNNMLKQLNSQWLATLRHWKAIQLYLTCERGPWAERKQNPIHWKLANVENYSRMRLKLVPNYNFRTHEEASALRDNLGIQHSQPSSDSLLLEVVKQVKVNDMEEDKLDLPEDDITARVNIDEKEEQDQKEKLVLTEDCELITIIDVIPGRFEITTQHIYFYDGSVEKEDGAGFDFKWPHSQVREIHLRRYNLRRSALEIFHVDQSNYFLNFKKEVRNRVYSRLLSLHSPNSYGTRSPQEVFKASGLTQKWVNREISNFDYLIQINTMAGRTYNDLAQYPVFPWILQDYTSEEL	148919	177365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_149046_149396_149573_150393_150548_150833_150963_153123_153430_153522_153673_159869_160028_162372_162498_166295_166423_171983_172133_172761_172896_175110_175213_176640_176737_177326
877340	contig_19469_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_134999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAAAGTTGTTCGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135613	133634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_133600_135600
877341	contig_2646_pilon	-	974	1	Intergenic	novelGene_69566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	499	843	876775	876431	NA	65	AAAAAAAAAACCAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLVKEGAREGWSLGRPMMVGSLMSESKWLLIANQAVSYSAGFMLKAKRGRNTVFVVVYCLQSRFPSVTVGQLGQLKRSEIHSLPKGFDCKYCSLSTRRQQLSCSETAVKHYV	877273	876299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_876300_877300
877342	contig_10475_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_148723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATTCCGGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32250	30769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_30800_32200
877343	contig_1337_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_84262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576323	577576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_576300_577600
877344	contig_14142_pilon	+	2157	10	Intergenic	novelGene_120618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	7.6658614714046	55	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	96	1403	612831	616313	FALSE	10	GGACCCGTCACCCGGCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSPSLDTGSEGEEDEETEERGLGGQNQVAIMPTALEFLENHGKNILLSNGNRTATRVASYNQGIVVINQPLVPQLLVQVRIDFLNRQWTSSLVLGVITCPPERLNFPASACALKRAVWLLRGRGVFHNGLKIFEKFGPNLDTCPEGTILGLRLDSSGGLHLHVNGVDQGVAVTDVPQPCHALVDLYGQCEQVTIVSPEPGAATGKGAATQGDMEKADMVDGIKESVCWGPPPAASPLKSCEYHALCSRFQELLLLPEDYFVPPPKRSLCYCESCRKLRGDEAHRRRGEPPQEYALPFGWCRFNLRVNPHLEAGTLTKKWHMAYHGSNVAAVRRVLDRGELGAGTASILSCRPLKGEPGVGFEEPGENCAPPREEQPPPVLLSPSLQYAGAETLASKVQFRDPKSQRTHQAQVAFQVCVRPGSYTPGPPSAALQEPPDPHFRPAELEWVTKEKGATLLYALLVRVE	612553	617067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_612628_612809_612975_613539_613699_614039_614220_614346_614435_614528_614637_614786_614932_615090_615204_615292_615459_616108
877345	contig_3832_pilon	-	1213	1	Intergenic	novelGene_161418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAACCCATGCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7690	6477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_6500_7700
877346	contig_13292_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_142958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	437	769	378730	379062	NA	75	CAAGAAAGAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFLQTFPVSFALESNATYGSRDSRISFMRKNQQNYMHHWNLTQEYSRFHAHLLLPNENARSPASLLGPLPDISEREIMIFDILTTYPTFLHPVASPSIFFCPFHSPPQ	378293	380066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_378300_380100
877347	contig_3382_pilon	-	2584	1	Intergenic	novelGene_124040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGAACTGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194106	191522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_191500_194100
877348	contig_17158_pilon	-	1052	1	Intergenic	novelGene_141151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGTTTTGTGTCTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165043	163991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_164000_165000
877349	contig_16110_pilon	-	2636	5	Intergenic	novelGene_126766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGAGAAAATACATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34918	6055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_6193_7704_7767_9528_9613_14411_14537_32690
877350	contig_10444_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_139470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACTTCCTGGAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887293	885855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_885900_887300
877351	contig_18822_pilon	-	2731	1	Intergenic	novelGene_111728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145475	142744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_142700_145500
877352	contig_6544_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_142081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAGAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72565	70947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_70900_72600
877353	contig_5894_pilon	+	2665	9	Intergenic	novelGene_83066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	11.9765395670035	21	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	89	1189	778713	872699	FALSE	40	GGTGAACAAACGTGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVRNIASICNMGTNASALEKDIGPEQFPINEHYFGLVNFGNTCYCNSVLQALYFCRPFRENVLAYKAQQKKKENLLTCLADLFHSIATQKKKVGVIPPKKFISRLRKENDLFDNYMQQDAHEFLNYLLNTIADILQEEKKQEKQNGKLKNGNMNEPAENNKPELTWVHEIFQGTLTNETRCLNCETVSSKDEDFLDLSVDVEQNTSITHCLRDFSNTETLCSEQKYYCETCCSKQEAQKRMRVKKLPMILALHLKRFKYMEQLHRYTKLSYRVVFPLELRLFNTSSDAVNLDRMYDLVAVVVHCGSGPNRGHYITIVKSHGFWLLFDDDIVEKIDAQAIEEFYGLTSDISKNSESGYILFYQSRE	778624	874175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_778749_822171_822253_825104_825319_827070_827301_855081_855159_864981_865066_867637_867836_871623_871703_872597
877354	contig_3081_pilon	+	3283	1	Intergenic	novelGene_133963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTGGTTTACTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138770	1142053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1138800_1142100
877355	contig_10667_pilon	+	2564	8	Intergenic	novelGene_137310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAGTGCTTCATTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47073	68678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_48403_48581_48724_51601_51814_52670_52724_61281_61358_65888_66024_67021_67218_68257
877356	contig_4686_pilon	-	3573	1	Intergenic	novelGene_118565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	665876	665532	NA	30	ATCACATCAACCCCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFLHLKLILFMRKPYLLNSVAFVYCREDLKELVFRMTSNCIVLLSPGTGKGRYFICVDSRPKCISCRTNVPNPKTLMELVCSASKSRLLFSRNYLQNSIFNLLVFVHLKRKNE	665878	662305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_662300_665900
877358	contig_405_pilon	-	1459	8	Intergenic	novelGene_135337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	258	junction_7	29.2379401267795	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	361	897	648285	641296	FALSE	45	AAGAATGGAAGCTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEYLLQNGANVQARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVNLLLRHGADPNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGAEPTIRNTDGRTALDLADPSAKAVLAGEYKKDELLESARSGNEEKMMALLTPLNVNCHASDGRKSTPLHLAAGYNRVKIVQLLLQHGADVHAKDKGDLVPLHNACSYGHYEVTELLVKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRVEVCSLLLSYGADPTLLNCHNKSAIDLAPTPQLKERLAYEFKGHSLLQAAREADVTRIKKHLSLEMVNFKHPQTHETALVW	653024	640733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_641427_642824_643012_645023_645091_647570_647666_648228_648305_648470_648508_650772_650869_652816
877359	contig_10235_pilon	-	2176	3	Intergenic	novelGene_46263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	628	junction_2	113	34	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1333	1653	15042	14481	FALSE	10	CAGTGTGCGTCTGTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYSEY	16374	13957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_14640_14781_14927_15025
877360	contig_15888_pilon	-	986	9	Intergenic	novelGene_84422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1693.47803628361	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	59	568	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259784	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251730_252021_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253470_254018_254066_254198_254282_254527_254685_259659
877361	contig_6738_pilon	-	1248	4	Intergenic	novelGene_166122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTGTAATCCACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39238	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_23478_32604_32761_36544_36701_38327
877363	contig_10864_pilon	+	3440	1	Intergenic	novelGene_107124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTCCCAGCAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181821	1185261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1181800_1185300
877364	contig_7412_pilon	-	1573	8	Intergenic	novelGene_76312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1453.41434742682	5	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	72	1427	377290	364334	FALSE	10	TTTGCCTTTCCATACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRVPSRLRRRLPRQVPADVAAQMASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQCHLSAT	377361	364187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364355_364636_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239
877365	contig_8712_pilon	-	2466	10	Intergenic	novelGene_58863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	65	junction_4	82.7116066615999	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	134	1537	865076	799560	FALSE	20	TGGGAGGTCCCCAGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGRSRSWVGGGHGKSSRNIHSLDHLKYLYHVLTKNTTVTEQNRNLLVETIRSITEILIWGDQNDSSVFDFFLEKNMFVFFLNILRQKSGRYVCVQLLQTLNILFENISHETSLYYLLSNNYVNSIIVHKFDFSDEEIMAYYISFLKTLSLKLNNHTVHFFYNEHTNDFALYTEAIKFFNHPESMVRIAVRTITLNVYKVDNQAMLHYIRDKTAVPYFSNLVWFIGSHVIELDNCVQTDEEHRNRGKLSDLVAEHLDHLHYLNDILIINCEFLNDVLTDHLLNRLFLPLYVYSLENQDKGGERPKISLPVSLYLLSQVFLIIHHAPLVNSLAEVILNGDPSEMHAKTEQDVQRTSAKPSIRCFIKPTETLERSLEMNKHKGKRRVQKRPNYKNVGEEEDEEKGPTEDAQEDAEKAKGTEGGSKGIKTSGESEGECARERRPCRPVGSEAAFPVFSILTSGPLLCVHS	865209	798630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_799899_822386_822501_825907_825962_828071_828247_831436_831561_833408_833515_837505_837655_841769_841904_848875_849005_864996
877366	contig_7549_pilon	+	1069	4	Intergenic	novelGene_164520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	5.71547606649408	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	196	474	701734	702012	TRUE	50	CCAATGTCATAAAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCEVVTLQFCSLVTAGVWSAVPVSRRPEGRGDARSGARTRAELRPGRPQAGWSDSLFWKLNQWLMIHMFHCRMILTYHMWWVCFWHWDGLINSLYLPHFILFLVGLALLTLIINPYWTHKKTQQLLNPVDWNFAQPEAKSCQPERTNGQIPQKKKQ	679576	765553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_679727_701688_702110_764176_764382_765260
877367	contig_10734_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_51113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGGTCTCTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734975	736657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_735000_736700
877368	contig_8309_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_176436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAATTACTATTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18008	19781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8309_pilon_+_18000_19800
877369	contig_11898_pilon	-	3640	1	Intergenic	novelGene_144284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2992	3315	222623	222300	NA	30	CGATTCGATGGCATCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNTTKPFPAACKNAAVAPPSRGERQRRSELSPPSEVSLSSCLSPGPEGQSRGNCYSLRLSGSSAESPHLQIPLMSVSRAKGPERARLNFFHGAVLPVLGQMLLLNH	225614	221974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_222000_225600
877370	contig_16907_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_87476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	2	397	520820	521215	NA	20	TCTTTCCAAACGATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTLLKLIPITFNYHKAYFKIKFIFFKFLTFFDAFPDHSSSRFTHSFNIRHLLYARNCYKVPRTQNCLIIQILASRTRNLLGDRRETNNLLGDRHETDLSSNPDPTSGWTVDKEKQTTTDRGFHEFTACNV	520818	522774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_520800_522800
877371	contig_4923_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_109330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	470150	470545	NA	85	CAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEVLPVDIGAEGYSRSPKNGKFIIPPVDYLPDNRKWSEVSYTYRPEIQEQSWHQDANRSHLSNLPKYSAFQHVTFQDHNLPAVSVDSPVRYRTSPALEDANPSRFQYSGPSPPAYHYRNRDGLSIQESVLL	470149	471799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_+_470100_471800
877372	contig_6199_pilon	+	2354	2	Intergenic	novelGene_126417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGCACATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712881	715274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_714303_714341
877373	contig_1037_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_84598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGTGGGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206704	204375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_204400_206700
877375	contig_6870_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_104003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGATCCAAAACCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534168	1536570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1534200_1536600
877376	contig_14744_pilon	+	2768	1	Intergenic	novelGene_65937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	568	918	189000	189350	NA	35	AAGTTATTTTGGATATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLVDFISHELNLKCPKTINMKMSNRHLKYEKISGLQIQGTDYAWKVEFITIAVNSFTMRIRGYQLYCLDMFAVVGLAKSTFTFEAIFFSLNGFIKFLQYDVNLIFPVSTITQNF	188432	191200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_188400_191200
877377	contig_9373_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_162710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTGACTTTGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143815	145948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_143800_145900
877378	contig_20398_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_155195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	127	486	39776	40135	NA	30	CAGCCCAGCACTTTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKKAAGKDKPSDRTVQTKGKRGAKGKHAAVANIETKGLPAENGETKNEESPASDEAGEKETQSDSWLSTASYQCSPYLPSCTIQRHSFVNEFVNGKFFSSSRRILKEEIPPPPIFQV	39649	41913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_39600_41900
877379	contig_8453_pilon	-	4302	1	Intergenic	novelGene_125120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCATTTAATATAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172923	168621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_168600_172900
877380	contig_4305_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_136646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTAAATGTAAGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38375	37200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_37200_38400
877381	contig_14357_pilon	+	2015	10	Intergenic	novelGene_121710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	261.044908865207	135	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	55	1452	843871	880336	FALSE	55	CTTAAAAAAAAATTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICITRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDENLPVGTPRCNLKENLLKDNCAPESIEFPISEARILEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLQSIQSLGTNLASQMRKLTSNLRIGFGAFVDKPMSPYMYISPPEALKNPCHYMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQNVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHIGSDNLYSASTTLDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTEGLVSLYQNYSELIPGTTVGVLSTDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCVGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLTIQVTFDCDCACQARAELYSPRCNNGNGTFECGVCLCGPGWLGPQCECSVEMTANSRSFRT	843816	880899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_843895_853579_853776_854667_854921_856155_856319_856912_857075_858813_858910_859316_859407_860724_860860_862160_862401_880297
877382	contig_9730_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_150634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTGACATGCACACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465021	466504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_+_465000_466500
877383	contig_16897_pilon	-	2376	5	Intergenic	novelGene_174458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	2	junction_1	58.1823641664723	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	20	457	156559	154248	FALSE	80	CAATAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRNSAMVGGGGGMAGGPLENANPLIYERSGERPVTAGEEDEQVPDSIDAREIFDLIRSINDPEHPLTLEELNVVEQVRVQVSDPESTVAVAFTPTIPHCSMATLIGLSIKVKLLRSLPQRFKMDVHITPGTHASEHADVRVSCRDVTLHF	156578	152328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_154289_155273_155320_155804_155931_156176_156255_156412
877384	contig_546_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_117195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATCTTATCTTCATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76573	74634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_74600_76600
877385	contig_14516_pilon	-	3097	1	Intergenic	novelGene_153928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCCACCCTACTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298336	295239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_295200_298300
877386	contig_6902_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_135608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	297	891	1103	1993	514474	515364	NA	35	GTAAGTTTGCAACGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPTKFFKVWNKKNANEKGRNQTSKLPPRFAKKQTTGTQQAQCPASAPNSASAPALAPVPASAPVPSSTSAPIPASALAPVPPSTSAPLLASPSASVPTSASTPAPASTSATATASSSAPVPAPVPIPAPTPILASISAPASVPILASAPTSVPILASAPASVPTLASALVPASSPTPAPTASAPTAPTVSAAAAPASVPTAPVPLAPAPSTPGPSAPAQTQAQTHKTVQNSLQTTTQTSKQPPPLVRLHSAQTPNGVDYVTTGKSIQNSQCHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKK	513371	515365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_513400_515400
877387	contig_6199_pilon	+	1279	3	Intergenic	novelGene_126325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	2	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	122	475	4372	5153	TRUE	35	ATACTAGAACAAGGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPLDDAELAVLEASLRVRAGSAPRRCAQCQLFLPRAPGGMSPRGGRLGAQGCVAPQTSQEGQPATRLVVGQLPAAGPERPGPVGPGIGVHLLLLQALRGELLRAGGNQPPIALVSRDPARGCWWMCRPRAQGRSVYGGSICSQLIQAAFPTAGITG	4250	6148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_4579_5006_5278_5468
877388	contig_2480_pilon	-	1970	6	Intergenic	novelGene_63506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	79.3034677678095	185	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	49	1398	121439	107634	FALSE	20	AGAGTTTGCTAGCCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIRHSLLRRDALSAAKEVLYHLDIYFSSQLQSAPLPIVDKGPVELLEEFVFQVPKERGAQPKRLNSLQELQLLEIMCNYFQEQTKDSVRQIIFSSLFSPQGNKADDGRMSLLGKLVSMAVAVCRIPVLECAASWLQRTPVVYCVRLARALVDDYCCLVPGSVQTLKQTFSASPRFCCQFVTSVTALYDLSSDDLIPPLDLLEMIVNWIFEDPRLILITFLNTPIAANLPIGFLELTPLTGLIRWCVKAPLAYKRKKKPPLANGHLSNKVTKDSGVGLDRDSHLLYSKLHLSILQVLMMLQGHLTEKNLYGRLGLILFDHVVPLVEEINRLADELNPLNASQEIELALDRLAQALQVAMASGALLCTRDDLRTLCSRLPHNNLLQLVISGPVQQSPHTALPPGFYPHIHTPPLGYGAVPAHPAAHPALPTHPGHTFISGMTFPFRPIR	121487	107061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_107836_113221_113262_114553_115082_117768_117935_120441_120664_121247
877389	contig_7730_pilon	-	1084	5	Intergenic	novelGene_156247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	611.200202470516	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	210	815	43591	1964	FALSE	10	CTTATTGTGTTGCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDSFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSYTPSKIRHYFIASQVSYSSIICSILTKVTDLVLLAQILCHVCFLNLIN	43800	1694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2088_2345_2445_4051_4177_7798_7895_43429
877390	contig_18392_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_143094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121604	119790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_119800_121600
877391	contig_5947_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_101557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGAAGCCTGGACAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618032	616481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_616500_618000
877392	contig_10838_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_129161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTTAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46797	49113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_46800_49100
877393	contig_10765_pilon	-	2105	1	Intergenic	novelGene_122938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	26	331	243071	242766	NA	50	GTAAGTTTGAAAGAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGNRTDTFMWLFENAGIRVLESCTRLTDCQLLFLRSINSERLSARLLTRRSAVRTHPVALWKKDLAICSCKDFSLENPMGQFYSVTWGRYESESIYGTSNNGGICQLKN	243096	240991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_241000_243100
877394	contig_6070_pilon	-	1458	5	Intergenic	novelGene_177495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	5.40832691319598	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1305	154	1458	266373	233352	FALSE	20	TCCTTCTCATGGATGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGTDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECLSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILGHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHILLRKGARIERPHDYFCKCSECNQKQKYDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALVLSNELEVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVEMRHNGGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTS	266526	233351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6070_pilon_-_233526_241546_241712_243979_244166_256283_257059_266368
877395	contig_9146_pilon	+	1246	2	Intergenic	novelGene_79509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGACCTCCAGGGGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265872	273362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_265993_272236
877396	contig_8204_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_176987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10035	8734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_-_8700_10000
877397	contig_695_pilon	+	3574	1	Intergenic	novelGene_177171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	456	1371	169	1539	174085	175455	NA	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRFKCCFKYPLQQKVFILFLTLWLFSILKLLNVRRLLFPQRDIYLVEYSLSTSPFVRNRYTHVKYEGRYEVNCSGVYEQEPLEIGKSLEIRRRDIIDLDDEDVVAITSDCEVYQTIRSYHQKLVSREEKRFPIAYSLVVHKDAIMVERLIRAIYNRHNIYCIHYDRKSPDTFKVAMNSLAKCFSNIFIASKLEAVEYAHISRLQADLNCLSDLLKSSVQWKYVINLCGQDFPLKSNFELVSELKKLDGANMLETVKPLNSKKERFTFHHELRHMPYEYVKLPIRTNISKEAPPHNIEIFVGSAYFVLSRAFVKYIFNNSLVKDFFDWSKDTYSPDEHFWATLIRVPGIPGEISRSAQDVSDLQSKTRLVKWNYHEGLFYPSCTGSHLRSVCIYGTAELRWLIKDGHWFANKFDSKVDPVLIKCLAEKLEEQQKEWITLSSEKVFVDQNPTAPSLQ	173916	177490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_+_173900_177500
877398	contig_8896_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_171570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTAGTCTTTCATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21811	19857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_19900_21800
877399	contig_6208_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_53044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGTATGTCTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527629	526130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_526100_527600
877400	contig_12842_pilon	+	1609	8	Intergenic	novelGene_168348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACGGAACAGCGAGCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169894	223192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_170038_171065_171251_172684_173362_175422_175575_176203_176321_182466_182566_201758_201887_223084
877401	contig_18208_pilon	-	446	4	Intergenic	novelGene_176201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_3	1147.65161186757	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	20	445	155993	154427	FALSE	40	CATAAGTTTTGATGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPR	156012	154425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353_155514_155989
877402	contig_7870_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_109048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATTAAGAAAGAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636519	634873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_634900_636500
877403	contig_9389_pilon	-	410	3	Intergenic	novelGene_84054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	103.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGCCTGGATGGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748342	744979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_745152_746766_746919_748256
877404	contig_9653_pilon	+	2067	5	Intergenic	novelGene_48240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	155.978163535798	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	387	986	822860	830443	FALSE	35	TCCAAGGTGTGTTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVIELTKDLLSTQPSETLASSDSFASTQPTHSWKVGDKCMAIWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEGRKAKEDSGNKPMSKKEMLAQQREYKKKKALKKAQRIKELEQEREDQKVKWQQFNNRAYSKNKKGQVKRSIFASPESVTGKVGVGTCGIADKPMTQYQDTSKYNVRHLMPQ	822473	831524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_822863_824979_825123_825716_825879_829205_829360_830305
877405	contig_9177_pilon	-	1590	6	Intergenic	novelGene_32701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	60.0486469456223	14	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	116	1189	496626	479080	FALSE	50	CCAGGGACGTAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSRPACFLALGLALGSEARWQRLELYFKTLSKRKKQVMEKNGNNRKLRVCVATCNRADYSKLAPIMFGIKTEPEFFELDVVVLGSHLIDDYGNTYRMIEQDDFDINTRLHTIVRGEDEAAMVESVGLALVKLPDVLNRLKPDIMIVHGDRFDALALATSAALMNIRILHIEGGEVSGTIDDSIRHAITKLAHYHVCCTRSAEQHLISMCEDHDRILLAGCPSYDKLLSAKNKDYMSIIRMWLGDDVKSKDYIVALQHPVTTDIKHSIKMFELTLDALISFNKRTLVLFPNIDAGSKEMVRVMRKKGIEHHPNFRAVKHVPFDQFIQLVAHAGCMIGNSSCGVREVGAFGTPVINLGTRQIGRETGENVLHVRDADTQDKILQALHLQFGKQYPW	510587	478678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_479172_485371_485585_487893_488047_491911_492364_496462_496669_510514
877406	contig_15264_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_158879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAACTTCCAATTTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142513	141503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_141500_142500
877407	contig_5916_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_158020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTCCAACTGATAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237050	235439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_235400_237000
877408	contig_14414_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_166501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1196	1495	37400	37699	NA	35	AAATAAAAGTTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGGEHKRGPTKPPSLLPLADTSSQVFVLPSLSLKQTEAPVMGLQQALPFFPGKTQIGQERALGSWWTFAQAIVSQISPRKHKEYSFFLTWKSGPRGP	36204	38355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_+_36200_38400
877409	contig_8505_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_173187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36827	39321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_+_36800_39300
877410	contig_9582_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_106832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373888	376579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_374080_374567
877411	contig_16103_pilon	+	2169	4	Intergenic	novelGene_118910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	432.821235872528	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATGAATAATTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766993	775133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767083_771029_771160_772619_772698_773261
877412	contig_5590_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_163026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	77	613	351592	351056	NA	20	GAACTGTGCTCCACAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPCLVPWRRQALPSLRTEKGRAVRSRLQLGGQPHRACPCASRHPETQGRQHLSCRTPSLAPGPGKQGLLHLCLHFQGVLPQCLARAETLSTHRGLTEGAGHWPDAGTRAEAESRESVPWELSSFQKHHLQSECLVEAGSGSPCQGFWKLAGPNPGLKGCWVDALVTGTGGFPTADS	351668	349814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_349800_351700
877413	contig_8636_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_141931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGTGGTACCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394759	396722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_394800_396700
877414	contig_695_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_177166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1212	1556	67843	67499	NA	30	TCCCCCAAGTATACCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSKKEMDTNILVCQICYIYSIASQTSSPEPSDPYVIIPECLNSKSDVTSPNASTVFLFPLIIYKITSRCIPVKMFITKHRYTLCWCVSSTSIGSVLFLGAVNKNRKIKENIL	69054	67253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_-_67300_69100
877415	contig_3081_pilon	-	3538	18	Intergenic	novelGene_133946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_3	19.2051391622715	29	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	920	2763	153	2915	431656	289425	FALSE	15	CTTATGGTGTTTTTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIQNKADVGRLSTSKVTVLGYGLLTTDAKTLIDALNNQNFKVIIVDESHYMKSRNAARSKILLPLVQKARRAILLTGTPALGRPEELFMQIEALFPQKFGTWTDYSKRYCNAHIRYFGKRPQWDCRGASNLNELHQLLSDIMIRRLKTEVLTQLPPKIRQRIPFDLPAAAAKELNTSFEEWERLMRALNSGATETGSPFFQVMGLMTRMFKQTAVAKAGAVKDYIKMMLQNESLKFLVFAHHLSMLQACTEAVIESKTRYVRIDGSVPSSERIHLVNQFQKDPDTRVAILSIQAAGQGLTFTAATHVVFAELYWDPGHIKQAEDRVHRIGQCSSVNIHYLIANGTLDTLMWGMLNRKAQVTGSTLNGRKERLQAEEGEKEKWDFLQFAEAWTPNESSEELKNEVFFTHFEKEKQHDIRSFFLPKLKKRQLMTSCDEPRIFQEKNTVEASDPRKKAASNNTEYESDIEPEAKRLKSVAVQDCCSPPEEKPFQPRQTKAPLMEGAPEAKSQPAAPSLPGKGWQCGFCTYINNSVLPYCEMCENPQGSADSLIQTQGKSKCGKDDSQKDTSREVGTNPDCEKQVRAPSAPELLPENKEEPSEIEREDGLTPQPSNEQLKSSATLPVYDILMFCGSKNTDRIHLYTKDGKPMNCNFIPLDIKLDLWEDLPANFQLKQNRSLILRFVREWSSLTAMKQRIIRKSGQLFCSPILAFEEITKQQTRQNSTKRYITKEDVAAASVDKVKNDGGHVRLITKESRDPSAKKFLGAEACVPFLNPCTAQADLTANPSTSKGYLQAVDNEGNPLCLLCQQPTCQTNQECKVNAWDSRFCSLKCQEEFWIRSNNSYLRAKVFETEHGVCQLCNLNAQELFLRLRDAPKSQRKNLLDITWTSKLSLEQLNEMIRNPVEGHFWQVDHIKPVYSGGGQCSLDNLQTLCTVCHKERTARQAKERSQVRRQSLASKHGSDITRFLVKM	434034	288801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_289524_299845_299978_302949_303353_304247_304353_315995_316139_317721_317824_321959_322052_330806_331005_343658_344074_367665_367819_368603_368784_372021_372142_374509_374630_405471_405607_407054_407227_430032_430119_431548_431781_434006
877416	contig_5083_pilon	-	2777	7	Intergenic	novelGene_151689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCTGGGGCCGCTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252234	1205586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1205644_1210486_1210598_1243823_1243962_1244624_1244754_1246137_1246314_1247856_1247987_1250198
877417	contig_5217_pilon	-	873	6	Intergenic	novelGene_135776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3353.53166676565	2	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATATCTTGTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560393	557644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558360_558430_558674_558851_559273_559583_559825_559966_560368
877418	contig_7049_pilon	+	1014	7	Intergenic	novelGene_171440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	166.213717845429	173	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	53	1012	130398	134484	FALSE	35	CAGGGAGAAGGAGGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPAPPQRRSIISRLFGMSPAAEPAPTPPEPALSTEAPAKVPNVEDFVPEDSLDHSFLEDAAPLKDEKKAPPQDSDSDGEAPGGNPMVAGFQDDVDLEDRPSSRPPPPADPLPSKHVTLSSEEEAEEPTGPPGASVLVPQPCLEPEMKRSSRKTLKPQAEAAPSQAQEPQVPDSSSVPARPALEVPASRVTAPTGGPSRRPEGATAEQAASSESDPEGPIAAQMLSFVMDDPDFESEESDVPWRVNEFPVREDLSDLTEEDTTPAQPAQPPQLPVSPFRPKNDTDLFGLGLGEPGPKDSSDEDKDGKPPSREKKKKKKKKEKEEEGKATRKKNKHKK	130345	134486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_130435_130699_130842_131930_132147_132305_132595_133109_133282_134283_134346_134442
877419	contig_15105_pilon	+	2825	3	Intergenic	novelGene_150967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAATCCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573090	576338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_574279_574327_574388_574761
877420	contig_401_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_42929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCCAGACCTGTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1949997	1952472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1950000_1952500
877421	contig_13461_pilon	+	2133	2	Intergenic	novelGene_146607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_1	0	10	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACCTTTCATCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73541	76776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_+_75030_76131
877422	contig_1335_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_166509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAAGTTGACTACAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346484	344290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_344300_346500
877423	contig_7820_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_159915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAGCTGATAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18725	20624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_+_18700_20600
877424	contig_16970_pilon	+	3467	1	Intergenic	novelGene_157611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAATAAACATGTCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168591	172058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_168600_172100
877425	contig_9091_pilon	-	799	2	Intergenic	novelGene_32416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAAAAGGAAAAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4579	2306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_2417_3890
877426	contig_9571_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_136251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATAAAAAAAAGGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293029	294120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_293000_294100
877428	contig_3068_pilon	+	3248	3	Intergenic	novelGene_137650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	633	junction_2	340.5	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	405758	417626	FALSE	40	TGTAGACAGAATATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAVAQLYKDRVCQQPGLSLWVPFQNAATAVTNLYKESVDTHQRSFDIGIQIGYQRRNKDVLAWVKKRRRTIRREDLISFLCGKVPPPRNSRAPPRLTVVSPNRATSTETSSSVETDLQPFREAIALHGKAV	405757	420475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_405786_406381_406463_417336
877429	contig_5286_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_157360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCAAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549264	546963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_547000_549300
877430	contig_11709_pilon	+	2379	2	Intergenic	novelGene_168222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	42	1688	68683	70329	TRUE	55	GGAAAAAAAAAACTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFRKCLIDIFGILMEYEVGDPSQKALDHTAVRRDESQSLADDSGREEEDAECIDDEDDEEEEDSEKANADEKSSMAFPSPDAAADLKEKPKQASKFDKLPIKIVKKNNLFVVDRSDRLGRVQEFSSGLLHWQLGGGDTTEHIQTHFESKMEIPPRRRPPPALSSAGRKKDQEGKGDAEEQQEKSIIATIDDVLSARPGALPEEAHPGNQAESSKFPFGIHQAKSHRNIKLLEDEPRSRDETPLCTIAHWQDSLAKRCICVSNIVRSLSFVPGNDAEMSKHPGLVLILGKLILLHHEHPERKRAPQTYEKEEDEDKGVACSKDEWWWDCLEVLRDNTLVTLANISGQLDLSAYTESICLPILDGLLHWMVCPSAEAQDPFPTVGPNSVLSPQRLVLETLCKLSIQDNNVDLILATPPFSRQEKFYATLVRYVGDRKNPVCREMSMALLSNLAQGDALAARAIAVQKGSIGNLISFLEDGVTMAQYQQSQHSLMHMQTAPLEPPSVDMMCRAAKALLAMARVDENRSEFLLHEGRLLDISISAVLNSLVASVVCDVLFQIGQL	68641	71611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_70522_71112
877431	contig_6048_pilon	-	2272	9	Intergenic	novelGene_73234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	220.80729013101	1798	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	130	1146	1916833	1896861	FALSE	25	TAGAATTTGTCCTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSALARPAGAALRRSFSTSAQNNAKVAVLGASGGIGQPLSLLLKNSPLVSRLTLYDIAHTPGVAADLSHIETRAAVKGYLGPEQLPDSLKGCDVVVIPAGVPRKPGMTRDDLFNTNATIVATLTAACAQHCPEAMICIIANPVNSTIPITAEVFKKRGVYNPNKIFGVTTLDIVRANTFVAELKGLDPARVNVPVIGGHAGKTIIPLISQCTPKVDFPQDELTALIGRIQEAGTEVVKAKAGAGSATLAMAYAGARFVFSLLDAMNGKEGVIECAFVKSQETDCPYFSTPLVLGKNGIEKNLGIGKISSFEEKMIAEATPELKASIKKGEEFVKNMK	1916962	1895734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1896993_1899063_1899216_1899574_1899675_1900951_1901030_1905862_1905989_1907588_1907699_1908241_1908326_1909922_1910092_1916767
877432	contig_6871_pilon	+	1122	4	Intergenic	novelGene_21672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916950	995192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_917025_967302_967487_990834_991080_994573
877433	contig_17130_pilon	+	2828	1	Intergenic	novelGene_176547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCAAGGTCACACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14106	16934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_+_14100_16900
877434	contig_6397_pilon	-	1637	6	Intergenic	novelGene_146234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_5	19.177069640589	127	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	318	977	281230	272223	FALSE	20	TTTTCTAAAACCCTTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCEDDEEAAAEPVGWNLPLLGQQYLDILTVWYCSFQDCCDSGDCRISNNFTGLKSDLSVRLHGQHLARELVLRAVRGYVETRQPDKALTLSFHGWSGTGKNFVARMLAENLYRDGLRSNCVQVFIAMFHFPHPKYVDMYKEQLTSQIQETQQRCRQTLFIFDEAEKLHPGLLEALEPHLERRAPKANRAKTPRTIFLFLSNLGGNIINEVVLNLLKAGQAREEITMEHLEPHLQAEIVESTDSGFGHSCLVKENLIDFFVPFLPLEYRHVRLCARDAFLSQELPYTEEALDEIAKMMSYVPKEEQLFSSQGCKSISQRINYFLP	293068	271562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_272474_273211_273337_279118_279298_281125_281392_291874_291989_293026
877435	contig_18869_pilon	+	1250	7	Intergenic	novelGene_56467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGCCTTCCCAGCGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191128	213702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_191859_192206_192281_193748_193913_196376_196491_205360_205453_205947_206002_213680
877436	contig_10003_pilon	-	2752	1	Intergenic	novelGene_88191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGCTACCCAGCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469436	466684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_466700_469400
877437	contig_13823_pilon	-	602	1	Intergenic	novelGene_145282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAACCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344359	343757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_343800_344400
877438	contig_6418_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_81156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAGAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293659	290504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_290500_293700
877439	contig_9189_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_165133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACTGACCTGCTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509599	507740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_507700_509600
877440	contig_10140_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_148415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGTGCTTATAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248694	246885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_246900_248700
877441	contig_19311_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_144075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTTAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96862	94460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_94500_96900
877442	contig_2854_pilon	+	3923	1	Intergenic	novelGene_120900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATTTAGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243847	1247770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1243800_1247800
877443	contig_11601_pilon	-	2511	18	Intergenic	novelGene_141041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGCGACTGCGCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253217	240587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_-_240679_241112_241225_242332_242400_243058_243218_244335_244436_244609_244739_245002_245102_245761_245878_246436_246493_247526_247573_247825_247890_249345_249416_249769_249838_249939_250049_250964_251099_251944_252027_252111_252212_252308
877444	contig_13894_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_62210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCCAGCTCCATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766718	765780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_765800_766700
877445	contig_6266_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_170997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTCTCAGAGTCAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765719	767351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_765700_767400
877446	contig_5019_pilon	-	3147	1	Intergenic	novelGene_109217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266500	263353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_263400_266500
877447	contig_6062_pilon	+	3632	13	Intergenic	novelGene_5271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	192.788672442709	4	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	702	2486	662655	748747	FALSE	25	CACTCTTAGAGTGAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYGGK	660926	749893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_660973_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245_744299_748666
877448	contig_4686_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_118512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAGGTCTATCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408527	409562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_408500_409600
877449	contig_10324_pilon	-	2188	12	Intergenic	novelGene_7699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.3026034786179	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	192	1463	41274	27998	FALSE	55	TTAACTTTAAAAAAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSEIEHFMPLLMQREEEGALAPLLSHGRVHFLWIKHSNLYLVATTLKNANASLVYSFLYKTVEVFSEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDFGFPQTTDSKILQEYITQQGNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGRGKNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPEKNVVIWNIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPWVRYITQSGDYQLRTS	41465	27272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_28021_28723_28800_29362_29489_29981_30141_33416_33489_33567_33711_34318_34446_34527_34676_34784_34916_37341_37410_37622_37780_41232
877450	contig_4364_pilon	-	1736	11	Intergenic	novelGene_30	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_8	79.0771774913597	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	596	1309	314016	283469	FALSE	20	ACATTTGTGTGTTTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWNSPSQVFPRITQFLGLPAFRYHVLLGLAVSAGGLTESTVKYSMQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	315935	283041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_314033_314111_314455_315013_315155_315840
877451	contig_14275_pilon	+	2649	10	Intergenic	novelGene_162859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTCAGGAGCGCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292276	484822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_293468_309223_309313_340702_340775_346632_346673_373021_373088_462346_462431_462903_463087_466328_466391_471858_472573_484674
877452	contig_12414_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_59635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679088	677233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_677200_679100
877453	contig_9995_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_47808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGATGTGGCCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857400	858608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_857400_858600
877454	contig_14822_pilon	+	1291	4	Intergenic	novelGene_145426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	903	1289	192998	195834	FALSE	25	GCTGGGAAATGGAGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCRLSQNLGASVGMYLIISNDFDLQLWEALSNAAQVVGHTLVHRVHQCSQMAALQEGFEGPVKHGRCAEYQESQSRSGQGQMESWRQECIVPCHLERINLEAKRAQRVLNLLLQLCDLRLHSTRYTLS	191387	195836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_192227_192934_193088_193795_193989_195730
877455	contig_8273_pilon	-	965	8	Intergenic	novelGene_113081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	180.803648148132	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	141	665	109068	96481	TRUE	75	AAGAAGAAAAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSRQVTCVSWVRCGVAKETPDKVELSKEEVKRLITEAKEKLQEEGGSDEEETGDPSEVGMQSARTQARPREPLDDGDPEDNRTLDDDELAEYDLDKYDDDGDPDAETLGESLLGLTVYGSNDQDPYVTLKDTEQYEREDFLIKPNDNLIVCGRAEQDQCNLEVHGEPQDRTT	109208	94918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_95026_96088_96200_96398_96507_100983_101081_101570_101657_105590_105776_105910_105970_108996
877456	contig_10371_pilon	-	1840	1	Intergenic	novelGene_175489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTCCGAGGCTGTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835237	833397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_833400_835200
877457	contig_12079_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_67454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACGGAATTCGTCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580965	580157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580200_581000
877458	contig_13481_pilon	+	3614	1	Intergenic	novelGene_119339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAGGGGTAACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348174	351788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_348200_351800
877459	contig_5125_pilon	-	526	3	Intergenic	novelGene_43402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	570	658	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25867	23060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_23313_24803_24905_25694
877460	contig_5815_pilon	+	870	1	Intergenic	novelGene_141194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCCAGAGCAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217186	218056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_217200_218100
877461	contig_6217_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_109705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAACCCCCAGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101193	1099214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1099200_1101200
877462	contig_13778_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_70857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGATGAAAAACTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301765	300119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_300100_301800
877463	contig_10934_pilon	-	1913	11	Intergenic	novelGene_177472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAGATAAAAGCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395603	344486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10934_pilon_-_344607_356759_356913_360971_361121_361889_362122_372268_372401_374320_374419_374753_374825_376465_376630_389267_389467_390821_390953_395139
877464	contig_9678_pilon	-	2071	18	Intergenic	novelGene_146365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_9	95.459841372584	66	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	1112	2071	244743	227828	FALSE	30	CCCAGCTTGAAAGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGLVDVISKEKLLWNPSSDDGKDFERKPLLELIDPELLKETTEARNALIEQVADLDDEFADLVLGEFSENFDLLPAEKLQTAIHRVTVAQTAVPVLCGSALKNKGIQPLLDAITMYLPSPEERNYEFLQWYKSDLCALAFKVLHDKQRGPLVFMRIYSGTVKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAAHRAKREGEKKHGKNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSVAKQPELDHALKCLQRED	259722	227827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_227866_232115_232306_236789_236890_236971_237113_238584_238734_240385_240467_243469_243650_243886_243948_244723_244813_247884_248004_249161_249251_249356_249483_250119_250325_251679_251778_252229_252288_255072_255158_257586_257674_259547
877465	contig_9435_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_156945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTGGATTTGGCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139975	137628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_137600_140000
877466	contig_14450_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_49012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACTACATACAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154152	1151425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1151400_1154200
877467	contig_8289_pilon	-	2109	13	Intergenic	novelGene_171178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAGGACGCAGTTTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237585	198191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_198304_199806_199925_200043_200235_200324_200412_200507_200588_200739_200816_200903_201007_203307_203482_204934_205036_205134_205244_205334_205431_212516_212646_236852
877468	contig_1301_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_47290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTTAGGGAATGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248332	246307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_246300_248300
877469	contig_6020_pilon	-	2158	7	Intergenic	novelGene_155563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	532.92557329018	452	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	293	760	349599	291981	TRUE	35	TAATTTGTATTAAGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYHHRRYP	349891	288683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_290041_291939_292002_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
877470	contig_11855_pilon	+	2726	1	Intergenic	novelGene_66930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTACCCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915551	918277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_915600_918300
877471	contig_6017_pilon	-	1521	4	Intergenic	novelGene_152561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	69.1343297903115	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	210	1184	480395	472973	FALSE	50	AAATATTCACTAAGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTPETKTRVPAVSGLQTSGSPPRVPPRRRTRQPALGRSLSLSQKSKTSVGKRARRLTFGRSRLQKQEADMGTVADALLVCHPGTLTRVLQQKEGGAGRDLSVETRVDWEGTGREPSDGAMFAPENKLSTKEPVISISSNNVVIELAKSPESHGHWKQWYYGLNNDSLEERLFVSEENVNEFLDEVLSSPFKQTIPLTPPLIEVLQITDNNIQIHAKLQESSNSHELHVKEGVNEGSHLTEKENIEHLITTTTEQEQTLGDARPSDSCVADNALVTDSCGSVAYLKQESRDVFQVLSGKSQQPESKMEPEFIKEKCAVYSNEEKQNLKEPVLTGEKELDGDYLSSLQNKTTVHNISAFESIKETNMQDGSVQIMKDHVTHCAFSFRNSLLYDLD	480604	472635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_473507_474670_474815_479906_480051_480242
877472	contig_10341_pilon	-	3015	2	Intergenic	novelGene_47253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	0	70	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTGATTTATTTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174184	169888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_172871_174151
877473	contig_5039_pilon	-	3462	1	Intergenic	novelGene_64998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	49	564	1695977	1695462	NA	30	ACTAATAGCGACCCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSTLLYGVAVVGTDSSMGWSTLLYGVAVVGTDPAMGWSTLLYKVAVVGTDPAMGQSTLLYGVAVVGTDPAMRQSTLLYGVAVVGTDSAMGRSTLLYGVAVVGTDSAMEWSTLLYGVAVVGTDSAMEWSTLLYGVAVVGTDSARGRSTLLYRVTVVGTDSATTGLVFRFYLLSEAKFSYLKYNESKNE	1696025	1692563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1692600_1696000
877474	contig_4857_pilon	+	1040	8	Intergenic	novelGene_48722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTGCATCACCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178624	1226304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1178963_1181945_1182011_1182111_1182188_1183095_1183162_1213436_1213531_1214578_1214707_1216721_1216944_1226253
877475	contig_11096_pilon	+	2814	1	Intergenic	novelGene_143478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCAGCAATATTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263244	266058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_263200_266100
877476	contig_11590_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_125573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTCACTGCTGTCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389714	387645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_387600_389700
877477	contig_5881_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_129037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATATTCCCAGAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299322	299668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_299300_299700
877478	contig_9516_pilon	+	2359	12	Intergenic	novelGene_106203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	1962	2357	1355919	1473984	FALSE	55	TGAGGAAGAAAAAGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISFTTGISGGIGGGTIPKPGIIGVMGGIPVIIPRAGSKSGKIGCPAIPIGVIPRLFIAVAHAVGSDIGSVIAVESTFRVLLLSAEGVFVLFLFLLDSPPFSMRPSVTRGPLALPNCKGSLLLAGSKGSWFS	1301521	1473986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_1302202_1304421_1304505_1310087_1310197_1312522_1312705_1321920_1322032_1332472_1332575_1334277_1334491_1337286_1337525_1342668_1342875_1355881_1356037_1371465_1371601_1473841
877479	contig_7253_pilon	-	2893	24	Intergenic	novelGene_140197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_5	133.824024618965	19	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	901	2706	150	2855	198515	161921	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTQWDFPVELCCRPMAFVTLTGLDVVYNAVHRAVWDAFCANRRADRVPISFKVLPGDHEYPKCRPKRTSYEWYIPKGILKTGWMNKHLNLVPALVVVFYELDWDEPQWKEKQSECATRVEIVRQSLQGRNTKVAVVLIQKKTPLPPGEDVIASERAAALCNACELSGKSLFVLPHTDHLVGYIIRLENAFYEHAQTYYYTEIRRVKSHKEFLNKTTHQLLFVRHQFKIAFFSELKQDTQNALKNYRTAYNLVHELRAHETNILEIKTMAGFINYKICRLCFQHNTPLDAIAQFRKHIDLCKKKIGSAELSFEHAAWMSKQFQAFGDLFDEAIKLGLTAIQTQNPGFYYQQAAYYAQERKQLTKTLCNHEATVIYPSPDPLETQTGVLDFYGQRSWRQGVLSFDLSDPEKEKVGVLAIQLKERSVVHSEIIITLLSNAVAQFKKYKCPRMKSHLMVQMGEEYYYAKDYTKALKLLDYVMCDYRSEGWWTLLTSILTTALKCAYLMAQLKDYITYSLELLGRASTLKDEQKSRIEKNLISVLMNESPDPEPDCDISAVKTAQKLWADRVSLAGSGIFTVGVQHFVPFVQCKTKFHAPSFHVDVPVQLDIYLKADCPHPIRFSKLCVSFNNQEYNQFCVIEEASKASEVLENLNQEKMCFVPGKTRKFLFKFVAKTEDVGKKIEITSVDLILGNETGRCVVLNWQGGGGDAASSQEALQASRSFKRRPKLPDSEVHWDSIVIQASTMIITRVPNISVRLRHEPPALMNEMYCLVVTVQSHEKTQIRDVKLTAGLKPGQDANLTQKTHVTLHGAELCDDSHPALLTDVPVGELHPGEQLEKMLYVRCGTVGSRMFLVFVSYLINTTVEDKEIVCRCHKDETVTIETVFPFDVAVKFVSTKVCS	201059	161882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_161999_165965_166086_169477_169600_170668_170818_170940_171129_172775_172932_175885_176017_178166_178300_178449_178512_178951_179098_179455_179511_179594_179674_179758_179839_181830_181925_183737_183886_184495_184630_187284_187382_188871_188946_189384_189485_194905_195021_196077_196149_196978_197149_198311_198537_200931
877480	contig_1759_pilon	-	1857	1	Intergenic	novelGene_171326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAATAGAAGAAATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27566	25709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_25700_27600
877481	contig_6199_pilon	+	2149	2	Intergenic	novelGene_126416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712880	715283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_714303_714556
877482	contig_13097_pilon	+	2202	15	Intergenic	novelGene_107712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_9	507.874728447792	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	178	1668	184733	254318	FALSE	30	CCCCCAGAGAATTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGIPITVPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNRFVECERICTRVFHIHFRIYVQCEDGKPNSVEEHLRKPF	184555	254852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_225265_225360_226996_227154_241867_241895_243883_243939_245488_245545_253986
877483	contig_3382_pilon	-	1459	8	Intergenic	novelGene_124103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	1	3	junction_1	685.518513720134	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	99	989	694411	673341	TRUE	15	GAACTGTTGGCTCTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDIASRDRDRNSRDRSPRDRDRKDKNRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI	696540	672455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_672841_673255_673519_677153_677346_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303_694415_696445
877484	contig_6410_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_108635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAAGGGTGATCTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310922	312343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_310900_312300
877485	contig_12427_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_40569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGCAATTTAGCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516854	514414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_514400_516900
877486	contig_14219_pilon	-	3347	1	Intergenic	novelGene_54307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCGTATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654164	650817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_650800_654200
877487	contig_10930_pilon	+	674	5	Intergenic	novelGene_37105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_4	5603.29153266185	8	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	290	655	339823	342083	FALSE	0	CTTGGTGCTTTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339425	342102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339921_340994_341098_341522_341625_342020
877488	contig_3525_pilon	+	2280	3	Intergenic	novelGene_135140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTCCGGTGCCTCCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602024	609774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_602786_605990_606194_608458
877489	contig_10299_pilon	-	658	5	Intergenic	novelGene_79779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	9.09670269933013	201	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	111	437	654615	650503	FALSE	20	AGGGAAGGGTCTCTTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEERKAREEQAQREHEEYLKLKESFVVEEEGVGETMTEEQSHSFLTEFINYIKQSKVVLLEDLASQVGLRTQDTINRIQNLLAEGTLTGVIDDRGKFIYITPEELTAVANFIRQRGRVSITELAQASNSLIAWGRDAPTQAPA	654725	650281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_650670_651029_651079_651576_651634_654237_654277_654600
877490	contig_5770_pilon	-	608	7	Intergenic	novelGene_74193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7662	junction_6	2781.93576189914	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	36	590	264932	261935	FALSE	65	TGCAAATAAAAGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	265793	261916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
877491	contig_11378_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_112253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCTTTCACCATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366552	369515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_366600_369500
877492	contig_3472_pilon	-	3514	1	Intergenic	novelGene_166932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGTGGAGTAATTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256599	253085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_253100_256600
877493	contig_11978_pilon	-	2888	2	Intergenic	novelGene_62815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	376	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTTGTTTCAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408012	399214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_400361_406270
877494	contig_12119_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_88697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAAAAGTATCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429219	430745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_429200_430700
877495	contig_10246_pilon	-	1077	2	Intergenic	novelGene_46881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	506	970	38397	37933	FALSE	25	TGTGATATACCACATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKSAIFYLESAVEQKPTFAIAYIHLASMYIEAGDYGKAEDVYQKALSIKPLEEDHEQEIHLHYGRFQEFQRKSEVDAITHYLKAIKIEKESFSRNRSIDSLEKLASKKLQRKASDVEGLSLLGFIHKLKGKINEALEYYERALRLTGDLNPMF	39000	37825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_38830_38927
877496	contig_14182_pilon	+	2453	1	Intergenic	novelGene_76179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCCCTACTACAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48811	51264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_+_48800_51300
877497	contig_6326_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_168529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	109492	109157	NA	0	GTCCTGTCCTGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVLPGGADGTRGAEEDDVTKDIVLRASSEFRAVLLSLRQGSLVEFSTVLEGRLGSKWPVFELKAISCLNCAAQPSPAPRHVKLEQDWRGTVHGALKFAFDFFFFPFLSAS	109494	108008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_108000_109500
877498	contig_19377_pilon	+	622	4	Intergenic	novelGene_174103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	8.9938250421547	108	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	178	525	4708	8202	FALSE	35	AGTTACTGGATGTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVCSNPEFFSYGVEAYEACKKRTLARDIIDEQKKVQEADLVIFQFPLYWFSVPAILKGWMDRVLCQGFAFDIPGFYDSGFLKGKLGLLSLTTGGTAEMYATAGVSGDFRYFLWPLQHGTLHFCGFKVLAPQINFAPEFASEEERKGMVASWAQRLKTIWTEEPINCTPPWYFGQ	2409	8299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19377_pilon_+_2542_4662_4777_5894_5997_8025
877499	contig_8310_pilon	+	1293	5	Intergenic	novelGene_75550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	40.4876524387374	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	103	483	272460	279883	TRUE	10	GTTGCCGTCCCTGCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQGAVTRAGRGLGAAGCTLPPRAGRASCCCLSF	215088	281800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_280379_281485
877500	contig_3077_pilon	+	2642	10	Intergenic	novelGene_26830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	83.3186653757728	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	186	467	503890	518613	TRUE	20	TGCCTAGGAGAGTTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPDLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPHHS	498495	522580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_498579_503787_503938_507593_507709_517678_517786_518601_518796_519232_519392_519712_519812_520617_520806_520993_521122_521161
877501	contig_11026_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_167665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	770	1219	161709	162158	NA	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLVEALLLLGSLFPAALGAPLHLCMDGEMFCLGVVLSGCLWKPASSHRASSALPCTFIPERPVLPAIHCLHLLLLVAVSSDSWRPHVCRGELLYRVFKPVTFWKQISRPVFQGFSEWVRTANLLAGSRVLNCLCHPGTLPSFRRWGN	160939	163902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_160900_163900
877502	contig_1143_pilon	-	1726	6	Intergenic	novelGene_86596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_5	108.608286976639	39	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	8	532	201052	183502	FALSE	30	TGAGTAGCATCTCAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWMVGVKMAAAAASIRERQTVALKRMLNFNVPHVKNSTGEPVWKVLIYDRFGQDIISPLLSVKELRDVGITLHLLLHSDRDPIPDVPAVYFVMPTEENIDRMCQDLRNQLYESYYLNFISAISRSKLEDIANAALAASAVTQVAKVFDQYLNFITLEDDMFVLCNQNKELVSYRGT	201059	182307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_183598_185119_185243_192034_192126_194014_194104_196864_196936_200997
877503	contig_5871_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_160182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAATGTAAAGTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409564	411833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_+_409600_411800
877504	contig_5549_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_81698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTTCTGAAAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809072	807095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_807100_809100
877505	contig_12179_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_127998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAAAATAATACCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506501	504405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_504400_506500
877506	contig_10238_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_170107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATTATGGAAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434355	432340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_432300_434400
877507	contig_9272_pilon	-	1351	5	Intergenic	novelGene_125953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	30.2034766210779	48	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATAAAAATAGAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467262	458982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_459350_462224_462443_463396_463491_465686_465763_466666
877508	contig_4751_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_173721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125534	123849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_123800_125500
877509	contig_6767_pilon	+	1399	8	Intergenic	novelGene_174612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	48.4881639249861	81	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	11	1213	1901	29123	FALSE	30	TGGAACACTAAAGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIRKPKRIVIRGHDEREYPFLVKGGEDLRQDQRIEQLFEVMNVVLSRSAACSQRNMQLKTYQVIPMTTRLGLIEWIENTFTLKELLWNNMSQEEKTAYMSDPKAPLSEYRDWLTKMSGKRDVGAYMLMYKGASRTETITSFRKRESRVPGDLLKRAFVKMSTGPEAFLALRSHFASSHALLCISHWILGIGDRHLNNFMVNMETGGMVGIDFGHAFGSATQFLPVPELMPFRLTRQFINLMLPMKETGLIYSVMVHALRAFRSHPDLLTNTMDVFVKDPSFDWKNFEQKMLKKGGSWIQEVNITEKNWYPRQKINYAKRKLAGANPAVITCGELRLGHEKEPAFGDYMAVARGSKDHNIRAQETESGLSEEIQVKCLIDQATDPNILGRTWGGWEPWM	1890	29309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_2113_2425_2519_16154_16245_16690_16763_16836_17039_17653_17843_18682_18823_28918
877510	contig_13780_pilon	+	3338	12	Intergenic	novelGene_149018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	39.4748586167185	742	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	584	895	429553	431855	TRUE	0	CCGCGCCCCGCCCGCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELPSPEPEQLICPQTTPHPSEPAEDDNNNVATVLPTEQLPSPVAEDPSPGDEPLPPVPLPFTAPWPAASTGKRTNLKKPNSERTGHGLRVRFNPLALLLDASLEGEFDLVQRIIYEVEDPSKPNDEGITPLHNAVCAGHHHIVKFLLDFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNSVHLCKQLVESGAAIFASTISDMETAADKCEEMEEGYIQCSQFLYGVQEKLGVMNKGVVYALWDYEAQNSDELSFREGDAITVLRRKDESETEWWWARLGDREGYVPKNLLGLYPRIKPRQRTLA	427210	457164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_427425_428507_428646_428716_428851_429455_429623_430813_431014_431813_433580_433681_433825_436533_436625_436726_436803_437619_437793_439747_439797_456977
877511	contig_8651_pilon	-	2514	2	Intergenic	novelGene_168170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGAAGTACAGCAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152017	135803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_137283_150982
877512	contig_1450_pilon	-	1607	3	Intergenic	novelGene_27446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	4.5	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGTCCTTGAGAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836038	766530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_767953_777900_777980_835932
877513	contig_15282_pilon	+	4100	11	Intergenic	novelGene_177717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	61.4059443376616	6	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	332	940	24048	51033	TRUE	30	AAATGATCTTTGGCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKKKPKLLNKFDKTIKAELDAAEKLRKRGKIEEAVNAFEELVRKYPHSPRARYGKAQCEDDLAEKRRSNEVLRGAIETYQEVASLPDVPADLVKLSLKRRSERQQFLGHMRGSLMTLKRLVQLFPNDTSLKNDLGVGYLLIGDNENAKKVYEEVLNVTPNDGFAKVHYGFILKAQNKIAESIPYLKEGIESGDPGTDDGRFYFHLGDAMQRVGNKEAYKWYELGHMRGHFASVWQRSLYNVKGLKAQPWWTSKETGYTELVKSLERNWKLIRDEGLAVMDKARGLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQGRKK	7077	65804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15282_pilon_+_7166_14531_14619_22323_22475_24042_24180_27219_27319_31511_31602_36305_36444_43841_43978_51019_51113_51486_51621_62857
877514	contig_5389_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_143011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACATTAAACAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258507	259450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_258500_259400
877515	contig_17281_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_105200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2385	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2400_2900
877516	contig_11855_pilon	-	2565	2	Intergenic	novelGene_66995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	69	junction_1	0	60	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1374	1805	1307926	1307495	FALSE	10	GCCTTAACTGTGGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSHSGLLDFQGSSVLLGGPGCAGLSVADPPASTPRGLAAENLHPCAERMTPCSYTPTQFQVGFGGQAALQTSLQRWQVLPLPVWSLPDPGIPRGMASVRWMGARFWSENWNPTQHLSTQPSVCSAPALATVCLFVLNDGQC	1309536	1306734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1308887_1309123
877517	contig_13037_pilon	+	924	3	Intergenic	novelGene_155143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	20	559	35198	62278	FALSE	20	AGACGCTAGTTTTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHPCQDMLSESDETGPLGSTQESPDIKTEPEEPHAAGASQGEGAPSSWRWAPLSHSSKEKALLLPGGAHPSLQVPAVSREGRTRDRQMAAALLTAWSQMPVTFEDVALYLSREEWGRLDHAQQNFYREALQKRKGLSLGELPQGRWLPLSLFIWTVLSVELCRLVKMFFMSTNTVTADQTWLLSF	35178	62643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_35382_36023_36116_62014
877518	contig_8357_pilon	+	3984	4	Intergenic	novelGene_39710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	529	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473583	479948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_476119_476731_476866_477036_477202_478798
877519	contig_11677_pilon	+	1953	17	Intergenic	novelGene_85969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	14.4476425412591	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	77	1843	713501	721040	FALSE	35	AAGTCAAAATGTATTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETVLEAFCAHASQRISQLEQDLASMREFRALLNEAQTQLVRLHAEQQELAQQTVSVSSTLQQDWISMQLDYLTWTALLSQSRQLTEKLAAKSREALQERDAAVEEKQKVSRELEQVCTRLEDCKGQIEQLELENSRLATDLQAQLQILASMESQLKELQGQHANCTQDLAMKDDLLCQLTQSSEDQAARWEKEEMALKQMQAELQQQQAVLSKEVQDLKETLEFADQENQVAHLELGQVESQLKTTLEVLRERSLQCEDLKDTVENLKAKLASIVTENQEQDLEKTRQYSHELGVLTDQLQSLALFLQKKLKEKAEPEPLPMNTACAPAQEHPPPSNTTFLGSVLTLMTDEEPESAPVPLLGSDKSAFTRVASMVSLQPTETPDMERSLTEMRTMTLELQSLCSLMQESKEEAVRTLQQNICDLQDRLQAQEEQHQEAQKAKEADIEKLNQALCLRYKNEKELQEVIQQQNEKILEQIDKSGELISLREEVAQLTRSLRRAETETKVLQETLAGQLDADCQSMATDWIQEKVWLTQEVDKLRMMFLEMKDEKAKLMVKFQSHRNILEENLRRSDQELKKLDDIVQHIYETLRSIPEVVRGCKELQELLEFLS	713424	721150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_713546_713662_713756_713856_713971_714345_714440_714582_714731_714810_714914_715105_715240_715449_715589_718603_718716_718885_718973_719227_719349_719465_719578_719966_720048_720174_720331_720453_720529_720653_720735_720968
877520	contig_11677_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_85880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACAGGAGCTCCGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221850	219136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_219100_221800
877521	contig_5797_pilon	+	2457	9	Intergenic	novelGene_56931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	81.9828488160786	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	955	1815	254852	273501	FALSE	35	TCAGAATCTGAATGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGSDQNHFCQPTDVAVDPETGIIYVSDGYCNSRIMQFSPTGKFITQWGEASSGSNPNPGQFSVPHSLALVHHLGQLCVADRENGRIQCFKTDTKEFVREIKHASFGRSVFAISYIPGLLFAVNGKPYFGEREPVQGFVMNFSSGEIIGIFKPVRKHFDMPHDIVASEDGTVYIGDAHSNTVWKFTSAEKMEHRSVKKAGIDDQEIKDSEHKLETGSGRVLGRLRGKGTGGLNLGNFFASRKGYSRKGFDRLSTEGSDQEKDEDDASESEEEYSAPLPTPAPSSS	250080	274143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_250905_253720_253794_254794_255006_255434_255636_257484_257601_261303_261404_263481_263536_272595_272650_273319
877522	contig_3789_pilon	-	2438	16	Intergenic	novelGene_79838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	28.1303315934163	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1527	910	2436	408146	389096	FALSE	60	AGAGCTGAAAAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTKVRAIRHLEFLPDGFDAGSNQVLGVLSQDGIMRFINIQTCKLLFEIGSLDEGISSSVISPHGRYIASIMENGSLNIYSVQALTQEINKPPPPLVKVIEDLPKSKLNSSDLKMKVTSGRVQRPTKSRESKIQTRILKQDLTGNFENKENELSDGLNKKRLQILLKGYGEYPMKYRMFIWRSLLQLPENHTAFSSLVDKGVHVAFLNLQKKYPIKSRRLLRVLQRTLSALAHWSAIFSDTPYLPLLAFPFVKLFQNNQLICFEVIATLIVNWCQHWFEYFPNPPINILSMIENVLAFHDKELLQHFMDRDITSQLYAWPLLETLFSEVLTREEWLKLFDNVFSNHPSFLLMAVVAYNICSRAPLLNCNLKDDFEYFFHHRNNLDITVVIREVYHLVDTTPTDIHPESMLDVFVALTKGQYPVFNQYPKFIVDYQTQERERIRNDELDYLRERQTVEDMQAEVDQQRAEDEAWYQKQELLRKAEETRREILFREEEKMLEQRQRLAAVK	423618	389093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_389112_390169_390323_390586_390820_392144_392325_393750_393885_396846_396981_398574_398722_398799_398880_400274_400452_405170_405372_408074_408235_409521_409674_414849_415033_417558_417675_422565_422714_423396
877523	contig_11448_pilon	-	3292	1	Intergenic	novelGene_66378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311550	308258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_308300_311600
877524	contig_4211_pilon	+	2376	1	Intergenic	novelGene_80243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCCCGAGCAAAGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132994	1135370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1133000_1135400
877525	contig_4845_pilon	-	3203	24	Intergenic	novelGene_53660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	184	junction_23	110.14017533608	127	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	285	2273	520097	510222	FALSE	40	AAGAACGAAGGGCACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKSVSRRKCAACKIVVHTPCIEQLEKINFRCKPSFRESGSRNVREPTFVRHHWVHRRRQDGKCRHCGKGFQQKFTFHSKEIVAISCSWCKQAYHSKVSCFMLQQIEEPCSLGVHAAVVIPPTWILRARRPQNTLKASKKKKRASFKRKSSKKGPEEGRWRPFIIRPTPSPLMKPLLVFVNPKSGGNQGAKIIQSFLWYLNPRQVFDLSQGGPKEALEMYRKVHNLRILACGGDGTVGWILSTLDQLRLKPPPPVAILPLGTGNDLARTLNWGGGYTDEPVSKILSHVEEGNVVQLDRWDLQAEPNPEAGPEERDEGATDRLPLDVFNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGTAFSDFLMGSSKDLAKHIRVVCDGMDLTSKIQELKPQCIVFLNIPRYCAGTMPWGHPGEHHDFEPQRHDDGYLEVIGFTMTSLAALQVGGHGERLTQCREVVLTTFKAIPVQVDGEPCRLAASRIRITLRNQATMVQKAKRRSAAPLHSDQQPVPEQLRIQVSRVSMHDYEALHYDKEQLKEASMPLGTVVVPGDSDLELCRTHIERLQQQEPNGAGAKSPTCQKLSPKWCFLDATTASRFYRIDRAQEHLNYVTEIAQDEIYILDPELLGASARPDLPTPISPPPTSPCSPTPR	520660	509291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_510366_510898_510940_511088_511162_511308_511389_511493_511595_511822_512023_512255_512368_512454_512529_512631_512695_512850_512907_513065_513145_513741_513883_513980_514095_514182_514244_514338_514422_514690_514787_515097_515170_515265_515383_515475_515548_516441_516511_516935_516993_519701_519780_520091_520188_520466
877526	contig_8581_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_22855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTCTACAGATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355503	357209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_355500_357200
877527	contig_1406_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_25658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1295	1741	2793871	2793425	NA	65	CTTAAACAAAGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSHTARAEFKVFKENTCVSPGGIQIAHFIVLIFVQLSGFPQTSKVLRLNVASVLTKMRPSQLLLWLHEKWFSRRVECCEMESHEGGGLSFYICCLNDLACSRPLVACLTPPGNGRKAAQPPKQQPSLKTSTAQLLSFPFFKGRPTI	2795165	2792935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2792900_2795200
877528	contig_9354_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_108064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTTTACTTAAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262490	263709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9354_pilon_+_262500_263700
877529	scaffold_19766_pilon	-	2350	2	Intergenic	novelGene_34461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGATCAGTTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908932	906102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_908347_908826
877530	contig_4654_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_103046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTATGACTGCCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398779	397228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_397200_398800
877531	contig_6102_pilon	-	2855	1	Intergenic	novelGene_32297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTCTATCCGGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1490592	1487737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1487700_1490600
877532	contig_7308_pilon	+	1369	4	Intergenic	novelGene_159585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTCCCAAAAGAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97723	183274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_98714_176548_176664_182565_182742_183186
877533	contig_12550_pilon	-	4352	1	Intergenic	novelGene_175282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTATGAAATATATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98110	93758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_-_93800_98100
877535	contig_1516_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_50020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCTGCTTGGCTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359124	361687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_359100_361700
877536	contig_16103_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_118691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCAGCACGGCGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183853	181287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_181300_183900
877537	contig_12427_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_40485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321244	323715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_321200_323700
877538	contig_9272_pilon	-	2714	6	Intergenic	novelGene_125951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	31.9649808384113	36	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	393	827	459290	455757	FALSE	15	GCTTCATTAGGGCCTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDILGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEVSHSHNFGSKRR	465705	453869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_455889_458697_458892_459181_459350_462224_462443_463396_463493_465686
877539	contig_9242_pilon	-	3149	1	Intergenic	novelGene_155070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGGCCGATCAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653110	649961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_650000_653100
877540	contig_16345_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_178191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGTTAATTCTTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473481	472224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16345_pilon_-_472200_473500
877542	contig_7870_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_109054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAATGAAAAAAATATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658396	656997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_657000_658400
877543	contig_6272_pilon	+	2024	6	Intergenic	novelGene_160469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.74165738677394	32	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	63	701	624598	696424	FALSE	30	TGCAAGCATTAGTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRARGPDRRRLRAAPRGLKMVSRRVFNLPSGLLFWLAFGWTPTSAYSPRAPDRVSETDIQRLLHGVMEQLGIARPRVEYPAHQAMNLVGPQSIEGGAHEGLQHLGPFGNIPNIVAELTGDNIPKDFSEDQGYPDPPNPCPIGKTDEDGCLENTPDTAEFSRQFQLQQHLFDPEHDYPGLGKWNKKLLYEKMKGGQRRRRRSVNPYLQGQRLDNVVAKKSVPHFSDEDKDPE	622014	697747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_622067_624587_624824_680316_680467_686209_686323_691547_691602_696328
877544	contig_12427_pilon	+	930	3	Intergenic	novelGene_40594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	181.5	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	7	339	624033	628512	FALSE	25	TAGAAATGAGCCTTGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVMEVSAACLFLVLLLGAWAPALGSASSEVLPLVNEDVKRTVDLSSHLAKVTAEVVLAHPGGGSTSRATSFLLALEPELEARLAHLGVQVKGEDEEENNLEVRETKIKGKRG	624026	629103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_624294_627551_627617_628505
877545	contig_18184_pilon	+	1946	2	Intergenic	novelGene_123889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCGCTGCTGTCAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623763	625873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_625618_625781
877546	contig_10581_pilon	-	2225	12	Intergenic	novelGene_41441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	1777	2223	773913	772392	FALSE	10	AGCCTCCCGCTCCCGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVERLRVTMTDGLCSVGFCSRPFPSSSTPPAWATSVGSTVRTGTDTGMMRGTIPLSSRARLAVKAGSENSTPHLVFEVNTLFLLSSELLASFAFCIEASSTAFWARVSKLASWDARRLRRVLWITPPRSTCPQSPGPIARMPSSVPMA	792628	772389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_772562_773636_773934_780917_781270_783470_783538_784027_784169_784288_784392_784878_784955_785618_785708_788800_788952_789972_790187_791708_791903_792259
877547	contig_7733_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_147147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCACTTGAGGGCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146121	148521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_146100_148500
877548	contig_5832_pilon	+	1706	11	Intergenic	novelGene_134165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_10	32.9781746007871	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	11	1015	546486	560262	FALSE	25	GAGTCCTGGCTGCAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVFMVKKGYQDIDTSLQSAVITKVKGVAFTNTSELGERLWDVADYVIPPQGESVFVVMTNLIVTPNQRQDTCAENEDILNAKCSKDSDCHPGEAVVAGNGVKTGRCLRVGSAKGTCEIFAWCPVETKSKPAKLLLDEAEEFTIYIKNSIRFPKFNFSKTNVLDTKNSSFLKTCRFDLNNLYCPIFRLGSVVRWAGSNFQEMALEGGVIGIHIEWDCDLDKASSECNPQYSFSRLDNRFAEKSISSGYNFRFAKYYRDASGVEFRTLMKAYGIRFDVMVNGKAGKFSIIPTVINVSSGVALMGAGAFFCDLVLIYFIKKSHFYRGKKYEEVRYRRLDR	546475	560953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_546627_547814_547887_548123_548200_548282_548377_548621_548703_549040_549180_552637_552775_553243_553338_553473_553540_556229_556313_560240
877549	contig_7657_pilon	+	3387	22	Intergenic	novelGene_30035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_15	322.976407245465	140	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	787	2157	264903	332223	TRUE	30	AAATATTGACATCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRKSCRSRKNRFESVNQSLLFDQLVNSTAEAVLQEMDNINIRRNRRSGEVERLRMWTDTEFENMDMYSRVKRRRKSLRRNTYGIQNHHEVSTEGEEEESQEEDGDIEVEEAEGEENDRPYNLRQRKTVDRYQAPPIVPAHQKKRENTLFDIHRSPARRSHIRRKKHAIHSSDTTSSDEERFERRKSKSMARARNRCLPMNFRAEDLASGILRERVKVGTSLADVDPMNIDKSARFDSIGGLSHHIHALKEMVVFPLLYPEIFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKKVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYLMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDNRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFNLPDQKARKHILQIHTRDWNPKLSDAFLGELAEKCVGTSISEAASLSF	217905	374776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_218422_255711_255864_264416_264467_264834_264989_266973_267077_268682_268792_271571_271689_274530_274607_294983_295083_296346_296459_312105_312222_315213_315389_320379_320469_329527_329688_331094_331186_332185_332249_336468_336781_339854_339991_348595_348783_365439_365626_372397_372534_374528
877550	contig_19564_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_29661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGGGTTTGGAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41972	43460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_42000_43500
877551	contig_2419_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_137129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAGGGCTTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127970	129652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_128000_129700
877552	contig_7357_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_36764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGCCCCATAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47090	47706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_47100_47700
877553	contig_12644_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_44531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAATTGGTTTTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419730	1421753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1419700_1421800
877554	contig_1150_pilon	-	560	3	Intergenic	novelGene_61435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25453.5	15	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCTGGTGTGACTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311028	308931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309845_309927_311002
877555	contig_567_pilon	-	2400	5	Intergenic	novelGene_33957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1066.4957512808	1361	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	338200	308638	FALSE	30	TCAAACTGGATATTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGSRPFLRGHAVSSQARNRAAVFSAAPSTSRRVRTMDPRKVSELRAFVKMCKQDPSVLHMEEMRFLREWVESMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPNALRYFTVVCH	338308	306669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308675_326953_326997_329281_329358_331040_331099_338090
877556	contig_12277_pilon	+	1319	2	Intergenic	novelGene_139673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	0	204	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGTATTAAATGACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99390	102979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_99856_102125
877557	contig_3077_pilon	+	2894	1	Intergenic	novelGene_26909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTCTTAAGTCCTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712275	1715169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1712300_1715200
877558	contig_7695_pilon	-	833	6	Intergenic	novelGene_41631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	28.3167794778997	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	186	389	696795	694041	TRUE	20	GCTGCTCATCTGCTCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPIRRGSGFTFKAARGLLGRPAGWRRRDRLTAAGPGEAGREPEPEPERKPGRAGGAGGAAMATMVLPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAHEAGETEPGSQERCVLLRRSLAA	697679	692255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_692278_692847_693071_693727_693799_693912_694052_696602_696807_697505
877559	contig_19185_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_163650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATCTTCAGGGTGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133358	135600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_133400_135600
877560	contig_11677_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_85875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTTGAGAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114130	116445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_114100_116400
877561	scaffold_880_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_121488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	280	591	505795	505484	NA	70	TACCACAATAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQWPACAPWQKGTDVKASSSTTALPTLDLCWGCPSRLHDENASDTRLVTIAAGAGKGGCAPLDANSGDSLLAANKARESNSSAPESADTPSLSMREGRPRQLRTHWTSPLPKLRTHHIMVLWLTWTEALSVFEMTVKRRRGTCSSSPECQAEIWSRVFAEKKSLQFATEFFSASINFRYILGWAGFCWPGEKLKTI	506074	504214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_504200_506100
877562	contig_14220_pilon	+	3349	2	Intergenic	novelGene_159858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGATTCAACAATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309857	313472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_310670_310935
877563	contig_4845_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_53634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269888	267559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_267600_269900
877564	contig_5815_pilon	-	344	4	Intergenic	novelGene_141239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCGTTGATGGCAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046050	1041404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_1041453_1044121_1044246_1045491_1045607_1045993
877565	contig_11068_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_130558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAATGATAAATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625553	626929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_625600_626900
877566	contig_9185_pilon	+	1888	1	Intergenic	novelGene_166882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGTAAGGTTTTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168420	170308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_168400_170300
877567	contig_9049_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_83163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAATCTGCTTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119234	120540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_119200_120500
877568	contig_15361_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_167865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAAAACCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437926	439121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_437900_439100
877569	contig_14508_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_79058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2261	2647	87767	87381	NA	55	TTAAACAACTGAAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVKPRGICSFISLLTLDLGAQTMAWMSVSIPGLSQNAGFILHARIGSSTLIFKPDAYGSGDKKAGIGECLTLKLLGEGKLVPQKKISALPEEKGNIAGQANNMNVHTPHFSSSDCRQVMEFISPFFP	90027	87251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_87300_90000
877570	contig_10674_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_6464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCACAGTATTTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364067	366205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_364100_366200
877571	contig_5039_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_64817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGATGCCCTCCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230896	229577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_229600_230900
877572	contig_8044_pilon	-	3277	1	Intergenic	novelGene_132388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536273	532996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_533000_536300
877573	contig_8317_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_20747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57455	59377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_57500_59400
877574	contig_14727_pilon	+	597	5	Intergenic	novelGene_56628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1010	junction_1	298.665678476788	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	41	550	47396	55271	FALSE	35	ATGCAACTCAGATTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLATRVFSLVGKRAFSTSVCVRAHGSVVKSEEFSLPAYVDRRDYPLPDVAHVKNLSAQQKALKEKEKAAWSTLSIDEKVELYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	46218	55318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_46258_47394_47469_51362_51531_54130_54263_55134
877575	contig_20356_pilon	+	2180	1	Intergenic	novelGene_159550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGCTTACAAAGACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134808	136988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_134800_137000
877576	contig_10482_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_152821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104786	102854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_102900_104800
877577	contig_20697_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_134609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTCATCTAAAGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4580	6113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20697_pilon_+_4600_6100
877578	contig_5145_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_131348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	891	1277	22888	23274	NA	20	GCCAGTCAGCTGTCATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPSSIVTVPPNAPECTHLACPPCIMNRKQRTSQANTIRPPRACVRTTSLTTEKVNWQMLKIPTKIAQGQKQPKYPSTDEWVNTMWSIHTMEYYSAIKRNEVLIHATTWMNNENIMLSKRSQTQKVIQ	21997	23949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_22000_23900
877579	contig_5812_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_167493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103156	101297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_101300_103200
877580	contig_12080_pilon	+	4117	13	Intergenic	novelGene_128408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	17.0902425052686	285	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	103	1695	484514	497042	TRUE	25	TGAATGAGTGTTTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLPGLLGRAFHRLPGPGLRELNHRSTSPGGPQATSSNLLVPVPSLDSSGPHVPRPGTSKGTRTHGWKDAFQWMSARVSPNTLWDALSWGTLTVLALQLARQTHFQASLPGAPWRAEPCSWRSPLDHFLSSPLWHPHCSLRRHILPSPEGPAPRHTGLREHRLGQEGPSAQPRSLSSHSSTQPRSLPSHSSWRAAGVQDSSEEDASDIGFLHASSSSESKARLAQPQTTGEKQEQDKSKTLSLEEAATSVQQLFQLSVSIAFNFLGTENMRNGDYPTAFSYFQKAADCGYSKAQYNIGLCHEHGRGTPQDLSKAVLYYQLAASQGHSLAQYRYARCLLQDPASSGEPERQRAMSMLKQAADSGLKEAQAFLGVLFTKEPYLDEQRAVKYFCLAANNGDSQSRYHLGICYEKGLGVQRNLGEAVRCYQQSAALGNEPAQERLQTLFFMEAAALGPSNLAVTGLKSFSSPALCSLNTLLAGALRLPHAWSTGNLGLLCRSGHLRPNPRANSSAIPPHPHSLERSLVRLGFG	484411	500243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_484545_485620_485736_485829_485954_487377_487526_488472_488668_488922_489012_489110_489208_492136_492280_493300_493460_493553_493647_496096_496257_496803_497044_497822
877581	contig_12756_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_153228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCTCCGTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256123	253209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_253200_256100
877582	contig_13992_pilon	+	3717	5	Intergenic	novelGene_147645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_3	84.5354955033683	285	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	327	704	566887	570411	FALSE	0	CTGCTGTGTGTTGCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAELQPDVPDLILPSEVLKDTAPVLEGVKGEEITKEEIDILSDACSKLKEQKKSLTKEKEELELLKEDVQDYSEDLQEIKKELSKTGEEKLVEESKASKRLTKRVQQMIGQIDKMIAQLETEQKAGKLDPGQGTPTGENVISVTELISAMKQVKHIPESKLLRLASALDENKDGRIDIDDLAKVIELVDKEDIHISTSQVTEIMTMLEKEEKVEENEKAREKAEKEAAEVKN	561657	573424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_561750_565996_566132_566787_566976_568363_568503_570261
877583	contig_5317_pilon	-	256	2	Intergenic	novelGene_76553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGGCTGTCTGCTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36839	35308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682
877584	contig_6735_pilon	+	1578	3	Intergenic	novelGene_15829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTAAAAAGAAACCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660645	676765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_660751_667077_667226_675440
877585	contig_6277_pilon	-	977	3	Intergenic	novelGene_80405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	4.5	71	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGTGGGAGACCCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697912	544512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_544986_658364_658486_697529
877586	contig_253_pilon	+	1801	12	Intergenic	novelGene_129654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	120.968406503107	75	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	245	1459	306525	314636	TRUE	5	CTGGGAGTCCCCGGCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPPLYPVAGDAGPHGVEDPLGVPGGPEAPLDDLVGAYPNYNEEEEERRYYRRKRLGVLKNVLAASTGGSLTYGVYLGLLQMQLILHYDETYREVKYGNMGLPDIDSKMLIGINVTPIAALLYTPVLIRFFGTKWMMFLAVGIYALFVSTNYWERYYTLVPSAVTLGMAIVPLWASMGNYITRMAQKYYEYSHYKEQEEQGPQRRPPRGSHAPYLLVFQVIFYGFFHLSFACAQLPMVYFLNHYLYDLNHTLFNVKSCGTNSHGILSGFNKTVLRTLPRSRNLIVVESVLMAVAFLAMLLVLGLCGAAYRPTEEIDLRSVGWGNIFQLPFKHVRDFRLRHLVPFFIYSGFEVLFACTGLALGYGVCSVGLERLAYLLVAYSLGALDRLNPGPAGAVAATLRCPWWPGPCSTCCSPSASSSGPLCLGSCSTAGSSMWQLPSGVWAAPSTRSGSARSWESFTRTRRGRISSSPSTTGGRLWPSLLCT	305432	317802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_305524_305823_305966_306513_306668_309450_309613_309817_309951_310301_310396_310942_311068_311949_312133_312591_312868_314537_314657_316829_316911_317561
877587	contig_11512_pilon	-	1319	14	Intergenic	novelGene_43389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1084.4667601389	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	138	902	609650	556848	FALSE	20	GTTCTGTTTTTATTAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPSGGTWRSSGPCRAPTPSPCSALHCWWLGTILLPWTLWWSATLSWTPRRPPSSRWRTVAASPRSPSQPSLLRPSSTSCRAWDTCPLPA	622338	556430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_580103_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
877588	contig_1442_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_172157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTCTCAAATACTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419291	420819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_419300_420800
877589	contig_6084_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_127057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTGGTTTACAGAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432462	429779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_429800_432500
877590	contig_1154_pilon	-	1006	3	Intergenic	novelGene_87221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACAGTTCTAAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1618635	1588431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1589345_1592777_1592838_1618602
877591	contig_6192_pilon	-	2692	8	Intergenic	novelGene_170322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	193.410001218729	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	693	2654	121378	111272	FALSE	20	ATCAAGTTGGCTTGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVPAIKPSREEFLSSRMLMPQDIMAYRGREVVDNTLPLRNAPGCESRTFPPSLYSGLSTPPASYPMYSHLPVSSFLFSDEELRDARMPMANPFPKERALPCDSARPVPSEYSRPTMEVSLSVCHNNIYSPKEAAPEDARSDMHYSVAEGPKPAAPSARNPPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQTSGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQGELGRLSPRTYTAPPACQPPMEPDNLDLQSPTKLSIGGEDSTIPQASRLNNIVNRSLTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHTEMCLHAAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPDLKLSLTKLSLGTFVSSHPLSCLCYNYSGDRVWLRLNCITAL	122070	111233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_111402_112328_112451_114911_115050_115166_115298_116340_116509_117856_118042_118177_119150_121262
877592	contig_5136_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_126644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAACCCCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316874	318060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_316900_318100
877593	contig_9468_pilon	+	2962	15	Intergenic	novelGene_59447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGGCACACTACATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92290	136968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_92603_93107_93222_93877_94020_100541_100654_101821_101954_102968_103097_108424_108543_109702_110188_114029_114162_115130_115242_117411_117813_122481_122609_132946_133016_134479_134995_136904
877594	contig_10451_pilon	-	1144	6	Intergenic	novelGene_138289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	27.6882646621272	145	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	71	871	34136	27644	FALSE	45	TAGGGACAAAAGACTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFWYEGPSLGSHLTYKPSKLELLMKNTSKKTKKEDHVRLRALNGLLYKALTDLLCTSEVSQEVYDLNLELCKVSLTSDFSACRVYWRASLSAEQNEHTNAILQKSAAHMRHLLMSQQTLRNVPPIVFVQDRENAALAEVDRLLAIADFGPPDEKEDLKQNNVRKPLDQPPLTCAAEPAAHPHLFGIDHEALNKQIMEYKRKKEKGLGSVSLGQPEQAQEQLAELVRQIKRKKKKAKPPVHDISPKSFLLGRESEDGVDDDEDHAWLKEGTPECGGLEVETEIRKPGSGE	34848	27370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_28026_29564_29639_32671_32757_33260_33374_33989_34167_34808
877595	contig_2414_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_158457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGGAGATAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153042	155782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_153000_155800
877596	contig_11317_pilon	-	1306	13	Intergenic	novelGene_164078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	79.0732782508309	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	44	892	115161	85625	FALSE	85	AAAAAAAAAAAATCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAALRLCATVILLDMVFSKSVVPDLDDSFKESRKDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGIEMKNMGSPVKVGKMDATSYASLAAEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKDDIIDFAHRVSGALIRPLPSKQMFEHVQRRHRVFFVYVGGESPLKEKYVDAASELIVYSYFFAASEDVVPESVVLREVPAVLVFKDDTYFIYDEFEDGDLESWITRERFQNYLTVDGFLLYELGDTGKLVVIAVIDEKNTSIEHTRLKSIIQEVAQDYRAHFRRDFHFGHMDGNEYINSLLME	116211	85210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11317_pilon_-_85686_86014_86069_86261_86320_88311_88411_91703_91771_92712_92791_93761_93862_96938_97020_98307_98354_105084_105209_106414_106455_115120_115176_116182
877597	contig_14215_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_59360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGAAGAAGTAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185256	183240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_-_183200_185300
877598	contig_18039_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_171242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGGAAAACACGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108538	109173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_108500_109200
877599	contig_5039_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_64808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	406	711	211674	211369	NA	25	GACCTACAGCTATCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRLNGNKFVFFYNCECDLVMLMRSYWSRLGPKPNLSQVVPYKKSRTDTDTRGQTEAIEGPSVNQGMPETVDKRNPPLPRMSRLGRPASPTVRPYISVL	212079	211061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_211100_212100
877600	contig_17198_pilon	+	2394	3	Intergenic	novelGene_62365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3	58	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTCTAACGTCCCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808105	818085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_808382_813030_813150_816086
877601	contig_9683_pilon	-	3194	1	Intergenic	novelGene_151294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGAATATAAGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911394	908200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_908200_911400
877602	contig_4305_pilon	-	1729	14	Intergenic	novelGene_136699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	60	482	630978	629601	TRUE	30	AGCCACCATGTTTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAFRLRMRGDLLGRPGPSEGWAEVCSARSGSSDAFLGHRFSMLPWSVFISSFSEEAGRNPQPVGALPSSSTPFTPGLKCSSTWKRSSDKGSYRAVLIKHDDNLGHVIELRDGTKISQSALPLCILGLIKKSSITEDTQ	633718	624092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_624131_624269_624384_624468_624552_624723_624857_625023_625145_625435_625619_628333_628476_628655_628880_629203_629338_629525_629637_629812_629913_630540_630665_630815_630981_633661
877603	contig_7775_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_37484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACAATTCAGTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174573	175499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_174600_175500
877604	contig_14744_pilon	+	2667	12	Intergenic	novelGene_66113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_9	20.7889830963859	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	853	2559	109	2667	1563376	1578116	FALSE	40	TACGTCAAGAAATTCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTTAPNLSDSSSSSSSSPGQTPQSPSLLSKRKKVKMKREKASSGKRSSSRSMDSDPAMLSLGGSKPEDMLWFHRALTLLIILRHLTRKDPQGLGVTSDAIADACQALVGPTAHSRLLVISGIPTHLDEGIVRGAIRKACNAHGGIFKDEIYIPLQEEDPKKPKDKAEGGDGKAEPEKTLGFPGTDSLEVSTSSSLTPAMSVSASASTSQASICSSQGFSQTVSDLSVDPLPSGLELPIPPGLLEPHVVSSQESLDVSLCSTGSLGSLGSLGEPLDNAEMASVLDVGSMYTVTSLDSQPLTARPIKGFAVVEIRSRAKIEKIRASLFNNNDLIGLSSLDGEDELMEMSTEEILTVSVVNQSLFDTQGSPGLEDYFNDKSIKGEKLVPGAREVLTEIFKSCAHSEQMLSLTPAKPIKVSDIYLSKEQINSQTPGNLLHIFFTNVRPPKKVLEDQLTQILRKYGVPKPKFDKSKYSKAGKEQHPVKVVSTKRPISKPPAKDKAVLNSVRSALSEKKPTVKPKSPEKSKPDEKDPEKSPTKKQEVPEEKYLTLEGFHKFVIDRAKQDIRSVWRAILSCGYDLHFERCACIDVRHAQKASRKWTLEMDVALVQYINRLCRHLAITPARLHPHEVYLDPADSADPRVACLLNVPIESLRLRFALLQSLNTTLETFFLPLVELRQTPMYTHSIAALLKEAKGLIFYDTKVTVMNRVLNATVQRTADHAAPEITLDPLEIVGGEIRASENSYFCQAARQLASVPSSQLCVKLASGGDPTYAFNIRFTGEEVHGTSGSFRHFLWQVCKELQSSALSLLLLCPSSAVSKNKGKYILTPSPITYGEEQLLHFLGQLLGIAIRADVPLPLDLLPSFWKMLVGEPLDPDLDLKEADILTYN	1563267	1578116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1564204_1565192_1565401_1568591_1568816_1568899_1569052_1570765_1570870_1571600_1571725_1573682_1573874_1575117_1575265_1576204_1576325_1577106_1577263_1577578_1577683_1577915
877605	contig_9527_pilon	+	1610	9	Intergenic	novelGene_134096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	55	junction_8	112.865448100825	34	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1500	111	1610	728238	742217	FALSE	15	CGGCTCGATACCTGGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRSSEELDGLFRRYGSAVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGALLGGDLSSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSAQLGAPSRKPDLRVITSQGGKGLMQHLNNAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPQPQQPQQPQQPPQQQPHLVPVSLSNLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLGSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRM	728127	742217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_728292_729003_729208_730749_730888_731905_732117_732352_732410_734188_734380_736106_736237_741244_741468_741925
877606	contig_7843_pilon	+	3245	1	Intergenic	novelGene_152047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGGACAGGCTTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474998	478243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_475000_478200
877607	contig_7629_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_153565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1311	1667	252378	252734	NA	50	TAGAGCTATACAATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIHRLIENPETNPCVSGQPLNGKRTVFSVLGAETDNWIVICKRMNLNHCFTTNTKINSKWIKALNVRTKTIKLLEEDIGKNPNDLRLGNRFLDWTPKAQATKQKINWTSPNLKTFVL	251067	253277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_251100_253300
877608	contig_4604_pilon	+	1742	2	Intergenic	novelGene_19113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	56	436	5641	21584	FALSE	65	TATTAAGAAACCAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSAVIAFGLWFRFGGTMKDLSSEDKSPEYFYVGLYVLVGAGALMMAVGFFGCCGAMRESQCVLGSVSGVRGWRGLGGRSGKGFGLKGVRTSGLQPQLVHRLPETLATHSLSLRLSFSMSCIRIILLLSLSHVESVKINESLV	5585	22890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_5690_21252
877609	contig_5797_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_56911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89164	87617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_87600_89200
877610	contig_1925_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_162211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCACCCAGCAACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209899	207906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_207900_209900
877611	contig_253_pilon	+	2184	12	Intergenic	novelGene_129702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	59.1473855985241	87	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	333	1937	501196	505891	FALSE	25	CCACAGCATGCCCACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEVGPARDPLADGVEGLGRASPEPSALPAQRTPSDVASPEPEGSQNSLQAAPATSSGEPWRASTASCAPAAGSEAPDSPTSAARLDFKVSGFFLFGSPLGLVLALRKTVMPALEVAQMRPACEQIYNLFHAADPCASRLEPLLAPKFQAIAPLAVPRYQKFPLGDGSSLLLADTLQTHSGLFLEELEMMVPSTPTSASGAFWKGSELGTEPPAQPAAPSTTSEVVKILERWWGTKRIDYSLYCPEALTAFPTVTLPHLFHASYWESADVVAFILRQVIEKERPQLAECEEPSIYSPAFPREKWQRKRTQVKIRNVTSNHRASDTVVCEGRPQVLNGRFMYGPLDVVTLTGEKVDIYVMTQPLSGKWIHFGTEVTNSSGRLAFPVPPERALGIGVYPVRMVVRGDHTYAECCLTVVARGTEAVVFSIDGSFTASVSIMGSDPKVRAGAVDVVRHWQDAGYLIVYVTGRPDMQKHRVVAWLSQHNFPHGVVSFCDGLTHDPLRQKAMFLQSLVQEVELNIVAGYGSPKDVAVYAALGLPPSQTYIVGRAVRKLQAQCQFLSDGYVAHLGQLESGSHPHAPTGPPRAALAKSSYGVGAPVDFLRKQSQLLRTRGPSQAEREGPGTPPTTLARGKARSISLKLDSEE	500783	506138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_500929_501008_501212_501671_501843_502442_502608_502795_502945_503057_503169_503483_503601_503788_503938_504013_504164_504231_504416_504724_504854_505627
877612	contig_407_pilon	+	3141	18	Intergenic	novelGene_176519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25.6608166013967	38	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	324	2534	250056	266048	FALSE	25	AGCAGCTGAACCACGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTCRINEISCGAHSTQCVPVSWRCDGESDCDSGEDEENCGNVTCSADEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGPHEFQCSTSSCIPLSWVCDDDADCADQSDESLEQCGRQPLTHSRCPASEIQCGSGECVHRKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECQDGDCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVTCKNINQCSGPGKFKCRSGECIDISKVCDQEQDCRDWSDEPLKECDVNECLVNNGGCSHICRDLVIGYKCDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPEICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYNPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGSKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTVDIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHALVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNLEENGQKCRRINVTTAVSGVSIPPKGTSAAWATLPLLLLAMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA	214927	266655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_407_pilon_+_215002_236244_236369_248200_248324_250053_250177_252951_253324_253430_253554_253635_253759_254607_254728_254830_254957_255668_255841_256680_256900_258258_258378_259592_259733_260052_260195_261620_261768_263374_263456_264990_265161_266012
877614	contig_5718_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_110397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCCAACTTATATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294481	1292721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1292700_1294500
877615	contig_11883_pilon	-	1116	3	Intergenic	novelGene_163773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_1	71.5	31	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTATATAACAACACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144816	66475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_67356_140649_140790_144720
877616	contig_15273_pilon	-	2249	1	Intergenic	novelGene_140432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112483	110234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_110200_112500
877617	contig_2854_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_120882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100922	1101924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1100900_1101900
877618	contig_9363_pilon	-	2704	7	Intergenic	novelGene_6788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	583	junction_5	360.220033066211	19	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	106	828	1548961	1543516	FALSE	40	ATTGAATCACTGAATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVA	1549066	1541639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
877619	contig_12142_pilon	+	865	1	Intergenic	novelGene_147841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTAGCTGCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232781	233646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_232800_233600
877621	contig_10855_pilon	+	1188	5	Intergenic	novelGene_124373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	21.2955394390469	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	227	784	780603	786112	FALSE	40	ATCCACAATTGTGAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDGDSTWVPAQDLGRPHEGNVEEKGMVAGFLTTWSQESVAFEDVAVDFTPEEWVLLDRSQRTLYREVMLETYRNLASLDWRTQLKTKESTSKQDIFGESMFKGMKMVRFPWDGTWSFAHREVREGQKVRKRRKHQDQERNVRQVAFIQEKITSQEKVQEKYELGRTNACFFCKSTVGKSLWL	772728	786516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_772824_780471_780634_781331_781418_782042_782170_785798
877622	contig_11309_pilon	+	514	5	Intergenic	novelGene_149872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAAGGCCGAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56222	65796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_+_56391_56926_57018_64220_64337_64427_64497_65726
877623	contig_16999_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_84983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAACAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97030	98402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_97000_98400
877624	contig_16643_pilon	-	1855	5	Intergenic	novelGene_158111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	186369	175542	TRUE	70	TCAACAATAACAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERSLRRGACFQQGTWLGAGGAQELEVHVFLNTNVQWHLKRALNGFHKALKEALDGLKGERHGVAQLPKAHLLLHLLSGGRVCLQQLYGIGLLADTPDPV	186370	157817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_159091_162612_162709_175359_175594_178002_178166_186281
877625	contig_6278_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_119818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAAAAAGGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480873	478425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_478400_480900
877626	contig_9679_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_173404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTGACCATTCAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4457	6440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_+_4500_6400
877627	contig_12532_pilon	-	2802	1	Intergenic	novelGene_111155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCCTGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118712	115910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_115900_118700
877628	contig_294_pilon	+	3682	5	Intergenic	novelGene_166748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTATTCCGGATATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140709	158934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_142018_147443_147583_152755_152914_153968_154064_156952
877629	contig_21101_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_178192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGAACTACTTACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2860	1137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21101_pilon_-_1100_2900
877630	contig_14341_pilon	+	1513	1	Intergenic	novelGene_111901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	305	787	750527	751009	NA	25	GCCCACATGGTTAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGRVSALNTRLPSGESLPTTTCLSLPPWGGRPCGLCCAVLGGFVSSQVSPGSMKVLLLGAVATQQIRIHCVFICRFHKRYFLKFVFSSGAMFTWFKVQKGQSEKPVSHCCTSFENYSSSGSGCLLCAGHWHNRRLSRHSSSPQAACDRHTEKYVCVLVG	750222	751735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_750200_751700
877631	scaffold_8345_pilon	+	630	8	Intergenic	novelGene_107009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	322.36732755903	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	49	315	570477	599760	TRUE	70	AGGAAAGAAAAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAAALRSSGCPATGTMVFYFTSSSVNSSAYTIYMGKDKYENEDLIKYGWPEDIWFHVDKLSSAHVYLRLHKGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQVIAHLAK	570428	602696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_580076_580125_583891_583932_591070_591123_598125_598202_599737_599819_602217_602322_602543
877632	contig_7379_pilon	-	3212	1	Intergenic	novelGene_150030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTCAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540980	537768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_537800_541000
877633	contig_4674_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_174135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATTTTAATTTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93030	90568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_90600_93000
877634	contig_20175_pilon	+	3677	19	Intergenic	novelGene_142457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	34.0897508220742	94	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	107	2614	19661	50537	FALSE	5	CCTTTAGTGTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQLPEFRRLVLSYSLPQNVLENCRSHTEKRNVVFMQELQYLFALMMGSNRKFVDPSAALDLLKGAFRSSEEQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQLAVNVNSNSGNKCENPMVQLFYGTFLTEGVREGKPFCNSETFGQYPLQVNGYRNLDECLEGAMVEGDIELLPSDHSVKYGQECWFTKLPPVLTFELSRFEFNQSLGQPEKIHNKLEFPQIIYIDRYMYRSKELIRNKRECIRKLKEEIKVLQQKLDRYVKYGSGPARFPLPDMLKYVIEFASTKPASESSPSPSDTRVTLPLSSVHSPVSDLTSKESTSTESSSQDVESTFSSPEDSLHKSKSKPLTSSRSSMEMPAHPAPRTVTDEEINFVKTCLQRWRSEIEQDIQDLKNCIASSTQTIEQMYCDPLLRQVPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIYNQPRQIWLKYNDISVTESSWEELERDSYGGLRNVSAYCLMYINDKLPHFSAETATNESDQMLEELEALSVELKHYIQEDNWRFEQEVEEWEEEQSCKIPQMQSSTTSTSQDFSTSPEPSVASCHGVRCLSSEHAVIAKEQTAQAIANTAHAYENSGVEAALSEAFHEEYSRLYQLAKETPASHSDPRLQHVLVYFFQNEAPKRVVERTLLEQFADKNLSYDERSISIMKVAQAKLKEIGPDDMNMDEYKKWHEDYSLFRKVSVYLLTGLELYQKGKYQEALSYLVYAYQSNAALLMKGPRRGVKESVIALYRRKCLLELNAKAASLFETNDDHSVTEGISVMNELIIPCIRLIINNDISKDDLDAIEVMRNHWCSYLGQDIAENLQLCLGEFLPRLLDPSAEIIVLKEPPTIRPNSPYDLCSRFAAVMESIQGVSTVAVK	18820	51600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_+_18906_19639_19778_20959_21034_21993_22074_23379_23529_25356_25485_32003_32100_35101_35282_36970_37186_38103_38175_39589_39819_42474_42670_43565_43706_45415_45595_45716_45796_46813_46894_47446_47571_49036_49233_50361
877635	contig_11850_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_125202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTTCAAGATGCGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194246	197115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_194200_197100
877636	contig_5640_pilon	+	2998	2	Intergenic	novelGene_27277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	150	1928	962734	964512	FALSE	80	AAAAATTAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKRKWDDDYVRYWFTCTTEVDGTQRPQCVLCNSVFSNADLRPSKLSDHFNRQHGGIAGHDLNSLKHMPAPSDQSETLKVLGVASQEDALLQASYQFAYLCAKEKNPHTIAEKLVKPCALEIAQIVLGPDAQKKLQQVPLSDDVIHSRIDEMSQDILQQVLDDIRASPLKVGIQLAETADMDDCSQLMAFVRYIKEKEIIEEFLFCEPLRLTMKGTDVFNLFRDFFLKHKIALDVCGSICTDGASSMLGENSEFVTYVKKEVPHIMITHCMLNPHALVTKTLPSKLTDALFTVVRVINFIKGRAPNHRIFQAFFEEIGIEYSIFLFHTEMRWLSRGQILTHIFEMYEEINQFLHHQSSNLVDSFENKEFKIHLAYLADLFKHLNELSASMQRTGMNTVSAREKLSAFVRKFPFWLKRIEKRNFTNFPFLEEIVVSDNEGARIAAEITLHLQQLSNFFHGYFSVGDLDEASKWILDPFLFNLDFIDDSYLMKNDLAELRASGQILMEFETMKLEDFWCAQFTVFPNLAKTALEILVPFATTYLCELGFSSLLHFKTKSRSCSNMSDDIRVAISKKVPRFSDIIEQKLQQKSL	961228	965582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_961329_962684
877637	contig_10129_pilon	+	2103	17	Intergenic	novelGene_128164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	187.739139166557	3	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1191	913	2103	598159	626919	FALSE	30	GTATTTGAAGAGATGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQQAASGERHALLLLSDGTVHSCGDNSWGQLGRRDKPHGKRPERIQALETLKVDLLSCGKEHCLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGTGGFEELKFTPKKVNTLADIKIIQVSCGHYHSLALSQDGKVFSWGKNSDGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSVSGTSFGWGSNNAGQLALSGNNVSVQSYKPRSIGALKELGVIYISCGYEHTAVLTQDGKVFTFGDNSSGQLGHSPTAKKKGPQLVEGIDGLVSQIDCGSYHTLAYVYTTPRVVSFGHGPGHTSSSTHPDAMTKNFDVSCLISADDLVNVQVKHIFAGTYANFVTTYQDTSSTSVSRKTLPEISRINQSLTEKWIAVRRGSTEHEEAKSEIGMIFSSPACLTASFLKKSGTGETISIDVDLQVARDTFKKLTEKEWISSLITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEIFLLLPECPVMQDSKNWESLVVPFAEAVCKMSDQSLRVLKKCWASLHESSLNTLVQMLRTAIISQLSYWTDTSQSQCNAKALLGMMKEVYKKVNKANSRLPENAFNINELSNSLNFYIERCRVISRNKNPVPADNLSPLIFTDFPFAFNFLSKMKLLEADSFIKMQGSIEKAYQEHMQMFIQRKSEFPSPPKFILKVRRSHLVEDALRQISQVEVNDLRKALVIEFTEEIVSEAGGVRSEFFHC	586388	626919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_586519_588123_588284_589293_589371_592929_593158_595360_595456_596710_596839_598064_598202_598697_598766_607103_607226_608274_608335_608643_608738_611511_611702_614301_614457_620222_620340_620664_620773_626277_626449_626856
877638	contig_5586_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_143582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATGCTGAAATGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418068	416345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_416300_418100
877639	contig_6544_pilon	-	1563	6	Intergenic	novelGene_142083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	208.400575814943	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	1147	1563	75261	70957	FALSE	60	GAGATTAGGGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPAATFEKHGEHLSRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLRTTGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGGAYAGITGNPSGWHGSSRGHDGMSQRSGGGTGNHRHWNGSFHSRKGSAFQEKPPL	107163	70956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_71184_71956_72087_75201_75317_75995_76227_76286_77031_107047
877640	contig_6199_pilon	+	2001	4	Intergenic	novelGene_126323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	9.20144916122817	97	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	933	1874	3981	6033	FALSE	5	GGCCTGCTGTCTGGCTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRHCSAAGCCTRDTRETRNRGISFHRLPKKDNPRRGLWLANCQRLDPSGQGLWDPASEYIYFCSKHFEENCFELVGISGYHRLKEGAVPTIFESFSKLRRTCKTKGRGYPPGPPDVSRLQRCRKRCSEGRGPTTPFSPSPPTDIPCFPVEEASAPAALPTSPVGRLEPGLSSPFSDLLGPLGAQADEAGCSAQPSPQCEPERQPSPLEPRPVSPSAYMLRLPPPAGAYIQNEHSYQVGSALLWKRRAEAALDALDKAQRQLQACKRREQRLRLRLTKLQQERAREKRAQADARQTLKEHVQDFAMQLGSSLA	3048	6160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_4061_4422_4579_5136_5278_5468
877641	contig_5145_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_131386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTTCCGGGCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620013	618140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_618100_620000
877642	contig_4797_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_6939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656186	657719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656200_657700
877643	contig_4797_pilon	-	2911	6	Intergenic	novelGene_6935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	664.37049904402	959	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	106	651	671697	658501	TRUE	20	CCTGGTTGACTTCAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	671802	656185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_657277_657331_658729_659533_659644_661289_661351_665223_665308_671634
877644	contig_4797_pilon	+	1511	1	Intergenic	novelGene_6932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAACTTTGGTCACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656185	657696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656200_657700
877645	contig_4797_pilon	-	2795	4	Intergenic	novelGene_6941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_3	575.62024518485	1	142	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	70	483	665238	658501	FALSE	20	CTACCTGGTTGACTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	665307	656188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_658729_659533_659644_661289_661351_665223
877646	contig_11106_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_167458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTATTTCTTTGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292309	291110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_291100_292300
877647	contig_4103_pilon	-	1847	6	Intergenic	novelGene_51943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_3	20.9475535564419	83	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	216	413	97558	97142	TRUE	25	TTATTAAACTGCTTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSHSEQPAVAEACLPATSYLLTYLSGHSSDFIELCLYTLGNLIVESEAVRRQLLPQGIVPALAACIQSPHMAVLEALGYALSQLLQANEAPEKIIPSILGSAIPRHVLRLLQPGPKLSPGVAVEFAWCLHYIICR	98194	94675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_95089_95360_95529_96288_97263_97481_97568_97740_97846_98093
877648	contig_8671_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_126257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAGACACAAAACTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491812	490114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_490100_491800
877649	contig_19098_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_65869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGGACGTCTGGCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491923	493558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_491900_493600
877650	contig_6837_pilon	+	2167	10	Intergenic	novelGene_149813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_3	23.5513623102076	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	415	945	11753	15241	TRUE	15	TATGTTGGTAATTGGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLGFEGSANKIGVGVVRDGRVLANPRRTYVTPPGTGFLPGDTARHHRAVILDLLQEALTEAGLTSQEIDCVAYTKGPGMGAPLVSVAVVARTVAQLWNKPLLGVNHCIGHIEMGRLITGAISPTVLYVSGGNTQPNTRLYRLEVSWTSSPPLGDCVLRTSLPHLWGNHRYCSG	11338	17338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_11868_13136_13257_13422_13599_15121_15273_15420_15471_15617_16300_16413_16505_16747_16824_16921_17021_17145
877651	contig_5423_pilon	+	2673	3	Intergenic	novelGene_85191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACCAGGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203255	207762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_204458_205819_205967_206438
877652	contig_5121_pilon	-	2374	3	Intergenic	novelGene_170745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	637	960	440329	439938	TRUE	50	AAAAAAAAAATCCCCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYPISKVGTGFIVHYRFVSKHSEARVYLAYCKVVHTVLTRYSAPSSGYGFSYRSEGCLRAIVSGVPPVSVTPVGLAFFENLIFCSAVFLLLCLGPSVIIPANQSPF	440965	438191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_438765_439096_440223_440290
877653	contig_4364_pilon	+	2868	30	Intergenic	novelGene_34	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	502	1806	301074	322910	TRUE	30	GGTAGAAGGCTTCAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGREEETTATALSFSRLLGTESSHKIYSDARSKFLDVFGLLHFLLAKHKQLHSKGVVLLHREDIKAPIGQHLVQCLQQWHGHPVVQKIILEDLQEGSAEARHGLRVLLNALHVLTQALHRILDRGLRQATSGHGQPQQHMVAERRQAQELGDTWEHLGGRVPVHGGHVPPREDLLQLLSVRHVGERGAVEVQQCQEHVAGVGTDAVDLLTGLLGHIAQDALADAGSNQLRLAPPQQECQLHQTRHCSLADARSDVPPAVCGVVVHAVEQCGVNLGDVRLAQDLVGDASCTHPNCLADPNNGPQAVSPGLSKAHVLGGNVRNGSQTCQDLLQPALQEEAGKGPQGQREAAARHLLRALELGEVLPYQCIHHGRVCLSRLLQVVLAAERSQCQDSCLLDLLSRVTRDQVEIPEGVVDQPLPAVNYGITFKRHFGK	283188	438422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_283484_298403_298492_299637_299748_301065_301156_302646_302737_303529_303607_311032_311154_313891_314030_314108_314271_314370_314455_315013_315159_315844_315931_317036_317158_320223_320305_321421_321500_322870_322934_341505_341537_342346_342371_344982_345042_349099_349220_355492_355566_358293_358376_360982_361068_368136_368167_373002_373064_386161_386317_427491_427587_436570_436646_437122_437184_438334
877654	contig_4180_pilon	+	3155	1	Intergenic	novelGene_8316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTCACCCGCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768024	771179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_768000_771200
877655	contig_20211_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_147667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTCACTGAATTGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39962	38408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20211_pilon_-_38400_40000
877656	contig_10689_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_118609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTCTGCAGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50820	52422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_50800_52400
877657	contig_16122_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_134567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	178	915	562015	562752	NA	5	CTTGGGGTTGTCTGTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGLSHLSDHRSDGFHPCSLHQPIALQAHCCLRVFAPAWNPLPLNFILGLVAYHLIRKAFPRPDHCLSPYFAFFFFFARTNTWHMLYLFAYLFLPVSSHYSISSLSQNWFLKKILVLSVVCPAPAGGTIIYPGMYPGRLSDFLQRKSTLISAQWTVNCMRFIFNQPKGMSAPQVLSRECPAVNYLLNVLWREVIFKDRLRKAWRSASKRLQLRKSYGTQFYSVTHGVTVSQNRWQQFWFWLKDT	561837	563079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_561800_563100
877658	contig_10951_pilon	+	2726	11	Intergenic	novelGene_61637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_6	10.1	20	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	180	1064	250680	268462	FALSE	35	AAACATTCCAAGCCTGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAMEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVITLTVLGVVFGKNDVWFWLIFSAIHILASLALSTQIYYMGRFKIDLGIFRRATMVVYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLIIGNLVNWSFALFGLIYQPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSLEKVLPIPLFCIVATAVVWSAALYFFFQNLSSWEGSPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDRDMVRRDQIPVF	248482	270124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_248541_250558_250683_250889_251008_254969_255107_255919_256029_260300_260378_262457_262505_264139_264246_264335_264447_266100_266215_268399
877659	contig_10864_pilon	+	2136	4	Intergenic	novelGene_107038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	921	1838	621696	622613	FALSE	20	TTGGACCCAGCAGCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDALVVHVDKRLTQVHDHERSFSLWKLHTFYDCIKKITSLHILHDQVDLPRRFVYFVQFHYVGMREALDDKDLAVNHVLLPLESGLVNNLHRIGLPGVPVPALLHKGKIPIANDPASLIMLLHVSCDDARGPWPPAQWSFWFVFFQPCLGLLFYPCRFIISENHFSSSWHTRLFLFLGLRLLTSCPRQLLKVSPVLPQEPATMLVPANIPRVFLHFPQPLVYDRLSFHKFLLRLDCSQRMTFLTFWVSVLFLLCVLAGSPQVLSEIPGTVPAAFTLPLFLPRWGVHLRRPPAASRPRQLLHIIP	600695	622911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_601287_604089_604256_607475_607613_621669
877660	contig_16237_pilon	-	2439	1	Intergenic	novelGene_162670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAACAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14959	12520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_-_12500_15000
877661	contig_7704_pilon	-	1014	6	Intergenic	novelGene_154599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.0892448373223	39	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	160	549	171215	168548	FALSE	15	TCAGCTGGTCTCGGCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFIETQDGAETSVALEKYQEACENGRGAILLSVARGKVSEGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRENDFLTFDAMRHAAQCVGRAIRGKTDYGLMIFADKRFARADKRGKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKYFLRQMAQPFHRLRISLYSSSACWYLFCFR	171748	168082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_168605_170623_170768_170900_171045_171170_171242_171518_171592_171688
877662	contig_18231_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_105879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTAATGTTGCTTGCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230180	228210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_228200_230200
877663	contig_8045_pilon	-	1664	5	Intergenic	novelGene_35325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	180.737378535819	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	126	389	115779	102674	TRUE	10	CAATTTTCTTGTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQLPTKGLASKGAADVGRPGFVRTQATTRGCCGSTQGLFPMSRRRRPLPRRAAGGIEVCAGAVRPPARAGIRIGRRRGRGACASRSHSGGEMIRGQRKVQEVESIIKSMTAEYHLKKFKNKILDFHF	115904	71853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_72769_98059_98115_100942_101059_102484_102764_115605
877664	contig_6589_pilon	+	1129	6	Intergenic	novelGene_26035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1216.18008534921	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	342	959	1725832	1728022	TRUE	35	GGTAAAATAGCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNSLGRPQEALLWSPLPPLSEPQCLPVANGVAHTDHNNYSNNNSSHFSSTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLPIQWFLGRKDVAICSQKVTALEILWSSSTLHTCGRHESESTGRQLTTEIMIETEGNGQKDC	1725384	1731814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1727836_1728038_1731659
877665	contig_19737_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_158988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTACGAGGCTGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115560	113913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_113900_115600
877666	contig_16185_pilon	-	3097	8	Intergenic	novelGene_144768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_4	9.03733751653412	73	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	33	950	190804	182100	FALSE	40	TTAAATCTATTACAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGTQTGTLRMRGVNLSCVRTCMVVAEERPRITLTQSFSKLFKDLGLSARAVSTTFGCRVNVAICLQGTAGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVKVIIAHTETKGPLGDSHLGEIWVSSPHNATGYYTVYGEETLHADHFSARLSFGDTQTVWARTGYLGFLRRTELTDASGERHDALYVVGSLDETLELRGMRYHPIDIETSVIRAHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELEGLEQDALDLVALVTNVVLEEHYLVVGVVVIVDPGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM	192798	179952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_182353_182908_183033_183725_183901_185312_185388_187773_187832_188637_188700_190633_190805_192766
877667	contig_10581_pilon	+	1480	6	Intergenic	novelGene_41363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	5.23832034148352	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	218	631	241619	245338	FALSE	30	CCAGCTTGGTGACAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SILSYAVIAIPIFSGVYGDLSPTELSTLVSKNAFVCLYLISCFTRLIDLSTTLSDVAGYTHRIGELQETLLDMSLTSQDSENLDESEWDLDKAPEWPAEPADTAFFLERVSISAPSSDKPLIKDLGLKISEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWASTRGSVQMLTDFGPHGVLFLPQKPFFTDGTLREQVIYPLKEIYPDSGELEPP	241121	246187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_241216_241313_241406_241587_241678_244308_244515_244687_244780_245281
877668	contig_3601_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_132979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCAATATAGGAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180460	1179013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1179000_1180500
877669	contig_20429_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_169243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAGGAAAAGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97251	99601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_97300_99600
877670	contig_13021_pilon	-	1036	5	Intergenic	novelGene_8278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	275.937832672506	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	142	699	270418	249890	FALSE	30	AATGCTCTGAAATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYEK	270559	249552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249895_251082_251152_252257_252369_265837_266120_270327
877671	contig_8682_pilon	+	852	3	Intergenic	novelGene_165280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	7	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTAAGCTGCTGGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134345	144149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_134481_134986_135109_143554
877672	contig_15087_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_37157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	107	493	33448	33834	TRUE	35	TGGAGAGACAATGGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPGDFGLSLGGCGWGGLHPRLWVALAEVTVGGGGEGPSTKTSCYSLLLLEANPVFPQLLTEGRGWVQGNILLQNLKQNLNTRTGSGTWRGQKHLGESFERMGSYLHPTLETDSPGGISKGWQVRAR	33341	72642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_34037_66632_66722_69117_69200_71083_71173_72506
877673	contig_3426_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_57954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	552	1001	413188	413637	NA	15	TCTGAACTTGGTCTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRKQSPSPGATITFKWKQGNKTTRSEPGPRFWLGTLIPGSMGVGIFCFPFQYSSSMPSSPTVPATLFSAARQPDMVSTVNTEEARLQLAPCLRTTAQVASSTNQIELRDQLGGILHRVRSPGLSLFNPLSTQAPLPWKESKNKGMDTN	412636	414563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_412600_414600
877674	contig_11978_pilon	-	2850	1	Intergenic	novelGene_62946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	474	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATGTCCTGATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043490	1040640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1040600_1043500
877675	contig_14426_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_170616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAGAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39072	39936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_39100_39900
877676	contig_15882_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_144804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTCCAAACTGGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48259	50637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_48300_50600
877678	contig_10286_pilon	-	3149	1	Intergenic	novelGene_98422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAGCAGTGGCACCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426283	423134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_423100_426300
877679	contig_14472_pilon	-	2193	10	Intergenic	novelGene_111165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	6.82225841467056	15	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	225	1208	204582	172361	FALSE	30	TAGTATGGTTTTAAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDVGDFGLRDTLSIASTDSFASAAELAEHREVRHTYSLESLCHCPFYEEAMHLVDEGKIYSRVLRTEMLECLGDSDFLAKLHCIRQAFQVILSETANRMFLAESGRKILSALIVKARKNPKKFEDVFDEMIYFLEQTDHWDSTEMELAATGVKNLNFYDVVLDFILMDSFEDLENPPTSIQNVVNNRWLNSSFKETAVASSCWSVLKQKRQQMKIPDGFFAHFYAICEHISPVLAWGFLGPRNSLYDLCCFFKNQVVFFLKDIFDFEKVRYSSIETLAEDLMQLLIRRTELLMACLGADALRHTSSCISSHGHVMSSGLLEARVQ	222125	171375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_172580_174429_174547_177706_177761_179512_179648_181650_181750_183092_183180_183865_183939_184217_184337_204501_204603_221921
877680	contig_16686_pilon	-	2851	13	Intergenic	novelGene_162095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_2	192.64840960211	80	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	2	2632	180592	152179	FALSE	0	TTTTTTTCTTTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDDISRHDWHYVILDEGHKIRNPNAAITLACKQFRTPHRIILSGSPMQNNLRELWSLFDFVFPGKLGTLPVFMEQFSVPITMGGYSNASTVQVKTAYKCACVLRDTINPYLLRRMKSDVKMSLSLPDKNEQVLFCRLTDEQHEVYQNFIDSKEVHKILNGELQIFSGLVALRKICNHPDLFSGGPRNLRGLPDEELEEDQFGYWRRSGKMIVVESLLKIWHKQGQRVLLFSQSRQMLDILEVFLRARKYSYVKMDGTTTIASRQPLITRYNEDTSIFVFLLTTRVGGIGVNLTGANRVIIYDPDWNPSTDTQARERAWRIGQKKQVTVYRLLTAGTIEEKIYHRQIFKQFLTNRVLKDPKQRRFFKSNDLYELFTLTSPDASQSTETSAIFAGTGSDVQTPKRHLKRKIQPAFGTEHGVLNCKKLPDSDISANDATSPEEKSKFIGAEVPAVTANYSDPLRDDPQTSNNLTSSDVLLEEKYWQINAVSRLEESSKISGNRECSDSPRDSETCRTPGEEGTDEKQDLSCKGEGCQVQCEGQSCQVQKEPFSENAQMGNNFYKHKSKTKHHVVVEDGTLEKRLRRKEKPKCSKLCKDAKFEGTRIPHLVKKRQFQRQDSADESEAKERNSDDYVLEKLFKKAVGVHSVMKHDAIMDGASADYMLVEAEATRVAQDALKTLRLSRQQCLGAASGVPTWTGQRGISGAPAGVKSRFGQKRKSNFSVQRPSSPSLKEKCQDGAMKKEKKDNVPEHFSGKAEDADALSGAPTSSSLLAKMRARNHLILPERLESENVSLPEASAPQPSATEHDDLLVEMRNFIAFQARVDGQASTQEILQEFESKLSASQSCVFRELLRNLCTFHRTSGGEGIWKLKPEYC	180593	151959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_152602_153749_153829_154384_154590_163296_164041_164123_164270_165599_165695_166124_166245_166892_167004_167402_167619_172152_172249_172654_172772_179849_180027_180490
877681	contig_7806_pilon	+	2218	2	Intergenic	novelGene_157547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_1	0	27	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAGATCCCAGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277873	283409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_278111_281428
877682	contig_5817_pilon	-	1968	17	Intergenic	novelGene_169575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_10	74.4162438164545	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1758	210	1967	130205	9421	FALSE	20	TGAGTTACGGCTGGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REVEYIALSRDTTETDLKQRREIRAGTAFYVDQCAVRAATEGRTLILEGLEKAERNVLPVLNNLLENREMQLEDGRFLMSAERYDKLLQDHTKTELDAWKIVRVSENFRVIALGLPVPRYSGNPLDPPLRSRFQARDIYYLPFKDQLKLLYSVGANVPAEKVSQLLSFATTLCSQESSTLGLPDFPLDSLPAAVQILDSFPMMSIKHTIQWLYPYTILLGHEGKMAVEGVLKRFELQDSRSSVLPKEIVRVEGVSESHVSQASVTVQIAGKEVTIKVPAGTKPLTQPCTSDHFIQTLSHKQLLAEMMQSHMVKDICLIGGKGCGKTVIAKNFADTLGYTIEPIMLYQDMTARDLLQQRYTLPNGDTAWRSSPLVNAALQGKLVLLDGIHRVNTGTLAVLQRLIHDRELSLYDGSRLLREDRYMRLKEELKVSDEQLRERSIFPIHPSFRIIALAEPPVIGSTAQQWLGPEFLTMFFFHYMKPLVKGEEIQVIKEMVPNIPQEALDKLLSFTHKLRETQDPMAQSLAASLSTRQLLRISRRLSLYPNENLHSAVTKACLSRFLPSLARAALEKNLADAVIEGTTDNNLEPELKDYRCEVASGSLRIGAVSAPIYKAHEKMKVPDVVFYDNIQHMIVMEDMLKDFLLGEHLLLVGNQ	154568	9419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_9493_22637_22745_25972_26080_37440_37557_50285_50364_53332_53502_66718_66833_68711_68873_105355_105434_105522_105658_108424_108557_121192_121298_124048_124158_126453_126504_126855_127021_130145_130314_154467
877684	contig_16724_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_105286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGTGCTTTTGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538630	536932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_536900_538600
877685	contig_16125_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_155289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	84	320	198622	198386	NA	20	CTCCCAGCAGTTAGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLVLAPHVSPVSQDDLGLVSIVYCLFMVSSCYIWKSQTGGFLSLFYPQLHHVKALASLLLMVAKSVFKKSHYLVVISLFQVQFLIMYYAIRLFCCIVHKLNDDD	198705	196627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_196600_198700
877686	contig_5018_pilon	-	1161	9	Intergenic	novelGene_47180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCCCATCGGCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578672	1574696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1574722_1574798_1574933_1576245_1576361_1576445_1576536_1577513_1577659_1577747_1577870_1577982_1578071_1578161_1578228_1578296
877687	contig_2799_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_85542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705533	703972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_704000_705500
877688	contig_5451_pilon	+	1726	10	Intergenic	novelGene_167154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	69.7471624273466	77	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	62	1057	63825	91218	FALSE	25	TCACATCTACTGCTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPAFAVGLVFAGCCSNVIFLELLARKHPGCGNIVTFAQFLFIAVEGFLFEADLGRKRPAIPIRYYAVMVTMFFTVSVVNNYALNLNIAMPLHMIFRSGSLIASMILGIIILKKRYSVFKYTSIALVSVGIFICTFMSAKQVTSQPSMSENDGFQAFAWWLLGIGALTFALLMSARMGIFQETLYKQFGKHSKEALFYNHALPLPGFLFLASDIYEHAVLFSKSELYQVPVIGVTVPIMWFYLLMNVITQYVCIRGVFILTTECTSLTVTLVVTLRKFVSLIFSILYFQNPFTLWHWLGTLFVFTGTLMYTEVWNHLGATKSPPPKEDKEN	63763	91887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_63902_74151_74266_78226_78330_79514_79565_81944_82027_82245_82307_83823_83934_85834_85911_89661_89738_90971
877689	contig_8138_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_52512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGTTTCCGCGAAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479490	481960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_479500_482000
877690	contig_6175_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_16273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	56	171	161	331	17071	16901	NA	50	TCAAGCATCGTAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPLRNVFPKQLWSGGSSFHQLGACQPPRGVREPSGCSSCGPSAVALGRPPPDMTLSCSDLGQGCRALSPWGLPPFSLQAFSSRVLTLALCAELGCGRKETGMVLLCRH	17231	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_15700_17200
877691	contig_17386_pilon	-	2135	3	Intergenic	novelGene_157946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1189	1914	366903	365175	TRUE	20	GGCTGTCCAGGATTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQRFHVKLNPTRQYPSRRRLSVPDTVSTCMSTPFNQHQTHIHTLLCANLSLLISVRKHIREYHLFQWIHQSLHALQIDDIGTHILIPQENEVSSSSSIMYFKEFCFSEAIRIQLQILFFLQSYIFQSRSIRQTFNKQEAALKNVSNRYSLNSCSPICSFLFQDWRENPFIQGLARALKQMPRWWTQSLCFTNHLDLLSLVSVFWLLKESRIFTTSAAHKCPKDFVYHSGMRPLRSALYM	368091	364176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17386_pilon_-_364242_365018_365197_366199
877692	contig_6102_pilon	+	1285	4	Intergenic	novelGene_32005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCAGCGGCCACGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451427	473474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_452362_455534_455648_470682_470869_473422
877693	contig_7775_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_37508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTTCTGCTGGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316307	319966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_317322_317529
877694	contig_12344_pilon	-	1344	5	Intergenic	novelGene_164869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	35.3022662162077	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	45	1343	153461	118855	FALSE	5	TCACGCTGCTGCTGCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVASAPSGGPRATVMSGDMDKPLISHHLPDSNSGLTEAPPEAPRVGILGSGDFARSLATRLVASGFSVVVGSRNPKRTAGLFPSTVHVTFQAEAVSSAEIIFVAVFREYYSSLCVLSDQLAGKILVDVSNPTEQEHRQHQQSNAEYLASLFPTCTVVKAFNVISAWTLQAGPRDGNRQVPICSNQLEAKRTVSELVLAMGFSPVDMGSLVSAREVEAMPLRLLPGWKVPTLLALGLFICFYIYNFVRDVLQPYVQEGKSKFYKLPVSVVNTTLPCVAYVLLSLVYLPGVLAAALQLWRGTKYLRFPDWLDHWLQHRKQIGLLSFFCAALHALYSFCLPLRRAYRYDLVNLAVEQVLADNSYLWKEEEVWRLEIYLSLGILALGMLSLLAVTSLPSIANSLSWREFSFVQSTLGFVALVLSTLHTLTYGWARAFQESSYKFYLPPTFT	188500	118853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_-_118969_132342_132508_150366_150895_152969_153470_188464
877695	contig_8210_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_30230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAGCTAGGCAGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22506	20732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_20700_22500
877696	contig_10490_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_169881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	190	372	9440	9622	FALSE	10	CCCCAGCTTCCTTCTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGAETRTAEPREKENEAHRGCITCQSSYSKTATEDSNPNCLSLRKPSLKASSRSPWSSQGCDMGSQPPGKCVHTSPGPELTACWPQSFLPSCIPISHSLSESPRDYLSGDGNNFVVLNISSE	6509	12701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_+_6546_9286
877697	contig_12964_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_131654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGGTGTATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107405	109913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_107400_109900
877698	contig_6980_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_36079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTATCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374604	376046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_374600_376000
877699	contig_7020_pilon	-	3171	2	Intergenic	novelGene_57041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	0	244	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAATTGATGGCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38324	33466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_36438_38124
877700	contig_16882_pilon	-	1586	2	Intergenic	novelGene_148256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTCTCCCTCTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593322	590441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_591416_592710
877701	contig_15066_pilon	+	1460	7	Intergenic	novelGene_149556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	67.8986172335065	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	4	987	114962	116837	TRUE	40	CACGTTATAGTCAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMAALRAGQGAGWSLRGLRALGGIRWGKGPLLTPDLRALLTSGTSDPRARVTYGTPNLRARLSAGVPEPRPCLTSGTPDPQARLTAEIPDPRTREASGTPGTRPRVWLAVALGAGGAVLLLWGGGRGPPTVLAAVSAPPPTSPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILGRHPFSSREVPISNGSGFVVAADGLIVTNAHVVADRRHVRVRLPSGDTYEAMVTAVDPVADIATLRIQTKEPLPTLPLGRSADVRQGEFVVAMGSPFALQNTITSGIVSSAQRPARDLGLPQTNVEYIQTDAAIDFGNSGGPLVNLIPCLESVGPGAATLE	114958	118070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_115465_115566_115772_115860_116056_116270_116304_116789_116860_117518_117615_117715
877702	contig_12635_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_60836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGATGACTTTCCGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444440	442730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_442700_444400
877703	contig_6084_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_127049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTAGGAGCGACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356940	358868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_356900_358900
877705	contig_709_pilon	+	4636	1	Intergenic	novelGene_57660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1116	1568	3851447	3851899	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVSWAAETKYRTLGRRLNVLGTARRTNKSVSEETQLECSLEVRMVRLWLAYFGHVIRKDQSLEMGLVEGQRKQGKPSVTRVHTTTTMDSNLPRRRHRTNQHFALYTMAPNSVRTEMHCLTVVDASSLKAGRPSRLLGAPGVLRLAAAA	3850331	3854967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3850300_3855000
877706	contig_848_pilon	+	463	5	Intergenic	novelGene_83342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTCCTCATAGTTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556524	567607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_556593_559110_559229_563376_563448_566202_566360_567558
877707	contig_8089_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_177429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCACACTGGAGTTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27328	29426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8089_pilon_+_27300_29400
877708	contig_12079_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_67368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATCGTATGCACGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297657	295855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_295900_297700
877709	contig_4519_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_123743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGATGCGTCATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809138	810921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_809100_810900
877710	contig_740_pilon	+	1407	2	Intergenic	novelGene_158941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	0	1039	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTCTCAAATCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146638	152307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_740_pilon_+_147504_151765
877711	contig_2933_pilon	-	3834	9	Intergenic	novelGene_111328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_5	28.5326019668729	92	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	72	1661	610431	603809	FALSE	30	ACCAAAGCCGTTGCCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVFGSSDCDLWVTLAQTLSRLSPMQAGPLALGILKLHVCPQALRTQAFDVLLLPLACVLEAAAQPPGSSGLLDGTGSSLAMADALLASTSSCAGLLCQSLAHLGELQPLPHGPRLWPQAPLLKATVTTLCFCSGSAVPVSSVGGRLCRILAGCVRVQRAALDFLGTLSQGTGPQESVMQVFAILLEYLRSPESSPTVLKKAFQATLRWLLSTSKVCGSNDPGCHTQPFLRELFPVMQKRLCNPCWEVRDSALEFLTHLTAHWEGQPGFRQALLASDMPELAQQLLQDPEAYVRASAVAAMGQLASQGLHATPTGPEHPGAQQKSLLQELLHILSTDSEGFPRRAVMQVFTRWLQDGHTAMAEDLEQFMARVFQVVSRDLDWEVRVQGLELARVFLAQTLGPPDCPYAVALPAAAPPIPPIEVLRTLGRVQLLEFAFRALFDCDRPVAQKSCDLLLLLRARTAPDSGLQGAGGGPDTATVEAALRAWQAGEQGQPLGELVPEVVVAVLRALDLEGLQATLAQSSDHVEQSPRSLLQDMLATVGALGGHEADCY	610502	601635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_604502_605281_605458_605568_605668_605793_605897_607107_607182_607396_607584_607663_607783_609056_609149_610384
877712	contig_6630_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_30718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAAAAGTATTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425293	427277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_425300_427300
877713	contig_14160_pilon	-	2372	5	Intergenic	novelGene_171541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	63.1124987621311	100	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	95	1723	27093	4034	TRUE	30	GTAAGTCTTGAAACGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDVEEGEFLLSFLQGLTSLSFQLSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIRRNRKLTASSLSLDTASSSQLSCSLNSDSGLHQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQEVLSEFSKAQVNSVPTNGLSQETETSTLQSSLSCRGLDTSAYLHLDVPAEPLPAQASSRTPDGDHKQEPLFQMPGTLDLLQLSAAQTAPSGDTSAQKPSGPVREKTRAVRQGSGPEKPLEGDRVGLNLVVSSPTSPKSKSWISEDDFYRPPQERPPESLSDHSISSAKWTPESRPGLHRHFSLGPRKSHSMGALDRACVPSPGSRKTKAAPMQEHKNFCVVHRRQMGLSNPFRGLMKLGTLERRGAMGIWKELFCELSPLEFRLYLSNEERTCVENCSLLRCESVGPAHSDGRFDLVFSGKKLTLRASSQDEAEDWLDRVQEALHKCRPQQEDEWVNIQYPDQPEDLPEAPQGGLPLPLRPTLRA	27187	993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_1140_3530_4453_7428_7700_14681_15088_26560
877714	contig_15354_pilon	-	2326	3	Intergenic	novelGene_65740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTAGATGGCGGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608956	603699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_603774_606047_606223_606879
877715	contig_10750_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_172610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157997	155513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_155500_158000
877716	contig_20951_pilon	+	2655	5	Intergenic	novelGene_43103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	11.3880419739304	173	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	33	1514	98463	107927	FALSE	0	GCCCTGTGGCCCGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPANGTAEAVQIQFGLINCSNKYLTAEAFGFKVNASASSLKKKQIWTLEQPPDEAGSAAVCLRSHLGRYLAADKDGNVTCERETPSADCRFLIVAHDDGRWSLQSEAHRRYFGGTEDRLSCFAQSVSPAEKWSVHIAMHPQVNIYSLTRKRYAHLSARPADEIAVDRDVPWGVDSLITLAFQDQRYSVQTADHRFLRHDGRLVAQPEPATGYTLEFRSGKVAFRDCDGRYLAPSGPSGTLKAGKATKVGKDELFALEQSCAQVVLQAANDRNVSTRQGMDLSANQDEETDQETFQLEIDRDTKKCAFRTHTGKYWTLTTTGGVQSTASTKNASCYFDIEWRDRRITLRASNGKFVTAKKNGQLAASVETAGDAELFLMKLINRPIIVLRGEHGFIGCRKVTGTLDANRSSYDVFQLEFNDGAYNIRDSTGKYWMVGSDSSVTSSSDTPVDFFFEFCDYNKVAIKVGGRYLKGDHAGVLKASAETIDPATLWEY	98430	109068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_99295_106621_106779_106870_106993_107185_107354_107724
877717	contig_14928_pilon	-	2699	10	Intergenic	novelGene_98792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_8	100.811154585635	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	109	1200	308169	278576	FALSE	30	TTACACGATGATACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCPRAWAQEAAGADGSPATDREEAQDPHAKHLYTADMFEHGIQSAAHFVMFFAPWCGHCQRLQPTWNDLGDKYNNMKDARVYVAKVDCTADSDVCSAQGVRGYPTLKFFKPGQEAVKYQGPRDFQALETWMLQTLNEEPATPEPEVELPRAPEPKQGLYELSANNFELHVAQGNHFIKFFAPWCGHCKALAPTWEQLALGLEHSETVKIGKVDCTQHYELCSGNQVRGYPTLLWFRDGKKIDQYKGKRDLEALRDYVESQLQGPEREAAETIEPFEALELAVEPAADKGTVLALTESNFDNTVAEGITFIKFYAPWCGHCKNLAPTWEKLSKKEFPGLAAVKIAKVDCTAERNICSRYSVRGYPTLLLFRAGKKVSEYNGGRDLKSLYQFVLRQAKDEL	308277	277076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14928_pilon_-_278699_280380_280511_282073_282157_286607_286752_287421_287509_289948_290065_293589_293687_298585_298692_303504_303655_308113
877718	contig_5480_pilon	-	926	3	Intergenic	novelGene_107233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAATGTTGCTGGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446449	307739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_-_308052_309776_309920_445978
877719	contig_16846_pilon	+	2173	10	Intergenic	novelGene_82888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	110.31067239594	81	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	328	1392	348050	370491	FALSE	35	TCCTCAGCATTAATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSRSENVEVLEEEPVMSKTHDHQLKSSSNLVEVCTKSSASLEMTKSIAKERIHLGSSPPKGGSCDLSHQEGLQSRSLHLSPQEQSVHQGRRQSWRRASMKGMNRRKSLPPFHQGITALSRSISVNLAESKRLGALLLSSFQFSIQKLEPFLRDTEGFSLESFRAKASSLSEELKHFADKLESDGTLQKCFGKSKEKELDLSLEASVAEMKEYIAKFSSERQTWDHLLLHYQKEAEEIPSRSAEGRIIEVEVEPTTYLGSSQSEVLNTKPDYQKILQNQEKVFDCMELVMDELQGSVKQLHAFMDESTECLQKVSVQLGKRSMQQIDPSPARKLLKLRLRNPPTTHCSGSCQ	347722	371272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_348084_348292_348617_350707_350782_352036_352110_353713_353802_356714_356775_357182_357258_368496_368642_369719_369808_370387
877720	contig_4736_pilon	+	1330	7	Intergenic	novelGene_168625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_3	56.2980658834939	88	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	168	764	248143	272520	FALSE	20	GCAGTCTTTGAGTAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHNSSQKRHWTFASEEHLASLRADANRKFKCKAVANGKILPNDPVFLETHEEMIICKYYEKRLLEFCSVFKPAMPRSVVGTACMYFKRFYLNNSVMEYHPRIIIYLSESLMLKENRTCLSQLLDIMKSMRNLVKKYEPPRSEEVAVLKQKLERCHSAELALNVITKKRKGYEDDDYVSKKSKHEEEAWTDDDLVDSL	247975	273086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_248260_250224_250348_256168_256243_266104_266176_268852_268965_271628_271690_272481
877721	contig_14681_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_134198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCAAAGCCTCTGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23255	25135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23300_25100
877722	contig_8687_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_169676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCACAGTGCCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323792	325009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_323800_325000
877723	contig_17989_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_150804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAACAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191835	190702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_190700_191800
877724	scaffold_12510_pilon	+	1849	1	Intergenic	novelGene_151373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAACTGGAGAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209406	211255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_209400_211300
877725	contig_16516_pilon	+	1987	9	Intergenic	novelGene_173248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	7.88986691902975	34	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	8	826	13019	28564	FALSE	10	GTAGTGTTTCCTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTRIQCGPDEYPHNNLCCKNCASGEYLSKHCTRNHHAGKCEACEHETYMAHSSGLNDCLPCTQCREDQEVVTNCTRTRNRQCQCRTGFYCEQADCEMCRACLRCPEGTVIRHPCNATADTVCVNKKGNANLYLLFMIIPVLLFTVYIYCCKRKGTPPFSTVISFFEERWRKPGGPIPDSSPCGQALTHGDVEAGHPAPDMQPMVLLKESSVSAPENRTPSSFSKDLEEVLWRRTEAGDPGQLPETCPDAVNRPEGQTTNRSYSEFGKEVL	13011	29725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_+_13095_15312_15442_19586_19696_21278_21350_23420_23502_23898_23938_24044_24071_25749_25994_28520
877726	contig_7020_pilon	-	3279	1	Intergenic	novelGene_57050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGGGAACAAGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73931	70652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_70700_73900
877727	contig_6854_pilon	+	1974	7	Intergenic	novelGene_169494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	40.8931534611847	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1809	164	1972	476278	486165	FALSE	30	ACCCCAGCACCCCACAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGSDVKLNSPSSLIGQALTEILQHPERARDALRVLLHLVEKSLQRIQSGQRNAMYTSQQSVDNKVAGIPGWQALLTAVGFRLDPPASGLPAAVFFPTSDPGDRLQQCSTTIQSLLGLPNPALQALCKVITASETGEQLISRAVKNMVGMLHQVLVQLQAGEKEQDFASAPIQVSISVQLWRLPGCHEFLAALGFDLCEVGQEEVILKTGKQANRRTMHFALQSLLSLFDSTELPKRLSLDSSSSLESLASAQSVSNTLPLGYQHPPFSPTGADSIASDAISVYSLSSIASSMSFVSKTEVGLEGGGTRGRQDYDRSKNAYPQRSTLPQHQLSPQARTAGSKDEEEYEGFSIISTEPLAAYQENRKARFSPDHSQSRVGTAGGVKVSVSSKGSISTPNSPVKMTLIPSPNSPFQKVGKLASSDTGESDQSSTETDSTVKSQEESNPKLDPQELAQKILEETQSHLIAVERLQRSGSQASKSNNSDDGVSVPNSTTVFRASETSAFSRPVLSHQKSQQSPVTVKPKPPARSSSLPKVSSGYNSPTTSETSIKDSRSQNSGRPSPGSDSQTSLTDQPLFKLKYPSSPYSAHISKSPRNMSPSSGHQSPAGSAPSPALSYSSAGSARSSPADAPDIDKLKMAAIDEKVQAIHNLKMFWQS	475262	486167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_+_475381_476232_476465_477097_477175_478708_478733_479721_479852_483669_483778_484882
877728	contig_4114_pilon	-	1232	2	Intergenic	novelGene_15572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGAGTCCTTCACTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43659	42315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_42386_42497
877729	contig_19744_pilon	+	3104	1	Intergenic	novelGene_120376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143029	146133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_143000_146100
877730	contig_13460_pilon	+	883	5	Intergenic	novelGene_162170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	61.842541991739	112	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	224	628	7936	19547	FALSE	15	GCAAGGTATCCCTCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENSPSPLPERAIYGFVLFLSSQFGFILYLVWAFIPESWLNSLGLTYWPQKYWAVALPVYLLITIVIGYVLLFGVNMMSTSPLDSIHTITDNYAKNQQQKKYQEEAIPALRDIPISEVNQMFFLAAKELYTKN	7265	19802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_7465_7911_8018_13302_13376_17726_17846_19416
877731	contig_7165_pilon	-	3263	1	Intergenic	novelGene_116833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATATGGTGGATAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256097	252834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_252800_256100
877732	contig_3727_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_146755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGGAAAAAACGTAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350462	352349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_350500_352300
877733	contig_4501_pilon	-	1292	6	Intergenic	novelGene_168982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_5	47.4274182303865	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	18	977	190111	66855	FALSE	20	TAAGGATTTCTGAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGGWRMIGPGSHQQQRRPRGGGFSFECRPSSSPPPPEPLPSTHSSASRGGPGSRDSMSDSEEESQDRQLKIVVLGDGTSGKTSLATCFAQETFGKQYKQTIGLDFFLRRITLPGNLNVTLQVWDIGGQTIGGKMLDKYIYGAQGILLVYDVTNYQSFENLEDWYSVVKKVSEESETQPLVALVGNKIDLEHMRTVKPEKHLRFCQENGFSSHFVSAKTGDSVFLCFQKVAAEILGIKLNKAEIEQSQVIIVNCIFLKIIDFLNKILFFTHESFTIYAFHVHISNSLRNRLHNSVFIAKDVGCYLLFFCRSMISLKRHFVLFVGK	190128	66539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_-_67167_71653_71758_145989_146120_179875_179965_185338_185436_189883
877734	contig_9981_pilon	+	2881	6	Intergenic	novelGene_121060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295524	312438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_296884_297916_298046_301042_301142_306125_306236_307353_307498_311398
877735	contig_9727_pilon	-	2554	8	Intergenic	novelGene_86361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1923	2261	566906	565177	TRUE	20	ACGACTTCCGGTATGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPVNVDMCAEVFNELHGSRQVTRLEQVQLMVKGSGALSQCFQLFKKYSGGAGLRTQTGVGAGEKVDLRQELNMLLHLLLESLPLGKIENQSLGHFFALGLNPLHLLLLSG	573294	562137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_562196_562769_562811_563392_563501_565090_565288_565395_565486_566768_566923_568546_568695_571536
877736	contig_6544_pilon	-	1707	6	Intergenic	novelGene_142080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_3	245.050688634005	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	1279	1707	75261	70945	FALSE	65	GAAAAAAAAGAAGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPAATFEKHGEHLSRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLRTTGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGGAYAGITGNPSGWHGSSRGHDGMSQRSGGGTGNHRHWNGSFHSRKGSAFQEKPPLEIRE	107175	70944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_71184_71956_72087_75201_75317_75712_75773_75995_77031_107047
877737	contig_3787_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_102422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAGTAGGTGTAATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577706	575829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_575800_577700
877738	scaffold_13505_pilon	-	369	6	Intergenic	novelGene_111474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6158.2052255507	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548323	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_541897_547363_547465_547734_547806_548295
877740	contig_13700_pilon	+	2050	5	Intergenic	novelGene_68277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1420	1809	98330	100992	TRUE	20	TTGATGCCTTCAGGATATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYLMEPWIFSVQETSQVTLLSCRTSFHLCPGGGEGTLASLLQLMIISSGMIRLFSMPILGWLPRPRKSPGGSILKLAILSLWLSITQKPYSFNNFSFSSLIFCFFAHLFSCFRLGFEILAHLSEITFA	96910	106588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_98452_98711_98901_100913_101028_102733_102853_106501
877741	contig_6914_pilon	+	3151	7	Intergenic	novelGene_151755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	28.5404196807888	47	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	54	2087	276941	280750	FALSE	30	AACGCTAAAGTCCGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAAGSQRGPSREEVRMVGERCARDLMVPLGPRLQAFPEELLRQRPGHDGCPEYLIRWSVLKCGEVGRVGVGSEDKAEHILMWLSAPEVYANCPTLLGERALSKGPQHEPAGGSGSFPRDPGGLDEVAMGEMEADVRALVRRAARQLAEGGTSSLTAAVLHTIHVLSAYASIGPLTGVFRETGALDLLMQMLCNPEPQIRRSAGKMLQALAAHDAGSRAHVLLSLSQQDGIEQHMDFDSRYTLLELFAETTSSEEHCLALEGIHLPQIPGKLLFSLVKRYLCVTSLLDQLNNSPEPGAGDHGFHSPTKEEFSREKSRGQRELEFSMAVGSLISELVRSMGWARSLSEQGTLPPRPTRSIFQPCISGPSLLLPTVITTPRRQGRAFRQRCEFSSRSGYGEYVQQTLKLGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPVQVFWQSTGRTYWVHWHMLEVLGPEEAAEDTPSAAVEKGAGAPMLGTAFPAWDWKPVDGLYSLPYLQPEPQKNEELGYLTQAEWWELLFFIKKLDICEQQPIFQNLRENLDETLGEKALGEISVPVEMAEGLLQVLRNRFEDSTLSDLLNSQIYTKYGLLPDELSSSSSSRSHFCTPDPEEESKSEADFSEDETESSKAKAGSPKAETGPAKAKAEPPMAQSDSQLFNQLLVAEGLALPPEIKETASGKSGSGRGR	275149	281814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_275194_276931_277539_278088_278244_278547_279064_279561_279698_279840_280035_280315
877742	contig_9133_pilon	+	1092	7	Intergenic	novelGene_109296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	81.7287179229757	6	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	194	862	225876	257666	TRUE	40	AAAGAATCAGCCCTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVRPLSQRSLAAAPAAAPHPPLPCLLRVQATAGASGGRAATKRLRQAASSSWRLFSAQSRSGGKMAPAPQGVREELLLGSWFGPLLRLFFLAQAVFLLLPTARAGLCPAPCSCRLSLLDCSRRKLPASSWRALSGPLPPDTSSLDLSHNRLSNWNISLESQTLLEVKMNYNELTEIPYFGEPASNITLLSLVHNIIPEINAEMLQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRIATLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRISMIPPKIFKLPHLQFLGT	225682	258400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_226115_254387_254454_256482_256558_256720_256856_257390_257535_257656_257802_258305
877743	contig_10948_pilon	+	2130	1	Intergenic	novelGene_124969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACCAATTCTGAGACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118460	120590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_118500_120600
877744	contig_15361_pilon	+	1706	3	Intergenic	novelGene_167866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTGGAAATTTCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442975	449810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_444438_446968_447113_449710
877745	contig_10404_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_138717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGTTAATCTACTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266987	1268090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1267000_1268100
877746	contig_3584_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_108161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGGGCGCCCGCCCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480978	482310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_481000_482300
877747	contig_1339_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_163150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGGAAGACAGTGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605790	604408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_604400_605800
877748	contig_6361_pilon	-	905	5	Intergenic	novelGene_24029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	400	junction_4	110.804726884732	1512	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAACTTTTATTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594706	551044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_551475_556742_556858_572329_572455_577570_577700_594600
877749	contig_4388_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_161971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCCAACCCTCAGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782635	780078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_780100_782600
877750	contig_2069_pilon	-	3889	1	Intergenic	novelGene_23369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTCTTAGATACAACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039113	1035224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1035200_1039100
877751	contig_5317_pilon	-	2658	16	Intergenic	novelGene_76579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	180.113248325109	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	100	855	377315	373913	TRUE	10	TTTGTGTATTGTGTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGKPLSNMKILTLGKLSRNKEEVKTMIEKLGGKLTGTATKASLCISTKKEVEKMTKKMAEVREASVRVVSEEFLQDVSGSTRSLQELLSVHVLSSWGAEVKVEPAEVVAPKAKSGAALPKKSKGAVKEEGVNKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	379157	354927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356343_356925_356981_358004_358093_361103_361257_361766_361866_364146_364276_364800_364924_366581_366641_370354_370488_373902_374100_375290_375424_375690_375760_376055_376299_377191_377333_379075
877752	contig_15350_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_164267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	51	398	278296	277949	NA	15	TGCTGTAGATCACGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDYHQSWSRDGCPRNSGGGFGGSRGGGYGGSRGFGGGGGGGRGGRGRHPGHLKGRQIGLWYARLQEQKNKEAERQEVSRDSIMGWGRDEAGGLLPPDAPTFFLLFLNLVLFLN	278346	276635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_276600_278300
877753	contig_3832_pilon	+	2670	1	Intergenic	novelGene_161452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCCGTGACCTGCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314494	317164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_314500_317200
877754	contig_10581_pilon	-	3240	2	Intergenic	novelGene_41445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	690	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGATTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795959	792648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_793489_793559
877755	contig_9471_pilon	-	1315	2	Intergenic	novelGene_21728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAATTAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166965	165587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_166831_166893
877756	contig_10753_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_105157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1929	2255	405914	405588	NA	20	GGATGCCGCAACAGGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHTTLALAAGEAFPSVGGMKPTWWVHGESSPLGSQSSLPHWLLGPGLCSLRGPQASCLPPSQAQLSCLGHLLAASHPAGTPGCSCLPDTFGSLLRLGWLSSPNSCCI	407842	405147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_405100_407800
877757	contig_3942_pilon	+	3526	21	Intergenic	novelGene_128824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	137.828371535036	785	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	976	2931	74	3004	1184518	1194392	FALSE	5	GTGTACTCTCGCGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSELGPAGARDPIPVPAERPLGRAMDAAEPGLPPAPEGRKRYSDIFQSLDNLEISLGTVTLELLVGDPVLSGDPEPDKAPTATVTSETCCWSSPSPEGPAPLKGEELDLRLIRTKGGVDAALEYAKTWSRYAKELLAWTEKRASHELEFAKSIMKIAEAGKGSIHQQSHMPLQYIYTLFLEHDLMLGAQAQETVTQQRRDYFQPLAAKRTEIEKWRKEFKEQWTKEQKRMNEAVQALRRAQLQYVQRSEDLQARSQGSPEDPAPQASLGPSKQQERRRRSREEAQAKALEAEALYQACVREANARQQDLEATKQRIVSHVRKLVLQGDEVLKRVTLGLFGLRGTQAERVPRAFAALAECCAPFEPGQRYQEFVRALRPEAPPPPPPPFFFQEFVPATHSSPPNTRKKLSGPLPPPRLDEGVAEPGPWEDASLRWQGTPGPTPGSDVESVGGGSESRSLDSPTSSPGPGSRLLVKASSIGTESSDDFEERDPDLGDGLENGMAGPFRKWTLSSAAQTHRLRRLRGPAKCRECEAFMVSGTECEECFLTCHKRCLETLLILCGHRRLPARTTLFGVDFLQLPRDFPEEVPFVVTKCTAEIEHRALDVQGIYRVSGSRVRVERLCQAFENGRTLVELSGNSPHDVSSVLKRFLQELTDPVVPFHLYNAFISLAKTLHVDPGDNPGTPSPSLEVIRSLKTLLVQLPDSNYNTLRHLVAHLFRVAAQFEENKMSANNLGIVFGPTLLRPPGCPGAAGAGPVACLLDSGHQAQLVEFLIVHYEQIFGMDELPLATEPSSHNPSPAPGALTTSLQPVPPQLVQDPLPPALASDPGPDPEPQCVLEKDPAAVPAESPTLQSDQREEAATDTRDGGGEASNRGPEDSLLGTQSRGHFSRQPVKYPRGGVRPVTHQLSSLALVASKLCEETPVTSVPRGSLRGRGAGPAAASPEGSPLRRTPLPKHFEITQETARLLSKMHNEAVPRTTCCMDPQPEVVDPQPEEAEDHL	1184444	1194914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1184537_1185566_1185652_1186332_1186409_1186839_1186898_1187243_1187370_1187457_1187523_1187613_1187722_1188144_1188226_1188310_1188482_1188563_1188702_1189035_1189233_1189501_1189612_1189683_1189774_1190092_1190171_1190239_1190395_1190638_1190828_1190934_1191073_1191170_1191368_1191696_1192085_1193797_1193865_1193997
877758	contig_6199_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_126380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1463	1909	391303	390857	NA	10	CTAACGTGTTGGGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHHRPHMGQGGSQAPPSTWQGPVGPGAEGSLSVPHPSLLSPTRGLQVGNRPIHKYLEGEGVGLQLFCLIGAGKGSCPPDPSQKVGKSTPTRTPVLASAAVSHHLKFMSLERLNKFRSELHCSSPICYRKAILRRLISPSEACSLNVQ	392765	390808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_390800_392800
877759	contig_9121_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_134472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCAAAATGGTTAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266270	268055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_266300_268100
877760	contig_10980_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_162567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGTTGCACGGACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275971	274049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_274000_276000
877761	contig_3410_pilon	-	1788	10	Intergenic	novelGene_58940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.62466929133727	18	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	387	1520	202760	195532	FALSE	5	GCTCCACCTTCCTGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETEDLVQLRRLNLELLRQLWAGQDAVRRSVAEAASESNLDASSSHNAEMLSSRETTSTASSPPSAPQDGPCDLAWPGRTSSLAVSLPPPKCQRQKSLGQLRPYSAPLPLTSDLNDPELSAGLDSLGPQEALRSVLTPRQSKPSKPRVTFSKEPGVPEWNWRLRPYLGYDWIAGSLESTSPVTGKSEAFFSKLQNFREANKEECISSNPELQFLSLHESSNMDEDHECVYCYRVNRRLFLVPADPGTPCRLCRTQRGQRGPETLAEPAQVRVSIPLSVLEPPHRYRIHRRKSFDASDTLALPRHCLLGWDIVPPKPEKSSAPRNLDLWSCVSSEAQHRKLSATSPTRLALPTQAPPPTPIWLEPQVTRPHTPRQKL	205100	195263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_195619_195937_196073_197056_197154_197342_197473_197858_197912_197992_198102_201574_201660_202081_202406_202646_202833_204786
877762	contig_14986_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_59716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	305	915	315	1229	107543	106629	NA	35	TTTGGACTATGAAGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPLRRWGCRQPLLLFILLGKLWGTGAGQIRYSVLEELDKGSFVGNIAKDLGLQPRELTERGVRIVSRGKTQLFSLNPGSGSLITAGRIDREELCAQSAPCLVSFNILVENKMKIYGVEVEIIDINDNSPRFRDEELKVKINENAPVGMRLVLPFARDPDVDVNSLQNYQLSSNIHFSLDVKSGNDKQKYPELVLDRPLDREKEAVHDLLLTAVDGGDPIFSGTTHIRVLVLDANDNAPLFTRPEYRVSVPEDIPVGTRLLTLTATDPDEGLNGKLTYSFRNEEDKISETFELDSSLGQISTLQ	107857	106626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_106600_107900
877763	contig_17470_pilon	-	3006	1	Intergenic	novelGene_110464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGATTTTCTGTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33090	30084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_30100_33100
877764	contig_8570_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_120148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATAAGCCCTTGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312410	313464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_312400_313500
877765	contig_9682_pilon	+	2416	7	Intergenic	novelGene_125289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	194.58988211678	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	186	581	10767	28387	FALSE	60	AAAAAAAAAAAGTGGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLLPCTILTLDRP	2375	30222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14692_28347
877766	contig_7919_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_28028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	46	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169275	123018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_124870_167575_167662_168900
877767	contig_7919_pilon	-	1963	3	Intergenic	novelGene_28029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	9.5	82	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	302	1942	161808	160168	FALSE	45	TCACACAAAAAAGTTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLLSSEVRQLLHNKFVVVLGDSIQRAVYKDLVLLLQKDCLLTPTQLKAKGELSFEQDELVEGGQKGRMHNGIQYREVREFCSGHHLVRFYFLTRVYSEYLEAILEELLSGKYAPDVFIMNSCLWDLSRYGQDSWNCYRENLESLFRRLDQVLPKECLLVWNTAMPVGEKITGGFLPPDQQLCGASLHVDVVEANFYSFAEARKHGFDVLDLHFHFRHSGQHRQRDGVHWNERAHRHLSQLLLAHMADAWGVELPHRDPLSKWIKNGPVRRPAGQGVERQPQASRDELALLPPSSSSRPRPRPHPHPHLYPYPYRCLCATADPCARSYPQPHPEHLCPCHFPSHSRIPFPFARRCPSSRPVTKIPMFSQTSLSSRINSLSTLSTWMSPYLPTQDLSWKETLHLVPSRLCPSSQHPVISGVPPWFIGVSPDIVLGVLTLTGNGDADLQRGWPQPIQSKGHHRLTWTFLSSWRGLDRWPASPLPLTWPKQTDDLKPSVMLHVFLLFTAIASKGKEEQSDPLWPQPSSPLPGRDQALLPPPHFPVSFL	169059	160146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_161865_167575_167662_168900
877768	contig_6192_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_170341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCACCGTATATCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807226	805242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_805200_807200
877769	contig_12079_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_67464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	573	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	586341	586646	NA	35	AGGTCGAAAACCAAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKHPRSPRKPSAIQTPSCLIVWLHICRLSPPAPPPLSSLTLAWTAATGSYLLFLGLTLSLPTLLLARPISNAHLSSPGTGTSSVASTHKGLPALRASPLQL	586340	587658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_586300_587700
877770	contig_17753_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_105082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	178	486	66273	66581	NA	30	TGTCCCAGCCCAACCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRFSEGLFLLLFHHQHHHHHFHPTGEKRLVGQELGPRGAGAGHQDPSLELKVRERVGTRSSQLSCMCSVSATLLTVPAVLRGDHSPEGRTGRASCVRWGP	66095	67190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_66100_67200
877772	contig_9682_pilon	+	2092	7	Intergenic	novelGene_125309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_3	66.5022973705086	79	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	918	2090	430839	536247	FALSE	20	GCAGCGGGCCCGCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGLKPPLYYLPGMSHEPKSPSLGMLSTATRTTATVSPLTPSPLNGALVPGGSPATSSALSVQAAPSSSFAAALRKLAKQAEEPRGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDASSRGGSSSRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGISPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSFRPYHTAEDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPLPTPGSLPPLHPSAMHLHLSGVRYPPELAHSSLAALHSDRLSSLSTERLQMDEELRREREREREREADREREKEREREKEREREKELEREKERELERQR	429921	536249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_430876_515520_515740_529603_529804_534047_534221_534605_534804_535488_535681_536093
877773	contig_13904_pilon	-	2732	4	Intergenic	novelGene_165494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_3	167.046899602078	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1851	2234	115074	108049	FALSE	25	TGCTAAGTAAGTGTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMHVGGWSNLIELKPLKASHLFFLIFSMSPCWNLADSSPNSTHFWGPVANWGLPIAAISDMKKSPEIISGRMTFALCCYSLTFMRFAYKVQPRNWLLFACHATNEVAQIIQGGRLIRHEMSKKASA	116924	107550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_108074_108597_108731_111535_111633_114945
877774	contig_960_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_108252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1320	1667	560875	561222	NA	50	TGGGAAATGAGGAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLPCHLERYEPELIYTEKLSRAPRMGHARCSAASARAFSTASRQLVTLSKLQRQGHAKLPVIDSRHSHPPKGHPTAVCLGDNRHRMVYYRAGGPSLGARSQHWPGPRAGRKLE	559555	561429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_559600_561400
877775	contig_9406_pilon	-	2472	2	Intergenic	novelGene_136165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1730	junction_1	0	18	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1516	2067	67116	64973	FALSE	60	TTTACAGATAATAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQLISEKPETEAVVKEKLTALHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQASGRGGPVLGLFLRSPPCAQAPAVSGKGFEPCRVASLTASGGISRVNGTDTEIL	68631	64567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_65402_66993
877776	contig_5280_pilon	+	2874	2	Intergenic	novelGene_52582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	0	39	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	34	369	38343	39473	FALSE	55	TGAGAAAAGTAAGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRKFFLSF	38309	41978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267
877777	contig_9011_pilon	+	2836	1	Intergenic	novelGene_159332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAAAAATAAATAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621245	624081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_621200_624100
877778	contig_6509_pilon	-	1834	5	Intergenic	novelGene_145613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	43.3993087502555	121	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	96	1058	67681	61144	FALSE	20	ACGCTCTTGGTACACGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADPAPKPPPEAPKLPRVEEIPQRITRNRAQMLANQSKQGTPPPEKELPPAAPATRAKGRIPEDEDAQAQHPRKRRFQRSSQQLQQQMNTSTQQTREMIQQTLAAIVDAIKLDAIEPYHSDRANPYFEYLQIRKKIEEKRKILCYITPQAPQCYAEYVTYTGSYLLDGKPLSKLHIPVIAPPPSLAEPLKELFKQQEAVRGKLRLQHSIEREKLIVSCEQEILRVHCRAARTIANQAVPFSACTMLLDSEVYNMPLESQGDENKSVRDRFNARQFISWLQDVDDKYDRMKTCLLMRQQHEAAALNAVQRMEWQLKVQELDPAGHKSLCVNEVPSFYVPMVDVNDDFVLLPA	67776	60367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_61330_64763_64857_65880_66025_66105_66205_67240
877779	contig_10003_pilon	+	2680	1	Intergenic	novelGene_88223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTTCACAAGGAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592438	595118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_592400_595100
877780	contig_14618_pilon	+	824	1	Intergenic	novelGene_136834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACAGCTGGGTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118577	1119401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1118600_1119400
877781	contig_13888_pilon	-	1993	3	Intergenic	novelGene_151785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGAGCACGGCTGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356550	337482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_337762_338560_338803_355078
877782	contig_10016_pilon	+	1782	9	Intergenic	novelGene_117848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTGAATAAAATTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264300	284768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_264469_272043_272216_274377_274513_275187_275269_279813_279995_281375_281467_281910_281994_282579_282662_283979
877783	contig_5434_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_74689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATTACAGTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378630	376260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_376300_378600
877784	contig_14300_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_133078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTTAACGAAAGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121400	123919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_121400_123900
877785	contig_1406_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_25485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCCCCAACTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315634	1317871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1315600_1317900
877786	contig_10437_pilon	+	2247	12	Intergenic	novelGene_38445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	837	1250	1006137	1018107	TRUE	25	TCAGCTTCAGCCAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIHIFYSLQSFEELFGYSHSIFGAEEIASSDPFTTVFHNRRHELSILLRNPFVPEVHHESWQTIAAVALIMQSVKHHQASSIELCHSGVLQEPLHILESTGMVILTGQFLLNLRNLQQIPFTDQPRQLSDHRHML	950941	1023432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_951551_986392_986525_1006041_1006163_1007554_1007664_1007873_1008033_1017987_1018158_1018561_1018676_1019088_1019222_1021496_1021610_1022053_1022189_1022310_1022380_1023049
877787	contig_3153_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_104679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGGGTAAAAAGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235756	237816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_235800_237800
877788	contig_6533_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_114643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTTATTTGTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111397	109984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_110000_111400
877789	contig_11708_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_138956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTTTGGTTAGCAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239367	240500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_239400_240500
877790	contig_12689_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_145050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAAGCTCAAGCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264990	262608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_262600_265000
877791	contig_10197_pilon	-	1480	7	Intergenic	novelGene_115218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1291.08680532677	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	55	822	952331	910531	TRUE	30	CAAATATTATTGCGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952385	909616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_909773_910028_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
877792	contig_6497_pilon	+	2898	1	Intergenic	novelGene_35572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1670	1984	178617	178931	NA	85	AAAAACAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWIGSSAVTALICPFSFLAFHFLLPNINTGSSLSFDTTFLGNPGGIVVKSYVFSPKGYQFESTRHSLETLWGSSTLSYRVTMSRNRLNGNGFGFWFSRYICS	176947	179845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_176900_179800
877793	contig_5826_pilon	+	694	1	Intergenic	novelGene_71525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCACCATCATCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212969	213663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_213000_213700
877794	contig_16303_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_34025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCATCGATTCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27072	25854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_25900_27100
877795	contig_14333_pilon	-	952	2	Intergenic	novelGene_49097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCCCTGTTCTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296759	295718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_295970_296058
877796	contig_10126_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_105732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTATCCTCTCGTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147014	148249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_147000_148200
877797	contig_4845_pilon	+	1401	1	Intergenic	novelGene_53636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGAACTGCCCCATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276799	278200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_276800_278200
877798	contig_3601_pilon	+	3919	1	Intergenic	novelGene_132909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2729	3118	241507	241896	NA	50	AACTTAAGAGAAAATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEKKARTKRHHEPGSQPKPHERGQPLLLTLMLTDWRSGPGWGHAGHCCHPIVRSTPDLPNLRGPSASNSEPWADALASSHSPKPIQQRTWKEGFRHWQGQKNTTKQKGSVWQRYKYQRESSPDTILSF	238778	242697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_238800_242700
877799	scaffold_13505_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_111550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATTAAAAAGACAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603467	604434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_603500_604400
877800	contig_4125_pilon	-	2323	1	Intergenic	novelGene_25228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATATTGATTCCTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717057	1714734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1714700_1717100
877801	contig_10011_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_68059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	572	853	228545	228826	NA	10	CGCTTGTGCTTTTCAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSVFCFVLFLSTGEEDKTEINQQLSLESIELEELALEKYSTAVPLIYYSEESSEDEVGSPGGKISGGTSTCEKRFISLLVTIENHTPLVELSQCLGTRALSEILEFPSEEAENVHKSPECDQSFSDNSYLVLHPKIHSAEKEYKCGDCGKIFSHRANLRIHRRIHTREKPHKCAKCSTSFHQHSHLSWHMSVHVKEKPYTCGICGKGFMWFPGLQQHQKTHTAETAYEYADYEKHFGQKTNLPFHEKTHTLATHHQHTQSVKSFGQPSSLAPSTRGREGRGL	227973	229154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_228000_229200
877802	contig_709_pilon	+	1149	10	Intergenic	novelGene_57535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	52.8627386332043	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	220	936	1506140	1526933	TRUE	25	CACATGTGCACGACTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEAWKKSLKEKWNAKPAYVVGSATASLVRKIGLETEGEKCGNAEKLAEYICSSIPMESITVYQKIPHPGIQGNLKSYFSKQGVPASITFFSPSGLTYSLQHIQELAGDSIRQIQFAAIGPTTARALAAQGLPVSCTAELPTPGALATGIRKALHAHSCC	1498423	1527236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1498617_1506113_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1511942_1512018_1515791_1515867_1523140_1523227_1524145_1524245_1526795_1527085_1527174
877803	contig_10609_pilon	-	796	3	Intergenic	novelGene_123896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACTGAAGTCTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40678	22477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_23093_23764_23840_40572
877804	contig_20634_pilon	+	1093	5	Intergenic	novelGene_173430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_3	399.885217906339	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1044	49	1092	241256	251995	FALSE	30	CCTAATTAATTTGTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAGIFGLPCLVLYTWIMKVLGKTNLWILFSLLHLIANAAEHEEVAKHAIKLHRGKGAAIAQRKHWVLENCRKLSGLLRQKNVVLNKLKNAIRAVEKDVGLSDEEKLFQVHTFEIFQKELNESENSVFQAIHGLQRALQGDYKDVVNMKESSRQRLEALREAAIKEETEYVELLAAEKHQVEALKNMQHQNKSLSILDEILEDVRKAADRLEEEIEEHAFDDNKSVKGVNFEAVLRVEEEEANSKKNITKREVEDDLGLSMLIDSQNNQYILTKPRDSTIPRADHHFIKDIVTIGMLSLPCGWLCTTIGLPTMFGYIICGVLLGPSGLNSIKSIVQVETLGEFGVFFTLFLVGLEFSPEKLRKVR	241207	251996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20634_pilon_+_241700_243536_243717_244790_244983_246538_246668_251896
877805	contig_7004_pilon	-	2097	10	Intergenic	novelGene_126512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.1316821307158	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	14	1162	459614	455542	FALSE	15	TAGAACTGCTGCTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEATSEAEEEAATAEAVGRLAKTLWLRLRGWEAVLAAAQRLLVWEKPLHSLVTAAALNGLFWLLSSSSLRPFFLLSISLLAYLLLDLWQPRFLSDVPASSPEEPHSDSEGAGSGAQPHLLSVPELCRYLAESWLTFQIHLQELLQYKRQNPAQFCARVCSGCAVLAVLGHYVPGIMISYIVLLSILLWPLVVYHELIQRMYTRLEPLLMQLDYSMKAEADALHHKHDKRKRQGKNGPPGGDEPLAETESESEAELAGFSPVVDVKKTALALAITDSELSDEEASILESGGFSVSRATTPQLTDVSEDLDQQSLPSEPEEALSRELGEGEEAQLAPPEELLGPPQVLSRQALDSEEEDETAKETLLQLSSPLHFVNTHFRGA	459627	454606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_455554_455889_456105_456351_456488_456644_456740_456885_457030_457330_457416_457810_457947_458312_458344_459026_459134_459426
877806	contig_3575_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_141127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGGTCACGCCCTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791214	788388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_788400_791200
877807	contig_3797_pilon	+	1569	4	Intergenic	novelGene_120077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	95.4789098294603	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	49	807	317790	332908	FALSE	30	GAACTCAAACTCTGGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSYSSAGWLHRPVALAMAPWAGAELSTLNPLSAVWLTLAAAFLVTLLLQLVPAGLFPGCPLFQDLIRYGKTKGARPPRPAACQAFDIPKRYFSHFYIVSVVWNGFLLWCLIQPLFLGAPFPNWLHGLLRILGASQFQAYVIGKNLLMQARWFHILGMLMFIWSSAHQYKCHVILGNLRKNKAGVVIHCNYRIPFGDWFEYVSSPNYLAELMIYISMAVTFGFHNITWWLVVTYVFFSQALAAFLSHKFYKSKFVSYPKHRKAFLPFLF	317741	333670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_318011_326308_326452_331619_331755_332648
877808	contig_17603_pilon	-	2845	11	Intergenic	novelGene_152796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.62767142944341	32	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	80	1267	94667	82609	TRUE	10	CATTTTATTTGTGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFYRVLFAVCLLLRTCEPKTGKAFRPNVLLIMADDLGIGDLGCYGNDSLRTPNIDRLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMEASDGYRALQWNGGSGGLPVNETTFARVLQQQGYTTGLIGKWHQGVNCVSRTDHCHHPLRHGFDYFYGMPFTLVNDCHPDRPPEVDAAVRAGLWLYTQAMALGVLSLAAVKASGSISVPWKAVLGLASLPALCFLSWYASFGFVRRWNCIMMRNHDVTEQPMALESATRRLLKEAVAYIERNKPGPFLLFVSLLHVHIPFVTTKEFLGKSRHGSYGNSVEEMDWMVGKILNAIEEHGLKNSTFTYFTSDHGGHLEARDGRVQLGGVERNLQRRQRHGGLGRGHPRPRNLPVAWGAARRPGDR	94746	73622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_74546_75934_76399_81570_81693_82539_82703_84084_84221_87589_87727_88711_89136_91477_91601_92706_92829_93985_94136_94665
877809	contig_15323_pilon	-	615	1	Intergenic	novelGene_148509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCAAAGTCGAAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61655	61040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_61000_61700
877810	contig_4103_pilon	-	1268	3	Intergenic	novelGene_51971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	41	366	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	100	402	178679	177131	FALSE	55	AAAAACCAAGATCCCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSTSCPIPGGRDWLPDCYSTTPGGTLYASTPGGTRIIYDRKFLLECKNSPIARTPPCCLPQIPGVTTPTAPLSKLEELKEQKETEEEIPDDAQFEIDI	178778	176264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_177160_177306_177478_178576
877811	contig_5696_pilon	-	2111	4	Intergenic	novelGene_117528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483433	468264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_469406_470620_470742_480286_480345_482642
877812	contig_10466_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_173634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	461	1192	684833	684102	NA	50	AAGAGAATGGTCATAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFDGHAGCACSQAVSERLFYYIAVSLLPHETLLEIENAVESGRALLPILQWHKHPNDYFSKEASKLYFNSLRTYWQELIDLNTGESTDIDVKEALINAFKRLDNDISLEAQVGDPNSFLNYLVLRVAFSGATACVAHVDGVDLHVANTGDSRAMLGVQEEDGSWSAVTLSNDHNAQNQRELERLKLEHPKNEAKSVVKQDRLLGLLMPFRAFGDVKFKWSIDLQKRVIESGPDQLNDNEYTKFIPPNYYTPPYLTAEPEVTYHRLRPQDKFLVLATDGLWETMHRQDVVRIVGEYLTGMHHQQPIAVGGYKVTLGQMHGLLTERRAKMSSVFEDQNAATHLIRHAVGNNEFGAVDHERLSKMLSLPEELARMYRDDITIIVVQFNSHVVGAYQNQE	685293	681689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_681700_685300
877813	contig_11978_pilon	+	3806	1	Intergenic	novelGene_62847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCAGCAAAGCTCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553723	557529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_553700_557500
877814	contig_10013_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_125044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATAGGACAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193458	192367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_192400_193500
877815	contig_3161_pilon	+	2462	1	Intergenic	novelGene_84536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTGTTGTTGTAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509575	512037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_509600_512000
877816	contig_6165_pilon	-	616	5	Intergenic	novelGene_167412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_1	752.02160873209	38314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	158	475	507807	489749	FALSE	30	TGATATGTAATGTTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQIESKEDFQAALNSAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFYHSLSEKYGNVVFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	507964	489607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_503349_503410_503875_503981_507783
877817	contig_3602_pilon	-	1254	4	Intergenic	novelGene_60580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_3	69.6866000191014	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	58	585	675629	654949	FALSE	25	ACCCAGCAGTTTTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGREDGELEEGELEDDGVEETQDTSGGPERSRKEKGEKHHSDSDEEKAHRRLKRKRKKEREKEKRRSKKRRKSKHKRHASSSDDFSDFSDDSDFSPSEKGHRKYREYSPPRMCRPTSSTPRRTPHPCPRSPTPRWTARATACTKTMRMSSMGSTRGTRRRTWARRTTTTSPKS	675686	654279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_655130_656979_657093_657402_657623_675615
877818	contig_11551_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_168462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTAAACGCATTATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356258	359279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_356300_359300
877819	contig_13982_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_163482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTCCAGCATAGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363865	362926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_362900_363900
877820	contig_9593_pilon	-	1764	1	Intergenic	novelGene_59708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCTTTCCACCCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174559	172795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_172800_174600
877821	contig_14357_pilon	-	2218	2	Intergenic	novelGene_121704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTGGTAAAAGGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750794	732269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_734365_750671
877822	contig_5236_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_100906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	3	500	182722	182225	NA	45	TTTAAAAAAAAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGINSILYQRGIYPSETFTRVQKYGLTLLVTADPELIKYLNNVVEQLKDWLYKCSVPKLVVVISNIESGEVLERWQFDIECDKTVKDDSAPREKSQEAIQEEIRSVIRQITATVTFLPLLEVTCSFDLLIYTDKDLAVPEKWEESEPQFITNSEEVHLHSFATTI	182724	181459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_181500_182700
877823	contig_8652_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_168782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	408	713	356579	356274	NA	45	CTTAAACCAAAAATATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLHFLVCSLQKPTSPSCLRAVLEGTAPIAPFLVEQNKGIFLISHLGLLFTGCNKSRRAKPGVFTRQHTCSQVTMFPSPEMKPGLRTSSAEATSCGLFTTP	356986	355252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_-_355300_357000
877824	contig_1009_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_121742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199392	201688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_199400_201700
877825	contig_6658_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_168407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171418	173230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_171400_173200
877826	contig_10324_pilon	-	3655	1	Intergenic	novelGene_7824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1376	1864	250760	250272	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQEKHTQTSGQEAAGARGCWSGLADALGAPCPSSQPENGLSGRLSRVRDKGGGQASTSEHLGHPRGPGVEEAVGETEEAVGKAPAPGHTASSAQHTAGRGRADQAAGATAGSSQAGPSGGRPGSSLGECPALSRPGRDGNHCREISRPPSCSWKGLAWWP	252135	248480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_248500_252100
877827	contig_14577_pilon	-	1408	7	Intergenic	novelGene_164644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_2	315.653510813501	225	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	206	835	127106	72950	FALSE	30	CATATACAGAAGGTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNARRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPVRVFVCKPLL	127311	72376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_73079_77950_78052_78685_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
877828	contig_4364_pilon	+	2627	2	Intergenic	novelGene_41	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	362	790	487391	487819	FALSE	40	GACTCAAAAATACTCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTPATQTSCCPRLSAFPLLFDPVKLWFKGRAPPEEQECRGQAMAAALMPGPHIMGILPSICPTWWGGLGAPLSTPHWQPPILCEPETGARVQSITKWHQFQPKQRQVCVNFCTQLQNSPQIMKCHEPVGDLSRWSRPPWGG	486528	489656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_486570_487070
877829	contig_7688_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_160394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.5	168	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	947	1543	118333	118929	FALSE	35	ATAAGGAAGCATTGTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKRLHYDSALKRKVIVFAEKHGNRAAGRTFDISEANIRRWRNDRSSIFSCKATTKCFTGPKKGRYPQVDEAVLRFVRETRAKGLPITRQAMQLKAGEVAKTLGIDETKFKATRGWCDRFVRRAGLSLRHQTSFHPVLPAAVKQKMVVEHSPQNCCVPSALDHTDGTVVWKKADIDDCGLKSDAEERDSEYEVIVVT	64971	119035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7688_pilon_+_65029_65403_65578_117617
877830	contig_8885_pilon	-	2480	6	Intergenic	novelGene_115552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_3	147.594037819961	818	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	53	442	75477	56347	TRUE	20	ATCATGACTACCTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLREAGFSGEAKPVKHINIYIKRFISKKQLTRL	75529	45817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_55907_56437_58183_58308_63031_63130_75399
877831	contig_8885_pilon	-	2614	7	Intergenic	novelGene_115559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	154.283739331863	132	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	62	451	75477	56347	TRUE	30	GAAAACTCATTTTCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLREAGFSGEAKPVKHINIYIKRFISKKQLTRL	75538	45837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_48757_48903_49094_49264_55907_56437_58183_58308_63031_63130_75399
877832	contig_16907_pilon	-	2974	1	Intergenic	novelGene_87443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTAGAGTCAGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407582	404608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_404600_407600
877833	contig_13074_pilon	-	1324	6	Intergenic	novelGene_153438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.632455532033676	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	183	647	467035	464063	FALSE	35	CATAATTTCATTTGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYIWNGYAVIGKQRELTDGILEVITRAEEMLEKGPENEYSVDDECLVKLLKGLCLKYLGRVHEAEENFRSISANEKKIKYDHYLIPNGLLELALLFMEQGRNEEAIKLLETAKQNYKNYSMESRTHFRIQAAMLQAKSSLENGSRAMISSVSL	468091	463385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_464187_464836_464954_466228_466344_466926_467039_467413_467535_468033
877834	contig_9186_pilon	+	1359	4	Intergenic	novelGene_85366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCGGCTTCTGTCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637785	645796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_+_638888_643832_643913_645289_645414_645743
877835	contig_3285_pilon	+	1938	6	Intergenic	novelGene_153387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	35.0918794025056	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	582	1217	189825	198389	FALSE	50	AAAAGAACACAGTTGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLYEVATESVCESAARLLFMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNGDNTDSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTHSGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEEVFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI	187891	199110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_188446_189797_189945_192126_192224_192610_192761_193018_193125_198226
877836	contig_3818_pilon	-	2495	5	Intergenic	novelGene_99291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	21.683807322516	155	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	116	1396	925321	920089	FALSE	30	AACTAATGACTTTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSPTARHQEPVTFEDVAVIFTEEEWRHLVPIQRDLYKEVMLENYRSIVSLGLPVPQPDVIFQLKRGEEAWIVDLRGSEERECPENISLDGETKPEIQDTSEEEISKGTLRERLGSKGPLCPKFEVHVPEDRLETEKENPAVETCKKFFSQEKILQQGSIPPKKIFTKERDQECRDCGKTFFDHSSLIRHQRTHTGEKPYECHECGKVFSHRSSLSRHRMSHTGESPYECNVCGKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFKCSECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECNQCGKAFSQKSILTRHKLIHTGRKPYECNECGKAFYGISSLNRHQKAHTGEPRYQCNECGKAFFDRSPLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFECGVCGKVFSSKSSVIQHQRRYAKQGID	933918	918989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_921096_921605_921720_923957_924085_925288_925360_933841
877837	contig_6513_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_117781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTTCCTTTTCTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206342	203849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_203870_203959_204055_205628
877839	contig_4884_pilon	+	1738	8	Intergenic	novelGene_63824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	506.46506014024	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	853	1173	578494	580349	TRUE	40	ACTTTGGAATAGCAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVGNGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTITPQNAPRDEARGRSSFYPDGGDQETAKTGKFLKRFTDEESRVFLLDRGNTRDKEAPKEKGSEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKDSGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKGPGICFEMAKSMFQSKIAVERYRQS	576566	585200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_576827_577901_578568_578703_578874_580272_580500_581256_581363_582400_582486_584843_585020_585152
877840	contig_14133_pilon	-	2511	6	Intergenic	novelGene_119925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	414	782	148042	147674	TRUE	50	AAGATAATTAGAACAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLHRAYISPRHTPRNRSCSPNIQLLHSHWAPHPGKNPTVSQGKASGVSVQRCVAGEPDSRPLEGAGPEGSAAGGPNLPRYNHEASWLTWVQLGPKLPICHLLFCFGKNTNKKSWKLQDMK	148455	141493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_141680_142287_142360_142941_143088_145604_145734_146041_146228_146663
877841	contig_1225_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_44115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCCAAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136638	140368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_138222_139732
877842	contig_13481_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_119456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCACTATTGCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067120	1068975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067100_1069000
877843	contig_5918_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_99498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGGCTGCAGTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237987	250092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_238421_247467_247808_248795
877844	contig_7357_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_36931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTTGAAATTCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783205	781245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_781200_783200
877845	contig_11285_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_5728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGTATAGTGCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867449	865402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_865400_867400
877846	contig_2215_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_163847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTATTGTGTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146078	143144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_143100_146100
877847	contig_14851_pilon	+	963	5	Intergenic	novelGene_134692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	606	959	382323	384813	FALSE	20	CCCTCCACCTCTGAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLARGCAAGKVALMSLALSCLFNARGPSPRSPPGPILFRCALIAEFCSANLAIRAIMSFLCIRASFVPSCCPSPNTGGSSENTGLLDCWVFEWELQRGCDRLTKGAWFLFSKSSPM	365590	384817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14851_pilon_+_365857_370076_370163_370492_370603_382179_382358_384494
877848	contig_19185_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_163661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157902	155491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_155500_157900
877849	contig_2215_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_163863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACCAAAGAAGACATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232112	233534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_232100_233500
877850	contig_7234_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_145960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCACAGAATTAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537747	538955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_537700_539000
877851	contig_11071_pilon	-	1109	6	Intergenic	novelGene_131029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	143	junction_1	245.760045572912	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	66	620	206817	92024	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPGRAAGGGGAEDAGRQAGDMDRGEPGVLRTDPVLEEGEDAAATISTSEALSEEEQDELRRELAKVEEEIQTLSQVLAAKEKHLAEIKRKLGISSLQEIKQNISKGWQDVTATSAYKKTSETLSQAGQKASAAFSSVGSVITKKLEDVKNSPTFKSFEEKVENLKSKVGGTKPAGGDFGDVLNSTANASAATTEPRTEQTPENP	206882	91534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_92144_96150_96200_104797_104900_106647_106797_111264_111381_206798
877852	contig_6137_pilon	-	1502	10	Intergenic	novelGene_59302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	242	junction_9	225.665982820781	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	95	1096	1667703	1599563	FALSE	55	GAAAAAAAAAAACCCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELRQRAAREPDAPPEDKELESEAKVDGETASDSESRVEPAPPPTSADDTPEVLNRALSNLSSRWKNWWVRGILTLAMIAFFFIIIYLGPMVLMMIVMCVQIKCFHEIITIGYNVYHSYDLPWFRTLSWYFLLCVNYFFYGETVTDYFFTLVQREEPLRILSKYHRFISFTLYLTGFCMFVLSLVKKHYRLQFYMFGWTHVTLLIVVTQSHLVIHNLFEGMIWFIVPISCVICNDIMAYMFGFFFGRTPLIKLSPKKTWEGFIGGFFATVVFGLLLSYVMSAYRCFVCPVEYNNDTNSFTVDCEPSDLFRLQEYSIPGVIQSVIGWVCGWDE	1667797	1599156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1599737_1600637_1600707_1601231_1601320_1603538_1603622_1604888_1604948_1607359_1607500_1609787_1609886_1611042_1611140_1612441_1612579_1667646
877853	contig_709_pilon	+	3086	1	Intergenic	novelGene_57667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAGAAACTCTGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3915403	3918489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3915400_3918500
877854	contig_4678_pilon	+	1189	5	Intergenic	novelGene_126066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	592021	593272	TRUE	20	TTCCCGGTGACACAGTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDEFQQLIHISVVHGGLPRDPAQGSPLHGQLLFPPGQPRAELLPDLGIIPTRRGSGWRIVAEELTVAAVTELSISLVGGGRGAGAALRAAILFLAQPFICLTGLG	592019	598974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_592192_593125_593325_595880_596284_597780_598010_598788
877855	contig_17108_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_109554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTGTACTCTTCCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436979	435038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_435000_437000
877856	contig_12689_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_145026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	529	849	29463	29783	NA	30	ATTTGCAGGCAAACCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHCSLLNGLFYVNFISVKKHILGQLHTPEISLKICTERAVDHKCLIPRSLWAPQPSLPSFTICRAWGGSSPATFHVVLFCIPTAGCAPVQQSPRPRLPALHLPN	28934	30718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_28900_30700
877857	contig_20739_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_83168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCTCTATAACTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100341	102114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_100300_102100
877858	contig_730_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_155614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAATTTTGTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207769	205803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_730_pilon_-_205800_207800
877859	contig_9440_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_59124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAAAAAAAATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1991976	1994330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1992000_1994300
877860	contig_253_pilon	-	653	6	Intergenic	novelGene_129691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1019.23645931648	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	76	651	421041	418775	FALSE	15	GTGAGGGCTGTGAGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRRSRQHRHQAPVLTPLCPPGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGK	421739	418772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421088_421710
877861	contig_7342_pilon	-	1135	6	Intergenic	novelGene_71192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5590.68171156255	60883	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	634	951	666818	665411	FALSE	25	CCAGGCTCTGATTAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTHIRAKRKREELSNVLAAMRKAAAKKD	669443	665226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_665501_665573_665709_666725_666821_666997_667405_669077_669244_669385
877862	contig_709_pilon	+	2195	5	Intergenic	novelGene_57643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	52.7843490061211	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	726	1958	3031111	3058355	FALSE	15	ATGGCAGAGTGTTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVMASYILSGVHQELLIPSPFHYGGFLSNPGVVDSEGPGDLKEHHHQPSVNNISYVKDYPSIKLIVNSITARIEFTTRQLPDLEDLKKQELHMFSVIPSKFLPNSKSPCWYEEFVGKNTTDPYLTNSYVLYSRRFRSTFDALRKAFWGQLSHTNGKHFRLRCLPHFYIIGQPKCGTTDLYDRLRLHPEVKFSAIKEPHWWTRKRFGIVRLRDGLRDRYPVEDYLDLFDLAAHQIHQGLQADSAKEQSKMNKIVIGEASASTMWDNNAWTFFYENSTDSEPPFLIQDFIHAFQPHAKLIVMLRDPVERLYSDYLYFASSNKSADDFHEKVAEALQLFENCVLDYSLRACVYNNTLNNAMPVRRGDIRTPVLLGCWPVIMQVALRLWILAYKHTACFNVQMPHTSPLRGG	3030385	3058592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3031393_3032412_3032753_3035087_3035235_3040188_3040346_3058048
877863	contig_7549_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_164529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCGTAGCGACCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700808	698242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_698200_700800
877864	contig_14034_pilon	+	1938	7	Intergenic	novelGene_72632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7.40870359029762	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	238	783	152621	157240	TRUE	40	AAGAAATCACTTGATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKADVKGKPCEDHCILQHSNRICVITLAGSHPVLQSGKTIKSISYQISTNCSRLQNKVSGKFKRGAQFLTELAPLCKIYCSDGEEYTISSCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152383	158511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_154464_154595_156785_156863_156941_157012_157102_157357_157472
877865	contig_2114_pilon	-	1228	3	Intergenic	novelGene_104250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.5	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	49	300	286102	285851	TRUE	30	CCAAGAGTCAGCTGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFFLEACTRGRCAITNMTNSRGNVVKHNHPEPGKSTRKSLTWFTRPHPGEYLTGSDPPKEERDLLRTPGFQHSPREDAPHGFQPAPCHDQHLRLNTTSC	286150	267768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_268342_268438_268776_285832
877866	contig_12157_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_135916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTTTCGTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195243	192690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_192700_195200
877867	contig_12964_pilon	-	2756	1	Intergenic	novelGene_131732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	222	669	1963	2631	629314	628646	NA	25	ATACCCAGCACCTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSRTMLTVIWFIREVTWDQAQMEGTGSVSESTQAWPGRLLQSEEYISPFFGIGQPSPPLLRTGLLSAPSGQASSHPVRTGSSGALSGQAPLGPPQDRLLSAPSGKGTSWPPQDRFLSAPALLRQVLTALLAQPTSAWRQSTLPASLPKGPQLSCSMDQGAHCSCLCSMGQEAHYTILCQSPGCAATAPVLQLSLSPRSRRFSAQGPQVQKTSSAPDSS	631276	628520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_628500_631300
877868	contig_9363_pilon	+	4017	3	Intergenic	novelGene_6682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	1457	2425	1264037	1265005	FALSE	20	TCAAGGCCTATGTGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGFGDPALLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPLQEFRWPHRTPSPQTTSVPTPRGSLLEGIPIQVLRRAELTPRDSPLKCLMGRRASARGWGCSPPSPTFAPTVERASWIALSSSNISSPTATKNPFSFLITGLDLGKGQGPVPSLVASPLNALNAKKALASALSCCSTRKSMQAGNPKKVLSWGGALLFSWSTSRAP	1259672	1266597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1259773_1262525_1262634_1262788
877869	contig_11307_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_105231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	288	680	66994	66602	NA	65	TTACTGAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRILNDARSFDQKKTEEIHRVTVPKKNWSIISHFRRKHMIKNRWLKEEIQAALKALVKNKSPGIDGITVETFQQTDAALDVLSCLCQEVWKTATWATDWKRFVFVPIPKKGDLTECRNYRTISLMSHAK	67281	64805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_64800_67300
877870	contig_361_pilon	-	2205	6	Intergenic	novelGene_166610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.2262401283693	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	555	884	1011845	983145	FALSE	45	CACCAGGGCAAAAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVDFTQEEWALLDLAQRKLYIDVMLETFINLASVVSRNLSDGKTFSSEHTIVRFMKNDSWSSVLGDIYELHGIEDKHNDQGSYLRRHMVEKFHENNEDNM	1021177	981823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_983156_985208_985247_985602_985754_986721_986849_1011842_1012073_1020850
877871	contig_17194_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_155370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGATAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212653	214336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_212700_214300
877872	contig_6137_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_59305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGGCCAGACTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1621749	1623185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1621700_1623200
877873	contig_2168_pilon	-	1344	3	Intergenic	novelGene_147261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	3.5	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAAATGTTTACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133890	84421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_-_85253_131244_131439_133571
877874	contig_1443_pilon	-	4326	26	Intergenic	novelGene_28351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_20	250.85190531467	6	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	832	3180	913232	897092	FALSE	50	AAAGATAAATAAACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEHSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSAPPKKKRK	937461	895945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898936_899547_899678_902438_902609_903030_903107_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125_909222_909341_909408_910547_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913981_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_917674_937363
877875	contig_10453_pilon	+	3373	3	Intergenic	novelGene_162041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	79	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAATTCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221778	230969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_+_222938_223368_223536_228922
877876	contig_11898_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_144306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCTTAAATAGAGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347811	350149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_347800_350100
877877	contig_17108_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_109537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAATGGGAAAAAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116599	114417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_114400_116600
877878	contig_9682_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_125319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTACTCCATAGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577297	578114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_577300_578100
877879	contig_6228_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_164498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	0	16	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGGGTCTGTAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215000	212303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_212512_212946
877880	contig_5845_pilon	+	941	2	Intergenic	novelGene_98896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	470	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	157	597	159400	161337	FALSE	25	TCCTAGTTTTGTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVGRLKSSDPSVLHLSEEGNENDAALNCERTMTRTLAHKCHVDSRFQSSFVEFQDEEEISTSPGVSEFVSDAFDACNLNQEDLRKEMEQLVLDKKEEETTVLEDDSADWEKELQQELQEYEVVTESEKRDENWDKEIEKMLQEEN	159243	161681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_159713_161209
877881	contig_16541_pilon	-	1040	4	Intergenic	novelGene_126748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	263.446810992698	85	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	164	502	406172	400419	FALSE	15	TAAGTGTATCTTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEEKTYGGCEGPDAMYVKLISSDGHEFIVKREHALTSGTIKAMLSGPGQFAENETNEVNFREIPSHVLSKVCMYFTYKVRYTNSSTEIPEFPIAPEIALELLMAANFLDC	423684	399880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_400610_402577_402722_406168_406222_423570
877882	contig_15092_pilon	-	1690	15	Intergenic	novelGene_57769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.121014139455	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	11	487	319745	303128	TRUE	40	CCAACACAAAATTGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENNMADGEEPEKKRRRIEELLAEKMAVDGGCGDTGDWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQFLFRPKDVGRPKAEVAAEFLNDRIPNCNVVPHFNKIQDFNDTFYRR	319755	295691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296381_297099_297128_297248_297350_297680_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_304779_304824_310062_310144_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319500_319543_319725
877883	contig_15092_pilon	-	2664	16	Intergenic	novelGene_57772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_7	93.4794094974931	278	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	1278	2018	303989	296486	FALSE	45	AGAATTTAATGTTCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLIDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFT	319760	295839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304824_310062_310144_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319500_319543_319725
877884	contig_15092_pilon	-	1976	18	Intergenic	novelGene_57774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_13	111.778729770318	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	846	1703	304389	296486	FALSE	15	CACCCGCTTGTGCGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISLLNYEDGVLDPSSIVPLIDGGTEGFKGNARVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLIDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFT	319752	296212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304101_304383_304449_304779_304824_310062_310144_312141_312491_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319725
877885	contig_11378_pilon	-	1839	3	Intergenic	novelGene_112247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	949	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGGCGCGCCCGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364547	351384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_351596_360256_360342_363004
877886	contig_6677_pilon	-	2018	3	Intergenic	novelGene_114193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAAATAGTTGGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566895	563720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_564849_565733_565820_566091
877887	contig_10848_pilon	+	3184	1	Intergenic	novelGene_133531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824696	827880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10848_pilon_+_824700_827900
877888	contig_15939_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_160253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGCAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42898	41432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_41400_42900
877889	contig_15629_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_122484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCTACATATCAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200126	198766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_198800_200100
877890	contig_6361_pilon	+	3378	5	Intergenic	novelGene_24035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACGCAAAAAGATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671435	689295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_674310_676138_676270_678988_679076_681269_681381_689120
877891	contig_12257_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_152096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	794	1102	117223	117531	NA	20	CCCTAGTTACTGCTAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSNLDKQQSPLTKAIHVSQICRACCVGFRVEWTRGCEQAGGFSGTLRHFLCIQWQVVPPALSRADDPTHPGSLFRQLVNEEEDTSTPSLFKLGWLSSMTK	116429	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_116400_117700
877892	contig_11677_pilon	+	281	3	Intergenic	novelGene_85956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCCTTTCTCTCTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595830	598063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_595891_597211_597397_598027
877893	contig_4732_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_75485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745767	746734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_745800_746700
877894	contig_9185_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_166924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTAAAGGTTGGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889885	891825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_889900_891800
877895	contig_14041_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_144037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCTGGTAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106387	104764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_-_104800_106400
877896	contig_5484_pilon	+	2231	5	Intergenic	novelGene_151083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	313	junction_4	121.153569902005	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	152	763	48767	246700	FALSE	80	CTAAAAAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGR	48615	248168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_48855_137525_137720_201596_201681_238751_238863_246565
877897	contig_7229_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_39835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGGTTCTCCATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940833	938499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_938500_940800
877898	contig_4782_pilon	+	3378	8	Intergenic	novelGene_73625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	58.1567200040774	170	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	611	1204	257130	272820	FALSE	10	GCTTGGTGTGTAGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIRESYENDIASMNLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK	249113	274994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_249486_250936_251087_257041_257178_258860_258987_271124_271200_271532_271665_272303_272418_272721
877899	contig_16846_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_82872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAGTAGACCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202268	200787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_200800_202300
877900	contig_4730_pilon	+	2667	4	Intergenic	novelGene_71707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_1	74.593714361347	7999	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGTCTCCCATAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134845	142931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_135874_137082_137173_140626_140712_141467
877901	contig_11175_pilon	+	2917	3	Intergenic	novelGene_61184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	10.5	82	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTGTTAAAGTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397842	405299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_397916_399837_399962_402579
877902	contig_12010_pilon	-	302	1	Intergenic	novelGene_160958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	288	14	301	283447	283160	NA	55	GAGAAATAACAAATATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGRMADVLDVYEAGGEDFAMDEDGDESIHKLKEKAKKRKGRGFGSVEGSRAWMREDYDSVEQDGDEPGPQRSVEGWILFVTGVHEEATEEDIHDKFAEY	283460	283158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_283200_283500
877903	contig_14314_pilon	-	1816	14	Intergenic	novelGene_176837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_13	17.3433820060646	39	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	143	1402	135780	114151	FALSE	40	ACCAAAACTTTCTCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAACRARVVRLLKELQSAACQCPTHSHTYSQATGLSPSGKTTDYAFEMAVSNIRYGAGVTKEVGMDLQNMGAKNVCLMTDKNLSQLPPVQVVMNSLVKNGINFKVYDNVRVEPTDTSFMEAIEFAKKGAFDAYVAVGGGSTIDTCKAANLYSSSPRSEFLDYVNAPIGKGKPVSVPLKPLIAVPTTSGTGSETTGVAIFDYEQLKVKTGIASRAIKPTLGLIDPLHTLHMPDRVVANSGFDVLCHALESYTALPYHLRSPCPSNPISRPAYQGSNPISDIWAVHALQIVAKYLKRAVRNPDDLEARSNMHLASAFAGIGFGNAGVHLCHGMSYPISGLVKTYKAKDYNVDHPLVPHGLSVVLTSPAVFTFTAEMFPERHLETAKILGADIRTARTQDAGLVLADTLRKFLFELNVDDGLAALGYSTADIPALVRGTLPQERVTKLAPRPQSEEDLSALFEASMKLY	155721	113736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_-_114235_121932_122091_124805_124903_125070_125150_129575_129675_131407_131561_132160_132267_133549_133628_135044_135242_135386_135542_135726_135781_137543_137591_139783_139822_155664
877904	contig_10103_pilon	-	2499	3	Intergenic	novelGene_86154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	35	26	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	189	743	475881	474324	FALSE	30	TATTTGCAAGCTACATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFSRRFTVQCGRQAGELWSQSAVLLRLLLLRSAFFAALRASLSAGSGRSGFVRLSYDEAFAMANDPLEGFHEVNLASPTSPDLLGVYESGTQEKTTSPSVIYRPHPSALCSAPVQANALDVSDLPTQPVYSSPRRLNCAEISSISVHVTDPAPCSTSGATAGLTKLTTRKDNCNAEREFLQGATITEACDGSDDIFGLSTDSLSRLRSPSVLEVREKGYERLKEELAKAQRVRKKRYFILLYIIF	484832	472567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_474628_475630_475907_484669
877905	contig_6546_pilon	+	328	3	Intergenic	novelGene_140973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	96.5	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCCCAGCAGCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597576	599301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246
877906	contig_7057_pilon	-	3843	1	Intergenic	novelGene_123394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGATCCTGTCCTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222038	1218195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1218200_1222000
877907	contig_19155_pilon	+	1105	10	Intergenic	novelGene_173365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	79.483207326539	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	437	1105	526463	601738	FALSE	50	GTAATAAAAGTACACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNKVSGVHLSPASPEIVLDNDHSLPSVGCLSSDPIVSSPENTHADNSIVGQTVPKAQIQQSTHTHLDISLFPLGLTDEKSNGTIALVDDSENPGANVSNIQLQQKISSLEIKLKVSEEEKQRIKKDVEALMDKHSILEKGFLKEKEQEAISFQDRYKELQEKHKQELEDMRKAGHEALSIIVDEYKALLQSSVKQQVEAIEKQYISAIEKQAHKCEELLNAQ	378524	601738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_378668_464808_464903_480478_480523_483087_483167_526386_526476_527704_527866_529045_529250_530637_530743_570474_570553_601630
877908	contig_2403_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_71004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAATTTACTTGTGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129656	122472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_124024_128861
877909	contig_10324_pilon	+	1806	9	Intergenic	novelGene_7806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.15980616494113	49	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	374	937	165070	166108	FALSE	25	AACACTGGTCATGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKRDVPGFAIGGLSGGESKGQFWRMVALSTSRLPKDKPRYLMGVGYATDLVVCVALGCDMFDCVFPTRTARFGSALVPTGNLQLKKKQYEKDFSPIDPECTCPTCQKHSRAFLHALLHSDNTAALHHLTVHNIAYQLQLMSAVRASIVEKRFPDFVRNFMNTMYGDPTLYPPWATEALASVGITLG	153460	166977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_153497_153592_153732_162553_162633_162705_162823_165067_165207_165407_165484_165595_165706_165788_165877_165955
877910	contig_2693_pilon	-	2000	16	Intergenic	novelGene_167604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_6	20.5854317418897	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1944	55	1998	361778	333746	FALSE	25	CACCTTCAAAATTCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDFAYSAAAGGRPSATKVMVVVTDGESHDGSELKAVIEQCNNDNILRFGIAVLGYLHRNFLDTKNLIKEIKAIASVPTERYFFNVSDEAALLEKAGTLGEQIFSIEGTVQGGDNFQMEMSQVGFSADYSPQNDILMLGAVGAYGWSGTIVQQTSHGHSIFPQQAFDQILQDRNHSSYLGYSVAAISTRKNVHFVAGAPRANYTGQIVLYRVDENGNVTVIQPHRGDQIGSYFGSVLCSVDVDRDTITDVLLVGAPMYMNDLKKEEGRVYLFTITKGILNHHQFLEGPEGFENARFGSAIAALSDINMDGFNDVIVGSPLENQNSGAVYIYNGHQSTIRTKYSQKILGSDRAFRSHLQYFGRSLDGHGDLNGDSITDVSIGAFGQVVQLWSQSIADVSVEAFFTPEKITLFNKNAEIVLKLCFSAKFRPTKQIHQVAITYNITLDVDRFSSRVTSRGLFKENNERFLQKNMVVNQSQSCSEHIIHVQEPSDVVNPLDLCVNISLENPGTSPALEAYSETAKVFSIPFYKDCGDDGFCISDLVLNVQQLPADQKQPFIVSNQHKRLTFSVTLKNKKESAYNTRIVAAFSENLFFASSSMPVDGTEVTCQVDSSQKSVTCNVGYPALKRKQQVTFTVNFDFNLQNPQNQASVSFQALSESHEENKADNL	361832	333743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_-_333780_333862_333940_334542_334636_335764_335907_336332_336416_336983_337095_340161_340314_345811_345952_350367_350505_351190_351395_353251_353396_355430_355577_356544_356684_358460_358538_361219_361386_361679
877911	contig_6445_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_77037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCTCCCAACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555599	553676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_553700_555600
877912	contig_10642_pilon	-	1913	2	Intergenic	novelGene_78654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCCAGCATGCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178005	141532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_143389_177948
877913	contig_4751_pilon	-	2637	1	Intergenic	novelGene_173730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTACTCCTGTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336690	334053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_334100_336700
877914	contig_15596_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_139553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCAAGTCAGAGTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217101	215056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_215100_217100
877915	contig_13366_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_99762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	233	610	27155	27532	NA	25	GAGTCAGAGTCAACTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETTTCPSPAEGGLETGRDVLSSSANGLGAPGCCSSSGSWNTSLPRDSLSRTPGRTAEALLAGLAWFDPVGVFRSVKLDTLSLGKVTLSSNKLCFFRTAASFITKRDHKTKHDVNTLLWPAWIV	26922	27889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_26900_27900
877916	contig_9363_pilon	+	2140	1	Intergenic	novelGene_6513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	438	1317	705	2021	523482	524798	NA	30	TACGAACAACACCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIKRKSYTADFKLKVVARAEETSNRASAREFEVAESSIREWRKEKKELEKMNPQKRARRGPKAKWPELEHDLKEWIISQREQNQAVSTVAIQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRNGLSLRIRTTVGQQLPGDWEQKMVSFQKFIAKEISELGISAVDIINMDEVPMSFDILATSTVAASGTKTAAITTTGHERACFTVVLGCTASGVKLKPMVIFKRVTMPREKLPTSVVVHFNKKGWMDCDVMKVWIDKCYRARQGGFFSKKSLLIFDTMAAHKEKHVQNYINSTGAHIAVIPGGLTCKLQPLDIAVNHLFKTLVRREWDEWMQSGIHEFTPSGRLKRVTFTEVCNWVASAWGKITPETIRNGFRKAGIVYQQNTDDEDEDAEGSDDDDISSEVTEERLQAALRYFNDDSDEGSDFEGFRESDDDDDNK	522777	524917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_522800_524900
877917	contig_14341_pilon	+	2198	6	Intergenic	novelGene_111806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	16.1542564050469	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	245	1240	473414	489051	FALSE	20	ACAATTTCTTCTGGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPRSPLSLTSWEQESFLQVKVEDDEAGVSQGQESGLGGHTAHPDAARLRFRQFHYQEAAGPHEALAQLHELCHQWLRPEMRSKEEILELLVLEQFLDVLPPEIHAWVGAQCPESGEEAAGLVEDLTQVLDKRVLLTEDSELPPDGNFGNRWAGTKPLTVKYQEAASPKPGQEQRHNLNPGRVASTHSGELDSSGAPQFLEPFRIMAGIKHKSCIADFKLKVIVRAEETSSRAAATEFEVGELSIHKWRKEKKELEKMNPRKRTCCRPKTKWPELENDLKKWIISRREQNQAVSTVVIQIKVTLLVDERGIPDFKAGFTWISKFIKRNSP	470193	490009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_470230_471115_471272_473361_473817_474986_475076_486714_486827_488659
877918	contig_9366_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_166288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTCCCTGCCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090168	1087913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1087900_1090200
877920	contig_15114_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_121135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	147	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1839	2153	100865	100551	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLPQFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	102703	100441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100400_102700
877921	contig_7173_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_37551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTCAGCTGCTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608532	606216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_606200_608500
877922	contig_10926_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_137508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCGGAGTCACACAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272168	271199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_-_271200_272200
877923	contig_10196_pilon	-	2144	2	Intergenic	novelGene_132060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	345	677	688502	688170	TRUE	15	CACGCCCACGCTGGCGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGAAQSAGKKLANRTASQAVPYKGCRSSCFSALPKGRQTQDTGQATEKGIQGQETWPHGHLTPTPAEDTSTGGDQMLSERTSYSWRHPFLHPESALDGVRFSASTCL	688846	686598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_686814_686917
877924	contig_4519_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_123653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACAGGGTTTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40722	41897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_40700_41900
877925	contig_6299_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_172946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGCAAACAATCAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965305	963398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_963400_965300
877926	contig_9653_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_48178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAGACCACAGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167056	168181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_167100_168200
877927	contig_709_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_57547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCTAGAGGAAGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511378	1513528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1511400_1513500
877928	contig_10636_pilon	+	2381	4	Intergenic	novelGene_172278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	20.4178571081514	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1	417	118267	118683	TRUE	35	ATTTCAAAAGCTCTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGHELAQDLWYCLGWAGSCRWAKVGLRGRVGCVRDALSEAVPAKCPLGSPPKSGSSFHGPDGLCSSEKKGGGGAAVVATAAFAELSLAGSSDCRVRLPEAVRQAGESPEGAAAGRPSGGTARVEPRLFTVYEIIICRF	118266	134071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_118762_119951_120133_126019_126172_132518
877929	contig_10751_pilon	-	1985	7	Intergenic	novelGene_174820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCCGCAGCCACTGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275682	228771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_-_228792_232888_233189_254895_254974_264403_264627_269233_269399_274227_274308_274563
877930	contig_15236_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_141640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTGATATTTTATCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669690	671559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_669700_671600
877931	contig_3424_pilon	+	2541	5	Intergenic	novelGene_55573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	94.9772999195071	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1680	862	2541	1081484	1087802	FALSE	20	CACTCACAGCAGGTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEEAFQPQAGSGYASLLPSPPPDSLHSQPVLIAQPDQSYNLAQPVHFSVSLSNHNEKNPPQRDPLVGDRPALGSWGLPGESGESASLLGLPLSAPVSPPLLSSLAQGGFPQASGPETVVKQPASLLAQPSPQPPPVSLASESLKNCTTESVPPAFTHSPAGSAGVLLLPPGSGSLPPNRSSSGEETSGALDFTLNRTLGNPVRMCSPSHSDGPAAAQQSLAGHPRQPGPGAHDPDCFYQQVTQVALGPSGLERAQLESGPPQQPTLAPQMPKAALPEPSSTGSPPAPGQAHSSAQPPASPAPADTGQQVLPGPPRSSSMSVTSASSSQAAGRSEPQWPPPPPPPDLSSYYYYRSFYDLYPPQYPLPYPPEPGTAPVYYKDTYGLYRPYDSAASAYAENYRFPEPERPSSRASHCSDRPAPRQGYPDGYYHSQGGWSSQSDYYASYCSSQYDYGDPGHWDRYHYGSRFRDARSYDRRHWYDAEYNPYRKETYAYGDRPERYDDPWRYDPRFTSSFEEDPELHRDPYGDEGDRRSVHSEHSAQSLHSAPSLHSRRSSVSA	1080622	1087802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1082627_1084461_1084587_1086762_1086861_1087052_1087180_1087615
877932	contig_3410_pilon	-	1912	3	Intergenic	novelGene_58946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	25	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1194	1592	229347	228577	FALSE	20	CAGAACATGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHPSPVTHTHLLGFQVRRQHMERCTSFLVDELGVVDRAQAGDRIFFVSAKEVLNARIQKAQGMPEGGGALAEGFQVRMFEFQNFERRFEECISQSAVKTKFEQHTVRAKQIAEAVRLIMDSLHIAAQEQR	230540	228256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_228703_228843_228912_229142
877933	contig_1551_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_173420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	604	1080	394101	394577	NA	10	TCTTTGTGCACTTTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAYGALPALSGQASEEQGKIIQVTVKEEDHIWDQGSCLQRNLSHIREFSRQRFRQFCYQETPGPREALSQLRKLCCQWLSPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHNPESGEEVVTLLEDLERELDEPRQQVRNWRCHLWRIWVHGYPG	393497	395760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_393500_395800
877934	contig_11055_pilon	+	1959	9	Intergenic	novelGene_142177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGTAAAGCAAACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176065	204702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_+_176515_177127_177342_188532_188812_189120_189363_197729_197930_198198_198308_200948_201077_201606_201817_204574
877935	contig_6410_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_108656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGGCTGCCAGGAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496363	494101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_494100_496400
877936	contig_11855_pilon	-	2469	4	Intergenic	novelGene_67007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCGCCCCGCTCCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1381597	1375410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1375686_1377511_1377575_1379235_1379394_1379624
877937	contig_7919_pilon	+	1143	1	Intergenic	novelGene_28088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAACAAAAACCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1123418	1124561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1123400_1124600
877938	contig_7019_pilon	-	2791	5	Intergenic	novelGene_149453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.6424902109607	44	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	181	798	507011	506394	TRUE	20	CTTTCTTCAGGATTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQPDPETLNENSELLFSFGVIADIQYADLEDGYNFQGNRRRYYRHSLHHLQDAIEDWKKESNIPCCVLQLGDIIDGYNAQYQASEKSLELVMNTFEMLKVPVHHTWGNHEFYNFSRDYLTNSKLNTKFLEDQIVHHPETIPSENYYAYHFVPFPKFRFILLDSYDLSVLGMDQSSPKYQQCMKILKEHNPNAELNSPQGELFL	519417	501841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_503546_505060_505279_506322_507037_507474_507577_519364
877939	contig_6470_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_145599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGCTGCTACAAAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986079	984478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_984500_986100
877940	contig_1694_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_144997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCGCCAAAAATGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1705563	1703359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1703400_1705600
877941	scaffold_13505_pilon	-	494	3	Intergenic	novelGene_111505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12372	junction_2	1670	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGAAGTGGTTCAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548368	547114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_547465_547734_547806_548295
877942	contig_12543_pilon	-	2912	1	Intergenic	novelGene_168358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATACAAAAAAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142285	139373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_-_139400_142300
877943	contig_5718_pilon	-	3262	1	Intergenic	novelGene_110329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549935	546673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_546700_549900
877944	contig_10011_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_68018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1019	1465	23932	23486	NA	55	CTTTAACAAAGTCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVRYTPLFCHGGTPLGRQLSSPTSADKPLPRVMRGETTLLLPQCEHLTTLRVQRVNEGTLAHTSDLIWCSIQAAAIHQGRRIWVRSSAPAGAEGSGRPLGTERCSPQALLLCLSHTLTLGPAPLRLPTCCCTLKGKEWLPLSYYYR	24950	22568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_22600_25000
877945	contig_3584_pilon	-	3995	1	Intergenic	novelGene_108105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	149	532	115995	115612	NA	55	TAAAATAAAATGGAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEACFFGIRRQNSVNSGILLPVSKDKMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEAPKKKTGYFAAPTQLEPEDQFVVPRDLEEEVKEQMKQHQESRPEHEPSEQDRTEVPEEFDTAL	116143	112148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_112100_116100
877946	contig_5799_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_50284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCTCCCACCTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326696	325741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_325700_326700
877947	contig_6946_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_59764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTATCCAAAAACGGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380843	378599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_378600_380800
877948	contig_1813_pilon	+	825	1	Intergenic	novelGene_105524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACTTGGGAGAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553907	554732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_553900_554700
877949	contig_5485_pilon	+	1827	12	Intergenic	novelGene_37733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	56.6062228276178	42	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	121	1125	326170	344205	FALSE	25	AGTGTTATAAGCTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLTTVAVNVILENGSQYKCHPFRSDLVLPFLPRAREESTVMRQNNRDTMGDAVGSESLQSLFSEWDNPVFARYPEVAVDVSSGQAESLAVKIHNILYPYRFTKEMIHSMQVLQQVDNKFIACLMSTKTEENGEAGGNLLVLVDQHAAHERVRLEQLITDSYEKQQPQGSGRKKLLSSTISPPLEITVTEEQRRLLWCYHKNLEDLGLEFIFPETSDSLVLVGKVPLCFVEREANELRRGRSTVTKSIVEEFIREQVELLQTTGSIQGTLPLTVQKVLASQACHGAIKFNDDLSLAESHRLIEALSSCKLPFQCAHGRPSMLPLADIDHLEQEKQIKPNLAKLRKMAQAWSLFGRAEGCDTRQSLQVPVPPCEPT	322966	344907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_323007_326089_326189_326891_326978_327877_327983_329113_329187_332176_332249_334181_334294_335281_335442_340666_340691_340795_340875_342928_343081_344082
877950	contig_1948_pilon	-	2381	5	Intergenic	novelGene_31157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.9554907485873	102	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	144	512	463939	461730	FALSE	30	GATCTTTGTACAACATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHLVKPDTRNCKRPRELEPQMPDSPQLSSLGKSDSSFSESSGLFYKDEALEKDLNDMSKDINLMLSAYAKILSERAAVDASYIDEIDGLFKEANTIENFLIQKRELLRQRFMEIANTLHR	465571	459860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_461875_462608_462661_462769_462882_463879_463959_465447
877951	contig_9696_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_68776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATAAGCACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182590	183845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_182600_183800
877952	contig_5649_pilon	-	1452	12	Intergenic	novelGene_82473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	60.5330317585721	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	76	1293	1661373	1648882	FALSE	20	TTTCTTTTAAACATCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAASQVVNRAQHQLGEFKTWFQEYMNSKDRRLSPATENKLRLHYRRALRNNTDPYKRAVYCIIGRCDVTDNQSEVADKTEDYLWLKLNQVCFDDDGTSSPQDRLSLSQFQKQLLEDYGESHFTVNQQPFLYFQVLFLTAQFEAAIAFLFRMERLRCHAVHVALVLFELKLLLKSSGQSAQLLSHEPGDPPCMQRLNFVRLLMLYTRKFESTDPREALQYFYFLRDEKDSQGENMFLRCVSELVIESREFDMILGKLENDGSRKPGVIDKFTSDTKPIINKVASVAENKGLFEEAAKLYDLAKNADKVLELMNKLLSPVVPQISAPQSNKERLNQESVEERVAAFRNFSDEIRHNLSEVLLATMNILFTQFKRLKGTSSSSASRPQRVIEDRDSQLRSQARALITFAGMIPYRTSGDTNARLVQMEVLMN	1661448	1648722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1648993_1650155_1650285_1651700_1651756_1654494_1654584_1655343_1655461_1657297_1657343_1657610_1657684_1657798_1657926_1658641_1658834_1659677_1659772_1660050_1660217_1661353
877953	contig_2504_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_166855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCCCTTGACTACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399658	398511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_398500_399700
877954	contig_16541_pilon	+	1155	3	Intergenic	novelGene_126752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	19.5	314	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	593	751	434811	434969	FALSE	40	TTTAACATTCACAAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWAAGLRLGGKRAVPWASAAFRDPRAAAPRVASCSGPSAPVRGGSAGLRGAALPLGRPGRAQIPVCWEGCVRCLHTQLEKSEDGRLIYTGNLARTVFGVKCFSYSTSAISLAFLPYIFAQNNIIFGSLPLQILFYGIIGSFTVITPVLLHFVTKGYVVRLYHEATTDTYKAITYSVVLSETSTVFRQNDVKIPDSTHMFTTFYAKTKSLLVNPVLFPNPEDYNHLMGYDKPFTFDMEEASEKKQLKDEK	426607	435373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_426795_428280_428387_434511
877955	contig_8920_pilon	+	3465	5	Intergenic	novelGene_146062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAAAAAGCACCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88116	94927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_91014_91999_92125_92527_92619_93782_93948_94740
877956	contig_9706_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_21051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTAGAGCAGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721152	718715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_718700_721200
877957	contig_18687_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_178193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCACGTGTAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11306	13462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18687_pilon_+_11300_13500
877958	contig_6017_pilon	-	1424	9	Intergenic	novelGene_152566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.4142135623731	196	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	105	833	504251	483808	FALSE	25	ATCGCTCAACACTATCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAYYGNINFFGGPSNTSVKTSAKLKQLEDENKDAMFVFISDVWLDQVEVLEKLHTMFSGYSPAPPTCFILCGNFSSAPYGKNQVQSLKDSLKSLADIICEYPNIHQSSRFVFVPGPEDPGFGSILPRPPLAESITNEFRQRVPFSVFTTNPCRIQYCTQEITVFREDLVNKMCRNCVRFPSSNLDIPNHFIKTILSQGHLTPLPLYVCPVYWAYDYTLRVYPVPDLLVIADKYDPFTITNTECLCINPGSFPRSGFSFKVFYPSNKTIEDSKLQGF	504355	483216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_483827_487379_487448_489263_489441_490253_490363_501913_501992_502078_502139_502906_502962_503310_503401_504178
877959	contig_6589_pilon	-	734	2	Intergenic	novelGene_25847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	29	571	939872	939082	FALSE	35	AGAAAACCCTATGCGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGLGGLARTRVGAGLEVRAGVLRGLVPGEGWLPPHLLAIDAVERFALRHGEVVLPVAGDPFPEEGPAAVVQQAGRQQCVVGHGVGLHGAEGRVRHDRAQRLLAQRPTQELADALHGAAEVLGAARRRVRGGAYPPTAEGGDPAERSLHVRTLSQSCLGDATSLPQFPHLHAEGLDYGL	939900	938918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_939438_939685
877960	contig_13607_pilon	-	1484	3	Intergenic	novelGene_170222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCTTCCCTTTCCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469018	449559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_450562_456418_456486_468603
877961	contig_5815_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_141243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTACATACTTTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1049475	1051247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1049500_1051200
877962	contig_18251_pilon	+	988	6	Intergenic	novelGene_50149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_1	1018.80530033957	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	116	775	35708	53991	TRUE	50	AAAAATGACTATGCAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35592	55095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
877963	contig_12079_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_67357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAACTTGCAGGCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164246	166224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_164200_166200
877964	contig_4924_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_84717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGATGAAAAGGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104180	103344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_103300_104200
877965	contig_15122_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_162700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCACAGGATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442349	440544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_-_440500_442300
877966	contig_12340_pilon	+	1527	10	Intergenic	novelGene_122105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10.7817861961851	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	181	894	55696	68740	FALSE	35	TTATTAAATATGTATCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVAVAEHSGEFEKIMQLSERYSGFILPCLGVHPVQGLLPEDQRSVTLKDLDIALPIIENYRDQLLAIGEVGLDFSPRFASTDEQKEEQRQVLIRQVQLARRLNLPLNVHSRSAGRPTINLLLEQGADKVLLHAFDGRPSVAMKGVRAGYFFSIPPSVVRSGQQKLVEQLPLTSVCLETDSPALGPEKQVRNEPRNIYISAEYIAQVKGISVEEVIEVTTQNALKLFPKLQQLLRK	43010	69373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_43124_53538_53597_55686_55761_55940_56026_59536_59600_61820_61931_62566_62623_64091_64205_65708_65787_68596
877967	contig_14472_pilon	-	1691	7	Intergenic	novelGene_111167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	27.6164202362773	67	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	179	997	281325	244074	FALSE	65	TAAAGAAAAAAATAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETVSESRFSLKTAALRVFDLPLSWYYSLSQIKFSPGIKKLFVVTALSAVSVIFLAHHFKRRRGKKKGKTLPWQPEHLILEYTKRAASDKGSSCSSSRQNLTLSLSSAKDKGSQSCNYANGGLFSKYSGSAQSLASVQSVNSCHSCACGNSNSWDKADEDDIKLVNIPVTTPENLYLMGMELFEEALRRWEQALTFRNRQAEDEANCSAIKLGAGDAIAEENVDDIISAEFIHKLEALLQRAYRLQEEFEATLGASDPNSLANDIGKMDI	285129	243379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_244215_244968_245106_248906_249034_252560_252698_255167_255346_281226_281341_284966
877968	contig_6202_pilon	+	3770	1	Intergenic	novelGene_139831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAAAAGGAATCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519832	523602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_519800_523600
877969	contig_12046_pilon	+	3005	21	Intergenic	novelGene_83451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.217944947177034	46	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	680	1018	126728	130437	TRUE	25	AGTTCCTGTAGTTCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPITKSKYITNNRRSSHTAGVSQSFLKPNSWVQEFLHAEITENWLKILANIHKGCIFLFKRLLLHLHHFLLALIGTEILWPVSLMSTIFIVNKKLANGDSSCAPFKNTTSLR	116777	153600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_117085_117192_117328_121179_121246_121967_122088_126676_126760_128114_128280_130295_130445_136457_136578_137301_137442_138605_138691_139409_139548_140014_140175_140549_140664_141820_142025_142641_142863_145460_145578_146642_146809_147601_147837_150850_150974_151822_151928_153548
877970	contig_12626_pilon	+	2071	3	Intergenic	novelGene_80467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	626	junction_2	47	21	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1554	2042	187877	196455	FALSE	35	GGCAAATTCTATTTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	186323	196484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_187970_191972_192174_196260
877971	contig_3817_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_78371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	670	975	649519	649214	NA	30	CTTAGCACAGAGCCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQSSFGLGASHCRNLRSKGCALLPALSWWYEAPMCLCSLLLYLKRDWLKTLPNLVDLISLTATNPSYYIVVTEFITHKEITSDYKMEHNYTIVGIMTQPS	650188	648104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_648100_650200
877972	contig_9656_pilon	-	814	8	Intergenic	novelGene_121915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	346.871263539354	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	163	618	438091	431074	TRUE	30	ACTATAGTCTGTACATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVR	441231	430422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430611_431065_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183
877973	contig_4256_pilon	-	1942	2	Intergenic	novelGene_176393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	721	1035	321242	320928	TRUE	0	TGCTTGGTGGCTGCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMKLLHATAFACEGPILSAAQRCTAPSFRLPWMSPLALCVHIMSVLAVLQNPRVDGPLLAPTAWKSRNPCFYRFHCGVPQEKTPMEIKPLKQTVNFKALNCDK	321962	184286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4256_pilon_-_184351_320084
877974	contig_3588_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_72889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCAACCTTTCAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130675	128480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_128500_130700
877975	contig_10444_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_139456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	331	993	221	1213	710756	711748	NA	15	CAGGCTGGTATCTTGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASRRAPPRPALPPSPLARKSAATSARPPSPVYRPTWSTTAPARAPPLPLREESGSDTSEEGDEESDVENLAGEIVYQPDGSAYIVESLSQLTQSGGACGTGSGALPSLFLNSLPTAGGKQGDPSCAAPVYPQIINTFHIASSFGKWFEGPDQAFPNTSALAGLSPVLHSFRVFDVRHKSNKDYLNSDGSAKSSCVSKDVPNNVDLSKFDGFVLYGKTKPILMCFLCKLSFGYVRSFVTHAVHDHRMTLSEDERKILSNKNISAIIQGIGKDKEPLVSFLEPKNKNFQHPLVSTANLIGPGHSFYGKFSGIRMEGEEALPAGSAAGPEQP	710535	711748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_710500_711700
877976	contig_6418_pilon	+	3046	1	Intergenic	novelGene_81261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	125	376	1520319	1520570	NA	50	CACTTAAAACCAACAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVDLIKIIYSTTFPARCRSLSLSLSVCHLLPSSGCRFQLMATSICIRVELYFRIGFSTADILEVDCQAFFPSLVYTSKKQAKFLKSYTFLTVRSLLEIKLRMDQHLPWEKKKTNYIPTLKFF	1520194	1523240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1520200_1523200
877977	contig_14288_pilon	-	580	3	Intergenic	novelGene_153807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	20.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	102	359	170157	147092	FALSE	45	TAAAAGCCACAAACCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVIAKEGQNLKELYLVSCKITDYALIAIGRYSMTIETVDVGWCKEITDQGATLIAQSSKSLRYLGLMRCDKVNEVTVEQLVQQYPHITFSTVLQDCKRTLERAYQMGWTPNMSAASS	328023	146870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_147233_170040_170184_327948
877978	contig_13780_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_149131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCAGTAGTGTCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848563	846422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_846400_848600
877979	contig_4531_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_47890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAACCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319876	318733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_318700_319900
877980	contig_6710_pilon	-	314	2	Intergenic	novelGene_98308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	1	312	657505	653604	FALSE	15	CTCGCCTATCGTCGAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTL	657505	653601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
877981	contig_14970_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_45098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTAACCTTTTGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233364	232811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_232800_233400
877982	contig_7410_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_106043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAAAAGCACTTCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44361	44894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_44400_44900
877983	contig_4686_pilon	+	2819	1	Intergenic	novelGene_118515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACCCAAAGTAGCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418126	420945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_418100_420900
877984	contig_16846_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_82964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCGCCATGTTTGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550863	551507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_550900_551500
877985	contig_10511_pilon	-	2480	6	Intergenic	novelGene_126900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	10.4	108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	154	507	464288	451554	FALSE	10	TCTTGTTTCATAGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKKLIGKPLQPARPVRHLTSPPGVVFPFNFQNEYPCNTQCLQSGVGRCKTNGMQAFPQGLNEKQQHQSPVKKERIKYSRDFLLKLSSVSICRKKPDFLPDHPIVLQKPENNQSFK	473024	449580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_451578_453358_453466_457954_458031_461303_461378_464215_464315_472897
877987	contig_8921_pilon	+	4123	2	Intergenic	novelGene_161621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	994	2190	33857	35053	FALSE	10	CTTTTTTTATGTGGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASFVKSCIFHVSGTGTSEEVGMDFPASSGLLPHQAAPSSEKPHSGIERGEAFHSGNRQYEWGECGSTFSHEHTLLQPQSFCTGEGLYRCNRCGHPTVSCKCRRGKGQRTGPQERPYECGICGQFFGQISILVKHQITHSAERPYECSECGKSFKRTAELIRHWRIHTGEKPYECSECGKSYTRSSNLVEHQRSHTGEIGYARYTCGICGKSFKQSSKLTLHKRVHTGERPYECDQCGKCFSQISNLMQHQSVHTGERPYDCAECGRSFSRRSNFIEHQKVHTGERPYECGECGKFFSRSSILSEHQRVHTEERPYECGECGKAYRRVSSLIEHQRVHTGERPYECSDCGKSFIRNSTLTRHRRVHTGEFSGEFAGDFTEEFTDEFAGDFSLENAL	14720	36986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_15422_33564
877988	contig_4908_pilon	+	2368	5	Intergenic	novelGene_117373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	65.1402333431498	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	418	801	53589	60051	FALSE	40	CTTCACTTAAAACTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALFQLSMWIRTCHNYFIEDLGLPVWGSYTVFALATLLSGLLLGLCMIFVADCLCPSKRRRPQPYPSKKLLPESSQPLKKVEEEQETDEGDVSEEEAESEAGTKSGFSENALRQRSVGPSPRMEES	51074	61618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_51482_53578_53625_53724_53827_53950_54018_59872
877989	contig_9011_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_159322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGCTGATGATCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544515	546623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_544500_546600
877990	contig_5964_pilon	-	3020	6	Intergenic	novelGene_80367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	85.2370811325681	262	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	433	2268	128960	115131	FALSE	35	GACAAAAATGGATTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNCEAMKSLAQMLDEPAPLSLDFALSQEDLERTKSQASVTFMDVAVRFTRREWEQLAPTQRVLYRDVMLETYGNLLSVGCQYTKPDVIFKLEQGEEPWTEEGAPPRRSCREKFWKGDDLIDWQQENHVSFSTQVASTYRKTQTKVIHKKCIGKQFGLSSELISSSNKPHNCDSLGKNLKDNSDLVVHEKHCAIKKSSNCDGDAESFCHITSNTGVKTCECNHCVKAFIQKSNITVHHGIQSENKPSESNGYEEKFHANSFFTQEEEAYNSDKSYDCSQCGKTFSQKSYLIRHHKTHTGEKPYECKQCGKTFSQSTYLIAHKRAHTGEKPYECNQCGKNFSYQSSLIRHHKFHTGEKPYECLDCGKSYFEKSHLIVHQRIHTGEKPYECNECGKAFTSISVFVQHVRTHTGEKPYECDKCGKRFTTSSYLFLHARTHSDEKCYKCNECGKGFLQKVQLTVHKRIHSGEKPYKCNKCEKAYRDHSSLNHHIKIHSGEKPFVCNECGKSFTYQSFLIKHERYHTGEKPYECTECGKAFFYNRELTVHQRRHTGEKPYQCTECGKAFTASSCLRLHVRTHTGEKPYQCNQCGKSFSQNGQLTAHWRTHAQERSL	129546	114378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_116633_122054_122151_122590_122718_128252_128312_128908_129199_129352
877991	contig_6058_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_172425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGAATAAGGGCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401807	403959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_401800_404000
877992	contig_9389_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_83892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	209	619	106359	105949	NA	40	CGTACCATGATCACAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAGSPLVALPTGPDPSLGWGRPVHCRVLSSIPGLHPLHASSATPHKSWHLQMSPDIAPSRGGTVPQDDNLCPLLPRTRLRVLGTSSLATHLCLDLSGRRLKEITRESLLLLKVRSVLSCFNISSTLQGYNCLKYF	106567	105539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_105500_106600
877993	contig_9578_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_67976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGTTGAGATTTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1092688	1091197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1091200_1092700
877994	contig_2377_pilon	+	1419	10	Intergenic	novelGene_67937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	940	1374	873895	893940	FALSE	55	ATGACAAGATTAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSWILHHWLQTTIVALIYFSVVQWVLHIAVLFVQLSHEVVFFPFSLVCRLGKSTSLLAFWKVVGHSTPYGILYHKSHKKAYCPAFLPWILHALHVLHSIHCHLKAFTFVVNSGQNFKQDGSYHYCHNLHMRGVLLVSFHDLIL	861114	893985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_861167_864523_864679_867948_868095_870225_870342_871899_872022_873546_873928_877150_877285_879628_879714_879932_880045_893869
877995	contig_1786_pilon	+	2166	2	Intergenic	novelGene_142590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATATTGAAAAGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39875	42481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_+_41111_41550
877997	contig_7066_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_42172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAATTAATGGAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918000	920405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_918000_920400
877998	contig_15327_pilon	-	1624	3	Intergenic	novelGene_70799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	43.5	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	290	331	1247529	1247488	FALSE	65	CAAAAACAACGCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDGTFCVKPLKQKQVVDGVSYLLQEIYGIENKYNTQDSKVAEDEVSDNSAECVVCLSDVRDTLILPCRHLCLCNTCADTLRYQANNCPICRLRKHRMPRVGVRPRVCRH	1252686	1246194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1247701_1248422_1248495_1252640
877999	contig_13481_pilon	+	837	4	Intergenic	novelGene_119471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTAGAAGAAATATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289979	1299925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1290201_1293859_1294094_1299424_1299597_1299715
878000	contig_11898_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_144276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTATTTACACCGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203041	201779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_201800_203000
878001	contig_3153_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_104657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGGAGTGGCATGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133546	132218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_132200_133500
878002	scaffold_13936_pilon	+	3175	10	Intergenic	novelGene_178196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	23.7351643072332	7	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1026	3078	98	3175	76211	122680	FALSE	20	ACCCCAGCTGTTTCTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEHPVPRKHRRGHLLALAMSLLLTCQPGTDGNLVSTTKMPNQTAHEGSTRSSLSHGTGTNPTRTDGTAGSTTDLPTHESSAWLKSDPSTPMTVVDSTGPDESVVITTRESLTERAHGGSTWSTGDPTSPVTTINLDLGLPTRSPGTPQDLMNPSSEEPSSSPGTRSPVETSPRETLTETSPTDTTVALPTLQSRATQSGSTRLPHLHTGVTVPVESPTEQTVPMERGSLSPSPSETWAKPYSGTPRRTSQSRGTVSSFPTESNPTGTKGTGKESIPAQTPKTDGIAVYTWLDPTWEARVDTDVPLSTSSTDLEDSATSFITIPKITITSVTDESAVTGDVPLSEMTTPVSRQPEARPQTSPSSEEDTRSLSSKVPVSRLTSTSSGSSEVGGLRNPTLPPPTSGMRLSPSSTNSHSLKTKVASAPAFPEDSSGSLSTATGQDRTAEMSSVDISTSVARNTLPTSDTAEITATEESSPGVEPSSTPDSDNSTPFTRPDESVVITTRESLTERAHGGSTWSTGDPTSPVTTINLDLGLPTRSPGTPQDLMNPSSEEPSSSPGTRSPVETSPRETLTETSPTDTTVALPTLQSRATQSGSTRLPHPHTGVTVPVESPTEQTVPMERGSLSPSPSETWAKPYSGTPRRTSQSRGTVSSFPTESNPTGTKGTGKESIPAQTPKTDGIAVYTWLDPTWETRVDTHVPLSTSSTDLEDSATSFITVPNITITSVTDESAVTGDVPLSEMTTPVSRQPEARPQTSPSSEEDTRSLSSKVPVSRLTSTSSGSSEVGGLRNPTLPPPTSGMRLSPSSTNSHSLKTTVASAPALPEDSSGSLSTATGQDRTAEMSSVDISTSVARNTLPTSDTAEITATEESSPGVEPSSTPDSDNSTPFTRPDQSVVITTRESLTEGAHGDITWSTDDPTFLMTTVNLDLGTDGIVKPITKVPNKAAHGDTTGPTSFPQASTSSVIHRVLPTRGTERAETTVTALKVTGGTAIPTTPSTGTSGTLTALRTSGDTATSSTTGLIIT	76113	122680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13936_pilon_+_76299_88064_88170_91820_91926_97388_97509_99222_100291_100920_101041_102754_103823_106242_106363_117436_117551_122510
878003	contig_11171_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_48633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	428	748	446850	447170	NA	90	AAAAAAAAAAATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGVKLAETPSSWPGPGSLWLANPAGLTKYAQRPRDHQAGSRGDRLRFTSPAHSRQLCPARRGQEEGRASSDGQETSVAGLPRGVSGSRRPGAPSYPVCFLISLL	446422	447400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_446400_447400
878004	contig_11136_pilon	-	1471	14	Intergenic	novelGene_169018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_13	13.1792377508074	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	206	1246	135067	130695	FALSE	30	AACAGTGAGGACATTCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASESPEGEHPSVTLFRQYLRIRTVHPEPDYGAAVAFLEERACQLGLGCQKVEVAPGRVVIVLTWPGTNPTLPSILLNSHMDVVPVFKEHWSHDPFEAFKDAEGYIYGRGAQDMKCVSIQYLEAVRRLKAEGRRFPRTIHMTFVPDEEIGGHKGMELFVQRPEFQALRAGFALDEGLASPTDAFSVFYSERNVWWVRITCSGKPGHGSRFIEDTAAEKLHKVISSILAFREKEKQRLQSNPHLKLGAVTSVNLTKLEGGVAYNVVPATMSASFDFRVAPDVDLKAFEEQLQDWCQAAGDGVTFEFAQEPHCGARDLLCYHRQPLYPCGGGPGPGLLAHEPHACAAA	135689	130469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_130754_130840_130902_131743_131813_131909_132055_132156_132207_132291_132366_132710_132768_132867_132958_133047_133125_133433_133529_133812_133918_134004_134070_134973_135086_135502
878005	contig_4131_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_127898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAGGCTATTATACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378453	380741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_378500_380700
878006	contig_3476_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_134103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTCTTCCTGTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71719	70962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3476_pilon_-_71000_71700
878007	contig_15732_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_88916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCATTCTCAGGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361075	362379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_361100_362400
878008	contig_3307_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_86889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTCTTGGCTGTACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136434	134728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_134700_136400
878009	contig_8284_pilon	+	2383	10	Intergenic	novelGene_125655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.14269680527354	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	476	1849	98029	129573	FALSE	15	TGGACTCCCTTCCTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSLKNVLVVSFGFLLLFTAYGGLQNLQSSLNSEAGLGVTALSTLYGTILLSSMFLPPLLIKKFGCKWTITGSMCCYVAFSLGNFHASWYTLIPTSILLGLGGAPLWSAQCTYITILGNVHAEKAGKAGKDVVNQYFGIFFLLFQSSGVWGNLISSLVFGQTPTRGFLPDEELQHCGASDCLMATEPTNSTQRPSQELIYTLVGIYTGCGMLAVLLVALFLEPIRDSQQKSEGEKKSPLWSNLLATFKLLGDKRLRLLILLPMFSGFEQGFLAGDYTKSYVTCALGIHFVGYVMICFSATNALCSLLYGKLSQYTGRIAIYVLGALTHFCSIAALLLWKPYPDQLAVFFVFSALWGVADAVWQTQNNALYGTLFEKNKEAAFANYRLWEALGFVIAFGYSTYLCVYTKLYILLGILIVTMVAYGTVECLEFKTQIKPLAKEQTNQAQEEEEMQTKM	70973	130107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_71129_71576_71847_97978_98116_103992_104175_104927_105158_107639_107766_117822_118035_119768_119905_120924_121057_129304
878010	contig_11427_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_79018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	26	460	781353	780919	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPIEEEEELQPQQLLTQQLPESRVDGEASVEVSKLPMSEPEADSEIEPKESNGTKLEEPIAEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKVRKYFFVHFNLN	781378	778899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_778900_781400
878011	contig_7359_pilon	-	2292	2	Intergenic	novelGene_139842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	0	133	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACAAAAATTTTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38531	24718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38410
878012	contig_12951_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_68179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGAGCGGCACAGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355287	357641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_355300_357600
878013	contig_11416_pilon	+	1208	9	Intergenic	novelGene_145354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	199	582	229708	231389	TRUE	15	CTGCGGTCCCGCGCAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPLRCQLEELDVTPLHPVNENPQHVLLVLGGADQAADALDALAFGLHILVLRFLGQEHHYFLFFSLVTTVMDMVGVAVASPLLGSLLTWRDRKVHLSVFFCRGQVFLLRISLFLRRLSRRPVIHL	229509	240840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_229776_230910_231028_231190_231418_232155_232287_232576_232623_234461_234507_239396_239506_239786_239900_240686
878014	contig_11574_pilon	+	1130	7	Intergenic	novelGene_64048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_6	9.322910847298	298	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	223	738	421915	447103	FALSE	40	GATATAAAGTGAATGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPLSPYLNVDPRYLVQDTDEFILPTGANKTRGRFELAFFTIGGCCMTGAAFGAMNGLRLGLKETQNMAWSKPRNVQVLNMVTRQGALWANTLGSLALLYSAFGVIIEKTRGAEDDLNTIAAGTMTGMLYKCTGGLRGIARGGLTGLTLTSLYALYNNWEHMKGSLIQQSL	418668	447495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_418883_421906_421966_433334_433429_433644_433730_436308_436368_438349_438461_446987
878015	contig_10523_pilon	-	2630	2	Intergenic	novelGene_120933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTGCCAGGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16117	12738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_13173_13921
878016	contig_3627_pilon	+	1229	3	Intergenic	novelGene_78426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	1	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215007	220420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_215030_218667_218759_219304
878017	contig_13744_pilon	+	1631	6	Intergenic	novelGene_77161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_2	24.7661058707258	1771	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	58	435	297549	308103	FALSE	20	GCTATTTGGTGTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEELEALRKQRLAELQAKHGDPGDAAQQEAKHREAEMRNSILAQVLDQSARARLSNLALVKPEKSKTVENYLIQMARYGQLSGKVSEQGLIEILEKVSQQTEKKTTVKFNRRKVMDSDEDDDY	297491	309299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_297615_298569_298608_300594_300657_305292_305385_307646_307719_308055
878018	contig_16156_pilon	-	1490	13	Intergenic	novelGene_137089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	831	1229	698831	684621	TRUE	10	TCTGGGTCTGCTCAGCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSRGTAKVTQLDGPLVAKQQVFNLEVSVNDGRLLLVHVLHCSARLIKYLQNRITRERTSRLNFLYKVHQLPFTELCQQQKLSLPCVRLFFSYRRCRTKLDNIGVARKFFLETDFLNDGPVLLLFIGQQPL	732710	658836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_659041_684563_684625_685629_685690_686396_686512_692359_692503_698754_698881_707703_707792_711634_711777_712255_712367_715996_716109_726359_726486_731318_731366_732555
878019	contig_6436_pilon	+	979	4	Intergenic	novelGene_134916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCGGGACACGCGCACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726604	790169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_726690_728496_728749_739444_740016_790098
878020	contig_13456_pilon	-	2915	2	Intergenic	novelGene_153299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1387	1704	346328	346011	TRUE	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSREGDAGRRGSSTDCLPQPASGHLTNTRLAPHGRYAKPQRALNTSSERTDRKHHNQDSNSGRQLLPALGTMFCRQASTPHAITGAGQVKRGLTQILREGSLPSG	347714	344007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_344908_345699
878021	contig_6241_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_156401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATGGCTTTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183574	181394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_181400_183600
878022	contig_3787_pilon	+	1532	2	Intergenic	novelGene_102371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376155	378108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_377312_377732
878023	contig_11281_pilon	-	2003	2	Intergenic	novelGene_125505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	21	395	958063	957689	TRUE	70	AGAAAGAAAAATTAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARINLLMSSSSIKASQFILGGIFFFIWKGGSGALRLGVGTNCAQALIMPFDCCLTSGCSDLDLRQSQSCAKGFPKVKLVMLRGSSWRLCGPFDSMRKKILSCTGKLRRMRGWGGKGWESSHGFSRAAPFF	958083	948776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_949946_957249
878024	contig_19352_pilon	+	2745	5	Intergenic	novelGene_122425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	78.9695352651894	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	488	976	407124	413516	TRUE	35	ATAGAATTTCTGGAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTNHSACCVQFLPVKSCRYLLKCKPEWLLCCSSQKQSLELTSDLSILQMTRKELENQVGSLKEQHLRDSADLKTLLSKAENQAKDVQKEYEKTQTVLSELKLKYEMTEQEKQSITDELKQCKDNLKLLREKGNNPSILQPVPAVFIGLFLAFLFWCFGPLW	406636	416688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_407394_411413_411549_413432_413523_414888_416220_416256
878025	contig_7758_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_163540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATAGAGAGATGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159661	161840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_159700_161800
878026	contig_13048_pilon	-	1898	3	Intergenic	novelGene_138939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGTCACTGAAAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516744	510224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_511975_512891_513022_516726
878027	scaffold_12510_pilon	+	1550	10	Intergenic	novelGene_151403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTCCCCAGCCTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585729	602705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_585820_588355_588551_593705_593801_593911_594061_594434_594566_597775_598046_598526_598682_599598_599828_601682_601755_602541
878028	contig_5260_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_144385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAGAAAAAAACAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398787	396893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_396900_398800
878029	contig_8357_pilon	-	2976	6	Intergenic	novelGene_39775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_2	546.042122917271	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	279	854	891622	887100	TRUE	40	GACGACAAAGATGATAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSQGQLAEEIALSDRRLAFCREFSRPASRRLLAAWGPFAGVPVASLTRLGHSLAAPSPDGVPWSRVSDRCPEERDRAWPPPPSLLFPSFRRNMANNSPALTGNSQPQHQAAAAAAQQQQQCGGGGATKPAVSGKQGNVLPLWGNEKTMNLNPMILTNILSSPYFKVQLYELKTYHEVVDEIYFKVTHVEPWEKGSRKTAGQTGMCGGVRGVGTGGIVSTAFCLLYKLFTLKLTRKQVMGLITHTDSPYIRALGFMYIRYTQPPTDLWDWFESFLDDEEVCQQG	891900	883912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_884343_884647_884872_885631_887179_887257_887410_887717_887787_891346
878030	contig_2380_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_117892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGATGTCACTTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181861	183957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_181900_184000
878031	contig_11846_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_106021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATAAAATAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552891	554665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_552900_554700
878032	contig_10404_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_138713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCGCCCCAGCTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1247964	1249125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1248000_1249100
878033	contig_18778_pilon	-	2375	1	Intergenic	novelGene_151774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1000	1341	54261	53920	NA	0	TTTTGGGGGGGGTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWLASLIPRALPPPTFTDSNQPSTLMHTNTRTIHSTLVFTSVKWEKEKPLFHGFVMRTEQDDIFIARGTVPDTQEILTKCTSTVTNPSLPTVQHLWLPPSPPSRNTWVLRIG	55260	52885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18778_pilon_-_52900_55300
878034	contig_9706_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_20941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAGAAAAATAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248420	250400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_248400_250400
878035	contig_11321_pilon	-	2288	4	Intergenic	novelGene_86652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1521	2039	176431	168630	TRUE	30	CCGGAGAGGAAACAGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGLMTERWALSSPADEDEGLSSSRGSCFTTTAPTPPPPLRKGCSPGARGGSALLGADLAHRSMGHQHELQLLLLLLQLSNLLLQARLLLLQLLCLRLQLLRQLPAAVPALGSGQLVPLPPDSTLLFLFRRQLLVSPPAAHRGANGLDHARSWESHVSGDGSQARQRAVGV	177951	157337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_157452_168494_168748_173545_173655_176139
878036	contig_8651_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_168167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACCAAGGTACCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135592	134185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_134200_135600
878037	contig_6837_pilon	+	1689	10	Intergenic	novelGene_149828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	44.9570439694286	47	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1566	124	1689	55194	61073	FALSE	20	CTGATTCTCCAGCGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLRGHVSAHPDILSLENRCLAMLPHVKTMEKPHGHVSSHSDVLSIENRCLATLPDVKTMEKPHGHVSAHPDILSLQNQCLATLPSLKNTKCASTLLQHLQIPHLAQADLYSLNINNSLFSEPPTWRTQCLSEGQDLLTCPRALESTSATKRAQEEALGCWSLSEEDKKPEKIEGEEAQMPFYSLSFGEEEKVEELALELTLGESKSHPEPTDQALQEKKMALMSLLCSSVASKVNTKEEKYSFQTFLFKVCSELAPLEPEFILKASLYTRQQLNIRDAANRVLAIAAFLPACRPYMRRYFCAIVQLPSDWIQVAEFYQSLAEEQENKLVPLPACLRAAMTDKFAQFDEYQLAKYNPRKHRAKKRPRQPPRPPKSGRPFSQTQKYLPKFLWFFKDEQKKFEAAYNAVPKKKDQPRFTLKKLVQRLHIQEPAQHVQALLGYRYPANIQLFSQSRLPGPWDSSRAGKRMKLSRPETWERELSLGGSKASVWEELIDNGKLPFMAMLRNLSNLLRAGISARHHK	51206	61073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_51306_55169_55671_55865_56052_56363_56499_57244_57407_57867_58030_58344_58423_59787_59913_60132_60291_60990
878038	contig_10976_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_155605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATAATATATTAATATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236639	235415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_235400_236600
878039	contig_9305_pilon	+	3219	1	Intergenic	novelGene_148195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2430	2783	186625	186978	NA	45	AAGTCCCCCAAATTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCSKYVGRSLTILPSKEHSGYTSKTDLFILLAVRGIFNVLCQHHNSKTSIFLQSSLFTVQLLHAYEATENTWLGSGPLTLQSDIFAFLTLKRSFAADLPIQCCLIS	184195	187414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_184200_187400
878040	contig_6496_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_103524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATTAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900317	902237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_900300_902200
878041	contig_7318_pilon	+	1309	2	Intergenic	novelGene_152212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	0	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	782	1129	177513	179856	FALSE	75	AAAAAAAATCAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSASSPRPAPDENEFPFGCPPTVCQDPSEPKALCCDACLSEDMRNSEDQSCPKCRGDDPHSASPGNLLSQEKVCCAPAKGIVRSLDLFTVRPSRQQPTWPLAGASFLVFSPD	176731	180036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_177653_179648
878042	contig_6515_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_177995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCAAATTTAAATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465484	467453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_+_465500_467500
878043	contig_5057_pilon	-	1135	2	Intergenic	novelGene_151505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	97	483	371370	365835	FALSE	0	TTTCTTTTCTGTTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSGARKWLCGVTCDRSEINPHSTPKARFSTAMERQQGQVSQATLPLAQAHFEKGQYAKAEALYSAFIRHCGWTASARAGPGSKCSPEDLATAYNNRGQIKYFRVDFYEAMDDYTSAIEVKPSFEVPYYNRGLTLYRLGKFFFTAFVVDCILLFPSSQML	371466	365182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_366070_371218
878044	contig_16228_pilon	+	848	6	Intergenic	novelGene_147922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	288.050273389907	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAAAGGAGACCTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47753	72163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60015_69629_69790_71434_71573_71760_71862_72017
878045	contig_5331_pilon	+	1086	6	Intergenic	novelGene_112766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	7.98999374217527	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	194	751	194566	205969	FALSE	30	CGTGCACTAATGGATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDVLFCPQCRALQPPDPTRDYFSLMDCNRSFRVDTTKLQHRYQQLQRLVHPDFFSRRSQTEKDFSEKHSTLVNDAYKTLLAPLSRGLYLLKLHGIEISEGTDDEMDKQFLMEIMEINEKLTEAQSEAAMNEIESIVAVKQKECIDSARRAFEQDDFEKAKEILTKMRYLLNVEEKIKLKKIPL	194372	206304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_194652_195791_195889_196630_196721_197299_197445_202566_202615_205877
878046	contig_3081_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_133904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAAAACCCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30060	27841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_27800_30100
878047	contig_5230_pilon	+	1537	8	Intergenic	novelGene_173231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	6.45549915868286	57	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCACACAGGTAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14367	51100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5230_pilon_+_14808_16322_16451_18255_18446_29379_29528_33933_34028_46124_46323_49365_49535_50930
878048	contig_13412_pilon	+	3627	1	Intergenic	novelGene_80004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGGTGCATCCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334469	338096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_334500_338100
878049	contig_5331_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_112770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247406	245742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_245700_247400
878050	contig_14553_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_125008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCCTTTTTGGGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18765	16833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_16800_18800
878051	contig_12079_pilon	+	755	7	Intergenic	novelGene_67559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGCGCTGACTTCCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866538	872425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_866649_867246_867409_868245_868414_871103_871170_871499_871555_871641_871724_872313
878052	contig_16831_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_134796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGGAGTTAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399475	398385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_398400_399500
878053	contig_13457_pilon	-	1132	7	Intergenic	novelGene_118318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTCGAATCCGTACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54953	52086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_-_52408_53072_53178_53291_53413_53513_53613_53933_54168_54255_54441_54886
878054	contig_9099_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_149901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAAAAGAGCTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304230	301642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_301600_304200
878055	scaffold_6394_pilon	-	2441	7	Intergenic	novelGene_111018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1787	2233	401405	400959	FALSE	25	TGACTACACCAGCTACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSGGRAVILRCTRAFPGVPLATPLTGVRGREPINNNLPTQTADGVTHGKHQVTCGGSAGSVSFLGKLLLSTRALMTKPQSWKPDEWLPGAGCSVRRDSRQLRGELCEDGTVLSRLCGGYKSTPYTTAQTCMRRAPEGRLKTGKLG	406275	400750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_402242_402863_402971_403237_403372_405024_405198_405299_405498_405714_405870_406092
878056	contig_10324_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_7822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	2257	2637	239908	239528	NA	25	AATGCTGGGTTCTCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHWEPDTKPPRPFPPGRKSPCGRSNTLLVHCLTVLISSWITRSTHFRQGSFSLTTCFFTMASNAKSGVKSPVLKTSVPGGSGDKSERNKARSAIPQALAGSPRESKGQVKSGGQMPASTAWKPPE	242164	239422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_239400_242200
878057	contig_6202_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_139820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTTTGTAGAGAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437225	439311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_437200_439300
878058	contig_15120_pilon	+	2034	14	Intergenic	novelGene_107984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	12.1114157113256	8	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	56596	68732	TRUE	50	GCAAAGGGAATCCAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALVHTGVALVPRGLTLAPADGPTTDEVTLQVSGEREGSPSTAVRYPSGSVALPSQWLLIGHHEPPPVLHTTMLRVHPTPGSGTAKTRPPESTQAPSLFLELLSLNREELWNLELHPEEKTPDLYPQLGPQDLLAASLTAVLLGGWILFLMRQQQQLTEKQQQLTEKQQQLTEKQQQATQAPAGPSHIPQDAQSQPSGTTLQGQKRLQSPSEQAQPLKDAEAEQLTVVGKISFNPKDVLGRGAGGTFVFRGQFEGRAVAVKRLLRECFGLVRREVQLLQESDRHPNVLRYFCTERGAPVPLHRPGALPGLIAGVCGNPRPGSLGPGAQGGTPSADVWPGPPAFLAHSAPGLEAWEHSHHRARHPGQRQGGPLGLRPLQEAACRPPELQPPLRHPRHGRLDGTRTPSAPAPRQPYQRGGHLLGWLRVLLCAFWRQPPLWRESLSPGQHPWRGSLSGSPGGGGP	56183	70110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_56219_56303_56452_56560_56683_57377_57534_57797_58003_66916_67002_67147_67339_67423_67524_67606_67807_68495_68644_68731_68860_69418_69543_69626_69695_69786
878059	contig_12697_pilon	+	2009	12	Intergenic	novelGene_122825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_11	12.353605556595	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	33	1364	215749	231237	TRUE	45	TATTCTATAAAATAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLLSPLRSSAMECLRSLTLLLPRAVGLRRRTLCALALCSTPVAHPVVACGRAAELLGRSRAAPLCGPRRLRVAGEVHRFRTSDVAQATLASVAPVFTVTKFDKEGNVTSFERKKIELYQELGLQARDLRFQHVMSITTRSNRIIMRMEYLKAVIAPECLLILDYRNLNLEQWLFRELPSQLAGEGQLVTYPLPFEFRAIEALLQYWINTLQGKLSILQPVILETLETLVDPKHSSVDRSKLHVLLQNGKSLSELETDIKIFKESILEILDEEEMLEELCLTKWSDPQVFEKSSTGIDHAEEMELLLENYYRLADDLSNAARELRVLIDDSQSIIFINLDSHRNVMMRLNLQLTMGTFSLSLFGLMGVAFGMNLESSLEEDHRVFWLITGIMFMGSGLIWRRLLSFLGRQLEAPLPPMMTSLPKKTLQADRRMEVKTSLRPDGLGSSRNILTNR	215716	265478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12697_pilon_+_215939_217053_217128_219954_219992_221451_221565_222791_222966_225344_225476_227333_227451_228271_228425_228684_228803_230455_230570_231126_231248_264843
878060	contig_3584_pilon	-	951	3	Intergenic	novelGene_108123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	269.5	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTATTTCCAATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277338	226164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_226597_254109_254314_277023
878061	contig_1274_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_137808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTAGTTACCCACATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460097	459185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_459200_460100
878062	contig_10371_pilon	+	3088	1	Intergenic	novelGene_175475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	2	9	444	452	691198	691206	NA	20	GCTGCTGGAGAGCTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRCCRACAFWGSGADCVRPSGRCCRSLCTDGDTRSAPTRGWAWRGRAPRPERYQSGDNTGEKQQRGKRGKRGGEKGCSVTEEVTTDPTCWHWALLEAEGPAGSARAQTAQRGPGRLSEGPNGLARVQTAQRGPGRLSEGPTGSARAQMA	690754	693842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_690800_693800
878063	contig_13201_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_130876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGACTTATAATGATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124724	122405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_122400_124700
878064	contig_6576_pilon	-	1165	3	Intergenic	novelGene_42329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	22	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1143	23	1165	653173	646768	FALSE	20	TCCTCTAGACATCAGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKQKQIEMENSLSDTESEQTIQKRKSNVVIQEEELELAVLEAGSSEAVKPKCTLEERQQFMKAFRQPASDVLKNGVKKSSDKQKDLNEKSLLEEGRENSSKNIMENPNIQMISNNGNSQSHTDKGSFPKEKSKKLKQKGKKILDTGVALGENGEGNTQKKETTSFLKEKQNQNKITMSLRRKKTEVFKSSTLFNSKSLLCEDIAKDDPLKISSLFNNSKSSRKTSIRVKDVKIRDSKAEPKDNLVNVSTPKSTRRSVRGSSTPTTIIIRGSDFEDSEDNSPIKASTPKAANLPGKRNLYTAELITVPFDSESPIRMKFTRISTPKKSKKRCEKRSQKSEATDGDFISQTRKASNASKNISKAKQLIEKAKAIHISRSKATDEITPLRR	653195	646767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_646879_651511_651621_652250
878066	contig_5083_pilon	-	1204	3	Intergenic	novelGene_151691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	13	89	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	670	1080	1366270	1365860	TRUE	30	CCTACTGGCTCAAAATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDTFLEEDIWEYKSKRKAKRVHRNNGSENTPKSVEKATDGKYQSKRRRNKKELKRTVEAKEKTKDNEICLGETHSQISVASGQDSSGDSIQHSQDKETTPAKHCRTKKKNKNPQRYVHFMMDTVLIARCLFPHC	1367457	1363310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1363375_1365799_1366906_1367423
878067	contig_1264_pilon	+	1716	4	Intergenic	novelGene_161324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATAACTATGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145502	149667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_145535_146151_146289_147450_147549_148218
878068	contig_5598_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_148299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873009	874446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_873000_874400
878069	contig_6497_pilon	-	1168	4	Intergenic	novelGene_35626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_3	65.2039535270336	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	192	1166	724509	700820	FALSE	45	AGAATTGGAAGCAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFFKCYSSLTDQIFSEENKSFHNVIIEKKENKKHFIVGALANYFSRGSYIFIFQIRYIVHFLWDISKVFALKRLKHSNKCVYLYRYALQKANNRLLKTLLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKGQSSASLIWRSEAEAPIKSCIHEEHRGVTDESVPSYSGSDMPRDDSSMWSKVTEEGTELSQRLVRSGLTGTETDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEVTESLRCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADERTFFERQIQEKSDIIDRLEQELLCEGNRL	724700	700817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_700933_702457_702621_717343_717577_724043
878070	contig_2215_pilon	-	1217	8	Intergenic	novelGene_163858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCCTAGATGGGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244570	214721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_214761_216156_216252_216892_217104_226675_226824_227787_227878_238783_238925_241934_242289_244431
878071	contig_7179_pilon	-	1376	7	Intergenic	novelGene_78202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	50.5714565958132	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1365	10	1374	1439301	1409544	FALSE	25	GGATGTATTTAAGGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYGQTAGSGVLKTCDLDRILEALKLLLSPGGSGSSSLQITKRDVLLATLKSNLSDLEDKFLKDPHWTKLKLLRDEIANKTEWPQNSVDVTWSFTSQTLLLLLCLKETMFRLAADFSPGKPNPRTPEAAPALSPDTLSISQQKTVQSVLQFVVTLGVCPYLMPGVGVPLRYKTEFVAVVQDLVRLDAAPSATRRLYTSCRVLLNVAQHASLGSLIFCHHFGDIAAGLCQLGFCPTKRKPQKPMEEVLNEEERALSRGALRDILDQVYQPLAVRELLILQGGPAQPCTDGKTQVGSLAPAWLRRLCGQLLSERLMRPSGVQAVVRGILEGAGAGAAGGSDAEVMAADWKKCDLIAKILASCPQQSLSPESYYKDICPQILDLFHLQDKLTARQFQRVATTTFITMSGERPQLAAKYLLQPVLAPLHRCLNTAEIPEHDMVPGTILVTEEELSTCI	1439310	1409541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1409612_1420284_1420448_1423969_1424107_1430190_1430333_1431975_1432093_1434312_1434954_1439204
878072	contig_5039_pilon	-	1158	11	Intergenic	novelGene_64947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCGCCCCTTTGCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641967	1607250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1607313_1617835_1617910_1619955_1620033_1622005_1622080_1625156_1625201_1626526_1626596_1633303_1633440_1634409_1634522_1636688_1636788_1637896_1638024_1641683
878073	contig_9436_pilon	-	1889	6	Intergenic	novelGene_60879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_5	14.6969384566991	108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	98	838	233000	212409	FALSE	35	GGGAGCCAAAATTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGWTGGWLGWRVVTFHCLPPELGGGSGEVGGGMAGVPEERGPGPAAGEQLQQQHVSCQVFPERLEEGKPQPGFFSSFFTNNQKCQLMLLKTLETNPYVKLLLDAMKHSGCAVNRERHFSCEDCNGSVSGGFDASSSQIVLCQNNIRNQAHMNRVVTHELIHAFDHCRAHVDWFTNVRHLACSEIRAANLSGDCSLVNEVFRLHFGLKQHHQTCVRDRAILSILAVRNINKEVAQKAVDKVFESCFNDLEPFGRIPHNKTDAKYAHRDFQNRDRYFSNI	233097	211357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_212613_220839_220924_222982_223121_226758_226841_227498_227545_232813
878074	contig_15114_pilon	+	2263	4	Intergenic	novelGene_121185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_3	91.0726205959959	53	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	22	783	688565	717152	FALSE	70	ATATAAAAAGCTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVMDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDTSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEHTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDEWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVSSVLHCVVDVLYDRHRK	688543	718632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_688689_711862_711950_713497_713766_716869
878075	contig_6946_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_59765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATATTAATTTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381738	382779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_381700_382800
878076	contig_3745_pilon	+	3636	4	Intergenic	novelGene_85065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	141.98826242569	768	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	109	594	363058	369359	TRUE	20	TAAACTTATTTTCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGQQRARGPGHSHSLCCTLRRWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGYRMERPDNCSEEMYSLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKSRDYLDLAASTPSDALLYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRTLPSTWIENKLYGRISHAFTRF	362949	372818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_363264_364271_364372_369179_369539_369955
878077	contig_6164_pilon	+	3507	2	Intergenic	novelGene_121262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	62	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	28	372	246404	253898	FALSE	25	ACTTTGCTAATATGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLHTLRNLMYLVSPNSEHLGRSGPFEVRADLEESMEFVDPGVAGESDESGDEHISDEETDLGMDWENLPSPRFCDIPSQPVEVSQSQSTQASPPIASSSAGGMISSAAASVTSWFKAYTGHR	246376	257033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_246442_253591
878078	contig_5302_pilon	-	1787	1	Intergenic	novelGene_81468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	22	393	289380	289009	NA	50	AATCGACAATTTTAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDENDREMYCPPWNPVVTHPGWPYLRLLWCSLREGPLPASPPVSGPAGKLLHCGPGLAGPWMHSFTLANRWQHTPYLSPTRYLHHQLNHSARALHSDKFSKELSPVHEIGISLFYLQLRKLKLVRKRFPA	289401	287614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_287600_289400
878080	contig_8866_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_77796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTTTCCAATCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401606	403251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_401600_403300
878081	contig_6674_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_148032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATACTGTGGTGGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351465	349644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_349600_351500
878082	contig_1339_pilon	+	270	3	Intergenic	novelGene_163143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9378	junction_1	908.5	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAGTGGGGCCCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431391	433794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431421_431611_431736_433677
878083	contig_7070_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_104053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTTGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201597	203584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_201600_203600
878085	contig_6048_pilon	-	538	1	Intergenic	novelGene_73124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928063	927525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_927500_928100
878086	contig_14441_pilon	-	862	4	Intergenic	novelGene_100398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.37704215656966	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	119	448	67804	67328	TRUE	35	GATTAAAGTTTAACTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLFPELGQDEFVFQEQPTCSTVDGLLAQKYMPESLSSVDWIFMLQWTQSIVALCFVVMTSCLGVWVTSVSMEPGEEGDRSWRTAQEEPVITAPGGSPDPGVQQGQQD	69990	65817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_66073_67168_67516_67662_67831_69898
878087	contig_7095_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_166465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACCAGCTGTTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486762	487670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_+_486800_487700
878088	contig_13664_pilon	-	2128	3	Intergenic	novelGene_144195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAATTAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36657	16513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13664_pilon_-_16896_34856_35196_35250
878089	contig_11094_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_177017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGTGTCTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288662	287145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_-_287100_288700
878090	contig_7045_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_77436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCCAGTTATGGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250896	250250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_250200_250900
878092	scaffold_13505_pilon	-	342	5	Intergenic	novelGene_111489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	6596.83774622356	65	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATCTTGGTCTGGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548347	540194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_547363_547465_547734_547806_548295
878093	contig_7898_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_47566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTGGAGAGTCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381894	380798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_380800_381900
878094	contig_5083_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_151652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCCCAATGTATAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309059	307571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_307600_309100
878095	contig_5338_pilon	-	1324	9	Intergenic	novelGene_114588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	16.7032930884901	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	651	1064	388624	387805	FALSE	20	TTTTGGAAAGGGCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LETERRYQEQLGLVATYFLGILRAKGTLRLPERQALFGPWELIYGASQDLLPYLEGGHWGQGLEGFCPHLELYTQYAANAESSWTTLQEQLKKNKRFRRFVQLQEGRPEFGGLQLQDLLPLPLQRLQQYENLVVALAENTGPNSPDHQQLTRAARLISETAQRVHTIGQRQKNDQHLRRVQALLSGRQAKGLTTGRWFLRQGWLLVVPPRGEPRPRMFFLFTDVLLMAKPRPPLHLLQSGSFACRALYPMAQCQLHRVFGHSGGPCGGLLSLSFPREKLLLMSTDQEELSRWYHSLTLAISAHASAWTVFSLQQPEELEDSTNSRTQNASRIGQSQEYKGILFSAKTLTRLVV	391409	387544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_387965_388106_388196_388459_388690_389280_389410_389658_389730_390314_390434_390691_390813_391079_391175_391359
878096	contig_6823_pilon	-	1770	2	Intergenic	novelGene_131250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATATTTATAGACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460716	452940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_454578_460583
878097	contig_1093_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_139983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCGTGTCCTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412427	414397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_412400_414400
878098	contig_18113_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_137544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209571	207425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_207400_209600
878099	contig_987_pilon	-	3150	1	Intergenic	novelGene_72276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	863	1339	908637	908161	NA	30	AAATAGGTGCTTAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLYLAIFSFKDKLSAVSLCKSMYVSISNELFSLRQVMLKTAFLALVLCYVDPILTGLLFVTSVCVETYLVTVSFCPFTSMLASGFFGFFPGLSLKICISGSCMNWPNETKSRHLLHFIHGYIKRQAPHLIQATLGRPSRISRVESHVETKREQPCE	909499	906349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_906300_909500
878100	contig_1694_pilon	+	2720	3	Intergenic	novelGene_144954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	43.5	209	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	3	1103	808010	822349	FALSE	30	CTAAAATACTCCATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKYLTPQLPPVPIIPEHKKYRRDSASVVDQFFTDSEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVTIFSHQSETTAPPPAPTQALPEFTSIFSSHQTAAPEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPSQQGHLYQLLNTPDLDMPSSTNQTAVIDSLNVSMSAAMAGLNTLTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYFPPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPATLPVNSQNIQPVRYNRRSNPDLEKRRIHFCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKCTWDGCDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCAVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN	808007	823966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_808872_809970_810031_822170
878101	contig_7444_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_174925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	16.0251538387485	65	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	49	954	67899	78563	FALSE	30	AATGAATTTGTTGACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDHQTWFNLFSLYTGMVSILSNIIVLGIFIKYKELRTPTNAIIINLAVTDIGVSSIGYPMSAASDLHGSWKFGYAGCQIYAGLNIFFGMASIGLLTVVAVDRYLIICHPDIGRRMTSNTYVGMILGAWINGLLWALLPITGWASYAPDPTGATCTINWRKNDVSFVSYTMTVIAMNFVVPLAVMFYCYYHVTQSIKHHSASNCAEYLNRDWSDQLDVTKMSVIMILMFLVAWSPYSIVCLWASFGDPKKIPPSVAIIAPLFAKSSTFYNPCIYAVANKKFRRAMFAMLKCQTHQAVPVMSILPMNVSQNPLASGSV	61909	79355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_61956_67896_68088_69813_69914_71337_71492_72426_72596_76476_76656_78448
878102	contig_10940_pilon	+	3937	1	Intergenic	novelGene_49281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATACTAGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893818	897755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_893800_897800
878103	contig_10404_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_138630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCATAGACAGAGTAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36379	34713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_34700_36400
878104	contig_10861_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_39309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGGGACATCGTTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1462007	1462931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1462000_1462900
878106	contig_5454_pilon	-	2970	1	Intergenic	novelGene_145502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAACAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201377	198407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_198400_201400
878107	contig_12790_pilon	-	1412	6	Intergenic	novelGene_35291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	299.014648470606	210	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	163	1308	483225	460180	FALSE	20	TAGGGATCACTCCAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDYDEVTAFLGEWGPFQRLIFFLLSASIIPNGFNGLSAVFLIGTPEHYCRVPDSANLSSAWRNHSIPLRLQDGQEVPHNCRRYRLATLANFSALGLVPGRDVNLTQLEQERCLDGWDFSQDVYLSTIVTEWNLVCEDDWKAPLTISLFFVGVLVGSFISGQLSDRFGRKNVLFATMGVQTGFSFLQVFSTNFEMFTVLFFIVGMGQISNYVAAFVLGTEILGKSARIIFSTLGVCIFYSFGYMLLPLFAYFIRDWRMLLLALTVPGVLCAVLWFIPESPRWLISQGRFKEAEAIIRKAARFNGIAVPSTIFDPTETQDLSSQKQQSHSILDLLRTQNIRMVTVMSIILWCVSETCLRLPDRASCSQTCLRPKLKACVIRK	483387	460075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_460378_462132_462260_463455_463625_464782_464938_475227_475332_482832
878108	contig_3601_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_132837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102377	101388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_101400_102400
878109	contig_15918_pilon	+	3096	1	Intergenic	novelGene_132709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAACCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29688	32784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_29700_32800
878110	contig_8122_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_40197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCAGATAGTGTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116981	115987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_116000_117000
878111	contig_2703_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_101802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCGGAGTAACCAGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620764	618510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_618500_620800
878112	contig_9195_pilon	+	2361	18	Intergenic	novelGene_155687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	27.5797679217197	42	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	8	2122	341734	372830	FALSE	45	ATTAAAGATTCTTGAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGTCLRRRGGPYKTEPATDLSRWHLSSEEGRQRWKYSQEGEDPGRTQTGLEAHLLGLDTKNFFKDLPKAHTAQEGAVNGMTFYAGLQAEDGHWAGDYGGPLFLLPGLLITCHVAHIPLQPGYREEMVRYLRSVQLPDGGWGLHIEDKSTVLGTALNYVSLRILGVGPDDPDLVRARNILHKKGGATLIPSWGKFWLAVLNVYSWEGLNNLFPEMWLLPEWFPAHPSTIWCHCRQVYLPMSYCYATRLSCATDDPLVQSLRQELYPEDFASIDWPAQRNRVAPEDMYTPHSWLLHVVFALLNLYERRHSTILRQRAVQKLYEHIAADDRFTKSISIGPISKTINMLVRWRVDGAASPAFQEHVDRIPDYLWLGLDGMKMQGTNGSQVWDTSFAIQAFLEAGAHHRPEFESCLQQAHGFLRLSQIVDNPPDYQKYYRQMNKGGFPFSTRDCGWIVADCTAEGLKSVLLLQEQCPFITEHVPRERLYDAVAVLLNMRNPDGGFSTYETKRGGRLLELLNPSEVFGDIMIDYTYVECTSAVMQALKHFHTQFLPGLPECCPHSPGTRLPRGVCSSCPSTAPLPVPACVDLPWTCGSNRVHRWPVSSTQQVPGERTLLGHLETGLSEGIVLEPLKPVSLRLHLLLTPPPQLGQQDREGRASPRHQRLPTHDHVTIQNIFSRKEIKFAFVLRLQMGKCYQSQRHDQLP	341726	373069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_341748_343503_343673_344507_344647_347275_347385_348615_348738_349084_349182_350857_350997_351367_351477_352200_352320_353265_353364_353613_353642_355381_355439_356416_356489_356840_356892_357274_357425_357995_358093_358898_358978_372364
878113	contig_9195_pilon	+	717	4	Intergenic	novelGene_155688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	20.9920619917784	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	237	641	368438	370984	FALSE	20	GGAGGGCAGGGAAGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRYQDGAACMEITRACDFLLCRQMEDGGWGEDFESCEQRRYVQSARSQIHCTCWALMGLMAVRHPDVQALERGVRCLLGKQLPNGDWPQENLSGVFNKSCAISYTSYRNVFPIWTLGRFSRLYPKNALASPH	368201	371060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_368461_369089_369261_370283_370363_370852
878114	contig_8044_pilon	+	1801	2	Intergenic	novelGene_132379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	0	126	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAGTGTTTCTCGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381068	387494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_382051_386675
878115	contig_9366_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_166250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGGTGAATTATTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925503	923404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_923400_925500
878116	contig_14405_pilon	+	2851	17	Intergenic	novelGene_85611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	39.9309951666622	7	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	120	1673	14713	98328	TRUE	40	TAAATACACACCCACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTEKDLAEDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVNKRIGNLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKHMYRKYHQRPTFRQMQLENVSVALEFLDRESIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLVWTLILHYSISMPVWEDEGDDDAKKQTPKQRLLGWIQNKIPYLPITNFNQNWQDGKALGALVDSCAPGLCPDWESWDPQKPVDNAREAMQQADDWLGVPQVITPEEIIHPDVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLKPKLNPKKARAYGRGIEPTGNMVKQPAKFTVDTISAGQGDVMVFIEDPEGNKEEAQVTPDSDKNKTYSVQYLPKVTGLHKVTVLFAGQHISKSPFEVNVDKAQGDPSKVTAKGPGLEASGNIANKPTYFDIYTAGAGVGDIGIEVEDPQGKNTVELLVEDKGNQVYRCVYKPVQPGPHVVRVSFAGDTIPKSPFVVQVGEACNPHACRASGRGLQPKGVRIRETADFKVDTKAAGSGELSVTVKGPKGLEELVKQKRLSGWGLHLRVLP	14593	106688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_15005_78497_78747_80204_80303_82234_82383_89984_90104_90912_90991_92483_92647_93575_93774_96359_96498_98257_98614_101351_101463_103018_103133_104031_104176_104392_104517_104845_105007_106172_106264_106540
878117	contig_6595_pilon	-	2618	1	Intergenic	novelGene_122563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACATTAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742047	739429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_739400_742000
878118	contig_1719_pilon	-	2723	2	Intergenic	novelGene_87290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1694	junction_1	0	6	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCAGTGCTGTAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378244	375353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_375868_376035
878119	contig_8541_pilon	-	832	4	Intergenic	novelGene_105585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_2	373.026361892382	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	486	806	567317	548514	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKAREEEERAKREELERILEENNRKIAEAQAKLAEEQLRIVEEQRKIHEERMKLEQERQRQQKEEQKIILGKGKSRPKLSFSLKTQD	577298	548487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_564935_567245_567472_576967
878120	contig_2504_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_166854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAAAATGTGTTTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399678	397997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_398000_399700
878121	contig_14034_pilon	+	2468	6	Intergenic	novelGene_72659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_5	169.548341189172	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	445	912	337852	402626	FALSE	55	ATATGTTTCAAAAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGGDFGNPLRKFKLVFLGEQSVGKTSLITRFMYDSFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSAAAVVVYDITNVNSFQQTTKWIDDVRTERGSDVIIMLVGNKTDLADKSSLKRPKQGGMTRLPSVNTISL	337407	404182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_337922_377287_377347_387756_387811_389248_389355_391385_391498_402559
878122	contig_16744_pilon	-	872	3	Intergenic	novelGene_178197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	13279	11998	TRUE	60	GGTATAAAAAGTGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFAAFLSRVDPLVSPGEDRGQLTFPRKRVKSSRRHLRNHKLTASHPSKHTYLPLAKSSRTNPITCLLKLLCRPIRNLYPGSGGAQQWSDTEEPWQLTTSPTQAREKTT	13280	8454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16744_pilon_-_8927_11925_12101_13055
878123	contig_7182_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_117112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCTAGACCACAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161342	162228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_161300_162200
878124	contig_5485_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_37706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	554	junction_2	348.264586517524	5	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	165	1307	87935	85491	FALSE	40	TAAGTTGAACGCAACCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFSGFNADYEASSSRCSSASPAGDSLSYYHSPADSFSSMGSPVNAQDFCTDLAASSANFIPTVTAISTSPDLQWLVQPTLVSSVAPSQTRAPHPYGVPAPSAGAYSRAGVVKTTPGGRVQSIGRRGKVEQLSPEEEEKRRIRRERNKMAAAKCRNRRRELTDTLQAETDQLEDEKSALQTEIANLLKEKEKLEFILAAHRPACKIPDDLGFPEDMSVASLDLSGGLPEAATPESEEAFTLPLLNDPEPKPSVEPVKSIRTMELKAEPFDDFLFPASSRPSGSETARSVPDMDLSGSFYAADWEPLHSSSLGMGPLATELEPLCTPVVTCTPSCTTYTSSFVFTYPEADSFPSCAAAHRKGSSSNEPSSDSLSSPTLLAL	88099	84694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_86133_86257_86366_86774_87027_87794
878125	contig_9144_pilon	+	1290	5	Intergenic	novelGene_151146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAGAAAATACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782666	836795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_783216_785446_785646_788266_788358_789686_789894_836551
878126	contig_16113_pilon	+	2650	2	Intergenic	novelGene_140549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAACGAAAACAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84567	87562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_85522_85866
878127	contig_11448_pilon	+	2986	1	Intergenic	novelGene_66342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGCACAGTCCTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151436	154422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_151400_154400
878128	contig_5023_pilon	-	2542	1	Intergenic	novelGene_7161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCACCACTATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373579	371037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_371000_373600
878129	contig_120_pilon	+	1417	1	Intergenic	novelGene_165251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCACCCAACATCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92593	94010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_+_92600_94000
878130	contig_3132_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_127448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTAAAATAAAGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345616	343723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_343700_345600
878131	contig_19744_pilon	-	1926	6	Intergenic	novelGene_120370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	802	1119	139885	137862	TRUE	25	ATTCCACATTGCAGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKREAPGFGVTIHVRYILLYCLIIQSEPYTIIIVDLINKSDSSINFNYAYLFTLKGRVATDTESCTVLGHKFSNLIWLRFSLWFDQLSSRWYHAFWWIFYFYF	152585	129854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_130536_133816_133933_137851_137950_138749_138867_139772_139916_151814
878132	contig_13428_pilon	+	2449	1	Intergenic	novelGene_143447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80048	82497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_80000_82500
878133	contig_14954_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_165180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGGCAGCTCAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110393	108335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_108300_110400
878134	contig_2799_pilon	+	1205	2	Intergenic	novelGene_85563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAATAAAACTTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727102	730176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_728205_730073
878135	contig_19957_pilon	-	4155	1	Intergenic	novelGene_57705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	422	724	167528	167226	NA	30	CTTTCCCCACTAATAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHFHPDASCFKVLTTHQIEPRLFAILEQAPQHSPCTPACLECLQFSEYTLCILCPCLPCPLWVERFPLPNVPVEILPIFQGLAQVPPPPWCFPGCPIES	167949	163794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_163800_167900
878136	contig_9366_pilon	-	379	1	Intergenic	novelGene_166273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGGAATTGACAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043666	1043287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1043300_1043700
878137	contig_14357_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_121705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736695	734932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_734900_736700
878138	contig_8122_pilon	-	640	2	Intergenic	novelGene_40196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_1	0	776	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGTTCTGTGTATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116956	115875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_116390_116830
878139	contig_8558_pilon	+	1060	6	Intergenic	novelGene_123155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	460.846004647973	156	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	101	784	390433	527687	FALSE	75	AAATTAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKVALTKRADPAELRTIFLKYASIEKNGEFFMSPNDFVTGYLNIFGESQPNPKTVELLSGVVDQTKDGLISFQEFVAFESVLCTPDALFMVAFQLFDKAGKGEVTFEDVKRVFGQTTIHQQIPFNWDSEFVQLHFGKERKRHLTYAEFTQFLLEIQLEHAKQAFVQRDNARTGRVTAIDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAVSCKQFALIKQFILSGVSSVNK	390332	527963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_+_390448_426563_426618_435133_435277_481552_481669_507338_507479_527471
878140	contig_8273_pilon	-	3783	11	Intergenic	novelGene_113072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	3274	3783	23130	16521	FALSE	20	GGGAGAGGCGCTGCCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGYSFFLVTHTSPLDRQYPLGASETKQKAENSGRDQGLELPLAGLGQGWHCEWVRQPSPGDFLRLARHCSQRMKSAAPSPLGSGSSHSSCDASTWRQVSEKRPHGWLGTGIRVCIPGSRATASCSQPLHKRGHSPPGPPNFSRGPAAAHPAWGWGMPRPTWGPSSTSF	55319	16520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_16757_21185_21320_22990_23176_24525_25324_40891_41043_41969_42083_45168_45260_46270_46406_47027_47337_48834_49007_53860
878141	contig_12671_pilon	-	1467	7	Intergenic	novelGene_19201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	29.2598511426304	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1416	50	1465	157372	116504	FALSE	50	AGAAAACAAACCAGCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGYSLDKSFRYLISCFRVRLKTYIHVQPVLDYLTFLPAEVKEQIQKTAATTGDMQAVELLLNYLEKGDWPLGWTREFVAALQRAGNSLAARYMNPDLTDLPSPSSESAHDECLQLLNLLQPTLVDKLLVKDVLDQCVANNLLTTEDRNRISAAENHGNESGVRELLKRIVQKDNWFSTFLTVLNQTGNNILFQELTGASCFESNAEIENLSQRDGPEPEEPLLSATDQPSSEKESWDMENNSSESSFADSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENEMKRASPEPELHLRSYQMEAAKPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKKKKDSEPGKVIVLVNKVPLVEQLFCKEFKPFLKKWYRTMGLSGDTQLKISFPEVVKSYDVIISTAQILENALLNSEKGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNKEEVYNNIMRRYLKQKLKNNKLR	157421	116501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_-_116614_117672_117884_122538_122760_128635_128741_143975_144123_147798_147968_156919
878142	contig_11436_pilon	-	2684	1	Intergenic	novelGene_173116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	987	1301	124157	123843	NA	60	CTGAGGAAAAAGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLIREVTGYNSGSEMTRDTVLRSGQPLFSHAHRQASLLALSPSAPQPASALFRKALHISLDLPVSAWGHPILPVSLGLKAIILCCFLGSAAAGSLPHLCHLWW	125143	122459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11436_pilon_-_122500_125100
878143	contig_7593_pilon	-	2078	5	Intergenic	novelGene_127309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.6086715511276	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	73	783	214611	208513	TRUE	35	TACTTGAGTATATATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGWEAEEEVESEDEYLALPARLTQVSSLVSYLGSVPTLMPLPNGTAKGQSSLEVSDSDGLASLPSDSSPSQLPSVTVLPESRGSGSQNHCFLHSLIRARDSAGEGSLASSQALGVPSGPLRARLSCQTMLDQRAFADPGADGQPPRREGEQRKSLVQCVKTFCCQLEELIHWLYNVADVTDHLIPPKSNLTGLKSSLQLYRQIKKDIDEHQLLTESVLQTGGESSTVPVGQYPR	214683	202303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_203424_204496_204671_208511_208615_212510_212634_214125
878144	contig_15273_pilon	+	2207	4	Intergenic	novelGene_140428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_1	88.6002257333467	1019	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	70	528	95964	146076	FALSE	20	GCTTTTGATGACTGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLPRRIIKETQRLLAEPVPGIKAEPDESNARYFHVVIAGPQDSPFEGGTFKLELFLPEEYPMAAPKVRFMTKIYHPNVDKLGRICLDILKDKWSPALQIRTVLLSIQALLSAPNPDDPLANDVAEQWKTNEAQAIETARAWTRLYAMNNI	95894	147755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_95994_144775_145023_145197_145339_146035
878145	contig_7815_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_134375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	717	2154	1286	3439	393197	391044	NA	45	TCTACAAAACACAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDQWTFSPQLDSLDESSKFLATADPNVQECSKYVGSSERAEDENKSNPFHNDQKSHPDQWTFSPPLDSLDESSKFLATTDPNVQECSEYVGSSERAEDENKSNPFHNKQQSSPDQWTFSPQLDSLDESSKFLAKADPNVQECSEYVGSSEPAEDENKSYPFHNNQQSSPDQWTFSPRLDSLDESTKFLDKADPNTQECYEYVGSSEQEEDENKSNPFHNDQQSSPDQWTFSPQLDSLDESRKFLATAEPNVQECSEYVGSSERAEDENKSNPFHNDQQSSPDQWTFSPQLDSLDESNKFLAIAEPNVQEYSECIGSSEPAENKSDRFYDDQQNSPDPWTFSPQLDSLNESSKFLAKADPHVQECSEYVGSSEPAEDENKSDLFHDDRQSSPDHWNFSRVKETELQITAVDRETKSSPEAVKTGDTAWQMSPQTQPQTADNSKLEMLGFSAESDEWWTASPQEGRPIERTFEGELSNSSDTLEMNSSVYQNVDPCKVYIHGDAESMETHCTNSFKDKHQSAFLDSNEKNSHEQLWNIQPKEPDSDADELNQLEILDQIKEKDSREQILMSSAGDELTFETHTQEQCPDTMLPYGDQPDPTFTGENECVASHVSTFECQETNRWEQEKSYTSEITNSSIASENVPVVSSPTQLLKKAGSEWNDSTPSEGLQGTFVPDILHGSFQEGGQLASASPDLWMDAKQPFSLKADGENPDILTHCDHDSNSQASNSPDICHDYEAKQETEHHSSAQMGPEVESGELNVTEPKMDEEPSQDPGQEFVPYNSRLYSENAIPLPTISKQAKTSGMSQPASHKVSLEPSEINDENDIDLQASEIGTSSDIVPVLELFDRTIPVNENVGTSIFVTHPEPGLDGNSHLISEDFAPENKRDVRALLDYEQPFAAEGPASVTDTLLVSDMCLDVSEAAFDHSFSDASGLNTSTGTIDDMSKLTLSEGNPETPVDGDAGKQDICSSEASWGDFEYDVMGQNIDEDLMKEPEHFLYGADHPMEEDVLKQPLAPYTPPFDLSYLTEPTQGSEKTEEAESPKDESLGSEAAELLFSALPDRRGKENHTETTSIQPGLQLVALHIDEDSESLSLPVREGLDVELSPSNDVDWDVETDYSYSPAGGDIGPANGKKCPSLPTPRNYLH	394482	390878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_390900_394500
878146	contig_401_pilon	+	1534	3	Intergenic	novelGene_42865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	421	807	1722130	1722516	TRUE	15	CTGCTGCCCCAGGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRVRSASPRARRSRSRSLPSCSSSRSSCTMVSSFLLRQFWAATLFLPRRRMSLTSASWLSVSGYRANNSLKSSTGKLTILSVGKGIFMARALRSSRLPASARALGLARTGPEEGSKAKDVSVGGKE	1721709	1727453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1722987_1724180_1724348_1727363
878147	contig_5457_pilon	+	2779	7	Intergenic	novelGene_139002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGAAGTGCAGCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118770	126066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_119451_121719_122532_122858_122954_123083_123233_123302_123420_123536_123609_125212
878148	contig_10126_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_105767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1320	1637	180574	180257	NA	20	TCTATGTTTATACCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELSNGAWSKFSQLWHEGLPEKVALGHGKPHVATGTADQEGVTSDRGSYRSTHTPPASNTSGVQAQLLSGSRPTPGPAQKPPVVWPLLTPSGSFTPPLIHPLNI	181893	180097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_180100_181900
878149	contig_10135_pilon	+	2757	1	Intergenic	novelGene_106684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	919	1401	316873	317355	NA	20	ACACTGCTCACTACCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWILTPGDPTCLRLYLHSTAFSMACNVSEVERQACERHTVACRGPHRHTEASHHPRNFLHAPVGEWWVDDRTGGSGLRVWVAWHAGRGKEQETQKRGQTRAECGEVTEGVQSVQESLGQEGALGVRLASQLLVLQRLQGSGALYLAGVGMTVGTSEGQG	315954	318711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_316000_318700
878150	contig_6287_pilon	+	2705	15	Intergenic	novelGene_160432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_14	11.8252583351856	27	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	105	1658	160042	185509	FALSE	80	TAAAGTAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSADFTSSSEQNSSHETKTPNLRTAEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKGYLTEESGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAKENSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYQPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEIVDLKVWTSQLKRTIQTAESLGVTYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKQYPEEFALRDQEKYLYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKSADELPYLRCPLHTIFKLTPVAYGCKVETVKLHVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPIRMRRNSFTPLSSSDTVRRPRNYSVGSQPLKPLSPLRALDMQEGADQPKTQVSIPVV	158669	186556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_+_158756_160023_160130_173162_173289_173815_173913_174329_174397_174533_174609_174966_175024_175943_176069_180392_180601_181020_181168_181962_182068_183398_183529_184278_184342_184616_184682_185308
878151	contig_10500_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_41198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAGAAAGAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392651	1394485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1392700_1394500
878152	contig_3817_pilon	-	2014	16	Intergenic	novelGene_78353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	59.762269776916	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	289	1638	593076	574560	TRUE	30	TGGGATGGAATCGTAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTTSQTSRAWFIDKARQAREERLVQKERERAAVEIQAHVRSFLCRSRLQREIRREIDEFFNADDSGSSKRSAVCIFQIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRCILSSMDAENEPKVWYVSLALSKAVTLLWIKQIKAILWHCCEFLQQLKPEILQDSKLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRGKGENLRPAMNHICANIMGHLNQRGFYSVLQILLTRGLARPRPSLSKGTLTAAFSLALRPVTAAQFSDNLLRPFLIHIMSVPALVTHLSTLTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDEYRCRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPKVLEEETDGFVSLLTQMLCYCQKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSVDYGLNESMPLVTKQLQFLWGVPLIRIFFNDILSKKLLENQETAHVQPASPPERTSSEKSPKACISEVCICSEYSQASRG	599766	568876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_568980_570576_570749_574458_574627_576208_576374_578232_578411_579448_579570_579882_579989_583385_583469_584578_584665_585951_586049_590193_590299_590668_590729_592633_592755_592915_593099_595101_595203_599601
878153	contig_2394_pilon	+	1235	11	Intergenic	novelGene_177759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	20	junction_1	13.2608446186508	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	56	958	4646	88891	FALSE	65	AAATAAAAAATAACTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPANQQPRDLHWSEKTSVKDMADFPVPTQDVTLDDKQASKNTTDEPSPKDMLEDPATPKDSNSLKARPRSRSYSSTSIEEAMKRGEDPPTPPPRPQKTHSRASSLDLNKVFQPSAPAAKSGSLPQPPALPPRPCPSQVSEHSVNSEPSTQPKPPAQPYGDFRLQEQSEQTSEAEVHPQSSRGPSQAAESSPAKKDIPYSQPPSKPIRRKFRPENQAPENQELPPTVGGPASAATMKPHPTVQKQSSKQKKAIQTAIRKNKEANAVLARLNSELQQQLKEVHQERIALENQLEQLRPVTVL	4590	89168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2394_pilon_+_4688_11008_11079_12751_12806_17075_17122_21058_21196_56445_56508_58883_58971_80013_80098_80577_80724_82082_82189_88822
878154	contig_8587_pilon	-	1271	7	Intergenic	novelGene_159135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13.2507861402006	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	88	861	453328	440323	FALSE	30	TCCAAAATCTGATCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGDTRRGAGTRVCAGGSARGGAGVGVPGAMKLTRKMVLSRAKASELDSVRKLNCWGSRLTDISICREMPSLEVITLSVNGVSTLEPVRQCQHLSELYLRKNRIPSLAELFYLKDLPRLRVLWLAENPCCGSDPHLYRMTVLRNLPGLQKLDNQTVTEEELSRALREGDEITTAPAREDTESGRPEAPFTLSSMDPAAETEQDALGSSADEASSVQEQLGMRLPARNQPSSFPPREAAPSLKNRNNVLTAILLLLRELDAEGLEVVHQTVGSRLQALHRRELQEDTE	453415	439912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_440455_441918_442013_442693_442869_444304_444535_448813_448861_450296_450316_453251
878155	contig_1472_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_86119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTGGTTTAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186155	184301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_184300_186200
878156	contig_13863_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_42104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCATCACGGTCACGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490685	490185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_490200_490700
878157	contig_20199_pilon	-	479	2	Intergenic	novelGene_82572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	44146	40809	FALSE	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRAFSPFCKNNPGVTAAAEVVAVPADPSVEGAAHRTEGISSNVKTVCSCPGPGRLGPARSRRPQVKASDSHSAGLCPPANPR	44146	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41055_44074
878158	contig_7131_pilon	-	1455	12	Intergenic	novelGene_175330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_11	7.83191183397813	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1431	23	1453	125307	7164	FALSE	35	GGTAAGCCAAATATGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQTCLSFVPGEPQVVVGTDKSFTYDFVFDPSTEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAAQENEPTVGVIPRVIQLLFREVDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKASQINIREDPKEGIKIVGLTEKMVLVAQDTVSCLEQGNNCRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISIEQRKKSDKNSSFRSKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGGFVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPVVNIDPQTAELNHLKQQVQQLQVLLLQAHGGTLPGSINVEPSENLQSLMEKNQTLVEENEKLSRGLSEAAGQTAQMLERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKIVETLEDQELKENVEIIRNLQQVITQL	125329	7161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_-_7267_7380_7440_9026_9160_15431_15494_19687_19864_20466_20584_97651_97747_97985_98153_103147_103241_108005_108197_124961_125077_125187
878159	contig_20157_pilon	+	3054	1	Intergenic	novelGene_145869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2568	2942	56705	57079	NA	50	AAACTAAGATGTTTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKLTRAHYVSISRECAIIRLAPYAPAPLRFPSFYLHPHPLPVQPPEKYFRPRVQNAVSTPFPERLLRTRYREERLWPSSEAWDPYHLSVRKLTFFKSIAVKKKKKKKTSSLELNCTGVQRSH	54137	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_+_54100_57200
878160	contig_567_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_33999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTACTCAGCCATAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583880	586236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_583900_586200
878161	contig_9297_pilon	+	2644	1	Intergenic	novelGene_69823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	2	496	473691	474185	NA	30	CATAACTTTTCCAGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGRGAALGNRAAARRAGGGGQRGHEGQPGKRQLSGSGGAPVLEDPRSAELGAGAGRRGGSRALPSGTCPGASRLALWKQLQVKVAPAAGSLARSPAHLPACGAWRPPSLLRCQRCPAGSPSGRCLSRRTTSVSWLFLERGCREPDSWVCDLGEEKLVDLGEWG	473689	476333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_473700_476300
878162	contig_14744_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_66156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACTGTCTTCAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681862	1680272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1680300_1681900
878163	contig_10051_pilon	-	3644	11	Intergenic	novelGene_175594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	10.2371871136558	61	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	15	1394	141331	123413	FALSE	15	CTTAATATTTGTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPLTMCLNGVIDAAVNGGVSRYQEAFFVKEYILSHPEDGEKIARLRELMLEQAQILEFGLAVHEKFVPQDMRPLHKKLVDQFFVMKSSLGIQEFSACIQPSPVHFPNGSPRVCRNSAPASMSPDGTRVIPRRSPLSYPAVNRYSSSSLSSQASAEVSNITGQSESSDEVFNMQPSPSTSSLSSTHSASPNVTSSAPSSARASPLLSDKHKHSRENSCLSPRERPCSAIYPTPVEPSQRMLFNHIGDGALPRSDPNLSTPEKAVNPTPSSWSLDSGKEAKTMSDSGKLLSPPVPPRPTLTASPARHTTPVSPSPAGRSPLKGSVQSFTPSPVEYHSPGLISNSPVLSGSYSSGISSLSRCSTSETSGFENQVNEQPAPVSVPSYSGPEEPVRKESKTPPPYSVYERTLRRPVPLPHSLSIPVTSEPPALPPKPLAARSSHLENGTRRTEPGPRPRPLPRKVSQL	141345	121162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_123845_127030_127093_130317_130432_132232_132306_134886_134997_135172_135255_136251_136373_136698_136821_137156_137277_140469_140554_141271
878164	contig_11815_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_50943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGATGGATGTTTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448601	447206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_447200_448600
878165	contig_6069_pilon	+	1510	11	Intergenic	novelGene_8060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	35.4176509667143	63	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	298	1230	495244	497817	FALSE	20	ACAGCATCTTGTTCTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEGPIFFYTGNEGDVWSFANNSGFILELAAREAALVVFAEHRYYGKSLPFGAQSTQRGRTELLTVEQALADFAVLLQALRASFGVQDVPAIAFGGSYGGMLSAYMRMKYPHLVAGALAASAPIVAVAGLGDSYQFFRDVTADFEGQSPKCVQGVRDAFREIKDLFLQKAYDTVSQEFGTCQPLSGQDLTQLFAFARNAFTVLAMMDYPYPTDFLGPLPANPVKAGCDRLLTENQSIVGLRALVGLLYNASGTEPCYDIYQQYRSCADPTGCGSGTDSEAWDYQACTEINLTFASNNVTDMFPKLALTEELRQQYCLDTWGVWPRRDWLRTSFWGADLRAASNIIFSNGDLDPWAGGGIRSNLSASVIAVTIQGGSPPPRPQGFQPSRPCVSCGGSEARGCPHPQVGEGS	494179	498097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_494303_494384_494549_495233_495370_495479_495562_495654_495819_496003_496065_496419_496539_496612_496770_496972_497038_497508_497581_497730
878166	contig_3161_pilon	-	3571	8	Intergenic	novelGene_84504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	214.687147795511	23	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	38	727	411534	348693	FALSE	30	GGAGTACAGTAAGATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPDITYVYDIAKRMHACTASS	421126	345848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_348804_370060_370175_374317_374413_390456_390565_391487_391597_409839_409942_411483_411547_421101
878167	contig_1107_pilon	-	2025	6	Intergenic	novelGene_126567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	377.682935807272	155	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	33	848	511637	496767	TRUE	60	CCAATACAGACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRKSPAQSRQMGTGGRSGPRPGKGSAEEAAATPIAASASCQYRCIECNEEAKELYRDYNHGVLKITICKSCQKPVDKYIEYDPVIILINAILCKAQAYRHILFNTKINIHGKLCIFCLLCEAYLRWWQLQDSNQNTDPDDLIRYAKEWDFYRMFAIASLEQTAFFIGIFTFLWVERPMTVKKKLNFILLLKALLLSSYGKLLLIPAVIWEHDYTPLCLKLIKVFVLTSNFQAIRVTLNINRKLSLLAILSGLLLESTMVYFFQRMEWDIGSDCAIYKSQDF	511669	492689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_493863_496762_496910_497729_497955_501697_501852_504360_504481_511463
878168	scaffold_12124_pilon	-	881	4	Intergenic	novelGene_22134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	125.865007051205	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGGGAAAAAAGTGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987359	940090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_940259_940531_940882_942735_942805_987065
878169	contig_12277_pilon	+	1290	3	Intergenic	novelGene_139672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63	205	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGATAACACATGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98780	103012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_98889_99560_99856_102125
878170	contig_8310_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_75565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGCAGTTTTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226331	227762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_226300_227800
878171	contig_16322_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_87522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	546	926	57102	57482	NA	35	GAAGAAAGAATGCGCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLIPTSARSRGGYGVTPPTGPRCCPYSHILALAAFNLLAPCFPTPTILGAKREVCEEEEGRPGRPREGPRRRQAAEGRCRSFSGPGGGEAGQAAKPGPRVASSADQRRGRADGVRRAYSPNLEF	56556	57720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_56600_57700
878172	contig_11253_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_126825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATAAGAAAGAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124226	122747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_122700_124200
878173	contig_14445_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_137355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277146	275824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_275800_277100
878174	contig_5959_pilon	+	2409	4	Intergenic	novelGene_150170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	35.1409858838492	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	405	1862	71784	76042	FALSE	25	AATTATTTGTTGAGCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMESKALSTLVTQDPQEQELIVVKVEEGLSWGQKSKQDGSAQSCQEMFRQQFRKFCYKETPGPREALGRLHELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQVWVQQQSPKSGEEAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASLQGPAVPWKDLTSLGASQESTNVQLQPLKTQLKSWEPCLSLKSDCKNNESTTKEEVLGEKSQGLAQEPSFREVSECENHLEWQQGSATGAKLRRFSSQGDSFSQVIFTHESLGKRDQHGNPQSSLILSTNTLSYQKVHIEERPYRCDVCGHSFTQHSSLTQHQRIHTGEKPYKCNQCGKAFSLKSYLIIHQRIHSGERAYKCSECGKAFNQRSALIRHQKIHTGEKPCKCNECGKAFSQSSYLIMHQRIHTGERPYECNECGKAFRQSSDLITHQRIHSGEKPYECSECGKAFSFSSNLIRHQRIHSGEEPYRCNECGKAFKRSSALTQHQRIHSGDEAYTYI	70367	76589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_70682_71693_72198_72439_72582_75140
878175	contig_5236_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_100901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGACCTGTAAGACAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77498	78819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_77500_78800
878176	contig_1428_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_158400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121933	120696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_120700_121900
878177	contig_4754_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_35981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCATTTATTTATTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489217	490979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_489200_491000
878178	contig_18859_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_150528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	688	1035	32131	31784	NA	5	CTTCCTCTTTGGATTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNIVRWRQEVRERGLSESALYYLGAKLWHECWVTMLDSDMVGLMRPRIWVRIFHKEGHDDFPTSTIHEGVGKWDLVWISTQNRPQTEAEKELQTLISFFMRTADVFPWVPKGQC	32818	30097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_30100_32800
878179	contig_16541_pilon	-	3218	5	Intergenic	novelGene_126715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	98.1335187385024	66	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	30	860	99905	48074	FALSE	35	AAACGAAGTTGTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQELRKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTSLQDQLDKTGENKGWSGPKAGFPEPTSNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSPTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV	99934	45715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_48388_67211_67273_79866_79999_85346_85485_99719
878180	contig_7744_pilon	+	1719	4	Intergenic	novelGene_62535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	19.2238278070616	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1360	1659	830107	830740	FALSE	15	CCTGTGCACCCCCAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	828747	830800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_830176_830326_830402_830494_830537_830626
878181	contig_9833_pilon	+	2050	10	Intergenic	novelGene_68489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	6.36735501417529	48	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	75	1268	205190	218991	TRUE	15	CCTCTGTCTTAGCATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYKRSLTGQASSATAEQTGKLTEFMSNLAWDFAVKEGFRVFKKMPATKPLLRSFHTRASPQTLLSITGMRSYSSFPEPSPTCASKGALVISPEGLSQPVRELYHRLKQFIEQHVYPVEQELRSHQASADRWTPSPLIEDLKEKAKAEGLWNLFLPLETDPEKKYGAGLTNVEYAHLCELMGSSLYAPEIFNCSAPDTGNMELLVRYGTKEQKARWLVPLLEGRARSCFAMTEPQVASSDATNIESSIREENGCYVINGRKWWISGILDPRCQLCVFMGKTDPQAPRHQQQSVLLVPMDTPGIKVIRSLTVFGLEDAPGGHGEVLFEDVRVPKEHIVLGPGRGFEIAQGRLGPGRIHHCMRLIGLSERALALMKARVKSRSGLRETPGGAGHAPGRHCSVTSGDRADPAAGAQSCPPHGHGW	202066	221186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_202091_205139_205541_207642_207784_208932_209071_209190_209282_210404_210564_211205_211379_218850_218996_219867_219946_220486
878182	contig_15207_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_176371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321566	322943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_321600_322900
878183	contig_4388_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_161977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	118	429	906075	906386	NA	15	TCCCCTGAAGTTTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNKELPPPSTVLPLRNSRAWEGCISIIAAAACPHWKLRMKTRPGPCGRSARGWSRSGLASSPAKSGLPQGSHTHPPRVRTQLPMLDPFQSYDPEGFHVPLTQISQGKGNKSSHNRVKDVKYQWETGNSRGRGTVSLLGGLG	905957	907081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_906000_907100
878184	contig_12057_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_131619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTACCATCAAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17379	19664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_17400_19700
878185	contig_10082_pilon	+	3195	6	Intergenic	novelGene_63854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2705	3019	178526	189020	TRUE	25	GGCTCCGCCAACTCGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKKVFLFWWRGQGWNHTTIKPQISAVLSCCLGGERFEFLPVQLGSTAVVLGVGVTGGAPVLMEKGRCISISSNLHASQLKPRPVRIQLCRSDKTQVNTKGSM	171627	198554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_174318_178511_178598_178963_179096_182032_182106_188982_189099_198456
878186	contig_9548_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_141060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAGGAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141238	139169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_139200_141200
878187	contig_5988_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_16062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174750	1173459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1173500_1174800
878188	contig_13224_pilon	+	1581	1	Intergenic	novelGene_104113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285870	287451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_285900_287500
878189	contig_1450_pilon	+	1031	9	Intergenic	novelGene_27337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_8	162.353587887672	78	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	927	105	1031	209407	216276	FALSE	15	AACTGCGGACCCCGCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRSPVSAQLALDGVGTMVNCTIKSEEKKETCHEPPQGSAAAAEPQPGDPAQAPQDGADPQAPAQDCSSPERSGSPEPKRPGAAEAASGSQEKLDFNRNLKEVVPAIEKLLSSDWKERFLGRSSVETKDVKGTQESLAEKELQLLVMIHQLSTLRDQLLTAHSEQKNMAAMLFEKQQQQMELARQQQEQIAKQQQQLIQQQHKINLLQQQIQQVNMPYVMIPAFPPSHQPLPVTPDSQLALPIQPIPCKPVEYPLQLLHSPPAPVLKRPGAMAAHHPLQEPSQPLNLTAKPKAPEPPSTSSSPSLKMS	198581	216276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_198685_209405_209605_211032_211145_211234_211322_213354_213528_213975_214045_214459_214575_215848_215935_216189
878190	contig_3382_pilon	-	2110	2	Intergenic	novelGene_124118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	1256	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	235	525	735876	731519	FALSE	50	TAACAGGGTAAGAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVKTRRTSRSQESLRDPDCAFGSATSLPAFAQAPGRRRRLTRTQAVRAPALCPALALLLGKISWSRSAASALWTTTPSMLRPARRYGVRLLNRSPVRSCAEPNMSFTSKPPPISACYAVSGNTWPCIRNFTARASAQWRSLLAWWVSSCPVSLEGRAASHENGDFLEHFLHTII	736110	729933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_731766_735832
878191	contig_3147_pilon	-	1620	9	Intergenic	novelGene_142285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	95.1327197918781	195	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	49	804	225055	218819	TRUE	10	CCAAGTCCTCCTCTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSINSDIEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEAGGSPLTQGKDAYELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIVKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPENTTVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVSRQLRNIRSKSVIEQVSWDN	225615	213867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_214655_218789_218852_219342_219429_220953_221117_221818_221906_222748_222869_224022_224183_224948_225067_225578
878192	contig_7730_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_156291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAGGAGGGAAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396830	394397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_394400_396800
878193	contig_9415_pilon	+	2321	8	Intergenic	novelGene_109756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_7	794.493908994003	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	252	686	1505573	1510305	FALSE	0	TTTCTGTTTGCTCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGQVRQLEEQLRIMDQTLKALMAAEDKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSM	1495621	1511940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1495692_1503364_1503499_1505525_1505645_1506854_1506926_1507180_1507257_1508229_1508293_1508784_1508855_1510222
878194	contig_16122_pilon	+	2928	5	Intergenic	novelGene_134499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	5.21416340365355	18	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	643	1800	116739	117896	TRUE	55	GTGGAAAGAATGAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPYDSNEVSYLLPSNKEDWEEQGIPDFVYGQEELLMREIQWPRNASGVPGALPLSRFDSAVCSAWRQRMELGLFRYHLGELQTQTLPGAVGFVAQLNVERGVQRRRPQSIRSVRQPFDPEQFNFNKVRPGEILFRLHREPDLPGAVQQEDILVMINVSPLEWGHVLLVPEPARGLPQRLLPGALRAGVEAVLLSLHPGFRVGFNSLGGLASVNHLHLHGYYLAHRLPVEGAPSEPLDPGGHLHFLQALPAPGFLFYTGGPGPDLEALVSRVCRATDYLTDHEIAHNLFVTRGALPGKTSPSSALTGVRVILWARKSSFGIKEGEAFNVALCELAGHLPIKTSQDFTSLTEAAALTLIQDCLLPPAQAEEVQAALVALVAQEEQ	110890	120270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_111247_115108_115329_115852_115910_116729_117908_119153
878195	contig_8689_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_170029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	223	555	137990	138322	NA	50	AATTTGCACAAACAAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRGALRGPGAKLHASSERRRGPDNELSSCSALGRADLPLVSTTPRHPGGFCVLFALRHPGLWCRTSAWGRWLYSLGVFCLGKCLMVHYGNFPEDLRALQWKTVYVQDP	137767	138930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_+_137800_138900
878196	contig_3818_pilon	+	2487	1	Intergenic	novelGene_99216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCACAGAGAAGTAGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205073	207560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_205100_207600
878197	contig_9415_pilon	+	874	3	Intergenic	novelGene_109898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTAACGCAGAGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2080492	2085007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2080642_2082733_2082931_2084479
878198	contig_401_pilon	-	2716	12	Intergenic	novelGene_42747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_6	81.3701876488959	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	54	2216	949257	924761	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGTGCPVTCNGRWAAAMSERKPNGGSGGASTSSSGTNLLFSSSATEFSFNVPFIPVTQVAASPASLLLPGEDSTDVGEEDSFLGQTSAHTSTPQTFSYFSQVPSSGDPFGNIGQSPLTTATASVGQSPFSKPPAALPFTTGSQDVLNAFSPSVSKAQYGAPPMPQMGVNAYLPSQQSGLPPAHFGSPPPGAPQQGYNPYRHTPGSSRANPYITPPQLQQCQTPGHPTQLPPPGPPVQMYQMPPGALPPSPPSVQSALPPPAQQQVLARPAGPSVQAPPPFLLQNQYEPVQPHWFYCKEVECKQLWMPFSVYDSFNLEEIYNSVQPDPESVVLGTDGGRYDVHLYDRVRKPVYWEEEPAEVRRCTWFYKGDADSRFIPYTEEFSEKLEAEYKKAVTTNQWHRRLEFPSGETIVMHNPKVIVQFQPSSVPDEWGTTQDGQTRPRVVKRGIDDSLDEIPHGEMPQVDHLVFMVHGIGPVCDLRFRSIIECVDDFRVVSLKLLQTHFKKSLDDQKVSRVEFLPVHWHSSLGGDATGVDRNIKKITLPSIGRFRHFTNETLLDILFYNSPTYCQRIVEKVGMEINRLYALFMGRNPDFKGGVSVAGHSLGSLILFDILSNQKDLSLSKSPGPLTIANGVVKQSHFPEKQMTEEPKLTLDESCDLDVENEEVLTLQETLEALSLSEYVSTFEKEKIDMESLLMCTIDDLKEMEIPLGPRKKIANFVKHKAAILVKFLSALIP	949310	924260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_924887_926174_926328_926757_926877_927265_927475_928712_928855_929787_929878_933258_933380_934910_935001_939513_939708_940531_940755_942397_942931_949094
878199	contig_7057_pilon	-	1154	1	Intergenic	novelGene_123425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGTAATTAAACTATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1572212	1571058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1571100_1572200
878200	contig_13479_pilon	-	1138	5	Intergenic	novelGene_168557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGATTCCATTCTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37464	12426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13479_pilon_-_12547_19241_19346_29541_29859_32238_32410_37038
878201	contig_5928_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_40365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGATTGAGGACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209300	206989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_207000_209300
878202	contig_14546_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_157423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	210	527	151323	151006	NA	55	CTACCATTATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTKAGSMWTKISLGSSVALIFQKSINGDILVSSNISKASEDYSLPGESHVLLSKKGQIRGGNLPKFLTINQETTLLLTCYRCSICFKHYKAASLCVCKDKVAHF	151532	149638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_149600_151500
878203	contig_10297_pilon	+	1561	7	Intergenic	novelGene_112538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_5	81.8589572917276	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	52	633	543854	558581	TRUE	75	AAGCTGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGCKIGPSILNSDLANLGTECLRMLDSGADYLHLDVMDGHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEEKVVP	543802	561219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543976_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554385_554473_558563_558617_560326
878204	contig_7919_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_28037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	324	623	174530	174829	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISPGGTVVKGPAVNQKVGGWNPPAAPRDKDVAVCFCNDYSLGSPLGQFYSVLEGQYESESTKRRWFFFFFVILHFYVTYCSLQTALKSCHLIPTPSC	174206	175648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_174200_175600
878205	contig_6576_pilon	+	1272	10	Intergenic	novelGene_42289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	38.7928974026031	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	17	538	343037	347415	TRUE	25	TGAGGAATGTCTTCACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSLQESLDGDEKELESSEEGGSAEERRLELPPSSHYCLYSYRGSRLAQQRGDSDDGSGTNAETPSGDDFSLSLVDANLPSEVEPQLRSFIAKRLSKGAVFEGLGNVTSVELSSPGCRVGCYYCLFQQEKLLPEAATVDSEYKPSEYVVCFLGGSEKGLELSGLNWTSTFKG	343020	352816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_343177_343944_344020_346051_346178_346983_347126_347376_347436_348776_348804_349465_349531_349672_349810_351781_351886_352435
878206	contig_14722_pilon	+	1321	2	Intergenic	novelGene_110226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	155	535	108054	108434	TRUE	35	CACCTTACTACCAAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLHKVICKVWLFVPLSLFSIPNFTTSNLCLGVTMSNLYLEVNTSDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLCLGVTTPDLSGGHHA	107899	109460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_108543_108782
878207	contig_10042_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_79123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTCCCCTCATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50495	48304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_48300_50500
878208	scaffold_16539_pilon	+	2191	7	Intergenic	novelGene_68321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22.9104537032528	37	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	602	1132	149159	150996	FALSE	20	AACGACAGTGGGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLAQEALGCQVELLCGGLGGPNRDRVLQHLIAGHPLLIPYDEDFNHEPCQRKGHKAHWAVSTGVLLGVPGVPSLGYAEDPELAGLFHPVPSTPCQPPPLPEEGSPGTIYLLSKQGKSWHYQLWDYDQVRESNLQLTDFSPSRAADGWSYVVPAGGLQSGLCGQALLLRLHNASR	145274	152055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_145497_146091_146268_148147_148217_148692_148819_149150_149281_149373_149445_150658
878209	contig_6364_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_51735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTAATCAGACTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463352	461324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_461300_463400
878210	contig_709_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_57578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1562	1912	2180519	2180169	NA	35	TACTCTTGCCCAAAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVSTGTRCRPLQAAWPPSSGAGLHVLTLALSSMDRALRAHPTVGGDEESTSRGAELGQAWLRAPKHPSTLPPSLRSSQEPTMTKPPFSKQAKKVNDLTLKVISSPSAHCTPSKL	2182080	2180108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2180100_2182100
878211	contig_13542_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_131533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526809	528775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_526800_528800
878212	contig_6674_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_147999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTTTCTCTTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132216	133568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_132200_133600
878213	contig_13461_pilon	-	1011	2	Intergenic	novelGene_146606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATATTGTAACAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61004	59584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13461_pilon_-_59675_60083
878214	contig_4125_pilon	+	1640	7	Intergenic	novelGene_25064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	922	1242	408196	410346	TRUE	10	AGATGGCCGCTCGCCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTPMIPLGEEGFTGLLRLLQSPFGFVLFQLLKRLNTKLCAASCLFVKSEVSMLPSVGPFSTMKLRSPVRMVETDHAGFHVSGWKSVMERHSLVLHLNLPLGVII	407274	420305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_408300_409432_409469_410086_410225_410303_410407_413266_413308_415858_415991_420140
878215	contig_2069_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_23565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAATCTGAAGTTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2274585	2272535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2272500_2274600
878216	contig_7629_pilon	+	3418	9	Intergenic	novelGene_153592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1536	1910	377693	378067	TRUE	15	GTTTTCAGGGCTCATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISNKDVISNFAFTANNSAFVSSFLHTAILFSQSLYYVLLLLQLSFHLNKEHDVMFYKAFSTTEKRIINKNGVIHYLLFLDAIEPTDSWQLCVCRVELLHRVFKAVTFWKQKAERVDLNCQTFI	376157	413613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_378722_387033_387175_387399_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391812_392731_392882_396941_397053_413488
878217	contig_18251_pilon	+	827	4	Intergenic	novelGene_50165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	66	407	48676	53991	TRUE	45	ATCAAGAATAGTGTGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKACSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFSPNSSVELNCTLNHES	48610	55317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_48794_50702_50876_53940_54012_54917
878218	contig_2114_pilon	+	1999	2	Intergenic	novelGene_104288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTTCAATTATATTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723426	725860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_724682_725116
878219	contig_4083_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_152321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAACAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45804	44936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_44900_45800
878220	contig_13952_pilon	-	2503	3	Intergenic	novelGene_133264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	413	769	187071	186715	TRUE	55	AAATTTCTAAAAACTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGESEVVSPEVWEVPPEAGICVLPGGCRVFRLAGTRFQQENKPCKAGRKRAVGTHPVSEGRGDCGSSRGSSTERRYVLGRVGYTHPERGRVCFGSAKGELPLTKGVFSDGEGQNAVE	194453	184653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_184775_185101_187423_194392
878221	contig_3382_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_124175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTGCAAAATTCATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950141	948889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_948900_950100
878222	contig_563_pilon	-	2819	18	Intergenic	novelGene_169760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1419	1943	577971	573964	TRUE	30	CAGCAGCCCAGAGAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRTSAFRPESNCVTRLAKIFTRTWAAPLQATAFSARRIRFTAPSFMASTWASVKGFRTSLRRKIFLRPPAPANLGCVTGMMGSGLLLAWGASSSSVDMELREPTTEMAWPWADRRRLIRTLSGFTTFSSLGSSLHCLVCSTPGPSPAAVICVAMSRARCLIWASVPADSTGV	590445	562586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_562841_564643_564813_566291_566530_570658_570815_573904_574056_575617_575824_576652_576801_577892_578133_579311_579393_579759_579874_580931_581079_581956_582120_583327_583436_583786_583888_584750_584843_585913_586015_589296_589484_590282
878223	contig_9759_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_167232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACGCAAGACCCGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122090	124259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_+_122100_124300
878224	contig_2450_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_160322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800425	801072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_800400_801100
878225	contig_20541_pilon	-	1712	2	Intergenic	novelGene_178200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	113	junction_1	0	130	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	112	453	40949	40162	FALSE	20	GTTCCTTTAAGATTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVTGMAVLLTLGITGDTKTTQPNSMESTEGEPVNLPCNHSTISGNEYIYWYRQIPHQGPEYLIHGLNNNETNEMASLTIPTGRKSSTLILPHVTLRDTAVYYCMVRDTQWL	41060	38902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20541_pilon_-_40464_40909
878226	contig_3942_pilon	-	1496	5	Intergenic	novelGene_128713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	4.20565096031518	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	137	799	448479	443411	FALSE	50	AATTTCAGAGAAAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVTADCRGLSRRPCRAAPHQRTGDPVVATKKVAAARVATASVQSKMASATDSRYGQKESSDQNFDYMFKILIIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFKVKTIYRNDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFILMYDITNEESFNAVQDWSTQIKTYSWDNAQVLLVGNKCDMEDERVVSSERGRQLADHLGFEFFEASAKDNINVKQTFERLVDVICEKMSESLDTADPAVTGAKQGPQLTDQQAPPHQDCAC	449713	442713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_443602_445506_445632_446845_446965_448251_448480_449577
878227	contig_5222_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_58998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCATCACACCTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193714	192273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_192300_193700
878228	contig_8445_pilon	+	3398	11	Intergenic	novelGene_177053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_2	13.7040140105007	32	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	175	2565	42324	109513	FALSE	15	GATTCTTTTTTAATTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENYCLQAALVCLGMLCHSQAFATERRSHLRPSFHKHHEKGKEGQVLQRSKRGWVWNQFFVIEEYTGPDPVLVGRLHSDIDSGDGNIKYILSGEGAGTIFVIDDKSGNIHATKTLDREERAQYTLMAQAVDRDTNRPLEPPSEFIVKVQDINDNPPEFLHETYHATVPERSNVGTSVIQVTASDADDPTYGNSAKLVYSILEGQPYFSVEAQTGIIRTALPNMDREAKEEYHVVIQAKDMGGHMGGLSGTTKVTITLTDVNDNPPKFPQSVYQMSVSEAAVPGEEVGRVKAKDPDIGENGLVTYNIVDGDGMELFEITTDYETQEGVVKLKKPVDFETKRAYSLKVEAANVHIDPKFISNGPFKDTVTVKIAVEDADEPPMFLAPSYIHEVQENAAAGTVVGRVHAKDPDAANSPIRYTIDRHTDLDRFFSINPEDGFIKTTKPLDREETAWLNISVFAAEIHNHHQEAKVPVAIRVLDVNDNAPKFAAPYEGFICESDQTKPLSNQPLVTISADDKDDTANGPRFIFSLPPEIIHNPNFTVRDNRDNTAGVYARRGGFSRQKQDLYLLPIVISDGGIPPMSSTNTLTIKVCGCDVHGGLLSCNAEAYILNAGLSTGALIAILACIIILLVIVVLFVTLRRQKKEPLIVFEEEDVRENIITYDDEGGGEEDTEAFDIATLQNPDGINGFIPRKDIKPEYQYMPRPGLRPAPNSVDVDDFINTRIQEADNDPTAPPYDSIQIYGYEGRGSVAGSLSSLESATTDSDLDYDYLQNWGPRFKKLADLYGSKDTFDDDS	42149	110346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8445_pilon_+_42552_48372_48668_52527_52648_63423_63592_67593_67782_77761_78016_84715_84853_86356_86491_86717_86836_105474_105727_109016
878229	contig_14822_pilon	+	2830	1	Intergenic	novelGene_145403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCGACACACCTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117861	120691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_117900_120700
878230	contig_15118_pilon	+	1365	2	Intergenic	novelGene_74543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	99	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTCCCCTCTCCCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125258	152015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_125328_150719
878231	contig_10490_pilon	-	1236	1	Intergenic	novelGene_169883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	500	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCATTCCGGAGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25433	24197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10490_pilon_-_24200_25400
878232	contig_8822_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_117927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	14	1063	56535	55486	NA	35	ATTCAAGGTCTGTAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHDVSKEFGNSLSEQSFFNQHKQIHTRSKPYDCHLCGKAFIQSSDLIQHIRTHTGEKPYDCHMCGKTFSTRSNLKKHERIHSGEKPYVCQLCGKAFSQSYELRSHEKTHTGEKPFECNVCGKAFIQRSCLTQHNRTHTGEKPYDCHICGKTFSTRSNLRKHERIHTGEKPYICQLCAKAFSQSYELRSHEKTHTGEKPYECQVCGKVFIQKSCLTQHNRTHTGEKPYECHLCGKAFMNCSNLRRHERSHTGEKPYGCQLCEKVFSQCSELRDHEKTHTGEKPFQCNVCGKTFSRSSNLRLHERIHTGEKPYECRVCGKAFTRSSNMRLHENSHLRETVFANFVESL	56548	54515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_54500_56500
878233	contig_5125_pilon	-	494	3	Intergenic	novelGene_43404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	533	1785	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26465	23060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_23313_24803_24905_26324
878234	contig_3135_pilon	+	856	2	Intergenic	novelGene_176601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTAAATAAATGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128374	130137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3135_pilon_+_128496_129402
878235	contig_9516_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_106167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	67	321	846831	846577	NA	20	TTTTCCCCACTTGGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HESGAEPTPELRSANPKPGLSFMKIYHVCVWWPTFPSRHLYFQVLYDILVRNEVKFIHTEAVGGEAFSPGVSRVSAKGQIVNTLGFAGHTVSVTTTQLYCHSRKAA	846897	845776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_845800_846900
878236	contig_7327_pilon	+	3893	1	Intergenic	novelGene_172124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATACTTGCGACTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126407	130300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_126400_130300
878237	contig_18145_pilon	+	862	9	Intergenic	novelGene_37300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	42.5205832509386	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	45	827	57127	60220	FALSE	25	AGGAACTATCCTCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARAARGTGGILLRGFLRAPGRAPRRASSGLPRNTVVLFVPQQEAWVVERMGRFHRILEPGLNILIPVLDRIRYVQSLKEIVINVPEQSAVTLDNVTLQIDGVLYLRIMDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAALASLLRFWFLFFI	57082	60255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57172_57414_57553_57963_58064_58193_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130_59146_60176
878238	contig_8900_pilon	-	2818	19	Intergenic	novelGene_171610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	48.8309315551445	127	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1362	2309	129260	119201	FALSE	0	GTGGCTTTTCTTTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVPFPPDALIGPGIPRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISQPGNKSPVSQLDCLNRDNYIRSCKLLPDGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHVSKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY	226851	118691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8900_pilon_-_119309_119451_119529_120851_121003_122405_122554_127054_127303_129044_129295_145110_145189_147029_147221_148260_148406_150812_150966_152006_152061_155578_155696_170256_170478_184178_184254_185870_185934_224238_224284_224394_224459_225940_226042_226831
878239	contig_1406_pilon	-	1570	2	Intergenic	novelGene_25604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	518	1030	2214557	2206396	FALSE	30	GAGAACGGAGGCCATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPQSPVGAEIDTTAWVFLSPGWRAPPGLGCHGFLRCACLHPCPLHCGSDPLPQSTGSPQVHFLLSDELADPVSPGSALHRLLPSRASFCEVKKPVHLVVQQAVPSLPRVCLHHVALKKAWTLSLNPHSSTFEQHELEQVVQPLSASITFSGKKNGDNNTYLARLLCWV	2215074	2205855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2206858_2214506
878240	contig_6496_pilon	-	4018	2	Intergenic	novelGene_103497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3506	3826	569101	568781	TRUE	10	TCACCGTCTTCCCTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWAASGPHPGSHLERPLGPLPPVGYPLPRLHKCPVLHTSGAPPCLISSAWKHVYFYLPPGQCCPGLMTLKTLFCLWYSLLSSQGVCMLPAERNLPSPEIQAHTLH	572606	534481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_534532_568638
878241	contig_10005_pilon	+	4237	1	Intergenic	novelGene_148906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAGAGATAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97798	102035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_97800_102000
878242	contig_7753_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_41505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226254	1225065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1225100_1226300
878243	contig_9646_pilon	-	3933	1	Intergenic	novelGene_117484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATTTTAGTGCCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524223	520290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_520300_524200
878244	contig_2161_pilon	-	1488	4	Intergenic	novelGene_114968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2952.52404261544	24175	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCTGCTGTGTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066394	1059515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1060455_1060530_1060815_1063660_1063751_1066219
878245	contig_2161_pilon	-	1552	3	Intergenic	novelGene_114967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4734	junction_1	1184	17354	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCTGCTGTGTGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066382	1059515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1060815_1063660_1063751_1066219
878246	contig_2161_pilon	-	1213	4	Intergenic	novelGene_114969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2952.52404261544	2096	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACCTGCTGTGTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066374	1059516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1059697_1060026_1060815_1063660_1063751_1066219
878247	contig_10523_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_120955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39820	40961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_39800_41000
878248	contig_17198_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_62341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACAGTGTGCGTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578626	580972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_578600_581000
878249	contig_12950_pilon	-	4144	4	Intergenic	novelGene_114795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	3.55902608401044	50	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	268	891	120657	111081	FALSE	10	CAGACTTGTGCTGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLMAPSGYKGPQPTVKPDLVGKLSRCGHIYHIYCLVAMYNNGNKDGSLQCPTCKTIYGVKTGTQPPGKMEYHLIPHSLPGHPDCKTIRIIYSIPPGIQGPEHPNPGKSFSARGFPRHCYLPDSEKGRKVLKLLLVAWDRRLIFAIGTSSTTGESDTVIWNEVHHKTEFGSNLTGHGYPDANYLDNVLAELAAQGISEDSAAQEKD	120924	107827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_111315_112259_112350_116351_116514_120519
878250	contig_2450_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_160304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448396	445919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_445900_448400
878251	contig_6270_pilon	-	815	1	Intergenic	novelGene_99881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAATATGATGAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073145	1072330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1072300_1073100
878252	contig_5033_pilon	-	897	5	Intergenic	novelGene_29104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	101.218513622756	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	235	570	838859	789799	TRUE	35	CCTTTGTGAATAAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLQELVDRVLERFQSSGLIVKEWNSVKLHATVMNTLFRKDPNAEGRYNLYTPDGKYIFKERESFDGRNILKLFENFYFGALKLNSIHISQRFTVDSFGNYASCGQIDFS	839093	788688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_788974_789756_789916_812829_812916_825673_825799_838851
878253	contig_10986_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_71494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1402	1719	134815	135132	NA	30	CTGCTTCTGTAAAGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGDDTAWVPPAHSSLPTDSSNVSFWAESCFTLVPYTLVRPHRPTQPRPVMVVPRVVGKILIEKLCLLRGFEKCPAGTLSPVITCDPAACGAGSGPCRAVIRSP	133413	135890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_133400_135900
878254	contig_7816_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_66555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAAATATAAATTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337927	335622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_335600_337900
878255	contig_12080_pilon	-	1068	1	Intergenic	novelGene_128364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAACTTCATACATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103450	102382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_102400_103400
878256	contig_11160_pilon	+	2677	1	Intergenic	novelGene_168798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCTGTGGCTGTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91766	94443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_91800_94400
878257	contig_5039_pilon	+	3320	2	Intergenic	novelGene_64917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGCTAACGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121638	1142215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1122180_1139436
878258	contig_1154_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_87102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362032	364771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_362000_364800
878259	contig_11850_pilon	-	1850	7	Intergenic	novelGene_125197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1233.29591159444	39	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	5	778	186097	181211	TRUE	15	TTGTTTTATTTCTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGGPSQNWNQGYSNYWNQGYGNYGYNSQGYGGYGGYDYTGYNNYYGYGDYSNQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	186101	179834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180877_181180_181279_182405_182553_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932
878260	contig_6958_pilon	+	1513	3	Intergenic	novelGene_69977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCTAATTCAGCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684126	687197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_685272_685648_685784_686964
878261	scaffold_13505_pilon	-	569	3	Intergenic	novelGene_111618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATTAGAGAACGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663815	662056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_662356_663493_663581_663632
878262	contig_14300_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_133158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	3	419	639594	640010	NA	25	AGAATACAGTCTGCCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSVWLNLKHQYQHCVRGTGGGSVPGPTHTVCTSLLHLGANAAWLRGWDCFLAPQISGQDCHNPLTHSVPCPGPVKKEGPLRELGLQGHCPLVRPDNGPFQGCVPLRKGVSRAHYHPELGLSGKPRAFVSVALQAQIA	639591	640929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_639600_640900
878263	contig_8138_pilon	+	863	3	Intergenic	novelGene_52450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	531	14	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280099	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288610_307404
878264	contig_6299_pilon	+	1083	2	Intergenic	novelGene_172939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_1	0	103	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	225	596	956551	956922	FALSE	70	GAAAAAAAAAAAAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQLLPLALYLSNMRKAVKIRERTPEDIFKPTNGIIHHFKTMHRYTLEMFRTCQFCPQFREIIHKALIDRNIQASLESQRKLNWCREVRKLVALKTNGKKGSVPLLLSGDGSQRAWSPLIKF	952669	957409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_952879_956535
878265	contig_17344_pilon	-	3668	9	Intergenic	novelGene_169584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.330718913883074	186	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1626	2120	46548	46054	TRUE	25	TAGACCAGTTTGGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKDLEEVKQKVQPFLDDFQKKWQEEVALYSQMGPLGEELRDSARQKLQELQEKLSPVAQELRDRVRVRVDELRTQLTPYSEELRQRLARRLETLKESNLANYHTKAMEQLSALGEKTKPVLEDFRQGLLPVLESLKVSFQTAIDEATKKLKASEGPAAAAPSA	71473	30072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_31210_31965_32093_45168_45348_45948_47197_60013_60165_62028_62346_68181_68254_70129_70370_71276
878266	contig_16578_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_148653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATTAAAGAGGTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188271	190224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_188300_190200
878267	contig_14341_pilon	+	778	2	Intergenic	novelGene_111881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	165	395	724932	725653	FALSE	10	TCCTTGGACTTCGCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGASAPSGGPGALDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEVSPVDGGGIGLVEGA	724767	726036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_724977_725467
878268	contig_9121_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_134440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1040	1426	88796	89182	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKASHKAALKSMGTKMYMDSLQERIANSQHQLEEGRVKELKPKCPSTDERINEMWYIHTMNYYTITKRNEILIHATTWMNLENIMLSKISLLQKDKYKTCINEISKYMLFLVAMESILTHGKAMGAE	87756	89560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_87800_89600
878270	contig_5779_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_106538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGACTAAGAACTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357582	355599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_355600_357600
878271	contig_16846_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_82877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTGCTCCTGGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227053	228369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_227100_228400
878272	contig_7749_pilon	+	1912	1	Intergenic	novelGene_170873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	761	1120	40169	40528	NA	45	TAAACACAAGTGGCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHTDWNEAISYWFTRIISLISHIVTGCARHRQAVWCQPNSVLTVCAQVGASEQYSYGVRNRTAHGALGHSRLPALNPGVLGKSHRTTVSLKGVHMAGECVYGVKDRYTTAGLATLPSP	39408	41320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_+_39400_41300
878273	contig_11311_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_170463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCGACACACAGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4841	7099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11311_pilon_+_4800_7100
878274	contig_5023_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_7312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAAGGTTCTGTATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598848	601347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_598800_601300
878275	contig_7593_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_127271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCAAATCAAAATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2402	3223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_2400_3200
878276	contig_13607_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_170207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCAGCAGAGCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325250	322095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_322100_325200
878277	contig_9335_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_147440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1105	1539	345155	344721	NA	75	AAAAAAAACAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCYVYFTTIKTKTNNNKKKTLAKSGLKCLASDVTAASQTTGTEFGAEEASVFGSGKTSFDSWSKTSFSSETGAAAPQTPGARGLQLRSVRSQSIPRWHSVCQEMVVFKKHAKVSQRFGFLQLNQGTLSKDASVPIQLCNVVVF	346259	344586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_344600_346300
878278	contig_19737_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_158970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATATAGTTAATTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41789	40448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_40400_41800
878279	contig_11855_pilon	-	1274	8	Intergenic	novelGene_66996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	21.3732619534458	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	479	1273	1310207	1307615	FALSE	20	CACGTTTCTGGTCTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRASLYIHWPYCEKRCGYCNFNKYIPRGVEEAAVRSCLVTEAQTLLLLSGVRRVESVFFGGGTPSLASPHTVAAVLEAVAQAAYLPADAEVTLEANPTSSAGSRLAAFGTVGVNRLSIGLQSLDDAELQLLGRTHSASDALRTLAEARHLFPGRVSVDLMLGLPAQQVGPWLGQLQELLCHCDDHVSLYQLSLERGTALFAQVQQGALPAPDPELAAEMYQKGRVVLREAGFRQYEVSNFARNGALSTHNWNYWQCGQYLGVGPGAHGRFLPQGAGGHTREARIQTLEPDNWMKEVKLFGHGTRKRVPLGELELLEEVLVMGLRTDLGITHQGSSVLLGGPGCAGLSVADPPASTPRGLAAENLHPCAERMTPCSYTPTQFQVGFGGQAALQTSLQRWQVLPLPVWSLPDPGIPRGMASVRWMG	1313612	1307613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1307891_1308831_1308887_1309123_1309272_1309713_1309778_1309955_1310322_1312759_1312965_1313087_1313222_1313587
878280	contig_12837_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_57332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAAACAACCAGTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157456	156034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_156000_157500
878281	contig_12969_pilon	+	3541	5	Intergenic	novelGene_61709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	24.6005589367396	98	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	269	1534	647635	654673	FALSE	30	ATGGAGTGAGTGTGCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITTFTEVQRRQDRTLPRVISSFFRTKKMTKAQESLSFEDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPNPVFKLEQGEPPWIVEGAIHSWTSPEEIWAIDHMQWHSENQNELKNLEGCQQSYALGNNSNLSKNLFPLTQRGNTFDLHCKSLKAPLSFVIQNRRYAVKDSDEFSGYRKSPVHMKHDKTFSGIKYHGYVKPSSTKSQLNDHHKTYVGEKLHECSECGKTFSRKSRLMVHQRTHTGGKLYVCSECGKAFTWKSWLKRHQQSHTGEKLCGCNECGKAFSQKAYLIAHQRLHTGEKPYECSECRRTFFFKSDLTKHQRIHTGEKPYECSDCEKAFRSKSKLIQHQRTHNRERPNGCRECGKTFAQMSVLIKHKEKHRREKVIKSLKVGKPSSGNPFYMSELI	638738	656680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_638908_647535_647734_649028_649156_649421_649518_653729
878282	contig_1107_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_126576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGACTCACAGCGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597921	596353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_596400_597900
878283	contig_10163_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_82647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGTAATTCAAAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167160	168396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_167200_168400
878284	contig_3529_pilon	+	1102	6	Intergenic	novelGene_105378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.77174369109018	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	126	704	745173	751006	FALSE	20	CTCCAGGGTATGACTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMDEKVKESFVLDTASAICNYDAHYKDYPKYWCRGYFRDYCNIIAFTPNSTGRVALRDTGNQLIVTVSCLTKEDTGWYWCGIQRDFARDDMDFTELVVTDNRGALTDDFSSEKDLLGNKNRSCRASKVVQKADRSRMSILIICTLITALGIISIVSHYLTKRRRSQRNRRGKVLTRSSKNSQASSVIPTPL	744594	751404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_744715_745167_745516_747999_748067_748785_748890_749371_749434_751003
878285	contig_5649_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_82471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	93	302	1573807	1573598	NA	30	AAGTAGATACAGTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVHCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPVRGAPNSRSRLPSPEPSF	1573899	1571807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1571800_1573900
878286	contig_5039_pilon	+	3256	1	Intergenic	novelGene_64819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAGGCTCTATTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233647	236903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_233600_236900
878287	contig_4519_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_123752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332237	1333480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1332200_1333500
878288	contig_9440_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_59081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAAAAGAGGTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330511	1332010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1330500_1332000
878289	contig_7695_pilon	+	1331	5	Intergenic	novelGene_41557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGACGGCCGCAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373560	381081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_373987_375819_376227_376485_376515_379658_380085_381038
878290	contig_14314_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_176844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTTTGCCAGTAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156560	159481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_+_156600_159500
878291	contig_7513_pilon	-	2123	7	Intergenic	novelGene_89034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.765016539018	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	582	1571	738519	710220	TRUE	50	AAAAAATCATTTGAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQNADPESLQVQELAVPVPALQKRESKEAENRDETVSEGSIDRIPMRLWVMHGAVMFGREFCYAMETALVTPVLLQIGLPEQYYSLTWFLSPILGLMFTPLIGSASDRCTLSWGRRRPFILALCVGVLFGVALFLNGSAIGLSLGDVPGRQPIGIVLTVLGVVVLDFSADATEGPIRAYLLDVVDSEEQDMALNIHAFSAGLGGAVGYVLGGLDWTQTFLGSWFRTQNQVLFFFAAIVFTVSVALHLFSIEEEQYSPQQERGADETEALPPRASTSDGSGQYGVALYPDEVQSEHELPLDYLDVDIVRSKSDSVLHVPDAALDVEPP	757109	704866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_705090_709890_710603_711286_711467_713556_713746_738281_738934_740809_740918_757050
878292	contig_11832_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_106913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAGGGAAAAAAAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74465	76146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_74500_76100
878293	contig_5253_pilon	+	1354	4	Intergenic	novelGene_61540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	997	1353	55248	91713	FALSE	25	GAGGACGTTTACCAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLRGGILSLIRSKPLASSKLVILCCGENPLIASYQWACLPLCRVCFPPESTPLGSMPVGVKPFSVSTLSLSSLRTENTLAILPIARILFLITSFRAAAVAPIQIHLLLTLVHHLSRY	54251	91714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_55350_61427_61548_71439_71530_91668
878294	contig_7775_pilon	+	1488	1	Intergenic	novelGene_37512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAGTATGTGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334125	335613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_334100_335600
878295	contig_4087_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_156070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGATAAGGAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60477	62441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_60500_62400
878296	contig_7066_pilon	+	3586	13	Intergenic	novelGene_42127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	338	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2874	3266	660461	674782	TRUE	40	GGGGCGGACGAACAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPSVDDSKSTLADFVVWVEVVGCLDHVCLTPEKAVSSQAQKFFLLRNRGAEILLNQMKQGGWFLRSVGHLLQTEAGERTAGWLRLEQTLGPGRWPAAQAASSAHLWCSSRKLPKDFLASQCPGREWET	643049	718038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_644849_645840_646131_647891_648097_649359_649418_652998_653197_655252_655362_657735_657852_660279_660347_660429_660626_663336_663441_674658_674800_707477_707662_717919
878297	contig_20951_pilon	-	771	5	Intergenic	novelGene_43142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	113.165807556876	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	395	769	356666	344050	FALSE	35	AACAAATCTTGTTCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQELVSFKDVAVNFTQEEWQQLDSDEKIIYRDVMLENYSHLISLGFDITKPDVIIKLEQGEEPWIVEDEFPCQICPEEAWKVGDLIERIQGNEDKYSRQTVSINSRSLIEQRENICDKIYNV	358295	344047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_344187_347580_347677_348732_348860_356651_356711_357945
878298	contig_3382_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_124078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCAGAAGCATGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396493	398635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_396500_398600
878299	contig_16930_pilon	+	2525	1	Intergenic	novelGene_139154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTGTTTTTGCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97863	100388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_97900_100400
878300	contig_5482_pilon	+	3121	1	Intergenic	novelGene_144472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2491	2880	377407	377796	NA	35	AAGAAGTGGATACAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPSFERSHRANLSPTAKMQQHVCDISAQKSPSETQCQSFLLRAGHVGTFCLTCTKIPESQKETDVQHQPYCLHSLGTVNHPCQLTADWEHSKSQIPRCQPRANRVSGLLATLLHGKLFNSDPSSVQT	374916	378037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_374900_378000
878301	contig_11253_pilon	+	1259	3	Intergenic	novelGene_126843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACATTACATAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215993	228225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_216857_220976_221135_227987
878302	contig_5047_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_157982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2030	2371	852012	851671	NA	70	ACATCCAAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSNCTPNPHPYLHITVFAGPEEIMLLRKNEERKAQGGIVEIYYKMKTKNENHNILADENFSPNPPEAEENCNLNPNWMKDPETRICRQEKNTSNQKFKNSEPNEIRKMCNEE	854041	851543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_851500_854000
878303	contig_2394_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_177763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAGTATGATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92568	94246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2394_pilon_+_92600_94200
878304	contig_6446_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_149171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTAAACACTGCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116984	115116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_115100_117000
878305	contig_11328_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_88373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1404	1724	255560	255240	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAFSALYQFASRLSGRVVTIIIRTASNSTVKIFWVMCITVWKKDDHTTEAGSRAHPTTVSSASRPVPNPVIRSKIAWVKSNGWAHSTDQFYWATGCSFRGIALLT	256963	254806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_254800_257000
878306	contig_6691_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_60148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAGTGTTTCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285574	283073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_283100_285600
878307	contig_9678_pilon	-	1637	13	Intergenic	novelGene_146355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1315	1635	195524	190948	FALSE	15	GGACTGGGGCCTGCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLIETKNILIISPKSLLQDGAGGAGRGIGTVADGEVPGGKKQLAREHLHGERQGPQGRLVAQGPRRYQRGQQRQQPRQHQWAQPARAARRQRTSLHGRSLLCRVC	213302	190945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_191227_195482_195631_199413_199480_200863_200913_201169_201280_204660_204762_206751_206882_208319_208502_209056_209145_210397_210492_212334_212418_212585_212689_213100
878308	contig_15134_pilon	-	384	1	Intergenic	novelGene_140210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAGAAAGACAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174459	174075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15134_pilon_-_174100_174500
878309	contig_253_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_129771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGGTAGCTGGGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794624	792438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_792400_794600
878310	contig_12619_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_73565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAACTGCCCCATAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805559	807849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_805600_807800
878311	contig_14405_pilon	-	2794	1	Intergenic	novelGene_85671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTCATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762550	759756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_759800_762600
878312	contig_17311_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_57871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATCTTTACAGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202359	204669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_202400_204700
878313	contig_19269_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_175627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAGAAAAATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6092	8164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_6100_8200
878315	contig_11126_pilon	-	930	8	Intergenic	novelGene_138155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_6	610.507717780363	498	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	72	788	1001201	987939	FALSE	10	TTCTTGGTGTGACTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTILIQNIYRNPQNSAQTADGSHCAVSDVEMQEHYDEFFEEVFTEMEEKYGEVEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAEKAVIDLNNRWFNGQPIHAELSPVTDFREACCRQYEMGECTRGGFCNFMHLKPISRELRRELYGRRRKKHRSRSRSRERRSRSRDRGRGGGGGGGGGGRERDRRRSRDRERSGRF	1001272	987796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_988081_989154_989248_989354_989489_990028_990128_990285_990336_994841_994909_997708_997797_1001157
878316	contig_13612_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_157268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCTCTCTCACCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27451	25991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_26000_27500
878317	contig_7327_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_172109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70786	69167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_69200_70800
878318	contig_13048_pilon	-	1392	11	Intergenic	novelGene_138902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCGCCTCCGACTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285376	155669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_155839_163595_163855_170674_170801_188949_189043_192595_192658_231065_231155_239265_239410_262151_262260_264553_264713_281974_282078_285296
878319	contig_4769_pilon	-	1926	7	Intergenic	novelGene_118043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	25.7902867159109	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	611	1618	1583092	1528303	FALSE	55	AATTCCTAAATCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDMERHLKIHTGDKPHKCDVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKGNLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRIHERIHCTDRPFKCDFCSFDTKRPSSLAKHIDKVHRDEARTENRAPVGREGPRESSSQHVAKIVTQRAFCCDTCGASFVRDDSLRCHKKQHSDQSENKNSELVTFPSESSASSQPGTLVSVGQLEAPLEPSQGL	1604965	1527994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1528670_1571927_1572280_1578266_1578519_1583055_1583119_1585030_1585193_1600749_1600991_1604784
878320	contig_19957_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_57722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGAGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234837	237509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_234800_237500
878321	contig_17214_pilon	+	2732	1	Intergenic	novelGene_153465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATAGGATTTTCAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6877	9609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_6900_9600
878322	contig_12970_pilon	+	4371	31	Intergenic	novelGene_50517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTATATGGAGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103673	213738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_104385_122216_122573_127369_127482_128785_128930_130260_130323_133187_133309_133853_133985_138781_138899_139387_139592_139876_139973_143032_143166_144525_144599_146878_147038_147876_148000_151988_152149_161058_161167_170831_170948_177779_177920_185708_185758_187207_187292_189288_189400_190616_190770_193049_193198_194607_194701_196713_196830_201537_201679_203820_203902_205870_206000_211788_211887_212443_212533_213725
878323	contig_19518_pilon	-	364	3	Intergenic	novelGene_170727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5162.5	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49271	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47656_47728_49223
878326	contig_14142_pilon	-	1467	3	Intergenic	novelGene_120431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	5.5	201	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	8	388	39801	38652	FALSE	20	CAGGTTTATTGGTTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAFPPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGAVVSDGLDRKEPRAGEVICIDD	39808	37572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_38774_39297_39425_39669
878327	contig_9785_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_157905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGCCTCATAGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542232	544493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_542200_544500
878328	contig_14814_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_137758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAACGGCAGTGGGTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416973	416042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_416000_417000
878329	contig_2444_pilon	-	717	4	Intergenic	novelGene_83759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	160.25812511903	2825	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	235	543	229702	227685	FALSE	30	GTTAATCAATGGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQAFRKFLPLFDRVLVERSAAETVTKGGIMLPEKSQGKVLQATVVAVGGGSKGKGGEIQPVSVKVGDKVLLPEYGGTKVVLDDKDYFLFRDGDILGKYVD	229936	227510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_227736_227810_227901_228866_229032_229699
878330	contig_5084_pilon	-	947	3	Intergenic	novelGene_64673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCTAGGGGCTCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1753010	1751481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1751506_1751643_1751720_1752163
878331	contig_6375_pilon	-	758	2	Intergenic	novelGene_73049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	161	550	517464	516447	FALSE	5	CCCTGGACTTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALGPGIYSSPGNYDPRAVAVKEEPRGPEGSRGAARSSYNPLQYQVAHCGQTAMHLPPALAAPSQPLRVLKAPLAAGAQPCSPLLKAPSPAGPSHKGKKAVNKDSLEYRLRRERNNIAVRKSRDKAKRRILETQQKVLEYMAENESLRSRVEQLTQELDTLRNLFRQIPEAANLIKGVGGCS	517624	516238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_516783_517410
878332	contig_20948_pilon	+	3562	1	Intergenic	novelGene_178187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACAAATGAGAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14400	17962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20948_pilon_+_14400_18000
878333	contig_6436_pilon	+	2432	1	Intergenic	novelGene_134912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGGTACCAAGGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713480	715912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_713500_715900
878334	contig_8866_pilon	-	2464	1	Intergenic	novelGene_77858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAATACCATTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665448	662984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_663000_665400
878335	contig_13740_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_34770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATAAAAAAGTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752183	749713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_749700_752200
878336	contig_13456_pilon	-	2965	1	Intergenic	novelGene_153290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATATAAAAAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323771	320806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_320800_323800
878337	contig_12864_pilon	+	2875	1	Intergenic	novelGene_76372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAATTTTTTCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185823	188698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_185800_188700
878338	contig_1535_pilon	-	3037	18	Intergenic	novelGene_127235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_17	128.174027458292	88	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	655	2370	99102	77914	FALSE	25	AGAAACTGCTTGTTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILSLELMKLRNKRETKMRSMMAKQEGMEMKLQVTQRNLQESQGKIAQLEGKLVSVEKEKIDEKSETEKLLEYIEEISCASDEVEKYKVDIAQLEENLKEKNHEVLNLKQSLEENAVMLSKQVEDLNARCQLLEKEKDDLVIRDREQVENLNAEIQNLKEKLILERQEHEKLQQKELQIDSLLQQEKELSCSLQQKLCSFQEEMIKERNIFEEELKQALGELDELQQREEEAERLVKQLEEETKSKAEELRFLQEKLKGKEAELEKSNAAHTQATLLLQERLDSTVQNLGDVTAQLESYKTLTTSEIEDLKLENSSLQEKVAKAEKCTEDVQHQILATESANQEYARRKEGKKSRYKCLMDTSFSNPRMLLDLQTKSALKEAEIKEITVSSLKKITDLQNQLKQQGEDFKKQLEEEARKAGKENTVEELTEEINKWRLLYEELYNKTKPFQLQLDAFEAEKQALLNEHGAAQEQLNKLSDSYAKLLGHQNLKQKIKHVVKLKDENSQLKSEVSKLRSQLAKKKQSETKLQEELNKVLGIKHFDPSKAFHHESKENFALKTPLKEGNTNCC	115967	77246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_77934_78495_78659_79249_79427_80118_80219_80313_80527_81102_81250_86894_87012_92458_92674_94085_94235_96066_96246_96378_96454_98851_98953_99042_99130_101961_102151_107128_107177_109270_109363_109824_109924_115768
878339	contig_5676_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_159089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAAACCTCGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254921	256231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_254900_256200
878340	contig_7962_pilon	+	977	5	Intergenic	novelGene_149312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	37.2189467878929	562	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTGTCTTATCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444831	446297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_445425_445586_445647_445751_445798_445922_445973_446069
878341	contig_12080_pilon	-	1032	4	Intergenic	novelGene_128402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	15.556349186104	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	43	744	218255	217306	FALSE	25	TTGTAGGCGCTTGGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPQDLDIAVWLATVHLEQYADTFRQHGLATAGAARGLGHEELRQLGITATGHRKRILRLLQAGAAEGSLDPQSDSAMEPSSSPDPQAQTLKPVPKPRTVFGGLSGPATTQRPGPSPALRGPEVSRSPESSPRSPPLPTSSSEQPSALNTMEMIPNAIYFGLDLRGQSQAAQDITPDSSQKAAPTPALRPTAGTVHIMDPGCLYYGVQPVGVAGLPDRREGRGICQDRAEHR	219923	217017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_217422_217528_217591_217731_218273_219898
878342	contig_16578_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_148651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATGGCTAACCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181774	182894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_181800_182900
878343	contig_10323_pilon	+	2758	1	Intergenic	novelGene_123643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAACAAACCCAGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532091	534849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_532100_534800
878344	contig_9180_pilon	-	1109	3	Intergenic	novelGene_109105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	216	710	240370	239806	FALSE	5	TCCTGTCTTCCAGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPVLWTVVRTYAPYVTFPVAFVVGAVGYHLEWFIRGKDPQPVEEEKSISERREDRKLDELLGKDHTQVVSLKDKLEFAPKAENGLVNMSAQHQTPPLICFVVAYSAAPAPHTHTHTGCSSRAADAPAAEGPVKRTYLVGSGLKAAPVVWWPQLLRLLSLWVHC	243963	239406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_240055_240124_240376_243753
878345	contig_14060_pilon	+	928	1	Intergenic	novelGene_156049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTTGTCATACATGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43214	44142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_43200_44100
878346	contig_9682_pilon	+	1027	2	Intergenic	novelGene_125298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATGGATGCTGACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27083	28475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_27377_27741
878347	contig_4742_pilon	+	1518	1	Intergenic	novelGene_131009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGATTTGGGGAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263384	264902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_263400_264900
878348	contig_13460_pilon	+	898	5	Intergenic	novelGene_162168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	43.8349175886074	667	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	243	647	7936	19547	FALSE	30	ATAAGCAAGGTATCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENSPSPLPERAIYGFVLFLSSQFGFILYLVWAFIPESWLNSLGLTYWPQKYWAVALPVYLLITIVIGYVLLFGVNMMSTSPLDSIHTITDNYAKNQQQKKYQEEAIPALRDIPISEVNQMFFLAAKELYTKN	6183	19798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_6402_7911_8018_13302_13376_17726_17846_19416
878350	contig_11656_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_53960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTCAAAAGCAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141907	143440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_141900_143400
878351	contig_4686_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_118594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATGAAGAAGAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847752	846414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_846400_847800
878352	contig_6873_pilon	+	2182	22	Intergenic	novelGene_129804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	84.5925810098307	2	67	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	378	1736	80229	168570	TRUE	60	CATAAAAAATTTCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGPIQDGVTRPMTAVRAAGFTKAALRGSAFDPLGQSRGPAPPLEAKNEDSPEEKIRQLEKKVNELVEESCIANSCGDLKLALEKAKDAGRKERVLVRQREQVTTPENINLDLTYSVLFNLASQYSANEMYAEALNTYQVIVKNKMFSNAGRLKVNMGNIYLKQRNYSKAIKFYRMALDQIPSVHKEMRIKIMQNIGVTFIKTGQYSDAINSFEHIMNMAPNLKAGFNLILSYFAVGDREKMKKAFQKLIAVPLEIDEDDKYISPSDDPHTNLVIEAIKNDHLRHMEHERKAMAEKYIMTAAKLIAPVIETSFAVGYDWAVQLAKHHLWKKLYFPYCTLNVKFDINQVTTCVEVVKASQYVELANDLEINKAITYLRQKDFNQENEFAQASSYADSAVNSDRYNPSALTNKGNTVFANGDYEKAAEFYKEALRNDSSCTEALYNIGNLPIRS	44062	182206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_44160_56254_56351_60382_60446_78981_79039_80164_80247_80868_80933_81660_81731_82282_82374_87152_87258_88729_88833_89952_90068_98684_98917_100247_100319_110338_110426_122090_122184_145151_145252_165726_165918_168551_168659_170368_170520_172084_172201_180266_180320_182168
878353	contig_8822_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_117934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	2	394	104585	104193	NA	30	AGTAGAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASVPRGSLGEFRVFSSNPELRVPSGPASSPPRVRGSLRRFKAQHLLAVVPDPRLLPVKPAPRPVARPPCFRNCGSRLPFCCLTFADRSPPRVRKGPAGEPPLHPPVPSLWPSGRPRPRSTAQDRVGKFF	104586	102957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_103000_104600
878354	contig_1230_pilon	-	2084	8	Intergenic	novelGene_28863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	396	722	408595	407721	TRUE	20	GTTCAATGAGACCGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408990	404463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_404519_405233_405455_405712_405914_406381_406930_407146_407348_407584_407787_408002_408234_408565
878355	contig_11265_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_174508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23978	24695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11265_pilon_+_24000_24700
878356	contig_10642_pilon	+	1648	2	Intergenic	novelGene_78751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTTGTCAGTCCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1374360	1378578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1375887_1378456
878357	contig_9931_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_134842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	624	3	626	364112	364735	NA	40	CCGTAGCAGTGAAAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQ	364109	364736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_364100_364700
878358	contig_10446_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_162472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTTTTTCTCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689795	687168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_687200_689800
878359	contig_7308_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_159599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCTAAAAAGAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489931	491675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_+_489900_491700
878360	contig_7272_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_25425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCACATGCACACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963089	960754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_960800_963100
878361	contig_3942_pilon	+	1093	4	Intergenic	novelGene_128858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	11.2249721603218	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCGGGTTGTGATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1484814	1486668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1485120_1485242_1485334_1485696_1485765_1486039
878362	contig_10431_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_117394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGCTGACCCATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50650	52368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_50600_52400
878363	contig_10734_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_51264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	533	1602	188	1789	1294645	1296246	NA	20	AATGCTTGAGTCTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDQIKRLATENLLLAKDKDEIIQKLQSSYEELVKDQKALVQEIEDLTTEKKSALEKQCSLDTMCLALKIERNNLLQNNKDLQFEKDSLLQGQEKLNANLEATLQAKQQLSTEARELHTRLDDAGKALRKTELETLQLQATNTSLAKLLEEIKTSREITDSECIQLLHEKETLASSERRLLAEKEELLSENKILTEKLNKCSKEAVHIEMSLSEKITYLTSEKEMACQKINKLKKQQESLLREKSTLEMQNGDLLAERENSIKAIGELKRKYDQESTNRRIIIHEKMKLLGSLDALKKELQERKKENQELVASKCDLSLMLQEAQNARKNLEKEHTSILQAKESLDVELKTCCSENNILLRDGLNLQEECQKLNEDIRAVQQSLLLEKEARAKEKESSLYENNKLHGRIVLLEQEVQELTACTKELQSEKFVLIQEKTKSEQKVAEIIKEKELLRAETAQLATNIETLKSDFATLSKSKLELQELHSCLTKILEDLRLNHEVTLAEQAKVVQDNKDLLTEKREMMLEKDELLKEKEKLAESYFILQKEISQLAKTNSHISANLLESQNENRTLRKDKSKLTLKIRELETLQTFTVK	1294457	1296857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1294500_1296900
878364	contig_14300_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_133122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	26	81	285	365	353877	353797	NA	10	GCATTCAGTTTTGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHQTDSGPHPGTLGRRAPACLLSGALSGLPLGPTSSPRTWCFLSQPGWSVVGQLRGDFDPCPTPFPPLASLVPWPSLQARSLLSVELQAFSLAWMKGASGALEAYPPGAYPPGLPGCGCV	354161	353301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_353300_354200
878365	contig_6445_pilon	-	2650	2	Intergenic	novelGene_76981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	623	934	400824	400513	TRUE	5	TGTGCGTCCCTCCTCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPCQERLMLGVPAQRGYFKCPGVSEARTHPCLGLSVSHTCRGQEPPGEWTVTVSGTYFSYLQVRRVSQTTGFRDGDHSSRFGNLKSLLQKQVFCFSCAIFTS	401446	398729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_399210_399276
878366	contig_20378_pilon	-	1016	6	Intergenic	novelGene_159570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	381	junction_5	66.6735329797364	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	468	755	74410	69827	FALSE	35	TATAACCATCCAGAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGWQQKSKGPKKTAKSKKKKPLKKKPTPVPLPQSKQQKQKQANGVIGSEAVVKEDEEEVSDKGSDSEEEETNRDSQSEKEDGSDRDSDREQDEKQNKDDEAEWQELQQSIQRKERALLETKSKITHPVYSLYFPEEKQEWWWLYIADRKEQTLISMPYHVCTLKDTEEVELKFPAPGKPGNYQYTVFLRSDSYMGLDQIKPLKLEVHEAKPVPENHPQWDTAIEGDEDQEDSEGFEDSFEEEEEEEEDDD	88101	69565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_69971_71103_71209_74371_74471_78344_78447_80157_80317_87955
878367	contig_20378_pilon	-	1245	6	Intergenic	novelGene_159571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	381	junction_5	66.6735329797364	6	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCTTTGTTATAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88340	69575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_69971_71103_71209_74371_74471_78344_78447_80157_80317_87955
878369	contig_1948_pilon	+	3220	1	Intergenic	novelGene_31162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	514	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTCTATTTTAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468414	471634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_468400_471600
878370	contig_10002_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_157660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTCCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425125	426158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_425100_426200
878371	contig_7840_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_68955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	392	1179	105	1283	99675	98497	NA	50	TTTAAAGAAGAGAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHFYRRLWEREAVLVRRQDHNYYQGLFSTADLDAMLRNEDVQFGQHLDAARYINGRRETLNPPGRALPAAAWSLYQAGCSLRLLCPQAFSTTVWQFLAVLQEQFGSMAGSNIYLTPPNSQGFAPHYDDIEAFVLQLEGRKLWRVYRPRVPTEELALTSSPNFSQEDLGEPVLQTVLEPGDLLYFPRGFIHQAQCQDGVHSLHLTLSTYQRNTWGDFLEAVLPLAVQAAMEENVEFRRGLPRDFMDYMGAQHSDSKDPRRTAFMEKVRVLVARLGHFAPVDAVADQRAKDFIHDSLPPVLTDRERALSVYGLPIRWEAGQPVNVGAQLTTETEVHMLQDGIARLVGEGGHLFLYYTVENSRVYHLEEPKFLEIFPQQADAMELLLRSYPEFVRIGDLPCDSVEDQLSLATMLYDKGLLITKMPLTLN	99779	97881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_97900_99800
878372	contig_11145_pilon	-	1830	4	Intergenic	novelGene_160528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	63.9739530329857	66	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	31	429	284014	180309	FALSE	70	TATATTTAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRVELWGLCMPLGCRAGSRRSLTMAPQGLLPSRMALRGMLLGLLMVSCFTFCSSHQNSKEFALTNPEKSTTKETERKTKAKEELDTKVLEVFHPTHEWQALQPGARSGECWKRDESDQALEDWGQHLFFSALELDLFYNVF	284044	178907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_180425_209147_209284_215605_215721_283982
878373	contig_854_pilon	+	1246	9	Intergenic	novelGene_36416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	97	300	1064699	1064902	TRUE	5	CCTCTCTTCTCTTCGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FESKWFISEIKCGNRESTRESQAQWGRETWTRMSVPCSQAFLEVLKSLFQVSQGHLRSGDGVVDPVVVLLGDVQLPGEEAFLGREASGLPHHELHILVR	1064602	1075822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1064974_1067168_1067220_1067525_1067661_1069791_1070045_1070782_1070849_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075393_1075804
878374	contig_14415_pilon	+	1604	2	Intergenic	novelGene_77615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_38018
878375	contig_10446_pilon	+	3113	1	Intergenic	novelGene_162475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAGTAGTAAAGATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715936	719049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_715900_719000
878376	contig_8354_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_24151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATATATAACAGTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549381	547915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_547900_549400
878378	contig_10749_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_133465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146298	147908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_146300_147900
878379	contig_8907_pilon	+	2576	2	Intergenic	novelGene_85856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAGATGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788143	792062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_788937_790279
878380	contig_2444_pilon	-	1725	2	Intergenic	novelGene_83780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACTTGGTTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247867	244814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_245819_247146
878381	contig_11986_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_69112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAGAAGGAGCGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88788	86902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_86900_88800
878382	contig_9406_pilon	-	2901	1	Intergenic	novelGene_136159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTAAGTTGATGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42738	39837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_39800_42700
878383	contig_8898_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_137257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGAATAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339341	337426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_337400_339300
878384	contig_16594_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_53865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACATCCCAGAATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143878	141549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_141500_143900
878385	contig_15442_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_119146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAATTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244713	247319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15442_pilon_+_244700_247300
878386	contig_12425_pilon	-	1430	4	Intergenic	novelGene_46675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	514.964292181722	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTGCTTTCTGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226620	203275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_211048_211200_226517
878387	contig_12425_pilon	-	2050	10	Intergenic	novelGene_46681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	730.781992791047	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	512	1105	208662	204225	FALSE	15	CTTGAAATTTGCTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226588	203279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209395_209497_210302_210389_211048_211200_226517
878388	contig_4364_pilon	+	3204	1	Intergenic	novelGene_21	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAGGGTCCAACATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260127	263331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_260100_263300
878389	contig_13037_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_155153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	293	895	74185	73583	NA	20	TCTTCTCTAGAAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGLARNGAPAAPEGLCGGDSSFRSSLSPRKAVCGRPITSWSSVSGDPFPASWVPPSPKSLAAGRQLEPTQQLRGRKDLAMCPRKDYSLGNPVGQCSSFTLGRYESKVVDWTAQQRGVKFPRKCHPVGARSLLLRFSVSAGGNADPGGRRASPTSSVTCGELKRRRGPEAGRDLQDAGHIWEAQSSLFHAIGSIPTFST	74477	72442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_72400_74500
878390	contig_10749_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_133489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167765	168876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_167800_168900
878391	contig_9389_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_83953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTAAATAAAATTTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204210	204675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_204200_204700
878392	contig_10752_pilon	+	2713	2	Intergenic	novelGene_153037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_1	0	233	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	70	315	182954	186792	FALSE	15	TCTGCTATCGTGAGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAWLLPGRVGHQEKTSAAAGAGMSRSSKVVLGLSVLLTAATVAGVHLKQRQDQQRLRDGVIRDIERQNRKKENIRLLGEQIILTEQLEAEREKMLLTKGSQKT	182884	189190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_183050_186642
878393	contig_13258_pilon	-	2029	2	Intergenic	novelGene_146931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAAGTCCACCAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137806	128270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_129005_136511
878394	contig_4364_pilon	+	1535	13	Intergenic	novelGene_122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_9	44.0216960398191	127	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	21	1046	1085936	1089743	TRUE	10	TGTGGCGTGAGGGGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCYTPMLHAQVFVRDANYRKENLYCEVCPEDRPLIVQFCANDPEVFVQAALLAQDYCDAIDLNLGCPQMIAKRGRYGAFLQEEWDLLQRMILLAHEKLSVPVTCKIRVFPEIEKTVRYAQMLEKAGCQLLTVHGRTKEQKGPLPGPASWEHIRAVRKAVSIPVFANGNIQSLRDVERCLQDTGAQGVMSAEGNLHNPALFEGRSPAVWELAEEYLELVRQHPCPLSYVRAHLFKLWHHTLQVHQQLREELAKAKTLEDVGEVSQALRLQCQEDMSRQKEGEKPSGGLPFFHWICQPYVRPGPKEGSKENSGAAGSKRALEEEDGGPPRSPFQEQTEEETEEPPQDL	1085915	1091437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1086032_1086242_1086352_1086688_1086740_1087122_1087236_1087478_1087562_1087695_1087800_1088440_1088586_1088829_1088927_1089016_1089106_1089604_1089758_1090575_1090614_1090910_1090987_1091076
878395	contig_13760_pilon	-	1791	6	Intergenic	novelGene_61343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.85472369909914	25	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	36	710	345059	339807	FALSE	15	CCATGTGACAGGCCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQALLAHLPRYMQHLQRHPHSLLARLLGVHSLRVAQGKKKYFIIMQSVFYPAGRISERYDIKGCEVSRWVEPAPEGSSVVLVLKDLNFQGKTIDLGPQRSWLLRQMELDTTFLQELNVLDYSLLMAFQCLHEDERGPGSNLIFRMARSVQGTPSQEELGAQNRRLLPDTPNALHILDGSEQRYFLGLVDLATVYGLRKRLEHLWKTLRYPGRTFSTVSPARYARRLCQWVEAHTE	345094	338725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_340075_342684_342839_343103_343217_344203_344260_344354_344390_345010
878396	contig_14744_pilon	+	3138	15	Intergenic	novelGene_65963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	64.9777041824065	152	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	5	1708	672404	690470	FALSE	45	TTTTTTCCAAATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMVETVFGAGPGDPSAEAPVCPLLPTAGVNKTPTVDCRDVCGLNISDRCDFIRTNPDCRNNGGYLNYLEGIFCLFPHSLLPLAITLYAIWLLYLFLILGVTAANFFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPRTAGLAFGALFGAGVLVTTVVAGGIAILRPFTAASRPFLRDIIFYMVAVFLTFTALYFGRVTLAWALGYLGLYVFYVITVVLCTWIYRWQQRKSLVYSMPGTPELLSDAEDERVSSNTNSYDYGDEYRPLIPYQETTAQILARALNPLDYRKWRNKSIYWRALKVFKLPVEFVLLLTVPVVDPDKDDHNWKRPLNCLHLVTSPLFCVLTLQSGAYGLYEIGNLLPVWAVVVIAGTGLATVTFFATSNYEIPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILQSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFLDLTLARQGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLHISRGHVEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVFSLVLVPVQCFQLNRAYGVCLLVFYLTFLVVALLTEFGVIHLKSV	672399	691900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_672509_676648_676802_676890_676944_677450_677509_677640_677747_677830_677999_679115_679224_680114_680175_680454_680586_681605_681748_682728_682851_684300_684455_685277_685359_686995_687061_690272
878397	contig_5451_pilon	-	518	1	Intergenic	novelGene_167155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCACAGCTTTCCCGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75497	74979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_75000_75500
878398	contig_10299_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_79766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGTAGTTCCAGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581234	582914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_581200_582900
878399	contig_10930_pilon	+	408	4	Intergenic	novelGene_37118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7400	junction_3	6465.72034312926	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	22	387	339823	342083	FALSE	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339801	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339921_340994_341098_341522_341625_342020
878400	contig_10930_pilon	+	552	6	Intergenic	novelGene_37094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8252.18981846637	3319	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	119	526	339645	342083	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKPASSIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339418	342109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339665_339800_339921_340994_341098_341522_341625_342020
878401	contig_15867_pilon	-	1481	13	Intergenic	novelGene_170894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	52.2650828841674	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	308	1480	116805	99711	FALSE	40	TCGTGACCAAGTTCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVDEQNAQTQEQEGFVSSLSESEEKKDLKPDDRVGRPPPPSENCGVSKGRSHRKVSKSPCEKLISKGSLSVGSSASLPPQAGSRDTLPALNTKILYPHVRAGMSGSLPGGSVISRLLINADPFNAEPENLEYYTEKCVMNNYFGIGLDAKISLDFNNKRDEHPEKCRSRTKNMMWYGVLGTKELLHRTYKNLEQKVLLECDGRPIPLPSLQGIAVLNIPSYAGGTNFWGGTKEDDTFAAPSFDDKILEVVAVFGSMQMAVSRVIKLQHHRIAQCRTVKISVLGDEGVPVQVDGEAWIQPPGYIRIVHKNRAQTLTRDRAFESTLKSWEDKQKCELPRPPSLSLHPEVLSEEESTQMSQFGQAAGALIHSIREIAQSYQDMEQELAHAVNASSKAMDRVYGKPWATEGVNCTFVLEMVNNIKALRSETELLLAGKVALQLDPPQKERLAVALAEMDLQLRKLADTPWLCQPPEPGDEENVMLDLSKRSRSGKFR	118862	99709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_99759_105720_105841_106645_106739_106811_106924_108050_108203_109124_109260_110201_110316_111390_111499_111731_111829_113967_114079_116722_116820_117785_117915_118698
878402	contig_5917_pilon	-	2766	17	Intergenic	novelGene_122166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_16	209.883152015592	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	542	2584	759810	699492	FALSE	30	TAGCCGGCACCTTAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETPTATGKEELKKEVNNDVNFKKGHAGAPDNEKRSESQGTAPTFKEKLQDVRVAEGKKLLLQCLVSSDPPATITWTLNGKTLKTTRFIILSQEGSLCSVSIERALPEDRGLYKCVAKNSAGQAECSCQVVVDDAPTSENAKAPGTKSRRPKSSLSTVLGTESDATVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENIRQEIGIMNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	801460	699309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_793276_793394_801176
878403	contig_9633_pilon	+	942	1	Intergenic	novelGene_139621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTTGAAGGTGTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031295	1032237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1031300_1032200
878404	contig_9785_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_157907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553247	551188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_551200_553200
878405	contig_7697_pilon	-	416	4	Intergenic	novelGene_128272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_3	37.1513421321791	7512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	17	349	120699	118914	FALSE	15	CTTTCTGGCTCTCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRKRMRSRPGRPRYTFTSPRRSGPLRCLPPAADCASGARVRDKMVPPVQVSPLIKLGRYSALFLGVAYGAKRYNYLKPRAEEERRIAAEEKQQQDELKRIARELAEAQEDTILK	120715	118846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_118940_119437_119537_120216_120272_120546
878406	contig_10104_pilon	-	3657	21	Intergenic	novelGene_160130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	71.3595648809604	125	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	877	2634	316	2949	615844	409372	TRUE	55	AAGTATTGAACTACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAANMMENLRLPALQVPEPQAAPEGSPVWSSSSTPTLRRRRFKMRRMKNVQEQSLEAGLARDLPSVLDPGKEFLQLPSIEITPSSDEDTPWSNCSTPSASPRRKRFLLRKWLRVRERKECSESSSQQSSQQSSHDDDSSKFLSPRVREESTASNSNRSTPACSPILRKRSHSPTPQNPDGDTMVEKGSDHSSDKSPSTPEQGVQRSCSSQSGRSSGKNSKKSQSWYNVLSPTYKQRNEDFRKLFKQLPDTERLIVDYSCALQRDILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETLLTVRLKDICSMTKEKTARLIPNAIQVCTDSEKHFFTSFGARDRTYMMMFRLWQNALLEKPLCPKELWHFVHQCYGNELGLTSDDEDYVPPDDDFNTMGYCEEIPIEENEVNDSSSKSSIETKPDASPQLPKKSITNSTLTSTGSSEAPVSFDGLPLEEEVLESDRPLERELAIDNIIAEKIEIIAPVNSPSLDFNDNEDIPTELSDSSDTHDEGEVQAFYEDLSGRQYVNDVFNFSVDKLYDLLFTDSPFQRDFMEQRRFSDIIFHPWKKEENGNQSRVILYTITLTNPLAPKTATVRETQTMYKASQESECYVIDAEVLTHDVPYHDYFYTINRYTLTRVARNKSRLRVSTELRYRKQPWGLVKTFIEKNFWSGLEDYFRHLESELTKTESTYLAEMHRQSPKEKASKPPTVRRRKRPHAHLRVPHLEEVMSPVTTPTDEEVGHRIKHVAGSTQTRHIPEDTPSGFHLQSVSKLLLVISCVLVLLVILNMMLFYKLWMLEYTTQTLTAWQGLRLQERLPQSQTEWAQLLESQQKYHDTELQKWREIIKSSVMLLDQMKDSLINLQNGIRSRDYMSESEEKRNRYH	616159	404238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_404943_409367_409462_411483_411602_411923_412032_419123_419215_420361_420566_421200_421305_423236_423380_423658_423778_425197_425342_427016_427207_434074_434232_436275_436392_438698_438780_440027_440124_440917_441022_441549_441635_451928_451950_458388_458600_574733_574812_615470
878407	contig_7254_pilon	-	586	3	Intergenic	novelGene_145845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTTTTGTGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217146	214655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_214736_215025_215125_216739
878408	contig_20878_pilon	+	878	3	Intergenic	novelGene_173441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_1	507	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	310	531	22404	24270	FALSE	75	GAAAGAAAAAAAACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLKTGVPPDSNNETCTAGAGSLLVEFGILSRLLGDSTFEWVARRAVKALWNLRSNDTGLLGNVVNIQTGRWVGKQSGLGAGLDSFYEYLLKSYILFGEKEDLEMFNAAYQSIQNYLRRGREACNEGEGDPPLYVNVNMFSGQLMNTWIDSLQAFFPGLQVFWGHICKKGTLVWCSG	20157	24617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_20339_22275_22451_24095
878409	contig_500_pilon	-	1476	4	Intergenic	novelGene_31102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	2.62466929133727	16	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	52	579	1529324	1524979	FALSE	65	AAGAAAAAACAAAGATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLDVHHVEADVTFFNTLMRKKSKLGDLEGAKALLPVLAKRGLVPNLQTFCNLAIGCRRPGDGLQLLADMQKSQMTPNTHVYSTLINAALKRLDYAYLIDILKDMRRNNVPVNEVVIRQLEFAAEYPPTFDRYKGKNTYLEKIDGFRAYYKQWLKVMPAEEIPHPWQKFRSKPKQGDQGSMMEADVDRGLGGR	1529375	1524081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1525165_1526927_1527111_1527575_1527693_1529282
878410	contig_5569_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_86763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAATCCAGTTTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537479	538926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_537500_538900
878411	contig_10958_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_5339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCACCTCTCTCCGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568295	570772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_568300_570800
878412	contig_5423_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_85164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAAGAAAGGTCCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60485	59479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_59500_60500
878413	contig_6344_pilon	-	927	3	Intergenic	novelGene_157107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_2	20.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	22	621	992867	991066	FALSE	50	AAAAAAGTTTTATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSRKQPMSATLRERLRKTRSSFNSCYSVAKRLKVENEESDQIFSEKPVSSTEENRLEFQESFKHIDSDFEESTYLKNTFKNISVCESKSLDIGSCNALQNDFVNENLPIQGLKEEKAKLVKQVQEKEDFLRRLKLVKMYRSKNDLSQLQLLIKKWRNCSQLLLYELQSAMSEENKKLSLTELIDHYGLDDKLLHYNRSEEEFIGV	993918	990759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991258_992459_992871_993900
878414	contig_3818_pilon	-	2269	20	Intergenic	novelGene_99319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	12.4152528832531	27	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	13	2079	1192428	1141426	FALSE	35	TACTGTCATATCTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARRPRDPLQALRRRNQELKRQVDSLLSESQLKGALEASKRCDIYQRCIQLKRAIDENKNTLQKLSKADESAPVGNYSQRKEEERDLLDKLTHQLQELAVAISRESITETGTLTEREEDDDSAEEGDDEEDEEDDEDNSEECGEEEKGTEEEEKQGNESHRQAARGEYVAVGDFAAQQVGDLTFQKGEILLITEKQPDGWWVAENAKGNKGLVPRTYLEPNNKEKGEESSEEGSEEDVEVVDEAADGAEVKQRAGSHWSAVRKSISEQINTVDVLTTMGAIPAGFRPSTLSQLLEEGNQFRACYFLQPELTPSQLAFRDLIWDGKAGTIRSRTSRISLILTLWSCKMIPLPGTSIQVLSRHIRLCLSDGSKVLSNIHTVRATWQPRKPQTWTFSPQVTGILPCLLDGDCFIRSNSSSPDLGILLELGISYIRNSTGERGELSCGWAFLKLFDTSGIPIPTRTYELFLNGGTPYEKGVEVDPSVSRRAHGSVFYQMMTMRRRPQLLVKLRSVSRGWRSTLSLLPETLIGSMCSVHLLAFYRQILGDVLLKDRMSLQSADLISNPVLATFPRLLEQPDIMDALRSSWAEKESTLKRSEKRDKEFLKATFTLVYHDCVYPLIHSTLLPPFRWAEEETEATRWRLIADFLKQNQEKEGALQALLSPEGVHEPFELSEQTYDFLGEVRKNAA	1192440	1141235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1141699_1143317_1143363_1148619_1148694_1151183_1151297_1157549_1157650_1158474_1158552_1160426_1160510_1161592_1161704_1165698_1165774_1174960_1175090_1175283_1175379_1178427_1178516_1179384_1179428_1179757_1179859_1180747_1180850_1182074_1182304_1184086_1184212_1185851_1185913_1188054_1188129_1192359
878415	contig_11720_pilon	-	1483	2	Intergenic	novelGene_43773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACCCGGTCCCCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78057	67786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924
878416	contig_12081_pilon	+	1107	5	Intergenic	novelGene_166974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	626.654609813093	9	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	115	750	16400	18277	FALSE	45	GTAATAAAATTATGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15768	18634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
878417	contig_4884_pilon	+	1271	2	Intergenic	novelGene_63830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGAAAAAGCAATGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581247	584098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_582486_584065
878418	contig_12884_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_105021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	303	912	1	912	1234234	1235145	NA	15	CTCGAAGGCTGTGCCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGGAGAADAVGAVVALAGLGSSLHQTQPRALFHHAAVQRVLVGDLELGLGTGEILGVGTDVTQLLGGAGVHGALLEGLVKWHAARSTGLNQPTCQVLHLQEALAGLVVEPALLECLGRRHLGLGAWVLEAAEGLLGQADAVHHDLVHQALVDGLGDREALARAGVDDAAGAGLCFQQPLPRYVVHQVAAHGLGDGHLLQCLRVEDASHRARLLRGVRPGGQLGAGDSGAERVGGGGADRGGAGAEATGIAREHVGELSDGERAGAVLVQCRAVNEVLGNGLVDIVLAAGAPVDDHGLDNTI	1234233	1235805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1234200_1235800
878419	contig_5602_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_133034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTCTAATCCATCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582971	585322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_583000_585300
878420	contig_13110_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_138743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCCAAAATTAATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513349	514297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_513300_514300
878423	contig_3818_pilon	-	3301	1	Intergenic	novelGene_99225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAATAAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281429	278128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_278100_281400
878424	contig_4732_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_75477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	16	51	276	326	704638	704688	NA	40	AAAAAAACCAGTTGCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEGDCGAGGDVASPEGDAPQGLELQLLLQDLPHLTLLRPFLHLLPPDHIHILGGQDQVPLDGLWDTGPEAGGWSPGHGHPDPSGSTPGSGMVLVDQVKVCRSGECV	704362	707255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_704400_707300
878425	contig_6375_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_73001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAAAATGGCGGCAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324834	325899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_324800_325900
878426	contig_4364_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_4565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGCCAGAAGGATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539796	1538558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1538600_1539800
878427	contig_5039_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_65062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTATTTCCTTACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1839143	1840135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1839100_1840100
878428	contig_15031_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_138403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAGAAAGAAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80957	83119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_81000_83100
878429	scaffold_12124_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_22154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGAGCCTCCAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976112	977389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_976100_977400
878430	contig_8202_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_177151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACGGGGCGAGTAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84275	82126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8202_pilon_-_82100_84300
878431	contig_960_pilon	-	885	4	Intergenic	novelGene_108202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	3.39934634239519	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	515	817	97371	97069	FALSE	10	CCTCCCGCTGATGTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFYLYPFTCRAVNWLGENEAYVQLIHPVRDCQTHVIGIFVTLTVAIACSIFVYKIFKVDIVLWYRDSCYDFLPQKASDGKIYDAYILYPKTVEKGSTTNSDIFVFKILPEVLEKQCGYNLFIYGRDDYVGEAIVEVIDENIRKSRRLIIILVQDALGLSFLGNTSEEQIAMYSALIRDGIKVILLELEKIQDSEKLSESIQFVRQKHRAIRWSGDFTEKSQSAKTRFWKNVRYHMPAQRKMPSSAQNLLSVATSPDSMEKFQGEVHVPLG	102843	97000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_97488_98374_98543_99736_99881_102757
878432	contig_16322_pilon	+	2745	3	Intergenic	novelGene_87554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1111	junction_1	418	929	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATTGCAATGGCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109146	113391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_109295_109541_109618_110870
878433	contig_7568_pilon	-	2145	16	Intergenic	novelGene_173995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	220.448532668184	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	838	1821	58460	15487	FALSE	65	AAAAAAAAAATTCTCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTHVSRQCQPTVSSHSETAAIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNLHGSPRSAVVRRSNTSPLGFRRLGSCTPVPADPVQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHPHVHESRSRNSSGSPVPQAQSPQSLLLGARLQSTPTLTDIYQNKQKLRKQHSDPVCPSHARAGYSYSPQPSRPGSLGASPTKHMGSSPRSSDWFFKTTLPTIIGSPTKTIAPFKIPKTQASSNLLALVTRQGPSEGQSRDGNDPRECSHCLPVQGGERQRAEQQNKTVFGRSVSTGKLSDQQIKTPLGGQLHQGSTDSLNTERPMDIVFY	126606	15162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_15498_16679_16790_18066_18255_18619_18907_20827_20909_28445_28592_50582_50721_58437_58581_64619_64681_93727_93897_103969_104059_104596_104645_116677_116761_119295_119398_125890_125965_126515
878434	contig_1275_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_108782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACAGGTATCAAATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448293	449220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_448300_449200
878435	contig_9373_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_162725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCTGTGAAAGACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253083	254792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_253100_254800
878436	contig_15120_pilon	+	1613	3	Intergenic	novelGene_108001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	21	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	228	371	133328	135381	FALSE	30	GAGGAAGATAGTCATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVLQIVSVPDVCNLVCVALGNLEIREIRALLCSSNDGSEKQLLLKSGNIKAVLGLTKRRLVSSSGTLCDQQVEIMTFAEDGGSKEKQFLMPPEETILTFAEVQGMPEALLGTTIMNSIVIW	132848	136623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_132937_133188_133351_135260
878437	contig_6217_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_109568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAGCATGGAGATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56191	58112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_56200_58100
878438	contig_13876_pilon	-	1083	3	Intergenic	novelGene_174241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	759	1082	29723	9277	FALSE	45	AAAATCATGAAGGAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPAPWLWECHLVPLHLGVLQARSAPVTCAALAETRHSLHYERGLQHHGAADSLGLYHSHREDLITLLEPPIQGRSPILFDTADVDAIVIGDILLICPTDDVEAQP	30481	9275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_-_9425_27487_27578_29637
878439	contig_9785_pilon	-	2017	1	Intergenic	novelGene_157904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	88	432	539103	538759	NA	50	CTGTTATCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVEGKDLFFPAFRSTLHPADGLIQDGVGTQQCIPKIEFLLPPLFLILYLMCLDHLEVLHINAAISGAREADVVAEVAEQGVYGVRGSELLGGDVHNLGHLPIGPLQLTVFQT	539190	537173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_537200_539200
878440	contig_3103_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_146186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59459	60092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_59500_60100
878441	contig_16110_pilon	-	1276	10	Intergenic	novelGene_126768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGAGAAAATACATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57395	6055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_6193_7704_7767_9528_9613_14411_14537_32690_32770_53174_53330_54083_54157_55827_55974_56199_56572_57352
878442	contig_3153_pilon	-	1784	2	Intergenic	novelGene_104709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAAGTCCTGGTGTACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501396	491251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_491477_499837
878443	contig_12142_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_147794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATCCAACTGCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36320	34142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_34100_36300
878444	contig_11026_pilon	+	635	1	Intergenic	novelGene_167678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCCAGCAGATAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219518	220153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_219500_220200
878445	contig_12540_pilon	-	2720	12	Intergenic	novelGene_148080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1326	2135	950958	941521	TRUE	25	GAACTTCCCAAAGCGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNHLCHPGTLSRGSDLDGLRSCSPVQFFRCGAGCSLRLSWVISDARAICTCRLLGPLSPQPSSLPQHSHSMHGGPQHGPAEHGHGVHANELAYIGAITASQESHDVRPHVVHVLLPEVLDLVLDPPCEVLDDEGRLHYRRAQEVLVVLVLLLELGQQGLARGMGEAALLVQQVEEASGLPADEVNTAHIVCVVNVVPSDAFALVLLLLQFENVLIKVILKLLIGVVDAELFKAVPLEVFKAEDVEYPNGEALHRLLHVLLVEEGVVDP	952283	924469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_924506_930420_930484_932604_932704_935002_935107_937837_937966_939377_939468_941455_941573_941790_941924_944551_944675_947805_947949_948988_949190_950800
878446	contig_8304_pilon	+	1627	2	Intergenic	novelGene_153184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTCCTATCCACGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155468	161213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_156407_160524
878447	scaffold_13505_pilon	-	1853	9	Intergenic	novelGene_111634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	277.678208543631	235	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	680	1435	751788	746784	FALSE	10	AGTTCGGCTCTGTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSATFVTISSPLATQIPQAVGAAYAAKRANDNRVVICYFGEGAASEGDAHAGFNFAATLECPIIFFCRNNGYAISTPTSEQYRGDGIAARGPGYGIMSIRVDGNDVFAVYNATKEARRRAAAENQPFLIEAMTYRIGHHSTSDDSSAYRSVDEVSYWDKQDHPISRLRHYLLNRGWWDEEQEKAWRRQSRKKVMEAFEQAERKLKPNPSLLFSDVYQEMPAQLRKQQESLARHLQTYGEHYPLDHFEK	772696	746365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_746955_747638_747811_748008_748151_748398_748606_751724_751888_755081_755191_760393_760557_760653_760837_772571
878448	contig_1443_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_28265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAAAAGAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738439	737228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_737200_738400
878449	contig_9195_pilon	-	2135	5	Intergenic	novelGene_155679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	66.9813406852983	55	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	68	562	289038	285852	FALSE	25	TGAGCAAGGCAGTTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSTSFTPVPSQRIVKVPVVLEMSLVLRNLQRVVPIRRVPLRKKIEIVRSILGVQKFDLGVICVDNKNIQHINRIYRKKNVPTDVLAFPFHEDLKAGEIPQPDLPDDYNLGDVFLGVEYIFQQHKENEDYYDVLTVTATHGLCHLLGFSHDTEAEWQKMFQKEKQVLEELSRHTGTRLQPLSRGLF	289521	284278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_285939_286957_287027_287311_287441_288828_289081_289496
878450	contig_5967_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_44423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTTCAGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517596	516281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_516300_517600
878451	contig_3382_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_124220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACTATAGTATAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1836705	1837824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1836700_1837800
878452	contig_16622_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_48502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTTGTATGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126393	128156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_126400_128200
878453	contig_11160_pilon	+	979	5	Intergenic	novelGene_168851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	16.3859696081739	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	36	425	796774	820083	FALSE	25	TTTTTTACGTAACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPVRVKTWVEENRASFLPPVCNKLLHQEQLKIMFVGGPNTRKDYHIEEGEEVVAHGQGSSKGPRQDVDVWLWQLEGSSVVTMRGQRLSLTPDDSLLVPAGTSYTWERAQGSVALSVTQDPARKKPLG	796738	820637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_796854_800250_800330_819563_819633_819808_819892_820004
878454	contig_16578_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_148634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGAAGAAACCTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131000	129497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_129500_131000
878456	contig_15610_pilon	-	1014	2	Intergenic	novelGene_154286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	275	637	705432	705070	TRUE	25	AACATACCCTCTGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRGPAWLRQDWKVHLSEEEWLLPQFCPSSSLLVVCHCSPKLWAGTLSRPASTVLLSWGIQGHSLLVSIPTTWHTLGSVLGSDVGWGGVRTSPVGDREGSRAYHSMTIEPPPSPPLCHFT	705706	695082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_695122_704731
878457	contig_3382_pilon	-	3100	1	Intergenic	novelGene_124184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1459	1890	966180	965749	NA	30	TTTTTCAGAAATCCATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWKKKPKPAAVKLTPTHGDPMCVTVELCSIGFSRAEFSEVDRQAFLPRHLWVDSNLQPFNWQSSTLTICTHTIATTMDSNISTIMLMVQDWATFYSVIRKAAMSQSQLDSNLQQPHEAKGGRDTQKLCSSNSYLLLLPPLSE	967638	964538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_964500_967600
878458	contig_13403_pilon	+	2448	1	Intergenic	novelGene_158094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAGAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73749	76197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_73700_76200
878459	contig_7870_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_109009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTTGCATTTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513105	515276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_513100_515300
878460	contig_8195_pilon	+	2097	22	Intergenic	novelGene_170067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	33.6276125606712	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1953	143	2095	534256	696875	FALSE	50	AAATATGCTTTAAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFFRRTLGRRSARKHAEKERLREAQRAATHIPAAGDAKSIITCRVSLLDGTDVSVDLPKKAKGQELFDEIMYHLDLIEGDYFGLRFMDSAQVAHWLDGTKSIKKQVKIGSPYCLHLRVKFYSSEPNNLREELTRYLFVLQLKQDILSGKLECPFDTAVQLAAYNLQAELGDYDLAEHSPELVSEFRFVPIQTEEMELAIFEKWKEYRGQTPAQAETNYLNKAKWLEMYGVDMHVVKARDGNDYSLGLTPTGVLVFEGETKIGLFFWPKITRLDFKKNKLTLVVVEDDDQGKEQEHTFVFRLEHPKACKHLWKCAVEHHAFFRLRGPVQKNSHRSGFIRLGSRFRYSGKTEYQTTKTNKARRSATFERRPSKRYSRRTLQMKANTARREELSVHNNVSTQSDGSQQACGLRPPLPVMSPLPCGPALAEKENVPRSPGVDPHDRKRLPLSTDLLDCPDLLETTIGDGTGARDTVETSQSLAEINGAAAPTGLEELQCGTLKDVSEKLKQLEVENSPSPSPRPNTDVNVNNQEEVVKLTEKCLNNAIESPGLNATRLPPDFKSNILKAQAEAVHKVTREDSVLSHKNASVQDAAANSAALNENSMSLPEAPLALMSATPTANGSALKDATDELDALLLSLTENLIGQTVTPQ	525462	696877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_525597_534247_534436_551137_551243_580786_580830_581801_581881_584304_584350_584526_584580_587421_587543_587693_587782_588879_588969_592367_592438_601841_602012_603190_603298_604597_604626_618381_618425_618848_618965_651928_652087_669043_669142_674477_674607_678347_678413_685905_685997_696800
878461	contig_11677_pilon	+	1780	12	Intergenic	novelGene_85980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	82.760632634421	77	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	173	1474	727781	737308	FALSE	35	TGATATGAAGTATGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSPVFPEVVRGKRAALFFAAVAIVLGLPLWWKTTETYRAPLPYSQISGLNALQLRLMVPVTVVFTRESVPLVDQEKLPFTVVHEREIPLKYKMKIKCRFQKAYRRALDHEEEALSLNSVQEAEATLAEPQEQPEGSLTVYVISERSSLLPQDMMSYIGPKRTAVVRGLMHREAFNIIGRRIIQVAQAMSLTEDVLAAALADHLPEDKWSSDKRRPLKSSLGYEITFSLLNPDPKSHDVHWDIEGAVQRYVQPFLNALSAAGNFSVDSQILYYAVLGVNPRFDPASSSYYLAAHSLPHVINPVESRLGSSAASLYPVLNFLLYVPELAHSPLYIQDKDGAPVATNAFHSPRWGGIMVYSVDPKAYNASGLPVRVEVDMVRVMEVFLAQLRLLFGIAQPHVPPKCLLSGPKSEGLMSWELDRLLWARSVENLATATTTLTSLAQLLGKISNIVIKDNVASEVYRAVAAVQKAAEELATGHLASAFLASSPS	727524	737614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_727688_727771_727884_729828_729919_730223_730316_731538_731747_732015_732159_732976_733092_734207_734354_735086_735188_735996_736208_736531_736612_737295
878462	contig_13226_pilon	-	1349	2	Intergenic	novelGene_175345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	291	362	183557	183486	FALSE	35	TTATCATCCATTGAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRRARARGVVASLRLRRRRTRAAAGVRGAGCCAPSSPLSPLWRVEEAEVVLGAPPSSSPSGDLSRPSRAARSLRRKTVPARIWLVGSRRFSLSRKMPKSKLDKRRNKDMTKRLLPKLL	187056	182498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_-_183600_186808
878463	contig_1521_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_145450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	674	994	168097	167777	NA	45	AAGAATAAATTTCTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSQATWLQGLTNQNWQFRPQATGSQGYGSWQIRSDDRPLAHGAVEVGESQNQQVIQQASGSGPKNWRSVNHEPDVGSRCTERGPHQVISIYTLDAGHTSGKAIT	168770	167046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_167000_168800
878464	contig_11227_pilon	+	895	1	Intergenic	novelGene_163208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGGTATGTATATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354315	355210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_354300_355200
878465	contig_8065_pilon	+	3917	1	Intergenic	novelGene_107351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	597	965	610785	611153	NA	30	TTCCAGAACTTCAGCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLRFRKVKKQVHITQLASQRAKTQTKAHLTPEPTTLATRQHGSLVILPERTCHPAPVRCLPPPPPTAPPAPGIRRPVICTLFPPPNPRRCQERSKRSFHALAPWLHDGLLLGTKPGLVST	610188	614105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_610200_614100
878466	contig_6102_pilon	+	1976	1	Intergenic	novelGene_31757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	42	129	269	397	290557	290685	NA	85	AAAGAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTDTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRPSPAYAKEDPKPQEGLPRSTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMGCHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHKVG	290288	292264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_290300_292300
878467	contig_13265_pilon	-	2754	1	Intergenic	novelGene_146003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTTTCACCTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72350	69596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_-_69600_72400
878468	contig_3380_pilon	-	1979	2	Intergenic	novelGene_60116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1381	1761	437532	437152	FALSE	50	GATAAAAAAAAATCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQWNSSPLAFTSSWNSSIVLVKLASILNMIQNSVIQYLQERSLKKKHHPKPKPETCTLVGSYRNLLPRKGLRQRLLCSVISFKELGLGYQGRKPRTGHLLPPHSKCFDRIMCIIIQGAMMKMSA	440814	436933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_437548_439449
878469	contig_5039_pilon	+	4611	1	Intergenic	novelGene_64987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCAATAATCCCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680531	1685142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680500_1685100
878470	contig_1948_pilon	+	1761	6	Intergenic	novelGene_31197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	10.6845683113545	11	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	746	1303	575612	579683	FALSE	40	ATACAGGCCAATGTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMKCIEERLQSTLSQSYHITKLTIKGSIQRMKQNLMGIQNDSTDLRQKMRKELTLEQIRNSIVSSPDHFPQLTLPKNQVSDKAGCLIEEICSTEIQVEMKTPTYELKIVKDENEKPLKIELIVELPGIDSVSLCDLSVSKDDVLIEVSEKYRLHLNLPESVDTEMTTAKFIKEKATLIITMPLV	569602	580141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_569912_571079_571303_574835_574960_575522_575769_577120_577387_579548
878471	contig_13966_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_158160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	12	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATACAGGGAAGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487547	484802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_486795_487193
878472	contig_19476_pilon	-	2598	18	Intergenic	novelGene_116803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_4	38.8313717569435	147	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	69	1967	173625	122075	FALSE	25	CTTTCAGTCTCTCTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEADEQHKHVEAELRNQLAALEMEATQHQAVVDGLTRKYMETIEKLQSEKAKLEVKSQALEKEAKECRLRTEECQLQLKNLHEDLSGRLEESLSIINEKVPFNDTKYSQYNALNVPLHNRRHQLKMRDVAGQALAFVQDLVTALLNFHTYTEQRIQIFPVDSAIDTISPLNQKFSQYLHENASYVRPLEEGMLHLFESITEDTVTVLETTVKLKTFSEHLTSYICFLRKILPYQLKSLEEECESSLCTSALRARNLELSQDMKKMTAVFEKLQTYVSLLALPSTEPDGLLRTNYSSVLTNVGAALHGFHDVMKDISKHYSQKATIEHELPTATQKLITTNDCILSSAVALTNGAGKMAAFFSNNVDYFIASLSYGPKAATGFISPLSAECMLQYKKKAAAYMKALKKPLLESVPYEEALANRRVLLSSTESREGLAQQVQQSLEKISKLEQEKEHWMLEAQLAKIKLEKENQRIADKLKSAGSGQLVGLVLENAAVLSAPGQEEAAAKTGPEPVQSTSLIGVLTRMSDSEVLDVDSREDLIKNHYMARIAELTSQLQLADSKSVHFYAECRALSKRLALAEKSKEALTEEMKLAGQNISRLQDELTTTKRSYEDQLSMMSDHLCSMNETLSKQREEIDTLKMASKGNSKKNKSR	173693	121443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_122105_124617_124747_126484_126584_128914_129032_130239_130273_136603_136847_139584_139678_142727_142881_146517_146646_150618_150712_158915_159053_162554_162644_162732_162835_165540_165691_167205_167259_172251_172347_173328_173388_173529
878473	contig_15545_pilon	+	2940	2	Intergenic	novelGene_120123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	676	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACTAGTATACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9188	29861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_+_9310_27042
878474	contig_6958_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_69962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCTCATATGGCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241132	242790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_241100_242800
878475	contig_2069_pilon	-	1471	3	Intergenic	novelGene_23412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	600	junction_1	109.5	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	67	420	1246500	1245519	FALSE	80	AAAAAATGAGAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKETIGVGSYSVCKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKHVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTISKTVEYLHSQGVSLGQGLGTRGVLPRIIPSAECKNHGLK	1246566	1244467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1245765_1246182_1246273_1246482
878476	contig_16775_pilon	+	1823	2	Intergenic	novelGene_107805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAGGAACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235858	240097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_235949_238364
878477	contig_13700_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_68258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAGTAGGTCAGGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9196	7473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_7500_9200
878478	contig_11594_pilon	-	1656	4	Intergenic	novelGene_80895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	89.7143615407626	26	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAACTTATTCATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142322	108375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_109521_111145_111377_114758_114833_142116
878479	contig_678_pilon	+	2251	7	Intergenic	novelGene_167853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	12.7758452644912	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	440	1282	564466	584886	FALSE	55	TATAAAGAAAGACAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFAGLVSHLFYHEPSNLVFVSFLVRGLFHDLCQPTREGSKHFSQDVMEKLVLVLAHLFGRKYIPAKFQDAALTFHQSKVFLDDLPEDFNAALHEHNMSATKDFASFLLIVSKLADMKQEYQLPLSNIDFAGKECEDSQLVAHLMNCKEGRKAISPFVCLSGSTDVDLLQPQAIDNVVLRTIGISGNQAPVLWPQQIDNKGGIMPLNAYALDFYKHGSLKGLVQDNRILEGEAYSLLKDFALTIKSISVSLRELCENEDDNVVLAFEQLSADFFEKFNKI	564026	585855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_564581_566184_566307_572217_572366_573690_573834_575511_575664_576042_576106_584786
878480	contig_10904_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_22500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315417	314030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_314000_315400
878481	contig_5389_pilon	+	1945	3	Intergenic	novelGene_143017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_2	16.5	13	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1323	1691	385302	386672	FALSE	20	TGTAAATGTTCTTCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIFLIDCPGVVYPSEDSETDIVLKGVVQVEKIKTPEDHIGAVLERAKPEYISKTYKIDSWENAEDFLEKLAFRTGKLLKGGEPDLQTVGKMVLNDWQRGRIPFFVKPPNAEPPAAPQVRR	383979	386926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_385386_386173_386333_386546
878482	contig_18364_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_102581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTGTTTGGGTTTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162308	164674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_162300_164700
878483	contig_4087_pilon	+	3398	15	Intergenic	novelGene_156066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_14	211.440359227381	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	6	1166	16169	113477	TRUE	65	TTTTTAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMGLSEVWRLTSKFNSFRRTHIILQHLAMSKHTNAAEEVLLERKGCAGVITLNRPKLLNTLTFNMVRQIYPQLKKWEQDPETLLIIIKGTGGKAFCAGGDVRAVSEAGKANKKLSQDFFRDEYILNNAIASCRKPYVALIHGITMGGGVGVSVHGQFRVATEKTVFAMPETAIGLFPDVGGGYFLPRLQGKLGYFLALTGFKLKGRDVHKAGIATHFVDSEKLDTLEEDLLALKSPSKENIADVLETYHAKSKIDQDKPFILEEHMDKINSLFSANTMEQIIEYLQQDGSSFAVEQLKMINKMSPTSLKITLRQLIEGSSKTLQEVLTMEYRLSQACMGGHDFHEGVRAVLIDKDQSPKWKPADLKEVTDEDVNNYFKSLGSNDLKL	16163	116969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_16204_24107_24151_31783_31925_33898_33984_45559_45641_51815_51869_67942_68022_82056_82203_84893_84981_87655_87715_88598_88681_105957_106078_110391_110426_113361_113479_114738
878484	contig_1276_pilon	+	2642	1	Intergenic	novelGene_159772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1620	1982	191672	192034	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSPIYNTVNSGKGISYVTNLNCAPCLNELKRFCFLYQSQARSLFPNVLNYIFSTQKFYFFMVMSKPSTCWVSSSVKISKKRKLLSSTLILLLNAWLKVERVSVCYLPKRYSLICGYTRT	190052	192694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_190100_192700
878485	contig_11492_pilon	+	1511	13	Intergenic	novelGene_152254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	85.3194975762672	399	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	94	1068	394652	486678	FALSE	10	CTCTGAGCACCTCGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGEQSICQARASVMVYDDTSKKWIPIKPGQQGFSRINIYHNTASNTFRVVGVKLQDQQVVINYSIVKGLKYNQATPTFHQWRDARQVYGLNFASKEEATTFSNAMLFALNIMNSQEGGPSAQRQAQNGPSPDEMDMQRRQVMEQQQQQRQESLERRTSATGESAHLGGGGGGLMEEMNKLLAKRRKAASQTDKPADKREDESQTEDPSTSPSPGTRAASQPPNSSEAGRKPWERSNSVEKPVSSLLSRTPSVAKSPEAKSPLQSQPHSRMKPAGSVNDVALDALDFDRMKQEILEEVVRELHRVKEEIIEAIRQELSGISTT	394558	487121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_394663_420235_420405_431936_432115_467628_467693_470712_470794_474808_474863_477958_478020_479357_479422_480854_480922_481010_481074_483808_483876_484297_484356_486640
878486	contig_15327_pilon	-	3829	28	Intergenic	novelGene_70566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	380	1384	670124	667155	TRUE	30	ACAGGAACAGCGCCGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVGDRNKHCVQDNQGSGELLGQQQPVSKVLEPAWSRVSVTGQHDGGAVGEVAGPRGVAEALQCEAKADEAGGDGEAELEQEAEQEVVLGLLRDGLKVFPCRHRHDGAMGRFPQQRDAEKQRVAKAGQPQDVGGTQKRGQLDQARQELDNHEHQLALQQEEEALTNAIGGMPSLLNEPDDADGLLLAEGQRAGQAVELARELQRGKAVRGLGHAGAGGVAKGLPGAPGRVQGVQGDADVALEEEAAVAQVGRAAQAAGHLPVLLHDLNHLTHGLRGTVGEEGHQQGHIVDVLQVGPHLVDPPGQLGPVAILQEAGDVAVRGLEANEVRVALLFH	671413	656880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_656976_658282_658485_658818_658970_659372_659476_659702_659800_660058_660168_660503_660558_661125_661233_661371_661524_661755_661966_662938_663256_663564_663746_664135_664228_664337_664562_666493_666675_666757_666897_667123_667241_667355_667457_667748_667855_668025_668216_668493_668573_668845_668924_669163_669257_669628_669777_669884_669980_670095_670193_670385_670439_671155
878487	contig_3601_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_132946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCACCCGCAAATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439932	437738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_437700_439900
878488	contig_754_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_161111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246477	248670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_754_pilon_+_246500_248700
878489	contig_16156_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_137085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	470	808	637856	637518	NA	20	GATGCCCCACCAGCGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTRALEAHAPALCQRGGTLRLCGFGRSVGGGPNGCRPALDWGLCSWVNPEPPLKLRQNLGKAPGQCPSPVKHESRPRCPATPTASASLTPKAKGQLVRGKETGWALCETTR	638325	637078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_637100_638300
878491	contig_15886_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_144331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGTTTAAGTAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13317	12404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_-_12400_13300
878492	contig_8864_pilon	+	1366	4	Intergenic	novelGene_135975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	19.3045763140937	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	200	556	107039	109422	FALSE	25	GGAGCAAGTTGCATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEQKKLIPGGEKVTVCKDNRQEYVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVRLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA	92136	110232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_92197_106899_107084_107307_107411_109213
878493	contig_12079_pilon	+	2682	2	Intergenic	novelGene_67397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	285	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCAGCTTTAAATATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478364	493301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_478403_490657
878494	contig_1093_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_139971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTTCTTTAACTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10594	8904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_8900_10600
878496	contig_3747_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_24742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	403	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115410	114092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_114100_115400
878497	contig_9784_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_165706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACAGTTCTTGGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367431	365497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_-_365500_367400
878498	contig_10331_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_54195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	746	1081	611710	611375	NA	85	AAAAAAAAACAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAIMGTVSKAWETSIFRAVGNSGDAPGTLAMSGDISGCDNLGKGVRVLVASRGQRPEMLLNILQYTGQHPAQSHPAKNVNSIENHMRKQSQKQNKYFSYSNKHYFLKKGA	612455	611189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_611200_612500
878499	contig_9133_pilon	+	2248	3	Intergenic	novelGene_109295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	1	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	205	360	94896	95051	TRUE	55	AACTGGACAAATGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLRQLARAGAPSPPRDGGGASPGRSALTVSRGWSRSARVAHLRPNSHPRLVSRRIGREKGKAAKDRGMPRASRGLTLRCGGRWEHGIGGEVTGRGATNQKLNGARMQLQRGKGRGAAD	94691	98576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_95312_96694_96867_97120
878500	contig_6479_pilon	+	1268	3	Intergenic	novelGene_160617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAAAACACACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614333	670080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_614689_626168_626296_669294
878501	contig_16883_pilon	-	1407	7	Intergenic	novelGene_161768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	75.3959916411712	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	467	925	716034	701053	FALSE	20	TAATACTGTGATTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQHTVLQGQRLIAPQTLNLTAVNAAVLIENLEIFRKNGFDFIIDEDAPVTERVKLISLPTSKNWTFGPQDIDELIFMLSDCPGVMCRPSRVRQMFASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIASLDVVSQN	738815	700570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_701197_709798_709969_710300_710402_715990_716159_735084_735241_737134_737220_738714
878502	contig_14744_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_66106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGAGCAGCTGGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1516743	1515553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1515600_1516700
878503	contig_299_pilon	+	2379	2	Intergenic	novelGene_129433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	33	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAGAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873984	883458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_874686_881780
878504	contig_6241_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_156431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1434	1796	299143	299505	NA	50	TGTCAAAATTAAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKKEKMVVRFIVTRTCHKPGTTCKRTLGGTSSFRSAAHLKVGGLNPLSSSTEEKPGELLPERLQPRNPMEPFYSVTHGVTMSQNQLSGNGFAVIPCGDRNVLCLNYTNVNILVVITVV	297709	299598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_297700_299600
878505	contig_4565_pilon	+	1309	1	Intergenic	novelGene_174700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCAGATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42708	44017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4565_pilon_+_42700_44000
878506	contig_10307_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_170296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	1887	2195	634471	634779	NA	60	TATATCTGAAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHEARGSACSWWRPFPREACPAPGGLAGLACLVPSSAVSKEQPLSAGSGSRLHADVRPLRLDQLEAGLRTLDAVAASTGRSLWEEPHCCNVGIVFLYLKIVF	632584	634780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_632600_634800
878507	contig_13215_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_145887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109847	108131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_108100_109800
878508	contig_9698_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_82504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATCTATTGCAGTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243653	245802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_243700_245800
878509	contig_8330_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_71729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTGAGACAACCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165256	165992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_165300_166000
878510	contig_2093_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_152978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGTGGAAAGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347273	1345877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1345900_1347300
878511	contig_19680_pilon	-	2720	1	Intergenic	novelGene_132015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTAAATCCTGCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186342	183622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19680_pilon_-_183600_186300
878513	contig_1301_pilon	-	706	1	Intergenic	novelGene_47295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTCCCAAATTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261594	260888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_260900_261600
878514	contig_11630_pilon	+	2031	3	Intergenic	novelGene_147166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_1	94.5	277	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGAATGAATGATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77614	146266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895_132058_144489
878515	contig_11630_pilon	+	1739	4	Intergenic	novelGene_147175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	227.72351657218	7	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGAATGAATGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77641	146265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_77707_131895_132058_144489_145803_146066
878516	contig_15866_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_63595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246652	247959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_246700_248000
878517	contig_10581_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_41381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546446	544484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_544500_546400
878518	contig_8045_pilon	-	1387	11	Intergenic	novelGene_35429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	196.326360940145	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	549	1166	401967	380007	FALSE	20	TTCTGTTATTTGACATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLALSNSDVIRQVHNSFARQQMFEFDAKTSAKEEDAFHFVSYVPVNGRLYELDGLREGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEKRIQKYSEGEIRFNLMAIVSDRKMIYEQKIAELQRQLAEEEPMDTDQGNNMLSAIQSEVAKNQMLIEEEVQKLKRYKIENIRRKHNYLPFIMELLKTLAEHQQLIPLVEKAKEKQNAKKAQETK	434667	379785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_380052_388099_388199_390871_390986_392296_392400_399315_399380_401391_401523_401905_401968_402049_402176_414824_414889_433952_434213_434569
878519	contig_14426_pilon	+	1047	2	Intergenic	novelGene_170629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTGACGTACTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187248	189220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_+_187820_188744
878520	contig_5346_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_161856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATATTATTCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171700	170186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_171105_171270
878521	contig_15236_pilon	+	2733	13	Intergenic	novelGene_141595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_7	24.6310271811794	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	96	1607	472264	507635	FALSE	35	TAGAGACCAGTCAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGFLSENPEFAELCKQEGIIFIGPPSSAIRDMGVKSTSKSIMAAAGIPVIEGYHGEDQSDQCMKEHAGRIGYPVMVKAVCGGGGKGMRIVRSEKEFQEQLESARREAKKCFNDDAVLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNTVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPGPGIEAEVRRKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHNFYFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQEEITLQGHAFEARIYAEDPNNNFMPVAGQIVHLSTPQTDLCTRIETGVREGDEVLVHYDPMVAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLHTNIDFLLSLSGHPDFEAGNVHTDFIPQHHTELFPAQRATAKELLCQAALGLILKERAATDAFRLKAQDRFSPFASSSGRRLNICYTRNMTLRDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIDDKTFRVLGDLHSEGDCTYLKCSVDGVASKAKLIILENTTYLFPQEGSVQIDFPVPKYMSSVSAEGTQGGTVAPMTGIIEKVIT	472168	508761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_472278_472737_472886_472958_473081_482969_483082_488131_488214_489403_489532_492971_493156_495822_495933_497260_497478_499243_499331_503696_503747_505706_505845_507515
878522	contig_9366_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_166276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCACCTGGGACTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044159	1043366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1043400_1044200
878523	contig_3397_pilon	+	2023	3	Intergenic	novelGene_154573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	109	junction_1	25.5	35	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	470	817	124812	126368	FALSE	10	TGCCATTGCTTGGTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAEGVPETSPNSPRANLPSAHSPLRQLPGPHSLHRGGVGSQARLPLGHTQGPGAGTGPPRQGGTDRQTDGREPGPAGRQAGGGGGGGTTGRTGSGEFPLNYRGEKLPAAGGKTQTVSSSRGPRSPAPRSGSRRHRRRHLPSLSPPPRAPVSPASTMPILLFLIDTSASMNQRSHLGTTYLDTAKGAVETFMKLRARDPASRGDRYMLVTFEEPPYAIKAGWKENHATFMNELKNLQAEGLTTLGQSLRTAFDLLNLNRLVTGIDNYGQVG	124342	127574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_124923_125314_125393_126209
878524	contig_9516_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_106169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAAGTTGAGCACGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860968	862999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_861000_863000
878525	contig_11136_pilon	-	1073	5	Intergenic	novelGene_169026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	16.5680415257809	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	176	904	144459	137339	FALSE	15	CTTGCCTGGGGAGTGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSHVALLGLGLLLMLLLYVGLPGPPEQTSWLGGDPNVTILAGLTPGNSPIFYREVLPLHRAHRVEVVLLHGKAFNSHTWEQLGTLQLLSQRGYRAVALDLPGFGNSAPSAEASTEAGRAELLQRVLQDLEVHNAVLVSPSLSGHYALPFLMRAHHQLRGFVPIAPASTQNYTQEQFWAVKTPTLILYGELDRILARESLQQLRHLPNHSVVKLRDAGHACYLHKPQDFHLVLLAFLDHLP	145642	137169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_137522_137734_137971_143996_144113_144265_144478_145485
878526	contig_19311_pilon	-	1813	9	Intergenic	novelGene_144076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	34.2882997537061	226	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	392	1378	164618	99129	FALSE	40	TTTCAGTGTTAATAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPKKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEEFRRKLLKAGGDPNRSVHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKADSSLLTITSGQQDKKAPSKRPPVSDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKVESETSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENMSSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEAEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQI	202994	98693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_99135_105459_105532_106862_106935_113333_113434_116025_116156_117990_118067_164087_164781_193126_193271_202909
878527	contig_17274_pilon	-	1916	17	Intergenic	novelGene_26482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	416	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGACACAAAGATACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80306	26182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_26360_27831_28000_30126_30210_31292_31346_36252_36336_42654_42707_47225_47294_51701_51784_69750_69855_73732_73876_74917_74966_76378_76418_77044_77166_77891_78000_78278_78360_78575_78718_79942
878528	contig_17274_pilon	+	2301	20	Intergenic	novelGene_26476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_6	452.614100029712	89	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	829	2046	41446	80052	FALSE	20	AACTTCATCTCATTCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEGDSQELTPTLLPHDGQDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	7064	80307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_31277_31349_36255_36337_41218_41507_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
878529	contig_17274_pilon	+	1008	9	Intergenic	novelGene_26474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	39	junction_6	245.121111646876	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	17	493	7054	31294	TRUE	70	AGAAAACAGAAGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEVMIFK	7037	42687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_30212_31277_31349_36255_36337_41218_41507_41796_41857_42655
878530	contig_839_pilon	+	1051	8	Intergenic	novelGene_171538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAAGGGGCAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469207	485137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_+_469264_469875_470065_472516_472581_472931_473030_478221_478395_480015_480197_481918_482045_484973
878531	contig_5350_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_99358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	969	1268	192942	192643	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRSACGYQGRTTRLGISLKSEQESLCCNVLLAFHDLPSLLDCKLLQVRDDVIANTVPHAWHTALNTVNLLLTDYSLSEPEMQYPFYRAKRLMQTEGS	193910	191477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_191500_193900
878532	contig_12145_pilon	-	2175	6	Intergenic	novelGene_172325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	4.53431361950185	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	172	849	184413	168085	FALSE	10	CGGGGAGTAGCGTGTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THFDVQFLEKFGVTFRREGETLTLKCTLLITPDLRRVQPRAEWYRDNVLLKESKWTKMFFGEGQASLSFSHLNKDDEGLYTLRIVSRGGVSEHSAFLFVRDADPLVTGAPGAPMDLQCHDANRDYVIVTWKPPNTTTESPVIGYFIDRCEVGTNNWVQCNDAPVKICKYPVTGLFEGRSYIFRVRAVNHAGISRPSRVSEAVAALDPVDLKRLQAVHLEGDKEIVIYQDDLEGEGQIPGPPINVHASEISKTYIVLSWDPPAPHGKEPLMYFIEKVLCGHIF	194331	166758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12145_pilon_-_168237_176443_176498_177161_177362_180508_180651_184283_184446_194192
878533	contig_16098_pilon	-	1793	8	Intergenic	novelGene_46172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	36.7806515240094	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1674	120	1793	522955	514753	FALSE	15	CCTCCTCCACCAGGCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASSQSSSVNSLADASDNEEEEEEEEEEEEEEEGPEAREMAMMQEGEHTVTSHSSIIHRLPGSDNLYDDPYQPEMTPGPLQPPAAPAPTSTTSSARRRAYCRNRDHFATIRTASLVSRQIQEHEQDSALREQLSGYKRMRRQHQKQLLALESRLRGEREEHSARLQRELEAQRAGFGAEAEKLARRHQAIGEKEARAAQTEERKFQQHILGQQKKELAALLEAQKRTYKLRKEQLKEELQENPSTPKREKAEWLLRQKEQLQQCQAEEEAGLLRRQRQYFELQCRQYKRKMLLARHSLDQDLLREDLNKKQTQKDLECALLLRQHEATRELELRQLQAVQRTRAELTRLQHQTELGNQLEYNKRREQELRQKHAAQVRQQPKSLKSKELQIKKQFQETCKIQTRQYKALRAHLLETTPKAQHKSLLKRLKEEQTRKLAILAEQYDQSISEMLSSQALRLDETQEAEFQALRQQLQQELELLNAYQSKIKIRTESQHERELRELEQRVALRRALLEQRVEEELLALQTGRSERIRSLLERQAREIEAFDAESMRLGFSSMALGGIPAEAAAQGYPAPPPAPAWPSRPVPRSGAHWSHG	523074	514752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_514993_515076_515260_516436_516650_519784_520025_520358_520563_520647_521014_522528_522691_522889
878534	contig_13992_pilon	+	2087	12	Intergenic	novelGene_147631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	923	1378	409986	428070	TRUE	10	GGCGTGCACTCTTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSVCVSSALSYGDSEGSSPGPSDTSFSVKDVEGDELLLNPRVEGAAAEARFRFFSGLHASDRFFVAVWLFSEEAASVTLEEFVLAVLSLMVSLFRRLCLSVLSLFLGASSTSKSSVGSCVLFVWFLFFPFNLPESSSDWGEVTRANFVL	404354	436493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_404561_404708_404864_405290_405469_406338_406542_407859_407985_409930_410061_421231_421361_422524_422607_424867_424980_428012_428165_435394_435864_436347
878535	contig_6707_pilon	+	1631	12	Intergenic	novelGene_167033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	31	junction_11	27.412972738836	81	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	285	1010	99533	121462	FALSE	10	TTTCTTCTTCTCTGTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKGVWLRLRKILLCVLGLYVAIPFLVKLCPGIQAKLIFLNFVRVPYFIDLKKPQDQGLNHTCNYYLQPEEDVTIGVWHTVPAVWWKNAQGKDQMWYEDALASNYPIILYLHGNAGTRGGDHRVELYKVLSSLGYHVVTFDYRGWGDSAGTPSERGMTYDALHVFDWIKARSGDNPVYIWGHSLGTGVATNLVRRLCERETPPDALILESPFTNIREEAKSHPFSVIYRYFPGFDWFFLDPITSSGIKFANDENVKHISCSLLILHAEDDPVVPFQLGRKLYNIAAPSRSFRDFKVQFIPFHSDLGYRHKYIYKSPELPRILREFLGRSKQEHHH	91697	122083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_+_91827_96421_96528_99483_99604_106108_106140_107955_108002_112069_112200_114988_115027_115745_115826_116902_116986_118304_118384_119690_119819_121422
878536	contig_12010_pilon	+	3072	1	Intergenic	novelGene_160934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATCCAGTAACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35358	38430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_35400_38400
878537	contig_13171_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_177957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84153	86330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13171_pilon_+_84200_86300
878538	contig_9177_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_32743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAATGCCTTTCCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117100	1119070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1117100_1119100
878539	contig_6048_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_73130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATCCCTGAGCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962532	964611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_962500_964600
878540	contig_10904_pilon	-	2581	7	Intergenic	novelGene_22441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	21.7389818835504	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	18	2252	87313	70972	FALSE	20	TTTCCAATTGCTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLDWAEGRLFQGRFDFLFYINCREMNQKAKRSLQDLISSCWPEQSVLLPELVRVPERLLFIIDGFDELKPSSHNPQGPWCFHWQEKWPTELLLGSLIRKKLLPELSLLITTRPKALEKLHHLLEHPRHVEILGFSEAERKEYVYKYFHNVEQAGQVFNFVRDNEPLFTMCFVPMVCWVVCTCLKQQLEGGGLVRQTSRTTTAVYMLYLLSLMQPKPGTPTHQTPPNQKGLCSLAADGLWNQKVLFEEQDLQKHGLDGADVSAFLNINIFQKDINCEKFYSFIHLSFQEFFAAMYYILDGEESGLGPEKNVSRLLADYGSSDRSFLAPTVRFVFGLLNKETRSYLEKNLCWKVSPHIKMELLKWIQSKAQSEGSTLQQGSLEFLSSLYEIQEEEFIQQALSHFQAITVSHIATKMEHMVSSFCVKHCRSVLVVHLYGAAFSADDDGVKWTSGSQTLLAQSPEKNLLPNAYSENLAAALCTNPNLIELVLYRNALGSRGVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKMCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKL	87330	70642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_70973_71079_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_85934
878541	contig_12050_pilon	-	882	1	Intergenic	novelGene_62760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCCCAGGGCGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785904	785022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_785000_785900
878542	contig_8269_pilon	+	3073	1	Intergenic	novelGene_106262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAAATCATATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385038	388111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_385000_388100
878543	contig_16187_pilon	-	2175	2	Intergenic	novelGene_101080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	1019	2140	73188	72067	FALSE	65	GAGAAAATAAAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPFSIKNCFQFLCNRQVPAAGLKDTVKNGLILQSISNDVYQNLAVEDWIHDHMNLEGNPILFLWRNSPSVVIGRHQNPWQECNLNLMREEGIKLARRRSGGGTVYHDMGNINLTFFTTKSKYDRMKNLKLIVRALKAVQPQLDVQPTKRFDLLLDGQFKISGTASKIGRTTAYHHCTLLCSTDGTFLSSLLKSPYQGIRSNATASIPSLVKNLLEKDPTLTCEVLMNAIAAEYAAYHGIDNHINLINPADETLFPGINSKARELQAWEWIYGKTPKFSINTSFNVLDGQSHLEIKVHIDIKNGRIQVCNIEAPHHWLPLEVCDKLNSSYIDSKFCPIETTTLTNILLRTCPGDHELYCKWNILCEKMKGIM	75850	72031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_73190_74833
878544	contig_6885_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_83696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGGTTTCATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275408	276218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_275400_276200
878545	contig_16594_pilon	+	3651	1	Intergenic	novelGene_53918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGTGAACTTTCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278356	282007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_278400_282000
878546	contig_1472_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_86138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621942	619993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_620000_621900
878547	contig_2867_pilon	-	2447	10	Intergenic	novelGene_135216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_9	57.3488351136175	19	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	85	1284	1057221	1027761	TRUE	25	TCATGAGCTTTTAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTSQAPPPQPLSPAPRPGRAELDRARAMLLTVYCVRRDLSEVTFSLQVDADFELHNFRALCELESGIPAAESQIVYAERPLTDNHRSLASYGLKDGDVVILRQKESADPRPPAQFPNLPRIDFSSIAVPGTSSSWQRQPPGAQQPHSSPGEIASSPQGLDNPALLRDMLLANPHELSLLKERNPPLADALLSGDLEKFSRVLVEQQQDRARREQERIRLFSADPFDLEAQAKIEEDIRQQNIEENMTIAMEEAPESFGQVVMLYINCKVNGHPVKAFVDSGAQMTIMSQACAERCNIMRLVDRRWAGIAKGVGTQKIIGRVHLAQVQIEGDFLACSFSILEEQPMDMLLGLDMLKRHQCSIDLKKNVLVIGTTGSQTTFLPEGELPDCARLAYGAGREDLRPEDIADQELAEALQKSVEDAERQKP	1057305	1024075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1025193_1027714_1027778_1029995_1030186_1031858_1031963_1035957_1036087_1038491_1038620_1042160_1042288_1043926_1044164_1047637_1047768_1057083
878548	contig_3424_pilon	+	1434	2	Intergenic	novelGene_55569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	659	1030	1059011	1059456	FALSE	35	ATCCAGATTTTACTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICDHHGAEVSTQLGGEVRLGPTWTSPAHFWEKTLPADLPGRPRCPRLISSSFSRELAREPTPRLCRRRAHRSHWSWGSLAEVTPRVVWSLLAEPPLLGQKSALREECILAISSISLWQSKCL	1058352	1059860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1059175_1059248
878550	contig_15313_pilon	+	307	2	Intergenic	novelGene_175655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATTTGTAGTGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38165	48369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15313_pilon_+_38338_48234
878551	contig_1719_pilon	+	1920	3	Intergenic	novelGene_87392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	11.5	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1015	1380	935452	935817	FALSE	45	ATTAACATAACTGAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQRFRTEAAAATAPQRSQSPLRGVVEAAQPDKQSGQAAAAVAAQPLAAHRPEQSQSPAASDCSSSSSSASLPSSSSRSSLGSHQLPRGYIPIPVIHEQSVARPTAQPSLHQAQKTHYPAQQGEYQTHQPVFHKIQGDDWEPRPLRAVSPFRSPARGASSREGSPARSSTPVHSPSPVRVHSVVDRPQQPVAHRESFPIPPPENKPESKPGAAGPDLAPGHIPIQVIVKEADAKPVSQKPPPPSEKVEVKVASLSAPVPCPPSPGPSAVPSAPKDVAAEEKAAPSPAPTEAVPTKAGDAEPPPKHPGVLKVEAILEKVQGLEQAVDNFEGKKTDKKYLMIEEYLTKELLALDSVDPEGRADVRQARRDGVRKVQTILEKLEQKAIDVPGQVQVYELQPSSLEGDRPLQEIMEMGTMATDKKSAGNEGEPQTETQQPEAKEAAAPDPASTTETAGNPAAP	930387	936357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_930547_932148_932554_935001
878552	contig_11396_pilon	+	2030	7	Intergenic	novelGene_71384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_6	74.9814791946799	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	20	976	1094493	1096496	TRUE	20	CCTGTGACTTAGGTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAKLVRMKPEELVSKELSMWKERPAKSAIEARAKLHNESKKTAVKQETIPDMEDSPPVSDSDEQQESVRAVPEKSCAPLLDVFSSMLKDTTSQHRAHLFDLNCRICTGQVPSSEDEPALKKPKLLTSAKREDARSRYDSVHSEPAPHADEGMPESPPEGAAEPEPERMPRPEAERTCPPVPPELGHPEPSPLQDFTSFPASCGGPVVTTVTVSGRDPRTVPSGVSTVPASTAARPTSSLLPDSAHTAETKQDALKPALTSVVMPKSILAKPSSSPEPSISESQSPPRRRHNALPVSAWHHLERLHQHAERGEIRHEGVSCVGVF	1094473	1099236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1094556_1094695_1094801_1095052_1095189_1095412_1095924_1096354_1096510_1097146_1097237_1098285
878553	contig_7720_pilon	+	1793	11	Intergenic	novelGene_155749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_7	55.7645945022467	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	11	1576	305129	345203	FALSE	45	GCAGCAAGGAAAAGCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKSKKEMKREVRTLLRAHLLRDNRRRLMKYFFPLCSIVLLERLKTSTTEFIISHPGLSYVFFQETPTSHLFAEYLTLKSVGIRRNKRKNGLQLSKSVISAVDELVSVASEEVDGCPVILVCGGQDIGKSTFNRYLINQLLNSIPCIDYLECDLGQTEFTPPGCISLFSITEPVLGPPFTHQRTPQKMVYYGKTSCKDNYEHYIEIIKYVFSSYKRESPLIINTMGWVTDNGLLLLIDLIRILSPSHVVQFSSGRSKYMPNLTPDYVDDTDGLYTKSRPKIRDRGFHLPEAENLEFVDDERESPVVFAGHKLMCVRSEFTFRKTPRNRESHNRVLRELAVLGYLGKLQPPDPKSVSPLHGLTPYQVPFNAVALRITHADVAPTHIMYAVNASWVGLCKIQDDVRGYVNGPILLAQTPLCDCVGFGICRGIDMEKRLYHILTPVPPEELRDVNCLLIGAVSIPQCVFKSQRGLEGTIPYVTTDYNFSLPGARDKIGARDSEQNYEEKRYLTPKLYRKINRY	305118	345420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_305199_305580_305709_310015_310152_310274_310372_310959_311058_339142_339305_339482_339778_340201_340314_342328_342507_343817_343952_345047
878554	contig_5918_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_99598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1684	2112	2067765	2067337	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEVKRLPSPAFYLYLAFLVSLRCRRSASSLYTRDTDRTHGAVQRTLSLRPTSAAGDQVSSHAHSLLPFFPTAHKVVMGLLSKRMFTPTGRIVQTTFDCIYRKQLRTPRTRGKTFRKGSTFLGARILCSSPRAEPVAGTP	2069448	2066706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2066700_2069400
878555	contig_5815_pilon	+	336	3	Intergenic	novelGene_141232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	13274.5	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	2	334	1041346	1045593	FALSE	35	CACTTTCAAAAGTAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPV	1041344	1045595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493
878556	contig_14405_pilon	-	873	1	Intergenic	novelGene_85657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTAAAGATTTTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724727	723854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_723900_724700
878557	contig_5515_pilon	-	1121	6	Intergenic	novelGene_52317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	120.831452858931	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	519	1073	60874	58831	FALSE	30	AATGACTGCCCATTCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLERPLPAQDLFDYITEQGPLGEGRSRCLFAQVVAAVRHCHACGVVHRDIKDENILMDLRRGCVKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFERDQEILEAELHFPDHVSPDSCCLGARIVQLRKCKYLCIGGGELQVCSPLPFPPAWII	64037	58782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_58950_59978_60156_60615_60989_62830_62882_63556_63668_63795
878558	contig_7207_pilon	-	1096	2	Intergenic	novelGene_72035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	498	1094	294505	291808	FALSE	25	GCAGCAGCTGTATTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISKTVAWVNEQLELGNERLLLMDCRAQELYESSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFIRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLKKLKDEGCRAFYLEDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVP	295002	291805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_294144
878559	contig_17382_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_165193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACAGCAGCTCACAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71416	72284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_+_71400_72300
878560	contig_5999_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_45650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACTTTGTTAACATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268281	269530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_268300_269500
878561	contig_7045_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_77459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCAGTATGGACTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369550	368979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_369000_369600
878562	contig_9415_pilon	+	555	1	Intergenic	novelGene_109782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGATTAATCCATTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1646545	1647100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1646500_1647100
878563	contig_7753_pilon	+	2466	1	Intergenic	novelGene_41475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGCCACAAGAAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944601	947067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_944600_947100
878564	contig_10446_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_162471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAGAGAAAAACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683802	685724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_683800_685700
878565	contig_14288_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_153833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGCATTCCATTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423601	422298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_422300_423600
878566	contig_15327_pilon	-	1668	16	Intergenic	novelGene_70506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	578	1111	442109	438159	TRUE	15	CTGGAACTGCCTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQSRGIFQQEELSHVGTEVEVVRLEQFAVVQQVGEMSHKPPVAQGDAALLDHLVDVKLKGRHQDVVQGLWAAIPSQKQVQAGLCIEVQLSGLHRGVGVQEPSHQEMVPVTQQLLLPQQGFFISQHDLTEGLQVRAGGERAILEVPLTLLVPVLPLQLQLRQGLCVPRAKNGHRPH	446089	432432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_432575_433557_433629_434459_434502_436287_436354_437486_437614_438049_438186_438266_438392_438603_438732_438941_439049_441747_441834_442048_442110_442308_442466_443230_443254_445020_445118_445423_445533_445898
878568	contig_6710_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_89048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGAAAAATCCGGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583337	582186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_582200_583300
878569	contig_9915_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_174174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727379	729305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9915_pilon_+_727400_729300
878570	contig_9673_pilon	+	1653	8	Intergenic	novelGene_119156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	768.504564271496	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	54	647	59036	203445	FALSE	20	TCACTCACCTCTTTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKLAREVLVSREPVGSMAAGVDCGDGLRARQYVFLLPEYLKDASKKMKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKAAAQRQRRNK	58982	204451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_162523_162606_164186_164230_203412
878571	contig_9554_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_170682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGGCTGTCTCTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80327	78017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_78000_80300
878572	contig_5344_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_125332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCATGAGATAAATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44768	43489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_43500_44800
878573	contig_9415_pilon	-	1833	13	Intergenic	novelGene_109881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	150	junction_6	56.8658264885179	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1821	12	1832	2063813	2049477	FALSE	35	GCCACGGAAACAGTGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKMVNIWQVNGGKGLVDIQPHWVSALAWPEEGPAASWSGESPELLLVGRMDGSLGLIEVVDVSTMYRRELEHCYRKDVSITCIAWFSEDRPFAVGYFDGKLLLGTKEPLEKGGIVLIDAHKDTLVSMKWDPTGHILMTCAKEENVKLWGPVSGCWHCLHSLGHPSVVNGIAWCGLPGQGSKLQLLMAVGCQSGLVCVWRIPQDITQTTVTSSEGWWDQESSCQDGYRKSAGAKCVYQLRGHITPVRTVAFSSDGLALVSGGLGGLMNIWSLRDGSVLQTVVIGSGAIQTTVWIPEVGVAACSNRSKDVLVVNCTAEWAAANHVLATCRTALKQQGILGLNMAPCMRAFLERLPMMLQEQYAYEKPHVVCGDQLVHSPYMQCLASLAVGLHLDQLLCNPPVPPHHQNCLPDPASWNPNEWAWLECFSTTIKAAEALTNGAQFPESFTVPDLEPVPEDELVFLMDNSKWINGMDEQIMSWATSRPEDWHLGGKCDVYLWGAGRHGQLAEAGRNVMVPAVAPSFSQAQQVICGQNCTFVIQANGTVLACGEGSYGRLGQGNSDDLHVLTVVSALQGFVVTQLVTSCGSDGHSMALTESGEVFSWGDGDYGKL	2063824	2049475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2049587_2050752_2050892_2051773_2051900_2052047_2052114_2053310_2053605_2054966_2055141_2056334_2056437_2056804_2056952_2058479_2058586_2059010_2059211_2060697_2060829_2062782_2062984_2063788
878574	contig_10130_pilon	-	851	3	Intergenic	novelGene_172723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	134	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	203	697	56581	48792	FALSE	20	GGGCAGTGTCTCAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSALKSRAETAGKDRWCPGERCLAPSPDNGKLCEASIKSVTVDENGKSFAVILYSDSLERKVPLRRLQEVKSVKDCSRSFIFDDEDLEKPYFPDRKFPSSAIAFKLSEDGDCIPHTINRYLRDYQREGAQFLYGHYIQGRGCILGDDMGLGKTVQVFTLIAL	56911	48637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_49241_56535_56600_56727
878575	contig_16897_pilon	-	991	5	Intergenic	novelGene_174459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	42	junction_4	41.5052707496289	682	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	34	558	156589	154704	FALSE	20	GAGACGTGACCCTTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEVRRSERKCMPTVARRNSAMVGGGGGMAGGPLENANPLIYERSGERPVTAGEEDEQVPDSIDAREIFDLIRSINDPEHPLTLEELNVVEQVRVQVSDPESTVAVAFTPTIPHCSMATLIGLSIKVKLLRSLPQRFKMDVHITPGTHASEHAVNKQLADKERVAAALENTHLLEVVNQCLSARS	156622	154270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_-_154802_155273_155320_155804_155931_156176_156255_156412
878576	contig_3424_pilon	-	1047	5	Intergenic	novelGene_55566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	1046387	1046085	TRUE	5	GCAGTGGTGGGTGTTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAVPATRVVVAGDAADLVAGVGLALGDLAGLLDLRRGDVAPGAAPETVVQDVAVEPVELRGGTGSGRRGSRTWARRCPGCSRGCRPGRGCWLGTGTRGP	1046389	1044315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1044430_1044810_1044947_1045222_1045479_1045549_1045661_1045959
878577	contig_12019_pilon	+	1280	5	Intergenic	novelGene_87741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	181.477960094332	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	4	564	623205	642506	FALSE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQDPRPQTTEAIWDVNP	623201	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635815_642460
878578	contig_9981_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_121061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAAAGTGTTATTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304530	306532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_304500_306500
878579	contig_3132_pilon	-	2295	1	Intergenic	novelGene_127442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATCAGGATGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292807	290512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_290500_292800
878580	contig_821_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_149393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCAATGTCACCGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149839	148159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_148200_149800
878581	contig_11702_pilon	-	1388	11	Intergenic	novelGene_142001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	183.20633176831	30	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	15	761	509434	508213	TRUE	10	CGCCAGCCAGCTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSCMVQRSKPEQKATGVGVWGAEQAHPAKRPLYPQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGGCPAGQHGGGE	509448	506003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506173_506348_506403_507258_507359_507568_507653_507909_508098_508180_508249_508330_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277
878582	contig_10050_pilon	-	3646	1	Intergenic	novelGene_119620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGTAAATCACAGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200452	196806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_196800_200500
878583	scaffold_17542_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_139250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATGACTACATCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522330	523414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_522300_523400
878584	contig_5999_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_45659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTAAATACGGGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278075	275396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_275400_278100
878585	contig_4418_pilon	+	1143	2	Intergenic	novelGene_98379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCATGAAAACTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811200	813090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_811418_812164
878586	contig_9415_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_109790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTGGCATTTGTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672043	1670617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1670600_1672000
878587	contig_18145_pilon	+	1751	7	Intergenic	novelGene_37307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.1761122766856	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	247	792	58238	59279	FALSE	30	ACTCGTCATGGCAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRLLWIAPKHRGTVCAAAGGLGGGANGPIPPDPGLNILIPVLDRIRYVQSLKEIVINVPEQSAVTLDNVTLQIDGVLYLRIMDPYKASYGVEDPEYAVTQLAQTTMRSELGKLSLDKVFRERESLNASIVDAINQAADCWGIRCLRYEIKDIHVPPRVKESMQMQVEAERRKRATVLESEGTRESAINVAEGKKQAQILASEAEKAEQINQAAGEASAVLAKAKAKAEAIRILAAALTQHVRYPWVGVGDRIDSERGSFIQS	57443	60238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_57546_57963_58064_58193_58253_58342_58445_58594_58730_58881_59027_59130
878588	contig_10855_pilon	+	604	7	Intergenic	novelGene_124361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	872.402175350082	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	72	530	691871	697957	FALSE	0	CGTTGTCTTGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLQAQYHSLKLECDKLASEKSEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNGICAQVLPYLSQEHQQQVLGAIERAKQVTAPELNSIIRQQLQAHQLSQLQALALPLTPLPVGLQPPSLPAVSAGTGLLSLSALGSQAHLSKEDKNGHDGVGCSMPAWSSPLRHGRGGRGWRA	689136	698031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_689165_691827_691892_693198_693244_693842_693906_696987_697063_697149_697331_697883
878589	contig_511_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_132728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGACAAGTGTACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50327	47776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_-_47800_50300
878590	contig_6673_pilon	-	871	5	Intergenic	novelGene_164030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGGGGGAGGAGGAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159366	157252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_157662_157797_157867_158174_158278_158612_158724_159187
878591	contig_6634_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_171127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGGTCCGAAGCCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26078	25309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_25300_26100
878592	contig_16103_pilon	+	3068	24	Intergenic	novelGene_118940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	33	junction_15	85.5330444993235	17	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2712	356	3067	902654	915277	FALSE	15	CTATCCTCTTTGCCATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEERRARANDREYNEKFQYASNCIKTSKYNILTFLPVNLFEQFQEVANTYFLFLLILQLIPQISSLSWFTTIVPLVLVLTITAVKDATDDYFRHKSDNQVNNRQSQVLIDGILQQEQWMNVCVGDIIKLENNQFVAADLLLLSSSEPHGLCYIETAELDGETNMKVRQAIPVTSELGDISKLAKFDGEVICEPPNNKLDKFSGTLYWKENKFPLSNQNMLLRGCVLRNTEWCFGLVIFAGPDTKLMQNSGRTKFKRTSIDRLMNTLVLWIFGFLVCMGVILAIGNAIWEHEVGMRFQVYLPWDEAVDNAFFSGFLSFWSYIIILNTVVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDKKMFCMKKRTPAEARTTTLNEELGQVEYIFSDKTGTLTQNIMVFNKCSINGRSYGDVFDVLGQKAELGERPEPIDFSFNPLADKKFLFWDPSLLESVKIGDPHTHEFFRLLSLCHTVMSEEKSEGELYYKAQSPDEGALVTAARNFGFVFRSRTPKTITVHEMGTAITYQLLAILDFNNIRKRMSVIVRNPEGRIRLYCKGADTILLDRLHHSNQELLNSTTDHLNEYAGEGLRTLVLAYKDLDKDYYEEWAERRLQASLAHDSREDRLASVYEEVESDMMLLGATAIEDKLQQGVPETIALLTLANIKIWVLTGDKQETAVNIGYSCKMLTDDMTEVFVVTGHTVLEVREELRKAREKMMDSSRTVGNGFMCQEKLSAPKLTSVLEAVAGEYALVINGHSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVELVKKYKKAVTLAIGDGANDVSMIKTAHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLVHGRWSYLRMCKFLCYFFYKNFAFTMVHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVLAMGVFDQDVPEQRSMEYPKLYEPGQLNLLFNKREFFICIAQGIYTSVLMFFIPYGVFAEATQDDGTQLADYQSFAVTVATSLVIVVSMQIGLDTGYWTAINHFFIWGSLAVYF	901451	915278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_901513_901869_901984_902110_902210_902471_902534_902634_902708_902973_903045_903293_903374_904722_904882_905135_905225_906554_906752_909740_909950_911306_911351_911649_911816_911959_912149_912284_912401_912493_912659_912744_912857_912995_913102_913224_913370_913555_913740_913875_914100_914383_914468_914779_915026_915205
878593	contig_11563_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_142298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGTCATTCTCACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98638	97385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_97400_98600
878594	contig_1172_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_162026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCACAATAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576554	574828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_574800_576600
878595	contig_8357_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_39771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCCCTCCCGATGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883756	884266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_883800_884300
878596	contig_7272_pilon	-	982	7	Intergenic	novelGene_25371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_3	704.28247568398	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	344	982	610299	606906	FALSE	10	CGTTCTTTTTACCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKDMAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKV	620569	606905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502
878597	contig_4388_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_161943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	243	587	196656	196312	NA	45	AGGTATGAAACTCAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVILKTALRRNNSCFWLPYSSLGQTYPRGEPCNGNCLSCPEFFFHKIRSRVPPTHIQLVWMGFSYPEFSNFCKYTPTFFSFFFFPGLTNLFFIWINDNERVVDGDSECCNGLC	196898	195926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_195900_196900
878598	contig_4223_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_117277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATGAAAAGTGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214355	213075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_213100_214400
878599	contig_14744_pilon	+	1378	5	Intergenic	novelGene_66027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGGGCGGACCCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978139	987538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_979161_980363_980464_983597_983678_986380_986536_987516
878600	contig_2646_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_69698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2429131	2427139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2427100_2429100
878601	contig_7720_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_155790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831105	829825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_829800_831100
878602	contig_5954_pilon	+	2618	1	Intergenic	novelGene_28807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	543	2076	2618	1460785	1461327	NA	20	AACTTCCTTATCCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHFFSPQDGICTADLCTRGACQPAPTSRQTRIQRKLKAACSFPPSLSQKWEEKGVKPAPALSEFLPPPPFLQQTPPFCYTAINNSPQKTRNPNIFDGLALLLIYYLLQYITTDCIRPPPRRASEEQAVLQMQPRNHLGPSAVPFQIFPELFSSCLFTLEPQKNRACHQKLKADENSKERL	1458709	1461327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1458700_1461300
878603	contig_11386_pilon	+	1910	5	Intergenic	novelGene_82816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_4	125.945424688632	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	42	698	137770	173507	FALSE	25	TTACTTTTAACTTATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPNLLLLLLLTLAGQGSVGSLPEVLQVPVGGSILVQCHYRLQDVKARKVWCRFLLEGCQPLVSSAVDRRAPEGTRMFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKGTNTSC	137728	174719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_137813_137981_138315_140637_140759_141029_141170_173487
878604	contig_11386_pilon	+	1767	4	Intergenic	novelGene_82819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_3	129.42007400537	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	414	842	138167	173507	FALSE	50	GCTAAAAATACAAGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTDLGGGLLQVEMLALREEDAGEYGCVVEGAAGPQTLHRIALEMLPPAPSLKEEEVEETYKTGVLVDKHFSDPVGSASPLEPSWDEKRAPGKQALQDSGLSQLSLRILLILGVVLLLGLLVVAVVLFAVMAKRKGTNTSC	137753	174432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_138315_140637_140759_141029_141170_173487
878605	contig_11978_pilon	-	821	7	Intergenic	novelGene_62987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.9678711917328	21	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	8	541	1504849	1500501	FALSE	25	ATACTCTCCGAGACTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQEKGALSDDEIVSLSIEFYEGVRDREEKKGPLENGDGDKEKTGVRFLRCPAAMTVMHLAKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLTLPTAPTPSEGTNTSGASESEAEPGQSDRGI	1504856	1500220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1500539_1501800_1501910_1502497_1502579_1504002_1504099_1504186_1504242_1504418_1504528_1504803
878606	contig_16594_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_53877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATTAAAAAAAATTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174704	173333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_173300_174700
878607	contig_405_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_135327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGACTCCTTCTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590129	592182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_590100_592200
878608	contig_15613_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_147195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAGAAAAAGAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67514	65950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_66000_67500
878609	contig_1239_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_150400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCTTATGACCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179228	177156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_177200_179200
878610	contig_9113_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_68603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	23	72	284	355	384262	384333	NA	50	TCTTTTGAGATAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHNGARRGPSLLTALPWNYGCTAPYGSSGWGSASGNGLRLRRQPSEGWECGLPGCRPQEARTCGKLGAGSAGCARRHDTGRQRPRPRARAGVSMVIVNKPPLPRGQLPSPLRSALL	383978	385736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_384000_385700
878611	contig_15033_pilon	+	1875	14	Intergenic	novelGene_177368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	53.3054167568485	112	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	265	1659	50400	85044	FALSE	5	CTCGGGTCTCTACTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALSFPRYNVAEILIHIRNKILTGADGKNLSKNDLYPNPKPEVLHMIYMRALQIVYGIRLEHFYMMPVNSEVMYPHIMEGFLPVSNLFIHLDSFLPICRVNDFEIADILYPKAKRTSRFLSGIINFIHFRESCRETYMEFLWQYKSSLDKMQQLNAAHQEALMKLEKLDSVPVEEQEEFKQLSDDIQELQQLLNQEFRQKTIVLQDGNSQKKSDISEKTKRLNELKLSVASLKEVQESLKAKIVDSPEKLKNYKEKMKDTVQKLKNSRQEVMEKYETYRDSVDCLPSCQREVQLYEKKIQDLANSREKLTSNLKESMNLEDQIESEESELKKLKAEENSLKRLMIVKKEKLATVQFKINKKHEDIKQYKRTVIEDCNKVQEKRGAVYERVITINQEIQKIKFGVQQLKDTTEREKMKSQEIFLNLKTALEKYHEGIEKTAEDYNAKTEEKTAELKRKMFRFST	42271	85260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15033_pilon_+_42516_50379_50523_53877_53953_55054_55132_55829_55892_61019_61118_65108_65183_67163_67261_68152_68216_71326_71465_73262_73404_74241_74418_75388_75525_84909
878612	scaffold_14128_pilon	-	1951	5	Intergenic	novelGene_169532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	31.6178351567592	341	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	245	1306	551463	547499	FALSE	45	GAAGGCACAGAGTGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLAKDSYLQNLARKICAQPSAEPQKRKWAGQTENSKAAGPSKKKRKKTQKKFQEQREKAAEHKAKSVEKSPAASGAKESVTTEEGEASTVAPAERPTPEPDSFFALDVLRQRLHEKIQEARGQGSTKELSPATLEKRRRRKQERDRKKRKRKELRAKEKAAKAGKTEVATEPAPVAPCPEPQEQTGLIFNKVEVGEEEPASKAQRQKEKRQQVKGKLTPLTGRNYRQLLERLQARQARLEELRERDTGQAQALEAKMQWTNLLYKAEGVKIRDSEPLLQEALKRKEKRRAQRKRKWEKRTAHVVEKMQQRQDKRRQNLRKKKVAKAERRMEKARKKGRILPQDLERAGLV	551707	546853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_547979_548088_548293_549356_549446_549810_550006_551369
878613	contig_7919_pilon	+	2753	2	Intergenic	novelGene_28085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	0	113	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114012	1117070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1115059_1115363
878614	contig_3424_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_55532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCACAGTGGAGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255097	253974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_254000_255100
878615	contig_8801_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_66277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAATCATGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429308	427462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_427500_429300
878616	contig_20550_pilon	+	1072	2	Intergenic	novelGene_142601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	446	junction_1	0	488	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	84	404	3777	10883	FALSE	20	GTAATGTATTCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGGKLYHKYFRYFTRCLVEVIFQYFSNVFIETLIIRFLKL	3693	11551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676
878617	contig_2114_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_104247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAGAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162594	163736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_162600_163700
878618	contig_13496_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_107628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACGTGAGGAAGTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239706	240419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_239700_240400
878619	contig_7426_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_27463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	82.6180972910899	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	32	1057	649816	637491	FALSE	20	GTTTCCAGACTAGGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTFRVAPWIMTPNTQPPQEVYVCSVFDNGNFLKSVTALAKKAKCKLTICCEEENKNDRWIQDEMEIGYIQARHKTLPVVFDSPRNRGLKDFPMKHLLGPDFGYMTRGAKIGQITGLDSFGNLEVSPPVTVGEKEYPLGRILTGNSSYPSDKSREMNQALQDFLAAQQGFRLLLASPRACYKLFQEKEKEGHGEAVLFEGVNTRKKQQKIKDILSSKKLREHNLYAERCIDWNREVLKQELGLEERDIIDIPQLYKLLKDSRGTLKAEAFFPNMVNMLVLGKYLGIPKPFGPIIEGCCCLEEKVRSLLELLGLHCTFIDDFDTYHVHCGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP	649847	637236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_637725_640443_640585_641114_641189_642075_642179_642463_642519_643780_643936_647291_647400_648900_649013_649772
878620	contig_17769_pilon	+	1212	11	Intergenic	novelGene_124252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_1	77.203950676115	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1170	43	1212	75316	84604	FALSE	35	GAGCTCTGCAGAGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYDEKLARFRQAHLNPFNKQLSEQQHEQGPREAAPDLAAEEAPPELSPAEPEFRCTECVMDLGLSEDHFSRPVGLFLASDVQQLRQAIEECKQVILELPEQSEKQKDAVVRLIHLRLKLQELKDPNEDEPNIRVLLEHRFYKEKSKSVKQTCDKCNTIIWGLIQTWYTCTGCYYRCHSKCLNLISKPCVRSKVSHQAEYELNICPETGLDSQDYRCAECRAPISLRGVPSEARQCDYTGQYYCSHCHWNDLAVIPARVIHNWDFEPRKVSRCSMRYLALMVSRPVLRLREINPLLFNYVEELVEIRKLRQDILLMKPYFITCKEAMESRLLLQLQDRQHFVENDEMYSVQDLVDVHVGRLSCSLTEIHTLFAKHIKLDCERCQAKGFVC	70368	84604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_70401_75305_75440_76695_76794_78367_78518_79933_80076_81477_81643_82203_82332_82533_82648_83579_83661_84336_84478_84577
878621	contig_15518_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_127619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGGTGTTGCCGAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14360	13269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_13300_14400
878622	contig_6445_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_77054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCGAAAGTAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656220	658353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_656200_658400
878623	contig_12885_pilon	-	1736	1	Intergenic	novelGene_176900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	7	306	73636	73337	NA	35	GTGTATAATTCAGCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNMMSNLEKVQVQISLSIFFYFSFLMNHPAFAPTTYPVRVQRALSGVSGCLSSAANDYPRLHCLWTSGVGHSLLFCKIGYFVSRSVAVHQKYNSVTNPASS	73642	71906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12885_pilon_-_71900_73600
878624	contig_2069_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_23223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGGAGGGATCAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202889	204757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_202900_204800
878625	contig_5628_pilon	+	2996	2	Intergenic	novelGene_157565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95051	98540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_96147_96639
878626	contig_7009_pilon	+	336	2	Intergenic	novelGene_23579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	158	junction_1	0	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTGTGTCTGTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198145	223032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_198267_222817
878627	contig_7730_pilon	-	875	2	Intergenic	novelGene_156251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGCACTTATTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43693	1702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_2325_43440
878628	contig_10258_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_155057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	169	453	117258	117542	NA	20	CTCCCAGCCAATCAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTSRRKKKSAWIAAPPFLGPPAPRWGRSERLLRRYPPGGPPLAGTWLLSGVRRLEMDPGPRARRASTVDWARTLVPGVGVKGKAFGKAKNGRNIAFRGLGWNKRKVPLAQIIISTDQMVFGNWARLGYADETVWLGIVPAPRCTTFGSW	117089	118611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_117100_118600
878629	contig_11978_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_62810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAATAAGTGCTAGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382717	381837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_381800_382700
878630	contig_13412_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_80002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAACTAAACTGCAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303033	305340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_303000_305300
878631	contig_9332_pilon	+	2052	2	Intergenic	novelGene_60728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACCATATTCTCCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540531	544263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_540594_542273
878632	contig_8377_pilon	-	1893	5	Intergenic	novelGene_35086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	281	340	162010	161951	TRUE	25	TCTATGGTATAATTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFFQGASDWTQTSNNELFNCLYYPGTPDVTSDNGISSSLSLLSLRATSEAHLTLGLETRDGPLVGVNGLCLTTSQKLGGSNPSNGTTEERPIKMCFHKYYSQENHMELSSTL	162290	136038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143589_161226
878633	contig_3424_pilon	+	1451	10	Intergenic	novelGene_55592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	34	junction_7	30.3343508172859	136	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	37	1050	1182807	1188655	FALSE	10	CTTGCGGATGTCCCCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARQSEEKGAALMRNRDLQLEVDRLKHSLMKAEDDCTVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASAQDQGWDRSGAYIQLLEEDWRQALRHQQEQASTIFSLRKDLRQAEAQRTRCVEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAVLQQMEEVAIERDQAIAMREELHAQQARCLQEKDGLRKRVRELGERADELQLQLFQREGQLLAAEGRLKRQQLETLVLSSDLEDSSPRSSRELSLPRGLEEDTQLLDKGGRAEGQSLEQPFRALQKEQLSLTPNDTGLSGGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQNGTRQGEVDWENTTGSDNTDTEGS	1182770	1189056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1182834_1182994_1183175_1183316_1183461_1183800_1183927_1185411_1185604_1186042_1186085_1186438_1186488_1187674_1187752_1188362_1188440_1188555
878634	contig_5951_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_153243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGAAGCCATCTGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187704	188142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_187700_188100
878635	contig_14513_pilon	+	781	1	Intergenic	novelGene_70222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAATTGTTGTGTCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7428	8209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_7400_8200
878636	contig_7165_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_116911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGTTTCCTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220668	1221222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1220700_1221200
878637	contig_500_pilon	-	3137	3	Intergenic	novelGene_30954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGCTGACAGATCCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457415	1446832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1446940_1452268_1452366_1454482
878638	contig_14687_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_107973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCCCCCAATCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756323	754378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_754400_756300
878639	contig_6102_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_32089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	618	1109	790772	791263	NA	5	CTTCTATGGTGGTGGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLYWRRLHSCPLPHGPPRPRTCYFPLTTWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSAYPPKGERNQESPKYTSHSLSLVPGPPSLRAQKCNYKRRSSLNLKPKISPEVFFK	790154	792238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_790200_792200
878640	contig_13171_pilon	-	918	6	Intergenic	novelGene_177959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.84682690007294	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	215	547	279572	271519	TRUE	20	TCAGAAACGTTTGCTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPFPDRSSLEKEAREEENSSLEMPRKLHYFNMLRPAVSDENVTSGSPCTLLLPTLDFPCPFNQLLTLSAFSSRLWTRAAHLVACIYLSWVPGTPLNVSRNSLARVTWN	367591	253458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13171_pilon_-_253822_271510_271583_272733_272854_275987_276115_279550_279626_367430
878641	contig_17059_pilon	+	2589	1	Intergenic	novelGene_166082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGGGGAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418271	420860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_418300_420900
878642	contig_5586_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_143537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACCCGAGTTGTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321196	319820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_319800_321200
878643	contig_9981_pilon	-	1267	8	Intergenic	novelGene_121066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	10.1679769424424	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	255	1100	376874	357103	FALSE	20	AGTTAAAGCCCGTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGIVGLASARALIQRHSALSLGLLEKEKDLALHQTGHNSGVIHSGIYYKPASLKAKLCVQGAALIYEYCSKKGISYKQCGKGLMAIDCPYTGIVDYRQVALSFAQDFQDAGGSVLTNFEVKDIEMAKESPSGSQDGMKYPIVIRNTKGKEIRCQYVVTCAGLYSDRISEMSGCSPEPRIVPFRGDYLLLKPEKCYLVKGNIYPVPDSRFPFLGVHFTPRMDGSIWLGPNAVLAFKREGYKPFDFSARDVMDIIINSGLVKLVVENFSYGVNEMYKACFLGATVRYLQKFIPEITVSDILRGPAGVRAQALDRDGNLVEDFVFDGGVGDIGSRILHVRNAPSPAATSSLAISGMIADEVQQRFEL	394392	356935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_357299_367463_367596_368913_369072_370401_370570_375200_375236_376717_376881_393444_393597_394296
878644	contig_7357_pilon	-	1441	11	Intergenic	novelGene_36907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_10	31.938847818918	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1230	212	1441	642730	419484	FALSE	25	GACCACTTTGCTGCCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFWLRNEEMALEEMVQRLNAVSKRADEIMHQDIVPLCAADIKDQLKKRFAYLSGGRGQDGCPVITFPDYPTFSDIPDKEFQNVMTYLTSIPSSQDTGIGFILVIDRRQDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVPIIMLSSVPELHGYIDKSQLTEDLGGTLDYCHSRWLCHRTAIESFALMVKQTAQMLQSFGTELAETELPNDVQSTSLVLSAHTEKKDKMKEDMKLALQEGHTILESIREPLAKNPEYSLNQDQLDNQTTVQRLLAQLNETEAAFDEFWAKHQQKLEQCLQLRHFEQNFREVKVALDLVSQKMTTLADVGNSLAHVEHLLKDLANFEEKSNVSVEKARALCLEGSQLIENKHYAVDSIHPKCNELQHLC	642941	419483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_419598_420230_420351_423858_423974_425739_425865_426973_427124_427713_427831_431176_431297_450606_450698_481817_481933_510787_510872_642651
878645	contig_15570_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_137840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTCCTGGATTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489205	490821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_489200_490800
878646	contig_5935_pilon	+	661	2	Intergenic	novelGene_102701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941833	947301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_942407_947213
878647	contig_9389_pilon	+	1308	3	Intergenic	novelGene_84156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	419.5	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	878	1306	1894380	1895163	FALSE	25	TAACGAATGTGGCGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTEHLIMRFMKNNFQYTVLGETCEFPGTEEKCNNKGRHIRWHTDESLHESKERKEKKEGNQRVKLFSKMACLTRLRRTLARENSYQCCVRGRAFRYSSFKRHIRSHTGCDSYQCKECGMACSCSSCLSTHVKTLTVKNVSK	1879986	1895165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1880838_1894353_1894505_1894859
878648	contig_4686_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_118588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTACCAGGCCCTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827687	826229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_826200_827700
878649	contig_6412_pilon	+	3023	22	Intergenic	novelGene_149937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	60	junction_1	81.8950990977838	156	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2859	164	3022	90047	212683	FALSE	50	CTTACAATGACAAACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFNLDRFRFEKRSKIEEAPEATPQPSQPGPSSPISLSAEEENAEGEVSRASTPDSDITEKTEDSSVPETPENERKASISYFKNQRGIQYIDLSSDSEDVVSPNCSSTVQEKKFSKDTVIIVSEPSEDEESQGHPTMAGRNNDDIAELEDLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFGDAGGGPRKRKVSSSSEPYEDDEFNDDQSIKKKKLDHGEESNESAESSNNWEKQESIVLKLQKEFPNFDKRELREVLKEHEWMYTEALESLKVFAEDQDMHFASQSEVPFGKEVSSRSQNYPKNSSKTKLKQKFSMKPQNGFNKKRKKNVVNPKRVIEDSEYDSGSDVGSSLDEDYSSGEEVMEDGYKGKILHFLQDASIGELTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSEDLIWHCKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNKGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPTLNVLCYYGSQEERKQIRYNINNGYEEYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDQIELCTMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLEKSTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRALGCILSELKQKGNRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCN	89285	212684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_89401_89998_90237_125832_126011_132421_132594_136034_136102_148624_148726_165479_165582_174437_174520_176245_176638_187879_188080_199041_199133_202303_202404_203106_203167_203262_203339_204438_204575_205101_205240_207525_207622_207717_207836_208034_208157_210797_210987_211283_211403_212553
878650	contig_12151_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_54988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013520	1014945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_1013500_1014900
878651	contig_21208_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_175766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2209	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_0_2200
878652	contig_9705_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_41743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCCAAATGTGAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340906	338658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_338700_340900
878653	contig_3382_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_124135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	261	174	434	819048	812052	FALSE	20	GTAAGTAATTTTCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVPVTLQTSSLNKPPSATVALGNDVSDLNLSGADPDLPIFVSTNEHELFQEAENALEMLDDFDFDRLLDAASDGSPLSESGGENGSTAHPACASQVMPKLVPTLPEGLPVLLEKRIEDLRVAAKLFDEEGRKKFFTQDMNNILL	819221	812049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_812121_818856
878654	contig_20739_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_83193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	158	493	195013	195348	NA	5	TCGGTCATGTTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTALVHTSPSTAGSTLLQPSNITQTSSSHSALSHQVTAANSATTQVLIGNNIRLTVPSSVATVNSIAPLNARHIPRTLSAVPSSALKLAAAANCQVTKVPSSSSVDSVPR	194855	196845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_194900_196800
878655	contig_11017_pilon	-	846	3	Intergenic	novelGene_128065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	11.5	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	276	845	124849	115699	FALSE	50	AAAATTTTCCGAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRRRPPPPASQLPEGSGVGGCGVDGGSEEVEVQFSAGRLGSAAAVSAAAARSTEEEEERLEREHFWKIINAFRYYGTSMHERVHRTERQFRSLPANQQKLLPQFLLHLDKIRKCIDHNQEILLTIVNDCIHMFENKEYGEDGNGKIMPASTFDMDKLKSTLKQFVRDWSETGKAERDACYQPIIKEIL	125124	115697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_115840_116664_116861_124616
878656	contig_8452_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_48052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAAAAATGAAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429385	431257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_429400_431300
878657	contig_15118_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_74571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	688	996	257075	256767	NA	20	CATAGGGTTTTCAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRRAGIMDGIMLQLQTKEFLGIPEVGKDEKGSSFRAFRGSMALLTHLLWTSSLQNWETINFCTYKPLVCGTFYSNLRSKYNHSERDHSHFMEWETSTQCGK	257762	256171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_256200_257800
878658	contig_18419_pilon	-	1295	1	Intergenic	novelGene_141474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGACCCAACTTGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77978	76683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_76700_78000
878659	contig_13044_pilon	+	3184	1	Intergenic	novelGene_99976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAGGAGGGACACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31338	34522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_31300_34500
878660	contig_10640_pilon	+	1189	2	Intergenic	novelGene_175154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAAGTTGGCTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8028	9261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_+_8080_8123
878661	contig_5797_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_56904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTCTCTAGAGAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29475	27366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_27400_29500
878662	contig_14260_pilon	-	731	1	Intergenic	novelGene_28888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAAACACAGCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50661	49930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14260_pilon_-_49900_50700
878663	contig_10581_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_41454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAAAAATGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802658	801362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_801400_802700
878664	contig_5967_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_44418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTGAGTCCAAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473144	475241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_473100_475200
878665	contig_8581_pilon	+	1100	3	Intergenic	novelGene_22859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	24.5	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1	315	386753	387067	TRUE	15	TATTGTTTTATGGCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAVLGPGFPAFAGPGAQRVARGRCILPTSPSAAAGPLAHSAYLRLENCIAKASVTPFRASPQVTDFCSSPGGPTPGEHVLALRPWPPPSPESLPPVGSLWYLG	386752	391271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_387301_387440_387812_391090
878666	contig_8310_pilon	+	1342	2	Intergenic	novelGene_75546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATGCCATGTGAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176901	191766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_177964_191486
878667	contig_521_pilon	-	1716	2	Intergenic	novelGene_174735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCCCTTAGCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36705	34361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_35996_36623
878668	contig_17382_pilon	+	699	2	Intergenic	novelGene_165194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGATGTGAGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120416	122349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17382_pilon_+_120979_122212
878669	contig_13901_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_146662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCAGAGCTCCACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265148	266726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_265100_266700
878670	contig_5936_pilon	-	1022	3	Intergenic	novelGene_53601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACGAGAGTAAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560522	552991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_553220_555393_555898_560232
878671	contig_18116_pilon	+	2239	12	Intergenic	novelGene_175446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	680	1324	45046	60494	TRUE	40	AAAAGGAAGTGACACCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLVLQAAHHSGQQPHFLAFLRVSDEQVHVVALQLPPPEATSQHDSGTGQGLHHSRLHHLPQSLRVLLLHWGAQVLVVLEARGSTERGEVPAAFCCWVSFWGCLRRSSRVRSPSWYQRSAVFTPTPKIWVKSFMVWYLSECCTLSTSSHTPFSSISWMTLEECSPKWGSPCNCLRAMMGLGRALSTEAALRNERRRPSLPSKPAASASVSRAS	43940	63949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18116_pilon_+_44298_44642_44727_44807_45051_45171_45278_45471_45605_45684_45718_47184_47308_57981_58054_60167_60339_60492_60586_61438_61628_63314
878672	contig_13481_pilon	+	2096	2	Intergenic	novelGene_119340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTAAAGCTAGCCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353418	356649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_354973_356107
878673	contig_5954_pilon	+	1765	8	Intergenic	novelGene_28544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	89.9260467136803	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	48	791	540542	546998	TRUE	45	AGGGGAACTCAGACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGAGAGSHSSAQRADYFAMELLDGYLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLASGESEILDLESELYLGGLPDGGAGGPAPAPGGVDGGAPGWLRGLRARPLHRRA	540494	557291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_540644_541388_541828_546795_547184_547400_547605_553803_553831_555685_555815_556234_556617_557244
878674	contig_6199_pilon	-	283	1	Intergenic	novelGene_126421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTGCTGTTGTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718240	717957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_718000_718200
878675	contig_10864_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_107053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	194	349	737617	737772	NA	55	AAAAAAAAACCCCACTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEISFPTSSHVRENLPHKEESRQKHNLNDQSCSSANIRGQYKWSRNNILLPSRTGAYSSGGHVAMMTAELMLTGRSNQGPIIFSHQVYIQLRGGCGKKNSQNSREDFPEGPGPHF	737423	739120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_737400_739100
878676	contig_10196_pilon	+	1693	12	Intergenic	novelGene_132334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_10	46.9754639665861	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1452	240	1691	2419317	2446179	FALSE	10	CCTGCTGGCCAGCCTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDNTSPISVILVSSGSRGNKLLFRYPFQRSQEHPASQTNKPSSRYAVNSTGDHSEDQDGDSRFSDVILATILATKSEMCGQKFELKIDNVRFVGHPTLLQHGLGQVSKTDPSPKRETPTMILFNVVFALRANADPSVISCLHTLSRRIAVVLQHEERRCQYLTREAKLILALQDEVSAVSDANEGPQSPFYHILPKCKLARDLKEAYDSLCSSGVVRLHINNWLEVSFCLPHKIHYVASSLIPPEAIERSLKAIRPYHALLLLSGEKSLLAELPVDCSPALVRVIKTTTAVKNLQQLAQDADLALLQVFQLAAHLVYWGKAIIIYPLCENNVYMLSPNASVCLYSPLAEQFSRQFPSHDLPSVLAKFSLPVSLSEFRSPLAPPVAETQLIQMVVWMLQQRLLVQLHTYVCLMAAPREEEARPREDDLPLPARVGGRSLSTPNALSFGSPTSSDDMTLTSPSMDNSSAELLPSGDSPLNRRMTE	2419077	2446181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2419435_2421905_2421976_2429142_2429273_2431508_2431584_2434782_2434937_2435683_2435766_2440894_2441033_2441123_2441281_2443189_2443297_2443692_2443823_2445464_2445655_2446078
878677	contig_20241_pilon	+	1127	5	Intergenic	novelGene_159725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	4.27200187265877	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	183	890	99491	127986	FALSE	80	ACAAAAAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPYVPLPMPVGNPVSSFTTNRNQRSPSFGSISTSSNSSKGQLEDTNMGNYKRPSVPDQMDSTSSVCNSPLIRTKFTGTDSSIEYSARPRESEEQNPETVSWEDRPSTPTILGYEVMEERAKFTVYKVLVKKTPEESWVVFRRYTDFSRLNDKLKEMFPGFRLALPPKRWFKDNYNADFLEERRLGLQAFLQNLVAHKDIANCLAVREFLCLDDPPGPFDSLEESRVSAVLYIT	97690	128223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_97772_99389_99866_107573_107661_113677_113827_127889
878678	contig_12540_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_148076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	881	1273	911207	911599	NA	10	CCGTCCCTTGCCAGGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTNSHHLDKVFGNRSRALMLGPLFLAGSPSHLPPSPHFPILVNRSRALMLGPLFLAGSPSHLPPSPHFPILVNRSRALMLGPLFLAGSPSHLPPSPHFPILVSTPWRVLLGAFLLICVLTVTISCHLFL	910326	911744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_910300_911700
878679	contig_5896_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_159250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364926	362947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_362900_364900
878680	contig_9982_pilon	-	985	9	Intergenic	novelGene_55747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTCAAAAAGGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330551	317259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_317442_318516_318614_322719_322850_323657_323753_325016_325074_326515_326608_326943_326998_327935_328113_330450
878681	contig_5758_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_119083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTTCCACTCTGTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161978	159771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_159800_162000
878682	contig_3155_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_26339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	181	603	122225	121803	NA	60	AAAATTTTTAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLVLIMLKKLTLPVSWQLTKNGTVESVEADGLTLDDVSDEDIDVENVEVDDYFFLQPLPTKRRRALLRASGVHRIDAEEKQELRAIRLSREECGCDCRLYCDPEACACSQAGIKCQVSPSWPQMVYLHQGQGVWCGCQ	122405	121165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_121200_122400
878683	contig_8420_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_69372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGACTCCATGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255646	256490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_255600_256500
878684	contig_13004_pilon	+	6251	1	Intergenic	novelGene_112739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2686	3063	934800	935177	NA	25	ATGGCACCATCATCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTLFGTFQILSHIVCTTPIRDIIMPLTQIWSPGRAVVKSLSANQQVGSSNPPVAPWKPYGAVLLCPIGLLSQNQHPQVWIFGFFYTDTGTETQGDHNTSKVKSGENSNPGLLGSKVQILYTTL	932114	938365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_932100_938400
878685	contig_2940_pilon	-	1777	6	Intergenic	novelGene_81951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_5	155.883289675321	87	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	478	723	884688	883810	FALSE	40	TTTATAATAAAAGTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIEKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIHDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPAARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA	888335	882755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_883927_884183_884259_884634_884776_886208_886357_887493_887658_888257
878686	contig_9682_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_125301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	3	458	27915	28370	NA	35	CAGGACAAATGGATGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQGFLSCARDTGKRSSFRSCKTVPFLNPDRAAFYFKRDREVHAQGPSDRGRAAGRGTVGSDCPRLVIEYVLHLKPEHWTPPPAAPGRHSRTVTALLRTLLIVPSPISVSGACPSHTSQRGWHPGRQHQAHRLPSLPLPRVNTPSACCPAQF	27912	28470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_27900_28500
878687	contig_5918_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_99589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGCCTCAGGATTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1989246	1988278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1988300_1989200
878688	contig_11564_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_158545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGACTGTTTGCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40487	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_39800_40500
878689	contig_8330_pilon	-	3520	7	Intergenic	novelGene_71773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	33.170016581244	93	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	62	1588	705342	660948	FALSE	50	CCAGAAACCAGCACTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADWLGSIVSINCGDSLGVYQGRVSAVDQVSQTISLTRPFHNGVKCLVPEVTFRAGDITELKILEIPGPGDNQHFGDLHQTELGPSGVGYQVGINQNGMGKLVKKPASSSSAPQNIPKRMDTKSQDVAVSPQQQQCSKSYVDRHMESLSQSKSFRRRHNSWSSSSRHPNQATPKKSGLKNGQMKNKDDECFGDDIEEIPDTDFDFEGNLALFDKAAVFEEIDTYERRSGTRSRGIPNEKPTRYRHDENILESEPIVYRRITVPHNVSKEFCTDSGLVVPSVSYELHKKLLSVAEKHGLTLERRLEMTGICASQMALTLLGGPNRLNPKNVHQRPTVALLCGPHVKGAQGISCGRHLANHDVQVILFLPNFVKMLESITNELSLFSKTQGQQVSSLKDLPTSPVDLVINCLDCPENAFLRDQPWYKAAVAWANQNRAPVLSIDPPVHEVEQGIDAKWSLALGLPLPLGEHAGRVYLCDIGIPQQVFQEVGINYHSPFGCKFVIPLHSA	719479	659015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_661283_664024_664243_668362_668517_683273_683610_701703_702024_705178_705353_719428
878690	contig_960_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_108255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCGAAAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583410	585117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_583400_585100
878691	contig_9471_pilon	-	1411	2	Intergenic	novelGene_21725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	639	junction_1	0	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	46	309	153207	150571	FALSE	10	CCCAGCTACTTTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKVTFLFLGSCS	153252	149468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_150710_153082
878692	contig_9440_pilon	+	1834	9	Intergenic	novelGene_59114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	46	junction_6	11.112352361224	112	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	100	1221	1741730	1791383	FALSE	30	AAGTTATCACGTTTTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSTHSLGYAGCNFLRQRLVLATLSGRPVKIRKIRARDDNPGLRDFEASFIRLMDKITNGSRIEINQTGTTLYYQPGLLYGGTVEHDCSVLRGIGYYLEALLCLAPFMKHPLKIVLRGVTNDQVDPSVDVLKATALPLLKQFGIDGESFELKIVRRGMPPGGGGEVFFSCPVRKALKPIQLTDPGKIKRIRGVAYSVRVSPQMANRIVDSARSILNKFIPDIYIYTDHMKGLNSGKSPGFGLSLVAETTNGTFLSAELASNPQGQGVAVLPEDLGRNCAKLLLEEIYRGGCVDSTNQSLALLLMTLGQQDVSKVLLGPLSPYTIEFLRHLKSFFQIMFKIETKPCGEELKGGDKVLMTCVGIGFSNLSKTLK	1741630	1791996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1741866_1757696_1757769_1760883_1761060_1767951_1768027_1768999_1769125_1772827_1772954_1775369_1775527_1778127_1778232_1791232
878693	contig_6272_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_160464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTCTCCTAGGTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243864	245103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_243900_245100
878694	contig_10861_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_39183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTAATACCTAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282286	283572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_282300_283600
878695	contig_12050_pilon	+	979	5	Intergenic	novelGene_62724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.8044884126	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	125	496	668283	679994	TRUE	35	TGCAGATGGTTTCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAHGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQGKLLADLAKRLGLHYVVYSGLENIKKLTGGKLAAGHFDGKGEVEEYFRDIGVPMTSVRLPCYFENLLSYFLPQKAPDGKSYLLSECPSWPVCAC	666331	683267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666343_668169_668370_679709_679999_681576_681768_682979
878696	contig_4364_pilon	-	2089	19	Intergenic	novelGene_31	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	66.4001385168866	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	151	1662	322898	283469	FALSE	20	ACATTTGTGTGTTTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKGDAIIDGWQWLINDTLRNLHLVSSHSRQQVKEAAVLALAALCGEYYLKEPGEADPAVVDALIRQYLAELQSPEEMTRCGFALALGALPSFFLKGRLQQVLAGLRAVTHISPKDVSFAEARRDSLRAIARICQTVGVSAGGVPDKVLCEANVPQIYSTLLDCMNDYTTDSRGDIGACVREAAMTSLMELTLLLGRSQPQLIGASVCERVLCYVAQQASEKIDRVRAHAGNVLLTLLHFDSPPLPHVPHREELEQIFPRSDVATMNWNSPSQVFPRITQFLGLPAFRYHVLLGLAVSAGGLTESTVKYSMQSLCEYMKSIQKDPQAMACLSGTLLQIFEDNLLNDRVSVPLLKTLDQMLANGCFDVFTVEEDHPFAVKLLVLCKEEMKKSKDIQKLRSSIAVFCGMIQFQGDVRKKVLLQLFLLLCHPFPIIRNTTASHVYEMVLTFGEEIVGAEALEEVIAVLGNTVWDAELPLVREQRNRLCDLFQVPRPQLVSKPSPH	344786	283041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_283484_298403_298489_299634_299748_301065_301154_302646_302737_303529_303608_311033_311156_313893_314033_314111_314271_314370_314455_315013_315155_315840_315933_317038_317158_320223_320306_321422_321500_322870_322934_341505_341538_342347_342371_344726
878697	contig_8729_pilon	-	2112	11	Intergenic	novelGene_40090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	153.711548037225	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	42	1448	223115	214139	TRUE	40	TATAAGGAGTTGGCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGNYSYSCSAGAMARTAAVAVAVLGPLLWGCGLALQGGMLYPRESPSRERKELGGLWSFRADFSDSRRQGFEEQWYQRPLRELGPTLDMPVPSSFNDVTQDRWLRGFIGWVWYEREAALPQRWTQDLRTRVVLRIGSAHYYAIVWVNGVHVAEHEGGHLPFEVDISKLVQVGPLESCRITIAINNTLTPNTLPPGTILYKTDTSKYPKGYFVQDTNFDFFNYAGLHRPVLLYTTPTTYIDDITVTTGVDQDNGLVNYQASVQGSARFELAVRLLDAEGQVVAHHTGAQGQLQVPSAHLWWPYLMHSYPAYLYSLEVRLTAQTAAGPVSDFYTLPVGIRTVAVTNSQFLINGKPFYFHGVNKHEDADIRGKGFDWPLLVKDFNLLRWLGANAFRTSHYPYAEEVMQLCDRYGIVVIDESPGVGIVLAESFGNVSLHHHLEVMEELVRRDKNHPAVVMWSVANEPASFLKPAGYYFKLRTWM	223156	209547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_209918_212114_212251_213980_214158_217871_218019_218101_218281_218513_218667_219481_219670_220489_220633_220770_220953_221162_221349_222905
878698	contig_8964_pilon	+	2409	6	Intergenic	novelGene_168692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGCAGGCCCGCGGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526824	549484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_528628_543392_543519_547369_547461_547847_548008_548898_549078_549434
878699	contig_4891_pilon	-	1528	4	Intergenic	novelGene_124519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	913	junction_1	83.1718435262533	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACCCAGCAGTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60258	55330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_56682_58132_58193_59630_59682_60192
878700	contig_10017_pilon	-	983	2	Intergenic	novelGene_156990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACATGAATCGGCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304516	302911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303364_303985
878701	contig_13744_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_77151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATAGAACAATAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149355	151045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_149400_151000
878702	contig_14546_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_157417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACCGTGACAGTGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75663	77720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_75700_77700
878703	contig_5472_pilon	-	2624	9	Intergenic	novelGene_130033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	73.2900914175989	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	196	2313	449707	402325	FALSE	55	ATAAACTGAAAACTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINLTIDIYIYLLSNARSLCGKQRSKQLHFLCSPKYYWRVSHISPQRGFHTSKVRCKWTKSEARSCSKHCCWPSNHGLHSGILKLSTSAPKGLTKVSIRISRIKSTLHSISKAVFGSQNEMISRLAQFKPSFGILRKVSDSGWLKEKNIKQAIKTLKKHSDTSTTESPIVGKDEDTGKQSLFQYTSSITTKFEESFSFLSNHINSYFLNKEKMAQKKESEHFQDKSESEDKTIEGDEKFSSGISTNDKPHSESSLDPASPSETPGVLPVSTKQSITSFLSRPTGGVQALVGGYIGVLVPKLKPDTKNTSEEKEATKAELANGKDKVAEEKKRLSLQREKIIARVSIDNRTRALVQALRRTTDPKLCINRVEELTFHLLEYPEGKGVAVKERLIPYLLRIRQTKDETLQAAVREILALMGYVDPVKGRGIRILTIDGGGTRGVITIQTLRKLVELTQKPVHQLFDYICGVSTGAVLAFMLGLFHMPLDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVKMSWSHAFYDSQTWEKILKDRMGSSLMIETARNPTCPKDGGLLLNNPSALAMHECKCLWPDVPLQCIVSLGTGRYESDVRNTVMHTSLKTKLSHVINSATDTEEVHIMLDGLLPPNTYFRFNPVMCENIPLDESRNEKLDQLQLEGLKYIERNEEKMKKAAKILSQEKTTLQKINDWIKLKSDMYEGLPFFSKL	456322	402013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_-_402600_408091_408288_425925_425984_431084_431257_434161_434257_446854_447007_448380_448531_448687_449801_456220
878704	contig_5988_pilon	-	2926	12	Intergenic	novelGene_16128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGACTGGGCCAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1549558	1539020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1539099_1539369_1539414_1539507_1539630_1540104_1540230_1541308_1541426_1542921_1543021_1543310_1543474_1543563_1543661_1544911_1545049_1546840_1546964_1547583_1547686_1547839
878705	contig_8017_pilon	+	3401	5	Intergenic	novelGene_65363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_4	35.2233942146409	195	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	2820	3401	989721	1001862	FALSE	30	GAGTAATAAACTTCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQITSLHSLNAFLLPIKTVGVQGDCRSYSYVCGISSKDQIDWESLIFLARLIPRMCHNINRVVYVFGPPVKEPPTDVTPTFLTTGVLSTLRQADFEAHKILRESGYAGKISQMPVILTPLHFDRDPLQKQPSCQRSVVIRTFITSDFMTGVPATPGSEIPVEVVFKMVAEIKKIPGISRVMYDLTSKPPGTTEW	986901	1001862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_989787_993537_993654_997251_997383_1000526_1000700_1001766
878706	contig_15991_pilon	-	936	2	Intergenic	novelGene_70950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCGATCAAGGCGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132119	130935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_131147_131394
878707	contig_12677_pilon	-	203	1	Intergenic	novelGene_110862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3150	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3200
878708	contig_9335_pilon	-	847	1	Intergenic	novelGene_147435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135950	135103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_135100_136000
878709	contig_10444_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_139448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTGGAGTAACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604244	605828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_604200_605800
878710	contig_3269_pilon	-	1769	3	Intergenic	novelGene_117021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	818	junction_1	49	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	151	579	116096	114870	FALSE	65	AGGACAGAGAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRFPEAYHHVLHSLLLAVIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFVFNLINDYISGFSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQGRYLHVPSFGMVFFFFHFVASASLAECFLVKSVNLKVTSEFLLSEDRFINGILHFCHFLHSSSGSTSSMKRSQVSSIDCCLN	118358	113679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_115230_116027_116112_118223
878711	contig_5590_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_163022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGTGCCAAGTACCACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332138	329862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_329900_332100
878712	contig_9206_pilon	+	912	4	Intergenic	novelGene_137493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	440.289551192041	80	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	207	911	307319	318705	FALSE	25	ATGGGAAAGATTTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSQGLLTFRDVAIEFSQEEWDCLDPAQRALYREVMLENYRNLVSVDIFARKVINKLLPKQDNNKGELHHPVILERHESHGIEDFDFREVWENMHEFESQWGYDQRNYKGMTTTQNKNLSGTKEQHNKSWNNLHLEQSISVRKSMYQYLKHDKSFIRNLLKLKYNIGYAANKSIKYFENRLGLNFPSYLDELQRFQTEEKIYECSQVEKSIKNCSSISSLQRFPPIVKTNICNK	305278	318706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_305433_307266_307334_309783_309911_318142
878713	contig_7340_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_159887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTCTTCTGAGGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77960	78740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_78000_78700
878714	contig_7599_pilon	-	2682	4	Intergenic	novelGene_73765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	2.05480466765633	56	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	41	1453	214074	204481	FALSE	15	GAATTTTTGTAGTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVWTLGTNIFLSLWRIYVSPRSPRWTDFIQHLGVCCFVAFLSAIFLSVAFYWLLSSFVVFTTSWITMCVLLYCSKHARCFTLLFFLSCGLREGRKALIAAGTGIVIFGHVENIFHNFKGLLDSMTCNLKAKSFSIHYPLLKRYVEAIQWIYGLAPSLSLFENLVSWKHTLVVLLSSPSEAVKAQLNDTRGEVLSVMDPMMTTAEVLSSLGQRLFTITGLLLVLLRTGLFMKRFLGPRGSKFENIYITRQFVQFDERERLQQRPCVLPLSKKERKTYVVVPSFCLTPKERKNLGLFFLPILTHLYIWVLFAAIDYVLYRLIFSLSKHFQSLPELKVHLKLHTEEQGPQSVINDSSFYISLFESSCIPKPKLLLSKTWVPLIIILVILVVLGLLSSTLMQLKILVSTSFYPSVERERIQYLHAKLLKKRSEQLPGEVKKKMSLYLTKIHFWLPVLKMMKNKQMDIASEDNP	223145	203251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_-_204556_206112_206422_213045_214088_223118
878715	scaffold_12510_pilon	-	1106	4	Intergenic	novelGene_151347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	2.94392028877595	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	206	574	67578	55181	FALSE	35	AGAGCTTGGCTGCAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDLPYYGGSVEIADYCPFSQEFSWHLSGEYQRSSDCRILENQPDLFKNYGAEKYGPHSVCLIQKSAFVMEKCERKLSYPDWGSGCYQVSCSSQGLKVWVQNTSYLCSRAGQVLPVSIQMNGWIHGGNLLCPSCWDFCELCPPETDPPVSNLTRALPLDLCSRSSSLMVTLWLLLANLFPLLAGFLLCVWH	69956	54648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_55282_60214_60426_67521_67653_69825
878716	contig_9706_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_21009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAAGGATCACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513897	516277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_513900_516300
878717	contig_4845_pilon	-	2270	12	Intergenic	novelGene_53646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGATCGTGGACTATCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461261	355769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_355800_356328_356510_357872_358045_358989_359054_359616_359766_360035_361067_389011_389106_393178_393361_404237_404317_404911_405012_449655_449768_461185
878719	contig_6327_pilon	-	1528	3	Intergenic	novelGene_147487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	297	659	66365	66003	FALSE	45	CACCAATGCTAAAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSHHLSVETYISMMLLNRFQQSFQTDMARKKDLVIYFQKPAKENLWITMAKTVTHYGNGAGLGSISSLCAWSRHESETYAMAATTLFSRHYSPYCLLHALILEPNTDSPVKNRSCLFVN	94554	65133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_66442_82852_82980_94461
878720	contig_3523_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_171493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415669	416677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_415700_416700
878721	contig_10013_pilon	+	962	2	Intergenic	novelGene_125088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1888	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGAATGCTGGCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514141	515761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_514261_514918
878722	contig_17840_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_154296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACAGTGAGAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53904	52197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_-_52200_53900
878723	contig_2487_pilon	-	4167	1	Intergenic	novelGene_148467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	706	1074	152275	151907	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSFRGTKSASFPFWSHFSPAHVVPTCGLLALPVPADGEISKFKMRALSYMVELYRACGAFLRTVRSPSSVSLLPCLRASSDYSHAPSPDFCMAFIASSNYISSMVSIFISFKCVQRKCQKP	152980	148813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_148800_153000
878724	contig_3426_pilon	-	526	4	Intergenic	novelGene_57949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	746	junction_1	317.533550283361	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	35	511	379910	368746	FALSE	30	AGAGTCGTCTGCAAGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPWFLGFAAPSMAVGQENCPFSGKRWTGGLPQAAPETCLPVCAQDADLARLLSSGSFGNLENLSLAFTNVTSACAEHLIKLPSLKQLNLWSTQFGDAGLRLLSEHLTMLQVLNLCETPVTDAGLLALSSMKSLCSLNMNSTKLSADTYEDLKAKLPNLKEVDVRYTEAW	379944	368730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_368800_377192_377264_378652_378759_379664
878725	contig_10482_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_152846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATAAACAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159727	161584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_159700_161600
878726	contig_14814_pilon	+	512	2	Intergenic	novelGene_137704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGCCTTTGTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279160	283810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_283659
878727	contig_18544_pilon	-	1431	3	Intergenic	novelGene_152753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_2	64.5	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55421	52491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_53280_54685_54803_54895
878728	contig_5649_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_82314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCAGTGGGGTTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189567	192197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_189600_192200
878729	contig_2069_pilon	+	1144	8	Intergenic	novelGene_23285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	360.355946479679	3	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	620	934	342587	346747	FALSE	25	GCTTTCTCAATTTCAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPEYSSLLYRYQHAY	339056	346957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342072_342574_342729_343519_343652_346706
878730	contig_9133_pilon	-	1358	1	Intergenic	novelGene_109294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTTAAAGCTTTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86811	85453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_85500_86800
878731	contig_7426_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_27502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	419.117748967996	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	87	644	952246	980919	FALSE	10	TCTCTAGACCCTGGTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVVGVSLRRRFPATTLGAACLQACRGAQTAAAVAPQIKKFAIYRWDPDKAGDKPRMQTYEIDLNKCGPMVLDALIKIKNEIDATLTFRRSCREGICGSCAMNINGGNTLACTRRIDTNLNKVSKIYPLPHMYVIKDLVPDLSNFYAQYKSIEPYLKKKDESQEGKQQYLQSIEDREKLVISPH	952159	981805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_952318_962052_962181_970075_970162_979923_980061_980784
878732	contig_5549_pilon	-	803	5	Intergenic	novelGene_81595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	80	556	96842	91727	TRUE	10	TCGAAGTTGGGGGCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLQENMIGSWHPLAHCAKRAAPAPTSQRHSRLGSVAEVLLARWELFGENSFREKLFSFLFRDGWKDHHTVSILPINRGGNPLFCCQLERDNYSENLIKVPSSGSWIEDRQLQFLIRTKNKHHTSRHRHALFILLRWVQHAQEDGKVSILIIDDGKR	96921	82198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_82250_86661_86817_91685_91834_93263_93410_96618
878733	contig_11978_pilon	-	3327	12	Intergenic	novelGene_62951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	132.983128240744	16	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	68	1213	1063431	1045209	TRUE	30	ATGTGAAATTGATGTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPSEVDEIFDAISYSKGASVIRMLHDYIGDKDFKKGMNMYLTKFQQKNAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTKQMGFPLIYVESEQVEDDRVLRLSQRKFCASGPYVGEDCPQWMVPITISTSEDPNHAKLKILMDKPEMNIVLKNVRPDQWVKLNLGTVGFYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSVSYNENYFREDYYPLSVTSVFDSVSS	1063498	1040648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289_1044338_1044611_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699_1053835_1055522_1055663_1057598_1057663_1060456_1060567_1062723_1062785_1063404
878734	contig_16964_pilon	-	2996	20	Intergenic	novelGene_143124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_18	15.5640042131456	102	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2766	231	2996	208608	152741	FALSE	55	CAGGAAGAAAAGATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNLNQDGAPRPSYVFSADPIERPSEINFDGIKLDLSHEFSLVASSAEVNSLESKDYLQVCLRIRPLTQLEKEHESEGCVCILDSQTVLLKDPQSIIGQSTEKSSGQMAQKFSFSKVFGPETTQKEFFQGCIEQLAKDLLKGQSRLIFTYGVTNSGKTYTIQGTEENIGILPRTLNVLFNSLREKLYTKMNLKPHRSREYLRLSPDQEKEEIACKNALLRQIKEVAMHNDSSDTLYGSLINSLNTPECEESVIDCEQASLNMDDNIKFSVWVSFFEIYNECIYDLFVPGSPKFQKRKMLRLSQDVKGYSFIKDLQWIQVSDSKEAYRLLKVGIKNQSVAFTKLNNASSRSHSIFTIRILQIEDSEMPRVLRVSELSLCDLAGSERSMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNSEKSKFQQHVPFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCCFAYDETLNVLKFSATAQRVFVPDTLNTSLGKSFAPVKSSQDTSLDINDLDNKTLNVKRTTISWESNLEDLAEDEDLTEDLEKAEENKNVGTEFTEEDLDQTLEEDKALISQEKRKLLDLIEDLKKKLINEKKEKLTLELKIREEVTQEFTQYLAQREADFKETLLQEREILEENAECRLAIFKDLVGKCNLQEEPTNEDPAMKVETEGTHNCIGIEDIIDSLQDDVTDIKKQAEIAHLYIASLADPQEAIACLELKFNQVKAELAKTKEELIKTQEKLKKRENESEINLNSLVQELENSNKDNTDASSLIIKNKLTCPEIVEVPEDSKTKTSSGRKRSNENELLQQDEPPAKKGPIYISSSISEYRKKSEDMQQSISKEKEDIRVLKKNNEELKTHLLIVENEFINEKEEKAELNKQIVSLREELSSSEKKIFNLSIEVQQIQSKYENAISELQVQKDINQE	211802	152740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_153067_161815_161973_168859_168913_170403_170633_171620_171760_172030_172171_176809_177098_177656_177820_181125_181273_181354_181427_182336_182449_183426_183655_184133_184171_186622_186808_187732_187872_188347_188465_188560_188648_208461_208689_210743_210815_211723
878735	contig_11096_pilon	+	1684	4	Intergenic	novelGene_143483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	61.6495471732491	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	272	649	275201	276694	FALSE	20	GCTCTTAAATACTGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPTVVEEYTKREEEIEQLTEELKRKKVELDKYRENISQVKERWLNPLKELVEKINEKFSSFFSSMQCAGEVDLHTDNEVKVRFIYVSSQVILTMY	274929	277729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_275204_275631_275728_276192_276298_276520
878736	contig_5954_pilon	+	719	5	Intergenic	novelGene_28460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.93190525885234	29	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	630	89	718	130245	136684	FALSE	60	CCATAAAAGAGAAACGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERGTRSGGAARRSGPQSPSPTKSLRRSQRKSGSDLLNTLPEIWPKAPPAAPVRKAIVLKKIVAHEVEIPAVHSPRRSPRIAFLLEKENNPPTKEPTKEDLFKTCSTPVTPTTTPVLLPLNVESSPRSGDLDTRDLEMSKKVRRSYSRLEALSSTSTPGRRSCFGFDGLPVAQEFARVSPVVCSKSFEVTGVSVKPWAPDTTLPGISPP	130156	136685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_130291_130516_130612_130693_130760_130839_130876_136297
878738	contig_859_pilon	+	1324	9	Intergenic	novelGene_132811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCAGACTACCCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2037	93846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_2162_4128_4222_11093_11308_12738_12875_16405_16521_22873_23059_41894_41988_82403_82470_93548
878739	contig_9839_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_88596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTTAAAGCACACACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518103	516853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_516900_518100
878740	contig_10141_pilon	-	1823	6	Intergenic	novelGene_84626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	85.9897668330366	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	411	1364	405576	395735	FALSE	30	AACAGTGGTCACAACTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLLDETGIESKAVSSEAEAKAGAPPCKAKAKTGATVSDQVLLLCDDDAGEGPSSLIKEEPISKQNEDKEEKLNEEQTEKLKQEPNGRIATCKEHPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRQPEIVIATPGRLWELVKEKHPHLSHLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLSDAQYNPERQTLVFSATLTLVHQAPTRILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDLYLYYFLMQYPGRTLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLKDCVLLATDVAARGLDIPEVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFKKIYKTLKKDEDIPVFPVQTKYMDTVKEEKLMSKKSVGGKNR	409216	395275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10141_pilon_-_395783_399918_400108_402332_402409_404649_405166_405451_405606_408835
878741	contig_6576_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_42242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAACCTGTGAAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289338	287909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_287900_289300
878742	contig_12802_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_114240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTCCAAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44539	42462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_42500_44500
878743	contig_14807_pilon	+	1603	2	Intergenic	novelGene_124741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	18	383	263720	264085	TRUE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNTTEMEGSDQQLSHAHGAGSLKVTFTVASTLHLGVSFHLLSLVHPILLPAGGLVISGIASLERWHSHSQALVQRQWGHLEMPHRPAHQGRTSHGPEAPCWPRASFAIALKGTLKGLSPEANSQVG	263702	266404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_264280_265378
878744	contig_9982_pilon	+	2827	1	Intergenic	novelGene_55727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATATTTCGTTTGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302855	305682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_302900_305700
878745	contig_12624_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_60938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCAGCCCAGCACTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5993	7577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6000_7600
878746	contig_12520_pilon	-	1127	1	Intergenic	novelGene_161061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTCAAAGTTTACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367541	366414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_366400_367500
878747	contig_18533_pilon	+	1622	2	Intergenic	novelGene_174050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	404	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAAAGGGGCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153005	156550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_+_154258_156180
878748	contig_13004_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_112597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACTCTTCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76756	77940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_76800_77900
878749	contig_8663_pilon	+	2126	2	Intergenic	novelGene_58009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	576	junction_1	0	72	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	106	810	263925	276645	FALSE	40	CTGAGAAGTAAGGTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRVTVAAVCAAGKFWREAGRELAALWRIEAWGPCEDSAAARHFPTLTMPGRNKAKSTCSCPDLQPNGQDLSESGRVARLGADESEEEGRRGPVSNAGDPEIVKSPSDPKQYRYIKLQNGLQALLISDLSNMEGKTGDATDDEEEEEEGEEEDDDDEDEDSGAEIEDDDEEGFDDEDEFDDDDEHDDDDLDTEDNELEELEERVEARKKTTEKQVRVISVKSFSSLGILWDKF	263819	277961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_264266_276281
878750	contig_11590_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_125601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGGTTTTATGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750431	752604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_750400_752600
878751	contig_14142_pilon	+	2685	4	Intergenic	novelGene_120445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCACCGTCCACTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90880	94337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_92973_93526_93749_93867_93944_94042
878752	contig_3426_pilon	+	3056	1	Intergenic	novelGene_57984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	2749	3054	616837	617142	NA	30	CCCCTTAAAATGCACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPPRLAARRETVPQKCPLPPPSKSASATASTEEQAELVPELPAAKKPEQAVLHHPHCRLRRKGPAEEQLNTFHLDWRDAARGQEGISGCTRLNRQHQNLL	614088	617144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_614100_617100
878753	contig_11720_pilon	-	2486	5	Intergenic	novelGene_43916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1739	2284	211460	209260	TRUE	30	TGCAGGATGGCAGAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMGTDGGGGGSNERDGVVRAVGSLPTLGVGWLVGGITCSCACPSADGVPPGAGLGKSNHPRWGLGLAPEPPAVPDSGSSGTGCRSAPPPGWTDTCSCAPFAASAPTASSSPGPGSRAPPCPQSPGSPLHTRDLGHSRVSSPSPSTVSSELSMVSAVPSKVRPGWERKSRSPEKRQEGPL	213198	208711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_208806_209151_209307_209944_210038_210842_210962_211173
878754	contig_6446_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_149233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCAGCCACGGTGTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491795	489027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_489000_491800
878755	contig_253_pilon	-	1294	7	Intergenic	novelGene_129652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	29.6928723209235	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	493	1269	281766	279983	FALSE	35	AAGAGAACAGTTTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAKHLTPVTLELGGKNPCYVDDDCDPQTVANRVVWFRCFNTGQTCVAPDYVLCSRETQERLLPAMQSAITRFYGEDPKSSPDLGRIIGEKQFRRLQGLLGCGRVAIGGQSDESERYIAPTVLVDVQETEPVMQEEIFGPILPIVNVRGLDEAVDFITRREKPLTLYAFSNNSQRPLLGAWFREGPHCVLLTDHNRGARPDSQASELGPHLSPPLWHPPCSSPHGWAAGWEPRVHLEAPTILLSPLPALFLFVLLR	289475	279957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_280232_280555_280723_281405_281793_283902_283957_284919_285113_285259_285371_289367
878756	contig_13894_pilon	+	3344	1	Intergenic	novelGene_62068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAATTTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288680	292024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_288700_292000
878757	contig_4689_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_165408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGGCGACCCGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087042	1087913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_+_1087000_1087900
878758	contig_6980_pilon	+	3753	1	Intergenic	novelGene_35993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCCTGAAACACGTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231356	235109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_231400_235100
878759	contig_13760_pilon	+	2208	10	Intergenic	novelGene_61326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1002	1436	245280	247203	TRUE	15	CATCCAGCCCGGCTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGMFFSGKILKEYSPVVQICTLWVASMSQDISGGPCRMRMASGSPDVQLSSTFTVTVRGLTAEPGRTLKMCASLWPDTPSKRQPRINAGVRGCHSSMRPMSTGASCGQTNSGFGAWPRRRRMLPGSFSLAIEAIEPFVAAQL	238293	274355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_238887_239122_239267_244781_244928_245161_245336_245784_245914_246248_246413_247117_247284_250125_250266_264595_264752_273959
878760	contig_13993_pilon	+	695	4	Intergenic	novelGene_178201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.7044966667418	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATTTTTGTACATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374	10140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13993_pilon_+_570_2376_2606_8693_8740_9915
878761	contig_160_pilon	-	2604	4	Intergenic	novelGene_156320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_3	53.4665004153691	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	708	1478	105783	73704	FALSE	20	ATCGCCAACATTTTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSKQIRILFLNEMEKLEKTLFRLEQGFELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLKWENPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHILPLDCVTLQTFLAKCMGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGVSRSCYSLADQLELNPDFSRPDRKYSWNDVGQLVEKLKKEWNILCITDVVYNHTGTSFINRLLFLRMLYSYHFIPCCLYNINFENTNDA	106490	72577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_74015_74909_75077_75663_75875_105701
878762	contig_7165_pilon	+	805	4	Intergenic	novelGene_116842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268931	279010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_269223_276517_276619_277628_277838_278806
878763	contig_14536_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_69308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGTCAAAATACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176472	178198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_176500_178200
878764	contig_9333_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_120319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATATGGCATTTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114494	112334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_112300_114500
878765	contig_12761_pilon	+	1609	2	Intergenic	novelGene_164050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	27	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	247	339	204615	204707	FALSE	15	ATTGCTTGTGTTTGCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVPEHGGGDVPVHLLPGAGVPPSHHRVPAQRVQGLPGQVLPGAGVQLPGLPLRPGPELRHADQPAAAGGAQPALPGLRQRPVMPKHFRPAFPCARGPGGYFSALILFLVGLT	201393	205977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_201494_204468
878766	contig_5499_pilon	+	1003	5	Intergenic	novelGene_56991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	55	junction_4	349.620866082103	183	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	3	608	803341	818533	FALSE	25	GAAGTGCCATGTTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTDKKAKDLEH	803338	818928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_818504
878767	contig_2730_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_135371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTGGGAAAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298108	300680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_298100_300700
878768	contig_19825_pilon	+	664	3	Intergenic	novelGene_59691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	7	683	junction_2	106	15983	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAATTTGGTGTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77834	82343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_+_77962_80559_80685_81931
878769	contig_5018_pilon	-	2449	1	Intergenic	novelGene_46933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1393	1710	209095	208778	NA	20	GAGTTGTGCTTCATCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRYSKDWGGSGKVRVTGWREGEREMIGEVLRRHPKPGAARAWRFAGRAPRHGCPDPRPSFLALPPLQDLLPAPLPPREDSLTVPNLPSSAMPTAIKPCCPLQP	210487	208038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_208000_210500
878770	contig_6102_pilon	-	1215	8	Intergenic	novelGene_32132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	380.844496628539	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	391	1215	820350	817409	FALSE	15	AAGCTGACTGTGTCTCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDASSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYEVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEED	822114	817408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_817472_818042_818256_818916_819040_819152_819312_819853_820039_820268_820391_821306_821521_821978
878771	contig_8640_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_117731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	651	1100	26353	25904	NA	45	TCAATTCTCAGTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIYVETPLYSACWIKGTCETSCHQVDSDSWRPHVLQSRTVLHRVFIAVTFWKQIARPVFRVASGCVRTAKILIGSPVQHMVLINHLTEEACILTDLGSLRSYLREWFRNKRRHLEIYHVGLKGYQRLHRGRILEFMKQRNTQEGSEE	27003	24840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_-_24800_27000
878772	contig_9074_pilon	-	1867	17	Intergenic	novelGene_156620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	239.799004376582	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	16	1731	111461	61565	TRUE	25	TTAACTTAATTTCTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPERQIPFHDVRFPPPVGYNKDINESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKPATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKESAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKRAHMLIDMHFRSLRTKLSLILRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKNGKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIIPPNSLPSSNSRVGPNPSEEKKHLDIKENSAHFSQPNSTKVQRGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQLRQIGASSRPPPNRTDKEKGYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTSGTNSEASNASETESDHRDELSDWSLAPTEEERENFLRRGDGRRRGGGGRGQGGRGRGGGFKGNDDHSRTDNRPRNPREAKGRTADGSLQVLKDQHRKDLGPR	111476	60529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_60648_61546_61607_62803_62887_63085_63269_64807_65004_67449_67537_70814_70950_71841_71952_76158_76238_76326_76498_78722_78840_78924_79019_79641_79791_80067_80140_82886_82981_88322_88376_111410
878773	contig_10426_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_144670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCTGGCAATCCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84274	81447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_81400_84300
878774	contig_12142_pilon	+	904	4	Intergenic	novelGene_147800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	71.899621386733	92	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	14	487	87452	95846	FALSE	5	ATCCTCGCCCTGTCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPARRCCLGWDFSTQQKLGKCCLPLLENAFQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQVKCGALLGTATHPTHGVSLERRCQPDGGGRDGGLGHVATVSTHSLLTRHPCTPGHGPALMGPPPCSSRKSLLL	87438	96263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88878_89007_94352_94423_95624
878775	contig_19469_pilon	+	967	10	Intergenic	novelGene_135006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATACTAAAAAATAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326659	361316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_+_326692_327558_327780_328242_328352_329393_329462_329887_330042_332298_332442_339280_339354_340313_340373_344987_345034_361254
878776	contig_5569_pilon	+	1562	9	Intergenic	novelGene_86717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	51.1566222497147	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	452	1102	61337	63783	FALSE	5	GGCTGTGACTCTCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERRLPLSSVLDVLEGRTQHPGVLYVQKQCSNLQTELPQLLPDLEPHVPWASEALGKMPDAVNFWLGEAAAVTSLHKDHYENLYCVVSGEKHFLLHPPSDRPFIPYELYTPAIFQLTEEGTFKVVDEEAVEKVPWIPLDPLAPDLARYPGYRRAQALRCTVQAGEMLYLPALWFHHVQQSHGCIAVNFWYDMEYDLRYSYFQLLDSLTKASGLN	39891	64243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_39981_52092_52219_61025_61180_61254_61509_61913_61971_62797_62894_63097_63175_63416_63577_63694
878777	contig_233_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_14497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAGCTTTTGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68741	66094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_66100_68700
878778	contig_9218_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_157683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAATGGCATTCTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306178	306606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_306200_306600
878779	contig_10323_pilon	-	1156	6	Intergenic	novelGene_123554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	190.067987835932	16	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	92	424	305132	268465	FALSE	50	AAGAAAATACGTGAGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRRRAGGAWCWAPGRLACLGVPRVKAAVMLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVEDFRNKVEDYIKRYAR	309134	267732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_285482_285551_292633_292700_295187_295218_305014_305149_309059
878780	contig_15613_pilon	-	1836	7	Intergenic	novelGene_147203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	216	junction_5	43.2550575077643	22	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	429	1436	130853	111270	FALSE	15	TCTAGCCACAGTTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAYYYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAISIRREKVEDAKEKEGSQFNYRVAFRTSELTTLRGAILEDAVPSTARHGTARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQALNSPKVSEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNEMAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDYELMFHVSTMLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKSIRSHFQHVFVIVKVHNPCTESVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSVGAIMWHVIARDYGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVIFNCSCRDVIGWTSGLMSIKVFYERGECILLSAVDNCAEDVREIVQRLGVSTCFVFSTTLISSTPGS	160302	110869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_111904_117671_117830_126058_126163_130741_130917_136894_137084_139303_139438_160260
878781	contig_19816_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_156458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTGGCAGGTCAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25345	26988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_25300_27000
878782	contig_19744_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_120412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGTATAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257647	258835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_257600_258800
878783	contig_15049_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_160727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	151	696	266980	266435	NA	50	TCTGAATAATAAAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLSQLEAASSLTPSSELTSSGQSELNNIDLVSLFSNASGDNNSSTVASDMALVNSGILTIDVNSVSSSLGGNLPVNNNSLGQMDPLVLVANSDIPSSLDSPLMLGSTAPVLQQSNLNPDDVQTVSAEALGCLVSLPVKNLSQDPQALTSSSNSALNRSTPTPSNSPGGNSHVPELLAPIKVERNLPPGPDVGPQERDKVVTQFGLSNPAENCSAQKDIDLSAVPGNLYLV	267130	264797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_264800_267100
878784	contig_3900_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_84186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	131	junction_1	0	41	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAATTCCAGCAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249292	230663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_232166_248802
878785	contig_12724_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_146873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGCTAACCATAAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446575	447480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_+_446600_447500
878786	contig_3797_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_120103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATTATCTGAAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401339	403324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_401300_403300
878787	contig_20949_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_178203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTGTAAAAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2509	4565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20949_pilon_+_2500_4600
878788	contig_9554_pilon	-	1666	5	Intergenic	novelGene_170685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	92.5216190952147	24	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	492	1145	89731	82668	FALSE	35	GACTCAGCAAAGTGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNMKEKSEEVTVEPWFIDLSLKIKKYYYCRQDLKETFIDSGVMSAIKEWLSPLPDRSLPALKIREELLKILQELPSVSQETLKHSGIGRAVMYLYKHPKESRSNKDMAGKLINEWSRPIFGLTSNYKGMTREEREQRDLEQMPQRRRMSSTGGQTPRRDLEKVLTGEEKALRPGDPGFCARARVPMPSNKDYVVRPKWNVEMESSRVSEQREQQG	90222	82146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_82810_85714_85772_86573_86686_88386_88505_89506
878789	contig_1379_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_134583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTAAAGAAAATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397618	399971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_397600_4e+05
878790	contig_3394_pilon	+	1332	6	Intergenic	novelGene_152679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	476	junction_5	124.581860637895	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	94	957	445602	511923	FALSE	5	AGCTGCTGTGCCTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEEGLWENGLSYECRTLLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTSVEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQYFYPMVLKKKEELKEEEELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSGASAGGHITVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQVLIGESGGTQSAVSHLGSQEGGMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKYVFWFMSGSWFSNHLLDDYMKRFQQAALS	431599	512298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_431686_445594_445679_504426_504573_507352_507548_507935_508125_511666
878791	contig_6954_pilon	+	799	1	Intergenic	novelGene_64456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	335	718	767900	768283	NA	45	CAGAAAATGTGAGTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDICRSRHRRFSCSQSKSRSKSLPRRSTSARQSRTPRRNSGSRGRSRSKSLQKRSKSIGKSQSSSPQKQTSSGTKSRSHGRHSDSIARSPCKSPKGYTNSETKAQTAKHSHFRSHSRSRSYRHKNSW	767565	768364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_767600_768400
878792	contig_4125_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_25152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAAACAGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874898	873434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_873400_874900
878793	contig_11372_pilon	+	1583	9	Intergenic	novelGene_176655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	53.4298605650436	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	77	1582	171966	272230	FALSE	0	CCTCCCTCTTTTTGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVVGSVKSWRGSLTGLLASYHVPCMRLPLAGVTTQEGRVKLCSESPQERPGSRRSLPGSLSEKSPSMEPSAATPFRVTGFLSRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAAASASAADNERSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCSALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLIS	171889	272231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_+_172024_174711_174816_198025_198178_262153_262308_264225_264325_265152_265708_269143_269289_269378_269524_272136
878794	contig_10003_pilon	+	1280	1	Intergenic	novelGene_88275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGGTTAAGCGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816564	817844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_816600_817800
878795	contig_19841_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_178204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTACAGGAAAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3063	21883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19841_pilon_+_3216_21376
878796	contig_4364_pilon	+	2280	5	Intergenic	novelGene_132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	6.18465843842649	227	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	180	503	1099737	1100594	FALSE	30	CAATGACAGTGTATTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLLASFSPSQDVYLGRPSLDHPIEATERAPGGGTVTTVKFWFATGGAGFCLSRGLALKMSPWAGLGSFMSTAERVRLPDDCTVGYIVEGLLGARLLHSPLFHSHLENLPRLPADAVLQQVTLSYGGPENPHNVVNVAGGFSLQQDPTRFKSVHCLLYPDTDWCPA	1099311	1102371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1099419_1099664_1099754_1099827_1099994_1100355_1100442_1100539
878797	contig_9389_pilon	-	1232	6	Intergenic	novelGene_83866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	26.4227174983952	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	124	573	31262	29009	TRUE	15	AACGGATGGCTGCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAYVCEWEKWPRSTLCPSVPLACAWSCRNLIAFTTDLRNDDQDLTRMIHILDTEHPWDVHSIDSEHREAITCLEWDQSGSRLLSADADGQIKCWSMADHLANSWESPVGSLVEGDPIVALSWLHNGVKLALHVEKSTTRLTDGCCLQ	32293	28061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_28256_28543_29048_29794_29965_30244_30353_31129_31300_32207
878798	contig_20614_pilon	+	1023	2	Intergenic	novelGene_107511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1	576	1119	2119	FALSE	5	ATGTCTGGCTTTGCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKYIASTQRPDGTWRKQRRVKEGYVPQEEVPVYENKYVKFFKSKPELPPGLSPEATAPATPPRPESGEPGLSKTAKRNLKRKEKRRQQQEKGEAEALSRTLEKVSLGETAQLPSAPQGSRAVATAVSDQPDSAAAEKAKKIKNLKKKLRQVEELQQRIQAGEISQPSKEQLEKLARRRALEEELEDLELGL	1118	2566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_1214_1638
878799	contig_20879_pilon	+	3422	9	Intergenic	novelGene_168601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2756	3220	171306	177862	TRUE	30	TCTGGAAAGGCGGGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDFSGGVHVVHQLNYIIPGRDILKETAGCVCISLLSTGLSLKESFVLELVMKIEEAEAEVVGCMVEGHLHVRSMLGDVQVPRLPEGFAGQVVRLQQEVTCTGSEEEGVIIAFIFNGRKRDNLYKVIRFKFHIQERLRFHSSSFEAAVELLRVL	166395	186273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_+_169023_170270_170383_171289_171345_172602_172668_173927_174081_174180_174226_177169_177290_177819_177939_186147
878800	contig_7165_pilon	-	963	2	Intergenic	novelGene_116918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	0	93	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAATACCCAGCAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233100	1231911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1232770_1232995
878801	contig_7815_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_134420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTGATTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951458	952855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_951500_952900
878802	contig_1406_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_25611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGCGGAGCGGCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2215434	2215077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2215100_2215400
878803	contig_3584_pilon	-	1661	5	Intergenic	novelGene_108120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	149.855555452576	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	343	933	254310	216538	FALSE	20	CACAGTTACTTTGGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGNVIWRHS	277362	215809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_216661_218252_218395_223202_223328_254109_254314_277023
878804	contig_7119_pilon	-	1077	7	Intergenic	novelGene_41006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	364.306494894371	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	246	638	195610	188651	FALSE	15	TTTTCCTCTAGTAAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDHYENPRNVGSLDKTSKNVGTGLVGAPACGDVMKLQIQVDEKGKIVDARFKTFGCGSAIASSSLATEWVKGKTVEEALTIKNTDIAKELCLPPVKLHCSMLAEDAIKAALADYKLKQEPKKGEAEKK	196785	188211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188737_191009_191089_193612_193724_194906_195021_195607_195676_196293_196379_196690
878805	contig_177_pilon	-	793	4	Intergenic	novelGene_41783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGACTGCGTAGGCGCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380960	377715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_378101_379329_379462_380570_380741_380854
878806	contig_3382_pilon	-	1823	1	Intergenic	novelGene_124079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTGTGTGTCGCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403197	401374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_401400_403200
878807	contig_5881_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_129033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAGTAACTTCAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258701	257618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_257600_258700
878808	contig_10196_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_132173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTTTTCATTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059364	1057462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1057500_1059400
878809	contig_5878_pilon	+	936	3	Intergenic	novelGene_145721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213042	215425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_213649_214925_214999_215168
878810	contig_15108_pilon	+	1627	1	Intergenic	novelGene_131188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	380	706	147468	147794	NA	30	ACGGCATGCTACCTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPWCGRDPGSFHLVALQSRMAAAAPAIRSAFQPIIKREEEGVGTHFPFKVMPCELCISCPLTSLWPELSYLVILLCRGNWEMLLLAGRQCALAKKEVFIKSEKDQK	147088	148715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_147100_148700
878811	contig_7962_pilon	-	1243	7	Intergenic	novelGene_149315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	93.6334460661479	567	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	537	899	447270	446742	FALSE	20	TCTAGCAGCCCTGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRGGPEKVRRLQLRWVDVAHLVLYHLSVCCKKKYFDFDREILPFTSENWDSLLLGELSDTPKGERSSKLLSALNSHKDRFPSGQGPGGGVSRPLGKRRRLEPEPLRQRQKGKVEELGRPSAVRNHPEPQEQRERARLQRALQASVSPPPPSPNQSYQGSSGYNFRPTDARCLPSSPIRMFASFHPSASTAGTSGDGEPPDRSPLELHIGFPTDTPKSAPNSMTASSSSVPAPSPGLPRRSAPPSPLCRSLSPGTGGGARGGAGSGYLSRGDPVRVLARRVRPDGSVQYLVEWGGGSIF	448820	446397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_447037_447202_447284_447562_447658_447742_447933_448332_448401_448509_448634_448774
878812	contig_1143_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_86585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGTCGTTGAGTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126738	125792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_125800_126700
878813	contig_2577_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_172046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	8186	7791	NA	5	CCCCTCCTTGTGCGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGQQFHHYGVPASGTRNKDSFPRPLRTTRPQQYCPAADNAQSSPRKAGSHLWQAKGTLVRRTLPDPGSLRPARDAGPLANGRATEEHPSPFGIPYSKLSQSKHLKARTGGGQWASSDSKRRTQAPRDHKDP	8186	6249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_6200_8200
878814	contig_6102_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_32406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGTCACTTCCTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1819095	1821450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1819100_1821400
878815	contig_10196_pilon	+	1119	2	Intergenic	novelGene_132076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTTTCTACCTGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827914	829373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_828651_828990
878816	contig_17829_pilon	-	2013	15	Intergenic	novelGene_157034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	105.19110403141	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	47	1801	57091	26438	FALSE	15	AACCCATTTCTCTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGELAGCFAARARPAMLAGSCAPREREAEGNGAGAVPAPPAIDFPAEGSDPKYDESDVPAELQVLKGPLQQPTFPFAVANQLLLVSLLEHLSHVHEPNQGRSRQVFKLLCQTFIKMGLLSSFTCSDEFSSLRLHHNRAITHLMRSAKEKVRQDPCDENSHIQKIRPREVAFEAQTSRYLNEFEEIAILGKGGYGRVYKVRNKLDGQYYAIKKILIKGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCPYVMVSVATKIFQELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACTDILQKNTDWTNRNGKGMPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKSDMYSLGVILLELFQPFGTEMERAEVLTGLRTGQIPKSLSKRCPVQAKYIQHLTRKNSSQRPSAVQLLQSELFQNSGNVLL	57137	26225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_26450_28032_28267_29240_29324_29537_29653_36213_36315_39444_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439_44521_45061_45162_45846_45885_47172_47307_48431_48591_56973
878817	contig_6589_pilon	-	1288	4	Intergenic	novelGene_25752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.31245915016974	33	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	85	762	645299	640289	FALSE	25	TTCTCCCAGCCTGATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGQSPDDLRKKLAPPQLPDNLEDPPGFESKDNYPLSKEELLSQVVKSLEAREQAREQHQKELAEVARKADSSPNGGFMGAQGASSATVLESTRSASGVPGSILSHRTNGILTSSGGRATGSNVGHVTFGIPSSSGGHESNHATYGDPGSTSSSASHATFRPVSSESYPASTGYQESSGGQEGAGGAESRGAGSESSGGPVSSTGPASSTGASSTTSKDYRGYY	645466	639762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_640820_640903_640983_645231_645336_645418
878818	contig_3382_pilon	+	1776	4	Intergenic	novelGene_124143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1.4142135623731	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	63	338	848014	850419	TRUE	25	CTTAATACGATCTGCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIVWAAESRESGRVRGSDVMALFVSLGTGTLSAPSARGGVGVSRRLPEAVASVAVPASRCHQVDADSQQPPRDRVRLPQRVSSVIIFMEADCQVFLPWSSWVGSNQEPFA	847017	852611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_847046_847979_848133_850262_850454_851207
878819	contig_9293_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_175196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGGGGGAAGGCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86831	88878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_+_86800_88900
878820	contig_8020_pilon	-	3324	1	Intergenic	novelGene_114426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1193	1516	268145	267822	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEKFTMTPVSPNYSIPSQVSELGLLPHSKRILKQSSIGDGCGIWNQTHLGKYQAPTYISENTYAPTVSNGFPFLKGMKTSTDCFREYTNASFRYLWWKMAITGTF	269337	266013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_266000_269300
878821	contig_20157_pilon	-	1236	8	Intergenic	novelGene_145861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGCCAAGAGCGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53892	40951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20157_pilon_-_41333_48493_48565_48786_48866_49548_49687_51046_51140_52574_52711_52846_52964_53671
878822	contig_16907_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_87474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCAGCAGCAGTAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492379	490325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_490300_492400
878823	contig_14142_pilon	+	2017	9	Intergenic	novelGene_120422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGGGAATTGCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15445	22057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_15553_15868_16106_17132_17233_17560_17678_17903_18021_18944_19102_19574_19656_19898_19984_21041
878824	contig_5765_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_141421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTCATTGAGTCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924943	923042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_923000_924900
878825	contig_1372_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_140525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCCAGAGATAACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487646	488651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_487600_488700
878826	contig_5916_pilon	-	1326	5	Intergenic	novelGene_158075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_4	381.130801038174	1199	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCAAAGATAAGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928211	899374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_900264_906485_906584_914232_914355_919315_919414_928092
878827	contig_10106_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_73907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	29	463	244814	244380	NA	35	TTAAACGGGAGCTAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKPSKPKTNMKHVAGAAAAGAVVGGLGGYMLGSAMSRPLIHFGNDYEDRYYRENMNRYPNQVYYRPVNEYSSQNNFVHDCVNITVKQHTVTTTTKGENFTETDVKIMERVVEQMCITQYEKEFQAYQRGSSVVLFSSPPVILLISFLIFLIVG	244842	242084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_242100_244800
878828	contig_5316_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_61224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAATTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421594	423177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_421600_423200
878829	contig_18869_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_55983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	187	645	59342	58884	NA	25	CCCTTCACCCTGGCAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGWGRECCFPSGTAWSRGLSFLGSGGREQRQAGPKGKQSKAVVRREAGVRGVRGELCLDKYMGVRWRAEHCALIQLPPSSLTGLTLPDQVLGLASKFRRYHNGFCSISMAVYVFVLVKALLNFLHTIQFAHLKYTTLRCLVYSELCNHHHSQFRNIGITSKGNHVPSSIHSPFLPNPQFPRPKPQIKSSAVESILTVSHSIWLFWTFHIIGVI	59528	57120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_57100_59500
878830	contig_11594_pilon	-	2287	4	Intergenic	novelGene_80944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	2.35702260395516	10	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	5	1483	585362	573511	FALSE	30	CAAAATCTTATCTGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGKIFRIWFEQLPTGRKRQEQFQEKIVAKREVKRRQQELEYQIKAELEIMPPRKSLRLQGLAQSTTVEIISVQVPPQTPSSPAKDKVVSTSEFVRCRNVSDSSIKRRLIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQCFLKLDLNQWLAVTASDKTRASYKPLPVTDTVFQINEYQEKDTGSVCSRHPSLSSGLSGGASKSKKMELIQPREPSSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPSFRGYAQQDAQEFLCELLDKIQHELETTGTRLPTLIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVTCLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKDTAFQPCLVTEMLAKFTETEALEGKIYVCDQCNSKHRKFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFEEILNMEPYCCKESLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGI	585366	572706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_573725_579101_579211_582020_582217_584402
878831	contig_7593_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_127272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTGACTAGGTTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10267	8196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_8200_10300
878832	contig_20420_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_172475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGAGAGAATAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18388	17331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_17300_18400
878833	contig_14526_pilon	+	2508	3	Intergenic	novelGene_111218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	818	1132	376378	376692	TRUE	55	CAGGGTAGATAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHSAVCHNLKTIRNFRQVHEKSRKQNWQSEKKHQIVFNWASSVFQYKNKLLLRRRGKHFIVQNFKIMSQTHLCSYFSLNHHFRWHKIWQLRQHLAFGEHLGS	375560	385517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_377326_381447_381625_384951
878834	contig_12599_pilon	-	975	2	Intergenic	novelGene_176963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGCTGTCTGCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28308	26260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_-_26810_27882
878835	contig_8140_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_86463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCAAATTTATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893179	894983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_893200_895000
878836	contig_5881_pilon	-	1562	3	Intergenic	novelGene_129036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_2	9	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	215	1258	598281	261878	FALSE	25	TTTAAACATGGTCTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCTSRATPASCTPPPAAGVSVSGREASSTLPRSPAQSYAAPPGLGSARQSPRCCAPGALPGHPGPGSQDKAMKPALLEVMRMNRICRMVLATCLGSFILVIFYFQIMRRNPFGVDICCRKRSRSPLQELYNPIQLELSNTAILHQMRRDQVTDICRANSAMSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNTSFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGGYLKFPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE	598495	261573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_262733_431863_431950_598178
878837	contig_14167_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_105535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCCCGGCAGCATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24458	25095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_24500_25100
878838	contig_13044_pilon	+	2698	1	Intergenic	novelGene_100009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGAGAAAATTCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253727	256425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_253700_256400
878839	contig_15857_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_152081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTTGCAATATATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137371	135398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_136755_137090
878840	contig_14326_pilon	-	2117	7	Intergenic	novelGene_120737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	64.8862252116905	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	657	1034	443129	442066	FALSE	35	TCTGAACAGTAAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	473619	440982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443468_444176_444332_445734_445901_447415_447627_473560
878841	contig_4305_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_136647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGAAATGAAAAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41308	40058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_40100_41300
878842	contig_11564_pilon	-	2900	7	Intergenic	novelGene_158589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	270.757989519957	35	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	72	1286	195486	171959	FALSE	15	TTTTTGTTATTTTTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQMPAEERIFGVVLLFSWTVYLWETFLAQRQRRIYKTTTHVPLELGQIMDSETFEKSRLYQLDKSTFSFWSGLYSEIEGTLILLFGGIPYLWRLSGRFCGYAGFGPEYEIIQSLVFLLLATLFSALTGLPWSLYNTFVIEEKHGFNQQTLGFFMKDAIKKFIVTQCILLPVSSLLLYIIKIGGDYFFIYAWLFTLVVSLVLVTIYADYIAPLFDKFTPLPEGKLKQEIEVMAKSIDFPLTKVYVVEGSKRSSHSNAYFYGFFKNKRIVLFDTLLEEYSVLNKDIQEESGMEPHRDGEGDSEEIKAKVKVSSFPRRLLLGFYKQFYDNSEHQFLHSECRIQGDYQIKTPCLLYNSGIWVGLPLLSHANYFKQDILISQFCFFFFHLQNKNGTSHPVQLGVVRIK	195557	170344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_172432_178147_178290_179798_179952_180361_180479_188507_188595_193267_193415_195390
878843	contig_13933_pilon	+	1700	11	Intergenic	novelGene_178205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTGGAGAAAATGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485525	500656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13933_pilon_+_486215_487408_487493_487714_487815_487987_488052_488169_488277_488748_488829_488953_489028_489124_489215_492096_492231_492424_492556_500509
878844	contig_16156_pilon	-	2194	10	Intergenic	novelGene_137067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	61.0472393487106	12	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	554	1285	116987	99837	FALSE	10	GGAGGCTGCTATTGGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGRQSEHEAKTARKSRAASGSPRESEDLGVEALRGRPELSCLEFSLRIQEFIELIRQNKRLDAVRHARKHFSQAEGSQLDEVRQVMGMLAFPSDTHISPYKDLLDPARWRMLIQQFRYDNYRLHQLGTSSVFTLTLQAGLSAIKTPQCYKEDGSSKSPDCPVCSRSLNKLAQPLPMAHCANSRLVCKISGDVMNENNPPMMLPNGYVYGYNSLLSIRQDDKVVCPRTKEVFHFSQAEKVYIM	160221	98927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_99933_100398_100595_102131_102266_106956_107066_112174_112252_116160_116275_116981_117105_123176_123381_133367_133555_160176
878845	contig_5093_pilon	-	2967	3	Intergenic	novelGene_135080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_2	52.5	136	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCAGCAGTCATTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653139	533266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_535961_540726_540859_652998
878846	contig_10475_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_148732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCATGCTCTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89721	90573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_89700_90600
878847	contig_13680_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_149585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTTGATAGACAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311876	313407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_311900_313400
878848	contig_10940_pilon	-	2263	1	Intergenic	novelGene_49300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGGCTTTGTCCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045536	1043273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_1043300_1045500
878849	contig_2703_pilon	-	2867	15	Intergenic	novelGene_101681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_11	54.1920714887787	52	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	51	2174	263452	245908	FALSE	10	TGATTTTCATGTGTGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKAPVTDTNIPSHLEQMLDILVQEENERESGETGPCMEYLLHHKILETLYTLGKADCPPGMKQQVLVFYTKLLGRIRQPLLPHINVHRPVQKLIRLCGEVLATPTENEEIQFLCIVCAKLKQDPYLVNFFLENKLKSLASKGTSDITSEDSLKDQGALSTDTGQSSQREELSGATGMEKTELEDEPSHQMDDLSTSLDNLNVTSLPEASVVRPNQDYNLVNSLLNLTRSPDGRIAVKACEGLMLLVSLPEPAAAKCLTQSTCLCELLTDRLASLYRALPQSVDPLDIETVEAINWGLDSYSHKEDASAFPGKRALISFLSWFDYCDQLIKEAQKTAAVALARAVHERFFIGVMEPQLMQTSEMGILTSTALLHRIVRQVTSDVLLQEMVFFILGEQREPETLSGISRHPLRHRLIEHCDHISDEISIMTLRMFEHLLQKPNEHILYNLVLRNLEERNYTEYKPLCLEDKDVVENGLIAGAVDLEEDPLFTDIAPDNTLSNQEWLSSSPPTTPDHPKTDGKTEVHKTVNSFLCLVPDEAKSSYHVEGTGYDTYLRDAHRQFRDYCAICLRWEWPGSPKALEKCNLEAAFFEGHFLKVLFDRMGRILDQPYDVNLQVTSVLSRLSLFPHPHIHEYLLDPYVNLASGCRSLFSVIVRVVGDLMVRIQRIQDFTPKLLLVRKRLLGLEPEGPIIDHITLLEGVIVLEEFCKELAAIAFVKYHASSTP	263502	245214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_246014_246097_246202_246547_246689_250658_250803_253229_253321_254183_254328_254730_254901_255073_255267_255348_255426_256062_256178_257272_257470_257647_257942_260114_260238_260637_260743_263332
878850	contig_13966_pilon	-	1198	6	Intergenic	novelGene_158149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	65.8464881371816	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	698	1156	415811	412840	FALSE	45	GCTCAAACGTTGGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNFLIQVTGKKRVVLFSPRDAQYLYLSGTKSAVLNIDNPDLAKYPLFSNARRYECSLEAGDVLFIPALWFHNVISEEFGVGVNVFWKHLPSECYDKTDTYGNKDPTAASRAAQILDRALKTLAELPEEYRDFYARRMVLHIQDKAYSKNFE	420427	412797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13966_pilon_-_413097_415225_415343_415726_415815_417992_418131_419096_419142_419916
878851	contig_7318_pilon	+	1465	3	Intergenic	novelGene_152218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_2	9	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	55	318	242289	245333	FALSE	40	AAGCACGAGGGAGTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGGALKKGAIARTLQAVKMVLSYQPEELEWDSPHRTNQQQCYCYCGGPGEWYLRMLQCYRCRQWFHEACTQCLNEPMMFGDRFYLFFCSVCNQGPEYIERLPLRW	242234	246480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_+_242384_244487_244584_245260
878852	contig_20716_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_176136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGCAATCACTTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111887	113397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_+_111900_113400
878853	contig_14744_pilon	+	1733	8	Intergenic	novelGene_66103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_4	97.1067159660664	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	723	1733	1494270	1503459	FALSE	35	CTCATCAATAGTGACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWTCSNDYIDQWCNPGNQAFHYVCQRLGVSHIITEPKEEAITTSEVINQLLHHVGAMCIHQLNLLATNPNLPITSVLGKQHPIEAHHLSSICDIMEKAMVNGDTCIIRCILVVFQVVFKFFFSPQTERNRDIIRRSGLLLWQLLMAPKDQICPDIQKEVCLAISSGLNILYPGETEINNLLKLVLTEGERNSGLSQLRDVILTNLAEQLQYNRFGSDEDDHYRLNDELLHYILKIVVRESCILITKCQTVSKDDFQKLLSTVPAASSCLRYLMAVQNHLLSNTVLIKPDENDDSDNSLQGETLKVQELKVSILALATQILTGCDEVLEMLQQVTTA	1493547	1503459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1494385_1495337_1495571_1495951_1496098_1498952_1499024_1499767_1499874_1500448_1500570_1501241_1501371_1503369
878854	contig_2414_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_158463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGGGTCAAAAAAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173188	175362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_173200_175400
878855	contig_6902_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_135568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTGCAAGATCACGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435376	434337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_434300_435400
878856	contig_987_pilon	+	1343	11	Intergenic	novelGene_72298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	411.244161052774	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	351	1175	956443	967663	TRUE	50	TAAAAAATTCACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGIGSLALYEKADIKVPEGKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEVATLTAAGKEVMLVGVGDKIRGILHRTHSDQFLVTFKEVGRKPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTDEKPIFSLNTIASAESMSIYDDIDADVLQNYQEYNLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD	945375	968491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_945476_946230_946465_956426_956462_957008_957141_962301_962507_963036_963181_963302_963368_964553_964710_965183_965281_967656_967694_968353
878858	contig_18545_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_161882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1662	2117	249304	248849	NA	70	CTGGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTAAGASSHRPWSLRTLGFRGVARSPPRAGPICSWFLSPTPRLLFHPSQGGRHTPRPGSALCLFHNFRGIGRQCTFSFCFALGLQVWSLGSSGGRLHPPSLGHLRRPLALLVHLDQDQRRERVSKIPQEKAAGSSEAERLGQTVFPDDL	250965	248698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_-_248700_251000
878859	contig_3948_pilon	+	1828	12	Intergenic	novelGene_53248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	876	1307	1208738	1212551	TRUE	5	CCCACGTGCGCTCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFTVSQAFPPALSCMGEKLIIQCTATETQQAICPHLSVHFRQEEEELLLEVRWEGMEGPSVDQSTEIGVDKNRPRCLKIYLLPSVAFHLTCGWLPEASQERGRVPGDLSLATNSSAAQGQRAAAAAGRAATLTIGMAAREP	1206859	1276975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1207009_1207479_1208114_1208645_1208750_1210308_1210403_1210490_1210662_1211922_1212073_1212546_1212641_1213259_1213359_1213433_1213557_1268275_1268385_1270824_1270912_1276961
878860	contig_8045_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_35340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATTCTGCTTACTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101386	99289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_99300_101400
878861	contig_10017_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_156996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTTGCAGAGCACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344610	345858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_344600_345900
878862	contig_10235_pilon	+	1395	4	Intergenic	novelGene_46290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	22.86676384819	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	139	756	75775	76714	FALSE	10	CGTCTGTGTATATCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRPGRLYLLRVHGNPLLLLLLGLLLALLSETQGLPGVGLSPSAAPTAQQHPKKHFTSGTLKPAAHLIGDPSTQTSLRWRANTDHAFLRHGFALSNNSLLVPTSGLYFVYSQVVFSGEGCSPKATPTPLYLAHEVQLFSSQYPSHVPLLSAQKSVCPGPQGPWVRSVYQGAVFLLTRGDQLSTHTVGSSHLLLSPSSVFFGAFAL	75363	77353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_75493_75765_75874_75959_76066_76301
878863	contig_7056_pilon	-	2544	1	Intergenic	novelGene_43661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	1754	2509	761602	760847	NA	5	TCTCGTTGAGGCTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPHGLGEQAAPAACSLGLLPPSSAPGLPSAFRTPGLSKHGTGPGRQRPRSSPLAARAPDAARPDPALEAFGGPIPGHAGRLWEQLRQFWADHFSRRFSPRRPPLRRISSMSTFYLLDHRTRQAELGLCYGAPRTRLSDETFVFRGGRWEAESSLGRSRLPQPSPTVSGLKANVQRVRSQVLLEENNYLKLQQELLMDMLTETTARMHLLEKKLDADASPAGAARAWQRKLHNRQSVSGVLMIEPRALEAR	763355	760811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_760800_763400
878864	contig_9233_pilon	-	2655	1	Intergenic	novelGene_78260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACTATAGAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698420	695765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_695800_698400
878865	contig_8907_pilon	+	1726	1	Intergenic	novelGene_85822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTTTAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180271	181997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_180300_182000
878866	contig_3285_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_153383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	69	800	73399	72668	NA	20	TGGTTGCCAACCCCGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAALSGRGEAVVSVPGFVNPVMDPEGRVARRRSSLLPWLLLLWSRLALGTLSFGSSPHGVLHDLLSEQQLLEVEDLSLSLLQGGGLGPQSLPPDLPNLDPECRELLLDFANSSAELTGCIVRSARPVRLCQTCYPLFQQVANKMDNISRAVGVGRRAHQGPLAWRVGKGRGCRWWSALGNLSFPTCKKRDLDWVCGVWGIRKMGGVMGLRIWNFAPVSAVEHPLGTYLRIDMTGFLGTSELLILLLFSSPPFRHSFLPISTWSF	73467	71262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_71300_73500
878867	contig_2444_pilon	+	2341	13	Intergenic	novelGene_83769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	381.694540466879	3	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	244	1917	231271	243030	TRUE	45	AAGTTAATAACTGTATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLPAVLRQMRPVPRVLASHLTRAYAKDVKFGADARALMLQGVDLLADAVAVTMGPKGRTVIIEQSWGSPKVTKDGVTVAKSIDLKDKYKNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLARSIAKEGFEKISKGANPVEIRRGVMLAVDAVIAELKKQSKPVTTPEEIAQVATISANGDKEIGSIISDAMKKVGRKGVITVKDGKTLNDELEIIEGMKFDRGYISPYFINTSKGQKCEFQDAYVLLSEKKISSVQSIVPALEIANAHRKPLVIMLKVGLQVVAVKAPGFGDNRKNQLKDMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQSHDLGKVGEVIVTKDDAMLLKGKGDKAQIEKRIQEIIEQLDITTSEYEKEKLNERLAKLSDGVAVLKVGGTSDVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVLGGGCALLRCIPALDSLIPANEDQKIGIEIIKRTLKIPAMTIAKNAGVEGSLIVEKIMQSSSEIGYDAMLGDFVNMVEKGIIDPTKVVRTALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGGMGGMGGGMGGGMF	230308	243491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_230550_231268_231445_232598_232852_234422_234506_235503_235600_236019_236114_238920_239042_240847_240948_241446_241693_242125_242301_242567_242747_242877_243333_243369
878868	contig_7870_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_108953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAGAAATTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319571	318252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_318300_319600
878869	contig_15047_pilon	+	1390	2	Intergenic	novelGene_52294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	403	885	129120	130117	FALSE	20	GTTGATGGTGGGGCACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSLVSFPPGEGREEGAFLRIHLHTTVYTPGLEAPALSSGCWALGLDANTAPWASEICLPGNLDATANTGHMEPGVTTITLNPGHCLFLGQAAVGSCTGFPTPSCRGGHVGAHWVLPRTPTTVSRKLRGRHKNQGHWKPAGCQWGFLSSLFLPGLHEDW	128717	130622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_129536_130050
878870	contig_10734_pilon	-	1143	1	Intergenic	novelGene_51063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	16	525	437052	436543	NA	20	TTGGGGTTTTGGCATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRIHMSKRFGNSSSKRLRGITVINTKDGVRFRPLWGAIRVGKGVTQRRGRFLSGQEGAAGVSGNLHPEERPESALRTGAGARHDRWLSLGEKGSLVPPGAALAPQLVRTPVLGRRLGWACATTEGGVCPTSPPLHTYFAAKTVKPTLCGKLIFSGGHFQPLCLLHAKGPKTGA	437067	435924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_435900_437100
878871	contig_5023_pilon	-	2684	13	Intergenic	novelGene_7138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2102	2407	353590	353285	TRUE	20	GTAGCAAAGCGCCGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAKGPMKKQRQLQSGSRSSPWLPPGGRKSCNGGCTSWGLIQVTLGLENRMSTGEGEWSESERQGEPSTSTESSLILSQGSTEVSCRPVDCDSIFPGSGLV	405973	323648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_323838_353196_353848_358603_358687_359328_359540_369251_369354_369821_369883_370402_370538_373031_373207_375330_375398_387160_387395_388219_388278_402035_402248_405467
878872	contig_12793_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_164115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189260	186711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_186700_189300
878873	contig_20600_pilon	+	2240	2	Intergenic	novelGene_137118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	81	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	3	479	132416	133370	FALSE	35	AGGAAAGGAACATTTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETYRKPVLGKAYERDSSLTLSRLFDRLKLQDSSKKETDSKSAVEDSTLSKYSQTSTWKVASVWGRGDTDRGSRKRSRSIPSSLQASGREETRSELSGRTTQTEGSSAEGTFSRAATLSRGQPRKKKRKPKVDYQQVFTRHINQIFIRGENVLLVHLAQ	132413	135131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20600_pilon_+_132482_132959
878874	contig_501_pilon	+	3610	2	Intergenic	novelGene_134892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725767	729536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_725826_725984
878875	contig_3602_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_60543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	153	353	270872	270672	NA	40	CCTAATTAAAGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLILSLSLFLTPYLSLGFLSVFLSLPAPLCTLPPLPPPGSFGFSSDVFIMDTIGGGEVSLGDLADLTVTNDNDLSCDVSSWGTPPQPHPIGPCPHSSMMPAPAELSLGTRPVLAP	271024	269542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_269500_271000
878876	contig_10196_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_132248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	51	323	1792723	1792451	NA	90	AAAAAAACAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWFSCVLEKSSPHLHCMHLTQQNRILCKWEEAALGRRPSPITGLIRSPRPPLLGRDLLKQQKQVRRNLNVQPASRHHGEPSFTGPPGGPSQSPELLPHHSALSTQY	1792773	1791552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1791600_1792800
878877	contig_11304_pilon	+	1806	4	Intergenic	novelGene_156734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	107.079409785448	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	470	928	554560	557848	TRUE	30	AATTGATTGGTTCACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKRFKGKSEKDKVFGPTLALLTFVFCDHTGKNIKKPPPKSYLIHAGLEPLTFTNMFPSWEHREDIAEITEMDTEVSNQITLVEDVLAKLCKTIYPLADLLARPLPEGVDPLKLEIYLTDEDFEFALDMTRDEYNALPSWKQVNLKKTKGLF	554090	558777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_554776_557511_557668_557761_558105_558155
878878	contig_2733_pilon	+	305	2	Intergenic	novelGene_128582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1	303	772108	821797	FALSE	75	CGAGAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQLHPSPQNTPQKVPVRQHSPSEPFLEKPGLDVTQVSGPNTQLGKSEDYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIVAEDSSKSFGKDDFPGGVDNQELSRNSLDGSQ	772107	821799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_772162_821548
878879	contig_16541_pilon	-	2720	1	Intergenic	novelGene_126735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGGATGGCCAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310854	308134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_308100_310900
878880	contig_10258_pilon	+	969	3	Intergenic	novelGene_155055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	3	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAATGTTACTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116870	124880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_117023_123574_123701_124189
878881	contig_9535_pilon	+	1131	3	Intergenic	novelGene_124469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	55	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	53	1129	246363	274054	FALSE	50	GGAAAAAAGTGAAAACGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPQNCDPNIPLVAQELMKKMIRQFAIEYISKSGKIQENRNGSVGPSLICKSIQMNQAESSLQEEQEGPLDLTVNRMQEQNTQQGDGVLDLSTKKTSIKSEESSICDPPSENSMAGSTVDANSEEATKMEKEKSALSKVLESLCIHHQQQILAMLKILVQEQNAASVCCCNTSYAVSSESQKPLIEDDLRGLYCSCGEYRLAERGCLQNERRSPGLAPLSDCIKDLHCLSCQTVTIEHIETVVNRRISDRYDSLRCCSGPLPNIHPTKSACHTPPLSREVCDVSINLKDVCRSRSPSPPRLSPVQTEEFEKLKDVISKFSALENNKLETNINQPPSLIPAEVSSDKDDNEGKIYKTKISINSDSLLLGDSNNYNTN	246310	274056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_246565_265223_265318_273273
878882	contig_8587_pilon	+	2565	13	Intergenic	novelGene_159117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	15.0690540143995	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	1267	2565	173685	179681	FALSE	30	CACTCAGCCAAGGGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTWVFGAERWDNLIYYALGGHKDAIVACFFESCSLDLYTLSQDGALCVWQCDTPPEGLRLMAPRGWKADLLKRDEDVEDDADRERETTVRGTATPAEEEKKGKVKYTRLAKYFFNKEGDFNNLTAAAYHKKTHLLVTGFASGTFHLHELPEFNLIHSLSISDQSISSVAINSTGDWVAFGCSGLGQLLVWEWQSESYVLKQQGHFNSMVTLAYSPDGQYIATGGDDGKVKVWNTLSGFCFITFTEHSSGVTGVTFTSTGYVIVTSSMDGTVRAFDLHRYRNFRTFTSPRPTQFSCVAVDGSGEIVSAGAQDSFEVFIWSMQTGRLLDVLSGHEGPISGLSFNPAKSVLASASWDKTVRLWDMFDSWRTKETLALTSDALAVTFRPDGAELAVATLNSQITFWDPENAVQTGSIEGRHDLRAGRKELDKITAK	166356	179681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_166426_168271_168385_169728_169824_171635_172600_173659_173796_174130_174355_175056_175201_175969_176041_176721_176859_177477_177627_177825_177974_178217_178369_179517
878883	contig_7695_pilon	-	3786	18	Intergenic	novelGene_41667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	315.031365495048	29	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	2828	3646	903807	896494	FALSE	45	GAAATGAATATGTAACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTRSLPPWLIAMQRYGPPPSYPNLKIPGLNSPIPESCSFGYHAGGWGKPPVDETGKPLYGDVFGTNAAEFQTKTEEEEIDRTPWGELEPSDEESSEEEEEEESDEDKPDETGFITPADSGLITPGGFSSVPAGMETPELIELRKKKIEEAMDGSETPQLFTVLPEKRTATVGGAMMGSTHIYDMSTVMSRKGPAPELQGVEVALAPEELELDPMAMTQKYEEHVREQQAQVEKEDFSDMVAEHAAKQKQKKRKAQPQDSRGGSKKYKEFKF	912852	896353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_896566_896931_897118_897219_897320_901340_901443_901530_901674_901959_902068_903699_903809_903914_904005_904635_905995_906230_906312_906494_906597_907274_907957_908116_908214_908578_908630_910760_910836_912102_912181_912460_912508_912688
878884	contig_15849_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_176064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTCACTGTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111272	112334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_111300_112300
878885	contig_12672_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_141478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90867	91697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_90900_91700
878886	contig_4782_pilon	+	1191	2	Intergenic	novelGene_73662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543724	547486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_544891_547461
878887	contig_9038_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_143325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAGGTGAAATAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387108	384660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_384700_387100
878888	contig_1309_pilon	+	2270	14	Intergenic	novelGene_73961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_4	278.352613630253	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2256	14	2269	109345	170075	FALSE	50	CAAGAAAAATTGGATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQQMYGRGPPAPHIVGSTSGSFQGAASSASHLYTSASQPYSFVNHYNNPVMYSANSSATSQGFPSTCGNYAMSTVSNAAYPNVSYRSLPAGDPYGQMFTSQNVLTVRPLKDSSFSGHNTPISHPSPLPPPPSQQHQQQQSLSGYNTLSWSAPGLQSTQDSLIRNHTGSLDTDSNNPTHTDSLSCPVMQNVQPPKPSPVVSTVLSGTSSTRTPPAANHPVKPVASVPQPAELLQQKGVDSSSTTSSASPMPNSYDALEGGSYPDMLSSSASSPAPDPAPEPDPVPTLASAVPQPTKMAKPFGYGYPTLQPGYQNATAPLNSGVQSSSPVYSGFQHYAQYPGMNQLSSSLGGLSLQSSPQPDSLRPVNLTQERNILPMTPIWAPVPNLNVDLRKLNCSPDSFRCTLTNIPQTQALLNKAKLPLGLLLHPFRDLTQLPVITSNTIVRCRSCRTYINPFVSFIDQRRWKCNLCYRVNDVPEEFMYNPLTRSYGEPHKRPEVQNSTVEFIASSDYMLRPPQPAVYLFVLDVSHNAVEAGYLTVLCQSLLENLDKLPGDSRTRIGFMTFDSTIHFYNLQEGLSQPQMLIVSDIDDVFLPTPPDSLLVNLYESKELIKDLLNALPNMFTNTRETHSALGPALQAAFKLMSPTGGRVSVFQTQLPSIGAGLLQSREDPNQRSSTKVVQHLGPATDFYKKLALDCSGQQTAVDLFLLSSQYSDLASLACISKYSAGCIYYYPSFHYTHNPSQAEKLHKDLKRYL	109331	170076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_109874_124480_124649_147447_147529_148523_148748_155381_155564_157791_157895_160201_160329_161086_161197_163771_163885_166785_166905_167229_167289_167553_167761_169144_169269_169965
878889	contig_1996_pilon	-	943	6	Intergenic	novelGene_131955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	23.4350165350912	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	6	860	527304	523904	FALSE	0	GGTGCTCTTTGGGCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSDPVRRRALARLVLRLNAPLCVLSYVAGIAWFLALAFPPLTQGTYMSENAMGSTMVEEQFVGGDRARNFARDFAAHRRKSGALPVAWLERAMRSVGLEVYTQTFSRKLPFPDETHERYMVSGTNVYGILRAPRAASTESLVLTVPCGSDSANSQAVGLLLALIYLALQLGCIALINFSLGFLLAATMVPAAALTEPRGPRSLYAALLVLTSPAATLLGSLFLWRELQEAPLSLAEGWQLFLAALSQGVLEHYTYGALLFPILALGLYPCWLLFWNVLFWK	527309	523820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_524148_524357_524475_526228_526357_526590_526703_526786_526967_527230
878890	contig_6266_pilon	+	1730	16	Intergenic	novelGene_170999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCCAGGCCCGCCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799749	923681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_799815_802708_802759_805873_805956_812635_812749_813966_814120_816466_816612_820884_820981_826093_826211_829654_829800_834820_834902_845028_845156_846072_846171_846287_846374_848837_849043_852133_852260_923640
878891	contig_16620_pilon	+	2411	2	Intergenic	novelGene_156000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15936	19558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_16295_17505
878892	contig_5854_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_68856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	532	873	8833	9174	NA	15	CTCATTCTTATTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEESKEDGRNTQNHCTKKDLVNIQSFQEVTYDQELMVLRGEVQAALKALVKNKSAGIQEYQLRCFNKWMQHWKHSLYAKKFGRQLPSGRHPYLYLFQRKVIQQNVKIIKQYH	8301	10513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_8300_10500
878893	contig_10016_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_117865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGGAAAAATTGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370280	369087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_369100_370300
878894	contig_11632_pilon	-	1853	1	Intergenic	novelGene_177105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAGATTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2982	1129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11632_pilon_-_1100_3000
878895	contig_8156_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_98900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGCACTGACAAATAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29260	30922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_29300_30900
878896	contig_3789_pilon	+	404	1	Intergenic	novelGene_79903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGAACAGACACTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646200	646604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_646200_646600
878897	contig_7123_pilon	+	375	2	Intergenic	novelGene_170584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	72	371	547895	548434	FALSE	45	TTAACGAAACAGATTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSETSILSCGKRNRRQHKRKSILTECFIKRKRLDRNCKPTDSANKERNVLALRHVSNESKCSNRRVQKKKVFKNFVKTDRSVINNSFSNKARPETKIN	547823	548438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_547937_548176
878898	contig_5918_pilon	+	3285	1	Intergenic	novelGene_99554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGCCTGTAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784103	787388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_784100_787400
878899	contig_3789_pilon	-	1880	6	Intergenic	novelGene_79837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	17.8594512793647	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	31	771	389014	377344	FALSE	10	TTGCAGTGGCTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKQQQDQREMELRRLDDEIERKVYMRDQEIAATAKDLEMRNLELESQTRLFEKKLNRNQEAVAKEMREDTDAYRRKVDLEEHVFHKLLETDQAQSLKAQKIIEENLANAEQACIDADWRLQALHTQRCDALQRNERYQEVAKLLRNNRRKEMEVLNAAMEAEAKKWEEAEEKEFHLRSEKRASALSDASRRWFLEQELSDALEHAENPCCEVSLNRRKLDWDTTEQDLLEKVRNLRQRLTAQARSRCQPPHVLAT	389044	376234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_377478_378263_378403_378914_379110_380509_380651_383370_383464_388975
878900	contig_2278_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_118124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACCAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999520	1000751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_999500_1000800
878901	contig_7342_pilon	+	2372	2	Intergenic	novelGene_71149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327668	331034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_328758_329751
878902	contig_15629_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_122486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTAAGTAAGAACAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209368	211454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_209400_211500
878903	contig_3948_pilon	-	3637	4	Intergenic	novelGene_53156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	20.8219969156552	25	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	2231	2971	115206	95293	FALSE	70	AACAAAAAATAAATAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTEMRKTGSELVSRQHSPGSADSLSNDSQREFSSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERARMEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWERHHRLCGQNLHGQSPHSQSRPLLPGGRGTSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASVTAIDTSGL	117436	94626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_95593_99681_99873_102851_102921_115025
878904	contig_7521_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_160551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGGGATTTTGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307611	308053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_307600_308100
878905	contig_9460_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_155315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCCCTGTCCAACTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383978	385205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9460_pilon_+_384000_385200
878906	contig_13456_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_153312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGCTCATTGTAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586402	588484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_586400_588500
878907	contig_3382_pilon	+	2388	2	Intergenic	novelGene_124139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATAGGCTAACTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829568	843859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_830547_842449
878908	contig_12654_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_129261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATATGCTCTTGCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82178	79787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_79800_82200
878909	contig_4876_pilon	-	1322	2	Intergenic	novelGene_137920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	382	junction_1	0	115	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	243	554	654022	633288	FALSE	20	AGTTTGCTTATGTACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLGPPPAYSPSNGDFTFVSSADAEDLSGSIPSPDVRLNLGGDFSKESTATAFLRQRGYGWLLEVEDDDPEDNKPLLCVKIIICIFLLFRLICGIIMFLHVI	654264	632519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_633521_653943
878910	contig_1244_pilon	-	1024	2	Intergenic	novelGene_38089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCTTAGAGATGACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578210	1571325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1571521_1577381
878911	contig_21208_pilon	+	1850	5	Intergenic	novelGene_175774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	58.7430846993925	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTCCCCACATCTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41608	54767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_41859_45632_45712_47424_48773_53579_53686_54700
878912	contig_4232_pilon	-	1359	2	Intergenic	novelGene_63463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAACCCTGGATGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557377	555919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_556311_556409
878913	contig_20753_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_168255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60639	59339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_59300_60600
878914	contig_8682_pilon	+	321	1	Intergenic	novelGene_165285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGTGCAGGTATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211969	212290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_212000_212300
878915	contig_6677_pilon	+	1369	2	Intergenic	novelGene_114181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	448	765	474387	474704	FALSE	15	TTCCTGGCAGTATCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFHTWQFYDLIFILFLWSAIAVALVGLLLLTWVDYIQITGFSNYIYIKDSWICICLVQTCFVSFRPAYSATAWHFHLDSSQTRVQNSAYIISSFPNLLFCLYLS	473832	475308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_474006_474112
878916	contig_5479_pilon	+	3688	1	Intergenic	novelGene_133593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1793	2095	269147	269449	NA	25	TGGTGGTACAGTGGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTSWALASALEPSESSLICLPFISPGEFPSCQVKIHHLSSFFKTCCIHKSLHKCGLLFKPSKGLGIWNIKPEQSESFFYILPCHILSEGERRGGKGKK	267354	271042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_267400_271000
878917	contig_13760_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_61366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415527	416671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_415500_416700
878918	contig_401_pilon	-	792	1	Intergenic	novelGene_42728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGCAGCCAGGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105269	104477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_104500_105300
878919	contig_14142_pilon	+	1690	9	Intergenic	novelGene_120583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.8828994298395	62	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	949	1329	553689	557303	TRUE	30	TTTGGACATTGGAAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVQAPPGTTIGHVLQTWHPFLPKFSIQDADRPTVLRVVGPCWTCGCGTDTNFEVKTRDESRSVGRISKQWGGLLRETLTDADDFGLQFPMDLDVKVKAVLLGATFLIDYMFFEKQGGTGPSAITS	551901	557942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_552148_552353_552536_552781_553038_553121_553165_553277_553499_553688_553851_556902_557065_557246_557317_557594
878920	contig_1143_pilon	+	979	1	Intergenic	novelGene_86616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAACTTATTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816199	817178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_816200_817200
878921	contig_2069_pilon	+	2589	8	Intergenic	novelGene_23228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAAAAAGGCGGAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235071	260589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_236801_237536_237621_241276_241413_246539_246627_253829_253983_254717_254775_258949_259012_260308
878922	contig_11855_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_67096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	173.780572849787	5	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	912	1547	2445507	2446910	FALSE	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPLDSLRRRPQASSILLHPLRSHTISVRATQFSACLGSSAHHPAPPKGKKKAGGNSRLLVVE	2431686	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2432380_2441567_2441665_2443329_2443442_2445497_2445956_2446723
878923	contig_6241_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_156439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342891	341268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_341300_342900
878924	contig_18584_pilon	+	1583	2	Intergenic	novelGene_171428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAAGCGAAAGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20426	23229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18584_pilon_+_20610_21829
878925	contig_5467_pilon	+	1029	7	Intergenic	novelGene_111970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	84.5826354651014	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	163	1029	145174	155967	FALSE	20	AGGGCCCAGGTGACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPSGGPVGDQDMLAEESSLGKPAMLHLPSEQGASEPLQRCLEENQELRDAIRQSNQMLRERCEELVHFQVSQREEKEFLMQKFQKARKLVEKLSLEKLELKRQREQALQEVEHLKRCQQQMAEDKASVKAQVTSLLGELQESQSRLEAANKDRQALEGRARAASEQARQLESEREALQQQHSVQVDQLRMQSQSVEAALRMERQAASEEKRKLAQLQVAYHQLFQDYDNHIKSSMASSERNRGIQLEDLKQQLQQAEEALVAKQELIDKLKEEAEQHKTVMETVPVL	141649	155967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_141761_145122_145325_149467_149680_151185_151305_151808_151962_154687_154785_155832
878926	contig_18970_pilon	+	784	2	Intergenic	novelGene_157814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	102	425	31445	31768	TRUE	15	ACCTCTCTGGGTCTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGWVSPYPRSSSSGSSLNTLCRDHLLLHGAPLMCDLAAVAVMRPPLREQSQAAAGCILFDAGFGGLRGLHTLGDGCAVFLPGHSHGTRVEVIHETHQCGLVGLELL	31343	38785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_+_31816_38473
878927	contig_14219_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_54338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1356	1658	799061	799363	NA	35	CAGTACGGTAAGAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVTQPLFAESEEDLKQLLMKIKDYNSLQYGLHLNIKKTKILTTVPISNITINRDKTDVVKDFILLTSTINTHGSNSQEIKRHTALGKSAAKDLFKVSEK	797705	800415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_797700_800400
878928	contig_10734_pilon	-	2345	7	Intergenic	novelGene_51125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	6.79256129077161	95	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	609	1661	745893	740928	FALSE	10	CAGCCTTCTGAGTTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGAPRRFCRCACFCSENLYVARYGLHLRFRGKQQLLRDYGPTLRDRGCVSPKDFQQLLAELEQEVERRRQLGQESAARKALIASSYRPARPEVYASLQAVALAPEFLAAAEYSASPGADLKGLLQRLETLSEEKRIYRVPVFTASFCQALLEELEHFEQSDLPKGRPNTMNNYGVLLHELGLDEPLVTPLRERFLQPLMALLYPEYCGGPLDSHRAFVVKYAPGQDRELGYHYDNAELTLNVALGKAFTGGALYFGGLFQAPAALTEPLEVEHVVGQGILHRGGQLHGARPLGTGERWNLVVWLRASAVRNHLCPMCCRKPDLVDDEGFGDGFTREEPTTVDVCMLT	746501	740243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_741192_741265_741524_741763_741892_743411_743512_743608_743723_745262_745320_745761
878929	contig_1261_pilon	-	1379	3	Intergenic	novelGene_168140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	489	junction_1	12	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAACTTGTGTAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16036	13977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_-_14070_14640_14794_14902
878930	contig_10777_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_101174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTTTTTTTTTTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52040	51064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_51100_52000
878931	contig_4931_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_138349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAATGAGAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151716	149983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_-_150000_151700
878932	contig_4686_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_118533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGATGAGGCAACAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471274	469594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_469600_471300
878933	contig_2069_pilon	-	1001	6	Intergenic	novelGene_23406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	447.67550748282	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	504	1001	1251809	1234055	FALSE	35	CAGGACAGAGTTCACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVVNRQGHSHSADWWSYGVLMGKDRKDTMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPPFPFCSTGGSGTTSCLRRGPRPHRLPAPGTSIRIGLANGSAVVSLGCPRGRIRKALSGDFCWGLP	1252312	1234054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1234252_1249475_1249513_1249791_1249857_1250859_1250949_1251243_1251282_1251737
878934	contig_9415_pilon	-	1074	2	Intergenic	novelGene_109919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	930	145	1074	2173237	2172308	FALSE	35	GTACGTATTTTAAATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATMVPPVKLKWLEHLNSSWITEDSESIATREGVAVLYSKLVSNKEVVPLPQQVLCLKGPQLPDFERESLSSDEQDHYLDALLSSQLALAKMVCSDSPFAGALRKRLLVLQRVFYALSNKYHDKGKVKQQQHSPESSSGSADVHSVSERPRSSTDALIEMGVRTGLSLLFALLRQSWMMPVSGPGLSLCNDVIHTAIEVVSSLPPLSLANESKIPPMGLDCLSQVTTFLKGVTIPNSGADTLGRRLASELLLGLAAQRGSLRYLLEWIEMALGASAVVNTMEKSKLLSSQEGMISFDCFMTILMQMRCSL	2226091	2172307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2173264_2225973
878935	contig_9036_pilon	-	3184	1	Intergenic	novelGene_155460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAATAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166641	163457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_163500_166600
878936	contig_12379_pilon	-	2097	1	Intergenic	novelGene_148926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTTTTTTTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63287	61190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_61200_63300
878937	contig_3285_pilon	+	1803	5	Intergenic	novelGene_153386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	35.8782664018205	31	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	603	1115	192130	198389	FALSE	45	TGGGTAACATCTTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNGDNTDSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTHSGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEEVFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI	187846	199077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_188446_192126_192224_192610_192761_193018_193125_198226
878938	contig_3975_pilon	-	1121	1	Intergenic	novelGene_54750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCAGCCACTAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1768879	1767758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1767800_1768900
878939	contig_1452_pilon	-	650	3	Intergenic	novelGene_115163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	52	648	715391	699670	FALSE	40	GAGATCCACTATGTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAG	715442	699667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
878940	contig_1452_pilon	-	2059	3	Intergenic	novelGene_115141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	70	AAAAAAATTAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
878941	contig_15354_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_65703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTGTGGTATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119316	121956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_119300_122000
878942	contig_15273_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_140423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	731	1078	48096	47749	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITQIYAPTSKAKDEEIEDFYQLLRSEIDRTCSQDALIITGDWNAKDGSKKGSVVGKYGLGDRNDARDHMIKFCKTNDFFIANTFFHHHKRRLYMWTLPDGIHRNQINYICGKK	48826	47074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_47100_48800
878943	contig_11416_pilon	+	2969	1	Intergenic	novelGene_145348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGGCCAGCAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182000	184969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_182000_185000
878944	contig_6870_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_103941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTGGACTCTATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1180206	1179163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1179200_1180200
878945	contig_16071_pilon	-	1902	3	Intergenic	novelGene_166003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_2	48	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	288	803	72866	70458	FALSE	70	AAGATTACAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYQLFYEAAQELLDGNVSIIEDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHIRAKRDRCGALELEGVEIHVQLDEKKNIHDLISKQPLEVHEMVAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFLELRECAKAKGFSIDTRSNKTLADSLGNAHDPSDPVVNRLLRSMATQAMSNALYVSTGSGAEAEFYHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIEENLFSNKDLEELCRHINNRNRVRGLF	73153	69358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_-_70655_70757_70913_72702
878946	contig_7415_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_168670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAATCACACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217915	219606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_+_217900_219600
878947	contig_10038_pilon	-	711	6	Intergenic	novelGene_160329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_3	15.239422561239	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2	520	183995	165460	FALSE	80	AAGAAGAAAAAAATAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQPSPHEPPYNNKAECAREGGKKVSKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATVDELKASIGNIALSPSPVVSGFLCQALVRWDREPCSARAH	183996	165268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10038_pilon_-_165705_166431_166487_170829_170887_174552_174625_177556_177582_183930
878948	contig_4000_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_176083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACGAGAAACTGAGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274042	273778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_-_273800_274000
878949	contig_5454_pilon	-	1195	2	Intergenic	novelGene_145504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTGGTGTCTCAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565387	563869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_564795_565117
878950	contig_12479_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_56878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTTTATGGAAGAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511712	510359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_510400_511700
878951	contig_9815_pilon	+	269	2	Intergenic	novelGene_164242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAAGAGAAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73937	75982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_73991_75766
878952	contig_9649_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_160691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGATCAAAAGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52234	50762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_-_50800_52200
878953	contig_4232_pilon	+	1347	6	Intergenic	novelGene_63178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	6.43117407632541	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	136	843	133812	137648	FALSE	20	AGCGGTTTGCAAACTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIDECRYRYCQHRCVNLPGSFRCQCEPGFQLGPNNRSCVDVNECDMGAPCEQRCFNSYGTFLCRCHQGYELHRDGFSCNDIDECSYSSYLCQYRCVNEPGRFSCHCPQGYQLLATRLCQDIDECESGEHQCSETQTCVNYHGGYRCVDTNRCVEPYVQVSDNRCLCPASNPLCREQPSSIVHRYMSITSERSVPADVFQIQATSVYPGAYNAFQIRAGNSQGDFYIRQINNVSAMLVLARPVTGPREYVLDLEMVTMNSLMSYRASSVLRLTVFVGAYTF	133531	138152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_133650_133794_133915_135602_135723_135810_135938_136187_136384_137486
878954	contig_6691_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_60168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCCTGCTCAGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401695	399592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_399600_401700
878955	contig_10855_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_124359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAATTCATTCTACGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672894	675051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_672900_675100
878956	contig_5906_pilon	+	3371	1	Intergenic	novelGene_174812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239101	242472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_+_239100_242500
878957	contig_9272_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_125912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCATGTCTATGCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300134	298542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_298500_300100
878958	contig_8276_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_174479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAAGGCTCCGTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150716	148364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_-_148400_150700
878959	contig_9335_pilon	-	1501	5	Intergenic	novelGene_147426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	824	1402	44683	41026	FALSE	70	GTTCAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEERSELSSELSPATGIFLNMSPEFCSSSSSSNEIMLVTFFFFFRSFLHLASALTFLDRTGRGSVSWSDLMRMETAEDAVISLRRLLTPCVDSFNKEVTFCVDSFKRSETVGANLLCPFKSLLSMLIAKSMEFRPAKMRGTSGVFAAQQSHTSSTIHKWQTLQYTSAYTRSLNGYEKPPIILKKHKNRTY	62345	40926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_41444_44522_44893_50897_51020_59562_59641_61931
878960	contig_14814_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_137699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAAATCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124750	123255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_123300_124800
878961	contig_8362_pilon	-	2566	3	Intergenic	novelGene_150678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_1	8.5	2059	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	77	364	119616	81775	FALSE	5	TTTTGAGCCTTCCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRPADPPRCTQSFPRPLSGPGPLAMAETTVTPPQPSVYTDPGVAYTVTDIAIIAGVVAAIAFVLIGLLFIMLHYLCQHKGTYYTNEDKGTEFAESADVALQDDPDLQDVGDSSTKEYFI	119692	79572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_81972_83911_83963_119576
878962	contig_12250_pilon	+	1363	1	Intergenic	novelGene_80589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTTCAGCCCACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322736	324099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_322700_324100
878963	contig_1093_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_139987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTTAGAAGCCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799643	800583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_+_799600_800600
878965	contig_11016_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_163303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTGCTGTACTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251251	253106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_251300_253100
878966	contig_15354_pilon	-	1943	12	Intergenic	novelGene_65697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_11	154.280146604687	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	81	1160	107742	74273	FALSE	25	CAGAGGCAGTGGCCAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHYAGEDATDAFHAFHPNLDFVRKYMKPLLVGELAPEEPSQDRGKNSQITEDFRALKKTAEDLKLFKTNHLFFLLLLAHIIAMESLAWFIIFYFGNGWIPTLITTFVLATSQVQAGWLQHDYGHLSVYKKSRWNHIVHKFIIGHMKGASANWWNHRHFQHHAKPNIFHKDPDVNMLHVFVLGEWQPIEYGKKKLKYLPYNHQHEYFFLIGPPLLIPMYFQYQIIMTMIVRKDWVDLAWAISYYSRFFITYIPFYGILGALLFLNFIRFLESHWFVWVTQMNHIVMEIDREPYRDWFSSQLAATCNVEQSFFNDWFSGHLNFQIEHHLFPTMPRHNFHKIAPLVKSLCAKHGIKYQEKPLLRALLDIIHSLKKSGQLWLDAYLHK	118285	73489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_74325_74764_74891_75629_75710_76034_76132_76361_76460_86819_86897_87359_87421_97527_97654_105390_105493_105610_105809_107679_107791_118253
878967	contig_9976_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_147904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTGAAAGAGAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16466	15710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_-_15700_16500
878968	contig_10444_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_139474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTCCAGCTGTTTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891600	890648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_890600_891600
878969	contig_5590_pilon	+	875	5	Intergenic	novelGene_162992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	97.8072083233133	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	22	714	179992	185134	FALSE	20	TAAAATCTGTGGTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCRLPELPQHQVRLREGCEDVFENIVHSYDWFPAELGTVFSGWREACKARGSEALGSRLVCASLFLRLLCPAILSPSLFGLAPEHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEDRGPAMAHFLDQVATVDVDAAPSSYQGGSDLAHQLAVLHAQLCTIFAELLPRTPGFRNQPLTLEAPCANGDTT	179970	185295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_180032_180251_180397_181504_181742_181846_182040_185056
878970	contig_15328_pilon	-	1577	9	Intergenic	novelGene_161215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	33.6152402192815	66	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	673	1398	145549	137528	FALSE	10	TAGTTTTGGTGTTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLPDEDQEKLLRICSIYTQSGENSLVQEGSEASTIGNSPYTLDSLYWSLKPASSSFESEGKAQEQGSLNHDKEDEKNEKEVLEEQVEEEEDDDQEEDEEDDDEDDDEEDRMEVEAFSPREESPTAENARLLAQKRGALQGSVWQVSSEDVRWGTFPLGRMPSQTEDPAELMLENYDTMYLLDQPVLDQRLEPPMCKTGTLGLSCGIGSANYSNSSSNFEGFLWSQGQLHGLKTGLQLF	154288	137348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15328_pilon_-_137652_139547_139699_145098_145563_148143_148260_150972_151121_151469_151677_151923_151975_152344_152431_154237
878971	scaffold_8345_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_106994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCACAAAGCAACCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148473	150874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_148500_150900
878972	contig_10734_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_51349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTCCTCGACCCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1753599	1756042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1753600_1756000
878973	contig_14505_pilon	+	621	3	Intergenic	novelGene_171963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	7	2608	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTTGTGTTTGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61092	67772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14505_pilon_+_61232_65285_65412_67416
878974	contig_18647_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_162838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGGAGTACGGATCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21613	18902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_-_18900_21600
878975	contig_4845_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_53727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	529	1008	1706683	1706204	NA	40	ATTTACTCACCAAGGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDRGCLQSCSPDQPSPYGSTRHPFPIPEASSDPVPPFPNIYQRTSVSSRPAPTTWSSGLGSVLPMPTSLPLHVHPGLLEPQLDDSWVSERPLVPGSRGTRPSRAFLPWRWVRPSGRGWASPGSNPTMHCTSERDDAMGPKGPALRPEEDCRYNTAHKR	1707211	1705808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1705800_1707200
878976	contig_5586_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_143511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTCAAAAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241940	240788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_240800_241900
878977	contig_7050_pilon	-	654	5	Intergenic	novelGene_153616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	183.243008052149	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTTTCATTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677374	585560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_631905_631945_651814_651853_654330_654383_677083
878978	scaffold_17542_pilon	-	2273	4	Intergenic	novelGene_139236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	109	junction_1	74.4102740815332	11	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2244	29	2272	438147	427781	FALSE	25	TCTATCACCCGATCCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLPNLDFHKTGDGLEGAEPSGQLQNIDEEVISSACRLVCEWAQKVLSQPFDTVLELARFLVRSHYIGTKSLAALTVMAAAPAGIKGIPQPSAFIPTAESNSFQPQVKTLPSPMDAKQQLQRKIQKKQQEQKLQSPLPGEFSARKSEGAASNGATNVSSGNPAILSPQPIGIVVAAVPSPIPVQRTRQLVTSPGPVSSSDGKVLPLNVQVVTQHMQSVKQAPKTPQNVPASPGGDRSARHRYPQILPKPANSSALTIRSPTTVLFTSSPIKTAVVPASHVSSLNVVKMTAISLTPSNSSAPLKHSSSVSSAPGTAEESRSIPQIKNGSVVSLQSPGSRTSSAGGASAVEVKMEPGTLSDERPAQGPENSDGARAPRTAPSALLGQKSSTDGAMQKPSSEGIVEIKATKVCDQRTKCKSRCNEILPGTSAGNNQSTVTLSVATQNLTSTSTSSPSNGDSVNKDPKFCTKSPRKRLSSALQESQVPPVKKPIVEQFSAVVTEGQKPGSVKKDQKVPHSGKTESSTAGAQISSKVALSVSSHIVASRPLNCSALTPGDSALEQQTTPSSSPDIKVKLEGSVFLLDSDSKSDGSFNPNEWQQVTKDSEFVSANCEQQQDISVVTIPEHSDINDLEKSVWELEGMPQDTYSQQLHSQMQESSLNQIQAQSSDQLPLQSELKEFESSVSQTNESYFPFDDELTQDSIVEELVLMEQQMSVNNSHSYGNCLGMALQTQSVTPGAPVSSHASSTH	438175	427779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_429476_432152_432449_437247_437456_438102
878979	contig_18108_pilon	+	2901	1	Intergenic	novelGene_33525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273008	275909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_273000_275900
878980	contig_5649_pilon	-	2428	3	Intergenic	novelGene_82320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTATTGCAATTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305470	296797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_297459_300527_300758_303933
878981	contig_19743_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_173157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCTGGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255363	254357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_254400_255400
878982	contig_7356_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_60344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTATATAATGGAACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58084	60568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_58100_60600
878983	contig_10774_pilon	+	2059	6	Intergenic	novelGene_158676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCGCCTAGGGAAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23992	60901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_24542_24719_25611_38731_38893_42281_42460_56037_56160_60743
878984	contig_6929_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_139397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTGAATAAGGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117856	118419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_117900_118400
878985	contig_15371_pilon	+	1770	1	Intergenic	novelGene_151443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCCTCAGCAGCAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140704	142474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_140700_142500
878986	contig_9216_pilon	+	3347	1	Intergenic	novelGene_163514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAAAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621215	624562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_621200_624600
878987	contig_9535_pilon	+	3071	2	Intergenic	novelGene_124475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	65	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	74	1450	276737	300633	FALSE	40	AGTGGATAAGAACAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARNSRNARKCLEDNKLIPIAEVSMDPIISSNPLLRWWASTSNDSLLEELNNRFEQITNAWVQVSGDEAENCVYKKREHIENDHFKTANPLETCLLELQVSPVKMLFQKKYDLNELCTWFMQTTETQSLSLVRKANARNPLEVINTREIKLGTKHSDFNTSPFRKHFKKFALSSPSKSAGKLHILHKMVSSPVLHAKSNLTLARLKRTEFKKLQHERWRRERKLRNRETVGWNSQRRNLRFFCQNQFLNKTEEGTNVDIPLQGSSTVDNQFILPPEIRDDFLQQAMPGFKTHASLENKFKSETKENGTNCSQKEEKGTKLGNVCTNNWRSKTLKDCRIFLRKINYLEHRNTFKLNTIMYSPEPIDSGSNHQTHIEESKRFTLRSHSARQNSLKKQSKEIENAKANNPSTNKFASQLGNSKLNKYVNYDKNPSDSSVVLSKLSKRKRPPWKTTEMSTKRHKQQSCKSGQMTNYYSKSQLACYK	276663	302254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_278100_300619
878988	contig_10861_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_39199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTTTTATATGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361065	359579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_359600_361100
878989	contig_15025_pilon	-	2750	1	Intergenic	novelGene_155972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTGAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48195	45445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_45400_48200
878990	contig_3942_pilon	+	1163	7	Intergenic	novelGene_128893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	44.1323766260856	633	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	113	961	1649690	1657083	FALSE	5	GCTCTGTGGTCTCTGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLSSEASGPLPKPAEVDVPETSQTISPCPSADIDAKTMETAEKLARFVAQVGPEIEQFSIENSADNPDLWFLHDQNSSAFKFYRMKVLELCPSIHFSSSPLTVHADSREGHRARGDEPPLREAELEEDEDEEEASALREASEPEGAADASGSSEGGAPADGLPSVATEDDPSSAPAPSQASAGAYFPRKRVSSKSLKVGMIPAPKRVCLIQEPKVHEPVRIAYDRPRGRPVSKKKKPKDLEFAEQKLTEKNVGFQMLQKMGWKEGHGLGSCGSGIREPVTVGTASEGEGLGADQEHKEDTFDVFRQRMMQMYRHKRANK	1648989	1660198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1649088_1649675_1649788_1650294_1650729_1653511_1653574_1656189_1656327_1656965_1657084_1659996
878991	contig_5084_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_64658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAAAAAAAAAACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1480051	1478094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1478100_1480100
878992	contig_4496_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_66624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTGTTCATTCACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606877	605733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_605700_606900
878993	contig_13206_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_161917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	551	940	245983	246372	NA	25	GGCACAGCATTTTTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKINYRRTFFHYKKLKGGKLCKENGQVFEIFYIKKSYSQICLFAGLSRTGHIRITVTQILSFLHEAVPTLPASSASFENVYSVELQLFMGVLGIHQGFETYLDLEACLGDQENCQVNEQTFLFPSLSP	245432	246571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_245400_246600
878994	contig_5451_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_167199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGCCTAAAACTATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892524	894116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_892500_894100
878995	contig_7753_pilon	-	2115	7	Intergenic	novelGene_41462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_6	114.49696745135	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	634	1431	562350	527304	FALSE	10	ACTTTCCCATTTCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRIHFVVDPHGWCCMGLIVFVWLYNVVIIPKIVLFPHYEEGHIPGILIIIFYGISIFCLVALLRASITDPGRLPENPKIPHGEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRNLDLFVIRHELAIMRLAAFMGIIMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEEISRPRKPWQQTFSEVFGTSWKILWFIPFRQRQPLRVPYHFANHV	562983	526619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_527437_527981_528026_535563_535681_550197_550337_553390_553503_560672_560772_562196
878996	contig_12520_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_161055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGACCACAGCAGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320409	318487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_318500_320400
878997	contig_5389_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_143039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	73	447	491793	491419	NA	20	GAGAGGAGATCTGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLDSLPYTSQDCLDSGIGSLESQMSELWGIRGGGPGEPGAPRGPYTGCGLYGSELPATPAFSTFGQAVGAGHFSVPADFAAPPPAYPPREYWSEPYQLPQSTPVLQESRVQGADGCPWGGAGSLNKERANVYTKLCGVFPPPIWWMQ	491865	490599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_490600_491900
878998	contig_18081_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_23817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTAGCAGGCGTAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171502	172238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_171500_172200
878999	contig_9333_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_120342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAAATACTAGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541393	543482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_541400_543500
879000	contig_8978_pilon	+	1067	5	Intergenic	novelGene_49478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	315.894760956873	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	151	903	1721282	1749795	FALSE	45	TAAATGCCTAGAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASSDPYLPYDGGGDNIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGICLGALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEVSCAVFSISQHLVIVTMRVSLSLEGKSSFSGKMV	1721131	1749959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567
879001	contig_3068_pilon	-	1159	4	Intergenic	novelGene_137633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	700	junction_2	30.6847772609735	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	45	470	243306	241336	FALSE	35	TTTTCTAAAAGTATCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRKSLLQASSK	243350	240646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_241461_242304_242411_242606_242709_243213
879002	contig_11978_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_63007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGAAACTCTCATCGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581761	1580462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1580500_1581800
879003	contig_10569_pilon	+	2530	1	Intergenic	novelGene_44052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1388	1837	18048	18497	NA	30	TGGCCAGATCACAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGPVCTLESLEGLKKQKPLMPGPHPGQSGNPKTRRNRWCPATATGHSDWNHNRGSRQGERKIVEQKIKFTKMTRLTGLTETGRTPKTTALRQPSALELKQFLETTFQPNHRQARKINNNTWEEHAPYQLYEIKRVTFAQKGDICPKG	16660	19190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_16700_19200
879004	contig_10437_pilon	+	2249	4	Intergenic	novelGene_38442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACATTTGGGTCTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936690	941398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_937492_938585_938686_939074_939179_940154
879005	contig_10134_pilon	-	1949	2	Intergenic	novelGene_16173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTAATTTTTACCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17666	15242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_16282_16756
879006	contig_10095_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_57251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345700	343651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_343700_345700
879007	contig_9981_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_121015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATTGGTCTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9668	7107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_7100_9700
879008	contig_13952_pilon	+	2311	14	Intergenic	novelGene_133245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	57.53815302262	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	194	1654	30903	62879	FALSE	65	ATAAAGAAGAAGGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVLNGIIPLGLVLLLYGAQGFFLPNATHLERLLSKYQQDGPHSRARRAIPRVDKEEILMLHNKLRGQVYPTASNMEYMTWDEELEKSAAAWAEGCIWEHGPTSLLVSIGQNLAVHWGRYRSPGFHVQSWYDEVKDYTYPYPHECNPWCPERCSGAMCTHYTQIVWATTNKVGCAVHTCQRMNVWGEMWENAVYLVCNYSPKGNWIGEAPYKSGRPCSECPPSYGGSCKNNLCYREETYDQKLETDEMNEVETAPVPEEKPMRVPPKVMRPTKPRKASVVSYMAQVVGCDTKMKDKCKGSTCNRYQCPAGCLNNKAKIFGTLYYESSSSICRAAIHYGIIDDKGGLVDVTRNGKVPFFVKSERHGVGSLSKYKASSSFMVSEVKVQDLDCYTTVAQLCPFEKPTTHCPRVRCPAHCKDEPSYWVPVFGTNIYADVPSSRFQPTATLCMRERNPARSCAILTIIVMLEPIVAATVSIHLLEGLLFC	13997	63536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_14115_30826_31143_32117_32237_35980_36114_37060_37177_40843_40945_47239_47384_49692_49754_53997_54065_54538_54670_57158_57203_58062_58136_60869_60946_62723
879009	contig_5039_pilon	+	1215	1	Intergenic	novelGene_65046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCCCGGTCCTGCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1812443	1813658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1812400_1813700
879010	contig_4492_pilon	+	1312	3	Intergenic	novelGene_166110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAGCTAGTACATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36039	76490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_+_36116_45575_45698_75376
879011	contig_6375_pilon	-	2461	9	Intergenic	novelGene_73010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_8	22.5333086784875	398	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1549	2163	360291	357917	FALSE	20	GAATTTTAGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRARLQLEVEEQLKKKCFTLLCYHDPSSDTDSETLKAAKMWKLAEVLVSEKQQCQDTKSQQKERMVLLEKQIATFSQVLLRCLALLHRLLQEHRLKTQSELDRINAQYLEIKCSAMVLKLRMEELKILSDTYTAEKVEVHRLIRDRLEGAIRLQEQDMEKSQQVLNTYEVLGEEFDRLVKEYTQLKQATENKCWALQEFNKAYH	366677	357618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_358101_358241_358311_358671_358803_359206_359353_360206_361292_361625_361758_361846_361990_364645_364731_366489
879012	contig_253_pilon	-	1370	8	Intergenic	novelGene_129639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	102.407947714531	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	66	878	252548	250157	TRUE	25	GGAGACTCAGGAACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYNECFSRAATIFRSGWSVAAMANHSGWSDAFLAQHPILTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSIILGVIHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLEFLPQLTFLLGLFGYLVFMVVYKWLRVSAAGAAEAPSILIHFINMFLFSRSPTNRPLYSGQEVVQSTLVVLALAMVPILLLGTPLYLRWQHRRHSLRRPSGPQLDEDKAGFMDSRDSGASVNSWGSDEEKGGPPGDEEQAKFAFSEVFMHQAIHTIEFCLGCISNTASYLRLWALSLAHARE	252613	249580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_249730_249813_250283_250358_250470_250724_250854_251200_251415_251497_251617_252198_252290_252525
879013	contig_11056_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_130369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTGGGGGTTGGCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305483	305042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_305000_305500
879014	contig_10003_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_88198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAAAAAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483542	481335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_481300_483500
879015	contig_13697_pilon	+	1328	10	Intergenic	novelGene_165928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	22.1247863908221	203	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	65	1141	248117	259949	FALSE	10	GTTGGGATGGCGTGTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVAWPGRGFGEPRASGPRRAMRPPPPAALGLLLLLLPLLPAPEAAKKPTPCTRCRELVEKFKQGMVDTAKKNFGGGNTAWEEKSLSKYEFSEVRLLEILEGLCDSSDFECNRMVEEQEELLEAWWLRLKKQSPDLFEWFCVEMLKVCCSPGTYGPNCLACPGGAKRPCGGNGHCSGDGSRQGDGSCQCHMGYRGALCTDCVDGYFSALQNDTHNICTVCNEACKTCTGPTSRDCAECEVGWAREQDACVDVDECAEETPPCSEGQYCENVPGSYTCEECDSTCVGCTGKGPGKCIACVPGYAKEESGQCSDVDECSRPETPCARENENCYNTPGSFICVCPEGHEETDGACVPKAGAKWKRKSQRSPLPTKIYKMILN	248052	260136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_248246_248500_248584_249086_249198_250048_250141_251272_251450_251726_251823_254726_254811_257483_257583_258050_258191_259883
879016	contig_1717_pilon	-	2319	7	Intergenic	novelGene_146110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4.76095228569523	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCAATATTCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138302	67363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_-_68440_71243_71287_79812_79917_80504_80658_83243_83332_84075_84246_137617
879017	contig_11978_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_62978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	166	603	1483140	1483577	NA	35	AAAACCCAAATCGGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPAAPTPSAPPSPSAPDPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARAPSPGDYKSPHVSGSGPSAGTHKRMPTLSAAPAPNEEIPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGSGGPTAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLASRNFGPSGSLPSLSLESPLLGAG	1482974	1485144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1483000_1485100
879018	contig_11525_pilon	+	2287	1	Intergenic	novelGene_171069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1774	2079	16334	16639	NA	50	TATCCATAAAAATCTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFFSGSVVGILVGQHHCSEYPGLCWMCYIPGYYLLNASNTLSHCDSQKCPYKFTNLTQWRTIDLTPVSKGHKEWSPCGAVVKSLATNQKVSSSNPPAAP	14560	16847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_14600_16800
879019	contig_12327_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_140634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTCCCGTGGAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156824	155295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_155300_156800
879020	contig_10494_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_102122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATGAACTCGCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154876	157101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_154900_157100
879021	contig_13933_pilon	-	1779	10	Intergenic	novelGene_178206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	12.6354390896262	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	576	1376	489051	485947	FALSE	30	CTTGATCTATTTTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCPLCVQILWEITRFFLLAIELSVVILGLAFGHLESKSSIKRVLAITTVLSLAYSVTQGTLEILYPDAHLSAEDFNIYGHGGRQFWLVSSCFFFLVYSLVVVLPKTPLKDRIPLPSRRSFYVYAGILALLNLLQGLGSALLCADIIEGLCCVDATTFLYFSFFAPLIYVTFLRGFFGSEPKILFSYKCQVDETEEPDMHLPQPYAVARREGLETAGAVGASAACYSSTQFDSAGGVAYLDDVASMPCHTGSINSTDSERWKSLNT	500656	485543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13933_pilon_-_486215_487408_487490_487711_487815_487987_488049_488166_488278_488749_488830_488954_489212_492093_492227_492420_492557_500510
879022	contig_14142_pilon	-	2270	18	Intergenic	novelGene_120433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_8	261.481737339222	10	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2262	7	2268	48998	41760	FALSE	25	AGCTATTTCCTCTGGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKASGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASTTNSPCTSKPATPAPSEKGDGIRTPLEKDEAENQEEKPEKESRIGEKMETEPDAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPGVPGEMETEPGYPGDREKSATESPPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPPRDEPRSNGRREEKAEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEER	49004	41757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_41792_42170_42300_42489_42592_42706_42843_42947_43070_43193_43357_43521_43667_44236_44371_44525_44612_45096_45163_45630_45809_46300_46468_46784_47017_47208_47334_47556_47675_48311_48444_48666_48809_48945
879023	contig_4364_pilon	+	2611	1	Intergenic	novelGene_91	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAGAGGAAAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888779	891390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_888800_891400
879024	contig_5039_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_64839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	428	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGAGAGTGCCTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305210	303807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_303800_305200
879025	contig_12799_pilon	+	1035	6	Intergenic	novelGene_173281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	39.1336172618888	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	199	1035	16875	28095	FALSE	20	CCAGTCTCCCTGGAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPAALVEAIVEEVACPICMTFLKEPVNIDCGHSFCHSCLSGLWEVPGESQNWSYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLGLHPGMGLKGDICELHREWLKLFCKEDGLMMCEACSQSPEHETHSVVPMEDVAWEYKWKLHETLEHLRKEQEEAWKLEVGERKRTANWKIQVETRKQSIIWEFEKCRRLLKKKQTPSQQLEVEAAAALASLEQEEGETMQKLELNRNKLVQQSGVLWRMIAELEERSQRPVRWMLQGIQEVLNRSKTWSLQRPE	14863	28095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12799_pilon_+_15007_16819_17301_25781_25878_26696_26958_27399_27423_28064
879026	contig_14618_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_136779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	267	344	1941	1864	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSGLALGRERPGISNFLFEGGEINLGQTIPEKRGLLRWCILGVVRAVGRSAARGKKTNSPDGGGAARGIKPRGFLVGSAYLVLHFRVMVGIQDLPCVARFVSFRCGLGRPRW	2207	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_0_2200
879027	contig_1154_pilon	-	1187	10	Intergenic	novelGene_87248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.4943346460705	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	423	1187	1870083	1864159	FALSE	15	GAGGCCTGGGGGTCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLEKLSDAYTCFSTENGNYLYVLHLFGECLFIAINGDHTESEGDLRRKLYVLKYLVEVHFGLITVDGQLIRKELRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETVYSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSG	1878781	1864158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1864224_1864366_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1869642_1869786_1870002_1870141_1871457_1871619_1875484_1875602_1878694
879028	contig_546_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_117211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	828	1193	113205	113570	NA	40	TTATCTATAAAATGAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSEWHQAFAEVERKENLGVRHPGKVRSLTADLLPIIYLRRQEGKGRSSCRTLKPFTPSCSLNPGFACPFLKCCPGPEILLNHDCSIAPTPAIWTTHLAQPHLELRPSRLSVSRLVQTVP	112377	114452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_112400_114500
879029	contig_11427_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_79029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTAGCTCATGAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832862	835266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_832900_835300
879030	contig_3862_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_137444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAACTCTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710964	710299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_710300_711000
879031	contig_10838_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_129172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATACATTAGCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101016	102564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_101000_102600
879032	contig_9982_pilon	+	897	5	Intergenic	novelGene_55753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	95.2978882242414	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	232	417	332177	338017	TRUE	25	GTGGGCCGTGGGTCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKKKTQGSSIPYMES	330938	338595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_331132_332138_332234_333522_333610_337975_338123_338220
879033	contig_10078_pilon	+	1435	13	Intergenic	novelGene_160006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	543.731679129411	62	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	203	1291	211491	240568	TRUE	20	TGAGTATTTTAGGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLWMCKIRNQKKLSPPVVETLPTVDLHEDSSSVVVNSENIENISGSSTSEITPVSKLDEIEKSGTIPIARPTETEQSETNCGDGEALDANAPAEQPSFVSPPESLVGQHIENVSSSHGKGKITNSEFESKVSASEQDGGDPKSALNASDNLKNESSDYKNPGEIDPSSVASPKDPEDIPTFDEWKKKVMEVEKEKSQSMHPSSNGGQHATKKVQKNRNNYASVECGAKILAANPEAKSTSAILIENMDLYMLNPCSTKIWFVIELCEPIQVKQLDIANYELFSSTPKDFLVSISDRYPINKWIKLGTFHGRDERNVQSFPLDEQMYAKYVKVMFTHTGGVYITFWIRTLLSIKPHKGVWY	209594	241781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_209709_211402_211514_215793_215950_217307_217446_217669_217821_218985_219110_220543_220669_221142_221211_235856_235965_237385_237511_240018_240075_240553_240646_241714
879034	contig_6326_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_168539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627314	624687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_624700_627300
879035	contig_12881_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_176143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTACATTCTGAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10831	11277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12881_pilon_+_10800_11300
879036	contig_10436_pilon	-	1515	8	Intergenic	novelGene_108470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	35.1544696261212	25	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	38	1303	90536	87443	FALSE	25	CTTTATTATTTTTTATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKCWDPSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITSGSSLPDGCEGRGLSIHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGFPERREARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSGASDQDTLAPLPGATPWPLLPTFSYQYPAPHPYSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHSEGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSGSGSESEPSSRGGSLRRGGEPGAAGDGGPPPSRGSSGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGAPPVRDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM	90573	87230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_87892_88009_88229_88654_88835_88940_89073_89150_89280_89467_89536_90348_90426_90524
879037	contig_4659_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_118211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474569	472401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_472400_474600
879038	contig_4315_pilon	-	4055	1	Intergenic	novelGene_46833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	785	1114	384919	384590	NA	30	CTCAATAAAGGTTTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMVFGENLFCGLFPGAASVLLLEGESAHMGLCVSESSRSAFETCDLSHFLRGDFISLNTGGARVGVSTETRNHSGTVGSHAEKVFWKLVSATTFQFTPMKQGEEEYF	385703	381648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_381600_385700
879039	contig_18800_pilon	+	2529	5	Intergenic	novelGene_110668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	84.6621964042984	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	201	947	44318	63976	FALSE	35	AAGGAAGAGGTGTGTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFKGRTDCAAGAAPGAPRLAHPFLGPSEGRYGSPATPLASTHPNLHNGIVKADTSGGSCAAFALWMMGDDRLSDHPKSTEFLDIYLEDNLQPSPGVPSREPSSHPESPGPCREQTWAFDPPDSKGQDAPRGPDTEPVHLESCSSQGEHRQRTTPPGSPGASHPRRFVRPILPMGPAQSSLEEQHRSHESCLDAASDDLLDLQRSLPERRGRSRDLEEYRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPTEDLDPWEEQLGREAGGTREPKPSLKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL	36234	65558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_36324_44206_44612_61097_61149_61398_61543_63718
879040	contig_7045_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_77435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230895	232294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_230900_232300
879041	contig_6137_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_59309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	626	652	1649033	1649007	NA	45	GCGCCAAAAAGAAATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLCRVFKRALATGDLPATLSAPGSLAVRGCFLSTRNPSVSDLLRATSSKDIPSACLSVSQTYFVSNLTFSPSRLSFRLLFSSSTSRITYLCYPDLKFSSPLCLFLFPHPLQVTGYNQVLPGFLTHCSCVSQTSTSSGFDACAIVVSCHSVGCSSWQPHPQWHKNAARFHTDRSLVCWIPVLWPLCTLSAFQPRGFIFSIISDNILLRSMGFLLASF	1649658	1648231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1648200_1649700
879042	contig_7359_pilon	-	987	3	Intergenic	novelGene_139872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	26	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	147	341	387902	387708	FALSE	20	TTTAGAGCAGTCTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STDPRVCQERRDIEGSDAVASRGVDEVLKLPKTKEQGTGSDQNWKYVAMDAGITITSQTHCCIRFKSWQPFWNLQSLRISSVTWACKCRHEGFSTKGRLRLGLQDLLHPAPP	394074	387061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_387908_391168_391230_393994
879043	contig_6327_pilon	+	1776	8	Intergenic	novelGene_147479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	153.023540939401	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	878	1774	30135	57686	FALSE	20	TCACCCTGGCAGTGATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCFCQDYHPYQENQLYYDPSTGIYYYCDVESGRYQFHSRVDLQTYQTCSMRQSKDKKLKKKRKDPESATSEEKDLNLEDKKVSSVEHMSCSEGEDFANVKKKAKRDIHYKNSSPKFTVPVSGNSIESPFNENTYNSTSFKVEKIIETDSEPEEGEITDSQTEDSYDEDITSEDGITAENTEDEDEEKIWPPCIRVIVIRSPVLQIGSLFIITAVNPATIGREKDMEHTLRIPEVGVSKFHAEIHFDHDLQSYVLVDQGSQNGTIVNGKQILQPKTKCDPYVLEHGDEVKIGETVLSFH	24042	57688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_24197_29411_30171_33670_33857_44196_44528_45811_45924_49725_49778_56660_56763_57608
879044	contig_8354_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_24169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTTGCTCCTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599373	601197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_599400_601200
879045	contig_3155_pilon	+	1640	8	Intergenic	novelGene_26335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	33.4438304612131	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	727	1638	108330	119947	FALSE	45	CAAGATGAGACCAACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISYVVTKTKVINEKYHRFLDRNFPRFYVLYTIFTKGLRMLWADAKKARRIKANMLKHNIKFHQLSYREMEHLRQFRRDVIKCLFLGIISIPPFANYLVFLLMYLFPRQLLIRHFWTPKQQADFLDIYHAVRKQSHPEILTCLERTIPVISDAGLRWHLTELCSKAQRGTQPAVNDILVLRECFSDHPLGMNHLQALQLKVLSQAMLLTPHLPPFLLRSRLKNHTTVIHQLDKALAKLGIGELTSQEVKSACYLRGLNSTHIAEDRCRTWLGEWLQISCSLKAIPGAATWKGHAIHLREETRS	107603	119949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_108439_110327_110444_111195_111279_112561_112749_112865_112968_113065_113219_113903_114001_119882
879046	contig_6497_pilon	+	1054	1	Intergenic	novelGene_35565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAGAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164947	166001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_164900_166000
879047	contig_15066_pilon	+	1223	4	Intergenic	novelGene_149552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATCTGACACCGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111781	113328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_111869_111969_112148_112274_112392_112487
879048	contig_7513_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_88966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	471	794	215665	215342	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGIHYHQKELGVKRVLWIRDPCTENLLDLGDRAVTPETVRSGSNHGRETAAAEPRDLCEMARWASQPMEQGSYSGYADPWSETAKCLQAEAYWQSGVLLGTYWQS	216135	214226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_214200_216100
879049	contig_2214_pilon	+	2611	1	Intergenic	novelGene_144270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAATGTATTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332359	334970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_332400_335000
879050	contig_6470_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_145606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCAGCTGTTCGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024233	1025494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1024200_1025500
879051	contig_11590_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_125609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAATCACAGGGAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888216	886706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_886700_888200
879052	contig_6418_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_81127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGGGTCGCTGTGAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109104	108255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_108300_109100
879053	contig_2596_pilon	-	1017	2	Intergenic	novelGene_53470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	120	653	663279	662746	FALSE	15	CACTGAGTACTTTGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAYARLRGIEQAVQSHAAAEEAARKAHQLWLSVEALKYSMKTASADLPTVPLGGAVEAIRVSCADSEFAQALTAALPPESLTRGVYSEETLRARFCAVQKLARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPRQLKPPLELCPEDLNTFKLLAYASYCIEHGDLELAAKFVNQLKGESRRVAQDWLHEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTPAP	664463	662381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418
879054	contig_3424_pilon	+	800	2	Intergenic	novelGene_55587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTAATTCCGTGACCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144999	1146447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1145556_1146203
879055	contig_9871_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_75679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGGGGTTTCTGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505220	506406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_505200_506400
879056	contig_4783_pilon	-	1738	10	Intergenic	novelGene_108405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	258	junction_1	374.436597346064	113	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	133	924	335593	292842	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERILMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFSDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVTLKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDR	473186	292027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_292941_300778_300880_302093_302224_303697_303803_313098_313210_322707_322810_330045_330118_333871_333934_335583_335680_473140
879057	contig_14814_pilon	-	1972	12	Intergenic	novelGene_137701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.4888638187846	127	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	65	1114	268983	254988	TRUE	40	TGTAATAAAAAGTATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRVQLPPEIQLAQHLAGNEKVTRDRAVKKLRKYIVARTQRAAGGFTHDELLKVWKGLFYCMWMQDKPLLQEELGRTISQLIHAFQTAEAQYLFLQTFWQTMNREWTGIDRLRLDKYYMLMRMVLNESLKALQMRGWEESQCEQLLKLLTAEILHPDSQAPHGVKSHFTEIFLEELGKVGAKELTADQNLRFIDPFCRIAARTKDPRDLHDIARGIFETIVEQAPFAIEDLMNELDEQEEEEEEEGALSEEGDLEQMEEEDTEGEPDVPTTKPAETRPKGSIRRPEPKTGEEAAENDEDGAGTALQFDYEAVANRLFEMASQQSTPSQNRKRLYKVVRKLPRFPRRLP	269047	252927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_253685_254886_255019_256324_256423_257243_257324_258549_258774_259010_259076_259660_259791_262268_262331_264418_264505_265988_266047_266934_267018_268850
879058	contig_4301_pilon	-	2436	11	Intergenic	novelGene_65070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	158.24398882738	369	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	84	1685	62379	41330	FALSE	10	TGGCTGTATTCTCTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGGPSGQPALLSLLLAVVLPFFCLAISIDEARNELIKREKMMRLGGQLVLKKEEEEANGKLMTLKKAEITKAMKTQMFPPSMHFFQAKKLIEKSEVFHILKKMPKGAALHLHDFGIVDVDWLVKNVTYRPHCHVCFTPNGTLHFKFAHPTPPAPNQEDCSKWILLQQYRKELKNVTEFDNSLQKTFTLVTENPEVTYVDQNVIWTKFETIFLTISGLVHYAPVFKDYIFRGLEEFYMDNVIYLELRARLPPVYELNGETHDRKWCVKTYKEVAEAFAKDHPEFVGLKLIYSDHRSKDASLIKISVKTAMELRTDFPTTVAGFDLVGREDTGHTLYDYKEALLIPSLKGIKLPYFLHAGETDWQGTSVDGNLLDALILNSTRIGHGFALSKHPAVMEDLQKRDIPIEVCPISNQVLKLVTDLRTHPATAFMAVGYPMVISSDDPAFFGAKGLSHDFYEVFMGISGMDADLRTLKQLAINSIKYSALSPTEKKTAMKTWEKTWDKFIHDLSKKMYLESIYFFLPLLLLAESRP	65099	40578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_41394_42277_42368_42626_42830_43377_43536_46294_46404_48416_48508_50463_50592_59025_59237_60477_60704_62057_62388_65024
879059	contig_4301_pilon	+	848	2	Intergenic	novelGene_65073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAATTGCTCATAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40855	41753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_41496_41545
879060	contig_13424_pilon	+	2957	1	Intergenic	novelGene_151597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62822	65779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_62800_65800
879061	contig_7171_pilon	-	2040	9	Intergenic	novelGene_101288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCCTAGAACAGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057516	1050620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1051721_1051813_1051875_1052971_1053118_1053397_1053534_1055771_1055933_1056366_1056431_1056519_1056621_1056772_1056823_1057295
879062	contig_4156_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_88082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAATACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186395	185507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_185500_186400
879063	contig_16532_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_110070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588137	589629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_588100_589600
879064	contig_1618_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_141776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1425	1745	102501	102181	NA	25	CAGGGACTATGCCTTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNIPWTARRMNKSVLEEVQPECSLEARMVRLCLIYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVVGRQKRGRPSTRWIDTVAATMGSNIVTIVRMVQDWSALHSVVHRVAMSWN	103925	101843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_101800_103900
879065	contig_5894_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_83038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCCTCAGAGTAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395137	397538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_395100_397500
879066	contig_12586_pilon	-	2925	3	Intergenic	novelGene_121808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_2	84.5	71	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	70067	65334	TRUE	60	TGAACATGCAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYTPDEKLRVQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPQRLWPLEEFWNKFLQNPTPWRNALFKVYRHSVFAFTHVLIPAWIIHYYLKYHVNVSMCFLELTFNIVQNYFACGYALEPWWCSG	70145	56210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_56465_63106_65520_69887
879067	contig_6136_pilon	+	1586	6	Intergenic	novelGene_154109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	260.415514130783	12	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	495	1247	460760	494274	FALSE	20	CAATATGGGTATCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQVNPSKRLDHLQWAREHFINYLTQCHYYHVAEFQLPKTKNNSAESNTASTSMAYPSLVAMASQRQAKIERYKQKKEMEHRLSALKSAVESGQADDERVREYYLLHLRRWIGISLEEIESIDQELKILREKDSSKEASTSYSSRRDRPPMKPFVLTRDMAQAKVFGAGYPSLATMTVNDWYDQRRKYGALPDPGIAKTTPAEFKKAAQQQEDQEQKEEEDDEKALQRAREWDDWKDTHPRGYGNRQNMG	460107	494613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6136_pilon_+_460301_460458_460975_470795_470992_472546_472627_473367_473481_494125
879068	contig_17068_pilon	-	2317	6	Intergenic	novelGene_172570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTCCGCTCACCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160227	35284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_-_35366_129027_129203_137025_137196_139982_140047_155458_155610_158551
879069	contig_8885_pilon	-	3501	1	Intergenic	novelGene_115577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1073	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	160	321	75477	75316	NA	75	ACAATAACAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQTGSEKNKHALGTEEVSAPLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKVGWGRGWNLRTGDPGKPPRVQSRRRKV	75636	72135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_72100_75600
879070	contig_7049_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_171435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_4	19.765816451642	467	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	84	410	90484	92038	FALSE	25	AGAGGCCATTATGTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLGLSRVDDAVAAKHPGLGEYAACQSNAFMKGVVTFVTGTGAAFGLQMLIHRKFPYPLQWTVLVAVVTGSVASYGVTRVETQKCSNLWLFLETGRLPKDAGSDQHS	90400	93195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_90538_90815_90883_91084_91169_91549_91658_92024
879071	contig_12638_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_33289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	159	653	1101512	1101018	NA	10	CATGTGCCTCCATGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSPHYLCWSRHDSRLVLRVKLLLIPLHLIGHDLLYHWVLLEQNLPLRPHHLVMWRHHLWALLGKHLLGWGHPLGRGPKILALRVHNHLALWHKLGPRKDHGILRVQSSLLLDHLALGGHNLLVHAHQLRWWALLGLALDVAHVHLWNPRTTSLLVVHVAMNSHEAGLHHTWWSVGHLHLVLRRTRPLTTLKKKKQFQILRYSNYLNQKDTQHSYLH	1101670	1099574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1099600_1101700
879072	contig_12864_pilon	-	1053	8	Intergenic	novelGene_76449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	675.839342097314	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	174	683	251873	242831	TRUE	15	AGCCAACCCTGGGCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252159	242363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242575_242671_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863_251999_252111
879073	contig_5039_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_64868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGTGGGTGAATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372568	371386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_371400_372600
879074	contig_6898_pilon	+	1769	2	Intergenic	novelGene_35799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAACACACCACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129042	149307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_129134_147629
879075	contig_9266_pilon	+	2641	1	Intergenic	novelGene_178146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCCCAAACTATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22573	25214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9266_pilon_+_22600_25200
879076	contig_9440_pilon	+	2924	2	Intergenic	novelGene_59023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCCTCTGGAAAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236172	240374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_238576_239853
879077	contig_11986_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_69239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	846	1181	793410	793745	NA	15	AGAGGGGGCGGCGGGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVYAESWQEDIQKSKMEHPQGVQRLTIQEKKFTKMYFISEKRYLHYYIYTGLKRPRVCRVQHTSQKEQVNVETATGLKLLRTDWVTFSKSPDFPGTQFHLRERRFWVRGS	792564	794433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_792600_794400
879078	contig_20879_pilon	-	1667	2	Intergenic	novelGene_168599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	47	493	165591	164230	FALSE	55	AGGAAAAAAATTAGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALEKFDSGLVLNDVMCKPGTESSFCLKAEAAVIGVAALSRSRSGSQHLGLDEDTEARTSPEGSSVLRPQLHVVKAASPSDMPRDSGIYDSSVPSSELSLPLMEGLSTDQTETSSLTGSVSSSSGLGEEEPPALPSKLLASGLCTAELGCHSCTDELHAVAPS	165637	163055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20879_pilon_-_164343_165257
879079	contig_10718_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_164617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTGGAGAAGAGAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109279	111674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10718_pilon_+_109300_111700
879080	contig_18607_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_175116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	288	611	305501	305824	NA	60	GCAGAAAAAATAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQAREAVSQLSGSSQPFKKKMALGARCSRERNGRWLGHGRKQKKWEKATPSTSIWHSRSRPLWVGQIHVSRGQSLCLLAKRLRPLGSSGSQAGVKKSGRWEGVYC	305213	307944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_305200_307900
879081	contig_19778_pilon	+	1846	2	Intergenic	novelGene_143743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	413	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	262	426	9539	9703	FALSE	75	AGAAAAAAAAAGAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEVLCSILERESWEKKERNNCFL	5642	11123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527
879082	contig_19778_pilon	+	1009	3	Intergenic	novelGene_143744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	337	junction_2	38	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	262	606	9539	10726	FALSE	60	AAAAAGAAAATATGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATVRTLHSPKYLHVQHPFPSNKLSL	5642	11129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480
879083	contig_11378_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_112309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	1965	2264	1095204	1095503	NA	25	CTGGTCAGTCTAGAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPSCPIESHTRDTDTVLAIVKTVDHLQKAAGFYLQITSTRVTIQKSKTKVNTQNPLSIYPFFSKTPCFPESGVIALDPTSTDTNLWYQTSPGRSQLAF	1093239	1095504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1093200_1095500
879084	contig_14522_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_147322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAGGAGAAGAGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92175	94721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_92200_94700
879085	contig_9242_pilon	-	1555	16	Intergenic	novelGene_155061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_3	77.995555428926	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	120	1361	405675	371258	FALSE	50	ATTTAGCAAAACAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEETVKKAREAWKIWADIPAPKRGEVVRQIGDALREKIQMLGKLMSLEMGKILVEGVGEVQEYVDICDYAVGLSRMIGGPILPSERPGHVLIEQWNPVGLVGIITAFNFPVAVYGWNNAIAMICGNVCLWKGAPTTSLISVAVTKIIARVLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAKDEQVNLLSFTGSTQVGKQVALMVQERFGRSLLELGGNNAIIAFEDADLNLVIPSAFFAAVGTAGQRCTTTRRLFLHESIYDEVVNKLKKAYEQIRVGNPWDSDVLYGPLHTKQAVNMFLGAVEEAKKEGGTVVCGGKVMDRPGNYVEPTIVTGLAHDASIVHTETFAPILYVFKFKNEDDAFAWNNEVKQGLSSSVFTKDLGRIFRWLGPKGSDCGIVNVNVPTNGAEIGGAFGGEKHTGGGRESGSDAWKQYMRRSTCTINYSKDLPLAQGIKFQ	409101	371063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_371313_372640_372717_381994_382069_382271_382370_383654_383772_385125_385233_386411_386497_389018_389114_391417_391460_396071_396170_397611_397690_400726_400772_404304_404438_405214_405339_405660_405742_409048
879086	contig_12728_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_155805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGCAAAACGAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184870	186043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12728_pilon_+_184900_186000
879087	contig_3584_pilon	+	1207	3	Intergenic	novelGene_108108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	56.5	510	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGTTTATAGAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178772	180505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_179005_179331_179430_179628
879088	contig_10958_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_5359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800361	798286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_798300_800400
879089	contig_5718_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_110362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGACCAGTCAGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709596	710890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_709600_710900
879090	contig_12842_pilon	-	1113	8	Intergenic	novelGene_168338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.728431359084683	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	231	1016	134323	123948	FALSE	0	CTGCTGTGCGTGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVHVVWVNHRAFRLQWCQKCGFHRPPRTYHCPWCNVCVEDFDHHCKWVNNCVGHRNFRLFMLLVLSLCLFSGAVLVTCLVYLVRTTHMPFSIDKAVAIVVAVPATGLLVPLSLLLLIQALSVSAAERSYEGKFRYLQGYNPFDQGCARNWYLTICAPLGPKYMAEAVWLQRVVGHDWVPLQNLHSPTCPSAPSPLASQPLSLYIPGRGLPGSGEASALQELHASPVLPLLQERGPQTASAFLSHLHTRPFQEHLHQSLTS	135446	123850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_124071_124658_124837_125151_125238_132644_132751_132994_133168_134203_134344_134885_135008_135358
879091	contig_14142_pilon	-	2303	11	Intergenic	novelGene_120488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCTGGAAAGTGAGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318469	307818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_308037_308196_308248_308380_308465_308564_308668_308812_308854_309004_310042_311185_311229_311316_311381_312642_312815_313547_313643_318074
879092	contig_10307_pilon	-	2499	1	Intergenic	novelGene_170291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	111	566	564203	563748	NA	35	CTATGGCTGCTAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTNSPSAQRCPGIQRRTYKRLGLSHLRGEFDQVGPGGMESKEGWFPLVPTFEVLQTKWKEIFADHTLFTPLGIIHLGFPEGLHSSLCQQRSRVREHAQCTPGLAHTQLSTHLLGMEEWDHGRPVHLTPLWSAYTCGCALLAARCWNFSR	564313	561814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_561800_564300
879093	contig_9479_pilon	+	2532	4	Intergenic	novelGene_176672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	360	743	14827	19489	TRUE	30	TGAAAGCGGTTAAGGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQVIPQRRLLGCSIVTEFTFVRLFTCMRSEMNIEVIIGTEKLSTITTLSRRRKMLHLSSIIIFIQMESFRKPILRAIFRTAFSPIHRPIFIQRGGEVRGTRPRLPSIDGHGGRLCIRPPVLLMYS	14467	30949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_+_14905_15745_15865_19302_21081_30751
879094	contig_10569_pilon	+	2656	1	Intergenic	novelGene_44064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTGTCTTACTAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233922	236578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_233900_236600
879095	contig_11056_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_130400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	649814	649512	NA	35	AGCGTATGCTTAGGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKYNLEYIPPEFRDHLENRFDALNTNDQRPDELWNHVRDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWISEETLKLALECQKAKANGINADIKELKRKFQRAAQEDKV	649814	649284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_649300_649800
879096	contig_4339_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_146105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAGAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224450	1226727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1224400_1226700
879097	contig_4982_pilon	-	3786	5	Intergenic	novelGene_172232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_3	41.821047332653	148	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	35	502	80188	43969	FALSE	20	CACTTTATTATCTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFLVALQTKNRTEANWARVDEQDLWQWGLTGIQLRSYQLEGVNWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLARRLNDEGPFLILCPLSVLGNWKEEIERFAPSLSCVVYTGDKEERAHLQQDLKQESCFHVLLTTYEICLKDASFLKS	80222	40684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_44005_44628_44744_54312_54420_63954_64068_80091
879098	contig_12528_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_81340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTCATTCAACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951745	950760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_950800_951700
879099	contig_10722_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_70982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGGTTTCTTTCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14658	12731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_12700_14700
879100	contig_10126_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_105710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	971	1372	124426	124025	NA	15	CACGTCCTCCAGCTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTACSGLPEPLPNAGKSTGWGSPGQLCRLTSAGLLGQEVVRGQDHRQHAETLGAQRGVRKQPSEPVSQQMLEEGAAGIHVWEFLTFRIPEGILQGQQTGFPVLPLPLTSPVTWASPRPVIMLSLQMSHNITA	125396	123337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_123300_125400
879101	contig_5769_pilon	+	2601	11	Intergenic	novelGene_138773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGAGCTCCTGGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273634	319793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_274604_278795_278913_284860_285328_286841_286957_288524_288694_289990_290204_290930_291092_295668_295830_308024_308111_310272_310332_319709
879102	contig_17859_pilon	-	2955	2	Intergenic	novelGene_155726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	96	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	251	487	240203	239967	FALSE	40	ACAGTATCAGTAGGCGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIRPQLSKEKIEGCHICTSVTPGEPQVLLGKDKAFTYDFVFDLDTWQEQIYSTCVNKLIEGCFEGYNATVLAYGQTGAGKTYTMGTGFDMTTSEDEQGIIPRAIAHLFAGIAERKRRAQERGVTGPEFKVSAQFLEVLWPRRVGWRQTWGTTRSWKLGLHL	240774	237498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_240228_240548
879103	contig_9527_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_134099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1261	1617	745588	745944	NA	0	CTTCGGCTTGGGCTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESLGTQTSSGDFISSSAHKPNLPPPTPSSEELGICQSNHWSHPMPLPFPGFPQRSGTVGKRTPLMEHTISPHTNRALSAARLTPDPHPNPPPPWTERKLMHLLLLIIYLFGEREMM	744327	746517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_744300_746500
879104	scaffold_880_pilon	-	1136	4	Intergenic	novelGene_121393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	41.2499158248299	136	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	322	711	275473	271774	FALSE	30	TTAGATAATGTCATCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGLQNIITVTFEAPGNAKEESLNVFIQNLLWEKNVRNKDGHCMEVIRLKGLVSIKDRAQQVIVQGVHELYDLEETPVSWDDDAQRTNRLVFIGKNLDKDVLKQLFMATVTETGKQRTTHSKEGQVCP	275794	271348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_272251_272382_275217_275284_275386
879105	contig_16846_pilon	+	4286	18	Intergenic	novelGene_82856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_13	66.6201856418015	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	566	3124	95153	144358	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIFFPPFRRIPCSVKDLFDFCWTLFVYTKGNFHMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIICPNRRDLLNPSFKGLPPDFHTADFRASEEPPCIIAELCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTGDTPSGKLTARASVECNLQQHFEKKRTFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQGIVAGLKNAPSQQLINIFESCMRNPMENITKMVKGIGESFCQHYTQSTDDQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKMLETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGSIQGHLPMMPTSPIMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDLPKEMLMDKMITEGAKLKIAPSSSIITENISVSPGQSLLTMATATVTGTIGQKVTIPCHGIANDAEGITLIPTCMNTTQESKMESPVSLTAQSLIGASPKQNHLTKAQEVHPTGISKPKRTGSLALFYRKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVTFNENINGDIEMTDCDLEDATKTPDCFSGSVREERGDLIKFYNTVYVGRVKSFALKYDLSNQAHMMEAPPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYVSPHKNGAGLTPRSALLYRFSGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRAITIDGDAESPAKRLCQENDDILLKRLQDVVSERAHH	94587	145520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_95244_95337_95467_95577_95739_97776_97827_98441_98629_102424_102592_105105_105219_105411_105516_108349_108488_110175_110335_116052_116186_126755_127023_130106_130319_136594_136667_138172_138264_140340_140490_142044_142210_144187
879106	contig_5423_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_85247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGATGTGTGCAGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524976	523120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_523100_525000
879107	contig_7513_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_88978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270869	269186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269200_270900
879108	contig_7513_pilon	-	1153	5	Intergenic	novelGene_88979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	34.3392996434115	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	236	583	274570	269761	FALSE	80	TCAGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNYWLAEPTSRAGLSQAASSPFLSIKFLICNLSSPGDSYNEGVKLQPQEISPRPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPVLPASTHREIEMAQKLLNSDLGGLINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLAQTRPH	284706	269190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279670_284613
879109	contig_15629_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_122453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTTATGCTCTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102559	104855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_102600_104900
879110	contig_19098_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_65810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAGGACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291453	293011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_291500_293000
879111	contig_5954_pilon	+	579	4	Intergenic	novelGene_28578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_2	24.5130350811336	176	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	182	319	925361	925859	FALSE	15	CTTTGATGCAGCTTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADDDGPVRRQGKVTVKYDRKELRKRLNLEEWILEQLTRLYDCQEEEIPELEIDVDELLDMESDDTRAARVKELLVDCYKPTEAFISGLLDKIRGMQKLSTPQKK	924059	926119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_924193_925312_925397_925667_925701_925790
879112	contig_11978_pilon	-	1594	1	Intergenic	novelGene_62967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	494	805	1232238	1231927	NA	0	TTTCTTTTTTTCCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRQKPGHTLAWRAGAARGQKWLQGGRAPLLVKNWQPLQVQKDTPHHFLKNNQKMYVSGCVTGSISFGIPTTQRAVPGSSLSLGKHSGHNREGQVPVQGSTRG	1232731	1231137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1231100_1232700
879113	contig_14023_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_165353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATATTTTATTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55333	56358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_55300_56400
879114	contig_8587_pilon	+	2388	1	Intergenic	novelGene_159115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTTGCTGTTTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161883	164271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_161900_164300
879115	contig_4754_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_35932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATTGTCTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287007	287941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_287000_287900
879116	contig_3111_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_129969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTAGGACTTTCAGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54409	53404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_53400_54400
879117	contig_10914_pilon	+	812	5	Intergenic	novelGene_176666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	115.259218720239	449	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	90	533	8345	34396	FALSE	20	GCAAATGTTCTGCTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIFSKSMSENMKNQQEFMLMSARLQLERQLIMQNEIRERQMAMQVAWSREFFKYFGAFFGIAAISLTAGAIKRKKPAFLVPIVPLSFVLTYQYDLGYGTLLQRMKGEAENILETEKSKLQLPRGMITFESLEKARREQSKFIIDK	5458	34675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10914_pilon_+_5542_8338_8426_29679_29811_30545_30656_34274
879118	contig_15118_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_74552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.5	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCTCCATTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136863	153823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_136944_150719_150892_153680
879120	contig_12277_pilon	-	1590	1	Intergenic	novelGene_139720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTGATCAAAGACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420737	419147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_419100_420700
879121	contig_4114_pilon	+	2994	5	Intergenic	novelGene_15642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566505	576074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_567174_569005_569106_570031_570145_573311_573450_574099
879122	contig_8570_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_120172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGGGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423215	425323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_423200_425300
879123	contig_16930_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_139160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTAACTGAATCCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122906	124646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_122900_124600
879124	contig_9053_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_87946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275956	277707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_276000_277700
879125	contig_9375_pilon	+	1083	1	Intergenic	novelGene_136042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135245	136328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_135200_136300
879126	contig_5718_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_110339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCTGAAAGGCTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578279	575774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_575800_578300
879127	contig_8660_pilon	+	1324	3	Intergenic	novelGene_136478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9	229	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTCTCTCAAAGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12459	66451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_12529_50363_50486_65318
879128	contig_5816_pilon	-	1158	2	Intergenic	novelGene_158269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACCCCCTTTGCTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393085	384660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_385777_393043
879129	contig_6215_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_21236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	295	630	571836	572171	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCPKSAQGRRWNCGVFPSLQRCKFQSDSASSVEFPEVLTPQPECCLPRCYTPLRLLLERMGPSFLFTWMPSKLHTGRTNFIHSQHLTQCLIQQWFSKCGLWTSSSSSIT	571541	572418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571500_572400
879130	contig_6058_pilon	+	657	1	Intergenic	novelGene_172380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	375587	375889	NA	5	TCTCCTGCCTCAGTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGLTGGATGSGPEGGREGLAARQEESGSSAPGRFQLGPLRRGWGGDGALFHLPWSPELTCSDRCWASAQTSSLRLTGTGPGLRGGLLALGLLHLGGVSV	375585	376242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_375600_376200
879131	contig_17775_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_177542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTCACTATGAGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176129	178287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17775_pilon_+_176100_178300
879132	contig_3472_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_166941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCTAGACAGTATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916686	918499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_916700_918500
879133	contig_15203_pilon	+	554	3	Intergenic	novelGene_178207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	51	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	75	554	19371	28665	FALSE	25	GTAAGTTTTCTCATAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALNSLLDKESQKIDPHKNQVFIFQMLATFYIKYIQIFRKLENVYDQIVHPQKRILIRKMLDGVMGRILELKNEMVELEFTEFHYFDDILQDLKLAPKKIPKAMPLDEAIKIIQISERARQGRLRAMFMKQIYLQEYRVKQSKLLSDRLPDVAAAALSIQKVWRAFHQSKKTGKERGEEMIFLGM	19296	28665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15203_pilon_+_19587_25679_25872_28593
879134	contig_4350_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_136371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGATGTGGCAGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69846	67419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_67400_69800
879135	contig_3601_pilon	-	601	3	Intergenic	novelGene_132952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	133	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	273	347	459988	459914	TRUE	20	GTCTGTTGCCACCTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEADQAGRRRIAAKGSNFRHVDTRVDAAWLPGRRWSYKQSTLAWKVNRSKPGATSSPKGRRNATLKSNTFLDSAFREIKEERSEQRVGNLMPPRKQCWEQSMCFGTGVPAWRSS	464196	455635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_455783_459806_460030_463965
879136	contig_10986_pilon	+	1102	3	Intergenic	novelGene_71507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	6.5	1121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171755	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_171959_173254_173328_174229
879137	contig_10986_pilon	+	2157	14	Intergenic	novelGene_71501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	34.8988394374776	1054	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	228	1424	156065	174321	FALSE	5	ATTTCTGGTGTCCGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLVLKLMRDHVPPVHPEMPPGVRLSHGLVWTATTARNALVVSFAALVAYSFEVTGYQPFVLTGEIAEGLPPVRTPPFSVTTANGTISFTEMVQDMGAGLAVVPLMGLLESIAVAKAFASQNNYRVDANQELVAIGLTNTLGSLVSSYPVTGSFGRTAVNAQSGVCTPAGGLVTGVLVLLSLDYLTSLFYYIPKSALAAVIIMAVAPLFDAKIFGTLWRVKRLDLLPLSVTFLLCFWEVQYGILAGTLVSALILLHSVARPRTQVSDGPVLILQPASGLHFPAVEALREAMLSRALEASPPRSVVLECTHVSSVDYTVVLGLGQLIEDFRRRGVTLAFVGLQVPVLRVLLSADLKGFQYFSTVEEAEKQLRQEPGTQPYNISEDSVPEHKVALLKA	154056	175054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_154173_154390_154471_156033_156177_162077_162254_162905_162979_164633_164685_167930_167992_168422_168479_168746_168888_170492_170621_170910_171011_171824_171959_173254_173328_174229
879138	contig_10986_pilon	+	2617	17	Intergenic	novelGene_71500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.7821606028981	1126	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	63	1883	150738	174321	FALSE	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGSCGPGCGEDRRPRAVVAGMSSSVQALGKPRSPGSGMAGQAGCCSAAALQRRLPILAWLPDYSGQWLKMDFIAGLSVGLTVIPQALAYAEVAGLPPQYGLYSAFMGCFVYFFLGTSRDVTLGPTAIMSLLVSFYTFHEPAYAVLLAFLSGCIQLAMGFLRLGFLLDFISCPVIKGFISAATITIGFGQIKNLLGLQDIPRQFFLQVYYTFLNIGETRVGDAVLGLVCMVLLLVLKLMRDHVPPVHPEMPPGVRLSHGLVWTATTARNALVVSFAALVAYSFEVTGYQPFVLTGEIAEGLPPVRTPPFSVTTANGTISFTEMVQDMGAGLAVVPLMGLLESIAVAKAFASQNNYRVDANQELVAIGLTNTLGSLVSSYPVTGSFGRTAVNAQSGVCTPAGGLVTGVLVLLSLDYLTSLFYYIPKSALAAVIIMAVAPLFDAKIFGTLWRVKRLDLLPLSVTFLLCFWEVQYGILAGTLVSALILLHSVARPRTQVSDGPVLILQPASGLHFPAVEALREAMLSRALEASPPRSVVLECTHVSSVDYTVVLGLGQLIEDFRRRGVTLAFVGLQVPVLRVLLSADLKGFQYFSTVEEAEKQLRQEPGTQPYNISEDSVPEHKVALLKA	149497	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_149558_150735_150972_151481_151675_152086_152173_154390_154471_156033_156177_162077_162254_162905_162979_164633_164685_167930_167992_168422_168479_168746_168888_170492_170621_170910_171011_171824_171959_173254_173328_174229
879139	contig_10986_pilon	-	1467	8	Intergenic	novelGene_71505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1010	1315	170990	168793	TRUE	50	GAAGCTGAAAAGAATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRRASTAGKCRPLAGCRIRTGPSDTWGLLGLATECKRISADTRVPARIPYCTSQKQSRKVTLRGNRSSLLTRQSVPKILASNRGATAMMITAARADLGM	175012	164637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_164693_168425_168479_168748_168888_170492_170616_170902_171004_171818_171953_173249_173325_174225
879140	contig_10986_pilon	+	2031	13	Intergenic	novelGene_71502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.6934284334432	6	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	718	1302	168830	174321	FALSE	5	CGTGATTTCTGGTGTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAPLFDAKIFGTLWRVKRLDLLPLSVTFLLCFWEVQYGILAGTLVSALILLHSVARPRTQVSDGPVLILQPASGLHFPAVEALREAMLSRALEASPPRSVVLECTHVSSVDYTVVLGLGQLIEDFRRRGVTLAFVGLQVPVLRVLLSADLKGFQYFSTVEEAEKQLRQEPGTQPYNISEDSVPEHKVALLKA	155504	175050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_155574_156033_156177_162077_162254_162905_162979_164633_164685_167925_167992_168422_168479_168746_168888_170492_170621_170910_171011_171824_171959_173254_173328_174229
879141	contig_10986_pilon	+	2031	13	Intergenic	novelGene_71503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.6877940427978	14	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	101	1297	156065	174321	FALSE	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLVLKLMRDHVPPVHPEMPPGVRLSHGLVWTATTARNALVVSFAALVAYSFEVTGYQPFVLTGEIAEGLPPVRTPPFSVTTANGTISFTEMVQDMGAGLAVVPLMGLLESIAVAKAFASQNNYRVDANQELVAIGLTNTLGSLVSSYPVTGSFGRTAVNAQSGVCTPAGGLVTGVLVLLSLDYLTSLFYYIPKSALAAVIIMAVAPLFDAKIFGTLWRVKRLDLLPLSVTFLLCFWEVQYGILAGTLVSALILLHSVARPRTQVSDGPVLILQPASGLHFPAVEALREAMLSRALEASPPRSVVLECTHVSSVDYTVVLGLGQLIEDFRRRGVTLAFVGLQVPVLRVLLSADLKGFQYFSTVEEAEKQLRQEPGTQPYNISEDSVPEHKVALLKA	155529	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_155599_156033_156177_162077_162254_162905_162979_164633_164685_167930_167992_168422_168479_168746_168888_170492_170621_170910_171011_171824_171959_173254_173328_174229
879142	contig_5434_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_74690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	372	686	378950	379264	NA	10	CCCTGGAGTAGCGGCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIMLLTWGSEEESPSSDNVYSTVRSYGTQNDVEESERATGPQRGRHADATPLAAYGRVRTAPRPIRKLGYGFLGPGHRGESAEAKCAAGPRTARGRGDNRAR	378578	379420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_378600_379400
879143	contig_501_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_134899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGAGAGAGTCAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757633	759770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_757600_759800
879144	contig_5878_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_145724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTACGTATCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224986	223506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_223500_225000
879145	contig_10775_pilon	-	1798	2	Intergenic	novelGene_157939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_1	0	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	141	716	26002	25427	FALSE	30	ACAGATTCAGTGACAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVKVREVNPVAGPGAEQGAESGGARAGAGAVGLKTLALDDSWCHSEMSSLSGKVQTVLGLVEPSKLGRTLTHEHLAMNFDCCYCPPPPCHEATSKETIMMKNLFWIQQNPYSHKENLQLNQETEAIKEELLYFKANGGGALVENTTSGISRDMQTLKWLAEETSVHIISGAGFYVDATHSSETRAMSIEQVRSPKFFHKFMYKFISGWYKQLMCLACNQKISSSSPHRHTYLTRMAW	79551	24344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_26042_79450
879146	contig_19941_pilon	-	3086	20	Intergenic	novelGene_139748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	60.1246627371171	230	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	1035	2561	15749	8281	FALSE	30	TTCCATGAGTGTTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSNEISMIINSIKEECFRSGVAEAPGGSKAPSIDGKEDLDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKAVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSIEIKVEPTEPEQGISGAEIAAVVPALSMEPPELRSHSLDEDPRSTATGEIAEADVSSGKGDETQLTTVKTEASPESLLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGISAKSLRGRDSTRKQDSSEKDGGTRGRRCAIEADMKMKK	40385	7755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_8341_10605_10711_11965_12144_12519_12589_12784_12878_13071_13287_14070_14118_14325_14420_14709_15160_15533_15797_17371_17453_17844_18064_18596_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_40327
879147	contig_14637_pilon	-	2451	6	Intergenic	novelGene_114554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_5	251.669147890638	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGATGCGTTTGTGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391499	362098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_364112_369328_369396_369469_369589_371424_371498_377829_377892_391382
879148	contig_16535_pilon	-	801	7	Intergenic	novelGene_167724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.6691175145591	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	211	801	462428	442966	FALSE	15	AGCTGTGTCATTCTTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLNEEKIIERLVGLIHPGQEEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQSGQLQETAEPDPLLAVLESQGCVEQLLGNMFDGDQTESCLVHGTQVLLTLLEARRAGTDGGSVDSFSQGPERPHSVSSSVLQGIEPRLRDFHRLLLSPPKKSAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLVAALLHTNTPSVNRELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREDRADAGEPVSQAEPAPGNGSTLGAEVLRLRCVHLTDRPLAPTPIN	464024	442965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_443044_454130_454278_459765_459919_460635_460766_462345_462460_462705_462819_463958
879149	contig_8284_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_125683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348574	346414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_346400_348600
879150	contig_10016_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_117858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339295	338136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_338100_339300
879152	contig_5084_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_64590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACCCAAAAACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915367	914510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_914500_915400
879153	contig_20614_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_107602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGTGAATGATCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439719	440632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_439700_440600
879154	contig_13702_pilon	-	1644	9	Intergenic	novelGene_102653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	213.640432444329	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	217	1404	231006	211780	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETKPEPAWHDQDETSSVKSDGAGGARASFRGRGRGRGRGRGRGRGGTRTHFDYQFGYRKFDAAEGPRIPKYMNNITYYFDNVSSTELYSVDQELLKDYIKRQIEYYFSVDNLERDFFLRRKMDASGFLPITLIASFHRVQALTTDISLIFAALKDSKVVEIVDEKVRRREEPEKWPLPGPPMVDYSQTDFSQLLNCPEFVPRQHYQKETESAPGSPRAVTPVPTKTEEVSNLKTLPKGLSASLPDLDSENWIEVKKRPRPSPARPKKSEEPRFLHQTSLPQQLPSQQLMSKDQDEQEELDFLFDEEMEQMDGRKNTFTAWSDEDSDYEIDDRDVNKILIVTQTPPYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWTEKFEPEYSQIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVDPNQEVPPGPPRFQQVPTDALANKLFGALAAPLGPRSTNPLVI	231322	211539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_211831_223467_223503_223607_223732_224591_224985_226908_227079_227195_227371_229697_229843_230911_231075_231174
879155	contig_8200_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_169829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAAGCAAGTATCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444086	441824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8200_pilon_-_441800_444100
879156	contig_11719_pilon	+	700	3	Intergenic	novelGene_154787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCGACCCAGGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165966	170279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_166470_169847_169956_170190
879157	contig_16156_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_137084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	202	519	576234	575917	NA	10	TTTGCAGCTGTTTCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLCVCDTRARSLSCHIMGGRCQLDHSSTWNPKPSPISCSPFPVGASGLGVWCLVGRPDCHPQGPVLCVSVTCCGDCTGSHGSISEVQVSPSLPPLGSSGPISPW	576435	575269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_575300_576400
879158	contig_10246_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_46897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTTTAATAGATTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140729	142264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140700_142300
879159	contig_13718_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_142914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACACTAGTTAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273023	275410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_273000_275400
879160	contig_7549_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_164547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCAGTGCTCCGCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001876	1004482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_1001900_1004500
879161	contig_11855_pilon	-	2238	7	Intergenic	novelGene_67123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGATCCGCCGGCGGCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2650983	2642421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2642531_2642909_2642961_2644483_2644625_2645566_2645670_2646489_2647958_2648834_2648906_2650688
879162	contig_10904_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_22493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTGACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297482	298921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_297500_298900
879163	contig_7933_pilon	-	543	2	Intergenic	novelGene_164680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189536	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186069_189402
879164	contig_15325_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_157155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGGTCGGTGGGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26485	24543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_24500_26500
879165	contig_8452_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_47991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGACTTTTGGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133066	134340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_133100_134300
879166	contig_1107_pilon	+	3061	1	Intergenic	novelGene_126600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870818	873879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_870800_873900
879167	contig_7909_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_155886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	1091	1531	215886	230582	FALSE	20	GGAGGGCCAGGGCGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEPDTPWHLHFTSREARRAWDGAAGAAGQVAGGAGPGDGVADGGRRQRIHEGRLPGPSLQVKQVVGGELDGGAVPAHVCEGPAASLRDLAGGMHDGVHELQVAAAQLHLCRHQALQLLAVLRLVQHQGHRRLGQRQPLDAIAHAG	209682	230584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_210541_215653_215947_218920_219035_220619_220856_230552
879168	contig_12427_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_40424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCATCTCTATCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214076	215041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_214100_215000
879169	contig_12150_pilon	-	2229	1	Intergenic	novelGene_6968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120745	118516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_118500_120700
879170	contig_7342_pilon	-	560	1	Intergenic	novelGene_71223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTCTTACTGTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706659	706099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_706100_706700
879171	contig_10003_pilon	-	2325	1	Intergenic	novelGene_88232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAACAGGTACAGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643633	641308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_641300_643600
879172	contig_10197_pilon	+	2053	4	Intergenic	novelGene_115285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	15	junction_3	3.85861230093008	101	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	557	1141	1237108	1239054	FALSE	15	GCTGTGGAATGGAGTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGNRIQIPTDSQPETPGPLGPISGVGGRGLSSSSEDHALKRELPRSAHGLSGNWLAYWQYEIGVSQQDAHFHFHQIRLQSFPGHSGAVKCVAPLSSEDFFLSGSKDRTVRLWPLYNYGDGTSETAPRLVYAQHRKSVFYVGQLEAPQYVVSCDGAVHVWDPFTGKALRTVEPSDSRVPLTAVAVMPAPHTSITMATSDSTLRFVDCRKPGLQHEFRLGGGLNPGLVRSLAVSPSGRSVVAGFSSGFMVLLDTRTGLVLRGWPAHEGDILQIKAVEGSVLVSSSSDHSLTVWKELEQKPTHHYKSASDPIHTFDLYGSEVVTGTVANKIGVCSLLEPPSQATTKLSSENFRGTLTSLALLPTKRHLLLGSDNGVVRLLA	1235867	1239966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1236362_1237045_1237192_1237534_1237715_1238733
879173	contig_7912_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_129563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1746	2063	63528	63845	NA	65	GGGGAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIATGRQGNTGHKMVLNYNTILQLCLFCTQEGKWDEKIYVDGFMSLYNNKNIQKQCKIMVQTEIKRQKVFDSQGKMIFPLFLHCQPHPCIHQNHLGWLSQPQK	61782	64026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_+_61800_64000
879174	contig_7412_pilon	+	1297	7	Intergenic	novelGene_76295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTACTTACACTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289999	293869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_290237_290684_290801_291236_291361_291824_291962_292386_292471_293117_293225_293377
879175	contig_7378_pilon	-	1222	1	Intergenic	novelGene_120289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTACTTTATTTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602130	600908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_600900_602100
879176	contig_4797_pilon	+	3352	23	Intergenic	novelGene_6921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	10.0371211835313	27	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	148	2571	411156	623026	TRUE	20	GTATGTTAGGGTCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAVPRDTLPEHWSYGVCQDGRVFFINDQLRCTTWLHPRTGEPVNSGHMIRSDLPRGWEEGFTEEGASYFIDHNQQTTVFRHPVTGQFSPENSEFILQEEPNLHMSKQERNQRPSSMVSETSTAGTTSTLETRPGPKIVKSSNKVHSFGKRDQAIRRNLNVPAVVRGWLHKQDSSGMRLWKRRWFVLADYCLFYYKDSREEVVLGSIPLPSYVVSPVAPEDRISRKYSFKAVHTGMRALIYNSSTVGSQAEHSGMRTYYFSADTLEDMNAWVRAMNQAAQVLSRSSLKRDMEKVERQAVPQANHTASCRECGRVGPGHTRDCPHRGHDDSFGFERREQEEERYHSQRDPLEDKQDRSKARSPYSPAEEDALFVDLPGGSRGQQAQPQHAEKNGMLPASYGPGEQNGTSGYQRAFPPRTNPEKRSQKKSSLAQVEHWAKAQKGDSRSLPLDQTLPRQGPSQPPSFPENYQTLPKNTRHPSGSSPPPTRNLPSDYKYAQDRASHLKMSSEERRAHRDGTVWQLYEWQQRQQFRHGSPTAPICAGSPEFTDQGRSRSMLEVPRSISVPPSPSDIPPPGPPKAFPPRRPHTPAERVTVKPPDQRRSVDISLGGSPRKARGHAIKNSSHVDRRSMPSMGYMTHTVSAPSLHGKSADDTYLQLKKDLEYLDLKMTGRDLLKDRSLKPVKIAESDIDVKLSIFCEQDRILQDSEDKIRALKENKDQLESVLEVLHRQMEQYRDQPQHLEKIAYQQRLLQEDLVHIRAELSRESTEMENAWNEYLKLESDVEQLRQTLQEQHRRAFFFQEKSQIQKDLWRIEDVIAGLSANKENFRILVESVKNPEKNSAFISSPACAFTLTF	410893	630099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_410977_411091_411169_411255_411314_554130_554215_569455_569568_570406_570512_572988_573062_574457_574559_584447_584624_591611_592083_599367_599891_600431_600519_603243_603298_613705_613775_613942_614024_614876_615027_615590_615693_622650_622760_622970_623196_626825_627015_627129_627248_629211_629316_629898
879177	contig_9548_pilon	-	1174	1	Intergenic	novelGene_141052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATCAGTGGAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119807	118633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_118600_119800
879178	contig_10982_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_87881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCCCCCTTCTGCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144391	142388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_142400_144400
879179	contig_15105_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_150964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569766	571792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_569800_571800
879180	contig_2009_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_165452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59126	56846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_56800_59100
879181	contig_4824_pilon	-	2945	1	Intergenic	novelGene_176034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACTTGGCAACAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807686	804741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4824_pilon_-_804700_807700
879182	contig_6589_pilon	+	2378	15	Intergenic	novelGene_26260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	41	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	459	2159	2228754	2233891	FALSE	55	ATAAAAAAAGTGGGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPADTRCSLRKVDFPAPRKSHSDDHLRVRAQKGARLREAERPRGGDSPRVKGRELEAGCGPLKKELLGRGEGQAEVEGELGAVCTREVFLLPPRGPVGRATGCVSHEEAVLDGERYALVGLRGETGGWTAGSEEPFLHLSHLLLQMVPHASQWLPVQASMCGHQNLEWDPQLLHHSLHFGLELLCWQLPTPDAHLVGEDHQLIALGFQLTELPRNLGVQNPLPRAFTPGDVNVSSFSKFSQPGDDFRIRFFCGSASSFKSGATSRVPGGVSGWDPAVQVSSQRRVRGWRPLTKYSVSPTPREPSNPGFSSWVPAVEGLTPSCFTVTVRVSGSAISSTWFREHFRSVTRVRGPRPRMRACPFVGKKMGSAPPRGLSSHRRPSASNSAILGPGLEKSRRGPQKSRLMTLPRGRSCYRKSRFLRTDNSSPPSSKNALCSGNPTPSLANSSRCFPGDDSCPLPSVAWLHPSASQDPKLTRQEPRASRSPPTPTLTCARCSGSGATSDQRIPAQDTRPTTRPADFSVPPRTEMTRSTERGGALAPPTTAAPPRPKPRTAPPPLSFPLAAM	2227804	2234110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2227993_2228062_2228125_2228296_2228484_2228732_2228805_2228892_2228989_2229065_2229165_2229235_2229304_2229388_2229496_2230166_2230246_2230525_2230632_2230737_2230796_2231913_2232217_2232515_2232561_2233110_2233285_2233376
879183	contig_4654_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_103106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAGGGGATGGCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505923	504294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_504300_505900
879184	contig_14525_pilon	-	3817	1	Intergenic	novelGene_149777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	955	1260	192467	192162	NA	50	CTAACATCTAACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQPCSRSLGERCGSSTRFYRVTMSHNQLDGTQQQPPHKYINPSTLNLSIQRDHKYISSQRDEKNRPKVKLVLLGNLGLDFRSSVRELLPVLTRTTRQCH	193421	189604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_189600_193400
879185	contig_13148_pilon	-	838	6	Intergenic	novelGene_162928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_3	34.5218771216167	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	804	34	837	143061	83593	FALSE	25	TGGAGACCTTTGCAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAAKNSFAKLMDKISLAMESIPLHSRSITYIEKDSLVQRLARGLHKVNTLALKYGLRSHVPIMKSTTSLQKQIFGFTQRLHAAEVERRSLRLEVTEFKRNVGEMKKELDKAQSLQMQLNEFKQSKLITHEKFESACEELNNALLREQQAQMLLNEQAQQLQELNYRLELHSSEEADKNQTLGEAVKSLSEAKMELRRKDQSLRQLNRHLTQLEQDKRRLEENIHDAESALRMAAKDKECVANHMRIVENMLHKVRDQILLSRTAASRNDFTLQLPKLH	143094	83591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_-_83668_103183_103239_105193_105340_136014_136201_142232_142416_142902
879186	contig_9133_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_109318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCCAGGGGTCAGGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911112	913612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_911100_913600
879187	contig_10000_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_139337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAACAGCAATAACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297880	296292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_296300_297900
879188	contig_14822_pilon	-	761	1	Intergenic	novelGene_145399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACCACATAGGGGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63773	63012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_63000_63800
879189	contig_14467_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_138233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTATGTGTAGGATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187043	188863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_187000_188900
879190	contig_6434_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_61879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGGGGTTCCTGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877100	878374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_877100_878400
879191	contig_5758_pilon	+	2738	11	Intergenic	novelGene_119122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	116.906330025367	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	95	1180	540308	581137	FALSE	10	GATTTTCAGTCCCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADEARLRLGRKGDGNGAFAAAARPVTGVCYKMGLLVSLTCLWLLSAVKADSKAITTSLTTKWVSTPLLLEASEFLAENNQEKFWNFVEASQNIGSSEDHGTDYSYYHAVLEAAFQFLSPLQQNLLKFCLSLRSYSATIQAFQQIAADEPPPEGCSSFFSVHGKKTCDFDTLETLLLTASERPKPLLFKGDHRYPSSNQESPVVIFYSEIGHKEFSTFHQQLVSKSNAGKINYVFRHYISNPGKEPVYLSGYGVELAIKSTEYKAKDDTQVKGTDVNATVIGENDPIDEVQGFLFGKLRDLYPDLEGQLKELRKHLVESTNEMAPLKVWQLQDLSFQTAARILAAPVELALVVMKDLSQNFPTKARAIMKTAVSSELRTEVEENQKVITNGKY	535070	582695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_535151_540293_540430_554844_554928_557280_557412_562662_562776_569603_569779_573387_573485_574434_574514_578646_578748_579965_580066_581052
879192	contig_9239_pilon	-	916	5	Intergenic	novelGene_137158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	201.385668556628	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	699	216	914	94804	80120	FALSE	30	AGGAGCCCTGCACCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGPRAEPGLGAPPGVAARTPPEPRPSPEGDPFPPPPPMSALIPDTPPDTPPAMKNPASPKQLPLEPESPPGQVGCGPVPPQEESPSSEVKSRGPTPPATGLRDTRPPRRSSQPSPTAVPASDSTPTKQDAKKAGERHKLAKERREERAKYLAAKKAVWLEKEEKAKALREKQLQDRRRRLEEQRLKAEQRRAALEERQRQKLEKNKERYEAAIQRSVKKTWAEIRQQRWSW	95019	80117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_80195_80946_81111_81707_81777_81957_82303_94758
879193	contig_10531_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_114525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCTAACCAGTCTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429112	430591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_429100_430600
879194	contig_3469_pilon	+	2146	2	Intergenic	novelGene_34145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTTGAAGTTCGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256355	260342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_258316_260156
879195	contig_9705_pilon	-	1878	5	Intergenic	novelGene_41711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_2	203.608079407473	37	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	22	702	118663	111239	FALSE	60	CAATTAAAAAAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALSKNIVNSLYIYS	118684	110062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624
879196	contig_7070_pilon	-	2260	2	Intergenic	novelGene_104038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGCATTCTGAGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83618	81162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_81686_81881
879197	contig_6129_pilon	-	1061	4	Intergenic	novelGene_159968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	17.326921891156	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	321	662	71114	68750	FALSE	65	AATAAATAAGGCAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLIKAKIDVCKRGGVTVKPSHVISLGSAVNISCSLKPKQGCSGYSSSNKLILYKFYRKIHFQQGLTLSSQVTDLPLGTTVFVCKLACSSSDEIRICGAEISVGGEHSILNS	74165	68350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_69064_71086_71199_73242_73293_73979
879198	contig_11846_pilon	-	411	4	Intergenic	novelGene_105989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	164.114458703539	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAAGAAAAGGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558023	356726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_356764_437088_437157_467816_467906_557806
879199	contig_4364_pilon	+	1782	13	Intergenic	novelGene_154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.0204651699521	21	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	294	1226	1228103	1232039	FALSE	15	AAGCTCCCTCTCCAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQAIKWVDEVVAAAPYITTLQTLDKYNCDFCVHGNDVSLTVDGRDTYEEVKRAGRHRECKRTQGVSTTDLVGRMLLVTKAHHSGQEMSSEYREYADSFGKCPGGRNPWTGVSQFLQTSQKIIQFASGKEPQPGETVIYVAGAFDLFHIGHVDFLEKVHRLAERPYVIAGLHFDQEVNHYKGKNYPIMNLHERTLSVLACRYVSEVVIGAPYAVTAELLDHFKVDLVCHGKTEIVPDRDGSDPYQEPKRRGIFCQVDSGSNLTTDLIVQRIIKNRLEYEARNQKKEAKELAFLEAARRQEARQVESDCDL	1225728	1232595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1225876_1227786_1227876_1228045_1228209_1228431_1228499_1229062_1229148_1229403_1229449_1230037_1230177_1230432_1230516_1230702_1230781_1230991_1231058_1231175_1231242_1231425_1231515_1231930
879200	contig_10765_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_122942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGACAGAGACTGGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265716	263758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_263800_265700
879201	contig_15185_pilon	-	758	4	Intergenic	novelGene_99434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.24264068711928	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTTTTCAAAGAGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399276	391010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_391436_391482_391647_393031_393079_399154
879202	contig_12603_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_105788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTCACATGGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559391	556604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_556600_559400
879203	contig_11709_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_168225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAAATAAACTCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73197	74074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_73200_74100
879204	contig_9731_pilon	-	411	5	Intergenic	novelGene_154393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_4	89.7339818574881	9	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	123	287	409	86753	76842	FALSE	50	AACAAGATCAGAAGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSVTETLIKPLEKFRKEQLGAVKEEKKKFDKETEKNYSLIDKHLNLSAKKKDSHLQEADIQVEQNRQHFYELSLEYVCKLQEIQERKKFEFVEPMLSFFQGMFTFYHQGHELAKDFNHYKMELQINIQNTRNRFE	103808	76839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_-_76860_86648_86754_88505_88617_94367_94470_103735
879205	contig_5696_pilon	+	1573	4	Intergenic	novelGene_117501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	31.0948370133836	1333	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	72	383	301589	314462	FALSE	35	TGTTGATATATAAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGSKVASASRVVQVVKPHTPLIRFPDRTDNPKPNVSEALRSVGIPSHSSAVSQHSKGSKSPDLLMHQGPPDTAEIIKTLPQKYRRKPVSQEEIEFIQRGGPE	301517	315652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_301631_308651_308716_310355_310544_314444
879206	contig_5718_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_110433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	316	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1544685	1547392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1544700_1547400
879207	contig_7707_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_72196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGAACGAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651184	649444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_649400_651200
879208	contig_299_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_129481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTCTTTCCTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398233	1399774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1398200_1399800
879209	contig_13744_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_77159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1280	1606	270721	271047	NA	80	ATTAAAAAAAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNTVLPPNPDITLLDIYPNKLKTNDHTKNSTGMFIIALFIIAQNWKQPYCPSKGKRINKLQHIHTMEYDSAIKRNEPSSNQRLWGASLLVECCLVKEVSLKRLHTV	269441	271442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_269400_271400
879210	contig_5331_pilon	+	956	5	Intergenic	novelGene_112765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	8.04285397107271	53	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	194	661	194566	205969	FALSE	25	TGCTTTAACTGCTTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDVLFCPQCRALQPPDPTRDYFSLMDCNRSFRVDTTKLQHRYQQLQRLVHPDFFSRRSQLKLHGIEISEGTDDEMDKQFLMEIMEINEKLTEAQSEAAMNEIESIVAVKQKECIDSARRAFEQDDFEKAKEILTKMRYLLNVEEKIKLKKIPL	194372	206264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_194652_195791_195889_197299_197445_202566_202615_205877
879211	contig_16594_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_53881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTCTCTCCATAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191608	192408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_191600_192400
879212	contig_8683_pilon	-	910	4	Intergenic	novelGene_150276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTGCTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727939	722526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_722998_723916_724064_726502_726635_727779
879213	contig_14744_pilon	-	1937	1	Intergenic	novelGene_65934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAACCAAAAGATCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170338	168401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_168400_170300
879214	contig_12638_pilon	-	1014	3	Intergenic	novelGene_33290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	163	546	1109246	1108863	TRUE	10	TGATTTCCATTCGGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFGPPEADGTSLPLASGSEDTSPIGELEGFCGFSWYTIFLELLPKGVFTGAGILCLSGDGGTEAGPCKLTMTGMLPLCCMGILWESGFRGPLGGWTFWETGSLTDLGSCCIMSIIIICCCCCCCCC	1109408	1102021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1102220_1105197_1105318_1108712
879216	contig_6069_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_8022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1162	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	75	482	123914	123507	NA	25	GGAGTTGATCATTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLTGVTRGLVRGADRMSKWTSKRGPRTFYKGRGAKGTGVHAPGRKFVMIKEMVPEFVVPDLTGFKLKPYVNYRVPAGTETPLTAKQLFLQAVAPAIEKDFKEGTFDPENLEKYGFEPTQEGKLFQLYPKNFPR	123988	122856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_122900_124000
879217	contig_11396_pilon	-	1606	3	Intergenic	novelGene_71310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	356	847	435975	434997	FALSE	30	AAATTAGGACAGGCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSLHRLLRVPGSDFPTSPWTGRVLLPAEMSLGPPWGGPVCTGGGRAGSPSWRAGTFLRLDVKSMCGPKYGQCHHPLPNVPSLVAGACGAGVPTNVGQEVCELLFLPLSPHPVVRSVALSISCPGDGTKPLCSHPRTCKWEKLTGLKGSLSGWGKKPWWRSG	441172	434237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_435044_435530_436094_440935
879218	contig_7593_pilon	+	3268	1	Intergenic	novelGene_127327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532522	535790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_532500_535800
879219	contig_19352_pilon	+	4160	1	Intergenic	novelGene_122349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTTTGGCTCTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94443	98603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_94400_98600
879220	contig_5039_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_65052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	1820429	1820743	NA	25	TTTCCCCAACACCGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIFWLAAKRINHLHHPRDSPSLLSLPPFLSLRLHLPQKQNKKKPNPLPWSLIPTHRLIETHRTEQNCPIGFPRSGWWIRTANLLVSSRALNHFTTRAPNQELS	1820427	1821087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1820400_1821100
879221	contig_12694_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_171985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACCTGGACCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327727	329431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_+_327700_329400
879222	contig_16125_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_155292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATTTGAACTGCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210914	208933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_208900_210900
879223	contig_11337_pilon	-	3134	1	Intergenic	novelGene_107171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACTAGGTTTATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108763	105629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_105600_108800
879225	contig_8570_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_120169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTCCTGCCACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394234	395562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_394200_395600
879226	contig_12158_pilon	+	1105	2	Intergenic	novelGene_104846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	292	606	65524	65838	FALSE	15	GACGTGTTGTTTGTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVSAVRPAISAFPAMCVLIQSSENGHTHFLSLYAGGSTNRICRYNFQSLFSPDVFKVLEFPRCQLAQNMSQCILNMKHLPICPGLIFCLFMHTATHLACTSGA	44224	66337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_+_44486_65493
879227	contig_2703_pilon	-	2923	1	Intergenic	novelGene_101850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTTATTTTGCAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1378057	1375134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1375100_1378100
879228	contig_8452_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_48023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATCAAAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328980	327459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_327500_329000
879229	contig_5302_pilon	+	2003	2	Intergenic	novelGene_81507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1140	junction_1	0	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	382	654	353721	355700	FALSE	40	TAAATCCATGATTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALALADSPSQAVSNPDVFTANASALTRENQTRSSASQISTTVPPITSTQKSGGASVAPHLSPTTSLPQEDADNNEDPNIEEEVLFTLNSSPATAKDTQDNGDYGDYDWTASPRDDESEETLEENRGYMEIEQSVKSFKTPSSNIEEEDSHFFFHLLIFAFCIAVVYITYHNKRKIFLLVQSRKWRDGLCSKTVEYHRLDQNVNEAMPSLKITNDYIF	353339	357049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_353862_355568
879230	contig_2487_pilon	-	1101	1	Intergenic	novelGene_148445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAGGCAGGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96750	95649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_95600_96800
879231	contig_5059_pilon	-	1277	3	Intergenic	novelGene_140771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	6.5	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1248	28	1275	633493	609545	FALSE	35	AGACCCAGCTCTTACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSNPLPQNGMLAPFPLPVIRPGAEVSVGMPINHLKIDSLEMDSDLSPSCRLSDLSRGGSLESRSSSSRSRSFTLDDESLKHLTHEEKDVILFFEETIDSLEEDFEEQVLCDSSIHCRSPRSLEESTSSHSEPEDVIDLVLPVPAAREPECPPDVTQAAEAEPVGKEEIPVLECRRQNAENSLPPDSMVPETLPLPPSSPITSTPAHTRKELLPPSPPAEHPKLPRSVPTPLVIAQKISEKLAGNEALSPTSPSKEGRSGEWRTPTSLAPQNGGHFLWHRHMTQPVHKIHRFPSNISVTNSSGKEFSKTISKAAVNVQERKAQVLANINGVSFLTTGEMEDQSPKSDLTEQRRGFSPEQVTRDQSKPGPVKEAVCQGTGGQPSSQQSKGVQTEHSPALANGFQSIHDVLKSEPSPFVSTGKTITFR	633520	609542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_610345_612237_612491_633298
879232	contig_3424_pilon	+	1539	13	Intergenic	novelGene_55575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	68.3426822872956	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1137	402	1538	1089384	1097833	FALSE	40	CCCAGCTGAAAGAGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHSEHSAQSLHSAPSLHSRRSSVSAHSQQSQIYRNHNVTAGSYDATALPGSFHGDYGYGTYGSDFSGVQAFPEYGYPAGTSWPTAGSAPSRPSSPEKFSVPHVCARFGPGGQLIKVIPNLPSEGQPALVEVHSMETLLQHSLEQEEMRSFPGPLGKDDTHKVDVINFAQNKATKCLQNEDIIDKESASLLWNFIILLCRQNGTVVGTDIAELLLRDHKTVWLPGKSPSEANLIDFTNEAVEQVEEEASGEAQLSFLNDSQAASTSGLEKDTERFRELLLYGRKKDALESAMKSGLWGHALLLASKMDSRTHARVMTRFANSLPINDPLQTVYQLMSGRMPAASTCCGDEKWGDWRPHLAMVLSNLNNSMEVESRTMTTMGDTLASKGLLDAAHFCYLMAQAGFGVYTKRTTKLVLIGSNHSLPFLKFATNEAIQRTEAYEYAQSLGAHTCSLPHFQVFKFIYACRLADMGLATQAFHYCEVIAKSILAQPHAHSAVLISQLVQVASRLRLFD	1087725	1097834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1087815_1088117_1088293_1089246_1089390_1090096_1090159_1090265_1090405_1090943_1091190_1092601_1092700_1093340_1093423_1093599_1093718_1093886_1093999_1094203_1094310_1095294_1095436_1097806
879233	contig_11416_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_145330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	356	712	107677	107321	NA	0	CTCGTGTTCCTGTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLVCVCVCLCVCAGRVLDGCPGGLCSLPGGGALGWREAHPGDRGALSWRLLGNPSNAQTKSHLCPRMCSPPAGMALSSQRPRPHQQGQAAWPPPACPLHQTFLSPRLLHLWPQAACL	108032	107184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_107200_108000
879234	contig_6674_pilon	-	3511	1	Intergenic	novelGene_148017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTTGCACAAGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239122	235611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_235600_239100
879235	contig_6063_pilon	-	1646	4	Intergenic	novelGene_27570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	146.221293478982	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	885	1214	20191	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	21075	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065
879236	contig_12654_pilon	-	1505	4	Intergenic	novelGene_129282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720681	711297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_712436_712982_713120_718650_718786_720586
879237	contig_6445_pilon	+	2191	3	Intergenic	novelGene_77001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCCCTTCCTCTCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488284	511959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_490211_490293_490399_511799
879238	contig_4964_pilon	+	2202	11	Intergenic	novelGene_157261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149379	178811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_149526_150119_150180_155756_155880_158007_158129_160037_160120_160961_161098_163601_163704_170354_170510_174078_174157_177481_177596_177726
879239	contig_6058_pilon	-	943	7	Intergenic	novelGene_172378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGTCGGAGCGCGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375004	366419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_366449_366782_366886_368154_368301_369393_369588_372249_372412_374149_374309_374854
879240	contig_14034_pilon	-	3175	3	Intergenic	novelGene_72661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2648	3040	377318	337560	FALSE	20	CAGCCCAACCTGCTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVIKDVFPTLCSPRNTSLNFLSGFPKSPPADMMKPEELPPPQSRDLPDRPCSSRQTKTARGGQEPSSIGPCRARRRSKPGPQDTFTDTQAAVAAASRQSRLAPREAHGWEGKEGGVGNSHGCARGSQG	390375	337424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_337921_377286_377344_387753
879241	contig_9548_pilon	+	2677	12	Intergenic	novelGene_141062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGTAGGTACTGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142271	162091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_143023_143282_143404_143639_143714_146520_146709_147554_147819_148180_148312_148621_148787_149467_149576_150055_150222_156088_156257_161422_161540_161667
879242	contig_15371_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_151450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCTTCATAATACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158890	157085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_157100_158900
879243	contig_15548_pilon	-	994	2	Intergenic	novelGene_173483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256421	252766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_253731_256391
879244	contig_13145_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_116659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCAACCTCGGCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254199	256187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_254200_256200
879245	contig_13865_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_122744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGATGGAGAAGAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48570	46808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_-_46800_48600
879246	contig_7171_pilon	-	1453	5	Intergenic	novelGene_101391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5.71729831301464	214	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	145	402	1399279	1398774	TRUE	5	TGCCTTTTCTTGATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVCSDIYEGLARDDNQEPQGADAFLPALAEELIWSPNIGETQLDVEFLMELLDPNELRGEAGYYLTTWFGALHHIAHYQPDVGRAPQGLSSEARASLRQWHRRRTLHGHDRASTQADLPFEEPWAGGTEPGNQ	1399704	1397023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1397360_1398058_1398831_1398913_1399078_1399242_1399375_1399655
879247	contig_13607_pilon	+	3613	1	Intergenic	novelGene_170180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3099	3407	218671	218979	NA	40	AGTATTGTGAAACAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNSGASRLRQTKKQGLMIYFQKSASEYPIDYVHIGAQSVLSCSSLLSCHLHFQIQKLRHGKVTDLPKHISKSFDKRSWILTSAWDVIHLLELRIATSSVLN	215572	219185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_215600_219200
879248	contig_6269_pilon	+	1953	5	Intergenic	novelGene_170534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_4	35.3862614583683	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	173	787	166268	171601	FALSE	40	AGATGAAGACAATGTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNHTCSYPGWHSTTVADHSRPHGDSAPVSCLGEHHSTPSLPVDPGSLPEESASPARCMIVHQGTILDNVKNLLEFAETLQFIDSFLNTSSNHENLDLEMPSLTSTPLNGHKLTVTTPFHRDQTVKTQKENTIFRTPAIKRSILESSPRTPTPFKHALAAQEIKYGPLKMLPQTPSHLVEDIQDVIKQESDESGIVAEFQENGLPLLKKIKQEVESPTDKAGNFFCSNHWEGESLNTQLFTQSSPVADMPVSICAQAPTLCW	166095	172767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_166349_169154_169298_170398_170514_170600_170727_171451
879249	contig_6048_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_73325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGTTGTAAAATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2274811	2277129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2274800_2277100
879250	contig_5779_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_106466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTCAAATGAGCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112922	113799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_112900_113800
879252	contig_16633_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_165076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCATAGCATTTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90948	90203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_90200_90900
879253	contig_13206_pilon	+	2758	1	Intergenic	novelGene_161899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATTTTGAAGCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131793	134551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_131800_134600
879254	contig_2646_pilon	+	3247	13	Intergenic	novelGene_69700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	745	1056	2481125	2481436	TRUE	35	GCTGGCCAACTAAAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLGPSTACVQAAHSRPLRMDSAADGVSQLSAQHTCAQSCNDSAKCSGSVDSVINKFRASWVTAEPLLTEAGPCSPRRYHSEDPVLHEDRILVSLQPASPVR	2480380	2511010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2482066_2483549_2483620_2484294_2484371_2485266_2485494_2487159_2487362_2488258_2488338_2491428_2491503_2492400_2492505_2498947_2499047_2499540_2499668_2504376_2504566_2507721_2507899_2510872
879255	contig_9389_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_84083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	465	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTGGCCTTGCGTGCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201037	1200094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1200100_1201000
879256	contig_5696_pilon	-	2795	2	Intergenic	novelGene_117496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGTTTTTCAGTCGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281976	270673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_273025_281532
879257	contig_4519_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_123742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGAGATTTCTAAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802100	800472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_800500_802100
879258	contig_12357_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_6143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGGGGCAGTTCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57445	55649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12357_pilon_-_55600_57400
879259	contig_8196_pilon	-	2666	1	Intergenic	novelGene_168769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGACGTACTCTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498966	496300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8196_pilon_-_496300_499000
879260	contig_9389_pilon	+	1235	12	Intergenic	novelGene_83964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGCCACGCAGGAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232835	237227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_232888_233138_233215_233299_233432_233532_233628_233711_233807_233961_234110_234223_234297_234943_235053_235147_235219_235355_235469_236144_236282_237093
879261	contig_12150_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_6952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTATATATTTAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12670	10113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_10100_12700
879262	contig_7843_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_152046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGTGTAGGGGAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473464	472002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_472000_473500
879263	contig_6175_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_16342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTAGGGAGACATGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1654961	1656281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1655000_1656300
879264	contig_4884_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_63795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGGAATAGAAAGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224097	225055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_224100_225100
879266	contig_5815_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_141191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208178	209794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_208200_209800
879267	contig_5988_pilon	+	2217	7	Intergenic	novelGene_15984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	131.615601912033	1923	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	855	2099	783406	786813	FALSE	30	GACTGGCTTCTCAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	655093	786931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_655541_746160_746223_750790_750906_752523_752652_783303_783527_783653_783803_785838
879268	contig_6589_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_25835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCCAAGAAGAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905522	907180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_905500_907200
879269	contig_5261_pilon	-	1592	2	Intergenic	novelGene_102471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	174	596	549414	548178	FALSE	45	TAGTGAAATATTTGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRESLAAGERLVSPAYVRQGFEARRSHEHLIRLLLEKGKCPEDGWDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRCIFYAVCENISFFLFLVRNSGCSTHFFCIHMLLQGDGNNLSDWCFSKIMG	549587	547181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_548487_549300
879270	contig_15613_pilon	-	1079	1	Intergenic	novelGene_147211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCCTATAGGGTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148941	147862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_147900_148900
879271	contig_16380_pilon	+	1779	1	Intergenic	novelGene_178208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGATGTAAGTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16380_pilon_+_0_1800
879272	scaffold_7386_pilon	+	2622	5	Intergenic	novelGene_136613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	70.3291369206249	2161	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708224	721503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_708324_710625_710699_711992_712247_712488_712641_719459
879273	contig_7744_pilon	-	1929	2	Intergenic	novelGene_62517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_1	0	83	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGCCATGGTGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825062	822873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_823501_823760
879274	contig_504_pilon	-	3228	1	Intergenic	novelGene_54443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAGAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243548	240320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_240300_243500
879275	contig_11227_pilon	-	2792	9	Intergenic	novelGene_163181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_8	84.9189871289101	775	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	158	1510	216342	135558	FALSE	15	TGTCTAACTTCTGTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASLKRSRSEEPAELPPPARNVEEEEEGDGMEQGLEEEEEVDPRIQGELEKLNQSTDDINRRETELEDARQKFRSVLVEATVKLDELVKKIGKAVEDSKPYWEARKVARQAQLEAQKATQDFQRATEVLRAAKETISLAEQRLLEDDKRQFDSAWQEMLNHATQRVMEAEQTKTRSELVHKETAARYNAAMGRMRQLEKKLKRAINKSKPYFELKAKYYVQLEQLKKTVDDLQVKLALAKGEYKTALKNLEMISDEIHERRRSSAMGPRGCGVGAEGSSTSAEDLSGSKPEPDAVSVASEAFEDDSCSNFVSEDDSETQSVSSFSSGPTSPSEMPDQFPVVARPGSLDLPSPVSLSEFGMTFPVLGPRSECSGASSPECEAERGDRAEGAENKTSDKANNSRGLGGNSKSQSSTATEGQALEKRMKQLSLQCSKGRDGIIANIKMVQIG	216499	134275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_135758_136257_136519_138868_139089_140476_140520_142684_142816_147879_148045_186783_186913_214202_214266_216201
879276	contig_7513_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_88993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAGCAGCACTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488507	486152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_486200_488500
879277	contig_4055_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_158173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTTTGCTGTGTCATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897798	897207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4055_pilon_-_897200_897800
879279	contig_12119_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_88646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATAATCATAACTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131682	133002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_131700_133000
879280	contig_15787_pilon	+	2717	8	Intergenic	novelGene_143968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_7	683.399037823408	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	23	985	56204	102101	FALSE	60	AAAAAACAACAAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRKPSNASEKEKHQKPKRSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQEYISTLLLNGYETIEDLKDIKESHLIELKIENPEDRMRLLSAAENLLDEESHCLTGGKDASPTS	56181	103833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_96021_98169_98321_102057
879281	contig_9199_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_65640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	60	674	124244	123630	NA	5	TACCCCCTCTTGCCTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPRAALTRLLRDAEGLQELMLAPCHEWLSDEDLVPVLARNPQLRSVTLAGCGQLSRRALGALAEGCPRLQRLSLAHCDWVDGLALRGLADRCPALEDLDLTACRQLKDEAIVYLAQRRGAGLRSLSLAVNANVGDTAVQELARNCPQLEHLDLTGCLRVGSDGIRCRGWGGGVVVAGGQSFSFWGRLSCSSQKAELAGSGSFCYHSPPILNRKTLQDCLGQRA	124303	122959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_123000_124300
879282	contig_7549_pilon	+	1849	6	Intergenic	novelGene_164541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	46.8742999947733	18	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	145	813	841049	855688	FALSE	35	TAAAACTATGTATGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSSEFESYEEQSDSECKNGTPRSFLRSNHKKQLSHDLTRLKEHYEKKMKDLMANTVGAVEIQQLKQKHELKMQRLMKAAKEGTKDGLEKTKAAVKRGRSFIRTKSFISQDHRSCLEEEQSLFIDFDCKHPEAVMTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKILSERKLKMVFYRIKEILQCHSMFQIALASRVSEWDSVEMIGDVFVASVIKLVQQLFCRVLCVLTSVGSVLLSRKACKLTSSWFSL	838521	856724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_838621_841003_841121_847255_847371_850478_850586_854813_854892_855391
879283	scaffold_12124_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_22138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAAGAATAGAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945396	944946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_944900_945400
879284	contig_4125_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_25154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAGTTTGCAGAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880959	879519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_879500_881000
879285	contig_11908_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_133237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGTAAGTGAGGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730704	732407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_730700_732400
879286	contig_11986_pilon	+	1751	2	Intergenic	novelGene_69254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCTCCAGTATTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828746	830606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_828884_828992
879287	contig_5794_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_69778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTAATTTAACAGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735307	734501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_734500_735300
879288	contig_11338_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_6380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTTACCACCTGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305201	303640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_303600_305200
879289	contig_10163_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_82672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAACAACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434264	432047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_432000_434300
879290	contig_12778_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_173489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAGCAACTAATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5554	4541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12778_pilon_-_4500_5600
879291	contig_9389_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_83948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	68	364	195076	194780	NA	55	CTCAAAAAAAAAACCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHHPVRTGAPWPVWEETGEASPMQGPVCWPDPVPHPGLPHPAPAHLARVSGRHREEGANVHFTHEELGHAAGQGSGLYDPPGTDPPALLAATITHVLLKETAMVSRAFSNSRLSASLLLS	195143	193927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_193900_195100
879292	contig_16532_pilon	+	1420	3	Intergenic	novelGene_110069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	131	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	123	497	594901	598125	FALSE	45	TCAAATTTAAATGTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHELVLERNKVELLQVNQENSHDSPLIKWKCFIPNPYSPSSQLISMFFQWLQRRCDKWKGKFLKSKLTLIRSAGGALVKRLAAKGLWTPRERRPGMKPYGAVALRPVWSLRVRMDSTAHSNSTE	586923	599048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_586961_594815_594986_597835
879293	contig_5019_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_109210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCACAATCTGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195875	197746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_195900_197700
879294	contig_13481_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_119545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAGAAGAATATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1500992	1498540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1498500_1501000
879295	contig_5918_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_99601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGTTTATAAGCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2086283	2088250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2086300_2088200
879296	contig_4059_pilon	+	951	2	Intergenic	novelGene_140587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	164	307	177614	177757	TRUE	10	TTGTGGCAGCGATTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAATIAGGWGRGNETQTPRRSSTPLGYSWEFRTGLQGSYEISNTLRTDTCHAHMLVFAWRRPGRAPALLPLGADTPHPWPGQMPPFRKRGDNAVAAHLFR	177450	178719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_+_178195_178512
879297	contig_9646_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_117414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	188	394	23591	23797	NA	10	TGTTATTTCTATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPRSWDEAEAQEEEEAVGDGDADGDGEDDQGPWDADAAAAFGGSSGGRQHSRALAAEEIRQMLEGKPLADKMRPDTLQDYIGQSRAVGQETLLRSLLETNEIPSLILWGPPGCGKVSAALTEGFPGLHL	23403	24238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_23400_24200
879298	contig_8045_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_35343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAGAATATATAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108614	109929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_108600_109900
879299	contig_13744_pilon	-	1337	3	Intergenic	novelGene_77170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCGACGGCCGCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405559	399916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_399993_403386_403602_404513
879300	contig_3754_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_146843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAAGTGCACTAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384085	385267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_384100_385300
879301	contig_2455_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_119215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAAAAGGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366444	1364605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1364600_1366400
879302	contig_990_pilon	-	1858	3	Intergenic	novelGene_76005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAAATACTTCAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235156	223113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_224689_232493_232605_234984
879303	contig_12635_pilon	+	2027	9	Intergenic	novelGene_60876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCCGTTTGTTCTCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947359	1016662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_947955_950018_950189_952094_952177_957878_958035_962624_962763_967292_967414_973335_973591_1014722_1014834_1016263
879304	contig_5196_pilon	-	1831	5	Intergenic	novelGene_38661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	374.185448674852	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	181	624	11848	9642	FALSE	20	ACTTAATTGTGTTGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16065	8434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14428_14542_16024
879305	contig_1516_pilon	+	2837	11	Intergenic	novelGene_50036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	19.2873015219859	51	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	111	1244	641774	685317	FALSE	65	GAAAGCTGCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKETDLVEEHNGHIFKATQYSIPTYCEYCSSLIWIMDRASVCKLCKYACHKKCCLKTTAKCSKKYDPELSSRQFGVELSRLTNEDRTVPLVVEKLINYIEMHGLYTEGIYRKSGSTNKIKELRQGLDTDAENVNLDDYNIHVIASVFKQWLRDLPNPLMTFELYEEFLRAVGLQERKETIRGVYSVIDQLSRTHLNTLERLIFHLVRIALQEDTNRMSANALAIVFAPCILRCPDTTDPLQSVQDISKTTTCVELIVVEQMNKYKARLKDISSLEFAENKAKTRLSLIRRSMGKGRIRRGNYPSPSSPVVVRLPSVSDVSEEALTSEAAVEADITEQQQAAMQQEERVLTEQIENLQKEKEELTFEMLVLEPRVSDDETLESEASIGTADSSENLNIEPEGAVSEKPEKLSP	634044	686910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_634068_641686_641799_643910_643973_647699_647893_649404_649534_651824_651931_653105_653238_654001_654126_682178_682382_684540_684684_685300
879306	contig_408_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_84932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAAAAAAAATCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209419	211582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_209400_211600
879307	contig_11896_pilon	+	1179	3	Intergenic	novelGene_87988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_2	31.5	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	158	679	21965	34879	FALSE	75	GTCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHFQAEEEANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQDLVREELNKRQTQKDLEHAMLLRQHESMQELEFRHLNTIQKMRCELIRLQHQTELTNQLEYNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSLKSKELQIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSINEMLSTQAVSLLYLG	21807	35379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_22010_24326_24567_34642
879309	contig_9242_pilon	-	2255	11	Intergenic	novelGene_155066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGGGCCGAACAGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660266	593941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_594627_631190_631346_632448_632581_635598_635768_637377_637502_642854_643077_643911_644137_645723_645831_651604_651723_657597_657705_660055
879310	contig_12528_pilon	-	1550	2	Intergenic	novelGene_81287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGTAAATACACAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308565	306552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_308068_308530
879311	contig_8447_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_69421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCAGTTTCACCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75039	74114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_74100_75000
879312	contig_6445_pilon	-	431	1	Intergenic	novelGene_77109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	150	281	430	1332057	1331908	NA	20	AGCAATGAGCCTGGGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLVVGRLLLLLLLLLLLAPVELGVALAQVELARVAKHVGHQEVLVQLDAAALGPGAVDLAQGDADQALGVQGALHAPAETAAAKQPPPLLKLMLLLFLLPAGLWGALGKGNGARVSGSAALPEAPPPSAARHPRACAPQTAP	1332337	1331906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1331900_1332300
879313	contig_5936_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_53544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAATCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68306	66569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_66600_68300
879314	contig_12981_pilon	+	1607	2	Intergenic	novelGene_176120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	316	1266	170914	171864	FALSE	15	TAGCTGTCTGTGTCACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLLGAVLLVAQPQVVPSRPTTVVTEPPGQPSQQELLRKVATLADDHLPDSAAPNGSARQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSHGLGWYLSQMPLSSPHQLTVEKTPAYFTSPKVPARVHSMNPAIRLLLILRDPSERVLSDYTQVFYNHVQKRKPYPSIEEVLVRDGRLNVDYKALNRSLYHVHMQNWLRFFPLHHIHIVDGDQLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQIHPSNFYFNKTKGFYCLRDSGRDRCLHESKGRAHPHVDPKLLNKLHEYFHEPNKKFFELVGRTFDWH	132916	172205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12981_pilon_+_133119_170800
879315	contig_11396_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_71380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACTTTAGAACCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074189	1073063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1073100_1074200
879316	contig_7035_pilon	-	3034	1	Intergenic	novelGene_83524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGTCTATAGTCAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296173	293139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_293100_296200
879317	contig_8907_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_85786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGCAATTATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47430	45622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_45600_47400
879318	contig_709_pilon	+	2482	24	Intergenic	novelGene_57519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	21	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAGAAGGCGTAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18037	405969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_18158_22681_22771_24566_24613_33348_33503_33693_33780_46577_46725_58882_58941_65876_65981_72083_72163_145327_145422_154591_154697_305028_305124_307005_307135_332777_332885_336385_336456_373915_374031_382147_382283_386817_386920_387257_387345_392837_392936_399483_399670_400291_400394_404766_404842_405870
879319	contig_5864_pilon	+	1016	2	Intergenic	novelGene_162768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGTTTCTTAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18120	39998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_18304_39165
879320	contig_8260_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_163233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAATTTAGAAACAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93465	95497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_93500_95500
879321	contig_11285_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_5730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910568	908196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_908200_910600
879322	contig_13044_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_99999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	751	1056	211163	211468	NA	45	CCCCAACTTCAACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWCFLNKLEIKLPYDLATPLLGIYPRDLIEETRTDICKTMFTAALLTIAKRWKQLKCPSMDEWINKMWYIHTMEYYTAIRNNDEFSKHYNVGEPEGHYAE	210412	211967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_210400_212000
879323	contig_4364_pilon	+	1038	4	Intergenic	novelGene_104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_3	25.4602086052377	342	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	119	448	981403	1004956	TRUE	15	GCACCTGGGGCTGGAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSPQRPLLASRPVAGGAISDVCIPGPCRWRAHGDGGPGAAGHTALLGAPTPAEAEGRRQEHPPPAAGEGAARGSQQPAPRGAGPSPGHRRDATWPFPNSCPGSPEPR	981284	1036615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_981669_1004892_1005024_1011113_1011331_1036309
879324	contig_15236_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_141655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTACCTTAAACCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709615	707552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_707600_709600
879325	contig_17875_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_143179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGTTTGAGTTCACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41814	43045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_41800_43000
879326	contig_14243_pilon	+	1566	9	Intergenic	novelGene_57415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3.37036719067819	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	26	958	415774	524699	FALSE	55	ATTAAAATGACTACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWRRPRLCLWAWLPDFLLLSLLRGCLIGAVNLKSSNRTPVVQEFESVELSCIITDSQTNDPRIEWKKIQDDQTTYVFFDNKIQGDLAGRAELLGKTSLKIWNVTRRDSALYRCEVVARNDRKEIDEIVIELTVQVKPVTPVCRVPKAVPVGKSATLHCQESEGSPRPHYSWYRNDVPLPTDSRANPRFRNSSFFLNSETGTLVFSAVHKEDSGQYYCIASNDAGSARCEEQEMEVYDLNIGGIIGGILVVLTVLALITVGICCAYRRGYFINKKQDGESYKNPGKPDGVNYIRTDDEAFCGASICTVV	415748	525307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_415850_508842_508909_509414_509529_512892_513046_513539_513743_514905_515006_521243_521374_521470_521526_524663
879327	contig_8149_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_169957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGGGGATACAAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694331	696260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_694300_696300
879328	contig_7914_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_165031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAAAGAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177313	178327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_177300_178300
879329	contig_5039_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_64849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1184	1561	328501	328124	NA	35	GAATCAACTCGATGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPFFLLHLSLEAPLKPVQPHSHTQASTDGREVAAQEVHQPGIEHGSPAQKERILPRSHHAHSEATRVSSAPGLSFHHPQPCQLGSVSSLLLLGRFGGMRNSPLVTQGKAVSLWAVCPEGHAPR	329684	327633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_327600_329700
879330	contig_4232_pilon	-	1800	16	Intergenic	novelGene_63181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_8	40.6746440263055	152	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	38	1696	143830	138528	FALSE	20	CATAGCTTTATGTGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPVRLGRKRPLPVCPNPLFVRWLTEWRDEATSRGRRTRFVFQKALRSLQRYPLPLRSGKEAKILQHFGDGLCRMLDERLQQHRASGGDHTPVSPSGEKSSAPEGPAAEAQDPSLPVSAQPRSRGSGGYWPARHSGARAVLLLLYQEHLNPSGCSFLTKEELLQRCAQKAPRVVPANVRSWPALRSLLNRNLVLRAHQPARYSLTLEGLELAQKLAESEGLSSLNAGTGPEEPAREEPEVPGAASAKLGASEGGGQQPPLELGPGEYRVLLCVDVSETTGAGHRPELLRELQRLHVSHTVRKLHVGDFVWVAQETRPRDPARPSELVLDHVVERKRLDDLCSSIIDGRFHEQKFRLKRCGLGRRVYLVEEHGSVHNLSLPESTLLQAVTNTQVIDGFFVKRTADIKESAAYLALLTRGLQRLYQGHTLRSRPWGTPWDPEPGARPSPNPLCSLLTFSDFNAGAIKNKVQSVREVFARQLMQVRGVSGEKAAALVDRYGTPASLLAAYDACATPKEQEMLLSTIKCGRLQRNLGPALSRTLSQLYCSCGPLT	143867	138423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_138595_138681_138766_139300_139405_139484_139614_139779_139876_139965_140083_140633_140732_140817_140940_141029_141126_141292_141434_141960_142047_142229_142299_142484_142584_143153_143240_143479_143610_143695
879331	contig_16122_pilon	-	1265	3	Intergenic	novelGene_134528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAACCCGTTGAATGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166629	161202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_162129_166168_166275_166396
879332	contig_8693_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_150882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCATGAGACAGTCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176680	1175831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1175800_1176700
879333	contig_9415_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_109758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTTATTTCAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498741	1500125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1498700_1500100
879334	contig_13593_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_156122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAGAGAATAAATTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59318	58424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_58400_59300
879335	contig_9363_pilon	+	2017	7	Intergenic	novelGene_6709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACCTGACTGGCGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288113	1299284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1289120_1289229_1289321_1291183_1291348_1291432_1291498_1292773_1293279_1298772_1298888_1299213
879336	contig_13097_pilon	+	869	2	Intergenic	novelGene_107690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152673	168197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_152729_167383
879337	contig_8476_pilon	-	2724	1	Intergenic	novelGene_121330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100083	97359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_97400_100100
879338	contig_13643_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_178084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGATGGGAAACACATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6289	5637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13643_pilon_-_5600_6300
879339	contig_13794_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_168555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCAGCTTTAGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104416	106319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_104400_106300
879340	contig_9713_pilon	-	1742	10	Intergenic	novelGene_170255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	47.4739694756798	30	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	726	1015	1740	405726	299188	FALSE	60	GAGAAAAATGTTACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTQSTITDRFPPKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERSTSHDFDPTDSSSKKTKSSSEESRSETYGDQSKGLIDHMNHSNQPEPRRTRWCPATTLATLTGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADPEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGVSGNMERITSPVLVGEENNVVHNQKVEI	406740	299185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_299227_300536_300716_303438_303497_305459_305510_306179_306279_311192_311295_325065_325123_326756_326843_328100_328125_405694
879341	contig_14034_pilon	+	2416	9	Intergenic	novelGene_72662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	146.915739030915	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	272	898	337852	407151	TRUE	20	TTATTTTGACATGGCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGGDFGNPLRKFKLVFLGEQSVGKTSLITRFMYDSFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSAAAVVVYDITNVNSFQQTTKWIDDVRTERGSDVIIMLVGNKTDLADKRQVSIEEGERKAKELNVMFIETSAKAGYNVKQLFRRVAAALPGMESTQDRSREDMIDIKLEKPQEQPVSEGGCSC	337580	409068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_337922_377287_377347_387756_387811_389248_389355_391385_391498_404226_404321_406464_406532_407086_407683_408081
879342	contig_8729_pilon	-	672	7	Intergenic	novelGene_40094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	47.4552420708187	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	28	591	260026	257455	FALSE	15	TGAGCCGTGTGTGGGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFAAITLNSMDATSERDFVAEFLFWASLCMTHLSRMAEDLILYGTKEFSFVQLSDAYSLELIRSKAGRVFGRCAGLLMTLKGLPSTYNKDLQEDKEAVFEVADTMSAVLQVTTGVISTLQIHRENMARALSPDMLATDLAYYLVRKGMPFRQAHEASGKAVFAAETKGIALNQLSLQELQTIRCVAPCPSAASQEA	260053	257373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_257605_257721_257803_258981_259066_259327_259388_259474_259518_259742_259858_259995
879343	contig_567_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_33980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403991	405191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_404000_405200
879344	contig_10389_pilon	-	1188	8	Intergenic	novelGene_176568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	9.09361740733688	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	16	1188	41872	10232	FALSE	25	TAAGTGGCTTAAAGCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTISGMKNIIAEMEQASRQSTEALIMCEQDISRMRRQLDETNDELAQIARERDILAHENDNLQEQFSKAKQENQALSKKLNDTHNELNDIKQKVQDTNLEVSKLKNILKAEESENRQMMEQLRKANEDAETWENKARQTEADNNTLKLELITAEAEGNRLKEKVDSLNREVEQHLNAERSYKSQISTLHKSVVKMEEELQKVQFEKVSALADLSSTRELCIKLDSSKELLNRQLVAKDQEIEMMENELDSARSEIELLRSQMTNERISMQNLEALLVANRDKEYQSQIALQEKESEIQLLKEHLCLAENKMAIQSRDVAQFRNVVTQLEADLDITKRQLGTERFERERAVQELRRQNYSSNVYHMSTSLKPNTKCHSPERAHHRSPDRGLDRSLEE	41887	10231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10389_pilon_-_10383_10555_10661_12539_12743_26004_26215_34108_34295_37799_37911_40553_40723_41834
879345	contig_10196_pilon	+	1537	11	Intergenic	novelGene_132256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_6	45.2817844171362	19	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	10	1356	1950014	1958849	FALSE	15	CATGGAGACGGCCGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLFSGALQLTDLDDFIGPSQDCIKPMKVDKKPGSGVAKIHIEDDGSYFQVSQDGGMRKLEKAKISLNDCLACSGCITSAESVLITQQSHEELRKILNANKAAEPDHRKLVVASVSPQSVASLAARFQLNPTDTARKLTSFFKKIGVHYVFDTAFSRNFSLIESQREFVQRFRSQADSRQALPVLASTCPGWICYAEKTHSSLLLPHLSTARSPQQVMGALVKDFFAQQQHLTPDRLYHVTVMPCYDKKLEASRPDFFNQEFQTRDVDCVITTGEVFRLLEEEGVSLPDLEPAPLDALSSCVSAEEPTSHRGGGSGGYLEHVFRHAARELFGIDMAEVTYKPLRNKDFQEVTLERDGQVLLHFATAYGFRNIQNLVQKLKRGRCPYHYVEVMACPSGCLNGGGAARGSGWARQGAAAAGGAALQGGQDAAARGRARGPRAVRTLATG	1950004	1959030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1950080_1951188_1951285_1951567_1951712_1953180_1953314_1953954_1954090_1955032_1955152_1955887_1956018_1956948_1957022_1957882_1958021_1958425_1958584_1958694
879346	contig_16804_pilon	+	2646	5	Intergenic	novelGene_167284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	244	591	2304	2651	TRUE	75	AAGAAAAAAAAATGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVWGQRCTGFSAVLIAAGLPFRPGSRLWVGVRVVPFCFLLLPLLAFQTYEFRVSGLLQGRQSHAHARGEKHGWVNESRRHSWDKKWVKSHRTTRSYCRFRLIRKWTRTRLVFS	2060	16779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_3146_10675_10797_12070_12262_14535_14992_15986
879347	contig_19908_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_167618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGGAAAAAAAAGCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72259	70197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_-_70200_72300
879348	contig_7644_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_64270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCCGCCAGTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258998	257389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_257400_259000
879349	contig_10196_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_132213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAAGCTCTGTGCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1282205	1283267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1282200_1283300
879350	contig_12021_pilon	+	1644	9	Intergenic	novelGene_172200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	29.4353104281236	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	421	1437	273810	318257	FALSE	5	CCTGTCGTGTTCTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSSGNKDFVVLSNGNIATSATNPSPLTSCDGDLAAQQLTPKEAPRTKVSPNGCLQINGTVKSSFLPLDNQRTAQMLPQCCHPCPYHHPLTSHNSHQECHPEAGPTAPSALASCCMQPHSEYSASLCPHHSPVYQTACCLQPSPSFCLHHPWPDHFQHQPVQQHIGNRRPSRPFKLPKSYAALIADWPVVVLGTCTVFTVVCALVGVLVPELPDFSDPLLGFEPRGTAIGQRLVTWNNMVKNTGYKATLANYPFKYADEQAKSHRDDRWSDDHYEREKREVDWNFHKDSFFCDVPSDRYSRVVFTSAGGETLWNLPAIKSMCNVDNSRVCKVKLKSL	164470	318464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_164543_175172_175319_236226_236412_273792_274319_304849_304880_313264_313389_314197_314326_314671_314770_318129
879351	contig_11932_pilon	+	497	5	Intergenic	novelGene_85415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	355.243138568502	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTTGTCTTTATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285606	291287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_285670_287555_287693_289580_289677_289769_289863_291179
879352	contig_12008_pilon	-	2104	7	Intergenic	novelGene_24996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	735	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAGAGGGAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40348	23637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30215_34010_34145_34558_34711_38999
879353	contig_10042_pilon	+	898	6	Intergenic	novelGene_79227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_4	52.4724689718332	1024	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	92	559	1163065	1175962	FALSE	20	TATCCTTTTGTATTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSPRRERRRSRSTSRERERRRRERSRSRERDRRRSRSRSPHRRRSRSPRRHRSTSPSPSRLKERRDEEKKETKETKSKERQITEEDLEGKTEEEIEMMKLMGFASFDSTKGKKVDGSVNAYAINVSQKRKYRQYMNRKGGFNRPLDFIA	1162973	1176301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1163099_1164778_1164900_1165493_1165607_1166020_1166101_1171935_1172001_1175907
879354	contig_10011_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_68030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	120	652	771	105036	105155	NA	10	CCCCAGGTCCTCGGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAERSAPPSSLGQRSRGKEDTETREQEATRETLHHSSSSSPSGEHRAEGKEGTSLPSIGDYEQLFPSAQGEYAEPSRITSDQVEQKVVEKEAEASCSPRHQQVQAQPAWGGSPSRFHLRPHCTGGSSPLTPPSQSAVSRVVSQNSRSPVLPPKQRRGSNVPALLTDPGHQEGRGGGYVWACKSKGGLVSPEKSPSIDLTQSDSGHLGPRPPRSPSNMGRDEDVILLLDSDEELVLEQTGMKSVSNGPPEERKVLEV	104384	105157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_104400_105200
879355	contig_2365_pilon	+	1284	1	Intergenic	novelGene_103762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGAAAGAAAGAACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263045	264329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_263000_264300
879356	contig_8558_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_123165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATAGGAATTGGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546184	544226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_544200_546200
879357	contig_4364_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_79	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATACGCCGTCCGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816495	818528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_816500_818500
879358	contig_2924_pilon	+	2741	21	Intergenic	novelGene_140285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_11	22.9988586673339	127	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	354	2501	414000	448272	TRUE	40	TTCAACTTTTAAGCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNIMGSSGELEGESDGDTLEYEYDHDVNGDRVVLGKGTYGIVYAGRDLSNQVRIAIKEIPERDSRYSQPLHEEIALHKYLKHRNIVQYLGSVSEDGYIKIFMEQVPGGSLSALLRSKWGPMKEPTIKFYTKQILEGLKYLHENQIVHRDIKGDNVLVNTYSGVVKISDFGTSKRLAGVNPCTETFAGTLQYMAPEIIDQGPRGYGAPADIWSLGCTIIEMATSRPPFHELGEPQAAMFKVGMFKIHPEIPEALSAEARAFILSCFEPDPQKRVTAATLLREGFLRQVNKGKKNRIAFKPSEGALALPLLGEFAGGGGGGSGVSSSSSSEHSSISPDSEAQSDVFFEKARSPASESLPKHHLSHLPSVPDESTALSPEDRDPGLFLLRKDGERRAILYKILWEEQSQVVSNLQECVAQSSEELHLSVGHIKQIIGILRDFIRSPEHRVMASTISKLKVELDFDSSSINQIHLVLFGFQDAVNKILRNHLIRPHWMFAMDNIIRQAVQAAVTILIPELQAQFEPASEMEGVDKDADMEDYHPLADSNGSKVPATYGGSRPSSAAFQEIQLHHPYQHLSLQLGKLREETTRLLEYLIQREREYQNFLRQTLEQKTQELYHLRLHLKSNGITQKPAPHCGYPGQRTDQELEDWLKLQGADAETIEKIAEEGYTLSDILNDITKEDLRYLRLRGGLLCRIWNAVSQYRARALEPSKTKQ	398471	455367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_398546_400960_401069_407740_407791_409795_409892_413974_414063_415928_416063_416499_416628_418183_418315_418552_418659_434118_434277_438582_438767_439535_439732_440467_440622_441650_441837_442485_442592_443720_443941_445984_446098_447274_447385_447463_447541_448190_448289_455143
879359	contig_5338_pilon	+	2496	7	Intergenic	novelGene_114580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.143912407212	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	3	728	384915	387258	TRUE	15	CCCAATTTGTGGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGAVFLWGGAGAAACVCAARAPRRPPQPQPRGTPSTQVGLGATEPLRQPPPKDQRERARAGALPLGALYTAAVVAFVLYKCLQQGKDEATVLQEEAGKESLQSEQQLAQLTQQLAQTEQHLNNLMAQLDPLFECVTTLAGAQQKLLNMKLQTVHQLLQENKQDKGVEVPEPEASTPFPEDLCIEETGDSQAWEEPINWSTETWNLATAWEVEQGLRRRSSMAVAKGPSHGSSWEGRRDSS	384912	389188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_+_385022_385117_385263_386519_386581_386669_386761_386856_386970_387049_387664_387825
879360	contig_6589_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_25992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAATATATTACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385467	1387376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1385500_1387400
879361	contig_6513_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_117772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGTTTTATTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171841	172703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_171800_172700
879362	scaffold_13505_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_111661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACCCACCCAGCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852754	851635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_851600_852800
879363	contig_4754_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_35884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTGTAAAATGGTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54865	53420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_53400_54900
879364	contig_13412_pilon	-	1739	1	Intergenic	novelGene_80028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTAGCATCAATGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737189	735450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_735400_737200
879365	contig_4392_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_117301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAGAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223639	225242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_223600_225200
879366	contig_16541_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_126724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTTACAGCGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218056	216646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_216600_218100
879368	contig_6326_pilon	-	2456	3	Intergenic	novelGene_168542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	64	28	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1492	1848	675922	675566	FALSE	25	TACCCAGAGAGCACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGLLLRSDLNLLSSKRFSAPILAGLSAVFVLLITPPPGTLGSASVTPNFAGFLPAPACRLSHPLPISPPLCRLKGVCLILCRQVYPHKDFWISTSVGLYIHRLLNTPLEYLGSSQP	680319	674957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_676976_678951_679158_680087
879369	contig_16722_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_118288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGGTCTACTGCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126143	126925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_126100_126900
879370	contig_12021_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_172182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1404	1709	26310	26005	NA	60	TCAGTAAAAACAAACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPKFVPVKWCEKYSVLFSSSLYKEFDSKDNVDLHFENRVLLYFTVCFLKDLFSPCCTGNTLLSFSLKECVFSSYRLARHLQKEAQAQHNNSEFTEEQKVP	27713	25603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_25600_27700
879371	contig_9363_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_6670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	255	584	1071746	1072075	NA	30	GACTTGTCCAAGGACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAQSSSRSPMRICSQLKRGPSISEERAWRICSSCCGRGKALQARGVARACGARHSGGASCRTHRNLGRLGGVPGKWKNTTSRRDSGRFPGAAQNVGIVFLLLSSSGL	1071491	1072717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1071500_1072700
879372	contig_1379_pilon	-	596	1	Intergenic	novelGene_134572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGTCATATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347199	346603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_346600_347200
879373	contig_10494_pilon	+	2298	12	Intergenic	novelGene_102178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	649	1068	965799	966471	TRUE	20	AGGCTGACATTGCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLQLYHPPFEEATGSCAHTLPPQLDAHIQVVVLLIGLQLFHGIGFRPVGGTDILGEKVGDDHGLVQCALKQTGQLPPRCTVGSQVQGVLLVGILHSATFGQVPLDVPGEAQGDVRRALVQLPLHLGPAWGADAPQRP	965073	970293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_965641_965717_965909_965986_966066_966161_966288_966366_966538_966613_966707_966875_967065_969032_969179_969264_969428_969521_969737_969819_969966_970081
879374	contig_7292_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_175367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTCATAGACAGAGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198487	196776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_196800_198500
879375	contig_6062_pilon	+	2639	2	Intergenic	novelGene_5264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	0	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	948	1301	662655	663008	FALSE	30	TCAGATGGGAACTGGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKVPYVIFMLIVLLINIVSDASL	660729	664346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_661022_661999
879376	contig_5018_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_46971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTACAAAACGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492425	492898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_492400_492900
879377	contig_14333_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_49123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGAAGAAAAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397141	399235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_397100_399200
879378	contig_1084_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_152398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACACGGCGCCCAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567697	569124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_567700_569100
879379	contig_14176_pilon	-	1466	2	Intergenic	novelGene_74871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	257	junction_1	0	539	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	508815	503240	FALSE	25	CACCAGCGACTCTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQPPYNLRAFNLRIDFSEEYPFKPPKLKFTTNIYHPNVDENGEVCLPIITKKYWKPCTKTCQVLEVLNVLVNKPELDQPLRVDLADLLAQNPKQFNENAEKFTLLFGVERPT	508815	502112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_503392_508628
879380	contig_5125_pilon	+	1003	1	Intergenic	novelGene_43507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTGTAAGTGGGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113842	1114845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_1113800_1114800
879381	contig_12125_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_76257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGCACATGGCTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677149	677721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_677100_677700
879382	contig_6497_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_35631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATATATGATAATTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726984	727651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_727000_727700
879383	contig_10962_pilon	-	2388	2	Intergenic	novelGene_103879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	242	367	177336	177211	FALSE	10	TCCTGTGTGGTGCCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQVALIFGARILDYVLNLCQGKYDFLERLSDSLLLSIISYLDLEDIARLSQTSHRFAKLCVCDQLWEQIVQSACDTITSDMRALAEDIGWKQMFFTNKLQLQRQLRKRKQKRESLRRQHQP	186355	175189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_177403_186180
879384	contig_5236_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_100975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGACGCATCTGTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063823	1066244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1063800_1066200
879385	contig_9406_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_136178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAGAAACAAAAACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149816	148925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_148900_149800
879386	contig_6079_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_160120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAATAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506462	505557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_505600_506500
879387	contig_6446_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_149227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGGAAATTCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424533	422618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_422600_424500
879388	contig_5574_pilon	-	1910	11	Intergenic	novelGene_155832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1076	junction_10	472.085416000113	40	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	196	1365	136875	78496	FALSE	50	AACAAAATCATGGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKSKRKDNLNDDGVDLKTQPVSESQLLPGQRFQAKDPEEQGDIVVALYPYDGIHPDDLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLSTKREGFIPSNYVAKVNTLETEEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGTIYLAISIQAAYMRKQVELHEGIKKKTCLFNT	141971	77950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363_131517_132909_133060_133571_133676_134201_134301_136858_136965_137531_137578_141911
879389	contig_12599_pilon	+	1159	9	Intergenic	novelGene_176965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	85.8821867444	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	283	1158	93672	100568	FALSE	10	TATGTGTTCTGCCAGCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDRLLDTLRETQETLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQEKTLTDGMLDINHEQEDTPSTNGKRSSGGSLSHEQDLAKVAELQEIIDRQSREQSQMKERLAALSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEDVNTKLQRDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEMANKDAARRQTEDKNRQLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVAALSKAEERHGNIEERLRQMEVQLEEKNQELQR	35971	100569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_+_36098_93204_93307_93617_93783_94208_94284_94588_94691_94907_95130_96731_96879_98979_99115_100484
879390	contig_10197_pilon	-	978	1	Intergenic	novelGene_115173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTCCAGAAAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318496	317518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_317500_318500
879391	contig_12969_pilon	-	2819	5	Intergenic	novelGene_61689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	213.969039816512	5	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	875	2518	509012	493044	FALSE	40	ATGATGTATTCAAAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKNQESLTYRDVAVDFTWEEWQLLDTAQKDLYRDVMLENFSNLVSVGFQAGKPDALSKLERGEEPWTVEDEIQRQARSEIEKVDDYLQGHLQNQRCLKRMEHCQGHNVFGNIVYQRKSHFPLRQNHDIFDLCGKTLKSNLYLVNQSRSFEVKKPHKANGGGKSFLHTKHEQFHPEIKFPECGKPLNTKSQFIKHQRTHKIDKPHVCSECGKAFIKKSRLIDHLRVHTGEKPHGCSVCRKAFARKSRLTEHQKSHIREKHYACTECDKTFPKKSQLIIHQTAHTGEKPYVCNECGKDFVKKSRLINHQRVHTGEKPHGCSICEKAFARKSRLIEHQRTHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKTHTGEKSYICSDCGKGFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLLIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKTCLISHQRFHTGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYICSDCGKAFRDKSCLNRHRRTHTGEKPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCIGSVKV	512858	492742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_494450_504289_504386_504665_504793_508997_509204_512175
879392	contig_14499_pilon	-	474	1	Intergenic	novelGene_174024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTACTGTTTTACCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101733	101259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_-_101300_101700
879393	contig_990_pilon	+	2034	3	Intergenic	novelGene_76110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	6.5	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	205	594	1432199	1445597	FALSE	55	AAAAAATAACTTGAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVAGPWLSWTCALFFLICEPDQPDQNQVHSPGVYLNSGIVISTQWGVLTVQGRRAVHPNNSVREALTMQVGHELPLVVQINDQIIQLLLKPVLGLFQFVIGGRLLFKLLARRTSGTGKSHIPAELGAVQPPHLQLVDLVVEFGADPLPVTVLGLQFLQLHLQLLLLVLHLLLCLVQDPQLTGQVCVLLLQRLLVLV	1431994	1447037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1432205_1443060_1443182_1445334
879394	contig_8920_pilon	+	358	2	Intergenic	novelGene_146052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCTAACTAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26309	33093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8920_pilon_+_26559_32984
879395	contig_1379_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_134599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGTTCCATTTTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469357	471166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_469400_471200
879396	contig_6735_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_15807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552043	554703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_+_552000_554700
879397	contig_21412_pilon	-	1704	10	Intergenic	novelGene_142846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	542	junction_9	355.03082808242	5565	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	117	1271	41608	14010	FALSE	15	CATCCATTTTTATGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFPLKIILVPMLLDYFLGPNNLIVATPELTVHVGDSALMGCVFQSTEEKHVTKVDWMFSSEEDTRDEYVLYYYANLSVPMGRFLNRVHLVGDISRNDGSLLLQDVKEADHGTYKCEIRLKMESLVFKKEVVLHVIPEEPKELMVHVGDSTKMACVFQSTEEKRMTKLDWVFSSGEHATKEIVLQYYPKLKVPVGFPQNWGRFQNRVNLAGDISRNDGSIMLQGVKESDGGNYTCSIYLGNLEFKKTILLHVILKEPRTLVTPATLTPDILGNNHLVIIVGIVCTTILLLAALILIMKRTHRNKSSVNSTTLVKNLENTKKVNPEKHIYSSISTKEVIQEEELTGKSEATYMTMNPVWPSMRSTQNNPLEKKSAEEMLKTEQAF	46460	13576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_14103_16785_16873_19335_19397_22838_22978_29531_29770_32093_32207_37215_37442_38947_39103_41565_41629_46364
879398	contig_5429_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_127772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGCCTTCATTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71667	69726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_69700_71700
879399	contig_12038_pilon	+	1215	2	Intergenic	novelGene_165817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAACTCTTAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47013	73419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_+_47484_72674
879400	contig_7694_pilon	+	863	3	Intergenic	novelGene_159938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	0.5	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	543	863	239001	243332	FALSE	35	GACTTGGAGAGATACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKLEFFHKSIQL	238458	243332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_+_239086_242729_242854_243220
879401	contig_3424_pilon	-	888	5	Intergenic	novelGene_55567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	484	888	1054778	1049815	FALSE	30	ATGGAAGATGCACGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAGIQVCSSVPDQDLEDALSIGRHGRVQRGPPHVVLDVGVSTGLQQALGGVRARVAGGQVQGGLAGAVGLVVQAGALIDEVRDDRRRVLLLLTVASLQAPSAAGGDHERREAICPRTLTSMQSASTSPWGGVGA	1056962	1049814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1049877_1051106_1051401_1054729_1054878_1054957_1055060_1056680
879402	contig_11396_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_71387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTTCTCTTCTGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134169	1136640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1134200_1136600
879403	contig_15047_pilon	-	1643	3	Intergenic	novelGene_52277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATGATGTGGTATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33163	28690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_29989_31865_32176_33128
879404	contig_15182_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_136468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	703	1011	607394	607086	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLILLVPFMTMIFKFMGQNSKYVIFADLIGFSSDTEQAVFHTLKPGKTLLLLKESPYLFSELLPSRCRLLECTQKTSTADTLVTCSCFSGFTGTYLNSKET	608096	605604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_605600_608100
879405	contig_9074_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_156627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAGACTAAGTAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74237	75289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_+_74200_75300
879406	contig_11986_pilon	-	1651	2	Intergenic	novelGene_69137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	69	368	218982	213348	FALSE	25	AAGTCCCTTATTGCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPEHALNTWAGPDTTLRNGAPRMTKALSLTSRHVANTFRRDSSLGWWQKPQSVLTLPARPSSAPSQRLPLSPGFSERAPGPGGGAASVPGHILLESSFDSENWRRNWSYIIERHSDVQGWH	219050	212064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_213380_218714
879407	contig_4732_pilon	+	544	3	Intergenic	novelGene_75423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	48	386	596758	609330	FALSE	20	CAGAAACCTGCGCCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTSFSAGRRPLFPPPTFCTQHALHYPPTPSCLPIWSGTCLQVKQYLRVLYIQLLL	596710	609488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_596798_604021_604158_609167
879408	contig_12654_pilon	+	2930	17	Intergenic	novelGene_129275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	204.279679606171	38	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	378	2645	662573	683630	FALSE	45	AGAATAAAGGCCTTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGGDPFEEGMNDPDLASWSNEMVDDRLNNMDWSGQQKKANRSSEKNKKKFGVEGDKRVTNDISPESSPGVGRRRTKTPHTFPHSRYVTQMSVPEQAELEKLKQRINFSDLDQRSIGSDSQGRATAANNKRQLSENRKPFNFLPMQINTHKSRDAAASPPRRQAVGAAQCKELFASALSNDLLQNCQVSEEDGRGEPAIESSQIVSRLVQIRDYISKASSMREDLVEKNERSANVERLTHLIDHLKEQEKSYMKFLQKILARANEEEDVRTIDSAVGSGSVAESTSLHVDVQSEASDTTARDPQQEPVEEIEDLKKQHDLLRRMLQQQEQLRALQGRQAALLALQHKAEQAVAVMDDAEKAAGTTADHPTAPGRQPARSPLHQRVPLRETTGSLSGISITSELNEELNDLIQRFHNQLRDSQPPAVPDNRRQAESLSLTREVSQSRNPSVSERSPDEKVQLFSKMRVLQEKKQKMDRLLGELHTLRDQHLNNSSFVPSAASPLRSVDQRSTSSAPSAPGGLAAVGNGEPTSLTSSVPYPTAALVSQNESENEGHLNPTEKLQKLNEVRKRLNELRELVHYYEQTSDMMTDAVNENTKDEETEESEYDSEHESPEPVTNIRNPQVAATWNEVNTNTNAQCISNNKDGRSVNSNCEINNRCAASMRAPNLPSSLDCRYNREGEHGIHVAPGEEDDEEEEDAEEEGASGASLSSHRSSLVEEAPEDAEFEQKISRLMAAKQKLRQLQDLVAMVQEVF	651039	683915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_651238_652585_652673_652963_653031_662547_662669_664432_664679_666373_666644_667358_667530_667762_667880_672271_672450_672567_672658_675037_675139_676079_676297_678631_678834_680073_680248_680750_680909_681009_681246_683618
879409	contig_4125_pilon	-	2753	20	Intergenic	novelGene_25105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_19	129.90759554199	425	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	171	2519	750308	736245	FALSE	20	ATATTTTCCTTGTTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGKHARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKLREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREEYGEKVKASHWSRSPLRPPRDRFELSDGRKPVKEEKMEERDPLSDLQDVSDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEGSSSEESEEEEEEEEEEEEEEEEETGSNSEDASEQSAEEVSEEEMSDDERENENHVLVVPESRFDRDSGESEEGEEEGGEGTPQSSALTEGDCVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVRHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGVLKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAIDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSDIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSDLPAVKKMTFTEYPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF	750999	736010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_736338_736593_736784_736986_737136_737292_737410_737522_737631_737820_737943_738287_738394_738642_738765_739544_739636_740384_740561_740743_740807_741094_741257_741367_741464_742079_742203_742722_742860_747257_747397_748096_748225_749126_749243_750197_750322_750842
879410	contig_4732_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_75503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGTCTGAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030086	1029065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1029100_1030100
879411	contig_15185_pilon	-	847	2	Intergenic	novelGene_99435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTTTTCAAAGAGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399366	391011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_391647_399154
879412	contig_16204_pilon	+	3717	6	Intergenic	novelGene_154483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	795	1097	199039	199341	TRUE	85	AAAATTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYALLSVLTAPAKPQPWSFPSWPLQILLNLSVSCPPPHVARWASVGVLLLPKTPWGSCCSPEKSQHPGSVPKALRDLAPPCLPSLILHTSQQASLQPLHA	197784	206792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_198073_198532_200258_202328_202499_203202_203314_204771_204922_205519
879413	contig_15897_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_49520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGGAACTTCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206287	207553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_206300_207600
879414	contig_14483_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_133772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGCAGGGGAAGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166513	168095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_166500_168100
879415	contig_17993_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_61935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTCACTAAAGGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79211	77921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_77900_79200
879416	contig_5153_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_74327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566528	568491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_566500_568500
879417	contig_6391_pilon	-	646	5	Intergenic	novelGene_173684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	51.2999756335225	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	117	479	43486	35886	FALSE	10	ATGTTCTTTTTGGCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNVTGEARMPAARGKSKSKVPVTFGDLAIYFSREEWEWLSPVQKDLYEDVMLENYRNLVSLGLSVRRPNVITLLEKGKAPWLVEPSRRCRGPEEDTVDQRSSVICPQSYTAGRWQRSWV	53031	35718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6391_pilon_-_35969_36632_36726_38523_38651_43426_43519_52947
879418	contig_14924_pilon	-	1775	9	Intergenic	novelGene_104161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.2391270080593	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	25	924	206743	55017	TRUE	50	AAAACTGGAAAAGATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDAVCQLLENKEDISQYGIARFFTEYFNSVCQGTHILFREFSFIQATPHNRASFLRAFWRCFRTVGKNGDLLTMKEYHCLLQLLCPDFPLELTQKAARIVLMDDAMDCLMSFSDFLFAFQIQFYYSEFLESVAAIYQDLLSGKNPNTVIVPTSSSGQHRQRPALGEASMLEGVEASLFYQCLENLCDRHKYSCPPPALVKEVLSNVQRLTFYGFLVALSKHHGINQALGALPDKGDLMHDPAMDEELERLVVRSRLHRTSRQHRAKEPGAFGFQRRDRPEALERVPSASAPSPYPYRW	206767	52415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_53259_55008_55165_57468_57533_60520_60631_61256_61453_63179_63266_79036_79122_163115_163247_206663
879419	contig_14924_pilon	+	1603	8	Intergenic	novelGene_104162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	386	757	52819	53190	TRUE	55	TGCAAACAAAAAGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGLGSSSSQAAAPSALQTSLGRWMELMEQVRPQWFGGQHQGLSAELEGTVGWGGLPAGLWVIPSLAFTGSVSLGNVLPTADIAQFKQGVKSVAGKMAVLANGVMNSLQVRLGLLDLGWEGA	52433	206767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_53259_57468_57538_60524_60631_61256_61459_63184_63265_79035_79122_163115_163247_206663
879420	contig_15777_pilon	+	981	3	Intergenic	novelGene_75755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	9	46	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCGAAACGGCTGCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258879	281501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_258909_261891_261980_280637
879421	contig_312_pilon	-	719	2	Intergenic	novelGene_128296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	22	354	20788	13343	FALSE	25	CTACCAGGGTAATTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPISGLQRTTSAGYRLPPTKLRAPVSPAARSGAATRRGPAGGRQEFQAPKAERGALGAEGVQQDQLWRELLEAERRSQQRWAHNWSFLKDYDPMVRQNMFQAAILAF	20809	12977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_13425_20537
879422	contig_1309_pilon	+	1826	7	Intergenic	novelGene_73986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTCCTGAAGCCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312708	330111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_313863_314529_314693_317902_318080_319648_319729_320167_320314_320801_320842_330045
879423	contig_15277_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_175427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGAAAATTATACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244577	246341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15277_pilon_+_244600_246300
879424	contig_10982_pilon	+	378	1	Intergenic	novelGene_87856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGAGGAGTGCAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69022	69400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_69000_69400
879425	contig_7887_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_124947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835637	833261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_833300_835600
879426	contig_5725_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_167149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	869	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAACCAGAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250287	249373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_-_249400_250300
879427	contig_4674_pilon	-	1589	2	Intergenic	novelGene_174151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACCCAGCAGCTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368518	361658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_362097_367367
879428	contig_1865_pilon	+	3187	1	Intergenic	novelGene_103242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2603	2908	134843	135148	NA	15	AGTTGGTTTGTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQRRRRPRGSDFDFQRSRQHRQRSAVVEGAELTSLPAAIERVFQGTMTTGAQRRGRWRPGVGVGVVVTSCKHPHCVLLGKRKGSFGAGSFQLPGGHLEFG	132240	135427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_+_132200_135400
879429	contig_6048_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_73183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCCTGGGGGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1330438	1331422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1330400_1331400
879430	contig_15327_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_70708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	471	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATTTTCGCATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945031	942998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_943000_945000
879431	contig_20951_pilon	-	586	5	Intergenic	novelGene_43143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	113.559180606413	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	212	586	356666	344050	FALSE	30	GAAACAAATCTTGTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQELVSFKDVAVNFTQEEWQQLDSDEKIIYRDVMLENYSHLISLGFDITKPDVIIKLEQGEEPWIVEDEFPCQICPEEAWKVGDLIERIQGNEDKYSRQTVSINSRSLIEQRENICDKIYNV	357421	344049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_344187_347580_347677_348732_348860_356651_356711_357254
879432	contig_10734_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_51155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	85.4742066356863	55	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGTTATGTTTATCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965440	948589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_949904_952711_952829_955443_955528_957646_957742_964455_964575_965334
879433	contig_13403_pilon	-	626	5	Intergenic	novelGene_158084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.6435769357052	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAGAAGCTTACACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42976	30904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_-_30970_33045_33214_35544_35680_41706_41822_42833
879434	contig_8017_pilon	-	2157	5	Intergenic	novelGene_65346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	23.6048194231602	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	13	897	894626	880650	FALSE	25	AATTCTTCTTTTACGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARPGGPASPPQGRDGAAPNVVARVAQWADDHLVLVRNISTGMAVAGIMLLLRSVRAASKFTSSSDIPVEFIKRNVKLRGRLRRITENGLEIEHVPITLPIISSWKKEPRGALLVKLAGVELTLAGRVWLQRELKPSQLLWFQLLGRENSALFCYLLVKKGGYFNVSLNEEILRRGLGKTVLVKDLDYDSKIYWTIHRNLLKAELTALKKGEGIWKEESEKESYLEKLKGSWREIWKKDSYFKEIGSNFNLKKESYYDKLRRTYKTWKENVNNYTLILKFRELLSRVYFRRKE	894638	879389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_-_881052_882725_882887_888962_889111_891405_891466_894512
879435	contig_10746_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_176818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1065	1379	186362	186048	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGARLGMGKKRERREKQEPPYPTPQKKSAEGACCWSAEMINREMKGKRMPLGIPPAQLCRSGTWFPSRAVQLEGVKLIYSARYSGDRKRRQVERVEKLRNEEK	187426	186020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_186000_187400
879436	contig_1154_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_87138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGGTTTGGCTTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820926	819627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_819600_820900
879437	contig_1154_pilon	-	1062	2	Intergenic	novelGene_87140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGGAACATGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820819	819637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_819851_819970
879438	contig_15076_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_177252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTCACATGAAAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110196	108315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15076_pilon_-_108300_110200
879439	contig_16686_pilon	-	1636	8	Intergenic	novelGene_162096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	98.2466699856301	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	502	1632	225408	152003	FALSE	45	TTGAATAATGTTAAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCALGVPRRGPALLQIDRHQIQAVEQSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDDAIHEARRVAQLADTEKEYQSVLDDLTSCTTSLRQINKIIEQLSPQAPTNRDINRKLDSVKRQKYNKEQQLKKITAKQKRLQAILGGAEVKVEIDSASLEEDAEPGPSSLGSMLMPAQETAWEELIRTGQMTPFGTQIPQKQERKPRRLMLNEASGFEKYLADQAKLSFERKKQARKKRLTRKAPASATSESNPTLNENQQNKRSKVPSKMDKRLEKHIKKLQRRALQFQGKVGLQKRAKALEAGIKREDGASESEESEYLPEEEEDKMAEADLSEGCAAYELKPPLKGRKRQKKVTVQEMDEDFFPSSGEESEAGGSGSRKAVRWRDDGDEDCYKQRLRRWNKLRLRDQEKCLKLEDNSEDSDAEFDEGFKVPGFLFRKLFKYQQTGVRWLWELHCQQAGGILGDEMGLGKTIQIIAFLAGLSYSKIRTRGSNYRFEGLGPTIIVCPTTVMHQWVREFHTWWPPFRVAILHDTGSYTHKKKKLSPKT	245871	151998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_152027_192177_192314_200073_200233_205320_205450_224725_225435_241441_241551_243877_243999_245626
879440	contig_10437_pilon	-	797	7	Intergenic	novelGene_38104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	15.1327459504216	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	44	736	71164	68844	FALSE	5	CTTGAGTCTCGTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKREGDDWSQLSVLKKRRVGDLLASYIPEDEALMLRDGRFACAICPHRPVLDTLAMLTAHRAGKKHLSSLQGFYGKKQPGKGMEQNPRQQNELRREETKAEAPLLAQTRFITHSALHRAPHYNSCCRRKYRPEAPGPSVAHSPFPPPEVELQSGKISRESEPEAGLQAKKSATVPAPAPMSPTRRRALERYLTLRSSGWIPDGQGRWVKDENVEFDSDEEEPPDLPLD	71207	68782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_68944_69099_69295_70027_70117_70233_70332_70430_70520_70784_70856_71113
879441	contig_12125_pilon	-	502	4	Intergenic	novelGene_76221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTCTCCTGGAAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354053	344563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_344707_347610_347712_352115_352289_353968
879442	contig_16921_pilon	-	886	5	Intergenic	novelGene_177080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.11247489949718	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	101	460	154141	149087	TRUE	50	GAAGCCAAGCAAATCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSNNGKDIQPPRILGETSGLAVHQIITITVSLIMVIAALITTLVLKNCCAQSGNTRRNSHQRKINQQEESCQNLTDFTPARVPSNLDIFTAYNETLQCSHECVRASVPVYTDETLHPAGEYKSTFNGNRPSSSDRHLIPVAFVSEKWFEISC	217277	140245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16921_pilon_-_140613_149027_149160_151045_151289_154097_154186_217221
879443	contig_2739_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_165829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGCTACAACATGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51862	51108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_51100_51900
879444	contig_11846_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_105971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGATTTAAATTGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300866	299171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_299200_300900
879445	contig_3862_pilon	+	398	4	Intergenic	novelGene_137433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	102.769429090346	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATCTCAGAGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631102	646587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_631123_638155_638337_645611_645730_646508
879446	contig_14866_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_175816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1755	152	1906	5486	3732	FALSE	10	GCAAGTCGGTCTCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKGYHSPPEDLEMERRWSQVSQSVEHTSLGPTERTDENKYMEIVNVSCVSGAIPNNSTQGSSKEKHELLPCLQQDSNRSGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSIRDADYTCDQQNQQGSVSPAKIYQNVEQLVKFYKENGHHPSTLSSVSRPLRSFMSDPGSCVNGGVMRAIVKSPIMCHEKSPSICSPLNMTSSVCSPAGINSVSSTTTSFGSFAVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSPISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNSTFSYAASGTPVGSSATRDMVPSPDTHEKGAPEAPFPKTEEGENVISNGVAGQLNIVQYIKPEPDGAFSSPCLGGNSKINPDSPFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGFDGNCEGSEFSMGIKQEPDDGSYYPETSIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSARDQSFQHLSSFPPVSTLVESWKSHGDLPSRRSDGYPVLEYIPENVS	10990	3729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14866_pilon_-_5489_10841
879447	contig_6544_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_142102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCATCTATACCATGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116298	115180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_115200_116300
879448	contig_6691_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_60191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGGAGTTTTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531142	533337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_531100_533300
879449	contig_6076_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_81749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104975	102541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_102500_105000
879450	contig_16535_pilon	+	1006	7	Intergenic	novelGene_167726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	4.59770474137791	42	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	181	846	544732	546284	FALSE	40	AGTAAACGCAGTATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGHGAPHRQRLPHPGLYTAYTAHLHRDKVLLKRLLKGMQKKRPADVQSALLRRHLLELTQSFIFPLEHYMASLMPLQRSITPWKTPPQIRPFRQDDFLRSLKHAGPQLTCILKGDWLGLYRRFFKSPHFDGWYRQRHKEMAQKLEALHLEAICEANIEAWMKDKSEVEVVDLVLKLREKLVRAQAHQLPVKEETLQRTQLYIQTVISSLPKDLQAVLCPP	544551	546444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_544843_545049_545140_545244_545299_545560_545671_545760_545864_546014_546090_546161
879451	contig_15762_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_177359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAGAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231925	232743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15762_pilon_+_231900_232700
879452	contig_6608_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_162548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACAACGACCAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402351	403837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_402400_403800
879453	contig_5551_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_134260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAAAAGCTAGTAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602145	604238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_602100_604200
879454	contig_7057_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_123368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	249	750	1	750	1029890	1030639	NA	40	TAGCACTAATTTAAGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FECNECGKTFSQKQYVIKHQNTHTGEKLFECNECGKSFSQKENLLTHQKIHTGEKPFECKDCGKAFIQKSNLIRHQRTHTGEKPFVCKECGKTFSGKSNLTEHEKIHIGEKPFKCNECGTAFGQKKYLIKHQNIHTGEKPYECNECGKAFSQRTSLIVHVRIHSGDKPYECNVCGKAFSQSSSLTVHVRSHTGEKPYGCNECGKAFSQFSTLALHLRIHTGKKPYQCSECGKAFSQKSHHIRHQKIHTH	1029889	1032118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1029900_1032100
879455	contig_6084_pilon	-	2435	8	Intergenic	novelGene_127060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	63.2374856539753	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	121	990	438209	431247	FALSE	60	TTTGTAAAAATAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWKLEGSAWETKSHVLLGQECLLEDIGEDDVSESFQLLQIDMECESQERRSLPTGSASWCSKNVQRKQKHWEKMVAAKKSKRKQEKERRKANRAENPGIRPQHSKRFLRTLTKERLLEAKHSGPRLCIDLSMTDHMSKKELSRLAGQIRRLYGSNKKADKPFWICLAGFSRDSPLYEECLRMNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQGTAYMARA	444511	429801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_431397_433030_433099_433811_433891_435337_435491_436607_436733_437315_437425_438023_438240_444421
879456	contig_4339_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_146074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1286	1633	1024276	1023929	NA	30	AGGTAGGAAACAGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKNIEYTMDCQKSEQICLGRSTTTMLLEGRMTRLHFTYFGHVVRRDQSLEKNIVLGKVEGQRKRGRPSMRWIDTVAATVGSSITTIVSMVQDWAVFCSVVHRVAMSQNRLDGT	1025561	1022962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1023000_1025600
879457	contig_15610_pilon	-	521	2	Intergenic	novelGene_154282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTAGCTGGCCTTTGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672733	651481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_-_651830_672560
879458	contig_15664_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_171502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGGAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23036	22602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_22600_23000
879459	contig_13292_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_142962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGGGTAGGAGGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391573	393669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_391600_393700
879460	contig_2969_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_157064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAGGAGAATGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810760	810160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_810200_810800
879461	contig_7179_pilon	-	1003	2	Intergenic	novelGene_78053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2658	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAGCAGAACTGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392174	387523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_388440_392087
879462	contig_8045_pilon	+	649	3	Intergenic	novelGene_35463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	356.5	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	509763	515691	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVLSVLRQYNIQKKEIVVKGDEVIFGEFSWPKNVKTNYVVWGTGKEGQPREYYTLDSILFLLNNVHLSHPVYVRRAATENIPVVRRPDRKDLLGYLNGEACE	509760	516023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_509894_512430_512537_515613
879463	contig_10159_pilon	+	2490	2	Intergenic	novelGene_30895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTATCTTGATGAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002448	1006922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_1004188_1006171
879464	contig_10371_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_175468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAAGTGAGTCTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109407	110489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_109400_110500
879465	contig_9646_pilon	-	2892	1	Intergenic	novelGene_117424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGGCTGAAGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135006	132114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_132100_135000
879466	contig_14537_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_158658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGGGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85210	87199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_85200_87200
879467	contig_10196_pilon	-	1983	5	Intergenic	novelGene_132022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	38.2908278834501	118	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	261	455	300994	296158	FALSE	25	CATAACAGCCTGAGTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DETGAYLIDRDPTYFGPVLNYLRHGKLVVNKDLAEEGVLEEAEFYNITSLIKLVKDRIRERDSKTSQVPAKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWKFEQLVSIGSSYNYGNEDQAEFLCVVSKELHNTPYGTASEPSEKAKILQERGSRM	303139	294629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_296188_299404_299531_300955_301052_302471_302564_303028
879468	contig_20878_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_173442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCTTTTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22577	25169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_22600_25200
879469	contig_3942_pilon	-	950	1	Intergenic	novelGene_128895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1652586	1651636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_1651600_1652600
879470	contig_5047_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_157989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACCCCGGCTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893972	892937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_892900_894000
879471	contig_1244_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_38068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGCATGCCTGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241666	1241122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1241100_1241700
879472	contig_5222_pilon	-	2053	3	Intergenic	novelGene_59002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	12	59	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	131	499	216927	215130	FALSE	15	GTGTCCCAGCACCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKAFRVKSNTAIKGSDRRKLRADVTAAFPSIGTDQASELVPGKEELNVVKLYAHKGDAVTVYVSGGNPILFELEKNLYPTGCQLQAVHIDTVFHEVHHKRSTCWYHGSGSASHFLVTLEP	217057	213575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_215252_215489_215681_216871
879473	contig_10109_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_131336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGGCAAAAGCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234799	233939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_233900_234800
879474	contig_17880_pilon	-	1011	6	Intergenic	novelGene_167331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_3	67.4228447931412	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	11	1009	46189	33347	FALSE	25	GTAGTAGTTTTTTGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVQVVGSLLRGLTREAPREPPPEPGNVFRRLSARLRALRPDDSSFARTEIHLLFDQLISENYSKSDGVAPEDVNALLVQACRLVPLSQNHLVSKVSQLIHHLLNRLQVIVDEQNLDFLLAYTISAIQQCSSWTHMAILQALAALVYCNGSKCQKLLQNALKGIQSLLNSGKMKLTLAEELGALLAVLKKAMFHGLPGLNIEIPTVLYPTLLPQYDGRPPAKPQQSESCASRPTVNKKKKAKVKPEKVHQGEEAEEESNGEIEAAAATGRVHLHKGNTQCPSSPGVQSLPLDGSGAAGKDRVSSPFSSASWKRVSSSESDYSHAEGGMQSKM	46199	33344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_33638_35770_35909_37047_37150_41000_41142_43188_43297_45970
879475	contig_6227_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_49829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGCACAACCTTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409390	1407099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1407100_1409400
879476	contig_12427_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_40573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAACACCCTAAAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535008	533885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_533900_535000
879477	contig_15474_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_136232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	171	647	66953	66477	NA	35	ATATTATTAAAGGTTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTWCPRRAGWGPGWQGSLPLKLWVSPPRNADNFQFSYGLEREWSWREEGEASKAGLWIPGFLLPRARHCFRGRQPPASPCPVSPAGRRSPWAPATAMHWEVGWGTLQLGYLPVPSSKRKAMGGPRNMERGILVPPRRARGTDCVTGERFPSSSSSH	67123	65663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15474_pilon_-_65700_67100
879478	contig_14445_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_137362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCATACAAAAATTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300703	298920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_298900_300700
879479	contig_10948_pilon	+	1656	4	Intergenic	novelGene_124965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACAATCCTTTGGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68609	137752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_69345_77074_77278_100743_101174_137464
879480	contig_9633_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_139605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGCTTTTTAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482800	481471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_481500_482800
879481	contig_13780_pilon	+	2975	1	Intergenic	novelGene_149096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATAGCTTTTCTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718123	721098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_718100_721100
879482	contig_8149_pilon	-	2109	4	Intergenic	novelGene_169945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	44.6044342588891	175	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	14	406	525211	492695	FALSE	50	AACTTACCAAAGTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLSMSAPARSSSEDKVTVHFINRDGETLTTKGKVGDSLLDVVVENNLDIDGFGACEGTLACSTCHLIFEDHIYEKLDTISDEENDMLDLAYGLTDRSRLGCQICLTKSMDNMTVRVPDTVTDARQPIDMSKKS	525224	490991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_492810_498689_498820_519285_519411_525188
879483	contig_13680_pilon	-	2058	2	Intergenic	novelGene_149577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	32	394	274431	274069	TRUE	20	CCTCATATCTGTCTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWDLPSTVPTMTQRRPRSQHHGGQRQRGNQLPSPLHFLTKLYVLEEFQCRRHAHKNRGGWECEVQPNLTMYGNEDRVRQHKQLKITDNREASLMLIKIFNKDTSPSKYDQYELTRLNSQSEDRLCSELCH	274462	271961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_272595_273037
879484	contig_12841_pilon	+	1989	2	Intergenic	novelGene_55881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	0	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTATTTTCCTCTACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727640	730994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_729224_730588
879485	contig_6513_pilon	-	384	4	Intergenic	novelGene_117789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.29983164553722	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	18	383	330787	323974	FALSE	35	TTCGCATCTGGATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFLTHMDKEHQSDKEETSEPEFSVTENYSSQKASVFPSADSAVSLSTDQNTATAGMNNSDELFESVSVDPLQMTGLTDIADIIDDLITKDGVSSEELGLTEQQAKTISRIQHTSGRRPQRTEKERRE	330804	323972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_324029_327833_327966_328465_328497_330639
879486	contig_15093_pilon	+	1804	5	Intergenic	novelGene_143303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_4	25.3019268040993	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	230	1405	132965	140987	FALSE	35	GTGAAATCTTTCTAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAPNLPTIPSASDFNTVLSSDQNTLDGTHSQHSTSQDDVAGVEEANQGFPAVQLADAQVVFKPLLSHTGIQSQDAMPLCYRMYFGEHLSFSGTLDCLRADIVDSDTAKERKGKRARRQGHVNLPPLEFKPALMLETFSISAVVMEKSVCTPQNSTSALSFHDLNKRYYSTFHCNFTISCQSISQHVDMALVRLIHQFSTMIDDIKATQTDIKLSRYTAGSASPTPTFKTRKHRDFRSSDFSRSSRGSLNGGSRVNNAKNKRTNNENNKKESRNKNSLGRSERRTSKVSRKGSKDVVDHMTIHMDDSDSITVSEQSEPSAECWQNMYKLLNFYSLISDPTGILEKSSETFGPAGVRSPVEPTCKVVFENEQDNNSLTKPQRKRSLVTSEPQHVTLIVFGIGMVNRTHLEADIGGLTMESELKRIHGSFTLKEKMKDVLHQKMTETCATAHIGGVNIVLLEGITPNIQ	129682	141386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_129861_132913_133090_137281_137989_138422_138669_140889
879487	contig_11602_pilon	+	1031	3	Intergenic	novelGene_166580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAAGCACAGCTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44832	113066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_45021_92413_92613_112422
879488	contig_8322_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_143230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCCCAGGCCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252222	251204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_251200_252200
879489	contig_7272_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_25299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383046	381010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_381000_383000
879490	contig_6896_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_174217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1218	1520	128459	128761	NA	40	TAAACCCCATAACCATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGTITKGLVNFANLSDLKESQSQSRGGPDYHQEEETGVEHILCTWDPCAETLLDPGGRERAVTLGMARWQEAVAEKWRQQRQQNQIFRRRRSELPSLRS	127241	128980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_127200_129000
879491	contig_935_pilon	-	1761	3	Intergenic	novelGene_45516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAATGAGTACTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32136	21259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_21806_26497_27193_31616
879492	contig_20398_pilon	+	2263	13	Intergenic	novelGene_155190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	36.4664990855382	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2067	197	2263	68898	114761	FALSE	25	GTACTGTGACCAGTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLGVPSGEEMDSKAENSHVWPTAAEHEQNTAQVHFVPDTGTVTQIVYTDEQGRPPQQVVYTADGASYTSVDGPEHTLVYIHPVEAAQTLFTDPGQVTYVQQDATAQQASLPVHNQVLPSIESVDGSDPLATLQNPIGRLEAKEEEEEDEDEGTEEDEEEDGEDTDLDDWEPDPPRPFDPHDLWCEECNNAHSSVCPKHGPLHPIPNRPVLTRARASLPLVLYIDRFLGGVFSKRRIPKRTQFGPVEGPLVRESELKDCYIHLKVSLDKGDRKDRDLHEDLWFELSDETVCNWMMFVRPAQNHLEQNLVAYQYGHHVYYTTIKNVEPKQELKVWYAASYAEFVNQKIHDISEEERKVLREQEKNWPCYECNRRFISSEQLQQHLNSHDEKLDVFSRTRGRGRGRGKRRFGPGRRPGRPPKFIRLEITSENGEKCDNGTQDLLHFPSKEQFDEGEPATLNGLDQPEQTAIPMPPLPQEGQSSLEREPETHSLHLQPQLEESVVPTPSALTADDMRRAKRIRNAALQHLFIRKSFRPFKCLQCGKAFREKDKLDQHLRFHGREGNCPLTCDLCNKGFISSTSLESHMKLHSDQKTYSCIFCPESFDRLDLLKDHVAIHINDGYFTCPTCKKRFPDFIQVKKHVRSFHSEKIYQCTECDKAFCRPDKLRLHMLRHSDRKDFLCSTCGKQFK	25254	114761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_25370_68816_69000_71642_71808_73526_73587_90985_91212_93335_93578_94602_94807_98962_99036_100340_100459_104959_105090_105823_106067_112422_112771_114605
879493	contig_2414_pilon	+	772	1	Intergenic	novelGene_158471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCAAACCTGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214091	214863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_214100_214900
879494	contig_17427_pilon	-	2172	8	Intergenic	novelGene_30280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1820	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCCGGCGAAGCGCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176878	147918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_148079_151317_151421_152119_152250_152572_152642_155689_155794_171333_171438_173591_173666_175450
879495	contig_12139_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_146479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGGTTTAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166676	165481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_165500_166700
879496	contig_11126_pilon	+	741	1	Intergenic	novelGene_138115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACCTTGTCCAATAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160321	161062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_160300_161100
879497	contig_11396_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_71291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347244	345087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_345100_347200
879498	contig_13244_pilon	+	1792	12	Intergenic	novelGene_86901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	138	530	27827	31973	TRUE	25	CCGGCCCACCGACCGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSMTGRNSDAACTDSHVIKGSSDNADSEVLSFSLMISWSCLGCNLRISGLLCSTGPSSSLETTIGSAEINEWFPSLCPLRRGFSIVFNSFSPFSTRGEFPTVLLEAGLSNVPVVAQSEALLGAALKANS	18608	187364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_18643_27723_27861_30784_30944_31773_32114_33210_33396_36542_36667_89969_90165_103532_103731_134658_134755_152886_152992_175957_176011_187198
879499	contig_7229_pilon	+	2003	2	Intergenic	novelGene_39840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCACCAATGGCTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954987	958265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_956838_958112
879500	contig_12532_pilon	-	3101	5	Intergenic	novelGene_111154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_3	117.822960410949	15	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	784	2463	134658	114411	FALSE	50	TGAAAAGAACTTGACGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRRKVTSDLDEKIHLGYHKDSLEGNGAVECDQVTCTPTERPIPEALRCYQDLPPSPDQRKLLSSLQYNKNLLKYLNDDRQKQPSFCDLLIIVEGKEFSAHKVVVAVGSSYFHACLSKNPSTDVVTLDHVTHSVFQHLLEFLYTSEFFVYKYEIPLVLEAAKFLDIIDAVKLLNNENVASFQSELTEKSSPEETLNELTGRLSNNHQCKFCSRHFCYKKSLENHLAKTHRSLLLGKKHGLKMLERSFSARRSKRNRKCPVKFDDTSDDEQESGDGSDTLNQENFDKEKSDRNDSEDPGSEYNAEEDGLEEEMSDEYSDIEEQSEKDQNDAEEKPEAGDSVGNIHEGLTPVVIQNSNKKILQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHNNETEFHKKEHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRFHLENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLGPFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRER	135441	113772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_114545_119470_119619_121562_121633_122668_122877_133538
879501	contig_5083_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_151696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTGTTTATGTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416087	1418547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1416100_1418500
879502	contig_91_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_127117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTTGAAAACTTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443576	441991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_442000_443600
879503	contig_6445_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_77108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1245	1613	1180826	1180458	NA	30	GATTAAGCACTTGGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGACSVARELRGGRNHLRPHCQGLGQAAQPQRVGRQVSPAHLQPQGPARQVALPSEHEILRQCPGEATPGPLLWRRSSTLEGEAWSQPVLSLLRRFQGLPAALAFSCAVWGQWVELLLSVGT	1182070	1180310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1180300_1182100
879504	contig_10642_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_78726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTGTGTGTTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951079	953812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_951100_953800
879505	contig_4924_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_84710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTTAATTAACAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83741	82995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_83000_83700
879506	contig_4125_pilon	-	1091	4	Intergenic	novelGene_25088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	174.368065373859	5430	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	417	866	547327	544194	FALSE	15	TGCAAGTTGTGTTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLTTQLWLRSRLTDRYWRVQEVLKHARHFRGRKNRCYRLAARAVIRAFVKCTKARRLKKRNMRTLWINRITAASQEHGLKYPAFIGNLIKCQVELNRKVLADLAIYEPKTFKSLAALAKRRREEGFAAALGDGKEPEGVFSRVVHYR	547743	543968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_544368_545598_545677_546944_547056_547240
879507	contig_4125_pilon	-	1968	3	Intergenic	novelGene_25089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	308	junction_2	175	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	72	356	547327	545590	FALSE	10	GGTCTGCTTTGCAAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRPLQYGGAVCALLTPERWSVGAMVFLTTQLWLRSRLTDRYWRVQEVLKHARHFRGRKNRCYRLAARAVIRAFVKCTKARRLKKRNMRTLWINRITAASQEHGLKYPAFIGNLIKVW	547398	543977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_545677_546944_547056_547240
879508	contig_3161_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_84498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTAACTATTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34595	33758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_33800_34600
879509	contig_5352_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_177067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCAGCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166938	166457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_166500_166900
879510	contig_4686_pilon	-	927	4	Intergenic	novelGene_118570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_2	108.947489900206	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	20	832	696322	691380	FALSE	55	CAAAGAAAGAGAAGATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEVISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKMLSQTEHAKKDFFRNLPHWIQQHTAMNDAGNFLIETCDEMVSLDLKQQLLLLNGRWRELFMEVKQYARADEMDRMKKEYADCVKTLSAFATEAQRKLSEPLQVSFMNVKLLIQDLEDIEQRVPVMDAQYKMITKTAHLITKESPQEEANEMFATMSGLKEQLAKVGKYQNSLHPEIPTLPSLLVASSPTHGQKRLVCLLTNHAFASYYVSGISNFDISFTKKTVKLIPSITSVNLEVLVAIF	696341	691284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_691761_693116_693270_693738_693904_696208
879511	contig_4531_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_47889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGACAGAGAAAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317630	318576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_317600_318600
879512	contig_14322_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_115637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTCTCATTGTTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330451	329539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_329500_330500
879513	contig_4426_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_15376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGTTTCCTTGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171097	170296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_170300_171100
879514	contig_990_pilon	-	3531	8	Intergenic	novelGene_76098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	241.19667645864	6	125	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1347	2102	1369421	1365428	FALSE	75	TAGAATAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCATKSPSAIADKVKSPKKLKNLKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNANVKSLQELCHMESKTGNRNSEPQQGNMSLAAPPHSNSSAAVPTYKNSGMAESVYKGNQKKENLSARSVPSSPVERKDKEESMFQVSYPSAFSKLIVSRQVGPLLTSQSWSSR	1376852	1363998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1365591_1365679_1365838_1366036_1366466_1369415_1369589_1370161_1370280_1372672_1372848_1373529_1374220_1376656
879515	contig_19647_pilon	-	247	1	Intergenic	novelGene_144015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTAGCTTTCTTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95486	95239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_95200_95500
879516	contig_5297_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_175665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	329	990	1	990	58013	57024	NA	50	GGATGTTTAGAGAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGALLRVCVVHLARFSVSVWCTWRASLCVCGAPGVLLRVCGAPGALLRVCVVHLACFSVCVVHLARFSVCVVHLARFSVCVVHLARFSVSVWCTWRASPCVCGAPGRLLRVCGAPGVLLRVCGAPGGLLRVCVVHLAGFSVCVWCTWRASPCVCGAPGALLRVCVVHLARFSVSVWCTWRASPRACGAPGALLRVCVCVCVCVCVCVVHLARFSVCVCVCVCVWGVPGALLRGCVGVCGCVWVWVGGVPGALLHVCGAPGALLRVCVCVCVCVCVCVCVVYLAHFSVCVWCTWRASLRVVHLHLQRPPVDGEGGEDLNQEWLCECLSA	58013	56343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_56300_58000
879517	contig_6424_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_109259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGATTTCATCTGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16741	15606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_15600_16700
879518	contig_1472_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_86133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTTGTGCAGTTTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592942	591235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_591200_592900
879519	contig_753_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_112991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	441	1323	1496	2818	1217742	1216420	NA	50	ACAGCTATTAACAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKQMKEAFVSNLNGTTILEVTQVLCLPAPYILCRGLLTILLQHFYPSSYTWRTQFFIDFVVLIVPLVAAFTILSSFLLLEQLTVIIFGAGLAYQIYHRRTCYARVPVQKILENFLKVGLESEYIPAISCFRIMNNVFTAVAILAVDFPLFPRRFAKTELYGTGVMDLGVGGFVFGTAMVCPEVRKKSNMEISRFYHLTKSLHSVCPLVFLGIGRLVTIKYIDYQEHLTEYGVHWNFFFTLVIVKLLTSLLLIIFPLNKSWIVAISITVLYQLALDFTPLKRLILYGTDGSGTRVGLLNANREGIISTLGYVTIYMAGVQTGSYLFKSRSHIKDWIKVIRCLLLTAVSLFLCLYIVQANIEAVSRRMANLAFCVWIVASSLIFLSSLLMGDIILSFAKFLFKGTLVPCSWKLIQSPATTKKHSESLVPEAERKGTSLCLI	1219237	1216419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1216400_1219200
879520	contig_8019_pilon	+	2260	3	Intergenic	novelGene_126999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	14	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAATGTTCACTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382758	387945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_382891_384520_386047_387343
879521	contig_6445_pilon	-	2083	5	Intergenic	novelGene_77083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	20.8626460450251	123	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	27	1037	765711	761453	FALSE	10	CCTTTGGACTGTTGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLPGRRMQLAGRLGGAAVLRLLLAAQVVSAFEPISIGIAIGAASALTGYLSYTGFYCRFAECCRPEQPLNASALKLDLKEKLFGQHLAAEVIVKALTGFRNNKNPKKALTLSLHGWAGTGKNFVSQIVAENLHSKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQNWIRGNVSTCASSVFIFDEMDKLHPGLIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLSNAGGDLITKTALDFWRAGKKREDIQLKDLEPVLSVGVFNNKHSGLWHSGLIDRNLIDYFIPFLPLEYRHVKMCVRAEMEARGSPINEDIVTRVAEEMTFFPKDEKIYSDKGCKTVQSRLDFH	765737	760406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_761695_762009_762138_762608_762785_764426_764693_765512
879522	contig_14923_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_157769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590196	591204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_590200_591200
879523	contig_16716_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_169283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAATGGCTGTGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157709	156889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_-_156900_157700
879524	contig_16578_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_148617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	661	1119	63221	63679	NA	25	TTGACTAAAGCTGGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRMFLLVVGMLSADNSIAIYYRLLVGTIEQPFFPPPSIESVRFLKPVPRGRTMCRNLAIIVQDAKLALEGIVCWGDGKRCLSSIDCQPLGNYSSALQAWHKEAMFSCYYPIHCNPRWHMTQGEMSLNLGVGIFLMIVLNSLIQLARVVLSI	62560	64082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_62600_64100
879525	contig_1084_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_152387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	268	579	537329	537640	NA	20	GCTTTCTTGGGAAATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDSLIPPDNMSKVCETKSRHLASKEHSGCTYSKTHLFVLLAVHGIFNILRQHHIQRHQFFFSFPYSLPAFSHAYEATESTMAWVRHTLVLKVTSLPNAN	537061	539292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_537100_539300
879526	contig_5649_pilon	+	1291	2	Intergenic	novelGene_82415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	235	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTTTAGAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301441	1341812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1301601_1340680
879527	contig_9995_pilon	-	885	4	Intergenic	novelGene_47676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCCAGAGCCACGTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224791	216962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_217165_219505_219652_224033_224176_224396
879528	contig_7728_pilon	-	1097	3	Intergenic	novelGene_64731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_2	384.5	21	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAGGAAGGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789111	769812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_770102_774462_774657_788497
879529	contig_15114_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_121175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTATCGTTTTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650743	651553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_650700_651600
879530	contig_6403_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_139889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGATCTCCCACTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091769	1090987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1091000_1091800
879531	contig_19012_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_159476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTACCCATACCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24995	26116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_25000_26100
879532	contig_9150_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_140909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACACCGAGTCGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59172	58459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9150_pilon_-_58500_59200
879533	scaffold_7386_pilon	-	2435	11	Intergenic	novelGene_136608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	39.8396787135639	178	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	211	1680	403467	396690	FALSE	20	CAAACCTGATCTCCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFQVILRYTSTDAPAIWWLDPELTYGHAKPFVFTQGHSVCNRSFFPCFDTPAVKCTYSAVVKAPSGVQVLMSATRSTYVKEEGVYRFHMEHPVPAYLVALVAGDLQPADIGPRSRVWAEPCLLSMATSKLSGVVEQWLSAAERLYGPYMWGRYDIVFLPPSFPIVAMENPCLTFIISSILESDEFLVIDVIHEVAHSWFGNAVTNATWEEMWLSEGLATYAQRRITTETYGAAFTCLETAFRLDALHRQMKLLGEDSPVSKLQAKLEPGVNPSHLMNLFTYEKGYCFVYYLSQLCGDPQRFDDFLRAYVEKYKFTSVVAQDLLDSFLSFFPELKEQSVDCRAGLEFERWLNATGPPLAEPDLSQGSSLTRPVEALFQLWTAEPLDQEAASASTIDISKWRTFQTALFLDRLLDGSPLPQEVVTSLSKCYSSLLDSMNAEIRIRWLQLVVRNDYYPDLHRVRRFLESQMSRMYTIPLYEDLCTGALKPFALEVFYQTQGRLHPNLRRTIQQILSQGLGPGVELAAEPGAERDAGADTPALLLGDEAPGSAISLRDVNVSA	407239	395934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_396969_397635_397779_398122_398354_399528_399638_399761_399875_400126_400241_400433_400670_402756_402874_403339_403492_403898_404040_407194
879534	contig_12414_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_59606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCTTTTCACACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526328	528665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_526300_528700
879535	contig_10857_pilon	+	872	8	Intergenic	novelGene_160929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	15.5511007550552	7	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	224	871	689193	700281	FALSE	10	CTGACGGCCTGTCCCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGIWGRLRFARKPISIIDLIVVVASLVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYADALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTVASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPGSSTWKIYVRKPARSHALVSPSPKPKKSVMVKKKKFKLDRDSGVGPGEKMLTVPHITCDPAGEDRR	687730	700282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_687847_688290_688370_689164_689262_689954_690096_696382_696494_698841_698938_699509_699633_700173
879536	contig_14980_pilon	+	3563	6	Intergenic	novelGene_78232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2905	3240	529871	536562	TRUE	50	ACCAAAGCCCAGAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLPVRAGGSVVPGELIPSCRVPWAWVRTGTFSAGPSRSLCSSSTRATASSPLPGRCSCTQVRSSPGRMLRNCSSTSSSRIWALVRASGLSHRRHSSRSRLRASWGPDVSL	517655	541451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_+_520277_528943_529066_529347_529441_529802_529961_536316_536795_541360
879537	contig_12993_pilon	+	1187	4	Intergenic	novelGene_136733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28.9635786616379	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATGGAAAAAGAATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111373	151554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_+_111541_117583_117679_148823_149007_150812
879538	contig_9389_pilon	+	1105	8	Intergenic	novelGene_83945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_6	29.5848830675811	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	73	1005	185571	187640	FALSE	20	GTGTGACCATGGACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGIPPGECFGLLGVNGAGKTSTFRMVTGDMLPSAGEAVLVGHSVVQESAAAHRHMGYCPQSDAVFQLLTGREHLELFARLRGIPEAQVAQTARVCLARFGLVRYSNQPAGTYSGGNKRKLATAVALVGDPAVVFLDEPTTGMDPQARRFIWNSLLAVVREGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMTNGRFRCLGSAQHLKGKFGAGHTLTLRVPATQPKPAVGFVAAAFPGAELREAHGGRLRFQLPPGGLCALGRVFGELAAHGAEHGVEDFSVSQTTLEEVFLYFSKDQGKEEDEKDTLQKEAGVGMYLAQRLERPKRISCFLEDPSAAETVL	184557	187740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_184579_185519_185627_185767_185910_186003_186139_186218_186323_186626_186720_187145_187387_187478
879539	contig_10159_pilon	-	2772	8	Intergenic	novelGene_30896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	236.322073554248	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	796	1158	1027025	1004067	FALSE	5	CTTACTTTTTGGTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKAQFMSLWDGLDTDHNCQVIVMGATNRPQDLDSAIMRRMPTRFHINQPALKQREAILKLILKNENVVPDLQQSATTTPFHDEDEIRPVQQQDLHRAIEKMKKSKDAAFQNVLTHVCLD	1056660	1002452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_1004188_1010082_1010124_1012821_1012873_1016485_1016576_1026965_1027073_1029101_1029303_1050916_1051092_1056288
879540	contig_10940_pilon	-	572	3	Intergenic	novelGene_49189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCGCAGCTGCACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267071	254188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_254239_265322_265437_266663
879541	contig_14146_pilon	-	921	6	Intergenic	novelGene_178102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	9.06421535489973	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	64	921	353609	346324	FALSE	35	GTATGGAAATGGGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDAVTDLASHPGYYGNLVEESMGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVDQSVFEELIKERLPELAEHMNDLSALASISLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEESPGPAGGSHHAFFSDDQEPYPVTDIADLIRDAYEKFGDQSVEQIEHLRCKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVTPEVSILPEDLEELYDLFK	353672	346323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14146_pilon_-_346393_347027_347127_347279_347410_348968_349255_352369_352488_353453
879542	contig_9038_pilon	+	2077	3	Intergenic	novelGene_143335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATCTGCAAATGGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645440	648368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_+_647302_648066_648129_648214
879543	contig_9505_pilon	-	988	11	Intergenic	novelGene_121859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	388	687	597953	577876	TRUE	15	TCCACGGGGCCATTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEAFPFPHDHDLHRDMFRKPDRGPEVHGQRDEEMEDGYEILPVNCVDIPAEHPAVGPQQLVHSLQHCLQLLFLPDFRLGHLGHVQLAVPQFLCKAASR	632693	536896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_536988_555849_555943_560335_560408_577830_577890_589566_589715_593381_593498_597931_598010_614984_615047_617655_617727_620887_621009_632616
879544	contig_8017_pilon	+	2463	1	Intergenic	novelGene_65367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1012463	1014926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_1012500_1014900
879545	contig_9955_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_21391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAACCCTATGAGGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712018	714267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_712000_714300
879546	contig_11978_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_62784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTTTCTTCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173215	172303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_172300_173200
879547	contig_12127_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_130108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCAGTTTCCAGTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108343	107838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12127_pilon_-_107800_108300
879548	contig_2093_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_152995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATTTCTTCTATTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394489	1395157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1394500_1395200
879549	contig_6427_pilon	-	1754	9	Intergenic	novelGene_162577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_8	50.2468904510518	6	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	539	1102	927036	911772	TRUE	30	ATATTTTACAGATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPCPEEAAMRGEVVKRIETVIKDLWPTADVQIFGSFSTGLYLPTSDIDLVVFGKWERPPLQLLEQALRKHSVAEPCSIKVLDKATVPIIKLTDQETEVKVDISFNVETGVRAAELIKSYMKKYSLLPYLILVLKQFLLQRDLNEVFTGGISSYSLILMAISFLQLHPRIDARRADENLGMLLVEFF	939156	906703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_-_907083_908325_908453_911625_911841_914794_914924_916078_916187_923139_923261_924225_924273_926946_927071_938652
879550	contig_10750_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_172615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGAATGTTTATAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360162	361771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_+_360200_361800
879551	contig_5189_pilon	-	852	1	Intergenic	novelGene_34879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATAAATGTGAAGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216853	216001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_216000_216900
879552	contig_10868_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_173905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	464	790	671773	672099	NA	30	CAAAGACACCTTGCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQGGLPLVSDRTGQGGTRVSLSSWDVFGAQERRGGCPVENPAPSLLQLVPFQAFSENPESEISLTISHWLLGAGREGWRDLFYKWRQFIEAFHEELQRLENENSIHL	671309	673572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_671300_673600
879553	contig_2854_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_120789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGAGCTGGGAAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34185	32532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_32500_34200
879554	contig_4402_pilon	+	1872	4	Intergenic	novelGene_140816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1420	1725	411648	411953	TRUE	15	CCGCTGCACCAGCGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVAKSWWYFTRISRQGLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLIVGCGSLGIIISAGCCGSAVIRVGRLRLAYTGLYLFWH	399768	462755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_401034_411493_411955_462241_462296_462663
879555	contig_10855_pilon	-	1692	10	Intergenic	novelGene_124290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	59.4906362587352	211	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	81	1034	216076	211924	FALSE	5	GCTTGTGAGTGTGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHGPKQPGAAAAPAGGKAPGQHGGFVMAVKQERGEGPRAGEKGPHEEEPVKKRGWPKGKKRKKILPNGPKAPVTGYVRFLNERREQIRTRHPDLPFPEITKMLGAEWSKLQPAEKQRYLDEAEREKQQYMKELRAYQQSEAYKMCTEKMQEKKIKKEDSGSGLMNTLLNGHKGGDCDGFSTFDVPIFTEEFLDQNKAREAELRRLRKMNVAFEEQNAVLQRHTQSMNSARERLEQELALEERRTLALQQQLQAVRQALTASFASLPVPGTGETPTLSTLDFYMARLHDAIERDPARHEKLIVRIKEILAQVASEHL	216439	211265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_211937_212454_212588_213081_213298_213484_213558_213832_213880_214255_214377_214807_215012_215531_215641_216038_216095_216377
879556	contig_5965_pilon	-	2754	2	Intergenic	novelGene_154652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	0	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	75	1541	45358	43892	FALSE	45	TCTGTAGAAAAAAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSGQPRDGHPAADGRVPDWETRLEMKESNPKEDISEDEPSCGVVTEGPKRNGGWCSTVEGAWKQGDWLERQHGSTETHLEPLEISHGNKLTGQLGPGCNEFKAVFNQSSILVPPRLEDPTEKGSHAFVMHRKRFSGNSDLNKPSKLYLEKKSYDCRECGKVFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECNICGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYKCNDCGKAFSQRMNLIVHQRTHTGEKPYVCNVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYTCGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCSECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYECKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCNECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYKCNECGKSFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYKCSECGRSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYKCSECGKTFSRNTNLTRHLRIHT	62984	42678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_45379_62930
879557	contig_7695_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_41564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCCCCAGCTGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380415	381612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_380400_381600
879558	contig_5605_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_143939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCAAACAATGTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313445	311116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_311100_313400
879559	contig_14684_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_99643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTTTAATTCAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55597	56517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_55600_56500
879560	contig_14618_pilon	+	1797	2	Intergenic	novelGene_136796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	941	junction_1	0	857	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	157	360	349076	349279	FALSE	20	GAAGAAGTGGGTCTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFAVGVQQLHPALIQRTYGLTPHYIYPPAILQPSVVVPATPVPSLSSPYIDYMPASPAYAHYPPATYDQYPYAASPAAATSFVGYGYPAAVPQALSAAAPAGTTFVQYQPTQLQPDRMQ	331423	350716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_331480_348975
879561	contig_13697_pilon	+	1767	4	Intergenic	novelGene_165913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.3185612575358	194	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCTGTAGATCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122752	131994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_122885_126215_126286_130218_131516_131726
879562	contig_18794_pilon	+	332	1	Intergenic	novelGene_54627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	875	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCCTCCTTCGGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63798	64130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_63800_64100
879563	contig_7565_pilon	+	1917	10	Intergenic	novelGene_172909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	14.7723465374402	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1857	61	1917	157946	193798	FALSE	60	TTAATAGAAGAAAACAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTGSSETPTNQLWPNSSTSDMIVKDDILRLKNEIQVLQQQNQELKETEEKLRNTNQDLCNQMRQMVQDFDRDKQEAVDRCERTYQQHHEAMKTQIRDSLLAKHALEKQQLFEVYEGTRLQLRSDLDKMNKEMATVQECYLAVCREKDNLELNLRKAIEKEQQSQEEKKQLLEEREEYVSKLQVKLEEKYHDTFMMEKDKWRKERETDIKQQVEVEVILAKALWEKEQNEIKQELTQQLEKEWQAKLDETLKEMKKKTSDCGSQTDQVSAVDVLSKEEMATMVEEQKRKIQHDLEQEESVLQEGWRKREIELELKHCENVAKQVEIAVQNARHRWLKELPELAEYKARLRAEQKKWEEKQEIAVAKRILFAVSEAKEKWKSELEDMKKNIIPGKELEEKIHSLQRELELKAEEVPVVVRAELAKARSDWNKEKQEEIHRIQEQNEQDYRQFLDDHRNKINEVLAAAKEDFMKQKTELLLQKETELQTCLDQSRREWTMQEGRRIQVEIYQYEEDVLTVLEFLLRDAQKEHVGGSENTQLLEVVSTCSSKWVSVQYFEKLKACVQKAFRDTVFPLIENAGPQWEKKNMAKLSKDPASRDTGKGDLGVSEALRAPTSGHHAQPLALPETEAEAEENSELVEE	157885	193798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7565_pilon_+_158012_160267_160378_161136_161266_161399_161536_167056_167243_168810_169090_170830_170963_182046_182698_186518_186661_193772
879564	contig_11292_pilon	-	2131	9	Intergenic	novelGene_109386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	27.1937492817743	9	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	51	722	20641	16156	TRUE	5	GTGCTATTTCTGTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPASSSLFAAIDLTAVMAGRRSAWSRAALLRLLLGVNLIVMPPALARSLRFVTLLYRHGDRSPVRTYPKDPYQEEDWPQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMSAEANLAGLFPPNGMQRFNPNISWQPIPVHTVPVAEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTPEYQNESTQNAQFLDMVANETGLTDLTLETIWNVYDTLFCEESCWLRYGRT	20691	12791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_13717_15571_16006_16105_16189_17583_17674_17752_17852_17959_18113_19161_19249_19564_19661_20527
879565	contig_12344_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_164866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAAAGAGTTTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70858	72456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_+_70900_72500
879566	contig_8673_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_129932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAATTATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329461	328352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_328400_329500
879567	contig_15123_pilon	+	840	2	Intergenic	novelGene_110907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	77	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	82	297	215666	216146	FALSE	20	TTGAGACATCTTTTGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTWLRRALVLEELSPALRSTNFSCVLMDPAQVAQRHVILAQLRAGLKTTLPPTQEVLSSSHYPGPQLPSSAGPGISTQCQQQDSNLDQSPGPAYLEG	215584	216689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_215717_215981
879568	contig_6663_pilon	-	1451	3	Intergenic	novelGene_178171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	2	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	284	1450	160335	156801	FALSE	25	TGAGTCTGGAACAGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCLFGFRSFSKLWKNNSYLWLGPGNSLSLFLVDCYGIRNKQRWFSLTTVSPQNTKAMNLLIAKTRYHRKGDEGSNKQVSSDSPHLFAAGAAKKRAQMNPQSKDPVSPPLRNTVQLPTKPLNSEEWDKLKEDFKGKANFENWISSQITHCRSSVDVAKSLLAWVAAKNNGIVSYDLLVKYLYLCVFHKQTAEIFDVYEIMKARYKSLEPGAYTLLIRGLIHSDRWREALLLLEDIKKVMIPSKKNYDDCIQGALLHQDVDTAWNLYQELLGHDLIPMLETLKAFFDFGKDTKDDQYANKLLDVLLYLRNNQLYPGESFAHSIKAWFESVPGEQWKGQFTTIQKSGQCLGCGKTIESIYLSPEEYEFLKENIMRNVIDGGDQYKKTTPE	160618	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6663_pilon_-_156934_157649_157698_159349
879569	contig_720_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_155157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCTCATCGAAGTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60860	58263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_58300_60900
879570	contig_19518_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_170733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49502	51799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_49500_51800
879571	contig_10159_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_30847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTAATTCCCCTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633080	634980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_633100_635000
879572	contig_13215_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_145899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTGTGCTACTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179089	180817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_179100_180800
879573	contig_709_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_57623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCAGGGAGTGGCTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2507009	2508087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2507000_2508100
879574	contig_19815_pilon	-	421	2	Intergenic	novelGene_154695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	161	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTAAAATGTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39260	23224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19815_pilon_-_23295_38909
879575	contig_7912_pilon	-	2529	1	Intergenic	novelGene_129580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTTGTGTTGATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336048	333519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_333500_336000
879576	contig_253_pilon	-	1845	10	Intergenic	novelGene_129649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_3	24.588966711731	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	35	1441	289529	273225	FALSE	10	GATCCAGGCGTCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPFADTLQRLREAFRSGQTQAADFRATQLKGLGRFLRENKQLLQDALAQDLHKSAFESEVSEIRMSQGEVNLALKNLRAWMKDEKVPRNLATQLDSAFIRKEPFGLVLIIAPWNYPLNLTLVPLVGALAAGNCVVLKPSEISKNMERVLAEVLPRYLDQSCFAVVLGGPEETQQLLENKFDYIFFTGSPRVGKIVMAAAAKHLTPVTLELGGKNPCYVDDDCDPQTVANRVVWFRCFNTGQTCVAPDYVLCSRETQERLLPAMQSAITRFYGEDPKSSPDLGRIIGEKQFRRLQGLLGCGRVAIGGQSDESERYIAPTVLVDVQETEPVMQEEIFGPILPIVNVRGLDEAVDFITRREKPLTLYAFSNNSQVIKRVLAGTSSGGFCGNDGFMHVTLTTLPFGGVGASGMGRYHGKFSFDTFSHHRACLLHAPGMEKIYAIRYPPYSPRNQRLLLAAMETRSCSCTLL	294856	272820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_273416_274871_274972_280555_280723_281405_281793_283902_283985_284519_284606_284991_285113_285259_285371_289367_289531_294823
879577	contig_5600_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_174949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAACAAACAGTCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82519	84301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_82500_84300
879578	contig_9434_pilon	+	2373	1	Intergenic	novelGene_150480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51638	54011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51600_54000
879579	contig_20739_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_83195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTCCCCTGCCCCGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243497	241468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_241500_243500
879580	contig_6375_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_73037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGGAGAAAGGCGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484722	483266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_483300_484700
879581	contig_9696_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_68801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCTTTTTAGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360426	358819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_358800_360400
879583	contig_5341_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_168035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341131	342517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_+_341100_342500
879584	contig_8616_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_72449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATTTAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267575	266729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_266700_267600
879585	contig_7057_pilon	-	1725	4	Intergenic	novelGene_123427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	18.4571575998762	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAGTATGGTCTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606252	1595423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1596351_1603515_1603657_1604832_1604949_1605711
879586	contig_7898_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_47510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCTTGACAGAAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217986	217339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_217300_218000
879587	contig_16532_pilon	+	1534	3	Intergenic	novelGene_110071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	17	151	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	251	619	588804	598125	FALSE	45	AACTGCCATCAAATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSKLLLSSSSSQRIVLITATATSKGKCFIPNPYSPSSQLISMFFQWLQRRCDKWKGKFLKSKLTLIRSAGGALVKRLAAKGLWTPRERRPGMKPYGAVALRPVWSLRVRMDSTAHSNSTE	588553	599040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_588815_588948_589017_597835
879588	contig_6445_pilon	-	2157	3	Intergenic	novelGene_77123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	16	59	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	146	325	1441250	1441071	TRUE	20	ATGGCCATACTGCTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPDGFISHFYSVSEHVSPVLAFGFLGPKPQLSEVCAFFKHQIVQYLRDMFDLDNVRYTSVPALADDILQLSRRRSEILLGYLGVPAASTIGLNGTLPRENGPLEGLQ	1441704	1439200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1440766_1440803_1441278_1441586
879589	contig_5041_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_27121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGCTACAGTTTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636087	633880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_633900_636100
879590	contig_4955_pilon	+	2294	19	Intergenic	novelGene_178209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	39.3966847010265	31	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2154	140	2293	92163	159717	FALSE	50	ACAAAATTATATTAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPPFPVRIGATGIWSSCFQIEAGLRPGDLFFASPPVGSASLSSSTMWVTKLLPVLLLQHVLLHLLLLPIAIPYAEGQRKRRNTLHEFKKSAKTTLIKEDPLLKIKTKKMNTADQCANRCIRNKGLPFTCKAFVFDKAKKRCLWFPFNSMSSGVKKGFGHEFDLYENKDYIRNCIIGKGGSYKGTVSITKSGIKCQPWNSMIPHEHSFLPSSYRGKDLQENYCRNPRGEEGGPWCFTSNPEVRYEVCDIPQCSEVECMTCNGESYRGPMDHTESGKICQRWDHQTPHRHKFLPERYPDKGFDDNYCRNPDGKPRPWCYTLDPDTPWEYCAIKMCAHSTMNDTDLPMETTECIQGQGEGYRGSTNTIWNGIPCQRWDSQYPHQHDITPENFKCKDLRENYCRNPDGAESPWCFTTDPNIRVGYCSQIPKCDVSSGQDCYRGNGKNYMGSLSKTRSGLTCSMWDKNMEDLHRHIFWEPDASKLNKNYCRNPDDDAHGPWCYTGNPLIPWDYCPISRCEGDTTPTIVNLDHPVISCAKTKQLRVVNGIPTRTNVGWMVSLKYRNKHICGGSLIKESWVLTARQCFPSRNKDLKDYEAWLGIHDVHGRGDEKRKQVLNVSQLVYGPEGSDLVLLKLARPAVLDDFVSTIDLPNYGCTIPEKTTCSVYGWGYTGLINSDGILRVAHLYIMGNEKCSQYHQGKVTLNESEICAGAEKIRSGPCEGDYGGPLVCEQHKMRMVLGVIVPGRGCAIPNRPGIFVRVAYYAKWI	91751	159718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4955_pilon_+_91849_92120_92251_99086_99253_106247_106361_106996_107112_113404_113548_120050_120172_122162_122282_134783_134959_138183_138312_144594_144698_146280_146415_150142_150182_151321_151419_154437_154513_155339_155487_155981_156089_156226_156373_159579
879591	contig_5484_pilon	+	2414	11	Intergenic	novelGene_151078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_8	159.460841588147	449	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	1056	2318	48767	342119	FALSE	40	AAAAAACCTGTTCATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRPRTTSFAESCKPVQQPSAFGSMKVSRDKDGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQAAASTPTNATAASDANAGDRGQTNNAASASASNST	47711	342215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_48855_137525_137720_201596_201681_238751_238863_246565_246697_250578_250686_263868_263967_302319_302416_318738_318926_333538_333638_342051
879592	contig_19851_pilon	+	1441	5	Intergenic	novelGene_29813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCGTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22830	30824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_23282_23843_23928_27402_27444_27708_27880_30130
879593	contig_9099_pilon	-	2607	1	Intergenic	novelGene_149883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1646	1951	177476	177171	NA	50	CCCAGACGTAAAAATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQEMGLPIHHPLDSTSEEENGPQPVHCSQCRRQHIHIHLGREATREAKHQSADCLQKPTPQHKNNYLECGVCTCLSCRVSTFSCFFKGNKNNPQMVIIDY	179121	176514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_176500_179100
879594	contig_2062_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_139038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTTACGAAAACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201085	1200303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1200300_1201100
879595	contig_7318_pilon	-	1318	1	Intergenic	novelGene_152221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGATTTGCTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260170	258852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_258900_260200
879596	contig_678_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_167842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTTAGAGCCCAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458944	460107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_458900_460100
879597	contig_9133_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_109317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913438	889627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_889989_913289
879598	scaffold_12124_pilon	-	686	2	Intergenic	novelGene_22421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGAACCTCCAACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636054	1635185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1635811_1635993
879599	contig_8145_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_118670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCCTCCCCATCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891542	893999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_891500_894000
879600	contig_13888_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_151777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	88	426	243912	244250	NA	40	AAGAAATATCTCCCTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASPRPVDHGVLKALRHEVALPVALPAAMGVLKLWLCELWVLLLGSGLSARFLPLEEDVDFINEYVSLHNELRGDVTPRGSNLRFMVSREGGCRNLQQPLSFRSPQPRKVWDIALGLRIVENLPFSWVKKKARKISKLEK	243824	244865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_243800_244900
879601	contig_3602_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_60559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCTCAAAGACCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489153	487240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_487200_489200
879602	contig_15185_pilon	-	541	2	Intergenic	novelGene_99475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	120	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGACCTGTTGTGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505812	501144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_501652_505778
879603	contig_5690_pilon	+	1810	5	Intergenic	novelGene_119708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	59.0550590550886	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAGAAGAGAAAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941154	949046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_941196_942386_942426_946171_946262_946599_946717_947523
879604	contig_1090_pilon	-	691	5	Intergenic	novelGene_131166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	17.8115131305569	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	105	560	923638	919578	FALSE	55	AAATACAAGAAGTTATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEDIYDTSRQATAFGLLKAILSRKLLVPEVDDVMRKVSKLAISGQSEPVRVQCRQVFLKYILDYPLGDKLRPNLEFTLAQLNYEHETGRESALEMIAYLFDTFPQGLLHENCGMFFIPLCLMMVNDDSAACKKMAAVTIKSLLSKINLEKKDWLFDMVTTWFGRKKVRFEFSVINGNFSAFVIC	924104	919446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_919818_919949_920020_920420_920501_923572_923684_924045
879605	contig_4501_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_168985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	28	462	190111	189677	NA	20	CTTTGTTCCCAGCACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGQDGGWRMIGPGSHQQQRRPRGGGFSFECRPSSSPPPPEPLPSTHSSASRGGPGSRDSMSDSEEESQDRQLKIVVLGDGTSGKVSPRISPPSRACRNPSAAWRPQPPPRRRASPRYRKPGASRPGPSQRCPGAGHQAGAQRRRTRAVQLPL	190138	189214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_-_189200_190100
879606	contig_7410_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_106114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTGTCCTCTGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497315	495533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_495500_497300
879607	contig_5039_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_64827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACATTTCCCAGTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259231	260112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_259200_260100
879608	contig_6609_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_175454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1293	1820	285636	286163	NA	20	ATGGATGCCGTGCTGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCWLGPDSDVGLVVSLGAELDTVDPVWPAEPAGPLEPVEPGGPAGPVGPIGPMGPMGVNGTMGLMGPMGVTGPTGPMAVPSTPTPTPGVKLGMRPGASVANVCSPCWICIKACIALGFDMADSVSGFCICCRKAGSCGRICSCSCGFAANSGLFSIICAARSGFWLRDCIMLLM	284343	287053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6609_pilon_+_284300_287100
879609	contig_9988_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_113047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	924	1556	26182	26814	NA	50	AAACAACCCTTCAGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALPHCKTLYLGKQSKLKNCNAKTLLLQQYLLFLSVLLWYPSSASLYPSLPSCPDNMACELPCYPREFSEETKLVATGETKLVTEMPFKIKYPKAGGGPPEVTFAPRSKVKLHAIVKEFPNPREEPHMFCQEFKFLGETYKLRLADLYNLLYMLLGLGGTQKRMEEAKWKEPEKSLPIQPNFPGLELKPRPKKLLQTQLTPSQKCFLER	25258	27383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_25300_27400
879610	contig_7025_pilon	-	574	1	Intergenic	novelGene_104394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGTGGAATTCAACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71213	70639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_70600_71200
879611	contig_5196_pilon	+	1732	1	Intergenic	novelGene_38702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAAAAAAATACTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318553	320285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_318600_320300
879612	contig_14445_pilon	-	1456	8	Intergenic	novelGene_137352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	17.5940620781036	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	109	1362	274326	254108	FALSE	35	TTGAAAGCAATTTCTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRGPAGGLRVWSGRGAGHLGCRDAGQASPQATLRKMALSAQRVPRWFSAIKLSSFINATQIRRLFLRPRYTLLYGFSAQPQMSSDNCLVQRRIKTYRTSSLWNSSQSTNSSREDNNSVQSTLLPSVNEQPQEPQKIPNSDSELSLEGLEDLPPLSPLQPISEEEAIRIIADPPLPPVSFTLRDYVDHSETLQKLVLLGVDLSKIEKHSDAANLLLRLDFEKDIKQILLFLKDLGIEDNQLGSFLTKNYAIFSEDLENLRTRVTYLQSKNFSKADIAQMVRNAPFLLNFSVERLDNRLGFFQKELELSVKKTRDLVVRLPRLLTGSLEPVKENMKVYHLEFGFKRNEVQHMITRIPKMLTANKRKLTETFDYVHNVMGIPHYIIVRFPQVFNTKLFKVKERHLFLTYLGRAQYDPAKPNYISLDKLVSIPDEIFSEEVAKASVQDFQKFLKTL	277355	254013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_254303_256885_257048_258409_258482_258848_258997_262067_262258_266119_266273_273992_274342_277262
879613	contig_6689_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_175257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGAGGACCTAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26140	27306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6689_pilon_+_26100_27300
879614	contig_6102_pilon	-	2063	5	Intergenic	novelGene_32337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_4	251.732993467285	24	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTTCTGATGCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689431	1685249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1688077_1688226_1689005_1689102
879615	contig_5918_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_99570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1756773	1754498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1754500_1756800
879616	contig_3382_pilon	+	1225	8	Intergenic	novelGene_124086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	43.143803206278	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	28	816	535178	556738	TRUE	20	GATTGTCATCCCCGACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYIFNCLDDMAQVNMTTDLEGSDMLVEKADRREFIDLLKKMLTIDADKRVTPIETLNHPFVTMTHLLDFPHSTHVKSCFQNMEICKRRVNMYDTVNQSKTPFITHVAPSTSTNLTMTFNNQLNTVPNQAPTSTSATLSLANPEVSILNYQSALYQPSAASMAAVAQRSMPLQTGAAQICARPDPFQQALIVCPPGFQGLQASPSKHAGYSVRMENAVPIVTQAPGAQPLQIQPGLLAQQAWPSGTQQILLPPPRGSSSRAWPPTRPCSTRP	535150	564228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_535187_536401_536587_539300_539464_542304_542513_544213_544336_556636_556782_560007_560188_564042
879617	contig_11681_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_102975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	688	2064	60	2123	163570	165633	NA	55	CATTGAAAAAAGTTACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIIN	163510	165635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_163500_165600
879618	contig_11681_pilon	+	2647	2	Intergenic	novelGene_102974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	101	2467	163570	165936	FALSE	20	TGATATGTTGTTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKANSSIFRFAIIFMLILEIRIQLSEESELLVDRSKMDLTHVPKDLSLKTTILDVSQNSISELQASDILSLSKLRILILSYNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNNLSKISCHPTVNLKHLDLSFNGFEVLPICKEFGNMSQLDFLGLSATLLQKSSVLPIAHLNINKVLLVLGEHYGQKEDPESLQDLNTKSLHIVFPTRKEFDFVLDVAASTAVSLELSNIKYVPDDNEYSYFINVLLKLQKNPRLLNLTLNNIETTWNSFIKILQLVWHTTIEYFSISNVKLTGELDHEYFNYSGTSLKALSIHQVFSDAFRFQQGYVYNIFSNMKIQNLTVTGTRMLHMLCPLHISPLVYLNFSNNLLTDVVFKNCTSLTALKTLILQMNQLKELANIIYMTKDMKSLQQLDISQNSLRYENEGNCFWTKSLLILNMSSNILTDSVFRCLPPSVAVLDLHNNRIVSIPKDVTSLEALEELNVAFNHLTDLPGCGTFSRLSVLIIDYNLVSHPSADFLYSCQKIRSIKAGNNPFQCSCEIREFIKSIGQISSDMVKGWPESYKCAYPESYKGTPLQDFHISQLSCNTTLLIITIGVTVLVLVVTVTFLCICLDLPWYLRMICQWTQTRYRARNTPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSAWVKSELLPNLEKEDIRICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKTIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHKLFQDASDNLILILLEPIPQYSIPSNYHKLKTLMAQRTFLEWPKEKNKHGLFWANLRATINIKLIEQNK	161411	166116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_161445_163502
879619	contig_14341_pilon	+	2883	2	Intergenic	novelGene_111764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1212	1661	251773	252222	TRUE	15	CACACCGCCCTCCGCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLVYCQVRVLLEGFATFWTLVWGLFSVNPLMLGQTGTIPESFATLITLIGLLTSMSPLVADEAGNVPEKFLTLVTAIGLLASMNPLVPDEVSALNECFPTLFTFIWFLPRMDFLMHNEMRVAVEGFATLRTFERLLSSVSPLMLGKV	250561	269954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_253283_269792
879620	contig_5620_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_161346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGTGGCAGACCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348339	346656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_346700_348300
879621	contig_1154_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_87214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACACACCTGTCTATCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569262	1570112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1569300_1570100
879622	contig_10986_pilon	+	1650	9	Intergenic	novelGene_71449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	65.3919672054603	106	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	121	1101	60137	65850	FALSE	0	GCTGCTGTCGCTCCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATGRGDVWSSWEQLALSVPATLLFNLLGVPLVGADICGFLGNTSEELCVRWTQLGAFYPFMRNHNSLDSLPQEPYRFSATAQEAMRKAFTLRYALLPYLYTLFPQDPHTWTVDRQLLWGEALLITPVLEAGKTEVTGYLPAGTWYNLQTVPMDALGSLPPPSPTPLKSVIHSQGQWVMLPAPLDTINLHLRGGYIIPLQGPSLTTTESRKQPMALVVALSSSGDAQGELFWDDGESLGVLEHGAYTLVIFLAKNNTVVNKLVHVASEGAGLQLRKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKILDIPVSLFMGEQFLISWS	59567	66399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_59617_60065_60201_61010_61163_61446_61542_63118_63261_63692_63843_64682_64848_65161_65315_65790
879623	contig_19185_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_163673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGGAATGGTAGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178045	180028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_178000_180000
879624	contig_10235_pilon	+	1337	4	Intergenic	novelGene_46257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGTGGAAGTCAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3214	6206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_4090_5438_5633_5805_5966_6098
879627	contig_7815_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_134395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTGACAGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604934	602775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_602800_604900
879628	contig_16578_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_148671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAACTTTAATGGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246258	247377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_246300_247400
879629	contig_9435_pilon	+	2666	1	Intergenic	novelGene_156951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	270	584	184250	184564	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCRKNEQICLGRSTARTLLRSKDGETLSHILWICYQEGSVPGEGQHAWYSQRKRGRLSMRWTDTVAATMGSSITMTVRMVKDWAMFPSGVHRVTMSWNQLDST	183980	186646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_184000_186600
879630	contig_9673_pilon	+	1491	10	Intergenic	novelGene_119152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	31	junction_9	659.089008395417	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	303	1151	59036	183902	FALSE	10	GTGATGGTATTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGVDCGDGLRARQYVFLLPEYLKDASKKMKNGLMFVKLVNPCSGEGAIYLFDMCLQQLFEIKVFKEKHRSWFINQSVQSEGHLHFATPMDPLFLILHYLMKTEKEGKFQPLDQVVVDDTFPNCTLLLKLPELEKLLGHVTEEKEIDSKKYYKYSKEKTLKWLEKKVNQTIVALKTNKINVGARVQSAAFFPGDQASSDKEEDYIRYAHGLISDYIPKELSDDLSKHLKLPEPSASLPNPPSKKNSKMTAAQKALAKVDKSGMKSIDSFFGAKNKKKDLKL	58733	184242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_59100_114452_114525_117149_117258_123989_124067_128160_128276_149481_149547_151566_151673_162523_162606_164186_164230_183785
879631	scaffold_12510_pilon	-	2404	2	Intergenic	novelGene_151424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	0	36	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCTCCCCCCCCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687740	684735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_687015_687615
879632	contig_18869_pilon	+	2287	2	Intergenic	novelGene_56427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTAAGAAATGAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93599	96609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_93624_94346
879633	contig_2703_pilon	+	2414	2	Intergenic	novelGene_101632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	678	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCGGAGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345	3825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_3377_3442
879634	SIRV3	-	481	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146211	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
879635	SIRV3	-	463	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	18	-2	18	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1964	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
879636	SIRV3	+	468	3	NNC	SIRV3A	novel	2373	3	NA	NA	-946	-4756	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2365	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATACCGAATTTAGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998	1962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_1165_1522_1765_1902
879637	contig_2703_pilon	+	1122	2	Intergenic	novelGene_101653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	423	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366	3291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1778_2580
879638	SIRV3	-	462	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	19	-2	19	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1963	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
879639	SIRV1	-	1477	4	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	360	29	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGAATCGATGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10636	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1410_6346_6814_7552_7815_10291
879640	SIRV3	-	456	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	25	-2	25	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1957	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
879641	SIRV3	-	318	3	NNC	SIRV3B	novel	479	3	NA	NA	1	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTTTATTTGTATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_1010_1532_1765_1902
879642	SIRV3	-	450	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	27	2	27	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTTTATTTGTATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1955	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
879643	contig_16103_pilon	+	538	5	Intergenic	novelGene_118801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	12249.2053900447	188808	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599201	605579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_599300_603801_603938_604249_604359_605006_605118_605495
879644	SIRV5	+	2039	17	FSM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	15	31	-4	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	194211	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCTCAGTGGTGACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023	10960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879645	SIRV5	+	2027	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	203659	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879646	contig_3942_pilon	+	470	4	Intergenic	novelGene_128781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	4966	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	269	376	795165	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793531	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879647	contig_16103_pilon	+	294	3	Intergenic	novelGene_118814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	25191	junction_2	2817.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604259	605579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_604359_605006_605118_605495
879648	contig_1150_pilon	+	580	3	Intergenic	novelGene_61423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136375	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAGGCAACTGGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	312899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309387_309813_309917_312880
879649	contig_1150_pilon	-	831	3	Intergenic	novelGene_61394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_2	36516.5	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310382	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_310121
879650	contig_1150_pilon	-	815	5	Intergenic	novelGene_61425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	31877.6878121673	9184	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349767	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002_311092_346557_346616_349669
879651	contig_16103_pilon	+	523	4	Intergenic	novelGene_118811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13402.2468348491	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	310	468	604340	605524	FALSE	10	CATCCTGTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSIRRRSRSSVPTLPSRCFRNAEGAELPSALLRTLPTGTAEAHWATCIDRSGQTKDGGPAAQTSGGARGELSPLAKDLLHPSPEEEKRKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFRRKQH	603950	605579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_604170_604249_604359_605006_605118_605495
879652	contig_4364_pilon	+	1909	6	Intergenic	novelGene_675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	1530895	1532568	FALSE	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530460	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879653	contig_3942_pilon	-	515	5	Intergenic	novelGene_128750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGGCAGAACCGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795492	792273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_792302_793507_793623_793793_793885_795076_795177_795311
879654	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	140	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879655	contig_16103_pilon	+	719	3	Intergenic	novelGene_118805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9626	junction_1	10600	158	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603900	605579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604359_605006
879656	scaffold_13505_pilon	-	661	6	Intergenic	novelGene_111483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5787.52604832151	95	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	36	566	547805	541178	TRUE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVRSGCGPGAGPSVIPWASPDPLLCQSPAQGGGGQWKALH	548330	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540265_541155_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
879657	contig_15039_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_110191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1419	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTTTGTCAGATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364990	365961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_365000_366000
879658	contig_4732_pilon	+	284	4	Intergenic	novelGene_75407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5423	junction_1	585.227780915735	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524069	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524233_524536_524671_525073
879659	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	185	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879660	contig_1150_pilon	-	1274	2	Intergenic	novelGene_61374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	182	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAGAAAAAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309896	308194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
879661	SIRV5	+	552	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
879662	scaffold_13505_pilon	-	478	5	Intergenic	novelGene_111469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5309.37703502021	5456	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2	439	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	547806	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734
879663	SIRV6	-	489	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8209	49	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACGACCATTGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10756	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723
879664	contig_1150_pilon	-	2251	3	Intergenic	novelGene_61376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36526	3720	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAGAAAAAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310987	308194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308815_308928_309385_309812
879665	contig_1150_pilon	-	1274	2	Intergenic	novelGene_61375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	233	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAGAAAAAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309896	308194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
879666	contig_4364_pilon	+	1934	6	Intergenic	novelGene_695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	156185	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	61	1188	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530464	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879667	contig_13245_pilon	-	606	4	Intergenic	novelGene_148822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4261	junction_1	3752.10776320013	82115	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	210	569	26752	25454	FALSE	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA	26961	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26749
879668	contig_3942_pilon	+	499	4	Intergenic	novelGene_128777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	13	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	14	400	793521	795407	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDAEMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793507	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879669	contig_16103_pilon	+	656	3	Intergenic	novelGene_118804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	25191	junction_2	2817.5	1548	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603899	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_604359_605006_605118_605495
879670	contig_4364_pilon	+	1924	6	Intergenic	novelGene_693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	254	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	61	1188	1530895	1532568	FALSE	20	CTGCAGTGAACGGCGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530464	1533304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879671	SIRV1	-	1558	5	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	57	-21	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	262	78	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCGACTGACGTAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7809_10282_10367_10444
879672	contig_9706_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_20757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291402	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGTCAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_100_1700
879673	contig_9389_pilon	+	464	3	Intergenic	novelGene_84037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4932	junction_1	4699	174	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	80	436	584884	586236	FALSE	20	TGTGGCCCGAGTCCAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584804	586264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584892_585654_585890_586122
879674	contig_3942_pilon	+	793	5	Intergenic	novelGene_128749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5794.82184260224	27	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	308	694	793521	795407	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792272	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792569_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879675	contig_1150_pilon	-	610	3	Intergenic	novelGene_61400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311042	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
879676	contig_3942_pilon	+	521	5	Intergenic	novelGene_128755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	41	427	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792274	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879677	contig_9706_pilon	+	3992	1	Intergenic	novelGene_20752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60128	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_0_4000
879678	contig_6546_pilon	-	492	4	Intergenic	novelGene_140986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	65	430	599635	597660	FALSE	25	CCTTAGTCGCAGCTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSDSSDSSFFASTFFSSAGAAAVEGAGPPAGAAPAAGAGPPAPTLQMRLPMLTLARAFANKPGQKGSTFTPAALMRALILSSVTVTSSSCRIRAEYMQASSETEAMARECWAGGCRARC	599699	597597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_597774_598337_598412_599244_599363_599575
879679	contig_18869_pilon	-	1987	4	Intergenic	novelGene_55987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_3	1442.53719382051	125038	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	28	387	79419	74943	TRUE	50	TAACAAAGAGAAATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79446	72199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73786_74928_74957_75486_75766_79352
879680	contig_10930_pilon	+	626	7	Intergenic	novelGene_37110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_3	8007.16378730114	29617	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTTTGTGTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339429	342107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340505_340639_340994_341098_341522_341625_342020
879681	contig_6807_pilon	+	827	4	Intergenic	novelGene_84581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	17414.0677486782	119460	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	52	495	601833	603160	TRUE	15	CTTTCTGATTCATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLTPEEKALVIGLWAKVNVKEYGGEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSASAIMNNPKVKAHGEKVFTSFGDGLKHLEDLKGAFAELSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLARHFGKEFSPEAQAAYQKVVAGVANALAHKYH	601781	609198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_601925_602053_602277_603031_603278_608983
879682	contig_9389_pilon	+	488	4	Intergenic	novelGene_84030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	160	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	19	456	584401	586236	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584382	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
879683	contig_6017_pilon	-	303	3	Intergenic	novelGene_152544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4630	junction_2	1029	15558	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTTAATATACTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442513	440560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442225_442457
879684	SIRV6	+	1527	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879685	scaffold_13505_pilon	-	289	5	Intergenic	novelGene_111493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6118.46749603199	3608	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCGTAATCTTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547803	540201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_541857_547363_547465_547734
879686	scaffold_6394_pilon	+	749	5	Intergenic	novelGene_111035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10205	junction_4	2532.80865591935	109981	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAAGCCTTTTTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441767	444567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443338_443388_444267_444367_444474
879687	contig_6807_pilon	+	360	2	Intergenic	novelGene_84583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTGATTCATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603095	609198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_603250_608992
879688	SIRV5	+	1928	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	99	2	-97	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCCGAAAGAACACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879689	contig_4232_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_63355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTTCAGAAGATAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468094	467088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_468100
879690	contig_9389_pilon	-	1035	3	Intergenic	novelGene_84036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCCTCGGAAAGGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586268	584394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_584892_585654_585888_585963
879691	scaffold_13505_pilon	-	763	5	Intergenic	novelGene_111495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	3935.09332799109	2832	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCGTAATCTTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548321	540201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547806_548295
879692	SIRV5	+	2022	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	5	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5332	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879693	contig_19518_pilon	-	1541	2	Intergenic	novelGene_170721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	14023	junction_1	0	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCAAACCCATTGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47728	44160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623
879694	SIRV5	+	2024	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	3	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23582	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879695	contig_17311_pilon	-	528	6	Intergenic	novelGene_57837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	7779.50642650291	39756	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	34	426	126865	119271	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	126898	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
879696	contig_10953_pilon	+	753	5	Intergenic	novelGene_42554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2633.72050291978	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	268	723	422508	426254	FALSE	20	AAATTGCCTTCGCGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419997	426284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420263_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879697	contig_16103_pilon	+	332	4	Intergenic	novelGene_118809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9626	junction_1	8965.75243170737	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603911	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604359_605006_605118_605495
879698	contig_1450_pilon	+	810	1	Intergenic	novelGene_27410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTCCCCAAAACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358050	358860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_358000_358900
879699	scaffold_13505_pilon	-	949	6	Intergenic	novelGene_111486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5237.06517049387	4231	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	473	910	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548767	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
879700	contig_10953_pilon	+	522	5	Intergenic	novelGene_42555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	37	492	422508	426254	FALSE	20	AAATTGCCTTCGCGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419997	426284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879701	contig_11258_pilon	+	371	4	Intergenic	novelGene_67741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4814.9257753596	176	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	265	306	53514	53555	FALSE	20	AAATCTTCAGTGTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVPRKIEEIKDFLLTARRKDAKSVKIKKNKDNVKFKVRCSRYLYTLVITDKEKAEKLKQSLPPGWVGLISEFCELCSAEVQHQAAVQMYLLNDSPLSLSL	49140	53620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_49150_50092_50154_52748_52876_53446
879702	contig_10953_pilon	+	524	5	Intergenic	novelGene_42549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	65498	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	39	494	422508	426254	FALSE	20	AAATTGCCTTCGCGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419995	426284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879703	contig_11677_pilon	-	518	5	Intergenic	novelGene_85950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_4	14365.8301970335	452	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	16	486	598052	594927	FALSE	20	TTTTTTCACCACATATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598067	594894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_598027
879704	SIRV5	-	1255	8	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	5	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTCCTCCCTATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10915	6334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_6450_6655_6722_6825_6957_7143_7305_7678_7762_7869_8381_8453_8590_10863
879705	scaffold_13505_pilon	-	681	7	Intergenic	novelGene_111497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	5392.02458626525	148	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	221	658	547805	540231	FALSE	20	ATTGCCTCATTCGTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548328	540207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_547990_548178_548295
879706	contig_4232_pilon	-	1531	1	Intergenic	novelGene_63288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	979	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468094	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
879707	contig_3942_pilon	+	515	5	Intergenic	novelGene_128770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	85	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	35	421	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792280	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879708	contig_3627_pilon	+	1196	3	Intergenic	novelGene_78501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	63656	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	44	517	621315	634316	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSAGSWSYSVLVTMEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621271	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
879709	contig_2940_pilon	-	627	5	Intergenic	novelGene_81932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	8685.83409926761	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	166	573	722201	717705	FALSE	15	TCTGGTATGTTTCACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE	723514	717650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720954_722105_722207_722562_722677_723468
879710	contig_10988_pilon	+	4626	3	Intergenic	novelGene_104735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	975	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	1786	2748	176412	177374	TRUE	25	CCGATAGTCTCTGCAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPLEENAVELPDWEFKSLILRILQELRQKFGKSEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMLEDRISGIEDKHLDTTLFRENSEERTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFRNALKDEKLTIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAACAKQEVTYREETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLFKFDGEIRLFPDKQIKGICKSQTKLTRVIKGSSSI	174498	286454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_175429_175556_177468_284669
879711	contig_4232_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_63301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1009	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCAGCGGTGCGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468094	466749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466700_468100
879713	contig_18208_pilon	-	503	4	Intergenic	novelGene_176197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1968.16987749195	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1	465	156048	154421	FALSE	25	ATGCCAGAAATGCTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVPSCPTSFFRLGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS	156048	154382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353_155514_156011
879714	contig_17311_pilon	-	510	6	Intergenic	novelGene_57847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	7779.50642650291	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	20	412	126865	119271	TRUE	10	CTTATATGTGTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	126884	118800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
879715	contig_4732_pilon	-	437	4	Intergenic	novelGene_75405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99747	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAAAGGAGTCACGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525153	524036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_524092_524184_524231_524534_524683_524965
879716	contig_4232_pilon	-	2678	2	Intergenic	novelGene_63265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1163	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGAAAGTCAGAGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468029	463386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_464599_466563
879717	SIRV6	+	514	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2302	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
879718	contig_17440_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_7527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16058	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAAGGAACTCGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242	2203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_200_2200
879719	contig_10953_pilon	+	538	5	Intergenic	novelGene_42556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	8628	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	37	492	422508	426254	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419997	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879720	contig_8651_pilon	-	465	4	Intergenic	novelGene_168184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTGGGGCTGACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189356	185066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_185124_185618_185757_186928_187009_189166
879721	contig_1146_pilon	+	460	5	Intergenic	novelGene_84859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4074	junction_1	2080.05076560646	61936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	29	421	950980	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	949780	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951113_951651_951732_956017_956104_957038
879722	SIRV2	+	1328	10	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-2266	1451	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51989	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTACCTGGTTGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1767	5908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877_3010_3101_3326_3665_3828_3962_4095_4338_4479_4686_4800_5787
879723	contig_4732_pilon	+	323	4	Intergenic	novelGene_75400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5423	junction_1	585.227780915735	91619	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGGTTCCTGTCTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524030	525153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524233_524536_524671_525073
879724	contig_19518_pilon	-	379	3	Intergenic	novelGene_170724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10325	junction_2	1849	334	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49253	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623_47728_49223
879725	contig_6477_pilon	+	1057	4	Intergenic	novelGene_154185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	15	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTGCGCGGATCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770029	773205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_770106_770616_770699_771241_771343_772407
879726	contig_16103_pilon	+	533	3	Intergenic	novelGene_118678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49567	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAGGACATGCGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17542	18573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_17745_17881_18042_18402
879727	contig_3942_pilon	+	489	5	Intergenic	novelGene_128764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5794.82184260224	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	10	396	793521	795407	FALSE	30	ACTGAAGCAGTAACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792277	795500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792285_793518_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879728	contig_8317_pilon	-	1732	8	Intergenic	novelGene_19245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3394	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	777	1346	15828	14905	TRUE	20	AACGTTCAGGGCGACTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHFNRLDFSGDVDWSKGDHHPRLEDTSLHPAHRDSANTTNFIDILERQTQRLVSWASWWQDAIQSFKQRGSTGIAILTGDFPSLEPRHVSTWLQHVVTIPTRNWHKCYCVGVVANFLNVGADFLNNFLISLLAVRWLSGIHFVNTNDELFHTQCISQKGMLTGLPILGDTSFKFTNTSSNNQDSTVSL	16781	13257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_13289_14256_14436_14728_14909_15090_15390_15467_15618_15711_15968_16045_16281_16379
879729	contig_15744_pilon	+	767	5	Intergenic	novelGene_83586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	42607	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	149562	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
879730	SIRV6	+	508	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2308	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
879731	contig_6589_pilon	+	806	5	Intergenic	novelGene_26137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	45181	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	208	684	1885124	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1884916	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
879732	contig_18208_pilon	-	544	4	Intergenic	novelGene_176186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_3	1147.65161186757	327	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	65	496	155993	154421	FALSE	5	TGCTTGTGTCTTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS	156057	154372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353_155514_155989
879733	contig_4232_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_63295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
879734	contig_5770_pilon	-	627	6	Intergenic	novelGene_74185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10692	junction_3	2103.27348673443	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	39	593	264932	261935	FALSE	25	AGAAGAATGTTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE	264970	261900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261983_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892
879735	SIRV6	+	1534	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	-13	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879736	contig_4232_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_63285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCTTATCTGCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466563	468063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466600_468100
879737	contig_4732_pilon	+	312	4	Intergenic	novelGene_75402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5423	junction_1	585.227780915735	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATAAACTTGGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524032	525144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524092_524184_524233_524536_524671_525073
879738	contig_2940_pilon	+	1463	5	Intergenic	novelGene_81927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAGGGAAGGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716176	723511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_717129_717649_717835_720771_720954_722105_722206_723467
879739	contig_14807_pilon	-	1026	6	Intergenic	novelGene_124653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	149	640	38669	37247	FALSE	5	TGCTCTGTGTCCCTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39768	36860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
879740	contig_1146_pilon	+	793	5	Intergenic	novelGene_84852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	3360.97459823784	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	362	754	950980	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	949778	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_950135_950974_951113_951651_951732_956017_956104_957038
879741	contig_12841_pilon	-	3430	1	Intergenic	novelGene_55898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	678	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTTGCTGTTTTGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908846	905416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_905400_908800
879742	contig_14807_pilon	-	1167	7	Intergenic	novelGene_124650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7423.44342831097	71	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	24	668	39773	37247	TRUE	40	TCATAGAATAAAATCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	36547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_36951_37150_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
879743	contig_16103_pilon	-	472	3	Intergenic	novelGene_118704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	125	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	92	364	199173	198413	FALSE	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGPAETRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199918	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
879744	contig_10867_pilon	-	1042	6	Intergenic	novelGene_159448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	2596.79913739973	54115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	622	1008	88226	86811	FALSE	10	TGTTAGGTCTTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	91456	86776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_90943
879745	contig_1146_pilon	+	1632	4	Intergenic	novelGene_84856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4430	junction_3	2017.99620085536	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1201	1593	950980	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	949779	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_951113_951651_951732_956017_956104_957038
879746	contig_10861_pilon	+	6654	8	Intergenic	novelGene_39259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1814	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3521	3967	1329210	1329656	TRUE	20	GCCAACAGCGTTGCACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLPKVIYRCNAILIQIPMAFSYEMEKQITNVIGKGKRPLISKALLKKQNKVGGLTLPNFRIYDTATVVKTAWYSYNNRYIDQWNRLENPDINSSTYEQLIFDEGPESVNRGKDSLFNKWCWHNWIPICKKLKQDPCLTPCTETNSK	1303818	1555173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1305599_1326789_1328072_1328751_1329841_1330531_1331952_1455535_1455871_1549082_1549284_1549785_1550022_1554862
879747	contig_8317_pilon	+	3368	7	Intergenic	novelGene_19265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	12435	junction_4	9712.29771561121	32078	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	37	1425	14294	16506	FALSE	20	AGTTGCATGATGGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	14257	18449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
879748	contig_15744_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_83571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2734	junction_3	552.243152967966	32831	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	68	562	149562	153378	FALSE	45	TATAATTGTATAAAGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVPLCRRCCVNPCFLVLLLRPAMVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149494	154022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149631_152145_152177_152263_152353_152532_152706_153245
879749	contig_8317_pilon	-	1736	8	Intergenic	novelGene_19247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3294	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	781	1350	15828	14905	TRUE	20	AACGTTCAGGGCGACTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHFNRLDFSGDVDWSKGDHHPRLEDTSLHPAHRDSANTTNFIDILERQTQRLVSWASWWQDAIQSFKQRGSTGIAILTGDFPSLEPRHVSTWLQHVVTIPTRNWHKCYCVGVVANFLNVGADFLNNFLISLLAVRWLSGIHFVNTNDELFHTQCISQKGMLTGLPILGDTSFKFTNTSSNNQDSTVSL	16785	13257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_13289_14256_14436_14728_14909_15090_15390_15467_15618_15711_15968_16045_16281_16379
879750	contig_7286_pilon	-	979	7	Intergenic	novelGene_108678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	4859.35865967242	46574	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	174	911	292049	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293113	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_292991
879751	contig_19518_pilon	-	379	3	Intergenic	novelGene_170725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10325	junction_2	1849	385	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49253	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623_47728_49223
879752	SIRV2	-	1353	10	NNC	SIRV2A	novel	2051	11	NA	NA	1	-745	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3065	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTAGAACGAGGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	1780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881_3011_3105_3375_3665_3826_3963_4095_4338_4480_4687_4801_5788
879753	contig_14666_pilon	+	402	3	Intergenic	novelGene_39652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43941	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGAGCGGAAGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488758	492454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_488913_490404_490532_492333
879754	contig_1339_pilon	-	844	4	Intergenic	novelGene_163140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64217	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCTACGGCAGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434175	430948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_431421_431611_431733_433674_433795_434044
879755	contig_15937_pilon	-	703	5	Intergenic	novelGene_143137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3847	junction_1	511.446661441836	42835	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTCTTAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30730	28044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601_28680_29194_29246_29914_29960_30533
879756	contig_11719_pilon	+	651	7	Intergenic	novelGene_154734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	2917.50456535871	44701	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	108	605	13921	20039	FALSE	20	CTAATTGAGTGTCCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASAWDAPVATSLRCIALKVQARDSSLGPIADSLQMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	12998	20085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13481_13554_13920_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
879757	SIRV6	+	1541	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	-13	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	558	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879758	contig_8697_pilon	-	933	4	Intergenic	novelGene_83197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3937.51808461455	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCCTATCTAACTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19107	16154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436_18573_18816
879759	contig_11719_pilon	-	578	6	Intergenic	novelGene_154731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1994	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAGCATGCGCGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20085	12996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_13033_13918_14063_14327_14502_16245_16326_19126_19183_19997
879760	contig_7293_pilon	+	1560	3	Intergenic	novelGene_54255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	41	367	335695	336451	FALSE	35	AAGGGCATCTGGAGAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335654	337644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
879761	scaffold_12510_pilon	-	501	5	Intergenic	novelGene_151349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_4	694.592506438127	3763	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	62	394	148136	145678	FALSE	45	TGCACATTTTAATAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPPSWSLWRPAGNRTSKPTNMSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI	149119	145570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_146287_146433_147758_147912_148125_148171_149092
879762	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15820	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
879763	SIRV2	-	748	6	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	5	2202	1	406	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACGTTCTAGCCGTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	3237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3326_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
879764	contig_6477_pilon	-	594	7	Intergenic	novelGene_154180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	2937.24676449827	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	60	557	773121	769365	FALSE	15	AACCAGTGGGCTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNFLRSSRIWVHPTPAASAMPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773180	769327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
879765	SIRV5	+	505	2	FSM	SIRV5A	SIRV506	552	2	47	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5896	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTACGGCCAGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055	2398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987
879766	contig_6005_pilon	-	501	5	Intergenic	novelGene_158899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2944.83678452644	52751	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	93	446	367537	364535	FALSE	5	TTTCTCGGTTACTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRLTYRRRLSYNTASNKTRLSRTPGNRIVYLYTKKVGKAPKSACGVCPGRLRGVRAVRPKVLMRLSKTKKHVSRAYGGSMCAKCVRDRIKRAFLIEEQKIVVKVLKAQAQSQKAK	368801	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862_366967_367290_367391_367472_367547_368718
879767	contig_18208_pilon	+	516	4	Intergenic	novelGene_176185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	561	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	151	516	154523	156029	FALSE	45	TAGGACAGGAAGGAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSERKR	154372	156029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
879768	contig_12677_pilon	+	3824	2	Intergenic	novelGene_110674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	544	junction_1	0	85087	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2598_2638
879769	SIRV6	+	1530	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	-13	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879770	contig_5317_pilon	+	1034	5	Intergenic	novelGene_76496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5577.68945778626	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	196	606	35282	43326	FALSE	25	GAGTTGTCCTACATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33243	43754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33339_33688_33766_35258_35410_36684_36839_43197
879771	contig_5815_pilon	+	417	5	Intergenic	novelGene_141225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16663.8406643697	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	8	385	1041346	1046025	FALSE	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPMAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1040933	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040941_1041345_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
879772	contig_5770_pilon	+	756	7	Intergenic	novelGene_74183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	313	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGCAGTGGCTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261899	265793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_262077_262727_262956_263575_263675_263925_264064_264768_264808_264892_264942_265767
879773	contig_10973_pilon	+	3767	1	Intergenic	novelGene_150321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTCAAGAAAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_0_3800
879774	contig_7286_pilon	-	2505	7	Intergenic	novelGene_108669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_6	4852.60231445172	50	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	216	953	292049	286948	FALSE	30	CCCAGACAAGGGCCCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292861	285395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_292697
879775	contig_4232_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_63298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCCGCTGCGGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
879776	scaffold_13505_pilon	-	711	7	Intergenic	novelGene_111472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	5392.02458626525	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	235	672	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548318	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_547990_548146_548239
879777	contig_16999_pilon	+	4946	1	Intergenic	novelGene_84953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCCTCCCTGCTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31565	36511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_31600_36500
879778	contig_14341_pilon	+	720	6	Intergenic	novelGene_111847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	12735	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	73	687	548758	551737	FALSE	5	CCTTGGGGTGGCCCCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547743	551770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
879779	contig_19769_pilon	+	932	6	Intergenic	novelGene_102250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3227	junction_1	241.073432795901	111	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	126	899	87249	89322	FALSE	15	ACTTAGCTGTGTACTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86904	89355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87020_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
879780	SIRV2	-	727	6	ISM	SIRV2A	SIRV202	1971	11	8	2220	4	388	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTGCAAGAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5903	3255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_3326_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
879781	SIRV2	+	1361	10	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-2256	1449	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52450	3	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACTACCTGGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1777	5906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV2_+_1853_1972_2062_2671_2802_2877_3010_3101_3374_3664_3828_3966_4095_4338_4479_4686_4800_5787
879782	SIRV5	+	1118	6	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	5839	11	-1354	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTAGTATAGGTTTACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6847	10980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879783	contig_8452_pilon	-	2381	5	Intergenic	novelGene_47999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2603	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	683	1093	263166	262756	TRUE	35	GTTCACCACACTACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNMFDRDILDIEAYVVHRQSFAQNLMVHFNRFYFSGDVAWSKVDHHALFENTNLHSAHRDSTNITNFVDILEKQMQRLVSWTSRWQNAIQSFVVPLASPSLQVTFHPLNQSMLALGSSMLSSFQPEIGTSSVSGL	271943	254767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_254894_255032_255184_260985_261404_262162_263412_271506
879784	contig_11978_pilon	-	806	5	Intergenic	novelGene_63016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	5583.83927060943	93	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596998	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1596020_1596304_1596389_1596738
879785	contig_11978_pilon	-	588	5	Intergenic	novelGene_63010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	3737.87934529728	13221	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	27	449	1596982	1591984	FALSE	5	CTTGCCTTCCGGTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1597008	1591844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1596020_1596304_1596389_1596969
879786	scaffold_13505_pilon	-	667	7	Intergenic	novelGene_111479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6062.50004581901	2308	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	34	648	547805	540211	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGHSRRGTVARPDLHSPAPQALTPPQRQVGILQESQQSGALPCPLWLTTLRSKKGPQTDTSGTERSGQNRRTGGSCQQETLEQMMLG	548328	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541609_541767_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
879787	contig_13244_pilon	-	5376	7	Intergenic	novelGene_86951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	1939.64416123737	40134	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	4372	5226	292294	283082	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEESYRAILRYLTNEREPYAPGTEGNVKRKIRKAAACYVVRHGTLYYQRRQRHRKTFAELEVVLQPERRRGLIEAAHLGPGGTHHTRHQTWHDLSKTYWWRGILKQVKDYIKQCSKCQEKLDRSRPISDASEMLEELGLDLESGEESNESEDDLSNFTSPPTTASKPVRKKPVSKHELVFVDTKGVVKRSSPKHCQAVLKQLNQQRLSNQFCDVTLLIEGEEYKAHKSVLSANSEYFRDLFLEKGAVSSHETVVDLSGKNFLIFLLFVFKSILEEGCVYVYV	299386	282931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_283391_284063_284300_291984_296172_296855_296920_297254_297392_298566_298678_299204
879788	contig_6102_pilon	+	3646	4	Intergenic	novelGene_31759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3497	junction_1	3056.94862385499	1904	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	245	592	296199	298454	FALSE	35	TATTAAGTGGAGGAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCARCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEASVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIHSKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPRPPPKPM	295954	301508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296202_296425_296604_297810_297942_298418
879789	contig_17075_pilon	-	468	5	Intergenic	novelGene_131750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_4	2140.30329334419	54925	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	71	418	91005	88043	FALSE	20	CACTATCTGTTTTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQTLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIELGTACGKYYRVCTLAIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK	91174	87992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_90723_90984_91038_91136
879790	contig_6599_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_175989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGGGGGTGGGCGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262717	262114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
879791	SIRV6	+	446	3	ISM	SIRV6A	SIRV607	574	4	29	543	22	47	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATGGCTATTGTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1159	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845
879792	contig_16103_pilon	+	457	3	Intergenic	novelGene_118703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGGGCCGGCCTGATAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198304	199903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198548_199035_199195_199848
879793	contig_10953_pilon	+	524	5	Intergenic	novelGene_42565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	27	482	422508	426254	FALSE	15	CGTACTCTGTTTCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	420007	426296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879794	contig_14666_pilon	-	382	3	Intergenic	novelGene_39656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTGCTGTTGGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492438	488762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
879795	contig_9468_pilon	+	571	1	Intergenic	novelGene_59488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49546	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	46	504	319740	320198	NA	20	TAATATTGTGTTTTCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSSTGGLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRWKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319694	320265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319700_320300
879796	contig_10953_pilon	+	614	5	Intergenic	novelGene_42564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2633.72050291978	23	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	113	568	422508	426254	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	420003	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420054_422445_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879797	contig_17440_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_7575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2975	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAGCTTAAATTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537	2470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1500_2500
879798	contig_9424_pilon	-	487	4	Intergenic	novelGene_143783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1715	junction_3	1522.66695855222	48464	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	110	445	279584	277512	FALSE	10	TGGTCTGAGTGTAGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280144	277469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552_279629_280079
879799	contig_10953_pilon	+	511	5	Intergenic	novelGene_42552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2633.72050291978	42	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	10	465	422508	426254	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFHMAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419995	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420003_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
879800	contig_2332_pilon	+	766	8	Intergenic	novelGene_58662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	2796.64659978368	41323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	102	680	331257	334269	TRUE	10	TTATTCATTTGCGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330769	334832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330870_331255_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
879801	contig_11978_pilon	-	720	5	Intergenic	novelGene_63011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5584.81299485489	35	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	338	583	1595939	1591984	FALSE	5	TGCTTGCCTTCCGGTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYFLSVLFRRARCRSEVRFRLCRIVCHLWHGAGECKQKSERVLTVDLSPVSLPFLLTGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1597018	1591846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1596020_1596304_1596467_1596923
879802	contig_11978_pilon	-	589	5	Intergenic	novelGene_63018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	3737.87934529728	51355	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	31	453	1596982	1591984	FALSE	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1597012	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1596020_1596304_1596389_1596969
879803	contig_5815_pilon	+	413	5	Intergenic	novelGene_141223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16663.8406643697	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	8	385	1041346	1046025	FALSE	10	CTGCCTTCGTGCGATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPMAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1040933	1046053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040941_1041345_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
879804	contig_6546_pilon	+	488	4	Intergenic	novelGene_140984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	106	450	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597597	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
879805	contig_12677_pilon	-	3815	2	Intergenic	novelGene_110735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2593_2633
879806	contig_12677_pilon	-	2894	2	Intergenic	novelGene_110747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3070	11	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_1175_1339
879807	contig_18208_pilon	-	955	3	Intergenic	novelGene_176178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3047	junction_2	856	29	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGTGTCTTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155992	154372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353
879808	contig_6477_pilon	-	836	7	Intergenic	novelGene_154165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	2937.24676449827	56073	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	85	582	773121	769365	FALSE	20	CTAGTAAGCTTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773205	769110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
879809	contig_11978_pilon	+	953	6	Intergenic	novelGene_63053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_5	2755.83806490875	43962	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	280	870	1827946	1831883	FALSE	20	CTGCCTCTCAGCTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827666	1831966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
879810	contig_11719_pilon	+	548	5	Intergenic	novelGene_154744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3152	junction_4	1718.95322434905	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4	501	13921	20039	FALSE	20	TAATTGAGTGTCCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13917	20086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
879811	SIRV1	-	1504	5	NIC	SIRV1A	novel	973	3	NA	NA	74	0	combination_of_known_junctions	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11569	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_7552_7809_10553_10792_10882_11243_11403
879812	contig_16103_pilon	-	476	3	Intergenic	novelGene_118706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	96	368	199173	198413	FALSE	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQAGPAETRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199922	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
879813	contig_6589_pilon	+	593	5	Intergenic	novelGene_26161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6307.46157340653	33462	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	230	469	1886667	1887829	FALSE	20	GACCAGACTCATGGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885104	1887953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885112_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
879814	scaffold_12510_pilon	-	713	5	Intergenic	novelGene_151348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	917.70076141409	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	274	606	148136	145678	FALSE	45	TGCACATTTTAATAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI	149095	145570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_146287_146433_147758_147912_148125_148171_148856
879815	contig_6005_pilon	-	385	5	Intergenic	novelGene_158905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2553	junction_4	1883.1987415034	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369022	364535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862_366967_367290_367391_367472_367547_368999
879816	contig_6589_pilon	-	587	4	Intergenic	novelGene_26165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGATGAGAAAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887953	1885926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1886060_1886256_1886332_1886649_1886774_1887698
879817	contig_8697_pilon	-	975	3	Intergenic	novelGene_83201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	7372	junction_1	851.5	64	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	584	928	18626	16506	FALSE	25	CATCTGGTGTTTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRNLRDAEFFVYPLNLQTKGTSSFGKRRNKTHTLCRRCGSKAYHLQKSTCGKCGYPAKRKRKYNWSAKAKRRNTTGTGRMRHLKIVYRRFRHGFREGTTPKPKRAAVAASSSS	19209	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436
879818	contig_7457_pilon	+	477	5	Intergenic	novelGene_31288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAAATGGTACTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157850	161041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_157929_158042_158156_159096_159269_160683_160767_161010
879819	contig_1435_pilon	+	2434	2	Intergenic	novelGene_115491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	760	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	102	620	493807	494325	TRUE	30	GACGGTAATCAGCTGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISYDEMFSDIYKIREITDGLCLEVEGKLVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLKETSFTEEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDCREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	493705	530442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_495448_529750
879820	contig_16103_pilon	-	784	3	Intergenic	novelGene_118684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2699	52228	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18715	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17743_17879_18162_18413
879821	contig_17964_pilon	-	2271	8	Intergenic	novelGene_33864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8603	junction_7	2533.79669142364	54365	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	127	1107	163122	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRTAAIRQTCCCFNVRMATTALAIYHVIMSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	163248	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_163035
879822	contig_5317_pilon	-	2368	4	Intergenic	novelGene_76497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29485	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1833	2144	43257	35312	TRUE	15	GGAGGGAAGGCTCGGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTQVGVFKKANQIGLTCLLQSTNSCALETQICFEVLSNFSHQTLEGKFANQKFSGLLITSDFPECHSTRPVTMRFLHPSSRGRTLASGFCSQLLPGCFTTS	45089	33594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_33765_35257_35408_36682_36837_43195
879823	contig_8697_pilon	-	412	4	Intergenic	novelGene_83203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2801	junction_3	2649.05278668936	76409	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGGTGTTTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19255	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436_18573_19181
879824	contig_9468_pilon	+	528	1	Intergenic	novelGene_59492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	22	480	319740	320198	NA	85	AAAAAAATAAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRWKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319718	320246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319700_320200
879825	contig_6005_pilon	-	625	5	Intergenic	novelGene_158900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	2941.45961853975	164	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGGTTACTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368999	364479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862_366967_367290_367391_367472_367547_368792
879826	contig_9014_pilon	+	1610	6	Intergenic	novelGene_106786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2096.98654263684	56598	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	548	925	150693	152329	TRUE	30	CAAGTCTTTGTATAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150145	153642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425_152985_153520
879827	contig_3942_pilon	+	577	5	Intergenic	novelGene_128632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCCCCACCCTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176948	180074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
879828	contig_7020_pilon	-	553	5	Intergenic	novelGene_57054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32701	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGGGAGCAGGGGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81891	79455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_-_79547_79912_80016_80158_80226_81322_81446_81722
879830	contig_6477_pilon	-	898	7	Intergenic	novelGene_154167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	136	junction_6	4470.56832392582	15337	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGCTTGTTTTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773201	769322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_772806
879831	contig_12677_pilon	+	3856	1	Intergenic	novelGene_110736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9933	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	3865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_3900
879832	contig_6477_pilon	-	643	7	Intergenic	novelGene_154179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4513.0415741493	617	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	152	604	773071	769365	FALSE	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773222	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772469_773069
879833	contig_5217_pilon	-	1718	5	Intergenic	novelGene_135751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_4	1932.08928365125	520	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCGTATGCATCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	557019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858
879834	contig_14322_pilon	-	4157	5	Intergenic	novelGene_115671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6339	junction_1	1263.02402491006	137114	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	3710	4156	668581	668135	FALSE	15	CAGCCAGTCCTCCAGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGVGGVHAWKEARGPGTRCQRALSTLRTCWPEAPAPWKGCPCPFGEALSTSTGKGRYWRGGGVHTLGKPLIRPHTVHQPPLEEDIHAVVGTPAISPSTGKGRLLLDRPRPTFTLEQAWGLLLAGVSPTAAPGREPRSPRWLQPGTHS	674893	668133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672416_672787_672934_674670
879835	contig_14341_pilon	+	745	6	Intergenic	novelGene_111825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	21444	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	80	694	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547736	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
879836	contig_6599_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_175991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCGGAGGGGAGAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262223	262717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_262200_262700
879837	contig_11978_pilon	-	557	5	Intergenic	novelGene_63019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	46	junction_3	4861.25896116428	46	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTTGCCTTCCGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1597012	1591847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1595988_1596304_1596389_1596969
879838	contig_12677_pilon	+	1663	2	Intergenic	novelGene_110803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	544	junction_1	0	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2598_2638
879839	contig_6102_pilon	+	883	5	Intergenic	novelGene_31973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2756	junction_2	290.583464773892	138	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	253	735	413309	416047	FALSE	10	CTCTGCCCAGATTTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPLFSEQCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413056	416195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
879840	contig_12677_pilon	+	3529	2	Intergenic	novelGene_110760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	131	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_813_877
879841	SIRV6	+	217	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	26	-12	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAATCGGTAGTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2311	2528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2300_2500
879842	contig_5217_pilon	-	1521	7	Intergenic	novelGene_135752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3143.55534740876	386	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAGCATTTAAATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	557033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557343_557380_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858_560224_560368
879843	contig_16103_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_118685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2194	junction_2	1602	55049	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	195	464	18020	17614	FALSE	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCHIHLLGKQVACSNLSREPLSLNGPRPGWLGWPTCYKTELTLSPACPLSSLLRGDLVRQNLGTMLTDLENAMDSLITVYHKYSLVKGNAHALYKDDLKNLLQIEGPCYLKIKDADTWFKELDINSDNAINFQEFLILVIKMGVIAHHDIHKE	18723	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17743_17879_18042_18550
879844	contig_16103_pilon	+	473	3	Intergenic	novelGene_118705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10539	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGGGGCCCGTCCCGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198304	199919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198548_199035_199195_199848
879845	contig_15991_pilon	-	1132	7	Intergenic	novelGene_70907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	2811.83155019405	8158	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	179	1066	105108	100445	FALSE	20	AAAGGTTGTGTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105839	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_105694
879846	contig_17964_pilon	-	2179	8	Intergenic	novelGene_33874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_7	5090.69691311754	189	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	134	1024	144952	135358	FALSE	15	ACAAGCTTCTCTCTGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	165630	134202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_165500
879847	contig_11719_pilon	+	626	6	Intergenic	novelGene_154739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2665.74894541853	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	79	576	13921	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLGLGRSSRNSEFVRSPFSIGSPSGMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	12999	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13078_13920_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
879848	contig_12939_pilon	-	362	5	Intergenic	novelGene_166196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1000	junction_4	201.052232019443	15362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46753	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031_46116_46311_46379_46727
879849	contig_16525_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_133861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	41780	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	126	566	181436	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181561	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
879850	contig_4232_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_63306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1579	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGGTGCTGTCGGAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466800_468100
879851	contig_15327_pilon	-	3472	4	Intergenic	novelGene_70599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	76	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	94	504	901528	900904	FALSE	25	CACTCCAGGCACCCTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902121	897935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
879852	contig_9424_pilon	-	746	4	Intergenic	novelGene_143776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1715	junction_3	1522.66695855222	1958	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	110	445	279584	277512	FALSE	10	CACCTGTTCGTGTTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWTLVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA	280144	277210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_-_277641_278586_278762_279552_279629_280079
879853	SIRV1	+	1578	5	NNC	SIRV1B	novel	464	3	NA	NA	-9582	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70383	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTCGGCTAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	11643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_+_1485_7552_7808_10552_10792_10882_11243_11403
879854	SIRV6	+	1003	6	NIC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-231	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2792	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
879855	contig_2940_pilon	+	1904	4	Intergenic	novelGene_81929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGTGGGGCGCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716263	723519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_717834_720772_720956_722106_722206_723467
879856	contig_14341_pilon	+	1140	6	Intergenic	novelGene_111820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	26	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	492	1106	548758	551737	FALSE	5	CTTGGGGTGGCCCCGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547324	551771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
879857	contig_1150_pilon	-	547	2	Intergenic	novelGene_61388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	2927	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309903	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
879858	contig_11396_pilon	-	350	6	Intergenic	novelGene_71398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_5	558.748029079298	6771	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	47	298	1555280	1554317	FALSE	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSHVRRGVFRRGLDMQNDAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIQMNVAEVDKVTGRFNGQFKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKADGIVSKNF	1555551	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554413_1554470_1554871_1554944_1555079_1555144_1555230_1555294_1555518
879859	contig_7933_pilon	-	657	3	Intergenic	novelGene_164689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2381.5	13524	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	108	401	189534	185916	FALSE	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFSRKGPRTGAPGRGDPGPASQDLILQQAPTDLTKMPSQMEHAMETMMFTFHRFAGDKGYLTKEDLRVLMEKEFPGFLENQKDPLAVDKIMKDLDQCRDGKVGFQSFFSLIAGLTIACNDYFVAHMKQKGKK	198554	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_198468
879860	contig_17075_pilon	-	468	5	Intergenic	novelGene_131751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_4	2140.30329334419	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	71	418	91005	88043	FALSE	20	CACTATCTGTTTTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQTLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIELGTACGKYYRVCTLAIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK	91174	87992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_90723_90984_91038_91136
879861	contig_7457_pilon	-	705	4	Intergenic	novelGene_31278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7055	junction_3	1224.22301889811	19656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	248	658	160764	157884	FALSE	0	TGCCTGTGTCTCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161011	157836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683
879862	contig_14133_pilon	+	1327	5	Intergenic	novelGene_119948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3184	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	206562	207634	TRUE	10	ATGCCATTCCGGCTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KASLLLLKVPDRDLLFLLHILLCGLFGPLCADPEESGVGAGHAETGKCLEVLLVLRDEPGFLLLVDLSYGHHRSGQLSRQFEFLGLSPGVLILLEKEPVLWPNKGATPLHRTPS	206561	209093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_206762_207409_207464_207543_208400_208591_208731_209015
879863	contig_6005_pilon	-	727	4	Intergenic	novelGene_158903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5922	junction_2	756.585458197259	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	363	716	367537	364535	FALSE	55	AAAAAAAAATGAAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQRLTYRRRLSYNTASNKTRLSRTPGNRIVYLYTKKVGKAPKSACGVCPGRLRGVRAVRPKVLMRLSKTKKHVSRAYGGSMCAKCVRDRIKRAFLIEEQKIVVKVLKAQAQSQKAK	367899	364523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_364620_366862_366967_367290_367391_367472
879864	contig_10135_pilon	+	751	5	Intergenic	novelGene_106655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1047.8066376961	78	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	50	307	116715	119864	FALSE	35	ACCTGAAGTACAGCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116665	120308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801
879865	contig_8617_pilon	-	4072	2	Intergenic	novelGene_73374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179007	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTTTTGGCGAGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64137	60010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63257_63311
879866	contig_4364_pilon	+	1945	6	Intergenic	novelGene_644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	499	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879867	contig_7229_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_39807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3961	junction_1	46.5	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	123	737	877522	875654	FALSE	50	TTAAATTCACATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877644	874949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350
879868	contig_3270_pilon	+	541	6	Intergenic	novelGene_104433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1374	junction_1	4370.44833398131	9894	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	39	509	44259	46726	FALSE	20	CAGTTGTTGAGTTTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSAICGGAATKMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44121	46758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44241_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
879869	contig_6589_pilon	-	820	7	Intergenic	novelGene_25849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1199.9318962156	8853	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	367	819	957293	955182	FALSE	5	TGGCTCTTTGTGTGTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQKLTPDPTLLLKRFWMQ	959141	955180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_958019_959101
879870	contig_6494_pilon	-	836	7	Intergenic	novelGene_108566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	8885	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	29	760	8286	2635	TRUE	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8314	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
879871	contig_8317_pilon	-	2521	3	Intergenic	novelGene_19301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCAGTCTCCACCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18449	15751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_15968_16045_16281_16379
879872	contig_7286_pilon	-	1156	7	Intergenic	novelGene_108683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4087.57262932416	47046	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	492	1088	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293142	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291773_292022_292101_293119
879873	contig_5217_pilon	-	670	5	Intergenic	novelGene_135774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_4	1932.08928365125	107	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1	624	559966	557689	FALSE	15	TATATCTTGTGTTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	559966	557642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858
879874	contig_8914_pilon	+	1939	6	Intergenic	novelGene_112855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1247	1687	264665	267418	TRUE	25	CATCCTGCTGCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	263418	268941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264950_265588_265799_267319_267508_268075_268179_268881
879875	contig_6477_pilon	-	505	7	Intergenic	novelGene_154169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4486.29359828355	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	28	504	773121	769325	FALSE	10	AGTGGGCTTGTTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINIDN	773148	769323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769333_769575_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
879876	contig_7933_pilon	-	593	3	Intergenic	novelGene_164700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTGCATCCTCCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197964	185710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
879877	contig_3942_pilon	+	977	5	Intergenic	novelGene_128630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	29371	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTCTTGCCTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176947	180473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
879878	contig_15327_pilon	-	1203	4	Intergenic	novelGene_70653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	177	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	94	504	901528	900904	FALSE	25	GCATAAGTCCTCATTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902121	900204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
879879	contig_6477_pilon	-	543	6	Intergenic	novelGene_154181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4942.90839890848	1229	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	354	506	770052	769365	FALSE	15	AACCAGTGGGCTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEEAKVQLSSVVPHLGSSDTSRLRHASQVRPQRDQSRWSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773199	769327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_773080
879880	contig_9468_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_59491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	27	485	319740	320198	NA	70	CATCTTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRWKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	319713	320233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_319700_320200
879881	contig_11396_pilon	-	338	6	Intergenic	novelGene_71396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3341	junction_5	558.748029079298	8536	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTGTTAGTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1555539	1554264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1554327_1554413_1554470_1554871_1554944_1555079_1555144_1555230_1555294_1555518
879882	contig_14133_pilon	+	2024	3	Intergenic	novelGene_119932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCCATTCCGGCTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206559	209093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_208287_208511_208731_209015
879883	contig_4797_pilon	+	525	6	Intergenic	novelGene_6916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2294	junction_5	2641.58626586375	594	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	26	481	368372	371710	FALSE	10	GACTTTCGTATTTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCRTAAIMGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA	368346	371754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368844_369855_370026_370914_371016_371676
879884	contig_15937_pilon	-	855	5	Intergenic	novelGene_143136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	1987.19304233383	42157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGTTCTTAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30554	28044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601_28680_29194_29246_29914_29960_30205
879885	contig_17964_pilon	-	2325	9	Intergenic	novelGene_33852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6139.89571878057	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	313	1203	144952	135358	TRUE	0	TCTGGCTGGTGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	147723	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134943_134986_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_147414
879886	contig_20951_pilon	-	1786	6	Intergenic	novelGene_43054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	62079	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	29171	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	29998	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
879887	contig_9706_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_20759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAGCTTAAATTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146	1199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_100_1200
879888	contig_20819_pilon	-	1016	5	Intergenic	novelGene_55675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_2	634.564811504704	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	504	974	69739	65441	FALSE	5	CTTCTTTGTGGTTCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFNQSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK	70242	65398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048_66136_69625
879889	contig_3942_pilon	+	471	5	Intergenic	novelGene_128761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5794.82184260224	77	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	265	372	795165	795407	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLRGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792275	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792288_793547_793624_793794_793882_795075_795179_795313
879890	contig_14341_pilon	+	725	6	Intergenic	novelGene_111831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	4994	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	78	692	548758	551737	FALSE	5	CCTTGGGGTGGCCCCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547738	551770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
879891	contig_2332_pilon	+	1149	7	Intergenic	novelGene_58666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_4	1451.46799252802	5273	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	485	1063	331257	334269	TRUE	10	TTATTCATTTGCGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
879892	contig_6589_pilon	+	1398	4	Intergenic	novelGene_26162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8966	junction_1	3715.87576039171	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885115	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
879893	contig_1150_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_61426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	807	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGTGTGACTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309737	308929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309700
879894	contig_2892_pilon	-	3451	4	Intergenic	novelGene_119009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	3150	3449	318688	256720	FALSE	35	GGTAGCAGAGAACGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCCTYSSRNQRDSGFSLGSLSFIISGQRCSHIVRWGLWKPRLIFVVKICCTLCRDAAVRWRSITSSLFRFSQLLLILQRFLTIFPSGNRQVPGYLLRSL	322011	256717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_256782_305211_305296_318534_321338_321511
879895	contig_6557_pilon	+	872	4	Intergenic	novelGene_32984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5979.15094306876	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	159	656	434404	440040	FALSE	20	GGACTGGTGGGACAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAHFPSRSGAIGLGREAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434245	440256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434459_435132_435306_436630_436772_439911
879896	contig_7933_pilon	-	519	3	Intergenic	novelGene_164711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4810	junction_2	276	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	52	354	238534	233326	FALSE	35	ACATACTGGAGCGTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALCVPVTANSPLLRSNMANISSPTETERCIESLIAVFQRYAGQDGHGLTLSKKEFLNFMNTELGAFTKNQKDPGVLDRIMKKLDLNSDGQLDFPEFLNLIGGLAQACHESFINRVR	238585	233160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_233473_234430_234584_238531
879897	contig_9146_pilon	-	1154	6	Intergenic	novelGene_79484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1829.28123589567	496	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	309	815	146356	142549	FALSE	40	CAGTAAGGATAGATTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147510	142209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_147073_147422
879898	contig_6589_pilon	-	1487	10	Intergenic	novelGene_25876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1330.10640992681	11	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	925	1485	959104	955230	FALSE	30	ACTAACCCCAGATCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVDIRHNKDRKVRRKEPKSQDIYLRLLVKLYRFLARRTNSTFNQVVLKRLFMSRTNRPPLSLSRMIRKMKLPGRENKTAVVVGTITDDVRVQEVPKLKVCALRVSSRARSRILKAGGKILTFDQLALDSPQGLWHCPALWSTQGPRGVQAFRQGTGNPAQPHQTVRPLQGQEVRACQRPTGQPRLQ	970192	955227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957251_957360_957758_957846_959101_959516_961883_962042_968597_968715_969954
879899	contig_6361_pilon	-	712	5	Intergenic	novelGene_23999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	2844	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	89	427	420979	415399	TRUE	10	GACTGTGCTTCTTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436353	410934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
879900	contig_15937_pilon	-	535	5	Intergenic	novelGene_143132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3847	junction_1	511.446661441836	736	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGTGTATTTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30551	28033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601_28680_29194_29246_29914_29960_30533
879901	contig_2332_pilon	+	633	7	Intergenic	novelGene_58669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2508.69027360671	21	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	199	540	332129	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330780_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
879902	contig_17964_pilon	-	2181	8	Intergenic	novelGene_33863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8603	junction_7	2533.79669142364	39200	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	37	1017	163122	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPQCLRGGDSGAMALRTAAIRQTCCCFNVRMATTALAIYHVIMSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	163158	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_163035
879903	contig_14666_pilon	-	377	3	Intergenic	novelGene_39658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492434	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
879904	contig_6807_pilon	+	440	2	Intergenic	novelGene_84582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTGATTCATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603052	609198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_603278_608983
879905	contig_15327_pilon	-	2836	4	Intergenic	novelGene_70608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	277	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	77	487	901528	900904	FALSE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902104	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
879906	contig_15991_pilon	-	989	6	Intergenic	novelGene_70882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	33	920	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105140	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
879907	contig_10930_pilon	+	508	6	Intergenic	novelGene_37085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_5	5111.4698316629	84995	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	84	482	339608	342083	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339416	342109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
879908	SIRV3	+	3114	7	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	3	999	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130231	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACTTAATTTTTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947	9938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4568_4780_6057_7989_8127_8208_8755_8976_9189_9297_9431
879909	scaffold_12510_pilon	+	420	4	Intergenic	novelGene_151350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45212	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACAAAAAAGACTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145628	148172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_145705_146288_146433_147758_147911_148124
879910	contig_2332_pilon	+	931	7	Intergenic	novelGene_58663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_5	1567.46785364875	108	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	25	501	331257	333932	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSG	330769	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_334280_334756
879911	contig_12677_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_110768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGTCATAGTGTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	1447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_1400_3800
879912	SIRV6	+	1510	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879913	contig_15991_pilon	-	1016	7	Intergenic	novelGene_70887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_6	2325.96766004077	31	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	60	947	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106341	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
879914	contig_9389_pilon	+	2667	4	Intergenic	novelGene_84031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	314	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	19	456	584401	586236	FALSE	15	CACACCCATTCCTTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584382	588447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
879915	contig_14666_pilon	-	388	3	Intergenic	novelGene_39666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTCCTGCTGTTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492447	488765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
879916	contig_9014_pilon	+	2498	6	Intergenic	novelGene_106788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2096.98654263684	56942	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	548	925	150693	152329	TRUE	25	TCACAGAGCATATGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150145	154317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425_152521_152843
879917	contig_12677_pilon	+	1420	2	Intergenic	novelGene_110794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGGGGGAAATGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2556_2631
879918	contig_15991_pilon	-	1406	6	Intergenic	novelGene_70911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	454	1341	105108	100445	FALSE	20	TAAAGGTTGTGTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105561	100379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
879919	contig_14133_pilon	-	946	5	Intergenic	novelGene_119933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_3	430.166828102772	2540	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	270	905	209116	206601	FALSE	25	CTCAAGTAGTATCATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209385	206559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208728_209012
879920	contig_12677_pilon	-	3765	1	Intergenic	novelGene_110677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117558	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_3800
879921	contig_12677_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_110804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3900
879922	contig_7286_pilon	-	1135	7	Intergenic	novelGene_108691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3438.67186893752	215	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	276	1067	293122	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293397	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
879923	contig_5954_pilon	+	736	4	Intergenic	novelGene_28426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	532	junction_1	1917.19013141629	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	327	728	97851	98983	FALSE	30	TAATCCTAACTCGCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97524	98991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97926_98017_98163_98637_98694_98857
879924	contig_7286_pilon	-	876	7	Intergenic	novelGene_108679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3438.67186893752	9	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	17	808	293122	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGAAMARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293138	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
879925	contig_6102_pilon	+	1644	6	Intergenic	novelGene_31948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1527.42921276241	102	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	334	684	414294	416047	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	411148	417007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_411296_411526_411639_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
879926	contig_12677_pilon	-	3651	2	Intergenic	novelGene_110734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3809	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2684_2832
879927	contig_17075_pilon	-	356	3	Intergenic	novelGene_131756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5743	junction_1	286.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	41	325	90680	88043	FALSE	45	CTAGAAGTTGTTTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQTLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIELGTACGKYYRVCTLAIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK	90720	88011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576
879928	contig_7707_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_72200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1779	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	28	426	676468	676866	NA	80	AAAAAAAAAAAACCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSALVVALEMGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAIVVKNIDDGPYSHALVAGIDRYPRKVTAVMGKKKIAKRSKIKTFVKVYNYNHLMPTRYSVDIALDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	676440	676901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_676400_676900
879929	contig_11136_pilon	+	624	4	Intergenic	novelGene_169015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	681	junction_1	1248.85734440194	19749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	39	518	126603	128257	FALSE	5	GCTGCTGTCAGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAPGAAGDGADMAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKSKAKAQSKAEAPAKASTQVLAPGQAPKGTQAPTKASE	126146	128363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_126177_126594_126640_126975_127041_127879
879930	contig_4812_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_103626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61339	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGAACGCACGGCCGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77892	82830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_79240_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
879931	contig_15327_pilon	-	2884	4	Intergenic	novelGene_70611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	68620	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	125	535	901528	900904	FALSE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902152	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
879932	SIRV6	+	1298	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	0	-135	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12566	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2472	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
879933	contig_15327_pilon	-	2889	4	Intergenic	novelGene_70616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	2393	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	20	GACTCTTGATCTTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
879934	contig_7020_pilon	+	373	4	Intergenic	novelGene_57060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9569	junction_3	1249.00636062787	33378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	242	319	81391	81745	FALSE	15	ATTCGGTCGCATTTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF	79909	81799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_80017_80159_80228_81324_81448_81724
879935	contig_8317_pilon	-	1449	4	Intergenic	novelGene_19300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2330	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCGTGGTTCCACTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17249	15529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_15618_15711_15968_16045_16281_16379
879936	contig_15991_pilon	-	1031	7	Intergenic	novelGene_70893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	75	962	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQVSVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102267_103579_103703_104975_105142_106315
879937	contig_12677_pilon	-	3659	2	Intergenic	novelGene_110731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11500	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3439_3536
879938	contig_6102_pilon	+	1768	13	Intergenic	novelGene_31946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1422.53950345461	13762	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	209	856	409986	412472	TRUE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKKDVPMKKPAGPSPSKPAAKPAAAAQPAAADPPAKAKDEPVATATVVPEKPEEPPIDLSKVVIEFNKDQLEEFKEAFELYDRVGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDELKSRRVDFETFLPMLQAVAKIPNRGTYQDYLEGLRVFDKEANGKVMGAELRHALTTLGEKMTEEEVESVLAGHEDVNGCINYEAFLKHILSV	408542	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_408705_409939_410181_410902_410931_411151_411296_411526_411701_412205_412284_412443_412509_412618_412885_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
879939	contig_17440_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_7530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTAAAGGGAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358	2178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_400_2200
879940	contig_5549_pilon	+	3161	5	Intergenic	novelGene_81572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	20074	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	64	738	82155	96749	FALSE	30	ACTCCCCAACTTACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAGWLLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82091	99172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
879941	contig_10135_pilon	+	739	5	Intergenic	novelGene_106657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1047.8066376961	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGAAGTACAGCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116677	120308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801
879942	contig_17440_pilon	+	3584	1	Intergenic	novelGene_7533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114775	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_400_4000
879943	contig_13366_pilon	+	7597	5	Intergenic	novelGene_99756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75442	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4358	4699	27155	29865	TRUE	20	TCTGGGATGTCCATCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETTTCPSPAEGGLETGRDVLSSSANGLGAPGCCSSSGSWNTSLPRDSLSRTPGRTAEALLAGLAWFDPVGVFRSVKLDTLSLGKVTLSSNKLCFFRTAASFITFRVSSRRV	22797	42740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_27468_29836_29948_35678_35790_38160_38270_40144
879944	contig_2332_pilon	+	567	7	Intergenic	novelGene_58670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2508.69027360671	31	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	133	474	332129	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAVNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330780_331443_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
879945	contig_6494_pilon	-	1554	7	Intergenic	novelGene_108539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	39	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	27	758	8286	2635	TRUE	15	TTGGCTAGGCCATGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	1384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
879946	contig_10436_pilon	-	910	4	Intergenic	novelGene_108497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	22536	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	124	477	103480	102032	FALSE	15	GCTGAACTGATTTTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GASPGDRSAESSLKLSPSPPPPVPAPPGSLSPTRSSPVPGRMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103603	101598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
879947	contig_12677_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_110805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78061	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3900
879948	contig_10867_pilon	-	3180	6	Intergenic	novelGene_159437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	2596.13247735935	74	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1872	2354	88670	86811	TRUE	15	GTGGTAGTAGCATTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	90541	83664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_84488_86807_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603
879949	contig_12677_pilon	-	3389	1	Intergenic	novelGene_110758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCACGCCAAAATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3517	128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_100_3500
879950	contig_7933_pilon	-	617	3	Intergenic	novelGene_164682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	20227	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197937	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
879951	contig_10235_pilon	+	612	4	Intergenic	novelGene_46312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1686	junction_1	634.542880085079	29948	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACTTTGGGGTCAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89878	91964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90857_91627
879952	contig_5671_pilon	-	1717	7	Intergenic	novelGene_79446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1060	1644	531410	370440	TRUE	0	CCCTCTCTCCGGCCCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGGQVQILQSLLMEDFKKHYKNFEKIVMTGYIGTEHLYRMEHLSADLRKLGAKILLRLRVHSLDSLPQKAFHKPHCQDPQAYLEEFLPVRLLLHSCPSDPSCQSQWRPQWCLLLLLSFVLLLSHLSPPPLQHLSPVLWSSQPLLSHHEPRLPWFWNLHREHPLLSFLLLLPRPVWFFQQQPRLPPWPLKVLS	534265	368861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_-_368898_370402_370548_376735_376778_392772_392917_521216_521301_531203_532100_533895
879953	contig_1443_pilon	+	1163	2	Intergenic	novelGene_28185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	27015	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	344128	344592	FALSE	35	TCACATACCGATTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	345194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
879954	contig_2069_pilon	+	675	3	Intergenic	novelGene_23537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAGACGACGCCGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508413	1509862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
879955	contig_2940_pilon	-	1899	4	Intergenic	novelGene_81928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4233	junction_3	6336.9463203239	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	51	458	722201	717705	FALSE	35	TGAGAAATGCTTAGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCLQRWRPSPIGTMAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE	723513	716263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720954_722105_722207_723468
879956	contig_5815_pilon	+	393	5	Intergenic	novelGene_141224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	14408.2615602126	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	24	371	1041346	1046032	FALSE	10	TGCCTTCGTGCGATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDKTSPTESASGCPENVTRTKTHQTSSIHWLPMSLSPLSKIYRQSTWMRISS	1040933	1046054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1040957_1041345_1041453_1044121_1044211_1045493_1045607_1045993
879957	contig_14666_pilon	-	371	3	Intergenic	novelGene_39667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTCCTGCTGTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492431	488766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
879958	SIRV7	-	2143	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	13	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	27	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTAATTAGTGTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147944	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2340_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
879959	contig_7202_pilon	-	1048	3	Intergenic	novelGene_17532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	96	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29927	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
879960	contig_10861_pilon	-	608	6	Intergenic	novelGene_39362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1362.63823518937	24014	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	23	559	1585418	1581171	FALSE	10	CATTACTGTTGTGTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1585440	1581121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584525_1584677_1585412
879961	contig_11422_pilon	-	2265	2	Intergenic	novelGene_99008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2350	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1161_1245
879962	contig_2332_pilon	+	1231	6	Intergenic	novelGene_58671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_3	627.65710383935	36115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	485	1138	331257	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENGMNLMFAFYLYYSLFYDLTNTFSILVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
879963	contig_11328_pilon	+	7619	16	Intergenic	novelGene_88420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2178.88537865885	133	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	348	1148	644019	647995	TRUE	70	TAAAAAAGAATAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGGEPFAPGVFSWSLTSELNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643671	674831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644076_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899_651870_652065_652130_653947_654103_657584_657701_660518_660764_662726_662927_663695_663879_669336_669511_670046_670157_670832_671012_673660
879964	contig_11677_pilon	-	510	5	Intergenic	novelGene_85919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_4	14365.8301970335	135	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	253	465	595842	594927	FALSE	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598046	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_598027
879965	contig_1146_pilon	-	1447	5	Intergenic	novelGene_84850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAATAGTGAGCGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958152	949776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_949802_950972_951112_951650_951732_956015_956103_957037
879966	contig_8697_pilon	-	430	4	Intergenic	novelGene_83202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3938.44608387059	78	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	39	383	18626	16506	FALSE	25	CATCTGGTGTTTTAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRNLRDAEFFVYPLNLQTKGTSSFGKRRNKTHTLCRRCGSKAYHLQKSTCGKCGYPAKRKRKYNWSAKAKRRNTTGTGRMRHLKIVYRRFRHGFREGTTPKPKRAAVAASSSS	19209	16458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16576_18131_18217_18436_18637_19181
879967	contig_11978_pilon	+	562	5	Intergenic	novelGene_63026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	592	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGGAAAAGGACAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591852	1596991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592061_1592184_1592304_1595890_1596019_1596303_1596391_1596971
879968	contig_11978_pilon	+	1781	6	Intergenic	novelGene_63054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_5	2755.83806490875	248	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	280	870	1827946	1831883	FALSE	20	AGTACTCTTAGCCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827666	1832794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
879969	contig_7870_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_109077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99002	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTACAGCCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755981	753953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_754000_756000
879970	contig_13366_pilon	+	3115	2	Intergenic	novelGene_99767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74273	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGATGTCCATCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39406	42740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_39740_39958
879971	SIRV6	-	1507	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9291	419	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1689	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGGCGGCGCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11838	1125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2471_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
879972	contig_5217_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_135775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_4	1932.08928365125	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1	579	559921	557689	FALSE	15	TCTATATCTTGTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	559921	557644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858
879973	SIRV5	+	923	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6232	0	-961	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7240	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879974	contig_4305_pilon	-	640	3	Intergenic	novelGene_136679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	814.5	25294	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514709	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514516
879975	contig_7870_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_109078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATAAAATTATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756039	753989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_754000_756000
879976	contig_15720_pilon	+	1105	8	Intergenic	novelGene_41902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22578	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	20	GATCGAGCAGCCCACCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	283997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281929_282569_282750_283785
879977	contig_14744_pilon	+	1804	6	Intergenic	novelGene_66068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	37450	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	900	1763	1382976	1386652	FALSE	0	CTTGTGTCCTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFALTNGVYPHKLVF	1382076	1386693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
879978	contig_14133_pilon	-	1158	5	Intergenic	novelGene_119928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_3	430.166828102772	22	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	336	971	209116	206601	FALSE	40	AGGTCATTAAGCAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209451	206413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208728_209012
879979	scaffold_13505_pilon	-	392	4	Intergenic	novelGene_111465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	1642.33620864372	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	138	353	541982	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	547450	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363
879981	contig_14133_pilon	-	1169	5	Intergenic	novelGene_119929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_3	448.421955305491	19	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTCATTAAGCAGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209468	206413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_209131_209421
879982	contig_12677_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_110797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3800
879983	scaffold_6394_pilon	+	408	5	Intergenic	novelGene_111050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10205	junction_4	2532.80865591935	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	237	392	444288	444551	FALSE	30	GATAAAGCCTTTTTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGRTREVCPPPPRCATLPPTCWPPSGAIPPPSAKDIKKILDSVGIEADDDRLNKVISELNGKNIEDVIAQGIGKLASMPAGGAVAVAAAPGSAAPAASSAPAAAEEKKEEKKEESEESDDDMGFGLFD	442108	444567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442494_443338_443388_444267_444367_444474
879984	contig_5317_pilon	+	972	4	Intergenic	novelGene_76519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	91	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	102	512	35282	43326	FALSE	0	TGTTGTCTGTCTTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33687	43786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
879985	contig_17440_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_7562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTATCAAACCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420	2142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2100
879986	contig_11328_pilon	+	1336	6	Intergenic	novelGene_88409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	897	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	37	786	643683	647995	FALSE	35	GAAAGCTGCTCAACTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGAAEAIGCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643646	648545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
879987	contig_7229_pilon	-	2156	5	Intergenic	novelGene_39796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2004.01975726289	1809	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	84	698	877522	875654	TRUE	25	GCAAATGGACCTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878195	874013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_874710_874891_875960_876729_876867_877350_877535_878124
879988	contig_4364_pilon	+	1953	6	Intergenic	novelGene_559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	776	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
879989	SIRV5	+	873	5	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6279	3	-914	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7287	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
879990	contig_3942_pilon	+	762	4	Intergenic	novelGene_128650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	458.534137830059	53	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	306	617	179125	179974	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHVSVQVPWGLEEGGDGSFREADGGSHTSVALEEVQRPLAGYSPRLLLLFP	176958	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714
879991	contig_9014_pilon	+	2062	6	Intergenic	novelGene_106787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2096.98654263684	57232	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	548	925	150693	152329	TRUE	30	CAAGTCTTTGTATAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150145	153642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425_152662_152745
879992	contig_12677_pilon	+	3310	3	Intergenic	novelGene_110732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1709	147	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_423_535_2565_2898
879993	contig_6557_pilon	+	494	4	Intergenic	novelGene_32977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5979.15094306876	26	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	16	453	435138	440040	FALSE	15	AAGCGCCTTTTTGTTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPSKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434242	440081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434253_435132_435306_436630_436772_439911
879994	contig_7933_pilon	-	998	3	Intergenic	novelGene_164692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	281	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTAAGAGAGAACGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197978	185660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189160_189556_197792
879995	contig_4812_pilon	-	1227	6	Intergenic	novelGene_103641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	60041	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	178	696	82626	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82803	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
879996	SIRV6	+	1466	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	10	52	10	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	341	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	248	739	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1097	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
879997	contig_5643_pilon	+	1310	12	Intergenic	novelGene_38773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	29689	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	97	1098	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233578	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
879998	contig_11136_pilon	-	631	4	Intergenic	novelGene_169013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8667	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAGAAAAAGCCGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128363	126139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_-_126176_126593_126638_126973_127040_127878
879999	contig_9014_pilon	+	1647	5	Intergenic	novelGene_106805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1335.6856853317	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	49	426	150693	152329	TRUE	30	CAAGTCTTTGTATAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150644	153642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425
880000	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880001	contig_18869_pilon	-	2415	3	Intergenic	novelGene_55988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_2	1547	948	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	33	392	79419	74943	FALSE	35	GTAGTGTAGGTACATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79451	72919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74957_75486_75766_79352
880002	contig_8697_pilon	-	256	4	Intergenic	novelGene_83208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3794.21053126412	81	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACATCTGGTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19209	16463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_16471_18131_18217_18436_18573_19181
880003	contig_9014_pilon	+	1791	6	Intergenic	novelGene_106790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2096.65781662149	57312	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	190	567	150693	152329	TRUE	20	GTCTTTGTATAGTCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150149	153645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150182_150535_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425
880004	contig_2377_pilon	-	2091	3	Intergenic	novelGene_67882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_2	281.5	18930	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	35	355	192930	191056	FALSE	40	GCAAGATACAGATATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVERGAAVAAMAVTALAARVRLYSLGARAMQAQGFSSDQSEDLDRRAGSIREAGGAFAKREAAEEERYFRAQAKEQLAALKKYHEEEIVHSKKEIERLQKEIERHKQKIKKLKHDD	192964	189319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_191198_192656_192749_192843
880005	contig_6589_pilon	+	668	4	Intergenic	novelGene_26121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3240.43467591755	65	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGATTGGTGTCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1876595	1881101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876603_1880150_1880274_1880498_1880567_1880631
880006	contig_15937_pilon	-	503	4	Intergenic	novelGene_143138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3847	junction_1	495.386717625735	634	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTGGTTCTTAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29958	28046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601_28680_29194_29246_29914
880007	contig_8317_pilon	+	1240	3	Intergenic	novelGene_19303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	904	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	111	497	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15832	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
880008	contig_4232_pilon	-	1829	2	Intergenic	novelGene_63266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	999	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGAAAGTCAGAGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468111	463386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_464599_467494
880009	SIRV6	+	1273	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	77	350	58	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	30	TTTGGTCGCAAAAATTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880010	contig_6361_pilon	-	7514	5	Intergenic	novelGene_24004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4808.59152975172	414	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1115	1495	426756	426376	TRUE	15	AGACTGTGCTTCTTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKWPGGILSFQLNGISDVFPGGDIPPFASKTSRPTKHKVTGTGRKNFASGSLVVRVSGVTPISTPRILYPSILARRDAAPYIGHTHAASWRTLPQSCKVLPPSWCRNCVFRRSFHHSIKPAASG	427934	410935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_427420_427483
880011	contig_7286_pilon	+	811	6	Intergenic	novelGene_108716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGAGAGTTTTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286930	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290857_291315_291499_292022
880012	contig_9706_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_20774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGTAAAAGGAACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164	928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_900
880013	contig_16103_pilon	-	454	3	Intergenic	novelGene_118701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	25344	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	74	346	199173	198413	FALSE	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199900	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
880014	contig_1443_pilon	+	828	2	Intergenic	novelGene_28195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	58	522	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343691	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
880015	contig_15327_pilon	-	2728	5	Intergenic	novelGene_70628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	950	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	TRUE	25	AAGTTAGACTCTTGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899879_900033_901033_901126_901281_901400_901536_902035
880016	contig_16103_pilon	-	366	2	Intergenic	novelGene_118695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	129	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199158	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
880017	contig_1150_pilon	-	599	3	Intergenic	novelGene_61396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	234	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311031	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
880018	contig_4232_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_63411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAGAAAAAATTAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468111	467418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467400_468100
880019	SIRV3	-	440	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	39	0	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTATTTGTATGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1943	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
880020	contig_10973_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_150325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACATGAATTGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	27	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
880021	contig_5445_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_135406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1341.9220046883	79	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	513	851	52520	53758	FALSE	65	AAGAGGAAAAAGAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCFLPVIPLPVLFLSNTELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51576	53933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51860_52290_52635_53127_53240_53646
880022	contig_17440_pilon	+	3347	2	Intergenic	novelGene_7535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73899	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_713_887
880023	contig_10867_pilon	-	3572	6	Intergenic	novelGene_159441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2597.46587273057	1236	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1750	2232	88670	86811	TRUE	10	GTCTTCAGTTTTCTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	90419	85419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86102_86152_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603
880024	contig_16882_pilon	-	1482	7	Intergenic	novelGene_148198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_6	1371.25170920586	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	36	620	189133	181967	FALSE	25	GTGAAATCTGTGAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPTPALSKEKAMFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	189490	181104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187625_188683_188756_189058_189143_189464
880025	contig_17440_pilon	+	3315	1	Intergenic	novelGene_7544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_700_4000
880026	contig_5018_pilon	+	981	6	Intergenic	novelGene_47135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	236.389509073478	17858	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	131	727	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497617	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497739_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
880027	contig_9014_pilon	+	1669	6	Intergenic	novelGene_106792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2096.98654263684	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	61	438	150693	152329	TRUE	30	CTAGTAGATATATATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150632	156233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425_152438_155018
880028	contig_13244_pilon	-	1189	6	Intergenic	novelGene_86959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3014	junction_2	885.448044777332	40451	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	40	513	299402	296091	FALSE	20	ACTGCTAGAGTAGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRHLPCSLSVGTMKVELCSFSGYKIYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQKPEVRKAQREQAIRAAKEAKKAKQASKKTAMAAAKAPTKAAPKQKIAKPVKVSAPRVGGKR	299441	295414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296172_296855_296920_297254_297392_298566_298678_299204_299281_299397
880029	contig_7720_pilon	+	2515	5	Intergenic	novelGene_155764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3049.43424056004	818	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTGTGCAAGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699781	709416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_699803_701856_702333_705016_705142_707279_707997_708240
880030	contig_10973_pilon	-	2971	1	Intergenic	novelGene_150318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	242	754	2730	2218	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2971	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_3000
880031	contig_9243_pilon	+	5053	3	Intergenic	novelGene_60304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	472	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1721	2371	2400	3050	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQRQQTITKHLQKQDRIIPGGIQNKTPDDSPVEENALKLPDREIKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEWLRSRSETVEDRISGIEDKHLDTNLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRMIGIPVQRERTENTERITEELLKENFLNIMKDEKLVIQETQ	541	41535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_1487_1624_3505_39307
880032	contig_10930_pilon	+	441	5	Intergenic	novelGene_37086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9080.6825734633	108	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	55	420	339823	342083	FALSE	5	TGGTGCTTTTTGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFPCRRRVVRRRIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339417	342104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339453_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
880033	SIRV5	+	2081	15	NIC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	1	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1161	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
880034	contig_10867_pilon	+	3242	6	Intergenic	novelGene_159439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1262	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGAAATACACATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85281	90308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_86901_87085_87236_87725_87842_88195_88255_88602_88683_89090
880035	SIRV6	+	507	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	24	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95609	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2309	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
880036	SIRV3	+	2339	3	FSM	SIRV3A	SIRV306	2373	3	3	31	3	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3191	39	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACGTAACCATCGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947	8261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_2006_4003_4081_6057
880037	contig_12677_pilon	+	3327	3	Intergenic	novelGene_110733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1709	250	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_423_535_2347_2663
880038	contig_19459_pilon	-	1220	8	Intergenic	novelGene_59884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	137	922	16240	7003	FALSE	35	TTAAGTTTAGTGGAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19100	6704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
880039	contig_17075_pilon	-	718	4	Intergenic	novelGene_131749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_3	2470.6523205196	52772	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTATCTGTTTTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91162	87992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_91038_91136
880040	contig_15327_pilon	-	2882	4	Intergenic	novelGene_70610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	74556	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	123	533	901528	900904	FALSE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902150	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
880041	contig_3942_pilon	+	1090	9	Intergenic	novelGene_128738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6131.26346583638	55	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	69	671	785130	793582	TRUE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAIPEARARPPDVQAVEEEEEMDAPDSASRVFCSRVLSMVNADDVNAIILAQKNMLDRFEKTNEMLLNFNNLSSARLQQMNERFLHHTRTLIEMKRDLDSIFRRIRTLKGKLARQHPEAFSHIPEASLLEDEDEDPIPPSTTTTIATSEQSTGSCDTSPDLISLPLSPGFEDLSQARPGSPTINGHGPTDDDEETPGDRRRDADLCEDPDRQDHHSRGRAQ	778910	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_778958_785108_785231_786164_786318_789060_789108_790165_790395_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
880042	contig_11422_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_98999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144527	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGGGCTGTTACGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_2200
880043	contig_15146_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_116949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	146	514	457083	457451	NA	40	ATCAAAAGATGCATTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKFRISLGLPVGAVINGADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRSCIQCWQHCMILQCNYKNKITVFYTNNTHLVRLANKRRRPHYLCKNTYAY	456937	457477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_456900_457500
880044	SIRV6	+	1399	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	28	167	-27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	35	AGTTTAGAAGTTTTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880045	contig_7933_pilon	-	1183	4	Intergenic	novelGene_164674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3074.05891651774	22325	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACCTACAATGTCCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198180	185212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891_197995_198118
880046	contig_19518_pilon	-	544	4	Intergenic	novelGene_170728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6608.14857244868	38	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49276	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623_47728_48789_48932_49223
880047	contig_17075_pilon	-	1707	8	Intergenic	novelGene_131748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2657.33789606771	56309	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1308	1655	91005	88043	FALSE	15	CTATCTGTTTTCAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQTLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIELGTACGKYYRVCTLAIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK	95448	87990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_90723_90984_91038_91136_91872_92029_92071_93162_93292_95078
880048	contig_4232_pilon	-	794	2	Intergenic	novelGene_63392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGACAGCTATTGGACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467277_467353
880049	contig_11316_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_122677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139423	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
880050	contig_10436_pilon	+	911	4	Intergenic	novelGene_108498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24046	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCCCTATTCACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101598	103603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_102103_102539_102655_102788_102866_103388
880051	SIRV6	+	1528	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	129145	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880052	contig_854_pilon	+	1355	7	Intergenic	novelGene_36288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	18	596	543600	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPDTMQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543582	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
880053	contig_18613_pilon	+	821	6	Intergenic	novelGene_80222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_3	1150.88880435948	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	87	575	24385	31105	FALSE	15	TTCTTTGCCTAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23728	31351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
880054	contig_11052_pilon	+	777	4	Intergenic	novelGene_115443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2270.64043829048	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	77	508	102902	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102320	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_102391_102895_103136_106346_106461_107445
880055	contig_16525_pilon	-	1684	5	Intergenic	novelGene_133840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	11404	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	55	495	181436	178157	FALSE	5	GTTCTGCGTCTCCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181490	176967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
880056	scaffold_12510_pilon	-	1268	3	Intergenic	novelGene_151357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1625	junction_1	442	23	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	960	1268	148136	146288	FALSE	50	GTAAGTAAAATTATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRV	149095	146287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_146433_147758_147912_148125
880058	contig_2770_pilon	-	4276	6	Intergenic	novelGene_107431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	34836	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	297	746	750561	743833	FALSE	25	CTCTAACTGCGAACTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750857	740302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880059	contig_5018_pilon	+	1020	6	Intergenic	novelGene_47134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	461.865781369436	16906	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	170	766	1498209	1500271	FALSE	0	TCTGTGTCGGTGTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNAHIGKPAPDFQATAVVDGAFKEVKLSDYRGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSEHAEDFRKLGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPRKEGGLGPLNIPLLADVTRSLSHDYGVLKEDEGIAYRGLFIIDGKGVLRQITVNDLPVGRSVDEALRLVQAFQYTDEHGEVCPAGWKPGSDTIKPNVDDSKEYFSKHN	1497372	1500525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1497533_1498199_1498312_1498400_1498555_1499164_1499288_1499456_1499588_1500185
880060	SIRV6	+	1012	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	4239	0	-1655	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7344	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
880061	contig_6599_pilon	-	1065	2	Intergenic	novelGene_175978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10293	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGACAGCAGGACGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	260845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261459_262266
880062	contig_6599_pilon	-	1056	2	Intergenic	novelGene_175975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCGCTAAGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262695	260813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
880063	contig_253_pilon	-	782	7	Intergenic	novelGene_129690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_6	436.090204735977	600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	94	726	421711	418769	FALSE	55	AATAAAAGTGGTAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421804	418712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
880065	contig_2161_pilon	+	1424	4	Intergenic	novelGene_114964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGGCCGTCAGGCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059514	1066305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1060452_1060503_1060812_1063657_1063751_1066219
880066	SIRV6	+	515	6	NNC	SIRV6A	novel	459	5	NA	NA	0	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46764	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATTGCGTTCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2516	11081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724_10819_11028
880067	SIRV6	+	532	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2285	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2816_3106_3165_10724
880068	contig_12677_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_110799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3767	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3800
880069	contig_9839_pilon	+	6953	8	Intergenic	novelGene_88478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1683.37801786183	19094	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	166	900	49467	61360	TRUE	20	CAAACTGCTTCTGTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	44235	68889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_44385_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264_61976_63451
880070	contig_12677_pilon	-	1365	2	Intergenic	novelGene_110823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTATTCTTTTAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2565_2898
880071	contig_7720_pilon	+	2844	3	Intergenic	novelGene_155769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4230	junction_1	1410	429	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATTGTGCAAGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701379	709416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_701962_705016_705142_707279
880072	contig_16882_pilon	-	1068	8	Intergenic	novelGene_148204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	1918.76079269716	24815	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	450	1034	189133	181967	FALSE	15	TTCTGTCTTAGGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	190446	181932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187625_188683_188756_189058_189143_189464_189786_190327
880073	contig_10973_pilon	-	1120	2	Intergenic	novelGene_150316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1056_1222
880074	contig_12939_pilon	-	827	5	Intergenic	novelGene_166201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1000	junction_4	201.052232019443	25689	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	98	481	47121	46738	TRUE	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPGPLRPPHQLTQSAHSEGTSTNGSRAGPDLTIPPRLLPSPTRAGIPARPHAPTSGVRLSGFGTLKLQLGTQSQHPGPRTKKKTPGSRRSGQGGGAPEFRTSASGSQGRLRPGFVFKLRGCGVGTF	47218	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031_46116_46311_46379_46727
880075	contig_8914_pilon	-	1191	7	Intergenic	novelGene_112856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2634.56551868087	4	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	109	792	268130	264566	TRUE	35	ACCGAAGGTTGAGTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268941	263782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_263866_264249_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075_268180_268882
880076	contig_17440_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_7549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGATGGCAGAGACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892	2978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_900_3000
880077	scaffold_12510_pilon	-	441	5	Intergenic	novelGene_151351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_4	694.592506438127	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	60	392	148136	145678	FALSE	25	CATTTTTCTTAAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSWSLWRPAGNRTSKPTNMSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI	149117	145628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_146287_146433_147758_147912_148125_148171_149092
880079	contig_7293_pilon	+	1933	4	Intergenic	novelGene_54256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4979.55607124437	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	41	367	335695	336451	TRUE	15	TGAAGACGTTCTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335654	338088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363_337395_337465
880080	contig_4305_pilon	+	1635	4	Intergenic	novelGene_136664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25733	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTTTTTCATGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511089	513995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_512380_512649_512709_513072_513297_513933
880081	contig_20951_pilon	-	1786	6	Intergenic	novelGene_43055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	89	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	29171	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	29998	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
880082	SIRV1	-	2034	8	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	132	0	combination_of_known_junctions	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	400395	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11511	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444_10792_10882_11243_11403
880083	contig_11328_pilon	+	829	6	Intergenic	novelGene_88407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	28722	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	37	786	643683	647995	FALSE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643646	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
880084	contig_6557_pilon	+	518	4	Intergenic	novelGene_32978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5979.15094306876	3351	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	38	475	435138	440040	FALSE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434243	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434276_435132_435306_436630_436772_439911
880085	contig_13245_pilon	-	2475	4	Intergenic	novelGene_148804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5283.67639264766	362	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGTAATGTGCAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26870	23648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26125_26216_26457_26749
880086	contig_2770_pilon	-	1564	6	Intergenic	novelGene_107451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	23817	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	217	666	750561	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750777	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880087	contig_854_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_36401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGACTTTGAGGAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975571	976874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975600_976900
880088	contig_11328_pilon	+	1645	5	Intergenic	novelGene_88421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2560.72065052008	34	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGACTGTAAGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643679	648327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644383_644805_645017_645230_645376_647064_647223_647899
880089	contig_16103_pilon	+	449	3	Intergenic	novelGene_118700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTCTCCGCGGGGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198304	199895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198548_199035_199195_199848
880090	contig_12279_pilon	+	1124	6	Intergenic	novelGene_50108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3417	junction_3	967.051187890279	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	42	644	68297	77128	FALSE	60	AATAAAACAAAAGCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHPGQRREPLNIKMTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57561	77608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
880091	contig_14208_pilon	-	3162	2	Intergenic	novelGene_129110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18068	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	14	322	325034	324726	TRUE	50	AAAAAATATGGTGGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSFMEFPERDRTTGNQRYMLSHPPPFFTPTRSPLLPSATDSRLGSTGFTPVLPGFHPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLSPHHPCPPSLKYLAPCAIFAFS	325047	321730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_324250_324404
880092	contig_12279_pilon	+	2821	6	Intergenic	novelGene_50112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2026.48053531239	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	156	758	68297	77128	FALSE	15	GTGTGGCTCACAGATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	58288	79191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_58438_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
880093	contig_6599_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_175988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4652	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGGCCGGGGGTGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262717	262098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
880094	contig_19851_pilon	+	1942	6	Intergenic	novelGene_29863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	128	643	53637	56177	FALSE	40	ATACTGGGCTCCATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53509	57476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
880095	contig_4232_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_63291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468109	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
880096	SIRV6	+	1521	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	1	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1984	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880097	contig_9014_pilon	+	1621	5	Intergenic	novelGene_106807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2324.63728353479	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATAAATAAAGCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150658	153610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151036_151578_151763_152234_152334_152425_153328_153551
880098	contig_10861_pilon	+	604	6	Intergenic	novelGene_39361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25527	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCAAGGTTTCCGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1581121	1585436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1581201_1581626_1581736_1582706_1582835_1583235_1583349_1584525_1584677_1585412
880099	contig_4364_pilon	+	1933	6	Intergenic	novelGene_545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880100	contig_6102_pilon	-	1613	8	Intergenic	novelGene_32187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	1290.43035061793	13725	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	240	887	905250	895000	FALSE	15	TCCCTGCCCTAAACGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906322	894273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_906085
880101	contig_6557_pilon	+	1373	3	Intergenic	novelGene_32982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12582	junction_1	100.5	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	893	1330	435138	440040	FALSE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434245	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_435306_436630_436772_439911
880102	contig_1275_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_108817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	28422	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	349	1038	747279	747968	FALSE	20	TGGTAGCATAATTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746288	748105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
880103	contig_854_pilon	+	1492	7	Intergenic	novelGene_36197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	18255	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	146	724	543600	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543454	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
880104	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	991	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880105	contig_5605_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_143931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1746	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	909	1247	215324	214986	NA	70	ACTGCAAAAACGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNPFVTSDWSKSHKRHFSAPFYIRRKIMSSSLSKELRQKYSVQSMSIRKDDEVQVIRRHYKGRQIGRVVQVYRKKYVIYIEWVKQEKANGTAVHVGIHPSKVVITRLSIG	216232	214846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_214800_216200
880106	SIRV1	-	1487	5	NIC	SIRV1A	novel	1363	6	NA	NA	1	-127	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1326	30	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTACTATCAAAGATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11642	6576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6814_7552_7815_10282_10367_10647_10792_10882
880107	contig_16310_pilon	-	1225	5	Intergenic	novelGene_70071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18604	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCACGCGGCGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290634	285793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_286018_288626_288705_288966_289060_289557_289631_289877
880108	contig_3825_pilon	+	1511	7	Intergenic	novelGene_77939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1676	junction_6	714.269965302569	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAATAAAGGTACAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12500	15833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
880109	contig_253_pilon	-	829	7	Intergenic	novelGene_129675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	930.675501390731	6946	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	65	754	421635	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSRGAGLRSIELGLPGVPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421699	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421577
880110	SIRV7	-	2460	5	FSM	SIRV7A	SIRV705	2462	5	-19	21	13	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3555	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAACCTATTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147944	1026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880111	contig_8594_pilon	+	3376	4	Intergenic	novelGene_140000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170124	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2970	3308	280236	280574	FALSE	15	GTTGTAGAGGTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVMTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKHHIIFQNGCIILPSHQQWIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	36998	280642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_37458_95287_95363_252080_253095_278814
880112	contig_17976_pilon	-	4104	4	Intergenic	novelGene_32460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	242	322	51155	51075	TRUE	10	CCCTCTGGCCTCAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFNKKKFIFLQFRRPDVQIQSSRLQVQIQGVSSRERLSLSVGSGGRSLCCISLPLVWENLCTGTAGPKDVLCSWGCFLGGMRFPCLSAHSVFYISKEFGLRHYPIL	51396	6058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_6125_9281_9548_33515_33561_47669
880113	contig_11422_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_98993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCCAGCCGGGTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_1700
880114	contig_6599_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_175990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGGGGGTGGGCGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262717	262114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
880115	contig_11316_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_122672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139385	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
880116	contig_11316_pilon	-	3268	1	Intergenic	novelGene_122636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12526	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140702	137434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137400_140700
880117	contig_18613_pilon	+	998	6	Intergenic	novelGene_80221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_3	1150.88880435948	1237	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	88	576	24385	31105	FALSE	10	TTCTCATGTTTGATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23727	31527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
880118	SIRV1	-	1932	5	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	6	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	32	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11637	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_7552_7815_10282_10367_10444_10792_10882
880119	SIRV6	+	1518	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	8	2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880120	contig_4812_pilon	-	1285	7	Intergenic	novelGene_103640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	7901.37046481319	62500	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	206	754	82339	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCSPTFTRSGRSRTGCAWRWRGSDQRVPNWKQLLVVGDKELVLMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82800	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_81924_81986_82268_82343_82598
880121	contig_5445_pilon	-	550	4	Intergenic	novelGene_135425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1704	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCTTGCTGCCTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53918	51707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_51818_52578_52635_53127_53240_53646
880122	contig_6102_pilon	-	1004	8	Intergenic	novelGene_32194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	1880.73560293925	11904	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	112	894	905986	895000	FALSE	5	CCCAGTGGGTGCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLQDPYSAVGSAALRSPDKMGSAVGVLAKTGQKRGRPGVQGREEMPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906097	894889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_905853
880123	scaffold_13505_pilon	-	505	6	Intergenic	novelGene_111475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5237.06517049387	113	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	29	466	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	548323	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
880124	contig_6929_pilon	-	1427	8	Intergenic	novelGene_139375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19973	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGAGAATGGCGGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132319	101616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_101788_101872_101920_102602_102690_126540_126641_126936_127240_127701_127784_130704_130969_131946
880125	contig_5779_pilon	-	2973	2	Intergenic	novelGene_106439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2001	2333	94343	94011	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	96343	93302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93482_93549
880126	contig_11422_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_99005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89842	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2259	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_2300
880127	contig_1339_pilon	-	427	5	Intergenic	novelGene_163135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCAGGCAAGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434135	430921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_430929_431332_431421_431611_431733_433674_433795_434044
880128	contig_16310_pilon	+	881	5	Intergenic	novelGene_70077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	181	513	285976	289927	FALSE	0	CGTTCTCTGTCCTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285795	290295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
880129	contig_3612_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_87818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	995	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGGCAGACATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878854	878018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_878000_878900
880130	contig_11422_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_98994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16653	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_1800
880131	SIRV2	-	1350	10	ISM	SIRV2A	SIRV201	2051	11	1	780	1	-745	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3066	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTAGAACGAGGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5906	1780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV2_-_1854_1973_2065_2674_2803_2881_3011_3105_3375_3665_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5788
880132	contig_15937_pilon	-	1768	3	Intergenic	novelGene_143134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3847	junction_1	600	724	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTTCTTAAAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30551	28043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_-_28377_28601_28680_29194
880133	SIRV6	+	1349	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	567	0	351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	79	570	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1654	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880134	contig_8317_pilon	+	1152	3	Intergenic	novelGene_19309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	23	409	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15920	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
880135	contig_11422_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_99040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCAGCCGGGTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	1689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_1700
880136	contig_14807_pilon	-	2923	14	Intergenic	novelGene_124646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	7804.85858087484	1228	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	323	814	38669	37247	TRUE	50	GAGGGAGAAAAGAGGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	32724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_32813_33578_33784_34134_34222_34304_34393_35271_35374_35512_35625_35703_35951_36066_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39620_39796_39900
880137	contig_2377_pilon	-	2078	3	Intergenic	novelGene_67881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_2	281.5	18555	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	22	342	192930	191056	FALSE	40	GCAAGATACAGATATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAAVAAMAVTALAARVRLYSLGARAMQAQGFSSDQSEDLDRRAGSIREAGGAFAKREAAEEERYFRAQAKEQLAALKKYHEEEIVHSKKEIERLQKEIERHKQKIKKLKHDD	192951	189319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_191198_192656_192749_192843
880138	SIRV6	+	1455	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	69	4	66	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	200	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	40	CAAAAATTATGGATTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880139	contig_13245_pilon	-	2350	4	Intergenic	novelGene_148805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2312.58138595524	338	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	26870	26387	TRUE	30	AAGGGTTTCCAAGGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFEEDAVVVEGWLALALLLLTHRCSLSPRNKSVRKQRRSHGENGDGAARVGAPAACVLSPSRGPQPRGCLFWGRGLRKRRSLLLRTPERHPWNQRWPFTGLELL	26872	23707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26356_26457_26625
880140	contig_4232_pilon	-	1169	2	Intergenic	novelGene_63324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCGTAGTATACTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468185	466942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467774_467847
880141	contig_7293_pilon	+	2368	3	Intergenic	novelGene_54257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	41	367	335695	336451	FALSE	15	CGTATGGTGTGTTCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335654	338452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
880142	contig_6361_pilon	+	4125	6	Intergenic	novelGene_23965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	382	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1405	1749	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	399344	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_400573_405183_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
880143	SIRV6	+	1293	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	567	56	351	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	79	570	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1654	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880144	contig_6589_pilon	+	492	5	Intergenic	novelGene_25875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	244	306	956086	956737	TRUE	35	TGCAGGGGAAGGGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSGVSFCSRGWPVGLWHARTSCPWSGRTVWCGCAGFPVPCRNACTPRGPCVDLRAGQCHSPWGESRASWSKVRILPPALRMRLRARLLTRSAHTFSLGTS	955209	957360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_955299_955760_955834_956004_956124_956712_956815_957251
880145	contig_253_pilon	-	735	6	Intergenic	novelGene_129682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	1013.09636264276	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	79	660	421041	418769	FALSE	5	GCTGTGCTGTGAGCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421774	418693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421710
880146	contig_12644_pilon	-	1591	10	Intergenic	novelGene_44660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAAAAGGAAGTGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680820	2675481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2675528_2677222_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
880147	contig_10689_pilon	+	2106	5	Intergenic	novelGene_118608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1603.15462448262	10963	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	394	912	57608	61101	FALSE	25	TATTTCAGAGTTACTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	50810	62295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51020_51177_51347_57592_57792_58211_58374_60928
880148	SIRV6	+	1444	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	32	52	-5	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	226	717	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1119	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880149	contig_16103_pilon	-	534	3	Intergenic	novelGene_118708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	112	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	164	436	199173	198413	FALSE	20	GCCAAGTCTACACCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSPRAGLLDRARYKAGLRDGPRYQAGPAETRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199990	198314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
880150	contig_1331_pilon	-	2191	4	Intergenic	novelGene_37792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	17576	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	174	650	169924	160009	FALSE	15	ATGATATGTCTCCCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	170097	158467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
880151	contig_16836_pilon	-	609	1	Intergenic	novelGene_177789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGCGAGGCGAGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1771	1162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_1200_1800
880152	contig_20951_pilon	-	1706	7	Intergenic	novelGene_43042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	12436.4536209752	193	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	TRUE	10	GGAGTGGCTCTGTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27003_27111_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
880153	contig_854_pilon	+	2431	4	Intergenic	novelGene_36368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	346	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1983	2363	976970	1198085	FALSE	20	AGGCCCCAGGTTACTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGVSTHLLGPAHLPRGQRQVVLLLHCFEELNGWHLGHDWAWGLLGLGHLVQAPHLRRRVRGRGLAPGREQARPESREEAVILLAAVKSIPTHMTPCVQSRTAPQGFQGWDLSEANCQACLSRRC	974691	1198153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975017_975312_977219_1078919_1078932_1197965
880154	contig_11052_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_115460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	86	517	102902	107529	FALSE	45	AAAAGTAACATCAGCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102816	107781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
880155	contig_4902_pilon	-	3261	2	Intergenic	novelGene_178212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17415	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1393	1758	116800	116435	FALSE	30	ATTCCCCAGGTCACCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTKLGALIHGINRIRTIINNAQAPEERLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYNKSDQHLISKIYKVLQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFAKEDIQVADRHVKKCS	206868	114931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4902_pilon_-_116893_205568
880156	contig_15327_pilon	-	1771	4	Intergenic	novelGene_70641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	143	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	30	TTCTAAAATTTGAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	899674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
880157	SIRV6	+	1452	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	18	-44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	ATTGCCTACTAAGCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10827_11149
880158	contig_17311_pilon	+	2935	4	Intergenic	novelGene_57856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39726	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCATGAACTTCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118818	123668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_+_121409_121532_121642_123344_123553_123640
880159	contig_4232_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_63296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468425	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468400
880160	contig_16310_pilon	+	990	6	Intergenic	novelGene_70083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	3478.18259440185	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	175	507	285976	289927	TRUE	30	TTCTAACAAAGCTGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285801	290624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879_290082_290295
880161	contig_16103_pilon	+	546	3	Intergenic	novelGene_118707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49985	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGCGCCCGGCCCGCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198304	199992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198548_199035_199195_199848
880162	contig_21007_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_161520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5484	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564
880163	contig_17440_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_7579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGATGGCAGAGACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1655	2978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1700_3000
880164	contig_11422_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_99066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2350	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2400
880165	contig_4180_pilon	+	3805	7	Intergenic	novelGene_8366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1551.55725536207	368	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	716	1252	875200	888134	TRUE	25	TCACTAAACTTTTTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	873709	890814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888669_888795
880166	contig_10235_pilon	+	460	3	Intergenic	novelGene_46316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	843	25847	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTCAGGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89927	91874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_91617
880167	contig_13894_pilon	+	1359	10	Intergenic	novelGene_62085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1106	junction_1	2223.11118330445	12863	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	92	1303	520713	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHRKFSAPRHGSLGFLPRKRSSRHRGKVKSFPKDDTSKPVHLTAFLGYKAGMTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520621	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520716_521575_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
880168	contig_7457_pilon	-	1176	5	Intergenic	novelGene_31696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1881.64507479493	521	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	145	486	1176842	1174926	TRUE	15	CAGCTGGCTTGCCGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176986	1174113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174615_1174736_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880169	contig_7933_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_164698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4764	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	24	317	189534	185916	FALSE	40	TTTAATAGCTAATCTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTDLTKMPSQMEHAMETMMFTFHRFAGDKGYLTKEDLRVLMEKEFPGFLENQKDPLAVDKIMKDLDQCRDGKVGFQSFFSLIAGLTIACNDYFVAHMKQKGKK	189557	185671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402
880170	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880171	contig_7229_pilon	-	2241	4	Intergenic	novelGene_39793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1889.53509861259	1705	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	123	737	877522	875654	TRUE	25	CAAATGGACCTTGTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877644	874012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875260_875396_875960_876729_876867_877350
880172	contig_8452_pilon	+	7146	3	Intergenic	novelGene_48003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	24	142	147	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1424	1780	263026	263382	FALSE	35	AAGCAGCTGATATTTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNFAPGNVTTEVKSVEMHHQILSEALPVDNVGFNVKNVSVKHVCHGNVAGDSKNDPPMEAAGFTTQVIILNHPGQISAGCAPVLDCHTAHTACKFAELKERTDLRSGKKWRMALNS	255040	268748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_255187_260988_261402_262161
880173	contig_11316_pilon	-	2717	1	Intergenic	novelGene_122655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGTATGGCTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140702	137985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138000_140700
880174	contig_12677_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_110712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
880175	contig_12677_pilon	-	1614	1	Intergenic	novelGene_110718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
880176	contig_14536_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_69317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGAAGTGTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238638	236773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_236800_238600
880177	SIRV7	-	2358	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	30	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	38	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAACCTATTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147888	1026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608_147786_147831
880178	contig_15720_pilon	+	1085	8	Intergenic	novelGene_41887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22485	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	278500	279803	TRUE	30	CGCGTCCCTGCCGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278499	283977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280373_281446_281555_281785_281929_282569_282750_283785
880179	contig_8317_pilon	+	1208	3	Intergenic	novelGene_19304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	79	465	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15864	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
880180	contig_17440_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_7531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGATGGCAGAGACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426	2978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_400_3000
880181	contig_11422_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_99019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAAATACTTCGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740	31	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
880182	contig_12279_pilon	+	1283	7	Intergenic	novelGene_50105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2280.8823402359	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	175	777	68297	77128	FALSE	15	CTGAGATCTTCATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57549	77634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57601_60917_61035_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
880183	contig_12677_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_110782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
880184	contig_2377_pilon	-	492	2	Intergenic	novelGene_67884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTTTGATGCCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193009	190932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_191198_192782
880185	contig_11422_pilon	-	2262	2	Intergenic	novelGene_99013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
880186	contig_10436_pilon	-	1401	4	Intergenic	novelGene_108476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3268	junction_3	1263.88457630522	853	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	195	548	103480	102032	FALSE	15	GTTGCGTATCACCTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIGDLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDESVYGL	103674	101178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_102098_102535_102655_102788_102868_103390
880187	contig_11052_pilon	+	861	3	Intergenic	novelGene_115444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	17837	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	161	592	102902	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGGEPGGQSDKLTTAVDRSLLTEALVLTFPALLRCPFARLLVCSPTPPSQPAMAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102741	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
880188	contig_253_pilon	-	1090	6	Intergenic	novelGene_129688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1899	junction_5	360.424194526394	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	310	1023	421436	418769	FALSE	30	TAAGAGAAGCTGTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQGGQAVHPPTPSSQALIDVSLSALVPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421745	418701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318
880189	contig_2940_pilon	-	455	5	Intergenic	novelGene_81933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7796.46645522829	83	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	58	453	722201	717654	FALSE	20	ATCTGGTATGTTTCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLKTL	723520	717651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717663_717725_717835_720771_720954_722105_722207_723468
880190	contig_11136_pilon	+	601	4	Intergenic	novelGene_169011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1565.80799163456	23	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	16	495	126603	128257	FALSE	5	GCTGCTGTCAGTCTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMDARAEAIKTLLKPKEVKPRIPRGVNRKLSRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLSRPKSKAKAQSKAEAPAKASTQVLAPGQAPKGTQAPTKASE	126136	128363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_126144_126594_126640_126975_127041_127879
880191	contig_6102_pilon	+	444	3	Intergenic	novelGene_31810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACGTGCACAATAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360144	361171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
880192	contig_5954_pilon	+	433	5	Intergenic	novelGene_28429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2149.03785157451	691	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	194	385	98153	98983	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97525	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97533_97874_97926_98017_98163_98637_98694_98857
880193	contig_17964_pilon	-	4824	1	Intergenic	novelGene_33855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	3260	3631	135758	135387	NA	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVIDSFILPEVEDGSPHPRLRCGYFLPILSPCHSVFSRWSCHPTRKPCLCHPRLQRGGLAPPPLFGGVTLARPQPWCWERQSCLIICFFALVAPVAWVDHPADFRTICLCPPRWPASLWGL	139017	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_139000
880195	contig_8317_pilon	+	978	3	Intergenic	novelGene_19306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	26	412	15943	16506	FALSE	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15917	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
880196	contig_10973_pilon	-	3473	1	Intergenic	novelGene_150320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	744	1256	2730	2218	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3473	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_3500
880197	contig_4232_pilon	-	1975	2	Intergenic	novelGene_63279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121463	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGCAAATGACTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468126	466020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466826_466956
880198	contig_5452_pilon	+	388	2	Intergenic	novelGene_101016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	298	junction_1	0	258	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTTGAGCGTCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439805	441540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_439937_441283
880199	contig_3825_pilon	+	3573	7	Intergenic	novelGene_77937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1676	junction_6	714.269965302569	5305	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAATGTCAGAATTACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12216	17611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
880200	contig_12677_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_110806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3900
880201	contig_9650_pilon	+	372	1	Intergenic	novelGene_177380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACAAACACACAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180842	181214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9650_pilon_+_180800_181200
880202	SIRV1	-	1629	7	NIC	SIRV1A	novel	1363	6	NA	NA	-357	0	combination_of_known_junctions	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392588	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11148	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10647_10792_10882
880203	contig_8914_pilon	+	836	6	Intergenic	novelGene_112860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13974	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	144	584	264665	267418	TRUE	25	CATCCTGCTGCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHEFSQFKLGLLQHFYFSNKHIMERINRLASLFYVFSNAVWNQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264521	268941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264950_265588_265799_267319_267508_268075_268179_268881
880204	contig_20199_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_82520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41251	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40600_41300
880205	SIRV5	-	763	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	261	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATCCTTAATCCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10986	7876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
880206	contig_18272_pilon	+	5398	1	Intergenic	novelGene_7056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	937	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTTGGTCATTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476318	481716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_476300_481700
880207	contig_2770_pilon	-	1013	6	Intergenic	novelGene_107484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	217	666	750561	743833	FALSE	30	ATTGAGCACAGTCAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750777	743485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880208	contig_5954_pilon	+	668	4	Intergenic	novelGene_28430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	1626.09969627395	520	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	97851	98756	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVSESVSGVLRCLLSQLSQAP	97525	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98637
880209	contig_20199_pilon	-	1016	4	Intergenic	novelGene_82516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	174	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	143	478	43987	41055	TRUE	25	GGGACATCCCAGTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44129	27557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_27692_40650_41250_42110_42171_43906
880210	contig_854_pilon	-	3746	3	Intergenic	novelGene_36396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTATTCTGTTAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995967	974836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_977307_984844_984852_994698
880211	contig_11978_pilon	+	1835	6	Intergenic	novelGene_63072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4015.20198246614	368	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	598	924	1830693	1831883	FALSE	20	AGTACTCTTAGCCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827919	1832794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830430_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
880212	contig_7229_pilon	-	2332	4	Intergenic	novelGene_39804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1889.53509861259	1835	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	84	698	877522	875654	FALSE	40	ACTAAAGCAAATGGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878195	874019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877535_878124
880213	contig_4180_pilon	+	2722	10	Intergenic	novelGene_8350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2052.58074832516	21	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	640	1176	875200	888134	TRUE	30	GTATCTGTGGAATTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865725	890239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866080_866126_870451_870714_872514_872681_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888634_889192
880214	contig_16310_pilon	+	1136	5	Intergenic	novelGene_70072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3800.40092457362	158	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	182	448	285976	289927	FALSE	30	GCTGAGTTGTTCTAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEDDDVDTKKQKTDEDD	285794	290615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289567_289879
880215	contig_13680_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_149614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26999	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532629	531229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_531200_532600
880216	contig_10139_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_177806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4577	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTGCCTCTCGGCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182995	183719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183000_183700
880217	contig_15327_pilon	-	1997	5	Intergenic	novelGene_70638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	12	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	130	540	901528	900904	TRUE	20	CTTTTGAGCCAGGTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902157	899378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899477_899544_901033_901126_901281_901400_901536_902035
880218	contig_19518_pilon	+	396	3	Intergenic	novelGene_170726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111017	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAGAAAGAGAGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45351	49270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_45593_47619_47728_49223
880219	contig_7457_pilon	-	1260	4	Intergenic	novelGene_31715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	28163	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	138	479	1176842	1174926	FALSE	45	CTCTTATTTAAATAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176979	1174144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880220	contig_9848_pilon	-	3002	1	Intergenic	novelGene_79923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	710	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTTCCTTGTCCCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65798	62796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_62800_65800
880221	SIRV3	+	1429	7	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	6	999	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5600	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACTTAATTTTTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1969	9938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4568_4775_6057_6334_8755_8976_9189_9297_9431
880222	contig_10135_pilon	+	629	5	Intergenic	novelGene_106653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1047.8066376961	26324	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	55	312	116715	119864	FALSE	30	TTCATTTACCATATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116660	120181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801
880223	contig_2770_pilon	-	1029	6	Intergenic	novelGene_107483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	29920	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	193	642	750561	743833	FALSE	55	AAAAAAATTCAAAACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750753	743445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880224	contig_11422_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_99004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_2200
880225	contig_16310_pilon	+	1179	6	Intergenic	novelGene_70075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3478.18259440185	81	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	285976	289927	TRUE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285794	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879_290126_290167
880226	contig_2770_pilon	-	1561	6	Intergenic	novelGene_107466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	78	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	218	667	750561	743833	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750778	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880227	contig_8317_pilon	+	1547	8	Intergenic	novelGene_19246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	13326.7903204372	210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	69	866	14294	15923	TRUE	45	CAAAGTTTAATGAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQECLCERCSSWQCGW	13257	16781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15597_15875_15970_16047_16283_16381
880228	contig_1331_pilon	-	1763	6	Intergenic	novelGene_37816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3640.61849690406	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGCATTCATCATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177867	159069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_170279_170331_170564_170786_177728
880229	SIRV6	+	1523	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	-13	18	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4975	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880230	SIRV6	+	1466	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	56	6	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	89	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880231	contig_2438_pilon	+	1423	5	Intergenic	novelGene_112052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	2567.64428757178	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	167	766	310588	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFRALGQCPQSGTETLQLEASALPAVSRPQSVGGALSIQPLPFALSSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	307595	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_307734_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
880232	contig_11316_pilon	+	3422	1	Intergenic	novelGene_122611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4823	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	570	1082	137674	138186	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137104	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137100_140500
880233	SIRV6	+	1462	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	14	2	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	28	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880234	SIRV6	+	683	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	39	61	39	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTTATTAGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10276	11269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
880235	contig_6375_pilon	+	501	4	Intergenic	novelGene_72977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	479	junction_3	114.545478595476	2782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTTCTCCCACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241662	244535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241865_241940_242009_243940_244006_244369
880236	contig_20951_pilon	-	1217	4	Intergenic	novelGene_43051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9558.77663023186	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	174	623	27908	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28127	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_27968_28013
880237	contig_10404_pilon	+	1029	5	Intergenic	novelGene_138660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2112.4489786738	72	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	82	423	1098040	1099868	FALSE	15	ATTTGCCCAACTGTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085380	1100474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085388_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
880238	contig_14807_pilon	-	777	7	Intergenic	novelGene_124696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	81580	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	39773	37247	FALSE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
880239	contig_21388_pilon	-	984	5	Intergenic	novelGene_136629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	519.081580775122	11078	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	125	775	28487	21603	FALSE	0	CCTGCGTGTGGGCTGGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREEPLSPPRLLLGGGAEAQAPASPPSSGPRLPRRTPFSRWMLRLSERNMKVLFAAALIVGCVFFLLLPGPSVADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVVIGLFGKTVPKTVDNFLALATGEKGFGYKDSRFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDENFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTSWLDGKHVVFGKVLEGMDVVRKVESTNTDGRDKPLKDVTIIDCGKIEVEKPFAIAKE	28611	21393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21388_pilon_-_21726_22313_22499_26756_26851_27534_27649_28352
880240	contig_5779_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_106427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22367	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	94343	94011	NA	90	AAAAAAAAAAAAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
880241	contig_6375_pilon	+	465	5	Intergenic	novelGene_72975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_1	170.06083470335	9372	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	14	385	241671	244522	FALSE	25	TTACCGATTCAACAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLSMAVLVAFLWSVRRLHCSSAARAGSQWRLQQGLAANPSGCGPLTELPDWSYADGGPAPLMKGQLLRKAQREKFARRVVLLSQEMEAGLQAWQYRRQQKLQEEEKRQKNALKPKRASLQSPLPSQ	241657	244602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_241699_241806_241865_241940_242009_243940_244006_244369
880242	contig_9839_pilon	+	3050	8	Intergenic	novelGene_88516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1686.6918957001	18	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	231	965	49467	61360	TRUE	10	CTCCACCACTTTGTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45396	64921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45611_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264_61976_63451
880243	contig_4364_pilon	+	1937	6	Intergenic	novelGene_385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	30	TAAAGTGCTGCAGTGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880244	contig_6929_pilon	+	1503	8	Intergenic	novelGene_139379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2091	junction_1	4962.03419856767	12289	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	724	1104	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSGSGERTPESPEQPHRRRRPSYHHTPGGAAAAAAGPSHHHRNHEQRGRDPAAARRPPAAPALSAADTKPGTTGSGAGSGGPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101622	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
880245	SIRV6	+	657	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	222	1	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
880246	contig_5317_pilon	+	1046	4	Intergenic	novelGene_76508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	5580.21666246034	19	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	196	606	35282	43326	FALSE	35	ATGCAAGTACATGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33677	43766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33850_35258_35410_36684_36839_43197
880247	contig_4812_pilon	-	1967	6	Intergenic	novelGene_103627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	5	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	115	633	82626	79235	FALSE	25	CCAGTAAATCTTCCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82740	77900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
880248	contig_11422_pilon	+	639	1	Intergenic	novelGene_99018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
880249	contig_4732_pilon	+	784	3	Intergenic	novelGene_75404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5569	junction_2	581	1082	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	21	323	524053	524659	TRUE	35	TAATGTATACAGTTCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSRVQPIKLARVRRESGFGGRGAEGRCKKSGGPSLTPASFCQVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR	524032	525523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_524233_524536_524671_525073
880250	contig_16666_pilon	-	1698	4	Intergenic	novelGene_61728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	869	junction_1	373.711415696955	11106	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	40	546	59748	55974	FALSE	5	ACTTCTTCTCCTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTGTSSPWSAEWCDFPVNMKALLILGLLFLSASVQGKIFERCEFARTLKRNGMGGYHGIRLADWVCLARWESSYNTKATNYNPGSKSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACGISCNVLLQDDITQAIACAKRVVRDPQGIRAWVAWKKHCENQDLTQYIQGCGV	59787	54821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_56041_56584_56664_58098_58264_59552
880251	contig_7933_pilon	-	708	3	Intergenic	novelGene_164693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4764	junction_1	1334	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTAAGAGAGAACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198030	185661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189556_197891
880252	contig_11052_pilon	+	791	3	Intergenic	novelGene_115458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	17454	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	93	524	102902	107529	FALSE	15	TACTTCTCGACTTGTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102809	107796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
880253	contig_4232_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_63280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1389	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTTGAGACAAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466200_468100
880254	contig_7457_pilon	-	1284	4	Intergenic	novelGene_31708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	29077	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	137	478	1176842	1174926	FALSE	25	CAGAAACAGCTGGCTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176978	1174119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880255	contig_11422_pilon	-	1519	2	Intergenic	novelGene_99073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_2040_2143
880256	contig_17068_pilon	+	854	1	Intergenic	novelGene_172566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	110	472	9770	10132	NA	75	TCAAAAAAAGAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9660	10514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10500
880257	contig_7457_pilon	-	1292	4	Intergenic	novelGene_31706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	29538	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	143	484	1176842	1174926	FALSE	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176984	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880258	contig_6165_pilon	-	4849	5	Intergenic	novelGene_167416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	628.596601565742	440	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4314	4763	493933	489749	FALSE	25	TAAAACTTTGTGGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKVVLKPRTPPGQNGLPTQEKEKKTSKQTKAPGSHQCGSPDREAAPHSNGALQRLRKKQDGSRSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKKATAAANKWHSESRPVQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	579839	489662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_493612_495833_576854_577218_577788
880259	contig_9706_pilon	+	526	1	Intergenic	novelGene_20779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384	910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_400_900
880260	contig_16836_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_177784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25856	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1798	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_0_1800
880261	contig_14807_pilon	-	976	6	Intergenic	novelGene_124675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4791.07284853821	15	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	40	879	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEGEAGFFGNPNPSALELIQQAHCPLIRPGAHWRAGPSPRQHGHHLAYTWGCGGECLCAILSLSLCIALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38741_38827_38887_39750_39796_39900
880262	contig_12638_pilon	+	1333	4	Intergenic	novelGene_33311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCAGCCCAGGCCCGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1297618	1325618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1298672_1303534_1303694_1310592_1310677_1325581
880263	SIRV6	+	1425	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	80	-14	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880264	contig_5317_pilon	-	880	3	Intergenic	novelGene_76554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2809	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTTTACCACCAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43844	35330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682_36837_43195
880265	contig_11309_pilon	-	4540	8	Intergenic	novelGene_149854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2394.35483193793	27	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	63	995	65730	56293	FALSE	70	TTAGAAAAGAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGLLGLVTSEARGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65792	52747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65688
880266	contig_5988_pilon	-	1681	5	Intergenic	novelGene_15939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	918.537526451696	13973	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	152	1507	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655778	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456_655569_655736
880267	SIRV6	-	990	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1446	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGACGTGTCCCAGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11690	2765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_11109_11205
880268	contig_11316_pilon	+	3422	1	Intergenic	novelGene_122612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	570	1082	137674	138186	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137104	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137100_140500
880269	contig_2770_pilon	+	1260	7	Intergenic	novelGene_107460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCCAAACACCACTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742937	750760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743463_743746_743862_744034_744173_744574_744674_746594_746748_747768_747796_750557
880270	SIRV7	-	1965	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	110	387	105	-385	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	35	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACGGTGATAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147813	1390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880271	contig_4232_pilon	-	895	1	Intergenic	novelGene_63372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGGGGAAAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468128	467233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
880272	contig_10973_pilon	-	3267	1	Intergenic	novelGene_150319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7885	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	538	1050	2730	2218	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3267	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_3300
880273	contig_1641_pilon	-	5779	2	Intergenic	novelGene_172797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	382	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTACAACTTCTACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93640	87807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_-_88317_88370
880274	contig_12677_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_110807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3900
880275	contig_10973_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_150333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	156	668	2730	2218	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2885	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2900
880276	contig_10973_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_150347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2400
880277	SIRV1	-	1389	6	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	413	71	combination_of_known_junctions	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	47	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAACGTTCGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11230	6378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444_10792_10882
880278	contig_2069_pilon	-	1131	6	Intergenic	novelGene_23422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	300	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCTCTGATCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331287	1327095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
880279	contig_12939_pilon	-	481	5	Intergenic	novelGene_166204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	571.882855137309	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	66	383	46367	45320	FALSE	10	TGCTGCTTTAGTGTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVVCNDRLGKKVRVKWAEADGVLAERFQPWNPLFLARPSSIFLNSSAPSTDDTIGDLKKLIAAQTGTRWNKIVLKKWYTIFKDHVCLGDYEIHDGMNLELYYQ	46781	45221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031_46216_46315_46379_46727
880281	contig_12677_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_110719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
880282	contig_15313_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_175657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11141	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTTGCATTTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54796	55875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15313_pilon_+_54800_55900
880283	contig_1641_pilon	-	6561	6	Intergenic	novelGene_172796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	136	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93546	84611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_-_85800_87810_88317_88370_91361_91440_92483_92602_92875_92983
880284	contig_11720_pilon	-	2992	10	Intergenic	novelGene_43783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5775	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCACCGACAAACCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100145	67796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
880285	contig_5445_pilon	+	718	4	Intergenic	novelGene_135400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2710	junction_3	105.805901956785	5129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	190	543	51744	53758	FALSE	65	AAGAGGAAAAAGAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSVAALSFFILAVSLGSQGRVIQELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51554	53933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53240_53646
880286	contig_6361_pilon	-	7253	6	Intergenic	novelGene_24014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5324.95353594752	377	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1115	1495	426756	426376	TRUE	45	GAAGATTACATTTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKWPGGILSFQLNGISDVFPGGDIPPFASKTSRPTKHKVTGTGRKNFASGSLVVRVSGVTPISTPRILYPSILARRDAAPYIGHTHAASWRTLPQSCKVLPPSWCRNCVFRRSFHHSIKPAASG	427934	410981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_423751_423965_427420_427483
880287	contig_9871_pilon	+	783	7	Intergenic	novelGene_75704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2412	junction_1	872.457767204554	249	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	68	604	572939	584180	FALSE	25	TTTTGCAATATTAAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRKRRALADNSYLDPSSGAAKMPAYHSSLMDPDTKLIGNMALLPIRSQFKGPAPRETKDTDIVDEAIYYFKANVFFKNYEIKNEADRTLIYITLYISECLKKLQKCNSKSQGEKEMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAKPANKQEDEVMRAYLQQLRQETGLRLCEKVFDPQNDKPSKWWTCFVKRQFMNKSLSGPGQ	572871	584359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_572945_575074_575175_579914_579992_581756_581826_582912_583040_583534_583630_584117
880288	contig_11422_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_99050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2024	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2000
880289	contig_12677_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_110721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATGAAAGGCATGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1700
880290	contig_18637_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_81863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGAATTTAACTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221192	223903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_221200_223900
880291	SIRV7	-	2364	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	93	5	88	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	30	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147830	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880292	contig_4678_pilon	-	2584	1	Intergenic	novelGene_126008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2869	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTAGCATTGGTATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208076	205492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_205500_208100
880293	contig_12677_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_110774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2829	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2800
880294	contig_6546_pilon	+	490	4	Intergenic	novelGene_140983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	108	452	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597595	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
880296	contig_10775_pilon	+	4704	7	Intergenic	novelGene_157943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	144	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3293	3616	119880	120292	TRUE	35	AACTCTCTCAAAGACCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTFPPHHPSSPQLSLLLPAATVSWPGSTSCLDPARPHWLTPWVPFVGCWRCLLPLLLTLLKCGTRFLVYAAVLVGSRGFFVCFEFFVCFIFLFSSWGPVLAGQCCA	91589	200811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_+_92248_96633_97891_115601_116683_119583_120055_120143_120621_198253_198812_200609
880297	contig_5779_pilon	-	1093	2	Intergenic	novelGene_106446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	94343	94011	TRUE	75	GTTCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93791_93912
880298	contig_12864_pilon	-	2459	3	Intergenic	novelGene_76360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	898	junction_2	231	2509	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	273	584	176557	167907	FALSE	10	TTCACTGCTACTTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFVRNLVEKAPAMVNAAVTYSKPRLATFWHYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIVNSAQTGRFKQLTVKEALLNGLVATEVWMWFYIGEIIGKRGIIGYDV	176829	166031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_168006_169369_169531_176505
880299	SIRV7	+	1787	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCTGATATTATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	3110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996
880300	contig_7457_pilon	-	1113	4	Intergenic	novelGene_31719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	51	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	115	456	1176842	1174926	FALSE	25	TCATGTAGCTAGCTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176956	1174268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880301	SIRV6	+	1145	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	13	5	13	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTATCTAAAATGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	11685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880302	SIRV1	-	1141	3	NIC	SIRV1A	novel	744	3	NA	NA	1	-1216	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	38	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCGATCTGTAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11642	7665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_7809_10553_10792_10882
880303	contig_14341_pilon	+	745	6	Intergenic	novelGene_111826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	14427	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	80	694	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547736	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
880304	contig_21007_pilon	+	2074	2	Intergenic	novelGene_161531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	42	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	15	GCTTTAAGTCCTCCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	2615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
880305	contig_8538_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_4634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8832	junction_1	0	79	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	324	2153	841232	843061	FALSE	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840054	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228
880306	contig_15720_pilon	-	1100	8	Intergenic	novelGene_41905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	37	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	105	1058	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283998	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
880307	contig_7933_pilon	-	833	3	Intergenic	novelGene_164688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2382	25	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198033	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402_189672_197887
880308	contig_17068_pilon	+	1208	4	Intergenic	novelGene_172562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	55	315	9872	10132	TRUE	20	AGGTGCGGCTAAGCAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9655	30632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9665_9826_10450_28654_28729_30130
880310	contig_12638_pilon	-	1346	4	Intergenic	novelGene_33312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	931	junction_3	672.896392883448	80	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	47	337	1325585	1298628	FALSE	20	TTGAAACCCCCTTCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLTSIDAELLHRSEMAEVEETLKRLQSQKGVQGIIVVNTEGIPIKSTMDNSTTTQYANLMHNFILKARSTVREIDPQNDLTFLRIRSKKNEIMVAPDKDYFLIVIQNPTE	1325631	1297618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1303534_1303703_1310601_1310678_1325582
880311	contig_4369_pilon	+	434	2	Intergenic	novelGene_177862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	247	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTGTGTATGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230693	231750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4369_pilon_+_231000_231622
880312	contig_17976_pilon	-	2383	5	Intergenic	novelGene_32458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	479	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCTCCCCGACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48913	5928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_6146_32149_32277_41620_41856_45522_45608_47194
880313	contig_16103_pilon	-	577	3	Intergenic	novelGene_118682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	731	junction_2	2333.5	6222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18584	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17743_17879_18042_18369
880314	contig_6599_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_175985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	987	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGACCGGCCGCCGCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262717	262058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
880315	contig_12677_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_110716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
880316	SIRV6	+	1153	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2482	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880317	contig_7457_pilon	-	1739	6	Intergenic	novelGene_31669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2118.26302427248	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	140	481	1176842	1174926	TRUE	55	AGCATAATAAAAGTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176981	1171522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1172094_1172938_1173234_1174533_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880318	SIRV6	+	1409	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	112	7	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	35	GCGGTCTTCAAAGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880319	contig_12677_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_110832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTCTCAAGGGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437	3627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2400_3600
880320	contig_7457_pilon	-	1175	6	Intergenic	novelGene_31678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2118.26302427248	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	133	474	1176842	1174926	TRUE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176974	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174322_1174375_1174649_1174707_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
880321	contig_19098_pilon	-	1504	4	Intergenic	novelGene_65784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416.206946388719	8612	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	195	380	52529	50887	TRUE	50	CCATAATTTAAATAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGAGLGPEVDCGFRPSRRGGRLGPALGTAPVLLTSWPSPPTSCSSSCLDLLLATSLECIWLRTMKFQTWPKNLKKLRRTWRPRRSHLAHEVTPLSVDTPIGPSLKVFSPLNQRLLFPSQPRQIL	64053	49721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_50259_50299_51068_52524_52579_63908
880322	contig_6557_pilon	+	892	4	Intergenic	novelGene_32983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	5971.60918197283	376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	367	849	434612	440040	FALSE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFWTRENCAGFPAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434245	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434652_435132_435306_436630_436772_439911
880323	contig_8317_pilon	+	1113	5	Intergenic	novelGene_19299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	12435	junction_2	10653.2456644677	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	53	841	15369	16506	FALSE	60	AAACAAAGTTTAATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15316	16778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
880324	contig_20199_pilon	-	1033	3	Intergenic	novelGene_82565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	21922	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	207	509	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44193	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906
880325	contig_10139_pilon	+	997	2	Intergenic	novelGene_177807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCACCACCAGGAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183070	184189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183643_183764
880326	contig_12786_pilon	+	3180	6	Intergenic	novelGene_103372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGAAGACAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306139	597365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_306464_339503_339865_356368_356936_472094_472142_516625_516931_595789
880327	contig_4180_pilon	+	3350	8	Intergenic	novelGene_8342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	2050.10163013387	18	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	276	812	875200	888134	TRUE	20	TTTCTGTCAGTATATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865708	890825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866033_866126_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888637_888789
880328	contig_1301_pilon	-	4847	3	Intergenic	novelGene_47431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCTTCAACTTCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996763	986245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_986256_990217_990315_992023
880329	contig_1301_pilon	+	5528	5	Intergenic	novelGene_47419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	28	junction_1	1186.9695394154	1918	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	322	870	851545	992105	FALSE	15	TTTGAATCCACTTCCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAAEKAHVSGLRGLKHRAIGEPEATPTGPAGLALLHSALDAFAHPLHPEVGGRMPKSKELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL	851223	996763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_851709_983736_983810_986236_986360_990207_990317_992025
880330	SIRV3	+	444	2	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	2643	2606	603	-385	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	155	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTTTAATCATCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4606	6333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4775_6057
880331	contig_6958_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_69983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.4367576584918	2379	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGAAGTGTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718489	724733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_718756_718949_723190_723336_724623
880332	contig_4232_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_63340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGAAGGTCTTAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
880333	contig_5317_pilon	+	1191	5	Intergenic	novelGene_76495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5577.20312410262	27421	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	263	673	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33227	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33390_33688_33766_35258_35410_36684_36839_43197
880334	contig_10139_pilon	+	579	2	Intergenic	novelGene_177808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTCCCGCGGGGCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183126	183756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183654_183704
880335	contig_12279_pilon	-	2569	5	Intergenic	novelGene_50102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1964	2287	69588	68377	TRUE	15	TCTGACTTCTGAGTACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICELVPAYIALGFTLLGFASAGTGHRDQVITAISSGLAEQNRYVHLPVRSIVIGPGALSHTRVSRVTVTLGAVGSATTGPSPNSVFLYLAKLSSSLSISCSSFRDF	77511	57549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57597_58288_58437_68289_68471_69358_71188_77147
880336	contig_10196_pilon	-	842	5	Intergenic	novelGene_132322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_3	20346.6817119524	317	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	327	755	2389772	2389023	FALSE	0	CCTGGTGTGGCCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSDEDKTNVKTFWGKIGTHTGEYGGEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSGQIKAHGKKVADALTRAVGHLEDLPGTLSELSDLHAHRLRVDPVNFKLLSHCLLVTLSSHLREDFTPSVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR	2392030	2388935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2389152_2389265_2389471_2389677_2389791_2390932_2391026_2391815
880337	contig_4232_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_63289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468101	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
880338	contig_7963_pilon	-	2530	6	Intergenic	novelGene_58276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	1442	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	37	333	48841	43622	TRUE	10	TCTCTCTCATTGTCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48877	36857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
880339	contig_12677_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_110776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2919	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
880340	SIRV6	+	1441	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	80	7	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880341	contig_8907_pilon	-	454	4	Intergenic	novelGene_85799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6559	junction_1	1806.20861352047	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	170	406	178678	173397	FALSE	5	CTTGCCTGTGTCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV	179544	173348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_173478_177972_178039_178588_178695_179391
880342	contig_11978_pilon	+	634	5	Intergenic	novelGene_63089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	211	576	1830113	1831883	FALSE	40	TTCAATAAAATGAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829089	1831941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
880343	contig_12081_pilon	+	3828	5	Intergenic	novelGene_166979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1069.46937777573	129	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	188	823	16400	18277	FALSE	15	TTTTGACTATTCATGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15786	21282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15955_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
880344	contig_10973_pilon	-	928	1	Intergenic	novelGene_150336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAATGACCAACATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961	1033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2000
880345	contig_5039_pilon	-	9216	12	Intergenic	novelGene_64960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_1	776.855709503657	23793	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2033	6102	838	6939	1686270	1674767	TRUE	5	TGTGGTGTTTTATTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETSTPIEGNQAGDSAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPDLKEASRKSRCVSVQTDPTDEIPSKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKPKSHHDGNIDTESDSFLKFDSEPSVMALEHPVRALGLSETSDSPAVVLESPGVAMEVSEPQNLETLKPVTKTAELPAAGPSVISEQSERSVAVMLEPSMTKILDSFATAPVPATTLVLKSSEPVVAMSVEHQMKSVLKPLESTSPEPSKIMLVEPPVAKMLESTETLVDSSEIPAEVHPEPSTSTTVDFPESSAPEVLRLPEQPVEVPLGSAASSMTRPQELQELPKTTALELPESSVASVMELPGPPATSMPEMQGPPVTPVLELPGPSAIPVPELPGPPSTPVPELPGPPATVVSELPGPSVTPVPQLLQELPGLPASSVGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASSTMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSTMDSQMLATSSMDSQMLASGTMDSQMLASGTMDAQMLASGTMDAQMLASSTQDSAMLDSKSPDAYRLAQDPYRLAQDPYRLGHDPYRLGHDAYRLGQDPYRLGHDPYRLTPDPYRMSPRPYRIAPRSYRIAPRPYRLAPRPLMLASRRSMMMSYAAERSMMSSYERSMMSYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMDRSMMSMGADRSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPPLPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALATEQSALTTESMWPTEAPALPPEESVSLPEPPVSQSENSEPLAAPANYSVSASEASVLATEAVVTVPEPPPEPESSVTSTPVQSAVLAEYEITPEMPVTCMVSETPITSAEPTMLTSEPPVTAEMAGTFDSLRESGCAASEVSMSLLEPAVTIPESTQSTPELPAMAVSEPPAVVVPEPQAMAVPELPAMVVTESSALAVPEPLVVAVPEPLAVASSEPLEVAGPEPLAVSEVLVVAVSEPPAVTEPEHLPVPVPVVSALEPAVPVVEPAMSVLQPAMIASEPPVSVQESMLTVSEPAVTVSAQTQVVSTELVLESASVILESTVMSSTHIIKGMNLIPSDSNLAPEIGMQEITMYSSEEPPAEEHLKSDSYGSEWGMSIDLNVNNHLIAKEMEHSTVSTASTGGVGEVGEEKILPVNETEQCTALLTCPGVSEAEVGGTLSSTDPLALELDAKGTSKGIEFATASAFSSVNTYDVEVSLTTQDTERDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDVHLGLPTNHNLIGEDAEGPLPVKESDQAVAVALSPKESSGEDKEVPVPTEEILPDSGFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTNLRAGIEGPLLPSEVERDKSAASPGVIGLPERASESSSEEKDDYEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRSRSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSVSPSRRSRTRAVGAAPRAVGAAPRADGAAPRADGAAPRAVGAAPRAVGEDQGLW	1687107	1653712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654782_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1662234_1662352_1663443_1663555_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047_1673209_1674622_1680625_1682882_1683050_1686193
880346	SIRV3	-	1334	8	Fusion	SIRV3B_SIRV3C	novel	796	3	NA	NA	3	-963	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62149	7	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTATTTGCTTCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9940	1963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Fusion_SIRV3_-_2010_4007_4080_4573_4774_6056_6334_8755_8976_9189_9299_9434_9556_9651
880347	contig_16836_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_177785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAAAAGTCGTAACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1604	51	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_100_1600
880348	contig_5954_pilon	+	415	4	Intergenic	novelGene_28439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	532	junction_1	1917.19013141629	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	176	367	98153	98983	FALSE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97885	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97926_98017_98163_98637_98694_98857
880349	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	646	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880350	contig_8617_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_73375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATGTTCATCAATCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61821	60398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60518_60896
880351	contig_12677_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_110788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3233	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3200
880352	SIRV6	+	1270	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	566	80	350	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	80	571	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880353	contig_8616_pilon	+	1378	9	Intergenic	novelGene_72589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_2	648.64684873589	5880	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	350	1303	428108	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	426886	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
880354	contig_12019_pilon	+	751	3	Intergenic	novelGene_87652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	55	TAAACATGAAGTGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
880355	SIRV5	-	1989	16	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-8551	1170	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	794	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGTCCTGGACTGCGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10957	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481_3643_5379_5448_5538_5626_6110_6169_6326_6452_6825_6957_7143_7305_7678_7762_7869_8381_8453_8590_10863
880356	contig_11422_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_99003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23190	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2238	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_2200
880357	contig_8045_pilon	+	1354	5	Intergenic	novelGene_35378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	10108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	17	658	116067	118722	FALSE	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116050	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
880358	contig_10404_pilon	+	2311	7	Intergenic	novelGene_138657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2767.78447298356	5370	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	155	616	1089653	1099868	FALSE	25	CAACAGACCTTGTTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQKTADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085379	1101563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1089569_1089668_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
880359	SIRV6	+	1158	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880360	contig_4232_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_63290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	796	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468106	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
880361	contig_16846_pilon	-	1450	4	Intergenic	novelGene_82949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3759.16217024781	11829	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	302	820	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558738	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555365_558562
880362	contig_15087_pilon	+	2337	4	Intergenic	novelGene_37284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2103	junction_2	404.236179589221	14099	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	3	542	284695	301944	FALSE	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284692	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788
880363	contig_10689_pilon	+	1037	4	Intergenic	novelGene_118630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	75	593	57608	61101	FALSE	30	GATTTTTTCCTGAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQQRQLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51287	61545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
880364	contig_17440_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_7545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47216	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_700_3000
880365	contig_16836_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_177786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGTCTGGTTCATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482	514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_-_500_1500
880366	contig_12644_pilon	+	1373	10	Intergenic	novelGene_44671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4390.15570465458	2	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	387	1298	2678137	2680545	FALSE	35	AGGCAGTGAGAAATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALPWLPQPCQHWSCLKVCHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675503	2680620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678198_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
880367	contig_854_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_36365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	240	392	977137	976985	TRUE	10	CTTGTGTGTATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPTTGQPPKSPLCSPASAELGSPVLSPGEPRAHEAPGSPHPEGLLVLQQVGDYCFLPGFGPGLLSPRSKPSSPDPSPEMGGLDQVSQAKKPPGPVMPQVPAIQLFKAMKQQDYLSLPPWEVGRPKEVC	977376	974691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975016_975311_976427_976503
880368	contig_15114_pilon	-	2938	4	Intergenic	novelGene_121229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	863	junction_1	48.7259912389909	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	18	404	1695069	1691054	FALSE	50	TTGTCTTTAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGSVMVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1695086	1688519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990
880369	SIRV6	+	1156	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2479	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880370	contig_9839_pilon	+	2894	10	Intergenic	novelGene_88475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	1769.06039090435	1066	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1559	2293	49467	61360	TRUE	45	TCACCAAACTAAAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	43882	79089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264_61456_76159_76347_77384_77514_78899
880371	contig_10973_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_150335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	352	864	2730	2218	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3081	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_3100
880372	contig_16846_pilon	-	1205	4	Intergenic	novelGene_82944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	57	575	555239	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558706	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
880373	contig_11309_pilon	-	1844	9	Intergenic	novelGene_149862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2456.45144212134	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	260	1153	65730	56293	TRUE	15	ATCCTTTGGACCTGTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65989	54886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_54950_55664_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
880374	contig_16525_pilon	-	559	7	Intergenic	novelGene_133808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	34	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	29	457	97608	91591	FALSE	35	ACTTAAAAGATCGCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKPLDRKAMSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97636	91488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
880375	contig_4180_pilon	+	3747	8	Intergenic	novelGene_8351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2051.68416632954	14	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	476	1057	870689	888134	FALSE	20	TTTTCTGTCAGTATATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLLAVHGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865725	890824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866033_866126_870451_870714_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
880376	contig_9839_pilon	+	1460	7	Intergenic	novelGene_88476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	1461.15153408384	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	101	835	49467	61360	FALSE	25	GGCATAGTTGTTAAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPLEGKEPGARRERNLDSSTACPQIPRIGSNVMISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	43962	61985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_44047_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
880377	contig_10973_pilon	+	1330	2	Intergenic	novelGene_150358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17450	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGCCCACTCCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_2501_2625
880378	contig_5217_pilon	-	855	6	Intergenic	novelGene_135766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2882.62849496774	16635	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	22	807	560372	557689	FALSE	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHLGNAANPRVRSGEANLGELSLRSARRVGSWSWRRTGPESQCLKLLLLPSQTGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	560393	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858_560125_560368
880379	contig_11422_pilon	-	608	2	Intergenic	novelGene_98987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_555_621
880380	contig_6589_pilon	+	591	5	Intergenic	novelGene_26159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6307.46157340653	24216	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	230	469	1886667	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885104	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885112_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
880381	contig_16496_pilon	-	1502	2	Intergenic	novelGene_5211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	185	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	25	CTCTTCCTAATGATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	33	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
880382	contig_7959_pilon	-	5254	5	Intergenic	novelGene_178214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1003	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1793	2323	390214	389684	TRUE	20	ACCCTGTTGCCATCAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTLDDPPLEENALELADREFKSLILRILQELRQKADKHEEKNRQIHGKYGQNTGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYKTQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLYTSLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTTKSKTLRVIGIPEQGGENRKHREDH	392151	347501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7959_pilon_-_347591_350488_352794_388415_388423_389153_391041_391185
880383	contig_14790_pilon	+	2830	2	Intergenic	novelGene_127922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAGAGGTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282115	330743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_283113_328910
880384	SIRV6	+	646	4	ISM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	287	350	243	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCAACTCACCATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2759	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880385	contig_10596_pilon	-	4262	3	Intergenic	novelGene_173583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2097	2801	340345	339641	TRUE	50	TAAATTTCTTTAACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKITKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILTAAREKQEVTYGGETIRLSSDYWAETMQARMQWDDIYNILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVQVKPHLQELLKRVLRSEDKQLQLTGRT	342593	181432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_182825_339571_341475_341626
880386	contig_5217_pilon	-	509	6	Intergenic	novelGene_135772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2993.16251479935	72	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	22	507	560372	557644	FALSE	15	ATATCTTGTGTTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISMFI	560393	557641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557652_558338_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
880387	contig_16103_pilon	-	2074	4	Intergenic	novelGene_118675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	463.627963877168	1050	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTCTCACCTCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3410	179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1979_2484_2646_2937_3032_3390
880388	contig_3627_pilon	+	3610	4	Intergenic	novelGene_78496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	5232.36290365601	21406	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	194	658	626132	634316	FALSE	15	TCTCAGAGTCTGCTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAASHLWLLSTRNVTSPNGDVCYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621257	637268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_626071_626199_630851_631000_634066
880389	SIRV1	-	1565	8	NNC	SIRV1A	novel	1363	6	NA	NA	1	-396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1626	40	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	26	340	11617	11142	TRUE	10	CTGAGTGGTCACCGGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRIGVLSAAVPALLHPFPLIADGKVKVYSAVAVDLRFSIKNLLAKTVGASAPLFPAILLPVAFKLAICGFVERPGSIVICIVVTSITDYKISILHSPVRSI	11642	1402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1485_6337_6472_6557_6818_7552_7815_10282_10367_10647_10792_10882_11243_11403
880390	contig_19518_pilon	-	404	3	Intergenic	novelGene_170729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10325	junction_2	1849	125	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49278	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623_47728_49223
880391	contig_8616_pilon	+	1392	10	Intergenic	novelGene_72584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_3	617.136577716437	5884	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	4	1317	425778	436516	FALSE	5	CCTTTTCATGTCCTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMAAGTLYTYPENWRAFKALIAAQYSGAQVRVLSAPPHFHFGQTNRTPEFLRKFPAGKVPAFEGDDGFCVFESNAIAYYVSNEELRGSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425774	436591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425790_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
880392	SIRV6	+	997	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	34	132	-10	-132	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTGTTTAGAAAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2506	11558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880393	contig_7963_pilon	+	1585	6	Intergenic	novelGene_58372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1176.26789465666	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	87	851	51450	63007	TRUE	50	AAATATGCAAGAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51363	64339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003_63203_63800
880394	contig_19459_pilon	-	2218	8	Intergenic	novelGene_59803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	7597.68620793763	84	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	638	979	11335	7003	FALSE	15	AATGTTGTGTTGTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19033	5763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15776_16153_16265_18988
880395	contig_9706_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_20762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159	1706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_1700
880396	contig_4131_pilon	+	1632	3	Intergenic	novelGene_127873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	684.5	5983	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	955	1347	240672	241064	TRUE	5	TTTCTTTGTGTGTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	222794	248865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_223022_239944_241199_248714
880397	SIRV3	-	409	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	1	69	1	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTTTCTCCTTTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	1069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
880398	contig_14341_pilon	+	673	6	Intergenic	novelGene_111854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	55	669	548758	551737	FALSE	30	CTGGCTATGGCCCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547761	551741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
880399	contig_4232_pilon	+	1546	1	Intergenic	novelGene_63292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACCTCTGCGCTCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466563	468109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466600_468100
880400	contig_9839_pilon	-	1231	7	Intergenic	novelGene_88480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3925	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGTTTACAGATTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61483	45252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45422_49447_49798_52064_52202_54064_54121_57650_57850_59824_59925_61263
880401	contig_11088_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_85037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	152	439	14398	14685	TRUE	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGAAQGWHRSGLKKCLQHEGGGKCLEEALRICGRWEERRLQEKVARTAGMGRILIWLHLGGLQPSDLSRSGSEDLGTGGCPPPCAASVRLRRLRDGAAPAGGSLLRAEASRRGPLPGGLRRQVLPERPPVTGSSCPHSALPGAG	14246	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
880402	contig_17964_pilon	-	2166	10	Intergenic	novelGene_33878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6604.67428940563	180	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	218	1108	144952	135358	TRUE	55	AAATTTCAATAAAGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	163194	134221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134819_134896_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_155391_155447_163035
880403	contig_9706_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_20763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159	1706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_1700
880404	contig_1443_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_28186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	473	937	344128	344592	NA	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343655	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343700_344900
880405	contig_3942_pilon	+	610	5	Intergenic	novelGene_128628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGACTGATGATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176947	180106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
880406	contig_11316_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_122615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	672	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTATGAAGACCAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139370	137238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137200_139400
880407	contig_11309_pilon	-	4143	8	Intergenic	novelGene_149855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2302	junction_7	1690.83161521791	2522	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	260	1153	65730	56293	FALSE	20	ATTTCTATTTAATCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65989	53302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
880408	contig_12019_pilon	+	1004	4	Intergenic	novelGene_87624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	363	686	5225	8336	FALSE	55	ATAAACATGAAGTGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_5400_6114_6226_8298
880409	contig_12677_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_110773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2734	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2700
880410	contig_12864_pilon	-	474	3	Intergenic	novelGene_76362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	898	junction_2	231	5848	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	59	370	176557	167907	FALSE	20	TTCAGTGTTCTCTCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFVRNLVEKAPAMVNAAVTYSKPRLATFWHYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIVNSAQTGRFKQLTVKEALLNGLVATEVWMWFYIGEIIGKRGIIGYDV	176615	167802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_168006_169369_169531_176505
880411	contig_11316_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_122625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	274	786	137674	138186	NA	45	TCAACTATAAGAACCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137400	139356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137400_139400
880412	contig_16103_pilon	-	1051	5	Intergenic	novelGene_118674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	405.339672373677	11198	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3670	165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_450_1317_1412_1746_1979_2484_2646_3390
880413	SIRV5	+	1980	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	15	34	-4	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
880414	contig_5434_pilon	+	1923	2	Intergenic	novelGene_74648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAACAAACAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175059	178915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_176146_178078
880415	contig_2438_pilon	+	1816	5	Intergenic	novelGene_112006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	456	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	569	1168	310588	312871	FALSE	10	TTGGATGGACTCTGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	304597	313519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
880416	contig_1719_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_87331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGTATGTTGACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510503	508632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_508600_510500
880417	contig_16525_pilon	-	715	7	Intergenic	novelGene_133811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	1914.98430512861	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTGTGAGATCCTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97634	91521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96733_96975_97069_97167_97605
880418	contig_8317_pilon	+	1154	3	Intergenic	novelGene_19307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	425	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	25	411	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15918	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
880419	contig_7182_pilon	-	1193	5	Intergenic	novelGene_117139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	6954	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	81	728	889318	887056	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891340	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
880420	contig_3095_pilon	-	1283	6	Intergenic	novelGene_75233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_3	861.747666083291	14560	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	144	941	255481	246716	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGLLH	255624	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_246730_247362_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
880421	contig_4232_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_63304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCCAGCGGTGCGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468109	466750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466800_468100
880422	contig_10689_pilon	+	2409	5	Intergenic	novelGene_118612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1813.85611336732	31	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	697	1215	57608	61101	FALSE	25	TATTTCAGAGTTACTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	50844	62295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_54066_54229_57575_57792_58211_58374_60928
880423	SIRV7	-	1299	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	156	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147762	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1815_43049_43078_114680_114989_147608
880424	SIRV6	+	1437	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	79	12	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880425	contig_10404_pilon	+	2321	6	Intergenic	novelGene_138673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	3981	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	22	471	1085448	1099868	FALSE	20	AATTGTTACTTGGTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGSACSMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085426	1101718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
880426	contig_11422_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_99020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTCAAATACTTCGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687	32	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
880427	contig_8620_pilon	+	2231	5	Intergenic	novelGene_173869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	99.0025252203195	7748	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	176	601	57797	60703	FALSE	40	AACCCAGCAATTCAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFACAKLACTPALIRAGSRVAYRPISASVLSRPEARTGEGSTVFNGAQNGVAQLIRREFQTSAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	57434	62333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57537_57723_57836_59040_59119_59712_59907_60588
880428	SIRV6	+	271	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	293	15	-214	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAGTGCAAATAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2809	10800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
880429	contig_14133_pilon	-	814	6	Intergenic	novelGene_119934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1574.14477097883	2546	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	138	773	209116	206601	FALSE	25	CTCAAGTAGTATCATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSAEELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209450	206559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_208728_209012_209131_209327
880430	contig_6102_pilon	+	405	3	Intergenic	novelGene_31816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATCGTCTTGTCTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360230	361218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
880431	contig_4812_pilon	-	706	6	Intergenic	novelGene_103671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	8	526	82626	79235	FALSE	15	CATGTCTTGTAGGTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82633	79054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
880432	contig_12677_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_110791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10679	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3496	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3500
880433	contig_11316_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_122624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	277	789	137674	138186	NA	20	GCCATAGCTGTGGTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137397	139080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137400_139100
880434	contig_6233_pilon	+	3939	7	Intergenic	novelGene_74771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	299.679643767956	198	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1029	1793	121401	131406	FALSE	80	GCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVHYTSSSNAFLGYGSGLWDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	120372	133552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_121461_123348_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
880435	contig_13244_pilon	-	2598	5	Intergenic	novelGene_86958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3014	junction_1	977.020310689599	301	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	17	430	299402	296835	FALSE	35	CTCAACCAGGTTACATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVGTMKVELCSFSGYKIYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQKPEVRKAQREQAIRAAKEAKKAKQASKKTAMAAAKVIVGFS	299418	294666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296920_297254_297392_298566_298678_299204_299281_299397
880436	contig_16010_pilon	+	1200	2	Intergenic	novelGene_165262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	789	junction_1	0	274	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAACAGTCTCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23285	25013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16010_pilon_+_24230_24757
880437	contig_11752_pilon	+	1478	9	Intergenic	novelGene_37636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	6872	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	67	1185	84194	105616	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84127	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
880438	SIRV3	+	1221	7	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	3	975	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5681	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCGGCAAAGCGCAATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	9914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4087_4544_4775_6057_6334_8755_8967_9189_9325_9667
880439	contig_10861_pilon	-	2222	6	Intergenic	novelGene_39354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	1362.63823518937	604	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	19	555	1585418	1581171	FALSE	5	CCTGCTTTACCTTTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLFSIMAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFSDTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGCIGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK	1585436	1579503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1581201_1581626_1581738_1582708_1582841_1583241_1583349_1584525_1584677_1585412
880440	contig_7182_pilon	+	3569	4	Intergenic	novelGene_117130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTTTGCCTCTTGGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884096	889280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_887232_888168_888345_888814_888961_889168
880441	scaffold_13505_pilon	-	1598	5	Intergenic	novelGene_111432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	234.134977096546	7127	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	394	669	532469	531050	FALSE	15	GTGGGGCTGGTACTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535592	530120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
880442	contig_854_pilon	+	6127	10	Intergenic	novelGene_36128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59101	99	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	5554	5934	976970	1078926	TRUE	20	AGGCCCCAGGTTACTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGVSTHLLGPAHLPRGQRQVVLLLHCFEELNGWHLGHDWAWGLLGLGHLVQAPHLRRRVRGRGLAPGREQARPESREEAVITHLLQDKEPLGVGGPRGLMCPGLPWAQDRAAEFSRSRAAERGC	433816	1198153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_433908_529180_529409_619201_619377_814884_816611_883079_883592_902893_904450_964590_964710_975823_977344_1078919_1078932_1197965
880443	contig_11422_pilon	-	673	1	Intergenic	novelGene_98986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
880444	contig_10973_pilon	-	864	2	Intergenic	novelGene_150370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3289	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2217_3106
880445	contig_1150_pilon	+	501	4	Intergenic	novelGene_61431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGCCGCCACCGAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308930	311037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_308938_309040_309387_309813_309927_311002
880446	contig_8616_pilon	+	1716	10	Intergenic	novelGene_72586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	886.835837384313	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	691	1644	428108	436516	FALSE	15	GAACCTTTTCATGTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425803	436588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_426146_426887_427047_427756_427821_427982_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
880447	contig_13680_pilon	+	4225	1	Intergenic	novelGene_149610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8236	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1709	2092	443441	443824	NA	30	TATTTAGCCACAATTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKGLEIDRIPIEMFHQTDAVLEVLTCLCQEIWKTATWPTDWKKSVFMPIPKKSDPTEYRNYRTISLISHASKILLKIIQKRLQQYIDRELPEIQVEFRRGRGTRDIIADVG	441732	445957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_441700_446000
880448	contig_4812_pilon	-	1226	6	Intergenic	novelGene_103667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_4	7324.91609235218	415	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	587	1003	81738	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82766	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_81924_82343_82598
880449	contig_1452_pilon	-	4502	1	Intergenic	novelGene_115167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2064	2363	711116	710817	NA	10	GCCAGTTACTGGTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYYYDETVCDLLMCCKFYHCDEVILMRLTRLDSVLMQSLLQYKREKRAETQGYLIPPGKQCWEQSASFGSEVPAQRSSQTKGRLITRTFLQSQWR	713179	708677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_708700_713200
880450	contig_9183_pilon	-	4972	2	Intergenic	novelGene_40276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	4487	4873	301951	301298	FALSE	25	GGGTGTGTGGAATCCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKRKKKTKQIKKIKQNKKGPQRNRKKKKKTNVKRNALRDPSACLWKPKGSLPATQLSLARKGSQFKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRDPTSTAAQTGKQLHTRMELHSPSGRSKDGARSEVLK	306437	301198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_301339_301605
880451	SIRV3	+	2083	5	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	2784	1003	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	9	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATTTTTTTTTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6787	9942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755_8976_9189_9281_9451
880452	contig_6005_pilon	-	2647	4	Intergenic	novelGene_158904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2553	junction_3	2126.89356156396	45	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	40	312	367537	366859	FALSE	55	AAAAAAAAATGAAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLFRGRCLEAFKMVQRLTYRRRLSYNTASNKTRLSRTPGNRIVYLYTKKVGKAPKSACGVCPGRLRGVRAVRPKVLMRLSKTKKHVSRAYGGSMCAKCVRDR	369029	364523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_366967_367290_367391_367472_367547_368999
880453	contig_16098_pilon	+	1434	9	Intergenic	novelGene_46081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.30718913883074	11461	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	837	1433	457627	460253	FALSE	35	GTTCCAAAAGGAATGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPNFQHTAPFGKVSSVLLILGTALRQPIQPLGGGLAICSCQGYHTLVNLDAHNTALGFDNLGEWTPIIRLLVECLMEEDDTPNAGVHAVVSSQQQLAVESPVLLGVLSSNGLQPLGNASCGLICSQDALARSHNAMSDFKKLLLLLRGQCWVLVGHGVGGGRFLAQKRGGLEGCSGGERRVDCESEHSVRHQHLGSAA	456062	460254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456374_456462_456663_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458621_458707_458842_460152
880454	contig_14744_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_65932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	153	407	163477	163731	NA	30	TTCAAGGTGGAAACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRRQSRGQGVTPHHQAGLPGWGHEDQVPGGDLSVSLPIREFEIINFFLGMALKDKVLKITPVQKQAHAGQWTRFKAFVAIGGYSGHVIVGIKCSKEVATPSVGPSFWPSSPLSTCGKATGGTRLTSPILFPAR	163324	164910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_163300_164900
880455	contig_5594_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_150122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76426	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGATGGGGTAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145600	144096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_144100_145600
880457	contig_3942_pilon	+	522	5	Intergenic	novelGene_128631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	3564	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCACAAGCCACGCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176948	180019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
880458	contig_20951_pilon	-	794	2	Intergenic	novelGene_43070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGCAAGGAGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27565	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
880459	contig_21007_pilon	-	1426	2	Intergenic	novelGene_161529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10559	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1967	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564
880460	contig_19098_pilon	-	724	4	Intergenic	novelGene_65789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	476.35584271518	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTACTATCTGGAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63939	50561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_52524_52579_59807_59941_63908
880461	contig_12677_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_110868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGATGTGCTGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2948	3649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3600
880462	contig_500_pilon	+	2234	12	Intergenic	novelGene_31051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1063.63581973568	29	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	318	1295	1492663	1498065	TRUE	15	GTAGAGCATGTTTTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485773	1500113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1490762_1490903_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
880463	contig_12677_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_110808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3900
880464	contig_11720_pilon	+	1819	13	Intergenic	novelGene_43846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_11	2632.84544530986	14	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	129	1025	78465	98482	TRUE	5	CTGCAGGGTTGGCGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68100	104784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299_99032_100050_100112_101159_101307_104747
880466	contig_15114_pilon	-	830	5	Intergenic	novelGene_121230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_4	345.389182662109	84	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	92	565	1699026	1691054	FALSE	20	TCTTCAGTTCTCAAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTKAVCVLKGDGPVAGTIYFEQKGDGSVMVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1699117	1690788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990_1695085_1698954
880467	contig_17440_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_7541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74555	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_600_3000
880468	contig_663_pilon	-	1146	3	Intergenic	novelGene_163748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	530	junction_1	39.5	9733	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTAAACATGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103327	99772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_663_pilon_-_100607_102049_102194_103159
880469	contig_4797_pilon	-	529	6	Intergenic	novelGene_6909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45959	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGACGGTGGAAACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371754	368343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_368394_368540_368589_368762_368841_369851_370024_370912_371016_371676
880470	contig_1641_pilon	-	6501	4	Intergenic	novelGene_172795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	151	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93297	84611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1641_pilon_-_85800_87810_88317_88370_92483_92602
880471	SIRV6	+	1153	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	155	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2482	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
880472	SIRV5	+	766	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-436	875	-322	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	153	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7879	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
880473	contig_12081_pilon	+	1665	5	Intergenic	novelGene_166968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	626.654609813093	8798	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	194	829	16400	18277	FALSE	35	GGTGGAATACCAGAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPLARLVKLQCAENSAKQEAEDCVSDKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15689	19113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
880474	contig_12677_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_110787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3068	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3100
880475	contig_6102_pilon	+	654	6	Intergenic	novelGene_31967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2298	junction_1	387.78839590684	6081	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	42	497	413086	416047	FALSE	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413044	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
880476	contig_6165_pilon	-	3686	4	Intergenic	novelGene_167415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	683.778229155233	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3151	3600	493933	489749	FALSE	25	TAAAACTTTGTGGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKVVLKPRTPPGQNGLPTQEKEKKTSKQTKAPGSHQCGSPDREAAPHSNGALQRLRKKQDGSRSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKKATAAANKWHSESRPVQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	501138	489662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_493612_496007_500061
880477	contig_8620_pilon	+	609	4	Intergenic	novelGene_173874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	204.364054243075	453	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	66	464	57797	60703	FALSE	10	TTTTTGCTGTGATTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFACAKLACTPALIRAGSRVAYRPISASVLSRPVFNGAQNGVAQLIRREFQTSAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	57731	60848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57836_59040_59102_59722_59907_60588
880478	contig_1150_pilon	-	604	3	Intergenic	novelGene_61399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311036	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
880479	contig_10973_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_150312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
880480	contig_6929_pilon	+	1836	8	Intergenic	novelGene_139384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2091	junction_1	4962.03419856767	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	685	1065	127176	130939	TRUE	40	TTTAAAAAGGGAGCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQPHRRRRPSYHHTPGGAAAAAAGPSHHHRNHEQRGRDPAAARRPPAAPALSAADTKPGTTGSGAGSGGPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101661	132688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
880481	contig_500_pilon	+	1533	11	Intergenic	novelGene_31042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	921.99937093254	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	187	1164	1492663	1498065	TRUE	35	TGAACTGCTTCAAAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485764	1499543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
880482	contig_15327_pilon	-	2678	5	Intergenic	novelGene_70609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	193	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	77	487	901528	900904	TRUE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902104	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899149_899306_901033_901126_901281_901400_901536_902035
880483	contig_4426_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_15448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	40	636	862341	861745	NA	75	AGCATAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYYLTLALLARIKNPGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWIMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRAVRVVTRIDICTPMFMTALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNSESANHLITWMKLVDIMLREMSQSQKHKYCMRPLL	862380	860442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_860400_862400
880484	contig_12677_pilon	+	1360	2	Intergenic	novelGene_110795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1168	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAGGGTAGGTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3374_3532
880485	SIRV3	-	1249	2	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAATTGTGATTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8195	6804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_7983_8124
880486	contig_10973_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_150309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
880487	contig_17075_pilon	-	712	4	Intergenic	novelGene_131746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_3	2470.6523205196	46	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCTGTTTTCAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91154	87990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_91038_91136
880488	contig_11316_pilon	-	1857	2	Intergenic	novelGene_122630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15959	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGCCCACTCCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139376	137414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137650_137754
880489	contig_11316_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_122639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	214	726	137674	138186	NA	40	GACGACCCACCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137460	138867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137500_138900
880490	contig_8620_pilon	+	690	5	Intergenic	novelGene_173871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	99.0025252203195	7842	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	120	545	57797	60703	FALSE	10	TTTTTGCTGTGATTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFACAKLACTPALIRAGSRVAYRPISASVLSRPEARTGEGSTVFNGAQNGVAQLIRREFQTSAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	57490	60848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57537_57723_57836_59040_59119_59712_59907_60588
880491	contig_14814_pilon	+	1979	3	Intergenic	novelGene_137705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1173	junction_2	77.5	6880	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	954	1283	283904	284233	FALSE	20	TTGCAGACTTGGGTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGHRQVCAQEDWLRGVTSVRWCRPILPCPWSRSWVGYRTVGQAQPGVSWGKGCGDRLGLKGEGLPLPLQNRLPPSPPCSVPALTNVDRSTSCPLASPRSVCLSPAPP	279160	284929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_282889_282992_283413
880493	contig_15765_pilon	-	2520	2	Intergenic	novelGene_177800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	1534	2520	1990	1004	FALSE	35	GAATTATTAAAGGGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLQVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQ	3843	1003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15765_pilon_-_3004_3323
880494	contig_11720_pilon	+	1240	8	Intergenic	novelGene_43854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_7	1578.75961386379	55	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	60	956	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	78405	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
880495	contig_500_pilon	+	1800	11	Intergenic	novelGene_31055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	989.960933572634	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	408	1385	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1486408	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1486669_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
880496	contig_6929_pilon	+	1260	8	Intergenic	novelGene_139386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2091	junction_1	4962.03419856767	463	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	481	861	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGGLTSAAPAGGDKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101865	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
880497	contig_854_pilon	-	5455	6	Intergenic	novelGene_36333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	130	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4595	4936	881707	881366	FALSE	45	AAACCTAGGAAGATAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRISKIENKHLDATLLEGKSEKRMKKNEETMRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQRDKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQETQRTPYKIDPKTKSSRHIIITLAKAKDK	977080	880846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_881838_881975_882984_883073_883592_902893_904452_964593_964718_975824
880498	contig_15327_pilon	-	3911	4	Intergenic	novelGene_70488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	989.31322980473	37	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGTACCCTAATGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411560	398297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409966_411409
880499	contig_10196_pilon	+	946	8	Intergenic	novelGene_132088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	5648.20699380768	11676	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	23	904	906520	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDAGAAGGPGGPGGPGMGTRGGFRGGFGSGLRGRGRGRGRGRGRGRGARGGKAEDKEWLPVTKLGRLVKDMKIKSLEEIYLFSLPIKESEIIDFFLGMALKDEVLKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	906338	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_906358_906516_906697_906783_906874_907382_907491_907737_907912_907991_908152_908260_908353_908475
880500	contig_10139_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_177811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCATGGTAGGCACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184203	183378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_-_183400_184200
880501	contig_20199_pilon	-	750	3	Intergenic	novelGene_82527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	285	34	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44036	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_42110_42397_43892
880502	SIRV3	+	1434	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4835	39	2776	-37	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	37	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATTAAGAGGACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6779	8900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
880503	contig_4315_pilon	+	2659	2	Intergenic	novelGene_46850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2774	junction_1	0	24	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAATCATGAAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578024	581907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_578863_580086
880504	contig_5445_pilon	+	551	4	Intergenic	novelGene_135423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2710	junction_3	105.805901956785	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	43	396	51744	53758	FALSE	25	TTTAACTCTACTTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGSLGPSLLAPRKMKVSVAALSFFILAVSLGSQGRVIQELRESLLMDLQHESNVLHSLHHAPDCCVSYTPRNIRCVFMEDYFETSSGCSKPGVIFITKRGQRVCANPSSNHVQNCMEQLKGDHWVKKLEQ	51701	53913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53240_53646
880505	SIRV1	-	369	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	527	9	-325	-9	3prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAGAAGGTGTGAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11116	10656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10792_10882
880506	contig_15114_pilon	-	648	5	Intergenic	novelGene_121231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_4	345.389182662109	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	59	445	1695069	1691054	FALSE	10	TTTCCGTGATCTCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGPVAGTIYFEQKGDGSVMVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1698997	1690850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990_1695085_1698954
880507	contig_3627_pilon	+	6014	1	Intergenic	novelGene_78521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAATGTTACTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628943	634957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_628900_635000
880508	contig_20199_pilon	+	645	2	Intergenic	novelGene_82600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGAGAGGCAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40667	42173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109
880509	contig_5020_pilon	-	3641	5	Intergenic	novelGene_27789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGAACATTGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340878	30043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_32519_150137_150501_229564_229585_281473_281896_340517
880511	contig_16496_pilon	-	1431	3	Intergenic	novelGene_5158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_386_489_1354_3413
880512	contig_8317_pilon	-	1144	3	Intergenic	novelGene_19312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTCACCAGCCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17249	15928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_15968_16045_16281_16379
880513	contig_18208_pilon	-	425	3	Intergenic	novelGene_176190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2379.5	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGCTTGTGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155468	154376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155355
880514	contig_10196_pilon	+	544	3	Intergenic	novelGene_132319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17202	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	291	253	543	2389302	2389798	FALSE	20	GATCAGAAGCGTGTCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPTQTLFKDSEARAGRGGRPVAPLLGSSLTIFGGQHGANAAEELVQGSVDGRGEIFTEVAAQSHQQAVAQELEVDGVHPQPVSMQVAQLRQSARQVLQVADSAGQRVRHLLAVGLDLAGAVAQVEVRKVGLGGGEGEEHPAPGPRRHTLRCGCQSCPRRSSRWSCPHQTAPWWVVSESVW	2388935	2389799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2389152_2389265_2389475_2389680
880515	contig_4068_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_161708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1405	1809	75145	75549	NA	25	ATTTTTGAAATGGTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKKQERPPKKKEKKNNVKRNALRDPSACLWKPKGRLPATQLSLARKGSQFKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRDPTSVAAQTGKQLHTLTELRSPSGRSKDGARSQVLERREGEVARGK	73740	76447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_73700_76400
880516	contig_15114_pilon	-	750	5	Intergenic	novelGene_121234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	404.332474580017	24	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	251	655	1698496	1691054	FALSE	15	TAACTGTGTGACTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDGSVMVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1698746	1690958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990_1695085_1698493
880517	contig_9839_pilon	+	1964	7	Intergenic	novelGene_88487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_4	779.358853303292	13345	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	133	867	49467	61360	FALSE	35	CATCTAAAATATTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45308	62457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
880518	contig_8620_pilon	+	830	4	Intergenic	novelGene_173873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_3	88.7956455388814	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	260	685	57797	60703	FALSE	10	TTTTTGCTGTGATTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFACAKLACTPALIRAGSRVAYRPISASVLSRPEARTGEGSTVFNGAQNGVAQLIRREFQTSAISRDIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM	57537	60848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57836_59040_59119_59712_59907_60588
880519	contig_10973_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_150313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGGTTCTTATAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_0_1000
880520	contig_12427_pilon	-	3732	5	Intergenic	novelGene_40449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2184	junction_3	1899.97781237045	24369	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	197	709	316061	314393	FALSE	40	TAACCAGTATATTGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	326035	311369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_325856
880521	contig_7333_pilon	-	2229	2	Intergenic	novelGene_142754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATTGACTTATTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99193	96685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_98792_99070
880522	contig_3077_pilon	+	1707	10	Intergenic	novelGene_26650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	732	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	63	1214	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9613	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
880523	contig_19459_pilon	-	2198	8	Intergenic	novelGene_59805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	583	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	174	959	16240	7003	FALSE	15	AATGTTGTGTTGTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19137	5763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
880524	contig_2069_pilon	-	1096	6	Intergenic	novelGene_23441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1506	junction_5	380.858188831486	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTAATAAAGCTGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331286	1327129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327972_1328524_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330201_1331254
880525	contig_5779_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_106433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13163	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	180	512	94343	94011	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94522	93294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
880526	contig_6546_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_140964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	131	475	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597572	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
880527	contig_10973_pilon	-	932	2	Intergenic	novelGene_150314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15240	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_554_649
880528	contig_16846_pilon	-	1234	4	Intergenic	novelGene_82986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2601	junction_3	2927.41937928651	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	97	615	555239	551492	FALSE	15	GCTGAGCACTACTTCGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPRPEGRQRHAQSAFSAPALPAEKPPPPKAKMSSKRAKAKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	558746	550872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055_555278_558688
880529	scaffold_13505_pilon	-	1072	5	Intergenic	novelGene_111459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	234.134977096546	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	396	671	532469	531050	FALSE	35	AACTGCAGACCTTAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535594	530648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
880530	contig_1301_pilon	-	5064	5	Intergenic	novelGene_47427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1973	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCCCCTGCTCGCTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996763	981518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_981540_983736_983814_986240_986357_990204_990315_992023
880531	contig_4305_pilon	-	2334	3	Intergenic	novelGene_136667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	564.5	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAGATTATGTATGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514683	511107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514648
880532	contig_20951_pilon	-	1811	6	Intergenic	novelGene_43057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	42847	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
880533	SIRV3	+	1998	3	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	4	-12	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	74	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACGAACCATCTCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	7810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4069_4595_4780_6057
880535	contig_4232_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_63293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192083	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468126	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
880536	contig_4797_pilon	+	330	4	Intergenic	novelGene_6917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_3	2066.12315433734	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	3	329	368543	370944	FALSE	30	TTGAGAGCCGAATTCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLIL	368540	370945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368591_368764_368844_369855_370026_370914
880538	contig_11574_pilon	-	1122	3	Intergenic	novelGene_64078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	139.5	35	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	51	524	451135	449890	FALSE	20	CATATTAGTTCTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	451185	449291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808
880539	contig_3942_pilon	+	1888	8	Intergenic	novelGene_128679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	460.109525559083	12	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	264	752	428109	429999	FALSE	25	CTTTGTTAAAGCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQLQPSLSQPLGTGTAVAGGEGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	425840	431135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_425909_426641_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
880540	contig_19459_pilon	-	1466	8	Intergenic	novelGene_59870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	8445.01792025745	40	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	792	1133	11335	7003	FALSE	10	CTGTCTTCTTGTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16793	6669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15858_16157_16265_16672
880541	contig_9839_pilon	-	985	6	Intergenic	novelGene_88514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2490	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGAGACTTTAGCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61492	45374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45610_49448_49613_54063_54121_57650_57850_59824_59926_61263
880542	SIRV7	-	2146	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	32934	2	-73	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
880543	contig_7376_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_108072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	881.450446076743	1907	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTATCTTCTGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80330	70942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_79674_80116_80266
880544	contig_13674_pilon	+	3079	2	Intergenic	novelGene_140308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1182	1562	13719	14099	FALSE	10	ACCCGTGCTTCTAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKNFRVIGVPEQGEKRENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQIILRAAREKQEVTYREETIRQSSDYLAETMQAIRQWDDIYKILKEKIASQE	11596	15616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_11901_12841
880545	contig_4232_pilon	-	1655	2	Intergenic	novelGene_63270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGTATGAATAATAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	463842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_464628_467264
880546	SIRV6	+	1271	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	256	1	-121	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	20	AAAGTTAGGTGCGTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880547	contig_6477_pilon	-	564	7	Intergenic	novelGene_154173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	2937.24676449827	49895	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	28	525	773121	769365	FALSE	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773148	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
880548	contig_253_pilon	-	725	7	Intergenic	novelGene_129684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1568	junction_6	436.090204735977	317	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	21	653	421711	418769	FALSE	15	GAAGCTGTGCTGTGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASTAIMPPYTIVYFAVRGRCEAMRMLLADQGHSWKEEVVTIDNWLQGSLKASCLYGQLPKFLDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNPREAALVDVVNDGVEDLRSKYVTLIYTNYEAGKDDYVRALPPQLKPFETLLSQNKGGQGFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDAFPLLSAYVAQLSARPKLKAFLESPEHVNLPINGNGKQ	421731	418696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_418958_419102_419211_420224_420329_420752_420841_420948_421056_421318_421355_421710
880549	contig_1331_pilon	+	1368	5	Intergenic	novelGene_37815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCTAAAAGGTCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159065	169950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_159231_159308_160217_160874_160949_166402_166534_169860
880550	contig_18869_pilon	-	1989	3	Intergenic	novelGene_56227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_2	1547	903	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	36	395	79419	74943	FALSE	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TALRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79454	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74957_75486_75766_79352
880551	contig_15327_pilon	+	2178	4	Intergenic	novelGene_70617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	178	348	898735	898905	TRUE	10	TTGGTTCGGGCCATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898557	901514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_899441_900005_901035_901128_901281_901400
880552	contig_10749_pilon	-	3278	4	Intergenic	novelGene_133470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	726.120283883233	219	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	234	680	168321	164528	FALSE	90	AAAAAAAAAAACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	168819	161929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168302_168346_168610
880553	contig_10196_pilon	+	815	8	Intergenic	novelGene_132089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5896.09558460997	11436	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	108	773	906823	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKSLEEIYLFSLPIKESEIIDFFLGMALKDEVLKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	906339	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_906358_906516_906567_906783_906874_907382_907491_907737_907912_907991_908152_908260_908353_908475
880554	contig_6165_pilon	-	1393	3	Intergenic	novelGene_167417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	725.5	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	976	1311	493933	489749	FALSE	25	CTTTTAAAACTTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKVVLKPRTPPGQNGLPTQEKEKKTSKQTKAPGSHQCGSPDREAAPHSNGALQRLRKKQDGSRSQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	494908	489666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_493726
880555	contig_4315_pilon	+	2182	3	Intergenic	novelGene_46835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2593	junction_1	90.5	7456	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	178	534	575508	580260	FALSE	50	GAGAATCATGAAAAACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575330	581908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086
880556	contig_14563_pilon	+	7747	28	Intergenic	novelGene_135031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1382	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1153	1467	62926	63240	TRUE	35	AAAGATACTCCATCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLLWKLARSISHRLNLFNKRLCRHVLGEHSGTRVLSLYNKIFQIFKFCFHFAQFIFNSISFLLHFTISSKEKPHGPIKILLTNFSSQTSKFIIYKFYLPPNI	61773	159503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_65405_66606_66647_75195_75374_76340_76511_80678_80773_81215_81316_82384_82531_83279_83434_89283_89356_91433_91588_91927_92086_96549_96739_107763_107957_108805_108898_110643_110860_113623_113748_115996_116177_116346_116392_118159_118259_119823_120052_120931_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131744_133438_133529_136798_137029_158443_158577_158916
880557	contig_16103_pilon	-	903	2	Intergenic	novelGene_118681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5398	junction_1	0	267	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18582	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17743_17879
880558	contig_7963_pilon	-	1061	6	Intergenic	novelGene_58306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	10037	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	37	333	48841	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48877	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
880559	contig_7963_pilon	+	1207	5	Intergenic	novelGene_58356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	10105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	110	874	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQVYNFRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51340	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
880560	contig_18208_pilon	-	235	2	Intergenic	novelGene_176188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4759	junction_1	0	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGCTTGTGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154757	154376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713
880561	contig_18208_pilon	-	311	2	Intergenic	novelGene_176192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4759	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAATGCTTGTGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154834	154377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713
880562	SIRV1	-	809	4	NNC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	-55	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	9	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10695	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_1270_7609_7815_10282_10367_10444
880563	contig_7286_pilon	-	883	7	Intergenic	novelGene_108686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3438.67186893752	21	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	24	815	293122	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293145	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022_292101_293119
880564	contig_12677_pilon	+	1366	2	Intergenic	novelGene_110796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAGAAACGATAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3482_3692
880565	SIRV6	+	1176	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	351	1	143	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880566	contig_8617_pilon	+	698	1	Intergenic	novelGene_73379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCAGAAGTGGAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60778	61476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_60800_61500
880567	contig_12677_pilon	-	1604	2	Intergenic	novelGene_110722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_1437_1496
880568	contig_13674_pilon	+	3079	2	Intergenic	novelGene_140309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1182	1562	13719	14099	FALSE	10	ACCCGTGCTTCTAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKNFRVIGVPEQGEKRENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQIILRAAREKQEVTYREETIRQSSDYLAETMQAIRQWDDIYKILKEKIASQE	11596	15616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_11901_12841
880569	contig_4857_pilon	-	16163	7	Intergenic	novelGene_48715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	787.661729424504	1360	142	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	4085	4759	1193569	1192806	TRUE	25	AGAAATTTCCTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKKKNNIKRNAFRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKETIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLEWSSARSGKKATPAANKWHSQSLPFGCVESKQPLFPGQETVATGSRGGRVGMKKGGGWESIYRQLPVVLSPPGSSVRLLSRTPCLLVSDRSPRWRIHAALAGRGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	1302260	1177410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1193172_1193260_1195387_1299791_1299981_1300182
880570	contig_10958_pilon	+	2032	4	Intergenic	novelGene_5405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	21	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTGTGAATCATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888219	901688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889019_895279_895855_900457
880571	contig_854_pilon	+	2591	7	Intergenic	novelGene_36259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	14847	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	99	677	543600	562402	TRUE	25	TAGAGTTTTACTTCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543501	564941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
880572	contig_6589_pilon	+	604	5	Intergenic	novelGene_26163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1567	junction_1	5734.3447478766	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	6	482	1885124	1887829	FALSE	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKMKMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF	1885118	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885139_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
880573	contig_9706_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_20767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	887	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGGGTCGGGCTAGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928	160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_200_900
880574	contig_11422_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_99064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	548	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2348	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2300
880575	contig_14322_pilon	-	1527	4	Intergenic	novelGene_115675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6339	junction_1	762.024059112746	1541	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	598	927	672553	671886	TRUE	10	CCAGACCTGTGCTGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWPGGPPRHPWSSGCFTGFPRRSLCSGGGAGFSPACWVLCYLLQDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674887	671129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671662_671817_671904_672241_672934_674670
880576	contig_4315_pilon	+	2095	3	Intergenic	novelGene_46839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2593	junction_1	90.5	9688	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	76	432	575508	580260	FALSE	20	CACGTGTATTTACTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575432	581923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086
880577	contig_10749_pilon	-	5819	5	Intergenic	novelGene_133468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	732.574228320926	534	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	95	541	168321	164528	TRUE	35	AATCTAATACTCAGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLERSPLNLRWESCLHPLLWGAVWGGNTGTMWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	168810	158978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_161939_162209_164573_167011_167395_168302_168346_168740
880578	contig_9839_pilon	+	957	7	Intergenic	novelGene_88510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_4	779.358853303292	15950	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	88	822	49467	61360	FALSE	15	CTTGTTTTCTTGTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45353	61495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
880579	SIRV5	+	2022	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	5	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5473	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
880580	contig_10867_pilon	-	423	5	Intergenic	novelGene_159462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3857	junction_4	1100.77359161637	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	79	423	88631	87095	FALSE	20	AAGCGCCAGGTGAGTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQL	91456	87094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_91429
880581	contig_6040_pilon	-	6358	3	Intergenic	novelGene_178215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2588	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2629	3033	279384	278980	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	282012	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6040_pilon_-_1750_87485_88186_278101
880582	contig_1150_pilon	+	248	1	Intergenic	novelGene_61384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15153	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGCCTTGGATGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	309176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_308900_309200
880583	contig_4315_pilon	+	1013	3	Intergenic	novelGene_46846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2593	junction_1	90.5	7032	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	39	395	575508	580260	FALSE	5	TTGTTTTCTCTCTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVSEARKRKNRRLKQAKEEAQVEIEQYRLQREKEFKAKEAAALGSHGSCSTEVEKETQEKMTILQTYFRQNRDEVLDNLLAFVCDIRPEIHENYRING	575469	580878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_578761_578863_580086
880584	contig_20641_pilon	+	3620	9	Intergenic	novelGene_52774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1436.51381389112	653	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	1931	3322	14599	56882	FALSE	15	TCTCTGTGAAAGCTCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	3705	57180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_5227_12293_12337_14232_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
880585	contig_3095_pilon	+	5566	5	Intergenic	novelGene_75157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_4	877.457263916597	6122	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	47	814	220513	226800	TRUE	25	GATACATTCATTGTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220466	231730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_227001
880587	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	602	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
880588	contig_16310_pilon	+	1142	6	Intergenic	novelGene_70076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3478.18259440185	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	285976	289927	TRUE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285794	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879_290265_290343
880589	contig_7376_pilon	-	514	3	Intergenic	novelGene_108076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1792	junction_1	73.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAAGTCTCTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79827	72022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_79674
880590	scaffold_12124_pilon	+	3159	10	Intergenic	novelGene_22327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	635	junction_1	2979.02902815956	11826	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1554	2333	1508626	1509405	FALSE	15	CAAGTCGGAGTCTCGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483572	1510231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
880591	contig_2438_pilon	+	1821	5	Intergenic	novelGene_112007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	12945	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	569	1168	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	304597	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
880592	contig_4232_pilon	+	1159	4	Intergenic	novelGene_63205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1426.88129226724	9151	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	139	663	148204	149200	FALSE	20	GATTCATTAATGGGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCVWLISQASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146284	149696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148145_148539_148806_148884_149087
880593	contig_12677_pilon	-	596	2	Intergenic	novelGene_110781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2940	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2571_2753
880594	contig_854_pilon	-	1417	7	Intergenic	novelGene_36274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	482	838	563319	562338	TRUE	15	CCAGGGGTGTGGAGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563800	543536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562404_563028
880595	contig_4180_pilon	+	3430	5	Intergenic	novelGene_8389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	4	126	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	220	756	875200	888134	FALSE	30	AAGCTCTCACTAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874980	890808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
880597	contig_10749_pilon	-	2678	13	Intergenic	novelGene_133445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1192.62025657327	1512	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	73	1047	155250	144631	TRUE	20	CTGGATGCCACAGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGMDTSVCVSVRCSARQRPAPRSQVDFCLKQTSFFVFFFFFCIRNNLSDRVRMRPPNSFSLVS	155322	135868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_144722_145092_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
880598	contig_6477_pilon	+	831	7	Intergenic	novelGene_154164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	56134	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGTAATTTGCGCGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769110	773202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_769371_769552_769668_770021_770106_770616_770699_771241_771343_772407_772479_773084
880600	contig_15325_pilon	+	3447	7	Intergenic	novelGene_157167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	669.182440660907	12495	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	23	769	93248	96243	TRUE	15	TTCCTTTTGGAGGCTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFFPAGIMEGVEEKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93225	99225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
880601	contig_11316_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_122605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	705	1217	137674	138186	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136969	139376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_139400
880602	contig_7376_pilon	-	879	3	Intergenic	novelGene_108074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	896	35	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGTCTCTTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79864	72020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75556_79354
880603	contig_20819_pilon	+	3994	5	Intergenic	novelGene_55678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3560	3868	69843	70151	FALSE	35	GAGAGCGGAAGTGACGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPFTFSHHDKLLIPAESRNTKRLGLRKCNLWKGGRSPAGSQKYTLRRGGRRSPHTPKPFAAFMHPGSDPSSGPVPRIWKSLVIHSQGRNPRLRTESCRPLG	65398	70277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_65517_65650_65741_65858_65960_66045_66135_66681
880604	contig_20951_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_43045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27064	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27100
880605	contig_20199_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_82538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	119	421	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44105	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906
880606	contig_20199_pilon	+	699	3	Intergenic	novelGene_82522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATGCCTGGTGAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40646	43943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42173_43909
880607	contig_1301_pilon	+	3627	5	Intergenic	novelGene_47428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	308	junction_1	1078.07777432799	1874	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	17	400	983738	992105	FALSE	30	CACCCTATGAATGAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKSGAMPKSKELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL	981524	995332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981540_983736_983810_986236_986360_990207_990317_992025
880608	contig_8045_pilon	-	2907	1	Intergenic	novelGene_35467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	405	2502	2906	524974	524570	NA	30	GCCAAGTGATCTAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDRKCLLEARADRGEENQRRSSCLHCVDSSTAKMVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRCYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLESVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRK	527475	524568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_524600_527500
880610	contig_1150_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_61387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41519	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCAATCGCTGTAACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	309374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_308900_309400
880611	contig_17068_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_172561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	115	477	9770	10132	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9655	10459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10500
880612	contig_1301_pilon	+	3519	5	Intergenic	novelGene_47421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1197.59529892197	1820	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	134	517	983738	992105	FALSE	20	TGTGTCATCGCAGTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSKELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL	957716	995107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_957849_983736_983810_986236_986360_990207_990317_992025
880613	contig_4857_pilon	-	13482	5	Intergenic	novelGene_48714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	687.003275101364	721	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1404	2078	1193569	1192806	TRUE	25	AGAAATTTCCTGATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKKKNNIKRNAFRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKETIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLEWSSARSGKKATPAANKWHSQSLPFGCVESKQPLFPGQETVATGSRGGRVGMKKGGGWESIYRQLPVVLSPPGSSVRLLSRTPCLLVSDRSPRWRIHAALAGRGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	1194972	1177410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1193172_1193260
880614	contig_3529_pilon	-	1101	7	Intergenic	novelGene_105383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_5	687.703101313027	5409	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	161	931	790139	777431	FALSE	25	AGTAAGGTGTTTCTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRVVLSAAATAAASLKNAAVLGPGVLQATRIFHTGQPSLAPVPPLPEYGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYMLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYKEVKNRLDYHISVQNMMRRKEQEHMINWVEKNVMKSISTQQEKETIAKCIEELKLLAKKAQAQPVM	790299	777260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713_778894_784507_784634_785190_785355_786999_787146_789784_789822_790099
880615	contig_10749_pilon	-	1933	13	Intergenic	novelGene_133433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1068.06881800753	26534	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	169	660	155219	149652	TRUE	40	AAACTAAAAACTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSPSGYLCMERYASLQKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPSPPRRA	157606	135449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149679_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154272_155171_155324_157542
880616	contig_15991_pilon	-	1028	7	Intergenic	novelGene_70890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_6	2325.96766004077	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	72	959	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106353	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
880617	contig_3409_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_172309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAGAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121088	123369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_121100_123400
880618	contig_11316_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_122597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	759	1271	137674	138186	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136915	139376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_136900_139400
880619	SIRV1	-	396	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	509	0	-343	0	3prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1583	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGGCGCAAGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11134	10647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10792_10882
880620	contig_1150_pilon	-	456	4	Intergenic	novelGene_61418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30584.16143838	161	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311054	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309177_309342_309385_309812_309927_311002
880621	contig_12677_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_110699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1124	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1100
880622	contig_15047_pilon	+	2908	10	Intergenic	novelGene_52139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2396.64566518383	19813	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	29	652	2194	4178	TRUE	30	CTGTTCTATCAGAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2165	118060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232_21511_87220_87462_116594_117207_117377
880623	contig_11422_pilon	-	1156	1	Intergenic	novelGene_99080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1901	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1900
880624	contig_4091_pilon	-	2501	5	Intergenic	novelGene_172986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	130	432	56589	56287	TRUE	45	GAGGAACTGAAAGGGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	56718	10669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_55003_55543_55617
880625	contig_5092_pilon	-	1595	7	Intergenic	novelGene_62266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	416	junction_6	388.12530193225	4956	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	211	780	252711	232507	FALSE	10	GTCTTTGATCCCACCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRALVILAKGAEEMETVIPVDVMRRAGIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGNHYSYSENRVEKDGLILTSRGPGTSFEFALAIVEALSGKEVADQVKAPLVLKD	254103	231691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252621_252780_253961
880626	contig_2100_pilon	-	1688	12	Intergenic	novelGene_50727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	39	1343	1182812	1170268	FALSE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185449	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
880627	contig_11720_pilon	+	1920	10	Intergenic	novelGene_43816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	197	997	68064	98324	FALSE	35	ATAATGACTACTGCGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYTFSSR	67867	99247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98306
880628	scaffold_13505_pilon	-	1349	5	Intergenic	novelGene_111447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	234.134977096546	7765	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	270	941	535595	531050	FALSE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPSPTQAASPQGNCGHHRCREQFLSHLSLTCTPAGAVPGPDSQRPAVGASGAHLLQGWAGSEAGFGPGRGGVWYPRTADTRPTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535864	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
880629	contig_11752_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_37559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1472.32973791296	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	282	1379	84194	105606	FALSE	20	GTGGTTTATATAGCTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGTQHE	83912	105822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96576_105593
880630	SIRV3	-	615	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	4	-2	4	2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
880632	contig_15327_pilon	-	2817	4	Intergenic	novelGene_70620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2915.88709581759	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	627	1037	901528	900904	TRUE	25	AGACTCTTGATCTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902154	898557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899439_900004_901033_901126_901281_901400
880633	contig_5092_pilon	-	969	7	Intergenic	novelGene_62269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_6	515.396422399518	3574	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	171	740	252711	232507	FALSE	5	TGATTGTTGCTTCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRALVILAKGAEEMETVIPVDVMRRAGIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGNHYSYSENRVEKDGLILTSRGPGTSFEFALAIVEALSGKEVADQVKAPLVLKD	259031	232277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252621_252780_258929
880634	contig_6958_pilon	-	490	4	Intergenic	novelGene_69984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1087	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGAAGCTGCGGCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724733	718489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_718554_718721_718892_723189_723334_724621
880635	contig_8772_pilon	-	1280	9	Intergenic	novelGene_21117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	937	1266	19240	15784	FALSE	10	TGAGCTGCTCGAGCTCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23399	15769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
880636	contig_6102_pilon	+	539	3	Intergenic	novelGene_31796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11669	junction_1	539	1736	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCGTCTTGTCTGTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360259_360591_360615_360864
880637	contig_6546_pilon	+	510	4	Intergenic	novelGene_140970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	114976	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	128	472	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597575	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
880638	contig_11720_pilon	+	1361	10	Intergenic	novelGene_43821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	170	1081	68064	98482	FALSE	20	CGTACTTGAGAATTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67894	98762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98353
880639	contig_5727_pilon	-	2826	2	Intergenic	novelGene_7980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	18	395	298933	298556	TRUE	65	CATTTAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPTEIRVVTRIDIYTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPATDEWINKLWYIHTMEYYSTMKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	298950	295152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_296434_297405
880640	contig_2377_pilon	-	1938	2	Intergenic	novelGene_67885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	0	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGAACTGTGTTTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192971	190938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_192749_192843
880641	SIRV7	-	1907	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33173	2	-12	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114750	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
880642	contig_5302_pilon	+	4831	3	Intergenic	novelGene_81510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	3642	4472	1010891	1011721	FALSE	25	GTCCCTTAATTATGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLMEKKEQEKPPQITEKKNDKRNVLRDPSARLCKPRGYSPCHAAPPGQKGLPTQEKEQKTNKQFKTNKQTKALGSHQRGSPDREAAPHSNGAPQPLRKKQRWRTEPGTQAKGGGGGERQGRNQKKQKKKQHQQPTNGTQRASQCGPVESKQPALPGQETVSARSRVGPVWVKKGREWESIYHKLPELCRPSGRSKDGTQSQVFERKKGEVVRGKEEIKRSGEKQHQQPTNGTQRAGQFGWVESKQPVVPRQDIVAAGSRRG	738190	1012080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_739656_853633_854282_1009362
880643	SIRV6	+	1179	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	348	1	146	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	40	ATTCGGCTAACCAACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880644	contig_19459_pilon	-	1321	8	Intergenic	novelGene_59863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	7394.14587801094	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	202	987	16240	7003	FALSE	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	17257	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17080
880645	SIRV6	+	1295	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	210	-14	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	30	TTGTTTGCGACAGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880646	contig_10078_pilon	-	3822	2	Intergenic	novelGene_159997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1741	2055	169606	169292	FALSE	15	TGATCTCCGAGCTGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRISGSGDKHLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNL	171699	167524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_170852_171204
880647	contig_6958_pilon	+	546	4	Intergenic	novelGene_69985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	62.9444199274249	20	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGAAGTGTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718489	724733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_718723_718949_723190_723336_724623
880648	contig_12081_pilon	+	1111	5	Intergenic	novelGene_166981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1069.07609060347	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	98	733	16400	18277	FALSE	10	TTTTTATTGTCTTTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGSRGDKCERGSRRGSRGTFLSGKRPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	16046	18655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_16125_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
880649	contig_1301_pilon	+	1252	5	Intergenic	novelGene_47425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1197.98922678795	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	179	376	986351	992105	FALSE	30	CCTAACATTTTGTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVRKL	981496	992981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981504_983752_983810_986236_986360_990207_990317_992025
880650	contig_12120_pilon	+	2094	3	Intergenic	novelGene_21446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_2	3	5636	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	140	520	273980	293038	FALSE	50	GTGCCACAATAAAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEIAKAQAARPGGDTIFGKIIRKEIPAKIIFEDDQCLAFHDISPQAPTHFLVIPKKHISQISVAEDDDESLLGHLMIVGKKCAADLGLHKGYRMVVNEGSDGGQSVYHVHLHVLGGRQMNWPPG	273840	294612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_274091_276213_276319_292873
880651	contig_16103_pilon	-	444	3	Intergenic	novelGene_118699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	110	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	64	336	199173	198413	FALSE	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199890	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
880652	contig_15327_pilon	-	1164	4	Intergenic	novelGene_70493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	977.528970869349	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTTTTCTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410681	401046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409830_410392
880653	contig_10958_pilon	+	6080	5	Intergenic	novelGene_5444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4731.09678087439	403	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3271	3609	892868	893206	TRUE	45	ACTAGGGATAAATACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEVTEGPMMCNFVADCKDLGLALSEQGSSCRGLRRGGPWLAWVFRGALWCLGRDQTMRGQMWKQETSEEMLAVMRVGGAGGVGQRSSSTGGKMRLDSGHVLKVELGLLVD	888230	901710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889466_890259_893850_895279_895855_900457
880654	contig_12677_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_110707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGGCAGCTTCACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1500
880655	contig_4232_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_63287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTATCTGCGAGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466563	468067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466600_468100
880656	contig_11309_pilon	-	1640	10	Intergenic	novelGene_149852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2792.86549162701	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	260	1192	65730	54869	TRUE	35	CCCACTTTAGAATATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKLHSECTEKCNSILKKKKGRNEILWTC	65989	50481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_50916_54854_54950_56334_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
880657	contig_14822_pilon	+	1455	6	Intergenic	novelGene_145420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	495.998225803278	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	115	714	183396	190065	FALSE	35	CAGAACAGTCCTGAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSHWLVRLLWCWGHLEKQVWSLFLLGSHSVVKLQCDNKMSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	182343	190806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_182447_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
880658	contig_614_pilon	-	3017	1	Intergenic	novelGene_132607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1662	2258	214272	213676	NA	40	AGCTCAAGTAGATACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYFAKEDIQTANRHMRKCSRSLAIRDMQIKTTTRYHLTPTRLALVQKTQNNKYWRGCGETGTLIHCWWECKIVQPLWKSIWHFLIKLEIEVPHHPPIPLLGIYPRVIRAITQIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWINRLWCIHTMEYYTMIKNNNESVKHLLTWRNLEGIMLSEFSQSQNDKYCIRLLL	215933	212916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_212900_215900
880659	contig_20199_pilon	-	787	3	Intergenic	novelGene_82595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	285	110	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	160	489	43987	40954	FALSE	30	GAAGTCAAAGAGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRCRP	44146	40655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_42110_42347_43906
880660	contig_17440_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_7532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_400_3000
880661	contig_5613_pilon	-	4334	5	Intergenic	novelGene_176654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2578	3159	183260	182679	TRUE	40	GGGACAAGGGCTAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEETLRITWDTIKRKILQVIGVPKQGKKTKNTERIIEELLTENFPTIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRYIIITLTKTKNKQRILRAAREKQKVTYRGQTIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKENNCQPRRIYPAKLSFKYDGEIRLFPDKQKLRNCVKTKPNLQSLLKGILRSENKQHQTTG	209984	181191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5613_pilon_-_181999_182310_183687_200487_200655_204164_204476_208311
880662	contig_5954_pilon	+	564	6	Intergenic	novelGene_28421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1953.7838570323	106386	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	60	311	97851	98335	TRUE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGGTPERFTGD	97520	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98303_98359_98637_98694_98857
880663	contig_3584_pilon	+	2356	5	Intergenic	novelGene_108176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	999	junction_1	917.231806851463	207	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	30	1073	527096	531381	FALSE	10	TTTTCTCTTGGGAGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSAADGPKMSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDIADDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527066	532664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528393_528477_528774_528877_529607_529683_530602
880664	contig_6980_pilon	+	2102	9	Intergenic	novelGene_36020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	7276	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	105	1001	356720	372790	FALSE	25	CTGTGTCATTGGAAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346078	373891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
880665	contig_3747_pilon	+	3779	9	Intergenic	novelGene_24756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3826.39692628718	58	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	361	1368	201481	203804	FALSE	20	CTGATTTCTGGCTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200977	206215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201211_201353_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
880666	contig_12414_pilon	+	2564	1	Intergenic	novelGene_59593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	637	1707	372984	374054	NA	5	GTGGCAGTTCTGCTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372347	374911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372300_374900
880667	contig_15304_pilon	-	1045	3	Intergenic	novelGene_30664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_2	5148	30023	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	307	903	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107175	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106931
880668	contig_3942_pilon	-	529	5	Intergenic	novelGene_128752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143883	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGGCAGAACCGGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795506	792273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_792302_793507_793623_793793_793885_795076_795177_795311
880669	contig_500_pilon	-	1121	5	Intergenic	novelGene_31112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	336.816251834736	7510	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCGTGGTGTCTGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1567685	1559330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1559492_1560220_1560338_1562150_1562259_1566530_1566826_1567245
880670	contig_11422_pilon	-	1487	2	Intergenic	novelGene_99069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2359	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_2038_2165
880671	contig_11719_pilon	+	427	4	Intergenic	novelGene_154740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6658	junction_1	210.252757942012	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	31	426	13921	16321	FALSE	25	CTCGTAAGTGATGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAV	13003	16322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14504_16247
880672	contig_8059_pilon	+	2764	2	Intergenic	novelGene_111093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1205	1654	128537	129359	FALSE	35	AATACTATCAGATCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQSSTRSGKKQHQQPTNCIQRAGPFRCVKSKQPVLPGQEIVATGSRGGRVGVKKGRGWKSIYRKLPVVLSPAGTSVKLISCTACLLVSDRIPRWRIHAALADRGPLLESLLAVHYLLVFHSIWCLAEFFISSFDVLGFQDCCFLCLA	127332	130469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_128557_128929
880673	contig_18208_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_176189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3047	junction_1	0	22	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGCTTGTGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155464	154376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154835_155353
880674	contig_11752_pilon	+	2222	9	Intergenic	novelGene_37561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	74	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	251	1369	84194	105616	FALSE	15	CACAAGCTCCCTGCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	83943	106469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
880675	contig_12689_pilon	+	4176	3	Intergenic	novelGene_145041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	236	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1	393	71951	72343	TRUE	15	CATTTCAGTTTGGTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARSKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	71950	79441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_72513_75731_77357_77452
880676	contig_8452_pilon	+	5695	3	Intergenic	novelGene_48001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	24	123	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1424	1780	263026	263382	FALSE	35	ACTACCTACCTACCTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNFAPGNVTTEVKSVEMHHQILSEALPVDNVGFNVKNVSVKHVCHGNVAGDSKNDPPMEAAGFTTQVIILNHPGQISAGCAPVLDCHTAHTACKFAELKERTDLRSGKKWRMALNS	255040	267297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_255187_260988_261402_262161
880677	contig_2703_pilon	+	2411	2	Intergenic	novelGene_101651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCGGAGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348	3825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_3377_3442
880678	scaffold_12124_pilon	+	2113	10	Intergenic	novelGene_22227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
880679	contig_20951_pilon	-	1867	6	Intergenic	novelGene_43043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13601.3822826947	125	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	342	1340	28919	27149	TRUE	10	GGAGTGGCTCTGTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26822_26892_27293_27504_27687_27784_28224_28685_29178_29940
880680	contig_11422_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_99062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2280	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2300
880681	contig_9389_pilon	+	358	4	Intergenic	novelGene_84035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	13	357	584401	586143	FALSE	15	TGGGCGAGTTCTCCATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHY	584388	586144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
880682	contig_4364_pilon	+	1947	6	Intergenic	novelGene_551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	535	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	15	AACGGCGACTGGCTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880683	contig_10958_pilon	-	3077	4	Intergenic	novelGene_5456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22043	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTGTTCACGTAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901686	889013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_889053_893823_895057_895279_895852_900453
880684	contig_3103_pilon	+	5819	2	Intergenic	novelGene_146173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	185	526	1003	1344	TRUE	35	CTACACTGAAACTACATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFAQFQSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRDCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKVEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVT	818	9648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_4666_7676
880685	contig_4364_pilon	+	1952	6	Intergenic	novelGene_562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	2485	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	75	1202	1530895	1532568	FALSE	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530450	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880686	contig_12250_pilon	-	963	11	Intergenic	novelGene_80700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	188.219579215341	3424	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	80	829	401239	398710	FALSE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQEKVFELMTTLQTKLEGFHTQISKYFSERGDAVTKAAKQPHVGDYRQLVHELDEAEYRDIRLMIMEIRNAYAVLYDIILKNFEKLKKPRGETKGMIY	401318	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
880687	contig_2770_pilon	-	1470	6	Intergenic	novelGene_107475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_1	1798.24743569955	46	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	218	649	750561	743785	FALSE	45	TTTTCCAAATAAAAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEESN	750778	742963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743796_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
880688	contig_8954_pilon	-	2654	6	Intergenic	novelGene_130305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4028	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCACATCCGCCGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640760	618444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_618529_621520_621619_623283_623346_627018_627119_632109_632205_638545
880689	contig_9852_pilon	+	3554	8	Intergenic	novelGene_138453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	353.40483809908	6351	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	63	596	21374	33393	TRUE	40	TTGAAGGCAAGGAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGGRPSRLGAGRGGGAVGTMAYPGHPGAGGGFYPGGYGGAPGGPAFPGQTQDPLYSYFAAVAGQDGQIDADELQRCLTQSGIAGGYKPFNLETCRLMVSMLDRDMSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIAKRYSTNGKITFDDYIACCVKLRALTDRQLSKT	21311	38348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_24546_24617_30839_30884_31683_31832_32069_32184_33370_33434_35430
880691	contig_4797_pilon	+	571	6	Intergenic	novelGene_6911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2294	junction_5	2641.58626586375	4971	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	27	482	368372	371710	FALSE	20	TAGGTACGTGGTGATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCRTAAIMGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA	368345	371799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368844_369855_370026_370914_371016_371676
880692	contig_10140_pilon	+	5510	5	Intergenic	novelGene_148382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2930	3238	307431	307739	FALSE	30	TCCCAAACATGTTTATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIQESLYQNELVNVQSFQDEAAYDKELMVLKEEVQAALKALVKNKGPGIDGIPIEMFQQTDATPGVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVLIPKKGDPTE	97878	310011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_98515_98802_99085_187736_189114_306289_306530_307036
880693	contig_6589_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_26154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_1	6300.3870664825	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCAGACTCATGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1885102	1887951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1885488_1885929_1886062_1886258_1886335_1886652_1886783_1887705
880694	contig_11309_pilon	-	3860	11	Intergenic	novelGene_149849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2964.56007528942	2438	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	139	1032	65730	56293	TRUE	50	TGAGAAAAAGAGCACATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65868	9299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_9438_40486_40593_52783_52963_53887_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
880695	contig_9146_pilon	-	749	6	Intergenic	novelGene_79494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1829.28123589567	8872	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	200	706	146356	142549	FALSE	25	CAATGTTTGCACCTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKCMQLTDFILKFPHSARQKYVRQAWQKADISTKWAATRWAKKIEAREKKAKMTDFDRYKVMKAKKMRNRIIKHEVKKLQRAALLKASPKKATATKGAAAAAATTAAKVPAKKVTTAGKKAPAQKEKAAGQKEKAPAQKAGPPKAQKGQKAPAQKTPAPKASGKKA	147510	142505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_142849_143321_143376_143479_143580_146303_146399_146894_147029_147487
880696	contig_12250_pilon	+	2437	13	Intergenic	novelGene_80586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	709.28267754589	2486	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTGGAATCTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314835	332457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_315396_315596_315757_316413_316457_316647_316755_316838_316921_317883_318061_318238_318321_321446_321564_321701_321829_322337_322828_328400_328449_328603_328687_332096
880697	contig_15123_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_110943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	57	467	690382	689972	NA	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTKQTARKSTGGKAPGKQLATKAARKGAPSTGGVKKPHCYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFHRLVREIAQDFKTDLRFQRAAIGASQEASEAYLVGLFEDTNLCALHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	690438	689456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_689500_690400
880698	contig_5954_pilon	+	983	4	Intergenic	novelGene_28422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	2198.06055927088	652	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	59	304	97851	98188	TRUE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGELGRSVH	97521	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98694_98857
880699	contig_7457_pilon	-	1321	5	Intergenic	novelGene_31683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2019.01783053048	18	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176983	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174445_1174612_1174971_1175539_1175642_1175967_1176324_1176811
880700	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
880701	contig_11752_pilon	+	2081	9	Intergenic	novelGene_37574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	10329	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	113	1231	84194	105616	FALSE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84081	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
880702	contig_19851_pilon	+	997	6	Intergenic	novelGene_29862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	767	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	128	643	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53509	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
880703	contig_1274_pilon	-	2883	2	Intergenic	novelGene_137821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTCAGCTTCAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712638	662009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_663523_711268
880705	contig_10988_pilon	+	5813	5	Intergenic	novelGene_104736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	563	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	1786	2748	176412	177374	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPLEENAVELPDWEFKSLILRILQELRQKFGKSEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMLEDRISGIEDKHLDTTLFRENSEERTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFRNALKDEKLTIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAACAKQEVTYREETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLFKFDGEIRLFPDKQIKGICKSQTKLTRVIKGSSSI	174498	479294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_175429_175556_177468_284669_286752_403988_404248_478663
880706	contig_8571_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_169192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	447	1010	542908	543471	NA	80	AAAGGAGAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRDFTKEDIQVANRHMKKCSQSLAIREMQIKTAMRYHLTPTRLALIQKTQNNKLWRGCGETGTLIHCWWEGKMVQPLWKSILCFLKKLQTDIPYDPAIPLLGMYPREIRAVTPIDIYIAMFITALFTIAKRWKQPRCPSADEWKNKLWYIHTMEYHAMIKHNDEAVKRLIIWRNVEGIMLSEFSQS	542461	544443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_542500_544400
880708	contig_7376_pilon	-	3343	3	Intergenic	novelGene_108075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1792	junction_1	73.5	407	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAAGTCTCTTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82655	72021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_79674
880709	contig_1331_pilon	-	2026	4	Intergenic	novelGene_37791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2608	junction_3	2391.50849651196	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	9	485	169924	160009	FALSE	15	ATGATATGTCTCCCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKMKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169932	158467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860
880710	contig_12677_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_110860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3900
880711	SIRV5	+	1173	5	ISM	SIRV5A	SIRV510	2474	18	6916	1	-257	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7632	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7944	11866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133
880712	contig_6445_pilon	-	3715	16	Intergenic	novelGene_76876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_15	707.304102443449	302	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	220	1458	88578	43105	FALSE	15	CTCTATTGGGCAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96397	40847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89993_90107_96306
880713	contig_8658_pilon	+	5694	4	Intergenic	novelGene_55833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	3488	4447	285552	286511	TRUE	60	GAATCAACAAAACCAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMSISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSPRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKGLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFILKGKKP	243262	351374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_+_245108_271797_272708_284819_287121_350736
880714	contig_12570_pilon	+	5135	5	Intergenic	novelGene_79334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1534	2142	105362	105970	TRUE	45	CAATGCCATCAAGGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTDAEKAFNKIQHPFLIKTLNKIGIEGIFLNIIKRIYAKPTANIILNGERLKTFALKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQGKEINGIQIGNKEVKLSLFADNVIIYIENPKDSMRKLLELIERFNRVAGYKINIQKSVRFLYANKQNNEKEIRKTIPFIIAPKKLKYLGINLTRDIKDLYKENYKTLLQETKRDT	40463	131151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_41750_54519_54634_105228_106459_127083_127407_128969
880715	contig_10953_pilon	+	796	5	Intergenic	novelGene_42547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_1	2568.6180623051	8574	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	295	750	422508	426254	FALSE	10	CTCTGTTTCGACTCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL	419739	426300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_420032_422505_422657_423202_423365_425213_425291_426186
880716	contig_8631_pilon	-	4377	2	Intergenic	novelGene_121982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3221	3598	837202	836825	FALSE	25	AACCCTTATACATTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRRKQNKETNKKYQNENKTKKPKKIKIKNKCPQGCPCVFVQSKGVASKPHSTAQLERAPKPREEKENKQIKADKKAPGVPSAWQHGPGSSFTVEQCFAPFQEEAKMAHGTRYLRERRGSGER	1017534	836045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_837413_1014524
880717	contig_6494_pilon	-	626	5	Intergenic	novelGene_108579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	667.319451237561	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	209	562	3457	2635	TRUE	35	CTTTTTAAAAGACACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	6480	2116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395
880718	scaffold_12124_pilon	+	2403	11	Intergenic	novelGene_22211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	11	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	65	388	1473608	1496374	TRUE	35	TAAGAAACGTTGTTAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSRRPPAPLRGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1473543	1509987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508790_1508936
880719	SIRV6	+	1373	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	153	2	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	AACTGGAAATTAAAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880721	contig_7202_pilon	+	882	4	Intergenic	novelGene_18338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4397	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	388	690	28117	29923	FALSE	0	CGCTGCTGGTTGCCCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTPLHSVRSLDVMKDDSATSLVLQLHQFLSVLPLLVRLVKKIFGKILQSHIITVEVVRHGQVDVGGVELQVDLAVDGGLRVLTVVLAHLRGGCGRHGGG	27637	30115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28147_28486_28634_29797
880722	contig_10235_pilon	+	1461	3	Intergenic	novelGene_46318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	228.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGCCGTGGTCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89933	91855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90005_90395_91509_91578
880724	contig_2703_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_101636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGAGGTAAACGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_1800
880725	contig_11752_pilon	+	1933	10	Intergenic	novelGene_37573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	1316.4660700452	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	113	1231	84194	105616	TRUE	35	GCATTTAACCACACAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84081	106458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597_105821_105960
880726	contig_7286_pilon	+	856	6	Intergenic	novelGene_108702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7375	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	228	326	288412	288510	TRUE	30	TGAAGGAGAGTTTTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCIIFNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286885	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290857_291315_291499_292022
880727	contig_10345_pilon	+	2150	14	Intergenic	novelGene_158369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1351.6130227671	25	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	294	1334	11670	24141	FALSE	45	TGATATCACAACAGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4373	24957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_7611_7840_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
880728	contig_4110_pilon	+	7525	11	Intergenic	novelGene_177874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	157	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	5252	5599	532308	636666	TRUE	25	ATTCGACAGCATTACCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKNTMRYHLTPTRLVLIQKTQNNKCWRSCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWHFLKKLEITVPYDPAILFLGIYPREIRAVTRIDICTPMFIAALFTIAKGWKQPRCPSMDE	203964	766584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4110_pilon_+_204450_204535_205614_215080_215177_339100_340195_341319_341740_402051_402269_428310_429896_532031_532634_636644_637442_713010_713403_765825
880729	contig_15327_pilon	-	1604	4	Intergenic	novelGene_70489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	989.31322980473	21	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGTGTCTATTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411560	400570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409830_411307
880730	contig_20951_pilon	-	823	2	Intergenic	novelGene_43049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	2614	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27589	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
880731	contig_20951_pilon	-	1808	6	Intergenic	novelGene_43065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	19	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	FALSE	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
880732	contig_12786_pilon	+	3159	2	Intergenic	novelGene_103378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11823	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGAAGACAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533910	597365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_535567_595862
880734	contig_9753_pilon	-	1732	6	Intergenic	novelGene_41317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	329.522927882113	69	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAAATCTGTTGTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93896	69102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_85817_85932_86172_86247_93707
880735	contig_15991_pilon	-	978	7	Intergenic	novelGene_70905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	30	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	72	911	105108	100445	FALSE	15	AAGGTTGTGTTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRTPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106353	100377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102234_103594_103703_104975_105142_106315
880736	contig_5317_pilon	+	1122	5	Intergenic	novelGene_76524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3089.94890734459	18	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATACCTGTTTTTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33694	43839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_39690_39795_43197
880737	contig_5039_pilon	+	9150	13	Intergenic	novelGene_64961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23820	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	6578	7480	1679067	1680035	TRUE	5	CCGCGCCCGGGGGCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVD	1653712	1687107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1654779_1655312_1655438_1655545_1655609_1657591_1657741_1662233_1662352_1663443_1663560_1670573_1670761_1670976_1671124_1673047_1673211_1674623_1679968_1680033_1680625_1682882_1683050_1686193
880738	contig_5092_pilon	-	1097	8	Intergenic	novelGene_62271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	620.592113572652	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	302	871	252711	232507	FALSE	15	TAATGATTGTTGCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKRALVILAKGAEEMETVIPVDVMRRAGIKVTIAGLAGKDPVQCSRHVVICPDASLEDAKKEGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESPAVKDILKEQEKRKGLIAAICAGPTALLAHEVGFGSKVTTHPLAKDKMMNGNHYSYSENRVEKDGLILTSRGPGTSFEFALAIVEALSGKEVADQVKAPLVLKD	258989	232280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_252621_252780_258476_258650_258929
880739	SIRV6	+	510	4	NNC	SIRV6A	novel	545	4	NA	NA	22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99650	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2307	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2816_3106_3165_10724
880740	contig_10689_pilon	+	1790	4	Intergenic	novelGene_118629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	78	596	57608	61101	FALSE	25	TATTTCAGAGTTACTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRQQRQLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51284	62295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
880741	contig_10749_pilon	-	988	2	Intergenic	novelGene_133478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1784	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	220	387	167134	164528	FALSE	10	TCTCTGTTCACCTGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	167353	163926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011
880743	contig_5039_pilon	-	9262	12	Intergenic	novelGene_64964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	604	junction_1	770.934658666922	24044	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2033	6102	838	6939	1686270	1674767	TRUE	30	GAATAAATGTGGTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETSTPIEGNQAGDSAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPDLKEASRKSRCVSVQTDPTDEIPSKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKPKSHHDGNIDTESDSFLKFDSEPSVMALEHPVRALGLSETSDSPAVVLESPGVAMEVSEPQNLETLKPVTKTAELPAAGPSVISEQSERSVAVMLEPSMTKILDSFATAPVPATTLVLKSSEPVVAMSVEHQMKSVLKPLESTSPEPSKIMLVEPPVAKMLESTETLVDSSEIPAEVHPEPSTSTTVDFPESSAPEVLRLPEQPVEVPLGSAASSMTRPQELQELPKTTALELPESSVASVMELPGPPATSMPEMQGPPVTPVLELPGPSAIPVPELPGPPSTPVPELPGPPATVVSELPGPSVTPVPQLLQELPGLPASSVGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASSTMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSTMDSQMLATSSMDSQMLASGTMDSQMLASGTMDAQMLASGTMDAQMLASSTQDSAMLDSKSPDAYRLAQDPYRLAQDPYRLGHDPYRLGHDAYRLGQDPYRLGHDPYRLTPDPYRMSPRPYRIAPRSYRIAPRPYRLAPRPLMLASRRSMMMSYAAERSMMSSYERSMMSYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMDRSMMSMGADRSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPPLPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALATEQSALTTESMWPTEAPALPPEESVSLPEPPVSQSENSEPLAAPANYSVSASEASVLATEAVVTVPEPPPEPESSVTSTPVQSAVLAEYEITPEMPVTCMVSETPITSAEPTMLTSEPPVTAEMAGTFDSLRESGCAASEVSMSLLEPAVTIPESTQSTPELPAMAVSEPPAVVVPEPQAMAVPELPAMVVTESSALAVPEPLVVAVPEPLAVASSEPLEVAGPEPLAVSEVLVVAVSEPPAVTEPEHLPVPVPVVSALEPAVPVVEPAMSVLQPAMIASEPPVSVQESMLTVSEPAVTVSAQTQVVSTELVLESASVILESTVMSSTHIIKGMNLIPSDSNLAPEIGMQEITMYSSEEPPAEEHLKSDSYGSEWGMSIDLNVNNHLIAKEMEHSTVSTASTGGVGEVGEEKILPVNETEQCTALLTCPGVSEAEVGGTLSSTDPLALELDAKGTSKGIEFATASAFSSVNTYDVEVSLTTQDTERDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDVHLGLPTNHNLIGEDAEGPLPVKESDQAVAVALSPKESSGEDKEVPVPTEEILPDSGFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTNLRAGIEGPLLPSEVERDKSAASPGVIGLPERASESSSEEKDDYEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRSRSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSVSPSRRSRTRAVGAAPRAVGAAPRADGAAPRADGAAPRAVGAAPRAVGEDQGLW	1687107	1653719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1654835_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593_1657742_1662234_1662352_1663443_1663555_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047_1673209_1674622_1680625_1682882_1683050_1686193
880744	contig_6958_pilon	+	654	3	Intergenic	novelGene_69990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	66.5	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGAATTTGAAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718510	724729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718914_723190_723336_724623
880745	contig_18208_pilon	-	346	3	Intergenic	novelGene_176187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3047	junction_2	856	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	155382	154421	FALSE	10	ATGCTTGTGTCTTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS	155384	154373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353
880746	contig_6958_pilon	+	703	3	Intergenic	novelGene_69988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	66	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGAATTTGAAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718496	724729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718949_723190_723336_724623
880748	contig_15325_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_157178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	727.679874670174	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	6	752	93248	96243	FALSE	80	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMEGVEEKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93242	97558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_94567_95094_95233_95674_95785_96034
880749	contig_854_pilon	+	4133	5	Intergenic	novelGene_36334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2470	2874	976970	994708	FALSE	30	CTATTCTGATATATACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGVSTHLLGPAHLPRGQRQVVLLLHCFEELNGWHLGHDWAWGLLGLGHLVQAPHLRRRVRGRGLAPGREQARPESREEAVITHLLQDKEPLGVGGPRGLMCPGLPWAQDRAAEFSRSRAAERGLGRLACGCK	902316	995967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_902722_902757_903247_903530_904060_975923_977365_994698
880750	contig_20951_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_43079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGCTTACCTGTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27799	26613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27800
880751	contig_4812_pilon	+	4424	2	Intergenic	novelGene_103624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCGTTAAGGAAAAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77053	81739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_81286_81547
880752	contig_3721_pilon	-	3551	3	Intergenic	novelGene_123803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	316	690	86000	85055	TRUE	45	TTTCTAAGTAAAAAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQAFPPPTLLHPYLASCASCNHSLLAGKHELPPNAAWITPASTGQLPECHLLAAGVAFFHFFRFLPYLSPPPPPFSQISGSMHHLCFFLKGCKTPLNSGTCHKKPSQQLPFSWTCPAVPYLRD	86315	80721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_83096_84567_85135_85705
880753	contig_7963_pilon	+	3378	5	Intergenic	novelGene_58406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	4792	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	104	727	56777	63007	FALSE	70	GAAAACATAAAAAATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51487	65658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
880754	contig_5317_pilon	-	768	2	Intergenic	novelGene_76562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAGTACCAGGCCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43824	36697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_36837_43195
880755	contig_11370_pilon	-	813	3	Intergenic	novelGene_98719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22104	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCACCGCCACTTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148544	145681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_145966_147425_147616_148205
880756	SIRV7	-	2019	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33061	2	54	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114862	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
880757	contig_11720_pilon	+	1318	10	Intergenic	novelGene_43845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	138	1034	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68091	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
880758	contig_15952_pilon	-	3557	3	Intergenic	novelGene_154085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	790	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATATTAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811988	599154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_600372_642952_643628_810323
880759	contig_8452_pilon	-	670	3	Intergenic	novelGene_48089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1595	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGCTAGTGGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981706	962613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_963082_968669_968752_981586
880760	contig_6102_pilon	-	3956	8	Intergenic	novelGene_32214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1815.0679191205	145	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	1444	3855	902933	895000	FALSE	20	TTGGATGAACCCAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPVSSSLSVTAALGQPGPTQQCPLATTNQPSPFPPPSNVASTPFEAPFLQSSSGIALPLGASPSPSGTPAFLPDLIGPPISPAALALASPVIAPALKGAHSPSPPLALVALAPPAVQKSSAFPPNPLTSPPVAKAESVSVTSPSTTIAPPSPKTCSIQVPSQVVPNPKSTCSPPGIVSAAQSHLVIPLAPDQSGLASCPEMPPITPIAITSPQVTGIPIPPALTSPQNLVTLKESIGPPAALSLSTQCIPVATSQNTVAPSDPVFLTSVASHLAPLCQSSFGSSVQPSGQTDQNNLSNPTTVASIPVGHSSMGVSSPSQRSVIPPLHSRNEVVPAGGAPTSLLPLNVDTVPSAITSIASHSPSGSPLSPTDSLILQGSPNADYHQPLVAWIPGASPGSPSLKEAPVSSLGATPLVMTNPSTISVAPTAFEVTTCMSPPVSPGSISSKDPTSHSALITGPVTPKEFPTAQEDFQTIPISPVEAPVSPAQAGLPTKKDSTPLALSVPKDSSPQSALSSLEMSLSPEATLAKKSLVEPLPLVKPASAPPSPLSVLHSPASIIKTNPCASPDPASLLLKSSPTTPPVATTAAPAGIPNKKDPATPAGVALITTKGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	904376	894898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_900645_902477_902930
880761	contig_14822_pilon	+	1053	6	Intergenic	novelGene_145419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	495.745337849989	116	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	173	772	183396	190065	FALSE	10	CTTTGATGTTTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	182091	190346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_182253_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
880762	contig_5039_pilon	+	3101	4	Intergenic	novelGene_64977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1699	2691	1679067	1680059	TRUE	15	GCTCCCAGCATGCCTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1677368	1686314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680070_1680512_1680625_1682882_1683050_1686193
880763	contig_6059_pilon	-	3602	15	Intergenic	novelGene_44813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	3939.39028290171	8910	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	568	2007	580626	569146	TRUE	25	AGTTTATATGTATTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584577	566650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580647_580964_581116_584181
880764	contig_2770_pilon	-	1680	6	Intergenic	novelGene_107464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1807.35818254158	26	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	445	786	746670	743833	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	749520	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_749181
880765	contig_17964_pilon	-	2363	8	Intergenic	novelGene_33871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	5098.86663677251	243	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	313	1203	144952	135358	FALSE	0	CTTCTCTCTGGCTGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	147723	134197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_147414
880766	contig_11752_pilon	+	1970	9	Intergenic	novelGene_37637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1059.78028383246	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	63	1181	84194	105616	FALSE	35	CAATAAAGGTCCTATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84131	106405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
880767	contig_6494_pilon	-	832	7	Intergenic	novelGene_108569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	31653	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	27	758	8286	2635	TRUE	25	GACACATGGCCTGACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	2106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
880768	contig_1715_pilon	-	4107	4	Intergenic	novelGene_127196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGCTATAATTTTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652106	303138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_304357_304458_304560_616715_617586_650188
880769	contig_9706_pilon	+	915	2	Intergenic	novelGene_20773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTGACCTCCCCGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161	1145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_481_549
880770	contig_7720_pilon	+	2405	5	Intergenic	novelGene_155768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2989.412849959	33783	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	229	666	700935	707424	TRUE	20	TTAATTGTGCAAGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEKLTQLKALDEVLLNIRMEKKLVAKGGQKKKQVLKFTLDCTHPVEDGIMDAANFEQFLQERIKVNGKAGNLGGGVVTIERSKSKITVTSEVPFSKRYLKYLTKKYLKKNNLRDWLRVVANSKESYELRYFQINQDEEEEEDED	700706	709416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_700998_701856_701962_705016_705142_707279_708941_709193
880771	contig_10930_pilon	+	1438	6	Intergenic	novelGene_37114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_2	8391.02262182626	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCAGTGGAGGCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339571	342953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339622_339803_339921_340505_340639_340994_341098_341522_341625_342020
880772	contig_6017_pilon	+	561	3	Intergenic	novelGene_152541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47037	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAAACGTTCTAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440459	442670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_440708_442124_442225_442457
880773	contig_6418_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_81191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4332	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	83	472	1188392	1188003	NA	40	GAAGTCTTCCTGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKVRAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESQKTKSK	1188474	1186693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1186700_1188500
880774	contig_9705_pilon	-	5824	7	Intergenic	novelGene_41726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGTCGACATATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611578	185131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_186745_187140_187405_188468_189957_262375_263852_407265_407493_486472_486858_611207
880775	contig_7376_pilon	-	5533	4	Intergenic	novelGene_108099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1805	2224	270270	269851	TRUE	55	AATTTAAAAAAAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENGLELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTK	428882	263848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_265870_268562_271108_271254_271903_428563
880776	contig_15720_pilon	-	1101	8	Intergenic	novelGene_41875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	102	1055	283894	278542	FALSE	15	TTGGAAGTGTCTTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283995	278495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
880777	contig_5928_pilon	+	6703	6	Intergenic	novelGene_40347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1909	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2549	2857	155644	155952	TRUE	30	AAAGTGTAGTGTAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGQETVAAGYRGGQVEVKKGGGWESVYCRLLVVLSPAGSSVKLLSRTPCSLVSDSSPRWQIRAALADRGPLHVSLLALCSLSVSYSIRCLAEFFISSFDA	9871	433088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_10460_11399_13329_155612_156065_329258_331694_431700_432494_432582
880778	contig_12299_pilon	+	1730	4	Intergenic	novelGene_29750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	578	junction_1	230.110601426551	5087	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	243	557	356040	372452	FALSE	40	AGGATTATTAAAATTAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHTILLVQPTKRPEGRTYADYESVNECMEGVCKMYEEHLKRMNPNSPSITYDISQLFDFIDDLADLSCLVYRADTQTYQPYNKDWIKEKIYVLLRRQAQQAGK	355797	373625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_356043_359506_359595_364891_365013_372349
880779	contig_5039_pilon	+	4553	3	Intergenic	novelGene_64975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	2753	3745	1679067	1680059	TRUE	0	TGGCGTCCGCTCCGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1676314	1686269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680625_1682882_1683050_1686193
880780	contig_5988_pilon	+	2904	11	Intergenic	novelGene_16088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1942.81719160605	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	395	1108	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210202	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1226117_1226480
880781	contig_6361_pilon	-	4876	8	Intergenic	novelGene_23961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5003.98977551607	21197	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	25	CTTCATGCAATCTTTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	496323	389203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_390941_400462_400568_408714_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
880782	contig_500_pilon	+	3361	10	Intergenic	novelGene_31059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_8	853.79672024796	6249	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	1969	2946	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1490107	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
880783	contig_5020_pilon	+	2540	1	Intergenic	novelGene_27785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	687	1037	30730	31080	NA	40	AACGAAAATATTTTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRERTQPSTKWSEKTDREWRASRDSCRGPLQANAAWIRHLGLLSETSKRGTRKQPHGASSGRQNRLFAIYTFPPPTLLHPDSASSASRGHSLWTGKHRLLGFHTPKRVGSLSAIS	30043	32583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_30000_32600
880784	contig_8954_pilon	+	1040	5	Intergenic	novelGene_130311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_4	127.750489235854	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTTTATCTTGTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621329	639039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_621620_623284_623346_627018_627121_632111_632206_638546
880785	contig_2834_pilon	+	4151	6	Intergenic	novelGene_27996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2294.97532884343	96	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	2633	3208	274763	290707	TRUE	40	AAAATCCTTTACAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	272130	292115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291345_291809
880786	contig_9177_pilon	+	1699	6	Intergenic	novelGene_32680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	735.495044170931	4127	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	14	478	395377	415476	TRUE	25	TGTAATATCTTCCTCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395363	416878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315_415993_416173
880787	contig_10793_pilon	+	3785	15	Intergenic	novelGene_83387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2837.28569000985	10957	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	132	1058	146975	163940	TRUE	30	ACCTTACTGCATTGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	169589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
880788	SIRV6	+	1424	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	78	-11	57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	GTTTGGTCGCAAAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880789	SIRV7	-	2094	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	7	361	2	-359	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGTGGTAACTTAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147916	1364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880790	contig_3529_pilon	-	1466	7	Intergenic	novelGene_105379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_5	687.703101313027	3722	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	87	857	790139	777431	FALSE	30	ATCAGAAAATTCTGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAILLLSVTDSPVGVRGTLRPPPGSFLIMLSRVVLSAAATAAASLKNAAVLGPGVLQATRIFHTGQPSLAPVPPLPEYGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYMLGTGLILYFLSKEIYVITAETITTISTIGLLIYGIKKYGASVGKFADKLNEEKIAKLEEVKQASIKNIQDAIDFEKAQQALVEKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYKEVKNRLDYHISVQNMMRRKEQEHMINWVEKNVMKSISTQQEKETIAKCIEELKLLAKKAQAQPVM	790225	776821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_777509_778713_778894_784507_784634_785190_785355_786999_787146_789784_789822_790099
880791	contig_16525_pilon	-	574	7	Intergenic	novelGene_133795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	37095	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	36	464	97608	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97643	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
880792	contig_2438_pilon	+	4229	5	Intergenic	novelGene_112051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	2569.36737106627	172	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	318	917	310588	312871	FALSE	15	TTCCCTGCTTTATCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	306844	316183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_307134_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
880793	contig_10235_pilon	+	2979	3	Intergenic	novelGene_46325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	843	527	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2524	2850	92983	93309	FALSE	35	TATCAAATCTCACCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSAWWSQRKRTEPRGTRRPQNSGVLFLTSFPWATSSRYHVTEPMAGLPWLALKKQGREVVAPSWVRISGGWITQRAQDPGGQKEDPEKYLHSYTKVKGRDSLESDI	89968	93438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_92461_92590
880794	contig_5324_pilon	+	5319	7	Intergenic	novelGene_102055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	348	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3919	4440	592839	593360	FALSE	10	CCCTGGCCTGGATGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVKGLNVLIKRQRVADWIKKHDPSICCLQETHLRLEDTNKLKLKGWKKIYQANNTQKRVGVAILIYDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQKDITITNIYTPNDRAPKHINSNNNENRDRQLHNSSRRLQHTTFSEGQNIQKEAQQRHGRPKCYSQPT	368185	594239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_368609_368660_368761_369330_370629_370812_370887_520719_520962_568778_570546_592824
880795	SIRV7	-	2440	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	20	2	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5108	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147903	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880796	contig_8377_pilon	+	22540	3	Intergenic	novelGene_34895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2556.5	7587	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3573	4040	71594	72061	TRUE	30	TTTCCTTAAATGCACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTLIHAFIIFRLDYCNGFLISLKSLPFLFMLCSFRRNKRKKKSLISHYCLWYKFYSPGQSTGPTKEEPRACREFFFFLLSLTKREQAGVDSAPFLSTSSRPSGLCTHPVFSLMADSITLAQNFSTEIEHFLPPFFGIFHIVFHFTIIIILLLL	67940	90618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_79220_79276
880797	contig_12938_pilon	-	2429	7	Intergenic	novelGene_99731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7010	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATTGCCCTTGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86402	52004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52044_78097_79228_80719_80795_81369_81459_83391_83468_84548_84632_85465
880798	contig_9839_pilon	+	865	6	Intergenic	novelGene_88526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_3	788.602155716049	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	122	733	49590	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	49468	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
880799	contig_10437_pilon	+	2991	9	Intergenic	novelGene_38307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	898.046621493005	4401	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	48	1070	431167	451175	TRUE	35	GAAATCAATTGATGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431119	461432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075_452926_461261
880800	contig_5020_pilon	+	7804	8	Intergenic	novelGene_27891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	5957	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	324	1253	122915	125772	FALSE	25	AAGGCATTGTGAGACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118501	132323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
880802	contig_8452_pilon	+	5695	3	Intergenic	novelGene_48002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	24	93	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1424	1780	263026	263382	FALSE	35	ACTACCTACCTACCTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNFAPGNVTTEVKSVEMHHQILSEALPVDNVGFNVKNVSVKHVCHGNVAGDSKNDPPMEAAGFTTQVIILNHPGQISAGCAPVLDCHTAHTACKFAELKERTDLRSGKKWRMALNS	255040	267297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_255187_260988_261402_262161
880803	contig_6424_pilon	-	2376	5	Intergenic	novelGene_109241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	569	junction_4	231.810671669792	4339	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	17	496	21039	6307	FALSE	40	AACGATACCAACATTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAWFGMELPAVNLKAILLVHWMLTTWGSIVFSGPYAWANFTILALGVWAVAQRDSIDAMSMFLGGLVATIFLDIIHISVFYPREYLTDTGRFGAGMAILSLILKPFSCCFAYHMYRERGGELQLHVGFLGPSPERSAYQTIDSPDAPNNSFAGPESKGQVAHGY	21055	4426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_-_6423_7842_8039_9173_9280_12062_12098_21012
880804	contig_19098_pilon	-	1875	3	Intergenic	novelGene_65781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_2	303	9101	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	195	380	52529	50887	FALSE	10	GCTGTCTGCCTGATCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGAGLGPEVDCGFRPSRRGGRLGPALGTAPVLLTSWPSPPTSCSSSCLDLLLATSLECIWLRTMKFQTWPKNLKKLRRTWRPRRSHLAHEVTPLSVDTPIGPSLKVFSPLNQRLLFPSQPRQIL	64053	49391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_51068_52524_52579_63908
880805	contig_12019_pilon	+	1025	4	Intergenic	novelGene_87627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	12911	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	363	686	5225	8336	FALSE	10	TCTCTTTCCTGTGATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_5400_6114_6226_8298
880806	contig_1150_pilon	+	576	4	Intergenic	novelGene_61419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49837	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGGGCGGGGCGCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	311054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309280_309326_309387_309813_309927_311002
880807	contig_16594_pilon	-	2390	2	Intergenic	novelGene_53930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1315	1683	318565	318197	FALSE	30	TATGAATTGAGGAACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRELANMGRWNPSDTRVKVVLPSQDTGHRKQRRLSASEEGLGVGKRISLVTGCSVSCWKLGEAAFSYPRSLISDRSPRWQICAALADREPLHVSLLAVCSLSVSYSIRCLAEFFISSFDA	319970	317489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_318608_318698
880808	contig_5317_pilon	+	871	4	Intergenic	novelGene_76511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	42	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	108	518	35282	43326	FALSE	30	TGATGGCAACTAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33681	43679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
880809	contig_8377_pilon	+	6863	1	Intergenic	novelGene_35011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	3378	3845	71594	72061	NA	25	GGCTCCCTATGCGGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTLIHAFIIFRLDYCNGFLISLKSLPFLFMLCSFRRNKRKKKSLISHYCLWYKFYSPGQSTGPTKEEPRACREFFFFLLSLTKREQAGVDSAPFLSTSSRPSGLCTHPVFSLMADSITLAQNFSTEIEHFLPPFFGIFHIVFHFTIIIILLLL	68216	75079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68200_75100
880810	contig_3103_pilon	-	4267	3	Intergenic	novelGene_146174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGGGCTTCCATGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7620	1782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_4143_4453_4783_6042
880811	contig_9538_pilon	-	572	1	Intergenic	novelGene_176446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCCGCGGAGCCTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26755	26183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_26200_26800
880812	contig_1076_pilon	+	2778	4	Intergenic	novelGene_101153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGTATATGTACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060857	1132642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_1061249_1062209_1063324_1083213_1083600_1131755
880813	SIRV6	-	779	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	11	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCCAATAACGTCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11330	10243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
880814	contig_11422_pilon	-	1446	2	Intergenic	novelGene_99056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_912_960
880815	contig_10958_pilon	+	2486	5	Intergenic	novelGene_5420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	192	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	888255	894000	TRUE	40	TCATATCTAAAACTAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888221	901699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894040_895084_895855_900457
880816	contig_8273_pilon	-	5018	4	Intergenic	novelGene_113092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1500	1904	470734	470330	TRUE	25	CAGGTACCTAACGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVLVGIQNKTPEDFPVEEKALELTDREFKSLILRIIQEFKQKADKNEEKIDIFMERADKFMGNTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNEISEMDSIIEGLRSRC	472322	310264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_311119_313236_314780_469612_471736_471824
880817	contig_16098_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_46118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	11	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	678	1772	458816	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460804	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
880818	contig_1150_pilon	-	659	4	Intergenic	novelGene_61427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34432.5655835674	141	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGTGTGACTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310377	308929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309177_309342_309385_309812_309927_310121
880819	contig_2438_pilon	+	3069	4	Intergenic	novelGene_112036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2805.05650566972	153	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	76	408	311995	312871	FALSE	25	CCCAGCAGTGCCAGAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLCPEFATPQSACTIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305092	315532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_311964_312083_312305_312409_312729
880820	contig_12677_pilon	+	1471	2	Intergenic	novelGene_110800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36647	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCATCCATTGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2683_2831
880821	SIRV6	-	517	4	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-8237	49	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACGACCATTGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10784	2309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723
880822	contig_12864_pilon	-	1475	6	Intergenic	novelGene_76407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	652.884185748131	118	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	249	758	251873	242831	FALSE	35	GACAAGTACAACCTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDDAPRKSYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNKEKPPPVPNPDYEPIRKGQQDLYAGLNQRNI	252121	242113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_245915_246329_246348_251863
880823	contig_19459_pilon	-	1228	8	Intergenic	novelGene_59860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7597.31690285781	64	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	174	893	16240	7003	FALSE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19137	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12638_15503_15702_16203_16265_18988
880824	contig_5039_pilon	-	3452	4	Intergenic	novelGene_64980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1392.07670606025	207	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	2063	3451	1679446	1678058	FALSE	20	GTCATGATGCCTACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASSTMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSTMDSQMLATSSMDSQMLASGTMDSQMLASGTMDAQMLASGTMDAQMLASSTQDSAMLDSKSPDAYRLAQDPYRLAQDPYRLGHDPYRL	1687107	1678056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1679595_1679791_1680625_1682882_1683050_1686193
880825	contig_3281_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_128525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1	387	139503	139117	NA	45	TAGAATTACAATATTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAK	139503	138648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_138600_139500
880826	contig_5988_pilon	+	1293	11	Intergenic	novelGene_16096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1946.70923355287	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	191	904	1218380	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210815	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210974_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1224900_1226671
880827	contig_5317_pilon	+	888	4	Intergenic	novelGene_76500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	118	528	35282	43326	FALSE	30	AACTAAATGGTGTTTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33671	43686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
880828	contig_8377_pilon	+	1502	3	Intergenic	novelGene_34893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2556.5	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67940	69567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_69452_69495
880829	contig_12677_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_110819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2163	3865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_3900
880830	contig_1331_pilon	-	3700	3	Intergenic	novelGene_37795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6242	junction_2	1081	14	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1493	1861	167260	166892	TRUE	15	TTGTTCTGTTTATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKEGCDVWNWVIKVKTVFVYLLINLVWYGRNPMLISVFSLTLAFGSDFSKATLIRSYASETIGKNQNSPSLGVHRLYQGVGGEKKKKIPCRVHLDFFHYDIRFQFIYYCGEICITRHFPL	168752	158940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406
880831	contig_14443_pilon	-	2638	6	Intergenic	novelGene_126665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	943.536877922638	25	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	102	455	39405	29618	TRUE	20	AATGTCTTCATCTTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSSLTMGQLYEKEKDEDGFLYVAYSGENTFGF	39506	27320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_28070_28113_28543_28612_29709_37689_37863_38988_39045_39371
880832	contig_7963_pilon	+	2391	5	Intergenic	novelGene_58369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	780.668463561837	14	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	89	922	51450	63007	FALSE	60	AACTCTATCAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKGECSGECSTYSYLHFVIFFSLYAADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51361	64476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51551_56667_56964_57281_57564_57782_57934_63003
880833	contig_2069_pilon	-	980	3	Intergenic	novelGene_23493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	470	38466	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTTTGGTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509914	1508362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509201_1509642
880834	contig_13418_pilon	-	4792	3	Intergenic	novelGene_177919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1484	2317	279852	279019	TRUE	25	CCGGAACTCGTGATACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARACRMQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAAARRNVAPQPRRKGPRQLLESGSRAKRGRRQRVASENPKEAEKEKGGKRKKKKATPAAHKRHPRSRPPGARNPNSRQPWTQILQPREAEEQTNKGPSPSPAQQTRPGRSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQHQHPTNGTQRAARPGARNPSNRCPPAKRPWPREAGEPQPGRRGVGGWEAHTANYRLFCLPLDAPRGFSLVPPFAVL	281335	275290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13418_pilon_-_275770_276043_277780_278758
880835	contig_7229_pilon	-	2369	4	Intergenic	novelGene_39798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1648.12627617614	30467	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAATGGACCTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878214	874013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877272_877535_878190
880837	contig_12677_pilon	+	280	1	Intergenic	novelGene_110838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTGCCCTGCGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3200
880838	contig_12250_pilon	-	1110	11	Intergenic	novelGene_80702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	294.796268633102	1748	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401323	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400687_401183
880840	contig_12948_pilon	-	2578	2	Intergenic	novelGene_126224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	432	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTGATGGAGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369440	366690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_367914_368085
880841	contig_5954_pilon	+	690	5	Intergenic	novelGene_28419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2084.67359555399	7081	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	102	392	97851	98569	TRUE	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQRSVRACALSLLPLSRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGAHSWSEVKSLQLLSRFPLGPACP	97478	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98163_98498_98694_98857
880842	contig_9297_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_69817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186756	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCTTGACCAACCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383477	386160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_383500_386200
880843	contig_6445_pilon	-	1925	18	Intergenic	novelGene_76936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	835.708439083697	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	461	1699	88578	43105	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	91172	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_88839_88950_89656_89714_89993_90107_91007
880844	contig_4232_pilon	-	1442	2	Intergenic	novelGene_63268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTTTTAGAAACCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468109	463708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_463957_466915
880845	contig_14796_pilon	-	3359	1	Intergenic	novelGene_159367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGCAATAATCCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110014	106655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_106700_110000
880846	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
880847	contig_5594_pilon	-	2499	1	Intergenic	novelGene_150114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33525	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_31000_33500
880848	contig_12938_pilon	+	1547	8	Intergenic	novelGene_99697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	620.043415201463	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	119	766	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51944	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
880849	contig_9839_pilon	+	1216	8	Intergenic	novelGene_88489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1576.7720966893	38	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	131	907	49467	60393	TRUE	35	TTTAAAAAATCACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGVTGTWVVTFLVRNTFCHSHKSLLSSHSWTMTKENQRIDAFELWCW	45310	61483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_60255_60484_61264
880850	contig_3077_pilon	-	1670	8	Intergenic	novelGene_26683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGCAGCAGAGCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18074	9672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9705_11258_11477_11858_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_17447
880851	contig_9706_pilon	-	482	2	Intergenic	novelGene_20771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCGGGTCGGGCTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815	161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_488_659
880853	contig_11328_pilon	-	974	7	Intergenic	novelGene_88398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAACTTCCGCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648330	643643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_643687_644248_644381_644803_645014_645225_645374_647062_647221_647897_648120_648269
880854	contig_15039_pilon	-	2809	4	Intergenic	novelGene_110164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	737	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1578	2396	293955	293137	FALSE	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVLVGIQNKTPDDFPGEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKDEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIIQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPSIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPKYIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETT	365992	292723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_294073_312275_312713_314516_314592_365044
880855	contig_8878_pilon	-	2178	7	Intergenic	novelGene_147855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_6	290.110180218941	48	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	33	683	231110	228170	FALSE	30	AGTATAGCACTTGACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231669	226674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231121_231647
880856	contig_10404_pilon	+	1275	7	Intergenic	novelGene_138655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2787.7638838722	8	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	69	659	1085448	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSYLLCIVNLQGRSFSCVTDEVDYERLTNTSKVTQLLKWQSWVTSPADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085379	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085455_1089512_1089650_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
880857	contig_11548_pilon	+	3164	6	Intergenic	novelGene_66752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1352.34099250152	28	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	173	763	112832	119638	FALSE	65	GTAATAAGTGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63736	122039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
880858	contig_9445_pilon	-	4167	4	Intergenic	novelGene_178220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2931	3281	223987	88965	FALSE	50	TAAGCATAGAAGCAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQYHIKKKIHHNQVRFIPGMQGWFNIRKSINVIHHIIKRKEMTKRDGIKKFIESKENENTSYQNLWDAAKAVLTGQFIAINAHIQKEERATIKTLTHNLNK	228962	88078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9445_pilon_-_89148_223819_225656_227330_228108_228477
880859	SIRV6	+	1191	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	617	108	401	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	29	520	1733	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1704	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880860	contig_8377_pilon	+	6821	2	Intergenic	novelGene_34987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5113	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3399	3866	71594	72061	FALSE	35	CTAGCAGTACCAGGATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTLIHAFIIFRLDYCNGFLISLKSLPFLFMLCSFRRNKRKKKSLISHYCLWYKFYSPGQSTGPTKEEPRACREFFFFLLSLTKREQAGVDSAPFLSTSSRPSGLCTHPVFSLMADSITLAQNFSTEIEHFLPPFFGIFHIVFHFTIIIILLLL	68114	75016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219
880861	contig_5039_pilon	+	9262	12	Intergenic	novelGene_64965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24696	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	6624	7616	1679067	1680059	TRUE	5	CCGCGCCCGGGGGCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1653719	1687107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1654832_1655312_1655438_1655545_1655609_1657591_1657741_1662233_1662352_1663443_1663560_1670573_1670761_1670976_1671124_1673047_1673211_1674623_1680625_1682882_1683050_1686193
880862	contig_20507_pilon	+	2083	6	Intergenic	novelGene_164204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	667	junction_2	144.026941924072	3818	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	65	670	46163	75775	FALSE	35	GAATAATTTTGGATTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLSPAFCRSCRSCSLRPPATMEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASSIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAAANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELLRKCLEELQKRFILNLPTFSVRVIDKNGIHDLENISFSKGGS	46098	77188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_46254_50610_50734_52471_52543_72663_72827_74317_74368_75667
880863	contig_4232_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_63283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468029	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468000
880864	contig_10460_pilon	+	2233	2	Intergenic	novelGene_157474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAATAAGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97915	113693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_98016_111560
880865	contig_17440_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_7558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_4000
880866	contig_8878_pilon	-	1150	7	Intergenic	novelGene_147860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_6	290.110180218941	3653	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	161	811	231110	228170	FALSE	35	AAGCAAGTGAACTCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231797	227830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231121_231647
880869	contig_8260_pilon	-	5329	4	Intergenic	novelGene_163264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	148	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	374	745	421554	421183	TRUE	45	TACACCTTAACCTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVSCLENTSFTLVLLGFHPHALAVSLSAFCWLLVLLFSTSLDFFLTSHHLPLLSQIPGSVRHLCFFLKGYETPLDCETASHPVLSCWWDPWGFFVCLFVCSDLFCFDLFVFFFFSQLGSPF	421927	344296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_346165_412621_413202_418105_418613_419553
880870	contig_3747_pilon	+	2854	8	Intergenic	novelGene_24773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4081.07126792434	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	332	1459	201313	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201559_202176_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
880871	contig_13021_pilon	-	3469	6	Intergenic	novelGene_8259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2135	2515	224233	223853	FALSE	35	ATTAAAAAATTCCGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGLEGKFLSTIKGIYRKPTANIILNGQTLKAFPLRMGTRQVCLLSPLLFNIVLEVLARAVRLEKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMISYTENPKNPQENYWN	258030	222898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_224676_234000_234186_238892_239064_254379_254942_256746_257109_257618
880872	contig_8617_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_73385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATTTAGGTTAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61818	60779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
880873	contig_10749_pilon	-	1270	4	Intergenic	novelGene_133471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	730.849277667199	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	50	583	168321	167043	TRUE	10	CCTGTGCCATTACCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGRCLRDLFSPHHPLFRWAPLQEVSVLILPRLSPPPKSKILRLQSSLPSSLPSTSGAAGAKSMSSLHWVPWRCQPCPSTAYQSCLSSRPLSPSPRSSPRESSVPPMWTPSTCATTRVSRMPTPRTLPTSWPPPSSMPTTCPWNASFESLGSWHGGTRNGDGQEDAEENEESS	169037	163916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168139_168346_169012
880874	contig_2834_pilon	+	2178	7	Intergenic	novelGene_27985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2576.40029347581	65	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	277	852	274763	290707	TRUE	50	AAAAAAATCCTTTACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	239245	292112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_239472_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291709_291787
880875	contig_17964_pilon	-	3029	5	Intergenic	novelGene_33861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6058.24491911643	17	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1487	1933	139592	135358	TRUE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	142407	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134957_135024_135640_136905_136999_139520_140968_142296
880877	contig_6059_pilon	-	3672	15	Intergenic	novelGene_44812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6035	junction_12	2985.29580201196	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	242	2077	584299	569146	TRUE	25	AGTTTATATGTATTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584540	566650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
880878	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	1700	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880879	SIRV5	-	714	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14306	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCACCCACGAAAAGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	7930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
880880	contig_9406_pilon	+	4795	4	Intergenic	novelGene_136136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	377	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	695	1441	784	1530	TRUE	20	AATGTCCTCCAGTTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSLSPEQRQHKTQLLGLLKASKLKVPEKALTQLLLLIESVCPWYPLRGNLDVEAWERIGNIIRDMNIPASVLIAWHHCRLALQSLQAVPSAPSPSKENVYDPPFSTPPKADFSQHESLMEKCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFNELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWKLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDNLNHNIPISLDMLLGSGNYSTPKPKAK	89	20182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_3049_3622_3930_4949_5253_18956
880881	contig_10749_pilon	-	2002	15	Intergenic	novelGene_133432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1227	junction_9	945.926575762989	863	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	114	1202	155250	136250	FALSE	40	AAACTAAAAACTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157582	135449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
880882	contig_9112_pilon	+	4583	6	Intergenic	novelGene_60195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	513.259778279966	2514	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	428	1279	108641	114303	TRUE	30	GAGAACTTTCTTACAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108014	119712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108241_108439_108743_111553_112128_113625_113750_114251_114806_116910
880883	contig_6445_pilon	-	3685	15	Intergenic	novelGene_76950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_14	599.75699585885	25	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	2225	3463	88578	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	92202	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89993
880884	contig_12019_pilon	+	771	3	Intergenic	novelGene_87668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	623	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	10	TCTCTTTCCTGTGATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
880885	contig_5217_pilon	-	466	3	Intergenic	novelGene_135755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5823	junction_1	1533	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3	416	558848	557689	FALSE	5	TCTTGTGTTTATGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	558850	557638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674
880887	contig_2438_pilon	+	1577	5	Intergenic	novelGene_112050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	2569.36737106627	3	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	321	920	310588	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	306841	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_307134_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
880888	contig_17440_pilon	+	3768	1	Intergenic	novelGene_7529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242	4010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_200_4000
880889	contig_34_pilon	-	5086	8	Intergenic	novelGene_39973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	6222	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	160	1545	247052	212049	FALSE	5	GTGATTGTGCTTGTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247211	208507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
880890	contig_16525_pilon	-	1004	6	Intergenic	novelGene_133793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1248.10038057842	327	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	565	894	97070	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97634	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069
880891	contig_8878_pilon	+	1027	7	Intergenic	novelGene_147866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	669	1025	228789	231679	FALSE	40	GAGATGGAAAGATGGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRHVLISNSRCYIKHYNGTLGLDIIAISQSSKFFLTSCIPHVEFNRSSVSMEHKRMDLNTQGGYILLLKFTSQMTFHKRSFSSTTITNQYEFKLDLGFSLGSHRDGPSRSVSGPRLT	227837	231681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_+_228213_228311_228487_228670_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231120_231646
880892	contig_6595_pilon	+	2506	4	Intergenic	novelGene_122536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	758	1213	476288	476743	TRUE	15	TCTCTTCTAAGGTCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKYNVVSYRIISRRLQGKPANTTIIQVYAPNTKAKNEEIEDFYQLLQSDIDQICNQDVLITTGDWNMKVGKKEGSVVGKYGLIDRNKDRDRMIEFCKVNDLFIANVFFNNINGDYTHGPHKMDTQESNRLHLWKEMMEKHNIITQNKARG	475530	530576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_476951_495359_495605_517094_517426_530066
880893	contig_6059_pilon	-	1378	8	Intergenic	novelGene_44820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2932.86324541847	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	70	924	573354	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573423	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
880894	contig_11422_pilon	-	601	2	Intergenic	novelGene_98965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5579	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_213_270
880895	contig_3449_pilon	+	3168	1	Intergenic	novelGene_73711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4547	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGTAAAGAAACAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308920	312088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_308900_312100
880896	contig_4857_pilon	-	1850	5	Intergenic	novelGene_48736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2837	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1427	1741	1193569	1192921	FALSE	10	GGCTGAGTTCTTTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKNNTSSQQMALTEPPIRVCGIQAAAVSRSRDCGHRKQRRPSRDEEGWGVGKHISPITGCFVSPWKLREAAFSYPLFAGL	1355599	1192811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193156_1193489_1193615_1193749_1193847_1353393_1354610_1355531
880897	contig_5549_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_81691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATGCTAGATTAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759068	757045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_757000_759100
880898	SIRV7	-	2381	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5147	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2367_2444_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
880900	contig_10078_pilon	+	3486	2	Intergenic	novelGene_159999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3035	3361	171240	171566	FALSE	30	GGAACTCCAAATTCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPVRVCGIQAAGVARSRDCGCGKQRRPSWGEEGWGGGKAYIANYWLSPAGRSVRLLSPTPGLLVSERSPRWQIHAALAGRGPLHESLLAVRSLSVFSLHLVLG	167941	171691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_170909_171172
880901	contig_3942_pilon	+	391	4	Intergenic	novelGene_128783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6656.48841357063	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793568	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793577_793794_793882_795075_795179_795313
880903	contig_2703_pilon	+	266	1	Intergenic	novelGene_101634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCCCGGAGTCGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_1600
880904	contig_17311_pilon	-	531	6	Intergenic	novelGene_57842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	7779.50642650291	40545	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	37	429	126865	119271	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	126901	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344_123555_123642_123709_126862
880905	contig_12279_pilon	+	1133	6	Intergenic	novelGene_50109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3417	junction_3	967.051187890279	15514	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	25	627	68297	77128	FALSE	15	CTGAGATCTTCATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREPLNIKMTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57578	77634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
880906	contig_4689_pilon	-	3508	5	Intergenic	novelGene_165415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	303	383	1154784	1154614	TRUE	40	TTTATAAGATATATCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAPNGVIKLTENSERGEIHAEVPYQLTQHRSTILDSYRRPANRAYEKAASRSFQQETKPVIGDIRFPTPHTSSPRLGLICFLRPQSLDQESPTAWIPHTQMERLSECHFLAAGVAFFLLLLSSSNL	1155086	1146128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1147354_1151075_1152549_1153786_1154191_1154590_1154632_1154721
880907	contig_1867_pilon	+	1526	6	Intergenic	novelGene_54518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	5487.61239884888	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	178	909	195352	220943	FALSE	55	CAACAGAATATAAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEWCRVHCHLCSQAKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	195174	221560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195400_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
880908	contig_11422_pilon	-	2128	2	Intergenic	novelGene_99009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2359	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1956_2186
880909	contig_8377_pilon	+	1302	2	Intergenic	novelGene_34976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5113	junction_1	0	1486	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACATCGCTGGTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68103	69486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219
880910	SIRV5	+	2308	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10986_11130_13014_13543
880912	contig_9097_pilon	-	3946	5	Intergenic	novelGene_173574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1970	2293	21304	18913	TRUE	30	TTATTGATTTAGATTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLLIIMLNMNGLNAPIKRQRVEEWIRKHDPSICCLQETHLRLKDTNKLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVSLLISDKIDFKRPIQRKLQDANARNQIRSASNL	76506	16986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9097_pilon_-_17262_17534_18982_21049_21578_50321_51414_75902
880913	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
880914	contig_9363_pilon	+	3276	3	Intergenic	novelGene_6621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_1	465	9729	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	554	1171	872458	873683	FALSE	45	ATTTGGTACCAACCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	871904	875788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872729_873004_873095_873426
880915	contig_6980_pilon	-	2615	9	Intergenic	novelGene_36013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1790	2107	370598	365020	TRUE	10	ACGACCCGCCCCCCCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKKTISGCRAIFHYGCYFSIFKDKTNMSSTILMHGNSPFKGPITNSHGNLLSKCLFQHFVCFVRAPTSTVFTINLEYLIPKSQTNQRRWRISLDQLNKYTIIY	374390	346064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_346164_356700_356766_361141_361226_362331_362441_364868_365032_368206_368381_370466_370639_371428_371522_372734
880916	contig_10793_pilon	+	1635	15	Intergenic	novelGene_83400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3022.52910807881	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	127	1053	146975	163940	TRUE	60	AGGAGAATTAAAAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130875	167471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166446_167141
880917	contig_11720_pilon	-	1384	11	Intergenic	novelGene_43786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9334	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCGCCGCCGCCGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98766	67809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_67837_68052_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
880918	contig_14807_pilon	-	911	7	Intergenic	novelGene_124676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_5	6914.42451208583	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	323	814	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39620_39796_39900
880919	contig_12677_pilon	-	1326	2	Intergenic	novelGene_110817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTTTTAGTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2594_2870
880920	contig_15039_pilon	-	2809	4	Intergenic	novelGene_110165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1578	2396	293955	293137	FALSE	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVLVGIQNKTPDDFPGEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKDEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIIQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPSIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPKYIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETT	365992	292723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_294073_312275_312713_314516_314592_365044
880921	contig_14822_pilon	+	1439	6	Intergenic	novelGene_145418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	492.475542539932	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	559	1158	183396	190065	FALSE	10	CTTTGATGTTTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	181679	190346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_182227_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
880922	contig_7151_pilon	-	6542	9	Intergenic	novelGene_40760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	953.20635718348	658	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	237	914	551063	529189	TRUE	65	ACTGAAAAAAAAAATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	584687	521313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526664_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996_551123_582157_582274_584626
880923	contig_17936_pilon	+	2600	11	Intergenic	novelGene_29902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	758.03224865437	34	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	67	1350	50646	121021	TRUE	20	GGGTCGCTAGGAGTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50579	126975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
880924	contig_7426_pilon	+	5110	2	Intergenic	novelGene_27484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	647	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1159	1464	974385	974690	FALSE	15	GCTGATGGCTGCCCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILCPETLLKSLISSSSFLEDSLGFSVYKIISSANRGTLTSSLPIWMPFISFSSLIALARTSSTMLNKSGDKGHPCLILVLKGNAFKVSPFRMMLAVGFV	822527	978336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_822624_973322
880925	contig_15123_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_110944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3662	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	108	518	690382	689972	NA	75	GAACGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTKQTARKSTGGKAPGKQLATKAARKGAPSTGGVKKPHCYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFHRLVREIAQDFKTDLRFQRAAIGASQEASEAYLVGLFEDTNLCALHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	690489	689460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_689500_690500
880926	contig_17964_pilon	-	3801	2	Intergenic	novelGene_33860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	13404	junction_1	0	141	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2237	2608	135758	135387	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVIDSFILPEVEDGSPHPRLRCGYFLPILSPCHSVFSRWSCHPTRKPCLCHPRLQRGGLAPPPLFGGVTLARPQPWCWERQSCLIICFFALVAPVAWVDHPADFRTICLCPPRWPASLWGL	140516	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_136999_139520
880927	contig_4180_pilon	+	3356	6	Intergenic	novelGene_8381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	12784	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	132	668	875200	888134	FALSE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874293	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
880928	SIRV3	+	1700	10	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	3	1003	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3069	1	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATTTTTTTTTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	9942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4568_4780_6057_6334_7270_7367_7872_7989_8124_8208_8755_8976_9189_9281_9451
880929	contig_5770_pilon	+	627	6	Intergenic	novelGene_74186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	797	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAACACATTTACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261900	264970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_261983_262764_262956_263575_263675_263925_264064_264768_264808_264892
880930	contig_2326_pilon	-	8182	5	Intergenic	novelGene_178221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1067	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	7738	8085	83128	82781	FALSE	15	CATGAATCTCTCCTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGTGSEVLERKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPAANKWHSESHPFGCVESKQPLFPGQETVAVGSRGGRVGVKKGGGGKAYIANYWLFCLLL	161092	82683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2326_pilon_-_83455_120326_121103_123766_127709_158334_158853_158917
880931	contig_3747_pilon	+	2615	8	Intergenic	novelGene_24898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	38	1213	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201275	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
880932	contig_3825_pilon	+	1007	7	Intergenic	novelGene_77957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1356.06460842477	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATCCAGTGACTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13014	15913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13109_13695_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
880933	contig_15760_pilon	-	7124	1	Intergenic	novelGene_131064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2019	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	4894	5355	447008	446547	NA	35	AATTATTTTAAGAAGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQFELIETLQDRVELHHRVSKAAIFMEADCHIFLLRSSLWVETTDLLVSSQALNNCATRAPSQYKLLFEKGPLNIFPLPVGTVLSFVSRRHRRDTAGGKCFAPGSGVHDFLQHLAPVALAASPVPSSCSPWQSAASQMLLLQNAYSETLP	451901	444777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_444800_451900
880934	contig_4364_pilon	+	1933	6	Intergenic	novelGene_676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	265	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	1530895	1532568	FALSE	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530460	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
880935	contig_6418_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_81192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4815	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	315	704	1188392	1188003	NA	40	GAAGTCTTCCTGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKVRAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESQKTKSK	1188706	1186693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1186700_1188700
880936	contig_4232_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_63302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1494	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAACTCCTACCTCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466749	468101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466700_468100
880937	contig_6599_pilon	-	198	2	Intergenic	novelGene_176002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAGAAACTAACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264193	262662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262720_264052
880938	contig_7293_pilon	+	1878	4	Intergenic	novelGene_54254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4979.55607124437	59	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAATAAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335646	338035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335678_335758_335804_336110_336241_336363
880939	contig_5643_pilon	+	1316	12	Intergenic	novelGene_38769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2351.35752947206	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	103	1104	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233321	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233406_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
880940	contig_15105_pilon	-	1932	7	Intergenic	novelGene_151001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	2805	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	37	759	839916	829338	TRUE	25	CCCACTGCCATCCAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839952	827847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828844_829160_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
880941	contig_18869_pilon	-	2256	2	Intergenic	novelGene_56418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	29461	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTTTTAAAAATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76529	73743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74957_75486
880942	contig_8317_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_19411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16385	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
880943	contig_8317_pilon	-	813	2	Intergenic	novelGene_19320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATCAATCTTCTCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17072	16160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
880944	contig_6589_pilon	+	1037	6	Intergenic	novelGene_26126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_2	2598.31137472013	173	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	97	525	1879232	1880585	FALSE	30	TAAACAAGATTGGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878958	1881097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
880945	contig_6208_pilon	-	2280	6	Intergenic	novelGene_52968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	380	junction_1	191.845145885946	3848	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	153	644	351804	334758	FALSE	20	ACAAGTTTTCTGTCTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRRLPGAPTSEGRWPLLGSETGTSDFLGRGYVTSSQARRFAGGYPQQVNMRIEKCYFCSGPIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVRWTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRSEPVKYQRELWNKTIEAMKRVEEIKQKRQATFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEDKMVQKLQEDVDMEDVS	351956	333121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_334832_336085_336172_338944_339009_344015_344089_345798_345913_351723
880946	contig_14441_pilon	+	758	4	Intergenic	novelGene_100756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	187	522	125667	126274	TRUE	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVTVHRLPPAQFPTRGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTLCWSVPSC	121201	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125878_126149_126283_126514
880947	contig_7057_pilon	+	2479	4	Intergenic	novelGene_123199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	866.202568045656	47	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACGAAGACCATACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418011	433568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_418086_419809_419927_421272_421374_431381
880948	contig_10135_pilon	+	712	5	Intergenic	novelGene_106644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7037	junction_3	1047.8066376961	86	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	154	411	116715	119864	FALSE	25	GGATTCTATTCATTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCRKGKGPKHGGRRGRKGGTLWSGNCSLSTYSCALLSERPIRSSAPSPLPRMISAVVLLLLLLVGQAEALGEPQLCYVLDAILFLYGIVLTLLYCRLKIQMRKAVASYEKSDAIYTGLSTRNQETYATLKHEKPQQ	116561	120165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_116764_118749_118842_119162_119196_119619_119641_119801
880950	contig_1867_pilon	+	1984	6	Intergenic	novelGene_54503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2286	junction_1	4918.0384138394	56	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	183	983	194973	220943	FALSE	30	TCTGAGGTTTCAAGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194790	221944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
880951	contig_7229_pilon	+	588	3	Intergenic	novelGene_39812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1748	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGCAAAACCGGGTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875602	877537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_875959_876728_876869_877445
880952	contig_2227_pilon	+	2571	2	Intergenic	novelGene_142331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCTGAGTTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230131	234509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230226_232032
880953	contig_2227_pilon	+	2788	3	Intergenic	novelGene_142330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3432.5	6920	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	234	749	230369	231819	FALSE	20	TGGCATTCTAGTTTGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFYTRAATMIGEIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230063	233858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230280_230351_230517_231451
880954	contig_854_pilon	-	1463	7	Intergenic	novelGene_36210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3905	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	468	824	563319	562338	TRUE	40	AGAGGAAGCGGAAGGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563786	543476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562404_563028
880955	contig_11316_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_122658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACGACCCACCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138157	138866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138200_138900
880956	SIRV6	+	1250	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	274	4	-139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	30	AAACTTGTGCTTGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
880957	contig_6434_pilon	-	4615	1	Intergenic	novelGene_61868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATAAACTATGGTACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845395	840780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_840800_845400
880958	contig_7151_pilon	-	1885	6	Intergenic	novelGene_40781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	885.403275349713	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	238	690	536425	529189	FALSE	20	GAATATTGTTGTTGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	584705	527993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_584626
880959	contig_854_pilon	-	1494	2	Intergenic	novelGene_36357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGTGTTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976417	974687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975870_976105
880960	contig_8712_pilon	+	6281	4	Intergenic	novelGene_58793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	577.82407934134	9007	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	73	552	314974	321793	FALSE	10	TGGGTGGAGCCATCGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKHQNYHLTSPGCICHNRETAVVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	301239	327522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_301306_314967_315188_318064_318222_321684
880961	contig_12081_pilon	+	1134	4	Intergenic	novelGene_166980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1113.97067585582	66	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	46	345	16400	16995	TRUE	10	TTATTTTTATTGTCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKRLSPCSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPP	15836	18652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15847_16364_16550_16845_17245_18112
880962	contig_5928_pilon	+	5304	3	Intergenic	novelGene_40348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2130	2438	155644	155952	TRUE	80	ATAAAAAAAAAAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGQETVAAGYRGGQVEVKKGGGWESVYCRLLVVLSPAGSSVKLLSRTPCSLVSDSSPRWQIRAALADRGPLHVSLLALCSLSVSYSIRCLAEFFISSFDA	11230	332012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_13329_155612_156065_329258
880963	contig_20199_pilon	-	1133	4	Intergenic	novelGene_82553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	414.835978296108	19450	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	193	609	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44179	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_42232_42347_43906
880964	contig_4812_pilon	-	860	4	Intergenic	novelGene_103644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8633.4188284055	54	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCTAAGTATTGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81685	78706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81278_81571
880965	contig_854_pilon	+	241	3	Intergenic	novelGene_36105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTGGGATGGCTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91908	94587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_92043_93127_93207_94559
880966	contig_7457_pilon	+	4666	23	Intergenic	novelGene_31487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	321.510127984632	562	119	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	169	1221	641631	652375	TRUE	15	CTGAGAGCGTGGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNRILDEHPSLVFLLPVCWERPRGLREPRGPHPGPSAASACRASAGETVGTPDSSRMAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVR	612246	671992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_612392_641607_641759_642572_642718_643349_643449_648697_648794_648955_649038_649226_649322_649492_649645_651964_652124_652278_652376_658172_658239_658337_658432_658533_658582_660732_660817_661554_661626_661764_661926_662947_663001_663253_663349_663458_663599_664102_664316_668470_668514_668793_668907_669728
880967	contig_10005_pilon	-	2796	4	Intergenic	novelGene_148905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	739	1065	293085	292373	TRUE	30	TATTTGAGCGAAAGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKTEGGRERKEKNEQIKIRKVKELQSSQGSHRCSYEVWGSRSQVSQHSLVRRRRGIQCLVFRNQKEKERQRDEKLSNEERQKGKREKKTKLIKKKATPAVNEWHS	293823	94585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_96014_203331_203445_292182_292374_292759
880968	contig_9515_pilon	+	1210	10	Intergenic	novelGene_73816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	276.970827897403	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	38	1087	65880	72530	FALSE	5	TCCTTGGCTCTCTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPIPQSGSPFPASVQNPGLHVWRVEKLKPVAVAPENRGVFFSGDSYLVLHNGPEELSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSPGATPAAIKKLYHVKGKKNIRATERALSWDSFNTGDCFILDLGQTIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPPLKEGNPEEDLTADQTNAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFPLELLVSDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQVALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGRESPIFKQFFKNWK	57305	72653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_+_57330_65866_65903_66074_66248_66345_66501_66687_66856_68199_68350_68730_68824_69343_69477_71788_71878_72464
880969	contig_2227_pilon	+	2622	2	Intergenic	novelGene_142326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6865	junction_1	0	7179	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	313	828	230369	231819	FALSE	25	TTACTTGAAATCAGTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFYTRAATMIGEIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230056	233613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230517_231451
880970	contig_4803_pilon	-	2774	2	Intergenic	novelGene_150740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	979	1575	318399	317803	FALSE	55	AAAGATATAGAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKQDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPLWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	349293	316603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_318609_348524
880971	contig_18081_pilon	-	4581	4	Intergenic	novelGene_23783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2958	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2059	2421	114425	114063	TRUE	0	GGGCCCCGGGGCCTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRLEVNSSWIQRTFKTTMVQFHVEFHNLPTTNQLSLNQSLLLDPRSKLFLVLQMTSPVKTPAMISFIISQVSSGDIITNTSIQALMQTDNVLSNRAEAMSSHTDQLLRTSLATLEMIS	116483	90767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_90789_104502_104680_108416_108517_112200
880973	contig_34_pilon	+	10118	4	Intergenic	novelGene_39975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2588	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3614	3982	212125	212493	TRUE	20	AATATTGCCACTCCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	208511	220830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_213048_214057_214151_215287_219383_219436
880974	contig_10235_pilon	-	3517	4	Intergenic	novelGene_46308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2349	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGACCTGAGCTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94103	88500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_88541_88904_89012_90391_90490_90831
880975	contig_10139_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_177810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCGGCCCGGACACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183367	184244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183400_184200
880976	SIRV7	-	2459	5	NIC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	6	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAATTAGTGTTAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114961_147608
880977	contig_8182_pilon	-	3049	3	Intergenic	novelGene_173256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCCAGTGCGAGCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366595	209917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8182_pilon_-_210102_239833_240348_364244
880978	contig_7293_pilon	+	2470	3	Intergenic	novelGene_54258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	560	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	41	367	335695	336451	FALSE	45	TCATGACTTATAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335654	338554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
880979	contig_12677_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_110792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99718	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3630	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3600
880980	contig_341_pilon	+	4546	5	Intergenic	novelGene_178222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1725	2030	20588	49886	TRUE	35	GCACTACCTGACCTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAVYKYSAILIEEIQDGIKKFLESNENENTPYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTAELKQIEREQQKKAHNHRKKGNNKDQSRNQ	4610	131127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_341_pilon_+_5484_19736_20631_49623_50610_82624_83196_129905
880982	contig_13542_pilon	+	2452	9	Intergenic	novelGene_131489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	987.919143642333	5030	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	100	882	417080	505589	FALSE	20	CCCAGCTCTGGCACTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTPGHPGKWKRRALLRGGESQTPGLGLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346539	507159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346618_417058_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
880983	contig_8661_pilon	-	2481	11	Intergenic	novelGene_137928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_8	440.494994296189	3131	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	172	1038	315977	301399	FALSE	40	CTGAAGAAACATCATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316148	299955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
880984	contig_13224_pilon	-	3890	4	Intergenic	novelGene_104065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1278	1622	148732	148388	TRUE	35	TGATGCAGAGAAAGCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHASKKKIRAEIKTLTLQLEQIEREQQKKPSGTRRKQTIKIRAELNEIENRKTIESVKKTKSWFFENINKINKPLAKMTKEKQERKQINQIRNEMGDITKDPSEIKRIYEIIIL	150009	17348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_17467_17520_18903_137308_137895_148205
880985	contig_9753_pilon	-	1757	6	Intergenic	novelGene_41313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	687	junction_2	114.437056935243	2990	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	166	642	93294	70212	FALSE	0	TCTGTTGTCTGCCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRDLNRKRNQVKNCKARIELLGSYDPQKQLIIEDPYYGNDSDFETVYQQCVRCCRAFLEKAT	93459	69096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70559_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
880986	contig_15093_pilon	-	4757	3	Intergenic	novelGene_143295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	1875	2996	57582	56461	FALSE	30	GATCCATACAAATCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKLVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKRKNIPRSCIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATLVKTARYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWEKGSLFNKWCWKNWIAICKKMKQDLYLTPYTKTTSKWIKDLNIKRTTIKFIEEKTGPTLQDLTHGINRIQTITINAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREATDWENIFGQYKTDKGVISIIYKKIQHLYNKKTIILLKNWQRK	188788	54699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_57696_107420_108445_188051
880987	contig_6445_pilon	-	1607	15	Intergenic	novelGene_76919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_11	426.757183744517	5543	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	139	1377	88578	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96429	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
880988	contig_1737_pilon	+	6571	4	Intergenic	novelGene_178223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3249	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTTTTAAATTAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296881	375082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1737_pilon_+_301445_337600_338804_356975_357158_374459
880989	contig_13021_pilon	+	3757	13	Intergenic	novelGene_8130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	232	2082	174676	180850	FALSE	10	TTCTCTCTCTCTTATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174444	182525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
880990	contig_12786_pilon	+	2508	3	Intergenic	novelGene_103377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3248	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGAAGACAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531327	597365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_531952_560016_560410_595874
880991	contig_5020_pilon	+	4422	2	Intergenic	novelGene_27923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	503	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	235	363	134043	134171	TRUE	55	AAAAGCAAAAAACCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPEPPKVQIHLTSFFIKKLCRRWGEKRNRIVSRDSDSQVTPYLFGAPSVIPNIPFLPLRLRLFGWVRKLPSAAEPVMSIPCRSPLLHPPLWASSHFPAPLSFPFSLCCLRKERSARWW	133808	138379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_137038_137186
880992	contig_8878_pilon	-	1288	7	Intergenic	novelGene_147864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	424.778537070266	129	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	567	953	228839	228170	FALSE	40	ACCTAAGCAAGTGAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231711	227834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230598_230874_231121_231647
880993	contig_3077_pilon	+	1706	10	Intergenic	novelGene_26669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	20668	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	57	1208	9676	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9619	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
880994	contig_4732_pilon	-	279	4	Intergenic	novelGene_75406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	35	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCCATGATGGCGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525140	524060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_524092_524184_524231_524534_524668_525071
880995	contig_9363_pilon	+	1266	2	Intergenic	novelGene_6632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2959	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	62	352	872530	872820	TRUE	25	CATCAAGTCGATTCCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGERPTTPRRVQAPGPPATSLLPQTFSARQT	872468	874066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_873095_873426
880996	contig_6533_pilon	+	6021	3	Intergenic	novelGene_114620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	4291	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	4505	4858	29503	29856	FALSE	50	ATTAAACAATATTATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVVSYACESWTMNKEDRRRIDAFKLWCWQRILKIPWTARRTNKSVLEEVQPEWSLEVRTVRLCLMYFGRVIRRDQSLEKDIMLGKVEGHQKRGRPSMKWIDTVAATVGSNIAPL	10484	31019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
880997	contig_15720_pilon	+	2670	1	Intergenic	novelGene_41965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAACAAACAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305624	308294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305600_308300
880999	contig_15123_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_110942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46229	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	105	515	690382	689972	NA	65	AAAAAAAAAACTCTTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTKQTARKSTGGKAPGKQLATKAARKGAPSTGGVKKPHCYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFHRLVREIAQDFKTDLRFQRAAIGASQEASEAYLVGLFEDTNLCALHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	690486	689443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_689400_690500
881000	contig_17964_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_33875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1156	1527	135758	135387	NA	25	GCAGCAACAAGCTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVIDSFILPEVEDGSPHPRLRCGYFLPILSPCHSVFSRWSCHPTRKPCLCHPRLQRGGLAPPPLFGGVTLARPQPWCWERQSCLIICFFALVAPVAWVDHPADFRTICLCPPRWPASLWGL	136913	134208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_136900
881001	contig_17427_pilon	-	5216	13	Intergenic	novelGene_30305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	3933	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	144	1568	188879	178046	FALSE	20	GTCATTAGCTGCTTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204804	174397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
881002	contig_14208_pilon	+	3345	5	Intergenic	novelGene_129069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	653	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83606	207832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_84089_84256_84337_152834_153240_179710_180394_206137
881003	contig_17964_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_33851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1058	1429	135758	135387	NA	0	TCTGGCTGGTGTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVIDSFILPEVEDGSPHPRLRCGYFLPILSPCHSVFSRWSCHPTRKPCLCHPRLQRGGLAPPPLFGGVTLARPQPWCWERQSCLIICFFALVAPVAWVDHPADFRTICLCPPRWPASLWGL	136815	134191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_136800
881004	contig_8317_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_19561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
881005	contig_8712_pilon	+	6312	6	Intergenic	novelGene_58799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	567.797992247243	25	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	246	725	314974	321793	TRUE	40	ACATCATGGGATAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	308539	451661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_308779_314967_315188_318064_318222_321684_327093_389177_389444_451639
881006	contig_4364_pilon	+	522	1	Intergenic	novelGene_794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532792	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
881007	contig_5669_pilon	-	2864	5	Intergenic	novelGene_86046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1055	1441	123502	121299	TRUE	10	CGCCCCGCCATCCTCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPQDPASQRQTQQLRLTRKLVISSSLPESTCPADSRSEGQVAGVQQCKHAVLAEEGIDAAHLAGDQFLLHWGTQLPAICEVGGDGEEVALLWQVQFSGVEVAAAPLRVVGDAFIQQGPDGRQYWAHF	126962	117774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_117920_120020_121468_123284_123557_125884_126051_126128
881008	contig_4654_pilon	-	3237	6	Intergenic	novelGene_103075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	822.841758784762	45	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	374	1159	515234	494476	FALSE	35	CGTCAGTTAACACAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGRTRDYLGRTGGMTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515607	492397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_515192
881009	contig_15105_pilon	-	1539	7	Intergenic	novelGene_151010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	85	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	35	757	839916	829338	TRUE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839950	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828928_829131_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
881010	contig_17440_pilon	-	3505	1	Intergenic	novelGene_7539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24312	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGATACCCGCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4005	500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_500_4000
881011	contig_8317_pilon	-	1147	3	Intergenic	novelGene_19308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCACATTGCCACGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17243	15919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_15968_16045_16281_16379
881012	contig_6165_pilon	-	979	3	Intergenic	novelGene_167413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	723.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	444	893	493933	489749	FALSE	25	TAAAACTTTGTGGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKVVLKPRTPPGQNGLPTQEKEKKTSKQTKAPGSHQCGSPDREAAPHSNGALQRLRKKQDGSRSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKKATAAANKWHSESRPVQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	494376	489662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_493612
881013	contig_8907_pilon	+	5167	3	Intergenic	novelGene_85859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	4096	4581	1102900	1103385	FALSE	25	CGGTTAGTTACATTTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTEPPVRARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPCRKGQRRLSESGTRAKGGGRQQVANENPKEVEKEKRGEKKIATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAALGPEPAAPGSRGAKEQRPRILARTAAQTWKQPHTRT	1065621	1103971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_1067485_1069564_1070356_1101458
881014	contig_1244_pilon	-	2744	13	Intergenic	novelGene_37970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	902.721390974105	4164	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	510	1961	948448	923211	FALSE	15	TGATGGGCTAAGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948957	922427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
881015	contig_14744_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_65930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1247	1699	163279	163731	NA	15	CTTCCCGACTTTGGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLGGFRGAFRSSLWSSRRQSRGQGVTPHHQAGLPGWGHEDQVPGGDLSVSLPIREFEIINFFLGMALKDKVLKITPVQKQAHAGQWTRFKAFVAIGGYSGHVIVGIKCSKEVATPSVGPSFWPSSPLSTCGKATGGTRLTSPILFPAR	162032	164313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_162000_164300
881016	contig_16098_pilon	-	1458	9	Intergenic	novelGene_46088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	154	1248	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460280	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
881017	contig_5020_pilon	+	3952	7	Intergenic	novelGene_27830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_2	473.205616572284	10	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	1237	2166	122915	125772	FALSE	25	CCCTGAGTGGAAGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	127558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
881018	contig_9706_pilon	+	960	2	Intergenic	novelGene_20872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2949	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3363_3445
881019	contig_4812_pilon	-	680	5	Intergenic	novelGene_103659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8338	junction_4	4091.763250727	13	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	41	457	81738	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82308	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268
881020	contig_19769_pilon	+	1062	5	Intergenic	novelGene_102266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	13771	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	255	1028	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
881021	contig_3077_pilon	+	3579	8	Intergenic	novelGene_26648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2827.8955180884	40	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	2278	3081	13747	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKANEVPQTSASIHKSRFHMVWVRGTWPSLLTCLSPIQEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9609	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_12071_13019_13228_13664_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
881022	contig_9839_pilon	+	920	7	Intergenic	novelGene_88486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1554.34696005178	1185	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	252	785	49583	61360	FALSE	15	CTTGTTTTCTTGTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNDRDQSPWVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45305	61495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52151_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
881023	contig_9297_pilon	-	1589	2	Intergenic	novelGene_69904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTAGATATTTGATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987797	985870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_986956_987293
881024	contig_3964_pilon	-	3471	3	Intergenic	novelGene_174211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1757	2131	266033	265659	TRUE	40	GTGAAAATTATATTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKPNKFLKKRIRKSPKKTEKKKKKTRKKKCSQGSLCVSAQDEGVGPKPQSTVRPERAPNSRKEKENKQTIENKQTKALGSHQHGSMDREAVPHSNGAPQPLRKMQKWRMEPGI	267789	218751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_219065_220602_221092_265120
881025	contig_6533_pilon	-	829	3	Intergenic	novelGene_114616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCCAAAACAACAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25827	10484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_10567_13450_13558_25187
881026	contig_11422_pilon	-	2256	2	Intergenic	novelGene_99010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_823_928
881027	contig_4531_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_47907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCTGATGGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376281	375072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_375100_376300
881029	contig_12677_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_110744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	11	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
881030	contig_16870_pilon	+	1485	3	Intergenic	novelGene_155492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	15	827	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGCACTTTCTTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104455	108796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104578_104672_104755_107515
881031	contig_14744_pilon	+	873	6	Intergenic	novelGene_66070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4120.86323966229	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	3	608	1382976	1385910	TRUE	50	TAATTAAATAAGTGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLQDLCPSIEFLCVEHTRNLSLPPPPKLISVV	1382973	1386669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385221_1385818_1386006_1386499
881032	contig_2770_pilon	-	2640	5	Intergenic	novelGene_107452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	906.807139087469	53	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1401	1742	746670	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750832	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_747797_750558
881034	contig_2770_pilon	-	1457	7	Intergenic	novelGene_107455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1650.32259472706	1376	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	216	665	750561	743833	TRUE	20	AGTCGTGTTAAATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750776	742935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743146_743250_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
881035	contig_7202_pilon	-	1077	3	Intergenic	novelGene_17533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	15	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	46	318	29911	28475	TRUE	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKVNE	29956	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
881036	contig_4782_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_73613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161707	159289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161700
881037	contig_4654_pilon	-	2949	6	Intergenic	novelGene_103076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_5	611.654608418836	3015	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	131	871	500418	494476	FALSE	35	CGTCAGTTAACACAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515920	492397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_515793
881038	contig_17440_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_7565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_3000
881039	contig_3285_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_153373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63679	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTAGTATTCCTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40402	38335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_38300_40400
881040	contig_16098_pilon	-	3059	11	Intergenic	novelGene_45930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1210.30002891845	713	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	226	1611	352350	348413	FALSE	40	ATAGAATGGTTGAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354214	346964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
881041	contig_14925_pilon	-	996	5	Intergenic	novelGene_55104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	1555.7699661261	71	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	201	458	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKLTFGDGTTLTVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	61670	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_61622
881042	contig_14822_pilon	+	1592	6	Intergenic	novelGene_145412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_5	400.780937670444	108	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	717	1316	183396	190065	FALSE	20	CAAGACTTTGATGTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	181002	190341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_181708_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
881043	contig_5247_pilon	-	5342	4	Intergenic	novelGene_81814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTTTGGGGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369318	209652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_209849_349946_351288_365424_369111_369199
881044	contig_5302_pilon	+	8264	10	Intergenic	novelGene_81400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	916.82824165236	43	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	42	446	155509	170054	TRUE	40	AAAACCACAGCTGGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVEIAKQSVTIKTMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEEEEAQVRKENQWCEEK	155467	209272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_155519_161142_161217_167388_167533_169186_169328_170018_177299_179916_179965_180994_181107_181210_181373_181903_182029_209145
881045	contig_1264_pilon	-	4310	1	Intergenic	novelGene_161301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2567	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2700	3086	130919	130533	NA	40	AAAAACCCGTTGCCATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVLLPAPTFGHIQVEEVTVEDGLYHSRHYCDLVIEILRLVPPDPVSQVECPVQTQKEQVVSSNGLGLTSLADHEELRQDGHRFQVDRESPEDLSQREKRPKRLIKNEKGSISLKSLITSMCTGEKS	133618	129308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_129300_133600
881046	SIRV7	-	2459	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	2	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	61	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
881047	contig_9656_pilon	-	1394	11	Intergenic	novelGene_121928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_1	187.25608134317	3936	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	201	1325	446594	430496	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDAPAAARARTGVGSRRSTRPSDPSPSWPARGDPEAVVRCHRAALFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	446794	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
881048	contig_15744_pilon	-	685	5	Intergenic	novelGene_83602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	369	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	332	658	153261	149572	FALSE	50	ACACAAGAAAACACGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAIQPVSPSSADEKLGTVCIGSSICHGQDARTCMLQEEVLIIKFFPIDGLATSAIMACESRNLCNQILSPQYSGRGSFLLSLELYLRTARRRRGPAVRRRRRCRRTP	153592	149544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_149629_152143_152175_152261_152326_152546_152705_153244
881049	contig_12250_pilon	-	1089	11	Intergenic	novelGene_80704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	188.219579215341	3535	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	206	955	401239	398710	FALSE	20	CCCAAGTCTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLRVQPEAQAKVDVFREDLCTKTENLLGSYFPKKISELDAFLKEPALNEANLSNLKAPLDIPVPDPVKEKEKEERKKQQEKEDKDEKKKGEDEDKGPPCGPVNCNEKIVVLLQRLKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPRIEDGNNFGVAVQEKVFELMTTLQTKLEGFHTQISKYFSERGDAVTKAAKQPHVGDYRQLVHELDEAEYRDIRLMIMEIRNAYAVLYDIILKNFEKLKKPRGETKGMIY	401444	398575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_398791_398966_399054_399131_399187_399297_399366_399451_399521_399747_399846_399972_400019_400106_400218_400314_400378_400528_400562_401200
881050	contig_2377_pilon	-	1940	2	Intergenic	novelGene_67886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	0	51	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGTGAACTGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192977	190942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_192749_192843
881051	scaffold_13505_pilon	-	471	5	Intergenic	novelGene_111468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5309.37703502021	77	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	217	432	541982	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	547799	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734
881052	contig_6059_pilon	-	2869	15	Intergenic	novelGene_44833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6035	junction_12	2985.29580201196	11057	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	580	2415	584299	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584878	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
881053	contig_8712_pilon	+	2310	5	Intergenic	novelGene_58762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	589.583327444052	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	356	835	314974	321793	FALSE	25	CTCATGGTGTGAAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	277787	323268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_278018_286372_286492_314967_315188_318064_318222_321684
881054	contig_10765_pilon	+	2830	1	Intergenic	novelGene_122997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1027	1539	714454	714966	NA	40	AAAAAGAAGAGTCTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTVRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEIRTFMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIEIPYNPAIPLLGIYPREIRVVTPIDICTSIFIAVLFTAAKRWKHPRCPSTDEWLNKLWYIHTMEYFATIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	713427	716257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_713400_716300
881055	contig_4180_pilon	+	2197	7	Intergenic	novelGene_8362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	1943.58463212236	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	129	665	875200	888134	FALSE	25	GGTTTGCCAGTTTTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNNNNCEEGEQPLPPPAGLNRSCVGNCCCSVLGSAGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865808	889666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866080_866126_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
881056	contig_2834_pilon	+	1969	7	Intergenic	novelGene_27981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2449.13037287388	635	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	81	656	274763	290707	TRUE	20	CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238728	292126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291291_291396
881057	contig_5954_pilon	+	552	3	Intergenic	novelGene_28438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3853	junction_1	607.5	285	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97840	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_98163_98637_98694_98857
881058	contig_19816_pilon	-	5458	9	Intergenic	novelGene_156467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	270.526685375029	189	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	490	831	124800	123459	TRUE	20	CACATGTTGTCTTATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126805	114494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125864_126380_126435_126731
881059	contig_10749_pilon	-	1078	5	Intergenic	novelGene_133474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	633.521655115277	7986	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	83	475	168308	164528	FALSE	15	TCTGTTCACCTGTGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSRGQIHVLLTLGTLEVPTLSIHSLPILPVIQAPFPLPQEFPTGIQCSPHVDPLNLCHNQGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169057	163924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167173_167213_167395_168302_168346_169012
881060	contig_18081_pilon	-	1551	4	Intergenic	novelGene_23786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	799	1230	112611	108496	TRUE	0	GCCGCTCCGGGCGCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYRNNWPLPPKKTTFEASFNRYKEKLKTKRLWSPRELTHGPRVVQTAVCLPSRSPNEVVSTITQILQERLCTRAQASRRVTTLCNVCPQSLSVQWFREGLCPGGHLWFSQLGLLVFSMEHDGEVQQKHQTCQKPKHDCSGLS	113409	90788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_90852_104500_104680_108416_108517_112200
881061	contig_15327_pilon	-	1617	2	Intergenic	novelGene_70496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTAAAATGAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405027	401057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070
881062	contig_4364_pilon	+	1563	6	Intergenic	novelGene_640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	30	TACAGAATTTCCCAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1532932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
881063	contig_5033_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_28897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	779	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2159	2470	443271	443582	NA	10	CTCCGTTTCCCTGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCARLCPKDLKFRMTTFLFSSQNVGGGTTVVQVRATDHDIGLNSILSYYITEGNEDMTFRMDRISGEITTRPAPPDREHQSFYHLVVTVEDEGTPTLSVSHGG	441112	445101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_441100_445100
881064	contig_18108_pilon	+	4736	2	Intergenic	novelGene_33444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	45	326	58243	58524	TRUE	15	CTCACCCAGCATTTGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDVTLRTKVHLTQAMVFSIASYACESCTINKEDRRRRNDAFELWCWERILNIPWTARRMNKSILEEVQPERFLEARMARLCLMYFGHVIRRDQSLEKTIMLGKVEGQ	58198	127344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_60060_124469
881065	contig_12425_pilon	+	4282	10	Intergenic	novelGene_46657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5599	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	3484	4146	207185	211162	TRUE	5	CTATTTCTCCCGGCCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVFFVGWGIARLTGLAAFRSLFSFSLAWGPGAIDMVLTWRDGVGSAAYMGVIEATGNQAFLSPEIPSSSRKAPIAAVPTLHVTAGEQVLCRHLHIDVLTGVNADPVRNGLHSPKCPTRATGTLVSDLFDGWTVWPVFPGIKVFRQIHFLSKVNSLGQLGSIQQGATQSLHVAHINIVEVVSSLPCSVMFVDMVDQLIRQGIEIQSALGTDQHHQAAEGS	201089	226616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204322_204828_204962_206555_206669_207179_207327_207650_207738_208645_208764_209380_209497_210302_210388_211047_211198_226515
881066	SIRV5	+	2210	8	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-938	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCGACCATGTAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7263	13602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_7308_7681_7763_7870_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12641_13538
881067	contig_7286_pilon	-	1008	7	Intergenic	novelGene_108670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4087.57262932416	200	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	223	939	291934	286948	FALSE	0	TGCCTTGTGGGTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293175	286878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_291928_292101_293119
881068	contig_17976_pilon	+	2044	4	Intergenic	novelGene_32480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	33	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	238	1254	41843	47385	TRUE	55	GATTAAATAATAATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41605	48865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47782_48471
881069	contig_14666_pilon	-	2165	2	Intergenic	novelGene_39654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5091	junction_1	0	24	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	419	430	492000	491989	TRUE	0	TCCTGCTGTTGGTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIDSVLAIRTEAPPPRHHGGVLATGWAQVGPGLRGRALGGPGLGQGSQPADPRAHAALGAPTAHQDGGSARSTGLPSGAVCPDLPPLPRPRGWGRSPSLFLASSVKWAGESCPFLPCSASDRTLAETFARCARDVKERTMLI	492418	488761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404
881071	contig_1708_pilon	+	4645	3	Intergenic	novelGene_178226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAGTCCAACACACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408855	572331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1708_pilon_+_410362_413587_415496_571100
881072	contig_12864_pilon	-	1834	2	Intergenic	novelGene_76364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	898	junction_1	0	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATTCAGTGTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176616	167807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_169531_176505
881073	contig_10500_pilon	-	2016	2	Intergenic	novelGene_41246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTATAATTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628531	1626452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626521_1626583
881074	contig_10404_pilon	+	704	2	Intergenic	novelGene_138685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1724	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098799	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098859_1099839
881075	contig_7066_pilon	-	1950	4	Intergenic	novelGene_42146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.884800728252	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAATCTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757825	747998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_748471_748586_749885_750340_750424_757728
881076	contig_5669_pilon	+	1700	3	Intergenic	novelGene_86048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	136.5	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1116	1646	121044	123391	FALSE	15	CCTGGTGAGGCGAAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQLNMDTLRQNFWKEEYLREKMLRCEWYRKYGSMVKAKQKAKAAARLPLKLPALYPQAPLLPAPAPKAAPSRAPSPVQEAPIQSEMCPVLPAIRALLYEGISHDSQGRRRYLNTRKLDLPEKRYLFPITTNFTYGWQLGPPVKQELVSCKMCRIDSFFRKNGVFALLDPRDLAL	117827	123445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_117922_120022_121465_123281
881077	contig_3747_pilon	-	2504	8	Intergenic	novelGene_24911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1073	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTCCCCACTGCCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202741_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
881078	contig_1867_pilon	+	2967	6	Intergenic	novelGene_54501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_1	5514.84110378531	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1702	2313	213588	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	192689	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194319_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
881079	contig_2215_pilon	-	1863	2	Intergenic	novelGene_163854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAAGTGTTTGATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200352	198200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_199788_200076
881080	contig_5033_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_28898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1135	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2159	2470	443271	443582	NA	10	CTCCGTTTCCCTGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCARLCPKDLKFRMTTFLFSSQNVGGGTTVVQVRATDHDIGLNSILSYYITEGNEDMTFRMDRISGEITTRPAPPDREHQSFYHLVVTVEDEGTPTLSVSHGG	441112	445101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_441100_445100
881081	contig_21007_pilon	+	1426	2	Intergenic	novelGene_161530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	20	CAATTGGTGCTATGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
881082	contig_16322_pilon	-	2898	6	Intergenic	novelGene_87494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	475	junction_5	373.95957000724	3787	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	293	706	37060	32956	TRUE	60	AGAAATTATTAGAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57720	30252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
881083	contig_16109_pilon	+	2659	5	Intergenic	novelGene_80317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAAACTACCAAAGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2533	95948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_3138_3594_4115_9615_9781_13087_13097_94587
881085	contig_4180_pilon	-	3611	8	Intergenic	novelGene_8349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGGCAGCAACACAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890825	865722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_865865_870446_870712_875177_875362_882858_882929_886080_886187_886317_886467_888084_889339_889384
881086	contig_8818_pilon	-	4272	4	Intergenic	novelGene_178232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9740	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1119	1484	58087	57722	TRUE	20	TGTAGCCCCACAGCCCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCLCIISSCEFILAFCSYIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFFSCLSAFCVSSWKIRSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWMPTGTILSCFCKCFDIVCCFGGIQ	59205	666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_1679_43145_43265_44625_46174_57612
881087	contig_9121_pilon	+	4914	1	Intergenic	novelGene_134454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1293	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	230	693	168	860	155974	156666	NA	75	AGAAAAGGAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFQRLHQKSKTRTYRLGKNFWMVQVRQSLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKNGQRSLAIREMQIKTTVRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGALMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRVDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNESVKHLITRMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	155806	160720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_155800_160700
881088	contig_14441_pilon	-	1290	6	Intergenic	novelGene_100630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	814	1290	113153	111251	FALSE	5	GGTGTGGGCGCCTCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGRETWPATSRSLRPQVSQLASSGLSRHLILGLGGLSRVIHKITGDRSPCPVCIKTRIQTFLIKMHFCQSTEMGPTDPCCLLGGSWPPSPGSLTDDTEPGPIPKIQGVSRAHPVPTMLQLCTKTAPPTDPAPQNQEELPACCCFERSQGGRERRRW	117790	111250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111384_112610_112842_113040_113208_116577_116961_117218_117343_117538
881089	contig_15453_pilon	+	1837	5	Intergenic	novelGene_112474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	299.615899945247	2674	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	205	666	6981	17260	TRUE	30	GATTTACCAAATTCTACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLQSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6776	18855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103_18308_18731
881090	SIRV5	+	2398	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10986_11130_13039_13478
881092	contig_6059_pilon	-	2371	16	Intergenic	novelGene_44827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4560.62810683889	24	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	108	1283	584299	572926	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSDSEPCCILSS	584767	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573191_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584340_584700
881093	contig_12019_pilon	+	1035	4	Intergenic	novelGene_87633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	2032	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	363	686	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_5400_6114_6226_8298
881094	contig_12081_pilon	+	965	4	Intergenic	novelGene_166983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1526	junction_3	516.607738574981	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	106	588	16849	18277	FALSE	10	ATTTTTATTGTCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	16447	18654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_16550_16845_16992_17069_17245_18112
881095	contig_7182_pilon	-	2219	5	Intergenic	novelGene_117134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	104	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	56	703	889318	887056	FALSE	35	TATTAGTTAAATGGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891315	885539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
881097	contig_10968_pilon	+	1860	11	Intergenic	novelGene_84287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	236.614221888711	1703	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	230	1114	166381	177921	FALSE	45	AAGGAAAATAAAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGQSCVRPMCIPPSYADLGKAARDIFNKGFGFGLVKLDVKTKSCSGVEFSTSGSSNTDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTGKKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNNFAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLDPTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKLGLALELEA	165812	178667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_165936_166067_166156_166362_166412_167440_167510_168249_168300_171487_171641_171738_171792_172253_172482_173419_173571_176189_176248_177829
881098	contig_11422_pilon	-	2125	2	Intergenic	novelGene_99002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
881099	contig_20199_pilon	-	913	3	Intergenic	novelGene_82576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	440	43	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGTGGCTGCTGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44187	40648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42084_44024
881100	contig_2834_pilon	+	2053	6	Intergenic	novelGene_27984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_1	2002.52746298272	120	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	76	651	274763	290707	FALSE	60	ACAAAAAAAATCCTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238733	292109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
881101	contig_11548_pilon	+	2364	11	Intergenic	novelGene_66744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	726.118723074953	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	184	1521	63836	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63652	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
881102	SIRV5	+	2755	8	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-984	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	651	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7217	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_7308_7681_7763_7870_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_13012_13414
881103	contig_8317_pilon	-	705	3	Intergenic	novelGene_19305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1095	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACATTGCCACGACGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16798	15916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_15968_16045_16281_16379
881104	scaffold_12124_pilon	+	3305	10	Intergenic	novelGene_22267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2863.78591689005	19	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1347	2126	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489230_1490329_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
881105	scaffold_13505_pilon	-	478	5	Intergenic	novelGene_111470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2309	junction_1	5309.37703502021	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2	439	547805	540231	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH	547806	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542033_547363_547465_547734
881106	SIRV6	+	1443	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	79	6	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881107	contig_16211_pilon	+	3415	2	Intergenic	novelGene_150046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1060	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1849	2337	19629	20117	FALSE	55	GAAAAGGTAATACAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVIEELRGSFEMVEDRISEIEDKHLDTTLCEEKSEKRMKKNKETLRIMWGTIKSKHFRVIRVPEQGETTENTERIIEELLTENFPSIMKHEKLTIQEAQRTPYRTGPKRKSPRHIIITLAKTKGKQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSSDYSAEIIQARR	17687	21195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_18142_18234
881108	contig_7066_pilon	-	2030	4	Intergenic	novelGene_42149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.884800728252	56	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAATCTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757869	747998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_748960_749039_749885_750340_750424_757728
881109	contig_854_pilon	+	1559	2	Intergenic	novelGene_36348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCCGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974685	976417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975638_975810
881110	contig_9839_pilon	+	3505	6	Intergenic	novelGene_88482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_3	787.239582338185	140	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	2798	3373	52079	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45255	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
881111	contig_17440_pilon	+	3088	1	Intergenic	novelGene_7550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAAACATAAAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910	3998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_900_4000
881112	contig_6589_pilon	-	3752	2	Intergenic	novelGene_25801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGACACCCGAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673604	669602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_669746_669995
881113	contig_17311_pilon	-	2776	5	Intergenic	novelGene_57835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	7191.86564807769	85	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	25	471	126865	121474	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126889	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_121642_123344_123555_123642_123709_126862
881114	contig_11548_pilon	+	2406	11	Intergenic	novelGene_66730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1026.1607281513	2930	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	292	1563	84723	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63629	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63895_84696_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
881115	contig_10793_pilon	+	1557	15	Intergenic	novelGene_83372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1625	junction_14	2438.89322088056	855	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	132	1055	146975	163295	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEGK	130870	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163399_163944_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
881116	contig_8317_pilon	+	911	2	Intergenic	novelGene_19313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	178	357	16228	16506	FALSE	40	TTACATAAAGAATTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	16050	17060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
881118	contig_7457_pilon	-	3785	16	Intergenic	novelGene_31497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8674	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2564	2899	664175	662973	TRUE	10	ATCTGTTGCCTCCTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISANDMLFSCCLVYGSTDWIWVLPLMSFSTQVKVIPPSLLLSLNLSRKVPGGLVLKMARSRSLLMKPIIYPSFQRARMYFFTRSMILSSQTQKEKPLPAMFSLQNLAHVI	671993	649593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
881119	contig_6914_pilon	-	3616	19	Intergenic	novelGene_151724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	95.5515018520004	3177	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	73	597	123393	122480	TRUE	0	TTCGCCTCCGCCTGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNTSCGAGSEGAGSTAGSERPLPRMAALVLAGDTMGPERIFPNQTEELGPHVGSAEGTGDWSSEEHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQALGLHLPDPPLESEDEEEEGATALSNHNSIPMDPEHVELVKRTMAGISLPAPGVPAWAREISDAQWEDVVQKALQARQASPAWK	123933	100354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_100467_105415_105493_116820_117063_117318_117520_117598_117709_117830_117926_118350_118476_118608_118671_118776_118886_119088_119145_119456_119626_119732_119862_120559_120664_120766_120837_120979_121096_121237_122632_122937_123041_123123_123406_123873
881120	contig_6914_pilon	-	640	3	Intergenic	novelGene_151730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	31	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	244	405	122947	122480	FALSE	25	GCCAAAAGGTGCACTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQALGLHLPDPPLESEDEEEEGATALSNHNSIPMDPEHVELVKRTMAGISLPAPGVPAWAREISDAQWEDVVQKALQARQASPAWK	123273	122244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_122632_122937_123041_123123
881121	contig_15327_pilon	+	2418	3	Intergenic	novelGene_70601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	186	356	898735	898905	TRUE	20	GGAGCGAGCGAAGGGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESNLNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898549	901282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_899080_899300_901035_901128
881122	SIRV5	+	2682	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-257	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7944	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12931_13161
881123	contig_6076_pilon	+	4015	6	Intergenic	novelGene_81776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTACGACCACTGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546385	832788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_547455_633914_633941_812857_813104_829985_830969_831011_832516_832601
881124	contig_160_pilon	+	5250	3	Intergenic	novelGene_156334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTGTGGAAATAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894191	903233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_896423_899519_901753_902447
881125	contig_19816_pilon	-	2642	5	Intergenic	novelGene_156471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	382.383969329259	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	174	608	126303	123193	TRUE	60	TTAGCAATTTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWDVGRLAPPHLRGPPPHTELCPLPDPCSCSSRGRAGKSPSLL	126773	116821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_123319_125683_125854_126164_126435_126731
881127	contig_7695_pilon	-	5282	5	Intergenic	novelGene_41653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1521	1895	970878	970504	TRUE	85	ACAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKREKRKQMKLKKKKKTRKAPKKQKKKNQREKKCAQGSLSRSVEAEWDSLCHAALPGQERLPTQEKEKKTNKQLKTNKRRKAPGSQQCGSPDREATPHLNGAPQPLRKKQRWRKEPGT	1011302	838052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_840900_969697_970222_970487_971312_971925_972778_1011067
881128	contig_4857_pilon	+	6903	3	Intergenic	novelGene_48748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	240	470	1198189	1198661	TRUE	20	ACTCGAATAGCCTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKSVGFLYTNKENHEKEIRKTIPFSIAPKKRKYLGINLTRDVKDLYQENYKRLLQETQRELHKWKNIPCSWIDRLNIVKMTILPKAVYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGPIPHAIYKNYFKMDQRPEYKA	1197949	1208336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1198352_1198593_1203433_1206674
881129	contig_11309_pilon	-	2551	7	Intergenic	novelGene_149860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_4	2688.34524175912	37	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	67	825	65730	56293	FALSE	25	CTTCACGAATTTCACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65796	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_64220_64337_64427_64498_65727
881131	contig_12677_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_110811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGAATGATAGTGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2163	2827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2800
881132	SIRV6	+	1366	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	82	80	32	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	176	667	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1169	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881134	contig_13680_pilon	+	4216	1	Intergenic	novelGene_149611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1700	2083	443441	443824	NA	30	TATTTAGCCACAATTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKGLEIDRIPIEMFHQTDAVLEVLTCLCQEIWKTATWPTDWKKSVFMPIPKKSDPTEYRNYRTISLISHASKILLKIIQKRLQQYIDRELPEIQVEFRRGRGTRDIIADVG	441741	445957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_441700_446000
881135	contig_5669_pilon	+	1664	2	Intergenic	novelGene_86043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	304	junction_1	0	3555	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	111	470	117764	120224	FALSE	20	TACCTCTTCCCCATCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRGKLIAVIGDEDTVTGFLLGGIGELNKNRHPNFLVVEKDTTLNEIEDTFRQFLNRDDIGIILINQYIAEMVRHALDAHQRSIPAVLEIPSKEHPYDATKDSILRRAKGMFTAEDLR	117653	121418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_117922_120022
881136	contig_4103_pilon	-	742	2	Intergenic	novelGene_52019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTGCATTATTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543733	528798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_529278_543470
881137	SIRV5	+	2664	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-270	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1199	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7931	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12176_12437
881138	contig_18208_pilon	-	393	3	Intergenic	novelGene_176200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2379.5	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTCATATGCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155454	154392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154833_155355
881139	contig_9177_pilon	+	3113	20	Intergenic	novelGene_32548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5123	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	794	1222	2759	3724	TRUE	30	CCCTGCAGACACATCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1710	9859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589_7741_8489_8611_8687_8789_8903_9056_9149_9315_9403_9509_9727
881140	contig_6691_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_60178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCATTTTGTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416907	419407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_416900_419400
881141	contig_9678_pilon	+	3535	6	Intergenic	novelGene_146371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	622	junction_4	429.346759624432	3502	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	2583	3365	259970	266767	FALSE	15	TCGGTCTTTATTTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNEYIELHRKRHGYRLDYHEKKRKKEGREAHERSKKAKKMIGLKAKLYHKQRHAEKIQMKKTIKMHEKRNTKQKNDEKTPQGAVPAYLLDREGQSRAKVLSNMIKQKRKEKAGKWEVPLPKVRAQGETEVLKVIRTGKRKKKAWKRMVTKVCFVGDGFTRKPPKYERFIRPMGLRFKKAHVTHPELKATFCLPILGVKKNPSSPLYTTLGVITKGTVIEVNVSELGLVTQGGKVIWGKYAQVTNNPENDGCINAVLLV	257387	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_259973_261565_261754_261842_261994_263530_263711_265596_265790_266699
881142	contig_11709_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_168215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGAGTGGGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50086	47664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_47700_50100
881143	contig_15092_pilon	+	2189	4	Intergenic	novelGene_57786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	229.991787292986	3980	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	186	752	325159	351165	FALSE	15	TTTTTTTCGGTGAGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324673	352602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_324791_325090_325335_348139_348358_350992
881144	contig_6445_pilon	-	2417	17	Intergenic	novelGene_76926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	775.956305148686	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	919	2190	89674	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_91007_91854_96306
881145	SIRV6	+	1203	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3998	50	-1896	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTATTGCCTACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
881146	contig_4974_pilon	-	2898	1	Intergenic	novelGene_161400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	262	789	433	1221	57772	56984	NA	55	GTATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMDRQTQHCENDNSTQSNLEIQAIPIQIPTTFSKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKKKVGGLTLPDFRTYYTATVVNTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDINPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLVNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKCIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQLQKDNG	58204	55306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_55300_58200
881147	contig_12624_pilon	-	2663	15	Intergenic	novelGene_61028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	833.352927660794	3881	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	336	1898	903621	862389	FALSE	25	TGGTAGCGCAGTGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903956	861623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
881148	contig_6599_pilon	+	1215	2	Intergenic	novelGene_175965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5672	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260674	262715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_261472_262297
881149	contig_6797_pilon	+	5064	4	Intergenic	novelGene_178235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1271	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3865	4173	275972	276280	FALSE	5	GGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKGKKKKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	158894	277171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6797_pilon_+_160214_162061_162232_226231_226587_273951
881150	contig_15500_pilon	+	2790	1	Intergenic	novelGene_128965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	207	638	5196	5627	NA	80	TATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMDRQTRHCENGNSTQSNLQIQCNPDPNTSNILQRMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTFYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIQWGKTVFLTKGAGKTGYPFAKK	4989	7779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_5000_7800
881151	contig_17522_pilon	-	4577	7	Intergenic	novelGene_160806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1484	2152	216849	216181	TRUE	45	AGCTCAATTGGCAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDSEFKSVILRIIQEMKQKADKNEEKIEKFMEKADKFMENTDKKKMEKFRKIMQEQNTKINSQLEIIEKQLEIQKINKISETDSVIEGLRSRFKMVEDRISGIENKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVTWDTIKSKNFQVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTETFLNIMKDEKLAIQEAQ	249977	81147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_81308_82113_83090_120547_120639_209651_210056_215386_216879_248338_248847_249031
881153	contig_20199_pilon	-	1115	3	Intergenic	novelGene_82554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1345	19669	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	196	591	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44182	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42347_43906
881154	contig_2750_pilon	-	1825	2	Intergenic	novelGene_164475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAGAGGTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7927	6049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_6675_6727
881155	contig_1867_pilon	+	1508	6	Intergenic	novelGene_54504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5518.78245267921	63	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	222	854	213567	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKICAAVAASAAARGACSFLSRSGAPPVAPPRRLNSQPGVRSPRLEPAAALRGHSRDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194795	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194966_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
881157	contig_19514_pilon	-	3288	2	Intergenic	novelGene_166317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTGCTGGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70641	66959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_-_67969_68362
881158	contig_2770_pilon	-	1644	6	Intergenic	novelGene_107453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	36795	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	297	746	750561	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750857	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
881159	contig_7457_pilon	-	480	5	Intergenic	novelGene_31292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4566	junction_4	1871.99043467107	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	41	451	160764	157884	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFMKPGKVVLVLAGRYSGRKAVIVKNIDDGTSDRPYSHALVAGIDRYPRKVTAAMGKKKIAKRSKIKSFVKVYNYNHLMPTRYSVDIPLDKTVVNKDVFRDPALKRKARREAKVKFEERYKTGKNKWFFQKLRF	161048	157854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_157933_158046_158158_159098_159269_160683_160767_161010
881160	contig_5217_pilon	-	939	5	Intergenic	novelGene_135765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_4	1449.06476304546	42760	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	20	505	560372	558576	TRUE	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLVSEWAASSPLGTVGRAARLQPSCDENSVQFCY	560391	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558851_559273_559374_559858_559966_560368
881161	contig_9177_pilon	-	2664	18	Intergenic	novelGene_32561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1962.20491401063	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	361	2466	26442	1909	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIAKPRAWPCPVPLHIPCPLPDSKCLHALGPRKCLPLPRVLTLQEYYY	33086	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2049_20054_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
881162	contig_8268_pilon	-	3240	1	Intergenic	novelGene_147010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAGTACAACTAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327488	324248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_324200_327500
881163	contig_1939_pilon	-	3414	1	Intergenic	novelGene_144885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1373	1675	922866	922564	NA	30	TTTTTCCAAGGTAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQAGCVFFVVCSSVGTIIFCFLLLLARSVTQIWYSRAGLAEEELLGWVVCGTYYSHQGGSVINTGQVPLGCACAAWWCDVKRMVQVGRMEGGDCDVWS	924238	920824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_920800_924200
881164	contig_5039_pilon	+	4122	1	Intergenic	novelGene_64976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	129	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	2656	3648	1679067	1680059	NA	10	TTATGCTTCTTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1676411	1680533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1676400_1680500
881165	contig_10793_pilon	+	1519	15	Intergenic	novelGene_83376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3119.00345479456	10530	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	132	740	146975	161398	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEICYVSLNKAVFNFSF	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161347_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
881167	contig_7775_pilon	+	5081	4	Intergenic	novelGene_37499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	3965	4360	488046	488441	FALSE	45	CTCAACAAAATTCTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNDTINQLDLMDIYRTLHPTAAKYTFFSNGHGTFSRIDHTLGHKASLNRIKILQSIFSDHKAIKIEINNRKSKEKKSKRKLNNTFLKNYWVIAEIKDGIKKFIESNENEIHPTRTFGTQQKQCSEVSL	267771	489162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_269794_423780_425459_477622_477627_487785
881168	contig_1150_pilon	-	773	3	Intergenic	novelGene_61407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25453.5	119	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309539_309812_309927_311002
881169	contig_6059_pilon	-	2572	13	Intergenic	novelGene_44844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	3947.03678849364	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	815	2122	578225	569146	TRUE	25	CGTGCACATGATGTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	567795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_584161
881170	contig_9706_pilon	+	876	1	Intergenic	novelGene_20883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3116	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3100_4000
881171	contig_11752_pilon	+	1976	8	Intergenic	novelGene_37627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	821.470806367631	83	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	98	1126	87165	105616	FALSE	20	CCACACAAGCTCCCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	84104	106466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597
881172	contig_6059_pilon	-	2777	16	Intergenic	novelGene_44851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	3905.58225222423	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	505	2340	584299	569146	TRUE	35	AAATTCCTTAAACCGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584869	567808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584614_584679
881173	contig_1331_pilon	-	1586	8	Intergenic	novelGene_37823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3350.51349704453	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTGTGTGAAATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194024	159246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_170279_170331_177728_177880_193604_193652_193763_193859_193957
881174	contig_17964_pilon	+	2085	9	Intergenic	novelGene_33876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	1506	2084	139584	163158	FALSE	20	GGAGCCCAGTGCCGGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHALLAGEIIHVVHGLEVEKGGHFHVGAAEGHDAQAEVQQLQGHQWDLGGAGSAPRGELEVGRQLDVGAQQSEQAQEEVHDLQGQEGQEVLLPVLNHTDQQAQADDKEHGDEQEAGQQVSDPEVACLRELAGGLAVSHLHRVLNEQQDAHDHMVNGQGGGGHADIEATAGLADGSCAEGHGSTVPSSEALRE	134213	163159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_134651_134730_135637_136899_136997_139518_139617_140844_140967_142295_142426_144075_144153_144861_144956_163035
881175	contig_4782_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_73611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGACAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161707	159281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161700
881176	contig_3747_pilon	+	2876	8	Intergenic	novelGene_24864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	19741	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	299	1474	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201014	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881177	contig_1146_pilon	+	460	5	Intergenic	novelGene_84860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4074	junction_1	2080.05076560646	54044	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	29	421	950980	957132	FALSE	0	CTCTGCTGCTTCCCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFDVQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF	949780	957171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_949804_950974_951113_951651_951732_956017_956104_957038
881178	contig_17936_pilon	-	2299	12	Intergenic	novelGene_29946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	489	866	126099	121018	TRUE	30	TCCCGGGAAGGCACAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIRQGNKQQSEFKQGSWWGPWTCYSLAKTGMDGWGHWEQNWDAGCISKPRDRWLLDQRPDTVLRLSGFYEPWQEEKGDTGCMPSNCVKGLLEKGRPSSVAQGKGVYRKPKLDPGSHAACSKQQS	126587	51311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_51365_54170_54299_68273_68390_79102_79298_90971_91159_95140_95305_106374_106471_110996_111164_114797_114932_118633_118827_121017_121060_125763
881181	contig_6059_pilon	-	2716	16	Intergenic	novelGene_44834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3905.58225222423	10852	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	427	2262	584299	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584878	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584579_584731
881182	contig_13211_pilon	-	3777	3	Intergenic	novelGene_123142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTCAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281279	214790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_216042_265067_266316_280001
881183	contig_9177_pilon	-	1290	10	Intergenic	novelGene_32558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2166.9363307971	14	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	90	1010	26442	1991	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLALSPP	32815	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2005_23292_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
881184	contig_8878_pilon	-	1296	7	Intergenic	novelGene_147856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	424.778537070266	3394	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	569	955	228839	228170	FALSE	25	GCAAGTGAACTCATCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231704	227828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230774_231041_231121_231647
881185	contig_1331_pilon	-	2210	6	Intergenic	novelGene_37793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3369.93782731967	17019	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	193	669	169924	160009	FALSE	15	ATGATATGTCTCCCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKHLLFWGVLAIFVQAVLVTAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	194024	158467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_169860_169955_193763_193859_193957
881186	contig_8258_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_130440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	139	651	10664	10152	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHVITWMKVEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	10802	8362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_-_8400_10800
881187	contig_12677_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_110693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1000
881188	contig_2770_pilon	-	1344	5	Intergenic	novelGene_107439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	848.014850990241	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	105	446	746670	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	747795	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765
881189	contig_9881_pilon	+	3927	2	Intergenic	novelGene_178241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	3607	3927	1144155	1144475	FALSE	45	AACATTGTGAAAATGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSIRNLLELIERFSRVAGCKTNIQKSVGFLYTNKDNDEKEIRKSIPFSIAPEKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQKDLHKWKNIPCSWIGRL	1132022	1144475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9881_pilon_+_1134117_1142642
881190	contig_15114_pilon	-	1163	2	Intergenic	novelGene_121232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	863	junction_1	0	53	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	369	704	1692985	1692650	TRUE	15	TAACTGTGTGACTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSFCRADLLLKTRRGSMAYVCFLRAFWEDFMDKDYFIAEAWGTAALAVPVSNRPSSATEVSLWCFTSKVSWAPPLLMALPDYHFVGLEPVLKSCVSKVLLLWKGGSHLIL	1693353	1690958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405
881191	contig_9484_pilon	+	3615	12	Intergenic	novelGene_105614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_10	427.41040335088	2991	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	60	1721	95848	104965	FALSE	25	TTATATGGCTGTATTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95788	106859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
881192	contig_854_pilon	+	1678	1	Intergenic	novelGene_36383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974740	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
881193	contig_4654_pilon	-	2843	6	Intergenic	novelGene_103084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_5	611.654608418836	8836	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	191	931	500418	494476	FALSE	15	AGTTAGTTGCCTGTGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515980	492563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_515793
881194	contig_10973_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_150383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	620	1132	2730	2218	NA	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3349	1540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3300
881195	contig_1867_pilon	+	1392	6	Intergenic	novelGene_54502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6133.01786724937	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194079	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194319_213515_213629_215772_215811_218786_218898_219457_219609_220857
881196	contig_1264_pilon	-	932	2	Intergenic	novelGene_161305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGACAATAAAGAATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133811	132734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_133589_133733
881197	contig_4501_pilon	+	7439	12	Intergenic	novelGene_168977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	164	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	3503	4525	212402	213638	TRUE	60	AAACACTCAATAAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDKKK	3374	454725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_+_3628_3724_5274_73465_73650_103277_103398_137984_138316_174538_175553_212350_213413_213626_213712_284838_284868_406872_408191_408239_408518_453509
881198	contig_17144_pilon	-	4175	18	Intergenic	novelGene_29162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2102.58877508024	2081	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	183	1034	179764	167934	TRUE	20	TTTCTTTCTGCCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLPACIMFTSWPPAGAGPPTIQASP	183264	157604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_159529_161422_161508_162014_162064_162875_162952_164215_164261_164551_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168007_173644_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
881199	contig_20199_pilon	-	833	3	Intergenic	novelGene_82569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	69	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43993	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41324_42100_42171_43906
881200	contig_9112_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_60228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	512	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGCCAGACTCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119133	116665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_-_116700_119100
881201	contig_2311_pilon	-	3278	2	Intergenic	novelGene_169813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2443	2841	270978	270580	FALSE	65	TCCCATAAAAATAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLLCFLSFCPGEINDSAKPEMFTFHNGGVQIICKHPETIQQFKMRLLKGRQILCELTKTKESGNTVSTVKNLEFCQLSNNSISLFLRNLDSSHASYYFCEITIFDPPPYRVATLSGEYLHVYGKALLLSS	273938	270142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_271249_271766
881202	contig_1150_pilon	-	668	3	Intergenic	novelGene_61408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	245	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309976_311002
881203	contig_17144_pilon	-	5106	17	Intergenic	novelGene_29166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	1844.38485256603	322	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	132	1574	172736	166363	TRUE	15	ACAGTCATTTCTTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173353	157611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_157758_158012_158205_159469_160598_161422_161508_162014_162064_162875_162952_164215_164261_164551_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305
881204	contig_14925_pilon	-	1638	5	Intergenic	novelGene_55353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	20	AGACCCTGTCTCTACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
881206	contig_935_pilon	-	4658	7	Intergenic	novelGene_45525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2172	2507	123091	122756	TRUE	30	TAAAGGGCATCTGAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIDIPFDPTITLIGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAERWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNDNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCTRPLL	264154	46054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_46508_86536_86608_87047_87503_105441_105453_121594_123321_153275_153291_262227
881207	contig_15325_pilon	+	981	7	Intergenic	novelGene_157170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	778.253314944576	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	172	660	94428	96243	TRUE	30	GAAGTTCACTTCACAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLSTITRNTGRCTERKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93227	96868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_94482_95116_95233_95674_95785_96034_96245_96548
881208	contig_2703_pilon	-	1449	2	Intergenic	novelGene_101645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	540	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3291	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_2047_2541
881209	contig_12081_pilon	+	1284	5	Intergenic	novelGene_166978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	886.388599881564	9213	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	424	906	16849	18277	FALSE	10	TTTTTATTGTCTTTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15773	18655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16684_16992_17069_17245_18112
881210	contig_8617_pilon	-	498	1	Intergenic	novelGene_73378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61276	60778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61300
881211	contig_12644_pilon	+	1397	10	Intergenic	novelGene_44667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	38	1309	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675488	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
881212	contig_4232_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_63361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTTTTTTAAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468087	467154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
881213	contig_17144_pilon	-	2111	4	Intergenic	novelGene_29356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	96.3512094140782	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1098	1817	167982	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	169079	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918
881214	scaffold_12124_pilon	+	2740	11	Intergenic	novelGene_22246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1178	1828	1508755	1509405	FALSE	30	GTAATGAAGTCACTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473571	1510317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508643_1508754
881215	contig_13894_pilon	+	1267	10	Intergenic	novelGene_62126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2403.62868170318	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	156	1211	521729	528117	FALSE	10	CACCTGCGTCTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHIVREVDRPGSKVNKKEVVEAVTIVETPPMVVVGIVGYVETPRGLRTFKTVFAEHISDECKRRFYKNWHKSKKKAFTKYCKKWQDDDGKKQLEKDFNSMKKYCQVIRIIAHTQMRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520697	528173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_520708_521583_521769_522677_522847_523488_523625_524837_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
881217	contig_4305_pilon	-	1404	5	Intergenic	novelGene_136661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	109.079099739593	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	247	612	507008	505823	TRUE	40	TTCCAGTATTATGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEGDVELELETETSGPERPPEKPRKHDSGAADLERVTDYAEEKEIQSSNLETAMSVIGDRRSREQKAKQEREKELAKVTIKKEDLELIMTEMEISRAAAERSLREHMGNVVEALIALTN	507254	504514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_504926_505441_505919_506055_506108_506433_506490_506846
881218	contig_2703_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_101658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGAACTTTGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1467	1725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1500_1700
881219	contig_8878_pilon	-	1215	7	Intergenic	novelGene_147867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	413.407688204594	84	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	237	887	231110	228170	FALSE	45	TCAAATAACCTAAGCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231706	227841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231288_231647
881220	contig_14467_pilon	+	3868	7	Intergenic	novelGene_138260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.372677996249965	139	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	110	793	313398	319153	TRUE	15	ATTGGCCCGAGCTTCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGAKCWIPVVDSNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	313288	351743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_313438_318509_321587_322015_322124_322254_322506_335306_335485_347812_347888_351713
881221	contig_16322_pilon	-	2241	6	Intergenic	novelGene_87495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_5	373.95957000724	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	212	625	37060	32956	TRUE	20	TGTACCAGCGCACACCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57639	30828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
881222	contig_16496_pilon	-	1492	2	Intergenic	novelGene_5161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3456
881223	contig_18637_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_81864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAGAGAATTTAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222238	223901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_+_222200_223900
881224	contig_4232_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_63320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
881225	contig_9484_pilon	-	1659	10	Intergenic	novelGene_105642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1193	1528	100777	98571	FALSE	30	TATGAGTGGACAATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTKLSTALMPVCIGSRTEILGMIPGAFSPTRLRFLEPIGPFPSMALPSASTTRPSSSSPTGTSTMAPVLFTISPSLISLSFPNTTTPTLSGSKFRDIPFNPEENSTISSA	105097	98439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_98609_100387_100562_100653_100822_101218_101366_101600_101754_101849_102078_103263_103371_103492_103641_104260_104410_104881
881226	contig_9706_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_20756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGTCAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_100_1700
881227	contig_2703_pilon	+	1855	3	Intergenic	novelGene_101649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCGGCTGGACGAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	4176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1759_2579_3345_3497
881228	contig_15897_pilon	-	2358	2	Intergenic	novelGene_49535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAATGTTCTTGCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598774	589555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_589564_596424
881229	contig_5317_pilon	+	943	4	Intergenic	novelGene_76540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5601.48623134968	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	172	582	35282	43326	FALSE	30	ACTAAATGGTGTTTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	34448	43687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_34597_35258_35410_36684_36839_43197
881230	contig_990_pilon	-	3888	6	Intergenic	novelGene_76030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063450	743728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_743828_831129_831429_906516_906762_989567_989906_990250_990593_1060885
881231	contig_6929_pilon	+	1370	9	Intergenic	novelGene_139373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5622.67398574735	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	591	971	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101616	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101743_101881_101921_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
881232	contig_7457_pilon	-	4707	23	Intergenic	novelGene_31484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	544	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4399	4698	642577	612248	FALSE	20	CCTCAGGGGCGACGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDSQSKGPETALAPSGSCHCTADAAAPGTVCRAAAADSIGPSCWNPGSQLFLRLRPDRLRLRLGRGAGRGAPSGRGASPSRQGEGTPSWGARQGSG	671993	612238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_612390_641605_641758_642571_642716_643347_643446_648694_648792_648953_649036_649224_649322_649492_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
881233	contig_9774_pilon	+	6847	4	Intergenic	novelGene_178245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2803	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	6034	6606	177990	178827	FALSE	15	CTCCCCCTTTCAGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLSERRGRRREASKKSKEEAEKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSREGRLWVKKGKGVGKHISQTTGALQPLRKKQRWRMERGTRAKGGRDGERQGRNQKKRKKATPAANKWHPESRLLGCVESKQPAHPGQETVAVGSRGGRAGAKRGGEWESAHCKLPAVLSPARCSVRLLSHTPFAGLR	22334	179068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9774_pilon_+_26725_68205_68889_177029_178047_178311
881234	contig_14467_pilon	+	4489	3	Intergenic	novelGene_138251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34	102	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	2	661	306508	319153	FALSE	15	CCCAGCTCCACTTATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAAAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306506	322981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_318548_318583
881235	contig_13422_pilon	-	3905	5	Intergenic	novelGene_178246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2992	3696	2119	1415	FALSE	50	AAACTTATAAAGATAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	117125	1205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13422_pilon_-_2207_2325_3178_11747_11754_32689_34217_116606
881236	contig_9684_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_178250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	216	572	140223	139867	NA	15	ACGCGAGCTGGATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSKENNEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKEYYKTLLNETQRDLHKWKSIPCSWIGRLNIVKMTILSKGIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEELIINFIWKGKKPRISQALLKKKNKVGGLTLPDFRIYYTATVIKTAWYWYNDRSIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKCPKVHQMGKRQSF	140438	137672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9684_pilon_-_137700_140400
881237	contig_15105_pilon	-	1383	5	Intergenic	novelGene_151011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_4	1072.40975727564	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	35	397	839916	829338	FALSE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839950	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_839849
881238	contig_12080_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_128405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAACTATTTGTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463237	550566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_464126_550279
881239	contig_6589_pilon	+	526	6	Intergenic	novelGene_26129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_2	2598.31137472013	5	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	73	501	1879232	1880585	FALSE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878982	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
881240	contig_11548_pilon	+	1557	6	Intergenic	novelGene_66765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	1305.61688101832	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	124	714	112832	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112499	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112595_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
881241	contig_8712_pilon	+	2019	4	Intergenic	novelGene_58802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	576.151793270566	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	73	552	314974	321793	FALSE	25	TATCAATTCTCATGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	311677	323260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311744_314967_315188_318064_318222_321684
881242	contig_14467_pilon	+	3113	2	Intergenic	novelGene_138244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	283	858	318578	319153	FALSE	45	CCCATCATAGAAAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHPGLCRNNLLEANAWRPPAPAGSPGPPASVRLHQDPPPAPSVSPDLPVTHESVSCANRQPAGGPQTRNCSGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	291093	321408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_291308_318509
881243	contig_19518_pilon	-	2373	5	Intergenic	novelGene_170717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6187.95172088471	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCACACACACAGAAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49267	32134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_33385_33620_34442_45442_45597_47623_47728_49223
881244	contig_14807_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_124689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	167	484	37320	38373	FALSE	25	GCCACAACTTTTCACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFSATMSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLSAPAQDNILLMRMTWKGWSRTRM	37153	38384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37648_38297
881245	contig_9389_pilon	+	701	2	Intergenic	novelGene_84039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4932	junction_1	0	26	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	80	337	584884	585904	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKVSSV	584804	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584892_585654
881246	contig_9839_pilon	+	764	6	Intergenic	novelGene_88513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1853.43622496163	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	34	633	49467	61360	FALSE	15	ATCACTTGTTTTCTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSESSPGTNVMISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45374	61491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45401_49459_49614_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
881247	contig_9177_pilon	+	8271	57	Intergenic	novelGene_32613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.132432115840994	393	36	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	628	1056	2759	3724	TRUE	25	TCTATGCGAAGGCGGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1876	33086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589_7741_8489_8611_8687_8789_8903_9056_9149_9315_9403_9509_9727_9861_10294_10478_10571_10713_10958_11120_11613_11759_12844_12967_13080_13173_13274_13368_13554_13696_13890_14089_14296_14415_14809_15020_15162_15267_15424_15553_15705_15844_16051_16170_16268_16379_16549_16677_17437_17611_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20809_20907_21023_21210_21390_21607_21689_21864_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327_25480_25583_25714_25970_26070_26312_26474_32757
881248	contig_9815_pilon	-	3505	5	Intergenic	novelGene_164228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	2523	3374	983	132	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGGGERQVRSQKKQKKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKGGGGGERQGRNKKKRKKSNTSSQQMALREPPVRVCGIQAAAVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGWESVYHQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSVLR	86715	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_1249_21039_21192_38646_39124_83445_83862_85503
881249	contig_13093_pilon	-	4793	2	Intergenic	novelGene_105209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	442	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTTCTTGTTTCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29840	18409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_22608_29245
881251	contig_14142_pilon	-	1242	6	Intergenic	novelGene_120628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_5	432.844729666424	2852	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	132	596	622927	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	624783	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_624673
881252	contig_15092_pilon	+	2685	3	Intergenic	novelGene_57785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	3432	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	499	1065	325159	351165	FALSE	15	GGATGTTTTTTGCAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324660	352785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
881253	contig_9839_pilon	+	2036	10	Intergenic	novelGene_88496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_7	1684.40349554448	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	131	901	49467	60058	TRUE	20	GATCATTGTCTTGATGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGVSMLAGLIEFCLVYPNFWAVLNYVIKSGRRNCCLVMRYTWVGF	45310	79102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_60484_61264_61456_76159_76347_77384_77514_78899
881254	contig_3627_pilon	+	2385	4	Intergenic	novelGene_78557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1188	1691	820442	821567	TRUE	25	CGGTCACGCGGAATCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAAARRNVAPQPRRKGPRQLLESGSRAKRGRRQRAASENPKEAEKEKREKKKKNNTCSLQTAPKEPPARSRGIQAAGSPGSRACGPGKQRSKRTKAPNSRPRGSPDLEAAAHPNVAPQPRRKGQRRRSEPGT	819133	871703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_819332_819452_820889_821510_821578_871019
881255	contig_3601_pilon	-	5346	1	Intergenic	novelGene_132846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	489	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	946	1251	130167	129862	NA	30	GTGAAGATGTGGGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131112	125766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_125800_131100
881256	contig_11720_pilon	+	1077	6	Intergenic	novelGene_43859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_5	1586.12251733591	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	74	793	86302	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	86228	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
881257	contig_2227_pilon	+	1275	3	Intergenic	novelGene_142335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3432.5	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATCTCTTGTCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230490	232765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230517_231451_231644_231708
881258	contig_10793_pilon	+	1941	14	Intergenic	novelGene_83360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3221.93064801087	686	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	134	1060	146975	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130868	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_165377_166434_166473_167141
881259	contig_16011_pilon	+	5139	3	Intergenic	novelGene_177374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	320	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	3666	4715	30928	31977	FALSE	50	ATGACAGCAACAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	2075	32401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_+_3814_18611_18666_29054
881260	contig_12081_pilon	+	1131	5	Intergenic	novelGene_166973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	626.654609813093	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	118	753	16400	18277	FALSE	10	TTTTTATTGTCTTTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15765	18655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
881261	contig_8452_pilon	+	4563	3	Intergenic	novelGene_48000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	24	80	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1424	1780	263026	263382	FALSE	55	AAAGGATGGAAGGAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNFAPGNVTTEVKSVEMHHQILSEALPVDNVGFNVKNVSVKHVCHGNVAGDSKNDPPMEAAGFTTQVIILNHPGQISAGCAPVLDCHTAHTACKFAELKERTDLRSGKKWRMALNS	255040	266165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_255187_260988_261402_262161
881262	contig_4654_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_103079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1441	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGAGGCAGGAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492558	493456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_492600_493500
881263	contig_10404_pilon	+	1538	5	Intergenic	novelGene_138670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1724	junction_4	2121.84252184275	7	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	64	441	1085448	1098397	TRUE	10	TTTGCCCAACTGTTGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKVGSQGLDLLNFNLRMKLRFQGPLFFKGLFF	1085384	1100475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098859_1099839
881264	SIRV6	+	1253	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3998	0	-1896	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
881265	contig_14142_pilon	-	1210	6	Intergenic	novelGene_120632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	462.25992688097	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	100	564	622927	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625390	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625312
881266	contig_4857_pilon	-	5630	6	Intergenic	novelGene_48735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCTCTTCATTTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362554	1192800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193512_1193579_1193955_1194045_1195650_1199440_1200748_1360443_1361543_1362020
881267	contig_10437_pilon	+	2304	2	Intergenic	novelGene_38482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12507	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTGGATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212892	1215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214303_1214827
881268	contig_9484_pilon	+	1657	10	Intergenic	novelGene_105643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_8	460.063280671499	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	145	1524	98584	104965	FALSE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	98439	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
881269	contig_7057_pilon	+	2754	4	Intergenic	novelGene_123267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_1	41.2983723112129	37	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	90	326	703803	705218	FALSE	10	CACTGGATGTGGCTTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCFLSLPPWLLRTSLDHSPLSDLSSPPLAMPPPGLILLLLLLPVAAAQTTPGPCSGCGPLSLPLLVGLVAADAVLSLLTVGVVFMCARPRHQPMPDDKIYINMPVRG	703713	707646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_703846_704345_704370_704826_704959_705180
881270	contig_7151_pilon	-	4583	8	Intergenic	novelGene_40762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	924.42858246683	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	133	810	551063	529189	TRUE	35	GTCAATTCAGATTCATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	571438	523168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526664_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996_551120_571362
881271	contig_9415_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_109850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	429	839	1975058	1974648	NA	40	AAAAGCCACTACATCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPYNPAIPLLEIYPREIRVVTQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPKRPSTDEWINKLWYIHTVEYYATRKNNDEFVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLLQKPMKKFTHKK	1975486	1973491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1973500_1975500
881272	contig_12425_pilon	-	3591	10	Intergenic	novelGene_46658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	732.309284994318	5108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	247	1269	211174	204225	FALSE	25	TTATTATTAACCCTCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226981	201902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226760
881273	contig_9177_pilon	+	1819	6	Intergenic	novelGene_32679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	735.495044170931	2849	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	14	478	395377	415476	TRUE	20	TCTTTTATGTAATATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395363	416871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315_416126_416179
881274	contig_10541_pilon	-	3800	4	Intergenic	novelGene_144625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1969	2322	98985	98336	FALSE	40	TCCTAGCAGTAAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNKKEKREEKNKKLKKKKIPGIPLAWQRKPGKQFPSRVVLHHLSRRSKNGTHSQVFKRKEGEEVRGREETKRSREKQHQQQRNGTEGAGWCGRGKSKRQEAGTSPAKWPQPAGKW	139796	96857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_98623_98918_99196_115301_115935_138671
881275	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
881276	contig_16594_pilon	+	7216	12	Intergenic	novelGene_53789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	803	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6051	6404	149311	272805	TRUE	50	GAAAAATAAATGGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWWLSLVQLKTLAQAVMGHRASWHWLAAFAGPTWPCSSAESSYCAHLFPIVFLSVGVDEDICSSPWSNDLSMNQSRRLRVHFQLGSFSMDVQIYIPCLAVSKSPFGTLYILPVLAI	113175	293889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115995_116098_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_272661_273515_289514_289526_293797
881277	contig_3679_pilon	-	5265	5	Intergenic	novelGene_112109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2265	2765	51637	51137	TRUE	50	CTCTCAACAAAATAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSIDTENEFDKVQHPFMTKTLSKIGIEGKFLSIIKGIYTKPTAMIILNAESLKAFPLRMGTRQGCPLPPLLFNIVLEVLARAIKQEKEIKGIQIGKEEVKLSLFADDMILYTENLKESTRKILELIEDFSKVSGYEINIQKSVGFLYTNEENFEEEITNQYCLQ	156171	20639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_21168_21216_22767_50714_51690_103425_103879_154412
881278	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80622	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
881279	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
881280	contig_14322_pilon	-	1265	3	Intergenic	novelGene_116511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6853	junction_1	648.5	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	602	931	672553	671886	FALSE	25	GACTCCTCGGAGGAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWPGGPPRHPWSSGCFTGFPRRSLCSGGGAGFSPACWVLCYLLQDNRLNVTEELASNDKTRILNVQTRLTEAKHITWRAVLSSSSLYIEIPGGALPEGEQRQLRSCP	674891	671551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671904_672241_672934_674670
881281	contig_4305_pilon	-	479	3	Intergenic	novelGene_136680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	564.5	96	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTGAGCGCCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514683	512962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514648
881282	contig_16103_pilon	-	662	3	Intergenic	novelGene_118698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_2	3069.5	1951	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	255	554	199309	198413	FALSE	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGALAMIYNEALKG	199563	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199303
881283	contig_11088_pilon	+	622	3	Intergenic	novelGene_85035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_1	1553	1758	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13629	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_17119
881284	contig_1867_pilon	+	1609	6	Intergenic	novelGene_54507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2286	junction_1	4918.0384138394	199	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	160	960	194973	220943	FALSE	20	CTAAAGGACTGTGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194813	221592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
881285	contig_5059_pilon	+	654	2	Intergenic	novelGene_140743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	280	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	218	583	414332	414697	FALSE	10	ACCTTTCTTGGTGCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERKKPANMEEKESLLNNKEKDCSERRPVSSREKPKDDIKLTAKKEVIKVPEDKKKKLEEDKRKKEDKERKKKEEEKVKAEEELKKREEEEKQKYEEEERKKQEEQAKRQQEEEAAQLK	408659	414768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_408859_414313
881286	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
881287	contig_602_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_134966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	185	493	558062	558370	NA	70	AATTAAAAAAAGAAAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKKKNHQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQSRKTKWD	557877	559823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_557900_559800
881288	contig_15449_pilon	-	5940	3	Intergenic	novelGene_33637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2891	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	57	314	91775	91518	TRUE	50	ACCTTATTAAGAAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWGDPLYPGLQNLSSPPVMQMPISLVKHQSSLCIFPQTERKSSNKMTVQPRRLLNKNNSNHLNRTSYVPSTTLSARCTLTSQTILTYCYYYHFTDVETEAQKG	91831	84790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_84953_86000_86195_86247
881289	SIRV3	+	1418	7	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	6	994	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCTAATACTTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1969	9933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4775_6057_6334_8755_8976_9189_9297_9431
881290	contig_6599_pilon	+	1016	2	Intergenic	novelGene_175980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260873	262715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_261472_262297
881291	contig_11719_pilon	+	578	6	Intergenic	novelGene_154741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3152	junction_5	1612.31212859049	2366	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	31	528	13921	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	13003	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
881292	contig_4654_pilon	-	2744	7	Intergenic	novelGene_103082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	812.502188031242	9427	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	152	892	500418	494476	TRUE	5	GTTGCCTGTGAGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515941	492558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493459_493523_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_515793
881293	contig_17144_pilon	-	2615	16	Intergenic	novelGene_29258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2146.60879218051	7486	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	467	2320	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPANAPGGRQWADPRVPGFLETLRPGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183188	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172670_172740_173356_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179746_181790_181850_183158
881294	contig_8665_pilon	+	3080	4	Intergenic	novelGene_178251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1608	1985	111266	111643	TRUE	75	AAATAAACAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLRKSIWRFLKKLEIEVPYDPPIPLLGIYPRETRAVTRADICKTMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEGINNLWYIHTMEYYETIKNNDEAVKHHITWWKLGLIMLSEFSQAQKDKYCIRPLL	6084	159559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8665_pilon_+_7100_11945_12277_111004_112647_159467
881295	contig_11594_pilon	+	1951	11	Intergenic	novelGene_80922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_10	468.104261890447	3985	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	418	1647	540415	637881	FALSE	50	ATAAATGAATTGAGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPISCSKNPLENHVYSCDYS	539997	638185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_637829
881296	contig_13612_pilon	+	2620	6	Intergenic	novelGene_157270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	303.594729862032	10945	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	10	396	26005	33493	TRUE	15	TTTTGTTTAGTGTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGVRGAAVAASTSVKPIFSRDMNEAKRRVRELYRAWYREVPNAVHLFQLDITVKQGQDKVREMFMKNAHVTDPRVVDLLVIKGKMELEETIRVWKQRTHVMRFFHETEAPRPKDFLSKFYVGHDP	25995	38933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_26144_32509_32626_33361_34562_34688_35128_36277_36418_38356
881297	contig_614_pilon	-	4276	1	Intergenic	novelGene_132652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	3473	3853	1036545	1036165	NA	35	AAAGAAGCCCTCGGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKYQGNNTQKRAGVAILNSDKTDFKVKSTTKDKEGQYIMIKGSIHQKDITLINIYAFNDRAPKYIKQTLAALKREIDSSTVVVGDFSTPLLVKDRTSRKKLNKDTEELSAIINQLDLIDIPNTQ	1040017	1035741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1035700_1040000
881298	contig_2377_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_67883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAATTTTGTAGATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192882	190569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_190600_192900
881299	contig_18081_pilon	+	1745	4	Intergenic	novelGene_23771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	1754	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	123	674	90717	112338	FALSE	5	CTGGCCTTTGACTTTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90594	113409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
881300	contig_8377_pilon	-	2983	2	Intergenic	novelGene_35075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5431	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTGATTATTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131407	128374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_128936_128985
881301	contig_9177_pilon	+	1933	6	Intergenic	novelGene_32678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	854.283887241238	7	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGGTCTTCTTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395359	416782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_404188_404334_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315
881302	contig_6059_pilon	-	3463	14	Intergenic	novelGene_44840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6035	junction_12	2922.54571893922	46	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	1315	3012	581095	569146	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	582409	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921
881303	SIRV6	+	1436	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	88	4	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	10	TGAAGTTTGCGTTTGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881304	contig_17144_pilon	-	1912	11	Intergenic	novelGene_29412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2210.17419223011	99	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	257	970	179764	167672	TRUE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPPYTLYHLLDQGSEAIFLHRPECLFLELCPPWPGACQLVSCSPHGHQPGRGHQQYRPHPDDLGPG	183338	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168216_174729_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
881305	contig_454_pilon	-	6093	7	Intergenic	novelGene_178254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4837	5226	62767	62378	FALSE	45	GGATAAACAAACTATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRFEAMEDRISEIKDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIRVPEQGEKTENTERITEELLTQNFPNIMKDKNLTIQEAQQTPCKIDPKRKSPRHIIITLMKTKDKES	383694	61510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_454_pilon_-_63762_63967_64624_110511_111113_235283_235291_348467_348741_348800_350176_382764
881306	contig_18208_pilon	-	238	2	Intergenic	novelGene_176194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4759	junction_1	0	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAATGCTTGTGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154762	154378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713
881307	contig_17281_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_105194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2818	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACATGGTACTTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3500
881308	contig_17936_pilon	+	2190	11	Intergenic	novelGene_29945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	812.683800749098	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	222	1331	79133	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	51291	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_51369_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
881309	contig_7293_pilon	+	3683	4	Intergenic	novelGene_54224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.24710337399	37	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2791	3147	329270	330139	FALSE	25	GTGTGAATCTTGTAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRHNTTSCTSVSPFGVLQVWLLLSLLLTALVPGTSQETNCVEAELYTELRCMCVKTTSGVHPSYINTLKVIRAGAHCNKVEVIATLKDGKKICLDPEAPIIKKIVQKILQSDGSAA	186015	330675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_188753_329216_329388_329744_329881_330036
881310	SIRV5	+	2668	5	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10986_11130_13337_13506
881311	scaffold_9100_pilon	+	2314	9	Intergenic	novelGene_83242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	479.320286968954	25	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	536	1534	647136	654304	FALSE	10	CCATATCGTTCTGGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644266	655084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644412_644564_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
881312	contig_6477_pilon	+	616	7	Intergenic	novelGene_154177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	910	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGTAATTTGCGCGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769325	773202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_769371_769552_769668_770021_770106_770616_770699_771241_771343_772407_772479_773084
881313	contig_9297_pilon	-	1369	3	Intergenic	novelGene_69847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGATCATTTTAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951720	707396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_707404_770163_770515_950709
881314	contig_13760_pilon	-	1093	4	Intergenic	novelGene_61346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	157.022999023144	816	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	124	378	355698	353496	FALSE	5	TGGCCCTTGTGTTGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSSWASLRTTTPGVPRGSKQKGPGSGSGSSLLLRCRSLGVMATGTDQVVGLGLVAVSLLIFTYYTVWVILLPFIDSQHVIHKYFLPRAYAVAIPLAVGLLLLLFVGVFITCVMLKNQKVAKKAQ	355821	352780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354491_355293_355384_355695
881315	contig_10197_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_115238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGATGCCTTCCGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972066	973995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_972100_974000
881316	contig_5317_pilon	+	675	3	Intergenic	novelGene_76557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	263	313	43276	43326	FALSE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35379	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
881317	contig_11422_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_99074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2400
881318	contig_8853_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_159159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCTCAGTACCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14499	12569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_-_12600_14500
881319	contig_2438_pilon	+	3278	6	Intergenic	novelGene_112022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2309.15937951455	4	119	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	TRUE	40	GAGAGAAGAGAGATGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	315514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729_313654_313700
881320	contig_10404_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_138662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_3	2663.17498486299	10440	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085380	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098305_1098722_1098859_1099839
881321	contig_18081_pilon	+	1548	4	Intergenic	novelGene_23784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	904.257460879121	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	115	477	104555	112338	FALSE	5	CTGGCCTTTGACTTTTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPERPHRLLLPGSHVAFPLQLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90772	113409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90812_104479_104681_108417_108517_112200
881322	contig_5815_pilon	-	418	5	Intergenic	novelGene_141230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5811	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGAGCGCAAAGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046057	1040934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_1040942_1041344_1041453_1044121_1044246_1045491_1045607_1045993
881323	contig_7963_pilon	+	1111	6	Intergenic	novelGene_58355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1176.26789465666	116	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	122	778	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFRVIQVYNFRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51328	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56791_56898_56964_57281_57564_57782_57934_63003
881325	SIRV7	-	1722	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	30	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTAGTGTTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147888	1004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1228_1931_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
881326	contig_6047_pilon	+	1370	8	Intergenic	novelGene_24209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	531.800714553864	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	510	1184	109227	116045	FALSE	45	TCACATTTATATAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKVSILGYTSFVINE	105191	116231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109173_109511_114652_114765_115034_115155_115886
881327	contig_6445_pilon	-	3070	15	Intergenic	novelGene_76877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	110	junction_14	589.546492082288	21	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	1125	2396	89674	43105	FALSE	45	GAGGAAGAACCCCAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	90798	42430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656
881328	contig_10371_pilon	-	3170	3	Intergenic	novelGene_175490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1381	2034	840902	840249	FALSE	65	CCACAAAAAAAGAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKSRQYKEIKDWYKLRKIVVNIKVTTKETNNATSQNKNLEKYKDSANTKSTIMKKKKRKYIKKNDSAQKVKWNKETVNNTHKDIKMTALNSYLSIITLNVNGLNAPVKRQGVADWIKKHNPSICCLQETHLRFKDTNKLKLKGWKRIHQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTPKDKEGHYLVIKGSIYPEDITIIKYIKQTLTALKREIAPRY	861080	839112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_-_841696_856449_856760_860803
881329	contig_854_pilon	+	7876	29	Intergenic	novelGene_36516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2936.67454576688	20	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	327	2801	1683971	1704639	TRUE	30	ACCCAGAACCTCATGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENGQGGLRAQTEESGGPAAGAAGEVQ	1612777	1739488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649577_1681837_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704525_1704565_1704689_1704893_1704999_1712430_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1717830_1718477_1719963_1737993_1738042_1739406
881330	contig_4180_pilon	+	1261	6	Intergenic	novelGene_8373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	546	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	149	685	875200	888134	FALSE	10	CCAGCTTTGGAGCCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874276	888710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
881331	contig_12786_pilon	+	5289	11	Intergenic	novelGene_103371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	838	1155	324337	324654	TRUE	60	AAAAATGAAGACAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPKYKAKNYKVHRRIGPMLQALIHGINRIETININTQTPEVKLDNWDLLKIKHQCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISLHHLQENPTPLQQKDK	214453	597365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_214519_231955_232112_268732_269257_324244_325126_344889_344911_357081_357360_387257_387451_427747_428617_472041_472231_565136_565836_595951
881332	SIRV6	+	1199	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	233	162	-98	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	50	AGTAAATTTAGAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881333	contig_4088_pilon	+	3266	4	Intergenic	novelGene_178060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCCAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72911	111834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_74283_109478_109836_110000_110323_110618
881334	contig_19816_pilon	-	3318	9	Intergenic	novelGene_156470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	323.405487546207	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	677	1018	124800	123459	TRUE	60	TTAGCAATTTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126543	116821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125702_125755_125854_126164
881335	contig_6599_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_175986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	481	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGGGGTGGGGCCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	262093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
881336	contig_3942_pilon	+	520	5	Intergenic	novelGene_128759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	40	426	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792275	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
881337	contig_7963_pilon	+	1044	5	Intergenic	novelGene_58358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	780.668463561837	141	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	236	709	56927	63007	FALSE	5	GCTGGGTGACTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51341	63342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56881_56964_57281_57564_57782_57934_63003
881338	contig_3270_pilon	+	543	6	Intergenic	novelGene_104434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1374	junction_1	4370.44833398131	60	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	39	509	44259	46726	FALSE	25	GTTGTTGAGTTTTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRSAICGGAATKMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK	44121	46760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_44143_44241_44307_44596_44652_45124_45211_45934_46067_46576
881339	contig_15105_pilon	-	1998	6	Intergenic	novelGene_151007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	916	junction_4	702.528746742793	8532	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	39	761	839916	829338	FALSE	50	GTATCTCAGATACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839954	828100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
881340	contig_4015_pilon	-	3417	2	Intergenic	novelGene_178256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2795	3352	218899	218342	FALSE	30	TTTGACATAGTCCAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIVTEYYEKLYSNKFENLEEMNKFLETHGLHKIQQSDVENLNRPITREDTEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHLIKKITHHDQLGFIRGMQGWFNIRKSSM	248999	218276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4015_pilon_-_219866_247171
881341	contig_3233_pilon	+	4209	10	Intergenic	novelGene_56539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	213.907445082513	4432	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	3190	4071	740857	747909	FALSE	10	TGGGATTGTGTTGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	735711	748047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
881342	contig_10404_pilon	+	1039	5	Intergenic	novelGene_138663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2112.4489786738	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	82	423	1098040	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085380	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085388_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
881343	contig_10404_pilon	+	1058	6	Intergenic	novelGene_138669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2915.08918559964	36	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAACTGTTGCTCGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085383	1100479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098081_1098235_1098305_1098722_1098859_1099839
881344	contig_21007_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_161538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	25	447	589	1011	NA	55	AAATTAATAAGCAGAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	564	1721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1700
881345	contig_15991_pilon	-	1032	7	Intergenic	novelGene_70894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	29558	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	595	963	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102268_103579_103703_104975_105142_106315
881346	contig_11338_pilon	+	2492	2	Intergenic	novelGene_6319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	976	1374	247359	247757	TRUE	45	CACCTCGAAAGAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKKGIRERRKQNKETNKQKPQNNNNNKKQTNKQKNKRKEMPSGMSLCICAEKGSSIKLRGTAQLEGAPKPRKETENKQIRANKKALGVPPAWRHGPGSSFKVEQCFAAFQEEAKMAHRARYLRERRGRW	246383	249967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_248482_249573
881347	contig_15165_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_145305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCCGGGGCGCGGCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643	2928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_1600_2900
881348	contig_14142_pilon	-	1351	6	Intergenic	novelGene_120631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_1	247.10758790454	3415	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	241	705	622927	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625257	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625038
881349	contig_8671_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_126296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	100	528	978712	979140	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSSHLRYSTGLTSLGARENEENRIQGKDQSKGLMDHSYQGLHQTESSTRWCLATTTDCSDRDHNRGFWTKLEKDVAQNSNTQKKTRFTSLTDWRNPESMAPGHPFSSVMKPLPRFTVHLGLGSPTKQNETNEAQQSRDKD	978612	980302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_978600_980300
881350	contig_16431_pilon	-	3289	1	Intergenic	novelGene_87614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1708	2151	223047	222604	NA	35	AGGGGGGGTTCACCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVIYRYNAISIQIPTAVFNETEKQISYFIWKGNRPPISKALFKKNNKVGGLILPDFRTYYTATVVQIAWYWYNNRCIDQWNRIENPIENPEVNASTYEQLIFDKGPKSVNWGNDSLFNKWCWHNGISSCKKLKQDPYLTHKK	224754	221465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_221500_224800
881351	contig_6102_pilon	-	1363	8	Intergenic	novelGene_32217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	1880.99340883524	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	615	1262	905250	895000	FALSE	20	TTGGATGAACCCAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSDESVPELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTVQEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM	906066	894898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_895015_895469_895593_895810_895940_896211_896359_896627_896706_896888_896975_905180_905253_905454
881352	contig_17976_pilon	+	2749	3	Intergenic	novelGene_32471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	4363	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	251	1267	41843	47385	FALSE	55	TTAAATAATAATTAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41592	48867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
881353	contig_15304_pilon	-	2597	7	Intergenic	novelGene_30653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4633.57006889216	125	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	407	1210	106308	103245	TRUE	25	AATTATGCGGTTTATCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	107224	101823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102938_102971_103329_103548_103680_105638_105960_106040_106371_106480_106532_106931
881354	contig_11171_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_48547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46643	44263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_-_44300_46600
881355	contig_12837_pilon	+	2724	8	Intergenic	novelGene_57295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	2218.19382307649	4023	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	561	1004	129778	166049	FALSE	35	AATATGTAGTTTGGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128450	167769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128880_129646_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
881356	contig_8820_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_79312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGGAGTAATGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256406	254184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_254200_256400
881357	contig_233_pilon	-	3037	16	Intergenic	novelGene_14498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_15	1311.84188410375	787	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	138	2507	126473	78579	FALSE	20	ACTGTGGATGTATACCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLQVQESQEAHGSTPRLVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126610	78048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126416
881358	contig_6163_pilon	+	4085	4	Intergenic	novelGene_103865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	285	junction_3	206.462802676145	3420	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	126	635	521249	522692	FALSE	55	ATTTGGGAAACAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTANPRRARNVSARPQPLPPQPSRAVRRATASSKSARRLAMARGGATGWLGPSETSASGAAAITLPGSAGPPGFTQAQTPAATISESLRLSPRCPPSALRRPSSQAVMLEALGSLPTQMDYKGQKLAEQMFQGIILFSAIVGFIYGYVAEQFGWTVYIVMAGFAFSCLLTLPPWPIYRRHPLKWLPVQDSGTEDKKPGDRKIKRHAKNN	521123	526142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521486_521834_521895_521976_522064_522566
881359	contig_4486_pilon	+	3131	13	Intergenic	novelGene_38558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1254.17054262967	148	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	293	1447	343083	412464	FALSE	20	TGTTTATACTCTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311615	414148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
881360	contig_6823_pilon	+	2935	1	Intergenic	novelGene_131208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1187	1660	151559	152032	NA	50	ACAACCATACAAATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKQLEIENQKGRTRSAFLMLEELTKKFKHRVAIVKDSMGKVLNNAGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQLFQEEAYDQEPMVLKEEVQAALKALAKNKAPGTDRISIEIFQQTDAALEVLPHLCQEIWKTATCPTNWKRSIFMPIPKKGEPNEYGNY	150372	153307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_150400_153300
881361	contig_12938_pilon	-	1259	6	Intergenic	novelGene_99746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGCACATTGCCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86321	79147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_79228_80719_80795_81369_81459_83391_83468_84548_84632_85465
881362	contig_1150_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_61411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36526	13	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_310060_311002
881363	contig_3095_pilon	+	5384	4	Intergenic	novelGene_75194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_3	926.096107323641	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	81	632	225596	226800	TRUE	25	GATACATTCATTGTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	225515	231730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_225711_226126_226409_226645_226824_227001
881365	contig_3155_pilon	+	3691	7	Intergenic	novelGene_26415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	969.670562613922	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	249	575	259780	261211	TRUE	10	GCTGCCCGGAGTTTCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEVLEGYLFTFRSHLRALRWFGRQPSRQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258541	288938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258623_259209_259329_259731_259978_261082_264064_264773_264867_288432_288507_288841
881366	contig_12938_pilon	+	1447	7	Intergenic	novelGene_99742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_1	601.714494867236	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	19	666	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	78098	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
881367	scaffold_17542_pilon	-	4196	1	Intergenic	novelGene_139237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	395	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGACTTTGCCATCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436574	432378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_432400_436600
881368	contig_4797_pilon	-	2982	5	Intergenic	novelGene_6940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	383	junction_4	602.8749352063	5725	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	123	668	671697	658501	FALSE	25	ACCTGGTTGACTTCAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	671819	656186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_658729_659533_659644_661289_661351_665223_665308_671634
881369	contig_11338_pilon	-	4596	1	Intergenic	novelGene_6316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	614	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	71	382	249898	249587	NA	40	TTACAAAATGCAATCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERDSPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAATSCHLISRSWDLSCQLICQTWDSSICTACEREPCSPTCRSWACQLLQLCDLGEAFTLIHRLAMF	249968	245372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_245400_250000
881370	contig_7465_pilon	+	6666	8	Intergenic	novelGene_178257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1197	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	6043	6573	68927	69548	FALSE	15	GCCTGCCCGGCTGCGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKKSNTSSQRMALIELPVRARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKQHLQPTNKRTKAPNSRPRGSPDLEGAAHPNIAPQPHRKGQRRLSEPGT	6211	69641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7465_pilon_+_6789_22629_24060_32911_32923_33512_33823_53748_54985_65053_67182_68576_69331_69421
881371	contig_11422_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_99014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56218	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_2400
881373	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
881374	contig_19459_pilon	-	1230	8	Intergenic	novelGene_59835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	109	894	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	17782	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17698
881375	contig_19032_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_172513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATTTACGAAAACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	1934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_1900_3600
881376	contig_14577_pilon	-	1369	13	Intergenic	novelGene_164641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_8	281.208540154021	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1260	110	1369	127106	67037	FALSE	30	AGGTAAATTTTCTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSC	127215	67036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
881377	SIRV6	+	949	4	NNC	SIRV6A	novel	1163	5	NA	NA	4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTAAAATGGGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	11689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2794_10840_11109_11205
881378	contig_2438_pilon	+	1318	5	Intergenic	novelGene_112042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	62	661	310588	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305104	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
881379	contig_9538_pilon	-	3766	2	Intergenic	novelGene_176441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81811	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCCGGGGCGCGGCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30586	26097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_27362_28084
881380	contig_20199_pilon	-	1039	3	Intergenic	novelGene_82560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	440	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44188	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42122_43939
881381	contig_4797_pilon	-	2779	6	Intergenic	novelGene_6936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	664.37049904402	110	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	110	655	671697	658501	TRUE	20	CCTGGTTGACTTCAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	671806	656185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_657679_657869_658729_659533_659644_661289_661351_665223_665308_671634
881382	contig_1331_pilon	-	1788	2	Intergenic	novelGene_37790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8404	junction_1	0	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGATATGTCTCCCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160909	158467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867
881383	contig_14704_pilon	-	2247	9	Intergenic	novelGene_82698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_8	332.884904095995	3129	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	105	845	111918	77600	FALSE	25	TAAACTAGTTTTTGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHKLLRPQTRLTKGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGIQAGL	116435	76197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_111873_111947_116359
881384	contig_21007_pilon	+	833	2	Intergenic	novelGene_161516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	8370	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	45	CATTACAATTTTAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
881385	contig_6233_pilon	+	2606	17	Intergenic	novelGene_74756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	365.808388837312	4628	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	111	1112	113021	131406	TRUE	20	AGCCGCGCGGCGCGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	112910	250154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119756_123348_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230_131948_143461_143512_144361_144544_144765_144880_145615_145785_148117_148191_149522_149789_200465_200545_250134
881386	contig_15039_pilon	+	2624	2	Intergenic	novelGene_110199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGTAAAAACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401698	538188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_403542_537407
881387	contig_7230_pilon	+	566	5	Intergenic	novelGene_52515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	19.600701518058	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	10	468	2651	8648	FALSE	30	TACCTAAACCTCCTGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLSKEYGFVLLTGAASFIMVTHLAINVSKARKKYKVEYPTMYSTDPENGHLFNCIQRAHQNTLEVYPSFLFFLAVGGVYHPRIVSGLGLAWIVGRVLYAYGYYTGEPRKRNRGGVSFIALIALMGTTVCSAFQHLGWVKTGLGSGSQHCH	2641	8746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_2768_4000_4075_5588_5647_7543_7617_8511
881388	scaffold_9100_pilon	+	1853	8	Intergenic	novelGene_83244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	349.780105850775	4314	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	309	1307	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644646	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
881389	SIRV7	-	925	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	466	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56068_70837_70988_78841_78964_114686_114961_147608
881390	contig_8377_pilon	-	5760	2	Intergenic	novelGene_34892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGACCAAAATGAGTGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73876	67681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_67783_68217
881391	contig_17440_pilon	+	1624	1	Intergenic	novelGene_7554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_3000
881392	contig_20951_pilon	-	699	2	Intergenic	novelGene_43052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28928	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27196_28870
881393	contig_9484_pilon	+	1620	10	Intergenic	novelGene_105641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_8	460.063280671499	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	145	1524	98584	104965	FALSE	55	TACAGAAATCACGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	98439	105061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
881394	contig_7057_pilon	+	2446	4	Intergenic	novelGene_123268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_1	41.2983723112129	6214	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	84	320	703803	705218	FALSE	20	AACACCCTTGGATGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSLPPWLLRTSLDHSPLSDLSSPPLAMPPPGLILLLLLLPVAAAQTTPGPCSGCGPLSLPLLVGLVAADAVLSLLTVGVVFMCARPRHQPMPDDKIYINMPVRG	703719	707344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_703846_704345_704370_704826_704959_705180
881395	contig_6958_pilon	+	1598	3	Intergenic	novelGene_69982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	47	8497	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGAAGTGTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717212	724733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_718556_723190_723336_724623
881396	contig_1150_pilon	-	915	4	Intergenic	novelGene_61424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30584.16143838	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325910	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002_311092_325654
881398	SIRV7	-	1682	2	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	111908	8	111730	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3008	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993
881400	contig_1150_pilon	-	558	4	Intergenic	novelGene_61402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30584.16143838	410	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311048	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309102_309159_309385_309812_309927_311002
881401	contig_11413_pilon	+	4462	2	Intergenic	novelGene_103210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	0	825	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTTCTAAAATCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739198	744808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_740709_741856
881402	contig_20951_pilon	+	1754	6	Intergenic	novelGene_43075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGATTGCGCGCCGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26563	30023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_27233_27492_27686_27783_28226_28687_28925_29047_29178_29940
881403	contig_7151_pilon	-	4261	7	Intergenic	novelGene_40765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	842.94701296503	6428	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	336	1013	551063	529189	TRUE	25	AAATCATTCTTTGGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551398	523696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526661_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996
881404	contig_3747_pilon	+	2046	5	Intergenic	novelGene_24950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_4	1878.15727509706	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	393	644	203322	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202697	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881405	contig_10867_pilon	-	886	5	Intergenic	novelGene_159459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2670	junction_1	1689.79059353519	226	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	547	876	87815	86811	FALSE	35	ATAAAGACATCTGCTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	91456	86800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_88256_88603_88683_91429
881407	contig_6191_pilon	+	904	1	Intergenic	novelGene_107853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCACTTGCATTCCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182061	182965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_182100_183000
881408	contig_4812_pilon	-	1035	6	Intergenic	novelGene_103670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7231.84172946283	90	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCATTTAAACTCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82739	79026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81397_81463_81739_82268_82343_82598
881409	contig_835_pilon	+	4601	2	Intergenic	novelGene_152167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3655	4176	347116	347637	FALSE	15	GTATTGTTGTACATGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYTDQEAVVRTEQGDTAWFKVRKGVCQGSILSPYLFNLYTEQIIQEAGLYEEECGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESQEDLKDLLMKTKNYTLQYGLHLNIKKTKILTSGPISNIMINGEDLSCQGFHFTCIHSQCPWKQQLRNQTTYCTGQICCKRPL	335573	348062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_338101_345988
881410	contig_14970_pilon	+	4545	9	Intergenic	novelGene_44926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	143	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	388	1281	177395	231550	FALSE	35	GGCTAATGGAAATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135952	234814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
881411	contig_1150_pilon	-	611	3	Intergenic	novelGene_61401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	981	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311043	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
881413	contig_13481_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_119495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1381753	1378966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1379000_1381800
881414	contig_10197_pilon	+	7541	6	Intergenic	novelGene_115203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.8	294	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTACACCAGATCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903731	952300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_910582_915128_915274_918066_918267_920433_920540_923906_924117_952270
881415	SIRV5	-	1050	6	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTACGACCGTTGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10984	6918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_6957_7143_7305_7678_7762_7869_8381_8453_8590_10863
881416	contig_13760_pilon	-	1086	4	Intergenic	novelGene_61345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	161.247222198296	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	355698	353496	FALSE	5	TGGCCCTTGTGTTGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLGPGAGCLGNLGAEAASAQELGLRHSEPGLPSRRPIATGTDQVVGLGLVAVSLLIFTYYTVWVILLPFIDSQHVIHKYFLPRAYAVAIPLAVGLLLLLFVGVFITCVMLKNQKVAKKAQ	355700	352780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354491_355293_355384_355581
881417	contig_2227_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_142336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACCAAAAAAGATACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230913	233029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230900_233000
881418	contig_2703_pilon	-	1012	2	Intergenic	novelGene_101624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGAGGGGAGAGTCGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3282	1342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1566_2493
881419	contig_10973_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_150344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	693	1205	2730	2218	NA	45	CCAAATCCAGACCAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3422	1460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3400
881420	contig_10500_pilon	+	2120	2	Intergenic	novelGene_41202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	394	junction_1	0	2142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCATTTATCAGGACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1406357	1409611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1406636_1407769
881421	contig_11104_pilon	-	1905	12	Intergenic	novelGene_112452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	148.033389130698	2238	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1271	1840	309844	295435	FALSE	10	TATTTTTGCTCTCTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMSLLQRASITALAALSGRRLATRLGFGGFLTRGFPKTAAPVRHSGDHGKRLFIIKPSGFYDKRFLTLLKFYIFLTGVPVAIGITLINVFIGEAELAEIPEGYIPEHWEYFKHPISRWIARTFFDCPEKNYERTMSVLQIEAEKADLRLKELEVRRLMRMRGDGPWYQYPTIDKALVDSSPKASPDN	327226	295369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_295556_299530_299638_300685_300748_301631_301699_304444_304534_309720_309918_312711_312865_313390_313451_315984_316082_319860_319991_321558_321656_326566
881422	contig_6270_pilon	-	4471	2	Intergenic	novelGene_99843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2060	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1560	1898	447330	267032	FALSE	60	AGGAGAGTAAAAGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLPVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQGTPYRIDPKRISPRHIIITLTKTKRSKKLNKNREGREIHAEVPFSYHSMDPPSQTPIGDQ	448889	264458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_267147_447106
881423	contig_9839_pilon	+	883	6	Intergenic	novelGene_88525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_3	788.602155716049	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	14	748	49467	61360	FALSE	15	CTTGTTTTCTTGTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSNVMISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	49453	61495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
881424	contig_8317_pilon	-	821	2	Intergenic	novelGene_19318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1599	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTTTGAGCTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17072	16152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
881425	contig_16204_pilon	-	2340	6	Intergenic	novelGene_154532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	1565	2338	459850	454771	FALSE	20	GTGTAAAGCCTTGGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPDCPLLSGYLFCGRSQPSQVGPAMPAMAWLGLQGASSSQPSSNNSGKFQDLRISPQGPAPHLPNVGTGWQWVVDAIDGDDDVRERVNGFTVHDVLATIGLPGIDNPLDVEDRFRWSSHQRGSSIQNGMAATVTANNRSVHGDAAYGKLPEEGSGHRHPVKFSLVVGWVYPTEHHHTAVLFLVGQVEGKETLRNEALSPQVVKEGGCPSDAESGVGQSQNAIEGHGVHELARLLDAQAKLLDHFGKPRDLWKRTVF	465772	454768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_454992_457373_457488_459320_459467_459557_460368_464679_465569_465614
881426	contig_4654_pilon	-	2668	6	Intergenic	novelGene_103091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_5	611.654608418836	3658	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	194	934	500418	494476	FALSE	25	GATGGTTATATTGCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515983	492741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_515793
881427	contig_19816_pilon	-	1616	8	Intergenic	novelGene_156490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	251.437256343508	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	950	1297	124800	123351	FALSE	15	AGAATCCTGTGTTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKAGV	126820	123031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125857_125928_126435_126731
881428	contig_3747_pilon	+	2251	6	Intergenic	novelGene_24922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	114	854	202422	203804	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202308	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881429	SIRV6	+	1444	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	-12	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1258	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881430	contig_12250_pilon	+	2347	10	Intergenic	novelGene_80583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	657.184191630014	1912	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTGGCCTCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314812	332447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_315396_315596_315757_316413_316457_316647_316755_316838_316921_321445_321564_321701_321829_322337_322828_328400_328687_332096
881431	contig_16525_pilon	-	536	7	Intergenic	novelGene_133812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	32	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	39	467	97608	91591	FALSE	35	CGTGTGAGATCCTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97646	91521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
881432	contig_20641_pilon	+	1991	9	Intergenic	novelGene_52780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1435.27862604269	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	799	1707	38688	56882	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	4958	57166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_5228_11751_11876_12293_12417_14233_14424_38595_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
881433	contig_5179_pilon	+	8105	5	Intergenic	novelGene_178259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	675	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	5550	6338	401493	422139	FALSE	45	TAATAATAACTTATTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKVICKYNAIPIQIPTTIFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALMKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNGIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNRWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTMKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQIPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHSTTKRQIILLKNGQRK	222647	423906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5179_pilon_+_224496_272588_274177_274225_274515_399668_401518_421375
881434	contig_20527_pilon	+	9453	7	Intergenic	novelGene_138548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1257.2416125082	12038	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	964	1590	13527	27453	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12563	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_29978_30943_31742_32802
881435	contig_6233_pilon	+	3145	9	Intergenic	novelGene_74755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	321.13704239779	1769	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	111	656	113021	125895	TRUE	20	TGCCTAAGTCCTTAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEGNFGKMKTAKKMMVSHSVTRWGLLGQAQKETTRMRSY	112910	133441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119756_123348_123496_125135_125231_125888_126031_127998_128056_130494_130581_131230
881436	contig_1719_pilon	-	3399	5	Intergenic	novelGene_87354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_3	399.987812314325	2492	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	151	696	803613	754873	FALSE	5	CTCCTGAGTTTGTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803763	752169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
881437	contig_2689_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_100811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACCACAAACAATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_1800_2600
881438	contig_2867_pilon	-	2038	3	Intergenic	novelGene_135243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	371.5	36	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	22	402	1289430	1286649	FALSE	0	TGTGTGTGTGTTTCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQRKAAFKELQSTFK	1289451	1285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286781_1288013_1288149_1289316
881439	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
881440	contig_10793_pilon	+	1584	15	Intergenic	novelGene_83377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3119.00345479456	5862	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	132	743	146975	161336	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQVIISHYLESKLGFIIVI	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160562_161287_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
881441	contig_2867_pilon	-	2063	5	Intergenic	novelGene_135248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.747234239876	33	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	81	515	1305476	1286649	TRUE	5	CTATGTGTGTGTGTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPQSPSRRVFNPYTEFKEFSRKQIKDMEKMFKQYDAGRDGFIDLMELKLMMEKLEAPQTHLGLKNMIKEVDEDFDGKLSFREFLLIFRKAAAGELQEDSGLHVLARLSEIDVSTEGVKGAKSFFEAKVQAINVSSRFEEEIKAEQEERKKQAEEMKQRKAAFKELQSTFK	1305556	1285015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286324_1286408_1286781_1288013_1288149_1289316_1289465_1305456
881442	contig_14467_pilon	+	3127	5	Intergenic	novelGene_138247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.4448637286709	2798	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	140	715	318578	319153	TRUE	15	TGGGGAAGAGGGGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFLLEPGDAAAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306488	347889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_321274_321480_321587_322015_322125_347812
881443	contig_11850_pilon	-	5777	7	Intergenic	novelGene_125205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	824.577198057014	29	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	261	728	284313	282879	TRUE	30	GTATGCCCTCACATTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	285438	276664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361
881444	contig_21025_pilon	-	3745	2	Intergenic	novelGene_76487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1563	1937	21680	21306	FALSE	70	AAAAAAGAAATCTAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIIAVAKSKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDKQKLRDYVKTKPNL	23895	19497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_21928_22580
881446	contig_10500_pilon	-	6530	8	Intergenic	novelGene_41222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	948.285133215507	9062	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	3307	3900	1635596	1629460	TRUE	55	TAGAGAGAAGGAAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640226	1625469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627682_1628265_1628615_1629390_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940
881447	contig_10855_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_124372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCCTCCAGGCCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698923	697642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_697600_698900
881448	contig_3747_pilon	+	2607	9	Intergenic	novelGene_24759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3826.39692628718	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	198	1205	201481	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200979	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201130_201433_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881449	contig_7356_pilon	-	2789	5	Intergenic	novelGene_60380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	645.747773902473	11199	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	682	1098	430684	430268	FALSE	40	CTGATGGCACTTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVTCLWKEPPGEADLLVHTICLEDQHAKLNGFSHWMVTSTPWRISVDGPAVLQVTAPPSPSAITSENEIVLKEEVGAGVGKWLTRSNVTSRSPVLPRFHSAEILQKIALLVMFSYLRDQEITKPCDVELPSNSYTM	457913	428576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_430730_433742_434073_435516_435623_437474_437529_457767
881450	contig_8377_pilon	+	3309	2	Intergenic	novelGene_34919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCCCAAATCCACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68073	71521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68081_68219
881451	contig_7151_pilon	-	2484	7	Intergenic	novelGene_40778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_6	803.583570984098	48	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	150	788	551180	529189	FALSE	40	AAAATACTAAGTGTTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	579266	527492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152_551263_579199
881452	contig_9815_pilon	-	4708	5	Intergenic	novelGene_164229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	3726	4577	983	132	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGGGERQVRSQKKQKKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKGGGGGERQGRNKKKRKKSNTSSQQMALREPPVRVCGIQAAAVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGWESVYHQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSVLR	86850	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_1249_21039_21192_38646_39126_82801_83865_85084
881453	contig_15407_pilon	+	4898	3	Intergenic	novelGene_123046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	4048	4398	335829	336179	TRUE	50	GTACTACAAAATGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDDIYKTLKEKKCQPRKIYPAKLSFKYDGEIRSLPDKQKLRD	331720	375243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_332981_333041_336359_374922
881454	contig_16870_pilon	+	1565	2	Intergenic	novelGene_155495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	41	junction_1	0	4015	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	83	457	104553	107688	FALSE	25	GAAAGCACTTTCTTAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPNGDLGMPVEAGAEGEDDGFGEAGDREGQLKLPLPLQGCPPGDGNWGQVWSLEGTEEPSSLPSLEYAAINSMLDQINSCLDHLEEKNDHLHARLQELLESNRQTRLEFQQQLGEASSDATH	104470	108796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_104755_107515
881455	contig_1723_pilon	+	2677	1	Intergenic	novelGene_165530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	393	1182	575	1756	46038	47219	NA	20	TCCTGTAAGCCTTCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKKQKKQYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQCRSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEFYATRKNNNESVNHCITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	45463	48140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_45500_48100
881456	contig_5023_pilon	+	5602	19	Intergenic	novelGene_7177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2138.43785720694	3448	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	249	2132	607279	646990	TRUE	75	AAAATTAAAAAATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	540483	652079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_540573_580769_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_648261_648426_650194_651646
881457	contig_12081_pilon	+	1085	6	Intergenic	novelGene_166972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	973.536234559351	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	148	708	16400	18277	FALSE	10	ATTTTTATTGTCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKQEAEDCVSDKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15735	18654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16444_16518_16550_16845_16992_17069_17245_18112
881458	contig_9468_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_59526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACAATAGCTGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517127	515426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_515400_517100
881459	contig_2770_pilon	-	1562	6	Intergenic	novelGene_107456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	43	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	216	665	750561	743833	FALSE	20	AGTCGTGTTAAATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750776	742935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
881460	contig_1339_pilon	+	288	3	Intergenic	novelGene_163145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9682	junction_2	756.5	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGGCCTCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431695	434175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431736_433677_433797_434046
881461	SIRV6	+	780	2	ISM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	8341	0	576	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10813	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
881462	contig_5033_pilon	+	4155	1	Intergenic	novelGene_28895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4990	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2325	2636	443271	443582	NA	10	CTCCGTTTCCCTGAGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCARLCPKDLKFRMTTFLFSSQNVGGGTTVVQVRATDHDIGLNSILSYYITEGNEDMTFRMDRISGEITTRPAPPDREHQSFYHLVVTVEDEGTPTLSVSHGG	440946	445101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_440900_445100
881463	contig_3155_pilon	+	3741	7	Intergenic	novelGene_26375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	947.901835048803	5668	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	71	577	258156	261211	TRUE	40	AGACGCTCAGAGTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258085	289734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_264064_264773_264867_288432_288507_289589
881464	contig_2227_pilon	+	1287	3	Intergenic	novelGene_142332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	150	344	230369	231819	FALSE	30	TAACCAATCTCTTGTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQAAVARLFLSPAAACLDNNFFTKKKGEKCRLPLTPSFPLSSPSSTAAPMHPFYTRAATMIGEIAAAVSSPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230144	232762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230271_230345_230427_231682
881465	contig_15666_pilon	-	6752	6	Intergenic	novelGene_70117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	5681	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	191	1360	110619	107816	FALSE	40	GATGTGTGAATTGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110809	102423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
881466	scaffold_13505_pilon	-	304	5	Intergenic	novelGene_111476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6014.89908477274	2806	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	29	304	547805	540192	FALSE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSS	548323	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540199_541935_542033_547363_547465_547734_547806_548295
881467	SIRV6	+	1240	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3998	13	-1896	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATAGTTACGCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
881468	contig_5018_pilon	-	2394	9	Intergenic	novelGene_47019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	201	junction_6	137.452207603225	2802	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	216	1304	1397263	1392342	FALSE	30	AAGGGGCACCTTGAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTITLKTLQQQTFKIRMEPDETVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397478	1391251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
881469	contig_5988_pilon	+	1228	10	Intergenic	novelGene_16068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2016.33049539669	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	132	734	1218923	1224777	TRUE	25	GCCGGGCAAATACCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKRTLGELEAHPVWKEPCWLVRDGTPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209835	1225320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225153_1225201
881470	contig_10196_pilon	+	820	7	Intergenic	novelGene_132091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1634	junction_1	5251.51343265285	184	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	113	778	906823	908556	FALSE	5	CTTTTTGTGTTTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRGRGRGRGRGRGARGGKAEDKEWLPVTKLGRLVKDMKIKSLEEIYLFSLPIKESEIIDFFLGMALKDEVLKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVAIGDYNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSIVPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGRCGSVLVRLIPAPRGTGIVSAPVPKKLLMMAGIDDCYTSARGCTATLGNFAKATFDAISKTYSYLTPDLWKETVFTKSPYQEFTDHLVKTHTRVSVQRTQAPAVATT	906623	908598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_906697_906783_906874_907382_907491_907737_907912_907991_908152_908260_908353_908475
881471	contig_3817_pilon	+	1693	6	Intergenic	novelGene_78313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	571.358171377639	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	282	674	199102	204532	FALSE	10	CATCTGTGTGCTGTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRCAGGSGDAGVPGACGGRRRRPRPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178561	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178639_178749_178820_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
881472	contig_16103_pilon	-	3396	7	Intergenic	novelGene_118816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3250.04225613555	2030	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	65	352	743628	734995	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAACTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAARSGGGENRSVSKSWVGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERWMSRSD	743692	720890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_732167_732247_733297_733370_733542_733606_734953_735017_737495_737630_743496
881473	contig_8726_pilon	+	5215	4	Intergenic	novelGene_178260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	978	4237	5214	185619	202587	FALSE	65	GCAAAGACATCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPKPGKNVTKKENYRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKP	18400	202588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8726_pilon_+_20813_183745_185344_185392_185669_201659
881474	contig_5018_pilon	+	2532	8	Intergenic	novelGene_47187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	305.577873437678	54	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCTGTGTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586792	1593202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1587091_1588171_1588635_1590292_1590424_1590509_1590592_1590906_1591013_1591093_1592050_1592607_1592706_1592804
881475	contig_12081_pilon	+	1185	5	Intergenic	novelGene_166976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886.388599881564	8816	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	356	805	16882	18277	FALSE	15	TTTATTGTCTTTGTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15769	18657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16789_16992_17069_17245_18112
881476	contig_13021_pilon	-	1761	10	Intergenic	novelGene_8205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5590	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCACTTAAAGCAACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181151	176675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
881477	contig_11720_pilon	+	1273	9	Intergenic	novelGene_43852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_1	1819.02050823376	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	93	989	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	76924	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
881478	contig_7358_pilon	+	1981	2	Intergenic	novelGene_178264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGATAACCCCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92585	152592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7358_pilon_+_93617_151642
881479	contig_1668_pilon	+	7893	6	Intergenic	novelGene_178266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1118	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1290	6603	7892	183104	184393	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPKANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARALRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYN	50769	184394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1668_pilon_+_54550_54599_55625_122585_122895_130725_131648_139221_139584_182899
881480	contig_6870_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_103966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	168	569	1415750	1416151	NA	35	CTCTTGCAAAAGCCACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWESIMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRAVTRIDICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMIKNSDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRHLL	1415582	1417682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1415600_1417700
881481	contig_5439_pilon	-	4126	3	Intergenic	novelGene_178267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2063	2428	2065	1700	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLWGIQ	21983	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5439_pilon_-_2686_2818_3908_21630
881482	contig_19352_pilon	-	2181	6	Intergenic	novelGene_122352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	903	junction_5	296.528986778696	3032	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	354	896	122805	104000	FALSE	35	TTCAACAGAAAGGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123158	102714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
881483	contig_14577_pilon	-	3851	20	Intergenic	novelGene_164635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_15	275.164116226527	624	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	146	2266	127106	50623	FALSE	50	ACAATATGCTTATTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPVMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL	127251	49037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66718_67034_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
881484	contig_9389_pilon	+	2763	8	Intergenic	novelGene_83978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	1093.11421812981	2107	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	122	643	383398	384766	TRUE	5	GCACCGGCTTCTTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	379466	386998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_379582_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749_386771_386882
881485	contig_9112_pilon	+	2476	5	Intergenic	novelGene_60196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	467.214618778137	549	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	309	1160	108641	114303	TRUE	10	CTTTTCTTCAGCCACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108332	117724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251_114806_116910
881486	SIRV6	+	1050	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	813	163	-385	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	102	434	2002	10736	TRUE	35	GTCGTAGATTAACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1900	11662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881487	contig_4364_pilon	+	510	1	Intergenic	novelGene_793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532792	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
881488	contig_4891_pilon	+	2854	9	Intergenic	novelGene_124565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	546.036628807995	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	51	866	701017	756631	TRUE	25	CTTAATAACCTGCTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLEVLFASAAPAITCAQDALICFLHWEVVTHDYYGLGAGDQPGPDDKKSELLPAGWNNNKDLYVLRYESKDKSRKLLVKAVTVENSMIINVLECGSQQVADLTLNLEDYIDGEHLGDFHRTYKNSEELRSRIVSGIITPIHDLWDKANVSSPHREFPPATAREVDPLRIPPHHPHTSRQPPWRDPLGPFSVGGEDLDPFGCRRGGMIVDPLRSGFPRALIDPSSGLPNRLPPGAVPPGARFDPFGPIGTSPSGPNPDHLPPPGYDDMYL	700966	758828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_701146_707771_707925_708893_708977_733743_733930_754711_754766_755867_756027_756579_757539_757663_757786_757869
881489	contig_11548_pilon	+	2284	10	Intergenic	novelGene_66726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1067.78289974491	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	497	1441	101984	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63623	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84826_96111_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
881490	contig_8576_pilon	-	1712	4	Intergenic	novelGene_88767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.9337084664613	136	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	51	368	763004	761002	TRUE	5	TTTGTTGCTTCTGCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVRLARPGSGVRTRAVMSALTRLAPFVRGGGRLFRSCRKRTAGSGGVRHAGGGVHIEPTYRQFPQLTRSQVLQAEFFSATMWFWILWRFWHDSDAVLGHFPYPDPSQWTDEELGIPPDDED	763054	753662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_754984_760978_761077_762178_762324_762906
881491	contig_12079_pilon	-	1281	10	Intergenic	novelGene_67427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	448	1260	600738	579745	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKALSFSVTISRAAAFHATAT	638816	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_579804_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
881492	contig_3942_pilon	-	822	7	Intergenic	novelGene_128703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1969	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	104	433	430070	429465	TRUE	10	GAGCGCCCTCGGCGGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIQKSLFKEFPFSTILRGARFLILGWDSESGLHGMCRSYPGAKSWQSKKWRQLGFYGRHWKQTSLWDLVPIWQTSGFSPWYKWQTRLRSSSCSLMGFPLTTTQGTYLWGGCRASVSWALTCMSCVPRSPIAHSVMVSEDTSGA	430173	426680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426703_427974_428157_428244_428321_428491_428584_429447_429606_429797_429849_429932
881493	contig_15062_pilon	+	2083	3	Intergenic	novelGene_162284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2041	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGAACGTCGTGGCGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12891	43692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_14652_42551_42624_43441
881494	contig_9955_pilon	-	1399	4	Intergenic	novelGene_21253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	7	1033	junction_1	642.470751604045	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	86	382	23469	13719	FALSE	40	ACAGCAATAGTTTTAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNPDLGFSDYAAAQLRQYHRLTKQIKPDMETYERMRDKHGEEFFPTSNSLIHGTHVPSTEEIDRMVVDLEKQIEKRDKYSRRRPYNDDADIDYINERNAKFNKKAERFYGKYTAEIKQNLERGTAV	23886	12701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_13885_22538_22638_23437_23529_23860
881495	contig_4364_pilon	+	1933	6	Intergenic	novelGene_546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	66	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
881496	SIRV6	+	1447	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	80	1	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881497	contig_10793_pilon	+	5277	14	Intergenic	novelGene_83401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2711.73180980052	443	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	127	1053	146975	163940	TRUE	15	GCATACTTTGTATCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130875	170417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
881498	contig_14970_pilon	+	4685	11	Intergenic	novelGene_44929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	5927.70458525052	7264	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	375	1475	177395	231550	TRUE	30	TTGAGGAGTCTCTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135965	234830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_233166_233235
881499	contig_2227_pilon	-	8797	5	Intergenic	novelGene_142352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	5225	5536	441648	441337	TRUE	70	CTATCAACAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKFMEGFRKIMQEQKVKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRRRLEMVEHRISGIEDKHLDTTLFDVKSEKRTKKNEETLIVVWDTIKSKN	471060	411921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_411941_424654_426658_440097_442628_462349_462420_466885
881500	contig_2100_pilon	+	4211	11	Intergenic	novelGene_50696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	476	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAGCCACCTCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1185526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175784_1176281_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1182824_1185422
881501	contig_14173_pilon	+	8091	5	Intergenic	novelGene_144576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	6525	6872	137486	137833	FALSE	55	TCAAACAAACAATTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFTSFMILRKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITGKFLLLSVSLITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTISNLLLSPSMTPSISEMLLFIFWISYCCLYNF	61827	139052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14173_pilon_+_64048_78317_80426_80669_81152_113322_113659_136107
881502	contig_2227_pilon	+	1672	3	Intergenic	novelGene_142325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3432.5	7531	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	211	726	230369	231819	FALSE	25	CCAATCTCTTGTCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFYTRAATMIGEIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230056	232765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230264_230365_230517_231451
881503	contig_14142_pilon	+	491	3	Intergenic	novelGene_120448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	217.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	71	448	94812	95549	FALSE	10	CTAAGTCGCCTGTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPTMLLREENGCCSRRQSSSSAGDSDGEREDSPAARARQQLEALLNKTMRIRMTDGRTLVGCFLCTDRDCNVILGSAQEFLKPSDSFSAGEPRVLGLAMVPGHHIVSIEVQRESLAGPPYL	94741	95592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_94893_95079_95264_95436
881504	contig_3584_pilon	-	2242	4	Intergenic	novelGene_108181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTGCTATGAGGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531635	527071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_527099_528391_528475_528772_528876_529606
881505	contig_4065_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_133411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852373	850156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_850200_852400
881506	contig_12427_pilon	-	3769	6	Intergenic	novelGene_40448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2515.03148290434	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	234	746	316061	314393	FALSE	40	TAACCAGTATATTGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325928	311369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_325492_325637_325856
881507	contig_3281_pilon	+	2729	3	Intergenic	novelGene_128526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	11594	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1147	1527	163628	164008	TRUE	90	AAAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	139070	167886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_140204_163614_164116_166791
881508	contig_8661_pilon	-	2354	10	Intergenic	novelGene_137938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	678.193642910305	7	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	158	745	315977	308838	TRUE	15	ATTTTTTAGTACGTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDNTDFISFVVMMMMILMMKKLKKKLQ	316134	305149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_306568_307639_307742_308421_308506_308832_308917_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
881509	scaffold_13505_pilon	-	667	6	Intergenic	novelGene_111480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5932.72361061932	3069	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	34	393	547805	541845	TRUE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	548328	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541506_541844_542033_547363_547465_547734_547806_548295
881510	contig_11316_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_122661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138261	139376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138300_139400
881511	contig_21007_pilon	+	760	2	Intergenic	novelGene_161515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	59	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	25	AATTCATGTTTTGAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
881512	contig_13004_pilon	+	5226	1	Intergenic	novelGene_112715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	3899	4492	866355	866948	NA	55	TACTATGAAGATGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVLAAVGACGSGRKESSVVREGFVQETFALGLKGQDSRGWRTEWRGRQQLCDSYQPPPLAVVVCFCFSFGDDRFCEQGLQLFIRGPPRPRVPGAPTPCWRGCEALIMETAEAGDPGQKGQENWKAAVRSRGAVWGESQGEGRALALLCLLKCCSVEAPFRWHLFCDSTHSLDIARWHQSELTPLLCSLNTSTCCS	862456	867682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_862500_867700
881513	contig_3942_pilon	+	569	5	Intergenic	novelGene_128744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	3180	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	84	470	793521	795407	FALSE	15	GCAGTAACTGGTGTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792231	795506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
881514	contig_12081_pilon	+	1156	5	Intergenic	novelGene_166971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	626.654609813093	1886	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	148	783	16400	18277	FALSE	15	TATTATTTTTATTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKQEAEDCVSDKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15735	18650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16845_16992_17069_17245_18112
881515	contig_610_pilon	-	7661	3	Intergenic	novelGene_76761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	5457	5948	232794	232303	TRUE	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSTRKLLELMGEFSTVAGYKVNKQKSTGFLYTSNEESEREIREITPFTIASKRIKYLGTNLTRDVKDLYNENYKTLLKENKENLKKWKDVSCSRTGRLNIVKMSMQPKPIYRDNTITIKILTDFLTEMEKQIINFIWNGKRPQIAKAMLKEKERSRRTCIS	238250	222835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_223813_224213_224280_231632
881516	contig_12125_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_76249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCCCACCTGTCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634963	632088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_632100_635000
881517	contig_4769_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_117975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	485	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	475	822	427393	427046	NA	70	ACACAGAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKDLYKESYKMLLQETKKDLYKWKNIPSSWIGRLNIVKMSVLPKAICRYNAVPIQIQTTFFNEMEKLIPNFIQKGKRQQISKPLLKNKNRVEGLTVPDLTICYTATVVKTAWY	427867	425320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_425300_427900
881518	contig_3095_pilon	+	1427	4	Intergenic	novelGene_75193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_3	926.096107323641	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	100	651	225596	226800	TRUE	45	AGAGCTGACAGAGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	225496	227754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_225711_226126_226409_226645_226824_227001
881519	contig_5399_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_176847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279844	281420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5399_pilon_+_279800_281400
881520	contig_4364_pilon	+	1945	6	Intergenic	novelGene_645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
881521	contig_9406_pilon	+	2709	8	Intergenic	novelGene_136137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4185	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1673	2269	34731	46011	TRUE	15	CTGTGTCGACCAGCCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFHGTGRRAGGGRKGVHFFLPKRLNRFSLSFSLSFSRLPGLDSLVMVTTLAGKVWARLDAGVLWVLADTSCLSEEMALRLEVGEGMGLDSFELVLCSAAPLTISPVSAVSAIPVEIPVQLANRSGKFALLWKYPTAVGTRPPLKPSCSAREKVAASSSPLPLAVCALPITPMLSAFPRRRISRPRWLPTSQMPHGA	33058	51232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_34963_39052_39162_43996_44062_44736_44851_45934_46141_48562_48646_49442_49579_51140
881522	contig_1331_pilon	-	1345	4	Intergenic	novelGene_37838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3563.14505271209	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169956	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166612_169860
881523	contig_10752_pilon	+	4944	4	Intergenic	novelGene_153043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3898	4410	232208	232720	TRUE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEELSPQNRVDLNDVDGVKLSRPLFPDVARLKMKRNSCKHLLIIGTWNVRSMNLGKLEIIKNETECINIDIVGISELKWTGIGHFESDGHMVYYAGNDNLRRNGIAFIVKKNISRSILKYNAISDRMISIHVQGIPVNTMVIQIYAPTTKAKDEETEDFYQLLWSEID	198556	329814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_199018_222300_225458_231928_233070_329629
881524	contig_12886_pilon	-	4789	8	Intergenic	novelGene_135539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.2916649453302	44	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	46	648	889832	885491	TRUE	65	TGAGGAAAAATCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAEYCVSFADVKKAHTNIQDLIHLTPVLTSSILNQVTGRNLFFKCELFQKTGSFKIRGALNAIRGLIPATSEGKPKAVVTHSSGNHGQALTYAAKLEGIPAYIVVPHTAPNCKKLAIKAYGASIVYSEHSDESRENVTKRIMEETEGIMIHPSQEPAVIAGQGTIALEVLNQVPLVDAMVVPVGGGGMVAGIAITVKKP	892726	881019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_885066_885395_885500_886078_886154_886290_886411_887831_887936_888080_888208_889664_889837_892685
881525	contig_610_pilon	+	3908	4	Intergenic	novelGene_76705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2588	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211062	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
881526	contig_6599_pilon	-	372	1	Intergenic	novelGene_175997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGTTGAAAAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	262346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262300_262700
881527	contig_15327_pilon	-	1010	4	Intergenic	novelGene_70490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1937	junction_3	77.0468832739016	7308	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	112	399	411438	401655	FALSE	15	GCTGTTTTCTTTATTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTAASFFCGSWCCLCARSVRTWYLFCEAAAEETPVLAMADEKPKEGVKTENNDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGVF	411549	401043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409830_411417
881528	contig_11548_pilon	+	2354	11	Intergenic	novelGene_66724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	1028.73502905267	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	225	1511	63836	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63611	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102493_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
881529	contig_5217_pilon	-	2106	2	Intergenic	novelGene_135731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	45	350	515720	515415	TRUE	45	AGGGTTTGAGACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDVTLKTKVYLTQVMVFSIASYVWESWTMNKEDRRRIDAFELWCWWKILNIPWTAKRTNKSVLEEIQPECFSEARMARLRLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVDGQQKRGRPSKR	515764	510671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_510776_513762
881530	contig_4874_pilon	-	5325	8	Intergenic	novelGene_78630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	4594	4914	270903	259625	FALSE	15	AGTGGCAGGTGGTGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQCGLHLNIKKTKILTTGLISNIMINGKKVEFVKDFILLGSIINSHGSSSQEIKGCITLGKSAAKDLFKVLKTKDVTLRTKVCLTKAMVFSIASYACES	411043	259213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_259651_270608_270934_271454_271844_313285_313641_346723_347225_363577_363593_381534_382616_408821
881531	contig_3825_pilon	+	2004	7	Intergenic	novelGene_77938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	1235.22476587147	3656	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAGTGACTCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12241	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_13904_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
881532	contig_8620_pilon	-	3127	2	Intergenic	novelGene_173875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAGAAAATCCCTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62229	58420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_59904_60585
881533	contig_3817_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_78299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAGTTAGCAGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120373	118720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_118700_120400
881534	SIRV6	+	1308	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3108	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
881535	contig_10588_pilon	+	1858	3	Intergenic	novelGene_177324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTTTTCACTGGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32964	63124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10588_pilon_+_33010_33359_34055_62006
881536	contig_20199_pilon	-	667	2	Intergenic	novelGene_82518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	880	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGGCTGCTGGAGCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41997	40645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934
881537	contig_19990_pilon	-	2953	1	Intergenic	novelGene_30759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAAGTTGATTCCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48276	45323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_45300_48300
881538	contig_19132_pilon	-	6724	6	Intergenic	novelGene_169991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	152.343559102444	449	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1781	5346	1323	6668	333671	327353	FALSE	35	AATGTCTGCGTGGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGDTAIGQKATSRSGETDKASGRWRQEQSAVIKMSTFGSQEGQRQPRIDPEQIGNTASAQLFGSGKLAPPSEVAQQVPEKQYPPHCPSPYSCQHSLSFPQHSLPQGVMHSNKSHQSLEGPPWLFPGHLQSVASEDLLPFPIHGHSGGYPRKKISSLNPVYSQYSQKSIDQSEDAHKKEHKPKKPGKYICPYCSRACAKPSVLKKHIRSHTGERPYPCIPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHAIKAGLVPFTESAVSKLDLEAGFIDVEAEIHSDGEQSTDTDEESSLFAEASDKMSPGPPIPLDIAGRGSYHGSLEESLGGPMKVPILIIPKSGIPLPSESSQYIGSDMLANPSLNAKADDSHTVKQKLALRLSEKKGQDSEPSLNLLSPHSKGSTDSGYFSRSESAEQQISPPNTNAKSYEEIIFGKYGRISPRNALSVTTTSQERTTMGRKSIMESLPHVNTRLDVKMFEDPVSQLIPGKGDIDPSQTGMLKSSKFNSESRQSQPIVSSIRNEGKLYSANFQGSNPILLEAPVDSLPLIRSNSMPTSSATNLSIPSSLRGSHSFDERMTGSDDVFYPGTVGIPPQRMLRRQAAFELPSVQEGHVEVEHHGRMSKGTTGSSLKEKKLIPGDRVGYDYDVCRKPYKKWEDSEPPKPSHRDISFLSSLKHGGEYFMDPLVPLQGVPTMFGTTCENRKRRKEKSVGDEEDTPMICSSVVSTPMSIMTPDYDPKLQMQEGVRSGFAMVGHENPAHGHSERFDPCRPQLQSGSPSLGSEELPSATDSDKMSDLGGRKPPGNVISVIQHTNSLSRPNSFERSESAELVACAQDKASSPSETCDSEISEAPVSPEWAAQGDSAESGGKPSPSQQVQQQSYHTQPRLVRQHNIQVPEIRVTEEPDKPEKEKEAQSKEPEKPVEEFQWPQRSETLSQLPAEKLPPKKKRLRLADMEHSSGESSFESTGTGLSRSPSQESNLSHSSSFSMSFEREETIKLAAPPRQDEFGKHSEFLTVPAGSYSLSVPGHHHQKEMRRCSSEQMPCPHPTEVPEIRSKSFDYGNLSHAPMAGAPASTLSPSRERKKCFLVRQASFSGSPEIAQGDAGIDQSVKQEQMEHLHAGLRSTWHHGPSAVLPPLQAEDPAKQVVGPCAQLSTGSLHLAQQQIMHMDSQESLRNPLIQPTSYTASKHLSEQPHLFPHQETIPFSPIQNALFQFQYPTVCMVHLPAQQPPWWQAHFPPPFAPHPQKSYGKPSFQSEIHPSYPLEHVLEHSGKKSADYAHAKDQTYPCYSGTSGLHSKSLLPKFPSDQSTKSMDTPSEQLFQEDFASANAGPLQSLPGAVVPVRIQTHVPSYGSVMYTSISQILGQNSPAIVICKVDENMTQRTLVTNAAMQGIGFNIAQVLGQHAGLEKYPIWKVPQTLPLGLESSIPLCLPSTSDSVATLGGSKRMLSPASSLELFMETKQQKRVKEEKMYGQIVEELSAVELTNSDIKKDLSRPQKPQLVRQGCASEPKDGSQSGSSSFSSLSPSSSQDHPSAGTPSREPFPPSREMLSSSRAPPPGQRPSGPSESKESSDELDIDETASDMSMSPQSSSLPPGDSQPEGQGKGQKLPVGMLVQMASGPSGKVANSTLLFTDVADFQQILQFPSLRTTTTVSWCFLNYTKPNYVQQATFKSSVYASWCVSSCNPNPSGLNTKTTLALLRSKQKMTAEIYTLAAMHRPGTGKLTSSSAWKQFAQMKPDASFLFGSKLERKLVGNILKERGKGDIHGEKDIGSKQTEPIRIKIFEGG	455385	327296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_327512_328484_334056_334824_334870_344630_344726_409974_410088_454700
881539	contig_11850_pilon	-	4107	8	Intergenic	novelGene_125207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	813.400395919275	2978	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	520	1782	286754	282879	TRUE	65	ATTAAAAAAAAAGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLTSRSLSHWRSRAPRQLAPLLPSLAPSSSRQGARRVQRHVTAQQPSGLAGGTAIKGGRRRRPDLFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	287273	279388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
881541	contig_5988_pilon	+	3297	10	Intergenic	novelGene_16099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1655.58655451963	9	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	753	1532	1218314	1224777	TRUE	0	CTTTTTTCTTGTTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLPVLDSSEWRLCATDAGTMNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1217561	1226934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1226095_1226486
881542	contig_6896_pilon	-	5396	7	Intergenic	novelGene_174223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9484	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCATCATATTTGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566853	385788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_386681_411675_412440_412706_412944_415270_415545_431695_431869_439337_441058_565517
881543	contig_401_pilon	+	1366	10	Intergenic	novelGene_42814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1119.04444466509	2387	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	61	1023	1711949	1715475	TRUE	20	TGTGCTGTGTAAAGTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711888	1716049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
881544	contig_15787_pilon	+	1561	8	Intergenic	novelGene_143957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	672.153225971336	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	262	1176	84229	111562	FALSE	20	CGTCTCTGTTTAATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDAVCHRQHTLGYFQFASVTIESALTLGIVKIQNAEENSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQEYISTLLLNGYETIEDLKDIKESHLIELKIENPEDRMRLLSAAENLLDEETIQEQENEPVSLSSSPNISLNKSQLDDCPRDSGCYTSSENSDNGKEDVESKNLPNMIQKMTITEPSD	56100	111947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56217_79246_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_96021_98169_98321_111359
881545	contig_15165_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_145303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCGCTCCGGGGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547	2264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_1500_2300
881546	contig_16098_pilon	-	1747	10	Intergenic	novelGene_46095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1870.64435983638	11942	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	443	1537	458816	456273	FALSE	0	GTCTGTTGTCTGTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460742	456062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148_460443_460615
881547	contig_4232_pilon	-	13906	2	Intergenic	novelGene_63440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7129	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCCCAGCCCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546398	530265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544051_546277
881548	contig_6059_pilon	-	2010	14	Intergenic	novelGene_44822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4047.35835975858	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	396	1556	576206	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	581012	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576609_576646_578185_578326_580594_580711_580921
881549	SIRV6	+	1148	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	379	1	115	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	45	AATGGCTATGTGGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881551	contig_9705_pilon	+	5140	3	Intergenic	novelGene_41698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84534	188284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_85779_175988_176449_184848
881552	contig_3747_pilon	+	2900	8	Intergenic	novelGene_24801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	10	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	330	1505	201313	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881553	contig_16098_pilon	-	2730	4	Intergenic	novelGene_46220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2323	2661	766357	764972	FALSE	55	ATGAAAAAAATGAGGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTLTQRSPPCAQRAALELKASHCWSAPGLLSHRSEWLFPAHARRAQDSCLLGSAFSILVMNISLLIFRPLSSNLSRKIPEAPNVFHLCSFLLVLRTGVRKSHQAGSWRRV	769157	764902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765636_766288_766688_767165
881554	contig_5794_pilon	+	4581	4	Intergenic	novelGene_69754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9054	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2584	3054	552884	553354	TRUE	45	AGGCGAATGAAGACCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFDTRILNKILANSTQQHIKKIIHHDQVGFLPGMQGWFNIRKTINGIHHINKTKDKNHMMLSISAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLDIIKGVYTKPTAIIILNGETLKAFPLRTGTRQGRPLSPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKRHPNW	519237	555469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_519709_550720_552238_552288_554823_555410
881555	contig_15327_pilon	-	2393	4	Intergenic	novelGene_70607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2915.88709581759	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	319	369	900954	900904	TRUE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901486	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899071_899395_901033_901126_901281_901400
881556	scaffold_8345_pilon	+	570	6	Intergenic	novelGene_107004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	391.292422620219	162	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	67	570	570477	602747	FALSE	30	TATGTTGGAGATACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPELPELSAAALRSSGCPATGTMVFYFTSSSDEDLIKYGWPEDIWFHVDKLSSAHVYLRLHKGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELR	570410	602747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_583891_583932_591070_591123_598125_598202_602217_602322_602543
881557	contig_1939_pilon	-	4007	4	Intergenic	novelGene_144854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2780	3190	66112	63050	TRUE	45	TTGTGAAAAACAAGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGENEENRIQRKD	182355	45394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_45445_62282_63087_65738_66990_180453
881558	contig_15087_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_37223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAAACTCTTTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131848	129000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_129000_131800
881559	contig_9705_pilon	+	3610	1	Intergenic	novelGene_41725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCCTCAATAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184851	188461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_184900_188500
881560	scaffold_12124_pilon	+	2866	7	Intergenic	novelGene_22323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4108.77001059928	586	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	908	1687	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483570	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483679_1483992_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491937_1508049
881561	scaffold_12124_pilon	+	2983	8	Intergenic	novelGene_22239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3259.75576273025	11	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1012	1791	1508626	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491944_1497040_1497122_1506629_1506687_1508010
881562	contig_3747_pilon	+	3419	7	Intergenic	novelGene_24862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1727.26450396767	107	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1061	2044	202075	203804	FALSE	65	AAAATAAATAAATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFKHNKKPLMVAHFSLPSGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201014	205179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881563	contig_299_pilon	+	5769	11	Intergenic	novelGene_129423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_7	248.798090828688	4020	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	102	2438	841615	882832	FALSE	25	ACTTTGTAAAAGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKGIARPWKLVYYRAKKMFDIHNYKGRYSEGDAEKVKLYHSLHGNDWKKIGEMVARSSLSVALKYSQISNQVNHGTWSKTETQKLVKAVEQVILKKMSLQELKEVDSRLQEDPEGRLSIVREKLYKGISWVEVEAKVETRNWMQCKSKWTEVLTKRMTNGQRVFQGVNALQAKINLIERLYKINVEDSNEIDWEDLASAIGDVPPSFVQSKFYKLKATCVPFWQKKTFPEIIDYLYETSLPLLKEKLEKKIEKGTEIQTPAAPKQVFLFRDIFYSEDDSDGEDINEKS	832792	886163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_832887_841607_842679_860693_860915_863075_863262_864117_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619_874686_881780_881867_882653
881564	contig_9797_pilon	-	1425	4	Intergenic	novelGene_65598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1516	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	712	1098	191434	189331	TRUE	20	AGGTCAGTCCCCCAGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPLSQAKKGPQCTPLYRWAGSQHPRGCHGDEVFEAEPNVALYSCVLLPEGLSQHLQLGAHLDEAVQLHGGIGGAWTVAGDQELGELGAQVVAHLGQSLLQLRVADGARVVPVILLEEVFPLLDEFP	192145	183870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9797_pilon_-_183983_188571_188734_189277_189420_191136
881565	contig_6443_pilon	+	5948	4	Intergenic	novelGene_175146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2839	3477	415669	454085	FALSE	40	GCATAGGTTACAATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKTINVIHHINKTKDKNHTILSINAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIEIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGESLKAFSLRMGIRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIWLGKDIKRIQIGKEEVKVSLFAVDMILYTENPKESTKKLLELIEDFSKVSGYKTNIQKSVGFLYTNRELRRGNHQINIIYNSPQEDKILRYKSNQRHKRPIR	369770	456556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_+_371291_414108_415104_415345_416160_453937
881566	contig_9538_pilon	-	3875	2	Intergenic	novelGene_176440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73178	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGATCTATTGAAAGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30586	25891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_29562_30381
881567	contig_5889_pilon	-	4135	1	Intergenic	novelGene_133698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTCTGTAAAGATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306998	302863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_302900_307000
881568	contig_12638_pilon	+	1734	7	Intergenic	novelGene_33220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	115.852876049276	1556	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	111	848	610544	616849	FALSE	75	CCCCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRASFENNCEIGCFAKLTNAYCLVAIGGSENFYSVFEGELADTIPVIHASIAGCRIIGRMCVGNRHGLLVPSNTTDQELQHIRNSLPDSVQIRRVEERLSALGNVTTCNDYVALVHPDLDRETEEILADVLKVEVFRQTVADQVLVGSYSVFSNQGGLVHPKTSVEDQDELSSLLQVPLVAGTVNRGSEVIAAGMVVNDWCAFCGLDTTSTELSVVESVFKLNEAQPSAIATSMRDSLVDSLT	610179	617735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_610278_610531_610651_610784_610871_613329_613506_614064_614242_614437_614620_616839
881569	contig_7457_pilon	-	4283	21	Intergenic	novelGene_31494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2522	2857	664175	662973	TRUE	20	CTATACTGCTGGTCAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISANDMLFSCCLVYGSTDWIWVLPLMSFSTQVKVIPPSLLLSLNLSRKVPGGLVLKMARSRSLLMKPIIYPSFQRARMYFFTRSMILSSQTQKEKPLPAMFSLQNLAHVI	671951	642650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_642716_643347_643446_648694_648792_648953_649036_649224_649322_649492_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
881570	SIRV6	+	928	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	601	387	385	107	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	45	536	1733	10736	TRUE	20	TGGGAGTCAATGGCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1688	11438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881572	contig_14970_pilon	+	4234	10	Intergenic	novelGene_45006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6118.16508642022	250	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTGAGGAGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136113	234826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177383_182341_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_233192_233286
881573	contig_14684_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_99663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1322	1849	303467	303994	NA	35	CTTATATTGAATTTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGCILSPYLFSVYAEQIIREAGLYEEEWGIRIGGRLINNLRYAGDTALLAESEEDLKDLLMKIKDHSLQYGLHVNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTVSTHGSSSQEIKRLIALGKSAAKGLFKVLKSKDVTLKTKVCLTQAIVFAIASYAWESWTVSKED	302145	304783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_302100_304800
881574	contig_15327_pilon	-	891	3	Intergenic	novelGene_70495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	1007.5	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTTTTCTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411565	401046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_411417
881575	contig_11422_pilon	+	1214	1	Intergenic	novelGene_98992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATAGAGAGGACATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_1200
881576	scaffold_12124_pilon	+	3274	11	Intergenic	novelGene_22235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3250.95907233542	160	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1316	2095	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1477437_1477588_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
881577	contig_5023_pilon	-	4508	14	Intergenic	novelGene_7341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2432	2932	647301	643482	TRUE	35	CCTTGAACAAGTCATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	649732	607989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_608098_609592_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
881578	contig_1154_pilon	+	4849	3	Intergenic	novelGene_87029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	456	875	16939	17358	TRUE	70	AAAAAAAAAAAATCATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASASSQNKESRNLPEEDNFLELLEVEYKRLIYRTLQDIRKEIRQNTKQAKEHTEKAIEELKKIREEHNGKFNSLQESIERQQTDIQKINNKISKLDNSTESHRSRTGATEVRISEIEDKALDTNLFEENSPKRIFKK	16483	189072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_19943_88920_89275_188036
881579	contig_3817_pilon	+	1578	5	Intergenic	novelGene_78329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	588.984082976781	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	249	641	199102	204532	FALSE	60	AAAAAACCCAATGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	193330	205469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_193445_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
881580	contig_3747_pilon	+	2785	9	Intergenic	novelGene_24811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3826.39692628718	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	330	1505	201313	203804	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_203936_204057
881581	contig_12677_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_110762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATTTTGACGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_200_1700
881582	contig_6048_pilon	+	2113	5	Intergenic	novelGene_73087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	192.968099695261	2653	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	110	586	130291	135654	FALSE	25	ACCCCTCAACTCTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	130181	137181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_132370_132550_133132_133242_134181_134320_135606
881583	contig_20641_pilon	+	2364	9	Intergenic	novelGene_52777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1616.77622427317	3821	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	1147	2055	38688	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	4860	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_5227_12293_12337_14232_14771_16769_16884_38602_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
881584	contig_5817_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_169576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	583	1044	18507	18046	NA	45	CTCAACAAAATTCTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSTNQEDVTIVNVYAPNDRTPKYIKQTLTALKREIDSSTTVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTAELNATINQLDVIDIYRTLHPKAAEYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQSIEILQSIFSDLKAIKVEINNRKSKEENQTHGN	19089	17178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_17200_19100
881585	contig_7810_pilon	+	7766	4	Intergenic	novelGene_144230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3044	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	5950	6963	658634	659647	FALSE	35	AGGGAACCCAAGGTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIHLQKNETLTPYTKTNSKWIIDLNIKPKTIKFIEEKIQPTLQALIHDINKIQTITINTQTPKDKLDNWDLLRIKHLCFSKDFTRRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWTKEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSGSLAIRKMQIKTTIRYHLTLALLAQIKNTGNNKSWRGCREIETHMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPYDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRLKQPRSPSKDEWMNKLWYIHTMEYYAKIKNNDESVKHLITWMKLKDTMLSEISQSQKDKYCMRPLL	625295	660450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_+_625940_626171_631075_636510_636829_658549
881586	contig_12301_pilon	-	5078	2	Intergenic	novelGene_110032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	733	1209	301315	300839	TRUE	40	CTGGAAAAACTGGATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHFQKQDRMVSVGVQNKTLDDSPVEENALELTDREFKSLILRILQELRQKADNHEEKIDKFMDNTDKKLEEFRKIMQEQNTKINSQLEIIQRKQLENQKINNKISEMDGAVEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTRFQENSEKKNKEK	302047	213422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_215750_299296
881587	contig_10973_pilon	-	960	2	Intergenic	novelGene_150310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_347_409
881588	contig_15327_pilon	-	2667	3	Intergenic	novelGene_70622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3046	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGACTCTTGATCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901803	898559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899232_899714_901033_901126
881589	SIRV3	+	1535	3	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	2718	-17	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	321	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTGGCATTTGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6721	8920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_8002_8117_8208_8755
881590	SIRV5	+	2288	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	4	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCGACCATGTAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8319	13602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_13021_13527
881591	contig_1715_pilon	-	7010	11	Intergenic	novelGene_127172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	243.241957729336	5696	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	268	408	284622	284482	TRUE	40	GTATTAACAGATGCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKVSLGAYEIRKILNNESDLL	312158	242913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284418_284644_311912
881592	contig_3747_pilon	+	1254	2	Intergenic	novelGene_24963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203914	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204203_204240
881593	contig_15105_pilon	-	1454	7	Intergenic	novelGene_151021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	40	762	839916	829338	TRUE	25	CTATAACGTCTATTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839955	828354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828867_829157_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
881594	contig_1867_pilon	+	1496	7	Intergenic	novelGene_54515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5436.87483762501	7140	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	210	842	213567	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSGAPPVAPPRRLNSQPGVRSPRLEPAAALRGHSRPRHGEVPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194855	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194982_195057_195090_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
881595	contig_10431_pilon	+	7477	1	Intergenic	novelGene_117389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2813	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	627	974	19606	19953	NA	40	TTTCAACACTTTAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFTVLGFIFRFPVHFELLFMHGVRYGSCFIFLHIDTQFCLRHLLKRLSLPLLKDFDPLLKISCPQVDGFMSGFSILFHWSVSVIVAAPGCFNYHGCIADSEMRYYEVFYFVLLL	18979	26456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_19000_26500
881596	contig_10436_pilon	+	899	4	Intergenic	novelGene_108493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23915	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACTTGCGCCACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101598	103590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_102103_102538_102655_102788_102866_103388
881597	contig_8377_pilon	+	4898	27	Intergenic	novelGene_35015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	2604.97903687235	48	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1076	3231	41	3271	68257	197939	FALSE	15	CTTTCACTTCTCTCATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPELLFLFFISAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68216	199566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180479_183238_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
881598	contig_4486_pilon	+	2441	14	Intergenic	novelGene_38585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1281.3582567918	49	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	274	1428	343083	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311783	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_341226_341376_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
881599	contig_14441_pilon	+	943	4	Intergenic	novelGene_100765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	94	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	355	903	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121666	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
881600	contig_5222_pilon	+	7049	6	Intergenic	novelGene_59004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1168	123	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	5163	5723	357727	358287	FALSE	45	ATCTACACAATGGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDAEKAFDKVQHPLMIKTLNKIGIEGKFLNIIKSIYTKPAANIVLNGETLKAFPLRTGTTKGCPLSPLLFNIVPEVLARAIRLEKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYIENPKESRRKLLELIEDFSKVSGYKMNIQKSVGFIYTNKENLEEEVTKSIPFAVAPKKIKYLGINLTRDVRDL	223031	359613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_223840_223909_225239_260632_260767_290825_292345_313190_313472_356635
881601	contig_10953_pilon	+	3651	7	Intergenic	novelGene_42573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4307	junction_6	14096.2444693219	7065	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	246	833	455261	463828	FALSE	25	ATGGAGGCTTAGAGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455015	466646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817
881602	contig_16103_pilon	+	2216	9	Intergenic	novelGene_118843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6678	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCCACTTCCGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722281	743696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723676_732163_732241_733288_733369_733541_733608_734955_735030_735661_735731_735854_735975_737495_737636_743500
881603	contig_12677_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_110692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5740	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_900
881604	contig_6754_pilon	+	6921	4	Intergenic	novelGene_178270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGAATCTGTTATTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372697	528857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6754_pilon_+_376794_524174_524792_526534_527232_527346
881605	contig_12079_pilon	-	2754	11	Intergenic	novelGene_67430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1320.99152533239	795	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	467	1318	600738	581160	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKAPSSPVRASWTTAMRRSGSPRPRRMSACSGSC	638835	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582015_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
881606	contig_10431_pilon	-	4513	1	Intergenic	novelGene_117401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20441	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	500	913	242431	242018	NA	70	AAAATAAAAAAAAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHYLPKLTQTEVEQLNNPITKEEIEKIIQKLPTKTSPGPDGFTREFYQTFREELTPLLLKVFQSIEKDGILPDSFYEASITMIPKPGKDTTKKKENYRLISLMNTDTKILNKILANRIQQHIKKIIHHDQV	242930	238417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_238400_242900
881607	contig_14925_pilon	-	1697	6	Intergenic	novelGene_55312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	909.532715189509	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	101	514	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGYAPYKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	130947	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129484_130929
881608	contig_13026_pilon	-	2056	12	Intergenic	novelGene_146287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	76.4901549328598	1968	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	684	1094	14211	6494	FALSE	10	CCTTTCATGTCATGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28176	5531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
881609	contig_17144_pilon	-	2812	17	Intergenic	novelGene_29378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2110.26359339153	94	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	1273	2520	172541	166363	FALSE	25	AAATTCTTGAGTGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183188	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172650_173111_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179746_181790_181850_183158
881610	contig_12119_pilon	+	2648	1	Intergenic	novelGene_88634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87876	90524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_87900_90500
881611	contig_6233_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_74770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	390	713	121118	120795	NA	5	CTCTTTCCATCTGTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNLRPRMSLKNISNTKNQQIKTWCLSYLVLLQQKYHKWMALTDVFSQSRRLEVQIQGTSSRGSAFFVSSGGRSLSSIFPWSRSFSAQGPQVQRMCSAPSASFLVA	121507	120372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_120400_121500
881612	contig_854_pilon	-	1364	7	Intergenic	novelGene_36244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	387	743	563319	562338	TRUE	30	AGCGGGACAGGAGGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563705	543491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545982_556076_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562404_563028
881613	contig_11548_pilon	-	1703	7	Intergenic	novelGene_66761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1814	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAAAAGTTCTAGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120481	102068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_102178_102442_102573_112801_112902_117681_117854_118973_119121_119346_119399_119488
881614	contig_13283_pilon	-	5070	3	Intergenic	novelGene_154004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1203	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2105	2437	133519	133187	TRUE	55	AAAATGTCAGCACCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKSMENTDKKIGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQQDFRNGWCHRRAEKQI	136356	4935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_7219_132836_133686_134418
881615	contig_14807_pilon	-	661	4	Intergenic	novelGene_124660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	1876.46695207302	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	73	564	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38741	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632
881616	contig_5461_pilon	-	4429	5	Intergenic	novelGene_156806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2505	2819	210371	210057	TRUE	20	ACTGTGATCCTGATTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHLILPSDLVCNCSSSTQDTLKNRALIRLFSILLVLFKVSPTIFRIKCRLDTQWAGPILSLAPFNFPAPIQAYPPSLTPLVTMTLLPFYKQMEFHKTMVKRNI	212875	30627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_30655_31473_31502_39614_40119_195499_196525_210030
881617	contig_16594_pilon	+	2753	5	Intergenic	novelGene_53866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATAAATGGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147496	293889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_149330_197541_197549_272661_273472_289514_289526_293797
881618	contig_12938_pilon	+	1658	9	Intergenic	novelGene_99724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	935.236459070646	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	230	877	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51967	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_76550_76685_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
881619	contig_15327_pilon	-	2750	5	Intergenic	novelGene_70629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	1736	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	TRUE	25	AAGTTAGACTCTTGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899608_899740_901033_901126_901281_901400_901536_902035
881620	contig_14441_pilon	-	3115	2	Intergenic	novelGene_100798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGCACACTTGCGCAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140998	136577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_137947_139252
881621	contig_2770_pilon	-	1562	6	Intergenic	novelGene_107447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	1592	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	215	664	750561	743833	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750775	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
881622	contig_5057_pilon	-	2078	7	Intergenic	novelGene_151512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	104	junction_6	474.592690864727	350	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	954	1529	514257	507037	FALSE	5	CTCTTGTCATTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	524685	506487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523747
881623	contig_9363_pilon	+	738	4	Intergenic	novelGene_6628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1235.46761277754	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	68	688	872458	873735	FALSE	5	CTTGTGTTTTTCCTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTPAAPYSTPSGSS	872390	873785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872729_873004_873095_873426_873649_873697
881624	contig_5023_pilon	+	3352	18	Intergenic	novelGene_7174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	2077.26049631484	7067	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	249	2132	607279	646990	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	538668	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538780_580791_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647646_647736
881625	contig_4232_pilon	+	2536	2	Intergenic	novelGene_63272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	515	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGAATGCCTGTCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465501	468125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467393_467480
881626	contig_15720_pilon	-	2220	4	Intergenic	novelGene_41970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.539881877263	12	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1497	1952	307437	306982	FALSE	50	ACATAAGGTCTCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	310905	306713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_308532_309676_309909_310619_310728_310843
881627	contig_9345_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_24579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGGGACGGCTCAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944005	945682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_944000_945700
881628	contig_9112_pilon	+	2146	6	Intergenic	novelGene_60194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	513.259778279966	8195	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	428	1279	108641	114303	TRUE	5	TCTTGAGTCTGGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108014	117310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108241_108439_108743_111553_112128_113625_113750_114251_114774_116913
881629	contig_15105_pilon	-	1765	7	Intergenic	novelGene_151018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1096.72142720423	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	6	470	839916	835244	TRUE	35	ATAACGTCTATTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGAAHLVSCIYLS	839921	828352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_835229_835282_836187_836548_839849
881630	contig_13863_pilon	+	2353	11	Intergenic	novelGene_42011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_10	666.917806030098	3374	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	75	1148	98341	118962	TRUE	20	TCACCCAGTGTCCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSSFCLEAVRGRFCPSCGRQARAMRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98266	120774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
881631	scaffold_13505_pilon	-	5730	5	Intergenic	novelGene_111543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	192.257639640145	4408	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	691	1023	635299	634967	TRUE	35	TAATATTGTTCAATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGAFFNPMFQPSSQAGSQEVLQCKCPRQGWGEQPGVYLPCKHFSLIKFLHLEQDQVCKTNVFLFWEQQTSGSFSPALVGRRMAQDIQGQRQVTVHVTFHDQGDIAVVMK	635989	592612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_593313_605754_607284_608139_609103_609532_610113_634031
881632	contig_9931_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_134843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	146	466	365030	365350	FALSE	35	GAACTCTTAATGCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESMVHLLYLNCCSMHPTAKIRVSSSITGVGSDAFDSAAHRACTKAIRSYESSIFCVFFLIYSLSYFDIFLNVVDECQLSDRAHLACPQVSPCQPPILLSRYFWE	364110	367187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_364175_364948
881633	contig_5419_pilon	+	3382	3	Intergenic	novelGene_15513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1252	junction_1	236	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	513	977	248067	249830	FALSE	55	AATGCATATGAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	247554	252235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_248112_248673_248878_249614
881634	contig_6047_pilon	+	8998	5	Intergenic	novelGene_24220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	6991	7425	208434	208868	TRUE	55	CAAAGACACAAGCAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKIFNKILANRIQQHIKKIIHHDQVEFIPGMQGWFNIRKTINVIHHISKTKDKNHMILSIDAENTFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNEVTLKAFPLRTGNQTSMPFITTLIQHCAGDPNQSN	125688	211038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_130158_132090_132202_143742_144003_206283_210373_210969
881635	contig_12624_pilon	-	2029	15	Intergenic	novelGene_61040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	833.352927660794	4416	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	106	1668	903621	862389	FALSE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903726	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875528_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
881636	contig_10140_pilon	-	6765	5	Intergenic	novelGene_148384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTTGGCATAAATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310011	104170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_106607_107263_108190_111649_111930_168349_168492_307030
881637	contig_9613_pilon	+	6170	7	Intergenic	novelGene_178271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	132	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	4599	5768	574464	575633	FALSE	55	CTCTACACCAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENNEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQITATFFKEMEKLIINFIRKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLKTYYIATVVKTSWYWYNTYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIK	410438	576035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9613_pilon_+_411637_411730_412205_418451_418907_496198_497246_500368_501157_569616_569755_573965
881638	contig_1541_pilon	-	7517	5	Intergenic	novelGene_178272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	5389	5778	77627	48040	TRUE	60	GCAAAAAAATGAAACAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEETLRITWDTIKSKNLQVIRVPEQGEKTENTERITEERLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLTETKHKQRILRAAGEKQKVTYRGETIRIKEIRRIRAELKQIENRKKS	138935	22393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1541_pilon_-_23326_47232_48104_77301_78876_134243_135951_136502
881639	contig_9955_pilon	-	645	5	Intergenic	novelGene_21259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	904	junction_4	713.901735184892	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	216	512	23469	13719	FALSE	20	GTTTTTTCTTAAACGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEWELREEEKKKECAAKGEDYEKVKLLEISAEDAERWERKKKRKNPDLGFSDYAAAQLRQYHRLTKQIKPDMETYERMRDKHGEEFFPTSNSLIHGTHVPSTEEIDRMVVDLEKQIEKRDKYSRRRPYNDDADIDYINERNAKFNKKAERFYGKYTAEIKQNLERGTAV	24471	13585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_13885_22538_22638_23437_23529_23860_23979_24433
881640	SIRV7	-	2150	6	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	282	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147636	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2394_2454_2676_2993_3115_3809_3897_114680_114989_147608
881641	contig_9843_pilon	+	3426	3	Intergenic	novelGene_114303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTGTAGATTGGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3717	67033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_6768_34898_35188_66946
881642	contig_15434_pilon	+	3494	7	Intergenic	novelGene_56697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	417	junction_1	361.726607936006	1100	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	295	1380	26904	33302	FALSE	30	CATGATCATACTGCAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSVAHLARANPFNAPHLQLVHDGLSDPRSSPAGPPGLPRRSRNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26609	35416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
881643	contig_7151_pilon	-	3500	7	Intergenic	novelGene_40766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	842.94701296503	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	62	739	551063	529189	TRUE	5	TCTTGTGATGTCTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551124	524180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526664_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996
881644	contig_9871_pilon	+	1711	4	Intergenic	novelGene_75687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.84447196547	3501	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGAAGCACTTTATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533382	541773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_533413_537743_537936_539747_539984_540520
881645	contig_11783_pilon	+	5286	3	Intergenic	novelGene_178273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	977	1282	2423	2728	TRUE	25	CCAAATGACTCTCCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	1446	69011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11783_pilon_+_3652_3911_6149_68167
881646	contig_10345_pilon	+	2105	14	Intergenic	novelGene_158357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1351.78468927335	22	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	249	1289	11670	24141	FALSE	45	TGATATCACAACAGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_7662_7840_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
881647	contig_19459_pilon	-	1291	8	Intergenic	novelGene_59834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_7	7322.9125130285	16672	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	170	955	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16817	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_16672
881648	contig_8620_pilon	+	2656	4	Intergenic	novelGene_173872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	113.755097565877	44	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTGGTCTCTATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57499	62229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_57537_57723_57836_59040_59907_60588
881649	contig_15165_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_145306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGCCGGCGCGCGCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2928	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_1600_2900
881650	contig_6980_pilon	+	1910	9	Intergenic	novelGene_36035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	145	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	82	978	356720	372790	FALSE	30	AACCGAGCTACTTTGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346101	373722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
881651	contig_10009_pilon	-	2926	2	Intergenic	novelGene_82728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5829	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCTAACTGCAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44923	41960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42384_42420
881652	contig_10437_pilon	+	1737	2	Intergenic	novelGene_38488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGCTTTGCTGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213561	1215715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214376_1214792
881653	contig_2227_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_142327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3432.5	11	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	271	645	230510	231819	FALSE	25	CCAATCTCTTGTCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230059	232765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230254_230433_230517_231451
881654	contig_14925_pilon	-	2621	5	Intergenic	novelGene_55250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_4	888.4594813496	176	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	252	764	119922	114666	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGCAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSWDTRQMFFGAGTKLFVEPQSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	120173	111420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_119858
881655	contig_11720_pilon	+	1396	10	Intergenic	novelGene_43822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2337.26792602489	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	221	1117	78465	98482	FALSE	20	TCGTACTTGAGAATTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLSPIPAPLPLSLYLLPHQAPLVRVQQGRSLCPYLLYPPSPANKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67896	98761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68026_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
881656	contig_10734_pilon	+	1725	6	Intergenic	novelGene_51294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	370	junction_5	204.111146192461	2080	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	16	729	1368595	1388936	FALSE	25	ACCCAGCTTCCTCAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YARRGMAALRSWLLRSVTSFFRYRQRVPVAANFKKRCFSELIRPLHKTVAVGFGVTLCAVPIAQKSEPHSLSNDALMRRAVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTKAVYTLISLYRQYTSLLGKMNSQEEDEVWQVIIGARVEMTSKQQEYLKLETTWMTAIGLSEMAAEAAYQTGADQASVTAQNHIQLVKSQVQEVRQLSQKAESKLAEAQTEELRQKAQEEGEERADPQQEAYLRED	1368579	1389932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1368645_1369474_1369602_1377320_1377453_1378250_1378362_1378533_1378631_1388739
881657	contig_13481_pilon	+	3868	5	Intergenic	novelGene_119553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1041	junction_1	171.453164158612	3199	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	355	1005	1568681	1586220	FALSE	20	TCCATTCCCTGTGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568326	1589083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080
881658	SIRV5	+	1965	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	30	34	2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
881659	contig_12935_pilon	-	5888	7	Intergenic	novelGene_165727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	380	1165	232322	231537	TRUE	35	GAATCACTTTCTAGACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKEDRMVPEAIQNKTPDDSPVEENALELPDTEFKSLILRILQELTQKADKYEEKIDKFMENTDKKLEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKITETDSVIQGLRSRFEMAEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKENEETLRLMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILTAAREKQEVTYRGKQ	275195	207271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_207634_207797_208010_208073_208445_208932_209569_211966_212135_228562_232338_274831
881660	contig_6102_pilon	-	2097	8	Intergenic	novelGene_32139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_7	319.848816327531	333	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	331	813	867239	839973	FALSE	35	CTGGAATATGAAGATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867569	838688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
881661	contig_12464_pilon	+	6934	14	Intergenic	novelGene_68624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_13	178.239417472198	3996	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	102	2684	45237	113708	FALSE	15	TATTTTGTGACATTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASAAERVIATAVPASGTNSNGESSEVEGGVGAVGEEKDAPVKAEAAGDSEEDGEDVFEVEKILDMKTEGGKILYKVRWKGYTSDDDTWEPEVHLEDCKEVLLEFRKKVADNKAKPVKKDIQRLSLSNDIFEANSDSDQQSETKEDTSSKKKKKKLRHKDEKSPEDLKKKKAKTGKLKEKSKSDLESFSESLVFDLRTKKRIFEAKEELKEFKKPKKDDIKETKELKKVKKGEIRDLKTKVREDFKENKKTKKDKCIESQLESESSVLNDSLSQDDDNEDLHSDNKEEKQKIKSTKDKSGPDIIAGVVFDKQPDGKVSADEDTDVRTKRKKKKLRKTEEHKDSNKLENKDLFLERKNTHKKQRNQDKGKSTIEFDKPIPASSQTQKSSKLGGEERGHRSTDSPGEEKETKKSESKEKCQKRHDSDKDERGRKEPKGLKTFKEIRSAFDIFKLTPEEKNDLTENNRKREEIPLDCKITEDYKTKENKLFKERRNTRDETDTWAYIAAEGDQEVLDNVCQTDESSDGRQQILSLGMDLQLEWMKLEDFQKHLDGEDENFATADTIPSNLLRDAVKNGDYITVKVALNSSEEYNLDQEDSSGMTLVMLAAAGGQDDLLRLLIKKGAKVNGRQKNGTTALIHAAEKNFLTTVAILLEAGAFVNVQQSNGETALMKACKRGNSDIVRLVIECGADCNILSKHQNSALHFAKQCNNVLVYDLLKNHLETLSRVAEETIRDYFEARLALLEPVFPIACHRLCEGPDFSTDFNYKPPQNIPEGSGILLFIFHANFLGKEVIARLCGPCSVQAVVLNDRFQLPVFLDSHFVYSFSPVAGLNKLFIRLTEAPSAKVKLLIGAYRVQLQ	45135	117958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_45453_51803_51960_53873_54723_57019_57120_58834_59090_69115_69242_69321_69411_89136_89278_89882_89970_103451_103607_105124_105280_112063_112192_113105_113190_113666
881662	contig_12682_pilon	-	4500	1	Intergenic	novelGene_178274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2760	3065	3760	3455	NA	15	CTGTCCTTTACTGAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSRMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	6519	2019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12682_pilon_-_2000_6500
881663	contig_1264_pilon	-	1254	1	Intergenic	novelGene_161306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACACTGTTGACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133997	132743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_132700_134000
881664	contig_3233_pilon	+	1374	10	Intergenic	novelGene_56544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	213.907445082513	4225	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	355	1236	740857	747909	FALSE	10	TGGGATTGTGTTGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	738546	748047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
881665	contig_2067_pilon	+	7505	4	Intergenic	novelGene_158924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_1	154.670258578981	2929	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1570	4713	458	5170	604648	609360	FALSE	25	GTCTTTTGGTGACTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQVTLPEMTQDWTKEHVKKWVTEDLKIDEKYGQILLREEVTGLVLQVLTEQDLRDMGLPQGPVLLIKRGYNKLNNSSPESHNQNSGQLDHTKTSKKEQRKKPQQTKKEELISSNIDHDLTETGDTKEEELILMKENATNEVGATKGKKKNKLKTEQLTCMPYPFDQFHDGRRYIEHYMLQPETGPLNLIDPIHEFKALTNTDMATEKDIQMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVKDKPHGEIVGVKVTSKDAFIDHFNLMIKQYFEESHIKEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPSDKFVIEVDIIPKHSVCKDKYFYINMQNCKDGSWRQDKDASLFVREGASSKNIFANVRQQDADFKAFLLNVKPLAASRRKAEEEYGVKANKKESEGLKLVKLLIGSRDSLDNSYYDWYILVTNKSHPKQTKHLDFLKEIKWFSVLEFDPESVSNGVVKAYKESRVANLHFPSQYEEKTTNIKDMISTLNLYEQPSWIFCNGRSDLNNETYKPLDPHLWQRERASEVRKMILFLTDENVMTKGKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFCAFYQALKGMENILCICINSQIYLRWKDLLQTRLTIADEITNHSISTLNLEQINSTILKLKSVIQSSRRFLPSLGSSSVILEKKEEDILTALEILCENECKDTDIEKDETKFLEFRKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSAFVKRDGYENLKELIQCGAESPRPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHILWDLKKKFRCAVLKNKATDFTEIGEQVTNLITYKATSHQEYIPVLLLVDDFEELENIYVLQDAINSSLAKKGLRYEKTLVIILNCMRSQNPDRRAKSADSVALIKQLSAKEQRAFEAKLEEIEKQHKNCENFYSFMIMKSNFDETYIENVVRNILKGQNFDSKEAQLISFLALLNSYVADSTISGSQCETFLGITSTRTPWEPETLEDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIAIYCLKELENSYHLDKSQIALKLLHENLFYVSGIGRDKLLHDVQTLLLTRQRKEYGDETDTLFSPFIEALPNRKIENVLTAGSIRFPQNAFICQALARYFYIKEKNFSTALLWANQAKKIAPKNSYISDTLGQVYKSKIKWWLDENKTCRNITVNDLTHLLETAENASRAFKESQRQTDSKDYETEAWSPQKYQRKYDMYNTAGFLGEIEVGLYTITILQLTPLFHKENELALKPMVQFLSGIGDIPADPENEYHLTLRNFTSYLKSLQLDLKRCFDFFVDYMVLLKTRTTQKETVEIILSKKVSRSYRKYMEIFCHLGLDPLPSKELLQEENCRKSLEALRADRFSGLLEYLNPNHTGAANTMESIVNKYSLLLQQNLNKRLIKEKQNFILANIILSCLKPTSKYIQPFNMLKKQLREVLELVEPTHQYPDPYFLACLLFWPENQELDQDSKLMENYVSSLNRSFRRQYRHMCRSKQASTLFYLGKGRGLHSIIHKAKIEQYFSKEQNINSLWQSGDVWKKKRSQRSPASSNWSGCRQANLYTIWDRGKNKNTSDISLFRSTQKWWGHRKSVLLPRIFH	590072	611695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_590224_593355_593454_594299_594487_604626
881666	contig_10958_pilon	+	1799	5	Intergenic	novelGene_5449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4652.00497097757	24	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTGTGAATCATATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888518	901690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888650_888850_889054_893824_893900_895697_895855_900457
881667	scaffold_12124_pilon	+	2431	11	Intergenic	novelGene_22319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3172.38362119085	35	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1489	2268	1508626	1509405	FALSE	30	TGTGGTAAACTTGACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483570	1509568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483623_1483689_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
881668	contig_6914_pilon	-	1227	3	Intergenic	novelGene_151728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	31	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	347	985	123507	122480	FALSE	5	GGTGCACTGCCTGTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGGDCKEVDNRLSSKVGLATVDSCSPAFLFLQPLPRMAALVLAGDTMGPERIFPNQTEELGPHVGSAEGTGDWSSEEHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQALGLHLPDPPLESEDEEEEGATALSNHNSIPMDPEHVELVKRTMAGISLPAPGVPAWAREISDAQWEDVVQKALQARQASPAWK	123853	122237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_122632_122937_123041_123123
881669	contig_12638_pilon	+	1140	7	Intergenic	novelGene_33223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	128.683612873676	1321	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	127	864	610544	616849	FALSE	10	TGTGTTGTTTGCTGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRASFENNCEIGCFAKLTNAYCLVAIGGSENFYSVFEGELADTIPVIHASIAGCRIIGRMCVGNRHGLLVPSNTTDQELQHIRNSLPDSVQIRRVEERLSALGNVTTCNDYVALVHPDLDRETEEILADVLKVEVFRQTVADQVLVGSYSVFSNQGGLVHPKTSVEDQDELSSLLQVPLVAGTVNRGSEVIAAGMVVNDWCAFCGLDTTSTELSVVESVFKLNEAQPSAIATSMRDSLVDSLT	610273	617125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_610388_610531_610651_610784_610871_613329_613506_614064_614242_614437_614620_616839
881670	contig_4847_pilon	+	4065	2	Intergenic	novelGene_156174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	995	junction_1	0	126	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATAAACAACATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105084	110062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_108658_109570
881671	contig_11422_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_99055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2238	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2200
881672	contig_14970_pilon	+	4251	8	Intergenic	novelGene_44973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4670.90491167157	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	133	987	136145	231550	FALSE	35	GGCTAATGGAAATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITIRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	234814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
881673	contig_12677_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_110789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3320	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3300
881674	contig_12273_pilon	+	10446	7	Intergenic	novelGene_178275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5063	150	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	9275	10009	327175	327909	FALSE	50	GAAAGAGGGAATAAACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISQMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKES	94613	328346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12273_pilon_+_97773_204459_205284_205780_207484_237462_238722_282692_282806_324664_325671_325964
881675	contig_1462_pilon	-	5028	4	Intergenic	novelGene_178278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCAGAACAATAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221312	42851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1462_pilon_-_44981_110146_110734_188493_189157_219663
881676	contig_6270_pilon	-	7570	6	Intergenic	novelGene_99841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1502	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGACACAAGGAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267289	253439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_253510_254108_256253_257993_260540_262777_263334_264452_264541_265123
881677	contig_7909_pilon	+	1282	2	Intergenic	novelGene_155939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGTGGATCCGTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997975	1029961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_999100_1029803
881678	contig_3077_pilon	-	2658	3	Intergenic	novelGene_26771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATGGGAGACAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18068	13863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13985_15135_17052_17447
881679	contig_16098_pilon	+	1574	4	Intergenic	novelGene_46215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	1335	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	351	707	766291	767258	FALSE	15	TCTTTATTGTATCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDCCGSGNWVWGCTILGQSLQAYLLN	764893	768125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766575_767185
881681	contig_5445_pilon	+	925	4	Intergenic	novelGene_135405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1376.78909867206	23	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCCTACTGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51574	53972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_51820_52580_52635_53127_53325_53543
881683	contig_5260_pilon	+	1128	6	Intergenic	novelGene_144339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	50.2051790157151	1874	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	180	623	62159	90708	FALSE	90	AAGAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGNSILLAAVSVLSACQQSYFAFQVGRARLKYKVTPPAVTGSPDFERVFRAQQNCVEFYPVFLVAFWMAGWYFNEVFATFLGLVYIYARHQYFCGYSEAAKNRISGFRLSLGILAALTVLGSLGIANSFLDEYLDLNIAKKLKWHL	61843	91213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_61996_62131_62217_70367_70468_84015_84087_90024_90107_90575
881684	contig_5954_pilon	-	632	4	Intergenic	novelGene_28436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCCGCTACGGCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99023	97556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_97564_97836_97932_98018_98161_98635
881685	contig_13863_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_42054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTGCTCTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353630	355399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_353600_355400
881686	contig_15327_pilon	-	2341	5	Intergenic	novelGene_70627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	52	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	130	540	901528	900904	TRUE	25	AAGTTAGACTCTTGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902157	898562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899519_900058_901033_901126_901281_901400_901536_902035
881687	contig_11422_pilon	+	1898	2	Intergenic	novelGene_98997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTTCAATTATAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_1484_1588
881688	contig_7009_pilon	-	3961	9	Intergenic	novelGene_23642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2389	2790	537017	536616	TRUE	25	GTCCTTAGGGTATCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	539873	444953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_444992_453478_453600_496797_496860_506372_506631_512644_512815_517990_518116_522864_522972_536325_538534_539001
881689	contig_9177_pilon	-	2596	17	Intergenic	novelGene_32606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1940.18627387778	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	361	2325	26442	1991	FALSE	15	TACCTGTAACCTCTGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEVRGRGAGLLALPSPTAHPLSPP	33086	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2036_20248_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
881690	contig_10749_pilon	-	1806	15	Intergenic	novelGene_133440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1227	junction_9	945.926575762989	259	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	324	1412	155250	136250	FALSE	15	TGATTTCATGTGGGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157792	135855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
881692	contig_10404_pilon	+	916	4	Intergenic	novelGene_138664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	745.596852639995	21	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085380	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085455_1098243_1098305_1098722_1098859_1099839
881693	contig_2377_pilon	+	1789	9	Intergenic	novelGene_67889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	471	junction_8	518.901348403528	2221	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	37	798	197521	224342	FALSE	30	AGGATATGCTCAAATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEAVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	197484	225333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
881694	contig_8377_pilon	+	4981	31	Intergenic	novelGene_34911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2215	junction_3	2452.35388600875	3362	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1184	3555	127	3681	68257	197939	FALSE	5	CTTTTGGTGGATTCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGQDSNSGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68049	199239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720_124739_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
881695	contig_9955_pilon	-	1378	7	Intergenic	novelGene_21254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	907.723786304084	2489	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	8	745	27271	13719	FALSE	50	CATACACGTAAAGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVTQAETLPVDRAEEEEPLKATEELAAQKREQRLRKFRELHLKRNEARKLNHQEVVEEDKRLKLPANWEAKKARLEWELREEEKKKECAAKGEDYEKVKLLEISAEDAERWERKKKRKNPDLGFSDYAAAQLRQYHRLTKQIKPDMETYERMRDKHGEEFFPTSNSLIHGTHVPSTEEIDRMVVDLEKQIEKRDKYSRRRPYNDDADIDYINERNAKFNKKAERFYGKYTAEIKQNLERGTAV	27278	13085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_13885_22538_22638_23437_23529_23860_23979_24433_24560_26956_27068_27244
881696	contig_8452_pilon	+	2503	2	Intergenic	novelGene_48034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1115	junction_1	0	2743	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	145	1230	432928	434013	FALSE	30	TTACCCAGCCCCCAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423885	435286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909
881697	contig_16970_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_157604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1331	1630	108396	108097	NA	40	CCCAGCAAGCACAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATSADCSDQDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKEDRRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPESGQPRKTKWD	109726	107668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_107700_109700
881698	contig_11896_pilon	+	7238	11	Intergenic	novelGene_88008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7711	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	5417	6022	138978	141781	TRUE	45	AAGACAAGGAACAGTCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISGLTSSEIAFDCSSSIEDSSDAWGVLLKELLLWSSAVTSEGATSTTDSRQLSLLPPLNSSILEWEKDWDRVSWESSTNFSRALKKSMRSVLKSETSAWQLGWGLGDSGSGDMGRSFSRDVNSSIGSKWTFMSAFSASVSKSSTVKSGNSLAISGACPGWIKALDAWQLSRGNFDSFRQHPDEHPLMSFRFNSSSICPA	131988	181637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_133825_135397_139012_141209_142048_151208_151407_154470_154617_160037_160084_173159_173290_173423_173521_177242_177435_180736_180805_181564
881699	contig_8376_pilon	-	4328	1	Intergenic	novelGene_153774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1500	1823	158749	158426	NA	40	AAAAAAAAGCCCTGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKRKSMMASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRSLQEIRKEIKANTEHAIEEIKKIREEHNDKFKRLQGSIERQQSEIQINNKISELAQ	160248	155920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_155900_160200
881700	contig_8554_pilon	+	4325	1	Intergenic	novelGene_160275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAATGGGACCAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40010	44335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40000_44300
881701	contig_15325_pilon	+	1752	6	Intergenic	novelGene_157179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	794.769249530957	893	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	280	837	94466	96243	TRUE	55	AAATAAAGATGCTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	94007	97462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94203_94381_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
881702	contig_6691_pilon	+	3005	3	Intergenic	novelGene_60176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACCACCAACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416873	455451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_419468_440381_440736_455394
881703	contig_4103_pilon	-	2132	5	Intergenic	novelGene_51872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	505	junction_4	146.255555450041	1745	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	209	580	43906	40734	FALSE	45	AAAAAAAAGACCTTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY	45221	39181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_40878_41783_41930_42374_42449_43898_44023_45129
881704	contig_7963_pilon	-	721	3	Intergenic	novelGene_58415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCCCAGCTCCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63340	57332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_57559_57775_57934_63003
881705	contig_12644_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_44460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATTTGGAAGCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929208	931326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_929200_931300
881706	contig_2703_pilon	+	1076	2	Intergenic	novelGene_101643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCGCTAAGGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	3244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1759_2579
881707	SIRV7	-	2319	6	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147915	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2124_2299_2676_2993_3112_3809_3897_114680_114989_147608
881708	contig_2817_pilon	-	3117	2	Intergenic	novelGene_104338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	21	566	257722	257177	TRUE	15	CCTCATTGGGTTTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNIVKMTILPTAVYKYNTIPIQIPTTFFKEMEILIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQQNIIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIRWGKDSLFNKWCWQNWISVCRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRI	257742	253693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_253874_254805
881709	contig_12938_pilon	+	1918	9	Intergenic	novelGene_99712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	936.31624431866	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	493	1140	78117	85540	FALSE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51950	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_53392_53773_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
881710	contig_6726_pilon	+	2062	13	Intergenic	novelGene_86223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	653	junction_9	553.202412975777	2061	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	101	1438	287836	333034	FALSE	15	TCCGTTTATTGTTGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287735	333658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
881711	contig_13691_pilon	+	3560	3	Intergenic	novelGene_178281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1357	1668	234944	235255	FALSE	50	TACATGGAAACTGAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQWSISNHLKRQTMMASASSQNKESRNFPQEEDFLELLEAEHKRLIYRTLPEIRKKIKQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFTRLQKSIERQQSEFQKTNNKI	165112	237147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13691_pilon_+_165798_165929_166195_234537
881712	contig_10973_pilon	-	434	1	Intergenic	novelGene_150366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	1969	1571	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSNHPSGFRTGYRIKPIHISPQIRLSTLHTQVLKHTRLLPYYYPPFSTVPRSQYQSKFSIHYYRPGLARKGYPKRPGLNTKIRLNLNLKPKRNNQIILPFLPHLSNLRPPTHNLTPPSNLNDNKNTDKQHST	1969	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2000
881713	contig_15937_pilon	+	1089	4	Intergenic	novelGene_143140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCGGAAAGACTGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28048	30544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15937_pilon_+_28376_28600_28679_29193_29250_29916
881714	contig_2940_pilon	-	623	3	Intergenic	novelGene_81940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7379	36	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTATCTGGTATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722199	717656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717943_720710_720954_722105
881715	contig_3787_pilon	-	916	1	Intergenic	novelGene_102397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGCAGAATTCTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477662	476746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_476700_477700
881716	contig_6102_pilon	-	1626	7	Intergenic	novelGene_32140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1233	junction_1	155.03915276113	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	347	481	844937	839973	FALSE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	847093	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979
881717	contig_1472_pilon	-	3761	2	Intergenic	novelGene_86128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1390	1791	519006	518605	FALSE	45	CTCTTATTAAAGAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKNQKKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVFEVPEQGEKTENTEGITEELLTENSPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKIKDKQRILRAAQEKQSHIQRRNNKTKLGLFSRNHAGKKATG	521594	516634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_519084_520282
881718	contig_12414_pilon	+	3444	2	Intergenic	novelGene_59578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_1	0	129	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	41	1099	370898	374054	FALSE	30	GCAGTATATCTTTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSHRGVEEQAVTMDGISFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	370857	376399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_370913_373010
881719	scaffold_12510_pilon	-	441	5	Intergenic	novelGene_151352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_4	694.592506438127	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	60	392	148136	145678	FALSE	25	CATTTTTCTTAAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSWSLWRPAGNRTSKPTNMSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI	149117	145628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_146287_146433_147758_147912_148125_148171_149092
881720	contig_10235_pilon	-	2059	3	Intergenic	novelGene_46382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_2	144	2254	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	115	567	172801	168920	FALSE	45	AAACACATCCTACCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFMAGPAGSRSLGLLGLHSNPQALCMVLLLLLVMKSLVFGKFAVINREAPPPLELPKYLRCYRCLFETKELGCLLGSDTCLAPRGGSCITLHIKNSSSTDIMVSDCRRKEQMSDCSYTRTSPVFGFWMYSRCCFLDFCNDPQSRAIYNP	172915	167427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_169084_171276_171445_172680
881721	contig_2227_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_142337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAACCAATCTCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231583	232759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_231600_232800
881723	contig_7820_pilon	+	5242	6	Intergenic	novelGene_159912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	132.294217560708	80	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3067	3477	49708	50118	FALSE	20	AATGTCATGGATTCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILPIDAEKALDKGQHPFMIKTLNKIRTEGRFLNIIEDIYTKPTANIIGETLKALSWRTGARQGCPLSSLFFNIVLEVLAGAIRLQKEIKGIQIGKEEVRVSLFADDLILYTENPKESTRKLLELMKVSAKYQDSR	12864	51883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7820_pilon_+_12995_24534_24753_25526_25660_27726_27828_47141_49159_49240
881724	contig_10749_pilon	-	2075	14	Intergenic	novelGene_133431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1305.41906939709	801	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	77	688	155250	150548	TRUE	40	AAACTAAAAACTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIREVGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLEVSPQAHADNEGRGNLGRRTDLYLVRLELGEAVRSVQ	155326	135449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150545_150781_151763_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
881725	contig_6102_pilon	+	394	3	Intergenic	novelGene_31982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3008	junction_1	243	159	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGTCCTGCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414657	416204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414788_414877_414956_416018
881726	contig_9706_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_20878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13695	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_4000
881727	contig_3747_pilon	+	2436	7	Intergenic	novelGene_24812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4393.17446601986	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	294	1034	202422	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201227_202371_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
881728	contig_16594_pilon	+	5163	12	Intergenic	novelGene_53796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9602	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3998	4351	149311	272805	TRUE	50	GAAAAATAAATGGTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWWLSLVQLKTLAQAVMGHRASWHWLAAFAGPTWPCSSAESSYCAHLFPIVFLSVGVDEDICSSPWSNDLSMNQSRRLRVHFQLGSFSMDVQIYIPCLAVSKSPFGTLYILPVLAI	115119	293889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115469_115611_118501_121102_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_272661_273515_289514_289526_293797
881729	contig_2367_pilon	-	2117	3	Intergenic	novelGene_65312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1347	junction_1	90.5	3105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	101	307	213194	193580	FALSE	30	CCTAAATTGATATCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPEDSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEAQAKQKQQA	213294	191769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_193619_208552_208634_213107
881730	contig_4604_pilon	+	4796	6	Intergenic	novelGene_19123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2475	2804	116494	184831	TRUE	35	AATGGCAAGAAGGTGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFLNTTKGIYTKPTANIILNGKKLKTFPLRPGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLVREIRQEKEINGVQIGNEEVKLSLFADGIILYIENPKDSMRQLLKLTDSAKWQDTR	57431	217036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_59459_116046_116678_184685_185005_189565_190244_209960_210526_216460
881731	contig_16098_pilon	+	1841	4	Intergenic	novelGene_46217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	494	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	342	686	766291	766965	FALSE	30	AGGAATCTTTATTGTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSQISAFWRREGRTSVGF	764902	768120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766585_766914
881732	contig_10990_pilon	+	3226	21	Intergenic	novelGene_7441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	415.906047082752	7	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	921	3206	722379	752144	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708529	752164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_709348_709396_714557_714612_715525_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749334_749501_750918_751086_751451_751520_751885
881733	contig_15062_pilon	-	1477	3	Intergenic	novelGene_162286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	101	624	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	188	490	42672	14469	FALSE	70	TATCTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVNAFEFYVTLSLSIAFLRSSAPSDWEKMVNVLKGVLIECDPAMKQFLLYLDESNALGKKFIIQDIDDTHVFVIAELVNVLQERVGELMDQNAFSLTQK	43477	13481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_14650_42550_42824_43441
881734	contig_7840_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_68980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAGCCCATGACCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185923	188570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_185900_188600
881735	contig_11422_pilon	-	1554	2	Intergenic	novelGene_99070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	612	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_2068_2131
881736	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	84	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
881737	contig_3018_pilon	+	2119	14	Intergenic	novelGene_78788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	668.161063741813	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	183	2069	438778	523702	FALSE	35	CTAATGGTGACAAAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNRLDSNRPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVEQELANIDPSWIESPKTNGHIENGPFLLEQQLDDEEDDEEECPNPEEYNLDEPTAESDYTYSSSYEQFNGELPNGQHKIPESQLPEFPTSLFPGPLEPVACGSALSEGSPLNEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKTKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGSTSSF	438595	523752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_438807_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373_499857_517300_517402_517509_517618_522876_522947_523589
881738	scaffold_13505_pilon	-	1101	5	Intergenic	novelGene_111453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	234.134977096546	27	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	23	694	535595	531050	FALSE	30	AGACCTTAGCAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTHHWEKMPGAPGLLQALPATVFLLFLLSAAGLDHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535617	530642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707_532999_535516
881739	contig_20199_pilon	-	1109	3	Intergenic	novelGene_82539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	20	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	121	348	43987	41931	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQR	44107	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41348_41870_42078_43906
881740	contig_18081_pilon	+	2524	4	Intergenic	novelGene_23787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	112	474	104555	112338	FALSE	30	GTATCCAGCTAGAATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90794	114388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
881741	contig_19352_pilon	-	1710	6	Intergenic	novelGene_122355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_5	514.988931919901	1417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATGTATACATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120367	102870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_120262
881742	contig_2770_pilon	+	1556	4	Intergenic	novelGene_107433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCACCATCTTTGTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742650	746702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744574_744674_746594
881743	contig_10431_pilon	-	3544	1	Intergenic	novelGene_117390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2642	2941	23815	23516	NA	60	TTTTCAAAAATAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPDKDFRRLMYGVLKGIKEDTSKIMGNTDKTKESTGKMLEEFRKTIQKQNDKINRQLETIQKQQLEMQKLNNKTSEIDNSMESHRSRIATMEDRSAE	26456	22912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_22900_26500
881744	contig_4232_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_63303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCAGCGGTGCGAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468139	466749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466700_468100
881745	contig_10867_pilon	-	942	6	Intergenic	novelGene_159457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2334.20525232894	1135	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	41	370	88670	87548	TRUE	30	CTGCTGTGTAAAAATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKYVGQRKYPFKTQADWVFVLYPVRGNKLK	91457	86790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87632_87722_87840_88193_88256_88603_88683_91429
881746	contig_4364_pilon	+	1941	6	Intergenic	novelGene_549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	20	GCAGTGAACGGCGACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
881747	contig_12079_pilon	-	3509	7	Intergenic	novelGene_67466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1277	junction_6	643.540920739829	90	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	477	956	600738	591597	FALSE	55	TTAAAAATGAAGTAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPVSSYGL	638845	589043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
881748	contig_11328_pilon	+	826	6	Intergenic	novelGene_88410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	36	785	643683	647995	FALSE	35	AATCATCTTTACACAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643647	648036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
881749	SIRV6	+	332	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	3	80	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGTGGCTCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	2620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2300_2600
881750	contig_10627_pilon	-	3607	2	Intergenic	novelGene_59992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	129	608	284773	284294	TRUE	20	AAACTCTCCGTGCAGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFMLYPVSKLETLCALWALNTSRGLEPWAGQDAWPVLLAWCPLPHWSRRKVDNTGRASDLGGCKSRPCWARALSIGQKGRATCCRQLCADRQLCSSLASLAYPQEVSALCPSCSSPGGGMATGVGETVSPSSLELAIFTSAWALVLSSGPSPPKCAYC	284901	281199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_281508_281602
881751	contig_7225_pilon	+	6615	8	Intergenic	novelGene_178282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3178	3483	126260	126565	TRUE	10	CATCCTGCTTTTTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	53910	324795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7225_pilon_+_54493_54963_55452_114016_114251_118590_119489_125284_127082_321434_321834_322093_323393_323877
881752	contig_14925_pilon	-	1675	5	Intergenic	novelGene_55343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	377	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	5	GTGCACTTGCCTTTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
881753	contig_19518_pilon	-	288	2	Intergenic	novelGene_170723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTAGCATTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47675	45351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45588_47623
881754	contig_7963_pilon	+	1080	6	Intergenic	novelGene_58378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1176.26789465666	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	77	841	51450	63007	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51373	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003_63167_63260
881755	contig_6302_pilon	+	1235	1	Intergenic	novelGene_171713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484777	486012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_484800_486000
881756	contig_13901_pilon	-	4468	7	Intergenic	novelGene_146633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	2514	3266	119195	118443	FALSE	60	AAATCTATCATCAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVQAEAKERTSSQEPKYDLEYIPPEFRDHLKNRFDTLNTNDQRRDDCRNNIQDITHEESKSSLKNSKERKRSRSLAIREMQIKTTMGYHPTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTVEYYATRKNNNESVNHLITRMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	153458	117240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_120748_120858_121009_135112_135188_138179_138338_140172_140303_150065_150170_153114
881757	SIRV6	+	1354	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	83	91	33	44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	175	666	1733	10736	TRUE	10	TCTTGAAGTTTGCGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1170	11734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
881758	contig_4486_pilon	+	2474	14	Intergenic	novelGene_38582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1330.64857612222	30	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	309	1463	343083	412464	FALSE	35	AATAGAGTGTGAGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311771	413475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_332818_332991_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
881759	contig_14925_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_55256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	1815	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
881760	contig_11719_pilon	+	844	5	Intergenic	novelGene_154728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3152	junction_4	1618.70324256795	7813	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTGAGTGTCCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12994	20085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14504_16247_16326_19126_19183_19997
881761	contig_4857_pilon	-	7240	2	Intergenic	novelGene_48747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	607	junction_1	0	33	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAAACAGGGACAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208336	1197854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1203431_1206672
881762	contig_5023_pilon	+	3246	16	Intergenic	novelGene_7225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1726.01444052154	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	216	1928	608043	646990	FALSE	10	TGTCTGTAGATGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607311_607946_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
881763	contig_17144_pilon	-	1511	10	Intergenic	novelGene_29422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1838.98595245677	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	503	1222	167982	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183210	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168033_174730_174761_174876_175001_176164_176271_179700_179786_181794_181850_183158
881764	contig_7720_pilon	+	979	4	Intergenic	novelGene_155762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3317.28366120368	16	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTGGCTATCCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699771	707480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_699803_701856_701962_704499_705142_707279
881765	contig_14814_pilon	+	1312	4	Intergenic	novelGene_137713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	547.54867870862	1619	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	787	1116	283904	284233	FALSE	25	TAGGTCACCACGGGTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGHRQVCAQEDWLRGVTSVRWCRPILPCPWSRSWVGYRTVGQAQPGVSWGKGCGDRLGLKGEGLPLPLQNRLPPSPPCSVPALTNVDRSTSCPLASPRSVCLSPAPP	279385	284429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_279522_280661_280720_282889_282992_283413
881766	contig_4232_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_63297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCCGCTGCGGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
881767	contig_9678_pilon	-	2233	6	Intergenic	novelGene_146372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3209	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGCACGATTGAGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267577	259330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_259972_261564_261754_261842_261993_263529_263709_265593_265789_266698
881768	contig_2438_pilon	-	969	3	Intergenic	novelGene_112071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGAAGGCCGTGCTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313505	311991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_312082_312305_312405_312725
881769	contig_854_pilon	+	6530	16	Intergenic	novelGene_36392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	6101	6472	1001296	1001667	FALSE	15	AGCAGTGAGCTCCGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAQKPEAARGNSKSGHTQVSLSGPSFHHHPSCPLCQDSQNPLVRPGFPQSPLHTTQNREQHPLCLLTHWLPEAPGLRSFQEQSSSSLTPTAYLFPMCPSRLSLSLSIQDSLHSPLHPTESCP	974793	1001725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976255_977360_978094_978795_978892_979721_979779_980007_980100_980727_980893_981768_981907_984025_984183_984331_984468_985010_985183_985262_985419_991117_991309_991918_992043_993048_993303_994869_995135_999392
881770	contig_7368_pilon	-	4207	7	Intergenic	novelGene_158809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	2784	3572	336083	261740	TRUE	45	CAACTCCAAGAATGTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNQNFIYRTQTHRKRTAKKSPQPPEEIIKIRVEINEIENRKTIERINKIDKLLARLTKEKQERMQITQRRNEMGDNTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETRYLPKMSQNGVENLRRPITREEIEKVIKKKKKKLPTKENPGPDGFTGEFYQAFREELIPVLLKLFQNIEKEAKFPNSFYEASITLIPKSGKDTTKKENYRPISLMNMDAKILTKILANRIQHHFKKITHNDQVRFTPGMQGWFNIRKST	391408	231164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_-_231656_253705_253823_261712_261841_332233_332239_335400_336236_367716_368451_389511
881771	contig_8447_pilon	+	3844	14	Intergenic	novelGene_69386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	605.493822619826	16	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	52	1152	5825	44901	TRUE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDKGLTEPQIQVICRQMLEALDFLHGKKIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAKNLKTLQKRDSFIGTPYWMAPEVVMCETMKDTPYDYKADIWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKVALDKNPETRPSAAQLLEHPFVSSITSNKALRELVAEAKAEVMEEIEDGRDEGEEEDSGDVTSPLGNHTQDSSEVSQLSLNADKPLKESSSTLPTPSQPQDSVNGPCSQPSGDRSLQTTSPPDVAPGNENGLAVPAPLRKSRPVSMDARIQIAEEKQVTDWGDLGPVANRSQKASQSRPNSSALETLGDEKLANGSLEPPPRWLQAHPRATQTLAASPSPRAWTTAPPSLLTCP	5773	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70912_82807
881772	contig_7057_pilon	+	1159	7	Intergenic	novelGene_123337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_6	606.006508949276	18	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	100	306	938907	941124	TRUE	5	GGCATCTGCCTCCCGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQVRGTL	938655	943720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941288_941405_941523_942970_943030_943206
881773	contig_8375_pilon	+	6165	4	Intergenic	novelGene_141295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1011	150	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	5368	5667	222853	223152	TRUE	20	GTATTTCACGTGAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGHLGPQLPVLLAATVSALNSWGPHAKENEHCLVLYLPHQLWLGSLLSIGFSLADFLITRSFFLVLKPWRNLLSITAASLHSGQAVAVHDVHLEFYH	139543	224063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_141475_208982_209225_219658_223193_223605
881774	contig_7293_pilon	+	2832	3	Intergenic	novelGene_54246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	22188	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	403	729	335695	336451	FALSE	45	TCATGACTTATAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335292	338554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
881775	contig_5461_pilon	-	3498	1	Intergenic	novelGene_156811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2505	2819	210371	210057	NA	25	GATTTCCACAACTGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHLILPSDLVCNCSSSTQDTLKNRALIRLFSILLVLFKVSPTIFRIKCRLDTQWAGPILSLAPFNFPAPIQAYPPSLTPLVTMTLLPFYKQMEFHKTMVKRNI	212875	209377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_209400_212900
881776	contig_18162_pilon	+	3008	3	Intergenic	novelGene_122308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	627	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1783	2688	9632	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNIGSPFLLRPPGSAELSAIDKGCLSLWWHEMRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7849	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_9694_9894_10810_16364
881777	contig_7345_pilon	-	3843	3	Intergenic	novelGene_159198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	2804	3460	323389	322733	FALSE	30	AACTTCATTCTCAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDCPLEENALELADRELKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDNVIEGLRSRFETAEDRVSGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGKKTENTERIIEELLTENFPNILKDEKLAIQEAQRNPYRRDPKRKSPRQRCQI	336907	322349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_324208_324586_325267_335602
881778	contig_12869_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_75354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3386	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	7	441	96950	97384	NA	30	GAGGATGAAGACGCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	96943	98617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_96900_98600
881779	contig_4891_pilon	-	1612	5	Intergenic	novelGene_124594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	117	junction_4	451.173192909331	6367	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	118	444	964296	940000	TRUE	10	GCTCTGTGTGATGGCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964413	937403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
881780	contig_2438_pilon	+	1325	5	Intergenic	novelGene_112034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2388.18372408825	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	77	538	310588	312412	FALSE	10	TCTGGCTGTGTCTGGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	305089	313529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312413_312742
881781	contig_15105_pilon	-	1674	7	Intergenic	novelGene_151024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	851	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	37	759	839916	829338	TRUE	25	CCTATAACGTCTATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839952	828355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828873_828939_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
881782	contig_6059_pilon	-	2452	7	Intergenic	novelGene_44818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2707.51487633135	30	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1435	1998	571639	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573281	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_572958_573165
881783	contig_5226_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_140493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATAACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3356	5641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_+_3400_5600
881784	contig_8853_pilon	+	3829	3	Intergenic	novelGene_159162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2946	3287	83026	83367	FALSE	20	TGATTGACACTGGCTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPVYLIMLMRNLYIDQEAVIQTEQGDTVWFKVRKGVHQSCILSPYLFSLYSEQIIQEVGLYEEERGIRIGGRLINNLCYADDTTLLAEIEEDLKHLTIEDQRLQPSVWITP	60476	83909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_+_61878_80747_82257_82990
881786	contig_16125_pilon	-	3258	17	Intergenic	novelGene_155222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1095.24077689566	6	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	56	1447	236934	148939	TRUE	45	AGCTTACATTAAAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNASNASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDI	236989	110374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_110914_117149_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179581_234309_234318_235796
881787	contig_12938_pilon	+	1741	9	Intergenic	novelGene_99728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	937.574130402498	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	313	960	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51979	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_54598_54828_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
881788	contig_16103_pilon	-	2007	7	Intergenic	novelGene_118871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	1134	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	83	670	743628	723671	FALSE	45	GATACTGAAAATTGACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILKIN	743710	722333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723682_733559_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
881790	contig_13760_pilon	-	1239	3	Intergenic	novelGene_61349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	221	junction_2	86.5	443	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTGTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355722	352847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_353555_354387_354491_355293
881791	contig_6059_pilon	-	1123	7	Intergenic	novelGene_44817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	3166.90818815801	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	106	669	571639	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	572960	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866
881792	contig_8377_pilon	+	4860	28	Intergenic	novelGene_34945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_18	2275.67550561558	1211	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1131	3396	162	3557	68257	197939	FALSE	10	TTGGTGGATTCTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68095	199242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
881793	contig_5686_pilon	-	3755	4	Intergenic	novelGene_45327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCTACTCTGACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231136	108305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_108314_220883_222914_224040_225102_230480
881794	contig_8397_pilon	+	5198	6	Intergenic	novelGene_177733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6244	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGTCTATTGCCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122293	312387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8397_pilon_+_124881_157817_158205_252884_253136_280125_280646_303520_303873_311286
881795	contig_21412_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_142853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAAGGCATCCAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25753	27919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_25800_27900
881796	contig_8878_pilon	-	1170	7	Intergenic	novelGene_147859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	413.407688204594	3563	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	124	831	231167	228170	FALSE	35	AAGCAAGTGAACTCATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRPPAASRSPPFLCRTITMAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYYIQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKPFLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL	231720	227830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_228215_228313_228485_228668_228857_230277_230404_230484_230570_231074_231198_231627
881797	contig_16703_pilon	+	2847	7	Intergenic	novelGene_72775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1521.16407362549	25	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	22	888	27154	40668	TRUE	25	AGTCTCTGAACACCGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	27132	44877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600_41673_43922
881798	scaffold_12124_pilon	+	3188	7	Intergenic	novelGene_22324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2102.04389953101	12	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1271	2050	1508626	1509405	TRUE	40	TATATATATATGTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483570	1510591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1497093_1497122_1506629_1506687_1508010_1510289_1510336
881799	contig_4103_pilon	+	3357	2	Intergenic	novelGene_51948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	352	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	174	1301	104499	105711	FALSE	20	GGGGTCTTACAAGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSPSLLLLLLLPPQLAASEATPEPCELDDEDYRCACNFTDPQPDWSSGIQCMVAVEVEIRAGGHSLDKYLKHADPDSQQYADMIKALRLRRLTVGAARVPARLLFAVLRALGYSRLKELTLEDLEVTGTYPPQPLEATGPALSTLRLRNVSWATGGAWLAELQKWLKPNLKVLSIAQTHPLALSCEQFRTFPTLTTLDLSDNPGLGERGLAAALCPHKFPALQDLGLRNTGMETPNGVCAVLAAAAVQPHRLDLSQNALRATANPGGPRCVWPSTLSSLNLSFAGLEQVPNGLPAKLSVLDLSCNRLIRAPRPDELPQMENLILDGNPFRDLGDPKPQQDTMNSSVPLACVHSLLAIGISGTLALLQGVRGFV	104325	107767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_104502_104586
881800	contig_14666_pilon	+	7368	5	Intergenic	novelGene_39551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	5925	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	302	1657	477340	484940	TRUE	15	GGCGGAGCGGAAGGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477038	492453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_490532_492333
881801	contig_1244_pilon	+	3783	3	Intergenic	novelGene_38083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGAGCCCTGGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418014	1569745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1418690_1566501_1566786_1566921
881802	contig_8397_pilon	-	7215	7	Intergenic	novelGene_177732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1738	138	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177493	2915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8397_pilon_-_3118_3236_4170_17299_17798_85340_85663_121890_124881_157821_158969_176370
881803	contig_7914_pilon	-	2920	2	Intergenic	novelGene_165020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATTTTCAAAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106924	103601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_105792_106194
881804	contig_10627_pilon	+	6329	18	Intergenic	novelGene_59991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4245	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3408	3785	284547	284924	TRUE	30	AACAAACCGCTGGTCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERALAQQGRDLQPPRSEARPVLSTFLLLQWGNGHQARSTGQASCPAQGSSPRLVFRAQRAHKVSSLETGYSIKVIPTCKTDKIALTKPGLPPQQGQFHISGPCLAGVGAQGQAGQVPPSLNKAA	280824	346576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_280870_281184_285707_286818_286997_287403_287534_287910_288042_288697_288850_289343_289535_290170_290265_290473_290544_292749_292822_296012_296146_307135_307260_313280_313393_319338_319439_327019_327061_337840_337968_346238_346293_346523
881805	contig_11448_pilon	+	4459	2	Intergenic	novelGene_66419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	4120	4458	558666	559124	FALSE	65	GAACAAAGAAAAATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPGDFPVEEKALELPDREFKSLILKNNSQLEIIQKQQSEIQKINNKISEMDGVKEGMRSRFKMVEDRISGIENIYLDTTLFEENSEK	554546	559125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_558817_558936
881806	contig_854_pilon	+	9952	37	Intergenic	novelGene_36590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3440.5395419187	206	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1605	4818	71	4888	1680888	1714980	TRUE	30	ACCCAGAACCTCATGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1679336	1739488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679348_1680828_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715151_1715198_1719963_1737993_1738042_1739406
881807	contig_3601_pilon	-	3713	2	Intergenic	novelGene_132861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAATTAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133726	129873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_130037_130176
881809	contig_16594_pilon	+	4091	10	Intergenic	novelGene_53801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	674	1027	115812	116270	TRUE	10	GTGGCGTGGAGCCGGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHTYL	115138	306539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_116155_116259_117388_124973_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_272661_273507_273555_273672_306354
881810	contig_6048_pilon	+	1429	6	Intergenic	novelGene_73091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.165441809651	2541	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	234	707	132371	135654	FALSE	5	CTTTGCCTTTCTTGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	130258	136376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_130294_131047_131246_132370_132550_133132_133242_134181_134320_135606
881811	contig_6361_pilon	-	2910	5	Intergenic	novelGene_23981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	25	TTGCATTATTTACTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	408702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
881812	contig_5341_pilon	-	3424	3	Intergenic	novelGene_168001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1410	junction_1	237.5	136	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	302	979	339968	338480	FALSE	35	AACTATGGTTTAATACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340269	336034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881
881813	contig_4091_pilon	-	3987	2	Intergenic	novelGene_173032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2960	3265	14700	14395	FALSE	15	TCTGGCTGGTACGATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSVVRVCFMYFEALSLGAWMFIMVMSS	39059	13672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_15316_36715
881814	contig_15543_pilon	+	789	7	Intergenic	novelGene_164365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1987.37773208819	1299	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	6	578	223940	236035	TRUE	40	GTAATTTGAGTAAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMRSEKEAAGGAGSTGAAVATRGSSGREKLSASAPRGGPAMEIQFRWESPRREPETQSASTSGCGGSGSGAGKPREEKRTLLSKVVIRRLPPSLTKEQLEEQLHPLPAHDYFEFCTANLSLYPHLYSRAYINFRNPDDILLFRDRFDGYIFIDSKGLEYPAVVEFAPFQKISKKKLKKKDAKTGSIEDDPD	223934	236337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_224189_225536_225644_227241_227349_230287_230387_230506_230514_236031_236088_236178
881815	contig_10042_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_79186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGGCATTCTCAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862164	860714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_860700_862200
881816	contig_17344_pilon	-	7882	20	Intergenic	novelGene_169587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	42	junction_12	54.142369008787	3100	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1082	3249	116	3364	101818	59988	TRUE	25	TTTTTAACACTTCAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQADPLNEDVLLAMEDMGLDKERTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRVGAPSMPRAMAFQTPVNIQAEQASTTVNISVPQVQLINPENQIVEADGTVNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGVSPQAQFLQVAPNMNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLLNGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEAVQRYLANRSKRHTLAMTNPTAEIPPDLQRQLGQQPFRSRVWPPHLVPDQHRSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQKMYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQATCENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMNSAMIQSHGAASPSQFPGLPSRSAIFQQQPENCSPPPNVALTCLGMQQPTQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSAGRGISISPSASQIQMQHRTNLMATFSYGHRPLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSRGSPSNYSPSTGVGFPPTQALKVPPLDQFPTFPPSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPAEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQDYQELFRHMNQGDAGSLASSLGGQSMTEHQALPYQNADSYHHHHTSPQHLLQIRAQECISQVSSPTATHGYAHQPALMHSESMEEDCSCEGAKDGFLDSKSSNTVTKGCRDSPLLLSTGGPGDPESLLGTVNHAQELGIHSYRHQPTAAFSRNKVPSRESVIGNCMDRSSPGQAMELPDHNGLGYSARSSVSEHHRPRTLQRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGSQQFQDEDNEECRESLQGHEHPDLTDGSQHLNSSCYPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAGV	101933	54704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_59210_59974_60146_61056_61190_62082_62247_71701_72589_73225_73566_74598_74709_75176_75263_75535_75662_76397_76549_80322_80467_82686_82758_86125_86282_86545_86700_88138_88249_88340_88419_88840_88982_89234_89346_89909_90029_101808
881817	contig_7963_pilon	+	753	4	Intergenic	novelGene_58412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	869.906636114219	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2	421	56777	63007	FALSE	15	AGAGCTGGGTGACTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILSIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	56775	63339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_56909_57430_57564_57782_57934_63003
881818	contig_14513_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_70294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	3206	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	184	600	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
881819	contig_10437_pilon	-	4125	3	Intergenic	novelGene_38355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5893	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3630	4115	558727	557964	FALSE	10	CCTCCTCGGGCGACATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSWFTLFKCLATKAPKDIRVTILPQFVTPSLKTWTITRDIDLTSSSFFMSSFRSMPWKAVSWLRCSPSATRRSVSSAFLPAGPDAPIGFASLAPLACSRRYREIISSDCRYNSSSSSSSSSAEGGVDGSDPLVPAPLPTSPSSPGRARTDGRFPSGSGS	563284	557953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_558276_558553_558800_559727
881820	contig_4232_pilon	-	4830	3	Intergenic	novelGene_63444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGAAAAAATCTCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546397	540487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544060_544618_545312_545832
881821	contig_21007_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_161539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	25	447	589	1011	NA	35	TCTAAAAACTACGTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	564	1855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1900
881822	contig_4156_pilon	+	6404	7	Intergenic	novelGene_88104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	190	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1426	1914	320538	321026	TRUE	45	AAGAACTATCAATATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPNDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRITQELEQKADKNEEKIEKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKLIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMNSVIEGLRSRFEMMEDRIRETVKKNTSIQLCMRKNQKKE	319112	590382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_321300_421068_422625_472130_472698_479872_480605_480783_481384_580725_580788_589682
881823	contig_5698_pilon	-	2591	1	Intergenic	novelGene_55049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGTACTTTTGAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34763	32172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_32200_34800
881824	contig_17_pilon	+	4929	9	Intergenic	novelGene_173969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1571	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3115	3522	410086	427675	TRUE	45	AAAAAAAGCCCTGGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNQIVIEGKFLNIIKGIHTKPTVNIILNGERLKTLSLRTGTRLGCPLSLLLFNIVLEVLARAIRQEKEKKGIKIGNEEVKLSLFADDMILYMENPKDSMRKLLIDLAVWQDTR	134223	448397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_134266_207110_207700_229532_230234_300496_300740_318265_318685_381080_382036_409920_410165_427346_427999_447313
881825	contig_2069_pilon	+	3912	12	Intergenic	novelGene_23178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	256.604432367689	47	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	114	926	70041	89492	TRUE	30	GTGCCATGGAAGGGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSLGRQLKVDTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69927	216975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407_91972_136666_136858_212640_212922_216940
881826	scaffold_12124_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_22414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	198	491	1509112	1509405	NA	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508914	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508900_1510600
881827	contig_15105_pilon	-	1945	7	Intergenic	novelGene_151019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1096.30024273564	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	37	531	839916	833571	TRUE	30	TATAACGTCTATTTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRVPGVPGWCKWLTARLLTKRLEV	839952	828353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_833436_833639_836187_836548_839849
881828	contig_12677_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_110867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3900
881829	contig_14441_pilon	+	1729	6	Intergenic	novelGene_100504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.627971484648	17	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	889	1689	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	107310	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_107931_108257_108362_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
881830	contig_11422_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_98953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAGTGGGGATTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_300
881831	contig_10437_pilon	+	1821	2	Intergenic	novelGene_38360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3455	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	558618	559848	FALSE	25	TTTTGTGTGAATATTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHVFSDGVTNWGRIVTLISFGAFVAKHLKSVNQESCIEPLAESITDVLVRTKRDWLVKQRGWDGFVEFFHVEDLESGIRNVLLAFAGVAGVGAGLAYLIK	558617	561366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_558804_559731
881832	contig_6443_pilon	-	11337	17	Intergenic	novelGene_175145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33706	226	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	10518	10817	81692	81393	FALSE	35	TGAAGAGATATATTTTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHSSKRMGRRREASKKSKEAGKKKKATPAANKWHSESQLVPTGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKFPALCNPSGRSKGGAQSQALE	670680	80872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_-_82354_135323_137234_191288_191764_228249_229314_236331_236346_246667_246792_264733_264984_337867_338977_344401_347118_370998_371435_450871_451012_482920_483755_551097_551301_578184_578304_639240_639248_658569_658813_670468
881833	contig_16103_pilon	+	301	3	Intergenic	novelGene_118813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	25191	junction_2	2817.5	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTGTATTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604254	605581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_604359_605006_605118_605495
881834	contig_5684_pilon	-	1015	3	Intergenic	novelGene_81017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1156	28	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTGTGAACTCGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361515	351254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_359036_361315
881835	contig_15666_pilon	-	3486	6	Intergenic	novelGene_70122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	5320	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	737	1906	110619	107816	FALSE	10	GACTTTTCTCCATGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	111355	106235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
881836	contig_11422_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_98988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14351	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
881837	contig_1248_pilon	+	4025	2	Intergenic	novelGene_178285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3306	3749	99077	99520	FALSE	10	GAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRPSVGEEGWRVGKRISQIAGALQPLRKKQRWRTEPGTRVKGGGGGERQVRNQKKQKKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQPALPGQETVAAGSRGGRAGAKRGGGGKAHTANYQLFCLPLDTP	30979	99796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1248_pilon_+_33053_97844
881838	contig_13780_pilon	-	5367	11	Intergenic	novelGene_149107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1030.32276496251	4420	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	379	1671	826505	821461	FALSE	30	CTGTTCTCCAAAACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	827328	817764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827158
881839	contig_20951_pilon	-	1798	6	Intergenic	novelGene_43063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	2023	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	80	1207	29171	27149	FALSE	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30013	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
881841	contig_12677_pilon	-	1555	2	Intergenic	novelGene_110809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2684_2832
881842	contig_5686_pilon	-	3827	6	Intergenic	novelGene_45464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1484	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTAGCAGCTGAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259265	221507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222912_224039_224201_241595_241799_250016_250101_253203_253296_257382
881843	contig_14467_pilon	+	1141	2	Intergenic	novelGene_138239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1794	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2	559	258821	319153	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	258819	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_258827_318601
881844	contig_8317_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_19248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11138.4392267572	57247	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	69	1457	14294	16506	FALSE	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	13257	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
881845	contig_19816_pilon	-	1425	5	Intergenic	novelGene_156478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_4	209.653881433185	35	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	348	752	124800	124293	TRUE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	125849	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124556_124658_124935_125636
881846	contig_10793_pilon	+	1543	16	Intergenic	novelGene_83384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3339.03101047128	79	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	199	1125	146975	163940	TRUE	35	CATAAGGTAATGTCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_140211_140279_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
881848	contig_10793_pilon	+	1683	14	Intergenic	novelGene_83389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3211.38401839604	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	131	772	146975	162632	TRUE	25	GCAATTCATTATTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMDEV	130871	166893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162620_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166404
881849	contig_19974_pilon	-	2446	2	Intergenic	novelGene_130464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	649	1095	137651	137205	FALSE	40	ATGACAGGGCCCCAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHINRQTMMASASHQNKESRNLLEEENFLELLEVEYKRLIYRTLQKIRQNTEQAKEHTDKAIEELKKIKEEHNGKFNRMQESIERQQTEIQKINNKISELDNSLESHRGRIEAMEVRIGEIEDKALDTNLPGKNQIKES	138392	135853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_137713_137805
881850	contig_19816_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_156488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	153.731677189279	3133	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	14	1099	126795	123459	FALSE	10	GAATCCTGTGTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126808	123030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
881851	contig_16098_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_46237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTACACCCCCACACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768125	767219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_767200_768100
881852	contig_15123_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_110945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	117	527	690382	689972	NA	75	GAACGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTKQTARKSTGGKAPGKQLATKAARKGAPSTGGVKKPHCYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFHRLVREIAQDFKTDLRFQRAAIGASQEASEAYLVGLFEDTNLCALHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	690498	689460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_689500_690500
881853	contig_776_pilon	-	4890	1	Intergenic	novelGene_139923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATTTTCATTACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823290	818400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_818400_823300
881854	contig_3956_pilon	+	3343	15	Intergenic	novelGene_15120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1082.03108333639	8510	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	279	2819	1282731	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281757_1282601_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
881855	contig_4131_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_127865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	109	312	240156	239953	TRUE	50	ATATATATATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	240264	192570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_192753_239943
881856	contig_12970_pilon	-	3716	4	Intergenic	novelGene_50537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	2407	2940	450929	366171	FALSE	50	TAACTATAATAAATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSIKTNNLRVIGVPEQGEITENTERIVEDLLAENFPDMVKDDKISIQDAHQTRRKVDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIYKALKEKSCQPTITYPGKLSLKYDGEIRAFPDKQKFREFAKIKPKLQEILKGVLRLENQ	616489	365394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_366181_450405_451782_493235_493346_615045
881857	contig_15327_pilon	-	1893	5	Intergenic	novelGene_70472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	194.406790004876	3083	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	94	405	390867	381607	TRUE	5	ACGCCGCGCTGGTGTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKVSVT	390960	368808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_369064_371610_372840_381602_381720_382830_382974_390811
881858	contig_8317_pilon	+	1149	3	Intergenic	novelGene_19310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	505	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	20	406	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15923	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
881859	contig_2438_pilon	+	3410	4	Intergenic	novelGene_112002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2614.88087682785	67	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1964	2302	311851	312412	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	208501	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_208725_209227_210240_311122_312083_312305
881860	contig_3627_pilon	+	5133	15	Intergenic	novelGene_78486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_14	90.1273758496885	2779	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	74	2437	490450	510052	FALSE	60	AACAATCCTAAAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLSDATLESEKTMGKLEISRKQNEKKAKKEKPKSNKTEEPAEEKEETISPKAKKIKKKAEPSEVEIDSPKSKKVKKMEEPPQDGTTSLKTKNVKKKKEPVENQVVSPKIKKAVKNEEPSEEETGAPEPKKMKKEMGMNGEIGEKKPKLKNGLPHSGPASNCNEAISEESNSEVEQEIPVEEKEGAFSNFPISEVTVKLLKARGVNFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLQGELQDKKRGRPPQVLVLAPTRELANQVSKDFRDITKKLAVACFYGGTPYGGQFDNMRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVYNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTHRAAVIGDVIRVYSGYHGRTIVFCETKKEAQELSQNASIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGDFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVVQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQYKEEYQLAQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIVKASSKDAIRYLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATAVDQRSLINLDVGFVTMILKCSIEMSNISYAWKELKEQLGEDIDSKIKGMVFLKGKLGVCFDVPTAAVTEIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREGYRGSRGPREGNRGFRGQREGSRGGFRGRREGSRGGFRGQRSGGGNRNNRFQNKGQKRSFNKAFGQ	490376	512748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_490537_492642_493093_494368_494445_495121_495301_496705_496824_498238_498425_499634_499781_500502_500653_501121_501284_502582_502703_504261_504336_505813_505974_506852_506988_509130_509176_509776
881861	contig_15453_pilon	+	2346	4	Intergenic	novelGene_112475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_1	221.816741177637	3773	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	205	666	6981	17260	FALSE	15	TGGTGATTTTACTACTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLQSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6776	18940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103
881862	contig_8330_pilon	+	2867	5	Intergenic	novelGene_71880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.2692280606717	1891	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	265	648	1060926	1065600	TRUE	25	GACAATTGGTATTCCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKCRSDPVLHIDLRRWADLMLVAPLDANTLGKVASGICDNLLTCVIRAWDRSKPLLFCPAMNTTMWEHPITAQQVGQLKAFGYVEIPCVAKKLVCGDQGLGAMAEVETIVDKVKEIFCQRNGFQKK	1059785	1072139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1060050_1060925_1061055_1064905_1065075_1065514_1066471_1070790
881863	contig_7839_pilon	+	4963	15	Intergenic	novelGene_45733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	683.755476044184	2315	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	105	2273	952473	956984	TRUE	5	CCCTCCGCTCCGCGCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	951352	961346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_951457_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877_959176_960147_960299_960477_960671_961191
881864	contig_10940_pilon	+	1849	4	Intergenic	novelGene_49178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1459	junction_3	200.293673278902	3	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGAAATTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172546	176218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_172629_173150_173218_174001_174123_174639
881865	contig_11898_pilon	-	4609	1	Intergenic	novelGene_144282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14985	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTCCAATAGGCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214498	209889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_209900_214500
881866	contig_8864_pilon	+	4680	3	Intergenic	novelGene_135965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACAACAGCCAAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55845	61113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_59128_59287_60560_60987
881867	contig_2770_pilon	-	1266	4	Intergenic	novelGene_107469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3001	junction_1	974.202693944586	37	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	33	374	746670	743833	FALSE	30	CTTAAAGTCGTGTTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	746702	742940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600
881868	contig_17427_pilon	-	4485	8	Intergenic	novelGene_30303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1046.67069846271	6	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	295	891	179819	178046	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAATCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	182790	171839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_172370_174981_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181441_182689
881869	contig_13780_pilon	-	5432	13	Intergenic	novelGene_149108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1042.90399845815	4523	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	547	1839	826505	821461	TRUE	35	GGCACCAAGCAAGTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	827939	817816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_820180_820230_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827507_827825_827918
881870	contig_10292_pilon	-	4451	4	Intergenic	novelGene_178287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAGACAAAAGGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144337	104395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10292_pilon_-_106843_107489_108366_108648_109066_143626
881871	contig_14142_pilon	-	1497	6	Intergenic	novelGene_120633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	453.049401279816	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	387	851	622927	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625816	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625451
881872	contig_16121_pilon	+	5952	1	Intergenic	novelGene_6869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAATAGGAGAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35427	41379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_35400_41400
881873	contig_9931_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_134818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	839.5	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	174	872	364058	365350	FALSE	30	GTCATAAAGACTATTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	297144	365645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_364048_364753_365346
881874	contig_18081_pilon	-	2718	4	Intergenic	novelGene_23772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1936	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	15	320	114368	114063	TRUE	0	CCCCGGCCCCGCCCCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKTTMVQFHVEFHNLPTTNQLSLNQSLLLDPRSKLFLVLQMTSPVKTPAMISFIISQVSSGDIITNTSIQALMQTDNVLSNRAEAMSSHTDQLLRTSLATLEMIS	114382	90594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_90852_104500_104680_108416_108517_112200
881875	contig_9633_pilon	-	5896	7	Intergenic	novelGene_139634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	941.855688993218	2766	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	380	796	1141485	1138462	FALSE	10	GATGTGTGCTCTGTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1151802	1133361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737_1147844_1150154_1150205_1151721
881876	contig_1263_pilon	-	3606	8	Intergenic	novelGene_170382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	855.92868766466	5719	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	317	1633	65303	55502	TRUE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76860	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53515_55364_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
881877	contig_5686_pilon	-	2997	1	Intergenic	novelGene_45448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTTGTTTTTTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223214	220217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_220200_223200
881878	contig_6633_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_143166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	2620	3033	76407	76820	NA	50	CCCCAAAAGAAAATCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIRRQQLEIQKINNRISEMDGVIEGLRSRSEMVEDTISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIRVPKQEEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRI	73787	76822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_+_73800_76800
881879	contig_13780_pilon	-	4024	13	Intergenic	novelGene_149112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1029.10592263382	4875	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	466	1758	826505	821461	TRUE	25	CCCAGCTTTCCTTACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	827981	819143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_820180_820230_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827630_827825_827918
881880	contig_9668_pilon	+	5987	2	Intergenic	novelGene_58213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4960	5265	593409	593714	FALSE	10	GGGTTATTTGCATCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSNNSSSFFVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSSPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHLCLVPVLKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	535529	594436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_540167_593086
881881	contig_12247_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_177083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	418	1074	235049	234393	NA	55	AAGATGAAGAATTGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHKVCSPSFQTYVTYFGVKTSSLQIKIIHCLQIKTLAFSSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	235466	233182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12247_pilon_-_233200_235500
881882	contig_13740_pilon	+	5954	16	Intergenic	novelGene_34645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	545.832436640485	5738	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	4248	4799	167703	176906	FALSE	15	ATGTGGTTAGACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNKTTLQKMGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	155100	178061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157300_157451_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161269_161573_161719_161916_162031_165237_166216_167674_167727_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
881883	contig_11493_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_143726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGAATAGCGGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350647	354033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_350600_354000
881884	contig_5039_pilon	-	3008	4	Intergenic	novelGene_64985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1392.07670606025	238	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2169	838	3006	1686270	1678646	FALSE	20	CTCCCAGATGTTAGCGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETSTPIEGNQAGDSAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPDLKEASRKSRCVSVQTDPTDEIPSKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKPKSHHDGNIDTESDSFLKFDSEPSVMALEHPVRALGLSETSDSPAVVLESPGVAMEVSEPQNLETLKPVTKTAELPAAGPSVISEQSERSVAVMLEPSMTKILDSFATAPVPATTLVLKSSEPVVAMSVEHQMKSVLKPLESTSPEPSKIMLVEPPVAKMLESTETLVDSSEIPAEVHPEPSTSTTVDFPESSAPEVLRLPEQPVEVPLGSAASSMTRPQELQELPKTTALELPESSVASVMELPGPPATSMPEMQGPPVTPVLELPGPSAIPVPELPGPPSTPSVTPVPQLLQELPGLPASSVGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTM	1687107	1678643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1679546_1679599_1680625_1682882_1683050_1686193
881885	contig_5057_pilon	-	1792	7	Intergenic	novelGene_151517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_6	409.760770314691	2949	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	561	1253	523430	507037	FALSE	30	TAAATATTTACTCTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKRSRSDRFYSTRCCGCCHVRTGTIILGTWYMVVNLLMAILLTVEVTHPNSMPAVNIQYDVIGNYYSSERMVDNACVLFAVSVLMFIISSMLVYGAISYQVGWLIPFFCYRLFDFVLSCLVAISSLTYLPRIKEYLDQLPDFPYKDDLLALDSSCLLFIVLVFFALFIIFKAYLINCVWNCYKYINNRNLPEIAVYPAFEAPPQYVLPTYEMAVKMPEKEPPPPYIPA	523990	506497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_507112_508156_508256_508803_508900_511016_511140_511243_511321_514151_514273_523328
881886	contig_17427_pilon	-	3378	5	Intergenic	novelGene_30306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1522	junction_3	527.243480282118	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	122	718	179819	178046	FALSE	40	CTTGAGAAATATTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	179940	175385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657
881887	contig_16776_pilon	-	2687	6	Intergenic	novelGene_130492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	197	junction_5	278.368532704399	2401	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	445	972	43087	35073	FALSE	20	TCCACCCGGAGATGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	58010	33357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43228_57706
881888	contig_1337_pilon	-	6863	1	Intergenic	novelGene_84218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	141	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTAGATTTTGAGATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59871	53008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_53000_59900
881889	contig_19006_pilon	+	4794	19	Intergenic	novelGene_145577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	124	junction_1	396.091494761276	2670	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	27	2339	20540	91868	FALSE	5	GGTCATGTGTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGVEMRKECSRQRHQEMSTYKRATLDEEDLVDSLSEGDVYPNGLQVNFCSPRNGQRCWAARTQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGVQYQTRAPPVCLSEACISVTSSILSSMDPTVDPCQDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENSTASVSEAERKAQVYYHACMNETRIEELKAKPLMELIEKLGGWNITGPWDKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKQQTECMVEQYSNYSVNGEPVNGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEQTLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSVSNSKEFSEHFHCPPGSPMNPHHKCEVW	20513	94323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_20591_22246_22334_30891_31034_41862_42076_55695_55818_56975_57123_58689_58756_59858_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80534_83349_83454_86755_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691
881890	contig_16103_pilon	-	1971	8	Intergenic	novelGene_118852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3577.63804765099	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	240	563	735970	733309	TRUE	15	ACCCTCTGACCTGCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIGSQAGKDN	743597	722282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733339_733572_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
881891	contig_2636_pilon	-	914	5	Intergenic	novelGene_52065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	168.058025693509	4234	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	123	638	85555	59826	FALSE	30	GAAGTCATGGATCGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85677	59549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_81113_81216_85551
881893	contig_5671_pilon	+	1635	7	Intergenic	novelGene_79439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1908.71629345193	201	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	79	501	370430	531238	TRUE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368846	534265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205_532050_533942
881894	contig_10990_pilon	+	5928	19	Intergenic	novelGene_7462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	344.406436074991	146	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	1754	4204	722379	752144	FALSE	20	CTTGACGTCGTAAGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708563	753868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_714557_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
881895	contig_18162_pilon	-	2945	3	Intergenic	novelGene_122275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16364
881896	contig_8570_pilon	+	4617	1	Intergenic	novelGene_120176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCCAGCAAAATAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434144	438761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_434100_438800
881897	contig_10752_pilon	+	4940	3	Intergenic	novelGene_153041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3903	4415	232208	232720	FALSE	65	AGAAAGAAAATACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEELSPQNRVDLNDVDGVKLSRPLFPDVARLKMKRNSCKHLLIIGTWNVRSMNLGKLEIIKNETECINIDIVGISELKWTGIGHFESDGHMVYYAGNDNLRRNGIAFIVKKNISRSILKYNAISDRMISIHVQGIPVNTMVIQIYAPTTKAKDEETEDFYQLLWSEID	198551	233245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_199018_222300_225458_231928
881898	contig_15720_pilon	-	2295	7	Intergenic	novelGene_41971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.594371544654	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	440	613	310695	309844	TRUE	50	ACATAAGGTCTCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTKRWWETERCYAEYDKAYLQGLCLTSLRRYLELGGQSLIRTEPPKVQVTRHTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPARDKESYQQAPGEEDLHKSQSPSRAVSAQHLC	314533	306713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_308009_308297_308533_309691_309909_310220_310254_310619_310728_310843_311120_314402
881899	contig_12079_pilon	-	2208	9	Intergenic	novelGene_67433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1060.91940522124	69	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	471	1160	600738	580772	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLFQWEYSGAEDQWKLPCFIIPIVS	638839	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580847_585900_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
881900	contig_6302_pilon	-	2457	4	Intergenic	novelGene_171679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108547	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_18_16475_16823_66365_66567_106645
881901	contig_6302_pilon	+	5029	5	Intergenic	novelGene_171680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAATAAATTGCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6915	42582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_7544_8875_9005_25326_25648_37806_38122_38946
881902	contig_6059_pilon	-	2399	14	Intergenic	novelGene_44843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	4042.57354465016	152	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	246	1949	584299	569146	TRUE	25	CGTGCACATGATGTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFIGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584544	567795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576654_580594_580711_580921_581116_584181
881903	contig_7416_pilon	+	4845	6	Intergenic	novelGene_134317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10301	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2462	3061	605612	606211	TRUE	40	TTTTTTTAAAAATGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGFQNKTPDDFPVEEKALELPEREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQIEIQKINNKISEMDNVVDGLRSRFEMGEDRISRIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTEDTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQ	74701	608328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_76043_234492_234510_287378_287465_425026_425253_604820_607882_608214
881904	contig_8317_pilon	+	628	1	Intergenic	novelGene_20256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16444	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
881905	contig_15325_pilon	+	1976	6	Intergenic	novelGene_157177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	588.866232687866	54	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	481	1038	94466	96243	TRUE	30	TATAAAATCATGCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93239	97485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
881906	contig_7009_pilon	+	7508	4	Intergenic	novelGene_23663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	114.106188360764	778	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGATAGAGAAAAATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515571	573413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_522768_522866_522972_536325_536518_573398
881907	contig_18162_pilon	-	3815	2	Intergenic	novelGene_122276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4093	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
881908	contig_5217_pilon	-	1679	3	Intergenic	novelGene_135771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5823	junction_1	1533	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATCTTGTGTTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560066	557641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674
881909	contig_16121_pilon	+	5952	1	Intergenic	novelGene_6870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4377	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAATAGGAGAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35427	41379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_35400_41400
881910	contig_5341_pilon	-	1611	4	Intergenic	novelGene_168008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	647	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	259	936	339968	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340880	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_339978_340631
881911	contig_10752_pilon	+	4909	4	Intergenic	novelGene_153044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3863	4375	232208	232720	TRUE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEELSPQNRVDLNDVDGVKLSRPLFPDVARLKMKRNSCKHLLIIGTWNVRSMNLGKLEIIKNETECINIDIVGISELKWTGIGHFESDGHMVYYAGNDNLRRNGIAFIVKKNISRSILKYNAISDRMISIHVQGIPVNTMVIQIYAPTTKAKDEETEDFYQLLWSEID	198591	329814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_199018_222300_225458_231928_233070_329629
881912	contig_11422_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_99036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAACCATACCTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	1538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_1500
881913	contig_18473_pilon	+	1978	7	Intergenic	novelGene_169643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	41	junction_1	237.266844619208	32	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	127	564	59536	77005	TRUE	25	GGTAAGAGCGACGGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSDAVLKRLEQKGAEADQIIEYLKQQVALLKEKAILQTTLREEKKLRVENAKLKKEIEELKQELIQAEILNGVKQIPIPSGTQLQANSTLSGNEIQSAPPTTISSGGKEQINREGEEKKVKEKTEKRGEKKEKKTAAVSSRKC	43516	89053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_43618_59510_59645_66184_66299_68948_69114_76955_77172_80412_80582_87974
881914	contig_9705_pilon	+	4885	3	Intergenic	novelGene_41699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84953	188448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_85779_175988_176449_184848
881915	contig_17427_pilon	-	2282	6	Intergenic	novelGene_30338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_5	801.027340357369	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	591	1187	179819	178046	FALSE	15	TGCTTCGTTGTTTACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	181837	176950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270
881916	contig_2100_pilon	-	2635	8	Intergenic	novelGene_50705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	661.414038717236	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	1273	2289	1176787	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1178059	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765
881917	scaffold_12124_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_22415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	146	439	1509112	1509405	NA	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508966	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1509000_1510600
881918	contig_6599_pilon	-	617	1	Intergenic	novelGene_175987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGGCCGGGGGTGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	262098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
881919	contig_3975_pilon	+	3522	6	Intergenic	novelGene_54928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2137.13181624344	5376	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	705	1211	2344841	2354386	FALSE	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEKELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2327150	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2327257_2344242_2344937_2347066_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277
881920	contig_13888_pilon	+	7093	7	Intergenic	novelGene_151791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	514.248858908689	3180	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	104	904	337589	361964	TRUE	35	ATAAGCTGACAGCTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVVWANSYKVGCAVQFCPKVSGFETLSAGAHFICNYGPAGNYPTWPYKKGATCSACHKNDMCLDKLCANQERDKVKRYYSLQYPEWPIYLRNRYTSLFLIVSPLIHILTVIITILIKHKYPNLVLLE	337485	368234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_355083_355197_358600_358687_361679_361707_361809_364159_364239
881921	contig_5253_pilon	+	3516	1	Intergenic	novelGene_61607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4441	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCATGAACGTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395437	398953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_395400_399000
881922	contig_5023_pilon	+	3439	17	Intergenic	novelGene_7173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1988.9982236276	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	249	2132	607279	646990	FALSE	10	TGTATTTTTGGTGTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	538668	648297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538780_580791_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
881923	contig_8275_pilon	+	4246	5	Intergenic	novelGene_178289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9779	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2431	2883	7830	8282	TRUE	35	GGAGAGGGGAAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNLSRYSYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYALNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNIPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQLGLIDIYRTPHPTAAKYTFFSNAHWKMCMEHFPE	69	13551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8275_pilon_+_779_6108_8387_8644_9692_9886_10084_13536
881926	contig_3817_pilon	+	1436	4	Intergenic	novelGene_78330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1083	junction_3	231.004088467908	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	136	528	199102	204532	FALSE	20	AGAATTGGTGTGTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLGSPVFTPIKADISGNITKIKAVYDTNPTKFRTLQNILEVEKEMYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	197948	205440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_198009_199026_199161_201700_201852_204349
881927	contig_14704_pilon	-	761	7	Intergenic	novelGene_82701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	287.7572761895	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	240	698	99017	77600	FALSE	40	CATAAATTTATTTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGIQAGL	100913	77536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845
881928	contig_11316_pilon	-	2825	2	Intergenic	novelGene_122643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2551	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGGGTATCGTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	137600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138589_138689
881929	contig_16125_pilon	+	8067	16	Intergenic	novelGene_155224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	7162	7485	236051	236374	FALSE	35	CCAGCCTACAAGCACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAASIFLSSFFPSAFLERLGDPLLAAGFRTTPGKGELDVLPPWSLFSGSSLAGFKGPGLDLAPRGAGGPFCGDTFLVRLSSSWEASVLRDGFWPKAGLGKRGLGS	110394	236956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_111120_112618_117615_118857_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138993_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_153471_153486_155566_155618_179440_179596_235794
881930	contig_4093_pilon	-	5318	6	Intergenic	novelGene_27604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	4823	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	485	1222	69245	41737	FALSE	30	TTAGAGAAGATTTTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72908	37640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
881931	scaffold_13505_pilon	+	8327	7	Intergenic	novelGene_111597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4452	4913	659510	660022	TRUE	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	652843	663815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_656131_656809_659613_659663_660929_661255_661942_661993
881932	contig_1090_pilon	+	4080	6	Intergenic	novelGene_131114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3390	3725	355234	405188	TRUE	30	GAATTGGGTGATTTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGKDVTLRTKVHLTQAMVFSSTSYICKSWTMNKEDRRRRIDAFELWCWRRILNILWTARKTIKSDLEEVELECSLEARMVRLCVMYFGHVIRREEFLEKDIMLGKAESR	339386	412974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_341599_353725_354535_354865_355235_372356_372475_404971_405511_412941
881933	contig_10793_pilon	+	1264	14	Intergenic	novelGene_83367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3304.11678841401	37	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	551	928	160548	163940	TRUE	5	CGAGTTTTTTTTGTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151473_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
881934	contig_7587_pilon	+	4773	6	Intergenic	novelGene_163708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTTGTTTTGCTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99222	246961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_99483_99608_100050_204752_205343_209107_210135_210210_211675_245970
881935	contig_6958_pilon	-	4082	3	Intergenic	novelGene_69951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2219	2584	173150	172785	TRUE	25	AGTTTTCCACAACGGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSRDWSPLITCPKYVRRSLAILAPKEHSSCISSKTDLFILLAVHGIFNIFCQHHDSNASILSQSSLFIVQLSHAYEAAENTMAQVRHTLVLKVTSLLLNTLKRSFAADLPSVIHRLMS	175368	168112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_169192_169677_169989_172676
881936	contig_14244_pilon	+	7526	1	Intergenic	novelGene_169445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACTCCCAGCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553	8079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_+_600_8100
881937	contig_2733_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_128537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAAAGTGAGAATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475192	476956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_475200_477000
881938	contig_15434_pilon	+	2016	8	Intergenic	novelGene_56699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	391.563532520586	1170	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	36	1121	26904	33302	FALSE	20	TGATTACGTTTTATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSVAHLARANPFNAPHLQLVHDGLSDPRSSPAGPPGLPRRSRNLAAAAVEEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26629	34197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_27061_28957_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
881939	contig_12638_pilon	+	1273	6	Intergenic	novelGene_33224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	115.430325304921	1265	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	264	1001	610544	616849	FALSE	15	TGAATGTGTTGTTTGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRASFENNCEIGCFAKLTNAYCLVAIGGSENFYSVFEGELADTIPVIHASIAGCRIIGRMCVGNRHGLLVPSNTTDQELQHIRNSLPDSVQIRRVEERLSALGNVTTCNDYVALVHPDLDRETEEILADVLKVEVFRQTVADQVLVGSYSVFSNQGGLVHPKTSVEDQDELSSLLQVPLVAGTVNRGSEVIAAGMVVNDWCAFCGLDTTSTELSVVESVFKLNEAQPSAIATSMRDSLVDSLT	610280	617121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_610651_610784_610871_613329_613506_614064_614242_614437_614620_616839
881940	contig_16103_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_118817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGTTCCCATGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723377	721069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_721100_723400
881941	contig_1608_pilon	-	5942	5	Intergenic	novelGene_178290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4587	4955	4825	4457	FALSE	50	GAAGTCTATTCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWCKCKMVQPFWKTIWHFLRKLEIEILYDTAMSLLGIYPREIRAVTRIDICTSMFIAALFTTAKRWKQPKCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATINNNDESSKHLRTWMNLEGIMLSEISQS	41719	3469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1608_pilon_-_6489_13489_14815_18586_18622_39828_40912_41239
881942	contig_11375_pilon	+	1342	2	Intergenic	novelGene_152653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	233	junction_1	0	1205	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	89	559	178418	179000	FALSE	5	CCCAGCCCGCGCTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGPAQSLCGHNYPRQAALPHSAFCSAQRDMCHSRSSLPTMTVLRARTPPPSTSPGPRRGSGPEIFTFDPLPEPAVAPVTRFSASRGHRKRSRRVLYPRVVRRQLPPEEPNHAKRLLFLLLAIIFCQILMAEEGVPVTLTLEDAPSDASPAPIPAPPVFEPFNLTSESSDYALDLSTFLQQHPAAF	178329	179783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_178628_178739
881943	SIRV6	+	1251	5	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	3998	2	-1896	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7103	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
881944	contig_5961_pilon	+	6464	3	Intergenic	novelGene_144159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2647	3006	224510	224869	TRUE	45	TCAACGATAAAGATCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQADNTQKRAGVAILISEKIDIKLKSTTKDKEGHCIMIKGLIHQEDITIINIYAPNRAPKYINSNSIEKRDSSTIIVGHFNTQLLVKDRTSGKKLNKDTEELNATISQLDLLDIY	221642	237441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_223762_223982_226756_235869
881945	contig_20199_pilon	-	782	3	Intergenic	novelGene_82596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	5	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	49	384	43987	41055	FALSE	30	TGAAGTCAAAGAGTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44035	40656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
881946	scaffold_12124_pilon	+	2038	10	Intergenic	novelGene_22270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	3415.53405617465	21	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	195	1070	1490385	1509405	TRUE	45	TATAAACAATAACACTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1621467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497082_1508781_1510351_1621444
881947	contig_14815_pilon	-	1488	7	Intergenic	novelGene_127203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	686	junction_1	102.115403125853	1757	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	52	840	22749	17106	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRPLQDSLRIAQVSEAAMAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23286	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702_22765_23250
881948	contig_233_pilon	-	2406	14	Intergenic	novelGene_14499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1425.34498678774	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	284	1876	105485	78579	FALSE	20	ACTGTGGATGTATACCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127041	78048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105543_108791_108814_109914_109976_126898
881949	contig_8914_pilon	-	3131	4	Intergenic	novelGene_112853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2120	junction_3	1997.6537904919	38	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	10	576	268944	265586	FALSE	15	TATTTCCTCTGTCCACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRMAVGKNKRLTKGGKKGAKKKVVDPFSKKDWYDVKAPAMFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKL	268953	263030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_265799_267319_267508_268075_268180_268882
881950	contig_10009_pilon	-	3837	1	Intergenic	novelGene_82714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGCTGCTGCAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44923	41086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41100_44900
881951	contig_6975_pilon	-	2956	3	Intergenic	novelGene_74249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAGCATTTTACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199612	137666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_139855_140988_141279_199134
881952	contig_21025_pilon	+	3691	2	Intergenic	novelGene_76485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	999	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	3133	3651	23270	23788	FALSE	15	GGCTTAGTTTTTTAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQTGKQFHTRTELHSSSGRSKNGARSQVFEQKEVEVVRGKEEIERSGKKQHQQPTNGTQGVGQCGQVESKQLVLPGLETAASGSRGGQVGMKKGGGWESVYHCLLVVLSPAGSSMKLLSCTPYLLVSDRSPRWQLCAALADRGPLHVCFLALCSLSVSYSIWCLAEFFIS	19487	23828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_+_21930_22579
881953	contig_4232_pilon	-	5425	2	Intergenic	novelGene_63443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGAAAAAATCTCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546325	540487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544131_544543
881954	contig_10867_pilon	-	746	6	Intergenic	novelGene_159456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2368.94525052818	47	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	334	720	88226	86811	FALSE	30	TGTAAAAATGTTAGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	91456	86784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88259_88408_88683_91429
881955	contig_14970_pilon	+	4833	11	Intergenic	novelGene_44974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	6051.11858750099	3786	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	133	1569	136145	231550	FALSE	35	GGCTAATGGAAATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	234814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
881956	contig_12079_pilon	-	1909	10	Intergenic	novelGene_67439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	473	1306	600738	580327	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKEILQRSFRMNHTGGHSGINFCVLLNS	638841	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580407_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
881957	contig_5125_pilon	+	4254	8	Intergenic	novelGene_43421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	74	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	467	1525	35729	58893	FALSE	10	TTGGGTTCTCAGCTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25957	61622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26116_26311_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
881958	contig_8330_pilon	+	2930	7	Intergenic	novelGene_71878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	72.3795935022818	373	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	46	711	1047979	1065600	TRUE	25	GACAATTGGTATTCCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARIGGLPGLEATGCHMEPRASCQAAASLVEGKFHVLVGVTGSVAALKLPLLVSGLLDIPGLEVAVVTTERAKHFYSPQDVPVTLYSDADEWEMWKCRSDPVLHIDLRRWADLMLVAPLDANTLGKVASGICDNLLTCVIRAWDRSKPLLFCPAMNTTMWEHPITAQQVGQLKAFGYVEIPCVAKKLVCGDQGLGAMAEVETIVDKVKEIFCQRNGFQKK	1043232	1072139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1043255_1047955_1048165_1059953_1060050_1060925_1061055_1064905_1065075_1065514_1066471_1070790
881959	contig_15327_pilon	-	2621	6	Intergenic	novelGene_70612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2761.42564629215	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	TRUE	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899149_899306_900773_900884_901033_901126_901281_901400_901536_902035
881960	contig_10749_pilon	-	1813	14	Intergenic	novelGene_133437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1227	junction_8	1011.72422979771	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	328	1323	155250	136250	FALSE	30	CCTTTATTCCAATTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157796	135759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
881961	contig_7593_pilon	-	3486	10	Intergenic	novelGene_127267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1240.46351352833	4504	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	120	1304	43266	4357	TRUE	25	GTAAATTTGAATTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR	43385	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_2639_2933_4528_8407_8541_12823_12970_15244_15395_17527_17665_25124_25198_27978_28195_33772_33884_43218
881962	contig_10904_pilon	-	8979	5	Intergenic	novelGene_22681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	16.393596310755	791	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	8225	8662	610704	542146	FALSE	0	TGGCTTGTGTCCTGGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCTLRSPSLTGTCKKPSLLAHPGPSVTSGESITLQCHSDHLFDTFHPFKEGFIGPPQHLCWQNNTGPFQANFTISPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGEEPLTLSPQCSDGQFRALSPGELQAEMGGKGL	620337	541828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_542247_610367_612262_613149_613435_613627_618902_619229
881963	contig_19006_pilon	+	4465	18	Intergenic	novelGene_145582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	391.331645471466	37	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	211	2181	41925	91868	TRUE	5	GGTCATGTGTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVNFCSPRNGQRCWAARTQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGVQYQTRAPPVCLSEACISVTSSILSSMDPTVDPCQDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENSTASVSEAERKAQVYYHACMNETRIEELKAKPLMELIEKLGGWNITGPWDKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKQQTECMVEQYSNYSVNGEPVNGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEQTLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSVSNSKEFSEHFHCPPGSPMNPHHKCEVW	30885	94323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_31034_41862_42076_55695_55818_56975_57123_58689_58756_59858_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80534_83349_83454_86755_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691_93878_94048
881964	contig_11422_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_99071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	759	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2400
881965	contig_8687_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_169665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTTTTGCTTTTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258985	256664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_256700_259000
881966	contig_5671_pilon	+	1593	7	Intergenic	novelGene_79422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1908.71629345193	8	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	99	521	370430	531238	TRUE	40	GTAAATCTACCTAAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368826	534243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205_532014_533946
881967	contig_1443_pilon	+	1063	2	Intergenic	novelGene_28165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	28997	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	293	757	344128	344592	FALSE	25	TGAGTGAGAGTGTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343456	344898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
881968	SIRV3	+	1559	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4748	1	2689	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	190	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTTAACGTCTCGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6692	8938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
881969	contig_8317_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_19249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11138.4392267572	57254	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	69	1457	14294	16506	FALSE	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	13257	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
881970	contig_20332_pilon	+	1852	4	Intergenic	novelGene_156187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_3	280.015475762799	2885	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	249	590	642243	644522	FALSE	55	AGAACAAATGAAAACAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLLEVGIVKEEQLKVHGF	641994	645784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932_644035_644477
881971	SIRV6	-	1260	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGCCGCGCCTTGCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	7099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7806_7923_10723_10825_11035_11109_11205
881972	contig_10437_pilon	+	1935	2	Intergenic	novelGene_38486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTGGATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213560	1215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214328_1214553
881973	contig_10009_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_82713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6295	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGCTGCTGCAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43863	41086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41100_43900
881974	contig_19032_pilon	+	3755	2	Intergenic	novelGene_172511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	2066	2797	2776	3507	FALSE	45	AGTAAGAAACTTTTAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGGSEWQARIQKKQKKKKGEKKKKQHLQPTNGTQRAARPVARNPSSRQPRVQSLRPREAEEQTNKGPEFSPARQPRPGSSRTPERSPTAPQEGAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQPQHPTNGPLRAACPGAQNPSSRQPWVKSLGPRETEEQTNKGPGI	584	4465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_2013_2138
881975	contig_5096_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_111982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAACAGCCTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81091	83599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_+_81100_83600
881977	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
881978	SIRV7	+	1658	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36145	28	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCGCAATACTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	2663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1000_2700
881979	contig_9392_pilon	+	6234	5	Intergenic	novelGene_178291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1885	2229	30830	31174	TRUE	0	GTTTCTCCCCCTGTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKDAFNISMLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGWSVRYMSMRSSWLIVAFSSSVSFLSFFLDVLSFTESGVLKSPTIVELSFSIFNAVRGYFMYFGALSLSV	28945	302601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9392_pilon_+_32072_108442_108817_144540_145971_164505_164534_301325
881980	contig_4232_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_63299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4474	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCGTACGCTGGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466700_468100
881981	contig_4232_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_63286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTTATCTGCGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466563	468065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466600_468100
881982	contig_9177_pilon	-	2360	17	Intergenic	novelGene_32555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1988.4280498361	29	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	116	2080	26442	1991	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEVRGRGAGLLALPSPTAHPLSPP	28449	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2036_20248_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
881983	contig_11422_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_99048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1979	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2000
881984	contig_9049_pilon	+	5831	8	Intergenic	novelGene_83137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1538.0454599051	1888	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	327	914	90226	112652	FALSE	15	TTGCTTCTCTGGAAGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88318	117569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_89285_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569
881985	contig_4232_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_63308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	304	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGGAGCGGTGCTGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468067	466780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466800_468100
881986	contig_11309_pilon	-	2687	8	Intergenic	novelGene_149861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2302	junction_7	1690.83161521791	11821	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	68	961	65730	56293	FALSE	25	CTTCACGAATTTCACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65797	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
881987	contig_4364_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532806	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
881988	contig_16098_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_45858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	913	1212	221490	221191	NA	45	CGATAACTCACAGAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDSSDWDHNRGFWTEPEKDVEENSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGSGQPHKTKWD	222402	220738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_220700_222400
881989	contig_16703_pilon	-	5816	9	Intergenic	novelGene_72768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACATTAACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44883	19337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_20117_25955_26078_27098_27264_28511_28685_29678_29788_32821_33013_38541_38757_40599_43760_43981
881990	contig_6047_pilon	+	2562	18	Intergenic	novelGene_24207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	522.057792873879	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	809	2430	84	2513	105237	123830	FALSE	20	AATACCCAGTGTCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEVGFLVEFFFNIPPECKFVLFN	105153	123879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123078_123758
881991	contig_5696_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_117561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	461	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGATACAACTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697203	695298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_695300_697200
881993	contig_299_pilon	+	4351	13	Intergenic	novelGene_129421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	261.101339947198	104	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	153	2546	841615	882832	FALSE	25	TCCAGCAAGCAGCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQASFSFIFYQSFYKSCKISKSVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKGIARPWKLVYYRAKKMFDIHNYKGRYSEGDAEKVKLYHSLHGNDWKKIGEMVARSSLSVALKYSQISNQVNHGTWSKTETQKLVKAVEQVILKKMSLQELKEVDSRLQEDPEGRLSIVREKLYKGISWVEVEAKVETRNWMQCKSKWTEVLTKRMTNGQRVFQGVNALQAKINLIERLYKINVEDSNEIDWEDLASAIGDVPPSFVQSKFYKLKATCVPFWQKKTFPEIIDYLYETSLPLLKEKLEKKIEKGTEIQTPAAPKQVFLFRDIFYSEDDSDGEDINEKS	830681	884637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830734_832793_832887_841607_842679_860693_860915_861020_861078_863075_863262_864117_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619_874686_881780_881867_882653
881994	contig_2834_pilon	+	1787	7	Intergenic	novelGene_27979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2449.13037287388	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	82	657	274763	290707	TRUE	40	AAAATCCTTTACAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238727	292115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291538_291815
881995	contig_16496_pilon	-	1243	3	Intergenic	novelGene_5165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_412_703_1354_3413
881996	contig_3721_pilon	+	4238	9	Intergenic	novelGene_123806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1254	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCATTTGGTATTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81799	399710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_83173_83439_83516_84285_85503_116863_117338_128412_128949_281836_281858_331803_332185_378036_378136_399649
881997	contig_20199_pilon	-	864	3	Intergenic	novelGene_82540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	71	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	121	456	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44107	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
881998	contig_10437_pilon	+	1945	2	Intergenic	novelGene_38361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3455	junction_1	0	22	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCCAAGTCCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558652	561525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_558804_559731
881999	contig_18843_pilon	+	2303	12	Intergenic	novelGene_165603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	625.724505693035	3993	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	290	1252	28527	45456	TRUE	25	CAAATCACAGTGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPESQVIGENTKQP	28237	47918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44351_45422_45498_46028_46259_47138
882000	contig_15327_pilon	-	2597	3	Intergenic	novelGene_70602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3046	9	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTGTTAATGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901282	898549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899680_899721_901033_901126
882001	contig_8712_pilon	+	2218	4	Intergenic	novelGene_58761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	569.059457936222	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	260	739	314974	321793	FALSE	20	TGGTGTGAAGAAGGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	277764	323272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_278018_314967_315188_318064_318222_321684
882002	contig_14513_pilon	-	1194	2	Intergenic	novelGene_70279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3051	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
882003	contig_9091_pilon	-	8238	3	Intergenic	novelGene_32418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2228	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	849	1160	20463	20152	TRUE	25	GTTACTTATTCTGAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQWLFSSFIDCRFVCFILLFCFIWLCLSSGLRIVCCLLVCGQDTFHLLLQWAGSVTEVWYSRAGPAEGELLGWVVHGVYQG	21311	5819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_6153_7076_7195_13524
882004	contig_14244_pilon	-	6850	1	Intergenic	novelGene_169443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8907	124	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGCCAGGCACCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7403	553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_-_600_7400
882005	contig_5153_pilon	+	5313	2	Intergenic	novelGene_74382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	707	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTTCTTCCTCGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971135	976676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_972541_972768
882006	contig_233_pilon	-	3945	14	Intergenic	novelGene_14522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_11	1328.77991819786	39	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	2066	3502	104176	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105555_107300_107472_108401_109976_126898
882007	contig_12000_pilon	-	4344	4	Intergenic	novelGene_43181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	618	929	534125	533379	TRUE	70	AAAAAAAAAAATGGATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIVPTYEQTTKNTQPACLDITKTKKDRISETEDKYFDTNLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVTGVPEQGDKIENTERITEELLTKKLPQYHER	534742	509634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_512234_516753_516896_532704_533612_534046
882008	contig_12081_pilon	+	1422	4	Intergenic	novelGene_166977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	534.275833878594	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	562	1044	16849	18277	FALSE	10	TTTTTATTGTCTTTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15770	18655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16992_17069_17245_18112
882009	contig_10235_pilon	+	2692	3	Intergenic	novelGene_46314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1686	junction_1	750.5	3274	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2389	2691	92983	93285	FALSE	35	ACAGCTTGGAATCAGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSAWWSQRKRTEPRGTRRPQNSGVLFLTSFPWATSSRYHVTEPMAGLPWLALKKQGREVVAPSWVRISGGWITQRAQDPGGQKEDPEKYLHSYTKVKGR	89891	93286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833
882010	contig_9181_pilon	+	3407	2	Intergenic	novelGene_177102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAATGAACAAAAGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656680	702248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_+_658550_700710
882011	contig_16578_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_148689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1238	1621	325451	325834	NA	50	TATAGATAGATAGATAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPVFSPPGPSCRASSDMQGPLWTGTVLWTRGLENRWCLRAWIRASLPGTAAALHQDTRLRAWSFVGLNFNPQYTLVQYASCTISHDGPVLPTLRGLLQVYSHSSTSVTKCESQIEWTNETHPALL	324213	326764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_324200_326800
882012	SIRV6	+	1239	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	4	285	4	-150	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	254	745	1733	10736	TRUE	40	ACGAAGAAGCTAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1091	11540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882013	contig_10973_pilon	-	1193	1	Intergenic	novelGene_150382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	4	516	2730	2218	NA	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2733	1540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2700
882014	contig_14815_pilon	-	2223	6	Intergenic	novelGene_127200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	686	junction_1	104.33676245696	306	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	30	785	22716	17106	FALSE	75	AAAAAGAAAAAAACAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	22745	15667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702
882015	contig_10958_pilon	+	1983	4	Intergenic	novelGene_5445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888234	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889019_895279_895855_900457
882016	SIRV6	+	336	2	ISM	SIRV6A	SIRV609	485	4	424	113	258	57	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTCGGCCTGGATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561	2007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845
882017	contig_1719_pilon	-	847	5	Intergenic	novelGene_87359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	581.427123550321	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	101	529	788084	754873	FALSE	20	GCACTTTACCTTTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAAATRTSKARPSGEFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803649	754554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_788033_788100_803564
882018	contig_15327_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_70600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTGTACACATTTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898297	900587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_898300_900600
882019	contig_11316_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_122662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138628	139376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138600_139400
882020	contig_4857_pilon	-	6648	2	Intergenic	novelGene_48749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	607	junction_1	0	25660	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCATTGGTCAATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208336	1198446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1203431_1206672
882021	contig_8317_pilon	+	992	2	Intergenic	novelGene_19319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGAATGCTTTTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16152	17243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
882022	contig_1443_pilon	+	4585	6	Intergenic	novelGene_28145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	333	398	5921	5986	TRUE	25	CCATGAGCATGGACTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNIKPKTIKFIEEKIGPKLQALIHGINRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIQHLCSSKASTKRVKREPTDWEKNFGQYKSDKGLISIIYKRIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVTMRHMRKCS	5588	186916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_6626_6726_7683_92868_93882_99790_100305_126624_126993_186219
882023	contig_4088_pilon	-	4540	5	Intergenic	novelGene_178059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2086	2523	111019	110286	TRUE	15	TCCATCATCTTTGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVCRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGREAVARPNVAPQPCRKEQRWLLESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAACTGARNPGSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGI	113287	72901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_74512_109382_109506_110001_110318_110613_112286_112468
882024	contig_8651_pilon	+	466	4	Intergenic	novelGene_168185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3160.6362580271	75229	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	56	427	185122	189318	FALSE	15	GCTTTGTGTTTGAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185066	189357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_187011_189168
882025	contig_19816_pilon	-	1458	8	Intergenic	novelGene_156484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	150.317622902646	15912	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	44	1135	126795	123351	FALSE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRFLVTRNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKAGV	126838	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
882026	contig_7057_pilon	+	517	2	Intergenic	novelGene_123356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	83	517	943281	943715	FALSE	5	TTCGTGGCATCTGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLAAADYVFLNGNPRPAPSVPRCGVTMDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	941402	943715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_941411_943206
882027	contig_7376_pilon	-	549	3	Intergenic	novelGene_108077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1792	junction_1	73.5	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAAGTCTCTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79862	72022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_72239_75404_75550_79674
882028	SIRV6	+	1249	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	265	14	-130	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	25	CTTGTTTAGAAAGTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882029	contig_12938_pilon	+	1810	4	Intergenic	novelGene_99747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1772	junction_3	278.40178798915	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80660	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_81459_83391_83470_84550_84635_85468
882030	contig_10749_pilon	+	1507	12	Intergenic	novelGene_133449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGAAATGCAAACATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135873	155322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_136289_142196_142365_143587_143644_145189_145263_146512_146554_147654_147751_149597_149681_150658_150788_151767_151899_153557_153676_154232_154268_155160
882031	contig_15325_pilon	+	1668	7	Intergenic	novelGene_157175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	751.363076163729	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	171	728	94466	96243	TRUE	30	TAAAATCATGCTGTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93229	97487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94436_94567_95094_95233_95674_95785_96034_96245_96548
882032	contig_17144_pilon	-	1469	7	Intergenic	novelGene_29357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1487.49861811327	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	90	1175	170784	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170873	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744
882033	contig_14970_pilon	+	4483	9	Intergenic	novelGene_44981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	54	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	131	1219	136145	231550	FALSE	35	GGCTAATGGAAATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136014	234814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
882034	contig_5317_pilon	+	1010	4	Intergenic	novelGene_76520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	311.598388242872	4	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTGTTTTTGGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33688	43842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36690_36828_43197
882035	contig_10021_pilon	+	4212	1	Intergenic	novelGene_168668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3175	3531	1145650	1146006	NA	40	CGTCACATGAATAGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWRNKSSTSYRPQTSKALLKKKNKAGGLTLPDFRNYYTAMVVKTAWYWYNNRYTDQWNRIENPDINSSTCEQLIFDKGPKSLIGGKDSLFNKRCWHNWISISKKTETRPIHHTMHKN	1142475	1146687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_+_1142500_1146700
882036	contig_10009_pilon	-	2128	4	Intergenic	novelGene_82719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCAGGTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43843	41538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41752_41823_43036_43088_43427_43478
882037	contig_1264_pilon	+	3552	12	Intergenic	novelGene_161316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2175	2591	142014	143614	TRUE	15	CGCAGTTTAAGCGTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTHSWPTISAHSSSEVITASLGLHKYNCLIFLFGHYFLHELDQFVVFFTFHADIHNLEDVVVGTQLQIAHIDLSVITKKILSKLSYFFWPGCTPHQGLSIRPDLVNNFTDLGFKAHIKHSVCLIQYKVSTSAKICLS	138591	152860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_140269_140471_140929_141973_142036_142291_142403_143248_143422_143503_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148364_152537
882038	contig_3077_pilon	+	1453	8	Intergenic	novelGene_26687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3985.53131172428	72	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	394	960	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9679	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9694_11310_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
882040	contig_12046_pilon	+	1732	10	Intergenic	novelGene_83501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_2	252.194271579043	2097	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1626	106	1731	955093	1023738	FALSE	45	TAAGGAATAAAAGTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASGRFESAKSIEERKEQTRIARAEVLRQAKDNFEKEERCKELKRLRGEDTWMLPDVNERIEQFSQEHSVKKKKKKDKHSKKVKKEKKKKSKKQKYEKNESADNSSSSEDEWVEAVPSQTPSKEKAWKVKDEKSRKEEDSEVIQRDEWMTVDFMSVKTVSLSSLKAEKETIRKIEQEKAQAVEQSRLLERELNPYWKDGGTGLPPEDCNVSSVTKVSVVEDGGLSWLTKSYQRMKEQAEKQNRNFEDIVAERYGSMEIFQLKLKEAEKTASKKEDCRQERWRKPTYSDKAQSSQERRKSDLVNYNKNSRDRYSVTDSTNNVNKDKFSGDEKDNNRFRSLETHRRQYNPRQNQEFSSVGNLRPKFVRPSDDEELSFHSKGRNFEPSSSSSASIAQGSLRCGFRKPTENSEECLSSWSRSDRREGDKKHSNQKASLETSSSVDYGHIPGDVREKSQDESLRDDPPKKEHLPDTKSSLSGSSPKDESIHILSVDEKNKLGAKIIKAEMMGNMELAEQLKAQLEKANKLEETATQIPSKKSGVE	954987	1023739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_955186_962293_962405_963932_964053_983545_983660_984635_984756_990041_990136_997169_997286_1002216_1002885_1021841_1021939_1023645
882041	contig_2703_pilon	-	1016	2	Intergenic	novelGene_101639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3184	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1766_2586
882042	contig_7915_pilon	-	3766	8	Intergenic	novelGene_42981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_6	316.235187601808	4979	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	417	956	151603	142263	FALSE	25	GCTTCACACATTACCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC	167364	139452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_148028_151427_151606_154716_154771_155911_155971_167063
882043	SIRV6	+	1316	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	212	0	-77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	25	TGTTGTTTGCGACAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882044	contig_13021_pilon	+	5260	33	Intergenic	novelGene_8113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3022.70675923811	5607	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	3111	4961	174676	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	147801	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_148147_148412_148487_148779_148925_150111_150269_151769_151844_151958_152130_152920_153049_154323_154417_155194_155333_157299_157478_158091_158224_158406_158517_160044_160225_160916_161043_163205_163323_164972_165070_166456_166569_169578_169690_171696_171824_173610_173970_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
882046	contig_9833_pilon	+	3487	1	Intergenic	novelGene_68513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3292	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	728	1045	214494	214811	NA	15	ACCCGTTCGGGTGTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIVLGFIFRSLIHFEVVFVYGVRYESCFIFFADGYPVLPAPFVKKTVFSPFDGLWALVEDQVTIGGWIYIWVLNSVPWVNVSVVVPVPGCFDYCSCIVGSQVR	213766	217253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_213800_217300
882047	contig_15062_pilon	+	668	4	Intergenic	novelGene_162287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2442	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTACAAAGCGCGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14181	43473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_14652_26987_27080_42549_42624_43441
882048	contig_18473_pilon	+	1321	7	Intergenic	novelGene_169638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	214.673718828262	2507	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	297	734	59536	77005	TRUE	15	TATGACTGGTTCATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSDAVLKRLEQKGAEADQIIEYLKQQVALLKEKAILQTTLREEKKLRVENAKLKKEIEELKQELIQAEILNGVKQIPIPSGTQLQANSTLSGNEIQSAPPTTISSGGKEQINREGEEKKVKEKTEKRGEKKEKKTAAVSSRKC	41878	88226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_42150_59510_59645_66184_66299_68948_69114_76955_77172_80412_80582_87974
882049	contig_10855_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_124370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1301	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCCTGTGTCCCCGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697535	698303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_697500_698300
882050	contig_6477_pilon	-	538	7	Intergenic	novelGene_154170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4486.29359828355	196	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	58	537	773121	769325	FALSE	10	AGTGGGCTTGTTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNFLRSSRIWVHPTPAASAMPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSVDN	773178	769323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769333_769572_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
882051	contig_5145_pilon	-	1412	4	Intergenic	novelGene_131461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	202.559182023976	2551	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	29	364	956111	949748	FALSE	15	TTAAATGTGTCTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTYRFRGCVMEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVEDFNRHLDTLTEHYDIPKVSWTK	956139	948699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949817_952957_953012_955790_955930_956037
882052	contig_14441_pilon	+	786	5	Intergenic	novelGene_100424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	366	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	198	746	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWAPYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81882	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81897_121656_121691_125517_125902_126159_126283_126514
882053	contig_9955_pilon	+	8848	17	Intergenic	novelGene_21325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	438.915491403243	5020	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	7667	8035	86994	107178	TRUE	35	AGCTAATTTTAGCTCCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLPEILVIIIFIHTGCFPYLEPQNTTCQETRCQTHNHDEAEYPHVEENLVAVRGILVLGGLKRHQRNVGDLSKQTRQAKGIVNHQHTVKTHRQALGSPNRDQPSQKAHQHGGPRRRDQVT	62495	124644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_65836_66389_67858_69952_70058_71904_72018_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575_87005_91217_91292_96125_96203_105377_105493_107086_107227_108941_109112_109884_110026_113652_113810_118306_118493_124533
882054	contig_13422_pilon	-	5824	5	Intergenic	novelGene_178247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1775	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	5293	5823	2464	1934	FALSE	35	GAATTCCAGAACAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVI	118482	1932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13422_pilon_-_3556_4490_4516_56805_56813_113760_115479_116031
882055	contig_9389_pilon	+	1361	7	Intergenic	novelGene_83979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_5	1142.0787212603	3440	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	86	607	383398	384766	FALSE	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	381996	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749
882056	contig_5302_pilon	+	2167	5	Intergenic	novelGene_81398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	421	junction_4	1039.99792668063	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1279	1770	155422	170054	FALSE	40	TTAACAAAGTATTATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSIKLQSSDGEIFEVDVEIAKQSVTIKTMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEEEEAQVRKENQWCEEK	154143	170451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_155519_161142_161217_167388_167533_169186_169328_170018
882057	contig_16846_pilon	-	1105	3	Intergenic	novelGene_82940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3154	junction_2	2957.5	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	29	475	555167	551492	FALSE	0	CTTCGGGTCTGTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASMGKNPTDEYLEGMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	555195	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661_552824_555055
882058	contig_2703_pilon	+	5622	18	Intergenic	novelGene_101740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.41196777521	7749	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	154	1437	559489	610870	TRUE	20	GTAAACGCCTCCACTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526277	615904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526342_526377_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756_613403_614251
882059	contig_2703_pilon	+	587	1	Intergenic	novelGene_101660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAATGCGAGTGCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	3088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_2500_3100
882060	contig_12938_pilon	+	1501	7	Intergenic	novelGene_99703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	960.113260101235	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	109	390	78117	79259	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIAPDIRVSSLVAATSRAITKFCLKDLRKVPAKDPSMGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSVSPYQTWFP	51945	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78108_78180_79040_79269_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
882061	contig_12677_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_110812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	925	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGATAGTGGAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2163	2829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2800
882062	contig_5023_pilon	+	3284	16	Intergenic	novelGene_7230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	1860.47279534591	8170	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	87	1970	607279	646990	FALSE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580842	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
882063	contig_5260_pilon	+	775	5	Intergenic	novelGene_144340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	40.8839821935193	1706	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	218	661	62159	90708	FALSE	30	TGACTTTGTAAAAACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGNSILLAAVSVLSACQQSYFAFQVGRARLKYKVTPPAVTGSPDFERVFRAQQNCVEFYPVFLVAFWMAGWYFNEVFATFLGLVYIYARHQYFCGYSEAAKNRISGFRLSLGILAALTVLGSLGIANSFLDEYLDLNIAKKLKWHL	61941	90822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_62217_70367_70468_84015_84087_90024_90107_90575
882064	contig_16103_pilon	-	1905	9	Intergenic	novelGene_118855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3358.13939369705	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	65	697	743628	733331	TRUE	15	CACCCTCTGACCTGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743692	722283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_723600_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
882065	contig_8377_pilon	+	11312	29	Intergenic	novelGene_34955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	2645.63893824944	10966	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	6961	9303	131448	189239	TRUE	20	GTGCATTTACTCTGAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKSRK	68096	198936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_124720_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185774_189229_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
882066	contig_5889_pilon	-	3864	1	Intergenic	novelGene_133699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTCAAATACAATAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306997	303133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_303100_307000
882067	contig_18208_pilon	+	507	4	Intergenic	novelGene_176184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	151	507	154523	156020	FALSE	50	AGAAAGAGGTAGGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFATKSSNQNFIVFLNKIQATIVGYKSCDFLAILDQLDSDTLPNGRIWLFGFNPYFFQHNSLCVGSASKGIGLQSCAQMGFFVLFIMPLLVPSVATELPGCTKTSTLAHASGTAAPSE	154372	156020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154567_154712_154835_155353_155513_155988
882068	contig_10752_pilon	-	3375	3	Intergenic	novelGene_153042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTTCACAGCAGCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225343	198556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_199035_203038_203521_222928
882069	contig_17281_pilon	+	1483	1	Intergenic	novelGene_105193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACATGGTACTTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3500
882070	contig_15047_pilon	+	1584	7	Intergenic	novelGene_52210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	357	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	20	355	2194	2833	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGE	2174	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2910_3238_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
882071	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
882072	contig_1867_pilon	+	1672	6	Intergenic	novelGene_54511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5518.78245267921	99	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	162	794	213567	220943	FALSE	40	CATATAAAAGTTACGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARGACSFLSRSGAPPVAPPRRLNSQPGVRSPRLEDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194825	221821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194936_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
882073	contig_4962_pilon	+	3410	4	Intergenic	novelGene_107371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1335	1661	245251	245577	TRUE	45	AAAAAAGATTTACAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAHTKKKKGGGSKIKTLTLRSKQTETEQQKKPIVTRRKEIIKITAEITETKNRKTMERINKTRSWFFEGINKINKPLANLTEEKQEKKQITQIRNVTVKWVTLPLMQ	60310	349898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_61339_61852_62058_245149_246133_348704
882074	contig_8377_pilon	-	5936	1	Intergenic	novelGene_34894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6462	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCAAGTAATTAGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73876	67940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_67900_73900
882075	contig_9833_pilon	-	4564	4	Intergenic	novelGene_68500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	55	TTGTTCAAAGACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	212433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
882076	contig_13702_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_102636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1166	1465	211071	211370	NA	25	CAGAGCCTTCCATGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	209905	211824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_209900_211800
882077	contig_11720_pilon	+	1426	11	Intergenic	novelGene_43797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2863.67809643472	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	112	951	78465	96027	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQASGARNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHQGFWMEKSSVCSACRRGQGDMEPKESHLRKVPGLGSPPGEI	67819	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_95901_96036_98299
882078	contig_18869_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_56224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	638	952	73776	73462	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLDWTNSKFYFFKNTDLLLHFMHIIKEIILLLTLTSSFFRILFWELHPQVRGVWEGSAWMTGCLGCEGENSQVQHQPLGQISTLHSILHTKLNNKTFVHVEN	74413	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_74400
882079	contig_15449_pilon	+	5123	17	Intergenic	novelGene_33561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	793.903801536276	3	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	357	2888	37166	54621	FALSE	75	TGAGACAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	11178	56856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_12845_12884_15759_15842_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47165_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
882080	contig_6208_pilon	-	2280	6	Intergenic	novelGene_52969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	380	junction_1	191.845145885946	3852	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	153	644	351804	334758	FALSE	20	ACAAGTTTTCTGTCTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRRLPGAPTSEGRWPLLGSETGTSDFLGRGYVTSSQARRFAGGYPQQVNMRIEKCYFCSGPIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVRWTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRSEPVKYQRELWNKTIEAMKRVEEIKQKRQATFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEDKMVQKLQEDVDMEDVS	351956	333121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_334832_336085_336172_338944_339009_344015_344089_345798_345913_351723
882081	contig_15897_pilon	-	3480	5	Intergenic	novelGene_49538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1242	2012	819785	819015	TRUE	65	AAAAAAAAGAATTACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKNSSKDFTKRVKREPTDWEKNFGQYESDKGLISIIYEKIKHLHNKKTNNPIKKWAEEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSCSLAIRETQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMMQPFWKMILHFLRKLEIEIQYDPAIPLLGTYPREIRAVTRIDICTPMFKAALFTIAKRWKQPRSPSADERINKLCYIQTTEYYATIKNNDESVKHLIA	821026	596433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_596730_597662_597839_597960_598539_780911_780949_818633
882082	contig_9183_pilon	-	4957	1	Intergenic	novelGene_40277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	492	4465	4956	301951	301460	NA	20	CTGGTGTTTCTGGACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKRKKKTKQIKKIKQNKKGPQRNRKKKKKTNVKRNALRDPSACLWKPKGSLPATQLSLARKGSQFKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRDPTSTAAQTGKQLHTRMELHSPSGKAKMAKGATYLSKGRGRWREASKKSKEAEKKKATLAANKWHSESQPVR	306415	301458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_301500_306400
882083	contig_753_pilon	+	4979	4	Intergenic	novelGene_113038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1592	1984	1451285	1451677	TRUE	60	CCTGAAATACAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVIEGLRSRFEMVEDRISGNEDKHLDTTLFQENSEKRAKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIKKDEKWPSKKLNEPHIEETPKENHQSISYSHSPKPKTNKES	1449544	1465910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1449678_1449826_1452695_1455390_1456987_1465528
882084	contig_10437_pilon	+	1776	2	Intergenic	novelGene_38490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTGGATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213571	1215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214345_1214718
882085	contig_9919_pilon	-	4238	1	Intergenic	novelGene_137954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	948	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	277	576	547437	547138	NA	45	TTTTTATATATATATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRHPESMALRHPFSLVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	547713	543475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_543500_547700
882086	contig_7963_pilon	+	873	4	Intergenic	novelGene_58410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	869.906636114219	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGGGTGACTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56718	63341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_56930_57390_57564_57782_57934_63003
882087	contig_4782_pilon	+	2387	2	Intergenic	novelGene_73609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	451	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATACAAGCGGTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159278	161821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_159720_159875
882088	contig_2703_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_101659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCGTGGAATGCGAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2426	3084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_2400_3100
882089	contig_7963_pilon	-	2281	6	Intergenic	novelGene_58282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	127	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAATCCATGCTCTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48834	37063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
882090	contig_13766_pilon	+	3028	4	Intergenic	novelGene_178293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTAGTTTTTCAGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64929	90610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13766_pilon_+_65183_66882_67728_67996_68432_89115
882091	contig_3817_pilon	+	2066	2	Intergenic	novelGene_78331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1083	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCCAATGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200905	205469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_201852_204349
882092	contig_8651_pilon	+	461	4	Intergenic	novelGene_168183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1947	junction_1	3160.6362580271	219	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	56	427	185122	189318	FALSE	10	CTGTTGCTTTGTGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIKARDLRGKKKEELLKQLEDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKPLDLRPKKTRAMRRRLNKHEENLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA	185066	189352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_185125_185619_185757_186928_187011_189168
882093	contig_6048_pilon	+	3284	1	Intergenic	novelGene_73166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1333	1779	1196591	1197037	NA	50	AACCACAGCAGAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEATLKLALEHRVAKANGTNDEVKELKGRFQRVALEDKVKYYNEKCTDLELENQKRRTCSAFPKLKELKKKFKPQVAIFKDKMLNDTRSIKRRWKEYTESLYQKELVNIQPFQEVTYDQEVEVEVQAALKALAKNKAPGIDGRRIEM	1195258	1198542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1195300_1198500
882094	scaffold_6394_pilon	+	722	5	Intergenic	novelGene_111037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	5905.25928198754	109517	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTTACGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441846	444573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_442151_442368_442540_443338_443388_444267_444367_444474
882095	contig_7619_pilon	-	2430	2	Intergenic	novelGene_162165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	304	609	659214	658909	TRUE	25	TATGCCAATTTCCCTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	659517	454676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_455008_657418
882096	contig_854_pilon	-	2574	5	Intergenic	novelGene_36192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	777	1106	562395	562066	TRUE	10	CTGAGCTGATCCTTTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQERFCCLVGWGHRTARIASSKTVFRPRWVRAEHSKYFTESGTEQQESRGLGQGKGPGQKTPPKPHNRTPGCGVAVSSSPDGAAWELGLLSRVFPSLCLSVLMSKVTR	563796	494036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_494082_552882_553388_560042_560426_561530_562404_563028
882097	contig_4180_pilon	+	1558	7	Intergenic	novelGene_8361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1959.40237487522	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	398	979	870689	888134	FALSE	5	GCTTTGGAGCCGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLLAVHGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865771	888713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_870391_870714_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
882098	contig_4883_pilon	-	4798	4	Intergenic	novelGene_178294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1767	3032	4798	164463	162697	FALSE	65	AAAGAAAAAAATCACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFITIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKR	227803	162696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4883_pilon_-_165165_225146_226150_226409_227222_227288
882099	contig_14666_pilon	+	2945	1	Intergenic	novelGene_39641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3135	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	11	406	484545	484940	NA	30	CTAATTACTTGGCGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	484534	487479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484500_487500
882100	contig_12677_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_110842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAATGGGTAGACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3600
882101	contig_233_pilon	-	2088	11	Intergenic	novelGene_14585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1032.00459785797	6192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	57	1649	105485	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	105541	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461
882102	contig_5279_pilon	+	4662	2	Intergenic	novelGene_105552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1012	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCCACTGGGTGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277809	297861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_282349_297738
882103	contig_8377_pilon	+	4463	27	Intergenic	novelGene_34958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3348.03805129204	2	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	1318	2325	176610	192233	TRUE	20	GATTCTGCTTCAGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQLLET	68096	199248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169295_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189212_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
882104	contig_19816_pilon	-	1705	8	Intergenic	novelGene_156487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	251.528308140293	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	936	1277	124800	123459	FALSE	10	GAATCCTGTGTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126805	123030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125859_125929_126435_126731
882105	contig_9706_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_20873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2949	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2900_4000
882106	contig_12677_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_110739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
882107	contig_10793_pilon	+	1970	14	Intergenic	novelGene_83397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2925.4446382321	794	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	130	1056	146975	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130872	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_165377_166401_166473_167141
882108	contig_13702_pilon	-	1903	2	Intergenic	novelGene_102637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1480	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGGCTGAGGATTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273732	209905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_211733_273656
882109	contig_10990_pilon	-	5461	18	Intergenic	novelGene_7489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	312	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2521	3063	749198	743951	TRUE	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPVVSSETYCLCCSNTALRCNFTSFLKFLLFFLPVLLGMRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	753868	714807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715362_715413_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731660_731910_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736266_738882_738955_743881_744391_744703_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
882110	contig_5686_pilon	+	3220	6	Intergenic	novelGene_45451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2729	junction_4	713.931537333938	32	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	2479	3186	222847	257484	FALSE	10	ACCCTGGTGGCCTAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGEDGRLAYEQVDRFPRDCVKVGGHHGTEVATAF	220368	257518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_257383
882111	contig_7051_pilon	+	3424	1	Intergenic	novelGene_64327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCAAGATTGGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310452	313876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_310500_313900
882112	contig_14244_pilon	-	6850	1	Intergenic	novelGene_169444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	124	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGCCAGGCACCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7403	553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_-_600_7400
882113	contig_3018_pilon	+	2202	14	Intergenic	novelGene_78774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	646.862770444383	1757	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	26	883	371069	497158	TRUE	20	CCCAGCAGAATTGCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKQKIELLMSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPVSTYTCAYIHLHVKRDCPLLSFPNCNI	371043	523795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497263_498505_498753_499373_499857_517300_517402_517509_517618_522876_522947_523589
882115	contig_7452_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_109148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAAACAACAAAAACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125826	123658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_123700_125800
882116	contig_5996_pilon	+	4798	4	Intergenic	novelGene_169276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	56	559	4316	4819	TRUE	70	TAAATAAAAGGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKIRDGIKKFLQSNENENMSYQNLWDTAKAVLRGQLIPIDAHSKKEEGDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFLERINKIDKALARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPIEIKRIITEYYENLHSNKFENLEEMDKFLETQYLPNYNKVMLKI	4260	182050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5996_pilon_+_6398_119647_120548_126105_126896_181079
882117	contig_11427_pilon	+	4263	1	Intergenic	novelGene_78987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	2816	3379	586225	586788	NA	25	CGCTATGAGTCGGAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGISIETFQQTDAALEGLTRLCQEIWKTTTWPTYWKRSIFMPIPKKGDPIECGSYRTISLLSHTSKILLKITQKWLQQYINTELTEIQAGFKRGCGTRDIITDVSWILAESREYQKDVYLCLIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLTVLMRNLYTDQEAVI	583409	587672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_583400_587700
882118	contig_17603_pilon	+	1720	3	Intergenic	novelGene_152790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.5	1399	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACCCTATAATTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60404	69006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_60788_61074_61863_68457
882120	contig_2646_pilon	+	2283	10	Intergenic	novelGene_69521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_2	199.908312316755	1121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	711	1277	566553	573396	FALSE	10	CTCGCTGGTGCAGCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554018	574402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
882121	contig_602_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_134943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACAATTTTTTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332468	331343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_331300_332500
882122	contig_8020_pilon	+	2308	5	Intergenic	novelGene_114347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_1	49.0580013861144	1251	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	220	603	47467	53381	FALSE	5	TGATGGTTTCTTTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKPIWEQIGSSFIQHYYQLFDNDRTQLGAIYIDASCLTWEGQQFQGKAAIVEKLSSLPFQKIQHSITAQDHQPTPDSCIISMVVGQLKADEDPIMGFHQMFLLKNINDAWVCTNDMFRLALHNFG	39795	55086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_39986_47437_47566_51342_51415_51503_51603_53267
882123	contig_12079_pilon	-	1999	11	Intergenic	novelGene_67440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1256.63663801435	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	473	1396	600738	580327	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLDRSTEILQRSFRMNHTGGHSGINFCVLLNS	638841	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580418_584225_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
882124	contig_2636_pilon	+	915	5	Intergenic	novelGene_52066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	369	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCAAATTAGATTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59549	85677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_59968_61644_61758_62468_62626_81115_81218_85552
882126	contig_9389_pilon	+	1063	4	Intergenic	novelGene_83991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1572.60548135888	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382091	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382145_383391_383501_383576_383702_384744
882127	contig_1150_pilon	+	533	4	Intergenic	novelGene_61420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGGGCGGGGCGCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	311054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309190_309279_309387_309813_309927_311002
882128	contig_5954_pilon	-	4502	7	Intergenic	novelGene_28756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	4379	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	197	907	1462068	1392942	FALSE	25	ATTCCCAGGTTATGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462264	1389346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
882129	SIRV3	-	697	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	1203	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	24	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTTACCCTTGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	7556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
882130	contig_854_pilon	+	3552	23	Intergenic	novelGene_36589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2530.60838241004	10	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1130	3393	71	3463	1680888	1707138	FALSE	55	ATGAAAATATACACAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQVHGGSALSCSCPSATVTQPKAKATVKGVEPGLHPGRPSTVGRPCGD	1679336	1707227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679348_1680828_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748
882131	contig_10958_pilon	+	1896	4	Intergenic	novelGene_5423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	61	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	34	558	888255	895766	TRUE	60	AAAACTAGGGATAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVLLIKSVIEVRPWMFLAGHLLPDASFLSVPGFKHGLPQEGKLTSRRGRPHVSLRNNYFPRRAFELFCSFLLFFIFFLKMYNHDRNLILCCFSVKEKYTHKAVTPPVKFCCCLVLAN	888221	901707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889005_895418_895855_900457
882132	contig_3747_pilon	+	2101	5	Intergenic	novelGene_24813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	689	1015	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201180_202969_203128_203228_203386_203498_203651_203768
882133	contig_8616_pilon	-	1594	10	Intergenic	novelGene_72551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4244	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGAAAAGCTGGCGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436591	425576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_425788_426885_427045_427754_427820_427981_428124_428647_428791_430488_430621_431029_431243_435729_435897_435990_436118_436356
882134	contig_9656_pilon	-	2971	11	Intergenic	novelGene_121911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.040802733244	3183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	201	1328	446594	430496	FALSE	25	ATTCTTTGAATGTCTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSDAPAAARARTGVGSRRSTRPSDPSPSWPARGDPEAVVRCHRAALFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKSDAASKVMVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	446794	428852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431142_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026_438111_440922_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
882135	contig_9871_pilon	+	3056	4	Intergenic	novelGene_75684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	251.224998756095	3415	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2017	2688	535375	540638	FALSE	25	TATACTTTCTTCATAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFFLVCFFLLLSFNIGHVSPFFFHPLVCNQLLHSTKAGHRLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	533358	541006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_535501_537743_537936_539747_539984_540520
882136	contig_15666_pilon	-	1961	6	Intergenic	novelGene_70178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	130	1299	110619	107816	FALSE	25	GAAAGTGATGTTGCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110748	107153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
882137	contig_5954_pilon	+	273	3	Intergenic	novelGene_28443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3853	junction_1	607.5	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCTCATTGATTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98116	99028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_98163_98637_98694_98857
882138	contig_16103_pilon	-	2659	8	Intergenic	novelGene_118819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3530.51272798286	36	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	335	697	735970	733331	TRUE	20	TATTCTGTTGGATATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743696	721750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737626_743496
882139	contig_4083_pilon	+	673	6	Intergenic	novelGene_152341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	335	junction_4	56.3666568105649	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	78	629	323237	329750	FALSE	10	GGATTGTTCTGGCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKKFATVTSEESWKRERELLQEKKNRDRPTREHTTSSSVSKKPRLDQIPAANLDADDPLTDEEDEDEDFEEESDDDDTAALLAELEKIKKERAEEQARKEQEQKAEEERIRMENILSGNPLLNLTGPSQPQANFKVKRRWDDDVVFKNCAKGVDDQKKDKRFVNDTLRSEFHKKFMEKYIK	322267	329794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_322331_323222_323337_324449_324539_325623_325738_328878_328998_329620
882140	contig_10196_pilon	-	199	3	Intergenic	novelGene_132318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5940	409	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGTGTGGCCTTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2389711	2388935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2388944_2389313_2389471_2389677
882141	contig_10990_pilon	+	3696	17	Intergenic	novelGene_7466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	395.68153229586	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1818	1877	3694	722379	750944	FALSE	20	TGTGGTTAAAGTTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKP	708583	750946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749334_749501_750918
882142	contig_5686_pilon	+	3137	2	Intergenic	novelGene_45470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	253	669	226735	227151	TRUE	35	ATATGCACACCCATATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDTCRGPLSATGAQIHHLGILSEISEQEVQDSSFTELPAGDRTTGNPRYRLSHTPTLLHPHLASSTSCSHSLLAGKHKLPPSVTWIPPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLTSHHLRLLSVKYLAPCTIFASS	226482	271085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_229460_270925
882143	contig_20748_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_138172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGTATCTTTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51672	52770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_51700_52800
882144	contig_6031_pilon	-	1971	5	Intergenic	novelGene_56749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	327.376694344604	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	157	831	256770	254965	FALSE	20	CTCTACCTATTTTGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGLQKPRPCAIPRSLRLPGPHAVHSPTLGVFPSLPRRFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	256926	253824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256375_256704
882145	contig_10404_pilon	+	1004	4	Intergenic	novelGene_138683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_2	1950.43180404295	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	47	388	1098040	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1097993	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
882146	scaffold_12124_pilon	+	2819	3	Intergenic	novelGene_22383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1261.5	14	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	861	1640	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497069	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506823_1508010
882147	contig_17144_pilon	+	1475	7	Intergenic	novelGene_29195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	25	AGCCCACCCAGATGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	170873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744
882148	contig_5967_pilon	-	2774	10	Intergenic	novelGene_44338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_4	268.047674034966	7	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	271	1416	488569	388566	FALSE	15	TCACTTTCTGAATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517772	387207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
882149	contig_8284_pilon	+	3218	8	Intergenic	novelGene_125702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	592.060256172271	72	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	22	471	426599	449191	TRUE	15	TTTTGAGCTTCACCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRNFNTMKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDR	425053	505016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425064_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_451687_504764
882150	contig_233_pilon	-	2681	14	Intergenic	novelGene_14529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1223.25295298325	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	136	2238	108522	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127002	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_126927
882151	contig_16103_pilon	+	1880	7	Intergenic	novelGene_118870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGCCTGCATTTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722330	737623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723674_733288_733369_733541_733608_734955_735030_735661_735731_735854_735975_737495
882152	contig_10990_pilon	-	6720	17	Intergenic	novelGene_7477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9155	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2642	3064	744373	743951	TRUE	30	AAATTTCAAGTGCTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	753868	713592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_743881_744386_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
882153	contig_854_pilon	+	8280	21	Intergenic	novelGene_36648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_2	3354.52181241977	151	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1082	3249	53	3301	1698226	1714980	FALSE	20	CTGGTGAGTCAGGCCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1697760	1719959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
882154	contig_10311_pilon	+	3084	10	Intergenic	novelGene_50474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAGCGGGCTCGCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65330	71558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65656_65767_67260_67490_67585_67826_67961_68263_68754_68868_69038_69807_69947_70223_70360_70448_70493_71497
882155	contig_20527_pilon	+	2170	5	Intergenic	novelGene_138581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	19	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	50	676	13527	27453	FALSE	35	ATAATGACCATGCTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13477	28947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
882156	contig_14441_pilon	+	785	4	Intergenic	novelGene_100742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	78	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	197	745	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121191	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
882157	contig_13702_pilon	-	1920	2	Intergenic	novelGene_102639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGCCAGGGGCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273732	210004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_211847_273654
882158	contig_4891_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_124523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATACACAATAGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81111	79045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_79000_81100
882159	contig_10140_pilon	+	3701	2	Intergenic	novelGene_148424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1121	1429	307431	307739	FALSE	30	TCCCAAACATGTTTATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIQESLYQNELVNVQSFQDEAAYDKELMVLKEEVQAALKALVKNKGPGIDGIPIEMFQQTDATPGVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVLIPKKGDPTE	305803	310011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_306530_307036
882160	contig_2227_pilon	+	1622	4	Intergenic	novelGene_142328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3236.19203523043	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	232	747	230369	231819	TRUE	25	CCAATCTCTTGTCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFYTRAATMIGEIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230061	232765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230268_230343_230517_231451_231955_232025
882161	contig_13740_pilon	+	6255	14	Intergenic	novelGene_34612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.120180169131	4074	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	4582	5103	170866	176906	FALSE	15	TTTATGTGGTTAGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	154897	178058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157528_158261_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161269_161573_161719_161916_162031_165237_166216_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
882162	contig_1719_pilon	-	860	6	Intergenic	novelGene_87364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	459.214721018392	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	352	660	786528	754873	FALSE	25	GTTTCAGTTCGCACACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803668	754672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_798509_798569_803564
882163	contig_9839_pilon	+	739	5	Intergenic	novelGene_88524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_1	1671.24511966378	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	14	613	49467	61360	FALSE	35	AAAAAATCACTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSNVMISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	49453	61486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_49614_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
882164	contig_14467_pilon	+	5604	7	Intergenic	novelGene_138262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1903	2670	318386	319153	TRUE	10	CCTTCTGATTGGCCCGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLWDGVRLQEQELVSLCAPILCSQWVEDSLTRSVPLICPAGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	316483	351736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_321274_321480_321587_322015_322124_322254_322505_326248_326517_347828_347888_351713
882165	contig_5671_pilon	+	1100	6	Intergenic	novelGene_79421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_5	728.393684761201	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	118	540	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368807	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
882166	SIRV3	+	730	5	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	3	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	853	3	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1966	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4574_4757_6086_6334_8755
882169	contig_16103_pilon	-	1986	8	Intergenic	novelGene_118872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	36	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	246	608	735970	733331	TRUE	45	TGATACTGAAAATTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743603	722334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
882170	contig_7151_pilon	-	7079	6	Intergenic	novelGene_40761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1370	junction_2	498.724533184402	6704	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	180	818	551180	529189	FALSE	40	TTCATAATAAGGTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551359	522927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
882171	contig_4151_pilon	+	5300	2	Intergenic	novelGene_65230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	0	2157	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	172	738	528988	663644	FALSE	30	CAGCCCAGCAGGAGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528816	668206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078
882172	contig_20641_pilon	+	1654	7	Intergenic	novelGene_52790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1613.80620652612	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	252	1367	14599	56882	FALSE	55	AAAAAAAAAGATCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14289	57169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14339_14396_14771_16769_16916_38522_38570_45848_45965_54835_54968_56379
882173	contig_12864_pilon	-	503	3	Intergenic	novelGene_76363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	655	7788	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTGTTCTCTCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176615	167802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_168006_169369_169531_176476
882174	contig_3018_pilon	+	1385	9	Intergenic	novelGene_78786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	541.34924032458	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	800	1384	478971	498610	FALSE	60	AAGCTGAAAGGAAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELER	420957	498611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_421501_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505
882175	contig_5696_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_117562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTACAATCAGTAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697204	695756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_695800_697200
882176	contig_17427_pilon	-	2525	13	Intergenic	novelGene_30337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1077.0384033182	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	90	749	188879	181330	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGSGSREDSWAVLAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWPASPSSPHQFRLR	204750	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181372_182702_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
882177	contig_18843_pilon	+	1974	11	Intergenic	novelGene_165605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	637.861434795991	2964	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	32	1024	28527	46092	TRUE	15	TCACAGTGTTGTTTGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERHHRSSSGSSHSGSRSSSKKK	28495	47922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44351_46028_46259_47138
882178	contig_6059_pilon	-	2438	16	Intergenic	novelGene_44841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3905.58225222423	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	212	1987	584239	569146	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPLSSFRFRLIFVLLRLPPLPSPRLRPPAPALALFLRKGRGLWPCGQPCRDEPQRPQLPHGLALWVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584529	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584254_584332
882179	contig_7593_pilon	-	2010	2	Intergenic	novelGene_127259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5289	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3935	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_2913_2963
882180	contig_12677_pilon	-	705	1	Intergenic	novelGene_110881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTACCTACATGACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3674	2969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3000_3700
882181	contig_3233_pilon	+	3372	10	Intergenic	novelGene_56538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.46386291491	69	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	2358	3239	740857	747909	FALSE	15	CCCAATGGGATTGTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	735711	748042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_736685_737430_738776_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
882182	contig_16496_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_5167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
882183	contig_14970_pilon	+	4833	11	Intergenic	novelGene_45003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5800.13240883344	6010	138	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	37	540	136145	191752	TRUE	25	TGGATTGAGGAGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLTLSPVCPDTMNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITIKLKLLLCDKEPDGAVVKAIDR	136108	234826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191687_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_234318_234375
882184	contig_8712_pilon	+	1931	5	Intergenic	novelGene_58770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	209	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	41	520	314974	321793	TRUE	35	AATTCTCATGGTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286980	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_322121_322180
882185	contig_1339_pilon	+	621	2	Intergenic	novelGene_163144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11195	junction_1	0	66	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	202	471	433758	434027	FALSE	0	CCTGGGCCTCCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGQRKPATSYVRTTINKNARATLSSIRHMIRKNKYRPDLRMVSGAQWVNSGVPCVSCCLGPVFGDGRDQWTTLQGLVRESLASTVEKGLPLRHLPPQGPKGRLGGDSCEGWGRPGCC	431614	434177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431736_433677
882186	contig_12427_pilon	-	3664	6	Intergenic	novelGene_40450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2513.25855414838	25	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	276	809	316061	314393	FALSE	10	CAATTTTTGCTGTCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325976	311537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_322569_322708_325856
882187	contig_3557_pilon	-	2584	3	Intergenic	novelGene_173614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	2054	2584	409629	409099	FALSE	30	AGCTTCAGCTCACAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRATREKQEVTYGGETIRLSSDYSAETKQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKEVLQSEDK	662914	409098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_-_410854_528666_528675_662093
882188	contig_7898_pilon	+	1873	4	Intergenic	novelGene_47595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	355.439008676438	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGACAGAGTAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508568	540816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_508922_521762_521834_537784_537923_539505
882190	contig_17_pilon	-	5740	7	Intergenic	novelGene_173970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3510	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATACTTGTTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430218	136097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_136822_291590_293421_301511_302442_375630_376832_411944_412493_429665_429687_429732
882191	contig_16594_pilon	-	5595	10	Intergenic	novelGene_53800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_9	2342.71889104714	10935	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	1018	2163	272836	121101	TRUE	20	CTTCTCTTTCTTAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306534	115136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_306350
882192	scaffold_12124_pilon	+	2085	10	Intergenic	novelGene_22256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	159	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	195	572	1490385	1508039	FALSE	40	CAATAAATGCGAAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
882193	contig_12125_pilon	+	2874	1	Intergenic	novelGene_76250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTCACTAGTACCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632089	634963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_632100_635000
882195	contig_15114_pilon	+	1664	4	Intergenic	novelGene_121233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	210	542	1691168	1695129	FALSE	30	GACACTAGCCTTGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHHCAANDGIASCERDQRVFNRHMGHAIFVGSHVAQVSNMPLCRLWPTMFFGKRIKVRPGTGTALCVIAKLVNVETVVAFRQSCDASCYHDRPVSLYSKKSKVSKSKSF	1690958	1696251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1691172_1692403_1692523_1693289_1693360_1694989
882196	contig_12644_pilon	+	1600	9	Intergenic	novelGene_44668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	3604.61092734015	36	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	34	870	2675526	2679668	TRUE	30	TGAGAAATATGTGTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYK	2675492	2680626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679963_2680107_2680229_2680311
882197	contig_16846_pilon	+	896	2	Intergenic	novelGene_82938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	100	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTGAAGTTGATGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550861	552753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_551671_552666
882198	contig_7396_pilon	-	6354	18	Intergenic	novelGene_79526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3288.67031111738	4206	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	118	1506	255163	246442	TRUE	25	TGCCCACAGGGTAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257471	211547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_211974_230531_231863_233694_234257_243912_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
882199	contig_19727_pilon	+	4598	3	Intergenic	novelGene_168997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	995	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1615	2055	55625	56065	TRUE	65	AAATAAAAGTTGAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFLENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEITKTTIRNPKDNKISEMDSVVEGPRSRFETMEDRISKIEDKQLDTTLFEEKSEKRMKKP	13573	58659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_14791_55227_56995_57045
882200	contig_500_pilon	+	2002	10	Intergenic	novelGene_31061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1105.79508292997	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	991	1587	1494461	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1491498	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492755_1493615_1493721_1494244_1494472_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
882201	contig_12864_pilon	-	567	3	Intergenic	novelGene_76361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	680	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	29	463	176557	167907	FALSE	20	TTCAGTGTTCTCTCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFVRNLVEKAPAMVNGERAVRVPRQVHRPTGRCVRGPESKRRALVSGGACVGRGARAAVTYSKPRLATFWHYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIVNSAQTGRFKQLTVKEALLNGLVATEVWMWFYIGEIIGKRGIIGYDV	176585	167802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_168006_169369_169531_176382
882202	contig_4486_pilon	+	2440	14	Intergenic	novelGene_38564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1281.3582567918	3365	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	273	1427	343083	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311707	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_341303_341376_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
882204	contig_9053_pilon	-	3544	1	Intergenic	novelGene_87951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	181	642	302282	301821	NA	50	TGAAAACTAACGAAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKEIVKIRAEISEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLAKLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLGEMDKFLETHSLSKLQQSDVENLNRPITREEIKKVVKKLLTEKSPGPDGFTGEFYKTFTGELLPVLLKLFQSTEEEATLLNSFYEASITLIPKPGKDITNKRKLQTNISHEYRCKNSQQNSSQ	302462	298918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_298900_302500
882205	contig_21025_pilon	-	3678	2	Intergenic	novelGene_76486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1496	1870	21680	21306	FALSE	70	AAAAAAGAAATCTAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIIAVAKSKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDKQKLRDYVKTKPNL	23828	19497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_21928_22580
882206	contig_6137_pilon	-	9216	17	Intergenic	novelGene_59244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	280	136	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	785	1129	1355493	1355149	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFPSTLNSSKWSWNWKGIGDRNRTRNTYIWPIKLPYIMVTVLYKDLQMRKTYFFKSFLKVSNSHQNAGKSQCGQSIQNPCRILHFLNYFPLNISVTNTIPYDFKAYLDTIKI	1356277	1316658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1316754_1316796_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331859_1332172_1332306_1333047_1333217_1333460_1333519_1336698_1336790_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341638_1345124_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
882207	contig_11677_pilon	-	525	5	Intergenic	novelGene_85939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_4	14365.8301970335	2397	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	12	482	598052	594927	FALSE	10	CATATGCTTCTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDVAKVNTLIRPDGEKKAYVRLAPDYDALDVANKIGII	598063	594883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595237_595714_595892_597212_597397_598027
882208	contig_15327_pilon	-	1969	4	Intergenic	novelGene_70639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	18	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	113	520	901528	900904	FALSE	45	TCAAGGTACAACACAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902140	899454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901030_901126_901281_901400_901536_902035
882209	contig_16098_pilon	+	905	1	Intergenic	novelGene_46236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGGAATCTTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767211	768116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_767200_768100
882210	contig_9512_pilon	-	3291	2	Intergenic	novelGene_178000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGACTCCAAAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720708	527995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9512_pilon_-_529434_718855
882211	contig_15087_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_37290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAATCCTCCTTTGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301839	303735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_301800_303700
882212	scaffold_12124_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_22407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	10	747	1508668	1509405	NA	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508658	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508700_1510600
882213	contig_9582_pilon	+	1050	5	Intergenic	novelGene_106841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	37.0835205987781	1472	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	539	910	437107	439239	FALSE	25	CATCTGCACTGTATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARYEEVKVSGFEEFSGAVEQHSGKTIFAYFTGSKDAEGKSWCPDCVQAEPVVREGLKHINEGCVFIYCQVGEKPYWKDPNNDFRKKLKVTAVPTLLKYGTPQKLVESECLQSSLVEMLFSED	435392	439379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_435919_437094_437252_437958_438041_438432_438509_439170
882214	contig_11986_pilon	-	3885	16	Intergenic	novelGene_69208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1100.93692623854	20	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	1811	3067	751619	734807	FALSE	40	TAAAGAAAAAGGTGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	794706	733988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734808_736169_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
882215	contig_10904_pilon	+	5899	7	Intergenic	novelGene_22535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	148	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	3474	3932	613328	613786	FALSE	25	GCCCTGGGTGAAGTACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRSLQRPLTPDGHRAPLGDDRAWSSPAVGFGEDPWKGMRPGVPRGSSTLNSPNLHFDASPTLVTISSDPLCLHPNPELPRCIHCADQRLDLGGLGRTHLSVPGSADPGTALGESSLCEACPHTHTQKYHWGQTGAENIPPLEGSASSLAS	362980	615753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_363345_363517_363940_403066_403824_528408_528596_542243_542549_611474_612261_612675
882216	contig_12919_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_75869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTTGGAGGGAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252642	251302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_251300_252600
882217	contig_16310_pilon	+	1318	5	Intergenic	novelGene_70044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCTAGGGCTCGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56163	66256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_56581_62095_62275_63077_63536_64829_64954_66116
882218	contig_3747_pilon	+	2727	7	Intergenic	novelGene_24791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4140.37929019392	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	330	923	201313	202759	TRUE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPSA	200983	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202812_203200_203386_203498_203651_203768
882219	contig_11548_pilon	+	2272	11	Intergenic	novelGene_66734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1030.23863740398	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	203	1429	63836	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63633	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102067_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
882220	contig_2798_pilon	-	4627	1	Intergenic	novelGene_120070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4192	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGATCTCAAGTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193539	188912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_188900_193500
882221	contig_3862_pilon	+	1225	7	Intergenic	novelGene_137440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	94.2079555498838	2140	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	138	596	646528	651138	FALSE	20	TGATGAGTTGTTTGAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVIRKRLLIDGDGAGDDRRINLLVKSFIKWCSSGSQEEGYSQYQRMLSTLSQCEFSMGKTLLVYDMNLREMENYEKIYKEIECSIAGAHEKIAECKKQILQAKRIRKNRQEYDALAKVIQHHPDRHETLKELEALGKELEHLSHIKESVEDKLELRRKQFHVLLSTIHELQQTLENDEKLSEVEEAQETSLETDPKP	645611	651767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_645730_646508_646637_646966_647054_648716_648775_649490_649558_649650_649721_651070
882222	contig_14483_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_133758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAAATAGGGCAGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81323	83460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_81300_83500
882223	contig_9833_pilon	-	4632	1	Intergenic	novelGene_68508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	1911	2432	215789	215268	NA	25	CAAGGGTTCTGGACAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	217699	213067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_213100_217700
882224	contig_15991_pilon	-	1029	7	Intergenic	novelGene_70914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_6	2325.96766004077	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	78	965	105108	100445	FALSE	20	CTAAAGGTTGTGTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106359	100380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
882225	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
882226	contig_10437_pilon	+	2221	2	Intergenic	novelGene_38359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3455	junction_1	0	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	186	548	558558	559848	FALSE	20	GACCCCCCTCCAAGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKWQPSPKPGKRGGRIPKRGRAELGRARVRRFPRAGWAGVGPGVHKGAQSVRACVRFFVSGMLRKLDMKNEDDVKSISRVMVHVFSDGVTNWGRIVTLISFGAFVAKHLKSVNQESCIEPLAESITDVLVRTKRDWLVKQRGWDGFVEFFHVEDLESGIRNVLLAFAGVAGVGAGLAYLIK	558372	561521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_558804_559731
882227	contig_4364_pilon	+	1928	6	Intergenic	novelGene_384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	45	AAGGAGAAATAAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
882228	contig_9705_pilon	+	5244	3	Intergenic	novelGene_41721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	760	1260	184455	184955	TRUE	75	AAAATAAAATAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVPEQGRKTENTERIVENLMAENFPDIVKDDKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKEKILRVARDKRKVIYKGESIRLSSDYSAETMQARRQWDDKYKAFKEKNYQPRIIYPAKLSLKYEGETRGFPDNQKCKEFAKTKPKLHEILKGVLQLQNQ	175877	267101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_176436_184253_188457_266618
882229	contig_9839_pilon	+	900	6	Intergenic	novelGene_88485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1440.74933281262	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	136	768	49467	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45305	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_61264
882230	contig_11233_pilon	+	7603	6	Intergenic	novelGene_178295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	605	216	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	6998	7414	369461	369877	FALSE	20	ATCCACCTATGGTCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENLKNSTRNLLELTERFSRVAGYKKNIRKSVGFLYTNKENDEKEIRKTISFIIDPKRIKYLEINLTGDVKVLFKENYKTLLQENQRDLHKWKNIPCLWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNPNTNNILQIDGKTNH	188129	370066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11233_pilon_+_190653_191093_191589_191884_192374_194983_195862_212499_213596_367944
882231	contig_11846_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_105951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2094	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTAGCTATATACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285232	283418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_283400_285200
882232	contig_5125_pilon	+	3356	2	Intergenic	novelGene_43492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1033	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTCCGGGAGCCGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899276	909646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_902570_909583
882233	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
882234	contig_15453_pilon	+	2767	4	Intergenic	novelGene_112477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_1	221.816741177637	3759	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	126	587	6981	17260	FALSE	40	TTAAAATTCAAGTACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRVKEIGSTMSGRKGTDDSMTLQSQKFQIGDYLDIAITPPNRAPPPSGRMRPY	6855	19440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17103
882235	contig_10494_pilon	+	2170	4	Intergenic	novelGene_102209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_3	38.7671109174889	18	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1693	2022	1085154	1087047	FALSE	10	GACTTGGAGTTTTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTSLDVVDEKISALGKALVDQRELYLGLLYPTEDHKVYGYVTNSKVKFVMVVDASNTALRDNEIRSMFRKLHNSYTDVMCNPFYNPGDRIHSRAFDNMVTSMMIQVC	1083461	1087195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1085270_1086225_1086314_1086606_1086687_1087001
882236	contig_610_pilon	-	8123	2	Intergenic	novelGene_76774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7145	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	5456	5947	232794	232303	TRUE	55	AAAATAATTTTTAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSTRKLLELMGEFSTVAGYKVNKQKSTGFLYTSNEESEREIREITPFTIASKRIKYLGTNLTRDVKDLYNENYKTLLKENKENLKKWKDVSCSRTGRLNIVKMSMQPKPIYRDNTITIKILTDFLTEMEKQIINFIWNGKRPQIAKAMLKEKERSRRTCIS	238249	229789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_231256_231592
882237	contig_9491_pilon	-	7560	7	Intergenic	novelGene_178296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	128	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	5963	6556	46232	45639	FALSE	45	TATAATAAAGAGCATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQEDITTINIYVPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIIGEFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKDTISQLDLIVIYRTLHTTAAKYTLFSNSHGTFSRIDHILGHRAILNKIQKVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKIKEKKLITWKLNNTLLTNHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYKTFGTQQWQSSEDNL	210435	44634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9491_pilon_-_47027_87177_87739_110403_110784_157964_158960_159392_160385_160559_162202_209837
882238	SIRV6	+	487	4	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1826	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7173	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7365_7798_7924_10724_10819_11031
882239	contig_7396_pilon	-	1164	13	Intergenic	novelGene_79646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_12	3051.87250807689	9	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1107	57	1163	255163	247880	FALSE	15	GTAAGTTTTCTTCTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQGGSGY	257061	247878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_247895_248193_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255173_257014
882240	contig_8377_pilon	+	3623	20	Intergenic	novelGene_35115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_10	1611.67426408627	8072	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	276	2312	176610	197939	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	164536	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
882241	contig_383_pilon	+	5021	8	Intergenic	novelGene_126077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	2068	3111	180367	181410	TRUE	60	CAATAAAGTAAATAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIDAKILNKILANRIQYQIQKIIHHDQVGFIPGMQGWFNVRKSINVIHHVSKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDTILYIENPKDSIRNLLELIERFSRGAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIVSKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLYETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTVQ	14421	263544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_15768_179645_181623_193145_193154_254571_254834_255748_256290_256357_256779_262439_262578_263216
882242	contig_7293_pilon	+	2275	2	Intergenic	novelGene_54247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11140	junction_1	0	199	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAATAAAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335637	338035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_336241_336363
882243	contig_2069_pilon	+	2664	5	Intergenic	novelGene_23420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	2262	2663	1328487	1331396	FALSE	20	TATAGCGCTAGGAGCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPNEKSNCNCTWSVLASPFSAGLFPSLPASAFPFFPLGTFSPFFAGAFLGLGSGFGGAGLADNLADLLCGSSFTLALSPLASPSAFLLGMVATAAGRRRWTRGCSGARALVDPGVVLASSSHCSGSGGFIKF	1326225	1331397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1328621_1329451_1329503_1329861_1329892_1330155_1330200_1331253
882244	contig_11720_pilon	+	1425	9	Intergenic	novelGene_43828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2565.92385591915	4	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	536	1144	86413	98482	FALSE	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67974	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_86188_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
882245	contig_10009_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_82729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCAGCCATCTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43785	41995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42000_43800
882246	contig_16125_pilon	-	2751	15	Intergenic	novelGene_155242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1163.20305490433	71	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	29	1429	236934	148939	TRUE	30	GTAAGTCTCATATGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRADVKSLMAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDI	236962	118857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_137851_137946_138906_139395_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
882247	contig_10197_pilon	-	2986	6	Intergenic	novelGene_115213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	811	junction_1	1121.41250215966	5327	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	108	875	952331	910531	FALSE	40	TTAAGAAACCACTCAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952438	908419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
882248	contig_9389_pilon	+	974	4	Intergenic	novelGene_83986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	932.784481479451	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCTGAAACGAACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382005	385506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_384343_384382_384749
882249	contig_14536_pilon	-	4349	4	Intergenic	novelGene_69305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2641	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3577	4134	124401	123844	FALSE	25	GACCCATAAGGTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGIPLCICAEYGSGSKAAQYCPAGRGSQAEKRKRDKQIRTEQYKKKQKTTKKRPRDPTSMAAQAVFSSLSGKSKDGTQRQVFERKEEEEVIRGMEEIKRSGKKPPWQVESKRHQDEANASLPRDCGHRKQRRPSGDEEEWGVGKDVSLVTSCSASCWKLREAAFSYPVRQSPVGVQDGGSMLR	132122	123628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_124503_124628_125849_126331_127063_130598
882250	contig_5041_pilon	-	7080	21	Intergenic	novelGene_27036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	634.815099064287	7119	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	108	2534	616721	525456	TRUE	55	TGTAATAAAAACACAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636087	370643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_370716_470666_470863_513724_513896_521348_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
882252	contig_14925_pilon	-	1006	5	Intergenic	novelGene_55144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	1543.31088896567	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	212	469	29675	27020	TRUE	15	AGGCTGTGCTCCTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSNTRLIFGQGTTLQVKPDIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	73141	25790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_73082
882253	contig_12624_pilon	-	2379	15	Intergenic	novelGene_61051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_8	954.399397099387	2735	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	47	1048	903621	875649	TRUE	35	ACAAGGCACCCAGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFSWPSGLTSTLCCSPGQLSPDPAQLGELTKHTRNLPSQKGREGKDCKALLCRIVFVLFLLFLSHCEYDCGARSNAVSYLIPPEPGAGRHPAQGHIGS	903667	862028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875938_877417_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
882254	contig_5686_pilon	-	7255	6	Intergenic	novelGene_45436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23008	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTCCACTGTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301840	207126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_207280_220467_222914_224040_224199_226530_227355_227434_229510_300241
882255	contig_854_pilon	+	632	4	Intergenic	novelGene_36335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCCGAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936141	976420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_936206_936285_936442_945111_945126_976022
882256	contig_2377_pilon	+	1162	5	Intergenic	novelGene_67903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	471	junction_4	416.703131737692	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	197	460	221892	224342	FALSE	15	CCATTGATGTACTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	215419	225044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
882257	contig_11512_pilon	-	3274	6	Intergenic	novelGene_43332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	582.04068586311	13	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	273	572	566314	556654	FALSE	15	AGAAGTGCCTTCTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622345	553951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566340_608472_608513_609587_609669_622219
882258	contig_16594_pilon	+	2497	2	Intergenic	novelGene_53791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	550	939	115812	116201	FALSE	35	GCTTTGGTTTCCAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHNQPSRVCTHAIILVT	115119	117759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115469_115611
882259	contig_2377_pilon	-	3380	6	Intergenic	novelGene_67931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1532	1888	660789	660433	FALSE	15	GTTAATCTTCTGGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGWSVQYMSMRSSWLIVAFSSSMSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTTIVELCISLFSAVRVCFMYFEALSLGA	855532	658940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_660914_724410_724948_762951_763062_769596_769777_777491_777563_855023
882260	contig_5018_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_46957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	0	1573	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	8	436	318549	316841	FALSE	5	TTTGCAGCCTGTGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSMAKRMLLLLLEVWVLAGELWLRAEVQAAPYSVKLCGREFIRAVVFICGGSRWRRADVLTYEAMGDAFQDAATDSDSLAGELDEAVASSEWLALTKPRQAYPSGQSSWQGTPGALRGGRDVLAGLSSNCCKWGCSKSEISSIC	318556	316394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_317080_318359
882261	contig_14142_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_120446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	217.5	2400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	375	752	94812	95549	FALSE	10	CTAAGTCGCCTGTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGPTMLLREENGCCSRRQSSSSAGDSDGEREDSPAARARQQLEALLNKTMRIRMTDGRTLVGCFLCTDRDCNVILGSAQEFLKPSDSFSAGEPRVLGLAMVPGHHIVSIEVQRESLAGPPYL	94437	95592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_94893_95079_95264_95436
882262	contig_4797_pilon	-	1532	3	Intergenic	novelGene_6903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCAATTTTCCTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354168	352191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_352239_352333_352406_352755
882263	contig_5350_pilon	-	5423	5	Intergenic	novelGene_99330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4630	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4560	4925	97725	97360	FALSE	50	GAAGGGGGATGAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	263438	96861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_98090_112045_112793_114996_115480_158234_158246_260484
882264	contig_7421_pilon	-	2455	5	Intergenic	novelGene_178297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1753	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	230874	230300	TRUE	20	CTTAGGGTTCCAGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNAAWIHHLGLLSETSKQGYEKAASWSWLHAPSLFLPEGLRSSVRVWSCFPVWAAALVGSQGFCSFVCFELFVSFPFLELGARSGQVVLRGLEPTSLACTDVQRDP	230876	192942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7421_pilon_-_193251_193319_193497_194167_194956_229440_230539_230792
882265	contig_6031_pilon	-	1756	6	Intergenic	novelGene_56758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	650.794775639756	2210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	310	1254	257696	254965	FALSE	15	AGTTGCCCTGATGACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	258005	254462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256375_256704_256814_257469
882266	SIRV5	+	663	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-333	875	-219	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7982	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
882267	contig_1863_pilon	-	1891	4	Intergenic	novelGene_156521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	78.4984076271615	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTTAACCTTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62723	49131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_49540_51778_51906_55778_57021_62609
882268	contig_5686_pilon	-	2607	4	Intergenic	novelGene_45463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTAGCAGCTGAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243166	221507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222912_224039_224201_241595_242557_243085
882270	contig_10973_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_150372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	905	1417	2730	2218	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3634	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3600
882271	contig_20602_pilon	+	2269	12	Intergenic	novelGene_133703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1923	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAGAGACTGTCGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9590	29964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_+_10090_13343_13515_17102_17274_19178_19327_19761_19859_21147_21278_23426_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26554_28880_28948_29482
882272	contig_8616_pilon	+	4957	10	Intergenic	novelGene_72508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	221.693036582424	1617	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	123	1004	336939	339244	TRUE	20	AGCGAGGCAGCCTTTCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTALESLIEMGFPRGRAEKALALTGNQGIEAAMDWLMEHEDDPDVDEPLATPLGHVLGREPISSGQGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336816	343288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336998_337137_337192_337275_337371_337467_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194_343061_343151
882273	contig_13301_pilon	+	2080	9	Intergenic	novelGene_153115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	272	junction_4	194.481843625568	1700	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	185	1579	169218	174444	FALSE	30	CACCCACCCACTCCCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFSPTVSMVEGQGEKNVTFWGKMWPQCEELQGQKLVVEEKRPCLHAPACKDPNRKP	169033	174945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171671_171809_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173087_174281
882274	contig_15327_pilon	-	2885	4	Intergenic	novelGene_70625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	73534	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	131	541	901528	900904	FALSE	20	TTAGACTCTTGATCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902158	898559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
882275	contig_11309_pilon	-	1031	8	Intergenic	novelGene_149869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2302	junction_7	1690.83161521791	4	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	67	960	65730	56293	FALSE	20	CATCTGTGTTAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65796	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
882276	contig_10500_pilon	-	6992	4	Intergenic	novelGene_41190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3240	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639871	1371556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1371661_1371801_1372993_1626859_1627272_1634586
882277	contig_3956_pilon	+	4507	11	Intergenic	novelGene_15181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	927.436472217909	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	524	1900	1286460	1290491	FALSE	65	ATTACAAAAAGGAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282712	1293098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284103_1286180_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
882278	contig_10811_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_165815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2071	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	140	298	457226	457384	NA	20	AAGACATGGTTCTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHASPQTGSPHPGLAVTMASSIDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPTRNALSSELALVGDTTGDTLEKFVEGL	457086	458532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_457100_458500
882279	contig_3155_pilon	+	3050	4	Intergenic	novelGene_26385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	1050.07756327278	5669	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	292	618	259780	261211	FALSE	15	CCCCACCTGTTGGCCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258099	263643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258224_259209_259329_259731_259978_261082
882280	contig_16594_pilon	-	4937	9	Intergenic	novelGene_53819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_3	2548.13402316283	7	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	973	2082	272836	121101	TRUE	70	GAAAAAAGAGAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306489	115713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_306350
882281	contig_8377_pilon	+	8991	22	Intergenic	novelGene_35105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2924.19537007333	1983	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	5886	7688	179410	197939	FALSE	10	TTGGTGGATTCTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCMCFEQGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	154940	199242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_154992_155715_155845_161226_163969_164011_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
882282	contig_20614_pilon	+	3377	2	Intergenic	novelGene_107571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAATGCCCCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234447	238820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_235112_236107
882283	contig_6691_pilon	+	2520	1	Intergenic	novelGene_60177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTTGGAAAAGCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416879	419399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_416900_419400
882284	contig_16703_pilon	+	9218	16	Intergenic	novelGene_72753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1248.99745751899	20	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	863	1999	20022	40668	FALSE	65	TAAGAAAAAAAAAACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5735	47887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15437_16997_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
882285	contig_10158_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_150779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAAAAACGAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169734	172145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_169700_172100
882286	contig_9633_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_139593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1272	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1899	2228	33245	32916	NA	25	AGCACATGCTTCCCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVQLGLLPSLPSVLDYMPPPEMVECRPILFGTVTLFLSSSFDASCVIEFFAHRIFQYCNSRLEFFLQFFQLFFFFFLSQISFLIIQPCKSKNSVSSTQAQKGLTARK	35143	32304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_32300_35100
882287	contig_3077_pilon	+	1336	8	Intergenic	novelGene_26680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3558.82763314676	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	19	843	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9657	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13155_16209_16328_16936_17054_17449
882289	contig_4797_pilon	+	3528	1	Intergenic	novelGene_6933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCCGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656185	659713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656200_659700
882290	contig_5018_pilon	-	2174	8	Intergenic	novelGene_47026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_6	143.422310620327	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1013	2053	1395875	1392342	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAACTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYPSLQVKVLKEKIEAEKGRDAFPVAGQKLIYAGKILSDDVPIRDYRIDEKNFVVVMVTKAKAGSGTSAPPETSPTAAPESSTSFPPAPASGMSHPPPTAREDKSPSEESVPTMSPESVSGSVPSSGSSGREEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1396887	1392220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395148_1395205_1395340_1395523_1395689
882291	contig_12638_pilon	+	7448	7	Intergenic	novelGene_33285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	891	1196	1071088	1071393	TRUE	50	TCAACAAACCAATTATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYKIISFAHRDTLTSSLPIWMPFLSFSSLIALARTSSTMLSKSGDKGHPCLVPVLSGNAFKVSPFRMMLAVGFV	993188	1367394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_993879_1070887_1073816_1249175_1250632_1250877_1250934_1269940_1270314_1365185_1365422_1365685
882292	contig_6797_pilon	+	4387	2	Intergenic	novelGene_178237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3188	3496	275972	276280	FALSE	5	GGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKGKKKKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	225195	277171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6797_pilon_+_226272_273860
882293	contig_19459_pilon	-	1040	7	Intergenic	novelGene_59810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7972.17407960686	338	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	361	702	11335	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16268	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12592_15503_15702_16203
882294	contig_9389_pilon	+	1429	7	Intergenic	novelGene_83980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1148.39685358909	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	154	675	383398	384766	FALSE	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRALGGSGCCAALSSRLRQGPARLSGEGPGGNGSEKPEAAGGLRPAGEAAMASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	381996	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382144_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749
882295	contig_16666_pilon	+	4983	2	Intergenic	novelGene_61771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	2075	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	81	1214	106098	117928	FALSE	10	GGTCATCATGCTGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGWLIGTSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106017	121697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851
882296	contig_5961_pilon	+	5165	22	Intergenic	novelGene_144100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	510.405734299138	2312	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	541	2346	144074	204388	TRUE	75	AAAAAGATAAATAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKTAC	113355	311233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_204376_204468_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060_214260_267703_268568_310837
882297	contig_12677_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_110737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCATCGGGTAATAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1000
882298	contig_8045_pilon	-	3003	1	Intergenic	novelGene_35466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2742	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2502	2921	524974	524555	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDRKCLLEARADRGEENQRRSSCLHCVDSSTAKMVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRCYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLESVEPNCRSKRMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVI	527475	524472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_524500_527500
882299	contig_10749_pilon	-	893	4	Intergenic	novelGene_133483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	730.849277667199	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCTGTTCACCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169049	163928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167177_168298_168346_169012
882300	contig_11316_pilon	+	2876	2	Intergenic	novelGene_122642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	567	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	124	636	137674	138186	TRUE	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137550	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138599_138698
882301	contig_14441_pilon	+	1095	5	Intergenic	novelGene_100392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	466.767875929782	13299	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	507	1055	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	47264	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47561_122126_122188_125517_125902_126159_126283_126514
882302	contig_17976_pilon	+	2979	5	Intergenic	novelGene_32469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1266.39409347959	251	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	91	1107	41843	47385	TRUE	30	AGGGCAGAGGGGATTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41586	53525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41649_41814_41858_45524_45585_46443_48866_53133
882303	contig_20602_pilon	+	1751	12	Intergenic	novelGene_133707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTCGCCCCCAGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9675	29534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_+_10090_13343_13515_17102_17274_19178_19327_19761_19855_21146_21278_23426_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26554_28880_28948_29482
882304	contig_1452_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_115166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGAATTGGCTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709615	707956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_708000_709600
882305	contig_6589_pilon	-	3817	13	Intergenic	novelGene_25874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1266.86229574839	7286	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	951	1478	969260	968733	TRUE	15	ATGCAGATGGCTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPRWLGEMANRSTKSSSIVTQPGGSGAPRGGSRWSGGPQVEAAARESGQGCGSPEGAGISGGPSVTGERTAALGEPGGEGSSGSGDSGASPAPPQSPANSGPPPLRDRMGRGSGEPGEARAGWGRGRGRSDTERCRGEWAMGRAGSGARVSSDLARGKPWVGVGEAGSPVAGR	970210	955187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_955299_955760_955831_956001_956127_956715_956815_957184_957360_957758_957846_959101_959516_961883_962049_965442_965916_966949_967097_967583_967676_967766_967889_968473
882306	contig_5023_pilon	+	2071	7	Intergenic	novelGene_7217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2459.7412465542	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	341	760	609620	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRPLEKQSTRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609658_639072_639197_643413_643539_646857
882307	contig_1452_pilon	-	4928	4	Intergenic	novelGene_115128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1096.53403453285	21	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	TRUE	15	TATGCATCTATTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	695214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_697699_697873_699953_700534_700690_715232
882308	contig_10482_pilon	+	7537	9	Intergenic	novelGene_152806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1329.93768651016	3743	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	126	680	116203	123281	TRUE	45	CCATACAATACAAAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	77243	137613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942_128260_133103
882309	contig_7933_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_164681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4764	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	24	317	189534	185916	FALSE	30	TCTAAGAGAGAACGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTDLTKMPSQMEHAMETMMFTFHRFAGDKGYLTKEDLRVLMEKEFPGFLENQKDPLAVDKIMKDLDQCRDGKVGFQSFFSLIAGLTIACNDYFVAHMKQKGKK	189557	185659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_186078_189402
882310	contig_6272_pilon	+	4834	20	Intergenic	novelGene_160460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	125	junction_11	194.364565925826	156	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1118	3357	1364	4720	186620	248604	FALSE	0	CTTCGGTGTTTGTCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSLSGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYEIRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADITINLNVRDHIKDEWEGLRKHDVCFLITVRPTKPYGTKFDRRRPFIEQVGLVYVRGCEIQGMLDDKGRVIEDGPEPRPNLRGESRTFRVFLDPNQYQQDMTNTIQSGAEDVYETFNIIMRRKPKENNFKAVLETIRHLMNTDCVVPDWLHDIILGYGDPSSAHYSKMPNQIATLDFNDTFLSVEHLKASFPGHNVKVTVDDPALQIPPFRITFPVRSGKGKKRKDADGEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMVVGPPGTGKTDVAVQIISNIYHNFPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIMALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNYVLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASYTCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGNPLPDVAEIATFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRSKYLLVKEAKVIAMTCTHAALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPPVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRYKNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYMCLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGSNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLSLVRTRAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYVFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLHIIPTEPFPATRKNGERPSHEVQMIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTFLQLPPAMVEEGEGVQSQETELETEEETTPVHGDILPGSADASSSQEMSASETETTPDLAETIPGPAEATSNHTASSDPEATHPQAETTAAVAASVTAPTKAHAPQEATPTPAETTAAVAASVTAPTKAHAPQDATPAPAETTAAVAASVTAPTKADAPQDATPAPAETKEPNSNPS	185256	248718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_186781_189277_189457_192577_192746_195368_195539_199591_199834_201721_201869_202642_202713_206226_206338_208819_208930_211281_211418_214324_214535_216555_216694_219214_219287_220337_220526_220854_221027_227478_227650_239229_239316_242789_242965_245320_245435_248067
882311	contig_7009_pilon	+	4450	8	Intergenic	novelGene_23643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	153	junction_3	562.24535279066	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	2	1591	444955	537035	FALSE	5	GGTTTGTTTTGTTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVVTYGADGFRDFHAIIPKSFSPSNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKREKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	444953	539894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_444995_453481_453602_496799_496860_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_522972_536325
882312	contig_11309_pilon	-	868	8	Intergenic	novelGene_149870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2535.89870556731	21	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	801	67	867	65730	56223	FALSE	20	CATCTGTGTTAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRPA	65796	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56230_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
882313	contig_6233_pilon	+	1199	9	Intergenic	novelGene_74749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.925143175622	27	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	126	515	113021	123472	TRUE	10	GCTGCCAAGTTCTTTGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAVMFKSQLNQRMTLTLCLAIKRRKRRMSSSQMRMKY	112895	131509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119742_123365_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
882314	contig_10689_pilon	+	1119	4	Intergenic	novelGene_118615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	7	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	128	646	57608	61101	FALSE	25	TTGATGAAAAGCTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51234	61574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
882315	contig_10431_pilon	-	4291	1	Intergenic	novelGene_117402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	555	968	242431	242018	NA	35	AACTAGAACAGTTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHYLPKLTQTEVEQLNNPITKEEIEKIIQKLPTKTSPGPDGFTREFYQTFREELTPLLLKVFQSIEKDGILPDSFYEASITMIPKPGKDTTKKKENYRLISLMNTDTKILNKILANRIQQHIKKIIHHDQV	242985	238694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_238700_243000
882316	contig_15327_pilon	-	2757	4	Intergenic	novelGene_70623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGACTCTTGATCTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902150	898559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899113_899295_901256_901409_901539_902035
882317	contig_5779_pilon	+	5389	2	Intergenic	novelGene_106475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1935	2333	280705	281103	FALSE	20	TCCACGTGTATGCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKSTNKRNSAQESKRNKENISTTKKALQNAIPLLGIYPREIRAITRIDICTPIFIAALFTTAKRWKPPRCPSTDEWINKRWYIQTTEHYAKIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	136233	284159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_137925_280461
882318	contig_15449_pilon	+	4117	15	Intergenic	novelGene_33588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	692.617602185465	3	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	260	2791	37166	54621	FALSE	35	ATAGCAAGAATCATGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	28061	55947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47165_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
882319	contig_15105_pilon	-	4347	3	Intergenic	novelGene_151003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	977.5	282	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	37	516	839916	836135	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGQSVNALFQYIPFCSDL	839952	827912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_830670_835060_836548_839849
882320	contig_15741_pilon	-	1279	7	Intergenic	novelGene_159677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	575.405195396156	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	457	552	60544	50677	TRUE	75	ATGGACAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVAIASVQQAAFGDHNIQYQFRTENNGGQVTYRVVQVTDGQLDGQGDTAGAVSVVSTAAFTGGQQAVTQVGVDGAAQRPGPTAASVPPGPAAPFPLAVIQNPFSNGGSPAAEAVSGEARFAYFPASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSFKNHSRL	61682	49621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50703_60474_60559_60681_60833_61252_61454_61592
882321	contig_3975_pilon	+	3144	8	Intergenic	novelGene_54930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2050.66190409291	158	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	780	1283	2344841	2354386	TRUE	5	TCTTTGTCTGTGCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2327402	2356695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2327495_2327660_2327750_2344242_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277_2354534_2354981
882322	SIRV6	+	1363	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	163	2	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	GTCGTAGATTAACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882323	SIRV6	+	1344	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	57	127	7	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	201	692	1733	10736	TRUE	10	ATGGGGTTTGCCGATGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1144	11698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882324	SIRV3	+	569	3	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	2703	-1	663	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4666	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_4775_6057_6334_8755
882325	contig_12677_pilon	-	488	1	Intergenic	novelGene_110771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2649	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2600
882326	contig_4103_pilon	+	1370	4	Intergenic	novelGene_51968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	82.3056633666373	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	462	785	174424	175646	FALSE	30	AGACCAGATTACTGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVLTPTEAGGSYSAECGASISPSPNVTLPSELRSLFTRPLFSAGNKERGWNDPPQFSYGLQTQAVGSKRTPLTKRVAAAQDGSPRAPASETTPGPPPKGPPPPSDKAPRPSPVGSCPASSVKPPSFPVIKSETLLEDVLRPLEQALEDCRGHMRKQVCDDISRRLALLQEQWAGGKLSMPVKKRMALLVQELSSQRWDTADDIHRSLMVDHVTEVSQWMVGIKRLIAEKKSLSSEEEAAEKSAATTEENQTVPGFFGAP	171380	176231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_171642_174223_174430_175196_175306_175437
882327	contig_5341_pilon	-	1580	4	Intergenic	novelGene_168013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	465	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	381	905	339444	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_339958_340655
882328	SIRV6	+	1128	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	387	13	107	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	20	TGGGAGTCAATGGCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882329	contig_11896_pilon	+	8815	10	Intergenic	novelGene_88003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8560	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	6994	7599	138978	141781	TRUE	45	AAGACAAGGAACAGTCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISGLTSSEIAFDCSSSIEDSSDAWGVLLKELLLWSSAVTSEGATSTTDSRQLSLLPPLNSSILEWEKDWDRVSWESSTNFSRALKKSMRSVLKSETSAWQLGWGLGDSGSGDMGRSFSRDVNSSIGSKWTFMSAFSASVSKSSTVKSGNSLAISGACPGWIKALDAWQLSRGNFDSFRQHPDEHPLMSFRFNSSSICPA	131984	181637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_139012_141209_142048_151208_151407_154470_154618_160036_160084_173159_173290_173423_173518_177241_177435_180736_180805_181564
882330	contig_11639_pilon	-	2020	10	Intergenic	novelGene_151151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.3071540382928	509	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	190	1044	79829	27170	TRUE	30	GGCCTTGAGGTGTAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEDARYLKRKVKGGNIDVHPSEKALIVQYEVEATILGEMGDPMLGERKECQKIIRLKSLNANTDITSLARKVVEECKLIHPSKLHEVEQLLYYLQNRRDALTGKEKKEKSSKPKDPPPFEGMEIDEVANINDMDEYIELLYEDIPDKVRGSALILQLARNPDNLEELLLNETALGALARVLREDWKQSVELATNIIYIFFCFSSFSQFHGLITHYKIGALCMNIIDHELKRHELWQEELSKKKKAVDEDPENQTLRKDYEKTFKKYQGLVVKQEQLLRGMNS	80018	17527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_-_17536_17832_18739_27107_27283_29603_29729_30868_30969_43506_43649_44209_44266_46813_46969_51022_51155_79797
882331	contig_2377_pilon	+	1465	9	Intergenic	novelGene_67900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	471	junction_8	518.901348403528	4	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	2	763	197521	224342	FALSE	15	CCATTGATGTACTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEAVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	197519	225044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
882332	contig_4891_pilon	-	2838	6	Intergenic	novelGene_124590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.76411595413	1348	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	79	405	964296	940000	TRUE	25	TCCTTAATTAGACTTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPPPGLLLVHAARRSARPASVAAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964374	936022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937856_937971_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
882333	contig_7728_pilon	-	2255	9	Intergenic	novelGene_64697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_6	173.346473860878	882	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	35	985	752150	713693	FALSE	15	TTACTTTCTAGTGTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	752184	712422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
882334	contig_9836_pilon	+	2828	3	Intergenic	novelGene_176160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCTTATTGAGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29786	226402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_30841_31113_31321_224835
882335	contig_9049_pilon	+	2117	8	Intergenic	novelGene_83131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	1469.82804769671	2921	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	50	742	88356	112652	TRUE	45	CACAGATGAATTTATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88306	114139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112874_112985
882336	contig_6233_pilon	+	2694	9	Intergenic	novelGene_74747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_1	171.741630072618	5781	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	128	1129	113021	131406	FALSE	15	TTAGTACTTTGTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	112893	132971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119756_123348_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
882337	contig_13403_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_158092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCTAGCCTTGGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66647	65589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_-_65600_66600
882338	contig_3627_pilon	+	4065	3	Intergenic	novelGene_78512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATAGGAATTCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621409	627370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621482_621526_625155_627005
882339	contig_12312_pilon	-	5329	1	Intergenic	novelGene_63930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	326	349	214932	214909	NA	40	CTCTTAAACACAGTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIWGWVHFLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215257	209928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_209900_215300
882340	scaffold_12124_pilon	+	3201	11	Intergenic	novelGene_22237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3172.24735006588	1	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1232	2011	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1483992_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
882341	contig_16846_pilon	-	902	2	Intergenic	novelGene_82989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9069	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	6	308	552791	551492	FALSE	40	AGGGGAGGCAAATCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMMSEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEASGFIHEDHLRELLTTMGDRFTDEEVDEMYREAPIDKKGNFNYVEFTRILKHGAKDKDD	552796	550897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_551665_552661
882342	contig_10500_pilon	+	3896	3	Intergenic	novelGene_41200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	118	899	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAAAGTATTAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402848	1408179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1406264_1406564_1406636_1407769
882343	contig_5961_pilon	+	6852	20	Intergenic	novelGene_144124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	506.229027471606	151	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1115	3348	140	3487	144074	214246	FALSE	60	AAGAAAAAAAGCATTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	135139	217611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_135214_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_204380_204468_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
882344	contig_4093_pilon	-	3184	6	Intergenic	novelGene_27620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	3919	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	485	1222	69245	41737	FALSE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72908	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
882345	SIRV3	+	398	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5911	-1	3852	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7855	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
882346	contig_8330_pilon	+	2764	5	Intergenic	novelGene_71886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.3192386025375	89	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	162	545	1060926	1065600	TRUE	25	GACAATTGGTATTCCGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKCRSDPVLHIDLRRWADLMLVAPLDANTLGKVASGICDNLLTCVIRAWDRSKPLLFCPAMNTTMWEHPITAQQVGQLKAFGYVEIPCVAKKLVCGDQGLGAMAEVETIVDKVKEIFCQRNGFQKK	1060656	1072139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1060818_1060925_1061055_1064905_1065075_1065514_1066471_1070790
882347	contig_10930_pilon	-	10918	8	Intergenic	novelGene_36965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1643.30593869896	182	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	2596	4203	280415	268388	FALSE	20	GGTATGCCCACTGACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	284987	261672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157_281849_283825
882348	contig_8122_pilon	+	2170	2	Intergenic	novelGene_40173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1166	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2325	111381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_2638_109523
882349	contig_13702_pilon	+	1830	1	Intergenic	novelGene_102643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	953	1252	211071	211370	NA	30	CCACAGGCAGGCTACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210118	211948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210100_211900
882350	contig_10500_pilon	-	3937	9	Intergenic	novelGene_41224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	881.125549723194	15	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	120	1028	1640040	1629460	TRUE	50	ACTAAAACTCAGTAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640240	1625778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628615_1629386_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871_1640061_1640141
882351	contig_9931_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_134815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1679	junction_1	0	5079	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	193	891	364058	364756	FALSE	30	GTCATAAAGACTATTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKLSKKKKGYSVNDEKAKDKDKKAEGTGTEEEGTAKENETQAAVETTEVKEGKEEKPEDTQDTANKSEEKEGDKGTAVAKEEAPKAEPEKTEGAAEAKPEPPKDTEQEQAAASAPAASGDAPKASEASADAKAETTAPTKVDDKSEEEGEPKKTEAPAAPADQETKSDGAPASDSKPSSTEAAPASKEPPAATEAPSSTPKAQAPAAPAEEAKAAETPAVNSDQTVAVKE	297125	365645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_297309_364048
882352	contig_9345_pilon	+	4295	4	Intergenic	novelGene_24432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	455	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCATTTGAATGTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334647	482928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_336575_392279_392453_393407_393862_481187
882353	contig_3956_pilon	+	2900	14	Intergenic	novelGene_15043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1203.84285081877	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	712	2376	1285728	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282803_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
882354	contig_10627_pilon	+	6569	20	Intergenic	novelGene_59987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	377.242289718895	4281	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	108	494	280603	281325	TRUE	10	ACCTCCGCAGCGGGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQATEAAQATPSHEAKSSGGSSTVQRSKSFSLRAQVKETCAACQKTVYPMERLVADKLVFHNSCFCCKHCHTKLSLGSYAALHGEFYCKPHFQQLFKSKGNYDEGFGRKQHKELWVHKEVDPGTKTA	279774	346277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_279829_280549_280645_280824_280870_280946_281087_281165_285707_286818_286997_287403_287534_287910_288042_288697_288850_289343_289535_290170_290265_290473_290544_292749_292822_296012_296146_307135_307260_313280_313393_319338_319439_327019_327061_337840_337968_346238
882355	contig_13542_pilon	+	1241	6	Intergenic	novelGene_131522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	859.852312900303	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	222	521	487955	505589	FALSE	80	AAAAAACAACCAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	464704	506309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
882357	contig_8020_pilon	+	1092	5	Intergenic	novelGene_114350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	128.749757281325	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	291	707	40454	53381	FALSE	30	TCTTAACAGTTTAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSEAGRHSRMGDKPIWEQIGSSFIQHYYQLFDNDRTQLGAIYIDASCLTWEGQQFQGKAAIVEKLSSLPFQKIQHSITAQDHQPTPDSCIISMVVGQLKADEDPIMGFHQMFLLKNINDAWVCTNDMFRLALHNFG	40163	53766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_40458_47437_47566_51342_51415_51503_51603_53267
882358	contig_19990_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_30760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGCCATAAGCACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51423	52976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_51400_53000
882359	contig_11363_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_160485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	994	1362	144580	144948	NA	50	GGTAAAAAAATATCAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCISLWSVASVVLKVRSSHLRCTSLSQPPGVKENEEHQRHKGSGSPGDRKGHINQRLHQPETRTRWCLASTNGRPYRKHNRESLLEQEKSEVQKSNSSKKTRLNGLIETGGTPEDMAPRLC	143586	146339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_143600_146300
882360	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
882361	contig_1150_pilon	-	455	4	Intergenic	novelGene_61412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30584.16143838	215	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309177_309342_309385_309812_309927_311002
882362	contig_3018_pilon	+	1712	10	Intergenic	novelGene_78771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	759.828895618799	2612	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	207	1712	371069	499858	FALSE	20	AAGTGTCCTTCCATCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVEQELANIDPSWIESPKTNGHIENGPFLLEQQLDDEEDDEEECPNPEEYNLDEPTAESDYTYSSSYEQFNGELPNGQHKIPESQLPEFPTSLFPGPLEPVACGSALSEGSPLNEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKS	370862	499858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373
882363	contig_20951_pilon	-	892	2	Intergenic	novelGene_43048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27582	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27365_27500
882364	SIRV6	+	1445	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	81	2	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	TGCGTTTGGTCGCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882365	contig_753_pilon	+	3070	1	Intergenic	novelGene_112976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	26	514	1190616	1191104	NA	45	GATAGCATACTAAGATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGEIRTLMHCWWECTMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPYDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRCKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMGKNNNESVNRLITWMKLENIMLSEISQSQKDKYLYETSIVKTHEKVHTQNVTIFVGYQGWKGWEGNTK	1190590	1193660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1190600_1193700
882366	contig_16525_pilon	-	2414	6	Intergenic	novelGene_133784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3939	junction_5	653.69424045191	1016	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	55	462	97608	91737	FALSE	40	ACAGAAGTAAACACTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVPSPRADGAGGLSAWV	97662	89784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
882367	contig_3817_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_78301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120458	119881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_119900_120500
882368	contig_7457_pilon	-	4743	23	Intergenic	novelGene_31486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4438	4737	642577	612248	FALSE	10	CTCCCTCAGGGGCGACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDSQSKGPETALAPSGSCHCTADAAAPGTVCRAAAADSIGPSCWNPGSQLFLRLRPDRLRLRLGRGAGRGAPSGRGASPSRQGEGTPSWGARQGSG	671993	612241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_612390_641605_641758_642571_642716_643347_643446_648694_648792_648953_649075_649224_649322_649492_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
882369	contig_1462_pilon	+	5486	5	Intergenic	novelGene_178277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	4894	5352	219641	220393	FALSE	75	GAAAAAAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVRRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAALGQEPAAPGSRGANEQRPRDLISAAAQT	42783	220527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1462_pilon_+_44956_110105_111121_188144_189109_218898_219996_220289
882370	contig_16666_pilon	+	3829	3	Intergenic	novelGene_61774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7	1809	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	195	1262	116861	117928	FALSE	15	ACTTCCGTCTATGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106070	120495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_106395_106497_116851
882371	contig_10197_pilon	-	7209	6	Intergenic	novelGene_115204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	811	junction_1	1121.41250215966	278	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	252	1019	952331	910531	FALSE	75	TTAAATGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952582	904340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
882372	contig_10235_pilon	+	2453	2	Intergenic	novelGene_46310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2218	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGTGTCTCAGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89316	91872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_91544_91646
882373	contig_10973_pilon	+	770	1	Intergenic	novelGene_150381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAATAATAAGGGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540	2310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_2300
882374	contig_3673_pilon	+	5741	4	Intergenic	novelGene_178298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3652	4062	323550	323960	FALSE	15	CTGATGCCTTTGAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKRLHQKSTNRAYRLGKKFWTVQVRQGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPVLLARIKNIGNSKCWRGVGRWELLCTAGGNAKCYNHFGK	204636	325639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3673_pilon_+_204996_205518_206869_261477_263287_323416
882375	contig_16496_pilon	-	1386	2	Intergenic	novelGene_5122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3446	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
882376	contig_6137_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_59243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAGGAATGACTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318003	1316505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1316500_1318000
882377	contig_12869_pilon	+	2297	8	Intergenic	novelGene_75320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	228.514903725096	1790	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	117	1196	67397	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67280	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
882378	contig_16703_pilon	+	1061	7	Intergenic	novelGene_72773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_4	1214.6354391339	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	76	942	27154	40668	FALSE	80	ACAAAAAACAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	26057	40787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
882379	contig_20819_pilon	-	2272	4	Intergenic	novelGene_55683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3101	junction_2	355.588088789387	100	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGTTTATACATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68027	65417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65650_65743_65860_65963_66048
882380	contig_4093_pilon	-	4452	6	Intergenic	novelGene_27607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_5	1917.86172598548	70	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	337	1074	69245	41737	FALSE	30	CAGTCTGACTTAATAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72423	38358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72098
882381	contig_10437_pilon	-	3178	2	Intergenic	novelGene_38356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	515	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	2788	3177	558727	558060	FALSE	5	GCGACCCGCTGGTCCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSWFTLFKCLATKAPKDIRVTILPQFVTPSLKTWTITRDIDLTSSSFFMSSFRSMPWKAVSWLRCSPSATRRSVSSAFLPAGPDAPIGFASLAPLACSRRYREIISSDCRYNSSSSSSSSSAEGGVDG	561514	558058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_558276_558553
882382	contig_12939_pilon	-	643	3	Intergenic	novelGene_166203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1250	junction_2	130	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTTTAGTGTTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46493	45220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031
882383	contig_15165_pilon	+	2900	2	Intergenic	novelGene_145297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCCGGCGCCCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216	3172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_406_461
882384	contig_3747_pilon	+	2613	7	Intergenic	novelGene_24769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	332	1369	201313	203939	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEVSTVGYGSTSASDFPM	200981	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203889
882385	contig_8693_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_150878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	889	1227	1168584	1168246	NA	50	GAGTGAAAAGAATTTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRNFTKDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHFTPTLLARIKKTENNKCWRDCGEIGTLMHCWWECKMVQPFWKTIWHFLKNLEIEIPYDPAILFLGLYPREIRAIT	1169472	1167040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1167000_1169500
882386	contig_8317_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_20054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGCAACTGTCTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17068	16422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_17100
882387	contig_5023_pilon	+	2341	9	Intergenic	novelGene_7229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2367.1683208794	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	87	839	607279	643481	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEARFH	580842	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_643467_643539_646857
882388	scaffold_12124_pilon	+	2986	11	Intergenic	novelGene_22311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	149	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1028	1807	1508626	1509405	FALSE	45	TTTAAAATATATATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473602	1510584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508120_1508221
882389	contig_12079_pilon	-	3175	13	Intergenic	novelGene_67444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1277	junction_12	992.55381536161	6374	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	478	1410	600738	583739	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRVARAAGQGGAGETGCGSDKEPGAAGHGAR	638846	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582170_583662_583756_584142_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
882390	contig_4232_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_63294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468100
882391	contig_10009_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_82718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCAGGTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43758	41538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_41868_41978
882392	contig_9919_pilon	-	3775	2	Intergenic	novelGene_137956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	277	576	547437	547138	TRUE	0	TTCTTTTTTTTTTTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRHPESMALRHPFSLVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	547713	543890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_544190_544237
882393	contig_14513_pilon	-	1308	4	Intergenic	novelGene_70323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	2642	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
882394	contig_11422_pilon	+	653	1	Intergenic	novelGene_99015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTGGAGGGGATATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
882395	contig_17829_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_157019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739	2208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_700_2200
882396	contig_5023_pilon	+	2502	11	Intergenic	novelGene_7356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1411.60830615295	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	215	1315	618569	646990	TRUE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	616411	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647615_647736
882398	contig_10627_pilon	+	6126	16	Intergenic	novelGene_59990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	378.983001670993	286	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	109	345	281010	281325	TRUE	45	TGAAAAGGAGCAGGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKSSGGSSTVQRSKSFSLRAQVKETCAACQKTVYPMERLVADKLVFHNSCFCCKHCHTKLSLGSYAALHGEFYCKPHFQQLFKSKGNYDEGFGRKQHKELWVHKEVDPGTKTA	280824	319439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_280870_280946_281087_281165_281329_281416_285707_286818_286997_287403_287534_287910_288042_288697_288850_289343_289535_290170_290265_290473_290544_292749_292822_296012_296146_307135_307260_313280_313393_319338
882399	contig_854_pilon	-	1646	2	Intergenic	novelGene_36349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGTGTTGGAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976418	974685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976116_976202
882400	contig_6102_pilon	+	2565	13	Intergenic	novelGene_31770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	189.439450895413	2427	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	329	1513	350018	357373	FALSE	20	TGGATTTGGTCATACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKKASKTAENATSGETLEENEAGD	349689	358425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038_357093_357307
882401	contig_8317_pilon	+	800	2	Intergenic	novelGene_19329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCAGTTTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	17069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
882402	contig_8661_pilon	-	3038	11	Intergenic	novelGene_137926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	862	junction_8	440.494994296189	3409	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	172	1038	315977	301399	FALSE	40	CAAAAATGAAGTGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMSPLRPQNYLFGCELKADKDYHFKVDNDENEHQLSLRTVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIKVTLATLKMSVQPTVSLGGFEITPPVVLRLKCGSGPVHISGQHLVAVEEDAESDDEEDEDVKLLSISGKRSAPAGGNKVPQKKVKLAADEDDDDDDDDDDDDEDDDDDDFDDEETEEKVTVKKSVRDTPAKNAQKSNQNGKDSKPSTPRSKGQESFKKQEKTPKTPKGPSSVEDIKAKMQASIEKGGSLPKVEAKFINYVKNCFRMTDQEAIQDLWQWRKSL	316148	299398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_308421_308506_308832_308891_311743_311812_311905_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_315937
882403	scaffold_12124_pilon	+	3032	9	Intergenic	novelGene_22361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_5	2745.91694327687	29	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1063	1842	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1486529	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
882404	contig_8317_pilon	+	883	2	Intergenic	novelGene_19377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16267	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
882405	contig_10749_pilon	+	1114	4	Intergenic	novelGene_133480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	510	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGGTCCCGCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163926	169053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_164573_167011_167398_168304_168344_169010
882406	contig_15449_pilon	+	3831	18	Intergenic	novelGene_33568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	819.804859049039	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	441	2000	37166	48304	TRUE	70	ACCAATAAAAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFDV	12844	55601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_12884_14474_14552_15759_15842_17357_17421_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47290_48296_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
882407	contig_15991_pilon	-	1054	7	Intergenic	novelGene_70903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2812.56026108281	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	98	985	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106526	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106462
882408	contig_6589_pilon	+	415	5	Intergenic	novelGene_26131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_1	2660.67965941035	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	42	395	1879501	1880585	FALSE	5	CCTCACTGGCCTGGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1879265	1880605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
882409	contig_14807_pilon	-	1906	3	Intergenic	novelGene_124697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	2034	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1005	1814	38792	37247	FALSE	10	ATCTGTGTCTGTGGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEGEAGFFGNPNPSALELIQQAHCPLIRPGAHWRAGPSPRQHGHHLAYTWGCGGECLCAILSLSLCIALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	37154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298
882410	contig_10437_pilon	-	2065	8	Intergenic	novelGene_38295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1155	1478	446992	443860	TRUE	35	AAGGAGACCTGAGTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHILSAGWVKVDATFVEEESWATCIHTNRHGPFVSHGLCQGNLTAIGKLSVLGTRGSSVFGVIPALSIHGFVGIGSFRIDAFVIDDVLESPGHEATVAAFIAVFFI	452167	431116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_431191_432086_432214_439689_439814_441716_441866_443746_443976_445308_445475_446950_447053_451073
882411	contig_4857_pilon	+	4673	5	Intergenic	novelGene_48731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	620	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1610	2188	1194283	1194861	TRUE	35	GCGTAGAGACATAAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	1192673	1437275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1195407_1195457_1195967_1394407_1395302_1398677_1398982_1437042
882412	contig_15327_pilon	-	1116	4	Intergenic	novelGene_70474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	186.235215669743	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	91	441	390867	372464	FALSE	10	CATCGTGTCCCGCGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPVRKNKMASSIFGTSEENPPSWAKSAGAQSSGGREDSESSWPQRRNSSEASSRDFLDLKVSVPLSVLTPPGLLAMA	390957	371788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372512_381615_381720_382830_382974_390811
882413	contig_10627_pilon	-	6225	18	Intergenic	novelGene_59986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.968844370988	4231	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1039	1593	287929	285479	TRUE	10	GTAATCCCCGCGCGGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYMPGGSVKDQLKAYGALTESVTRKYTRQILEGMSYLHSNMIVHRDIKGANILRDSAGNVKLGDFGASKRLQTICMSGTGMRSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLVY	337956	279734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_279789_280565_280645_280824_280868_280944_281082_281159_285708_286819_286998_287404_287535_287911_288044_288700_288821_290228_290265_290473_290542_292747_292822_296012_296147_307136_307258_313278_313393_319338_319439_327019_327061_337840
882414	contig_12677_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_110855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3782	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
882415	contig_6047_pilon	+	2754	18	Intergenic	novelGene_24206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_3	415.142206843768	324	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	88	2499	105237	123624	FALSE	20	AATACCCAGTGTCTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105149	123879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
882416	contig_10930_pilon	+	565	6	Intergenic	novelGene_37090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_5	5111.4698316629	654	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	83	481	339608	342083	FALSE	10	GGTTGTCATCAGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339417	342167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
882417	contig_15185_pilon	-	2323	8	Intergenic	novelGene_99438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	385	junction_7	224.515623746149	1977	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	214	1269	472420	429911	FALSE	20	AGATATGCAGCCTCCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDRLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQRSIAELVPKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDEMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF	472633	428856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_430073_430179_430258_430363_430541_430670_430749_434091_434172_435509_435689_444528_444701_472290
882418	contig_7272_pilon	+	1347	2	Intergenic	novelGene_25427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	12	389	967255	967632	TRUE	70	GAAGAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECKMVQPLWKSIWHFLRKLEIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAITQVDICTPMFIAALFTIAKKWKQPRCPSTDERINKLWCIHTMEYYATIKNNDEAVKHLVTWRNLEGMMLSEFSQSQKDKYCIRSLL	967243	975619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_968573_975601
882419	contig_18251_pilon	+	1118	7	Intergenic	novelGene_50142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1127.51284791891	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	70	678	35759	53991	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	28601	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_28660_35747_35799_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
882420	contig_4812_pilon	-	1940	6	Intergenic	novelGene_103625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	3988	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	80	598	82626	79235	FALSE	15	TCTTCCATTTGGTTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82705	77892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
882421	contig_20951_pilon	-	796	2	Intergenic	novelGene_43072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	14	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGAAGCAAGGAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27569	26561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
882422	contig_5944_pilon	+	5967	4	Intergenic	novelGene_178301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	4578	5036	192691	193444	FALSE	20	AGTCATCACAGGCCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVACPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRDLISAAAQT	41907	194375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_+_43911_46605_47420_190930_193095_193389
882424	contig_12677_pilon	+	1326	2	Intergenic	novelGene_110818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	690	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2163	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2598_2874
882425	contig_11264_pilon	-	3509	1	Intergenic	novelGene_154212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	824	1357	688664	688131	NA	30	ACCAGGTATGCAGGAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGITENTEKIVEDLLTENFPDIMKDEKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKLTKTKDKERILRVARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIFKALKENNCQPRVIYPAKLSLKYDGEIRAFPDKQKFREFAKTKPKLQEILKGVLRLDNQ	689487	685978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_686000_689500
882426	contig_14142_pilon	-	4734	16	Intergenic	novelGene_120509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_1	254.979179977939	3785	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	12	1232	355495	349539	TRUE	25	CTTCCAGACTCATATACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355506	345188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_345773_346105_346277_346387_346461_346602_346723_346896_347337_347424_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
882427	contig_9837_pilon	+	8332	7	Intergenic	novelGene_178308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	5272	5889	298398	299015	TRUE	60	CAGAAAAAAAAAGTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTQTHVRNKDVNLLKIKGWKKIYQANSYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDIITTNIYAPNGIALKYIKQTLIALKREINSSTKRVGDSNTLLPEKDRTYRKKLNKDTEDIKGTISQLELIDIYRTLLPTAEKYTFFSNAQGTFSRIDHILGHRAILNKLQNVEIIQSIFSDHNAITVEINNRKSK	211982	336104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9837_pilon_+_215278_215777_216850_238135_238490_270707_271128_298267_299678_330495_330994_334821
882428	contig_14467_pilon	+	1138	3	Intergenic	novelGene_138248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	161	556	318609	319153	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPETLPPPPPAPPPWGGHQVTASRGAQKREEALPPLQQLHPGCRASSVWWWVMEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306498	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_318612_318760
882429	contig_5889_pilon	-	4437	3	Intergenic	novelGene_133694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1752	2090	379126	378788	TRUE	0	TCGCCTCCTCCCTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVTEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEENLRIKWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLNNC	380877	279725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_281665_352877_353060_378561
882430	contig_13021_pilon	+	2417	14	Intergenic	novelGene_8127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2489.2111699333	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	270	2120	174676	180850	FALSE	40	ACTGAATTAAGTGGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174083	181147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174217_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
882431	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	27070	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
882432	contig_18869_pilon	-	1568	2	Intergenic	novelGene_56245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGGCTAAGCATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74957	73350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74126_74164
882433	SIRV6	+	1398	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	128	2	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	15	AATGGGGTTTGCCGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882434	contig_10749_pilon	-	1193	5	Intergenic	novelGene_133481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	384.599141964722	7139	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	108	440	167375	167043	TRUE	10	TCTCTGTTCACCTGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWKEERIKPRWWCKGLGRKHRHNVEIQCRAAGAKSMSSLHWVPWRCQPCPSTAYQSCLSSRPLSPSPRSSPRESSVPPMWTPSTCATTRVSRMPTPRTLPTSWPPPSSMPTTCPWNASFESLGSWHGGTRNGDGQEDAEENEESS	169057	163926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_166471_166548_167011_167395_168302_168346_169012
882435	contig_6762_pilon	+	3499	2	Intergenic	novelGene_178309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	985	1467	43530	44012	TRUE	40	GAATTTCTAGAAACTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSVKDITSRKKLNKDTEELNATINQLDLIGIYRTLHPTAAKYTFFSNTHGTFSIIDHMLGHKASLNKIQNIKILHNIFSEHKAIKVEINNINSKEKKKSNAWKLNNTLLKKYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTSKAVLRVQFIAINAHI	42545	81857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6762_pilon_+_44462_80274
882436	SIRV6	-	1166	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTGGCGTTCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11811	7180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7806_7923_10723_10825_11035_11109_11205
882437	contig_7357_pilon	-	4391	10	Intergenic	novelGene_36824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2238.86416859802	87	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	2426	3532	159941	136424	FALSE	35	AATAAAAATTCTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	170686	135564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_159960_166886_167980_169372
882438	contig_10057_pilon	-	1851	5	Intergenic	novelGene_162332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	2354	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	64936	35399	FALSE	35	GACCATAAGGGGCAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64958	34148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
882439	contig_15327_pilon	-	1652	3	Intergenic	novelGene_70615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTTGATCTTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902154	898556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899218_900060_901025_902127
882440	contig_10749_pilon	-	717	1	Intergenic	novelGene_133477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTTCACCTGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164643	163926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_163900_164600
882441	contig_5549_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_81690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGTTACAATCCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757040	759068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_757000_759100
882442	contig_9053_pilon	-	2868	1	Intergenic	novelGene_87952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	76	537	302282	301821	NA	40	AGTTGATAAACTAGGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIDKPLAKLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLGEMDKFLETHSLSKLQQSDVENLNRPITREEIKKVVKKLLTEKSPGPDGFTGEFYKTFTGELLPVLLKLFQSTEEEATLLNSFYEASITLIPKPGKDITNKRKLQTNISHEYRCKNSQQNSSQ	302357	299489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_299500_302400
882443	contig_10482_pilon	+	4311	9	Intergenic	novelGene_152811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1442.27697040998	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	736	1290	116203	123281	TRUE	30	ATAAACATTTGTGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	78848	133777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_79562_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942_128260_133103
882444	contig_10331_pilon	+	5743	23	Intergenic	novelGene_54130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	272.094193249323	2467	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1228	3687	305	3991	410802	598981	FALSE	50	ATAAAAATTAAAAGTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNLSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQDDETSAQDIDNNGKQDSKTDHLAHNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHAELVISKPVSKSPERLRKDTEGLSEDTDYEEEDEVTKKKKDVKKDTIDKSSKPQVKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEEKVKNKESLCIENSSNSSSDEDEEEKSKAKMTPTKKYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSDERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDSDTEAAASPPHPSPEEAVAEEPLHTVAEEESCSPSAELEKPLSASVDSKPVEDKTVEVNDKKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEAGRQQSSVTVSETLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPTGFDASVSSSSSNHPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNSKKKGKGTNSSDSEELSAGESVTKTQPVKSVSTGMKSHSTKSPARMQSPGKCGKNGDKDSDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERITILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERESAATSSSSSSPSSSSITAAVMLTLAEPSMSSASQNGMSVECR	409493	600733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_573425_573511_575995_576195_582599_583815_586578_586693_588938_589155_594919_595067_598853
882445	contig_2730_pilon	-	3638	5	Intergenic	novelGene_135388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAAATACCCACCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543192	363017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_364111_407592_407799_426477_426485_440605_441828_542082
882446	contig_18869_pilon	-	1460	2	Intergenic	novelGene_56392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAATTCATTTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74878	73376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74161_74202
882447	contig_5084_pilon	-	640	3	Intergenic	novelGene_64517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	321	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGCGCCACTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393603	375614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_375979_377896_378045_393475
882448	contig_16125_pilon	-	8246	19	Intergenic	novelGene_155225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1201.36765684514	649	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	55	2550	236934	117592	TRUE	45	TATGTTATGTTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHSQSGSGGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGSTLQVEEKSNSWSWGILKMLKGKDDKKKSIREKSKVSDSDNNEGSSFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	236988	110394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_111127_112627_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_143589_143728_144626_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
882449	contig_3817_pilon	+	2081	6	Intergenic	novelGene_78316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	660.126230352953	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	752	1144	199102	204532	FALSE	60	AAAAAACCCAATGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGAQWPKVGATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGEQDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQNVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDIIYEMYTKMNAELNYKV	178642	205469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_193004_193445_197949_198009_199026_199161_201700_201852_204349
882450	contig_3956_pilon	+	3102	15	Intergenic	novelGene_15158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1082.03108333639	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	35	2578	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281647	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282734_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
882451	contig_17427_pilon	-	2248	12	Intergenic	novelGene_30311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1007.29416616502	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	57	746	188879	179445	TRUE	20	TTCGTTGTTTACCTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSHLYLNCRARSGEWKIKRMFPTW	204717	176947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179697_182700_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
882452	contig_3004_pilon	-	3782	1	Intergenic	novelGene_127552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTAACTTGAATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815627	811845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_811800_815600
882453	contig_17976_pilon	+	2653	2	Intergenic	novelGene_32489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6958	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	271	1188	46468	47385	FALSE	65	CAAGAACAACAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41624	48850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41862_46434
882454	contig_12586_pilon	-	1810	8	Intergenic	novelGene_121794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.874764877086	2916	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	59	445	70067	56396	TRUE	10	GCTGTGGAGGAGGTGTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDKPWVGDAPSFCLGTIGDMSGYTPDEKLRVQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPQRLWPLEEFWNKFLQNPTPWRNALFKVYRHSVFAFTHVLIPAWIIHYYLKYHVNVKPYAIVERKPRIFPGDTILETGEVIPPMKDFPDQHH	70125	33277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_33350_46102_46237_52936_53069_55041_55303_55629_56465_63106_63152_65426_65520_69887
882455	contig_1443_pilon	+	862	2	Intergenic	novelGene_28182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5175	junction_1	0	146	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	97	561	344128	344592	FALSE	25	TCTAATGAGTGAGAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	343652	344893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_343744_344122
882456	contig_9363_pilon	+	4376	6	Intergenic	novelGene_6622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1256.70149200198	10699	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	123	740	872458	873683	TRUE	35	TCCATACAATGGGATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVEGLLDALYGKVLSEEQYQAVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	872335	996040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872729_873004_873095_873426_876223_876313_876808_916241_916697_995892
882458	contig_14744_pilon	-	1678	6	Intergenic	novelGene_66063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGCCCCACCATTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386567	1382076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1383209_1383301_1383401_1384428_1384572_1385181_1385231_1385818_1386004_1386497
882459	contig_5836_pilon	+	2716	1	Intergenic	novelGene_106286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	944	1540	122619	123215	NA	75	AAAAAAAAATAATAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFGKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	121675	124391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_121700_124400
882460	contig_854_pilon	+	5134	33	Intergenic	novelGene_36536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3162.61991605037	4	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1612	4839	80	4918	1649514	1710183	FALSE	25	CTGGAAATATGGCGTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANHLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQVRSSRPHWI	1612866	1710399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677550_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991
882461	contig_5337_pilon	+	2652	2	Intergenic	novelGene_136572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAAAAACTTAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375689	382349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_+_375697_379704
882462	contig_3627_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_78514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621816	622883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621800_622900
882463	contig_10923_pilon	+	1054	5	Intergenic	novelGene_66219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	954	junction_4	332.757700887598	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	37	939	32909	42718	FALSE	20	ACACTTGTAGGTAGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CILYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLIKKSNPETPKIVAFETVHSMDGAICPLEEMCDVAHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIVSGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQILRRTHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGDAALNSKICDLLLAKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLVAWTEVGLPLQDVSMAACNFCHRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA	32872	42833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10923_pilon_+_33051_36532_36698_37270_37540_38578_38742_42554
882464	contig_16098_pilon	-	2326	11	Intergenic	novelGene_45932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1460.85428773714	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	46	1335	352350	348413	FALSE	15	CATCTTCGACTGCCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354034	347421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350342_350528_350643_350765_350889_352152_352352_353990
882466	contig_19722_pilon	-	3633	4	Intergenic	novelGene_171899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCAGAAAGGAGATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173726	100054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_100142_108246_109189_170683_171386_171824
882467	contig_8059_pilon	-	4354	3	Intergenic	novelGene_111077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2925	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3037	3393	36565	36209	FALSE	10	GGCATCCCATTGCCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNILMLWTLLRLALWPNMWSILENLPCALEKKVYLAAVGCSVSYMSMRSSWLIVPFSSSMSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTTIVELSLSLFSVVRVCFMYLGALLLGA	213261	35247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_37243_150703_151207_211405
882468	contig_7151_pilon	-	4240	4	Intergenic	novelGene_40723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	447	1433	429177	428191	TRUE	45	GGCAAAGGATATGAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVTLRCCSTAWLEGVEVCNAGYSGNRKRRKMQRDKKLSNEERQKGKKRKKKIKQIKKKKKQKTKQERPPKKQTNKQKTQHKKKCPQRSLYMSVEAEGGVSLTRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLKRSSTASQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKATLVANKWHSESQLVRAGVSGQETVSVGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPATNKWHSDNHPFRCVESKQPLFPRQETVAAGSRGGRVGVKKGVG	429623	355434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_356579_360094_360961_402602_403260_428050
882469	contig_4151_pilon	+	4224	2	Intergenic	novelGene_65264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_1	0	2137	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	234	872	620441	663644	FALSE	50	TATTCTAATAAAACTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	620207	666996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_663078
882470	contig_1264_pilon	+	3541	11	Intergenic	novelGene_161315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2378	2794	142014	143614	TRUE	5	GGGCCTGAGGCTCCGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTHSWPTISAHSSSEVITASLGLHKYNCLIFLFGHYFLHELDQFVVFFTFHADIHNLEDVVVGTQLQIAHIDLSVITKKILSKLSYFFWPGCTPHQGLSIRPDLVNNFTDLGFKAHIKHSVCLIQYKVSTSAKICLS	138591	152648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_140929_141973_142036_142291_142403_143248_143422_143503_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148370_152545
882471	contig_3894_pilon	+	3997	4	Intergenic	novelGene_174749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	921	1676	4458	5213	TRUE	40	GAACCAATTATATACGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKWTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGN	3537	25574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3894_pilon_+_5430_6616_6872_23612_24626_24737
882472	scaffold_13505_pilon	+	8706	5	Intergenic	novelGene_111598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5311	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4452	4913	659510	660022	FALSE	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	652843	663815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_656131_656809_659613_659663
882473	contig_20527_pilon	+	4805	6	Intergenic	novelGene_138570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1158.2056121432	510	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	656	1282	13527	27453	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12871	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27660_34026
882474	contig_5013_pilon	-	3982	5	Intergenic	novelGene_110092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	363.963253639705	422	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	2254	2832	195418	194840	TRUE	50	TAAATAAAGTTTCAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKRFLGILIASIITATAIAATAATAVALSQSIQTAQQFNTYMQNVTSEMQTMVHIDQEILKRLGALEASFLWLGEQQEALWEHSQLTCDAEYTRFCITALPYNDSWKDVKNNLLASFASPLKSDIQKLQFQLQEQLLRLQSESNKATLNTLNDFAYWLNPTHWFSGLSLRVWILFAIGCLIVLCLFIVVI	197724	173852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933_187998_194666_197119_197171
882475	contig_2892_pilon	-	3551	2	Intergenic	novelGene_119017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60265	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCGAAGGAGCGAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322011	265063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_265138_318534
882476	contig_854_pilon	+	9612	32	Intergenic	novelGene_36504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	3509.16810672397	71	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1019	3060	1145	4204	1679334	1714980	TRUE	25	CTGTTGGTAGGAACCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612772	1783808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1672755_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687064_1702636_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1719501_1778550_1779107_1783363_1783469_1783581
882477	contig_10500_pilon	-	4695	8	Intergenic	novelGene_41223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_7	722.555724847713	3201	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	106	1014	1640040	1629460	FALSE	50	ACTAAAACTCAGTAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640226	1625778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871_1640061_1640141
882478	contig_11978_pilon	+	584	5	Intergenic	novelGene_63009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAGTAGGTACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591844	1597005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592068_1592191_1592304_1595890_1596019_1596303_1596391_1596971
882479	contig_10904_pilon	+	3514	3	Intergenic	novelGene_22450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1063	junction_1	388	3951	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	203	1171	149100	150068	FALSE	40	AAAAATAGTGTCCCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143843	152411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097
882480	contig_13267_pilon	-	3239	3	Intergenic	novelGene_146609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6402	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGTGTGCATCTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262269	29528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_-_31885_214238_214603_261750
882481	contig_7657_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_30006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAACCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97843	96304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_96300_97800
882482	contig_16098_pilon	-	1559	9	Intergenic	novelGene_46098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1954.21614720583	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	256	1350	458816	456273	FALSE	5	AGTCTGTTGTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460251	456063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458866_460045
882483	contig_5341_pilon	-	1322	3	Intergenic	novelGene_168011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	705	169	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340889	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339346_340668
882484	contig_7593_pilon	-	3015	4	Intergenic	novelGene_127260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1129	junction_3	521.770703150979	5504	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	273	533	8497	4357	FALSE	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR	15327	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_4528_8407_8541_12823_12970_15244
882485	contig_4091_pilon	+	6778	6	Intergenic	novelGene_173042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	4253	4843	375050	375640	FALSE	70	AACAGAAAAACAATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQETISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKVMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	34102	377575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_34156_36757_38159_236731_237637_372736_372913_373004_373912_374239
882486	SIRV6	+	1386	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	62	80	12	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	196	687	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1149	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882487	contig_11417_pilon	+	4625	4	Intergenic	novelGene_103326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1997	junction_1	308.14390577564	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	102	425	575953	586628	FALSE	40	AATATTACTTTTAATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	573557	590828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_573637_575930_576054_583804_583914_586514
882488	contig_7396_pilon	-	2900	16	Intergenic	novelGene_79547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3141.55552694663	3521	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	176	1564	255163	246442	FALSE	25	ATTATTTATGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257077	245105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
882489	contig_20527_pilon	+	2167	5	Intergenic	novelGene_138586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	146	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	43	669	13527	27453	FALSE	30	TGACCATGCTAGCTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13484	28951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
882490	contig_7963_pilon	-	718	3	Intergenic	novelGene_58414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCCCAGCTCCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63339	57332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_57563_57781_57934_63003
882491	contig_4131_pilon	+	6193	1	Intergenic	novelGene_127877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	73	465	240672	241064	NA	40	TTTTGTAACCCAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	240599	246792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_240600_246800
882492	contig_6748_pilon	-	3711	4	Intergenic	novelGene_178310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAGCAACAGAAAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187497	17742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6748_pilon_-_18753_118198_119985_120053_120195_186723
882493	contig_10990_pilon	-	6573	19	Intergenic	novelGene_7476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8307	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2324	2746	744373	743951	TRUE	30	AAATTTCAAGTGCTTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	753861	713592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722232_722431_723510_723633_727930_728100_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_743881_744386_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883_752187_752497
882494	contig_11056_pilon	-	1580	3	Intergenic	novelGene_130375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAATAAAACTACATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354252	349199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_349333_349402_350418_353820
882495	contig_10904_pilon	+	6002	2	Intergenic	novelGene_22561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2410	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1147	1572	411105	413802	FALSE	25	CCAGGAATCTGAGTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTGCGAPRIVSPTPGIQASPPSLSSKSSHVASLYPVPLGLRRGGHQERSSGCDSQKPPTRPGRSGPGWPAPGGRGYHGYSPRVKSLSPAVPGHHWVGTRPPAPTLASCSNSGNCPPGLGSPLPGRTLPAPQPHPETALG	409958	418232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_411365_413636
882496	contig_6102_pilon	+	1049	12	Intergenic	novelGene_31780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	179.959315879731	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	92	1048	352330	357092	FALSE	10	TGCGTTATGATCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKK	350088	357093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038
882497	contig_11160_pilon	+	2888	2	Intergenic	novelGene_168824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2106	2417	322577	322888	FALSE	20	CATCCCAGCTAGCATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFISGPCSWKKVIIWTVKGISWLFPLVIRCIPVLAGWLVAGRPGGVWRACESLSGSRGRRGSQGSAFSLGHPRNNCSEWEGPLPACGRQPVRAELEVGESHC	318184	323359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318370_320656
882498	contig_9177_pilon	-	1535	12	Intergenic	novelGene_32557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2164.13322789961	564	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	120	1337	26442	1909	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKYYY	28453	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1921_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
882499	contig_16703_pilon	+	10009	19	Intergenic	novelGene_72752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	1495.32235366092	11092	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	207	2123	6490	40668	TRUE	55	TTTCACCTCAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	84659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600_47657_52864_53119_83885_84268_84397
882501	contig_16548_pilon	+	2037	3	Intergenic	novelGene_167095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	15	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTCAGGGGGCCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83453	106195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_+_83494_103008_103106_104295
882502	contig_854_pilon	+	6369	16	Intergenic	novelGene_36650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	3598.48956214811	23	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	53	1792	1698226	1715383	TRUE	30	GAAATCCCAGCTCTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1697760	1783657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165_1717113_1776334_1776847_1776925_1779080_1783363_1783474_1783585
882503	contig_7963_pilon	+	907	5	Intergenic	novelGene_58368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	780.668463561837	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	99	572	56927	63007	FALSE	5	GCTGGGTGACTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRYPSSSSLFLCLEWSLYLTTCILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51361	63342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51436_56902_56964_57281_57564_57782_57934_63003
882504	contig_6059_pilon	-	1264	8	Intergenic	novelGene_44837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2932.86324541847	7	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	49	813	573264	569146	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573312	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
882505	contig_4232_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_63397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACAGCTATTGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
882506	contig_19402_pilon	+	3153	1	Intergenic	novelGene_80841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTCCCAGCTTGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144494	147647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_144500_147600
882507	contig_11316_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_122666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139375	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
882508	contig_10904_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_22487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTGTGTGTTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150788	151582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_150800_151600
882509	contig_19816_pilon	-	1857	3	Intergenic	novelGene_156501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	156.5	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	584	961	124800	124423	TRUE	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWSKRGRQGQSLFSGKQGPFWAPAAGSQPLTSPSFPRVPFSVHCPHHGDHCCPGSPCGHCSCGGWSCDLEEEELRYRGWA	125383	123036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001
882510	contig_16125_pilon	-	6437	6	Intergenic	novelGene_155263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_5	468.490597557731	479	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	29	1549	236934	152893	TRUE	25	CCAGGTCACTCATCACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRADVKSLMAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDMYELHFLPGYVPSKINIFYVRESGQTILERKKALFVQMTGI	236962	147461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_148240_148782_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
882511	contig_6735_pilon	-	7020	12	Intergenic	novelGene_15650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	138	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2459	2914	352265	345998	TRUE	40	AACACCATTAACCATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREQQKKPTATRRKEVIKIRAEVNEIENRKTIEGINKTKSWVFERINKIDIPLAKLTKEKQEQTQMTQTRNEMGDIATAPTEIKRIIAEYYEKLHSNKFENLGEMDKFLETHYLLKLTQTEVENLSRPMTREEIEKVKKNSQQKKPCWGP	483258	43784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_43872_113253_113481_174300_174331_179641_181516_323751_324838_340339_340456_345311_346011_351822_352297_352500_352803_440926_442267_481055_481297_482714
882512	contig_10399_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_114503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTCTTATTTACAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441145	443238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_441100_443200
882513	contig_11160_pilon	+	1860	2	Intergenic	novelGene_168830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318200	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318281_320656
882514	contig_15327_pilon	-	975	3	Intergenic	novelGene_70491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	957	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	149	364	411438	401655	FALSE	15	GCTGTTTTCTTTATTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAHDVRAPSLSSTTAASFFCGSWCCLCARSVRTWYLFCEAAAEETPVLAMADEKPKEGVKTENNDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQLEMEDEDTIDVFQQQTGGVF	411586	401043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_409697_409830_411417
882515	contig_8616_pilon	+	3040	10	Intergenic	novelGene_72501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_8	202.725015966864	1770	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	103	984	336939	339244	FALSE	15	TCCAACTGCATTCTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNRFGHFRPPSAFFFLVPTADPEPGPRGGGGDGAMAELTALESLIEMGFPRGRAEKALALTGNQGIEAAMDWLMEHEDDPDVDEPLATPLGHVLGREPISSGQGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336741	341300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337371_337467_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
882516	contig_6488_pilon	+	3570	6	Intergenic	novelGene_44762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	547	junction_1	322.553561443677	27	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2453	2935	196121	203836	FALSE	45	TACAATTTTAATAATATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQKALRVLKQKRMYEQQRDNLSQQSFNMEQANYTIQSLKDTKTTVDAMKLGVKEMKKAYKQVKIDQIEDLQDQLEDMMEDANEIQEALSRSYGTPELDEDDLEAELDALGDELLADEDSSYLDEAASAPAIPEGVPTDTKNKDGVLVDEFGLPQIPAS	193668	204471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_196165_197384_197479_197611_197684_199944_200054_201539_201653_203785
882517	contig_7182_pilon	-	2322	5	Intergenic	novelGene_117133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	2396.49666179613	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	159	806	889318	887056	FALSE	35	TATTAGTTAAATGGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRAARPPPFRSFAAGRPQNGERAHVAGVLGAGPPPRPAGPPQAEFREKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	890325	885539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_890181
882518	contig_3627_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_78490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1750	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAACACGGAAGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621208	623064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621200_623100
882519	contig_16666_pilon	+	3812	3	Intergenic	novelGene_61781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.5	383	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	243	1310	116861	117928	FALSE	20	CACCATTGTTCTGTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106090	120430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_110652_110822_116851
882520	contig_17144_pilon	+	2494	12	Intergenic	novelGene_29224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGCAGGGTAATGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	176062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166989_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173750_174583_174760_174875_175003_175986
882521	contig_4093_pilon	-	4208	6	Intergenic	novelGene_27609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	34	junction_5	1955.81833512216	26	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	108	845	69245	41737	FALSE	35	AAGTACTTTAATCATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLRPTSTASWVNRAIRELPRPSKLASSRIKEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	73872	38373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_73776
882522	contig_19402_pilon	+	5805	18	Intergenic	novelGene_80782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	1375.62131165506	273	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	624	2375	29462	143056	TRUE	20	CTCCTCCCAGCTTGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23464	147647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144301_144721
882523	contig_7009_pilon	-	5516	11	Intergenic	novelGene_23605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4963	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCTCGCCCGCGCCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541000	430003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_430028_435036_435243_444939_444992_453478_453600_496797_496860_506372_506631_512644_512815_517990_518116_522864_523001_536324_536889_537202
882524	contig_17522_pilon	-	4577	7	Intergenic	novelGene_160807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1484	2152	216849	216181	TRUE	45	AGCTCAATTGGCAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDSEFKSVILRIIQEMKQKADKNEEKIEKFMEKADKFMENTDKKKMEKFRKIMQEQNTKINSQLEIIEKQLEIQKINKISETDSVIEGLRSRFKMVEDRISGIENKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVTWDTIKSKNFQVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTETFLNIMKDEKLAIQEAQ	249977	81147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_81308_82113_83090_120547_120639_209651_210056_215386_216879_248338_248847_249031
882525	contig_11986_pilon	-	3058	17	Intergenic	novelGene_69202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_1	1185.51986882338	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	233	2380	792566	736169	TRUE	25	GAAAAAGGTGTTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	793284	733984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736031_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_793082
882526	contig_12677_pilon	+	592	2	Intergenic	novelGene_110856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTGAGGAGAGGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3094_3343
882527	contig_10323_pilon	-	7634	7	Intergenic	novelGene_123600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2060.52895716933	350	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	5333	7405	468796	459306	FALSE	40	CACTCCAGTGATATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFLQDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSREAAGKVKA	476221	459076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_459334_459377_460999_463310_463453_467386_467480_468607_470287_470380_473697_475695
882528	SIRV6	+	1442	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	56	-7	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882529	contig_11512_pilon	+	669	2	Intergenic	novelGene_43207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	412	junction_1	0	335	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	318	668	4011	4584	FALSE	20	CCACAGTGCTTCAGCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLVSLLLWASGASGEVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWFQQKPGEAPKLLIYRASNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCAYAAYSAG	3693	4585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_4060_4282
882530	contig_9133_pilon	+	4690	5	Intergenic	novelGene_109308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	4252	4602	637551	637901	FALSE	35	TTACAATTGCCCCCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLIKIGIEGKFLNIINGIYTKPTANIILNGETLKAFLLRMGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIMLQKEIKGIQIGREEVKASLFVHDMILYTENPKESTTKLLELIEDFSKV	427795	637989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_429027_430484_431420_489535_490475_506076_506146_636473
882531	contig_5814_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_143057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	70	306	361384	361148	NA	75	AAAAGAAAAAAGGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIPLLGIYPREIRVISRTDICTPMFMAALFTIAKLWKQPRCPSTDEWIHKLWYIHTVEYYATRKNNDESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCLRPLL	361453	358971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_359000_361500
882532	contig_4232_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_63351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGACCTGGAAGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468101	467038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
882533	contig_14220_pilon	+	3276	1	Intergenic	novelGene_159882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1393	1731	398517	398855	NA	25	GAGGGGTCGGGGGGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQINIQSINEENNHSMPPKQQTISKHLQKQYRMVPVGVQHKTPDDLPVEVKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKADKNQEKTHKFMEKEDKFMKNTDQKKNSRKYSNKMLK	397124	400400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_397100_400400
882534	contig_13542_pilon	+	1614	10	Intergenic	novelGene_131481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1003.03747329774	410	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	104	922	346638	505589	TRUE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVHSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346534	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501_505760_505824
882535	contig_3916_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_141855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	361	957	28427	27831	NA	80	TAAAAAAGAAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQSLIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKVKHLCSSKDFTKRVKREHTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCTRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGILMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQCRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNNESGNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	28787	26104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_26100_28800
882536	contig_7457_pilon	-	1368	5	Intergenic	novelGene_31677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	2210.19890224839	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	105	554	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAPSLPDVPSPLPAFSRRRLPQAVSTEEKESYRMSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVETFIQHLCRWNLSTGCSKGSFLTESLQLRTIMFVVVEIGLAKDDQLKVHGF	1176946	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175066_1175175_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
882537	contig_10500_pilon	-	4052	7	Intergenic	novelGene_41250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1657	junction_6	296.400301769227	9095	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	185	1093	1640040	1629460	FALSE	20	CCAAAGAGGTTGTTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640224	1626500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
882538	contig_7876_pilon	-	3323	2	Intergenic	novelGene_144844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	2048	2611	127039	126476	FALSE	30	TATGCTCTTCAAAAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLKKALHKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGEKLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKERKGIQIGNEEVELSLFADDMILHTENPKDATRNLLELIERFSRVEGYKIKIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTMPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLY	304773	125763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_-_128376_304062
882539	contig_4315_pilon	+	2130	4	Intergenic	novelGene_46836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	1289.62535472732	9687	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCATGAAAAACACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575428	581910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575590_577893_577938_578761_578863_580086
882540	contig_7056_pilon	+	2223	10	Intergenic	novelGene_43716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.323299635988	39	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	22	402	935507	937314	TRUE	5	CCGAGCCCGCCGTGGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTLGGWGCMKPFRVVEKVT	935485	960598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_935546_935846_936043_936993_937083_937257_938605_940175_940252_940915_941078_944197_944266_946462_946553_952293_952352_960521
882541	contig_3602_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_60569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAGAGAATCATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522506	520591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_520600_522500
882542	contig_5341_pilon	-	1740	5	Intergenic	novelGene_168014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	720.141782915003	1358	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	241	1065	340653	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEVGSLDVGSLRALLREARTTQVFFLKGGYEAFSAFCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340028_340286_340318_340596
882543	contig_3077_pilon	+	2854	8	Intergenic	novelGene_26813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	650.905491744903	127	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	201	1328	473998	481662	FALSE	20	TGACCCACTGAATTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	472540	483188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_472647_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
882545	contig_160_pilon	-	6878	5	Intergenic	novelGene_156333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	5053	5412	613102	612743	FALSE	30	TTTTTTTTTTTTAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIRTMLRARIHGINTIRTISNNAQAPEERPDKWELLKIKHLCSSKDFTKTVKRQPTDWEKKIWLRQIQSAFNIDKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQVTNRHMKKCS	875796	611276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_613197_688948_689955_730711_732038_872673_873054_873550
882546	contig_11427_pilon	+	3338	1	Intergenic	novelGene_78988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	1850	2413	586225	586788	NA	30	CATGAGAGATACTGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGISIETFQQTDAALEGLTRLCQEIWKTTTWPTYWKRSIFMPIPKKGDPIECGSYRTISLLSHTSKILLKITQKWLQQYINTELTEIQAGFKRGCGTRDIITDVSWILAESREYQKDVYLCLIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLTVLMRNLYTDQEAVI	584375	587713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_584400_587700
882547	contig_15849_pilon	+	6478	6	Intergenic	novelGene_176057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	38.9389265388762	172	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	56	898	89870	109684	FALSE	35	ATTATTTTTGGTACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCCTPTISTARLASWQSLMTCKTMATGVPSPAGPSSGQTCVLILIFTLLLQSLSVAVTYLYFTKELKQMQDKYSRSGVACFLKEDDSFGDPDDEDSMDNPCWQIKWQLRQLVRKMVMRIYEETTPTGQEKQQDSPYLGRERSLPRVAAHITGNSRRTSTFLPPSSGNEKALGQKIKTWESSRKGHSFLNNLHLRNGELVIHQTGFYYIYSQTYFRFQEKETVPTVSLEENRKKNKQMVQYIYKYTSYPDPILLMKSARNSCWSKDSEYGLYSIYQGGIFEKDVTVYFCKEFSLENPMV	89814	115264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_90020_97054_97193_100149_100193_106574_106680_108831_109182_109627
882548	contig_15327_pilon	-	2643	5	Intergenic	novelGene_70632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	4	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	130	540	901528	900904	TRUE	25	TAAGTTAGACTCTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902157	898563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900308_900544_901033_901126_901281_901400_901536_902035
882549	contig_11512_pilon	-	3095	16	Intergenic	novelGene_43354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1127.02865190829	3707	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	489	1400	586598	556654	FALSE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622338	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586671_592723_592904_608476_608513_609587_609669_622219
882550	contig_11160_pilon	+	1958	4	Intergenic	novelGene_168818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	717.006276123159	35	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	297	731	318478	320838	TRUE	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALGHWQTAGRAEHLGLELCWEWAPTPPRSVSSHFYYFYYYYSEVSLLLSKESQRTFCVGEHNIHNRAVVMRIEQKRKNKHLF	318181	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319178_320596_321713_322083
882551	contig_13026_pilon	+	1366	12	Intergenic	novelGene_146295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	822	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	110	451	6220	6561	TRUE	25	CCCAGCGCAGAGTAGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDQLKTRLKATGWYSSLHQEIQMSLLFGGILLPGLLWDPRPGTAVRREGGGPLGGSPHHFLQGSIFTEWPWLPGPPLHHQQLLLLLPSLLTPEGWGRRHRRPDHTCSSLAR	6110	28058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_+_6566_7408_7539_9215_9325_12667_12740_14181_14260_16279_16339_17182_17272_19880_19985_20919_20991_22260_22370_22975_23008_28000
882552	contig_2894_pilon	-	1179	4	Intergenic	novelGene_86529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.0172362570938	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	233	889	136491	133851	FALSE	15	GATTGGGTTGAGCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCRSEVLEVSVEGRQVEEALLAVLHTVLLHRSTGKFHYKKEGTYSIGTVGTQDVDCDFIDFTYVRVSSEELDRALRKVVGEFKDALRNSGGDGLGQMSLEFYQKKKSRWPFSDECIPWEVWTVKVHVVALATEQERQICREKVGEKLCEKIINIVEVMNRHEYLPKMPTQSEVDNVFDTGLRDVQPYLYKISFQITDALGTSVTTTMRRLIKDTLAL	140021	133560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_134256_136239_136566_139540_139653_139975
882553	contig_3386_pilon	+	4653	13	Intergenic	novelGene_34544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_5	561.58591778601	1194	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	699	1574	494402	508362	FALSE	25	TGGCTTAACAGTGCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470010	511441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231
882554	contig_15327_pilon	-	2904	4	Intergenic	novelGene_70630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	174	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	132	563	901528	900904	FALSE	25	AAGTTAGACTCTTGATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVRQKDGFEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901105_901281_901400_901536_902035
882555	contig_17274_pilon	-	1989	9	Intergenic	novelGene_26475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTGCCATCTTCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55885	7064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_7084_26182_26360_27831_28000_30126_30210_42653_42710_47229_47294_51701_51784_54320_55579_55803
882556	contig_1443_pilon	-	4494	2	Intergenic	novelGene_28218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2476	2859	512565	512182	FALSE	30	CTGAACATGGTTTTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILFIFRVSNCCFCIISSCAFILEFCSCIIFLNSSIFLSAFSVNLSAFSMNFSIFSSFLSAFCFNFWIILSIRDLNSLSVSSSAFSSTGRSSGILFWTSTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIR	732496	510546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_512810_730265
882557	contig_5419_pilon	+	5982	8	Intergenic	novelGene_15488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	558	junction_1	381.838730783731	4937	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	2929	3693	244831	249830	FALSE	30	TGACATCACAGACTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238758	252119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240675_241836_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
882558	contig_5961_pilon	+	2167	13	Intergenic	novelGene_144097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	623.949711960472	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1869	299	2167	144074	204455	FALSE	60	GAAAGAAATAAAGTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDT	113001	204455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113069_113347_113514_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_204380
882559	contig_13702_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_102640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	558	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1065	1364	211071	211370	NA	15	CCTTCCTGCCCAACCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210006	212284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210000_212300
882560	contig_3956_pilon	+	1622	3	Intergenic	novelGene_14759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.5	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	13	1044	794009	796007	TRUE	10	CAATCTGTCCTGCTGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSGNRLQMLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793996	796687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007_796448_796549
882561	scaffold_12124_pilon	+	3065	10	Intergenic	novelGene_22294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3265.70877112117	12	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1107	1886	1508626	1509405	TRUE	75	TAAAAAGAAAGAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473580	1563688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1510536_1563639
882562	contig_13740_pilon	+	2402	4	Intergenic	novelGene_34733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1221	junction_3	36.4264860903284	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	725	1246	170866	176906	FALSE	10	TGTGGTTAGACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	170141	178062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_171003_173068_173232_176358_176454_176779
882563	contig_7816_pilon	-	949	3	Intergenic	novelGene_66536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	212.5	2119	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	56	466	250068	246154	FALSE	20	AGTCTAGCTGTCGGGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFERDPSRRLGVTGNIKIHPFFKTINWTLLEKRQMEPPFKPKVKSPGDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQTAFAGFSFVNPKFEHLLEK	250123	245670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246313_249177_249307_249945
882564	contig_8138_pilon	-	3529	1	Intergenic	novelGene_52504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAAGTAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467531	464002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_464000_467500
882565	contig_15105_pilon	-	3131	6	Intergenic	novelGene_151006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	985.93155949082	9	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	35	514	839916	836135	TRUE	65	ACTAGATGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGQSVNALFQYIPFCSDL	839950	827921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_835229_836548_839849
882566	contig_6446_pilon	-	3202	4	Intergenic	novelGene_149214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACTTGGAATTGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407430	372109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_372562_372822_373511_373619_373691_405439
882567	contig_10930_pilon	-	2760	3	Intergenic	novelGene_37068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2341	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCTGCTGTTTTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340811	286013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_286243_286406_288918_340791
882568	contig_10930_pilon	+	9560	7	Intergenic	novelGene_36964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7256	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAAAGACCTCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261672	281703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268580_272836_273001_273947_274324_276722_277001_278478_278637_279700_279834_280159
882569	contig_4232_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_63339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAATGCCTGTCGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466964	468128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
882570	contig_34_pilon	+	5226	6	Intergenic	novelGene_39976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4917	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3614	3982	212125	212493	TRUE	0	GTCGTCCGGCTCTGCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	208511	243324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_213048_214057_214151_215287_215458_224659_224818_230228_230389_243215
882571	contig_7157_pilon	+	2235	2	Intergenic	novelGene_131276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	380	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATAAAAACAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770760	944787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_771705_943496
882572	contig_10990_pilon	-	5764	16	Intergenic	novelGene_7480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8301	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2086	2415	751051	749304	TRUE	60	TTAAAAAAAAGCAATTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWVLQEATSP	753868	714044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
882573	contig_11316_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_122673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139391	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
882574	SIRV6	+	1360	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	160	8	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882575	contig_4364_pilon	+	540	1	Intergenic	novelGene_781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532769	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
882576	scaffold_12124_pilon	+	2193	11	Intergenic	novelGene_22320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	3170.88587779504	26	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	278	655	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483679_1483992_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
882577	contig_15327_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_70613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTTGATCTTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900474	898556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_898600_900500
882578	contig_10749_pilon	-	3738	6	Intergenic	novelGene_133469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	657.395345283187	234	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	58	435	168308	164528	TRUE	25	TTTATCTTATACCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSRGQIHVLLTLGTLEVPTLSIHSLPILPVIQAPFPLPQEFPTGIQCSPHVDPLNLCHNQGIQDAHPQDPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169032	160953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_161939_162209_164573_167011_167129_167184_167395_168302_168346_169012
882579	contig_11592_pilon	-	7322	7	Intergenic	novelGene_178311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5842	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	5363	5692	238037	237708	TRUE	20	GTGATAGTGGACCTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERASNSRKGKENKQTIQNKQMKKSPGIPPARQPRPGNSFTLERSSAAPQEEAKMAPGARYLSEGRGRWREASKKSKGAGKKKQQ	399300	211667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11592_pilon_-_211748_211995_213097_237258_238659_378191_378447_393898_394153_394568_397001_397500
882581	contig_6445_pilon	+	774	6	Intergenic	novelGene_76879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGCACAGGGACCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42867	64924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_43153_44514_44579_49734_49890_55478_55611_64137_64207_64855
882582	contig_9706_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_20761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATTTCACAATCCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159	621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_600
882583	contig_7056_pilon	+	2880	12	Intergenic	novelGene_43700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	241.324478932891	19	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	30	929	926284	937151	TRUE	5	CCGCGCGGGCTGAGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926254	960566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928664_930581_930638_935330_935546_935846_936043_936993_938605_940175_940252_940915_941078_944197_944266_946462_946553_952293_952351_960521
882584	contig_5084_pilon	-	4931	17	Intergenic	novelGene_64500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	254.327022502525	368	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	104	1861	377978	348019	FALSE	30	GCTAGGAAGCGAGATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSDSETSDSDDEWTFGSNKNKKKGKARKIEKKGTMKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMTEKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAKKKEKKEKKKKQEEEQEKKKLTQIQESQVTSHNKERRSKRDEKLDKKSQAMEELKAEREKRKNRTAELLAKKQPLKTSEVYSDDEEEEEDDKSSEKSDRSSRTSSSDEEEEKEEIPPKSQPVSLPEELNRVRLSRHKLERWCHMPFFAKTVTGCFVRIGIGNHNSKPVYRVAEITGVVETAKVYQLGGTRTNKGLQLRHGSDQRVFRLEFVSNQEFTESEFMKWKEAMFSAGMQLPTLDEINKKEFSIKEALNYKFNDQDIEEIVKEKERFRKAPPNYAMKKTQLLKEKAMAEDLGDQDKARQIQDQLNELEERAEALDRQRTKNISAISYINQRNREWNIVESEKALVAESHNMKNQQMDPFTRRQCKPTIVSNSRDPAVQAAILAQLNAKYGSGVLPDAPKEMSKGQGKDKDLNSKSASDLSEDLFKVHDFDVKIDLQVPSSESKALAITSKAPPAKDGAPRRSLNLEDYKKRRGLI	394701	344948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_348126_348371_348484_349384_349481_349949_350028_350979_351038_351224_351347_352303_352382_353176_353285_353383_353472_354825_354909_356011_356190_356700_356837_364477_364590_365264_365380_375773_375979_377896_378045_394664
882585	contig_15327_pilon	-	1269	3	Intergenic	novelGene_70654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1760	62071	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGTCTTGTCATTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900323_900400_901536_902035
882586	scaffold_13553_pilon	+	5378	8	Intergenic	novelGene_73758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	623	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	3663	4667	330860	331864	TRUE	30	TACTCAAGATCATATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREAFCPSWSRHLLWIWICLLCTHCFCQNYHPWTCRMLNDHHGIPHSIASDQGTHFTANEVWQWAHAHGIHWSYHIPHHPEAAGLIERWNGLLKTQLRCQLGGNTLQGWSNVLQEAVYALSQRPIHGAVSPIARIHGSRNQGVEMGVAPLTITPSDPLARFLLPVPSTLCSAGLDVLVPKGGMLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHFGLLMPLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQEEIRLILHNGGKEEYARNTGDPLGCLLVLPCPVTKVNGKLQQSNSDVTTNDPDPSGMKVWVTPPGKGPRPTEVLVEGKGNMEWVVEEGSSKYQLRPHDQLQE	138105	332698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_138113_143152_143160_245914_247563_271277_271703_282958_282967_329211_330339_330419_332373_332495
882587	scaffold_13505_pilon	-	997	4	Intergenic	novelGene_111458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_3	205.365257258595	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	319	594	532469	531050	FALSE	25	CTGCAGACCTTAGCAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHKYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	532999	530646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532496_532707
882588	contig_11850_pilon	-	3408	8	Intergenic	novelGene_125211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	813.400395919275	2885	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	370	1632	286754	282879	TRUE	70	TTTAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLTSRSLSHWRSRAPRQLAPLLPSLAPSSSRQGARRVQRHVTAQQPSGLAGGTAIKGGRRRRPDLFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	287123	279937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
882589	contig_7106_pilon	+	3814	4	Intergenic	novelGene_148307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCGCTGCTGCGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188961	323114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_189880_191747_193140_229489_230625_322745
882590	contig_7157_pilon	-	6761	8	Intergenic	novelGene_131300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	482.355064411337	610	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	247	1296	1009401	997010	TRUE	45	AAAAAAAGTGGGCAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPAKIRDATNAEMEAQRSWVTCPQPVPRSQRKLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVARCILFLIIWLITGGRHHFWFLPNLTADVGFIDSFRPLYTHEYKGPKADLKKDEKSEAKKHQKSDSEEKSDSEKKEDEEGKVGPGNNGTEGSGAERHSDTDSDRREDDRSQHSSGNGNDFEMITKEELEQQTDGDCDEEEEEEDNDGETTKPSSEKS	1009647	906131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_906445_906554_906801_992103_997483_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589_1004795_1009303
882591	contig_9839_pilon	+	2360	8	Intergenic	novelGene_88508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	1753.15200686754	761	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	92	661	49467	57979	TRUE	40	TAAAATATTTATTTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTVWTSGGRQGL	45349	62461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_57946_58380_59824_59927_61264
882592	contig_835_pilon	-	6724	2	Intergenic	novelGene_152166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2601	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	190	543	347934	347581	TRUE	70	AATTAGAAAGAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKDWSLLITCSKYMTRSLATLASKEHSGCTTSKTDLFVLLAVHGIFNILRQHYNSTLLWSSLLTAQLSHASEVTENTMAWVRCTVVLKVTSLFFNTLERSFAADLPSAICRLVS	348123	333606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_338449_346241
882593	contig_16666_pilon	+	4063	2	Intergenic	novelGene_61779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	1936	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	429	1496	116861	117928	FALSE	15	ACTTCCGTCTATGTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106077	120495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106497_116851
882594	contig_6137_pilon	+	6745	6	Intergenic	novelGene_59278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1050.61041304567	51	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	3586	4170	1346651	1353702	FALSE	35	TGAAATTATGTACTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1341504	1356277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1344071_1344208_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
882595	contig_2703_pilon	+	2481	1	Intergenic	novelGene_101629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCGGAGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	3825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_3800
882596	contig_8317_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_19414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTTTTCTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16387	17246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
882597	contig_9548_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_141089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4140	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCTTGGGCTACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313286	315686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_313300_315700
882598	contig_12404_pilon	-	3414	3	Intergenic	novelGene_178312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	11	607	72057	71461	TRUE	55	AAAAATAATGTACTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	72067	13058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12404_pilon_-_13640_66176_67171_70228
882599	contig_5125_pilon	+	1746	2	Intergenic	novelGene_43456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2704	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	81	650	54399	58893	FALSE	15	ATGTTTGTATCTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	54318	59989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_54525_58449
882600	contig_12603_pilon	+	4577	7	Intergenic	novelGene_105791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1063	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGAGCTTTACGCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573405	591057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_+_577194_578475_578593_579305_579382_582716_582809_586752_586817_587666_587864_590814
882601	contig_1150_pilon	-	608	3	Intergenic	novelGene_61441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAACCTGGCTGGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311049	308937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
882602	contig_3081_pilon	+	2084	2	Intergenic	novelGene_133978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	429	896	1213592	1214059	FALSE	65	AAAAAAAATACAGTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMLQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRAITRIDICTPMFTVALFTTAKRCKPPRCPSTDEWINKLWDIHTMDYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1208616	1215247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1208970_1213516
882603	contig_6885_pilon	+	6172	10	Intergenic	novelGene_83636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2317	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2498	2947	122652	123101	TRUE	55	TCAAGGCAAAAAACATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQGLHEWRKHSLVFQVLQRMRIPSWEPGVEARVTQAPRIQTWEDRRGEGKLVAFSPAPRMPTMRHLATFALLVRDLLLPRSLLGRVQGRHCPGLFPSNDQVQILQAALYGTCRANVLRAHFPVQDGMDHAFHLPEILQSHMVRLSRS	120154	314345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_124615_128441_128646_144722_144821_154941_154995_156958_157161_163848_163965_219234_219465_278048_278273_313327_313592_314024
882604	contig_17976_pilon	+	958	5	Intergenic	novelGene_32466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	1186.88423508782	1320	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGCAATCAAAAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41577	48102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41649_41814_41858_45524_45585_46443_46522_47396
882605	contig_16125_pilon	-	4686	11	Intergenic	novelGene_155248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1269.02386108379	25	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	89	1384	236829	148939	TRUE	65	CTGAAAAAGCAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDI	236917	135678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_135731_138906_138974_140135_140246_141938_144711_148094_148240_148782_148943_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
882606	contig_3956_pilon	+	2119	9	Intergenic	novelGene_15082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1120.1747003816	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	498	1595	1287410	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281602	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283892_1287307_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
882607	contig_4364_pilon	+	1935	6	Intergenic	novelGene_547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	51	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
882608	contig_9951_pilon	+	4885	3	Intergenic	novelGene_176326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	476	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	761	1405	85575	86219	TRUE	55	AAAGAAGAGATTGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIVNIYAPNDRAPKYIKQSLTTLKTEIDSSTKIVGDFNTQLSVRDRTSKKKLSKDTEELKGTISQCDLKDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHREILNKTENVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLTNHWVIEEVRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGRFITIYAHIKREERDKIKH	84814	94079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9951_pilon_+_86909_89416_90293_92164
882609	contig_9389_pilon	+	1419	7	Intergenic	novelGene_83984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1148.39685358909	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	144	665	383398	384766	FALSE	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYATHNE	382002	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382144_383395_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307_384382_384749
882610	contig_6946_pilon	+	5628	3	Intergenic	novelGene_59782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1622	junction_2	80.5	4495	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	66	347	439287	451444	FALSE	75	TAAGATAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKLINPVKTSRNHQDLHRELLMNQKRGLAPQNKPELQKVMEKRKRDQVIKQKEEEAQKKKSDLEIELLKRQQKLEQLELEKQKLQEEQENAPEFVKVKGNLRRTGQEVAQAQES	439221	456725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_439301_450624_450776_451327
882611	contig_4716_pilon	+	2020	2	Intergenic	novelGene_166629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1279	1581	841387	853662	FALSE	45	TTTTGAAAAGCTGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRRFWTGLEKDVEQNSNSRKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPVSSVVKSFPRFTIQPGRIGQPHITKRD	840108	854101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4716_pilon_+_841655_853627
882612	contig_10930_pilon	-	1574	2	Intergenic	novelGene_37065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGTTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289048	284950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_285019_287542
882613	contig_16103_pilon	-	1622	4	Intergenic	novelGene_118847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	2927	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	74	409	743628	723495	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQADL	743701	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723508_735917_735975_737495_737630_743496
882614	contig_10003_pilon	+	3807	2	Intergenic	novelGene_88254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1382	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2466	2960	738912	739406	TRUE	35	ATTACCTTAGGTGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYIYNALLIKIPMVLFNEMEKQITNFTRIQKWPQISKALLKKKNKVGSLTLPDFRTYYTNTVVKTAWYNNRYIDQWNRIENPDIDSSTYEQLMSDKGPKSVNWGKDSLFNKWCWYNWISICKQLKQDAYLTPCTKINSKWIKDLNIKLKTIKIMEEK	736446	740378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_739482_739606
882615	contig_4654_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_103081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTGTGAGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494600	492558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_492600_494600
882616	contig_2703_pilon	-	4672	12	Intergenic	novelGene_101763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2529	2831	612160	611858	TRUE	30	TACACAGGGGAGTTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKHQRPSVKEVVSGMGNVASSKSLSWVHCVYADVAKKVQHSGTNIQAEMRLKSICAHTHTHTARQDGKAKLNQFEAIYFGVAGIEKEKNVPFPSLLLN	615901	584532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_584589_596349_596399_599679_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754_613470_614263_614751_615169
882617	contig_11681_pilon	+	3273	1	Intergenic	novelGene_102983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2325	2813	197854	198342	NA	50	AAGGGAATATGTAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQTLDRMVQVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILGILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQSEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRLETVEDRIRGIEDKHLATTLFQENSEKKEKRKMKRP	195529	198802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_195500_198800
882618	contig_10749_pilon	-	2161	13	Intergenic	novelGene_133430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1054.98803310749	14	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	394	1359	155179	136250	FALSE	30	ACTAAAAACTTGTCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157791	135447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_155170_155324_157542
882620	contig_7896_pilon	-	3772	4	Intergenic	novelGene_178313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2413	2961	329681	329133	FALSE	40	TAGTCCAAAGGACTAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKLIIDFIWKGKKPQISKTLLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYCYNDKYTDQWNRIENPDVNPYTYGHLIFDKGPKSIRWGTDCLFNKWCWQNWTSFCKKMKRDPYLTSHTKTNSQWIKDLNIKPKTTKFIEEKIGSMLQALIHGINRIQTITNNTQTPEDKLDNWVLLKIKHLC	413240	328321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7896_pilon_-_329864_331929_332479_365216_365245_411587
882621	contig_10437_pilon	+	2063	8	Intergenic	novelGene_38303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	49	1071	431167	451175	FALSE	50	ATGATGTTAGAGTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431118	452167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
882622	contig_4891_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_124591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5906	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTGATGGCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939241	937403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_937400_939200
882623	contig_5944_pilon	-	4906	4	Intergenic	novelGene_178300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2550	2864	191830	191163	TRUE	50	ACAGACAAAGTTCTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKKITKTYHIHTRQN	194379	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_-_37837_46643_47442_190952_191205_191557
882624	contig_12837_pilon	+	8430	7	Intergenic	novelGene_57316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3248	junction_2	1928.19212966159	3789	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	707	1150	129778	166049	FALSE	55	AAGAGAGAAAAAACCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	129071	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
882625	contig_9363_pilon	+	670	4	Intergenic	novelGene_6631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1235.46761277754	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	9	569	872458	873683	FALSE	10	ACTTGTGTTTTTCCTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTMGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGPGAARAAPAALAAPAAPARLGPVQTAAKPALHFVDQHRAALITRVTEVVRAEATNPTKMRKLFSFAPSWNLTCKDLLLQALKDTQPFLVADLEQS	872449	873784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872729_873004_873095_873426_873484_873540
882626	contig_11986_pilon	-	2850	17	Intergenic	novelGene_69196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1434.65586983212	3613	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1366	2319	744270	734510	FALSE	5	GGTGTTTGTCTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	794701	733978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744293_747984_748074_751583_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_793963_794175_794615
882627	contig_19402_pilon	+	6255	19	Intergenic	novelGene_80769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	1607.53512048112	787	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2433	10	2442	23458	143056	TRUE	20	CTCCTCCCAGCTTGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGVKKTSILPSERKVGGPEPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	147647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_109781_109833_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144315_144352
882628	contig_7056_pilon	+	3167	12	Intergenic	novelGene_43699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	261.343762090223	4363	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	30	1352	926284	937151	TRUE	25	GGCGTCTACAGTCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926254	946516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935546_935846_936043_936993_938605_940175_940252_940915_941078_944197_944275_946469
882629	contig_12677_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_110827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATGAGGATCCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2930	2177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
882630	contig_12677_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_110751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1729	19	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
882631	contig_1452_pilon	-	2837	4	Intergenic	novelGene_115133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1096.53403453285	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	TRUE	20	CTTTCCTGATAGTGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	697305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_697699_697873_699953_700534_700690_715232
882634	contig_34_pilon	-	5135	8	Intergenic	novelGene_39977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1396.30117796693	6242	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	996	1598	213064	212049	FALSE	5	CTCTGTGATTGTGCTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYFRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247107	208511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213205_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
882635	contig_10500_pilon	+	3948	3	Intergenic	novelGene_41228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACCAGGCATACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626408	1640089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1627117_1635525_1635615_1636938
882636	contig_12677_pilon	-	736	2	Intergenic	novelGene_110822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTTTTAGTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2941	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2593_2633
882637	contig_7157_pilon	-	6138	8	Intergenic	novelGene_131310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_7	186.266979776615	8521	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	27	1229	1019968	997010	FALSE	60	AAAAAAAACTGAGGCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERRRHKKRIQEVGEPSKEEKAVAKYLRFNCPTKSTNMMGHRVDYFIASKAVDCLLDSKWAKAKKGEEALFTTRESVVDYCNRLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVARCILFLIIWLITGGRHHFWFLPNLTADVGFIDSFRPLYTHEYKGPKADLKKDEKSEAKKHQKSDSEEKSDSEKKEDEEGKVGPGNNGTEGSGAERHSDTDSDRREDDRSQHSSGNGNDFEMITKEELEQQTDGDCDEEEEEEDNDGETTKPSSEKS	1019994	992100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_997483_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589_1004795_1010536_1010643_1011511_1011621_1019932
882638	contig_6076_pilon	-	2784	2	Intergenic	novelGene_81711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1330	1635	1455	1150	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECSLEVTVVRLHLTYFGHVIRRDQSLEKDNMLGKNRGHQKRGRPSMRWIDTVARTMDSNTAMIVRVAQGQVVFRSIVQRVTISQNRFGGT	2885	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_1976_2076
882639	contig_6576_pilon	+	3083	3	Intergenic	novelGene_42399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	14	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	119	637	1301228	1303337	FALSE	30	AGTTGGAACTTTTAAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLSFWLPSYCFAPGQ	1295658	1305783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301702_1303292
882640	contig_8820_pilon	-	3009	11	Intergenic	novelGene_79288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_10	1057.08769740263	3614	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	150	2351	170762	166441	FALSE	35	GAAATGGTGTGTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKVREASGKGAARWAGPPLYKGGAGAARQLLLRPGAAALRSVCRLFAKMPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	171422	165782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170763_171273
882641	contig_15172_pilon	+	2162	6	Intergenic	novelGene_158743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_2	164.396593638676	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	225046	237132	FALSE	25	TGGGCTAGAGTGCAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	225043	238890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
882642	contig_5906_pilon	-	7564	7	Intergenic	novelGene_174807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	163	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACACACACAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430556	188896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5906_pilon_-_190912_191089_191165_311119_312426_382501_382530_392668_394322_427579_427852_428341
882643	contig_18039_pilon	+	3075	5	Intergenic	novelGene_171243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	23.6959912221456	72	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	2037	2894	122075	122932	FALSE	55	CCGAAATAAAAAGGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNHRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEITDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKI	108540	123113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_108559_116200_116281_117220_117348_118160_118257_120359
882644	contig_15172_pilon	+	2179	8	Intergenic	novelGene_158734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_4	311.607812115532	3043	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	87	833	215528	237132	FALSE	30	CAACTTGTGTCAATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKGWRPGRRCCNVAESSLRPRVPPRLAMAGLNSLEAVKRKIQALQQQADEAEDRAQGLQRELDGERERREKAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	215441	238478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
882645	contig_8447_pilon	+	4803	16	Intergenic	novelGene_69383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_5	428.437937940452	1972	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	1299	2534	48468	82214	FALSE	25	GCGAGAAACTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	5773	84483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073
882646	contig_19727_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_168999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17216	19485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_17200_19500
882647	contig_17522_pilon	+	7737	2	Intergenic	novelGene_160809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1168	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1973	2338	83819	84184	TRUE	55	TCTAAAAAGCACCACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRERKQNKQTNKKKTGKKKCPQGCHCVSAQSKGVSPKLRGTVQQEGAPKPRKEKENNQTNKSKENKSEQTNTQPKKKAPGVPPAGRHGPGSSSTVEQHLAAPQEEAKMAMEPGI	81846	89708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_89356_89480
882648	contig_19459_pilon	+	1180	7	Intergenic	novelGene_59866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATAATTTTGTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6668	19120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7789_7945_10267_10330_12582_12707_15506_15700_16201_16265_18988
882649	contig_6233_pilon	-	1285	9	Intergenic	novelGene_74760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACGGAAGGGAAGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131697	112998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_113009_117980_118154_119649_119754_123346_123483_125127_125229_125886_126038_127998_128054_130492_130581_131230
882650	contig_10793_pilon	+	1466	15	Intergenic	novelGene_83378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2837.28569000985	21	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	132	1058	146975	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
882651	contig_7345_pilon	+	4909	5	Intergenic	novelGene_159179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1361	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1437	1736	157974	158273	TRUE	0	G	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALCPKMWSILENVPCALENSMYFAAVRWNVLYMSMRSSWLFVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIMELSISLFSVVRACLMYFGALLLGA	156537	353906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_159092_296561_297639_340510_340792_351925_352785_353768
882652	contig_5125_pilon	+	2738	8	Intergenic	novelGene_43418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	45	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	513	1646	35654	58893	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25953	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26135_26213_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
882653	contig_5020_pilon	+	1758	9	Intergenic	novelGene_27827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1025.43271354097	590	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	509	1438	122915	125772	FALSE	5	TCCTCCCTCTCTTGTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121820_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
882654	contig_7839_pilon	+	2322	12	Intergenic	novelGene_45723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	608.063747201851	831	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	955	2040	955026	956984	FALSE	10	ACACTTCTGCTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950900	957266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954405_954983_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
882655	contig_17274_pilon	-	2441	7	Intergenic	novelGene_26516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAGCCAGAGTCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125845	118186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_118672_119764_119812_120644_120689_121929_122044_122739_122850_123426_123570_124347
882656	contig_10437_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_38366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAGCCAGCAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561534	559802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_559800_561500
882657	contig_6199_pilon	+	2782	3	Intergenic	novelGene_126391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	46	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	2215	2781	515493	516059	FALSE	0	CCGGCTTGGCCCTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSVKGYPNKLLFVLVASPNPETLPFLETISALRVYAVVALPAYHHLTSLCSPRRRSLCPQPLRDSALAFTPCGLPQQQRPGWLMAGQWVAPPGAWAACLSICTLAKSWPSAWGRLEQGRAILAAPKPKPWPSGEGRAVSSPCRRPTQELQFLQVHWVSPYPPPPPVVENRLKCCDPILLPLIKMLSD	478433	516060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_478499_501226_501414_513530
882658	contig_20199_pilon	-	861	3	Intergenic	novelGene_82535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	118	453	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44104	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
882659	contig_7066_pilon	-	6537	2	Intergenic	novelGene_42140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGCTGAATCATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755767	746973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749996_752252
882660	contig_14807_pilon	-	1729	5	Intergenic	novelGene_124686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	2256.45523997264	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1020	1634	38792	37247	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39916	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_39796_39900
882661	contig_21007_pilon	+	1322	2	Intergenic	novelGene_161525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	1687	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	15	CTACGTATCTGTCGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
882662	contig_9177_pilon	-	2585	20	Intergenic	novelGene_32584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1952.57966592929	28	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	118	2544	26442	1755	FALSE	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDVPQSEPARALARSTLPAASSQSPQLQLYSSFFDTICPHPQLPMGAAGL	28451	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1901_18373_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
882663	contig_10627_pilon	+	5782	11	Intergenic	novelGene_59988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	387.988711175983	4427	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	89	361	280603	281132	TRUE	20	GAGGAGAGCTTCGGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWGPPDRLPVAEPSGCGVPTRSLHHLQRAMFQATEAAQATPSHEAKSSGGSSTVQRSKSFSLRAQVKETCAACQKTVYPMERLVADKLVFHNSCFCCKHCHTKLRCALAQPALTLAYQQ	280514	296116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_280645_280824_280870_280946_285707_286818_286998_287403_287534_287910_288042_288697_288815_290221_290265_290472_290544_292749_292822_296012
882664	contig_10324_pilon	-	2750	2	Intergenic	novelGene_7732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	729	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTAACTGTTAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57253	54330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_54853_55025
882665	contig_13740_pilon	-	7024	7	Intergenic	novelGene_34735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTAAGTGTTTTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588212	206553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_207062_224153_224551_329316_330448_330981_332208_444951_446120_584968_586233_586882
882666	contig_13780_pilon	-	4453	9	Intergenic	novelGene_149109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	510	junction_3	1044.554181218	858	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	128	1159	825690	821461	FALSE	40	AGATAATCCCACTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	826257	818166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237
882667	contig_8204_pilon	+	10044	7	Intergenic	novelGene_176996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.634166890345	480	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	3	1730	18967	63532	FALSE	20	CACTTCTCCCATACTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGPFQSQKKNLFHKIVSKYKHKKEKPNVPEKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEVTDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	71846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_43538_43629_45005_45066_57893_58087_63444
882668	contig_6576_pilon	+	4939	2	Intergenic	novelGene_42383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1604	junction_1	0	2090	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	267	1010	1288392	1289135	FALSE	40	TCATAACCTCAACGAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTGHYLHLAWLMTTVFFLSPGTKANYAHLWANNTIWDPVIQNKTGKNQDENINTNPITPEVNYKGNSTSKPEIATSSHIISLTPKSEQIYTLSVLRNSSPPVQNTENTSKSHSEILKKDVCDENNNKTAMLICFIIIAVLFLVCTLLFLSTVILANKVSSLRRSKQAGKRQPRSNGDFLASSGLWPAESDTWKRAKQLTGPNLMMQSTGALTATRERKDEEGTETLTNRCFNEEKCKVAMRKTME	1286337	1293064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1286583_1288370
882669	contig_1867_pilon	+	1621	6	Intergenic	novelGene_54506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2286	junction_1	4918.0384138394	7418	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	167	967	194973	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQKEAKKDGSKNGEEALIIPPDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194806	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
882670	contig_4088_pilon	-	8538	12	Intergenic	novelGene_178063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	684	128	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	5730	6563	111019	110186	TRUE	80	GAAAAAAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVCRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGREAVARPNVAPQPCRKEQRWLLESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAACTGARNPGSRQPWVKSLRPREAEEQRNKGPGFSSAWQPRPGSSRTPERSPTAPQERAKTVLGARHPSKRRGEAARGKQESKRSRKSNTSSQQTAPREPPAQGRGIQAASSLGSRACGPGKQRSKRTKAPGSNQHSSRDLEAVACPNVAPQPRRKGPRRLSESGT	427488	73698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_74000_74316_74563_90801_90859_91504_92196_109505_111120_111262_111582_232943_233950_276848_276863_381868_384290_391262_391514_425731_427169_427307
882671	contig_10323_pilon	-	3864	8	Intergenic	novelGene_123590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	65	junction_7	1675.96698861844	712	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	163	2532	531203	459350	FALSE	25	TAAGAGCCTGTGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPAVHNTELDCLSPEAQRLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	531365	458017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208_474245_513276_513364_531137
882672	contig_11512_pilon	-	2545	14	Intergenic	novelGene_43361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1149.32820614644	14	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	24	980	592804	556654	TRUE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	592827	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556492_556618_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
882673	contig_6902_pilon	+	12568	34	Intergenic	novelGene_135577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_30	468.365920456818	4169	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2592	7779	265	8043	460308	535880	TRUE	20	CTTCTAGAGCTTCTCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTNEVTVSTNGTVNSVVQEAASTAGDISGSKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQMVVKAGENVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRSNNGPPKSARNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQSAGTTGVDPVNGSSTHHQEGALNGTGQKNSKDTTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVVEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQIIQVWNKKNANEKGRNQTSKLPPRFAKKQTTGTQQAQCPASAPNSASAPALAPVPASAPVPSSTSAPIPASALAPVPPSTSAPLLASPSASVPTSASTPAPASTSATATASSSAPVPAPVPIPAPTPILASISAPASVPILASAPTSVPILASAPASVPTLASALVPASSPTPAPTASAPTAPTVSAAAAPASVPTAPVPLAPAPSTPGPSAPAQTQAQTHKTVQNSLQTTTQTSKQPPPLVRLHSAQTPNGVDYVTTGKSIQNSQCHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAASPEGTKNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPMLSDKPTDKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVESKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDVQQVEPEGQEKPSPATGRSTDPVTTKETKTVSEMSSEIGTMISVSSAEFGTNAKESVTDYTTPSSSLSNTVATNNAKMEDTLVNNVPLPNTLSLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIASGVSSGASGPSTASYNSFSSASMPQIPVASVTPTTSLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAVTQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPAVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTSFYNTAQSPSALQQVNRLQYLCQPPSFPCLILDLQGNL	434419	542114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273_498512_501734_501944_513073_513229_514497_515366_515764_515851_519137_519327_519462_519715_520975_521069_524058_524161_527222_527425_528805_529010_530355_530472_530826_530964_534150_534383_534617_534732_535811_536033_536457_536562_536925_537011_537930
882674	contig_15991_pilon	-	623	4	Intergenic	novelGene_70866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	520.405824546788	1860	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	186	554	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	102188	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024
882675	contig_11422_pilon	-	2125	2	Intergenic	novelGene_99006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2327	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1420_1621
882676	contig_10627_pilon	+	4481	4	Intergenic	novelGene_59989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	505.817050808777	35	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3580	3957	284547	284924	FALSE	10	GGGGCGGCCGGCAGCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERALAQQGRDLQPPRSEARPVLSTFLLLQWGNGHQARSTGQASCPAQGSSPRLVFRAQRAHKVSSLETGYSIKVIPTCKTDKIALTKPGLPPQQGQFHISGPCLAGVGAQGQAGQVPPSLNKAA	280645	285448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_280704_280824_280870_280946_283786_283909
882677	contig_7095_pilon	-	6979	5	Intergenic	novelGene_166459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	3353	3823	170997	170527	TRUE	15	GTCACCTCCACCTTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERDVLRASESRLKCHINDLKASTCALKESLISCSNRAEIAENHTQSLIVRVAELQHQLNCKPRQVSEVKVRALIGKRWNPETWDGDIWADNQEAGGTEPVNSVESLLPAEPVPSEEITSCLSAKPTCPEKPLAPPLPSEEISPSPAASKEHLAE	324356	166493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_169384_170260_171582_270408_271045_283091_283579_322711
882678	contig_5023_pilon	+	2171	8	Intergenic	novelGene_7218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	50	junction_6	2371.73280320442	54	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	88	684	607279	643495	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQVPLTMTF	580841	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_643471_643539_646857
882679	contig_9183_pilon	-	3668	7	Intergenic	novelGene_40286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_6	218.49593182076	4914	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	200	2083	323783	312131	FALSE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARELLLPQPRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	326017	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
882680	contig_9706_pilon	+	1040	1	Intergenic	novelGene_20879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_4000
882681	contig_13481_pilon	-	3043	6	Intergenic	novelGene_119552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCGCTGGGAGCACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1588320	1568326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1568719_1576149_1576348_1576596_1576789_1578048_1578129_1586077_1586672_1586733
882682	contig_854_pilon	+	7630	30	Intergenic	novelGene_36518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	2864.49011011788	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1213	3642	166	3807	1649514	1715249	TRUE	25	ACCCAGCTGTTTCTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1612780	1777361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702642_1715188_1718562_1724204_1724280_1776925
882683	contig_6654_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_85717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1336	1776	263583	263143	NA	40	AACTTTTAATGAGCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETETLTHCWWECKMVQPLWKSIWHFLKKLEIEVPYDPAILRLAIYPREVRAVTRIDLCTHMFIAAQFTVAKRWKQPGCPSADEWINKLWYIHTIEYYAIIKNNDEAVKHNMEESGGDYAE	264918	262098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_262100_264900
882684	contig_5836_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_106289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	477	1073	122619	123215	NA	25	CAAAACTCCCTTTCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLRKGFIRNLENNKCSQNFLLPFSLLLKRWFLTLLNNIKNFSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCASKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFGKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	122142	125435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_122100_125400
882685	contig_6199_pilon	+	2891	4	Intergenic	novelGene_126389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	246.593232312288	1066	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	2324	2890	515493	516059	FALSE	0	CCGGCTTGGCCCTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSVKGYPNKLLFVLVASPNPETLPFLETISALRVYAVVALPAYHHLTSLCSPRRRSLCPQPLRDSALAFTPCGLPQQQRPGWLMAGQWVAPPGAWAACLSICTLAKSWPSAWGRLEQGRAILAAPKPKPWPSGEGRAVSSPCRRPTQELQFLQVHWVSPYPPPPPVVENRLKCCDPILLPLIKMLSD	468335	516060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_468414_478402_478499_501226_501414_513530
882686	contig_18970_pilon	+	2526	2	Intergenic	novelGene_157813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	627	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	102	425	31445	31768	TRUE	50	AACATATGAAAGTCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGWVSPYPRSSSSGSSLNTLCRDHLLLHGAPLMCDLAAVAVMRPPLREQSQAAAGCILFDAGFGGLRGLHTLGDGCAVFLPGHSHGTRVEVIHETHQCGLVGLELL	31343	35400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_+_31816_33346
882687	contig_11316_pilon	+	874	1	Intergenic	novelGene_122656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137989	138863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138000_138900
882688	contig_9582_pilon	+	2507	1	Intergenic	novelGene_106856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGGCCAGAGGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804723	807230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_804700_807200
882689	contig_4964_pilon	+	3404	13	Intergenic	novelGene_157256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACATCTAGGGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123970	143293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_125955_126966_127048_129697_129794_130691_130776_133553_133646_133820_133921_136662_136750_136831_136992_137125_137232_138331_138423_139820_139994_142198_142422_143166
882690	contig_9049_pilon	+	1992	8	Intergenic	novelGene_83140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_7	1460.6070585862	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	31	723	88356	112652	TRUE	40	CAGATGAATTTATAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88325	114141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113028
882691	contig_11512_pilon	-	2462	10	Intergenic	novelGene_43346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_3	1148.4334042297	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	21	767	581687	556654	FALSE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	581707	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645
882692	contig_15165_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_145304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGCCGGCGCGCGCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2902	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_1600_2900
882693	contig_4315_pilon	-	4943	2	Intergenic	novelGene_46788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2052	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2360	2680	334715	334395	TRUE	20	AAACATCCTGTGTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRAGLDGQEGYLEGVMAELRAEGQADKSWNSPRQGIGDRGGERTVCPLSTSPGAQGAVLGHSHVENRSVSLWWNGHRYRVCVWESTGLGSDRGPPLPSSETLANY	337074	327070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328307_333367
882694	contig_18544_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_152761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTATTGCCCAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167881	165637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_165600_167900
882695	contig_12677_pilon	-	448	2	Intergenic	novelGene_110779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2927	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2343_2660
882696	contig_14666_pilon	+	3210	3	Intergenic	novelGene_39552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1754.5	357	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	272	1153	479860	484940	FALSE	75	GAAAAAAAAAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQEVTTATRPCSWRGSVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477150	486997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479920_484118
882697	contig_6589_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_26193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTACAGCCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947191	1948856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1947200_1948900
882698	contig_10437_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_38484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	767	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTGAGAATGGGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215721	1213559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1213600_1215700
882699	contig_854_pilon	+	6273	12	Intergenic	novelGene_36647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	3194.27971161466	150	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	53	1849	1698226	1715383	FALSE	40	TAAAGGAAATGGCTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1697760	1719807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
882700	contig_9779_pilon	-	3815	7	Intergenic	novelGene_178314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCCCCTAGCATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271774	2333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9779_pilon_-_3318_3891_4122_160900_162134_162384_162583_163451_163514_208834_209859_271690
882701	contig_5247_pilon	+	7418	5	Intergenic	novelGene_81827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4732	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	6378	6866	403806	404294	TRUE	35	GAAAAGTGGGGTGCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSTHHKDITIINIYAPNNRVPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYRTIHPTVAKCTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNRIQSIKILQSIFSDHKAMKVGINNRKGKGKKSNTWKLNNIWLKNY	350587	407850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_351370_365515_369681_379576_379936_402734_404511_407514
882702	contig_3721_pilon	+	3850	6	Intergenic	novelGene_123805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAATAAAATTCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81799	282306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_83173_83439_83507_84572_85503_116863_117338_128412_128949_281836
882703	contig_7839_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_45751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATGACATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096402	1094100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1094100_1096400
882704	contig_1725_pilon	+	4593	20	Intergenic	novelGene_24250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_17	403.91125845802	3297	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	1318	3873	201480	255543	FALSE	35	TAACCCAGATCAGCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	200162	256263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
882705	contig_5961_pilon	+	5620	2	Intergenic	novelGene_144160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1237	1596	224510	224869	TRUE	30	GTGGAGAGGGAGGGAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQADNTQKRAGVAILISEKIDIKLKSTTKDKEGHCIMIKGLIHQEDITIINIYAPNRAPKYINSNSIEKRDSSTIIVGHFNTQLLVKDRTSGKKLNKDTEELNATISQLDLLDIY	223273	229263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_227866_228235
882706	contig_4232_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_63352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGACCTGGAAGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468101	467038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
882707	contig_6946_pilon	+	5044	4	Intergenic	novelGene_59761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	705.226677506365	4752	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	189	584	439173	451444	FALSE	30	GGAAGAATTGGTTTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTQPSASLTYARPPGAAGALALPWPPPAPDCWGTSRALLCERRDSPFEDTDLKDSYLIPRNIMAEADYIEDDNPELIRPQKLINPVKTSRNHQDLHRELLMNQKRGLAPQNKPELQKVMEKRKRDQVIKQKEEEAQKKKSDLEIELLKRQQKLEQLELEKQKLQEEQENAPEFVKVKGNLRRTGQEVAQAQES	375132	455904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_375265_439116_439301_450624_450776_451327
882708	contig_13740_pilon	-	2749	11	Intergenic	novelGene_34641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3043.78695706516	10	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	211	678	165243	160666	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165453	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_165237
882709	contig_14577_pilon	-	6524	12	Intergenic	novelGene_164629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	363.00338090086	2051	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	761	1306	65703	50623	FALSE	20	CTGAAGTCACCCTGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPVMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL	127291	45404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65793_78022_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
882710	contig_11160_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_168841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	13	42	285	326	320797	320838	NA	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRARCLWGCWRTSLATSSLLGNRGQDTGHWQTAGRAEHLGLELCWEWAPTPPRSVSSHFYYFYYYYSEVSLLLSKESQRTFCVGEHNIHNRAVVMRIEQKRKNKHLF	320512	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_320500_322400
882711	contig_9363_pilon	+	1393	2	Intergenic	novelGene_6623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2959	junction_1	0	386	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	117	479	872458	872820	TRUE	25	CATCAAGTCGATTCCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGERPTTPRRVQAPGPPATSLLPQTFSARQT	872341	874066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_873095_873426
882712	contig_7207_pilon	-	7004	22	Intergenic	novelGene_72051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	235.932779926807	3637	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	906	2721	652	3372	696514	643417	TRUE	25	TTCTGAATGGGGACTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQAYINEKHYKKIPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPRHVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSFRIFSKGASEIILKKCFKILSTNGEAKVFRPRDRDDIIKTVIEPMASEGLRTMCLAFRDFPAGEPEPEWDNENDIVTGLTCVAIVGIEDPVRPEVPDAIKKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILHPGEDFLCLEGKDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVSEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQEKSFLILIVEEMLLCMLLLRNIILLFLIPLC	758020	625554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_628780_637109_637293_639627_639736_643300_643513_644422_644615_649857_649965_650325_650414_651074_651255_656875_657114_659130_659373_660702_660946_663524_663740_665433_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738031_757787
882713	contig_16098_pilon	+	1416	3	Intergenic	novelGene_46228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	533	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	175	573	766291	767278	FALSE	25	GGAATCTTTATTGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	765463	768121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290_766596_767184
882714	contig_9633_pilon	-	5932	5	Intergenic	novelGene_139635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	902.434866070677	2295	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	423	839	1141485	1138462	FALSE	20	TAACCCAGATGTGTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1147833	1133368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418_1141611_1144627_1144829_1147737
882715	contig_17144_pilon	-	2389	10	Intergenic	novelGene_29179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1920.79025660704	26	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1028	1747	167982	166363	FALSE	20	GTCAGGGACTGACTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173353	165720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168395_168908_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305
882716	contig_10855_pilon	-	1124	3	Intergenic	novelGene_124367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	185	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	332	718	697970	697489	TRUE	25	TGTTGGTGCTGAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPAKLATLCPLCRGGGERTRRAWSIPHQEGRQEVEEGADGVGGWGDKGCPGQGGGSWHRVACSGWEGGCGVCQRAGGRTVSYTCANREVQGMLNSLRFCSLWTWGRCEARGQQASQRSEGPSRPLP	698301	696995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_697063_697149_697558_697652
882717	contig_11304_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_156692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCATCTAGAATATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308123	309488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_308100_309500
882718	contig_7182_pilon	-	973	4	Intergenic	novelGene_117143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1041.99178926174	490	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	103	354	889318	887210	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKRYCCIPG	891362	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888881_888961_889168_889333_891274
882719	contig_2739_pilon	+	7922	5	Intergenic	novelGene_165825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4334	141	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	6677	7048	262193	262564	FALSE	40	AGCTGATACCAAAACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDRASKYIKQTLTTLKREMDSSTIIVGDFSTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYTTVHPTAEKYTFFSNAHGTFSRIDHILGNRATSTRSKTLR	12673	263438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_13130_178775_179378_179441_181413_247066_248190_259668
882720	contig_7416_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_134309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	333	1319	5530	6516	NA	35	TGGGGAGGAACACCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPNTIKFTEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLDIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGKTGTLMHCWWECKMIQPFWKMTWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNKESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLV	5197	7835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_5200_7800
882721	contig_1264_pilon	-	4306	3	Intergenic	novelGene_161307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41	92	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGATACCATCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139621	132783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_135293_136731_136923_138015
882722	contig_8801_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_66304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2729	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGTATCCCCAGCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561083	559480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_559500_561100
882723	contig_5918_pilon	+	3543	1	Intergenic	novelGene_99539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTTAAAAGAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718260	721803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_718300_721800
882724	contig_2703_pilon	+	4556	1	Intergenic	novelGene_101631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	464	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTGACCAACACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	5900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_5900
882725	contig_15449_pilon	+	5155	15	Intergenic	novelGene_33589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	607.646299676221	4960	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	242	2920	37166	54621	FALSE	75	TGAGACAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	28079	56856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51932_54570
882726	contig_15327_pilon	+	2624	2	Intergenic	novelGene_70614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	179	349	898735	898905	TRUE	20	CCGGGTCTGGAGCGAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898556	901274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_901035_901128
882727	contig_5261_pilon	+	2976	6	Intergenic	novelGene_102498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	13.8188277360998	2760	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	350	985	838678	842810	FALSE	50	CCCCGAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILRRHTDISQSVSNGLIAVKFGSFTYATTEKVRRSTYSCLDAQFYDDETVTVVLKDTVGREGRDRLLVQLPLSSVYNSEDSADYQFSGTYSTRLDEQCSAIPTRTLHFEKHWRLLESMKAQYVAGNGFRKVSCVLSSNLRHVRVFEMDIDDEWELDESSDEDEEASNKPVKIKEEVLSESEAENQPASAAIAPPEIVIKVEKLDPELDS	838248	844801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_838531_838610_838713_839556_839632_840531_840706_841860_841985_842582
882728	contig_3747_pilon	+	2045	2	Intergenic	novelGene_24853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	633	959	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200991	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201599_203768
882729	contig_6059_pilon	+	1245	8	Intergenic	novelGene_44819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCGCTCTTCTTTGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567791	573286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165
882730	contig_5341_pilon	-	1974	5	Intergenic	novelGene_168026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	720.141782915003	82	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	629	1306	339968	338480	FALSE	30	TACAAAATCTCAGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340028_340286_340320_340357
882731	contig_10581_pilon	-	1008	5	Intergenic	novelGene_41378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	650	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCACCGCGCTCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550882	530590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_530881_534838_534923_540172_540237_549080_549155_550386
882732	SIRV6	+	1487	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	29	12	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882733	contig_7049_pilon	+	842	3	Intergenic	novelGene_171442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	48	1503	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	278	658	144151	145581	FALSE	5	GCTGCCTGGTTCCTGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAADLAEIPDVDIDSDGVFKYVLIRVHSAPPSDAQAAESKEIVRGYKWAEYHADIYDKVSGEIQRRGYDCECLGGGRISHQSQDKKIHVYGYSMGYGRAQHSISTEKIKAKYPDYEVTWADDGY	143873	145765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_144314_144743_144869_145488
882734	contig_5033_pilon	-	10227	1	Intergenic	novelGene_28901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4398	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	4288	4590	448729	448427	NA	35	CATAAAGCAACCGTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPAPWRDRLLWGQRTSQQKRLPVSKRRESSSCPSGRLARPRPSASALKAETTSKNLAARPQAWLLLCSEREGGAPRRTATTLPLELPPGLARCSSLDSY	453016	442789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_442800_453000
882735	contig_1230_pilon	+	2245	9	Intergenic	novelGene_28859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1052.5022268385	5165	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	67	2007	405241	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404459	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
882736	contig_3986_pilon	+	6715	4	Intergenic	novelGene_52723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5639	5944	162132	162437	FALSE	35	CAACTCTCAAGGACTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTILKHLQKRDTMVPVGVQNKTTDNFPVEEKALEVPDREFKALILRIIQQLKQKADKNEEKIDKFMENTDKKWNNSRKIIHKQNAKINTPLEIIQK	105218	163208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_105259_135340_139207_139276_140049_161171
882737	contig_5961_pilon	-	5509	1	Intergenic	novelGene_144161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	4325	4669	225021	224677	NA	40	CAACATCATAGTTGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWIVLRLALWSNMWSILKNVPCPLEKTVYLAAVGWSVQYMSNRSSWLIVAFSSSVSLLSFFPDVLSFTRSCVLKCPTIIVELSLFSMLLEFMYFGALLGA	229345	223836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_223800_229300
882738	contig_1264_pilon	-	3687	3	Intergenic	novelGene_161302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	79.5	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	596	1141	136725	135270	FALSE	25	GAATGAACCTTTTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGSRRDSASYRDRSETDRAGYANGSSYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSGYTAQEYGAGTYGASTTTTTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK	138413	132723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_135776_136685_136923_138015
882739	contig_5779_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_106426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	5	337	94343	94011	NA	60	AAAACAAAAATCTAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94347	93280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94300
882740	contig_5874_pilon	-	8818	7	Intergenic	novelGene_178315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	131	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	4470	5231	285566	284805	TRUE	20	CAACCTGTTGCCATTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNQQVSIITLNVDGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQKTHLRNKDVNLLRVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHNEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTLFSDAHGIFSRIDHVLGHRGILNKIQNVEIIQSILSDNNAIKVEINTRKSKEKKINYMETE	339544	108273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5874_pilon_-_108851_108898_109019_109597_110272_173246_173254_282595_287779_288005_288657_337938
882741	contig_10235_pilon	+	2475	2	Intergenic	novelGene_46297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	84	junction_1	0	1379	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACACCGCCGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83481	87642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_84758_86443
882742	contig_5594_pilon	-	1615	3	Intergenic	novelGene_150110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108592	3257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_4232_10746_11173_108377
882743	contig_13740_pilon	+	1261	8	Intergenic	novelGene_34660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAGGTTACAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156799	161664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157302_157453_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160763_161102_161269_161573
882744	contig_854_pilon	-	5775	4	Intergenic	novelGene_36359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1458.10569651936	134	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4065	4433	993124	976030	FALSE	15	TGTGTATGTGTTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSIVTPRIDATRGGGMKGERERMFVSLWDSC	997188	974687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976120_991229_991309_991918_992043_993048
882745	contig_16686_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_162093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140024	142278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_140000_142300
882746	contig_2636_pilon	+	3911	2	Intergenic	novelGene_52043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	686	2485	28495	68525	FALSE	40	AATTCTAGAAACTCACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAICKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRSIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWTKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMKIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMLQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIKIKN	27809	69951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_30278_68508
882747	contig_1867_pilon	+	866	6	Intergenic	novelGene_54517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2286	junction_1	4918.0384138394	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	79	711	213567	220943	FALSE	25	TTAAAAATCTTCTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDAVAVDCKDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	195062	221098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195090_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
882748	contig_6375_pilon	+	2020	6	Intergenic	novelGene_73076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	75.9673614126488	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	122	409	750284	754277	TRUE	50	TAATGAATATAACTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLGSWARAHLGSLPGSRLGLGPEALTFIIFICFTASISTYMAAALLEFFITLAFLFLYATQYYQRFDRVNWPCLDFLRCVSAIVIFLVISIAAVTSRDGAAIAAFVFGIILVSVFAYDIFKIYQTEMAPRATEAC	748882	758640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_748953_750232_750386_750937_751031_751230_751316_754269_754351_757102
882749	contig_18465_pilon	-	7188	3	Intergenic	novelGene_178316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33013	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1866	2171	76819	76514	TRUE	0	CTGGTGGTTGTGGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKGKKKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	78684	396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18465_pilon_-_2775_24258_25995_75610
882750	contig_9837_pilon	+	3644	3	Intergenic	novelGene_178306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2667	3023	299198	299554	TRUE	60	ACAAGAGAGTAAGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQNQNINYRTQTNRKRTAKKKKPTATRKKETINIKVEIDETENRKTIERIHKTKSWFFESINKIDKPLARLTKEKQERMQITQIRNEMGDITTDTTEIKRIITEYYEKLYSNNLKT	157559	330993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9837_pilon_+_159631_298602_299678_330495
882751	contig_6102_pilon	-	1902	8	Intergenic	novelGene_32153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_7	319.848816327531	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	276	758	867239	839973	FALSE	20	ATCTTTGAGCCGTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867514	838828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
882752	contig_10930_pilon	-	8381	6	Intergenic	novelGene_36962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	9	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	818	1666	276835	268388	FALSE	20	GGTATGCCCACTGACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279277	261672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277232_278443_278637_279049
882753	contig_16053_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_178318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	13	390	13049	13426	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	13036	15026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16053_pilon_+_13000_15000
882754	contig_5317_pilon	+	1127	5	Intergenic	novelGene_76513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3089.94890734459	146	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	108	449	35282	39762	TRUE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVSQNIRPPPPSQAWERRGG	33681	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_39702_39950_43197
882755	contig_10500_pilon	-	6298	7	Intergenic	novelGene_41241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	973.55311445584	4136	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3307	3897	1635596	1629460	TRUE	25	ATATCTTGTATTTCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640226	1626418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940
882756	contig_1148_pilon	+	3566	8	Intergenic	novelGene_178319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1546	2298	113259	114332	TRUE	25	GAGGTAGGTAGTTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSFEPRARGPGKQMSKRTKAPVPRLRSRLDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYPRLLVSDRSPRWWIRAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	14400	142255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1148_pilon_+_14428_21072_21289_24038_24319_31244_31252_112243_113349_113669_114393_123324_123625_141347
882757	SIRV5	+	2839	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-260	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1315	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7941	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12212_12288
882758	contig_5649_pilon	+	3136	5	Intergenic	novelGene_82355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	458	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGTGAGCATGGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968114	976257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_969226_969512_970881_971445_971726_974496_974602_975985
882759	contig_2310_pilon	+	2028	13	Intergenic	novelGene_71593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	451	junction_11	159.842630942645	7	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	63	1757	106097	134479	FALSE	30	TCAGAGTGAATTATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGDDYESEAAYDPYAYPGDYDMHTGDPKQDLAYERQYEQQTYQVIPEVIKNFIQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106034	134750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
882761	contig_20527_pilon	+	11177	6	Intergenic	novelGene_138554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1158.2056121432	5339	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	661	1287	13527	27453	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12805	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13021_13081_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
882762	contig_10323_pilon	+	2454	8	Intergenic	novelGene_123602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4422	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	1947	2453	463447	513349	FALSE	10	GCCTGGCCTCCGCCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFKHFFSLLQGLFHLRKLKLQDTVGVSFPFQLTLFFSSYCLLDSASCSSSSSNVSFRLSTWYMKLVFSLSSWALETIAFLYFSSTSASESLISLMDASVSMEMDVSPLPLREDVPPREARVAADKLGMLRDPFSVKSFSGLSSTSFCCRSNSFMRISRASARAARFAA	459142	513350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459327_459372_461003_463314_463453_467386_467477_468602_468778_473476_473603_474207_474243_513274
882763	contig_7728_pilon	-	3733	9	Intergenic	novelGene_64707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	726	junction_6	173.346473860878	202	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	2521	3471	752150	713693	FALSE	25	ATTTTTCTAACTGATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVDRLLCVLSLLLCGVASLELSAPPSGSTEKPIIGILMQRCRNKMRNLGKYYIAASYVKYLESAGARVVPVRLNLTDKEYEKLFKSINGILFPGGSVNIRTSSYAKVARIFYNSALKSFDVGDYFPVWGTCLGFEALTLLVSEENLLTSTKTENLSLPLNFTGATLQGRMFRNFPADLLLSLSTEPLTANFHKWSLSMKNFTANEKLKTFFNVITTNTADKIEFVSSVEGYKYPVYGVQWHPEKPPYEWGNDNISRSPNAVKAAFYLAEFFVSEARKNNHHFESEDEEREALIYQFRPIYTGNFSSFQQSYIFD	754670	713430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_713815_716036_716172_724822_724914_724993_725101_726429_726569_729251_729337_730500_730552_735945_736058_752041
882764	contig_14970_pilon	+	4157	9	Intergenic	novelGene_45061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5621.47215482742	29	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	833	937	231446	231550	TRUE	30	TTGAGGAGTCTCTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTEQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192100	234830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_196136_196257_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_232700_232759
882765	contig_14467_pilon	+	1207	3	Intergenic	novelGene_138250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	122	625	318578	319153	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAAAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVATVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306506	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_318606_318677
882766	contig_1867_pilon	+	3427	1	Intergenic	novelGene_54532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATTCATGGAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323899	327326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_323900_327300
882767	contig_5023_pilon	-	2756	10	Intergenic	novelGene_7316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	628	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1003	1503	647301	643482	TRUE	5	TTCCCTTTTCTGCTGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648303	606326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_606424_607253_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611793_629973_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
882768	contig_4232_pilon	-	1053	2	Intergenic	novelGene_63275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1442	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAGAAAATCCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468101	465996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466005_467056
882769	contig_11417_pilon	-	6809	35	Intergenic	novelGene_103300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4428	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCATGGCATTCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588833	517498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_517508_521564_521647_527037_527106_528492_528609_529167_529346_530871_530957_536806_536969_537760_537849_538884_539047_539277_539439_540488_540616_542616_542779_551050_551144_551338_551504_552202_552346_556568_556738_557383_557471_557567_557642_557739_557810_558178_558386_559104_559260_559487_559655_560664_560888_566038_566182_566274_566360_567426_567657_568274_568413_569457_569559_570058_570197_570597_570684_572531_572750_573471_573635_575928_576053_583802_583912_586512
882770	contig_563_pilon	+	2685	2	Intergenic	novelGene_169765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGACGGATTGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684473	687257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_686908_687006
882771	contig_6946_pilon	+	2617	1	Intergenic	novelGene_59791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTGTTTGTCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451460	454077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_451500_454100
882772	contig_13612_pilon	-	2551	2	Intergenic	novelGene_157280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	0	10	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1968	2300	36612	36280	TRUE	20	ATCAGCTGTCCTGTACGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIKTITLAPLLIIFLALNLAKDFKIKLLMMGLGSTGGNASRGPGLLWSCQPGPWSSRLHSDPLQMSFGLLRVFSIVIPFLYVGTLISKNFAALLEEHDIFVPEDDDDDD	38579	34878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_35126_36275
882773	contig_8377_pilon	+	3199	3	Intergenic	novelGene_34999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1001	61	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGACTGTGTTGCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68138	135196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68337_128717_131572_135049
882774	contig_3018_pilon	+	403	5	Intergenic	novelGene_78799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	501.410198839234	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	32	403	480162	498526	FALSE	80	AAAAAGAAAAAACTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKN	480130	498526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505
882775	contig_8358_pilon	-	3790	2	Intergenic	novelGene_173289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2631	2939	102870	102562	FALSE	45	CACAAGTAAAATTTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKKKKGNTSSQRMALIELPAGARRIQAASGPGSRDCGPRKQRSNRTKAPVPNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRQLLESGT	280267	101710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8358_pilon_-_103173_277939
882776	contig_5280_pilon	+	2632	9	Intergenic	novelGene_52573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	487.431725988369	1978	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	148	1176	38385	78098	FALSE	25	ATGCATCATGGCATTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38237	79554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
882777	contig_9313_pilon	+	3566	4	Intergenic	novelGene_86481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	1140.74916904053	20	140	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAGATATTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387481	464806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387576_432396_432583_457278_457360_461601
882778	contig_11160_pilon	-	2463	1	Intergenic	novelGene_168843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTAGCTGCTGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323359	320896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_320900_323400
882779	contig_546_pilon	+	4885	12	Intergenic	novelGene_117180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1004.40125661885	2928	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	281	1804	119834	152874	TRUE	55	AGGACAAAAAAAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	61169	156168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_84740_84818_89663_89753_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_153989_154156_154805_154849
882780	contig_8330_pilon	-	5671	2	Intergenic	novelGene_71722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	5310	5609	159075	158776	FALSE	10	ACCCTTCCCTCAGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAGWVAGAGQRSLRAQRQWSLPSGVPGSGSLLRAQIGEGLVSKPTGSPRTHKGIQVAPRDVSWPWNLICGIFTEVGPREGEVVLGQMTTEYGDLELL	165282	158713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_163357_164254
882781	contig_10749_pilon	-	1114	4	Intergenic	novelGene_133473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	763	junction_3	475.975489565027	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	65	511	168321	164528	FALSE	15	TCTGTTCACCTGTGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169052	163924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168302_168346_169012
882782	contig_11385_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_178320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCAATAGATATCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76018	74014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11385_pilon_-_74000_76000
882783	contig_16103_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_118676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTCCCCCTCCCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18616	17454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17500_18600
882784	contig_8712_pilon	+	2083	5	Intergenic	novelGene_58773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	590.732754720779	115	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	92	610	301117	321793	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRANKSDISVVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286982	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_301057_301150_314967_315188_318064_318222_321684
882785	contig_14441_pilon	+	1661	4	Intergenic	novelGene_100725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	1754	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	825	1625	121136	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120311	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
882786	contig_10902_pilon	+	1990	5	Intergenic	novelGene_65671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	159.664491982407	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	150	497	108143	110362	TRUE	25	TCCTGGTTATTTCATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRVMKRTFLRSSQLMRCTISWKRPPPRSASNGSKPSSWPPGLGSEGTPAASPHPPRGNLPDTLAPAAIHFCEESMRKGPGVGSYLLQGILNVINHQAVWSGWAALPLQDSSLF	107120	111922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_107203_108075_108146_109942_110231_110305_110404_110470
882787	contig_2100_pilon	-	849	6	Intergenic	novelGene_50659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	374.201336181473	50	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	148	516	1174340	1170252	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLFRRASWPSPAGGASWCLIVLGRLRIPSLPTWWWDSALGRSRQVHLADLSAWPSTTRSSELKRSWAARLSLPARSSETPSPTKLWAV	1175647	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173180_1174233_1174403_1175562
882788	contig_9668_pilon	-	3738	15	Intergenic	novelGene_58172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	835.659143479943	543	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	616	2520	605373	503609	FALSE	45	CCAGACCCAGTGAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	670398	502390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866_670221_670306
882789	contig_13021_pilon	+	2304	13	Intergenic	novelGene_8179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2584.84501469624	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	166	2001	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174510	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176603_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
882790	contig_3975_pilon	+	2397	1	Intergenic	novelGene_54952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2354300	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2354300_2356700
882791	contig_7839_pilon	+	2431	12	Intergenic	novelGene_45732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	605.934194392332	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1154	2146	955334	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950917	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_954959_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
882792	contig_7527_pilon	+	5886	8	Intergenic	novelGene_139562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1238.11474526757	3965	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	548	1174	85507	96119	FALSE	45	CATAAAAGATAACTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80073	100831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84555_85436_85578_85708_85781_86443_86519_89859_90038_94415_94590_96062
882793	contig_1694_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_145001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	547	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2152	3201	1712834	1713883	NA	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSLVEENALELPHREFKSLILGILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIMQSQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTEKIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAARKKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	1710682	1714068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1710700_1714100
882794	contig_11422_pilon	-	1425	2	Intergenic	novelGene_99087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGGTGTTAGTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2342	746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_2038_2208
882795	contig_16525_pilon	-	552	5	Intergenic	novelGene_133860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2029	junction_3	944.218724660764	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	55	495	181436	178157	FALSE	10	GGTTCGAGGACTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPVAAPRGEVQSSKATAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR	181490	178099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178476_178588_178686_181150_181253_181388
882796	contig_2770_pilon	-	1422	6	Intergenic	novelGene_107448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1801.97320734799	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	216	572	750561	743785	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEESN	750776	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743799_744112_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
882797	contig_17989_pilon	+	2701	4	Intergenic	novelGene_150826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	95.9826373187707	1820	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	144	605	261854	265002	FALSE	40	GGAGCCCAGCAGACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFINKGEKGIMVLAGDTLPVEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDLGAAAGSKRPTCVIMVKPHEEYQEAYDECLEEVQALPPPL	261710	267098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262087_262158_264163_264270_264876
882799	contig_13863_pilon	+	4218	12	Intergenic	novelGene_42088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	398.823289852694	3897	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	450	1517	478688	490279	FALSE	20	TTTATTTATCTATGTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455996	492980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_476611_476659_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
882800	contig_3018_pilon	+	1294	10	Intergenic	novelGene_78782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	537.863262259925	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	799	1293	478971	498520	FALSE	75	AAAACAAAAAGAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKIS	398223	498521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_398266_421000_421501_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505
882801	contig_6137_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_59245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTAATGACCGCCGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318007	1316757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1316800_1318000
882802	contig_2332_pilon	+	653	7	Intergenic	novelGene_58679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_4	1451.46799252802	369	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	219	560	332129	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	331275	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
882803	contig_11316_pilon	+	1443	2	Intergenic	novelGene_122596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136895	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138135_138665
882804	contig_2463_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_43006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342226	340220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_340200_342200
882805	contig_10437_pilon	-	2898	1	Intergenic	novelGene_38497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	51	431	1251887	1251507	NA	10	TGGTTTGAGTCCCTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSDNCLWVSAALVANMPEPAKSAPVPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	1251937	1249039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1249000_1251900
882806	contig_20527_pilon	+	3106	1	Intergenic	novelGene_138604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5779	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCATGAGCCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15588	18694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_15600_18700
882807	contig_5485_pilon	+	534	6	Intergenic	novelGene_37779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTCTTTCTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638670	652010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_638769_639398_639498_641109_641198_645872_645942_650865_651017_651981
882808	contig_6215_pilon	+	4894	7	Intergenic	novelGene_21212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1055	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGCGCCTTTCTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226741	243071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228367_229714_229951_230071_230215_231669_234147_235190_235361_238588_238755_242994
882809	contig_6137_pilon	+	5706	15	Intergenic	novelGene_59223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_7	1212.02051954409	24	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1749	3131	1328176	1353702	FALSE	35	TGAAATTATGTACTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1312227	1356277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
882810	contig_2703_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_101796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	484	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCACTCCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615141	615909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_615100_615900
882811	contig_5988_pilon	+	1751	11	Intergenic	novelGene_16094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1946.70923355287	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	191	904	1218380	1224777	TRUE	15	ATTCCTTAACCTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210815	1226924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210974_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225372_1226671
882812	scaffold_12124_pilon	+	1858	10	Intergenic	novelGene_22292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3150.78283041603	106	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	190	666	1490385	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENLWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506658_1509248
882813	contig_10345_pilon	+	1391	13	Intergenic	novelGene_158370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	641.766588540309	91	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	57	1097	11670	24141	FALSE	30	AGGACAACTGGTATGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4382	24435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
882814	contig_5279_pilon	-	1154	7	Intergenic	novelGene_105561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_5	258.328387049421	1285	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	34	1152	340212	322496	FALSE	65	TAAGAATTAAAAACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSEDEEKIEEELQGDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEKKGKENDMEMEIKWVP	340245	322493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885
882815	contig_12644_pilon	-	7862	17	Intergenic	novelGene_44467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	556.260042044186	2037	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	865	2793	1123673	1026128	TRUE	10	CGGTGCACAGCTCGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1124537	1006329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1006541_1011459_1011600_1013250_1013441_1017032_1017349_1021915_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231
882816	contig_5643_pilon	+	1235	11	Intergenic	novelGene_38853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3957	junction_1	1692.65827620344	29268	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	22	1023	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233951	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
882817	contig_4857_pilon	+	4390	3	Intergenic	novelGene_48730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	380	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	3119	3772	1196042	1196695	FALSE	65	AAAAGATGTCACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTVIVGDFNTPLSVKDRTTRKKLSKDTEELKGTISQLDLIGIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILDKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKNFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEGTKSKL	1192673	1197313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1193161_1193319_1194607_1194697
882818	contig_16103_pilon	-	1936	8	Intergenic	novelGene_118876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_7	3511.91701240801	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	56	559	742197	733331	TRUE	45	TTGATACTGAAAATTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNERTRVVYWCSLLFSAMAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	742252	722335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_742194
882819	contig_7020_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_57075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	449	1350	1	1350	102160	103509	NA	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSTEGREGFVVKVRGLPWSCSADEVMRFFSDCKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	102159	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_102200_104300
882820	contig_8270_pilon	-	3012	1	Intergenic	novelGene_143807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	63	380	429421	429104	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDSRASAGKKLKNSLKKKKKMKVIARATSSKLEDEDKDAADGGGNVRGLSFGGLAEDAGSREESGFAASRPGLISSWLSERTWGSGLQGRVPVSCYFEFSFFLSDVSGVTVSKQEKLLPLPRDLR	429483	426471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8270_pilon_-_426500_429500
882821	contig_9848_pilon	-	2284	10	Intergenic	novelGene_79946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_2	504.004507132502	5	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	81	704	113970	106351	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGRRAPGVGRGGVTAQLRPNSLLLQEAGTDQMQPTCEWPSPCPSPVRHCPGFLI	114050	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104841_104905_105852_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
882822	contig_3817_pilon	-	4542	3	Intergenic	novelGene_78275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	802	1401	65519	64920	TRUE	60	AAGAAACACATAAAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNQTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	66320	45793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_45803_59091_61120_63815
882823	contig_17274_pilon	+	2837	17	Intergenic	novelGene_26510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_15	160.032601659006	354	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	127	1659	87831	124457	TRUE	30	TCATCACAGCCCACCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRRRKRGRPRKHLTQRNKAPLKRGRPRGSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87704	216275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_113142_113218_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123427_123572_124349_125333_199566_199792_216197
882824	contig_11285_pilon	-	1409	12	Intergenic	novelGene_5670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	461.110194606721	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	281	1219	788506	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	789510	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788583_789133_789265_789437
882825	contig_12644_pilon	-	6811	17	Intergenic	novelGene_44466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	556.260042044186	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	39	1742	1123448	1026128	TRUE	10	CGGTGCACAGCTCGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1123486	1006329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1006541_1011459_1011600_1013250_1013441_1017032_1017349_1021915_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231
882826	contig_16103_pilon	+	533	3	Intergenic	novelGene_118679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9345	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAGGACATGCGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17542	18573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_17745_17881_18042_18402
882828	contig_14925_pilon	-	1731	5	Intergenic	novelGene_55329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	93	junction_4	888.4594813496	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	40	552	119922	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSWDTRQMFFGAGTKLFVEPQSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	119961	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_119858
882829	contig_233_pilon	-	2289	12	Intergenic	novelGene_14638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1004.7439540615	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	268	1860	105485	78579	FALSE	15	GGGGTGTCCTAGAAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	107349	78149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300
882830	contig_6102_pilon	+	1740	13	Intergenic	novelGene_31781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	226.898089581106	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	454	1476	352330	357373	FALSE	15	CATCGTCTTCAAGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKKASKTAENATSGETLEENEAGD	350493	357637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350873_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038_357093_357307
882831	contig_2069_pilon	+	3902	12	Intergenic	novelGene_23296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	874.710766836578	1723	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	388	1509	504404	523739	TRUE	15	GGCAGTGAGTGGGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNITLANVIRQLGSLSKYAEDIFGELFTQANTFASRVSSLAERVDRLQVKVTQLDPKEEEVSLQGINTRKAFRSSTIQDQKLFDRNSLPVPVLETYNTCDTPPPLNNLSPYRDDGKEALKFYTDPSYFFDLWKEKMLQDTKDIMKEKRKHRKEKKENPNRGNVNPRKIKTRKEEWEKMKMGQEFVESKEKLGPSGYPPNLVYQNGSIGSVENMDAGGYPPPPPQSDSTSPPSPSFSEDNLPPPPAEFSYSADNQRGSGLAGPKRSSVVSPSHPPPAPPMGSLPGPKPGFAPPPAPPPPPPMIGAPPPPPPAGFGTPGTPPPPSPPSFPPHPDFAAPPPPPPPPAVDYPTLPPPPFSPQIRCLWHTAGTRFHC	452835	533824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_453099_504279_504453_510937_511073_511590_511745_514129_514248_515265_515397_518070_518230_520112_520434_523684_525373_532115_532268_533110_533176_533281
882832	contig_233_pilon	-	2535	15	Intergenic	novelGene_14572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1418.46127647431	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	89	2095	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126995	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105576_108417_108583_108724_108814_109914_109976_126898
882833	contig_14142_pilon	-	1191	6	Intergenic	novelGene_120630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	368.820064530117	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	225	545	622896	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPQPPSQCSAQHYFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625210	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621507_622851_622949_625038
882834	contig_7157_pilon	-	6721	11	Intergenic	novelGene_131308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	472.14908662413	8249	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	22	1182	1019968	997010	TRUE	50	TAAATAAACAATGATAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERRRHKKRIQEVGEPSKEEKAVAKYLRFNCPTKSTNMMGHRVDYFIASKAVDCLLDSKWAKAKKGEEALFTTRESVVDYCNRLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVARCILFLIIWLITGGRHHFWFLPNLTADVGFIDSFRPLYTHEYKGPKADLKKDEKSEAKKHQKSDSEEKSDSEKKEDEEGKVGPGNNGTEGSGAERHSDTDSDRREDDRSQHSSGNGNDFEMITKEELEDNDGETTKPSSEKS	1019989	981098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_981311_981818_982240_992103_997055_997096_997483_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589_1004795_1010536_1010643_1011511_1011621_1019932
882835	contig_6164_pilon	+	2473	1	Intergenic	novelGene_121257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCAAATTTGTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37573	40046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_37600_40000
882836	contig_14970_pilon	+	3463	1	Intergenic	novelGene_45094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTGAGGAGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231363	234826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_231400_234800
882837	contig_854_pilon	-	7362	23	Intergenic	novelGene_36649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.66639116180212	13393	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	5745	6332	1706853	1702673	TRUE	10	TGCTTCTCTCGGACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1777330	1697760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1718564_1724207_1724280_1776925
882838	contig_17144_pilon	-	1208	5	Intergenic	novelGene_29265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2979.6830682977	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	470	913	166806	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183195	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166863_174905_175001_175973_176215_181809_181850_183158
882839	contig_17144_pilon	-	2339	11	Intergenic	novelGene_29457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1885.26212766289	3	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	316	1344	173384	167839	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALGKGRQGLGREGCWEGTPGAPHKDSPF	183264	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167424_167786_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173440_181695_181850_183158
882840	contig_2332_pilon	-	4601	8	Intergenic	novelGene_58683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACAGATTGAAAAGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619109	418618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_420517_441914_442311_463960_464013_467668_467944_478231_478240_484421_484517_553900_555402_618733
882841	contig_11258_pilon	-	327	5	Intergenic	novelGene_67748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTCACCCGGTAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53623	49240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_49272_49377_49421_50091_50154_52748_52870_53553
882842	contig_12677_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_110715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1554	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
882843	contig_3747_pilon	-	2687	8	Intergenic	novelGene_24844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATTTCAACAACGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	200986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202725_203073_203127_203227_203384_203496_203649_203766
882844	contig_6576_pilon	+	5718	2	Intergenic	novelGene_42398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8439	junction_1	0	5465	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	120	1466	1301228	1302574	FALSE	50	GAAAAAATACCCCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295657	1306826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211
882845	contig_9848_pilon	-	1776	13	Intergenic	novelGene_79945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	472.177307504524	71	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	481	861	106569	104044	TRUE	0	GTCGTTCTCCTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAFLPGSATPRYQNFSKGSRHGSDAAYVDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	113894	98493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106441_106511_106636_106774_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
882846	contig_2703_pilon	+	8075	18	Intergenic	novelGene_101695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1115.92462321874	8508	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2259	2858	597815	608290	TRUE	10	CGCCTCCACTCCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKPKNTALAHLAQDS	526164	615909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_597819_599674_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_608248_608367_609320_609402_610756_611429_611521
882847	contig_10594_pilon	-	3310	5	Intergenic	novelGene_142321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1684	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	569	1147	461392	460814	TRUE	60	GCACCACATAAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIIPECYEKLYSNKFENLEEMEKFLETHHLPKLTQSDVENLSRPIRREEIEKVIKKKNKKPPTHAPKQSPGSDSFTEEFYQTFREELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASVTLIPKPGKHTTKKENYISISLMNTDAKILSKILASRIQHHIKKIIHHNKQDSYQVCKDGSTLENQSM	461960	305084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_306143_392676_393174_393239_393742_398105_398131_460732
882848	contig_6589_pilon	+	1503	10	Intergenic	novelGene_26216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	109.1929993686	1179	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	94	1155	2048791	2059863	FALSE	0	TCTCGGGGTCTCTGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048697	2060211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
882849	contig_7202_pilon	-	854	2	Intergenic	novelGene_18576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	139824	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCACTACTGGAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30111	28093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28634_29797
882850	contig_8034_pilon	-	8233	5	Intergenic	novelGene_178321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	917	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	769	1473	501342	500638	TRUE	40	GAGAAATCTATGTGACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVIEAVSSRFEMVEDRLSGIEDKRLDTTLFQQNSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFQVIGIPEQGENTENTESIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTLYRRDPKRKSPRNIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGKTRRLSSDYSAETMKTRRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFEGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGSI	502110	130790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8034_pilon_-_131227_131454_132233_136201_136886_301006_305386_500154
882851	contig_15434_pilon	+	3217	7	Intergenic	novelGene_56698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	395.804946350542	20	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	2051	3037	28900	33302	FALSE	15	TTTGTTTGTGACTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIINMSFTLKRMVCLVFTAEYSCEYGSMKFYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVKCRMQVDPQKYKGIFNGFSITLKEDGFRGLAKGWAPTFIGYSLQGLCKFGFYEVFKVLYSNILGEENAYLWRTSLYLAASASAEFFADIALAPMEATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGVWKGLFARIIMIGTLTALQWFIYDSVKVYFRLPRPPPPEMPESLKKKLGLTQ	26610	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_26661_26899_29080_30409_30590_31082_31265_32182_32356_32952_33064_33141
882852	contig_11548_pilon	+	2175	9	Intergenic	novelGene_66736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1129.91431505889	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	199	1332	63836	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTVSQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63637	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63885_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
882853	contig_15025_pilon	-	467	4	Intergenic	novelGene_155969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	315.292809235408	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGAGAGAAGAATATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42475	39021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_39105_39446_39638_41248_41314_42347
882854	contig_4732_pilon	-	311	4	Intergenic	novelGene_75403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	690	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAGTCACGTGTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525144	524032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_524092_524184_524231_524534_524668_525071
882855	contig_6434_pilon	+	3485	14	Intergenic	novelGene_61902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	380	junction_2	1159.95102936829	14	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	189	2108	913560	932457	FALSE	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRFVFSKPMAQPTLAGWDLGPSLPRTDLSTLSTEISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	913371	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
882856	contig_12677_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_110723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
882857	contig_10126_pilon	+	3595	1	Intergenic	novelGene_105769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAAGATAATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184809	188404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_184800_188400
882858	contig_2703_pilon	+	960	2	Intergenic	novelGene_101628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	3291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1759_2745
882859	contig_13674_pilon	-	2426	2	Intergenic	novelGene_140301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	264	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1833	2240	9607	9200	FALSE	45	CTGTGAGAGAAAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIIAPILVRFRASEILGNFTELQGSKSQTHICQILYSSLLPSRSRKNRYPGHPESPLGTRRATTHQGTEMYLYTGGKWNIDMIPCRECQGCPAQHKDLGSIRNQGKIQKPPGKKQLRSFKVSQVPGLAGVSGMI	12893	9013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_10679_12132
882860	contig_10861_pilon	+	3811	3	Intergenic	novelGene_39280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1828	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3275	3604	1355031	1355691	TRUE	40	AAAATGGAGACGGCGACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFLFLMNNLHLGILILGLLSIKLLLVLTNISRLGDWNVIPLSTTHLQLLCHLSVCFSDCRISSTCPLPCCQAQDNRCCFLTDPFLCLNTEVFMGQSAEFSLGAEANI	1351756	1356821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1355192_1355522_1355727_1356649
882861	SIRV3	-	480	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	1	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	491	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
882862	contig_14822_pilon	-	1231	7	Intergenic	novelGene_145406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4437	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	45	413	190302	186548	TRUE	20	TCCTTGACTGCAGAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHYRYMIHVSWPTAQSSGHFHQGKERLPSPTPAEKAYTYSHIRSQPSIRLCILCMKRSTKGFCSQGCPLQAGTKMAQRSLLLGEILFAFLDIRLDGITARLPASWAHFPVFVRELEGLNKS	190346	118414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_118618_171023_171157_183383_183500_185581_185737_186101_186221_186455_186592_189977
882863	contig_10766_pilon	+	4834	2	Intergenic	novelGene_151230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2204	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAATTGTGAAACCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213130	218464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_213587_214086
882864	contig_6576_pilon	-	3439	4	Intergenic	novelGene_42397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCCCCTAGCAGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305802	1295655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1295756_1301204_1301395_1301544_1304494_1305602
882865	contig_14142_pilon	+	502	3	Intergenic	novelGene_120449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281	161	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTCGCCTGTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94829	95593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_94924_95012_95264_95436
882866	contig_15327_pilon	-	1037	4	Intergenic	novelGene_70492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1937	junction_3	77.0468832739016	150	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	141	428	411438	401655	FALSE	10	GAGCTGTTTTCTTTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRAPSLSSTTAASFFCGSWCCLCARSVRTWYLFCEAAAEETPVLAMADEKPKEGVKTENNDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGVF	411578	401045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409830_411417
882867	contig_14970_pilon	+	3944	6	Intergenic	novelGene_45047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_2	3787.14275410896	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	576	680	231446	231550	FALSE	35	GGCTAATGGAAATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	188799	234814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
882868	contig_13481_pilon	-	4049	1	Intergenic	novelGene_119530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGATGACAATATATTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472601	1468552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468600_1472600
882869	contig_3233_pilon	-	5031	3	Intergenic	novelGene_56519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6490	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4321	4710	229620	229231	FALSE	35	AAAAGGTGGTGCAGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIQRRGKKQHELPTNGTQRAGRCGQVESRWHQGEACACWPRDCGHRMQRSLSGGEEVWGWESIYRWLLVVLSPAGSSVKLVSHIPCSLISDRSPRWQSRAALADSRPLHVALLTLFCVSFLFYSVLG	234061	228909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_229685_229735_233558_233627
882870	contig_15327_pilon	-	2296	3	Intergenic	novelGene_70634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3046	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATGGACGAGACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901278	898592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_898741_899036_901033_901126
882871	contig_4759_pilon	+	1685	3	Intergenic	novelGene_106333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3065	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGGTGTCTGATACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586091	589610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_587631_588756_588810_589517
882872	contig_17440_pilon	+	446	1	Intergenic	novelGene_7576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAGAAGAAATAATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1600_2000
882873	contig_3155_pilon	+	2710	5	Intergenic	novelGene_26358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1065.63088708051	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	82	594	258156	261405	TRUE	15	CCCCACCTGTTGGCCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAAGSQRPRNSAEGKLLHGWLRWWLHHLVRSQGHLCAGKDITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	258074	263643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259837_261129_261806_261927
882874	contig_14815_pilon	-	1865	6	Intergenic	novelGene_127202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	686	junction_1	104.33676245696	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	429	1217	22749	17106	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLETVDPKRYPRKKMEKRFVFNKLQVKDKLEFESAEYPNWYISTSQMEEMPVFLGNTRGGQDITDFTMEEISS	23177	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_17319_18316_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702
882875	contig_10263_pilon	-	1965	2	Intergenic	novelGene_135811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACTCACCAAGGTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10264	8132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_9605_9771
882876	contig_9112_pilon	+	3939	6	Intergenic	novelGene_60192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	507.292184051755	5996	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	521	1372	108641	114303	TRUE	5	TCTTGAGTCTGGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	107824	117310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108241_108536_108743_111553_112128_113625_113750_114251_116539_116978
882877	contig_19816_pilon	-	2930	3	Intergenic	novelGene_156476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_2	79	20	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	779	1078	124800	123991	FALSE	25	AATGTGAGTGGATGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASKY	125578	122138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_124035_124441_124556_124658
882878	contig_14682_pilon	+	5078	6	Intergenic	novelGene_139135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	339	junction_4	321.976769348349	4727	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	167	709	165806	174580	FALSE	30	ATGATGTCATAGAAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYLLIFLKFVQAVIPTIEYDYTRHFTM	165639	178949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_165879_169207_169243_169509_169666_170436_170565_172795_172865_174498
882879	contig_9406_pilon	-	2352	5	Intergenic	novelGene_136138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	649.444522264989	4375	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	130	627	38984	34784	FALSE	35	CAAAATATTTTTCAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	58632	33058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39033_58551
882880	contig_6616_pilon	-	4312	3	Intergenic	novelGene_141766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_1	3.5	2987	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCTTTCCTGCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363742	358689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_362108_362327_362433_362953
882881	contig_8330_pilon	+	2327	4	Intergenic	novelGene_71884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	62.403703593795	1202	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	470	853	1060926	1065600	TRUE	5	TCTTTCTGGTATTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKCRSDPVLHIDLRRWADLMLVAPLDANTLGKVASGICDNLLTCVIRAWDRSKPLLFCPAMNTTMWEHPITAQQVGQLKAFGYVEIPCVAKKLVCGDQGLGAMAEVETIVDKVKEIFCQRNGFQKK	1060456	1071394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1061055_1064905_1065075_1065514_1066471_1070790
882882	contig_854_pilon	-	4835	11	Intergenic	novelGene_36473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	212	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1603	1917	1717580	1717266	TRUE	35	CAAGTGAGACGGTAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGQGPKDEGSSPSAPARFTVMGRPLVDEETLRKGERSEDELQSFCSQKTPSNMKRGKHTALQCPAPPTSPVAAFPGTEVEPAQRWARLLLEAWGALEKLCPT	1719830	1599824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1599832_1653438_1653447_1699278_1699287_1709994_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712300_1714826_1715202_1715267_1717830_1718477
882883	contig_5815_pilon	+	2949	6	Intergenic	novelGene_141205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	213	junction_1	319.49209692886	1377	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	133	855	561980	571884	FALSE	30	TAAAAGCAGTGTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGEGLWVILHLYRQGIPLCALINQHFSGLARKFPDVKFIKAISTTCIPNYPDRNLPTIFVYLEGDIKAQFIGPLVFGGMNLTREELEWKLSESGAIKTDLEENPKKPVEDTLLSSVRCSVPMRRGSDSEGD	561847	573978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_567037_567804_568014_571741
882884	contig_1435_pilon	+	5007	5	Intergenic	novelGene_115487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	503	junction_1	103.321101426572	3251	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	22	738	486392	563411	FALSE	65	AAATAAATAAAAAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRDGTSSMSSGYSSLEEDAEDFFFTARTSFFRRAPQGKPRGGQQDVEKEKETYNYLSKEEIKEKVHKYNLAVTDKLKMTLNSNGIYTGFIKVQMELCRPPQTSQNPGKLAATSNGCMNTLHISSTNTVGEVIEALLKKFHVTDSPAKFALYKRCHREDQVYACKLSDQEHPLYLRLVAGPRTDTLSFVLREHEIGEWEAFSLPELQNFLRILDKEEDEQLQNLKKRYTAYKHKLEEALSEVWKPD	486370	567680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_486503_554737_554846_557482_557721_560262_560373_563261
882885	contig_10404_pilon	+	1126	6	Intergenic	novelGene_138653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	93	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	69	518	1085448	1099868	FALSE	15	TTGCCCAACTGTTGCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085379	1100476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
882886	contig_7963_pilon	-	2746	5	Intergenic	novelGene_58292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1215.48570538695	198	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1643	2065	40241	38897	TRUE	35	TACCATGATAAATAGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	43225	37885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_41537_42878
882887	SIRV3	-	481	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	258140	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
882888	contig_10437_pilon	+	806	3	Intergenic	novelGene_38334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1970	junction_2	798	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445403	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_445476_446951_447055_451075
882889	contig_14577_pilon	-	4161	22	Intergenic	novelGene_164632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	473.457955233778	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	255	1355	86842	66521	TRUE	35	AGTCCAGCACTCTAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLKLIKAF	97164	48478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66548_67141_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_95581_95654_95822_95954_97130
882890	contig_12938_pilon	+	1541	8	Intergenic	novelGene_99732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	963.204579113124	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	192	764	78117	85540	FALSE	30	TCAACCGCAATATTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	52005	86317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_76550_76685_78099_78180_79040_79230_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
882891	contig_8885_pilon	+	5412	3	Intergenic	novelGene_115583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10153	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1734	2087	253283	253636	TRUE	15	TACAAGTTGTGCTGGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWSEKILCIISTFWILLRIALWPKMWSVLENVPCTLEKNVYLAAVRWSVLYMSMRAGWLIVPFRSSVSLFSFFLDVLSFTESGVLKSPTIIVELSVSLFSAVRVCFMYFGALSLGA	251480	367002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_252697_252765_254319_364359
882892	contig_18272_pilon	+	4785	9	Intergenic	novelGene_7047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2658.23000027744	1078	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	13	1332	468524	538332	TRUE	20	TTCATAATGATGTGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGTMKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	468511	541833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_468606_507838_507953_509541_509743_512634_512713_514111_514361_518778_519040_537077_537197_538116_540700_540747
882893	contig_5125_pilon	+	2813	7	Intergenic	novelGene_43423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	1316.31885701502	4503	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	583	1716	35654	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25962	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
882894	contig_10500_pilon	+	3002	3	Intergenic	novelGene_41201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	182	2799	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGTATTAGCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1403803	1408182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1406264_1406506_1406636_1407769
882895	contig_8443_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_150621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1400	1813	840515	840928	NA	55	GCAGGATGAAACAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGSTILDSCWRSADREYGKANSWSSQQETEHSVTSETCFPTPHLASPCSTFAASRLASLLLPGRQIPGFSESRFTAPQQAATMAWEAPVLGRANLSCPHWPSSSVPFLCCRYCFFQPLLLSSLPLTSSTSFLLNT	839115	841753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_839100_841800
882896	contig_3155_pilon	+	1794	4	Intergenic	novelGene_26400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	563.986012434903	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	42	302	258156	259931	TRUE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSATPSRTGAAATMNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELTVSSHGPVCGCRAFRFHNPHGLLSSWSHLSTWFYSAGGRRV	258114	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259802_259978_261082
882897	contig_3942_pilon	+	804	6	Intergenic	novelGene_128696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.491001022267	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	322	630	428548	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPSGRPLFHPASPPRWSWPGFCRSWRCCCYYRAPRRRARPRRGRSTRWRPPARLVTSHPTALQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426543	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_428216_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
882898	contig_6589_pilon	+	1259	10	Intergenic	novelGene_26220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	109.1929993686	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	39	1100	2048791	2059863	FALSE	25	TATGGTTGCATTTACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEAANCIMEVSCGQAESSEKPNAEDMTSKDYYFDSYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMFHNRHLFKDKVVLDVGSGTGILCMFAAKAGARRVIGIECSSISDYAVKIVKANKLDHVVTIIKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVLYARDKWLAPDGLIFPDRATLYVTAIEDRQYKDYKIHWWENVYGFDMSCIKDVAIKEPLVDVVDPKQLVTNACLIKEVDIYTVKVEDLTFTSPFCLQVKRNDYVHALVAYFNIEFTRCHKRTGFSTSPESPYTHWKQTVFYMEDYLTVKTGEEIFGTIGMRPNAKNNRDLDFTIDLDFKGQLCELSCSTDYRMR	2048752	2060022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2048827_2051673_2051776_2052672_2052829_2052964_2053029_2055074_2055218_2056137_2056226_2056310_2056427_2057347_2057499_2058190_2058313_2059779
882899	contig_11017_pilon	+	3501	4	Intergenic	novelGene_128097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	280	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	540	1415	532855	533730	TRUE	5	TTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGTEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYPRLLVSDRSPRWWIRAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	532315	610461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_533897_540806_541093_541355_542153_609624
882900	contig_6434_pilon	+	3133	16	Intergenic	novelGene_61901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1337.76458649827	5670	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	22	1881	911813	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVPDRMLPPEMVERRPVLFEISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	911791	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_911856_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_932690_932816
882901	contig_2750_pilon	-	2198	4	Intergenic	novelGene_164476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAGAGGTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128057	6049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2750_pilon_-_6675_6727_7797_76450_76608_127710
882902	contig_2770_pilon	-	3479	5	Intergenic	novelGene_107442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	432.873177154695	42	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750771	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_746745_747765_747797_750558
882903	contig_5623_pilon	-	5232	11	Intergenic	novelGene_154796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	393.210427125223	217	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	517	1122	210106	207631	TRUE	35	ACAAGAACCCCTTCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	239369	202346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_202711_203152_203341_204072_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210122_218066_218140_218220_218450_220829_221000_239340
882904	SIRV5	+	2814	6	NNC	SIRV5A	novel	1890	17	NA	NA	-298	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	5	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7903	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8017_8275_8382_8454_8586_10858_10998_11147_13028_13161
882905	contig_19459_pilon	-	1193	8	Intergenic	novelGene_59815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	70	855	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19033	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
882906	contig_7229_pilon	-	3040	2	Intergenic	novelGene_39795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4054	junction_1	0	10	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	16	348	877522	876706	FALSE	25	GCAAATGGACCTTGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEVSGFCFE	877537	874013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_876867_877350
882907	contig_6738_pilon	-	3431	4	Intergenic	novelGene_166121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	539	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAACACATACCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40906	23400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_23476_32601_32755_36539_36701_37864
882908	contig_9720_pilon	-	2143	3	Intergenic	novelGene_116800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGCATTATTTGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468266	445175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_445184_453150_454065_467045
882909	contig_1263_pilon	-	3868	2	Intergenic	novelGene_170377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	156	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2413	2736	50982	50659	FALSE	30	GTAGGATGCAGAATATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPTGYRALGNQGYTLSHPPSFFPVQGLCHFPMGHGCSAREILAHCHLDFHFGLQQPKNSGQGVRDGNSTELPAGDRAPCNQGYTLSHPSSFLPLQGPYCLPTSQG	54469	49526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_52776_53850
882910	contig_16411_pilon	-	3530	1	Intergenic	novelGene_77367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	1558	2268	309333	308623	NA	80	AAAAAAAAATAGAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNFNTPLSVKDRTSREKLNKDMEDLNATINQLDLIDIHRTLQRTAAKYTFFSNAHGTFSKTDKILGHKASLNRIQIIEISHSIFSDHNAIKVEINNKKSKERKSNAWKLNNTLLKNYWIIEEIKDGINNFTESKENENISYQNLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAKIKTLTLQLEQIQRKQQKKPSGTRRKQIIEIRAELNAIEKQLKGLTRSKAGSLKRSTKSINHWPN	310890	307360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_307400_310900
882911	contig_10890_pilon	-	2677	7	Intergenic	novelGene_166777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	418.518186250278	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	418	840	149139	126635	FALSE	25	TTGAATCCTACAGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQNGGEGGIIINMSSIAGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	160928	124797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_149081_149179_156819_156927_160559_160684_160781
882913	contig_854_pilon	-	4870	15	Intergenic	novelGene_36363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1302.47095819399	330	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	2064	3752	993124	975808	FALSE	15	TGTGTGTATGTGTTGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHVQPAAPKDLQVSDARDRFLLTWRVHLGGLQSSWLSEWHLESELVYRRLQDSWEEASILYSNSSQAVLGPEHLMPSSTYVARVRTRLAPGTGLSGRPSEWSPEVRWDSQPGDEAQPQNLQCFFNGADMLSCSWEVRSEVASSVPFTLFYKPSPDTEEKECSPVMKEKLSSPYTRHRCQIPVLDSGTHSQYTVSVQPKKEEKFIKSSEHIQMGRPTVNVTMDGDSYILRWEAQKQYYDHIVYTFEVQYRKDTVSWEESKTQPLKNMHSMSLPPLEPSTRYWARVRVKPTLSSYNGIWSEWSEECSWDTEWVLPTWVLVFMLVLITLALLPMLRFCFVYGYRLNQKWKEKIPNPSKSHLFQPPCSQGLRTMWSSLQPQASLPSPLSAALLSGRSDLLPTSRLVGPGEIEERRGGPEPTLTLEKLGNTVQPCEKGK	1001014	974689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975946_977322_977410_979721_979780_980008_980100_980727_980891_981766_981907_984025_984184_984332_984469_985011_985181_985260_985419_991117_991309_991918_992043_993048_993301_994869_995136_999393
882914	SIRV6	+	1341	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	184	3	-49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	45	AACGACAAAGAAGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882915	contig_19459_pilon	-	2151	8	Intergenic	novelGene_59804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	127	912	16240	7003	FALSE	15	AATGTTGTGTTGTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19128	5763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_19026
882916	contig_11160_pilon	+	2525	3	Intergenic	novelGene_168815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	478	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	298	591	318478	320502	FALSE	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVARGRQ	318180	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319266_320489
882917	contig_6445_pilon	-	2543	18	Intergenic	novelGene_76889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_16	824.440399494311	4229	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	1035	2306	89674	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96342	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_89993_90107_91007_91854_96306
882918	contig_4093_pilon	-	2736	6	Intergenic	novelGene_27618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1993.12809422776	96	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	397	774	46358	41737	FALSE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72516	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46403_68985_69257_72435
882919	contig_1715_pilon	-	3737	12	Intergenic	novelGene_127177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	387	junction_8	153.11034210498	6525	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	338	2089	312293	248253	FALSE	20	GATAGCATTGTTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSWQDELAQQAEEGSARLREMLSVGLGFLRTELGLDLGLEPKRYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	312630	246604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
882920	contig_3095_pilon	+	2639	4	Intergenic	novelGene_75169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1300.49913494781	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	10	429	220485	226800	TRUE	55	GGAAAAAGATAAACCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSMFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220475	229188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220486_226144_226409_226645_226824_227001
882921	contig_11493_pilon	+	4301	1	Intergenic	novelGene_143734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCGCAGCCGCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352296	356597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_352300_356600
882922	contig_5389_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_142991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAAATTGCTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11239	13108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_11200_13100
882923	contig_17311_pilon	-	3163	4	Intergenic	novelGene_57844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	2091.86461214763	678	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	40	486	126865	121474	FALSE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126904	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344_123555_123642_123709_126862
882924	contig_16411_pilon	-	6345	32	Intergenic	novelGene_77293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	5581	6237	124503	99679	TRUE	5	GCTCTGGCCGGCCGCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLGDPIVVGQEHGEVLGLLDRLGVRHLPQELCRPLVGRVVVLNTALHVLQLVQDGKHVDELAQGQEVGLRDKVLPPLCMAQTLHLAAEPLDGLALKVHELHELGDLWLQHLHCLLIDLHSVGLLIAFHLGDGPGTAAPGVQHDRILMPFFQHFIHARVDRSLLNVPCNACDKCIPVLKVRVKVGLVHDGGGRRLDAWLLVREGQLFEQVHVGQGIF	243915	75826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_75891_99634_99776_101237_101329_111958_112036_113688_113790_120326_120510_122764_122862_124492_124622_127061_127167_129440_129535_131612_131729_134142_134264_135019_135145_142144_142311_143074_143224_146692_146848_147895_148054_148956_149049_152589_152667_157182_157293_160869_160991_167134_167336_169239_169329_184037_184183_185347_185435_187180_187314_231224_231299_231771_231864_238091_238336_240227_240375_241201_242273_242325
882925	contig_10323_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_123586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	2	9	613	621	459358	459350	NA	25	TAAGAGCCTGTGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	459970	458017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_458000_460000
882926	contig_9727_pilon	-	4001	5	Intergenic	novelGene_86350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGTGCAGTTTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609210	461830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_462240_482305_483623_493168_493336_505052_505277_607326
882928	contig_4232_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_63332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATCTGCGAGTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466956	468068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
882929	contig_8623_pilon	-	3155	3	Intergenic	novelGene_178322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	76	672	76445	75849	TRUE	50	GAATTAACAGGATACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKIT	76520	35969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8623_pilon_-_37219_41650_42435_75398
882930	contig_11512_pilon	-	2067	4	Intergenic	novelGene_43358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	899.443161072449	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576924	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556839_571049_571107_573287_573392_576895
882931	contig_9406_pilon	-	2010	7	Intergenic	novelGene_136149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	557.179205163533	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	49	510	61918	37742	TRUE	30	AAATCTAGCACGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAARPPCPPEPRRRPRPRWRASSIGSTNGRLTTRKPPAGHGTTFTVS	61966	33690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39031_58582_58732_60400_60532_61873
882932	contig_11422_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_99026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTTCAACCTATAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125	687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_100_700
882933	contig_2036_pilon	-	8502	7	Intergenic	novelGene_131806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	774	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	7479	8066	422313	421089	FALSE	10	GTGTTTCTGCCTAGAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRISESGSRAKGGRRQRVASENPKEAEKEKSNTCSPQTAPKEPPAPARGFQAAGSPGPRSRGPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNVVPQPRRKGQRRRSEPRTRAKGGGGSERQARNQKKQKKQH	569216	420652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_421393_422029_423467_423691_424793_425345_428054_481185_482726_531812_532751_569178
882934	contig_19816_pilon	-	1164	7	Intergenic	novelGene_156480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	289.11743096688	14961	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	11	694	126795	124090	TRUE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEGSRISCLF	126805	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124117_124887_124935_125577_125854_126164_126435_126731
882935	contig_17753_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_105109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTCCATAATCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146136	144924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_144900_146100
882936	contig_4732_pilon	+	1933	5	Intergenic	novelGene_75453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	540.551743591675	32	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	174	716	672691	675284	FALSE	30	GAGCATCTACGTACCCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	670260	676501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_670316_672214_672328_672685_673018_673616_673669_675120
882937	contig_9177_pilon	-	9774	50	Intergenic	novelGene_32620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1674.76235590944	15	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	1850	4216	44235	37263	TRUE	35	TGTGTGGACAGAGCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNSVPLRQIYGCPLGGIGGGTITRGWRGQFCRWQLNPGMYQHQTVIADQFTVCLRREGQTVYQQVLSLERPSVLHSWNWGLCGFFAFYHALYPRAWTVYKLPGQNVTLTCRQITPILPHDYRDSSLPVGVFVWDVENEGDEALDVSIMFSMRNGLGGRDDAPGGLWNEPFCLERDGETVQGLLLHHPTLPNPYTMAVAARLTADTTVTHITAFDPDSTGQQVWQDLLQDGQLDSPAGRSAPSQKGVGIAGAVCVAAKLPPRGRCCLEFSLAWDMPRIVFGAKGQVHYRRYTRFFGKDGEAAPALSHYALCRYADWEEKISAWQSPILEDRSLPAWYKSALFNELYFLADGGTVWLEVPEDSLMEELEEGMRQLRPVLREYGRFGYLEGQEYRMYNTYDVHFYASFALVMLWPKLELSLQYDMALATLREDLTRRRYLMSGLIAPVKRRNVIPHDIGDPDDEPWLRVNAYVIHDTADWKDLNLKFVLQVYRDYCLTGDQGFLRDMWPVCLAVMESEMKFDKDNDGLIENGGYADQTYDGWVATGPSAYCGGLWLAAVAVMVQMATLCEAQDIQEKFSSILSRGKEAYERLLWNGRYYNYDSSSQPQSRSIMSDQCAGQWFLRACGLGEGDTEVFPTPHVVRALQTIFEFNVQAFAGGAMGAVNGMQPHGVPDTSSVQSDEVWVGVVYGLAATMIQEGLTSEGFRTAEGCYRTVWERLGLAFQTPEAYCQQQVFRSLAYMRPLSIWAMQLALQQQQCKKASRPVVEQNTGLNTGPKSGPKEAMANLSPE	46084	15162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21057_21127_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759_33247_33457_33596_33696_33845_33920_33989_34096_34193_35241_35348_35448_35521_36142_36225_36322_36409_36491_37542_37808_38001_38095_38212_38304_38448_38596_38704_38823_38976_39077_39186_39396_39502_39729_39903_40109_40236_40323_40478_40637_40741_40988_41229_41533_41753_43877_43994_44201
882938	contig_3747_pilon	+	2436	6	Intergenic	novelGene_24859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4134.29420336773	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	318	1034	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200995	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_203078_203128_203228_203386_203498_203651_203768
882939	contig_12951_pilon	+	5349	3	Intergenic	novelGene_68187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1683	2015	663783	664115	TRUE	40	CAAGATGGGTGATATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPIGVQNKTPDDFPVDEKSLELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKIGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQQDFRNGRCHRRAEGQI	662100	799841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_664479_665060_665153_796962
882940	contig_546_pilon	+	2802	1	Intergenic	novelGene_117190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTCCAGCTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64242	67044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_64200_67000
882941	contig_19402_pilon	+	5312	13	Intergenic	novelGene_80797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_12	1225.39612642878	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	409	1527	57720	143862	FALSE	20	CTCCTCCCAGCTTGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQELYYPQLPALLPPKRKPAK	36983	147647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_143802
882942	scaffold_12510_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_151421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1225	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGGTCTTGTGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652543	651963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_652000_652500
882943	contig_4093_pilon	-	2932	7	Intergenic	novelGene_27613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2217.29184792821	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	257	994	69245	41737	TRUE	15	CTTCTGAATACTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72204	39741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_40482_40538_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_71959
882944	contig_16594_pilon	-	5703	12	Intergenic	novelGene_53797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2939.24478409445	3715	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1358	2398	272836	121101	TRUE	20	TATTCGTGTATCTGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306336	115119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115467_115610_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133047_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273561_289518_289526_305710
882945	contig_8744_pilon	+	3745	2	Intergenic	novelGene_173640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGACTCAATGCACCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54349	114362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_+_56156_112423
882946	contig_16625_pilon	+	4557	4	Intergenic	novelGene_171118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	697	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAACTAAATGCTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72006	81482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_73106_77457_79496_79623_80975_81413
882947	contig_12677_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_110746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	11	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
882948	contig_11677_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_85912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAGGAGGAAAAAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547499	546117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_546100_547500
882949	contig_6048_pilon	+	3190	1	Intergenic	novelGene_73168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1239	1685	1196591	1197037	NA	50	AACCACAGCAGAAACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEATLKLALEHRVAKANGTNDEVKELKGRFQRVALEDKVKYYNEKCTDLELENQKRRTCSAFPKLKELKKKFKPQVAIFKDKMLNDTRSIKRRWKEYTESLYQKELVNIQPFQEVTYDQEVEVEVQAALKALAKNKAPGIDGRRIEM	1195352	1198542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1195400_1198500
882950	contig_12019_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_87665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	5084	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	10	CATCTCTTTCCTGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
882951	contig_11720_pilon	+	1266	8	Intergenic	novelGene_43806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_3	2729.73587718366	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	464	982	87158	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67856	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78468_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
882952	contig_11548_pilon	-	3795	3	Intergenic	novelGene_66808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	514	849	286935	286600	TRUE	40	TAATGGACCACAGCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQPRVVSEVKVRALIGKKQDPETWDWNMWADNQEAGDTEPLNSVESLLPTEPAVSLPSEEIAPALSSKLSSPVKPLAPPPSSDEINSVVSEESLSHRLGRHLSHCLGHH	290648	248541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_248588_283699_287238_290437
882953	contig_10235_pilon	+	2053	6	Intergenic	novelGene_46374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	147.108939225324	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	662	1225	156557	158044	FALSE	25	TCTCTCCTGCCAAGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVCSLPSGGKEAVQSEDLSGPEKGPLDRGRGLGDTMIWVGLRSESALGGLHHLFRSIYQSPPFYSPQLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153820	158872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_154761_154845_155532_155636_156206_156840_156980_157171_157953
882954	SIRV6	+	996	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	367	337	127	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	55	GAAAAACATGAACTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
882955	contig_5485_pilon	-	973	8	Intergenic	novelGene_37772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	143.661023927572	618	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	216	776	653227	638722	FALSE	15	TTTTATCAGCTTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRMLSLRDQRLKEKDRLKPKKKEKKDPSALKEREVPQHPSCLFFQYNTQLGPPYHILVDTNFINFSIKAKLDLVQSMMDCLYAKCIPCITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVTQHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF	653577	638524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870_645944_650867_651017_651981_652054_653192_653300_653434
882956	contig_5023_pilon	+	4446	18	Intergenic	novelGene_7250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	2198.78645988958	52	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	211	2094	607279	646990	TRUE	5	CCGTCCTGCGCCATCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580846	649499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_606296_606425_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647620_647776
882957	contig_18162_pilon	-	3691	3	Intergenic	novelGene_122277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4531	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9148_9271_10809_16363
882958	contig_4180_pilon	+	3416	6	Intergenic	novelGene_8338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1177.34436763421	1605	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	72	728	865772	888134	FALSE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865700	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
882959	contig_12019_pilon	-	994	4	Intergenic	novelGene_87642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1401	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCATACTTACCCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8659	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_2298_5116_5401_6114_6226_8298
882960	contig_10855_pilon	+	1557	7	Intergenic	novelGene_124360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_6	649.589293323097	1663	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	34	627	687920	697371	FALSE	0	TTGGTCCTGTGTCCCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQPAPPAATDMMFPQSRHSGSSHLPQQLKFTTSDSCDRIKDEFQLLQAQYHSLKLECDKLASEKSEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNGICAQVLPYLSQEHQQQVLGAIERAKQVTAPELNSIIRQQLQAHQLSQLQALALPLTPLPVGLQPPSLPAVSAGTGLLSLSALGSQAHLSKEDKNGHDGDTHQEDDGEKSD	687886	698301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_687947_689066_689165_691827_691892_693198_693244_693842_693906_696987_697063_697149
882961	contig_7056_pilon	+	5316	8	Intergenic	novelGene_43713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	174.28278686066	8	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1431	1778	935853	937151	TRUE	5	GCGGCGCCATCGCGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	934073	960580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_935498_935846_936043_936993_940252_940915_941078_944197_944266_946462_946554_952293_952352_960521
882962	contig_7009_pilon	+	5445	7	Intergenic	novelGene_23617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_1	494.415030336075	4919	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	182	1480	444955	537035	FALSE	0	CTCTGCCTGCCCTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGEKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	431111	541000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991_518118_522866_523002_536325
882963	contig_15410_pilon	+	1763	5	Intergenic	novelGene_130603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	832.08694707945	4314	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	960	1313	146836	148093	FALSE	35	GATCAATGTGGATAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	144887	148543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145750_146738_146980_147081_147178_147750_147842_148070
882964	contig_10766_pilon	+	2287	2	Intergenic	novelGene_151233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATAATTTCATCTGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214392	217038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_214500_214858
882965	contig_5023_pilon	+	2808	13	Intergenic	novelGene_7259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1888.06448512756	73	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	80	1492	607279	646990	FALSE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580849	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_616541_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
882966	contig_10930_pilon	-	3906	6	Intergenic	novelGene_36966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1357	junction_5	1024.14596615912	26	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	180	1415	279066	268388	FALSE	50	AGTGAACTGAAAAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSQERFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279245	265896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279049
882967	contig_7527_pilon	-	3990	2	Intergenic	novelGene_139578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	337	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2254	2598	117121	116777	TRUE	25	AGAGAAGCCGGTTGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHVSPLVFIFYSFAYKSKPYTEVTALRTCASMPACAHLTRCHCVLFVFIYRVFVLLSALRPQWYSRKIPDPANSTWAKKYPTMEVMYKTLVASQWSTGGHPKLALVVRRKPGP	119374	113118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_114351_116616
882968	contig_14333_pilon	+	3305	13	Intergenic	novelGene_49105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	258.718677653289	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	98	1375	367143	422143	TRUE	0	TGCGGTTGTTGTGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYVDRQNRICGFLDIEENENSGKFLRRYFILDTQANCLLWYMDNPQNLAVGAGAVGSLQLTYISKVSVATPKQKPKTPFCFVINALSQRYFLQANDQKDLKDWVEALNQASKITVPKGGSLPLATEVIKSPAVPPALEKKTQVAYKTEIIGGVVVHTPINQNGGDGQEGNEPGSHAILRRSQSYIPTSGCRVPTGPPLIKSGYCVKQGNVRKSWKRRFFALDDFTLCYFKCEQDREPLRTIFLKDVLKTHECLVKSGDLLMRDNLFEIVTSSRTFYIQADSPEDMHSWIKEIGAAVQALKCHPREMSFSRSISLTRPGSSSLSGVPNSILYRGRPPAEEKKTLCKAPSAASSWQPWTPVPQAREKMLPAEETPEDSLIMPRLGESKTAGVLPSSRIRHRSEPQHPKEKPFMFNLDDENIRTSDV	340698	425697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_340773_367119_367284_387315_387373_397050_397100_398576_398675_404560_404702_405250_405398_405722_405792_406191_406263_409108_409173_421243_421322_421780_423075_424698
882969	contig_10867_pilon	+	4005	3	Intergenic	novelGene_159449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	776	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	308	394	87759	87845	FALSE	20	GAAGGAGGCGGAGCCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYTADVFILHLLCHELIGNRFQQLRLLSIGSHKVCFSGWSRLALQLNPGTFLFGFLLFLIIFLHTFQEAISALRVLNVLDTHINSLGKNLALNLFVHNNANSMLGNIVDSSSFAMVTLVGHSFLNSACSL	86776	91456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_86901_87085_87236_87725
882970	contig_10345_pilon	+	975	10	Intergenic	novelGene_158385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1248.94119107564	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	68	730	14227	24141	FALSE	35	ACACTACCCGAGAATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYLALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	13227	24386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_13237_14168_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
882971	contig_14142_pilon	-	4095	15	Intergenic	novelGene_120515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	461	junction_1	235.339398854211	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	12	1232	355495	349539	TRUE	25	CTCTTCCTGAAACTACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355506	346160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_346277_346387_346461_346602_346723_346896_347337_347424_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
882972	contig_10500_pilon	-	2299	8	Intergenic	novelGene_41225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	955.242783542594	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	182	868	1640040	1627737	FALSE	45	GCGAGAAAATATATCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAASGVSKGGVVTPMD	1640221	1626305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627783_1629535_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637043_1640039
882973	contig_15518_pilon	-	7292	4	Intergenic	novelGene_127579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3963	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	4422	4748	38282	15122	TRUE	20	CGTTCATTTCCTTATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILICLGNLTFSHTLGKWSESVLKSSDGDFALEALSTVRRNSRRVCTGRFPEQGGTWSRVCGSCHQTSSLRLGHQRRKEGARMISDNLAVPRREPCKVLWATSQMT	42703	10507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_12061_13445_14201_14885_15200_38033
882974	contig_2940_pilon	+	3535	2	Intergenic	novelGene_81985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1414	1818	1122358	1122762	TRUE	70	GAATAAATAAATAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLQNIFKKKTLTALKREIDSFTITVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNSTTGQLDLTNIYRTLHPTAAKYTFFSSAHGMFSREDPILGHRATHNKIQNAEVIQTFFSDHDAIKVEINRKIKEKNQFHGN	1120944	1126734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1122995_1125249
882975	contig_14441_pilon	+	1271	5	Intergenic	novelGene_100733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	431	1231	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120577	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120642_120769_121239_125517_125902_126159_126283_126514
882976	contig_177_pilon	+	3055	1	Intergenic	novelGene_41843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	459	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	407	1224	379	1602	417525	418748	NA	15	CCACTTTTAGTTGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEVKVTSMQANANSPRFLGRGRARNRRGLYCVVTFISLLQARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	417146	420201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_417100_420200
882977	contig_15327_pilon	-	2199	4	Intergenic	novelGene_70618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2915.88709581759	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	9	419	901528	900904	TRUE	25	AGACTCTTGATCTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901536	898557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899439_900004_901033_901126_901281_901400
882978	contig_15327_pilon	-	2930	3	Intergenic	novelGene_70626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3137.5	7	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAGACTCTTGATCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902147	898560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901281_901400_901504_902040
882979	contig_3155_pilon	+	1332	2	Intergenic	novelGene_26366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACTCCAAGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258078	262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258197_261337
882980	contig_3956_pilon	+	2584	12	Intergenic	novelGene_15228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_5	830.123041761166	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	85	2064	1284252	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284167	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
882981	contig_10890_pilon	-	2708	7	Intergenic	novelGene_166778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	645	junction_1	225.635706886615	2361	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	166	951	161049	126635	FALSE	20	CTCTTGGGTAAGAACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVNGKVALVTGAAQGIGRAFAEALLHKGAKVALVDWNLEAGVKCKAALEELFEPQKTLFIQCDVADQKQLRDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNWEKTLQINLVSVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSIAGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	161214	124877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_149081_149179_156819_156927_160559_160684_160956
882982	contig_4125_pilon	-	2975	4	Intergenic	novelGene_25079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	84.5156132846996	526	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2312	2911	527566	526557	FALSE	5	CCTGTCCCCAGGCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVRLTSQLVRAASRAGRSLPWPVSGVPGAHAWKPCYSTQPVGPSKAASLPGREAQLELEEMLVPRKMSISPLESWLTARCLLPSLGAGIPGTVTPSQLYECPPSHVGEGAEQGDEGVLDVPQVQCKNVLKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLKRKQMKFERDLRRIWLRAGLKEAPEGWQTPKIYLKGK	530564	526492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_526659_526769_527216_527514_527676_528362
882983	contig_17427_pilon	-	2010	10	Intergenic	novelGene_30315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1030.83793076612	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	28	474	188801	179662	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDV	188828	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179664_184279_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
882984	contig_14666_pilon	+	3081	6	Intergenic	novelGene_39599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1732.84568268499	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	558	1217	484281	484940	TRUE	45	CAATTTCAAATAGCTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	486856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483942_484165_485461_485512
882986	contig_4857_pilon	+	4736	1	Intergenic	novelGene_48805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTAAAAAGATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244695	1249431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1244700_1249400
882987	contig_11512_pilon	-	2982	16	Intergenic	novelGene_43353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	1073.06100893141	3781	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	133	1287	609650	556654	FALSE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622333	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
882988	contig_11422_pilon	-	1703	2	Intergenic	novelGene_99000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2208	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_468_972
882989	contig_5217_pilon	-	787	5	Intergenic	novelGene_135769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3221.55004423337	36190	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATCTTGTGTTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559966	557641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559157_559374_559858
882990	contig_5419_pilon	+	4251	10	Intergenic	novelGene_15486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	558	junction_1	555.771335872747	171	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	298	1785	238919	249830	FALSE	30	AATAAATTGCTTTGCCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREKVTASLVFAISIATIGSFQFGYNTGVINAPELIIRDFLNYTLDMRLDELPSAMLLTSLWSVSVAVFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238621	252296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240675_241836_241998_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
882991	contig_2703_pilon	+	4489	17	Intergenic	novelGene_101731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1039.64059106681	1304	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	262	1650	559489	610870	FALSE	10	CCTCTCTGTGATGTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526205	613709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526408_559429_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
882992	contig_7728_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_64725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAAAAAATTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752330	754670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752300_754700
882994	contig_18108_pilon	+	3680	2	Intergenic	novelGene_33490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	651	junction_1	0	15	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	74	310	252287	260192	FALSE	35	GTAGCATGACCTTAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	252213	263562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_252329_259997
882995	contig_6691_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_60172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATGTATATTTCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419380	416713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_416700_419400
882996	contig_7963_pilon	+	1491	4	Intergenic	novelGene_58380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_3	966.213571973954	19	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	613	1158	57173	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLALNQDPELDDTPKVEPLYLSQNRGLTRSYLPSEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51374	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_57564_57782_57934_63003
882997	contig_11720_pilon	+	2338	15	Intergenic	novelGene_43920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_11	295.188767000483	92	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	61	1788	262271	272210	FALSE	10	GTCCGTGCCTCTGAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262210	272760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
882998	contig_4088_pilon	+	9993	9	Intergenic	novelGene_178054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7463	174	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	6679	7230	92284	92835	FALSE	55	GAAAAACTCTCAATCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQKISKHLQKLDRMVPVGTQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILGILQQLRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMVQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKISNKISEMDDVTEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKTNEETLRVTWDTIKSKNLQVIGIPEQG	26664	95598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_27892_32326_33152_36713_37009_37772_38198_40418_40694_41618_41762_65676_67276_72877_73999_91515
882999	contig_6533_pilon	+	2108	3	Intergenic	novelGene_114619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_1	753.5	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	9	347	10493	25345	FALSE	75	TGAAAAAGAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMRSSQTHRSFPEDRESDGFLRCLSLNSGWILTTTLVLSVMVLLWICCATVATAVEQYVPSEKLSIYGDLEFMNERKLNRYPASSFVIVKSKTEDHEEAGPLPTKVHLAHSEI	10484	27106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25189
883000	contig_12938_pilon	+	1104	4	Intergenic	novelGene_99720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	1016.03685409974	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51953	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_83391_83470_84550_84635_85468
883001	contig_12312_pilon	-	9168	30	Intergenic	novelGene_63928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	951.502345470775	3514	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1095	3288	148	3435	278150	214909	TRUE	15	CTTTCCGGACCGAGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVHFLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	324167	190654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_190691_199978_200255_201333_201506_205090_205227_206259_206349_207041_207177_208046_208259_209751_209891_210370_215242_215864_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_324071
883002	contig_4891_pilon	-	1482	6	Intergenic	novelGene_124592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.76411595413	992	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	30	356	964296	940000	TRUE	10	GCTCTGTGTGATGGCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPASVAAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964325	937403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_938390_938431_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
883004	contig_14450_pilon	+	6272	2	Intergenic	novelGene_49036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	4685	5098	1306950	1307363	FALSE	55	AAAAAAGTTCTGAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCQSTDEWINKLWYIHTMEFYAMRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1288199	1308537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1292591_1306656
883005	contig_18843_pilon	+	3125	11	Intergenic	novelGene_165602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	58	junction_9	617.672599359887	4055	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	290	1252	28527	45456	TRUE	20	GCATCAAGTGGTGTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPESQVIGENTKQP	28237	47860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44351_45422_45498_46028
883006	contig_9653_pilon	+	4116	14	Intergenic	novelGene_48276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4108	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCACACCTTGGCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005010	1039989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1007277_1007759_1007912_1009487_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016035_1016594_1016781_1017927_1018026_1018138_1018278_1018769_1018921_1019947_1020029_1021004_1021157_1025284_1025425_1039824
883007	contig_15172_pilon	+	1927	7	Intergenic	novelGene_158738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.042652842555	25	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	105	581	224971	237132	FALSE	30	CAACTTGTGTCAATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	215502	238478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215603_224966_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
883008	contig_2450_pilon	+	6724	8	Intergenic	novelGene_160295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	443	1516	31329	97512	TRUE	55	AGAAAAGGTTTAAACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIVNIYSPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPVSVKDRTTKKKLSKNTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFCRIDHILGHRAILNKIQNVELIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIQKFLESNENENTTYQNLWDTAKAVLKGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREEQKKSTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFDRINQIDKPLSRLTKEKQERTQIMQNEGISRQTEVLRICKNQTKITRNTKGSSMVRKSVTSDNNPTLEHRTEQPDINPDRKVTKGNQS	30886	293359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_32206_97315_98853_123792_124838_250144_250181_285947_286931_291326_291464_291636_291761_291816
883009	contig_1263_pilon	-	5456	7	Intergenic	novelGene_170383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1154	junction_4	481.142275100504	5902	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	317	1633	65303	55502	FALSE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76860	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
883010	contig_13093_pilon	-	6370	1	Intergenic	novelGene_105213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTAGCAATCTACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52987	46617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_46600_53000
883011	contig_5023_pilon	+	3172	16	Intergenic	novelGene_7248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2013.47929272248	3109	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	83	1861	607279	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQVLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580846	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614489_616524_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
883012	contig_6795_pilon	-	1620	2	Intergenic	novelGene_27677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTCTTACTGTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66633	64909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_66087_66190
883013	contig_11160_pilon	+	2346	4	Intergenic	novelGene_168832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	717.006276123159	347	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	274	570	318478	320239	TRUE	25	GTACTGTAAATGTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHSDPQLRRGGRRLLSQPAATARPGDPLAAPGAA	318204	322386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319179_320136_321713_322083
883014	contig_13021_pilon	+	2427	13	Intergenic	novelGene_8158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	2493.0695312205	3643	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	169	1527	174676	180019	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLAHTFLGIQLSNFLFLVWLLWCAKLCTLLFCHTATPYRCGRCEICHQL	174507	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179876_180211_180440
883015	contig_4180_pilon	+	2287	5	Intergenic	novelGene_8346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	1663.72133709344	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	186	533	882886	888134	FALSE	40	ATTTCTATATTAATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865711	889888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
883016	contig_10345_pilon	+	1143	12	Intergenic	novelGene_158363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	670.2931269475	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	67	1125	11670	23244	FALSE	40	TTCATATGTAAAATTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILVCCDFHNATPTSDSSFCDFFKEKS	4372	23262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046
883017	contig_6434_pilon	-	5059	4	Intergenic	novelGene_61898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	164	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4112	4510	911122	910724	FALSE	35	ACAACTAACAGATGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIEGSLIFNLRYADDTTLLAESEEGLKHLLMKIKDYSLHHGLYLNIKKTKILTTRSISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINAHGSSSQVIRQHTAVGKSAVKDLFKVLKSKDVTLKTKMHVTQAMMFSITS	966664	910174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_912449_923382_923978_957405_957841_964909
883018	contig_5023_pilon	+	2646	12	Intergenic	novelGene_7219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2179.88063969241	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	88	1335	607279	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPRNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611765_625742_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
883019	contig_9609_pilon	-	4614	24	Intergenic	novelGene_22992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAAATGGCGCCGCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333331	309959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310538_311498_311590_313098_313264_314272_314431_317882_317951_318438_318513_320953_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330305_331386_331487_331563
883020	contig_10930_pilon	-	4025	7	Intergenic	novelGene_36967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	131	1534	280211	268388	FALSE	50	AGTGAACTGAAAAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280341	265896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
883021	contig_7593_pilon	-	3524	11	Intergenic	novelGene_127263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1363.14815409038	4672	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	99	1283	43266	4357	TRUE	25	AAATTTGAATTTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR	43364	1877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_2985_3068_3822_3975_4528_8407_8541_12823_12970_15244_15395_17527_17665_25124_25198_27978_28195_33772_33884_43218
883022	contig_7894_pilon	-	3964	1	Intergenic	novelGene_170791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	447	929	232033	231551	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLNIVNTSILPKGTYRYNAILIQIPPAFFNEMEKQITNFLWKGKRPRISKALLNKKNKVGGLTLSDFSTYYTTTVVKTAWYWYNNRYTDQWNRIENPDINSSTYEQLKFYKGPKSVNWTKDSLFNKWCWQNWLSICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKT	232479	228515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_228500_232500
883023	contig_4232_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_63346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5012	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGCAAGAAGGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
883024	contig_610_pilon	+	4028	5	Intergenic	novelGene_76698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7920	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197521	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_197639_211059_214263_220517_220785_234998_235302_252475
883025	contig_5765_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_141377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1023	1433	547023	547433	NA	50	GAATTCACAACAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGMIHREDITIINIYASNDRAPKYMKQTLTALKRETDSSTMIVGDFNTPLSVRDKTSRKKLNKDTEDLKATVSQLEPIDIYRTLHPTDAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGHKKPSTKTKTLRQYKIPSLITRPSK	546000	548374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_546000_548400
883026	contig_6898_pilon	+	3063	7	Intergenic	novelGene_35754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2445.41541574342	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	175	1056	119670	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119495	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126110_126157
883027	contig_6434_pilon	+	5425	25	Intergenic	novelGene_61848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	1000.88727217266	4746	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1153	3462	587	4048	875528	932457	FALSE	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYLNIKEDCNAMAFCAKMRSSKKTEVNLEVPEPGVEVIFYLPDREPLRLDSGEYTAEDLCIKAAQECCISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNHTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKVPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQDGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRINNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLLISSENEMNRFHSNDSGNILCYEVMVTGNLGIQWRQKPNVLPVEKEKNKLKWKKLENKHKKDEEKNRIREEWNNFSYFPEITHIVIKESAVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDFDNILMTVTCFEKSQVLGGQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	789170	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_789681_875451_875534_878052_878252_882312_882437_887886_888041_892417_892582_894298_894642_896139_896326_900033_900192_902412_902537_904708_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
883028	contig_854_pilon	+	1734	1	Intergenic	novelGene_36345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1506	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974684	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
883029	contig_8820_pilon	-	2747	10	Intergenic	novelGene_79293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1151.45358483297	5	124	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	447	2099	170373	166441	FALSE	50	AAATTACAAAGAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIKDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	171330	165792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166542_167090_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170763_171273
883030	contig_14559_pilon	-	1025	5	Intergenic	novelGene_83722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	73.8291947673818	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	256	822	286587	253785	TRUE	75	GAAAAAGAAGAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQKKEKQLSNFKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDISSQCLPQKDLYATEEEADTLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKNPGEQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEPKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKKSGADSAARTKSRKARSRNII	354685	251468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_251496_253608_253804_277453_277975_286560_286617_354459
883031	contig_20199_pilon	-	725	3	Intergenic	novelGene_82552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.5	1868	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	182	418	43987	40954	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRCRP	44168	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_41934_42078_43906
883032	contig_10557_pilon	-	4456	5	Intergenic	novelGene_171927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	3946	4419	297942	297469	FALSE	35	CAATGCAGAAAAGGCGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLEMHYLPTLTQTEVEQLNKPITKGEIEKVIKKTPNKKKHWPGWLHWRILPNFQRRINTTTFKGISEHRNDGILPDLFYQTSIILIPKLGKDTTKKENDRPISLMYIDSKILTKILVNRIQQHIKKQFTMIKWDLYQVCRDGSALENQSMLPIT	475913	297431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_298434_307723_308242_426797_427370_431852_432158_473854
883033	contig_10958_pilon	+	2025	4	Intergenic	novelGene_5406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	14	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATATCTAAAACTAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888219	901699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889001_895279_895855_900457
883034	contig_8258_pilon	-	9089	5	Intergenic	novelGene_130441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1767	7322	9088	12769	11003	FALSE	50	ACAGGATACAAACCATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGVPKLQQSDAENLNGPITRGEIEKVIKKTPNQKSPGPEGFTGEFYKTFTEELVPVLLKIFQSIKEEATPPNSFYKASITLIPKPGKDVTKKQNYRLTSHMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHNQVGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFPIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLETGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEELKLSLSADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTILFSTAPKKKKYYLGINLTRNVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKSIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYKFVFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQGNRIENPDVNPSTYSRLIFDKVPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKSTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKILPTLQALIHGI	72151	11001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_-_16405_17021_17324_43260_44648_68217_69397_71333
883035	contig_3747_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_24962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203907	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203900_205200
883036	contig_500_pilon	-	5864	7	Intergenic	novelGene_30910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	137	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTAGTTTTTCTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736344	469768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_472096_473047_473883_474011_474560_475516_476310_485358_485703_647610_647746_735462
883037	contig_11422_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_99096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAGAAGAAGAAGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1800
883038	contig_4151_pilon	+	1952	3	Intergenic	novelGene_65265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	432	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	263	862	637928	663644	FALSE	15	AAGCAGTTTGTGTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTVWTLKVAVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	620258	664734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_637920_637962_663078
883039	contig_9177_pilon	-	7789	54	Intergenic	novelGene_32560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1372.38439295859	9783	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	265	2916	26442	16653	TRUE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	32990	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6769_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
883040	contig_9633_pilon	-	3996	7	Intergenic	novelGene_139637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	740	junction_6	767.087275926859	3239	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	203	934	1167518	1138462	FALSE	30	TAAATGCCCCAGGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPVRNRKVVDYSQFQESDDADEDYGRDSGPPAKKIRSSPREAKNKRRSGKNSQEDSEDSEEKDVKTKKDDSHSAEDSEDEKEDHKNVRQQRQAASKAASKQREMLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1167720	1135399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737_1147844_1150154_1150205_1167501
883041	contig_3472_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_166933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4042	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGACTATATCAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264968	262644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_262600_265000
883042	contig_10793_pilon	-	1217	13	Intergenic	novelGene_83379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCCGAGAGCCCGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167270	130870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_130981_146953_146992_151413_151496_152862_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161472_162548_162689_163140_163203_165321_165375_166399_166473_167141
883043	contig_6999_pilon	+	5425	5	Intergenic	novelGene_176122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	989	1870	96954	97835	TRUE	55	TGAAATGGAACACATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILTIDAEKAFDKVQHPFMTKILNKIGIQGKFLIIIKSIYTKPKANIILNGEILKAFPLRTGTRQGCRLSPLLFNIVLEVLAREIRLEKEIKGNQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKEYTRKLLELIDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNEDNLEEEITKSIPFTIAPRKIKYLGLNLTRDIKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIMKMSVVPKVIYRYNAILIQIPPAFFNEIEKQITNFIWKGKRPQISKPLLKKKNKMGGLTLPEFRTYYTATVVKTAW	95965	267269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6999_pilon_+_97973_207824_208313_209064_209766_209896_210161_265304
883045	contig_15172_pilon	+	2225	9	Intergenic	novelGene_158732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	432.397603485496	2592	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	25	879	210646	237132	FALSE	30	CAACTTGTGTCAATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPHSPTAAMEAIKKKMQMLKLDKENAIDRAEQAEADKKAAEDKCKQVEEELMHLQKKLKGTEDELDKYSENLKDAQEKLDLTEKKASDAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNNLKSLEAASEKYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEAETRAEFAERTVAKLEKTIDDLEEKLAQAKEENVGLHQTLDQTLNELNCI	210621	238478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_210760_215068_215195_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227653_231618_231682_231767_231838_237049
883046	contig_7457_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_31512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGAGGCACTTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671993	670156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_670200_672000
883047	contig_12355_pilon	+	4459	4	Intergenic	novelGene_172100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2898	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAGAATAAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130704	255330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12355_pilon_+_130833_222453_222843_222937_225131_253581
883048	contig_12427_pilon	-	4710	2	Intergenic	novelGene_40407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAGTTTCCAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94918	38068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_41141_93280
883049	contig_6059_pilon	+	2519	17	Intergenic	novelGene_44826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2176	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTCCGGCGGGGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567791	584720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165_573437_575784_575882_576079_576218_576549_576645_578184_578326_580594_580709_580919_581116_584181_584356_584468_584603_584685
883050	contig_12677_pilon	-	683	2	Intergenic	novelGene_110777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2926	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2561_2642
883051	contig_6546_pilon	+	488	4	Intergenic	novelGene_140985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	106	450	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597597	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
883052	contig_7887_pilon	-	2505	3	Intergenic	novelGene_124912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	131.5	90	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1760	2080	541762	541442	FALSE	20	TATTTTCTCCATTTATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREYLAKTTGKVVGGGRQSPGLWPVVGLVVGNCREEKGVDTAVAPKECQNWKERLESGKIQERDGENNSTSHTILTALFTIQSALSLTKVHFKSRQDKGNDSMVM	545304	541016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_543052_544749_545015_545099
883053	contig_2703_pilon	+	340	1	Intergenic	novelGene_101635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAGACCGATAGTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_1700
883054	contig_12079_pilon	-	1863	5	Intergenic	novelGene_67435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1330.08221080503	44	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	134	427	638707	581160	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVTPSSPVRASWTTAMRRSGSPRPRRMSACSGSC	638840	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582015_601778_601879_609189_609274_638695
883055	contig_20614_pilon	+	3400	3	Intergenic	novelGene_107542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAATGCCCCCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144370	238820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_144380_234433_235112_236107
883056	contig_1719_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_87361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	434.664813390732	28	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	425	733	786528	754873	FALSE	30	GGTGAAGCCCAGAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803666	754568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788105_803435
883057	contig_16594_pilon	+	4638	11	Intergenic	novelGene_53831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	723	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3344	3697	149311	272805	TRUE	20	GCATTGTGGGAGTCATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWWLSLVQLKTLAQAVMGHRASWHWLAAFAGPTWPCSSAESSYCAHLFPIVFLSVGVDEDICSSPWSNDLSMNQSRRLRVHFQLGSFSMDVQIYIPCLAVSKSPFGTLYILPVLAI	116040	306427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133149_134023_134081_135251_135507_149146_149351_165477_165648_272661_273672_306352
883058	contig_312_pilon	+	3192	8	Intergenic	novelGene_128313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.511886707148	22	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	50	820	428979	440781	FALSE	20	ATTTCTCCATTCCTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDDTFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHLEPEWAAAATEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLANRYGIRGFPTIKIFQKGEPPVDYDGGRTKSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIISEDIAKKTCEDHQLCVVAVLPHILDTGATGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	428929	443153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_429011_429396_429512_430056_430198_433659_433745_433872_433946_435041_435201_439433_439531_440712
883059	contig_11498_pilon	+	4874	12	Intergenic	novelGene_65529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1400	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2602	2967	284227	284592	TRUE	15	GCCCCGCTACATGGGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSASTDLPCCPVSNAKSFGPFRNALIVGQPSRRSTCCSERSEPSPKPGRVPVPSPSFTKPIIPANSEGELPKIPQILFLLLPQEKSLPASRSKQFLYQYVSFWHCSWVLILRNDLDTAFH	281625	312371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_285000_285655_285796_286839_287008_287602_287772_290290_290404_291017_291187_292007_292124_292992_293088_293971_294089_296917_297064_300506_300618_312215
883060	contig_6137_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_59241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCCAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318012	1315569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1315600_1318000
883061	contig_8697_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_83213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTTAAAAGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33244	30733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_30700_33200
883062	contig_5341_pilon	-	1912	3	Intergenic	novelGene_168006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	942.5	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	273	752	339444	338965	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIGKWNGFLGLLCLLPAISATQPGLPGKDLNEILLSLPLTLNISLVWAPCPQNRVLISQFTNYQTEAQKDELICPRSVCLVERLGLGLNPSLFFLQCPYCLQEWCPYDGI	340867	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_339511_339881_339917_340696
883063	contig_9345_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_24448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCATTAAACAATAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420604	423054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_420600_423100
883064	contig_5485_pilon	-	752	9	Intergenic	novelGene_37776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	159.174776189571	1180	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	322	669	650876	638722	FALSE	20	TTGAGTGTGGTTAAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNIIFRSYITISRGIPCITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVTQHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF	653603	638638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870_645944_647554_647591_650869_651017_651981_652054_653192_653261_653562
883065	contig_16883_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_161754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCTAACGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521284	519049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_519000_521300
883066	contig_1331_pilon	-	1508	7	Intergenic	novelGene_37832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	3505.16097664889	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193999	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_177728_177880_193604_193652_193763_193859_193957
883067	contig_14666_pilon	+	3303	4	Intergenic	novelGene_39567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1676.85108329737	342	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	245	1384	483256	484940	FALSE	35	TTTCAAATAGCTAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	486859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477363_479891_479944_483205_483317_483861
883068	contig_1452_pilon	+	4996	4	Intergenic	novelGene_115134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24610	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGACTTCCCCAGACCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697305	717601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_697698_697872_699952_700533_700690_715232
883069	contig_9706_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_20884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	965	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3318	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3300_4000
883070	contig_8377_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_34968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	511	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68100	69351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
883071	contig_13740_pilon	-	1749	10	Intergenic	novelGene_34690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3515.54536450272	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	750	1235	160838	157474	TRUE	45	AAGGAAATTGTGTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	156806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919_161950_165270
883072	contig_13863_pilon	+	4164	13	Intergenic	novelGene_42061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	384.815206372559	4519	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	706	1773	478688	490279	TRUE	25	CAGCATTTATTTATCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455551	492975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_476611_476659_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006_491304_491608
883073	contig_7870_pilon	-	1411	10	Intergenic	novelGene_108883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	558.266762200454	33	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	176	1120	600052	143294	FALSE	40	ATCCAAAAGATCGCTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	848809	143002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821_497905_600045_600086_848667
883074	contig_6726_pilon	+	1486	13	Intergenic	novelGene_86229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	653	junction_9	553.202412975777	1965	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	13	1350	287836	333034	FALSE	25	TATTTTATCTTATTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYDLTTRIAHFLDRHLVFPLLEFLSVKEIYNEKELLQGKLDLLSDTNMVDFAMDVYKNLYSDDIPHALREKRTTVVAQLKQLQAETEPIVKMFEDPETTRQMQSTRDGRMLFDYLADKHGFRQEYLDTLYRYAKFQYECGNYSGAAEYLYFFRVLVPATDRNALSSLWGKLASEILMQNWDAAMEDLTRLKETIDNNSVSSPLQSLQQRTWLIHWSLFVFFNHPKGRDNIIDLFLYQPQYLNAIQTMCPHILRYLTTAVITNKDVRKRRQVLKDLVKVIQQESYTYKDPITEFVECLYVNFDFDGAQKKLRECESVLVNDFFLVACLEDFIENARLFIFETFCRIHQCISINMLADKLNMTPEEAERWIVNLIRNARLDAKIDSKLGHVVMGNNAVSPYQQVIEKTKSLSFRSQMLAMNIEKKLNQNSRSEAPNWATQDSGFY	287823	333170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_287926_295669_295785_297493_297612_300301_300345_301435_301541_308106_308233_309138_309264_321665_321793_322621_322724_324405_324516_331125_331229_331541_331677_332995
883075	contig_10093_pilon	-	2642	15	Intergenic	novelGene_147497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1153	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	477	2166	2642	101802	73056	FALSE	10	AGCGTTGTGGGGAGTGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSEGEFDVGILTTLEWTRFFVRRSWVKMNHYFGTFPNSSRLFFNEHNLRKRNGHAAFMVFLISPNQSVCTKKEGPSVKFHLLLTIVDAHPALLDHQGLVDLQEATGPQEPVHGRQEGSAARQCRRSQAASRPPGSLWRPLAAGGERRQEDGARSSLSR	128059	73055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_73288_90934_91006_93068_93138_101697_101813_102832_102922_103661_103750_108822_108856_108970_109049_109678_109808_118723_118798_122853_122916_123500_123590_124996_125073_125164_125446_126903
883076	contig_11766_pilon	-	4399	6	Intergenic	novelGene_178323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1112	2152	250401	136545	TRUE	30	CGAGGGGCCTCCAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKTPKLAFEHTAANATGRNDEVKELNRRFQRAAGENKVKYYNDMCKDLELENQKGRTHMAFLRLKELKKKIQAPSCNIEGFYGENIKRRRKHQKKVEGLHRVIVPKRTGRHSFQEVAYDQKPMVVKEEVQAALKAMVKNKSPAIDRIPTEMFQQKDAALEVLAHLCQEIWKTATWPIDWKRSVFVPIPKKGDPTECRNYQTISLVSHTSKILLKIIQKQLQQYVNRKLPEIQARFRSGRGARDIIADVRWILAEIREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVNHNKLWIMLQKTGIPEHLIVLMRNLYLDQEAVVLTEQGDTAWFKVRKGVHEGCILSPYLFNLYTEQII	298352	47807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11766_pilon_-_47877_48232_49586_69196_69638_136160_136803_249618_250972_297811
883077	contig_5033_pilon	-	2476	9	Intergenic	novelGene_28977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4267.63490560052	29	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1024	1770	536585	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	537608	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531441_531533_531648_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504
883078	contig_15327_pilon	-	2814	5	Intergenic	novelGene_70603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	123	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	TRUE	25	GATCTTGTTAATGATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899104_899185_901033_901126_901281_901400_901536_902035
883079	contig_8140_pilon	-	3390	3	Intergenic	novelGene_86447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1790	2149	770599	770240	TRUE	45	ATCTCAATTGACGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQNRMVPVDAQNKTPDDSPVEEKALELPDRELKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENSDKKLQEFRNIMQEQNAKINSQLEIKQRQELEIQKINNKISEMMVS	772459	768947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_769044_769094_771538_771608
883080	contig_8317_pilon	+	1078	3	Intergenic	novelGene_19302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	4	513	15820	16506	FALSE	20	ATTCAGTTTGTGTAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15816	17071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
883081	contig_14351_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_174692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGACATAAAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31323	29117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14351_pilon_-_29100_31300
883082	contig_854_pilon	+	3807	15	Intergenic	novelGene_36684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3717.60021892552	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	210	2384	1704560	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1702563	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1702695_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
883083	contig_13021_pilon	+	3632	12	Intergenic	novelGene_8174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2586.10424326337	8	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	169	1362	174676	178735	TRUE	30	AAGCTAAACTGACTTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQMLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174507	181235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176700_176846_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440
883084	contig_9389_pilon	+	422	1	Intergenic	novelGene_84135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	153	239	391	1673812	1673964	NA	75	GAAAACCAAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGHHPHDIIDNINSGAVECPAS	1673573	1673995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1673600_1674000
883085	contig_15327_pilon	-	919	3	Intergenic	novelGene_70655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	100	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	287	337	900954	900904	FALSE	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901454	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
883086	contig_11493_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_143732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1430	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCTACCAAATCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352064	354287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_352100_354300
883087	contig_10904_pilon	-	2900	1	Intergenic	novelGene_22770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGGCTACCCGGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709244	706344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_706300_709200
883088	contig_5286_pilon	+	2438	10	Intergenic	novelGene_157333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	109	459	489908	528047	TRUE	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRFSHRVLFSGEGSSFQRNSSHNHPLAFGCRNLCEQCLGHFSALHFLLNLIINGSINVHGIVLWFPISLSGYSSCFHLWRAAGRCAYQGGRTHSRGSIQTPFPFVLVNSVSFSFR	489799	567635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_489985_519309_519462_527925_528292_537002_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_567121
883089	contig_5062_pilon	+	7338	14	Intergenic	novelGene_157839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	251.092806812812	1834	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	366	1826	676221	744018	TRUE	30	CCACACAGTGCAAGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWIKRKFGERPQPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	622708	749903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_662401_662572_676054_676238_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702_744854_745226
883090	contig_10749_pilon	-	1015	5	Intergenic	novelGene_133476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	633.521655115277	53	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	108	413	168321	164528	FALSE	10	CTCTGTTCACCTGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169095	163925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167133_167273_167395_168302_168346_169012
883091	contig_16103_pilon	-	273	2	Intergenic	novelGene_118694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199065	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
883093	contig_13894_pilon	+	2484	8	Intergenic	novelGene_62128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2701.60825118246	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1720	2430	524838	528117	FALSE	15	GACACCTGCGTCTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	520907	528171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_523519_524820_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
883094	contig_12873_pilon	+	765	3	Intergenic	novelGene_27228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2918	junction_1	271	140	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTTGACTTTAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19153	20415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_19264_19611_19703_19851
883095	contig_13863_pilon	+	2545	11	Intergenic	novelGene_42068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	351.086086309327	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	123	1472	474588	490279	FALSE	15	ATTTACCTTGTTCTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSLSFAAVPVAREEVVVRGNTLVAIQLTKLERLTLCSKEMVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455698	491352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455797_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
883096	contig_5447_pilon	-	9370	10	Intergenic	novelGene_178327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2036	199	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	8644	8949	356698	356393	FALSE	0	CCCTGCCTCGCTTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMSCCTAIMRVYSVEMATHNSLQGERHSKSMDPICLCLGKRAVLTLGSRIWGAGSLFFPLFVDLFTLQGQENGPGPFPQPRGLSNCLSQSGTQCRAGSEE	449478	355971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5447_pilon_-_356770_375131_378734_391483_391586_394824_395307_395379_395880_444342_444643_444853_447313_447479_447731_447948_448434_449087
883097	contig_7119_pilon	+	6030	4	Intergenic	novelGene_40879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1284	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	250	1404	137033	139798	TRUE	20	GTCAACATCCGTTGCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127408	147831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_142349_145755
883098	contig_4674_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_174141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	39	120	204	323	252958	252839	NA	65	TACATATATATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLRCINWAQPPGLKENEEHQRHKESISPRDRKGHINQRLHQPETKRTRWCLATTNDCPDREHNRESWMEKEKGGIQNSNSSKKTRLNGLSETGGTPESMASGFSIS	253161	251282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_251300_253200
883099	contig_7963_pilon	+	982	5	Intergenic	novelGene_58370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	88	852	51450	63007	FALSE	15	TAAGTCCTGTCCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51362	63137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
883100	contig_16846_pilon	+	2735	2	Intergenic	novelGene_82890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTTTATATGATACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355397	431761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_355446_429074
883103	contig_20506_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_149729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	392	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	519	884	12476	12111	NA	25	TCTTCCTCTCAAAACCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAAASSEHFEKLHEIFRGLPEYLRGTPEWLLGTAGTEEKKLISDFDEKQQEANEMLAEMEEELRNAPLSFRNPMMSKLLTYRKDLAKLHREVRSTPLTATPGSRGERNTAHMLWGMNI	12994	10613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20506_pilon_-_10600_13000
883104	contig_7527_pilon	+	4372	1	Intergenic	novelGene_139579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	740	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTACAGCCTCTCCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115002	119374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_115000_119400
883105	contig_17769_pilon	-	1957	11	Intergenic	novelGene_124242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1383	1688	37896	32650	TRUE	10	CTTCCCCGTACCCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTAARNLCCTCWYSSLCSNIKEESPFFVSSSRIERPYLCSPRIARAPKYLFSSVSGFKCLCSTWSTCFLELRGGGPGRANPPLSSILSKMRSISSSPFS	44421	14189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_14220_30167_30333_31840_31913_32647_32771_33779_33853_37784_37996_38558_38659_39506_39600_40694_40970_42221_42372_43756
883106	contig_13863_pilon	+	2649	11	Intergenic	novelGene_42082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	348.26267385409	75	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	248	1597	474588	490279	FALSE	45	AGTAAAATCGACTAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455869	491331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
883107	contig_13123_pilon	+	3751	5	Intergenic	novelGene_136899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	1723	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	128	616	434529	444679	FALSE	65	TAAGAAAAAAAAATTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434401	447814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
883108	contig_5968_pilon	-	2367	10	Intergenic	novelGene_112173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	556.142889534917	15	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	15	1214	732362	567845	TRUE	25	CCTTGAAAAAGCCTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRKEGTGSVATSSSSTTGTAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGLVVLKIIKHYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDRLEITNCFPFPQHTEDDADFDEVQYQMEMMRSLRHVNIDHLHVGWYQSTYYGSFVTRALLDSQFSYQHAIEESVVLIYDPIKTAQGSLSLKAYRLTPKLMEVCKEKDFSPEALKKANITFEHMFEEVPIVIKNSHLINVLMWELEKKSAVADKHELLSLASSSHLGKNLQLLMDRVDEMSQDIIKYNTYMRNTSKQQQQKHQYQQRRQQENMQRQSRGEPPLPEEDLSKLFKPPQPPARMDSLLIAAGETEFQRVNSLGQDHAAKTFHKDLSVEDTSGNRFTKRNGNRDRNHNSKHSNYRIAEGTITTLYQCFSLSWLDSLVPGP	732376	421957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_422276_567009_568018_578718_578785_625775_625909_631643_631765_635195_635346_636586_636687_638184_638353_700585_700743_732230
883109	contig_4093_pilon	-	2682	7	Intergenic	novelGene_27626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2193.18548133886	3	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	88	660	69245	45507	TRUE	35	TAAATATTGATGATGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTPLLNLIH	72511	39792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_40939_40979_41797_45447_45531_45619_45751_46300_46425_68951_69257_72435
883110	contig_12469_pilon	-	4110	3	Intergenic	novelGene_178328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1182	2027	50964	30744	FALSE	20	TTCCTCCTCTATGTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSPL	52787	28660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12469_pilon_-_30771_50145_51685_52326
883111	contig_20951_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_43136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTACATTCAGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320219	318145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_318100_320200
883112	contig_14703_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_174673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCGATCCCGCGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80023	78142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14703_pilon_-_78100_80000
883113	contig_15449_pilon	+	1675	4	Intergenic	novelGene_33610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_3	180.85414626771	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	77	673	49356	54621	FALSE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	49279	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_49557_51106_51330_51809_51932_54570
883114	contig_11176_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_123451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTGTGGTTTTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137321	139606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_+_137300_139600
883115	contig_6397_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_146259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCTAAACCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466469	464283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_464300_466500
883116	contig_2703_pilon	+	2269	14	Intergenic	novelGene_101702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1098.12648951851	21	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	301	1395	559489	610870	FALSE	35	AAAAAAGTTTGGTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526166	611744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
883117	contig_2067_pilon	+	1569	4	Intergenic	novelGene_158923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	482	junction_1	154.670258578981	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	458	1567	604648	605757	FALSE	40	GGCAGCATCTAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQVTLPEMTQDWTKEHVKKWVTEDLKIDEKYGQILLREEVTGLVLQVLTEQDLRDMGLPQGPVLLIKRGYNKLNNSSPESHNQNSGQLDHTKTSKKEQRKKPQQTKKEELISSNIDHDLTETGDTKEEELILMKENATNEVGATKGKKKNKLKTEQLTCMPYPFDQFHDGRRYIEHYMLQPETGPLNLIDPIHEFKALTNTDMATEKDIQMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVKDKPHGEIVGVKVTSKDAFIDHFNLMIKQYFEESHIKEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPSDKFVIEVDIIPKHSVCKDKYFYINMQNCKDGSWRQDKDASLFVREGASSKNIFANVRQQDADFKAFLLNVKP	590072	605759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_590224_593355_593454_594299_594487_604626
883118	contig_7773_pilon	-	5401	3	Intergenic	novelGene_178329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	573	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	4522	5271	23823	23074	FALSE	40	CAATTTATAGCAATAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRQRVTEWIRKQDPSVCCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQDNNYEKRAGVAILISDKIDFKIKSTRKDKEGHYIMIKGRIHHEDITIINTYTPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDLNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLMDIYRTLHPTAAKYTFFSNSHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEGTKGTKTNYMETE	118153	22943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7773_pilon_-_25754_26613_26935_115883
883119	contig_2798_pilon	-	5850	3	Intergenic	novelGene_120052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCTCTTTCTTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193459	170288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_171141_176011_180694_193143
883120	contig_10749_pilon	-	1662	15	Intergenic	novelGene_133438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1416.84623911917	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	242	1249	155250	136250	FALSE	5	TTCCTGTTGTCTTGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157962	135836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157429_157475_157839
883121	contig_11986_pilon	-	4573	14	Intergenic	novelGene_69212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1713	junction_2	787.867671284729	32	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	351	2396	758331	736169	FALSE	40	GTTTAAAGAAAAAGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	758681	733991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220
883122	contig_11493_pilon	+	5405	2	Intergenic	novelGene_143714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	577	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1910	2296	286883	287269	TRUE	35	CAGGATCATTGAAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEQNAKINSQLEIMQKQPLEIQKINNKISETDSVIEGQRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEEKLEKRTKKNEETLRIMWDKTKSKNLQVIRVPQQGKKTEDTKRITEELPTENFPNNMKDEKMTI	284973	319235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_288741_317597
883123	contig_11417_pilon	+	3747	4	Intergenic	novelGene_103328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1245.3865085007	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	23	346	575953	586628	TRUE	25	TTTAAACTCGTATTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSKKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	575930	590074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_576054_583804_583914_586514_586832_586876
883124	contig_6361_pilon	-	5470	5	Intergenic	novelGene_23942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5154.94507123985	270	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4753	5052	419660	415399	TRUE	55	CTAAGAACTTTAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTNFQLWWGQSGVTCLSFMCPGLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	424481	351582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_351759_410977_411210_415388_415504_419465_423897_423965
883125	contig_11227_pilon	+	4785	4	Intergenic	novelGene_163218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1518	1964	491212	491658	TRUE	70	AAAAAAGAAGAGACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGFQNKTADDLPGEEKVLDLTDREFKPLIFRTIQELSKKQTKMRKKIDKFMEKADKFMENTHKKMEEFKKIIQEQIAKINLQLEIIQKQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMMEDRISEIEDKHLDTSLFEEKSEKKKMKKP	489694	551800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_491918_492498_492579_493404_493967_549880
883126	contig_8045_pilon	-	4223	1	Intergenic	novelGene_35363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1700	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCGGGCGGGCAAGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120263	116040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_116000_120300
883127	contig_7839_pilon	+	2355	12	Intergenic	novelGene_45725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	608.063747201851	1507	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	97	2070	952473	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950902	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954434_954980_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
883128	contig_835_pilon	-	5231	6	Intergenic	novelGene_152124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11311	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2597	3190	172428	171835	TRUE	55	TATTGCTGAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKKETKSKHKTTELKQIEGEQQKKPTTTGRKKIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQLTQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSKKFENLEDMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKINSQPKKNLAQMASLENSTKHLQKSLYQYHSSYFRA	179424	58727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_58755_95022_95250_127358_128147_170835_173399_177533_178708_178972
883129	contig_10437_pilon	+	1604	8	Intergenic	novelGene_38291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	4059	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	51	1073	431167	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431116	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
883130	contig_8377_pilon	-	7084	28	Intergenic	novelGene_35079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.13311544746506	87	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199250	129002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_131569_136288_136371_137708_137737_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182895_183046_183256_183373_185762_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660
883131	contig_6434_pilon	+	4984	25	Intergenic	novelGene_61849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1084.64990431501	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1106	3321	384	3704	875528	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYLNIKEDCNAMAFCAKMRSSKKTEVNLEVPEPGVEVIFYLPDREPLRLDSGEYTAEDLCIKAAQECCISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNHTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKVPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQDGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRINNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLLISSENEMNRFHSNDSGNILCYEVMVTGNLGIQWRQKPNVLPVEKEKNKLKWKKLENKHKKDEEKNRIREEWNNFSYFPEITHIVIKESAVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDFDNILMTVTCFEKSQVLGGQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	789373	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_789681_875451_875534_878052_878252_882312_882437_887886_888041_892417_892582_894298_894642_896139_896326_900033_900192_902412_902537_904708_904896_913662_913770_916994_917094_918879_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
883132	contig_10331_pilon	+	5842	24	Intergenic	novelGene_54145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	280.920058726829	193	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1312	3939	152	4090	410802	598981	FALSE	50	ATAAAAATTAAAAGTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGDETNKDEDEDDEDAEEEDEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYGRGKNQKMYEASIKDSDVEGGEVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNLSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQDDETSAQDIDNNGKQDSKTDHLAHNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHAELVISKPVSKSPERLRKDTEGLSEDTDYEEEDEVTKKKKDVKKDTIDKSSKPQVKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEEKVKNKESLCIENSSNSSSDEDEEEKSKAKMTPTKKYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSDERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDSDTEAAASPPHPSPEEAVAEEPLHTVAEEESCSPSAELEKPLSASVDSKPVEDKTVEVNDKKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEAGRQQSSVTVSETLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPTGFDASVSSSSSNHPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNSKKKGKGTNSSDSEELSAGESVTKTQPVKSVSTGMKSHSTKSPARMQSPGKCGKNGDKDSDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERITILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERESAATSSSSSSPSSSSITAAVMLTLAEPSMSSASQNGMSVECR	409814	600733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409917_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_550874_551127_573425_573511_575995_576195_582599_583815_586578_586693_588938_589155_594919_595067_598853
883133	contig_9836_pilon	+	3938	5	Intergenic	novelGene_176167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	3488	3937	225337	226050	FALSE	20	AGGGTTGGGGGGTGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLHVCGSRRGDSLPRSSAWPERASNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKATLAANKWHSESHLFGCVESKQPLFPGQETVATGSRGGRVGVK	175160	226051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_175569_175627_177637_223910_224439_224794_225668_225931
883134	contig_10158_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_150780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAAACTAGTAGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169734	172155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_169700_172200
883135	contig_2069_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_23292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCTTTATCACTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344057	346448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_344100_346400
883136	contig_7157_pilon	+	2023	5	Intergenic	novelGene_131312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGTGCTCGATGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995902	1004757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_997485_999547_999667_1003386_1003445_1004295_1004391_1004588
883137	contig_2332_pilon	+	529	6	Intergenic	novelGene_58682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_3	627.65710383935	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	110	451	332129	334269	TRUE	30	AAATTCATTTATTCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	331459	334824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
883138	contig_9575_pilon	+	5510	5	Intergenic	novelGene_169719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3551	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCTAGACAGGGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176224	243839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_178120_191504_192891_201926_202394_205135_205381_242322
883139	contig_1301_pilon	+	2541	2	Intergenic	novelGene_47281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCTCACACAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242483	248066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_244650_247691
883140	contig_8651_pilon	-	2548	2	Intergenic	novelGene_168194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATCTTGGCCTACGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189349	185629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_185757_186928
883141	contig_12427_pilon	-	2101	5	Intergenic	novelGene_40451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2454.5266855343	3	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	247	780	316061	314393	FALSE	20	ATATGTGTCTAGTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325918	313071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325689
883142	contig_11512_pilon	-	2798	12	Intergenic	novelGene_43352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1177.72653240214	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	129	887	609650	571046	TRUE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQ	622329	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_571041_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
883143	contig_9829_pilon	-	5873	4	Intergenic	novelGene_178330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	4294	4785	33780	33289	FALSE	45	TCATTAGCAATTAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGWFSIRKTISVTHHINRTKDKNPMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKTGIERKFLSIIKDIYIKPTANITLNGETLKAFPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRLEKEIKDIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELKKISAKFQDTR	418252	32200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9829_pilon_-_34281_274377_275612_296403_297878_417167
883144	contig_8377_pilon	+	5007	29	Intergenic	novelGene_34946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1667	junction_1	2433.76437136098	1534	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1178	3537	162	3698	68257	197939	FALSE	20	GATTCTGCTTCAGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68095	199248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
883146	contig_4315_pilon	-	6229	18	Intergenic	novelGene_46797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	265.824108664743	3600	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	2852	4975	358035	333617	TRUE	30	ACTCCCAAAACATCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSISNQNPSVSHVSSSCAPPRGGEPRHSHLWSRKGCHKEKCAFQLQPQAEERTGGVTPRGHPPGCGI	375025	327077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334079_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155_363231_365433_366299_373159
883147	contig_4797_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_6904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTGCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353333	355738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_353300_355700
883148	contig_3612_pilon	+	6610	5	Intergenic	novelGene_87797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4834	5175	705242	705583	TRUE	25	TGTAGAGTTAGTCACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQVANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTLALLVRIKNTRNNKCWRCCGEIGTLMHSWWEWIMIQPFWKMIWRFLRKLEIETPSDPAVPLLEIYPREIRAVT	484619	707140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_486525_486568_487599_579537_580919_704724_706748_706869
883149	contig_9389_pilon	+	474	1	Intergenic	novelGene_83952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAATTTTAGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204206	204680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_204200_204700
883150	contig_5988_pilon	+	3975	2	Intergenic	novelGene_15836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGGCAATACGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240080	244839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_242384_243167
883151	contig_2799_pilon	+	5238	3	Intergenic	novelGene_85583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_2	295.5	4546	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	159	515	780145	781598	FALSE	15	ATTGTTGCTGTGATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLKRDTEQLSQRRIEGDVCQVSHQHTKTMRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGDGPASEVPAEGEEIFC	777993	786321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_778128_780120_780452_781548
883152	contig_4315_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_46842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTCTCTCTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575439	580878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_575523_580086
883153	contig_14441_pilon	+	1481	6	Intergenic	novelGene_100322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	455.459065120017	535	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	893	1441	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5656	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_121188_121239_125517_125902_126159_126283_126514
883154	contig_1150_pilon	-	591	3	Intergenic	novelGene_61392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36526	297	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310009	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309018_309079_309385_309812
883155	contig_12624_pilon	-	5460	13	Intergenic	novelGene_61059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	856.579774289717	397	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	4211	5104	875571	862389	FALSE	45	ACAAACAAGGCACCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAKRRIPCLIPCRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	903859	862032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
883156	contig_5286_pilon	+	3018	7	Intergenic	novelGene_157352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1255	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535715	567631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_567121
883157	contig_6048_pilon	+	2351	4	Intergenic	novelGene_73095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_1	106.904942199445	2386	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1160	1633	132371	135654	FALSE	10	TGGACTTTGCCTTTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMLLFSRQGKLRLQKWYLATSDKERKKMVRELMQVVLARKPKMCSFLEWRDLKVVYKRYASLYFCCAIEGQDNELITLELIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLMGGDVQDTSKKSVLKAIEQADLLQEEDESPRSVLEEMGLA	131211	136372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_132550_133132_133242_134181_134320_135606
883158	contig_19402_pilon	-	2067	2	Intergenic	novelGene_80843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGGTGAAGGCCACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	144504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_146482_146623
883159	contig_6743_pilon	-	4503	6	Intergenic	novelGene_33538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	152	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	4167	4502	146609	146140	FALSE	75	GGGGAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCENPKEAEKEK	339170	146138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_146172_146305_147115_216198_216238_290317_292191_292693_293841_338568
883160	contig_5419_pilon	-	3692	2	Intergenic	novelGene_15514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	544	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1943	2278	249956	249621	FALSE	25	CCTTAACTATCCACCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKESSSSIQKTVLGYILMRSLPHSGRGFLFHVWREVGKRHDLDIGGGLLLRLDAVHLNGVLPRSTHLLRLPFKGPCNIFKSPATGLRNFEEGEDQEDNKEGSKDDKNVGP	252122	248206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_250689_250912
883161	contig_9471_pilon	+	2484	7	Intergenic	novelGene_21819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_6	357.409040487537	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1491	2267	413930	417296	FALSE	40	TATCAAATTTATATGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	412439	417513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
883162	contig_9706_pilon	-	510	1	Intergenic	novelGene_20770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1179	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCGGGTCGGGCTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671	161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_200_700
883164	contig_12019_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_87772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	657	1169	702425	701913	NA	30	GTTCACAAAGCACTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGSNKCWRGCGEIRTLKHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKPEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTNEWINKLWYTHTMEYYATRKNNDESVKHFITWMKLEDIIFSEISQSQKDKYCMRLLL	703081	700729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_700700_703100
883165	contig_10583_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_167927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGAAGACAGCAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302681	304503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_302700_304500
883166	contig_13295_pilon	+	4529	2	Intergenic	novelGene_31199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1203	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2991	3341	5945	6295	FALSE	50	AATACCTAAAAGTTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPGASEKINFSSLKPPTWGYFCYSSTRKLRQHSTPYPGKPQQLSPGPLSLECSPPHYGPCKPGQGALGGCSHSGLKTTDLPHRADFVSPGLLTRSQGRRGSPVNDTGICTDLGG	2640	7483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_4546_4859
883167	contig_5005_pilon	-	2185	6	Intergenic	novelGene_84312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_5	438.66132722181	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	104	877	540029	512817	FALSE	40	CGAATTGTTATATTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNIYLVRQRISRLGQRMSSFQINLSPLKEPLGFIKVLEWIASIFAFATCGCYKGKTEIQVLCSNGNNNTVTAAFGYPFRLNQASFQTASGEELCGKKWSSYFLIGDYSSSAQFYVTFAVFVFLYCIAALLLYVGYTNLYRDSRKLPMIDFVVTLVATFLWLVSTSAWAKALTDIKIATGHNIIQELDACKQPEVTCYFDSVTSMGSLNVSVIFGFLNMILWGGNAWFVYKETSLHSPSNTSAAHGQGGIPPPAGM	540132	511508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555_515745_520412_520621_521921_522041_539649_539722_539978
883168	contig_16666_pilon	+	3131	1	Intergenic	novelGene_61787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	355	1068	12	1079	116861	117928	NA	25	TGGGCCACAGGAGCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	116849	119980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_116800_120000
883169	contig_4891_pilon	-	1440	4	Intergenic	novelGene_124593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	545.352689143049	1082	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTGATGGCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964354	937403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_938536_939963_940129_964127_964176_964259
883170	contig_7704_pilon	+	2547	9	Intergenic	novelGene_154624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	964.93312592117	82	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	108	455	355658	358129	TRUE	25	TCATTGGAGCTAAGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAIAGAKLRKVSKQEEASAGPAAPKAESGRGTGGLMEEMNAMLARRRKATQVGEKPKDESANVEPEARVPAQTESVRRPWEKNSTTLPRMKSSSSVTTSEAHPSTPSSSDETDLERVKQELLEEVRKELRKVKEEIIEAFVQELRKRGSP	355438	360265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_355480_355591_355690_356652_356702_356856_356891_357110_357157_357301_357393_357916_357975_358091_358520_358563
883171	contig_14807_pilon	-	1073	7	Intergenic	novelGene_124677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	6949.40440493524	54	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	485	976	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38951_39522_39796_39900
883172	contig_16703_pilon	+	9269	15	Intergenic	novelGene_72749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_5	1319.83069415152	1566	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	644	2050	10033	40668	FALSE	65	TAAGAAAAAAAAAACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	47887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
883173	contig_4232_pilon	-	4362	3	Intergenic	novelGene_63442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	21.5	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGAAAAAATCTCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545512	540487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544075_544584_545270_545422
883174	contig_7915_pilon	-	4470	7	Intergenic	novelGene_42989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_5	340.129387145539	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	3970	4365	148059	142263	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTLNFNFCRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC	167373	142157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_151606_154716_154771_155911_155971_167063
883175	contig_18251_pilon	+	8921	6	Intergenic	novelGene_50151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1131.77464187885	1198	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	7963	8481	44863	53991	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	35592	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_38069_39376_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
883176	contig_1264_pilon	+	6276	2	Intergenic	novelGene_161303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9502	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGCAGAGACAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132723	139903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_135775_136678
883177	contig_15327_pilon	-	2088	4	Intergenic	novelGene_70637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	376	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	127	435	901528	901100	TRUE	20	CTTTTGAGCCAGGTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVRQKDGFV	902154	899378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899477_899544_901281_901400_901536_902035
883178	contig_12638_pilon	+	1290	1	Intergenic	novelGene_33075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	332	670	143850	144188	NA	45	CTCACTTATATAAAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDSCLTPYTKANSKWIKDLNAQTKTIKFLEEQAGAKLSGLAFNNGLYLITKAQTAKDKINKWDLIKIKNFCSSKDFTKEVRRQAIDWENIFGNRISDMNLITKTCKTLTT	143518	144808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_143500_144800
883179	contig_10990_pilon	+	3775	19	Intergenic	novelGene_7459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_14	401.888247626435	32	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	1801	3747	722379	752144	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708563	752172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_709348_709396_714557_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
883181	contig_17198_pilon	-	3422	2	Intergenic	novelGene_62394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	639	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGAGTAACATATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063128	1059658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1061911_1061958
883182	contig_13460_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_162197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	172	420	345190	344942	NA	25	TGGCACAGGATCAGGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISHSSKILLKIIQKGLQQYIDRELQKFKPDSEEDVEQEISLLRSAGSWLKTENTRKMFTCVLLTMQRHLTGLIITNYELTLLRIGISEHLIVLMQYMYIHQEAVVQTEQGDTAWFKIRKGVCQHCILSPYIFNLMLSK	345361	343234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_343200_345400
883183	SIRV6	+	859	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	363	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	67	552	1733	10736	TRUE	30	ATTTGTGAACGCAGTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGELGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1666	11356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2627_2752_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
883184	contig_14287_pilon	-	2308	4	Intergenic	novelGene_24042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	125.88883985485	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	179	991	22710	21898	FALSE	10	GCTCTTGCTGTGTTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	33819	20580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823_25875_32891_32937_33780
883185	contig_13894_pilon	-	2210	2	Intergenic	novelGene_62039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1628	junction_1	0	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	1072	2130	287445	286290	FALSE	5	CTTCTGCAGGTGTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGVEESLGLLDDYLEVAKHFRSYGFSRDKAKAGSSEWLAVDGLVDASDNGKEDAFFGTDWMVEKMDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288516	286209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_287123_287219
883186	contig_6059_pilon	-	2810	15	Intergenic	novelGene_44832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	3939.39028290171	73	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	917	2356	580626	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580660_580926_581116_584181
883187	contig_7527_pilon	+	4945	7	Intergenic	novelGene_139564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1316.88045732667	480	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	622	1209	85507	96119	FALSE	10	GCCAGCTTCATTTTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80086	99855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85578_86410_86519_89859_90038_94415_94590_96062
883188	contig_3412_pilon	-	6228	7	Intergenic	novelGene_178332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	5329	5673	183824	183480	TRUE	10	CATCATTTTGCCCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKEKRGKRKQNKLKKKKKQQERPPKKQKKRRRKKKLKRNALRDPSARLWKLKGSLPATQLSLARKGSQLKKRKRKQTIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLERSSAAS	376280	182654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3412_pilon_-_183116_183385_183983_232747_234278_291291_291682_350127_350828_354266_355124_374587
883189	contig_7963_pilon	+	4994	3	Intergenic	novelGene_58273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	2728	3273	206991	207536	FALSE	30	CGATTTTGAAGATGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERKYQNTLKLPLERRVPKVNGRNDEVKELNRRFQRVAREDKIKYYNDMCKDLKLENQKERTCLAFLKLKKTKKKFKPQVAILKDSIGKILNDAEIIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQEVAYDQEPMILKEEVQVALKALVKNEAPGIDGIPIEMFQQMDAVLEVLTHLCREIWKIAT	22041	209257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_23930_53988_54312_206474
883190	contig_6445_pilon	-	1231	12	Intergenic	novelGene_76910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	637.425827803058	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	303	1001	74005	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74053_88113_88216_88473_88594_96306
883192	contig_14970_pilon	+	4318	1	Intergenic	novelGene_45014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAAAGGTTGTGTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144214	148532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_144200_148500
883193	contig_6445_pilon	-	995	9	Intergenic	novelGene_76947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_8	718.506861049357	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	81	773	73829	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPLTHYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	73909	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73809
883194	SIRV6	-	1443	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9199	446	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTAAGCTTGATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11746	1098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
883195	contig_6489_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_128947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294732	292779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_292800_294700
883196	contig_10793_pilon	+	1750	14	Intergenic	novelGene_83402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2682.15094510128	62	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	126	503	146975	159297	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKVMLFTTLFI	130876	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
883197	contig_3975_pilon	-	2491	2	Intergenic	novelGene_54951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	292	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	305	610	2356390	2356085	TRUE	35	CCTGCAGAGAGAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAHTHTHTIPPNYTNQSMSKGKGLLWLLIKTLGVDSRSELRGYAVLIFSLCERSLLSCSEIKNFGEYHHFHFKILVTISKSIILFCFLGWEEENLHICI	2356694	2352984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2353059_2354277
883198	contig_9633_pilon	-	1385	6	Intergenic	novelGene_139642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1065	junction_5	712.702911457502	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	934	1350	1141485	1138462	FALSE	80	AAGAAAGAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1150839	1138426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737_1147844_1150154
883199	contig_11720_pilon	+	1746	11	Intergenic	novelGene_43790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_9	2627.69175513415	10689	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	251	1255	68064	96027	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHQGFWMEKSSVCSACRRGQGDMEPKESHLRKVPGLGSPPGEI	67813	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_95901_96052_98299
883200	contig_1070_pilon	+	4729	3	Intergenic	novelGene_178333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	734	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1214	2053	359932	360771	TRUE	65	TTAAAAAAAAAATACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSRLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDSISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKDEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIKELLTKNFPNIMKHEMLAIQEAQRTPYRGDSKRKSPRHIIFTLAKTKHKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYWAETMEARRQWDDIYKILKEKNCQPRIKYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVIPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	247399	366146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1070_pilon_+_247534_358852_361442_364140
883201	contig_10973_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_150327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTGAATCCTAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1013	59	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_100_1000
883202	contig_12019_pilon	+	1749	3	Intergenic	novelGene_87638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2044	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_6226_8298
883203	contig_5967_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_44400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGGAGTGCACCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406761	404119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_404100_406800
883204	contig_8377_pilon	+	3256	10	Intergenic	novelGene_35135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4711	junction_3	1431.77248347789	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	690	2003	183306	197939	FALSE	45	AACCTTAAGAATAATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	182405	199192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
883205	contig_16310_pilon	-	1938	10	Intergenic	novelGene_70039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1280.52903804793	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	154	1542	66135	56549	FALSE	10	GTGCCAGACTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRRRPQTTRKEDEV	66288	56152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56589_59486_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
883206	contig_9177_pilon	-	4500	26	Intergenic	novelGene_32610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1829.10422491448	21	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	1801	3588	23335	16653	TRUE	20	ATTCTACCTGTAACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	32990	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1968_15196_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
883208	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	223	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
883209	contig_13863_pilon	+	7876	25	Intergenic	novelGene_41979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	500.653482682606	2479	127	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	570	2345	55383	81541	TRUE	35	GCGATTAGGATTTACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	48514	150914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54989_55222_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493_82899_83190_86452_137081_137431_150350
883211	contig_13021_pilon	+	3904	10	Intergenic	novelGene_8166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_9	2132.47508777946	1547	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	169	1284	174676	178303	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGYVGFLQ	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_180211_180440
883212	contig_2703_pilon	+	1489	8	Intergenic	novelGene_101783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	671.737770750656	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	30	623	602068	610870	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	599800	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
883213	contig_17337_pilon	+	2222	2	Intergenic	novelGene_144726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2548	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGAGGGTTTCTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31045	33367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_31282_31381
883214	contig_13633_pilon	+	2245	14	Intergenic	novelGene_15320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	439.500590705825	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	234	1634	20259	49142	TRUE	10	TACATTTCCTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5284	51759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5517_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019_49479_51484
883215	contig_10345_pilon	+	1179	12	Intergenic	novelGene_158361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1319.61481983466	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	290	931	13203	24141	FALSE	30	CTACCCGAGAATGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNASKSKQHTSRKPLDEALKKALKELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4369	24389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13245_14118_14153_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
883216	contig_12312_pilon	-	8616	22	Intergenic	novelGene_63932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	754.066340152824	2652	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1066	3201	94	3294	326065	215838	TRUE	20	CTTGGAACTTTCCAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326158	210462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215359_215411_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
883217	contig_9345_pilon	-	3583	3	Intergenic	novelGene_24329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	2759	3205	74464	20782	FALSE	25	CGACGCATTGTATTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTHPTFLKLRELKKKFKPRVAVVKDSMGKILNDAESIKSRWKEYLESLYQKELVNVQPFQQVAYDQEPMVLKEEVQAALKTLAKSKAPGIDRIPIEMFQQTDAVVECSLVYAKKFGRRLPGQSTGCSDRTRGYCVV	172199	20403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_20819_74054_75374_170350
883219	contig_10140_pilon	+	2929	1	Intergenic	novelGene_148427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	349	657	307431	307739	NA	30	TCCCAAACATGTTTATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIQESLYQNELVNVQSFQDEAAYDKELMVLKEEVQAALKALVKNKGPGIDGIPIEMFQQTDATPGVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVLIPKKGDPTE	307082	310011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_307100_310000
883220	scaffold_12124_pilon	+	1866	6	Intergenic	novelGene_22369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_2	1796.58976953561	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	915	1694	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1491932	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
883221	contig_5961_pilon	+	5509	1	Intergenic	novelGene_144162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	674	1033	224510	224869	NA	30	GGAAGTCTGCATAACTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQADNTQKRAGVAILISEKIDIKLKSTTKDKEGHCIMIKGLIHQEDITIINIYAPNRAPKYINSNSIEKRDSSTIIVGHFNTQLLVKDRTSGKKLNKDTEELNATISQLDLLDIY	223836	229345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_223800_229300
883223	contig_7230_pilon	-	7015	8	Intergenic	novelGene_52534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	407.230967909477	3809	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	218	784	177508	134622	TRUE	30	TTTGGCACTTCCTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177725	76913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_76921_128397_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
883224	contig_546_pilon	+	5272	9	Intergenic	novelGene_117208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	898.435410867136	2452	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	202	1725	119834	152874	TRUE	55	CCCCCAAAAAAATCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	103368	156560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_154385_154523
883225	contig_2703_pilon	-	2954	8	Intergenic	novelGene_101778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTGTTTGTAGATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611739	596399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_597818_599670_599819_603410_603515_605149_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
883226	contig_4151_pilon	+	2009	3	Intergenic	novelGene_65236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	17.5	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	246	845	593026	663644	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLGELKLPSVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528877	664808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_592891_593060_663078
883227	contig_5423_pilon	+	4805	2	Intergenic	novelGene_85223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	2991	4013	400557	453222	FALSE	35	GGACTCAAACTTACATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLAIAIRLQKEIKGIQIGREEVKVSLSADYMILHTENPIEPTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQNSVGFLYTNKEKLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGTNLTRDIKDPYDENYKTLVQETKCDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSVLPKAIYRYNAIAIQIPLAFFNEMEKQITNFIWKGKRPRISKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYLYNNRYIDQWNRIENPDINLSTYEQLIFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWHNWICICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEDKIGTMLGALIHGINTV	397566	454014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_401178_452820
883228	contig_11594_pilon	+	2282	11	Intergenic	novelGene_80921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_10	433.882484089874	4577	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	418	1848	540415	568385	FALSE	25	GAGCTATACTTCAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	539997	568819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
883229	contig_15744_pilon	+	3622	1	Intergenic	novelGene_83624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGCCCAGAGACAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193150	196772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_193200_196800
883230	contig_4305_pilon	-	613	3	Intergenic	novelGene_136681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	250	76	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	111	425	513968	513151	FALSE	5	TTCCTTGAGCGCCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFLLLPASRGWEYSSHMLNLVPSTSILPFVPFIPLHLVPFALWYLPVPHHLYPQGLGDHAAEAEKSKREEGGTQVALWLRVQPSCPSPVCLEPVPPRSRFLL	514683	512962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513432_513934_514044_514648
883231	contig_15720_pilon	+	4143	4	Intergenic	novelGene_41953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGGAAATGAACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305250	367163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305498_305624_307606_349435_349915_365727
883232	contig_13780_pilon	+	4510	9	Intergenic	novelGene_149119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1183	1497	821465	822491	TRUE	10	TTAACCTTCGCTCCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASISMSSSLLSDFTVSTLGTLAVFEYTFTSIFSSSSSSSPPEDSSSASFNHFINGSALTRISLASSFETYFLEAFSDQLMMTSSSKRSASYISFKIWGILEMS	820282	827328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_821549_821968_822108_822399_822566_822826_823881_824129_825308_825627_825798_826237_826318_826431_826713_827152
883233	contig_10500_pilon	-	5613	8	Intergenic	novelGene_41269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	950.233784338338	380	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2500	3093	1635596	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640207	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1639084_1639871
883234	contig_12939_pilon	-	615	4	Intergenic	novelGene_166200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1000	junction_3	208.219969156552	922	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAGTGTTGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46810	45216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12939_pilon_-_45364_45850_45889_46031_46379_46727
883235	contig_13740_pilon	-	2009	12	Intergenic	novelGene_34658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_11	4155.91530231308	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	195	1256	165243	157474	TRUE	30	ATAACCCCAGCGAGGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165437	156567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
883237	contig_6673_pilon	-	1853	2	Intergenic	novelGene_164019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCATCACTCCTTCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160380	100878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_102531_160179
883238	contig_10958_pilon	+	3220	6	Intergenic	novelGene_5439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	7	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	29	430	888255	894000	TRUE	35	TGTTGTGAATCATATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888226	901690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894555_894593_895022_895279_895855_900457
883239	contig_13780_pilon	+	3038	1	Intergenic	novelGene_149103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGACATGTGGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795874	798912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_795900_798900
883240	contig_12273_pilon	+	4036	4	Intergenic	novelGene_178276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	786	1238	238279	282702	TRUE	20	CCCTGAGAGTTATGTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVIRD	237493	327655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12273_pilon_+_238722_282692_282806_324664_325470_325765
883241	contig_6898_pilon	+	2651	9	Intergenic	novelGene_35752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2602.14203830229	10	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	183	1064	119670	125646	TRUE	30	AGGAATACTTTACTGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLNIYEQNDSPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	116784	127694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_116819_117871_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125833_126293
883242	contig_12951_pilon	-	2012	3	Intergenic	novelGene_68162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	567	junction_2	122.5	1	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	66	383	307115	296988	FALSE	20	TATTTAAGAGGCTCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	307180	295358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_307070
883243	contig_5317_pilon	+	1115	4	Intergenic	novelGene_76518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	5580.21666246034	1361	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	187	597	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33686	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33850_35258_35410_36684_36839_43197
883244	contig_8317_pilon	+	1149	3	Intergenic	novelGene_19311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	18590	junction_1	11171.5	774	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	20	406	15943	16506	FALSE	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	15923	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_15970_16047_16283_16381
883245	contig_8377_pilon	-	8616	2	Intergenic	novelGene_34951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	698	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTAGCGTAAGAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133103	68096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68327_124717
883246	contig_8464_pilon	+	2633	7	Intergenic	novelGene_125370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_6	46.4737082182556	948	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	71	790	792642	804080	FALSE	60	AAACAGGAAACAAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYQSLRLEYLQIPPVSRAYTTACVLTTAAVQLELITPFQLYFNPELIFKHFQIWRLITNFLFFGPVGFNFLFNMIFLYRYCRMLEEGSFRGRTADFVFMFLFGGFLMTLFGLFVSLVFLGQAFTIMLVYVWSRRNPYVRMNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	792571	805923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_792735_793605_793672_796183_796258_797898_797993_798725_798922_799187_799279_803974
883247	contig_5020_pilon	-	3851	2	Intergenic	novelGene_27788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGAACATTGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34171	30043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_32514_32790
883248	contig_19459_pilon	-	962	8	Intergenic	novelGene_59893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	97	882	16240	7003	FALSE	35	AAACAGATTTATTTCGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19060	6922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
883249	contig_11493_pilon	+	3003	1	Intergenic	novelGene_143733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352271	355274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_352300_355300
883250	contig_10331_pilon	+	3158	20	Intergenic	novelGene_54134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	278.529378986219	2109	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2877	281	3157	410802	583357	FALSE	30	CCGAGGAGGCAGTAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGDETNKDEDEDDEDAEEEDEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYGRGKNQKMYEASIKDSDVEGGEVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNLSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQDDETSAQDIDNNGKQDSKTDHLAHNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHAELVISKPVSKSPERLRKDTEGLSEDTDYEEEDEVTKKKKDVKKDTIDKSSKPQVKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEEKVKNKESLCIENSSNSSSDEDEEEKSKAKMTPTKKYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSDERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDSDTEAAASPPHPS	409517	583358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_550874_551127_573425_573511_575995_576195_582599
883251	contig_5341_pilon	-	1906	4	Intergenic	novelGene_168012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	265	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	554	1231	339968	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340890	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340039_340407
883252	contig_11855_pilon	-	1662	15	Intergenic	novelGene_66953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2042.12279008778	1546	5	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	364	1545	1087425	1078618	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILSVGVVSGP	1102165	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1078576_1078643_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090578_1091736_1091804_1101936
883253	contig_4486_pilon	+	2233	13	Intergenic	novelGene_38593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1350.6935949726	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	409	1584	325090	412828	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEKVQPECLLEARMQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEGFH	324681	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_325147_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411218_412817
883254	contig_16594_pilon	-	4041	6	Intergenic	novelGene_53794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3148.51873743829	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	215	592	135375	121101	TRUE	20	TATTCGTGTATCTGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRKVQILPSSRTSASQDQGCPIGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	149229	115119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_132997_133152_135303_135510_149149
883255	contig_3747_pilon	+	2808	8	Intergenic	novelGene_24882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	944	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	231	1406	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201082	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
883256	contig_13780_pilon	-	4885	11	Intergenic	novelGene_149110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	1030.20546009036	4425	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	299	1591	826505	821461	FALSE	40	AGATAATCCCACTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNVNRSVSDQFYRYKMPRLIAKVEGKGNGIKTVIVNMVDVAKALNRPPTYPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	827423	818166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827333
883257	contig_11498_pilon	+	1325	5	Intergenic	novelGene_65534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCACATGAACAGCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292035	301385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_292124_292992_293088_293971_294089_296917_297064_300506
883258	contig_16400_pilon	+	5130	3	Intergenic	novelGene_150899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	17	2070	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	172	366	16949	36995	FALSE	60	ATATGAAAATCAAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQYNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVMYLKEILREIGIQNVKGTHKNTWELKPEYRHYQGEEKSD	3464	41759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879_17024_36875
883259	contig_5696_pilon	+	1583	2	Intergenic	novelGene_117580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGTGGTATAACTACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719961	721684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_720455_720594
883260	contig_7020_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_57077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	372	1119	133	1251	102391	103509	NA	30	TAATCTTACATAGTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKIQNGTSGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNSVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGMTLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYGGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSSFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPMRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMAKDKANMQHRYVELFLNSTAGTSGGAYDHSYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDYQSNLA	102258	104308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_102300_104300
883261	contig_11986_pilon	-	3514	10	Intergenic	novelGene_69150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_9	723.570894595804	1956	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	133	1140	523776	507353	FALSE	25	CCAGGTTTGATACTCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEQGQEEGRGSSACQQDSYKCGRRHGRGACQPASEAAPGSTGDMADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	548076	504978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_547976
883262	contig_1263_pilon	-	4083	8	Intergenic	novelGene_170384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	855.92868766466	280	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	317	1633	65303	55502	TRUE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76860	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53517_54889_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
883263	contig_7730_pilon	-	6802	4	Intergenic	novelGene_156259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	786	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	6177	6575	28019	27621	FALSE	10	TGACCTGTTACTGTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPTSVPGLGEPAVYFFPFVNLFTLQGLENGSGRVTDPASGSEDSAIAEAGPGPGAEQGVGRLMGERFFPKGRVFDPPGRLYASYLSFANVGLLLTCSGWPCRLSGAVSLPVRKTHLLSTTACQLHCSPMS	173277	27393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_28331_29252_30167_30591_35172_172906
883264	contig_3525_pilon	-	5007	4	Intergenic	novelGene_135129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	4573	4893	225760	225440	FALSE	50	CAAAAATATTTTCAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKFFPKGVVFDLQGNLYLITYLLPDQGLLLTGSGWPCRLFGSRSLLVWKTHLPSIDACLPHRSPTSYSGLKGSGSRWVRSGNFLLPPNCLSLSLPLSPVPQLCL	344502	225325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_227948_228174_229641_250121_250468_343929
883265	contig_3077_pilon	+	2474	7	Intergenic	novelGene_26794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_2	724.96975032679	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	260	1270	473998	481662	FALSE	40	AACAGTCAAGTTTGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467351	482866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
883266	contig_12528_pilon	-	4455	11	Intergenic	novelGene_81303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	494.15650354923	2404	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	516	1391	966228	933323	TRUE	40	TGAATAAATAAATCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968126	926302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_927625_931580_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
883267	contig_7151_pilon	-	4244	5	Intergenic	novelGene_40763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	779.36364265983	2	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAATTAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551357	523206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526714_529337_530062_530179_549638_549729_551152
883268	contig_6661_pilon	-	5283	9	Intergenic	novelGene_174108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	4146	4760	9970	524	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKILNKIGIEGKFPSIIKGMYTKQTANIILKGESLKAFPLRTGTRQGCPLSPVLINIVLEVPVRTIRLEKEIKGIHTAREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIEDFSQVSGHKTNIQKSVEFFYTNKENLEEEIIKSIPFSLAPKKIKYLGVNLTRDVKDLYNENFKTLLQETKKVLYKWKNIPCSWILRGRYIMKT	457229	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_-_554_9385_10381_54668_54689_144276_144403_144467_145197_161296_162351_265182_265673_335019_335027_455920
883269	contig_10003_pilon	-	7700	1	Intergenic	novelGene_88134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7579	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTAAAGCATTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376529	368829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_368800_376500
883270	contig_11316_pilon	+	1901	1	Intergenic	novelGene_122600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	709	1221	137674	138186	NA	45	AGACGACCCACCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136965	138866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138900
883271	SIRV3	-	311	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	1	532	1	-532	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTTTGCCCACAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981	1532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1765_1902
883272	contig_12019_pilon	+	769	3	Intergenic	novelGene_87666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	109	432	5225	8336	FALSE	10	CATCTCTTTCCTGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5116	8673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
883273	contig_10345_pilon	+	1585	13	Intergenic	novelGene_158367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1141.99586494678	6203	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	622	1284	14227	24141	FALSE	10	CTGGTATGTCACTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4372	24442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13426_14114_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
883274	contig_4812_pilon	-	617	4	Intergenic	novelGene_103665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3455.89477077452	477	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	114	488	82626	79141	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSYLDLSSVILTGCCSSSTQHQDLDKWD	82739	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79223_81547_81739_82268_82343_82598
883275	contig_3956_pilon	+	3181	15	Intergenic	novelGene_15044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_8	816.551521800739	581	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	81	2657	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
883276	contig_4654_pilon	-	643	5	Intergenic	novelGene_103103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1252	junction_1	427.508187056108	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	71	574	500181	494476	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	500251	494406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118
883277	contig_5125_pilon	+	2546	8	Intergenic	novelGene_43422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	21	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	321	1454	35654	58893	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25962	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26067_26328_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
883278	contig_10323_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_123574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACACACCTCTCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458014	459520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_458000_459500
883279	contig_2646_pilon	-	4756	8	Intergenic	novelGene_69533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTTGTCCCCCCCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574386	562319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_565386_566419_566585_567965_568156_569609_569726_570832_570914_572008_572070_572765_572842_573385
883280	contig_13542_pilon	+	1769	10	Intergenic	novelGene_131490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1104.78361659927	5940	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	98	1012	346638	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLSPKGPAPGVSKVYSSRGKLSELGRHPTILARPVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346540	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_422224_422321_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
883281	contig_6477_pilon	-	922	4	Intergenic	novelGene_154182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	3152.18171360021	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAACCAGTGGGCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771298	769330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616
883282	contig_3018_pilon	+	1151	9	Intergenic	novelGene_78773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	467.573456795828	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	672	1151	478971	497074	FALSE	30	GTAAGTACTTACACATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKP	370879	497074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_386426_386615_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048
883283	contig_6048_pilon	+	2292	4	Intergenic	novelGene_73188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	274.567943423036	143	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	360	1933	2292	1451549	1457846	FALSE	10	TCATTTTTCTTGATTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRHCARFWDIIWKKKSRHGPSCYFQFLSLSSSAGAGSGEFHVYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDAEFQKRLERNRIAAEEQTAKRRKKRQKLKEKKLLTKKMKLEQKKQKEGEWW	1449616	1457846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1451643_1451714_1451816_1456961_1457048_1457767
883284	contig_4604_pilon	-	3008	8	Intergenic	novelGene_19165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCTGACAGATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381084	371318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374926_377353_377531_378438_378606_379334_379468_379806
883285	contig_6059_pilon	-	2385	16	Intergenic	novelGene_44861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5107.57817191497	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	238	1932	584239	569223	TRUE	85	AAAACAAAAAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKMKQ	584875	568039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568283_569012_569235_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584264_584662
883286	contig_3018_pilon	-	9298	27	Intergenic	novelGene_78814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	524.773583185613	3521	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1858	5577	442	6018	600079	539862	TRUE	45	AACTGCAAGCACCTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKREKRREQALERISTAKTEVKTECKDAQIVSDAEVIQEQAKEETATKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRTVSMCSDIQPSSPDIEVAAQQNDIENAVLAIEPETETAVAEIIPETEVPALNKCPTKYPKTKKHLVNEWLSEKNEKTGKPSDGLSERPLRITTDPEVLATQLNSLPGLTYSPHVYSTPKHYIRFTSPFLSEKRRRKEPTENISGSCKKRWLKQALEEENSTILHRFNSPYQERSRSPTVNGESKSPLLLNDSCSLPDLTTPLKKRRLYQLLDSAYSETSTPTPSPYATPTHTDITPIDPSFATPPRMKSDDETYRNGYKPIYSPVTPVTPGTPGNSMHFENISSPESSPEIKRRTYSQEGYDRSSTMLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLIDGSCTPQNPPQKKKVSLLEYRKRQREARKSGSKAENFPLVSVSPHPSGNLNSTGDGCANSSENGEQGENTASLPLPTPAAAYATSEETSNNCPAKEASASEKNEPEVQWTASTSVEQVRERSYQRALLLSDHRKDKDSGGESPCISCSPSHVQSSPSSHSNHIPQLQPKGPVPSFSELAEDLDPENPEPTTTDECPSPDTYQKTCKSPSKMSKPSSPGPIVPAQPHGKILTKPDSHWEATVTVPEAENGVHVKTELQQKQLSNNTQALSKNHPPQPHLRSSSEQLSQKLPSAPVKLHCPPSPHIENPPKSSTPHTPVQHGYLSPKPPSQQLGSPYRPHHSQSPQVGTPQREPQRNFYPAAQNLQANTQQATSGALFTQTPSGQSSATYSQFNQQSLNSTAPPPPPPPPPSSSSYYQNQQPSANFQNYSQLKGSLSQQTVFTSGPNQALPGTTSQQTVPGHHATPGHFLPSQNPTIHHQTAAAVVPPPPPPPPAPGPHLVQQPNSHQQHSVAHVVGPVHAVAPGSHIHSQTAGHHLPPPPPPPGPAPHHHPPPHPPTGLQGLQVQHQHVVNSVPPPPPPPPPSSVLASGHHPTSAQALHHPPPHQGPPLFPSSAHPAVPPYPSQATHHTTLGPGPQHQPSGTGPHCPLPVAGPHLQPQGPNSIPTPTASGFCPHPGSVALPHGVQGPQQASPVPGQIPIHRAQVPPTFQNNYHGSGWH	625099	536516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_539374_539438_541377_542304_542403_542582_542709_542815_542905_543793_544078_545134_545699_545829_545887_546200_546452_547000_547146_547311_547567_550198_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
883287	contig_6005_pilon	-	7923	5	Intergenic	novelGene_158882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	100.416632088514	4259	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	19	468	327313	311978	TRUE	45	ACAATTTAAACAGAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAATNMEALYRVPFLVLECPNLKLKKPPWVHMPSAMTVYALVVVSYFLITGGIIYDVIVEPPSVGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSNAPNIPKLNRFLLLFIGFVCVLLSFFMARVFMRMKLPGYLMG	327331	136097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_137182_305606_311997_320205_320404_321980_322075_327174
883288	contig_6871_pilon	+	2060	7	Intergenic	novelGene_21527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	210.239545915288	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	979	2004	63442	72153	FALSE	20	TGAGTTTTAATGGTGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETEETHLEETTESQQNGEEGTSTPEDKESGQEGVDSMAEEGTSDSNTGSESNSATVEEPPTDPMPEDEKKE	62463	72209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_71944
883290	contig_9852_pilon	+	3341	7	Intergenic	novelGene_138458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	376.449494915616	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	172	537	30866	35457	FALSE	20	GTAGCCAGTGACATTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRHHGLPRAPWRRRRLLPRRVWRGSRRACVSRTNSGSAVQLLCCCSWTAFNLETCRLMVSMLDRDMSGTMGFNEFKELWSVLNGWRQHFISFDSDRSGTVDPQELQKALTTMGFRLSPQAVNSIAKRYSTNGKITFDDYIACCVKLRALTDSFRRRDTGQQGVVNFPYDDFIQCVMSV	21363	38261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_21425_22410_22495_30839_30884_31683_31832_32069_32184_33374_33434_35430
883291	contig_5286_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_157353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536996	567635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_567121
883292	contig_5062_pilon	+	3431	11	Intergenic	novelGene_157832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	181.185098725033	648	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	955	1689	739675	744018	FALSE	40	GAGTGCAAAACCATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	622496	745760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734084_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
883293	contig_16686_pilon	-	3243	4	Intergenic	novelGene_162101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	398	811	319091	318678	TRUE	25	TAAGGGGGGACTACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRELRVVTRIDICTPMFMAALFTIAQQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	319488	176448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_176764_206709_206718_236011_236940_317496
883294	SIRV6	+	1014	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	418	3	77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATGGAACAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
883295	contig_9774_pilon	+	2256	3	Intergenic	novelGene_178242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGATAGATCTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842	26676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9774_pilon_+_1770_2090_2649_25905
883296	contig_4232_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_63353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGACCTGGAAGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468101	467038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
883297	contig_5084_pilon	-	2959	18	Intergenic	novelGene_64501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	254.995067460266	2498	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	117	2129	408100	348019	FALSE	10	CCCCAGCTTAGCCCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKKRKGRVVIDSDTEDSGSDENLDQELLSLAKRKRSDSEEKEPPVSQPAASSDSETSDSDDEWTFGSNKNKKKGKARKIEKKGTMKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMTEKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAKKKEKKEKKKKQEEEQEKKKLTQIQESQVTSHNKERRSKRDEKLDKKSQAMEELKAEREKRKNRTAELLAKKQPLKTSEVYSDDEEEEEDDKSSEKSDRSSRTSSSDEEEEKEEIPPKSQPVSLPEELNRVRLSRHKLERWCHMPFFAKTVTGCFVRIGIGNHNSKPVYRVAEITGVVETAKVYQLGGTRTNKGLQLRHGSDQRVFRLEFVSNQEFTESEFMKWKEAMFSAGMQLPTLDEINKKEFSIKEALNYKFNDQDIEEIVKEKERFRKAPPNYAMKKTQLLKEKAMAEDLGDQDKARQIQDQLNELEERAEALDRQRTKNISAISYINQRNREWNIVESEKALVAESHNMKNQQMDPFTRRQCKPTIVSNSRDPAVQAAILAQLNAKYGSGVLPDAPKEMSKGQGKDKDLNSKSASDLSEDLFKVHDFDVKIDLQVPSSESKALAITSKAPPAKDGAPRRSLNLEDYKKRRGLI	408216	347188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_348126_348371_348484_349384_349481_349949_350028_350979_351038_351224_351347_352303_352382_353176_353285_353383_353472_354825_354909_356011_356190_356700_356837_364477_364590_365264_365380_375773_375979_377896_378045_394664_394776_408022
883298	contig_10749_pilon	-	2601	13	Intergenic	novelGene_133436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1615.78382036913	168	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1038	1985	155250	137351	TRUE	25	AATTAAGATGTTTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRSVSF	156287	135749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_137271_137367_142194_142365_143587_143644_145189_145263_146512_146555_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
883299	contig_11815_pilon	-	2734	4	Intergenic	novelGene_50928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1831	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1748	2110	299755	299393	TRUE	15	CTCCGACTCGACGACGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLCFIGGGGRLDPAMPFLVFNLGCCFAGLLAISAQDAGFGGAMVAGGKLLEATMLLVIDPLPTAEPTTFGTLLATSVLPNFSAAIPWSIVFMPGALFRVSLAKADCPSIMAPPKELGA	323748	294716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_294926_296005_296090_299061_300649_322894
883300	contig_13021_pilon	+	3627	13	Intergenic	novelGene_8128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2491.79715377387	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	219	1439	174676	178735	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174134	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174217_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440
883301	contig_4891_pilon	-	1498	5	Intergenic	novelGene_124600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	117	junction_4	451.173192909331	19	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	27	353	964296	940000	TRUE	5	GTGCTTTATGCTGGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASVAAAAMGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPNATLVFDVELLKLE	964322	937426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_938536_939963_940129_943507_943621_964127_964176_964259
883302	contig_20719_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_140579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200655	198380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_198400_200700
883303	contig_12046_pilon	+	905	8	Intergenic	novelGene_83499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	151	junction_2	274.412842562562	1918	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	106	903	955093	1002246	FALSE	40	AGCTGAAAAGACTGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASGRFESAKSIEERKEQTRIARAEVLRQAKDNFEKEERCKELKRLRGEDTWMLPDVNERIEQFSQEHSVKKKKKKDKHSKKVKKEKKKKSKKQKYEKNESADNSSSSEDEWVEAVPSQTPSKEKAWKVKDEKSRKEEDSEVIQRDEWMTVDFMSVKTVSLSSLKAEKETIRKIEQEKAQAVEQSRLLERELNPYWKDGGTGLPPEDCNVSSVTKVSVVEDGGLSWLTKSYQRMKEQAEKQNRNFEDIVAERYGSMEIFQLKLK	954987	1002248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_955186_962293_962405_963932_964053_983545_983660_984635_984756_990041_990136_997169_997286_1002216
883304	contig_2463_pilon	-	2970	3	Intergenic	novelGene_43029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2646	2957	522976	516959	FALSE	40	CCATCATCACAAAATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRIGYFIFLSVARLSWSLDISGSYASMTSVPLWSKNLAMDLVNSASRCCFVLPLMKVSFRVYLSSYLLRLEDSCQISSGSIPVGSFLWATRKMLFSLYEV	525690	516945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_517070_522775_523662_523730
883305	contig_12080_pilon	+	2635	1	Intergenic	novelGene_128333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2570	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCCAAAGGTTCACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43898	46533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_43900_46500
883306	contig_12079_pilon	+	3524	14	Intergenic	novelGene_67450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	1354	2184	581102	586025	TRUE	0	CTCGGGCCGCCCCGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWVLLLSSLAWDNSLVKVCSLPLHALILLGLGDPLLLIAVVHDALTGELGAVACVLGALLLQVVLDVVIHRLIHGGRGRRGRCHHQVQLLPGLHQVVLRLFGPVLPFLHLVLLAPPRLFQQGNLGCVLSELRGLLLLALYLIHSLSLQLLLGPQRGPHGQPPSALPPPGHASSPPPAAGLSGSARKVLSRPSWFSAHSPAASASVLPSPASSALSPSQQFLSSSSQFPTVAAPAVSGASPRGPGPSSAAPQWCRACDDACTAHGSPYTAAGSAC	579748	638844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582169_583661_583759_584145_584305_585247_585378_585891_586056_591616_591713_598002_598251_599418_599548_600607_600883_601780_601877_609187_609274_611022_611253_638694
883307	contig_21203_pilon	+	1543	10	Intergenic	novelGene_84470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	277.76208844581	1427	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	255	1541	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	52643	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_52693_53314_53505_53934_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
883308	contig_10861_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_39281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTTGTTTTTATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354984	1353141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1353100_1355000
883309	contig_10990_pilon	+	6154	20	Intergenic	novelGene_7448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_4	399.694779672573	8226	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	2142	4430	723621	752144	FALSE	20	CTTGACGTCGTAAGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708543	753868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557_715994_722232_722433_722635_722699_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
883310	contig_4232_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_63347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	759	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGCAAGAAGGACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
883311	contig_8712_pilon	+	2589	3	Intergenic	novelGene_58804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	17	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	128	478	314974	321821	FALSE	40	TGGATCTTAGAAAACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANASAWRAAASSPSAWTPCRMWTTTVPTAKLSWAPTSVCRTRPTWRRP	311680	323932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311802_314967_315188_321684
883312	contig_16310_pilon	-	1442	6	Intergenic	novelGene_70040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1397.10623790748	3343	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	154	1050	66135	56545	FALSE	10	GTGCCAGACTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKGGFRGGRGGGGDHKPQGKKTKFE	66288	56152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56616_61942_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
883313	contig_19402_pilon	+	3286	15	Intergenic	novelGene_80779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1685.43354805165	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	624	1196	29462	79139	TRUE	55	AAAAAAAAAGGACTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGRE	23464	146717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70507_79130_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138599_145534
883314	contig_11277_pilon	+	2714	9	Intergenic	novelGene_80308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	115.45067940467	1593	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	118	1155	250372	269500	FALSE	30	ACTCCAAAGTCAGTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248220	271059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
883315	contig_9177_pilon	-	1735	12	Intergenic	novelGene_32573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2164.13322789961	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	116	1480	26442	1968	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKSPETVPATTKAVRAQPAQPQHSPKCLPNPGPGPAQSHCTSPVPSLTPSAFMP	28449	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2127_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
883316	contig_20527_pilon	+	10593	6	Intergenic	novelGene_138592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	1336.10559462941	11546	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	41	703	13547	27453	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSEGEDVSCGRFMGNVTKRPCIRRQNAGERIRVDGKLRDSNNAVIYILAKGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13506	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_13994_14051_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
883317	contig_11986_pilon	-	2911	7	Intergenic	novelGene_69152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1534	junction_1	411.498784931377	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	60	683	518015	507353	FALSE	50	AAATAAATGTTTCAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	518540	505124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494
883318	contig_6929_pilon	-	1666	2	Intergenic	novelGene_139417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	368	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGTTGTCAGCACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132306	127720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_127790_130709
883319	contig_6418_pilon	-	6428	2	Intergenic	novelGene_81215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCAGAGCACGGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355317	1345155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1350057_1353790
883320	contig_9609_pilon	-	7182	11	Intergenic	novelGene_22980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	960	1397	325405	324968	TRUE	20	GTCTCCTACCCACAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIWIKLLYYLSNTTRHIEKEGWNVCIIQSWLIGQERIILVQQNKVSPTVTSSVLRTTGLPESQADWRFDYTAGDSGTQQLLRWSSLLCLMRNTGIRESQGTDLQVKHLYLSLYMSVLNNLISTNPLNLQHFHFLIILLEFDIQS	326364	309933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310029_311496_311590_313098_314431_317882_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406
883321	contig_20614_pilon	+	3610	4	Intergenic	novelGene_107525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63010	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_66206_67449_67601_67866_68042_68861
883322	contig_12837_pilon	+	3345	1	Intergenic	novelGene_57413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	443	856	618882	619295	NA	50	CAACAACAGTAACATTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVKNEMKRIKIYILGISELIWTGTGNFESENHMVYYARKEKLKRNDLAFIVEKNISRPVLKHRPVSDRIISIHLQGKPVNTTIIQIYTPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEVDQTWNQDALIITGDWKVKAHTKKKDL	618439	621784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_618400_621800
883323	contig_4093_pilon	-	2750	7	Intergenic	novelGene_27622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1838.02273743644	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	127	864	69245	41737	TRUE	30	GAGGCAGTGAGTCTTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72550	39776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_40415_40488_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
883324	contig_6488_pilon	-	2341	7	Intergenic	novelGene_44753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	923	junction_6	126.693418227713	2057	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	32	805	193038	182397	FALSE	35	ACAGAGTTGTACATAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAAGARRPRMKKKIQFRVARSEEMAQREEVARTEEMAQSEEMARSEEMTRSEEVSQSEEMAATGLNVTVSHNNEKHNLYVTLQQGTSEPVVQDLAQLVEEATGVPVAFQKLIFKGKSLKEMEQPLSALGIQNGCRVMLIGKKNSLEEQVELKKLKDLEKAVEKIANQLEELNKDFAGIQQGFLAKDLQAEALCRLDRRVKATIEQFMKILEEIDTLILPENFKDSRLKRKGLVTKVQAFLAECDTVEQNIGQETERLQSTNFALAD	193069	180860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_182487_183513_183577_184411_184520_186801_186916_189040_189124_190955_191085_192851
883325	contig_4782_pilon	+	4006	3	Intergenic	novelGene_73602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3417	3788	113009	113380	FALSE	50	TGTTTAAAGCACAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLVPTHLEQKRMKNTKDTSITPRDRNGHINLRLHQPETRRTRWCLATTNDPPDREHNREFLMEQEKSRVQHSNSSKKTRLNGLTETGGTLEDMAPRVSVSPKLKAFPTPTLQTKIRLDYKT	79432	113598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_80714_107975_109015_111912
883326	contig_5794_pilon	-	9318	11	Intergenic	novelGene_69779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	141	junction_10	4509.2948683802	3099	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	58	1191	749501	743712	TRUE	45	GAGGGAACTATTAAGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749558	735492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749429
883327	contig_9177_pilon	-	1639	5	Intergenic	novelGene_32687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACCGTGCTTCTGCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416869	405507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_405553_405912_406015_407996_408074_415309_415791_415935
883328	contig_3747_pilon	+	1957	3	Intergenic	novelGene_24955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10121	junction_1	739	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	193	450	203322	203692	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVKIVICPKPSIGC	203028	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203128_203228_203386_203498
883329	contig_10734_pilon	-	3997	13	Intergenic	novelGene_51463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_10	422.410435937476	447	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	225	2036	2305085	2265543	FALSE	45	CACTTCACCAAAGAAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305309	2263581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
883330	contig_17753_pilon	+	4872	1	Intergenic	novelGene_105105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3032	3418	146485	146871	NA	5	TCTTTTGGGTGTGATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	143453	148325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_143500_148300
883331	contig_2799_pilon	-	8175	33	Intergenic	novelGene_85508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1638	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	3253	3750	781803	780209	TRUE	30	AAATTGTGAGCAATCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGSTPRVLCLSGWLNSVCEKFYLCVSERCCSFLGTLKVLSPVTLI	785729	604558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_604830_607923_608056_681360_681435_687150_687272_696526_696898_699189_699244_702702_702769_704623_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302_755438_756997_757116_757722_757864_758459_758712_761266_761394_761506_761624_762147_762398_766300_766385_766967_767147_767272_767354_770116_770313_771764_771926_772372_772444_772914_772960_776041_776089_777674_778125_780117_780451_781547_783245_783918
883332	contig_12414_pilon	+	4231	13	Intergenic	novelGene_59640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2187	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACGTCGCCGTCGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754029	795235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_756659_759115_759319_760668_760804_762804_762903_765743_765875_766736_766903_767635_767693_774262_774353_781926_782108_782791_782911_783428_783460_787131_787235_794947
883333	contig_11427_pilon	+	3503	9	Intergenic	novelGene_78990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1381	1722	588369	588710	TRUE	65	ACAAAAAAAAAAGCTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQMGLACSFCYPSPPILQTWGCRGHHEEPRTAAGETEGIHIPGNLKEQLQQPGLANTVTINHFLFKRPFVVTAKCSPDSHTTHSPLLPISCSCCKVLFSSSSSNDQCAVNA	586988	655883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_589748_592464_592614_597236_597321_597415_597507_598871_598938_601026_601115_623518_623587_655604_655786_655866
883334	contig_17522_pilon	+	7709	2	Intergenic	novelGene_160805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1655	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2454	2819	83819	84184	FALSE	15	GCCCCTGGACACCCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRERKQNKQTNKKKTGKKKCPQGCHCVSAQSKGVSPKLRGTVQQEGAPKPRKEKENNQTNKSKENKSEQTNTQPKKKAPGVPPAGRHGPGSSSTVEQHLAAPQEEAKMAMEPGI	81081	89074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_81472_81755
883335	contig_7963_pilon	+	1166	5	Intergenic	novelGene_58394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	9488	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	67	831	51450	63007	FALSE	5	GCTGGGTGACTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51383	63342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
883336	contig_9609_pilon	-	2328	11	Intergenic	novelGene_22987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGCCGCCTCCGACGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324330	309953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310538_311498_311590_313098_313264_314272_314431_317882_317951_320953_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_324070_324250
883337	contig_8712_pilon	+	1751	5	Intergenic	novelGene_58785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	27	506	314974	322019	FALSE	35	AATTCTCATGGTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDDIQRHSLQAWIQGSPAHP	286994	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_321737_321962
883338	contig_19459_pilon	-	1425	9	Intergenic	novelGene_59827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	7906.54299852344	17182	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	103	582	16240	11160	TRUE	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKPLKREISFR	19066	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_10989_11190_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
883339	contig_20199_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_82519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41229	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40600_41200
883340	contig_15105_pilon	-	1253	7	Intergenic	novelGene_151013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	333	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	37	756	839916	828849	FALSE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQN	839952	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828854_829345_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
883341	contig_7151_pilon	-	2820	5	Intergenic	novelGene_40771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1006.72861288433	5	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	295	720	551063	529325	FALSE	25	TCTATATATACTATTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQILA	551357	527224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_535501_535654_536388_536494_549638_549729_550996
883342	contig_312_pilon	+	2357	13	Intergenic	novelGene_128303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_10	244.371458485279	1260	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	86	1408	402673	440781	FALSE	15	CTGTGTGAGCAATTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGDFVAAGARRAVEFKPRESGTAAGALSMARLVLSLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKVATALKDIVKVGAVDADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRAEDYQGGRTAEAIVDAAISAVRQLVKDRIGGRSGGYSSGRQGRSESSSKKDVIELTDDTFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAATEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLANRYGIRGFPTIKIFQKGEPPVDYDGGRTKSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIISEDIAKKTCEDHQLCVVAVLPHILDTGATGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	402587	441730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415_409558_414598_414657_415103_415231_424174_424282_428888_429020_429396_429512_430056_430198_433659_433745_433872_433946_435041_435201_439433_439531_440712
883343	contig_9363_pilon	-	2090	15	Intergenic	novelGene_6637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_10	533.303910753043	1562	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	70	1635	893500	883303	FALSE	20	CTTTTTAAGGACATGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNDYTQQATQSYGAYPTQPGQGYSQQSSQPYGQQSYSGYSQSADTSGYGQSSYGSSYGQTQNSYGTQSAPQGYGSTSGYGSSQSSQSSYGQQSSYPGYGQQPAPSSTSGSYGSGSQSSSYGQPQSGGYGQQSGYGGQQPSYGQQQSSYNSPQGYGQQNQYNSSSGGGGGGGGGGNYGQDQSSMSSGGSGGYGNQDQGGGGGYGGGQQDRGGRGRGGGGGGGGGGYNRSSGGYEPRGRGGGRGGRGGMGGSDRGGFNKFGGPRDQGSRHDSEQDNSDNNTIFVQGLGENVTIESVADYFKQIGIIKTNKKTGQPMINLYTDRETGKLKGEATVSFDDPPSAKAAIDWFDGKEFSGNPIKVSFATRRADFNRGGGNGRGGRGRGGPMGRGGYGGGGGGGSGRGGFPSGGGGGGGQQRAGDWKCPNPTCENMNFSWRNECNQCKAPKPDGPGGGPGGSHMGGNYGDDRRGGRGGYDRGGYRGRGGDRGGFRGGRGGGDRGGFGPGKMDSRGEHRQDRRERPY	893569	882847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_883343_883632_883781_883939_884041_884404_884529_884660_884763_884969_885100_885502_885607_886208_886242_887731_887767_889375_889599_889804_889996_890182_890325_891696_891852_891937_891963_893487
883344	contig_9609_pilon	+	6732	21	Intergenic	novelGene_22999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_20	230.357651272972	489	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	5414	6232	328876	332820	FALSE	40	ACCTTGAAAAATGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	310633	333320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_311591_313099_313266_314274_314431_317882_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
883345	SIRV6	+	1306	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	126	3	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTTTGCCGATGCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
883346	contig_10930_pilon	-	2871	2	Intergenic	novelGene_37067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCTGCTGTTTTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289048	286013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_286243_286406
883347	contig_4531_pilon	+	4550	3	Intergenic	novelGene_47951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1609	2094	896920	992050	TRUE	40	TAATTCAACATGACCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKESTRKLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFIITPKKLKYLGLNLTRDVKDLYKENCKTLLQETQRDLHKCKNIPCSWIGGLNIVKMTVLPKAIYKYNAILIHHEDIPIVNIYAPNDKAPKYINSNSTEKKLTVQQ	895311	1013375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_897296_991940_992721_1011589
883348	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
883349	contig_16999_pilon	+	3457	13	Intergenic	novelGene_84961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	114.342565224951	22	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	562	1389	81649	189898	FALSE	30	GCACGTGTAACTTTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSCPEPSVAAWFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTADARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQRKAQPAQPSDEPAEKADEPMEH	50603	191966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_73925_74018_79797_79986_81568_81688_174439_174485_174760_174863_175244_175349_182566_182656_183734_183806_183921_184052_185263_185344_188357_188469_189841
883350	contig_9468_pilon	+	8047	14	Intergenic	novelGene_59459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	293.433298369009	1686	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	372	2642	172913	207089	FALSE	35	TATCCCAGCAAGTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKMTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	150687	212494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150989_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
883351	contig_9471_pilon	-	8206	14	Intergenic	novelGene_21747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1041.31333778821	4360	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	323	1582	445281	434615	TRUE	25	CTGTTTCATTTTTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELVAEQAIKHLKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEGD	446806	267828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_268821_290260_291020_429741_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
883352	contig_12312_pilon	-	4975	2	Intergenic	novelGene_63931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1024	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGAACTTTCCAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215558	210462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215311_215431
883353	contig_16103_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_118835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	5186	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	65	754	743628	723303	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLSPEIPTGLGAEHLWEQHLRETEHSSANVFRSLL	743692	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723405_733548_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
883354	contig_9297_pilon	+	3416	8	Intergenic	novelGene_69866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	287.817827871757	1888	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	237	2201	909195	912790	FALSE	30	CAGTACCTACTGGGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908958	914005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
883355	contig_3737_pilon	-	2745	3	Intergenic	novelGene_178336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1496	1816	239746	239426	TRUE	20	AGACCGCCATCTTGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKATPAAHKRHPRSRPPQRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQDVISAAAQT	321834	121034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_-_121806_239267_240257_320849
883356	contig_7056_pilon	-	4840	15	Intergenic	novelGene_43704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.49960752347276	460	22	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	195	350	946475	941211	TRUE	25	AGGTAGGCCTTGACAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPARVLRCCSCRLFQAHQVKKSLKWTCKACGEKQSFLRDYGEGSGADCRRHVQKLNLLQGQISEMLLRSLEEPVNASEEESAGHQQAENVSLQVLDKLCLLLPRWLPVCTKPSGA	960580	926312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_926488_928592_928689_929209_929306_929399_929440_929533_929676_930554_930634_935326_935552_935850_936041_936991_940249_940913_941072_941178_941280_944191_944268_946464_946554_952294_952355_960524
883357	contig_6871_pilon	+	1394	11	Intergenic	novelGene_21516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	372.20026867266	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	193	1371	54514	72196	FALSE	5	TGGTGTTATGTGGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRPSYAPPPTPAPATQMPSTPGFVGYNPYSHLAYNNYRLGGNPGTNSRVTASSGITIPKPPKPPDKPLMPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRLCGLKVEVDMEKIAAEIAQAEEQARKRQEEREKEAAEQAERSQSSIVPEEEQAANKTEEKKEDESIPMETVWQRKEPVTVTLAQRATVQQWKSHQQIPCQKMRKKNKCCLVLCILNTFFK	52251	72219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_52398_54467_54521_54695_54740_57960_58066_63387_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898_69001_69656_69868_72044
883358	contig_6946_pilon	+	3324	4	Intergenic	novelGene_59780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	805.253169299362	4695	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	296	691	439173	451444	FALSE	15	CAACTGTGTTTGTCTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADYIEDDNPELIRPQKLINPVKTSRNHQDLHRELLMNQKRGLAPQNKPELQKVMEKRKRDQVIKQKEEEAQKKKSDLEIELLKRQQKLEQLELEKQKLQEEQENAPEFVKVKGNLRRTGQEVAQAQES	430882	454077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_431122_439116_439301_450624_450776_451327
883359	contig_5686_pilon	+	6091	1	Intergenic	novelGene_45353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1777	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3013	3330	132358	132675	NA	15	CTCTATTCTCTTCAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLCKQQTFGLSLQISVLFYYSLYSVCWGKSKKLKRRQKSKTIFLLFWEEMVIEAKVRFIYTMGAPRGNGRFDFPVGLPLHWWLRAGPCACEQLLYQGYFHLPS	129345	135436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_129300_135400
883360	contig_4421_pilon	-	2774	2	Intergenic	novelGene_177251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1793	2092	274858	274559	FALSE	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEKNAKINSQLEIMQTHRLEIQKVNNKISEMDGVIEGLRSRFETMEDRNSGIEDKHLDATLFAENSEKRTQKNEETLRVLWDTIKSKNFRVIGIPEQG	276995	273876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4421_pilon_-_276257_276601
883361	contig_3525_pilon	-	4205	4	Intergenic	novelGene_135131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1198	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTTTTTTTAATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654193	546597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_548423_568735_569407_651663_652956_653776
883362	contig_18272_pilon	-	8655	1	Intergenic	novelGene_7076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1086	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	4023	4502	526189	525710	NA	85	AAAAAAAGAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFICPKDSLQIITISGSKHWDGSASCCFQRKPVETGSLCLPRFLKKKCFKETNREAISSYYVATFYGWQKIKKTCHKANASEDKDGKNDVQATQTGFCCQAVSSLSGNFPPQCSTVLPINFPSISEQHVNPSLHGDHQVHPRGSLGSTTQHSRVLPSS	530211	521556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_521600_530200
883363	contig_17753_pilon	-	3338	2	Intergenic	novelGene_105110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	1	7	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	101	412	148219	147867	FALSE	15	CCCTGGCCAAGGGCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLFIHSDSDHWKFLTINTAGAKEGGLLLTSFKMHPDLTLSCEANTREAGRREKPDCKTPTTKQTGLRRRKVLKKLWLREGIQGGADAILHKKGMRPSSSRRGGAPDPGAGLLTQARDKADVWAQDHLQVSDSVLC	148319	144940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_147937_147977
883364	contig_4654_pilon	-	3134	7	Intergenic	novelGene_103088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	927.616554521437	85	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	191	673	500418	496972	TRUE	20	ACTAGATTTGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQRALVVQWLKRSAVNQKIGS	515980	492661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493455_493523_494533_494873_494970_496408_497031_497816_497941_500118_500422_515793
883365	contig_11160_pilon	+	3493	2	Intergenic	novelGene_168827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2711	3022	322577	322888	FALSE	20	CATCCCAGCTAGCATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFISGPCSWKKVIIWTVKGISWLFPLVIRCIPVLAGWLVAGRPGGVWRACESLSGSRGRRGSQGSAFSLGHPRNNCSEWEGPLPACGRQPVRAELEVGESHC	318188	323359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318966_320643
883366	contig_5020_pilon	+	1475	8	Intergenic	novelGene_27847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	915.526613262464	30	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	363	1160	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122939_123182_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
883367	contig_11896_pilon	+	7449	1	Intergenic	novelGene_88000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8474	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	6352	6912	138336	138896	NA	30	AAGAGTTCCATTCAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFCSGRGSEPALDPLHSPLSLLISDSLGTTECSRVASSLFPFGARSATRESFLEFLRVDSDVHTGAAPWCSCSCRKRSSNSNVARLTEPGHHLAPGCISGLRSSCSPSAGSSSSKSAVNEHVVRQPSGSHFPESLASSGWAAQEPLFCSRFPGLFSRAWALSMGSSWMVFFFGVWHGLGRTSPFS	131984	139433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_132000_139400
883368	contig_4364_pilon	+	1916	6	Intergenic	novelGene_643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	45	GTTAAGGAGAAATAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1533285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
883369	contig_14005_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_154726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTCATTTTCCTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14597	16145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_14600_16100
883370	contig_8204_pilon	+	7618	7	Intergenic	novelGene_176995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.634166890345	565	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	3	1730	18967	63532	FALSE	25	TAATGTGTGGAGCAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGPFQSQKKNLFHKIVSKYKHKKEKPNVPEKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEVTDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	69420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_43538_43629_45005_45066_57893_58087_63444
883371	contig_9177_pilon	-	14014	77	Intergenic	novelGene_32607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_17	1528.78910676522	10198	213	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	11099	13582	9494	2152	FALSE	15	TACCTGTAACCTCTGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	46084	1719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9024_9156_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13694_13890_14089_14296_14417_14811_15111_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21127_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759_33247_33457_33596_33696_33845_33920_33989_34096_34193_35241_35348_35448_35521_36142_36225_36322_36409_36491_37542_37808_38001_38095_38212_38304_38448_38596_38704_38823_38976_39077_39186_39396_39502_39729_39903_40109_40236_40323_40478_40637_40741_40988_41229_41533_41753_43877_43994_44201
883372	contig_11396_pilon	-	3593	1	Intergenic	novelGene_71318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1727	2146	451038	450619	NA	60	AAAAAACCTCAAACAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARLQGAGTLMHCWWECKMVQPFWKMILHFLKKLEIPFDPAIPLLGIDPRKIRNVTQINIFTAALFKTAKRWKQPRCPSTEWINKLWYMHTTEYYTMIKNNDKSAKHLTIWVNFEGIMLSEKSQSQKDKYCRRPALVI	452764	449171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_449200_452800
883373	contig_1715_pilon	-	1825	10	Intergenic	novelGene_127187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_4	267.676744425385	31	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1473	352	1824	312293	252372	FALSE	65	TAAGAATATCAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSWQDELAQQAEEGSARLREMLSVGLGFLRTELGLDLGLEPKRYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIAAWSSVDRGMNTSEKNSASFASLTLNSAVSGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQ	312644	252370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252480_256575_256701_262484_262584_265651_265742_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
883374	contig_6915_pilon	-	3364	1	Intergenic	novelGene_162408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCGAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179566	176202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_176200_179600
883375	contig_2596_pilon	-	5354	6	Intergenic	novelGene_53517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_1	248.38679514016	1628	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	1921	2817	1053762	1052866	FALSE	25	AATGGGTGAATTGTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPMLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGVHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQRQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSQSQELTSEIGAHPPVLSRSQELTSEIGAHPPVLSRSQELTSEIGAHPPVLSRSQELTRESKVWSYIITSSHTSGAFLKSIEQ	1120689	1050328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
883376	contig_11307_pilon	+	1733	2	Intergenic	novelGene_105245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGAGGACCCCCGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85280	87570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_85388_85944
883377	contig_16103_pilon	-	1966	7	Intergenic	novelGene_118826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4138.54609803438	539	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	275	577	735970	723671	FALSE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESKCSELEEELKNVTNNLKSLEAQAEKPSWKRQLTIWKIN	742928	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733331_734314_734391_735661_735733_735856_735975_737495_737630_742792
883378	contig_7207_pilon	-	5122	23	Intergenic	novelGene_72054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_22	254.79916333529	3367	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	906	2721	840	3560	696514	643417	TRUE	35	TTAATGCGGGACATCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQAYINEKHYKKIPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPRHVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSFRIFSKGASEIILKKCFKILSTNGEAKVFRPRDRDDIIKTVIEPMASEGLRTMCLAFRDFPAGEPEPEWDNENDIVTGLTCVAIVGIEDPVRPEVPDAIKKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILHPGEDFLCLEGKDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVSEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQEKSFLILIVEEMLLCMLLLRNIILLFLIPLC	758015	627624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_628780_637109_637293_639627_639736_643300_643513_644422_644615_649857_649965_650325_650414_651074_651255_656875_657114_659130_659373_660702_660946_663524_663740_665433_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_746740_746860_757787
883379	contig_17440_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_7559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCAAAGTGGTCAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887	1411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1400_1900
883380	contig_8420_pilon	+	2655	14	Intergenic	novelGene_69328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_12	235.812306267044	1985	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	80	1723	10943	51079	TRUE	10	GTTGTTCAGGGCTCAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10863	59375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
883381	contig_5059_pilon	+	5941	21	Intergenic	novelGene_140749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_8	225.607507632171	283	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1270	3813	843	4655	414332	552919	FALSE	15	GATTTAGCCTGGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERKKPANMEEKESLLNNKEKDCSERRPVSSREKPKDDIKLTAKKEVIKVPEDKKKKLEEDKRKKEDKERKKKEEEKVKAEEELKKREEEEKQKYEEEERKKQEEQAKRQQEEEAAQLKEKEESLQLHQEAWERHQLRKELRGKNQNAPDNRPEENFFSRLDSSLKKNTAFVKKLKTITEQQRDSLSHDFNGLNLSKYIAEAVASIVEAKLKISDVNCAVHLCSLFHQRYADFAPSLLQVWKKHFEARKEEKTPNITKLRTDLRFIAELTVVGIFTDKEGLSLIYEQLKNIINADRESHTHVSVVISFCRHCGDDIAGLVPRKVKGAAEKFNLSFPPNEIISPEKQQPFQNLLKEYFTSLTKHLKRDHRELQNTERQNRRILHSKGELSEDRHKQYEEFAMSYQKLLANSQSLADLLDENMPDLPQDKPTPEEHGPGIDIFTPGKPGEYDLEGGIWEDEDARNFYENLIDLKAFVPAILFKDNEKGCQNKDASKDDSKEAKECKDNKELPSPDELELELENLEINDDTLELEGGDEAEDLTKKLLDEQEQEDEEASTGSHLKLIVDAFLQQLPNCVNRDLIDKAAMDFCMNMNTKANRKKLVRALFIVPRQRLDLLPFYARLVATLHPCMSDVAEDLCSMLRGDFRFHVRKKDQINIETKNKTVRFIGELTKFKMFTKNDTLHCLKMLLSDFSHHHIEMACTLLETCGRFLFRSPESHLRTSVLLEQMMRKKQAMHLDARYVTMVENAYYYCNPPLAEKTVKKKRPPLQEYVRKLLYKDLSKVTTEKVLRQMRKLPWQDQEVKDYVICCMINIWNVKYNSIHCVANLLAGLVLYQEDVGIHVVDGVLEDIRLGMEVNQPKFNQRRISSAKFLGELYNYRMVESAVIFRTLYSFTSFGVNPDGSPSSLDPPEHLFRIRLVCTILDTCGQYFDRGSSKRKLDCFLVYFQRYIWWKKSLEVWTKDHPFPIDIDYMISDTLELLRPKIKLCNSLEESIRQVHDLEREFLIKLGLVNDKDSKDSMTEGENLEEDEEEEEGGAETEEQSGNESEVNEPEEEEGSDDDDEGEEEEEENTDYLTDSNKENETDEENTEVMIKGGGLKHVPCVEDEDFIQALDKMMLENLQQRSGESVKVHQLDVAIPLHLKSQLRKGPPLGGGEGETESADTMPFVMLTRKGNKQQFKILNVPMSSQLAANHWNQQQAEQEERMRMKKLTLDINERQEQEDYQEMLQSLAQRPAPANTNRERRPRYQHPKGAPNADLIFKTGGRRR	413489	554205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_414694_420161_420942_431285_431447_443420_443619_459480_459631_465491_465596_472837_472924_486534_486644_493599_493714_495906_496024_500139_500326_502769_502974_503480_503757_506354_506539_514291_514432_518588_518691_518994_519094_522752_522921_546644_546787_548164_548286_552909
883382	contig_7050_pilon	-	1074	7	Intergenic	novelGene_153610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.219788359652	1387	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	214	663	677188	585724	TRUE	15	CTCTCACTTCCCCTTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGGVAPAGEGLRYAEYSPPSARRPDADIDPGLARSLIAVGLGVAAFAFAGRYAFQIWKPLEQVITETAKKISNPSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGGSPYLATKINEAKDLLESSTKH	677401	578765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_578885_585431_585795_631905_631977_637860_637938_651778_651853_654330_654383_677083
883383	contig_11160_pilon	+	2268	4	Intergenic	novelGene_168822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	717.006276123159	58	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	294	713	318478	320483	TRUE	20	AAATGTTTTGTAGTTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318184	322393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319184_320262_321729_322083
883384	contig_14577_pilon	-	3103	20	Intergenic	novelGene_164637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_15	275.164116226527	2761	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	206	2326	127106	50623	FALSE	50	AGTTGGTGTAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPVMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL	127311	49845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66718_67034_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
883385	contig_15518_pilon	-	7743	5	Intergenic	novelGene_127578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	4275	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3378	3806	38282	16009	TRUE	20	CGTTCATTTCCTTATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILICLGNLTFSHTLGKWSESVLKSSDGDFALEALSTVRRNSRRVCTGRFPEQGGTWSRVCGSCHQTSSLRLGHQRRKEGASGLLLPVDIDGRDTNHQQHLEAYKEASGGSELQGQVFGDCCLPVMHHLAGEHHILSVGR	41659	10507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_12061_13445_14349_14527_16108_37305_37387_38033
883386	contig_4103_pilon	-	1832	3	Intergenic	novelGene_51938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGCCTCCTAGTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96002	92168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_92279_92396_92506_94389
883387	contig_7839_pilon	+	3234	16	Intergenic	novelGene_45747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_11	190.113954131609	2703	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	279	2687	1079288	1129773	FALSE	20	TTTTTAATACCTCAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIMIKGGVWRNTEDEILKAAVMKYGKNQWSRIASLLHRKSAKQCKARWYEWLDPSIKKTEWSREEEEKLLHLAKLMPTQWRTIAPIIGRTAAQCLEHYEFLLDKAAQRDNEEETTDDPRKLKPGEIDPNPETKPARPDPIDMDEDELEMLSEARARLANTQGKKAKRKAREKQLEEARRLAALQKRRELRAAGIEIQKKRKKKRGVDYNAEIPFEKKPALGFYDTSEENYQALDADFRKLRQQDLDGELRSEKEGRDRKKDKQHLKRKKESDLPSAILQTSGVSEFTKKRSKLVLPAPQISDAELQEVVKVGQASEIARQTAEESGITNSASSTLLSEYNVTNNSIALRTPRTPASQDRILQEAQNLMALTNVDTPLKGGLNTPLHESDFSGVTPQRQVIQTPNTVLSTPFRTPSHGSEGLTPRSGTTPKPVINSTPGRTPLRDKLNINPEDGMADYSDPSYVKQMERESREHLRLGLLGLPAPKNDFEIVLPENAEKELEDREIDDTYIEDAADVDARKQAIRDAERVKEMKRMHKAVQKDLPRPSEVNETILRPLNVEPPLTDLQKSEELIKKEMITMLHYDLLHHPYEPSGNKKGKTVGFATNNSEHVAYLEHNPYEKFSKEELKKAQDVLVQEMEVVKQGMSHGELSSEAYNQVWEECYSQVLYLPGQSRYTRANLASKKDRIESLEKRLEINRGHMTTEAKRAAKMEKKMKILLGGYQSRAMGLMKQLNDLWDQIEQAYLELRTFEELKKHEDSAIPRRLECLKEDVQRQQEREKELQHRYADLLLEKETLKSKY	1079009	1130320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1079333_1082113_1082218_1083655_1083818_1086346_1086475_1087916_1088017_1096616_1096836_1098213_1098359_1099234_1099424_1104874_1105024_1106679_1106843_1109437_1109603_1110873_1110955_1111248_1111492_1116872_1117071_1128704_1128918_1129668
883388	contig_9995_pilon	+	4581	3	Intergenic	novelGene_47708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	2987	3787	514328	515128	TRUE	30	TCGCGATCACTAACCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKRIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHLFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTNPLRTGIRQGCPLSPLLFNIGLEVLARAITQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFIIAPKKIKFLGINLTRDVKDLYKENYKHYCKKPKRIDIDGKT	331395	516006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_331404_511349_515239_515322
883389	contig_2078_pilon	+	2658	6	Intergenic	novelGene_100135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	103.898026930255	369	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	31	1032	266439	311030	FALSE	60	GATGGAAAAGCAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266408	312656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308836_308962_310937
883391	contig_11564_pilon	-	2120	2	Intergenic	novelGene_158535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	251	652	41091	40690	FALSE	45	TGTTCACAAAAACCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQQIRLSVLRCGNKNKAPVWLPLSSPFLFFPQHLPPYPTFLPLSVSFQNCSIRHLGLGILPSPATSQTCRPLCCFMLHMSCSLPDFPPQPQPLVIAWHQHLRNCWQKALNCGRNVHTTEYPSLEDKPPIRL	52182	39221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41253_52093
883393	contig_9363_pilon	-	2213	5	Intergenic	novelGene_6741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	791	junction_4	78.2859342410883	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	153	533	1509135	1506537	FALSE	35	AAGCCTGGCATACAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1509811	1504856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767
883394	contig_593_pilon	+	3578	6	Intergenic	novelGene_101982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_4	904.124106525205	2477	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	42	851	146142	152494	FALSE	65	TACAACCAAAAATTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRELRVEGLGGWDMADFDGPAKPLLSLNPQEQAKFQKQVAQVRRRATQQKKLTPGVVYVGHIPRGLFEPQLKAYFSQFGTVTRLKLSRSKKTGNSKGYAFVEFESDDVAQIVAETMNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQGSTPVCTPTFLEKRKSEVAKMNDDDEDNEITFKQPVVGVRAEIQETQTPTRSGKRRRRKSKQ	146100	155221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148891_149001_151208_151421_151590_151657_152305
883395	contig_2078_pilon	+	2025	6	Intergenic	novelGene_100132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	88	junction_4	76.4109939733806	2357	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	8	1072	266397	311030	FALSE	30	CAATGCATACCTACCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266389	311983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
883396	contig_854_pilon	-	7139	33	Intergenic	novelGene_36492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1497	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2773	3360	1706853	1702673	TRUE	10	TCTGCGCGCCTCACCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1717625	1612770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612925_1649492_1649847_1656036_1656198_1672788_1672896_1677513_1677608_1678130_1678196_1678749_1678848_1679248_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709528_1715229
883397	contig_15327_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_70605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTGATCTTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900495	898554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_898600_900500
883398	contig_13282_pilon	-	3962	5	Intergenic	novelGene_178164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	820	1419	95164	94565	TRUE	50	CCCCGAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTLDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFTENAGQKFEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTQFQENSEKRTKKNKETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLAIQNAQ	96579	2635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13282_pilon_-_3839_4133_4628_4796_5145_94066_95856_96451
883399	contig_11277_pilon	-	2744	9	Intergenic	novelGene_80311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	331	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACACAATTCCCCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271075	248283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_-_248372_250331_250500_254696_254798_255953_256066_256491_256635_260594_260702_266763_266956_267436_267610_269415
883400	contig_8674_pilon	+	7235	3	Intergenic	novelGene_102931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	528.5	1680	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1799	5400	1345	6744	451273	460416	FALSE	45	AAATAAACATTTATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWNAKPESATMPSSYPKSQSSFLQQALINPLASASQSSFNYPGSNQEACMYSSNSNLISQPLLNIKNYTTPQQISVSDMHNGANVASQTSVERKTYVNVQGPKQLNHNLQMSSGVAQNAWLNSQMRNPMLSHTGTTVVSNQTGVTVVSNQTGFGANRSNINTLQNQFIPSDTYSLQLQTIPSNSVRVPVTYQGNQGLNPSLSEQQVDWAQHCTANGLIFPDNSSLPKQYCYSQQGFLQDTALQKRNPMLSALLEVKNSQFPNPALSLQLQQNAAVQSHQYAVTQIDNRPPPPSYDCIYARQPLQNTQQVSKHSPMEVPQNQETHLPEVLKDLCSGFQQQWQNPNKGINTIGNFCNLKVNGKVSTNGNFCNLKVNGSVNQPANKPVRSLVDGVQTFAQNNKDKRMDSGSSTSNPILDTNVTKEGLVRDIKKLVDTRKKLLELARKIKINQNILMAAGCSKATNTSHSESAQNSELSLKQTSKIQSGSQVTPVTPEISEGQQSTVMKSAEEANRTHCTLNPNIHDINCKKSNQGNSILLNSDCSEKLAMPDQFHDLQALTSLKTSTVEITQTTLNNTQLSSENVRDDQNLSTDSKTITAPQSVLFQEYVSKYPNKNTLLRFLMPREKTKNESVKNVNETIQDPKPKSFEMNQNTQISGDLPNLKTMETQSTCNINAKASDKSCLLDYKPSTNGMSSKSDSHCSMELLATCLSLWKKPPSEPTEEKHDESRTNRTTSHISKPVEVYDKSPCAVVGPSQNKMFNNSEQETALPMVVQNYESAGANTTKGSELQIAVVSPLILSDVKTISVKGITPEALPEIMYPVIKEGSVCSLQDQLAENMSVSPLKANVSELVASTTSSTKISPLIQKEKQDKSTNCNLEGVPNTNQGKHIKSKSHVHSSPNVDTLICPDVSGNQQVLDESRGSTVVSGDTLQIANICSLVEGDISYNSQIAKIFNSPYLDKVEPQKPCLPDHQVISCRQQKEQLDKTTENKNFGFQKEKIVQVTDVSPKITHQPESLPPSESSLKNVKANGEILEENKLECITNKEIMTSNMYCSAAIQQDSPEIDAPCNYISQDPTSSEIFSDKTSLLYLHDQLSELLKEFPYGIEAVNSREGSAGQQITEQVKNQSYDKTSCDSKDSTSTDQIKITIISSEQMKELFPEQDEQPSDGDKLTEPQKEKPITKVESQCDPKAHTEGESHDSVVSNLKRDDIHCCALGWLSMIYEGVPQCQCNSMKNSASEEEKKSHCSALETNRCKQGERTSDRDIPGVECNRSPNKDLKTPLILPDGKNSFPEIKQDKNMKDNTETKHSNSLKTEKELPSQFSSKCDKKLDPLQSHKRKRKLQFHEVTFHSSSKLMKFCEQDSQESLQKKHTAQNSRPLKAKTVILTNKDLYKKNGSLIQSISPEKIKLKFRAGGSRYKLLENRKLDQGNIFDMERKKKKYDKREQNKNAGSSFKLCNSLSNLNERTSIKEKTVSIEVKSTNLEINIHRSLMKSSNINSSDSKDISCKINRVMAPKEYLQRQKHKEAIGNKASKKSCVIEKIKNVPCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGNSPLK	444502	460907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_445790_451215_456506_460249
883401	contig_6031_pilon	-	1365	7	Intergenic	novelGene_56768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	777.446175343062	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	101	937	257588	254965	FALSE	20	ATGTACTTAGTGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257784	254536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256375_256704_256814_257469_257613_257708
883402	contig_7230_pilon	+	2382	8	Intergenic	novelGene_52544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGACATCACACTTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132798	177627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_133453_133580_134723_150916_151060_162610_162681_164219_164266_171092_171155_176935_177011_177437
883403	contig_11316_pilon	+	1379	1	Intergenic	novelGene_122631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	240	752	137674	138186	NA	50	ATAAACAACATTCAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137434	138813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137400_138800
883404	contig_10003_pilon	-	10301	14	Intergenic	novelGene_88135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	495	junction_3	784.49100069887	5597	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	3046	4776	473312	374355	FALSE	40	TTAAGTAAAGCATTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKTAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTTPITPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPITSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHSYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFDHDRDYEDEPVNEDME	476357	368829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_374500_380678_380846_385999_386070_387779_387902_391285_391388_391978_392059_392162_392365_402817_402902_416834_416923_430739_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195
883405	contig_7457_pilon	+	4653	24	Intergenic	novelGene_31485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_6	257.302202556553	725	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	174	2525	641631	669784	FALSE	40	CTGTAAAAATTTATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPNRILDEHPSLVFLLPVCWERPRGLREPRGPHPGPSAASACRASAGETVGTPDSSRMAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGGKSILETLKSSVENMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGNGGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKEGGITFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSNTIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMDLTSECATSPM	612241	671912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_612392_641607_641759_642572_642718_643349_643449_648697_648794_648955_649077_649226_649322_649492_649645_651964_652124_652278_652372_653188_653249_658208_658239_658337_658432_658533_658582_660732_660817_661554_661654_661789_661926_662947_663001_663253_663349_663458_663599_664102_664316_668470_668514_668793_668907_669728
883407	contig_6137_pilon	+	14609	20	Intergenic	novelGene_59167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	1242.94384716375	4824	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	773	2248	1328176	1353702	FALSE	50	GGAAAAAAAAAATTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1239045	1366063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
883408	contig_8377_pilon	+	4656	32	Intergenic	novelGene_34915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3243.76161760414	834	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1157	3474	378	3851	131448	197939	FALSE	35	TATTATTTATATTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68057	198744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128871_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183372_185759_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
883409	contig_16125_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_155293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	19	60	240	299	227421	227362	NA	80	AAAAGAAAAAGAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRHEENISPRDRKGHRNQRFHEPETRRTRWCLATTNDRPDREHNRESLTEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGLTPEDMAPGLSVIPELKPFPKPTL	227660	225355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_225400_227700
883410	contig_17144_pilon	-	1947	12	Intergenic	novelGene_29212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1707.30448222961	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	567	1652	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173663	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173168_173424_173460_173580
883411	contig_5779_pilon	+	5416	2	Intergenic	novelGene_106474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1962	2360	280705	281103	FALSE	20	TCCACGTGTATGCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKSTNKRNSAQESKRNKENISTTKKALQNAIPLLGIYPREIRAITRIDICTPIFIAALFTTAKRWKPPRCPSTDEWINKRWYIQTTEHYAKIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	136206	284159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_137925_280461
883412	contig_1143_pilon	-	4368	2	Intergenic	novelGene_86621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	3989	4366	947065	946688	FALSE	15	TAGCCCTGGCCCTGACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKIRTELNEKEKQLKESTRPKAASLKRSTKSINHWPSRQEEQERKQITQTRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLTQTEVEQLNKPITKKEIEKVIKKLQTK	980664	946685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_948128_977738
883413	contig_10437_pilon	+	1606	9	Intergenic	novelGene_38288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	998.993743724154	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	308	1075	440148	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431115	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439781_440133_440169_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
883414	contig_610_pilon	-	6615	1	Intergenic	novelGene_76776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4031	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	5456	5947	232794	232303	NA	60	CGAAACCAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSTRKLLELMGEFSTVAGYKVNKQKSTGFLYTSNEESEREIREITPFTIASKRIKYLGTNLTRDVKDLYNENYKTLLKENKENLKKWKDVSCSRTGRLNIVKMSMQPKPIYRDNTITIKILTDFLTEMEKQIINFIWNGKRPQIAKAMLKEKERSRRTCIS	238249	231634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_231600_238200
883415	contig_4232_pilon	-	3843	1	Intergenic	novelGene_63445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	851	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGCTGGGGCTCTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546398	542555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_542600_546400
883416	contig_17427_pilon	-	2562	13	Intergenic	novelGene_30336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1135.78565563911	39	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	79	1065	188879	179441	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSREDSWAVLAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKERKSRECFQLGD	204739	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179695_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
883417	contig_11512_pilon	-	1252	5	Intergenic	novelGene_43341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	322.693643414307	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567780	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555876_556599_556818_561325_561378_566278_566315_567751
883418	contig_8317_pilon	+	1732	8	Intergenic	novelGene_19254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11138.4392267572	56987	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	65	1453	14294	16506	FALSE	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	13261	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
883419	contig_10793_pilon	+	1395	13	Intergenic	novelGene_83394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3426.39696571583	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	607	984	160548	163940	TRUE	30	TAGTTCTCATAAGGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130871	167273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_147117_159134_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
883420	contig_9406_pilon	-	2059	4	Intergenic	novelGene_136148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1394	junction_2	112.02083139607	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	292	966	39161	34784	FALSE	30	AAATCTAGCACGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	39452	33690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922
883421	SIRV6	+	326	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	244	9	244	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2760	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
883422	contig_6364_pilon	-	3283	4	Intergenic	novelGene_51832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	799	junction_1	519.759559796643	2402	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	738	1184	1604482	1603291	FALSE	50	AAAAGTTTCATAAAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERPEDLNLPNAVITRIIKEALPDGVNISKEARSAISRAASVFVLYATSCANNFAMKGKRKTLNASDVLSAMEEMEFQRFVTPLKEALEAYRREQKGKKEASEQKKKDKDKKTDSEEQDKSRDEDNDEDEERLEEEEQNEEEEEVDN	1605219	1601191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1603467_1603752_1603872_1604236_1604323_1604416
883423	contig_2940_pilon	-	389	4	Intergenic	novelGene_81942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4233	junction_3	6336.9463203239	50	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	51	389	722201	717774	FALSE	30	AGAGCAGCCCAGTTAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCLQRWRPSPIGTMAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVE	723513	717773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720954_722105_722207_723468
883424	contig_9113_pilon	-	2396	5	Intergenic	novelGene_68582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	654.092262222999	1426	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	367	1611	348512	347268	FALSE	30	TGTGACTGGAAATGGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364445	346482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364380
883425	contig_1450_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_27441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGTTTTACTTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423767	425103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_423800_425100
883426	contig_5686_pilon	-	6202	2	Intergenic	novelGene_45415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGGTTTTAAGAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196490	186326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189975_193936
883427	contig_6076_pilon	+	3480	1	Intergenic	novelGene_81737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	520	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGGAGAAAACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53644	57124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_53600_57100
883428	contig_4093_pilon	-	4668	6	Intergenic	novelGene_27605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_5	1863.92300270156	4206	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	143	880	69245	41737	FALSE	10	GTGAGAGTTGCTTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPALPHPGRWRRGGEGPGVLHAGRGAWVRTRSRGPARSCQPEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	71859	37948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_71728
883429	contig_13021_pilon	+	2766	13	Intergenic	novelGene_8145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2493.0695312205	6909	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	170	1390	174676	178735	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174506	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178817_179628_180211_180440
883430	contig_7357_pilon	-	2289	9	Intergenic	novelGene_36800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1921.20056458846	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	859	1407	139820	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167089	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139883_154580_154721_154861_155079_159911_160034_166772
883432	contig_5643_pilon	+	1016	10	Intergenic	novelGene_38847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3030.7674862245	8	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	78	806	236108	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLLAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233634	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233645_236040_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_237199_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
883433	contig_9982_pilon	+	2313	15	Intergenic	novelGene_55728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	123.581935969458	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	386	2020	311199	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	304955	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_305300_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_337965_338123_338220
883434	contig_15089_pilon	+	4302	6	Intergenic	novelGene_178342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGATTCTTTCCAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78937	242656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15089_pilon_+_79102_79153_79214_124179_124441_207017_208315_240092_241467_241510
883435	contig_6291_pilon	-	2769	1	Intergenic	novelGene_164795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385600	382831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_382800_385600
883436	contig_593_pilon	+	1827	7	Intergenic	novelGene_101983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	915.016879018572	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	30	878	146142	152826	FALSE	15	GCCACGCTTGTTTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVEGLGGWDMADFDGPAKPLLSLNPQEQAKFQKQVAQVRRRATQQKKLTPGVVYVGHIPRGLFEPQLKAYFSQFGTVTRLKLSRSKKTGNSKGYAFVEFESDDVAQIVAETMNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQGSTPVCTPTFLEKRKSEVAKMNDDDEDNEITLSCFACFEVVLSCCSNSDEQGTSYRHLYASETSRFLPSQLLMMP	146112	153775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148891_149001_151208_151421_151590_151657_152305_152397_152689
883437	contig_4232_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_63315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	805	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGCAGTCCCCTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466912	468085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466900_468100
883438	contig_11720_pilon	+	1470	10	Intergenic	novelGene_43789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	254	1315	68064	98482	FALSE	25	TATGTTACTGGTAATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGFRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67810	98637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
883439	contig_3747_pilon	+	2508	8	Intergenic	novelGene_24906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	934	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	99	1106	201481	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201382	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
883440	contig_15031_pilon	-	3567	2	Intergenic	novelGene_138421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTCCTTTAAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153380	149354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_152403_152861
883441	contig_16103_pilon	+	1895	7	Intergenic	novelGene_118864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAATTTTAGAAACAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722292	742252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723689_733563_733608_734955_735030_735661_735731_735854_735975_737495_737628_742192
883442	contig_11422_pilon	-	1316	2	Intergenic	novelGene_99067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2358	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1359_1656
883443	contig_9293_pilon	-	1837	8	Intergenic	novelGene_175188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_7	155.107336107244	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	281	1675	86448	13698	FALSE	20	TTCCCCAGCCTCCCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMCSATASPAVVSSGPGGDGFFPAATISSSPAPGAPFMPVSEGSGAAAGLGLGLPAADSRGNYQLLLSGRALADRYRRIYTAALSDRDQGGSSAGHPASRNKKILNKKKLKRKQKSKSKVKTRSKSENLENTVIIPDIKLHSNPSAFNIYCNVRHCVLEWQKKETSLAAASKNSVQSGESDSDEEEESKEPPIKLPKIIEVGLCEVFELIKETRFSHPSLCLRSLQALLNVLQGQQPEGLQSEPPEVLESLFQLLLEITVRSTGMNDSTGQSLTALSCACLFSLVASWGETGRTLQAISAILTNNGSHACQTIQVPTILNSLQRSVQAVLVGKVQIQDWFSNGIKKAALMHKWPLKEISVDEDDQCLLQNDGFFLYLLCKDGLYKIGSGYSGTVRGHIYNSTSRIRNRKEKKSWLGYAQGYLLYRDVSNHSMTAIRISPETLEQDGTVMLPGMLFRWSLFLHK	86728	13535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_13833_15510_15583_15812_16056_21296_21494_25882_26037_34885_35102_44623_44700_86146
883444	contig_10078_pilon	-	3444	2	Intergenic	novelGene_160000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1780	2094	169606	169292	FALSE	15	GCCTTTGCTTTGATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRISGSGDKHLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNL	171695	167941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_170791_171100
883445	contig_10861_pilon	+	3888	18	Intergenic	novelGene_39216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	109.647058823529	3300	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	3421	3888	608945	614438	FALSE	15	CCCTCTAGCCGACGCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCALNSRGHSSPINSLAFFPFKNPVRLICIILESGFFTSSWLNINSITTSSSNPRISVTRFVIQGFITSKFTLLMSTFFSRHSANFSCFSSFFCLLLNRLSCSALVPRKNPASILLPRSEIAPYPTVHRAAATEGGIRRGKAELRDAARASPPA	582487	614438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_583681_585564_585767_587630_587826_588383_588836_590803_590874_593731_593878_596263_596356_596851_596933_603011_603289_603819_603843_605069_605190_605701_605897_606400_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611260_611523_611611_614295
883446	contig_6058_pilon	-	6177	6	Intergenic	novelGene_172387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_5	353.172139331516	29	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	679	1335	390928	385415	FALSE	35	AGGTCACTGAAAACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	395740	380572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659
883447	contig_7009_pilon	+	9114	9	Intergenic	novelGene_23619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	586.669146538319	327	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	177	677	444955	506713	TRUE	25	TGCTTATAGAATGGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGKAWHSSSFSVLEKVPGVLKEANILL	431116	539291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_506372_512816_517991_518118_522866_523002_536325_536672_537095_538537_539004
883448	contig_7182_pilon	-	1199	5	Intergenic	novelGene_117140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	172	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	87	734	889318	887056	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891346	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
883449	contig_14546_pilon	+	3636	2	Intergenic	novelGene_157407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23515	27314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_24037_24199
883451	contig_34_pilon	-	4998	9	Intergenic	novelGene_39974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	942.626508419427	6530	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	59	1501	247052	212049	TRUE	5	CTGTGATTGTGCTTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNDFKRTHLFASLKLQICSSPGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247110	208509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_209683_209724_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243411_246970
883452	contig_14441_pilon	+	1291	6	Intergenic	novelGene_100332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	4	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	28	1251	5836	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LESLSALSAMPGSLTVGRWMQVAPLVRSPPGGRSEHPPQEGPWHCREEGRAGSQSPGRWCGERPALEDAGAASARGARAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGATFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5808	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6644_6905_121178_121239_125517_125902_126159_126283_126514
883453	contig_6724_pilon	+	4367	1	Intergenic	novelGene_167957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATCCTTTTATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177859	182226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_177900_182200
883454	contig_5643_pilon	+	1565	10	Intergenic	novelGene_38797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2090.99753499568	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	935	1360	237186	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
883455	contig_17144_pilon	-	1305	7	Intergenic	novelGene_29523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2663.2073186709	1	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	538	1026	167257	166363	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183208	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167308_174933_175001_175973_176271_179700_179750_181825_181850_183158
883456	contig_5945_pilon	-	2406	7	Intergenic	novelGene_104552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	228.825018057224	985	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	330	1043	249693	219523	TRUE	30	CCTATGAGATACAGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	250022	214972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
883457	contig_14666_pilon	+	3346	5	Intergenic	novelGene_39554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	7	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	170	1420	477340	484940	FALSE	25	TAGCTAAATTGCTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477170	486866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483942_484046
883458	contig_20614_pilon	+	3419	3	Intergenic	novelGene_107569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	232	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAGAAACGAGGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234213	238703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_234778_234852_235112_236107
883459	contig_14923_pilon	+	1931	5	Intergenic	novelGene_157765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1672	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAGAAAAAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540528	592957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_541959_547843_547946_581685_581795_591067_591204_592803
883460	contig_12312_pilon	-	4396	11	Intergenic	novelGene_63934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	871.898526205888	21	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	102	1397	326065	215532	FALSE	85	AGCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLTAPSLSLLSFPAPSIPVFCRPRFAAPPAAAMPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDER	326166	212532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215542_241392_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
883461	contig_17440_pilon	+	833	2	Intergenic	novelGene_7574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGACCTCCCCGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1529	2417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1977_2031
883462	contig_6946_pilon	+	271	1	Intergenic	novelGene_59790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACTTAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451442	451713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_451400_451700
883463	contig_5125_pilon	-	1658	3	Intergenic	novelGene_43455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1278	1628	58713	54327	FALSE	50	GAACTGAAAATCACAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPTGSWEMMVGGCCTSDWHFWFAAVLGRLQSRKVMCHKLPTVDQLRAIHLCFLKQFNCKRKPIRNEFLHFQTNHGQSKHGSFELQKLVAGHTMKELLGKGCQMLRWAQFGQTEE	59990	54296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_54522_58446_58519_58629
883464	contig_5071_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_171280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6059	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1465	1881	195816	196232	FALSE	70	TCTTAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSVHLCKLRGRSQATQHRLARRAPNLSKEKENKQTNKKPWDPTSMAARTTKQLHTRMELHSPSGRSKDGAQSQVFEQKEAEVVRGKEEIKRREKSDTSSQQMALRESASVSRWNPSSRCFPAKRLWLWEVEEAEWG	193549	196754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_+_193976_194777
883465	contig_7004_pilon	+	1808	2	Intergenic	novelGene_126461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	868	1755	394844	395731	FALSE	15	ACAGTCTCCTTGCACGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIAAIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGIDSYEDEDEGEE	370595	395784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_371431_394811
883466	SIRV5	+	2022	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	5	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5472	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
883467	contig_11417_pilon	+	5272	15	Intergenic	novelGene_103314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1997	junction_12	1121.56626315749	4057	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	22	1821	558340	572821	TRUE	55	TTTAATAATTAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHDEVRTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIISSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARVLHLGGQCGPGLVESCFRGSYRRQ	558318	588918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_558388_559106_559263_559490_559655_560664_560890_566040_566182_566276_566362_567428_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597_570686_572533_573637_575930_576054_583804_583914_586514
883468	contig_10973_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_150380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	698	1210	2730	2218	FALSE	50	AAAGACGACCCACCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3494	1539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2796_2862
883471	contig_5041_pilon	-	2739	18	Intergenic	novelGene_27074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	598.991256990916	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	1014	2363	576515	525456	FALSE	35	AGAATTCATCCTAATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636087	525079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581160_594953_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
883472	contig_8122_pilon	-	1718	2	Intergenic	novelGene_40233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGACAACCTCGGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605715	603518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_604015_604493
883473	contig_13026_pilon	-	2755	11	Intergenic	novelGene_146290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	79.134126645841	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1953	2363	14211	6494	FALSE	5	CCAGGCCTGTGCTGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28172	6101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_22370_22975_23008_28000
883474	contig_13702_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_102644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATTCCCACTCCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210119	211349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210100_211300
883475	contig_8377_pilon	+	9444	21	Intergenic	novelGene_35104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	2995.54471006527	1910	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	6650	8644	176583	197939	FALSE	45	ACAAATATTATTTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	154940	198739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_154992_155715_155845_161226_164590_169245_169307_172896_173006_173646_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185748_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
883476	contig_10259_pilon	-	1848	2	Intergenic	novelGene_177186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	175	561	34624	34238	TRUE	45	TCTATAATTCAATAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEVFLWISKRGGTRHESQGKDCSLHPLKSQIRAPRLSSTGLTRRNKQSALAVRLGAARAGRASVARHIPLPLTLLGGCTLHIYMTPANSHRARPCPGTCAPWSTGQSTMELGSRDSCSSSIPGHTT	34798	18936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_18945_32958
883477	contig_6291_pilon	+	10567	6	Intergenic	novelGene_164785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	417.972726382954	4070	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	47	916	355015	381395	TRUE	65	ATTTAGAAAAAAAACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPERAGERVRARLAMELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEDVSSLTGDALTDLLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQFRQDQRDGGKSEDELDQASTPTDVRDIDL	354968	391699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961_360122_370429_370579_381245_386853_387505
883478	contig_9313_pilon	+	4919	4	Intergenic	novelGene_86469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	766.050041881512	2353	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	160	483	387329	461613	FALSE	10	ATTCTTCTGTCACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICGPGGREPDPRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387169	466049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601
883479	contig_19558_pilon	+	3307	1	Intergenic	novelGene_164747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTGATTATGGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28069	31376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_28100_31400
883480	contig_16496_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_5219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	10	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	20	TTTGTATTTGGTTAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	81	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
883481	contig_8122_pilon	-	1759	9	Intergenic	novelGene_40176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_8	88.9043552082799	1617	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	83	868	36501	30981	FALSE	50	ACCTGAAAGGTATAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEEEEAKAEREKKEKEQKEKDK	37974	30089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_31136_32701_32826_33336_33468_33926_34016_34339_34418_35756_35920_36212_36256_36498_36525_37915
883482	contig_4442_pilon	+	1864	5	Intergenic	novelGene_127956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	208.462676515486	1101	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATCAGGCCTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347184	1356946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_1347364_1348537_1348705_1349832_1349874_1353102_1353231_1355597
883483	contig_6691_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_60173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAATAAAACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416713	419388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_416700_419400
883484	contig_5779_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_106441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	461	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	177	509	94343	94011	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94519	93305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
883485	contig_12081_pilon	+	983	4	Intergenic	novelGene_166982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1526	junction_3	516.607738574981	39	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	7	606	16436	18277	FALSE	10	ATTTTTATTGTCTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKSEAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	16429	18654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_16550_16845_16992_17069_17245_18112
883486	contig_10437_pilon	-	1287	1	Intergenic	novelGene_38369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGTTAATGAACTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561535	560248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_560200_561500
883487	contig_12078_pilon	+	4795	3	Intergenic	novelGene_74121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1082	1393	675664	675975	TRUE	80	CAAAAAAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRIRAELNEIENRKKKIESVNKTKSWFCEKINNIDKPLDNLTKEKLERKQTTHIRNEIGDITTDLTEIKTIITGYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYTYLN	490757	752609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_491678_675502_677747_750978
883488	contig_10734_pilon	+	3651	6	Intergenic	novelGene_51397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTATATATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2026101	2293009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2026587_2114415_2114439_2131799_2132347_2185677_2185977_2262849_2263021_2290883
883489	contig_5727_pilon	+	3546	22	Intergenic	novelGene_7957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	911.872636509847	5	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	732	1766	173359	176713	TRUE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPSLSFPCSRRPDPEEAAAVAAAEFSVKILRCQAAKVESAIAEGGASRFSASSDGGGSRGAPQHYPKTTGNSEFLGKTPGQNAQKWIPARSTRRDDNSAANNSANEKERHDAIFRKVRGILNKLTPEKFDKLCLELLNVGVESKLILKGVILLIVDKALEEPKYSSLYAQLCLRLAEDAPNFDGPAAEGQPGQKQSTTFRRLLISKLQDEFENRTRNVDVYDKRENPLLPEEEEQRAIAKIKMLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSMEMQMRLSMA	168294	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169882_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176318_176462_176545_176681_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
883490	contig_9982_pilon	-	1920	15	Intergenic	novelGene_55760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	196.280996512237	1579	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	135	1781	353538	339852	FALSE	25	GAGCCTCAACTGTCCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353672	339712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
883491	contig_13547_pilon	+	4658	15	Intergenic	novelGene_104868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	321	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCGGAACAGAAAAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73046	223740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_75931_84853_84962_88970_89177_91158_91268_93754_93917_98146_98303_98905_99063_101109_101249_103068_103245_114701_114835_163206_163349_176601_176674_196798_196883_221449_221507_223667
883492	scaffold_12124_pilon	+	2808	11	Intergenic	novelGene_22356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	3247.42929715183	174	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	242	619	1490385	1508039	TRUE	45	AAAGATTAGACAGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1484107	1510352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484250_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509100_1509223
883493	contig_4921_pilon	+	3813	7	Intergenic	novelGene_178343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAGACAGAAAGGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361610	528069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4921_pilon_+_362116_380362_381030_407752_408269_409736_409789_415647_416034_501393_501443_526431
883494	contig_6980_pilon	+	2016	10	Intergenic	novelGene_36031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	661.323756651091	252	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	86	982	356720	372790	TRUE	20	CTGTTACTGTGTCATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346097	373885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735_373699_373759
883495	contig_3187_pilon	+	6506	9	Intergenic	novelGene_176231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	4402	4944	543617	544454	TRUE	30	AGAGTCCTAATTTGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKKSNTSSQRMALIEPPTRARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPHPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAALGQEPAAPGSRGANEQRPRDLFSAAAQT	55877	584146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3187_pilon_+_55946_216813_217924_218811_219271_230335_230793_392145_392454_540221_541521_542916_544056_544350_544581_582710
883496	contig_17440_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_7572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTAGAAGCAGCCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1498	1914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1500_1900
883497	contig_15323_pilon	-	7917	2	Intergenic	novelGene_148520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3077	144	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACAAGGTCAGCCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94825	85972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_91287_92222
883498	contig_1150_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_61413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	19102	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
883500	contig_20614_pilon	-	3622	2	Intergenic	novelGene_107568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	972	1706	237859	237125	TRUE	40	CAACCTAGGAAATGAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIERLRSRFETMEDRISEIEDKHLATTLSEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQREKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETVRLSLDYLAKTLQARRQLDDIYKTLKEKNCQPRMIYPAKLSFKYDGEIRSFPEIRGLCKNQTKLTRIVKGSPLIREQTTSDHRLSIGHRIVLARYQLS	238830	234212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_235114_236109
883501	contig_7182_pilon	-	807	2	Intergenic	novelGene_117136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6644	junction_1	0	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	88	342	888247	887056	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	888334	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169
883502	contig_6898_pilon	+	3847	14	Intergenic	novelGene_35682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	3	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	138	1871	59668	125646	TRUE	0	GGCTTTTCTTCTTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59530	140484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_127591_140452
883503	contig_6589_pilon	-	1657	9	Intergenic	novelGene_26188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_3	103.661031130314	960	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	63	971	1950197	1936442	FALSE	15	AGTCCTGACGTTTCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRHGKNCTAGAVYTYHEKKKDTAASGYGTQNIRLSRDAVKDFDCCCLSLQPCHDPVVTPDGYLYEREAILEYILHQKKEIARQMKAYEKQRGARREEQKELQRAAAQDQVRGFLEKEAAIVSRPLNPFTPKAASSGNGPDDAQPGPSAGPASKDKDKALPSFWIPSLTPEAKATKLEKPSRTVTCPMSGKPLRMSDLTPVRFTPLDSSVDRVGLITRSERYVCAVTRDSLSNATPCAVLRPSGAVVTVECVEKLIRKDMVDPVNGEKLTDHDIIVLQRGGTGFAGSGVKLQAEKSRPVMQA	1953436	1935755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1936514_1936951_1937061_1937166_1937355_1937504_1937624_1937714_1937878_1941840_1941923_1949540_1949647_1950127_1950199_1953375
883504	contig_5954_pilon	-	2876	8	Intergenic	novelGene_28780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1744.28404118324	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	157	813	1462068	1392942	FALSE	85	TTAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462224	1390878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926_1461964_1462017
883505	contig_15087_pilon	-	3818	26	Intergenic	novelGene_37169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_3	922.334472954362	2066	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	159	2015	158925	113497	TRUE	25	TTGAAACCTGACTCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181198	109368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
883506	contig_10106_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_73902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1406	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTATTTAAATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180383	175914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_177590_180285
883507	contig_12654_pilon	-	5690	8	Intergenic	novelGene_129299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	583	junction_3	366.234785851026	1001	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	4506	5213	764461	759069	FALSE	10	GTCTTTGCTTTCTGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	768966	758591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438
883509	contig_7294_pilon	-	2792	4	Intergenic	novelGene_172601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	411	758	389468	389121	TRUE	30	TGGTCAAAGGATCTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALIHGINTIQTVSNNAQASEERLDKWELPKIKHLCSSKDFTKRVRRQPTDWEKKFGYNKSDQHLISKIYKILQNLNSKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKKCSR	389878	363140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_-_363407_366320_366822_374839_375451_388464
883510	contig_10904_pilon	-	4877	3	Intergenic	novelGene_22560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	171	1660	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3284	3607	411823	411229	FALSE	25	TCTTGATTTATGTCCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFALYRVGEAAPLQYRNSARPWADFPLPAARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSQPLVVSWDGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	416825	409958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636_411919_413637
883511	contig_12677_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_110770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTATTAGGCTGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2500
883512	contig_9363_pilon	-	1918	2	Intergenic	novelGene_6770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTGAAATTCTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508766	1505339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228
883513	contig_7375_pilon	+	6718	5	Intergenic	novelGene_178344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5047	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	5959	6717	411948	412706	FALSE	50	CAACACTAGCAGCCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESGKAYITNCQCSGAPQEEANMAHGARHLSERRGRWREASEKSKEAEKNSNISSQQMAPRELPAWVCGIQAAGASWSRDRGRGKQRNKRTKAPGSHQHSSPDREAAAYSNGAPQPLRRKQRWRSEPGTGAKGGGGGERQARNQKKQEKKKSNTSSQQMAPREPPAWVCGIQAAGASRSRHCGRGKQRNKRTKALGSHQHGSPDREAASHSNGAPQPLRKKQRWRSETGTRAKGGGGGERQVRNQKKQEKKK	102067	412707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7375_pilon_+_104583_171798_172243_297589_298252_342011_343627_411225
883514	contig_3747_pilon	-	5018	4	Intergenic	novelGene_24743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	641	946	287627	287322	TRUE	30	AACCCAGTAGTTTTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSINSSSFLVDSLGFSVYKIISSANRYTLTPSLPIWMCFISFSSLIAMARTSSTVLNMSGDKGHPCLVSVLKGNGFKVSPFSMMLAVGFI	288267	133309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_134174_134322_135724_157841_158636_286308
883515	contig_14666_pilon	+	3790	4	Intergenic	novelGene_39553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1654.15846345573	29	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	264	1400	479860	484940	TRUE	50	AATAAAAGACTTCTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQEVTTATRPCSWRGSVCTTTRPTAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477158	487467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483887_485266_485402
883516	contig_34_pilon	-	6196	7	Intergenic	novelGene_39972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1467.09497533959	1956	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2359	2874	212564	212049	TRUE	5	TGATTGTGCTTGTCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247117	208506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_209249_209468_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
883517	contig_5317_pilon	+	4291	2	Intergenic	novelGene_76560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	524	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTATACCTGTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36683	43838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_36839_39702
883518	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
883519	contig_16594_pilon	-	3900	7	Intergenic	novelGene_53793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2602.32174648375	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	74	595	135431	121101	TRUE	20	TATTCGTGTATCTGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	135504	115119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115467_115610_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251
883520	contig_1213_pilon	+	1453	4	Intergenic	novelGene_76468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_2	78.4106001904221	2765	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	4	339	65832	70752	FALSE	70	AAAGAAAAGAAAACTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAASVVRRSMAVRTSINRPIAFVRKIPWTAASNELREHFAQFGHVRRCTLPFDKETGFHRGMGWIVFSSEEELQNALQKENHIIDGVKLQVQAQRPKVLQGDQTSDEEKDF	65828	71866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_65929_67179_67239_69817_69926_70680
883521	contig_11427_pilon	-	2476	9	Intergenic	novelGene_78998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	97.2779522810796	926	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	352	852	655701	597239	FALSE	30	AGCTACTCTCAGAAGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPAAGVGRLEEEALRRKERLKALREKTGRKDKEDGEPNTKQLREEEEEGEKHRELRLRNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAVEEKVKEQLEAAKPEPVIEEVDLANLAPRKPDWDLKRDVAKKLEKLEKRTQRAIAELIRERLKGQDDSLASAVDATAEQEACDSD	656493	595614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_655605_655781_655862_655953_656311
883522	contig_2332_pilon	-	441	5	Intergenic	novelGene_58678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGAATGGTCTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333913	331274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_331302_331376_331492_332051_332147_332910_333046_333844
883523	contig_12938_pilon	+	1507	7	Intergenic	novelGene_99690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_3	817.921841552656	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	154	726	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51909	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
883524	contig_12677_pilon	-	1323	2	Intergenic	novelGene_110752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCACATTCTGTAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1746	20	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_136_538
883525	contig_15327_pilon	+	1337	4	Intergenic	novelGene_70652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCAGCCCCCCCGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900106	902157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_901035_901128_901281_901400_901534_902033
883526	contig_15888_pilon	-	3160	15	Intergenic	novelGene_84390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_6	333.714843749533	2866	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	78	1751	49714	37821	FALSE	10	TGCTCCGACTTCCCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGAPSRVVHIRKLPSDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVAAVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGSLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYAEPVSAQHAKLSLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGAPGIISASPYAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKVLFNKKENALVQMADGSQAQLAMSHLNGHKLHGKPVRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	49791	36411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38722_38798_38892_39322_39357_40759_40909_41509_41588_41880_42056_42149_42261_42376_42548_42626_42774_42847_43021_43145_43222_46483_46515_49706
883528	contig_4364_pilon	+	651	1	Intergenic	novelGene_761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532663	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
883529	contig_3975_pilon	+	3645	6	Intergenic	novelGene_54940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1857.70944983332	40	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1232	1735	2344841	2354386	TRUE	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2343609	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277_2354612_2355012
883530	contig_12123_pilon	+	2375	18	Intergenic	novelGene_144585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_1	1107.99803879756	138	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2262	114	2375	82142	181799	FALSE	10	TGTGCACTCCTATGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPHEYNRQHLNYIDLTFFLSILANVYQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVVVALARDSLALARPRSSDVYVSYDYGKSFKKISEKLNFGVGNNSESVIAQFYHSPADNKRYIFVDAYAQYLWITFDFCNTLQGFPIPFRAADLLLHSKASDLLLGFDRSHPNKQLWTSDDFGQTWFMIQEHVKSFSWGIDPYDEPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSLENQEVILEEVKDFQLRDKYMFATKVVHLLGSPQQPSVQLWVSFGRNPMRAAQFVTRHPINEYYIADALEDQVFVCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGLQGVYIATLINGSMSEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQRLSQLLNFQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSGGARWREALPGPHYYTWGDHGGIIMAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFLFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIFGSNKEDVHSWLIFQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRIPHATCFNGEDFDRPVIVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYFPPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYATRKSIHRYDLASGAIEELPLTGLRAVVALDFDYEHNCLYWSDLALDIIQRLCLNGSTGQEVIINSGLQTVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEV	61984	181799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_62071_82114_82232_91500_91627_98944_99107_100690_100759_109332_109514_131864_131967_133170_133341_138303_138497_141348_141467_143157_143232_154195_154285_167972_168152_169728_169916_174127_174257_176521_176608_180997_181171_181664
883531	contig_12148_pilon	-	2493	1	Intergenic	novelGene_140336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGGGTGCATTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90199	87706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_87700_90200
883532	contig_5643_pilon	+	1471	12	Intergenic	novelGene_38770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	29612	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	258	1259	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233417	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
883534	contig_12654_pilon	-	8098	15	Intergenic	novelGene_129289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	432.209392752718	2108	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	105	1292	788119	759069	FALSE	15	GAGCCTCAGTCTTATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASSASTDSRSAASRSARLLLSAASLAAALVAAAMLGRDRLLSVLLAAAASCAMAQHVPPWTEDCRRSMYPPSGPTYRGPVPWYTVNLDLPPYKRWHELMADKAPALRIIVNSLKNLVNAFVPSGKVMQIVDQKLPGLLGPLPSPFEEEMKGIAAVTEIPLGEIILFNIFYEFFTICTSIVTEDKEGHLLHGRNMDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788352	752262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_768979_769059_771246_771334_771768_771860_775941_775989_788041_788150_788278
883535	contig_10437_pilon	+	4271	2	Intergenic	novelGene_38154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_1	0	27	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGCAAAAGCGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159588	164080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_161639_161859
883536	contig_8818_pilon	-	4868	7	Intergenic	novelGene_178229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	800	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCCCAGCCAAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195174	163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_1872_4691_4819_40146_40571_44318_44954_57898_57995_193027_194382_194650
883537	contig_13542_pilon	+	1689	9	Intergenic	novelGene_131480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	414	junction_1	910.658475705904	5553	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	114	932	346638	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADPDVHSWAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346524	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
883538	contig_12079_pilon	-	2562	11	Intergenic	novelGene_67436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1256.63663801435	2	53	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	472	1368	600738	580918	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEETLHEEGRTVGRQVGCDGFWESLSDT	638840	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580996_584239_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
883539	contig_4125_pilon	-	3418	5	Intergenic	novelGene_25275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10465	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	905	1222	3861478	3861161	TRUE	45	AAAAGAATTATCTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRILLSLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGWTILYMSMTSSWLIVAFRSSVSLLSFLLDVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFNAVRVCFMYFGALSLGA	3862382	3794571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3795280_3795560_3796184_3796261_3796451_3860234_3860722_3860971
883540	contig_11338_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_6317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACAATAAAAGAGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248612	245664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_245700_248600
883541	contig_10766_pilon	+	3803	2	Intergenic	novelGene_151229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	488	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAATATTTTTAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213095	217398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_213587_214086
883542	contig_5954_pilon	-	2770	8	Intergenic	novelGene_28778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	133	843	1462068	1392942	TRUE	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462200	1390877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392154_1392290_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
883543	contig_8330_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_71932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	737	1036	1316216	1316515	NA	55	AAAAAAGAGGATAACGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRLKYLLCMDVSFKRILPIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVAKRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTRALLARIKDTGNNKC	1315479	1318110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1315500_1318100
883544	contig_7909_pilon	-	7297	8	Intergenic	novelGene_155928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4839	5138	907390	907091	TRUE	65	TAAATAAAAATAGTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTEFSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSHKKDQIYWPKGDWSNPESMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	1030196	853339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_853699_861366_862504_887865_888107_906668_907422_910102_910440_944029_944565_994567_994978_1026671
883545	contig_10500_pilon	-	2495	9	Intergenic	novelGene_41230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	895.865215517937	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	190	1098	1640040	1629340	TRUE	15	TTTCTATATTGTATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640229	1626408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627017_1628550_1629341_1629460_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
883546	contig_9609_pilon	+	10020	18	Intergenic	novelGene_23005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_4	180.374619778415	5686	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	7884	9785	320917	331717	FALSE	20	TTGGGTAAAACCTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGITNCCLFFFLQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEVSGRVGL	313033	331952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563
883547	contig_5935_pilon	-	1656	2	Intergenic	novelGene_102733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	944	1354	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1216237	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237
883548	contig_17075_pilon	-	445	5	Intergenic	novelGene_131747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2833.61909710885	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCTGTTTTCAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91166	87990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_-_88093_88995_89127_90576_90702_90980_91038_91136
883550	contig_11493_pilon	+	2807	1	Intergenic	novelGene_143735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2872	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352467	355274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_352500_355300
883551	contig_6364_pilon	-	2205	4	Intergenic	novelGene_51814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAATGTTTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702482	1495013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1495404_1672692_1673597_1685432_1685647_1701785
883552	contig_15449_pilon	+	2961	14	Intergenic	novelGene_33583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	607.549730109571	381	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	240	1919	28094	54621	FALSE	15	TATATTTGTCAGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGAQWRRSQPPRAAEEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27854	55663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
883553	contig_8697_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_83214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAATTATTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33244	30742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_30700_33200
883554	contig_16999_pilon	+	1681	10	Intergenic	novelGene_84996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	104.097176821575	1300	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	230	1021	173125	189898	FALSE	20	ACCATCATTTCCTCTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTADARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQRKAQPAQPSDEPAEKADEPMEH	172895	190558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_173128_174439_174485_174760_174863_175244_175349_182566_182656_183734_183806_183921_184052_185263_185344_188357_188469_189841
883555	scaffold_12124_pilon	+	1956	12	Intergenic	novelGene_22263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3133.64789670056	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	195	572	1490385	1508039	TRUE	45	CTGGAAATTATATGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508529_1508633_1508790_1508843
883556	contig_15112_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_124755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTTGAACAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24322	21483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_21500_24300
883557	contig_10126_pilon	-	4971	3	Intergenic	novelGene_105747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCGGAGGGGGCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169718	161331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_165722_166332_166664_169468
883558	contig_6497_pilon	+	4155	9	Intergenic	novelGene_35557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	341.703819118253	144	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	98	421	156503	166541	TRUE	25	CCTAGCGGCAGCAGGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRRNCGGPALAVCEAWSPLASDRAVLKPSSTMGKRDNRVAYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRFFRF	156405	216467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_161444_163401_163481_165792_165868_166001_166035_166526_166549_166881_166975_168288_171786_216330
883559	contig_6163_pilon	-	3589	10	Intergenic	novelGene_103798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	285.362537446277	1861	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	24	965	93933	76108	TRUE	30	CATGTTATCAGTCTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGSEDGKIHVWNGESGIKVAVLDGKHTGPITCLQFNPKFMTFASACSNMAFWLPTIDD	93956	73280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_73594_73796_76138_77094_77238_77811_77882_78301_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
883560	contig_10930_pilon	-	3943	7	Intergenic	novelGene_36968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	16	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	131	1534	280211	268388	FALSE	25	AGCTCCTTGTGGACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280341	265978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
883561	contig_17281_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_105195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACATGGTACTTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	3533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_3500
883562	contig_8317_pilon	+	928	2	Intergenic	novelGene_19353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16222	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
883563	contig_11422_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_99097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAGAAGAAGAAGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1800
883564	contig_15974_pilon	-	4831	1	Intergenic	novelGene_164825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1431	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1379	1906	341853	341326	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKELGKSKAQGIDGIPDEMFQQTDAVLEVLIHQCQEIWKTVTWPTDCKRSIFMLIPKKGDPTECRNNRIISLISHGSKTLLKIIQKRLQQYTDRELPEIQAGFRRGRGMRDITADVRWILAESREYQKDVYLCFTNYTNAFDYVDHNKLQRMGIPEHLIVFMRNLYTDQEAVV	343231	338400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_338400_343200
883565	contig_2332_pilon	-	2326	4	Intergenic	novelGene_58674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	547	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCGGGAAGAGCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334839	331002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_333046_333844_333926_334160_334278_334754
883566	contig_4857_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_48800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAGAAAATACATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243289	1245283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1243300_1245300
883567	contig_13021_pilon	+	2286	13	Intergenic	novelGene_8129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	2937.96254396175	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	199	1983	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSCLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174154	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174217_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
883568	contig_2969_pilon	+	3454	7	Intergenic	novelGene_157087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	188.621902816778	625	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	228	905	1191349	1201364	FALSE	25	CATACAAGTTTGTGTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRPNHTIYINNMNDKIKKEELKRSLYALFSQFGHVVDIVALKTMKMRGQAFVIFKELGSSTNALRQLQGFPFYGKPMRIQYAKTDSDIISKMRGTFADKEKKKEKKKAKTVEQTAATTNKKPGQGTPNSANTQGNSTPSPQVPDYPPNYILFLNNLPEETNEMMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFENDGQAGAARDALQGFKITPSHAMKITYAKK	1189063	1203913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1189265_1191322_1191413_1191802_1191976_1197947_1198089_1198880_1198932_1200570_1200660_1201204
883569	scaffold_13505_pilon	-	5073	4	Intergenic	novelGene_111611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	41	367	664532	664206	TRUE	50	GTATTACAGAATGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTNRNLFSSILVGYKSKFRVSAPEEGFLCLSALEEGPCHQSSRGLEASSCRNPGSKGRTLLLALLSWWYEVPILSLLPSPFISCKIKGDAGHSPVNLPLHWIKNST	664572	657055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_657109_658753_661238_661934_663784_663885
883570	contig_14577_pilon	-	3619	20	Intergenic	novelGene_164633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	356.74461484598	2204	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	203	1327	127106	66521	TRUE	30	TTTACTTCAATACAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNARRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLKLIKAF	127308	48992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66548_67141_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78685_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
883571	contig_10494_pilon	+	406	4	Intergenic	novelGene_102212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_3	38.7671109174889	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCGTGTGGATCACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085191	1087161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1085270_1086225_1086314_1086606_1086687_1087001
883572	contig_11422_pilon	-	2259	2	Intergenic	novelGene_99012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2364	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
883573	contig_12635_pilon	-	1584	12	Intergenic	novelGene_60812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_11	463.892496095684	1112	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	407	1567	227344	180251	FALSE	10	CCTTTTGTTATTTGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262807	180233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_261771_261979_262709
883574	contig_1301_pilon	-	5539	21	Intergenic	novelGene_47274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	706.480450897263	269	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	83	2125	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
883575	contig_6691_pilon	+	5663	3	Intergenic	novelGene_60147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1013	1366	274326	274679	TRUE	20	AGAATTGCCTATCGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLVLLFYLLVHCVVLRVLKACKPVQGTTIGLCSPGVRNRKRIWSMWLTAFMNNCLLCHETRSTGWCPATIIEHFDQRFYRRILIKKGKNAEENFKFSWTLDFLKPWRVDEPLKLLP	273092	421039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_273912_274132_274718_416780
883576	contig_19352_pilon	-	1905	6	Intergenic	novelGene_122353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	625.742886495724	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTATACATGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122360	102869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122061
883577	contig_6488_pilon	-	1825	7	Intergenic	novelGene_44754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	923	junction_6	126.693418227713	1988	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	177	950	193038	182397	FALSE	35	TCAGCAAGGAGAAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERPGHRTRALRPGGEPHQAETPAHHKPPRSQRPSVPSKASGHDRSTRGPAAGARRPRMKKKIQFRVARSEEMAQREEVARTEEMAQSEEMARSEEMTRSEEVSQSEEMAATGLNVTVSHNNEKHNLYVTLQQGTSEPVVQDLAQLVEEATGVPVAFQKLIFKGKSLKEMEQPLSALGIQNGCRVMLIGKKNSLEEQVELKKLKDLEKAVEKIANQLEELNKDFAGIQQGFLAKDLQAEALCRLDRRVKATIEQFMKILEEIDTLILPENFKDSRLKRKGLVTKVQAFLAECDTVEQNIGQETERLQSTNFALAD	193214	181521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_182487_183513_183577_184411_184520_186801_186916_189040_189124_190955_191085_192851
883578	contig_3132_pilon	-	4979	10	Intergenic	novelGene_127415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	115.443535447175	123	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	323	1273	229252	221274	TRUE	30	TTGGCCTTGAGAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKYITGAREEGESRIGGGYGMCC	229574	208642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_221340_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
883579	contig_11328_pilon	+	831	6	Intergenic	novelGene_88411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	35	784	643683	647995	FALSE	25	CTTTACACAAGCCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643648	648042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
883580	contig_34_pilon	-	2960	8	Intergenic	novelGene_39980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1395.86608327912	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	56	859	247052	214054	TRUE	25	GTCCCTGGGGGTATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKR	247107	210709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_213877_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
883581	contig_6102_pilon	-	1835	9	Intergenic	novelGene_32146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	533.374106514368	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	208	690	867239	839973	FALSE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867505	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237_867338_867396
883582	contig_6239_pilon	+	7917	7	Intergenic	novelGene_178346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1667	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1752	2801	2073	3122	TRUE	35	GTCCTCAGCCACCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	0	210953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_405_725_3933_4754_5200_47761_47769_148205_151367_210117_210386_210528
883583	contig_6929_pilon	+	1045	4	Intergenic	novelGene_139407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4020.57826133948	118	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	135	515	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127041	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130975_131821
883584	contig_253_pilon	+	5566	1	Intergenic	novelGene_129762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1260	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACCAAGAAATATAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737997	743563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_738000_743600
883585	contig_5686_pilon	+	6579	6	Intergenic	novelGene_45499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	137	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCTGTCTCCCGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270598	524727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_271658_300870_301866_330217_330761_331073_332358_386922_387483_522589
883586	contig_7457_pilon	-	4774	22	Intergenic	novelGene_31493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2942	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2564	2899	664175	662973	TRUE	40	AAACCAACATGTCCATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISANDMLFSCCLVYGSTDWIWVLPLMSFSTQVKVIPPSLLLSLNLSRKVPGGLVLKMARSRSLLMKPIIYPSFQRARMYFFTRSMILSSQTQKEKPLPAMFSLQNLAHVI	671993	641603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_641758_642571_642716_643347_643446_648694_648792_648953_649036_649224_649322_649492_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660516_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
883587	contig_2504_pilon	-	7454	3	Intergenic	novelGene_166841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11	379	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAGCTCTAAACTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406016	368418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_373980_376439_378109_405792
883588	contig_15172_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_158747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAATGCCCTCATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238235	237432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_237400_238200
883589	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
883590	contig_3737_pilon	+	3925	4	Intergenic	novelGene_178338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	768	1823	122879	238589	TRUE	75	AGACAAAAGAACAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEGRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLRETPARWRSRQKHHAVPPQQRSEKLSQTENQQP	122111	322233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_+_123836_238490_239590_321000_321913_322043
883591	SIRV3	+	706	5	NNC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	30	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	8	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGCGTTAGGTTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1993	8929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4048_4574_4775_6057_6334_8755
883592	contig_5981_pilon	+	2728	2	Intergenic	novelGene_35541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2228	2533	591847	592152	FALSE	20	GGTATGAATCTTACTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIVYPATLLNLCISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSRMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	527633	592347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_529209_591194
883593	contig_7182_pilon	-	2949	5	Intergenic	novelGene_117131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	8972	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	153	800	889318	887056	FALSE	35	TTCAGTTTTTGACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891412	884906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
883594	contig_9366_pilon	-	1366	2	Intergenic	novelGene_166268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAATAATTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043597	1038824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1039056_1042462
883595	contig_9668_pilon	-	3459	15	Intergenic	novelGene_58173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	862.343319102085	698	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	542	2515	605373	503609	FALSE	45	TTTTAAAATTAAGGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKCFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	670493	502664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545692_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_669866_670221_670306
883596	contig_6233_pilon	+	2595	9	Intergenic	novelGene_74754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.925143175622	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	391	1035	123409	131406	FALSE	25	TGTAATTAGTACTTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	112910	132966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119709_123378_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
883597	contig_12414_pilon	+	2545	12	Intergenic	novelGene_59645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGGTGTATTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756007	787810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_756663_759115_759319_760668_760804_762804_762903_765743_765875_766736_766903_767635_767693_774262_774353_781926_782108_782791_782911_783428_783460_787131
883598	contig_12046_pilon	+	2364	8	Intergenic	novelGene_83500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_2	274.412842562562	91	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	106	1569	955093	1002912	FALSE	55	GAAAATACCAACAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASGRFESAKSIEERKEQTRIARAEVLRQAKDNFEKEERCKELKRLRGEDTWMLPDVNERIEQFSQEHSVKKKKKKDKHSKKVKKEKKKKSKKQKYEKNESADNSSSSEDEWVEAVPSQTPSKEKAWKVKDEKSRKEEDSEVIQRDEWMTVDFMSVKTVSLSSLKAEKETIRKIEQEKAQAVEQSRLLERELNPYWKDGGTGLPPEDCNVSSVTKVSVVEDGGLSWLTKSYQRMKEQAEKQNRNFEDIVAERYGSMEIFQLKLKEAEKTASKKEDCRQERWRKPTYSDKAQSSQERRKSDLVNYNKNSRDRYSVTDSTNNVNKDKFSGDEKDNNRFRSLETHRRQYNPRQNQEFSSVGNLRPKFVRPSDDEELSFHSKGRNFEPSSSSSASIAQGSLRCGFRKPTENSEECLSSWSRSDRREGDKKHSNQKASLETSSSVDYGHIPGDVREKSQDESLRDDPPKKEHLPDTKSSLSGYFVICFLN	954987	1003707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_955186_962293_962405_963932_964053_983545_983660_984635_984756_990041_990136_997169_997286_1002216
883599	contig_18511_pilon	-	2013	11	Intergenic	novelGene_126863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATCGGTTAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61360	35387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_35548_47346_47559_48080_48209_49185_49303_51676_51874_52222_52462_55272_55552_56903_57117_59149_59253_59751_59947_61190
883600	contig_133_pilon	-	6305	5	Intergenic	novelGene_178351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	139	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAATAGAATTCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89673	39810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_133_pilon_-_41616_42589_42978_70644_72122_86947_88470_88560
883601	contig_14577_pilon	-	3899	20	Intergenic	novelGene_164634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_15	279.577560237523	2126	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	232	2295	127106	50623	FALSE	30	ATCTATGGAATGACTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFTPTPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNARRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPVMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL	127337	49018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66718_67034_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78685_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
883602	contig_8631_pilon	-	2007	3	Intergenic	novelGene_121989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	182	junction_2	12	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCTACCACCCAGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874233	860560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_862415_863663_863793_874209
883603	contig_7066_pilon	-	2040	4	Intergenic	novelGene_42147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.884800728252	42	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAATCTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757854	747998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_748974_749028_749885_750340_750424_757728
883605	contig_2332_pilon	+	1981	5	Intergenic	novelGene_58673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_2	696.260143552681	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1582	1887	332930	334269	TRUE	15	TTGCGTCTTTTTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330788	334840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331494_332053_333048_333846_333928_334162_334280_334756
883606	contig_18096_pilon	+	3341	14	Intergenic	novelGene_58023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	649.161288662706	1941	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	226	1938	40382	76634	TRUE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40156	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77122_78216
883607	contig_19778_pilon	+	1979	6	Intergenic	novelGene_143757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	161.106672735799	1585	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	1085	1978	25062	34225	FALSE	15	GCAGGCCTCTTGTGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METIRRENATDMKKARALIDPVIRKGRRVCEICISHIYEADPFLAEKMGLSSGLQSGNDFNAQDLPAVTPFLPASWAAQDKPAECTSSEPGGMLKLCSPETAHRIWNEKSAKIYPIREKLNRTRLALIICNIDFENLPKRAGADADIRGMKTLLEGLGYSVDVKQNLTASDMTAELKTFADCPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPGN	23977	34226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_25219_28501_28565_32062_32179_32846_33021_33442_33678_34076
883608	contig_12079_pilon	-	1887	10	Intergenic	novelGene_67441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	473	1231	600738	580380	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKSCSDHSE	638841	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580407_585269_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
883609	contig_10793_pilon	+	2403	13	Intergenic	novelGene_83427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3006.93716909564	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1193	1996	152887	163940	TRUE	30	ATTTTAGTTCTCATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	150327	167269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
883610	contig_10074_pilon	-	2347	3	Intergenic	novelGene_57194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	607	49	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTCCCAGCAGCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596417	582029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_583872_586186_586330_596055
883611	contig_9708_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_67250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCAGAAGAGTGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20499	19090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_19100_20500
883612	contig_6691_pilon	-	2662	1	Intergenic	novelGene_60174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCAACATGTATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419380	416718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_416700_419400
883613	contig_17936_pilon	+	2270	11	Intergenic	novelGene_29909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	725.524748027247	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	63	1073	50646	114788	TRUE	25	TACCAGCCTAGTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSGGNFHQIGTIQKAVELT	50583	126582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114733_114934_118635_118827_121017_121063_125766
883614	contig_9668_pilon	-	3101	16	Intergenic	novelGene_58174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_15	762.704352215778	2779	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	616	2607	605373	503609	FALSE	60	CAGAAAAATCAGAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	670398	503114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866_670221_670306
883615	contig_5696_pilon	-	1736	3	Intergenic	novelGene_117520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	160	junction_2	2.5	646	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	197	994	436095	435298	FALSE	25	CTTGGTAGCACAGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGKMTSPKSMPKDAQMMAQILKDMGITEYEPRVINQMLEFAFRYVTTILDDAKIYSSHAKKATVDADDVRLAIQCRADQSFTSPPPRDFLLDIARQRNQTPLPLIKPYSGPRLPPDRYCLTAPNYRLKSLQKKTSASAGRITVPRLSVGSVTSRPSTPTLGTPTPQTMSVSTKVGTPMSLTGQRFTVQMPASQSPAVKASIPATSTVQNVLINPSLIGSKNILITTNMVSSQNTANEPSNALKRKREDDDDDDDADDDNYDNL	438766	434555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_436113_436686_436780_438680
883616	contig_4982_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_172233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	730	1242	52116	52628	NA	80	AAAATAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSFEPRARGPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGSPSRG	51386	53637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_+_51400_53600
883617	contig_6076_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_81716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	462	1859	2320	4786	4325	NA	65	GATGAAAAATCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQIISKHLQKQDRMVPVGVQNKTTDDLPVEEKELDLTDREFKSLIFRIIQEFKQKADKNEEKIDKLMEKADKYMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSHREIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMMEDRISEIEDKHLDTTLF	6644	4324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_4300_6600
883618	contig_16411_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_77358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTAAACTAATGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242664	243915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_242700_243900
883620	contig_11493_pilon	-	3417	2	Intergenic	novelGene_143728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCCCAGTTCCAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354288	350647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_353926_354149
883621	contig_7843_pilon	+	3245	9	Intergenic	novelGene_152004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAAAAGAGAAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117820	190953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_118471_120935_121248_129905_130241_155958_156573_177701_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_190893
883622	contig_9235_pilon	+	4450	2	Intergenic	novelGene_156199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	420	1331	46042	46953	FALSE	20	CAGATGCTTCTTACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43687	50072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_43900_45834
883623	contig_3472_pilon	-	6075	10	Intergenic	novelGene_166926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1804	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4443	4775	242077	230128	TRUE	5	GCCTCCGACTCCTCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPLPEEIILGFLLQGHYCHCVVRVHSHLFLAESPSFHHLKTDLSLCQKTDEAKKQTIPHHCILSYLHLCHTVGNNLHSHSKRCYPQRLALLLWLHFRVLFGDLLVLSV	265682	198356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_198425_226119_226233_227851_228054_229210_230262_236442_236630_242065_242251_248291_248404_256669_256784_257157_257281_261762
883624	contig_5280_pilon	+	2633	10	Intergenic	novelGene_52572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	728.429530048661	2016	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	148	1227	38385	78098	FALSE	5	CTTCATCTGTTTTTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSANLPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38237	79504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56359_56460_56486_62043_62065_78042
883625	contig_4876_pilon	-	2854	4	Intergenic	novelGene_137911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	119.021006549264	131	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	654135	625920	TRUE	45	AAACCAGAATCAGCCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTCSPHRRASVRVSAAAAFGPGPSRSLLRLSWLKGAARCSRWAHRRRIPPPTGTSPLSPQQTQKVVSWIITIWIFGSLTIFLLARVLGGEPLYFWWLDHLKWCLHL	654135	621149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_623681_625917_625971_629225_629304_653943
883626	contig_9815_pilon	+	5846	6	Intergenic	novelGene_164235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	126	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1647	2237	1819	2409	TRUE	60	CACCAAAAGAGTAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLRNC	114	113820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_1480_1537_2915_4014_4163_4231_5513_21352_21674_112466
883627	contig_8697_pilon	-	1262	2	Intergenic	novelGene_83221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTTTCAAAACATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108949	59499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_60537_108724
883628	scaffold_8345_pilon	+	6858	6	Intergenic	novelGene_107013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1297	155	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTTATTTGTGTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573382	802384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_575959_576461_576835_730110_730221_733159_734590_774584_775099_800529
883629	contig_15185_pilon	+	2884	1	Intergenic	novelGene_99469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAATTTCTCTTTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466714	469598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_466700_469600
883630	contig_5023_pilon	+	2937	14	Intergenic	novelGene_7280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2090.93839243215	5	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	506	1624	611764	646990	FALSE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQVFEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580856	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611688_611820_614402_614489_622552_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
883631	contig_15866_pilon	+	2030	14	Intergenic	novelGene_63629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	659.728498935503	8	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	387	1361	601021	633133	FALSE	15	TCTAAGTGTGGCTTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	458891	633802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_551831_551943_581438_581475_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
883632	contig_7009_pilon	+	3747	9	Intergenic	novelGene_23611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	565.375082909567	4	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	120	1190	444955	537231	TRUE	25	TGACCTGTTGATTGCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGERTRQDRGIPSSKVTLHTRGSVLAPRVRRRNPHTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGEKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDSKKSTITHEQKMHKRTAASSPSASSMDWMMMCLEVVFFFFLLLF	430832	540025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430938_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991_518118_522866_523002_536325_536672_537095_538796_539032
883633	contig_5488_pilon	+	4043	6	Intergenic	novelGene_178352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3589	3948	469865	470224	FALSE	30	TGGAACTCTAAAACTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRQPPVQVCGIQAAAVSRSRDCSRGKQRRLSQVKKGGAWESVYHQLPVVLSPPGSSVRLLSRTPCLLVSDRSPRWRIRAALASRGPLHDSLLALRSLVSFLTPFGAWLSSLSLHLMF	265718	470319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5488_pilon_+_265920_266040_267907_389894_390379_396838_396904_397050_397163_469004
883634	contig_6823_pilon	+	4091	1	Intergenic	novelGene_131235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	435	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAAAAAAGGAAAATTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329250	333341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_329200_333300
883636	contig_5125_pilon	+	2662	7	Intergenic	novelGene_43411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_6	1630.31044248906	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	603	1412	35654	58735	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQAQISTRTAANQKCQSEVQQPPTIISQLPVGASIPLLNAK	25942	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58615
883637	contig_7707_pilon	+	2767	4	Intergenic	novelGene_72239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1975	2274	1435772	1436071	FALSE	25	TGACTATAGCGCCATACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGMSLCICTECGSNFQAAWYCLARRGSQAEKRKIKQTNQNRTNQSKQTKKPWGSHQRGGTGWEAVSQSSGVLPPFRKKQRWCTEPGILEKGGGGGEK	1226379	1436564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1227366_1405617_1406190_1433690_1433863_1435527
883638	contig_10126_pilon	-	6965	2	Intergenic	novelGene_105746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCGGAGGGGGCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168907	161331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_165722_166332
883639	SIRV6	+	1128	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	382	18	112	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	GTCAATGGCTATGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
883640	contig_546_pilon	+	4729	2	Intergenic	novelGene_117232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2358	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCAAAAAAATCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151468	156561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_154719_155082
883641	contig_13074_pilon	+	3546	4	Intergenic	novelGene_153422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1380.10080147148	2152	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	144	608	403694	451174	FALSE	40	TCTCCTGAAATATTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403480	454112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403596_403665_403817_449108_449279_451002
883642	contig_20199_pilon	-	847	3	Intergenic	novelGene_82532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	689	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	104	439	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44090	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
883643	contig_6227_pilon	+	6011	3	Intergenic	novelGene_49617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1880	2458	317907	372878	TRUE	65	TTTAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMHDVIEGLRSRFETVEYRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGS	316027	376671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_318484_372876_373273_373512
883644	contig_17144_pilon	+	4736	9	Intergenic	novelGene_29118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	476.150563766336	62	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	2566	4248	11605	23384	FALSE	25	TAAATGGGCTCCAGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNPFVYLPCVFVTRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKMKEKGSFSDTGLGDTKMTSDPFAPKTDAEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIAGVNKNQEEEKSGKWEGLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFSERSRKEDRGGAKRSESGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRGKGDFSTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGSYSGNNNNNSNNDFQKRKNFLVLLILSATGVETGGQFLVCFLRNF	5053	23872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_12357_13329_13503_14254_14367_15442_15528_17464_17653_19971_20171_20624_20714_23299
883645	contig_5125_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_43462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGCTTGCACCCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59985	58715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_58700_60000
883646	contig_6058_pilon	-	3214	8	Intergenic	novelGene_172396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	418.28727556305	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	119	1654	401483	385415	FALSE	30	GACTTTGGAGAAATGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFETPGLLTTKFFEALSAPEATKRARPGNPQPLQTPAPRFEKMAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401601	383854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401364
883647	contig_7963_pilon	-	5394	1	Intergenic	novelGene_58496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1887	2246	138374	138015	NA	65	TATATAAATAAATAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNSLKLECNTQDEHYLLNELNSCFKMTSWDSFGSSIKSCFQAIHLGIPLVSRYPVSLVSNKNLKFCSTILPTFDEDPTIGSLIKKFSNGSWAPSISSWSHGKGVSNSFFIFPPRLTKK	140260	134866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_134900_140300
883648	contig_2278_pilon	-	5007	1	Intergenic	novelGene_118089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2125	2493	648615	648247	NA	45	AAAATGCTATTTTTAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVPGEGFLYRVRRKVLVINLPLVEKLLSTGTLGPKDKLYSQRCFLGGMRSRRLSAHFSLYISKDIGLRHNLILYIKSCLINITATNPILLTLTLQRQNLQHTGKSHQMIKWWKIIQYWES	650739	645732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_645700_650700
883649	contig_20819_pilon	-	2161	2	Intergenic	novelGene_55646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACTCTATGTCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43375	35416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_37316_43113
883650	contig_6375_pilon	+	2181	4	Intergenic	novelGene_73055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	542	694	636996	637148	TRUE	25	AAGTTGGTTCTAGGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLIDIYRTLHPAAAKYTFFPNPHGTFSRIDHILGHKASLNKIQSIEILQSIFSDHKAIKVEISNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYGVIEEIRDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRSQFIAKNAHIEKEERAQIKTLTVQLEQVEREQQKKPSGARRKEIIRVKAELHEIENRKTMERVNKTESWFFEKINKIDKPLAKLAKEKQETKQITHIRNEMDDITTDPT	621882	768085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_621921_636492_637344_757684_758662_767770
883651	contig_6576_pilon	+	1372	3	Intergenic	novelGene_42395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	87	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	122	649	1301228	1303557	FALSE	20	AGAGAAGTTTCCTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHSFQTQKINLGKCLVMSVEQPYLCLQ	1295655	1304280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301679_1303480
883652	contig_5039_pilon	-	5685	1	Intergenic	novelGene_64765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	5033	5605	120595	120023	NA	25	CCAGCACGTTAACCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIQIELKKEKKKKPQTQLLEKRICDDVRGLVTWSSEMTNVSAERETDHVQRPWNKWVPLAHCAAGAQRYWGPVFRRDRGRFLLSQLHKALLGRIFISTTGVTRCQRLWRCRPLGILDLLKDGLGGWLEGGASTAAQIFPRVPLSLGLGAWARKGQESLAKTSHCRVNSNSRRPQVCQSRTVLCRVFND	125627	119942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_119900_125600
883653	contig_4364_pilon	+	1958	6	Intergenic	novelGene_396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	21606	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
883654	contig_10861_pilon	+	1196	9	Intergenic	novelGene_39235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGCTCGGAGATTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603077	614324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605111_605181_605704_605897_606403_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611260_611524_611611_614295
883655	contig_16775_pilon	+	6958	35	Intergenic	novelGene_107745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	315.908960704326	644	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	205	1611	134135	174136	TRUE	5	CACCGCGCTGCGGCGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	76533	235762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_76676_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984_177585_178276_178355_179106_179257_181580_181663_187781_187849_188395_188494_189713_189783_189871_190186_191684_191786_209277_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219484_227459_227558_227944_227994_228445_228571_231993_232055_233245_233307_233399_233474_235686
883656	contig_15185_pilon	+	2889	1	Intergenic	novelGene_99470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCTCTTTGTACATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466714	469603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_466700_469600
883657	contig_8322_pilon	-	9215	5	Intergenic	novelGene_143249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2491	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTGGGATGAGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305008	292595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_295076_295472_301404_301681_301873_303492_303654_304556
883658	SIRV7	-	2457	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	3	2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6826	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147920	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
883659	contig_7009_pilon	+	3485	2	Intergenic	novelGene_23669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATATGACCCAGCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523196	527251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_523311_523880
883660	contig_11512_pilon	-	2831	14	Intergenic	novelGene_43350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1161.76487350142	7	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	83	1021	609650	556769	FALSE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKHDPPDAVPHGLRFQRHLPGGCPQPLPH	622283	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556853_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
883661	contig_17989_pilon	+	6070	11	Intergenic	novelGene_150830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	148.509393642288	3097	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2744	3103	269425	271477	TRUE	40	CAGATTCACAATCAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCRRCSLNSRELLSSRRRCLWETAHSKAGPRSCSCRASRIRFNSRKGCLKSKSTFSVDSWHSSSATLSMPCWYRCSTMAICRICCCFSRESHTASETTPQISESKFLSMALPTRETLL	261787	315049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262158_264163_264270_264876_266630_266713_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269825_271171_271311_271437_272963_313567
883662	contig_15112_pilon	-	5057	2	Intergenic	novelGene_124754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5086	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATCTCATGTTCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26219	21063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_25622_25720
883663	contig_13074_pilon	-	2989	4	Intergenic	novelGene_153418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2283	2609	451276	449227	TRUE	15	GCCAACGCCGGATCCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILIPNPWLFGLSDKRSKPPKMMVHLKCQTRDPGSISLIGRKQCCINWLHAGGAREGSHQPVIYTVQVIDVHAWQKSNWVPINKVHHTDHTPPGSFFLIHLSRGHKHL	453558	403301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_403400_403652_403815_449106_449278_451000
883664	contig_10860_pilon	-	4620	4	Intergenic	novelGene_178354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2952	3266	36822	36508	TRUE	15	TGGGCTGCTGCATTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRLDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGSPSRG	39773	1208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10860_pilon_-_1443_34361_34495_34890_35468_36097
883665	contig_11160_pilon	+	1855	2	Intergenic	novelGene_168835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAATAAAATTTTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318243	322412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318363_320676
883666	contig_7207_pilon	-	5348	21	Intergenic	novelGene_72052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_20	236.771044471236	3587	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	519	4172	696514	628468	FALSE	35	TTAAAAGAGATTTCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQAYINEKHYKKIPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPRHVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSFRIFSKGASEIILKKCFKILSTNGEAKVFRPRDRDDIIKTVIEPMASEGLRTMCLAFRDFPAGEPEPEWDNENDIVTGLTCVAIVGIEDPVRPEVPDAIKKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILHPGEDFLCLEGKDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVSEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEPPTESLLLRKPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLVVVFTLLFAGEKFFDIDSGRNAPLHAPPSEHYTIVFNTFVLMQLFNEINARKIHGERNVFEGIFNNAIFCTIVLGTFVVQIIIVQFGGKPFSCSELSIEQWLWSIFLGMGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKEEIPEEELAEDVEEIDHAERELRRGQILWFRGLNRIQTQIRVVNAFRSSLYEGLEKPESRSSIHNFMSHPEFRIEDSEPHIPLIDDTDAEDDAPTKRNPSPPPSPNKNNNAVDSGIHLTIEMNKSATSSSPGSPLHSLETSL	758074	627291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_628780_637109_637293_639627_639736_643300_643513_643980_644195_644422_644615_649857_649965_650325_650414_651074_651255_656875_657114_659130_659373_660702_660946_663524_663740_665433_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_757787
883668	contig_13894_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_62054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	264	795	1122	1916	287084	286290	NA	30	AGTGAAAGTACTTCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKEFDFDAILSLDDLETMPDELLATLDDSCDLFDPLDQETNKEPSQTVNPIGHLPESLSQTDQVAPFTFLQPLPHSLGVLASTPDHSFSLELGSEVDISEGDRKADSLPYVPVVPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYPGSPQHSPSTSGGSPNRSLLSPAALAGSARPKPYDPPGEKVLAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKRAEQEALTDECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRRARGKKRVP	288205	286219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_286200_288200
883669	contig_12901_pilon	+	3429	7	Intergenic	novelGene_142983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	142.411863581967	110	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	2741	3427	155722	156408	FALSE	40	ACATATCATATTCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKYEEKIEKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMNDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSP	129603	156410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_+_129918_141277_141398_149141_149226_150616_150659_152178_152262_153296_154624_154951
883670	contig_15105_pilon	-	1504	7	Intergenic	novelGene_151023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	946.152692046409	15	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	29	751	839916	829338	TRUE	25	CCTATAACGTCTATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839944	828355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828904_829132_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
883671	contig_9705_pilon	+	3391	1	Intergenic	novelGene_41724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAAAAATTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184851	188242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_184900_188200
883672	contig_11422_pilon	-	1901	2	Intergenic	novelGene_98998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
883673	contig_10106_pilon	-	3707	1	Intergenic	novelGene_73900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2040	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTTCACGCTGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177736	174029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_174000_177700
883674	contig_17144_pilon	-	1077	4	Intergenic	novelGene_29188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	96.3512094140782	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	63	782	167982	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168044	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918
883675	contig_5549_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_81692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAGAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759068	757057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_757100_759100
883676	contig_5967_pilon	-	2627	11	Intergenic	novelGene_44341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	472.124866957884	2820	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	190	1335	488569	388566	FALSE	40	AATAAGTATATGAGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517599	387273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_512863_512956_517515
883677	contig_3081_pilon	+	1090	4	Intergenic	novelGene_133958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	28.1937739383873	774	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	156	476	1107895	1191532	FALSE	25	TTACTTACATCTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDPADQHLRHVEKDVLIPKIMREKARERCSEQVQDFTRCCKDSGILMVVKCRKENSALKDCLTAYYNDPAFYEECKMEYLKEREEFRKTGIPAKKRLQKLPTSM	1107739	1192146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1107914_1129274_1129365_1178703_1178795_1191411
883678	contig_6691_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_60175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAATAAAACTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416871	419390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_416900_419400
883679	contig_10345_pilon	+	1516	13	Intergenic	novelGene_158356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1132.01262200953	6307	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	553	1215	14227	24141	FALSE	10	CTGGTATGTCACTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11972_13085_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
883680	contig_6898_pilon	+	3064	14	Intergenic	novelGene_35681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	200	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	138	1892	59668	126535	FALSE	10	TGTGACTTGATCTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESSPNLLQLE	59530	127707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125638_126505
883681	contig_1301_pilon	-	2976	11	Intergenic	novelGene_47282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	939.36001618123	72	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	337	648	268752	259065	TRUE	30	GTGAACTTTTACTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	270379	242484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_243522_243692_244650_247691_247743_249993_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310
883682	contig_6576_pilon	+	3995	3	Intergenic	novelGene_42406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	3	119	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	302	1315	1301561	1302574	FALSE	25	ACACTTCCATGAGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295684	1305254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301437_1301560
883683	contig_12427_pilon	-	1554	5	Intergenic	novelGene_40455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2967.86905876927	10	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	101	592	316061	314393	FALSE	30	CTGAAAGCTGACAGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325942	313430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315982_316064_325844
883684	contig_15744_pilon	+	3750	2	Intergenic	novelGene_83616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGACCAGGATCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190059	195169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_192987_194346
883685	contig_3754_pilon	+	2847	3	Intergenic	novelGene_146822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1628	2068	108837	109277	FALSE	25	CACCAACTAGGGCGGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINPQLEIIQKQQLEIQKINNKISERYDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKRLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRVMWGTIKSKNLRVTGIPEQGKKTENTERIIEDLLTENFPNIRKDEKLVIQEAQ	106828	110056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_107302_107626_107814_107869
883686	contig_5153_pilon	-	2282	3	Intergenic	novelGene_74377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCCACCAAAACATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994899	962885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_962898_971130_971713_993211
883687	contig_4088_pilon	-	7198	9	Intergenic	novelGene_178055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1585	115	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	3195	3632	111019	74476	TRUE	65	CAAGAAAAACCTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVCRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGREAVARPNVAPQPCRKEQRWLLESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAACTGARNPGSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGV	392453	29370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_30767_63681_64441_72899_74016_74180_74508_110613_111703_183229_183264_382589_383234_390253_391221_391587
883688	SIRV6	+	1104	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	422	2	72	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	CATTCGCATGGAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
883689	contig_9706_pilon	+	3036	2	Intergenic	novelGene_20926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCTCTAATGGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179670	183012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_181161_181466
883690	contig_14807_pilon	-	1251	6	Intergenic	novelGene_124651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8683.56550271834	11	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGTTATTTTTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39796	36753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37609_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39620
883691	contig_20550_pilon	-	2630	1	Intergenic	novelGene_142630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	108	302	27663	27469	NA	55	AGAAACTGGATCATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGFWTELDKDAEQNSNTQKKTIYWPDRDWRNPEIMAPRHPFSSVVKSLPRFIVQLGTGQSHKMGLMRHSSPGTRTRRQKGTGKLVIGNSRFTKDSVDM	27770	25140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_25100_27800
883692	contig_10734_pilon	+	3253	4	Intergenic	novelGene_51416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	457	756	2101715	2102014	TRUE	65	AGTATATATTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGSWTELEKDVEQNSNTHKKNQIYWPERDWRNPKSMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHETKWD	2100965	2293009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2101202_2101494_2102200_2102324_2102562_2290934
883693	contig_610_pilon	+	3908	4	Intergenic	novelGene_76706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	652	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211062	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
883694	contig_10958_pilon	+	1982	4	Intergenic	novelGene_5416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	4	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889005_895279_895855_900457
883695	contig_854_pilon	+	1410	7	Intergenic	novelGene_36681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2749	junction_5	3913.35209038662	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	212	1408	1702628	1709542	FALSE	40	CAGCAGATGGAGGAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVRVQPGGRGLSGVSGPWMLASPSGLTGFFWVGHHRGRGCEWTLGALRFLWSDQALWVRFMNWRSPSGPW	1702074	1709544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122
883696	contig_16103_pilon	-	3291	2	Intergenic	novelGene_118956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATACAGAATGCAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024539	1020224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1020266_1021289
883697	contig_11924_pilon	+	1619	2	Intergenic	novelGene_128024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAATTTATATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51743	53489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_52361_52487
883698	contig_12951_pilon	-	4006	4	Intergenic	novelGene_68158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_3	324.341726510105	1194	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	143	619	325807	296988	FALSE	10	TCAAGTGTCTTTGCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRPTADGSPLLGAGGPGVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTIYENRIYSLKIECGPKYPEAPPFVRFVTKINMNGVNSSNGVVDPRAISVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQCYSN	325949	293600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_297135_298383_298510_307070_307220_325752
883699	contig_10057_pilon	-	1747	5	Intergenic	novelGene_162333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	261	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	21	599	64936	35399	FALSE	65	CAGAAAAAGAAAAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64956	34250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
883700	contig_6546_pilon	+	511	4	Intergenic	novelGene_140971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	19401	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	128	472	597703	599657	FALSE	20	GCAGCTGTTGATTTTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597575	599696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
883701	contig_5988_pilon	+	3010	11	Intergenic	novelGene_16089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1942.81719160605	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	395	1108	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210202	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225602_1225859
883702	contig_3018_pilon	+	1368	11	Intergenic	novelGene_78770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	761.815207251732	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	299	1366	371658	499417	FALSE	45	CATTGAGAAAGATGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQSLHAVMVHACRPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKE	370862	499419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_371603_371699_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373
883703	contig_5125_pilon	+	2094	7	Intergenic	novelGene_43448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1364.79930352008	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	27	998	35729	58893	FALSE	15	ATGTTTGTATCTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	35702	59989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54384_54470_54525_58449
883704	contig_5033_pilon	+	3718	1	Intergenic	novelGene_28908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	3037	3420	452335	452718	NA	15	CCTGGCAAGCTGTGAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALCPECRNAYPPIYCTLSCCTFWALSASAPVASRAWQFLHRGPCWEKPPLQVCSWAGPRPPFHALFSVSAQLSCFLPLPTLARLTLRPKGRCMALWSAAGRRARPAQVCRPQEQMAGALLTSCGR	449298	453016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_449300_453000
883705	contig_20951_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_43044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27041	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27000
883706	contig_7707_pilon	-	5074	4	Intergenic	novelGene_72172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGGTTCCCTGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971315	517403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_520788_719176_719184_882622_882812_969821
883707	contig_11253_pilon	+	4472	3	Intergenic	novelGene_126837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	884	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1482	1934	188148	188600	FALSE	65	TTAAAAAAAAAAAGACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKMKQDSYLTPYRKTNSKWIKDLNIKRKTIKFIEEKIGSTLKALIHGINRIQTITNNPQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHYKSDEGQICIIYKKIQHLYKKKTHHPIKKWAKEMNRHFTKEDIQAAN	183060	191138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_183130_183299_184601_188036
883708	contig_14687_pilon	-	8673	24	Intergenic	novelGene_107898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	561	junction_3	559.875134607358	2243	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2324	6975	878	7852	459974	416161	FALSE	20	AAGTTGGCTTGTTCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHGHYTRAQANSPRPAMNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENELKNKNTSKINGEEGKSQSNEKTGEQTLIDGPAPWDQIQEGEKHEEVEKLKSVDSQLQEKKIIHPSEQAALSDHNPNDLLLQECNMEKIHTVELVPKEKFVSGPPTPKCVIDITNDTNSQKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSESKHSIANTKYLETTKQDSDPSWVSDVVKVDLTQSNTNASSGNNQLNLEKEKHQYVSYMSSLSTVSVTEDNKLHKQSPPPETIKSKLNTSVDVPKTKSSPSPEVVKSKITHSPDSVKSKATYVNSQAAGERRLANKIEHELSRCSFHPVPARGSTLETTKSPLIIDKNEHFTVYRDPALIGPETGANHISPFLNQHPFPLHSSSHRTCLNPGTHHPALTPAPHLLAGSSSQTPLPTINTHPLTSGPHHSVHHPHLLPTVLPGVPTASLLGGHPRLETAHASSLSHLALAHQQQQQLLQHQSPHLLGQAHPSASYNQLGLYPIIWQYPNGTHAYSGLGLPSSKWVHPENAVNAEASLRRNSPSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHMPVRPSSAEPHRPLKITAHSSPPLTKTLVDHHKEDLERKAFIEPLRSVASTSAKNDLDPNRSQTGKDGHLHRHFVDPLLNQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLDGERDNYSRVPSSSSSPKSHVIKQDKDLGSSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNSVVNEPPRSYPSKEVSNIYTEKQSSSLAAAVNPAVNPQTLTSFISSLSKPPPLIKHQTESEGLVGKIPEHLPHQIATQSVTTFQNDCRSPTHLTVSSTNTLRSMPALHRAPVFHPPIHHSLERKESSYSNLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWKSNNNLSKEKAEWHVEKSNGKSQAAMASVIVRPPSSTKYESMSAIQLASKDRLSERSSTEANKTDCRKHTEARETGRIILPSVNSDSAHIKSEKIFQSVSQGRVPSSVMSAVNTMCNTKTDVFTSVATTATGSSWGGSEVIYSLSNTTLASTSLECTSSKSVSQSVAQTQECKVSTTASITPASSKTVSAFQPSAGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNIGETEPNAVKNQTSSASLPLESTVVCSTVNKAISVGNGQASQTNQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSNDIQNSVDSKIIVDKYIKDDKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKEKSKLKLQSNSNSAGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPTHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAISLWTHENYEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDACEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDKELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNAQAGNFPIVNGVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKECTLEKQIKEEQEQDNPDSPNCRTSPPVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPNKASKINVKSELKEEPKESRKPAMNENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSNNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNGSVKEFWDGFEEVSKRQKTKSGETVVLKLKDCPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSAYGVAAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGVLSKAGILKKFEEEDLDDILRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKVSKEQGLEILPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIILPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVQSFHLTQELRLLKEEINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKTHEDEVEDMEEN	528123	415339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_416251_416567_416700_421409_421587_422834_422975_425040_425164_425356_425488_425837_425929_426487_426657_429457_429737_430476_430692_431201_431416_431602_431731_433569_433660_442444_442598_443640_443856_445842_446045_450569_452789_453057_453231_456291_457977_458081_458275_458371_458516_459962_460088_523429_523544_527473
883709	contig_7457_pilon	-	4659	23	Intergenic	novelGene_31490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2214	2528	669780	664159	TRUE	15	GGGGTGCTCGTCAAGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVAHSEVKSMSNVRDSNCPPAEGSAPSPLFPNCINEWCHTDKLGLQVWGSTTWVSFRVLLALWSTILSKRFLFRNVRVEIDQRRHQDVGGIHDLIAHDDFSK	671993	612273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_612390_641605_641758_642571_642716_643347_643446_648694_648792_648953_649075_649224_649322_649492_649642_651961_652122_652276_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668843_668906_669727
883710	contig_15720_pilon	-	3908	9	Intergenic	novelGene_41966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.17157285886	1048	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	65	1285	327739	309844	TRUE	20	CAGACACCCTTTTGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGPQSPRSAHTRPPLLLLLLFGLMRERAAESPWGLPVVADGPASFAKEVMAELASQELGKKPWPGGTHSLHYHYLALSEPGQGLPQFLAVGYVDDQPFIRYDSRVGRAQPQALWMAAVDAQYWERETQKLRVWEKVQQVEMWTVMGYHNHSSGKHSAQRMFGCEIQEDGRSSSFWQFGFNGQDHLSLDLDTLSWVSAHPVALRTKRWWETERCYAEYDKAYLQGLCLTSLRRYLELGGQSLIRTEPPKVQVTRHTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPARDKESYQQAPGEEDLHKSQSPSRAVSAQHLC	327803	305899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306266_307586_309909_310220_310254_310619_310728_310843_311120_314402_314679_316351_316613_321157_321266_327645
883711	contig_7839_pilon	+	2381	12	Intergenic	novelGene_45718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	603.284083952505	7	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	131	1594	952473	956091	TRUE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITE	950868	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_956086_956153_956428_956763_956877
883712	contig_10766_pilon	+	3514	2	Intergenic	novelGene_151228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2137	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTTATTGAAAGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213095	217109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_213587_214086
883713	contig_6434_pilon	+	3185	15	Intergenic	novelGene_61895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1264.13627244302	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	98	1855	904814	932457	TRUE	25	TTACATGCATATGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	904716	933833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_904896_913662_913770_916994_917094_918879_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933271_933316
883714	contig_13026_pilon	-	1554	6	Intergenic	novelGene_146294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	53.124758822982	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	759	1169	14211	6494	FALSE	10	TCCTGGACCAGGCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	16989	6108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280
883715	contig_4604_pilon	+	4085	19	Intergenic	novelGene_19138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	1030.4139001176	2921	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	548	2851	358980	379856	FALSE	25	CCACTAGCACCCAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339850	381090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_340012_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
883716	contig_4857_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_48876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTTCCAGTTGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376932	1379377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1376900_1379400
883717	contig_6445_pilon	-	1429	14	Intergenic	novelGene_76898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_11	418.945774689491	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	398	1198	77905	43105	FALSE	15	ACATTAGCCTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88537	42873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473
883718	contig_6898_pilon	+	3655	13	Intergenic	novelGene_35729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2014.87077577088	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	84	1595	59668	125646	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59584	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124413_124953_125008_125481
883719	contig_5062_pilon	+	3480	11	Intergenic	novelGene_157830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	189.897051056619	73	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1064	2308	723798	744018	FALSE	30	CTCAGCAAAAGCATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	621641	745190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622506_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
883720	contig_593_pilon	-	1886	6	Intergenic	novelGene_101980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1470	1823	151237	146164	FALSE	10	GTGAGGCCTTCAGCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLFRWHKITLQESFTKKVVVHCFSNYLGNIIRLKLYKGIAFAISSLFTSGQFESCNSAKLGEICLELGFKKASRYVAHIDYSRSKFFFSPGSRAGGPAPPASETWPAPAGSATGAA	153773	146100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_146252_147446_147573_148889_149001_151208_151420_151589_151658_152554
883721	contig_2100_pilon	-	1705	12	Intergenic	novelGene_50665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	2219	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	52	1356	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185462	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
883722	contig_8254_pilon	+	3943	2	Intergenic	novelGene_48358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	518	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGTTCCAGCAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2231	131135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_2446_127406
883723	contig_233_pilon	-	2112	12	Intergenic	novelGene_14532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1422.45958562178	203	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	233	1669	104176	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKHQGQYLFPEVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRVCAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127023	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104223_109914_109976_126898
883724	contig_12102_pilon	+	2764	3	Intergenic	novelGene_151045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAAGTCCTTATCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4251	7259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_4835_4898_5184_5363
883725	contig_20527_pilon	+	8348	6	Intergenic	novelGene_138587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	1101.03453170189	18	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	43	531	13527	26633	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSM	13484	34941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_26626_26818_27308
883726	contig_13481_pilon	-	1208	4	Intergenic	novelGene_119393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	209	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	28	321	536852	527468	TRUE	30	AGATGAGTTTAATGTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536879	526363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
883727	contig_12479_pilon	-	6850	6	Intergenic	novelGene_56842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1401	143	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2345	2650	174708	174403	TRUE	25	ACACTTTTTGATGGTTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVTVGVQNKTLDDLSVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFVENTDKKMEEFKKTIQEKNAKINS	339201	154597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_157667_173271_175331_335668_335878_335920_336584_337718_337979_338611
883728	contig_7229_pilon	-	1951	5	Intergenic	novelGene_39806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1715.16331219508	80	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	57	623	877468	875654	TRUE	40	CAAAAGGCTCAGTTACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGAGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878209	874187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875264_875401_875960_876729_876869_877346_877499_878183
883729	contig_7059_pilon	+	2476	3	Intergenic	novelGene_178355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAGGGTCAGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25196	55918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7059_pilon_+_25323_40107_41171_54631
883730	contig_17976_pilon	+	2938	3	Intergenic	novelGene_32498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1417	5	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	493	1410	46468	47385	FALSE	20	TGAGTGGCTGCCAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41655	48913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_42064_45524_45585_46443
883731	contig_8476_pilon	-	4946	17	Intergenic	novelGene_121318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	234.479001925012	3037	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1646	2380	160701	40454	FALSE	55	ACCAGGAAAATAAATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSRNGSVVCTYTVNETYTKSVTPVSVQLNSMLCPAPTLNKAGETLDVSVSFNGGKSVFSSSLIVTATECSNGIAAIIAILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPRPPPPPPKEKEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVTIPEETEEPIRPRPPKPKPTYQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEGRCINFSRVPSQ	210532	37887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_40493_104782_104864_106930_107099_113163_113257_114099_114145_130076_130173_144931_145011_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187519_188560_188630_188745_188854_189298_189381_206164_206241_208667_208740_209471
883732	contig_13780_pilon	-	5788	7	Intergenic	novelGene_149111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	1122.10234233187	121	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1626	2132	824289	822800	FALSE	25	CCCAGCTTTCCTTACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLIENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRVSKLCLGL	827408	819143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_822989_823722_823882_824130_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827333
883733	contig_1715_pilon	-	3059	13	Intergenic	novelGene_127178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	215.929708212855	144	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	62	1411	284622	248253	FALSE	20	GATAGCATTGTTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFFFKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	338496	246604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912_311937_338480
883734	contig_299_pilon	+	2368	4	Intergenic	novelGene_129416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	60.8331050224026	3272	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	121	1425	841615	860934	FALSE	85	ATAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGKLVEV	829983	861877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830004_832793_832887_841607_842679_860693
883735	contig_9406_pilon	-	6882	26	Intergenic	novelGene_136151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	745.804860268422	740	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1846	5541	436	5976	155571	34597	FALSE	30	AAATCTAGCACGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHRTSSISGPLSPAYTGQVPYNYNQLEGRFKQLQDEREAVQKKTFTKWVNSHLARVSCRITDLYTDLRDGRMLIKLLEVLSGERLPKPTKGRMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLIWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNIHNFTTSWRDGMAFNALIHKHRPDLIDFDKLKKSNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTKLLDPEDISVDHPDEKSIITYVVTYYHYFSKMKALAVEGKRIGKVLDNAIETEKMIEKYESLASDLLEWIEQTIIILNNRKFANSLVGVQQQLQAFNTYRTVEKPPKFTEKGNLEVLLFTIQSKMRANNQKVYMPRDGKLISDINKAWERLEKAEHERELALRNELIRQEKLEQLARRFDRKAAMRETWLSENQRLVSQDNFGFDLPAVEAATKKHEAIETDIAAYEERVQAVVAVARELEAENYHDIKRITARKDNVIRLWEYLLELLRARRQRLEMNLGLQKIFQEMLYIMDWMDEMKVLLLSQDYGKHLLGVEDLLQKHALVEADISIQAERVRGVNASAQKFATDGDGYKPCDPQVIRDRVAHMEFCYQELCQLAAERRARLEESRRLWKFFWEMAEEEGWIREKEKILSSDDYGKDLTSVVRLLSKHRAFEDEMSGRSGHFEQAIKEGEAMIAEEHFGSEKIRERIQYIREQWANLEQLSDIRKKRLEEASLLHQFQADADDIDAWMLDILKIVSSNDVGHDEYSTQSLVKKHKDVAEEITNYRPTIDTLHEQAGALPQEHAESLDVRGRLSGIEERYKEVAELTRLRKQALQDTLALYKMFSEADACELWIDEKEQWLNNMQIPEKLEDLEVIQHRFESLEPEMNNQASRVAVVNQIARQLMHSGHPSEKEIKAQQDKLNTRWSQFRELVDRKKDALLSALSIQNYHLECNETKSWIREKTKVIESTQDLGNDLAGVMALQRKLTGMERDLVAIEAKLSDLQKEAEKLESEHPDQAQAILSRLAEISDVWEEMKTTLKNREASLGEASKLQQFLRDLDDFQSWLSRTQTAIASEDMPNTLTEAEKLLTQHENIKNEIANYEEDYQRMRDMGEMVTQGQTDAQYMFLRQRLQALDTGWNELHKMWENRQNLLSQSHAYQLFLRDTKQAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIKKQEDFMTTMDANEEKINAVVEAGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRHRKNREAASELLMRLKDNRDLQKFLQDCQELSLWINEKMLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQLISEKPETEAVVKEKLTALHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGKSTDEVDSKRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEILGRIQDKHKKLPEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDPEHLSPS	156006	33690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34621_57774_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329_62420_63104_63330_65137_65402_66993_67141_72060_72152_78954_79158_80220_80978_81865_82004_82096_82968_83738_83893_86062_86366_87519_87679_88906_89025_90288_90477_91297_91411_95493_95610_96485_96567_98217_98310_102173_102348_112698_112851_155462
883737	contig_11285_pilon	-	3448	29	Intergenic	novelGene_5667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	406.176162834677	83	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	30	1940	798530	789437	TRUE	5	TCCGCCAGCGTGCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARALCPLHGLWFLGWAQLLLGPGGTPPTWALNLDPVRLTVYTGPNGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSVVTQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANM	798559	784060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793919_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_795695_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
883738	contig_19032_pilon	-	9155	18	Intergenic	novelGene_172521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1265.97501300935	4071	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	357	1898	162634	157239	TRUE	15	GTCCCCCATCTCAGCGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANSVKGIGAVRHQAGPLCSTNPPPAAAAAAAAARAGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166729	140078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_140207_146808_146874_147686_149038_149652_149755_151627_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_166618
883739	contig_18162_pilon	-	1704	3	Intergenic	novelGene_122317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8802_10177_10809_16364
883740	contig_2036_pilon	+	6387	12	Intergenic	novelGene_131800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	134	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2372	2749	383500	383877	TRUE	25	AAACACCTCATGGGGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILIRILANRTQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQAWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIRIEGKFLNIIKDIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQG	260408	568497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_261248_268221_268572_268620_268912_277223_277791_277856_278086_278643_278656_383416_384682_514640_514774_521250_521573_565467_566455_566583_566848_567369
883741	contig_15666_pilon	+	3622	5	Intergenic	novelGene_70121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2622	2930	108776	109324	TRUE	35	CCCTCAAAGAGCAGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEACQESRASVTEKALHYFFNISVAIEHPADILGPTPCSWRRLPGIPLETQEICSLIRPFKEAF	105644	110587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108105_108198_108579_108859_109098_109378_109948
883742	contig_15327_pilon	-	2791	3	Intergenic	novelGene_70636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3137.5	33	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	484	792	901528	901100	TRUE	35	ATAAAGCAATGGTTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVRQKDGFV	902011	899030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900290_900359_901281_901400
883743	contig_7066_pilon	-	2000	4	Intergenic	novelGene_42148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.884800728252	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAATCTGATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757865	747998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749367_749472_749885_750340_750424_757728
883744	contig_5020_pilon	+	1157	7	Intergenic	novelGene_27813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	978.835021849954	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	180	842	123294	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118460	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119476_123256_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
883745	SIRV7	-	1957	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	287	218	282	-216	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATAGCAGACAACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147636	1221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
883746	contig_9235_pilon	+	4505	2	Intergenic	novelGene_156193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1885	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	238	1386	45805	46953	FALSE	20	CAGATGCTTCTTACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	42771	50072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_42848_45643
883747	contig_12528_pilon	-	3356	8	Intergenic	novelGene_81305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	556.556761320378	219	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	553	1050	966228	937599	TRUE	55	AAAAGAGGAAAAGGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENDGFREEC	968163	931132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
883748	contig_19032_pilon	-	4864	14	Intergenic	novelGene_172535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	224	junction_13	970.975682057964	67	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	806	2421	165	2585	166531	157239	FALSE	55	AAAGAAATTTAGATAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVEPGNGSLDLGGDSAGRSGAGLEQEAATAGDEEEEEEEEEEEGIAALDGDQMELGEENGAAGAADSGPMEEEEAASEDENGDDQGFQEGEDELGDEEEAAGDENGHGEQQPQPPATPQQQPQQQRGAAKEAAGKSSGPTSLFAVTVAPPGSRQGQQQAGGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166695	154959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_165897
883749	contig_2438_pilon	-	1468	5	Intergenic	novelGene_112026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.66025403784439	316	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGGGCGCAGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313518	305087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310775_311771_312081_312303_312405_312725
883750	contig_13760_pilon	-	3436	1	Intergenic	novelGene_61363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGCTTTAAAATCGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399791	396355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_396400_399800
883751	contig_11316_pilon	-	924	1	Intergenic	novelGene_122654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAAAGCTAAGTGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137900_138900
883752	contig_5317_pilon	+	950	3	Intergenic	novelGene_76546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	13	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	22	432	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35260	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
883753	contig_6898_pilon	+	2290	11	Intergenic	novelGene_35688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1651.2715827507	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	134	1534	59668	126940	FALSE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALIPQFAQPRQVPISPLPSPSSKVVTGLCLHLTNLQPGSSYQLCCLLEL	59534	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_126790
883754	contig_14796_pilon	-	2780	1	Intergenic	novelGene_159366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAGCAATAATCCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109435	106655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_106700_109400
883755	contig_6870_pilon	-	2663	1	Intergenic	novelGene_103935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2147	2491	1166628	1166284	NA	25	TGTAGAACCGACCTGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAVKKSNDVLHWADLLQDLFKVLKSKDVTLRTKVHVAQAMIFSVALYACKSWTMTKEEQRRIDASELWCWQRISNIPWTARKMNKSVLKEVQPECSLEARMVRLSSHILWTY	1168774	1166111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1166100_1168800
883756	contig_12427_pilon	+	2377	3	Intergenic	novelGene_40409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	355	1416	39918	40979	TRUE	35	CAGAGACTGGAGAAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILASRVQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINIIHHINKRKEKNHMIISIAAEKAFDKVQHLFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIIRNGERLKTFPLKTGTRQECPLSLLLFNIVLEVLARAIGQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFVDDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSAGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSITPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNNVKMSILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKEMEELIINFLWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTCYTATVVKTAW	39563	94885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_41141_93280_93404_94208
883758	contig_4125_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_25157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2171	2548	894252	893875	FALSE	10	GTTCTCCCACTTCCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGADYQVFSLWGAALSTVGCLATSLAFTHQMPVALPPPAMTTRNVSRHHRCPLEGNMAPLRTAGLGIVTIIPVSKYRSFPVFSTSKTGRKRNTHQKIISYLALFEIPRLQLSYQAPTGGSRQEPH	896498	893682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_895906_895981
883759	contig_10183_pilon	+	2290	3	Intergenic	novelGene_169498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTACCCAGTGATTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4868	178121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_6846_145276_145347_177878
883760	contig_5039_pilon	-	6329	5	Intergenic	novelGene_64766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15631	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1476	1979	129118	128615	TRUE	25	CCAGCACGTTAACCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHLQKQDRMVPVSVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLLLRILQELKQKANKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIRKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLGTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNF	131066	119942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_123952_127688_127804_128388_129683_129854_130429_130729
883761	contig_19534_pilon	-	4199	4	Intergenic	novelGene_151610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	509.876673541968	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	67	822	68652	62762	FALSE	60	AAAAAAATATATATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAVGSRALLWIALLLFATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDGEALQYWYENHNISIPKATLKDNGTYHCEGFVQKLHRISDSLNITVQEAEQIKNYWPQFFIPLLVGILFTVDTALFFFTRQQFKLLLKIKRTRRGSRLLDPQPKTDPQKK	68718	59384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62953_64567_64823_66767_67023_68597
883762	contig_7963_pilon	+	1050	5	Intergenic	novelGene_58404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	18	782	51450	63007	FALSE	20	TGAGGAACCCTTTGCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51432	63275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
883763	contig_14133_pilon	+	2301	1	Intergenic	novelGene_119901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATTTAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98523	100824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_98500_100800
883764	contig_7396_pilon	-	2007	15	Intergenic	novelGene_79599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3144.01595844213	653	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	111	1499	255163	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257069	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_256986
883765	contig_12677_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_110813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTTTTAGTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2932	2163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
883766	contig_21007_pilon	+	849	2	Intergenic	novelGene_161517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	243	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	CTAGTAAGCAAGAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
883767	contig_1301_pilon	-	5716	22	Intergenic	novelGene_47275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	725.680729757894	5591	77	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	83	2302	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
883768	contig_854_pilon	+	7792	38	Intergenic	novelGene_36493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_37	2973.96135093811	880	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1746	5241	176	5416	1649514	1715249	FALSE	40	CACAGGCGTAAAATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1612770	1717625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
883769	scaffold_8345_pilon	+	4053	9	Intergenic	novelGene_107008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_4	301.967894609675	3131	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	52	678	570477	619659	FALSE	5	CCGTGTGTGTGTATGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSAAALRSSGCPATGTMVFYFTSSSVNSSAYTIYMGKDKYENEDLIKYGWPEDIWFHVDKLSSAHVYLRLHKGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELRSYSSLMKVENMSSNQDGNDSDEFM	570425	623034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_580076_580125_583891_583932_591070_591123_598125_598202_602217_602322_602543_602747_612492_612539_619629
883770	contig_20694_pilon	+	1963	2	Intergenic	novelGene_141247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	431	1027	44413	45009	TRUE	50	AATCCTTTCAAACATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQTANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKEWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	43982	62963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_+_45430_62447
883771	contig_2161_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_114931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAAGAGAAGGAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851677	850317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_850300_851700
883772	contig_5954_pilon	+	2189	17	Intergenic	novelGene_28528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	221.311917536652	228	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	151	1977	465084	479031	TRUE	40	AACCTGAAATCAGAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVPTYKWKRQVTQRNPVAQKKRKMSLLFDHLEPMELAEHLTYLEYRSFCKILFQDYHSFVTHGCTVDNPVLERFISLFNSVSQWVQLMILSKPTAPQRALVITHFVHVAEKLLQLQNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHVSPETVKLWEGLTELVTAAGNYGNYRRRLAACVGFRFPILGVHLKDLVALQLALPDWLDPARTRLNGAKMKQLFSILEELAMVTSMRPPVQANPDLLSLLTVSLDQYQTEDELYQLSLQREPRSKSSPTSPTSCTPPPRPPVLEEWTSAAKPKLDQALLVEHIEKMVESVFRNFDVDGDGHISQEEFQIIRGNFPYLSAFGDLDQNQDGCISREEMVSYFLRSSSVLGGRMGFLHNFQESNSLRPVTCRHCKTLILGIYKQGLKCRACGVNCHKQCKDRLSVECRRRAQSMSLEGSAPSPSPTHTHHRAFSFSLPRPGRRGSRPPEIREEEVQMVEDGVFDIHL	463498	479400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463580_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893_467026_467808_467960_468149_468324_468497_468615_470129_470412_471210_471289_471548_471672_472042_472159_477111_477254_477518_477556_477933_478111_478972_479038_479194
883773	contig_8617_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_73388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCATTCTGGAATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61821	60794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
883774	contig_15245_pilon	-	3419	3	Intergenic	novelGene_145217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1682	junction_2	363	40	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	56	463	131120	47478	FALSE	35	CTAACATGGATGAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTVTQLSAPSFSGAPGTMADPRVRQIKIKTGVVKRLVKEKVMYEKEAKQQEEKIEKMRAEDGENYAIKKQAEILQESRMMIPDCQRRLEAAYTDLLQLLVSKDFFVLYFNLFFHLIQGRPNFKIFNTEKNRLMTFFIHLPCVPVYFKIINGV	131175	44521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_47727_56801_56908_131067
883775	contig_16156_pilon	-	2994	1	Intergenic	novelGene_137096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAATTAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711773	708779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_708800_711800
883776	contig_935_pilon	+	1889	2	Intergenic	novelGene_45503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	356	847	5315	5806	TRUE	25	TCAATTCTGACTCAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPTRARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRAKKKKKKATPPAYKRHPKSRLPGRAESKQPAAPGPEPVTPGSRGANEQRPRILARVAAQTWKQPHSRT	4959	7142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_6322_6615
883777	contig_10106_pilon	+	5087	13	Intergenic	novelGene_73869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	627.24828395319	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	160	1140	151101	172575	TRUE	25	ACCCTACGAGGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	131628	177736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131684_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505_174026_175239
883778	contig_3727_pilon	+	2132	6	Intergenic	novelGene_146744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	1196	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	20	TCTTAGACAGTGTCCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	309112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
883779	contig_1150_pilon	-	393	1	Intergenic	novelGene_61429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309323	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309300
883780	contig_10323_pilon	-	3933	9	Intergenic	novelGene_123589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	65	junction_8	1648.99889611091	331	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	820	2463	139	2601	531203	459350	FALSE	25	TAAGAGCCTGTGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPAVHNTELDCLSPEAQRLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEALERQKEFFDSIRSERDDLRDEVAMLKQELKKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	531341	458017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_465065_465159_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208_474245_513276_513364_531137
883781	contig_2036_pilon	-	2084	5	Intergenic	novelGene_131801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	397	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACACCACAATTCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423585	291226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_291311_313856_315231_380165_380216_422888_423267_423387
883782	contig_7356_pilon	+	2986	5	Intergenic	novelGene_60379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCACTGACGCCACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428381	457913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_430732_433742_434072_435515_435620_437471_437532_457770
883783	contig_4093_pilon	-	2488	6	Intergenic	novelGene_27614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2431.50526217814	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	181	558	46358	41737	TRUE	40	GAGAAACTGAACTTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	69189	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41495_41548_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46405_69055
883784	contig_15327_pilon	-	881	3	Intergenic	novelGene_70664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1760	19	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTATATATTGTAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902133	900371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901020_901400_901536_902035
883785	contig_8263_pilon	+	2918	8	Intergenic	novelGene_83073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	248	junction_2	95.6443241112293	1246	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	48	1178	48580	192899	FALSE	15	TAGCCGTTTCCAAGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLALTPWRVYLLISVMLLGRVIMQIIKDLILSRTRGAQLWRSLSESWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	48532	194639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_48641_60217_60249_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
883786	contig_5317_pilon	+	710	3	Intergenic	novelGene_76506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	330.5	8	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAACTAAATGGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33677	43683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35395_43197
883787	contig_1263_pilon	+	2633	2	Intergenic	novelGene_170379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATAAATTGCCATCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51678	54483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_+_53528_53699
883788	contig_16041_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_178362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTGAGACTCTTAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9466	11516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_+_9500_11500
883789	contig_11512_pilon	-	2611	12	Intergenic	novelGene_43380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1157.39373787092	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	40	939	592804	556654	FALSE	40	ACCAATAAATTTGTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNRCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	592843	554981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
883790	contig_4924_pilon	-	9488	13	Intergenic	novelGene_84635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_12	1034.11526866636	5186	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	97	1563	252576	65524	FALSE	20	AATGGAGTGGGGGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	253913	57598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_253836
883791	contig_3747_pilon	+	2706	8	Intergenic	novelGene_24877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3869.49268414518	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	234	1328	201313	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGNYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201079	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202744_202955_203128_203228_203386_203498_203651_203768
883792	contig_2834_pilon	+	1976	5	Intergenic	novelGene_27983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	2029.38944020117	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	130	582	274813	290707	FALSE	75	ACAAACAAACAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDILHNKQISIRICTDWQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238729	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_285323_285434_285547_285746_290617
883793	contig_5033_pilon	-	2231	8	Intergenic	novelGene_28921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1082.02057772126	3791	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	538	987	464569	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477310	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464774_464846_464983_477113
883794	contig_19032_pilon	-	7235	15	Intergenic	novelGene_172532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1111.9407858445	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	459	2000	162634	157239	FALSE	30	ATACTTGGCAAGCATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLRVSLANSVKGIGAVRHQAGPLCSTNPPPAAAAAAAAARAEKQGQQQAGGKKKAEGGGGGGRPGAPAAGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166747	152003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_165840_165917_166610
883795	contig_20199_pilon	-	844	4	Intergenic	novelGene_82590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1236.83502897067	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	104	439	43987	41055	FALSE	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRSWVFCTLDGEEPQKVSVWPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44193	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906_44028_44130
883796	contig_2251_pilon	-	2059	11	Intergenic	novelGene_128467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	114.145740174568	11	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	64	1041	138003	66074	FALSE	25	TTGGTACCCAGCATGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLIHCVRNTPAFLADRLHQAVKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKVSFLLKIAKHILPFLTYPFSFLFLKRQKSGDPLTDCVEHSLELSLHPGWSKGE	145204	65055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_66359_70007_70067_78774_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988_138042_145179
883797	contig_5039_pilon	-	9024	7	Intergenic	novelGene_65019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1703	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3382	3684	1792004	1791702	TRUE	10	CCGGCAGTGGGAGCGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGHSANSELTPPLKSTFQPKTRQACKTVTHGRNLLLSPSKCKRTNRQHLPKSEAETAGRDRKPGQTDTGNPGWKGGECRHTAGIAINVTKQSVYKISE	1795385	1756797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1756870_1773326_1773467_1775229_1775344_1776931_1776997_1781411_1781508_1784537_1784594_1786904
883798	contig_7169_pilon	-	3807	6	Intergenic	novelGene_178363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	885	1241	240452	239824	TRUE	70	GAAAAAAAACAGCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPTALCPTVQSLREFGSVYEASMTFPCTSCAGFPSILYHHTLHQSYHLSLVYLVPPQPSIPHSQQRLFLFVCKLLHEFLQQRSRTIFVLLYLNYFTQHNVLQFHPFPLTLLY	241461	99001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7169_pilon_-_100334_163874_163987_238120_239166_239746_239847_240118_241117_241241
883799	contig_20183_pilon	+	2552	6	Intergenic	novelGene_174232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.099975621647	2687	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	713	1435	35750	41955	FALSE	40	GTAACAAATGCAGCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVRLAANRHAGSFGTRGEEVSSVEFKKKNVKQRTWRTNHRKTFVGSVREGQGFALRRKLKVQQSYKKLLWKEKKAQISQDSQFTDRYPDHLKHLYLAEEERLRKQLRKVPRPLPEEQVNQPLREEQVDQPLPEEQCSIDQPLPEEQCSKTVNSFATRNKNRKKTSNQKAQEEYAQIQAKRAAKKQEFERRKREREEAQRLYKKKKMEVFRILSKKTKKGQPNLNVQMEYLLQKIQEKN	9034	43072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20183_pilon_+_9147_15276_15437_35309_35904_36987_37295_39480_39581_41793
883800	contig_6102_pilon	-	1937	12	Intergenic	novelGene_31783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	460	759	355700	353188	TRUE	20	TAACGCCTTGGAAGTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLCPASLALPSPELTRTSTAYTSCTSNSAFSWSFFCWSVGFWIMVFSPSMTCCFNWCDNIPSIGVQLNEWATLFQASVTCVFWFPGLTRRRAASAQR	357384	351426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_352383_352649_352758_352864_352933_353141_353235_354960_355025_355269_355351_355504_355582_355669_355804_356495_356602_356753_356873_357036_357087_357303
883801	contig_12869_pilon	+	3527	1	Intergenic	novelGene_75330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1956	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	90	308	67431	67649	NA	20	ATCTTCCTTACTCCACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSCKATQPCASCSDLDSQCLYESSCNRAAMAVWWTTVLVQCIALTLHSQAAFRWMIIGGFKCWQTLWPLCLGDESRYDCYFVPLECHVLLRAECYVCLTSY	67341	70868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67300_70900
883802	contig_4093_pilon	-	2817	6	Intergenic	novelGene_27623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	121	858	69245	41737	FALSE	25	GGAGGCAGTGAGTCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72544	39777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
883803	contig_14785_pilon	+	3375	2	Intergenic	novelGene_158419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTATACCTATTTGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150534	193721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_+_152230_192041
883804	contig_5988_pilon	+	2961	11	Intergenic	novelGene_16095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1946.70923355287	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	191	904	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210815	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210974_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225772_1225874
883805	contig_12596_pilon	-	1779	2	Intergenic	novelGene_172734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149761	1360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12596_pilon_-_2303_148924
883806	contig_3948_pilon	-	2845	7	Intergenic	novelGene_53190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_6	143.123489802804	1606	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	185	934	866419	840803	FALSE	10	TTCTCAGCCTCTCAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869695	838891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
883807	contig_21007_pilon	-	1321	2	Intergenic	novelGene_161524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1862	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564
883808	contig_9177_pilon	-	2841	19	Intergenic	novelGene_32547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_15	765.159623869425	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	763	2400	7310	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	9480	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8541_8728_8789_8903_9054_9147_9319_9407
883809	contig_9720_pilon	-	1536	3	Intergenic	novelGene_116769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	47.5	1066	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	83	352	259809	208427	FALSE	50	CCAGCTTAAAACCCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DITTLTGVPEEHIKTRKVRIFVPARNNMQSGVNNTKKWKMEFDTRERWENPLMGWASTADPLSNMVLTFSTKEDAVAFAEKNGWSYDVEDRKVPKPKSKSYGENFSWSRRTRVSTK	259891	207242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_208531_250454_250529_259717
883810	contig_15760_pilon	+	3080	3	Intergenic	novelGene_131066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2604	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTAGGAACCCAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450851	455580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_453802_454369_454447_455527
883811	contig_9653_pilon	-	4113	15	Intergenic	novelGene_48272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_14	954.833303647868	4437	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	100	2220	1040020	1006903	FALSE	20	ATGGATTTGATGTGGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1075353	1005009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825_1040050_1075283
883812	contig_5945_pilon	+	1562	7	Intergenic	novelGene_104564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCCACATCTGCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215591	240957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_240728
883813	contig_15327_pilon	-	1450	2	Intergenic	novelGene_70667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAGAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901569_901843
883814	contig_5020_pilon	+	1560	8	Intergenic	novelGene_27800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	889.218413976624	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	322	1251	122915	125772	FALSE	5	ACCTTGGTGTCTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118457	126081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118547_119465_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
883815	contig_7527_pilon	+	1513	2	Intergenic	novelGene_139573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_1	0	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTCTGAATTTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94277	97263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_94590_96062
883817	contig_4232_pilon	-	1922	2	Intergenic	novelGene_63446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGCTGTATCGCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546352	542764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_542976_544641
883818	contig_6445_pilon	-	4185	1	Intergenic	novelGene_77032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	2528	3124	542546	541950	NA	20	GGGTTAAAATGTTGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRCKQCRCPATDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	545073	540888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_540900_545100
883819	contig_19378_pilon	+	4038	4	Intergenic	novelGene_73770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCAGCACCCGACGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14374	19128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_17497_17676_18125_18241_18338_18756
883820	contig_19402_pilon	+	2923	12	Intergenic	novelGene_80760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1612.67826101604	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	10	1770	23458	145560	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAERNDGLSGWCLGLGCLVRSSG	23448	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97706_145498
883822	contig_10386_pilon	+	2544	3	Intergenic	novelGene_173547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	1519	2544	782099	783124	FALSE	20	CTTCAGCCCTCAGGCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLQSEDKQ	779503	783124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_779953_780572_780752_781208
883823	contig_7457_pilon	+	3770	7	Intergenic	novelGene_31504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	425	junction_1	202.269416043718	36	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	909	1562	663260	669784	FALSE	15	CTGAGAGCGTGGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKEGGITFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSNTIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMDLTSECATSPM	662098	671992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_663001_663253_663349_663458_663599_664102_664316_668470_668514_668793_668907_669728
883824	contig_546_pilon	-	5948	6	Intergenic	novelGene_117173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2384	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTACACTTCCTCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145518	61157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_61244_119793_119882_123931_124065_136648_136837_139865_140003_140202
883825	contig_15371_pilon	+	1449	6	Intergenic	novelGene_151477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_3	224.832382009354	284	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	41	817	222106	230717	FALSE	40	GTTATATAAACACTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAERPSPDVKAELFELLFQTLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	222065	231349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_222117_222289_222462_225539_225702_226862_226962_227140_227372_230615
883826	contig_11815_pilon	-	2291	2	Intergenic	novelGene_50876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAGAAACTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29209	8458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_9288_27747
883827	contig_4105_pilon	+	3899	15	Intergenic	novelGene_21487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2651	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	527	874	98626	98973	TRUE	40	CAAAGGACCCGGATGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAAANKPAPLHGWTGSSLGLMGERLANKRPRCHFSAGTRIPPTKLTRTKAHIKAGNLSYCVARETRTLLNSSLHHHLFSQGKLKNTHTHTHWSRPHYKSKHWCGIIRQKEMCF	98099	137469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_100234_100868_100941_101402_101510_102097_102154_102710_102927_104164_104264_105789_106014_108691_108870_108973_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121988_137436
883828	contig_14441_pilon	+	2901	5	Intergenic	novelGene_100528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	406.858083365687	5	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1258	1686	116728	117610	FALSE	45	AATTATCTTTGAATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111194	118825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
883829	contig_10225_pilon	-	5446	4	Intergenic	novelGene_86764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2805	3110	4438	4133	TRUE	0	TCTCTTCGTTTTTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFEGNVFSLCPLRMMLAIGFA	94336	1242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_2427_2980_4490_81319_82681_92944
883830	contig_6291_pilon	-	11404	6	Intergenic	novelGene_164782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.2	5254	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	10835	11242	357054	354898	FALSE	30	ACTCTGAGGCAGTGACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRGRDPSQETVQVIHGQREDLFFTLLFFTDLQHPGGHHPPHVGLDVLLHAFEVGALRKVALLDGEQVLQNAVVVEQVGVRHGPADRVHLAAQQLHGEPGAHSFPCSLRTGKVSLFFFFLRGEGKGFPLPPSFG	391717	354735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_355208_356956_357172_359958_360119_370426_370578_381244_390902_390968
883831	contig_9981_pilon	+	3389	2	Intergenic	novelGene_121018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	238	765	10529	11056	FALSE	50	CAAACTAAAAAGTACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVLSKIFGNKEMRILMLGLDAAGKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS	10072	13680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10184_10402
883832	contig_3942_pilon	+	499	5	Intergenic	novelGene_128756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5794.82184260224	74	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	19	405	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792274	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792285_793512_793624_793794_793882_795075_795179_795313
883833	contig_3077_pilon	+	1593	5	Intergenic	novelGene_26816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	720.705687156692	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	393	872	479489	481662	FALSE	30	CATTCAGAGATTTAACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	473949	482383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_474139_476732_476905_479457_479646_481023_481218_481533
883834	contig_10890_pilon	-	1593	6	Intergenic	novelGene_166785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	444.43474211632	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	193	798	157083	126635	FALSE	60	GAAAAAAAATAAATGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLIRRPHVEKQDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNWEKTLQINLVSVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSIAGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	157275	125839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_149081_149179_156819_156927_157046
883835	contig_615_pilon	-	3262	1	Intergenic	novelGene_80037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1108	1437	10929	10600	NA	50	CTACAAAAAAAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLSNVYLCEGTPGCILAQLGISCIISSRGTFPSVFLPLPTSLALFLHSSDIFILLKIDELLKSTTKQDISDFTIAHSVTVLKLYTSFNPYDENFKNLFLPTLQEE	12036	8774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_8800_12000
883836	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	635	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
883838	contig_6365_pilon	-	2352	4	Intergenic	novelGene_134004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_2	813.685579460655	1045	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	302	667	50867	47435	FALSE	20	CTTCCTGCTAAGCAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEYKKIILLEELCVINDYSFKILKNFLAHDLQLTRKMEEEYDRIKIVDLMEEKFQGAAYRMLKRAKLKVAKDIEEKRTLIKSSKQDRTGPAMSTFTTQEGQEESERGPASTPVNENTAV	56712	45749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_47492_49511_49610_50656_50888_56431
883839	contig_5341_pilon	-	2010	4	Intergenic	novelGene_168029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_3	509.513711515424	220	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	241	1344	340653	338480	FALSE	30	TCTACAAAATCTCAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEVGSLDVGSLRALLRERAAHCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAKGAMGLEHIVPNSELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDCAKRDSTVALAAGALCREARTTQVFFLKGGYEAFSAFCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340028_340286
883840	scaffold_12510_pilon	-	633	6	Intergenic	novelGene_151354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	947.440678881797	169	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	252	584	148136	145678	FALSE	25	CATTTTTCTTAAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRLWSKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGNSGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI	149120	145628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_145702_146287_146433_147758_147912_148125_148171_148433_148623_149092
883841	contig_15744_pilon	+	2125	2	Intergenic	novelGene_83622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAATGCTCTACATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192443	195860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_192986_194277
883842	contig_5696_pilon	+	1240	3	Intergenic	novelGene_117522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGGCGCAAACAAATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435075	437593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_436113_436686_436782_437485
883843	contig_5649_pilon	+	3494	1	Intergenic	novelGene_82445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	842	1321	1501980	1502459	NA	10	CTTTCTGGCCAGGCGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVQVGVQNKTPDDFPVEENALELSDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDEFMENTDKKLEDFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKTNNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIKDKHLATTLFQENSEKRKTKRP	1501138	1504632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1501100_1504600
883844	contig_11816_pilon	-	5818	8	Intergenic	novelGene_98566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_7	339.493500283428	1601	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	16	2556	1347378	1265886	FALSE	30	CAACCATAATCTCTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPASPVRGTAAASTAAVSEKEPFGKLHSLSGDPPGSLSAKKVRTEEKKAPRRVNGEGGSGGNSRQLQSPPAAVPSPQSYGSPASWSFTALSAAPSPSSSSRSSFSFSVGSAAPSSASASSSQLLPRKLLVPPTLLHAQPHHLLLPAAASSANAKPRRPKEKREKERRRHGLGGAAEAVGAAREENGEVKPLQRDKIKDKIKERDKEKEREKKKHKVMNEIKKENGEVKILLKGGKEKPKTNIEDLQIKKVKKKKKKKHKENEKRKHPKMYSKSIQTICSGLLSDVEDQEAKGILNDNIKDYIGKSLDTKTYDSKIPENSEFPFVSLKEPRVQNNLKRLDTLEFKHLIHIEHQPNGGASVIHAYSNELSHLSPVEMARFAEEFVGLVFSENENSAAFYVMGIVHGAATYLPDFLDYFSFNFPNSPVKMEILGKKDIETTTMSNFHAQVKRTYSHGTYRAGPMRQISLVGAVDEEVGDYFPEFLDMLEDSPFLKCTLPWGTLSSLKLESRKDSDDGPIMWVRPGEQMIPVADMPKSPFKRKRTTNEIKNLQYLPRTSEPREMLFEDRTRAHADHIGQGFERQTTAAVGVLKAVHCGEWPDQPRITKDVICFHAEDFLEVVQRMQLDLHEPPLSQCVQWVDDAKLNQLRREGIRYARIQLYDNDMYFIPRNVVHQFKTVSAVCSLAWHVRLKLYHSEDDSSQNTAIQETSTSSDATSSVLGTHTDNMICAMSKTSLDSFSDKLHPKYELQRIKHEPIASVRIKEEPVNVNISEKTRASNNTDSKNVKAKFDHVHFTQFKTDVDSKFENSNKDLKEELCAGSLISLVDTRQHSSTHSNQDRKDDDILC	1347393	1262623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1266525_1266610_1266720_1280177_1280346_1284821_1284965_1286533_1286672_1302512_1303154_1312055_1312173_1346792
883845	contig_5718_pilon	+	4165	5	Intergenic	novelGene_110303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	965	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2754	3401	172686	173333	TRUE	60	AAGAAAACAATATGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQKKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENADKKLEEFRKIMQELNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGAVEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLLEENSEKRTNKNEETLRVTRDTIKSKNFRAIGVPEQGEKTENTRRIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRIPYRRDPKRKSPRHS	116275	174264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_117245_117812_118833_171866_172596_172650_174024_174190
883846	contig_2067_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_158934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCAGTCTCTGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606115	605025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_605000_606100
883847	contig_15449_pilon	+	3784	15	Intergenic	novelGene_33576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	581.187138360716	357	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	243	2777	37166	54621	FALSE	15	TGTTTATTGGTTATACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27813	55628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27877_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
883848	contig_6270_pilon	-	2613	5	Intergenic	novelGene_99877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	166.303186980887	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	56	421	1082152	1057601	TRUE	20	GCATAAGTGTTCCGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPYYHGPLSKRDCETLLLKEEVDGNFLLRDSESVPGALCLCVSFEKMVYTYRIFREKNGYYKIQTAEGTQKQLFPSLRELISKYQKPNQGLVVRLLNPVMSTHLRCRRLKIQLNDIYGK	1082207	1055124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1056694_1056977_1057609_1058856_1059017_1061613_1061678_1082018
883849	contig_10323_pilon	-	3380	5	Intergenic	novelGene_123581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1937.47187076355	321	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	114	2045	468739	459350	FALSE	15	GAGCCTGTGATTCCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNAQLDNEKTNFMYQLERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	473551	458014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467477_468688_468779_473477
883850	contig_4009_pilon	+	3424	8	Intergenic	novelGene_145456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	493	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCACTTATATGAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278794	550581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4009_pilon_+_278929_279093_279450_279744_280505_411823_411843_482467_483120_508615_509349_538339_538988_550459
883851	contig_5400_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_162822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTATGGCCATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269219	267570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_267600_269200
883852	contig_10106_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_73901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1537	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTTAATTTCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176660	175257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_175300_176700
883853	contig_12677_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_110869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGACACACCAGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3758	2948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
883854	contig_16413_pilon	-	5397	3	Intergenic	novelGene_178364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1451	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	4802	5197	1551	1156	FALSE	10	CCACTGGGACGGGTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISHCCFCLISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFQGIQ	10710	955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16413_pilon_-_3988_8260_9162_9246
883855	contig_1452_pilon	-	2713	3	Intergenic	novelGene_115132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1178	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	150	542	700626	699652	TRUE	20	CTTTCCTGATAGTGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	700775	697305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_697699_697873_699953_700534
883856	contig_11328_pilon	+	832	6	Intergenic	novelGene_88396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1688.81681659083	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	40	789	643683	647995	FALSE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643643	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
883857	contig_1009_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_121725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTTAGGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111475	109423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_109400_111500
883858	contig_9955_pilon	-	841	5	Intergenic	novelGene_21258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	997.511152819857	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	290	586	23469	13719	FALSE	20	TTTTTCTATGGATTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVDRAEEEEPLKATEELAAQKREQRLRKFRELHLKRECAAKGEDYEKVKLLEISAEDAERWERKKKRKNPDLGFSDYAAAQLRQYHRLTKQIKPDMETYERMRDKHGEEFFPTSNSLIHGTHVPSTEEIDRMVVDLEKQIEKRDKYSRRRPYNDDADIDYINERNAKFNKKAERFYGKYTAEIKQNLERGTAV	27068	13463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_13885_22538_22638_23437_23529_23860_23979_26956
883859	contig_15410_pilon	-	2769	11	Intergenic	novelGene_130583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_10	56.9386511958265	52	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	1536	2618	57724	54277	FALSE	25	ACTTCCCCAAGCAATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQPLRGVTSLHFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPLMEKGHLDHEQVGSMGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	60672	54125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_57295_57401_57488_57564_57669_57870_59282
883860	contig_9471_pilon	+	3062	1	Intergenic	novelGene_21711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAACCTTTCAGAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96989	100051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_97000_100100
883861	contig_18843_pilon	+	4285	9	Intergenic	novelGene_165612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_8	639.190308124271	28	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	28527	38569	TRUE	25	GATTTTTAAGCTCTGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVAVDKMSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSR	28507	47893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_40125_44191_44351_46028
883862	contig_9272_pilon	+	4474	23	Intergenic	novelGene_125880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_16	194.08878006071	1072	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1284	3852	621	4472	251187	314269	FALSE	55	AACTGAAGAGAAGGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIVEDGGQTQYEATLQQGFQYQPTTEDLPPLTNGYPSSISMYETQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVSFGKQVDSPSATADADISDVQSVDSSLSRRSFGMNKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLTLLPDGKFICMECQTGQHPCFSCKVSGTDVKRCSVGACGKFYHETCVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSVEKDIYKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSIFVSSYILICSNHSKRSSNSSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIDMPEGCWNCDDCKAGKKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAETCNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVVGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFTKRLYPDAEIIKTEQRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFYMLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFNYNLDCLGNGRTECHCGAANCSGFLGVRPKSACAS	214931	314271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_215475_251109_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_281875_282007_282540_282670_283486_283614_289341_289540_290013_290188_294983_295131_298470_298628_302280_302484_303122_303236_303826_304097_310458_310576_312365_312508_313585_313693_314254
883863	contig_6738_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_166131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAGTAAATATATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38296	40636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_38300_40600
883864	contig_16930_pilon	+	3154	1	Intergenic	novelGene_139168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTCACTTTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224174	227328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_224200_227300
883865	contig_6137_pilon	+	20438	17	Intergenic	novelGene_59210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_6	1076.41909059332	5990	164	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	7199	8077	1336783	1353702	FALSE	50	GGAAAAAAAAAATTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1307385	1366063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332239_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
883866	contig_11564_pilon	+	2799	9	Intergenic	novelGene_158549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCCGCCTACTTCCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39852	101156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_41171_52105_52426_52867_53032_53824_53921_54953_55044_59669_59762_60761_60848_62470_62607_100659
883867	contig_8712_pilon	+	1735	3	Intergenic	novelGene_58784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	227.5	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAATTCTCATGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286989	323260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_321770
883868	contig_12938_pilon	+	1286	6	Intergenic	novelGene_99726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	841.503036239323	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51973	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_81336_81459_83391_83470_84550_84635_85468
883869	contig_9389_pilon	+	646	4	Intergenic	novelGene_84025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2136.54570640451	45075	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	20	364	584401	585986	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPDMISH	584381	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_585965
883870	contig_11816_pilon	+	6137	5	Intergenic	novelGene_98440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	5536	5859	645433	645756	FALSE	0	GCCGTGCCTGGGCTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSGIIFLNYSIFLSVFSTNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIALNIRDLNSLSGSSSAFSSNGKSSDVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	217421	646034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_218235_350315_350876_470676_473668_555086_555188_644362
883871	contig_16411_pilon	+	8115	31	Intergenic	novelGene_77294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_30	1106.81140067613	2032	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	3212	5929	131665	241370	TRUE	35	ACCCTAAACTAATGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	75827	243915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_75894_99637_99778_101239_101330_111959_112038_113690_113793_120329_120512_122766_122864_124494_124624_127063_127169_129442_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241758_242116
883872	contig_8660_pilon	-	905	3	Intergenic	novelGene_136499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_2	230.5	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	315354	308633	FALSE	20	CTTAGTTTCCTGTCGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGDNIYEWRSTILGPPGSVYEGGVFFLDITFSSDYPFKPPKVTFRTRIYHCNINSQGVICLDILKDNWSPALTISKVLLSICSLLTDCNPADPLVGSIATQYLTNRAEHDRIARQWTKRYAT	315354	308096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_308731_310288_310437_315231
883873	contig_9633_pilon	-	3784	3	Intergenic	novelGene_139640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1325	junction_2	32	211	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3105	3521	1141485	1138462	FALSE	20	TCACTGGATTGACTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1144589	1138198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418
883874	contig_6445_pilon	-	1454	16	Intergenic	novelGene_76930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	785.839802730528	7	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	469	1227	77863	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96340	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85405_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
883875	contig_19816_pilon	-	2143	4	Intergenic	novelGene_156486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	300.306880078066	3674	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	22	372	125833	125483	TRUE	10	GAATCCTGTGTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	125854	123030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124225
883876	contig_5039_pilon	-	4446	1	Intergenic	novelGene_64762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	3794	4366	120595	120023	NA	25	CCAGCACGTTAACCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIQIELKKEKKKKPQTQLLEKRICDDVRGLVTWSSEMTNVSAERETDHVQRPWNKWVPLAHCAAGAQRYWGPVFRRDRGRFLLSQLHKALLGRIFISTTGVTRCQRLWRCRPLGILDLLKDGLGGWLEGGASTAAQIFPRVPLSLGLGAWARKGQESLAKTSHCRVNSNSRRPQVCQSRTVLCRVFND	124388	119942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_119900_124400
883877	contig_10319_pilon	-	3206	1	Intergenic	novelGene_147254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGATACAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228530	225324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_225300_228500
883878	contig_15407_pilon	-	6305	9	Intergenic	novelGene_123075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2762	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGCTAGCTAATGTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475397	449459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468070_468151_468305_470254
883879	contig_252_pilon	-	1257	7	Intergenic	novelGene_99911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_6	307.365914758868	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	352	1083	68085	37945	FALSE	15	TGTTTAATTCCTCTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDYGEEQRNELEALESIYPDSFTVLSETPPSFTITVTSEAGENDETVQTTLKFTYSEKYPDDAPLYEIFSQENLTDIDVSDILKLLALQAEENLGMVMIFTLVSAVQEKLNEIVDQIKTRREEEKKQKEKEAEEAEKQLFHGTPVTIENFLSWKAKFDAELLEIKKKRMKEDEQAGKNKLSGKQLFETDHNLDTSDIQFLEDAGNNVEVDESLFQEMDDLELEDDEDDPDYNPADPESDSTD	68436	37770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_38067_41271_41335_41811_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_68012
883880	contig_6898_pilon	+	3816	12	Intergenic	novelGene_35704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1596.84911855755	2432	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	134	1756	59668	125646	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124800_125008_125481
883881	contig_3465_pilon	-	1623	4	Intergenic	novelGene_173390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGGTGTCTGGGGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905148	684251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_-_684777_838171_838428_869383_869406_904328
883882	contig_9434_pilon	+	5453	24	Intergenic	novelGene_150479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_6	223.271457350233	1337	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	1523	3922	86420	124169	FALSE	10	TTTGCTTTCTAGAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKKKKKAQQLENKEVSEQIELSAAVEVVDQGAPDKEESAPPVDPEEEEETEDGGLDDWEAMASDEEREEEGTTVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEEEEESDEEEEEEGESEVSEGDEEGEKVSDDKDAGGTLDRRPSKDMSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKMKILPQFIFNSRDPIVIGVTVEAGQVKQGTPLCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDVAKKGQEVCVKIEPIPGESPKMYGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRDEMQKSDWQLIVELKKVFEII	51226	125700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_82476_83184_83870_85455_85674_86041_86448_92818_92915_93398_93489_94724_94800_96554_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683_118849_120465_120605_123554_123717_124061
883883	contig_2596_pilon	+	5945	6	Intergenic	novelGene_53453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2879	3436	689880	690437	TRUE	40	AAAAAACTATCTCCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLRENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSLRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSDRT	90416	693831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_91286_206040_206059_231668_232339_390579_391853_689831_692153_693037
883884	contig_9445_pilon	+	4454	7	Intergenic	novelGene_178219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2487	3191	78473	138989	TRUE	70	GTAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPFLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIRKCAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKSTGNNKCWRGCGEMGTLMHCSWECKMIQPFWKMIWCFLKNLKMEMPYYPAIPLTHS	33682	140533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9445_pilon_+_34372_34664_35276_53601_53757_73368_74394_78466_79111_138922_139460_139740
883885	contig_12677_pilon	-	1458	2	Intergenic	novelGene_110724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_76_285
883886	contig_1275_pilon	-	2777	13	Intergenic	novelGene_108749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	509	junction_2	481.992450378865	61	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	569	2695	464550	395556	FALSE	40	ATCAATTGATTTATTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEGR	465118	395473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410
883888	contig_9434_pilon	-	3555	2	Intergenic	novelGene_150496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	629	1000	462526	462155	TRUE	25	GGATAGTTCCAGTAGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEQVQAALKALVKNKAPGIDGISIEMFQQMDAALEVLTHLCQEIWKTATWPDWKRSIFMPIPKKDDPTECRNYRTISLISHESKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQAGFRRGRGTKGYHC	463154	271581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_273535_461552
883889	contig_12079_pilon	-	2658	10	Intergenic	novelGene_67424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2022	junction_2	816.091059431453	5	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	96	893	599543	583739	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRVARAAGQGGAGETGCGSDKEPGAAGHGAR	600698	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582170_583662_583756_584142_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607
883890	contig_9183_pilon	-	3748	7	Intergenic	novelGene_40287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	441.003180890519	90	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	281	2164	323783	312131	FALSE	30	GGCACCAAGGCCTGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPAAQDPELPCRLRPPQRASQAEELVQVGFHLDLSEERASGQRSGGKNPCYSALNFGRQITITCDTQLLPCFCSLAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325953	310546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323919_325808
883891	contig_8377_pilon	+	3882	20	Intergenic	novelGene_35116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2253.03057214117	11	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	463	2571	173245	197939	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSEKTVNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	164536	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_164590_169245_169307_172896_173265_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
883892	contig_16310_pilon	+	1998	4	Intergenic	novelGene_70094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_3	2059.69129294228	49	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTGCCTCGAGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287627	290632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_288705_288966_289061_289558_289633_289879
883893	contig_9363_pilon	-	2861	18	Intergenic	novelGene_6578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	554.388044429376	46	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	1270	2226	761958	754431	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	777269	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_761739_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977
883894	contig_6497_pilon	-	12784	45	Intergenic	novelGene_35618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	64	junction_3	271.607218985355	2757	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3160	9483	289	9771	790005	668749	TRUE	45	CATTAAATAATTAAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEERQKKLEAGKAKLAQFRQRKAQSDGQNPSKKQKKKRKTSSSKQDVSAYHAMNIDQSQTDEMYINSSQRVGSAVTPESTVMRTLHSGEIVKRDQVFSVEPESEISTTADDYSSEEEFGVDDSYSEHGAQYSETHLEMMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLQKQMKEKEDDLQEKFTQLEAENSILKDDKKALEDMLKIYTPVNQEERFIFLDSSNSKSKDGSWQKEIDMLTEENENLKAQCIQLKEEIVKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKTDLEDSKNQQEVEYKSKLKALNEELHHLQRINPSVVKMKTSVFDDDKTFIPEMLEIGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSERLSDLSEQLKQKHGEISVLSEEVESLKQEKEQVLLRCRELEIIINHNRTENVNVFDVQSRSFKDRVVTVTSRDSEESLSKINKGFVEESRVMKEDKIPFENMTIGEESKQEQLLLDHLPSVTNESMLEATEPGENDKLQQELSVLKSEQNDLRLQMEAQRICLSLVYSTHVDQVREYMENEKDKALSSLKEELISAQEEMIKELQKIHQLELQNIKTQETDIKKIKQLEEQVQELENLTSSLQQRLKETEENYGAEIHSLQERLHAVSESSLQPSFSVDSMVIAESDVQKTIYPGSCLQQNIDGTVEFSGEFGLRQETNMTKLMEKQYQERLEEEVAKVIVSMSIAFAQQTELSRISGEKGDTTPSKQPHVLCQQEEHFLNEVKLSQDEVSFQTFETKDMKFKEEFKPLSKELGEDGKQVLLSNNDNLDEILESKDHELTISEEMFSRDKTFVFGESIHDEVLVSSMDASRQLMLNEEQLEDMRQELVRQYQEHQQATELLRQAHMRQMERQREDQEQLQEEIKRLNRQLAQRSSIDNENLVSERERVLLEELEALKQLSLAGREKLCCELRSSSTQTQSENENEGEVEEQPFKEKELDRKLEDAPPDILSSERYALQKANNRLLKTLLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKGQSSASLIWRSEAEAPIKSCIHEEHRGVTDESVPSYSGSDMPRDDSSMWSKVTEEGTELSQRLVRSGLTGTETDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEVTESLRCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADERTFFERQIQEKSDIIDRLEQELLCEGNRLQELEAERQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDDLQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNAELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQKLEQQLKVVPRFQPISEHQTKEVEQLTNHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQERNEEIEKLEFRVRELEQALLISADTFQKVEDRKQFGTVEAKAELSLEVQLQAERDAIDRKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTTRLEELEQENKLFKDEMEKLGFAIKESDAISTQDQHLLFGKFAQIIQEKEIETDRLNEQITKLQQQLKITTDNKVIEEKNELIRNLETQIECLMSDQERVKKNREEEIEQLNEVIEKLQQELANIEQKTSVDAISLPEEADSLKHQLDMVVAEKLALEKHLETTNEEMTFTKNVLEETNFKMNQLTQELCSLKEECENMRKIQSVPEKNINMSVDDPSKDKTELDIVLTKDSVKPLENQTYLKSFEENSRVSISSLETKLFQLESTVSAKELELVQCYKQIKDMREQGLSETEMLKKKIVNLQKMLEEKIAAALVSQVQLKAVQEYAKFCQDIPAVSSKPEGTNTQNLNELREKEMESNISALTLRISELESQVVEMRSSLTLEKKQVQIAENNALEKEKKLLELQKLLADNEKKQEGNERKRSPQDLEVLETTTELFHTNEENIFFGELETLRAESAATKEELASYKEIAEKLQEELLVKETNIAFLQKDLSQVEDQLAEAKEKLSYFLEKEDKMEEQENRKVCSLEPLPIKVGKNSASQTDGTLEVNSSNQTPQVLVRNTGIQIDLQSECSSEEVAEIISQFTEKIEQMQELHAAEILDMESRHISETETLKREHYVAVQLLTEECSSLKAVIQCLRTKEGSSIPELTHSDSYQNREICSSDSGSDWGQGIYLTQSQGFDATSEGQEEGESSTDSFPKKIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSAQQISESWLEERRAYLSTISSLKDLITKMQVQRETEAYDGSQSHECFSDWRGELLIALQQVFLKERSVLLAAFQTELTVLGTRDAAGLLNCLEQRVQEQGLEYQAAMECLQKADRRSLLSEIQALHAQMNDRKMNLKREQENDPSSQELLEYNMQQKQSQMLEMQVELSSVRDRATELQEQLSSEKMVVAELQSELAQTKLALETTLKVQHKHLKELEAFRLEVKEKTDEVHLLNDTLASEQKKSRELQWALEKEKAKLERNEERDKEELEDLKFSLEGQKQKNIQLSLLLEQQKQLVNESQQKIESQRVIYDTQLSEEQSRNLELQVLLESEKVRIEEMRSTLDREQGTACTATEQR	790293	653825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_655142_656393_656534_657101_657232_658811_658898_660774_661008_664472_664674_665764_665951_667477_667584_667899_668109_668342_669013_669901_670053_670883_671104_673807_673953_678687_678877_679287_679480_680059_680179_680262_680327_680759_681249_681759_681901_682624_683699_684478_684659_685013_685167_688945_689051_689657_689835_697016_697137_698069_698303_700719_700933_702457_702621_717343_717577_724043_724250_726416_726521_727015_727157_728256_728482_729767_730125_738389_738483_742431_742529_743590_743754_744892_745107_749822_752208_754320_754519_755398_755555_756694_756863_764427_764473_767272_767531_789957
883895	contig_18850_pilon	+	6970	11	Intergenic	novelGene_142421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	935.917779508435	1611	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	234	1166	176401	180704	TRUE	15	ACCGTCTGCCCCGAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARCGPGGNEVASASAEAGEPARCGGSIGGSRPRGTRELEQRQRRDLSPSEKAGGGGGGGGGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	171870	186665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_172058_176354_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515_181030_181186
883896	contig_34_pilon	+	2868	2	Intergenic	novelGene_39967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2169	2594	105477	105902	FALSE	10	TGTCATGCTTTTTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGILITCRFLLLIVSYIVLRVSSFFFILFSDFSSNRVVSKCFSSVSLILSSIISNLLVSPSMTMSISEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILTFYSCIIFLNSSMFCLYFP	103033	106176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_104109_104383
883897	contig_6047_pilon	+	2846	17	Intergenic	novelGene_24208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_3	423.105907988768	284	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	58	1377	105237	118250	TRUE	5	CCCAGTGTCTTGCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALWVLGLCCVLLTFASVRADGEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVSI	105179	123883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107150_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118423_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981_123102_123594
883898	contig_1244_pilon	-	1951	13	Intergenic	novelGene_38016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_7	902.721390974105	134	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	79	1530	948448	923211	FALSE	25	ATTTATGCTTTTTATCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948526	922789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
883899	contig_14785_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_158418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2420	2785	152954	153319	NA	30	CATTTTTTAATAGGATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSFIHVMRCFADSSLFFIVVCTKVYPLICCFHLFAIVNNAAMNMGVHISICVMALISLGYILGLRLLDCMVSLFLAKEAPYRFPKWLYHFAFPPAVRKSSSLPAASPAFVISSVFDSCQ	150534	153455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14785_pilon_+_150500_153500
883900	contig_15720_pilon	-	2859	3	Intergenic	novelGene_41952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1088	1615	307437	306623	TRUE	55	TTTAAAAAAAAATGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEKKHKVSVKTKPTKTKEMKKKIHKQKELSTEE	308524	305250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305496_305623_306719_307005
883901	contig_2799_pilon	+	5442	4	Intergenic	novelGene_85584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5758369027902	48	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	436	795	780145	781458	TRUE	15	ATTGTTGCTGTGATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGERSLPTHPGHLPASQKI	779709	786321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_780452_781405_783287_783425_785564_785640
883902	contig_15720_pilon	-	5470	9	Intergenic	novelGene_41946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	206.640350307001	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	51	1163	327739	309844	TRUE	45	TGTCAGACAAAAGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGPQSPRSAHTRPPLLLLLLFGLMRERAAGTHSLHYHYLALSEPGQGLPQFLAVGYVDDQPFIRYDSRVGRAQPQALWMAAVDAQYWERETQKLRVWEKVQQVEMWTVMGYHNHSSGKHSAQRMFGCEIQEDGRSSSFWQFGFNGQDHLSLDLDTLSWVSAHPVALRTKRWWETERCYAEYDKAYLQGLCLTSLRRYLELGGQSLIRTEPPKVQVTRHTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPARDKESYQQAPGEEDLHKSQSPSRAVSAQHLC	327789	305238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305496_305623_306457_306626_309909_310220_310254_310619_310728_310843_311120_314402_314679_316351_316613_327645
883903	contig_16431_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_87612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2132	2506	220351	219977	NA	15	CCCTCAATGTGGTCACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTGPNPPEVKENEEHQRHKESISPRDRKDHINQRLYQPETRRTRWCPATNNDCPDREHNRASLTEQEKSGVQNSNSSKKNRLIGLRLEGSSEDMAPRLSVMPKLKPFPRPTLQTKIKLDYGT	222482	219710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_219700_222500
883904	contig_9682_pilon	-	1100	2	Intergenic	novelGene_125305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	1189	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTCACTTGGCAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210326	208377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_209245_210093
883905	contig_1150_pilon	-	617	3	Intergenic	novelGene_61404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	2669	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311049	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
883906	contig_9921_pilon	-	7496	2	Intergenic	novelGene_23722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	130	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	788	1087	110821	110522	TRUE	20	GGAAATTTTGTTGTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYPETLLKSSIGSSSFLVHSLGFSMYKIISSANRGTLNSSLPIWIPFISYSSLTALARTSSTMLNKRGDKAHPCLVPVLKRNAFKLSSFRMMLAVSFV	111608	103888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_108506_108729
883907	contig_5594_pilon	-	3927	4	Intergenic	novelGene_150116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222060	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_33646_47691_47857_104174_105054_221796
883908	contig_11512_pilon	-	740	3	Intergenic	novelGene_43318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_2	29.5	1132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTCTTGAAATTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419196	400991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_401252_409314_409576_418977
883909	contig_6898_pilon	+	3062	7	Intergenic	novelGene_35670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2904.65169550881	29	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	565	1002	124416	125646	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59483	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113071_123005_123145_124370_124464_124782_125008_125481
883910	contig_1841_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_178365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTATACTTTTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154188	151931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1841_pilon_-_151900_154200
883911	contig_8712_pilon	+	3389	4	Intergenic	novelGene_58794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	574.063295000357	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	122	601	314974	321793	FALSE	40	ACTGAACTGTTTACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	301933	324581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_302049_314967_315188_318064_318222_321684
883912	contig_15327_pilon	-	938	4	Intergenic	novelGene_70671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	119	535	901528	900840	FALSE	85	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQKTLICVPSTPRESPSCPKTSSWLAGYGGRELKWKAVFMVFCSKFCKILRFNL	902146	900436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900998_901149_901281_901400_901536_902035
883913	contig_10013_pilon	-	1424	11	Intergenic	novelGene_125093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	170.794759872778	1124	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	238	990	526951	520669	FALSE	20	GATTTGGCCCTGTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERPYIVFESPPRKRCCRQGTWLTLLGLVTASMWAVLLTLLILWHWDTAQNLKQLEGSASQNVSQVSKDLEGHKSDQMAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	528548	520234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714_524778_525330_525385_525686_525801_526929_527050_528409
883914	contig_11160_pilon	+	1580	2	Intergenic	novelGene_168831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	870	1175	319072	320734	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAAGPSTWDSNSAGSGPPPLPVRFPLIFIIFIIIIQKFHCC	318202	321139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_319258_320614
883915	contig_11986_pilon	+	1584	10	Intergenic	novelGene_69155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	319	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	704	1081	517945	523699	TRUE	40	ACCCAACACAGGAAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRLMLISSCRYFSYWSLMNFMMGCQLFSLLMWSPKPGVSITVSFIRTPFSSISCVMDLISMVFGMRSSEVGCTDFRLIWDLKRVLIRVDFPKPLCPTTMMLNSKPCFMAFLRICSRIESMPT	507202	525743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_507488_508544_508598_514823_514920_515234_515332_516431_516550_517890_518032_518497_518577_519051_519180_523615_523811_525351
883916	contig_1452_pilon	-	5151	3	Intergenic	novelGene_115154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	17	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	990	1508	717554	717036	TRUE	70	ATACAGAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKATPAAHKRHPRSRPPGAAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQSSPAQQTRPGRSRTPERSPHSPTGKGKDGARSQAPEQTEGEAARGKRETKRSRKGNTSSQQTAPREPPARAHGIRPPSAPQPRDLGHGKQGSPSRG	718543	698267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
883918	contig_9235_pilon	+	3135	3	Intergenic	novelGene_156192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	262	1743	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	624	1772	45805	46953	FALSE	30	TGAAAGATCCCTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	42701	48316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_42848_43723_44040_45643
883919	contig_10857_pilon	+	1388	7	Intergenic	novelGene_160868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	786.401809227036	391	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	204	581	21903	58216	TRUE	0	TGCGCTGCCTCTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAASDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRQAPRS	21699	66898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56565_58201_58392_61883_61962_62094_62198_66447
883920	contig_10899_pilon	+	4516	5	Intergenic	novelGene_178366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	463	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	4081	4515	190174	190608	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQTKAPGSHQHGSPDREAAPHSNGTLQPLRKKKRWHTEPGTRAKGGGGGKRQANQKKQEKKKCNTSRQQMALREPASAGWCFCTRDCVRGKQRRLSVGEEGWRVEKRISQITGSLQPLRKKQMWCTEPGTRVKGWGGGERQVR	39286	190609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10899_pilon_+_39301_43337_44840_48126_48344_187770_189841_189896
883921	contig_13481_pilon	+	2198	6	Intergenic	novelGene_119563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	661.335618275623	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATGTTGTCAGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569281	1587834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1569364_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080_1586255_1586363
883922	contig_6364_pilon	+	4352	1	Intergenic	novelGene_51846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	348	812	1739774	1740238	NA	45	ATGCACAAACATAGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLERNEWVCCVLPGSPRCQAWWRRSLWSVLKIAVGMELRGRGGGSFRSWVGMPHLLPLPARPYVRKSHKFTDSVISQGPGATPPPHTDEETPETQIGGLTSGHRAQREGPDGRPFSSCYFSRVDAGLVRYSLAAPGHAQGLGTPGARCDRAS	1739426	1743778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1739400_1743800
883923	contig_3241_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_146402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTTCAGAAGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834590	829031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_830244_833062
883924	contig_18869_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_56408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	420	1040	1459	74524	74943	NA	30	GTTGTTTGGATCTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNRLNRFGFVFLCKGRTVHLLKALFSAEMPVWKRQKIKPLQMNQLPDTFPHHVDGSSAPPLEVSDAGKATSGDTCLLHTIPQGKEMCCVGSFLPAEMLPQLMSPTIRVIVAELSVNRPQEGEAKKVFSRSETHLHDAG	73484	74945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73500_74900
883925	contig_14925_pilon	-	2135	7	Intergenic	novelGene_55340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	951.461507366431	141	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	89	640	322420	115968	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPGLLWALMVSTYLGYSTAQTVTQSQRQMSIRETESVTLDCTYDTKDSNYYLFWYKQFPRGGMIFIIRQDGFKQQSATKNRFSVNFRKAAKSFSLRISDSQLEDTAMYFCVYSSPQNLLSAVIQAHLWERNSCDCGTKKSASNQTICFRNEKWDEGCLSGEGFLSQGYKYNPQLIQEYNRI	322508	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129503_321808_322113_322371
883927	contig_9614_pilon	+	3997	17	Intergenic	novelGene_104418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2355	2954	140385	145758	FALSE	55	TAATATTGAATAGATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDLLALLRVGDHLLIGLASFDLSRLLRISSRGRVLGEESRLLSGSLRFLSKDRLLALLPGDRVREGDLLCLDLLSFKSGDLLLLDLSRCFGDTLLLLGLRPGLLLGDLFSFPEDASLEGDLIGFFSLSVSERFDFLSLDRDLRSLDLPLKSTGDLDFLPRSRLLLSFITGDFFLSFDLFLSSILILSSVGDLGFPIFS	105305	146801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_+_105395_106165_106255_106770_106819_107327_108064_109250_109339_110641_110794_111390_111509_114562_114714_115366_115504_116616_116764_118461_118555_119989_120062_131386_131602_133060_133142_136325_136391_140311_140490_145263
883928	contig_10437_pilon	+	1759	8	Intergenic	novelGene_38306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	959.89952705521	10	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	461	1228	439794	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431119	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432374_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
883929	contig_7527_pilon	+	3614	9	Intergenic	novelGene_139559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1248.08510827587	12	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	590	1180	85507	96168	FALSE	40	ATAGGTAATACTCTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRFVDPPL	80071	98602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80283_80329_80487_84490_84642_85436_85578_85690_85781_86443_86519_89859_90038_94415_94572_96147
883930	contig_12152_pilon	-	2998	3	Intergenic	novelGene_178367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGATGCTTCACAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19103	9931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12152_pilon_-_10111_10237_11215_17261
883931	contig_6691_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_60179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAAAGCATTTTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416944	419404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_416900_419400
883932	contig_10958_pilon	+	1746	5	Intergenic	novelGene_5392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	17	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	117	704	888255	895766	TRUE	20	GGGGAGCTTGTGATGACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPEGAVAVPLRVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHMLPDASFLSVPGFKHGLPQEGKLTSRRGRPHVSLRNNYFPRRAFELFCSFLLFFIFFLKMYNHDRNLILCCFSVKEKYTHKAVTPPVKFCCCLVLAN	888138	901411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893894_895473_895855_900457
883933	contig_10323_pilon	-	3640	10	Intergenic	novelGene_123592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1792.4403049791	25	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	180	2309	531203	459350	FALSE	25	TTAAGAGCCTGTGATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPAVHNTELDCLSPEAQRLAEARLAAKRAARAEAREIRMKELERQQKEASDEDERVSVGSRGSLRVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	531382	458018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460241_460531_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208_474245_498923_498975_513276_513364_531137
883934	contig_12938_pilon	+	2321	7	Intergenic	novelGene_99729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	668.719173744355	358	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	59	646	78117	84646	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVRA	52004	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550
883935	contig_3077_pilon	-	1896	7	Intergenic	novelGene_26815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	824	1207	481557	479480	TRUE	15	CCTCTCAGCCCCAGGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLMRLEPYVKLPRKEALRNSSSIQASSGDVHHSHKEEPAHLAHCGGLDKALSDSKVHGGHNTTQAKSQEHSCSCLPVLRSGKPVPLCHDDGRNAQDTDDGEVDEPWLWGAVEGVIEPGDKAPHNQ	482380	473947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_474137_475511_475629_476730_476904_477442_477631_479457_479643_481020_481217_481532
883936	contig_709_pilon	-	2443	9	Intergenic	novelGene_57528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.362460709347	955	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	15	962	1498098	1481990	TRUE	40	CTGCGAATTTTATACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRSKRRAVGNGAPRPPGSQLQRDEEEEDEVEDEKEDSDEEDSDEEDDEVVDEEVNVEFEAYSISDTDYDGINKLLQQLFLKAPVNTAELTDLLIQQSHIGSVIKQTDVSEGSDDDVDVDEDEIFGFISLLNLTERKGTQCAEQIKEWILSCCDQSGEESLVEQLDKLLRDTARPVGFLLSERFINVPPQIALPMHQQLQKELAEAHKTNKPCGKCYFYLLISKTFVEAGRHSSRKKRSNQKTDGLMFANAEEEFFYEKAVLKFSYSVQDESDTCLGGRWSFDDVPMKPLRTVMLIPADKMSEIMDKLKEHLSL	1498112	1478626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1479315_1480215_1480398_1481378_1482161_1483364_1483540_1484964_1485153_1487576_1487673_1489760_1489842_1490541_1490617_1497936
883937	contig_15491_pilon	-	3248	6	Intergenic	novelGene_75928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	402.437870981348	2414	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	116	859	46982	32303	FALSE	40	CATTTTTCCAAGACACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47097	29913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
883938	contig_3469_pilon	-	2785	4	Intergenic	novelGene_34139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1976	2356	231660	231280	FALSE	25	ATGGGAGGCCTCACACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDADKTFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTAYIILNGESLKVLSLRTGTRQGCPLSPLLLNIVLEVLARLIRLEKEIKGIQIGKEGVKVSLFADDMILYTENPKESTENYWN	364528	230850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_232040_336575_337203_340625_341205_364138
883939	contig_7704_pilon	-	2445	3	Intergenic	novelGene_154626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1694	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1711	2148	358257	357179	FALSE	5	CTGGGACTCTGGCCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGKDAFLCSLQPIPSQVEAGKSWVTGRVCGKEKCDPPGPCGQGEPRFLSSWTKASIISSFTFRSSFLTSSRSSCFTLSRSVSSLELGVEGWASEVVTEEEDFILRELGWFGANLGLERGPVSHSRHHTLLLSINLASSAFLGG	359967	356881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_357390_357913_357973_358089
883940	contig_16525_pilon	-	763	7	Intergenic	novelGene_133807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	1914.98430512861	26	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGATCGCCAGTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97647	91486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96733_96975_97069_97167_97605
883941	contig_4782_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_73617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCATGATTAGAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161697	159532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159500_161700
883942	contig_11512_pilon	-	2317	8	Intergenic	novelGene_43359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_3	551.138302580603	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	38	625	576922	556654	FALSE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	576959	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895
883943	contig_5479_pilon	-	3172	1	Intergenic	novelGene_133598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1405	1791	283866	283480	NA	85	ATAAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKDDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRLLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAAFSQ	285270	282098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_282100_285300
883944	contig_19342_pilon	+	1243	7	Intergenic	novelGene_41115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.41565025531987	559	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	344	820	4349	6183	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3763	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
883945	contig_17014_pilon	-	6579	4	Intergenic	novelGene_163165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2869	3273	30310	29906	TRUE	45	TGAACTTCACCAAAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSVHQEDITIINIYTSNDKAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLLVKDRTCRKKLSEDKEELNATINQHNLMDIYRTLYATAAKYTFFSNAHETVSRTDHILSHKASLNKIQNIEILQSIFLTIKP	49940	20026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_-_23214_29786_31137_31216_31721_48402
883946	contig_4315_pilon	-	4878	20	Intergenic	novelGene_46800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	236.67718234477	38	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1207	3624	137	3760	366414	328205	FALSE	60	AGAAAGAAAACTCCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEEPDEALGSPQEVEEGGESSPRLRYETGQDSEGNGSSSSVALGQDQARGWVASGNKASGDKLSEHSEVSPSVDLCSARSWSSGTVSLGHPSDILDSTWEGETHIPQPTPLVETLPQSLGCHLLNPDDRTRGSVAQATPTEFHDSSAAPPQSLQCPGDGWRETTSLSHLQPGDQAWKRTRIPAKPLPSRFIGSVSPPNPRPRPAQQDRLPRQGATLAGRSSSDASKYGQGRLNYPLPDFSKVGPRVRFPKDESYHPPKAKSHSWQSQGPAGPLIFKSPAEIVQEVLLTSEEASPAKDPPPAHPITRVPQEFQTPEQATKLVHQLQEDYHKLLTKYAEAENTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	376068	327086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155_363231_365433_366498_376015
883947	contig_5686_pilon	+	1928	2	Intergenic	novelGene_45315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAGCTCTCTCTAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98996	113937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_100851_113863
883948	contig_678_pilon	+	3250	1	Intergenic	novelGene_167797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1581	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTCAATTTCCAGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45831	49081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_45800_49100
883949	contig_4732_pilon	+	1854	16	Intergenic	novelGene_75436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	612.013057231806	2661	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	393	1595	653092	675284	FALSE	0	GCTGCTTGGCTGGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634966	675543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_670261_670316_672214_672283_672738_673018_673616_673669_675120
883950	contig_7428_pilon	-	1840	3	Intergenic	novelGene_77746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	808	junction_1	48.5	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	125	502	515358	514339	FALSE	25	ATTTTATTAATCTGGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYAEKLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515482	513000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515026_515337
883951	contig_5698_pilon	+	2055	8	Intergenic	novelGene_55010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	852.735837269236	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTATCAGGTAGACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7871_7995_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
883952	contig_5727_pilon	+	3667	21	Intergenic	novelGene_7952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_13	914.683032530942	13	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	920	2911	173359	179323	FALSE	15	CTTGATGTAGTTGTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168163	180079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
883953	contig_4088_pilon	+	2826	4	Intergenic	novelGene_178062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2276	2749	111883	112356	FALSE	40	TCCCAATATCATGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	73692	112433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_74090_109096_109737_110029_110290_110904
883954	contig_6291_pilon	-	10766	7	Intergenic	novelGene_164783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	22	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	10197	10604	357054	354898	FALSE	30	ACTCTGAGGCAGTGACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRGRDPSQETVQVIHGQREDLFFTLLFFTDLQHPGGHHPPHVGLDVLLHAFEVGALRKVALLDGEQVLQNAVVVEQVGVRHGPADRVHLAAQQLHGEPGAHSFPCSLRTGKVSLFFFFLRGEGKGFPLPPSFG	391717	354735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_355208_356956_357172_359958_360119_370426_370578_381244_384316_384953_390902_390968
883955	contig_10323_pilon	-	3712	8	Intergenic	novelGene_123588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_6	1806.13423010109	135	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	47	2380	473591	459350	FALSE	25	TAAGAGCCTGTGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGRYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEALERQKEFFDSIRSERDDLRDEVAMLKQELKKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	474242	458017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_465065_465159_467386_467480_468607_468779_471164_471237_473477_473604_474208
883956	contig_14666_pilon	+	2720	10	Intergenic	novelGene_39499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1640	junction_3	678.134041158367	9	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1521	2378	315481	323175	FALSE	25	GATGTGACTCTTGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL	313873	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322120_322302_322434_322677_322746_323028
883957	contig_12709_pilon	-	1705	8	Intergenic	novelGene_147396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_6	585.115477875077	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	229	1074	42147	29115	FALSE	75	ATAAAAGAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFAPDEPGKIFLIDLNEQNPRAQTLKISDGFDKASFNPHGISTFIDKDHIVYLYVVNHPHMKSTVEIFKFEEQQLSLVHLKTIKHELLKSVNDIVVLGPEQFYATRDHYFTNFFLLLLEMLLDLHWTYVLFYSPQEVKVVAQGFSSANGITISLDNKYVYVADVAAKNIHVMKRDDNWDLTQQKVIQLDTLVDNLTVDPATGDVLAGCHPNAMKLLIYNPEDPPGSEVLRIQNVLSKNPGVSTVYANNGSVLQGSSVASVYHGKLLIGTIFHRVLYCEL	59068	28483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_29274_32143_32273_32517_32600_33607_33809_37396_37524_41999_42166_57378_57450_58929
883958	SIRV7	-	1648	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112262	6	112084	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAATTAGTGTTAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2654	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2700
883959	contig_7207_pilon	-	5070	25	Intergenic	novelGene_72055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_24	282.648584327292	204	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	1032	4685	696514	628468	FALSE	20	GCTGTTGGCTGTTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQAYINEKHYKKIPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPRHVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSFRIFSKGASEIILKKCFKILSTNGEAKVFRPRDRDDIIKTVIEPMASEGLRTMCLAFRDFPAGEPEPEWDNENDIVTGLTCVAIVGIEDPVRPEVPDAIKKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILHPGEDFLCLEGKDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVSEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEPPTESLLLRKPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLVVVFTLLFAGEKFFDIDSGRNAPLHAPPSEHYTIVFNTFVLMQLFNEINARKIHGERNVFEGIFNNAIFCTIVLGTFVVQIIIVQFGGKPFSCSELSIEQWLWSIFLGMGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKEEIPEEELAEDVEEIDHAERELRRGQILWFRGLNRIQTQIRVVNAFRSSLYEGLEKPESRSSIHNFMSHPEFRIEDSEPHIPLIDDTDAEDDAPTKRNPSPPPSPNKNNNAVDSGIHLTIEMNKSATSSSPGSPLHSLETSL	758013	628082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_628780_637109_637293_639627_639736_643300_643513_643980_644195_644422_644615_649857_649965_650325_650414_651074_651255_656875_657114_659130_659373_660702_660946_663524_663740_665433_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_734033_734228_737456_737530_737916_738105_746740_746860_757787
883960	contig_2710_pilon	+	3800	1	Intergenic	novelGene_161794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAAAGGAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062383	1066183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1062400_1066200
883962	contig_2969_pilon	+	2179	8	Intergenic	novelGene_157085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	199.107805892554	1591	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	432	1109	1191349	1201364	FALSE	30	AAGACTTCACCGTGTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRPNHTIYINNMNDKIKKEELKRSLYALFSQFGHVVDIVALKTMKMRGQAFVIFKELGSSTNALRQLQGFPFYGKPMRIQYAKTDSDIISKMRGTFADKEKKKEKKKAKTVEQTAATTNKKPGQGTPNSANTQGNSTPSPQVPDYPPNYILFLNNLPEETNEMMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFENDGQAGAARDALQGFKITPSHAMKITYAKK	1175751	1202434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1175994_1188846_1189010_1191322_1191413_1191802_1191976_1197947_1198089_1198880_1198932_1200570_1200660_1201204
883963	contig_7527_pilon	+	3675	8	Intergenic	novelGene_139558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_7	1093.58420259405	4360	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	642	1286	85507	96119	FALSE	30	TTCAAGGGCTGACACATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80066	98508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85578_85690_85781_86443_86519_89859_90038_94415_94590_96062
883964	contig_20550_pilon	-	2962	1	Intergenic	novelGene_142631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	506	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	255	647	27861	27469	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESTTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELDKDAEQNSNTQKKTIYWPDRDWRNPEIMAPRHPFSSVVKSLPRFIVQLGTGQSHKMGLMRHSSPGTRTRRQKGTGKLVIGNSRFTKDSVDM	28115	25153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_25200_28100
883965	contig_13021_pilon	+	3690	11	Intergenic	novelGene_8155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_10	1998.95352872447	12	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	169	1509	174676	178735	TRUE	40	GACTGAATTAAGTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSVSFESTFVYSEAYARENGFRIKGIQEYCNKTFVSPPTPQQYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174507	181146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440
883966	contig_15112_pilon	+	2036	7	Intergenic	novelGene_124762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCCCCTCCGGCTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24920	43258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_26491_34754_34829_34915_34956_36236_36316_40032_40122_40362_40445_43156
883967	contig_1275_pilon	-	2129	17	Intergenic	novelGene_108777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	538	junction_2	468.58383304778	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2058	72	2129	513735	440364	FALSE	20	GTGAGTATATTGGGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQK	513806	440363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627
883968	contig_15207_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_176366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAGTTTCCCAGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12194	14529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15207_pilon_+_12200_14500
883970	contig_9833_pilon	+	2187	13	Intergenic	novelGene_68522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	428.458639258862	3	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	73	1266	230823	254740	TRUE	35	TTCATTAACAAATGTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSAARAAASLGPRLGRRLLSAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGLLQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230750	260486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252452_254635_254811_256795_256954_258491_258607_259908
883971	contig_6365_pilon	-	1055	5	Intergenic	novelGene_134007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_4	783.251675708389	42	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	264	629	50867	47435	FALSE	45	TGAAAACTGAGTACTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEYKKIILLEELCVINDYSFKILKNFLAHDLQLTRKMEEEYDRIKIVDLMEEKFQGAAYRMLKRAKLKVAKDIEEKRTLIKSSKQDRTGPAMSTFTTQEGQEESERGPASTPVNENTAV	57013	47008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_47492_49511_49610_50656_50888_56431_56501_56839
883972	contig_7079_pilon	+	1954	5	Intergenic	novelGene_129243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	617.704369014823	906	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4	393	344650	348688	TRUE	10	AGGCCTGGCTGGTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMTKSRTRSKPQCQCASHLAPLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPATPGGPRELNAAATTTELRGAGGGPDARDAEEK	344646	351063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_344803_344900_345004_345095_345131_348589_348706_349519
883973	contig_3747_pilon	+	2909	8	Intergenic	novelGene_24778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	689	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	332	1507	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
883974	contig_11316_pilon	+	1431	2	Intergenic	novelGene_122599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	709	1407	137674	138833	FALSE	45	ATCATACAAAGACGACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSLARKGYPKRPGLNTKIRLNLNLKPKRNNQIILPFLPHLSNLRPPTHNLTPPSNLNDNKNTDKQHST	136965	138857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138171_138631
883975	contig_7051_pilon	+	3780	13	Intergenic	novelGene_64338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_12	455.853313090467	395	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	205	2211	331836	348229	FALSE	50	TGAAAAATTATTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKDQQPLPVVNAEE	321843	349798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867_347510_348191
883976	contig_6418_pilon	+	3081	13	Intergenic	novelGene_81203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	220.434970884587	1690	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	479	1981	1375762	1444680	FALSE	45	TAACACTTATACAGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341074	1445780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1342274_1342397_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
883977	contig_14684_pilon	+	6487	5	Intergenic	novelGene_99681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	149	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	6174	6485	716069	716380	FALSE	30	TCCCCTTAATCATTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSFLENVPCALEKNVYFAAVEWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSVVRVLFYVFWSPVIGCIDVYYSFVFMMD	396014	716382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_397166_397395_400178_466211_466260_593081_594666_715460
883978	contig_6885_pilon	+	4619	1	Intergenic	novelGene_83634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2486	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	4084	4533	122652	123101	NA	25	TTACGACCTGGAACTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQGLHEWRKHSLVFQVLQRMRIPSWEPGVEARVTQAPRIQTWEDRRGEGKLVAFSPAPRMPTMRHLATFALLVRDLLLPRSLLGRVQGRHCPGLFPSNDQVQILQAALYGTCRANVLRAHFPVQDGMDHAFHLPEILQSHMVRLSRS	118568	123187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_118600_123200
883979	contig_18168_pilon	-	1176	7	Intergenic	novelGene_122088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_3	72.7774385064187	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	20	1060	27110	23837	FALSE	10	AATGTGTCTGTGTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27129	23720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26754_27040
883980	contig_10732_pilon	-	4005	2	Intergenic	novelGene_114687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	624	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAATTCAAGCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86983	82722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_82760_83015
883981	contig_15970_pilon	-	5444	2	Intergenic	novelGene_144059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1345	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4971	5270	195902	195603	FALSE	50	CGATAAAGATCATGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILSRGIYGYNPILIQSPAAFFNKVKKQVTNFIWKGKMPRVSKALLKKKNIVGGLTLLDFRTCYTANVVKTAWYWYNNRYMDQWNRIENPDINSSTCE	201113	195428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_198259_198499
883982	contig_15449_pilon	+	2731	14	Intergenic	novelGene_33584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	110	junction_1	596.593426025071	428	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	160	1689	44312	54621	FALSE	15	TATATTTGTCAGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSLGERGNLSFSLSLFLKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27854	55663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
883983	contig_4857_pilon	-	6842	2	Intergenic	novelGene_48803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	479	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACCAAGGTAGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252147	1244424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1251155_1252035
883984	contig_19098_pilon	-	4483	1	Intergenic	novelGene_65843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	2572	3207	407806	407171	NA	35	AACACCATTCTTGGTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	410377	405894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_405900_410400
883985	contig_5039_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_64772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1369	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	762	1061	123431	123132	NA	45	TCATAAAACAATATGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHSFSLVVKLSSRFNFQPGSGQPHKTKWD	124192	122779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_122800_124200
883986	contig_5039_pilon	+	1443	3	Intergenic	novelGene_65041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	891	1223	1806384	1807063	FALSE	10	CCCAAGGCCTCTGCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQAPTSNTTDREAPTNVRMACSSLVAASSVVLWQDVLLKFPGREMPCVDQTSSAWTCKQYTRKGFKSSNEMKLLLTGPLTYLKDTNNHTCRSPEQTCSCYFQLFQCLR	1802068	1807283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1802886_1806310_1806469_1806815
883987	contig_11422_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_99057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAATTCGGCCCGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	2239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_2200
883989	contig_17976_pilon	+	2979	5	Intergenic	novelGene_32470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1266.39409347959	27	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	91	1107	41843	47385	TRUE	30	AGGGCAGAGGGGATTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41586	53525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41649_41814_41858_45524_45585_46443_48866_53133
883990	contig_10438_pilon	+	904	3	Intergenic	novelGene_161680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.5	74	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCAAGCTCACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53854	83302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_+_53881_65366_65615_82672
883991	contig_4857_pilon	-	6011	15	Intergenic	novelGene_48708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1399	junction_4	2166.34213477418	5496	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	2099	3436	1243185	1178809	FALSE	20	CTGTGTGAGTAGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1245283	1176233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122
883992	contig_1225_pilon	+	3728	3	Intergenic	novelGene_44174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	274	122	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACAGGAGAGAATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251339	277683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222
883993	contig_6137_pilon	+	9454	18	Intergenic	novelGene_59209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_15	1248.41194347973	24	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	6196	7809	1313581	1347661	TRUE	45	TATAAAATGAGATTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYEVFMHFNLKLMLLLLIFFPPHSMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLCVTSR	1307385	1354909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1347643_1347749_1348119_1348281_1353512
883994	contig_12312_pilon	+	3815	1	Intergenic	novelGene_63933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4055	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAGCAGCGAAGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211467	215282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_211500_215300
883995	contig_405_pilon	-	1666	2	Intergenic	novelGene_135299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1070	1408	346756	243914	FALSE	60	AAAAAGTTAAAAAAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTRKSSSPRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRPDREHNRESQMEQEKGGVQNSNSSKKTTLNGLTETGGTPESMAPLFSISPELKQFLRPTLQTGIGLDCGT	347825	243655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_243940_346443
883997	contig_8464_pilon	+	1192	3	Intergenic	novelGene_125382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	158	junction_2	23.5	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	482	781	798819	804080	FALSE	20	TTAAAGCTTTTGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	798337	804491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_798922_799187_799279_803974
883998	contig_7230_pilon	-	6406	3	Intergenic	novelGene_52537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	732.5	117	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCACCTTGGTCTCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177633	128476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134632_176955_177012_177438
883999	contig_10904_pilon	-	496	2	Intergenic	novelGene_22566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	0	1583	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGACATGTTGCAATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419266	410981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_419154
884000	contig_6735_pilon	-	5386	13	Intergenic	novelGene_15696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_8	784.192932610053	363	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	3410	4906	564868	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784
884001	contig_5988_pilon	+	1676	6	Intergenic	novelGene_16030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	38.1649053450942	1174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	873	1352	809857	811007	FALSE	25	GAGAAACCTCTCTAGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLSIKTTVPEVEPPQDSHSRKMVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKASTPSY	808885	811331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_809695_809793_809920_810000_810222_810314_810365_810603_810684_810941
884003	contig_7154_pilon	-	6128	3	Intergenic	novelGene_178368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2417	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	5804	6127	124488	124165	FALSE	5	CGTACCCCCGTTTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPHSPAGKGKDSARSQAPEQKEGEAARGKGETKRSRKSNTSIQQMAPREPPARARGIQATVAPQPRDLGHGKQGSPSRGKEGWGVRKRTPQITGCFVSLWMLCEAAL	166503	124163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7154_pilon_-_128415_164589_165832_165868
884004	contig_16724_pilon	-	1509	5	Intergenic	novelGene_105289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	847.819261399504	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGGTTTTCTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568175	540910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568103
884005	contig_546_pilon	+	4452	7	Intergenic	novelGene_117204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	647.568207475732	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	240	1340	119834	152874	TRUE	60	GACAAAAAAAAATCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPIPR	103330	156170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140577_152853_153966_154149
884006	contig_13888_pilon	+	5157	7	Intergenic	novelGene_151783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	594.880006574622	459	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	126	581	337589	343145	TRUE	25	GTTTTTTTATTTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPCSVYNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQERPNSRASTQP	337463	400072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_343109_346255_383076_383782_384449_384811_386431_386720_399959
884008	contig_383_pilon	+	6709	19	Intergenic	novelGene_126100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	684.223343166055	3033	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1613	4842	218	5059	127911	169172	FALSE	50	ATACTAAAAACCATTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRPYSIYPHGVTFSPYEDEVNSSSISGGTFMIRPVQPGETYTYKWNILESDEPTENDAQCLTRPYYSDVDITRDIASGLIGLLLICKSRSLDKRGIQRAADIEQQAVFAVFDENKSWYIEDNINKFCENPNKVKRDDPKFYESNIMSTINGYVPESIRALGFCFDDTVQWHFCSVGTQDDVLIIHFTGHSFIYGKRHEDTLVLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTTMSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPWEDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	118209	170822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_118275_123731_123869_127895_127996_128779_128992_130280_130432_132625_132839_134494_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
884009	contig_12520_pilon	+	2818	2	Intergenic	novelGene_161092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTGATTCGGAACCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616477	625436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_616494_622634
884010	contig_1867_pilon	-	4065	1	Intergenic	novelGene_54533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2657	2959	326410	326108	NA	50	CACAACCCACAAAACGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKIQQNKLKKKKEQEKPPKDQWGKKKKTTRKEMPSGIPLHVCISRGGSLLATQHCLAKKGSQLKKRKRKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPRP	329066	325001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_325000_329100
884011	contig_12528_pilon	-	1660	8	Intergenic	novelGene_81313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	561.914003152418	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	529	1065	966228	933312	FALSE	15	TCGGTGCCTATGACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRNQFATRGLFSSHPAGCMLHLFCMCKMVSGRNVSQCLHLLGDDDFGLCCQVIVSQHCQLFQSHHLCLVCQNLTSI	968139	932716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
884012	contig_5643_pilon	+	4897	15	Intergenic	novelGene_39030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	641	junction_2	587.926453994139	2386	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	3207	4685	634785	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPALGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631199	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
884013	contig_11316_pilon	+	959	2	Intergenic	novelGene_122665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139372	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140072_140266
884014	contig_11594_pilon	-	2447	4	Intergenic	novelGene_80920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4156	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTCGCGCTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554568	539997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_540564_543388_543491_548947_549014_552855
884015	contig_7378_pilon	-	4154	1	Intergenic	novelGene_120292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	531	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608611	604457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_604500_608600
884016	contig_18081_pilon	-	3661	8	Intergenic	novelGene_23840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258.709828785464	7	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	271	846	454731	430068	TRUE	15	CTAAATCTGTGCTTTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIDISVLMGANIASEVAAEKFCESTIGSKVMENGLLFKELLQTPNFRITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDGLRCGDNTKAAVIRLGLMEMISFARIFCKGQVSTATFLESCGVADLITTCYGGPEPQGGRGVCQDRQDHSRTGGRDAEWTETPGSSNFCRSVPHPQAEGTDGQVSAVYCRVSDLL	465645	427173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_428420_428498_430107_434819_434927_435608_435844_448204_448318_454649_454789_456513_456655_465573
884017	contig_13863_pilon	-	1911	11	Intergenic	novelGene_42079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	682	1008	489584	482108	TRUE	15	CCGGGCCACAGGCACTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSTTFPKPHEEFFQFIFINIMWQVTNKKLMTVWIANYSTVVRFILFSISSAWSWSSRRKTRSLPRSLFTHTRWLRLNFWFSFNSRLWWFLWQRNRFCRRRRSRFLL	490596	455739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_455902_474561_474681_477706_477791_478582_478757_479276_479423_481370_481474_481992_482172_487478_487581_488864_488996_489554_489676_490006
884018	contig_9653_pilon	-	3950	13	Intergenic	novelGene_48270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_6	729.603545313024	92	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	32	2056	1040020	1006903	FALSE	15	TGGATTTGATGTGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1005008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
884019	contig_9014_pilon	+	2415	3	Intergenic	novelGene_106798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3294	junction_2	1499.5	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGCTGCTCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150635	153614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151763_152234_152334_152425
884020	contig_16411_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_77357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	482	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTAAACTAATGACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242615	243915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_242600_243900
884021	contig_3747_pilon	+	2527	7	Intergenic	novelGene_24808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	9	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	330	1331	201313	204008	FALSE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPVL	200983	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203994
884022	contig_18162_pilon	-	2900	3	Intergenic	novelGene_122278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8929_9843_10809_16363
884023	contig_6102_pilon	+	1963	6	Intergenic	novelGene_31936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_4	271.653897450414	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGGCAGCTCAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393069	395678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
884024	contig_3386_pilon	-	6557	5	Intergenic	novelGene_34578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	1097	2488	545598	543011	TRUE	70	AAAAAAAAAACAACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKGKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIRKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPYINGKTYHAHG	546694	478749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_480835_524988_526414_542451_543047_544076_545283_545448
884025	contig_2036_pilon	+	6792	7	Intergenic	novelGene_131795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3804	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1543	2190	104365	105012	TRUE	55	AAAAAGAGCCATCATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISNHSQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQNANKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQGQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRICGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFQVIGIPEQGEETENTERIIEELPTENFTNIMKDEKLAIQEA	73982	301075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_74387_74584_74714_94554_94570_103370_105642_231546_231910_296500_298138_299102
884026	contig_6102_pilon	+	2853	1	Intergenic	novelGene_32318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAATAAATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1596434	1599287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1596400_1599300
884027	contig_12464_pilon	+	2464	10	Intergenic	novelGene_68623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	239.455864641297	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	102	2141	45237	94215	FALSE	30	AATGGACTAAGTTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASAAERVIATAVPASGTNSNGESSEVEGGVGAVGEEKDAPVKAEAAGDSEEDGEDVFEVEKILDMKTEGGKILYKVRWKGYTSDDDTWEPEVHLEDCKEVLLEFRKKVADNKAKPVKKDIQRLSLSNDIFEANSDSDQQSETKEDTSSKKKKKKLRHKDEKSPEDLKKKKAKTGKLKEKSKSDLESFSESLVFDLRTKKRIFEAKEELKEFKKPKKDDIKETKELKKVKKGEIRDLKTKVREDFKENKKTKKDKCIESQLESESSVLNDSLSQDDDNEDLHSDNKEEKQKIKSTKDKSGPDIIAGVVFDKQPDGKVSADEDTDVRTKRKKKKLRKTEEHKDSNKLENKDLFLERKNTHKKQRNQDKGKSTIEFDKPIPASSQTQKSSKLGGEERGHRSTDSPGEEKETKKSESKEKCQKRHDSDKDERGRKEPKGLKTFKEIRSAFDIFKLTPEEKNDLTENNRKREEIPLDCKITEDYKTKENKLFKERRNTRDETDTWAYIAAEGDQEVLDNVCQTDESSDGRQQILSLGMDLQLEWMKLEDFQKHLDGEDENFATADTIPSNLLRDAVKNGDYITVKVALNSSEEYNLDQEDSSGMTLVMLAAAGGQDDLLRLLIKKGAKVNGRQKNGTTALIHAAEKNFLTTVAILLEAGAFVNVQQSNGETALMKCAGSKL	45135	94538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_45453_51803_51960_53873_54723_57019_57120_58834_59090_69115_69242_69321_69411_89136_89278_89882_89970_94194
884028	contig_14970_pilon	-	6832	6	Intergenic	novelGene_45108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	136.115539156997	1556	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	412	1155	291083	268709	FALSE	20	AGCCCGCAGTATTTTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315809	263031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311915_312047_315615
884029	contig_7963_pilon	+	958	4	Intergenic	novelGene_58360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	869.906636114219	210	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51351	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51536_57277_57564_57782_57934_63003
884030	contig_5779_pilon	-	400	1	Intergenic	novelGene_106449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	44	376	94343	94011	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94386	93986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_94000_94400
884031	contig_4783_pilon	-	5217	1	Intergenic	novelGene_108336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	875	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	267	804	3737	4540	28052	27249	NA	45	TCCTACAGACTTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDTKILNKILANRIQQHIQKITHHDQVGFIPDMQGWFNIRKTINVVHHINKTKDKKHMILSIDAFDKVQHPLMIKALNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPLRKGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLTRTIRLEKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYAENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEIAKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLHNENYKTLLQETKRDLHEWKNIPCS	31788	26571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_26600_31800
884032	contig_7119_pilon	+	5246	4	Intergenic	novelGene_40877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	381	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	280	1374	137044	139798	TRUE	25	ACAGGTGAACATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127389	145312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_142440_144081
884033	contig_6477_pilon	-	1478	6	Intergenic	novelGene_154178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4525.9269371036	27	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773205	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_769767_770106_770616_770699_771241_771341_772404
884035	contig_16103_pilon	+	1734	6	Intergenic	novelGene_118824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTCAATAATCACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722281	735702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723676_732163_732241_733288_733369_733541_733608_734316_734393_735661
884036	contig_13074_pilon	+	2657	4	Intergenic	novelGene_153416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1380.10080147148	225	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	448	912	403694	451174	TRUE	35	ACACCTGAAGTTGTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403246	452963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002_452388_452431
884037	contig_13780_pilon	-	4355	9	Intergenic	novelGene_149122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1035.02823029133	123	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1769	2275	824289	822800	TRUE	80	ATTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLIENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRVSKLCLGL	827942	820296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822989_823722_823882_824130_825305_825624_825798_826237_826320_826433_826714_827630_827825_827918
884038	contig_14666_pilon	+	2741	3	Intergenic	novelGene_39616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1754.5	64	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	144	944	479860	484940	FALSE	50	AGCAATTAAATAGATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477278	486737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479878_484157
884039	contig_5758_pilon	-	2078	3	Intergenic	novelGene_119114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGACTAACTTGAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298578	280992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_281863_295859_295952_297462
884040	contig_9434_pilon	+	3465	25	Intergenic	novelGene_150478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	238.524631851723	2318	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	1250	3154	96761	124169	FALSE	30	TTTCAATTTTATACTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKMKILPQFIFNSRDPIVIGVTVEAGQVKQGTPLCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDVAKKGQEVCVKIEPIPGESPKMYGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRDEMQKSDWQLIVELKKVFEII	51198	124480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_82476_83184_83406_83848_83870_85455_85674_86041_86193_92818_92912_93398_93489_94724_94800_96649_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683_118849_120465_120605_123554_123717_124061
884041	contig_15172_pilon	+	2167	8	Intergenic	novelGene_158733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	455.059717991799	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	107	613	215528	231626	TRUE	30	CAACTTGTGTCAATTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGRGCRRRKGWRPGRRCCNVAESSLRPRVPPRLAMAGLNSLEAVKRKIQALQQQADEAEDRAQGLQRELDGERERREKAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNVTNIF	215421	238478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227621_231618_231682_231767_231838_237049
884043	contig_3825_pilon	+	1264	7	Intergenic	novelGene_77931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	972.868210784768	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	20	553	12232	14316	TRUE	25	GAGCCCAGGAGTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGEWVLLRGVSGGASCCNDDDFSPEVTVRGELSFLTLSHS	12212	15854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14471_14780_14912_15231_15302_15498
884044	contig_17753_pilon	-	3849	2	Intergenic	novelGene_105103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	107	367	148219	147959	TRUE	45	CACACACATTCACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIALLFIHSDSDHWKFLTINTAGAKEGGLLLTSFKMHPDLTLSCEANTREAGRREKPDCKTPTTKQTGLRRRKVLKKLWLREGIQGGADAILHKKGMRPSSSRRGGAPDPGAGLLTRGRGS	148325	134823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_134927_144579
884045	contig_12644_pilon	+	1179	10	Intergenic	novelGene_44641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	49	1179	2675526	2680404	FALSE	35	GGAGGAAAGAAAGCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKK	2675477	2680404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
884046	contig_10106_pilon	+	4843	7	Intergenic	novelGene_73866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	749.10057179705	1456	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	170	538	151101	173056	FALSE	15	GTGTAGTTTCAGTTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPERAQQA	131618	177361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131684_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159359_173039
884047	contig_4151_pilon	+	1856	3	Intergenic	novelGene_65259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	265	765	663144	663644	FALSE	10	AGCAGTTTGTGTGTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	592894	664735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_593039_597782_597838_663078
884048	contig_14925_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_55305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
884049	contig_12677_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_110727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1729	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_135_733
884050	contig_9706_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_20880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4729	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	622	1038	3371	2955	NA	30	GATTAGTACGGGAAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRGANFCQVSRIAPEIRLVPWVTSGTQKWNGASPNFIINAARAMLEVTTLGSLVIDHCPDSIKLIMIAIMSSMDAVDWARKYFVAASVDRGLEFMVRIGIMANIFISRPIQASSQFELSIVVIVPSIRVIRIMLKIRG	3992	2952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_3000_4000
884051	contig_11720_pilon	-	1505	10	Intergenic	novelGene_43851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATCCACCAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98771	70870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_71213_76923_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95390_98319
884052	contig_7056_pilon	+	5199	12	Intergenic	novelGene_43696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	268.200492416087	4254	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	38	1033	926284	935572	TRUE	5	GCGGCGCCATCGCGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEASLLSQVT	926246	960580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_936043_936993_940252_940915_941078_944197_944266_946462_946554_952293_952352_960521
884054	contig_5945_pilon	-	1601	7	Intergenic	novelGene_104569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_6	308.341080983741	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	145	858	237053	219523	TRUE	15	TATATGACTGTGCCTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRCNLFSIIATHKPPLIDRWWLNMNMKCIIWDSNPGLLHGSRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	237197	215592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_236928
884055	contig_16098_pilon	+	957	6	Intergenic	novelGene_46062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	467.740953947802	1074	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	207	566	436826	438839	FALSE	15	GTTCCAGGCTCGCGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIKDNGWD	436012	439230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436298_436339_436759_436943_437045_437090_437263_437373_438749
884056	contig_9406_pilon	-	2563	8	Intergenic	novelGene_136150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	557.610682707378	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	265	1470	86131	34784	FALSE	30	AAATCTAGCACGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSENQRLVSQDNFGFDLPAVEAATKKHEAIETDIAAYEERVQAVVAVARELEAENYHDIKRITARKDNVIRLWEYLLELLRARRQRLEMNLGLQKIFQEMLYIMDWMDEMKVLLLSQDYGKHLLGVEDLLQKHALVEADISIQAERVRGVNASAQKFATDGDGYKPCDPQVIRDRVAHMEFCYQELCQLAAERRARLEESRRLWKFFWEMAEEEGWIREKEKILSSDDYGKDLTSVVRLLSKHRAFEDEMSGRSGHFEQAIKEGEAMIAEEHFGSEKIRERIQYIREQWANLEQLSDIRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	87549	33690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39061_82558_82968_83738_83893_86062_86366_87519
884057	contig_6898_pilon	+	2759	14	Intergenic	novelGene_35697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	38	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	134	1867	59668	125646	TRUE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125707_126871
884058	contig_6513_pilon	+	7729	38	Intergenic	novelGene_117770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_37	286.001146769118	2093	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1829	5490	700	6189	171798	262401	FALSE	40	AAAGAACTGCTCAGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKSGFKSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHPDSKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKKMEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQCVVHLPSSEKDSNSEEDSNKKVDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHSKEVETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVVAVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQLLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVTQNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGALCRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQEVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQQLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIRGNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTEVNMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVSGSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSESEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKITEDVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAITSLLGGGSPKNNAAAETEDDESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQMNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSNGFSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKDGTSS	171098	263941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_171994_198973_199157_203369_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250_212332_213108_213210_215594_215734_217492_217576_218551_218685_219547_219692_222542_222633_223706_223922_224032_224136_224940_225040_225147_225295_227702_227838_228598_228698_229501_229556_237118_237228_239085_239223_246518_246660_246868_246963_247402_247558_248063_248155_250105_250280_250714_250906_252976_253085_253506_253708_256838_256986_258594_258870_260341_260517_261288_261478_262035
884059	contig_15323_pilon	-	6172	2	Intergenic	novelGene_148514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4270	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAAGGAAGCAGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90932	65049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_65202_84912
884061	contig_6304_pilon	-	3641	1	Intergenic	novelGene_122256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	115	723	153893	153285	NA	55	AAGAATTAAACGCTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRYMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPSGIAFDPAIPLLGIDPREIRVITQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNHESVNHLIPWMKLEDIMLIEISQSQKDKYCMRPLL	154007	150366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_150400_154000
884062	contig_9363_pilon	-	4005	24	Intergenic	novelGene_6579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	871.949882363371	5	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	541	3213	777144	755098	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKSSPDTDQSGAV	780595	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755134_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570
884063	scaffold_13505_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_111658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	408	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTGAAAAAGTTTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849479	846761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_846800_849500
884064	contig_4103_pilon	+	2468	2	Intergenic	novelGene_51936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	0	12	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAAGTAGGCCAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92164	94750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_92282_92399
884065	contig_4797_pilon	-	2890	4	Intergenic	novelGene_6938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	856.556283420224	244	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	141	575	671697	658501	FALSE	20	CCTGGTTGACTTCAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVEDHDGEGDVAGDDDDDESPDPESPDDSESDSESEKEESAEELHATEHPDEVEDPKNKKDAKSNYKMMFVKSSGS	671837	656185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_658729_659533_659644_665273_665308_671634
884066	contig_20951_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_43067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	13748.9314562078	210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	90	824	29171	26737	FALSE	30	AGAAGCAAGGAGTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRGLCTLFFFLIVIPNIVRCDSKFLPSQKLPHFPLRARSPPQVHTGAGTVGLLFCKLCDPSFF	30023	26558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26922_28036_28224_28685_28926_29048_29178_29940
884067	contig_9112_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_60227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5219	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1897	2322	116699	117124	NA	20	CTCTCAGCTTACCCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAHNTGFLSGLRNTFTKITHSILLREKMHFSFGNSKSKHLICWVLENSFFGHAVCLAITIPLSKKVNKRQKKKKKLALACFTYEIPSELFEWVGLGATYVNPCNFHNKQVHEEVHSVQVITEPQSSRNFLLEIKKKNFY	114802	117434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_114800_117400
884068	contig_6058_pilon	-	6552	8	Intergenic	novelGene_172388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_7	389.565115984269	4028	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	304	1710	398054	385415	FALSE	35	AGGTCACTGAAAACCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401595	380572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
884069	contig_14687_pilon	+	4116	1	Intergenic	novelGene_107962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3228	3548	687447	687767	NA	35	GAGAATATGCACTTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEKKGKEEKTKQRNKKTKTNKKNKCSQGCHCASAQGKGVSPKPHGTAWPEVAPKPRKQSKKQIKTVQIRTNKKKPRGSHQRVGRGQEAVPRSSGALQPPWKKER	684219	688335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_684200_688300
884071	contig_3986_pilon	-	3278	1	Intergenic	novelGene_52719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	2334	2774	90227	89787	NA	40	AAAGTTGTGAGTGATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHCNQRLVSAPKIPKQACPPRTVGESFCTTHSVTNDPGTFAPTIWQAVDYTHNMQPNDQGEHTCTHGQVTSWTNTSPHHKQHLCPQHPSKNSEQSSMLTPTSSCAHLETGSKSFNLARLGTTVAHTLSLLGYIKAKQNKTKFRTQ	92560	89282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_89300_92600
884072	contig_15327_pilon	+	1916	3	Intergenic	novelGene_70426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	287	328	53822	53863	FALSE	30	CGCCCAGCCTACGAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAELASWLLQPFAVLARSRRDTCSLHPSECWDSLGRTTSSDTSEELNSQDSPKKQDSAVPSSASSSSDPILDFNISLAVAKERAHQKRSSKQAPQMDWNKKNELFSNF	35969	55451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36068_53403_53442_53671
884073	contig_13863_pilon	+	4422	11	Intergenic	novelGene_42062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_10	298.763869970919	4600	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	377	1726	474588	490279	FALSE	25	CAGCATTTATTTATCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455551	492975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
884074	contig_9468_pilon	+	843	6	Intergenic	novelGene_59504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	284.518962461204	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	81	572	350773	354884	FALSE	35	GTAAGTATAATTATTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQADDEP	350692	355155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_354779_354865
884075	contig_16666_pilon	+	2164	2	Intergenic	novelGene_61778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	468	1124	117272	117928	FALSE	75	TTAAAAAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGICHSPHEDRVADWHVQRSTSRAIRGRCRGFGPAPEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106073	118968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106184_116914
884076	contig_14273_pilon	-	3161	2	Intergenic	novelGene_21168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGACCTTTTTAGCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321172	317856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_318290_318444
884077	contig_10500_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_41236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTATTTCTATATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628605	1626415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626400_1628600
884078	contig_5854_pilon	+	5470	3	Intergenic	novelGene_68854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2939	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	2667	3893	3621	4847	TRUE	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHNQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLMKTLNQIGIEGKFLNIIMGIYAKPTVNIILNGERLKTFPLKTGTRQGCRLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIGRFSRVAGYKINIQQSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVIMAILPKAIYKYYAIPFQIPTIFFKDMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKGGGLTLPDFRAYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISI	454	179256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_2218_2717_5181_178012
884079	contig_6902_pilon	+	7969	27	Intergenic	novelGene_135570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	447.460627668636	23	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2132	6399	1217	7615	467103	529035	FALSE	65	AAGAAAAAAAATTTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTNEVTVSTNGTVNSVVQEAASTAGDISGSKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQMVVKAGENVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRSNNGPPKSARNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQSAGTTGVDPVNGSSTHHQEGALNGTGQKNSKDTTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVVEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQIIQVWNKKNANEKGRNQTSKLPPRFAKKQTTGTQQAQCPASAPNSASAPALAPVPASAPVPSSTSAPIPASALAPVPPSTSAPLLASPSASVPTSASTPAPASTSATATASSSAPVPAPVPIPAPTPILASISAPASVPILASAPTSVPILASAPASVPTLASALVPASSPTPAPTASAPTAPTVSAAAAPASVPTAPVPLAPAPSTPGPSAPAQTQAQTHKTVQNSLQTTTQTSKQPPPLVRLHSAQTPNGVDYVTTGKSIQNSQCHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAASPEGTKNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPMLSDKPTDKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVESKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDVQQVEPEGQEKPSPATGRSTDPVTTKETKTVSEMSSEIGTMISVSSAEFGTNAKESVTDYTTPSSSLSNTVATNNAKMEDTLVNNVPLPNTLSLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIASGVSSGASGPSTASYNSFSSASMPQIPVASVTPTTSLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAGNAFRIEY	434337	529389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_463913_464046_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273_498512_501734_501944_513073_513229_514497_515366_515764_515851_519137_519327_519462_519715_520975_521069_524058_524161_527222_527425_528805
884080	contig_12327_pilon	+	2913	5	Intergenic	novelGene_140669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	57.6216105293839	9	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTATGGAAGTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124007	1137651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1132998_1136332_1136479_1136945
884081	contig_19459_pilon	-	1140	7	Intergenic	novelGene_59878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6037.35383535977	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	25	810	16240	7003	FALSE	10	TTCCTGTCTTCTTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16264	6672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203
884082	contig_5686_pilon	+	10889	4	Intergenic	novelGene_45307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4847	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGGAAAAAGATGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95573	112151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_97690_97777_99389_99453_104352_109887
884083	contig_11104_pilon	+	870	7	Intergenic	novelGene_112455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_6	8.43932593411478	866	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	26	784	310041	326692	FALSE	30	GTAAATGACTGTTTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRLAGFCQGVSAALKASRVLINSQAPTSPGCRFAVGLLPGNLPNVTAFHQCRSLHTTLSRKGLEEFFDDPKNWGEEKVKSGASWTCQQLRNKSNEDLHKLWYVLLKERNMLLTLEQEAKRQRLPMPSPERLEKVVDSMDALDKVVQEREDALRLLQTGQEKARPGAWRRDIFGRIIWHKFKQWPIPWYLNKRYNRKRFFAMPYVERFVRLRFEKYARTESRKKSLKKKKEKILQEKFPHLSEAQKSSLA	310015	326778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_310139_312713_312866_313391_313453_315986_316084_319862_319994_321561_321658_326568
884084	SIRV6	+	1166	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	351	11	143	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884085	contig_15991_pilon	-	934	8	Intergenic	novelGene_70901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3099.91792518079	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	497	865	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106362	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102098_102200_102271_103583_103703_104975_105142_106315
884086	contig_4131_pilon	+	4320	1	Intergenic	novelGene_127891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	2726	3367	300864	301505	NA	25	TGAAACAGGCTTTCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPAAPATASPAEKTQIKKKARKSTGAAKRKATGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAGGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEAKPKAKKAGAAKAKKPDGTKKPKRPAAATPKKSTKKTPKKAKKPAAAAGVKKVAKSPKKVKAAKPRKAAKSPAKAKAPKPKAGKLKAGKPKKAAPKKK	298138	302458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_298100_302500
884087	contig_10074_pilon	-	749	3	Intergenic	novelGene_57195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_2	396.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTTTATTAGTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596818	583526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_583872_586186_586330_596557
884088	contig_233_pilon	-	4038	14	Intergenic	novelGene_14530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1204.54905996801	67	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	1558	2487	108522	98333	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDHLRLLLQQEGPTTGPAQRGL	127002	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98397_99789_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_109976_126898
884089	contig_9836_pilon	-	4756	2	Intergenic	novelGene_176156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1000	2049	224498	223449	TRUE	40	TAATAATAATAGCATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILTAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKRVLRSEDKQLQLTGRT	225497	23334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_25337_222743
884090	contig_7056_pilon	-	2198	14	Intergenic	novelGene_43629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	899	junction_10	782.069391131234	3754	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	112	1461	730480	723226	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	731058	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
884091	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	4019	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
884092	contig_5286_pilon	-	16379	10	Intergenic	novelGene_157324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	469.331860267049	1982	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	262	1857	564457	527754	TRUE	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLNEATQGKEHSEMSNNVSDPKGPPAKIARLEQNGSPLGRGRLGSTGAKMQGVPLKHSGHLMKTNLRKGTMLPVFCVVEHYENAIEYDCKEEHAEFVLVRKDMLFNQLIEMALLSLGYSHSSAAQAKGLIQVGKWNPVPLSYVTDAPDATVADMLQDVYHVVTLKIQLHSCPKLEDLPPEQWSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNSTYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKTKDMMVEMDSLSELSQQGANHVNFGQQPVPGNTAEQPPSPAQLSHGSQPSVRTPLPNLHPGLVSTPISPQLVNQQLVMAQLLNQQYAVNRLLAQQSLNQQYLNHPPPVSRSMNKPLEQQVSTNTEVSSEIYQWVRDELKRAGISQAVFARVAFNRTQGLLSEILRKEEDPKTASQSLLVNLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDERERSLNAASAMGPTPLISTPPSRPPQVKSPFPPCCLYLSVVFFLPFFLCLRKDMTLNRWMDSWIYRFLKNNPTLLLEENLIPGH	589455	481802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_487678_489780_489985_519310_528144_536997_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559632_560396_560574_564246_564482_589218
884093	contig_11720_pilon	-	1285	11	Intergenic	novelGene_43844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	543	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98766	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_95901_95913_98380
884094	contig_10930_pilon	-	2193	6	Intergenic	novelGene_37004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_3	1842.38981760104	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	124	630	280211	274196	TRUE	40	TAAGACTACTTTGTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKGVASMHHTLPKCIIMIWKQHLESFFFQRWIHTLASLLPTQQP	280334	267432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_278443_278637_279700_279832_280157
884095	contig_8617_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_73380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61762	60778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
884096	contig_8484_pilon	-	2716	1	Intergenic	novelGene_178374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTAGGTTGTTTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8983	6267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_-_6300_9000
884097	contig_11564_pilon	-	2458	10	Intergenic	novelGene_158546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_8	227.888374234209	2160	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	202	1254	60844	41045	FALSE	15	AAGGACTGTTTGCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLANLLLEEDNKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	100721	39840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62605_100657
884098	contig_19438_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_175897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	365	709	23989	23645	NA	50	AAAAAAAAATTCTGTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKGDSTECGNYRTISLISHTSKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQAGFRRGCGTRDIIADVIWILGRSREYQKDVYLCFIDYAKTFDCVDHSKLWIALQRMGIPEHLIVLM	24353	21835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_-_21800_24400
884099	contig_7816_pilon	+	480	3	Intergenic	novelGene_66542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCAGGATCTGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246139	250123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_246313_249177_249309_249947
884100	contig_2170_pilon	+	7664	8	Intergenic	novelGene_178379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	219	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57806	312920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2170_pilon_+_59606_145828_146497_146555_147018_158662_158850_183349_185656_197778_197831_205116_205252_310865
884101	contig_6128_pilon	-	4469	5	Intergenic	novelGene_178382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2172	2546	47932	47558	TRUE	20	CCTCTCAATCGATTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVREDTSYYLKVLDLAEDCSGPEMWSILENIPCALEKNVYFASVGWSVLYMCMRSSWLLVPFMSSVTLLSFFSDSLSFTDSGVLKSPIIIVELSISLFSTVRVCFMYFGALSLGAYMFIMVISS	136301	44165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6128_pilon_-_45563_47031_48063_49658_50165_93096_94395_136064
884102	contig_9014_pilon	+	1726	4	Intergenic	novelGene_106793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1386.11503450792	279	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	60	437	150693	152329	FALSE	30	AAAGCTGCTCTGAAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150633	153618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234
884103	contig_10973_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_150351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	243	443	2418	2218	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2660	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2700
884104	contig_5523_pilon	-	4406	3	Intergenic	novelGene_169097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3189	3764	89149	88574	FALSE	65	GCAAAAAAAATGAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDTKILNKILANRIQHHIKNIIQHDQEGFIPGMQRWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHIIISIDAEKAFNKVQHPFLIKTFNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTASIIFSGERLKTFPLRTGTRQGCPLSLLLFNTVLEVLARAIRQGKEIKRIQIGNEDVKLSIFADDMILYTENPRDSMRKLLELIDSAK	103143	87931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_89827_100574_102789_102846
884105	contig_16205_pilon	+	2817	10	Intergenic	novelGene_156852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGAGAAACACCAAACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16180	70752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_16365_19569_19661_29161_29268_30233_32215_37670_37729_42368_42439_47377_47451_48103_48193_70505_70563_70644
884106	contig_5988_pilon	+	2600	9	Intergenic	novelGene_16079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2088.41024690433	43	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	81	485	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209863	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218910_1221789_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225902_1225946
884108	contig_8045_pilon	-	3134	2	Intergenic	novelGene_35396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1363	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGTCCGCTTCATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119418	116182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_117349_117450
884109	contig_11248_pilon	-	7599	6	Intergenic	novelGene_142564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1093	123	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2473	2910	746001	745564	TRUE	40	AACTTCAGATCACAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQAKNNQKRAKVAILISDKIDFKAKPTTKDKEGHYITIKESIQQEDMTIINIYAPNDRVPKYIKQMLTALKSEIDSSTIIVEDFNTPLLVKDRTSRKKLNKDMEELNATIYQLHLIDIYRALHPTAPSIHSYPIHMEHSPE	804156	493000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_494980_597433_597808_700310_700609_733986_735377_744915_747144_802826
884110	contig_12869_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_75344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTGCTTGTTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76257	77281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_76300_77300
884111	contig_8122_pilon	-	1254	9	Intergenic	novelGene_40174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	114.195487542197	48	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	102	803	36501	12680	FALSE	20	GTACTACTCTTTTATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKGDDSLQQQQPFHCHLISQCLLAV	37993	12228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_12751_32701_32826_33336_33468_33926_34016_34339_34418_35756_35920_36212_36256_36498_36525_37915
884112	contig_6412_pilon	-	2227	2	Intergenic	novelGene_149975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	217	375	561210	561052	TRUE	50	TCTACAGAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHRYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRTLAIREMQIKTTMRYHLTPGMTGTNQKHWK	561426	544346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_544773_559625
884114	contig_19777_pilon	-	2067	7	Intergenic	novelGene_29704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	996	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATGTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19266	10121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_10583_12884_12976_13206_13283_13382_13517_15437_15559_16872_17025_18234
884115	contig_6898_pilon	+	3116	14	Intergenic	novelGene_35678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	51	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	138	1871	59668	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59530	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126067_126876
884116	contig_10930_pilon	-	8302	7	Intergenic	novelGene_36963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	6058	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	25	1587	280370	268388	FALSE	20	GGTATGCCCACTGACCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	261672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
884117	contig_9609_pilon	+	2127	9	Intergenic	novelGene_23044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_8	557.664535697762	4335	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	54	1121	435608	454609	TRUE	75	AAGAAAAAAAATACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGRVGAGRRPGRADGGMGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435554	456264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
884118	contig_4232_pilon	+	646	1	Intergenic	novelGene_63391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCCCTTTCTCAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467255	467901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467300_467900
884119	contig_935_pilon	+	2979	2	Intergenic	novelGene_45502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1446	1937	5315	5806	TRUE	25	TCAATTCTGACTCAGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPTRARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRAKKKKKKATPPAYKRHPKSRLPGRAESKQPAAPGPEPVTPGSRGANEQRPRILARVAAQTWKQPHSRT	3869	7142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_6322_6615
884120	contig_10904_pilon	-	2511	3	Intergenic	novelGene_22469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1886	2248	149507	149145	TRUE	35	GTTAGGAGGAAGTTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDAAVGLELDVGGGVDDGSGEAEEGGVAGVGDGEVAPGQGESGLEPADLNDENDQGHRKAEAPGEHRPVTHGPCPGIHAGHQREGDAGGQQLQQTEESQGLSQCPRGPHNGGGTQARG	151392	144886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_145027_146149_146223_149094
884121	contig_7151_pilon	-	2281	6	Intergenic	novelGene_40784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	913.950195579606	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1381	1686	535543	529189	FALSE	25	GTCCATTTCTTCACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	584843	528593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_536494_549638_549729_550996_551120_584626
884122	contig_7963_pilon	+	3419	4	Intergenic	novelGene_58524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	428	junction_3	65.1783876927178	42	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2636	3130	197649	200117	FALSE	15	TATTGTTTATCCATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSFMTMFLFYIGLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSYTSIPGSNYPEGQHTF	195013	200406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_197974_199411_199529_199689_199726_200100
884123	contig_15611_pilon	-	1935	3	Intergenic	novelGene_178384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACACAGAGTCAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32432	19294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15611_pilon_-_20309_29150_29856_32216
884124	contig_8045_pilon	+	1321	5	Intergenic	novelGene_35384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2	628	116082	118722	FALSE	25	GAACACTTGAGTTCAGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116080	119415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
884125	contig_19459_pilon	-	1277	8	Intergenic	novelGene_59813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	154	939	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	17577	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17448
884126	contig_7593_pilon	+	4503	6	Intergenic	novelGene_127287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_3	72.9739679611846	2019	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	195	812	166172	198612	FALSE	30	TGAACAACCCTTTCCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC	165977	202303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_166195_183166_183240_192341_192438_196398_196495_198038_198171_198414
884127	contig_11417_pilon	+	5272	15	Intergenic	novelGene_103315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1997	junction_12	1121.56626315749	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	22	1821	558340	572821	TRUE	55	TTTAATAATTAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHDEVRTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIISSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARVLHLGGQCGPGLVESCFRGSYRRQ	558318	588918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_558388_559106_559263_559490_559655_560664_560890_566040_566182_566276_566362_567428_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597_570686_572533_573637_575930_576054_583804_583914_586514
884129	contig_11850_pilon	-	3173	7	Intergenic	novelGene_125206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_5	936.069560568135	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	105	848	286397	282879	TRUE	65	ATTAAAAAAAAAGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	279388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285361_285531_286311
884130	contig_8204_pilon	+	5037	7	Intergenic	novelGene_176994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.634166890345	1984	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	3	1730	18967	63532	FALSE	50	AAACCCTTTCTAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGPFQSQKKNLFHKIVSKYKHKKEKPNVPEKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEVTDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	66839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_43538_43629_45005_45066_57893_58087_63444
884131	contig_13283_pilon	-	4754	3	Intergenic	novelGene_154006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	2522	2950	135315	134621	TRUE	45	AACAATAACACTAACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLTENRERGEIHAEVPYQLTQRGSTILDSYRRPAKGGLEKAASQSVQQETKQPVVCDIRFPTPHPSSPRLGLLCFLWPQSLDQETPAAWIPRTRTGGSLSAICWLLVLLFSASFDFFLASHHLPLLLLKYLAPCAIFASS	137836	5572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_6993_134236_134683_134948
884132	contig_1450_pilon	+	2982	2	Intergenic	novelGene_27433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1772	junction_1	0	2606	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	116	1132	419840	423253	FALSE	5	GCTGGTTTTACTTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419724	425103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293
884133	contig_4857_pilon	-	5575	3	Intergenic	novelGene_48753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.5	635	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACCATATCATTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208103	1199225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1199631_1199691_1203431_1206672
884134	contig_8204_pilon	+	3006	7	Intergenic	novelGene_176992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.634166890345	5	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	3	1730	18967	63532	FALSE	40	CTAGCAACAGATGCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGPFQSQKKNLFHKIVSKYKHKKEKPNVPEKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEVTDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	64808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_43538_43629_45005_45066_57893_58087_63444
884135	contig_5031_pilon	-	7809	1	Intergenic	novelGene_133171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1118	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	254	765	183	947	25850	25086	NA	45	GTGGGGAACAAAACAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGEFYQTFREELTPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEASITLTSKSGKDTTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQQHIKEIIHHDQVGFIPAMQGWFNIRKTINVIHHINKTKHKNHMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKPKANIILNGETLKAFSLRMGTRQGCPLSPLLFNTALEVLARAVRPKKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRTLLELIEDFSKVSGHKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPFTIASEKIKYLRMNLTREIKDLYNENYRILL	26032	18223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_18200_26000
884136	contig_7230_pilon	-	2387	7	Intergenic	novelGene_52547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	434.853104188325	395	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	115	639	177508	134555	FALSE	35	TCTGGGAATAATGAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCVIWWSQHLGKYLRFTFPAFRALPPPSRVGVPGRRCEMSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNPLIAVILFRYIRLVTVL	177622	132806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134612_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438
884137	contig_8712_pilon	+	1621	4	Intergenic	novelGene_58778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	589.359539387178	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	37	396	314974	322039	FALSE	35	AATTCTCATGGTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCTGYSKTFTASVDSRVSCPPVTPTHPI	286984	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318126_321954
884138	contig_8019_pilon	-	2869	1	Intergenic	novelGene_126986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	1344	2330	114808	113822	NA	25	GTTCTGGACAGAGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTQYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTRTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNLIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVATRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	116151	113282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_113300_116200
884139	contig_11160_pilon	+	2344	2	Intergenic	novelGene_168813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	318183	320483	FALSE	40	TGGACAAAAAGTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQQSASCRRLRAGGGGPGTPGARRSALCFSQLSPHSSLQGLATPSQPPAPPSAPLPASATAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318180	322426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318297_320198
884140	contig_14208_pilon	-	3428	2	Intergenic	novelGene_129109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	921	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	284	592	325034	324726	TRUE	25	TATGGTGGTGAAATTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPERDRTTGNQRYMLSHPPPFFTPTRSPLLPSATDSRLGSTGFTPVLPGFHPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLSPHHPCPPSLKYLAPCAIFAFS	325317	321724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_324242_324406
884141	contig_4857_pilon	+	3874	2	Intergenic	novelGene_48744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACCCAGATTAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197841	1203154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1198277_1199715
884142	contig_9614_pilon	-	7848	15	Intergenic	novelGene_104415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_3	293.443281033445	1845	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1041	3126	204	3329	155634	107861	FALSE	5	CCGTATTGTCTCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRPYPGSSTDLLPTGPNLRPLRRRQAPPPRSRKWRHDARRSSPDAGFYIRILRVDSHLCVRLRVQHMRDGSFSSSSTTACLHRPASRCRYRQEVRKFKMAAAEIPSLREQPEIEDADNSEKSINEENGEVSEDQSQNKHSRHKKKKHKHRSKHKKHKHSLEDDKDKKHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPVINESRSRDRGKKSRSPVDLRGKSKDRRSRSKERKSKRSETDKEKKPIKSPSKDASSGKENRSPSRRPGRSPKRRSVSPKQRDKSRRSRSPLLNDRRSKQSKSPSRTLSPGRRAKSRSLERKRREPDRRRLSSPRTRPRDDILSRRERSKDASPINRWSPTRRRASRSPIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRDRGRRSRSRLRRRSRSRGGRRRRSRSKVKEDKFKGSLSEGMKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDKVTEREKVTVMSTINPTKDLLADLIGCQRLPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQEKI	155837	103341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_108065_109251_109339_110641_110794_111390_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136482_140312_140490_145263_146464_155497
884143	contig_6165_pilon	+	3354	3	Intergenic	novelGene_167421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAGCTTGAGCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500247	507870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_503410_503875_503980_507782
884144	contig_15105_pilon	-	1694	6	Intergenic	novelGene_151014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_5	987.227430737214	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	37	708	839916	829338	FALSE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839952	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836497_839849
884145	contig_8538_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_5109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	622	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTATGCATTTTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912217	913993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_912200_914000
884146	contig_16103_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_118958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGGAAAAAACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023043	1021003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_1021065_1021216
884147	contig_13863_pilon	+	6768	24	Intergenic	novelGene_41985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	468.055875358345	3122	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	390	2165	55383	81541	TRUE	45	TAAATAAATAGCATATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	48642	86436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54864_55053_55191_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493_82899_83190
884148	contig_10345_pilon	+	1391	13	Intergenic	novelGene_158351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1141.99586494678	10	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	480	1142	14227	24141	FALSE	30	TACCCGAGAATGATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13276_14111_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
884149	contig_13702_pilon	+	3849	1	Intergenic	novelGene_102624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2447	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3372	3671	211071	211370	NA	40	CCAAGGATGGAAAGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	207699	211548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_207700_211500
884150	contig_1435_pilon	-	3189	4	Intergenic	novelGene_115509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1339	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAAAAGATTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565948	556420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_556565_557474_557719_560258_560371_563259
884151	contig_1275_pilon	+	12126	46	Intergenic	novelGene_108732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3513	121	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	7778	8092	370740	373051	TRUE	45	AAAGAAAATCACCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERPISLMVVMPSYGFPLVMAPSNARMGGLSLLICLGYLRPSSKLSLVALGVTLHDGPRQHSPLFEVRMRAAPGQRSAYQPSKGADTGDSLIDIPGFIFPSKDS	333546	525126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_338262_339757_339941_342543_342757_343259_343317_350095_350240_351961_352100_355195_355421_355599_355761_356170_356298_359071_359568_359777_359944_363605_363713_364055_364216_364696_364910_367967_368193_369970_370327_370648_370893_371282_371370_372976_373119_375532_375687_380109_380214_380549_380658_380754_380880_388394_388556_395564_395758_397804_397936_400307_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409_464583_468120_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486075_495660_495854_505867_506006_513629_513803_524939
884152	contig_8934_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_167249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGACAGTTTTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723798	725472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_723800_725500
884154	contig_15974_pilon	-	3730	1	Intergenic	novelGene_164826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	2277	2804	341853	341326	NA	45	GTATGCCTGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKELGKSKAQGIDGIPDEMFQQTDAVLEVLIHQCQEIWKTVTWPTDCKRSIFMLIPKKGDPTECRNNRIISLISHGSKTLLKIIQKRLQQYTDRELPEIQAGFRRGRGMRDITADVRWILAESREYQKDVYLCFTNYTNAFDYVDHNKLQRMGIPEHLIVFMRNLYTDQEAVV	344129	340399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_340400_344100
884155	contig_3975_pilon	+	3086	5	Intergenic	novelGene_54941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2378.06175014443	5000	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	491	847	2344841	2354455	FALSE	5	CTCTTTGTCTGTGCATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEKELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPGNSWYLEM	2344350	2356694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2344937_2347066_2347163_2351503_2351635_2352983_2352990_2354427
884156	contig_11160_pilon	+	2650	3	Intergenic	novelGene_168821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	760.5	57	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	294	767	318478	320483	FALSE	35	ACATTGTGACTGTAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPNAPLPASATAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318184	322366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319215_320239
884157	contig_21007_pilon	+	1317	2	Intergenic	novelGene_161523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	AAAAACTACGTATCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
884158	contig_8914_pilon	+	3761	9	Intergenic	novelGene_112850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1788	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	307	726	170449	170868	TRUE	25	CATCCTGCTGCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYELRCFNKQMKCWGCSFISTKKFERQLPGQPPGRDPYLCLFQRKVIQLNEEIIQQYHKYHTSKILLQIIQKHLEQYINGELPEIQAEFRRGHGTRDIIADARWIVAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCVNHNELWIT	42552	268941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_42670_170259_171752_239468_239643_263379_264688_264840_264950_265588_265799_267319_267508_268075_268179_268881
884159	contig_10500_pilon	-	4357	7	Intergenic	novelGene_41247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	794.385594168363	64	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	898	1413	1635203	1629460	TRUE	35	TTCTTTTATAATTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640229	1626452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626521_1626583_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635617_1636940_1637067_1639871
884160	contig_6902_pilon	+	10407	35	Intergenic	novelGene_135571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	465.245271474905	4152	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2732	8199	347	8545	460308	540241	FALSE	40	CTAAATAATGACTTCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKPPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTNEVTVSTNGTVNSVVQEAASTAGDISGSKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQMVVKAGENVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRSNNGPPKSARNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQSAGTTGVDPVNGSSTHHQEGALNGTGQKNSKDTTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVVEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQIIQVWNKKNANEKGRNQTSKLPPRFAKKQTTGTQQAQCPASAPNSASAPALAPVPASAPVPSSTSAPIPASALAPVPPSTSAPLLASPSASVPTSASTPAPASTSATATASSSAPVPAPVPIPAPTPILASISAPASVPILASAPTSVPILASAPASVPTLASALVPASSPTPAPTASAPTAPTVSAAAAPASVPTAPVPLAPAPSTPGPSAPAQTQAQTHKTVQNSLQTTTQTSKQPPPLVRLHSAQTPNGVDYVTTGKSIQNSQCHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAASPEGTKNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPMLSDKPTDKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVESKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDVQQVEPEGQEKPSPATGRSTDPVTTKETKTVSEMSSEIGTMISVSSAEFGTNAKESVTDYTTPSSSLSNTVATNNAKMEDTLVNNVPLPNTLSLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIASGVSSGASGPSTASYNSFSSASMPQIPVASVTPTTSLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAVTQIPAFYMDTSHLFNTQHARLAPPSLAQQQGFQPGLSQPTSVQQIPIPIYAPLQGQHQAQLSLGAGPAVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPAVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTSFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTIQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPISGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQKRAVGRGLSHKTFGPRCWQSREQRFFSPRSGSSLNSSRANK	434337	542103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462130_463562_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273_498512_501734_501944_513073_513229_514497_515366_515764_515851_519137_519327_519462_519715_520975_521069_524058_524161_527222_527425_528805_529010_530355_530472_530826_530964_534150_534383_534617_534726_535813_536033_536457_536562_536925_537053_539667_539721_540168
884161	contig_14970_pilon	+	5468	9	Intergenic	novelGene_45029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_4	5745.96425219475	1	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	130	735	177395	210890	TRUE	60	AAAAAAAGAGAATAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATRKDGDSQPLY	177265	232865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
884162	contig_5125_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_43412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.5	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	691	1041	35742	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAKCHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25942	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35757_58557
884163	contig_14441_pilon	-	2713	3	Intergenic	novelGene_100797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11.5	238	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	2374	2712	137212	136570	FALSE	10	TGCGCAAGCCGGCCGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSVLALLLGTFLDVGAQTILQWPVVEVRQVGSSLSLQCTVTGTSNPTLYWYWQATGGAPQLLFYSLDMDNIKGEAPKHFSAFRPRDGQFTLNADKLQPGDSGVYLCAWDAH	140997	136568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_136866_137169_137907_139318
884164	contig_6898_pilon	+	3128	14	Intergenic	novelGene_35699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	122	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	134	1867	59668	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126611_127407
884165	contig_6902_pilon	+	2050	12	Intergenic	novelGene_135569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	558.959437609351	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1704	347	2050	460308	490145	FALSE	65	GAAATGGAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNNIISSHNLPFIRGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQR	434337	490145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470364_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
884166	contig_253_pilon	+	2706	4	Intergenic	novelGene_129695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	104	junction_1	157.391938237707	1278	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1860	2243	488491	490018	FALSE	5	GCTCTGAGCCTTTCTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYKPIAPAPSSTPGSSTPGPGTPVPTAGSVPSPSGSGPGAAAPFRPLFNDFGPPSMGYVQAMKPPGAQGSQSTYTDLLSVIEEMGKEIRPTYAGSKSAMERLKRGIIHARALVRECLAETERNART	486631	490481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_488573_488881_488983_489064_489198_489950
884167	contig_15021_pilon	+	4715	27	Intergenic	novelGene_26976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	125.489432356418	684	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	834	2505	1814	4318	335125	353345	FALSE	0	CGTTTGCCCTCTTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYVEINIDHKFHRHLIGKSGSNINRIKDQYKVSVRIPPDSEKSNLIRIEGDPQGVQQAKRELLELASRMENERTKDLIIEQRFHRTIIGQKGERIREIRDKFPEVIINFPDPAQKSDIVQLRGPKNEVEKCTKYMQKMVADLVENSYSISVPIFKQFHKNIIGKGGANIKKIREESNTKIDLPAENSNSETIIITGKRANCEAARSRILSIQKDLANIAEVEVSIPAKLHNSLIGTKGRLIRSIMEECGGVHIHFPVEGSGSDTVVIRGPSSDVEKAKKQLLHLAEEKQTKSFTVDIRAKPEYHKFLIGKGGGKIRKVRDSTGARIIFPTAEDKDQDLITIIGKEDAVKEAQKELEALIQNLDNVVEDYMLVDPKHHRHFVIRRGQVLREIAEEYGGVMVSFPRSGTQSDKVTLKGAKDCVEAAKKRIQEIIEDLEAQVTMECAIPQRFHRSVMGPKGSRIQQITRDYGVQIKFPDREENPVHSVEPAMQENGDETAEGRGAKEADPSSPRRCDIIIISGRKEKCEAAKEALEALVPVTVEVEVPFDLHRYIIGQKGSGIRKMMDEFEVNIQVPAPELQSDTIAITGLLANLDRAKAGLLERVRELQAEQEDRALRSFKLSVTVDPKYHPKIIGRKGAVITQIRLEHDVNIQFPDKDDGSQPQDQITITGYEKNTEAARDAILKIVGELEQMVSEDVPLDHRVHARIIGARGKAIRKVMDEFKVDIRFPQSGAPDPNCVTVTGLPENVEEAIDHILNLEEEYLADVVDSEALQVYVKPPAHEESKAPSKGFVVRDAPWTANSSEKAPDMSSSEEFPSFGAQVAPKTLPWGPKR	318792	353742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_318892_321189_321252_322333_322447_324679_324838_326027_326244_332248_332456_332677_332894_333107_333315_333453_333562_334697_335195_336589_336730_338549_338655_338751_338866_339781_339869_340026_340159_343846_344066_346167_346390_346511_346731_346943_347083_348988_349144_349427_349533_349880_350016_350611_350756_351924_352111_352592_352710_352984_353114_353258
884168	contig_15185_pilon	+	2878	1	Intergenic	novelGene_99472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATTTCTCTTTGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466722	469600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_466700_469600
884169	contig_401_pilon	-	3177	1	Intergenic	novelGene_42913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1241	1576	1936096	1935761	NA	40	AAGAAAATGTCTTTGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWDIPVNWPNNLFSASVLPPSSLHRAWGLKSLQAAIQGTKNWFLLTWSNRGRRRLKKRRKIWNVWLIASMNNCLLCHETRRTGWCPATITEYFHQRFHRLILIKRGKMH	1937336	1934159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1934200_1937300
884170	contig_10734_pilon	-	5502	1	Intergenic	novelGene_51457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCCTGCCTACCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2262321	2256819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2256800_2262300
884172	contig_6059_pilon	+	2807	15	Intergenic	novelGene_44829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1197	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTTCCGATCACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567791	584815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165_573437_575784_575882_576079_576220_576551_576645_578184_578326_580594_580709_580919_581122_584190
884173	contig_10323_pilon	-	1968	10	Intergenic	novelGene_123550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	263.435845025776	27	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	158	715	305132	268465	FALSE	0	GCTGCCTGCCTGGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVPPKVKCLTRIWHPNITETGDICLSLLREHSIDGTGWAPTRTLKDVVWGLNSLFTDLLNFDDPLNIEAAEHHLRDKEDFRNKVEDYIKRYAR	309242	267211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_277887_277921_278700_278759_279648_279720_285482_285551_292633_292700_295187_295218_305014_305149_309101
884174	contig_5988_pilon	+	2886	9	Intergenic	novelGene_16069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_1	1695.77489201102	1546	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	132	734	1218923	1224777	FALSE	10	TTAACCTTTTTTCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKRTLGELEAHPVWKEPCWLVRDGTPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209835	1226929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
884175	contig_14621_pilon	-	2017	16	Intergenic	novelGene_105861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	140.863937503141	1551	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	499	1752	431679	396330	FALSE	25	TTTCTATTATGAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGSGTGGTWSEEWRRRKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAGKCLLDSAQHVPDAEVPGHLGYCDVSGWQSNAGPAGNQEDSTLVPEEGKKF	463832	396064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402107_403701_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_463781
884176	contig_14514_pilon	-	1579	4	Intergenic	novelGene_137458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1411	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCCTCCTGCAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36318	24708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_24763_30104_30201_34831_35314_35371
884177	contig_11924_pilon	+	3326	3	Intergenic	novelGene_128020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAATTTATATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27310	53489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_29044_51769_52361_52487
884178	contig_19179_pilon	+	9433	7	Intergenic	novelGene_142360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	804.187789014481	2730	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	510	1292	8945	28134	FALSE	10	TTCTTTTGTTGTAGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VERPPSPFSTAPQASLPPVPPRLDLLQQRVSIPSSASGPGTASKAASGSLHKDKPLPIPPTLRDLPPPPPPDRPYSVGAETRPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSNRLGESWLPRPIPKVPVGSLSPGDPWAGRELTNRHSLPFSLPSQLEPRPDVPRHGSTFSLDTSMSMNSSPLVGLECEHPKIKPSSSANAIYSLASRPLPVPKLPPGEQYENEEDTEYMTPSSRPLETAQSSRVSECDQQIDNCTYEAMYNIQPQATSVTESSTFGEGNLAAAHASTGPEESENEDGGYDVPKPPVPAVLARRTLSDISNASTAFGWLSLDGDPTTNFTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSSQQGGGAAAAAAAAAAASPQLSSEIESLMSQGYSYQDIQKALVIAHNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT	8351	36275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_8486_8569_8948_10964_11060_24879_24988_25453_25552_26229_26413_27838
884179	contig_7357_pilon	-	2092	8	Intergenic	novelGene_36803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1709.08558914421	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	219	1211	166824	136424	FALSE	15	TTTTCTGGACCTAGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167042	135542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_159952_160034_166772
884180	contig_854_pilon	-	1222	7	Intergenic	novelGene_36262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	258	614	563319	562338	TRUE	25	AGCCGGGGACAGCAGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563576	543507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562404_563028
884181	contig_205_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_144326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATATAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317316	314973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_315000_317300
884182	contig_19006_pilon	+	4659	18	Intergenic	novelGene_145581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	420.284645676003	2408	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	2	1714	22247	87640	TRUE	5	GGTCATGTGTCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYKRATLDEEDLVDSLSEGDVYPNGLQVNFCSPRNGQRCWAARTQVEKRLVVLVVLLAAGLVACLAALGVQYQTRAPPVCLSEACISVTSSILSSMDPTVDPCQDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENSTASVSEAERKAQVYYHACMNETRIEELKAKPLMELIEKLGGWNITGPWDKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQLRKAPNRDRVSSWNPAGTLLHSLLTQGLELWWHRCRRGP	22245	94323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_22334_30891_31034_41862_42076_55695_55818_56975_57123_58689_58756_59858_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80534_83349_83450_86810_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691
884183	contig_19816_pilon	-	1939	7	Intergenic	novelGene_156493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	164.578923991568	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	22	1170	126795	124293	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	126816	123033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
884184	contig_10958_pilon	+	2213	5	Intergenic	novelGene_5398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	2917	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	87	416	888255	895286	TRUE	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNN	888168	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893922_895279_895855_900457
884185	contig_9981_pilon	+	5191	3	Intergenic	novelGene_121016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	66	2584	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	363	890	10529	11056	FALSE	75	AAAAAAAAAAAATCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVLSKIFGNKEMRILMLGLDAAGKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS	9897	15357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_9936_10034_10078_10247
884186	contig_7396_pilon	-	2847	15	Intergenic	novelGene_79542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2902.34727313558	790	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	119	1507	255163	246442	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257472	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
884187	contig_610_pilon	+	3908	4	Intergenic	novelGene_76707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211062	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
884188	contig_12635_pilon	-	1778	12	Intergenic	novelGene_60800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	504.613820102082	43	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	528	1619	227344	174072	TRUE	25	AATAATGTTGGCCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSGTRTSSPFQCHEKWNGQLAKCTSCSGGLGSEEQSSVL	262197	173287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_173437_174061_174187_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_261771
884189	contig_14030_pilon	-	2455	6	Intergenic	novelGene_62228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	772	junction_5	399.794647287829	228	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTTAAACTTGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394666	335773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_338941_339036_344002_344109_344193_344383_350784_350849_394346
884190	contig_4732_pilon	+	3131	2	Intergenic	novelGene_75500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCATCACAGCAACACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022175	1025666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1022714_1023073
884191	contig_12090_pilon	+	2967	2	Intergenic	novelGene_80507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	48	junction_1	0	1803	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	32	1225	324954	326147	FALSE	50	TCAGTGAGTATAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGRRRIKLLGILMLVNVFIYLIVEVSKSNSQEKNGKGEVIIPKEKFWKISSPPVAYWNREQEKLNKRYNPILSMLANQTGEGYGSSNVSHLNHCEPDLTVMSVVTGFNNLPDRFKDFLLYLRCRNYSLIIDQPDKCAKKPFLLLAIKSLTPHFARRQAIRESWGREANVGNQTVVRVFLLGQTPPEDNHPDLSEMLKFESERHQDILMWNYRDTFFNLSLKEVLFLRWVSTSCPKAEFVFKGDDDVFVNTHHILNYLNSLSENKAKDLFIGDVIHNAGPHRDKKLKYYIPEVVYSGVYPPYAGGGGFLYSGHLALRLYNITDQVHLYPIDDVYTGMCLQKLGLVPEKHKAFRTFDIEEKNKNNICSYVDLMLVHSRKPQEMIDIWSRLQSAHLKC	291163	327889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_291186_324944
884192	contig_15777_pilon	+	2588	1	Intergenic	novelGene_75757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTGTATATTCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262012	264600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_262000_264600
884193	contig_8263_pilon	+	2465	7	Intergenic	novelGene_83085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	120.246506070747	502	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	779	1852	140133	192899	FALSE	25	TAGGCTGATACATGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGEDFRPGKSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139354	193512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
884194	contig_14666_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_39639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	25	684	484281	484940	NA	45	TCAATTTCAAATAGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	484256	486855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484300_486900
884195	contig_15407_pilon	-	3379	9	Intergenic	novelGene_123073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGCTAGCTAATGTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472471	449459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468070_468151_468305_470254
884196	contig_6440_pilon	-	1372	5	Intergenic	novelGene_161653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACAATTCAAAGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13766	10158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_10266_11193_11336_12287_12476_12734_13032_13128
884197	contig_2078_pilon	+	1771	7	Intergenic	novelGene_100138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.355479283506	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	8	823	266439	311030	FALSE	30	CCACTCAATGCATACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266431	311978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_285966_286172_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
884198	contig_8006_pilon	-	2805	3	Intergenic	novelGene_173931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	590	1018	413179	347327	FALSE	30	GGGGGGAAAGTCCAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIRRFLRKLEIEILRNPAIPLLGIHPREIRVVTRTDICTPMFMAALFTIAKRSKQPRCPSTDEWINKLCYIHTVEYYAMRKNNEESVKHLITRMKLEGGLWGPWSRRTSSSIGITQFIKTMFYILLW	413768	345539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_347420_400599_400609_412852
884199	contig_6058_pilon	-	4960	7	Intergenic	novelGene_172389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	435.834353089948	36	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	302	1624	398054	385415	FALSE	10	CCAGCGTTTGACCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401593	382078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_397985_398065_401302
884200	contig_11338_pilon	+	6019	5	Intergenic	novelGene_6402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTATGACCTCCACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310379	323474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_315654_318590_318769_319185_319265_321279_321459_323165
884201	contig_15720_pilon	-	4546	3	Intergenic	novelGene_41951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1632	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2541	2996	307437	306982	TRUE	55	AAAATGTCAGACAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	369374	305242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_306888_308160_367556
884202	contig_15105_pilon	-	2951	1	Intergenic	novelGene_151037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGCAGAAGAGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835021	832070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_832100_835000
884203	contig_8772_pilon	-	1618	9	Intergenic	novelGene_21112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1004	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	952	1281	19240	15784	FALSE	15	ACGTAGCTCCGGTTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLLLVEVPQA	23414	15446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
884204	contig_3956_pilon	+	4745	1	Intergenic	novelGene_14750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3220	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	363	1092	1265	2356	794916	796007	NA	30	GGAAAACCCTATGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEMRRKWADSGYILILLCHLGLLIIIVCSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSGNRLQMLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793651	798396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_793700_798400
884205	contig_9434_pilon	+	3312	21	Intergenic	novelGene_150477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	133	junction_9	220.103356403304	28	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1071	3213	100	3312	51222	118798	FALSE	55	TTTACAAAATATAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKQKNKSEDSAKDDIDLDALAAEIEGAGAAKEQDPPKSKGKKKKEKKKQDFDEDDILKELEELSLEAQGIKVDRETAAVKPTENNEEESTLKQEKKKKGQKGKKQSFDDNEDNDNEELEDKDSKSKKTAKPKVEIYSGSDDDDDFNKISKKAKGKAQKSNKKWDGSEEDEDNSKRTKERSGVNSSGGSGDESDEYVQSRKGQKKNQKNKPGANVESGNEDDGSSFRIKTVAQKKIEKKERERKKRDEEKAKLRKLKEKEELETEKKAQSQHREALKRAEEEPVKSKVTLDAGATPASEEKGEAPTAAEDDNEGDKKKKDKKKKKGEKEEKEKEKKKGPSKATVKAMQEALAKLKEEEERQKREEEERIKRLEELEAKRKEEERLEQEKRERKKQKEKERKERLKKEGKLLTKSQREARARAEATLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKKKKKAQQLENKEVSEQIELSAAVEVVDQGAPDKEESAPPVDPEEEEETEDGGLDDWEAMASDEEREEEGTTVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEEEEESDEEEEEEGESEVSEGDEEGEKVSDDKDAGGTLDRRPSKDMSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDA	51122	118798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_82476_83184_83870_85455_85674_86041_86193_92818_92915_93398_93489_94724_94800_96554_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683
884206	contig_5623_pilon	+	5452	1	Intergenic	novelGene_154864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	978	1595	252158	252775	NA	40	ATATGGCCAAAATGATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHMILSVDAEKAFDKVQHPFMIKTLSKIGTKGKFLNIIKGIYVKPTANIILNGEPLKAFPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKRIQIGREGLKVSLFADDMILYTENPKEFTRKLLELIEDFSKVSGYKIKIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYNENYKTLLQETKRPA	251180	256632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_251200_256600
884207	contig_5279_pilon	-	2910	12	Intergenic	novelGene_105549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	318.873378325878	169	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	419	1723	340266	289591	TRUE	40	GTATCTGAAAAATGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLIMTGDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSEDEEKIEEELQGDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEKKGKENDMEMEIKWVPGLKESAEEMVKNRLEGKDKLTPWEQFLLLLKRPVKMNCPPMWI	340684	265978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_266900_271993_272147_273539_273617_289554_289643_292820_292900_322494_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885
884208	contig_10235_pilon	+	1720	8	Intergenic	novelGene_46329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1171.52287076894	153	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	17	415	90027	91792	TRUE	15	ATGCCTGGGTCTCTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPFWMRRRTVHICGTGTGRAPPPGHDHSVHLSVLAPSESKEAGEELGESGGRGRGRAREGPMPTPLCPPLCANPPVPASLCKPQALSSEQELHYASLQRLPGTGGAEGLDLSEGDGKDAKEDPSADYACIAKKKPT	90010	94755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90035_90395_90492_90833_90902_91565_92461_92590_92705_92877_93223_94488_94578_94666
884209	contig_12765_pilon	-	3578	2	Intergenic	novelGene_106569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACGACAGAGAAAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238688	186779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_189459_237789
884210	contig_15449_pilon	+	3328	13	Intergenic	novelGene_33582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	110	junction_1	619.131442470463	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	161	1528	44312	51340	TRUE	15	TTAAACTTTCTGGTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSLGERGNLSFSLSLFLKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGKI	27853	55779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51932_54570
884211	contig_7078_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_130131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAATTTTATTTATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113212	114755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_113200_114800
884212	contig_17144_pilon	-	1981	5	Intergenic	novelGene_29505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	872.33479811366	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	981	1700	167982	166363	FALSE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	169065	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162
884213	contig_8377_pilon	+	4743	32	Intergenic	novelGene_34891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	3255.53684286874	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	931	2796	145	2940	68257	189239	TRUE	60	TTAAAAGAAACAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKSRK	67677	198730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_67785_68219_68330_128717_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185774_189229_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
884214	contig_16310_pilon	-	2630	14	Intergenic	novelGene_70043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1094.69120230427	290	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	154	2238	66135	56549	FALSE	10	TCTGGTGCCAGACTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGRGGFGGRGGHGRGGRGGFGGRRLPRRQRRRRRPQTTRKEDEV	66288	56156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56616_56991_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
884215	contig_14621_pilon	-	2276	17	Intergenic	novelGene_105853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	128.44197072511	1779	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	42	1979	463759	396356	FALSE	25	TTATGAGAGTTTATTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGPCGRHALESGPSPAEGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	463800	396058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463704
884216	contig_15720_pilon	-	4026	3	Intergenic	novelGene_41949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2019	2474	307437	306982	TRUE	50	AATGTCAGACAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	368852	305240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_306888_308160_367556
884217	contig_10904_pilon	-	1733	4	Intergenic	novelGene_22562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	63.268387753197	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	56	553	419210	411229	FALSE	15	TCTGGCTAGTCTCAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSAHHGPGPECHTDITSHVPPASYPKPWLGVQPGAVVTPGVNVTLRCQAPQPSWRFALFKAGEITPVLFRDVAAELAEFFLEEVTPAQGGSYHCCYRRQGWGPEVWSPPSDALELLVTGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	419265	410048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_413637_413938_417965_417999_419182
884218	contig_5889_pilon	+	3834	3	Intergenic	novelGene_133700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2393	2731	385853	386191	FALSE	30	ATGCTTGGTAAAGTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILNNAGSIRRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQKVAYDQEPVVMKEEVQTALKALAKNKAPGIDGIQLSCFNKQMQCWKYSLVYAKKFGRQLPGQPTGRDPYLRLFPRKVI	303446	387294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_305282_322104_322522_385712
884219	contig_8377_pilon	+	7972	16	Intergenic	novelGene_35124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2437.27986265199	241	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	5863	6804	191158	197939	FALSE	35	TTTAAAATATTTGTAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	174969	199107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_187966_188202_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
884220	contig_9668_pilon	+	2794	1	Intergenic	novelGene_58145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAATAAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340605	343399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_340600_343400
884221	contig_9113_pilon	-	2317	5	Intergenic	novelGene_68592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	653.091494355883	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	461	1708	348515	347268	FALSE	35	CAATGACTGGCACAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364440	346658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364278
884222	contig_11594_pilon	+	2263	10	Intergenic	novelGene_80926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_9	420.228979321665	362	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	28	1209	540415	567460	FALSE	50	GAAAAAATTTGATCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIR	540387	568514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340
884223	contig_9706_pilon	-	2358	2	Intergenic	novelGene_20925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAGCCACCCCATGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182335	179670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_181159_181465
884224	contig_7943_pilon	+	4480	3	Intergenic	novelGene_173125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	877	1383	1227	1733	TRUE	35	CAGTACCATTTATAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQWKKSALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFRVIGIPEQGRKQKTQRGSLKNC	4	4880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_392_737_3082_3131
884225	contig_10861_pilon	-	3934	18	Intergenic	novelGene_39215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	308.009459253477	3093	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	104	2845	614317	583577	FALSE	55	AAAAGGTGGCAAAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGFFRGTSAEQDNRFSNKQKKLLKQLKFAECLEKKVDMSKVNLEVIKPWITKRVTEILGFEDDVVIEFIFNQLEVKNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRERKRSHSRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRMQMGKRWQSPMTKSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	614420	582487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611258_611521_611612_614296
884226	contig_13863_pilon	+	1910	13	Intergenic	novelGene_42081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	388.598148262872	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	442	1608	478688	490279	FALSE	80	GAGTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455815	490581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_476611_476659_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
884227	contig_5419_pilon	-	2938	1	Intergenic	novelGene_15512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1005	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCATTCCTTATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246673	243735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_243700_246700
884228	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
884229	contig_15459_pilon	+	2944	1	Intergenic	novelGene_106387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGGATCGAATGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30867	33811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15459_pilon_+_30900_33800
884230	contig_8651_pilon	-	373	3	Intergenic	novelGene_168195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGCCGCGAAGGTCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189356	185653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_185757_186928_187009_189166
884231	contig_4088_pilon	-	5855	10	Intergenic	novelGene_178058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	961	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1865	2350	388605	385992	TRUE	20	CATCATCTTTGCTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGRCFLDKRLCLRETEEAECGCRRVENGKAYITNCWRSGTPQEEGNMAYGARHLSEKRGRWGEASEKSKEAGKKATLAANKWHPESCPLGCVESKAAGASRSRDCGRGKQRKKRTKAPGSHQRCSPNREAAPHSNRAPQPLRKKQRWRTEPGT	390645	72899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_74120_90852_91616_111040_111326_207309_207318_234027_234118_338417_338827_381677_382295_385878_386083_388210_389666_389841
884232	contig_16703_pilon	+	9294	17	Intergenic	novelGene_72750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1299.68022359108	11526	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	207	2075	6490	40668	FALSE	65	TAAGAAAAAAAAAACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	47887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_32938_32985_33016_38544_38758_40600
884233	contig_7870_pilon	-	3776	7	Intergenic	novelGene_108911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_1	391.252263039249	374	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	240	785	496465	217271	FALSE	30	GCCAGAACACTTATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTK	497931	214279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
884234	contig_14755_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_129388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAATGACCGAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285508	284046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_284000_285500
884235	contig_2100_pilon	+	1681	2	Intergenic	novelGene_50600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697432	699383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_697620_697889
884236	contig_2069_pilon	-	2482	11	Intergenic	novelGene_23279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3032	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	704	1060	344113	343644	TRUE	10	GCCTGAGTGGGGTCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTECPICSDVLGLCRILSLGALGRESWGLTRASGHAQRGAQCPSRLCLIPGLVLGFCGGEVVLQEGLQVLKGRPLIRVQTPGLLHGLIQGHRAAWGAWHVVAMLHLFHYFPVTHACR	344816	334013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_334100_334694_334967_335586_335707_339002_339105_339556_339708_341057_341218_341298_341474_341998_342074_342571_342734_343524_343647_343759
884237	contig_7694_pilon	-	2435	2	Intergenic	novelGene_159939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGATGAGTGGTGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415101	249320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_-_250621_413966
884238	contig_5482_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_144471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1487	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1541	1852	372740	373051	NA	75	TAAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSHVYSVDKQISKSSKIQTKGHGLEVSVREKVTARVKTYTLIIAQMSEKSQVWSQWPHVHPKRDKRLCFNWLKVGMPLLYRMLELEIIRIFGRYLQGNLESS	371199	374094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_371200_374100
884240	contig_10437_pilon	+	2810	2	Intergenic	novelGene_38165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGCAAAAGCGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161049	164080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_161639_161859
884241	contig_6898_pilon	-	2596	6	Intergenic	novelGene_35764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2227	2553	124838	122725	FALSE	10	CTCCCGTTCAATCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127701	122681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126653_126815
884242	contig_11982_pilon	-	4259	15	Intergenic	novelGene_100256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_14	370.402070563261	2457	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	137	856	132917	111793	TRUE	25	TGTCACAAATTTTGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKKYLQAKLTQFLREDRIQLWKPPYTDENKEVGLALKDLAKKYSDKLECCENEVEKIIEEIRCKAIERGTGNENYKTTGIATIEVFLPPRLRKDRKNLLETRLHITGRELRSKIAETFGFQENYIKIVINKKQLQLGKTLEEQGVTHNVKAMVLELKQSEEDVRRNFQVEEEEQNEAELKEKRIQRTKRGLEILAERAEMVVDPETTPYLDIANQTGRSIQIPPLREKSSYVSYGIS	136028	92560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_95017_95238_95417_96090_96187_99609_99757_104652_104806_105434_105543_106268_106456_111714_111822_113127_113221_113402_113586_126690_126762_127789_127849_130101_130270_132800_132919_135893
884243	contig_10973_pilon	-	780	1	Intergenic	novelGene_150346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2314	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2300
884244	contig_6227_pilon	+	3334	1	Intergenic	novelGene_49641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	323	972	167	1138	373504	374475	NA	65	TTTAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLMPYTKTTSKWINDLNIKPKTIKFIEEKIGRTLQALIHGINRIQTITINAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKTVKREPTDCEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKEWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAITEMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMTWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFAIAKRWKQPRCPSTDEWINKLRYVHTMEYYAMRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQMDKYL	373337	376671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_373300_376700
884245	contig_6576_pilon	+	3103	3	Intergenic	novelGene_42410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4219.5	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	90	1436	1301228	1302574	TRUE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295687	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303214_1303253
884246	contig_5988_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_16120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	341	700	1285182	1285541	NA	25	AGACCTCTTTACAGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMELPEFTLDSEEDVEQGISLLMSDGSWLKAENTRKMFTCVLLTTQRHSTVWIITNYITLRRMGIPEHLIVLMRNLYIDNQEAVFQTEQGDTGGLKSKKVCIRVVSFHHTYSVYILSK	1284841	1286829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1284800_1286800
884247	contig_9363_pilon	-	3801	20	Intergenic	novelGene_6761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	374.716942109109	9	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	48	2588	1548961	1506537	FALSE	10	CCAGTTGTTGTGATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVRSGASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1549008	1505323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1528110_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
884248	contig_10197_pilon	-	5298	6	Intergenic	novelGene_115206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	811	junction_1	1121.41250215966	5819	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	86	853	952331	910531	FALSE	25	AGCCATTACCCCCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952416	906085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
884249	contig_7870_pilon	-	1142	8	Intergenic	novelGene_108891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	25	ATATTTACCTATATGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
884250	contig_9720_pilon	-	5325	4	Intergenic	novelGene_116765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1338	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	4447	4932	144855	144370	FALSE	70	AAACCTACAAAAACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNVQEIGVPEQGEKTKNTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTSYRIDTKRKSPRHIIITFANTKEKQRILRAAHEKQEVTCRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPTIIYPAKLSFKYDSEIRTFPDKQKLRDYVKTM	471259	143976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_146122_286529_287244_467450_468282_469624
884251	contig_13021_pilon	+	3466	13	Intergenic	novelGene_8196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2564.14754624005	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	90	1793	174676	180850	FALSE	10	CATTCTCTCTCTCTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174586	182523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180085_180461
884252	contig_11846_pilon	+	7464	24	Intergenic	novelGene_105957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2230	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	7088	7456	437124	557978	FALSE	30	TAAACAAACTTTCCCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFHYKILLFHLGAAFFRYFSLIGLHGSRLCKTPQKHTNTACDSILGQHKPVKMSLGYIQCKKPKPAEPLPAPSARRSAVRRCEAGGPRFSADSGGDVVGRLRGAGVTPSRFTSQKHGDPRN	288380	557986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_290503_291703_291847_295011_295085_295497_295722_298106_298202_298461_298610_299885_300062_302252_302391_307392_307580_308017_308111_308652_308784_319251_319382_324473_324609_326101_326151_327244_327317_329615_329792_332588_332748_334951_337301_339601_339946_356655_356764_437088_437159_467818_467905_476995_477071_557805
884253	contig_10500_pilon	-	2944	8	Intergenic	novelGene_41256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	735.523303921939	281	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	188	1096	1640040	1629460	TRUE	70	GAAAAAAAAAAAAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640227	1626835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628615_1629390_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
884254	contig_7963_pilon	+	1367	5	Intergenic	novelGene_58367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1313.42957557686	10684	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	89	538	51450	57085	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNGMAISASSSLALLEREERVPLLHTERETQMPTTEWSSFPG	51361	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_57145_57281_57564_57782_57934_63003
884255	contig_408_pilon	-	4276	6	Intergenic	novelGene_84900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	764.167154489121	1970	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	14	475	181137	133511	FALSE	5	TGGCCTTTGTTCAGCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFLGMYRLNVDGVEIYVIVTRNVFSHRLSVYRKYDLKGSTVAREASDKEKAKELPTLKDNDFINEGQKIYIDDNNKKVFLEKLKKDIDVYGIKCHENSPRKEVYFMAIIDILTHYDAKKKAAHAAKTVKHGAGAEISTVNPEQYSKRFLDFIGHILT	181150	129709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133592_136727_136832_138499_138531_147693_147802_167538_167578_181038
884256	contig_5286_pilon	+	8066	11	Intergenic	novelGene_157323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481802	566837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487678_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564479_566446
884257	contig_9678_pilon	+	993	6	Intergenic	novelGene_146375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	43	junction_5	571.079679204224	140	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	107	823	259970	266767	FALSE	15	TCGGTCTTTATTTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNEYIELHRKRHGYRLDYHEKKRKKEGREAHERSKKAKKMIGLKAKLYHKQRHAEKIQMKKTIKMHEKRNTKQKNDEKTPQGAVPAYLLDREGQSRAKVLSNMIKQKRKEKAGKWEVPLPKVRAQGETEVLKVIRTGKRKKKAWKRMVTKVCFVGDGFTRKPPKYERFIRPMGLRFKKAHVTHPELKATFCLPILGVKKNPSSPLYTTLGVITKGKYAQVTNNPENDGCINAVLLV	259863	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_259973_261565_261754_261842_261994_263530_263711_265596_265724_266699
884258	contig_6410_pilon	-	5255	8	Intergenic	novelGene_108644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	145.896664577001	1244	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	121	567	418605	410738	TRUE	25	GGAGACATTTCACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRRPVLQVLRWCVRHESEIASNFVLERSLNRVQLLGRVGQDPVMRQVEGKNPVTIFSLATNEMWRSGESEVYQMGDVSQKTTWHRISVFRPGLRDVAYQYVKKGSRIYVEGKVDYGEYTDKNNVRRQATTIIADNIIFLSDQTKEKA	419337	403019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_405670_408699_410782_413932_414022_415791_415880_416097_416239_417146_417208_418581_418648_419259
884259	contig_18364_pilon	+	4666	2	Intergenic	novelGene_102565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTCTGTAAGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118065	123506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_118455_119229
884260	contig_16310_pilon	+	1220	5	Intergenic	novelGene_70078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4695	junction_4	1796.8712391265	22777	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	181	513	285976	289927	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285795	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
884261	contig_10930_pilon	+	8129	1	Intergenic	novelGene_36976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1464	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGCAGATAAGTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267059	275188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_267100_275200
884262	contig_8795_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_146879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	869	1261	74961	74569	NA	60	TGTGGCATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIQTYTPTTNAKEEETEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNVKVGNKKEGSIDGKYGLGERNSTRDSIIEFCKTSDLFIANTFFQQHKRRLYTWTLLDGIQESNGLHMWKEMMEKLNIISQNKARG	75829	73776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_73800_75800
884263	contig_11281_pilon	+	2759	10	Intergenic	novelGene_125440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	758	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAGTAAAGGTAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796814	972057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_798780_802862_802977_847360_847395_849220_849331_853751_853827_859556_859634_860045_860125_886942_887025_925832_925940_971941
884264	contig_14621_pilon	-	2429	17	Intergenic	novelGene_105856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_16	121.721762639226	610	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	242	2137	463794	396356	FALSE	25	TTCTATTATGAGAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	464035	396063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463781
884265	contig_8310_pilon	-	4509	5	Intergenic	novelGene_75594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2627	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGACATATCCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327823	314978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320710_324736_326915_327574
884266	contig_9306_pilon	-	3720	14	Intergenic	novelGene_171474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_4	148.48393613432	4189	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	56	2068	77717	63595	FALSE	15	TTTATTACTGTGCTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLPMKLLRKKIEKRNLKLRQRNLKLQGASGMSLSEAQNGDVCEETVGGVKDKKSVKQCMNAGLSEAQNGDMPKETLEKVKIKKSPKKFAILTNGEATTQPPNSESKKKKKKKKRKMEDVAGPDIKKAKAEDEEASEEGDAEAPAEAETRVEKPGDEDDSEVPGLPLGLTGAFEDTSFTSLTNLVNENTLKAIKEMGFRNMTEIQHKSIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLKFMPRNGTGALILSPTRELAMQTFGVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLANGINIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLIPVRRQTMLFSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGVDDDKANATVDGLEQGYVVCASEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFSSCKSVKYHYELLNYIDLHVLAIHGRQKQNKRTTTFFQFCNADSGILLCTDVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLKQSKVPLSEFEFSWSKISDIQSQLEQLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLDLPQVALSFGFKVPPFVDLNVNSSEGKCKKRGGGGGFGYQKARKVEKSKIFKNISKKSPGSRQFSH	77772	61942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_-_63738_64915_65094_65466_65524_67454_67569_68298_68452_68722_68885_69401_69542_71704_71820_71911_72112_72229_72331_72710_72847_73517_73659_75828_76117_77632
884267	contig_2069_pilon	+	783	3	Intergenic	novelGene_23508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6389	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCAGGACCAATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508365	1509922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
884268	contig_12528_pilon	-	1981	10	Intergenic	novelGene_81315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	510.13500996801	411	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	551	1375	966228	933323	FALSE	15	TCGGTGCCTATGACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968161	932716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956166_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
884269	contig_8317_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_19562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACAGCAAAACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17249	16398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_17200
884270	contig_6497_pilon	-	6467	24	Intergenic	novelGene_35623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_23	321.681022954884	2570	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2059	6177	289	6465	790005	688961	FALSE	60	AAAGGAAAAAGAGGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEERQKKLEAGKAKLAQFRQRKAQSDGQNPSKKQKKKRKTSSSKQDVSAYHAMNIDQSQTDEMYINSSQRVGSAVTPESTVMRTLHSGEIVKRDQVFSVEPESEISTTADDYSSEVNGCSFVVRTEKPTNLLREEFGVDDSYSEHGAQYSETHLEMMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLQKQMKEKEDDLQEKFTQLEAENSILKDDKKALEDMLKIYTPVNQEERFIFLDSSNSKSKDGSWQKEIDMLTEENENLKAQCIQLKEEIVKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKTDLEDSKNQQEVEYKSKLKALNEELHHLQRINPSVVKMKTSVFDDDKTFIPEMLEIGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSERLSDLSEQLKQKHGEISVLSEEVESLKQEKEQVLLRCRELEIIINHNRTENVNVFDVQSRSFKDRVVTVTSRDSEESLSKINKGFVEESRVMKEDKIPFENMTIGEESKQEQLLLDHLPSVTNESMLEATEPGENDKLQQELSVLKSEQNDLRLQMEAQRICLSLVYSTHVDQVREYMENEKDKALSSLKEELISAQEEMIKELQKIHQLELQNIKTQETDVNHKNKLSSLQDIKKIKQLEEQVQELENLTSSLQQRLKETEENYGAEIHSLQERLHAVSESSLQPSFSVDSMVIAESDVQKTIYPGSCLQQNIDGTVEFSGEFGLRQETNMTKLMEKQYQERLEEEVAKVIVSMSIAFAQQTELSRISGEKGDTTPSKQPHVLCQQEEHFLNEVKLSQDEVSFQTFETKDMKFKEEFKPLSKELGEDGKQVLLSNNDNLDEILESKDHELTISEEMFSRDKTFVFGESIHDEVLVSSMDASRQLMLNEEQLEDMRQELVRQYQEHQQATELLRQAHMRQMERQREDQEQLQEEIKRLNRQLAQRSSIDNENLVSERERVLLEELEALKQLSLAGREKLCCELRSSSTQTQSENENEGEVEEQPFKEKELDRKLEDAPPDILSSERYALQKANNRLLKTLLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKGQSSASLIWRSEAEAPIKSCIHEEHRGVTDESVPSYSGSDMPRDDSSMWSKVTEEGTELSQRLVRSGLTGTETDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEVTESLRCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADERTFFERQIQEKSDIIDRLEQELLCEGNRLQELEAERQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDDLQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNAELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQKLEQQLKVVPRFQPISEHQTKEVEQLTNHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQERNEEIEKLEFRVRELEQALLISADTFQKVEDRKQFGTVEAKAELSLEVQLQAERDAID	790293	688958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_689051_689657_689835_697016_697137_698069_698303_700719_700933_702457_702621_717343_717577_724043_724250_726416_726521_727015_727157_728256_728482_729767_730125_738389_738483_742431_742529_743590_743790_744892_745107_749822_752208_754320_754519_755398_755555_756694_756863_757225_757280_764427_764473_767272_767531_789957
884271	contig_3956_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_14797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1593	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGAGGCAGGAAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226710	1224772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1224800_1226700
884272	scaffold_12124_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_22404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	167	946	1508626	1509405	NA	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508459	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508500_1509600
884273	contig_19438_pilon	+	2882	1	Intergenic	novelGene_175898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAATCTACTGTCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21835	24717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_+_21800_24700
884274	contig_2414_pilon	+	1441	7	Intergenic	novelGene_158483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1165	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAGCAGAAGAGTCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263133	528197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_263220_272530_272769_295904_296085_318227_318398_371340_371480_410023_410160_527705
884275	contig_16776_pilon	-	1561	7	Intergenic	novelGene_130498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	331.065325879954	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	350	877	43087	35073	FALSE	40	TCCTATTAAACCAGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESMQVWHGLVIAAVSLLLQTCLLAVINYLLNRHMAEKNEQILKAAKLPAPQLSPAHQHPPAAKETEGTPAERSIPVSDLRDRHDSNISSDSSDSSDSSEKSPSRCQAPKDVNYTQVVFSAAGGLESESALDYENLNEATDYVNVNPKGHKTNFWTVVNRDASEPAEYTQVVV	58019	34388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_37129_41422_41567_42702_42804_43076_43228_57706_57754_57857
884276	contig_383_pilon	+	5194	13	Intergenic	novelGene_126109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_9	510.146459090154	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1429	4290	628	4917	132574	169172	FALSE	35	AAGTAATATTCATGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFCWHRPGVLTHLTISAINGYVPESIRALGFCFDDTVQWHFCSVGTQDDVLIIHFTGHSFIYGKRHEDTLVLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTTMSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPWEDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	131946	169449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_132839_134494_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
884277	contig_5643_pilon	+	1047	10	Intergenic	novelGene_38811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2299.90832882262	141	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	68	835	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVRKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
884278	contig_9400_pilon	-	4216	2	Intergenic	novelGene_146597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGAGAAACTGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144627	139481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_140269_141198
884279	contig_854_pilon	+	963	3	Intergenic	novelGene_36464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18.5	341	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1513471	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514674_1526868
884280	contig_7056_pilon	+	3193	2	Intergenic	novelGene_43718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	505	junction_1	0	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1924	2250	938838	939164	FALSE	90	AGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLSKKKDTLMQSRSPLYGDLKVRWEAWKEVRAGKALRDHLEWGGCGCPPCCSVPSDGGVFTEVGGGGRSRVWFYEASWQMTTGAGTVCPFTSGTKEALRAGLTLTK	935963	940107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_936043_936993
884281	contig_1275_pilon	+	2561	2	Intergenic	novelGene_108851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	69	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	70	759	747279	747968	FALSE	25	AATTGTAGTTGGTGGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746567	749770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
884282	contig_9363_pilon	+	2530	1	Intergenic	novelGene_6620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCGTTCTTTTAGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863987	866517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_864000_866500
884283	contig_5981_pilon	-	6083	5	Intergenic	novelGene_35540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1506	2555	595329	532489	TRUE	35	TGACATATCTGATAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQVEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTNLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGKKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKKRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	597096	389079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_391465_427648_427666_531362_533475_595265_596367_596628
884284	contig_10235_pilon	-	1713	3	Intergenic	novelGene_46622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	122	2123	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAGGCTAGTGTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610679	608524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_609314_609537_609738_609955
884285	contig_14467_pilon	+	1043	2	Intergenic	novelGene_138265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	72	461	318578	319153	FALSE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	318506	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_318620_318805
884286	contig_16011_pilon	-	4334	4	Intergenic	novelGene_177372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8104	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAATGGCTAATGATCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31063	1557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_-_1995_2077_4293_29052_29779_30107
884287	contig_11277_pilon	+	2811	9	Intergenic	novelGene_80305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	112.436579345869	2157	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	436	1236	255962	269500	FALSE	50	GTGAAATGTATCAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248213	271075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248376_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
884288	contig_7527_pilon	+	3476	8	Intergenic	novelGene_139561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_4	1191.38316117641	4477	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	635	1324	85507	96119	FALSE	40	TCACTTTTTAAAAAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTEGPRYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80073	98271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85578_85690_85781_86398_86519_89859_90038_94415_94590_96062
884289	contig_5623_pilon	-	4255	8	Intergenic	novelGene_154792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3102	3464	203338	200905	TRUE	15	GTCATGTGCAGGTCGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFTVMVKAESSQSISLSFPASWSLMVRWWAARIRNTPRIIMKTKKLTHTTITTVAVLGTTAARMGTGQVVPRQVNEGAVLRVHKLWLCSQVAGMLHGVGRVDYIHLHFEFVADVAAIQL	207171	195569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_195708_196312_196470_196689_196910_200205_200377_200799_200948_202578_202709_203148_203341_204072
884290	contig_7830_pilon	+	9511	7	Intergenic	novelGene_177913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10648	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	6454	7251	244133	244930	FALSE	55	AAAAACTCTCAATCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQHAKINAQPEIIQRQQLEIQKINNKISEMDYVIQGLRSISETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTNKNEETLGVMWDTIKSKNSRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRNPKRKSPRYIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGEMIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNFQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	52300	247190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7830_pilon_+_54656_55233_55343_120701_121929_158203_158293_158336_159103_208976_209804_243052
884291	contig_19960_pilon	-	3680	1	Intergenic	novelGene_164186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	316	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATATTTTTTTCTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13285	9605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_-_9600_13300
884292	contig_19032_pilon	-	3255	4	Intergenic	novelGene_172533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	628.762983077796	41	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	112	384	158321	157239	FALSE	55	ATAAAAATAATCAAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDIRRVRSAARTHLQPQPPPQPPPGPRSSRYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166699	154367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158340_166606
884293	contig_7536_pilon	-	3966	7	Intergenic	novelGene_178386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	760	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAAAAGTATTGAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282455	71940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7536_pilon_-_73591_163696_164225_164761_164814_166939_167385_200786_200955_280371_281192_282152
884294	contig_4732_pilon	+	1245	11	Intergenic	novelGene_75440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	649.804963046605	10	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	366	878	653092	660334	TRUE	0	GCTGCTTGGCTGGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAG	634993	675543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660344_675185
884295	contig_10437_pilon	+	2419	6	Intergenic	novelGene_38155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	226.678980057702	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159594	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_159766_159886_160203_160732_160844_161549_161639_161859_162497_162996
884296	contig_17976_pilon	+	2119	2	Intergenic	novelGene_32529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	11	649	46747	47385	TRUE	20	TGAGTGGCTGCCAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	46736	48913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_47843_47900
884297	contig_10324_pilon	+	2295	3	Intergenic	novelGene_7741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1105	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67937	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_68799_68964_69043_79411
884298	contig_3469_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_34233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	408	782	631104	630730	NA	55	TGAAAGAAATTAATTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEDKNGKRGKRKQNKLKKKKTSPKKPKNKSKKPAKKEVPSGIPLHVCASRGGTSPCHTSPPGQKGLPTQEKGKKTNKQLKTNEKKKAPGSHQCNSPDQAATPHSNRAPQPLRKKQKWRTEPGI	631511	629160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_629200_631500
884299	contig_4232_pilon	+	844	2	Intergenic	novelGene_63378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5298	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTCGCACAGCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467236	468134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467449_467502
884300	contig_6666_pilon	+	6196	6	Intergenic	novelGene_178387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	4484	4786	373060	373362	FALSE	30	ATAATTTACATGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQDHHRTESSTARLCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSHTKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLCPRFTVQPGSGQPHKTKWD	249943	374772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6666_pilon_+_251615_252114_253130_267595_268555_317284_317292_371989_372475_372713
884301	contig_11026_pilon	+	2894	1	Intergenic	novelGene_167666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGATATAACCACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165149	168043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_165100_168000
884302	contig_5125_pilon	-	1986	4	Intergenic	novelGene_43454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3361	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTGAAATTTTGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	53634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_53706_53840_53984_54293_54522_58446
884303	contig_2227_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_142338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATTTTAACCAATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231920	232755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_231900_232800
884304	contig_10708_pilon	-	6184	5	Intergenic	novelGene_174350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1628	2110	357561	357079	TRUE	35	GACTGGGAAAAAATCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLQKQDRMVPIGIQNKTPDDSPVEENALELPGKEFKSLICGILQELTQKADKQEDKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLDIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRSETVEDRISGIEDKYLDTTLRKTQKKEQRKMKRP	487108	134754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_-_136190_154377_154697_180988_180995_354764_358381_486300
884305	contig_7329_pilon	+	7310	9	Intergenic	novelGene_178388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2873	211	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	107	859	107	859	TRUE	60	TAGAGAAGAGAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QANNYQKRAGVAILISDKIDFRTKSTIKDKEGHYIMFKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPNYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDCNTPLSVKDRTTKKKLSQDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEIN	0	500315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7329_pilon_+_1468_125284_125362_164582_166216_169619_170026_268011_269070_338144_338160_411231_411400_421378_421680_498130
884306	contig_15105_pilon	+	5268	4	Intergenic	novelGene_150975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.8978113919839	3600	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATAGAAAGATTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620269	632544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_620412_620549_620770_621244_621388_627781
884309	contig_7230_pilon	-	2383	6	Intergenic	novelGene_52553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_3	473.612668749475	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	436	741	162672	134622	FALSE	30	GTAGTTATGGTCTATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177729	132979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_171092_171153_176933_177012_177438
884310	contig_3612_pilon	-	3150	1	Intergenic	novelGene_87833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	446	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	237	714	387	1100	960518	959805	NA	70	AAATAGAGGAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSPTILSVFSVFSACSGMPITHKFLLLIVSHKILGVSSFFLILFSDFSRVVPRCLSSILLILSSTVSNLLLSPSMALSISEIFLFTFWISNCCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSSFLSVFSMNLSAFFMNLSIFSSFLSAFCFNYWIALNIRDLNSLSGSSSAFSSIGKSSGILLWMPTGTILSCFVNVLILSAVFGAFSSYFPHLLTVDLFVSSCFLF	960904	957754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_957800_960900
884311	contig_18850_pilon	+	4477	9	Intergenic	novelGene_142437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	524	junction_8	783.123992417548	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	325	1254	176401	180704	FALSE	40	TCCCCAGAGCTCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	176076	183927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_176463_176669_176835_177030_177109_177569_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515
884312	contig_11386_pilon	-	3714	7	Intergenic	novelGene_82817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTGACACAGCACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453028	137731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_137811_137979_138311_140633_140762_141030_141168_144574_145591_198256_198333_451081
884313	contig_5623_pilon	-	4655	9	Intergenic	novelGene_154797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	347.324393578971	4135	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	83	1078	211298	207631	TRUE	20	GGTCAAGGCAGAGTCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211380	203321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_203341_204072_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203
884314	contig_13542_pilon	+	1486	9	Intergenic	novelGene_131498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1051.13938181385	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	58	765	346638	505589	FALSE	80	AAAAACAACCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346580	506310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454039_464664_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
884315	contig_2438_pilon	+	1562	4	Intergenic	novelGene_112017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	573.046245952279	203	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	83	598	310588	312243	TRUE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGGTGTGCGGCPRGDQRQRGVYVFVLWGELAMLGVGVEKGMGGRVIRRSGLLTE	305083	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312409_312729
884316	contig_854_pilon	+	7790	23	Intergenic	novelGene_36535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3304.08472716689	193	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1094	3285	82	3366	1649514	1715383	FALSE	40	TAAAGGAAATGGCTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612864	1719807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679325_1702030_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
884317	contig_854_pilon	+	3769	17	Intergenic	novelGene_36668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3856.57547046275	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	145	2346	1704560	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1699278	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1702632_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
884318	contig_5686_pilon	+	2381	7	Intergenic	novelGene_45329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1805.63049160736	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1452	2102	222847	265109	FALSE	25	TGATGTATTATTCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGLLRKDVSLLSKVK	108305	265388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_108480_221569_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_265065
884319	contig_7593_pilon	+	2445	8	Intergenic	novelGene_127280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	227.580979083965	93	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTAAAGGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43577	200060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_43689_50348_50494_51977_52124_183166_183240_192341_192438_196398_196495_198038_198171_198414
884320	contig_3956_pilon	+	2180	9	Intergenic	novelGene_14837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1108.63001041826	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	290	1666	1286460	1290491	FALSE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282851_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
884321	contig_17427_pilon	+	2190	9	Intergenic	novelGene_30298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	259	junction_8	126.277905331851	2548	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	91	891	148069	175576	FALSE	10	TTATCCTTGGTGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147978	176875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
884322	contig_10500_pilon	-	3707	4	Intergenic	novelGene_41248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTATAATTAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690423	1626452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626521_1626583_1628600_1667620_1668801_1689980
884323	contig_16703_pilon	+	9266	10	Intergenic	novelGene_72759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_7	1205.42016648876	11818	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	911	2047	20022	40668	FALSE	65	TAAGAAAAAAAAAACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	14755	47887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
884324	contig_10904_pilon	+	3892	5	Intergenic	novelGene_22707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	131	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1392	1961	635759	636328	TRUE	55	AAAACGATTACAGCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIDHILGHKGTLNKIQNTEIIQSIFSNHNTIKVEINNRKSKEKKSNTWKLTNTLLTNHWVIEEIRDGIKKLLESNENENTSYQNLWDTAKVVLGGQFIAIDACIKKEERDKIKTLVTELKKIEREQQKKSIATRRKEIIKTEAEINEIENRKTIERINKTKSWFLERINKIDRPLAKLTKEKQERM	634367	828174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_637456_711736_711913_736508_736710_824515_824674_827905
884325	contig_12151_pilon	-	2323	2	Intergenic	novelGene_54973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	585	junction_1	0	30	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTGGCCAAAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978144	974604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386
884326	contig_397_pilon	+	8341	4	Intergenic	novelGene_178390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	7748	8320	189177	189749	FALSE	30	GTCAGGAAAGGTGTGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKKEVQAALKALAKNKATGIDGIPIKMFQQTDAVLDMLAHLCQEIWKTATWPSNWKRSIFVPIPKKGDPTECRNYQTMSLISHQVKFCLKSFKSCCSSTSTGKLQNIQARFSRGHGRRDIIADVTWILTESREYQKDVYLCFINYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYSDQEAVIQTE	137585	189770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_397_pilon_+_137836_167253_169623_179693_183199_187553
884327	contig_3386_pilon	-	2826	5	Intergenic	novelGene_34546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	619	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGACTTTCCGGCGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490338	470026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476262_476403_485244_485297_486415_486539_488103
884328	contig_5954_pilon	-	2679	8	Intergenic	novelGene_28762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	2919	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	101	811	1462068	1392942	TRUE	30	CACACAATAATGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462168	1390858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392107_1392321_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
884329	contig_6040_pilon	-	4701	4	Intergenic	novelGene_178216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1423	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCTGAAGTTTTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280870	86434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6040_pilon_-_88645_278116_278843_278916_279170_279358
884330	contig_10904_pilon	+	2577	3	Intergenic	novelGene_22461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	531.5	314	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	282	1061	149289	150068	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143917	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149133
884331	contig_7357_pilon	-	3510	6	Intergenic	novelGene_36805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1434	junction_2	2113.00159962079	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	593	1261	154994	138880	TRUE	15	GTTTTTCTGGACCTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMVRTSLLFNTGDFGVHLP	155586	135544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_139060_139775_139973_154561_154721_154861
884332	contig_1213_pilon	+	2101	14	Intergenic	novelGene_76471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1057	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTTCTTCCAGCGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70794	101781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_71478_71556_71720_73624_73743_75373_75473_77896_78039_81101_81220_82679_82744_83399_83469_84279_84382_85229_85341_85432_85523_92921_93089_96620_96776_101761
884333	contig_6375_pilon	+	1996	5	Intergenic	novelGene_73083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.1954811605269	28	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAATAATGAATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749712	758633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_749919_750937_751031_751230_751316_754269_754351_757102
884334	contig_20199_pilon	-	804	3	Intergenic	novelGene_82530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	69	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	61	396	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44047	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
884335	contig_7898_pilon	-	3917	4	Intergenic	novelGene_47563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3476	3808	363491	363159	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQLYSQEPKTRNTPTIHQPENGFTIVVYLSPRYPSNPELKPLPKFLSAKDRPKKQIITHVRNMLLRSSIETKQATPAQKQRGEGRKGQENQRNGKGELQEVRGRVLKH	511045	363049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_365413_459720_460662_493722_493844_510553
884336	contig_11512_pilon	-	2508	11	Intergenic	novelGene_43360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1170.62154858007	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	73	816	586520	556654	FALSE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	586592	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573359_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515
884337	contig_13301_pilon	+	447	3	Intergenic	novelGene_153129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_1	15	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	148	381	173016	174444	FALSE	40	TTTGAAGAAGGAAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFSPTVSMVEGQGEKNVTFWGKMWPQCEELQGQKLVVEEKRPCLHAPACKDPNRKP	172717	174510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_172824_172974_173087_174281
884338	contig_9332_pilon	+	3581	2	Intergenic	novelGene_60719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2283	2777	172245	172739	FALSE	35	CTATAAACTGTCCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKKQSMMASASSQNKKSRHFPEEENSLELLVAEYRRLIYRTLQEIRKEIKQNTEHAIEEIKKIREEHKDKFKRLQESIERQQSETQKINNKMSELDNSVESHRSRIEAMGVRISETEDKALDTNLFEEKSDKRIKKNEETLRIMWDCIKRNNL	95412	173543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_96844_171393
884339	contig_4388_pilon	-	4247	1	Intergenic	novelGene_161987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCCTTGTGTGTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310602	1306355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1306400_1310600
884340	contig_5988_pilon	+	1071	5	Intergenic	novelGene_16031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	39.4778418863038	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	303	602	809857	810610	TRUE	10	CCTCTCTAGTGCGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGAHGAGRLGSVRWASHLPAAQELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYENIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRFSSA	809455	811337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_809695_809793_809920_810000_810222_810594_810684_810941
884341	contig_7182_pilon	-	3247	4	Intergenic	novelGene_117135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_3	700.856777253543	218	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	151	648	889318	888143	FALSE	45	TAAATATTAGTTAAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKVRSTCLVD	891410	885543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888345_888814_888961_889168_889333_891274
884342	contig_1450_pilon	+	2514	3	Intergenic	novelGene_27421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_2	884.5	56	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	35	GAAACCATGATGGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423510_423983
884343	contig_5356_pilon	-	2560	4	Intergenic	novelGene_178393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTTTCTGAGGAAACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285303	280607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5356_pilon_-_281164_281602_282129_282760_283282_284346
884345	contig_7066_pilon	+	1893	1	Intergenic	novelGene_42131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAATTGTCCCTCCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699377	701270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_699400_701300
884346	contig_10235_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_46255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	869	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	224	550	4102	3776	NA	45	TGTGAACAAATAAATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAHAQYNPAVLLLVIYSGEFLAHVPPETRTLMFTTKTGINQIDINRKIAQFCAIFIKCNFTRVKMNELQLHTSEMPLLHIMLCHRRYCSATPLSMQKIHSAPLHST	4325	1042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_1000_4300
884347	contig_5684_pilon	+	5271	3	Intergenic	novelGene_81065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56	104	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1525	2088	443906	447039	TRUE	15	TGTGGGGAGTTTATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	442381	450339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_443949_446518_447806_447922
884348	contig_7025_pilon	-	2075	2	Intergenic	novelGene_104405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTTTTTTAAATGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386113	237131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_237600_384506
884349	contig_19032_pilon	-	2886	12	Intergenic	novelGene_172537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	718	junction_1	809.660575756214	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	132	1673	162634	157239	FALSE	35	CTGACAACTGATTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	164748	156025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676
884350	contig_4812_pilon	-	1206	6	Intergenic	novelGene_103642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	40572	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	158	676	82626	79235	FALSE	25	AGCTAAGTATTGTCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82783	78704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
884351	contig_854_pilon	+	4896	30	Intergenic	novelGene_36558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	2480.26252062654	1	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1267	3804	69	3872	1656112	1715383	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1656043	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698988_1699029_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1715226
884352	contig_5062_pilon	+	2870	11	Intergenic	novelGene_157855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	181.598485676506	79	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	454	1698	723798	744018	FALSE	30	CTCAGCAAAAGCATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	696861	745190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_697116_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
884353	contig_7657_pilon	+	4420	4	Intergenic	novelGene_30027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	2375	3445	355309	356379	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDTTIINIYTPNDKAPKYIKQTLTTLKREIDSTTIIVGDFNTPLSGKDRTSRKKLSKDTEDLKGTDNQLDLIDIDRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNEIKNVEIIQSIFSDHNAIKVQVNNRKSKEKKLITCKLNNTLLTNHWVIEEIRDGIKKFLESNENENISYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTATRRKEIIKIRAEINETENRKAVERINKTKSWFLERINKINTLLAGLKKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKGIITKYYKNLYSNKFENLEEMDRLLETYYLPRLPQSDVENLNRPIT	180498	357354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_180823_181270_181320_302299_303988_354995
884354	contig_8377_pilon	+	6333	30	Intergenic	novelGene_34934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	671	junction_1	2801.19427222977	995	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	1898	5158	136354	197939	FALSE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68093	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128934_131430_131572_135049_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
884355	contig_6137_pilon	+	8364	15	Intergenic	novelGene_59247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1352	junction_14	808.694201305098	98	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	3701	5176	1328176	1353702	FALSE	20	GGTGGCAATGATCCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1317996	1356890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
884356	contig_2733_pilon	+	453	2	Intergenic	novelGene_128559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1284	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAGAGGCCCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571048	578183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_571388_578069
884357	contig_19962_pilon	-	530	1	Intergenic	novelGene_178394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	609	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGCGTGTGTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4283	3753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19962_pilon_-_3800_4300
884358	contig_10734_pilon	-	4047	9	Intergenic	novelGene_51462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	658.540763734486	38	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	430	1515	2275768	2265543	FALSE	40	TGAGACCTCTATTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQFRLGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305192	2263010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275750_2275885_2277109_2277191_2304960
884359	contig_8820_pilon	-	3307	10	Intergenic	novelGene_79295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1105.28910245239	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1665	2660	168430	166441	FALSE	50	TAAATTACAAAGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	171322	165793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170503_170600_170966_171228
884360	contig_3747_pilon	+	2905	8	Intergenic	novelGene_24746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	47	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	336	1511	201313	203804	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200977	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
884361	contig_21203_pilon	+	1697	8	Intergenic	novelGene_84471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	226.348566307339	1459	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	409	1695	53950	122159	FALSE	15	GTGAGTTTTTGTTGGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFSLLLLLLLLLLPLLAPGAAIPRSPALRSLGRLHLPTRLTSRPTVARNYSILYFKQKVDHFGFDINKTFKQRYLIADKYWKKDGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGANSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKQTIPGTENQPVIALGGSYGGMLAAWFRMKYPHLVVGALAASAPIWQFEDLVPCGIFMETVTRDFKKSGPNCSESIRRSWNALNRLATTSSGLQWLSVALHLCSPLTDFHDFWMLKDWISETWVNLAMVDYPYECNFLQPLPAWPIKVVCQYFKDPNVSDQQLVQNLFQALNVYYNYSGQVKCLNISETTTSSLGSLGWSYQACTEIIMPFCTNGVDDMFEPHSWNLKELSDDCFEQWGVRPRPSWITTQYGGKNISSHRNIIF	53541	122161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21203_pilon_+_54130_93211_93353_102795_102898_105782_105965_106205_106364_108205_108379_120210_120376_121973
884362	contig_6691_pilon	+	3116	1	Intergenic	novelGene_60171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAAATTTTATCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415104	418220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_415100_418200
884363	contig_11422_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_99085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGGTGTTAGTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1848	746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1800
884364	contig_10930_pilon	-	2701	7	Intergenic	novelGene_36980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	526	1374	276835	268388	FALSE	85	CAGAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280261	267060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276933_278443_278637_279700_279832_280157
884365	contig_2747_pilon	-	4570	3	Intergenic	novelGene_178395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153037	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2747_pilon_-_2008_5410_6267_151330
884366	SIRV6	+	1312	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	604	0	388	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	369	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	42	533	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1691	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884367	contig_5279_pilon	-	3278	14	Intergenic	novelGene_105550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	277.858420378343	1519	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	163	2688	353702	266606	FALSE	35	CATTTTATGTACCTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKQEIMSDQRFKRVTKDPRFWEMPEKDKKVKIDKRFRAMFHDKKFKLNYAVDKRGRPINHSTTEDLKRYYDLSDSDSDLSDEDSKALNQKKMKKKKPQTKIGIDSKSLVEEKKKETKKINRMNSESKNELENSERIQKAKTSFKSKKLDSEIRPKKDSKEFAQKGTKEKEDIVQRSTDDFPKGKLKMVSLDITEVKSPKVKCSETRRKIQSGDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSEDEEKIEEELQGDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEKKGKENDMEMEIKWVPGLKESAEEMVKNRLEGKDKLTPWEQFLEKKKEKKRLKKKQKALAKETSEDELPSDVDLNDPYFAEEVKKMGVKKKSLKYAKDVTSPEEETEIESQKAEMALLMMDEEEEEGSKKHFNYDKIVEHQNLSKKKKKQLIKKKELLEDDFEVNVKDVRFQAMYTSHLFNLDPSDPNFKKTKAMEKILEEKARQREQKEEEFTQAIKKKESEIQKESQKKSIDPSLSMLIKSIKTKTEQFQARKKQKVK	355083	266015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_266900_271993_272147_273539_273617_289554_289643_292777_292900_322494_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885_340245_353062_353746_354964
884368	contig_10074_pilon	-	5657	3	Intergenic	novelGene_57171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1860	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATCAGGGTGATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553926	547051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_547307_548152_553481_553852
884369	contig_8631_pilon	+	3284	1	Intergenic	novelGene_121946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	2708	3100	678362	678754	NA	70	AAAAAAAAAGTTAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTHPNGQGSPLVSHPISGSQLPPHSVDSGIPGALALPPAPFLSRSGSCPAHPTSLWVCQHSFSVSCGNSMKLTFCASHLGSPVGFVSSWPCYAKSAGRAPPLRITLCSLFSISFFFQSVFNLILYSFI	675654	678938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_675700_678900
884370	contig_11986_pilon	-	1415	10	Intergenic	novelGene_69159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_9	719.789012296119	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	259	1266	523776	507353	FALSE	15	ATCTTGCGTGTGTTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	547778	507203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_547552
884372	contig_5686_pilon	+	8288	3	Intergenic	novelGene_45312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1670	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGAAAGGGCGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96788	129201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_99563_99637_104402_128451
884373	contig_1264_pilon	+	1398	2	Intergenic	novelGene_161314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAACAAAAAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137785	139246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_137922_137984
884374	contig_3956_pilon	+	2837	15	Intergenic	novelGene_15089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1229.63801915981	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	719	2314	1285728	1290491	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281603	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284187_1285079_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286454_1286522_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
884375	contig_5375_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_169231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	317	951	1429	2379	173514	172564	NA	40	CCCTGAATAAGTAAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDTEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLRTGTRQGYPLSPLLLNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAAYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIAFSIAPKMLKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLQKWKNIPCSWIGRLNIVKITILPKAIYKYNAIPIQISTTFFKEMEKLVINFIWKGKK	174942	172563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_172600_174900
884376	contig_15172_pilon	+	2187	7	Intergenic	novelGene_158736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	486.885823941872	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	52	627	215528	231705	TRUE	30	ACAACTTGTGTCAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNVAESSLRPRVPPRLAMAGLNSLEAVKRKIQALQQQADEAEDRAQGLQRELDGERERREKAEGDVAALNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRAMKDEEKMEIQEMQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVILEGELERAEERAEVSELKCGDLEEELKNYSEKEDKYEEEIKLVSDKLKEVSLITPS	215476	238477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_215660_220390_220525_224966_225085_226237_226309_227576_227611_231618_231838_237049
884377	contig_13702_pilon	+	2652	1	Intergenic	novelGene_102629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1933	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2247	2546	211071	211370	NA	20	GGAAAACTTTTTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	208824	211476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_208800_211500
884378	contig_312_pilon	-	1728	5	Intergenic	novelGene_128316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGCTAACAGACAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441730	433363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_433742_433869_433945_435040_435199_439431_439529_440710
884379	contig_11277_pilon	+	4208	9	Intergenic	novelGene_80309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	115.45067940467	169	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	95	1132	250372	269500	FALSE	30	ATTCCGAAGCAAGAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248243	272576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
884380	contig_5153_pilon	-	2592	2	Intergenic	novelGene_74390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACAGGAGCTGGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994954	991446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_993091_994006
884381	contig_4659_pilon	-	3983	1	Intergenic	novelGene_118264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAGACTCATTAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904541	900558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_900600_904500
884382	contig_9363_pilon	-	2819	16	Intergenic	novelGene_6750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	255.685170994852	2143	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	317	1603	1526264	1506537	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1549090	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1549013
884383	contig_5023_pilon	-	2376	9	Intergenic	novelGene_7362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	673	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1241	1591	647062	639176	TRUE	20	CCCATCTCAGCAGGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	648302	618605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
884384	contig_7707_pilon	+	4940	7	Intergenic	novelGene_72158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	926	1501	236440	237015	TRUE	35	ACCAGCCCAGAGACAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKYLYYI	235514	521936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_237352_385470_385480_403168_403576_469593_469898_514737_514938_517947_519352_521157
884385	contig_10126_pilon	+	5333	10	Intergenic	novelGene_105721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1735.59314228755	1	150	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	710	1120	165618	166639	TRUE	60	TATAAAGATAATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139718	188404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_140705_140794_161932_162305_165472_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074_184440_184759
884386	contig_5686_pilon	+	3050	6	Intergenic	novelGene_45457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2729	junction_4	713.931537333938	108	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	2309	3016	222847	257484	FALSE	10	ACCCTGGTGGCCTAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGEDGRLAYEQVDRFPRDCVKVGGHHGTEVATAF	220538	257518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_257383
884387	contig_6738_pilon	-	3806	3	Intergenic	novelGene_166129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTTATCACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40655	32659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_32755_36539_36701_37105
884388	contig_19098_pilon	-	3050	2	Intergenic	novelGene_65814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1888	2523	407806	407171	TRUE	10	CTGTCCCCTAGGCTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	409693	329049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_329354_406947
884389	contig_4232_pilon	-	1391	2	Intergenic	novelGene_63457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTAGTTCTGTTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546292	542858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544064_546106
884390	contig_7207_pilon	-	1410	6	Intergenic	novelGene_72073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_5	230.663044287549	54	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	510	1409	696514	671669	FALSE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDE	705174	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_704896
884391	contig_14970_pilon	+	2361	10	Intergenic	novelGene_44983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	5041.40011661468	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	130	1218	136145	231550	TRUE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136015	232854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_232630_232790
884392	contig_11115_pilon	+	1407	6	Intergenic	novelGene_102833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	644.528975299016	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	472	1320	171830	173241	FALSE	15	GGAGTCTGTGGCTTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165512	173328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166429_171711_171981_172339_172595_172714_172964_173047
884393	contig_6058_pilon	-	2132	9	Intergenic	novelGene_172407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	435.502421778571	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	551	1957	398054	385415	FALSE	15	CTGTATTCTCCCTTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401605	385239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_399522_399760_401302
884394	contig_4388_pilon	-	5664	2	Intergenic	novelGene_161984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAACTAGGCCCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310716	1303221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1305779_1307609
884395	contig_11396_pilon	-	2821	1	Intergenic	novelGene_71319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	973	1392	451038	450619	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARLQGAGTLMHCWWECKMVQPFWKMILHFLKKLEIPFDPAIPLLGIDPRKIRNVTQINIFTAALFKTAKRWKQPRCPSTEWINKLWYMHTTEYYTMIKNNDKSAKHLTIWVNFEGIMLSEKSQSQKDKYCRRPALVI	452010	449189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_449200_452000
884396	contig_7840_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_69001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGCCCCCCCCCCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279769	276842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_276800_279800
884397	contig_4091_pilon	+	3607	2	Intergenic	novelGene_173031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	715	1749	14387	36818	FALSE	55	AAAAAAAGAATTACCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIHAPNDRASKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAIFNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKRLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKELVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKKERTQITRIRNETGDITTDPTEIKRIFLTNDAGKTRCSSAKKWNRTHTSRHKQKLIQNGSKT	13672	38676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_15309_36705
884398	contig_10345_pilon	+	2580	12	Intergenic	novelGene_158352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	659.057917669589	178	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	1439	2329	13133	24141	FALSE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFCFLFPGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
884399	contig_5988_pilon	+	2656	6	Intergenic	novelGene_15952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	170.690831622557	1378	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	1205	2554	779480	786813	FALSE	25	TTCTTTTTAAATGTCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLTVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAVAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGADSAEGEDEGEEY	651787	786915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652760_690137_690343_779452_779483_783303_783527_783653_783803_785838
884400	contig_6403_pilon	-	5380	2	Intergenic	novelGene_139896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_1	0	1430	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	124	393	1136936	1118254	FALSE	55	CTCAGCAATAACAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRSGRAGRWEPAIRIGGVGCFWGWQLHAPSPLSGQERTAGMGVGGQPSACRDPQASHRRGLAQTEGASMTRGLRRLPETPPHTGYRIAPRNQGKTAAAREQTSWVSLDPVLDALLYRKSGARAGRLITY	1137059	1113266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1118341_1136753
884401	contig_2414_pilon	+	1184	7	Intergenic	novelGene_158482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1162	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCCAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263133	527940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_263220_272530_272769_295904_296085_318227_318398_371340_371480_410023_410160_527705
884402	contig_5302_pilon	-	8648	16	Intergenic	novelGene_81395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	591.869490118669	2655	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	92	1000	209238	177220	TRUE	20	AGGCCACTACGACGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209572	152102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_152189_155421_155517_161140_161215_167386_167530_169184_169332_170022_170298_170391_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209510
884403	contig_20883_pilon	-	4181	3	Intergenic	novelGene_173829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAACTGTGCACCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24918	46	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_-_1096_10648_11003_22140
884404	contig_5023_pilon	+	1657	3	Intergenic	novelGene_7382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2736	junction_2	342	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	226	345	646871	646990	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	639109	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_639197_643413_643539_646857
884405	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1394	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
884406	contig_5023_pilon	-	3174	3	Intergenic	novelGene_7155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10804	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367565	363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_365224_365494_365580_366345
884407	contig_20259_pilon	+	2652	2	Intergenic	novelGene_178017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20259_pilon_+_2522_2627
884408	contig_5341_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_168003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	891	1370	339444	338965	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIGKWNGFLGLLCLLPAISATQPGLPGKDLNEILLSLPLTLNISLVWAPCPQNRVLISQFTNYQTEAQKDELICPRSVCLVERLGLGLNPSLFFLQCPYCLQEWCPYDGI	340334	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_337800_340300
884409	contig_15327_pilon	-	1039	3	Intergenic	novelGene_70432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGAATCTGGGTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54575	48254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_48306_53357_53440_53669
884410	contig_10748_pilon	+	6803	3	Intergenic	novelGene_150747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	4544	5290	215106	215852	FALSE	70	AATAGAGAACAGAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKIHSELEIIQRQQLEIQKINKISEMHDVIEGLGSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRIKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLMENFPNIMKHEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFSLAKTKDKQRILRAAQEKQEVTYRGETTRLSSDYSAETMQARTQWDDIDKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFLDKQKLRKYVKVKPNLQELLK	158384	217365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_161043_212955_213424_213688
884411	contig_16303_pilon	-	2994	2	Intergenic	novelGene_34125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1250	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCGAAAATAAGTTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59312	46134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_47986_58169
884412	contig_13888_pilon	+	7955	1	Intergenic	novelGene_151811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	703	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGCTGTGCACGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356624	364579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_356600_364600
884413	contig_233_pilon	+	2012	11	Intergenic	novelGene_14550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	339	848	78477	91651	TRUE	20	CAGCTTCCCATCCCCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78138	104224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92214_92359_93764_94007_94722_94914_95799_95963_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151
884414	contig_20641_pilon	+	1742	7	Intergenic	novelGene_52822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1323.86891974495	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	63	962	14599	56386	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGKL	14536	57166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54972_56379
884415	contig_9839_pilon	+	809	6	Intergenic	novelGene_88502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	253	junction_1	1517.8511916522	523	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	110	685	52079	61360	FALSE	35	TTAAAAAATCACTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45327	61484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
884416	contig_16098_pilon	-	1836	4	Intergenic	novelGene_46211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1329	1667	766357	764972	FALSE	15	TGATCTGGCACGCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTLTQRSPPCAQRAALELKASHCWSAPGLLSHRSEWLFPAHARRAQDSCLLGSAFSILVMNISLLIFRPLSSNLSRKIPEAPNVFHLCSFLLVLRTGVRKSHQAGSWRRV	768116	764802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765636_766288_766706_767136
884417	contig_10126_pilon	+	5375	1	Intergenic	novelGene_105733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTGTTTCGTTCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149161	154536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_149200_154500
884418	contig_4857_pilon	+	3092	3	Intergenic	novelGene_48797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAAAGGAGGTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241549	1247017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1241685_1241727_1241953_1244285
884419	contig_10973_pilon	+	1787	2	Intergenic	novelGene_150363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTTAGTGTAATTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	3397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1731_1806
884420	contig_5945_pilon	-	1705	8	Intergenic	novelGene_104554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	331.453447342311	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	245	958	237053	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRCNLFSIIATHKPPLIDRWWLNMNMKCIIWDSNPGLLHGSRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	240957	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_236928_237069_240728
884421	contig_10437_pilon	+	1341	7	Intergenic	novelGene_38323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1033.91145118375	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	27	545	432132	445413	TRUE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCPGRGRG	432105	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443885_445387_445476_446951_447055_451075
884422	contig_11594_pilon	+	3741	11	Intergenic	novelGene_80923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_10	433.882484089874	4480	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	62	1492	540415	568385	FALSE	70	AAAATAAAAAAAAGGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	540353	570634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
884423	contig_14536_pilon	+	2925	4	Intergenic	novelGene_69267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1191	1499	23635	23943	FALSE	35	TAATGAGATAATCCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTALLRRSRIPGRQWIGKHRRPRTVSFHAKQNMIRRLEIEAENHYWLSMPYLTAEQEYGHAAIRRAETFAAIKASSTSKFPPHRFVVDQLNHLNVTKKWS	14073	25369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_14483_17433_17599_17710_17773_23080
884424	contig_6017_pilon	-	302	3	Intergenic	novelGene_152551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	4630	junction_2	1029	47992	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAATGGAATAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442547	440595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_440708_442124_442225_442457
884425	contig_7752_pilon	+	11084	15	Intergenic	novelGene_178396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12181	207	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTCACACGAGTACTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84964	443187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7752_pilon_+_85657_141671_141838_144567_145689_149175_150578_214801_214978_274231_274282_349717_351183_354051_354597_354645_355926_359182_359341_399511_400771_401539_401620_401889_403271_412070_412876_442683
884426	contig_6059_pilon	-	2459	17	Intergenic	novelGene_44830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4953.7908826852	8	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	886	2193	578225	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584850	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_567966_568153_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580596_580711_580921_581116_584181_584572_584763
884427	contig_14142_pilon	-	1579	12	Intergenic	novelGene_120523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	326.690795758096	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	12	1202	355495	349408	FALSE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDILSFFFFPFE	355506	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349439_349599_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
884428	contig_5698_pilon	+	1922	3	Intergenic	novelGene_55016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	365	7	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8020_19229
884429	contig_9481_pilon	-	1017	7	Intergenic	novelGene_149697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_6	63.5043743025278	842	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	87	824	600300	583459	FALSE	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKSQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNYTFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKSGGKWIIRLRKGLASRCWENLILAMLGEQFMVGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKMPGRLGPQRLLFQNLWKTRVNVP	600386	583265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_583532_585236_585374_585465_585619_587035_587141_591476_591612_592669_592785_600280
884430	contig_13004_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_112616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176807	174942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_174900_176800
884431	contig_11115_pilon	+	1738	7	Intergenic	novelGene_102840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	502.906441486773	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	13	1650	165608	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165595	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
884432	contig_5988_pilon	-	2874	4	Intergenic	novelGene_16134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTTTACTGAGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1651065	1561477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1562000_1576646_1577729_1578302_1578581_1650073
884433	contig_8160_pilon	-	2122	2	Intergenic	novelGene_136405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAACTTCTCTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73880	71573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_-_71686_71870
884434	contig_10235_pilon	+	1149	2	Intergenic	novelGene_46326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTCTGTGTCAGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89979	91488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_90644_91003
884435	contig_3900_pilon	+	2504	1	Intergenic	novelGene_84177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196154	198658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_196200_198700
884436	contig_9121_pilon	-	3099	1	Intergenic	novelGene_134428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCCAGCAGCTCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49040	45941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_45900_49000
884437	contig_8354_pilon	-	4170	9	Intergenic	novelGene_24137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_8	516.986686845029	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	123	1148	578686	537192	FALSE	25	CATTTCCCAGCATTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA	618440	534169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_537381_538002_538147_539084_539151_543399_543460_550970_551140_555802_555922_558330_558496_578572_578731_618362
884438	contig_34_pilon	-	1705	8	Intergenic	novelGene_40014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	34	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	62	1447	247052	212049	FALSE	60	ATTATTTAAGAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247113	211790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
884440	contig_10953_pilon	+	3242	8	Intergenic	novelGene_42570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9180	junction_7	13621.9918184545	23778	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	257	907	455261	463828	FALSE	10	TATGAGCGTCCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKEPLELEDLTSGLGLTKQGVGEVFI	455004	466163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463465_463529_463817
884441	contig_1150_pilon	-	596	3	Intergenic	novelGene_61395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	171	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311028	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
884442	contig_8075_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_42482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCCTGAACCTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615196	616525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_615200_616500
884443	contig_4305_pilon	+	3861	12	Intergenic	novelGene_136655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	379.976032301995	4130	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	120	1439	490540	504013	TRUE	20	CTTCTCCAGTACGTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPSALMKQPPIQSTAGAVPVRNEKGEISMEKVKVKRYVSGKRPDYAPMESSDEEDEEFQFIKKAKEQEAEPEEQEEDSSSDPRLRRLQNRISEDVEERLARHRKIVEPEVVGESDSEVEGDAWRMEREDSSEEEEEEIDDEEIERRRGMMRQRAQERKNEEMEVMEVEDEGRSGEESESESEYEEYTDSEDEMEPRLKPVFIRKKDRVTVQEREAEALKQKELEQEAKRMAEERRKYTLKIVEEETKKELEENKRSLAALDALNTDDENDEEEYEAWKVRELKRIKRDREDREALEKEKAEIERMRNLTEEERRAELRANGKVITNKAVKGKYKFLQKYYHRGAFFMDEDEEVYKRDFSAPTLEDHFNKTILPKVMQVKNFGRSGRTKYTHLVDQDTTSFDSAWGQESAQNTKFFKQKAAGVRDVFERPSAKKRKTT	490420	507254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_490619_496273_496494_498155_498286_498553_498742_499264_499374_499476_499638_501232_501393_503641_503732_503830_505919_506055_506110_506434_506489_506845
884447	contig_5039_pilon	-	3519	3	Intergenic	novelGene_65035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	399.5	1439	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1575	1889	1801145	1800831	FALSE	20	TCCCATCATTTAGGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVYLQPTFHTKRHSCCMVGFRKKPVGQLYPDSAWGSGSQSAVSSSSKLLAPGDGTAVSEEGALYIDPAAENWLLANLLSIVHPAIQGRQRRTASHHRVNAKSW	1806940	1799200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802437_1806310_1806469_1806815
884448	contig_15114_pilon	-	600	5	Intergenic	novelGene_121237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	405.624441447998	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	127	513	1695069	1691054	FALSE	35	TAAAAGTTTAACTGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGRITGLTEGHHGFHVHQFGDNTQGCTSAGPHFNPFSKKHGGPQSAERHVGDLGNVTANKDGVAHVSIEDPLISLTGSNSIIGRTMVVHEKEDDLGQGGNEESTKTGNAGGRLACGVIGIASENIP	1699120	1690966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1692405_1692524_1693290_1693361_1694990_1695085_1699009
884449	contig_16322_pilon	-	1498	6	Intergenic	novelGene_87506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	507.55074623135	9	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	342	755	37060	32956	TRUE	55	AAATAAAAAGTTTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57611	31701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37159_57368
884450	contig_18096_pilon	-	2277	12	Intergenic	novelGene_58025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1137	1454	69547	62869	TRUE	35	ACAGCAGCCTCAAGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAKEVFLRGRRQCEGMPLQLGHLGALDKNVLSHLHLESLLLHLQLKGFERVSDHLCDDHFLLRSPKPDQPLTEIQEHGTHYPFPSLRRVPSKFWNWAFFYFPPV	78942	40308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_40427_42488_42584_44144_44256_53716_53800_57199_57353_59463_59657_62798_62927_66640_66734_69380_69637_70499_70661_71980_72138_78213
884451	contig_10140_pilon	+	4272	19	Intergenic	novelGene_148398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1138	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAGTGCCTGCAGCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204572	283826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_206766_207482_207656_225871_226003_231194_231327_231633_231784_237110_237316_238203_238301_238480_238549_239768_239848_242173_242303_245464_245554_245923_246039_250302_250403_251965_252009_252677_252795_257468_257546_275890_276073_279907_280085_283811
884452	contig_5023_pilon	+	2683	13	Intergenic	novelGene_7223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1888.06448512756	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	270	1370	618569	646990	FALSE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_607970_616541_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
884453	contig_15410_pilon	+	1090	5	Intergenic	novelGene_130613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	828.677070697627	5546	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	297	650	146836	148093	FALSE	25	TTAATCCTTTGATCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGVLGLVSTCLFGYDAYITFPFRQQRHTAAPTDPADGPV	145471	148533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145750_146817_146980_147081_147178_147750_147842_148070
884454	contig_7408_pilon	-	3069	7	Intergenic	novelGene_168720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	216.410617936264	636	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	325	1404	38514	12597	FALSE	25	AACTATTTCGTTTTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48329	10931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47312_47360_48133
884455	contig_12948_pilon	+	4701	2	Intergenic	novelGene_126174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGCAGAAAACTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166101	171665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_166426_167288
884456	contig_10904_pilon	-	1279	3	Intergenic	novelGene_22565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	171	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	632	1027	411895	411229	FALSE	25	CATGTTGCAATCGCGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPGPVVARGANVSLRCAGLIGGMSFALYRVGEAAPLQYRNSARPWADFPLPAARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSQPLVVSWDGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	414245	410976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636_411919_413637
884457	scaffold_12124_pilon	+	1735	3	Intergenic	novelGene_22375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2523	junction_1	1107	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	788	1567	1508626	1509405	FALSE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497006	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1508010
884458	contig_8464_pilon	-	2206	7	Intergenic	novelGene_125375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	911	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACTTCCCCTTCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805537	792622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_792734_793604_793670_796181_796263_797902_797991_798718_798921_799186_799272_803963
884459	contig_11846_pilon	-	4520	1	Intergenic	novelGene_105952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2739	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	624	947	287807	287484	NA	60	AGAAAAAAAAAGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSKSFWPSLGRWSYLSWQRLVWSHRMPCRKMTVSSSSSPVSIATTLFHLFPRTQCLLPAPLVALWAAEQSPVVCGGLRGKSSYVPTSTEGEILVFLGQEHIPRLP	288430	283910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_283900_288400
884460	contig_4388_pilon	+	1456	1	Intergenic	novelGene_161991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGATGGAACTCAGCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309149	1310605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1309100_1310600
884461	contig_13021_pilon	+	2697	8	Intergenic	novelGene_8209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3729.50953715835	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	248	658	177637	178880	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGYLCGKA	177165	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177287_177412_177521_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178735_178861_180211_180440
884462	contig_9678_pilon	+	1042	6	Intergenic	novelGene_146376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	622	junction_4	429.346759624432	78	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	90	872	259970	266767	FALSE	15	TCGGTCTTTATTTTTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQNEYIELHRKRHGYRLDYHEKKRKKEGREAHERSKKAKKMIGLKAKLYHKQRHAEKIQMKKTIKMHEKRNTKQKNDEKTPQGAVPAYLLDREGQSRAKVLSNMIKQKRKEKAGKWEVPLPKVRAQGETEVLKVIRTGKRKKKAWKRMVTKVCFVGDGFTRKPPKYERFIRPMGLRFKKAHVTHPELKATFCLPILGVKKNPSSPLYTTLGVITKGTVIEVNVSELGLVTQGGKVIWGKYAQVTNNPENDGCINAVLLV	259880	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_259973_261565_261754_261842_261994_263530_263711_265596_265790_266699
884463	contig_3866_pilon	+	4951	5	Intergenic	novelGene_112409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	4645	4950	250265	250570	FALSE	35	GCACAGCCCCAATAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSACIFLDKGYSSHQNPQRYPYHNSTGNVLPTFSFKHLAASKSSPLNIQPHFVLRLKGLICDDKTSLHGGDNITPKLQALNIPYLKLFNFCLCSLPGFTD	194297	250571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_194642_194767_195129_210092_210842_246343_246481_247211
884464	contig_3382_pilon	-	1293	2	Intergenic	novelGene_124119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTTGACTGGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734803	731457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_731766_733818
884465	contig_6436_pilon	+	3206	2	Intergenic	novelGene_134909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2474	2773	235157	235456	FALSE	55	GAACAGACTAACAATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTEFSTARWYPATTSDCSNQDHNRGFWTELEKDVEQNYNPPKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVTSSPRFTVQPGSGQPRKTKCD	167381	235889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_169063_234364
884466	contig_16594_pilon	-	3730	2	Intergenic	novelGene_53792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCGTGTATCTGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118993	115119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115467_115610
884467	contig_11850_pilon	-	3442	9	Intergenic	novelGene_125191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	967.366269827515	1219	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2463	3089	186097	181211	TRUE	20	AATGTATTGGCTCTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	200262	179679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195775_197694_197756_197922
884468	contig_8712_pilon	+	1878	3	Intergenic	novelGene_58815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	761	junction_2	326.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	85	405	315133	321793	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	315048	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684
884469	contig_11104_pilon	-	2923	12	Intergenic	novelGene_112451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	148.033389130698	1801	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	823	1392	309844	295435	FALSE	25	GACATCGATTACATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMSLLQRASITALAALSGRRLATRLGFGGFLTRGFPKTAAPVRHSGDHGKRLFIIKPSGFYDKRFLTLLKFYIFLTGVPVAIGITLINVFIGEAELAEIPEGYIPEHWEYFKHPISRWIARTFFDCPEKNYERTMSVLQIEAEKADLRLKELEVRRLMRMRGDGPWYQYPTIDKALVDSSPKASPDN	326778	293903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_-_295556_299530_299638_300685_300748_301631_301699_304444_304534_309720_309918_312711_312865_313390_313451_315984_316082_319860_319991_321558_321656_326566
884470	contig_13145_pilon	+	9600	8	Intergenic	novelGene_116616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	669.25477897709	2533	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	89	949	35323	57392	FALSE	30	CCCAAGACTCCTACAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35234	66043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324
884471	contig_5039_pilon	-	1722	7	Intergenic	novelGene_65042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.918550554527	1898	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	465	920	1810321	1802871	FALSE	35	GTCCCAGCAAAATTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSQRGDGGCRTLKSEREARSALGFAGSLQRHRSHPEDSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYTASEWDDVSGVNCRKTTETRCDFTAAGLLQGFPRHFNVSLRVQAELGDRVSAWATVPWFQHYRNVTIGPPENMEVAPGEGSLIIRFSAPFDIDTSMVTFEYYVYYWEEAGTRKVKGPVKSNFISLDDLKPLRVYCLQVQAELVWSTQGISLPGNLSNTSCHKTTLDAATKLEQAILTFVGASLSVVLLVGACFFMILRYRGLIKYWFHSPPKIPLQIGELHRV	1829599	1802068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802886_1806310_1806469_1806815_1806976_1810198_1810345_1812911_1813106_1822685_1822819_1829485
884472	contig_10241_pilon	+	2744	4	Intergenic	novelGene_142825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	56.7587487137935	271	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAGAGCCCTGGTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92567	122460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_120082
884474	contig_17195_pilon	-	1008	1	Intergenic	novelGene_168968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGTTAGAAATATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2467	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_-_1500_2500
884475	contig_10867_pilon	+	1320	7	Intergenic	novelGene_159438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGAGGCGGAGCCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83664	91455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_84488_86807_86901_87085_87241_87757_87842_88195_88255_88602_88683_91429
884476	contig_15449_pilon	+	2691	14	Intergenic	novelGene_33577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	609.615496238767	73	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	160	1689	44312	54621	FALSE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCCGGLWEPPSPARWEREEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27819	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27877_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
884477	contig_2036_pilon	+	10269	9	Intergenic	novelGene_131794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	256	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2708	3355	104365	105012	TRUE	45	AGCCATTGGAGAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISNHSQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQNANKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQGQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRICGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFQVIGIPEQGEETENTERIIEELPTENFTNIMKDEKLAIQEA	41929	299616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_43000_56077_56894_103543_105682_110948_110956_260144_261248_268221_270013_292502_293383_297048_298239_298342
884478	contig_9235_pilon	+	3878	2	Intergenic	novelGene_156213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	366	junction_1	0	1896	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	1234	2382	45805	46953	FALSE	55	GGAAAAAAAAAAACCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	44173	48449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643
884479	contig_14441_pilon	+	1176	5	Intergenic	novelGene_100437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	229	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	588	1136	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81985	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82365_121631_121691_125517_125902_126159_126283_126514
884480	contig_5954_pilon	-	1845	2	Intergenic	novelGene_28767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACACAATAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392948	1390862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391865_1392105
884482	contig_2463_pilon	-	592	2	Intergenic	novelGene_43027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	268	579	522976	516959	FALSE	40	CCATCATCACAAAATAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRIGYFIFLSVARLSWSLDISGSYASMTSVPLWSKNLAMDLVNSASRCCFVLPLMKVSFRVYLSSYLLRLEDSCQISSGSIPVGSFLWATRKMLFSLYEV	523243	516945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_517070_522775
884483	scaffold_12124_pilon	+	2133	10	Intergenic	novelGene_22318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	3081.96265028922	18	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	218	595	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483560	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483679_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
884484	contig_10500_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_41301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAATACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640229	1638750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1638800_1640200
884485	contig_8138_pilon	+	2747	5	Intergenic	novelGene_52408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	438	junction_2	330.950147303185	74	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	229	711	280295	306552	FALSE	20	GGGACTCCTACCAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280066	308588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364
884486	contig_2069_pilon	+	2792	14	Intergenic	novelGene_23234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	303.302434648826	2821	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1235	1951	341330	343975	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323387	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_323503_323918_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
884487	contig_18272_pilon	+	4821	8	Intergenic	novelGene_7046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2642.43252187318	2	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	13	1332	468524	538332	FALSE	50	CAAAGAAATTCATTCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGTMKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	468511	541821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_468606_507838_507953_509541_509743_512634_512713_514111_514361_518778_519040_537077_537197_538116
884488	contig_4857_pilon	-	4948	11	Intergenic	novelGene_48756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	2173.35511134283	1023	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	202	915	1234343	1212354	FALSE	65	CAAAAGGAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRLGPFLHSSALINYVCCLNN	1242210	1208320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1212414_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190
884489	contig_10176_pilon	-	7613	10	Intergenic	novelGene_72714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1707	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	75	GTTAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	254764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
884490	contig_10323_pilon	+	1980	2	Intergenic	novelGene_123575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGGCTGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458014	460076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459771_459852
884491	contig_13780_pilon	-	3079	9	Intergenic	novelGene_149125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	510	junction_3	932.158784757189	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1917	2786	824289	821461	FALSE	15	TGGTCATTCTTCAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLIENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	827079	821167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_825305_825624_825798_826237_826320_826433
884492	contig_504_pilon	+	2960	9	Intergenic	novelGene_54457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1144	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	792	1139	488917	491983	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAWIACHICCCPSGSIPVDGSSRSTTAGPPRMLSAKHSFLFIPSDKAFTGTFSWSCSLSASTNRVMAAAASPFLQPFHSGVHIQMLLHRQGGPQCVLLRTVPQEPSGIPSAVAL	484727	497004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_485140_485273_485332_486801_486878_488460_488607_488817_488937_490816_490913_491010_491085_491825_491988_495187
884493	contig_18843_pilon	+	2592	10	Intergenic	novelGene_165608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_8	636.165558077416	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	24	710	28527	38569	TRUE	40	AACAGTACAGTGCATGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVAVDKMSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSR	28503	46121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_40125_44191_44351_45422_45498_46028
884494	contig_4857_pilon	+	4554	1	Intergenic	novelGene_48750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	6	347	1198606	1198947	NA	45	AATCACCCAGATTAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMPYIKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKTEPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKSKKRTYRLGKNFWTVQVRQRSNLHNLQENPTPLQQKDK	1198600	1203154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1198600_1203200
884495	contig_34_pilon	-	6465	4	Intergenic	novelGene_39995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	819.327095175601	41	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	5680	6195	212564	212049	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	220436	211778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_213048_214057_214152_215288_219047_219092
884496	contig_10324_pilon	+	3648	22	Intergenic	novelGene_7734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1369.30933647475	3	79	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	775	2229	69577	79348	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILWRTWSGMMARPRGLTSCLPTSRSF	57250	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_57429_57928_58047_66121_66171_67844_67919_68040_68092_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_79273
884497	contig_4232_pilon	-	1301	2	Intergenic	novelGene_63447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAATTGCTGTATCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544115	542768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_543568_543613
884498	contig_6902_pilon	+	2403	11	Intergenic	novelGene_135581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_1	504.111743564857	352	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	1728	2402	470620	490127	FALSE	65	AGCAGGAAAAACAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEK	434441	490128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
884499	contig_9112_pilon	+	1552	4	Intergenic	novelGene_60212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	194.18605053459	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	225	1076	108641	114303	FALSE	90	AAAAACAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108416	114779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251
884500	contig_12429_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_136205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAATGGAAAATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98998	100558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_99000_100600
884501	SIRV3	+	431	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5878	-1	3819	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7822	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
884502	contig_1725_pilon	+	2564	18	Intergenic	novelGene_24274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	581.835622870861	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	743	2248	245349	255543	FALSE	20	CTACATTGGAGCACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201425	255859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236077_245034_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
884503	contig_11081_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_167079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAATTAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35082	33002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_33000_35100
884504	contig_14871_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_63730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_4	303.500823722111	1098	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	115	693	316026	288466	FALSE	15	TTTCCTTGATTTTGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLGGGAGAAGGGGADPGNKKWEQKQVQIKTLEGEFSVTMWSSDEKKDLDHETVVEEQIIGENSPPDYSEYMTGKKLPPGGIPGIDLSDPKQLAEFARMKPRKIKEDDAPRTIACPHKGCTKMFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	316140	287479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_289618_291318_291380_299799_299963_316013
884505	contig_9653_pilon	-	3824	12	Intergenic	novelGene_48277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	810.448523915835	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	32	1696	1040020	1007139	FALSE	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSKTMSCFPRASSPWKCLSW	1040051	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
884506	contig_13074_pilon	+	2148	4	Intergenic	novelGene_153423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	892.840162378214	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	172	561	403725	451174	FALSE	25	TAAAGATTTGACGTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFPCFTSLSPIGLALEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403507	452761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403666_403711_403773_449108_449279_451002
884507	contig_8162_pilon	+	2518	3	Intergenic	novelGene_178398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	475	960	44675	45481	TRUE	30	TTTATCGTATACAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLFLLLLVSRLPLAASPPFAQVPGSEHRLCPFLWGCGATFGCAAPSGSGLLHRRGTGAFVRLLLCFPGPRDLGPGLPAVWISRARAGGSLGAICGLQVLLPPSFFLFLLLLDSHLPLAASPLFWLRCLTPRAVLALSYGAVGLRLGVRLLLGLGCCAD	44200	119628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8162_pilon_+_44790_45110_46029_118617
884508	contig_11572_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_100042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167038	169159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_167000_169200
884509	contig_6126_pilon	-	6294	4	Intergenic	novelGene_178399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3978	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1165	1722	122991	122434	TRUE	30	GACCAGATTTACTGACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPSEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEKMDKFLETHGLPKLQLNDIENLSRSITREEIQKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKIFTEEIVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPVSLMNIDTKILNKILANRIQHHVKKIIHHDQVGFIPGMLGWSTLENQST	165797	16875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6126_pilon_-_20359_101145_101661_121859_123172_164813
884510	contig_3817_pilon	-	8931	16	Intergenic	novelGene_78291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATCTAAAACCAAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131139	84241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_84349_84972_85080_86587_86678_86786_86914_89564_89659_94131_94179_95297_95350_99004_99082_99334_99432_100442_100565_110570_110710_113089_113240_117076_123708_124543_124732_129751_129818_130302
884511	contig_9839_pilon	+	2052	4	Intergenic	novelGene_88553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_2	197.308557003153	37	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	18	719	255906	260431	FALSE	30	TATGCAAGTAAGTCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAGEMRQLHQLPLVGLLLFFLTPSQLFKTCEVNEDDRFRLNPLLSTMSYSICTSEVQAANVLLSLRLVGIKRQNLEQKLMQEVNDTAVRKASNISSGQLAWTMMALGACHNPNETFIIDLQLVRLLEEKFQEEIENMRAHNGNPLTNYYQLSQALLALCLFSGNYSVTEIAELFTPENKNYYFGNQFSVGESLDSISLVQMTQSPVGLGLLVFLPLSNWIFFPILFTLSPLRRQLSF	255888	261764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_255985_258479_258660_258843_258985_260129
884512	contig_5286_pilon	+	6006	11	Intergenic	novelGene_157327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTCTTCTTTCCCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483644	589388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487678_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_589214
884513	contig_16766_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_153371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186122	188444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_186100_188400
884514	contig_11498_pilon	-	1512	10	Intergenic	novelGene_65507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_9	427.03916031723	1160	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	170	1135	176010	172960	FALSE	20	TTTACTTGTACAAGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRICQAIETYDLQTLGLDFLELLTRFLPTEYEHSLIARFEREKRPIEELSDEDRFMLRFSRIPRLPERMATLTFLGNFPDTAQMLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQSLDVLLEMKSTDRKQTLLHYLVKVITEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGTVSLDSVLGDVRSLQRGLELTQREFMRQDDCMVLKEFLRANTPTMDKLLADCKTAQEAYESVVEYFGENPKTTSPSMFFSLFSRFIKAYKKAEQEVEQWKKEAVAQEAGTDAQGRGEPSAPKSPPKARRQQMDLISELKRKQQKEPLIYESDRDGAIEDIITDLRNQPYIRADTGRRSARRRPPGPPPLQVTSDLSL	176617	172582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173555_173677_173933_174030_174180_174283_174499_174664_174824_174955_175035_175117_175666_175736_175914_176150_176587
884515	contig_16103_pilon	+	2214	9	Intergenic	novelGene_118844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6733	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCCACTTCCGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722281	743696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723676_732163_732241_733288_733369_733541_733608_734955_735030_735661_735731_735854_735975_737495_737629_743495
884516	contig_15720_pilon	-	4798	3	Intergenic	novelGene_41950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	378	junction_1	25.5	1034	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2604	3059	307437	306982	FALSE	55	AAAATGTCAGACAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	310718	305242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_309909_310220_310254_310619
884517	contig_10958_pilon	+	1814	3	Intergenic	novelGene_5451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATTACCGCTTGATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888609	901578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_889025_895576_895855_900457
884518	contig_3721_pilon	-	4642	4	Intergenic	novelGene_123800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15046	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	984	1328	84528	83146	TRUE	60	AAAAAAAAAATTTCTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVTEGLRSRFETMEDRISETEDKHLATTLFEEKSEKRRKKNEETLRTMRDTIKSKNLRMIGVPEQGEKTENTERIIKKTKPTKTKEMKKNSTNKRNSAQESKRNETGGHYAE	85511	74325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_76219_81724_83173_83439_83521_84291
884519	contig_3155_pilon	+	1753	5	Intergenic	novelGene_26414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.50752120974	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	12	587	258545	261211	TRUE	30	CACTCCAAGGATTCTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLKGIFSPSVRISAPFAGLAGSLPVRQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258533	262554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258627_259209_259329_259731_259978_261082_261670_261846
884521	contig_9406_pilon	+	8024	35	Intergenic	novelGene_136147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.168957724898177	701	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3676	4041	63162	65335	TRUE	30	CTCAAGTGAAACCTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFVQGLQQLHELGLHGEALAVHLVCALPLLAEGLGLALQLLDLLLPHFHLVLQHLLLFQQDVDAGEVFAVIIRLNLTLQAMQPFVQVRTALGKKLRLVGIEEPLGLGLGGGFKDFPHFM	33687	112908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_34646_34725_35002_35740_35787_37598_37769_38920_39162_43998_44062_44736_44851_45934_46132_48558_48646_49442_49579_51140_51389_57755_58129_58526_58732_60400_60531_61872_62160_62332_62420_63104_63330_65137_65401_66992_67141_72060_72152_78954_79161_80223_80980_81867_82004_82096_82970_83739_83895_86064_86363_87516_87678_88905_89023_90286_90479_91299_91413_95495_95609_96484_96565_98215_98310_102173_102352_112701
884522	contig_4364_pilon	+	1884	6	Intergenic	novelGene_728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	52	1179	1530895	1532568	FALSE	20	ACGCGGCGGTGTGTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530473	1533273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
884523	contig_5153_pilon	-	2774	2	Intergenic	novelGene_74388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTTCAAGGCCAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994939	991249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_993091_994006
884524	contig_16098_pilon	-	1614	8	Intergenic	novelGene_46002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_7	1550.64484282231	12	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	197	889	350768	349343	TRUE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPSSSSSSSSSSIWGVTLISRQQTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354066	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_353990
884525	contig_8801_pilon	-	1737	11	Intergenic	novelGene_66305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.900957393689	2704	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	66	1112	567942	560690	FALSE	15	GTTGCCAGCACTGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPSPMDSQMAEQTFEQAIQAASRVIRSEQLSIRRIQSMPVRLLGHSPVLRNITNTQAPDSWRRSKMGSRAASSSGEDKENNGSVFKMPRKPAFPSHAQAMAEWASRREAFAQRPNSAPDLMCLSPEEKMEVGDLSPLPRHRSSLTPMEGAAEEDDGFVDILESDLKDDDEVPPGMESLISAPLVKTSEKEGEQDLIMYSKCQRLFRSPSMPCSAIRPVLKRLERPQDKDMPIQSKRRRSVTPPEDQEEQQEPEEPKARVLRSKSLCHDEIKKSPPLSRGFVCMLAEARGKPRPLNGPELNSPPSSGGPYSSPCTYGPPLLRNHGLFLLLPSFSFLPSCPSTHTPTA	568105	560064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_560918_563903_563952_564167_564354_564439_564521_564934_565070_565226_565350_565455_565579_565893_565931_566079_566122_567898_567951_568048
884526	contig_9680_pilon	-	6202	6	Intergenic	novelGene_178400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	237	833	141453	140857	TRUE	50	CAACAATAAAAATCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEVGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLRIYPREIRVITRIDISTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNKNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYRMRPLL	141689	84527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9680_pilon_-_84854_88454_89428_89978_90986_109473_109960_111956_113344_139666
884527	contig_10749_pilon	-	1616	15	Intergenic	novelGene_133446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1149.76671325011	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	135	1235	155250	136250	FALSE	20	CTGGATGCCACAGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157603	135868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
884528	contig_6743_pilon	-	5349	21	Intergenic	novelGene_33537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	285	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	542	931	207475	207086	TRUE	10	CGCCCACGCCTGGCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVASYAWESWTMNKEDRRIDAFELWCWRRILNIPWTCQKNEQICLGRSTIRMHLRGKDGETSSHVLWTCYQEGPVLEKDIKLGRVSVKKRKTFNEMDWHCGCNSGLKHNKDYGDGVGPGSDSFCFA	208016	131469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_131637_139448_139544_162267_162328_162862_162935_174599_174687_177463_177508_177881_177939_178734_178882_183723_183808_188393_188555_190493_190683_192149_192191_192271_192329_192423_192513_194528_194691_194852_194906_196600_196776_201834_201874_202080_202220_203183_203232_204633
884529	contig_854_pilon	-	1258	10	Intergenic	novelGene_36422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	133.902212338467	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	377	1087	1074160	1064774	FALSE	35	GGCAAGGTTGAGGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPALNAYMKNLLSLPISVLMDEDVRIFFYQSSYDSEQVPQALRRLRPHTRKVKSVSPQGPSFDNMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGEVIFLLSRINKDWLEGTVRGTTGIFPLSFVKILKDFPEEDDLTNWLRCYYYEETISTIKDIAVEEDLSSTPTFKDLLELMRREFQREDIALNYRDAGGDMVRLLSDEDVELMVRQARGLPSQKRLFPWKLHVTQKDDYRVYNTVP	1082286	1064602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1064970_1067166_1067233_1067534_1067666_1069792_1069892_1070788_1070847_1072016_1072145_1074127_1074199_1075239_1075395_1075806_1075892_1082188
884530	scaffold_8345_pilon	+	2160	9	Intergenic	novelGene_107012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	325.778298847544	203	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	23	607	570477	612330	TRUE	20	TGTATCTCAAGTTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCPATGTMVFYFTSSSVNSSAYTIYMGKDKYENEDLIKYGWPEDIWFHVDKLSSAHVYLRLHKGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELSCKVLCTSCCL	570454	620974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_580076_580125_583891_583932_591070_591123_598125_598202_602217_602322_602543_602747_612296_612539_619629
884531	contig_10003_pilon	-	5041	1	Intergenic	novelGene_88133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGTAAAGCATTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373870	368829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_368800_373900
884532	contig_4486_pilon	+	2206	12	Intergenic	novelGene_38559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1017.43870609544	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	259	1038	343083	411202	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGQRRRAATPRNRRRRLWRIGGLRCAGVGRGGGRGCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSK	311649	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399367_411195_411318_412424
884533	contig_6102_pilon	-	1840	7	Intergenic	novelGene_32148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	527.780073094424	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	303	695	867239	839973	FALSE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867541	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
884534	contig_5023_pilon	+	2992	16	Intergenic	novelGene_7193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2168.57811480242	3	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	118	1032	607279	625757	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKGWAAGSLSQPLMWSEGIPS	580811	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618640_625696_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647620_647767
884535	contig_13863_pilon	+	4448	23	Intergenic	novelGene_41978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_22	427.038214172498	219	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	129	2195	48604	81541	TRUE	35	TAAAGCAAGTTCCCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRNNNKLPSNLPQLQNLIKRDPPAYIEEFIQQYNHYKSNVEIFKLQPNKPSKELAELVMFMAQVGHCYPEHLSNFPQELKDLLSYNHTVLDPDLRMTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	48475	83849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54864_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493_82255_82309
884536	contig_11855_pilon	-	7092	10	Intergenic	novelGene_66957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2018.14943346683	2019	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	126	1274	1102035	1079438	FALSE	20	GATCTTGGTGTAGGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKERI	1102160	1073619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079449_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
884537	contig_3747_pilon	+	2622	9	Intergenic	novelGene_24832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3826.39692628718	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	329	1504	201313	203804	TRUE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200984	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204642_204917
884538	contig_7182_pilon	-	2825	6	Intergenic	novelGene_117095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	366.030381252704	411	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	175675	175289	TRUE	20	CATTTTGGTGGTAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWQRRRRDRTLRGNNRRVFRGAPRGGEGGDGEAVAREAGEDEAPREQALPPPPPLSRGARSLTRGGGSRRAELASRSSRGSASAADKFHARSSAAPRAARVDV	175676	90862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347_102457_174799_175332_175406
884539	contig_8317_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_19924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16408	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
884540	contig_10003_pilon	-	1853	2	Intergenic	novelGene_88140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGGTGGTATCAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371811	369837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_370451_370571
884541	contig_383_pilon	+	3388	12	Intergenic	novelGene_126115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_8	349.517022132443	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	973	2922	190	3111	135598	169172	FALSE	35	AAGTAATATTCATGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	135408	169449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
884542	contig_18055_pilon	+	8505	25	Intergenic	novelGene_117800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	328.202911385117	1770	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	1058	3220	77213	97425	FALSE	60	AATTAGAAAAATGAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKEEEEEKQKSLLRERRRQRKNRESFQIFLDELHEHGQLHSMSSWMELYPTISSDIRFTNMLGQPGSTALDLFKFYVEDLKARYHDEKKIIKDILKDKGFVVEVNTTFEDFVAVISSTKRSTTLDAGNIKLAFNSLLEKAEAREREREKEEARKMKRKESAFKSMLKQAAPPIELDAVWEDIRERFVKEPAFEDITLESERKRIFKDFMHVLEHECQHHHSKNKKHSKKSKKHHRKRSRSRSGSDSDDDDSHSKKKRQRSESRSASEHSSSAESERSYKKSKKHKKKSKKRRHKSDSPESDAEREKDKKEKDRESEKDRTRQRSESKHKSPKKKTGKDSGNWDTSGSELSEGELEKRRRTLLEQLDDDQ	40215	102710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571_85706_90730_90846_91012_91105_91211_91329_91842_91981_92274_92371_94711_94799_94881_94979_95062_95125_96033_96166_97332
884543	contig_7963_pilon	+	6622	12	Intergenic	novelGene_58435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCGGAAACAGAAGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115659	129559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123131_123745_124053_125564_126910_129471
884544	contig_19402_pilon	+	3051	7	Intergenic	novelGene_80823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1295.83353697748	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	105	542	107581	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	97765	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_142957_143063_143802_145823_146230
884545	contig_15982_pilon	+	2935	2	Intergenic	novelGene_145975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	75	junction_1	0	1340	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	54	380	66315	68114	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGWLRVRQAEVAGCWTMLTAACGRLVSAPLSAVARKWLHASVSQLSADRRGKAEESPRALDPVLLEFLVCPLSKKPLRYEASTNELINEELGIAYPIIDGIPNMIPQAARMTHQHKKKEEMEQH	66261	70669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_66500_67972
884546	contig_11145_pilon	-	8667	9	Intergenic	novelGene_160509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	259	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	7506	7871	5739	5374	FALSE	50	AAAAGCAACACCAGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFRGIQ	243065	4577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_-_6503_7636_8283_50724_50880_53072_54181_87218_87833_127796_128455_128513_129642_167930_169218_241919
884547	contig_8263_pilon	+	1777	8	Intergenic	novelGene_83086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	171.72878474561	1100	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	368	1441	140133	192899	FALSE	20	GTAAGTATTCTTTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGEDFRPGKSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139405	193235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_139714_140073_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
884549	contig_10749_pilon	-	823	4	Intergenic	novelGene_133475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	730.849277667199	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTTCACCTGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169049	163925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167108_168302_168346_169012
884550	contig_11986_pilon	-	1278	10	Intergenic	novelGene_69157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	724.923256900385	1505	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	121	1128	523776	507353	FALSE	10	TCTTGCGTGTGTTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARLLAGFQNGPLSQWEDPGILPKSRASHTSEAAPGSTGDMADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	535543	507202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_535455
884551	contig_11375_pilon	+	1214	3	Intergenic	novelGene_152656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	28	426	178418	179000	TRUE	35	AGAGGGAAGGAAACGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAFCSAQRDMCHSRSSLPTMTVLRARTPPPSTSPGPRRGSGPEIFTFDPLPEPAVAPVTRFSASRGHRKRSRRVLYPRVVSVAEVSSRGAHQTLTLEDAPSDASPAPIPAPPVFEPFNLTSESSDYALDLSTFLQQHPAAF	178390	180410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_178667_178850_179660_180281
884552	contig_9995_pilon	-	3375	1	Intergenic	novelGene_47787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTTTGGTGAAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761951	758576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_758600_762000
884553	contig_14970_pilon	+	6794	7	Intergenic	novelGene_45069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	347	junction_2	5532.03144574095	2178	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	5275	6093	207723	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	202448	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_207823_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
884554	contig_10235_pilon	-	778	5	Intergenic	novelGene_46605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATGGGGGGAGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598856	597512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_597529_597619_597734_598023_598081_598159_598277_598382
884555	contig_9471_pilon	+	2823	14	Intergenic	novelGene_21756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.112231212181	1119	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2074	2559	385781	401578	FALSE	20	TTTTAAATGCTGAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTLHTDVGDIKIEVFCERTPKTCENFLALCAGNYYHGCIFHRNIKGFMVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGKVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	369149	401842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_369657_374070_374164_375797_375932_377176_377308_380281_380440_381309_381774_381900_381988_384401_384837_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_401451
884556	contig_1867_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_54559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1815	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAATCTGATAATGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445726	450031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_445700_450000
884557	contig_615_pilon	-	3935	3	Intergenic	novelGene_80034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1778	2107	10929	10600	FALSE	50	CAAAAAAAATTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLSNVYLCEGTPGCILAQLGISCIISSRGTFPSVFLPLPTSLALFLHSSDIFILLKIDELLKSTTKQDISDFTIAHSVTVLKLYTSFNPYDENFKNLFLPTLQEE	153029	8771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_12035_88016_88629_152969
884558	contig_7593_pilon	-	2495	3	Intergenic	novelGene_127378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	294	869	956186	955478	TRUE	55	AACAACAAATATATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIGSTLQDLIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWKCKMIQPFWKIIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISHKWYLG	956479	931489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_932038_954399_955498_955630
884559	contig_14577_pilon	+	1780	9	Intergenic	novelGene_164642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70520	101680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_70553_70951_71005_72982_73078_77949_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84971_86766_86864_100579
884560	SIRV6	+	1459	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	21	48	-16	-47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	237	728	1733	10736	TRUE	30	ATTATTGCCTACTAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1108	11777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884561	contig_8330_pilon	+	2569	3	Intergenic	novelGene_71887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76	49	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAGACTCCATCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062397	1066105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1062751_1063449_1065075_1065514
884562	contig_14353_pilon	-	3975	11	Intergenic	novelGene_82069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	510.564599242838	294	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1742	2236	83931	80452	TRUE	20	CATCGTAAGGTTTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104441	32361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_33621_79971_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87365_88750_90961_91054_104333
884563	contig_10734_pilon	+	3116	10	Intergenic	novelGene_51179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	405.919471427463	880	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	115	1389	1123789	1142903	FALSE	35	ATTTAACAATTTCTACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASDTERDGLAPEKMSPDRDKKKEQSDVSVSPRASKHHYSRSRSRSRERKRKSENEGRKHRSRSRSKEARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123674	1144630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
884564	contig_9957_pilon	+	5903	5	Intergenic	novelGene_173846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	76	1176	715818	729167	TRUE	30	GGATCAAAGATGTTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFKNN	715742	813932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_+_716907_729155_730311_733481_734322_808323_809162_812026
884565	contig_3077_pilon	+	2055	8	Intergenic	novelGene_26801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	771.973987084211	45	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	851	1330	479489	481662	FALSE	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467407	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_476732_476905_477443_477631_477865_477982_479457_479646_481023_481218_481533
884566	contig_401_pilon	+	1758	7	Intergenic	novelGene_42844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2039	junction_6	795.881621571673	256	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	339	893	1713259	1715475	TRUE	20	CTGGCTAATGCCACCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1712920	1716571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
884567	contig_5039_pilon	-	5243	1	Intergenic	novelGene_64764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	4591	5163	120595	120023	NA	25	CCAGCACGTTAACCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIQIELKKEKKKKPQTQLLEKRICDDVRGLVTWSSEMTNVSAERETDHVQRPWNKWVPLAHCAAGAQRYWGPVFRRDRGRFLLSQLHKALLGRIFISTTGVTRCQRLWRCRPLGILDLLKDGLGGWLEGGASTAAQIFPRVPLSLGLGAWARKGQESLAKTSHCRVNSNSRRPQVCQSRTVLCRVFND	125185	119942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_119900_125200
884568	contig_1715_pilon	-	1057	9	Intergenic	novelGene_127188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	387	junction_5	146.450023472173	19	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	930	128	1057	284622	252423	FALSE	80	AAGAAAAAGAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSK	312018	252422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
884569	contig_10331_pilon	+	2810	2	Intergenic	novelGene_54214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2158	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	202	795	1188709	1189302	FALSE	35	ACCTCATAGATGTTACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPTSSFVSPPPPTASPHSNRTTPPEAAQNGQSPMAALILVADNAGGSHASKDANQVHSTTRRNSSSPPSPSSMNQRRLGPRDVGGQGAGSTGGLEPVHPASLPDSSLAASAPLCCTLCHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRQSIKQQGASGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDS	1188224	1191317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1188304_1188586
884570	contig_14415_pilon	+	877	4	Intergenic	novelGene_77606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	15	CAAGTGCACGGTGCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	38417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
884571	contig_12425_pilon	-	2761	9	Intergenic	novelGene_46661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	728.228329578025	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	719	1021	206628	204225	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226605	202484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_210302_210389_211048_211200_226517
884572	contig_11816_pilon	-	3747	3	Intergenic	novelGene_98484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	301	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTTCTTAAAACCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485107	470082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_470214_470256_473348_484582
884573	contig_14621_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_105877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCAACCCCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463849	466977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_463929_465468
884574	contig_7272_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_25292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAGCTACCACACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343304	340820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_340800_343300
884575	contig_1986_pilon	-	2692	4	Intergenic	novelGene_64143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_1	323.218536322133	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	116	457	410259	384418	FALSE	30	CCCCAGCTGAAAGGGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRQGKLRLQKWYVPLSDKEKKKITRELVQTVLARKPKMCSFLEWRDLKIVYKRYASLYFCCAIEDQDNELITLEIIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLLGGEVQETSKKNVLKAIEQADLLQEEAETPRSVLEEIGLT	410374	382182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_384466_402862_403001_403608_403718_410212
884576	contig_6589_pilon	+	776	8	Intergenic	novelGene_26094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3001.15991182185	53730	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	26	751	1876599	1880585	FALSE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKYLHCLILMRIALAEMPDLAVSPCLSCHSRPLSPLLPSQKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1876573	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879644_1879819_1880150_1880274_1880498
884577	contig_4180_pilon	+	1219	4	Intergenic	novelGene_8336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	1837.61753970249	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCCTGGGCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865700	888678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_882860_882931_886082_886468_888085
884578	contig_7356_pilon	-	2475	15	Intergenic	novelGene_60405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	460.917790049021	103	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	362	1522	483720	463380	FALSE	30	GTAATTTTATCCACATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTPQKTKPVRPAVDLGRDKLLRPPLEKWKRQDDRDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGLSKSDCVFGSPSSPSSLRPTGTFFQAVLLHEDKKKQKTAIFLSPQSGSLSSKYMTQGKASPKRTQQES	489749	462426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_463448_473372_473437_473787_473865_475963_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485117_487277_487336_488978_489080_489683
884579	contig_15371_pilon	+	4278	23	Intergenic	novelGene_151434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	533.515142263829	429	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	97	1959	111161	209039	TRUE	30	TTGTTGTTATATAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEASLRALESLMTEFFHDCTTNERKREIEELLNNFAQQIGAWRFCLYFLSSTRNDYVMMYSLTVFENLINKMWLGVPSQDKMEIRSCLPKLLLAHHKTLPYFIRNKLCKVIVDIGRQDWPMFYHDFFTNILQLIQSPVTTPLGLIMLKTTSEELACPREDLSVARKEELRKLLLDQVQTVLGLLTGILETVWDKHSVTAATPPPSPTSGESGDLLSNLLQSPNSAKQLNQPIPILDVESEYICSLALECLAHLFSWIPLSASITPSLLTTIFHFARFGCDIRARKMASVNGSSQNCVLGQERGRLGVLAMSCINELMSKNCVPVEFEEYLLRMFQQTFYLLQKITKDNNAHTVKSRLEELDESYIEKFTDFLRLFVSVHLRRIESYSQFPVVEFLTLLFKYTFHQPTHEGYFSCLDIWTLFLDYLTSKIKSRLGDKEAVLNRYEDALVLLLTEVLNRIQFRYNQAQLEELDDETLDDDQQTEWQRYLRQSLEVVAKVMELLPTHAFSTLFPVLQDNLEVYLGLQQFIVTSGSGHRLNITAENDCRRLHCSLRDLSSLLQAVGRLAEYFIGDVFAARFSNALTVVERLVKVTLYGSQIKLYNIETAVPSVLKPDLIDV	111064	231344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_111164_150998_151090_154077_154191_155017_155216_160082_160243_162798_162877_177203_177658_180956_181084_186475_186586_195433_195543_196973_197067_198099_198170_205106_205267_208942_209040_212974_213120_215190_215338_216235_216426_220720_220877_222001_222462_225539_225702_226862_226962_227140_227372_230615
884580	contig_7119_pilon	+	3619	3	Intergenic	novelGene_40914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	245	847	139196	139798	TRUE	25	CTAGCATATCGATCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGADATAGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127467	145977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_139085_142349_145755
884581	contig_6137_pilon	+	2813	3	Intergenic	novelGene_59281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1352	junction_2	625	56	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATTTTGAGAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346199	1354916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1346749_1347420_1348281_1353512
884582	contig_9091_pilon	+	6206	25	Intergenic	novelGene_32415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	518.675369464262	2332	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	5	652	2310	13675	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVNVKANPKVIDTGGGFLLEEEEEEEHKIGQVVHQPGPVMEFDYTICEECGKEFMDSYLMNHFDLATCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCELEKREPALKFIVKKNPHNSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSLWKRETVAHQHEYGPEEKIEDDMYRKTCTVCAHELTYEKM	2305	55565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_2419_3892_3999_5988_6155_7078_7197_13526_16067_18581_18790_24579_24692_25320_25450_28659_28781_31154_31255_32012_32105_33092_33198_34423_34547_37956_38059_40451_40527_40774_40844_43445_43507_44146_44257_45905_45973_46704_46802_48850_49068_49505_49576_51483_51602_52146_52257_54488
884583	contig_8303_pilon	+	2903	6	Intergenic	novelGene_154909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1355	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	27288	27617	TRUE	5	GCCTCCTCCCCTTAGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTINSKENLCGSKYSQQSICDLENLETFPPKLTIHQCYSTEKTDRQVSVDGVPRDPNEKEKEARTNSFYEDAAKYVSQELVNAALTAGSRDNITVVVILLSGSEYQFLI	27287	54956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_29283_33988_34085_35773_35897_36178_36329_51333_51595_54678
884584	contig_19132_pilon	-	3841	3	Intergenic	novelGene_169981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	248.5	4	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	234	1664	329756	327353	TRUE	50	CTTTCACTAAAACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFPPPFAPHPQKSYGKPSFQSEIHPSYPLEHVLEHSGKKSADYAHAKDQTYPCYSGTSGLHSKSLLPKFPSDQSTKSMDTPSEQLFQEDFASANAGPLQSLPGAVVPVRIQTHVPSYGSVMYTSISQILGQNSPAIVICKVDENMTQRTLVTNAAMQGIGFNIAQVLGQHAGLEKYPIWKVPQTLPLGLESSIPLCLPSTSDSVATLGGSKRMLSPASSLELFMETKQQKRVKEEKMYGQIVEELSAVELTNSDIKKDLSRPQKPQLVRQGCASEPKDGSQSGSSSFSSLSPSSSQDHPSAGTPSREPFPPSREMLSSSRAPPPGQRPSGPSESKESSDELDIDETASDMSMSPQSSSLPPGDSQPEGQGKGQKLPVGMLVQMASGPSGKVANSTLLFTDVADFQQILQFPSLRTTTTVSWCFLNYTKPNYVQQATFKSSVYASWCVSSCNPNPSGLNTKTTLALLRSKQKMTAEIYTLAAMHRPGTGKLTSSSAWKQFAQMKPDASFLFGSKLERKLVGNILKERGKGDIHGEKDIGSKQTEPIRIKIFEGG	329989	171273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_173386_327287_327512_328484
884585	contig_11293_pilon	+	2579	5	Intergenic	novelGene_134670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACACATACACACACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47672	237777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_48354_50396_50515_211498_212516_223286_223673_237400
884586	contig_839_pilon	-	6501	13	Intergenic	novelGene_171534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	157	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	6071	6448	221861	220557	FALSE	25	CTATGATTTCTTTTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQVGCVFLVVCSSVGMILFTSFSNGQCRSLRYSTAGQVQLKKGGVWESLYRWLPVVLSPAGNSMKLLSCTPCSLISDRSPRWRIRAAVVDRRPLHVSLLTLCSRSVSYSIQCLAEFFISSFDA	585337	220503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_-_220806_221732_222155_278854_279028_388271_389317_457934_458093_492959_493878_528662_528681_548127_548975_557536_557743_565577_566689_573046_573130_584021_584969_585066
884587	contig_7730_pilon	-	2388	1	Intergenic	novelGene_156296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1440	1781	405391	405050	NA	15	CCGGACACCTAGTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSKILLACDINDVVRQFLHFAGSPFFGMGINIDLFQLVGRVTVFQISSHRQVSTSNAHLFVETSQLVFRQFLEPCFWPIHSVRLELPPSISSVLDHILPPEMVERRHCFTE	406830	404442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_404400_406800
884588	contig_18108_pilon	+	3155	10	Intergenic	novelGene_33475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_5	266.173711031808	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	662	1231	247233	260192	FALSE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226773	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_230734_230801_232751_232919_244345_244450_245849_245923_246447_246550_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
884590	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
884591	contig_8210_pilon	+	3055	5	Intergenic	novelGene_30226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTTTTGAAAAAGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13640	37800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_15993_18143_18324_23934_24081_29712_29926_37636
884592	contig_12019_pilon	+	1239	4	Intergenic	novelGene_87667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	54.6829244117597	3029	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	109	417	5225	6248	TRUE	10	CATCTCTTTCCTGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKGKESVGS	5116	8673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6434_7726_8013_8322
884593	contig_15888_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_84406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_7	1285.85843636356	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	8	817	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259733	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
884594	contig_2845_pilon	+	2227	2	Intergenic	novelGene_178402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2750	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCCCCTTTCTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83572	102487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2845_pilon_+_84604_101291
884595	contig_9708_pilon	-	5071	2	Intergenic	novelGene_67255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	736	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	127	999	50111	49239	FALSE	40	TAAAAACATGAATTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	85763	45166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50118_85643
884596	contig_1275_pilon	-	3243	22	Intergenic	novelGene_108750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_21	505.711407040502	2474	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1022	3069	93	3161	513735	395556	FALSE	40	ATCAATTGATTTATTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEGR	546799	395473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
884597	contig_5671_pilon	-	5252	6	Intergenic	novelGene_79419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	820	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	4535	5119	531410	370440	TRUE	10	TCTCCTGCGCTCACCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRGGQVQILQSLLMEDFKKHYKNFEKIVMTGYIGTEHLYRMEHLSADLRKLGAKILLRLRVHSLDSLPQKAFHKPHCQDPQAYLEEFLPVRLLLHSCPSDPSCQSQWRPQWCLLLLLSFVLLLSHLSPPPLQHLSPVLWSSQPLLSHHEPRLPWFWNLHREHPLLSFLLLLPRPVWFFQQQPRLPPWPLKVLS	535944	368801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_-_368898_370402_370548_376735_376778_392772_392917_521216_521301_531203
884598	contig_13702_pilon	+	5063	18	Intergenic	novelGene_102646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1424	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	950	1249	211071	211370	TRUE	40	TCTGTGGGAACAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210121	234059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_212528_214223_214354_214530_214640_218907_219053_221531_221684_222747_222855_223296_223503_223607_223732_224591_224985_226908_227079_227195_227370_229696_229843_230911_231075_231174_231381_231458_231588_232516_232693_233671_233736_233996
884600	contig_11493_pilon	+	3988	4	Intergenic	novelGene_143708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	149	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1380	1973	289796	290389	TRUE	30	CAGGAAAGCTGCTGATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQHTISKHLQKQDRMVPEGIQNKTPDDLPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKEKADKNEEKIDKFMENTNKKLQAFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQLLEIQKIKKKKISEMDCVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKQLDTTLFEEKSEKRTKKNEEILRVMWDTIKRKNLQVIGVQNRERKQKTQRGSLKNC	264412	353900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_264875_288633_289001_289245_291863_353358
884601	contig_1263_pilon	-	5571	5	Intergenic	novelGene_170402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1154	junction_2	535.649780640299	754	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	264	1268	65303	59754	FALSE	20	TGTGAATTAAGTTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKVII	76807	55450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
884602	contig_18869_pilon	-	2670	2	Intergenic	novelGene_55975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	431	973	53041	52499	FALSE	25	ATTGTCTAGCCCAGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59721	50801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_53330_59579
884603	contig_10377_pilon	+	2170	11	Intergenic	novelGene_115370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	668.815849094502	9	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	214	1074	208954	255047	TRUE	30	TTTAAGAAGTCTGATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLKGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	208740	261745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_208967_219445_219615_227487_227752_235978_236012_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_257234_261135
884604	contig_3727_pilon	+	1270	7	Intergenic	novelGene_146739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	334.78820004428	78	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	TRUE	25	ACCTGGACTGCCTCTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	308297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336_307440_307486
884606	contig_11338_pilon	+	3421	12	Intergenic	novelGene_6150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	526.803302009644	68	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	447	1613	6086	11802	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSPQAFGIQHVKAGFGQAGSSHSSFCTC	744	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10579_11719
884607	contig_11422_pilon	-	1406	1	Intergenic	novelGene_99053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2150	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2200
884608	contig_13123_pilon	+	2842	2	Intergenic	novelGene_136909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_1	0	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGCCTGTGTGCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442455	446294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_443550_444546
884609	contig_16098_pilon	-	2000	9	Intergenic	novelGene_45981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1353.88122055629	15	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1414	1875	349429	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354136	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_350076_350236_350422_350528_350643_350765_350889_352152_352352_353990
884610	contig_11281_pilon	-	3847	18	Intergenic	novelGene_125439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_14	321.590984397378	3120	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	602	1957	844638	798705	FALSE	10	TTTGTGAGACCTGGCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVKKKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	859613	796814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558
884611	contig_17144_pilon	-	3004	17	Intergenic	novelGene_29347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_12	2164.036993532	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1624	2709	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183407	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
884613	contig_110_pilon	+	5223	5	Intergenic	novelGene_178403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTATGTACATTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73033	242978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_110_pilon_+_75737_151216_151364_154969_155582_160772_160878_241322
884614	contig_4131_pilon	+	2935	1	Intergenic	novelGene_127892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	759	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	1018	1659	300864	301505	NA	25	AACCCGTTGCCGTCGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPAAPATASPAEKTQIKKKARKSTGAAKRKATGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAGGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEAKPKAKKAGAAKAKKPDGTKKPKRPAAATPKKSTKKTPKKAKKPAAAAGVKKVAKSPKKVKAAKPRKAAKSPAKAKAPKPKAGKLKAGKPKKAAPKKK	299846	302781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_299800_302800
884615	contig_9982_pilon	+	1391	12	Intergenic	novelGene_55740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	110.056859834788	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	216	1391	311199	326999	FALSE	30	GTAAGACTACTGAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQ	308474	326999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_308649_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942
884617	contig_5084_pilon	+	2460	19	Intergenic	novelGene_64502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	390	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACACAAAGGCGACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347260	408197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_347565_347972_348126_348371_348483_349383_349481_349949_350027_350978_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383_353471_354824_354907_356009_356185_356695_356837_364477_364588_365262_365380_375773_375975_377892_378045_394664_394775_408021
884618	contig_12938_pilon	+	1545	8	Intergenic	novelGene_99710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	620.043415201463	2	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	117	764	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51946	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
884621	contig_9239_pilon	+	5754	7	Intergenic	novelGene_137190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	789	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1044	1682	214573	215211	TRUE	50	CTACAAAAATTACAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTKLGALIHDRNTIRTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLRSSKDFIKTVKRQPTDWEKIFGYDKSNQHLISKIYKILQNLNNKETNNPVKKWAKDMNWHFTKEDIQAANRHMKKCSQSLAIRETQIKTTMRYHLTPTRLALIKKTQNKKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQRLWKSIWRFLKKLEIEVPHDPAILEYILEKQEPSHE	213529	279130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_218533_218860_218982_234934_235055_235498_235649_235788_235879_240385_240519_278993
884622	contig_11656_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_54031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	68	207	112	318	498483	498277	NA	30	TAGATATTTTGGCAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISHASKLLKIIQKWLQQYIDRELPEIQAEYRRGCGTMDVITDVRQILAKSREYQRDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLKITLQRVGIPEHLIVLMQNLYTDQEAVV	498594	496337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_496300_498600
884623	contig_2798_pilon	+	4669	2	Intergenic	novelGene_120064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	702	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTTCCATCCAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188007	193401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_192616_193340
884624	contig_12079_pilon	-	3000	4	Intergenic	novelGene_67501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	357.22666318304	26	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	398	1555	862522	861365	FALSE	50	TTAAGCACTAATAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	859919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863562_871641_871725_872314
884625	contig_5686_pilon	+	2921	4	Intergenic	novelGene_45475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	226792	227210	TRUE	30	GAGAATAGCAGGGGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGILSEISEQEVQDSSFTELPAGDRTTGNPRYRLSHTPTLLHPHLASSTSCSHSLLAGKHKLPPSVTWIPPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLTSHHLRLLSVKLPC	226791	330206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_227116_227198_228767_230517_231161_329820
884626	contig_5125_pilon	+	2506	7	Intergenic	novelGene_43408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	1356.30069797716	374	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	276	1409	35654	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25617	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_25850_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
884627	contig_6896_pilon	-	4205	2	Intergenic	novelGene_174226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	652	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	900	1670	730040	729270	TRUE	10	TTAGCATTCTTTTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKEDGKDSEEENREKERPASLYPDLTSSSLLAKLPFHSSDSLKIEPLSPLMPLVVRKPKLAGGPVEVTVNPWSKSELRAIVKDFSNPRENPQKFLHELIILTSTYEPGTSDLYNLLHVLLGSGEAARWMAKAKWKDPEASLISKSGVTGKELRDEVQGLVKELINAFPKVFPRKVDWAKIQPCKQEKGENVCAFMDHFSKLFEEHSGLKAIIKEHRPVFSSMFLGGLLPELAALVKRHHLNWENINPSELVTVA	730939	591375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_592526_727884
884628	contig_6445_pilon	-	1757	16	Intergenic	novelGene_76895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	814.018334491852	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	725	1525	77905	43105	FALSE	10	CATTAGCCTTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	91121	42872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_86113_86271_88146_88216_88473_88594_91007
884629	contig_5023_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_7153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365042	363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_363400_365000
884630	contig_9366_pilon	-	2066	3	Intergenic	novelGene_166267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCAGAAGACTTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084365	1038570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1039056_1042462_1044001_1084322
884631	contig_7045_pilon	-	4064	10	Intergenic	novelGene_77475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	135.254492634359	41	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	78	1313	585475	552552	TRUE	55	CGGACAAAATCAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKHALQRDIFTPNDERLLSIVNVCKAGKKKKNCFLCATVTTERPVQVKVVKVKKSDKGDFYKRQIAWALRDLAVVDAKDAIKENPEFDLHFEKIYKWVASSTAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKVWI	590993	466794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_468269_551274_552714_568441_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204_577365_581399_581531_585351_585486_590926
884632	contig_1301_pilon	-	1726	13	Intergenic	novelGene_47312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	690.141667220096	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1644	83	1726	322831	268672	FALSE	60	TTAACAAAAGAGAACGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRG	322913	268671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
884633	contig_4654_pilon	-	5900	4	Intergenic	novelGene_103092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	629	junction_3	722.037087382328	184	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	191	565	500418	500044	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAACAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVRGQCFHLKQCFLNSINFMYKCKL	515980	492928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_500422_515793
884634	contig_10437_pilon	+	2034	2	Intergenic	novelGene_38491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTGGATTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213575	1215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214417_1214528
884635	contig_11285_pilon	-	1943	16	Intergenic	novelGene_5700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	494.790307998135	7	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	15	1754	794634	784252	FALSE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDLKMLHRLLGEQVRALSQRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALPSSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	794648	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787840_789959_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794590
884636	contig_19032_pilon	+	6058	19	Intergenic	novelGene_172519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	56.9641700252595	2279	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	171	704	139993	147826	TRUE	15	GACTCGCCTGGCGCGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAAQGRGGGEAGTAPADCTSSALRWGTGTARMVRRGFPLWAVLGGSRTGPAARLVPMAAEREPGEPGKGKPFKLLGILDVENIPCARDSVLYGSLGSVVAGLGHFLLTSRIRRSCDVGVGGFILVTLGCWLHCRYNYAKLRIQERIAREGIKNKILYESTHLDPQRKQTDRNSSN	139822	166738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_140209_146611_146727_146810_146875_147687_149036_149650_149750_151622_151705_157175_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159393_159618_159746_160163_160284_160593_160862_161306_161416_161874_161972_162546_164751_164837_164945_166606
884637	contig_2703_pilon	+	2459	16	Intergenic	novelGene_101698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1073.39143528041	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	301	1176	559489	603502	TRUE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIAQLRPGAVDTERRDGEGEPGKSISLSQSL	526166	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_596400_599680_599822_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
884638	contig_13542_pilon	+	1816	9	Intergenic	novelGene_131487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1051.13938181385	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	537	1094	464668	505589	FALSE	80	AAAACAACCAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346539	506311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454151_464488_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
884639	contig_15327_pilon	-	4048	4	Intergenic	novelGene_70813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7165	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1425	2027	1449247	1448645	TRUE	20	TAATGTTCCGTTTTTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQPEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGMRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIPEQGEKTENTERIVEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKTGSHIQRRNNKTKLRLFGRNHAGKKAIG	1451348	1400814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1401857_1402076_1402547_1448135_1450358_1451034
884640	contig_8377_pilon	+	5231	30	Intergenic	novelGene_34918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	3065.32730415034	450	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1244	3735	186	3920	68257	197939	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPELLFLFFISAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68071	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180479_183238_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
884641	contig_9538_pilon	-	3793	3	Intergenic	novelGene_176439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72831	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAAAGTCAGCCCTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30586	25884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28676_28764_29562_30381
884642	contig_10948_pilon	-	2521	3	Intergenic	novelGene_124962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	695	1051	218917	218561	TRUE	20	CATTCATCTGTTGATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNILMFWILLRLALWPNMWSILENVPYVLEKKVYLAAVGWSVRYMSMRSSWLIVAFNSSMSWLSFFLNVLSFTGSGVLKSPSTIVELSLSLFSAISVCFMYLGALSSNA	219611	45251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_46452_116766_116899_218422
884643	contig_7056_pilon	-	4935	9	Intergenic	novelGene_43617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_5	701.553978233322	1450	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3565	3930	725582	724627	TRUE	10	CAATTTGTCTTGTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMLGGMGLCKYHFSVFF	731014	721894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724746_725182_725319_725471_725734_725813_729063_730383_730513_730979
884644	contig_2414_pilon	+	4011	9	Intergenic	novelGene_158460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	97.0512107085738	37	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	165	671	219781	230279	TRUE	15	TGGGGGTGCAGAGGGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHTQQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	161608	243326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_161712_170460_170484_219742_219899_228474_228619_230034_233015_237979_238084_240800_240989_242494_242623_243141
884645	contig_12586_pilon	+	1783	2	Intergenic	novelGene_121806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	0	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGACAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55168	57278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_55304_55630
884646	contig_9653_pilon	-	4897	29	Intergenic	novelGene_48214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	487.644552090632	61	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1187	3564	247	3810	540405	507413	FALSE	35	TCATAAAGTTCACCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG	543083	506325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_507485_508175_508283_508928_509107_509263_509456_509787_510001_510109_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513575_513728_516115_516269_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_530278_530455_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_540404_540578_543009
884647	contig_10134_pilon	-	3112	3	Intergenic	novelGene_16214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_2	302	1756	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39865	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_35178_38558
884648	contig_9463_pilon	-	477	2	Intergenic	novelGene_83855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	693	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	54	476	721377	718316	FALSE	30	CCCCAGCCCAATGCAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDITGDIYYFNFANGQSMWDHPCDEHYRNLVIQERGKLSTGAVKKKDKRKKKEKKDKKGKETSKSPLETQPEQGLLPSSSFLRGPSPLPAPGLAGLDLEQEMQARSEGSFKKGKSSCMLGDTPWPLVGTLPSKLQPLSKGQASRTHQIFADVEKILGR	721430	718314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_718589_721227
884649	contig_4388_pilon	-	4720	3	Intergenic	novelGene_161986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3653	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	411	728	1311615	1311298	TRUE	20	ACACGGGTATCTCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRELNRQLRGVSKEEVIRLKQKRRTLKNRGYAQSCRFKRVQQRHVLESEKNQLLQQVDHLKQEISRLMRERDAYKEKYEKLVSSGFRENGSSSDNPSSPEFFM	1313212	1305474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1305779_1307609_1311697_1312883
884650	contig_10990_pilon	+	5389	18	Intergenic	novelGene_7461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	418.184318892368	53	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	1754	3550	722379	752026	FALSE	25	AGTCTTGACGTCGTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDRSLTTRSIWPFLIPDGYKNSPTQLCFNRKAPALYGG	708563	753865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_714557_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751917
884651	contig_13558_pilon	+	1999	3	Intergenic	novelGene_123008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	108.5	995	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	160	1119	40701	41660	TRUE	30	ATCTAATTCCCAACTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36703	43753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655_42340_43552
884652	contig_5039_pilon	-	1619	7	Intergenic	novelGene_65039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_6	160.059103666948	346	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	33	1067	1829000	1802262	FALSE	30	GTTTTTTACAAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRRAERPGAMRLPPLLPLLLLLGGRAVSPHDSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYTASEWDDVSGVNCRKTTETRCDFTAAGLLQGFPRHFNVSLRVQAELGDRVSAWATVPWFQHYRNVTIGPPENMEVAPGEGSLIIRFSAPFDIDTSMVTFEYYVYYWEEAGTRKVKGPVKSNFISLDDLKPLRVYCLQVQAELVWSTQGISLPGNLSNTSCHKTTLDAATKLEQAILTFVGASLSVVLLVGACFFMILRYRGLIKYWFHSPPKIPLQIGEYLKDPAQPILETLDKDSSPKEDAWDSVSIISFPEKEQDARQSTLNQSAGPAQLSPERGH	1829032	1801709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802442_1806310_1806469_1806815_1806976_1810198_1810345_1812911_1813106_1822685_1822819_1828936
884653	contig_11720_pilon	+	2727	13	Intergenic	novelGene_43969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_9	296.878798221317	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	1433	2473	266216	272210	FALSE	30	TATTTATTGAGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262267	272464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_264427_265206_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
884654	contig_20819_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_55652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	292	660	40888	41256	NA	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGKIQEHCGTTRAGAG	40596	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_40600_43600
884655	contig_17427_pilon	-	2674	2	Intergenic	novelGene_30344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2568	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	434	460	179193	179167	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVGESFSLSQAVLVLEPERARTISPTLFLKILKGYTVDLFPFFSQITVRNSVWCSMTWWALWR	179808	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_179476_179657
884657	contig_11594_pilon	-	1790	11	Intergenic	novelGene_80929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	519	920	568297	563623	TRUE	20	AAGTCGCCATTCAGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHNGGYGSTMPKSHRFFRAIKYLLSPKRSSHLRQKARVPKFSLMTFNKCFVLGSLWHVSNIKIFHVMGAFHIIMNHTFSCATKGFNGIHFSFPSLLPLLLSQWALFSQHVFYMAQWNVHLDYGLASLSISTS	568815	540467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_540564_543388_543491_548947_549014_552855_552960_560271_560432_560909_561096_563007_563103_563561_563642_566671_566775_567339_567452_568129
884658	contig_14288_pilon	+	1944	3	Intergenic	novelGene_153843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524461	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_525078_563235_563912_660212
884659	contig_8710_pilon	+	708	2	Intergenic	novelGene_73550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTACGGCGAAAGCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518702	520879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_518754_520222
884660	contig_7357_pilon	-	2505	8	Intergenic	novelGene_36794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_7	1546.87360801834	5034	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	862	1623	154622	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167055	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_155079_159911_160034_166772
884661	contig_17769_pilon	-	1299	13	Intergenic	novelGene_124241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	649	1272	37896	14203	FALSE	10	GGGGACGGCGGCCAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTAARNLCCTCWYSSLCSNIKEESPFFVSSSRIERPGLEYRGQVLLGVVSHMDLGYTRCLCRDLCSPRIARAPKYLFSSVSGFKCLCSTWSTCFLELRGGGPGRANPPLSSILSKMRSISSSPFSKVSPVVLFLFFCFFFFFRSLPLELDCSEAAAFSTPSPSFLVSVFPCLALPLFPETTVSVGMQSDLSPFTTGSSSSSSVFI	43837	14175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_14205_30167_30333_31840_31917_32652_32771_33779_33846_36590_36672_37780_37915_38559_38659_39506_39600_40694_40789_40856_40963_42215_42372_43755
884662	contig_17427_pilon	+	2175	6	Intergenic	novelGene_30278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	220.672245649515	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	489	875	151385	175576	FALSE	10	TATCCTTGGTGTCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYLWKYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147656	176876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151401_171348_171426_172209_172309_173596_173669_175453
884663	contig_7345_pilon	-	2146	2	Intergenic	novelGene_159190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2662	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTCAAACCATGGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297611	294680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_294748_295532
884664	contig_1867_pilon	-	1316	5	Intergenic	novelGene_54523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAACTGGTACCACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221584	213542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_213660_215603_215809_218784_218895_219451_219607_220855
884665	contig_5039_pilon	-	4632	1	Intergenic	novelGene_64763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	922	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	3980	4552	120595	120023	NA	25	CCAGCACGTTAACCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLIQIELKKEKKKKPQTQLLEKRICDDVRGLVTWSSEMTNVSAERETDHVQRPWNKWVPLAHCAAGAQRYWGPVFRRDRGRFLLSQLHKALLGRIFISTTGVTRCQRLWRCRPLGILDLLKDGLGGWLEGGASTAAQIFPRVPLSLGLGAWARKGQESLAKTSHCRVNSNSRRPQVCQSRTVLCRVFND	124574	119942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_119900_124600
884666	contig_10377_pilon	-	6197	9	Intergenic	novelGene_115376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	306	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2609	2953	259131	258787	TRUE	25	AAACAGCTGACCTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEENHSVGFTQLNILNSFSLSYSVKTVYFTQPYASLSLLIAVDSNAPQPHVCRGELGSVGFFNVNNRIFELRPSEQRKSNPCGFVQRSQELGMGRGGAGGKINGARCRLRGR	261739	208822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_209211_219443_219613_227485_227752_240232_240353_245158_245257_251691_251748_252535_252616_255019_255167_256866
884667	contig_8330_pilon	+	1932	8	Intergenic	novelGene_71826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	149.917528348497	978	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	542	1018	855440	856687	TRUE	5	GCCCAGCCTTGGCGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853877	857815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_854060_854995_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
884668	contig_5698_pilon	+	2165	6	Intergenic	novelGene_55035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1535	junction_1	325.96478337391	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATTCATACTATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7733	20809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
884669	contig_10296_pilon	+	4453	5	Intergenic	novelGene_168876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	760	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1345	1704	425785	426144	TRUE	55	AATAAGAGCCATAACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLKAIYKYNATPLQIPTTFFKEMEKLIINFLWTGKKPQISKALLKKNKVGGLTLSDLRTYYTATVVKIAWYWYNDRYTDQLNRTENSDVNPSTYSHLMFNNGPKSIKWGKDSLFNK	424440	435809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_426535_432574_432802_433533_434248_434342_435169_435217
884670	contig_15991_pilon	-	980	7	Intergenic	novelGene_70906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	55	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	545	913	101267	100445	FALSE	15	AAGGTTGTGTTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106356	100377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102234_103595_103703_104975_105142_106315
884671	contig_2799_pilon	-	4269	4	Intergenic	novelGene_85589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	3786	4268	781803	780224	FALSE	25	TGACACTGATTTGACTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGSTPRVLCLSGWLNSVCEKFYLCVSERCCSFLGTLKVLSP	786317	780222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781547_783256_783929_785289_785343
884672	contig_3095_pilon	+	1142	5	Intergenic	novelGene_75165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_4	877.457263916597	8014	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	40	807	220513	226800	TRUE	10	GTCTTTTATTGCATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220473	227313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_227001
884673	contig_16125_pilon	-	3380	16	Intergenic	novelGene_155221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	900.251076089332	572	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	49	1446	236934	151848	TRUE	45	AGCTTACATTAAAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKT	236982	110374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_110914_117149_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_155553_155618_179440_179598_235796
884674	contig_15888_pilon	-	1426	9	Intergenic	novelGene_84410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1502.6340570395	1930	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	32	841	259726	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259757	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251872_251996_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
884675	contig_2646_pilon	+	2207	9	Intergenic	novelGene_69520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	271.843446444824	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	832	1209	566553	573396	FALSE	35	ATAGAAAACTCGCTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554018	574394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560734_565255_565390_566422_566586_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
884676	contig_11117_pilon	+	5319	4	Intergenic	novelGene_148587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTTAGCAAATTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78306	249927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_79179_79227_83132_107141_107663_249905
884677	contig_2414_pilon	+	4717	14	Intergenic	novelGene_158470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	60.2630329148365	1226	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	139	645	219781	230279	TRUE	10	ATGTGGCCCTCCAGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHTQQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	211559	258021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_211660_219742_219899_228474_228619_230034_233015_237979_238084_240800_240989_242494_242623_243141_243326_244212_244317_249399_249516_250628_250703_250828_250946_254277_254370_257791
884678	contig_11986_pilon	-	1198	10	Intergenic	novelGene_69163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	869.38902911793	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	11	1051	544174	507353	FALSE	15	TCATCTTGCGTGTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLMASLQELLHPADRELVSKESCLRGGSWQHWRHGRQPQGRGAQAGPRAAEREGARGLRLRGHRLDPGADAEEGHEAGLRVQHHGGRAERLGEIHPNQHPLQIPNQFRADIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	544184	507205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518588_519123_519181_523616_523809_544112
884679	contig_15021_pilon	-	3541	1	Intergenic	novelGene_26955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	134	526	243158	242766	NA	30	TTAAACAAGTGGTTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHVRRPPGWTPSSWGYSLRLSSPSCSHRRKSGLICASLTSQKESADTMDPGLGRARVYLCPVDGVGCPPAGWTISSPEERVKGQFTTQESKGERGTWAALTTQISWVGVVRAQQGVSVWPIWEQRRSWR	243291	239750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_239800_243300
884680	contig_4388_pilon	-	1415	1	Intergenic	novelGene_161993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAAAAGTAAATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310605	1309190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1309200_1310600
884681	contig_15327_pilon	+	1286	4	Intergenic	novelGene_70429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.60202482691	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	102	386	36170	53675	FALSE	10	CACTTCAGCCTCTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALAASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEVPCLSPLSMGRYRRRTVRKPRLRRQPQRAPGQPWGEPPPVTPVRS	36068	54575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36317_51741_51783_53348_53442_53671
884682	contig_13021_pilon	+	2157	12	Intergenic	novelGene_8136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2699.29153239503	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	316	1854	175996	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPNLRRNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174505	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176020_176617_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
884683	contig_16310_pilon	-	1747	11	Intergenic	novelGene_70046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1216.67006209572	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	136	1716	66135	56200	FALSE	30	AAAGTCCTAAACTCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYKGKQNVLS	66270	56168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56231_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
884684	contig_7171_pilon	+	1710	9	Intergenic	novelGene_101335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_2	83.216491003887	16	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	686	1573	1302218	1315309	FALSE	15	AACCTGCTGACCTTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSGIDLTDIASGLLQPPGDDVARKSWYLRNIITRYQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAQDAFFQVKEVDIGLAADVGTLQRLPRVIGSQSLVNELAFTARKLMADEALSSGLVSRVFPDKEALLDAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1301532	1315446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1302379_1302523_1302613_1313328_1313454_1313533_1313583_1313761_1313827_1314388_1314460_1314547_1314620_1314874_1315026_1315204
884685	contig_3948_pilon	+	3601	3	Intergenic	novelGene_53290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	54	380	1423728	1424054	TRUE	25	GTAAGGTGTCCAGTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLMRQPHTWPCWALTDDNEDHTEELNARAQQGAEDHGVLGWPEDITMHQLPSRLFHGVFLQQRAGVNVVLRGGGRSCRHHPQTGAKGPSSVNQPLSEQSENTGMSVI	1423674	1428882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1425383_1426895_1427004_1427097
884686	contig_11160_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_168844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321107	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_321100_322400
884687	contig_1385_pilon	-	4010	3	Intergenic	novelGene_178404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGAAGTTGCTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169875	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1385_pilon_-_16117_17207_18503_168853
884689	contig_16882_pilon	+	649	7	Intergenic	novelGene_148209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	144	380	182696	187537	TRUE	40	ATCAAAACCTCGCGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSLFSHFCLQLKLWELKINILARELLIHTRKSFNLVFHIVLLCFVQMNFYKPAAIQFYTDSLANNFTWEDQVFKDCIVHGCQSTAPGTLLLIFCSTFSSWFRQNSPLSNKDNVLSTELFLQFTY	181937	189490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_182043_182657_182811_186960_187028_187482_187624_188682_188755_189057_189142_189463
884690	contig_10003_pilon	+	4399	1	Intergenic	novelGene_88137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369471	373870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_369500_373900
884691	contig_9363_pilon	+	541	3	Intergenic	novelGene_6617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	3.5	696	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCCGTGTCCACCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856521	857553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_856806_857115_857159_857339
884692	contig_4924_pilon	-	9988	13	Intergenic	novelGene_84643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1108.32482139589	316	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	24	1385	252576	69027	TRUE	15	AATACTTGTTTCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGMQKKPS	252599	60050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_60763_60854_62869_63149_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
884693	contig_3153_pilon	-	3545	17	Intergenic	novelGene_104621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	91.1392950035823	96	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	2520	3233	141160	39293	FALSE	25	ATCAGTTGGATTCCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNITTDPTEIKRIITECYEKLYSNKFENLAEMDKFLETHYLSKLTQTEVEQLNKPVTKEEIEEVIKKLPTKKKKSPGSDSFTGEFYQTFKRRINTSTTKGISEHRKYGILPNSFYEASITLIAKPGKDATKKENYRPISLVNIDAKILNKILSIRIQQHIKKIIHHDQVGFISTMQGWFNIRKTINVIHHINKTKENNHMILSIDAEKAFDKVQHPFLIKKNFQQNRNRKEIPQYN	247701	38980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_39655_75566_75572_140813_141185_162529_162940_203812_205002_206345_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212283_214487_214583_217133_217170_217855_217937_221159_221226_224955_224999_229052_229138_233949_234037_247618
884694	contig_13558_pilon	+	3813	2	Intergenic	novelGene_123005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	2627	3586	40701	41660	FALSE	85	TAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36703	41887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_37383_38753
884695	contig_5153_pilon	-	3543	2	Intergenic	novelGene_74389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAGGAGCTGGCACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995145	991445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_994877_995033
884696	contig_6871_pilon	+	3808	1	Intergenic	novelGene_21567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1066	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTAATGCCTGTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123179	126987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_123200_127000
884697	contig_10054_pilon	-	3943	1	Intergenic	novelGene_171205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTATTTGCTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38846	34903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_34900_38800
884699	contig_8576_pilon	+	3492	8	Intergenic	novelGene_88777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	366.077832696596	1729	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	79	1527	893619	915551	FALSE	30	GTAGAAGACCTGCAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893540	917516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
884700	contig_10126_pilon	+	5272	1	Intergenic	novelGene_105735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	125	310	149459	149644	NA	20	TGGCTGCAAGGAGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVYFGKFQTCKIRKNDLTNSSYHSPPSLFHLPLALLGHCEMNTRHHGSSHPSVLQCASLNVHHNLILTMSQEAWSPPPHFTDKETEAPQSQLGLLLKPHSW	149334	154606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_149300_154600
884701	contig_5033_pilon	-	2672	6	Intergenic	novelGene_28905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	1245.1363941352	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	49	879	477189	450673	FALSE	40	GCCAGAATACTAAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESESAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477237	448879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_462973_463031_464547_464983_477113
884702	contig_1150_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_61414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	99	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
884703	contig_4732_pilon	+	2243	14	Intergenic	novelGene_75437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	561.957788639874	587	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	383	1987	653092	675284	FALSE	15	AAAGCTGCTTGGCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGQTMERIGSGVERMGAGMGFGLERMAAPIDRVGQTIERMGSGVERMGPAIDRMGLSMERMVPAGIGAGLERMGPVIDRMATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634976	675540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_672214_673018_673616_673669_675120
884704	contig_3081_pilon	+	666	5	Intergenic	novelGene_133959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	65.3069674690228	657	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGTTTATTAATGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107775	1191688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1107914_1110062_1110133_1129274_1129365_1178703_1178795_1191411
884705	contig_5643_pilon	+	1303	11	Intergenic	novelGene_38850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3957	junction_1	1692.65827620344	21583	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	90	1091	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233883	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
884706	contig_18096_pilon	+	4230	13	Intergenic	novelGene_58036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	652.962112862097	2160	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	69	1253	40382	70561	TRUE	40	TATTAAAATCAATGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQLMGLLAQPVKMCSATRW	40313	79111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69617_70507_70663_71982_72130_75381_75507_76507
884707	contig_13633_pilon	+	3097	15	Intergenic	novelGene_15313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	456.734795553599	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	247	1647	20259	49142	TRUE	10	TACATTTCCTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5032	51759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_15073_15274_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019_50312_51478
884709	contig_18850_pilon	-	7971	14	Intergenic	novelGene_142416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	79	624	189818	186855	TRUE	20	CACGTCAGCACGACTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGFRGGEAEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEDEEEEEEDEELELELLERLFLLAGVGSWGRPSRTASFGAGAGLGTLFRATSGCGGRLEPSESLELEPEEEEDEEEEEDDEDELEDDEDEDELRRSFVGCREASAGACWAPAEAGSSPPSGWNTPGAGPESMLLWSPAEDVVLATVPEEKA	190198	171837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_171939_175234_175507_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513_184082_184228_187171_187886_188087_189788_189842_190143
884710	contig_5031_pilon	-	3144	2	Intergenic	novelGene_133183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	195	422	25850	25343	FALSE	15	TTGATGTGCTTTTCCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDRFTGEFYQTFREELTPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEASITLTSKSGKDTTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQQHIKEIIHHDQVGFIPAMQGWFNIRKTINVIHHINKTKHKNHMILSIDAEKYLYLQMT	26044	22620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_25367_25646
884711	contig_4845_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_53695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCTCTATCAGAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904835	903233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_903200_904800
884712	contig_3727_pilon	+	841	6	Intergenic	novelGene_146740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	355.636106153467	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	21	416	300452	307872	FALSE	25	ACCTGGACTGCCTCTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEVGRSKHCLWPRISATLAAI	300431	308297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307812
884713	contig_12635_pilon	-	2490	11	Intergenic	novelGene_60803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	473.302493126753	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	378	1490	227344	180251	FALSE	25	ACCATGTCACGTTTTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262766	179250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_231544_231645_262590
884714	contig_15720_pilon	-	3548	5	Intergenic	novelGene_41856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1905	2360	307437	306982	TRUE	55	TAAATAAAGGAGGGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	368738	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_80259_111957_112532_306359_306700_306888_308160_367556
884715	contig_4364_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_52	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCCAGCCGAGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611879	613971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_611900_614000
884716	contig_13674_pilon	-	7156	2	Intergenic	novelGene_140299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3507	3923	10882	10466	FALSE	65	AAAAATTATTAGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMGFRSSGPPFLHRWDEWDEPPAFLLCCSRPCPETSRGVVDRRVGGRQSAREAYKARCNLFSLLSAKVLEGRNQQSLKFPQCREGSHCGQTCPSIESLTQRLFPKFLHLGSAWEAEGVDTQLCEDRHSPLPGLNPVY	14623	7232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_13158_13392
884717	contig_8027_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_158852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1151	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGCAGAGAAAAACGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462974	464065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_463000_464100
884718	contig_7151_pilon	-	832	4	Intergenic	novelGene_40796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1370	junction_2	187.172528848535	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	73	525	536425	529189	FALSE	35	ATAATACAATGTCTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	536497	528881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388
884719	contig_1986_pilon	-	2634	5	Intergenic	novelGene_64144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_4	491.378418329499	1656	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	118	591	410391	384418	FALSE	30	AGTAGAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSPPLSNTAAAPHRGDRGFPLAAAAAGRVPPRPRPAAAMQFMLLFSRQGKLRLQKWYVPLSDKEKKKITRELVQTVLARKPKMCSFLEWRDLKIVYKRYASLYFCCAIEDQDNELITLEIIHRYVELLDKYFGSVCELDIIFNFEKAYFILDEFLLGGEVQETSKKNVLKAIEQADLLQEEAETPRSVLEEIGLT	412783	382374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_384466_402862_403001_403608_403718_410212_410392_412666
884720	contig_5623_pilon	-	5754	20	Intergenic	novelGene_154795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.97146010013	5	114	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	78	1418	213916	209309	TRUE	20	TCACTTATTTCCTTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGGPGPSHRGVHPFLCWLLCGHLCAGHRRSAQ	214731	202206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_202719_203157_203341_204071_204125_204298_207309_207497_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210043_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212515_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681
884721	contig_8263_pilon	+	1191	7	Intergenic	novelGene_83082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	173.107866179828	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	166	1137	180047	192899	FALSE	85	CGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELRAHLCSILLHQGPGHRHLCFVGNLQGLPCSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	129431	192953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_129530_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
884722	contig_10953_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_42607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCACTGGAACTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464211	465899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_464200_465900
884723	contig_6724_pilon	-	3286	2	Intergenic	novelGene_167958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1552	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2789	3118	178357	178028	FALSE	45	TGTACCCAGCAAATAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQPGYKTVSGSCMSTGFNRAVKTHSSEFFKADGSLKEVHKINEMYASLQEELRSICKKVEHSERAVEKLLEDVNRLKQEIKKRKQAQIQVAGEKNVPEEPQENTSLC	235729	177859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_180106_234689
884724	contig_10003_pilon	-	4290	1	Intergenic	novelGene_88136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAAATTAGTCATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373761	369471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_369500_373800
884725	contig_14666_pilon	+	3130	5	Intergenic	novelGene_39601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	62	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	86	1204	477340	484940	FALSE	25	TAGCTAAATTGCTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESNTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	486866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483930_484166
884726	contig_11978_pilon	+	546	5	Intergenic	novelGene_63083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	46	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	4	546	1829081	1831841	FALSE	35	ATCATCAAGACTCTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEE	1829077	1831841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
884727	contig_1450_pilon	+	3180	22	Intergenic	novelGene_27390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	523.21265994655	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	147	2630	308979	355748	TRUE	5	TTTATGTGGCCTGTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEAVYRYLVSPCLPLRKKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	299058	356340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_299115_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589_355964_356005
884728	contig_15327_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_70680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	166	621	901987	901532	NA	75	CCTAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRTAAVGNRVTGGGGCSPTGVGCGRDGSFLGLQAVLRFYSWPGGDAAVPAPDSGHPGSARRGREVTPPCSPSPGGGCCFAQPESLGEWGRRLGHLPPQGGVQGGGRGRWRPVLNSAGARGRAWPPAAPAASGRGPGWRSARLHSRDSVLR	902152	900444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900400_902200
884729	contig_6576_pilon	-	3584	11	Intergenic	novelGene_42256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	726	junction_8	374.971265565776	1850	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	130	1524	339439	322526	FALSE	45	CAAAATTATGCAAAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339568	320465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
884730	contig_19378_pilon	-	4048	2	Intergenic	novelGene_73773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2842	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	217	801	18938	18070	FALSE	20	CTGGAAGGCTCACCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYGRPPPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVRFHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRSRSRSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	19154	14822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_18353_18636
884731	contig_1725_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_24305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1269	1580	232755	233066	NA	35	GAAAAAATCTTTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARPYQVLIDWFKSRKIRVNFKVTTKKVNKPTHQIKKKNKVSVKTKPTKTKEMKKKSTNKRNSAQESKRNKESVSTTKKKVLQDVVPLLGIYPGEIRAVT	231486	233886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_231500_233900
884732	contig_15013_pilon	+	3405	3	Intergenic	novelGene_178405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAATTAGTGAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28185	43801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15013_pilon_+_29601_41509_42417_42718
884733	contig_9633_pilon	-	1458	6	Intergenic	novelGene_139639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1065	junction_5	712.702911457502	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	302	718	1141485	1138462	FALSE	70	AAGAAGTTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRKVVDYSQFQESDDADEDYGRDSGPPAKKIRSSPREAKNKRRSGKNSQEDSEDSEEKDVKTKKDDSHSAEDSEDEKEDHKNVRQQRQAASKAASKQREMLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1150207	1137721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737_1147844_1150154
884734	contig_14890_pilon	-	1950	9	Intergenic	novelGene_122521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_8	1192.72984551197	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	593	1408	370199	366814	FALSE	0	TGCTTTTGTCTGTTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCRVFIGRLNPAAREKDVERFFKGYGRIKDIDLKRGFGFVEFEDPRDADDAVYELDGKELCSERVTIEHARARSRGGRGRGRYSDRFSSRRPRNDRRNAPPVRTENRLIVENLSSRVSWQDLKDFMRQAGEVTFADAHRPKLNEGVVEFASYGDLKNAIEKLSGKEINGRKIKLIEGSKRHSRSRSRSRSRTRSSSRSRSRSRSRSRKSYSRSRSRSRSRSKSRSVSRSPVPEKSQKRGSSSRSKSPSVDRQRSRSRSRSRSRSVDSGN	371188	366271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14890_pilon_-_367079_367168_367280_367777_367852_369070_369141_369436_369536_369684_369756_370073_370219_370322_370689_370981
884735	contig_8317_pilon	-	980	2	Intergenic	novelGene_19332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAACGGCGATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17249	16170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
884736	contig_13723_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_178406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGCGTCCAAACTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33291	35228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13723_pilon_+_33300_35200
884737	contig_12644_pilon	-	6502	15	Intergenic	novelGene_44472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	561.095798324991	806	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	8	1759	1151228	1025737	TRUE	25	AGTGTGCAGTATCCTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQEKKQAPTNHLLFIFFWILKIFIICPLVLVLFYFRQMALFYLQ	1151235	1012976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1013477_1017033_1017461_1021920_1025865_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
884738	contig_14744_pilon	-	1155	3	Intergenic	novelGene_66161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	95.5	1229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	62	847	1702872	1695288	FALSE	15	GTGGATCTGAAGCCGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVSRAASVSPLLPLLLGLLLLSAPHGGSGLHTKGALPLDTVTFYKVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKDNYPVFYLFRDGDFENPVVYSGTVKFGAIQRWLKGQGVYLGMPGCLPAYDTLAGEFIKASGKEARQALLKQGQDTLANVKETEKKWAEQYLKIMGKVLDQGEDFPASEITRITKLIEKNKMSDGKKEELQKSLNILTAFQKKGAEKVEL	1702933	1694979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1695791_1697721_1697861_1702728
884739	contig_11574_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_64038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304896	303202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_303200_304900
884740	contig_15866_pilon	+	3332	9	Intergenic	novelGene_63670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1036	junction_2	323.902377268213	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	2126	2662	620763	633133	FALSE	15	CTAAGTGTGGCTTGGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	606347	633803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
884741	contig_11160_pilon	+	1919	3	Intergenic	novelGene_168820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	294	1259	318478	320483	FALSE	60	AAAAAAAAAACATTGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLKEPSGGGGTALLNKENKFRDRSFSENGERSQHLLHLQQQQQQKGSGGGSQINSTRYKTELCRPFEESGTCKYGEKCQFAHGFHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNADERRPAPSGGRLRGPAQLQPALPASATAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318184	321143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319714_320246
884742	SIRV6	+	1216	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	53	-441	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	30	AGTCGATTATTGCCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884743	contig_7904_pilon	+	2907	1	Intergenic	novelGene_160030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCAGCACGTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482657	485564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_482700_485600
884744	contig_14666_pilon	+	1873	1	Intergenic	novelGene_39644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAATAGCTAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484986	486859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485000_486900
884745	contig_6272_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_160457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	334	633	185988	185689	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQPEFSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNCNSQKKDQIYWPKGDWKNPESMTPRYPFSSAVKSLPRLTVQPGIGQPHKTKWD	186321	183449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_183400_186300
884746	contig_6102_pilon	+	1235	12	Intergenic	novelGene_31776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	179.959315879731	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1092	142	1233	350018	357065	FALSE	75	AACTCAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASR	349876	357067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038
884747	contig_678_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_167811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	990	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCAATCACTGTATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116335	118466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_116300_118500
884748	contig_755_pilon	-	4164	4	Intergenic	novelGene_119760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	66.3777071011044	808	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	53	664	88997	83959	FALSE	25	TACCACTCTCTGTACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	80458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87817_88876
884749	contig_10904_pilon	+	2574	2	Intergenic	novelGene_22479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1839	junction_1	0	46	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	90	1058	149100	150068	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	146138	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097
884750	contig_10009_pilon	-	6464	2	Intergenic	novelGene_82743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2486	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTTCCATGTGTCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79185	72680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_72940_72980
884751	contig_4876_pilon	+	2129	6	Intergenic	novelGene_137912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2210	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCCTCTTGGTGGTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622335	654208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_623681_625917_626034_629226_629302_631879_632053_633365_633521_653943
884753	contig_10126_pilon	+	5717	9	Intergenic	novelGene_105722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	1612.80535384001	79	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	114	1184	140715	166639	TRUE	60	TATAAAGATAATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRKTSLRKVEPGAQPLGSPRQRVHSLPAGVAAQPRLMGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139718	188404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_140705_140794_161932_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074
884754	contig_15165_pilon	+	643	1	Intergenic	novelGene_145300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCCTCACGCCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447	1090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_400_1100
884755	contig_7410_pilon	+	5329	4	Intergenic	novelGene_106076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3926	4225	487474	487773	TRUE	30	CAGCAGTATGGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQVGCVFFVVCSSVGTILFTSFSNGHGWSLRYGTAGQVQLKGSCWDELFVARTRADSVDRVSGGQVPVGCACAPWDCDVQRMVQVGRKEGVDCDVWS	387159	576246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_389078_389120_389538_485883_488313_575681
884756	contig_6076_pilon	-	6078	2	Intergenic	novelGene_81732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2507	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACACTCCAGGCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55868	49667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_53628_53750
884757	contig_11422_pilon	-	1383	2	Intergenic	novelGene_99060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2265	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1369_1506
884758	contig_817_pilon	-	893	2	Intergenic	novelGene_132480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCCTTCCCGGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724585	723549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_723601_723743
884759	contig_13004_pilon	+	6091	10	Intergenic	novelGene_112583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2055	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAACAAAAACAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11375	46029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_15058_18268_18369_21458_21554_22899_23046_23625_23686_24944_25047_25927_26037_41329_43008_45819_45889_45979
884760	contig_3956_pilon	+	2959	14	Intergenic	novelGene_15045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1105.44001788251	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	81	2435	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1283804_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
884761	contig_7182_pilon	-	2680	6	Intergenic	novelGene_117096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	366.030381252704	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	635	988	174826	92559	FALSE	20	AGTGCATTTTGGTGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNVPADMINLRLILVSGKTKEFLFSPNDSASDIAKHVYDNWPMDWEEEQVSSPNILRLIYQGRFLHGNVTLGALKLPFGKTTVMHLVARETLPEPNSQGQRNREKTGESNCCVIL	175748	90866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347_102457_174799_175337_175624
884762	contig_1076_pilon	+	2359	5	Intergenic	novelGene_101114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	72.5857251806442	1258	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	542	847	91600	132125	FALSE	80	AAAAAAACAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQEAKPSTEDLGDKKEGEYIKLKVIGQDSSEIHFKVKMTTHLKKLKESYCQRQGVPMNSLRFLFEGQRIADNHTPKELGMEEEDVIEVYQEQTGGHSTV	91058	133637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_91612_116257_116333_118268_118347_125340_125413_132056
884763	contig_4105_pilon	+	3828	15	Intergenic	novelGene_21486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2476	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	527	874	98626	98973	TRUE	40	AACGCAAAGGACCCGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAAANKPAPLHGWTGSSLGLMGERLANKRPRCHFSAGTRIPPTKLTRTKAHIKAGNLSYCVARETRTLLNSSLHHHLFSQGKLKNTHTHTHWSRPHYKSKHWCGIIRQKEMCF	98099	137465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_100234_100868_100941_101402_101510_102097_102154_102710_102927_104164_104264_105789_105944_108688_108870_108973_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121988_137436
884764	contig_5988_pilon	+	2734	11	Intergenic	novelGene_16087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1942.81719160605	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	395	1108	1218380	1224777	TRUE	10	TTAACCTTTTTTCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210202	1226929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225953_1226478
884765	contig_20140_pilon	-	1808	3	Intergenic	novelGene_170558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	514	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCAATTTCCGGCGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34117	31216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20140_pilon_-_31273_32030_32100_32434
884766	contig_11512_pilon	-	4795	4	Intergenic	novelGene_43317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_3	236.265857786426	1175	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCTCCAACAGACGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419195	397077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_401252_401723_401866_409314_409576_418977
884767	scaffold_13553_pilon	-	5708	1	Intergenic	novelGene_73747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	521	820	18410	18111	NA	55	TGCCAGAAGAAAGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTAIVQTAQMRKPAPLPVSPGPTLSHRTHCWWGGPSGCTLGAQLGSVEKGALGLRALQPGLPTAPPEQEDSGLLPGSQTHGEWQLECLIFYNCLPVFL	18930	13222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_13200_18900
884768	contig_7356_pilon	+	4037	12	Intergenic	novelGene_60404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2414	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	914	1261	463340	476139	TRUE	45	GTTAGGAATACATGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGWMARVLHFHSLMIPVGSSSVRLFPESCIYWKGYLTGGSKILLFFVSFCLHVKALPEEPLNCGHSFLMCPSRPQIKQRFSLKSLSSCLFHFSNGGLRSLSLPRSTAGLTGLVF	462426	489081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_463445_473369_473436_475962_476290_479029_479145_479854_479948_480030_480083_482348_482528_483360_483436_483606_483721_484518_484608_485069_485173_487275
884769	contig_5210_pilon	-	2346	3	Intergenic	novelGene_65435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	515	877	477576	477103	TRUE	30	ACAGGGACGCTGAACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFIREVTGSTQYQDQEACSRSLECTPEVESTSLPSSLQDSRFSSLAPPISAQRHPTPLGSLLPEGSQPPLLEGSACPLLPPCSMGLEAHQAVLFQSPASSSLLPLLAVSSVIALSPGV	478090	475288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_475467_475811_477332_477442
884770	contig_5023_pilon	+	2959	15	Intergenic	novelGene_7172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	2175.58658287641	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	344	1648	607279	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	538663	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538780_540482_540573_580791_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609639_618636_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
884771	contig_14322_pilon	-	461	1	Intergenic	novelGene_115676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGACCTGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671592	671131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_671100_671600
884772	contig_4486_pilon	+	2107	12	Intergenic	novelGene_38586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1368.69407504905	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	660	1094	399314	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311783	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377423_389972_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
884773	contig_14142_pilon	-	1282	4	Intergenic	novelGene_120635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_1	297.998135713781	48	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	15	638	622870	620914	TRUE	25	AAGTCCCCAACTCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQVCRSSVRAWVSGLRGGGRTRGACGGREEGNDRRKRGYLVLAVCCHPSFSLPIEVSSSDYLNLHSASFPICPQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	622884	620098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621531_622762
884774	contig_16103_pilon	-	1018	2	Intergenic	novelGene_118712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6587	junction_1	0	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	162	341	199173	198994	FALSE	20	TGGCCAAGTCTACACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPRAGLLDRARYKAGLRDGPRYQAGPAETRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPVSGPLPQTPSSSL	199988	198316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_199195_199848
884775	contig_10861_pilon	-	3635	16	Intergenic	novelGene_39223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	326.476679446208	25	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	97	2679	611251	583577	FALSE	35	CTAAATTTAAAATCGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSAEQDNRFSNKQKKLLKQLKFAECLEKKVDMSKVNLEVIKPWITKRVTEILGFEDDVVIEFIFNQLEVKNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRERKRSHSRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	611611	582620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763_590875_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611258_611521
884776	contig_2834_pilon	+	1455	6	Intergenic	novelGene_27976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_1	2002.52746298272	24	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	97	672	274763	290707	FALSE	50	TTTACTGATAAATGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238712	291490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
884777	contig_6576_pilon	-	1854	2	Intergenic	novelGene_42442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTCTGATTGCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304281	1302296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303807_1303937
884778	contig_13863_pilon	+	2762	12	Intergenic	novelGene_42067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	376.227313914789	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	1102	2451	474588	490279	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455698	490590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_459244_460117_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
884779	contig_6533_pilon	-	6903	7	Intergenic	novelGene_114606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1299	1919	99485	98865	TRUE	65	TACATATATAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQLTISKHLQKQDRMVPVGIQNTTPDDFPVEEKALELPAGEFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNARRNSQIEIIQKQQLEIQNINNKISETDSVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHKRGSLKTADRKLPQYHER	100925	1850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_2239_3153_4644_64089_64452_95623_97341_97837_99693_99769_100268_100332
884780	contig_2377_pilon	+	2395	2	Intergenic	novelGene_67918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	212	763	269838	271018	FALSE	50	AGTAAAAAGTAACTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLAIFMRLSISLPPSLFLSLAYLISFISQKRLI	269626	272650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_270293_270921
884781	contig_11227_pilon	+	4329	3	Intergenic	novelGene_163204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2749	3054	309931	310236	TRUE	25	ATATATGTCTGAGGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPPTLLNLSVSSSRFLVESLGFSMYSIISSANWDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRRAAKGHPCLVPVFKGNVSSLSPLRMMLAVDFA	307128	311571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_309535_309588_310712_310771
884782	contig_7843_pilon	-	3632	3	Intergenic	novelGene_152055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	20.5	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTCTCAATTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547593	541494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_544856_547249_547466_547538
884783	contig_5686_pilon	+	3402	4	Intergenic	novelGene_45226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2724	junction_2	899.807757245958	851	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	58	510	93843	172616	FALSE	20	ATCCAGATATTCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLVGTIPSLGC	93785	175508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507
884784	contig_4103_pilon	-	3321	14	Intergenic	novelGene_51963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1574	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2833	3282	167154	165416	FALSE	15	CAGTCCCCAAGTCCCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTGNGLGRDVTTKHMALEHTAVFVTRHKSEIPALGAAHAPYTDVHQRLAVDQTVVQGIHQAHGILLQDHQHVLALTPGAIWELAPAAGLGQLLDAVINRNAALSWCQILLGYLYPAQRTDCKALSPWLHALDVGFLTVPGQGVTPVQ	175924	165376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_165428_166011_166073_166256_166404_166519_166647_167051_167168_167307_167393_167658_167744_168007_168122_168255_168450_169944_171357_171514_171640_174221_174429_175195_175304_175435
884785	contig_408_pilon	-	3269	9	Intergenic	novelGene_84906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_2	872.154650492102	2248	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	35	1078	233759	133511	FALSE	20	CAAGGTGAATCCTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INELSHVQIPVMLMPDDFKAYSKIKVDNHLFNKENMPSHFKFKEYCPMVFRNLRERFGIDDQDFQNSLTRSAPLPNDSQARSGARFHTSYDKRYVIKTITSEDVAEMHNILKKYHQYIVECHGITLLPQFLGMYRLNVDGVEIYVIVTRNVFSHRLSVYRKYDLKGSTVAREASDKEKAKELPTLKDNDFINEGQKIYIDDNNKKVFLEKLKKDVEFLAQLKLMDYSLLVGIHDVERAEQEEVECEVNDWEEEGESDGTHPVGTPPDSPGNTLNSSPPLAPGEFDPNIDVYGIKCHENSPRKEVYFMAIIDILTHYDAKKKAAHAAKTVKHGAGAEISTVNPEQYSKRFLDFIGHILT	233793	131319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133592_136727_136832_138499_138744_147687_147802_167538_167578_181038_181186_209757_209911_232035_232133_233694
884786	contig_7182_pilon	-	2631	4	Intergenic	novelGene_117132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2716.9403134163	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	690	1115	888888	887056	FALSE	35	TATTAGTTAAATGGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889834	885539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888912_889168
884787	contig_18869_pilon	-	3862	4	Intergenic	novelGene_55973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	22.6274169979695	7	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1625	2167	53041	52499	TRUE	35	TAATAACATTAGTCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	70529	49543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_49889_51148_54359_64018_64182_70385
884788	contig_4857_pilon	-	4503	19	Intergenic	novelGene_48709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	2265.90464655597	3859	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	453	1928	1249503	1178809	FALSE	20	CTGTGTGAGTAGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTAVRGGAASDSFGSSSNGSRSRSHTHFAAPFASPAGPLAQGLSSSPSEILQELGKRGTQPQPGASPPAAPPAPIPTDSPGETDAFGNCEGKEPVAAGENKIKQGLLPSLEDLLFYTIAEGQEKIPVHKFITALKSTGLRTSDPRLKECMDMLRLTLQTTSDGVMLDKDLFKKCVQSNIVLLTQAFRRKFVIPDFMSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1263941	1176233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122_1243253_1249432_1249555_1249909_1250007_1263360_1263555_1263831
884789	contig_7119_pilon	-	5336	6	Intergenic	novelGene_40881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2915	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	4108	4854	139626	138880	TRUE	15	GACGGCCCACACCTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	146162	127411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137096_138706_142347_144127_145036_145135_145295_145842
884790	contig_16724_pilon	-	1592	6	Intergenic	novelGene_105301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	831.717596302976	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	201	599	569099	560985	TRUE	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWSFSRPAAGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRSSLGTLQQAQGVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEVNPSSWQAKKRALYE	575966	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_560939_561029_567591_567766_568918_569140_575806
884791	contig_9243_pilon	+	1984	9	Intergenic	novelGene_60314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGCCACCTGACTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18785	64639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_20197_21196_21260_25151_25222_27303_27384_32836_32915_34500_34613_45078_45124_47702_47765_64576
884792	contig_16775_pilon	+	7018	36	Intergenic	novelGene_107758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.230922496595	2305	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	59	1648	130341	174136	TRUE	0	CTTGGCTGCGCGTGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLSRQSCRYRRYRASTSVAAAAASRSFPFAAPARCSFPVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130282	235743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130462_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984_177585_178276_178355_179106_179257_181580_181663_187781_187849_188395_188494_189713_189783_189871_190186_191684_191786_209277_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219484_227459_227558_227944_227994_228445_228563_228979_229024_231987_232055_233245_233307_233399_233474_235686
884793	contig_2799_pilon	+	6596	2	Intergenic	novelGene_85513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2320	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	13	366	607766	608119	TRUE	25	GGTAAATTGCTGTATTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSEMTPGAEVSAKEYFSILKQKQTQTKCMIPRACCVNSKAQESIFQMHSVTPLFSSEMPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVVSGINKSVWAQNVLSLFCCI	607753	649003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_613333_647986
884794	contig_3018_pilon	-	3984	22	Intergenic	novelGene_78824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_21	548.601813807956	2633	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1142	3426	558	3983	600079	545174	FALSE	35	GAAGTTGCACACCCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKREKRREQALERISTAKTEVKTECKDAQIVSDAEVIQEQAKEETATKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRTVSMCSDIQPSSPDIEVAAQQNDIENAVLAIEPETETAVAEIIPETEVPALNKCPTKYPKTKKHLVNEWLSEKNEKTGKPSDGLSERPLRITTDPEVLATQLNSLPGLTYSPHVYSTPKHYIRFTSPFLSEKRRRKEPTENISGSCKKRWLKQALEEENSTILHRFNSPYQERSRSPTVNGESKSPLLLNDSCSLPDLTTPLKKRRLYQLLDSAYSETSTPTPSPYATPTHTDITPIDPSFATPPRMKSDDETYRNGYKPIYSPVTPVTPGTPGNSMHFENISSPESSPEIKRRTYSQEGYDRSSTMLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLID	625142	545172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_545699_545829_545887_546200_546452_547000_547146_547311_547567_550198_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
884795	contig_12427_pilon	-	1601	5	Intergenic	novelGene_40453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2476.25554012505	4	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	121	633	316061	314393	FALSE	15	GCTGACAGTTTGGACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	320417	313424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_320314
884796	contig_6096_pilon	-	4500	3	Intergenic	novelGene_178407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTGTTTGGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169458	3724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6096_pilon_-_4657_9307_10180_166762
884797	contig_11422_pilon	-	2257	2	Intergenic	novelGene_99011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
884798	contig_12951_pilon	+	588	2	Intergenic	novelGene_68182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1022	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTGGGGGCAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398728	400242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_398752_399677
884799	SIRV6	+	2109	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	0	-140	0	140	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	383	12	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8999	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_9000_11100
884800	contig_755_pilon	-	1884	4	Intergenic	novelGene_119762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	66.3777071011044	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	53	664	88997	83959	FALSE	30	TATATATGGCTCTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	82738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87817_88876
884801	contig_12790_pilon	-	2674	2	Intergenic	novelGene_35279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438693	408846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_409843_437015
884802	contig_8546_pilon	-	3097	2	Intergenic	novelGene_178410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTTCACCATGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303493	241490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8546_pilon_-_242959_301864
884803	contig_7056_pilon	+	2347	14	Intergenic	novelGene_43611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3021	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAGAAATGAACAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721891	731004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725318_725471_725606_725661_725733_725812_726013_726761_727079_728560_728706_728906_729066_730386_730520_730987
884804	contig_6076_pilon	+	3230	2	Intergenic	novelGene_81735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCTTGGCTCCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52538	55868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_53627_53726
884805	contig_6418_pilon	+	6763	13	Intergenic	novelGene_81246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2177	113	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTAGTTATCTAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447687	1853357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1450369_1454062_1454170_1455955_1456146_1458963_1459119_1460540_1460618_1467819_1467885_1469633_1469662_1648411_1648584_1743167_1744039_1764147_1764341_1795609_1796356_1837207_1838478_1853149
884806	contig_16103_pilon	+	5558	10	Intergenic	novelGene_118945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	40	junction_1	177.730201967358	1710	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	25	1434	961659	1018923	FALSE	25	GCTTGAGATGTAATTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVRGALLAALLSTVGPALTPGACPALEVASDVLTSLPGANVTLTCPGVEPGENGSVHWAFRSQAVGSPHSRWTSVGTRLLLRSVQLSDSGNYSCFQDSRPAGTTHLLVEAPPEKPHISCFQKSPISSVWCEWSPRGTPSPTTKAVLLVRVSSHKSLVRDFQEPCQYSQESRKFSCQLKVPEGDSSLYMVSLCVANSVGRNSSGTQTFEGLNILQPDPPVNITVTGMVRNPHWLSVTWQNPPSWNSNYYRLQFELRYRAERSKTFTTGMVKEHQNHCVIHDAWSGMRHVVQVRAQEEFRHGSWSEWSQEVTGTPWTDSKTLSAETEVPASTQASTINEDSDDNTPPAYPANVTSLPVQNSSSAPLPMFLVAGGSLAFGMLLCIGLVLRFRKMWKLRALKEGKTSMHPPYTLGQLIPERPTPPVLVPLISPPLSPSSLGSDNTLGHSRPDARDPRSPYDISNRDYFFPR	961634	1023047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_961744_986733_986983_988015_988140_991634_991820_992269_992437_992963_993106_1004114_1004162_1005585_1005659_1011377_1011472_1018679
884807	contig_10861_pilon	+	2872	8	Intergenic	novelGene_39302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	168.823177633056	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	23	1183	1437804	1454668	FALSE	60	TATACCAATAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437781	1456357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1437953_1442887_1443023_1444871_1445010_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
884808	contig_2799_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_85603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTTAACCTTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785190	785831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_785200_785800
884809	contig_7056_pilon	-	1553	9	Intergenic	novelGene_43622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_6	701.711022697378	45	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	70	816	725925	723226	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	725994	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813
884810	contig_9609_pilon	+	3822	25	Intergenic	novelGene_22990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	249.945771896403	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	654	2810	311574	330367	TRUE	35	AAAAGCCTTGTATATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREVNRGQCATGKSMLGYLPFSF	309959	333227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310540_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330619_331388_331487_331563_331694_332694
884811	contig_401_pilon	+	2419	2	Intergenic	novelGene_42932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTGCAGCAACGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1972609	1976341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1973757_1975069
884812	contig_299_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_129452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGACCACTTATGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945434	946403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_945400_946400
884813	contig_7870_pilon	-	1142	8	Intergenic	novelGene_108892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	727	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	240	965	496465	143294	FALSE	25	ATATTTACCTATATGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
884815	contig_15327_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_70642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAATGTATAGAGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900556	899720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899700_900600
884816	contig_1544_pilon	-	4068	1	Intergenic	novelGene_167931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	2111	3493	35174	33792	NA	60	AATTCTAACTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKHKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKFIKWGNDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGIKRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQTKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	37284	33216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_33200_37300
884817	contig_854_pilon	+	1737	1	Intergenic	novelGene_36342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4654	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974681	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
884818	contig_6677_pilon	+	3883	8	Intergenic	novelGene_114203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	65.3121234487729	998	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	1457	2533	596728	626796	FALSE	75	CAAAAAAAACAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNKGLRLGFWPCYHNQVNRTYCCGTYRAGPMRQISLVGAVDEEVGDYFPEFLDMLEESPFLKMTLPWGTLSSLRLQCRSQSDDGPIMWVRPGEQMIPTADMPKSPFKRRRSMNEIKNLQYLPRTSEPREVLFEDRTRAHADHVGQGFDWQSTAAVGVLKAVQFGEWSDQPRITKDVICFHAEDFTDVVQRLQLDLHEPPVSQCVQWVDEAKLNQMRREGIRYARIQLCDNDIYFIPRNVIHQFKTVSAVCSLAWHIRLKQYHPIVEAPQNTESTSNMDCGLTGKRELEVDSQCLRLKTESEETCTEMQLLTTSSCPSSSELNLPQDQMTQPIPALKVESRLESDQQHNLQEHSGTPV	584287	628146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_585003_594908_595583_596660_596779_615719_615858_616164_616308_624372_624541_625423_625533_626328
884819	contig_5594_pilon	-	4849	3	Intergenic	novelGene_150115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1772	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	831	1220	106933	106544	TRUE	80	AAATAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGFQNKTPDDLPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNTKINSQLETIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRISRIEDKHLDTTV	107763	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_33632_33771_34495_106242
884820	contig_4486_pilon	+	2164	12	Intergenic	novelGene_38571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1017.43870609544	14	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	145	1002	343083	411202	TRUE	30	ATGTAATAGAGTGTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTNGVMSK	311763	413471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_411183_411318_412424
884821	contig_5400_pilon	-	1905	3	Intergenic	novelGene_162825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	47	1111	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	281	877	271258	268944	FALSE	25	CAAGCTACACTTACTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRCLEPSGNGAEGTRSQWGTVESAEEPPPEAARLATALRELSQTGWYWGNMTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	271986	267915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_271119_271483_271930
884822	contig_14450_pilon	+	4551	2	Intergenic	novelGene_48917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_1	0	3560	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	638	1657	17441	18460	FALSE	40	TGCCACTTCCAAAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTCIEGQHDLDHYLFPIVYIFVVIISIPTNIGSLCVSFLQAKKDNELGIYLFSLSLSDLLYSLTLPLWINYTWNNDNWTFSAALCKVTAFLMYMNFYSSTAFLTCITLDRYLAVVYPLKFSYLRTRRFAFMVSLSIWVLETIFNAVMLWEDEIAVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQIRLNLFRTCTGYAIPLVIIMFCNQKVCRAVRHNRATEDGEKKRIIKLLASITLTFVLCFTPFHVMLLVRSVLEHDASFNGLFDGQSWKQTYKIYRITVALTSFNCIADPILYCFVTETGRSDIWNVLKFWTGKLNKSARQRKSVLSMSTKDTVDLEVLE	13061	21354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_13136_16877
884823	contig_5023_pilon	+	3776	2	Intergenic	novelGene_7273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3904	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAGGCACAGAGAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580856	596778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_581853_593998
884824	contig_4180_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_8314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCATCTAATCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751367	753022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_751400_753000
884825	contig_11422_pilon	+	414	1	Intergenic	novelGene_98956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5384	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTATATAGAGGATTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_400
884826	SIRV6	+	1432	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	78	18	57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	GTTTGGTCGCAAAAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884827	contig_7816_pilon	-	6908	5	Intergenic	novelGene_66469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	943	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	4923	5246	144096	143773	TRUE	15	ATGGTCAGGATTGTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGTGWALSGRHLLAASPLLLNQDPRPLAVPLAKRFQIVLPLSDVCVQMEQTEKQIKPADERNLSKTSVTNLFSINQNSLQERRQKEFENKGMEQTEDILGVKARSL	152810	140565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_141667_143211_144699_146633_146701_148222_148442_148776
884828	contig_19534_pilon	-	4289	5	Intergenic	novelGene_151611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	911	junction_3	89.0824758299858	1980	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	136	912	68652	62762	FALSE	60	AAAAAAATATATATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAVGSRALLWIALLLFAPAGSLVATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDGEALQYWYENHNISIPKATLKDNGTYHCEGFVQKLHRISDSLNITVQEAEQIKNYWPQFFIPLLVGILFTVDTALFFFTRQQFKLLLKIKRTRRGSRLLDPQPKTDPQKK	68787	59384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62953_64567_64823_66767_67023_68150_68172_68597
884829	contig_9133_pilon	-	4418	1	Intergenic	novelGene_109299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGATGCTGGGGTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238299	233881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_233900_238300
884830	contig_12624_pilon	-	3217	7	Intergenic	novelGene_61036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	22	junction_4	1248.36181542941	100	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1989	2435	875571	867935	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAKRRIPCLIPCRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGNKAQCAHALHTQGALQVHCGHGDSARAPLQPGIGQCV	877559	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_874056_874133_875116_875186_875385
884831	contig_17144_pilon	-	2244	13	Intergenic	novelGene_29470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2148.2402278118	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	870	2168	170784	166152	FALSE	30	TTAAGAAATTCTTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAERRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	181849	166075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166845_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170872_173717_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
884832	contig_8453_pilon	-	4191	2	Intergenic	novelGene_125124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2629	2934	198971	198666	FALSE	55	TCACACATAATATCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSFTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	259396	197408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_200577_258373
884833	contig_1836_pilon	+	4985	2	Intergenic	novelGene_71068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_1	0	1495	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	206	1489	970856	995162	FALSE	15	GCTTCAAGTCCTCTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRHRVSRRDTEPFPLAYTQRALSVPRTDWLLAPEEGRRRGASRATRRRPQPPGAAARGAALTALNLRTMGARRLLLVAVGLSLCGPLLSVRTRARRPDSKAEIATAVPRSFLVRSYVGDFEKISHEEFEEKNETKLHEDRLISVNKSHPLQKPPSVFISEEASGYLTSPWLTVFIPAIYTGVFVVSLPLNIMAIVVFIVKMKIKKPALVYMLHLAMADVLFVTVLPFKISYYFSGSDWKFGSEMCRFVTAAFYGNMYASIMLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFICLAIWAVAIGAVMPLVLKEQTTQVPGLNITTCHDALNQTLHDSYYTYYFTAFSAVFFFVPLSISTVCYVSIIRCLSSSKVANRSKKTRALFLSAAVFCVFIICFGPTNVLLIVHYSLLSYNSSVEAFYFAYLLCVCVSSISCCIDPMIYYYASSDCQRYLCSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSTNLNSSIYKKLLT	970650	998658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_970944_993966
884834	contig_10345_pilon	-	1362	13	Intergenic	novelGene_158350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAAGTGGAGTCTTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24389	4367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_4425_11655_11736_11829_11939_13155_13251_14116_14231_14652_14745_16895_16975_17171_17231_18808_18901_20418_20515_21586_21646_23044_23167_24081
884835	contig_16525_pilon	-	1164	5	Intergenic	novelGene_133799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4251	junction_1	567.056434581251	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	603	911	97070	91737	FALSE	25	AAAGATCGCCAGTTCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVPSPRADGAGGLSAWV	97672	91483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069
884836	contig_4857_pilon	+	5308	1	Intergenic	novelGene_48745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	252	759	343	1101	1198189	1198947	NA	45	AATCACCCAGATTAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAVYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTTWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYSHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWIAICKKMKQDPYLMPYIKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKTEPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKSKKRTYRLGKNFWTVQVRQRSNLHNLQENPTPLQQKDK	1197846	1203154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1197800_1203200
884837	contig_6102_pilon	+	350	2	Intergenic	novelGene_31795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCGAAGAATCAAATCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360098	361207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_360106_360864
884838	contig_5125_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_43460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58615	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_58600_60000
884840	contig_1008_pilon	+	6075	3	Intergenic	novelGene_121597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_2	70	2004	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	48	311	750514	750777	TRUE	15	CCGCACTGTGTGATACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVELKSFGALAPAGQMRAGRPKGTRKQKLKRQGTQEAEQPQSQKVGPPPLEFLRVESPLRWTRRMGPPKFEGRVAVPVGLKGRAEAQDQGASTQNPESVANT	750466	766240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_760935
884841	contig_5189_pilon	-	2584	1	Intergenic	novelGene_34878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCTCTAATGGCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210731	208147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_208100_210700
884842	contig_16776_pilon	+	1424	5	Intergenic	novelGene_130510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCACATCTTTCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34687	44704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35273_41421_41567_42702_42804_43076_43230_44264
884843	contig_5400_pilon	-	1377	2	Intergenic	novelGene_162829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	399	839	269384	268944	FALSE	85	AATCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	274267	268405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_273886
884844	contig_10904_pilon	+	4241	1	Intergenic	novelGene_22571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1733	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	941	1342	413525	413926	NA	40	GTCACATAATGAATACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFPQSLIPCISLSLFSPSSHHPCAHSPLRLPHLDLTCHQQFQGITGWGPDLRPPPLPPVATVVTAPLGWGHLFQEELCQLRSHIPKQHWGDLSSLEECEPPGGLGSLAPQGHVDPRSHNCPWLNPQPWLGV	412584	416825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_412600_416800
884845	contig_9538_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_176442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGGGGCGCCCGGGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26755	26104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_26100_26800
884847	contig_1150_pilon	-	317	2	Intergenic	novelGene_61430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	500	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309346	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308941_309039
884848	contig_11417_pilon	+	8407	37	Intergenic	novelGene_103286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1997	junction_34	1062.16056996524	4491	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1156	3471	2732	6202	540507	586628	FALSE	35	ATAAAAGGTCATTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQETQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGVFAINEAVDSGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGATYQSDLAEAKKKKLAAGDNNSKWVKHWVKGGYHYYHNLETQEGGWDEPPDFVQNSVHLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITKLQACCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQSQWRGYKQRKAYQDRLAYLRSHKDEVIKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDIIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMIVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHDEVRTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIISSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARDIRNQRRYRQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	479520	588833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437_517516_521571_521649_527039_527108_528494_528609_529167_529347_530872_530958_536807_536972_537763_537849_538884_539049_539279_540616_542616_542781_551052_551144_551338_551507_552205_552349_556571_556743_557388_557473_557569_557642_557739_557810_558178_558388_559106_559263_559490_559655_560664_560890_566040_566182_566276_566362_567428_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597_570686_572533_572747_573469_573637_575930_576054_583804_583914_586514
884849	contig_18364_pilon	+	4196	6	Intergenic	novelGene_102555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	798.908505399711	61	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	882	1772	45177	50216	FALSE	30	GGACAATTGCAGCCGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	43903	52640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_44774_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
884850	contig_7704_pilon	-	1929	12	Intergenic	novelGene_154619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	955	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	691	1134	358257	356661	TRUE	0	GCCCCCTTGGCCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGKDAFLCSLQPIPSQVEAGKSWVTGRVCGKEKCDPPGPCGQGEPRFLSSWTKASIISSFTFRSSFLTSSRSSCFTLSRSVSSLELGVEGWASEVVTEEEDFILRAKLCCSSPRVFAQILSGLGLWPLAPPADWQIHPWVSPQPV	358947	345643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_345893_352495_352667_352774_352942_354475_354517_355418_355478_355589_355688_356650_356702_356850_356888_357107_357154_357296_357390_357913_357973_358089
884851	contig_5779_pilon	+	8534	5	Intergenic	novelGene_106424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	207	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	5080	5478	280705	281103	FALSE	20	TCCACGTGTATGCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKSTNKRNSAQESKRNKENISTTKKALQNAIPLLGIYPREIRAITRIDICTPIFIAALFTTAKRWKPPRCPSTDEWINKRWYIQTTEHYAKIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	81683	284159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_84653_91043_91228_100269_100295_191229_192576_280149
884852	SIRV7	-	2352	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147920	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1653_1761_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
884853	contig_4732_pilon	+	2124	13	Intergenic	novelGene_75445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	568.670940781124	217	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	195	1865	653080	675284	FALSE	0	GCTGCTTGGCTGGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESMKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGQTMERIGSGVERMGAGMGFGLERMAAPIDRVGQTIERMGSGVERMGPAIDRMGLSMERMVPAGIGAGLERMGPVIDRMATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	644309	675543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_644488_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_670261_670316_672214_673018_673616_673669_675120
884854	SIRV1	-	656	3	ISM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	33	6551	33	-1102	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTAACGACTGCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10753	7551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_7815_10282_10367_10444
884855	contig_3252_pilon	-	1366	2	Intergenic	novelGene_61501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAACAAACGAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332484	326130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_326655_331642
884856	contig_5623_pilon	-	5812	14	Intergenic	novelGene_154793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	349.051580596851	87	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	459	1232	210793	207631	TRUE	25	TTTCCCAGAACGGATCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211251	195618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_195707_196312_196470_196689_196910_200205_200377_200800_200962_202587_202712_203152_203341_204072_204854_204940_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728
884857	contig_9609_pilon	+	2935	24	Intergenic	novelGene_22988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	262.253236251501	4	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	152	1540	311574	328293	TRUE	40	ACCTTGAAAAATGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPQCLTHPLTNMMNLQDITTIQQQDSTMTPTRSTTTIH	309953	333320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329975_331366_331487_331563_331694_332694_332767_332821
884858	contig_8330_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_71725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	824	1180	163425	163781	NA	50	AAAAAAGACTAGACTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPDPLLIPSLPLTSGLSSPRTPGVRSFSSSSTPHNQGNRTTIERGPRCTKCQAREGLCPQGRGAEPEWLSVSASRGCCSSTGPAVEAAAVQSGWGKVMRFKLWQLSLSEVRYKLSVV	162601	164923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_162600_164900
884859	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	11526	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
884860	contig_5988_pilon	+	3091	11	Intergenic	novelGene_16093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2170.30496474574	29	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	629	988	1221737	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210386	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221653_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
884861	contig_9177_pilon	-	4375	29	Intergenic	novelGene_32583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1751.94428836673	11	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	36	2618	26442	15729	TRUE	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQATWWEDGGSCEGLSTHDSGSGFCHAAESVCQEPWHCLG	26477	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2826_13576_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16045_16149_18287_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312
884862	scaffold_13505_pilon	-	5302	1	Intergenic	novelGene_111583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	191	505	630215	629901	NA	30	CACATGGAGATATGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPKNQTLMLIQRVKRLPRDWEKNFGYNKSNQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAEDMNRHFAKEDIQAANRYMRKCSRSLATREMQIKTTMRYHLTQQG	630405	625103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_625100_630400
884863	contig_8174_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_160055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTGTCTCTCTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255738	253615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_253600_255700
884864	contig_5941_pilon	+	2309	7	Intergenic	novelGene_84554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGAGTTAGTGCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143245	151080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_+_144584_145527_145732_148030_148132_148227_148306_148485_148736_149825_149966_150882
884865	contig_19564_pilon	+	2297	3	Intergenic	novelGene_29660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1323	junction_2	132	2087	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	73	1161	39079	40167	TRUE	10	AACTCTCCTGCTGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPRGRESREERLSPREAREKKLGMGGARESSPRPLEAKDWRLSPGETGDRSSRQSEAQKWRLSPGETPEWSLRLAEPQEQSLRRTEVVESRLSPGESGNQKLGLTEVHKWRPDCEESQEQTSVQLVPSQWRLSSGEENKDFLGECGKKEERPIPTVAPEEITGLSETLTWEARDSSPRGVEAAEQRPRLVEDGERGLRPTEGWKWTLNSGKVREWTPRDIETQTQKPEPSESTEKQLGPPGVEPGEGEAEEEAGAQGRPLSTLQNRCSVPSPPPTRGHWDWRPSTAGRGSSRTPAPTTSPSVSPTPSSTCPPAPWGSPHEPSVLWGEGRARGGGAPAAADTPSQSTPGGLCPLQPRPLQQPLPRLMLQSLGLERSGTRLPRRSWF	39006	46687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_40233_44755_44967_45827
884866	contig_15327_pilon	+	1345	3	Intergenic	novelGene_70422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157	1008	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	213	443	36170	53675	FALSE	5	CTTCAGCCTCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRAVRNWLVGFSSLSRCSPAAAETPARSTRLSAGIPAALAASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEKSGLRRQPQRAPGQPWGEPPPVTPVRS	35957	54577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36324_53368_53442_53671
884867	contig_12464_pilon	+	4248	2	Intergenic	novelGene_68628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	353	junction_1	0	118	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	14	439	45237	52013	FALSE	60	GGAAAAAAAAAATTACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASAAERVIATAVPASGTNSNGESSEVEGGVGAVGEEKDAPVKAEAAGDSEEDGEDVFEVEKILDMKTEGGKILYKVRWKGYTSDDDTWEPEVHLEDCKEVLLEFRKKVADNKAKPVKKDIQVSCFVSFLMLYISISQS	45223	55822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_45453_51803
884868	contig_5918_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_99636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGAACAGAGTAGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2257374	2259283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2257400_2259300
884869	contig_19378_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_73782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	0	357	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCTTTTTTCAGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18033	16004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16440_16937
884870	contig_6724_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_167959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGAGCAAGCACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181043	178632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_178600_181000
884871	contig_3602_pilon	+	2968	3	Intergenic	novelGene_60611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	168	620	912736	913188	FALSE	15	CAGGTTAGGAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	915536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912162_912630
884872	contig_7452_pilon	+	4482	1	Intergenic	novelGene_109163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	3657	4049	199941	200333	NA	20	TCGGCGGTTTGAACCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSALPILCSTFTSAPLNIVFTLGQFFSPPRPHIYTIQSTKDKRTPLSPNPAIHSDWTDSSHMPPLNQSLWPYTDWLSSTCGLGVSLTGSKRILKRKLGSCRGAKGITGRRCWESRARSLELDRSAFEF	196284	200766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_196300_200800
884873	contig_17936_pilon	+	1899	7	Intergenic	novelGene_29987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	15.6276108929747	584	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	18	686	182729	209666	FALSE	20	AAAGTGGCTGTTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVVSRSVVCSDTRDREEYDDGEKPLHVYYCLCGQMVLVLDCQLEKLPMRPRDRSRVIDAAKHAHKFCNTEDEETVYLRRPEGIERQYRKKCAKCGLPLFYQSQPKNAPVTFIVDGAVVKFGQGFGKTNIYTQKQEPPKKVMMTRRTKDMGKFSSVTVSTIDEEEEEIEAREVADSYAQNAKVIEKQLERKGMSKRRLQELAELEAKKAKMKGTLIDNQFK	182711	210879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_182853_187002_187121_200853_200896_202891_203031_207011_207102_207675_207769_209603
884874	contig_3004_pilon	-	3521	14	Intergenic	novelGene_127508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	64	junction_9	70.2938885624545	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1014	3042	478	3519	330927	306327	FALSE	40	AATCCCAGCATTTCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHKEALKIQKNKKEMLTKQKTWHIKARKAALLVEKERSAKITSLQPPPPTLFENIDVKKIPSIKTNSSTYHHLYTLVNREMDTKQPDPHLAAEEEAKRLEELQKQVAQERLEQFEKAHVRGFHAMKKIHLAQNREKLMKELKQLQQEDLARRRQNVARMPPQLVELPYKRSEMKEDWQRELEFAFEDMYNADKKVKGNLILHLEPEPLPTDQTQDEELDLSMEQEDLNETENPQVSEAEKIHPSEIDVPLAVNTQQIPSKILFKKLLNKIRSQKSLWTIKSMSEDESEIIGTVSEAESKVLTIESGTIASEEQTLPPGQEQVLESDAQTVESGPLATEDKPLSCNTDSEKQREVNETQCITTVAQNSVLLHPQEEAARIRMSARQKQIMEIEEQKQKQLELLEQIEQQKLRLETDCFKTQLEEEKRKSIQQTEVGIAPTSGTVISDEDSHRQMIHNYQRQLLEQNRLHRQSVEAARKQLHEYQTLLKERYPSMSATSLIPDSVISVPPQKSERPTLISEHWDQGQRPKLSPNKHQPIQISRLEEGHFRVPRQNLFSQRQVETTEALSTSNILAKQSLESQEHLRLFSQAETQQRDYKLVPEDSHRLSRALSHDRPLIFQDTKEIPHTSRATTFQTLDSQQMFSENSQNISSKLTEPSSFLPLVAEHSFSSLPAKDESGRIQQPFSTESKSTFSLDHSVISQMQDRPLPSSERITAQQGNLKALQEQFDLQKEVLRARQESQEQLLLHKQKELEEQTGLSLFLPLVASRSFASLPFAKTELGEIQQSSLTKNDPAVYTGHPVTPQIQDRLLGFSQSNLSQQDNLKFLHEQLNVQRDRLQARREAQEVLCVHKQNEFDGSVSSEKAESSTLPSQVAQHTFTSLSSAETKSGKIQQPYSSRSEKRVVSSRSEIPTSQDRSSSFLQQFLPLHDSLKLLQQQLSTQRATLQARHEAQAALLLQRQRDLEVSKSGQVSSSFSAMVAQDSVASQASAKAEPSRIQKLYLSEESLIPSNHL	333330	306324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_307969_308255_308354_308759_308898_311019_311124_311278_311372_313412_313635_316831_316994_317192_317377_319204_319346_324107_324204_329963_330058_330859_330987_332097_332299_333113
884875	contig_13272_pilon	-	3037	1	Intergenic	novelGene_163948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	450	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAACAAATACTATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78415	75378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13272_pilon_-_75400_78400
884876	contig_7657_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_30040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGGGTGGTGGGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261754	259926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_259900_261800
884877	contig_16121_pilon	+	2862	6	Intergenic	novelGene_6856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	522.51736813239	92	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	180	1706	51510	62826	FALSE	30	AGAACAGAATGTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLQAILSYKYIFNGCNILLYIVLTAKYALNLISLVVDIMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	63982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_51442_51628_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
884878	contig_20332_pilon	+	2310	3	Intergenic	novelGene_156184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	329	junction_2	296.5	2217	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	264	593	642243	644067	FALSE	55	AGAACAAATGAAAACAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIQNLQSFDPFADATKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLLEVSDWVLYVQP	641979	645784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_+_642274_643305_643470_643932
884879	contig_11071_pilon	-	733	2	Intergenic	novelGene_131019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	0	615	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	335	730	84754	58739	FALSE	25	GAATCATTTCTAAGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALCWTRAVAAESRFLRVFVFSRPFRGAGSQSGSGSESSDSPEPRTRPGGFASALERHSELRRQAELGRGSPKNVESFASMLRHSPLTQMGPVKDKLVIGRIFHIVENDLYIDFGGKFHCVCRRPEVDGE	85088	58735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_58925_84544
884880	contig_2969_pilon	+	3604	4	Intergenic	novelGene_157054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2879	3394	4541	5056	FALSE	30	CGGAGCTATACTTTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTRDCVCGKQRRPSVGEEGWRVGKHISQIAGALQHLRKKQRWHTEPGTHMKGGGGDERQMRNQKKQKKKATLAANKRHPESRPLGCVESKQPVLPGQETVAAGSRGGRPGTKRGVGWESTHHKLPVVLSPAGRSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSALR	679	5266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1524_1700_2347_2854_4112_4409
884881	contig_7753_pilon	+	1299	1	Intergenic	novelGene_41517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1755	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCAGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1255951	1257250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1256000_1257200
884882	contig_5279_pilon	-	1682	8	Intergenic	novelGene_105565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	272.927440458269	4	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	643	1680	340212	322541	FALSE	50	AGGCAAAGAAAATGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEK	353668	322538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_322657_330175_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885_340245_353058
884883	contig_11258_pilon	+	2373	8	Intergenic	novelGene_67769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	171.030251531054	519	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	34	1119	278958	292582	FALSE	10	TTTTGAGCCATTTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278924	293836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285691_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
884884	contig_7396_pilon	-	4668	6	Intergenic	novelGene_79528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3086	3643	231870	231313	FALSE	20	TTGCCTTAACTGTATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDIQATNRHMKKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTPPRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIQCSWECKMVQPLWKSIWHFLKKLEIEVPYDAAILVLGLHPREIRAVTRIDICTPMFIAALFTIVKRWKQPRCPSMDEWIYNLWYIHTVEYYAMIKNNDEAVKHLRTWRNLEGIMLSEFS	458370	230287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_231955_293665_293808_453560_453898_454190_454423_455517_455588_456150
884885	contig_3584_pilon	-	4704	3	Intergenic	novelGene_108125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	445370	445023	TRUE	25	AGGGACAGCATATTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQGQDGRVVRRFWRSLLQQRPKKTSESIIYDNLGALNIKGKFEESDKWQGEGETVQKQEVVARPDPAGAGALQAGSAHGSRWGKQQHLGGVFHIRRHPAEDRLLSHPEPVRNSS	445370	240905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_242421_362533_363065_442712
884886	contig_16098_pilon	+	1637	4	Intergenic	novelGene_46224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	317	790	766291	767278	FALSE	15	TCTTTATTGTATCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPCSGLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	764927	768125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766662_767175
884887	contig_2703_pilon	+	1543	2	Intergenic	novelGene_101650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCGGCTGGACGAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	4176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1458_2743
884888	contig_17753_pilon	+	6359	9	Intergenic	novelGene_105064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	202.093071071227	3045	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1073	2095	131420	143267	FALSE	35	AGAAGTGATTAGGTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLRMNKAPTVGFEADVGSKTTHHLVYPESFRELGENVNMVLVPFKTIDLQWVVSATTKGTISHTYVPVPTKIKVKKEKILIYHPAFIKYVFDNWLQGHGRYPSTGILSVIFSLHVCDEVDLYGFGADSKGNWHHYWENNPSAGAFRKTGVHDGDFESNVTAILASIHKIRIFKGR	45529	147531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_74923_75173_96134_96221_130836_131726_137748_137946_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093
884889	contig_12869_pilon	+	2083	6	Intergenic	novelGene_75345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	557	junction_4	191.439389886199	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	221	982	81642	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	77464	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
884890	contig_10126_pilon	+	6521	6	Intergenic	novelGene_105734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3442	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAACTACTAACCTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149231	330568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_150089_150193_154609_273198_273456_273496_274208_326844_326948_330390
884891	contig_12079_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_67515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	385	1158	733	1890	862522	861365	NA	30	CAAACGTTAACTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	863254	860598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_860600_863300
884892	contig_15327_pilon	+	2072	5	Intergenic	novelGene_70484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1350	1694	379933	381633	TRUE	20	ACCGCCCGTAGCCCGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVHIFLRDPPIFFLGLHVKGAEIHYHLSPSMFLASLGCKIQNAAMCTDFLVSFLFPHHPDYTGTQGKSRFHFPAFFSKTRFQSKFRAVLKPRAEPEIWSSEVLTMNITFSLQI	374238	390960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_374288_378632_380265_381620_381718_382828_382973_390810
884893	contig_6902_pilon	+	6923	22	Intergenic	novelGene_135576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	354.208075210345	1671	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1828	5484	1440	6923	490149	530402	FALSE	25	ACCCAGCATGCACGATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTNEVTVSTNGTVNSVVQEAASTAGDISGSKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQMVVKAGENVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRSNNGPPKSARNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQSAGTTGVDPVNGSSTHHQEGALNGTGQKNSKDTTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVVEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQIIQVWNKKNANEKGRNQTSKLPPRFAKKQTTGTQQAQCPASAPNSASAPALAPVPASAPVPSSTSAPIPASALAPVPPSTSAPLLASPSASVPTSASTPAPASTSATATASSSAPVPAPVPIPAPTPILASISAPASVPILASAPTSVPILASAPASVPTLASALVPASSPTPAPTASAPTAPTVSAAAAPASVPTAPVPLAPAPSTPGPSAPAQTQAQTHKTVQNSLQTTTQTSKQPPPLVRLHSAQTPNGVDYVTTGKSIQNSQCHGTLTAELWDNKVAPPAVLNDISKKLGPISPPQPPSVSAWNKPLTSFGSAASPEGTKNGQESGVEIGIDTIQFGAPASNGNENEVVPMLSDKPTDKIPEPKEQRQKQPRAGPIKAQKLPDLSPVESKEHKPGPIGKERSLKNRKVKDVQQVEPEGQEKPSPATGRSTDPVTTKETKTVSEMSSEIGTMISVSSAEFGTNAKESVTDYTTPSSSLSNTVATNNAKMEDTLVNNVPLPNTLSLPKRETIQQSSSLTSVPPTTFSLTFKMESARKAWENSPNVREKGSPVTSTAPPIASGVSSGASGPSTASYNSFSSASMPQIPVASVTPTTSLSGAGTYTTSSLSTKSTTTSDPPNICKVKPQQLQTSSLPSASHFSQLSCMPSLIAQQQQSPQVYVSQSAAVTQIPAFYMDTSHLFN	434419	530402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_489723_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273_498512_501734_501944_513073_513229_514497_515366_515764_515851_519137_519327_519462_519715_520975_521069_524058_524161_527222_527425_528805_529010_530355
884894	contig_19816_pilon	-	1249	8	Intergenic	novelGene_156491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	271.19568956902	826	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	11	823	126795	123459	FALSE	15	CAGAATCCTGTGTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126805	123032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124717_125632_125854_126164_126435_126731
884895	scaffold_12510_pilon	-	5019	3	Intergenic	novelGene_151413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4221	4619	634065	625169	FALSE	40	GTTCCAGAAAAGGAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSLSSSRYCWHLLCARHSSGWSCQSLPRQKSLLLWSLHSREGVPGRRGAPRGAQDPEAQDRKAQAEEEVVTPGRREAQDVGVGGADECCEPRTVESCPTAGCGLQILFCHLRRLGIIEAVSAGRQQKAADR	652543	624768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_625447_633944_634083_648340
884896	contig_1275_pilon	-	2698	19	Intergenic	novelGene_108754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	538	junction_4	466.347059867341	61	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	877	2631	68	2698	513735	400413	FALSE	30	GCTCAGCAAATCACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVV	513802	400412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627
884897	contig_12079_pilon	-	3046	14	Intergenic	novelGene_67434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1328.83568736833	4	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	931	1347	585999	583739	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRVARAAGQGGAGETGCGSDKEPGAAGHGAR	638839	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_579904_579969_581161_581917_582170_583662_583756_584142_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598060_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
884898	contig_5676_pilon	-	9128	4	Intergenic	novelGene_159090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	154	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	6061	6732	355840	355169	FALSE	60	TTAAATCAATTAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEVSVAGSDAVWILWQAPIGESQRRPLGFWSKALPSSADNYSPFEKQLLACYWALVETERLTMGHQVTMRPELPIMNWVLSDPQNHKVGRAQQHSIIKWKWYIRDQAQAGPKGTSKLLEEVSQIPMVSTAVTLPSVSQSAPMASWGVPYDQLTEEEKTHAWFTDGSVRYGVATRKCTVAALQPLSGTSLKDSGEGKSSQWVELQAVHLVVLFAWKEKWPDV	441973	352772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_-_359469_412256_412291_413399_415145_441320
884899	contig_9468_pilon	+	849	9	Intergenic	novelGene_59503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	305.216700681663	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	12	848	347222	356123	FALSE	60	TACAATTAAGGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLKMVIVIILQYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLEIMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKVELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEVTDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNILMRRTLHKAFKGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKDTDLLILFKEDYFAKKNEERKQNKLEAKLRAKQEQEEKQKLAEDAEMKSLEEKMGCLLKFSGDLDDQTCREDLHNLFSNHGEIKWIDFVRGAKEGVILFKEKAKEALDKAKDASNGN	347210	356124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_347231_350670_350790_350872_351048_351910_352019_352104_352206_354706_354779_355112_355156_355530_355672_356054
884900	contig_8138_pilon	+	1686	3	Intergenic	novelGene_52429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280080	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280363_306455_306636_306714
884901	contig_16431_pilon	-	6430	3	Intergenic	novelGene_87602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	872	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2646	3089	223047	222604	TRUE	30	CCACCATTTTTTAATGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVIYRYNAISIQIPTAVFNETEKQISYFIWKGNRPPISKALFKKNNKVGGLILPDFRTYYTATVVQIAWYWYNNRCIDQWNRIENPIENPEVNASTYEQLIFDKGPKSVNWGNDSLFNKWCWHNGISSCKKLKQDPYLTHKK	225692	70842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_72939_143670_143758_221445
884902	contig_11720_pilon	+	4258	7	Intergenic	novelGene_43855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_6	1570.39334244641	96	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	3255	3974	86302	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	79104	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
884903	contig_19006_pilon	+	3930	12	Intergenic	novelGene_145587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	732	junction_10	127.015974787582	2570	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	17	1477	59883	91868	FALSE	10	AGGGTCATGTGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIMDPKELDKVFNDYTAVPDLYFENAMRFFNFSWRVTADQLRKAPNRDQWSMTPPMVNAYYSPTKNEIVFPAGILQAPFYTRSSPKALNFGGIGVVVGHELTHAFDDQGREYDKDGNLRPWWKNSSVEAFKQQTECMVEQYSNYSVNGEPVNGRHTLGENIADNGGLKAAYRAYQNWVKKNGAEQTLPTLGLTNNQLFFLGFAQVWCSVRTPESSHEGLITDPHSPSRFRVIGSVSNSKEFSEHFHCPPGSPMNPHHKCEVW	59866	94321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80534_83349_83454_86755_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691
884904	contig_9434_pilon	+	1127	7	Intergenic	novelGene_150475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	218.755126924046	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	106	861	51222	86108	TRUE	20	CCAGGCCAGTATCGTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKQKNKSEDSAKDDIDLDALAAEIEGAGAAKEQDPPKSKGKKKKEKKKQDFDEDDILKELEELSLEAQGIKVDRETAAVKPTENNEEESTLKQEKKKKGQKGKKQSFDDNEDNDNEELEDKDSKSKKTAKPKVEIYSGSDDDDDFNKISKKAKGKAQKSNKKWDGSEEDEDNSKRTKERSGVNSSGGSGDESDEYVQSRKGQKKNQKNKPGANVESGNEDDGSSFRIKTVAQKKIEKGKSKKRKKEKNV	51116	93484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_82476_83184_83653_86066_86193_92818_92915_93398
884905	contig_6616_pilon	-	1892	3	Intergenic	novelGene_141767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_1	3.5	2680	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCAGCACCTCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363104	360471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_362108_362327_362433_362953
884906	contig_17144_pilon	-	2201	12	Intergenic	novelGene_29348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1842.09839921669	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	302	1906	173384	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173591_183193
884907	contig_16310_pilon	-	2663	14	Intergenic	novelGene_70033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	139	junction_1	1078.67721973661	3200	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	151	2265	66135	56545	FALSE	15	GACTTGTGTTTTCTACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGIAYIEFKTEADAEKTFEEKQGTEIEGRSISLYYTGEKGQNQDYRGGKTSTWSGESKTLVLSNLSYNATEETLQEVFEKATAIKVPQNQNGKSKGYAFIEFASFEDAKEALNSCNKREIEGRAIRLELQGSRGSPNARSQPSKTLFVKGLSEDTTEETLKESFDGSVRARIVTDRETGSSKGFGFVDFNSEEDAKAAKEAMEDGEIDGNKVTLDWAKPKGEGGFGGRGGGRGGFGGRGGHGRGGRGGFGGRGRGGFGGRGGFRGGRGGGGDHKPQGKKTKFE	66285	56146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56622_56971_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59568_59986_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
884908	contig_7190_pilon	+	9191	9	Intergenic	novelGene_178411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	265	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	6625	7368	305069	305812	FALSE	65	AAACAAAAAAAACTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIQFIWKGKKPLISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVETAWYWYKDRYIDQCNRIENPDVNPSTYGHLIFEKAPKSIKWGKESPFNKRCWQNWISICKKMKQDQYLMLYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIDGINRIKTITINAHTPINKLDNWDLLKIKHLYSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHL	28423	307635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7190_pilon_+_29657_30227_30508_57191_57704_68200_68430_116931_117883_117932_118210_136324_138220_249085_249611_304346
884909	contig_10126_pilon	+	2723	8	Intergenic	novelGene_105714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	923.908843458275	11	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	491	1243	162172	166639	TRUE	5	CCCCTTTGGGTGTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139612	186778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140705_140794_161932_161994_162054_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_185436
884910	contig_13700_pilon	-	3683	23	Intergenic	novelGene_68267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.844789190378	1816	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	530	2638	123568	75590	FALSE	20	CGGAAATTTAGTGCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFCEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKIRASGDAKIKKEKENGFSSPPRIKDEPEDDGYFAPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDVKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKDKDKKVPEPDNKKKKPKKEEEQKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPESVNFCYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMSNEEKNIITSLSKCDFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCVMDNHRERIANFKIEPPGLFRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVRHDNKVTWLVSWTENIQGSIKYIMLNPSSRIKGEKDWQKYETARRLKKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEEGETADTVGCCSLRVEHISLHPELDGQEYVVEFDFLGKDSIRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLNTGILNKHLQDLMEGLTAKVFRTYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNHQRAPPKTFEKSMMNLQSKIDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMKLEVQATDREENKQIALGTSKLNYLDPRISVAWCKKWGVPIEKIYNIFAKR	163853	74544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_75607_75791_75833_77159_77310_77539_77635_81021_81150_82446_82562_83117_83187_84246_84433_85361_85506_98304_98450_98709_98898_100905_101029_102734_102857_106505_106622_112534_112642_117817_117894_118876_118973_121767_121824_123039_123164_123557_123682_132820_132924_163213_163239_163565
884911	contig_17144_pilon	-	1340	6	Intergenic	novelGene_29349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	286	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	328	768	179764	166640	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLRGTKRSFHSAPAPV	183409	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166684_174964_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
884912	contig_15236_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_141551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	404	811	122756	123163	NA	25	TTTGTATGGAATGTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	122352	124615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_122400_124600
884913	contig_14666_pilon	+	2192	2	Intergenic	novelGene_39610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	422	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477264	486997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_484937
884914	contig_10482_pilon	-	6544	2	Intergenic	novelGene_152837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTCTACTGTACCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131873	122696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_123308_125940
884915	contig_10126_pilon	+	4273	7	Intergenic	novelGene_105720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	1868.51977214288	1883	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	114	1007	140715	184341	FALSE	85	ACCAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRKTSLRKVEPGAQPLGSPRQRVHSLPAGVAAQPRLMGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSDTPVQTKPIFIVVGLVCALLVALLIAVLYLLRIRQKKAKGSTSSTRLHEPEKNAREVTQIQDTNNMNNDITYAELNLPRGKKPAPQAAEPNNHTEYANIEASPPRRSEDTLTYANLDMVHLNQVPKDSAPKPEPSCSEYASVRIQRK	139718	187607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_140705_140794_161932_162305_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074
884916	contig_2100_pilon	-	8787	15	Intergenic	novelGene_50580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3528	187	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	6559	6942	79663	45411	TRUE	45	ACAACTTGTACAAGGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSISSSNFLVDSLGFSVYKIISSANRGTLTSSLPIWMHFISFSSLIALSRTSSTMLNKSGDKGHPCLVPILKGNAFKQSPFRMMLAVGFHHAVPPQQRSEKLSQTESHVNPETLTIK	555623	42140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_42349_42613_42721_43302_43925_44140_44689_45050_45498_79366_80041_172233_172239_225900_227646_360176_360781_372992_373841_423063_424008_424054_424093_473316_473548_508245_508836_554447
884917	contig_1986_pilon	+	3472	2	Intergenic	novelGene_64161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTCTTCCAGGCAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649407	732063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_649532_728715
884918	contig_12464_pilon	+	2340	3	Intergenic	novelGene_68622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	353	junction_1	215.5	10	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	102	1334	45237	54734	FALSE	20	GGGCTGTAAAGATCGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASAAERVIATAVPASGTNSNGESSEVEGGVGAVGEEKDAPVKAEAAGDSEEDGEDVFEVEKILDMKTEGGKILYKVRWKGYTSDDDTWEPEVHLEDCKEVLLEFRKKVADNKAKPVKKDIQRLSLSNDIFEANSDSDQQSETKEDTSSKKKKKKLRHKDEKSPEDLKKKKAKTGKLKEKSKSDLESFSESLVFDLRTKKRIFEAKEELKEFKKPKKDDIKETKELKKVKKGEIRDLKTKVREDFKENKKTKKDKCIESQLESESSVLNDSLSQDDDNEDLHSDNKEEKQKIKSTKDKSGPDIIAGVVFDKQPDGKVSADEDTDVRTKRKKKKLRKTEEHKDSNKLENKDLFLERKNTHKKQRNQDKGKSTIEFDKPIPASSQTQKSSKLGGEERGHRSTDSPGEVSH	45135	55740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_45453_51803_51960_53873
884919	contig_15114_pilon	-	3256	16	Intergenic	novelGene_121119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	247.398428091656	1256	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	1003	2046	123696	100551	TRUE	5	TCCACTGTGGTGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	164553	94767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94837_99409_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212_125320_125693_125772_141879_142046_147669_147831_150654_150828_152061_152177_153332_153375_154909_155006_164497
884920	contig_1719_pilon	-	970	6	Intergenic	novelGene_87366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	630.447269801369	20	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	63	515	803613	773647	TRUE	30	TCAAAGTTTCAGTTCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQDVFKFIHVVACISTSSLLMAALAAPSKPRLARGGSWAQAGKSVLTDNIQAPSVPSRCRKRPRRST	803675	754677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773783_773998_774061_786510_786598_787980_788100_803564
884921	contig_2377_pilon	+	2150	3	Intergenic	novelGene_67914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	1981	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	77	766	269376	271018	FALSE	40	GTCACATTTTTAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLTIFMRLSISLPPSLFLSLAYLISFISQKRLI	254177	272402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_269971_270923
884922	contig_2636_pilon	-	3294	3	Intergenic	novelGene_52083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	10.5	435	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	123	401	85555	62451	FALSE	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_62624_81113_81216_85551
884923	contig_6361_pilon	+	2900	5	Intergenic	novelGene_23970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405180	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
884924	contig_15720_pilon	-	2917	4	Intergenic	novelGene_41947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1250	1705	307437	306982	TRUE	45	TGTCAGACAAAAGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	368083	305238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305496_305623_305947_306349_308160_367556
884925	contig_12677_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_110729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1746	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
884926	contig_5954_pilon	-	2734	8	Intergenic	novelGene_28773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	4	714	1462068	1392942	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462071	1390872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392313_1392361_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
884927	contig_16303_pilon	-	1314	2	Intergenic	novelGene_34134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTAAGTATGGTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66829	58172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_59311_66653
884928	contig_10126_pilon	+	4535	3	Intergenic	novelGene_105736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTGCAAGGAGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149817	154606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_149988_150088_151054_151206
884929	contig_2550_pilon	+	4666	4	Intergenic	novelGene_135703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	835	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1682830	1743228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1683005_1683529_1683608_1684683_1684755_1738885
884930	contig_401_pilon	+	1672	10	Intergenic	novelGene_42818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1335.68171894392	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	389	943	1713259	1715475	TRUE	35	TTGAATGGAATGACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711889	1716435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1712974_1713178_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
884931	contig_9363_pilon	+	4822	1	Intergenic	novelGene_6626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5459	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	78	440	872458	872820	NA	25	GACATACTCACTTATGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRARDAILEALENLTAEELKKFKMKLLSVPLREGYGRIPRGTLLPMDAMDLTDKLVSFYLEAYGAELTAAVLREMGMQETAERLQEINNGERPTTPRRVQAPGPPATSLLPQTFSARQT	872380	877202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872400_877200
884933	contig_8420_pilon	+	2202	15	Intergenic	novelGene_69337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	307.890154014018	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	261	1730	14814	51079	TRUE	45	AATAAAGATATTTAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10924	58915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_13897_13966_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
884934	contig_11564_pilon	-	2820	10	Intergenic	novelGene_158547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	514.175595696525	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	645	1616	60835	41045	FALSE	15	AAGGACTGTTTGCTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	101161	39840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52939_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62605_100663
884935	contig_5686_pilon	-	5851	2	Intergenic	novelGene_45211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4382	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGGTAATTCTCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100974	93650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_94090_95562
884936	contig_10196_pilon	+	2361	2	Intergenic	novelGene_132352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	29	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATGGATTTCGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477577	2481206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2479266_2480533
884937	contig_4857_pilon	-	6455	11	Intergenic	novelGene_48861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	174	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	460	1290	1502893	1502063	TRUE	40	GACTGTTTAATGAGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRELPEIQTGSRGGQGMKDIFSDVRWILAENREYQKDVHLCFLDCAEAFDCVDCNQLWITLGRMEIPKRFTVLMRNLCIDQEAVVQTEQGDAAWFKVRKGVCQGCILSPYLFNLFAEQIFREAGQYEEECGIRIRGRLINNLQYADDTTLLAESEKYLKHLLMKTKHYSLWYRLHLNIKKTKILTTGPISNIMIHGEKIDVVENFILFGSTINIHGSSSQEITRCITLGKYAANDLFKVLESKDVTLRTEVHLTQAMVFSVTSYACKSWTMSKED	1503352	1350271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1350457_1350598_1352429_1357833_1358411_1360787_1361543_1362020_1362633_1362683_1363098_1369250_1369467_1419879_1419952_1460949_1461078_1495049_1495309_1501945
884938	scaffold_9100_pilon	+	1724	8	Intergenic	novelGene_83246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	349.780105850775	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	180	1178	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSPLTSASRCHLRPIPPSGPSPGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644775	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
884939	contig_4093_pilon	-	2669	7	Intergenic	novelGene_27616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1838.02273743644	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	57	794	69245	41737	TRUE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72480	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41284_41370_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
884940	contig_6291_pilon	+	6535	3	Intergenic	novelGene_164798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAGAAAAAAAACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382930	391699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_383377_384957_386853_387505
884941	contig_16310_pilon	+	391	5	Intergenic	novelGene_70092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3738.02503837254	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287194	289957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_287268_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879
884942	contig_7965_pilon	-	4630	2	Intergenic	novelGene_174399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	3766	4497	28811	28080	FALSE	30	ACTTAGAATACTTTTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSPSGRNKDGAQSQALERKEGEAASGKQEIQRSREKKQHQQPTNGTQRASQCRLVFLDKRLCPREAEEVKCGDEGWRMGKRISQIADVPQSLRKKQRWRTERGTRAKGGGGGQRQGRNQNKWKKATPTANKWHQERRLVGCVESKQPGLPSQETVAAGSRGGQAGAKRGGGVGKRTQQITSCFVSHWMLREAAFSYPHLLVSDRSPRWWIHSALAGRGPLHESLLALRSLSVFSLHLVLG	159364	27946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7965_pilon_-_29348_156135
884943	contig_11564_pilon	-	2279	9	Intergenic	novelGene_158538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	395.241204045074	20	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	140	1069	60844	41045	FALSE	5	TGTTTGCTTGGCTCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	62606	39834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41146_52203_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470
884944	contig_8394_pilon	+	3354	1	Intergenic	novelGene_27327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	548	856	116376	116684	NA	40	TTGCCCATCAACAGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAEDRTTGNQRYRLSHPPPFFTLTWPPLLPAATVSWPGNTSFTPVSLGFHPPTLASSLSAFCQLLVLLFSASLDFFLTSHHLPLLSLKYLAPCAIFASS	115828	119182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_115800_119200
884945	contig_4876_pilon	-	1000	4	Intergenic	novelGene_137917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	138.441323310636	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2	649	654261	623543	FALSE	40	CACTTGAAGGGTAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLGSRRRSAWRSPPRGPWWSGFGVAQRPAALVCGLALNLQLLTCSPHRRASVRVSAAAAFGPGPSRSLLRLSWLKGAARCSRWAHRRRIPPPTGTSPLSPQQTQKVVSWIITIWIFGSLTIFLLARVLGGEVAYGQVLGVIGYSLLPLIVIAPVLLVVGSFEVVSALIKLFGVFWAAYSAASLLVGEEFKTKKPLLIYPIFLLYIYFLSLYTGV	654262	623191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_623681_625917_626032_629225_629304_653943
884946	contig_5258_pilon	+	3634	2	Intergenic	novelGene_100237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	684	1019	134364	134699	TRUE	10	TCTGCTTTGGCACAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWQFLKKLKIELPNNPAIPFLGLYPKDLKADIQKETCTQMFVAALFTIAKRWKQPKCPSTNEWINKMWYIHTMDYYPARRKNKVLIHATVWMELDDIMLSKIS	133680	202399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_135937_201021
884947	contig_13021_pilon	+	2314	13	Intergenic	novelGene_8159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2570.29130833885	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	921	2015	177472	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176922_177154_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
884948	contig_7230_pilon	+	2510	7	Intergenic	novelGene_52548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTTCCGTTTCCGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132806	177636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_134723_150917_151060_162610_162681_164219_164266_171092_171155_176935_177011_177437
884949	contig_7342_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_71090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1595	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAAAAGCTGCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23598	21798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_21800_23600
884950	contig_5084_pilon	+	3132	1	Intergenic	novelGene_64544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGAAGCATCTAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510649	513781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_510600_513800
884951	contig_15666_pilon	-	6209	5	Intergenic	novelGene_70198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_2	88.2365428833202	1623	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	748	1467	132068	129088	FALSE	15	TGTTGTCTATTTATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132815	124345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130515_130795_131446_131711_132007
884952	scaffold_9100_pilon	+	1885	8	Intergenic	novelGene_83277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	507.112272719619	5	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	862	1341	651131	654304	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644861	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649363_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
884953	contig_6885_pilon	+	3064	1	Intergenic	novelGene_83635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	2529	2978	122652	123101	NA	25	TTACGACCTGGAACTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQGLHEWRKHSLVFQVLQRMRIPSWEPGVEARVTQAPRIQTWEDRRGEGKLVAFSPAPRMPTMRHLATFALLVRDLLLPRSLLGRVQGRHCPGLFPSNDQVQILQAALYGTCRANVLRAHFPVQDGMDHAFHLPEILQSHMVRLSRS	120123	123187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_120100_123200
884954	contig_7457_pilon	-	2941	8	Intergenic	novelGene_31272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	104.241477897647	1049	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	161	1015	155936	146617	TRUE	25	TACTTTGTGTGAAATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLHTLLEEQDRLKKRLEELQKLRKDPKNPSQDKLQVPFPMPEIPLVFRGRTQQGEEAPKCLLSNLRICYPLPGGSALVTFDDPKVAEQVLQKKEHKIDVAEECRLRVQVRPLELPMVTTIQVSSQISDRRVLVSGFPAGLKLSEEQLLDKLEIFFGKDSNGGGDVEIRELLQGGAMLGFTRDGVAQRLCQIGQFKVPLGGQQFLLRVSPYLSGEIQKAETCFQPAPCSVVVFNIPDILDGPELHDVLEIHFQKPTRGGGEVEALTVVPPGQRGLAVFTSASG	156096	144141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_144769_145317_146809_147049_147157_147268_147456_147556_147667_147747_147902_148240_148340_155930
884955	contig_19851_pilon	+	1043	6	Intergenic	novelGene_29850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6799	junction_5	941.286226394501	15674	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	174	689	53637	56177	FALSE	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKDLLEDGFGEHPFYHCLVAEVPKEHWTPEGYSIVGFAMYYFTYDPWIGKLLYLEDFFVMSDYRGFGIGSEILKNLSQVAMKCRCSSMHFLVAEWNEPSINFYKRRGASDLSSEEGWRLFKIDKEYLLKMAAEE	53463	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061_54146_55650_55753_55840_55882_56006
884956	contig_9609_pilon	+	4057	13	Intergenic	novelGene_22994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_5	211.474716114139	258	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	3566	4057	322649	325179	FALSE	30	AGTCCCCAGCTGTATAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQ	309972	325179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_321040_321846_321908_322284_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138
884957	contig_2215_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_163850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1544	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156887	155653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_155700_156900
884958	contig_2940_pilon	+	5259	3	Intergenic	novelGene_81970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1003	1497	1070944	1071438	TRUE	45	AGAAACAGCTCACTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDFTVEEKALDLTDRELISLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMAKADKFMENTYKKMEEFKKIIQKQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINKKISEVGSVIEGLRSRFEMTEDRISEIEDKHLDTTLLEEKSEKKVKKNEETLSIMWDTIKSKNL	1069941	1128598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1072298_1072428_1073108_1126374
884959	contig_678_pilon	+	2678	6	Intergenic	novelGene_167765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	76.9014954340941	1755	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	74	625	9166	13583	TRUE	15	ACGTGACCTCACCGCGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQGGLVANRGRRFKWAIELSGPGGGGRGRSDRGSGQGDSLYPVGYLDKQVPDTSVQETDRILVEKRCWDIALGPLKQIPMNLFIMYMAGNTISIFPTMMVCMMAWRPIQALMAISATFKMLESSSQKFLQGLVYLIGNLLGLALAVYKCQSMGLLPTHASDWLAFIEPPERMEFSGGGLLL	9092	126568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_9252_9568_9684_12678_12833_13135_13297_13547_15207_126138
884960	contig_15087_pilon	-	1090	10	Intergenic	novelGene_37198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	501	junction_3	171.630093191401	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	6	566	132660	113497	TRUE	30	GTAAAATGAGTGACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	132665	110647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609
884961	contig_15720_pilon	-	5024	3	Intergenic	novelGene_41954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3027	3482	307437	306982	TRUE	55	TTTAAAAAAAAATGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	369860	305250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_306888_308160_367556
884962	contig_6361_pilon	-	3089	6	Intergenic	novelGene_23955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4521.2031584524	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	5	TCTTTCTGGTATTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	380293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
884963	contig_6513_pilon	-	4763	30	Intergenic	novelGene_117769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	4377	4679	171186	170884	FALSE	25	TAGCTTCTAACTTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQNLSYFHAYVLVFQVGLHFFALGFQVGPHLSALEFQAVHHPSVLGFQDAHHSFALEFQAGFHPSALGFQVLTLLFLPCHYFVCCHLVLGQTVYFHSV	250206	170799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_171992_198971_199157_203369_203567_203802_203874_203963_204055_205628_205732_207918_208008_210569_210800_211563_211712_212244_212331_213106_213214_215598_215734_217492_217574_218549_218684_219546_219690_222540_222632_223705_223922_224032_224133_224937_225039_225146_225292_227700_227836_228596_228697_229500_229556_237118_237225_239082_239223_246518_246660_246868_246962_247401_247556_248061_248151_250101
884964	SIRV6	+	1342	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	160	-11	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884965	contig_10973_pilon	-	1508	1	Intergenic	novelGene_150368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	314	826	2730	2218	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3043	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3000
884966	contig_1725_pilon	+	2924	20	Intergenic	novelGene_24262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	551.178314727674	3242	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	87	2603	201480	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201393	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218484_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
884967	contig_16776_pilon	+	3829	2	Intergenic	novelGene_130496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	969	2066	37116	38213	FALSE	70	AGAAAAAAAGCCAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSREKWKQVLFQRKPGFNRGVRQRQRQSQQCKEEWGREIQSPQKRKKEKQIERGRWERGPQKIARIEDFSKVSVYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTITPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIMKMSILPKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNLIWKGKRPRINKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTVTVVKTAWYWYNNRHIDQWNRMENPDISSSTYEQLIFDKGPKSINCGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKLKMVKIMEEKIGITLGALIHGINTIPTISKNAQAPEETLGKCELLKIKH	34363	39976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35273_37056
884968	SIRV6	+	1256	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	557	103	341	32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	45	AAAGTCTAAAATTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
884969	contig_13700_pilon	-	2857	12	Intergenic	novelGene_68276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.943177937477	2080	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	256	1002	163598	101018	TRUE	80	AAGCAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKDKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKIRASGDAKIKKEKENGFSSPPRIKDEPEDDGYFAPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDVKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKDKDKKVPEPDNKKKKPKKEEEQKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPESVNFCYDGNE	163853	96899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_98450_98704_98898_100905_101029_106505_106622_112534_112642_117817_117894_118876_118973_121767_121824_123039_123164_132820_132924_163213_163239_163565
884970	contig_21315_pilon	+	4368	1	Intergenic	novelGene_151570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGTGAAGAAGACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46620	50988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_46600_51000
884971	contig_19579_pilon	-	1751	7	Intergenic	novelGene_59386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_6	519.952775633412	1908	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	106	984	13090	7943	FALSE	65	AAATAAAAAAAATCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12301_12900
884972	contig_15744_pilon	+	1022	5	Intergenic	novelGene_83587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1568.37899995505	23	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	353	808	152116	153378	FALSE	0	GTTGTGTCTGTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINCNFLLQLFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFDDENFFLKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTARTDWLDGKHVVFGKVKEGMKIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQL	149503	153592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_149643_151902_152177_152263_152353_152532_152706_153245
884973	contig_7627_pilon	+	3041	3	Intergenic	novelGene_175559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1033	1878	11389	138810	FALSE	10	CTGTTGGCTGTAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQMLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSPL	9527	139973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_9837_10665_12208_138783
884974	contig_1008_pilon	+	3883	2	Intergenic	novelGene_121594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	409	junction_1	0	1512	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTGGCAAAATTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750420	764210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_760935
884975	contig_11512_pilon	-	3303	9	Intergenic	novelGene_43292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_8	409.135979840444	727	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	519	1349	396169	367967	FALSE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	419194	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314_409576_418977
884977	contig_10323_pilon	-	2659	1	Intergenic	novelGene_123587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	291	876	452	1327	460225	459350	NA	25	TAAGAGCCTGTGATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	460676	458017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_458000_460700
884978	contig_3825_pilon	+	844	7	Intergenic	novelGene_77955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1676	junction_6	714.269965302569	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	524	796	14814	15603	FALSE	15	GCCAGTGTCCATTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12985	15651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
884979	contig_10126_pilon	+	4757	8	Intergenic	novelGene_105723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1606.10526505861	1904	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	146	1021	162049	166639	TRUE	85	ACCAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRKTSLRKVEPGAQPLGSPRQRVHSLPAGVAAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139719	187607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139817_162000_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074
884980	contig_16970_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_157605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	861	1160	108396	108097	NA	40	GAGTTACCCAGCAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATSADCSDQDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKEDRRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPESGQPRKTKWD	109256	107674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_107700_109300
884981	contig_8853_pilon	-	5528	7	Intergenic	novelGene_159165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2184	2678	180376	179882	TRUE	40	TAACTTGAAATGTAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPALLARIKNTGNKKCWMGYGETGTLMHCWWECKMIQLFWKMIWRFLRELEIDIPFDPAIPLLGIDPREIRVVSRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWIKKLWYVHTMEYYATRKNNKESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	187807	102777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_-_103267_137306_138206_145101_145402_178719_180386_184700_184738_185433_186738_186974
884982	contig_8773_pilon	+	3931	1	Intergenic	novelGene_74525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1945	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCACTAGTACTGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41745	45676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_41700_45700
884983	contig_12837_pilon	-	4281	6	Intergenic	novelGene_57290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1467	2072	204453	203848	TRUE	45	ATAACAATAGGTGTATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNITTDPTEIKKIIPEYYDKLYSNKFENLEEKDKCLETHYLPKLTQTEIEKLNKPVTKEEIEEQFKNSQQKKSPSPNDFPGEFYQTFREELTPLLLKVFQSLEKDGILLNSFYEASITLIPKPGKDTTKKENYRPISLLNIDAKILNKILVDRIQQHIKKIIHHDQVGFIPAMQGWLNIRKTTNVIHHIKKTKEPHDLTN	309634	119986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_120153_142841_143569_196369_196577_202738_204866_266574_267512_309517
884984	contig_16594_pilon	-	3281	7	Intergenic	novelGene_53803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1935.2091546451	33	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	60	1088	272836	117336	FALSE	35	ATAAAACTTCTCTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILMHDKPKYENGKRLINLVIG	272895	115142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_117397_124981_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
884985	contig_7079_pilon	+	620	4	Intergenic	novelGene_129234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	467.477153333603	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTCTCTCTAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342459	349810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343001_348589_348706_349519
884986	contig_383_pilon	-	7203	23	Intergenic	novelGene_126089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2589	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCGGCGCCGGGGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169449	69422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_69601_79318_79410_116747_116962_118128_118272_123643_123867_125162_125331_126209_126388_127895_127991_128774_128989_130277_130432_132625_132838_134493_136795_141854_142024_143961_145290_148650_148831_150745_150862_153253_153324_154229_154335_155145_155307_157139_157282_159219_159372_164400_164584_169023
884987	contig_9839_pilon	+	3650	2	Intergenic	novelGene_88528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4774	junction_1	0	339	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56504	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_59927_61264
884988	contig_8210_pilon	-	3340	1	Intergenic	novelGene_30251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3	329	53093	52767	NA	15	ATCACCAGCTTTCCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYCRHRESNSQRARSQLLAVVWESKRGSCHSRNYPAPHPAGAGERVLSWPPAWSGTGAPLEGAAPRGPAAARAVSVLPCPRPCWAWRVGSGLRTLNQLPSPSVQGPRK	53095	49755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_49800_53100
884989	contig_6005_pilon	-	2070	6	Intergenic	novelGene_158888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	110.738249941021	64	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTTTATATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327322	311411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_325326_325713_326223_326883_327174
884990	contig_4442_pilon	-	8787	3	Intergenic	novelGene_127961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	147	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	5884	7428	1525110	1495787	FALSE	40	TAGTCAAAAACACTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDTEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNITKCIYAKLTANIILNGERLKTFLLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWENIPCSWIRRLNIVKMSILPKAIYKYNVIPIQIPTTFFKEMEKLITNFIWKGKTPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWCWYNNRYIDQWNRIENPDVNASTYGHLIFDKGPKSIKGGKDTLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEIIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTAKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGHYKSDKDLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKTWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSAFLKHKIIKIL	1552257	1494427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_1495824_1523602_1529147_1550410
884991	contig_4091_pilon	+	6800	6	Intergenic	novelGene_173043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	130	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1446	1949	36802	37305	TRUE	35	ATCATTCCTAATGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPNIKPKTIKFIEEKIRSTLEALIHSINRIQAITNNTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDREKIFGHYKSDKDLISIIYRKIQHLYNKKTNNPIKNWVKEMNRHFTKEDIQAAYRHMRKCSRSLAIREMKIKTTIRYHLTLVLLAQIKNTGNK	35356	314732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_38159_236731_237637_309698_310372_310423_310540_312357_314029_314099
884992	contig_9848_pilon	-	2063	9	Intergenic	novelGene_79952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.87212515043	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	748	1107	105976	104044	TRUE	10	GAGCAGTCGTTCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPHPPPRACHATPAVSVFLARDPVAVDYYNWGQFRKPLEDEDDSSSYQNVLICRPGTPEPDDNSEDYQNSASIQQWRESRRAVELVLGEAPPSLAGSPDEDDSEPDYVNEVTVARDT	110036	98498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99389_103977_104148_104467_104537_104841_104905_105852_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003
884993	contig_10323_pilon	-	5665	3	Intergenic	novelGene_123580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3125	junction_1	115	241	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	2912	4330	460768	459350	FALSE	15	GAGCCTGTGATTCCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	468741	458014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_463453_467386_467480_468607
884994	contig_6898_pilon	+	1943	10	Intergenic	novelGene_35700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1546.80530987796	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	134	1462	59668	127223	FALSE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMEPGSCLGCLVPSTSPSLALNSGAASFSTLSCVCSFSSYQYFIFQWYLVSNSVLISAYLANVPLEDISLGTGLYWPHSLTTPTPKKCILYYKRMF	59534	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122698_126939
884995	contig_14333_pilon	+	4999	10	Intergenic	novelGene_49122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	226.144496579805	2475	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	350	1453	396867	422143	FALSE	20	TACTGAAATGCGGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYFLFWLVSVATPKQKPKTPFCFVINALSQRYFLQANDQKDLKDWVEALNQASKITVPKGGSLPLATEVIKSPAVPPALEKKTQVAYKTEIIGGVVVHTPINQNGGDGQEGNEPGSHAILRRSQSYIPTSGCRVPTGPPLIKSGYCVKQGNVRKSWKRRFFALDDFTLCYFKCEQDREPLRTIFLKDVLKTHECLVKSGDLLMRDNLFEIVTSSRTFYIQADSPEDMHSWIKEIGAAVQALKCHPREMSFSRSISLTRPGSSSLSGVPNSILYRGRPPAEEKKTLCKAPSAASSWQPWTPVPQAREKMLPAEETPEDSLIMPRLGESKTAGVLPSSRIRHRSEPQHPKEKPFMFNLDDENIRTSDV	396517	425689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_396891_397050_397100_398576_398675_404560_404702_405250_405398_405722_405792_406191_406263_409108_409173_421243_421322_421780
884996	contig_6137_pilon	+	10824	15	Intergenic	novelGene_59230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_3	700.977033161863	4951	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	7562	8896	1328176	1348329	FALSE	30	CTGTAATTTACTAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRYLFFMKNFHGMIGTK	1312279	1350257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
884997	contig_10749_pilon	-	1403	12	Intergenic	novelGene_133455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1075.14371901106	54	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	251	1093	154244	136250	FALSE	30	AGTTCTGTAATGTCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157606	135939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_155158_155324_157542
884998	contig_12139_pilon	-	1920	2	Intergenic	novelGene_146456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGAATTTGGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66922	64966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_65135_65170
884999	contig_6361_pilon	+	4355	7	Intergenic	novelGene_23925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1635	1979	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	254296	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_255525_326889_327205_405268_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
885000	contig_12635_pilon	-	2205	10	Intergenic	novelGene_60808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_9	360.301965263638	110	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	249	1361	227344	180251	FALSE	70	TTTAAAAGAAAACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262856	179406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_262709
885001	contig_2278_pilon	+	4724	4	Intergenic	novelGene_118144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	517	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	3340	3729	1410919	1411308	TRUE	20	TGCCAGTTGAGCTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSGKMLCNILMLWILLRLALWPIMWSTLENVPCALEKKVYLPAVGWSVWYVSLRSSWLIVAFSSSVSLLNFFLDLLSFTKSGMLKSPTTIVELSLSVFSAVKSLFYVFLSPVIGCVNIYYCYVLVY	1406261	1483923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1406704_1408021_1411412_1482908_1483158_1483280
885002	contig_16766_pilon	-	2338	3	Intergenic	novelGene_153343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	797	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTACCACTCTGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108945	80785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_81402_103099_104634_108757
885003	contig_7056_pilon	-	2555	2	Intergenic	novelGene_43721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGACTAATGAGGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958722	955107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_955830_956889
885004	contig_5062_pilon	+	5157	12	Intergenic	novelGene_157838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	223.895304635931	1917	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	114	1520	706342	744018	TRUE	15	AGTTTGTGTGTTTACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	622708	748028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706344_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702_744854_745226
885005	contig_9345_pilon	+	1919	6	Intergenic	novelGene_24371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAACTCTCGCCCGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141104	176162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_142306_142580_142780_142954_143070_148861_148948_173643_173789_175989
885006	contig_2730_pilon	+	3969	5	Intergenic	novelGene_135357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	481.71484043986	2460	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATTCATTTCCTGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291588	394309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_361443_361478_379343_379459_390685
885007	contig_2438_pilon	+	1119	5	Intergenic	novelGene_112014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2465.96110826996	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	83	466	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310639_311994_312083_312305_312409_312729
885008	contig_10437_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_38379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACCTGAATTGTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638270	640168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_638300_640200
885009	contig_5643_pilon	+	1161	10	Intergenic	novelGene_38866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4118	junction_3	1641.29406939227	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	75	956	236108	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236033	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
885010	contig_13481_pilon	+	2553	6	Intergenic	novelGene_119549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	526.909631720659	3163	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	355	1005	1568681	1586220	TRUE	20	TTCCTTATGTTGTCAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568326	1587832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080_1586507_1586570
885011	contig_5549_pilon	+	693	3	Intergenic	novelGene_81589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_2	1341.5	200	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	40	420	82155	96749	FALSE	15	GCTCAAATTTGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82115	97022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_96620
885012	contig_5574_pilon	-	3902	4	Intergenic	novelGene_155821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1271	junction_2	234.095422139491	1425	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	84	560	81381	59952	FALSE	55	ATAAAACAAATGAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	120982	56609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_60155_78596_78729_81239_81394_120911
885013	contig_233_pilon	-	2593	15	Intergenic	novelGene_14513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	1284.17623281961	7	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	78	2150	109959	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCCSLWWDCSSSGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126959	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108453_109919_109976_126898
885014	contig_19378_pilon	-	3722	4	Intergenic	novelGene_73774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	217	783	18938	18070	TRUE	20	GCTTTGCTGACAGATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYGRPPPDVEGMTSLKVDNLTYRTSPDTLRRVFEKYGRVGDVYIPRDRYTKESRGFAFVRFHDKRDAEDAMDAMDGAVLDGRELRVQMARYGRPPDSHHSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	19154	14908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16747_16791_17502_17678_18335_18636
885015	contig_7657_pilon	-	8963	10	Intergenic	novelGene_30034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	570	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCTCTCTCGCTCCGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303927	217899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_218421_255710_255862_264414_264467_264834_264986_266970_267077_268682_268789_271568_271686_274527_274605_294981_295081_296344
885016	contig_19816_pilon	-	1454	8	Intergenic	novelGene_156504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	273.546474057678	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	142	1032	126303	123459	FALSE	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSGHGTRDPPLAALGGPGGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126805	123036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126391_126751
885017	contig_18108_pilon	-	2547	5	Intergenic	novelGene_33486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	262111	261764	TRUE	70	AGAATTTAAAAATAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTYFIILWDAIRKGGHLEKDSCTNTLILELILCFLPPKQFNANLLGYGFTRQEGKGGLVSGDTQTQGTKSIVTLCLRRDFQPGYGVVSWSSVVKVRHFTKQKKLSLKIQNINAT	262113	245847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_245920_247182_247267_250795_251000_252191_252314_260048
885018	contig_8208_pilon	-	8066	6	Intergenic	novelGene_178413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3903	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	984	1529	172306	171761	TRUE	20	GACCCAGATGGCTTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQPSISSHIKRQSMMASASSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRLIYRTLLEIRKEIQQSTETARRHTDTVVVELTKVIQEHNAQFNSLQESIEGQQSEIQKINNKISELDNSIESQRSRIEAVEVRISDIEDKALAANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERGG	173289	34254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8208_pilon_-_34556_53940_54952_65303_67295_158524_158970_159733_161501_170738
885019	contig_14744_pilon	-	2325	5	Intergenic	novelGene_66139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.607787113327	918	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	187	972	1702872	1695288	TRUE	20	TGCTGTTGGAATAAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVSRAASVSPLLPLLLGLLLLSAPHGGSGLHTKGALPLDTVTFYKVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKDNYPVFYLFRDGDFENPVVYSGTVKFGAIQRWLKGQGVYLGMPGCLPAYDTLAGEFIKASGKEARQALLKQGQDTLANVKETEKKWAEQYLKIMGKVLDQGEDFPASEITRITKLIEKNKMSDGKKEELQKSLNILTAFQKKGAEKVEL	1703058	1601740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1601765_1606042_1606332_1694247_1695791_1697721_1697861_1702728
885020	contig_11422_pilon	-	1428	2	Intergenic	novelGene_99068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2358	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1333_1518
885021	contig_15491_pilon	-	2607	6	Intergenic	novelGene_75930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.551109169279	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	98	799	46982	32303	FALSE	65	GAAAAAAATGTGAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMVSGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47079	30494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_40178_40302_45107_45180_46879
885022	contig_2646_pilon	+	1410	5	Intergenic	novelGene_69519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_2	280.430026922938	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	711	1061	566553	568284	FALSE	35	GGAAAGAGGAATTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEVSKSLSVLLEISVLLLIPNTNDQLLGYGQFLLYSVDRICKCN	554018	568633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566422_566586_567966
885023	contig_9312_pilon	-	6724	7	Intergenic	novelGene_178414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	161	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	2472	3380	180995	147465	TRUE	70	AAAAAAAAAAAACTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDEKILSKILANRIHQDTKKIIHSDQVEFIPGMHGWFNLRKTINIIHHINKDPSVCCPQETHLRNKDINLLKIKEWKKIYQANSHQKRARVAILISDKIYFKTKSTIKDKEEHYIMIKEAIHHADITIINIYTPNDRAPKYIKQILTALKREIDSSTIIVGDFNTQLSVKDRTSRRKLSKDTEDLMATISELELIDIYRALHPTAAKYTFFSNAYGTFSRTDHILGHRATLNKIQNIEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSVPWKLNNTVLKKHWVIEEIKDGIQKSLESNENENIS	290634	10359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9312_pilon_-_11420_84712_86888_147355_148215_180836_181737_270766_271950_289946_290129_290269
885024	contig_1150_pilon	-	1220	2	Intergenic	novelGene_61377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTGGGTGACTTCTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310480	308832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
885025	contig_3410_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_58894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCAGGATATATTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15469	13137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_13100_15500
885026	contig_15491_pilon	-	2564	7	Intergenic	novelGene_75944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	415.643042632604	2568	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	121	870	46982	37061	TRUE	20	AGAGTCTTTGGCCTCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47102	30747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37054_37200_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
885027	contig_4732_pilon	+	2307	15	Intergenic	novelGene_75435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	558.396227547049	2655	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	393	2051	653092	675284	FALSE	15	AAAGCTGCTTGGCTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGQTMERIGSGVERMGAGMGFGLERMAAPIDRVGQTIERMGSGVERMGPAIDRMGLSMERMVPAGIGAGLERMGPVIDRMATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634966	675540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_670261_670316_672214_673018_673616_673669_675120
885028	contig_3153_pilon	-	8685	13	Intergenic	novelGene_104642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14324	247	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2736	3086	432268	431918	TRUE	30	AAGAACCTGGCATCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIENIKTNERVSNCKSWFFEKINKIDKPLAKPSKEKQERKQVTRVRNKMGDITIDPTEIKRIITEYCEKLYSNKFKNLKEMDKFPETHYLPKLIQTKVEKLNKPIIKEDIEKII	498436	80759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_81032_117469_118867_160289_163152_181798_182125_306907_306920_400119_400123_419054_419357_419510_419897_431878_432902_433543_433908_466576_467619_472382_472887_498244
885029	contig_8210_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_30208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1399	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACATTTGTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15029	12597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_12600_15000
885030	contig_10734_pilon	+	2131	4	Intergenic	novelGene_51354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	15.5777619273972	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGAGCAGGGCTGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1779735	1784931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1783470_1783581_1784314_1784402_1784841
885031	contig_15112_pilon	+	3151	3	Intergenic	novelGene_124763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGTTTTTGATTCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25457	61909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_28130_61055_61114_61488
885032	contig_5084_pilon	-	602	5	Intergenic	novelGene_64515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	281.729812941407	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	281	601	377978	365346	FALSE	80	AGAAAGAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMTEKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAK	408091	365344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_365380_375773_375979_377896_378079_394664_394776_408022
885033	contig_1725_pilon	+	2816	19	Intergenic	novelGene_24277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	561.18385667057	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	44	2497	201480	255543	FALSE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201436	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
885034	contig_854_pilon	+	4936	24	Intergenic	novelGene_36578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	2476.01174295049	9	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1140	3423	492	3914	1679334	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1678842	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165
885035	contig_19402_pilon	-	4114	11	Intergenic	novelGene_80817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	360	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACTAGAGCAGACACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146721	79168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_102161_102225_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796
885036	contig_6576_pilon	+	3041	3	Intergenic	novelGene_42426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAATAATACTCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299939	1304204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1301115_1302251_1303073_1303159
885037	contig_11318_pilon	-	4109	19	Intergenic	novelGene_48127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_18	970.555022896248	2073	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	334	2358	49795	14674	TRUE	60	AAAAAAAATCTTTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGMLSFPSFLPFLLFS	58314	8456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_58143
885039	contig_19851_pilon	+	3281	2	Intergenic	novelGene_29879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACTGGGCTCCATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54027	57476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_54818_54985
885040	contig_9924_pilon	+	1804	13	Intergenic	novelGene_175920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	676.554547361523	4	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	100	1383	15841	148193	TRUE	25	GTAACCAATTTGTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETGSPPRSAINQNTDKISGAGTNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKKKR	15741	171886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352_127966_148181_148196_166286_166381_170996_171100_171664
885041	contig_12425_pilon	-	2494	7	Intergenic	novelGene_46662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	752.959807839849	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	452	754	206628	204225	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226608	202484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207259_210298_210389_211048_211200_226517
885042	scaffold_12124_pilon	+	2264	11	Intergenic	novelGene_22287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3150.87535297733	93	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1442	2092	1508755	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1492789_1492949_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
885043	contig_7898_pilon	-	1078	7	Intergenic	novelGene_47518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5680	junction_5	1651.6703329929	18933	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	51	1007	285587	282118	FALSE	10	GCCCTCTGCACTCTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	285637	282046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533
885044	contig_9468_pilon	-	1603	3	Intergenic	novelGene_59525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1183	1509	680400	515155	FALSE	35	AGCCAATTCCAACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNYLFCKPSPEVQLKKKSTIAEMKNSLEGLNSRFELAEGRISEPQYSSIEIIQSEVRNIECTGRKYRKSILHDHTTAIYPDPDLYYRPIIAASSKPCFSGIIHNLAH	761254	515060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_515446_680364_681245_760916
885045	contig_18970_pilon	-	3909	1	Intergenic	novelGene_157812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1399	1863	33854	33390	NA	25	CAATGTTTATCATCTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWALVGVCGIGQMQGLQKEYRIAEPRVVVWRSTWGGRKGRQGRRRLQGLIHQGEKSLWNEQPTIVLHPTEKDSVVTGADLVPASEKELGKGTRPWMGRGLGRGLPSPLWLATCLHSPTPPPVAWVCHAQQVPALAGPPGDRPQVLAPPVLVRA	35252	31343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31300_35300
885046	contig_1435_pilon	+	3201	5	Intergenic	novelGene_115488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	291.374651436943	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	167	673	554837	563411	FALSE	5	TGTTAGCTGGTGCTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGALREAEGSAGPDDSRRTINDVEKEKETYNYLSKEEIKEKVHKYNLAVTDKLKMTLNSNGIYTGFIKVQMELCRPPQTSQNPGKLAATSNGCMNTLHISSTNTVGEVIEALLKKFHVTDSPAKFALYKRCHREDQVYACKLSDQEHPLYLRLVAGPRTDTLSFVLREHEIGEWEAFSLPELQNFLRILDKEEDEQLQNLKKRYTAYKHKLEEALSEVWKPD	487092	565939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_487160_554737_554846_557482_557721_560262_560373_563261
885047	contig_14704_pilon	+	3766	4	Intergenic	novelGene_82679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1821	2186	18268	18633	TRUE	55	GAAACTGAAAGAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLGINRTKDVKDLCKENYKTLPRETKRDLHTWKNILCSWISRLNNMKMTILPKAIYKFNAIPMHILTTLFKEMEKTIINFTKEKRPQISQALLKKKNKVGGLALPDLRTYYTATVIKTA	16447	35467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_19131_19855_20335_20373_20724_35213
885048	contig_10599_pilon	+	3558	9	Intergenic	novelGene_49863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_1	745.547407949354	1318	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	153	1136	123528	163915	FALSE	35	AATGTGATGGATCACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123160	166337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
885049	contig_312_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_128317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTGTGTGAGCAATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440536	441728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_440500_441700
885050	contig_2036_pilon	+	2763	5	Intergenic	novelGene_131797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232048	423585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_232060_232106_232867_313850_314710_422333_423265_423383
885051	contig_6871_pilon	+	6147	4	Intergenic	novelGene_21550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	524.521580956293	3243	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	148	1419	125299	135017	FALSE	45	ATAACAGAAACTTTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKRQHRRVVRSVISGVGWPELETHLHCWPVVRLWESYLILLHFSFLIGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	139745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_125239_125444_129792_129843_133940
885052	contig_6159_pilon	-	2172	3	Intergenic	novelGene_128263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	145	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	113	415	314676	312453	FALSE	20	CTGACTGTATTCTTCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLELDTNLPADRVPAGLEKRLCAATAAILSKPEERVNVMVRPGLAMVVNGSAEPCAQLLVSSIGVDNYPLLPPGALADWQEGDSHDFLMIGMEGIQGM	314788	310695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312555_314215_314309_314568
885053	contig_12312_pilon	-	5052	15	Intergenic	novelGene_63935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	832.630307874892	3753	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	98	2086	326065	215838	FALSE	55	AAAAGAATCTAGAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326162	212871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218804_235099_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
885054	contig_5686_pilon	+	9785	4	Intergenic	novelGene_45208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1375.15962709789	1604	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	114	635	93669	171803	TRUE	20	ACCGGGCACCATCTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKPIHTNEAVFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLE	93555	181004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_176617_176667
885055	contig_4857_pilon	-	5620	16	Intergenic	novelGene_48757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2444.64404680018	1473	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	468	1475	1249503	1214596	TRUE	65	CAAAAGGAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMLRLTLQTTSDGVMLDKDLFKKCVQSNIVLLTQAFRRKFVIPDFMSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVSWSSCKIWSCWGHSFSCPQCHGHDVLVSSSGQDGQQC	1263933	1208320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216719_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122_1243253_1249432_1249555_1249909_1250007_1263360_1263560_1263813
885056	contig_9366_pilon	-	7096	18	Intergenic	novelGene_166272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4498	4809	1059697	1058337	TRUE	20	CCGGGCATAATGGTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAAVGCRVIATDIRLDLGPFGDVPKGDVKNKVPGSVLMSFLLDSELFPVLLGRIGMIGEGTGSGGSSLTNDKSGYLLTAVPTTLSGEDEGTKLSGVSRSPQ	1093067	1042566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1044172_1052667_1052884_1053574_1053740_1056332_1056475_1056621_1056770_1058325_1058507_1058657_1058793_1059690_1059948_1061256_1061392_1062001_1062110_1066164_1067285_1068527_1068667_1070014_1070156_1070427_1070596_1087903_1088021_1088562_1088638_1088924_1089034_1090932
885057	contig_9363_pilon	-	4006	28	Intergenic	novelGene_6562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	877.657846159056	26	97	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1112	3339	163	3501	786587	753891	FALSE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEDAPLDFHISQGRGGPRSALHSPVSPKVVPSVPLRVTLFTSASSVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGQRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQRSTTDPLLSENFLHGRVHSPAGACAAGTELPWRSHWWSQVLVSQHEPVPAHRTLQLMGSINMSNEQ	787928	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754093_755631_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766005_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_781037_781246_781352_786541_786648_787826
885058	contig_1719_pilon	-	783	4	Intergenic	novelGene_87357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	643.208796236149	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	56	457	803613	754873	FALSE	10	CCTTTGAAGTCTTTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803668	754546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_786510_786598_787980_788100_803564
885059	contig_17144_pilon	+	2991	11	Intergenic	novelGene_29116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	487.26154167962	86	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	925	2778	38	2815	5087	22548	FALSE	15	GAGGAGGCTGGCCTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIAGVNKNQEEEKSGKWEGLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFSERSRKEDRGGAKRSESGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRGKGDFSTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGSYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSEKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNLQPTTE	5049	22724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_11654_11725_11814_12357_13329_13503_14254_14367_15442_15528_17464_17653_19971_20171_20624_20769_22326
885060	contig_12644_pilon	+	1320	11	Intergenic	novelGene_44613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4309.84314795794	12	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	53	1246	2675526	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHLAESRLPLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675473	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679567_2679628_2679649_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
885061	contig_6076_pilon	+	4020	1	Intergenic	novelGene_81733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1482	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCTTGGCTCCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51848	55868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_51800_55900
885062	contig_10494_pilon	-	2797	8	Intergenic	novelGene_102158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1089.8042325602	535	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	180	551	910844	905947	TRUE	25	GGATTCCAAGTGTTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSQLTTLQVLITGGIVATAGQFTQWYFGAYSIAAGVLVCLLEYPRGKRKKGSTMERCGQKYMTSVVKMFGPLTRNYYIRAFLHLVLSVPAGFLLATILGTACLAIASGIYLLVSGPPWGTC	912940	903252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_904289_904736_905977_906373_906456_907136_907221_907637_907713_908356_908427_910813_910949_912865
885063	contig_16103_pilon	+	3497	15	Intergenic	novelGene_118742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	33.0750537969853	1356	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	32	442	312192	313449	TRUE	30	GAGGCCACACAAACCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGSAAVSGAGTPVAGPAGRNLFAEGLFEFLRPAVQQLDSHVHAVRESQVELREQIDNLATELCRINEDQKVALDLDPYVKKLLNARRRVVLVNNILQNAQERLRRLNHSVAKETARRRAMLDSGVYPPGFPSK	312160	321046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_312335_312601_312649_312907_313027_313347_314673_314804_314895_315103_315219_315293_315360_315760_316398_316881_317389_318032_318136_318474_318552_319099_319206_319791_319833_320328_320390_321017
885064	contig_10057_pilon	-	1727	5	Intergenic	novelGene_162335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	1938	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	64936	35399	FALSE	35	AGGGAGAGACCGAAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64958	34272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
885065	contig_5084_pilon	-	769	6	Intergenic	novelGene_64513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	314.673799354188	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	443	769	377978	365340	FALSE	80	GAAAAGAAAGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMTEKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAKKK	408197	365339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_365380_375773_375979_377896_378045_380465_380556_394664_394776_408022
885066	contig_14666_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_39648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485288	486997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485300_487000
885067	contig_17440_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_7563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCGGGCTAGGCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2142	1428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1400_2100
885068	contig_7066_pilon	-	2265	6	Intergenic	novelGene_42183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_1	234.629068957791	2542	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	31	537	992983	982719	FALSE	15	TCCCCAGTGGAACTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFPAQPAPAMTATLRPYLSAVRATLQAALCLENFSSQVVERHNKPEVEVRSSKELLLQPVTISRNEKEKVLIEGSINSVRVSIAVKQADEIEKILCHKFMRFMMMRAENFFILRRKPVEGYDISFLITNFHTEQMYKHKLVDFVIHFMEEIDKEISEMKLSVNARARIVAEEFLKNF	993013	980990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_982725_984840_985012_986396_986493_987936_988049_989339_989459_992980
885069	contig_19378_pilon	-	1380	4	Intergenic	novelGene_73780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.549615007593	39	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	19145	18070	TRUE	20	TTCAGAATATGTCTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGAEWVCSRRAASFFQTSPRGKRLPRRRSRSRSRSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	19146	15995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16755_16798_17040_18062_18365_19068
885070	SIRV6	+	1017	9	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	3	77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATGGAACAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
885071	contig_17803_pilon	+	4614	2	Intergenic	novelGene_175024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1955	2311	35411	35767	FALSE	40	AGCCAATAGAATTCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNYQVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQVAQRTPYRRDPKRNSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETRQARRQWDDI	0	38070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_+_958_34413
885072	contig_854_pilon	+	1593	2	Intergenic	novelGene_36374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974698	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975729_975855
885073	contig_5039_pilon	+	3918	2	Intergenic	novelGene_64768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGGGTTATTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120569	189362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_123883_188757
885074	contig_1264_pilon	+	3454	2	Intergenic	novelGene_161310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGCAGAGACAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135010	139903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_135290_136728
885075	contig_5039_pilon	-	3396	1	Intergenic	novelGene_64767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	535	834	123431	123132	NA	85	GAAAGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHSFSLVVKLSSRFNFQPGSGQPHKTKWD	123965	120569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_120600_124000
885076	contig_8907_pilon	+	6680	7	Intergenic	novelGene_85823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	130	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1060	1809	257723	435338	TRUE	35	GGGAGAAACCTCGAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIKAELNEIEKRNTIERINRTKSWFFEKVNKIDKPSVKLTKEKQKRKQITQIRNEMGNITTDPTEIKRIITEYIKQTLSALKKETDSYTIVIGDFNMPLLVKDRTSRKKLSKDTEELNATINQPDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSSTHGTFSRIDHILGHKASRNKIQNIEILQSIFSDHKSIKVEINNTKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIKEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGSL	256663	760303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_257940_434805_437328_460846_461827_560012_560353_563510_563746_707147_708195_760023
885077	contig_408_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_84901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCAATAAAGTCCAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131316	133525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_131300_133500
885078	contig_14333_pilon	-	4828	13	Intergenic	novelGene_49111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3215	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3395	3850	422100	409116	TRUE	15	TTTCCGGGTTAATTACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGFSLGCWGSDLCLIRELGNTPAVLLSPSRGMIKESSGVSSAGSIFSLAWGTGVQGCQEEAAEGALQRVFFSSAGGRPLYKMEFGTPERLELPGRVKEIDLEKDISSRMALEGLDSCPNLLNPAVHVFGTVGLYVEGPGACYYFKEVVSH	425697	353885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_354061_367118_367280_387312_387371_397048_397099_398575_398679_404564_404700_405248_405397_405721_405789_406188_406262_409107_409170_421240_421321_421778_423946_424148
885079	contig_10323_pilon	+	2807	1	Intergenic	novelGene_123577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4735	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	1950	2564	459964	460578	NA	10	CCTTGTCTTCACAGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFLQGLAIFSSCFSSSWSLSSSVMCPRSPPVGCSFLHGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRPLGPLAPQHELPLPHPHSLWGCHTARQCLYHLPFQRLVCAKEQIPDTVGC	458014	460821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_458000_460800
885080	contig_15977_pilon	-	4561	2	Intergenic	novelGene_137216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCGGGGCAGGGGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82530	77832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_78476_78612
885081	contig_10074_pilon	-	1783	1	Intergenic	novelGene_57190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	434	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTGCCACGGTAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575847	574064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_574100_575800
885082	contig_16660_pilon	-	2196	2	Intergenic	novelGene_178415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53577	4	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16660_pilon_-_1113_52489
885083	contig_8631_pilon	+	4388	4	Intergenic	novelGene_121983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAAAATTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836305	1066315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_837456_1016589_1017930_1035672_1036538_1065282
885084	contig_6871_pilon	+	7259	1	Intergenic	novelGene_21576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1688	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	315	948	1584	2531	134070	135017	NA	45	ATAACAGAAACTTTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	132486	139745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_132500_139700
885085	contig_14970_pilon	-	6868	9	Intergenic	novelGene_45111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	141.072676305513	1591	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	192	1097	327651	291094	TRUE	40	AAATTTTAACCAGATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKQVEVRMHDSHLTSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVLGVILGAVCGGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTVIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVTKKVLVAPKSEEEANATSAIVSLLNETVTEAPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGEQAKLMVEFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPPGYCLPNLWEDHCNQGLGGGC	327842	263691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_317271_317441_323363_323615_325523_325677_327521
885086	contig_16098_pilon	-	2220	1	Intergenic	novelGene_46243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1698	2030	825122	824790	NA	35	GGTTTGCAAATAAACGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCVIGPLRYSVPTCPAGGIRTDWLDHGPDPSSSRADSVLATGLCGEGHILSSASSHSLPESAYNTHTLTSCQTPPQPSRLSSNVCEATLAALTLNRGSVSSPRLQCLM	826819	824599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_824600_826800
885087	contig_13319_pilon	-	5815	5	Intergenic	novelGene_178417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2940	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2459	2848	27216	26827	TRUE	30	AGGGGGGGGGAAGCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAWNPGSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGFSPARQPRPGSSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQHQHPTNGPQRAARPGARNPSSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGI	29911	220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13319_pilon_-_652_1104_2568_22216_22322_25858_28313_28549
885088	contig_12964_pilon	-	4156	1	Intergenic	novelGene_131700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1652	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559839	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555700_559800
885089	contig_5779_pilon	+	7540	5	Intergenic	novelGene_106465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	766	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2828	3169	136802	137206	TRUE	20	TCCACGTGTATGCAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVRVQNKIPDDFPVEEKALELIHREFKSLILRIIQGLKQKAEKKNRQIHGKGRQKQMEEFNKKSQKINNKISEMDSVIEGLRRMFEMMEDRITETEEKHLATTPRKNQKKE	110448	284159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_111725_134973_135141_135417_136995_137057_137861_280442
885090	contig_17144_pilon	-	1519	8	Intergenic	novelGene_29461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1364.30541496621	121	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	317	1231	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183398	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168227_179710_179786_181794_181850_183158
885091	contig_13888_pilon	-	5816	1	Intergenic	novelGene_151812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCTTATCTGGGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364579	358763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_358800_364600
885092	contig_10902_pilon	+	2921	10	Intergenic	novelGene_65664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	470.816417264131	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	57	1223	79192	110362	FALSE	15	TAACTCTGATGTTTTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRALRGHLRVFPSVCPSDMEPKRIREGYLVKRGSVFNTWKPMWVVLLEDGIEFYKKKSDNSPKGMIPLKGSTLTSPCQDFGKRMFVFKITTTKQQDHFFQAAFLEERDAWVRDTKKAIKCIEGGQKFVRKSTRRSIRLPETIDLSALYLSMKDAEKGVKELKLEKDKKIFNHCFTGTCVIDWLVSNQSVRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDLSKTAVDGTSENPFLDNPDAFYYFPDSGFFCEENSSDDDVILKEEFRGIIIKQGCLLKQGHRRKNWKVRKFVLREDPAYLHYYDPAGGEEPLGAIHLRGCVVTSVESNSDGKKSDEENLFEIITADEVHYFLEAATSKERIEGILNVINHVLEVHLHSIAHRNSLPLLMCPKQKKQAVWSGWAALPLQDSSLF	79135	112060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_79234_93945_94102_94343_94526_96496_96589_100102_100288_102136_102242_107118_107203_108075_108146_109942_110038_110206
885093	contig_11978_pilon	+	3545	2	Intergenic	novelGene_62904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACAGCCCACAGAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773949	777843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_777361_777709
885094	contig_8377_pilon	-	15466	2	Intergenic	novelGene_35062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1621	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	7523	7846	113358	113035	FALSE	25	ATTCGGGGGAAGGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYSLGKQAILKENVTDMEVGQDLLVFLPNYSSKVHEFTNFRMLTELQQTFLGASLLGTNSYPRNTRQKSLTRKTETKIIRRRTWEKHRQCREDKKPKANWNSYPQE	123303	105414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_120645_123067
885095	contig_8138_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_52510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAAGTTAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481994	472307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_472953_481893
885096	contig_16303_pilon	+	1122	3	Intergenic	novelGene_34133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATAGTCTTAACGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58165	65406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_58587_58999_59309_65014
885097	contig_854_pilon	+	6219	34	Intergenic	novelGene_36515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3241.53920631526	6	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1536	4611	327	4937	1683971	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612777	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649577_1681837_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715052_1715192
885098	contig_11898_pilon	-	5115	1	Intergenic	novelGene_144280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1445	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	12	308	214906	214610	NA	30	AGCACAGCCTAGGGCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSMNFIVFGFIFRSLIHFELVFVYGMRYGPCFIFLQMDIQFCQHHLLKRLSVPHLMDFGPLSKIRRLQVNGFTSGFSILFYWSMYLLLYQYQAVLTTVAV	214917	209802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_209800_214900
885099	contig_408_pilon	-	6883	3	Intergenic	novelGene_84911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	374	junction_2	346.5	2146	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4262	4711	138764	133511	FALSE	35	AAAGCACTTTCATGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPTLQFLAQLKLMDYSLLVGIHDVERAEQEEVECEVNDWEEEGESDGTHPVGTPPDSPGNTLNSSPPLAPGEFDPNIDVYGIKCHENSPRKEVYFMAIIDILTHYDAKKKAAHAAKTVKHGAGAEISTVNPEQYSKRFLDFIGHILT	143025	131338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133592_136727_136832_138499
885100	contig_6418_pilon	+	3139	13	Intergenic	novelGene_81201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	220.700950886538	44	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	988	2559	1361867	1444680	FALSE	55	CACACCATACAGTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAQLKEEVHYATVYWKSSEKAMRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341067	1445260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1361198_1361892_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
885101	contig_3602_pilon	+	2942	1	Intergenic	novelGene_60618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1857	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	348	1047	144	1190	912142	913188	NA	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	911998	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_912000_914900
885102	contig_9197_pilon	-	3145	3	Intergenic	novelGene_154370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2605	2934	81764	80501	FALSE	10	CCGAGTCCGCGGCGGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGTGHLLPYQLCTRVSSSERPASAAMRHSVVGSGCLLTLLKLYSRISTWSSVGPFAVSADMVPARLRPAGCPSSRRFLATRGPAAAAGAALAALPGVALPGRPSRDEP	84368	80289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_-_80627_80728_80891_81722
885103	contig_34_pilon	-	2841	7	Intergenic	novelGene_40013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1234.44638963743	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1904	2578	214146	212049	FALSE	75	TTAAGAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247107	211785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
885104	contig_19579_pilon	-	1757	7	Intergenic	novelGene_59381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_6	598.122270108713	65	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	106	987	13090	7943	FALSE	55	TAAAAAAAATCTATATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHIGATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012_12301_12900
885105	contig_9706_pilon	+	408	1	Intergenic	novelGene_20758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2438	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTAGACTTTAGAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141	549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_100_500
885106	contig_8138_pilon	+	2090	4	Intergenic	novelGene_52404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1062	junction_1	35.2262528363278	3254	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	249	704	280295	306552	FALSE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280046	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364
885107	contig_9112_pilon	+	1550	4	Intergenic	novelGene_60197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.551661385832	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	306	1073	108641	114303	FALSE	90	AAAACAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108335	114780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108711_111605_112128_113625_113750_114251
885108	contig_17144_pilon	-	1902	12	Intergenic	novelGene_29519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1623.1735928103	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	375	1622	172541	166363	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183238	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172661_176235_176271_179700_179786_181794_181850_183158
885109	contig_11815_pilon	-	2567	2	Intergenic	novelGene_50933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1063	1425	299755	299393	FALSE	60	GATTTAAAACTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLCFIGGGGRLDPAMPFLVFNLGCCFAGLLAISAQDAGFGGAMVAGGKLLEATMLLVIDPLPTAEPTTFGTLLATSVLPNFSAAIPWSIVFMPGALFRVSLAKADCPSIMAPPKELGA	323094	298250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_300641_322917
885110	contig_8866_pilon	-	7289	4	Intergenic	novelGene_77775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_3	360.834526556919	1319	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	130	297	361186	361019	TRUE	30	TAGCAGAATTTCAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVPGSQDAGCGLSFSLFWKKHKIHTLGAQSWVGNFSISDSGMNLRVLKLPKCFTLKLGSFLLSLTQPFYELSRMGTLFFKPDNFQQREWPIDHWHA	361315	340773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_349552_352283_352488_356563
885111	contig_9177_pilon	-	3561	26	Intergenic	novelGene_32619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1797.76497507322	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	208	2859	26442	16653	TRUE	35	TGTGTGGACAGAGCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	32933	15162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
885112	contig_5696_pilon	-	4158	6	Intergenic	novelGene_117576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1635	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGGAACCTGTTTAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739586	714959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_716735_730426_730595_731912_732064_732416_732504_734429_734592_737771
885113	contig_9668_pilon	-	2522	15	Intergenic	novelGene_58188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_13	779.939545014581	589	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	213	2204	605373	503609	FALSE	20	GTTTTTCCTGAAAGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669988	503290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610423_610514_669866
885114	contig_17014_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_163161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTGTTACTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14830	16414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_+_14800_16400
885115	contig_15105_pilon	+	6861	16	Intergenic	novelGene_150970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	503.68501621108	3878	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	89	1873	600046	627498	FALSE	55	TAAAAATTTTCACACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDIATECAIRHRYNAVTGEWLQDEVLIKMASQQPFGRGAMRECFRTKKLSNFLHTRQWKGASNYVAKRYIEPVGRDVYLEDVRLQMEAKLWGEEYNRHKPPKQVDIMQMCLIELKDRPGKPLFHLEHYIEGKYIKYNSNSGFVRDDNIRLTPQAFSHFTFERSGHQLIVVDIQGVGDLYTDPQIHTETGADFGDGNLGVRGMALFFYSHACNRICKSMGLTPFDLSPKERDTVNQSTKLLQSAKTILRGTEEKCGSPRVRTLSGSRPPLLLRLSENSGDENMSDVTFDSLPSSPSSATPHSQKLDNLHWPVFCDLDNLAHRDHDHLDNHRDSENSGDSGYPSEKRGELDDPEPQEHGHSNGNRRYESDEDSLGSSGRVCVEQWNLLNSSRLHLSRPSAVALEVQRLNALDLEKKIGKSILGKVHLAMVRYHEGGRFCEKDEEWDRESAVFHLEHAADLGELEAIVGLGLMYSQLPHHILADVSLKETEENKTKGFDYLLKAAEAGDRQSMIVVARAFDSGQNLSPDRSRDWSEALHWYNTALETTDCDEGGEYDGMQDEPRYMLLAREAEMLFTGGCGLEKDLQRSGDLYTEAAEAAMEAMKGRLANQYYQKAEEAWAQMEE	591542	632486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_591582_599996_600058_602077_602119_602595_602768_606307_606458_606872_607006_607473_607602_608359_608562_610214_610283_613679_613758_614572_614636_617328_617464_617625_617815_619244_619370_621244_621424_627388
885116	contig_7457_pilon	+	4630	24	Intergenic	novelGene_31488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	70	junction_6	269.621782284076	39	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	159	2327	641631	668868	TRUE	15	TGAGAGCGTGGCACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDEHPSLVFLLPVCWERPRGLREPRGPHPGPSAASACRASAGETVGTPDSSRMAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGNGGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILSTKPPGTFLLRFSESSKEGGITFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPFIDAVWK	612256	671993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_612392_641607_641759_642572_642718_643349_643449_648697_648794_648955_649038_649226_649322_649492_649645_651964_652124_652278_652372_653188_653249_658208_658239_658337_658432_658533_658582_660732_660817_661554_661654_661789_661926_662947_663001_663253_663349_663458_663599_664102_664316_668470_668514_668843_668907_669728
885117	contig_1836_pilon	-	3232	1	Intergenic	novelGene_71080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2777	3142	994673	994308	NA	30	ACCAGTGTAAATGGCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLIERIMTGGYVEARNLGGLLLEDKGHHRSDGHSPNGQTNEGSPPQGAPGEGLHGIHHSQKAVNAYDCHEHDGGVHVTVKRCCDEATHFRPKFPVTSRKVIADLKGEYSHKQHICHGQM	997449	994217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_994200_997400
885118	contig_8138_pilon	+	1935	3	Intergenic	novelGene_52420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	514	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	219	575	280295	306577	FALSE	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKSVHWRRRGRVPNCRPTIPPQTTASTPTPRAAPSLPSMEAQTPARSQSRKSPKAGRNSGWRPAKLSGAGQQ	280076	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_306364
885119	contig_11104_pilon	+	792	7	Intergenic	novelGene_112456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	284	706	316012	326692	FALSE	30	GTAAATGACTGTTTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTLEQEAKRQRLPMPSPERLEKVVDSMDALDKVVQEREDALRLLQTGQEKARPGAWRRDIFGRIIWHKFKQWPIPWYLNKRYNRKRFFAMPYVERFVRLRFEKYARTESRKKSLKKKKEKILQEKFPHLSEAQKSSLA	310061	326778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_310113_312719_312866_313391_313453_315986_316084_319862_319994_321561_321658_326568
885120	contig_9177_pilon	-	3300	22	Intergenic	novelGene_32587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	781.999182281181	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	424	2007	9494	3803	TRUE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLPMATWNCWTMCY	10664	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4317_4530_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572
885121	contig_7840_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_69009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283404	285644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_283400_285600
885122	contig_16310_pilon	-	3051	13	Intergenic	novelGene_70042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_1	1020.11431821253	44	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	129	1424	66135	59959	TRUE	10	CTGGTGCCAGACTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSRKFGYVDFESAEDLEKALELTGLKVFGNEIKLERPKGKDSKKDRDARTLLAKNLPYKVTQDELKEVFEDAMEIRLVSKDGKSKGYVLCLLEY	66263	56155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56622_56971_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_60111_60991_61117_61552_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
885123	contig_4654_pilon	-	7178	6	Intergenic	novelGene_103036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	175	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	2710	3534	186163	185339	FALSE	40	CCAACACCTCTTCCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKIDKFMENTDKKLEEFRKTMQEQTAKINSQLEITQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLNTTMFEDNSEKRTKKNEETLKVMWDTIKSKNLRVIRILEQRKKRENTERIIEELLTENVPSIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLVKTKHKQRILRAAREKQEVTYRGDTIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVL	283294	181694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_186417_187142_187174_222883_223627_266736_266906_281373_281917_282324
885124	contig_16103_pilon	-	1889	9	Intergenic	novelGene_118827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3996.209983769	26	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	292	654	735970	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	742945	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722719_722914_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_742792
885125	contig_9653_pilon	-	3970	14	Intergenic	novelGene_48288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_7	825.367294964874	58	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	33	2153	1040020	1006903	FALSE	40	ATAAATGTTATCTGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040052	1005085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
885126	contig_2577_pilon	-	2722	2	Intergenic	novelGene_172054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1340	1804	101414	100950	FALSE	55	AAGCAAAGACAAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTPNFSQQLKILSVCLESSHILSSSERKLLNFLTCSNLHCRPLSRSVTELFVVLGSLPIIILETPFCLRFPISGILLLYFGRSPGDTMVKHLAAKHKVGAKQKVSGLQLNWRKDQLNWRKDQLNWRKDRAICSRKDYSLGDPMGQFYSFIEG	125541	100031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_102713_125500
885127	contig_383_pilon	-	3869	2	Intergenic	novelGene_126137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2160	2528	162850	162482	FALSE	40	CCTCTGCAAAATTGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTHCEEWEFQNTLIVLMRNLYIDQEAVIRTEQGDTVWFKVRKGVRQGCILSPYLVNLYAEQIIQEAGLYEEEQGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAEGKEDLKHLLMKIKDYTAFSTDYTST	169449	161140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_164584_169023
885128	contig_11427_pilon	+	3734	3	Intergenic	novelGene_78963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3	580	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	119	1180	70518	71579	FALSE	60	TCACCAAAAATGCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYETTSPMYYDMDYSASEPCQKLDVRQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLVNCKKLKSMTDIYLLNLTISDLLFLLTLPFWTHYATNGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVAGLVSLPGIIFTRSQKEGLRYTCSPHFPSSQYHFWKNFQTLKITILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFAIMIVYFLFWAPYNIVLALTTFQELFGLDNCNSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFRKHIAKRLCKYCPSFQLEAPERVNSVFTRSTGEQEISTGL	67967	74133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_68007_69277_69346_70506
885129	contig_15407_pilon	-	3379	9	Intergenic	novelGene_123074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGCTAGCTAATGTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472471	449459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468070_468151_468305_470254
885130	contig_19816_pilon	-	1450	9	Intergenic	novelGene_156499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	256.162759539711	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	20	1027	126795	123459	FALSE	15	TTCCAGAATCCTGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHETQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126814	123035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124810_124887_124935_125577_125854_126164_126435_126731
885131	contig_7452_pilon	-	1973	3	Intergenic	novelGene_109146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGAGACCTCCCATGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159796	118770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_118882_155886_155975_158022
885132	contig_9548_pilon	+	3859	7	Intergenic	novelGene_141053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	159.008822256992	1661	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	29	703	127751	141662	FALSE	35	CTCATTTAAACCTTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLRQRGKMAANVPQRAWTVEQLRSEQLPKKDIIKFLQSHGSDSFLAEHKLLGNIKNVAKTANKDHLVTAYNRLFETKRFKGTESINKVSEQVKNVKVNDDKPKETKSEETLEEGPPKYTKSVLKKGDKTNFPKKGDVVHCWYTGTLQDGTVFDTNIQTSSKKKKNAKPLSFKVGVGKVIRGWDEALLTMSKGEKARLEIEPEWAYGKKGQPDAKIPPNAKLIFEVELVDID	127722	144818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_127859_130889_130992_132207_132316_137204_137341_137799_137868_139965_140064_141607
885133	contig_5400_pilon	-	1640	3	Intergenic	novelGene_162828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50.5	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	475	1071	271258	268944	FALSE	10	TCCTGTATTTGTCTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRCLEPSGNGAEGTRSQWGTVESAEEPPPEAARLATALRELSQTGWYWGNMTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	274136	268374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_271119_271483_273886
885134	contig_12837_pilon	+	5273	3	Intergenic	novelGene_57264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	646	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAACAAAACAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23890	75371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_23923_44859_49954_75224
885135	contig_19777_pilon	+	4694	9	Intergenic	novelGene_29705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_1	618.099999494418	10	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	520	1236	13277	21503	FALSE	65	ACAAATACCAAATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGYHSKKEFIAMQGPLPNTLKDFWRMVWEKNVYAIVMLTKCVEQGRTKCEEYWPSKEAQDYGDITVAMSSEIIHPEWTIRDFTVKNVQTRESHPVRQFHFTSWPDHGVPETTDLLISFRYLVRDYVTQSPPETPILVHCSAGVGRTGTFIAIDRLIYQIENENTVDVYGIVYDLRMHRPLMVQTEDQYVFLNQCVLDIIRSRKDSKVDLIYQNTTAMTIYENFMPGPRFGKTNGYIA	10122	24961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_10395_10496_10585_12886_12978_13208_13283_13382_13518_15438_15559_16872_17034_18243_18380_21344
885136	contig_1986_pilon	-	6264	1	Intergenic	novelGene_64147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	552	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTGATGCAGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389167	382903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_382900_389200
885137	contig_4301_pilon	-	4431	3	Intergenic	novelGene_65109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	401	junction_2	326	626	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	561	950	545856	545467	TRUE	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFALNSPGIKVALPSGGLGREAADPALLASSTAWNGVDGDGTAVPSQPGCAKTFSASESSQRIFWPASHWSKSIWHHAAPSWKGLGRGGGGMALLSEVAAGVTAATGCGLRGCPLCCSLALLYIGPCL	546416	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_539512_542202_542416_543699
885138	contig_10861_pilon	+	449	2	Intergenic	novelGene_39305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	11	298	1437804	1454862	FALSE	20	GCATGTTGTAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTKMRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKEKA	1437793	1455013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438080_1454850
885139	contig_9839_pilon	+	2228	3	Intergenic	novelGene_88527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3525	junction_1	624.5	251	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	137	484	56088	56435	TRUE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDSNKSSGFFVFVCFFGWGVLSLELCLQLSSQGPGCGQLHTCPESWTHLSLSTIFEQVYPCGGIAVQGRTNCSSASSVWLMLHQGFLSELGKKETINGLLTSLALVTLFG	55951	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_57850_59824_59927_61264
885140	contig_4486_pilon	+	2190	12	Intergenic	novelGene_38597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	927	junction_11	1125.25968352727	52	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	94	1248	343083	412464	FALSE	25	ATATATTGCATTTCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	342989	413406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
885141	contig_15720_pilon	+	2681	2	Intergenic	novelGene_41944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305238	308109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_306695_306884
885142	contig_11396_pilon	+	5674	1	Intergenic	novelGene_71345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2551	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCCCCAATTCCCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487490	493164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_487500_493200
885143	contig_6418_pilon	+	1905	11	Intergenic	novelGene_81220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	204.744816784211	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	136	1800	1364337	1444680	FALSE	15	GTCTGTCACTTTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQGAHLGLPTTPAPLLRSLLPLLMLLAAAAPPSLAEVHYATVYWKSSEKAMRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1364201	1444785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1364455_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
885144	contig_11512_pilon	-	3139	9	Intergenic	novelGene_43291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_7	375.896511689055	594	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	355	1185	396169	367967	FALSE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409486	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_401723_401866_409314
885145	contig_15112_pilon	-	2336	2	Intergenic	novelGene_124759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATAAACTTACTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25618	22919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_23713_24075
885146	contig_6291_pilon	-	5110	6	Intergenic	novelGene_164784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.2	30	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	4774	5109	357054	354970	FALSE	10	AAGTTTCTCTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRGRDPSQETVQVIHGQREDLFFTLLFFTDLQHPGGHHPPHVGLDVLLHAFEVGALRKVALLDGEQVLQNAVVVEQVGVRHGPADRVHLAAQQLHGEPGAHSFPCSLRTG	386818	354968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_355208_356956_357172_359958_360119_370426_370578_381244_383802_385030
885147	contig_9708_pilon	-	2174	3	Intergenic	novelGene_67265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	311	1042	73780	73049	TRUE	40	AGACACCTAGGACATAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDLKTIFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGRNYIADAGFGRSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASMNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVNEVLKNLFSISLQKKLVPKLGDQFFTI	85939	70043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_70229_72101_73875_85723
885149	contig_2078_pilon	+	2152	7	Intergenic	novelGene_100129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	107.19919153924	28	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	33	1211	266417	311030	FALSE	35	GAAATCTCCACTCAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRQYGLLTHQMVLHPDPDAQIQPHSCQDPPDISKDIPCSTSSSESSSNFWHFPVDVLLQSLLNDLQQNFTCVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266384	311971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_280081_280216_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
885150	contig_10126_pilon	-	3412	1	Intergenic	novelGene_105738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	184	549	154423	154058	NA	10	TTTTGTGTTCTCTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDGSLLTTCPKYVRCSLAILASNEHSGCTSSKTDLFVLLAVYGIFNILHQHHNLKVSVLPWSSLFIIQLSHAYKVTENIIVRVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFAANLPNATRLLMS	154606	151194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_151200_154600
885151	contig_7078_pilon	-	4992	4	Intergenic	novelGene_130207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3615	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1782	2150	968176	967808	TRUE	15	TGTAATCCCCCTGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	970412	951295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951555_963631_963733_965325_968220_968674
885152	contig_20614_pilon	+	3610	4	Intergenic	novelGene_107526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63010	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_66206_67449_67601_67866_68042_68861
885153	contig_11422_pilon	-	2118	2	Intergenic	novelGene_99001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2223	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1484_1588
885154	contig_6509_pilon	-	3558	10	Intergenic	novelGene_145623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_7	107.180821022521	15	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1064	3192	367	3558	110717	71589	FALSE	50	AAGAATGAAAAATCTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGGCSKTPQPEEFSLSNDMVEKQTGKKDKDKVSLTKTPKLDRSDGGKEVRERTTKRKLPFTVGANGEQKDSDTEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEKLRLYKDERKKKSKDRPSKLEKKNDLKEDKMSKEKEKTFKEDKLKKEKVYRDDSAFDDYCNKNQFLENEDTKFSLSDDQQERWFSDLSDSSFDFKGEDSWDSPVPDYREMKSDSVAKLILETVREDSKEKRRDNKSREKRDHSERRSDRDSFFRKKDRDYLDKNAEKRKDQTEKHRSIPSYLSEKDKKRKESVDGAKERKDKDLSDICRDRKDSFESAKERKEVRAKPEEAYREGLKEFSCDSFFKDKSDSDFVKSLESWERHHSVKEKDKKDGIDKEKKEKVKSEKYKDKSSDKD	226716	71588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_91925_92065_110630_110775_192368_192478_193322_193438_226631
885155	scaffold_9100_pilon	+	1653	9	Intergenic	novelGene_83269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	555.765688037684	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	96	524	647136	650591	TRUE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPGET	644844	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650642_650978_651204_651950_652069_653324_653449_654139_654556_654652
885156	contig_11115_pilon	+	1383	13	Intergenic	novelGene_102877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	114.890134718154	825	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	182	1168	278265	300360	FALSE	75	ATGATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARTAPARVPALASPAILLPDDVRRRLKDLERDSLTEKECVKEKLNLLHEFLQTEIKNQLCDLETKLHKEELSEEGYLAKVKSLLNKDLSLENGAHAQEVNGCLENGSHTSKEDRRMAEANKPSKPVSKPRASRRSKSEGETKSDVSPSPRITRKTTRQTTITSHFAKGPAKRKPDEEPEKAKSEDSVDEEDKDQDEKRRRVTSKEPVVRPLPAEEPERVKPGTHTEKEEERDEKEEKRLRSQTKELTPKQKPKEEPDREAVPGTHTEVDEEGDEKDEKRHRSQPKDLAAKRRPEEKEPEKVKPQISDEKDEDEKEEKRRKTSSKEL	278083	300575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_278345_285869_285907_286400_286509_286701_286910_288130_288207_289275_289355_293202_293238_293630_293716_295231_295267_296296_296385_298117_298153_298855_298938_300321
885157	contig_15112_pilon	-	5803	6	Intergenic	novelGene_124760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	395	junction_5	239.417960896838	396	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGAGTGCCACTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42143	22991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_26477_32673_32704_34769_34829_34915_34952_36233_36316_40032
885158	contig_5153_pilon	-	2590	2	Intergenic	novelGene_74391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCACAGGAGCTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994954	991448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_993091_994006
885159	contig_13863_pilon	+	6596	21	Intergenic	novelGene_41994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	417.809941839588	98	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	271	2046	55383	81541	TRUE	15	CTATTTGTTCTGTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	55112	86383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493_82899_83190
885160	contig_13295_pilon	-	5263	7	Intergenic	novelGene_31201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	303.03795141863	1334	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	116	538	85663	79371	TRUE	45	CACACACACACAAATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGKC	134788	6523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_6789_6839_7489_75559_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_134686
885161	contig_19185_pilon	+	2306	2	Intergenic	novelGene_163652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACGCTCTCCTTCCCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139528	142106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_141541_141812
885162	contig_3627_pilon	+	5507	25	Intergenic	novelGene_78446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	270.556522000898	58	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2250	207	2456	294394	320367	TRUE	15	TTTATTAGTCTGTGTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKERRKRESVKRKWNASVVREDIFCLMNQPSLYILTGLQKVANLIVASCL	292747	334276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589_318776_320223_320418_323439_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842_331029_331550_331757_332370
885163	contig_10930_pilon	+	488	6	Intergenic	novelGene_37109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_5	5111.4698316629	53	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	72	470	339608	342083	FALSE	0	TCTTGGTGCTTTTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339428	342101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
885164	contig_11316_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_122598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	709	1221	137674	138186	NA	40	ACCTGATATTAACATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136965	138827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138800
885165	contig_10953_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_42610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACTGGAACTTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464288	465901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_464300_465900
885166	contig_13778_pilon	-	5595	1	Intergenic	novelGene_70840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGATGTGTTTTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8410	2815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_2800_8400
885167	contig_8310_pilon	+	4405	7	Intergenic	novelGene_75585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	139.271218211884	2039	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	25	792	308015	324814	FALSE	25	AACTCATTGCCATCGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	307990	328427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_308108_308705_308856_309224_309302_316688_316759_317718_317886_320576_320713_324739
885168	contig_6364_pilon	-	5835	14	Intergenic	novelGene_51704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	3	50	junction_12	1051.97468865089	42	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	255	1613	472628	436151	TRUE	25	CGTAGTGCATGGTTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521202	431219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_432737_433445_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_490716_490802_521045
885169	contig_8712_pilon	+	1934	4	Intergenic	novelGene_58769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	577.82407934134	212	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	143	463	315133	321793	FALSE	35	AATTCTCATGGTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQTAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286972	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_286984_315001_315188_318064_318222_321684
885170	contig_14621_pilon	-	1097	8	Intergenic	novelGene_105854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_4	80.0298413731033	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	662	802	402122	396356	FALSE	30	TATTATGAGAGTTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	413552	396060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462
885171	contig_4151_pilon	+	2020	3	Intergenic	novelGene_65231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	6.5	423	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	279	857	593026	663644	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528844	664807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_592891_593039_663078
885172	contig_10003_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_88142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCATGCTGTTATCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370688	371687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_370700_371700
885173	contig_16836_pilon	+	587	2	Intergenic	novelGene_177787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGGCACCAGACTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601	1249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_+_882_942
885174	contig_11117_pilon	+	8199	4	Intergenic	novelGene_148586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9877	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	6448	6810	108185	108547	TRUE	55	TAAAAAGGATCATAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCFKLRKIRVNFMVTTKKFSKPTHKNKEEKHKVLVKTKPTKTEEIFKKSTNGIQHRRVRETKKPSDHKKKALQNDTNKLRPINNYTERKWPQCTHKEMESDRMDKNTVSINMLFTRDTP	77662	292449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_79128_79192_83132_107141_108862_291374
885175	contig_9571_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_136322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	996	1304	709141	708833	NA	65	ATTACAACAAATAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTESSTNRCCPATTTDCSGRDHNRGPQTELEKNVEQNSDSQKKKKKKQTYWPDRDWRNPESMASGHSFSSVTESLPRFTLQSKIRQAHKTKRD	710136	708655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_708700_710100
885176	contig_854_pilon	+	1558	2	Intergenic	novelGene_36356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAGAGGGGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974687	976363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975902_976019
885177	contig_6871_pilon	+	1790	2	Intergenic	novelGene_21564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121913	124656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_122134_123086
885178	contig_16775_pilon	+	4790	15	Intergenic	novelGene_107752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	267.655085694181	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	747	1637	156947	174136	FALSE	20	GCTAACTATTTGTCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130232	177289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152263_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
885179	contig_10855_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_124371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	703	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	435	334	768	697970	697536	NA	25	AGCAGGCCAGCCAGCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPAKLATLCPLCRGGGERTRRAWSIPHQEGRQEVEEGADGVGGWGDKGCPGQGGGSWHRVACSGWEGGCGVCQRAGGRTVSYTCANREVQGMLNSLRFCSLWTWPPMRPLQASVGLICGVSRCRGCKVGGGRPEVGVGAKLGD	698303	697535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_697500_698300
885180	contig_3382_pilon	-	7317	4	Intergenic	novelGene_124164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	764	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943142	934511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_940472_940541_941210_941436_941717_942733
885181	contig_4924_pilon	-	4318	12	Intergenic	novelGene_84658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	515	junction_7	1012.69060648493	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	210	1676	252576	65524	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252785	62881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
885182	contig_9484_pilon	+	1938	11	Intergenic	novelGene_105621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_9	430.454178746124	3094	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	708	1805	100737	104965	FALSE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95796	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
885183	contig_18162_pilon	-	3219	2	Intergenic	novelGene_122302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
885184	contig_10857_pilon	+	1590	11	Intergenic	novelGene_160883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	84	junction_1	1260.97743437383	177	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	59	1129	21903	62184	TRUE	5	CCATGCGCTGCCTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAASDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRPQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLCLRPVVEPQEEPGLEETEPRDLEELAQDPQGPAEAGEAEEERLQCQQPRTPSPLALEGTAEHSPPPLSPTTKLIDRTESLNRSIEKSNSVKKSEPAQPISKIDERLEQYTQAVETAGRTPKLARQTSIELPSMAVANTKSLWETGEVQTQSTSKGPSCKDIVAGDMSKRSLWEQRGGSKTSSTVKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVDEDVAP	21844	66895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56561_58201_58392_58782_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61962_62094_62198_66447
885185	contig_9177_pilon	-	5567	38	Intergenic	novelGene_32599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1561.36292937429	48	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	2903	5131	16609	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNAAAQNAIKKKLVQRLEHTAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKCAQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	32933	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
885186	contig_11160_pilon	+	2260	3	Intergenic	novelGene_168817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	297	599	318478	320768	FALSE	50	ACAAAAAGTTTTTAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALPHPSPFGFLSFLLFLLLLFRSFIVVEQRKPTNILCW	318181	322429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319176_320656
885188	contig_6902_pilon	+	1511	3	Intergenic	novelGene_135580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_1	180.5	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTTAGCCCCTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434436	463125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973
885189	contig_13592_pilon	+	8013	15	Intergenic	novelGene_33705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	2330	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	516	2444	256608	269322	FALSE	80	CAATAAAATAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249302	274891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
885190	scaffold_13505_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_111649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	504	857	816156	816509	NA	30	GTTAGACCTTTACATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHSNENARSRATCNIIGEFYKENVEQKTEDKKEYILYDFIYINHKKQAKRINVFRSPVCCHPWRHPGRGMWGILGVAGHVLFLSCVLVTSCVQFVKINQAAHLGFLHFSIHMLHF	815652	817182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_815700_817200
885191	contig_546_pilon	-	6982	3	Intergenic	novelGene_117223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGCCTCCACCAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147637	136707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_136791_140027_146845_147555
885192	contig_10566_pilon	+	14639	14	Intergenic	novelGene_178418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	300	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	8668	9066	206292	206690	TRUE	15	GTGCGATGTCCTCCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEIDGAMEGLRSRFETVEDRISGIEDKHFDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKIENTERIIDDLLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	13977	360857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10566_pilon_+_15154_15508_16262_28960_29306_82281_82807_83358_85790_109338_109641_171671_173281_204126_204629_205267_207461_229535_232470_243739_244048_284717_285011_285079_285753_360262
885193	contig_4180_pilon	+	3939	6	Intergenic	novelGene_8367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	13698	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	716	1252	875200	888134	FALSE	20	ACTTTTTCTGTCAGTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	873709	890821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
885194	contig_5623_pilon	+	3595	4	Intergenic	novelGene_154794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	39.8525058462103	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	567	887	203214	204438	FALSE	10	CACCGGGCGTCCTTGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILGVFRIRAAHQRTMRDQDAGKESEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEERPFSFLLPKTLPLPPYSSQGSTMYKIIRPVGLQTLPGACCPPLLGV	202206	207146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_202717_203157_203343_204074_204125_204296
885195	contig_8617_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_73384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATTTAGGTTAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61814	60779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
885196	contig_13021_pilon	-	5209	9	Intergenic	novelGene_8228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	766	junction_3	339.728545128313	953	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	151	1197	236115	210494	TRUE	30	GTAAGACAATTTTTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236265	202275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
885197	contig_8617_pilon	+	963	2	Intergenic	novelGene_73387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCTGAAGATTAGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60785	61797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_61597_61645
885198	contig_500_pilon	-	1562	11	Intergenic	novelGene_31049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4033	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	962	1561	1495383	1485774	FALSE	15	GTCGACGCGCCGAGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLMCLHTHLLILLFEVADGDDPGATAHSKLVLLGGPAHTAGGPVDPQDDQRGLPHMALQGPHVGIAVCAAGHNAVTLGGPVDACHLPIVLLELVHLDPLGPALLIDVHLMVVGADSDLGAVLVPGVAADGLHQEAVVGHGAPPAALEPRCAGLDPASGWGSLGSRSDGSDVGVHKMAGLVPGCCPSTRLRAPRRRTLG	1499579	1485772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1485802_1491926_1492064_1492650_1492727_1493615_1493718_1494241_1494465_1495349_1495460_1496520_1496730_1496821_1496897_1497869_1498076_1498880_1498972_1499275
885199	contig_7151_pilon	-	8023	7	Intergenic	novelGene_40685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	156.295393406204	593	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	171	1661	65162	13305	TRUE	20	CCAGCTCAAACTGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	65332	6848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12398_12491_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
885200	contig_3386_pilon	-	4697	14	Intergenic	novelGene_34562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	912	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGCCCGGTCCGCCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511441	470090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476268_476403_485244_485297_486415_486539_488103_488187_491943_492072_494391_494547_497714_497820_498658_498718_504778_504898_505994_506119_506536_506632_507642_507738_508228
885201	contig_12464_pilon	-	2724	13	Intergenic	novelGene_68631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGTTGTAGAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114059	51804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_51958_53871_54721_57017_57120_58831_59087_69112_69242_69321_69409_89134_89277_89880_89967_103447_103607_105124_105278_112061_112189_113100_113188_113664
885202	contig_15105_pilon	+	7486	15	Intergenic	novelGene_150966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	563.287254082892	3930	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	1143	2498	607395	627498	FALSE	55	TAAAAATTTTCACACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIVPGTAPCFLTKQRDIPTLPALSAGVRGMALFFYSHACNRICKSMGLTPFDLSPKERDTVNQSTKLLQSAKTILRGTEEKCGSPRVRTLSGSRPPLLLRLSENSGDENMSDVTFDSLPSSPSSATPHSQKLDNLHWPVFCDLDNLAHRDHDHLDNHRDSENSGDSGYPSEKRGELDDPEPQEHGHSNGNRRYESDEDSLGSSGRVCVEQWNLLNSSRLHLSRPSAVALEVQRLNALDLEKKIGKSILGKVHLAMVRYHEGGRFCEKDEEWDRESAVFHLEHAADLGELEAIVGLGLMYSQLPHHILADVSLKETEENKTKGFDYLLKAAEAGDRQSMIVVARAFDSGQNLSPDRSRDWSEALHWYNTALETTDCDEGGEYDGMQDEPRYMLLAREAEMLFTGGCGLEKDLQRSGDLYTEAAEAAMEAMKGRLANQYYQKAEEAWAQMEE	572707	632486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_572802_591477_591583_599996_600094_602595_602770_606307_606458_606872_607602_608359_608562_610214_610283_613679_613758_614572_614636_617328_617464_617625_617815_619244_619370_621244_621424_627388
885203	contig_19851_pilon	-	1391	6	Intergenic	novelGene_29814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26390	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTGGCCCGTCGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56531	53121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_-_53701_53922_53978_54059_54144_55648_55751_55838_55880_56001
885205	contig_17274_pilon	+	5101	10	Intergenic	novelGene_26468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	620.873757073225	1277	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	50	544	7027	30219	TRUE	55	GAAATAAAGCCCCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVLHFLTGHDPRPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEGN	6977	113181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127_32295_40635_42710_47229_47296_51703_51785_68310_68374_104417_104478_113043
885206	contig_15570_pilon	+	5400	12	Intergenic	novelGene_137849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_9	311.368639641288	1049	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	314	1537	656070	740309	FALSE	70	TGAGAAGTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAVFLPVPDLRCSLLLLVTWVFSPVTTEITSLDTENIDEILNNADVALVNFYADWCRFSQMLHPIFEEASNVIKEEYPNENQVVFARVDCDQHSDIAQRYRISKYPTLKLFRNGMMMKREYRGQRSVKALADYIRQQKSDPVQELHSLEEITTLDRSKINIIGYFEQKDSDKYRVFERVASILHDDCAFLSAFGSVSKPERFSGDNIIYKPPMLSAPDMVYLGSMTNFDATFSWIQDKCVPLVREITFENGEELTEEGLPFLILFHMKEDTESLEIFQNEVARQLISEKGTINFLHADCDKFRHPLLHIQKTPADCPVIAIDSFRHMYVFGDFKDVLVPGKLKQFVFDLHSGKLHREFHHGPDPTLDIAPGQESQDVASSPPESSFQKLAPSEYRYTLLRDRDEL	655756	744172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_656127_686130_686204_687918_687959_692177_692294_709097_709283_710296_710413_713399_713458_715164_715282_723505_723618_724579_724722_737313_737420_740207
885207	contig_7452_pilon	+	2024	4	Intergenic	novelGene_109141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_1	310.897982553048	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	23	415	118756	196457	FALSE	20	CCCATTGCCATCGACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLTAALLIWALLLPKGGSGEAWPIHTACKDSSLEVLYQSCGENIKELFLDIALLTKGSSILNFSYPICEGDHPKFSFCGRSKGEQLYYVGPVNNPGLLVPEGEYQVLLELYDENRSTVACANATVICS	118733	198066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_118883_158022_158152_191492_191546_196373
885208	contig_8210_pilon	-	3841	1	Intergenic	novelGene_30249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2338	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	356	823	52740	52273	NA	10	GGCCCACTATGTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVDPGSSRSPGLAEVHWDSAAPQVPRLLPVAVCLPAGVLPPWFPRIQRRTDCDPPNTLLSWGACLCVWESVRVRAVGLVAWLSPVRSRAADAPSRRAYSCVFHVASTWSCVFLQSSQLWCRHRTCSHLHLWTRPAHAAFRLEKVCSSGGVFSRL	53095	49254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_49300_53100
885209	contig_2078_pilon	+	1853	5	Intergenic	novelGene_100134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	98.1997326880272	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	38	1048	266439	311164	FALSE	30	TTGAAATCTCCACTCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKDQHQEEQWSYTEPRADLGGEHCLRDDQDKNLRRTPGSRAHGDIVVLCFFCFNLSLWYLCYACSNQKTKTNLLLLS	266401	311969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_310937
885210	contig_3525_pilon	-	5920	2	Intergenic	novelGene_135112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	715	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGAAAAAATCACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27638	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_21981_22053
885211	contig_17964_pilon	-	797	8	Intergenic	novelGene_33883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8603	junction_7	2533.79669142364	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	726	71	796	163122	135613	FALSE	20	TGTCTCTGCCATCCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFLSCSRHWAPFPQCLRGGDSGAMALRTAAIRQTCCCFNVRMATTALAIYHVIMSILLFIEHSVEVAHGKASCKFSKTRYLRIADLLSSFLLITMLFVISLSLLIGVVKNRQKYLLPFLSLQVMDFFLCLLTLLGSYIELPAYFKFASRSRAGPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEA	163192	135611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140968_142296_142426_144075_144153_144861_144956_163035
885212	contig_2710_pilon	+	4645	1	Intergenic	novelGene_161792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	305	967	1061374	1062036	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKTTANIILNGETLKAFPLRMGTRLGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRLEKEIKGTQIWREEVKVSLFADDLILHTVNPRESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPVTTAHKTIKYLGINRTRDVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKTSIPNHQLHMEREQAPNK	1061069	1065714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1061100_1065700
885213	contig_7839_pilon	+	1864	8	Intergenic	novelGene_45740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_6	522.947377069312	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	497	1582	955026	956984	FALSE	10	ACACTTCTGCTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	953990	957266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
885214	contig_11258_pilon	-	5222	7	Intergenic	novelGene_67782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3036	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	2057	2632	294758	294183	TRUE	20	CCCAGCTGGACACCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWLGLGFPRDESEMSQESVFREFPPLHSSLYSASLFWSAGVHRIGACTASGPNPPSVICGHMFPHFLLRGAESHQPVWGCEQRRWLSTAFLLVGERGFYPGPSSWFRQAAEQSWEHPGACRAAPADMLITSSPTWPLLSVQPGSVCVCVVCVCIVCCVVWHVCVCFLLCVLYAVISSPSSPPRGPPASA	296814	279253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_279347_283713_284073_285641_285794_288173_288270_291348_291385_291792_291913_292448
885215	contig_2377_pilon	+	3120	2	Intergenic	novelGene_67912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	870	junction_1	0	1941	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	95	1117	269376	270398	FALSE	40	AGTCACATTTTTAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLYSMRSSQKCSRATIDTGTEVVMPLSQMTVNCLKN	254159	272401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329
885216	contig_7816_pilon	-	2634	10	Intergenic	novelGene_66521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	66	413	211694	209366	TRUE	20	CCTCAAGTAGGCACTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTYIYHSSQYIFEHLCQQLSGMCRIPTLHPIAPLGLGDQAPHGLHNGVLVNAKHLQQLIWLPASWYLADGQAGDSDARLAHDSTAHCLTYATFVIMVLHREDPALGGAGAVENEFSIQGLDGERIQHADVNLVFLQ	211759	191799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_193088_194849_194972_195756_195948_196742_196909_207502_207660_207802_207933_209064_209149_209282_209377_210625_210749_211480
885217	contig_6503_pilon	+	2644	10	Intergenic	novelGene_145769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	164.056900698101	12	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	163	918	143102	154252	FALSE	45	AATAGGTAATATTGAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVSSIRKIVSVALTRWAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSEKDLQQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE	140434	155978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140538_143042_143155_144426_144545_146770_146851_149655_149724_150052_150098_151127_151232_151798_151866_153032_153112_154110
885218	contig_8464_pilon	+	1465	6	Intergenic	novelGene_125377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_5	47.5419814479792	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	584	1054	797915	804080	FALSE	20	TTAAAGCTTTTGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGSFRGRTADFVFMFLFGGFLMTLFGLFVSLVFLGQAFTIMLVYVWSRRNPYVRMNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	793178	804491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_793672_796183_796258_797898_797993_798725_798922_799187_799279_803974
885219	contig_5967_pilon	+	1916	7	Intergenic	novelGene_44367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCTGGAAGGTCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387552	482501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_388933_389225_389308_403378_403477_412505_412604_430697_430794_465403_465532_482467
885220	contig_8820_pilon	-	2713	10	Intergenic	novelGene_79297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	1087.80788745072	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	439	2349	170373	166441	FALSE	30	TGTTAAAAGTTTGAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	171322	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170763_171273
885221	contig_12425_pilon	-	2203	9	Intergenic	novelGene_46667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	728.616111199855	18	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	124	930	211174	204225	FALSE	10	TAGTTGTGCTGGTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLKDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226615	202951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208686_210324_210389_211048_211200_226517
885222	contig_9389_pilon	+	1899	4	Intergenic	novelGene_83989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_3	1307.27562340753	26	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGCTCTGACCATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382012	385520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_384091_384307
885223	contig_7057_pilon	+	2686	5	Intergenic	novelGene_123270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	270.255781621781	215	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2308	2685	706944	707670	FALSE	40	AAAGTGAAGGAGGAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVSSRSPSTIPASTPGLMVAHLHSEAQGLGSSVGARDLGGESAEEGLKGWRNWGKGWRWRRSLGGGEGHGVWIPTTLGLGRAETTGSQKESQKQQSTGGSDAPHVAGDAAGHQSEGHWMWLCV	703741	707671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_703846_704345_704959_705180_706702_706874_707199_707547
885224	contig_16525_pilon	-	647	7	Intergenic	novelGene_133798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	39173	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	109	537	97608	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97716	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
885225	contig_7593_pilon	-	2213	2	Intergenic	novelGene_127268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAAGTAAATTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4253	1886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_3822_3975
885226	contig_11978_pilon	-	6538	22	Intergenic	novelGene_62935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	158.209468198539	2751	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1488	2762	987442	978504	FALSE	55	ACAAATATAAATAGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFSSLAEAAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSAAYESLMEIVKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNILPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELREGCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA	1000916	974727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_978505_979252_979415_980040_980156_980838_980945_981061_981206_981761_981870_982383_982467_983632_983778_985165_985238_985568_985717_986641_986773_987382_987593_988544_988678_990287_990390_991158_991270_991611_991702_992362_992423_993262_993416_994978_995180_998151_998335_1000507_1000567_1000671
885227	contig_6217_pilon	+	3727	4	Intergenic	novelGene_109617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	623	1270	428952	429695	TRUE	35	TGTATTTTAATATTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKIAEMDSVIEGLRSRYKMVKDRISITEDKHLDTTLIEEKLEKRMKKNEETLRLMWDTIKSKTVRVIGVPEQGEKTEDTERITEELLTENFPNIMKDKKLTIQEAQRTSYRIYPKRKSPRHTIITLAKKTTQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIILQNSRSNMMVKLGRFQININ	428329	616249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_429457_429552_430226_519144_519519_614696
885228	contig_19402_pilon	+	5363	18	Intergenic	novelGene_80780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1094	junction_12	1269.65367045765	4791	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	624	2438	29462	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23464	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802
885229	contig_383_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_126110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1047	1071	2117	134515	135561	NA	55	GAAAAAGGAAGAGAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPWEDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRK	133444	135563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_133400_135600
885230	contig_11088_pilon	+	3507	5	Intergenic	novelGene_85026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.331791652406	135	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10800	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_12708_12748_13696_14663_14937_16250_16348_17119
885231	contig_9133_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_109300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGATGCTGGGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235567	233883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_233900_235600
885232	contig_5882_pilon	+	6595	6	Intergenic	novelGene_159558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2018	150	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	3652	4413	27940	28701	FALSE	25	GGACCAACACTTCAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRKKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKGKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQILTTLKREIDSSTITVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLVDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSISSDHNAIKVEVNTRKSKEKKINYMETE	2563	30883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5882_pilon_+_3994_5267_5611_8691_8851_24284_24758_25017_26199_27874
885233	contig_13718_pilon	+	2404	4	Intergenic	novelGene_142889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	274.634706878468	1629	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	294	824	128681	141301	FALSE	40	AAAACCCCAAACCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLFVPPPPPGTPPPSPMSSAIERKSLDPSEEPVDEVLQIPPSLLTCGGCQQNIGDRYFLKAIDQYWHEDCLSCDLCGCRLGEVGRRLYYKLGRKLCRRDYLRLFGQDGLCASCDKRIRAYEMTMRVRDKVYHLECFKCAACQKHFCVGDRYLLINSDIVCEQDIYEWTKINGMI	128387	142881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_128700_129406_129483_133551_133768_141081
885234	contig_3651_pilon	-	8960	8	Intergenic	novelGene_177830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	254	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	6650	7720	107109	101548	FALSE	60	TTGAAGAAAAAGAACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISDKIDVKTKSTIKDKEGHYIMIKETIHHEDITIINIYAPNGRSLKCIKQTLTVQKREMDSSTIIVGNFSTPLSVKDRTSRKKLNKDTEGLKCTISQLDLIDIYRTLHPTAVKYTFFSSAHGTFSRIDHILDHRAILNKIQNVEIIQSIFADHNAIKVEINNRKSKGKKSTTWKLNNTLLIHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIATNAHIKKEERMILVNLDQQLEQIEKEKQMKPKTTRKKKIIKTRAEVNDIENRKTREKVNKTRGWFSAKINEINKLLARLAKEKKTEETTKFKNEIEDIITDPTEIKKIITNYYEKLYCNKFENLDEMEKF	284986	100307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3651_pilon_-_101912_106402_107805_125148_125960_175586_176400_223024_223033_247371_248093_281260_282551_282675
885235	contig_11422_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_98989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
885236	contig_2078_pilon	+	1857	6	Intergenic	novelGene_100124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	88	junction_4	76.4109939733806	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	26	1090	266397	311030	FALSE	40	ATGCAAAATACTTATTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266371	311797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
885237	contig_13905_pilon	-	3279	1	Intergenic	novelGene_130432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	978	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTACCTAGAAAAACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229559	226280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_226300_229600
885238	contig_9921_pilon	+	7513	2	Intergenic	novelGene_23723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1357	171	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2625	3062	107245	107682	TRUE	25	ATGTGGAGGAATCTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNYIKRQTMMASAMSENKESRNFPGEENFLELAEAEYKRLIYRTLQDIKKEIRQNTEQAIEELKKIREERNDKFDRLQESIERQQSEIQKINNKILELDNSVESHRSRIEAMEVRISETEDKALDTSLFEEKSDKRI	104620	112360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_108503_108729
885239	contig_14047_pilon	+	10727	10	Intergenic	novelGene_176576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	152.568948186114	2145	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	22	1899	8770	28355	TRUE	35	AATCTTCTTACGAACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELDPLAEELSCSICLELFRVPVTTPCGHNFCASCLDETWAVQGSPYRCPQCRAVYETRPQLNKNTVLCTVVEKFLSAEQARAVSVDCWTPPARSADPSAAEQVACDHCLKAAAAKTCLVCMASFCQEHLQPHLDSPVFQDHPLQPPIRDLLHRKCSQHNRLREFFCPEHGECICHICLVEHKACSPAPLSQASTDLETKLKQKLAIVYSQINGASKALEDVRARQQDVREAANRKIDEIRQEYMEIKALVEASEASSTRKIKEEEKRVSYKFDHIFQVLLKKKSEIQTLKEEIEVALSKGDEFEFLEKASKLQGISTKPVYVPKVELNHELIKGVYQGTIDFKKELKRHVSQSQEKRPEDSTSPGDPGEPVPPSTYKLPRPVRKAPKEEKKAKRPTPAPSLPSKPPTFKEPEQADPEAKGAVSQQTAAVKAKTLEAFLAMTRPQLLEYATKVILDFNTAHNKVALSENYTTASVAETPQNYRPHPQRFTYCSQVLGLHCYKRGVHYWEVELQKSNFCGVGICYGTMERQGPESRLGRNSASWCVEWFNTKISAWHNNVEKTLPLTKATRVGVLLNCEYGFVIFFAVSDKIHLLYKYRVDFTEAVYPAFWVFSAGATLSVCFSK	8748	48821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_9367_16940_17037_20637_20872_22796_22969_24768_24835_26517_26545_26884_26951_27031_27122_27825_35613_47250
885240	contig_6102_pilon	+	2564	16	Intergenic	novelGene_31871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.293360025771	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	367	1158	379418	393075	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370764	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371091_379377_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
885241	contig_12464_pilon	-	4705	13	Intergenic	novelGene_68625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCACACACCCCAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114089	45197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_45450_51801_53739_53869_54721_57017_57120_58831_59087_69112_69242_69321_69409_89134_89276_89880_89967_103447_103607_105124_105278_112061_112191_113665
885242	contig_12644_pilon	-	1341	9	Intergenic	novelGene_44679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTTGGGGGAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680619	2677225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
885243	contig_7286_pilon	+	856	6	Intergenic	novelGene_108703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	228	326	288412	288510	TRUE	30	TGAAGGAGAGTTTTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCIIFNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286885	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290857_291315_291499_292022
885244	contig_7079_pilon	+	902	7	Intergenic	novelGene_129233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	539.162519303987	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	32	688	342490	349575	FALSE	60	AACAAAGATAAAGTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPANEESSTLQPPPQSSEGLVGALMHVMQKRSRAIHSSDEGEDQAGDEDEDDEWDD	342458	349789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344803_344900_345004_345095_345138_348606_348706_349519
885245	contig_16125_pilon	-	7867	18	Intergenic	novelGene_155226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1076.73942641084	5599	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	636	1760	236037	140157	TRUE	20	GTAGCAATGCTTTTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLGDPQQELWVLVPKDALHSRLSFLMVVRSP	236672	110423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_111127_112627_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_140135_140246_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
885246	contig_5005_pilon	+	4286	1	Intergenic	novelGene_84332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1912	2274	597825	598187	NA	20	TTGACCTTCTCTGGTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLQITCPRYVKRSLAILASNEHSGCTSSKTDLFVLLAVHGILNILCQHHNSKASIFLWSSLFIVQLSHAYEAIENTRAWVRCSLVLKVTSLLFNTLKRSFAADLPNAMRRLIS	595913	600199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_595900_600200
885247	contig_9366_pilon	+	1944	2	Intergenic	novelGene_166269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_1	0	2281	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1884	61	1944	1038885	1044175	FALSE	40	GTAAGTTTGAATCGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDSQRKQYEEWLQETQQLLQMQQKYLEEQIGAHRKSKKALSAKQRTAKKAGREFPEEDAEQLKHVTEQQSMVQKQLEQIRKQQKEHAELIEDYRIKQQQQQCAMAPPTIMPGVQPQPSLVPGTTPPSVSQPSFPMVPQQLQHQQHTAVIPGHSSPARMPSLPGWQPTNAPAHLPLNPPRIPAPIAQLPIKTCTPAPGTVSNANPQSGPPPRVEFDDNNPFSESFQERERKERLREQQERQRIQLMQEVDRQRALQQRMEMEQHGMMGSELSSRASVSQIPFYSSDLPCDFMQPPRPLQQSPQHQQQMGQVLQQQNIQQGSMNSPPTHTFMQTNERRQVGPPTFVPDSLSIPGGSPNFPSVKQMHGSLSGISFQQSQVRPPFTPALPAAPPVANSGLPCGQEAAVTHGQSYPASNQSLIQLYSDIIPEEKGKKKRTRKKKKDDDAESTKAPSTPHSDVTAPPTPSISETTSTPTVNTPSELPQQAEQESVEPAGPTTPNAAASQLCTESENKLPISDCSQGTPNQQTHANPEMDKLSVETPAKIEEVKLEQAETEQCPGRDEPKLEEETSNKVEEKTVAHPVSSAQSPPRPVGGPAAKGDAGNELLKHLLKNKKSSSLINQKPEGSFCSEGDCAKDKKLVEKQNPAEGL	1038824	1044175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1039059_1042465
885248	contig_11548_pilon	+	2136	10	Intergenic	novelGene_66755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1077.01000144375	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	151	1293	87022	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	84700	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_84820_86990_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
885249	contig_1708_pilon	+	6475	5	Intergenic	novelGene_178225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	194	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2539	2844	170162	170467	TRUE	70	GGAAAAAAAAAAAAACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	67909	236783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1708_pilon_+_69257_168970_171619_172172_172760_199375_199524_235038
885250	contig_10990_pilon	-	1952	3	Intergenic	novelGene_7510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGAGAGGAGTGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753868	751475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751518_751883_752860_752934
885251	contig_4105_pilon	-	2839	2	Intergenic	novelGene_21499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_1	0	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTTCTATGAAAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101771	98295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868
885252	contig_11525_pilon	-	6478	1	Intergenic	novelGene_171081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2072	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	2293	2664	64469	64098	NA	25	CCAGAGCACTGGTGATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLVCTSQFLTTVTWLLKQLQMHSSTRSMCDQPFTKIHYSCHSLYIHSDHTLGHADTQGRRGHQAEVNIRHQENQDPLYKINTTCITAKKMKALIQTMAVQCVTVSLPNNKISYYKMKTSSM	66761	60283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_60300_66800
885253	contig_5324_pilon	-	3160	1	Intergenic	novelGene_102063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1245	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	115	714	444540	443941	NA	15	TTTCTTTGGTTGTGTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444654	441494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_441500_444700
885254	contig_7342_pilon	+	2449	17	Intergenic	novelGene_71230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_6	297.908274211627	1483	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2391	58	2448	716998	749131	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPEEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVSSSSGRNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCINHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSERKECEVKKEKSSSVDRHHSVEIKTEKTIIKKEEKSERKEEKKPGDIKKEEKDQDELKPAPPSRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSKSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHERKEKSRLQRERMELDCQRQRLERERWERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEKLRYEQERRPAFRRPYDVDGRRDDVYWPEGKRAALEDRYRSDFPRPEHRFHDFDHRSRGQYQDHVVDRREGSRSMMG	716940	749132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727572_728492_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034_738166_739511_739604_743088_743226_744985_745280_746617_746759_749103
885255	contig_6946_pilon	-	3126	5	Intergenic	novelGene_59785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2273	2575	442762	442460	FALSE	20	CCACCAGCCGCACCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTVRWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDIEQNSNSHTKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQLGSGQPHKAKWD	586554	441908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_443211_471297_471490_545376_546082_583225_583498_585899
885256	contig_12116_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_167502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGGTGGATACTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41395	39733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12116_pilon_-_39700_41400
885257	contig_7119_pilon	-	6649	3	Intergenic	novelGene_40985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1989	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	6010	6648	139626	138988	FALSE	10	CTCTCTGCCCCAATGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTG	290972	138986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_142440_144081_145667_289361
885258	contig_21315_pilon	+	7446	4	Intergenic	novelGene_151565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6774	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	936	1250	38151	38465	TRUE	60	TGGGAAAAAAAAAAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKRHLIKVQHLFLTKTLNKIVKEGKFLSIIKGIYTKPTANIILKREMLKAFLLRMETRQGCPLPQLLFNIVLQVLARAVRQEKEIKGIQIGKVEINYPYLQMI	26908	52528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_26947_37253_38573_40921_41106_46623
885259	contig_4604_pilon	+	2904	13	Intergenic	novelGene_19155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1155.07318190475	14	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	373	1428	365452	378537	TRUE	35	TGAGAACACCACTAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECQEALFPRERSSGWRGATGGR	364372	381082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377523_378474_378607_379336_379470_379808
885260	contig_10855_pilon	+	934	2	Intergenic	novelGene_124366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_1	0	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGAGGGTACTCACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696995	698016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_697063_697149
885261	contig_9363_pilon	-	4458	29	Intergenic	novelGene_6584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	818.837544003319	105	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	935	2808	1016	3823	777144	754431	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	787926	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755424_755624_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
885262	contig_2703_pilon	+	2388	15	Intergenic	novelGene_101708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1038.33282776983	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	297	1523	559489	610870	FALSE	70	CAAAAAAAAAAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526170	611735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559525_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
885263	contig_3737_pilon	+	3838	5	Intergenic	novelGene_178340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1331	1678	320164	320832	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRESSLTEHPEGDKTAGNLRCALSHPPPLFASAGAPLLPVSKVSWLGGAGCLDSARLGGRLSGGRLLDAGVAFSASFGFSLASRFLPLLLLGCLTPRAVSALSYRAVGLRLGL	234844	422085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_+_235497_235863_236277_319898_320445_320765_321732_420824
885264	contig_12427_pilon	+	2735	1	Intergenic	novelGene_40574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGGAAACATTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536989	539724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_537000_539700
885265	contig_854_pilon	+	5226	4	Intergenic	novelGene_36718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96.5850229935608	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	31	399	1709644	1714980	FALSE	40	TAAAGGAAATGGCTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1709613	1719807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1709695_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
885266	contig_40_pilon	-	5645	4	Intergenic	novelGene_178420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4186	4551	1460	1095	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	302836	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_40_pilon_-_1631_2507_2762_202073_203728_300729
885267	contig_5317_pilon	-	826	3	Intergenic	novelGene_76558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2743	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGTAGAGGGCGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43844	35384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682_36837_43195
885268	contig_16703_pilon	+	6295	17	Intergenic	novelGene_72746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	1299.68022359108	190	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	207	2123	6490	40668	TRUE	10	CACCGTTTGATTTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	44887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600_44333_44379
885269	contig_7532_pilon	-	3755	5	Intergenic	novelGene_178421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1989	2345	117167	116811	TRUE	10	TTTGCTCATCTGTGGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKIICIISVFWIWLRVALWFKMWSILENVPCALEKNVHFAAVGCNVLYISMRSSWLIVPFRSSVSLMSFSLDFLPFTESCVLKSPTIIVGLSVSLFSVVRVCFMYFGALSLGV	206562	114904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7532_pilon_-_114995_115490_117748_117792_118064_150702_151739_206461
885270	contig_11071_pilon	-	3492	6	Intergenic	novelGene_131024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	143	junction_1	245.760045572912	1668	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	75	629	206817	92024	FALSE	20	GAGTTCTTTTGTATATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSEPGRAAGGGGAEDAGRQAGDMDRGEPGVLRTDPVLEEGEDAAATISTSEALSEEEQDELRRELAKVEEEIQTLSQVLAAKEKHLAEIKRKLGISSLQEIKQNISKGWQDVTATSAYKKTSETLSQAGQKASAAFSSVGSVITKKLEDVKNSPTFKSFEEKVENLKSKVGGTKPAGGDFGDVLNSTANASAATTEPRTEQTPENP	206891	89160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_92144_96150_96200_104797_104900_106647_106797_111264_111381_206798
885271	contig_12327_pilon	+	1904	6	Intergenic	novelGene_140631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	774.105264159856	35	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	98	643	168930	171003	TRUE	15	CATGAGCTTTTCAGTGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	148627	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_148687_168891_169078_169396_169508_170312_170438_170841_171710_171800
885272	contig_7009_pilon	-	4569	1	Intergenic	novelGene_23638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2214	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGCACATGCAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447939	443370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_443400_447900
885273	contig_16525_pilon	+	3452	3	Intergenic	novelGene_133785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAAGCAGTCTCTCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90512	95593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_91661_91785_91861_93364
885274	contig_8322_pilon	-	9139	8	Intergenic	novelGene_143244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1806	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAACAGTAGTACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305866	291388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_291671_292425_292713_293832_293992_294461_295076_295472_300266_300339_301873_303492_303654_304556
885275	contig_17337_pilon	+	3031	2	Intergenic	novelGene_144721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_1	0	2731	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGAGGGTTTCTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13355	33367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_13394_30374
885276	contig_10197_pilon	-	5476	6	Intergenic	novelGene_115205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	811	junction_1	1121.41250215966	132	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	252	1019	952331	910531	FALSE	30	CCCCAGCAGAAAGTATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	952582	906073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910584_915130_915268_918060_918268_920434_920542_923908_924109_952267
885277	contig_11564_pilon	-	2756	11	Intergenic	novelGene_158539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	390.589157555609	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	332	1624	100760	41045	TRUE	5	TGTTTGCTTGGCTCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEEDNKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	101091	39834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_40890_40967_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62605_100657
885278	contig_11855_pilon	-	2731	15	Intergenic	novelGene_67140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	265.221047584148	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	153	1514	2723908	2710017	TRUE	20	CTACTCCTGTATCACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731340	2708599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2708846_2709045_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731068_2731170_2731299
885279	contig_4654_pilon	-	2213	8	Intergenic	novelGene_103095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	952.03511339806	39	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	302	1042	500418	494476	TRUE	30	AAACATCCCATGATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515968	493237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493457_493523_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118_500422_500562_500686_515793
885280	contig_2577_pilon	-	5277	6	Intergenic	novelGene_172055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	3895	4359	101414	100950	FALSE	55	AAGCAAAGACAAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTPNFSQQLKILSVCLESSHILSSSERKLLNFLTCSNLHCRPLSRSVTELFVVLGSLPIIILETPFCLRFPISGILLLYFGRSPGDTMVKHLAAKHKVGAKQKVSGLQLNWRKDQLNWRKDQLNWRKDRAICSRKDYSLGDPMGQFYSFIEG	389226	100031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_103510_213706_214163_340290_340796_388075_388314_388379_388896_389142
885282	contig_4232_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_63383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTCGCACAGCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467243	468134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467200_468100
885283	contig_7357_pilon	-	2196	10	Intergenic	novelGene_36792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.08627551365	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	220	1470	166824	136424	TRUE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167043	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_135773_135928_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
885284	contig_4857_pilon	-	9483	7	Intergenic	novelGene_48758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1464.89654545599	1642	190	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	5088	5597	1216861	1212207	FALSE	65	CAAAAGGAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1398688	1208320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1217756_1394377_1397165_1397208_1397882_1397955
885285	contig_3077_pilon	+	1822	7	Intergenic	novelGene_26799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	684.820171042491	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	198	1097	475601	481662	FALSE	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467406	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
885286	contig_10958_pilon	-	3015	4	Intergenic	novelGene_5331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_3	120.999540862306	1242	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1177	1653	505495	503411	FALSE	10	ATTGTGCGTCACGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLTNCCRRSSNVSYKYSKVNKEEEADENETEWLMEEIQMPAPRPGKEGQENGHITTKSVKADALTSLHGDDQDSEDEVLTIPDVKVHSARGPGVDSSHKTRSPPRMADPEQDGDRMGLIRGEKARKGRRRPGQQKPGNSAHPVSFHDDSDEDLLHV	509319	502048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_503828_505435_505506_505677_505831_508306
885287	contig_17572_pilon	-	2011	2	Intergenic	novelGene_178424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGATATTGTTGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26087	8548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17572_pilon_-_9426_24953
885288	contig_9752_pilon	-	4284	1	Intergenic	novelGene_122011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	699	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2379	2762	73938	73555	NA	5	CCTTCCATTTTCTCCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSYPPKSIPSLLLGDITNWREKPKSSELLLRNESLATLDFHLSNPMNTNACRSPLNQVPDSAHIGDQRVGMFSPLLFCQFKKNHEFQFPRNLVHRVNHPKGQLDFEGNVDGVGQRKRTLKKKKVGF	76316	72032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_72000_76300
885289	contig_9389_pilon	+	721	3	Intergenic	novelGene_84023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	1991	1331	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	21	359	584401	585904	FALSE	20	TGGCCCGAGTCCAACCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKVSSV	584380	586266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654
885290	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_92894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
885291	contig_5400_pilon	-	2114	3	Intergenic	novelGene_162824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	47.5	1142	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	487	1083	271258	268944	FALSE	25	GCTACACTTACTGCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRCLEPSGNGAEGTRSQWGTVESAEEPPPEAARLATALRELSQTGWYWGNMTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	273147	267912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_271119_271483_272885
885292	contig_5502_pilon	-	2241	2	Intergenic	novelGene_155018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	967	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAATAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537343	534479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_536577_537199
885293	contig_11525_pilon	-	1307	1	Intergenic	novelGene_171085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTATCACATCACAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62088	60781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_60800_62100
885294	contig_7457_pilon	-	1838	14	Intergenic	novelGene_31499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	888	1223	664175	662973	TRUE	25	GATGACCAAGGGCCGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISANDMLFSCCLVYGSTDWIWVLPLMSFSTQVKVIPPSLLLSLNLSRKVPGGLVLKMARSRSLLMKPIIYPSFQRARMYFFTRSMILSSQTQKEKPLPAMFSLQNLAHVI	670317	652339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_652370_653186_653259_658310_658431_658532_658582_660732_660815_661552_661652_661787_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668791_668906_669727
885295	contig_8978_pilon	-	5365	2	Intergenic	novelGene_49425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	3363	4001	460123	459485	FALSE	30	ACCTTGCTCATGGATAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKREIDSSTIIIGNFNTPLLMKNRTSIKKLNKDTEDLNATINQLDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNTHGTLSRTDYILGQKASLNRMQSIETQQSIFSDHKAIKVEIVTQKEKKSKHTETEQHLAQKLLGYRRNQGCNKQIHGLKQECKHILPEPLGHSKSSAHRSVYTNKCKHPKRRKGQNQNINPTTRTSRKRAATDNLGCQKKGSNKN	492075	458120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_460144_488733
885296	contig_6058_pilon	-	3643	9	Intergenic	novelGene_172395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	418.317761994396	55	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	310	1182	398054	390684	TRUE	25	CCAGCAAATTCTTGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQENRQCSFGLAELWAPDGVLILPRKRRQLIWQRYYPEQTSVFAVCHQNAGEPSRRWEQ	401601	383365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_390857_390978_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
885297	contig_13674_pilon	+	5846	1	Intergenic	novelGene_140297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAAGTATTGTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7232	13078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_7200_13100
885298	contig_15787_pilon	+	3731	7	Intergenic	novelGene_143961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	689	junction_3	441.727574416631	853	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	76	897	56204	96074	TRUE	20	CGTCTCTGTTTAATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRKPSNASEKEKHQKPKRSSSFGNFDRFRNNFTSKPDDSTEVYDGEPIRENGEQNKTSNNEGGLGKKMRGISWTMKKKMGKKYIKALSEDKDEEDGEDVFSYRNSDPMIGTHTEKVSLKASDSMDSLYSGQSSSSGITSCSDGTSNRDSFRLDDEGPYTGPFCGRARVHTDFTPSPYDSDSLKIKKGDIIDIICKAPMGMWTGMLNNKVGNFKFVYVDVISEEEVVPKKIKSHRSGKREKSNTLQEFLERIHLQVSKPMVCSVELLEDGRI	56128	111947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56261_79241_79314_84150_84301_88287_88418_90615_90768_95813_98321_111359
885299	contig_776_pilon	-	4947	3	Intergenic	novelGene_139910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATGGTCTCGGGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822347	667645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_668361_673639_673905_818380
885300	contig_8617_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_73497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATGGTGTTGAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63786	64076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63800_64100
885301	contig_10599_pilon	+	2832	8	Intergenic	novelGene_49873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1011	junction_1	594.345258006056	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	151	1134	123528	163915	FALSE	25	TATGAAGCCTGACTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123377	165613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
885302	contig_1146_pilon	+	5324	1	Intergenic	novelGene_84816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1602	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	101	520	511257	511676	NA	20	CCTTTGGAGTGGATGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWLQERAPPGACYLKCLQLLKALRDLGARGLDPMAATHWGRILSSYVLKTALLAVLLREGVPAQVWDEVHLGERLEEVVQFLRDCLLQRRALFHCVLGPGGAAAEVGPLPKVLREAAPVDVLAAFDQRPPGTRSCAAAVHVAKAAPASPGLRGSPLPCQVPATPESAHPGIP	511156	516480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_511200_516500
885303	contig_14618_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_136815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGAGACTAACTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608111	609839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_608100_609800
885304	contig_1276_pilon	-	3417	3	Intergenic	novelGene_159753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1353	1808	186534	186079	TRUE	55	ACTGCAAGAAACCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEAKTIINIYVPNDRAPKYTKQTITALKRETDSSTIIVGDFNTLLSVKDRTSRKKLNKDIEDLKATIRQLEFIYRILHQTAAKYRFFCKVHGMFSRTDHILGHKVTLNKIQNNEIIQSNFSDHKAIKVEINNRKSKGKNQLHGN	187886	19616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_20070_20172_20286_185035
885305	contig_6980_pilon	-	5110	6	Intergenic	novelGene_35989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGGTGCAAGCTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309108	156232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_156585_159775_159933_293217_294637_305077_307346_307928_308029_308294
885306	contig_7629_pilon	-	2452	3	Intergenic	novelGene_153601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_2	99.5	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	427	2220	449167	413485	FALSE	50	TTTAGTATATGAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVSLVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQGTPTHQKMTDFEQLNQFDSLKFHQVNQSFGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQNQSNGLFPDVADGSPMWGHHTATSISNLNGSPFHQQGHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRLQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFMDVSVSGPHRVSVNHPPQITNASTSQQSLSMQQFSQTSNPSIHFLKCSNHQEGNFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSHYSFSSNHLSSNSLLQSSAVLASNHTNQTLSDFTGNNSFSPQRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQMLHSSHPQGNYSSSKLSPVHMNFPDPVDSGTQMGHFNDRVETNGFSSLEENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPQYDESTFGQDSSSHVLDHHLDQQFTSHLVTRPSDMAQAQLQSHAQSWHSSLSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVRVMSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIG	471977	413252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_413821_447709_449330_471713
885307	contig_9112_pilon	+	1530	4	Intergenic	novelGene_60207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.551661385832	23	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	234	1049	108641	114303	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108407	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111589_112128_113625_113750_114251
885308	contig_9313_pilon	+	3158	4	Intergenic	novelGene_86485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1145.92097846618	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAGATATTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432395	464806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_432583_457278_457360_461601_462560_462874
885309	contig_17074_pilon	+	5313	7	Intergenic	novelGene_145134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1754	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	192	491	223356	223655	TRUE	45	ACACAGAACTCACAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSTNPVLGREPPAELQCMVASSAQCLSFPTVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	223164	239393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233608_233687_233825_237417_237499_239107
885310	contig_15114_pilon	-	2625	8	Intergenic	novelGene_121118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	187.301786386765	1387	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	76	1176	125261	100551	TRUE	5	TCCACTGTGGTGTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGTRRARSRQWPLWPDRLPSSDAAMARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125336	94767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94897_99230_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212
885311	contig_11720_pilon	+	1485	9	Intergenic	novelGene_43787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2565.92385591915	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	593	1201	86413	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67809	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78480_86254_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
885312	contig_4083_pilon	+	8922	7	Intergenic	novelGene_152325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	433	junction_4	173.162415732232	2034	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	307	990	65999	76949	FALSE	35	ATTATTGAGACATATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRPWLITKEHIQKLVKTGENNWSLPELVHAVVLLAHYHALASFVFGSGINPERDPEISNGVRLISVNNFCVCDLANDNNIENASLTGSNFGIVDSLSELEALMERMKRLQEEREDGEASQEEMTTRFEKEKKQSLFVVSGDTFHSFPHSDFEDDMIITSDVSRYIEDPGFGYEDFARRGEEHLPTFRAQDYTWENHGFSLVNRLYSDIGHLLDEKFRMVYNLTYNTMATHEDVDTTMLRRALFNYVHCMFGIRYDDYDYGEVNQLLERSLKVYIKTVTCYPERTTKRMYDSYWRQFKHSEKVHVNLLLMEARMQAELLYALRAITRHLT	58716	84881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_58753_64972_65210_65965_66141_71997_72117_72607_72799_74938_75084_76862
885313	contig_6434_pilon	+	4377	2	Intergenic	novelGene_61830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1317	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3837	4148	700031	700342	FALSE	30	AAGAGGTTGCCTCAGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASALLGQVFQSSVAPPESARRHPTPPESLVHRHSALSLHGSAPAPSFTGLLVLLLWFSAAAGSLSLPYIYLFTILKPFPHFRYLLEQHPTPGTKFCLSGWF	696125	700571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_699388_699456
885314	contig_10263_pilon	-	8629	21	Intergenic	novelGene_135840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	171.666792071152	2389	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	658	3030	900913	880676	TRUE	85	GAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTDISTSVIQSQVTVPTEKGVTGIVITSGGLPIPSVSEPPILTSVVSSITVPTVVSISTTSQSVLTPTCGSIVSSTSTLPSITVSTASASAVGSTVVPGAKPPTVLSQQAAGSTTGVATLTSVSTTTPFPSIVSQPFLQLSSSSSASTLAETVVVSAHSLDKTSHSSAAGLALSLSAPSSSSSPGAGVSSFVTQPGGVHPLVIPSAIASTPILPQAAGPMSTPLLPQVPSIPPLVQPVASVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHAHCPEIDVDAQPKAGIDDIKTLEEKLRSLFSEHSSSGTQHASASLETSLVVETTVMPGISTTAVAPSKLMTSTTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVLPVGTELPAGTPPSEQPPPLPGASLTQSQQPLEDLHAQLRRALSPETTAVTFAVGLVSVVAPTAVSEAGAHPQKDVSQVTEAPVLATSSGAGVFKTGRFQVSITTDDVQKEGKIKSEDAKSVHFESSTSESSALSSSSPESTLVKAEPDGVTIHGISSDVPEITHKTPASEAKSETGQPTKVGRFQVTTATSKVGRFSVSKTEDKITMAKKEGPVASPPFTDLEQAVLPAVIPKKDKPELSEPSHLNGPSSDLEAAFLSRHVDDGSGSPHSPHQLCSKSLPIQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLREKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYSKLGKVPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSAQSAASVLHPQQTLHPPGNIPETGQNQLLQPLKPSPSSDNLCSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGGTVNSQAPQAQPTAMTSSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAMNLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	901570	858837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_858986_866403_866502_867600_867703_868277_868373_868549_868617_870538_870655_871590_871671_873822_874021_874164_874271_875305_875385_875705_875924_876383_880994_881454_881646_888387_888583_890018_890222_891327_891990_893222_893297_897062_897124_897769_897854_899261_899346_900412
885315	contig_20641_pilon	-	1360	6	Intergenic	novelGene_52796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGAGGTCCGGACCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57171	14533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45928_56596
885316	contig_165_pilon	+	4242	1	Intergenic	novelGene_117080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440708	444950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_440700_445000
885317	contig_11816_pilon	+	3423	1	Intergenic	novelGene_98504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGGGAGTCGCCCAGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596280	599703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_596300_599700
885318	contig_14445_pilon	-	2980	7	Intergenic	novelGene_137370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTCCTTTCTATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360886	330903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_331171_333374_333617_336246_337682_348956_349062_356701_356770_357540_357611_360093
885319	scaffold_12124_pilon	-	3373	4	Intergenic	novelGene_22122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.01387685344754	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGCATTTTCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987320	936109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937116_938354_940328_944722_944862_987065
885320	contig_7025_pilon	-	3321	6	Intergenic	novelGene_104375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.670366293316	534	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1458	1823	58855	49239	TRUE	40	AATTATCTCTTGAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	61227	47693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_48782_48828_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939
885321	contig_16098_pilon	-	2169	3	Intergenic	novelGene_46222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3165	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1769	2107	766357	764972	FALSE	65	TTAACAAATGAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTLTQRSPPCAQRAALELKASHCWSAPGLLSHRSEWLFPAHARRAQDSCLLGSAFSILVMNISLLIFRPLSSNLSRKIPEAPNVFHLCSFLLVLRTGVRKSHQAGSWRRV	768125	764909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765636_766288
885322	contig_7919_pilon	-	2978	1	Intergenic	novelGene_28090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1302	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2381	2686	1132360	1132055	NA	20	TTCTCTTCTGTAAACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQLRMTGQRMPLHESRTEQLPEAHWAARARLPAVRATSNTGPALIQQWHLPCGSPIIIPVCYVNQNRQIIYETFFPPVKQNKYVQFKILFFSKKVQIV	1134740	1131762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1131800_1134700
885323	contig_9752_pilon	+	2344	2	Intergenic	novelGene_122010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	224	391	71977	72144	TRUE	5	CTTACTTCCTTGCGTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQYCSKAFTLNETLKIHERIHTGEKRYHCQFCFQSFLYLSTKRNHEQRHVREHNGKGYACFQCPKICKTAAALGMHQKKHLFRSPGQQEKMEGDVYQENSNPLENPHCIDSEDNDQKDDAHAIVENVVL	71753	74972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_73484_74358
885324	contig_4732_pilon	+	2336	16	Intergenic	novelGene_75438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	604.302514382398	2617	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	379	2082	653092	675284	FALSE	15	TGAAAGCTGCTTGGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMGMEGIGFGINKMGGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGQTMERIGSGVERMGAGMGFGLERMAAPIDRVGQTIERMGSGVERMGPAIDRMGLSMERMVPAGIGAGLERMGPVIDRMATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634980	675538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_661608_661654_662167_662246_670261_670316_672214_673018_673616_673669_675120
885325	contig_15325_pilon	+	2365	5	Intergenic	novelGene_157171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	658.370858635162	18	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	493	1050	94466	96243	FALSE	80	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	93227	97558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94567_95094_95233_95674_95785_96034
885326	contig_7457_pilon	-	3221	13	Intergenic	novelGene_31397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.646823197075	951	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	75	719	473193	469327	TRUE	15	TAGTCGCTCGGGGCAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473267	465898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_465969_466062_466165_466344_466433_466731_467468_467597_467653_467796_467858_467936_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
885328	contig_3861_pilon	+	3561	10	Intergenic	novelGene_57891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	230	junction_3	577.361195974655	687	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	2679	3560	150245	171805	FALSE	50	AAATTAAAAGAGAGAGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKE	141767	171806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793
885329	contig_10599_pilon	+	2827	9	Intergenic	novelGene_49868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	782.264980681099	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	144	1127	123528	163915	FALSE	20	TGAAGCCTGACTGGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123231	165615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123287_123439_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
885330	contig_7079_pilon	+	1025	8	Intergenic	novelGene_129235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	623.287989911042	1116	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	31	597	342490	348312	TRUE	15	TCTGAGTTTGCTTATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLHPFLLWGLGGAWPLVGVGGHFWIKSGREFS	342459	349826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344803_344900_345004_345095_345110_348219_348318_348589_348706_349519
885331	contig_11525_pilon	-	3717	6	Intergenic	novelGene_171068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1746	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAACAAAAAGTTCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62712	14308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_14432_18453_18549_22901_23174_26636_26766_56929_57040_59724
885332	contig_2940_pilon	-	770	4	Intergenic	novelGene_81930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8317.70610738856	54	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	51	299	722201	721953	TRUE	15	TCTGGTATGTTTCACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCLQRWRPSPIGTMAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKVCDPGMEMSVGMKDQSRHVAVESIPTQLSYRTEDSCPIEFPRSDLVDSNC	723513	717650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720984_721877_722207_723468
885333	contig_12677_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_110720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
885334	contig_15029_pilon	-	4068	6	Intergenic	novelGene_128178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	2124	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	66	641	172327	163104	FALSE	40	ATCCCTACAAAGTGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172392	159676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
885335	contig_8476_pilon	+	3034	6	Intergenic	novelGene_121317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2480	2812	40367	107056	TRUE	50	ACTAGAGTTGCAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFLFHWVGNQQCEDVPSSYFFGFPAFLLLRWNSGEVYAPALISFLRSHQGDTVVLSPQQSPECIKTPLNWRVPLCLRRLVCGFGLWWSRPDGFLCFFRNSHHSIFGFF	37887	130171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_40492_104781_104863_106929_107103_113219_113261_114104_114143_130074
885336	contig_15449_pilon	-	4183	18	Intergenic	novelGene_33567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAAGCGAAAGGCCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55784	11188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_11233_15756_15842_32835_32914_36984_38067_43214_43279_44271_44314_44648_44762_45019_45073_45573_45699_46861_46987_47159_47329_48211_48345_49036_49081_49185_49550_50960_51181_51223_51329_51808_51930_54568
885337	contig_3410_pilon	-	2137	5	Intergenic	novelGene_58921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	125.867738122205	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	199	408	30437	15425	FALSE	15	GTTTTACACGTTGAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCGHQRHCSRTPRRSRCLWVCRMPG	31538	13695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15497_29774_29831_30355_30472_30868_30963_31468
885338	contig_10930_pilon	-	2716	8	Intergenic	novelGene_36990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	1639.88517517389	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	302	1705	280211	268388	FALSE	20	ATCACTTACTGTGCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	289045	267376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157_280340_288872
885339	contig_6707_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_167042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGTAAAAAAAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185360	183913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_183900_185400
885340	contig_14618_pilon	-	2640	3	Intergenic	novelGene_136854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347177	1279745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1279892_1327227_1327380_1344835
885341	contig_11564_pilon	-	2914	10	Intergenic	novelGene_158542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_8	227.888374234209	1671	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	413	1705	100760	41045	FALSE	5	CTGTTTGCTTGGCTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEEDNKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	101172	39835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62605_100657
885342	contig_6270_pilon	-	3973	4	Intergenic	novelGene_99842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2435	2818	257810	257427	FALSE	70	AAAGCTTAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNDTTILEKDMVLPQKARIDIPFDPAIPNLGIYPREIRVVTQIDIRIPMFMAALFTIAKSWKQPRCPTTDEWINKLWYIRTVECYATRKNNNKSVKRLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	446226	256271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_258427_320579_321340_445042_445293_445418
885343	contig_10973_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_150376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTATTTTCATTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537	2095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_2100
885344	contig_11493_pilon	+	3389	1	Intergenic	novelGene_143727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCGGCACAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350647	354036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_350600_354000
885345	contig_12864_pilon	-	3210	5	Intergenic	novelGene_76426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	775.031410653788	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	389	1021	249596	244423	FALSE	10	AGAGTTGCTGCCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METIKLKVPTVVVCLHFIFKVRFCRGCYKVSISGTKVVLTCPEESDSPVWKHNDKDVGEPANLLVLDDFSEVENSGYYDCSNGNGNKGLRLYLKARVCESCMEVNLLAVVAIVIGDICITLGLLLVVYYWSKNRKAKAKPVKRGTGAGGRPRGKNSELGLRRFPPRGSPTWARWASIEHACEAKISADGSVSGHSSSSQPRKGSKKSINI	252145	242233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_244767_245704_245915_249517_249843_251887_251996_252111
885346	contig_4136_pilon	+	3987	3	Intergenic	novelGene_161237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	3109	3705	76480	77399	FALSE	10	AGTTTTTCGGATCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQKDEAKRSRKRKKGKKKKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSFEPRARGPGKQMSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGSPSRG	19858	77681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_21768_75280_76637_76959
885347	contig_6546_pilon	+	511	4	Intergenic	novelGene_140972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	19473	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	128	472	597703	599657	FALSE	20	GCAGCTGTTGATTTTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597575	599696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
885349	contig_2730_pilon	+	3824	6	Intergenic	novelGene_135354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	469.094020426609	2289	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCATTTCCTGTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291583	394311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_369274_369379_379343_379459_390685_393345_393566
885350	contig_9481_pilon	-	3730	4	Intergenic	novelGene_149660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	303	887	365899	365315	TRUE	40	ACTGGACTGTGAAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDTVPEDEPLRLEGPQKMTGEELPPQSRVNLNDVDGVKLSGPSFADMARLKMRRNSCKHPLIIGTWNVQSMNLGKLEIDKNERKCKNIDIRCISELKWTGSGHFELDGHRVCYTRNDRLKRNGVAFIIKKNISRSILKCNAVSDRIISIHLQGRPVSRTIIQIYVPTTKAKDEEIEDFYQLLQSEID	366201	240507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_240715_294301_295934_329230_329420_364499
885351	contig_8820_pilon	-	3585	9	Intergenic	novelGene_79283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1203.62398094255	74	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	543	1706	169721	167520	FALSE	20	CACCCGGGGTGTACCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVCE	171330	165640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169731_170188_170503_170600_170763_171273
885352	contig_13760_pilon	+	2811	2	Intergenic	novelGene_61353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1489	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTTCCTACATGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357335	360210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_359918_359981
885353	contig_15491_pilon	-	2033	6	Intergenic	novelGene_75948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	401.87291523565	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	110	715	46982	32303	TRUE	25	TGCTTATCAAAGAGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47091	30757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_31938_32164_32436_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
885354	contig_5727_pilon	+	2722	16	Intergenic	novelGene_7958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	774.588378143873	12	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	694	1155	173359	177012	TRUE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSLPVPSPSINIILLKILRCQAAKVESAIAEGGASRFSASSDGGGSRGAPQHYPKTTGNSEFLGKTPGQNAQKWIPARSTRRDDNSAANNSANEKERHDAIFRKVRGILNKLTPEKFDKLCLELLNVGVESKLILKGVILLIVDKALEEPKYSSLYAQLCLRLAEDAPNFDGPAAEGQPGQKQSTTFRRLLISKLQDEFENRTRNVDVYDKRENPLLPEEEEQRAIAKIKMLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRTSAPNWRLTSLW	169831	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174768_176974_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
885355	contig_854_pilon	+	3756	21	Intergenic	novelGene_36575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	2592.67956755169	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	144	2891	1679334	1715538	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQSHVVTSHTCCLIRPPLQGLWVVWQE	1678788	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702679_1715457
885356	contig_5153_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_74393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCCAACAGCCCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991461	993695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_991500_993700
885357	contig_2093_pilon	-	7675	10	Intergenic	novelGene_152984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_9	227.977960814821	2465	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	593	1546	1384563	1357866	FALSE	35	ATACAAGGTATCAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVAVNGKHTLLYAHRISLEKIDTLGIYGKVNIHSVGFRFSSDLQGTQASSVELIQINRENVQKSGISQLTLPFAARLNSSMGPGRTVVIKGEVNTNAKGFNVDLVAGKSRDIALHLNPRLNSKAFVRNSFLQESWGEEERNITCFPFSPGMYFEMIVYCDVKEFKVAINGVHSLEYKHRFKELSNIDMVEIDGDINLLEVRSW	1387098	1351736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1358016_1364609_1364776_1365572_1365662_1366409_1366437_1367575_1367633_1368504_1368625_1370810_1371022_1372530_1372620_1384518_1384668_1386610
885358	contig_6005_pilon	-	2660	4	Intergenic	novelGene_158885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	48.4722142629729	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	21	470	327313	311978	FALSE	15	CATCCGTTTGCCATATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAATNMEALYRVPFLVLECPNLKLKKPPWVHMPSAMTVYALVVVSYFLITGGIIYDVIVEPPSVGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSNAPNIPKLNRFLLLFIGFVCVLLSFFMARVFMRMKLPGYLMG	327333	309787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_327174
885359	contig_17144_pilon	-	3409	16	Intergenic	novelGene_29493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_7	2127.23967828942	13	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	329	1216	179764	173536	TRUE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	183410	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
885360	contig_4125_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_25158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTAATACTTTCCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895389	898097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_895400_898100
885361	contig_9313_pilon	+	3407	4	Intergenic	novelGene_86472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	766.050041881512	124	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	127	450	387329	461613	FALSE	10	TTTTTGTCTTCTGTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387202	464570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601
885362	contig_3077_pilon	+	1940	8	Intergenic	novelGene_26809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	798.346224314708	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	161	1051	473998	481186	TRUE	25	GATTTAACGTGTGGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKRGLCQGHHSGPDGLVLPYGCDVHHRSWPVCCSNS	467450	482391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479628_481082_481218_481533
885363	contig_5018_pilon	-	2037	8	Intergenic	novelGene_47020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	176.947472893131	45	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	510	1103	1394992	1392342	FALSE	10	CTCTGCCATCTGTTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEIMSMGYERERVVAALRASYNNPHRAVEYLLTGIPGSPEPEHSSVQESQVSEQPATEAGENPLEFLRDQPQFQNMRQVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISRHQEQFIQMLNEPPGELADISDVEGEVGAIGEEAPQMNYIQVTPQEKEAIERLKALGFPESLVIQAYFACEKNENLAANFLLSQNFDDE	1397333	1391407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1392456_1392536_1392702_1394287_1394419_1394550_1394630_1394887_1395016_1395340_1395523_1395689_1395852_1397191
885364	contig_7356_pilon	-	5630	27	Intergenic	novelGene_60402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_11	313.046513832186	2612	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1498	4497	177	4673	515889	463380	FALSE	20	TTTTATCCACATTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSENKKQRSRPRKPRRTRNEENEQDKDLEGPVIDESVLSVKELLGLQQAEERLRRDCIDRLKRRPRNFPTAKYTCKLCDVLIESVASAHKHIKEKRHKKNIKEKQEEELLTTLPPPVPSQINAIGIAIDKVVQEFGLHNESLEQRRGIKHIMENVFQHKLPDCSLRLYGSSCSGFGFKNSDVNIDIQFPAIMSQPDVLLLVQECLKNSDSFTDVDADFHARVPVVVCREKQSGLLCKVSAGNENACLTTNHLTALGKLEPKLVPLVIAFRYWAKLCSIDRPEEGGLPPYVFALMAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLNKLGNFNLKDVEKDIVVWEYADAATGDADPAKEELPRAPRDMPVKRGQVPLIFDLKRQPSVPVGQLWVELLRFYALEFNLADLVISIRVKESVSRESKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNNQPVFEYILHCLRTTYKYFALPHKISKSNLLKPVSAVTGISEHSKEVTNHDPGVQAKGDKFKNSVLAQGPGAISPAANTPKVQPLALKQTADHFEGPPVEEMGNRHISVSLENLDCVKAEVSCDDHEDVTMHRLETGGEHEKLKIEREGQHHLTAHDQDINSSKHGELAICGSTPTETDRTLDLEGFRNLTVRGRDGYVTIVVKADIDEESIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTPQKTKPVRPAVDLGRDKLLRPPLEKWKRQDDRDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASPKRTQQES	517113	462422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_463448_475963_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811_492900_494323_494505_497361_497524_499875_499996_501191_501319_502268_502339_503462_503515_505423_505513_509940_510119_510847_510965_511283_511466_515369_515921_516968
885365	contig_3727_pilon	-	5643	8	Intergenic	novelGene_146731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1850	2230	297157	296777	TRUE	35	GCTTACAAACCACTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	299865	28847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_29124_29606_31674_53565_53702_251560_251680_253977_254247_296230_297185_297430_298372_298984
885366	contig_9436_pilon	-	2131	6	Intergenic	novelGene_60903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	42.4009433857314	1036	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	131	763	418405	415989	FALSE	20	AGACACGTCTCGGGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNALCALNVVYMLVGLLLIGVAAWGKGLGLVPSIHIIGGVIVVGVFLLFIAVAGLVGAVYHHQVLLFFYMIILGLVFIFQFGISCSCLAINRSKQTDVINASWWVMSNKTRDELERSFDCCGLFNLTHQYQQDYTLCTAICKSRSPTCQMCGEKFLKHSDEALKILGGVGLFFSFTEILGVWLAMRFRNQKDPRANPSAFL	418535	414620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_416277_416889_417022_417377_417459_417701_417870_418342
885367	contig_6270_pilon	+	4975	4	Intergenic	novelGene_99874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	310	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2779	3093	1055962	1056276	TRUE	30	TAATGCTATATCCTTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEFSTARWCPATTTDCSDQDHNTGFLIELEKDVEHNSNSQKKKTRFTGLKETGEAPRVCPPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPLKPNGTNEVQ	1053183	1158354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1056723_1110628_1111576_1118871_1119122_1158115
885368	contig_7963_pilon	-	3156	5	Intergenic	novelGene_58540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	120.348192757515	6	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1262	1852	243778	240504	FALSE	65	CTTTTAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245039	239199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719
885369	contig_6364_pilon	+	6151	14	Intergenic	novelGene_51711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2280	17	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	5780	6151	477668	521264	FALSE	15	TCCCCGCCTCATCTAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTGRRTGRSISFKFLVVIPISIHTWSRSRIVHGKRSVNDARRKKLIRSPPSMAQMEERTVRGLTGSPRAEGGSGGNRAAPRTGKQRLSATPAGRRWESGKQGRGPGTLPPPPRPHLPHPASA	431225	521264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_432749_433367_436283_436418_436500_439764_439985_440671_440788_445010_445153_447070_447144_457072_457255_458660_458773_466203_466369_472493_472646_477569_477736_490716_490802_521045
885371	contig_7898_pilon	-	2934	6	Intergenic	novelGene_47544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.562299076034	1234	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	85	819	339020	291438	FALSE	15	TTTTTTAATGGCTTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQDIAVPPPVPPPPSSEALNGSILDPLDQWQPSGPRFVHQQPPSPSPAHGSSAPTPQDSLGAPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMSSSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNVPSFPADEANSSPPLPVALSPHYGIPENNSPLGGKAGPLTKEKPRKVPSPPPALPVSLGLGNCPPLPCTPTSPFFNCSRSTEKGLSSNNVF	339104	289322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_291586_301052_301162_301277_301415_301829_301931_302261_302489_339007
885372	contig_1263_pilon	-	4225	8	Intergenic	novelGene_170385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	855.92868766466	15	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	317	1633	65303	55502	TRUE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76860	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53518_54748_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
885373	contig_2078_pilon	+	2179	7	Intergenic	novelGene_100126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	81.4896039722587	91	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	40	1263	266417	309099	TRUE	20	TACTTATTCACGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCFRQYGLLTHQMVLHPDPDAQIQPHSCQDPPDISKDIPCSTSSSESSSNFWHFPVDVLLQSLLNDLQQNFTCVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKVGLKESNHVLSIRGPGDPDSSATIRPSVQFLFGQYGGCARVPTAG	266377	311805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_280081_280216_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_309148_310937
885374	contig_12938_pilon	+	1234	5	Intergenic	novelGene_99749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	1068.59870274112	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTCATTCTTATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81387	86327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_81459_82102_82245_83391_83470_84550_84635_85468
885375	contig_13421_pilon	+	3717	3	Intergenic	novelGene_166810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCAATGGAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222300	227217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_224520_224957_226135_226896
885376	contig_5302_pilon	-	4336	6	Intergenic	novelGene_81403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	769.696147840172	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	320	763	182005	177300	FALSE	45	TAGAAAAGCTACTTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209442	173726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_209142
885377	contig_13021_pilon	+	2399	12	Intergenic	novelGene_8153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_10	2135.25452447654	128	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1090	2112	177637	180850	FALSE	45	ATATTTGAAGACTGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
885379	contig_11855_pilon	-	2867	11	Intergenic	novelGene_66958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2040.09446104831	42	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	639	1286	1085005	1079293	TRUE	65	AGAAAAACAGAAAATGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102138	1076187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085010_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
885381	contig_16382_pilon	+	2550	2	Intergenic	novelGene_160226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCAATAAACTCACACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153194	155789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_154445_154489
885382	contig_3862_pilon	+	2334	7	Intergenic	novelGene_137438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	125.109840629034	68	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1164	1511	645524	646650	TRUE	30	TATATTTGTGCTCATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEKCYSLLVPDSDRSQMILVTPVALPSPDEVIRKRLLIDGDGAGDDRRINLLVKSFIKWCSSGSQEEGYSQYQRMLSTLSQCEFSMGKTLLVYDMNLREMENYEKIYKEIGKAA	644360	651403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_645730_646508_646701_646808_647054_648716_648775_649490_649558_649650_649721_651070
885383	contig_7165_pilon	+	2144	2	Intergenic	novelGene_116875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	66	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	621	941	649902	650222	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNLFYDASITLIPKPTKTPQKKENYRPISLITIEAKILKKILTNKIQHLSKKKKYTMTEWDSYQVCKHGSTFRKSINVIHHINRTKEKNHMIISIDAEKAFDKV	646952	651425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_647137_649465
885385	contig_9406_pilon	-	4068	20	Intergenic	novelGene_136155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	667.798923076438	20	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	100	2196	80811	49562	TRUE	55	AAGGAATAGAAAACGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELVDRKKDALLSALSIQNYHLECNETNDLAGVMALQRKLTGMERDLVAIEAKLSDLQKEAEKLESEHPDQAQAILSRLAEISDVWEEMKTTLKNREASLGEASKLQQFLRDLDDFQSWLSRTQTAIASEDMPNTLTEAEKLLTQHENIKNEIANYEEDYQRMRDMGEMVTQGQTDAQYMFLRQRLQALDTGWNELHKMWENRQNLLSQSHAYQLFLRDTKQAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIKKQEDFMTTMDANEEKINAVVEAGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRHRKNREAASELLMRLKDNRDLQKFLQDCQELSLWINEKMLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQLISEKPETEAVVKEKLTALHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGKSTDEVDSKRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETGAAGRHRRQVPLLQHGARPHALDGGCDPPDRSPGEAPGCVIC	80964	34166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51253_60456_60532_61873_62156_62329_62420_63104_63330_65137_65402_66993_67141_72060_72152_78954_79158_80220_80828_80881
885386	contig_11448_pilon	-	3303	5	Intergenic	novelGene_66418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACTTAGTGAAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659645	552871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_552879_565061_565587_568305_568471_655802_656807_658043
885387	contig_5954_pilon	-	209	2	Intergenic	novelGene_28445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGATGGAAAACAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99008	98635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_98692_98855
885388	contig_15087_pilon	-	2409	2	Intergenic	novelGene_37221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTTCTTCAGATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131848	128993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_129521_129966
885389	contig_383_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_126111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	478	1434	124	1557	135364	136797	NA	5	TTTGGCCAGTCTTGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQR	135240	136797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_135200_136800
885390	contig_10958_pilon	+	4592	23	Intergenic	novelGene_5330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	900	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACCGTCACAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502047	570825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_502869_502948_503693_533363_533541_534019_534102_535232_535411_535514_535665_536008_536180_538272_538462_541025_541139_542756_542857_547662_547843_548551_548722_549207_549323_550440_550620_551157_551305_551882_552024_553476_553619_555254_555398_558422_558588_565881_565984_566851_567027_567211_567377_570782
885391	contig_9683_pilon	+	4335	4	Intergenic	novelGene_151300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_3	180.268934896972	66	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	9	503	932275	934748	FALSE	75	CCCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKMAAARAGVLGVRWLQRAARNMVPLGTRTASHITKDMLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPDRSQQERDPWYDWDHSDLRLNWGEPLHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMCKHLFGFVAFMLFMFWVGEKYPSYQPVVSIWEVPP	932266	938580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_932360_932589_932717_934040_934141_934565
885392	contig_7202_pilon	+	1005	3	Intergenic	novelGene_17529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2627	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGCGAGGGGGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
885393	contig_12837_pilon	-	4744	3	Intergenic	novelGene_57273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_2	215.5	2068	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	101	508	60580	49099	FALSE	60	ACAATAAAATGTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARPPAASALGAGAAGLPVSGGGSGEERTLLVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTVSEWLRLLPFLGVLALLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPKVVNEINIEDLCLTKAAYCRCWRSKTFPVCDGSHNKHNELTGDNVGPLILKKKEV	60680	44862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_49189_51014_51230_60477
885394	contig_17440_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_7525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGATTAAAAGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242	2188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_200_2200
885395	contig_7963_pilon	-	4797	7	Intergenic	novelGene_58531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.186466104126	1512	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	45	704	245666	240504	TRUE	55	AACTACATGAAAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRGAPAGDLPGAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245710	236099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_239114_239424_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_245606
885396	contig_15720_pilon	-	4649	5	Intergenic	novelGene_41939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1891	2346	307437	306982	TRUE	55	TTTTAAAAAAAGAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	368724	299701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_300471_300700_300703_305260_306700_306888_308160_367556
885397	contig_9011_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_159272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGACTAAAAGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117286	115543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_115500_117300
885398	contig_15114_pilon	-	475	3	Intergenic	novelGene_121236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	68.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTGTGTGACTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1699120	1690958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1691174_1694990_1695085_1698954
885399	contig_9921_pilon	+	3742	3	Intergenic	novelGene_23756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	682	1857	321085	322260	TRUE	20	CATCTTGTCAGTTATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPNATNVTCYYQPAPYVSDGNFNNYYVAHPPVTYSQPYPTWLPCN	299300	326593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299956_321058_322993_325440
885400	contig_6137_pilon	-	3674	2	Intergenic	novelGene_59233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCCTATCAAGACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317982	1314256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1315915_1315966
885401	contig_12158_pilon	-	2829	3	Intergenic	novelGene_104843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_1	28.5	1670	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	201	758	36693	36136	FALSE	50	AATAAATACTACTTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLCSENEGKPENQGKMENQEQPQVKGKPEVAGTLEDKEKLGNEGKTEKKAKTEDEEMLKDKGKPEGEAKPRGKPASETRAAGKRPAQDDVPRKAKRKTNKGLAEYLKEYKEAIHDMHLSNEEMIREFDEMARVEDEVKKSKQKLGGFMWMQRSLQNPFHPRGPRELRGGCRAQQRGFEDIPYV	37792	34064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_36717_37060_37134_37688
885402	contig_18364_pilon	+	6177	25	Intergenic	novelGene_102549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1007	junction_23	494.425079989094	2533	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1304	3915	11	3925	16504	50216	FALSE	40	ATCTAAAATTTTAGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSRFAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQKKPGYHAPVALLNDIPQSTEQYDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGGKTPDPKMNARTYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	16493	52468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_29679_31509_31590_32506_32678_35655_35894_36637_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41726_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
885403	contig_2834_pilon	+	1862	3	Intergenic	novelGene_28002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2464.5	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	53	445	274763	290707	FALSE	25	TACAAGCCAGCCTGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274710	292124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_285547_285746_290617
885404	contig_12806_pilon	+	5453	5	Intergenic	novelGene_178426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1565	2017	3242	184938	TRUE	40	AGGGAGAAAGTTATTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDGSTTVVGDFNTPL	0	189382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12806_pilon_+_1500_3176_3601_184844_185889_186842_188065_188118
885405	contig_5472_pilon	+	5421	2	Intergenic	novelGene_130038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	4809	5420	436703	437314	FALSE	60	ACCACAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKFRKKRTKKNKETLRVMRDTIKIKNYRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPSIMKDEKLAFQAQRTPYRR	431752	437315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_435120_435261
885406	contig_5590_pilon	-	1198	7	Intergenic	novelGene_163034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAGAGAATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369181	354912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_355171_358766_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
885407	contig_5686_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_45317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATATTCCCCTTGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100974	99834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_99800_101000
885408	contig_7151_pilon	-	1659	5	Intergenic	novelGene_40786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	967.722713384366	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAAAGGCAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551203	528829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529276_530098_530179_535501_536494_549638_549729_551152
885409	contig_7707_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_72103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCCAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1788	3630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1800_3600
885410	contig_9682_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_125291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	515	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTACCTAGCTTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8363	6589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_6600_8400
885411	contig_10766_pilon	-	5812	4	Intergenic	novelGene_151181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	4833	5387	35876	35322	FALSE	10	CCTCTGCATGAGTCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKIRKRKQNKLKKRKEQGKPTKKTGKKKTNVKINALSDPSACLCKLRWKSRCHVAPPGQKRLPTQEKEKKTNNSKQTNEQKPRDPTSVEAQTGKQLHTRMELYSPSGRSKDGTWSQVFEQKEGEVVRGKEEIKRSRKKKATLAANKWHSESQLVQAGVSQTRDCVRGKQRGPSVGEEG	295748	34896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_36405_219823_222517_293194_294320_295262
885412	contig_5686_pilon	-	9175	13	Intergenic	novelGene_45425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	810	155	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	6074	6745	208699	203000	TRUE	50	CTTTTAAAAAATTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	300258	187114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_222914_224040_224199_226530_227324_298088_298859_299662
885413	contig_10855_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_124368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	633	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTTGTCTTGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697407	698031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_697400_698000
885414	contig_15720_pilon	-	3100	3	Intergenic	novelGene_41948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1093	1548	307437	306982	TRUE	50	AATGTCAGACAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	367926	305240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_306888_308160_367556
885415	contig_15897_pilon	+	3263	1	Intergenic	novelGene_49573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCGTTATCACTTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817763	821026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_817800_821000
885416	contig_16594_pilon	+	3460	7	Intergenic	novelGene_53834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTAGCCACTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	335679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118510_124148_124260_132997_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_335582
885417	contig_1765_pilon	-	3729	6	Intergenic	novelGene_178427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2503	2811	226551	192253	TRUE	35	ATTATTTTTTAAAAACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHLSIRVMTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLGKRHIIFQNGCIILHSHQQSIRVPISPQPLQHLLFPVFLILNLVFFCVLEFCSTSISSSVQSSLL	351218	164587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1765_pilon_-_164943_191689_192330_226319_226770_269488_270697_329433_329993_350701
885418	contig_10904_pilon	+	2678	3	Intergenic	novelGene_22454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	919.5	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	202	1170	149100	150068	FALSE	25	AAGAAGGACTTGTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143874	151576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146119_146226_149097
885420	contig_1443_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_28201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	158	463	344287	344592	NA	30	TGCATTCTAATGAGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344129	344888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344100_344900
885421	contig_14556_pilon	-	3307	1	Intergenic	novelGene_138535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2383	2793	177599	177189	NA	45	GCAAGAGGTCATTATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIRTWNVRSMNLGKLEIIKNELEHINIDILGISELKWTCIGHFELDTHMVYYVRNDNLKRNGIAFIVKKNIPRSILKYNAVSDRIISIHPQGRPVNTTVIQIYAPTTKAKDEEIEDFYQLLQSEID	179981	176674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_176700_180000
885422	contig_16635_pilon	+	3780	5	Intergenic	novelGene_153143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_3	146.408674606391	2044	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	174	626	86080	94700	FALSE	30	GAATGTAAAGTCTTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGAVAAKVRRHDMRVHPYQRVVTADRAATGN	53052	97854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_87773_90607_90683_94683
885423	contig_10930_pilon	-	2892	6	Intergenic	novelGene_36983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	3	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	732	1580	276835	268388	FALSE	40	GTCTCAATTGATTAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279258	267075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277020_278298_278637_279049
885424	contig_10404_pilon	+	2805	4	Intergenic	novelGene_138720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1334	1639	1284804	1285109	TRUE	60	AAAATAAATTTTAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSEPLSIACGNAKWHSHCGKQCGGSSKLELPHDSAIPLLGIYPKNLKAETRTETCTPMFIVALFTIAKREKQPKCPSTDEGINTYIKWNTTQPVREMKF	1283470	1387474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1285642_1288302_1288611_1386635_1386857_1387369
885425	contig_6291_pilon	+	2923	2	Intergenic	novelGene_164790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGAGGTCTTATCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382459	386678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_383707_385002
885426	contig_5698_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_55044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAACAAAAGATGTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21183	18919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_18900_21200
885427	contig_9113_pilon	-	1758	3	Intergenic	novelGene_68578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTACATGCACAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317792	207154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_207202_221989_222871_316962
885428	contig_7025_pilon	-	4782	19	Intergenic	novelGene_104368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_15	701.509978546278	2344	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	182	2587	95047	49239	FALSE	30	AATGGAGGTATCTGAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSTSQNSSLSCSSVLQPVTEGAPPCGSDKEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95228	47043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_94786
885429	contig_8269_pilon	+	3861	1	Intergenic	novelGene_106257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1578	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGATTCTTATTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378277	382138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_378300_382100
885430	contig_2646_pilon	+	1609	11	Intergenic	novelGene_69507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	261.264406301356	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	732	1298	566553	573396	TRUE	10	CTCGCTGGTGCAGCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	553997	574402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385_573503_574197
885431	contig_4924_pilon	-	4358	13	Intergenic	novelGene_84649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_12	1041.9091017881	8	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	144	1703	452629	65524	FALSE	75	AAAAAAAAAGAGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSFKLDFLPEMMVESRLLVSDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	452772	62868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_452555
885432	contig_11375_pilon	+	1132	3	Intergenic	novelGene_152655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	116.5	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	30	440	178418	179000	FALSE	5	GTCATTTGCGTGTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAFCSAQRDMCHSRSSLPTMTVLRARTPPPSTSPGPRRGSGPEIFTFDPLPEPAVAPVTRFSASRGHRKRSRRVLYPRVVRRQLPPEEPNHAKRLLFLTLEDAPSDASPAPIPAPPVFEPFNLTSESSDYALDLSTFLQQHPAAF	178388	179692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_178628_178739_178793_178852
885433	contig_10599_pilon	+	2957	8	Intergenic	novelGene_49869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1011	junction_1	594.345258006056	1156	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	279	1262	123528	163915	FALSE	25	TGATATGAAGCCTGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123249	165610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
885434	contig_19459_pilon	-	1325	8	Intergenic	novelGene_59806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4124.17644963878	4388	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	106	792	16240	7194	FALSE	30	TGTATTTATTTTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQFSKYH	19069	6660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7212_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
885435	contig_7327_pilon	-	2017	3	Intergenic	novelGene_172126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCTTCAGGACAGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196594	137000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_137012_170237_170679_195029
885436	contig_17427_pilon	+	2089	8	Intergenic	novelGene_30283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	199.322935592122	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	19	354	147949	155745	TRUE	10	ATCCTTGGTGTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDGVKMASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVFLDSLDAQERPLTSVT	147930	176877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152170_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
885437	contig_405_pilon	+	4344	3	Intergenic	novelGene_135298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1442	1753	195348	371571	FALSE	60	AAAAAAAGGAAAATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKNRQIHGKGRQIHGKYSQKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQFEIQKINNLSEMDSVIEELRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLRKNQKKNEEKMKKP	193731	374162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_193809_193983_195644_371555
885438	contig_8357_pilon	-	2828	4	Intergenic	novelGene_39734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1692	2123	744694	744263	TRUE	30	GCTGATATTTGACAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILAKRIQLHTKKIIHHDQLGFIPGMQGCFNIRKTINVIHHINKTKDKKHMILSIDAEKPFDKIQHPFMIKILSKRGIEGTFLNIIRDIYTKPTANIILKGESLKAFPLRLGTRQGSPLLPLLFNIVLEVLAEH	1080129	723601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_724216_744171_744940_907127_907612_1079167
885439	contig_9921_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_23731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150794	149248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_149200_150800
885440	SIRV6	+	1434	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	93	1	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	15	ATTCTTGAAGTTTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
885441	contig_10861_pilon	-	3759	18	Intergenic	novelGene_39222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	324.431181755857	3522	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	147	2798	614317	583577	FALSE	25	TTTAAAATCGTTTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGFFRGTSAEQDNRFSNKQKKLLKQLKFAECLEKKVDMSKVNLEVIKPWITKRVTEILGFEDDVVIEFIFNQLEVKNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRMQMGKRWQSPMTKSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	614463	582615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606511_607921_608038_608886_609058_611134_611258_611521_611612_614296
885442	contig_15021_pilon	+	2726	12	Intergenic	novelGene_26946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2058	2525	252040	263343	TRUE	20	AGACCGAGCCCCGGACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNFIQNPFLQALPFLQREGVSLGDDRHDVHLIVNRFHECNIQGLQSVPERRDEVEAAVNPVVDDVPPVQATLIVQVPFKLLVDVGDDGLKAVSAVDGITVAGRVHHRQSQLHPTLFNLHGGGLDLDSSLNFFCSSGYDSFWVEVSQEQAVYER	239745	279811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_240720_240979_241742_249286_249384_251250_251396_251960_252064_260956_261075_261238_261377_262376_262498_263276_263362_267740_267864_269629_269658_279779
885443	contig_18592_pilon	+	5071	2	Intergenic	novelGene_114772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3084	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACTGGTTACAGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	12797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_+_3072_9480
885444	contig_7396_pilon	-	2832	16	Intergenic	novelGene_79546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3218.82851291515	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	168	1553	255163	246385	FALSE	25	ATTATTTATGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257069	245105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
885445	contig_7056_pilon	+	5007	15	Intergenic	novelGene_43667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	632	junction_1	490.379991143894	2006	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	132	1913	798314	810882	FALSE	25	TAAAAGTTCGATTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781800	813976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828
885446	contig_9112_pilon	+	1669	4	Intergenic	novelGene_60208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	410.551661385832	33	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	238	1188	108645	114303	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSQCAASSRNSRLCMKRVTSQLYHPWKNIGNSPFVLPFLHVFANVLSVPFSAIVTITSLFLAPFAQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108407	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111450_112128_113625_113750_114251
885447	contig_546_pilon	-	5859	5	Intergenic	novelGene_117186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	510	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTTCTCAAGTTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145530	61216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_61244_119793_119882_123931_124064_139863_144781_144835
885448	contig_2636_pilon	+	3022	4	Intergenic	novelGene_52041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	322	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2618	2926	77626	77934	FALSE	50	ATCCAATAGAAAAAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREKNGYPYRQNKTIKIDSYLTAYPKINFRFIIHQQEKGKSIKLFEDNVEEHLHDISLVKASFLKTRSTVIKGKIYKYYYIKISNFCPSKDTIKRGKRLSY	23717	78030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_24299_51518_51579_72846_73623_76425
885449	contig_4180_pilon	+	2618	6	Intergenic	novelGene_8341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1177.34436763421	2304	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	64	720	865772	888134	FALSE	50	ACTAAATAGATAACACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865708	890032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
885450	contig_9706_pilon	+	3844	1	Intergenic	novelGene_20996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAATAAAATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465458	469302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_465500_469300
885451	contig_9297_pilon	+	4235	7	Intergenic	novelGene_69889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	572	junction_6	158.400775110337	1125	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	224	1141	939250	970821	FALSE	10	TTCACTTGGTTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRTTTPYFL	939026	973915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939325_955845_955942_964903_964970_966037_966180_968984_969065_969260_969471_970572
885452	contig_10126_pilon	+	3613	4	Intergenic	novelGene_105764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	508.174073412732	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	853	1176	184804	185170	FALSE	85	ACCAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLDKNPGTHILSLGEVAASGPAFPLPRNPLEGPPDETSSLSSCSSLCPSRTPQGPVIPTVTLHTDPPVLSSPACSLQLVLIHNISLWTPVNYLRNVKRAILKLRY	169514	187607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_169586_181522_181575_184074_184881_184923
885453	contig_9297_pilon	-	1837	7	Intergenic	novelGene_69883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	1432	1836	910899	910078	FALSE	20	ACTTGAATGTATGGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHDTLIKVFSTQVSISISGHDFKDTIVNGEKRHIEGSTTQVKHEDVLLTLPLIQAISNSSCCRLINDPHNIQSSNSSSIFGCLTLGIIEIGWYSNNCVGNLFSQISLSSFLHFSENHGRNFFRSKRLCLPTSNV	913134	910076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_910178_910504_910620_910709_910955_911039_911100_911206_911443_911697_911877_912233
885454	contig_5153_pilon	-	2983	2	Intergenic	novelGene_74395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACGATAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995364	991465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_993091_994006
885455	contig_8263_pilon	+	2206	6	Intergenic	novelGene_83110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_3	45.0484183962101	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1046	2149	179915	192899	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVEIIIQNFSSNCLFSFSLFSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	178869	192956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
885456	contig_9242_pilon	+	3949	3	Intergenic	novelGene_155064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	544	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	3592	3948	461745	462101	FALSE	5	GCTGTTGCAGGTTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPYETQVARLLVFLVSSASASCGISALGPNAHVCAAGASVPKLGSSANTCPEVPQSTRKTRAQRHSALSLCGSAPAPFRTGLLVLLLLVLCHCHSSATAGSLPLPLL	426371	462102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_426772_426916_429392_461028
885457	contig_5189_pilon	-	3067	12	Intergenic	novelGene_34856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_11	903.28620433512	6	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	838	1941	244235	199237	FALSE	40	AAACTGAATTACTTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	253014	198110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694_247751_252286
885458	contig_9633_pilon	-	595	2	Intergenic	novelGene_139643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1389	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	257	577	1140390	1138462	FALSE	50	GAGAGATTTTATTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1140646	1138443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138662_1140269
885459	contig_14142_pilon	-	884	5	Intergenic	novelGene_120636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	515.179277048291	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	146	574	622927	620409	FALSE	25	AAGTCCCCAACTCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQNFFFCCCFLFFFFFVFF	625162	620098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620461_621102_621210_621425_621531_622762_622949_625038
885460	contig_13275_pilon	+	5363	5	Intergenic	novelGene_178429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	4256	4960	140244	140948	FALSE	65	CACAAAAAAAGCACTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRMSGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNKETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQEEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDLKRKSPRHIIFTLAKNKDKQRILTAAHEKQEVTYRRETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIHKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYSKVKPNLQELLKGVLRPEDKQLQPSGRT	183	141351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13275_pilon_+_2700_121362_121494_137683_138099_138463_138517_139103
885461	contig_4232_pilon	-	865	2	Intergenic	novelGene_63375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1659	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGGGGAAAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468137	467233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467461_467499
885462	contig_19402_pilon	+	3304	19	Intergenic	novelGene_80777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1545.62155782067	12	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	572	2386	29462	143056	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAAGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23464	146712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23678_23729_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_145800
885463	contig_10599_pilon	+	2708	8	Intergenic	novelGene_49867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	823.410131646411	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	112	1011	146918	163915	FALSE	30	ATATGAAGCCTGACTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123207	165612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123287_146885_147018_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
885464	contig_6738_pilon	+	3805	3	Intergenic	novelGene_166128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	550.5	15	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGGAGTGTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32659	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_32756_36540_36701_37105
885465	contig_5643_pilon	+	4475	16	Intergenic	novelGene_39010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	758.896274569559	32	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	3494	4270	636518	641217	TRUE	10	CCGGTCATTGTGTGTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631896_632392_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635761_636125_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
885466	contig_8138_pilon	+	2017	6	Intergenic	novelGene_52410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.497194402944	3061	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	227	631	280295	306552	FALSE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKKLRMEAS	280068	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364_306451_306528
885467	contig_7151_pilon	+	2813	8	Intergenic	novelGene_40753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	170.492922828761	123	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	535	891	505515	507901	TRUE	65	CTGAAGAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502545	549233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440_505593_506568_506685_507738_509585_548994
885468	contig_2278_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_118094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	216	578	669895	669533	NA	75	AGAAAGTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHQPEPRTRCCLATTPTILTRDHNRGCTTEWEKNVQQNPNSQKKTRLTGLTETGGTPDTMAPRHPANSDLNSFPKSTFQPKIRQAYKTNNNTREASASWFNQVYETKWATCAQNQR	670110	668171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_668200_670100
885469	contig_20951_pilon	-	1269	3	Intergenic	novelGene_43062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3166	junction_2	9254	58	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	7	678	28130	27149	FALSE	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28136	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784
885470	contig_15449_pilon	-	4061	12	Intergenic	novelGene_33600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAAGTAAAAGTAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56177	42227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_43279_44271_44314_44648_44758_45010_45073_45573_45699_46861_46987_47159_47329_48211_48345_49036_49081_49185_49554_51103_51329_54569
885471	contig_2703_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_101661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCCTCACGCCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2598	4200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_2600_4200
885472	contig_383_pilon	+	2482	8	Intergenic	novelGene_126116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	972	junction_1	106.289170450719	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2295	188	2482	135598	154337	FALSE	20	GTGTGTCTTACTAATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQ	135410	154337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233
885474	contig_10197_pilon	+	2583	7	Intergenic	novelGene_115207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	61	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	2155	2583	920480	952434	FALSE	15	CCTCAATCCGGGACTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLSSTSRMSQQINFSSVSTICRYSRIIFSLSSPPLFSSFCSMLLIILQEALLAPITFLYATDRRFLSSTVNSTSIPATFFIDSTISSYRSACSASFAWYTRSSRSSIAAVAQAGSARRMEADSVSDSLSLSLRVRAAKMAA	908339	952434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_909995_910473_910582_915128_915274_918066_918267_920433_920540_923906_924109_952267
885475	contig_5341_pilon	-	1572	4	Intergenic	novelGene_168005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	220	897	339968	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPFAQYRGSFWFDATRPRVGLFFETTAPPLISEDKEHRRDLHPGDARTGHGHGGGYEAFSAFCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340801	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_340028_340641
885476	contig_20293_pilon	-	7778	15	Intergenic	novelGene_153494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_12	312.72397687783	2729	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	332	1615	50045	19443	FALSE	50	GTACAGAAGACAATTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116221	13279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50054_52323_52470_68598_68702_116147
885477	contig_10074_pilon	-	3307	6	Intergenic	novelGene_57182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	598.255798133207	221	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	533	901	586279	563841	TRUE	15	CCGTTGCTGTCAGGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAVISRIRAGINPFSGKYLKTVTSTW	596499	561327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_562073_562179_563868_577099_577200_583722_583872_586186_586330_596017
885478	contig_14768_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_115080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCAGTTGCCATTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222089	223782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_222100_223800
885479	contig_9239_pilon	+	2882	3	Intergenic	novelGene_137192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAATTAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227411	230875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_229899_230405_230504_230578
885480	contig_16724_pilon	-	1750	7	Intergenic	novelGene_105303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	753.627984411997	1282	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	363	1019	569099	541872	FALSE	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	576017	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_571072_571184_575806
885481	contig_12540_pilon	+	1966	5	Intergenic	novelGene_148125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	603.622139670175	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1164	1763	1250092	1252921	FALSE	5	GTCTCATCTGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLSTRSRLAESSGSFVGPPEQRVGDGCDFVPLSVQAQLLSRLPIPEGQVITINPSLSVEEAAEDYAKKLREAFQGDSIPVFDLLILGIGPDGHTCSLFPDHPLLQEKEKIVAPISDSPKPPPQRVTLTLPVLNAARTVIFVATGEGKAAVLKRILEDHEENPLPAALVQPHTGKLCWFLDEAAARLLTVPFEKHSTL	1248829	1253124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1249765_1249863_1250311_1251168_1251271_1251605_1251747_1252783
885482	contig_18108_pilon	+	2789	8	Intergenic	novelGene_33469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	205.081168599864	2535	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	63	917	226815	260192	TRUE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226752	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997_260257_260308
885483	contig_9415_pilon	+	7149	28	Intergenic	novelGene_109713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTTTGTCTTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438139	477367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_441208_441719_441839_444542_444593_446109_446273_446893_446971_447787_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453357_454140_454214_454332_454413_455170_455312_456369_456514_460019_460255_462549_462678_464335_464475_464747_464874_466631_466800_467517_467618_469493_469885_470544_470841_471349_471474_473863_474020_474605_474875_475040_475194_476568_476658_477067
885484	contig_14522_pilon	-	4035	8	Intergenic	novelGene_147305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	298.006574369337	878	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	181	990	146829	66449	FALSE	25	GTTAAAATCTGCCTGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHEGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	232092	63403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_206230_206293_232023
885485	contig_2069_pilon	+	3061	1	Intergenic	novelGene_23315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	583	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1131	1454	523820	524143	NA	15	CAGCCACCTCTGGTGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEDAPGCSPAVAGRGRQRAAVLPNRSPGAWPGQGFGLMALTKLPLPLLSRKGEASATFYHSALTLKGAVLAWLLEWTESTVERAGGRRRWGGALPVEGRIRSLAQ	522689	525750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_522700_525800
885486	contig_7057_pilon	-	2164	11	Intergenic	novelGene_123213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	43.7059492517895	7	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	329	697	538082	537131	TRUE	10	TGCCTACTGACTCTGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASYAERTEGFLRACEAPRGGGELHFPTLLRNGSDIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539837	534229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_534607_534852_535534_536039_536305_536986_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539734
885487	contig_20314_pilon	+	2677	9	Intergenic	novelGene_125630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	389.835221600101	2096	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	TRUE	15	CATATGTCTCTGTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	43780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190_25674_43263_43624_43662
885488	contig_14526_pilon	-	6328	4	Intergenic	novelGene_111200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4110	4439	79896	79045	TRUE	15	TGGCCACCTCCGAGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCNILMLCIPLRLALWPNMWSILENVPCALEKRVYLAAVGWSIRYLSMRSSWLIVAFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVLKSPTTVVELSVSLFNAVSFMYFGVLSLGA	84005	13472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_14204_45293_46185_78777_79132_79653
885489	contig_755_pilon	-	2449	4	Intergenic	novelGene_119761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	66.3777071011044	930	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	53	664	88997	83959	FALSE	20	TTTGATGCAAGAGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	82173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87817_88876
885490	contig_14814_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_137722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	706	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1094	1456	296804	297166	NA	10	CTCGCCTGTGGGGGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNTTSMDQVRFSVRTSLRLALSRSMWKWYVDCTASSKIRVKSAFSSRKWECWILPSATANVFLHASCTANICSQHPLLHAHGSSHTLSPRGHGFDTQEARRVQDSTTRDTDEKLLQVE	295710	297968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_295700_298000
885491	contig_17427_pilon	-	2264	11	Intergenic	novelGene_30324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1343.80656718145	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	42	1103	188879	178110	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRCTEVRQKWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAPSP	204691	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178122_179415_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204660
885492	contig_12896_pilon	-	3984	1	Intergenic	novelGene_178431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	3502	3984	486	4	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEQLIVLMRNLYIDQEAVIRTEQGGTAWFKIRKGVRQGCILSLHLFKLYAEQIIQEAGIYEEEQSTRIGGRLINNLQYTEDTTLLAESEENLKHLLMKIQDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISSIMINGGKTEVVKDLILLGSTFNTHGSSTQEIKR	3987	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12896_pilon_-_0_4000
885493	contig_11328_pilon	+	1901	5	Intergenic	novelGene_88418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_3	1835.72846575957	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	15	881	643683	647435	FALSE	45	AAAAGATAATTTGTTAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFTMKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKVSLKRFEKKSSPALKLHLNPFMLTGISGDQVLFLPLEGFWEAATPLIVFAATRQGLYDNLKPKKQACAAN	643668	648455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064
885495	contig_16496_pilon	-	1530	2	Intergenic	novelGene_5201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	17	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	5	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
885496	contig_6434_pilon	-	3153	2	Intergenic	novelGene_61867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATTTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843943	839314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_840616_842091
885497	contig_12789_pilon	+	4288	6	Intergenic	novelGene_176626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	3702	4253	238255	238806	FALSE	80	AAAAAAAAAATCATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKPDEFKSGISQALLELEMSSDLKAQLRELNITAAKEIEIGGGWKAIIIFVPVPQLKSFQNIQVRLVCELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSHTLTALHDAILEDLVFPIEIVGKRIRVKLDGSRLIKFHLDKAQQNNVEHKAETFSGVYKQLTGKDVNFEFPEFQL	86211	238841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_+_86219_100988_103299_134999_135016_137154_137351_231286_232390_238185
885498	contig_9149_pilon	+	4043	3	Intergenic	novelGene_178433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1288	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1981	2319	14965	70901	FALSE	20	CATAGGATTATTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISAFWVLLRIALWPKMWSILENVPCAFKKNVYFAAGGWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTDSGLLKSPTVIVEVSISLFSSVRVLCIFFS	6	72625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9149_pilon_+_1756_14733_15294_70891
885499	contig_5935_pilon	-	1911	4	Intergenic	novelGene_102737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1199	1609	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1280626	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237_1216252_1255356_1255420_1280448
885500	contig_2799_pilon	+	5858	1	Intergenic	novelGene_85568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTAAAGCAAAGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735276	741134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_735300_741100
885501	contig_6102_pilon	+	3305	23	Intergenic	novelGene_31828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	476.536523103151	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2445	107	2551	370803	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370696	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378971_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
885502	contig_9752_pilon	+	3620	1	Intergenic	novelGene_122009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1790	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	298	897	27	923	71248	72144	NA	35	ATAGCTTATTCCTACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCQSECVEMSEMFDEASDQDSTDKPWRPYYNYKPKKKSRQLRKMRKVSWRKEHGNRSPSNKCKYPAELDCAVGKAPQDKAFEEDDNKEMPKLQCELCDGDKGATPGSQGRPHRHLTARPHTCELCAKQFQSPSTLKMHMRCHTGEKPYECKTCGRCFSVLGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCSKAFTLNETLKIHERIHTGEKRYHCQFCFQSFLYLSTKRNHEQRHVREHNGKGYACFQCPKICKTAAALGMHQKKHLFRSPGQQEKMEGDVYQENSNPLENPHCIDSEDNDQKDDAHAIVENVVL	71221	74841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_71200_74800
885504	contig_7898_pilon	-	3242	4	Intergenic	novelGene_47545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	427.470336852616	1470	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	183	548	293293	292088	FALSE	15	TGTAATTTGCTTTTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQDIAWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	302446	289393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_292355_293194_293344_293488_293544_302369
885505	contig_17_pilon	-	9091	7	Intergenic	novelGene_173967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	141	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	7621	8922	107603	106302	FALSE	50	GGGCAAAGGAAATGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHINKRKEKNHMIISVDAEKAFDKVQHPFLIKALNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGVRLKTFPLKTGRRQGCPLSTLLFNIVLEVLARAIRQQKEMKDIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSMRNPLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYANKENNEKEIRKTKKISITPKKMKYLGINLTRDVKNPYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNLVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVRGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRDIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMNQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQTLIHGINRTQTITINAQNPTEKLDNWDLL	308435	106132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_108147_137840_141838_206668_208425_209115_209299_231113_231993_302273_302521_308420
885506	contig_4857_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_48754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTTCTAGTCTATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1199856	1201953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1199900_1202000
885507	contig_9290_pilon	-	1946	12	Intergenic	novelGene_77543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	355.122095171983	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	284	1609	491418	478940	FALSE	30	TAGAGTTATCTTTGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATHLAVNKIKEIAVTVKKEDKVEQRKLLEKCAVTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEESQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYENPTIALLNVELELKAEKDNAEVRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHRSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALTADVLGCCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGHVVWSGHQQRGHC	496964	478602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_478988_479880_480088_480828_480962_481339_481438_482141_482331_483136_483302_486105_486278_486625_486679_487536_487663_489929_490037_491390_491668_496930
885508	contig_1521_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_145452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATCAATTCGGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171583	170808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_170800_171600
885509	contig_10930_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_37078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCTTCTTATTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289048	287878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287900_289000
885510	contig_10331_pilon	+	4064	2	Intergenic	novelGene_54212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_1	0	2407	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	391	984	1188709	1189302	FALSE	10	CATCCTCTCAGGCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPAHRGPADSLSVAAGAAELGPEGTSKGRGPSEQDWVNRPKTVRDTLLALHQHGHSGPFENKFKKEPALTAGRLLGFEANGANGSKAVARTARKRKPSPEPEGEVGPPKINGEAQPWLSTSTEGLKIPMTPTSSFVSPPPPTASPHSNRTTPPEAAQNGQSPMAALILVADNAGGSHASKDANQVHSTTRRNSSSPPSPSSMNQRRLGPRDVGGQGAGSTGGLEPVHPASLPDSSLAASAPLCCTLCHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRQSIKQQGASGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDS	1187702	1192382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1187971_1188586
885511	contig_11277_pilon	+	3189	8	Intergenic	novelGene_80313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_5	108.382919054882	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	39	1076	250372	269500	FALSE	55	AAAGTAAAATATTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	250333	271613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
885512	contig_21006_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_177725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTCTAAAGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30571	32939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_+_30600_32900
885513	contig_10437_pilon	-	2032	4	Intergenic	novelGene_38229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGGGGGAAGGCGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362272	318735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_318818_349794_349908_355624_355665_360475
885514	contig_7207_pilon	-	1462	7	Intergenic	novelGene_72075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	267.217400048891	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758015	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_695223_695326_696315_696746_757787
885515	contig_12312_pilon	-	2683	11	Intergenic	novelGene_63945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	871.898526205888	17	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	98	1510	326065	215009	FALSE	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERACPRATSVPGTLPAPFPALAFQGSYRRNALCVLVLSATGGAE	326162	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215137_241393_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
885516	contig_9955_pilon	-	1503	6	Intergenic	novelGene_21256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	984.101011075591	2467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	44	505	27271	24236	TRUE	20	TTTTATATGTGTATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVTQAETLPVDRAEEEEPLKATEELAAQKREQRLRKFRELHLKRNEARKLNHQEVVEEDKRLKLPANWEAKKARLEWELREEEKKKVKNYPAIFISGLFNRCIVLRLCNVVLEYTGSGARLLDCSSSLCSSLAVTLWASYLFFLCFCFLIC	27314	13451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_13885_22538_22638_23437_23529_23860_24560_26956_27068_27244
885517	contig_11088_pilon	+	6209	4	Intergenic	novelGene_85022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.782900723499	1465	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	950	1273	10016	10339	TRUE	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIISPVVLRIRRHDIRKALGIVPATLYSYFSASYYFSLHPHIHGCYIRSSSQICQSPSRYQSTAIVQAIITLCLDYSSSPQTHLLISPLAFFHIQFILYSVVSDV	9066	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_12708_12748_14937_16250_16348_17119
885518	contig_6740_pilon	-	3346	3	Intergenic	novelGene_142721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTATTGATATCTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733714	729726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_730840_731133_732864_733211
885519	contig_9668_pilon	-	2550	15	Intergenic	novelGene_58183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	772.047228781625	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	272	2230	605373	503609	FALSE	20	TTTTCCTGAAAGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669968	503288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585964_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866
885520	contig_4604_pilon	+	2667	14	Intergenic	novelGene_19130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1198.00792738731	14	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	445	1839	358980	379856	FALSE	85	AAAACAAAAAAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339835	380684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364350_372884_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
885522	contig_7527_pilon	+	6118	7	Intergenic	novelGene_139567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_6	1104.40417571346	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1268	1834	86361	96119	FALSE	30	CAAGAAACCCTGTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDAFLFLSFLREGPRYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80181	100403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85578_85690_86519_89859_90038_94415_94590_96062
885523	contig_11574_pilon	-	3961	11	Intergenic	novelGene_64057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_10	241.465856799673	1359	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	237	2114	456525	449890	FALSE	20	GTGTGTGTGTGTATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463696	448042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463508
885524	contig_9752_pilon	-	6904	1	Intergenic	novelGene_122022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	355	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136544	129640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_129600_136500
885525	contig_16703_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_72785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGCTCCCTGCTTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44887	42115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_42100_44900
885526	contig_20314_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_125644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1400	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAAGCCATCCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5755	8232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_5800_8200
885527	contig_7051_pilon	-	4335	14	Intergenic	novelGene_64339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2250	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGATGGCGCCCGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349828	321848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_328187_328266_330086_330163_331794_331924_334316_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343470_344164_344222_345362_345536_346865_347950_348189
885528	contig_13863_pilon	+	4992	22	Intergenic	novelGene_41990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	454.328798995146	288	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	254	2029	55383	81541	TRUE	10	CTGTTGCTTACATGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	55055	84796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55264_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493_82899_83190
885529	contig_5954_pilon	-	2876	8	Intergenic	novelGene_28763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.28404118324	175	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	138	848	1462068	1392942	TRUE	30	CACACAATAATGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462205	1390858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392679_1392733_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
885530	contig_19016_pilon	-	3021	3	Intergenic	novelGene_173334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2515	3021	6021	5515	FALSE	50	GAAAACACAGAGAGGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEEDTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQEQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKT	23157	5514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_8322_12073_12250_23119
885531	contig_11253_pilon	+	3263	3	Intergenic	novelGene_126817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	333	866	41961	42494	TRUE	70	CTACAATAAAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTGRPLSCPQPLGQMLQSSSALPINAQGHHTPPGSLLPEGAQLSRSMGTHAYYNVLTPWAGKPTASSHTGLLFCCHCFSATASPRLALSPVLQLSLCLLGLGGSQYRDSESKGHTPLPSLLLDSSEDPLLPPLGWLIFKPSGMAKLTNPLVTAPYTLFAQFTPKRVPCTLSALLAS	41628	190053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_44290_189327_189686_189809
885532	contig_15449_pilon	+	2960	14	Intergenic	novelGene_33587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	628.440315996062	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	137	1960	28094	54621	FALSE	20	TAGGCCATGTTTATTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGAQWRRSQPPRAAEEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27957	55621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51932_54570
885533	contig_7051_pilon	-	3888	11	Intergenic	novelGene_64345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCTTCAAGAACAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347608	321865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_331924_334316_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343470_344164_344222_345362_345536_346865
885534	contig_9177_pilon	-	3699	26	Intergenic	novelGene_32553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1838.43499705592	51	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	36	2687	26442	16653	TRUE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	26477	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2022_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312
885535	contig_13894_pilon	+	2256	8	Intergenic	novelGene_62187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1085	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	985	1299	749966	751208	TRUE	20	CCTCTGGAAACCCCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGRFIYLDDESDGDQRCKFPKSSFKTSGVKGFRILLSRLSVLWLYKSSFSQGSKGFPWLSTKFFQQYSKSLKVMTATVTREFCRCCSPCIFVQHQWKYRREV	748981	766671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_750064_750744_750861_751107_751376_753094_753242_761486_761600_762021_762296_763796_763960_766578
885537	contig_7396_pilon	-	2835	15	Intergenic	novelGene_79540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3052.95148677673	3871	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	107	1495	255163	246442	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257093	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
885538	contig_4486_pilon	+	1918	10	Intergenic	novelGene_38573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1683.31795372512	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	203	907	377420	412464	FALSE	35	AATAGAGTGTGAGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKSWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIFENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311765	413475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343064_377340_377476_385369_385488_389958_389996_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
885539	contig_9098_pilon	-	3711	11	Intergenic	novelGene_75774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	398.575225020322	1587	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	326	1126	288130	264388	FALSE	10	TGGCTTATTACTGCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295268	261802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292840_292905_294101_294181_295200
885540	contig_15491_pilon	-	3003	6	Intergenic	novelGene_75969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_4	89.824272888791	1394	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	49	882	91394	80831	FALSE	20	GCTGCTATGAACATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARGPHLLSSPWWCPATMTLGILCLGLLVTIIIQGMQLSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91442	78709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_87650_87753_91306
885541	contig_8317_pilon	+	980	2	Intergenic	novelGene_19333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	538	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
885542	contig_5341_pilon	-	982	2	Intergenic	novelGene_168015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2367	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	340893	338457	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKEAGAGVALRVVRAEGNSSRKLRRCGVSLDGPLLSTEAVFGSTQPDPGSGFSSKPPPRHGCPRPRHLHHHRLQLPCLHSCPPYEQCIELSSESYHNLSQLLKSPWEVI	340893	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338616_340722
885543	contig_10861_pilon	+	2607	7	Intergenic	novelGene_39300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	152.802432354113	35	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1380	2156	1447236	1454668	FALSE	65	ACAGAATATAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFVLIISCLLRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437776	1455119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443428_1446806_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
885544	contig_10904_pilon	-	1593	4	Intergenic	novelGene_22564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	102.827795636956	35	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTAGTTTTAATCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419219	410061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_413637_413829_417965_417999_419154
885545	contig_5023_pilon	+	3206	15	Intergenic	novelGene_7249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2248.05842759425	1	95	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	805	1302	618569	630238	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYRCPGHLPTL	580846	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611688_611843_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630210_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
885546	contig_4213_pilon	+	5580	4	Intergenic	novelGene_124787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	119.099398263243	3485	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTATTTTAAAAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12820	47875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_40541_40646_42734
885548	contig_1301_pilon	-	5716	22	Intergenic	novelGene_47276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	725.680729757894	5565	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	83	2302	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
885549	contig_6797_pilon	+	2402	3	Intergenic	novelGene_178238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	281	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGAGAGCCGCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225196	276723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6797_pilon_+_225774_226040_226786_275643
885550	contig_15491_pilon	-	4860	1	Intergenic	novelGene_75931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGAGAATGTGTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35445	30585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_30600_35400
885551	contig_10958_pilon	+	1772	2	Intergenic	novelGene_5464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895279	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
885552	contig_15114_pilon	-	4937	3	Intergenic	novelGene_121091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2157	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34063	27102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_28305_29191_29399_30535
885553	contig_1867_pilon	-	3387	2	Intergenic	novelGene_54560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	737	1696	449145	448186	FALSE	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449925	446494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_449784_449827
885554	contig_13097_pilon	+	2121	2	Intergenic	novelGene_107687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	736	1035	141718	142017	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAATTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQIESRTARWCPATTTDCSDPDHNRGSWTELEKDVEQNSNSEKIDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPCKTKRD	140982	143454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_142402_142752
885556	contig_9366_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_166271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1191	48	1238	1039035	1043632	FALSE	25	ACTACCTCTACTCCTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDAEQLKHVTEQQSMVQKQLEQIRKQQKEHAELIEDYRIKQQQQQCAMAPPTIMPGVQPQPSLVPGTTPPSVSQPSFPMVPQQLQHQQHTAVIPGHSSPARMPSLPGWQPTNAPAHLPLNPPRIPAPIAQLPIKTCTPAPGTVSNANPQSGPPPRVEFDDNNPFSESFQERERKERLREQQERQRIQLMQEVDRQRALQQRMEMEQHGMMGSELSSRASVSQIPFYSSDLPCDFMQPPRPLQQSPQHQQQMGQVLQQQNIQQGSMNSPPTHTFMQTNERRQVGPPTFVPDSLSIPGGSPNFPSVKQMHGSLSGISFQQSQVRPPFTPALPAAPPVANSGLPCGQEAAVTHGQSYPASNQSLIQLYSDIIPEEKGKKKRTRKKKKDDDAESTKAPSTPHSDVTAPPTPSISE	1038987	1043632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1039059_1042465
885558	contig_8712_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_58829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2753	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAACAGAACCTCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323266	321880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_321900_323300
885559	contig_7408_pilon	+	2775	8	Intergenic	novelGene_168722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	580	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATTACAGCCTCGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11234	48724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_13227_24281_24445_26364_26456_36880_36936_38373_38596_47312_47364_47879_48042_48685
885561	contig_9673_pilon	+	4333	1	Intergenic	novelGene_119166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118026	122359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_118000_122400
885562	contig_8801_pilon	-	4937	15	Intergenic	novelGene_66306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_14	555.781523659087	2948	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	2440	3738	565899	561264	FALSE	15	GTTGCCAGCACTGTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRLLGHSPVLRNITNTQAPDSWRRSKMGSRAASSSGEDKENNGSVFKMPRKPAFPSHAQAMAEWASRREAFAQRPNSAPDLMCLSPEEKMEVGDLSPLPRHRSSLTPMEGAAEEDDGFVDILESDLKDDDEVPPGMESLISAPLVKTSEKEGEQDLIMYSKCQRLFRSPSMPCSAIRPVLKRLERPQDKDMPIQSKRRRSVTPPEDQEEQQEPEEPKARVLRSKSLCHDEIKNILDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVERFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAENFLLQSPITACSLDKRIILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAANDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPTFCEPQDYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ	569964	560064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_561405_561543_561656_562684_562819_563029_563129_563299_563363_563855_563952_564167_564354_564439_564521_564934_565070_565226_565350_565455_565579_565893_565931_566079_567951_568580_568709_569555
885563	contig_12464_pilon	+	4220	2	Intergenic	novelGene_68621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	577	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1731	2303	4698	5270	TRUE	40	AAACGCAGATCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFIKAPKKLKDLGINLTSNVKHLYKENYKTLLQETKRDLHKRKNKPCSWIGRLNIVKMTILAKAIYKYNAIMIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPWINKAQLKKKNKVGRLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYKDRYIDQWNRFENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGDSPFNKWCWQNWMSICKKK	2967	7429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_7063_7304
885564	contig_19032_pilon	+	3616	1	Intergenic	novelGene_172512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	1927	2658	2776	3507	NA	45	AGTAAGAAACTTTTAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGGSEWQARIQKKQKKKKGEKKKKQHLQPTNGTQRAARPVARNPSSRQPRVQSLRPREAEEQTNKGPEFSPARQPRPGSSRTPERSPTAPQEGAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQPQHPTNGPLRAACPGAQNPSSRQPWVKSLGPRETEEQTNKGPGI	849	4465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_800_4500
885566	contig_8879_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_159000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	346	729	420565	420948	NA	30	CAGTCCCACTCCTAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRSETMEDRISEIEDKYLDTILFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIESKTLQVIGVPEQGEKTEDTEKIIEELPTENLPNIMKDEKLTIQETQQTPYRIDPKRKSPRHVIITLTKTKDK	420219	421695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_420200_421700
885567	contig_2219_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_67207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1674	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAAATGCATTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266894	269374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_266900_269400
885568	contig_233_pilon	-	2889	6	Intergenic	novelGene_14544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	842.770051674833	706	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1568	2449	93993	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	96276	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725
885569	contig_7839_pilon	-	2525	10	Intergenic	novelGene_45736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	640	999	956514	955729	TRUE	45	TATTGATAATAAGAGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSMLAVQPYVLVTMQQGEDTSLLEIVTFSTFLSKISFMSLQRFSNLALLSSIFFFSSSSSGSSRPSLVTETKLFPSNSFSCCTQYSSIGSVIYTTSKPLFLTRSTKAELATCSLLSP	957268	952563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_952620_953274_953478_953589_954052_954238_954543_954894_955063_955277_955466_955583_955732_955881_956151_956426_956761_956875
885570	contig_2161_pilon	-	7164	9	Intergenic	novelGene_114892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	139	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	611	928	466310	465993	TRUE	30	CTAAGATAATTCTTGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFCMFLLYPATLLNLSISFSRFFMESLGFSMYSIISSSNRDSFTSSLPIWMLFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVLKGNVFSPSPLRMILAVGFA	466920	258335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_259239_342889_343363_343671_344440_416509_417178_417693_418301_444519_446368_452708_452903_462647_462655_465224
885571	contig_2219_pilon	+	4355	1	Intergenic	novelGene_67176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCCAAGATACCACTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108352	112707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_108400_112700
885572	contig_7527_pilon	+	3017	7	Intergenic	novelGene_139565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	611	junction_6	1179.0932132599	6	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1004	1369	89903	96119	FALSE	10	TGCTGGTGTTTTGGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80096	97767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85781_86443_86519_89859_90038_94415_94590_96062
885573	contig_10323_pilon	-	8740	6	Intergenic	novelGene_123582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2044.96147640976	324	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	5333	7405	468796	459350	FALSE	15	GAGCCTGTGATTCCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFLQDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	476221	458014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_470287_470380_473697_475695
885574	contig_15977_pilon	+	8996	2	Intergenic	novelGene_137211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_1	0	1911	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	84	1403	77599	78918	TRUE	40	AGAAAACCCTGTTACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISGLRFETQLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEIRFYQLGEEAMEKFREDEGFLREEERPLPRRDFQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASPSQDLFRTASNGTSGAPAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDVVAIIPYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSTFPQTTFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV	77515	97450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_80519_91457
885575	contig_567_pilon	-	2946	2	Intergenic	novelGene_33976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	955	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGGCCGTGCAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358337	343141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_346015_358264
885576	contig_5649_pilon	+	2326	3	Intergenic	novelGene_82424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGACCTCACACACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414258	1487350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1414896_1415127_1415218_1485751
885577	contig_401_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_42879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1570	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	535	906	1768276	1767905	NA	40	GAAAATCCCCAAGGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLDPRVGVPSSIFLGKSKSQRFTKDTFLHNPGRSSTQTYSLDVRWKHRQTQDRVKQQRLQTQGRGVKCMWGRQPRGPSHKFHPLPRSEQKLFFPRLEWNFSSRDWLCSRAQTGQARKRSHG	1768810	1766680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1766700_1768800
885578	contig_10930_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_37003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACAGGGTTTCCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267432	269699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_267400_269700
885580	contig_15105_pilon	-	1816	7	Intergenic	novelGene_151025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.428527391226	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	39	482	839916	833571	TRUE	25	CCTATAACGTCTATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRVPGVPGWCKWLTARLLTKRLEV	839954	828355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831002_831082_831461_831513_832201_832309_833515_833639_836187_836497_839849
885581	contig_10126_pilon	-	6140	1	Intergenic	novelGene_105740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2900	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	3997	4362	154423	154058	NA	35	AGGCGCCTCTAAAACCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDGSLLTTCPKYVRCSLAILASNEHSGCTSSKTDLFVLLAVYGIFNILHQHHNLKVSVLPWSSLFIIQLSHAYKVTENIIVRVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFAANLPNATRLLMS	158419	152279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_152300_158400
885582	contig_8628_pilon	-	3949	21	Intergenic	novelGene_164409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	775	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2547	3119	412238	397291	TRUE	5	TCGCTGCCTCCTCACGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQHHVHENTWAVVLILYKGGSGVKEEVVLLPLVQDWALHLSQAGHGYLSSLTVLWVVLVWEAQQKVEADHVPGEEEVSYCGQDLDLGLGQGQGQGQGLGLALGQDPGLGLALEALRFQEVVEEEAREEEVGKESCLAEQLHQQPGDHFHDQTGKGLQVHKILFLHNLCSASLVVGFDQKNWKSYDCYSN	446981	373160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_373278_384736_384854_388160_388286_395393_395486_396163_396359_397106_397370_398834_399155_401467_401603_412199_412370_414016_414161_417263_417411_419330_419483_424950_425248_430470_430622_435147_435259_436333_436409_436551_436717_438855_438961_439084_439281_444718_444828_446218
885584	contig_10581_pilon	-	2485	5	Intergenic	novelGene_41379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACAAACTGGGCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574837	534846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_534923_540172_540237_549080_549155_550386_551383_573562
885585	contig_2636_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_52097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1824	2132	77626	77934	FALSE	50	ATCCAATAGAAAAAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREKNGYPYRQNKTIKIDSYLTAYPKINFRFIIHQQEKGKSIKLFEDNVEEHLHDISLVKASFLKTRSTVIKGKIYKYYYIKISNFCPSKDTIKRGKRLSY	72999	78030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_73623_76425
885586	contig_9633_pilon	-	3720	8	Intergenic	novelGene_139636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	914.981565555352	98	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	42	773	1167518	1138462	TRUE	30	TAAATGCCCCAGGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPVRNRKVVDYSQFQESDDADEDYGRDSGPPAKKIRSSPREAKNKRRSGKNSQEDSEDSEEKDVKTKKDDSHSAEDSEDEKEDHKNVRQQRQAASKAASKQREMLMEDVGSEEEQEEEDEAPFQEKDSGSDEDFLMEDDDDSDYGSSKKKNKKMVKKSKPERKEKKMPKPRLKATVTPSPVKGKGKVGRPTASKASKEKTPSPKEDHEEPASPPEKKASASPPPEKSGDEGSEDEAQSGED	1167559	1135399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1138289_1138403_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737_1147844_1150154_1150205_1167501
885587	contig_11088_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_85021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1049	2098	7891	8940	NA	35	TTTTTGAGGTAGAGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	6842	9062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_6800_9100
885588	contig_13021_pilon	+	3854	11	Intergenic	novelGene_8132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_10	2056.42067680716	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	205	1320	174676	178303	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGYVGFLQ	174471	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178585_178670_180211_180440
885589	contig_2377_pilon	+	1196	10	Intergenic	novelGene_67890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	706.935762880551	2217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	23	838	197521	224342	FALSE	30	AAAATGGTGTTGCAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGWAGKMAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEAVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELIHLYKQMHALRYAFLYTYFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	197498	224700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_220364_220419_221864_221957_222879_222956_224219
885590	contig_10861_pilon	+	2751	8	Intergenic	novelGene_39294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	135.663298692922	2177	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	41	1435	1437804	1454668	FALSE	65	ACTTAAGAAATTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437763	1455984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1445010_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
885591	contig_11493_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_143730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCGGCACAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351831	354036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_351800_354000
885592	contig_18843_pilon	+	3996	10	Intergenic	novelGene_165607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_9	606.019618310973	1292	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	27	971	28527	44366	TRUE	15	TCACAGTGTTGTTTGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERFGFL	28500	47922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_45498_46028
885593	contig_6005_pilon	-	2388	5	Intergenic	novelGene_158890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.893922980652	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTTTATATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327348	311411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_325326_325713_326223
885594	contig_11328_pilon	+	1960	9	Intergenic	novelGene_88436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.206422490142	175	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	332	1702	830591	857309	FALSE	25	TCAGAGTAATTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGLPQNIQDEANNLGVMAADIYSVFRNAASFKEVSDGLLTSSKGQLQKMKASLDDVMSYLVNNTPLNWLMFDFTAIDLASETDEIPDIIALEEEDGPAHSRCNGSVLSRQNVE	761338	857567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_761645_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_848758_849050_857174
885595	contig_5686_pilon	-	3304	1	Intergenic	novelGene_45454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	480	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCTGTCCAATCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223772	220468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_220500_223800
885596	contig_6445_pilon	+	6363	1	Intergenic	novelGene_77062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2378	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTGGACGATTTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667681	674044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_667700_674000
885597	contig_15407_pilon	+	1150	6	Intergenic	novelGene_123059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_1	96.5090669315583	1645	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	335	961	449761	467861	FALSE	40	GAATGGAATGAAATCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRVCI	449426	468050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704
885598	contig_16411_pilon	-	6265	31	Intergenic	novelGene_77292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2578	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	5501	6157	124503	99679	TRUE	5	GCTCTGGCCGGCCGCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLGDPIVVGQEHGEVLGLLDRLGVRHLPQELCRPLVGRVVVLNTALHVLQLVQDGKHVDELAQGQEVGLRDKVLPPLCMAQTLHLAAEPLDGLALKVHELHELGDLWLQHLHCLLIDLHSVGLLIAFHLGDGPGTAAPGVQHDRILMPFFQHFIHARVDRSLLNVPCNACDKCIPVLKVRVKVGLVHDGGGRRLDAWLLVREGQLFEQVHVGQGIF	243783	75826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_75891_99634_99776_101237_101329_111958_112036_113688_113790_120326_120510_122764_122862_124492_124622_127061_127167_129440_129535_131612_131729_134142_134264_135019_135145_142144_142311_143074_143224_146692_146848_147895_148054_148956_149049_152589_152667_157182_157293_160869_160991_167135_167336_169239_169329_184037_184183_185347_185435_187180_187314_231224_231299_231771_231864_238091_238336_240227_240375_241201
885599	contig_15244_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_118073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTATAAATTTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771782	773964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_771800_774000
885600	contig_11558_pilon	-	2835	4	Intergenic	novelGene_178435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTCTTGTTTTTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62576	1441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11558_pilon_-_2350_2849_3490_47165_47500_61623
885601	contig_1725_pilon	+	2778	19	Intergenic	novelGene_24252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	548.18995085848	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	94	2457	201480	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201386	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246662_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
885602	contig_5302_pilon	+	2820	7	Intergenic	novelGene_81374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_2	305.491952976397	1033	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	347	1276	92713	117238	FALSE	10	TTCCTTGCTTTGTACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL	92366	118782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_92815_111035_111246_113703_113878_114505_114596_115046_115209_116464_116584_117165
885603	contig_19032_pilon	+	3157	9	Intergenic	novelGene_172536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2711	3094	159243	160649	FALSE	50	AAAATTAAATTCAACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKVFSFYFCFLLCSLLIVFIFWANYNSFSLEACKQAHFLNKLPKTLWGSLQQCVQFSSICHLLLKTCHHHFIHNGVRPKNVVFTRIFCCVFSNPGSFSGSWQANHHYNFTIFLLFRPLWSSDSIL	155074	160712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_156464_156504_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159362_159656_159746_160163_160284_160593
885604	contig_5033_pilon	-	2444	6	Intergenic	novelGene_28933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1309.19159789543	9	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	577	921	464569	453301	TRUE	35	CCACAGGAGAGAAGTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRRTLAKSSYRRQRWLPLRSWWQMWSCTLVKQSFICQWSKQATPPGPTCWINM	465145	449433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453251_453459_456495_456604_462973_463031_464547
885605	contig_4088_pilon	+	8578	4	Intergenic	novelGene_178056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	5569	6120	92284	92835	FALSE	30	CAGCATACTGCTGATACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQKISKHLQKLDRMVPVGTQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILGILQQLRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMVQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKISNKISEMDDVTEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKTNEETLRVTWDTIKSKNLQVIGIPEQG	32994	95293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_35105_65706_67276_72877_73999_91515
885606	contig_7963_pilon	+	1076	4	Intergenic	novelGene_58570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_2	174.378897805899	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	123	569	251586	253116	FALSE	30	CAGCCCTAAATGCACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	251224	253623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_251281_251519_251683_251956_252094_252903
885607	contig_9706_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_20786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1000_2700
885608	contig_8312_pilon	+	5202	1	Intergenic	novelGene_152886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2408	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATAAAAGGAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272692	277894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_272700_277900
885609	contig_7207_pilon	-	2328	13	Intergenic	novelGene_72064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_12	179.024362091371	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1800	527	2326	696514	659151	FALSE	45	TGAGATAATTCTGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQAYINEKHYKKIPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPRHVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSFRIFSKGA	758484	659148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_659373_660702_660946_663524_663740_665433_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738031_758376
885610	contig_7056_pilon	+	2340	3	Intergenic	novelGene_43714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	452	junction_1	26.5	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1167	1559	935507	937151	FALSE	30	AAGCAAATCTGTTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	934340	937932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_935546_935846_936043_936993
885611	contig_17522_pilon	-	4803	6	Intergenic	novelGene_160798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_5	533.759646282856	2096	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	420	878	96428	76631	FALSE	30	TGTACCAAAATGGTAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPARRRLMRDFKRLQEDPPVGVSGAPSENNIMQWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLVIEFSEEYPNKPPTVRFLSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWNDS	96847	72705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_76760_79726_79816_87962_88053_92939_92966_94250_94332_96384
885612	contig_3975_pilon	-	3666	13	Intergenic	novelGene_54816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	122	junction_12	180.282571413755	38	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	107	1636	2066301	2056837	FALSE	40	AATACATAGATCCACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079247	2054806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
885613	contig_11269_pilon	+	5235	2	Intergenic	novelGene_145822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_1	0	53	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	74	613	333594	334492	FALSE	80	GAAAAAACAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNPETLTQPADGQGLPLLPEPLGNSASGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSLMADGKIFVGSGSSGGTEGLVMNSDILGATTEVLIEDSDSTGP	333520	339114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_333623_333981
885614	contig_9538_pilon	-	534	1	Intergenic	novelGene_176444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCCGCGGAGCCTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26717	26183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_26200_26700
885615	contig_14023_pilon	-	2890	2	Intergenic	novelGene_165360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATTGGAATCTGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91655	88225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_90516_91055
885616	contig_9306_pilon	+	2594	14	Intergenic	novelGene_171476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1966	2568	72756	77712	FALSE	20	CCGCGGCGCCGCAGACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKPISFIAFRVFSLTRLVREVNEVSSKATCESQGQAGHFAVIFVTWLLHPCFCFCRSLGITFFRCLFVFSFCFFYVFGPATSSIFLFFFFFFFFDSELGGCVVASPLVKMANFLGDFLIFTFSSVSLGMSPFWASDKPAFIHCFTDFLSFTPPTVSSHTSPFWASDRLIPEAPCSFRFRCRNFRFRFSIFFRRSFIGR	62939	77738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_+_63744_64919_65094_65466_65522_67452_67571_68300_68451_68721_68783_69401_69542_71704_71820_71911_72111_72228_72335_72712_72844_73513_73664_75831_76116_77631
885617	contig_10176_pilon	-	4291	10	Intergenic	novelGene_72715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1313	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	20	AGCGCGACCATCCGCGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	258086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
885618	contig_7057_pilon	-	1027	8	Intergenic	novelGene_123339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATGGGTGCGTGGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943711	938678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_938752_938903_938960_939050_939117_941034_941105_941206_941285_941402_941523_942970_943028_943204
885619	contig_9706_pilon	+	1033	1	Intergenic	novelGene_20876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAATAGGGATTTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_4000
885620	contig_2377_pilon	+	2642	3	Intergenic	novelGene_67908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	366	1262	269376	271018	FALSE	30	TCGAGTCACATTTTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHTSLLSLSHSAPWHCGRCPHRAAPCSVRSLRVVPRAWVAQLGCSCGICWRALGSRHFLSEVTWQWCALFSHFCNFQLAQRLRLGSGPRLRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAIFMRLSISLPPSLFLSLAYLISFISQKRLI	253888	272398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_270176_270921
885622	contig_3410_pilon	-	2575	6	Intergenic	novelGene_58900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	629.272087415293	1319	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	129	887	57649	15376	FALSE	5	CGTTGAGCCTTGGCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPVTRDTAAELRGEAAASGCAGCRDEALLASWQGPCHSHRC	57777	13687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15497_30886_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
885623	contig_9614_pilon	-	7419	14	Intergenic	novelGene_104414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	264.865288971158	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	1410	2900	136360	107861	FALSE	5	CCGTATTGTCTCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDKVTEREKVTVMSTINPTKDLLADLIGCQRLPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQEKI	146465	103341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_108065_109251_109339_110641_110794_111390_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136391_140312_140490_145263
885624	contig_7359_pilon	-	2076	3	Intergenic	novelGene_139853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	873	1310	49019	40694	FALSE	50	GACTAACTTAAAATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWDKGFWERKDMPLPLYKGSVPTFKETDDCGKRRSSRGNKRVSFSTQGPARSTPTGLPRALPLIPTPGHLTLPGHHLHQDLNPHRAPTSHQGWLLIIQYIYLYMHIYIFFCGAWKGRQDNLCSSQNSFLTMKKAISSHALLIMR	50419	39927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_40856_48743_49723_50250
885625	contig_4364_pilon	-	1930	6	Intergenic	novelGene_694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	522	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	765	1154	1532546	1531972	TRUE	40	ACCAGCAGCGAAGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPDSSYSCLLIHICWKVDSEARMEPPIQTEYLRSGGAMILIFIVLGASAVISFCILSAMPGYMVVPPDSTVLAYRSFRMSTSHFMMELKVVSWMPQDSIPKKEGWKRASGHRKRSLPMVITWPSGSS	1533310	1530464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093_1531335_1531616_1532054_1532156_1532341_1532422
885626	contig_11160_pilon	+	1143	3	Intergenic	novelGene_168826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	290	772	318478	320768	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGAGHRPLADCRPGRALGTRTLLGVGPHPSPFGFLSFLLFLLLLFRSFIVVEQRKPTNILCW	318188	321139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319282_320582
885627	contig_11422_pilon	-	1495	1	Intergenic	novelGene_99058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2200
885628	contig_11267_pilon	+	7547	8	Intergenic	novelGene_175381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1620	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1008	6539	7546	436342	437349	FALSE	40	GATCTGAGAACAAACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGDIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVL	84483	437350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_+_85077_86111_87575_88874_89619_141681_142735_162146_162683_285145_285150_307078_307348_434465
885629	contig_16870_pilon	-	1795	16	Intergenic	novelGene_155515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_15	84.9924441086121	5	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1008	787	1794	201344	197018	FALSE	30	ATGACCGCACTACCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQREKDKKEFEQKFAKEQGALREQLQIHIQTIGILVSEKSDLHTALVHTQNAVRQKAGELEDVTNRLKTSRQRIGELERTLSSVSKQQKQTDKYNKELTQDRDSLRLQLLKQSNNNEDLAQQNSELTEKLRVLVKEKTAMQHGVEELQKKLEMSELLLQQISSASDKSEVLQQAQAEQAKLESRIEQLMEIVKQLQIERDHYAETLKTESAIWRQQAQQLLEQVQTLGEEKEHGVVRVQELEASLAELKNQTAVPPPEEPPPGPSEEEQRLHAEAERLQKELERLTGQLHFHLKDNETLTHQNQEQEQKLRELQRIAECWNEQEAAREKILETMQ	212853	197016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_197266_197706_197795_198281_198390_198506_198588_199062_199205_199521_199581_200599_200707_200806_200901_200988_201052_201326_201366_202226_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_207462_207586_212772
885630	SIRV3	+	1965	3	FSM	SIRV3A	SIRV303	2018	3	-16	69	3	-69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	924	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCAAAGTGGTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1947	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_+_2006_4568_4780_6057
885631	contig_6589_pilon	-	1306	7	Intergenic	novelGene_26105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	294	608	1880788	1880249	TRUE	20	GAAGGAAGTTTCTGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAVNSLEKGLPEMEAVAMGLTYALSAHPQASCGTWTLTVVKRPPCPRMMMEEGQARPVRNNSLYWAQTRSPWVLRTSVNLLIFFSTFFSACFRSLLSCFFFL	1881081	1876577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1876611_1878466_1878540_1878956_1879303_1879496_1879583_1879756_1879817_1880148_1880272_1880496
885632	contig_10861_pilon	+	2104	11	Intergenic	novelGene_39388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	453.183505878138	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	306	2102	1884022	1934696	FALSE	20	CGCTCAGCAACCGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRPGSRPGRDRARGLSSWIPAVPPPHGGGDAEGGFRSRVREESDPAPVQGHPRSPCSQNSSPGEWAGPVFRASRPAFPFLQRCLLAAFPALSPGKRTLAPEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDPTQRDLYRDVMQENYGNVVSLGLVAYVDLDERAIDALREFNEEGALSVLQQFKESDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNKTKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQP	1883716	1934698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1884055_1884832_1884960_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1926502_1928886_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
885633	contig_6958_pilon	-	1694	2	Intergenic	novelGene_70025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	583	897	822810	822496	TRUE	50	TCATCTAAGGTACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRGCRGIRTLTHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIEIPYDPANPLLGLYPKEIRAVTRINICTPIVIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINYGTYTQWSIIQQ	823392	821469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_821518_821746
885634	contig_5686_pilon	+	3292	1	Intergenic	novelGene_45313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	668	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97116	100408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_97100_100400
885635	contig_15371_pilon	+	3479	20	Intergenic	novelGene_151453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	527	junction_17	531.05132752435	456	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	324	2837	177425	230717	FALSE	15	CACTGGTTAAGGCGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLGLLTGILETVWDKHSVTAATPPPSPTSGESGDLLSNLLQSPNSAKQLNQPIPILDVESEYICSLALECLAHLFSWIPLSASITPSLLTTIFHFARFGCDIRARKMASVNGSSQNCVLGQERGRLGVLAMSCINELMSKNCVPVEFEEYLLRMFQQTFYLLQKITKDNNAHTVKSRLEELDESYIEKFTDFLRLFVSVHLRRIESYSQFPVVEFLTLLFKYTFHQPTHEGYFSCLDIWTLFLDYLTSKIKSRLGDKEAVLNRYEDALVLLLTEVLNRIQFRYNQAQLEELDDETLDDDQQTEWQRYLRQSLEVVAKVMELLPTHAFSTLFPVLQDNLEVYLGLQQFIVTSGSGHRLNITAENDCRRLHCSLRDLSSLLQAVGRLAEYFIGDVFAARFSNALTVVERLVKVTLYGSQIKLYNIETAVPSVLKPDLIDVHAQSLAALQAYSHWLAQYYSEVHRQSTQQFVSLISTTMDAITPLISTKVQDKLLLSACHLLVSLATTVRPVFLISIPAVQKVFNRITDASAQRLVDKAQVLVCRALSNILLLPWPNLPENEQQWPMRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDTKMVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAERPSPDVKAELFELLFQTLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	160218	231359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_160243_162798_162877_177203_177658_180956_181084_186475_186586_195433_195543_196973_197067_198099_198170_205106_205267_208942_209036_212974_213120_215190_215338_216235_216426_220720_220877_222001_222117_222289_222462_225539_225702_226862_226962_227140_227372_230615
885636	contig_19640_pilon	+	1878	2	Intergenic	novelGene_134876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAATTTACAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110651	119593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_111828_118891
885637	contig_9575_pilon	+	3547	1	Intergenic	novelGene_169726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1827	2261	691403	691837	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLEDSYLATDWKRSVFMPIPKKSDTTECGNYRTISLLSHVSKILLHTIQKRLQQYIDRELPEIQAGFRRGHATRDITVDVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITSRRMGNPEHLIVLMRNLSIDQEAVV	689576	693123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_+_689600_693100
885638	contig_2078_pilon	+	1906	6	Intergenic	novelGene_100123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	89.8888202169769	2267	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	28	1020	266397	310919	FALSE	20	TACTTATTCACGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQCYCVSGSMDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKKLARVP	266369	311805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310898
885639	contig_4305_pilon	-	479	3	Intergenic	novelGene_136682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	564.5	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTGAGCGCCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514683	512962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514648
885640	contig_2703_pilon	+	2386	17	Intergenic	novelGene_101699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1002.85652754706	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	301	1584	559489	610870	TRUE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526166	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756_611293_611352
885641	contig_6445_pilon	+	5880	16	Intergenic	novelGene_77009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	904.338039058896	1089	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	253	2091	522296	670255	FALSE	15	GTTTCTGGACGATTTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEEYKYTSCKAFLSTLNEMNDYAGQHEVISENMTSQIMVELARYVQELKQERKSHFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRHQMAEDSKADYLSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRIGESMKTYAEVDRQVIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKSDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYAQPMKRTVSDNSLSNSRGESKQEHKPGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSPKQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLTEVGQNIEKLRLEVQKFEAWLAEVEGRLPARSEQARRQSGMYDAQNPPSVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEVKVLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYMFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDEEGYVPTSYVEVYLDKNAKDS	522043	674044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_522320_579451_579568_597277_597335_598043_598192_613498_613562_613988_614094_635363_635493_636698_636846_644515_644714_645646_645830_656007_656118_661691_661825_663382_663505_663789_663927_665665_665825_670247
885642	contig_10058_pilon	+	4558	12	Intergenic	novelGene_67668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_8	298.807104919567	1519	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1103	3312	253	3564	31601	46246	FALSE	30	TTTACACGTAAATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRQKGKKKGSSKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLRSCAEFVEEYGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRQEFEADRKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEAVAVQMEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMQHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNLLRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAALSGGEAEGGWRLLSGARASNSTEDFMPRSLPHHLPSILQAGDGPPQMRPYHTIIEIAEHKRKGSLKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGGEDREDKSGKGTLRPAKSMDSLSAAAGASDEPEGLMGPSRPRPSPLLPESLENNSAEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAARAGGTSRSERCAGVHISDPYNISLPLHITSILNMPPNIISNVSLVRLTRGLECPALQHRPSPASGRGPGPGPGPGPPDEKSEASPAPGSLADSGPADMAPALEDSLSQEVQDSFSFLEDSSGSEPEWVGVEDGDVAKAGAAGAAFSPGEDDPGMGYLEELLGVEPQVEEFSVEPPLDDLSLDEAQFVLAPSCCSLDFADPRPEAEEESGEEVFLSAYDDLSPLLEPKPLNWESLGSLEEKAAGCARQAPGQAEGEEACMEVGESEEAEPGNRWDMREEAEGSPETKVEAGGSGEEGVEAEGGQDVMGSLREGSGEETEAKSKSQNEAENMEEAKGVEEPGGEQSKDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGNLGKSEEL	31348	47240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_31698_37028_37132_38857_39003_39874_39958_40113_40222_40833_40962_41465_41638_41717_41822_41898_41977_42737_43140_44263_44530_44620
885643	contig_10600_pilon	-	4459	1	Intergenic	novelGene_169862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGCCGCTGCTTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99981	95522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_95500_1e+05
885644	contig_6630_pilon	-	4273	12	Intergenic	novelGene_30692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_11	582.45958963152	1760	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	246	1559	374404	357618	FALSE	25	GGTTTTTCAGTAGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAEPPLGCSAILRSRSCSRRSRAQTPFGNSIGRYNGEPERIERNDIPPRSIQEKPHLSQESSYVSTQYSLRPRREEIKFKEMDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVLINLVMLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQAFYLVRHPNEISWPVASVIIALKLFGYIIFRCANSQKNAFRKNPTDPRLAHLKTIHTSTGKNLLVSGWWGFVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGFNHILPYFYVTYFTMLLIHREARDEHHCRKKYGLAWEKYCQRVPYRIFPYIY	384197	354903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358778_358860_360550_360720_364054_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_384123
885645	contig_2596_pilon	-	5430	2	Intergenic	novelGene_53529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	250	717	1099750	1099283	TRUE	30	TACATCTGACAGTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIVLLKDWFLNCFIPKGQAYCLEKSISFKILLLLDNASGHPPHVDDLNRDVKVMYLPPDITAVIQPVDQGAVTTLRSTFAQAIAATDGGMVTFLEELQYSSVYLEHCIFLEEVTGKCMQGIWKKLMSYVNTLQTLIRIIRWKRLVEKTSIWQEC	1099999	1094280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1095602_1095890
885646	contig_19098_pilon	+	4481	5	Intergenic	novelGene_65833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	17.6988700204279	107	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	186	803	402643	404538	FALSE	20	CAGTCGTATTAACTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDYYACARLVGAPAPPRHAINRGIGIEGLGCLLAGAWGTGNGTTSYSENVGVLGITQVGSRMVIVAAGCMLLLMGVFGKIGAAFATIPTPVIGGMFLVMFGVITAVGISNLQYVDMNSSRNLFVFGFSIYCGLAIPNWVNKNSEKLQTGILQLDQVVQVLLTTSMFVGGFLGFLLDNTIPGSAEERGLLAWNQIQEESQETSKAFEVYGLPCGIGTKFCTSSCVQCLPFWPRLEGGGKGEVEVSSLTSCSTDCSGDRHKNDLETRM	397118	408216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_397292_402630_402796_403128_403238_403357_403454_404278
885647	contig_366_pilon	-	6855	10	Intergenic	novelGene_51572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	604	junction_1	379.446217663011	2208	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	582	1595	803057	757099	FALSE	25	CATTCAGGCATGAGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF	803638	751838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764200_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
885648	contig_10734_pilon	-	5583	1	Intergenic	novelGene_51458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	680	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCCTGCCTACCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2262402	2256819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2256800_2262400
885649	contig_9653_pilon	-	3822	13	Intergenic	novelGene_48269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_7	854.087959788426	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	42	1928	1025386	1006903	FALSE	15	TGGATTTGATGTGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1025427	1005008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286
885650	contig_2414_pilon	+	1343	7	Intergenic	novelGene_158481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCCAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262974	527940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_263220_272530_272769_295904_296085_318227_318398_371340_371480_410023_410160_527705
885651	contig_11898_pilon	+	7209	3	Intergenic	novelGene_144279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	385	765	209914	210294	TRUE	65	GATAAAGTAGTATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQRMHTHLLRHSQLKQKSRMKQIYNQYTKKKTTECPKDNRQCENILKQDRMVPVGIQNKPPDDFPVEEKALELPDTEFKSLIFRAIQELKQKADKNKEKIDKFMEKADKFMENTDKKWKNSGK	209061	233441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_209366_209833_214703_231405
885652	contig_15666_pilon	-	2268	6	Intergenic	novelGene_70140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	649.994153819863	27	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	130	687	110619	108856	TRUE	30	CATGTAAACTACGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEI	110748	106764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109180_109378_109948_110246_110558
885653	contig_17603_pilon	+	2015	2	Intergenic	novelGene_152786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	1360	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACCCTATAATTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60396	69006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_61863_68457
885655	contig_8058_pilon	-	4799	3	Intergenic	novelGene_149506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	5.5	1135	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	162	1217	63142	61432	FALSE	30	AATAGTTGATCTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKFFRYHNAVVYLDEYTEIFKMNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75204	57849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_63122_63189_75089
885656	contig_5209_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_136427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAGAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96061	97880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5209_pilon_+_96100_97900
885657	contig_17144_pilon	-	4071	16	Intergenic	novelGene_29178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_1	1662.09660636465	39	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	135	2252	179764	167174	FALSE	35	TCCTCCCAACAGCCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEVRSLQGEGSGVEVLAQAQSEGKPL	183216	165354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
885658	contig_2377_pilon	+	3008	3	Intergenic	novelGene_67909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	469	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	149	1063	269376	270454	FALSE	30	CGAGTCACATTTTTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCNFQLAQRLRLGSGPRLRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFPKGLFFMSIKD	254105	272399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_270254_270417
885659	SIRV5	+	760	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-442	887	-328	-10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAGTATAGGTTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7873	10979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
885660	contig_3348_pilon	-	4299	3	Intergenic	novelGene_178436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	2585	3148	69837	69274	FALSE	45	AAAAAAAGTTCACGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRHMRKCSGSLAIREMQIKTTVRYHLTSALLAQIKKTGNHKCWRDCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMVWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWCIHTMEYYATRKNNNESVKHLIRWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	257792	68122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3348_pilon_-_70267_89725_91381_257292
885661	contig_12964_pilon	-	5161	3	Intergenic	novelGene_131702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	950	junction_2	166	1800	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	191	619	560654	560226	FALSE	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPSKDTAVTDPSRTADPKNAWQEASPADPVSRPHLIRLFSRDAPGREDNTFKDRPSESDELQTIQEDSAAAEGLDVMASQKRSSQRHGSKYLATASTMDHARHGFLPRHRDTGILDSLGRFFAGDRAAPKRGSGKVSAQE	616021	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_560679_595757_595846_615943
885662	contig_13700_pilon	-	571	8	Intergenic	novelGene_68285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	447.155271393164	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	489	81	569	163598	117842	FALSE	55	ACGAAAACTAGAGGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRRCRRRRLSRSWSLRPATVAAPADMSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKDKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKIRASGDAKIKKEKENGFSSPPRIKDEPEDDGYFAPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDVKKEK	163793	117839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_117894_118876_118973_121767_121824_123039_123164_132820_132924_163213_163239_163565_163608_163722
885663	contig_16411_pilon	+	3044	6	Intergenic	novelGene_77333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	641.478604475629	2315	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	188	679	238160	241370	TRUE	25	CGTGAAATCAGCATCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATQHCLQPHLQLLQELCGAPSLPKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	184037	243781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_184106_231812_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241771_241816
885664	contig_12250_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_80606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAACAGTGGTGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347735	346009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_346000_347700
885665	contig_8058_pilon	-	2680	2	Intergenic	novelGene_149508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_1	0	851	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	230	1216	62418	61432	FALSE	75	AAAGAAGGAGAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75269	59967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_75089
885666	contig_10904_pilon	+	2570	4	Intergenic	novelGene_22462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	640	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	129	917	149100	149931	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISSMPLPLSSGPSTNSTSATAAIPGGPGM	143917	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_149801_149843
885667	contig_5941_pilon	-	3885	2	Intergenic	novelGene_84552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_1	0	1551	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATACTACTTTGCAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147984	143155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144584_145527
885668	contig_20641_pilon	+	4512	6	Intergenic	novelGene_52834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2497	junction_2	659.430178259988	194	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	3273	4223	41419	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIYIRKYFTFVNRYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14540	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_41619_45848_45965_54835_54968_56379
885669	contig_17427_pilon	-	2521	13	Intergenic	novelGene_30318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1170.40964754036	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	828	1424	179819	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204673	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181279_181449_182695_182800_184281_184352_184468_184613_186421_186496_188038_188140_188767_188890_204653
885670	contig_11338_pilon	+	2802	10	Intergenic	novelGene_6186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	524.66626664769	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	300	1397	6086	12201	FALSE	40	AAAAGCTGAATTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFLALSLIYLGYRADEPDAGVQLPSQAKTDVRGRKGRAQAPNSAA	2630	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9959_12069
885671	contig_5794_pilon	-	5204	9	Intergenic	novelGene_69783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3440.16848924221	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	194	766	747241	743905	TRUE	10	TGTGTGTTTTGTCACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEEAMVEVVAAEVVMEEVMVDIMDLEVMVATMAVVLVIVVEGVMVVDQDMETKVEEDTVAVVDMMVTMKEEILAVVTMVVEIIMILEITVGNNNQIMDP	749496	739282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746883_747019_747097_747245_747330_747454_749429
885672	contig_15039_pilon	+	2599	3	Intergenic	novelGene_110182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.5	18	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACATAAAACCATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358009	414960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_359874_360287_360645_414582
885673	contig_14970_pilon	+	2792	11	Intergenic	novelGene_44972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6058.38827081923	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	133	1488	136145	231550	FALSE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATKHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_212641_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
885674	contig_9633_pilon	+	2425	5	Intergenic	novelGene_139641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	107	298	1138533	1140332	TRUE	25	TCTGAGTCTTCCCAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNKISPQTIITFNPPLTGLHLQTLHPQIFPVEGWQMLSFPEGLPVPRGLLWGKESFPLMLLKLWDDPLSLCLSLDLASLLPLAWVWAFSFLFSQVWTS	1138426	1149568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1138662_1140269_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737
885676	contig_6059_pilon	-	2512	15	Intergenic	novelGene_44828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	4729.90769207077	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	317	2071	584299	568233	FALSE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKIYR	584768	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584525_584677
885677	contig_2703_pilon	+	3323	2	Intergenic	novelGene_101793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCACTCCGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611795	615909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_613467_614257
885678	contig_8330_pilon	+	2421	13	Intergenic	novelGene_71783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_7	544.072579921303	785	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	408	1511	852673	856687	TRUE	5	CGCTGCCCAGCCTTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837343	857811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
885679	contig_19489_pilon	+	7362	5	Intergenic	novelGene_178437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	775	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	791	1840	964	2013	TRUE	70	GTACAAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSLKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	173	123367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19489_pilon_+_2416_117811_118971_119226_120836_120878_123000_123136
885680	contig_5130_pilon	+	6316	10	Intergenic	novelGene_178438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1559	1954	1646	5146	TRUE	40	AATGGTAAATATTACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETLEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRHSKISWIPIHQ	5	139007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5130_pilon_+_239_320_2005_5109_5522_5762_6235_39217_39225_52743_54051_54276_54390_109254_109634_137253_138306_138350
885681	contig_3747_pilon	+	2989	7	Intergenic	novelGene_24768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1729.50269024236	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	871	1611	202422	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
885682	contig_6031_pilon	-	1587	6	Intergenic	novelGene_56750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	840.182694418303	3299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	107	1081	257696	254965	FALSE	10	GCCCTGATGACTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGMSASPAPPEGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257802	254458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256133_256375_256704_256814_257469
885683	contig_7408_pilon	-	3020	8	Intergenic	novelGene_168721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	209.215541624285	679	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	579	1658	38514	12597	FALSE	15	ATTTGTTCATTATTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48329	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48129
885684	contig_10437_pilon	-	3632	4	Intergenic	novelGene_38417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.8578375602536	1292	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	57	320	811018	799511	TRUE	35	TGGCAATAGCAATTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAESARYCRVKASKSKAMAKHLKFIARTVMVQEGNVEGAYRTLNRILTTDGLIEDIKRRRYYEKPCRRRQRESYEICRRIYNTEMTRKINFLMRKNRADPWQGC	811511	795969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_798641_798869_799692_810935_811053_811489
885685	contig_5121_pilon	-	2471	4	Intergenic	novelGene_170751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528932	494717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5121_pilon_-_494830_494997_496560_521259_521595_528470
885686	contig_1452_pilon	-	2058	3	Intergenic	novelGene_115140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	51	665	715391	699652	FALSE	70	AAAAAAATTAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715441	698258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
885687	contig_12896_pilon	-	3672	1	Intergenic	novelGene_178430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	3190	3672	486	4	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEQLIVLMRNLYIDQEAVIRTEQGGTAWFKIRKGVRQGCILSLHLFKLYAEQIIQEAGIYEEEQSTRIGGRLINNLQYTEDTTLLAESEENLKHLLMKIQDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISSIMINGGKTEVVKDLILLGSTFNTHGSSTQEIKR	3675	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12896_pilon_-_0_3700
885688	contig_233_pilon	-	1634	6	Intergenic	novelGene_14611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_3	1052.0104562218	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	835	1197	91606	78579	FALSE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	95100	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725
885689	contig_2377_pilon	+	2614	3	Intergenic	novelGene_67910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	99	1121	269376	270398	TRUE	35	GAGTCACATTTTTAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLYSMRSSQKCSRATIDTGTEVVMPLSQMTVNCLKN	254155	272400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_270412_270920
885691	contig_11752_pilon	-	5580	7	Intergenic	novelGene_37633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	819	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTGCCTGTGCTGCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105902	84114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_84196_85033_85116_87158_87545_88665_93056_94218_94410_96442_96586_105595
885692	contig_11548_pilon	+	1764	6	Intergenic	novelGene_66771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1342.76431290082	3782	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	589	921	118990	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112605	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_114601_114706_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
885693	contig_4388_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_161992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAAAAGTAAATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310600	1309190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1309200_1310600
885694	contig_1239_pilon	-	6214	6	Intergenic	novelGene_150410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_5	121.873048702328	1544	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	182	796	684171	650485	FALSE	35	ACATTTTAAGGACTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNCLCALNLVYTLVSLLLIGIAAWGIGFGLISSLRVVGVVIAVGIFLFLIALVGLIGAVKHHQVLLFFYMIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEILGVWLTYRYRNQKDPRANPSAFL	684352	645066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_650560_654555_654670_664901_665016_665573_665655_666283_666452_684108
885695	contig_835_pilon	-	5112	5	Intergenic	novelGene_152165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2919	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	4633	4986	333135	332633	FALSE	50	AAGTTCTAAATAATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWTRKQFHPRMELHSPLGRSKDGARSQVFEQKEREVVRGKKEIKRSGKKQHRQPANGTQGVGQCGRVESKHPVLPGQETVATGSRGGRALADRGPLHVCLLTLFSVSFLFHLVLG	520438	332506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_332717_332865_334859_358333_358851_376615_377347_518777
885696	contig_5686_pilon	+	2976	2	Intergenic	novelGene_45391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2724	junction_1	0	206	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168424	172701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170343_171643
885697	contig_8161_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_156761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTTGACATACATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275986	278429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_276000_278400
885698	contig_3747_pilon	+	2511	6	Intergenic	novelGene_24847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4123.21974190074	186	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	325	798	201313	203262	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLM	200988	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_203259_203386_203498_203651_203768
885699	contig_9468_pilon	+	6967	14	Intergenic	novelGene_59457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	297.387440792022	1699	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	204	2474	172913	207089	FALSE	15	AGCATCGATTTGCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKMTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	150498	211582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150632_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
885700	contig_7527_pilon	+	2399	6	Intergenic	novelGene_139557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	858.226636734144	68	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1498	2064	86361	96119	FALSE	30	TACCAGTTTAAAGCTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDAFLFLSFLREGPRYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80066	96454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84488_84642_85436_86519_89859_90038_94415_94590_96062
885702	contig_17427_pilon	-	2461	13	Intergenic	novelGene_30330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1118.83514263223	522	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	57	1364	188879	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204696	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184359_184576_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188893_204653
885703	contig_6058_pilon	-	1582	9	Intergenic	novelGene_172411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	418.317761994396	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	243	1055	398054	387884	TRUE	40	AAGTGTCAAGAAACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLPRANQCLRCLPPERWRAKQKMGAVNAEVETKKRVMSHPE	401534	385252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_390760_390988_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
885704	contig_7568_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_173998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1966	2283	22969	22652	NA	65	TTTTAAAAAAAGAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAVSSQLKGSFLEGVACIQYSWTLWQGSWAWILQLAPVRLTFGSWDLSWQLTCGLACRSWDSRVFTACEPEPCRLTCRSWVHQPLQLHEPDPWTWDVPASITT	24934	22415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_22400_24900
885705	contig_11855_pilon	-	3221	13	Intergenic	novelGene_67138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	165	junction_12	202.015865026047	1239	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	60	1421	2723908	2710017	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALPGCCCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731348	2708216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
885706	contig_1008_pilon	+	2091	3	Intergenic	novelGene_121605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_2	70	8	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGATGTCTTTCTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750530	762320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_760935
885708	contig_12998_pilon	-	3226	8	Intergenic	novelGene_168960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.6461824512284	39	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	155	694	43998	28238	TRUE	25	GAAAATGGTACTGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCKDGLKGFTFSALRFIVGKEEIPTHSYSPEAAYAKVEQKREKHEEKPRRMNIIALVRKLVDSVCKHGPRHRCCKHYEDNCISYCIKGFIRMFSVGYLIQCCLRIPSAFRHLFTQPSRLFSLFYNKENFQLGAFLGSFVSIYKGTSCFLRWVRNLDDELHAIIAGFLAGISMMFYKSTTISMYLASKLVETMYFKGIEAGKVPYFPHADTIIYSISTAICFQAVSIFLK	46841	4693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_6837_27848_28358_32829_32907_33790_33855_37678_37847_41020_41091_43957_44105_46793
885709	contig_3862_pilon	+	3192	8	Intergenic	novelGene_137398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	213.787420641369	849	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	33	1202	429668	448739	FALSE	35	AGAGTCCTAAAGCATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPAAAAFAEMPLENLEEEGLPKNPDLRIAQLRFLLSLPEHRGDAAVRDELMAAVRDNNMAPYYEALCKSLDWQLDTDLLSKMKKANEEELKRLDEELEDAEKNLGESEIRDAMMAKAEYLCRIGDKEGALTAFRKTYDKTVALGHRLDIVFYLLRIGLFYMDNDLITRNTEKAKSLIEEGGDWDRRNRLKVYQGLYCVAIRDFKQAAELFLDTVSTFTSYELMDYKTFVTYTVYVSMIALERPDLREKVIKGAEILEVLHSLPAVRQYLFSLYECRYSVFFQSLAVVEQEMKKDWLFAPHYRYYVREMRIHAYSQLLESYRSLTLGYMAEAFGVGVEFIDQELSRFIAAGRLHCKIDKVNEIVETNRPDSKNWQYQETIKKGDLLLNRVQKLSRVINM	429635	450729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_429813_431396_431603_435577_435724_435975_436196_436301_436411_442094_442264_448428_448507_448642
885710	contig_3155_pilon	+	1463	5	Intergenic	novelGene_26402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	41	547	258156	261211	TRUE	20	CCTCACTCCAAGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258115	262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261306_261729
885711	contig_20609_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_118479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	967	1302	57579	56494	FALSE	30	CTGGGGAGGAACGTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGSSRKSEAEGTACSDSVHRPLPPGGVCKRCSLLLPASRAPEWQSLACAGPQGGRNGLPGDRGLRLGELLLQEGAPQSAWLGAGDGGGGHGPLLLPEDVPWVHGLLTGRL	59313	56493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20609_pilon_-_56585_57334_57665_58014_58120_58537
885712	contig_3975_pilon	+	2914	6	Intergenic	novelGene_54944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1857.70944983332	8	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	230	733	2344841	2354386	TRUE	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2344611	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277_2355136_2355265
885713	contig_10861_pilon	-	2393	9	Intergenic	novelGene_39239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	335.182762645993	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	909	1485	2393	609120	603151	FALSE	25	AGTCCTCCAAGGCGACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRFVCFKVTCFSSCHVFLQNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSA	614427	603150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606511_607921_608038_608886_610261_611134_611258_611521_611612_614296
885714	contig_5791_pilon	-	3108	5	Intergenic	novelGene_35828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	748	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCAGCAGCGCTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044971	999726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_999753_1003676_1003732_1036747_1037025_1038174_1038323_1042369
885715	contig_11630_pilon	+	7893	6	Intergenic	novelGene_147162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6814	125	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	136	2409	1319	59953	TRUE	15	AATGTTGGAGGGGCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIASKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRNYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRSLHTERKSLCWLRGMGGVGGN	1183	125191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_3527_59887_60466_85601_85898_86260_87087_121285_122648_122703
885716	contig_6488_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_44726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	741	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	17	331	47681	47367	NA	20	ACCACTCATCTGTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHQAWTESLGSASRPHSSLLTQLACTQPEYKARTISLRLLPVYLHPLSGLLAPGSLARSVHFRGEASCPSLACSCMALGTGAGPFPGFSPKLLPITDQSTDCL	47697	45483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_45500_47700
885717	contig_3602_pilon	+	2631	3	Intergenic	novelGene_60608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	34	879	902032	913188	FALSE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912225_912434
885718	contig_8377_pilon	-	6380	27	Intergenic	novelGene_35080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.20274170204252	106	44	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTACAACCTACGTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198736	129153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182893_183046_183256_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191215_192249_192350_193991_194117_194437_194521_196079_196217_197660
885719	contig_1230_pilon	+	2974	12	Intergenic	novelGene_28822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1400.67666056018	91	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	802	2742	405241	408754	FALSE	20	TTGGCACCATATAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	390289	408986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_390561_394353_394464_396361_396414_403888_404252_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
885720	contig_11375_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_152654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2222	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	32	541	178418	178927	NA	10	GCAGTCATTTGCGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSAFCSAQRDMCHSRSSLPTMTVLRARTPPPSTSPGPRRGSGPEIFTFDPLPEPAVAPVTRFSASRGHRKRSRRVLYPRVVSVAEVSSRGAHQPDAVRERPDVGGSDLICPLSSLPSGPAPAATRGTKPCQKASLPATRHHLLPDPDGRRRGAGDPDPGGRPQRRFPRAHPCAPSFRAV	178386	179689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_178400_179700
885721	contig_826_pilon	-	2557	3	Intergenic	novelGene_154927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.5	351	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	17	475	16566	8501	FALSE	15	CCCATTGCAGGGCCCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPCRMWFLVAFLLVSVAAPEVRSPVVNALDLEASAAGNMTNTSKKEETSAERHSDNHTTEPPSKEEHSSTPYLRPASTNGTSDSPDLEQTSQKVDPDRPVSEHATLKDPTDNEQSSISDPNAVPCFEGRIFEACFPTDYVDEGGLAEASLKPGFGR	16582	6418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_8600_16032_16347_16520
885722	contig_14441_pilon	+	1998	7	Intergenic	novelGene_100372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	441.835439451789	51	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	871	1419	125667	126705	FALSE	10	GGCGCCTCTGGGTAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	25711	127284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_25950_26652_26781_67434_67746_121194_121239_125517_125902_126159_126283_126514
885723	contig_17144_pilon	-	1433	7	Intergenic	novelGene_29529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1376.49615570356	187	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	435	1154	167982	166363	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168026_179700_179786_181794_181850_183158
885724	contig_3602_pilon	+	2564	3	Intergenic	novelGene_60609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	90	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	360	812	912736	913188	FALSE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912316_912592
885725	contig_5594_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_150113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33350	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_31000_33400
885726	contig_11422_pilon	-	2037	2	Intergenic	novelGene_99007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2347	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1338_1647
885727	contig_8122_pilon	+	2237	12	Intergenic	novelGene_40246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	873.308906562272	90	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	855	1562	732332	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	720364	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_720995_725248_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
885728	contig_1450_pilon	-	2479	18	Intergenic	novelGene_27400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	52	990	355898	349016	TRUE	35	AAAGCGAAGGATGATGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVLVPGQDLEGSHDLVCRICVSRLTRHKVDEGLECHYPQAVGIHDAHDAGKLCLSLGVVANIITQADEAGFELLGTQRAGVIPVKVVKGGPELVHLLLADALGVPGQDLVLHLIDGPGDGGEELFPAHADVLHSVVGVLVVEDERLLDELVVTLQLVDLWLVVDNALLVLPQVAELVLQGPVHLNGDSSDLLHLRLDPGPYDVGLGPKLLA	355949	322517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_322535_324990_325084_325652_325732_329044_329127_331945_332038_339442_339534_340844_341074_342471_342621_345693_345846_346444_346552_347010_347150_348035_348220_348940_349077_350343_350524_351264_351413_352391_352470_354166_354328_355587
885729	contig_3424_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_55552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330804	333184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_330800_333200
885730	contig_16303_pilon	-	1517	2	Intergenic	novelGene_34132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0	1469	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65388	58165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_59311_65016
885731	contig_3018_pilon	+	2821	1	Intergenic	novelGene_78919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTACAGCCTCCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628926	631747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_628900_631700
885732	contig_1351_pilon	-	3941	3	Intergenic	novelGene_178440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1100	1570	210070	209600	TRUE	30	TTTATGTGTGTATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHNKKIIHHDQVGFIPGMQGWSNIRKSNNVSHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLSKIGIEGKFLNIIKGIDAKPMANIILNGEKLKTFLLRTATRQGCSLSPLLFNIVQEVLARANKARKRNQGHSNW	211169	114203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1351_pilon_-_115075_207477_207892_208513
885733	contig_1982_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_151338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1195	1548	398739	398386	NA	30	CTGACTTAAATTGTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQLVPTHLEQWRMKNTKDTRKILAQRDRKGHINQRLHQPENRRTRWCAQLPPMTTLIGNTTESLTEQEKSGVENSDSSKKTRLNGLTETGGTLEDMVPGLSVSPELKPFPKPILQT	399933	398144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_398100_399900
885734	SIRV7	-	2139	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	176	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147742	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1228_1370_2676_2993_3115_43028_43078_114680_114989_147608
885735	contig_9839_pilon	-	3710	5	Intergenic	novelGene_88530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	815	1165	81266	80916	TRUE	35	CAAAGCAGCCAGGCTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEASKEDGRNTESLYQKEFVDIQPFQEAAYDQEQMVLKEEVQVTLKALVKNKAPGIDGIPTEMFQWMQRWKYSLVCAKKFGRELPGQLTGRDPSLYPFQSKVIQQNAEIIKQYH	82080	57738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_57850_59824_59926_76158_76346_77383_77512_78897
885736	contig_12638_pilon	+	2564	17	Intergenic	novelGene_33123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	545.857922076569	2	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	109	1296	171697	195520	TRUE	50	AAAGGCATAAGAAATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLTVATAAVAAAAEDNPSRIRVPQAPESPHRRLKKMADDIDIEAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAALLL	170975	200471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195506_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
885737	contig_16303_pilon	-	2707	8	Intergenic	novelGene_34069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	15	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	85	1197	47976	35759	TRUE	30	CCTGCAACCACATGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48060	33087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33877_35037_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
885738	contig_2646_pilon	-	2183	11	Intergenic	novelGene_69652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	330.76402464597	1383	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	386	1078	2178950	2174850	TRUE	20	CGATGCGGTAGCTCCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2181040	2171566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180696
885739	contig_13074_pilon	+	2873	3	Intergenic	novelGene_153421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_2	739	2311	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	268	732	403694	451174	FALSE	35	TAAAGGGCTGAAGTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403426	453315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002
885740	contig_1090_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_131115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTCTCTTCATTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342881	340727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_340700_342900
885741	contig_7898_pilon	-	2767	7	Intergenic	novelGene_47586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.713547901248	1504	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	36	701	508375	500592	TRUE	15	CTTCTCAGCCTCCGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAGPWRRAGRMSGWADDRGGEGDGRIYVGNLPTDVREKDLEDLFYKYGRIREIELKNRHGLVPFAFVRFEDPRDAEDAIYGRNGYDYGQCRLRVEFPRAYGGRGGWPRGGRNGPPTRRSDFRVLVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVQKDGMGMVEYLRKEDMEYALRKLDDTKFRSHEGETSYIRVYPERSTSYGYSRSRSGSRGRDSPYQSRGSPHYYSPFRPY	508410	491551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_491635_491724_491903_497671_497776_498890_500736_502264_502438_505661_505823_508187
885742	contig_18108_pilon	+	2834	7	Intergenic	novelGene_33474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_3	116.683927294589	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	56	910	226815	260192	FALSE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226759	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
885743	contig_16870_pilon	-	644	8	Intergenic	novelGene_155519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_7	98.8497107032815	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	79	642	209166	201339	FALSE	50	ACGAGAAAAAGTAATGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETRQSKLAAAKKKLKEFQQRNKTDVPAGVKKKRKIKNDGGTKTTTSDGCKPPEDAPKDCAAPAPEPGNDTIFPGGVSPTSVGSLHDSNMASLQNHDADNGTTSMDENQSLSSTESLRQISQQLNGLVSESSSYINGEGLASSTNIKDLENRYQELSIALESSTVTNKQLSSKIEELKQQNQDVMD	209244	201336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_201366_202226_202308_202502_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_207462_207586_209118
885744	contig_935_pilon	-	4055	4	Intergenic	novelGene_45592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	2912	3985	987143	986070	FALSE	50	CCATAAAGATCATGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSTDAEKASDKVQRPFTIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTTEIILNGESLEVFPLRMSPFSRGQGCPLSQLLSNIVLEVLARAIRLDKEIKGIQIGKEEVKVSLFADDMILYTENPKESSRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENFEDEITKSIPFTIDAKKIKYLGINLTRDVKDLYNENYKALLQETKRDLRKWKNIPCSWIERLNIVKMSILPKVLYRYNAIPIQIPMAFFIEMEKQITNFIWKGKRSQISKALLKKKNKVGGLPLPDFKTYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNSSTYEQLIFDKGPKSVNRGKDSLFNKWCWHNWISICKKMK	1115542	985999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_987367_987462_988736_1028191_1028664_1114599
885745	contig_2093_pilon	+	4123	1	Intergenic	novelGene_152935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	1582	2193	958641	959252	NA	20	CCCTCTCAACCTCTCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957059	961182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_957100_961200
885746	contig_4125_pilon	-	2666	6	Intergenic	novelGene_25144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	516	junction_2	354.556286081632	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	212	934	863886	853458	TRUE	15	CATGAGGGACCTGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	864097	851443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177_858245_863756
885747	contig_13021_pilon	+	2250	13	Intergenic	novelGene_8152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	169	2019	174676	180850	FALSE	35	TGTACAGTGATTTGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
885748	contig_2377_pilon	+	2548	3	Intergenic	novelGene_67911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	98	1165	269376	271018	FALSE	40	AGTCACATTTTTAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNFTRCFEHYEERSVPVLIIHIFIVCSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLIQAEQVQRNAEVKHRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELRFQNNSSHQAINDAHQITLCLLSTNCVLDPIIYCFLTKKFRKHITEKLYSMRSSQKCSRATIDTGTEVFMRLSISLPPSLFLSLAYLISFISQKRLI	254156	272401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_270354_270928
885749	contig_13674_pilon	-	2720	2	Intergenic	novelGene_140313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1768	2232	13849	13151	FALSE	40	GAACAGAACCGCAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSLFSPCSGTPMTRKFLLFIVSHITLRVSSFFFVLFPEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTRSVSEILLFIFWISDCYFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAF	15616	12662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_13153_13386
885750	contig_2903_pilon	+	5643	7	Intergenic	novelGene_148983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	486	junction_1	155.439609566617	2856	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	325	759	221148	238492	FALSE	60	AAAAAAGTTTAACTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKGKGGKNRRRGKNENESEKRELVFKEDGQEYAQVIKMLGNGRLEAMCFDGVKRLCHIRGKLRKKVWINTSDIILVGLRDYQDNKADVILKYNADEARSLKAYGELPEHAKINETDTFGPGDDDEIQFDDIGDDDEDIDDI	220823	243376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_221164_228693_228778_231689_231794_233695_233747_235105_235188_236334_236427_238486
885751	contig_17274_pilon	-	2281	10	Intergenic	novelGene_26473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTAGGGTCATGCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69830	7018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_7084_26182_26360_27831_28000_30126_31346_36252_36336_41217_41505_42653_42710_47229_47294_51701_51784_69750
885752	contig_9921_pilon	+	4362	12	Intergenic	novelGene_23711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_9	209.215970504284	1616	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	143	1627	3397	205627	FALSE	25	CCTGATTTTTTTAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEEERLRNKIRADHEKALEEAKEKLKKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKTKENKPLPPVPVPNLVGINGGDPEDNDIRKKREKIKEMMKHAWDNYRIYGWGHNELRPIARKGHSTNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFQDGKKWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFVHLSYLTGDPVYFKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAVEAIEKHLIKKSRGGLIFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRMDKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVSGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR	3254	208362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_3514_13617_13715_31049_31169_43118_43200_74155_74251_101233_101358_117950_118045_162397_162514_166370_166591_172567_172741_185438_185555_205494
885754	contig_9833_pilon	+	4819	2	Intergenic	novelGene_68498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6399	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4296	4808	216973	217485	FALSE	15	CCTCTGCATGAATCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAAVSQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKRISPITSCFVSHWKLCEAAFSYPVCWSPIGVRDGGSALR	212432	217496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_214563_214807
885755	contig_7530_pilon	+	4438	7	Intergenic	novelGene_141843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	796.660320755758	883	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	113	712	261111	300561	TRUE	15	TGTTTGTGTAAGTCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPKIWAQCRQERCLLLQLARYLGNTVDLSSFDFRTGKMMPSKLQKNKQRLRNDPLNQNKGKPDLNTTLPIRQTASIFKQPVTKVTNHPSNKVKSDPQRMNEQPRQLFWEKRLQGLSASDVTEQIIKTMELPKGLQGVGPGSNDETLLSAVASALHTSSAPITGQVSAAVEKNPAVWLNTSQPLCKAFIVTDEDIRKQEERVQQVRKKLEEALMADILSRAADTEEMDLEMDSGDEA	246237	307817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_246290_261050_261177_276342_276481_293747_293839_295176_295355_300434_300574_304103
885756	contig_12414_pilon	-	2163	14	Intergenic	novelGene_59642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	438.889683002635	30	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	222	1643	787209	756525	FALSE	30	GAATGATCCTATCTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	795187	756004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129_787233_794945_795006_795049
885757	contig_15327_pilon	+	1578	7	Intergenic	novelGene_70427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.369899668823	1148	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	250	864	48161	53863	FALSE	5	CTTCAGCCTCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGPNGYGFNLHSDKSKPGQFIRAVDPDSPAEASGLRAQDRIVEVNGVCMEGKQHGDVVSAIKAGGDETKLLVVDRETDEFFKKCKVIPSQEHLDGPLPEPFINGEIQKENSQEAPAEEAAPESPWPALGRTTSSDTSEELNSQDSPKKQDSAVPSSASSSSDPILDFNISLAVAKERAHQKRSSKQAPQMDWNKKNELFSNF	35973	54577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36124_36538_36611_48133_48296_49305_49460_51741_51783_53348_53442_53671
885758	contig_8637_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_175182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGTGGCTGAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330725	332823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8637_pilon_+_330700_332800
885759	contig_9839_pilon	+	1426	8	Intergenic	novelGene_88503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_5	1752.94534648263	2098	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	112	759	49467	58040	TRUE	20	AATCACTTGTTTTCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTCLYSFRFGRLGEGKGYERKGDYMAEINVLGFGIISQ	45329	61490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_57929_58380_59824_59927_61264
885760	contig_11171_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_48630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAACTTATTTACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423423	424964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_423400_425000
885762	contig_10990_pilon	+	4629	20	Intergenic	novelGene_7446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	370.118360944216	96	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	455	2905	722379	752144	FALSE	20	CTTGACGTCGTAAGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708540	753868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
885763	contig_4426_pilon	-	6458	11	Intergenic	novelGene_15401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	684.112629615913	3011	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1903	5712	87	5798	904546	797712	FALSE	60	AGAAAAAAATGAGTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYIKSEKGKNKEKDREVDKRERSRDKESANVTNSKHLQEEKKSSVADGSKAQHEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNSLLKLKSEADKPKPKSLPAPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENTFVPADVPKTDAIVSVYSESTIEEASPTFEKANTLPVLPSEKDFNGSDASSQLNTHHAFSKPVCKSSSGLEVENSTTDTQVISHEKGNKLESFVLTHLNDKCDSDLCEMSAGVPKENLSEQGNPKHCPESEKCLLSIEDEESEQSILSNLENHSQQSVPPEIHKYSQFIKVEIEENAEDDKTENHVPQRVTRNRANTMASQSRQFLAACTLLSEKDNESSSPRGRIRLTEEDDPQVHHPRKRKVSRVPQPVQVNPFLLQAKEKTQQSLAAVVDSLKLDEIQPYSSERANPYFEYLHIRKKIEEKRKLLCSVIPQAPQYYDEYVTFNGSYLLDGNPLSKICIPTITPPPSLSDPLKELFRQQEVVRMKLRLQHSIEREKLIVSNEQEVLRVHYRAARTLANQTLPFSACTVLLDAEVYNVPLDSQSDDSKTSVRDRFNARQFMSWLQDVDDKFDKLKEI	904632	797051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_797721_800548_800645_802509_802654_806901_807001_817234_819463_819510_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
885765	contig_2069_pilon	-	2455	3	Intergenic	novelGene_23373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.5	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	69	914	1059795	1058396	TRUE	20	GTAAGACGTTTGTGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLTEDGAKSAEATKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1059863	1056792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1057445_1057506_1059237_1059790
885767	contig_5732_pilon	-	2305	2	Intergenic	novelGene_119580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCCTTTCTGGTTCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150191	147745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_149533_149673
885768	contig_15114_pilon	-	2227	2	Intergenic	novelGene_121090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31490	27102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_28344_30504
885769	contig_12733_pilon	+	6804	12	Intergenic	novelGene_129590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_11	405.721660890447	1444	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	523	2202	331160	356267	FALSE	30	AGGATCTCCAGGAGTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEHVNGNGTEDTTSAVIHSENFQTLLDAGLPQKVAEKLDEIYVAGLVAHSDLDERAIEALKEFNEDGALAVLQQFKDSDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGTKVADSSKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGQQPSVGTEIFVGKIPRDLFEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLYNNHEIRSGKHIGVCISVANNRLFVGSIPKSKTKEQILEEFSKVTEGLTDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKTAAQARRRLMSGKVKVWGNVGTVEWADPIEDPDPEVMAKVKVLFVRNLANTVTEEILEKAFSQFGKLERVKKLKDYAFIHFDERDGAVKAMEEMNGKDLEGENIEIVFAKPPDQKRKERKAQRQAAKNQMYDDYYYYGPPHMPPPTRGRGRGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDYYGYDYHNYRGGYEDPYYGYEDFQVGARGRGGRGARGAAPSRGRGAAPPRGRAGYSQRGGPGSARGVRGARGGAQQQRGRGQGKGVEAGPDLLQ	329278	360869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_331147_331299_332031_332151_332282_332391_335125_335240_335339_335517_344594_344731_345322_345529_346808_346959_347505_347628_353727_354095_356225
885770	contig_5502_pilon	+	3775	7	Intergenic	novelGene_154959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_1	358.624068102271	754	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	86	1087	357713	398610	FALSE	35	AGAACCCAGCTTCAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	357627	401298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_398436
885771	contig_10437_pilon	+	3142	1	Intergenic	novelGene_38358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	461	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	186	446	558558	558818	NA	20	CCTGAGGGACCCCCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKWQPSPKPGKRGGRIPKRGRAELGRARVRRFPRAGWAGVGPGVHKGAQSVRACVRFFVSGMLRKLDMKNEDDVKSISRVMVHVFSDGVTNWGRIVTLISFGAFVAKHLKSVNQESCIEPLAESITDVLVRTKRDWLVKQRGWVSLP	558372	561514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_558400_561500
885772	contig_5979_pilon	-	9912	5	Intergenic	novelGene_178443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	253	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	9248	9673	425693	425268	FALSE	15	TCTCCTCATTATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRSGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPFAGLR	456711	425028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5979_pilon_-_427466_429173_430986_434069_436511_437488_438521_454521
885773	contig_7078_pilon	-	6007	26	Intergenic	novelGene_130170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	260.242766662207	1527	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	26	2917	795828	755142	TRUE	25	GCAGAGTAGAACTGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPAARKMADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEREKEKNKTLRNTIQWLENELNRWRNGETVPVDEQFDKEKANLEAFAVDKDITVTNDKPAATIGVTGNFTDAERRKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEESVDSLSEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQISNLRDEVEAKEKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEVDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPGAIRGGGAFVQNSQPVSVRGGGGKQV	795853	745610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_748681_755121_755273_756014_756232_757094_757200_757367_757440_757549_757611_758665_758768_759712_759823_759916_759979_760495_760614_761213_761403_766006_766151_767864_768072_771397_771467_772465_772660_773113_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702
885774	contig_14522_pilon	-	3208	7	Intergenic	novelGene_147306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	290	junction_6	202.265021417172	969	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	127	1104	175672	66449	FALSE	10	TCTTCCCAGCTCCCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSERAGCRQRPCGEQASGKTQPTFLTQPAESSFVFFLGSAPMPGPTQTLSPNGENNNDIIQDNGTIIPFRKHTVRGERSYSWGMAVNVYSTSITQETMSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHEGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	175798	64344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_175553
885775	contig_9311_pilon	-	1897	4	Intergenic	novelGene_178447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCATTTACAATAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118108	58707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9311_pilon_-_59115_86772_87396_117113_117394_117521
885776	contig_19402_pilon	-	4006	6	Intergenic	novelGene_80849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_5	487.638636697299	1095	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	337	1473	171006	167101	FALSE	20	AGCGTGTTTTTCCCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193161	164567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
885777	contig_9389_pilon	-	3533	7	Intergenic	novelGene_83882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_5	442.181241121783	23	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2183	2623	38959	36611	FALSE	20	ATAAATTTCTGGTGCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRSGEEQERVLRYLEDEGKSKARRRGPGRCEDRRPDDLAYTPRECFQRISRRLRAILKRSRIPMETLETWEERLLRFFSVSPQAVYTAMLDSSFERLLLHAVCQYMDLISASADLEGRRQMKVSNRHLDFLPPGLLLSAYLEQRS	42092	35700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36715_37984_38041_38119_38206_38582_38669_38850_38975_39409_39535_40050
885778	contig_6871_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_21537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	524	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	18	368	124646	124296	NA	30	GCGGAGGAAGTGGTACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKIWMPFGGTASSGSLRSPLLLHLMSVPSFTLLASVDKRVCHTFHILVLLLLLVCSAKSYTHFKTQLKYFLDSCSLLPILSFVSALPLPPSALFFTLLQWLVNMFVSFPTRLVIPEILST	124663	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_121900_124700
885779	contig_299_pilon	+	3952	11	Intergenic	novelGene_129419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	196.417005373771	200	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	153	1685	841615	863323	TRUE	30	TCATTTGATTTTGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKFRSVHSLTICIYNLITLK	830681	883439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830734_832793_832887_841607_842679_860693_860915_863075_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619_874686_881780_881867_882653
885780	contig_9363_pilon	-	1437	9	Intergenic	novelGene_6573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	943	junction_5	324.46715935515	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	62	802	757196	754431	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	758121	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070
885781	contig_6576_pilon	+	3051	3	Intergenic	novelGene_42391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	138	1484	1301228	1302574	TRUE	35	AGAACAGAGAAGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295639	1304275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303014_1303147
885782	contig_11422_pilon	-	1228	3	Intergenic	novelGene_99063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	463	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2335	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1137_1343_1588_1743
885783	contig_16884_pilon	+	3928	2	Intergenic	novelGene_161829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	3254	3787	112480	113525	FALSE	30	CGGCATAGGTATAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEIPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIPRIIYPAKLSLRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	109226	113666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_112840_113351
885784	contig_4857_pilon	-	3386	2	Intergenic	novelGene_48729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	651	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2098	2493	1193569	1193174	FALSE	40	TATTTAGGGCATGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKKKNNIKRNAFRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKETIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLEWSSAAPQEEAKMAHGARYSSERKGRWGEARKK	1354808	1192280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1194198_1353339
885785	contig_16098_pilon	-	3108	21	Intergenic	novelGene_45829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_20	513.676987512581	1240	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	91	2832	230275	201500	FALSE	20	GGTGGTGGATATGTTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230449	201223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230369
885786	contig_2219_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_67177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	25	78	225	302	113405	113328	NA	35	AATAGGTTAAGCTGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPTDKLDNWDLLNIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQTANRHEEMLAITSH	113629	110681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_110700_113600
885787	contig_6418_pilon	+	2269	12	Intergenic	novelGene_81197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	187.97551273618	142	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	415	1917	1375762	1444680	FALSE	35	TCTAGCCATGGAATCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341016	1445032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
885788	contig_3956_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_14801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCTTTTAAAAATTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226710	1225055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1225100_1226700
885789	scaffold_13505_pilon	+	10139	4	Intergenic	novelGene_111603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	6213	6725	659510	660022	TRUE	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	653228	663815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_657653_657721_660929_661255_661942_661993
885790	contig_9708_pilon	-	3300	2	Intergenic	novelGene_67256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	634	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	227	1099	50111	49239	FALSE	15	TCTCACCCCGGCATTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66316	47037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50118_66096
885791	contig_18394_pilon	-	3100	2	Intergenic	novelGene_178449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	23	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1827	2396	1909	1009	FALSE	20	ACTTTATGTTCCTTGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRTYGVHITLDPDTANPWLFLSEDGRQVSLGETCQELPENEERFDSYPAVLGAQYFHSGKLYWEVDVTGKETWDLGVCRHSVKRKGQFLLSPENGFWTIWLWKKQKYVAGISPETSLHLQVPPSQIGIFLDCETHTVSFYNITDHGSLIYTFSECDFAGPLRPFFNTGFNYGGQNMAPLTLCPLRLGW	3735	304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18394_pilon_-_1560_1890
885793	contig_8617_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_73390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACGCCTAATCTACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61802	60943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60900_61800
885794	contig_12837_pilon	+	2456	8	Intergenic	novelGene_57317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	2760.82279217554	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1	441	129310	129750	TRUE	20	CAAGTGCTATCTGTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLCPSDNGIAPTRPWLLLCWAPDPASHPPFLLRLFLSHPGLFLSGGREVRLVATPLLFPSPSPPLRAKHGIEAVGGFAILPSPDRDRFKGLGFIRVSPGPVRVLICSVFAKGACIWQSRCETKRQSFTAVRIIKSFGRTFERTPR	129309	167487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_129802_130402_130509_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
885795	contig_5686_pilon	+	10452	12	Intergenic	novelGene_45419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1440.02975175877	88	183	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	2460	4262	189037	219782	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEGKHQMQTLSPFMQMMTQLAHPPACVCSLFYQDSRETF	186577	229513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_222917_224043_224203_226536_227354_227433
885796	contig_14441_pilon	+	1400	5	Intergenic	novelGene_100349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	490.603391243885	486	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	812	1360	116728	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	10963	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_11024_30578_31150_116547_116963_126159_126283_126514
885798	contig_11422_pilon	+	1495	1	Intergenic	novelGene_99059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23929	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAATTCGGCCCGAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	2239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_2200
885799	contig_9668_pilon	+	8738	30	Intergenic	novelGene_58084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	347.050589643211	1727	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	4239	5399	184806	359314	TRUE	5	CGCGGCAGCGGCGGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGFLLPAFLSPPASWAGVVTTVAGQSHLPQKPILRQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	119676	417794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_121622_123176_123290_123622_123664_129338_129539_134527_134797_145066_145174_145970_146178_147289_147422_164932_165048_174462_174535_176721_176842_183888_184813_189906_190011_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138_361551_366858_366940_373727_373842_373983_374063_383656_383767_383861_383975_386776_386920_408409_408540_411672_411793_412454_412524_417650
885800	contig_11316_pilon	+	1381	2	Intergenic	novelGene_122629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	261	773	137674	138186	TRUE	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137413	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138599_138673
885801	contig_3469_pilon	-	3281	7	Intergenic	novelGene_34212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	847.234061848056	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	283	885	659538	545916	FALSE	50	TAAAAACAAAACTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC	660045	543519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_546000_550259_550362_550975_551066_565792_565932_590930_590992_659411_659753_659977
885802	contig_14959_pilon	-	632	2	Intergenic	novelGene_166727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	35	415	72129	71749	TRUE	15	GTCTATACATGCGTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK	72163	60219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_60434_71745
885803	contig_6364_pilon	+	6961	12	Intergenic	novelGene_51700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3390	27	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAGCCTTGAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431103	487001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_436283_436418_436500_439765_439985_440671_440788_445010_445153_447070_447144_457072_457255_458660_458773_466203_466369_472493_472646_477569_477736_486627
885804	contig_4780_pilon	-	3413	12	Intergenic	novelGene_65390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_11	78.2901997181054	623	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	352	1254	419817	312144	FALSE	35	ACCCTCACTATTCAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLGQGPPTDAPAVDTAEQVYISSLALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428930	309984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_419799_419852_422134_422262_428740
885805	contig_3747_pilon	+	1635	7	Intergenic	novelGene_24752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	149	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	336	1484	201313	205055	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVTFPNQRRDSRSRCPNTVIIAFGCCHEKPEGRSSQRPLGPFPEHQKTQMFTAPLTVPLALGQSPSAIALCSLSCVIALNSTFFGEFYS	200977	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203280_204788
885806	contig_19402_pilon	-	2275	6	Intergenic	novelGene_80852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_5	487.638636697299	1237	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	98	1603	193194	167101	FALSE	20	TTTGATGGTGCTTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193291	166428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
885807	contig_9389_pilon	+	1715	6	Intergenic	novelGene_83987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_5	1251.02380472955	26	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	77	682	383398	384482	FALSE	25	ACGAACCTTGCTCTGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDEGKLFVGGLSFDTNEQSLEQVFSKYGQISEVVVVKDRETQRSRGFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGKSVDGRQIRVDQAGKSSDNRSRGYRGGSTGGRGFFRGGRARGRGFSRGGGERGYGGSRFESRSGGYGGSRDYYGSRSQGGGGYGDRSSGGSYRDSYDSYGKWRSESTTLLWPTVGARCALVVSAWPLPVSWA	382005	385515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383501_383576_383684_383774_383914_384008_384091_384307
885808	contig_12837_pilon	+	2696	3	Intergenic	novelGene_57275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAACAAAACAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47442	75370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_49929_50047_50135_75247
885809	contig_6058_pilon	-	1735	8	Intergenic	novelGene_172404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	416.249728810355	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	51	1502	399048	385415	FALSE	30	TTGGAAGATTTTTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRKDCQEESRFEKMAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	399098	385181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_399013
885810	contig_5039_pilon	-	5645	2	Intergenic	novelGene_64981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2035	junction_1	0	137	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2001	3643	5643	1680376	1678376	FALSE	30	CTCCCAGATGTTAGCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEHPVRALGLSETSDSPAVVLESPGVAMEVSEPQNLETLKPVTKTAELPAAGPSVISEQSERSVAVMLEPSMTKILDSFATAPVPATTLVLKSSEPVVAMSVEHQMKSVLKPLESTSPEPSKIMLVEPPVAKMLESTETLVDSSEIPAEVHPEPSTSTTVDFPESSAPEVLRLPEQPVEVPLGSAASSMTRPQELQELPKTTALELPESSVASVMELPGPPATSMPEMQGPPVTPVLELPGPSAIPVPELPGPPSTPVPELPGPPATVVSELPGPSVTPVPQLLQELPGLPASSVGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASSTMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSMDSQMLATSSM	1686276	1678373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1680625_1682882
885811	contig_11512_pilon	-	1858	2	Intergenic	novelGene_43371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGCAGTGGCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562793	554965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556805_562774
885812	contig_11337_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_107210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGTTTTAGTTAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376239	374397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_374400_376200
885813	contig_9183_pilon	-	3874	7	Intergenic	novelGene_40289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	307.706931276427	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	223	1545	323783	318417	TRUE	30	GGCACCAAGGCCTGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFLFTPQEARELLLPQPRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	326040	310546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743_323834_325868
885814	contig_15114_pilon	-	1702	8	Intergenic	novelGene_121121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.301786386765	12	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	19	1119	125261	100551	TRUE	10	ATCCACTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125279	94768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_94826_100024_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212
885815	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
885816	contig_12528_pilon	-	2023	11	Intergenic	novelGene_81330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	562.329262976772	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	529	1413	966228	933897	TRUE	50	AATATCAACTTGAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWNVCLYSW	968139	932907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_933717_933922_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
885817	contig_14682_pilon	+	1265	13	Intergenic	novelGene_139128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	316.978738771756	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	272	1126	146592	174580	FALSE	15	GTGTTCTGCTACCAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERTAILQFVAAGDHLVHHCPTWQWASGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGIAGITEAVKEITLESKDSMKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYLLIFLKFVQAVIPTIEYDYTRHFTM	142407	174719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_146561_146619_151306_151357_157167_157239_158635_158744_162323_162374_165799_165879_169207_169243_169509_169666_170436_170565_172795_172865_174498
885818	contig_8712_pilon	+	2233	3	Intergenic	novelGene_58763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	4.5	18	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	178	528	314974	321821	FALSE	10	GCCGTTCTCATTCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANASAWRAAASSPSAWTPCRMWTTTVPTAKLSWAPTSVCRTRPTWRRP	277846	323526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_278018_314967_315188_321684
885819	contig_9121_pilon	+	1847	1	Intergenic	novelGene_134442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102799	104646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_102800_104600
885820	contig_7775_pilon	-	5570	1	Intergenic	novelGene_37490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	2464	2961	221774	221277	NA	25	TGGGATTTACACCAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPCFQNKESVNSLEEENFLELPETEYKRLICITLLEIRKEIRQNAETARQHTDTVVAELKKVIQEHNAKFNRLQESIEGQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSKIEAVEVRISDTEDKALEANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPEQGGG	224237	218667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_218700_224200
885821	contig_16103_pilon	+	3541	5	Intergenic	novelGene_118793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	569	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTAAAAAAATAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588870	593537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_589420_589795_589876_590287_590371_590564_590606_590749
885822	contig_11850_pilon	+	1354	8	Intergenic	novelGene_125194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	371	841	181235	185962	TRUE	30	CCACCTAAAATGGCCGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSPGYFPITTLLLTTTSSTSSSCKSSSRSPLLLLLILFLRHGYFYFTFTKTNIVIFLFHYLLHWLLFLKSNKAESTPLIGLVVHGELYGFHLTKTTKVLPYFLFRCIWRKATNKNFFNRLFCFHGFGPFRINHFPIQFMFLLIHDLIYTLRLFK	179686	198220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_180001_181178_181277_182659_182765_183240_183371_184499_184662_185930_186104_195718_195776_197905
885823	contig_9177_pilon	-	1699	12	Intergenic	novelGene_32572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2217.4234992907	12	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	32	1267	26442	20367	TRUE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKEAAGCPVGG	26473	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2046_20267_20397_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312
885824	contig_3862_pilon	+	1150	6	Intergenic	novelGene_137441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_2	71.3655379017072	12	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATATTTGTGCTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645650	651401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_645730_646508_647054_648716_648775_649490_649558_649650_649721_651070
885825	contig_14450_pilon	+	7697	8	Intergenic	novelGene_48967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3819	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	5934	6752	1042789	1169744	TRUE	10	ACCCCGGCTCCAGCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSKQIGDLFLIFWGFLLLFLPLCRPIGDVIQTGPDPRQVQERPRRLLHLLVVALRRLFRASLLEGQRVAGDLPRLGQVLPLPVLGRVAAVSQGILGLLLAVFPVVLLRVAVALMALEAPLAAFAALLAALGGELVVVVGRGGGDGVAGWGGAPGIGGFGTAVVVILLGVAADHWGAARRLALSPHPAAGDAVPHGCCHSNGSDWQRPDAGKHPSAQNPCSILDHSWRKTCLYLRGSIQKHHGSGSINVRILQKGSVSLKEGAARPDGWT	1036855	1502393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1043374_1065852_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689_1311248_1379343_1379461_1502264
885826	contig_3155_pilon	+	2302	3	Intergenic	novelGene_26416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1141	junction_2	718.5	39	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	655	981	259780	261211	FALSE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258722	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261082
885827	contig_10323_pilon	-	3385	6	Intergenic	novelGene_123583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1119.52857935829	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	41	2050	513306	459350	FALSE	15	GAGCCTGTGATTCCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRAARAEAREIRMKELERQQKEVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	513346	458014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460904_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208_474245_513276
885828	contig_20199_pilon	-	909	3	Intergenic	novelGene_82531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	83	385	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44069	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906
885829	contig_9898_pilon	-	4182	6	Intergenic	novelGene_178452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	2561	3121	38395	29655	TRUE	20	TGCATTGGGCAAATCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIEVDVPRDYGPHSPLSSNSVPQGVWMCLWSFHDVSLYKLCWLPQCCVLSYRLGHIRKSNIILNGERLRAFPLKLGIRDGCLLLLLPFNIVLEVLARATRQEKEIKSIQIGKEKVKLSLLTNDMILYIEDPKEYTRKLLELIGEFSKVVGNKANKQKSVGFLYTSNEKSERKIRETIPFTIALRE	253758	28279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9898_pilon_-_28310_28623_30059_38238_39183_133551_134524_134576_135352_253732
885830	SIRV6	+	1291	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	141	162	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	35	AAGTGGTATCTAAAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
885831	contig_1239_pilon	-	5094	5	Intergenic	novelGene_150412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_4	97.9728916588665	1127	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	609	989	665651	650485	FALSE	30	ATTATTAATGATTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEILGVWLTYRYRNQKDPRANPSAFL	666888	646379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_650560_654555_654670_664901_665016_665573_665655_666283
885832	contig_6946_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_59789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAATAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450808	451718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_450800_451700
885833	contig_15327_pilon	-	1929	5	Intergenic	novelGene_70644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3091.92709931848	520	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	336	746	901528	900904	FALSE	35	TTGAATGTATAGAGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	899720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_901689_901894_902035
885834	contig_6513_pilon	+	4756	19	Intergenic	novelGene_117741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	146	junction_1	374.028408012012	2367	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1425	4275	482	4756	136370	212289	FALSE	30	GTTAGTGAACTACAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNTRIAEEVNCLLSCRDDNLVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDVPVLLQAVLARSPNVFREKSLQNRYVQSGMMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHSSSYPTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSDDYLHMVHRLSSDDGDSSAMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSDGTPKGSRPPLILQSQPLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKDQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRIRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSIATKQPQTSVVQNQQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGEGRPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKSGFKSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHPDSKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKKMEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVEN	48452	212289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290_136434_148509_148676_151555_151684_152058_152159_152690_152843_158569_158728_159728_159826_163882_164510_170367_171994_198973_199157_203369_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250
885835	contig_3861_pilon	+	3514	8	Intergenic	novelGene_57895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	780.862474499596	212	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	2481	3512	150245	176462	FALSE	50	AGAAAAGATCGATGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQLIEGDEEE	147764	176464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171890_176396
885836	contig_6439_pilon	+	3882	5	Intergenic	novelGene_154231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2001	2369	203914	204282	TRUE	15	GCCGACGAGCCGACTGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVGRIQVARTLHFPAEQLQPTMKQQRSSRGEKDGAGKAYIAGYSAVSSAGSSVKLLSHTPCPPNSDVGGANPSSTDPALPSRPSYCSQLGISAGRAGGRRTVGMKACIAGYQVLCLLLRVP	201913	221325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_205543_209808_209872_215384_215503_220951_220999_221300
885837	contig_7898_pilon	+	3148	8	Intergenic	novelGene_47607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	536.019722451649	1091	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	267	560	598694	599921	TRUE	30	ATGCTTGAACCGCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGDSSPFPEQLGLGLEASVSLCVGDTRPRHQDNQPSPSTRWESVSGRPAGLAHPHFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	562993	603737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563159_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844_602061_602164_602246_602421_602576_603523
885839	contig_854_pilon	+	4743	24	Intergenic	novelGene_36527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3200.08238847153	72	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	973	2871	1687025	1702466	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRFKAERIQSILGAWAVG	1612796	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672902_1685125_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702206_1702416_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1715226
885840	contig_366_pilon	-	3376	16	Intergenic	novelGene_51643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	216.134978402129	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	1545	2579	1414038	1406847	FALSE	30	CATTAACAAAGCTGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGLSPDPGQDPDGVTGYKNIHLEKKCVHRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSSNDSFSEQGLDKEDRRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTSGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWDLEPTRRPTFKQICFLLREQAKVDRKEQDYANLTSSSSSGSSSGGSGSSEPEESSSEHLACCEQGDSSQSMLQPNNYQFC	1432887	1406049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1407006_1407102_1407212_1408086_1408187_1409179_1409292_1409372_1409496_1410512_1410611_1410712_1410805_1413068_1413232_1413959_1414674_1414808_1414936_1420693_1420810_1423388_1423577_1423718_1423841_1424022_1424139_1427903_1428091_1432834
885841	contig_10475_pilon	-	5669	2	Intergenic	novelGene_148725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	1410	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	247	1281	84427	83393	FALSE	50	TCTTTCAAAATAAAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPETTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQSPTEAESSMDDD	90165	79004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_84503_89994
885842	scaffold_8345_pilon	+	2204	4	Intergenic	novelGene_107020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	438.515931548926	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	1704	2204	590961	602747	FALSE	30	TATGTTGGAGATACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGIEGILFVLDCFKCKWPKEMVILYLLLKVIFILCRFHGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELR	589257	602747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_591078_598125_598202_602217_602322_602543
885843	contig_383_pilon	+	1871	9	Intergenic	novelGene_126133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_4	218.318574564786	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	442	1686	148663	169172	FALSE	20	TGGCTGTTATTTCTACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	148221	169357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
885844	contig_9653_pilon	-	4094	29	Intergenic	novelGene_48217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	500.193058391723	17	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	126	2114	544351	516239	TRUE	35	AATAATTGGTTTTATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEAKSVIGVL	544476	507091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_507485_508175_508283_508928_509107_509263_509456_509787_510001_510109_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513577_513728_516115_516265_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_530278_530455_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_543009_543086_544336
885845	contig_3601_pilon	-	2686	1	Intergenic	novelGene_132970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTAGAGCTGTGTGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150325	1147639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1147600_1150300
885846	contig_19352_pilon	-	1615	7	Intergenic	novelGene_122366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	581.975371758405	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	212	754	122805	104000	FALSE	10	TTGTGTGTGTTATTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123074	103138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738_122836_122893
885847	contig_8587_pilon	+	3996	10	Intergenic	novelGene_159139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_3	240.358733953344	64	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	195	1685	493112	513611	FALSE	15	TTCCCCAGTATTGTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWSPTSGAAIAASLGAGGRRPPLATVKRKVVCECGYTREQHLEEAIKAHVFQGKEWDPKKHVQEMPTDAFGDIVFTGLGQKVGKYVRVSQDTPSSVIYHLMTQHWGLDVPNLLISVTGGAKNFNMKLRLKSIFRRGLVKVAQTTGAWLITGGSHAGVMKQVGEAVRDFNLSSSYKEGDVITIGVATWGTVHNRESLVHPMGGFPAEYVLDEEGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGRYGVEIPLRTRLEKFISEQTKEKGGVAIKIPIVCVVLEGGPGTLNTIYNAITNGTPCVIVAGSGRVADVIAQVAHLPISEITISLIQKKLSMFFQEMEIFTESRIVEWTKKIQDIVRRRQLLTIFREGKDGQQDVDIAILQALLKASRNHDHFGHENWDHQLKLAVAWNRVDIARSEIFTDEQQWKPSDLHPMMTAALISNKPDFVKLFLENGVQLKEFVTWDTLLYLYENLAPSCLFHCKLQKVLAEEPERLACTPAVPRLQMHHVAQVLHELLGDFTKPLYPRPRHSDRSRLSLPVPHIKLNVRAGDRLCVIPAQLHMALRF	478496	515922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_478582_493002_493172_493436_493618_497239_497407_499568_499750_502138_502201_506792_506991_511372_511476_512843_512966_513194
885848	contig_19459_pilon	-	1210	8	Intergenic	novelGene_59864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	7394.83315482879	12	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	91	876	16240	7003	FALSE	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	18585	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18519
885849	contig_3588_pilon	+	5748	19	Intergenic	novelGene_72857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	600.082309169149	1388	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	183	1154	84577	127468	TRUE	30	CTGAATCTTGTAGTATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIDRLASGKGPQQPPVPPQRPMAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGKKTAFSDKLSLNYAGLSGSIYPRYKSLLYHQPPKDTKEAPCQGKSHLCQSMDGDQTEERM	84394	144895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125374_125401_125587_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134122_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
885850	contig_11258_pilon	+	2068	7	Intergenic	novelGene_67773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	124.398106452184	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	344	1249	279290	292582	FALSE	60	AAGAGAGAAGAAAAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278946	293401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285691_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
885851	contig_5574_pilon	-	3955	1	Intergenic	novelGene_155868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCCATTATAAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207893	203938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_203900_207900
885852	contig_854_pilon	+	6013	32	Intergenic	novelGene_36526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3199.67772960982	6	114	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	2248	4590	1702628	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612795	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681892_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692779_1702556_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
885853	contig_13097_pilon	-	4456	1	Intergenic	novelGene_107685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2223	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACATTACTATTAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142450	137994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_138000_142400
885854	contig_5686_pilon	-	4119	21	Intergenic	novelGene_45212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2111	2782	208699	203000	TRUE	30	AGTGAGTTCCAGGTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	258282	93662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222914_224040_224201_241595_241799_250016_250101_253203_253296_257382
885855	contig_14666_pilon	+	2013	6	Intergenic	novelGene_39566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1729.60277520591	38	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	987	1646	484281	484940	FALSE	20	GATTTGCGGGGAGCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	485307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_477933_478265_479834_479944_483205_483317_483861_483977_484136
885856	contig_9582_pilon	+	1368	6	Intergenic	novelGene_106840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	40.3058308436881	1475	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	857	1228	437107	439239	FALSE	25	CATCTGCACTGTATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARYEEVKVSGFEEFSGAVEQHSGKTIFAYFTGSKDAEGKSWCPDCVQAEPVVREGLKHINEGCVFIYCQVGEKPYWKDPNNDFRKKLKVTAVPTLLKYGTPQKLVESECLQSSLVEMLFSED	435365	439379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_435919_436057_436349_437094_437252_437958_438041_438432_438509_439170
885857	contig_9954_pilon	-	4060	1	Intergenic	novelGene_178454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2799	3167	401585	401217	NA	15	TCGAGCTCTATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	404383	400323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9954_pilon_-_400300_404400
885858	contig_5590_pilon	-	1356	8	Intergenic	novelGene_163029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.74963553055941	43	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCAAACATCTCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369362	352591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_352702_353454_353580_358766_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
885859	contig_6446_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_149173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	520	1230	127278	126568	NA	0	TGTTTGTGTTTTCTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLIFKAIQELKQKADKNKEKKIDKSMEKADKLMENTDKKMEEFRKITQQQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKMSEMDSVIEGLRSRLETVEDRISKIEDKHLDTTLFEEKSDKRMKKNEENLRIMWDTIKSKNLHVISIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKEEKAAIQEAQRTPYRTNPKRKSPRHTIINLPKPKTNEES	127797	125894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_125900_127800
885860	contig_5999_pilon	-	2377	3	Intergenic	novelGene_45643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.5	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTTCCAAAGGTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270528	239263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_241475_243337_243476_270500
885861	contig_7963_pilon	-	2295	7	Intergenic	novelGene_58535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	1	junction_1	130.949629841232	476	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	15	674	245666	240504	TRUE	25	ATGTTTATTTATACCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQAGMLRRGAPAGDLPGAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245680	237452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_238512_239941_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_245606
885862	contig_12586_pilon	-	1169	3	Intergenic	novelGene_121807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	162	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	110	403	70067	56396	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFPGVLARSLYRAGARVRDKPWVGDAPSFCLGTIGDMSGYTPDEKLRVQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPQRLWPLEEFWNKFLQNPTPWRNAVKPYAIVERKPRIFPGDTILETGEVIPPMKDFPDQHH	70176	55629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_56465_63106_63152_69887
885863	scaffold_9100_pilon	+	1547	8	Intergenic	novelGene_83254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	503.310874842471	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	114	998	647136	654304	FALSE	25	CTCTGTTAATTTATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644841	654853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651143_651204_651950_652069_653324_653449_654139
885864	contig_7534_pilon	+	2575	1	Intergenic	novelGene_162118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1439	1738	39887	40186	NA	50	AAAATCCCACCAAGTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHSRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLLRFAIQPGIGQPHKTKWD	38448	41023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_+_38400_41000
885865	contig_8628_pilon	-	2637	17	Intergenic	novelGene_164408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1229	1801	412238	397291	TRUE	15	CCTCACGCCCCCCTTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQHHVHENTWAVVLILYKGGSGVKEEVVLLPLVQDWALHLSQAGHGYLSSLTVLWVVLVWEAQQKVEADHVPGEEEVSYCGQDLDLGLGQGQGQGQGLGLALGQDPGLGLALEALRFQEVVEEEAREEEVGKESCLAEQLHQQPGDHFHDQTGKGLQVHKILFLHNLCSASLVVGFDQKNWKSYDCYSN	436571	373151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_373278_384736_384854_388160_388286_395393_395486_396163_396365_397115_397370_398834_399155_401467_401603_412199_412370_414016_414161_417263_417411_419330_419483_424950_425248_430470_430622_435147_435259_436333_436409_436551
885866	contig_2069_pilon	+	3844	12	Intergenic	novelGene_23297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	872.769913731019	2271	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	388	1509	504404	523795	TRUE	15	GGCAGTGAGTGGGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNITLANVIRQLGSLSKYAEDIFGELFTQANTFASRVSSLAERVDRLQVKVTQLDPKEEEVSLQGINTRKAFRSSTIQDQKLFDRNSLPVPVLETYNTCDTPPPLNNLSPYRDDGKEALKFYTDPSYFFDLWKEKMLQDTKDIMKEKRKHRKEKKENPNRGNVNPRKIKTRKEEWEKMKMGQEFVESKEKLGPSGYPPNLVYQNGSIGSVENMDAGGYPPPPPQSDSTSPPSPSFSEDNLPPPPAEFSYSADNQRGSGLAGPKRSSVVSPSHPPPAPPMGSLPGPKPGFAPPPAPPPPPPMIGAPPPPPPAGFGTPGTPPPPSPPSFPPHPEHAPSLSPDQVSLAHGWHQVPLLSISALCAPTLLPSLHFGS	452835	533824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_453099_504279_504453_510937_511073_511590_511745_514129_514248_515265_515397_518070_518230_520112_520364_523670_525373_532115_532268_533110_533174_533281
885867	contig_9389_pilon	-	374	4	Intergenic	novelGene_84024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCGCTTACCCCCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586151	584381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_584403_584804_584892_585654_585886_586116
885868	contig_5502_pilon	-	1250	2	Intergenic	novelGene_155023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	943	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537325	535577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_536713_537210
885869	contig_6361_pilon	-	1601	2	Intergenic	novelGene_23969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAATCAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405244	403233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_404318_404727
885870	contig_7356_pilon	+	4856	29	Intergenic	novelGene_60409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	3585	4154	505425	511470	TRUE	30	CTGGAGACCAGGGGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNWMSMFTSEFLKPNPLQDDPYNLREQSGNLCWNTFSMICLIPRLCSKLSLCKPNSWTTLSIAMPIAFIWEGTGGGNVVSNSSSCFSLMFFLCLFSLICLWADATDSIKTSQSLQVYFAVGKFRGRLLSLSMQSLLSRSSACCKPRSSLTERTDSSITGPSKSLSCSFSSFLVLLGFLGLDLCFLFS	463132	516994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_463445_473369_473436_475962_476081_476222_476290_479029_479145_479854_479948_480030_480083_482348_482528_483360_483436_483606_483721_484518_484608_485069_485173_487275_487338_488980_489082_489685_489771_491151_491303_491811_492902_494324_494503_497359_497524_499875_499996_501191_501321_502270_502339_503462_503515_505423_505513_509940_510118_510846_510965_511283_511471_515372_515919_516838
885871	contig_6069_pilon	+	4636	5	Intergenic	novelGene_8002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	3345	3983	176380	177018	FALSE	20	CCTATAGGGTTGCTATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNIVKNGNSRTLNCAHEEPVHRSRGSHLTEQGDTAWFKVRKGVHQGCILSPYVFNLYAEQIIREDGLYEERDIRIGGGLINNLRYADDTTLLAESEEDLKQSLMKIKDHSLQYGLHFNIKKTEILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGSSGQEIKRHIALGKSDAKDLFKVLKSRDVTLKTKGHLTQAMLFSIPHMHAKAGQ	2803	177671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_3103_75213_75949_76050_77016_158088_158598_175543
885872	contig_16103_pilon	-	2027	10	Intergenic	novelGene_118825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4224.99575279208	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	356	718	735970	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	742845	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722639_722760_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_737752_737917_742792
885873	contig_8628_pilon	-	754	6	Intergenic	novelGene_164410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGCTGCCTCCTCACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397218	373162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_373278_384736_384854_388160_388286_395393_395489_396168_396359_397106
885874	scaffold_12124_pilon	+	1966	10	Intergenic	novelGene_22249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	196	573	1490385	1508039	FALSE	10	ACGGCTTTTCTGCATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473572	1509432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
885875	contig_8254_pilon	+	5158	1	Intergenic	novelGene_48403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1138	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	318	680	127000	127362	NA	25	ACCCAGTGGTTAAGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSVSEILFIFWISNCCLCVISSCEFILEFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLCIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSVVLFWMPTGTILSYFCKCFDIVCCFRGIE	126682	131840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_126700_131800
885876	contig_17976_pilon	+	730	6	Intergenic	novelGene_32482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1099.71807296234	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41614	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41649_41814_41858_44601_44727_45524_45585_46443_46522_47396
885877	SIRV6	+	1437	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	80	11	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
885878	contig_13145_pilon	+	6286	8	Intergenic	novelGene_116615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	669.25477897709	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	89	949	35323	57392	FALSE	15	CAGTGATGCCATTGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35234	62729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324
885879	contig_6898_pilon	+	2643	7	Intergenic	novelGene_35757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2445.41541574342	197	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	35	916	119670	125646	TRUE	15	TTTACTGTGACTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119635	127702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126506_126834
885880	contig_13144_pilon	+	7429	2	Intergenic	novelGene_178455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9017	127	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	6779	7108	103596	103925	FALSE	15	CGCTGTTTCCCGGTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKQH	67029	104246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_+_69650_99437
885881	contig_17522_pilon	-	1640	6	Intergenic	novelGene_160802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_5	579.369174188617	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	861	1220	94276	76631	FALSE	20	GAGATTTTGTCACTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLVIEFSEEYPNKPPTVRFLSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWNDS	96541	76210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_76760_79726_79816_87962_88053_92939_92966_94250_94332_95736
885882	contig_9058_pilon	-	2116	5	Intergenic	novelGene_149361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1219	1536	56478	47432	TRUE	55	GCAAAAGAAACTGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRWRRLGNCWLLRSGAWNLVGLPDPFFSGYSVSSYLQLFIISPGALFSLLADTENEQCHKDDKDDASSSNADDERDIQTILCTADVGYTGFLKDFVFCHAAAE	57696	41881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_-_41982_42124_42435_47261_47500_51835_51960_56352
885883	contig_5640_pilon	-	3079	16	Intergenic	novelGene_27270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCTCCCAGCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957306	942167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_942244_945856_946042_946909_947064_947408_947490_947855_948022_949185_949269_950932_951080_951342_951440_951609_951680_951814_951962_952850_953000_954371_954476_954626_954701_954814_954923_955804_956479_956542
885884	contig_5574_pilon	-	4228	9	Intergenic	novelGene_155822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	561.859732829289	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	172	1092	132928	59952	TRUE	35	AAGACAGGTTCTTTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	133611	56675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_56886_57025_60155_78596_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363_131517_132909_133060_133571
885885	contig_15326_pilon	-	1212	5	Intergenic	novelGene_157711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_4	12.1963109176505	717	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	172	627	158391	111784	FALSE	40	TTTTGAATACAGAATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSQGNFEGNFESLDLAEFAKKQPWWRKLFGQESGPSAEKYSVATQLLIGGVTGWCTGFIFQKVGKLAATAVGGGFFLLQLANHTGYIKVDWQRVEKDMKKAKEQLKIRKSNQIPTEVKSKAEEVVSFVKKNVLVTGGFFGGFLLGMAS	158562	111198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_111862_113977_114110_122931_123008_149766_149918_158372
885886	contig_20420_pilon	-	5063	2	Intergenic	novelGene_172472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1202	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4064	4378	14174	13860	TRUE	35	CATGAAAATCTCGGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKAESGRIKKPDPSFCCLQETHLRHKDTNRLKIKGWRKIFHATSKQKRARVAILISDKRDFKSKSVTRDKGYDMIKGSIQQEDITIINTYAPNSNAPKYVKQI	18237	12961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_13461_13673
885887	scaffold_12124_pilon	+	2111	10	Intergenic	novelGene_22251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	196	573	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473572	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
885888	contig_15029_pilon	-	1946	7	Intergenic	novelGene_128186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1209.0084665635	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	54	524	172327	162140	FALSE	25	TTGACCTAATCTGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTVVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTFFFKWLLKYN	172380	160717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_162172_163240_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
885889	contig_4924_pilon	-	2596	13	Intergenic	novelGene_84686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_12	1038.50569396075	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	417	1910	252772	65524	FALSE	70	GATTAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	253188	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_252764
885890	contig_615_pilon	-	3272	1	Intergenic	novelGene_80035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1117	1446	10929	10600	NA	50	TACAAAAAAAATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLSNVYLCEGTPGCILAQLGISCIISSRGTFPSVFLPLPTSLALFLHSSDIFILLKIDELLKSTTKQDISDFTIAHSVTVLKLYTSFNPYDENFKNLFLPTLQEE	12045	8773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_8800_12000
885891	contig_7078_pilon	-	3977	27	Intergenic	novelGene_130172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	285.412296501189	1408	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	158	3049	795828	755142	TRUE	30	AATTTTATGTTAGTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEREKEKNKTLRNTIQWLENELNRWRNGETVPVDEQFDKEKANLEAFAVDKDITVTNDKPAATIGVTGNFTDAERRKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEESVDSLSEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQISNLRDEVEAKEKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEVDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPGAIRGGGAFVQNSQPVSVRGGGGKQV	796264	747772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_748681_755121_755273_756014_756232_757094_757200_757367_757440_757549_757611_758665_758768_759712_759823_759916_759979_760495_760614_761213_761403_766006_766151_767864_768072_771397_771467_772465_772660_773113_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702_795851_796129
885892	contig_13481_pilon	-	1755	3	Intergenic	novelGene_119383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1260	junction_2	5	590	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	67	360	536852	527468	FALSE	10	GAGTGGCCGTTCTCTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIRFDPENPQTLRLEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536918	526072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527531_536157_536304_536767
885893	contig_4803_pilon	-	2450	5	Intergenic	novelGene_150696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTGATGAGGAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12924	2302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_2468_4731_4895_5617_5760_6826_6907_11024
885894	contig_5419_pilon	-	3474	1	Intergenic	novelGene_15515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2346	2681	249956	249621	NA	35	AACAACCAGCCACTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKESSSSIQKTVLGYILMRSLPHSGRGFLFHVWREVGKRHDLDIGGGLLLRLDAVHLNGVLPRSTHLLRLPFKGPCNIFKSPATGLRNFEEGEDQEDNKEGSKDDKNVGP	252301	248827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_248800_252300
885895	contig_15304_pilon	-	1146	4	Intergenic	novelGene_30673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4814.46087901393	13	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	408	1004	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106532_106931
885896	contig_11720_pilon	+	1354	10	Intergenic	novelGene_43832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	6	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	12	1073	68064	98482	FALSE	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68052	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
885897	contig_2646_pilon	+	1719	11	Intergenic	novelGene_69505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	292.990187549003	1862	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	853	1419	566553	573396	TRUE	40	CAAATAGAAAACTCGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	553997	574391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560734_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385_573503_574197
885900	contig_7171_pilon	-	4553	7	Intergenic	novelGene_101377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_6	1037.12284978953	1157	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	3517	4254	1367042	1363653	FALSE	15	CTAGAGCGCTTGCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1370669	1363353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233
885901	contig_34_pilon	-	6465	4	Intergenic	novelGene_39996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	819.327095175601	4291	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	5680	6195	212564	212049	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	220436	211778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_213048_214057_214152_215288_219047_219092
885902	contig_9011_pilon	+	3388	1	Intergenic	novelGene_159317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	615	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGCTCCCTGAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508083	511471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_508100_511500
885903	contig_14519_pilon	-	3929	11	Intergenic	novelGene_66812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_10	82.4978181529669	1836	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	341	1297	283786	270622	FALSE	10	GGTGCGGTAGAGTCGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDVKPLGVIWGKFSEFYSKKNTIMFDDIGRNFLMNPQNGLKIRPFMKAHLNRDKDKELLKLTQYLKEIAKLDDFLELNHKYWERYLSKKQGQ	287397	267989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283842_287112
885904	contig_10990_pilon	+	4549	19	Intergenic	novelGene_7457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	351.223017504109	60	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	375	2825	722379	752144	FALSE	20	CTTGACGTCGTAAGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708557	753868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
885905	contig_8357_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_39763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1250	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	368	697	882967	883296	NA	10	CCCTCCCGATGATGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTDNSPIIHIQESFSKSLAFYYEKHSHANFSSQTIIPHLQNKNRISGSLLPYTNLTNMATMPKELEHLQDVCTDCTFQKIKKKKNIKNARTICASCVKLNNWVKTSMQ	882599	884270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_882600_884300
885906	contig_6418_pilon	-	1939	12	Intergenic	novelGene_81198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1256	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1284	1715	1390286	1341802	TRUE	10	GGAGGCCCTGCATTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKWVTLIIFDIFLDPLMLLRHKILHFIHDGRLLNQLWIEVCEVVIHVWGSKVTLQIAGCEHDDFIAQGLRTIPCFDLQNAPACSLHRVIVKAIGIPILVQYVFDSHCLFRTLPVHSCIVDFFPSKAHSHIQHYLARGVSSS	1444785	1341041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1341179_1341714_1341864_1375715_1375938_1388796_1388881_1390222_1390360_1409653_1409795_1410275_1410421_1428927_1429128_1429224_1429373_1441100_1441282_1441958_1442064_1444495
885907	contig_5669_pilon	-	11082	20	Intergenic	novelGene_86053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	156.130370270411	1243	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	170	1480	222000	196397	TRUE	25	GCAAAATCTGCTCCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSFMLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVFLDRLAVIFRHTNPIVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANCSVMRFLRDLIHTGVANDHEEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLKGLPKETTVGAVTVTHRQLTDFHKQVTSAEECKQVCWALRDFTRLFR	226144	177469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_177553_182926_186141_186549_186626_187233_187512_187718_188111_188197_188315_189008_194420_196365_196458_201969_202083_205122_205291_207172_207330_208491_208587_209481_209599_212408_212550_213404_213466_215462_215540_216828_216921_219864_220057_221963_222104_226078
885908	contig_12019_pilon	+	885	3	Intergenic	novelGene_87659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAAGTGAAAATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5530_6114_6226_8298
885909	contig_9415_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_109848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTCCTCCAGTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1972378	1974739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1972400_1974700
885910	contig_5643_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_38951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGATTGGAGGGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477297	475088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_475100_477300
885911	contig_10930_pilon	-	2919	7	Intergenic	novelGene_36971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	313	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	25	1587	280370	268388	FALSE	90	AAGAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
885912	contig_854_pilon	+	4521	24	Intergenic	novelGene_36569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3223.05940148208	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	924	3497	1700894	1715383	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1677572	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685182_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
885913	contig_5039_pilon	-	7122	4	Intergenic	novelGene_65029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3772	4074	1792004	1791702	TRUE	70	GTGAGAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGHSANSELTPPLKSTFQPKTRQACKTVTHGRNLLLSPSKCKRTNRQHLPKSEAETAGRDRKPGQTDTGNPGWKGGECRHTAGIAINVTKQSVYKISE	1873959	1784175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1785205_1789682_1795178_1872472_1872647_1873535
885914	contig_7909_pilon	-	4448	2	Intergenic	novelGene_155943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAATATATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030196	1025632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1025826_1025941
885915	contig_6441_pilon	+	6722	5	Intergenic	novelGene_172890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	643	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4976	5437	315457	315918	TRUE	50	TAAGCAACACAGAGCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLKAFPLRTGMRQRCPLSPLLFNIVLEVLARAIKLEKEIKGIQIGKEEVKVSLFADDMILYIENPKESTSKILELIEDFSQVSGYKINIQKSVGFLYTNKENSEEELTKSTPFTIAPKKIKYLGIKSNQRRKRPIQRKLQDATSRNQKRPT	307477	389730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_311042_314045_316539_358775_358791_373409_373968_389638
885916	contig_2438_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_112028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2465.96110826996	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	77	580	310588	312871	FALSE	10	TTTGGATGGACTCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305089	313518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310672_311907_312083_312305_312409_312729
885917	contig_11318_pilon	-	4356	22	Intergenic	novelGene_48124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	974.879509968753	2149	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	860	2583	282	2864	49997	9367	TRUE	25	TGTTGTAATTGTGCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQRKEGLCQLLWNTAVRMSFPPHLNRPPMGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRPWINKKIIEYIGEEEATLVDFVCSKVMAHSSPQSILDDVAMVLDEEAEVFIVKMWRLLIYETEAKKIGLVK	58282	7831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_8214_8256_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_52071_52142_58143
885918	contig_3469_pilon	-	2036	7	Intergenic	novelGene_34214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	847.234061848056	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	201	803	659538	545916	FALSE	85	AAAGAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC	660038	544682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_546000_550259_550362_550975_551066_565792_565932_590930_590992_659411_659655_659954
885919	contig_15327_pilon	-	1082	3	Intergenic	novelGene_70677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3046	16	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902147	900442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901507_902035
885920	contig_11978_pilon	+	3577	8	Intergenic	novelGene_63032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1285.57843726758	1690	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	100	891	1608423	1646860	TRUE	5	TGACTTGGTTTCCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNCARCDKIVYPTEKVNCLDKFWHKACFHCETCKMTLNMKNYKGYEKKPYCNAHYPKQSFTMVADTPENLRLKQQSELQSQVRYKEEFEKNKGKGFSVVADTPELQRIKKTQDQISNIKYHEEFEKSRMGPSGGEGMEPERRDSQDSSSYRRPQEHQQQPPHHISTSAPVYQQPQQQQMAQSYSGYKEPAAPFSVQRSAPGGGGKRYRALYDYSAADEDEVSFQDGDTIVNVQQIDDGWMYGTVERTGDTGMLPANYVEAI	1608323	1649719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1608492_1616197_1616293_1625946_1626032_1633574_1633683_1644678_1644836_1645277_1645382_1646686_1648749_1648921
885921	contig_16072_pilon	-	2733	1	Intergenic	novelGene_175856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTACCAGCTTATGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35368	32635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_-_32600_35400
885922	contig_1275_pilon	+	2144	11	Intergenic	novelGene_108756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACATGTTTGACAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400525	465118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409
885923	contig_9389_pilon	+	485	4	Intergenic	novelGene_84034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	43281	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	16	453	584401	586236	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584385	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
885924	contig_9807_pilon	+	2851	14	Intergenic	novelGene_32841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	478.319308565675	991	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	873	1871	140826	158783	FALSE	10	TCTCTTCGTTGTGGATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108985	159763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
885925	contig_3866_pilon	-	5826	24	Intergenic	novelGene_112389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_23	257.971833576293	1690	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1259	3780	133	3912	222507	161587	FALSE	20	TCCAGTTGGAGCTACGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPLRVGAIVETKTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVSVMSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKREEERQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTPNSEGKSDSCSSDSETEDPLEKDLMNEELSPDIKEEVEKNENLNDDKLDEENPKIAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEQVVEVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFSQDEAGCEPQMEAQNLEFSSLDNKDFSSANEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEITNSLPQERTSDCIVSEGMKNLNFEQHFETENEGMPSLIAESNQCIQELTGEKFDSPAEETINIPLKEEEDAMPLIGPETLVCHEVDLDDLDEKDKNSMEDVVVESSESNSLVSVPPALPPVVPHNFSAASPLTLSQDESRSIKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFEASVASSTCSIIIQERESREKGQKRPNDGNSGLLAKKQKRTPKRTSAVAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKCTPVKHLSVSKSQKLARSPARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLNELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSTSPPQNVLAVECR	222745	159672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_161691_164547_164695_165706_165914_169273_169379_169615_170750_172275_172418_174189_174275_177422_177621_180390_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_222664
885926	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
885927	contig_8330_pilon	-	4285	16	Intergenic	novelGene_71849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	301.698348244291	1258	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1915	2898	916108	896249	FALSE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	930418	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051_916272_923720_923849_924642_924845_925607_925751_926083_926267_928091_928267_929178_929388_929707
885928	contig_17989_pilon	+	1438	7	Intergenic	novelGene_150812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1359	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTCGCCTTCGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200621	206769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_201214_201519_201665_202348_202465_204529_204664_204858_205018_205678_205846_206644
885929	contig_4426_pilon	-	5363	6	Intergenic	novelGene_15408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	2711	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1759	5277	87	5363	904546	817370	FALSE	65	AAAAAAATTGAAGAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYIKSEKGKNKEKDREVDKRERSRDKESANVTNSKHLQEEKKSSVADGSKAQHEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNSLLKLKSEADKPKPKSLPAPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENTFVPADVPKTDAIVSVYSESTIEEASPTFEKANTLPVLPSEKDFNGSDASSQLNTHHAFSKPVCKSSSGLEVENSTTDTQVISHEKGNKLESFVLTHLNDKCDSDLCEMSAGVPKENLSEQGNPKHCPESEKCLLSIEDEESEQSILSNLENHSQQSVPPEIHKYSQFIKVEIEENAEDDKTENHVPQRVTRNRANTMASQSRQFLAACTLLSEKDNESSSPRGRIRLTEEDDPQVHHPRKRKVSRVPQPVQVNPFLLQAKEKTQQSLAAVVDSLKLDEIQPYSSERANPYFEYLHIR	904632	817369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
885930	contig_20614_pilon	-	3610	4	Intergenic	novelGene_107527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	134.556885946263	1333	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	90	551	68041	66070	FALSE	35	ACAATCTTCCATCTTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EECKWASAAASWKLQVWKGALRPRREAVRMNVGVAHSEVNPNTRVMNSRGIWLAYIILVGLLHVVLLSIPFFSIPVVWTLTNVIHNLAMYVFLHTVKGTPFETPDQGKARLLTHWEQMDYGLQFTSSRKFLSISPIVLYLLASFYTKYDAAHFLVNTASLLSVLLPKLPQFHGVRLFGINKY	68950	63010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_66206_67449_67602_67867_68043_68862
885931	contig_5423_pilon	-	3544	10	Intergenic	novelGene_85269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_9	171.990309804555	1042	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	27	1373	577004	558772	FALSE	20	AGGTGGGCAATTCCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	577030	556600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172_574294_576973
885932	contig_11825_pilon	+	5702	37	Intergenic	novelGene_155394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_31	499.602195918579	1723	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1646	4941	13	4953	10468	132403	FALSE	30	ACTGTAACTGCTTCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQLQEKKIQEKIQEEEQKAVEKQCKDKGGTASALVNYRALYPFEARSHDEMSFNSGDIIQVDEKTIGEPGWLYGSSKGNFGWFPCNYVEKMSSSEKALSPKKALLPPAVSLPATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPASVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEAVYASVNKKPTSAAYTVGDEYIALYSYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWAGSIGARTGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGTSNKKPEIAQVTSAYMASGSEQLSLAPGQLILILKKNASGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERTTPAFHPVCQVIAMYDYVANNEDELNFSKGQLINVLNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMDDLQLVLEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTLESHVDHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGPQSYTTRTLQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTMFDRDQFSPDDFLGRTEVPVAKIRTEQESKGPTTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKNQL	10455	133152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051_65201_66028_66127_77431_77608_77912_78058_81715_81922_83958_84024_84580_84748_86902_86949_87050_87173_88223_88321_89092_89285_113223_113346_116748_116856_117966_118151_123657_123757_126198_126367_126835_127052_127726_127849_128751_128835_130976_131061_131499_131674_132245
885933	contig_11525_pilon	-	3016	7	Intergenic	novelGene_171067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAACAAAAAGTTCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62095	14308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_14432_18453_18549_22901_23174_26636_26766_56929_57040_59724_60304_60387
885934	SIRV7	-	2403	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	50	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2101_2163_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114961_147608
885935	contig_13401_pilon	-	3027	3	Intergenic	novelGene_178464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	394	1125	194734	194003	TRUE	75	ACAATAAAAAAACATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSIYSHLIFDKGPNPSNGEKTVFLTNGAGKTGYPFAEK	195127	45227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13401_pilon_-_46227_109119_109377_193356
885936	contig_3975_pilon	-	5526	12	Intergenic	novelGene_54731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	192	junction_11	328.415504813115	1572	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	244	1521	1731202	1719543	FALSE	35	GCTGTCAATAATTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731445	1715537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
885937	scaffold_12124_pilon	-	3648	4	Intergenic	novelGene_22126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	125.163892556919	104	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAATGCTTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987381	936113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937090_938270_940567_942744_942805_987065
885938	contig_8310_pilon	-	4771	4	Intergenic	novelGene_75602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACGAGATAAAAAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327835	315006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316391_317730_317884_320574_320710_324736
885939	contig_11316_pilon	+	645	1	Intergenic	novelGene_122660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	179	553	138403	138777	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSTRIVFFVLLGQPRYPILIQINENNPFLINAIKRLILGSIFAGFIISSSLTPTTVPHMTIPHHLKFAALAITLLGFALAIELSLFTYHLKFDFPLYTHKFSNILGYYPTIIHRSPPFHVLNTSQNLASTIIDLAWLEKAIPKGLASIQKFASTSISNQKGIIKLYFLSFLISLTLGLLLTI	138224	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138200_138900
885940	scaffold_12124_pilon	+	1593	2	Intergenic	novelGene_22392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4737	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	638	1417	1508626	1509405	FALSE	45	ACTGGAAATTATATGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1506664	1509581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1506687_1508010
885941	contig_7963_pilon	-	4472	5	Intergenic	novelGene_58430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.959354138971	2879	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	391	789	119177	118559	TRUE	25	CCCAGTAAGTGATTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKSEYSLRKPHCVPVDSSS	120536	113557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_114521_115838_118735_118954_119260_120105_120366_120488
885942	contig_11720_pilon	+	2375	15	Intergenic	novelGene_43963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	338.736013341797	92	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	119	1825	262851	272210	FALSE	10	GTCCGTGCCTCTGAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTWKLQKEAGHSPCLMGPLAGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAVGLLAAGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVLPILTFTSMPACMHEFANGWLSKVITSSIMALICAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLVVLLAAVYLGLTIYLVWTCCIAHGATFLAHSSHQHFLYGLPDEEQEKGGTAG	262262	272760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262828_263052_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816_269907_270032_270153_270549_270700_271268_271343_271806_271961_272096
885943	contig_9668_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_58166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAAGGCAGCCCCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479939	481781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_479900_481800
885944	contig_6205_pilon	+	7417	8	Intergenic	novelGene_160331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2561	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	2072	2692	5179	89496	TRUE	10	TTCTGTCACTCTCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKISVSNSSKILSVFSVFSPFWNSDHMQIFAFDCSHMILRVSSFFFVLFSDFSSNRVVSKCLSSISLILSSIVSNLLLSLSVTLSISEILLFIFWVSNCCFCMISSCEFILAFCSYIIFLNYSIFLSVFSMNFSAFSMNLSIFYSFLSAFSLNFWVILNIRDLNSLSVRSSAISSTGRSSGVFFVYCTLDEGLQNK	3107	314049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_5757_89453_89691_89817_90064_131339_132550_132616_133440_241603_241612_311755_313617_313666
885945	contig_14970_pilon	+	4646	11	Intergenic	novelGene_44975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	5927.70458525052	1342	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	133	1428	136145	231550	TRUE	25	TGGATTGAGGAGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	234826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_234318_234375
885946	contig_11512_pilon	-	2875	8	Intergenic	novelGene_43288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	402.756370374884	43	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	247	921	382664	367967	FALSE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGAGGKPFLLALVERTIFLEYVWPEFTTGEWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409402	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381691_381783_382663_382723_401765_401866_409314
885947	contig_9113_pilon	-	2591	4	Intergenic	novelGene_68588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	485	junction_3	481.176567269115	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	626	1873	348515	347268	FALSE	15	CATCTAATCTGTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364434	346549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042
885948	contig_5400_pilon	-	2361	3	Intergenic	novelGene_162823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	42.5	1107	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	734	1330	271258	268944	FALSE	25	GCTACACTTACTGCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRCLEPSGNGAEGTRSQWGTVESAEEPPPEAARLATALRELSQTGWYWGNMTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	272752	267912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_271119_271483_272243
885949	contig_3424_pilon	-	3123	9	Intergenic	novelGene_55530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGGGAGGGGCGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333513	249149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_249337_276266_276474_309782_309884_310231_310404_313037_313146_314559_314694_315892_315998_317596_317711_331518
885950	contig_7151_pilon	+	2222	5	Intergenic	novelGene_40757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	227.198701580797	59	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	124	465	504080	507901	TRUE	45	GACACCATTGAACCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKISSHMRISQNSPATMMAQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	503290	509870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_503387_504052_504143_506568_506685_507738_507944_508155
885951	contig_7254_pilon	+	6162	1	Intergenic	novelGene_145846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2326	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGTCTTTCTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214694	220856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_214700_220900
885952	contig_14925_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_55257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	4321	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
885953	contig_5023_pilon	+	2476	12	Intergenic	novelGene_7187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2236.16364959468	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	574	1248	629246	646990	TRUE	10	TCTGTAGATGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580782	648310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609657_625742_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647643_647734
885954	contig_16411_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_77355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	879	1178	242905	242606	NA	30	CCCAAGAAATTTCTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSQTSCHGPFLCSFHGVTNDPLALGRGFFFSFSIFLPELGRGISNVTLCMFFKAQDHRVSLKMTCSAMRHLLPKDICPSKQFPQAWWEILQRNFGSI	243783	242436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_242400_243800
885955	contig_11825_pilon	+	6704	27	Intergenic	novelGene_155393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_26	500.588677127878	1557	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1141	3426	13	3438	10468	92940	FALSE	25	TACATTATTTGTATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQLQEKKIQEKIQEEEQKAVEKQCKDKGGTASALVNYRALYPFEARSHDEMSFNSGDIIQVDEKTIGEPGWLYGSSKGNFGWFPCNYVEKMSSSEKALSPKKALLPPAVSLPATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPASVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEAVYASVNKKPTSAAYTVGDEYIALYSYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWAGSIGARTGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGTSNKKPEIAQVTSAYMASGSEQLSLAPGQLILILKKNASGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERTTPAFHPVCQVIAMYDYVANNEDELNFSKGQLINVLNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQ	10455	96206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051_65201_66028_66127_77431_77608_77912_78058_81715_81922_83958_84024_84580_84748_86902_86949_87050_87173_88223_88321_89092_89285_92938
885956	contig_12644_pilon	-	3938	7	Intergenic	novelGene_44445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	874	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1572	1877	376638	376333	TRUE	20	CACTAACCTGATCGTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDIQKKVLWLAQTLPTFWCFFFKSFNADSIPLCLALRPKVSKCSIRFHTLKEKLVYQVTKRNPPPHTQPSSKLPRTPLRKSVACWDSKKPPPKKLYKKIY	378209	335233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_335428_367593_367742_367992_368115_370694_370898_372111_372210_374739_374805_375101
885957	contig_7898_pilon	+	1668	11	Intergenic	novelGene_47612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	421.961372639724	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	226	1446	589227	599921	FALSE	20	GAGATCTCTTCCTGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSASGLRRVSVSVSETPVPDTKTTSLLPPRGGRACPAGRRGSHTLPHLPFALSGLAESRGEVTGVVAALEQLVLMAPLAKEPVFQPRKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	563020	600143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563174_589154_589269_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
885958	contig_15304_pilon	-	3104	5	Intergenic	novelGene_30650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4431.4770111104	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	918	1721	106308	103245	TRUE	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	107225	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102492_102532_103329_103548_103680_105638_105960_106040
885959	contig_14984_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_174162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	432	779	123074	122727	NA	5	TTTTTCCCTCCCACCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITRPKYVRGSFTILTSKEHSGYTSSNTDLFVLLAGHGIFNILRQHHNSKASILFWSYLFTAQHSHAYEEIENIMAWVRCTLVLKVTSLLFNALKRSFFFFKLYFT	123505	121923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_-_121900_123500
885960	contig_11512_pilon	-	2698	7	Intergenic	novelGene_43282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	361.964393583433	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	313	831	378234	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQGHLPFPVNTSTRSALVSPGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	382824	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367447_367533_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663
885961	contig_12644_pilon	-	1507	10	Intergenic	novelGene_44659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16361	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAAAAGGAAGTGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680633	2675481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2675528_2677222_2677394_2677583_2677677_2677935_2678192_2678718_2678844_2679071_2679203_2679506_2679665_2679878_2679961_2680105_2680227_2680309
885962	contig_19777_pilon	+	5345	14	Intergenic	novelGene_29700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1034.35798342248	1890	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	132	890	305	9877	TRUE	5	CATTGTGCCTTTGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAPVNFSCEPVPKEPTLVLTWALPPGNNAGFKLEVSSGACDNMTCLENCSLENGTSCMAEVTHLNFCTSYNISITTLSCGKNASSVQKTCTTDSTDPPPPAEAPVITPVSHNSIKVTFSEFNDSHGPIKAYALILTTGKAKRPSPNVLKYTYEDFKKEASDTYVTYLITTDENYSQGLSEVLKYEIDVGNESTTCGYRNGKLEPLSSYRASVAGFTKIVFNCPQNCGLINGTRSYVSFSEYSKAIDLPQDPGVICGAVFGCIFGALVVAVGGFIFWRNKRKDEKNNEMSFSQIK	173	24994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_465_3267_3400_5238_5447_5562_5691_6105_6191_9831_9878_10496_10585_12886_12978_13208_13283_13382_13518_15438_15559_16872_17034_18243_18380_21344
885963	contig_10500_pilon	-	2610	8	Intergenic	novelGene_41231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	262	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	190	1098	1640040	1629460	TRUE	15	TTTCTATATTGTATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640229	1626408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626842_1628380_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
885964	contig_13026_pilon	-	1166	9	Intergenic	novelGene_146289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	100.4501586609	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	364	774	14211	6494	FALSE	5	CCAGGCCTGTGCTGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28168	6101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17240_22975_23008_28000
885966	contig_5620_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_161341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTTCTCCAGCTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187509	185855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_185900_187500
885967	contig_3817_pilon	-	4527	2	Intergenic	novelGene_78276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	802	1401	65519	64920	TRUE	75	AAAAAAAAATCTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNQTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	66320	59097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_61120_63815
885968	contig_12938_pilon	+	2119	7	Intergenic	novelGene_99696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	601.437098401265	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	119	481	78117	80832	TRUE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	51944	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_81459_83391_83470_84550_84635_85468
885969	contig_3584_pilon	-	2973	3	Intergenic	novelGene_108182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGTGCTATGAGGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531635	527071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_527099_528391_528471_528768
885970	contig_9400_pilon	-	2357	7	Intergenic	novelGene_146581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_4	273.396385004143	12	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	115	519	135537	121567	FALSE	25	TGCCGACATAGTTTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRNN	158630	119728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
885971	contig_14871_pilon	-	2633	1	Intergenic	novelGene_63726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1289	1642	288819	288466	NA	25	TTGATTTTGCACTCAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMRSQRSLPTDCRCLGSSPRAGGGSGPPSSATAESSWLPGSATVAGGLTLVFPRQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	290107	287474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_287500_290100
885972	contig_5684_pilon	+	2628	4	Intergenic	novelGene_81052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	187.446584984155	89	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1411	1974	443906	447039	FALSE	35	TTTCTCTTTTCATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403601	447693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_442785_443891_443949_446518
885973	contig_9098_pilon	-	6024	4	Intergenic	novelGene_75773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1802	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	4419	4781	179494	179132	FALSE	30	TCAATTGCCTATGCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAFSSTGRSSGVLFWTCTGAILSCFCKCFDIVCCPRDIQWLFSSFIDCRFVCFILLFVLFGYIRARGLCVLCCLLIFGQDTFHLLLQWAGSVTHVWYSRAGPAEREVVGWVVCGTYQG	366696	177888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_179719_180441_181837_183161_184329_365064
885974	SIRV6	+	1471	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	2	64	2	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18529	36	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
885975	contig_19378_pilon	-	2865	2	Intergenic	novelGene_73775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATCCAAGTGACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18154	15245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16755_16798
885976	contig_5794_pilon	+	5190	12	Intergenic	novelGene_69784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.287479787288034	833	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGGAAGAGGCGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739282	749547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_742988_743224_743602_743693_743763_743854_743975_745131_745276_746054_746134_746225_746321_746402_746495_746807_747018_747096_747243_747328_747428_749493
885977	contig_13301_pilon	+	1404	9	Intergenic	novelGene_153121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	260.503718783437	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	33	746	169218	172251	TRUE	40	CTTTGAAGAAGGAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSGGSTVLNMTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPGPPGAPGSPARAPAMVDAMRLRRDEAAPVLHLSPPQSLLGSPAQGQPMSSGAALACHPVQWLEDGGHGALSAPVL	169185	174509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171595_171821_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173087_174281
885978	contig_9415_pilon	-	2316	6	Intergenic	novelGene_109934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	149.21206385544	67	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTAAAAATTGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2472719	2451472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2452132_2465531_2465660_2466910_2468220_2470587_2470634_2470916_2471067_2472695
885979	contig_6871_pilon	+	2063	2	Intergenic	novelGene_21538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1065	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	356	691	122965	123300	FALSE	55	AAAAAAAAACCCATGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLDGSFSPASKAPRWPQSHKGLSLKSEGSLVHPVLSSHPSLPHHSLLAFIIFAFSIRPQPQVETQQTAVKGLKWPLPPTPQLRTSGRQGLILSSLCPQVFGACGQKMFVE	121892	124672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_122184_122900
885980	contig_5988_pilon	+	1907	2	Intergenic	novelGene_16130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_1	0	142	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGCAAGCCTCACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560211	1569278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1560469_1567628
885981	contig_7593_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_127258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3813	1874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_1900_3800
885983	contig_5954_pilon	+	1042	9	Intergenic	novelGene_28531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	250.924166831336	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	180	1004	465084	468827	FALSE	60	GGAAATTATAAAGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVPTYKWKRQVTQRNPVAQKKRKMSLLFDHLEPMELAEHLTYLEYRSFCKILFQDYHSFVTHGCTVDNPVLERFISLFNSVSQWVQLMILSKPTAPQRALVITHFVHVAEKLLQLQNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHVSPETVKVIE	463841	468865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463952_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893_467026_467808_467960_468149_468324_468497_468615_468815
885984	contig_7963_pilon	-	2484	12	Intergenic	novelGene_58591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1933	2274	264139	261060	TRUE	10	TCTTCGGTCAGGCGCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYSPTTFTRLRKSTLAFKGSQRLIKVVSELSREFSSPVLISWKKPRSWRSREEKSSSRIRKLILDMVKRKEPPRQPADSELPKEKKHMKKMALVKASGSKSPPRMSITRPE	270589	259855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_259890_260794_260952_261040_261154_263627_263758_264021_264228_265073_265273_265462_265594_267797_267985_268168_268343_268534_268695_269100_269239_269734
885985	contig_11978_pilon	+	1663	2	Intergenic	novelGene_63038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTACCTGCTGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1647854	1649707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1649008_1649197
885986	contig_12644_pilon	-	1935	7	Intergenic	novelGene_44447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTTTGCTCTCTCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376351	335370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_335428_367593_367742_367992_368107_370694_370898_372111_372210_374739_374805_375101
885987	contig_14522_pilon	-	2347	7	Intergenic	novelGene_147313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	287.421535186369	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	162	971	146829	66449	FALSE	25	ACTTATTATTTGACTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHEGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	167565	65072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_167453
885988	contig_10323_pilon	-	2334	5	Intergenic	novelGene_123547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	327	junction_1	64.901848972121	23	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGACTCCCCGTCTGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280492	267179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_277887_277921_278700_278759_279648
885989	contig_12019_pilon	+	646	3	Intergenic	novelGene_87679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTCTTTCCTGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5158	8673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5368_6163_6226_8298
885990	contig_8464_pilon	-	3811	6	Intergenic	novelGene_125365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAAGCAGCTAGACAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628439	457966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_458262_520977_522631_522804_523791_524224_524640_525176_525428_628228
885991	contig_854_pilon	+	2637	9	Intergenic	novelGene_36677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3489.03449888003	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	29	1210	1700894	1714980	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQALDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1700865	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702652_1711815_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
885992	contig_9543_pilon	+	6483	4	Intergenic	novelGene_175314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	771	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1515	1835	270013	270333	TRUE	20	TGCACGGATTACTGACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIKWSIQQDDITIINIYTPNDGAPKYIKQTLTAWKREIDSSTIVVGNFNRPLSVKDGTSRKKLNKDTEDLNGTINQLDLMIYTEHSTQQQPSILSFPTHMEVSPE	268498	408045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9543_pilon_+_272029_272067_272787_341765_342380_406425
885993	contig_12414_pilon	-	3780	1	Intergenic	novelGene_59592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1955	2287	374006	373674	NA	15	TCACGGGGTTTGAACCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	375960	372180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_372200_376000
885994	contig_15666_pilon	-	2117	5	Intergenic	novelGene_70207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_2	88.2365428833202	8	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	722	1441	132068	129088	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132789	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130515_130795_131446_131711_132007
885996	contig_8377_pilon	+	7671	16	Intergenic	novelGene_35126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2958.73221648883	65	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	1293	2306	176583	185837	TRUE	10	TTGGTGGATTCTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQVITVQQ	175290	199242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_187965_188204_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194419_196089_196218_197663
885997	contig_15087_pilon	-	2568	27	Intergenic	novelGene_37206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_19	859.666796776105	2038	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	912	2045	143049	113497	TRUE	30	TGTAAAATGAGTGACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181166	110648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146302_146365_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
885998	contig_5423_pilon	-	2716	1	Intergenic	novelGene_85221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTGAAAGACAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400004	397288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_397300_4e+05
885999	contig_854_pilon	+	1194	2	Intergenic	novelGene_36655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCGTGTGTCCCGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1698917	1716406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1698950_1715244
886000	contig_10331_pilon	+	1597	2	Intergenic	novelGene_54211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	390	983	1188709	1189302	FALSE	30	ACATTGGTGACTGTATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVEHEQREATAKEKAPPPAHRGPADSLSVAAGAAELGPEGTSKGRGPSEQDWVNRPKTVRDTLLALHQHGHSGPFENKFKKEPALTAVARTARKRKPSPEPEGEVGPPKINGEAQPWLSTSTEGLKIPMTPTSSFVSPPPPTASPHSNRTTPPEAAQNGQSPMAALILVADNAGGSHASKDANQVHSTTRRNSSSPPSPSSMNQRRLGPRDVGGQGAGSTGGLEPVHPASLPDSSLAASAPLCCTLCHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRQSIKQQGASGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDS	1187655	1189916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1187923_1188586
886001	contig_14559_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_83715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	105.095855717002	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	256	828	286587	277429	TRUE	20	CTTAGAATTATTCCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQKKEKQLSNFKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDISSQCLPQKDLYATEEEADTLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKNPGEQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEPKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKKSGADSAARTKSRKARCAPFSLL	354685	228989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_229519_230384_230448_249375_249526_251347_251496_277371_277975_286560_286617_354459
886002	contig_5302_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_81512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	315	junction_1	0	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1158	1490	1384168	1383630	FALSE	15	CTTTAAGTTGTCAGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVIKAKEIEAKIKELINICSPIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID	1385325	1383590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1383834_1384039
886003	contig_19722_pilon	+	4285	9	Intergenic	novelGene_171893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	67	junction_1	67.9916125341942	610	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	143	1396	68446	90122	FALSE	25	GATGGCACAGGACCGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVSGSRTPEGEASGSGGKRRSRSRSPKPSRAARSPRGHHSRSHSCSRSGDRNGLSHQLGSLSQSSRNQPYRSRSRSRSRERPSGPRGTPFASASSSAYYGGYSRPYGGDKPWPSLLDKEREESLRQKRLSERERIGELGAPEVWGLSPKNPEPDSDEHTPVEDEEPKKSTTSASTSEEEKKKKKKSSRSKERLKKRRKKKSSKRKHKKYSDDSDSDSDSETDSSDEDTKRRTKKAKKKEKKKKHRSKKYKKKKSKKSRKESSDSSSKDSQEEFLENPWKDRSKPEEPSDLIGPEAPKTLASQDDKPLNYGHALLPGEGAAMAEYVKAGKRIPRRGEIGLTSEEIASFECSGYVMSGSRHRRMEAVRLRKENQIYSADEKRALASFNQEERRKRENKILASFREMVYRKTKGKDDK	68303	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_68832_75202_75284_76545_76617_76801_76943_81717_81782_83617_83728_83824_83901_85074_85225_89947
886004	contig_2069_pilon	-	4290	8	Intergenic	novelGene_23306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	563	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCATTCCAGCTCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524683	504405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_504453_510937_511071_511588_511742_514126_514247_515264_515396_518069_518225_520107_520622_521646
886005	contig_1982_pilon	-	1188	1	Intergenic	novelGene_151335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTCAAAGCAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361975	360787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_360800_362000
886006	contig_6576_pilon	+	3055	3	Intergenic	novelGene_42409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	2365	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	90	1436	1301228	1302574	TRUE	20	CAGAGAAGTTTCCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295687	1304279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303519_1303604
886007	contig_9366_pilon	-	1944	2	Intergenic	novelGene_166270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1414	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAATAATTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044175	1038824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1039056_1042462
886008	contig_7530_pilon	+	1310	7	Intergenic	novelGene_141842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1328	junction_6	327.10327964659	915	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	30	818	246195	300561	TRUE	20	GACTGATTGGAATTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRATESGKRMDCPALPPGWKKEEVIRKSGLSAGKSDVYYFSPSGKKFRSKPQLARYLGNTVDLSSFDFRTGKMMPSKLQKNKQRLRNDPLNQNKGKPDLNTTLPIRQTASIFKQPVTKVTNHPSNKVKSDPQRMNEQPRQLFWEKRLQGLSASDVTEQIIKTMELPKGLQGVGPGSNDETLLSAVASALHTSSAPITGQVSAAVEKNPAVWLNTSQPLCKAFIVTDEDIRKQEERVQQVRKKLEEALMADILSRAADTEEMDLEMDSGDEA	246165	304583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_246290_261016_261177_276342_276481_293747_293839_295176_295355_300434_300574_304103
886009	contig_8576_pilon	+	2908	9	Intergenic	novelGene_88791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.968688961172	1559	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	128	1384	902723	915551	FALSE	10	CAAGGTGGCTTTCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINSNGGGCSSRNNSHTISSRSGSGGGGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893604	917075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893692_893770_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
886010	contig_5083_pilon	-	2916	2	Intergenic	novelGene_151704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1830	2468	1646782	1646144	FALSE	20	TCATGGCCCAGCCGAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHTIKK	1651213	1645695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1647895_1650496
886011	contig_20314_pilon	+	2055	7	Intergenic	novelGene_125629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	10	TTCTACTTGGAGTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	25529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
886012	contig_5649_pilon	+	3028	1	Intergenic	novelGene_82446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	376	855	1501980	1502459	NA	10	CTTTCTGGCCAGGCGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVQVGVQNKTPDDFPVEENALELSDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDEFMENTDKKLEDFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKTNNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIKDKHLATTLFQENSEKRKTKRP	1501604	1504632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1501600_1504600
886013	contig_9113_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_68611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTCCAGCTTAAAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420460	422380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_420500_422400
886014	contig_15888_pilon	-	2431	10	Intergenic	novelGene_84394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_6	381.297233463493	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	323	1120	41896	37821	FALSE	15	TTTGTACCTTTTCTGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYAEPVSAQHAKLSLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGAPGIISASPYAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKVLFNKKENALVQMADGSQAQLAMSHLNGHKLHGKPVRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSISEDDLKILFSSNGGMVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	42428	36509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_37954_38033_38112_38504_38722_38798_38892_39322_39357_40759_40909_41509_41588_41880_42056_42149_42261_42376
886015	contig_10404_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_138696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAACAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137663	1135049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1135000_1137700
886016	contig_12689_pilon	-	2989	5	Intergenic	novelGene_145033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	241.129114791226	1262	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	59	352	46610	43339	TRUE	40	AAGTTCCCTAATAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRWRKALRGKENKGSVEIMRKDLNDARDLHGQAESAAAVWKGHVMDRRKKALTDYKKLRAFFVEEEEHFLQEAEKAEEPPEDEGADPAERFRTLLQAVSELEKKHRDLGLSMLLQ	48470	40615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_42151_42236_43342_44216_44439_46541_46635_48436
886017	contig_5686_pilon	+	10842	16	Intergenic	novelGene_45237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1774.50820229155	1685	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	58	1314	93843	208515	TRUE	35	GATGACCTTCTGTAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAACPHRMRAQMTLAQHLPEAPRQKAKSRSHTWRNTQSIRKLPWLRLRPANSPQVLGPTACSWKITLLRLFCKHPMRPLNSSLWNWTLLKATSQSSWSRD	93785	228125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200484_208216_208722_211283_215475_219533_222917_224043_224203_226536
886018	contig_10103_pilon	+	3695	9	Intergenic	novelGene_86167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAGAGAAGAGGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648584	657001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_651475_651637_651738_653442_653647_654456_654569_654693_654772_655131_655243_655979_656052_656151_656223_656944
886019	contig_20199_pilon	-	504	4	Intergenic	novelGene_82567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	79	junction_3	218.882515417645	8638	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44198	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_42110_42171_43906_43951_44118
886020	contig_8464_pilon	+	1826	4	Intergenic	novelGene_125381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_3	53.3062431198781	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	949	1419	797915	804080	FALSE	20	TGTATTAAAGCTTTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGSFRGRTADFVFMFLFGGFLMTLFGLFVSLVFLGQAFTIMLVYVWSRRNPYVRMNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	796966	804487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_797993_798725_798922_799187_799279_803974
886021	contig_3866_pilon	+	1153	7	Intergenic	novelGene_112376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	111.847614587388	557	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	188	382	101747	126621	TRUE	25	AATGCACAATCCTTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDFKQISHYCNESASKGLCAICHRSPTCCLSSSGSGACPDPGPPPPDSTGSVAPPASYWCRMREPMLKYFLLNHLQVRTQAIPGDIQEKVGQPLFQNRKETHASEKVTNNHTKRIWLHKYQNLIR	101223	128928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_101243_101578_101767_103302_103328_104947_105038_126561_126627_127157_127254_128258
886022	contig_7009_pilon	-	1967	4	Intergenic	novelGene_23664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCCACATTTGTGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538481	518017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_518116_522864_523001_536324_536671_537094
886023	contig_8544_pilon	+	602	6	Intergenic	novelGene_55921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	461	junction_5	213.633892442187	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	226	600	90532	120355	FALSE	25	TGAGTTTTAAACATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQ	83414	120357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523_92618_120265
886024	contig_11720_pilon	+	1338	11	Intergenic	novelGene_43825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2297.89230382975	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	158	1054	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67931	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67939_68078_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
886025	contig_13863_pilon	-	3350	2	Intergenic	novelGene_42102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTCATCTGCAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490595	486686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_488996_489554
886026	contig_7963_pilon	-	533	4	Intergenic	novelGene_58328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1355.14041912842	151	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGTTGTTGTCTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48893	38329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_48728
886027	contig_9363_pilon	-	4321	25	Intergenic	novelGene_6775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	358.495806189634	5	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	986	2961	187	3147	1548961	1506537	FALSE	20	TGCCTGCATATATCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHQPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1549147	1505362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509668_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544730_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
886028	contig_1715_pilon	+	6266	7	Intergenic	novelGene_127198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2740	3279	548464	549003	TRUE	70	TAAATTAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKNLHEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQTQQLEIQKINNEISEMDNVRKGLRSRSEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRKKKNEETLRVKWDTIKSKNRRVIGIPEQGEKTKNTQRITEELLTENFPNIMKDKKLAIQEVQRTPHRRDPKRKSPRHIIHNHQNQGQTKNPESSL	424267	655756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_425417_465825_465917_472633_472964_547294_549285_649849_650583_653732_655295_655345
886029	contig_7356_pilon	-	2717	16	Intergenic	novelGene_60407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	382.720693050283	10	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	733	1983	489008	473420	TRUE	30	GTTGACACATAATTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EESIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTPQKTKPVRPAVDLGRDKLLRPPLEKWKRQDDRDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGSAFT	492234	462760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_463448_473372_473437_475963_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811
886030	contig_3077_pilon	+	6132	3	Intergenic	novelGene_26716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4785	junction_2	1670.5	278	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	2732	3526	12841	15480	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSKAHVLSKMPWVGPVSPCPPRAGQTQAPDPQASERLPGGQGPSLLVLSTLRGDFGPRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVSAWKGRELGGGPRDLPCSHTTHLLLSTILQGRGYEAHSEMAHSETEAQSLCILHGSPSKGGYTSIKDQDIS	10109	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13171_13863_13986_15137
886032	contig_20641_pilon	+	4316	4	Intergenic	novelGene_52801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_3	2047.09566622243	1201	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	64	408	14599	25978	TRUE	15	AGTAGGTTTTGGCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKVTTNNRSE	14535	30749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_25951_25997_26859
886033	contig_6914_pilon	+	3695	8	Intergenic	novelGene_151708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	96.532747959288	1731	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	221	964	13603	17589	TRUE	40	GAAAACAAACACTTCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEEPRRKIPLVPENLLKKRKAYQALKATQAKQALLEKKKQRKGKGLRFKRLESFLLDSRRQQRDRVRIRRLKVKPHGLEVPDGHSLAFAVRIQRINGVSGLVRKTIARLRLRKIFSGVFVKVTPVTLKVLRTVEPYVTWGFPNLKSVRELILKRGQAKVKNKTIPLTDNTVIEEHLGKFGVICLEDLIHEIAFPGKYFQVISQFLCPFYLSVARHATKNKVGFLKEMGLPGYRGESINQLIRQLN	13382	21801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_13617_14238_14348_15166_15331_16344_16483_17103_17214_17380_17596_18757_20931_21249
886035	contig_18364_pilon	+	7976	24	Intergenic	novelGene_102550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	620.995164497215	2268	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1149	3450	2277	5726	31533	50216	FALSE	45	ATATCTAAAATTTTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNARTYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEFVDFYYIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	16496	52466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_31590_32506_32678_35655_35894_36637_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41726_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43637_45143_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
886036	contig_34_pilon	-	6465	4	Intergenic	novelGene_39997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	819.327095175601	15	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	5680	6195	212564	212049	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	220436	211778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_213048_214057_214152_215288_219047_219092
886037	contig_14220_pilon	-	6768	17	Intergenic	novelGene_159844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	438.700170781537	682	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	140	1783	422880	291907	TRUE	15	TAATTTGGGTAGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVVTHSPRLIPPPQPQPPPPPPPPPQQQPIRSLFQQQQLQPLLPLQHPHHPSPPQGMHMPPQIETPRIMMTPPPVTPQQPKNIHINPHFKGTVVTPVQVPLLPLPSQPRPAVGPQRFPGPPEFPQHAPGPVPIASSIATSTSASASASTAATSASAAAAPASATASSAPTPAPAPTSAPTPTTTSAATSTSSPASASSPAAASAAAPASTSTPAASASPPPFRSSSTSDAHVSATV	423019	236362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_239854_240208_240298_258796_258986_264796_265004_285295_285941_289287_289576_291830_292221_294332_294376_313693_313753_319547_319834_325916_326126_331917_332090_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
886038	contig_14643_pilon	-	1495	5	Intergenic	novelGene_99138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	364.157932770934	41	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	757	1086	122125	111914	FALSE	80	TAAAAAAAAAACAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTRARLLMDSLSPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGDAPPQLEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGKFGCCYAFYNAYY	167707	111504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_112038_114366_114513_122065_122321_167027_167439_167557
886039	contig_6795_pilon	+	4678	2	Intergenic	novelGene_27678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1427	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTAGACCTAACAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67333	91079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_68032_87099
886040	contig_2703_pilon	+	2176	14	Intergenic	novelGene_101700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1013.1918806338	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	720	1313	602068	610870	FALSE	70	GGCAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526166	611733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
886041	contig_20199_pilon	-	820	3	Intergenic	novelGene_82521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42501	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_42427
886042	contig_10549_pilon	+	6416	3	Intergenic	novelGene_110602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1227	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1803	2186	148596	148979	TRUE	30	TAAGCTTTTAAGACCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKRRKQNKETKKTQKTKTRKKKWPQGCLSVSAQSKGVSPKPRSTTRPEGAPKPRKEKENNQTNKSKQDKLEQTNRQKAPGGPTSVVAQAGKQFHRKKQRWLQSQVFERREGEVVRGKKEI	146793	323363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_152236_292376_292638_322650
886043	contig_5400_pilon	-	2235	2	Intergenic	novelGene_162827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	726	1322	271258	268944	FALSE	35	CAGATACAGGGGAATACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRCLEPSGNGAEGTRSQWGTVESAEEPPPEAARLATALRELSQTGWYWGNMTVNEAKEKLKETPEGTFLIRDSSHSDYLLTISVKTSAGPTNLRIEYQDGKFRLDSIICVKSKLKQFHSVVHLIDYYVQMCKDKGTGSEAPRNGTVHLYLTKPLYTSAPSLQHLCRLTINKCTGTIWGLPLPTRLKDYLEEYKFQV	271983	268030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_269402_271119
886044	contig_9871_pilon	+	3040	4	Intergenic	novelGene_75685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_1	251.224998756095	3420	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2001	2672	535375	540638	FALSE	25	TATACTTTCTTCATAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFFLVCFFLLLSFNIGHVSPFFFHPLVCNQLLHSTKAGHRLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKS	533374	541006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_535501_537743_537936_539747_539984_540520
886046	contig_17074_pilon	+	2974	5	Intergenic	novelGene_145104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	249.626095390686	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	151	558	208015	224041	FALSE	60	TTAGACAGAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESSLITC	207864	226457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_224025
886047	contig_4180_pilon	+	1236	6	Intergenic	novelGene_8343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1690.80009462976	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	121	657	875200	888134	FALSE	5	GCTTTGGAGCCGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865710	888713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865825_875193_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
886048	contig_5623_pilon	-	4458	15	Intergenic	novelGene_154799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	353.108123580831	317	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	341	1903	220970	207631	FALSE	25	CAGCCAGTCTCCCCAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	280010	205075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212463_220891_221000_239340_239459_279817
886049	contig_15327_pilon	-	2681	2	Intergenic	novelGene_70755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAGAGAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074796	1071852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1071942_1072204
886050	contig_651_pilon	+	8030	11	Intergenic	novelGene_178465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	420	188	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5175	5480	225313	225618	TRUE	40	ACAGCAAGGCTAGCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQEDITIINIYTPNDRAPTYIKQTLTSLKREIDSSTIIVGDFNTPLSLKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYTTLDLTAAKYTFFSNDMERSPE	3714	304790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_651_pilon_+_4698_5405_5663_9462_9727_24800_26690_209987_209992_213351_213619_221634_222231_222453_222604_224548_226240_292130_292904_303634
886051	contig_960_pilon	+	3784	3	Intergenic	novelGene_108322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5	87	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCCAGCTGGATTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1058352	1065180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1058906_1060221_1062436_1064163
886052	contig_3386_pilon	-	3374	6	Intergenic	novelGene_34505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_3	807.517826428618	60	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	115	489	409604	406808	TRUE	15	ACAGTCTTGTGGTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRVTIMSLLTTL	412208	403522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_406842_407702_407838_409398_409607_412096
886053	contig_7816_pilon	-	2614	18	Intergenic	novelGene_66535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_17	194.586154765177	2691	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	103	2130	260356	246154	FALSE	15	GTCTAGCTGTCGGGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFLRIAFNSYELGSLQAMDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSSFDAHIYEGRVIQIVLMRAAEDPMSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKLSIRGEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKEFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTMFQKERFNIDMPHRFKVYNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCADCGMNVHHKCQKKVANLCGINQKLLAEALNQVSQRSSRRSDSGSSEPVGIYQSFEKKPGVSGDDGPDNGTYGKIWEGSTRCTIENFTFHKVLGKGSFGKVLLAELKGKREFFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLALAWENPFLTHLFCTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEILCGLQFLHSRGIIYRDLKLDNVMLDQDGHIKIADFGMCKENVFGENRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYSFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFERDPSRRLGVTGNIKIHPFFKTINWTLLEKRQMEPPFKPKVKSPGDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQTAFAGFSFVNPKFEHLLEK	273787	245669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_246313_249177_249307_249945_250135_250283_250423_251947_252011_252582_252675_252987_253162_253381_253480_253687_253785_254312_254414_255134_255265_255541_255628_256796_256829_256931_257095_257278_257340_258951_259152_260241_260376_273704
886054	contig_4686_pilon	+	2494	2	Intergenic	novelGene_118573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	25	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	910	1209	772963	773262	FALSE	15	TTTCTTCCTAACTCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESTVAATVSVHLAEVFLFSLTLHFTKHDVLLQGLVSPDNMSKVQEMMILTFKEHSGCTSSKKYLFILLADYAIFSILRQYHTTKASILWSSLLIIQL	743313	774547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_743671_772410
886055	contig_9733_pilon	-	2361	6	Intergenic	novelGene_160570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1817	2170	10934	7648	TRUE	40	GAGAGGAAGGTAGTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLAKLISERTDVLAGMAACSERLVSLMNSCFLESRFSSNSAAAFSSANTTLPLLLLFLDLRSLTSGSVLPGEKSSSCSAFGVLGAANSRLNLSKVGLLGVLHSEFMEREMMDICR	15332	6553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_-_6693_7595_7725_9173_9343_10826_10945_12530_12677_13672
886056	contig_8254_pilon	-	3191	2	Intergenic	novelGene_48393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	393	827	131448	131014	TRUE	35	AACCTCCTCAACCATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIELFSENVELAASASVFLYNAFPWIGILPFGKHQQLFRNAAVVYDFLSGLIEKASVNRKPQLPQHFVDAYLDEIDQGKNDPSSTFSKENLIFSVGELIIAGTETTASVLQWAVLFMALYPNIQGADLLDDLRFCPYMEGSYMF	131840	101463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_101490_128675
886057	contig_14287_pilon	+	4193	2	Intergenic	novelGene_24041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	270	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1637	2014	22217	22594	TRUE	40	TAGATGAGAATTTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCILFLMFDEFLMHLTVVSTRLAVFRSTAFTTPSQWPVDKSLLALDFADNLFECSTMLVETLVIAAAVPSPIPVAESDRLTPAVTGARAKPRMVRTPEKALTELATTQEMVQSLCVLSTLSARA	20580	27843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_22753_25822
886058	contig_12923_pilon	+	6036	22	Intergenic	novelGene_30171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_17	193.638745396733	68458	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	1238	2518	311762	348947	TRUE	35	GACGATACCCAGCATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRIGWFPSNYVEEDYSEYC	310269	495438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_310331_310486_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893_349522_350435_352350_466085_466879_481149_481296_491267_491299_495378
886059	contig_15025_pilon	-	4359	13	Intergenic	novelGene_155961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	260.577830130569	1685	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	179	2734	48018	6107	FALSE	40	AAAAACAGGAGGACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCEKWSRVAEMFLFFEDLEEDYKIRCLCTRAFVEDRILCNLGLKGYYVKGNSNNAANMLSIGDQTTEEEGGDLSRGSAETHGSKDIVLDESELDSEAELMRSMGLPLQFGGTSMHKNFEVSMNAKNKVKRKKKKHQKKYLDEIMRESWREEYDEDDILASEGPSSVEQYENTRTCKIQSGKDVETENLPVENTLSLKLEITEKWEKYWNEYGGGLLWQSWQEKHTGQTLSSEPWNFPDTKEEWEQHYSQLYWYYLEQFQYWEAQGWTFDASQSCDTDTCESQTEVDSNSDENCVKVDLISFPSSSVTISNKSSSSSDKDHNEILDRICNIILNSEEVEQNQLESSENHDGLQELSEVSSRRECPASGQSEPCDGGTKKSNMTRTRNTNPPAQDSQESSGANTSKERPHTNDIDGDESEEDPPECKPTKLKRSHELDIDENPHSDFDENGCLLGFKHGSGQKYGGISSISHRRVKYLEKNMKRKSKFLDLRRRIDTKNKQIFTEESEKQFCKKSKTLSKVEKFLKWVNEQMDEETSKESFSHNDTQDTCTSSGSEEQVSVTQGDSPFETSNREPDKCHTVYSPGEFETEKNGDSVVATVTEEQEKPDSLQVENEAETKKKKKKNKNKKVNSLPPEIAAVPELAKYWAQRYRLFSRFDDGIKLDREGWFSVTPEKIAEHIAGRVSESFKCDVVVDAFCGVGGNTIQFALTKKKVIAIDIDPVKIDLARNNAEVYGVADNIEFICGDFLLLASHLKADVVFLSPPWGGPDYATAETFDIRTMMSPDGFEIFRLSQKITNNIVYFLPRNADIDQVASLAGPGGEVEIEQNFLNNKLKTITAYFGDLIRRSASET	48196	4481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_6230_18702_18782_19683_19901_23078_23223_25592_25743_29155_29442_32002_32175_34737_34825_36289_36408_38284_39105_39446_39638_41248_41314_47914
886060	contig_2710_pilon	-	4279	2	Intergenic	novelGene_161771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTCTCAAGGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065714	875707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_877153_1062880
886061	contig_10930_pilon	-	1744	3	Intergenic	novelGene_36991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3254	junction_1	492.5	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	47	736	274277	268388	FALSE	25	TAAATCACTTACTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	274323	267379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950
886062	contig_15991_pilon	-	1380	6	Intergenic	novelGene_70902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_5	2467.64060592299	225	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	81	986	105108	100770	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTGVYLCGSLVVCVCVVPFWCVSVWFPSGVCQDSSVPSL	106362	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
886063	contig_3155_pilon	+	1571	5	Intergenic	novelGene_26393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	48	554	258156	261211	TRUE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258108	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261483_261782
886064	contig_19032_pilon	-	1886	11	Intergenic	novelGene_172543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	718	junction_1	822.940951709173	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	27	1568	162634	157239	FALSE	20	CCTGGTGTCTTTTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	162660	156920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553
886065	contig_8885_pilon	+	4699	4	Intergenic	novelGene_115593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGGGATCCCACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363921	369468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_367319_367900_368053_368155_369215_369377
886066	contig_34_pilon	+	947	1	Intergenic	novelGene_39985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGAACTGGGTTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211189	212136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_211200_212100
886067	contig_854_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_36284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCTCAAGGCGCGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563800	543568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562362_563302
886068	contig_5095_pilon	-	5371	5	Intergenic	novelGene_74946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	158	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	178	348	233083	232913	TRUE	50	GGTAATTAAAAAACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFVIPHKYNAKYVSCLPKRIINLWVLCLTVFISCCFSHSKNRNKKTVANESILTHGDSMCYRVELLHRVFMTMTFWKQIFSFKVPLDGFELPTFRLGVKCLTVSATQGLLLSQQ	233260	190175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_192222_192617_194348_227304_227668_228081_228208_232154
886070	contig_10867_pilon	-	2397	5	Intergenic	novelGene_159440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3857	junction_4	1100.77359161637	1065	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	201	605	88670	87074	FALSE	40	AGAACTGTGCTAACACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQVSA	91617	85281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_91429
886071	contig_4385_pilon	-	2540	9	Intergenic	novelGene_141512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	52.4891357806546	614	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	61	933	444516	438211	TRUE	30	CCTGAGGTAGGTTATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALRVLLPRVRGLLRPWAGYSALRSFASGANFEYIITEKKGQSSNVGLIRLNRPKALNALCSGLMAELNQALEAFEGDPAMGAIVLTGGEKAFAAGADIKEMQNQTFQNCYSGRFLSHWDRVAHVKKPVIAAVNGYALGGGCELAMMCDIIYAGEKAQFGQPEILIGTIPGAGGTQRLTRAVGKSLAMEMILTGDRISAQEAKQAGLVSKVFPVETLVEEAIKCAEKIANNSKIVVAMAKESVNAAFEMTLTEGNKLEKKLFYSTFATDDQKEGMTAFVEKRKASFKDQ	444576	436433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_437352_437521_438277_439115_439184_440177_440298_440791_440897_441613_441714_442388_442517_442918_443117_444428
886072	contig_8045_pilon	+	2111	5	Intergenic	novelGene_35351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1292.62571922425	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTACAGATCATCAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	119204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116144_116246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
886073	contig_2069_pilon	+	2645	10	Intergenic	novelGene_23295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	858.904398307576	103	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	388	1803	504404	521807	TRUE	10	GCCACCTCTGGTGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNITLANVIRQLGSLSKYAEDIFGELFTQANTFASRVSSLAERVDRLQVKVTQLDPKEEEVSLQGINTRKAFRSSTIQDQKLFDRNSLPVPVLETYNTCDTPPPLNNLSPYRDDGKEALKFYTDPSYFFDLWKEKMLQDTKDIMKEKRKHRKEKKENPNRGNVNPRKIKTRKEEWEKMKMGQEFVESKEKLGPSGYPPNLVYQNGSIGSVENMDAGGYPPPPPQSDSTSPPSPSFSEDNLPPPPAEFSYSADNQRGSGLAGPKRSSVVSPSHPPPAPPMGSLPGPKPGFAPPPAPPPPPPMIGAPPPPPPAGFGTPGTPPPPSPPSFPPHPDFAAPPPPPPPPAVDYPTLPPPPLSQPAGGAPPPPPPPPPPGPPPPPFSGADGQPAMPPPLSDAPKPKSSLPPVSDARSDLLSAIRQGFQLRRVEEQREQEKRDVVGNDVATILSRRIAVEYSDSEDDSSEFDEDDWSD	452835	525752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_453099_504279_504453_510937_511073_511590_511745_514129_514248_515265_515397_518070_518230_520112_520625_521649_521999_525101
886074	contig_10734_pilon	-	1873	7	Intergenic	novelGene_51156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	68.0334884858593	743	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	314	772	957719	949859	FALSE	45	GTGCATATATTTAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDVAKCRQWLEKNFPKEFAKLTVENSPKQEAGISEGQGTVGEEEEKKKQKRGGRGQIKQKKKTVPQKVTIAKIPRAKKKYVTRVCGLATFEIDLKEAQRFFAQKFSCGASVTGEDEIIIQGDFTDDIIDVIQEKWPEVDDDSIEDLGEVKK	965506	948757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_949904_950011_950152_952711_952829_955443_955528_957646_957742_964455_964575_965334
886075	contig_7612_pilon	+	5871	6	Intergenic	novelGene_170366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	73.2977489422424	1556	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	188	1963	214422	217534	FALSE	15	AACTTTATCTTTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENFQNLASLAGYPLHIPHLISQWEQEDLKIVKRGLIQDTCTGEHQEGFETQLKTSESIAQQDIFGEKISKVRFKRNDSWSSNLHENQEFHGIDYQNSDQERHLRSHVVKRIYECNEGNQYGQALSQIPNLNVVKKTTGVKPYECCECGKAFVDHSSLKSHIRSHTGSKPYQCEECGKAFHFLASFKKHVKTLIEEKPYECKECTKAFNCSSSFRTHVKSHTAKIKYECKECGKAFSCSSSLTEHKRIHSGDKPYECKECGKAFSCSSSLSKHKRIHSGDKPYECKVCGKAFSSSSHLIIHIRIHTGEKPYECKECGKAFSESSKLTVHVRTHTGEKPYKCKECGKAYNCPSSLSIHMRKHTGEKPYECLECGKAFYLPTSLNTHVKNQSREKPYECKECGKAFSCPSSFRAHVRDHTGKIQYECKECGKVFSRSSSLTEHLRTHSGEKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKKCGKGFIYPSALRIHMRTHTGEKPYECKECGKAFRHSSYLTVHARMHTGEKPFECLECGKAFSCPSSFRRHVRSHTGEKPYECKECGKAFVCPAYFRRHVKTHSRENI	208569	221442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_208588_208928_209005_214328_214456_215028_215140_215554_215727_216075
886076	contig_401_pilon	+	2042	9	Intergenic	novelGene_42819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1175	2058	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	60	1022	1711949	1715475	FALSE	30	ACTACCCACTACCCCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711889	1716495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419
886077	contig_4180_pilon	+	3640	6	Intergenic	novelGene_8365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	1670.1701230713	12	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2514	3095	870689	888134	FALSE	55	AAATCCTGGGCAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLLAVHGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	868175	888679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_870714_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
886078	contig_3935_pilon	+	5791	7	Intergenic	novelGene_178466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	127	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3553	4143	77738	84409	TRUE	5	AGTTGTTTTGTCTCCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMIPVGFKNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEKKIDKVMENKDKKLEEFTKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEILKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRINGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKENEETLRVMWDTMKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLRNC	57732	244839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3935_pilon_+_58563_58823_60238_76036_76444_76836_77834_83914_85125_204884_204912_243933
886079	contig_3975_pilon	-	4864	11	Intergenic	novelGene_54795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_10	267.122237936118	46	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	3568	4266	2018590	2016131	FALSE	10	TACTCTCCCGAGCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052476	2015532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
886080	contig_3818_pilon	+	1998	3	Intergenic	novelGene_99196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	7	junction_1	8	286	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	292	453	5932	9423	FALSE	30	ATACAGTTATATTCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIWSAALNGDLGRVKYFIQKAVDPSQPDAAGYTALHYASRNGHYAVCQFLLESGAKCDARTHGGATALHRASYCGHTEIARLLLSYGSDPQLVDGDGMTSLHKAAEKGHMDICSLLLQHSPALKAVRDQKARLACDLLPRNSDPQDLLAS	5257	10968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_5363_5745_5950_9279
886081	contig_12654_pilon	-	1012	9	Intergenic	novelGene_129326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	123.858538260388	8	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	172	948	827177	808478	FALSE	15	CTTTTACAGAGTCCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFLKSRWKRGGLLQQKRPLPPLRALSESSFCLRWCNFLPARAQSGGFRAVLESFASTMAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQDGKMALLASNSCFIRCNEAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKTDDIPEEDKGNIKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDNKILKKARKDGFLHETLLDRRAKLKADRYCK	827348	808413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_808515_809768_809880_810588_810681_812617_812723_815567_815683_816771_816830_817710_817837_823815_823887_827115
886082	contig_6445_pilon	+	4128	16	Intergenic	novelGene_77010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_15	801.940352450785	1022	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	253	1908	522296	670255	TRUE	15	GTTTCTGGACGATTTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEEYKYTSCKAFLSTLNEMNDYAGQHEVISENMTSQIMVELARYVQELKQERKSHFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRHQMAEDSKADYLSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRIGESMKTYAEVDRQVIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKSDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYAQPMKRTVSDNSLSNSRGESKQEHKPGGKSKGKLWPFIKKNKGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLTEVGQNIEKLRLEVQKFEAWLAEVEGRLPARSEQARRQSGMYDAQNPPSVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEVKVLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYMFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDEEGYVPTSYVEVYLDKNAKDS	522043	674044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_522320_579451_579568_597277_597335_598043_598192_613498_613562_613988_614094_635363_635493_636698_636846_644515_644714_656007_656118_661691_661825_663382_663505_663789_663927_665665_665825_670247_670285_671853
886083	contig_5286_pilon	+	8371	11	Intergenic	novelGene_157329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATCACAATTCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483886	567396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487678_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564485_564622
886084	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
886085	contig_17_pilon	-	5643	6	Intergenic	novelGene_173977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	2821	3441	538013	537098	TRUE	80	AGAAAAAAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKSNTSSQRMALIELPARARRIQAAGSPGSRDCSPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVAHPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGRRQRVASENPKEAEKEKREKKKKSNTYSLQTAPKEPPARSRGIQAAGSPGSRACGPGKQRSKRTKALGSNQCSSPDLEAVSRPNVAPQPRRKGPRRLSESGT	717603	353452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_354677_488273_488397_536242_537225_537519_539347_715660_716499_716954
886086	contig_12079_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_67526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	554	880	861691	861365	NA	35	AGTACAAACGTTAACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	862244	860602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_860600_862200
886087	contig_18843_pilon	+	5115	9	Intergenic	novelGene_165610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	647.191190839307	917	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	23	709	28527	38569	TRUE	20	ATCACAGTGTTGTTTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRVAVDKMSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSR	28504	47921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_40125_44191_46259_47137
886088	contig_9297_pilon	+	2358	9	Intergenic	novelGene_69879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	370.600842383015	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	131	2014	909195	912790	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQAMDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908981	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910565_910735_911101_911207_911446_911700_911869_912227
886089	contig_4857_pilon	-	2363	1	Intergenic	novelGene_48882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTCTCTCATACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401299	1398936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1398900_1401300
886090	contig_2414_pilon	+	923	2	Intergenic	novelGene_158474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	374	748	228489	230279	FALSE	25	TGAGAGTATGTAGCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	228115	230454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_228619_230034
886091	contig_9673_pilon	-	8570	5	Intergenic	novelGene_119179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	178	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2601	3197	178934	178338	TRUE	45	TATTAATATTTACAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKKHTMMVPASSPKESRNFPEEENILELPEVEYKRLIYRSLQEIRKEISQNPEQVEEHTDKATEALKKIREEHNDKFNRLQESTERHQTEIQRINNKISELDNSIDTHRSRIEGTEVRISETEDKALDTNLFEEKSDKRIKKNEQTLRIMGDSIKRNNLQVIGVREQRVDNRKHRENCCRFVSRKLP	271798	168221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_172902_173149_173550_178044_179561_192240_192974_270557
886092	contig_4110_pilon	+	5117	7	Intergenic	novelGene_177876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	133	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTTTGTTAATTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494492	522813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4110_pilon_+_494683_494979_496091_501537_502978_510446_510629_512585_513166_518713_518940_521425
886093	contig_366_pilon	-	4748	10	Intergenic	novelGene_51573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	524.456755976018	1158	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	504	1481	803057	757099	FALSE	30	CAAGTTTTGAGGACATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYESKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQMISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803560	753831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780185_802171_802279_802934
886094	contig_10134_pilon	-	2269	3	Intergenic	novelGene_16180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	536	38	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTTAGACTCTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39678	29372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30294_34949_35178_38558
886095	contig_8665_pilon	+	4748	5	Intergenic	novelGene_178252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1774	2160	65907	66293	TRUE	60	ACAAAAAAAACTCAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKIFCNILMLLILLRLALWPNMWSILENVPCAMEKKVYLAAVGWSVRCMSMRSSWLTVAFSSSMSLLSFFLDVLSFTESGMLKFPVTIVELCISLFSAVNFSVPLEFVLCILESCRWVCKYLL	64133	159565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8665_pilon_+_66550_143910_144334_153893_154127_154401_154472_157959
886096	contig_12635_pilon	-	1552	11	Intergenic	novelGene_60809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_10	466.927242726316	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	413	1525	227344	180251	FALSE	10	TTTGATGCTCATGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262813	180223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_261771_261979_262709
886097	contig_615_pilon	-	2671	1	Intergenic	novelGene_80039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1109	1438	10929	10600	NA	30	ATGGTCAATATGTAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLSNVYLCEGTPGCILAQLGISCIISSRGTFPSVFLPLPTSLALFLHSSDIFILLKIDELLKSTTKQDISDFTIAHSVTVLKLYTSFNPYDENFKNLFLPTLQEE	12037	9366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_9400_12000
886098	contig_15449_pilon	+	2839	14	Intergenic	novelGene_33580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	732.891695058957	25	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	164	1837	44312	54621	FALSE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27842	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_43216_43279_44279_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51932_54570
886099	contig_4125_pilon	-	1395	2	Intergenic	novelGene_25195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACACAAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385986	1384469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1385075_1385196
886100	contig_11316_pilon	+	1381	2	Intergenic	novelGene_122627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	186	698	137674	138186	FALSE	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137404	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137423_137506
886101	contig_10437_pilon	-	5033	2	Intergenic	novelGene_38109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1019	1573	80783	80229	TRUE	20	CCACCTGGCCTCCCAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	81801	76306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_78087_78548
886103	contig_233_pilon	-	2830	16	Intergenic	novelGene_14583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1335.34895314546	574	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	123	2390	126907	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127029	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108552_108747_108814_109914_109976_126898
886104	contig_5316_pilon	+	6212	10	Intergenic	novelGene_61207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_6	258.587378073187	2996	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	361	1758	453918	550408	FALSE	15	TTAGTGATGCAGTGTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	395999	554862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
886105	contig_9434_pilon	+	4277	25	Intergenic	novelGene_150473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_3	235.04830694396	23	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	1336	3966	85566	124169	FALSE	30	TTTCAATTTTATACTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEALAKLKEEEERQKREEEERIKRLEELEAKRKEEERLEQEKRERKKQKEKERKERLKKEGKLLTKSQREARARAEATLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKKKKKAQQLENKEVSEQIELSAAVEVVDQGAPDKEESAPPVDPEEEEETEDGGLDDWEAMASDEEREEEGTTVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEEEEESDEEEEEEGESEVSEGDEEGEKVSDDKDAGGTLDRRPSKDMSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKMKILPQFIFNSRDPIVIGVTVEAGQVKQGTPLCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDVAKKGQEVCVKIEPIPGESPKMYGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRDEMQKSDWQLIVELKKVFEII	51059	124480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_82476_82866_82999_83184_83870_85455_85674_86041_86193_92818_92915_93398_93489_94724_94800_96554_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683_118849_120465_120605_123554_123717_124061
886106	contig_6630_pilon	-	3694	14	Intergenic	novelGene_30697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_13	534.347425929641	1885	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	642	1955	374404	357618	FALSE	20	AGATGTTGCTTGGATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVLINLVMLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQAFYLVRHPNEISWPVASVIIALKLFGYIIFRCANSQKNAFRKNPTDPRLAHLKTIHTSTGKNLLVSGWWGFVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGFNHILPYFYVTYFTMLLIHREARDEHHCRKKYGLAWEKYCQRVPYRIFPYIY	384208	355878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358778_358860_360550_360720_364054_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379916_380096_384123
886107	contig_16125_pilon	-	5453	15	Intergenic	novelGene_155228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	868.365988391944	1480	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	36	1433	236934	151848	TRUE	5	TCCATCTGGGTGTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKT	236969	114524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_155553_155618_179440_179598_235796
886108	contig_16303_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_34129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59310	58165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_58200_59300
886109	contig_3077_pilon	+	4287	6	Intergenic	novelGene_26786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3160	3462	532548	532850	TRUE	55	CAACACTCAAAAAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDRNHNRRSWTELEKDVEQNSNSCTQKKTRFTGLTDWRKPESMAPGHHFSSVVKPLPKFTIQLGIGQPHKTKRD	394573	534297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_396266_396509_396935_447193_447230_531285_531487_531742_533420_534041
886110	contig_10126_pilon	+	1956	4	Intergenic	novelGene_105729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	304.055915910215	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	57	881	140715	185699	FALSE	15	ATGACCCCTTTGGGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSDTPVQTKPIFIVVGLVCALLVALLIAVLYLLRIRQKKAMWLVLLPSVTHSGKSQSSSASPGHLLGSAVLSRPNACLLICRMGRGKMKSLPTISHKHFRNLQGGEAEPGCCPHPFSALPYPSSLS	140658	186774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_140794_161932_162305_169472_169584_185436
886111	contig_1450_pilon	+	2760	3	Intergenic	novelGene_27431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	188	1138	422303	423253	TRUE	20	CCATGATGGTGAAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419723	425090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419902_422293_424696_424910
886113	contig_10446_pilon	-	3189	2	Intergenic	novelGene_162436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1339	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATCTTCTTAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164766	160523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_162479_163532
886114	contig_17274_pilon	-	1451	1	Intergenic	novelGene_26538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	203	505	135025	134723	NA	60	AAAGACAATGCATATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLHQTESRTTRWCLATTTHCPDMDHSRGSQTELEKNVEQNYNSDTKKDQIYWPERDWKNPESIAPRHPFRSVVKSLPRFTVQLGIGQPHKTKRN	135227	133776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_133800_135200
886115	contig_11978_pilon	-	3463	5	Intergenic	novelGene_63033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	943	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTGCTTGGGGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1649714	1625966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1626032_1633573_1633683_1644678_1644832_1645273_1645381_1646685
886116	contig_5649_pilon	+	2359	3	Intergenic	novelGene_82443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	709	1188	1501980	1502459	TRUE	45	CTCAACTGATGCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVQVGVQNKTPDDFPVEENALELSDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDEFMENTDKKLEDFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKTNNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIKDKHLATTLFQENSEKRKTKRP	1500048	1508818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1500378_1501600_1503546_1508733
886117	contig_854_pilon	+	4724	21	Intergenic	novelGene_36644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_2	3354.52181241977	895	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1082	3249	53	3301	1698226	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1697760	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
886118	contig_10605_pilon	+	5754	4	Intergenic	novelGene_178470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2968	3279	4044	6429	TRUE	20	TTTTGGTGAAGTCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFPRSCLRAEAVCKKKRGEKKKATPAAHKRHPRSRPPRRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQSLAHAADQTRKEPHTRTQPPQPHRKGQIQRWEPGT	898	24305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10605_pilon_+_2223_2400_4089_6162_6962_22362
886119	contig_13740_pilon	-	1590	11	Intergenic	novelGene_34683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	4001.14593710352	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	167	1072	161718	157474	TRUE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAGSRAEVLLAVLFLEQQQFSQQRQDESGSCSSAEISLISLGCGKSGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165407	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_161939_165263
886120	contig_7853_pilon	+	5178	2	Intergenic	novelGene_172638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46317	51770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_+_49198_49472
886121	contig_7056_pilon	-	2209	12	Intergenic	novelGene_43610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_9	828.472686173502	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	807	1466	725838	723226	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730735	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906_729063_730383
886122	contig_13004_pilon	+	2033	5	Intergenic	novelGene_112726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	335.388580604647	867	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	146	1021	922526	928299	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	922380	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
886123	contig_11038_pilon	+	2538	3	Intergenic	novelGene_165709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACTGTCTCTATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277484	296821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11038_pilon_+_278216_294803_295591_295801
886124	contig_4232_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_63267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	859	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAAACCGTCTCCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464690	463701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_463700_464700
886125	contig_17976_pilon	+	2746	5	Intergenic	novelGene_32479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	953.143844076014	3	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	242	1306	41843	47385	TRUE	25	GTTGGTTGAAGCCAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEETHAHTSTKSSRHTCAEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41601	48898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_45713_45762_46443_48612_48684
886126	contig_11702_pilon	+	3054	1	Intergenic	novelGene_141965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1509	1928	293413	293832	NA	65	GGGAAAAAAAAAAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGNRNTYPRLVGMQNGTATVENSVALPQKTENRTIKCPGHSTPRYIPQRLESRDSNRDLCTNVHCSTIHSSQKGETPSTPIHRRVDKQDVLHIYTEYYSASRRNEVLIHATAWMELGDIILSEISQSQKDKYCMTSLT	291904	294958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_291900_295000
886127	contig_6270_pilon	-	7454	1	Intergenic	novelGene_99882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	7052	7429	1075244	1074867	NA	30	TGATTTTGCCCCAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLYPDTLLKSSVSSNSFLVDSLGFSVYEIISSVNWDSFTSFLLIWMPFIACLIALARNSSTVLNKSGDKGHPCLVPVIKGDAFSLSPFRMMLAIGFVLMLFIMSRKFPSIPIFLRTFFIRNGC	1082295	1074841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1074800_1082300
886128	contig_1301_pilon	-	1929	14	Intergenic	novelGene_47305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_4	569.482033941588	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1833	96	1928	322831	268651	FALSE	45	GTAAGAAGACCAAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCRFLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENER	322926	268649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
886129	contig_12919_pilon	+	3969	2	Intergenic	novelGene_75903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1580	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACATCTGGTTTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733939	743738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_737737_743566
886130	contig_21007_pilon	+	1316	2	Intergenic	novelGene_161521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	TAAAAACTACGTATCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
886131	contig_8377_pilon	-	11556	1	Intergenic	novelGene_35061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2176	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3613	3936	113358	113035	NA	25	ATTCGGGGGAAGGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYSLGKQAILKENVTDMEVGQDLLVFLPNYSSKVHEFTNFRMLTELQQTFLGASLLGTNSYPRNTRQKSLTRKTETKIIRRRTWEKHRQCREDKKPKANWNSYPQE	116970	105414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_105400_117000
886132	contig_3601_pilon	+	5904	1	Intergenic	novelGene_132887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	909	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTTTATGTCCTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180147	186051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_180100_186100
886133	contig_5205_pilon	-	7165	4	Intergenic	novelGene_178471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	6254	6793	915	376	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	191530	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5205_pilon_-_2857_123989_124881_185820_185844_188132
886134	contig_6208_pilon	-	4789	19	Intergenic	novelGene_53015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	452.227180562498	1518	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	245	2659	513736	490249	TRUE	35	CTCCCAGGTCAAATAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPSRPDKKQRTVNIENSRHRKQEQKYPQPQPHKREGKWHKHGRTNGRHMAHLEIELGQFPFDPKY	532600	464416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_464510_468300_468410_469608_469740_473518_473661_477713_477764_478856_479070_479912_479983_486607_486820_488843_489025_489319_490439_492897_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
886135	contig_15114_pilon	-	5624	6	Intergenic	novelGene_121124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_5	147.427812844117	363	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	470	1513	123696	100551	FALSE	30	AAGGCTGTAAATCTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	124165	96439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580
886136	contig_18794_pilon	-	331	1	Intergenic	novelGene_54626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACAGCGCCTCTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64128	63797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_63800_64100
886137	contig_4604_pilon	+	3784	18	Intergenic	novelGene_19129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_1	1149.21963894928	35	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	544	2550	360296	379856	FALSE	25	CCACTAGCACCCAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339834	381090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
886138	contig_18511_pilon	-	4081	11	Intergenic	novelGene_126860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2363	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAGGAAACTGAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63418	35376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_35548_47346_47558_48080_48209_49185_49303_51676_51874_52222_52462_55272_55552_56903_57117_59149_59253_59751_59947_61190
886139	contig_2596_pilon	+	2770	2	Intergenic	novelGene_53482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	189	422	690204	690437	TRUE	60	AAAAAAAAAAAAGGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSLRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSDRT	690015	693670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_692153_693037
886140	contig_8616_pilon	+	1155	8	Intergenic	novelGene_72509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	225.019001465228	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	276	1064	337184	339244	FALSE	10	TACGCGCTTGACTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLMEHEDDPDVDEPLATPLGHVLGREPISSGQGGPEGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336908	339335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_337192_337275_337383_337467_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
886141	contig_6740_pilon	+	3498	2	Intergenic	novelGene_142669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGACCATGGTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577199	603119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_577207_599628
886142	contig_11427_pilon	+	3760	2	Intergenic	novelGene_78957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	298	junction_1	0	834	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	336	1385	55005	56054	FALSE	45	CTAATTATATTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQTSSPMYDYIDYSASEPCQKLDLKQIAAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLINCKKLKSMTDIYLLNLAISDLLFLLTLPFWAYHAANGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVVVLVSLPGIIFTRTQQEESHHICGPAFPVKWKNLHTIMRNILSLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLDLTTFQEFFGLDNCDSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYISVFFRKHIAKHLCKQCPVFYGETADRVSSTYTPSTGEQEVSAGL	49496	58429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_49821_54993
886143	contig_3161_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_84503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1495	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGATTTCTGTGTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348863	345839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_345800_348900
886144	contig_7056_pilon	-	2134	12	Intergenic	novelGene_43628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_8	791.522155289446	16	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	96	650	730480	725835	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGISKSLRAVELKLELTMIHLENLWPCSGQVPMTDLGLAEGITVLAEELALKG	731042	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
886145	contig_10437_pilon	-	4154	20	Intergenic	novelGene_38212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.8728757094831	584	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	187	1617	278628	235410	TRUE	25	GATGATGCTCTGGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRFLPIPFPPSRFLRIPCSSFSSFSFFPLPAEAGLGVVTAAVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRQFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELETWVKQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLHYRESSSEDEASRPTEIIEIPDEDDDVLSIDSGDAGNRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDVHKGTSSQVSGELSKDGDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKSLLSGNHIAYDHHPPPDKLYVGSRVVAKYKDGSQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDGYASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIEDISCRDFIEEYITAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEGTWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYRGSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQGGQLRTRPNMGAVRSKGPVVQYTQDLTSTGTQFKPVEPPQPAAPPAPPLSPQATDTDLESQLAQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSPPTSPDAVQQHRK	280298	231354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_231437_231669_231749_231945_232052_232160_232316_232508_234192_234335_234425_234684_234897_235278_235438_250750_250853_250940_251080_251796_251927_252623_252815_253701_253776_254383_254586_254730_254857_255775_255876_256317_256353_277602_277755_278476_278697_280180
886146	contig_2480_pilon	+	2286	2	Intergenic	novelGene_63563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	1250	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	478	1305	363853	364680	FALSE	5	GTGTGTAGTCTTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNPQLRRTQSMRDGRGALCICLAKAEGEGGAGSDRPLHGLSKRTQESADLSDIPSWVNQSVLHVNGSSPNEELSLEMKNLLREVPDLQESVRRNCASAAALSKAVALSSAPTEEQGVKVPRGVGEALVRDWLGRGPRDTDCHGDWCHKGELWLCSACLQPSGLPCYHTLNLLPLGMGIFEDEPPSAFLGISSELELPSLHSILSATLYACPEILLNDETKDLSLDCLKPMLSEQIVEYKEMLSGVKSIPDDLQVTLGLLALRALEFANLLYHS	363055	365661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_363485_363804
886147	SIRV6	+	1310	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	383	117	167	18	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	157	648	1733	10736	TRUE	20	CCGATGCGGTCTTCAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1470	11708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886148	contig_2069_pilon	+	2269	11	Intergenic	novelGene_23259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	315.529459797338	6	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	159	1001	333898	341321	TRUE	15	GACTACTGATGTGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324028	344811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_343773
886149	contig_7254_pilon	+	4268	4	Intergenic	novelGene_145844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	488.628920779585	2242	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	225	443	216751	216969	TRUE	0	TGTTTGTCTTTCTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGIKVHTKEGGYFHVLLAPGFHNINAIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKSLLSHEFQDETDTEEETLYSSKH	214621	220856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_214738_215027_215128_216742_216971_217032
886150	contig_13295_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_31208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGAGGGGCTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54949	52929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_52900_54900
886151	contig_6058_pilon	-	1707	9	Intergenic	novelGene_172412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	452.56834773877	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	890	1546	390928	385415	FALSE	40	TAAGTGTCAAGAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401601	385253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391056_391122_391339_392582_392667_395659_395744_397985_398065_401302
886152	contig_12079_pilon	+	2814	7	Intergenic	novelGene_67516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAGAGAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860598	871554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864706_867230_867409_868245_868414_871103_871170_871499
886153	contig_17796_pilon	-	3075	2	Intergenic	novelGene_33753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTTCACCATCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25955	1068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_3361_25172
886154	contig_11978_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_63125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATTAAAAGCTAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1914117	1911932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1911900_1914100
886155	contig_4213_pilon	+	3431	5	Intergenic	novelGene_124786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_3	110.228172442439	141	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	164	790	12984	42900	FALSE	20	ATCCATTGTGTGTATGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDTKNMEKDIEPTQMLANPGYISSKKNSNKATLNRVLSFSLLMCQIMVFGTIIGLVVTTAKFHQKLSGCLETACPDSCIGFQKKCFYFSHDTRNWTSSQRFCDTQGADLVQVETQEELEFLLRYKGPSDHWIGLKRKQSQPWKWKNGTELPTRLHSRGEGECAYLTDNGVSSARSYTERKWICSKPDTYAQMKQQSPNLSSKAVTPY	12820	45541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_24170_24356_40541_40646_42734
886156	contig_12119_pilon	-	3212	1	Intergenic	novelGene_88649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1872	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTTAAAAAGAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194003	190791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_190800_194000
886157	contig_13245_pilon	-	1411	2	Intergenic	novelGene_148808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	12714	junction_1	0	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTGGATAGCTCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26868	25164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_26457_26749
886158	contig_4857_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_48804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	857	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAAAGGAGGTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244454	1247017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1244500_1247000
886159	contig_15407_pilon	+	1772	8	Intergenic	novelGene_123062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	730.276548120432	1625	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	559	1212	465994	470398	FALSE	35	CCTCTTAAGAAAATGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIRRVVEVFKPGKFVTTLFVNQSSKCRTVLSSPQKIEGFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449426	470958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468308_470257
886160	contig_10331_pilon	-	2563	18	Intergenic	novelGene_54143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	776	1111	551106	546369	TRUE	20	GACGGCGGCGATAGACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQVKDLSTFDIRIFNTSFIHFLIFPSSIPHLDFHAWWIALKLLFLIVVIIIFIFFLLLILLFCIFIIFIFIFIRFISRFCFFFFSFYLYAEGFIYPSCLIIFIFQIFIFF	583070	409644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_409747_410750_410806_501843_501955_507018_507081_511864_511949_528497_528640_534685_534767_536900_536976_537995_538151_541969_542043_543766_543864_544890_544989_545719_545961_546292_546472_550873_551131_573429_573509_575993_576193_582597
886161	contig_7445_pilon	+	5405	5	Intergenic	novelGene_178472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	80	1321	6123	7364	TRUE	50	AAACCCAAACGCAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPTEIKRIITDYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEFEKVINKTSNQKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSTEEEATLPNSFYEASITLTPKPGKDVTKKKKRKLQTNISHEYRCKNSQQNSSQYNSVSYQKNNTPRPSRIHTRYARWFNFRKSINVIQHINKRKVKNHMIISIDTEKAFDKVQHPFLIKTLNKTHIQGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMIVYIENPKDSMRNPLELIESLSRAAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSEAPKKIKYLGINLTRNVKDLYEENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNLVKILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFTEME	6043	102184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7445_pilon_+_8456_8757_9277_39935_39938_65128_67112_101695
886162	contig_5981_pilon	+	2872	9	Intergenic	novelGene_35485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.302963223243	1656	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	317	1306	25511	37804	FALSE	15	GTCGTTCAGTGTAGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLGLRRRRLWVRLRSVRSAAFFPARCPAGRHGERGRHEAVRHPGRPARRHRKLAKEYHPDKNPNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23415	39370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23565_25013_25070_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612
886163	contig_21007_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_161540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	25	447	589	1011	NA	10	CGTATCTGTCGTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	564	1866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1900
886164	contig_17171_pilon	-	1289	7	Intergenic	novelGene_147383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	74.7724325314261	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGATGGCTCCTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350894	333586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_334272_337314_337352_338784_338875_343889_343980_347342_347538_347611_347706_350796
886165	contig_4232_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_63345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAATGTGTTCTTGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468042	466989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468000
886167	contig_5696_pilon	+	4163	1	Intergenic	novelGene_117589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAACCCAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747967	752130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_748000_752100
886168	contig_11071_pilon	-	2220	6	Intergenic	novelGene_131025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	301.773822589038	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	48	641	172374	92024	FALSE	20	GAAGGCAATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYCPFATSSRWKRAEMFEVKKTVARTDFEGAFLDGVLRTDPVLEEGEDAAATISTSEALSEEEQDELRRELAKVEEEIQTLSQVLAAKEKHLAEIKRKLGISSLQEIKQNISKGWQDVTATSAYKKTSETLSQAGQKASAAFSSVGSVITKKLEDVKNSPTFKSFEEKVENLKSKVGGTKPAGGDFGDVLNSTANASAATTEPRTEQTPENP	172421	90444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_92144_96150_96200_104797_104900_106647_106797_111264_111381_172316
886169	contig_4364_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532812	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
886170	contig_546_pilon	+	5793	1	Intergenic	novelGene_117189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	983	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATTCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64239	70032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_64200_70000
886171	contig_10857_pilon	-	1407	10	Intergenic	novelGene_160873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	952	1353	58214	21873	FALSE	5	CTCGGGCGGGCAGGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGPVLLVLLLLWAVSLRGLSAIHSELPLWPRFLGPVAKTLILVQFRGFRGFQVEQLVLLWFRGLVAEVLVLSLQLPVPLAPASLPGCLLLVLHAPLGGEPRGLVHQQLLLLPRTGVTRRLRHGPHSRPGGC	66898	21818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21970_54429_54566_56404_56559_58199_58390_58780_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61967_66561
886172	contig_9181_pilon	+	8858	10	Intergenic	novelGene_177099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1253	179	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147506	589285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_+_148812_154894_154908_208498_209100_333271_333880_404115_408230_408471_408904_411782_412082_412406_413640_533928_533942_589045
886173	contig_13481_pilon	-	1499	4	Intergenic	novelGene_119382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	571	junction_1	327.180208583724	828	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	28	321	536852	527468	TRUE	10	GAGTGGCCGTTCTCTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536879	526072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536304_536767
886174	contig_8866_pilon	-	5358	4	Intergenic	novelGene_77810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1653	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	4923	5357	517034	511283	FALSE	25	ACCACGTGACTGAACCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPAEVSLCQRHCQCSIWILLQVAYGELQRAQVEVGHAAARAGGPVTEREDVGKGSAAHRRHGGEGSQRAPVADVRHEAGDARRIFAGRQQSDRVPVPVIPAAPGQRRRRQKRQQCQCQCQRQQRGEQDARGPTTSPSHRGDSNK	528139	511281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_511656_516972_517093_518478_518666_523462
886175	contig_16775_pilon	+	5911	4	Intergenic	novelGene_107740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	981	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1468	2517	56961	58010	TRUE	55	TGTATAAATAAATTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETMEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLQSGDKQLQPSGRT	0	102909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_1078_56570_58060_95827_97880_101616
886176	contig_15323_pilon	+	5522	2	Intergenic	novelGene_148513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	847	junction_1	0	205	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	116	349	65165	85109	FALSE	35	TATTTTGGAAGGAGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGEGLRIYWGSVEEQSLLSRWNPWSTEVPYATFAEHPMKDRSEKLLEICKLSEFTSKLVPAIQKAHKNSTGSGRKKELMVLNEPILIQTYIGLMSFIGNRNKLGYSLARGTIGF	65049	90282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_65204_84914
886177	contig_5093_pilon	-	3355	4	Intergenic	novelGene_135099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	317	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCCCTGCCCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892779	629215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_630525_724507_724847_730922_731839_891988
886178	contig_5794_pilon	-	1559	9	Intergenic	novelGene_69798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4917.11031596557	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	141	764	747355	743764	TRUE	10	ATTTGGTTTTTGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHTHRLGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGKFF	749537	742876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_746043_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747213_747335_747454_749495
886179	contig_34_pilon	-	1671	9	Intergenic	novelGene_40008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1326.52739794548	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	554	1405	224662	212049	FALSE	80	AGAATGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247118	211782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230302_230348_230387_243214_243354_246970
886180	contig_6058_pilon	-	1869	3	Intergenic	novelGene_172399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	896	junction_1	71.5	251	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388007	384034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840
886181	contig_5684_pilon	+	2003	5	Intergenic	novelGene_81045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	181.926324373357	57	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	795	1358	443906	447039	FALSE	15	TATTTTGAATTTCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403580	447684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441968_442604_442785_443891_443949_446518
886182	contig_5770_pilon	-	2148	3	Intergenic	novelGene_74160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	374	junction_2	105.5	763	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGTTCTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260919	253180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_255058_255963_256152_260836
886183	contig_252_pilon	-	1723	7	Intergenic	novelGene_99909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_6	307.365914758868	1231	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	352	1083	68085	37945	FALSE	45	ACAGGAAAATCTCACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDYGEEQRNELEALESIYPDSFTVLSETPPSFTITVTSEAGENDETVQTTLKFTYSEKYPDDAPLYEIFSQENLTDIDVSDILKLLALQAEENLGMVMIFTLVSAVQEKLNEIVDQIKTRREEEKKQKEKEAEEAEKQLFHGTPVTIENFLSWKAKFDAELLEIKKKRMKEDEQAGKNKLSGKQLFETDHNLDTSDIQFLEDAGNNVEVDESLFQEMDDLELEDDEDDPDYNPADPESDSTD	68436	37304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_38067_41271_41335_41811_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_68012
886184	contig_633_pilon	+	4400	4	Intergenic	novelGene_178473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4029	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3501	3869	304991	305359	FALSE	20	CAGAAGCCCTCTATGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGTRRKRKQKKILKKNKKTPQKTERKKKKHTKKKCPQGSLCASTQVEGGGPKPHSTVWPEWAPTSRKEKENKQLKTNEQKAPGSHQHGSTDWEAVPHSSGAPQPLRKKQRWCTEPGI	101118	305890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_633_pilon_+_101564_101622_102884_291802_292260_303653
886185	contig_9049_pilon	-	3062	7	Intergenic	novelGene_83126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGAGGCGGGAGCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115013	88301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_88386_90150_90255_95968_96049_104279_104402_108620_108722_111556_111677_112562
886186	contig_7890_pilon	-	5015	6	Intergenic	novelGene_178474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAACACCAGCAGTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192328	1522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7890_pilon_-_2046_2080_3418_4516_5950_97717_98554_174655_175168_191954
886187	contig_7411_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_137010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	628	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCATATTTCATTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314401	316929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_314400_316900
886188	contig_2078_pilon	+	2197	6	Intergenic	novelGene_100131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	51	junction_5	77.0262292988564	2370	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	8	1117	266397	309099	TRUE	30	TTGAAATCTCCACTCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKVGLKESNHVLSIRGPGDPDSSATIRPSVQFLFGQYGGCARVPTAG	266389	311969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_309148_310937
886189	contig_2377_pilon	+	1405	8	Intergenic	novelGene_67888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	753.692596893618	22	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	37	402	197521	217214	TRUE	25	AACCATTGATGTACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEGERAKKAIKEGRETYKRGGG	197484	225042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_217152_217225_221864_221957_222877_222956_224219
886190	contig_7358_pilon	+	4650	3	Intergenic	novelGene_178263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	3400	4077	327555	328232	FALSE	50	GGCATAAACACAATACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQHLKNNQRNPSHKLKKDRNHMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKPLNKIGIEGKFLNIIKGNYTKPTANIILNVERLKAFPLRMGNRQGYPLSPLLFNIMLEVLARAIRLEKEIKDIQIGREEVKVSLFADNMILYTENPKESTRKLLELIDFREVSGYKINIQKSFGFLYTNKENFEEEITISIPFTIAPKKIKYLGINLIRDIKYLFNENYKTLLLETKRDLHK	92223	328805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7358_pilon_+_93619_256770_257250_326029
886191	contig_12964_pilon	-	4177	1	Intergenic	novelGene_131701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1639	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559860	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555700_559900
886192	contig_10217_pilon	-	2121	10	Intergenic	novelGene_87405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	1161	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	25	TCCAAGTACCTCAGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	108411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
886193	contig_15323_pilon	+	4988	2	Intergenic	novelGene_148512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	847	junction_1	0	187	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	116	349	65165	85109	FALSE	45	AATGTGAAATATGAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGEGLRIYWGSVEEQSLLSRWNPWSTEVPYATFAEHPMKDRSEKLLEICKLSEFTSKLVPAIQKAHKNSTGSGRKKELMVLNEPILIQTYIGLMSFIGNRNKLGYSLARGTIGF	65049	89748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_65204_84914
886194	contig_15047_pilon	+	2137	7	Intergenic	novelGene_52154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	2	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	27	650	2194	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4771_20030_20400_21013
886195	contig_5031_pilon	-	5973	1	Intergenic	novelGene_133170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	4726	5025	19471	19172	NA	45	GTGGGGAACAAAACAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNTPEPMIFLSLLKGAWKSFYLCLFWTLAQGCAASLTHEGAQGPTLLFCHFSELGECMSQRQKGNPMTILSPGTKQLIDGSGDVRLCPKVSWHHLCP	24196	18223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_18200_24200
886196	contig_10482_pilon	+	6486	9	Intergenic	novelGene_152810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1329.93768651016	230	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	54	608	116203	123281	TRUE	30	TCAGAGCCAGTGTTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	77315	131873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942_126177_126259
886197	contig_5485_pilon	-	2212	6	Intergenic	novelGene_37775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_3	107.475764710003	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1726	2052	650889	638722	FALSE	40	TTTAATAAATCAGATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCLYAKCIPCITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVTQHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF	653579	638561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870_645944_650867_651017_651981
886198	contig_8075_pilon	+	3487	10	Intergenic	novelGene_42497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	281.515343967054	1582	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	173	1081	719960	794834	FALSE	35	AAATTAGTCCTTCGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPPPPRARIVREGLGPGLPCGRSLAPGFDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC	719787	797240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794825
886199	contig_13295_pilon	-	2823	2	Intergenic	novelGene_31237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	59	454	103932	98911	FALSE	55	GTGAGCAATGAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAKAGQRKRKTKEELIPLNYGVGKYIEYTMDCQKNELICLGRNTARVLLGSEVVRLHLVYFGPVIRRDQSLEKDIMLGKVEGHRKRGRPSMRWIDTVTATMDSSIATIVRMAQDQVVFCSLVHRVGMSWN	103990	96541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_98913_103538
886200	contig_5039_pilon	-	1586	7	Intergenic	novelGene_65037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_6	160.059103666948	137	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	402	1022	1810321	1802262	FALSE	25	GTCTAAGTGAATTTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPLLLLLGGRAVSPHDSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYTASEWDDVSGVNCRKTTETRCDFTAAGLLQGFPRHFNVSLRVQAELGDRVSAWATVPWFQHYRNVTIGPPENMEVAPGEGSLIIRFSAPFDIDTSMVTFEYYVYYWEEAGTRKVKGPVKSNFISLDDLKPLRVYCLQVQAELVWSTQGISLPGNLSNTSCHKTTLDAATKLEQAILTFVGASLSVVLLVGACFFMILRYRGLIKYWFHSPPKIPLQIGEYLKDPAQPILETLDKDSSPKEDAWDSVSIISFPEKEQDARQSTLNQSAGPAQLSPERGH	1828987	1801697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802442_1806310_1806469_1806815_1806976_1810198_1810345_1812911_1813106_1822685_1822819_1828936
886202	contig_7457_pilon	+	2052	2	Intergenic	novelGene_31302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATGAAGCTGATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166222	168705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_167224_167654
886203	contig_13800_pilon	+	1834	17	Intergenic	novelGene_153706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_16	356.243925386806	19	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	320	1720	98375	160409	TRUE	25	TTAATGGACCTACCGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGILMCLRFRQWFRLKYPVDQRSLCWSARPRQRIILIKMIFLSKRLA	94443	162312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_95759_95802_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_160269_160458_162246
886204	contig_2069_pilon	+	4198	13	Intergenic	novelGene_23247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	307.01016767455	3	158	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1042	1758	341330	343975	FALSE	45	GTAAAATGGCAATAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323991	346415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335612_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
886205	contig_11525_pilon	+	1618	1	Intergenic	novelGene_171082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCCAGTATCATTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60478	62096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_60500_62100
886206	contig_2235_pilon	-	9523	11	Intergenic	novelGene_178475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6671	206	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	8051	8473	16383	15961	FALSE	50	AACTGAAAGAATGTAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKSTNKRNSAQESKRNKENVSTTKKKKKKKKKKSLQNVITLLGIYPREIKAVTLIDICTSVFIEKLFTIAKRWKQPRCPSADEWINKLWCIHTMEYYTKIKNNDESVKHLVRWMNLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLV	291837	14910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2235_pilon_-_16551_36246_38089_65388_65586_88818_89463_117427_117512_221017_221058_221363_222579_225848_227257_240795_240806_287315_288117_290195
886207	contig_13257_pilon	-	3837	1	Intergenic	novelGene_175184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	841	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6803	2966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13257_pilon_-_3000_6800
886208	contig_7530_pilon	+	1151	6	Intergenic	novelGene_141845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1328	junction_5	355.373381107815	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	60	659	261111	300561	TRUE	20	GACTGATTGGAATTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARYLGNTVDLSSFDFRTGKMMPSKLQKNKQRLRNDPLNQNKGKPDLNTTLPIRQTASIFKQPVTKVTNHPSNKVKSDPQRMNEQPRQLFWEKRLQGLSASDVTEQIIKTMELPKGLQGVGPGSNDETLLSAVASALHTSSAPITGQVSAAVEKNPAVWLNTSQPLCKAFIVTDEDIRKQEERVQQVRKKLEEALMADILSRAADTEEMDLEMDSGDEA	261051	304583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_261177_276342_276481_293747_293839_295176_295355_300434_300574_304103
886209	contig_15244_pilon	-	6104	5	Intergenic	novelGene_118070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1189	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3134	3439	782054	781749	TRUE	5	GCCCTCCGCGCGGCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKITYFVARDKSLQTAEKYSNFKTELYHTLSVSVTTNSSEITRPLNGGLTMILPKFNQRTKTKLIFKAVTLTNVPFISITIHSLVFFFSPYKQQLTLLKF	785187	749502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_749553_758068_759137_769550_769821_779365_779536_780641
886210	contig_8310_pilon	+	3196	17	Intergenic	novelGene_75575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_4	308.39886409486	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	438	1877	296664	324814	FALSE	75	ACAAAAAAGGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	279773	326133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295395_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
886211	contig_16362_pilon	+	3872	2	Intergenic	novelGene_161167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	783	1310	243282	243809	TRUE	50	ATCAAAAGATTAACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANIILNGQRLRTFPLKTGTRQGCRLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDLMLYIENPKDSMRNLLELIERFSRVAGYKTNIQKSVGFLYTSKENNEKEIRKSIPFSIAPKKTKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPSSWIGRLNL	242499	306022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_245444_305094
886212	contig_9313_pilon	+	2915	1	Intergenic	novelGene_86486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTCTGAAAATGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461898	464813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_461900_464800
886213	contig_2067_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_158930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	304	915	1031	1945	598844	599758	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKTRSIYMLPTRAHLRLKDKNKLKLKGWKGIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTEDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYPPNDSAPKYIKQILTALKREMDSSTIIVEDFNTPLSVKERTSRKKLNKDTEDLNATNNQLDLMDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRTDHVLGQYGLHLHIKKTKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFTSLRSTINTHGNSRQEIKRCIALSKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSIASCTCKSWTMNKEDQRRTDTFELWCSQRIMNIP	597813	600170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_597800_600200
886214	contig_7396_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_79545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAGAACACCTATGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245102	246290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_245100_246300
886215	contig_3091_pilon	+	5513	5	Intergenic	novelGene_178477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	773	1075	38223	38525	TRUE	15	TTCTATAGTCATTTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYAATLLNLSFSSSRYLMQSLGFSMCSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCFIALARTSSTVLNSGVKGNPCLVPVFKGNFFSLSPLRMILAVGFA	37450	352686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3091_pilon_+_38918_107979_109549_109793_110215_249137_251042_352534
886216	contig_13215_pilon	-	2698	1	Intergenic	novelGene_145890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACAATACATCTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114770	112072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_112100_114800
886217	contig_7850_pilon	+	5634	4	Intergenic	novelGene_178478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	2645	3604	10342	11301	TRUE	55	CTCAAGAAGAAGAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKKKKRDPSICCLQETHLRNRSKFIKNQRMEKIYQANSYQKRARVAILVSDKIGFRTKSTVKEKEVHYIMIKGMIYHEEITIINIYASNDMAPKYIKQTLIALKREIDSSTIIVRDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNGTISQLDLIDVYRTLHPTAAKYTFFSNAQGMFSRIDHILGHRAIVNKIQNIEIIQSIFSDHNAIKVEINNTKTKGKKSSTWKLNNNLLNHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENISYQNFWDTAKAALRGQFVAIDAHSKKKGQNQNINYKTRTNRKRTAKKAHSHQKKGNNKDQSRNK	6187	64622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7850_pilon_+_8756_10265_11483_62373_63080_63479
886218	contig_13224_pilon	-	8444	26	Intergenic	novelGene_104073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.195959179422654	2302	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2752	3066	255950	255636	TRUE	15	GCGATCTCGACGCACCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDMSGRGHLHLDNIPSSQSNTPSFQCKASAAPITQMGAPGEGISGPVQFSPAVVVIGYAACSPRVSSFMRLKNPRTVADYQEAPKSRAEGPSSLVAPLGEVLP	258701	106149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_106580_200740_200775_204793_204883_211545_211768_217730_217932_218812_218885_219632_219815_222441_222658_227333_227457_228920_229023_231290_231447_233550_233687_236325_236414_237803_237869_238601_238713_239984_240077_240977_241095_242343_242436_245179_245318_246691_246823_247556_247693_247889_247992_249056_249165_250727_250851_251507_251615_253630
886219	contig_15304_pilon	-	2599	7	Intergenic	novelGene_30643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4633.57006889216	5	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	408	1217	106308	103201	FALSE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVFVESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRRTHRSWTPP	107225	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103234_103271_103329_103548_103680_105638_105960_106040_106371_106480_106532_106931
886220	contig_2799_pilon	+	4523	1	Intergenic	novelGene_85467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	229	528	397065	397364	NA	5	AGTCCCTCTTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESMGAKTPGVPLVPVKPLSLIFLLGFEFCTPLFSCSVRDSVVFPVRAVIGGSRVPSSSSDLRLMESLVYVALSVSWANIFLVSLEFFILLCSRWVRTK	396836	401359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_396800_401400
886221	contig_7965_pilon	-	1905	3	Intergenic	novelGene_174400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	723	1190	155720	155253	TRUE	30	AGGATTCATACCAGGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDKAPKCIKQTLTTLKREIDSSTIIVEDFNTQLSVKDRTTKKKLSKDAEDLKGTISQLDFIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAYGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDYNAIKVEINNRKSKGKKINYMETE	258393	154325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7965_pilon_-_154386_154597_155919_257869
886222	contig_7171_pilon	+	3548	6	Intergenic	novelGene_101388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCCCCTGCCACTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363364	1369564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1363712_1364242_1364338_1364429_1364489_1365180_1365386_1365698_1365813_1366836
886223	contig_8452_pilon	-	3753	9	Intergenic	novelGene_48010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	150.838489782946	1008	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	342	1379	550776	316088	FALSE	30	ACACCCACAGTTCATGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGFLAPVFALFVPFYCSIPRVQVAQILGQFSITNKTLIYILGLQLFTSGSYIWIVAISGLISGMCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	551117	313713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
886224	contig_10990_pilon	-	2039	2	Intergenic	novelGene_7508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCCTACAAAAGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753861	751456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751518_751883
886225	contig_7963_pilon	+	6710	13	Intergenic	novelGene_58431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTGAGCTCCGCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113557	126298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_114515_115833_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121234_121411_121959_122054_122270_122349_122484_122995_123131_123745_123983_125548
886226	contig_13301_pilon	+	1466	9	Intergenic	novelGene_153117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	260.503718783437	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	60	1391	169218	174444	FALSE	25	GGAAAAGCTTCCCATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFSPTVSMVEGQGEKNVTFWGKMWPQCEELQGQKLVVEEKRPCLHAPACKDPNRKP	169158	174519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171647_171848_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173087_174281
886227	contig_12079_pilon	-	3631	4	Intergenic	novelGene_67564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	540.577674550311	494	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3098	3454	868372	867179	FALSE	30	CTAGTTCTATGATCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKVSSRHACQNSLSVGSDTFILRK	872424	867001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_867410_868246_869258_870148_872145_872208
886228	contig_8377_pilon	+	14106	3	Intergenic	novelGene_35050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5930	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTCAGTCTGAGTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91234	107671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_93445_93925_103017_104866
886229	contig_7629_pilon	-	5900	31	Intergenic	novelGene_153580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_20	169.365626841917	12	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1026	3078	2822	5899	374993	334126	FALSE	40	TCCAGCCAATCACGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESSVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILQRRTKTITIESEGRGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIDAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSHGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPGDLVIADGDGQLMEGDKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQMPPVFPVPASVMQPLYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEEFVDTNIF	449244	334124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_334149_338325_338529_341354_341575_343308_343352_347156_347215_347659_347778_348305_348410_350342_350433_350812_350973_353280_353481_353930_354128_356987_357099_360826_361007_361715_361884_365350_365547_367293_367505_368601_368858_368960_369105_370498_370676_374774_375019_375333_375414_378600_378723_387034_387173_387397_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391813_392732_392880_396940_397053_413488_413821_447709
886230	contig_6058_pilon	-	2924	9	Intergenic	novelGene_172398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	438.627119544608	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	231	1541	398054	385415	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401604	384031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_390857_390952_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401384
886231	contig_14807_pilon	-	1486	6	Intergenic	novelGene_124649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	875	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	130	774	39773	37247	FALSE	10	TCCTGTGACCTTTCGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39902	36534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
886232	contig_13004_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_112614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGGCCAGTAAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174932	176827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_174900_176800
886233	contig_12464_pilon	+	605	3	Intergenic	novelGene_68627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	385.5	50	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	82	603	45304	54236	FALSE	70	TTTCAAAGAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILYKVRWKGYTSDDDTWEPEVHLEDCKEVLLEFRKKVADNKAKPVKKDIQRLSLSNDIFEANSDSDQQSETKEDTSSKKKKKKLRHKDEKSPEDLKKKKAKTGKLKEKSKSDLESFSESLVFDLRTKKRIFEAKEELKEFKKPKKDDIKETKELKKVKKGEIRDLKTKVRE	45222	54238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_45307_51803_51960_53873
886234	contig_8354_pilon	+	7145	3	Intergenic	novelGene_24135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1513	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAGCTAGTCCAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534169	542874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_537379_538000_538147_539084
886235	contig_13074_pilon	+	1391	4	Intergenic	novelGene_153415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1380.10080147148	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAACATTTCTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403239	452000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403364_403717_403817_449108_449279_451002
886236	contig_5961_pilon	+	6154	2	Intergenic	novelGene_144163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1363	139	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	4162	4596	234955	235389	FALSE	30	ATCGGTAGACTCAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVVGDFNTPLSVKDKTSRKKLNKDTEDLNATVNQLDLIDIYQTLHPTAAKYTLFSNTRGTFSRIDQIFSHKASLNKIQSIEILQSIFSDHKSIKVEINNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDEIKKFIESNENENTS	223836	236947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_227994_234950
886237	contig_7376_pilon	-	9071	7	Intergenic	novelGene_108088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3480	204	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	3503	3922	270270	269851	TRUE	15	TGGGGACCATGGTCTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENGLELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTK	428884	100468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_102532_120022_121044_240430_240680_266942_268127_269218_271085_271129_272030_427096
886238	contig_16228_pilon	+	3804	9	Intergenic	novelGene_147924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_7	147.557986483281	29	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	337	933	59945	69797	TRUE	20	TCTTTAAAGCCTCCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHGE	47753	75076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843_60222_69477_71170_71434_71573_71760_71817_72142_72339_73641_73821_74146
886239	contig_7151_pilon	-	4426	3	Intergenic	novelGene_40804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	360	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	350	715	587997	586896	TRUE	35	TAGTGTACCACAACTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFYSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWMPIGAILSCFRKCFDIVCCFWDIQ	588346	537516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_541054_586721_586911_587646
886240	contig_8850_pilon	+	4861	4	Intergenic	novelGene_172435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1837	2646	95044	95853	TRUE	45	GACTAACCTAAAGAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKSDKHEEKIDKFMENTDKKLEELRKIMQEQNAKINSQLGIIQRQQLEIQRINNKVSEMDGVIKGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPQQGEKTENTERIIQELLTENFPNIMKDEKLATQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYREETIRLSSNYS	93140	277025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_93646_93712_96187_271708_272217_275651
886241	contig_14519_pilon	-	2182	11	Intergenic	novelGene_66814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_10	111.485828695848	102	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	68	1024	283786	270622	FALSE	75	CACCAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDVKPLGVIWGKFSEFYSKKNTIMFDDIGRNFLMNPQNGLKIRPFMKAHLNRDKDKELLKLTQYLKEIAKLDDFLELNHKYWERYLSKKQGQ	287178	269463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283788_287112
886242	contig_10236_pilon	+	2831	4	Intergenic	novelGene_169111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	5.43650214343336	1515	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1	429	77561	78888	FALSE	45	AAAGAAAAATATTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVAAGPGAPVSPDELLPKGDAEKTEEDLEEDDDEELDETLSERLWGLTEMFPERVRSAAGATFDLSLFVAQKMYRFSRAALWIGTTSFMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGKI	77560	81290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_77678_77901_78021_78467_78586_78813
886243	contig_3270_pilon	+	4509	14	Intergenic	novelGene_104463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTCACCTCATGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101443	135860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_102929_106359_106573_106711_106808_110361_110510_115233_115417_117393_117540_117767_118044_118969_119137_121337_121502_127794_127939_130712_130840_132594_133667_135020_135157_135708
886244	contig_15021_pilon	+	3910	28	Intergenic	novelGene_26974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	121.701765048467	1058	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1249	3747	164	3910	322371	353285	FALSE	10	TTCCCCAGCTTTGGGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVAVLTQESFAEHRSGLVPQQIKVATLNSEEESDPPTYKDAFPPLPEKAACLENAQELAGAWSSKIRPIKASVITQVFHVPLEERKYKDMNQFGEGEQAKICLEIMQRTGAHLELSLAKDQGLSIMVSGKLDAVMKARKDIVARLQTQASATVAIPKEHHRFVIGKNGEKLQDLELKTATKIQIPRPDDPSNQIKITGTKEGIEKARHEVLLISAEQDKRAVERLEVEKAFHPFIAGPYNRLVGEIMQETGTRINIPPPSVSRTEIVFTGEKEQLAQAVARIKKIYEEKKKKTTTIAVEVKKSQHKYVIGPKGNSLQEILERTGVSVEIPPSDSASETVILRGEPEKLGQALTEVYAKANSFTVSSVSAPSWLHRFIIGKKGQNLAKITQQMPKVHIEFTEGEDKITLEGPTEDVNVAQGQIEAMVKDLINRMDYVEINIDHKFHRHLIGKSGSNINRIKDQYKVSVRIPPDSEKSNLIRIEGDPQGVQQAKRELLELASRMENERTKDLIIEQRFHRTIIGQKGERIREIRDKFPEVIINFPDPAQKSDIVQLRGPKNEVEKCTKYMQKMVADLVENSYSISVPIFKQFHKNIIGKGGANIKKIREESNTKIDLPAENSNSETIIITGKRANCEAARSRILSIQKDLANIAEVEVSIPAKLHNSLIGTKGRLIRSIMEECGGVHIHFPVEGSGSDTVVIRGPSSDVEKAKKQLLHLAEEKQTKSFTVDIRAKPEYHKFLIGKGGGKIRKVRDSTGARIIFPTAEDKDQDLITIIGKEDAVKEAQKELEALIQNLDNVVEDYMLVDPKHHRHFVIRRGQVLREIAEEYGGVMVSFPRSGTQSDKVTLKGAKDCVEAAKKRIQEIIEDLEAQVTMECAIPQRFHRSVMGPKGSRIQQITRDYGVQIKFPDREENPVHSVEPAMQENGDETAEGRGAKEADPSSPRRCDIIIISGRKEKCEAAKEALEALVPVTVEVEVPFDLHRYIIGQKGSGIRKMMDEFEVNIQVPAPELQSDTIAITGLLANLDRAKAGLLERVRELQAEQEDRALRSFKLSVTVDPKYHPKIIGRKGAVITQIRLEHDVNIQFPDKDDGSQPQDQITITGYEKNTEAARDAILKIVGELEQMVSEDVPLDHRVHARIIGARGKAIRKVMDEFKVDIRFPQSGAPDPNCVTVTGLPENVEEAIDHILNLEEEYLADVVDSEALQVYVKPPAHEESKAPSKGFVVRDAPWTANSSEKAPDMSSSEE	316234	353285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_316299_321189_321252_322333_322447_324679_324838_326027_326244_332248_332456_332677_332894_333107_333315_333453_333562_334697_334803_335115_335195_336589_336730_338549_338655_338751_338866_339781_339869_340026_340159_343846_344066_346167_346390_346511_346731_346943_347083_348988_349144_349427_349533_349880_350016_350611_350756_351924_352111_352592_352710_352984_353114_353258
886245	contig_16411_pilon	+	3475	2	Intergenic	novelGene_77263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	828	1130	1081	1383	TRUE	25	GAATTTTGTCATGTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRIRAELNEIENRKTIERVNKTKSWFFEKITKIDKPLPKLTKEKQERKQMTHIRSEIGDITTDPTEIKRIITEYYEKLCTNKLENREETGKFLETQYLP	253	4828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_1799_2898
886246	contig_4114_pilon	-	4553	9	Intergenic	novelGene_15588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.992156741649222	127	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCGCTTCGTCAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253528	218159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_218360_222874_223041_223417_223507_223673_223713_232345_232444_234099_234228_247833_247998_249590_251987_252255
886247	contig_4232_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_63322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151209	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468137	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
886248	contig_8365_pilon	-	3624	8	Intergenic	novelGene_150912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	131.19762317409	975	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACTTTGCCCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211465	66022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_68390_70369_70496_71063_71178_76570_76666_110677_110902_118266_118278_175907_176023_210893
886249	contig_6513_pilon	+	3121	10	Intergenic	novelGene_117767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	416	junction_9	377.900960309006	565	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	887	2661	461	3121	170490	212289	FALSE	30	GTTAGTGAACTACAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGEGRPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKSGFKSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHPDSKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKKMEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVEN	170029	212289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_171994_198973_199157_203369_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250
886250	contig_2730_pilon	+	2063	5	Intergenic	novelGene_135356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.650551831383	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291588	392479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685_391633_391674
886251	contig_18194_pilon	-	2440	4	Intergenic	novelGene_55946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_3	51.6741930002029	648	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	129	1145	18897	4642	FALSE	15	GCTCTTGCTGTGTTGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20414	3346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866_18976_20364
886252	contig_5782_pilon	-	4186	4	Intergenic	novelGene_162135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1384	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAAATTCATGGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117764	844116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_845146_1028850_1029032_1095422_1096597_1115962
886253	contig_14467_pilon	+	3679	8	Intergenic	novelGene_138257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.0995626366713	87	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	200	775	318578	319153	TRUE	30	CCAAGGAAGGGGGAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEITPYPHSAAERTRREPHRPQSVSLCVCFSEAQPLHPWSQATGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	307075	351779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_307207_318509_321274_321480_321587_322015_322124_322254_322506_335306_335485_347812_347888_351713
886254	contig_19330_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_163703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAACAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134701	132535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_132500_134700
886255	contig_10904_pilon	-	1844	7	Intergenic	novelGene_22696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	277.563656362524	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	215	838	661760	613775	TRUE	35	GACACAATGGACACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSGDPRDSGG	662743	611687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_612262_613149_613435_613627_613801_660333_660634_661462_661763_662310_662445_662665
886256	contig_14513_pilon	-	1260	3	Intergenic	novelGene_70324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	1730	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	198	566	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
886257	contig_12677_pilon	-	2827	2	Intergenic	novelGene_110730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_490_598
886258	contig_9995_pilon	-	2914	5	Intergenic	novelGene_47701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	653.806163935459	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	16	1272	321973	297372	FALSE	20	GGATATCTTGAGTGGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQFNPMNPQQVYQPSQPGPWTTYPTSNPLSHTSAQQPNQQGHQTSHVYMPISSPTTPQPPTIHSSGSSQSSAHSQYNIQNISTGPRKNQIEIKLEPPQRNNSSKLRSSGSRTSSSSSSVNSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPAVSPGVVSPTFELTNLLNHPDHYVETENIQHLADPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARGPHFNPSAIHNFYDNIGFVGPVPPKPKDGGVLMLKVSPQS	321988	295729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297413_299626_299708_300994_301089_301628_301790_321093
886259	contig_17964_pilon	-	2498	3	Intergenic	novelGene_33856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10345	junction_1	1529.5	133	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520
886260	contig_5059_pilon	+	4073	12	Intergenic	novelGene_140750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.622632725619	241	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	1210	2787	500194	552919	FALSE	15	GATTTAGCCTGGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENAYYYCNPPLAEKTVKKKRPPLQEYVRKLLYKDLSKVTTEKVLRQMRKLPWQDQEVKDYVICCMINIWNVKYNSIHCVANLLAGLVLYQEDVGIHVVDGVLEDIRLGMEVNQPKFNQRRISSAKFLGELYNYRMVESAVIFRTLYSFTSFGVNPDGSPSSLDPPEHLFRIRLVCTILDTCGQYFDRGSSKRKLDCFLVYFQRYIWWKKSLEVWTKDHPFPIDIDYMISDTLELLRPKIKLCNSLEESIRQVHDLEREFLIKLGLVNDKDSKDSMTEGENLEEDEEEEEGGAETEEQSGNESEVNEPEEEEGSDDDDEGEEEEEENTDYLTDSNKENETDEENTEVMIKGGGLKHVPCVEDEDFIQALDKMMLENLQQRSGESVKVHQLDVAIPLHLKSQLRKGPPLGGGEGETESADTMPFVMLTRKGNKQQFKILNVPMSSQLAANHWNQQQAEQEERMRMKKLTLDINERQEQEDYQEMLQSLAQRPAPANTNRERRPRYQHPKGAPNADLIFKTGGRRR	413489	554205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_414635_500129_500326_502769_502974_503480_503757_506354_506539_514291_514432_518588_518691_518994_519094_522752_522921_546644_546787_548164_548286_552909
886261	contig_12931_pilon	-	2566	2	Intergenic	novelGene_166772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1296	1865	125321	124752	TRUE	75	AGAAAAAGATGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISSHIKRQSMMASARSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRRICRTHLGIRKEIQQSAEIARQHTDTVVAELKKVMQEHNAKFNRLQEYTERQQSEIQKINNKISELDNSIESHKSRIEAVEVRISDIEDKALDGNLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERGRNRKYRENC	126616	123946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_124073_124176
886262	contig_5628_pilon	+	7850	5	Intergenic	novelGene_157559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	5343	5699	170593	170949	TRUE	65	GAAATATCTACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNILMVSILLRLALRPNMLSILENIPCALEKKVYLAAVGWSVLYMSMRSSGLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFSDSGVLKSPTTIVELSISLLSAVRVCFMYFGAVSLGV	54757	218175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_55991_76963_79984_169503_171182_215982_216236_216509
886263	contig_5479_pilon	-	8860	17	Intergenic	novelGene_133560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2501	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	8496	8858	261208	58589	FALSE	10	CCTCGCCCTCGCTCGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVAFHPLVDEPIQQGPTVVTKRGTGVGVDLKFVFAPGVIRGWTLVSSWAGEGDKFMAPLVHNKAADLALEPLLPEAPDEVGAVAAEGGLLEETGGEFVVLHLVHVLLPEGAFAGEAHSA	453701	58586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_58714_59667_59701_218362_218448_258280_258392_261199_261330_318100_318259_319625_319760_334183_334280_344545_344693_375217_375393_395879_395973_398958_399021_403750_403889_409402_409484_409798_409908_415694_415837_446662
886264	contig_5586_pilon	+	2786	13	Intergenic	novelGene_143496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	485.664807820739	1263	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	210	1814	368997	430164	FALSE	40	TTTAAATGGTCTAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVQCKDKEATKLTEERDCSLNQSSGYRYGTDPTPQHYPSFGVTSIPNYNNFHAAGGQGLTVFGGVNSSSHTGTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	196895	431136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_197054_224687_224728_368985_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
886265	scaffold_9100_pilon	+	1078	5	Intergenic	novelGene_83257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	640.942080066522	115	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	98	532	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650525_654231
886266	contig_165_pilon	+	4487	18	Intergenic	novelGene_117052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	332.230649026018	977	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	2508	3722	45144	71673	FALSE	10	CTACCTTGTGGAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLQQEEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	32828	72438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_34121_34512_34648_39826_40045_43237_43821_44630_44878_45111_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
886267	contig_16303_pilon	-	1141	3	Intergenic	novelGene_34130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	37	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65385	58165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_58587_58999_59311_64976
886268	contig_14513_pilon	+	6234	3	Intergenic	novelGene_70224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCATATATATTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10353	18426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12641_13582_14298_15194
886269	contig_14142_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_120444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAACCAGCCAATTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88455	90517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_88500_90500
886270	contig_10930_pilon	-	1710	2	Intergenic	novelGene_37064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	284940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_285074_287478
886271	contig_14220_pilon	-	3500	15	Intergenic	novelGene_159848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	396.219172495554	1126	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1095	3285	214	3498	422880	264812	FALSE	35	CCCAGCAAAGAAGGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVVTHSPRLIPPPQPQPPPPPPPPPQQQPIRSLFQQQQLQPLLPLQHPHHPSPPQGMHMPPQIETPRIMMTPPPVTPQQPKNIHINPHFKGTVVTPVQVPLLPLPSQPRPAVGPQRFPGPPEFPQHAPGPVPNNFSQPPRLPIQDQWRAPPPPQDRDPFFIGVSGEPRFPSHLFLEQRSPPPPPPPPTLLNSSHPVPTQSPLPFTQPGPAFSQQGQQPGFPRERPVRPSLQPPGPVGILHFSQPGSANTRPFIPPRQPFLPGPGQPFLPTHGQPNLQGPLHPPLPPPHQPQPQPQQQQPQHQQQQPQHQPQHHQHQPQHQPPLQPQHQPPHQPPHQPPPQHQPPHQPQHQPQHQPPHQPQQHQHHHHLSVPPPPLMPMSQPQFRPHMQTTQPQPNNSRMQCPQRQGLRHNTTSQNVTKRPIQQMQPTAPRNSNLRELPIAPSHVIEMSNNRCSSTPAAQVKPIISTSPPTRSVVGSRNSQGKTEVKVKPVSPVVQPREEAKTEPEFPDEDEETRLYRLKIEEQKRLREEILKQKELRRQQQAGARKKELLERLAQQQQQLYTPQLPAEQEERTSSPSPTNGNPLLPFPGAQVRQNVKNRLLVKNQDVTVSSVQPKTSSFVPSGANMQYQGQQLKPLKHLRQARTVPQSQTQPSLKVLQVKPADMEEMPSSPQTARVASVPGRPQEVRPGVKRTVMQRANSGSGDGPHVSSKVRVIKLSGGGGESDGFFHPEGQPHRLPQPPEGRQPPVRKVTLTKGTLQQPQHPPVAAHMHPAIPPGIKNIQGI	423093	264809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_265004_285295_285941_289287_289576_291830_292227_293528_293873_294242_294376_313693_313753_319547_319834_325916_326126_331917_332090_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
886272	contig_4857_pilon	-	7763	9	Intergenic	novelGene_48799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2118.91608124885	144	191	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3656	3988	1531458	1531126	TRUE	60	AAAACTGAAAACCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFHSHLILGIFFNSIFDFFCYPVVFMQGVIQFPCTDFFLALPVINFYFDGIVIREDTLYYLSVLDFVEGCFVAHSGEHSMCIGKECVLCCCWVECSIYVCEVKLVDCGL	1788966	1241819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1242271_1243122_1245235_1359326_1359976_1360618_1361038_1381294_1381303_1530989_1531536_1667292_1668391_1724291_1724322_1786516
886273	contig_10940_pilon	-	2544	1	Intergenic	novelGene_49185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTTGGGAGCCCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179288	176744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_176700_179300
886274	contig_13481_pilon	-	12137	16	Intergenic	novelGene_119304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	75.2610272466582	2334	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	6611	7327	476673	475957	TRUE	5	CGCGGCCCCTCCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRTYLRTAGCSQGLCSLGLALRWPGRHQSSPCWGDTILSESSEPSSGKEEERSVWGPPGKGTKGPGGEREKGKELGEKKQQTQWGRRFYFTDSIRVQLQLTPRSPGEPCAVAGTPALRLTGSSKPWWGKCFGSSFPGWALSIYMCSCEGGEVFMFEDLVFTITEKTAPNFFPEILSPPRAASSQSPNRWGDAGSGDGGNEAEGYGCCAVFRPYPGLGVPPGGLVLLWQLTRAWGTKQ	494360	248557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_248652_251967_252068_283652_284528_414925_415153_466805_466893_468619_470279_470351_470967_471860_472221_473976_474157_474389_474604_475244_475326_475638_482680_482910_482997_483788_483965_485390_485549_494176
886275	contig_17976_pilon	+	2682	4	Intergenic	novelGene_32478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	244	789	41843	46972	FALSE	55	GATTAAATAATAATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQSSRSQVTCGSSWVQSRRSQVKCGSSWVQSRRNQVKCGSSWVQSRRSQVKCGSSWVQSRRSQVKCGSS	41599	48865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46706_46763
886276	contig_14687_pilon	-	5721	1	Intergenic	novelGene_107933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	115	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	4376	4681	494890	494585	NA	30	AATTCCAATACCCGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELNATVNQLDLIDIYQTLHPTAAEYTSLSSAHGTFSRIDHILGHKARLNKIQTIEILQSTFSDHKAIKVEINNRKSKEKIKYMETEQHLAQKLLGYRRN	499265	493544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_493500_499300
886277	contig_9708_pilon	-	1492	3	Intergenic	novelGene_67257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	58	681	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	326	1198	50111	49239	FALSE	35	TAATAGTAATGGCATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66310	48944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50118_51271_51377_66096
886278	contig_12429_pilon	+	2922	4	Intergenic	novelGene_136215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	69.6674641102685	747	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	186	503	327996	372953	FALSE	15	TCTTGTTCTATTAGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTRWTGMIIGPPRTNYENRIYSLKVECGPKYPEAPPSVRFVTKINMNGINNSSGMVDARSIPVLAKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQTYNN	305371	375372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_305453_327891_328041_334090_334217_372806
886279	contig_17440_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_7542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11985	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTAGCTTAACATAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677	1345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_700_1300
886280	contig_19640_pilon	+	1918	2	Intergenic	novelGene_134875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAACTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110620	119602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_111828_118891
886281	contig_7247_pilon	+	3091	1	Intergenic	novelGene_176698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	2767	3090	163956	164279	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNCVMKKDKKGKREKRKQNKLKKKGQEKPPKKQEKKNQRKKICPQGSLCMPVQAKGVGSKPRSTAWPEWVPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPAWQPRPGSSST	161189	164280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_161200_164300
886282	scaffold_12124_pilon	+	2397	8	Intergenic	novelGene_22316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3762.66846256532	7	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1453	2232	1508626	1509405	FALSE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483543	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1506629_1506687_1508010
886283	contig_11816_pilon	-	6327	1	Intergenic	novelGene_98496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	128	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	4301	4753	550628	550176	NA	40	TTTTTTTTAAAAAAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVHLFLQYPLVLDHMLPPKMVECRPILFGIVTVYSFNLLLMLPASFNMFPVESFNIVTLGLNFFFSSFRLRNADHVFLFFLTPGVCTFQYNALLCLLEPPLKSSVHISGTSKIKYLCLSKDFPKRVKKESTDWEKIFGYDIIQQGYNL	554928	548601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_548600_554900
886284	contig_2799_pilon	+	4309	1	Intergenic	novelGene_85466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	229	528	397065	397364	NA	15	ATGTATTTTCTTTTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESMGAKTPGVPLVPVKPLSLIFLLGFEFCTPLFSCSVRDSVVFPVRAVIGGSRVPSSSSDLRLMESLVYVALSVSWANIFLVSLEFFILLCSRWVRTK	396836	401145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_396800_401100
886285	contig_19032_pilon	+	1667	10	Intergenic	novelGene_172550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	795	1247	159243	160649	TRUE	35	ACTCTCCATAGTAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKVFSFYFCFLLCSLLIVFIFWANYNSFSLEACKQAHFSPLGSSRHVCLIQNEISLLTGGDLNKLPKTLWGSLQQCVQFSSICHLLLKTCHHHFIHNGVRPKNVVFTRIFCCVFSNPGSFSGSWQANHHYNFTIFLLFRPLWSSDSIL	157031	162625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159393_159618_159746_160163_160284_160593_160862_161306_161436_162546
886286	contig_16310_pilon	+	1154	4	Intergenic	novelGene_70037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	783	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCGAAAGACAGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56152	66277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_56621_63134_63536_64829_64954_66116
886287	contig_2646_pilon	+	1621	10	Intergenic	novelGene_69508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	268.724743286362	2084	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	908	1225	569631	573396	FALSE	25	TTCCTTTCTAACATATCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYCRY	553998	573792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566422_566537_567983_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572836_573385
886288	contig_6898_pilon	+	3724	13	Intergenic	novelGene_35727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2285.18607314347	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	90	1565	59668	125542	FALSE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVPSLQSWPMPAMSPRRLPMI	59578	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_124854_125481
886290	contig_9653_pilon	-	4879	14	Intergenic	novelGene_48175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	779.520820799016	212	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	146	1204	196924	175913	TRUE	25	ATCCCTTCCCAGAAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200979	162299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_162602_163224_163326_171532_171607_172714_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_194303_194351_196881_196987_200896
886291	contig_7334_pilon	-	4745	2	Intergenic	novelGene_50563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	467	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	3718	4098	118864	118484	TRUE	30	GATGAGGTGTTCCCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPYKNHISACDINAHGEGWVLATLSAGRRDILLGWGVRDFHFPSNPFLWLTPSRLVVTNEAVLAISDFCSQCLCERGQAARFCSQHVWGVGRFTVEAATSLGSTESNWCKADPISPVSGDFSLR	122581	116681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7334_pilon_-_117030_118184
886292	contig_1694_pilon	+	4332	1	Intergenic	novelGene_144980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	174	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1907	2284	1628860	1629237	NA	15	TGAGGAGTGTGCTTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYTENPKEFTRKLLELIEDFSKVSAYKINIQKSVGFLHNNRENFQEEITKSMPFTTAPKEIKYLGINLTRDVKDVYNENYKTLPQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVNMSILPKAIYRYNAI	1626953	1631285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1627000_1631300
886293	contig_7963_pilon	+	1686	8	Intergenic	novelGene_58563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_6	119.550177322993	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	16	1284	248655	253116	FALSE	10	CAGTGGTTTCTAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	248639	253518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
886294	contig_14666_pilon	-	1272	2	Intergenic	novelGene_39643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	874	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCTCCAGCTGATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486405	484983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_485254_485403
886296	contig_21007_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_161508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	516	899	589	972	NA	40	GCATTGCAATACAATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRI	73	972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_100_1000
886297	contig_7408_pilon	-	2626	2	Intergenic	novelGene_168731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	625	junction_1	0	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1077	1781	24356	12597	FALSE	30	TCAAAGTTCTGAGTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	25432	11751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283
886298	contig_6847_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_143889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAATGTAATCTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231976	230239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_230200_232000
886299	contig_15185_pilon	+	5448	3	Intergenic	novelGene_99385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1738	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGCAGAAAACTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68284	150436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_68486_88228_92751_149711
886301	contig_14807_pilon	-	1467	5	Intergenic	novelGene_124648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	3738.88033875116	738	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	141	755	38792	37247	FALSE	10	TCCTGTGACCTTTCGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEPSTAPLTLMWPFPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39796	36534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38887_39750
886302	contig_7207_pilon	-	1513	8	Intergenic	novelGene_72071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	253.955001638367	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	444	854	696514	684310	TRUE	60	AAAAGAAAAGTAAGTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNAPDLI	738055	671658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_684163_684324_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916
886303	contig_9415_pilon	-	1257	8	Intergenic	novelGene_109937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	238.172120920299	129	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	121	603	2490739	2468122	TRUE	65	CAAATTCATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSGLLSWTLSRVLWLSGLSERGAARRPQIMEEKALEVYDLIRTVRDPEKPSTLEELEVVTEGCVEVQEINEDYCLVIIRFTPTVPHCSLATLIGLCLRVKLQRCLPFKHKLEIYISEGTHSTEEDINKQINDKERVAAAMENPNLREIVEQCVLEPD	2490859	2451892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2452132_2465531_2465660_2466910_2467173_2468096_2468220_2470587_2470634_2472695_2472746_2481742_2481908_2490615
886304	contig_13519_pilon	+	4059	14	Intergenic	novelGene_124618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	359.197148813818	1135	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	193	1917	66179	120612	FALSE	30	TAAGACCCCAGACGCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	56967	122754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
886306	contig_12079_pilon	+	2913	8	Intergenic	novelGene_67528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCGCGCTGACTTCCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860603	872424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864706_867252_867409_868245_868414_871500_871555_871641_871724_872313
886307	contig_6069_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_8070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCAGCACAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550797	549409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_549400_550800
886308	contig_11176_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_123450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAACAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138954	137321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_137300_139000
886309	contig_7079_pilon	+	1810	5	Intergenic	novelGene_129237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	490.939405629656	1106	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	146	346	342612	348688	TRUE	60	AGAAAGGCAAAAAAATACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDKGRRRHEWGPCGRQTRGPRRSSSAEHTLHPPSGPREPATLRDAWTEMLDTGYRSCSAVPGAAPWSRALLDQIRQGIQLNKTPGGPRELNAAATTTELRGAGGGPDARDAEEK	342466	350966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343000_348275_348318_348589_348706_349519
886310	contig_6958_pilon	-	6919	4	Intergenic	novelGene_69925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	570.441544380803	1250	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	164	1204	190008	154300	FALSE	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHPQSSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQVTPGRREELWPRHHPQSFLPAVSGTLTPDWLLWPPALPSEQ	190171	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_154590_160928_161061_183108_183418_189698
886311	contig_15304_pilon	-	1095	3	Intergenic	novelGene_30674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_2	5148	29278	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	357	953	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106931
886312	contig_4232_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_63400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCTAGGACAGCTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
886313	contig_3942_pilon	-	668	6	Intergenic	novelGene_128709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1565	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	111	440	430070	429465	TRUE	30	ACCATCAGCCATGTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNIQKSLFKEFPFSTILRGARFLILGWDSESGLHGMCRSYPGAKSWQSKKWRQLGFYGRHWKQTSLWDLVPIWQTSGFSPWYKWQTRLRSSSCSLMGFPLTTTQGTYLWGGCRASVSWALTCMSCVPRSPIAHSVMVSEDTSGA	430180	428113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_428157_428244_428321_428491_428584_429447_429606_429797_429849_429932
886314	contig_10990_pilon	+	3550	16	Intergenic	novelGene_7437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	386.206968117125	37	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1818	1731	3548	722379	750944	FALSE	20	TGTGGTTAAAGTTGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKP	708523	750946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_714557_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749334_749501_750918
886315	contig_15273_pilon	-	3243	5	Intergenic	novelGene_140441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_2	128.397819296124	1752	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	54	596	183531	165604	FALSE	5	TTGTCTTTGTTTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPRRRPEQQQQQEPASMMKFKPNQTRTYDREGFKKRAACLCFRSEQEDEVLLVSSSRYPDQWIVPGGGMEPEEEPGGAAVREVYEEAGVKGKLGRLLGIFENQDRKHRTYVYVLTVTEILEDWEDSVNIGRKREWFKVEDAIKVLQCHKPVHAEYLEKLKLGCSPTNGNSAVPSLPDNNALFVSAAQTSGLPSGIR	183584	162956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_165807_166871_166957_169405_169451_170639_170751_183432
886316	contig_5686_pilon	+	11233	17	Intergenic	novelGene_45238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_16	1610.55958831085	8227	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	58	1983	93843	211355	TRUE	35	GATGACCTTCTGTAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93785	228125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283_215475_219533_222917_224043_224203_226536
886317	contig_20293_pilon	-	7352	14	Intergenic	novelGene_153493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	344.756015261767	2068	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	184	1467	50045	19443	TRUE	50	GTACAGAAGACAATTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	52449	13279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_18613_18890_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323
886318	SIRV6	+	1410	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	81	0	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	25	TGCGTTTGGTCGCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886319	contig_10500_pilon	-	1311	2	Intergenic	novelGene_41300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640221	1638743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1639758_1639924
886320	contig_6732_pilon	+	9521	7	Intergenic	novelGene_177696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25570	199	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	8175	8477	393566	393868	FALSE	40	TATAACTTTCTTTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDRKMRPKEAEKEKREKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTRKRSPTAP	27311	394912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6732_pilon_+_28514_30007_31623_95779_96417_96453_97138_268510_269663_274528_274536_390688
886321	contig_4876_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_137913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCTTTAATGTGATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622368	624318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_622400_624300
886322	contig_8992_pilon	+	3610	8	Intergenic	novelGene_174421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	76.7346341727948	518	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	122	1012	74535	108008	FALSE	25	ATACATGTATATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLCNRARLVSYLPGFCSLVTRVVNPKAFSTAGSSGSDESHVATAPPDICSRTVWPDETMGPFGPQDQRFQLPGNIGFDCHLNGTTSQKKSQVHKTLPDILAEPLSSERHEFVMAQYVNEFQGSDTPVEQEINSAETYFESAKVECAIQTCPELLRRDFESLFPEVTTSRLMIMTVTQKTKNDMTVWSEEVENEREVLLEKFINGAKEICYALRAEGYWADFIDPSSGLAFFGPYTNNTLFETDERYRHLGFSVDDLGCCKVIRHSLWGTHVVVGSIFTNATPDSHIMKKLSGD	73863	110606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_73937_74486_74544_90496_90642_96567_96786_100352_100459_102457_102589_106813_106901_107813
886323	contig_12677_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_110864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3517	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3500
886324	contig_7051_pilon	-	4489	11	Intergenic	novelGene_64280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1174	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACAAAGGTTCCGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209633	183956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_184194_187539_187646_188680_188765_189139_189213_191791_191846_197585_197651_199210_199320_199974_200045_201831_201912_203046_203166_206141
886325	contig_16575_pilon	-	2003	6	Intergenic	novelGene_146498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	67.1428328267433	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1179	1853	26213	17487	FALSE	45	TGAATTGAGTAAAGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRGIRCMLKLKFIVIICSMPVAFS	28021	17336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_26853
886326	contig_7963_pilon	+	2812	12	Intergenic	novelGene_58581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	163.857476873265	681	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	162	2273	260459	269915	FALSE	25	GAACCTATGCTAAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	259734	270454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_259888_260450_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
886327	contig_15449_pilon	+	4111	18	Intergenic	novelGene_33563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	834.478694779874	19	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	429	3002	37166	54674	FALSE	10	ACTTTCTGGTGCTGGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKISRRAQTEEGSLRCARSLMISKKIMFFCF	11183	55783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_12845_12884_14474_14552_15759_15842_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54584
886328	contig_11318_pilon	-	2472	17	Intergenic	novelGene_48137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_16	1023.13237627152	78	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2280	191	2470	49795	13528	FALSE	60	GATTAATAAGAAAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRP	58285	13525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58143
886329	contig_3602_pilon	+	2791	3	Intergenic	novelGene_60604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	1886	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	38	1039	902032	913188	FALSE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901994	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912357_912410
886330	contig_12414_pilon	-	8687	14	Intergenic	novelGene_59656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	535.979455139244	1193	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	7500	8378	787209	760779	TRUE	5	GTATCTGTTTTTGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSCTDCWQHLR	811091	759119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_759320_760669_760802_762802_762811_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129_788698_788783_793283_809539_810634_810673
886331	contig_10331_pilon	-	9352	30	Intergenic	novelGene_54052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2290	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	4756	5178	109745	104132	TRUE	25	TCGCTGGAATGAGGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCFKRCWSFRHQAITVPSLLAVYKWWPSQENVRLTIGLCDLGNVISRTGFKSQVLHNRTIPFSKPPAITLIDTPSGWLEKATEQMISLQWTCPTRSPFTVHSLRSLPPPAESHTVAISPVVSLAETAVTGLLCPAKLCT	114500	25615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_25781_26517_26698_28401_28572_29879_30111_32301_32469_33089_33242_37203_37394_42626_42809_46153_46361_52155_52331_52901_52979_53535_53724_55921_56072_56159_56257_59467_59531_60913_60971_64318_64470_67056_67298_71991_72154_75272_75414_79163_79382_83226_83464_88909_89099_92592_92730_96142_96243_103716_103855_104122_104219_107721_107883_108298_108370_109641
886332	contig_7963_pilon	+	7569	15	Intergenic	novelGene_58433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3963	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGGGTGTCACCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113557	129542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_114515_115833_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121068_121168_121257_121583_121959_122054_122273_122352_122489_122993_123131_123406_123502_123746_124053_125564_126910_129471
886333	contig_8617_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_73423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64137	62027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_64100
886334	contig_10500_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_41303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAAAAATACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640228	1638751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1638800_1640200
886335	contig_3085_pilon	-	8991	5	Intergenic	novelGene_178483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	352	266	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	8458	8802	364147	363803	FALSE	55	GATTGAAGAAGTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMKIQPTRTFQTQQSSTQRSTYTINAHIQREEKTRIKTLTPQLKQREREQQKQPSGIRREQIIKTRAELNEIENRKTIERLNKTKSWFFEKINKIDKSLAKLTKEKQERKQIT	485292	363613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3085_pilon_-_366146_423986_428683_434194_434485_455187_455718_484349
886336	contig_15691_pilon	-	3261	11	Intergenic	novelGene_60761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_6	456.945171765716	157	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	69	1325	114377	29697	FALSE	20	CCCTCCTCTTGTACAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVALLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLK	114445	27760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
886337	contig_7963_pilon	-	850	4	Intergenic	novelGene_58413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTGAGCATCAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63340	56883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_56963_57280_57563_57781_57934_63003
886338	contig_5777_pilon	+	7839	3	Intergenic	novelGene_173312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11215	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	238	696	32207	32665	TRUE	55	GAATATAATAAATTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLSDLRTYYTATVLKTAWYWYNDRYIDQWNRIENQDVNPSIYGHLIFNKAPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPIQKLIQNGSKT	31969	204878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_34768_77542_78032_200326
886339	contig_4315_pilon	-	4494	13	Intergenic	novelGene_46806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	208.95871136556	36	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	1484	3442	350785	328146	FALSE	65	TTAAAAAAGAAAGAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGTMCPQDLPQPKQLLSGPPKPPPSQLRRTGTPSS	352268	327093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759
886340	contig_4782_pilon	-	3534	4	Intergenic	novelGene_73659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	113	568	630888	630433	TRUE	40	AGAAATGGGCAAAGGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHHEDITVINIYTPSDRAPKYIKQTLTAPKREIDKSTIIAGDFNTLLSVQDRTSRKKLEKDTEDINATVNQLDLIDIYRTLNPPAAKYTFFSNAHGTFCRIDYTLGHKASLNRIQSIEILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEKKSNT	631000	532084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_532801_532844_533776_615382_615386_629116
886341	contig_7882_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_175008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGGAGTCCCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222270	223967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_+_222300_224000
886342	contig_4105_pilon	-	3664	16	Intergenic	novelGene_21492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	778.83167772133	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	26	1465	137447	102118	TRUE	30	TTTTAATGCAGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKCWGESSSSSAI	137472	98167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_99375_99438_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102814_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
886343	contig_1150_pilon	-	388	3	Intergenic	novelGene_61452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25453.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATGTTGGTGGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	309128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309845_309927_311002
886345	contig_12733_pilon	+	2285	9	Intergenic	novelGene_129589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_4	436.690966245009	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	523	1701	331160	346988	FALSE	60	CTGATCAAAAAAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEHVNGNGTEDTTSAVIHSENFQTLLDAGLPQKVAEKLDEIYVAGLVAHSDLDERAIEALKEFNEDGALAVLQQFKDSDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGTKVADSSKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGQQPSVGTEIFVGKIPRDLFEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLYNNHEIRSGKHIGVCISVANNRLFVGSIPKSKTKEQILEEFSKVTEGLTDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKTAAQARRRLMSGKVKVWGNVGTVEWADPIEDPDPEVMAKVKVLFVRNLANTVTEEILEKAFSQFGKLERVKKLKDYAFIHFDERDGAVKVNKWRILGI	329278	347572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_331147_331299_332031_332151_332282_332391_335125_335240_335339_335517_344594_344731_345322_345529_346808
886346	contig_7593_pilon	+	3086	3	Intergenic	novelGene_127302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_1	38	9	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTAAAGGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195186	200060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_196495_198038_198171_198414
886347	contig_826_pilon	-	2573	3	Intergenic	novelGene_154931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.5	11	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	25	468	16566	9405	FALSE	40	GTGATTCAGTTTAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRSPCRMWFLVAFLLVSVAAPEVRSPVVNALDLEASAAGNMTNTSKKEETSAERHSDNHTTEPPSKEEHSSTPYLRPASTNGTSDSPDLEQTSQKVDPDRPVSEHATLKDPTDNEQSSISDPNAVPDKGDDQHASRTESGEKVLKLLSEPPRA	16590	7299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_9441_15984_16347_16520
886348	contig_10009_pilon	-	4334	8	Intergenic	novelGene_82722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79187	41544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42018_54586_55301_60319_60407_63216_63355_68603_68814_70217_70384_71481_73501_78660
886349	contig_13894_pilon	+	4272	2	Intergenic	novelGene_62081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2838	3230	431800	432192	TRUE	10	GAGGGACCCCCGTGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLTTVCLTHCVSGTWLHLPNWTANAVKVGIPSSPSYPQAQEPQTSSPHDHLLNEDVSTALTRVRAMESRSVSLGYPVNRDVQIIIKESAGRGLVWPLPLNTYAFKANYPIFKSTRKESTTTLRNTHQS	428962	435100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_432528_434393
886350	contig_960_pilon	-	5795	5	Intergenic	novelGene_108204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	3331	4155	143747	142923	FALSE	30	CACAGCAGCACTCCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKQRPGEYVWERLLRVWDNGARNIKMDQSEFIDMGPLSTDCSFSVSAREVRKGSNSLFGWVAEAWIMRWPTLNQVEVPDLPWYTVEEGIQRLREIGMLEWIYQVRPTDPHMECPEDTPFTTTVRNKFVKGAPASLKTAVIAVLCKPDLTVGTALTELRHLTTVGLIGPRGSRGQVAALNRQRQGGRGYSNGQRSQSSNQNSLTCVDLWRWLLSHGVPRSEIDRKSTKYLLDLYKRLNSRSGEQQSNSNRQNRESRSLNQFPDLSEFKDPQSLE	471294	141282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_145188_302647_302908_340617_340866_432242_432674_470343
886351	contig_6047_pilon	-	2559	17	Intergenic	novelGene_24214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2116	2445	109264	107166	TRUE	40	GACGCTGAAGGAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPRFLTNSSLVIPIPVSVTCSRFFSLSHLILTVSSSFPERAFSSVSDISLILSKASEAFEISSLRKIYLFLYNELMISFIILLTSAWKANFSDFSLSSLIWDAFNPSN	123867	106270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_106368_107148_107290_107806_107925_109176_109511_114652_114763_115032_115153_115884_116002_117938_118077_118158_118239_118356_118426_119280_119547_119760_120050_120624_120675_122418_122498_122582_122738_122978_123100_123592
886353	contig_13004_pilon	+	1830	4	Intergenic	novelGene_112736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	436.398390871868	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	22	537	926404	928299	FALSE	65	CATTAAAAAAGAAAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSALSQRNLKFIAILDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	926382	929592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_926458_926828_926989_927531_927669_928134
886354	contig_15327_pilon	+	1614	6	Intergenic	novelGene_70428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	107.521160708021	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	445	909	49321	53863	FALSE	25	TCCAAAGCACTTCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKQHGDVVSAIKAGGDETKLLVVDRETDEFFKKCKVIPSQEHLDGPLPEPFINGEIQKENSQEAPAEEAAPESPWPALGRTTSSDTSEELNSQDSPKKQDSAVPSSASSSSDPILDFNISLAVAKERAHQKRSSKQAPQMDWNKKNELFSNF	35979	54568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36337_48223_48296_49305_49460_51741_51783_53348_53442_53671
886355	contig_12292_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_167020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAATGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385822	387604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_385800_387600
886356	contig_12183_pilon	-	6616	4	Intergenic	novelGene_178484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1335	5280	6614	1400	15	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIH	138194	12	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12183_pilon_-_1177_1227_3106_134566_136410_136463
886357	contig_9668_pilon	-	2651	17	Intergenic	novelGene_58180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_12	863.327137355099	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	540	2330	585955	503609	FALSE	20	TTTCCTGAAAGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669913	503287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_604202_604274_605301_605374_610344_610514_662727_662779_669866
886358	contig_2170_pilon	+	7938	4	Intergenic	novelGene_178380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3043	3387	149984	150328	TRUE	35	TAGAATGAATTTGGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGKSVPGFTAQPGQKAQRHTMPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKKKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSRKT	146941	324560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2170_pilon_+_151276_187423_187446_309213_310798_322562
886359	contig_8864_pilon	-	3178	1	Intergenic	novelGene_135966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCTTTGAATTACGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59910	56732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_56700_59900
886360	contig_1450_pilon	+	2352	3	Intergenic	novelGene_27423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	1631	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	20	CCATGATGGTGAAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423385_424024
886361	contig_1301_pilon	-	2509	12	Intergenic	novelGene_47319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	928	junction_10	324.863353345845	40	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	83	1291	322831	279341	TRUE	70	AGAAAAAGAGAAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKR	322913	269181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
886362	contig_16303_pilon	-	3835	7	Intergenic	novelGene_34076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_5	628.87980215265	896	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	53	1165	47976	35759	FALSE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48028	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
886363	contig_8631_pilon	-	2002	3	Intergenic	novelGene_121990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	182	junction_2	12	1139	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	53	394	874281	862274	FALSE	25	TTTACTATAGTCACAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAGAQAAAAGSRAPGIMYYKFSGFTQKLTGAWASDAYSPQGLKPVVSTEAPPIIFATPTKLTSDSAYDYAGKNKVPELQKFFQKSDGVPIHLKRGLPDQMLYRTTMALTLGGTIYCLIALYMASQPRNK	874333	860665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_862415_863663_863793_874209
886364	contig_6102_pilon	+	1485	5	Intergenic	novelGene_31834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.906371583389	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	96	731	370803	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370707	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371111_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
886365	scaffold_12124_pilon	-	2251	10	Intergenic	novelGene_22345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1048	1383	1508404	1508069	TRUE	20	AGTTGACCCCGACTCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509559	1483695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1509103_1509210
886366	contig_7025_pilon	-	3871	20	Intergenic	novelGene_104370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	811.795858104399	1985	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	764	2491	85393	49239	TRUE	40	TTGATGAAATCTGATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95098	47655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_48421_48623_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90729_90883_90969_91018_94786
886367	contig_12677_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_110847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3020_3075
886368	contig_6630_pilon	-	2232	5	Intergenic	novelGene_30702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	398.317947750287	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3	305	372608	358583	TRUE	45	AAATAAAAAGATGTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYAR	372610	355886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358586_367694_367844_370546_370602_372512
886369	contig_7843_pilon	-	2379	6	Intergenic	novelGene_152008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	265.316867160759	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	135	452	197252	183048	TRUE	35	AATGTTTAGGGTAGCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAASSEHFEKLHEIFRGLHEYLQGAPERLLGTAGTEEKKKLIRDFDEKQQEANETLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLQSAAVSKGIASARH	197386	176812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_188031_188132_190893_190953_197137
886370	contig_11855_pilon	-	4594	1	Intergenic	novelGene_66980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTGAAGTTGTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100740	1096146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1096100_1100700
886371	contig_16594_pilon	-	4019	9	Intergenic	novelGene_53820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2317.06311955458	308	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	295	1164	165546	121101	TRUE	70	GAAAAAAGAGAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306538	115713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306346
886372	contig_5686_pilon	+	3047	2	Intergenic	novelGene_45375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	748	1062	143970	144284	TRUE	35	ATTCAGCATCATAGCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIIIIIPIITTTKTVAIESIPTHGDPMCVRAELCSTGFSVTAFSEVDHQAFLPRAPLRGLELPAFQLAAKCVNCLHYPGTPNNNTINFTECVPSAGIYKFDVA	143222	165735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_146253_165718
886373	contig_4105_pilon	-	3769	16	Intergenic	novelGene_21497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	753.182285742008	2	88	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1382	1798	102811	100151	FALSE	30	CTTTAAAGTTCATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137472	98179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109012_109057_109098_114244_114380_115284_115340_116990_117103_119337_119547_121847_121986_137434
886374	contig_17440_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_7566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	371	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_3000
886375	contig_19722_pilon	+	731	7	Intergenic	novelGene_171895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.9769506828821	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	3	731	68340	81782	FALSE	10	TCGGTTTTTTTTCTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAVVRRLWESSSSNGSGVWLASPKPSRAARSPRGHHSRSHSCSRSGDRNGLSHQLGSLSQSSRNQPYRSRSRSRSRERPSGPRGTPFASASSSAYYGGYSRPYGGDKPWPSLLDKEREESLRQKRLSERERIGELGAPEVWGLSPKNPEPDSDEHTPVEDEEPKKSTTSASTSEEEKKKKKKSSRSKERLKKRRKKKSSKRKHKKYSDDSDSDSDSETDSSDEDTKRRTKKAKKKEKKKKHRS	68337	81782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_68348_68413_68468_68522_68832_75202_75284_76545_76617_76801_76943_81717
886376	contig_13004_pilon	+	1907	5	Intergenic	novelGene_112693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	344.505805466323	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	264	896	923669	928299	FALSE	10	ACCTTGGCTTCTTGGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837698	929310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
886377	scaffold_12124_pilon	+	3015	9	Intergenic	novelGene_22240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3130.97536470267	93	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	38	457	1473608	1508039	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494299_1497068_1497122_1506629_1506687_1508010
886378	contig_2125_pilon	+	4308	3	Intergenic	novelGene_147741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2298	junction_2	1884	1447	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	215	349	676489	682094	FALSE	20	ACCCCAGCCTCTTACCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVDPLSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEAIVHVVETPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK	674630	686053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_674747_676390_676558_682028
886379	contig_9363_pilon	-	4869	31	Intergenic	novelGene_6768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_11	291.346042819645	1957	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1170	3513	152	3664	1548961	1506537	FALSE	15	AATTCTGCCCAGTTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1549112	1505331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
886380	contig_20753_pilon	+	4495	2	Intergenic	novelGene_168253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	0	1051	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAGCAAAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39916	69665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_+_40181_65434
886381	contig_10659_pilon	-	5356	4	Intergenic	novelGene_178486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	123	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	2979	3584	23117	22512	TRUE	40	GGGAAATTCCTCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIENLKDSIRKPLKLIQRFSRVAGYNINIQKSVGFLYTNKENNEKEIRKTIPFIIAFKKIKYFGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGKLNIVKMRILPKAIYKYKAILIQLPTFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALWKKKKKVGGLTLPDLRTYYTAAVVKTAWTGTTTDTLTNRTGLRTQM	169124	15905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10659_pilon_-_17029_21862_24228_99055_99684_167884
886382	contig_15021_pilon	-	4239	28	Intergenic	novelGene_26972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	635	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3572	3964	332281	324694	TRUE	30	GAGAAGAGGCTACGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFGNSNSRRGLRLQSGNNVLPGFHDGIQLPRDHDGEALVFGEGQLQVRACPLHDLKADFCLLTFSELVHVLVLPLLQGHMEHLSDDRSLDGPDLAAPGPGQLLGILQAGRLLGERREGILVGRRVTLLF	353735	280083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_280167_321186_321249_322330_322445_324677_324835_326024_326242_332246_332453_332674_332892_333103_333313_333451_333560_334695_334802_335114_335195_336589_336729_338548_338653_338749_338865_339780_339867_340024_340156_343843_344064_346165_346369_346635_346728_346940_347079_348984_349142_349425_349531_349878_350015_350610_350753_351921_352109_352590_352708_352982_353112_353256
886383	contig_8365_pilon	-	515	4	Intergenic	novelGene_150916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.29983164553722	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTATTGGTGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210794	110677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_110902_118266_118278_175907_176023_210629
886384	contig_10904_pilon	-	353	2	Intergenic	novelGene_22569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTAGCTTCCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411677	411053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636
886385	contig_11825_pilon	+	3107	24	Intergenic	novelGene_155392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	492.924247526556	116	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1031	3093	13	3105	10468	87130	FALSE	55	AAAGAAAAATGCAAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPNMWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQLQEKKIQEKIQEEEQKAVEKQCKDKGGTASALVNYRALYPFEARSHDEMSFNSGDIIQVDEKTIGEPGWLYGSSKGNFGWFPCNYVEKMSSSEKALSPKKALLPPAVSLPATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPASVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEAVYASVNKKPTSAAYTVGDEYIALYSYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWAGSIGARTGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGTSNKKPEIAQVTSAYMASGSEQLSLAPGQLILI	10455	87132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051_65201_66028_66127_77431_77608_77912_78058_81715_81922_83958_84024_84580_84748_86902_86949_87050
886386	contig_10126_pilon	-	1447	2	Intergenic	novelGene_105756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165284	163770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_164393_164459
886387	contig_8310_pilon	+	3487	20	Intergenic	novelGene_75551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	361.445834687222	863	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1121	2173	308015	324814	FALSE	75	ACAATACAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215088	326128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303868_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
886388	contig_8357_pilon	-	3010	3	Intergenic	novelGene_39733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATAAAGAAAACAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779597	695224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_695761_776458_778838_779502
886389	contig_7356_pilon	-	1703	3	Intergenic	novelGene_60392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	945	junction_1	122.5	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	215	310	434019	433924	FALSE	40	GTCAATAAAAAATGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSSEFVFNNPNIKGTCGCGESFNI	437529	432530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_434073_435516_435623_437474
886390	contig_4952_pilon	+	3621	12	Intergenic	novelGene_145515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_2	145.330230967469	991	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	69	1754	332739	454157	FALSE	55	AAAAAAGAGATTGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPAATAATAYEACRVPGASGTMRPGPGGCCCRRPTRANGCFANGEVPNGYVRSTAAAAAAAAGQIHHVTQNGGLYKRPFNEAFEETPMLVAVLTYVGYGVLTLFGYLRDFLRHWRIEKCHYATEREEQKDFVSLYQDFENFYTRNLYMRVRDNWNRPICSVPGAKVDIMERQSHDYNWSFKYTGNIIKGVINMGSYNYLGFARNTGSCQEAAARVLEEYGVGVCSTRQEIGNLDKHEELEKLVATFLGVEASMAYGMGFATNSMNIPALVGKGCLILSDELNHASLVLGARLSGATIRIFKHNNMQSLEKLLKDAIVYGQPRTRRPWKKILILVEGIYSMEGSIVRLPEVIALKKKYKAYLYLDEAHSIGALGPTGRGVVDYFGLNPEDVDVLMGTFTKSFGASGGYIGGKKELIDYLRTHSHSAVYATSMSPPVVEQIITSMKCIMGLDGTSLGKECVQQLAENTRYFRRRLKEMGFIIYGNEDSPVVPLMLYMPAKIGAFGREMLKRNIGVVVVGFPATPISESRARFCLSAAHTKEILDTALKEIDEVGDLLQLKYSRHRLVPLLDRPFDETTYEETED	332670	456024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_332868_355900_356096_381347_381503_384289_384439_386788_386914_398188_398283_399566_399673_400398_400619_407004_407132_442835_442972_445583_445714_454037
886391	contig_12677_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_110772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCGTAGGCCTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	2703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2700
886392	contig_15410_pilon	-	3360	1	Intergenic	novelGene_130599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	264	671	141220	140813	NA	50	ACAAAGAAAACGTCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTLTKGGVQDNIQRRKEGTLVLTCKRPQRCAGPSSSSPSTASGTSPPTTSRPPLKVRPNPAGPRISSTQNKPEVWGGFEAEHASSWVTLGSVVLVSRVSDRRCYRKDTGPLRLSVPKTVALNRRIGAIPGTGV	141483	138123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_138100_141500
886393	contig_19564_pilon	+	2591	19	Intergenic	novelGene_29685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.70871747533	25	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2172	419	2590	99199	106993	FALSE	15	GTGGGGCCAGAGGAGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGPIDPKELLKGLDSFLNRDGEVKSVDGISKIFSLMKEARKMVSRCTYLNILLQTRSPEILVKFIDVGGYKLLNNWLTYSKTTNNIPLLQQILLTLQHLPLTVDHLKQNNTAKLVKQLSKSSEDEELRKLASVLVSDWMAVIRSQSSTQPAEKDKKKRKEEGKSRTTPPERPLTEVKAETRTEEAPEKKKEKPKSLRTTAPSHAKFRSTGLELETPSLVPVKKNASAVVVSDKYNLKPIPLKRQSSTAAPGDAVPPAEKKYKPLNTTPNATKEIKVKIIPPQPMEGLGFLDALNSAPVPGIKIKKKKKVLSPTAAKPSPFEGKTSTEPSTAKPSSPEPVPPSEAMDTERPGTPVPPVEVPELMDTASLESGALDAKPVESPGDPSQLTRKGRKRKTVTWPEEGKLREYFYFELDETERVNVNKIKDFGEAAKREILSDRHAFETARRLSHDNMEEKVPWVCPRPLVLPSPLVTPGSNSQERYIQAEREKGILQELFLNKESPHEPDPEPYEPIPPKLIPLDEECSMDETPYVETLEPGGSGGSPDGAGGSKLPPVLANLMGSMGAGKSPQGPGGGGINVQEILTSIMGSPNSHPSEELLKQPDYSDKIKQMLVPHGLLGPGPIANGFPPGGPGGPKGMQHFPPGPGGPMPGPHGGPGGPGGPVGPRLLGPPPPPRGGDPFWDGPGDPMRGGPMRGGPGPGPGPYHRGRGGRGGNEPPPPPPF	92466	106994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_92542_92631_92964_99187_99306_100004_100092_100257_100394_100795_100848_102870_102949_103087_103262_103520_103627_103743_103857_104365_104467_104720_104869_104946_105106_105211_105459_105632_105697_105801_105997_106182_106259_106515_106630_106778
886395	contig_1725_pilon	-	3042	1	Intergenic	novelGene_24298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2056	2400	216588	216244	NA	40	GAAGTCAAGCGATACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNARINSQLEIIQKQLEIQKIKNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLYTTLFEEKSEKRRKKNEETLRIMWDTIKSKNLLVIGIPQRGEKRRHKEDH	218643	215601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_215600_218600
886396	contig_8866_pilon	-	2353	7	Intergenic	novelGene_77763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	453.453201064405	198	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	115	627	418087	348825	TRUE	35	AATACATGGTATTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRAAPEPGPGGKERRAGIATPAPASGRVSCGVGHLEDMEGRPAETNANVDNSASLSVAQLAGRFREQAAAAKETPASKPTRRKPPCSLPLFPHKVELGQNGEEKSPPNASHPPKIKVKSSPLIEKLQANLAFDPVALLPGASPKSPGLKAVVSPFHSTPQNPLEKWRVATPQSRKKMRKRERRGVAFLRQSATLRLALPSWRPVARP	418201	340653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_342354_348798_348979_352398_352488_356563_356636_361315_361406_363336_363439_418081
886397	SIRV6	+	713	2	ISM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	8279	129	514	-129	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTAGAAAGTTAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10751	11561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11109_11205
886398	scaffold_12124_pilon	+	3280	10	Intergenic	novelGene_22329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	635	junction_1	2979.02902815956	120	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1554	2333	1508626	1509405	FALSE	45	AAAGATTAGACAGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483572	1510352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
886399	contig_11338_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_6240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	57	554	14324	14821	NA	40	GAAAATAAGTGATCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVPFSLGSGRSRHTGKTRSFPKTVQGRPMCWPPPRPHLRKPTVRAPGGWLDTQGGLRAGHNRSGHSPSCSSILSHSSSTKCFTFFRLRLLFRTSARMRPGVPTTTCGQFFFSTSSSFLMERPPKNTDTCRDREKLLLPTKDEGSAPVQANARPMALQAQACSP	14267	16406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_14300_16400
886400	contig_12635_pilon	-	1500	9	Intergenic	novelGene_60814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_8	352.789154453478	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	162	1112	227344	180623	FALSE	15	ACCTTTTGTTATTTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSRYVFFQG	262769	180234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_262709
886401	contig_2219_pilon	-	1859	2	Intergenic	novelGene_67175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	352	657	105896	100042	FALSE	75	ATAATTAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPLVSVTPLSLVFLLEFDFCTTLFSCSTRDSLLYSPSGQSLVVASDCSDQDHNRRFWTELEKDVEHNSNSQKKTRFTRLEETGETPRVWPPDTLLAQ	106247	98839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_100202_105750
886402	contig_8538_pilon	+	1944	2	Intergenic	novelGene_4643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8832	junction_1	0	23741	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	49	1878	841232	843061	FALSE	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840329	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228
886403	contig_15021_pilon	+	2948	12	Intergenic	novelGene_26977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_2	133.372528674231	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	843	2318	322371	334985	TRUE	45	GAAAGGAGGTGCAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVAVLTQESFAEHRSGLVPQQIKVATLNSEEESDPPTYKDAFPPLPEKAACLENAQELAGAWSSKIRPIKASVITQVFHVPLEERKYKDMNQFGEGEQAKICLEIMQRTGAHLELSLAKDQGLSIMVSGKLDAVMKARKDIVARLQTQASATVAIPKEHHRFVIGKNGEKLQDLELKTATKIQIPRPDDPSNQIKITGTKEGIEKARHEVLLISAEQDKRAVERLEVEKAFHPFIAGPYNRLVGEIMQETGTRINIPPPSVSRTEIVFTGEKEQLAQAVARIKKIYEEKKKKTTTIAVEVKKSQHKYVIGPKGNSLQEILERTGVSVEIPPSDSASETVILRGEPEKLGQALTEVYAKANSFTVSSVSAPSWLHRFIIGKKGQNLAKITQQMPKVHIEFTEGEDKITLEGPTEDVNVAQGQIEAMVKDLVSCGRAGKEHVGCASWRCIGWRQGKGQALRQSGRPSRRTVSRRDLVLKRNPAGEPEGQSC	321528	339843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_322447_324679_324838_326027_326244_332248_332456_332677_332894_333107_333315_333453_333562_334697_335195_336589_336730_338549_338655_338751_338866_339781
886404	contig_7815_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_134413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	90	455	888843	888478	NA	45	AGCTACTGGAACCAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRAGGAILISDKTDFKVKSTIKHKEGHYIMIKGSTYQKNITIINIYVPKDRAPKYIKQTLIALKRETDSSTIIVGNFNSPLSVKDRPSRKKHNKDTENLNATINQLDIRDIYRTLHPRAAKYTFFSNAHGTFSRIEHILVTKQALTKSKT	888932	887006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_887000_888900
886405	scaffold_12124_pilon	-	4808	3	Intergenic	novelGene_22123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	133.5	124	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGCATTTTCTTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987378	936109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_940548_942747_942805_987065
886406	contig_3747_pilon	+	2648	8	Intergenic	novelGene_24829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	329	1420	201313	203939	FALSE	65	CTTTGTAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDFPM	200984	205167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203588_203924
886407	contig_11548_pilon	+	3038	6	Intergenic	novelGene_66766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_1	1305.61688101832	27	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	47	637	112832	119638	FALSE	65	GTAATAAGTGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDSCYWLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112576	122039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112595_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
886408	contig_2646_pilon	+	1733	10	Intergenic	novelGene_69512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	249.381209505289	1849	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	848	1414	566553	573396	FALSE	35	GGTATTCTGAAGATCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554002	573715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560734_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
886409	contig_3077_pilon	+	5078	5	Intergenic	novelGene_26785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	4204	4506	532548	532850	FALSE	40	GAATAAGCTCAGACTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDRNHNRRSWTELEKDVEQNSNSCTQKKTRFTGLTDWRKPESMAPGHHFSSVVKPLPKFTIQLGIGQPHKTKRD	393529	533422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_396266_396509_396935_447193_447230_531285_531487_531742
886410	contig_15977_pilon	+	9118	3	Intergenic	novelGene_137212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_1	57	2221	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	84	1403	77599	78918	TRUE	40	AGAAAACCCTGTTACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISGLRFETQLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEIRFYQLGEEAMEKFREDEGFLREEERPLPRRDFQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASPSQDLFRTASNGTSGAPAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDVVAIIPYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSTFPQTTFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV	77515	97450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_80519_83878_84001_91457
886411	contig_17281_pilon	+	3434	1	Intergenic	novelGene_105175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1512	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1834	2190	1846	2202	NA	45	GATGGAAGAAAATTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDELCSAQVRLKSEVSGEVGGSKGLPHQSLKPVSWQLLGRLLTEELTVYSKSSLNPCRFSYPSASPTRSGGSIHHSRRSTLAPSHSLPDDGSAICSGHGPVFPYAEKPSKLNGGLED	12	3446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_0_3400
886412	contig_8992_pilon	+	1522	8	Intergenic	novelGene_174422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	70.3312860391332	678	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	175	1065	74535	108008	FALSE	25	GATTTAGTGTAGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLCNRARLVSYLPGFCSLVTRVVNPKAFSTAGSSGSDESHVATAPPDICSRTVWPDETMGPFGPQDQRFQLPGNIGFDCHLNGTTSQKKSQVHKTLPDILAEPLSSERHEFVMAQYVNEFQGSDTPVEQEINSAETYFESAKVECAIQTCPELLRRDFESLFPEVTTSRLMIMTVTQKTKNDMTVWSEEVENEREVLLEKFINGAKEICYALRAEGYWADFIDPSSGLAFFGPYTNNTLFETDERYRHLGFSVDDLGCCKVIRHSLWGTHVVVGSIFTNATPDSHIMKKLSGD	73873	108465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_74000_74486_74544_90496_90642_96567_96786_100352_100459_102457_102589_106813_106901_107813
886413	contig_6050_pilon	+	2512	2	Intergenic	novelGene_123108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGCAATGATGGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79721	185536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_+_80780_184082
886414	contig_4091_pilon	+	4468	7	Intergenic	novelGene_173020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	624	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1723	2049	222414	375426	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPHDTPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKSDKHEEKIDKFMENMDKKLEKFRKIMQEQNAKINSQQEIIQRQQLEIQKINNMISEMDGCHRRAEK	10946	381191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11061_11102_11702_187114_187124_221413_222715_375400_375619_378722_379127_379368
886415	contig_8377_pilon	-	5463	5	Intergenic	novelGene_35103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	4197	4559	162313	161951	TRUE	15	GTTTCCAGGTAATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCKQIARLFFQGASDWTQTSNNELFNCLYYPGTPDVTSDNGISSSLSLLSLRATSEAHLTLGLETRDGPLVGVNGLCLTTSQKLGGSNPSNGTTEERPIKMCFHKYYSQENHMELSSTL	174755	154940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_154990_155713_155843_161224_164588_169243_169307_172896
886416	contig_12677_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_110854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCATCCATTGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3800
886417	contig_7056_pilon	-	2039	13	Intergenic	novelGene_43620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1072.18604249553	170	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	69	1400	730480	722536	FALSE	10	TGCAATTTGTCTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYGKHDSLSCPV	731015	721896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722550_723705_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
886418	contig_16541_pilon	+	3323	1	Intergenic	novelGene_126731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	944	1288	296610	296954	NA	25	CCCATTCCTCACTTATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAIGWSVWYISMRSSWLIVASRSSVPLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTMVMELSLFLMLLEFVLCILEHCH	295666	298989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_295700_299000
886420	contig_15866_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_63616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1079	1378	396368	396069	NA	55	GAAAAAAAATTATCTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTASWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWHKADWRNPESMAHRHPFSSLVKSFLRFTVQPGSGQPHKTKWD	397446	395633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_395600_397400
886421	contig_9653_pilon	-	4993	14	Intergenic	novelGene_48179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	672.228995570116	857	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	184	1593	196924	175913	TRUE	20	GGTGAGAGAGATGCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	201017	168507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_168630_171526_171607_172714_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200896
886422	contig_854_pilon	+	3099	17	Intergenic	novelGene_36613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	2927.90855323279	1026	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	1	2508	1692680	1715383	FALSE	20	AAGGGGTTTTCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1692679	1715974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
886423	contig_14467_pilon	+	3672	9	Intergenic	novelGene_138256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.96862696659689	76	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	219	794	318578	319153	TRUE	20	TCTCGGGCCCAAGGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306536	351771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_317514_317642_318509_321274_321480_321587_322015_322124_322254_322506_335306_335482_347827_347888_351713
886424	SIRV6	+	921	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	16	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	194	685	1733	10736	TRUE	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1153	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1638_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886425	contig_9921_pilon	+	5811	3	Intergenic	novelGene_23754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	58.5	1412	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	303	1478	321085	322260	FALSE	20	CATCTTGTCAGTTATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPNATNVTCYYQPAPYVSDGNFNNYYVAHPPVTYSQPYPTWLPCN	299194	326593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_319519_319701_321058
886426	contig_567_pilon	-	4376	1	Intergenic	novelGene_33977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	698	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	258	777	975	1751	346807	346031	NA	35	AAAATCTGAGCCCTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHLRTLKRLITKWLLNGTLIKMQKIKKQQTEDLKKQLRHTRCYQMLKNETFYDKYGKEGLNGGSGSHFDDPCENSFRVCRPDNVFKEFFGQRNPFSFDFFEDSLEDLLNTPRRPYGSRSSRGAESFLSTFSEYPAFESRFSSYDRGYTSSGSLGHEGHTSFSSMTFDDNGMGNYICVTTSGKTVNGGNINVRRITENDQEREEVEDDGELKSFLINGMADEEGFAEECSWRRQSFSNYSSNSCSSKHVCTSVYFCRQ	347781	343405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_343400_347800
886427	contig_12638_pilon	+	3122	10	Intergenic	novelGene_33364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	86.8802212215541	898	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	584	1882	1515842	1538931	FALSE	25	GTTTACAAGGGCTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515258	1540171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799
886428	contig_11525_pilon	-	2797	3	Intergenic	novelGene_171079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTCTCCAGGGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62702	56968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_57040_59724_60930_61181
886429	contig_8453_pilon	+	2477	2	Intergenic	novelGene_125127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	63	1586	198157	355624	FALSE	60	AAAAAAGGTTTAAACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVNNPTTCQPSPFSTLFFFVKIYTAVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIK	198094	356515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_199664_355607
886430	contig_7704_pilon	+	2963	13	Intergenic	novelGene_154618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_5	1000.79164151297	1978	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	288	1097	345890	355670	TRUE	35	AGGCTCATAACACCCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETVICSSRATVMLYDDSNKRWLPAGTGPQAFSRVQIYHNPTANSFRVVGRKMQPDQQVVINCAIIRGVKYNQATPNFHQWRDARQVWGLNFGSKEDAAQFAAGMASALEALEGGAPPPPPTAPPTWSVQNGPSPEEVEQQKRQQPVQPEHVERERRVSSTGGPPAPPSWGATPTSRTTPSSRSPSAPRVCPPQGSRLQGKEQEEAHPLRPLSPRHRAPAVEGPEPLDWPQPLPAPNSGKSASRRRPQRGPRLPKPRAAGAQVGSWKR	345602	359657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_345895_352497_352670_352777_352944_354477_354566_355065_355122_355235_355480_355591_355690_356652_356702_356853_356891_357110_357157_357301_357393_357916_357975_358091
886431	contig_16870_pilon	-	2279	20	Intergenic	novelGene_155514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_19	88.7453326773987	28	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	1213	2277	199125	195414	FALSE	20	CCAGCAGCTGCAGGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGVEELQKKLEMSELLLQQISSASDKSEVLQQAQAEQAKLESRIEQLMEIVKQLQIERDHYAETLKTESAIWRQQAQQLLEQVQTLGEEKEHGVVRVQELEASLAELKNQTAVPPPEEPPPGPSEEEQRLHAEAERLQKELERLTGQLHFHLKDNETLTHQNQEQEQKLRELQRIAECWNEQEAAREKILETMQNDRTTISRALSQNRDLKEQLAELQDGFVRLTNENVELTTALQSEQHVKKELAKKLGQLQEKLGELKETVEVKSQEAHSLQEQRDQYLSDLQQYMAAYQQHVAAYQNLTSEKETLQKQLQLQTQLMEQLQLEEAQRKMAAEVVRQELQQTQERLEAASQQ	208874	195411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_195441_195525_195772_196501_196616_196927_197266_197706_197795_198281_198390_198506_198588_199062_199205_199521_199581_200599_200901_200988_201052_201326_201366_202226_202308_202502_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_206376_206458_207462_207586_208773
886432	contig_9668_pilon	+	4651	18	Intergenic	novelGene_58101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	422.802824462778	1766	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	146	1312	214129	359314	TRUE	5	CGCGGCAGCGGCGGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRRYRPTIPGGRAGRRFVSGLRGARSLRGPCCRCLFNGRGSDAEGWKMAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	213983	417794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138_361551_366858_366940_373727_373842_373983_374063_383656_383767_383861_383975_386776_386920_408409_408540_411672_411793_412454_412524_417650
886433	contig_12183_pilon	+	5329	5	Intergenic	novelGene_178485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2414	2818	3770	4498	TRUE	60	GGGAGGAAGAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRGIQAACSFEPRARGPGKQMSKRTKAPVLARAADQTRKEPHTRMQPPQPHRKGQRRRLEPGT	1266	194245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12183_pilon_+_3425_3514_3989_4312_5066_57574_58209_192935
886434	contig_10331_pilon	+	5518	7	Intergenic	novelGene_54076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	340.815688214808	9	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	36	800	89079	109782	FALSE	20	TGTTTTCCTACACATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICGLSRNFCLLMTYSKEQGVRSMNSTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPINFIQSSQQYQPSEIEMESQIHLYGHTEEITSLFVCKPYSIMISVSRDGTCIIWDLNRLCYVQSLAGHKSPVTAVSASETTGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEGVSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSHKPIVSLTFSCDGHHLYTANSEGTVIAWCRKDQQRLKQPMFYSFLSSYAAG	89043	114500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_89101_92594_92732_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643
886435	contig_5125_pilon	+	2930	8	Intergenic	novelGene_43416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	1723.11059495581	23	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1091	1837	53912	58893	FALSE	20	TTAATGTTTGTATCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25950	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_36038_36148_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
886437	contig_15498_pilon	-	4185	15	Intergenic	novelGene_42641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	179.143384027478	2349	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	10	1329	697708	688241	TRUE	35	CCCAGCCCGAAGGCCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697717	675390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_675456_679259_679549_681328_681429_682088_682116_685865_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
886438	contig_9049_pilon	+	2010	8	Intergenic	novelGene_83139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1469.82804769671	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	36	728	88356	112652	TRUE	60	TCAAAAAGAAACACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88320	114128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112792_112985
886439	contig_854_pilon	+	7471	42	Intergenic	novelGene_36489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_38	3114.46363476959	1274	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1956	5871	176	6046	1649514	1714980	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612770	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712449_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
886440	contig_10990_pilon	-	1959	4	Intergenic	novelGene_7506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCTTTCCTGCAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753823	751068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751085_751450_751518_751883_753670_753733
886441	contig_21007_pilon	+	1857	1	Intergenic	novelGene_161507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	589	1011	589	1011	NA	35	TAAAAACTACGTATCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	0	1857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_0_1900
886442	contig_15991_pilon	+	1036	7	Intergenic	novelGene_70899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29525	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	730	822	103606	103698	TRUE	30	GCCAGCAGGCCGGAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRNRCLFPSTSLLFSKITLCKGSLRPLGGGSHPLGGLSRGGCRPVFSCRLSTPVFCRELLNGHRGHLHALGPVCHLRLSSCKFRSRSSPFTLKFFLGHSLFSSRLLFLFNLFRISVEVEVRHDLPRVLPGNGATHAQDFPGQHPPHQTNRVRSLVVARDGNVHVAQRRVRVTQSNGGQVHVRRLCERLVVSPGVGHHQKTRLPEGCLDLVSEGSRSEAPGNGSGSSSSSKLQHRPTWPVFLEDMTLTSAGFSMATMARAANRSFSHVLFRFMM	100375	106359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100543_100885_101049_101159_101288_102023_102271_103581_103702_104974_105140_106313
886443	contig_8045_pilon	-	2182	3	Intergenic	novelGene_35398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	884	1186	118535	117385	FALSE	85	AAAAAAAAAAAACCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFISFGASFSMKSVYIFLAFEDSFWGDLVFLKSSQASQNSIFSSQNSDFKKALNAARPYLLASSSSNASDQSWASSGDGLQKKFCTLAWRHQNSPFQSSS	119418	116388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_117513_118075_118241_118525
886444	contig_5574_pilon	-	3859	12	Intergenic	novelGene_155823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1271	junction_2	427.036085339188	1355	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	6	1544	141980	59952	FALSE	25	AAGCCCAGCATTCTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCIKSKRKDNLNDDGVDLKTQPVRNTDRTIYVRDPTSNKQQRPVSESQLLPGQRFQAKDPEEQGDIVVALYPYDGIHPDDLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLSTKREGFIPSNYVAKVNTLETEEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	141985	57636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_60155_78596_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363_131517_132909_133060_133571_133676_134201_134301_136858_136965_137531_137578_141848
886445	contig_20199_pilon	-	1254	3	Intergenic	novelGene_82563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	440	78	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	206	304	43987	43889	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVSKSK	44192	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42158_43764
886446	contig_20641_pilon	+	1747	7	Intergenic	novelGene_52812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	64	1455	14599	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
886447	contig_9609_pilon	-	5677	23	Intergenic	novelGene_22995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGCCGCTCGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333323	309972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310031_311499_311590_313098_313264_314272_314431_317882_317951_318438_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322804_323228_323360_323984_324070_324250_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330303_331386_331487_331563_331692_332692
886448	contig_3601_pilon	-	3546	1	Intergenic	novelGene_132854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1734	2039	130167	129862	NA	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131900	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_128400_131900
886450	contig_6325_pilon	-	3800	7	Intergenic	novelGene_143347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_6	93.5867096452387	61	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	102	515	182776	127592	TRUE	20	TAGTTTATATTGCCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVSIRSHV	182877	115343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_116635_118233_118341_125704_127704_128782_128892_130009_130129_182201_182263_182763
886451	contig_15691_pilon	-	4401	16	Intergenic	novelGene_60746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	139	junction_15	584.2445226292	621	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	15	1748	187699	18031	FALSE	40	TTACTCATCATGAAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNKNKKEKESPKAGKSGKSSKEGQDSDQEIASRKNSLVAIQSATSNKIKVSVPQPIVKKDKRQNSTRFNTSNNRELQKLPSLKDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYAGYRQASALNIPVAMDTDGPLFEDVQMLGKTGSQDARQAQKDPKKDRALVRRKSELPHDPYTKRALDAHCRADELLSQGGH	187713	15377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_18163_23915_24033_27942_28016_29700_29803_32387_32516_32814_32986_39824_39879_41356_41466_43422_43483_50447_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_148364_148528_186770_186834_187672
886452	contig_2009_pilon	-	4516	10	Intergenic	novelGene_165444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1468	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	331	672	69244	68903	TRUE	70	CCTTAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLNVKCVKFRIKKNKTTHLGYEKQHDALRKNWTERGVEFPVFAIWELRVHVLQLNTGLTKQKHKQKVGREAGSSGDFLTNPSSQNTFCYNISFQCLNIGYKVLQETNKKNT	69574	28022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_28129_34914_35029_35596_35709_56315_56561_58029_58153_59127_59276_61714_61834_63287_63475_64658_64793_66346
886453	contig_5961_pilon	-	4148	4	Intergenic	novelGene_144096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1886	2230	225021	224677	TRUE	40	AAAAGGTTGGAGGATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWIVLRLALWSNMWSILKNVPCPLEKTVYLAAVGWSVQYMSNRSSWLIVAFSSSVSLLSFFPDVLSFTRSCVLKCPTIIVELSLFSMLLEFMYFGALLGA	226906	97257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_98000_112399_112705_196516_196548_223836
886454	contig_15304_pilon	-	3766	5	Intergenic	novelGene_30645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4431.4770111104	69	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1795	2598	106308	103245	TRUE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	108102	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102493_102750_103329_103548_103680_105638_105960_106040
886455	contig_4232_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_63404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1304	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTCGAGAAGTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468131	467301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
886456	contig_9683_pilon	+	2768	3	Intergenic	novelGene_151301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_2	37	46	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	339	728	932610	934748	FALSE	15	ACTTAGTGCTGTGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPDRSQQERDPWYDWDHSDLRLNWGEPLHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMCKHLFGFVAFMLFMFWVGEKYPSYQPVVSIWEVPP	932271	936788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_932717_934040_934141_934565
886457	contig_14333_pilon	-	2485	2	Intergenic	novelGene_49134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425234	422295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_423104_423557
886458	contig_10307_pilon	+	3478	3	Intergenic	novelGene_170276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	680	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	693	1712	389925	392058	FALSE	20	TTCGTCATGTGAGTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	389129	393824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_389542_389644_390382_391495
886459	contig_4803_pilon	+	4032	7	Intergenic	novelGene_150695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	85.6420198007704	1751	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	101	913	1519	11179	FALSE	10	TGCTTTTCTGTTGAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLINNAFQLVSIGKLPIEKALDLTLYLKHETEIMPVFQGLNELIPMYKLMEKRDMNEVETQFKAFLIRLLRDLIDKQTWTDEGSVSERMLRSRLLLFACVCKYQPCVQRAEGYFREWKESNGNLSLPNDVTLAVFAVGAQNTEGWEFLYSKYQSSLSSTEKNQIEFALCTSQNKEKLQWLLDQSFKGDIIKTQEFPGILILIGRNPVGYPLAWQFLKENWNKLVQKFDLGSPSITNMVMGTTNQFSTRTWLEEVKGFFSSLKDNGSQLRCVQQTIEIIEENIRWMDKNFDKIRMWLQNENLGL	27	14298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_61_1451_1609_2284_2470_4733_4896_5618_5760_6826_6909_11026
886460	contig_299_pilon	+	2740	9	Intergenic	novelGene_129422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_7	262.313624312577	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	102	2177	841615	874689	FALSE	35	GGTCTAATTATTGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKGIARPWKLVYYRAKKMFDIHNYKGRYSEGDAEKVKLYHSLHGNDWKKIGEMVARSSLSVALKYSQISNQVNHGTWSKTETQKLVKAVEQVILKKMSLQELKEVDSRLQEDPEGRLSIVREKLYKGISWVEVEAKVETRNWMQCKSKWTEVLTKRMTNGQRVFQGVNALQAKINLIERLYKINVEDSNEIDWEDLASAIG	832792	875252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_832887_841607_842679_860693_860915_863075_863262_864117_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619
886461	contig_17074_pilon	+	2830	9	Intergenic	novelGene_145128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	209.321187114444	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	148	915	214186	223655	FALSE	30	GTATACAACCTTGCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	213469	225570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_217591_217694_220892_221011_223452
886462	contig_4486_pilon	+	2299	13	Intergenic	novelGene_38561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1380.5432581053	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	214	1290	343083	412464	FALSE	25	GTAATAGAGTGTGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWRIGGLRCAGVGRGGGRGCRSVRDPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311694	413473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399384_399433_407559_407696_411177_411318_412424
886463	contig_10813_pilon	+	4371	6	Intergenic	novelGene_87028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTAGTCAATTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133568	292615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10813_pilon_+_134226_134560_135247_199723_201448_290839_291264_291462_291795_292067
886464	contig_10734_pilon	-	4176	9	Intergenic	novelGene_51464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	178.924390455857	19	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	1231	2289	2274500	2265543	FALSE	50	ACAAGAAAATCCAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2281849	2263655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839
886465	contig_8312_pilon	-	8137	11	Intergenic	novelGene_152874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3483	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2727	3068	277552	277211	TRUE	40	TCAAACCAACAACTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGATFQSFISWIRGSSTKNSDDIVSHAALSGQSPVCFSLPILPILGSEEKKISSNISRYGLRLTGTTRYKEKLGPFYAVTFLTMSSKSGTKYLTIFFFFLLEHQVFIFYDYF	280278	221674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_221809_241028_241095_242165_242293_244964_245054_252630_252749_263688_263805_264909_264956_265065_265170_266970_267052_271659_271766_273128
886466	contig_12355_pilon	-	2698	3	Intergenic	novelGene_172101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2026	2400	223113	222643	FALSE	25	CTTGTTACATATTTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPVVMAIPFEAEAARLLVSLVSSASASYGLLALAPQARICPAGASVPKLSSSTSKCPEAPHSARKPSVHRHSAPSLLGQLQRLFHQSPGSAAVGSLLLLVLCHCHCLSIHSFKTASTF	239156	222344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12355_pilon_-_222771_222866_225123_239140
886467	contig_20779_pilon	-	4281	2	Intergenic	novelGene_112354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	999	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	591	1064	3691	3218	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKIYSQLQIIQKQLEIQKKNKKFSGRDSAIKGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTPFEKNSQKRTKKYEKTLRIMWDTIQSKNLRVIRVTEQGEETETIIEELLAENIPNVMKNEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRDIQSHSPKPKTNKES	4488	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_-_3780_3986
886468	contig_12139_pilon	-	6912	1	Intergenic	novelGene_146452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2343	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCACAGCAGACTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67815	60903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_60900_67800
886469	contig_6795_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_27681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGATGCTTCACAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71318	69408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_69400_71300
886470	contig_16067_pilon	-	8232	4	Intergenic	novelGene_169843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	261	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTTGTGCATTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75685	15258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_-_17009_17226_19756_50608_52089_73212
886471	contig_12139_pilon	-	4463	4	Intergenic	novelGene_146454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAAACCAAGTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69666	62906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_62968_63166_66994_67172_67669_69587
886472	contig_12638_pilon	+	3169	19	Intergenic	novelGene_33100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_4	564.847157847497	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1765	2868	182987	199604	FALSE	50	AAAGGCAGACAGGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170802	199905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_176021_176961_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
886473	contig_5574_pilon	-	1872	6	Intergenic	novelGene_155826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	698.059768214728	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	73	840	132928	59952	FALSE	10	TTTTTGTGATTCTGCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQSYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	133000	58919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_60155_78596_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_132909
886474	contig_7025_pilon	-	4536	18	Intergenic	novelGene_104371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	656.561789996223	13	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	134	1924	95047	59936	TRUE	40	TTGATGAAATCTGATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVTEGAPPCGSDKEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGM	95180	47655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90812_90982_91018_94786
886475	contig_10990_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_7512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCACAAGACTGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753007	751895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751900_753000
886476	contig_2504_pilon	-	5597	2	Intergenic	novelGene_166845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	300	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3553	3906	387514	387161	TRUE	45	AAAATACAACTATTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYMQNHKDSTRKLLELTERFSRVTGYKINIQKSVGFLYTNKENLEKEIRKTISFIIVSKKIKYLGINLTRDVKDLNKENYKTYCKKPKETYHIMLMDKKTQQCENVNPTQSDLQI	391066	384930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_385453_385991
886477	contig_19816_pilon	-	1323	8	Intergenic	novelGene_156500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.711145489465	4309	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	22	900	126795	123459	FALSE	15	TTCCAGAATCCTGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126816	123035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125702_126219_126435_126731
886478	contig_6445_pilon	+	1931	3	Intergenic	novelGene_77064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	26	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCATGGGATTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668115	673359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_668504_670247_670285_671853
886479	contig_5770_pilon	-	1073	3	Intergenic	novelGene_74167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	292.5	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGTTCTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260825	254292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_255058_255963_256152_260705
886480	contig_5502_pilon	-	1446	2	Intergenic	novelGene_155021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	969	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537394	535572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_536835_537210
886481	contig_5954_pilon	+	2919	8	Intergenic	novelGene_28786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGAGAAGCCCAGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391001	1462279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1392987_1394689_1394750_1395552_1395600_1396503_1396576_1396999_1397137_1401500_1401709_1443844_1443902_1461926
886483	contig_16125_pilon	+	4599	15	Intergenic	novelGene_155227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	703	1056	115227	115580	TRUE	5	CCCTCTACTTGCTGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCEGRLQRRQEEMRSSILTLNWRSDNLFSGIVSGYGLRLKVVGNSIWSSQFLSQNRKQRYWDTDGRFGLEQAVPHPLRLKQKAVRMGAEKDFCRYGIKLRKRKADGLNFFFVFLMK	114524	236118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_117615_118857_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138993_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153048_153464_153486_155566_155618_179440_179596_235794
886484	contig_14959_pilon	-	1869	2	Intergenic	novelGene_166724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	42	422	72129	71749	TRUE	5	AGGGTTTTTTGTTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK	72170	14042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_15487_71745
886485	contig_9127_pilon	-	6112	7	Intergenic	novelGene_103010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1395	2243	326225	325377	TRUE	50	GGCAAACAATAAGCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISSHIKRQSMMASASSQNKESINSLEEDNFLELPETEHKRLIYRTLLEIRKEIRQNAETARQHTDTVVALKKVIQEHNAKFNRLQESIQRQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAVEVRISDIEDKALDANLFEEKSDKRIKKNEETVRIMWDSIKRNNLRVTGVPERGRGITQNTEKIVEDLLIENFPDIMKDEKISIQDAHRTSHKVDPKRKSPRHIIIKLTKTKDKERILRVARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDILKP	327722	168411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_168482_169123_169684_169977_170542_286729_286993_287960_289894_324897_327130_327232
886486	SIRV6	+	1344	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	80	170	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886487	contig_2069_pilon	-	3433	1	Intergenic	novelGene_23375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1552	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	312	939	893	1831	1059334	1058396	NA	20	GGTAAGACGTTTGTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTTEQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSAEATKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1060226	1056793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1056800_1060200
886488	contig_14807_pilon	-	638	4	Intergenic	novelGene_124702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	1876.46695207302	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	69	560	38669	37247	FALSE	30	AAATTGAACTTCCCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38737	37168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632
886489	contig_12920_pilon	-	4600	3	Intergenic	novelGene_166343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1345	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGTCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230691	210582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_212843_217525_217679_228504
886490	SIRV3	-	603	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	4	10	4	-10	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCGTCATAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1168_1532
886491	contig_13481_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_119271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACCAGAGCACAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68159	65689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_65700_68200
886492	contig_6410_pilon	-	1295	8	Intergenic	novelGene_108648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	149.824523209994	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGCATAAAGTAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419333	409855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_410558_410707_410782_413932_414022_415791_415880_416097_416239_417146_417208_418581_418648_419259
886493	contig_10323_pilon	-	3214	5	Intergenic	novelGene_123585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1874.92178170184	15	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	165	2021	467395	459210	FALSE	25	AAGAGCCTGTGATTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDFKMSGSTCLLSLLAICIKSSKSV	468687	458016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_459281_459363_460999_463310_463453_467386_467480_468607
886494	contig_6509_pilon	-	7265	9	Intergenic	novelGene_145614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_7	99.4691378016317	2469	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1933	5802	247	6048	110717	68979	FALSE	30	CCCCTAAGCCACCACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGGCSKTPQPEEFSLSNDMVEKQTGKKDKDKVSLTKTPKLDRSDGGKEVRERTTKRKLPFTVGANGEQKDSDTEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEKLRLYKDERKKKSKDRPSKLEKKNDLKEDKMSKEKEKTFKEDKLKKEKVYRDDSAFDDYCNKNQFLENEDTKFSLSDDQQERWFSDLSDSSFDFKGEDSWDSPVPDYREMKSDSVAKLILETVREDSKEKRRDNKSREKRDHSERRSDRDSFFRKKDRDYLDKNAEKRKDQTEKHRSIPSYLSEKDKKRKESVDGAKERKDKDLSDICRDRKDSFESAKERKEVRAKPEEAYREGLKEFSCDSFFKDKSDSDFVKSLESWERHHSVKEKDKKDGIDKEKKEKVKSEKYKDKSSDKDKNEKSILEKIQKDKEFDKCFKEKKEIKEKHKDVHSKDKERKASVDPVKEKKEKTYPGILSEDFSEKKDEKKGKEKSWYIADIFTDESEDEKDTYAASGFKLTETGEGQRAEGPQDREEGKEPYPSDKHRKYSSDKQHSEKQKDKESKDKKKDKGATEGGKDRKEKIFEKHKEKKDKESTEKYKDRKDRTSAESTQEKKNKQKLPEKAEKKHAVEDKAKSRHKEKSDKEHSKERKSSKSAEMEKSLLEKLEEEALHEYREDSNDKISEISSDSFTDRGQDPGPTALLEVSFTEPPEEKAREGSCLQEKLKERHRHSSSSSKKSHDRERGRKEKAEKKDRSEDYKETGSRKDSSQYEKDFLDGDTYSISYNTKADIEDELEKTIELFSTEKKDKNDSEREPSKKIEKELKPYGSSAINILKEKKKREKHREKWRDEKEKHREKHPDGFLRHHKDEPKPGAKDKDNPPNSNFKDKSKEETLRLGEVKLKEKFKESQEKGDLAKISNGNEKLPPSRDSSRKDHRPREKLLVDGDLMMTSFERMLSQKDLEIEERHKRHKERMKQMEKMRHRSGDPKLKDKTKLAEDMRKKSLELPTKKPPGVDMQLRDKKLKDSIVLAPTPPTADSKMLPGAGSEPKDWLTGSQMKEVLPASPRPDQSRPTGVPTPTSVVSCPSYEEVMHTPRTPSCSADDYSDLIFDCTDSHHVMPMPVSTPASACSPSFFDRFSTASSSLPENPSQTPTRTLSTSLYRSVSVDTRRTPEEEFSVGDKLFRQQSVPATSSYDSPARHLLEDKAAAPLEKFPCLSPGYYSPDYGVPSPKGETLHCAPVAVVNATPSPEGIFSSLQAKSSPSHRDELVAPSLEGTLPPRPGPPS	193402	67761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_91925_92065_110630_110775_192368_192478_193322
886495	contig_5623_pilon	-	4843	22	Intergenic	novelGene_154820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_12	334.000224041637	623	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1044	3135	24	3158	220970	207631	FALSE	10	GCCTTGTTATGTCTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLVIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPAARGWGTGTLRVPNRVLLVNVKFEGSEESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQPLVERPEDYALQVNGKYEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPTPQVQKLRTKPPPIPVKKPSSASLWSLEQPFCIELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKMVSSSEVSVCSGPVWNQRLEFDINICDLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	220993	205945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681_214904_216280_216371_216833_216984_217330_217511_217909_218140_218220_218450_220829
886496	contig_2125_pilon	+	4770	11	Intergenic	novelGene_147725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1567.42985807978	2221	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	121	687	648096	673170	TRUE	50	ATTAAAAAATTATCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAAARHPGGRASSREKQKPEPRSSRPEPTAPGTGRRAEKMNLQLIFWIGLISSVCYVFGQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNLTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCHPDDIENPRGSKDVKKNKNVTNRSKGTAEKLQPEDITQIQPQQLILQLRSGEPQTFTLKFKRLFFSSSVNVSARVKGSLKVQSVMKETGHLSVELAGATRDVLVDIVSAAQMK	611046	685302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_611167_648095_648163_649057_649144_651017_651241_657754_657787_671571_671678_673117_673357_673579_673803_674513_674747_676390_676558_682028
886497	contig_4604_pilon	+	3676	20	Intergenic	novelGene_19136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	196	junction_5	1225.87115499251	369	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	432	2828	358980	379856	FALSE	35	AAGTTGTGCCTGAAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQVVCAVPHNLESKSPAAPGQSPTGSVCYERNGEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339848	380704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_360707_360801_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
886498	contig_4857_pilon	-	12556	7	Intergenic	novelGene_48781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3257.38062798248	4862	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3403	3780	1243185	1234290	TRUE	15	GCTTCAAGTACTCTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKVRC	1305913	1225425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1226319_1226406_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122_1244344_1244780_1246888_1305776
886499	contig_15105_pilon	-	2893	1	Intergenic	novelGene_150979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGAGGCCACAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632486	629593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_629600_632500
886500	contig_12677_pilon	-	832	1	Intergenic	novelGene_110873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATGACACACCAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3781	2949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
886501	contig_6871_pilon	+	2199	2	Intergenic	novelGene_21544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	218	1165	134070	135017	FALSE	20	TAAACGAGTGTGTTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEPPARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_133940
886502	contig_7380_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_157527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTAAGGCATTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296007	297589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_296000_297600
886503	contig_9471_pilon	-	9170	9	Intergenic	novelGene_21713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	170.059502454288	225	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	129	1121	153444	126331	FALSE	25	TCCCGTCTCTTTAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGLQNGRRKEQRMVVEQLGIQREPVKTSIQESGTFLPQHIPEERYRMQSKPLGICLIIDCIGNDKENAHSWISTLNSTAKCMIGTVEFLLRRSIPSGCSTR	166990	118281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_140993_141076_141797_141848_144789_144848_147757_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_166912
886504	contig_4732_pilon	+	2403	14	Intergenic	novelGene_75439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	578.078197449847	2780	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	369	2144	653092	675284	FALSE	0	GCTGCTTGGCTGGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKVMATTGGMGMGPGGPGMINIPPSILNNPNIPNEIIHALQAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRVGSEIERMGLVMDRMGSVERMGSSIERMGPLGLDHMASSIERMGQTMERIGSGVERMGAGMGFGLERMAAPIDRVGQTIERMGSGVERMGPAIDRMGLSMERMVPAGIGAGLERMGPVIDRMATGLERMGANNLERMGLERMGANSLERMGLERMGANSLERMGPAMGPALGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634990	675543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_670261_670316_672214_673018_673616_673669_675120
886505	contig_19816_pilon	-	2455	6	Intergenic	novelGene_156508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	176.108602856306	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	5	709	126795	125483	TRUE	30	ATAACCTTCCAGAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	126799	123041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124556_124658_125854_126164_126435_126731
886506	contig_10526_pilon	+	1476	10	Intergenic	novelGene_142569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	91.1012189751895	530	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	242	1027	273810	315492	FALSE	10	ACTTGCACTTGGTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLTAMPAGLICASIVVRAAKEESKKQLVKPEQLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKGSRFKKIAYPLGLATLGATVCYPVQSVIIAKVTGKKAYATSQQIYEAVKSWTKSNKKETLPEPKEKTKVGSYAEIEIPTKTAQVLKRSVPLPTELGSETKTKSELTSGATQFMPDPKLMDHGQSHPEDVDMYSTRS	223344	315941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_270558_270760_273809_273912_279949_280070_283141_283197_284658_284758_291360_291453_307400_307512_307714_307833_315403
886508	contig_12158_pilon	-	2256	2	Intergenic	novelGene_104844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	71	628	36693	36136	FALSE	35	TTAACTAAAGTCTATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRICCSRRSARPEKEEEPKNLNMEKLCSENEGKPENQGKMENQEQPQVKGKPEVAGTLEDKEKLGNEGKTEKKAKTEDEEMLKDKGKPEGEAKPRGKPASETRAAGKRPAQDDVPRKAKRKTNKGLAEYLKEYKEAIHDMHLSNEEMIREFDEMARVEDEVKKSKQKLGGFMWMQRSLQNPFHPRGPRELRGGCRAQQRGFEDIPYV	37135	34507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_36706_37077
886509	contig_5324_pilon	-	2395	2	Intergenic	novelGene_102075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	79	621	444540	443941	FALSE	20	CTTTCTTAAGATCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444618	442166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_444482_444538
886510	contig_7057_pilon	-	1107	9	Intergenic	novelGene_123333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	803	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCCAGGATGCGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943724	937171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_937202_938641_938752_938903_938960_939050_939117_941034_941105_941206_941285_941402_941523_942970_943028_943204
886511	contig_11752_pilon	+	2516	3	Intergenic	novelGene_37567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	80.5	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	124	771	87165	88933	FALSE	80	AAAATTATAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSKVCVQHRQLALGKDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84078	90678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667
886512	contig_7025_pilon	+	2931	4	Intergenic	novelGene_104369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTAAAAGAGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47655	60254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_49327_54442_54607_58741_58901_59317
886513	contig_17796_pilon	-	3282	4	Intergenic	novelGene_33754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGTAGTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27946	2357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_3361_25172_26658_26850_27567_27868
886514	contig_5766_pilon	+	6449	6	Intergenic	novelGene_175047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	3151	4230	63677	81472	TRUE	40	CCAACAGCCAACATCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEIPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRRRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEGTLRVTWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKPKDKQRILRAALEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLFLICFLFFSLFFPFCLSSLLSFSSLYIFLLFLIPEYKALYTSTPSSQAVLQHLRATSPDLIAASVGSLGTLQFFNLSDFYLFILF	25012	240597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5766_pilon_+_27166_61770_62095_63003_64497_81212_81720_131905_132674_239393
886515	contig_16195_pilon	+	7154	3	Intergenic	novelGene_178488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	3402	4247	4005	4850	TRUE	40	AAGTAGGATCAATGCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIRTDPTEIKRFITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKLIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEATITLIPKPGKDITKKKRKENYRPVSLMNIDAKILNKILANRIQHYVKKIIHHDQVGFISGMQGWFNIRKSIHIIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPPANIILRGERLKTFPLRTEQDKDALYHHSYLTLCWNF	603	22601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16195_pilon_+_5382_5421_6067_20870
886516	contig_7629_pilon	-	1138	7	Intergenic	novelGene_153596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	143.245030939607	36	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	276	1115	449167	396186	TRUE	65	TTAAAAGAAAAAAATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFEENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPQYDESTFGQDSSSHVLDHHLDQQFTSHLVTRPSDMAQAQLQSHAQSWHSSLSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVRVMSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIGKLIITLGKKQKRKNESSDEISDTEQMPQHALKDEDSQLLIQWESSGSRLLGCCKS	471826	392857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_392880_396184_396243_396940_397053_413488_413821_447709_448003_449121_449330_471713
886517	contig_20693_pilon	+	3582	11	Intergenic	novelGene_60240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1258	junction_10	325.219556607532	44	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	74	709	14718	26039	TRUE	10	GATTTTCTGAGTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLRGYFTHHGQRYEIEPLKSTDQEEHAVLTESQEELDPANYTCGVRNVGRKQVLIRTSRSLRSSEVSIAL	14644	35163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923_24001_25834_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
886518	contig_15123_pilon	-	2965	8	Intergenic	novelGene_110928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.891111550864	991	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	160	645	313597	308460	TRUE	30	ACCCCCTAAGAAGAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCCYSSENEDSDQDREERKLLLDPSSPPTKALNGAEPNYHSLPSARTDEQALLSSILAKTASNIIDVSAADSQGMEQHEYMDRARQYSTRLAVLSSSLTHWKKLPPLPSLTSQPHQVLASEPVPFSDLQQVSRIAAYAYSALSQIRVDAKEELVVQFGIP	313756	299385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_299456_300031_300169_305467_305674_306552_308553_308863_308991_309338_309417_309661_309808_313555
886519	contig_7919_pilon	-	3106	13	Intergenic	novelGene_28081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1295	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1200	1505	1132360	1132055	TRUE	35	GACTCACAAACTCAGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQLRMTGQRMPLHESRTEQLPEAHWAARARLPAVRATSNTGPALIQQWHLPCGSPIIIPVCYVNQNRQIIYETFFPPVKQNKYVQFKILFFSKKVQIV	1133559	1091353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1091410_1113436_1113509_1114963_1115057_1115361_1115446_1116449_1116528_1118748_1118811_1118931_1119050_1120390_1120474_1122281_1122383_1124641_1124762_1125500_1125641_1125749_1125849_1131559
886520	contig_8729_pilon	-	1585	5	Intergenic	novelGene_40158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_3	150.47653471555	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	214	966	770511	765591	FALSE	40	TATAGCTGAAATTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFTPTNQIRLTNVAVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQALEVIKQLKEKMKIERAHMRLRFLLPLSEGKKLKEKLKPFIKVIESEDYDQQLEIVCLIDPGCFREIDELIKKETKGKGSLEVLNLKDVEEGDEKLE	770724	764971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_766779_768620_768822_769438_769569_770383
886521	contig_17337_pilon	+	2452	3	Intergenic	novelGene_144720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	386.5	167	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGTCACCCTAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13350	32846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_13394_30374_31679_31741
886522	contig_16666_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_61792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	608	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTTGTGTGACCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120496	118866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_118900_120500
886523	contig_11564_pilon	-	2529	10	Intergenic	novelGene_158541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_8	227.888374234209	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	28	1320	100760	41045	FALSE	5	CTGTTTGCTTGGCTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSASTGTLAMTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEEDNKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	100787	39835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62605_100657
886524	contig_2377_pilon	+	1580	10	Intergenic	novelGene_67894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	640.594862434736	831	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACCATTGATGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197513	225039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200082_200197_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
886525	contig_16098_pilon	-	1696	10	Intergenic	novelGene_45957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1115.24570730145	91	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	74	1072	352350	349467	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKVVPSGRGWGRGGQERLGKDHGWRHLLVLILPLDLLPAGRQLYPVL	354062	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
886526	contig_17427_pilon	+	1913	10	Intergenic	novelGene_30279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	198.115815984514	27	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	107	1027	147949	175576	TRUE	75	TTACAATAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147842	176564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453_176375_176476
886527	contig_15666_pilon	-	2151	5	Intergenic	novelGene_70209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_2	88.2365428833202	209	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	756	1475	132068	129088	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQGHPISIGLICLAIIVPSLILSIGLALWFMRRWSYQNIQ	132823	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130515_130795_131446_131711_132007
886528	contig_11978_pilon	+	2642	2	Intergenic	novelGene_62851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	714	1400	569925	570611	FALSE	15	GCGGAGGGCTCTGGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLYTENPKESTRNLLELIERFSRVAGYKIKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYKYNAIPIQLPTTFLKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKEKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYDHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNK	564856	571853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_564923_569277
886529	contig_7919_pilon	+	3506	1	Intergenic	novelGene_28089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1242	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAAAGAAACCCCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129607	1133113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1129600_1133100
886530	contig_6163_pilon	-	3589	10	Intergenic	novelGene_103799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	285.362537446277	1706	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	24	965	93933	76108	TRUE	30	CATGTTATCAGTCTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGSEDGKIHVWNGESGIKVAVLDGKHTGPITCLQFNPKFMTFASACSNMAFWLPTIDD	93956	73280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_73594_73796_76138_77094_77238_77811_77882_78301_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
886531	contig_2036_pilon	-	3772	6	Intergenic	novelGene_131827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	328.317285563828	1421	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	112	1185	661441	616864	TRUE	25	GCATCATTCTCTAATGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINTYVFVGNQLIPQPLDSEEDEKMEEDNKQEEEKDHREAMKPEEPPQNLLREKIMKLPLPESLKAYLTYFREK	661552	614113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_614472_614634_617232_631747_631872_636558_636731_647832_647936_661134
886532	contig_11855_pilon	-	3753	12	Intergenic	novelGene_66961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_9	2089.32325236967	2885	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	609	1679	1087425	1079293	FALSE	25	CTAGTCCGTTGTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102160	1077218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1089856_1089920_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
886533	contig_5041_pilon	-	3347	1	Intergenic	novelGene_27091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2619	2921	549770	549468	NA	65	GGAGAAGAAAACAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNIHKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLLLRFTVQPGIGQPHKTKRNE	552388	549041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_549000_552400
886534	contig_7963_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_58424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	812	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGGCCCATTCTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96738	94439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_94400_96700
886535	contig_17427_pilon	+	2134	9	Intergenic	novelGene_30284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	193.082721909548	466	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	275	832	152147	175576	FALSE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPKYRQFVRLSLRISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147933	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152192_152618_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
886536	contig_5020_pilon	+	1867	9	Intergenic	novelGene_27818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_3	947.111785574966	218	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	319	1554	121762	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
886537	contig_13760_pilon	-	3806	1	Intergenic	novelGene_61356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1430	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2815	3129	359380	359066	NA	10	TGTTTTGGTATGGCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGACWGRMELWLALRVPSCPADAWHFKRKLVALSPNGVTPRRWGSVILPFCVCDLSPARGGAFRMFLGLVQSSGASGTKLLALALLGRLPQTRNPSPAQGKV	362194	358388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_358400_362200
886538	contig_4678_pilon	-	2209	3	Intergenic	novelGene_126048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1163	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	49	306	561802	561490	TRUE	20	CATTTTTCATTGTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANRHVKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTRNNKCWRGCGETGTLIHCWWEYKMLQPLWKSIWHFFKKLEIEAPYDPAIPLLGIHPREIRAVT	561850	559293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_559987_560279_561580_561634
886540	contig_3956_pilon	+	2879	14	Intergenic	novelGene_14915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1066.43507224472	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	695	2359	1285728	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281600	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284147_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
886541	contig_7066_pilon	-	1014	4	Intergenic	novelGene_42156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.884800728252	54	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	262	612	749845	749381	FALSE	20	TCCGACATGGTGCTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGSCFTEHRPTWERPSSLQHLLSLQSNRAYSRFSFFKSVAFGLCHGAQSQKPGTLCEVLPTSLSLSLRLSLQLSMPLHCFCKQSCLLPIFGGEWGQSRLRHSCPGKVAARECCC	757867	748978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749591_749704_749885_750340_750424_757728
886542	contig_10904_pilon	-	2043	5	Intergenic	novelGene_22563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	125.406339552672	1514	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	75	863	419191	411229	FALSE	15	TCTGGCTAGTCTCAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHFLEGGRIRLSPGSSSCPDLLTMALVLLLLLLTLWPECHTDITSHVPPASYPKPWLGVQPGAVVTPGVNVTLRCQAPQPSWRFALFKAGEITPVLFRDVAAELAEFFLEEVTPAQGGSYHCCYRRQGWGPEVWSPPSDALELLVTDVLPPPSLMALPGPVVARGANVSLRCAGLIGGMSFALYRVGEAAPLQYRNSARPWADFPLPAARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSQPLVVSWDGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	419265	410048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636_411919_413637_413938_417965_417999_419154
886543	contig_6059_pilon	-	2596	16	Intergenic	novelGene_44855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3905.58225222423	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	367	2202	584299	569146	TRUE	40	GCAAGGAAACGTAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584878	567851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584438_584650
886544	contig_13740_pilon	-	3194	12	Intergenic	novelGene_34619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4346.84611419542	5804	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	169	1230	165243	157474	TRUE	15	TTCCTGTATATTCAGCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	154905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
886546	contig_8377_pilon	+	7596	32	Intergenic	novelGene_34908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3251.6903264592	9	99	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	3920	6271	164377	197925	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVALRNQKVLPMVLQVQL	68043	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720_124739_131430_131572_135049_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161947_163482_164590_169245_169307_172902_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197772_197871
886547	contig_18081_pilon	-	2202	2	Intergenic	novelGene_23844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAACATATAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429483	427191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_428231_428320
886548	contig_11978_pilon	+	1499	6	Intergenic	novelGene_63074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4362.28502507573	26	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	223	588	1830113	1831883	FALSE	20	AGTACTCTTAGCCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSALLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827922	1832794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827934_1829088_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
886549	contig_10217_pilon	-	2121	10	Intergenic	novelGene_87406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	636	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	25	TCCAAGTACCTCAGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	108411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
886550	contig_7123_pilon	+	5724	10	Intergenic	novelGene_170586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_9	91.2170116254449	325	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	705	3248	548776	598148	FALSE	65	CTCAATAAAAATAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQQKSKENSSKIIKKSEDKNLETQIQGSQKNVAKKLGPKETVQSLVKSSSENKVNQPESGTRMSTRSAKAASNDKKAINSIDKNMVTVKQLSQQESTKKKLSQKKPVHETSKSNEQLNRRSQRLQQLTEISTRSLRSRAVHGQVQAVKQSLPPKRKERCSSTQSKSNNVKTSQKHVKRKVLEVKSDSKEDENSGINDVINSPKGKKRKVEHQTACTCSSHCVQGSEKCLQKTTRKEETKPVPVTSEIKRSKMTTSVVCKKNEKMKKSVHTQVNISAKPKKSPQPSVPEQSVDNELEQAGKNKRGSILQLCEEIAGEIESDTVEVKRESSQMESANEEKPTEIKSEETDVERQILHQKETNQDVQCNRFFPSRKTKPVKCILNGINSSTKKNSSWTKIKLSKFNSVQQNKLDSQASPKLGLLRTSFLPPTLEIHHPMTQSTFLGTKRHDDKNIACQQEKTKEINSEEVRSNNIVEINKTTERVPENCHLDNQIQPSTEPPLLDNQMKQPITAAPDKNFSLCLESKLENTPVENTTAVSTLLNQAKIDTGESKFPGSAPKQHGVLNNQTSKNSDNRETPPNHPWPKCNSHLEIKIPKDLKLKESEKADEKQLIIDAGQKRFGAVSCNVCGMLYTASNPEDETQHLLFHNQFISAVKYVGWKKERILAEYPDGRIIMVLPEDPKYALKKVDEIREMVDNDLGFQQAPLMCYSRTKTLLFISNDKKVVGCLIAEHIQQGYRVIEEKLPVTGTEEEKVRFERQKAWCCSTLPEPAICGISRIWVFSMMRRKKIASRMIECLRSNFIYGSYLSKEEIAFSDPTPDGKLFATQYCGTGQFLVYNFINGQNST	547831	600624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_547937_548176_550327_555328_555444_556718_556780_557623_557739_560454_560587_579795_579886_586479_586624_588212_588401_598000
886551	contig_10341_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_47232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96968	98030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_97000_98000
886552	contig_15407_pilon	+	1800	9	Intergenic	novelGene_123060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	544.465276670606	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	335	934	449761	468052	TRUE	40	AGTCAAGTCCTCTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGIQ	449426	470950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467824_468041_468070_468151_468308_470257
886553	contig_610_pilon	-	2955	1	Intergenic	novelGene_76757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTCCTAGTAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223025	220070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_220100_223000
886554	contig_16103_pilon	-	374	2	Intergenic	novelGene_118696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199166	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
886555	contig_6374_pilon	+	1013	2	Intergenic	novelGene_158442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCGGGCACCATCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313738	314893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_314237_314378
886556	contig_6847_pilon	+	1767	6	Intergenic	novelGene_143849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	430.28855434464	17	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	552	1217	77788	98777	FALSE	30	TGAAGTTGATATGTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTGRKLLI	73261	99327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_73542_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610
886557	contig_11171_pilon	+	1205	9	Intergenic	novelGene_48543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1593.89604722987	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	43	810	41803	65562	FALSE	10	ACCTGCAGCTGTGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRGAAGAERGPLPPSQGPGRP	41760	65957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64830_65502
886558	contig_6062_pilon	-	4454	5	Intergenic	novelGene_5314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	276.637849904889	579	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAATTTGCACAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828603	818326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_822504_822639_822725_823326_823372_824526_824643_828572
886559	contig_5623_pilon	-	5183	17	Intergenic	novelGene_154801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	377.277454062325	104	134	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	768	1943	218410	213730	TRUE	25	GAACCCAGCAACTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLVIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPAARGWGTGTLRVPNRVLLVNVKFEGSEESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQPLVERPEDYALQVNGKYEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPTPQVQKLRTKPPPIPVKKPSSASLWSLEQPFCIELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKMVSSSEVSVCSGPVWNQRLEFDINICDLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVTRKGSC	219177	205174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207379_210755_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212590_212665_212717_213619_213751_213850_213944_214681_214904_216280_216371_216833_216984_217330_217511_217909_218140_218220
886560	contig_6902_pilon	+	5316	18	Intergenic	novelGene_135575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	494.252957663553	16	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1671	5013	302	5314	460345	513228	FALSE	30	TTAAAACTTGTTTCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKIAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPPKFERKFDPARERPRRQRPTRPPRQDKPPRFRRLREREAASKTNEVTVSTNGTVNSVVQEAASTAGDISGSKTPDLSNQNSSDQANEEWETASESSDFNERRERDEKKNADLNAQMVVKAGENVLPPKREIAKRSFSSQRPGVDRQNRRSNNGPPKSARNFSGPRNERRSGPPSKSGKRGPFDDQSAGTTGVDPVNGSSTHHQEGALNGTGQKNSKDTTGKKREDPKPGPKKPKEKVDALSQFDLNNYASVVIIDDHPEVTVVEDPQSNLNDDGFTEVVSKKQQKRLQDEERRKKEEQIIQ	434419	513230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460355_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273_498512_501734_501944_513073
886562	contig_16578_pilon	-	6035	2	Intergenic	novelGene_148620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2302	2610	229104	228796	TRUE	60	ACAGAATGGATAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDRPQKKVTKTYHNQNCQNKRQRKNPDSSLGKTQNQLQRGTNKTSSDYSAETMQAITQQKPCRQEGNGMTYIKLLKKKIANQELHIQKNCLSDIMVKSGHF	231405	89148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_90527_226748
886563	contig_10982_pilon	+	3784	4	Intergenic	novelGene_87851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	654	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	3460	3783	247820	248143	FALSE	45	AAAGCAAAGATAGTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIRERRKLNKEMKRKSQEQTRKKKCCQGCPYASAQSKGLASKPRGTARLEEAPKPRKGKENKTKENKSEQTNKPKSPGGPTSVAARAGKQFHSRAVFRSLSG	26340	248144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_26413_34381_35600_211773_212729_246605
886564	contig_13295_pilon	-	1959	3	Intergenic	novelGene_31211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.5	1094	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCTACAGTTATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134711	53610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_55393_134268_134421_134686
886565	contig_5718_pilon	-	4589	3	Intergenic	novelGene_110360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1743	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3018	3332	715114	714800	TRUE	50	CCAGAAAATAATGTAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVVQRRPFFPLRLNSLLQKNKSPQQNIFTQLLDCQACVVFSYFPLDGTCKLVPRCWGLPNILDSLLSSCSGEPPSCVVLTAIFGGACWTSTYLSEVQQHLG	718131	708481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_708689_710008_710110_713850
886567	contig_12923_pilon	-	4333	25	Intergenic	novelGene_30166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	66	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3299	3754	315600	308607	TRUE	35	ATCGAAGAGGTCAAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIGGGVLRVDIGDGHLELLHPLLLQLPRLEEQLVALGALVLNQQKHVGPLFLLSLSPEESSRTWKLCRFTKFFRSLHLVHALGQVPHGIQGQPQVLLLHRVLRVFHQLLQKEVVLEYPLHGHHQQVPQGEPPIVCSLRTLLQLHLHVLAG	487409	301961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_301988_302360_302409_302511_302568_302811_302922_303003_303097_304577_304656_305710_305810_308537_308638_310232_310325_310480_310555_311496_311529_312491_312567_314392_314505_315560_315658_315901_316019_316433_316481_330851_330988_332128_332212_339101_339248_340557_340645_343971_344086_346599_346753_348892_349437_350263_351239_486570
886568	contig_9415_pilon	-	2630	7	Intergenic	novelGene_109933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	235.35038890037	972	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	134	616	2490739	2468122	TRUE	25	ACATATGGATTCTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSGLLSWTLSRVLWLSGLSERGAARRPQIMEEKALEVYDLIRTVRDPEKPSTLEELEVVTEGCVEVQEINEDYCLVIIRFTPTVPHCSLATLIGLCLRVKLQRCLPFKHKLEIYISEGTHSTEEDINKQINDKERVAAAMENPNLREIVEQCVLEPD	2490872	2451456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2452132_2465531_2465660_2466910_2468220_2470587_2470634_2472695_2472746_2481742_2481908_2490615
886569	contig_5419_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_15509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	849	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGATCTGACTCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245372	243454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_243500_245400
886570	contig_6102_pilon	-	1684	5	Intergenic	novelGene_32147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	601.416245207926	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	867534	847043	TRUE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVTSRRPASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867536	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839941_846099_846188_846753_846824_846979_847094_867237
886571	contig_9921_pilon	-	5134	3	Intergenic	novelGene_23745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	997	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	4342	4680	321759	321421	TRUE	40	GGCTGGGCAAGAGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGFLKVPIHALSNHCGVEVLRNGVIGVIIEKKQRIQDDLKRVHAKLKLAPDGVNEFQLHIPPVVVGEGDQAPAVSVCADLHQLLDISLLKSDWTDFELAHSLRQEVQKGT	326593	295965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_296052_321052_325115_325607
886572	contig_15491_pilon	-	2197	6	Intergenic	novelGene_75943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	401.87291523565	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	109	531	46982	32412	FALSE	15	AGTCTTTGGCCTCCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVWFKVLFKLVSNKKYS	47090	30745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37466_37539_37560_38887_39040_45107_45207_46879
886573	contig_7056_pilon	-	3542	15	Intergenic	novelGene_43671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2795	3253	801798	799742	TRUE	15	TGAGTCTCCTCCTGACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFLISKIGLQICIWPLSMFFFIYTCLWVFVSEDEVQFIVLSTFIWTKHNCIRGLVVELILQVKFWSFRKQFHIGTTTFYSILEINLILNNKRLGIKQEGLVQFSRDGMMLGPRHQYKSFITWKLCLLHLIYLPLSIIFGNFIISVIFLGFG	812605	781897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_781927_798308_798486_798973_799048_799732_799793_800454_800598_801054_801134_801612_801812_802369_802559_804874_804988_805252_805410_806603_806820_807439_807560_808440_808569_808731_808811_810826
886574	contig_6599_pilon	-	1161	2	Intergenic	novelGene_175968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCCGTCGCCGGCAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
886575	contig_15407_pilon	+	1217	3	Intergenic	novelGene_123054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.5	1818	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	553	918	450902	451267	TRUE	45	TCAAGAGAAGAAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQARIKSTGNNEDAWALVPAALTPFVIPCLPRALHRVLPALPRANVTVPRRNRRGHFIEKWQPMSSWTRQQPGPRVWANRRFRNVGCARRRPLTKSNWKRQSRQTRAAGTLRHVGQPSF	449424	451988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_450795_451493_451914
886576	contig_10732_pilon	-	1884	3	Intergenic	novelGene_114717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	447	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCAGGCCTTGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145276	139346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_139443_142615_143284_144156
886577	contig_11145_pilon	+	2604	4	Intergenic	novelGene_160529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1143	1580	204657	205094	TRUE	20	GGTTCTGGGGAAAAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRTAVTEDQQQQRTYSSREAAAAENQQQQNQETSARWRWSRPMEQDYLCAGGFLAELGASGHLSVELGLLTHRARELSVCVHEAFWWSGVPPGTYTGGATELWNTCPSRADAGMRPEGQEATGNRSRNLRDKGHKKLPQSQKV	203514	308011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_205396_205515_206105_307033_307082_307925
886578	contig_8671_pilon	-	3012	1	Intergenic	novelGene_126248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5797	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	76	312	442912	442676	NA	20	GTGCTAATCGCCAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAIPFLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	442987	439975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_440000_443000
886579	contig_11277_pilon	+	2524	9	Intergenic	novelGene_80307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	115.45067940467	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	119	1156	250372	269500	FALSE	30	ACTGGAAAATATGTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248219	270868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
886580	contig_9995_pilon	-	3466	4	Intergenic	novelGene_47695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	679.606258554662	1301	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	107	1576	322165	297529	FALSE	15	TAATTTGCCTTTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSASGASNSAPHLGFHLGSKGTSNLSQQTPRFNPIMVTLAPNIQTGRNTPTSLHIHGVPPPVLNSPQGNSIYIRPYITTPSGTARQTQQHSGWVSQFNPMNPQQVYQPSQPGPWTTYPTSNPLSHTSAQQPNQQGHQTSHVYMPISSPTTPQPPTIHSSGSSQSSAHSQYNIQNISTGPRKNQIEIKLEPPQRNNSSKLRSSGSRTSSSSSSVNSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPAVSPGVVSPTFELTNLLNHPDHYVETENIQHLADPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARDQRSTIKTPKNQDTEDDEGAQWNCTACTFLNHPALIRCEQCEMPRHF	322271	295638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297672_300994_301089_301628_301790_321093
886581	contig_14142_pilon	+	2973	9	Intergenic	novelGene_120625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_8	205.750417678798	1721	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	58	978	617485	619552	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGFLQPGGALSLQKQMEHANQQTGFSDSSSLRPMHPQALHPAPGLLASPQLPVQMQPAGKVRMVIK	617427	621547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619167_619267_619348_619435
886582	contig_12414_pilon	+	2695	16	Intergenic	novelGene_59609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	94.4042371930413	672	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	128	814	527729	591484	TRUE	25	GTAGGAAGTTACCCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527601	607935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598995_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
886583	contig_4531_pilon	+	6105	31	Intergenic	novelGene_47849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	238.507712430623	874	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1581	4746	292	5037	148719	188820	FALSE	40	AAACCAAACACGTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFSKVKQLSLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM	123864	189888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_124124_148686_148956_149519_149682_152888_153003_153420_153595_156404_156603_157336_157538_159683_159837_160317_160441_160733_160872_161120_161286_161407_161589_163103_163268_170545_170672_171257_171401_173517_173753_175671_175795_176806_176953_177159_177344_177523_177717_178063_178222_178428_178594_178903_179012_179091_179260_179392_179543_179789_179922_180347_180459_181219_181391_181727_181950_186848_186925_188695
886584	contig_10734_pilon	+	3703	9	Intergenic	novelGene_51465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1669	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	442	801	2265456	2265815	TRUE	40	TTCAGCCGTAAACAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265014	2282736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266074_2267089_2267192_2269290_2269431_2270438_2270505_2270955_2271050_2274374_2274509_2275753_2275884_2277108_2277192_2280841
886585	contig_17753_pilon	-	6130	8	Intergenic	novelGene_105070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4616	4981	139139	137754	TRUE	35	GAGCCTCCCAGCAGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLVVALTTHCRSIVLKGTRTMLTFSPSSLKLSGYTRWWVVLLPTSASNPTVGALFILSTKSCSSIWEPYCDSFRLPELPTTAQRRQPTNSFSSIGSTSPRTTRNSSLMVLFRFLGFFSC	147531	48906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_49004_75016_75168_130828_131723_137746_137944_138963_139145_140835_140882_141745_141869_143090
886586	contig_12689_pilon	-	2957	2	Intergenic	novelGene_145032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	633	junction_1	0	1697	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	778	1107	42781	42452	FALSE	30	AGCTAGATCTGATCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKAHQLRLNLGLASRRSHCKGGIMTPGWGGGRHLSYHLGHCLCLGLRPFTISKGLVCLPLSLWLPVPLTVCAHRKMHLQGGVHRNVSAGFLVGPETAWTHLRVSSRKP	44433	40601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_43342_44216
886587	contig_5698_pilon	+	1999	7	Intergenic	novelGene_55005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	899.928515679625	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	20	628	4103	19438	FALSE	25	TGTCATTCATACTATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAECLKAECKILQYIGGKRKRIQHVVI	4083	20809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18839_19361
886588	contig_13823_pilon	-	5069	2	Intergenic	novelGene_145241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	739	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAGATCTCGGAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144946	64578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_66882_142180
886589	contig_9609_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_23019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTGATTGGCTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319767	318518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_318500_319800
886590	contig_835_pilon	-	2725	2	Intergenic	novelGene_152164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	338	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2246	2599	333135	332633	FALSE	50	AAGTTCTAAATAATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWTRKQFHPRMELHSPLGRSKDGARSQVFEQKEREVVRGKKEIKRSGKKQHRQPANGTQGVGQCGRVESKHPVLPGQETVATGSRGGRALADRGPLHVCLLTLFSVSFLFHLVLG	335380	332506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_332717_332865
886591	contig_3822_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_133284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAGGAAGGAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158913	157120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_157100_158900
886592	contig_16303_pilon	-	2397	8	Intergenic	novelGene_34081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	58	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	96	1208	47976	35759	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48071	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33552_35032_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
886593	contig_11594_pilon	+	1765	11	Intergenic	novelGene_80932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_10	433.882484089874	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	445	1332	560394	568385	FALSE	30	AGAGCTATACTTCAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	540513	568818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560435_560914_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
886594	contig_5590_pilon	+	2881	5	Intergenic	novelGene_163041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_4	295.706252047535	584	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	245	643	360033	364797	FALSE	20	GCCATCTTTATGTAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLAELQEQLKAVHEQLAALSQPQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKKKEEVEETKKSKAKELPPKKTKKNNSSTTTSKKELAPMKSKPAAAYESEEEDRCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKKRKPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESTSESSSSDSEDSETGPA	358954	367035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_358983_359431_359629_360013_360310_361040_361152_364786
886595	SIRV6	+	1154	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2481	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
886596	contig_14666_pilon	+	1995	3	Intergenic	novelGene_39597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1754.5	356	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	168	1181	479860	484940	FALSE	15	TAATGATGGTCTTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQEVTTATRPCSWRGSIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479920_483986
886597	SIRV6	+	1318	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	0	210	0	-75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	258	749	1733	10736	TRUE	30	TTGTTTGCGACAGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1087	11615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886598	contig_10003_pilon	-	3835	1	Intergenic	novelGene_88141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGGATACAGACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373761	369926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_369900_373800
886599	contig_6576_pilon	+	2773	3	Intergenic	novelGene_42416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	89	1066	1301228	1302574	FALSE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQDLNESLPLPPAELL	1295688	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302161_1302529
886600	contig_34_pilon	+	2395	2	Intergenic	novelGene_39970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGGTTCTTCCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208503	210997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_209457_209555
886601	contig_6825_pilon	-	1786	3	Intergenic	novelGene_155127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAACAAAAGAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118613	83119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_84015_85390_85472_117803
886602	contig_5686_pilon	+	9420	15	Intergenic	novelGene_45210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	1822.92773178372	33	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	112	1092	93669	208450	TRUE	40	GACAGAACAACTGGTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKPIHTNEAVFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGL	93557	226860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199799_208442_208722_211283_215475_219533_222917_224043_224203_226536
886604	contig_12677_pilon	+	1237	1	Intergenic	novelGene_110679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGTGTCGAGTGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4	1241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1200
886605	contig_12414_pilon	+	2074	16	Intergenic	novelGene_59616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	113	junction_7	69.2837643319126	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	39	1493	527780	606875	FALSE	15	TACTTTGTCTTTGTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFCIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVVEEIADTLVQIFKGLQERFETEIQMVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGIEMGDEEDLSTPNEKLLGRLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP	527741	607456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591474_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
886606	contig_6137_pilon	+	5444	2	Intergenic	novelGene_59284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2230	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1834	2229	1352129	1352524	FALSE	25	ACTCCAGCTACACTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREGVEHSSVLSIWYSYTVSNCPGGGGGSSSGCGFIKCPSFTWSCSPPVQETSVKFSASSPLSWSERDITSSKEYRRKMLPAEVFAIHILLMLAPLPFIPSSGGVWCCLFTQLFIFFSHYWLAIWPFLFC	1350211	1355739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1351715_1351798
886607	contig_8377_pilon	-	9292	2	Intergenic	novelGene_35057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1120	1473	106552	106199	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTLKQKAKNKPAGVKSISTHSDPIGIGQSKTAPGGFQGGAGGFELPTFWLAAERLDAHIAHQYSLTLIKIDLTEFSYLKQFKNVKSPSATFGRLVSSGLSTVTHYWSIFHVTRFFY	107671	96528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_103015_104865
886608	contig_7622_pilon	+	2623	3	Intergenic	novelGene_132405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	287	junction_2	27.5	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTTAGCAAATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251979	256684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_254222_255063_255135_256374
886609	contig_7457_pilon	+	2687	10	Intergenic	novelGene_31337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	283.241553762469	94	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	541	1632	285206	290630	FALSE	35	GAACCAGCTTCACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280851	291685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_281332_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
886610	contig_12080_pilon	-	6944	27	Intergenic	novelGene_128336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.154520581784	3796	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	57	2621	164251	62705	TRUE	65	AACATAAAATGAAACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPGGGLGPGRGTRDKKKGRSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLSKELEDAKKEMASLSAAAVAIVPPVPSSTNAPPAPPLPADSGTVIPSLPTHLPEEVSKPPPPPSLPEGYTIPPPPPPPPLPGSVCIPPPPPLPESASIPLPPSLPGSTAIPPPPPLPGDTGIPPPPPLPGVAGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGSTCILPPPPLPGDTGIPPPPPLPGGPGMPPLPPPLPGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLAPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164307	43907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45916_46002_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_108591_109504_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
886611	contig_20293_pilon	+	3280	2	Intergenic	novelGene_153497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17100	20543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_17374_17536
886612	contig_7078_pilon	+	3659	26	Intergenic	novelGene_130173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGGGAGGCGGGGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748320	796295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_748679_755119_755253_756074_756232_757094_757200_757367_757439_757548_757611_758665_758768_759712_759823_759916_759981_760497_760614_761213_761405_766008_766150_767863_768072_771397_771466_772464_772659_773112_773262_774111_774259_774781_774885_775958_776086_776237_776325_776418_776476_777368_777416_777868_777975_779164_779240_785885_785974_795702
886613	contig_8377_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_35052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTGGCTGCTAACCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92087	93451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_92100_93500
886614	contig_11512_pilon	-	2552	12	Intergenic	novelGene_43335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1286.11652621691	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	75	995	586520	556515	FALSE	0	TGGCCTGTGTCTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYSKSGTGQHAPAAAPTLAKVPAAALTPVRVLVSTSFPAPAPLGTVPGPSPWRCPARQPCGLRPWTWICSSPLPSSPFPPPACHAAHNLTLIQSLFSKSELW	586594	554957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556791_561299_561378_566278_566315_567751_567800_570039_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515
886615	contig_9937_pilon	+	2771	3	Intergenic	novelGene_129217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGGTATTTGAGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204200	355637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_204704_351699_353156_354825
886616	contig_675_pilon	-	3488	5	Intergenic	novelGene_136340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1666	1968	2758	2456	TRUE	15	GTTCCTATTATTATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQTDCVLFVVCSSVRSILFSSFSNWQVQSLSYGTAGQVKLKKSHWDRFFCGPHYSHQGGLVISAGQVPVGRACTAWWCDVKRTVQVGRMQWGNCYVWS	54871	72	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_-_461_1323_2892_24859_24999_31816_31825_53486
886617	contig_13593_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_156118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48093	50460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_48100_50500
886618	contig_12391_pilon	+	3738	13	Intergenic	novelGene_103592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	245	junction_1	247.188566685436	690	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	134	1465	56804	107379	FALSE	20	AGCAAGTTTGTTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56670	109652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
886619	contig_14953_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_137303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGAATAACCAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459471	461543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_459500_461500
886620	contig_5686_pilon	-	14118	2	Intergenic	novelGene_45365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2801	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	13386	13691	131421	131116	FALSE	10	TCCCTTCTCCAGACCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDDVSGQTQRLVQKGYRSKSNRGSQLIGIPGWGVRRKRGTFSEPDKPDRKQKGRNGCMLDNNGPNSHKMPTPVEKASYSIFGNGATIDTVLELQPNAWT	146407	130688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_134436_136036
886621	contig_15047_pilon	+	1808	5	Intergenic	novelGene_52137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	276.926321428643	2841	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	29	652	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2165	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4687_21013
886623	contig_10475_pilon	-	3404	1	Intergenic	novelGene_148719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	706	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	344	1035	1202	2236	26008	24974	NA	20	GTTATATGCGTGCAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHTPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPESTLKSAFERKISREERATLYSSGITGEVSDQVSQTPTEAESSMDDD	27209	23805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_23800_27200
886624	contig_1331_pilon	-	1520	4	Intergenic	novelGene_37808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3563.14505271209	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	421	465	160053	160009	FALSE	10	GTTTCTTGAGGCATTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLFWGVLAIFVQAVLVTEDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	169915	158953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166531_169860
886625	contig_3956_pilon	+	2186	10	Intergenic	novelGene_15093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1219.68311002854	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	78	1667	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281604	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284136_1286409_1286606_1287276_1287491_1289039_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
886626	contig_3747_pilon	+	2483	8	Intergenic	novelGene_24909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	554	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	97	1104	201481	203804	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201384	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
886628	contig_9668_pilon	-	6946	7	Intergenic	novelGene_58159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	155	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	4488	5225	434600	433770	FALSE	15	TTGTGGTACTGTGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHITTDPNEVKRTLTEYYEKLYSNKFENLEETDKFLETHYLPKLTQTEVEQKLNKRITKEELEKVILKLPTKKPPGPDGFTGEFYQTFREELTSLLLRVFQSIEKDGILRNSSYEAGATLIPKPGKDTTKRENYTPVSLRNIEAKILNKIPVNRIQQHTKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKTINVIQHINKTEDKNHTILSIDAEKAFDKVQHPFIIKTLSKIGIEGKFPNIIKGIYTQPTSS	591161	432048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_434355_434447_435395_451086_451122_497266_498165_535510_535835_582812_583093_589005
886629	contig_4732_pilon	-	1866	15	Intergenic	novelGene_75432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCAGCGAGCTGCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675519	634963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_635100_644310_644480_651995_652057_653062_653158_654506_654699_655351_655506_656584_656634_657711_657774_660227_660328_662165_662245_670260_670314_672212_672429_672968_673018_673616_673668_675119
886630	contig_13300_pilon	-	3231	4	Intergenic	novelGene_125763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_2	284.999415204078	231	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	82	513	56132	47432	FALSE	20	AGAGAATGTTGGCTCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEKEVDSGNDIYGNPIKRIQYEIKQIKMFKGPDKDIEFIYTAPSSAVCGVSLDIGGKKEYLIAGKAEGNGKMHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	58665	44713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_47630_49635_49761_56023_56133_58584
886631	contig_7123_pilon	+	4291	10	Intergenic	novelGene_170585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	107	junction_9	91.2170116254449	142	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	705	3248	548776	598148	FALSE	35	AATGGTGTGAAAAGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQQKSKENSSKIIKKSEDKNLETQIQGSQKNVAKKLGPKETVQSLVKSSSENKVNQPESGTRMSTRSAKAASNDKKAINSIDKNMVTVKQLSQQESTKKKLSQKKPVHETSKSNEQLNRRSQRLQQLTEISTRSLRSRAVHGQVQAVKQSLPPKRKERCSSTQSKSNNVKTSQKHVKRKVLEVKSDSKEDENSGINDVINSPKGKKRKVEHQTACTCSSHCVQGSEKCLQKTTRKEETKPVPVTSEIKRSKMTTSVVCKKNEKMKKSVHTQVNISAKPKKSPQPSVPEQSVDNELEQAGKNKRGSILQLCEEIAGEIESDTVEVKRESSQMESANEEKPTEIKSEETDVERQILHQKETNQDVQCNRFFPSRKTKPVKCILNGINSSTKKNSSWTKIKLSKFNSVQQNKLDSQASPKLGLLRTSFLPPTLEIHHPMTQSTFLGTKRHDDKNIACQQEKTKEINSEEVRSNNIVEINKTTERVPENCHLDNQIQPSTEPPLLDNQMKQPITAAPDKNFSLCLESKLENTPVENTTAVSTLLNQAKIDTGESKFPGSAPKQHGVLNNQTSKNSDNRETPPNHPWPKCNSHLEIKIPKDLKLKESEKADEKQLIIDAGQKRFGAVSCNVCGMLYTASNPEDETQHLLFHNQFISAVKYVGWKKERILAEYPDGRIIMVLPEDPKYALKKVDEIREMVDNDLGFQQAPLMCYSRTKTLLFISNDKKVVGCLIAEHIQQGYRVIEEKLPVTGTEEEKVRFERQKAWCCSTLPEPAICGISRIWVFSMMRRKKIASRMIECLRSNFIYGSYLSKEEIAFSDPTPDGKLFATQYCGTGQFLVYNFINGQNST	547831	599191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_547937_548176_550327_555328_555444_556718_556780_557623_557739_560454_560587_579795_579886_586479_586624_588212_588401_598000
886632	contig_10793_pilon	+	1379	15	Intergenic	novelGene_83373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2837.28569000985	7	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	132	980	146975	163944	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQNFLNK	130870	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163205_163928_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
886633	contig_9177_pilon	+	3216	21	Intergenic	novelGene_32605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	90	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	785	1456	2759	4576	TRUE	15	TGGCAGCCCGGCCCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPVMASAAWMSSVTEPATRFECPVNCCFSSGLGFCRVLAHGPAVPGSHWHTPGHNAGLEVAHQEPLPGGKLLPCKPGAYLQSHDGSDWLWQ	1719	10465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3700_3806_4280_4385_4516_4706_6478_6595_6696_6817_6906_7089_7261_7417_7589_7711_8504_8611_8687_8789_8903_9056_9151_9321_9403_9509_9727_9861_10294
886634	contig_9297_pilon	+	2461	9	Intergenic	novelGene_69871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	321.87953880295	2373	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	153	2117	909195	912790	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
886635	contig_11316_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_122601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	707	1219	137674	138186	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136967	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138900
886636	contig_13295_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_31212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.806410858642	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCAATTACCTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134802	53618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_55271_85617_85677_101889_102009_134686
886637	contig_13905_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_130433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226802	228571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_226800_228600
886638	contig_9668_pilon	+	3629	1	Intergenic	novelGene_58261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	450	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGGCCAAAGACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637299	640928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_637300_640900
886639	contig_8523_pilon	-	5701	5	Intergenic	novelGene_178490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	158	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	2816	4078	392679	391366	TRUE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPSDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKKIIDQYLS	396477	382527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8523_pilon_-_383075_387347_387548_390489_392456_392506_395195_396177
886640	contig_34_pilon	-	1648	9	Intergenic	novelGene_40007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1326.52739794548	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	62	1357	247052	212074	FALSE	80	AGAATGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRPIRNCYIEPSSPGTAHPHFSGIKSRRSIRHHV	247113	211782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212173_212237_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
886641	contig_10106_pilon	+	4060	5	Intergenic	novelGene_73862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	873.819632418499	121	143	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGAATGGGGAAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130104	177144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_130554_132392_132829_151068_151160_173988_176296_176367
886642	contig_12638_pilon	+	2908	19	Intergenic	novelGene_33086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	614.87890005138	2	76	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	924	2027	182987	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170769	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_176888_176961_178085_178281_180794_180854_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
886643	contig_14513_pilon	-	1247	3	Intergenic	novelGene_70300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	76	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	185	553	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19064	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
886644	contig_10793_pilon	+	1360	15	Intergenic	novelGene_83415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2837.28569000985	1	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	40	966	146975	163940	TRUE	45	AATGTCAAATACAATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130962	167256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
886645	contig_16303_pilon	-	5891	8	Intergenic	novelGene_34027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	1867	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	96	1187	45428	35759	TRUE	10	GTCTTTGCTGGACAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45523	29573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33552_35032_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
886646	contig_15152_pilon	-	4219	4	Intergenic	novelGene_126962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	938	junction_3	111.002502474294	199	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	769	1599	204689	203318	FALSE	25	GGGAAGGACTTGGTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHCHYKAPNCCPSCDKGGGGGYSSRRTSGRDKYGPPVRTEHRLIVENLSSRCSWQDLKDFMRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	205457	200697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512
886647	contig_7019_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_149463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACCTCCCACCTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536928	539811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_536900_539800
886648	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
886649	contig_20199_pilon	-	1239	4	Intergenic	novelGene_82517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.0538238691624	237	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	160	372	43987	41384	TRUE	25	GGGACATCCCAGTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQVSHCVPRVWLQVRAVAGKQRAFP	44146	27557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_27692_40650_41418_42072_42171_43906
886650	contig_7091_pilon	-	3222	1	Intergenic	novelGene_131791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAAAAACCCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441440	438218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_438200_441400
886651	contig_6233_pilon	-	1392	9	Intergenic	novelGene_74759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCACTAAGCTCTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131694	112924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_113034_117975_118154_119649_119754_123346_123487_125128_125229_125886_126038_127998_128057_130492_130581_131230
886652	contig_854_pilon	+	2997	13	Intergenic	novelGene_36643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	4103.99352934296	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	53	1939	1698226	1715343	FALSE	10	GCTACATGCGTGTGTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKSDQRALQPFLAKKHKMASQGGQAPGDGPECFL	1697760	1716401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709201_1715244
886653	contig_4422_pilon	+	6075	7	Intergenic	novelGene_155952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2736	3101	48877	49242	TRUE	35	TGACTTGTACTGTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSCWKILSISDLNSLPGTSSVFSSTGELSGVLIWMPIGDILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	45310	83836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_47585_48415_49900_50758_51075_64206_64360_72842_73061_81737_81843_82311
886654	contig_13718_pilon	+	1970	4	Intergenic	novelGene_142888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	274.634706878468	1648	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	703	1179	129442	141301	FALSE	10	TGCAGTGCTGCTTGTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAIERKSLDPSEEPVDEVLQIPPSLLTCGGCQQNIGDRYFLKAIDQYWHEDCLSCDLCGCRLGEVGRRLYYKLGRKLCRRDYLRLFGQDGLCASCDKRIRAYEMTMRVRDKVYHLECFKCAACQKHFCVGDRYLLINSDIVCEQDIYEWTKINGMI	128030	142092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_128707_129415_129483_133551_133768_141081
886656	contig_6445_pilon	-	1390	14	Intergenic	novelGene_76954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	787.772847444996	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	74	1168	89674	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHIRELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96340	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64886_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
886657	contig_6364_pilon	+	4551	4	Intergenic	novelGene_51698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2726	3091	417100	417465	TRUE	10	CTTTGCTGTGGAGGGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCLSSWKILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	413812	616728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_415228_415789_417708_615422_616194_616281
886658	contig_7056_pilon	-	2073	12	Intergenic	novelGene_43624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	1086.73161512205	59	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	37	1455	730480	722516	FALSE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYGSQGTMNSSYYSSGSRASMGVNGMGGMSSMSSMSGGWGM	730516	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383
886659	contig_1248_pilon	-	8300	3	Intergenic	novelGene_178284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4668	239	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	5897	7333	29692	28256	FALSE	40	TCGAGAAAGAACAACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHGLLKLQQSNVENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVRFIPGMQGWFNIRKSINVTHHINKMKEKSQMIISIDAEKAFDKVQHPLLMKTLNQIGIEGKFLNRINGICAKPTVNIILNGERLKTFPLKTGTRQGCSLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSMFADDMILYIENPEDSVRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENNENQIRKTIPFIIAPQKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYIATVVKTAWYWYNEDTLTNGTELRTQM	99799	27288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1248_pilon_-_30220_92759_96496_98166
886660	contig_10904_pilon	+	4219	3	Intergenic	novelGene_22704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1394	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAGAAAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632291	642091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_634521_639855_640345_640590
886661	contig_6272_pilon	-	1965	4	Intergenic	novelGene_160461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1237	1536	185988	185689	FALSE	55	AAAAAAATGTATTTGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQPEFSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNCNSQKKDQIYWPKGDWKNPESMTPRYPFSSAVKSLPRLTVQPGIGQPHKTKWD	195465	185259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_186778_189274_189454_192574_192745_195367
886662	contig_854_pilon	+	4697	1	Intergenic	novelGene_36339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4927	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	4388	4696	976970	977278	NA	5	CGGGGCTCCCCTGGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGVSTHLLGPAHLPRGQRQVVLLLHCFEELNGWHLGHDWAWGLLGLGHLVQAPHLRRRVRGRGLAPGREQARPESREEAVITHLLQDKEPLGVGGPRGLMC	972582	977279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_972600_977300
886663	contig_6031_pilon	-	1493	6	Intergenic	novelGene_56762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	513.638394203549	6	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	318	992	256770	254965	FALSE	15	GAGTTGCCCTGATGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257802	254463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256375_256704_256809_257523
886665	contig_10307_pilon	+	2999	3	Intergenic	novelGene_170262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	324	junction_1	6	720	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	585	1901	389628	392058	FALSE	25	GTTATGTAACTTATCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387278	393156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387851_389615_390382_391495
886666	contig_6503_pilon	-	3793	8	Intergenic	novelGene_145748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_6	111.884415576878	730	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	104	1051	134980	118803	FALSE	35	ATGTTCTTTAAAAATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSIGGWCWWGKSDLSYQRARRETLVRDSHTYLRMPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRADIEVACYGYEGIDAVKEALRAGLNCSTETMPIKINLIAPPRYVMTTTTLERTEGLSVLNQAMAVIKEKIEEKRGVFNVQMEPKVVTDTDETELARQLERLERENAEVDGDDDAEEMEAKAED	139849	116060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139747
886667	contig_21007_pilon	+	1322	2	Intergenic	novelGene_161526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	1776	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	15	CTACGTATCTGTCGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
886668	contig_2100_pilon	+	7543	3	Intergenic	novelGene_50582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	561	1277	430251	430967	TRUE	65	AGAGGTTAAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQENITIINIYAANDRAPKYIKTNSNNIEKRDRQSHNNSRRLQHTTFGEDRTSRKKFSKDIEDLNATINQLDLIDIYRTLYSTADKYTFFFNAHGTFSRIDHILGHKASLNRIQSIEILQSIFFEHKAIKVEIKSRKSKEKNSNTWKLNNILLKNYCVTEEIKNRIKKSTDSNENENTSFQNLWEIVKAALRGQFIAINAHIQKEERAKNQNMNLQLKQVEREQEKKPSGTR	429690	508993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_431659_473662_476735_506490
886669	contig_7963_pilon	-	3234	4	Intergenic	novelGene_58539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	135.426076596135	17	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1502	1930	242844	240504	FALSE	65	CTTTTAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	244345	239199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241572_241703_242815
886670	contig_7056_pilon	+	3208	9	Intergenic	novelGene_43664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	656.012183099521	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	163	954	798314	810882	FALSE	20	CTTTTGACTGAACTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLARRQQGWPRPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781769	813136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801746_808732_808813_810828
886671	contig_14333_pilon	+	3468	2	Intergenic	novelGene_49130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCGGTTGTTGTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421943	425696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_425229_425513
886672	contig_9673_pilon	+	6126	4	Intergenic	novelGene_119151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	144	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	4258	5289	95129	96160	FALSE	45	ATTCCTATGCAACAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKTFDKVQHPFLIKALNKIGIEGKFLNTIKGIYAKSAANIILNGERLKTFPLKTETRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKTIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNILCSYHVKMSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFREMEKLIINFIWKGKKPRISKALMKKNKIGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFKKWCWQNRISI	32978	96997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_33747_89713_90181_90444_91614_93275
886673	contig_11978_pilon	-	4980	1	Intergenic	novelGene_62934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	622	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAATATAAATAGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979707	974727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_974700_979700
886674	contig_2069_pilon	+	2161	9	Intergenic	novelGene_23282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.979589192811	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	603	1319	341330	343975	FALSE	10	TGATGTGGTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	335628	344817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_335711_338929_339107_339555_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
886675	contig_10811_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_165814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2149	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	666	64	729	456719	457384	NA	20	AAGACATGGTTCTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQQQQQQQQQQQQQQQQGSAGMAGGMAGHGQFQQPQGPGGYPPAMQPQRMPQHLPIQGSSMGQMAAQMGQLGQLGQPGLGADGTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQPNPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQMATSLSNQVRSPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHASPQTGSPHPGLAVTMASSIDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPTRNALSSELALVGDTTGDTLEKFVEGL	456655	458532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_456700_458500
886676	contig_7839_pilon	+	1967	9	Intergenic	novelGene_45739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	627	junction_1	544.422113345885	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	597	1682	955026	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	953726	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
886677	contig_8576_pilon	+	2766	9	Intergenic	novelGene_88789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	519.968688961172	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	15	1508	893619	915806	FALSE	55	ACAACAAAAAACAAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDESVVFSLFKNVTKINLEVSFFCNMNLTVRQLA	893604	917064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338_915500_915709
886678	contig_2414_pilon	+	979	8	Intergenic	novelGene_158449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	83.5002138577244	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	183	809	114181	230279	FALSE	40	TAAAATGAGAGTATGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIHGLHFTEGPRNVQLLERKELETFKAELDAEHTQKVLEMEHTQQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	79830	230449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_79906_96110_96165_96919_96971_114178_114240_170460_170484_219742_219899_228474_228619_230034
886679	contig_5317_pilon	+	3729	1	Intergenic	novelGene_76637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	367	1101	2629	3729	907195	908295	NA	55	CTACATAAATGGAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHGLPKLQQSDVENLNGPITREEIGKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFCRTFTEEFVPVLLKLFQSVEEEATLSNSFYEASITLIPKPDKDVTKKENYKPISLMNIDAKILNKILANRLKHHIKKIIHHDQVGSTPGMQGWFNVRQSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGMYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRRGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRQEKEIKGIKIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKGSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENNEKEIRKTIPFSIAPTKIKSLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQEAQMD	904566	908295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_904600_908300
886680	contig_7644_pilon	+	4248	5	Intergenic	novelGene_64254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	171.425457561005	20	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	3128	3589	235232	235693	FALSE	20	CCGGATGGCTTCACCGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSILQEDITKINTYTPNDRAPKYIKQTLTALKRETDSSTIVARDFNTPPSLKDRTSGKKLNKDMEELNATINQLDLIDIQRTLHPTAAKYTFFSNTCGTFSRIDYILGHKASLNKIQSIEISQSIFSDHKAIQAKISNRKTRKKNQTHGN	176272	236352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_176654_177755_177835_179596_180787_233176_234505_235082
886681	contig_16228_pilon	+	5891	8	Intergenic	novelGene_147928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	245.88930643769	1653	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	63	1106	47816	72232	TRUE	40	TGGAAAATGCAATTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMGIRGQHMEEKETFATVYSEVQKPGQAINI	47753	78646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71817_72142_72339_73641_73821_74146
886682	contig_4083_pilon	-	8803	6	Intergenic	novelGene_152327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2048	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCATGATAATGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84881	65055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_65209_65964_66136_71992_72115_72605_72795_74934_75082_76860
886683	contig_5686_pilon	+	6131	18	Intergenic	novelGene_45236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_17	1503.25798203556	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	818	2457	58	2514	93843	219782	TRUE	40	GACAGAACAACTGGTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEGKHQMQTLSPFMQMMTQLAHPPACVCSLFYQDSRETF	93785	226860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_222917_224043_224203_226536
886684	contig_10973_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_150359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	266	778	2730	2218	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2995	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3000
886685	contig_12841_pilon	-	2536	5	Intergenic	novelGene_55878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	371.880693233731	1754	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	588	911	719673	714529	FALSE	30	CCCATGATGAAATTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGYGVMDDDGSIDYTVHEAWNEATNVYLIVILVSFGLFMYAKRNKRKILRIFSVPPTAEILSEHNFYDTISKIRLRQQLEMYSISRKYDYQQPQIQADSVQLSLE	731003	712903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_714594_717403_717529_719539_719678_724208_724375_730586
886686	contig_9235_pilon	+	2225	3	Intergenic	novelGene_156201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	502	855	45805	46953	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43699	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_45870_46664
886687	contig_10106_pilon	+	2718	8	Intergenic	novelGene_73865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	712.930714783444	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	148	516	151101	173056	TRUE	25	GAGAAGTCCCTCTGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQQA	131604	176655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131648_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159367_173047_173293_174689
886688	contig_19778_pilon	+	2352	8	Intergenic	novelGene_143741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	315.558785234662	22	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	346	1206	9539	16019	FALSE	20	TCTTTGCTCTCAGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	2637	17165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_2723_5643_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920
886689	contig_2703_pilon	+	325	1	Intergenic	novelGene_101657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAAAAGAACTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397	1722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1400_1700
886690	contig_16303_pilon	-	1079	3	Intergenic	novelGene_34131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	34.5	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65386	58165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_58564_58999_59311_65016
886691	contig_18272_pilon	-	6032	3	Intergenic	novelGene_7049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1831	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2087	2644	477776	477219	TRUE	50	AAAAAAAAATGGCTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQSFVKETKPVTDGSNQLQQKIYELRLKGTEKEQKERKLPASWNSIGRKQAKGATSVVLQEKKRTIPGVARRSAELLEGAWEAGPSQFQWVGPRSPGSQRMRLQLLGSQRIGSPPLGSQRVEPPWPLRFQGVRFSPVQFQSVVLPSTLAKRMGPLPKAETVGPCPRGRRTGSAGAKGVGLPLR	481716	470682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_471180_474327_478150_480003
886692	contig_6622_pilon	+	6313	3	Intergenic	novelGene_178491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	396	123	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	3516	4046	46414	46944	TRUE	20	CTAGGAGTCCCTCAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEVSVADRDAVWSLWQAPIVESQCRPLGFWSTALPSSADKYSPFEKQLLACYWALVETERLTMGHQVTMWPELPIMNWVLSDPQSHKVGRAQQHSIIKWKWYIRGRAQAGPEGTRKLHEEVAQMPMISTPITLPSISQSAPMASWGVPYDQLTEEEKTRAWFTDGSARYAGTTQ	42839	49290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6622_pilon_+_43902_43960_47056_47134
886693	contig_4131_pilon	+	1509	2	Intergenic	novelGene_127893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	884	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	55	696	300864	301505	TRUE	15	CAGGCTTTCTAGTTTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPAAPATASPAEKTQIKKKARKSTGAAKRKATGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAGGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEAKPKAKKAGAAKAKKPDGTKKPKRPAAATPKKSTKKTPKKAKKPAAAAGVKKVAKSPKKVKAAKPRKAAKSPAKAKAPKPKAGKLKAGKPKKAAPKKK	300809	302463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_301521_301665
886694	contig_5341_pilon	-	1131	2	Intergenic	novelGene_168027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	180	464	338764	338480	FALSE	30	CTACAAAATCTCAGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGVALRVVRAEGNSSRKLRRCGVSLDGPLLSTEAVFGSTQPDPGSGFSSKPTICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340883	337812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338788_340727
886695	contig_12923_pilon	+	3448	18	Intergenic	novelGene_30170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	124.827299383109	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	1238	2518	311762	348947	TRUE	40	GAACGCCAAGGATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRIGWFPSNYVEEDYSEYC	310269	350781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_310331_310486_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893_349533_350436
886696	contig_6503_pilon	+	2065	9	Intergenic	novelGene_145763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_3	89.4469116291893	188	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	236	979	140497	154252	FALSE	50	AAAAAAAATCACTGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKDRIEIFPSRMAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSEKDLQQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE	140261	155338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140538_144426_144545_146770_146851_149655_149724_150052_150098_151127_151232_151798_151866_153032_153112_154110
886697	contig_1406_pilon	+	2734	4	Intergenic	novelGene_25593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	430.144420191896	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	184	525	2179513	2185260	FALSE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2176190	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2176336_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
886699	contig_3018_pilon	-	2516	16	Intergenic	novelGene_78827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	469.741328345245	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	465	1607	600079	568037	TRUE	25	CTGTCCTTGCAATAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKSFMG	625122	550308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568050_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
886700	contig_5429_pilon	-	6601	6	Intergenic	novelGene_127797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	2391	3047	517037	516381	TRUE	45	TTTTTTTTTAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTMLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELQTENLPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGEIMRLSSDYSAETMHARRQWDDIYKILKEKNCQPRMIYPAKLSFKFHGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLK	637040	275002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_275777_410733_412758_415436_415755_515942_518353_635684_636332_636612
886701	contig_11471_pilon	+	7054	3	Intergenic	novelGene_178492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	6498	7037	93752	94291	FALSE	15	ATTCTCTGTTCAGCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGREWESIYHKLPELCSPSGRSKDGARSQVFERKEGELVRGKEETKRSRKKQHQQPTNGTQRAGLFGCVESKQPVFPGQEIVVAGSRGGQVGVKKGGGWESVYHKLPVVLSPAGHSMRLLSCAPCLLVSDRSPRWQIHAALAGRGPLHESLLALRSLVSFLTPFDAWLISLSLHLLF	20270	94308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11471_pilon_+_20840_87786_88425_88461
886702	contig_7457_pilon	-	1880	8	Intergenic	novelGene_31416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_7	151.364676546817	1113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	57	791	473193	469327	FALSE	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473249	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
886703	contig_8377_pilon	+	4772	32	Intergenic	novelGene_34964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3465.61847303253	6	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	377	2158	128927	183005	TRUE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKR	68097	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143554_161353_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180471_183002_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197772_197871
886704	contig_16411_pilon	-	2304	3	Intergenic	novelGene_77343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGAATATATTTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250989	224162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_225195_229167_229961_250510
886705	contig_11574_pilon	-	3558	11	Intergenic	novelGene_64058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	293.13757862137	1277	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	150	2027	456525	449890	TRUE	15	GTTGTCGCGTGTATTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	474008	448316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_448578_448619_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_473873
886706	contig_7840_pilon	+	4434	1	Intergenic	novelGene_69008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	1422	1973	281897	282448	NA	55	GAATGAAGAACACCAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAITTDPTEIKRIITEYYEKLYCNKFENLGNGQIFRNSLPPKLTQTEVEQLNKPITKEEIEKVIQKFPTKKHPGPDDFTGEFYQTFREELTPLLLKVFLSIEKDGILPNSFYEASLTLIPKPGKDTTKGENYRPMSLMNIYAKILNKILAYRIQQHTKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKTM	280475	284909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_280500_284900
886707	contig_960_pilon	+	6547	8	Intergenic	novelGene_108297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	683.857098093048	2322	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	18	461	1038574	1053841	TRUE	20	CCTGCACCCCTCCACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTVVIMISYPKGRELLDLVQRGIPVKMTIGIGTRHVQEFISSQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQFGNQSHRKEIKKIIGQLVLHTVNRGEKGIDVDAENCAVCIENFKAKDIVRILPCNEHLLEECHLTDCRWGHKDRA	1038556	1065415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1038802_1039695_1039765_1046762_1046846_1051401_1051455_1053830_1054030_1055348_1057926_1060221_1062360_1064232
886708	contig_3077_pilon	+	1569	6	Intergenic	novelGene_26803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	895.584278557859	53	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	199	639	473998	481143	TRUE	20	GAGATTTAACGTGTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWAGSSLWL	467412	482389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476888_481115_481218_481533
886709	contig_1230_pilon	+	2466	8	Intergenic	novelGene_28858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	1106.42188506695	1452	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	68	1216	405241	406960	TRUE	15	TATAGTTGTTTCATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAGNKMILTSR	404458	408995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_407352_407588_407788_408003_408237_408568
886710	contig_20739_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_83185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1450	1905	162514	162969	NA	65	CGTAAATAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKEKQERAQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSSKFENREEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPIIRAEVEKVIKKTPNQKKPWPSGFTGGFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASINADTKTRQRRHKKRKL	161064	163131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_161100_163100
886711	contig_5684_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_81074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTCGTCCACACCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447686	446597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_446600_447700
886712	contig_9774_pilon	-	1911	2	Intergenic	novelGene_178243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGGCTCCAATAGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26670	871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9774_pilon_-_1692_25579
886713	contig_1443_pilon	-	3282	9	Intergenic	novelGene_28274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	275.284852471036	343	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1389	2312	776427	748649	FALSE	5	CCTTTTTGAGGTTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809527	747678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_804491_805718_809399
886714	contig_1275_pilon	+	2603	19	Intergenic	novelGene_108752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	184	405	400596	400817	TRUE	25	TGGTTGGGAGGATAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNQILIPRLSLLSGSLQVSFFGVTFNFSCTVSQHPHFSIYRVGFGSCWEIENRIHFSIVLLMIHVHWLCCFNTDVICLGFHTFIFSMFCTWACWGGRCTLCGFRVGLELSHRFRVSSRSTVFSAIFTGLDSFNW	400412	513706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409_464583_468120_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486075_495660_495854_505867_506006_513629
886715	contig_10930_pilon	-	5614	5	Intergenic	novelGene_36979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	769.86959122958	27	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	3438	4286	276835	268388	FALSE	90	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	281703	267059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443
886716	contig_383_pilon	+	6891	25	Intergenic	novelGene_126096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_9	612.144721223848	3209	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1466	4401	1797	6197	130425	169172	FALSE	30	TCTGACCCTCCATGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTINGYVPESIRALGFCFDDTVQWHFCSVGTQDDVLIIHFTGHSFIYGKRHEDTLVLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTTMSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPWEDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYIKTRKKKKEEKLTHYVPMSPRGLHPLRGEAYTTFSDRKLDDSLLRHKSNETSLLTDLNQTLPSMNPGPIAALPDHDQSPQNNNTGQTSSPPDIYHTVPPEERSYIQDPDQMHSTIVSNHRLFPPELDQMLNYDLSHESSPTDSGQIFPSLELEVRQTTTSPDLNQPSFSLDDLSSELSQTTVSPDLSQPTLSPDDFSSELSQTTPSPDLSQMTLSPDDFSSELSQTILSPDFSQITLSPEFSETNLPSDLSQATLSSEVSQMTLSPDLRQTLPPPDLNQTSYPSESNQSLPLPEFGQTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	86230	169866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_86425_89956_90080_116750_116964_118130_118275_123646_123869_125164_125331_126209_126388_127895_127996_128779_128992_129410_129511_130280_130432_132625_132839_134494_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
886717	contig_13863_pilon	+	2906	10	Intergenic	novelGene_42093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	357.875555997119	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1532	2599	478688	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	475536	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_476881_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
886718	contig_15105_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_150980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAATGTGTGTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629789	631530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_629800_631500
886719	contig_1719_pilon	-	1224	6	Intergenic	novelGene_87356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	627.524852097509	5590	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	396	704	786528	754873	FALSE	10	GGGGGAGCCGTGTGTGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803668	754352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_786990_787091_787977_788100_803564
886720	contig_5039_pilon	+	3131	2	Intergenic	novelGene_65038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	481	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTGTGTAACTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1801707	1808331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1802338_1805830
886721	contig_9705_pilon	+	7368	39	Intergenic	novelGene_41749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_37	250.751856956859	2642	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1594	4785	25	4809	450139	551256	TRUE	70	TTAAAAAAAGAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVVVPAEWIKNWEKSGRGEFLHLCRILSENKSHDSSTYRDFQQALYELSYHVIKGNLKHEQASNVLNDISEFREDMPSILADVFCILDIETNCLEEKNKRDYFTQLVLACLYLVSDTVLKERLDPETLESLGLIKQSQQFNQKSVKIKTKLFYKQQKFNLLREENEGYAKLIAELGQDLSGNITSDLILENIKSLIGCFNLDPNRVLDVILEVFECRPEHDDFFISLLESYMSMCEPQTLCHILGFKFKFYQEPSGETPSSLYRVAAVLLQFNLIDLDDLYVHLLPADNCIMDEHRREIVEAKQIVRKLTMVVLSSEKMDEREKEKEKEEEKVEKPPDNQKLGLLEALLKIGDWQHAQNIMDQMPPYYAASHKLIALAICKLIHITIEPLYRRVGVPKGAKGSPVTALQNKRAPKQAENFEDLRRDVFHMFCYLGPHLSHDPILFAKVVRIGKSFMKEFQSDGSKQEDKEKTEVILSCLLSITDQVLLPSLSLMDCNACMSEELWGMFKTFPYQHRYRLYGQWKNETYNSHPLLVKVKAQTIDRAKYIMKRLTKENVKPSGRQIGKLSHSNPTILFDYILSQIQKYDNLITPVVDSLKYLTSLNYDVLAYCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKDNLIELKESSAKLYINHTPPPLSKSKEREMDKKDLDKSRERSREREKKDEKDRKERKRDHSNNDREVPPDLTKRRKEENGTMGVSKHKSESPCESPYPNEKDKEKNKSKSSGKEKGGDSFKSEKMDKISSGGKKESRHDKEKIEKKEKRDSSGGKEEKKHHKSSDKHR	450114	559693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_462681_462741_466106_466199_468452_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229_541289_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695_550773_551228_551275_557152
886722	contig_3004_pilon	-	608	5	Intergenic	novelGene_127519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	146.500853239836	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	216	587	333221	330924	FALSE	75	TACAGAAAAATAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKVVKAGRLRLSPNEEAFILKEDYERRRKLRLLQVREQERDIALRIREDIKHRRNQQFTRLAEELRAEWEESQTQKIKNLEKLYLASLKNMGEGHRQAKENEPDLDGLARQAAERKKKKQK	339257	330902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_330987_332097_332299_333113_333231_333447_333590_339193
886724	contig_13992_pilon	+	4857	3	Intergenic	novelGene_147619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	2216	3049	150711	315935	TRUE	45	GGGAATATGAGAGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKEEVQAALKSLAKNKAPEVDGIPIEMFREMDTALEVLTCLCQEIWKTATWPTHWKRSIFMSILKKGDTTKCGNYLTISLISHKSKILLKIIQKLLQQYIDRELPEIQAGFRRGRGTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHKKLWITLWRMRILEHLIVHLYVDQEADIRTEQEDTVWFKVRKVVCQGCILSAYLFNLYAQQTIREAGLYEEEWGIRIGGRLINNLCCADDTTLLAESEENLKHLPMKLKDHTAFSMDYTST	148495	352753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_150969_315359_316077_351086
886725	contig_2054_pilon	+	3207	4	Intergenic	novelGene_51658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	209	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAGACCGCCCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	34795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_30934_31955_32272_34170_34676
886726	contig_7189_pilon	-	1999	5	Intergenic	novelGene_117660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAACGCGCCCTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590649	537694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_537785_562187_562234_580569_580716_585138_585212_589005
886727	contig_6227_pilon	-	2500	9	Intergenic	novelGene_49651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_5	54.3666660279992	239	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	577	852	438998	429379	FALSE	30	TGGTTTTAAGAAGACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVRGLEVEHLKLTFCGVGPAECAALAFALQHLRRPVALQLDHNSVGDIGVEQLLPCLSVCKALYLRDNNISDRGICKLIEHGLHCEQLQKLALFNNKLTDGCARSVAELLACKQNFLALRLGNNRITAAGAEVLAQGLRDNVSLQFLGFWGNRVGDKGAQALAEALSNHRSLKWLSLVGNDIGSLGAQALALMLERNVVLEELCLEENHLHDEGVCFLAEGLKRNSSLKVLKLSNNCISCVGAEALLQALERNDTILEVWLRGNTFSPEEIETLSHKDTRLLL	450527	427730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_429452_431540_431625_436287_436372_438963_439048_439707_439792_442026_442111_443269_443354_443545_443630_450336
886728	contig_3747_pilon	+	2147	5	Intergenic	novelGene_24749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	741	1067	203794	204120	FALSE	30	ACAAAATGTTGAGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200977	205200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201321_203064_203128_203228_203386_203498_203651_203768
886729	contig_5684_pilon	-	746	4	Intergenic	novelGene_81023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	984.932823428414	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361523	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351399_351448_351696_358661_358810_361315
886730	contig_10437_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_38363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTGCGTTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561534	558923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_558900_561500
886731	contig_7230_pilon	-	2456	7	Intergenic	novelGene_52552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	351.520230174911	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	344	658	164221	134622	FALSE	40	AATTTGCAAATACGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177624	132823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_176987_177438
886732	contig_15407_pilon	+	2711	7	Intergenic	novelGene_123090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.033349549987	816	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1016	1672	519178	526565	FALSE	20	TGAGTTGCTTTTGCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEERTGEEWEEEEEQLVLVELSGIIDSDFLSKCENKCKILGIDTERPIMQVDNYVFAGEYEDTLGTCVIFEEDVEEHVDAEGNNKTVLKYKCHTMKKLSMTRTLLTEKKEGEENIGGVEWLQIKDNDSSNRPNMICSFLHENEDEEVVAPAPDKPLELKEQEIQMKDNSDLSYEQGKPLHLEIEDSGPLIEIPSFDTEGFDFMETQDADLEATPR	517309	527604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_518011_518863_519226_519554_519636_520336_520401_520497_520546_523324_523439_526263
886733	contig_15327_pilon	-	875	3	Intergenic	novelGene_70682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	9	419	901528	900904	FALSE	65	TTTCCTAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901536	900447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
886734	contig_5871_pilon	-	1501	9	Intergenic	novelGene_160166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	571.929573898745	691	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	336	1310	384154	259468	FALSE	20	CATACTTTTTAGATCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALRCLCRVLIHHQRHSLSKTAYQASLSPCSVNVQVLNRHFAAATKPAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIATLDMSSDQIAANLQAIINDVCRHRPLSLGPFVVRAFLRSSTSEGLLLKIEPLLPKEVETKESNKETA	384489	259276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_259587_260970_261053_311832_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113_364226_384123
886735	contig_9848_pilon	-	2283	11	Intergenic	novelGene_79948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_10	389.179971221542	115	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	13	636	113970	106351	TRUE	5	CAGTCGTTCTCCTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQWLTGSPSPSLLPISVSGIGVSSGRCLGSGWGGRSEEPRLSGGLLGADMTTEPELLWTGVALLLLLGAAAGLCVRCSRPGAKKSEKIYEQRSLQENQQSFAVARTYSLIRQAWADPLVDAAPDTAQTRKDKLLQFSPSVEGSATPRYQNFSKGRRAPGVGRGGVTAQLRPNSLLLQEAGTDQMQPTCEWPSPCPSPVRHCPGFLI	113982	98495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_106548_106837_106876_107128_107190_107354_107399_110003_110044_110455_110570_113840
886737	contig_9075_pilon	+	5203	1	Intergenic	novelGene_178493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	964	1269	45818	46123	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLYPATLLNLSIRSSRFLMESPGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	44854	50057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9075_pilon_+_44900_50100
886738	contig_8322_pilon	+	4262	5	Intergenic	novelGene_143251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_4	139.162674593441	1469	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1679	2113	301345	304580	FALSE	15	CATTTGTAGTGTTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	298770	306729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
886739	contig_4232_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_63410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTTATCTGCGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467415	468065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467400_468100
886740	contig_5640_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_27253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	114	341	99159	99386	NA	15	CACCCACTGCTGTGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKNTNNPIYKWAKEMNRHFTKEDMQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLTHCWWECKMI	99045	101406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_99000_101400
886741	contig_6954_pilon	-	4299	2	Intergenic	novelGene_64460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	0	702	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	310	735	784404	783979	FALSE	10	CCTCCTGACTTTTCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSEKIAIPHGQLVHGIHLYEPKINRQKNKYNLPLTKITSAKRNENNFWQDSVSSDKTQKQEKKPFKNTENIKNMHLKKSAFLTEVSQKENYAGAKFSDPPSPSVLPKPPSHWMGSTVENSNQNRELMAVHLKTLLKVQT	786319	780414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_784420_786025
886742	contig_9921_pilon	-	2981	1	Intergenic	novelGene_23733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	239	679	152475	152035	NA	25	CTTGTAAGCTTGCAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIQKGRKPQISKALLKKKNKVRGLTLPDLRTYYTSTVVKTAWYCYNDKYIDQWNRIENPDVNPSTYGHQIFHKGPKSIKWGTDGLFNKWCWQNWISICKKMKQGPYYTLYTKTN	152713	149732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_149700_152700
886743	contig_11264_pilon	-	3405	1	Intergenic	novelGene_154213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	841	1374	688664	688131	NA	45	TAGAAAGTCACAGACCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGITENTEKIVEDLLTENFPDIMKDEKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKLTKTKDKERILRVARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIFKALKENNCQPRVIYPAKLSLKYDGEIRAFPDKQKFREFAKTKPKLQEILKGVLRLDNQ	689504	686099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_-_686100_689500
886744	contig_7272_pilon	-	5586	21	Intergenic	novelGene_25335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	335	junction_2	658.613033199314	1930	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1032	3099	94	3192	633189	593320	FALSE	70	AAATAGTTAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKDMAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633282	590925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
886745	contig_9653_pilon	-	2942	9	Intergenic	novelGene_48278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1276.61960245603	18	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	32	1111	1040020	1006903	TRUE	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1005446_1005506_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016676_1039998
886746	contig_5084_pilon	-	799	6	Intergenic	novelGene_64512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	325.285351652976	1854	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	280	798	395708	365337	FALSE	80	AGAAAGAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSELLSLAKRKRSDSEEKEPPVSQPAASSDSETSDSDDEWTFGSNKNKKKGKARKIEKKGTMKKQANKTASSGSSDKDSSAESSAPEEGEVSDSDSNSSSSSSDSDSSSEDEEFHDGYGEDLMGDEEDRARLEQMTEKEREQELFNRIEKREVLKRRFEIKKKLKTAKKKE	408206	365335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_365380_375773_375979_377896_378045_394664_394776_395696_395804_408022
886747	contig_15498_pilon	-	3040	13	Intergenic	novelGene_42682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_12	230.930304541339	1462	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	217	1878	829154	785428	FALSE	25	ACTTGACATTTTAATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	837871	784265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058_829255_837755
886748	contig_7078_pilon	-	2645	19	Intergenic	novelGene_130176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281.199640210156	1113	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2178	468	2645	795828	759745	FALSE	55	GCAAAAGAAAAACTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEETVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGNTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEREKEKNKTLRNTIQWLENELNRWRNGETVPVDEQFDKEKANLEAFAVDKDITVTNDKPAATIGVTGNFTDAERRKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEESVDSLSEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKASQAVEQQIQSHRETHQKQISNLRDEVE	796295	759744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_759823_759910_759979_760495_760614_761213_761403_766006_766151_767864_768072_771397_771467_772465_772660_773113_773263_774112_774259_774781_774887_775960_776086_776237_776326_776419_776476_777368_777418_777870_777976_779165_779240_785885_785974_795702
886749	contig_5684_pilon	+	1781	4	Intergenic	novelGene_81033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	174.847234909665	172	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	145	1113	403659	447039	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403514	447707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441837_443891_443949_446518
886750	contig_4531_pilon	+	4777	1	Intergenic	novelGene_47938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1633	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTTTTGGCTTATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701847	706624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_701800_706600
886751	contig_6513_pilon	+	2867	11	Intergenic	novelGene_117744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	422.081994403931	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	887	2661	207	2867	170490	212289	FALSE	30	GTTAGTGAACTACAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRREGRPRRQEDWFPGRRRCPPGSSGPWPGVCECFYVGEGGGGGRRSSDLSSSQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGEGRPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKSGFKSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHPDSKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKKMEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVEN	48548	212289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48708_170442_171994_198973_199157_203369_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250
886752	contig_16431_pilon	-	5131	6	Intergenic	novelGene_87607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3780	4223	223047	222604	TRUE	40	TGACAGCTCAGAGACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVIYRYNAISIQIPTAVFNETEKQISYFIWKGNRPPISKALFKKNNKVGGLILPDFRTYYTATVVQIAWYWYNNRCIDQWNRIENPIENPEVNASTYEQLIFDKGPKSVNWGNDSLFNKWCWHNGISSCKKLKQDPYLTHKK	249826	169297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_169310_182435_182482_221753_224030_224148_225041_247749_248743_248914
886753	contig_6102_pilon	-	1775	9	Intergenic	novelGene_32160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	242	724	867239	839973	TRUE	20	CTCCTCTAAATCTTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867480	838837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839119_839202_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
886754	contig_11898_pilon	-	4577	1	Intergenic	novelGene_144281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTACCGTGCAGGGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214437	209860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_209900_214400
886755	contig_8354_pilon	-	2788	8	Intergenic	novelGene_24136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	13	junction_1	589.520143845823	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	204	842	555816	536116	FALSE	25	CATTTCCCAGCATTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLSHLHFPA	558428	534169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_536143_537221_537381_538002_538147_539084_539151_543399_543460_550970_551140_555802_555922_558330
886756	contig_397_pilon	+	7018	3	Intergenic	novelGene_178391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	5544	6116	189177	189749	TRUE	35	ATGAGTCAGAACTGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKKEVQAALKALAKNKATGIDGIPIKMFQQTDAVLDMLAHLCQEIWKTATWPSNWKRSIFVPIPKKGDPTECRNYQTMSLISHQVKFCLKSFKSCCSSTSTGKLQNIQARFSRGHGRRDIIADVTWILTESREYQKDVYLCFINYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYSDQEAVIQTE	179278	191174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_397_pilon_+_183199_187553_189971_190493
886757	contig_9653_pilon	-	3548	15	Intergenic	novelGene_48297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.35261842365	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	32	2152	1040020	1006903	TRUE	70	GCAAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1005465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006507_1006547_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
886758	contig_15112_pilon	-	3620	2	Intergenic	novelGene_124757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25414	21758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_24136_24171
886759	contig_2125_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_147731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620536	618557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_618600_620500
886760	contig_546_pilon	-	4015	1	Intergenic	novelGene_117246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCATTTAATTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445412	441397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_441400_445400
886761	contig_10904_pilon	-	3908	8	Intergenic	novelGene_22624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	323.699533140074	1943	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	428	964	510205	507101	TRUE	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSRSGGGREASQDPPGPITKGWPWL	516000	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499852_500069_500201_505006_507532_510099_510260_514053_514181_514793_514925_515034_515114_515964
886762	contig_13112_pilon	-	3354	4	Intergenic	novelGene_98825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	3016	3354	227663	221949	FALSE	20	ACTACAGGCTTTGGGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECQEAILCTATVMPSCFWIIMFPLSDSRHTTGISVGSEVSLAACWARTEITPACSSDRVPRQPRLSPCESVHRTPTMDGFFIVSSKCCSKVVSIPPAVKPGPSFPQHVASFS	230678	221948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_222039_223786_223849_226376_226494_227593
886763	contig_5423_pilon	+	2293	1	Intergenic	novelGene_85224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACAAAAAAAAAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397711	400004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_397700_4e+05
886764	contig_1812_pilon	-	4590	3	Intergenic	novelGene_174514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1313	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2316	2954	14659	14021	FALSE	15	TAGTATTCCCCCCCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRGKRKQNKFKKKNKKVPPKKQKKRKKNQRKKKCSHGSLYTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPQDPTSAVAQTGKQLHTRMELHSPSGKSKDGAWSQTLERKAGEVARGKQEIQRSREKKKKATPAANKWHSESQLVQAGVSRQETVSVGSRGGRVWVKKRREWESVYHKLPTLWSPSGRSKDGARSQVLE	64929	12384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_-_15077_61356_61426_63100
886765	contig_4857_pilon	+	6507	8	Intergenic	novelGene_48798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5736	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAGGATCTTATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241819	1673928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1242269_1243120_1245283_1394395_1395585_1493130_1494124_1530931_1531143_1563990_1564623_1669954_1669998_1673100
886766	contig_5033_pilon	-	1690	5	Intergenic	novelGene_28928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	1151.89452642158	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	37	447	456896	450673	FALSE	30	AGGAGAGAAGTACGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRGLSCTLRDGMRAWFCLLWSCLSYITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	456932	449429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_456856
886767	contig_13740_pilon	-	4127	13	Intergenic	novelGene_34753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_2	224.401843798129	1785	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	144	1226	873748	687607	TRUE	20	TTTGGCTCAACAATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPGSVRTHSPAVLTGTASPSLGCRHSFTPSVPLSAQILSARPALSNMPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873891	684325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
886768	contig_11292_pilon	+	3344	1	Intergenic	novelGene_109469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	968	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456377	459721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_456400_459700
886769	contig_8541_pilon	-	5700	3	Intergenic	novelGene_105577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	840	junction_1	113.5	2633	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	219	944	577314	567093	TRUE	25	TTAAATTAGTTTGGTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKAREVTLGRLESRDSPWQNFQCRVVPPAQFRKRWNTDYLIPFSSKLTLLRKLIF	577532	546164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_567472_576967
886770	contig_8964_pilon	-	6303	8	Intergenic	novelGene_168694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	132.428340267944	887	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	421	447	548921	547451	TRUE	50	TTATTTAAAAAAATGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCSPPRLGRSPHPAVLPLSPRSGPAPLPFLPHFLTIPAQAWPLSKPRPLPVGPAHVLPHAAASFSAAGLRSLLKTRKRIARSEGHTESLPSRAALAAASSTCGTLQSSPSPETPGTTIFASSSHRLLLLSHPPATSVTSMLGEGIQL	549698	532770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_533456_537376_538722_538955_539311_540011_543276_543392_543520_547370_547457_548900_549078_549434
886771	contig_7810_pilon	-	4497	5	Intergenic	novelGene_144213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2071	2547	72767	72291	TRUE	55	CTAAACAAATAATTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGFQNKTPDDSPVEEYSLEIPDREFKSLILRILQELRKKSDKHEEKIDKFMENRDKKLEEFRKIMQEQNTKINSQLEIIQRQQLDIQKINNKISEMDGVTERLRSRFETVEDRISRIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEKTLRVMWNTIKSKIFE	122770	11491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_13239_41278_41403_72211_73624_73713_74368_122210
886772	contig_9400_pilon	-	3635	7	Intergenic	novelGene_146574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	604.082132017015	1175	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	115	426	135537	121567	TRUE	20	CAAGTCCATTGTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRNN	158630	117473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_120654_121537_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131262_135452_135561_158539
886773	contig_7457_pilon	-	5247	19	Intergenic	novelGene_31523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1392	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1718	2239	773012	772491	TRUE	5	CCGCGCGTCGTCGTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNWGGKGEQKGPDLENKNTIRRLQNSITNKPKESPDCASISTGEGWTGGTAASWLTRLCCWCLAAGLVCHLDQNTKDSNTINYYATLFSFLYFIKHVCTFVQVWGLNGNSTNRQRGRDREKEREEGGKEGQKCVKCHSFKEPPPIRRPVTSSLASTIFDCHPFPHPYPGKWG	774729	704826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_704904_747080_747217_750044_750200_751595_751692_752634_752808_757012_757145_757402_757553_757974_758137_758573_758753_759126_759214_759288_759411_760426_760520_762652_762864_764332_764428_764529_764662_765741_765898_770753_770805_771157_771268_771799
886774	contig_7151_pilon	-	4175	5	Intergenic	novelGene_40767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	701.274687622475	256	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	178	726	551180	529189	FALSE	20	GGTGTCGTATCTATGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKLTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551357	525739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_551152
886775	contig_10599_pilon	+	2666	7	Intergenic	novelGene_49871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	906.934335489008	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	210	962	123528	163915	FALSE	15	GCCTGACTGGTTATTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123318	165619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_146885_147018_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
886776	contig_9668_pilon	-	2467	16	Intergenic	novelGene_58193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_15	798.486724303472	63	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	284	2275	605373	503609	FALSE	25	ATGTACATATCTTTTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669929	503416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_662727_662779_669866
886777	contig_6102_pilon	+	4098	31	Intergenic	novelGene_31853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	499.238593593618	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	60	1664	370803	378885	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLLSITPTAQCGKRLSGSSCKTLEARSSMCR	370743	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376008_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
886778	contig_9981_pilon	+	1129	2	Intergenic	novelGene_121019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	216	668	10529	11056	FALSE	15	TCAAACTGCCGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVLSKIFGNKEMTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS	10313	11517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10569_10643
886779	contig_11498_pilon	-	1948	13	Intergenic	novelGene_65532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	185.026574667893	1152	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	376	1056	297063	290363	TRUE	50	TATTATATATATATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPAERIQEIQKAIELFSVGQGPAKTMEEASKRSYQFWDTQPVPKLGEVVNTHGPVEPDKDNIRQEPYTLPQGFTWDALDLGDRGVLKELYTLLNENYVEDDDNMFRFDYSPEFLLWALRPPGWLPQWHCGVRVVSSRKLVGFISAIPAIIHIYDTEEDGGDQLLMCPQEAALQEGGSSPDPGDNSAGSPGGHFPSCLHCWGSTTKACWHLQVLASVAKPSEAD	312349	284656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_285002_285657_285796_286839_287008_287602_287774_290292_290402_291015_291185_292007_292125_292993_293086_293970_294090_296918_297064_300506_300661_310875_310962_312214
886780	contig_15152_pilon	-	3801	6	Intergenic	novelGene_126963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_4	346.30645388153	1158	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	147	1181	206402	203318	FALSE	25	GGGAAGGACTTGGTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAPLCGWTRPPLRCEARVRALFPTRTAATALRFAVRQLAFGPLPATAMPRVYIGRLSYNVREKDIQRFFSGYGRLLEVDLKNGYGFVEFEDSRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDRDGYSYGSRSGGGGYSSRRTSGRDKYGPPVRTEHRLIVENLSSRCSWQDLKDFMRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	206548	200697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512_204638_205925_206075_206295
886781	contig_2100_pilon	-	3795	4	Intergenic	novelGene_50579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2104	2589	42950	42192	FALSE	35	TTTCTGTGCTTAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNQKNYKREPAQESKRNNRKCQYHKKKKKLQNAIPLLGIYPRGIRAITLLDICTPIFTEALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYTKIKNNDECVKHLITWMKLEDIMLSEISQSKKDKYCMRPLLYNSCTSLHTKRNNLCWLRGMGGMGGNK	79040	40985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_42644_42916_43160_76905_77307_77547
886782	contig_7151_pilon	+	4629	5	Intergenic	novelGene_40727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	174.124237256047	3	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	192	599	502420	505628	TRUE	45	GACACCATTGAACCTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSKSSASSCTEEGFFSSQVFVWTAAGVSILLLSACFVTRCVVTYHTFQLCDEENFQPHENITELSCYNDGSGSVKNCCPVNWEHFQSSCYFFSTNTMTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQVVGVQPPPVSI	502228	509870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505440_508007_508218
886783	contig_10307_pilon	+	2795	4	Intergenic	novelGene_170267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	155.64061166675	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	381	1697	389628	392058	FALSE	25	GTTATGTAACTTATCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387435	393156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387557_387603_387851_389615_390382_391495
886784	contig_4402_pilon	-	5234	4	Intergenic	novelGene_140833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_3	151.730023396822	268	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1121	3366	1468	4833	596783	592178	FALSE	35	TCAGTAAACTTTTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV	598540	591776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_595933_596736_596839_597128
886785	contig_12090_pilon	-	1323	1	Intergenic	novelGene_80495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGCTGTGGAGGGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166567	165244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_165200_166600
886786	contig_7300_pilon	+	5291	6	Intergenic	novelGene_170457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2728	3309	526833	658161	FALSE	45	GAAAATCCAACACCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGTIHHEDTTIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSIIIAGDFNTPLSVKDRTTNKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIHRTLQPTAAKYTFFSNAHGPFSRKDHILGHTAILKIQNTEIIQSIFSDHSAIKVEINNRKSKEKKSITWKLSNTLLTHHWLVLGKNQQNRHTTGQTDKRKTGADTKNPNKK	490497	660143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7300_pilon_+_491374_523411_523568_523837_524135_524417_524656_525672_527319_658065
886787	contig_18364_pilon	+	6284	26	Intergenic	novelGene_102548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	701.968883640863	2546	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	2388	4034	42021	50216	FALSE	45	ATATCTAAAATTTTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	16491	52466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_29679_31509_31590_32506_32599_32653_32678_35655_35894_36637_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41564_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
886788	contig_5770_pilon	-	1041	3	Intergenic	novelGene_74166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	290	685	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGTTCTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256960	254292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_255058_255963_256152_256872
886789	contig_2069_pilon	+	2842	13	Intergenic	novelGene_23274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	303.061634270435	5	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1386	2102	341330	343975	TRUE	15	ACTGATGTGGTTTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	332473	344815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766_344312_344411
886790	contig_5686_pilon	-	8155	2	Intergenic	novelGene_45319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTCTTCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114478	100830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_104378_109870
886791	contig_19061_pilon	-	4105	4	Intergenic	novelGene_173503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.0283861087154	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	212	523	78343	39948	FALSE	10	AGTTCTGCCTAGCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAASAGSAGCGEAVRDSGGGDGRPRGSAQHRSRPPRRGPSPRPTAELPRASVHSSPRPRSLLPLRPVLEIMNPVYSPGSSGVPYANAKGIGYPGYTPGTPYKVSCSPTSGTVPPYSSSPNPYQTAVYPVRSAYPQQSPYAQQAPCLHPDGGFECCIWGRGFCSHCLWQLGHEL	93432	36365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_40047_44036_44180_78273_78355_93232
886793	contig_16098_pilon	-	2063	2	Intergenic	novelGene_46250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATTTAGAAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828606	826323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_828290_828509
886794	contig_2444_pilon	-	5973	12	Intergenic	novelGene_83766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.287479787288034	1620	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGACTGCAGGACGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247221	230301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_230358_231265_231443_232596_232849_234419_234501_235498_235598_236017_236112_238918_239088_240845_240948_241446_241693_242125_242300_242566_242742_242873
886795	contig_177_pilon	+	2449	3	Intergenic	novelGene_41831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	70	1146	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415661	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419802_419901
886796	contig_6063_pilon	-	4444	15	Intergenic	novelGene_27568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	398.949647735866	1784	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	86	1645	70243	17150	FALSE	15	GCTAATGGCTGCTTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70328	14350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
886797	contig_20944_pilon	+	2584	1	Intergenic	novelGene_167541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGCACATAATTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50686	53270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_50700_53300
886798	contig_11248_pilon	+	8386	4	Intergenic	novelGene_142550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	683	137	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	154	537	259511	259894	TRUE	25	TGGCTTTAGTACCAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPNPLCLLISPPDRSCLFSLLYLLELRSTLLTSITLYPKVQSNPCLNAGFGNCFSSGLIQNPGDMLSGIPPVSFRPLSLVFLLEFEFCTPPLSCSIRFSLLCSLSGLSLAVARHHLVLLVSG	259357	268298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_262685_262726_262763_262841_263716_264149
886799	contig_34_pilon	-	1753	8	Intergenic	novelGene_39994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1579.95334469995	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	59	913	247052	212618	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKEHVSHPMTFLGEPLSESSLDFSLN	247110	211777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212693_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224755_224818_230228_230387_243214_243354_246970
886800	contig_10659_pilon	-	5006	4	Intergenic	novelGene_178487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1291	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	3402	4340	98277	93067	FALSE	15	AATGTTGGAGGGGCTGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHSLLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYSKPTANIILNGERLKTFPLRTETRQRCPLSTLLFNIVPEVLARAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFADNMMLYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGQKINIQKSVGFLYTNKEIDEKEMRKTVPFIIVSKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETKRHLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAILIQIPTAFFKEMENLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKIGGLTLPDFRTHYTATYSKQPGTGTTTETVTNGTELRTQM	169124	92400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10659_pilon_-_93549_97820_99573_122978_123845_167884
886801	contig_5649_pilon	+	2379	3	Intergenic	novelGene_82423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCTGTAAAGCTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414125	1487270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1414896_1415127_1415218_1485751
886802	contig_753_pilon	-	4684	6	Intergenic	novelGene_112981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	104.688872379064	653	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2602	3246	1210648	1192752	FALSE	25	ACATTGTCTTTATAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHR	1214350	1191313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1192870_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210773_1211873
886803	contig_18108_pilon	+	2113	8	Intergenic	novelGene_33440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	205.710416630282	29	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	76	1179	103448	123205	TRUE	40	GAATAAATTATTTTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGAVQLRAPLRAGPRRPASANQEKIMNVKGKVILSMLVVSTVIVVFWEYINSPEGSFLWLYHSKNSEVGDSSTQRGWWFQSWFNNGTQSYQEEDIDKEKGREDRKELQLSDWFNPKKRPEVVTVTGWKAPVVWEGTYNKAILENYYAKQKITVGLTVFAIGKYIEHYLEEFIISADKYFMVGHKVIFYIMVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	43087	125300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_43154_103438_103528_108412_108449_110391_110458_110981_111072_116603_116742_122511_123765_124925
886804	contig_17281_pilon	+	544	1	Intergenic	novelGene_105177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGAGTGAATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2600
886805	contig_11493_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_143682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	587	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCTTCCTGACATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179570	181281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_179600_181300
886806	contig_5794_pilon	-	1420	5	Intergenic	novelGene_69793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1191.71147934389	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTACTGGCTGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749537	742461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743740_747175_747245_747330_747454_749495
886807	contig_5317_pilon	-	3491	20	Intergenic	novelGene_76581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	265.943467635209	1039	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	121	1620	401580	373913	TRUE	10	TTTGTGTATTGTGTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESSDKLYRAEYAKSGRASCKKCKENIPKDSLRMAIMVQSPIFDGRVPHWYHFPCFWKVGHTLLHPDVDVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVAGKGQDGSDGKVEKTLSDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQMRLSKKMLDPEKPQMGVIDRWYHPNCFVQNREKLGFRPEYSVSQIVGFPLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKIKKQDRLFPPEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGRAFASLTGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	401700	354927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356343_356925_356988_357964_358093_361103_361257_361766_361866_364146_364276_364800_364924_366581_366666_370358_370488_373902_374100_375290_375441_379068_379221_381031_381209_381934_382052_384128_384229_386643_386859_388796_388913_394982_395149_401460
886808	contig_6025_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_178035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1512	1811	215778	216077	NA	30	ACAATACTCTAGTGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARRCPATTTHCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWSERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQAHITNRD	214266	216508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6025_pilon_+_214300_216500
886809	contig_14559_pilon	-	1813	3	Intergenic	novelGene_83726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_2	55	47	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	63	635	286587	277429	FALSE	45	CAGAAAAACTTAAGGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQKKEKQLSNFKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDISSQCLPQKDLYATEEEADTLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKNPGEQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEPKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKKSGADSAARTKSRKARCAPFSLL	354492	276250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_277975_286560_286617_354459
886810	contig_7629_pilon	-	3666	16	Intergenic	novelGene_153591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_15	145.783035135551	746	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	902	2709	260	2968	449167	375344	TRUE	30	AAATACTACCGGGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVSLVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQGTPTHQKMTDFEQLNQFDSLKFHQVNQSFGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQNQSNGLFPDVADGSPMWGHHTATSISNLNGSPFHQQGHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRLQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFMDVSVSGPHRVSVNHPPQITNASTSQQSLSMQQFSQTSNPSIHFLKCSNHQEGNFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSHYSFSSNHLSSNSLLQSSAVLASNHTNQTLSDFTGNNSFSPQRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQMLHSSHPQGNYSSSKLSPVHMNFPDPVDSGTQMGHFNDRVETNGFSSLEENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPQYDESTFGQDSSSHVLDHHLDQQFTSHLVTRPSDMAQAQLQSHAQSWHSSLSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVRVMSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIGKLIITLGKKQKRKNESSDEISDTEQMPQHALKDEDSQKRRSNRQIKRKKYVEEAEGKQCEEAVKGSMKIKKNSAPLPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSSRIVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFSDMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRYEPLEGREHVLFLLYPIFSYCP	540166	368734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_368858_368960_369105_370498_370676_374774_375019_375333_375414_378600_378723_387034_387173_387397_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391813_392732_392880_396940_397053_413488_413821_447709_449330_540069
886811	contig_3077_pilon	+	1634	10	Intergenic	novelGene_26667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	57	1208	9676	17590	FALSE	20	AGTCATGTCTCCCATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9619	18016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
886812	contig_9471_pilon	-	6037	2	Intergenic	novelGene_21687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4436	4765	52162	51833	TRUE	35	ACTACCTTGAACTGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVALELRVAKAKRRNDEVKGLNRRFQRVASEDKVKYYNDMCKDLEIENQKGRTCLAFLKLKELNKKIPPRVAVLKDSMGENIKQRRKHQKKMEERHSHYTIKN	56597	50338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_50427_50648
886814	contig_10323_pilon	-	1080	2	Intergenic	novelGene_123553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGAGACACGATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275553	267723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265
886815	contig_10235_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_46381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGCAAGGCCCCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166626	169123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_166600_169100
886816	contig_8462_pilon	-	3146	1	Intergenic	novelGene_159419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCGTTTCCAAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231109	227963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_228000_231100
886817	contig_16775_pilon	+	4664	15	Intergenic	novelGene_107775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	241.095850614799	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	92	808	130489	160138	TRUE	20	GCTAACTATTTGTCTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKESLSYFTKHEMYRI	130397	177289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_160096_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
886819	contig_3825_pilon	+	1431	6	Intergenic	novelGene_77952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1676	junction_5	779.234650153598	34	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	527	628	14814	14915	TRUE	25	CATCCAGTGACTCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNS	12982	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_15302_15498
886820	contig_4891_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_124524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGTGATACACAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81111	79048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_79000_81100
886821	contig_960_pilon	+	4935	4	Intergenic	novelGene_108316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	796.32656617747	540	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1232	1543	1053919	1055549	TRUE	15	TGTCTCACTTGATCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAEVTEAIYHHLPPTSLRFSAVPVLKMMQGKTQHYWKQAGVTPSVEDPSPRAHSHGRQAASWTQLQLELKDILFFYLSTLFVYLKVIYILLLFRFWLDIQKG	1051195	1061237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1051951_1053442_1054030_1055348_1057926_1060221
886822	contig_16148_pilon	-	2863	1	Intergenic	novelGene_50387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTTGCTTGCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144654	141791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_141800_144700
886823	contig_16411_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_77366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	1916	2251	309059	309394	NA	15	CCCGGTCGTTGGATGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCDISMICILLRLALWPNILSVLENVPCALEKKVYLAAVRWSVLCMSMRSSWLIVAFKSSMSLLSFSLDVLSFTESGVLKFPTIIVELSISLFNTVAFVLCILE	307143	309394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_307100_309400
886824	contig_6233_pilon	+	1403	9	Intergenic	novelGene_74758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_1	171.741630072618	32	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	99	1100	113021	131406	FALSE	15	CAATTTGGTTTGTCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDEMIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	112922	131709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113036_117977_118156_119651_119756_123348_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
886825	contig_9708_pilon	+	1023	2	Intergenic	novelGene_67262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTACAGCTATAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49157	73996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_49308_73123
886826	contig_10857_pilon	-	1225	10	Intergenic	novelGene_160889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	897	1223	58214	21948	FALSE	10	CCTCCTGCTCCCCAGGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGPVLLVLLLLWAVSLRGLSAIHSELPLWPRFLGPVAKTLILVQFRGFRGFQVEQLVLLWFRGLVAEVLVLSLQLPVPLAPASLPGCLLLVLHAPLGGEPRGLVHQQ	66898	21945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21970_54429_54566_56404_56559_58199_58390_58780_58874_59615_59660_59828_59911_61364_61500_61881_61919_66568
886827	contig_2798_pilon	-	6853	4	Intergenic	novelGene_120009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	175	junction_1	714.155134095916	2287	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	588	1520	116665	115733	FALSE	45	AACCACCCATATCAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193588	110399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452_120595_170381_170519_193294
886828	contig_8773_pilon	-	4285	2	Intergenic	novelGene_74514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	368	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2952	3353	29392	28991	TRUE	35	AATTTTTTAAAATGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIAFDPAVPLLGIYPREIRFVTQIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	32343	27834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_27961_28184
886829	contig_7850_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_178479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	658	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCAGTAATGCCGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8726	6333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7850_pilon_-_6300_8700
886830	contig_6630_pilon	-	3202	11	Intergenic	novelGene_30701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	557.503937205828	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	642	1469	372695	357618	FALSE	40	ATAAAAAGATGTTGCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKKMHSGKIPPIRGLHVNLKTIHTSTGKNLLVSGWWGFVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGFNHILPYFYVTYFTMLLIHREARDEHHCRKKYGLAWEKYCQRVPYRIFPYIY	380058	355884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358774_358822_366367_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372712_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379916
886831	contig_1715_pilon	-	2010	11	Intergenic	novelGene_127181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_7	218.81489894429	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	268	1548	284622	248253	FALSE	30	ACATATTTGTTGGTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	312158	247790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
886832	contig_9112_pilon	+	2110	3	Intergenic	novelGene_60203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	216.5	290	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	276	1112	108641	113786	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRYVNEVCACKEA	108365	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625
886833	contig_11448_pilon	-	3284	3	Intergenic	novelGene_66422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2499	3080	557833	557252	FALSE	20	TCTCTATCCATAAGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGIPLRICASRSGRFQATQHRPARSGSQLKKRKENKQFKTNRLKPQDPTSVAAQTRKQFHTRSELRSLSGRSKDGAQSQVFERKKGEVVRGKEEIKRSRKKATPAVNKWHSESRPVRAGGIQAAGASRTRDCGCRKQRRLSGGEEGWGVGKHILQITFCSFSHRKLREAAFSYPPICWSLIGFQDGGSVLR	578878	557047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_558210_558271_558748_577232
886835	contig_16303_pilon	-	2754	8	Intergenic	novelGene_34074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	26	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	47	1159	47976	35759	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48022	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33877_34951_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
886836	contig_8354_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_24140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTACTGTTTTAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534806	536469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_534800_536500
886837	contig_3862_pilon	+	1873	7	Intergenic	novelGene_137439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_2	94.2079555498838	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1090	1773	645524	651138	FALSE	30	GTGAAATACTTTGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEKCYSLLVPDSDRSQMILVTPVALPSPDEVIRKRLLIDGDGAGDDRRINLLVKSFIKWCSSGSQEEGYSQYQRMLSTLSQCEFSMGKTLLVYDMNLREMENYEKIYKEIECSIAGAHEKIAECKKQILQAKRIRKNRQEYDALAKVIQHHPDRHETLKELEALGKELEHLSHIKESVEDKLELRRKQFHVLLSTIHELQQTLENDEKLSEVEEAQETSLETDPKP	644434	651238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_645730_646508_646637_646966_647054_648716_648775_649490_649558_649650_649721_651070
886838	contig_17989_pilon	+	2554	3	Intergenic	novelGene_150828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	23.5	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	69	419	261854	264284	FALSE	5	ACCTCCCTCCTCGGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFINKGEKGIMVLAGDTLPVEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTVRST	261785	266419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262087_262158_264163
886839	contig_8688_pilon	-	381	3	Intergenic	novelGene_175585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAAAAACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20280	5119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8688_pilon_-_5343_6185_6288_20224
886841	contig_15897_pilon	+	4046	12	Intergenic	novelGene_49540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	204.189508476564	123	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	1679	2935	626956	659062	TRUE	25	TGATATTAATTTGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGQVAASTAPSLFGQQTGNIVSTAASTPPVSSSGFGSPAFGNSATGVFGQATFGQAPAFGQPTSSPASGFSFSQSGFSSVPAFGQSISSTPTSTGGNVFGPSSSTSSSSSFSFGQSSANTGGGLFGQGNPPAFGQSPGFGQGGSVFGSTSATTTTASSTGFNFCQASGFGSSNTGSVFGQAASTGGTVFGQQSSSSSGSVFGSGNTGRGGGFFSGLGGKPSQDAANKNPFSSASGGFGSTATPNTSNLFGNSGAKTFGGFASSSFGEQKPAGTFSSGGGSVASQGFGFSTPNKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGVPAFGSAPAFTSPLGSTGGKVFGEGTAAASAGGFGFGSSSNTTSFGTLASQNAPTFGSLSQQTSGFGTQSGGFSGFGSGGGAFSFGTSNSSVQGFSGWRS	617823	660382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_618024_620914_621006_623330_623393_625630_627461_629321_629393_638882_639040_649837_649991_654118_654291_657390_657531_658444_658470_659028_660114_660322
886842	contig_10331_pilon	+	7724	12	Intergenic	novelGene_54066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	361.351526383707	335	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	1371	2684	71795	92767	TRUE	35	AAGCTCAGTAATATGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKGPGLSRAPKGRLPDTQGGRSLGQSGRQAMEYGTGESSGEGTVDAVPVWPRALSHGLCSDPLSYQYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGVRSMNSTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPINFIQSSQQYQVNFFYEILYNH	70424	110877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_72156_75274_75416_79165_79384_83233_83465_88910_89101_92594_96244_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643_110229_110365
886843	contig_5643_pilon	+	1175	12	Intergenic	novelGene_38812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2515.69416672533	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	68	1000	233973	238020	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKLAFPSTTTLSSSFPGMTMNLATATGWWTLWSTWPLRSKIPLDHQPQQQH	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237583_237774_237819_237913
886844	contig_2646_pilon	+	1650	9	Intergenic	novelGene_69525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	289.644933496169	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	611	1219	566553	573551	FALSE	30	AGCAAACGCTTATTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMWRRMESCSRQGSDLQKALTFSLLQSWRIQITFQISVVLSSPLLKHEVEDFLKLAPELGYCLWTIFFIVSCLKSEQCLVKLGDFYTFYDDYFWWS	554118	573982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566422_566586_567966_568156_569609_569711_572025_572072_572767_572842_573385
886845	contig_8476_pilon	-	4139	16	Intergenic	novelGene_121320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	309	junction_9	178.230637096993	2582	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1560	2294	160701	40454	FALSE	25	ATAAAATTTTTCCCTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSRNGSVVCTYTVNETYTKSVTPVSVQLNSMLCPAPTLNKAGETLDVSVSFNGGKSVFSSSLIVTATECSNGIAAIIAILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPRPPPPPPKEKEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVTIPEETEEPIRPRPPKPKPTYQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEGRCINFSRVPSQ	210334	38608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_40493_104782_104864_106930_107099_113163_113257_114099_114145_130076_130173_144931_145011_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187519_188560_188854_189298_189381_206168_206241_208667_208740_209471
886846	contig_20293_pilon	+	4338	1	Intergenic	novelGene_153495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAACTAAGGTAGCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13922	18260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_13900_18300
886847	contig_7728_pilon	-	5026	3	Intergenic	novelGene_64716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2746	3081	746506	745913	TRUE	50	AACCAGGCAAAGATACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTDKFTENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFGMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEENLRVMWDTIKSKNL	749251	743415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_744222_744773_746237_746494
886848	contig_6735_pilon	-	3116	8	Intergenic	novelGene_15756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_1	865.338555899673	47	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1576	2640	547376	542464	FALSE	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASSTTDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	548951	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243
886849	contig_299_pilon	+	6549	2	Intergenic	novelGene_129444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	194	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTCTCCCCCCAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	922185	944587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_923979_939831
886850	contig_9633_pilon	-	6690	5	Intergenic	novelGene_139598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	144	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1224	1550	495470	495144	TRUE	45	CCACTCCCACAACTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYVRRSLTILASNEHSGCTSSMTDSFVLLAVYRIFSILREHHNLKASILLRSSLFIVQLSHAYKAIGNTMAWVRHNLVLKVASLLFNTLMRFFAADLPNGMHRLIS	496693	201490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_204100_287287_287480_377625_378488_379059_380158_494764
886851	contig_2710_pilon	-	3726	1	Intergenic	novelGene_161785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATCTAGGTTGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966708	962982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_963000_966700
886852	contig_10868_pilon	-	4579	5	Intergenic	novelGene_173890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1989	2336	415359	238195	TRUE	50	AAACTGAAAGGGGAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVRFIPKYFILLRPGGAVVKHSAAKPKASGSNPPATPWEKDTAVCFHKDLQPWKPCGAVLLCPIGSLWFGIYSMATGFIPKYFVFLGAIENDIVFLISFSSFSLLVYRNPTDF	537731	234031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_234574_236493_238307_385165_385361_415318_416406_536789
886853	contig_15047_pilon	+	1487	7	Intergenic	novelGene_52198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	252.887601295297	355	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4409_4552_4676_20997_21062_21232
886854	contig_7272_pilon	-	3682	20	Intergenic	novelGene_25336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_14	673.155117067641	47	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	918	2723	605006	593320	FALSE	5	AGTGTCTGTGTCTCTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633282	592360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
886855	contig_8122_pilon	+	6044	11	Intergenic	novelGene_40249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_9	906.513987757497	79	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	4696	5262	732332	745125	TRUE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAVPGKKTSGLQQKNVEVKTKKNKQKTPGNGDGGSTSETPQPPRKKRARVDPTVENEETFMNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQYELEQCWPIHLWMRRALLYY	720777	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_725296_726997_727066_731393_731481_732309_732391_736987_737014_737504_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744750_745062_745148_748083
886856	contig_16098_pilon	+	698	4	Intergenic	novelGene_46066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	499.730816429094	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	299	325	438813	438839	FALSE	45	AACAATGAAGTGGAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKEQAFESSQKYKEGKYIIELNHMIKDNGWD	436839	439212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436943_437045_437090_437263_437352_438749
886857	contig_10058_pilon	+	5170	9	Intergenic	novelGene_67709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	131.449550683903	596	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	2204	3022	72602	99369	TRUE	20	TTGAGTTTGTTTAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	70398	101643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532
886858	contig_6871_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_21570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTGAGGAAGTTCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124936	126018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_124900_126000
886859	contig_9468_pilon	-	5601	8	Intergenic	novelGene_59483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4890	5219	431279	282321	TRUE	60	CCACAAAAAATAAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRRSWTELEKDVQKNSNTKKKTRFTGLKETGETPRVWPPDTLLAQWLSRSQGSPFSQGLDSPIKQNGTNEAQQSRDKE	884000	260463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_260536_282010_282590_431218_431626_522073_524909_677204_677290_681798_682107_819523_819529_882690
886860	contig_7457_pilon	+	4325	16	Intergenic	novelGene_31536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	292.866218984406	5	64	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	8	709	752668	758691	TRUE	20	CAATATTGAGTCTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAMSQKHLQINQTFEELRLITQDTESELKKLQQTQEYFIIQYQESLRIQAQFAQLAQLNPQERLSRETALQQKQVSLETWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLLRKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLCQQLPIPGPVEEMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGEAERAHEPPLR	752660	774518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_752810_757014_757146_757403_757556_757976_758133_758570_758723_759126_759215_759289_759413_760428_760522_762657_762865_764333_764429_764530_764662_765741_765913_770753_770806_771159_771268_771799_772852_773053
886861	contig_9272_pilon	-	4582	11	Intergenic	novelGene_125890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	773	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1479	1787	281027	280719	TRUE	25	CTCTGGGTGACAGGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNRLYRNSHDEMCRSGTVNTKEPRRWLIFQPTALCFGIFFPQNFHTTDRHLDQPSKLWWKCAVQKRPWRNKSPEAMKIRNRLSESSTWYIDMFCGGGCGPR	283039	237462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_237517_251107_251829_262340_262412_262749_262912_267893_268047_269662_270179_272084_272214_276538_276640_278944_278991_279876_282003_282536
886862	contig_2903_pilon	-	7651	7	Intergenic	novelGene_148985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2990	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2506	2877	243044	242673	TRUE	5	GCTTGCGCCTACGTTCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKPAKARTCVRPKFEKENSNISTKISDRKVVRLHSVKSGKLMRPGKNKAVPSSSGSQGFLCIRCPGCDFGNVRSFLTTGFTIRKCFLQHRFVAKFTHPENATPYLEYEMGSFEQPNTKIKHR	245549	220988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_221162_228691_228776_231687_231792_233693_233745_235103_235187_236333_236427_238486
886863	contig_4125_pilon	-	3203	11	Intergenic	novelGene_25117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	454.014713417968	33	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	972	1490	813277	811045	TRUE	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYQVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	817046	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809861_810234_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_816642
886864	contig_7066_pilon	+	1955	7	Intergenic	novelGene_42165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	357.373015520509	43	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	225	695	832785	841366	TRUE	35	AGACCCCAGACACTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	830180	1030356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_830397_832776_832882_833878_833961_835771_835852_837208_837292_841237_842438_1030167
886865	contig_5623_pilon	-	4346	16	Intergenic	novelGene_154798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.820864515344	419	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	586	1758	211595	207631	TRUE	35	AGTCAGTTAATCATCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	213879	204772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_205280_205549_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212198_212424_212590_212665_212717_213619_213751_213846
886866	contig_7593_pilon	-	2830	5	Intergenic	novelGene_127266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	896.443249737539	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	60	602	15337	4357	TRUE	25	GTAAATTTGAATTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR	15396	1879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_3735_3983_4528_8407_8541_12823_12970_15244
886867	contig_15327_pilon	-	859	3	Intergenic	novelGene_70670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3046	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902144	900436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_902035
886868	contig_13888_pilon	+	4772	6	Intergenic	novelGene_151792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	681.442998349825	18	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	101	547	337589	358627	TRUE	15	TTGGGTCTCCTGGAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQRKLPNLAI	337488	366029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_338808_358600_358687_361679_361707_361809_364159_364239
886869	contig_16775_pilon	+	2245	15	Intergenic	novelGene_107750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	224.532757484679	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	264	1643	130489	174136	FALSE	40	ATAGTACATTTGATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130225	174738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
886870	contig_14060_pilon	-	4609	2	Intergenic	novelGene_156043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	848	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGCTTCTAGTTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67079	33631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_38161_66999
886871	contig_14522_pilon	-	903	1	Intergenic	novelGene_147309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATAAAGCTTTGAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65879	64976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_65000_65900
886872	contig_401_pilon	+	1881	9	Intergenic	novelGene_42823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1166.23293127917	1301	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	593	1147	1713259	1715475	TRUE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711890	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
886873	contig_13800_pilon	-	7448	12	Intergenic	novelGene_153699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1362	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	6835	7149	127789	125077	TRUE	0	GGGCCTGGGGCCGGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYNLHLLQILLLFHYLYQNIYIDVGGLFPGHLEKQQLVRDHHWKTEFHPPDLMNPLYSLPYFPHYSHYCHHYQHLHHLRLLPPLPPPPHLLQVVEQYYHNHKG	168393	94184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_94284_114263_114435_125047_125209_125886_126022_127741_127805_131979_132053_139616_139768_140991_141075_142262_142360_154784_154913_159543_159683_162245
886874	contig_6929_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_139418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8749	junction_1	0	282	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130709	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948
886875	contig_5434_pilon	-	2328	1	Intergenic	novelGene_74697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424387	422059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_422100_424400
886876	contig_1275_pilon	-	2335	16	Intergenic	novelGene_108741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	493.896273410611	50	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	1257	2333	400520	375648	FALSE	25	CATTTCTAGAATGCCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETAKPSVGSISLGLPRQQESVKSATVPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTTGAIQEGSITRGTPTSKISVDSIPSLRGSITQGTPALSQAGIPTEALVKG	459395	375645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_375702_380116_380218_380553_380656_380752_380874_388392_388554_395563_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411512_440376_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285
886877	SIRV3	-	393	3	NNC	SIRV3B	novel	479	3	NA	NA	4	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_1191_1639_1765_1902
886878	contig_14333_pilon	+	3193	2	Intergenic	novelGene_49136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATAATAAAACCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422407	425666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_423673_423738
886879	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
886880	contig_16147_pilon	+	1729	2	Intergenic	novelGene_178494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATCTAGGTTGCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199593	203159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16147_pilon_+_199875_201711
886881	contig_10307_pilon	-	2073	3	Intergenic	novelGene_170277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATCTTTCTCCTGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392566	389154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_389389_389613_390381_391494
886882	contig_10323_pilon	+	3307	8	Intergenic	novelGene_123591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	854	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	2826	3305	463447	513322	FALSE	0	CGCGCGGGCTGCCCGCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFKHFFSLLQGLFHLRKLKLQDTVGVSFPFQLTLFFSSYCLLDSASCSSSSSNVSFRLSTWYMKLVFSLSSWALETIAFLYFSSTSASESLISLMDASVSMEMDVSPLPLREDVPPREARVAADKLGMLRDPFSVKSFSGLSSTSFCCRSNSFMRISRA	458018	513324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_460241_460531_461003_463314_463453_467386_467477_468602_468778_473476_473603_474207_474243_513274
886883	contig_16775_pilon	+	2201	15	Intergenic	novelGene_107744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	266.240186175367	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	586	1584	156947	174136	FALSE	20	ATACATTTGTTATTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	76512	174753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_76676_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145084_156930_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
886884	contig_6165_pilon	-	2191	5	Intergenic	novelGene_167410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1354.22106301002	241	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	76	459	507807	487338	FALSE	50	GCACTGAAAAGAGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQIESKEDFQAALNSAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFYHSLSEKYGNVVFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKNPHALLEQLNCSSLGCRADGTSIQGKRIRHFEDKALGATAWN	507882	485605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_487467_490281_490348_503349_503410_503875_503981_507783
886885	contig_4232_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_63369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAATAGAAGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
886886	contig_8386_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_82231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	887	1201	57535	57221	NA	45	AAACAATAACACCCGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTRTLLAQIKKTENNTCWRGCGEIGTPMHCWWECKMVQPFWKMIWRFLKKPETEISHDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFTVALFTVAKR	58421	56336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_56300_58400
886887	contig_10793_pilon	+	1099	11	Intergenic	novelGene_83437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3289.80267037401	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	319	696	160548	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	159150	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
886888	contig_9668_pilon	+	4611	10	Intergenic	novelGene_58177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	824	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2815	3180	586819	587184	FALSE	25	AACCTTTGGTTAGTAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIQPAPNPLCLLISPPDRSCPFSLMYLLELNSTLFTSIICFIVQSNLYLKSWLQEWFQFWANRECRGHVFRSLSSVSLVFLLEFEFCTPLFSCSVRVCLVFPVRAGIGGSQASPECLERR	503287	588615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_504125_511992_512102_522292_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551887_553924_554017_573564_573687_580634_580715_585702
886889	contig_10958_pilon	+	2162	5	Intergenic	novelGene_5433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	32	433	888255	894000	TRUE	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888223	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894042_895395_895855_900457
886890	contig_5302_pilon	-	4541	7	Intergenic	novelGene_81404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	774.634967796661	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	330	968	209238	177300	FALSE	45	TAGAAAAGCTACTTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209567	173726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_185037_185126_185963_186076_209142
886891	contig_13300_pilon	-	3603	3	Intergenic	novelGene_125755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_2	329.5	1693	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	67	366	49737	47432	FALSE	70	AAAAAAAGAATAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLDIGGKKEYLIAGKAEGNGKMHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	56066	44194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_47630_49635_49761_56023
886892	contig_11088_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_85044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
886893	contig_8354_pilon	-	3424	10	Intergenic	novelGene_24142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	618.144355668192	334	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	185	1210	578686	537192	TRUE	10	CAGCCTTGTCCGTGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA	618798	534806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_536026_536196_537381_538002_538147_539084_539151_543399_543460_550970_551140_555802_555922_558330_558496_578572_578731_618658
886894	contig_9297_pilon	+	2303	9	Intergenic	novelGene_69874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	382.303033436827	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	153	1952	909195	912790	FALSE	25	CTAATTTTTGTGATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909526_910093_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
886895	contig_2036_pilon	-	4134	6	Intergenic	novelGene_131826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	316.494170562429	860	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	297	1370	661441	616864	FALSE	5	TGACCTGGCTTTTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINTYVFVGNQLIPQPLDSEEDEKMEEDNKQEEEKDHREAMKPEEPPQNLLREKIMKLPLPESLKAYLTYFREK	679259	614099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631747_631872_636558_636731_647832_647936_661134_661550_679071
886896	contig_5988_pilon	+	2469	10	Intergenic	novelGene_16070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_9	2015.56477395907	18	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	132	734	1218923	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKRTLGELEAHPVWKEPCWLVRDGTPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209835	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1226085_1226509
886897	contig_1210_pilon	-	3877	1	Intergenic	novelGene_171518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	8	445	270598	270161	NA	85	TAAAAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDMILYKENPKESTRKLLELIEDFSKVSGCRINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFIIAPKKIKYLGINLTRDVNIFTEKTRRHYCKKLRDLHKWKNIPCSWKGRLNIVKMSILPKAMYRYNAIPIEIPWVFFNEMEKQITNFIW	270605	266728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_266700_270600
886898	contig_11309_pilon	+	431	3	Intergenic	novelGene_149877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAAAGTTTTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56230	60349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_+_56391_56926_57018_60169
886899	contig_14682_pilon	+	1314	12	Intergenic	novelGene_139125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	339	junction_10	252.576704657293	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	283	1224	142535	174580	FALSE	45	ATATAATTTCTCTAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNMINTVKGKALEVAEYLTPVLKESKFKETGVITPEEFVAAGDHLVHHCPTWQWASGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGIAGITEAVKEITLESKDSMKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYLLIFLKFVQAVIPTIEYDYTRHFTM	142252	174670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_151306_151357_157167_157239_158635_158744_162323_162374_165799_165879_169207_169243_169509_169666_170436_170565_172795_172865_174498
886900	contig_3612_pilon	-	3524	3	Intergenic	novelGene_87800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	307	junction_2	28.5	51	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1973	2488	815793	815098	FALSE	30	AATCCTCAAAGGATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSATVSGQAELIFPFVFSGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN	817765	814061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_815256_815341_815439_815532
886901	contig_12080_pilon	-	6740	27	Intergenic	novelGene_128337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.154520581784	3	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	57	2621	164251	62705	TRUE	65	AACATAAAATGAAACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPGGGLGPGRGTRDKKKGRSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLSKELEDAKKEMASLSAAAVAIVPPVPSSTNAPPAPPLPADSGTVIPSLPTHLPEEVSKPPPPPSLPEGYTIPPPPPPPPLPGSVCIPPPPPLPESASIPLPPSLPGSTAIPPPPPLPGDTGIPPPPPLPGVAGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGSTCILPPPPLPGDTGIPPPPPLPGGPGMPPLPPPLPGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLAPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164307	43907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45841_46131_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_108591_109504_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
886902	contig_9839_pilon	+	2915	6	Intergenic	novelGene_88483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_3	853.55927737914	617	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	186	485	49467	52219	TRUE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCVSRVP	45255	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_54122_57651_57850_59824_59927_61264
886903	contig_2161_pilon	+	4493	4	Intergenic	novelGene_114937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	100.180947401301	483	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	265	1353	941059	953538	FALSE	10	CTGTCTCACTGCTCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALLGSRSRGPAANTRVGPAVAQDASHGLESQARPARPLALLPRGVRSRPRRPGADRPLPAPGAPRTAAPPGSRCNQFLPRDSLSEPTMCGGLMEKYVAAMVLSAAGDALGYFNGKWEFLQDGEKIHQQLAQLGGLDAIDVGRWRVSDDTVMHLATADALIEAEKTRDLARLYSLFAKHYQNCMEDMDGRAPGATSAQNAMQLEPHKANGWRIPFNKYEGGCGAAMRAMCIGLRFPHCSQRDTLIQVSIESGRMTHHHPTGYLGALVSALFTAYAVNGKPPQQWGNGLMEVLPEAKKYIVQSGYFVEENLQHWFYFQDQWEKYLKLRGIWDGKSAPIFPKPFDVKERDQFYVSVSYSGWGGSSGHDAPMIAYDAILAAGDSWKELAHRAFFHGGDSDSTAAIAGCWWGVMYGFKGVSPSNYEKLEYRKRLEETARALYSLGSKEDTVTAL	937887	956678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_938119_941025_941372_951472_951834_953123
886904	contig_10331_pilon	-	4913	1	Intergenic	novelGene_54063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	927	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAAAATACTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64255	59342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_59300_64300
886905	contig_2684_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_172699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	443	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGCCGCTCGCCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162777	143256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_-_143345_162337
886906	contig_19311_pilon	+	1548	2	Intergenic	novelGene_144085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATACAAAAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147702	149431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_+_149138_149318
886907	contig_5988_pilon	-	1774	4	Intergenic	novelGene_15942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	918.817113950806	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	206	1600	783384	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQAVELPAGIANLDTSLANVDGDAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	783589	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653743_783312
886908	contig_5095_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_74949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTAAGCTTAAGACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209136	207265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_207300_209100
886909	contig_3601_pilon	-	2462	2	Intergenic	novelGene_132941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	35	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	308	1690	427702	426320	FALSE	45	TAGAGAATAACAGTCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLRTMQTVKKEQAPIDTSSNVDKMIVLSSALTEVSEDLTTGEDLLLNEGSVGKNKSSACRRKREFIPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTAYAQEIQKLSNSTAVYFQDYPTSKSNVSSFVDEHERSMVASSCISVIKHSPQSLSDGSEVSSVEHTQESPVQSSCRSPENKFQIIKQEPMELESYTRETRDDREVTTPIYQNYIGNSFPGYSHSPPLLQVNRSSSNSPRTSETDDGVVGKSSDGEDEQQVPKGPIHSPVELKHGHATVVKVPEVNSSALPHKLRIKGKAMQIKVEALDGEFDAAQKLSSAIDMTSKRHFELEKHNTPNMVHSALTPFSVQVTNIQDWSLKSEHWHQKELIGKTQNSFKSGVVEIKDSVYRVSDPENLYLKQGIANLSAEVASLKRLITTQQISASDSG	453754	425547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_427880_453624
886910	contig_6076_pilon	-	7368	3	Intergenic	novelGene_81772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	4697	6727	449785	447454	FALSE	40	AGTGACAAGGGCCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHPIKKIIHHYQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAGKAFDKVQHPFLIKTLSKIGIERKFLNIIKSIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNMVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFRRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENNEKEIRKIIPFSIAPNKIKYLGINLTRDAKDLYKGNYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNFVKITILPKVIYKYNAILIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENSDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIRPTLQALIHGINKIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKRAKEMNRHFTKEDIQMANRPMRKCSGSLAIREMQIKTTVRYHLTSALLARIKNTGDTKCWRGCGEIGTLTHCWWECKMIKPFWKMTWSFLRKLEIDIPLDPAIPLLGIYPREIRVVTLIDICTPMFMAALFTTDKWYLG	454754	446812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_447474_447774_453899_454171
886911	contig_12313_pilon	-	3175	7	Intergenic	novelGene_171844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_6	10.4469559628099	675	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	180	806	82759	73274	FALSE	30	CATCCTCAGCTCAGCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	82938	70904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660
886912	contig_3584_pilon	+	3129	5	Intergenic	novelGene_108141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	143.666932521022	563	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAGGGTAATAAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338631	352794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717
886913	contig_7919_pilon	+	2383	2	Intergenic	novelGene_28060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	257	junction_1	0	569	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGCCCAGCGTAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035718	1069913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1036493_1068304
886914	contig_19007_pilon	+	2736	12	Intergenic	novelGene_168444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	584	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGATCCAAAGCGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34485	63896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_35115_43602_43691_45744_45841_46284_46427_50309_50411_52314_52483_52561_52678_53818_53917_55772_55954_59097_59345_62747_63558_63836
886915	contig_13612_pilon	+	2270	6	Intergenic	novelGene_157273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	169.415937857098	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	129	320	32566	33493	TRUE	15	CACCCGTACGCTTGCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCCGGQYLRETHLQPGHERGQAEVHLFQLDITVKQGQDKVREMFMKNAHVTDPRVVDLLVIKGKMELEETIRVWKQRTHVMRFFHETEAPRPKDFLSKFYVGHDP	26025	38659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_26098_32509_32626_33361_34562_34688_35128_36277_36418_38356
886916	contig_6497_pilon	+	3334	10	Intergenic	novelGene_35560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	318.356117082664	32	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	91	603	156503	167022	TRUE	20	TTAAAAGTTTGTTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNCGGPALAVCEAWSPLASDRAVLKPSSTMGKRDNRVAYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRYSSSSSSSSDSSSSSSDSEDEDKKQGKRRKKKKNRSHKSSESSMSETESDSKVKLFKFATFLDSKDI	156412	181116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_161444_163401_163481_165792_165868_166001_166035_166485_166549_166881_168340_174094_174188_176990_177039_179843
886917	contig_9133_pilon	+	3674	5	Intergenic	novelGene_109307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	738	1217	420287	504955	TRUE	50	GGTAATTAAAAAACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFCKTDDLFIANTFFNNINGNYTCGPHQMEYTGIKLTISVERVNREAQYHLRKRPGADCRTDHKLLLCKVKLKLKKIKTNPPEPKYDLEYMPPEFRDHLKNRSDALNTNDQRADALWDDIKDIIHEESKRSLKRQEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	393225	637078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_393956_420279_420701_504889_506058_628634_628644_635732
886918	contig_19727_pilon	+	3002	2	Intergenic	novelGene_168998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	918	1577	15222	15881	TRUE	10	TTTCCAGTCCCTGTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDRESKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINLQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISETEDKHLDTTLFEKKSRKRTKKNEETLRTTWDTIKSKNLQVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPEEITKVYHNHTR	14304	18884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_16333_17910
886919	contig_6445_pilon	-	4996	15	Intergenic	novelGene_77019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1302	1727	672261	671836	TRUE	0	CGCGGCGGGCGCGGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMHYRGCKNKQTKKPIQHPYRVESGQLNLVMFRSCWRYLAVWLTKSPACSCWDLINHASVGMQSQRGVPDPPHLSASWLRFRLPNQSYCLTDEYATVGLPTVGNGSPLLLQQPRGFHNSPAGTVLSARSAFPASILGKKE	673562	522267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515_644717_656008_656116_661689_661823_663380_663502_663783_663925_665663_665823_670245
886920	contig_16098_pilon	-	2137	1	Intergenic	novelGene_46245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1500	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTTAGAAAAATATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828458	826321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_826300_828500
886921	contig_7388_pilon	-	4046	4	Intergenic	novelGene_178495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	285	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2665	3024	1382	1023	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIVWISTCCFCSSCEFILTFCSCIIFLNSSNFLSIFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSIRDLTSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWTATGTILSCFCKAFDIVCCFRGIQ	50372	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7388_pilon_-_2691_5976_6926_22084_22410_50290
886922	contig_2636_pilon	-	1103	6	Intergenic	novelGene_52088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	283.805144421309	113	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	545	844	62513	59826	FALSE	40	GTATAAGCCATGGTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVFWHSGEPSNHNERCVIINLVNGNWGWNDIPCAGRQNWICEMMKIFL	85677	59566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_61761_62471_62624_80580_80787_81113_81216_85551
886923	contig_5574_pilon	-	2893	13	Intergenic	novelGene_155825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_12	563.953473997043	1274	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	125	1600	141980	59952	FALSE	20	TTTTTACCTGTGTTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCIKSKRKDNLNDDGVDLKTQPVSESQLLPGQRFQAKDPEEQGDIVVALYPYDGIHPDDLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLSTKREGFIPSNYVAKVNTLETEEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARIIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSDVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMTALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFYTATEGQYQQQP	215733	58658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_60155_78596_78729_81239_81394_120911_120989_123198_123382_131363_131517_132909_133060_133571_133676_134201_134301_136858_136965_137531_137578_141911_141986_215614
886924	contig_17440_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_7580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	544	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTACCTTCAAGTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2160	1730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1700_2200
886925	contig_14220_pilon	+	2273	3	Intergenic	novelGene_159880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	253	582	387746	388075	TRUE	60	AATAGAAATCATATAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHLRYSTGLTPSGARENENRIQGKDQSKGLMDHSYHSLHQTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGSWTELEKDVEQNSNTQKETSFTGLTGTGETPRVWPPDTLLAQC	387493	435971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_388953_389464_389959_435651
886927	contig_16303_pilon	-	4657	8	Intergenic	novelGene_34028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	1048	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	31	1143	47976	35759	TRUE	40	ACCATTAACATACCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48006	30360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33350_35233_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
886929	contig_7843_pilon	-	980	5	Intergenic	novelGene_152015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	284.383543827698	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	148	702	197252	178533	FALSE	30	CCAAGGTGTACTAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAASSEHFEKLHEIFRGLHEYLQGAPERLLGTAGTEEKKKLIRDFDEKQQEANETLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRSGDQ	197399	178254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_182917_183092_187939_188132_190893_190953_197137
886930	contig_15666_pilon	-	1654	7	Intergenic	novelGene_70171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	707.905046991159	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	128	532	110619	108848	TRUE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQGE	110746	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108701_108766_108850_109092_109138_109948_110246_110558
886931	contig_91_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_127153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1033	1332	1361892	1362191	NA	85	AGAAAAAGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVILFKTVDELALFKNPCAVRDEEKLRNCSRFKETLKGVSDPGLHPGLEERNLLYRTLGACYTALAAWRLSLQLLTKRLAVPTHPSAPQERDLAIYFL	1360859	1363108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1360900_1363100
886932	contig_18420_pilon	-	3216	10	Intergenic	novelGene_109349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	627	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGTGGGGGTCGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105865	96397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_96474_96696_96837_97410_97552_99557_99678_100624_100743_101206_101310_101703_101754_102628_102773_103140_103295_103695
886933	contig_20614_pilon	-	3397	6	Intergenic	novelGene_107524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.737904352906	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	716	1177	68041	66070	TRUE	15	CTCCTCAGCCTGGGGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVGVAHSEVNPNTRVMNSRGIWLAYIILVGLLHVVLLSIPFFSIPVVWTLTNVIHNLAMYVFLHTVKGTPFETPDQGKARLLTHWEQMDYGLQFTSSRKFLSISPIVLYLLASFYTKYDAAHFLVNTASLLSVLLPKLPQFHGVRLFGINKY	68756	62394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_62791_63622_63784_63878_63983_64510_66206_67449_67602_67867
886934	contig_5059_pilon	+	3723	8	Intergenic	novelGene_140748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_3	255.00412161535	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	843	2804	414332	486655	FALSE	25	ATTTCTGTGGCAGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERKKPANMEEKESLLNNKEKDCSERRPVSSREKPKDDIKLTAKKEVIKVPEDKKKKLEEDKRKKEDKERKKKEEEKVKAEEELKKREEEEKQKYEEEERKKQEEQAKRQQEEEAAQLKEKEESLQLHQEAWERHQLRKELRGKNQNAPDNRPEENFFSRLDSSLKKNTAFVKKLKTITEQQRDSLSHDFNGLNLSKYIAEAVASIVEAKLKISDVNCAVHLCSLFHQRYADFAPSLLQVWKKHFEARKEEKTPNITKLRTDLRFIAELTVVGIFTDKEGLSLIYEQLKNIINADRESHTHVSVVISFCRHCGDDIAGLVPRKVKGAAEKFNLSFPPNEIISPEKQQPFQNLLKEYFTSLTKHLKRDHRELQNTERQNRRILHSKGELSEDRHKQYEEFAMSYQKLLANSQSLADLLDENMPDLPQDKPTPEEHGPGIDIFTPGKPGEYDLEGGIWEDEDARNFYENLIDLKAFVPAILFKDNEKGCQNKDASKDDSKEAKECKDNKELPSPDELELELENLEINDDTLELEGGDEAEDLTKKLLDEQEQEDEEASTGSHLKLIVDAFLQQLPNCVNRDLIDKAAMDFCMNMNTKANRKKLVRALFIVPRQRLDLLPFYARLVATLHPCMSDVAEDLCSMLRGDFRFHVCI	413489	487574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_414694_420161_420942_431285_431447_443420_443619_459480_459631_465491_465596_472837_472924_486534
886935	contig_14220_pilon	-	2342	13	Intergenic	novelGene_159851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_6	397.127209887881	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	175	1182	422880	323912	TRUE	30	ACCCCAGCAGCATCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGTGGGAGAGDDDFDQFDKPGAERSWRRRAANEDWDSELEDDLLGEDLLSGKKNQSDLSDEELNDDLLQSDNEDEENFSSQGITISLNTTSGMVPSFELSDNTNDQSGEQESEYEQGEDEIVYHKSDGSELYSQEYTEEGQYEGHDAELTEDQIEYVEEPEEEQLYNDEVLDIEINEPLDEFTGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVVALVPPDNMSKVHETKFRHPCF	423054	291984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_292227_293528_293873_294242_294376_313693_313753_319547_319834_323815_323978_325916_326126_331917_332090_359287_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393916_422837
886936	contig_709_pilon	-	5702	17	Intergenic	novelGene_57522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	105.120002110683	380	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	2449	3279	1495058	1481990	TRUE	50	CAGAAACAATCACAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGGTNSWRRTSCLEVNVEFEAYSISDTDYDGINKLLQQLFLKAPVNTAELTDLLIQQSHIGSVIKQTDVSEGSDDDVDVDEDEIFGFISLLNLTERKGTQCAEQIKEWILSCCDQSGEESLVEQLDKLLRDTARPVGFLLSERFINVPPQIALPMHQQLQKELAEAHKTNKPCGKCYFYLLISKTFVEAGRHSSRKKRSNQKTDGLMFANAEEEFFYEKAVLKFSYSVQDESDTCLGGRWSFDDVPMKPLRTVMLIPADKMSEIMDKLKEHLSL	1497506	1444900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1444928_1453884_1454076_1456986_1457366_1463803_1464048_1465348_1465448_1465536_1465697_1476151_1476343_1477154_1477308_1479128_1479315_1480215_1480398_1481378_1482161_1483364_1483540_1484964_1485153_1487576_1487673_1489760_1489842_1490541_1490617_1495013
886937	contig_9668_pilon	-	3207	6	Intergenic	novelGene_58095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAATTCTTGAGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223865	169200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_169477_169888_170207_171329_171758_172285_172365_172534_172615_221839
886938	contig_177_pilon	+	2472	3	Intergenic	novelGene_41841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	4202	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	43	579	417672	418258	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFQPSLL	415688	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418183_418232
886939	scaffold_4438_pilon	-	3788	1	Intergenic	novelGene_174555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1245	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2796	3140	425734	425390	NA	20	GTAAATTTGTTTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSWLIVAFRYSVSLLSFFLDVLSFTESAVLKSPTIIVELSISLSSAVKVCFMYFGAPSLGGQIFIMVMSSCWIIPLVMIGVHSLSFMVDFVLKSILSEIGIATSALFWWLFA	428529	424741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_424700_428500
886940	contig_6192_pilon	-	5417	1	Intergenic	novelGene_170327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1270	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	3463	3867	129917	129513	NA	60	AGGAAAAAGAAAAGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVPSADHLQILMIKHIPLFYAFPRSLQAYNSAVGRKRDRNESQDIKSPNTSVTQSGCCGHRVIKFAFIYCRLPTLSPPVNSAKSVFPPPQNKNNPAVCRHPPTPILGPRPRELSSSLAEMKREHESAREGAL	133379	127962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_128000_133400
886941	contig_5499_pilon	+	2796	13	Intergenic	novelGene_56995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	270.394606187985	113	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	420	1457	816585	840037	TRUE	35	TTATTAACTATGAGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803346	841479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_807829_807916_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
886942	contig_6316_pilon	+	8502	11	Intergenic	novelGene_134719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	120.568694112527	1146	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	428	1333	147168	157164	FALSE	55	AACAAAAACCCAAACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	144031	164333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
886943	contig_10009_pilon	+	7120	6	Intergenic	novelGene_82732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	957	junction_4	116.645445689062	3018	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	362	664	54161	54463	TRUE	40	TCAGGAAGACACTTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPIIVNSGGRNHSCPPVTTLLYRILKESQTQGAELPSFILGFQYIVSVENRKEISPFPAFCFQSRLPEQESVLSFFFFFFLYIAIVQCQLPGYNRKNWC	53799	76499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_55301_60319_60410_63219_63357_68605_68816_70219_70384_71481
886944	contig_20527_pilon	+	4701	7	Intergenic	novelGene_138594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	1350.63857325176	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	300	776	24977	27453	FALSE	65	TAATAAAATGGAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13519	31378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_13994_14051_18652_18739_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
886945	contig_10323_pilon	+	3099	1	Intergenic	novelGene_123593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	1940	2554	459964	460578	NA	35	CCACACGTAACAGAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFLQGLAIFSSCFSSSWSLSSSVMCPRSPPVGCSFLHGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRPLGPLAPQHELPLPHPHSLWGCHTARQCLYHLPFQRLVCAKEQIPDTVGC	458024	461123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_458000_461100
886946	contig_7057_pilon	-	1183	8	Intergenic	novelGene_123227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	39.0190952729349	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	657	1025	538082	537131	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	540382	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539484_539951
886947	contig_7342_pilon	-	2530	2	Intergenic	novelGene_71171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1522	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	945	1313	470835	470467	FALSE	10	CCATCCACTTGTGGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASACRYTLRLAVSWQSAVPGRSLEQRDRCTGTLEGPRPQQDDQGRVTGGKLAGLVGRLSEGFHGRGLAWSHTQVREEAQSQKQLEQQPKETVAPGILYLGPADGIHGSEKLGGGESREVS	491298	469249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_471541_491059
886948	contig_11498_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_65538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTCTTTTTCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298790	300563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_298800_300600
886949	contig_14353_pilon	-	2982	12	Intergenic	novelGene_82070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	483.767941773329	322	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	797	1243	83281	80452	TRUE	20	CATCGTAAGGTTTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104522	32361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_33621_79971_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
886950	contig_4388_pilon	-	4988	1	Intergenic	novelGene_162000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	578	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1407	1727	1849005	1848685	NA	15	AGTTTTCTTTGTTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVMTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPHHLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLTVVLICISLMASDRKHFLMCLLAI	1850411	1845423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1845400_1850400
886951	contig_9696_pilon	-	3480	9	Intergenic	novelGene_68785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_8	449.96553687477	577	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	514	1032	240739	214683	FALSE	35	AACCCAGATGATATGCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKEEFTKMKQELEAEYLAIFKKTVAMHEVFLCRVAAHPILRKDLNFHVFLEYNQDLSVRGKNKKEKLEDFFKNMVKSADGVIVSGVKDVDDFFEHERTFLLEYHNRVKDASAKSDRMTRSHKSAADDYNRIGSSLYALGTQDSTDVCKFFLKVSELFDKTRVSTVNEPLGI	255818	212234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_214756_216376_216453_224243_224350_226518_226615_238468_238593_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599
886952	contig_16411_pilon	-	6566	22	Intergenic	novelGene_77362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	47	junction_11	497.324323749801	1777	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	21	1967	408447	320853	TRUE	20	TTGAAATGGTATCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTAESLMREKHPLKAELSVMAEGRELILDLEKNEDLFAPTYTETHYTPSGSPRTTTLKSEDHCFYHGTVRKAEESSVTLSTCQGIRGLIMVNRNLSYIIEPLRDSEDQHLIYRSEHLKLPPGNCGFQHSMPTSRDWALQFTNQTKKRPRRMKREDLHSMKYVELYLVADYAEFQKNRRDQEATKHKLMEIANYVDKFYRSLNIRIALVGLEVWTHGNMCEVSENPYSTLWSFLSWRRKLLSQKNHDNAQLITGMSFHGTTIGLAPLMAMCSVYQSGGVNMDHSENAIGVAATMAHEMGHNFGMSHDSADCCSASAADGGCIMAAATGHPFPRVFNGCNRKELDRYLQSGGGMCLSNMPDTRTLYGGRRCGNGYLEDGEECDCGEEEECNNPCCNASNCTLREGAECAHGSCCHRCKLLAPGTVCREQARQCDLPEFCTGKSPHCPTNFYQMDGTPCEGGQAYCYNGMCLTYQEQCQQLWGPGARPAPDLCFEKVNVAGDTFGNCGKDINGEHKKCNMRDAKCGKIQCQSSEARPLESNAVSIDTTIIMNGRQIRCRGTHVYRGPEEEGDMLDPGLVMTGTKCGNNHICFEGQCRNTSFFETEGCGKKCNGHGVCNNNQNCHCFQGWAPPFCTTSGPGGQHRQRAHAPPRVLVQW	408467	298643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_302653_303441_303595_318787_319013_319328_319414_320725_320871_322118_322230_322354_322433_323334_323540_326024_326134_327783_327980_333814_333905_336332_336511_338777_338918_340150_340236_342215_342383_346950_347023_351774_351841_352514_352708_362338_362416_372659_372739_403841_403913_408435
886953	contig_6102_pilon	+	2409	16	Intergenic	novelGene_31830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.293360025771	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	209	1000	379418	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370706	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_370898_379400_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
886954	contig_4857_pilon	+	2850	1	Intergenic	novelGene_48801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGACCCCACTGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243990	1246840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1244000_1246800
886955	contig_4402_pilon	+	6897	4	Intergenic	novelGene_140859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCACTCCGGGGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611046	625857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_617169_619559_619662_624647_625232_625768
886956	contig_7230_pilon	+	3136	1	Intergenic	novelGene_52536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5696	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAGGTATTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104312	107448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_104300_107400
886957	contig_9910_pilon	+	7408	4	Intergenic	novelGene_178497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	170	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	4364	5413	393341	394390	FALSE	70	ACAAAAAAAGAAAATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	192263	396385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9910_pilon_+_194017_319169_319857_367722_367771_391465
886958	contig_5686_pilon	-	3197	1	Intergenic	novelGene_45393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	507	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACATTGTCCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172715	169518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_169500_172700
886959	contig_10074_pilon	+	3959	10	Intergenic	novelGene_57173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGGAAAGTTGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556778	595379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_559726_560820_560890_561018_561091_561861_562073_562179_562283_563748_563892_577107_577200_583722_583871_586182_586328_595350
886960	contig_4857_pilon	-	13366	14	Intergenic	novelGene_48712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2423.82372618582	57	166	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	10991	11926	1226315	1178809	FALSE	20	TCCCAAGCTTTATCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1245280	1177368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1234361_1238553_1238943_1241784_1242271_1243122
886961	contig_11512_pilon	-	2753	13	Intergenic	novelGene_43334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	655.793264341405	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	555	1055	573331	556654	FALSE	0	GCCTGTGTCTTTTTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622340	554955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573383_582741_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
886962	contig_9235_pilon	+	3102	2	Intergenic	novelGene_156194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	633	1781	45805	46953	FALSE	30	ACATAGCTTTATCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43463	48274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_43935_45643
886963	contig_20407_pilon	+	2307	2	Intergenic	novelGene_178501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22615	25035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20407_pilon_+_24593_24705
886964	contig_19132_pilon	-	1720	2	Intergenic	novelGene_169990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	497	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	234	1664	329756	327353	FALSE	35	AATGTCTGCGTGGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFPPPFAPHPQKSYGKPSFQSEIHPSYPLEHVLEHSGKKSADYAHAKDQTYPCYSGTSGLHSKSLLPKFPSDQSTKSMDTPSEQLFQEDFASANAGPLQSLPGAVVPVRIQTHVPSYGSVMYTSISQILGQNSPAIVICKVDENMTQRTLVTNAAMQGIGFNIAQVLGQHAGLEKYPIWKVPQTLPLGLESSIPLCLPSTSDSVATLGGSKRMLSPASSLELFMETKQQKRVKEEKMYGQIVEELSAVELTNSDIKKDLSRPQKPQLVRQGCASEPKDGSQSGSSSFSSLSPSSSQDHPSAGTPSREPFPPSREMLSSSRAPPPGQRPSGPSESKESSDELDIDETASDMSMSPQSSSLPPGDSQPEGQGKGQKLPVGMLVQMASGPSGKVANSTLLFTDVADFQQILQFPSLRTTTTVSWCFLNYTKPNYVQQATFKSSVYASWCVSSCNPNPSGLNTKTTLALLRSKQKMTAEIYTLAAMHRPGTGKLTSSSAWKQFAQMKPDASFLFGSKLERKLVGNILKERGKGDIHGEKDIGSKQTEPIRIKIFEGG	329989	327296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_327512_328484
886965	contig_6375_pilon	+	2031	5	Intergenic	novelGene_73080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	67.1081217141413	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	128	445	749083	754277	TRUE	65	GTACAATAAAGAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLYNFQVSWTFLLLSASSSCQVSVSLPGCWWWCGGLCLVGPMEMLGARDRLDWPPEEGTAAGLQAFAVDKNFLSSLRGILLETELDFLRCVSAIVIFLVISIAAVTSRDGAAIAAFVFGIILVSVFAYDIFKIYQTEMAPRATEAC	748955	758615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_749215_750937_751031_751230_751316_754269_754351_757102
886966	SIRV6	+	1026	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	500	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	745	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
886967	contig_6133_pilon	-	5805	2	Intergenic	novelGene_178503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7334	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	5352	5681	133350	133021	FALSE	45	GGAAGTCTAAATTAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPAQALGIQATGALQPRDLGHGKKGSPSRGEEGWGVGKHTPQITGCFVSLWMLREAALSYPRLLFSNRSPRWWIRTALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFS	202994	132896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6133_pilon_-_136761_201053
886968	contig_5423_pilon	-	3198	12	Intergenic	novelGene_85271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_11	197.602573008309	1095	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	188	1900	590431	558772	FALSE	45	TGGAAAAAAATTATAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLRLLVLAVLALEQGVAGPTETVGNSSEGLLEFSLGKFRYFKLNKPFPEEAVLRDISSNATFLIFQIHSQYQNTTVSFSKTLLPSTSGTGTDKGLVFILRPEQSMCTWYLEAADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	590618	557473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172_574294_576973_577125_579789_579945_590340
886969	contig_5686_pilon	+	7456	3	Intergenic	novelGene_45336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	1672	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	6806	7108	124981	125501	FALSE	15	CTTAAAGCCCTGGGGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYILETKTVVLLDVGGCKRPILDSALHTWGQHESESTQQQPTTVSNQESLGEFLCNSFPLRKKESIMTSRFLAPATGLDIKKPVATESIPTYGNPMCAE	116131	125849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120404_122447_125262_125479
886970	contig_8138_pilon	+	3710	2	Intergenic	novelGene_52506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	427	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACAGAACAAATCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464013	500920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_467558_500754
886971	contig_7201_pilon	-	5275	2	Intergenic	novelGene_152519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	4103	4426	315460	315137	FALSE	40	TTTTAAAAGTTGAAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAALFTIAKRWKQPRCPPTNEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDESEKHLITWMNLEGIMLRELSQSQKDKYCMRPLLLKLMKTFTHKKKQSLMVMRKGRGGGGNMK	333497	314287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_315961_329895
886972	contig_11678_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_160845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	83.8908425836083	227	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	64	558	235648	251218	TRUE	30	TACCTACGAGACCCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPRRLVQASAPLAPVWLNQRMMGVLGVRRGLEWLLGVYFLSHIPVTLLIDLQALLPRELYPIELRNLQQWYAKEFKDPLLQDPPTWFKSFLLCELVFQLPFFPFATYAFFKGGCKWIRTPAIIYSVHTMTTLFPVLSTLLFENFSKASGFKGEGPKTFHERLTLVSVFVDLQKRIQVYRLPSSD	235584	257681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_235777_248121_248267_249699_249866_251163_251551_252066_252177_252763_252851_253963_254093_257464
886973	contig_12050_pilon	-	5304	2	Intergenic	novelGene_62706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	149	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1531	1863	676623	676291	TRUE	15	GAGTGTTGTTTGCTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKTNNSKQTKAPGSHQRGSPDRKQFHTQTELRSPLGRSKNGARSQVFERKEGEVVRDKEEIKRSGKKQHQQPTNGTQGVGQCRRVESKQPVLPCQETVAAGSRRGRVG	678153	626990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_628167_674025
886974	contig_6503_pilon	+	621	2	Intergenic	novelGene_145775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAATAGAAAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222124	227522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_222658_227434
886975	contig_7347_pilon	+	5262	5	Intergenic	novelGene_172497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	127	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	3332	4015	204720	239992	TRUE	60	TAAAAAAGAAGGAATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYRYNAILIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPQISKALLKKRSKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIAQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGQKSIKWGKDNLFHKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIRPTPQALIHGINRIQTIIINAQNSTDKLDNWVLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIF	176947	241876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_178372_200879_201064_202996_204812_239400_240045_240681
886976	contig_10904_pilon	+	1775	1	Intergenic	novelGene_22559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCACTGCTAGACAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404084	405859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_404100_405900
886977	contig_10126_pilon	+	4025	3	Intergenic	novelGene_105702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3376	3783	49910	50317	FALSE	45	ACAAAAAAAAGCCCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQHLPKKYWVIEEITDGIKKFIESNENENTSYQNLWDKAKAVLGDQFIAINVHIQKVERAIIKTLTLQLEQAEREQQKKPSGARRKEIIRIRAELNKIENRKTTERVNKSKSWFFEKINKIDKTLAKLTKEK	28689	50559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_29737_32661_32790_47709
886978	contig_8587_pilon	+	3824	10	Intergenic	novelGene_159141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_3	239.523137365335	58	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	6	1619	479704	513611	FALSE	25	CAAGACTATGGTCCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAGKVVCECGYTREQHLEEAIKAHVFQGKEWDPKKHVQEMPTDAFGDIVFTGLGQKVGKYVRVSQDTPSSVIYHLMTQHWGLDVPNLLISVTGGAKNFNMKLRLKSIFRRGLVKVAQTTGAWLITGGSHAGVMKQVGEAVRDFNLSSSYKEGDVITIGVATWGTVHNRESLVHPMGGFPAEYVLDEEGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGRYGVEIPLRTRLEKFISEQTKEKGGVAIKIPIVCVVLEGGPGTLNTIYNAITNGTPCVIVAGSGRVADVIAQVAHLPISEITISLIQKKLSMFFQEMEIFTESRIVEWTKKIQDIVRRRQLLTIFREGKDGQQDVDIAILQALLKASRNHDHFGHENWDHQLKLAVAWNRVDIARSEIFTDEQQWKPSDLHPMMTAALISNKPDFVKLFLENGVQLKEFVTWDTLLYLYENLAPSCLFHCKLQKVLAEEPERLACTPAVPRLQMHHVAQVLHELLGDFTKPLYPRPRHSDRSRLSLPVPHIKLNVRAGDRLCVIPAQLHMALRF	479698	515816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_479718_493002_493172_493436_493618_497239_497407_499568_499750_502138_502201_506792_506991_511372_511476_512843_512966_513194
886979	contig_7342_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_71224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	674	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706494	709457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_706500_709500
886980	scaffold_13505_pilon	-	3364	9	Intergenic	novelGene_111507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_5	421.34331310702	736	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	74	1426	603235	588797	FALSE	30	TTCCCAGCACAGCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPRRRLSHRGVFSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEQLLKPDTNIYCQLHPKAEVAPQLPPGTAPYGLRRGATSDPKSWGKGRS	603308	586858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
886981	contig_10437_pilon	+	3863	11	Intergenic	novelGene_38197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42.6	1185	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	86	316	229668	232791	TRUE	25	AGCGGTTGTTGAACCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGPQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITQPRTAPLSPQGHFRLWGERRERRVLCAASSPGRL	225687	250059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229790_232682_234191_234334_234425_234684_234900_235281_235444_235710_235850_236586_237233_237818_237986_248893_249016_249452
886982	contig_6434_pilon	+	4814	23	Intergenic	novelGene_61881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1100.20708512774	7	138	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	24	2651	878083	925567	TRUE	25	GACTTTACATGCATATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKEDCNAMAFCAKMRSSKKTEVNLEVPEPGVEVIFYLPDREPLRLDSGEYTAEDLCIKAAQECCISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNHTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKVPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQDGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRINNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLLISSENEMNRFHSNDSGNILCYEVMVTGNLGIQWRQKPNVLPVEKEKNKLKWKKLENKHKKDEEKNRIREEWNNFSYFPEITHIVIKESAVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDFDNILMTVTCFEKSQVLGGQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGGPLWKS	878059	933829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_878252_882312_882437_887886_888041_892417_892582_894298_894642_896139_896326_900033_900192_902412_902537_904708_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924377_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932366
886983	contig_9471_pilon	-	5146	12	Intergenic	novelGene_21851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	997.81316259008	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	74	769	445281	437164	TRUE	35	AACCTCAAGTACAGCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKSFQNMFGINKPLELVRSSRRNSKNRCPVVIHLRI	446557	430674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437743_438019_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
886984	contig_10855_pilon	+	802	2	Intergenic	novelGene_124369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCAAATAAAGATGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697407	698278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_697769_697837
886985	contig_10003_pilon	-	3973	5	Intergenic	novelGene_88178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2017	junction_4	686.257741304242	5	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	3046	3720	473312	430736	FALSE	45	ATTTAAAAAAAATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLK	476357	430482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195
886986	contig_16999_pilon	+	6039	1	Intergenic	novelGene_84945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2826	3245	11459	11878	NA	30	AAGATGGGTTGACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIQNSQAILMIMGFIREVNSYNSGLGTLRILFFHQYSLFPAMLAGIPLPGPQSLPKGTQLSFSVGQEARCAVSCCWSLLLGLSCHHFSLSSRLQLTLCLLGPGASRRRDPRFKGHAGAWLFFLGGAAILLSAMELVLF	8633	14672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_8600_14700
886987	contig_10930_pilon	-	5380	6	Intergenic	novelGene_36987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	5532	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	3283	4368	278514	268388	FALSE	15	TCACTTACTGTGCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIINIIPTWCTIQRENWWHVTISSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	282209	267375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277002_278443_278637_279049
886988	contig_6343_pilon	-	2197	3	Intergenic	novelGene_175943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	329	739	334015	333605	TRUE	20	AGTGGCTATGGTGGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGAWNVQIMSLGKLEIVKNETERIIINILGISEPKGTGIGHYEFDSHMVYYARNDNLKRNAVAFIVKKNISRSILKYNTVSVRIISIHLQGRPVNMTILQIYAPTSKTTGEETEDFYQLLQAEID	334343	170822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6343_pilon_-_171601_227245_227518_333196
886989	contig_18916_pilon	+	3551	8	Intergenic	novelGene_136866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	951	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6950	41069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_9309_13050_13301_14084_14223_16156_16509_18529_18696_20454_20510_20714_20810_40932
886991	contig_5125_pilon	+	2785	10	Intergenic	novelGene_43405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1681.25792852323	1147	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	854	1987	35654	58893	TRUE	15	CTAGATGTTGGGGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	23060	59743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_23313_24803_24905_25392_25850_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_59032_59083
886992	contig_10940_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_49221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	824	1204	875054	874674	NA	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	875877	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874000_875900
886993	contig_5586_pilon	+	2607	10	Intergenic	novelGene_143554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	519.471264904738	33	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	472	1338	384614	430164	FALSE	20	CTATTTCTATTGAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	369206	431433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_369244_373455_373610_380577_380719_383470_383575_384578_384729_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
886994	contig_7594_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_55396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCATAGACATCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366983	368942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_367000_368900
886995	contig_3022_pilon	+	6129	4	Intergenic	novelGene_178505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	44	640	25207	25803	TRUE	55	AAAACTAATTCAAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQVKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWTGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRTLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKNKYCMRPLL	25163	119163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3022_pilon_+_26483_104545_105049_105828_106803_115830
886996	contig_13110_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_138740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGTACAGAGGGGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440696	442665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_440700_442700
886997	contig_5316_pilon	+	5050	10	Intergenic	novelGene_61206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	247	junction_9	277.615819451768	487	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	361	1662	453918	550408	FALSE	30	TTTAACATTTTGTAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	395999	553796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
886998	contig_12078_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_74125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAAAATATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553909	552278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_552300_553900
886999	contig_6233_pilon	+	2798	9	Intergenic	novelGene_74753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	279.550951304051	27	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	250	1236	117978	131406	FALSE	25	TAATTAGTACTTTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFDPTMSKKKKKKKKPFMLDEEGDAQTEETQPSETKEVEPEPIEDKDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEALEDEDSKKDDGISFSNQMGPAWAGSERDYTYEELLNRVFNIMREKNPDMVAGEKRKFVMKPPQVVRVGTKKTSFVNFTDICKLLHRQPKHLLAFLLAELGTSGSIDGNNQLVIKGRFQQKQIENVLRRYIKEYVTCHTCRSPDTILQKDTRLYFLQCETCHSRCSVASIKTGFQAVTGKRAQLRAKAN	112903	132968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_113153_117977_118156_119651_119756_123348_123485_125129_125231_125888_126038_127998_128056_130494_130581_131230
887000	contig_12869_pilon	+	2006	6	Intergenic	novelGene_75336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	368.657781689198	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	8	907	67397	97384	FALSE	15	AACTCTGTGTGTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67389	98483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77333_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
887001	contig_13295_pilon	-	4927	20	Intergenic	novelGene_31210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_19	174.409395157238	1193	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	227	2854	85663	55632	FALSE	45	CATAAATCACTTCACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGISYQRLVRAEQGLPTRRHRSSTVTVLLLNPVEVQAEFLAVADKLSTPRHSPHSAYITLLLHAFQATFGAHCDLPGLHHRLQSKTLEELEDIFMETTDAQELASRTRDAAEARQWLRTKLQEVGEQAGFPGILDTANPGKLHTIPIPVARCHTYSWSQDSFDILQEILLKEQELLQPGVLGDDEEEQEEEDLDTDGHCAERDSLLSTSLSALRDSALSLASSQASGPAFSSQLLTSFVSGLSDGVDSGYLEDSEESSPEWPRKPGSQERRGHRRPGRKFNRIYKLFKSTSQLMLRRDSRSLEGGAAEVLPLRRAESLSSPLDCLALLPTRAQRSRSLPQSKLRAQVPRWLLAPASRHQPRRPFLSGDEDPKASTLRVVVFGSDRISGKVARAYSNLRRLENNCPLLTRFFKLQFFYVPVKRRHGTGSSASPAPPSQTPPVPTDSPRHASPAELGSVSWEESTNDISHYLGMLDPWYERNVLGLMHLPPEVLCQQSLKPESRPLAGCPAQLPILADMLLYYCRFAARPVLLQVYQTELTFSTGEKTTEIFIQSLELGHSAATRAIKASGPGSKRLGIDDDREAVPLTLQIVYSKGAISGRSRWSNMEKVCTSVNLSKACRKLEELDSNMEALTLTLTEVVKRQNPKSKKGFNQISISQIKVDKVQIIGSNSCPFAVCLDQDERKVLQSVVRCEISPCYKPEKSSLRPPRQRPPYPLAQAAPDLCSLLCLPIMTFSGPLP	134780	53558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_55780_55912_56026_56646_56730_56802_56897_59115_59193_59375_59470_59647_59777_60294_60421_60965_61129_61226_61933_62195_62280_63514_63669_64246_64422_67420_67491_79381_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_101889_102009_134686
887002	contig_2480_pilon	+	2712	2	Intergenic	novelGene_63562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	102	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	897	1724	363853	364680	FALSE	0	GTCTTGGTTTTTCTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNPQLRRTQSMRDGRGALCICLAKAEGEGGAGSDRPLHGLSKRTQESADLSDIPSWVNQSVLHVNGSSPNEELSLEMKNLLREVPDLQESVRRNCASAAALSKAVALSSAPTEEQGVKVPRGVGEALVRDWLGRGPRDTDCHGDWCHKGELWLCSACLQPSGLPCYHTLNLLPLGMGIFEDEPPSAFLGISSELELPSLHSILSATLYACPEILLNDETKDLSLDCLKPMLSEQIVEYKEMLSGVKSIPDDLQVTLGLLALRALEFANLLYHS	362854	365668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_363703_363804
887003	contig_18081_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_23835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2807	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGCTTTGGGTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429438	427168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_427200_429400
887004	contig_3424_pilon	+	4696	1	Intergenic	novelGene_55468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1323	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2958	3263	152798	153103	NA	50	AAATGACTGAAAAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSKVGTRSRTGTTDELNGATKPYADPGTPHFQPQVRKPPWSVLCRVPQQLCAATSKRDKQRRGLSPQETALGASVFSPWLFPQSPAEVHLGVQFVSSQ	149840	154536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_149800_154500
887005	contig_15327_pilon	+	2718	10	Intergenic	novelGene_70514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	40.7921561087423	515	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	242	970	465424	468070	TRUE	40	AGTTAACAGGGTTAGAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSVKAVRGWSGLALGVRGVVLRLPGLTQVRWSRYGPEYQDPRIDGEYYRKPMAKLTEEEKYERELRKTQLIKAAPATKTSSVFEDPVVSKFTNMMMKGGNKVLARNLMIQTLEAVKRKQFEKYHAASAEEQATIERNPYTIFHQALKNCEPVIGLVPILKGGHFYQVPVPLADRRRRFLAMKWMITECREKKHRRMLMPEKLSHELLQAFHNQGPVIKRKHDMHKMAEANRALAHYRWW	465182	473001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_465507_466038_466231_466347_466412_466777_466946_467848_469195_469714_469813_469923_470083_470267_470379_471591_471721_472874
887006	contig_4876_pilon	-	1904	5	Intergenic	novelGene_137916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	139.854388561818	37	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	298	309	633493	633482	TRUE	50	AACAATGTTATATGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWWSGFGVAQRPAALVCGLALNLQLLTCSPHRRASVRVSAAAAFGPGPSRSLLRLSWLKGAARCSRWAHRRRIPPPTGTSPLSPQQTQKISVVQYHLQMSD	654213	622392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_623681_625917_626032_629225_629304_633366_633521_653943
887007	contig_7119_pilon	+	2555	4	Intergenic	novelGene_40913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	387.026556654134	80	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	319	1404	138713	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127467	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138231_138291_138707
887008	contig_14300_pilon	-	4097	10	Intergenic	novelGene_133086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.256928694595	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	615	1361	180320	143271	TRUE	20	GAAGTGGGGAGACGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPVTGQTCPRPHQAVFPGVP	185377	139546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_139575_140458_140554_140657_143327_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_184804
887009	contig_15327_pilon	+	2006	6	Intergenic	novelGene_70424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	97.7903880757204	1176	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	208	1104	36170	53675	FALSE	5	CTTCAGCCTCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRAVRNWLVGFSSLSRCSPAAAETPARSTRLSAGIPAALAASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEKSGLLAGDRLVEVNGENVEKETHQQVVNRIRASLNAVRLLVVDPDVDEQLQKLGVTVREELLRAQVGSGPAELQAATEAQGDGGESEPREAEKSQAERRELRPRLCAMKKGPNGYGFNLHSDKSKPGQFIRAVDPDSPAEASGLRAQDRIVEVNGVCMEGKQHGDVVSAIKAGGDETKLLVVDRETDEFFKKCKVIPSQEHLDGPLPEPFINGEIQKENSQEAPAEEAAPESPWPALGRTTSSDTSEES	35962	54577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36611_48133_48296_49305_49460_51741_51783_53348_53442_53669
887010	contig_5023_pilon	+	3070	16	Intergenic	novelGene_7295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1931.9836438231	4	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	65	1759	607279	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVANDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580864	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609628_611778_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
887011	contig_4125_pilon	-	2971	11	Intergenic	novelGene_25141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_10	460.160417680617	7	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	212	1234	875313	853458	TRUE	5	GGGACCTGGGTGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	934602	851438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_853167_853448_853565_855788_856006_856294_856497_858177_858245_863756_863920_864951_865016_869024_869132_870351_870391_875256_875360_934437
887012	contig_9345_pilon	-	1595	6	Intergenic	novelGene_24683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	287	868	955353	947957	FALSE	20	AAATTCCCGTTTTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001361	947229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
887013	contig_10904_pilon	-	1002	5	Intergenic	novelGene_22567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	148.240303224191	1686	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	360	755	411895	411229	FALSE	25	CCAGACATGTTGCAATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPGPVVARGANVSLRCAGLIGGMSFALYRVGEAAPLQYRNSARPWADFPLPAARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSQPLVVSWDGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	419266	410981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636_411919_413637_413829_417965_417999_419154
887014	contig_3018_pilon	-	5784	19	Intergenic	novelGene_78819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	512.58449770155	238	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1039	3120	443	3562	583440	545087	FALSE	25	TATCAGAGAGCTTTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKREKRREQALERISTAKTEVKTECKDAQIVSDAEVIQEQAKEETATKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRTVSMCSDIQPSSPDIEVAAQQNDIENAVLAIEPETETAVAEIIPETEVPALNKCPTKYPKTKKHLVNEWLSEKNEKTGKPSDGLSERPLRITTDPEVLATQLNSLPGLTYSPHVYSTPKHYIRFTSPFLSEKRRRKEPTENISGSCKKRWLKQALEEENSTILHRFNSPYQERSRSPTVNGESKSPLLLNDSCSLPDLTTPLKKRRLYQLLDSAYSETSTPTPSPYATPTHTDITPIDPSFATPPRMKSDDETYRNGYKPIYSPVTPVTPGTPGNSMHFENISSPESSPEIKRRTYSQEGYDRSSTMLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLIDGSCTPQNPPQKKKVTNLTIYTLLNSVFL	625111	542864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_545699_545829_545887_546200_546452_547000_547146_547311_547567_550198_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583598_624826
887015	contig_8262_pilon	-	4010	1	Intergenic	novelGene_166105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228502	224492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_-_224500_228500
887017	contig_8062_pilon	-	2771	2	Intergenic	novelGene_178506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1731	2108	315193	181104	FALSE	40	CAATCAACGTAATCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKTTMRYHLTQALLAPIKKLNITLVTNDWVIEEIRDGIEKFLESNENENTSYQNLWDTVKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDTIKTLTTELEQIEREQQKMPTSFRRKEIIKIRAEINEKENRKK	316923	180440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8062_pilon_-_181419_315130
887018	contig_11422_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_99061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2272	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2300
887019	contig_4305_pilon	-	1981	13	Intergenic	novelGene_136692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	677.139756623402	854	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	43	1581	549989	528687	FALSE	20	TGAGCCCCCTTTAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRVGQTRERRLRLCGRRPDFCSPRQARPSWPPPPHLAAMRLRRLALFPVVALLLAAARLAAASDVLELTDENFESRVADTGSAGLMLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFEKFISEKDASVVGFFSDLFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNKYDDNGGGITLFRPSHLVNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLVAYYDVDYEKNTKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNDENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPNIVIAKMDATANDVPSPYEVRGFPTIYFSPANKKLTPKKYEVWWP	550031	528286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_528698_529047_529110_529457_529538_529853_529983_531020_531130_532180_532364_532962_533089_533404_533522_536851_536982_538239_538348_541824_541943_543486_543566_549702
887020	contig_16752_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_177682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1947	2369	84945	85367	NA	10	GTGCAGGCTCCAGTGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVCGSRRGVSLARSSAWPERAPNSRKGKENRQTIQNEEKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGKSKDGARSQALERKEGEVARGKQEIKRSRKKKKQHQQPTNGTQRASQCGLVFLDKRLCPWEAEEAECG	82998	85738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16752_pilon_+_83000_85700
887021	contig_16411_pilon	+	11954	29	Intergenic	novelGene_77303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1211.25824063665	2963	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	8425	10041	152659	241370	TRUE	20	TCAGCATCTTCGTCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	97731	243788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_99778_101239_101330_111959_112038_113690_113793_120329_120512_122766_122864_124494_124624_127063_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149052_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241797_242301
887022	contig_12125_pilon	+	2861	1	Intergenic	novelGene_76251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTCACTAGTACCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632102	634963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_632100_635000
887023	contig_3410_pilon	-	3208	10	Intergenic	novelGene_58908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	475.64342386568	1381	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	111	1484	57649	15414	FALSE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSKEECPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	57759	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
887024	contig_7452_pilon	-	2873	4	Intergenic	novelGene_109144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	220	606	193786	193400	TRUE	50	TAACAAGCCCAATAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARQQPPLAQSPAPRIWLEEGTCGRPLKPEDLAVSLSRTRKAKSLCAGWLAAMEAWADVAGVPPTWGAHAGIKASSCLAAHVVCSSWVVFPIRSVQGQQAGGRSALGRFLLPWPRPQEGMKWENQT	194005	118738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_118882_155886_155975_158022_158151_191491
887025	contig_18108_pilon	+	2737	8	Intergenic	novelGene_33468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	205.081168599864	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	63	917	226815	260192	TRUE	20	ACTAATTTTCTTTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226752	262111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997_260348_260446
887026	contig_9313_pilon	+	3448	3	Intergenic	novelGene_86475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	1244	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAGAAAAAGATATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387207	464802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_457278_457360_461601
887027	contig_12638_pilon	-	5065	16	Intergenic	novelGene_33254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	811	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	953	1270	860948	859070	TRUE	15	CACTCCATTTGGATTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPKAQQVVEIVEQEARVLLAVFHPLQQPQVQGQPLFPSGQHQNHQAGVEAADVLLGQCLHVDDVDEAEEEGHLCGYLGYVGKQAALRQDLGHFHVYLVFKSVQ	862075	800874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_800959_803872_803987_812884_812943_815113_815170_826234_826364_830579_830788_836183_836370_845370_845536_850765_850901_852616_852677_854778_854878_855925_858353_858995_859105_859707_859820_860777_860988_861162
887028	contig_11292_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_109473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAAGAGTTGGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457602	459668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_457600_459700
887029	contig_9239_pilon	+	4156	4	Intergenic	novelGene_137191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACCATTGCGATTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226784	286503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_228450_229487_230591_284872_286089_286331
887030	contig_16125_pilon	-	1946	12	Intergenic	novelGene_155247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_11	1073.2141037075	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	45	1193	236934	155607	TRUE	70	TGAAAAAGCAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNEAL	236978	135677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_235796
887031	contig_17769_pilon	+	2776	13	Intergenic	novelGene_124239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_10	154.79993809215	1563	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	733	2208	14031	43853	FALSE	40	CTTAAAAAATGCCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRALRRLRGKQRGQEPLGPGALQFVLREDDDAEEEGPKRGPAGRRPRGTGKESVRVNNRFELINTEELEEEPVVNGDKSDCMPTDTVVSGNKGRAKHGNTETKKDGEGVEKAAASEQSNSSGKLRKKKKKQKNKKSTTGETLENGLEDIDRILERIEDRGGLARPGPPPLSSRKHVLHVEHRHLNPDTELKRYFGARAILGEQRSRQRQRVYPKSMWLTTPKSTWPRYSKPGLSMRLLETKKGLSSFMFEHSEEYQQVQHKFLAAVESMEPNNIVVLLQTSPYHVDSLLQLSDACRLQEDQEMARDLIERALYSMECAFHPLFSLTSGTCRLDYRRPENRSFYLALYKQMVFLEKRGCPRTALEYCKLILSLEPDEDPLCMLLLVDHLALRARSYDYLIFLFQDWEAHRNLSQLPNFAFSVPLAYLLLSQQADHPQHERSAAREKASVLIRQALTMFPGVLMPLLEYCSVRPDATVANHHFFGPNAQIR	13298	44421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_14223_30169_30335_31842_31918_32653_32773_33781_33848_36592_36676_37784_37916_38560_38661_39508_39603_40697_40791_40858_40965_42217_42378_43761
887032	contig_8210_pilon	-	4042	2	Intergenic	novelGene_30225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1451	junction_1	0	17	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1523	1963	18302	15712	FALSE	25	TTCCAAATTTCCATACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	19824	13632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144
887033	contig_20199_pilon	-	522	4	Intergenic	novelGene_82571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	17	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	124	318	43987	40852	FALSE	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESL	44110	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40860_41203_41250_42110_42171_43906
887034	contig_2069_pilon	+	2700	14	Intergenic	novelGene_23270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	317.514478074595	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1177	1893	341330	343975	FALSE	45	TAGGCAACTGGAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324086	344782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332107_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
887035	contig_6192_pilon	-	5219	1	Intergenic	novelGene_170328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1248	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	3757	4161	129917	129513	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVPSADHLQILMIKHIPLFYAFPRSLQAYNSAVGRKRDRNESQDIKSPNTSVTQSGCCGHRVIKFAFIYCRLPTLSPPVNSAKSVFPPPQNKNNPAVCRHPPTPILGPRPRELSSSLAEMKREHESAREGAL	133673	128454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_128500_133700
887036	contig_17964_pilon	-	2788	8	Intergenic	novelGene_33891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_5	170.733591257472	160	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	8	1102	359169	340782	FALSE	25	CAGAACTTTGGAATCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPADQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPAQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII	359176	339095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_347653_347776_348928_349055_351505_351644_355598_355734_357565_357696_359050
887037	SIRV6	+	1481	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	29	18	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	888	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
887038	contig_13026_pilon	-	1248	11	Intergenic	novelGene_146296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	108.399077486849	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	122	865	22988	6494	FALSE	10	TCTCCTGGACCAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRDVGYPAATLRWGLVPGTRHQRRRRPVRELLREVSLSVMDGTAPKEIQLGGVPPKAADVCQELVPTHPLWTGGKKGHFVSPVKNQGACGSCWTFSTTGALESAIAIASGKLLSLSEQQLVDCAKDFNNHGCQGGLPSQAFEYILYNKGIMGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28102	6110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19944_22306_22370_22975_23008_28000
887039	contig_11825_pilon	+	3060	19	Intergenic	novelGene_155391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	365.345954769814	54	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	719	2527	21472	78072	FALSE	60	GAAAAACAAGTAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQLQEKKIQEKIQEEEQKAVEKQCKDKGGTASALVNYRALYPFEARSHDEMSFNSGDIIQVDEKTIGEPGWLYGSSKGNFGWFPCNYVEKMSSSEKALSPKKALLPPAVSLPATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPASVSPIHGQVCCF	10455	78605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21379_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051_65201_66028_66127_77431_77608_77912
887040	contig_5686_pilon	+	3832	3	Intergenic	novelGene_45308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	183	548	95808	97049	TRUE	75	GAAAAGAAAGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQNARPTFLSLKRFFSCTSGYIAEDYHLWTDGSTLCKRIKCGPTLTGKLPVVIEFTPTHDDDPMCVRIELFHRIFNGLFFRSRSPGLSSEVPPCRLKPPNFQLTTEHVICLHRSGTPKT	95625	100408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_96023_96898_99563_99637
887041	contig_10890_pilon	-	2387	5	Intergenic	novelGene_166780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	436.776473153031	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	58	639	161049	126635	FALSE	35	TGGAAACAACTCTTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRQRRDAELAHLRSSGRAMHVNGKVALVTGAAQGIGRAFAEALLHKGAKVALVDWNLEAGVKCKAALEELFEPQKTLFIQCDVADQKQLRGLMPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	161106	124886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_160559_160684_160956
887042	contig_7179_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_78201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGAACGGTGAACCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1390280	1388135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1388100_1390300
887043	contig_8254_pilon	+	4260	3	Intergenic	novelGene_48356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTTGAGGTATGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	129581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_415_457_1877_127154
887044	contig_3386_pilon	+	3105	12	Intergenic	novelGene_34566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	577.507496999744	835	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	181	1275	476274	508362	FALSE	20	GTAGTGGAAGTGTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCCPHPQRLFGPYSRSRHAFLLLLPAAAAAGASPVLTSRPLAGPASGLPAALPPRGSAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470130	510192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498684_506562_506635_507645_507741_508231
887045	contig_14220_pilon	-	2542	3	Intergenic	novelGene_159876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTACCAATATATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390270	378953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_378962_387223_388947_389459
887046	contig_13301_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_153124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	273.115883306493	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	28	1251	169218	174444	FALSE	40	CTTTGAAGAAGGAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGGSTVLNMTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPVHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFSPTVSMVEGQGEKNVTFWGKMWPQCEELQGQKLVVEEKRPCLHAPACKDPNRKP	169190	174509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171809_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173087_174281
887047	contig_3155_pilon	+	1558	4	Intergenic	novelGene_26407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	586.898628384834	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258123	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_261082_261534_261581
887048	contig_18162_pilon	+	3775	2	Intergenic	novelGene_122274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4288	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	2389	3495	9632	10738	TRUE	25	CTTGAATCACACAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNIGSPFLLRPPGSAELSPSPARPRPAAPARPRDAAAGGRLPRGLRAAALHGVPAHQPQAPRAAPVRMWWLQEAPVASESVLLLSAIDKGCLSLWWHEMRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7243	16573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_10810_16364
887049	contig_5302_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_81409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	594	968	176322	175948	NA	25	CCCTGAGGAATAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	176915	175547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_175500_176900
887050	contig_4180_pilon	-	982	5	Intergenic	novelGene_8391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGCAGCTCCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888582	875202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_875362_882858_882929_886080_886187_886317_886467_888084
887051	contig_9945_pilon	+	3398	1	Intergenic	novelGene_104819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTACTGCTATGTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106084	109482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_106100_109500
887052	contig_383_pilon	-	3187	13	Intergenic	novelGene_126086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCCCCTCCTGAGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135555	69290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_69601_79318_79411_89954_90078_116748_116962_118128_118272_123643_123867_125162_125331_126209_126388_127895_127991_128774_128989_130277_130432_132625_132838_134493
887053	contig_5669_pilon	-	6391	24	Intergenic	novelGene_86082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.993473658602	481	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	923	2772	344	3115	284753	196397	TRUE	15	GGGCAGTTTTACTCCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAKPTLQLVYQAVQALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWEISDQLLQIRQDVESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPTDSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIVTQLALAIADLALQMPSWKGCVQTLVEKYSNDVTSLPFLLEILTVLPEEVHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTVVSLLMTCVEKAGTDEKMLMKVFRCLGSWFNLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQDKTSSNLHEAASDCVCSALYAIENVETNLPLAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLLICAGHPQYEVVEISFNFWYRLGEHLYKTNDEVIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHEGVPEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKEGNPPWEVTEAVLFIMAAIAKSVDPENNPTLVEVLEGVVRLPETVHTAVRYTSIELVGEMSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSFMLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVFLDRLAVIFRHTNPIVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANCSVMRFLRDLIHTGVANDHEEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLKGLPKETTVGAVTVTHRQLTDFHKQVTSAEECKQVCWALRDFTRLFR	285096	190141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_190878_191910_194420_196365_196458_201969_202083_205122_205291_207172_207330_208491_208587_209481_209599_212408_212550_213404_213466_215462_215540_216828_216921_219864_220057_221963_222104_224247_224340_226078_226187_228431_228579_237834_237974_238509_238686_241752_241897_253893_254051_256853_256928_257825_258027_284633
887054	contig_11117_pilon	-	2828	4	Intergenic	novelGene_148584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATACTTTTCGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85560	76317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_76425_76925_78170_83469_84774_85387
887055	contig_5020_pilon	-	4026	4	Intergenic	novelGene_27951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	428	763	250092	249757	TRUE	30	GACAGAGTGAGAGCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNILMFCILLRLALWPSMWSVQENVLCVLEKKVYLAAVEWSVLYMFVGSSWLIVTFRSSVSLLNFFLDVLSFTRSGVLTFPRIIVKLSVSFFIAVRVCFMYFGDLSLGA	291900	179868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_181627_189410_190026_248866_250510_291890
887056	contig_15114_pilon	-	5665	12	Intergenic	novelGene_121085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	663.915968495367	1983	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	84	1502	56240	39532	TRUE	40	CAAAAATTAATGGTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRHPWGSRASPQVAEDVTGVAGSGPRTMLAFLGTTALVLVAGAPWALLAAAGGEDLESPQNVEVSIIDDVFLLKWNSSESVGNVTFSADYQTPGMHNWIELPGCQYITGTTCDFSSVKLSVFEKIQLRIRAEKGNRTSPWHEVGSFIPFRKAQIGPPKVHLKAEDKAIIVNISPPGTKDSLMWAMDILSFTYSVVIWKNSSSVDERTETVYPGGKIYKLSPETTYCLKVKARLRLHRKVGSYSPVYCVNTTVENKLPSPENIEVDVKDQSYVLKWDYTYENMTFQAQWLRAYFKKILGNHSDKWQQIPGCENVRATQCVFPQKVFSKGAYFLRVQASDGNKTSFWSEEKRLDTEMQTVILPPVISMKSVDNSLHIYIGAPRETENKSTSQHYPLIYEIIFWENTSNAERKILQKKTDFIVPNLQPLTVYCVKARAVIEDEKWNKSSVFSDILCEKTKPGQYIHNLDYSWSLHCLVFHPSCHLRCERPLEMHQLCILSIL	56323	24552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_24722_31269_35242_39509_39656_40365_40518_42847_43003_43108_43309_43981_44097_45363_45506_45615_45774_46802_46982_50036_50158_56167
887057	contig_10354_pilon	-	3416	2	Intergenic	novelGene_50866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1406	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTTTTTTTTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450982	440393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_443701_450873
887058	contig_7056_pilon	-	2862	6	Intergenic	novelGene_43636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_4	746.112163149751	100	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1063	1374	725582	725118	TRUE	35	AAAAACTGCAATTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	726724	721902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_725319_725471_725734_725813
887059	contig_10958_pilon	+	3833	19	Intergenic	novelGene_5368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	234.200900357781	769	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	150	1754	804900	811107	TRUE	15	CGGAGACAGCGCCCGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	804187	830173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_804335_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890_811514_811887_812705_813844_813964_816410_816558_819638_819759_821545_821727_828077_828216_830022
887060	contig_12638_pilon	+	4284	17	Intergenic	novelGene_33103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_9	477.342672871125	66	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	2289	3410	182987	199604	FALSE	40	TAAGAAATCTCATTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170803	200478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
887061	contig_13295_pilon	-	2013	4	Intergenic	novelGene_31213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.277457017791	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGATTAGCCTTGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134094	53631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_55271_85617_85677_101889_102009_133898
887062	contig_9415_pilon	-	1945	6	Intergenic	novelGene_109936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	239.120889928086	399	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATTCATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2479397	2451892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2452132_2465531_2465660_2466910_2468220_2470587_2470634_2472695_2472746_2479224
887063	contig_15039_pilon	+	1406	3	Intergenic	novelGene_110184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	292	junction_1	30.5	610	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	151	762	360528	414815	FALSE	45	GATACCCTATAAGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVRSAKQNLRAKLKQRLQAMSAEERLRQSLLLTQKVISHSQYQKSKRVSIFLSMQDEIETEEIIKDIFQQGKTCFIPQYQFQSNHMEMVKLASPEEISLLPKTSWNIHQPAEGEVREEALSTGGLDLIFMPGLGFDKHGNRLGRGKGYYDTYLKRCLQQQEVKPYTMALAFKEQICLQVPVDESDMKVDEVLYEDSSTS	360377	415459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_360645_367985_368248_414582
887064	contig_17976_pilon	+	2417	4	Intergenic	novelGene_32491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	217	1104	41843	49580	FALSE	20	TAAGGGTGGTGTCATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWRVLLSSSPCHSSSC	41626	50893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47213_49536
887065	contig_13780_pilon	-	4268	2	Intergenic	novelGene_149116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTTTGTCTCTGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823934	819268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_820631_821028
887066	contig_3509_pilon	-	1411	4	Intergenic	novelGene_160704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTTACTACGAACAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43032	38661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_38956_39786_39933_40576_40692_42176
887067	contig_14513_pilon	-	5185	3	Intergenic	novelGene_70265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4190	4639	12282	11833	FALSE	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVVDVYFWVFCGCVVSLQFRSSKIIFVTPHPINISCPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	18426	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12519_13576_14278_15174
887068	contig_1008_pilon	+	2084	3	Intergenic	novelGene_121601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	228	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAAAGATGTCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750496	762316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_752457_752666_760972
887069	contig_7527_pilon	-	2068	2	Intergenic	novelGene_139581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAGAGATGTAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121027	117619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_119487_120826
887070	contig_4426_pilon	+	4279	7	Intergenic	novelGene_15415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGGACGATTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818314	904541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_819469_819516_821944_868806_868955_881692_881834_887174_887380_889993_890139_904482
887071	contig_4857_pilon	+	2690	1	Intergenic	novelGene_48802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGACCCCACTGGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1244150	1246840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1244200_1246800
887072	contig_11574_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_64117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTATCGTCTATTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836824	839304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_836800_839300
887073	contig_15371_pilon	+	3047	12	Intergenic	novelGene_151467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	744.653061377029	403	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	1047	2405	213087	230717	FALSE	15	CACTGGTTAAGGCGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAITPLISTKVQDKLLLSACHLLVSLATTVRPVFLISIPAVQKVFNRITDASAQRLVDKAQVLVCRALSNILLLPWPNLPENEQQWPMRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDTKMVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAETLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	204425	231359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_205267_208942_209036_212974_213120_215190_215338_216235_216426_220720_220877_222001_222117_222289_222462_225587_225702_226862_226962_227140_227372_230615
887074	contig_6488_pilon	-	3598	7	Intergenic	novelGene_44717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	729.135427902267	27	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	151	1323	91238	31233	TRUE	35	TTGCCTTTAAAATCTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGVPSPLQGGSNSAATLGKPSGELRAGGASPPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQDGDSMFNRAKLLNVGFQEALKDYDYNCFVFSDVDLIPMDDHNTYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFKGMSVSRPNAVVGKCRMIRHSRDRKNEPNPQRFDRIAHTKETMRLDGLNTLTYKVLDTQRYPLYTKITVDIGKPS	91388	28440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_28793_29309_31366_31558_31664_34242_34366_36841_37030_53885_54122_90850
887075	contig_7182_pilon	-	2170	4	Intergenic	novelGene_117138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	1508.88752249979	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	121	618	889318	888143	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAGRPQNGERAHVAGVLGAGPPPRPAGPPQAEFREKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKVRSTCLVD	890287	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_888345_888814_888961_889168_889333_890181
887076	contig_19722_pilon	-	2685	2	Intergenic	novelGene_171902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACAAGATTCATCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190019	186429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_187777_188681
887077	contig_1948_pilon	-	2668	1	Intergenic	novelGene_31189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTGCGCATGCGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554859	552191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_552200_554900
887078	contig_15236_pilon	+	8219	28	Intergenic	novelGene_141623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1562	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1456	1851	615619	616014	TRUE	55	CCATACAGTATACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRALQRRRFKTLSPSNCKLFSGLDFCLSAGVASLADRSDFTTLGSSSGPSPGADNRAEYRYLFTGRLAPVRGSKVARGLGSGLGSFVYSESPGRGQLEKFGLSIAPFVLQSQSKPWELQSPQPSVRLLRG	614163	692096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_618980_623168_623402_635486_635652_637191_637297_637797_637864_644160_644302_645564_645692_647358_647419_648728_648880_650533_650631_654829_654987_656272_656477_657773_657957_660984_661087_661160_661233_662587_662661_663175_663354_663959_664199_667265_667470_668586_668736_675890_675973_677715_677783_679756_679805_683370_683475_684093_684221_684415_684528_689619_689699_692018
887079	contig_19185_pilon	-	5905	7	Intergenic	novelGene_163637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	381	junction_1	460.524700749048	1184	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	18	1721	185954	91474	FALSE	35	CACCCCAGATATACTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGSAMGRGLLGGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKSVNDDMMVTDNNGAFKLRQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPHEVCVAVWRKNDENITLETICHDPKLPYHGFVLEDTASSKCIMKEKKTVGETFFMCACSAEECNDHVIFSEEYNTSSPDLLLVIIQVTGVSLLPPLGVAIAVIITFYCYRVHRQQKLSPSWETSKPRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLHLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSSWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK	185971	87289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_91654_94806_94935_109520_109663_111372_112173_138347_138539_145114_145284_185860
887080	contig_3269_pilon	-	2678	21	Intergenic	novelGene_117006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_20	762.934825198064	1	23	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	266	2638	102350	45773	FALSE	25	CAGGAATATTCGGAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSLSTDKDTVFLTVPPVANKDSAFLVYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPEQGNTGENTRQSSARSSVSQYNRLDQYEIRSLLMCYLYIIKMISEDTLLTYWNKVSPQELLNILILLEVCLFHFRYTGKRNIARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRNRSGVMQARLQHLSSLESSFTLNHSSTTTEADIFHQALLEGNTATEVSLTVLDTISFFTQCFKTQLLNNDGHNPLMKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFATLRAFISKFPSAFFKGRVNMCAAFCYEVLKCCTSKISSTRNEASALLYLLMRNNFEYTKRKTFLRTHLQIIIAVSQLIADVALSGGSRFQESLFIINNFANSDRPMKATAFPTEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLIDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMAKIHIKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMKEDAGMMDVHYSEEILLELLEQCVDGLWKAERYEVISEISKLIIPVYEKRREFEKLTQIYRTLHGAYTKILEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDKVNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERNTEFERNHNITRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPINYEQQIHLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSPADVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPLAYARTFLNDSQASKYPPKKVNELKDVFRKFIQACSVALDLNERLIKEDQIEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQILQEDTMHSPWMSNTLHVFCAISGTSSDRGYGSPRYVEV	105814	45732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_45893_50721_50861_52711_52813_53479_53671_53949_54161_55787_55935_56458_56573_61063_61187_65584_65692_72223_72282_72369_72586_80198_80313_82852_83036_89133_89272_91826_91943_93500_93644_95065_95114_96508_96576_102313_102426_104463_104622_105782
887081	contig_5643_pilon	+	1482	11	Intergenic	novelGene_38779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1983.98180687223	4943	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	845	1270	237186	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
887082	contig_854_pilon	+	5453	31	Intergenic	novelGene_36490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_30	2508.91308582466	337	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1417	4254	176	4429	1649514	1715383	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612770	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1715226
887083	contig_10106_pilon	-	5012	13	Intergenic	novelGene_73880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	4334	4849	166139	151106	TRUE	25	CTTGGGGAGCACACTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDGEAVASDSALVARCPHIATATHPNITPGAHQLRRVFLQGLQAPGLPVGLSVWSLSGGSSASEIWMLGMVRGFRMVLSPQVAAGVPGRGGGWGADALIVILHLQTDRPAQPPGDVQQPLHDEFVFLLSVPQLQILAFVVQVVGLQVQEDSYLEMYLSCPQGTRAVWLL	176654	132794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_132829_150585_150676_151066_151167_153297_153364_155378_155532_159294_159387_165995_166155_167029_167129_168796_168849_169346_169463_170993_171096_172509_173703_173898
887084	contig_6137_pilon	+	3732	3	Intergenic	novelGene_59126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1370	1807	277040	277477	TRUE	50	TAGAAAATAAGAGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLSIQEAQRTPYRIDPKRKLPRHIIITLAKTKDKQRILSIAQEKQKVTYRGETIRLSSNYLAETTQARRQWDGIYKTLKEKNCQPRVIYPAKLSFKYGGEIRTFPDKQKLRDYVKTKPNLQDLLKGVLQSENKQHQTTGCI	274966	279530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_275313_276016_279135_279262
887085	contig_11427_pilon	+	2816	1	Intergenic	novelGene_78964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	625	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	422	1269	344	1612	70311	71579	NA	20	CTTTATTGTGTTAATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRYMQSRTVLHRIFKVVSFQKQITRQIFQGTSVGGFLRLVVKSLAECATQGLTYILVTFSLFTGLSKMDYETTSPMYYDMDYSASEPCQKLDVRQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLVNCKKLKSMTDIYLLNLTISDLLFLLTLPFWTHYATNGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVAGLVSLPGIIFTRSQKEGLRYTCSPHFPSSQYHFWKNFQTLKITILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFAIMIVYFLFWAPYNIVLALTTFQELFGLDNCNSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFRKHIAKRLCKYCPSFQLEAPERVNSVFTRSTGEQEISTGL	69967	72783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_70000_72800
887086	contig_1719_pilon	-	1022	6	Intergenic	novelGene_87358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	574.587991520881	5990	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	75	491	803613	767785	TRUE	15	CTTTACCTTTGAAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAVFGLGRSAGCSPSLRPSAAMFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQSPPGC	803687	754551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_767721_767803_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
887087	contig_6102_pilon	-	2031	9	Intergenic	novelGene_32150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	638.192944472908	3390	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	867552	864699	TRUE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARVFCCVTSRRPASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNTLEGSRNWT	867554	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_864640_864729_867237
887088	contig_5023_pilon	+	3996	2	Intergenic	novelGene_7125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1965	2351	163058	163444	TRUE	40	TACAAGACCAAAAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFFELPEAEYKRLIYRILQEIRKEINQNAEHATEEIKKIREEHNEKFNRLQESIETQQSEIQKINNQISELDNSIESHRSRTEAMEVRISETEDKALDTKLFEKKSDTRI	161093	165533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_164443_164886
887089	contig_8712_pilon	+	2872	8	Intergenic	novelGene_58728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	81.6193254426566	841	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	362	1234	2416	10836	TRUE	20	TTCCATTTTCTTGAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPYAIRPDLAEVCLFTKDEPNLTPEKTEHFYRNLLNKHNIKTVSQIIPLRTLKKEYKPYEAKLRLLGSFDFFLTDARIRRLLPSIIGKHFYLRKKVPVCVNLLAKDLSKEINDCIGGTIMNISKNGSCSTIRVGHTGMMVQHIIENVIAVTKGLSEKLPEKWESVKLLYLKTEKSVALPIFSSFVSSFYEGKGGPLTGQKKKEAKKKQKEKLQKKKEKKRRKREMQQAAKTKKTKLAQTKDKVAAEVSGAPAKSPGPQKGETLGEKEEIHRGKAQRKVGDGSEDEIPLLVPMEETPAKKKKMQKGATIKKSPSKSPGPGTPVGKKRKASSALETTKVSEPGTPGKGLGKKPRIKEEAEKERNAAPGKKDPRQTPKKPGPKFFATSSKSARKTPQTPKQQPKKPKVPQST	960	13032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_1100_2104_2254_2342_2445_5372_5467_5547_5674_8141_8439_10509_11540_12097
887090	contig_9313_pilon	+	2683	5	Intergenic	novelGene_86468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1052.16978192685	21	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	160	483	387329	461613	TRUE	30	TATTCTGAAAATGGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICGPGGREPDPRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387169	464815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601_461852_462853
887092	contig_19032_pilon	-	2268	9	Intergenic	novelGene_172542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	718	junction_1	879.910142784478	62	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	973	1950	160279	157239	FALSE	20	CCTGGTGTCTTTTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	162006	156920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304
887093	contig_9548_pilon	-	6476	2	Intergenic	novelGene_141084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1183	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2914	3216	312322	312020	TRUE	15	TTACGGGTGGGGCGGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLFSLGSPTSEIIPAALILNIIAPQSFTHESILFLYVLTRQRGGTFKSVRKFMEDFMVLIYTSKLHYLLMASKSPALISSFELQTHIQLAIGYPLLGYL	315235	296613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_296711_308856
887094	contig_2414_pilon	+	1143	9	Intergenic	novelGene_158448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	86.3907366272565	42	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	219	968	114191	230279	FALSE	25	TGAGAGTATGTAGCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTSQKGQGMCNCWRAHLEASFEEVENHLLHLEDLCGQCELERCKHTQSQQLENYKKNKRKELETFKAELDAEHTQKVLEMEHTQQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	79804	230454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_79906_96110_96165_96919_96971_114178_114240_147728_147862_170460_170484_219742_219899_228474_228619_230034
887095	contig_12677_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_110826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATGAGGATCCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2840	2177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2800
887096	contig_5033_pilon	+	3246	1	Intergenic	novelGene_28900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2037	2348	443271	443582	NA	25	TGGCTGCATGATCATGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCARLCPKDLKFRMTTFLFSSQNVGGGTTVVQVRATDHDIGLNSILSYYITEGNEDMTFRMDRISGEITTRPAPPDREHQSFYHLVVTVEDEGTPTLSVSHGG	441234	444480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_441200_444500
887097	contig_5033_pilon	-	4898	2	Intergenic	novelGene_28894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	778	1095	443573	443256	TRUE	15	ATTTGTTTTTGTATGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRQGRGTLVLHCDHEVVEALVLAVWRGGPCGDLATDSVHAEGHVLVALGDVVGQDAVEPNVMVGGSHLHHSGAPTHVLGGEQESGHSEFKVFGAKSSTHTYSW	444350	435974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_437645_441122
887098	contig_11417_pilon	-	1962	3	Intergenic	novelGene_103253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAGAAAGATAAGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498527	234602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_234694_394677_394799_496777
887099	contig_10003_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_88253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAAAACCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736329	737879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_736300_737900
887100	contig_6291_pilon	-	4359	1	Intergenic	novelGene_164792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3592	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGGAAGGAGAAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386818	382459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_382500_386800
887101	contig_8354_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_24094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2812	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1396	1842	184765	184319	NA	30	CAATTTCTATACATATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGTSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLICAGNAGVRWYLTVVLICISLMASDLEHFLMSVGHLNVFFGEVSVHFLCPFFNRIICLFVVEVLDFLVDYGD	186160	183943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_183900_186200
887102	contig_19378_pilon	+	2647	3	Intergenic	novelGene_73786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAACTGGGCGCGCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16025	19154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_17497_17676_18332_18633
887103	contig_5649_pilon	-	6178	34	Intergenic	novelGene_82276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1786	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	4566	4919	153515	149907	TRUE	15	ATCATTCGCTGCCCGCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGIVSKTEDLWIYKGMLNEGELAFCVFPRSIYEVYREHFHSQTSLNTINHIMKSFTVTNLKSRMVQFISYFLEIQTWVLFFENINQDFYIPCMCLCSITFIFPITPDATSRSRDTL	204633	94440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_94597_126346_126625_145420_145527_146101_146201_146614_146684_146771_146828_147491_147695_148625_148795_149783_149911_150059_150170_152881_153052_153445_153577_154086_154327_156609_156730_157503_157628_157819_157972_164097_164248_165469_165672_166772_166922_168032_168156_168449_168737_169639_169719_171510_171744_172063_172203_173116_173299_175074_175190_175537_175652_175975_176054_176223_176404_177179_177240_199918_199982_201360_201494_202871_203009_203189
887104	contig_10500_pilon	-	1820	9	Intergenic	novelGene_41234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	889.265699538108	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	174	1082	1640040	1629460	TRUE	20	TATTTCTATATTGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640213	1626410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626939_1628473_1628615_1629390_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
887105	contig_1450_pilon	+	1984	2	Intergenic	novelGene_27437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	193	504	420644	420955	TRUE	30	AACCATGATGGTGAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYSLPAGVRKASFKSGMFQEGGQSVYRKSLWILVFFPILLPTVWKVESVRLLLVAKSALPSFKHVGSCCSLFPACCSCRRSCQGPRAAGLGCRDAEKLKSNI	420451	425088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_421071_423723
887106	contig_11422_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_99095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAGTGAGGTGTTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2137	749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2100
887107	contig_3095_pilon	+	2285	5	Intergenic	novelGene_75091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	47	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	60	ATAGAACAAGCACAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	153299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
887108	contig_1516_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_50030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACGGCCACCCCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585482	583507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_583500_585500
887109	contig_10734_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_51355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1258	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTCCCCCCACGGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1782140	1779741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1779700_1782100
887110	contig_10958_pilon	+	1910	12	Intergenic	novelGene_5362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	148.039362645757	798	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	155	1825	803771	811107	FALSE	15	GCCTTGAGTTCTTGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGARRAVLPSSLRGVFRAGPRWCRCLRSPIKGRDTGLLGCEWNLYPAAKMEGPLSVFGDRSTGEAIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	803616	811192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890
887111	contig_5018_pilon	+	1415	9	Intergenic	novelGene_47181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_3	43.8290357525693	734	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	195	1304	1583103	1586783	FALSE	5	CTTCTGAGTCTGTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPSEGEAPAAALAAVLKHSSALPPESAQVRGYDFNRGVDYRALLESFGTTGFQATNFGRAVQQVNAMIEKKLEPLSQEEDQHADLTQSRRPLTGCTIFLGYTSNLISSGIRETIRYLVQHNMVDVLVTTAGGVEEDFIKCLAPTYLGEFSLRGKELRENGINRIGNLLVPNDNYCKFEDWLMPILDQMVLEQNTEGVKWTPSKMIARLGKEINNPESVYYWAQKNHIPVLSPALTDGSLGDMIFFHSYKNPGLVLDIVEDLRLINTQAIFAKRSGMIILGGGLIKHHIANANLMRNGADYVVYINTAQEFDGSDSGARPDEAVSWGKIRVDAQPVKVYADASLVFPLLVAETFAKKVDAFMPEKNED	1582908	1586894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1583310_1583877_1584043_1584265_1584388_1584469_1584567_1584644_1584732_1585207_1585314_1585397_1585502_1586484_1586611_1586687
887112	contig_6544_pilon	+	3090	5	Intergenic	novelGene_142101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	83.7167844580763	894	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	162	902	111681	113985	TRUE	20	TAGGATGGTTCCAGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFIQKFSRASSKMLRYPFTVRVTASKRIDKLLIKTSFLLFARPWHLSSFPECMSKIQCFHTSPCCFKKKRKQAELSARSPSTITYLSDSPKSAVYITLAGLVPFVAPPLVMVMTKTYIPLLAFTQMAYGASFLSFLGGVRWGFALLESRPAQPDFLNLANSIVPVVFSWFAVLISETLGEAIVTIIIGLGIALHIELFLLPHYPNWFKALRRVVTLVAFFSFVITLLLKDIYPEKGPKKPGQVV	110064	302416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_110128_111582_111723_113286_114721_300802_301668_301828
887113	contig_10009_pilon	-	6768	6	Intergenic	novelGene_82738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAATAGCAATATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77074	54421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_55301_63219_63355_68603_68814_70217_70384_71481_75992_76206
887114	contig_21208_pilon	+	2334	4	Intergenic	novelGene_175768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	48.8148429157453	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	388	1041	21563	23129	FALSE	30	GTCTATTAGCCTTACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARKGFNLQAPLILWSFCLAIFSIMGAVRTWSFMGTVLLRVGLKQSVCYSSFITHSTVKFWSSFFTFSKIIELGDTAFIILRKRPLIFVHWYHHSTVVIFTSFGYKNKMAAGGWFMTMNFGVHAVMYTYYTLKAARVNSPRMLSMLITSLQILQMFVGAMVSILTYIWRHEQGCDTTTMEQFFLSSILYSSYFILFAHFFRQAYIIPKVKNKTKSQ	20358	24422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20685_21501_21634_22289_22442_22698
887115	contig_11850_pilon	-	1462	9	Intergenic	novelGene_125190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1093.91897980381	1351	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	334	1107	186097	181211	TRUE	15	TGTATTGGCTCTTTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGGPSQNWNQGYSNYWNQGYGNYGYNSQGYGGYGGYDYTGYNNYYGYGDYSNQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	198222	179677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182405_182553_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195740_197915
887116	contig_7051_pilon	-	2957	13	Intergenic	novelGene_64333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2260	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCCCGATTGGTCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348526	321842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_330163_331794_331924_334316_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343470_344164_344222_345362_345536_346865_347950_348189
887118	contig_5033_pilon	-	2639	3	Intergenic	novelGene_28899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	315	632	443573	443256	TRUE	15	TCTATTAGCGTGATGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRQGRGTLVLHCDHEVVEALVLAVWRGGPCGDLATDSVHAEGHVLVALGDVVGQDAVEPNVMVGGSHLHHSGAPTHVLGGEQESGHSEFKVFGAKSSTHTYSW	444439	441201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_441309_441355_443764_444315
887119	contig_4730_pilon	+	3333	2	Intergenic	novelGene_71703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1594	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAACAAATCAGACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122954	126330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_123038_123080
887120	contig_3866_pilon	+	3177	13	Intergenic	novelGene_112403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1086	1415	183346	200506	TRUE	30	AACCAAATCTATTGGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINQPEEFEEIEIFIAQNRWFVDWNTSVFHKLIKLLEEVVPLFRIKFFLRLLLLLLPFWPLFPSLHHFLQPGHLHHHYWMTQGFHLYPFSNCQGQLLFLRRRLLFEALV	179905	219937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_180645_182064_182292_183051_183153_183327_183419_184713_184793_199818_199987_200496_200575_201701_201787_205906_206037_209029_209129_209213_209292_217713_217803_218724
887121	contig_10734_pilon	-	2855	4	Intergenic	novelGene_51135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATTCTACCACATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079558	852363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_853750_853802_855061_931902_932098_1079542
887122	SIRV3	-	481	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	299	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
887123	contig_6779_pilon	+	3414	3	Intergenic	novelGene_178507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTCTGTCTTAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138691	435008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6779_pilon_+_140118_324287_325303_434035
887124	contig_16103_pilon	-	492	3	Intergenic	novelGene_118673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	87.5	68	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGTCTCAGAATTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3436	164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_450_2484_2646_3390
887126	contig_21422_pilon	+	2172	15	Intergenic	novelGene_79076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	117.687496951781	22	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	146	1714	21493	38762	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSEVEKAIPDSAATTNNLPLLDGAANVAKDTYISEKTEDGSTACSLGSQYEEKVRPCIDLIDSLRTLGVEQDLALPAIAVIGDQSSGKSSVLEALSGVALPRGSGIVTRCPLVLKLKKLVHEDKWIGKVSYRDLEIDLSDPLKVEEEVNKAQNVIAGEGMGISHELINLEISSPNVPDLTLIDLPGIARVAVGNQPADIGRQIKSLIKQYIHKQETINLVVVPSNVDIATTEALSMAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKTWLCFSLTVVQS	19759	40704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_19797_19945_20029_21467_21619_24358_24552_25736_25875_27016_27172_28309_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_38723_38998_40481
887127	contig_8541_pilon	-	3521	5	Intergenic	novelGene_105583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	447.651301237917	44	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	232	870	577314	567093	TRUE	30	TTAAATTCCTATGTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKAREVTLGRLESRDSPWQNFQCRVVPPAQFRKRWNTDYLIPFSSKLTLLRKLIF	577545	547843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_564935_565360_567472_576967_577151_577237
887129	contig_6227_pilon	-	2394	2	Intergenic	novelGene_49681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATTAAATCCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866590	862095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_864396_866496
887130	contig_5020_pilon	+	1577	8	Intergenic	novelGene_27798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	881.008953138505	715	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	333	1262	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118455	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119475_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
887131	contig_7182_pilon	-	4131	5	Intergenic	novelGene_117090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	622	junction_4	190.826491871543	1853	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	902	1255	174826	92559	FALSE	20	TAGAATATTTCCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNVPADMINLRLILVSGKTKEFLFSPNDSASDIAKHVYDNWPMDWEEEQVSSPNILRLIYQGRFLHGNVTLGALKLPFGKTTVMHLVARETLPEPNSQGQRNREKTGESNCCVIL	175727	89682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347_102457_174799
887132	contig_7056_pilon	-	2733	11	Intergenic	novelGene_43674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	655	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2329	2652	801798	800996	FALSE	40	GGCTACCCAACCCCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFLISKIGLQICIWPLSMFFFIYTCLWVFVSEDEVQFIVLSTFIWTKHNCIRGLVVELILQVKFWSFRKQFHIGTTTFYSILEINLIPNFRQKRRKLHGILKTQIS	812196	800914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_801134_801612_801812_802369_802559_804874_804988_805252_805287_805343_805410_806603_806820_807439_807560_808440_808569_808731_808811_810826
887133	contig_3386_pilon	-	7501	10	Intergenic	novelGene_34555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1829	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	6344	6664	498798	494471	TRUE	15	AGGGCTGCCGCGGCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIYIHIFLTYSYLVYSSSETTAITYQLTSISLPGFCFSFGIHILESEITWEAVVQIPIKFCPMCFFQSCAKAKVRKFHMALAVQEKIVWFDVSVDESKLMNGVYG	506238	470064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476268_476403_485244_485297_486415_486539_488103_488187_491943_492072_494391_494547_497714_497820_498658_504898_505994
887134	contig_15897_pilon	+	7708	36	Intergenic	novelGene_49528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_31	158.736326102407	1270	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2102	6309	63	6371	547767	659062	FALSE	30	GTTACAACCAGTCTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEMDAMIPEREMKDFQFRALKKVRIFESPEKLPKERSSLLAVSNKYGLVFAGGASGLHIFPTKSLLIQNKPGDDPNKIVDKVQSLLVPMKFPIHHLALSCDNLTLSVCMMSSEYGSIIAFFDVRTFSNEAKQQKRPFAYHKLLKDAGGMVIDMKWNPTVASMVAVCLADGSIAVLQVTETVKVCATLPSTVAVTSVCWSPKGKQLAVGKQNGTVVQYLPTLQEKKVIPCPPFYESDHPVRVLDVLWIGTYVFTIVYAAADGTLETSPDVVMALLPKKEDKHPEIFVNFMEPCYGSCTERQHHYFLSYVEEWDLVLAASAASTEVSILARQSDQINWESWLLEDSSRAELPVTDKNDDSLPMGVAIDYTNQMEITINDEKTLPPAPVLMLLSTDGVLCPFYMINQNPGIRSLIKSPEQLSLEGERQPKSSGSTPTTPTSSQAPQKIDASAAAAPTSVPPALPTASTSTFSLPSAVGASAVFSFGSSSLKSSASVTGEPPPHSVASDNSKPTLGSGAPTFSFAPPSKTPLAPTPVASPMAPSAVSFSFGSSSFKPTLESTPVPSISMPNIGMKSSFPPSASAVKANLSEKFTAVATSAPVNSSQSTPSMLPFSPASKTGSSGSLSHPTPLSAPSSSVTLKPTVSPSAAGRSAQGSPTPAFSMVQKSPRITPPVAKSGSPQAKALQPPVSEKQGHQWKESDPVMAGIGEEIAHFQKELEELKARTSKACFQVGTSEEMKMLRTESDDLHTFLLEIKETTESLHGDISTLKTTLLEGFAGVEEAREQNERSCDSGYLHLLYKRPLDPKSEAQLQEIRRLHQYVKFAVQDVNDVLDLEWDRHLEQKKKQKRLLVPERETLFNTLANNREIINQQRKRLNHLVDSLQQLRLYNQTSQWNLPSAVPSQSSTHSFDSDLESLRNALLKTTIESHTKPLPRIPAKLSPVKQAQLRNFLAKRKTPPVRSTAPASLSRSAFLSQRYYEDLDEVSSTSSISQSLESEDVRVPCKDEDAVVQVPRHTPVVRTPSIQPSLLPQATPFAKSHLIHGSSPGVIGTSISTSANKIIPQGADSTMLATKTVKHGAPSSSHLISAPQAAAAAALRRQMASQAPAVNTLTESTLKNVPQVVNVQELKNNPTASSAAMGSSVPYSTAKAPHPVLTPVASNQAKQGSLIDSLKPSSPIPASSPLSSGDKASGPGTAKIETAVTSTPSAAGQFSKTFSFSSSGNGFNFGILASTPASNFTAAQGATPPNKESNQLDAFSFGGVGKPFYETTPESTPPSGITSSSNTAGAAVASSGEFVPSNSRLVAPSGIALSTASSKLETPSSKLGELLFPNSLAGETLGSFSGLRVGQADDSTKSASKASSTSLTSAQSTKTSTVSSGFSFTGPPVLGKHVEPPVTSSLTSTTVAPPAAASTSTSSSSTGVFGSLPLTSAGSSGVINFGGTSLSGGKASFSFGSQQTSSAVTTSVPSSATTATALPTSFPTLSLGNLLSSASTTTQPVSSGKNTEEVTSSALPEKPGSSEVVASTPSLLGQQQSAQLSQSPLQTSDSVKKEPALAQPAISNTTTAASSTSLVAPSAEATPAATRVPDVKTEAVSSASTFSVPGQTAVTTTTITSAVLVAAETSGTPTTSSTVSSIASSPATETAVFGTATSGSSVFTQPPASSSSSAFSQLTSNTATAPSATPMFGQVAASTAPSLFGQQTGNIVSTAASTPPVSSSGFGSPAFGNSATGVFGQATFGQAPAFGQPTSSPASGFSFSQSGFSSVPAFGQSISSTPTSTGGNVFGPSSSTSSSSSFSFGQSSANTGGGLFGQGNPPAFGQSPGFGQGGSVFGSTSATTTTASSTGFNFCQASGFGSSNTGSVFGQAASTGGTVFGQQSSSSSGSVFGSGNTGRGGGFFSGLGGKPSQDAANKNPFSSASGGFGSTATPNTSNLFGNSGAKTFGGFASSSFGEQKPAGTFSSGGGSVASQGFGFSTPNKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGVPAFGSAPAFTSPLGSTGGKVFGEGTAAASAGGFGFGSSSNTTSFGTLASQNAPTFGSLSQQTSGFGTQSGGFSGFGSGGGAFSFGTSNSSVQGFSGWRS	547704	660399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_547812_550494_550691_551333_551486_552335_552535_553187_553259_554492_554557_555066_555171_556819_556927_557854_557922_560634_560762_564348_564511_566822_567298_569355_569532_571150_571246_573896_573984_574189_574340_575743_575903_589819_589924_593344_593528_594235_594322_594426_594511_605092_605357_606194_606357_611557_611658_616493_616570_617944_618024_620914_621006_623330_623393_625630_627461_629321_629393_638882_639040_649837_649991_654118_654291_657390_657531_658444_658470_659028
887135	contig_2480_pilon	+	2675	2	Intergenic	novelGene_63555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	433	junction_1	0	168	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	318	1145	363853	364680	FALSE	20	TGAAATGTTTTCATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNPQLRRTQSMRDGRGALCICLAKAEGEGGAGSDRPLHGLSKRTQESADLSDIPSWVNQSVLHVNGSSPNEELSLEMKNLLREVPDLQESVRRNCASAAALSKAVALSSAPTEEQGVKVPRGVGEALVRDWLGRGPRDTDCHGDWCHKGELWLCSACLQPSGLPCYHTLNLLPLGMGIFEDEPPSAFLGISSELELPSLHSILSATLYACPEILLNDETKDLSLDCLKPMLSEQIVEYKEMLSGVKSIPDDLQVTLGLLALRALEFANLLYHS	344400	366210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_344670_363804
887136	contig_8322_pilon	+	4543	3	Intergenic	novelGene_143252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59	21	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGCAAAATAAAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298872	306704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_300750_303135_303655_304557
887137	contig_5400_pilon	-	3097	4	Intergenic	novelGene_162808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATGCTAAGGGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109955	16153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_-_16782_17550_18724_21678_22385_109365
887138	contig_19179_pilon	+	3017	1	Intergenic	novelGene_142375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32722	35739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32700_35700
887139	contig_7843_pilon	-	1143	6	Intergenic	novelGene_152014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	267.048010664749	1778	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	428	943	188122	178451	FALSE	25	GGTGTACTAAATGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKVVTNKLLLSIVILLELAILGGLVYYKFFHRH	197381	178250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_190893_190953_197022
887140	contig_753_pilon	+	4863	6	Intergenic	novelGene_112979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTTATAGCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191136	1214350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1192870_1196905_1197003_1199445_1199702_1202716_1202798_1210555_1210773_1211871
887141	contig_16666_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_61793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTATGTCACTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118871	120499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_118900_120500
887142	contig_20314_pilon	-	2471	2	Intergenic	novelGene_125637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	991	1386	7302	6907	TRUE	60	AAAAAAAAAACCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEPLRSWPYLLRRRQLGFFCSLSLQLLLPVASWPLGLMPAFALLGQVFQSSVAPLISARRHPTPPGSLLHIGTQLSRAPWVSSSAISHWTPGSAAVGSLPLPLLCCCRASAAAAPLYIHNFKTASTF	8292	5744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_6495_6571
887143	contig_15047_pilon	+	1456	6	Intergenic	novelGene_52126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	147	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	30	653	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4258_4608_4687_21013
887144	contig_9609_pilon	+	1959	9	Intergenic	novelGene_23062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	846.653965619957	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	5	1012	439509	454609	TRUE	10	TTGCTTTTTTCACATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMAMEPRPVRCCRLSLLSVYGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	439504	456205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_439567_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
887145	contig_7056_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_43678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTATTCTGTTTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812635	810598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_810600_812600
887146	contig_8462_pilon	-	4517	17	Intergenic	novelGene_159426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	501.851011257325	25	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	28	2013	245320	231564	FALSE	10	TGCACAGTCTCCTTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRNDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFSKFERGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYSRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLEEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEEPDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNVNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLESMAYEHHYKGSSRGRSKSRFSGGFGARDYRQSSGASSSGFSSSRAGSSRSGGGGHGGSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN	245347	229059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_231644_231853_231991_232351_232506_232811_232930_233055_233238_233431_233577_233656_233802_234185_234347_234449_234549_234760_234847_235892_236029_236489_236590_236676_236836_237573_237707_239551_239600_240961_241020_245275
887147	contig_20614_pilon	+	3610	4	Intergenic	novelGene_107528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1290	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63010	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_66206_67449_67601_67866_68042_68861
887148	contig_11525_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_171084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCACAGGGGAGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61766	60771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_60800_61800
887149	contig_14566_pilon	-	3347	8	Intergenic	novelGene_148840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2603	2986	68972	68589	FALSE	30	ATGTGTATGTATAGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLYLNIKKTRILTIGLISNIIINRENVKVLKDFTLLAFTTKAHGSSSQEIRQCVTLGKSAAKELFKVLKNKDVTSRTKVRLTQAMMFSIAFYECESWTKLTTNKGDQRRIDAFELRC	125250	68227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_70518_88762_88947_90602_90935_94951_95061_99198_99306_108217_108325_118468_118578_125141
887150	contig_1708_pilon	-	6445	9	Intergenic	novelGene_178224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1719	2048	323862	323533	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLTDMWDTIKSKNLQVIGIPEQGGENRKHREDY	361091	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1708_pilon_-_922_1420_2719_11306_11377_45583_46451_47281_48214_200947_201235_323510_323928_326866_327432_360003
887151	contig_17989_pilon	+	1380	7	Intergenic	novelGene_150806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1348	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCCGCGGTCCCGGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200611	206714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_201214_201519_201665_202348_202465_204529_204664_204858_205018_205678_205834_206645
887152	contig_8138_pilon	+	3534	1	Intergenic	novelGene_52505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCTCCTGTGGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464013	467547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_464000_467500
887153	contig_13301_pilon	+	1632	8	Intergenic	novelGene_153122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	389	junction_4	161.924522603614	1909	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	622	1566	171698	174444	FALSE	40	TTTGAAGAAGGAAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAILGRLVGLQQETAGGWEDFSTHDRTWHLPSLPVTVHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFSPTVSMVEGQGEKNVTFWGKMWPQCEELQGQKLVVEEKRPCLHAPACKDPNRKP	169185	174510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173087_174281
887155	contig_10345_pilon	+	1617	13	Intergenic	novelGene_158373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1383.0844354397	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1070	1369	20456	24141	FALSE	30	CTACCCGAGAATGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4396	24389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13531_14118_14233_14654_14754_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
887156	contig_2830_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_165853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1252	1650	700636	700238	NA	20	AAGGACGCACTCTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLKIENQKGRTLLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSMGKILNDAGNIKRRLKEYTGSLYQKGLVDVQPCQEVAYDQELMVLKEEVQAALKTLAKNKAVGVDRIPTEMFQQMDAELEVLTRLCQEIWKTAT	701887	699574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_699600_701900
887157	contig_15991_pilon	-	812	6	Intergenic	novelGene_70931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_5	2467.64060592299	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	77	811	105108	100941	FALSE	15	CAGACTGGTCCGAGGGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEV	106358	100939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
887158	contig_7730_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_156298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCAGCATTCATAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405069	406828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_405100_406800
887159	contig_5779_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_106435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	94343	94011	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
887160	contig_9363_pilon	-	1933	10	Intergenic	novelGene_6585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.81215433167	229	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	162	779	786587	777382	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	787927	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754167_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
887161	contig_16666_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_61791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGTCTATGTCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118802	120496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_118800_120500
887162	contig_17074_pilon	+	2273	8	Intergenic	novelGene_145105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.615424750556	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	139	747	208015	224041	FALSE	25	TTGGTATACAACCTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFCLLIKGLSLITC	207876	225567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216343_224003
887164	contig_13699_pilon	+	2850	2	Intergenic	novelGene_158341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	366	junction_1	0	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	317	370	158854	158907	FALSE	30	CCAAATCAGGTCCCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLKRPTPAFHSSRTSLAGDTSNSSSPASTGAKTNRADPKKSASRPGSRAGSRAGSRASSRRGSDASDFDLLETQSACSDTSESSTAGGQGNSRRGLNKPSKIPTMSKKTTTASPRTPGPKR	157713	161387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_157827_158650
887165	contig_5222_pilon	+	4406	4	Intergenic	novelGene_58994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	340	junction_2	194.151716162616	1854	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1639	2214	184088	188217	FALSE	20	GATTTGTATTGGAGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSEDGTYTGFIKVHLKLRRPVTVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSEVIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSVADCPLYLRLLAGPDTDVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYDKFRQKLEEALRESQGKPG	182449	190409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_184097_185448_185747_186224_186341_188064
887166	contig_15025_pilon	-	1879	8	Intergenic	novelGene_155963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_2	219.70936275369	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1842	37	1878	48018	29157	FALSE	40	GTAAGACTAAATATCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCEKWSRVAEMFLFFEDLEEDYKIRCLCTRAFVEDRILCNLGLKGYYVKGNSNNAANMLSIGDQTTEEEGGDLSRGSAETHGSKDIVLDESELDSEAELMRSMGLPLQFGGTSMHKNFEVSMNAKNKVKRKKKKHQKKYLDEIMRESWREEYDEDDILASEGPSSVEQYENTRTCKIQSGKDVETENLPVENTLSLKLEITEKWEKYWNEYGGGLLWQSWQEKHTGQTLSSEPWNFPDTKEEWEQHYSQLYWYYLEQFQYWEAQGWTFDASQSCDTDTCESQTEVDSNSDENCVKVDLISFPSSSVTISNKSSSSSDKDHNEILDRICNIILNSEEVEQNQLESSENHDGLQELSEVSSRRECPASGQSEPCDGGTKKSNMTRTRNTNPPAQDSQESSGANTSKERPHTNDIDGDESEEDPPECKPTKLKRSHELDIDENPHSDFDENGCLLGFKHGSGQKYGGISSISHRRVKYLEKNMKRKSKFLDLRRRIDTKNKQIFTEESEKQFCKKSKTLSKVEKFLKWVNEQMDEETSKESFSHNDTQDTCTSSGSEEQVSVTQGDSPFETSNREPDKCHTVYSPGEFETEKNGDSVVATVTEEQEKPDSLQVENE	48054	29155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_29442_32002_32175_34737_34825_36289_36408_38284_39105_39446_39638_41248_41314_47914
887167	contig_16228_pilon	+	2858	6	Intergenic	novelGene_147921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	265.849130147157	35	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	66	1010	47816	74763	FALSE	30	TAGCACAGGGACTTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQLCPPKYVLEY	47750	76611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71775_74730
887168	contig_15327_pilon	-	2888	4	Intergenic	novelGene_70621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	17	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	25	AGACTCTTGATCTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	898557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
887169	contig_6954_pilon	-	1739	2	Intergenic	novelGene_64462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_1	0	896	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	134	1114	787255	783979	FALSE	10	CTAGTCTTGACTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVSVPQREPLVLGGRLAPLGFSARGYFGALPMVTTAPPPLPRIPDPRALPPTLFFPHFLGGDGPCLTPQRRATAPLTNCSFATAGGTPRAAPKKRRKKKVRASPAGQLPSRFHQYQQHRPSLEGGRSPATSQSGAHEVPGQAAAAAPAPAAATRTEETSPVLGPLPPAVPGQPSLRKEVLKSKMGKSEKIAIPHGQLVHGIHLYEPKINRQKNKYNLPLTKITSAKRNENNFWQDSVSSDKTQKQEKKPFKNTENIKNMHLKKSAFLTEVSQKENYAGAKFSDPPSPSVLPKPPSHWMGSTVENSNQNRELMAVHLKTLLKVQT	787388	783353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_784420_786715
887170	contig_5967_pilon	-	3026	4	Intergenic	novelGene_44368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	841	junction_3	304.357611298872	13	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1472	2014	412501	388566	FALSE	35	CAACAAATGTTTTACTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	413972	387553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498
887171	contig_13224_pilon	+	7318	10	Intergenic	novelGene_104093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	336.570943487402	2276	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	1345	2454	242339	253800	TRUE	10	ATCTTCTCTCTGGTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEDIRLEPDLYEACKSDIKNYCSTVQYGNAQIIECLKENKKQLSTRCHQKVFKLQETEMMDPELDYTLMRVCKQMIKRFCPEADSKTMLQCLKQNKNSELMDPKCKQMITKRQITQNTDYRLNPVLRKACKADIPKFCHGILTKAKDDSELEGQVISCLKLRYADQRLSPDCEDQIRIIIQESALDYRLDPQLQLHCSEEISSLCAEEAAAQEQTGQVEECLKVNLLKIKTELCKKEVLNMLKESKADIFVDPVLHTACALDIKHHCAAITPGRGRQMSCLMEALEDKRVRLQPECKKRLNDRIEMWSYAAKVAPADGFSDLAMQVMTSPSKNYILSVISGSICILFLIGLMCGRITKRVTRELKDR	240994	258709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_242438_245181_245320_246693_246818_247551_247695_247891_247994_249058_249167_250729_250851_251509_251617_253632_257745_257789
887172	contig_11574_pilon	-	2331	1	Intergenic	novelGene_64118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAATTTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839172	836841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_836800_839200
887173	contig_9272_pilon	-	6074	7	Intergenic	novelGene_125893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	798	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	123	431	281027	280719	TRUE	25	TTCATACATGCTGATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNRLYRNSHDEMCRSGTVNTKEPRRWLIFQPTALCFGIFFPQNFHTTDRHLDQPSKLWWKCAVQKRPWRNKSPEAMKIRNRLSESSTWYIDMFCGGGCGPR	281149	251396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_251829_262340_262412_262749_262912_267893_268047_269662_270179_272084_272214_276538
887174	contig_678_pilon	-	2953	1	Intergenic	novelGene_167796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1727	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGATGGCATTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47337	44384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_44400_47300
887175	contig_2703_pilon	-	4330	11	Intergenic	novelGene_101770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	223	696	612160	611557	TRUE	40	TTTTTAAAGATAAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKHQRPSVKEVVSGMGNVASSKSLSWVHCVYADVAKKVQHSGTNIQAEMRLKSICAHTHTHTARQDGKAKLNQFEAIYFGVAGIEKEKNVPFFFFFAKSDAAPGQTWLQVSLNSTPPGQSGANLSLSFLCKGDPRYLLVLGGEEELSTLSSAEKC	612382	593949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_594672_596349_597818_599670_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754_611750_611879
887176	contig_12625_pilon	+	4266	10	Intergenic	novelGene_140478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_4	390.305515028584	958	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	345	1589	15248	30623	FALSE	40	AAGTGTAGCAAATATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQTNTTGSNVTTSSAPNSNSTSGSATSSPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTSNFSELQSQMQRQLMSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALSTGGSSGTNGSSSAPSENTSPSAGTTETGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS	7474	33300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_7629_9288_9405_15173_15437_15913_16073_16678_16914_23321_23465_27153_27238_28478_28595_28844_29011_30470
887177	contig_1132_pilon	-	7199	7	Intergenic	novelGene_178508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	106	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	6501	6818	213150	212833	FALSE	10	CGTTCCTCAACTCTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLLNGQSSVKCHKPATSQLKQLKLDFPYIPCCIAVMRAYAIDMGPHKSLQGERYSKSVDPLCLCLGKGIVPTLGSWLRGAGSFFSPCLLICSLSKAGRMALGV	278259	212451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1132_pilon_-_213279_216161_217323_222016_223419_273351_273649_274249_276552_276737_277169_277480
887179	contig_6102_pilon	+	1449	5	Intergenic	novelGene_31839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.906371583389	45	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	89	400	370803	393756	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKWAGPP	370714	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371093_393734_393856_393929_394036_394221_394272_394467
887180	SIRV5	+	2687	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-36	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	508	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCGACCATGTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8279	13601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12745_12891
887181	contig_5961_pilon	-	6590	2	Intergenic	novelGene_144125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	5788	6360	136773	136201	FALSE	40	AGTCTAGCATCAATCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDEAPNKALLKKNKMGGLTPPDFRAYYTVMVVKTAWYWYNNRYKDQCNRTANPDINSPTYEELIFDKGPKSVNWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDSYRTPCTTMNSKWIKDLNIKSKTIKIMEENIGTMLGTLIHGTNSTQTISNNAQAPEERLDNWELLKSNTYAHQKTSPKESKDNLQTGKKF	226906	135970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_139564_223909
887182	contig_3975_pilon	-	3949	12	Intergenic	novelGene_54735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	366.922357630229	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	128	1420	1730785	1719543	FALSE	40	GTATATGATGTGACACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREWFWPHEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1730912	1717013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1730754
887183	contig_12864_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_76456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTACAAGTTGTGCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329047	327636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_327600_329000
887184	contig_4426_pilon	-	4474	6	Intergenic	novelGene_15411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1462	4386	87	4472	904546	818261	FALSE	25	TGTCCCAGCAGATGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYIKSEKGKNKEKDREVDKRERSRDKESANVTNSKHLQEEKKSSVADGSKAQHEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNSLLKLKSEADKPKPKSLPAPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENT	904632	818258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
887185	contig_4876_pilon	-	2079	6	Intergenic	novelGene_137915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	123.457847057204	58	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	241	774	654022	625920	TRUE	80	AGTAAAAAAAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLGPPPAYSPSNGDFTFVSSADAEDLSGSIPSPDVRLNLGGDFSKESTATAFLRQRGYGWLLEVEDDDPEDNKPLLEELDIDLKDIYYKIRCVLMPVPSLGFNRQVVRDNPDFWGPLAVVLFFSMISLYGQFRVVSWIITIWIFGSLTIFLLARVLGGEPLYFWWLDHLKWCLHL	654262	622377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_623681_625917_625971_629225_629304_631881_632054_633366_633521_653943
887186	contig_5686_pilon	-	6436	5	Intergenic	novelGene_45416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAAAACATACACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204580	186577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189096_198548_198595_199758_199883_200408_201400_201823
887187	contig_6707_pilon	-	4545	6	Intergenic	novelGene_167032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1287	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2590	2889	189818	189519	TRUE	65	GGAAAAATTTTAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMARRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPCKTKWD	229433	79407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_80649_189103_190049_225693_226258_226784_227106_227690_227791_228059
887188	contig_5794_pilon	-	3776	3	Intergenic	novelGene_69761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGCACTCGCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734488	695402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_695549_730264_732168_732761
887189	contig_10307_pilon	+	2330	2	Intergenic	novelGene_170275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	336	junction_1	0	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	501	1817	389628	392058	FALSE	15	AGTTGTGAGTGTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	389127	392571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_390382_391495
887190	contig_15821_pilon	+	2222	3	Intergenic	novelGene_25016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTCAAATTGAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92922	125537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_93480_95886_96363_124348
887191	contig_9297_pilon	+	2454	9	Intergenic	novelGene_69877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	321.87953880295	2177	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	151	2115	909195	912790	FALSE	25	ATTTACACTGGTCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908961	913129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
887192	contig_2596_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_53525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATGTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062236	1064569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1062200_1064600
887194	contig_4442_pilon	+	1657	4	Intergenic	novelGene_127957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_2	199.178869919031	1209	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGCTCTTGTCATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348480	1356861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_1348705_1349832_1349874_1353102_1353231_1355597
887195	contig_7608_pilon	-	3937	3	Intergenic	novelGene_178509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	3308	3727	82708	82051	FALSE	30	TCACCATGACCAAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVNKSNSWFFEKVKKMDKPLAKLTKEKQERKQITRIRNETGGITTDPTEIKRIITEYYEKLYFNKFGNVEEMDKFLETQMDKFLETHYLPKLTQTEVQQLNKPMTKEEIEKEIKKCPTKKARSRTVSLENSTKFSEKS	121925	81840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7608_pilon_-_82466_82703_83964_119873
887196	contig_16098_pilon	-	4265	2	Intergenic	novelGene_46244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_1	0	1751	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	103	1464	830479	829118	FALSE	70	AGAAAAATATTAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQPHEELEQPGPSSVPLASTLQSCQLNWSQTRLMPVAIEMALLLLLLGGFWVQEVITESQTAMETLQTPTSLDNVSSIPVTLNLNSMTSDAMKISSTGDQPPSSTSSIANEKVTSFGTSTGVNTVPLALELTTFQEVSTKNLLMLTETSNATSDPVIPLKINSLESHTRSSRTITSSLETSSVTSGPPVTKATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSLKISTMITSETSKNTITEFSSHSEQGRGGNLLVVVLVILLVVAVLVALLVLWCRRQKHRTGALTLSTGGKHNKMVDAWAGPAQVPDEEVVTETVGGSGSDKGSGAPDREGSGRRSTLTTFFGRRKSRQGSLALEELEIGSAPSSKGEEEPLVDSKAGAVEAPTSDGPEVRDGNASQCL	830990	826316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_830496_830904
887197	contig_3095_pilon	+	4888	9	Intergenic	novelGene_75156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1956.85287834829	239	119	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	49	816	220513	226800	TRUE	45	AGTAAAAACCTATGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220464	255574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_244376_247386_247857_247967_248287_248759_253535_253805_255383
887198	contig_2377_pilon	+	1269	7	Intergenic	novelGene_67898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_5	808.750768503842	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4	369	197521	217214	TRUE	30	TTGTACCCAAACCATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEGERAKKAIKEGRETYKRGGG	197517	225033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_217152_217225_222879_222956_224219
887199	contig_9759_pilon	-	5172	3	Intergenic	novelGene_167229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46	230	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	208	1125	98155	97238	FALSE	25	GTTAATTGTAATCTTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRDENTRSTNRVLRISQLDALELNKALEQLVWSQFTQCFHGFKPGLLARFEPEVKAFLWVFLWRFTIYSKNATVGQSVLNIQYKNDFSPNLSYQPPSENQKLWYAICTVGGKWLEERRYDLFRNPHLTSFWKIQQCVNVVIGLLKLGELINFLVFLQRGKFATLTERLLGICSVFCKPQNMREVGFEYMNRELLWHGFAEFLIFLLPLINIQKLKARLSSWCIPLTGAPNSDNTLATSGRECSLCGEWPVMPHTIGCEHIFCYYCIKSSFLFDMYFTCPKCGTEVHSLQPLKSGIEMSEVNAV	123327	93190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_98173_99886_100002_123252
887200	contig_9538_pilon	+	566	1	Intergenic	novelGene_176445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGAGCGGGTCGCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26183	26749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_26200_26700
887201	contig_13700_pilon	-	1750	8	Intergenic	novelGene_68281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	443.174172237931	7	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	193	513	163598	123004	TRUE	60	CAAGAAAAAGAAGCCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKDKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKVQNFPVGKEEI	163790	112579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_112642_117817_117894_118876_118973_121767_121824_122056_123164_132820_132924_163213_163239_163565
887202	contig_5961_pilon	+	4472	17	Intergenic	novelGene_144135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	472.323177066032	19	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	999	3000	231	3230	170241	214246	TRUE	30	GGACCTTTACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTELELLLLSTIILRSSLLFSTRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	170010	311201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060_214260_267703_268559_310827
887203	contig_16411_pilon	+	4415	16	Intergenic	novelGene_77324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1564.08072255452	6	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	239	1789	149037	241060	TRUE	40	CAAACTCGTGAAATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKLVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVSPLRAH	147895	243775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_148054_148956_149052_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241039_242861_242949
887204	contig_15105_pilon	+	4609	10	Intergenic	novelGene_150971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_6	564.126944824073	52	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	44	1309	607485	627498	FALSE	15	TGTGACTTCATTTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIPTLPALSAGVRGMALFFYSHACNRICKSMGLTPFDLSPKERDTVNQSTKLLQSAKTILRGTEEKCGSPRVRTLSGSRPPLLLRLSENSGDENMSDVTFDSLPSSPSSATPHSQKLDNLHWPVFCDLDNLAHRDHDHLDNHRDSENSGDSGYPSEKRGELDDPEPQEHGHSNGNRRYESDEDSLGSSGRVCVEQWNLLNSSRLHLSRPSAVALEVQRLNALDLEKKIGKSILGKVHLAMVRYHEGGRFCEKDEEWDRESAVFHLEHAADLGELEAIVGLGLMYSQLPHHILADVSLKETEENKTKGFDYLLKAAEAGDRQSMIVVARAFDSGQNLSPDRSRDWSEALHWYNTALETTDCDEGGEYDGMQDEPRYMLLAREAEMLFTGGCGLEKDLQRSGDLYTEAAEAAMEAMKGRLANQYYQKAEEAWAQMEE	607441	630798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_607602_608359_608562_610214_610283_613679_613758_614572_614636_617328_617464_617625_617815_619244_619370_621244_621424_627388
887205	contig_8594_pilon	+	1703	3	Intergenic	novelGene_140005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_1	103.5	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1653	49	1701	82939	126282	FALSE	45	TAAGCTAACACAAATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHGVDHWISKQGQKLEMMLEQKLALLSRNLREKTTIAVTSRGYYGLEDEKGTACTSTRRRSTPRSLAGLTSGVFESVMVQVLRQKEQLRAKEEKRLREQERKEAEEASQKEIEEWERKLLAQAAPTCMETMWEIPAIGHFLCLAQQILNLPEIVFYELERCLLMPQCNAFLSKIMTSLLSPPHRRPTLHRRPTLPYRTWEAALRQKVQQWYTAVGQTENPDSCAEKLGLCPQFFKVLGEVNPLEEKPFHELPFYQKVWLLKGLCDFVYETQKEVQDAVLGQPIHECREVILGYDYLENAYVHFPQFCGADVRIYKQRPFQAPEFPIPPIKIQRVPRIKLEKLKCDYVNASNGEHRCSREGLPPAFKKEQGINFDPACCPAKMILDNHDISAEMEVKSNCEIRIRRPCEIKKTDCCKENLEKPGSPGEVTGFGEPLSPGEIRFIENQEKFGEASRVKPEPSPLKENALKSCQIHVNGSHSDYPEMNCHKVVRDLLLEQSLQSHKKLKLTKMRAKKKKKKKKKLKDVLNENLQRKREGLHSLAFKSYKPEIQNKLLIIKKKAKHKKHKS	82890	126284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_82974_106425_106627_124865
887206	contig_13863_pilon	+	1719	17	Intergenic	novelGene_41992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	497.731604381317	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	188	1609	55383	81541	FALSE	30	TAGTAAACTTGGTAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSRCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	55099	81651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64682_70300_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
887207	contig_7457_pilon	-	2327	5	Intergenic	novelGene_31619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	101.396498953366	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	176	1255	960838	956489	FALSE	10	CTAGCTGTGTGCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDNIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAQQDVVKKSYCKAFTLTISALFVTPRTTGARVELNEQELLLWPNDVDKLSPSDSLSRGSRAHITLGCANDVEAVQTGIDLLEIVRQEKAGSRGEEVGELHRGKLYSLGNGRWMLNLAKKMEVRAIFTGYYGKGKLVPTHSSRKGGTLQSCTIV	962726	955416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958234_958375_960225_960558_960680_960891_962603
887208	contig_12671_pilon	+	3685	5	Intergenic	novelGene_19225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	543.807123436242	68	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTAAGAGTATGTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197272	215658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_203720_203791_210609_210724_211053_211113_212286
887209	contig_5027_pilon	+	3704	4	Intergenic	novelGene_178510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	2697	3224	197144	197671	FALSE	20	ACTTATTTTCTGTTAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYIDQEVVVQTQQRDIVCFKVRKGVCQGCIFSSYLFNLYAEQIIQKAGLYEEGGIRIGGGVINNLHYADVTTLLAEKEEDLKHLLIKIKDYSLQSGLHLNIKQTKILTTGPISNIMINREKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRHIALGKRAAKKPLNC	81480	198151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5027_pilon_+_82136_128167_128674_188181_189623_197049
887210	contig_6795_pilon	-	2441	5	Intergenic	novelGene_27755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	741.177610293241	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	30	491	396012	387222	TRUE	25	CAATTGTCTGATGCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKVKSGIRQMRLFSQDECAKIEARIDEVVSRAEKGLYNEHTVDRAPLRNKYFFGEGYTYGAQLQKRGPGQERLYPPGDVDEIPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHLLRLQVPVQAYPGVRTCAFPACAQGERDCAQWIRC	396041	372304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_374033_374891_375048_387155_387237_395515_395610_395659
887211	contig_3817_pilon	-	5616	2	Intergenic	novelGene_78277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1939	2538	65519	64920	TRUE	40	CTTCACCTGAAGTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNQTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	67457	59145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_61120_63815
887212	contig_11986_pilon	+	3672	1	Intergenic	novelGene_69226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	2132	2554	770078	770500	NA	30	GCATAAAGTGTTTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWRILRKLETEIPYDPAIPPLGIYSREIRAVTQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYCATRKNNSESVKHLIAWMKLQDTMLSEIITNEQILYETSIVKTHKKVYTQKVTIFVG	767946	771618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_767900_771600
887214	contig_5918_pilon	+	2845	2	Intergenic	novelGene_99508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGTAAAGAAAATATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421396	439932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_422629_438319
887215	contig_16148_pilon	-	3467	12	Intergenic	novelGene_50350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_11	427.295183162318	724	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	1253	2674	111433	59018	FALSE	25	AGAAAATTGTCTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153212	58224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
887216	contig_9708_pilon	-	1615	3	Intergenic	novelGene_67251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	13	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	40136	24642	TRUE	80	AAAGCAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSGSWLLAGFLVAGVGTAWSSGSTSSCLPFFHRTLQNEAPTCLKSSFPEVVPETRIFVPVTSSGSTPRRTYEGTGRRREEKDEAKQVWEPGRGPASLQPGCEFHSEFVQTQGKAAGLS	40136	19686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_20429_24128_24943_40077
887217	contig_16492_pilon	+	3379	6	Intergenic	novelGene_100319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.495685556473	2584	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	562	1533	192139	195226	FALSE	35	CAGAAAGTTGAGAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPQLPTRPPGYLRFPIHSTTHTVGVGVCTSIDSNHCKGQESRLRQDFPRASGFGQIELNEPIAASFQLPLDPRPSILLGKGGTRCQRTGSGQQETRLVVATGLWPWRKT	189477	197072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_189906_192005_192228_193409_193544_194014_194104_194433_194769_194901
887218	contig_5643_pilon	-	2731	9	Intergenic	novelGene_38717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_1	180.04231273509	300	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1154	2191	36806	31788	FALSE	25	AAACTCTGCTCCTGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	38483	31247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461
887219	contig_4180_pilon	+	3170	10	Intergenic	novelGene_8295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	130.570070115155	982	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	296	1639	733322	821915	FALSE	35	TTAAAGGTACAGTGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733026	823446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
887220	contig_6079_pilon	+	2218	1	Intergenic	novelGene_160116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1495	1794	498924	499223	NA	35	AAAGATGGTCATTTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTASWCPATTTDYSDRDHKRGFWTELKKDVEQNSNTQKKHQIYWPKGDWGNPENMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIGQPHKTKQD	497429	499647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_497400_499600
887221	contig_2161_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_114948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	837	1196	956354	955995	NA	15	GAGCAGAGCGCGTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQQQRTYSSRTRRPVRDGAGADPRSERAECVCNGGFLAEWGASTHLLVELGLLTHGAREVSACVQEASCQSGVPPGIYTGGDTELWNTCPSRADVGLRAEGLEAIGSRS	957190	955149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_955100_957200
887222	contig_5910_pilon	+	3346	2	Intergenic	novelGene_168424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1156	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	630	1232	158190	158792	TRUE	15	CACTGCCGACGCGGACGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYRLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFLKMIWRFLRRLEIDIPFDPAIPLLGIYSREIRIVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCPPTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNESVKHLITWITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	157560	202118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_160776_201987
887223	contig_3727_pilon	-	4802	4	Intergenic	novelGene_146730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	965	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2261	2800	297316	296777	TRUE	20	TTCACAGCCCGCACTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	299863	5142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_6351_255213_255979_296747_298580_298866
887225	contig_5686_pilon	+	3304	1	Intergenic	novelGene_45455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGCAAGCTGTACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220468	223772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_220500_223800
887226	contig_7629_pilon	+	3714	5	Intergenic	novelGene_153554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	85.232036230516	16	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	116	541	225941	229873	FALSE	35	TCACATTAATACCCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPFWSMSTSSVRKRSDGEEKTLTGDVKTSPPRTAPKKQLPSIPKNALPITKPTSPAPAAQSTNGTHASYGPFYLEYSLLAEFTLVVKQKLPGVYVQPSYRSALMWFGVIFIRHGLYQDGVFKFTVYIPDNYPDGDCPVSR	223244	233046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_223290_225870_225983_227159_227366_229608_229674_229760
887227	contig_10331_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_54213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	254	765	617	1381	1188538	1189302	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIYSFFCSFYFFVFSVARTARKRKPSPEPEGEVGPPKINGEAQPWLSTSTEGLKIPMTPTSSFVSPPPPTASPHSNRTTPPEAAQNGQSPMAALILVADNAGGSHASKDANQVHSTTRRNSSSPPSPSSMNQRRLGPRDVGGQGAGSTGGLEPVHPASLPDSSLAASAPLCCTLCHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRQSIKQQGASGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDS	1187921	1189657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1187900_1189700
887228	contig_10953_pilon	+	2747	7	Intergenic	novelGene_42576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4307	junction_6	14096.2444693219	161	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	87	674	455261	463828	FALSE	20	TGCACTGGAACTTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455174	465901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817
887229	contig_7066_pilon	-	3123	3	Intergenic	novelGene_42143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	5.5	6656	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGACTTGCTGAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757861	746977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749885_750340_750424_757728
887230	contig_546_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_117191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTCCAGCTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64243	67044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_64200_67000
887231	contig_1725_pilon	+	1300	7	Intergenic	novelGene_24289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	959.443762465176	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	251	979	207418	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPGKAPADQHPRHRGRGECGRAEEGLQPALALHVGQGPQRGHPPRLLLRAGAHGARPPGGALDPHAAVLLRKRVYYLSLEFYMGRTLQNTKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201492	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201713_207387_207440_249036_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
887232	contig_14556_pilon	-	2919	7	Intergenic	novelGene_138531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_6	169.32972437099	2522	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	64	672	191054	168747	FALSE	50	AAAGAAAAATCAAGGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAAPLPPAAEPPACPQPAGAMETALLSFCNWSTLGVCAALKLPQISAVLAARSARGISLPSLLLELAGFLVFLRYQHYYGYPLLTYLEYPILIAQDIILLLCVFHFNGNVKQAAPYMAVFLSSWFILTLQKWIIDLAMNLCTFISAASKFAQLQYLWKTRDSGAVSALTWSLSSYTCATRIITTLITTSDLTILIRFMIMLAFNIWVTATVLRFRKTTVKAE	191117	166499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_168839_170621_170664_173269_173391_182394_182453_183775_183846_183924_184008_190911
887233	contig_7396_pilon	-	1948	14	Intergenic	novelGene_79608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3236.91810653318	55	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	124	1440	255163	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257477	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
887234	contig_2636_pilon	+	3423	1	Intergenic	novelGene_52096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72408	75831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_72400_75800
887235	contig_11846_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_105950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAACATGGGAAGCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282640	285406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_282600_285400
887236	contig_16098_pilon	-	2122	2	Intergenic	novelGene_46253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	18	482	830479	828094	FALSE	50	AAAGACTTGAAGGAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQTRLMPVAIEMALLLLLLGGFWVQEVITESQTAMETLQTPTSLDNVSSIPVTLNLNSMTSDAMKISSTGDQPPSSTSSIANEKVTSFGTSTGVNTVPLALELTTFQEVSTKNLLMLTETSNATSDPVIPLKINSSSSQPLYPFLKASFTATHVHRGRG	830496	826453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_828169_830089
887237	contig_408_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_84902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATTTCCAGCTGCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131316	133661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_131300_133700
887238	contig_3509_pilon	-	6778	8	Intergenic	novelGene_160698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12112	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1866	2600	191641	190907	TRUE	55	AGTAAGAATAACAGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQHTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPMEKNALELLDRKLKSLILRILQEIRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETLEDRISGIEDKHFDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVKWDTIKSKNFRVTGIPEQGEKTENTERINEELLKENFPNIMKDEKLASQEAQRTPYRREPKRKSPRHIIITLNKTKDKES	364191	8708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_9368_10507_11727_27100_27682_81502_81505_185749_186558_189997_191779_362166_363489_363785
887239	contig_6533_pilon	-	4008	4	Intergenic	novelGene_114626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3380	3685	56109	55804	TRUE	30	TCTAGCCAAGCTGATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNATVNQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRINHMLGHKASLNKILNIEILQSIFSEHKAIKVEINNRKRKKKIKHMETEQYLAQKLLGYRRN	70698	53966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_54282_55795_56831_67974_68150_68215
887240	contig_8322_pilon	+	3453	3	Intergenic	novelGene_143255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_2	88	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGAAAGCCTCATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299890	305866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_301875_303494_303655_304557
887241	SIRV6	+	1071	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	16	76	16	-76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTTGCGACAGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2488	11614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
887242	contig_504_pilon	-	3561	11	Intergenic	novelGene_54430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1053	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCCTTTTCTCCCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239078	219679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_219820_222773_222959_227466_227652_228468_228552_230989_231052_231900_231950_232809_232967_234124_234186_234983_235106_236050_236134_236644
887243	contig_14441_pilon	+	1047	5	Intergenic	novelGene_100510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	490.315395944284	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	459	1007	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	108171	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_108519_108639_125517_125902_126159_126283_126514
887244	contig_3424_pilon	+	2063	12	Intergenic	novelGene_55529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	758.52685630473	157	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	261	1331	276289	331654	FALSE	25	CTGAATCAAGGTTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRNKIISIFSGTEKGSRKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPVLNTKGSETSTVVTEEDDDDEEAAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSNVDSGAKPSDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLPARVQIMNTGGLDVLQCIEGTSRALYPVIP	249098	332386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_249338_276267_276476_309784_309886_310236_310385_312001_312034_313038_313147_314560_314694_315892_315957_317097_317147_317632_317746_318973_319017_331561
887245	contig_5794_pilon	-	2696	8	Intergenic	novelGene_69789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2206.65971596003	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	31	615	749501	743905	TRUE	25	TCAAGTTCTTTTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGRGESGLKMEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGE	749531	741639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743909_746400_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749495
887246	contig_5423_pilon	-	2563	10	Intergenic	novelGene_85276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_9	171.990309804555	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	27	1373	577004	558772	FALSE	50	AAAAAGCCTCATTGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	577030	557581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172_574294_576973
887248	contig_9982_pilon	+	3011	16	Intergenic	novelGene_55742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.065951618515	3	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	1446	2723	327980	338345	FALSE	20	CTCCAGAGACTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	311735	338633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_312019_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324356_324511_324996_325076_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
887249	contig_19179_pilon	+	3042	1	Intergenic	novelGene_142373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32699	35741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32700_35700
887250	contig_11258_pilon	+	2841	9	Intergenic	novelGene_67767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	203.61360465352	158	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	43	933	278958	289530	TRUE	45	ACAGCAAAGAATGTATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERVNKAACEYALGGRKQCFGAKKSRSVSWKFGPPFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKCALLLNCSPASTRLP	278915	293770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_289483_289961_291348_291387_291794_291915_292450
887252	contig_18592_pilon	-	3252	2	Intergenic	novelGene_114774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2399	junction_1	0	4753	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTGTATGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15662	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1645_12737
887253	contig_18511_pilon	-	1637	9	Intergenic	novelGene_126871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGTCTGCCAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59254	35400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_35548_47346_47559_48080_48209_49185_49303_51676_51874_52222_52462_55272_55552_56903_57117_59149
887254	contig_5229_pilon	+	2418	5	Intergenic	novelGene_117688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	70.0339203529261	504	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	116	934	466703	472935	FALSE	30	GCTTTTTTAATGTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFPPLLLATSLLGLVLLALLLYLWHRSQHWYLIIWNELVVQPVRNMLMGDSKEQRILRYVQQHAQSGDPQSVLNAIDTYCSQKEWAMNVGDEKGLIVDEVVRERNPMVLLELGAYCGYSAVRMARLLPHGSHLLTIELNPAFAAITQQMVDFAGLQDKVTVLVGASQDIIPQLKKKHDIDKLDMVFLDHWKDRYLPDTLLLEECGLLQKGTVLLADNVICPGAPDFLAHVRGSDRFECTHYPAHLEYRQMVDGLEKAIYVGPGLGGPAQP	455042	474419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_455158_466702_466989_468072_468267_468592_468725_472728
887255	contig_10958_pilon	+	1945	11	Intergenic	novelGene_5369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_10	125.71777917224	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	249	1853	804900	811107	FALSE	10	GTTCTTGTGAAGGTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	804651	811199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890
887256	contig_20753_pilon	-	4553	1	Intergenic	novelGene_168257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1370	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3265	3588	66397	66074	NA	30	TGTAACACATGGAGTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTRDPKSWAGNSIPCIFQHCLNARGNRDLRLQCKKKAYQPFSQLGIENKWQSLPPGCTGAEILVQRRSWGVPPIPPSLNCLPSEKTRGIGTSKKGTLSLCAAGPLE	69661	65108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_65100_69700
887257	contig_7749_pilon	-	2313	6	Intergenic	novelGene_170869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	31	junction_2	428.681420171204	1289	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	142	1053	43942	22029	FALSE	45	GAAAGACAGACACATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGKAKEEGSWKKFIWNSEKKEFLGRTGGSWFKILLFYVIFYGCLAGIFIGTIQVMLLTISDFRPTYQDRVAPPGLTQIPQIQKTEISFRPLDPKSYEAYVLNIVRFLDKYKDSAQKDEMIFEDCGNVPSDIKERGEYNNERGERKVCRFKLEWLGNCSGLNDESFGYKEGKPCVIIKLNRVLGFKPKPPKNESLEAYPMMKYSPYVLPVQCTGKRDEDKDKIGNVEYFGLGGYPGFPLQYYPYYGKLLQPKYLQPLLAVQFTNLTMDTEIRIECKAYGENIGYSEKDRFQGRFDVKIEVKS	44083	20768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_22293_23465_23547_25444_25630_27369_27526_39130_39260_43845
887258	contig_5423_pilon	-	2624	10	Intergenic	novelGene_85279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_9	171.990309804555	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	45	1439	577052	558772	FALSE	40	ATGTAAAAAAGCCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDKGLVFILRPEQSMCTWYLEAADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	577096	557586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172_574294_576973
887259	contig_12689_pilon	-	2189	2	Intergenic	novelGene_145031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1639	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	41	370	42781	42452	TRUE	5	TCTAGCTTTCTCTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGHWYPRPEITWQMRKAHQLRLNLGLASRRSHCKGGIMTPGWGGGRHLSYHLGHCLCLGLRPFTISKGLVCLPLSLWLPVPLTVCAHRKMHLQGGVHRNVSAGFLVGPETAWTHLRVSSRKP	42821	40585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_41603_41649
887260	contig_7963_pilon	-	1096	5	Intergenic	novelGene_58377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCAAGAGCTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63259	51373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_51531_56716_56970_57284_57563_57781_57934_63003
887261	contig_5643_pilon	+	1279	12	Intergenic	novelGene_38805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	68	1069	233973	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
887262	contig_11986_pilon	-	2836	1	Intergenic	novelGene_69230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAAGAGTTCTGATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772892	770056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_770100_772900
887263	contig_14621_pilon	-	1993	14	Intergenic	novelGene_105862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	135.962925681096	10	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	961	1704	431670	396356	FALSE	25	TATTTCTATTATGAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGTTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	461993	396066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405217_413523_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_461683
887264	contig_9733_pilon	+	5929	6	Intergenic	novelGene_160572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	267.685935379504	438	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	122	727	6678	13736	FALSE	55	AACAGAAAATGAGAGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASERWSMLRSYRQMSIISLSMNSECNTPSKPTLESFNLELAAPKTPKAEQEELFSPGSTLPEVKLRRSKKRSKRGSVVFADEKAAAELELKRLSRKHEFMSDTNLSEHAAIPARTSVLSEMSFASQSMPTIPGLTFSVAGGPGLDEVSTSSRLSQTFLHLLDGDKKTLKRKKVNQFFKTMLTSKSTEEGKQIPDFLPTDL	6556	18938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_6695_7632_7723_9171_9344_10827_10949_12534_12678_13673
887265	contig_10016_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_117868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTACTTTCAGATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405583	407945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_405600_407900
887267	contig_5229_pilon	+	1454	5	Intergenic	novelGene_117687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	71.4190975860099	630	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	137	955	466703	472935	FALSE	25	GATTGACTTAGTACTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFPPLLLATSLLGLVLLALLLYLWHRSQHWYLIIWNELVVQPVRNMLMGDSKEQRILRYVQQHAQSGDPQSVLNAIDTYCSQKEWAMNVGDEKGLIVDEVVRERNPMVLLELGAYCGYSAVRMARLLPHGSHLLTIELNPAFAAITQQMVDFAGLQDKVTVLVGASQDIIPQLKKKHDIDKLDMVFLDHWKDRYLPDTLLLEECGLLQKGTVLLADNVICPGAPDFLAHVRGSDRFECTHYPAHLEYRQMVDGLEKAIYVGPGLGGPAQP	454650	473434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_454787_466702_466989_468072_468267_468592_468725_472728
887268	contig_7182_pilon	-	1105	5	Intergenic	novelGene_117147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1309.87413517483	637	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	107	643	889318	887056	FALSE	10	TTAGTACTGTTGTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891366	886593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887152_888199_888345_888814_888961_889168_889333_891274
887269	contig_8354_pilon	-	3507	1	Intergenic	novelGene_24143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACAGCCTTGTCCGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538316	534809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_534800_538300
887270	contig_14925_pilon	-	1803	5	Intergenic	novelGene_55280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_4	926.772996747316	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	120	620	121339	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNPLLFLLQRVIIKFEESQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121458	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121287
887271	contig_854_pilon	+	1438	7	Intergenic	novelGene_36255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	101	679	543600	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543499	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
887272	contig_1715_pilon	-	3042	11	Intergenic	novelGene_127176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_7	218.81489894429	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	114	1394	284622	248253	FALSE	20	GATAGCATTGTTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	312004	246604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
887273	contig_8377_pilon	-	4563	7	Intergenic	novelGene_35102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3297	3659	162313	161951	TRUE	15	GTTTCCAGGTAATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCKQIARLFFQGASDWTQTSNNELFNCLYYPGTPDVTSDNGISSSLSLLSLRATSEAHLTLGLETRDGPLVGVNGLCLTTSQKLGGSNPSNGTTEERPIKMCFHKYYSQENHMELSSTL	174591	154940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_154990_155713_155843_161224_163919_164013_164588_169243_169307_172896_173004_173644
887274	contig_10990_pilon	-	939	1	Intergenic	novelGene_7517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAAATCTCCCATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752995	752056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_752100_753000
887275	contig_13224_pilon	-	3157	1	Intergenic	novelGene_104078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140491	137334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_137300_140500
887276	contig_14030_pilon	+	1838	6	Intergenic	novelGene_62223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAATGGAACACTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335765	344370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_336706_336856_337452_338937_339036_344002_344115_344198_344272_344350
887278	contig_5059_pilon	-	6159	7	Intergenic	novelGene_140744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1974	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2717	3130	445344	444931	TRUE	30	CACTCGATGGGAGGAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAEGVGPKQRSTAQPEWAPNSRKGKEKKQTIQNKTNKKKAPGSHQRGSMDQEAVLSSSGAPQSLRRSKDGARSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKKQHQQPTNGTQGVGQWGRVESKQPGLPDQETVAAGSRGG	450116	408659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_408856_414311_414694_420161_420940_431283_431445_443418_446305_447656_449256_449959
887279	contig_6871_pilon	-	5721	2	Intergenic	novelGene_21629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1295	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4821	5165	632925	632581	FALSE	25	TGGCTACTGTTAATAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIRERRKQNKETRKKKHPQGCPCVSAQSKRVASKPRGTVWLEGTPKPRKEKENKQTNQDRTNQSKQTNKKALGGSHQRGSTGQEAVSQSKGVLQPFRKKQRWHTEPGI	733038	632024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_634954_730246
887280	contig_5686_pilon	+	7370	3	Intergenic	novelGene_45339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1683	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	6720	7022	124981	125501	FALSE	15	CTTAAAGCCCTGGGGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYILETKTVVLLDVGGCKRPILDSALHTWGQHESESTQQQPTTVSNQESLGEFLCNSFPLRKKESIMTSRFLAPATGLDIKKPVATESIPTYGNPMCAE	116293	125849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120446_122413_125262_125479
887281	contig_7919_pilon	+	4495	12	Intergenic	novelGene_28095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_5	535.933895640001	1168	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1338	4017	429	4445	1340625	1412298	FALSE	25	TCACCCCTACCCCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKTVHTLNVGDQEYEDIEGEGNRDNTAATVLLYSEADRCPICLNCLLKKEIGFPENCNHVFCMTCILKWAETMASCPIDRKPFQAVFKFSALGNYIKVQVKRQSRKTNGKKNESYFKKQLSCHENSKSYIRKKAIIREDLLSPQFYDLTMIHRNSSYSETQEKKNATIKINKPRRSNCTNQCFRHFFSNIFSSSSHTGESSYRVYCTEFIEVNEISTVIRQKRQELELSWFRDTLPGIGRNGFVPWNIETEVLPLISSALPRTIFPTSTISLENFGTSCMGYALAHTQGEEKKQTSGTSNTRGSRRKPAAATPTRRSTRNTRAETVSQSQKSPVSNNSGCDAPDSNNPSVSVSSSAESEKQTRQAPKRKSLRRGRKPPLLKKKFRSSVPPPEKSSSSDSVDEETAESDLPPVLEKEHQSDIESSNTCTVQTNAENKSANGLISCNEHVEAREEHTENHDTKETVKPSYSECYTHNPPVLVGENQKPNPLPSSREEEEVEKVENTGIEDNVLCIESDISKNISEKRGDLLENQDQISGSLESEVKTDTCTDHPPVDFLKCSGSEIEVHQPISSPVDELPENAESVVNEEKIVESSIIEIIDHKDSTVKIEQPLESPKLDSSEGQNIQTVDKKSIESSEVQLPQHVETGDAEIIAKCDSSRNENFSSTQDSENNLLKNDLDSTKLDKCLEEKTESLGEHLTSRDLPNTYTEDIQKHFSEDNNEMIPMECDSFCSDQNESEIEPSVNADSKQLNENSGEHSSENIMLPSDPAVEKVETVSQPSESPIDTVDKAKKPRTRRSRFHSPSTTWSPNRDTAREKKRSQSPSPKKETGKDNRKSRSPSPKKESARGRRKSRSQSPKKDYARERRRSQSRSPKRDSSREGKRSESLSPRRDTSRENRRSQSRVKDSSPREKSRSRSRERESDRDGQRRDRDRERRTRRWSRSRSRSRSPSRSRTKSKSSSFGRNDRDSYSPRWKERWTNDGWRCPRGNDRYRKSDPEKQNENTRKEKNDTNPEADDPNPDKCRNDCPSWVTEKINSGPDPRTRNPEKLKDTHWEENRNENSGNSWNKNFGSGWMSNRGRGNRGRGTYRGGFAYTDQNENRWQNRKPLSGNSNSSGNESFKFVEQQPYKRKSEQEFPFDTPADRSGWTSASSWAVRKTLPADVQNYYSRRGRNSSGPQSGWMRQEEETAEQDSNLKDQTNQQGDGSQLPINMMQPQVNVMQQQMNAQHQPMNIFPYPVGVHAPLMNIQHNPFNVHPQLPLHLHTGVPIMQVAAPTSVSQGLPPPPPPPPPSQQVSYIASQPDGKQLQVCFWQLKFNQHCKNVAIRLPGIQNNSLFD	1296664	1412348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1297072_1340603_1340686_1344110_1344269_1352985_1353064_1372226_1372328_1374354_1374420_1402298_1402358_1402516_1402618_1403567_1403670_1407705_1407813_1408485_1411234_1411861
887282	contig_10732_pilon	-	4243	1	Intergenic	novelGene_114681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	471	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGTGCTAAAGTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67384	63141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_63100_67400
887283	contig_11574_pilon	-	2597	11	Intergenic	novelGene_64082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	245.225630797435	23	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	122	1999	456525	449890	FALSE	20	CATATTAGTTCTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	473946	449291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_473873
887284	contig_14333_pilon	+	4248	1	Intergenic	novelGene_49095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1750	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTGGGGGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294878	299126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_294900_299100
887285	contig_16098_pilon	-	1317	9	Intergenic	novelGene_45987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1358.60792725495	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	57	1193	352350	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354045	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349049_349636_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
887286	contig_9313_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_86484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1557	1928	427721	428092	NA	55	TATTAAGAAAGAAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHCQNGLPTQEKKKKTNQQFKTNKRKPRDLTSTAAQTGKQFHIRTELRSPSERSKDGAWSQVFEQKEREEVVRGKEEIKRSGKKQHQQPANGTQRAGLFVCVESKQPVLPGQETVAAGSKGG	426164	429047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_426200_429000
887287	contig_252_pilon	+	4778	5	Intergenic	novelGene_99912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1956	2333	68106	68483	FALSE	45	AATTAAAAATCACATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRPDSEAAHCHRDRGRAGRVSGGRAGAGAESLAGRPAAQSQRRPAEQQPGAGFCLLPRSAFDSFGLAYRGTDLPPPPSALGICQDGKTAASGVRQGHLGPRSWALQDLSLRSPAVWRPRSMCLG	41277	70928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_41945_42633_42782_49727_49855_60942_61011_67160
887289	SIRV3	-	726	4	Fusion	SIRV3D_SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	586	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4835	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAATTCGTACCTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	4015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Fusion_SIRV3_-_4080_4573_4774_6056_6334_8755
887290	contig_13888_pilon	+	5060	1	Intergenic	novelGene_151813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGCTGTGCACGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359519	364579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_359500_364600
887292	contig_10734_pilon	-	3925	10	Intergenic	novelGene_51480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	489.524889340624	1701	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	2378	3436	2274500	2265543	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305180	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2282926_2305109
887293	contig_1263_pilon	-	4268	8	Intergenic	novelGene_170386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	855.92868766466	5804	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	317	1633	65303	55502	TRUE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76860	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53551_54738_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
887294	contig_3942_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_128646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1188.37732503892	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	269	580	179125	179974	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHVSVQVPWGLEEGGDGSFREADGGSHTSVALEEVQRPLAGYSPRLLLLFP	176956	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_178309_178490_179045_179177_179714
887295	contig_14333_pilon	-	1998	2	Intergenic	novelGene_49101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481578	304197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_306158_481540
887296	contig_7720_pilon	+	722	4	Intergenic	novelGene_155767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2894.24674522098	195	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	229	666	700935	707424	FALSE	15	CAGGTGGCTATCCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEKLTQLKALDEVLLNIRMEKKLVAKGGQKKKQVLKFTLDCTHPVEDGIMDAANFEQFLQERIKVNGKAGNLGGGVVTIERSKSKITVTSEVPFSKRYLKYLTKKYLKKNNLRDWLRVVANSKESYELRYFQINQDEEEEEDED	700706	707480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_700998_701856_701962_705016_705142_707279
887297	contig_6058_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_172397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1350	1736	385368	385754	NA	15	CCACACCGGTGTCCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEAAAWHPLLAASRPQASFLSSKILCNSSASSLVLTRINMVTGVVAFFSSMGGFGTQTISTLFFPIRVQGMLGGIRTFSNMLPAFKPRKRHKHYTHYSSVKAVFNTLNGKYPSNLYLMDLKLGAQEC	384018	385882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_384000_385900
887298	contig_2093_pilon	+	10007	48	Intergenic	novelGene_152972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_45	103.825645191187	1098	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2142	6429	81	6509	1297984	1354833	TRUE	20	GTGTACGCACAACCCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLAQQLQRLALPQSDPSLLSRDEVASLLFDPKEAATIDRDTAFAIGCTGLEELLGLNPSFEQFEAPLFSQLAKTLERSVQTKAVNKQLDENISLFLIHLSPYFLLKPAQKCLEWLIHRFHIHLYNQDSLIACVLPYHETRIFVRVIQLLKINNSKHKWFWLLPVKQSGVPLAKGTLITHCYKDLGFMDFICSLVTKAVKVFAEYPRSSAQLRVLLTFYASTIVSALVAAEDLSDNIVAKLFPYIQKGLKSSLPDYRAATYMIICQISVKVTMEDTFVNSLASQLIRTLTKIPSLIKDGLGCLIVLLQRQKPDSLGKKPFPHLCNVPDLITILHGISERYDISPLLRYMLPHLVVSIINHVTGEESEERDGEIYRRHLEAILTNISLKNNLDHLLASILFEEYISYSSQEESDSNKVSLLNEQFLPLIRLLESRYPRTLDTVLEEHLKEVTDLKKQELFHQFISLSTSGGKYQFLADSDTSLMLSLNHPLAPVRLLAVNHLKNLMETSKESIDESFIKEAVLTRLGDDSIDVVLSALSAFEIFKQHFSSEVTVANLLNLFQRAEPSKNREWYKVLEIAADILVKEEILSENYQLANQVVVHLLPYMVIISDDKESAEMKIAVYLSKSGICSLHPLLRGWKEALENVFKSTKSGKLTGIANQKIIRLLADNINSGDPSSMLKMVEDLISVGEKEACNLRQKVTFHVITSVLVGCCSSLKETHFPFAMRVFGLLQKKIKKLESVITAVEIPPEWHCELMLDRGLPVELWAHYIEQLNTGQMIAVEDSVLLVFALKNFIHALKVPKCFSKDDRWWNPEQLKEESRDYLHLLIELFEIILAGADATHFRVLMKLFIKVHLEDVFQLFKFFSVLWTYGSSLSNPLNCSVKTVLQSQALYMGCTILSSQKAKDKHQLVSTSSPVVISLLINLGSPIKEVRRAAIQCLQALSPVQSEFQLIIDYLVPKAEEITSDATYVVQDLATLFEELQREKKVKSHQKLSETLKHLLNCVYNCPSYIAKDLMKVLQHVNSEVVLSHLLPMVEKLLEKVQKEPIAVLKDEAIVLYLTLGKYNEYSASLLHKDPVSLDIFMKAVHTTKELVTGMPTIQITALEKITKPFFAAISDQKVQQKLLGMLFDLLVNCKNTHCAQTVGSVFKGISVNAEQVRIELEPLDKAKSLGTIQQTRRQKMQQKKSQDLESAQEVEGSYWQRVTLILELLQHKKKLKSPQILIPTLFNLLSRCLEPSLLEQGNMEYTKQLILSCLLNICQKLSPDGGKIPKDILDEEKFNVELIVQCIRLSEMPQAHHHALLLLGTVAGIFPDKVLHNIMSIFTFMGANVMRLDDTYSFQVINKTVKMVIPALIQSDGGDSVEVTRNIEEIVVKIISVFVDALPHVPEHRRLPILVQLVDTLGAEKFLWVLLLLFFEQYVTKTVLAAAYGEKDAVLEADTEFWISVCCEFSVQHQIQSLMNILQYLTKLPEEKEETIPKAACNKSESQDEMLQVFNVDTHTSKQLRHFKFLSVSFMSQLLASSHFIRKVVESGGPQILKGLEQRLLETVLGYINAVAQSLEKNADKLTVKFWRALLSKAYDMLDKVNALLPTETFIPVIRGLLGNRLPSVRRKALDLLNNKLQQNTSWKKKVVHSFLQLVPVLLAIVQRKKKEMEEQAINRQTALYTLKLLCKNFGAENPEPFVPVLTTAVKLIAPETKEEKNVLGSALLCIAEVTSTLEALAIPQLPSLMPSLLTTLKTTLELVSSEVYLLSALATLQKVVETLPHFISPYLEGVLSQVIHLEKITSEMGSASQANVRLTSLKKTLATTLSPRVLLPAINKTYKQIKKTWKDHMGPFMSILQEHIGVMKKDMLTNHQSQLTKFFLEALDFRAQHSENDLEEIGKIENCIIDCLVAMVVKLSEVTFRPLFFKLFDWAKTEDAPKDRLLTFYNLADCIAEKLKGLFTLFAGHLVKPFADTLNQVNISKTDEAFFDSEKDPEKCCLLLQYILNCLYKIFLFDTQHFLSKERAEALMMPLVDQLENRLGGDEKFQERVTKHLIPCIGQFSVAVADDSLWKPLNYQILLKTRDSSPKVRFAALLTVLAVAEKLRENYIVLLPESIPFLAELMEDECEEVEHQCQKTVQQLEVVLGEPLQSYF	1297538	1387010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1297619_1297983_1298126_1298980_1299198_1302658_1302801_1303663_1303766_1304723_1304865_1306432_1306645_1306794_1306929_1308161_1308265_1311832_1311944_1312348_1312467_1313512_1313621_1316284_1316381_1316847_1316937_1318642_1318855_1319177_1319300_1320012_1320205_1321721_1321906_1322057_1322195_1322965_1323159_1328395_1328566_1329043_1329203_1330768_1331012_1331293_1331426_1332728_1332833_1333002_1333147_1333757_1333877_1333987_1334110_1335790_1335920_1337451_1337683_1338419_1338547_1340906_1341068_1344390_1344438_1346006_1346131_1346729_1346871_1347367_1347658_1348410_1348562_1349368_1349528_1349690_1349826_1349945_1350051_1350197_1350367_1350904_1351060_1351668_1351828_1353282_1353392_1354744_1357737_1372516_1372616_1384514_1384612_1386611
887300	contig_602_pilon	-	4275	3	Intergenic	novelGene_134950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	782	junction_1	130	1155	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTGGCTGGACCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509672	481145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_485250_490711_490841_509630
887301	contig_5954_pilon	+	3487	5	Intergenic	novelGene_28485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	394	junction_4	419.614406330383	815	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	175	1779	344839	365383	FALSE	5	GCTCCTGGTGCTTAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQKASARVVPYACAVWAAPAPGPVATPSAGRPGPASAPALVQLSAARLPAAGSPVSRNMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYSQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGMVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIADNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPNLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESQMPTQAVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLIPPSKRRHE	344664	367091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_345243_348617_348716_360707_361121_364255_364421_364858
887302	contig_11422_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_99104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATCATATCACACATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2347	868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_900_2300
887303	contig_13481_pilon	+	2057	5	Intergenic	novelGene_119506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	407	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410598	1413957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1410697_1411129_1411271_1411528_1411657_1411750_1411959_1412475
887304	contig_19185_pilon	-	1569	1	Intergenic	novelGene_163638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	932	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	193	498	90296	89991	NA	0	GCTTCCTGCCTCCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLASIALKKIEPLFKYLEFLQKKKKKKKQLESWVRKADGFQFFRVHIVLKAQICTHLESSFSSHCRHSPMPTFTPVWELNLTLTKVPSKKCVSKQSLAT	90488	88919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_88900_90500
887305	contig_5643_pilon	-	10145	56	Intergenic	novelGene_38895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	380.379459952452	2065	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1684	5055	157	5211	289395	269360	TRUE	10	ACCTCTGGCCACTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHAENEEDPEEDLSEAETPKLKKKKKPKKPRDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKKSKSKRKEEEEEDDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTVTEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDPEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPAPPTEDGIKIEENSLKEEENTEGEKEVKSAVPEATVECTQPPAPASEDEKVLVDPPEGEEKVEKTEVKERTEEPMETESKGVADVEKMEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKRSDASEWRDTEGPE	290425	252958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_253742_254843_255073_255186_255310_255450_255541_255664_255805_256547_256689_256762_256851_257651_257742_257880_258081_258178_258340_258456_258513_259728_259763_259846_259965_260147_260237_260409_260456_261513_261624_261902_263672_263844_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269040_269294_269434_269736_269809_270276_270407_270512_270611_270873_271040_271138_271284_271619_271754_271857_271947_272033_272121_272204_272386_274798_274975_275149_275388_275710_275836_276984_277103_277217_277350_277432_277575_277958_278133_278257_278380_278659_278798_278948_279150_279633_279826_280745_280843_280923_281056_281430_281637_281751_281956_282595_282836_283046_283226_283393_283530_283784_283913_284161_284404_284527_284647_285197_285414_285605_285728_289295_289474_290347
887306	contig_2969_pilon	+	1247	7	Intergenic	novelGene_157086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	161.247997403585	107	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	575	973	1197990	1201364	FALSE	45	TTAAAGCATATAAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGTFADKEKKKEKKKAKTVEQTAATTNKKPGQGTPNSANTQGNSTPSPQVPDYPPNYILFLNNLPEETNEMMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFENDGQAGAARDALQGFKITPSHAMKITYAKK	1188980	1201638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1189010_1191322_1191413_1191802_1192160_1197891_1198089_1198880_1198932_1200570_1200660_1201204
887307	contig_8729_pilon	+	3810	6	Intergenic	novelGene_40142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	387	junction_4	360.401664813025	1426	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	6	863	667413	676873	FALSE	5	TTACTTGGCGTGTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMAIAFLTLGYFFKIKEIKSPEMAEDWNTFLLRFNDLDLCVSENETLKHLTNDTTTPESTVTSGQARVSTQSPQALEDSGPVNISVAITLTLDPLKPFGGYSRNVTHLYSTILGHQIGLSGREAHEEINITFTLPTAWSSDDCALHGHCEQVVFTACMTLTAALGVFPVTVQPPHCVPDTYSNATLWYKIFTTARDANTKYAQDYNPFWCYKGAIGKVYHALNPKLTVIVPDDDRSLINLHLMHTSYFLFVMVITMFCYAVIKGRPSKLRQSNPEFCPEKVALAEA	667407	679820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_667485_670128_670415_672253_672405_673741_673926_675394_675539_676852
887308	contig_7025_pilon	-	2552	19	Intergenic	novelGene_104378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	775.988680393448	115	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	69	2348	95047	49239	FALSE	10	TATTTTGTCTTTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95115	49034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67054_73033_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_94786
887309	contig_9434_pilon	+	4822	23	Intergenic	novelGene_150474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	133	junction_8	215.048817252392	52	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	1881	4511	85566	124169	FALSE	30	TTTCAATTTTATACTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEALAKLKEEEERQKREEEERIKRLEELEAKRKEEERLEQEKRERKKQKEKERKERLKKEGKLLTKSQREARARAEATLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKKKKKAQQLENKEVSEQIELSAAVEVVDQGAPDKEESAPPVDPEEEEETEDGGLDDWEAMASDEEREEEGTTVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEEEEESDEEEEEEGESEVSEGDEEGEKVSDDKDAGGTLDRRPSKDMSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKMKILPQFIFNSRDPIVIGVTVEAGQVKQGTPLCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDVAKKGQEVCVKIEPIPGESPKMYGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRDEMQKSDWQLIVELKKVFEII	51091	124480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_51257_82163_82290_82390_83870_85455_85674_86041_86193_92818_92915_93398_93489_94724_94800_96554_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683_118849_120465_120605_123554_123717_124061
887310	contig_20199_pilon	+	802	3	Intergenic	novelGene_82529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88	7249	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGCGATGTCCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40646	44046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42173_43909
887311	contig_7151_pilon	+	5582	6	Intergenic	novelGene_40722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	224	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	2248	3045	429987	430784	TRUE	60	GAAAGAAATCAAAGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQQNSGKRTKKNEETLRVTWDTIKSKNQRVIGIPEQGQKTENTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQQTPYRRNPKIKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAVHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARKQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDSEIRSFPDKQKLREYAKSQTKLTRIIKGSSSI	271995	548445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_272318_272600_273319_428779_431522_434217_434941_483671_483978_547674
887312	contig_1534_pilon	+	2604	1	Intergenic	novelGene_176125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	73	447	853	1227	NA	55	GATGCATATCAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKTNNPIKKWVNETNRHFTKEDIQMANKHMRKCSRSLAIREMQIQTTMRYHLTPALLGRIKNTGNNKRWRGCGKMGTLMHCWWECKMIKPFWKMIWRFLRKLEIDIPFNPAIPLLGIYPREMRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQ	780	3384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_+_800_3400
887313	contig_9988_pilon	-	2395	1	Intergenic	novelGene_113069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATGTGTATTCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561382	558987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_559000_561400
887314	contig_11106_pilon	-	3763	1	Intergenic	novelGene_167445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5005	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACAGCGGCTGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5343	1580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_1600_5300
887315	contig_5794_pilon	-	3029	13	Intergenic	novelGene_69788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4607.88742493058	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	39	1112	749501	743712	TRUE	40	ATGGGGGAAAGATGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749539	741603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743078_743176_743603_743694_743765_743856_743892_743951_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749429
887316	contig_18162_pilon	-	3112	3	Intergenic	novelGene_122309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2966	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9744_9840_10809_16363
887317	contig_11898_pilon	+	4384	2	Intergenic	novelGene_144278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	453	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	549	929	209914	210294	FALSE	55	GGAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQRMHTHLLRHSQLKQKSRMKQIYNQYTKKKTTECPKDNRQCENILKQDRMVPVGIQNKPPDDFPVEEKALELPDTEFKSLIFRAIQELKQKADKNKEKIDKFMEKADKFMENTDKKWKNSGK	209061	213749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_209411_209714
887318	contig_9406_pilon	-	1454	3	Intergenic	novelGene_136141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1394	junction_2	123.5	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	142	354	34996	34784	FALSE	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	37688	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596
887319	scaffold_13505_pilon	+	2518	6	Intergenic	novelGene_111553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	208.865889986853	73	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTCTCATGGCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608086	635989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_609623_609748_610099_613391_613529_623354_623423_635129
887320	contig_2069_pilon	+	2462	13	Intergenic	novelGene_23240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	303.670142680435	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	200	1042	333898	341321	TRUE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323987	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342616_343552_343652_343766
887321	contig_5945_pilon	-	1151	7	Intergenic	novelGene_104529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	784.731093361853	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	594	556	1149	32224	2616	FALSE	15	GAGTCTTTGGGGACCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILPGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQKKNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKLAEDYNSSNTLNVKAVSETPAVPPVSEDEDDDDDATPPPVIAPRPEHTKS	55462	2613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_2733_12606_12645_16208_16357_16847_16949_32034_32246_53536_53566_54957
887322	contig_6418_pilon	+	1959	12	Intergenic	novelGene_81199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	207.462950988985	65	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	352	1854	1375762	1444680	FALSE	15	GTCTGTCACTTTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341041	1444785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375755_1375938_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
887323	contig_8820_pilon	+	3516	9	Intergenic	novelGene_79290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	2518	3297	168811	170457	TRUE	20	AAGCAACTGGCGCGCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHGQVVFPVIGQALIEFAVFFISNIVRISGPNGLRFVEHLLVNVLFLDLLSLLLVTILLFFLLFIRTNIFDFRLLIRLLFFFFFFLLFLFLFFGLIITHFFISFFLHEEGDGVADKLRVLLHNLLHPPFLQVLRLVFFQMQDHLCSTTHRFSCVRPNCEGPSCGRLPCILLIVIMFGDHSHFLSNQIRRVKPHTKLANHGDVCTSLQSFHERFGPRLGDGTEIIDQVGLGHPNSSVYNREGSILLVWNEINMQLLPRV	165785	171324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_167804_168032_168178_168295_168487_168647_168816_169018_169335_169661_169798_170134_170458_170594_170763_171273
887324	contig_7157_pilon	-	2744	9	Intergenic	novelGene_131311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_6	428.403066632348	944	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	6	1316	1019968	997010	FALSE	40	CTGTAAATTAACACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAERRRHKKRIQEVGEPSKEEKAVAKYLRFNCPTKSTNMMGHRVDYFIASKAVDCLLDSKWAKAKKGEEALFTTRESVVDYCNRFIFMYPAKIRDATNAEMEAQRSWVTCPQPVPRSQRKLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVARCILFLIIWLITGGRHHFWFLPNLTADVGFIDSFRPLYTHEYKGPKADLKKDEKSEAKKHQKSDSEEKSDSEKKEDEEGKVGPGNNGTEGSGAERHSDTDSDRREDDRSQHSSGNGNDFEMITKEELEQQTDGDCDEEEEEEDNDGETTKPSSEKS	1019973	995581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_997483_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589_1004795_1009303_1009412_1010536_1010643_1011511_1011621_1019932
887325	contig_5429_pilon	+	5435	14	Intergenic	novelGene_127799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	193.05758407592	1371	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	175	1317	460515	498838	FALSE	10	TTTTTGTTGTGAGTTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGATGGRSPRFGHKWSEEFKGQRKQIVFLEEASQQEKLAKEWCFKPSEVRELSPHEFFMPGLVDTHIHAPQYSFAGSNLDLPLLEWLTKYTFPTEHKFQNIDFAEEVYTRVVRRTLKNGTTTACYFGTIHTDSSLLLAEITDKFGQRAFVGKVCMDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLINPKASDSPIDLFHGDIAGGISEAVIQKFLYLGDDRNIEEVYVAGKQVVPFSSSV	427329	502956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_427405_457958_458048_460504_460677_463724_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495718_497667_497696_498767
887326	contig_4213_pilon	+	4054	7	Intergenic	novelGene_124788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	117.542899969898	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCGTCCCATTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12820	80364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_40541_40646_42734_45539_58525_58704_79549_79775_79956
887327	contig_15029_pilon	-	2965	6	Intergenic	novelGene_128181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	1826	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1	570	172321	163104	FALSE	25	TCTGATTTATTTTATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172321	160708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
887328	contig_14970_pilon	+	2763	2	Intergenic	novelGene_45018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1352	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAGAGCATATAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147384	151139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_148051_149042
887329	contig_5316_pilon	+	3527	9	Intergenic	novelGene_61205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	274.838105755006	154	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	361	1614	453918	550408	FALSE	75	ATAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	395999	552321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
887330	contig_9406_pilon	-	2258	9	Intergenic	novelGene_136154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	734.943099413145	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	46	1527	65395	34597	FALSE	35	ACTATTGTAATGACAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASNKEWLDKIEKEGMQLISEKPETEAVVKEKLTALHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGKSTDEVDSKRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEILGRIQDKHKKLPS	67032	33865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34604_57844_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329_62420_63104_63330_65137_65402_66993
887331	contig_19777_pilon	-	5286	15	Intergenic	novelGene_29701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.257539376818856	1816	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	4965	5285	3298	175	FALSE	40	CAAGGCAAGCACAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGASAGGGGSVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAAS	24996	173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_462_3264_3399_5237_5445_5560_5687_6101_6189_9829_9882_10496_10583_12884_12976_13206_13283_13382_13517_15437_15559_16872_17031_18240_18378_21342_23984_24048
887332	contig_5623_pilon	+	4575	2	Intergenic	novelGene_154857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGCCCGGATGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247037	251812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_248338_248537
887333	contig_10297_pilon	-	3387	6	Intergenic	novelGene_112554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	401	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTCTCCTGTATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692925	628728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_629608_665070_665240_686633_686723_686765_687836_691653_692591_692682
887334	contig_7357_pilon	+	2037	9	Intergenic	novelGene_36834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1061	1438	139801	154908	TRUE	25	CAGCGCAACCAGCCCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135892	167080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_154860_155083_159916_160034_166772
887335	contig_13800_pilon	+	7385	15	Intergenic	novelGene_153712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	348.990263591454	489	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	248	1117	98375	142318	TRUE	55	ATACGAGATTTAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQRNYLFGQRKSVEILNKG	94542	168205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_95759_95829_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
887336	contig_12765_pilon	-	2499	1	Intergenic	novelGene_106565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTATCCCAGCAACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152309	149810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_149800_152300
887337	contig_12479_pilon	-	4080	3	Intergenic	novelGene_56838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	313	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGGACAGAATTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143747	133925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_135846_141502_141605_141689
887338	contig_14666_pilon	+	1743	4	Intergenic	novelGene_39593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3229	junction_3	238.484101496655	171	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	86	1441	477340	484940	FALSE	45	AAAAAAAATGTCTTGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861
887339	contig_5350_pilon	+	1156	7	Intergenic	novelGene_99362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	56.942710000686	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTTTATGTATGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208151	225813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_208204_216070_216161_218949_219149_220454_220530_222758_222931_223349_223423_225318
887340	contig_3077_pilon	-	5247	4	Intergenic	novelGene_26715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGCAATCAAAGGTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18085	10109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13162_13856_13985_15135_15262_16144
887341	contig_4388_pilon	+	2689	2	Intergenic	novelGene_161989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCAATTTCTTACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307903	1350378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1310572_1350357
887342	contig_13612_pilon	-	588	4	Intergenic	novelGene_157279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.576966406035	448	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	57	380	38542	36280	TRUE	20	GCTGTCCTGTACGACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGAARWLALATVRSGALWSGPSLRKGGDVSAVRGGSGQSLVPSRSVIVTRSGAILPKPVKMSFGLLRVFSIVIPFLYVGTLISKNFAALLEEHDIFVPEDDDDDD	38598	34874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_35023_35069_35126_36275_36418_38356
887343	contig_17464_pilon	-	1876	2	Intergenic	novelGene_178512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	33	junction_1	0	369	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	152	505	42890	42537	FALSE	60	ACCTGAAATGTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSCEENEGKPQNMPKAEEDHPSEDVPQEADGNPQPSREGVSQEAQENFRGGLAQPGQRFKEDAPVRHLDPEEMIRGVDELERLREEIRRVRNKFVMMHWKQRHSRSRPYPVCFRP	44087	41165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17464_pilon_-_42933_43978
887344	contig_14341_pilon	+	714	6	Intergenic	novelGene_111857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	1907.08988776093	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	183	527	550058	551513	TRUE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQVLPGTSLPPGSLPRSPPSLGRLQLGTTFGLGHLAAMHRCP	548800	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_548866_549940_550151_550355_550485_550582_550674_551481_551581_551668
887345	contig_13800_pilon	-	1920	10	Intergenic	novelGene_153705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1094	1408	127789	125077	TRUE	15	CATCCGCCTGCAGTCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYNLHLLQILLLFHYLYQNIYIDVGGLFPGHLEKQQLVRDHHWKTEFHPPDLMNPLYSLPYFPHYSHYCHHYQHLHHLRLLPPLPPPPHLLQVVEQYYHNHKG	140621	94221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_94286_95566_95665_95756_95829_98357_98436_114263_114435_125047_125209_125886_126022_127741_127805_131979_132053_139616
887346	contig_11307_pilon	-	4070	5	Intergenic	novelGene_105238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3494	3802	74605	74297	FALSE	5	ACGGCGGGGTGGGTCTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSPFPPSTFSKEGVVTCKWDINKRIPQSSWPTDNLAGASKAAAPRLLGSKSETAGAPHGRLAPKPEKLTVTCCLLKTRRHRQAIPFLLVRISGSSPPEVE	88425	74028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_76959_78880_79039_79678_79832_87510_87597_87682
887347	contig_3382_pilon	-	4451	1	Intergenic	novelGene_124166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	833	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGAGTAACCACCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941474	937023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_937000_941500
887348	contig_12837_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_57414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	346	759	618882	619295	NA	30	ATATTGCATTGGGCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVKNEMKRIKIYILGISELIWTGTGNFESENHMVYYARKEKLKRNDLAFIVEKNISRPVLKHRPVSDRIISIHLQGKPVNTTIIQIYTPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEVDQTWNQDALIITGDWKVKAHTKKKDL	618536	621248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_618500_621200
887349	contig_6898_pilon	+	3809	14	Intergenic	novelGene_35721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	3399	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	107	1846	59668	125743	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIPHTPTPLPYSHCAGATN	59561	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125598_125688
887350	contig_10734_pilon	+	2543	4	Intergenic	novelGene_51521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTGTGCTGTAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2270757	2291948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2271050_2274374_2274505_2275749_2276361_2290438
887351	contig_12299_pilon	-	5179	6	Intergenic	novelGene_29718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	67.4080113933055	1808	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	152	1063	88403	30043	FALSE	20	GGCCATTGTGGGAGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHGRIAPKSTSAFAVASVGHGVLLPLVILSTLLGDGLASVCPRPPEPENGGYICHPRPCRDPLTAGSVIEYLCAEGYMLKGDYKYLTCKNGEWKPAMEISCHLNEEKDAHTSLGAPTLSIVASTASSVALILLLVVLFVLLQPKLKSFHHSRRDQGVSGDQVSIMVDGVQVALPSYEEAVYGSSGHCVPPADSRVQIVLSEGSEPSGRSVPREQQLQDQGACSSAGGEDEAPGHSGLCEAWGSRGSETVMVHQATTSSWVAGSGNSRPTHKEAPDSESSDIQSLLSLTSEEYTDDIPLLKEA	138232	25926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_30069_32922_33351_43082_43222_44256_44455_88282_88486_138163
887352	contig_10766_pilon	+	6901	28	Intergenic	novelGene_151188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	672.800940564252	1383	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	1804	3918	143906	212781	TRUE	35	TTATGGACCTCATGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTIREEGRVFVYINSGVGAVMIEMGTELIGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLRGAIYIYNGRVDGISPAFSQRIEGLQISESLSMFGQSISGQIDADDNGYVDVAVGAFQSDSAVLLRTRPVVIVKASLNHSESVNRTKFDCIENGLPSVCIDLKLCFSYNGKQVPDHIVLFYNVSLDVNRKAETPSRFYFSSDGTSEVITRSIQLSSGGVYCTAHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGHHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIIKTTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLVVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPTGLYFIKILDLEEKQINCDVTDNSGVVKLDCSVGYIYVDRLSRLDISFLLDASSLSRAEEDLNITVHAACENEGDVGTLKNNKVTLAIPLKYEVMLSVHGFVNPTSFVYGSHEENEPQTCMEEKINFTFHVINSGHSMAPNVSMEIMVPNSFTPNTDKLFNILDVQTSTGECHFQNYQRECLQQQKGVVESMKDIFKFLSKSDKRLLYCIINDPYCLNFVCNFGRMESGKEASVHIQLEGRPSVLEMDDTSTLKFEIKATAFLEPNPKVIELNKHENVAQVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLILLLLISYVMWKAGFFKRQYRAILQEENRRDSWSYVNSKSNNDD	113451	216031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_114378_114741_114864_135922_136030_136124_136255_138019_138088_139436_139567_142316_142403_143671_143963_147221_147334_153839_153935_155162_155254_155835_155882_156261_156417_161131_161287_172722_172873_174941_175019_188128_188280_189827_189924_190640_190721_191124_191215_193728_193820_198580_198689_199550_199674_200383_200504_211449_211549_211986_212107_212682_213587_213853
887353	contig_20527_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_138601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCACCATCTAGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14148	16078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_14100_16100
887354	contig_8616_pilon	+	12669	7	Intergenic	novelGene_72609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	311.072160260106	61	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2815	8448	3414	11861	465990	480301	FALSE	5	TGCTTTGTGACTTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPKVKGDVDVSLPKVEGELKVPDVDIKGPTVGVDVPDVDVHGPDWHLKMPKLKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPDLHLKAPKISMPEVDLNLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKAPEVDIEAAKVDVDVPGVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDANIEGPDAKLKGPKLKMPEMNIKAPKISMPDLDLNLKGPKMKGEVDVSLPNVEGDLKGPTLDIKGPKVDVDAPDIDIHGPEGKLKGPKLKMPDMHVNIPKISMPEIDLNLKGSKLKGDVDVSGPKLEGDIKAPKLDVKVPEVDISGPKLNIEGKSKKSRFKLPRFNFSGSKVQTPEVDVKVKKPDIDVSGPKVDINAPDVEVQGKVKGSKFRMPFLSISSPKVSMPDVELNLKGPKVKGDLDVAGPNLEGDFKGPKVDIKGPEVHLDAPDVDVHGPDWNLKMPKMKLPKFSVPSLKAEGPDMAVDLPKGDINIESPSMNIEGPEINVEGPEGSLKGPKFKMPDLNIKAPKISVPDIDLNLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLRGPEVDIKGPKMDIHVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDATLPKADIDISGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDIDLSLKGPKLKGDVDESLPKVEGDLKGPEIDIKGPKLDIDTTDINIEGPEGKLKGPKFKMPEMHLKSPKMSMPDIDLNLKGPMVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEVDLKGPKVDIDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPKVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNVEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDFDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKAPEVDIEAAKVDVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPDLHLKAPKIAMPEVDLSLKGPKVKGDMDVPLPKVEGDLKGPEVDIKGPKVDVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFGMPGFKGEGPKVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDFDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEIDIKGPKVNIDVPDVDAHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDIDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDIKGPEVDIKGPKLDIETPDVNIEGPEGKLKGPKFKMPEMNIKAPKISVPDFDLNLKGPKVKGDVDLSLPKVEGDLKGPEVDIEGPEGKIKGPKFKMPDVHFKTPQISVSDIDLNLKGPKVKGDLDISIPNVEGDLKGPKLDVKAPKLDIDTPDIDIHGPEGKLKGPKFKMPDLHLKAPKISMAEVDLNLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEVDIKGPKVGVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFRGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKAPKFKMPEMNIKAPKISMPDTDLHLKGPRVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEVDLKGPKVNIDVPDVDVQGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFQMPEINIKAPKISMHDVDMGLEGPKVKGDYDVSVPKVEGTFKSPEVELIGPGLDFKGPDAKLSGPNLKMPSLDISAPKVTAPDIDLHLKAPKIGVSGPKLEGGELDLKGPKVDLETPSLDVHMESPDINIEGPDVKIPKFKKPKFGFGAKGPKADIKSPCLDVTVPEAELNGQTPEISVGGKGKKSKFKMPKIHMSGPKIKPKKQGFDLNVPGGEIDASLKTPDVDINVVGPDAALKVDVKSPKTKKPMFGKMYFPDVEFDIKSPKFKAEASLPSPKIEGEIQAPDLGISSPGINVEGPDIKLKAPKFKAPSVDVSGPKIEGNLKGPRVQANLDTTDINIEGPDAKVKAPSFGISAPQVSIPDVNVNLKGPKVKGDVPSVGLEGPDVDLQGPEAKIKFPKFSMPKIGVPGMKMEDGRAEVHAQLPGLEGGLSAPDVKLEGPDVSLKGPKVDLPSVNLSMPKVSGPDLDLNLKGPSLKGDLDASIPSMKVHAPGLNLKGVGGKVQMEGDGVKVPGIDATSLNVHAPDVTLKGPSLQGDLNVSGDINCPEVSVGAPDLSLEASEGGIKLPKMKLPQFGISTPGSDVDINIKGPQVTGELKGPGMDMNLGGVNLKGPQISAPHISAPDGDFSLEGPKVKGEMKGPSVGGGLAGINVQGLEGSLQMPGIKSSGCDVELPGVNVKLPTGQISGPEIKGDLKGTGLGFDGAAPDIGVKGPSFNMAAPESDFSVGLKGPKIKGAVDVSGGVSAPGISLGEGHISVKGSGAEWKGPQVSSALNLDATKFAGGLHLSGPKVEGDVKGGQIGLQGPGLSVCGPQGHLGSGSGKVTFPKMKIPKFTFSGRELVGREVGVDVNFPKAEASVQAAAAEGEWEESEVKLKKSKIKMPKFNFSKPKGKGGVTGSPEASISGSKGDLKSSKASLGSLEGEAEGETSSPKGKFSFFKTKKPQQRSNSFSDEREFSAPSIPTGTLEFEGGEVSLEGGKARGKHGKLKFGTFGGLGSKSKGHYEVTGSDEEAGKLQGSGVSLASKKSQLSSSSSSDSGTKVGIQLPEVEVAVSTKKE	458888	481109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_459868_460231_460395_460854_461043_462008_463944_465841_466048_471143_473597_474364
887355	contig_5799_pilon	-	3607	4	Intergenic	novelGene_50254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_1	16.739839372653	75	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATAAATAAAACAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369270	188084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_191159_258752_258810_325686_325795_368902
887356	contig_2069_pilon	-	3718	10	Intergenic	novelGene_23305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524348	503016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_503134_504279_504453_510937_511071_511588_511742_514126_514247_515264_515396_518069_518225_520107_520622_521646_522769_523248
887357	contig_13366_pilon	-	3967	14	Intergenic	novelGene_99757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_13	196.3272536673	389	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	937	2814	117	2930	177621	26320	FALSE	60	AAAAAAAAGTCAAGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRISIQELAAGGRRELSVPPGGAGRTAPRSAHASTRAMGGSASSQLDESKCAYIRGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVITGDEVQILSNLVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAVCIEKVKLRVLKQYDYDSSTNRKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIQVENVYEEILYQTLLDETLKVIKEAAVLKKHNLFEDNVTLPSESVSSLTDLKTPTGSNQASPARRASAVLPGVLDSESLGNEVFQEPEEEQQPGAPSPLAEEESTSLPVSSPPSAGDGQVVVSSISGPGNLVATEDKTETLDKNSAELEFGEIPEEEDPAHEEPESVSASGSLKELRKLLTVTVEVPVESAVVIEKDIPEETLLPQEDEKEEEKPQIYTEAHEVAASHQDHCEEDEVNEREAHLSSTEASGMEWGSFPEASGSAPEPACGRLTEGASCPGPTGEQMEAGELPERASKLFHEEGGAQCALEGEASAGEDCILSSDHVHPSESQVSEEMMEGKISTGQREVSVDTEASKVASVHACQWVVENAPNTSSLGAHENNVKEREGCLESSPGQLVEEE	177737	25282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_27468_29836_29949_35679_35788_38158_38270_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49267_56149_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113726_116845_116977_177566
887358	contig_16635_pilon	-	4316	2	Intergenic	novelGene_153150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1703	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGGAACTGATTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95721	91279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_92295_92420
887359	contig_6497_pilon	+	3756	11	Intergenic	novelGene_35561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	303.395517435575	2135	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	91	834	156503	179930	FALSE	20	GTTGTAGTCAGGTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNCGGPALAVCEAWSPLASDRAVLKPSSTMGKRDNRVAYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRYSSSSSSSSDSSSSSSDSEDEDKKQGKRRKKKKNRSHKSSESSMSETESDSKDSFKKKKKSKDATEKEKDIKGLSKKRKMYPEDKLLSAESLSESDYIEEVRAKKKKSSEEREKATEKTKKKKKHKKHNKKKKKKAASSSSDSP	156412	182852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_161444_163401_163481_165792_165868_166001_166035_166485_166549_166881_166975_168288_168340_174094_174188_176990_177039_179843
887360	contig_5084_pilon	-	8268	3	Intergenic	novelGene_64533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_1	18	2232	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	220	324	503325	503221	FALSE	25	GCACTAAAATTTCGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEDGGVRGTLGSRPWGRGRAHPGRSSASDGLWGFLLTRRTFSLTFRCFIFSSSQKENKILNSGLGNLPPGSGMEKAAFLFVPPLKSNPEKPLGCSHPSSFSKEETS	516547	495276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_503345_514791_514891_516446
887361	contig_12683_pilon	+	4612	4	Intergenic	novelGene_178515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	380	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2762	3088	10155	100504	TRUE	20	CACAGAGCCGCCCACCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGMSLCSAQRKGVASKLPGTAWLEGAPKLRRKKENKQTNQSRTSQSKQTNKQKSPGGPTSVAAQAGKQFHSRSVFLLIFPQSCIQVFVFNFADPIFHCFKPTPQPF	6462	116271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12683_pilon_+_6576_7506_10387_100409_101165_115407
887362	contig_3018_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_78886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571595	569169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_569200_571600
887363	contig_17281_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_105186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2550	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTGTCAGAATTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2900
887364	contig_6059_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_44816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568244	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_567800_568200
887365	contig_6102_pilon	-	1523	8	Intergenic	novelGene_32172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	527.923927729543	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	867513	846789	TRUE	10	AGACTTTTTGGTTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCHSVALEEVTILNI	867513	839087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_846987_867249
887366	contig_7066_pilon	+	2056	8	Intergenic	novelGene_42158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_2	308.625458232771	935	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	202	987	823546	841366	FALSE	5	GAGTGTTGCCTCTGTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPELLLDSNIRLWVVLPIVIITFFVGMIRHYVSILLQSDKKLTQEQVSDSQVLIRSRVLRENGKYIPKQSFLTRKYYFNNPEDGFFKKTKRKVVPPSPMTDPTMLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	823344	842435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823701_829906_829965_830302_830397_832776_832882_833878_833961_835771_835852_837208_837292_841237
887367	contig_12603_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_105805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAATGGCATCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605083	603173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_603200_605100
887368	contig_7207_pilon	-	2780	4	Intergenic	novelGene_72024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	85.1286607958148	576	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	117	1076	294361	291736	FALSE	70	ACTAAAAAAAAAAGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELPRARVVGRLRPKDSEQKLYESSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFIRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFALHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPGQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST	295001	290031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293496_294144_294418_294941
887369	contig_13067_pilon	-	3832	4	Intergenic	novelGene_141332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	65.0743164901996	1101	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	231	587	75166	36326	FALSE	45	GATTTAGTTGAAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDKEFMWALKNGDLDEVKDYVAKGEDVNRTLEGGRKPLHYAADCGQLEILEFLLLKGADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVKLLLSKGADKTVKGPDGLTALEATDNQAIKALLQ	75396	33080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_36413_52559_52644_53605_53720_75094
887370	contig_8310_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_75597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	460	816	316947	316591	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGICHLATWLPMKTPTSRDEVGLRERRRGTAGLGPRSVQGLAEPCDRCSWPHLQEWKELWQHYLAGGDQEVSHADGLRQGVALELDGYFSVGNGALCWPVLVAFFLGGKITILSPVVK	317406	314988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_315000_317400
887371	contig_5039_pilon	-	3628	1	Intergenic	novelGene_64769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	902	1201	123431	123132	NA	20	GGTGGGGGGTAATTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHSFSLVVKLSSRFNFQPGSGQPHKTKWD	124332	120704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_120700_124300
887372	contig_18735_pilon	-	3729	1	Intergenic	novelGene_132671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	784	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTAAGGATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61812	58083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_58100_61800
887373	contig_9921_pilon	+	5558	3	Intergenic	novelGene_23752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274.5	1477	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	123	1298	321085	322260	TRUE	45	TTTAAAAAAACATCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPNATNVTCYYQPAPYVSDGNFNNYYVAHPPVTYSQPYPTWLPCN	299193	326583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_324416_324478
887374	contig_19564_pilon	+	1407	10	Intergenic	novelGene_29684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	237.399803425923	642	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	555	1406	99199	103855	FALSE	25	GTGAGTCTTAAGTGGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGPIDPKELLKGLDSFLNRDGEVKSVDGISKIFSLMKEARKMVSRCTYLNILLQTRSPEILVKFIDVGGYKLLNNWLTYSKTTNNIPLLQQILLTLQHLPLTVDHLKQNNTAKLVKQLSKSSEDEELRKLASVLVSDWMAVIRSQSSTQPAEKDKKKRKEEGKSRTTPPERPLTEVKAETRTEEAPEKKKEKPKSLRTTAPSHAKFRSTGLELETPSLVPVKKNASAVVVSDKYNLKPIPLKRQSSTAAPGDAVPPAEKKYKPLNTTPNATKEIKVKIIPPQ	92195	103856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_92213_92437_92964_99187_99306_100004_100092_100257_100394_100795_100848_102870_102949_103087_103262_103520_103627_103743
887375	contig_8377_pilon	-	13582	2	Intergenic	novelGene_35036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3770	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1251	1550	89368	89069	TRUE	20	CCAAGCTGCTACTGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIIHSIHCLNLSPHNTSKVIRLSLAACQSCYQNISHLDQPIHTKEAESLIWYRVISKSYRDLFIHAFNYLFNKYMFKGSSVMSGTADTKVNKEKCLP	90618	76979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_79220_79276
887376	contig_10711_pilon	-	3928	1	Intergenic	novelGene_118414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1885	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	1522	2031	209448	208939	NA	35	GAAGACAATTCCTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEILGRAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRTLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSVAPKKIKYLGTNLTRDVKDLCKENYKTLLQEPKGIYINGKTYHAHG	210969	207041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_207000_211000
887377	contig_17144_pilon	+	1300	4	Intergenic	novelGene_29109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	96	junction_1	369.793936612751	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	191	1300	5087	11721	FALSE	65	GAGAAAATGAAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDK	2913	11721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_3073_5055_5224_9209_10116_11654
887378	contig_4924_pilon	-	6852	12	Intergenic	novelGene_84644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1089.7235224459	100	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	85	990	252576	82377	TRUE	15	AATACTTGTTTCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFFLPVPHRAALTLPPGSVFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252660	60050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_60763_60854_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
887379	contig_9333_pilon	-	2628	2	Intergenic	novelGene_120337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGGGAACTAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445748	440703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_442423_444839
887380	contig_11752_pilon	+	1942	3	Intergenic	novelGene_37556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	714.5	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	281	928	87165	88933	FALSE	85	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	83512	89947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_83788_87159_87547_88667
887381	contig_19534_pilon	-	1547	6	Intergenic	novelGene_151612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	409.525872198571	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAAGGCTTGCTAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68718	61939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62953_64567_64823_66767_66836_66953_67023_68150_68172_68597
887382	contig_1452_pilon	-	2055	3	Intergenic	novelGene_115150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	53	667	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715443	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
887383	contig_10196_pilon	-	2818	2	Intergenic	novelGene_132222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	732	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCCGTGTCCAGGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1395054	1391464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1391525_1392296
887384	contig_6270_pilon	+	2952	2	Intergenic	novelGene_99888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1102	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAATTGCTTTTTCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142869	1145945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1144146_1144269
887385	contig_7123_pilon	+	3732	10	Intergenic	novelGene_170587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	113.899349113132	1209	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	864	2595	705	3299	548776	625728	FALSE	20	TTACCTCCGTTGAATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQQKSKENSSKIIKKSEDKNLETQIQGSQKNVAKKLGPKETVQSLVKSSSENKVNQPESGTRMSTRSAKAASNDKKAINSIDKNMVTVKQLSQQESTKKKLSQKKPVHETSKSNEQLNRRSQRLQQLTEISTRSLRSRAVHGQVQAVKQSLPPKRKERCSSTQSKSNNVKTSQKHVKRKVLEVKSDSKEDENSGINDVINSPKGKKRKVEHQTACTCSSHCVQGSEKCLQKTTRKEETKPVPVTSEIKRSKMTTSVVCKKNEKMKKSVHTQVNISAKPKKSPQPSVPEQSVDNELEQAGKNKRGSILQLCEEIAGEIESDTVEVKRESSQMESANEEKPTEIKSEETDVERQILHQKETNQDVQCNRFFPSRKTKPVKCILNGINSSTKKNSSWTKIKLSKFNSVQQNKLDSQASPKLGLLRTSFLPPTLEIHHPMTQSTFLGTKRHDDKNIACQQEKTKEINSEEVRSNNIVEINKTTERVPENCHLDNQIQPSTEPPLLDNQMKQPITAAPDKNFSLCLESKLENTPVENTTAVSTLLNQAKIDTGESKFPGSAPKQHGVLNNQTSKNSDNRETPPNHPWPKCNSHLEIKIPKDLKLKESEKADEKQLIIDAGQKRFGAVSCNVCGMLYTASNPEDETQHLLFHNQFISAVKYVGWKKERILAEYPDGRIIMVLPEDPKYALKKVDEIREMVDNDLGFQQAPLMCYSRTKTLLFISNDKKVVGCLIAEHIQQGYRVIEEKLPVTGTEEEKVRFERQKAWCCSTLPEPAICGISRIWVFSMMRRKKIASRMIECLSVSPAAEVPAETPSSSPTLVPGLWKLGVTGCFWDLSAVLEELTPFSMMEPGPGRTEPSPHPLCYRR	547831	626161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_547937_548176_550327_555328_555444_556718_556780_557623_557739_560454_560587_579795_579886_586479_586624_588212_588401_625529
887386	contig_16228_pilon	+	1942	5	Intergenic	novelGene_147926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	184.603629433443	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	63	1190	47816	74335	FALSE	10	TCCCACTTGTGGTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHEDQQSDMEHRGCRWSQWWLCLEAAEDTMTTNDPVWPRSQRWGLPYPTSSLILTEDLVQPVAEHKDEGESDAISSPSLPGDQSWLRINTHQPRSSVKCDYPVTCPPQLRQEKTEDGNHVFLSL	47753	75087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_73641_73821_74146
887387	contig_7078_pilon	+	4755	5	Intergenic	novelGene_130215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.0451720235695	1011	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	254	577	960948	961271	TRUE	15	TTTCTGCCTTTTTCTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPSQPPVLIFIAGSNSVCWNTQGLCSGFSFLVSLNIILFNPLPSNTMTLKYLVMAYLWISRLENSGIYLTFPYGCLNSFQMKNGKNRNTYFLLESVHSSQSSSSH	960694	982399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_961305_961440_965158_965319_965361_975279_975387_982119
887388	contig_12080_pilon	-	5462	27	Intergenic	novelGene_128343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.154520581784	9	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	57	2621	164251	62705	TRUE	30	GCATTGAAACAGTACCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPGGGLGPGRGTRDKKKGRSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLSKELEDAKKEMASLSAAAVAIVPPVPSSTNAPPAPPLPADSGTVIPSLPTHLPEEVSKPPPPPSLPEGYTIPPPPPPPPLPGSVCIPPPPPLPESASIPLPPSLPGSTAIPPPPPLPGDTGIPPPPPLPGVAGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGSTCILPPPPLPGDTGIPPPPPLPGGPGMPPLPPPLPGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLAPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164307	45145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45528_45858_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_108591_109504_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
887389	contig_16496_pilon	-	1498	2	Intergenic	novelGene_5130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3558	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
887390	contig_11292_pilon	+	5904	4	Intergenic	novelGene_109421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1655	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	5540	5893	215508	449008	FALSE	40	AATATGTATCACTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVSLLFAYVRRTYRCFIPRELLAPSWEREAEMQDKNLKNRWQKLSISTEGSYGGVSASSSKGPDWCQSAIPTLLKANLPCPVPRPHSSWMSVLISPTLMLREILRVRFLFWKLRI	209968	449019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_215844_390091_390099_445630_445636_449002
887391	contig_2438_pilon	+	1923	3	Intergenic	novelGene_112062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	369	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	794	1270	311851	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	311057	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305_312409_312729
887393	contig_9177_pilon	-	6908	46	Intergenic	novelGene_32597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_29	1374.00025805522	988	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	3950	6472	9494	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	28436	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13696_13890_14061_18798_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
887394	contig_1450_pilon	+	2853	22	Intergenic	novelGene_27392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	523.345790397258	3	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	179	2662	308979	355748	FALSE	65	TTCTGCAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWYRLAFLSVRSLLKVTLLHPKYKHAHFETFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	299078	355939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_299115_308752_308805_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
887395	contig_8462_pilon	-	4770	17	Intergenic	novelGene_159421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	508.517314724877	1594	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	752	2080	235911	231564	FALSE	50	TGAAATTCAGTGAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLEEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEEPDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNVNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLESMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQSSGASSSGFSSSRAGSSRSGGGGHGGSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN	245413	228873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_231644_231853_231994_232351_232506_232811_232930_233055_233238_233431_233577_233656_233802_234185_234347_234449_234549_234760_234847_235892_236029_236489_236590_236676_236836_237573_237705_239551_239600_240961_241020_245275
887396	contig_6902_pilon	+	4225	16	Intergenic	novelGene_135583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	485.297736789832	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1372	4116	108	4223	460308	497975	FALSE	30	GTTTGAGCGAAAATTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPEKTEKKDPLPSPSPPPAPTQPQSVPPPPPPELEKPPSTETSAVAQKPSQDTEKPLEPLNSVQVEPTVKTVSQQMVSAPTVKEEKQPEKVITKDLVIERPRPDSRPIVKKESTLQTPRTYWKEARDWFPDQGYRGRGRGEYYSRGRSYRGSYGGRGRGGRGHPRDYPQYRDTKPRTEHVPSGPLRQREESETRSESSDFEVVPKRRRQRGSETDTDSEVHESASDKDSLSKGKLPKREERSENKKPIKPQFSFKPENHVRINNRPLEKPYMRDDDKSKPGFLPKGEPTRRGRGGTFRRGGRDPGGRPSRPTTLRRPAYRDNQWNPRQAEAPKPEDGEPPRRHEQFIPIPADKRPP	434576	497977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465199_466950_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273
887397	contig_1836_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_71082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	898	1377	995823	996302	NA	30	CTTCAGTTCTGTTTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRPLRDLRLAFGDTHPWELRLFTLLGLTQDAKQQTHTGPCQEPSSWRCWQFQLSVPESRALGTTTFAPLSRCFPPGLAVNSTCLLKIGSDILGGDEHERLLYLFSEQTKKEHSLPVVTLQRSVLTWKHYGANMRIYNSISNPTMSIKYTKILTDMTK	994925	996693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_994900_996700
887398	contig_20641_pilon	+	576	4	Intergenic	novelGene_52821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_3	1999.83816011863	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	63	476	14599	26870	FALSE	30	CAGAGGCCTGTAGCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKDVTDFISQLFVQLGTVGIYDLPPLRNKLVVK	14536	26970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_23896_23982_26859
887399	contig_7342_pilon	-	1673	2	Intergenic	novelGene_71091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1419	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAAAAGCTGCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23598	21798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_22890_23016
887400	contig_14030_pilon	-	2035	6	Intergenic	novelGene_62229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	460.168230107208	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	15	371	395000	337442	FALSE	15	GCTTTTGGTTTTAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLRFVASFSRRPWRRRGRRELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKGTTE	395014	335777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_394937
887401	contig_5023_pilon	+	2884	16	Intergenic	novelGene_7300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2204.32863450278	3	46	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	460	1005	611764	629249	TRUE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKTWPSLPTSSTDTLPCTNQRTRTSTGGLLKVRRGRSGHLGTG	580882	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609700_611683_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618640_625756_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643427_643539_646857_647649_647739
887402	contig_7189_pilon	+	4411	5	Intergenic	novelGene_117658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_4	240.669249178203	1710	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	172	639	537775	589197	FALSE	15	TTTTTTCATTGTACGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPGCNKDNVRAGCKKCGYPGHLTFECRNFLRVDPKRDIVLDVSSTSSEDSDEENEELNKLQALQEKRVNEEEEKKTTKSKEKIKLKKKRKRSYSSTSTEEDTSKEKKQKYQKKEKNKEKKSKSKKGKHHKKEKKKRKKEKHSSTSKSSEISKK	537603	592969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_537788_562190_562239_580573_580718_585140_585214_589007
887403	contig_6954_pilon	-	1691	2	Intergenic	novelGene_64461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	533	junction_1	0	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	86	1066	787255	783979	FALSE	10	CTAGTCTTGACTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVSVPQREPLVLGGRLAPLGFSARGYFGALPMVTTAPPPLPRIPDPRALPPTLFFPHFLGGDGPCLTPQRRATAPLTNCSFATAGGTPRAAPKKRRKKKVRASPAGQLPSRFHQYQQHRPSLEGGRSPATSQSGAHEVPGQAAAAAPAPAAATRTEETSPVLGPLPPAVPGQPSLRKEVLKSKMGKSEKIAIPHGQLVHGIHLYEPKINRQKNKYNLPLTKITSAKRNENNFWQDSVSSDKTQKQEKKPFKNTENIKNMHLKKSAFLTEVSQKENYAGAKFSDPPSPSVLPKPPSHWMGSTVENSNQNRELMAVHLKTLLKVQT	787340	783353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_784420_786715
887405	contig_9389_pilon	-	2140	2	Intergenic	novelGene_83883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAATAAATTTCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41911	35704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36502_40568
887406	contig_8712_pilon	+	2314	4	Intergenic	novelGene_58765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	399.961942633991	96	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	88	567	314974	321793	FALSE	35	TTCTGCGAACAAAACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPPRCRPAAACAASSDLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286933	323540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684
887407	contig_12837_pilon	-	5132	11	Intergenic	novelGene_57374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	218.829705478941	1432	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	326	1279	382687	371718	TRUE	25	TTGTCTTCAAGGTAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSMSCLRLLMAAGADIDAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTFDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWERDGEDEGVVPGTTPLDMAANWQVFDILNGKPYESELTSDDLLAQGDMKQLAEDAKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVKELVEALRQMGYTEAIEVIQTAFCSSGTATTSSVKTPSQAHSLPLSPSSTRQQIDELRDNESICDSGVETSFRKLSFTESLTSSGSLLTLNKMPHDYGQHGSIEGNV	383650	336041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_336274_341568_342111_348879_349397_369155_371879_375467_375649_376626_376800_377341_377409_378812_378938_381971_382075_382543_382714_383351
887408	contig_3475_pilon	+	4901	5	Intergenic	novelGene_177123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	77	340	355135	355398	TRUE	60	CAAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPFLSLSSLHSNSKLPWHSFLFVCMFFGSCSSLLTPIFPIPILAPHITIYPLLLAYLHRTLNITLPSSTGTAYWNLPCTDYRPTLVAVVSATNNPSQKLPLNWTSPVVLSD	355058	476150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3475_pilon_+_355490_355708_357057_369797_371850_474713_474779_475145
887409	contig_3269_pilon	-	9674	53	Intergenic	novelGene_117001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	564.730019737137	1566	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1479	4440	255	4694	238182	83005	TRUE	40	AGAAAAGTGTCTGTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRSSVVLEKTKVVEPLDYENVVTQRKTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVISRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLYKANVNSTITVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKDEKNLKESKGCIYLDACNDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQEKKETVETAQDDETGSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNLFSFDSEVQRLDFSGIEPDIKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQVGDNAKGPPTNVEPFFINLAVFDVKNNCKISADFHIDLNPPSVREMLLVPSAQLASEGNLKGSSPESFIHGIGESQLRYIKQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNITHCAEPYIKNSDPAKTAQKVHKTAKHVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLEGKFSPLYKQDSSKLSNEDILKLLSEYKKPEKTKLQIIPGQLNITVECVPVDLSNCISSSYVPLKPFEKNCQNITVEVEEFVPEMTKYCYPFTVYRNHLYVYPLQLKYDSQKTFAKARNIAVCVEFRDSDESDASALKCIYGKPAESVFTTKAYAVVSHHSQNPEFYDEVKIELPIHLHQKHHLLFTFYHVSCEINTKGSTKKQETAETPVGFAWVPLLKDGRIITFEQQLPVSANLPPGYLNLNDAESRRQSSVDIKWVDGAKPLLKVKSHLESTVYTQDLHVHKFFRHCQLIQSGSKEVPGELIKYLKCLHAMEIQVMIQFLPVILMQLFRVLTNMTHEDDVPINCTMVLLHIVSKCHEEGLDNYLRSFIKYSFRPEKPSAPQAQLIHETLATTMIAILKQSADFLSINKLLKYSWFFFEIIAKSMATYLLEENKIKLPRGQRFPEAYHHVLHSLLLAVIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFVFNLINDYISGFSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQDSNLEYSLSDEYCKHHFLVGLLLRETSIALQDNYEIRYTAISVIKNLLIKHAFDTRYQHKNQQAKIAQLYLPFVGLLLENIQRLAGQDTLYSCAAMPSSASRDEFACGFTSPTSRGSLSTDKDTVYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPEQGNTGENTRQSSARSSVSQYNRLDQYEIRSLLMCYLYIIKMISEDTLLTYWNKVSPQELLNILILLEVCLFHFRYTGKRNIARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRNRSGVMQARLQHLSSLESSFTLNHSSTTTEADIFHQALLEGNTATEVSLTVLDTISFFTQCFKTQLLNNDGHNPLMKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFATLRAFISKLFFSFPRPFSKEG	238436	42585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_45893_50721_50861_52711_52813_53479_53671_53949_54161_55787_55935_56458_56573_61063_61187_65584_65692_72223_72282_72369_72586_80198_80313_82852_83047_89133_89272_91826_91943_93500_93644_95065_95114_96508_96576_102313_102426_104463_104574_105782_105859_107404_107522_112745_112925_115117_115230_116027_116112_118223_118371_119434_119507_120641_120768_120847_120918_122517_122637_131160_131251_132098_132186_132898_133021_136091_136216_138378_138472_140687_140754_140845_141031_145524_145602_145785_145909_148350_148434_149948_150072_156408_156622_157848_157990_165525_165610_166881_166962_167349_167528_170005_170141_187440_187537_188192_188263_191236_191320_191725_191816_191896_192014_238080
887410	contig_7396_pilon	-	2786	15	Intergenic	novelGene_79541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3011.93572918392	83	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	118	1503	255163	246385	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257471	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
887411	contig_1867_pilon	-	3466	2	Intergenic	novelGene_54535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2275	2577	326410	326108	FALSE	30	GGAAGTCCTACAACAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKIQQNKLKKKKEQEKPPKDQWGKKKKTTRKEMPSGIPLHVCISRGGSLLATQHCLAKKGSQLKKRKRKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPRP	330353	325218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_326859_328527
887412	contig_9843_pilon	+	3155	10	Intergenic	novelGene_114326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_7	50.7783856029752	1353	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	609	1718	107444	136634	FALSE	30	TGGACAAGTATGTTCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYWKSQPKKFCDYCKCWIADNRPSIEFHERGKTHIENVAKRISEIKQKSLDKAKEEEKASKEFAAMEAAALKAYQEDLKRLGLESDISEPSISPVASTIPPTSASNQQKEKKKKKKDPSKGRWVEGITSEGYHYYYDLITGASQWEKPEGFQGNLKKTVKPVWVEGVSEDGYMYYYNTETGESKWEKPDDFIPHPGSLLSSKINEKAVGSLEESKSTDARNDSDEQKVEGDASTKTQKLTIKFKEKNKSSDKGTKPESQKEKSLPEKDSSHPKEEKPKAVKKSNPYGEWQEIKQEVESSEDIDLELPSADEYVSASVADGSGESKVVFKEKTVTSLGVVADGVAPVFKKRRIENGKSRNLRQRGDDQ	106835	138071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_107446_108429_108503_111440_111504_111587_111712_117714_117883_120061_120109_120930_121004_125607_125796_130105_130270_136426
887413	contig_5020_pilon	+	1373	7	Intergenic	novelGene_27903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_2	473.205616572284	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	132	1061	122915	125772	FALSE	0	TTGGTGTCTCCTCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQRETLQGRIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	119566	126084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
887414	contig_14970_pilon	+	2362	12	Intergenic	novelGene_44984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_5	6300.99509391602	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	129	1661	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136016	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
887415	contig_3888_pilon	-	5074	4	Intergenic	novelGene_178516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4096	4557	30310	29849	FALSE	50	CTTAAAGGAAATGGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQEDITIKNIYAPNNRAPKYIKQTLTALKREIDSSTTVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILDHKASLNKIQSFEILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKNQTHGS	142586	29331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3888_pilon_-_30598_53360_54044_80162_82642_141940
887416	contig_16103_pilon	-	312	4	Intergenic	novelGene_118810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	581	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACCGCCGGAAAGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605582	603914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_603922_604251_604357_605004_605116_605493
887417	contig_6445_pilon	-	3831	14	Intergenic	novelGene_77012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2083	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACACTCGGGGAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667766	522056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515_644717_656008_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663
887418	contig_16303_pilon	-	2094	3	Intergenic	novelGene_34077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	554.5	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	53	616	47976	34567	FALSE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGKSSHVVVGRSQFIWGCYTEGLSSFWAISQRLPSVPCCMGLSKHDCLLHQSLQAEKAVDRVS	48028	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_34746_40424_40731_47897
887419	contig_5945_pilon	-	2158	12	Intergenic	novelGene_104584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	195.730798431278	1018	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	715	2157	308421	279663	FALSE	20	GTATGTATTTATCATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIEEKSLKSKKDKRPPRLECLEKLEKSKKTFLDNDTQRLSPIPEEVPRSTEKEPEKPGSPEAAETSPSNMTGLCDKLASEKEVVECQSTSSGEGQPLEAGNSKILKENSESLKVEMDNLNNAQASVIEDSSETKGSIQKSKFKYKLISEEETTASENREITSERQKEGIKLTIRISSRKKKPDSPSKIVEPETKQEKMEKEEEKANVGRTLRRSPRISRPTAKVAEIRDQKADKKRGEGEDEAEAESAALQKTDKKENLKKTEKDTNSKVSKVKPKGKVRWTGSRTRGRWKYSSNDESEASDSEKSSAASEEEKEKESEEVIPADDDEPCKKCGLPNHPELILLCDSCDSGYHTACLRPPLMIIPDGEWFCPPCQHKLLCEKLEEQLQDLDVALKKKERAERRKERLVYVGISIENIIPPQEPDFSEDQEEKKKDSKKSKANLLERRSTRTRKCISYRFDEFDEAIDEAIEDDIKEADGG	378728	279661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_279730_285739_285850_287295_287351_295379_295460_297011_297117_305613_305821_307602_308467_309248_309369_331936_332092_343035_343242_345424_345518_378633
887420	contig_8156_pilon	+	3479	4	Intergenic	novelGene_98951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2275	2598	685174	685497	FALSE	85	AAAACAAAAAAAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQELRQKPGKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIIQEQNAKINSQIEIIQIQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRINGIEEKHSDTTLFQENSEKRKMKQP	565541	686378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_566595_566714_567248_570692_570814_684606
887421	scaffold_12124_pilon	+	2402	11	Intergenic	novelGene_22326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	15	junction_10	3170.34192004585	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1452	2231	1508626	1509405	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483572	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508292_1508393
887422	contig_5959_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_150202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAGAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345035	347720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_345000_347700
887423	contig_12654_pilon	+	8746	41	Intergenic	novelGene_129272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	45	junction_40	139.520103838121	855	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2103	6312	499	6810	662573	736428	FALSE	20	GGATCAACTGCTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGGDPFEEGMNDPDLASWSNEMVDDRLNNMDWSGQQKKANRSSEKNKKKFGVEGDKRVTNDISPESSPGVGRRRTKTPHTFPHSRYVTQMSVPEQAELEKLKQRINFSDLDQRSIGSDSQGRATAANNKRQLSENRKPFNFLPMQINTHKSRDAAASPPRRQAVGAAQCKELFASALSNDLLQNCQVSEEDGRGEPAIESSQIVSRLVQIRDYISKASSMREDLVEKNERSANVERLTHLIDHLKEQEKSYMKFLQKILARANEEEDVRTIDSAVGSGSVAESTSLHVDVQSEASDTTARDPQQEPVEEIEDLKKQHDLLRRMLQQQEQLRALQGRQAALLALQHKAEQAVAVMDDAEKAAGTTADHPTAPGRQPARSPLHQRVPLRETTGSLSGISITSELNEELNDLIQRFHNQLRDSQPPAVPDNRRQAESLSLTREVSQSRNPSVSERSPDEKVQLFSKMRVLQEKKQKMDRLLGELHTLRDQHLNNSSFVPSAASPLRSVDQRSTSSAPSAPGGLAAVGNGEPTSLTSSVPYPTAALVSQNESENEGHLNPTEKLQKLNEVRKRLNELRELVHYYEQTSDMMTDAVNENTKDEETEESEYDSEHESPEPVTNIRNPQVAATWNEVNTNTNAQCISNNKDGRSVNSNCEINNRCAASMRAPNLPSSLDCRYNREGEHGIHVAPGEEDDEEEEDAEEEGASGASLSSHRSSLVEEAPEDAEFEQKISRLMAAKQKLRQLQDLVAMVQDDDADQGVTSANTSNLDDFYPTEEDTKQNPNNTRGIANKTQKDAGVDEKEREQFYEAKLRQQQRELRQLQEERRKLIEIQEKIQALQKACPDLQLSATSVGNCPTKNYLPAVTSTPTAHENDTNTGKSVLEPEESSVVDNELWTEMRRHEMLTVELRQRRKQLEALMAEHQRRQGLAETTSPVAVSVRSDGSENLCTPQQSRTEKTMATWGGSTQCALDGEDGDEGGYLSEGIVGTDEEGEEEEQDASSSDSFSVCPPNSVNRNSYNVKETKNRWKNNRPFSADGNYRPLAKTRQQNVSMQRQENLRWVSELSYVEEKEQWQEQINQLKKQLDFSVSICQTLMQDQQTLSCLLQTLLTGPYSVMPSNVASPQVHLIMHQLNQCYTQLTWQQNNVQRLKQMLNELLRQESQHPEKPGSKERGSSASHPASPSVFCPFSFPAQPVNLFPLPGFTNFSSFTPGMNFSPLFPSNFGDFSQNISTRTEQQQPLAQNPSGKTEYMAFPKPFESSSSAGAEKQRNQKQPEEEVENSRPPWLYDQGGEVEKPFINAGFAASVEKTTNSNRKTHFDSSRRSRQFDEESLESFSSMPDPIDPTTVTKTFKTRKASAQASLASKDKTPKPKSKRRSSTQLKSRVKNIGYESASMSSTCEPCKSRNRHSAQTEEPVQAKAFSRKNHEQLEKIIKYSRSAEISSETGSDFSLFEALRDTIYSEVATLISQNESRPHFLIELFHELQLLNTDYLRQRALYTLQDIVSRHVSERREKEEQDGKLVNSGTWIASNSELTPSESLATTDDETFEKNFERETHKISEQNDADNASVMSVSSNFEPFATDDLGNTVIHLDQALARMREYERMKTEAESNPNLRCTCRIIEEEDGAAATTAVNSVEETPVAENHSSQQPASEVSNIPCPRIDTQQLDRQIKAIMKEVIPFLKEHMDEVCSSQLLTSVRRMVLTLTQQNDESKEFVKFFHKQLGSILQDSLAKFAGRKLKDCGEDLLVEISEVLFNELAFFKLMQDLDNNSITVKQRCKRKIEAAGVIQSYAKEAKRILEGDRGSPAGEIDDEDKDKDETETVRQTQTSEVRDGERPKNGTSDPSDQEEDEESEGCPVSINLSKAETQALTNYGSGEDENEDEEMEEFEEGPVDVQTSLQANTETTEENEPEQVLQHDSEKTADSKNIPTEQEPTIIKDDQAGTPVKPCYLHISENEQPPSSAARKDSLVTPESWKQPDPLPLPFPEGDTLVPGVKEAKSAQETPESSLAGSPDTESPVLVNDYEAESGNISQKSDEEDFVKVEDLPLKLTIYSEADIRKKMVEEEQNNNLSGEILRETQTEELAGNSQKLKEPETVGAQSI	650834	738364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_651238_652960_653031_662547_662669_664432_664679_666373_666644_667358_667530_667762_667880_672271_672450_672567_672658_675037_675139_676079_676297_678631_678834_680073_680248_680750_680909_681009_681246_685943_686096_686234_686365_687385_687527_688080_688272_689701_689909_690459_690680_690797_690944_691580_691772_693759_693932_696417_696777_701085_701251_705915_706089_706404_706537_710696_710818_712276_712436_712984_713122_718652_718788_720588_720787_722411_722475_726471_726608_727102_727261_730463_730540_731073_731331_734140_734234_734328_734447_736402
887424	contig_5196_pilon	-	2922	5	Intergenic	novelGene_38665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	353.707859680839	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	964	1725	14523	9642	FALSE	40	TTGAGAAAATACTTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	15724	8444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_14779
887425	contig_10750_pilon	-	4206	4	Intergenic	novelGene_172608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3628	4038	111021	101344	FALSE	25	TGTGCGGCGGTTGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTTPLQVIISGIVDHMIVRFKMANTVHFSSLMPRISMFMCFISFLTISNFPRFILRIFHVLIINGCLQLFLLIWSSATSANEGPESLTPPTSLKSTTLMRQHFPNHLLSAFQPEGLIFWHYIRQCSAAIPKVFTG	146725	101175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_101676_110942_111879_143874_145534_145614
887427	contig_4232_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_63333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468088	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
887428	contig_11292_pilon	-	1977	7	Intergenic	novelGene_109480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_3	207.011808573542	192	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	88	1356	481968	474098	FALSE	40	TTTAAAAAGATGTCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKSRAVPGRRPILQLSPPGPRSSTPGRDPEPEPDTETDSTAAAASQPVPMAVVPATTTALTAVAASEDSPSEDPDEQEVVVEVTRVVQHPPKPVMTTRPTAVKATGGLCLLGAYADSDDDESDALEKPAQSKEANGNQSTDIDSTLANFLAEIDAITAPQPAAPVAASAPPPTPPRPEPKESSTSALSSTASNGTDSTQMSGWQYDTQCSLAGVGIEMGDWQEVWDENTGCYYYWNTQTNEVTWELPQYLATQVQGLQHYQPSSVTGAEANFVVNTDVFTKEKTVSASSSRSGPVIAKREVKKEVNEGIQALSNSEEEKKGVAASLLAPLLPEGIKEEEEKWRRKVICKEVEPVSEVKEASTAVEEAATIVKPQEIMTDNIEDPSQEDVCSVVQSGESDEEEEQDTLELELVLERKKVSF	482055	473476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_474452_475351_475473_475569_475718_476726_476914_477144_477282_480058_480158_481745
887429	contig_10766_pilon	+	5272	10	Intergenic	novelGene_151218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1171	junction_3	630.0006074855	1498	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	194	970	191198	212781	FALSE	35	ATAAAGTTGTGGACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSVGYIYVDRLSRLDISFLLDASSLSRAEEDLNITVHAACENEGDVGTLKNNKVTLAIPLKYEVMLSVHGFVNPTSFVYGSHEENEPQTCMEEKINFTFHVINSGHSMAPNVSMEIMVPNSFTPNTDKLFNILDVQTSTGECHFQNYQRECLQQQKGVVESMKDIFKFLSKSDKRLLYCIINDPYCLNFVCNFGRMESGKEASVHIQLEGRPSVLEMDDTSTLKFEIKATAFLEPNPKVIELNKHENVAQVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLILLLLISYVMWKAGFFKRQYRAILQEENRRDSWSYVNSKSNNDD	189883	217083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_189924_190640_190721_191124_191215_193728_193820_198580_198689_199550_199674_200383_200504_211449_211549_211986_212107_212682
887430	contig_9091_pilon	+	1835	4	Intergenic	novelGene_32412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1242	junction_3	185.991039210675	166	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	5	451	2310	6220	TRUE	30	GAGGAGCTGAATGGTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVNVKANPKVIDTGGGFLLEEEEEEEHKIGQVVHQPGPVMEFDYTICEECGKEFMDSYLMNHFDLATCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCELEKREPALKFIVKKNPHNSQWGDMKLYLKLQVSNKLYLFISDSGSGEVLTMN	2305	13934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_2419_3892_3999_5988_7197_13526
887431	contig_14871_pilon	-	3405	4	Intergenic	novelGene_63724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_3	205.791696193559	899	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	131	385	316026	291301	TRUE	25	TTTTGCACTCAATTACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGKKSYLGGGAGAAGGGGADPGNKKWEQKQVQIKTLEGEFSVTMWSSDEKKDLDHETVVEEQIIGENSPPDYSEYMTGKKLPPGGIPGIDLSDPKQLAEFARMKPRKIKEDDAPRTIACPHKVSNVR	316156	287470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_291380_299799_299963_316013
887432	contig_15021_pilon	-	2851	18	Intergenic	novelGene_26979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	893	1351	346325	340078	TRUE	10	CCCTGGTCTTTGGCGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIKSWSLSSAVGNMMRAPVLSRTLRILPPPLPMRNLWYSGLARMSTVKLLVCCLLGQVQELLLGLLHIRGRPPDDNRVASRTFHRKVDVDATALLHDGADQAALGANEGVVQLGWDGDLHLGNVGLVFLNRKNPAPGSFAVCPLACDDNGL	353712	326164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_326242_332246_332453_332674_332892_333103_333313_333451_333560_334695_334802_335114_335195_336589_336729_338548_338653_338749_338865_339780_339867_340024_340156_343843_344064_346164_346387_346509_346728_346938_347079_348984_349054_353308
887433	contig_6898_pilon	-	3520	10	Intergenic	novelGene_35744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4325	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2395	2721	124838	122725	TRUE	20	CTCGGATACATCCTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127706	114332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_114525_115894_115979_116669_116817_117863_117962_119611_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479
887434	contig_8879_pilon	+	2552	1	Intergenic	novelGene_158996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTGAAATGTAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405928	408480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_+_405900_408500
887435	contig_10990_pilon	+	3056	20	Intergenic	novelGene_7460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	364.077721451914	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	575	3025	722379	752144	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708563	752175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
887436	contig_12277_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_139688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1128	1478	232409	232059	NA	40	AGGGCCAACGTCAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHDPVTRRTTWCPATTTDCSGWDQNKGSTTECPGQSRRKTAEQKIKFTEKTRLTSLTETGGTSETTARRHPSELQLKPLSETTHQPNHRRKTKPVTVESNCPTGFPRRGWWI	233536	231410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_231400_233500
887438	contig_14450_pilon	-	6126	2	Intergenic	novelGene_48964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3212	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCACACTCACTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043026	1036855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042833_1042877
887439	contig_18208_pilon	-	314	3	Intergenic	novelGene_176203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_2	537.5	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	285	29	313	155993	154714	FALSE	45	TAAATATCTCAGCTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAWSCGTASMGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIE	156021	154712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154835_155353_155514_155989
887440	contig_5419_pilon	-	3850	1	Intergenic	novelGene_15507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGTAATCATTACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244894	241044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_241000_244900
887441	contig_14744_pilon	-	2158	3	Intergenic	novelGene_66159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	152	814	1702790	1695288	FALSE	60	ATTGGTACCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVSPDSGSLDYGRPSLGSRNPALWLPPCPAQLLSPRCFLSFWASCSSPPRMASMHLQVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKDNYPVFYLFRDGDFENPVVYSGTVKFGAIQRWLKGQGVYLGMPGCLPAYDTLAGEFIKASGKEARQALLKQGQDTLANVKETEKKWAEQYLKIMGKVLDQGEDFPASEITRITKLIEKNKMSDGKKEELQKSLNILTAFQKKGAEKVEL	1702941	1693943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1695791_1697721_1697877_1702785
887442	contig_7963_pilon	+	1442	7	Intergenic	novelGene_58564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	206.387984146364	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	22	1050	249285	253116	FALSE	15	GTATTTTGTACAGTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	249263	253508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_249345_250156_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
887444	contig_1263_pilon	-	2178	3	Intergenic	novelGene_170381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1275	20	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76807	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53569_65278_65324_76564
887445	contig_401_pilon	+	1442	9	Intergenic	novelGene_42828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1265.08860855673	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	56	715	1711949	1715475	TRUE	35	TCTTGAATGGAATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711893	1716433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713179_1713658_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
887446	contig_5669_pilon	-	8764	10	Intergenic	novelGene_86065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1130	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	7310	7627	187238	185904	FALSE	45	TTACTCTAAAGCAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTHLFLFLLLLLSWPKGVVLTGLCFCGCRAVGADLVDLVGLRRHVPGPIIDEAEIAALVKGASQVGLPLGGVGLIHALGVLPGLLGPGLGRKRRQPTTENLACA	251077	184766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_186141_186549_186626_187233_187512_187718_188111_188197_188315_189008_191766_191890_193360_193691_195364_250410_250909_250946
887447	contig_15114_pilon	-	2926	3	Intergenic	novelGene_121196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	378	944	798808	798242	TRUE	20	GTACCTGGGCACCATGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGHWNAKVGNKEEGSAAGKYGLDYRNDTRDGMTGFCKTNDYFVANTFFYQNNRRQHTWTSPDGIYRNQIDYMCGKRQWESSVSSVRTRPRDNCRTDHQLHICKFKLKLQKSRTSPLEPKYNLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDRRPDELWNDIIHEESKRSLKTQDRKKRPKWMLQETLEFAPER	799250	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_755185_797556_799050_799114
887448	contig_3469_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_34213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAACCCTGCCCTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546508	544456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_544500_546500
887449	contig_10437_pilon	+	1601	8	Intergenic	novelGene_38298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	49	1071	431167	451175	FALSE	30	CTATCATTGCCACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431118	451705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
887450	contig_12638_pilon	+	2758	17	Intergenic	novelGene_33108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	502.182949574903	66	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	822	1877	182987	199604	FALSE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170806	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
887451	contig_16322_pilon	+	3123	1	Intergenic	novelGene_87524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTTAGGTGCCATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69343	72466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_69300_72500
887452	contig_17074_pilon	+	2396	4	Intergenic	novelGene_145098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	287.711661216573	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	160	498	208015	223677	FALSE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVAGSSTGPCGPSSSAAWHWCPSSLLGHGYRPKSWSETGLAPA	207855	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213470_223551
887453	contig_10890_pilon	-	2425	5	Intergenic	novelGene_166779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	486.991016344244	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	313	672	130273	126635	FALSE	35	ACAACTCTTGGGTAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	160759	124881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_156819_156927_160559
887454	contig_5794_pilon	+	5990	2	Intergenic	novelGene_69766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1885	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACAAATGGATGCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702779	714670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_707492_713392
887455	contig_21007_pilon	+	1093	1	Intergenic	novelGene_161551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACTACGTATCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765	1858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_800_1900
887456	contig_10023_pilon	-	4114	3	Intergenic	novelGene_123472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	313	junction_1	2.5	822	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAACTGTTCTTCCGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137675	128911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_132681_136935_136996_137390
887457	contig_7333_pilon	-	2307	8	Intergenic	novelGene_142790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAAAACAGTTCTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237504	220681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_221915_222678_222775_222949_223024_223596_223675_224011_224319_230327_230391_236788_236836_237095
887458	contig_7915_pilon	-	1738	3	Intergenic	novelGene_42988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	966	junction_1	31	12	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145396	142157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972
887459	contig_11816_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_98548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085709	1083090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1083100_1085700
887460	contig_14925_pilon	-	2235	7	Intergenic	novelGene_55339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	980.967620373997	109	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	643	1056	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	322461	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129491_321808_322113_322212
887461	contig_1575_pilon	-	4743	2	Intergenic	novelGene_45166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2603	3046	70659	70216	FALSE	25	TTTTAACCCTGGAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPFSMNLYIFSSFLSVFCFNSWIILNIGDSNSLSVRSSAFSSTGWSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQYLFSSFIDCRFVCFVLVFLFYLVMSEQAGCAFFVCSSVGTILFTSFSNGQCQSLRYGTAGQVQLKGSY	73539	68518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_71882_72159
887462	contig_16666_pilon	-	1660	2	Intergenic	novelGene_61790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	585	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATATAGATAGCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120496	118751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_118760_118844
887463	contig_15977_pilon	+	3821	4	Intergenic	novelGene_137210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	82.5146451647625	376	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	84	1403	77599	78918	TRUE	25	AAAGATATGTGCCTTGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISGLRFETQLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEIRFYQLGEEAMEKFREDEGFLREEERPLPRRDFQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASPSQDLFRTASNGTSGAPAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDVVAIIPYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSTFPQTTFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV	77515	92041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_80519_83878_84001_90412_90525_91457
887465	contig_4812_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_103628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAAACTACAACAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78487	80400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_78500_80400
887467	contig_12278_pilon	+	3271	10	Intergenic	novelGene_152596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	299.355769183107	827	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	84	1460	194972	201939	FALSE	25	TTCCCAGAGCTCCTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLTGMILWWWKQWTSSPMSKGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	194888	203750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_195038_196480_196599_196695_196882_197627_197750_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
887468	contig_5686_pilon	-	3712	17	Intergenic	novelGene_45249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1830	2501	208699	203000	TRUE	15	AGCCACGGGCCGCCCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	221598	93788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_219759_220944_221463
887469	contig_10861_pilon	+	6399	15	Intergenic	novelGene_39219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	120.013349597587	1200	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2644	3000	593769	603091	TRUE	10	GGGACGCAGCGCGCGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERHSGTGNVSAACLPHHSSRGTSWAAHLLRRTKTQSQMKTAGFVVCTGVSAAQNLLLPFCHLYLILPDSDNSTFLGLGAGEGDSLFSVTLCFVTEVLPGETETRLFLVRFDCWGVGE	582608	614409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_583681_585564_585767_587630_588852_590760_590875_593734_593880_596268_596353_596844_596933_603017_603289_605072_605190_605701_605897_606400_606601_607921_608038_608886_611260_611523_611611_614295
887470	contig_5649_pilon	-	7501	49	Intergenic	novelGene_82283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6011	6364	153515	149907	TRUE	20	TCCGCTTGTTTCTCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGIVSKTEDLWIYKGMLNEGELAFCVFPRSIYEVYREHFHSQTSLNTINHIMKSFTVTNLKSRMVQFISYFLEIQTWVQFFENINQDFYIPCMCLCSITFIFPITPDATSRSRDTL	203505	94516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_94609_126397_126625_145420_145527_146101_146201_146614_146684_146771_146828_147491_147687_148624_148795_149783_149911_150059_150172_152883_153052_153445_153577_154086_154329_156610_156730_157503_157628_157819_157972_164097_164248_164587_164679_165469_165672_166772_166922_168032_168160_168454_168737_169639_169719_171510_171744_172063_172203_173116_173299_175074_175190_175537_175652_175975_176053_176223_176404_177179_177309_178571_178873_179498_179640_179732_179838_180469_180588_181689_181882_182440_182584_183101_183210_183312_183485_184367_184601_186999_187249_188081_188245_188448_188568_190179_190282_198338_198489_199800_199982_201360_201494_202871_203009_203189
887471	contig_10482_pilon	+	4101	5	Intergenic	novelGene_152807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	1184.33364703533	5	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATACATCTGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77251	129804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118623_125971
887473	contig_9752_pilon	+	5736	4	Intergenic	novelGene_122000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	274.554588783765	1922	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1192	3579	205	3783	68566	72144	TRUE	5	CTTACTTCCTTGCGTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVMSLSRDLKDDFHSDTVLSILNEQRIRGILCDVTIIVEDTKFKAHSNVLAASSLYFKNIFWSHTICISSHVLELDDLKAEVFTEILNYIYSSTVVVRRQETVTDLAAAGKKLGISFLEDLTDHHFSNSPGPYVFCITEKGVVKEEKNEKRHEEPAITNGPRITNAFSITETENSNNMFSPLDLRASFKKVSDSMRTSGLCLERTNVCQEPEPVRTLAEHSYAVSSAAEAYRSQPVCEEASSSTGKAGKENGEALAAKPKPCRKPKTLSIPQDSDPPTENIPPPPITNLEVNQERSPQPAAILSQSKSPHNEGDVDIPREDENKSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKSFDSSALLSAHMQLHKPTEEPLVCKYCNKQFTTLNRLDRHEQICMRSNHMPIPGGNQRFLENYPTIGQNGASFTGPESLLSENRIGEFSSTGSTLPEMEHMVKFVNGQMLYSCVVCKRSYVTLSSLRRHANVHSWRRTYPCHYCNKVFALAEYRTRHEIWHTGERRYQCIFCLETFMTYYILKNHQKSFHAIDHRLSISKKTANGGLKPSVYPYKLYRLLPMKCKRAPYKSYRHSSYENVRENSQMNESVPGTYVIQNPHSSELPTLNFQDSVNTLTTSPAIPLEASACQDIPTSTNVQNAEGTKWGEEAVKLDVDNNFYSAEVSVSSTENAVNSDLQAGGVPVLPVSNGSEKSTSVISYSGSAPSVIVHSSQFSSVIMHSNAVAAMTSSNNRAPADLAVSQSLKDNSKPEPDKGTKVASIKEKKKTIQHNKGEIPEESKYVADPGGSLSKTPNVTEETSKIETYIAKPALPGTSTNSNVAPLCQITVKIGNEAIVKRHILGSKLFYKRGRRPKYQTQEESLLQDSYPETKGDSPLGLCQSECVEMSEMFDEASDQDSTDKPWRPYYNYKPKKKSRQLRKMRKVSWRKEHGNRSPSNKCKYPAELDCAVGKAPQDKAFEEDDNKEMPKLQCELCDGDKGATPGSQGRPHRHLTARPHTCELCAKQFQSPSTLKMHMRCHTGEKPYECKTCGRCFSVLGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCSKAFTLNETLKIHERIHTGEKRYHCQFCFQSFLYLSTKRNHEQRHVREHNGKGYACFQCPKICKTAAALGMHQKKHLFRSPGQQEKMEGDVYQENSNPLENPHCIDSEDNDQKDDAHAIVENVVL	17577	74972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_17677_19617_19723_68565_73484_74358
887474	contig_15327_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_70648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGGACAAGAGCCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899727	901035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_899700_901000
887475	contig_7707_pilon	+	3628	1	Intergenic	novelGene_72106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACGTAGAACTTCAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3463	7091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_3500_7100
887476	contig_6059_pilon	-	2059	15	Intergenic	novelGene_44858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	3964.09952715929	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	404	1843	580626	569146	TRUE	75	AAAATGAAAAAAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPAVSAESAECVLRDRNTHLLLKKSKKNIKKPFKKPKKNLQKIRVSPAGDFYFFLFLFYKITGERDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	568029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581045_584679
887477	scaffold_12124_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_22398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	481	1260	1508626	1509405	NA	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508145	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508100_1510600
887478	contig_9921_pilon	+	2145	2	Intergenic	novelGene_23760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACATCTTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324403	326586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_324761_324798
887479	contig_16119_pilon	-	1640	7	Intergenic	novelGene_164270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	85.1464424780429	736	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	371	868	85327	76525	TRUE	10	TTTATCTTTGTCTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERKVKRRSPKSFSAHSTQVVNTKKSAIPVSKSTGFSNPATQSTSQRPKLKRVTKEKTRPQGGEGKGAQSTPIQHSFLTDVSDVQEMERGLLSLLNDFHSGKLQAFERSEQRHMGTSYHQESSAGSRAHPLDLRFLRREAPRSQRKTDDMDFPPELMEKAFPWS	87344	67785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_-_68347_72574_72598_73733_73889_76491_76701_78145_78310_85169_85370_87016
887480	contig_8174_pilon	+	6931	5	Intergenic	novelGene_160040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	305	junction_2	90.6793802360823	951	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	322	1545	246362	294744	FALSE	45	TTATAATGAAATGTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAITLWQFLLQLLLDQKHEHLICWTSNDGEFKLLKAEEVAKLWGLRKNKTNMNYDKLSRALRYYYDKNIIKKVIGQKFVYKFVSFPEILKMDPHAVEISRESLLLQDRDCKLPPEVREAHKHSLSALKSTSRNEYIHSGLYSSFTINSLQNPPDSFKAIKTEKLEEQPEGSPPVEEVRTVIRFVANKTNKHVTRPVVSLPSTSEAAAASAYLASSVSAKISSLMLPNAASISSASPSSSRSPSLSPNSPLPSEHRSLFLEAACHDSDSLEPLNLSSGSKTKSPSLPPKAKKPKGLEISAPPLVLSGTDIGSIALNSPALPSGSLTPAFFTAQTPNGLLLTPSPLLSSIHFWSSLSPVAPLSPARLQGPNTLFQFPTLLNGHMPVPIPSLDRAASPVLLSSSSQKS	210940	300130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_211260_246359_246569_274876_275672_291256_291380_294645
887481	contig_5758_pilon	+	3987	6	Intergenic	novelGene_119069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	766	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTCATCTCGAACCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89753	179174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_93086_93309_93404_110248_110354_111275_111347_113761_113987_179014
887482	contig_5643_pilon	+	4392	15	Intergenic	novelGene_39092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	873.875148697	34	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	3404	4180	636518	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631455	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631559_631884_633538_633588_633768_634183_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
887483	contig_10930_pilon	-	3779	1	Intergenic	novelGene_37062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1492	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2443	2748	286277	285972	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVVWFCLLLGWKVVSGNGCSPSQKGVLGPCSQGLLQSSSRPVNLIFFYEFDFLFYVFLPLCPGSSIVILVRALSSVAGHHVVLVSGMAAVLYTLSSNHF	288719	284940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_284900_288700
887484	contig_4232_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_63423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1958	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAATTTGAAAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468138	467710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467700_468100
887485	contig_9297_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_69829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTAGAAGATGAGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562953	561560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_561600_563000
887486	contig_8712_pilon	+	3059	2	Intergenic	novelGene_58825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACTGTTTACAAAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320142	324583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_320303_321684
887487	contig_987_pilon	-	2655	4	Intergenic	novelGene_72313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTTTGGACTCGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194199	991280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_991623_995960_996202_1169534_1171358_1193950
887488	contig_14445_pilon	+	6091	5	Intergenic	novelGene_137375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	471	junction_1	66.7382948538543	1859	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAATCACAGGAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336935	365199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095
887489	contig_7963_pilon	+	4155	2	Intergenic	novelGene_58289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTCTGGTGAGCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37162	42031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284
887490	contig_10811_pilon	+	1800	2	Intergenic	novelGene_165813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2123	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	113	652	456845	457384	FALSE	20	AAGACATGGTTCTGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPSAAAAGAEHPQVQPAAHGRLHQAAHGQVCGQPARMAAQMGQLGQLGQPGLGADGTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQPNPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQMATSLSNQVRSPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHASPQTGSPHPGLAVTMASSIDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPTRNALSSELALVGDTTGDTLEKFVEGL	456278	458532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_456391_456844
887491	contig_15666_pilon	-	6793	5	Intergenic	novelGene_70119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	335.366217738162	80	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	44	769	110619	108530	TRUE	55	AAATTCTCAAAATATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110662	102468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_103650_103686_108859_109098_109138_109948_110246_110558
887492	contig_10451_pilon	+	2363	1	Intergenic	novelGene_138306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGGGGTCACAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136073	138436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_136100_138400
887493	contig_15518_pilon	+	4644	4	Intergenic	novelGene_127601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	126.323218592449	236	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	585	1040	15096	38055	FALSE	25	GAAGGGGAATCTTGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPAPSFLL	11046	41659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_38035
887494	contig_8978_pilon	+	1688	2	Intergenic	novelGene_49369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTAGCTTTTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326969	329602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_327096_328040
887495	contig_13863_pilon	+	1651	9	Intergenic	novelGene_42064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	275.140617457692	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	949	1344	488993	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455668	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
887496	contig_2067_pilon	-	3236	1	Intergenic	novelGene_158932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGATAAAACCAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606836	603600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_603600_606800
887497	contig_7720_pilon	+	3823	2	Intergenic	novelGene_155766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4230	junction_1	0	61	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAACAGGTGGCTATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700598	707476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_701962_705016
887498	contig_15087_pilon	-	2645	27	Intergenic	novelGene_37210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_25	975.227087042692	16	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	268	2124	158925	113497	TRUE	30	TCTGTAAAATGAGTGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181187	110650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_164743_164864_181066
887499	contig_7396_pilon	-	5152	10	Intergenic	novelGene_79614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1473.48675252835	151	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	3503	4645	251531	246442	FALSE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	255033	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447
887500	contig_12327_pilon	+	5599	5	Intergenic	novelGene_140667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	22.0383189014044	393	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	52	360	1124059	1131941	TRUE	30	CAAATGTTTTATGGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLRAFTCDDLFRFNNINLDPLTETYGIPFYLQYLAHWPEYFIVAEAPGGELMGYIMGKAEGSVAREEWHGHVTALSVAPEFRRLGLAAKLMELLEEISER	1124007	1137647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128368_1131065_1131157_1131801_1136479_1136945
887501	contig_10404_pilon	+	882	6	Intergenic	novelGene_138658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	68	517	1085448	1099868	FALSE	25	GCGTGGACTATGGACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085380	1100233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
887502	contig_13780_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_149113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTCTCCTGCTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819149	820558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_819100_820600
887503	contig_8773_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_74524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1919	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAACCCCAGATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41722	44449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_41700_44400
887504	contig_5033_pilon	-	8462	6	Intergenic	novelGene_28902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1559	junction_2	616.522635431985	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	130	579	464569	450673	FALSE	35	CATAAAGCAACCGTCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	464698	442789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547
887505	contig_5623_pilon	+	3393	8	Intergenic	novelGene_154800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3385	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2710	3093	209004	210200	TRUE	0	TTGGTTTGCGGCTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVIGEDEWDSFTVDSKLGLEIPQKVAKINVEQLPTFTDHDVVTVPIADAQHIGGHTVASTGKGELLDGSVQGLPGFLDLSQLSRASLLKAAVAAMLLLFSWMLAMVSEWSTTSMRPVRSPVERQP	205174	211302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207791_208503_208551_208957_209106_209280_209409_210046_210212_210730_210808_211004_211121_211206
887506	contig_10176_pilon	+	3979	1	Intergenic	novelGene_72716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAATAAGTTTTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258511	262490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_258500_262500
887507	contig_12313_pilon	-	3651	13	Intergenic	novelGene_171842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	48.7251361094958	933	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	174	1217	115291	73274	TRUE	30	CTTTGCCAATCAAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPASSQPPSAPPSKGKSRKKKDLRITCVCKPPPPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	115464	69825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_70761_71774_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_100064_100114_100522_100590_115242
887508	contig_15029_pilon	-	3013	6	Intergenic	novelGene_128184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	1850	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	48	623	172327	163104	FALSE	25	CCTAATCTGATTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172374	160713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
887509	contig_7541_pilon	-	3774	4	Intergenic	novelGene_178517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	2745	3242	292093	291596	FALSE	65	ACTAAAAAAGAAAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSTNTPPTAAKYTFFTNAHGTFSRIDHILGHKASLNQIQSIKILQSIFSDHKAIKVKINNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGIKKFMESNENETHPTRTFGTSKSSAQRSVYSNKCTHTKRRKGQNQNINPTTGTSRMRAAKEALRHQKKGNNKN	314281	291063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7541_pilon_-_292526_292766_293189_312115_312345_312620
887510	contig_5316_pilon	+	2629	10	Intergenic	novelGene_61230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	308.721377440709	233	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	349	1650	453918	550408	FALSE	45	TTTAAAAAATCTGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	450383	551387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453775_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
887512	contig_14445_pilon	+	2597	13	Intergenic	novelGene_137356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	103.638092256982	1237	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	109	1530	277789	360205	FALSE	10	GTTGTATTTTTCAGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIRPSRRPLFRCGSPPLRSQPPGRGRHRRRRTGRRAMASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTRDDSGPEDNIWKGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLFLNFEQVKSIMYWLDPNLRYATREADIMEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGIYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	277680	361272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_277968_306298_306391_317729_317775_321012_321138_323271_323431_327188_327341_331031_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095
887513	contig_5429_pilon	-	3512	12	Intergenic	novelGene_127798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1224	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2784	3308	457980	427519	FALSE	30	CGAAGTTCAAAGTCTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLKTLFCRCHSHRGGDLAAPPWDRSRWSGRRSLGRYAPGAASGRRTCQQGAQRGVRGRRRMHPAEAQRGLPAEASGDQAGTATGLNTDPASWDYRQPPAGRAQGLAPCLLSANRISLPRVGSAPSWGVVFLSSTVLVFDVNSLSFQNHSAYVAVNSPWLSHPARGPEMKEGA	500408	427314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_428022_457958_458048_460504_460677_463724_463810_467272_467391_472128_472239_474438_474547_476954_477055_479553_479619_491571_491722_495584_495720_498735
887514	contig_11564_pilon	+	5378	2	Intergenic	novelGene_158580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	467	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	89	394	84842	86462	FALSE	15	GGGGGAGGAGGGGGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWALLIKCPKYMRQSLTILASKENSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILPRHHNPNASIFLQSSLFIVQLLHAYEVIENTMAFRHILVLKVKSSLSNT	84753	91446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_85102_86416
887515	contig_13800_pilon	+	4366	13	Intergenic	novelGene_153722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	489	junction_10	182.411850857704	1661	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	113	1651	99812	162575	FALSE	25	TTTTAAACTTACTTGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	99699	165290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_99821_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
887516	contig_10143_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_163339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTACTTTGCCTCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206172	204659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_204700_206200
887517	contig_9121_pilon	+	2834	2	Intergenic	novelGene_134479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	232	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAAGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282899	286652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_285241_286159
887518	contig_2703_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_101638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTGGGGCCGGCGGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_2000
887519	contig_7644_pilon	+	3129	4	Intergenic	novelGene_64223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2736	3044	199326	199634	FALSE	55	ACCCCAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNKFTTRNYTKTAIINLKDNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKPLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPERGEKRKHREDH	25447	199719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_26292_29803_29937_151609_151788_197745
887520	contig_10732_pilon	-	2166	2	Intergenic	novelGene_114677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAGTGGCTAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63959	61744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_62646_62694
887521	contig_7909_pilon	-	4456	2	Intergenic	novelGene_155942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATATAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030196	1025624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1025826_1025941
887522	contig_10973_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_150315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_152_233
887523	contig_6084_pilon	-	2550	10	Intergenic	novelGene_127059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	67.694484338656	997	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1325	1729	435364	430603	FALSE	25	TAACTGTGGTTTACAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQVFDILSTYFETRNWPEALKKGVSSGKGYVLQNSVE	445417	429781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430710_431272_431397_433030_433099_433811_433891_435337_435491_436079_436474_436607_436733_437315_437459_438023_438240_445097
887524	contig_5136_pilon	-	5104	16	Intergenic	novelGene_126632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_7	222.374299074531	1920	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	244	1719	360194	279549	FALSE	25	CTGAACTTTTATGGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVIVQSASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPIWNEILEFDLRGVPLDISSSLGIVVKDFETIGQNKLIGTATVPLKDLIGDQSRSLPYKLTPLLNERGQETGATIDLVIGYDPPSAPHPNDPSGTSMPGMEGEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDGKSLSRFGTRQGPGLLETE	360437	276163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_305916_306005_307058_307168_329056_329149_331432_331489_360106
887525	contig_7850_pilon	-	4885	5	Intergenic	novelGene_178481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1920	2567	183255	147021	TRUE	65	AACCCAAAACAAAATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKDPQSTLMEAAVNKSNGSSGKMAL	185174	73271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7850_pilon_-_75174_146360_146743_146986_147045_160162_160211_182679
887526	contig_8618_pilon	+	2041	2	Intergenic	novelGene_173848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	725	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCTGTCTTAAAAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89713	93013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8618_pilon_+_89778_91036
887527	contig_14959_pilon	-	1773	3	Intergenic	novelGene_166723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	8	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	42	422	72129	71749	TRUE	10	TTTTGTTGTTGTTTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK	72170	14036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_14695_14796_15487_71745
887528	contig_10904_pilon	+	2607	3	Intergenic	novelGene_22460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1063	junction_1	388	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	133	1101	149100	150068	FALSE	30	TAAAGAAGGACTTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143913	151574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097
887529	contig_4151_pilon	+	1689	3	Intergenic	novelGene_65238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	299	601	663342	663644	FALSE	15	TTAAGCAGTTTGTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528880	664732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078_663198_663270
887530	contig_1331_pilon	-	1617	5	Intergenic	novelGene_37801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	3733.58845482466	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATTGTTCTGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193856	158944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_193604_193652_193763
887531	contig_16775_pilon	+	2285	15	Intergenic	novelGene_107743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	251.014645072387	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	240	1538	134135	174136	FALSE	75	TTTAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	76498	174883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_76676_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
887532	contig_15029_pilon	-	2603	2	Intergenic	novelGene_128231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGTGCACTGAACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579367	535987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_537754_578530
887533	contig_4093_pilon	-	2813	6	Intergenic	novelGene_27619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	114	851	69245	41737	FALSE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72537	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
887534	contig_1301_pilon	-	3126	1	Intergenic	novelGene_47292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAGAAGTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258847	255721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_255700_258800
887535	contig_11338_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_6305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	484	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAACAAAACACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222294	224479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_222300_224500
887536	contig_11825_pilon	+	1606	12	Intergenic	novelGene_155387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	329.585414505171	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	13	1605	10468	34514	FALSE	10	AGGTTAGTCCTTTGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPNMWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQEL	10455	34515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376
887537	contig_10500_pilon	-	6176	6	Intergenic	novelGene_41277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1016.2788987281	50	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3694	4206	1635203	1629460	TRUE	80	ACCAAAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640220	1626849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635617_1636940
887538	contig_6563_pilon	-	4523	3	Intergenic	novelGene_178518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1724	2038	205713	205399	TRUE	25	GTAACAATCTTTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVTEGLRSRFQTVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTNKNEETLRVMWDTIKSKSM	271265	199440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6563_pilon_-_200759_204231_206031_269859
887539	contig_4295_pilon	+	4074	3	Intergenic	novelGene_169972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	892	1284	45484	122456	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIQNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMDITQ	34458	125246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_35346_45479_45864_122443
887540	contig_6403_pilon	-	1624	3	Intergenic	novelGene_139897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.5	410	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	357	779	1118208	1117786	TRUE	20	AAGTACCTCCTATGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDKQVVVDSSVGLYFRNEEGLVTLISHASKILLKIIRKWLLQYIDMEPPEIQAGFRRGCGMRDIIADIRWILAKGREYQKMFTCVLLTMQRPSTVWIIIIMDNISKNGNSRTINCAHAGPVHKPTGSHSNRTRRYYML	1136977	1116790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1117331_1117480_1118341_1136753
887541	contig_7593_pilon	+	1100	2	Intergenic	novelGene_127320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	160	junction_1	0	426	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCACTGTCCACTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406623	450889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_406806_449971
887542	contig_3866_pilon	-	3015	5	Intergenic	novelGene_112434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_4	46.299973002152	263	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	268685	253505	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCRYEILLDSQIYKYFPQFLVFYTLKNMNCF	268724	251020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_253667_253751_253854_257352_257477_265864_265948_268664
887543	contig_7963_pilon	-	3038	5	Intergenic	novelGene_58537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	138.854915289305	276	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	208	636	242844	240504	FALSE	20	TTGTACAGAGGGTTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETRAPGSAEHDTRPGCCAGEHQPGTSPGPEKSTPGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245710	238101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_245606
887544	contig_7357_pilon	-	2395	9	Intergenic	novelGene_36798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_8	1890.6231115693	4650	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	263	1513	166824	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167086	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
887545	contig_10642_pilon	-	4208	4	Intergenic	novelGene_78679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1382	1819	372591	372154	TRUE	25	AAAACCCTGGCCTGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISNHIKRQSMMASASSQNKESKNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRTRQEIRKEIKQNAEYAIEEIKKIREKHNDKFNRLQESLERQQSEIQKINNKISELDNSVESHRSRIEAMEVRISEIEDKALDTNLCEEKSDKMI	388882	200101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_202249_371911_373037_373095_373959_388809
887546	contig_2799_pilon	-	8171	27	Intergenic	novelGene_85546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1896	2219	784349	784026	TRUE	25	CCCGCGCCTCAACACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQHGERHQGIGSESQPRQLPLLTEEKGNRAVDSVTSTVLKVTSRSTGSDNPREFPKHDNAIPLGSVPKVERDDTCTTQKHSSRKVALFSTADEIPECSLGECRKF	786321	704744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302_755438_756997_757116_757722_757864_758459_758712_761266_761394_761506_761624_762147_762398_766300_766385_766967_767147_767272_767354_770116_770313_771764_771926_772372_772444_772914_772960_776041_776089_777674_778125_780117_780517_781540_783702_783757_785561_785637
887547	contig_8476_pilon	-	4971	2	Intergenic	novelGene_121314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2543	2848	10842	10537	FALSE	25	ATATCACCTTGACTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYKIISFANRGTLTSSLPIWMSFISFSSLIALARASSMVLNKSGDKGHPCLVPILKGNAFKVSPFRLILAVGFV	198110	8413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_11498_196223
887548	contig_16098_pilon	-	2878	21	Intergenic	novelGene_45832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	532.955108334651	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	107	2785	230275	201500	FALSE	20	TCCTAATTATCTGCATGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230486	201406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226359_226790_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230390
887549	contig_6958_pilon	-	2109	4	Intergenic	novelGene_69934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.769792755358	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	395	1081	183238	149618	FALSE	20	GTAAACGGCATCCCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSALHIILQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	183632	148589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149960_154506_154590_160928_161061_183108
887550	contig_17737_pilon	-	2701	8	Intergenic	novelGene_72909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.921029186506	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	75	908	68869	53442	TRUE	40	GACAAAATTACCAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGCDLLEADQQALFPGCLRLIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYAHKLELMRILTRVNWKVATEFESYSPDSTFHAKKQIPCIVSMLTKELYFNQ	90945	51554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_52796_52889_53672_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_90886
887552	contig_9144_pilon	+	5656	15	Intergenic	novelGene_151133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	234.87169749826	1220	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	238	1074	618610	624074	TRUE	15	CCACTGCCTCCACCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYSCWRTGLLLLLLQAVAVKVSWQTEEKSCDLVGEKGKESETELALLKRLKPLFNKSFESTVGQGPDTYIYMFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRAVVMISCNRHTLADNFNPVSEERGKVQDCFYLFEMDSSLACSPEISHLSVGSILLVTFASLVAVYIIGGFLYQRLVVGAKGMEQFPHLAFWQDLGNLVADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPM	615222	633546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615459_618608_618789_620115_620283_621888_621999_622274_622406_622954_623082_623951_626584_627404_627629_628097_628246_628692_628808_629678_629789_630387_630602_630837_630982_631518_632344_633253
887553	contig_5033_pilon	-	2215	7	Intergenic	novelGene_28916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	24	junction_1	1026.7220358446	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	596	1045	464569	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	465164	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_449871_449944_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547
887555	contig_10958_pilon	+	759	4	Intergenic	novelGene_5428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5109.3574938538	25	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	33	530	888255	901350	FALSE	30	AAATTACCGCTTGATTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKVEGGGKHAASVEHFPPCRVGLFKRSRSLKPTTDFNHPAENENVGFCGAPFS	888222	901579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893942_901195
887556	contig_13217_pilon	-	4598	3	Intergenic	novelGene_140890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.5	1013	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	118	450	38899	21477	FALSE	25	CATATGGAGCCCCTGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLWLWSLYFLPVSGALKILPAVNLEGELGGSVTFECPLPKTYSRIYLCREMAAPGVCATVVSNGNFAKKEYIGRVSLNVCRKKNLSPLGAPVISHCPHQHWSPVCLPRV	39016	17328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_21553_32435_32656_38862
887557	contig_1450_pilon	+	2611	18	Intergenic	novelGene_27399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_12	403.241648381736	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	99	2414	322479	355748	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRLHGTTGVLLILTLTRPAAVSVEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	322380	355945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
887558	contig_7843_pilon	-	1016	6	Intergenic	novelGene_152011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_5	129.187305877938	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	117	815	197252	178451	FALSE	25	GTGTACTAAATGTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAASSEHFEKLHEIFRGLHEYLQGAPERLLGTAGTEEKKKLIRDFDEKQQEANETLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKVVTNKLLLSIVILLELAILGGLVYYKFFHRH	197368	178249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_190893_190953_197137
887559	contig_14333_pilon	-	5164	5	Intergenic	novelGene_49142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	166.124952972153	1037	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	89	733	446908	441607	TRUE	30	ATTTTAAATTTTCTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKYTGHYFITTLLYSFFLGCFGVDRFCLGHTGTAVGKLLTLGGLGIWWFVDLILLITGGLMPSDGSNWCTVY	446996	436108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_437625_438691_441821_443131_443248_445731_445820_446681
887560	contig_253_pilon	-	3054	3	Intergenic	novelGene_129766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTGTTCTTGACTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788924	771588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_771606_775560_775726_786052
887561	contig_9406_pilon	-	4536	20	Intergenic	novelGene_136144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	649	junction_12	529.496410519904	4898	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1096	3291	146	3436	72114	34784	FALSE	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEEKINAVVEAGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRHRKNREAASELLMRLKDNRDLQKFLQDCQELSLWINEKMLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQLISEKPETEAVVKEKLTALHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGKSTDEVDSKRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEILGRIQDKHKKLPEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQEDAARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKALLDACEGRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLWMEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	79062	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51387_57753_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329_62420_63104_63330_65137_65402_66993_67141_72060_72152_78954
887562	contig_5918_pilon	-	5518	8	Intergenic	novelGene_99529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	387	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGCTGTTGTTGGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894736	673872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_674073_681421_681764_681919_683105_760918_761188_761876_761928_798718_799446_850421_851174_892744
887563	contig_401_pilon	+	1474	11	Intergenic	novelGene_42930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	299.715932175785	1324	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	168	1097	1957576	1972939	FALSE	10	TGGAGCTGCTATTGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1955898	1973316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1956008_1957517_1957607_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807
887564	contig_4232_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_63348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGGAGGCAAGAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
887565	contig_5686_pilon	+	6863	2	Intergenic	novelGene_45338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1702	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	761	1063	117054	117356	TRUE	50	CAACTCAACAGCAACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKQSEMSAPLRILSSVPDTVKGKWGLAPSSSEASEQDLAVIVRLKHIFVDAAQMPINAAALCSFSRGKSDRRQQGQCMFSILIQSIFIDHLLHSLPVG	116293	125089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120462_122394
887566	contig_233_pilon	-	2914	16	Intergenic	novelGene_14560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1298.68537631971	7523	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	87	2474	109959	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCCSLWWDCSSSGLVSSWVGRMGPAERSPQGSSGRPCCWELCLLVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126968	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108826_109835_109976_126898
887567	contig_7057_pilon	+	1031	8	Intergenic	novelGene_123340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_7	568.913859553304	99	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	77	547	938907	943233	FALSE	5	CGTGGCATCTGCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	938678	943717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
887568	contig_11253_pilon	+	6017	9	Intergenic	novelGene_126847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	96.0266076407992	1033	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	71	859	268605	275086	FALSE	35	CACCTCATTTAATACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNMAEEEDYMSDSFINVQEDIRPGLPMLRQIREARQKEEKQQEANLKNRQKSLKEEEQERRDIGLKNALGCENKGFALLQKMGYKSGQALGKSGDGIVEPIPLNVKTGKSGIGHEALLKRKAEENLESFRRKVHMKNQAQEKAAEQFRMRLKNKQDEMRLEGDLKRSQRACQQLDTQKNIQVPREAWYWLRPEEESEEEEEKEQDEDEVKSEDLSVLEKLRILTGYLREEHLYCIWCGTAYEDKEDLFSNCPGPTSTDHD	262307	280244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_262365_268591_268664_269779_270007_271282_271325_271988_272110_272240_272332_273188_273300_274231_274314_275030
887569	contig_1450_pilon	+	3657	21	Intergenic	novelGene_27361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_15	479.228700622156	1781	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	219	2897	244426	355748	FALSE	5	TGTGATGGTTCCTTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244207	356508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
887570	contig_7963_pilon	+	2420	12	Intergenic	novelGene_58550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.745064905761	309	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	170	2020	246278	253116	FALSE	15	TACAGTGGTTTCTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPVPRAFWEPRPGLSHSLLQPAVPAPARLKAPTEFDPAGTSENPGRDGTRSSACAPMASSGSPAPYGCLLLPRTCGANSRACGCTADRGGSGDVVTRLLRCIGPEIRRYPLVLVLLIFSCLGEMAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246108	253516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246340_246742_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
887571	contig_9014_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_106799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAGAGCAGCTCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153626	150635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_150694_150937
887572	contig_8820_pilon	-	2436	8	Intergenic	novelGene_79300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_7	566.043374699162	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1498	2154	168684	167520	FALSE	50	TAGTACTAAGAAGGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVCE	171330	167237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169799_170135_170503_170600_170763_171273
887573	contig_10732_pilon	+	2796	1	Intergenic	novelGene_114688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	390	701	84579	84890	NA	30	CTTCTATGATAATTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQAPLPLAACHERSKLQRETPPGSKIMYPKISESLQGTQPRRMETWSETATWIETWVESVHGGQLRLPDLLPISCSKAVSLGLLVKLESLISEEGCEGKDSK	84189	86985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_84200_87000
887574	contig_5033_pilon	-	2026	6	Intergenic	novelGene_28919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	1077.45682048052	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	41	757	477189	450698	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDKSCP	477229	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
887575	contig_18850_pilon	+	2830	11	Intergenic	novelGene_142410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	890.259787927097	1898	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	115	1110	175491	180704	FALSE	30	GTAAAGCCCCAGACTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSELRRLEAALVKRPNPDILDHERKRRVELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	163395	182424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_163405_175385_175508_176354_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515
887576	contig_753_pilon	+	5107	7	Intergenic	novelGene_112975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	742	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTTATAGCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190589	1214350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1190809_1191111_1192870_1196905_1197003_1199445_1199702_1202716_1202798_1210555_1210773_1211871
887577	contig_7080_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_100122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570090	568167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_568200_570100
887578	contig_10352_pilon	+	3467	14	Intergenic	novelGene_49594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	369	junction_13	164.11527194386	1037	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	172	1680	11687	34079	FALSE	15	GCTTCCTTAGAGGGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNVEALDPRGRTLLHLAVSLGHLESARVLLRHKADVTKENRQGWTVLHEAVSTGDPEMVYTVLQHRDYHNTSMALEGVPELLRKILEAPDFYVQMKWEFTSWVPLVSRICPNDVCRIWKSGAKLRVDITLLGFENMSWIRGRRSFIFKGEDNWAELMEVNHDDKVVMTEHFDLSQEMERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	10522	35866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_10659_11651_11777_14063_14110_15251_15396_16073_16264_21362_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883
887579	contig_16846_pilon	+	3906	6	Intergenic	novelGene_82915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	148.032428879621	189	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	430	678	476331	477023	TRUE	25	ACCATGGCTTGCGTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAMPPPVTVQRMALNWKELDSSFLFSEASATGEASLLSEGLREALSSYIRLTDDISLDDAKAQSRGRKGNQGYSIQHPNSAQPD	464057	480667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_464156_465206_465311_475327_475478_476253_476387_476830_477043_477458
887580	contig_20614_pilon	+	2390	1	Intergenic	novelGene_107567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233696	236086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_233700_236100
887581	contig_18108_pilon	+	3153	3	Intergenic	novelGene_33463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	226	9	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	248	1102	116581	123205	TRUE	30	CAGAATATTCTGGTCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYFVTRKRPEVVTVTGWKAPVVWEGTYNKAILENYYAKQKITVGLTVFAIGKYIEHYLEEFIISADKYFMVGHKVIFYIMVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	116333	125316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_116742_122511_124048_124107
887582	contig_12671_pilon	+	3598	6	Intergenic	novelGene_19215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_3	505.767930972299	42	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	87	557	197316	212313	FALSE	20	TGTCAGAAATGTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPGYGRGFGNFHVQMPGIQIQMGQPVPETGPQVLLGGYPGYPAYSDSYPSASDPMWTYFSAVAGQDGEVDAEELQRCLTQSGISGTYSRYRLSPQALTTIVKRYSKNGRIFFDDYVACCVKLRALTDFFRGRDPLQQGFVNFLYDDFLQGTMAI	197229	215354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_197343_200235_200410_203720_203791_210609_210724_211053_211113_212286
887583	contig_5698_pilon	+	2056	7	Intergenic	novelGene_55027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	920.569705852486	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	20	325	4103	17211	TRUE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKATSFNLKTSGMVVGDQSGSSPLHHLQLTWLESLKFRFTIMKMAMFSWLVIKMYRIQ	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7909_11182_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
887584	contig_9668_pilon	-	4539	1	Intergenic	novelGene_58078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	3290	3802	55734	55222	NA	20	CTGGCTAGGAGGTGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKSSVSNSSMVLSVSSVFSPCSGTPIIHRFFLLIVSHIILRVSSFFFILFSDFSSDRVVFQCLSSILLILCPTVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWSSNCCFCIISSCEFILAFCFRVIFLNSSIFLFVFSMNLSTCSMNLSFILIFVCFLLQLLDNSEY	59023	54484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_54500_59000
887585	contig_3866_pilon	-	5646	24	Intergenic	novelGene_112390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_23	241.65944886338	1776	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1259	3780	148	3927	222507	161587	FALSE	40	AGGCCATGTTTAAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPLRVGAIVETKTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVSVMSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKREEERQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTPNSEGKSDSCSSDSETEDPLEKDLMNEELSPDIKEEVEKNENLNDDKLDEENPKIAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEQVVEVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFSQDEAGCEPQMEAQNLEFSSLDNKDFSSANEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEITNSLPQERTSDCIVSEGMKNLNFEQHFETENEGMPSLIAESNQCIQELTGEKFDSPAEETINIPLKEEEDAMPLIGPETLVCHEVDLDDLDEKDKNSMEDVVVESSESNSLVSVPPALPPVVPHNFSAASPLTLSQDESRSIKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFEASVASSTCSIIIQERESREKGQKRPNDGNSGLLAKKQKRTPKRTSAVAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKCTPVKHLSVSKSQKLARSPARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLNELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSTSPPQNVLAVECR	223744	159867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_161691_164547_164695_165706_165914_169273_169379_169615_170750_172275_172418_174189_174275_177422_177621_180390_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
887586	contig_4857_pilon	-	2841	1	Intergenic	novelGene_48854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	610	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCCCTGGAAGAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336384	1333543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1333500_1336400
887587	contig_6938_pilon	-	281	4	Intergenic	novelGene_69070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_2	441.984162612191	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTACATTGTCTAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162409	157631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_157701_157886_157954_158074_158185_162374
887588	contig_11417_pilon	+	2599	19	Intergenic	novelGene_103284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2346	junction_1	1046.92987961922	80	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	179	2569	479699	556784	FALSE	15	GTCCAATGTCTCAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSARLGGAARARPAGRGRRRGAGTLETEQPAHSAGFSSAAAALPRSHRFLSRDPGLVAMSATDEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGEDLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWLNAMGEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEEEINNMKIELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDHRIPADTFTALKNPNAMLVNLEEPLASTYQDVLYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNINKVNAYSALANIDLALEQGAAQELFKALQSPALGLRGLQEQNSDWYLKQLLSDKQQKKQSGQTGPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVAAINAAIQRGVAEKTVLELMNPEAQLPQVYPFAADLYQKELATLQQQSPEHSLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDMNTVWKQLSSSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQETQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGVFAINEAVDSGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGATYQSDLAEAKKKKLAAGDNNSKWVKHWVKGGYHYYHNLETQEGGWDEPPDFVQNSVHLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITKLQACCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQVSQSQLFRQQVGF	479520	556814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437_517516_521571_521649_527039_527108_528494_528609_529167_529347_530872_530958_536807_536972_537763_537849_538884_539049_539279_539441_540490_540616_542616_542781_551052_551144_551338_551507_552205_552349_556571
887589	SIRV6	+	1490	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	35	3	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2278	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	223	714	1733	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1122	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
887590	contig_5302_pilon	+	795	5	Intergenic	novelGene_81484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_4	74.1261593501242	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	4	558	318287	328417	FALSE	20	GAGCAGAGTCCTTTCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNV	318283	328654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185
887591	contig_12920_pilon	+	4210	8	Intergenic	novelGene_166356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCAGATTCCTCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294165	460067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_294994_295399_296247_310884_311159_361369_361845_363042_363567_429459_430638_430797_430852_460037
887592	contig_9921_pilon	-	3045	1	Intergenic	novelGene_23728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	404	748	128181	127837	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECSLEARMTRLRLTYFECAIKRDQSLEKDIVLGKAEGQRKRGRPSMRWTDTVAATMGSSITRIVRWHSTGQCFIRLYTGSLSVGTDSMAPDNNNQIQNAKYKV	128584	125539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_125500_128600
887594	contig_6291_pilon	+	1585	3	Intergenic	novelGene_164779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	810	junction_2	243.5	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	280	918	355015	360189	FALSE	15	ACCTTGGCCAGTTTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATGRSRLELEREAEELFGGGTLRY	354735	360856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961
887595	contig_2114_pilon	-	4618	6	Intergenic	novelGene_104238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1128	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	4321	4617	158530	153500	FALSE	25	AACATGGCAGCGCCGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAQPEVSELLVLEAMVSDQGAPQQSSGGAASCSVLPAVGDGRLHGYLEQERGPVGLHGCGGRPPLLPTPPARGASSAGGGDNKAAAAAAAAAAAAAP	168922	153498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_153656_158389_159082_159853_159918_160988_161194_162413_162553_165561
887597	contig_10990_pilon	+	2898	20	Intergenic	novelGene_7450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	409.912172202373	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	608	2896	723621	752144	FALSE	35	GTGGTAGTGCAAAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708549	752146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_714557_714612_715933_715994_722232_722433_722635_722699_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
887599	contig_4803_pilon	+	305	2	Intergenic	novelGene_150700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCAGTTTGGTCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12589	12934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_12781_12820
887600	contig_13612_pilon	+	2088	10	Intergenic	novelGene_157293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	125.621516596874	640	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	413	1567	51083	57016	FALSE	20	GTGGTTGTAAGATGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	49649	57537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49913_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56382_56881
887601	contig_14666_pilon	+	2363	3	Intergenic	novelGene_39595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3509	junction_1	152	1972	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	979	1986	483933	484940	FALSE	30	GAGCCACACTGCAGTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205
887602	contig_17074_pilon	+	3234	13	Intergenic	novelGene_145126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	238.168868079399	1840	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	8	1048	208015	221624	TRUE	25	TACAACCTTGCCATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLGWSSGGVCRAAHLA	208007	225573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220895_221011_221580_221690_223452
887603	contig_8330_pilon	+	2044	12	Intergenic	novelGene_71796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	513.507739325424	1087	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	249	1139	853035	856687	TRUE	15	GACACCGCTGCCCAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCQVQLPRHCRARPSLLQRRRAHHCGRHQGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837540	857806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853901_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
887604	contig_13481_pilon	+	4965	11	Intergenic	novelGene_119494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1288	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATTACGGTTTCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1376059	1398783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1378668_1385411_1385479_1385654_1385817_1386415_1386536_1387529_1387782_1388002_1388203_1389429_1389579_1389671_1389844_1391335_1391435_1395365_1395559_1397840
887605	contig_5033_pilon	-	1919	3	Intergenic	novelGene_28932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1157.5	9	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGAGAGAAGTACGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456518	449431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450247_452042_453124_456495
887606	contig_11307_pilon	+	1722	6	Intergenic	novelGene_105232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	53.1954885305136	697	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	206	949	74141	87762	FALSE	15	TTCTTTTTATTTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVPAEDHKRASPRGRPPDRGGAGPAETHPAVCVCHWCSHVPFPVGKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDNFAHRTEVRKALAKNKEWQEQFLIPNLPLIDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEGVYELVSFQMKPGGPALWGDAFQRAVNSHVNLNYAKLVGVFHTEYGVLNRVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	73935	88535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748_76960_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
887607	contig_4103_pilon	+	8871	36	Intergenic	novelGene_51975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2026	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCAGCTTCTCCTTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176265	352753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_177160_177306_177477_182404_182515_185837_186003_186702_186880_187407_187663_188679_188853_195524_197138_200562_200716_201330_201477_201929_202387_203409_203582_215896_216019_216559_216654_218864_219025_219249_219429_220916_221126_221552_221700_222228_222380_222873_222984_223150_223297_229274_230026_238932_239036_239970_240116_240286_240414_243056_243146_264114_264230_269085_269274_269524_269763_276614_276710_282405_282640_286813_286960_287685_287837_289084_289239_300387_300544_352377
887608	contig_12414_pilon	-	3773	1	Intergenic	novelGene_59561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1062	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	NA	30	ACCGAAGTTTCTGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	370808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_370800_374600
887610	contig_10246_pilon	-	3060	3	Intergenic	novelGene_46912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGAAAGGGCCATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178041	157691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_159176_175186_175463_176741
887611	contig_10023_pilon	+	3387	4	Intergenic	novelGene_123506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.82842712474619	36	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	846	1181	429073	429408	TRUE	30	TGCATATGCTACAACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQIQGAIDDVYSGVSENRVSAATYVDVDKEIATEMDDINLQEVMDLQSKDDGEDYEDLPLEEPEPLSHTQVFSYIKALKEFGKVKGDQEFFDKAVDLEICFNHFINRLNS	426930	431732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_427298_427888_428278_428983_429621_429738
887612	contig_500_pilon	+	4046	1	Intergenic	novelGene_30985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGAGTTGAATTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471416	1475462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1471400_1475500
887613	contig_5967_pilon	-	2427	10	Intergenic	novelGene_44351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	428.665370656413	4	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	263	1408	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	505851	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_505602
887614	contig_6919_pilon	+	4718	3	Intergenic	novelGene_163967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	520	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2794	3420	4224	4850	TRUE	45	AAAGAAGTATCATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSINAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPLRTGTRRGCPLSPLLFNIVLEALARAVRLEKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENLKESMRKLLELTEDFSKVSGYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTTAPKKIKYLGINLTRDVKNLYSENCKKQKETCISGKIYLAHG	1430	105188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_5282_7572_7853_104601
887615	contig_14353_pilon	-	2421	10	Intergenic	novelGene_82096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_6	505.950834482542	893	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	52	1047	104372	80452	FALSE	40	CATTAATCAAAGTATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQPPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104423	79077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
887616	contig_10861_pilon	+	2047	9	Intergenic	novelGene_39299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.511546529846	2277	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	28	687	1437804	1445013	TRUE	20	GCATGTTGTAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNR	1437776	1455013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1445157_1445548_1445682_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
887617	contig_16594_pilon	+	8961	9	Intergenic	novelGene_53832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	771	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3438	3806	122010	122378	TRUE	10	TGTGGCGTGGAGCCGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLFQPRRWENNEITYMKAFFVGLLQFISPRLIQHIPAHTLECKLIRPCFIHISQLTSLHNFIALANGRKMCSKHNEASHTIFPAAAGQDVAPNSVEASRMGLSKHTKDLQHQSMQMKGQL	116040	306538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_239220_239785_272662_273672_306352
887618	contig_17144_pilon	-	1778	11	Intergenic	novelGene_29367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	127	1695	179764	166152	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183208	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166433_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
887619	contig_20819_pilon	+	2742	6	Intergenic	novelGene_55640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_2	290.524353540284	14	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	240	863	30450	40553	TRUE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYRECRGRGPHG	29983	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_30155_30381_30643_40122_41210_41309_41400_41530_41569_42519
887620	contig_7254_pilon	+	6317	21	Intergenic	novelGene_145835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	473	junction_17	758.838222218676	2276	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1241	3726	32	3757	149659	216969	FALSE	35	AAGAGGTGATGCTCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPQVKLVGNMHGDETVSRQVLVYLARELVAGYRRGDPRLVRLLNTTDVYVMPSLNPDGFERAREGDCGLSDGDPPGPTGRDNSRGHDLNRSFPDQFHTGEPPSLDDVPEVRALIDWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKVTGIYSKTSDDEVFKYLARAYASNHPIMKTGAPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSVTGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDFHRLLVPGMYNITAVLTGYMPLTFNNVTVKEGPATEVNFSLRPTVTSVIPDTTEAVATASTIATPNIPRGTPSSHQPSQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDPEVTDLVRSTRIHLMPSMNPDGYEKAQEGDSVSVVGRNNSNNFDLNRNFPDQFIQITDPTQPETIAVMSWMKAYPFVLSANLHGGSLVVNYPYDDDEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNIYPTEYFPHGITNGANWYNVPGGMQDWNYLHTNCFEVTIELGCVKYPFEKDLPKLWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGDSTNTDDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLEDLMLRSSSNLALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPQITNLTSLGQSAEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYKKNPAVTQLIDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKTGQTNAHGKDLDTDFTNNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSVLVTYPYDKPVQTVENKETLKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPTAAQLPSLWAENKKSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKSGKPVSKAVIVLNEGIKVHTKEGGYFHVLLAPGFHNINAIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKSLLSHEFQDETDTEEETLYSSKH	149627	219529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_149994_157068_157317_185170_185314_186017_186188_187832_188183_188591_188784_190323_190492_194685_194796_196400_196504_196969_197113_198436_198607_199953_200278_205645_205842_208095_208232_209151_209284_210075_210172_210260_210326_213907_214040_214551_214738_215027_215128_216742
887621	contig_7919_pilon	+	1093	2	Intergenic	novelGene_28072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	0	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAGAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066936	1069042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1067292_1068304
887622	scaffold_12124_pilon	+	2937	10	Intergenic	novelGene_22264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2914.99350104097	2	120	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1012	1791	1508626	1509405	FALSE	20	TGTTCTGTAAACCTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1510551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490413_1491906_1491976_1494270_1494335_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508265_1508394
887623	contig_6871_pilon	+	2405	4	Intergenic	novelGene_21563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	532.689611520839	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	189	1379	122965	135017	FALSE	40	GTAAAGGATAAACGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWRECVGSREGALSGSSSSGRPIYKSRLWSQTWTGAKKAMFLDGSFSPASKAPRWPQSHKGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121903	136043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_122853_123029_129792_129843_133940
887624	contig_3817_pilon	-	1780	2	Intergenic	novelGene_78311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTTTGAGGCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165356	159853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_159861_163583
887625	scaffold_12124_pilon	+	2210	10	Intergenic	novelGene_22355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	3078.04681134636	54	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	295	672	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1484054	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484250_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
887626	contig_2009_pilon	+	3051	11	Intergenic	novelGene_165443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	476	junction_10	473.644170237532	641	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	253	1668	35627	66411	FALSE	5	TTACTTTGGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSYSPQENSHNHSALHSSNSHSSNPSNNPSKTSDAPYDSADDWSEHISSSGKKYYYNCRTEVSQWEKPKEWLEREQRQKEANKMAVNSFPKDRDYRREVMQATATSGFAGGMEDKHSSDASSLLPQNILSQTSKHNDRDYRLPRAETHGSSTPVQHPIKPVVHPTATPGTVPSSPFTLQSDHQPKKSFDANGASTLSKLPTPTSSVPAQKTERKESTSGDKSVSHSCTTPSTSSASGLNPTSAPPTSASAVPVSPLPQSPIPPLLQDPNLLRQLLPALQATLQLNNSNVDISKINEVLTAAVTQASLQSIIHKFLTAGPSAFNITSLVSQAAQLSTQAQPSNQSPMSLTSDASSPRSYVSPRISTPQTNTVPIKPLISTPPVSSQPKVSTPVVKPGPVSQSAAQQPVPAEKPQGHEPVSPRSLQRSSSQRSPSPGPNPPSSSNAPSAAVVPQNSSARPSCSLTPTLAAHFNESLIKHVQGWPADHAEKQASRLREEAHNMGSVHMSEICTELKNLRSLVRVCEIQATLREQRILFLRQQIKELEKLKNQNSFMV	28020	67794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_28129_34914_35031_35598_35712_40718_41028_56316_56563_58031_58155_59129_59279_61716_61836_63289_63477_64660_64789_66341
887627	contig_5018_pilon	+	2810	1	Intergenic	novelGene_46978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592804	595614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_592800_595600
887628	contig_14525_pilon	+	3824	19	Intergenic	novelGene_149746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1277	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2759	3193	141246	146725	TRUE	10	TTGCAGGAGGGGCGGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCFSRQSWAAWINTGRRCSGLWDCKLEDILRHCSAWFVYIASKALLNSIACSCFLESLNSTPSALVNFTFFLESKTFWSLLMVMMLFAITASNPTSVGLEFYYLIVKLQSLLCMTLKLQNIGHLTMNDGQFCLWVFLSAIRVF	125875	157409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_127860_128433_128597_132108_132144_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137066_138536_138602_140183_140259_141222_141352_142241_142374_145156_145218_145304_145428_146712_146752_148429_148535_148613_148759_153473_153598_155326_155448_157299
887629	contig_10009_pilon	-	2339	7	Intergenic	novelGene_82740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACTGGTCATCGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72558	54575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_55301_60319_60407_63216_63355_68603_68814_70217_70384_71481_72031_72094
887630	contig_5424_pilon	+	5715	20	Intergenic	novelGene_172806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	122.001657497482	980	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	5363	5713	155836	168334	FALSE	25	AAACGGAGCCGCGACCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNEISFCVLSQSHRVHSFNCHCVRILFNCAHTQTWTMDGSATALPTESSRLPLATSITFMLSRLFHPHVSTSATLSCFGSGHFGRTRMEAPKNTRMEEAATGKSGCSWSERERRAT	96051	168336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_96449_112511_112563_113588_113694_115073_118245_118789_118946_120473_120562_123481_123695_124961_125110_126086_126161_126344_126574_128699_128812_129701_129730_131057_131224_135061_135139_139133_139250_144247_144343_152897_153021_155822_155942_156656_156778_168210
887631	contig_6914_pilon	+	4101	6	Intergenic	novelGene_151717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_5	115.380067602684	576	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	32	865	53500	68819	FALSE	30	TCATCTCACCCCAACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAGVGSGRAMESSPARAPQPGPRCMLLLPLLLLLSTPELSPSQAGAEETDWVRLPSKCEVCKYVAVELKSAFEETGKTKEVIDTGYGILDRKASGVKYTKSDLRLIEVTETICKRLLDYSLHKERTGSNRFAKGMSETFETLHNLVHKGVKVVMDIPYELWNETSAEVADLKKQCDVLVEEFEEVIEDWYRNHQEEDLTEFLCANHVLKGKDTSCLAEQWSGKKGDTAALGGKKSKKKGSKAKALGSRSGSSKQRKELSGLEGDPGPEEEGIQKASPLTHSPPDEL	53468	72055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_53651_65452_65577_66247_66345_67797_67921_68146_68265_68598
887632	contig_19311_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_144077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	100	423	99253	98930	NA	35	TAAAAGTCTTTCAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEIICDLLMYCKFYHCTDEVDKISVLMQSLLRYKREKRTEIYGNLISPRKQCWEQRLSFGPEVPAQRISQTRGRLMTWTFLQSQQRKRSPGADTLNLDL	99352	98701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_98700_99400
887633	contig_5951_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_153236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151456	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_153406_153604
887634	contig_5574_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_155824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	542	886	59433	59089	NA	45	TACATGAATATAATGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPDFSVFSFPLEFETVNHFPSMGTAHTDPQDWKLQRHFHSFCRTVICETAKSRGRGCGSQRLCRAQPDLQGDGEDTTPCLRNCSVLKRNVSNSPAFQFHDSLFPYIQTFLTM	59974	57714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_57700_60000
887635	contig_16103_pilon	-	2244	8	Intergenic	novelGene_118845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3510.04177543603	9	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	70	702	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743697	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733186_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
887636	contig_678_pilon	+	5811	6	Intergenic	novelGene_167768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	95.2898735438346	49	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2177	2485	12721	13583	TRUE	60	CAGGTTGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFIMYMAGNTISIFPTMMVCMMAWRPIQALMAISATFKMLESSSQKFLQGLVYLIGNLLGLALAVYKCQSMGLLPTHASDWLAFIEPPERMEFSGGGLLL	10544	20366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_12833_13135_13297_13547_14627_15199_16579_17500_17634_19595
887638	contig_3095_pilon	+	1472	5	Intergenic	novelGene_75180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1529.24693476888	25	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	29	331	220513	226298	TRUE	15	CCTATTTGTGGTATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHQLPSQG	220484	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225660_226275_226409_226645_226824_227001
887639	contig_9297_pilon	+	2461	9	Intergenic	novelGene_69872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	321.87953880295	2399	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	153	2117	909195	912790	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
887640	contig_5779_pilon	+	1768	1	Intergenic	novelGene_106534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCCAATCTGATTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346651	348419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_346700_348400
887641	contig_935_pilon	+	6461	31	Intergenic	novelGene_45524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	235.140574975907	1090	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	794	2233	247395	342978	TRUE	10	TCTTTCAAGCCTCGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWNSVTQALSSQFNMATNSSMFLKQAFEGEYPKLLRLYNDLWKRLQQYSKNTQGNFNASGSTDLYVDLQHLEDDTQDIFIPKKPDYDPEKALKDSLQPYEAAYLSKSLSRLFDPINLVFPPNGHNPPSSDELDSIIKTIASELNIAAVDVNLTLAVSKNVAKTVQLYGVKSEQLFSTQGDASQVIGPLTEGQRRNVAVVNSLYKLHQSVTKVVSSQNSFPPAAEQTIISALKTIHALMGNALQPLLTSVGDAIEAIIITMHLEDFSGSSYSSGTLDVPCSLYMKELQGFIARVMSDYFKHFECSDFVFDNTEATAHRAIELFVRHASLIRPLGESGKMRLAADFAQMELAVGPFCRRISDLGKSYRMLRSFRPLLFQTNECVASSPVLGDIIPFSVIIQFLFTRAPAELKSPFQRAEWSHARFSQWLDDHPSEKDRLFLIRGALEAYVQSVRSREGKEFAPVYPIMVHLLQKAMSTLQ	32328	377417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_32425_38644_38785_42660_42719_54776_54832_54940_55011_69923_70045_180131_180182_224606_224708_224960_225039_247370_247453_271835_272041_275731_275894_277978_278079_297805_297917_299379_299443_306936_307041_312307_312546_318261_318339_332052_332180_332648_332729_342863_345497_346641_346785_352424_352741_358168_358312_359245_359404_361934_362048_362131_362248_362607_362749_368062_368292_370637_370891_377319
887642	contig_13800_pilon	+	1917	12	Intergenic	novelGene_153719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_8	265.140598909489	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	140	958	99812	142318	TRUE	80	AGGAAAAAAAAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQRNYLFGQRKSVEILNKG	99672	162896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_99821_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
887643	contig_8138_pilon	+	3530	1	Intergenic	novelGene_52502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464001	467531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_464000_467500
887644	contig_7408_pilon	-	2224	6	Intergenic	novelGene_168723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	413	junction_5	76.9867521070996	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	206	1285	38514	12597	FALSE	20	ACCACTGTATATTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	47348	11657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224
887645	contig_1836_pilon	+	1684	2	Intergenic	novelGene_71081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	809	1288	995823	996302	FALSE	35	GTTCTGTTTAAAACAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRPLRDLRLAFGDTHPWELRLFTLLGLTQDAKQQTHTGPCQEPSSWRCWQFQLSVPESRALGTTTFAPLSRCFPPGLAVNSTCLLKIGSDILGGDEHERLLYLFSEQTKKEHSLPVVTLQRSVLTWKHYGANMRIYNSISNPTMSIKYTKILTDMTK	994924	996698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_994932_995021
887646	contig_1301_pilon	-	922	8	Intergenic	novelGene_47309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	849.497402429633	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	83	715	322831	269107	TRUE	55	AAGAGGTAAGAAGACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKARRKEGIRNI	322913	268654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269139_296669_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
887647	contig_6871_pilon	-	1769	2	Intergenic	novelGene_21536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	13	363	124646	124296	TRUE	30	GCGGAGGAAGTGGTACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKIWMPFGGTASSGSLRSPLLLHLMSVPSFTLLASVDKRVCHTFHILVLLLLLVCSAKSYTHFKTQLKYFLDSCSLLPILSFVSALPLPPSALFFTLLQWLVNMFVSFPTRLVIPEILST	124658	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_123215_124211
887648	scaffold_19766_pilon	-	3952	10	Intergenic	novelGene_34267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	304.971036876182	1338	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	239	1261	325368	322994	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	327884	320302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_323101_323179_323397_323489_323692_324034_324102_324196_324360_324442_324507_324827_324935_325050_325090_325311_325458_327735
887649	contig_14514_pilon	+	1630	3	Intergenic	novelGene_137457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_1	22.5	171	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAGATGATCTCGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24708	36311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_24764_30105_30203_34833
887650	contig_5988_pilon	+	3766	3	Intergenic	novelGene_16142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	973	1479	1650605	1651111	TRUE	30	TAACTACTGACTGCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQNKMVLVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFTEKADKFVENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKEQLDIQKINNKISEMDSAIEGLRSRPETMEDRISKIEDNTWIQHCLRKNLKKERRKMKKP	1649632	1834443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1651681_1656545_1656576_1832755
887651	contig_8538_pilon	-	2783	2	Intergenic	novelGene_5108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2059	2463	910823	910419	FALSE	45	GAAAATCCAACACCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKVIYKYNAIPSQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYCHPIFDKGPKSIEWGKDSLFNKWCLQNWMSICEKMK	913917	910098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_910871_911906
887652	contig_2834_pilon	+	2018	5	Intergenic	novelGene_27974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2033.47147754769	22	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	205	606	274857	290707	FALSE	25	TCCTTTACAAGCCAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238698	292119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274861_285323_285434_285547_285746_290617
887653	contig_7291_pilon	-	4795	10	Intergenic	novelGene_106294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_9	242.070237741033	1128	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	158	949	206279	173628	FALSE	75	CAGTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEADIMDINEIFKDLGMMIHEQGDVIDSIEANVESAEVHVQQANQQLSRAADYQRKSRKTLCIIISVLVIGVAIIGLIIWGVNKKN	213297	169781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180758_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
887654	contig_14876_pilon	+	5805	4	Intergenic	novelGene_170237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	330.325428765163	834	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	242	652	45475	51898	FALSE	35	AGAATTCTCCAGTGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQYDSFTFTASKNGTYKFCFSNEFSTFTHKTVYFDFQVGEDPPLFPSENRVSALTQMESACVSIHEALKSVIDYQTHFRLREAQGRSRAEDLNTRVAYWSVGEALILLVVSIGQVFLLKSFFSDKRTTTTRVGS	38587	57051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_38657_38944_39045_45402_45649_51661
887655	contig_18869_pilon	-	6099	1	Intergenic	novelGene_56282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79451	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_79500
887656	contig_10990_pilon	+	3817	2	Intergenic	novelGene_7464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1849	2919	710426	712742	FALSE	50	AAAAAATAGTGCAGCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICTLNVPVSSLSPGRRCSTLTGTGILGCVPTNSNTDEEDVVEAKMVAEGVDKEAKLPARKKRKKGLRIKGKRRRKKLLLAKKFSKDLVAGRPIADAPALLASSATEQDEENLFESNIEKQIYLPSTRAKTSIVWHFFHVDPQYTWRAICNLCEKSVSRGKPGSHLGTSTLQRHLQARHSPHWTRANKFGVTSGEEDFTLDVPLSPSSPGSNGSFEYIPTDPLDGNRMGKKLHKSASYALRAERGRFLIKSNIVKHALIPGTRAKTSAVWNFFYTDPQHISRAVCNICKRSVSRGRPGSHLGTSTLQRHLQATHPIHWAVANKDNGAVGNGLDEAETERNDVLSDPLRGEKSTVC	708577	713640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_711489_712734
887658	contig_8354_pilon	-	2978	7	Intergenic	novelGene_24146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	736.35289320633	20	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	153	734	555816	537192	TRUE	50	ATAAAATTTTGGAGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA	558377	534823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_536052_536175_537381_538002_538147_539084_539151_550970_551140_555802_555922_558330
887659	contig_2377_pilon	+	2033	2	Intergenic	novelGene_67921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1363	1770	277824	279327	FALSE	80	AAATACAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVLKACKGLRCINWSQPPGVKENEEHQRHKESISPRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTSDRPDREHNRKSLMEQQKDGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGSLESTAPGLSISPELKQFPRPSLQTGIGLDCGT	276461	279590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_277828_278923
887660	contig_9363_pilon	-	4817	28	Intergenic	novelGene_6586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_18	813.189186443872	2025	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	1695	3329	773622	756981	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTWDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTRFCLSSAFTTGLHTGNCVFVCNVSEYKDICACVYVCLCMCLYICVCV	787941	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773221_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
887661	contig_11258_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_67809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTATTCTCTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325185	324214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_324200_325200
887662	contig_7919_pilon	+	2865	17	Intergenic	novelGene_28063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	170.486150005653	84	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	685	1896	1079902	1131662	FALSE	20	CCCAGCAGCTTTCACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGILGLAFALANTGILLFLILLTSVTLLSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKLVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNELPSAIKCLMGKEEDFSAWYVDGRFLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFLIVVIYKKFQIPCIVPELNSTISANSTNADVCTPKYVTFNSKTVYALPTIAFAFVCHPSILPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFSMFVMYFLTAIFGYLTFYENVHSDLLHKYQSKDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTKFNLCRHILVTFILLVIINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITSQDGDKGTQRIWAALFLGLGVLFSLVSIPLVIYDWACSSSSGEGH	1036236	1132631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1036493_1068304_1068519_1079234_1079319_1079491_1079568_1079847_1079964_1113436_1113511_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449_1116533_1118753_1118813_1118934_1119052_1120392_1120473_1122282_1122384_1124642_1124762_1125500_1125643_1125751_1125850_1131560
887663	contig_9696_pilon	+	4882	5	Intergenic	novelGene_68813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGACTCAAGTGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391015	429837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_392347_393407_396533_399959_400061_410406_410552_429657
887664	contig_3155_pilon	+	1774	5	Intergenic	novelGene_26357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	167	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	82	588	258156	261211	TRUE	20	CCTCACTCCAAGGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258074	262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261765_261918
887665	contig_9235_pilon	+	2700	3	Intergenic	novelGene_156216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	426	1337	45805	46953	FALSE	30	TGAAAGATCCCTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	44981	48316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46423_46659
887666	contig_8138_pilon	+	1643	2	Intergenic	novelGene_52443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTAGTAGTGGTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280097	307937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280265_306461
887667	contig_17066_pilon	-	3502	4	Intergenic	novelGene_130962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGAAAAGGAGGAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418472	348248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_349633_356686_357268_409678_409892_417148
887668	contig_13004_pilon	+	2625	2	Intergenic	novelGene_112582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1451	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGCAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11226	13970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_13257_13375
887669	contig_6047_pilon	+	3248	10	Intergenic	novelGene_24224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_9	30.3168453357389	537	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	209	1444	150917	172538	FALSE	25	GTCTGATGGTTTTTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEENAGSYSLPQAQAFYTFPFQQMLAEAPNMETMNEQQVPAEVSVPAPAQELVQEAPKGRKRKPRTTEPKKPMEPKKPATPKKPGKSTKSKEKQEKITDTFKVKRKVDRFNGVSEAELLTKTLPDILTFNLDIVIIGINPGLMAAYKGHHYPGPGNHFWKCLFMSGLSEVQLNHMDDHTLPGKYGIGFTNMVERTTPGSKDLSSKEFREGGRILVQKLQKYQPRIAVFNGKCIYEIFSKEVFGVKVKNLEFGLQPHKIPDTETLCYVMPSSSARCAQFPRAQDKVHYYIKLKDLRDQLKGIERNTDVQEVQYTFDLQLAQEDARKMAVKEEKYDPGYEAAYGGAYGANPCNGELCSFSSNGLTADSAELQGESTFSDIPNGQWMTHLFTDQIPSFNNHCGMQAQEEGNRA	150708	174342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_150940_159859_160003_163929_164172_164955_165026_168623_168760_168960_169044_169122_169218_171232_171405_171854_171981_172392
887670	contig_7919_pilon	-	3302	16	Intergenic	novelGene_28061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	272	577	1132360	1132055	TRUE	25	GGACTGAGAACCCAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQLRMTGQRMPLHESRTEQLPEAHWAARARLPAVRATSNTGPALIQQWHLPCGSPIIIPVCYVNQNRQIIYETFFPPVKQNKYVQFKILFFSKKVQIV	1132631	1035718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1036491_1068302_1068517_1079489_1079568_1079847_1079964_1113436_1113509_1114963_1115057_1115361_1115446_1116449_1116528_1118748_1118811_1118931_1119051_1120390_1120472_1122280_1122383_1124641_1124762_1125500_1125641_1125749_1125849_1131559
887671	contig_16846_pilon	+	5274	2	Intergenic	novelGene_82918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	680	1060	477366	477746	TRUE	35	CTTCTAGATAAGACAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQAPPLKMTPSSLAHCSEAGHISKCWAGAESQTWHWRAGILPKVLEHLKVVNPLSFQKPRLQPSQLQPWMSLIPIKGKIWLELLRGRGVGGGMAPPLVLLLGSGARGCGGREGSITRYDQQIFN	476686	483140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_478280_479459
887672	contig_10437_pilon	-	898	3	Intergenic	novelGene_38332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAAAGAAGTATAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451706	445308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_445475_446950_447054_451077
887673	contig_10958_pilon	-	3611	3	Intergenic	novelGene_5376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_2	12.5	56	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	385	1206	846827	839744	FALSE	15	TTTTCCCAGCACCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGELEQTKDKLEQAQNELSAWKFTPDSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	847211	837338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692_841848_846744
887674	contig_15720_pilon	-	2692	3	Intergenic	novelGene_41940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	974	1429	307437	306982	TRUE	25	CATTGCAGGGTTGGCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	308410	303411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_303910_305384_305799_306630
887675	contig_4716_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_166628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1279	1578	841387	841686	NA	40	GTTGGGAAACAACTGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRRFWTGLEKDVEQNSNSRKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPVSSVVKSFPRFTIQPGSGQPHKTKWD	840108	842128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4716_pilon_+_840100_842100
887676	contig_14621_pilon	-	2430	17	Intergenic	novelGene_105857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_16	121.721762639226	1669	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	243	2138	463794	396356	FALSE	25	TTCTATTATGAGAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	464036	396063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463781
887677	contig_19769_pilon	+	869	6	Intergenic	novelGene_102267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	1501.47668646569	15904	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	62	835	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	86994	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87046_87238_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
887678	contig_8330_pilon	+	1721	3	Intergenic	novelGene_71883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	75	1130	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAGACTCCATCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060420	1066105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1061055_1064578_1065075_1065514
887679	contig_8138_pilon	+	1971	7	Intergenic	novelGene_52424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	455.550460676117	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280077	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305021_305075_305098_306364_306425_306484
887680	contig_5018_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_46979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593079	595614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_593100_595600
887681	contig_9098_pilon	-	6713	23	Intergenic	novelGene_75808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	171.946488889196	2267	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	858	1727	345261	335775	TRUE	20	GCACGCTCACGACACTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	383857	295403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_295477_302666_303079_309867_310015_311364_311510_324228_324309_330299_330439_330823_330984_331487_331612_332068_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_375715_375837_378117_378205_383589_383727_383818
887682	contig_12919_pilon	+	8471	1	Intergenic	novelGene_75909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1297	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACATCTGGTTTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735267	743738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_735300_743700
887683	contig_10437_pilon	+	1502	7	Intergenic	novelGene_38284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	1018.31505711914	1344	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	177	971	439767	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNVTQVSLLLLEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431091	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
887684	contig_12869_pilon	+	2145	6	Intergenic	novelGene_75322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	354.312517419297	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	70	1044	67397	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67327	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
887685	contig_9921_pilon	-	4736	3	Intergenic	novelGene_23744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3944	4282	321759	321421	TRUE	40	GGCTGGGCAAGAGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGFLKVPIHALSNHCGVEVLRNGVIGVIIEKKQRIQDDLKRVHAKLKLAPDGVNEFQLHIPPVVVGEGDQAPAVSVCADLHQLLDISLLKSDWTDFELAHSLRQEVQKGT	326543	295965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_296052_321052_323959_324799
887686	contig_5947_pilon	+	6165	37	Intergenic	novelGene_101592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	225	junction_16	473.048084204065	1988	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1484	4455	71	4525	894761	1005780	FALSE	15	GGAAGGAGGCTGTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKALRLLVELNKIPTVRAFLLSCMLLGGRKTTDIPLEGYLLSPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEALEQLQSHIEGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKISAGNIQERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSHGYTVTNGWKIHNTAKNKWFVCMAKTAEEKQKWLDAIIREREQRESLKLGMERDAYVMISEKGEKLYHMMMSKKVNLIKDRRRKLSTVPKCFFGNEFVAWLLEIGEISKTEEGVNLGQALLENGIIHHVSDKHQFKNEQVMYRFRYDDGTYKARSELEDIMSKGVRLYCRLHSLYTPVIKDRDYHLKTYKSVLPGYKLVDWLLAQGDCQTREEAVALGVGLCNNGFMHHVLEKSEFKDESQYFRFHADEEMEGTSNKNKQLRNDFKLVENILAKRLLILPQEEDYGFEIEEKNKAVVVKSVQRGSLAEMAGLQVGRKIYSINEDLVFLRPISEVEILLNQSFCSRCPLRLLVATKAKEVIKVPDPPEALCFQIRGAAPPYVYAVGRGSEAAAAGLCAGQCILKVNGNNVMSEGASDVLEHFQAFRSRREEALGLYQWIYHTHEDAQEARASQEAPGEDSSGEGARGEDEPDSAFPLESLGPQLTLHEDSPTVSLTVDNVHLEHGVVYEYVSTAGVKCHVLEKIVEPRGCFSLTAKILEAFAADDSVFVQNCGQLMSQSSVIMTMPHYEFRNICDTKLESITQRITCYQEFAAQLKSRVSPPFKQAPLEPHLLCGLDFCPTNCHINLMEVSYPKTTPSVGRSFSIRFGRKPSLIGLDPEQGHLNPMSYTQHCITTMAAPSWKCLPAIDGDPQGQCLNDSSFGLANGALGQEDRGLSFLLKQEDREIQDAYLQLFTKLDVALKEMKQYVTQINKLLSTITEPTFSGSCDPPLAEEASSSLLVSEESEMDRVEHGGIKKVCFKVSEEDQEDSGHDTMSYRDSYSECNSNRDSVLSYTSVRSNSSYLGSDEMGSGDELPCDMRIPSDKQDKLHGCLEHLFNQVDSINALLKGPVLSRAFEETKHFPMDHSLQEFKQKEECTIRGRSLIQVSIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	883002	1007420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_883067_894754_894857_921638_921801_930263_930398_937557_937677_939693_939844_942154_942303_950603_950705_950995_951100_951339_951390_955030_955107_963968_964042_967510_967654_969556_969650_970913_971063_976760_976847_978230_978368_979109_979231_981207_981396_981734_981897_982675_982887_983548_983826_985586_985794_987124_987214_988514_988598_988756_988848_990802_990932_992359_992402_993750_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737
887687	contig_5935_pilon	-	1662	2	Intergenic	novelGene_102734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	950	1360	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1216243	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237
887688	contig_18850_pilon	-	3563	10	Intergenic	novelGene_142414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTCAGCACGACTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182363	171837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_171939_175234_175507_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178390_179146_180513
887689	contig_3822_pilon	-	3878	12	Intergenic	novelGene_133296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	320	junction_10	928.698449399672	2082	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	254	1705	306185	277069	FALSE	35	AAAAATGTTTGCCCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGVIPDETKALSLLAPANAVAGLLPGGGLLPTPNPLTQIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	306438	274895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985
887691	contig_8866_pilon	+	3419	3	Intergenic	novelGene_77910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAACCAAACCGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166873	1206102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1170005_1182622_1182684_1205875
887692	contig_6881_pilon	-	922	2	Intergenic	novelGene_164844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_1	0	455	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	840	82	921	97871	96351	FALSE	35	AAGCTTAACATGGGAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRWFRLESKQGKRAKNRGEIKVNIQFMRNNMTASMFDLSMKDKTRSPFAKLKDKMKGRKNDGTFSDTSSAIIPSTHMPDANTEFPSGEIQMKSKPKKPFLLGPQRLSSAHSMSDLTGSHISSEKLKSGTIGQTHLLGRQIDSFGAVPESGSLKSPHRRTLSFDTSKTNQHDNSVDEGESSFGRQNDQLTNVTASLPQKFATLPRKKNPFEESSESWDSSVNLFSKSIEVRKENKREKREKVSLFERVTGKKDSRRSDKLNNGGSDSPCDLKSPNAFSENRQDYFDYESTNPFTAKFRASNIMPSSR	97952	96349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_96821_97501
887693	contig_14643_pilon	+	2639	13	Intergenic	novelGene_99135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1256	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2291	2605	167347	167661	FALSE	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFSCVTSSCSSSRNGGFTFPWSPPLSPLWAWSLCYGSFLPPAPTRTPGAEAVASRNGEAAAAGSGKASELNKTGRSSAQQRPEWAGCWEVAAPAAAETSFRSR	92805	167695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_92991_95056_95264_100908_101017_101989_102140_104320_104461_104537_104790_104984_105100_108114_108337_109679_109790_111956_112037_114365_114513_122065_122319_167025
887694	contig_13004_pilon	+	2062	6	Intergenic	novelGene_112696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	366.777643811615	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	418	1050	923669	928299	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837744	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039_898240_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
887695	contig_5643_pilon	-	5474	25	Intergenic	novelGene_38894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_5	442.11280729583	53	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	818	2457	2894	5350	261619	253080	FALSE	5	TCTGGCCACTGTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKLDPTKKEKRGPGRKARKQKGAETELARFLPADGDENSKRLSSRARKRAAKRRLGSAEAPKSKKSPGAKPLPGKLPKGAAQTSGKKGALSLYNAAKSRKRPAPPHSCDEEETEEDSEDGVVNEGDLWGSEDSDADMVDDYGADSDSEEGDENEDEELLPIERAARKQKAQEADVGGQWSEEETDEEEEKEKVSSESGPTKNDEVDGSLQINVDEEDLFVLPPAGDMEQGAQAPDLQRVHKRIQDIVAVLRDFSTQRQEGRSRSEYVNRLQKDLATYYSYGDFLLGKLMDLFPLSELVEFLEANEVPRPITLRANTLKTRRRDLAQALINRGVNLDPLGKWSKTGLVVYDSSVPIGATPEYLAGHYMLQGASSMLPVMALAPQEHERILDMCCAPGGKTSYIAQLMKNTGVILANDANAERLKSVVGNLHRLGVTNTIISHYDGRQFPKVVGGFDRVLLDAPCSGTGVISKDPAVKTNKDEKDIQRCAHLQKELLLSAIDSVNATSKTGGYLVYCTCSIMVEENEWVVDYALKKRNVRLVPTGLDFGQEGFTRFRERRFHPTLRSTRRFYPHTHNMDGFFIAKFKKFSNSIPQSQTGDSATVTPTNPDLPDLKGQVAPKPENSSQPTKKAKGAGKAKQKLQKQKHLKKASFQKQNGISKRTDSELSTVPSVTKAQASFKVQDSNQLAEKAEVVREPKVTGTLKQRLPKLQSPKKVVFLKQNAPPKGTDSGTPAALSFSKIQPTTPKPEDQGQPLWKAKGAEKVKQHLPELPFKKAAFQKQNGTPKRSTSYSHSPSRPPPAKRRKSQSRGNSQPPLS	270952	252955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_253742_254843_255073_255186_255310_255450_255541_255664_255805_256547_256689_256762_256851_257651_257742_257880_258081_258178_258340_258456_258513_259728_259965_260147_260237_260409_260456_261513_261624_261902_263672_263844_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269040_269294_269434_269736_269809_270276_270407_270512_270611_270873
887696	contig_5423_pilon	-	2288	8	Intergenic	novelGene_85278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	226.993032348339	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	233	1102	569105	558772	FALSE	40	TGTAAAAAAGCCTCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	574251	557585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_574172
887697	scaffold_12124_pilon	+	1936	12	Intergenic	novelGene_22210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3133.64789670056	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	225	602	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473543	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508120_1508221_1508545_1508646
887698	contig_5317_pilon	+	910	3	Intergenic	novelGene_76551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	346	396	43276	43326	FALSE	10	TATACCTGTTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35296	43840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
887699	contig_9363_pilon	-	3094	16	Intergenic	novelGene_6748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	395.177068610459	27	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	48	1601	1548961	1508323	TRUE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGGLLYVQALQLRLHLLQQQQALPPLWQQCLPGPGHHKS	1549008	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1530857_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
887700	contig_8120_pilon	-	4015	2	Intergenic	novelGene_159713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	325	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29791	23390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_27261_29646
887701	contig_8304_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_153175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAGAAGAACTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153127	151063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_151100_153100
887702	contig_14450_pilon	-	7577	2	Intergenic	novelGene_48965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1457	1984	1043352	1042825	TRUE	30	CATTCACACTCACTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1044808	1036855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042079_1042454
887703	contig_14643_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_99140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCAGTTCTACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137155	138807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_137200_138800
887704	contig_8377_pilon	+	3079	15	Intergenic	novelGene_35130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_5	1805.62906246673	31	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	201	1904	179603	197939	FALSE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	177293	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
887705	contig_11422_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_98955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_400
887706	contig_7408_pilon	-	2573	7	Intergenic	novelGene_168726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_6	165.886507387832	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	644	1723	38514	12597	FALSE	25	GTTCTGAGTGTACTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48304	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877
887707	contig_8581_pilon	-	3285	18	Intergenic	novelGene_22835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	579.63180653055	8	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	176	1978	353082	314569	TRUE	30	CAAAGACTCGAGTCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEEVLFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETAMINWWMNIL	361918	306343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314602_314686_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324013_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_361835
887708	contig_18162_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_122315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9022	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8000_9000
887709	contig_5959_pilon	-	2790	4	Intergenic	novelGene_150186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	164.568121659897	16	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	82	1191	216308	211902	FALSE	0	TTTTTTCTTTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218755	210302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216310_218675
887710	contig_7593_pilon	+	1317	5	Intergenic	novelGene_127289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	216.348099136554	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGTAACATCAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165999	199212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_166195_192341_192438_196398_196495_198038_198171_198414
887711	contig_5586_pilon	+	2994	13	Intergenic	novelGene_143497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_8	384.574539444421	36	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	277	1725	368997	430164	FALSE	20	CTATTTCTATTGAGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVQCKDKEATKLTEERDCSLNQSSGYRYGTDPTPQHYPSFGVTSIPNYNNFHAAGGQGLTVFGGVNSSSHTGTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	197175	431433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_197331_224687_224728_298146_298217_368985_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_384729_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
887712	contig_9333_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_120336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGGGAACTAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442532	440703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_440700_442500
887713	contig_15518_pilon	-	4042	2	Intergenic	novelGene_127629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3378	3728	38282	37285	FALSE	35	GAGGCTCAAAGAGTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILICLGNLTFSHTLGKWSESVLKSSDGDFALEALSTVRRNSRRVCTGRFPEQGGTWSRVCGSCHQTSSLRLGHQRRKEGASGLLLPVDIDGRDTNHQQHLEAYKEASEEEVRS	41659	36970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_37387_38033
887714	contig_4604_pilon	+	3707	16	Intergenic	novelGene_19134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1422.18956386115	12	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	1325	2473	365452	379856	FALSE	25	CCACTAGCACCCAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339842	381090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359186_364052_364409_364510_364626_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378503_379433_379470_379808
887715	contig_15775_pilon	+	5190	4	Intergenic	novelGene_148363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	228.159788062859	962	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	256	624	413	5817	TRUE	40	CAGCAGAGCTTCAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFTGAGLRDSGLTLESLLKCQLVQHVPTQEESCDPPSCVLSQVIQHLEGELCYANLTLHRTGTSPVSSQKKASAKSASSAQANKEEAEYVTMDPLPREEISYASLSLDTSNQEPFYSNMD	157	11046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_4935_5140_5730_8813_9475
887717	contig_14970_pilon	+	1741	8	Intergenic	novelGene_44953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4208.68383614795	5	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	133	453	136145	192031	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGNQP	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182401_192019_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
887718	contig_17796_pilon	+	3498	8	Intergenic	novelGene_33787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_6	244.357382970609	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	386	1357	53527	110323	FALSE	25	CTCTAGCTTAATTTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53141	112464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_99617_99648_110237
887719	contig_12312_pilon	-	4435	5	Intergenic	novelGene_63940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_3	398.157239667948	1941	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1581	2429	225540	215838	FALSE	40	TTAAATGATGGAGATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPVLLLDRQYSRALTCPAESEDVLCLGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	227120	213831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333
887720	contig_854_pilon	+	3775	19	Intergenic	novelGene_36584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	2939.48592391826	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	84	2756	1679334	1715383	FALSE	10	CTACATGCGTGTGTCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQERSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1679250	1716402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1681780_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702629_1715219
887721	contig_10747_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_178519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTACTTGTTAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225911	225616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10747_pilon_-_225600_225900
887722	contig_14970_pilon	+	3414	1	Intergenic	novelGene_45143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	729	1049	292059	292379	NA	45	TTAAGTGAGAATAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLWFTTEYYRINCGDGTGPGCVLFCNTWGCHELGPTQQQLKQQQEFIEYSVRHYGDSFTHIASFPLTTTLKSRYHYFYLANKETEVLKSYIICPRPQNQEVEKQ	291330	294744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_291300_294700
887723	contig_7079_pilon	+	1452	13	Intergenic	novelGene_129231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	551.866580091803	159	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	38	1144	342490	348688	TRUE	15	TTTTTCTCTCTCTAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPANEERRGGLPPLPPHPGGDLGGPPAGPLALGLVTVDIQNPDITSSRYRGLPAPGPGPADKKRSGKKKISKADIGAPCGFKHVSHVGWDPQNGFDVNNLDPDLRSLFSRAGISEAQLTDAETSKLIYDFIEDQGGLEAVRQEMRRQEPLPPPPPPSRGGTLLDQIRQGIQLNKTPGGPRELNAAATTTELRGAGGGPDARDAEEK	342452	349810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344803_344900_345004_345095_345138_345231_345286_346268_346444_347296_347340_347541_347696_347909_347949_348276_348318_348589_348706_349519
887724	contig_7695_pilon	+	3114	3	Intergenic	novelGene_41689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	320	868	1096312	1096860	TRUE	25	GAGTATTATGGTAGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAARKNNNESVYHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1095992	1120023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1097093_1097546_1098069_1118531
887725	contig_9481_pilon	+	4167	1	Intergenic	novelGene_149645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	995	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	873	1187	135462	135776	NA	80	GTACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQLVPIHLEQRRMKNTKDTKKILAQETKGPYINQKLHQPETRRTRWCPATTNDFPDREHNRESLTEQEKSVVQNSNSRKKTRLNGLIETGGIPKEHGPWTLC	134589	138756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_134600_138800
887726	contig_10331_pilon	+	6273	11	Intergenic	novelGene_54069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_5	356.243863105037	184	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	74	898	72119	96152	TRUE	35	AGTCAGAGTCAACTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGD	72045	114460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_72156_75274_75416_79165_79384_83233_83465_88910_89101_96144_96244_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643
887727	contig_11422_pilon	-	452	2	Intergenic	novelGene_98962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1315	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_406_606
887728	contig_19778_pilon	+	2128	13	Intergenic	novelGene_143752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_7	282.992000279552	582	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	262	1122	9539	16019	TRUE	15	AATGGCAGGCCTCTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	5642	34222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920_16025_24951_25219_28501_28565_32062_32179_32846_33021_33442_33678_34076
887729	contig_13481_pilon	+	2891	7	Intergenic	novelGene_119400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	292.385400152303	51	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	101	1597	613420	633859	TRUE	15	GAACTTCTCTGCTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGVKEGRERPRGARTADKAGWIKKSGGGLLSLWKDRYLLLCHAQLLVYENEDEQKCVETVELGSYEKCQDLRALLKRKHRFILLRSPGNKVSDIKFQAPSGEEKESWIKALNEGINRGKNKILDEVKVDKSCALEHVTRDRVRGGQRRRPPTRVHLKEVASAASDGLSRLDLDVLDSGPPVFTPSDDGSVAQPQEKFQPLMPPTKTSSAPETPSVGDRVETSAGERASTPTSASTETHAESQEDSETPSGEGRGPEQPRNGIMPDKLKMSWENPSPEEPLAPESTGAPQLHCSETSEAAPKESRKPPTPPPKIISEKLRASMSGMEPSGLAQSPGVPDISAPGPAQVSVNGIDDNSEPTKLSKATAAPGIHQKDAAMSTALPVWDLPPQFHPRCSSLGDLLGEGPQRPRQPRERLYRAELEVRVASEQTEQLLNKVRGTEPAPDSPEALLSHAVEQLRQATQVLQEIRDLGALSQGAPGLREKRKELVTLYRRSAP	613319	635634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_613429_620292_620443_624607_624725_628959_629065_630645_630745_632842_634251_634731
887730	contig_10627_pilon	+	3968	13	Intergenic	novelGene_59935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	302.903300943093	558	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	1820	3097	162810	166905	FALSE	10	TGTTTATTGGTGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTMMDPFRKRLLVPQPQPPMPAQRRGLKRRKMADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	160670	167776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162387_162706_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166775_166851
887731	contig_10331_pilon	-	9875	8	Intergenic	novelGene_54073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2481	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	4381	4803	109745	104132	TRUE	25	AGCACAAGGATGCGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCFKRCWSFRHQAITVPSLLAVYKWWPSQENVRLTIGLCDLGNVISRTGFKSQVLHNRTIPFSKPPAITLIDTPSGWLEKATEQMISLQWTCPTRSPFTVHSLRSLPPPAESHTVAISPVVSLAETAVTGLLCPAKLCT	114460	87904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_92730_96142_96243_103716_103855_104122_104219_107721_107883_108298_108370_109641_113433_113767
887732	contig_10042_pilon	-	3679	1	Intergenic	novelGene_79244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1079	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGCGCTCAGCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202236	1198557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1198600_1202200
887733	contig_13780_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_149114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGTCTCTGCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820632	819267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_819300_820600
887734	contig_10958_pilon	-	2752	9	Intergenic	novelGene_5328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	297.671379208684	27	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	179	940	538444	533534	TRUE	5	TTGTGCGTCACGGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLWNTEAACPIRVTTDTDQACSIKDPNSGFVFNLNPLNSSQGYVVSGIGKTFVLNICGAMPVCGTVDGKPAFGCEAETQTEDLKNLKPERPVGGEKSLQLSTEGFITLTYKGLVSAPGGAADAFIIRFVCNDDVYPGAPKFLHQDIDSGLGIRDTFFEFETALACVPSPVDCQVTDPAGNEYDLSGLSKVRKPWTAIDTSVEGKKRTFYLSVCNPLPFIPGCHGSAVGSCLVSEDNSWNLGVVQISPQAAANGSLSIVYVNGDKCGNQRFSTRITFECSQTSGSPVFQLLDDCEYVFVWRTVEACPIVRVEG	542812	502047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_503689_533362_533539_534020_534109_535237_535414_535517_535662_536005_536177_538266_538463_541034_541137_542754
887735	contig_7111_pilon	+	1878	1	Intergenic	novelGene_175936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTACCAGTAGTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64738	66616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_+_64700_66600
887737	contig_10973_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_150373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGACCCACCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2707	1536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2700
887738	contig_6227_pilon	-	6007	11	Intergenic	novelGene_49813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_1	414.83461764901	2327	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	203	1594	1409780	1360647	TRUE	20	CCATGTTGTAGTTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQGRSSPQLDPLRKSPTMEQAVQTASAHLPAPAPVGRRSPVSTRPLPSTSQKAIENQEHRRVEAHKVSRPENEQLRNDNKKQVVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKDNKVAA	1409982	1356036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360316_1360512_1360671_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373352_1375648_1375715_1376002_1376180_1378381_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
887739	contig_6208_pilon	+	7323	18	Intergenic	novelGene_53011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	38.4153227790872	2022	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	349	1419	469674	489456	TRUE	20	CAACAACCTGCCCTCGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVLTIIALFYYPLEGSKSVNSVKYLSLLALAFVVRPTAVIPWIPLLFRHFWQEHRKLDLILHHFLLVGFVTLGLSLIIDRIFFGQWTLVQFNFLKFNVLQNLGTFYGSHPWHWYFSQGFPVILGTHLPFFIHGCFLAPKRYRILLVTVLWTVLVYSMLSHKEFRFIYPVLPFCMVFCGHSLNHLKVWKKPAGSFLFLSNMLLALYTGLVHQRGTLDVMSHIQELCSNSHNTSSSASVFLMMPCHSTPYYSHVHCPLPMRFLQCPPDLTGKSHYLDEADVFYLNPLNWLYKEFHSDSSLPTHLIIFSVLQEEINAFLISNNYERTAVIFHTHLPEGRTGSHIYIYERKLKGRLSS	460529	532592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_460710_468306_468412_469610_469742_473520_473662_477714_477767_478859_479072_479914_479980_486604_486822_488845_489027_489321_494298_496608_496730_503056_503298_507293_507498_508304_508383_510804_510925_513675_513748_531834_531972_532502
887740	contig_18162_pilon	+	3416	3	Intergenic	novelGene_122289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3839	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	1990	3096	9632	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNIGSPFLLRPPGSAELSPSPARPRPAAPARPRDAAAGGRLPRGLRAAALHGVPAHQPQAPRAAPVRMWWLQEAPVASESVLLLSAIDKGCLSLWWHEMRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7518	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_9148_9271_10810_16364
887741	contig_7816_pilon	-	1351	3	Intergenic	novelGene_66558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	581	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTCAGTTGAACAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351968	346469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_346938_350740_350985_351329
887743	contig_8671_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_126237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATCAGCCACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98888	100951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_98900_101000
887744	contig_4486_pilon	-	1489	12	Intergenic	novelGene_38601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	692	1120	399315	377416	TRUE	10	TCAAGGTTCTTCTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVLINIFLRIVKSQCSPFSTSATPQGYCLPLTLLPLTSMIVLLPTTARGKRSFIFLTSLFSSSSSVSGNSYILILCSWISFIICFLNCWHSSGVSVSALAISGMIFTFSCKRFINSISNGLSPCPEGAMKYKQHCTLLSGI	412720	343006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_343091_360533_360641_376090_376193_377339_377475_385368_385486_389956_390050_391118_391216_392816_392869_399304_399431_407557_407694_411175_411322_412426
887745	contig_8801_pilon	-	2590	14	Intergenic	novelGene_66307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_10	553.77772013111	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	17	1414	567924	561264	FALSE	45	CAATAAAGCACCGACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPSPMDSQMAEQTFEQAIQAASRVIRSEQLSIRRIQSMPVRLLGHSPVLRNITNTQAPDSWRRSKMGSRAASSSGEDKENNGSVFKMPRKPAFPSHAQAMAEWASRREAFAQRPNSAPDLMCLSPEEKMEVGDLSPLPRHRSSLTPMEGAAEEDDGFVDILESDLKDDDEVPPGMESLISAPLVKTSEKEGEQDLIMYSKCQRLFRSPSMPCSAIRPVLKRLERPQDKDMPIQSKRRRSVTPPEDQEEQQEPEEPKARVLRSKSLCHDEIKNILDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVERFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAENFLLQSPITACSLDKRIILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAANDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPTFCEPQDYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ	567940	560087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_561405_561543_561656_562684_562819_563029_563129_563299_563363_563855_563952_564167_564354_564439_564521_564934_565070_565226_565350_565455_565579_565893_565931_566079_566122_567898
887746	contig_4103_pilon	+	3391	1	Intergenic	novelGene_51946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	322	969	913	1881	104743	105711	NA	25	AAAATTGCTGTGGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVEVEIRAGGHSLDKYLKHADPDSQQYADMIKALRLRRLTVGAARVPARLLFAVLRALGYSRLKELTLEDLEVTGTYPPQPLEATGPALSTLRLRNVSWATGGAWLAELQKWLKPNLKVLSIAQTHPLALSCEQFRTFPTLTTLDLSDNPGLGERGLAAALCPHKFPALQDLGLRNTGMETPNGVCAVLAAAAVQPHRLDLSQNALRATANPGGPRCVWPSTLSSLNLSFAGLEQVPNGLPAKLSVLDLSCNRLIRAPRPDELPQMENLILDGNPFRDLGDPKPQQDTMNSSVPLACVHSLLAIGISGTLALLQGVRGFV	103830	107221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_103800_107200
887747	contig_5136_pilon	-	2163	17	Intergenic	novelGene_126634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	264.165076230754	82	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	92	1702	360194	276846	FALSE	50	TTTTATAGCAATAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSRSGAARSSSAATFLTSFAETYFLPVRAMLRVIVQSASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPIWNEILEFDLRGVPLDISSSLGIVVKDFETIGQNKLIGTATVPLKDLIGDQSRSLPYKLTPLLNERGQETGATIDLVIGYDPPSAPHPNDPSGTSMPGMEGEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDDFSSSGTGAASYTGLCFVILLPTRFSYLLLSYSEYINWLLLEPFFKNFLIFFLHFAVSKIVLPE	360285	276384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_277040_279607_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_305916_306005_307058_307168_329056_329149_331432_331489_360106
887748	contig_3975_pilon	+	3290	6	Intergenic	novelGene_54931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1381.93276247435	120	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2327407	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2327533_2327713_2327750_2344242_2344937_2347026_2347163_2351503_2351546_2354440
887749	contig_1348_pilon	-	2479	2	Intergenic	novelGene_174378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	0	1817	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAATAAAACTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619328	614384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_616737_619201
887750	contig_11498_pilon	-	2187	13	Intergenic	novelGene_65508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	600.531963253322	1227	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	50	1810	178044	172960	FALSE	20	TTTACTTGTACAAGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRHRLRECPPPPPSPAEPAPGAAALPPPPPPLLPGAAPQQEAPPPAPPAAPPLPGSLDLPAAPPLPGDLPPPPPPPPLSTDGPVPPPPPPPPGGLSDAHGGPGPEMGPGIKAKKPIQTKFRMPLLNWVALKPSQITGTVFTELNDEKVLQELDMSDFEEHFKTKSQGPSLDLSALKGKASQKAPTKATLIEANRAKNLAITLRKGNLGADRICQAIETYDLQTLGLDFLELLTRFLPTEYEHSLIARFEREKRPIEELSDEDRFMLRFSRIPRLPERMATLTFLGNFPDTAQMLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQSLDVLLEMKSTDRKQTLLHYLVKVITEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGTVSLDSVLGDVRSLQRGLELTQREFMRQDDCMVLKEFLRANTPTMDKLLADCKTAQEAYESVVEYFGENPKTTSPSMFFSLFSRFIKAYKKAEQEVEQWKKEAVAQEAGTDAQGRGEPSAPKSPPKARRQQMDLISELKRKQQKEPLIYESDRDGAIEDIITDLRNQPYIRADTGRRSARRRPPGPPPLQVTSDLSL	178093	172582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_173067_173555_173677_173933_174030_174180_174283_174499_174664_174824_174955_175035_175117_175666_175736_175914_176150_176587_176791_177180_177306_177495_177775_177995
887751	contig_1725_pilon	+	3067	19	Intergenic	novelGene_24256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_16	408.830928863096	2216	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	92	1936	201480	248928	TRUE	20	CTACATTGGAGCACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKVSWFY	201388	255859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
887752	contig_4891_pilon	-	2734	9	Intergenic	novelGene_124607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_3	31	670	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	52	1164	1053819	1031913	FALSE	20	ACAATGGCGTTCTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAERQDALREFVAVTGADEDRARFYLESAGWDLQIALASFYEDGGDEDIVTISQATPSSVSRGTAPSDNRVTSFRDLIHDQDDEEEEEEGQRFYAGGSERSGQQIVGPPRKKSPNELVDDLFKGAKEHGAVAVERVSKSPGETSKPRPFAGGGYRLGAAPEEESAYVAGERRRHSGQDVHVVLKLWKSGFSLDNGELRNYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKPKGAFKAFTGEGQKLGSTAPQVLNTSSPAQQAENEAKASSSISINESEPTTNIQIRLADGGRLVQKFNHSHRISDIRLFIVDARPAMAATSFVLMTTFPNKELADESQTLKEANLLNAVIVQRLT	1053870	1030342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1032076_1034013_1034179_1040319_1040458_1040851_1040962_1042044_1042138_1042773_1042940_1045430_1045506_1051070_1051169_1053714
887753	contig_2799_pilon	+	7652	24	Intergenic	novelGene_85559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	570.046752966024	203	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1072	3219	90	3308	725798	781598	TRUE	35	ATGAACATTTCTGTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKWGRFHEAPLITVRFIGPKHGEEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANRRSQQSVLLSKSVSIQNIAGVGNDESMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGTDMNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYVFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMKDPEMVEVHASSKEERNSWIHIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTKARELKEQLQQKDQQILHLLEEKEMIFRDMTECSTPLPEDCSPTHSSRILFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGSLGGTLGPAVSSLIEQEGMVGPVSLPRRAETFGGFDSHQMNASKGGEKEEGDDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLGFMLKRNSEVIQSIVHLHELLSTLQGVVLQQDSYIEDQKLMLSERALTRSSSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQHLEEKRRREREWEARERELLEREARLAQWEEKVQRGQQDLERDREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLKRDTEQLSQRRIEGDVCQVSHQHTKTMRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGDGPASEVPAEGEEIFC	725708	786068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_725873_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302_755439_756998_757112_757718_757866_758463_758715_761269_761396_761508_761627_762150_762400_766302_766380_766964_767147_767272_767356_770118_770314_771765_771928_772374_772446_772916_772962_776043_776092_777677_778128_780120_780452_781548_782839_782887_785564_785640
887754	contig_6137_pilon	-	3501	4	Intergenic	novelGene_59159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1022	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTGAGCTTTGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309117	1239023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1239268_1300358_1300429_1305870_1308961_1309020
887756	contig_12079_pilon	-	3036	9	Intergenic	novelGene_67512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	312.345962035689	1487	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	239	2266	871513	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTREIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871500_871555_871641_871725_872314
887757	contig_14450_pilon	-	6258	3	Intergenic	novelGene_48955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	217	309	1042057	1041965	TRUE	25	TAATGCCTCCCCAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNKHTHTQARTHMREKTDAENKLCLLNCPSEKQSNPRNCNHC	1043070	1035619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039991_1040386_1042086_1042882
887758	contig_10734_pilon	-	2089	10	Intergenic	novelGene_51475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	620.720509261039	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	285	1595	2285163	2265543	FALSE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305226	2265048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269400_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2304960
887759	contig_11338_pilon	-	3073	2	Intergenic	novelGene_6396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	189	629	313440	313000	TRUE	55	AATAAAAAAAAGACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	313628	310366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_312357_312545
887760	contig_17440_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_7627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3238	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3200_4000
887761	contig_11564_pilon	-	2309	9	Intergenic	novelGene_158544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	395.241204045074	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	93	1103	60844	41045	FALSE	5	GGACTGTTTGCTTGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTIQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	62559	39838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41175_52151_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470
887762	contig_17427_pilon	-	2640	11	Intergenic	novelGene_30314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	1001.16761833371	1689	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	338	1543	186489	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188369	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038
887763	contig_9668_pilon	+	3206	9	Intergenic	novelGene_58109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_6	333.643428677983	1982	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	100	1443	214129	359314	FALSE	20	CATTGATTGATTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFVSGLRGARSLRGPCCRCLFNGRGSDAEGWKMAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214029	361077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
887764	contig_5791_pilon	+	3725	3	Intergenic	novelGene_35835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_2	892.5	62	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	661	1131	1036729	1042396	FALSE	25	CAAGAGTATGGTTTTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHILAGNPQQVLSSDKNPSCNNTVKLSTTAVSSVSSNVSVTTSKPKVTSHTSAITTSTTVKPAPNRTSISQSTSQMLTSTMTTTHNSSVTSASSSVTTSINFKENKGSKFDTGSFVGGIVLTLGVLSILYIGCKTYYSRRGIRYRTIDEHDAII	1036068	1044990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1037027_1038176_1038325_1042371
887765	contig_12886_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_135470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCACTCAGCATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294501	291725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_291700_294500
887766	contig_6102_pilon	-	1746	10	Intergenic	novelGene_32325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	315.484812101417	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	815	910	1687243	1682962	FALSE	35	TATACTAAGTGCTATGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRYHVAALKGDLLLT	1689775	1682125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1683005_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732
887767	contig_5316_pilon	+	2188	9	Intergenic	novelGene_61213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	339.183117946634	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	344	1597	453918	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396016	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
887768	contig_4213_pilon	+	2967	3	Intergenic	novelGene_124798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	144.5	16	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTCACAGATCCATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19207	45500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_19305_40541_40646_42734
887769	contig_9363_pilon	+	944	3	Intergenic	novelGene_6624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1479.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	274	465	872726	872917	TRUE	25	CAGCTAACTCACTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLSERRQRRQRAARVSGGSGGGLRNDGARARRCVKATGASRGGRCCPWTPWISPTSSSASIWRRTALNSRRPCCAKWVCRRPRSDCRRSTMVSAPPPPAGSRPPGLPQHPFCPRLFPLVKPDVCLFTLFRFLFLLASKKQLLLLGMKASRAWP	872378	873728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_872473_872546_873095_873426
887770	contig_5321_pilon	+	3296	3	Intergenic	novelGene_153872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	10.5	577	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	2952	3296	65753	66097	FALSE	5	CTCCAGGCGGCGGGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWSPGLSLAAALNTPRPGQQRVTRGWTARRLLARRPDPGVTLEAAREEINNRLGRRETEAAEAAGSPSRAQHLPNFPSPPSKHPPPQPRPGRPARPAAAPTCAAAGSVRDGSGS	52124	66097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_52261_58488_58737_63185
887771	contig_7293_pilon	-	1848	4	Intergenic	novelGene_54262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCAGAGCTCCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338085	335720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_335803_336109_336241_336363_337554_337640
887772	contig_10437_pilon	+	1540	7	Intergenic	novelGene_38281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	958.379998863823	561	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	281	1009	441733	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431081	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439846_441717_441868_443748_443977_445309_445473_446951_447055_451075
887773	contig_2036_pilon	+	5394	6	Intergenic	novelGene_131793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3714	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16728	599653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_17719_72076_73092_317097_317719_470278_470907_597013_598204_598703
887774	contig_12951_pilon	+	5626	9	Intergenic	novelGene_68198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_8	242.83942096579	2363	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	144	1442	755258	836145	FALSE	25	CCCAGCGGCCGATTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRVCFH	755114	840329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934
887775	contig_2438_pilon	+	3277	6	Intergenic	novelGene_112023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2309.15937951455	10	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	TRUE	25	TGATGCCCAGCAGTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	315527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729_313188_313248
887777	contig_8377_pilon	-	12774	2	Intergenic	novelGene_35035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	443	742	89368	89069	TRUE	20	CCAAGCTGCTACTGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIIHSIHCLNLSPHNTSKVIRLSLAACQSCYQNISHLDQPIHTKEAESLIWYRVISKSYRDLFIHAFNYLFNKYMFKGSSVMSGTADTKVNKEKCLP	89810	76979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_79220_79276
887778	contig_4364_pilon	+	1945	6	Intergenic	novelGene_646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	453	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
887779	contig_9653_pilon	-	3004	14	Intergenic	novelGene_48283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1137.56985350247	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	40	1767	1025386	1006903	TRUE	25	TAGATGGATTTGATGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1025425	1005012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006054_1006706_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021048_1025334
887780	contig_9720_pilon	+	1101	4	Intergenic	novelGene_116788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.881158828371	1326	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	47	355	391837	392457	TRUE	15	TGCCTGCATTCTGGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLYNMNDCYSKLKELVPSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQSSRTPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG	391631	393998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_391641_391799_392089_392400_392465_393259
887781	contig_8045_pilon	+	3309	2	Intergenic	novelGene_35374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	945	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116046	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116214_116276
887782	contig_12938_pilon	+	1582	8	Intergenic	novelGene_99691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	620.043415201463	3741	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	154	801	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51909	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
887783	contig_15304_pilon	-	1627	4	Intergenic	novelGene_30677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4975.27716704194	147	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	889	1485	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	112595	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106795_106931_107223_112484
887784	contig_2726_pilon	-	3621	4	Intergenic	novelGene_165903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2093	2437	220109	219765	TRUE	80	ATAAATAAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIKSHLSIITLTVNGLNAPIKRQRMTEWIKKQDPSICCLQEKQFRNKVINLLEIKGWKNMYEANSHHKRAGVAILISYKIDFKTKSTIKGKGGHYIMIKGMIQHEDITIINI	334381	218328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_218894_219145_220481_324044_324643_333258
887785	contig_3956_pilon	+	1639	8	Intergenic	novelGene_14874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1451.1488481861	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	84	1115	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285806_1290449
887786	contig_6364_pilon	+	6747	13	Intergenic	novelGene_51702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2979	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	6449	6745	477668	521189	FALSE	25	TGGGAAACAGGGGCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTGRRTGRSISFKFLVVIPISIHTWSRSRIVHGKRSVNDARRKKLIRSPPSMAQMEERTVRGLTGSPRAEGGSGGNRAAPRTGKQRLSATPAGRRWE	431103	521191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_436283_436418_436500_439764_439985_440671_440788_445010_445153_447070_447144_457072_457255_458660_458776_466277_466369_472493_472646_477570_477736_490716_490802_521045
887787	contig_8377_pilon	-	4066	1	Intergenic	novelGene_35058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	194	340	108388	108242	NA	55	AAAAGCTAAAAACACACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVQIQLTGTRIDFITFFSPLECDVTLVHNAFLPFNDSESYPSSDSNFLTIFLTSSGYWSLLTIRMIIPYATNERSFHKLTYLISYLFTCSVAVKSIDLERADIGLNLCTATL	108581	104515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_104500_108600
887788	contig_3822_pilon	-	3000	13	Intergenic	novelGene_133302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_11	1016.04145735081	115	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	958	1842	292774	277069	FALSE	25	TAAACTTATGTTCATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	306458	275910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296237_299561_299696_305985
887789	contig_18869_pilon	-	3754	13	Intergenic	novelGene_56462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	385.272630743478	1856	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	65	832	213911	191727	TRUE	20	AGCCGCACCTGAGGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAGDSDSWDADTFSVEDPVRKVGGGGTAGGDRWEGEDEDEDVKDNWDDDDDEKKEEPEEKPEVKVSEKKKIAEKIKEKERQQKKRQEEIKKRLEETEEPKVLTPEEQLADKLRLKKLQEESDLELAKETFGVNSTVYGIDAMNPSSRDDFTEFGKLLKDKITQYEKSLYYASFLEALVRDVCISLEIDDLKKITNSLTVLCSEKQKQEKQSKAKKKKKGVVPGGGLKATMKDDLADYGGYDGGYVQDYEDFM	213975	185243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_185348_186643_186891_187840_187929_188132_188289_188946_189101_189553_191859_192206_192281_193748_193911_196375_196491_205360_205453_205947_206003_213681_213786_213877
887790	contig_5954_pilon	-	2913	7	Intergenic	novelGene_28779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_6	1422.15490834625	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	139	849	1462068	1392942	FALSE	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462206	1390877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
887791	contig_5961_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_144178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCACCCAAGGTGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286588	288914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_286600_288900
887792	contig_15371_pilon	-	2952	19	Intergenic	novelGene_151461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1110	1457	225596	220873	TRUE	15	AGCTAGTGCTCTCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLEKELKQLSLHIRGGTLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSGKHIEESLYNLFSERHTHLYSKASKQSEEEAQHLISHI	231354	180715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_180807_180953_181082_186470_186584_195431_195543_196973_197064_198096_198175_205109_205265_208940_209036_212974_213118_215188_215336_216233_216426_220720_220875_221999_222115_222287_222460_225537_225700_226860_226960_227138_227371_230614_230661_230725
887793	scaffold_12124_pilon	-	4930	6	Intergenic	novelGene_22130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1814	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTTTAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434326	937155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_941429_991953_991996_1123424_1123572_1174636_1174850_1178793_1178900_1434177
887794	contig_6697_pilon	+	2824	1	Intergenic	novelGene_178520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGAATGACACTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146132	148956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6697_pilon_+_146100_149000
887795	contig_15893_pilon	+	2345	11	Intergenic	novelGene_128499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	459	junction_10	621.192570786226	712	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	25	2199	22021	58419	FALSE	10	CCTTGTCTTTAGGGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLQLPRNMIENSMFEEEPDVVDLAKEPCLHPLEPDEVEYEPRGSRLLVRGLGEHEMDEDEEDYESSAKLLGMSFMNRSSGLRNSAASYRQSPDGSCSVPSARTMVVCAFVVVVAVSVIMVIYLLPKCTFTKEGCHKKNQSMGLIQPFATNGKLFPWAQIRLPTAIKPLRYELNLHPNLTSMTFRGSVTISVQVLQATWNIILHSTGHNISRVTVMSAVSSQEKQVEILEYPFHEQIAIVAPEALLEGHNYTVKIEYSANISTSYYGFYGISYTDENNEKKYFAATQFEPLAARSAFPCFDEPAFKATFIIKIIRDEQHTALSNMPKKSSVLIEDGLVQDEFSESVKMSTYLVAFIVGEMKNLSQDINGTLVSVYAVPEKIDQVHHALETTVKLLEFYQNYFEIQYPLKKLDLVAIPDFEAGAMENWGLLTFREETLLYDNNTSSVADRKLVTKIIAHELAHQWFGNLVTMEWWNDLWLNEGFATFMEYFSLEKIFEELSSYEDFLDARFKTMKKDSLNSSHPISSSSVQSSAQIEEMFDSVSYFKGASLLLMLKTYLSEDVFQHAVVLYLHNHSYASIRSDDLWDSFNEVTNKTSDVKKMMKTWALQKGFPLVTVQRKGKELVVQQERFFLNTKPELQPSDASYLWHIPLSYITDGKKNRSLLLLDKKSGVINLTEEVQWVKVNINMNGYYVVHYADEDWEALIKQLKTDPYVLSDKDRANLINNIFELAG	21996	58565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_22839_30313_30453_31947_32080_41642_41764_42443_42599_43553_43668_45063_45199_48944_49077_51469_51631_51863_51944_58231
887796	contig_17144_pilon	+	1148	3	Intergenic	novelGene_29113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	286	junction_2	336	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	38	1147	5087	11721	FALSE	65	AGAAAATGAAAGAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDK	5049	11722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_11654
887797	contig_4103_pilon	-	6380	27	Intergenic	novelGene_51974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	40	junction_6	230.36693459829	28	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1811	5436	55	5490	269137	177156	FALSE	60	AAAAAACCAAGATCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQEPDRSSQENSPALLGVQKAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREKRKEKRKKKKEEQKRKQEDEENKPKESLELPEDEDEEENDEDVEQEVPIEPPSATTTTTIGISATSATFTNVFGKKRANVVTTPSTNRKNKKNKTKETPPTAHLILPEQHMSLAQQKADKNKINGEPRGGGAGGNSDSDNLDSTDCNSESSSGGKSQELNFTMDVNSSSDRRYPSVLLHSQEEKTSTTTSKTQARLEGEVNPNSLSTSYKSVSLPLSSPNIKLNLTSPKRGQKREEGWKEVVRRSKKLSVPASVVSRIMGRGGCNITAIQDVTGAHIDVDKQKDKNGERMITIRGGTESTRYAVQLINALIQDPAKELEDLIPKNHIRTPASTKSIHANFSSGVGTTAASSKNAFPLGAPTLVTSQATTLSTFQPTNKLNKNVPTNVRSSFPVSLPLAYSHPHFALLAAQTMQQIRHPRLPMAQFGGTFSPSPNTWGPFPVRPVNPGNTSNSPKHNNTSRLPNQNGAVLSSESPGLTTASCPITVSSVVAASQQLCVTSTRTPSSVRKQLFACVPKTSPPATVISSVTSTCSSLPSVSSAPITGGQVPTTFLPASTPQAQLSSQKMESFPAMPAPKEKVSTQDQPMANLCTPSSTANNCSSSASNTPGAPETHSSSSPTPPSSNTQEEAQPSIVSDLSPMSMPFASNSEPAPLTLASPRLVAADNQDTNNLPQLAVPAPRVSHRMQPRGSFYSVVPNATIHQDPQSIFVTNSVPLTPPQGPPAAVQLSSAMNIMNGSQMHINPANKSLPPTFGPATLFNHFSSLFDSSQVPANQGWGDGPLSSRVAADASFTVQSAFLGNSVLGHLENVHPDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSMDPSGSSPSSSSTPLTSFSSIPGTRVFLQGPAPVGTPSFNRQHFSPHPWTSASNSSTSAPPTLGQPKGGSASQDRKIPPPIGTERLARIRQGGSVAQAPVGTSFVAPVGHSGIWSFGVNAVSEGLSGWSQSVMGNHPMHQQLTDPSTFSQHQPLERDGSGMVAPSNIFHQPMASGFVDFSKGLPISMYGGTIIPSHPQLADVPGGPLFNGLHNPDPAWNPMIKVIQNSTECTDAQQASLLPSVPALKGEIPSPQLTRPKKRVGQPVVASPNQRHQDHLRPKVPAGVQELTHCPDTPLLPPSDSRGHNSNSTTLQAGGAEGAEGDRGRDTR	269191	176265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_177160_177306_177478_182405_182516_185838_186004_186703_186880_187407_187609_188676_188854_195525_197139_200563_200714_201329_201477_201929_202387_203409_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_238934_238990_239972_240117_240287_240416_243058_243147_264115_264226_269082
887798	contig_5302_pilon	+	1514	7	Intergenic	novelGene_81396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	1093.83738381088	4290	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	188	670	160708	170054	FALSE	40	GTTACATAGTAGGCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKCSKTSASDSSSERQRRSYRFGSETEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEEEEAQVRKENQWCEEK	152104	170898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152189_155421_155519_160701_160796_161142_161217_167388_167533_169186_169328_170018
887799	contig_5286_pilon	+	8748	10	Intergenic	novelGene_157325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATCACAATTCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483644	567396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487675_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245
887800	contig_10766_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_151232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTCGTCCACCATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215569	213591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_213600_215600
887801	contig_9873_pilon	+	1707	2	Intergenic	novelGene_176781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	417776	418147	TRUE	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQPSTEWNKKLTENRERGEVPYQLTQHGSAILDSYQRLANKGYEKAASRTFQQETEQPVNSDICFPTPPPFFTPTQPPLLPVATVSWLGSTSFTPVSLGFHPPTLAGSLSAVCWLLVLLFSAL	417773	530262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9873_pilon_+_418518_529299
887802	contig_9594_pilon	-	4178	5	Intergenic	novelGene_73914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	2725	3594	113553	112684	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHDDITIINIYAPNDRAPKYIKPTLTTLKIEIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILAHRAILKKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKIKEKQSATWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLDSNENENTSYQNLWDRAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQPK	296301	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_114475_114755_115112_115369_115818_234059_235010_296252
887803	contig_4213_pilon	-	3280	4	Intergenic	novelGene_124793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAATAAAATGTGATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45598	12835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_13041_19189_19300_40540_40640_42732
887804	contig_3380_pilon	+	7168	14	Intergenic	novelGene_60117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	333.549318585714	357	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	6	1976	437450	462606	TRUE	5	CCCCACCCTCCTCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMDANLTSTMEEFQELVKANGEEFHCRLIDTTQINARDWSRKLTQRIKSNTSKKRKVSLLFDHLEPEELSEHLTYLEFKSFRRISFSDYQNYLVNSCVKENPTMERSIALCNGISQWVQLMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHEINKVLGEMTELLSSYRNYDNYRRAYGECTHFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVNVHKLLALYNHINELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHRAPPLTPSKPPVVVDWASGVSPKPDPKTISKHVQRMVDSVFKNYDHDQDGYISQEEFEKIAASFPFSFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASSIYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTFCDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKTPTAPAESSSSVGPVSSLGSLGARDLLHGPEEGPFTFPNGEAVGHSEESKDRTIMLMGVSPQKISVRLKRTVAHKATQTEPLPWIGGDSPSGPFVLSSPRKAAQDTLHLLPSPPSPCPSPVLVRKRAFVKWENKESLIKSKEELRHLRLPSFQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQEKIESLQLERSNYVLAQMEQGDCS	437444	467867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_437548_439449_439604_443479_443654_444669_444787_450090_450367_451860_451942_453466_453572_454444_454555_455360_455506_456179_456217_456914_457068_458949_459336_462471_463801_463869
887805	contig_5686_pilon	-	3333	2	Intergenic	novelGene_45424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTTAAAAAATTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194409	187114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189975_193936
887806	contig_1725_pilon	+	2007	13	Intergenic	novelGene_24292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	619.408650560265	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	249	1688	207418	255543	FALSE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQAMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201504	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245073_249033_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
887807	contig_3601_pilon	-	2533	3	Intergenic	novelGene_132940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	256.5	46	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	379	1761	427702	426320	FALSE	45	TAGAGAATAACAGTCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLRTMQTVKKEQAPIDTSSNVDKMIVLSSALTEVSEDLTTGEDLLLNEGSVGKNKSSACRRKREFIPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTAYAQEIQKLSNSTAVYFQDYPTSKSNVSSFVDEHERSMVASSCISVIKHSPQSLSDGSEVSSVEHTQESPVQSSCRSPENKFQIIKQEPMELESYTRETRDDREVTTPIYQNYIGNSFPGYSHSPPLLQVNRSSSNSPRTSETDDGVVGKSSDGEDEQQVPKGPIHSPVELKHGHATVVKVPEVNSSALPHKLRIKGKAMQIKVEALDGEFDAAQKLSSAIDMTSKRHFELEKHNTPNMVHSALTPFSVQVTNIQDWSLKSEHWHQKELIGKTQNSFKSGVVEIKDSVYRVSDPENLYLKQGIANLSAEVASLKRLITTQQISASDSG	443672	425547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_427880_443345_443442_443567
887808	contig_252_pilon	-	5400	7	Intergenic	novelGene_99908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	319.170104420128	121	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2757	3194	42753	37945	FALSE	0	TGTTTTCTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFTLVSAVQEKLNEIVDQIKTRREEEKKQKEKEAEEAEKQLFHGTPVTIENFLSWKAKFDAELLEIKKKRMKEDEQAGKNKLSGKQLFETDHNLDTSDIQFLEDAGNNVEVDESLFQEMDDLELEDDEDDPDYNPADPESDSTD	69693	35738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_38067_41271_41335_41811_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_67158
887809	contig_11978_pilon	+	672	6	Intergenic	novelGene_63071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4362.28502507573	36	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	223	588	1830113	1831883	FALSE	20	TGCCTCTCAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSALQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827919	1831967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827931_1829088_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
887810	contig_1225_pilon	-	3132	4	Intergenic	novelGene_44126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1012	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAGAGCCGGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277046	250586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_250837_253413_253517_274219_274468_274515
887811	contig_6375_pilon	-	1649	7	Intergenic	novelGene_73069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	770	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1301	1648	701013	699608	FALSE	5	CCCCTGCGCCCCCCGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGPALPGGGLIFICFSTSFCSSFSFSASSSISLTRALIASSSGSSMAPSPGSPSTSPGSSSSSWLPGAPEPGPGPGAPGGARGRGGSSSGSGSGSGSSSSSSGSSSSDSRPFP	704901	699606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_699824_700170_700286_700996_701066_701386_701493_702744_702832_702919_703071_703997
887812	contig_3956_pilon	+	2554	12	Intergenic	novelGene_15099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	78	2033	1281682	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281604	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284129_1286168_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
887813	contig_16098_pilon	-	2680	2	Intergenic	novelGene_46251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATTTAGAAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829102	826323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_828615_828713
887814	contig_10009_pilon	+	2666	2	Intergenic	novelGene_82742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTAGGAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72503	75242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_72772_72844
887815	contig_10500_pilon	-	5614	7	Intergenic	novelGene_41266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1031.84575720728	171	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3128	3640	1635203	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1639715	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635617_1636940_1639382_1639442
887816	contig_4311_pilon	+	6423	7	Intergenic	novelGene_178522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	120	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	86	880	3646	4440	TRUE	20	ACCTCCTGACATTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYTETPKDSMRNLLELIERFSRVAGYKINIHKSVEFLYTSKENDEKEIRKTIPFSVAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKERYKTLLHETQRYLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIHKYNAIPIQIPTIFFKEMQKLIINFIWKGTKPRISKVLLQKKNTVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYINQWNSIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWENWISICKKKRNRTHASHHTQKLLQNGSKT	3560	321025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4311_pilon_+_4485_47293_47882_91498_91502_196199_196520_244477_244908_245190_247210_318886
887817	contig_987_pilon	+	2235	2	Intergenic	novelGene_72332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	358	2217	1169587	1194039	FALSE	55	AGAGTGAAACAAATTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVPLEEDDELEEEEIINDENFLGKRPLDSPEAEEMPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPKEKERKKDKKEKKKKKEKEKEKEKKEKEREKEKREREKKEKEKEKHKHEKIKVEPVVPAPSPVIPRLTLRVGAGQDKM	1169229	1194057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1171360_1193952
887818	contig_19735_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_167892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1665	2003	171540	171878	NA	20	TACCGTTTTTGATCATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHISIRVTTLISLGCIPRSGIVGSNGMSISSFLRKCHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAA	169875	171900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_+_169900_171900
887820	contig_6896_pilon	+	4756	3	Intergenic	novelGene_174218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2360	2659	149279	149578	TRUE	15	TTTCAGTTTTTTGCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWNILMLLILLWLGLRPNTWSILENVPCALEKKVYLAAVGWSVLYMSMRSSWLTVAFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSSVLKSPTIMWSCLFLFSMLLRV	146919	473334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_149670_337112_337196_471411
887821	contig_7129_pilon	+	4269	2	Intergenic	novelGene_169304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGTAAACAATGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904669	909103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_907835_907999
887822	contig_3018_pilon	-	2440	16	Intergenic	novelGene_78830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	517.127639520028	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	1065	2438	583440	550961	FALSE	65	TGAAAAAAGAGAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFAR	625103	550958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_598958_599185_600008_600194_624772
887823	scaffold_12124_pilon	+	2266	11	Intergenic	novelGene_22344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3172.38362119085	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	498	875	1490385	1508039	TRUE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483664	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508791_1508936
887824	contig_614_pilon	+	3259	1	Intergenic	novelGene_132604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212674	215933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_212700_215900
887825	contig_20398_pilon	+	2969	1	Intergenic	novelGene_155197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGGAGAGAATGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52337	55306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_52300_55300
887826	contig_11855_pilon	+	2247	9	Intergenic	novelGene_67041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	229.129875834645	1043	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	767	1228	2002362	2007496	FALSE	25	GCATGAGGTTCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLASPQPSGCASHEEHRGAVEELASIPSDKASSPGHPAFLEEGSPSPVLAFAASPRPNHSYVFKREPPEGCERVRVFEEATSPGPDLTFLTSCPDKNKVHFNPTGSAFCPVNLMKPLFPSMGFIFRNCPSSPGSPLPPDQPQATSSEGSRGL	1980780	2008515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1980838_1981051_1981141_1986608_1986779_1995528_1995625_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253_2002456_2004013_2004165_2007279
887827	contig_6794_pilon	-	1973	4	Intergenic	novelGene_148992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	158.248749336817	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	107	628	18797	13983	FALSE	15	TCGTTATGCTTGAGCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20652	12637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732_18827_20575
887828	contig_7915_pilon	-	5633	8	Intergenic	novelGene_42979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	225	junction_6	316.235187601808	5142	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	417	956	151603	142263	FALSE	40	ATAATCGATGTCACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKIKLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVIILIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGRLTSEPQPQREGCGC	167364	137585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_142441_143605_143637_143972_144061_147960_148028_151427_151606_154716_154771_155911_155971_167063
887829	contig_9038_pilon	-	6389	12	Intergenic	novelGene_143315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	103	junction_6	77.1713773856817	1451	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	492	2240	367629	343020	FALSE	5	GTTGTTTGTCATTTCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMLITSTFFFLNRDYHLSYLSLRTSIGLWTSFLCIVLVATDASSLVCYITRFTEEAFAALICIIFIYEALEKIFHLGEIYAFNMHNNLDELTTYSCVCIEPPNPSNETLELWKEKHVTARNISWGNLTVSECKTFHGVFVGSACSHHGPYIPDVLFWCVILFFTTFFLSSFLKQFKTKRYFPTKVRSTISDFAVFLTIVIMVVIDYLVGVPSPKLHVPEKFEPTYPNRGWIISPLGENPWWTLLIAAIPALLCTILIFMDQQITAVIINRKEHKLKKGAGYHLDLLMVGVMLGVCSVMGLPWFVAATVLSISHVNSLKVESECSAPGEQPKFLGIREQRVTGLIIFILMGLSVFMTSVLKFIPMPVLYGVFLYMGVSSLKGIQFFDRIKLFGMPAKHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKASSAAVVFPMMVLALVFVRKLMDLCFTKRELSWLDDLMPESKKKKEDDKKKKEKEEAERMLQAEDSDTVHLPFEGGSLLQIPVKALKYSVDPSVVNISDEMAKTAQWKALSVSTENARVTRANTSPEKPESVKINFEDEPTKRYMDAETSL	368120	338870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_343102_345036_345145_347572_347674_349921_350054_353248_353423_354823_354893_358381_358634_358811_358974_360920_361035_362372_362535_364926_365033_367342
887830	contig_3747_pilon	+	2709	5	Intergenic	novelGene_24845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4619.90338102433	12	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	327	662	201313	202945	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEIHVPASWSPKLPL	200986	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202176_202902_203128_203228_203386_203498
887831	contig_990_pilon	-	4123	13	Intergenic	novelGene_76146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1051	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	3418	3972	1782985	1761490	TRUE	15	CTCCTGGCCCAGGTGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLNREPMNILITCGIIESTVSNSLEKRFTRFPLGVRSKKLIGARRTLCSRSRCRRREAKMPPMDTVMDRYLVLQHPLGAHYIFKYVLSDVGIHRREGVVKEVDVRVAVHGPGQAHALLLAPRQVHALLTNLCPVPRGQDLQVWEQGTGLDHGLVIPLLQRASEEDISSEGIILDPGLLGDVGH	1805325	1756776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1756797_1759097_1759224_1761484_1761662_1763004_1763182_1782779_1783069_1787802_1788003_1790877_1791004_1791530_1791634_1795783_1795931_1797835_1797995_1798958_1799126_1800238_1800434_1803088
887832	contig_18162_pilon	-	1384	3	Intergenic	novelGene_122310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	430	762	10629	8472	FALSE	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGVGLTEKWPLRKDLQDMRELAMRMPGEGLPGRGTSSANTLGQERARVLGAARRAVGLEQTVAEMRPEVWSDHVGPLHQKVFFFLFPLSEMRSYKTILSRRETWYDGL	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8802_10626_10809_16363
887833	contig_1719_pilon	-	4818	23	Intergenic	novelGene_87268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	599.54219621418	1561	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1405	4218	149	4366	382036	350827	TRUE	35	AATACTTACAGAATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQEHVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDDPLSRKDSRWGDSESTWRRGPEVESEWRRGPPEKDWRREGRDEERSLRRDEDRPRRLGDDEESQSSVRPEDDRFPRRGTDEDRGLRRGPDEDRFSRRGVDDDRPSWRNTDDDRPPRRIGDEDRASWRHADDDRPLRRGLDDDRGTWRAADEDRGPRRGMDEDRGPRRGGVDDERTSWRSGDDDRGPRRSMDEDRGPRRSMDEDRGPRRSVDEDRGPRRSVDEDRGPRRSVDDDRGPRRSVDEDRGPRRSVDDDRGPRRGFDDDRGPWRNTDDDRVPRRGTDDDRGPRRSIDDDRLSRRADDDRIPRRGDDSRPGPWRPFGKPGGWRDREKARENSWGPRQESRLSEDSEWDREKERDRDNPDRDENDRDPERERDRDRERDEDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDWDRDDRRRERDDRRDLRDRRDDRDRRGPPVRSDREEASSWRRADDRKEDRAEERDTPRRVPPPALPRDRERERDREREGEKEKAAWKAEKDKESLRRTKNETDEDGWTTVRR	382184	349849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_349919_350443_351057_352093_352276_353049_353249_355121_355988_356639_356723_358421_358607_359047_359202_359740_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
887834	contig_8866_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_77831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGTAAGTCTCTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584206	586341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_584200_586300
887835	contig_6836_pilon	-	7617	9	Intergenic	novelGene_178523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	158	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	6675	6995	3644	3324	FALSE	20	AGTAGGTTCTCAAGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLICASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	272252	2701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6836_pilon_-_5025_34301_35218_112523_112951_113818_114263_129437_130241_232991_233572_253866_254174_269882_270686_271238
887836	contig_9696_pilon	-	5701	10	Intergenic	novelGene_68807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	319.658652817326	55	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	941	1507	383342	379470	FALSE	30	CTTAGAAATTTTGCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGQRLGAAVPRPGEGIPVPGGRRRSGWASFPRSGVGDFFERTILCNSLVWSCAVTGRPGLTYQEALESEKKARQNLQSFPEPLIIPVLYLTNLTHRSRLHEICDDIFAYVKDRYFVEETVEVIRNNGARLQCRILEVLPPSHQNGFANGHVSNVDGETIIISDSDDSETQNSSFQNGKKKDAVDPLLFKYKVQPTKKELYESAIVKATQISRRKHLFSRDKLKLFLKQHCEPQDGVIKIKASSLSTYKIEEQDFSYFFPDDPPTFIFSPASRRRGRPPKRIPVSQESIANKQTATGYRNKTTKERDKLLKQEEMKSLASEKAKLKREKADALEAKKREKEDKEKKREELKKIVEEERLKKKEEKERLKIEREKEREKLREEKRKYMEHLKQWSKPREDMECDDLKELPEPTPVKTRLPPEIFGDALMVLEFLHAFGELFDLQDEFPEGVTLGKCSSCLLLCGLKEQIIISQFCGLTVLSYPVLSWGLSCGYSEKVGGTGAI	439843	375275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_379761_380486_380583_382568_382736_383329_383427_385912_386048_396444_396533_399959_400062_410407_410552_429657_429937_439735
887837	contig_9471_pilon	-	2918	12	Intergenic	novelGene_21855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	977.293023045065	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	42	1253	445281	434608	FALSE	20	CTTAGGTTTACAGGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELVAEQAIKHLKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSNLSLKLKKVTEF	446525	432942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435158_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
887838	contig_11843_pilon	-	3063	3	Intergenic	novelGene_178524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1316	2005	162165	58084	TRUE	45	ATATACTCCAACAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNIPVSVKDRTTKKKLSKCVEDLKGTISQHDLIDIYKTLHPTTANYTFFSNAHGTFSRIEHILGHRAILNKIQNFEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKNKDKKSTTWNLNNTLLTHQWVIEAIRHGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRQQFITIDAHIKKEERDKIKTLTTQLKHIEREQQKKAHNHRKKGNSKDQSRNK	163480	32786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11843_pilon_-_33600_57838_58766_162157
887839	contig_5696_pilon	+	5162	16	Intergenic	novelGene_117551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_1	518.390414863375	199	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1401	4206	154	4359	689252	738140	FALSE	15	CTTACCAAGCTCTGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFADTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	684375	738943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_688772_688883_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_734430_734596_737775
887840	contig_17522_pilon	-	4305	1	Intergenic	novelGene_160800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1447	1860	77909	77496	NA	30	GCTTCAAAATCCATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDGVKCVDLTGPQFSVVWQLWYSVGGYVMMCNHLHNGSTLNSQSVERDFPWGCGLHPIYMDFLAKLPGFCSLWILHPACHRLTSRSWDLNQWLAILPANLGIHQPLQLMSQQPAILPATLGSVNPCSYMSQKKPPA	79355	75050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_75000_79400
887841	contig_2009_pilon	+	3704	8	Intergenic	novelGene_165451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	347.95226038956	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	140	1270	56208	66411	TRUE	30	TAGTCTCTAAGAAGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRYQVRGECSFDVGSGFFCSSIQVIFVSFIISFYLESTSGDKSVSHSCTTPSTSSASGLNPTSAPPTSASAVPVSPLPQSPIPPLLQDPNLLRQLLPALQATLQLNNSNVDISKINEVLTAAVTQASLQSIIHKFLTAGPSAFNITSLVSQAAQLSTQAQPSNQSPMSLTSDASSPRSYVSPRISTPQTNTVPIKPLISTPPVSSQPKVSTPVVKPGPVSQSAAQQPVPAEKPQGHEPVSPRSLQRSSSQRSPSPGPNPPSSSNAPSAAVVPQNSSARPSCSLTPTLAAHFNESLIKHVQGWPADHAEKQASRLREEAHNMGSVHMSEICTELKNLRSLVRVCEIQATLREQRILFLRQQIKELEKLKNQNSFMV	56068	68886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_56563_58031_58155_59129_59279_61716_61836_63289_63477_64660_64789_66341_67366_67406
887842	contig_6503_pilon	+	1463	9	Intergenic	novelGene_145766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	116.210746060767	2157	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	211	900	144440	154252	FALSE	15	GTTGTTCCCTTTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSEKDLQQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE	140400	154815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140598_144426_144545_146770_146851_149655_149724_150052_150098_151127_151232_151798_151866_153032_153112_154110
887843	contig_9014_pilon	+	1648	5	Intergenic	novelGene_106801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1335.6856853317	6212	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	58	435	150693	152329	TRUE	20	TCTGTGTACAAGTCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150635	153634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425
887845	contig_16722_pilon	-	4200	14	Intergenic	novelGene_118293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	258.353503061946	786	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1328	3987	171	4157	183828	136656	FALSE	30	GAGGTAAGGAAGTGGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRGKYEEPTEVGDKGNSVSTNLGDNTTNAASEESSPSERRSPVGYLSETHDSSNMAEKKVASELPQDVPEEPNKTSDNSNTSATTTSIQPNLENSNSSSELNSSPSESAKAADDPENGERESHTPVSSQEEIGDYKSEKSNGERSESPGAGRGGSGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLSTKKEVVMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTRLHRMTSIEREEKEKVKKKEKKQEEEETMQQATWVKYTFPVKHQVWKQKGEEYRVTGYGGWSWISKTHVYRFVPKLPGNTNVNYRKSLEETKNNMDENMDESDKRKSPRSPKKVKVELNSEKGEVKDSDAAKGIDQSEMDISKITEKDQDVKEVLDSDNDKSFKEEPMEIDDDVKLESHMNCQEISQVDVVNVSEGFHLRTSYKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKMKLESGIKGIGKTSTNSLKSLSESPVITKVKEECDLLRQVQSRNASNDKSENLIQGCSQSDSSVLGISDSNHTTNKLYPKDQGLDDVPIQSPEANCQKQNSVVNDIDKRLSEPTSKGQEPSNIKTKGTDLLMDDSKLASTNEIGTLIYKNKKPLLQEDNDTIVSPSESSLLPSLPRSSSDRENPSLSKAVDFEGKLGCDSEYNSTLENSSDTMSIQDSSEEDMIVQSSSESISEQFTAQEQGIEDSEPLKREFVSDKSPGKCGDRLQANVSEANGEKLSQEPKLEERPVNKCIDQINLRNITDKKNNENRESEKKGQKASTFQINGKDNKPKAYLKGECLKENSESKVVSGDVEPKVNKINKVIPENDTKSLTIRESTVKPFMNGDVIMEDFNEKNNLGTRSCLLGSSDAEGDYQDSLETLPSTKESESAQTTTPPPSHPERSSVNQVEEMETETSEVKKVTPSPITSGEESNLSNDFIDENGLPINRDENINGEAKRKTVITEVTTMTSTVATESKTVIKVAKGDKQTVVSSTENCAKSTVTTTTTVTKLSTPSTGSSVDIISVKEQSRTVVTTTVTDSLTTAGGTLVTSMTVSKEYSTRDKVKLMKFSRPKKTRSGTALPSYRKFITKSSKKSIFVLPNDDLKKLARKGGIREVPYFNYNAKPALDIWPYPSPRPTFGITWRYRLQTVKSLAGVSLMLRLLWASLRWDDMAAKAPPGGGTTRTETSETKITTTEIIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPEAPKGKVHCGQRDQKHPSRLALLLSKPG	236817	136612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_136724_143784_143920_144484_144610_148851_151154_152220_152398_155147_155287_155905_156036_164408_164541_164931_165288_166756_166945_171616_171806_183782_183972_184541_184552_236800
887846	contig_253_pilon	+	5171	6	Intergenic	novelGene_129748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1354	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	856	1176	699726	700046	TRUE	20	TCTGCGGCTGAGATAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTRLGQQMGRGPALTWILLEAVMEDCSGPPRWDFSLRKQLRSRVRQCLGGTWLPGWDKEVVPNAPAPSGAPSVTRWENTYWRPVGPEPAWCPRAGLHKAPVLHL	698870	707278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_703412_703699_703912_704488_704649_705221_705389_706120_706167_707233
887847	contig_8576_pilon	+	2244	5	Intergenic	novelGene_88790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	675.529607049166	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	367	723	914305	915551	FALSE	25	AAACAAGGTGGCTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893604	917072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893788_913383_913461_914198_914310_914837_914977_915338
887848	contig_14876_pilon	-	3872	3	Intergenic	novelGene_170235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	874	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTCGCCGTAGGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54754	38511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_39043_45400_45647_51659
887849	contig_4791_pilon	+	4092	3	Intergenic	novelGene_177987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2337	2753	132554	136440	FALSE	75	GAAAAAGAAAAGAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDCFKLRKIRVKFMVTTKKVNKHTHKNKEEKHKVSAKTKPTKTKEMKKKSTNKSNSAQESKKNKENFSTTKKKHHKMTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLKDTHLRNKDVNLLKVKGWRK	129588	137779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4791_pilon_+_129895_130523_132967_136436
887850	contig_9098_pilon	-	4678	16	Intergenic	novelGene_75815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.949769893204	600	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	187	1596	350397	335775	TRUE	65	TTATCTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350583	302672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_303079_309867_310015_311364_313368_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330
887851	contig_6898_pilon	+	2976	6	Intergenic	novelGene_35759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3511	junction_5	1472.93576234675	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	35	916	119670	125646	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119635	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
887852	contig_7963_pilon	-	7133	14	Intergenic	novelGene_58434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.549513266877	72	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	1406	2842	125592	120628	TRUE	25	CCCAGTAAGTGATTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	129559	113557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_114521_115838_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126910_129471
887853	contig_2703_pilon	+	2321	16	Intergenic	novelGene_101721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1024.32056614237	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	282	1523	559489	610938	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVADPPGWPHAWNADGPRSVHAQHVGTKDLSIRNAHGDQQRAQQNPKRHEEKSKTLLSPAHRQQLAKGVTMAGTHRMLY	526185	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607650_607732_609320_609381_610843
887854	contig_7749_pilon	-	3516	2	Intergenic	novelGene_170868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	863	junction_1	0	28	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1948	2256	23510	22029	FALSE	45	GAAAGACAGACACATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYSPYVLPVQCTGKRDEDKDKIGNVEYFGLGGYPGFPLQYYPYYGKLLQPKYLQPLLAVQFTNLTMDTEIRIECKAYGENIGYSEKDRFQGRFDVKIEVKS	25457	20768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_22293_23465
887855	contig_13366_pilon	-	2894	13	Intergenic	novelGene_99760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_7	168.781087671444	285	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	552	2759	56260	26320	FALSE	50	AAGGAAAAACACATAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVITGDEVQILSNLVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAVCIEKVKLRVLKQYDYDSSTNRKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIQVENVYEEILYQTLLDETLKVIKEAAVLKKHNLFEDNVTLPSESVSSLTDLKTPTGSNQASPARRASAVLPGVLDSESLGNEVFQEPEEEQQPGAPSPLAEEESTSLPVSSPPSAGDGQVVVSSISGPGNLVATEDKTETLDKNSAELEFGEIPEEEDPAHEEPESVSASGSLKELRKLLTVTVEVPVESAVVIEKDIPEETLLPQEDEKEEEKPQIYTEAHEVAASHQDHCEEDEVNEREAHLSSTEASGMEWGSFPEASGSAPEPACGRLTEGASCPGPTGEQMEAGELPERASKLFHEEGGAQCALEGEASAGEDCILSSDHVHPSESQVSEEMMEGKISTGQREVSVDTEASKVASVHACQWVVENAPNTSSLGAHENNVKEREGCLESSPGQLVEEE	116976	26184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_27468_29836_29949_35679_35788_38158_38270_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49267_56149_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113726_116845
887856	contig_5899_pilon	+	4590	2	Intergenic	novelGene_146949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	605	958	605	958	TRUE	60	AAAAAAAATTATAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPNRELKTLMLGIPQELRQKADKHEEKIDKLKENTDKKIGRVQEDDAGTKCQNKFTTRNYTRTTIKNPKDKKQDFRNG	0	8015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_2255_5679
887857	contig_17074_pilon	+	3038	12	Intergenic	novelGene_145107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	204.077120408879	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	166	1197	212372	223655	FALSE	45	AAATCACCATGAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207891	225496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212373_213428_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
887858	contig_10749_pilon	-	1561	7	Intergenic	novelGene_133511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	34.7678810909661	465	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	168	1319	311520	305197	FALSE	50	AGCATTACTGAAGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKSGTGDGVVREILCWLLSSSCPACCRGNDQQRKWDRAGTSTSGSALRLPHQGTCMGHRFLGRLIQWLPLAVPPPLQPRHRMLGTESVPPPKRPRGDFMAPPRIGTHNGTFHCDEALACAMLRLLPEYQDAEIVRTRDPEKLASCDIVVDVGSEYDPQRHRYDHHQRSFTETMSSLSPGKPWQTKLSSAGLIYLHFGRKLLAQLLGTSEEDSMVGTLYDKMYENFVEEVDAVDNGISQWEEGEPRYALTTHLSARVARLNPTWNQPNQDTEAGFQHAMALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVDSSGEILELAKGGCPWKDHLYSLESELAPPVAIAFVIYTDQAGQWRVQCVPKEPHSFQSRLPLPESWRGLRDKALDQVTGIPGCIFVHASGFIGGHHTREGALSMARATLAQCSAPMPSTNPLVQ	311687	304954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305396_305535_305718_305834_305958_306076_306230_308321_308482_310998_311112_311298
887859	contig_10722_pilon	-	2739	11	Intergenic	novelGene_70958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_8	266.853986292129	302	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	28	1401	17264	4150	FALSE	30	ACTGAGCTAAAAGGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERLSPTPSMQDGLDLPSETDLRILGCELIQAAGILLRLPQVAMATGQVLFHRFFYSKSFVKHSFEIVAMACINLASKIEEAPRRIRDVINVFHHLRQLRGKRTPSPLILDQNYINTKNQVIKAERRVLKELGFCVHVKHPHKIIVMYLQVLECERNQTLVQTAWNYMNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	17291	2811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637_6738_8496_8562_9665_9787_16247_16358_16853_16929_17168
887860	contig_16951_pilon	+	5176	3	Intergenic	novelGene_98641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	21	junction_1	372	2694	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	85814	106694	FALSE	25	ATGTCTGCTAACAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLQTSTRVSVQGCSEGKEEICWFLPPETFLRCPQQKVFPASQSTEHVLGPGVHLRGACVRAAWWQRHSHPSLKPFSRWTGRQAAQEQEPLHLDSGGCGLVRERCRPSGFGASRGALQKA	85812	111506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_103952_104099_106692
887861	contig_854_pilon	+	3612	15	Intergenic	novelGene_36689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_13	3823.64813845818	318	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	279	2189	1705343	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704572	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
887862	scaffold_12124_pilon	-	2145	8	Intergenic	novelGene_22354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACCTTGTTTGGAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509566	1484054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484261_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1508009
887863	contig_4426_pilon	-	4149	8	Intergenic	novelGene_15345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	543.779104311405	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	151	609	97685	10019	TRUE	25	TACTGAGTTTATCTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFCSLVCGGFLRTRPSSFKKDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERFHSLAPMYYRGSAAAVIVYDITKQDSFHTLKKWVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	116744	6427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_8035_8085_10117_25070_25181_71325_71433_72710_72783_97613_97696_110145_110226_116684
887864	contig_854_pilon	-	5233	25	Intergenic	novelGene_36624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.59861050777091	13	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	3136	3930	1706853	1702548	TRUE	15	TGTAGAGCTGCCCCACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHLPVSGGPIPESSPAPPAATVPHGGAHIPASSVLVALPAPPRPGSVSASSPGSGPHGSWPPPQESSSGCSLPVHV	1716403	1692707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1692746_1695114_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702770_1704478_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710677_1711569_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
887865	contig_14023_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_165349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTGGCTATGTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41202	42374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_41200_42400
887866	contig_504_pilon	+	3049	11	Intergenic	novelGene_54433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	988.534956387482	943	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	136	1281	222784	236818	FALSE	20	GCTTGAAGCTCGATTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPVEPPPSRYRSVEPGWEGSAEGAQHAAASHLQSRARRRPSPEKTMASGSPAASEEERSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKEEAKQIQTLQKGSSRADSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFPVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGEMDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV	220111	238586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_220239_222775_222961_227468_227640_228461_228554_230991_231054_231902_231950_232809_232969_234126_234188_234985_235108_236052_236135_236645
887867	contig_4730_pilon	+	3772	7	Intergenic	novelGene_71696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	909	junction_5	250.64234146156	1328	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	203	1282	84213	123105	FALSE	15	TTTTGCCATGTTCAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYNAKDEVDGGPPGAPGGTTKNRRPDNTAFKQQRLPAWQPILTAGTVLPTFFIIGLIFIPIGIGIFVTSNNIREIEIDYTGTEPSSPCNKCLSPDITPCICTINFTLEQSFEGNVFMYYGLSNFYQNHRRYVKSRDDSQLNGDPSALLNPSKECEPYRRNEDKPIAPCGAIANSMFNDTLELFLIGNDSDPMAIPLKKKGIAWWTDKNVKFRNPPGEESLEERFKGTTKPVNWRNPVYALDSEADNNGFINEDFIVWMRTAALPTFRKLYRLIERKDDLHPTLPAGRYYLNITYNYPVHSFDGRKRMILSTISWMGGKNPFLGIAYITIGSISFLLGVVLLVINHKYRNSSNTADITI	84010	125595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_84444_112057_112166_114406_114515_118486_118575_119487_119632_120292_120500_122911
887868	contig_9144_pilon	+	2252	7	Intergenic	novelGene_151138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	241.542094330022	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	227	841	620159	624074	FALSE	80	AAGATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRAVVMISCNRHTLADNFNPVSEERGKVQDCFYLFEMDSSLACSPEISHLSVGSILLVTFASLVAVYIIGGFLYQRLVVGAKGMEQFPHLAFWQDLGNLVADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPM	615315	625485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615405_618694_618789_620115_620283_621888_621999_622274_622406_622954_623082_623951
887869	contig_5696_pilon	-	5056	5	Intergenic	novelGene_117564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1392	1697	747511	709112	TRUE	45	CACATCTGTAATTATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIGVHMSIRVMTLISLGYIPRSGIAGLNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQHLLFPVFLIHASNAGVRWYLIVVLICISLMASS	944723	699379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_702633_709005_709120_747213_748762_801643_801654_944592
887870	contig_19179_pilon	+	2908	1	Intergenic	novelGene_142376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32831	35739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32800_35700
887871	contig_3424_pilon	+	5482	15	Intergenic	novelGene_55528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	393	junction_1	596.673568158315	2539	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	264	1838	276289	329904	FALSE	15	TTTTCCCTTTTCTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRNKIISIFSGTEKGSRKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPVLNTKGSETSTVVTEEDDDDEEAAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSNVDSGAKPSDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLTPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR	249095	333548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_249338_276267_276476_309784_309886_310236_310385_312001_312034_313038_313147_314560_314694_315892_315957_317097_317147_317632_317746_318973_319092_321267_321368_323488_323686_329184_329323_329817
887872	contig_18108_pilon	-	4030	9	Intergenic	novelGene_33437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1897	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTTGTGCTTCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125321	42254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_42572_42794_43152_94352_94472_103436_103526_108410_108449_110391_110457_110977_111072_116600_116742_122511
887873	contig_839_pilon	+	7434	6	Intergenic	novelGene_171533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	296	152	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2644	3030	125489	125875	TRUE	40	ACCAGACTAAATGGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKADKFMKNTDKKWKNSGKQCRKKNAKINSKLEIIQKQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRIVEIKEKHLDTNLTEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLEVIGVPEWGENRKHREDH	556	353787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_839_pilon_+_2760_125048_127262_280526_281406_349828_350712_352414_353074_353190
887874	contig_5041_pilon	-	2968	1	Intergenic	novelGene_27084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATTTTGTAACTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542469	539501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_539500_542500
887875	contig_6418_pilon	+	2033	13	Intergenic	novelGene_81214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	236.71654403996	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	607	1929	1388801	1444680	FALSE	20	AGTCTGTCACTTTCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341179	1444784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1383109_1383285_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
887876	contig_3529_pilon	+	4293	11	Intergenic	novelGene_105396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	92.6496627085064	756	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	150	1178	790486	809557	TRUE	30	TACGGAGTGGCCATCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790336	812879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397_811557_811763
887877	contig_7839_pilon	+	1802	2	Intergenic	novelGene_45681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101724	119561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_101740_117774
887878	contig_3745_pilon	+	3102	2	Intergenic	novelGene_85094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	268	873	434035	487098	FALSE	30	ACTTGTTACAGCAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPIHLDNEKKNQVFQNTKPLFCEHCAIEYLTD	433767	489327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_434548_487005
887879	contig_16775_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_107788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAATGAAAAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175373	173541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_173500_175400
887880	contig_10627_pilon	+	4228	12	Intergenic	novelGene_59934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	314.787767937344	541	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	2590	3357	165244	166905	FALSE	10	TGTTTATTGGTGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	160668	167776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164271_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166775_166851
887881	contig_14060_pilon	-	2212	5	Intergenic	novelGene_156044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	235.268463675011	172	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTATTATATGTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67018	36184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_38161_43215_43251_47974_48085_63033_63106_66999
887882	contig_4654_pilon	-	962	6	Intergenic	novelGene_103105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	813.493847548953	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	197	514	500418	497891	TRUE	55	TTTGTGCGATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVRGQK	515986	494418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497898_500107_500422_515793
887883	contig_3147_pilon	+	3420	2	Intergenic	novelGene_142279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	515	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAGAAAAATCAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128121	177370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_130829_176657
887884	contig_5643_pilon	+	1192	13	Intergenic	novelGene_38848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2410.81841077304	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	40	1041	233973	237983	TRUE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233635	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913_238085_238145
887885	contig_12414_pilon	+	1919	13	Intergenic	novelGene_59622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.008711776235	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	602	1342	591564	606875	FALSE	15	ATTATACTTTGTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCICADFEKVFCIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVVEEIADTLVQIFKGLQERFETEIQMVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGIEMGDEEDLSTPNEKLLGRLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP	561503	607452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_561659_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
887886	contig_6503_pilon	+	1520	9	Intergenic	novelGene_145764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	138.600087932873	158	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	382	960	146777	154252	FALSE	15	TAAGTTGTTCCCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSEKDLQQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE	140316	154812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140538_144426_144545_146734_146851_149655_149724_150052_150098_151127_151232_151798_151866_153032_153112_154110
887887	contig_11720_pilon	+	1482	10	Intergenic	novelGene_43801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2337.26792602489	6207	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	302	1198	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67836	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68047_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
887888	contig_4103_pilon	-	2045	13	Intergenic	novelGene_51929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	585	junction_1	338.686545922463	6	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	74	1297	91854	81700	FALSE	30	GTTGGGAAGGCACTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAPPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDEPMDVDKGGCIQSILRWL	91927	80951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_81754_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84688_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
887889	contig_12700_pilon	-	4756	5	Intergenic	novelGene_175817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	149	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTCCCTCCTTTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100859	52979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12700_pilon_-_54664_79320_79638_97807_98718_98896_99268_99385
887890	contig_960_pilon	+	4213	10	Intergenic	novelGene_108284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	550.11044906713	122	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	858	1190	1049072	1055443	TRUE	30	GAATCCGTTTATTAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLDVIKALGYWTEPEDVQETPAPESTSGSVSAANLSVAIQDEGRSDGSNLPSSSTNESALQCSASFKDDAGENTALLEAGRSDPQRGGPVSSCAFPRAAGGVVDTAPA	1020435	1060762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1020565_1038550_1038802_1039054_1039247_1039462_1039538_1039695_1039765_1046762_1046846_1049013_1049111_1053830_1054030_1055348_1057926_1060221
887891	contig_6102_pilon	+	3845	23	Intergenic	novelGene_31858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	484.996091404545	47	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	58	2235	370803	393134	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGSGRGGLAHWARYHCPSRSSSWLTSSAWIAGLHSTMVKGRCS	370745	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379730_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_394272_394467
887892	scaffold_13505_pilon	-	2133	4	Intergenic	novelGene_111551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	209.303607231218	25	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1519	1857	608426	607232	FALSE	50	AAAAGATAGCTAGACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKEKGRRGDEGEQGGGGDPALAHATGRAQKGAPGREEVGGRSNSVRRGEICAQLLGPELCTSHADPNRAVETPGVPLSPSSQMRRPLAGVAAHSLTFNLLEPTHRSPSHH	634293	606955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_607284_608139_609103_609532_610113_634031
887893	contig_12238_pilon	+	8317	7	Intergenic	novelGene_178525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1026	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2467	2955	6788	7276	TRUE	50	ATTCAGCATCATATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPARGRRIQAAGSLGSKACGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDLEAVTRPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKENRGKKKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAALGPEPAAPGRRGANEQRHRLLARAADQTWREPHTRT	4321	253375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12238_pilon_+_7858_63734_65136_102307_102315_102920_103262_249692_251028_251609_252581_252649
887894	contig_16492_pilon	+	3275	1	Intergenic	novelGene_100320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2617	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	167	478	193297	193608	NA	10	ACCTTACTTCTTTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKRMRLCLENTLYSLFQSFICSRLLILKLNTPCYFPRMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSGEPMAFCCQSGSGNMCQAPHS	193130	196405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_193100_196400
887895	contig_1435_pilon	+	4686	3	Intergenic	novelGene_115483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	148	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	3415	3894	416387	416866	FALSE	35	AGACCAATGTCTCTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITILNIYGPNDRATKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSIKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQLDLIDIHRTLHPTGAKYTFFSNAHGTFSRINHILGHRAFLEKTQHIEIIQSIFSDRKAIKVEINNLKSKEKNQLHGNRIRPCLKTTA	374006	417658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_376400_378299_378958_416023
887896	contig_678_pilon	-	10284	3	Intergenic	novelGene_167772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_1	354	1635	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	4301	4756	20054	17430	FALSE	65	ATGAAAAAAATCAACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENCILSESGVASRESFLSLVSLLCR	24354	11901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_17635_19596_19782_19988
887897	contig_2069_pilon	-	3059	1	Intergenic	novelGene_23374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1506	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	312	939	519	1457	1059334	1058396	NA	20	GGTAAGACGTTTGTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTTEQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSAEATKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1059852	1056793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1056800_1059900
887898	contig_16870_pilon	-	693	9	Intergenic	novelGene_155518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_8	119.002035171673	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAGAAAAAGTAATGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212865	201335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_201366_202226_202308_202502_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_206376_206458_207462_207586_212772
887900	contig_12733_pilon	+	3540	11	Intergenic	novelGene_129591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	353	junction_4	400.493807692454	1027	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	445	2307	331160	354319	FALSE	35	CTATGTTTATAACAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEHVNGNGTEDTTSAVIHSENFQTLLDAGLPQKVAEKLDEIYVAGLVAHSDLDERAIEALKEFNEDGALAVLQQFKDSDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGTKVADSSKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGQQPSVGTEIFVGKIPRDLFEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLYNNHEIRSGKHIGVCISVANNRLFVGSIPKSKTKEQILEEFSKVTEGLTDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKTAAQARRRLMSGKVKVWGNVGTVEWADPIEDPDPEVMAKVKVLFVRNLANTVTEEILEKAFSQFGKLERVKKLKDYAFIHFDERDGAVKAMEEMNGKDLEGENIEIVFAKPPDQKRKERKAQRQAAKNQMYDDYYYYGPPHMPPPTRGRGRGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDYYGYDYHNYRGGYEDPYYGYEDFQVGARGRGGRGARGAAPSRGRGAAPPRGRAGYSQRGGPGSARGVRGARGGAQQQRGRGVRGARGGRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQNWGSQPIAQQPLQGGDHSGNYGYKSENQEFYQDTFGQQWK	329356	355552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_331147_331299_332031_332151_332282_332391_335125_335240_335339_335517_344594_344731_345322_345529_346808_346959_347505_347628_353727
887901	contig_6048_pilon	+	3259	4	Intergenic	novelGene_73300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATACTCCCAACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2011647	2082397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2014218_2015213_2015294_2074872_2075344_2082259
887902	contig_15787_pilon	+	5985	2	Intergenic	novelGene_143972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1023	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACTTTTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60430	66557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_64351_64492
887903	contig_5302_pilon	-	3675	9	Intergenic	novelGene_81405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	693.210274285516	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	4	912	209238	177220	FALSE	65	TTAAAAAAAAAAAACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209241	174456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
887904	contig_7720_pilon	+	1026	4	Intergenic	novelGene_155770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	559.918049559239	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTGGCTATCCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701875	707480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_701962_704499_705142_706264_706362_707279
887905	contig_4876_pilon	-	2205	6	Intergenic	novelGene_137914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	133.349165726674	2465	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	213	707	654022	629214	TRUE	75	GTAAAAAAAAAAATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLGPPPAYSPSNGDFTFVSSADAEDLSGSIPSPDVRLNLGGDFSKESTATAFLRQRGYGWLLEVEDDDPEDNKPLLEELDIDLKDIYYKIRCVLMPVPSLGFNRQVVRDNPDFWGPLAVVLFFSMISLYGQFRVVSWIITIWIFGSLTIFLLARVLGGEVSS	654234	622376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_623681_625917_626032_629133_629304_631881_632054_633366_633521_653943
887906	contig_6898_pilon	+	2549	6	Intergenic	novelGene_35762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2678.3643814836	33	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	33	773	122646	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	122613	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126545_126823
887907	contig_6503_pilon	-	1913	6	Intergenic	novelGene_145752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	347	junction_5	46.8853921813607	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	769	1482	129868	118803	FALSE	20	AACTATAGGCTTCTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRADIEVACYGYEGIDAVKEALRAGLNCSTETMPIKINLIAPPRYVMTTTTLERTEGLSVLNQAMAVIKEKIEEKRGVFNVQMEPKVVTDTDETELARQLERLERENAEVDGDDDAEEMEAKAED	130636	118371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_122650_122758_126273_126426_129781
887908	contig_17171_pilon	+	4704	3	Intergenic	novelGene_147361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408	1765	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTGTGGAACCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186257	255612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_186314_249510_249562_251015
887909	contig_14666_pilon	+	1470	5	Intergenic	novelGene_39579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1772.56657138738	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	259	1182	483256	484940	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479877_479944_483205_483317_483861_484474_484689
887910	contig_4426_pilon	-	4298	8	Intergenic	novelGene_15346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	545.043117560437	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	45	707	136640	10019	FALSE	25	TACTGAGTTTATCTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWPLHTSAGKPGWMRFVWRCSPRFCTCSCSLSHSVAAGFLKRQMSPGGSSNDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERFHSLAPMYYRGSAAAVIVYDITKQDSFHTLKKWVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	137608	6427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_10117_25070_25181_71325_71433_72710_72783_97613_97696_110145_110226_136526_136649_137572
887911	contig_14970_pilon	+	10573	6	Intergenic	novelGene_45072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5330.18318634548	230	198	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAGAATAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204922	232865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_211931_212058_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
887912	contig_11364_pilon	+	3828	1	Intergenic	novelGene_65180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	569	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	2094	3080	203992	204978	NA	30	CTAACGAGGTACAGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKSTSKWIKGLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTTTINAENPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKYSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKVIWRFLRKLEIDIAFDPAIPLLGIYPREIRLVTRIDICTPMFMPALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNNESVEHLITWMKLEDIMLSEISESQKHKYCMRPLL	201898	205726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_201900_205700
887913	contig_19342_pilon	-	4759	10	Intergenic	novelGene_41049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	174	524	10622	10272	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYWKTTSYNSIRQGIKNGTVRQQTSSSNFTKERRENQDQLQPKADSCEVGVKYTSVLQLFTNSDTSHPSHGTVYFSPGFINSLQWPQNSRTILMIMQFIKEVKGYTQSGSGSGSI	10795	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_1275_2998_3357_3569_3848_4180_4363_5014_5292_5412_5520_5958_5988_6133_6184_6351_6466_8699
887914	contig_15353_pilon	-	4160	11	Intergenic	novelGene_151983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	881	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3156	3455	537168	534480	TRUE	40	TCAAAATGGCGGATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFKRLISKQEKTKQTGMKAYISHLKSGFFVWAFVLFSPSTISCWSSRPHSSRTLSTHRPRTSLPKALSTHVASHHGTTHGCWWNSRVGFITYATTTT	544839	529346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_529373_529615_529850_533012_533167_533265_533353_533691_533812_534315_534363_534442_534566_536954_540095_543232_543281_543789_543878_544746
887915	contig_15236_pilon	-	7264	7	Intergenic	novelGene_141619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	321	junction_3	431.656660115678	33	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1984	2535	637863	618893	FALSE	20	CTCTCAGCAATGTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMFFVFIQLLSSGSAWFGIIVMVVTCLFLDIVKKVFERQLHPTSTEKAQLTETNSGIKCLDSVCCFSGGEAACTSVGRMLERVTGRCGPAPVSRSWSGSEPFCTNDRSFLTLSTMDSSTC	647407	614163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563
887916	contig_7853_pilon	+	3186	1	Intergenic	novelGene_172639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAAAACCTACTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48086	51272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7853_pilon_+_48100_51300
887917	contig_7919_pilon	+	2889	15	Intergenic	novelGene_28064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	148.885194094	59	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	223	621	1068397	1114981	TRUE	20	TTACATGTCCCCCCGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLDTFDFSDVAVYIFHKPSIDLFKGNRLHGL	1036362	1132986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1036493_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847_1079959_1113436_1113511_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449_1116533_1118753_1118813_1118934_1119052_1120392_1120473_1124657_1124762_1125500_1125643_1125751_1125850_1131560
887918	contig_10531_pilon	-	2519	5	Intergenic	novelGene_114515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	76.8472510894176	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	375	965	390199	381292	FALSE	5	TCGTTCTTCTGGGTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPSEGDMYVDTLRIRSNLTYEDLEKTASFWATQLLHKIIDGICGRAYPLYQNYHSVWDSTEWIHVLEDITTFFKVIVGKNLSDEEISQQLNQLNSFHQEAIMKCLKSRKDDIRQALLGEIVDISSAQLQNFDWQLKLALSSDKIATLQMPLLNLHLDVKENGEVKPYSVEMSKEELQNLINSLEAANKVVLQLK	390573	379737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_381313_382393_382550_386747_386901_388812_388969_390094
887920	contig_12733_pilon	+	5960	13	Intergenic	novelGene_129593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	485.12136940724	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	684	1790	335433	356267	TRUE	25	TATTTTTAAATTGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLYNNHEIRSGKHIGVCISVANNRLFVGSIPKSKTKEQILEEFSKVTEGLTDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKTAAQARRRLMSGKVKVWGNVGTVEWADPIEDPDPEVMAKVKVLFVRNLANTVTEEILEKAFSQFGKLERVKKLKDYAFIHFDERDGAVKAMEEMNGKDLEGENIEIVFAKPPDQKRKERKAQRQAAKNQMYDDYYYYGPPHMPPPTRGRGRGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDYYGYDYHNYRGGYEDPYYGYEDFQVGARGRGGRGARGAAPSRGRGAAPPRGRAGYSQRGGPGSARGVRGARGGAQQQRGRGQGKGVEAGPDLLQ	329664	360565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_331147_331299_332031_332151_332282_332391_335125_335214_335339_335517_344594_344731_345322_345529_346808_346959_347505_347628_353727_354095_356225_356945_357072
887921	contig_13700_pilon	-	2019	7	Intergenic	novelGene_68283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	675	junction_6	331.41887728707	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	231	551	163598	123004	TRUE	65	AACAAGAAAAAGAAGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKDKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKVQNFPVGKEEI	163828	112581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_112642_117817_117894_118876_118973_121767_123164_132820_132924_163213_163239_163565
887922	SIRV6	+	1424	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	103	1	32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	45	AAAGTCTAAAATTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
887923	contig_13245_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_148816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	272	541	26597	26328	NA	15	TTTTGTTGACTTTTACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEEDAVVVEGWLALALLLLTHRCSLSPRNKSVRKQRRSHGENGDGAARVGAPAACVLSPSRGPQPRGCLFWGRGLRKRRSFIQQRGFNDQMFYYHDIRKNSGREFLTVMEEPEEVNELGSIIDTLFAPMFSHLCNRQAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKGQYSSLRAR	26868	25416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25400_26900
887924	contig_2798_pilon	-	5488	4	Intergenic	novelGene_120010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	742.959397724174	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	537	1469	116665	115733	FALSE	35	CTTTAAGAGTAAGTCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	181941	111713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452_120595_170381_170519_181698
887925	contig_5083_pilon	-	7974	16	Intergenic	novelGene_151697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	137	junction_15	249.784387022088	1221	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	899	2700	253	2952	1646782	1620064	FALSE	30	GAACAGTGGGGCCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHTIKKLIKENKKHQELILDICSEKDNLREELKKRTETEKQHMSIIKQLESKIEELNNEVKASKDKLVAQDIAAKNAIQQLHKEMAHRMEQASKKCEEARQEKEAMVMKYVRGEKESLDLRKEKEILERKLRDANKEFEKNTNKIKQLSQEKGRLHQLYETKEGETSRLSREIDKLKEDVNSHIIKVKWAQNKLKAEMDSHKETKDRLRETTTKLTQAKEEADQIRKNCQDMIKTYQESEEIKSNELGAKLRVTKGELEKQMQEKSDQLEMHHAKIKELEDLKRTFKEGMDELRTLRTKVKCLEDERLRTEDELSKYKEIINRQKAEIQNLLDKLKVADQIQEQFQRGKQEIENLKEEVESLNSLINDLQKDIEGSRKRESELLLFTEKLTSKNAQLQSESNSLQSQFDKLSCSESQLQSQCEQMKQTNINLESRLLKEEELRKEEVQSLQAELTCRQTEVKTLNTQVEELKDELITQRRKHASSIKDLTKQLQQARRKLDHVENGSYDKEVSSMGSRSSSSGSLNARSSVEDRSPEITGSSVTVDNFPEVDKAMLIERIVRLQKAHARKNEKIEFMEDHIKQLVEEIRKKTKIIQSYILREESGTLSSEASDFNKVHLSRRGGIMASLYTSHPADSGLTLELSLEINRKLQAVLEDTLLKNITLKENLQTLGTEIERLIKHQHDLEQRKRRT	1656596	1615041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1620148_1621487_1621708_1622720_1622932_1628712_1628794_1629959_1630150_1630799_1631056_1633601_1633745_1634639_1634727_1634904_1635004_1635465_1635571_1638517_1638638_1640224_1640438_1641769_1641899_1643849_1643977_1646147_1646844_1656405
887926	contig_10500_pilon	-	2816	9	Intergenic	novelGene_41259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	982.240296465178	106	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	381	833	1635143	1629460	TRUE	70	AGAAAAAAAAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1652350	1626836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635145_1635518_1635617_1636940_1637052_1640001_1640103_1652281
887927	contig_4469_pilon	-	3140	1	Intergenic	novelGene_21940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGTCCTCTGGACTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652566	649426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_649400_652600
887928	contig_6102_pilon	+	1062	4	Intergenic	novelGene_31941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_2	301.797945652385	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	189	308	394006	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	393743	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393856_393929_394036_394221_394272_394467
887929	contig_7521_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_160562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTTGTTTGGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359488	357714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_357700_359500
887930	contig_678_pilon	-	5388	4	Intergenic	novelGene_167771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_2	316.973184985733	112	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	327	803	20054	16487	FALSE	65	ATGAAAAAAATCAACAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS	20380	11901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_16579_17500_17635_19596_19782_19988
887931	contig_13244_pilon	+	3419	5	Intergenic	novelGene_86929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	559.479389700818	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	16	438	239761	252668	FALSE	20	AGTGGCCATCGAGTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAGKMADGKAGEEKPENPQRAGAAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSSKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239745	255649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245245_245347_247045_247121_250878_250935_252541
887932	contig_15114_pilon	-	1664	6	Intergenic	novelGene_121127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_5	197.866015272962	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	316	1032	112655	100551	FALSE	10	TAAGGCCCCGTTTGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIPAVAPVAGSPSQQRRGHGADSRDLAGRLPAADSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125316	99918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_125212
887933	contig_9243_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_60328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1476	1787	29563	29874	NA	60	TACAATGAAGAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHQTESSAARWCPAATTDCSDRDHGRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKEDWGSPESVAPRHPFSSVVKLSPRFAIQPGADSPIKPNGTNEVR	28087	30273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_28100_30300
887934	contig_14546_pilon	+	3562	12	Intergenic	novelGene_157431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_11	153.562112234918	815	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	138	1535	514567	533939	FALSE	5	GTGTGAGTTTTGGGGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKEIHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSVANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEPEERQQTPEVVPDDAGTFYDQTVSNDLEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKSEPVLEETAPEDGQKSSSPAPADIAQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQRDQRVREQRINIPPQRGSRPIREAGEQGDVEPRRIVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKDFFQNYGNVVELRINSGGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKTRAAREGDRRDNRLRGPGGPRGGLGGGMRGPPRGGMVQKPGFGVGRGIAPRQ	498439	535966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_498559_514548_514662_517685_517768_518157_518332_523716_523808_525315_525410_526579_526782_528373_528476_528722_528835_529060_529190_529581_529692_533732
887935	contig_16703_pilon	+	4576	10	Intergenic	novelGene_72766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1436.08642574959	26	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	1587	2378	20022	33001	TRUE	15	AACCCACTCTGCGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTCCPAL	18435	44821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_32932_32981_33016_38544_38758_40600_41673_43922
887936	contig_5791_pilon	+	3814	1	Intergenic	novelGene_35838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGAGAGTTTCAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041164	1044978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1041200_1045000
887937	contig_5400_pilon	+	3085	2	Intergenic	novelGene_162826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	818	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2094	2474	270022	270402	TRUE	20	CCGCCGACTCCACAGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAQMIISTSDLQSELPSFGLCFNPNSITTMGRPSIPYLICLHYFPSLSRFHKGLSHSAFKKFKPCVLPFQKTCSETYNLWVPPAEGKPETPRKDRNRKRGDFSLSLVLSKLQLCPKRKVLGSRF	267928	271179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_270957_271122
887938	contig_12677_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_110702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAGGGAAAAGTTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1200
887939	contig_6914_pilon	-	1030	4	Intergenic	novelGene_151729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	144.596757301892	9	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	294	788	123363	122480	FALSE	5	GGTGCACTGCCTGTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPERIFPNQTEELGPHVGSAEGTGDWSSEEHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQALGLHLPDPPLESEDEEEEGATALSNHNSIPMDPEHVELVKRTMAGISLPAPGVPAWAREISDAQWEDVVQKALQARQASPAWK	123923	122237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_122632_122937_123041_123123_123406_123672
887940	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
887941	contig_6163_pilon	+	3848	3	Intergenic	novelGene_103866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	384.5	44	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTGGGAAACAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521302	526142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521486_521834_521895_522537
887942	contig_14559_pilon	-	2884	18	Intergenic	novelGene_83709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_16	114.350278351955	529	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	225	2759	286587	195030	FALSE	30	TAACCATTAGGATGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQKKEKQLSNFKVLNHSPMSDASVNFDYKSPSPFDCSTDQEEKIEDISSQCLPQKDLYATEEEADTLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVKKKRKKKNPGEQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEPKEPKQKDGAKKARKPREASGTKEAKEKKSGADSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELDQGLPNSSLRSPEESTESADSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQVEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVLPEIKHAERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLAKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDASDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGKPAPGSHRPVL	354490	194904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_195103_206830_207042_208370_208627_211261_211406_212027_212205_213377_213622_214576_214699_223732_223868_224077_224165_228671_228790_229459_229519_230384_230448_249375_249526_251347_251496_277453_277975_286560_286617_349292_349457_354459
887943	contig_9708_pilon	-	1324	3	Intergenic	novelGene_67259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	61.5	123	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	350	1222	50111	49239	FALSE	15	GCTTGTCTTGTGTATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66271	49136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50118_51271_51431_66087
887944	contig_19816_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_156511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	268.616620649	10	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	394	735	124800	123459	FALSE	35	GACTTGATAACCTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126315	123047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125741_126160
887945	contig_5686_pilon	-	5134	1	Intergenic	novelGene_45318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTCTTCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105964	100830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_100800_106000
887946	contig_854_pilon	-	1635	2	Intergenic	novelGene_36372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAACTTGTGTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976418	974696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975461_975547
887947	contig_10892_pilon	-	4540	1	Intergenic	novelGene_116751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	645	977	171848	171516	NA	45	GCATATATAATGAAAATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANKCMKRCSMPLVTRETHIKTTMIPPHHNQDGYYQKNRKQQELGGMWRNRWQDCKMVQPLWKRVWQFFKKLNIQLPSNLEISIPKYTPKSLESRDTLDILHQGSLQPYS	172492	167952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_168000_172500
887948	contig_13542_pilon	+	1565	8	Intergenic	novelGene_131496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_7	830.016818123191	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	72	770	346638	505546	FALSE	20	AGTAAGCATCGGCCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEVCADFCRQIKTRSS	346566	506341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_505501
887949	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13777	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
887950	contig_6445_pilon	-	4921	15	Intergenic	novelGene_77013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1034	1459	672261	671836	TRUE	10	GCCGCAGCTCCCGCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMHYRGCKNKQTKKPIQHPYRVESGQLNLVMFRSCWRYLAVWLTKSPACSCWDLINHASVGMQSQRGVPDPPHLSASWLRFRLPNQSYCLTDEYATVGLPTVGNGSPLLLQQPRGFHNSPAGTVLSARSAFPASILGKKE	673294	522074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515_644717_656005_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663_665823_670245
887952	contig_11986_pilon	-	1650	10	Intergenic	novelGene_69168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	843.07281878719	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	859	1554	518553	507353	FALSE	10	TGTCATCGTCCTCCGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	525739	507256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518577_518926_519181_523616_523809_525350
887953	contig_11316_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_122685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	445	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAATAATCCTGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140675	139528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139500_140700
887954	contig_2917_pilon	-	7789	8	Intergenic	novelGene_147579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.779841392155	739	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	58	1107	124032	93080	TRUE	75	GGAAAAAAAAAAACGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124089	85272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_91775_92899_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
887955	contig_11708_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_138970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCACAGTGTGGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267904	269211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_267900_269200
887956	contig_20819_pilon	+	1917	6	Intergenic	novelGene_55641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	497.514864099556	21	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	166	834	40335	42531	FALSE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	30010	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_30155_40313_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
887957	contig_6847_pilon	+	5196	10	Intergenic	novelGene_143855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	378.384871673157	90	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	325	1236	77788	101322	TRUE	40	GTGAGAAACTAACTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMVSINLYLESVRFSFL	74054	107077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_102184_102632_102750_104095
887958	contig_7629_pilon	+	7274	27	Intergenic	novelGene_153555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	68.7475981291035	1055	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	175	576	229673	230786	TRUE	10	TCCGGACTGCGCCGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPITKPTSPAPAAQSTNGTHASYGPFYLEYSLLAEFTLVVKQKLPGVYVQPSYRSALMWFGVIFIRHGLYQDGVFKFTVYIPDNYPDGDCPRLVFDIPVFHPLVDPTSGELDVKRAFAKWRRNHNHIWQVLMYARRVFYKIDTASPLNPEAAVLYEKDVQLFKSKVVDSVKVCTARLFDQPKIEDPYAIR	227255	292207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_227366_229608_229674_229760_229862_230315_230405_230480_230580_230674_234140_243337_243503_244084_244291_244867_244968_245688_245762_253753_253936_254027_254304_254500_254773_257009_257120_257633_257800_258541_258684_260059_260162_260886_261005_262681_262844_275164_275352_275909_275975_276066_276227_277699_277829_282807_282873_285648_285851_289265_289399_291877
887959	contig_4615_pilon	+	3162	3	Intergenic	novelGene_178526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	2794	3162	15062	15430	FALSE	70	GGGAAAAAAAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKGEKEGKENKTNQKKKKSNTSSQRMALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKDKR	11107	15430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4615_pilon_+_12343_12395_12999_14106
887960	contig_610_pilon	+	3908	4	Intergenic	novelGene_76708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211062	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
887961	contig_2125_pilon	+	5674	16	Intergenic	novelGene_147728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	509	junction_1	1229.66252642296	736	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	70	2466	648096	682094	FALSE	50	ATTAAAAAATTATCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKPEPRSSRPEPTAPGTGRRAEKMNLQLIFWIGLISSVCYVFGQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNLTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCHPDDIENPRGSKDVKKNKNVTNRSKGTAEKLQPEDITQIQPQQLILQLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMKRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTDRGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGRCHLENDVYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENSKLPEGVTINYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVHFEISITSNKCPNKNSETIKIKPLGFTEEVEIILQFICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGEVCGGNGVCKCRVCECKPNYTGSACDCSLDTSSCMAKNGQICNGRGICECGTCKCTDPKFQGPTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDTCAHECSHFNLTKVENRDKLPQPGQVDPLSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEAIVHVVETPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK	611097	685302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_611167_648095_648163_649057_649144_651017_651241_657754_657926_658819_659059_664111_664268_665027_665124_669318_669409_671196_671338_671477_671678_673117_673357_673579_673803_674513_674747_676390_676558_682028
887962	contig_16098_pilon	-	1347	10	Intergenic	novelGene_45991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1539.87337141727	21	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	117	1223	352350	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354105	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350375_350867_350889_352152_352352_353990
887963	contig_7898_pilon	-	3692	11	Intergenic	novelGene_47549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	62	junction_9	293.726675669746	1519	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	109	1770	339020	292088	FALSE	5	CCTGTGCTAGTGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQDIAVPPPVPPPPSSEALNGSILDPLDQWQPSGPRFVHQQPPSPSPAHGSSAPTPQDSLGAPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMSSSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNVPSFPADEANSSPPLPVALSPHYGIPENNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQGEMGSLQRVTSSQQQSRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKAGSSSPPAGGTPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	339128	290165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_292355_293194_293344_293488_293571_294272_294447_294545_294720_300019_300156_300959_301162_301277_301415_301829_301931_302261_302489_339007
887964	contig_6446_pilon	-	3239	2	Intergenic	novelGene_149192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2210	2680	249549	248822	FALSE	55	AGAAAATTACAGACCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTVHHEDITIINIYVPNDRAPKYIKQTLTTLTREIDSSTIIVGDFNTPLSIKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLHLIDTYRTLHPTTAKYPFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIEVEINNRKSKTSPQPPEERKQ	251758	248262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_248862_249118
887965	contig_3509_pilon	-	5886	5	Intergenic	novelGene_160708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1147	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	3358	4020	176027	104525	FALSE	35	GAGGCGAAAAGTATTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKQKGTDREYLQK	362799	102658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_104560_175399_176787_286137_287749_329177_329485_362119
887966	contig_3601_pilon	+	2746	1	Intergenic	novelGene_132894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTACCGTCATGATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183209	185955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_183200_186000
887967	contig_9017_pilon	+	1506	3	Intergenic	novelGene_130340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_2	159	302	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	66	995	609348	610563	FALSE	20	GGGCAACGCCCAACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTPKMLLLLLLLLLWAGSLAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNLTCRATFPGADVTTESTVLLNVSCECWAGTPVSLRAVGVGGSGAEPGILAAASWKKGLVRKRTLNSTCFLFLKFLGETGCMD	609282	611074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609403_609470_609855_610072
887968	contig_2069_pilon	+	3079	2	Intergenic	novelGene_23378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	735	1034	1058170	1058469	TRUE	40	ATGGGAAGGAGCCATAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCETNEFINGDTEMSNSRDSYSVNSEWFSSTLARASSARAARRIMSTLVGSKGGFCMWSRLAWLCWNCVAARLSSRKPRRLPMLPFCTAMARAARLSP	1057435	1062310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1059872_1061667
887969	contig_14353_pilon	-	5367	4	Intergenic	novelGene_82068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	4893	5216	22258	21935	FALSE	0	TTTTGTGCTGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFMKPVSARRWNASNTGMKPVLPGPDSVAAGSRGGRVGVKKGGGWESIYRCLPVVLSPAESSVKLLSHIPCLLMSDKSPRWRIRAAVADRGPLYVSLLALCSRSIS	65649	21783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_23615_26688_29447_29570_29752_65052
887970	contig_753_pilon	+	4758	6	Intergenic	novelGene_112980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTTATAGCTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191241	1214350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1192870_1196905_1197003_1199445_1199702_1202716_1202798_1210555_1210773_1211871
887971	contig_8885_pilon	+	4760	3	Intergenic	novelGene_115582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1775	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACATGAGTTATACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250906	367136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_251372_251408_252865_364297
887972	contig_14450_pilon	-	7019	8	Intergenic	novelGene_48957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	475.84022357021	13	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	262	801	1077430	1041965	TRUE	25	TAATGCCTCCCCAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQDPDIDAATAMMLLNTPPEIQAGFPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHTHTQARTHMREKTDAENKLCLLNCPSEKQSNPRNCNHC	1310722	1035619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039694_1039820_1042081_1043096_1043375_1065853_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
887973	contig_5698_pilon	+	2022	5	Intergenic	novelGene_55004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	861.249383163785	16	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	20	592	4103	19377	FALSE	25	TTTGTCATTCATACTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQIIYYRQQLVKTIKQCQTPHSRPCAGSCQLLAPKSTGTRYSATRLAKKCRMLKG	4083	20807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_19215
887974	contig_6412_pilon	+	4455	6	Intergenic	novelGene_149947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCTTCTTATTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165727	387863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_166138_166429_167711_197248_197743_230259_231307_288939_289278_386978
887975	contig_960_pilon	+	3991	9	Intergenic	novelGene_108283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	564.816950436157	103	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	162	968	1020552	1055443	TRUE	30	GAATCCGTTTATTAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASASLRTLHLPPRPRTRALRPRGSARCPSPTPLPQPSAVVIYNEERYGNLTAPMSHAGTGNTVVIMISYPKGRELLDLVQRGIPVKMTIGIGTRHVQEFISSQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQFGNQSHRKEIKKIIGQLVLHTVNRGEKGIDVDAENCAVCIENFKAKDIVRILPCKHIFHRTCIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWTEPEDVQETPAPESTSGSVSAANLSVAIQDEGRSDGSNLPSSSTNESALQCSASFKDDAGENTALLEAGRSDPQRGGPVSSCAFPRAAGGVVDTAPA	1019988	1060762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1020097_1020498_1020565_1038550_1038802_1039695_1039765_1046762_1046846_1049013_1049111_1053830_1054030_1055348_1057926_1060221
887976	contig_2480_pilon	+	2515	3	Intergenic	novelGene_63517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	722	1087	128623	130100	TRUE	20	TAAGCTGTGCAACCGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPEGHPTLPEHRLHPQSPERNHCPASTSSGHRSSGRQMSLLLDLWDITLQTKHTWSFVGGSWGRECHTYCSAWIELASLNHKWDTLRSSETSSHQIHTLEETVIHLLLLWFLGWLHNSG	127901	149793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_128965_130076_131183_149447
887977	contig_5023_pilon	+	3147	15	Intergenic	novelGene_7213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2265.78037644554	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	88	1344	607279	631419	TRUE	25	AAATATTGCTGTATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS	580841	648288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_631415_631550_639072_639190_643413_643539_646857
887978	contig_16228_pilon	+	1086	2	Intergenic	novelGene_147948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73199	75084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_73932_74730
887979	contig_4103_pilon	+	2761	1	Intergenic	novelGene_51947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1895	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	322	969	449	1417	104743	105711	NA	20	AGGCCTTGTGCTAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVEVEIRAGGHSLDKYLKHADPDSQQYADMIKALRLRRLTVGAARVPARLLFAVLRALGYSRLKELTLEDLEVTGTYPPQPLEATGPALSTLRLRNVSWATGGAWLAELQKWLKPNLKVLSIAQTHPLALSCEQFRTFPTLTTLDLSDNPGLGERGLAAALCPHKFPALQDLGLRNTGMETPNGVCAVLAAAAVQPHRLDLSQNALRATANPGGPRCVWPSTLSSLNLSFAGLEQVPNGLPAKLSVLDLSCNRLIRAPRPDELPQMENLILDGNPFRDLGDPKPQQDTMNSSVPLACVHSLLAIGISGTLALLQGVRGFV	104294	107055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_104300_107100
887980	contig_5643_pilon	+	999	10	Intergenic	novelGene_38788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2299.90832882262	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	69	551	233973	237564	TRUE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSRGSDLPSGESCQIR	233606	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_237423_237456_237550_237635_237720_237819_237913
887981	contig_10734_pilon	+	10720	32	Intergenic	novelGene_51065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	349.163215549135	2058	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	2397	4319	481400	495551	FALSE	20	TAACATGCGTATCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGDDDDFNPFRDESSEDDEDDPWLIRKDHKKNKDKKKKKSIDPDSIQSALLASGLGSKRPSFSSAPVISPAPNSASANSNTNSNSLITSQDAVERAQQMKKDLLDKLEKLAEDLPPNTLDELIDELGGPENVAEMTGRKGRVVSNDDGSISYESRSELDVPVEILNITEKQRFMDGDKNIAIISEAASSGISLQADRRAKNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVTAPEYVFLISELAGEQRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSRFNFDNKYGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPGEFFKDVRQGLIGVGLINVEDRSGILTLDKDYNNIGKFLNRILGMEVHQQNALFQYFADTLTAVVQNAKKNGRYDMGILDLGSGDEKVRKSDVKKFLTPGYSTSGHVELYTISVERGMSWEEATKIWAELTGPDDGFYLSLQIRNNKKTAILVKEVNPKKKLFLVYRPNTGKQLKLEIYSDLKKKYKKVASDDALMHWLDQYNSSADTCTHAYWRGNCKKASLGLVCEIGLRCRTYYVLCGSVLSVWTKVEGVLASVSGTNVKMQIVRLRTEDGQRIVGLIIPANCVSPLVNLLSTSDQSQQLAVQRKQLWQQHHPQSITNLSNA	452568	501952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_452711_460685_460818_461380_461486_463215_463526_466146_466245_469398_469496_471472_471634_472997_473132_473331_473423_474648_474811_476100_476237_476315_476422_476554_476709_477478_477666_478248_478347_479657_479810_481268_481467_481858_482027_482122_482296_483014_483147_484714_484851_485510_485624_485723_485796_486328_486429_487935_488011_489271_489419_489502_489598_489677_489771_492001_492140_492654_492732_494129_494324_495408
887982	contig_16205_pilon	-	3108	6	Intergenic	novelGene_156867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_2	578.598513651738	1048	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	71	1597	105825	79834	FALSE	30	TATTAGAGTTGCAGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKSKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIDDEDPSSSIESSDPSLSSTTTSSRNQASRSRVSSSTGIKGTTTVLKPGNAKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQTVPEGEATVTNSMQEETLNSSVQSIRTIQAPAQVPVVVSAGNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSSGAGSQKFILQAIPSSQPMTVLKENVMLQSQKPGSPPIVFSPAHVQQVLTSNVQSICNGTGSMASSPSFSATTPVVTFSRSSQLVAHPPGTVITSVIKAQETKTLIQEVEKKEVEDNLDEDTEKMEAQPQPFVMVVSSSNGLTSQVAMKQNELLEPNSF	105895	78322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_80432_86981_87429_88544_88738_89468_89553_103300_103466_105785
887984	contig_7009_pilon	+	2878	1	Intergenic	novelGene_23639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	530	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2113	2520	445486	445893	NA	70	TTCTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLVTLITFFELCNHSHPPSLSFSSFISINTCVFSNHVRNSPAHCKRPTKWGSTQLEVTPRDGAQTVPLGFSEGEESSPIETCAVHIFIGPRGPLLASHQRCEEQWLQWALEVSRFSILDFHRFIVNPRRLASV	443373	446251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_443400_446300
887985	contig_9484_pilon	+	2088	8	Intergenic	novelGene_105644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_6	396.358217695425	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1102	1959	101609	104965	FALSE	0	TGGCTTGGTGGTGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	98493	105094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_98611_100389_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
887986	contig_7254_pilon	+	2170	3	Intergenic	novelGene_145843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	946	junction_1	81	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCATTTAGATATGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214077	218152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_214738_215027_215128_216742
887987	contig_6451_pilon	+	2523	3	Intergenic	novelGene_173690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_2	29.5	27	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	13	339	12389	153350	FALSE	10	TCCTCCTAGCAGTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSLMTGGAKQGASNPWLLEEPEETRGLGFDEIRQQQQKIIQEQDAGLDALSSIICRQKQMGQEIGNELDEQNEIIDDLTNLVENTDEKLRTETRRVTMVDRKSTSCGKTEL	12376	155534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_12504_29747_29841_153231
887988	contig_7963_pilon	-	3405	6	Intergenic	novelGene_58534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.306664185585	99	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	236	664	242844	240504	TRUE	20	TGTTTATTTATACCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAASWPQSETRAPGSAEHDTRPGCCAGEHQPGTSPGPEKSTPGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245738	237451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_239114_239424_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_245606
887989	contig_6427_pilon	+	1691	1	Intergenic	novelGene_162586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGGCCAGATGATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239766	1241457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_+_1239800_1241500
887990	contig_15787_pilon	-	4657	1	Intergenic	novelGene_143973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCCAACTCCATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66554	61897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_61900_66600
887991	contig_17074_pilon	+	2671	5	Intergenic	novelGene_145101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	264.072433245123	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	406	753	213507	223655	FALSE	25	TACAACCTTGCCATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGGWCTSSEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207859	225573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213534_220892_221011_223452
887992	contig_8457_pilon	+	4021	2	Intergenic	novelGene_178527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	285	620	16750	17085	TRUE	40	CAGTGAGATAACACTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNISMLWILLRLALWPNICSILEKVLCALEKKVYLAAVGWNVLYMSVRSSLLIVTFKSSVFLLSFFLDVLSFTKSGVLKSATIVVEPSISLFNAVRVCFMYFGALSLSV	16465	43141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8457_pilon_+_19201_41855
887993	contig_12964_pilon	-	3872	1	Intergenic	novelGene_131707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTTCACAGACCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559571	555699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555700_559600
887994	contig_8174_pilon	+	2585	2	Intergenic	novelGene_160059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGGGAGTTATTGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286874	348587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_289089_348216
887995	contig_7151_pilon	-	4154	4	Intergenic	novelGene_40764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	848.858187344754	350	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAATTAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551357	523206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_524418_526714_529337_530062_530179_551152
887996	contig_2414_pilon	+	1927	10	Intergenic	novelGene_158447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_1	72.430809896219	949	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	67	1122	79850	230279	FALSE	35	TCACTCATCTTCACAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETLRERLLSVQQDFASGLKTLSDKSREAKVKSQPRTVPCVPKYCAGLELLSRYEDTWAALHRRAKECAIAGELVDSEVVMLSAFWERKKTSLVELQEQLQQLPGLIADLESMQANLTHLEASFEEVENHLLHLEDLCGQCELERCKHTQSQQLENYKKNKRKELETFKAELDAEHTQKVLEMEHTQQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGPESSTCQNEITLQVPHPSRSRARPPSLSSPCPDSAPQDPSDSGESPLVQSDEEDVQVDTALATVNIDGKATSDVTDDSDA	79783	231084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_79906_96110_96165_96919_96971_114178_114240_123686_123820_147728_147862_170460_170484_219742_219899_228474_228619_230034
887997	contig_7963_pilon	-	9318	17	Intergenic	novelGene_58272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	710.025747772572	2846	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	653	2089	125592	120628	TRUE	60	AGCATCATATCAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126292	9975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_11105_11622_12475_13017_13583_19160_19273_113549_114521_115838_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_125690_125737
887998	contig_10482_pilon	-	4312	2	Intergenic	novelGene_152836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTCTAAGAATGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130443	122445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_122453_126138
887999	contig_12312_pilon	-	2618	14	Intergenic	novelGene_63962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	876.572332015127	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	80	1954	326065	214508	FALSE	50	ATAAATAATGCTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPLQLTTTKPLEFPPQVCLRE	326144	213843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214568_233761_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
888000	contig_19179_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_142374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCACACTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32702	35106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32700_35100
888001	contig_1150_pilon	-	603	2	Intergenic	novelGene_61393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310016	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309368_309852
888002	scaffold_12124_pilon	+	1960	10	Intergenic	novelGene_22314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	143	520	1490385	1508039	FALSE	0	GCTGTTTTTTTTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473625	1509479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
888003	contig_16594_pilon	+	2810	2	Intergenic	novelGene_53889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGAAGCCAGTGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221076	224695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_221812_222620
888004	contig_6208_pilon	-	4047	16	Intergenic	novelGene_53012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.172902684956	10	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	813	2090	493985	490249	TRUE	5	AGGCTGCTGTCGCCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPSRPDKKQRTVNIENSRHRKQEQKYPQPQPHKREGKWHKHGRTNGRHMAHLEIELGQFPFDPKY	532567	460602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_460705_468304_468412_469606_469740_473518_473661_477713_477764_478856_479070_479912_479975_486600_486820_489319_490439_492897_494229_507398_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
888005	contig_513_pilon	+	3859	3	Intergenic	novelGene_80119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1005	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	455	1021	150840	151406	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERININILGISELKWTGIGHFESDNHMVYYAGNDNLKRNGIVFIIRKNISRSILKYNAVSDRIISICLQRRPVNTTIIQIYTPTTKAKGEEIEDSYQLQQSELIKHDIKIITGDWNLKVGSKEEGLAVGKYGLDDRNHVGDHMIEFCKTNNFFIANTFFQQHKWRIYMWTSPDGIHRNQIDYICGKR	150385	343237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_151452_217576_218487_341354
888006	contig_1008_pilon	+	3710	1	Intergenic	novelGene_121566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	129	407	600786	601064	NA	35	AAATCTTCCTTTCCGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KINLKNFLKKAFALYSEAHDLHKKEKVRDPPPTLAGVFQDFQMFCRHSYRPQRAAGRAVKQFSYWCSNLFLIAHLSPSLPKAYTPYPATGAQQEYILCFLGGRRSRKNTLPPGPNSGFSTAAMPSLKALCGLFL	600657	604367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_600700_604400
888007	contig_20420_pilon	-	7147	7	Intergenic	novelGene_172474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	57	junction_6	495.400174942776	1335	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	127	1359	58097	19120	FALSE	45	CTCAGCAAAATGGGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAALEKSRREVPPTRTRQPGGAVTRRRLGASRAAGKQARHTTMIPLEKTGAGDSSPAAASGPAVRGASVLRRPPPQVRGLLTEIRAALRIEPFQDAYTLSPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETPSEMILVLEYAAGGEIFDQCVADRDEAFKEKDVRRLMRQILEGVHFLHTHDVVHLDLKPQNILLTSDSPLGDIKIVDFGLSRIMKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGDNKQETFLNISQMNLSFSEEEFDVVSESAIDFIKALLVKKPEDRATAEECLKHPWLTLSSIQGPSLRVKGALEEAHGLQEGDSVPEINSDTEKPETEETVLTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKTEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY	58223	13331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_19445_20155_20336_20422_20472_23582_23710_36764_36910_46600_46814_57903
888008	contig_4654_pilon	-	1596	7	Intergenic	novelGene_103104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	837.692001208612	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1159	1533	497874	494476	FALSE	85	CGATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	515968	494412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_498805_499420_500118_500422_515793
888009	contig_10437_pilon	+	1490	8	Intergenic	novelGene_38285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	64	1086	431167	451175	FALSE	40	TGTCAACCTAAAACAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSPCCFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431103	451579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
888010	contig_2409_pilon	-	5475	9	Intergenic	novelGene_178528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	564	4911	5474	565	2	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIH	123478	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2409_pilon_-_1005_1557_2675_49908_50511_51069_51218_51265_51407_60553_60891_118032_118204_121456_122767_122833
888011	contig_11850_pilon	-	2466	3	Intergenic	novelGene_125213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2377	junction_2	42.5	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAATATGAAGTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284122	280841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283292_283464_283935
888012	contig_11071_pilon	-	2140	6	Intergenic	novelGene_131027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	304.558303121094	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	82	579	206817	92024	FALSE	35	GGTGTCTGTGCTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRGGRSEPGRAAGGGGAEDAGRQAGDMDRGEPGVLRTDPVLEEGEDAAATISTSEALSEEEQDELTKEKHLAEIKRKLGISSLQEIKQNISKGWQDVTATSAYKKTSETLSQAGQKASAAFSSVGSVITKKLEDVKNSPTFKSFEEKVENLKSKVGGTKPAGGDFGDVLNSTANASAATTEPRTEQTPENP	206898	90462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_92144_96150_96200_104797_104900_106647_106757_111281_111381_206798
888013	contig_20951_pilon	-	590	2	Intergenic	novelGene_43083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCAAGTTTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27555	26753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
888014	contig_9633_pilon	+	3510	1	Intergenic	novelGene_139625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	883	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGTGGTGATTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037447	1040957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1037400_1041000
888015	contig_10930_pilon	-	2339	7	Intergenic	novelGene_37021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1614.17165719414	133	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	695	1543	276835	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279818_280187
888016	contig_7839_pilon	+	2187	11	Intergenic	novelGene_45726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	632.669265888584	896	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	97	1902	952473	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSHTGAVLDPCASCTQALPAAPWYLQSFPFKMPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950902	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_956098_956153_956428_956763_956877
888017	contig_5502_pilon	-	1821	1	Intergenic	novelGene_155020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	963	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537391	535570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_535600_537400
888018	contig_5039_pilon	-	5492	5	Intergenic	novelGene_65036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_2	139.212966350121	2109	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	352	1269	1810321	1805834	FALSE	20	TTTGTTTTCTTAAGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYTASEWDDVSGVNCRKTTETRCDFTAAGLLQGFPRHFNVSLRVQAELGDRVSAWATVPWFQHYRNVTIGPPENMEVAPGEGSLIIRFSAPFDIDTSMVTFEYYVYYWEEAGTRKVKGPVKSNFISLDDLKPLRVYCLQVQAELVWSTQGISLPGNLSNTSCHKTTLDAATKLEQAILTFVGASLSVVLLVGACFFMILRYRGLIKYWFHSPPKIPLQIGEVGVHTPRRATCGCITAKITPTSAAVNRAVDTEIRVKNSTVALSPSAAIMKHRKAGSLKEQEFIVSQFQRLGVQTRVSAVSIPPECCERGNVHTSAQLPVALTVLGVTLLLVDVAPVTSSSFIFDPISMSVLPFYKTPLRRGLGLGPTLLWYRAWWRSV	1822819	1801610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1806469_1806815_1806976_1810198_1810345_1812911_1813106_1822685
888019	contig_13798_pilon	+	1145	2	Intergenic	novelGene_178534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106402	107666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_+_107346_107464
888020	contig_13674_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_140306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGAACCTGCCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11082	12933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_11100_12900
888021	contig_5020_pilon	+	1358	7	Intergenic	novelGene_27797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	979.701938800209	87	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	373	1044	122915	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118452	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123001_124174_124363_124444_124547_124909_125091_125657
888022	contig_8687_pilon	+	3415	2	Intergenic	novelGene_169650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2799	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATTTAACAAAAACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8530	12891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_9129_10074
888023	contig_2703_pilon	+	10328	5	Intergenic	novelGene_101771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	346.361083264272	592	175	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	8355	8660	603453	609348	FALSE	15	CATGAGCCGACTCTTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVCRRPSRMATCLECGWTEECPCPTCWNQRSFHTKCSW	595098	611016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_603520_605155_605221_606091_606153_607646_607732_609320
888024	contig_3424_pilon	+	4321	2	Intergenic	novelGene_55526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	393	junction_1	0	198	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTCTAGCCATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249093	280344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_249338_276267
888025	contig_12277_pilon	+	1794	2	Intergenic	novelGene_139689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGCCCTCCGCCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231708	251491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_232857_250845
888026	contig_6510_pilon	+	5200	5	Intergenic	novelGene_173517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	119	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	4262	4846	151889	152564	FALSE	50	GAGTTACAACAACTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSVHQEDMTIKNIYTPNNRAPKYIKQTLTALKKEIDSFTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDREELKATINQLDFKDMYRTLHTTAAKYTFFSTAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNWKLNTILKNYWVIEEIKDGINKFIEVNKNENTSYQNLWDTAKTVLRGQFIAINTHIQKEERAIMKTLTLQLNK	127980	152918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_129441_136267_137647_137917_138445_150993_152252_152342
888027	contig_3747_pilon	+	2478	8	Intergenic	novelGene_24775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5089.8706891878	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	273	1397	201313	204120	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNILKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200981	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201145_201203_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203369_203966
888028	contig_6058_pilon	-	1831	7	Intergenic	novelGene_172415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_6	402.945267857669	29	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	305	1516	398054	386558	FALSE	25	TTTTGATAGAGCAGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGG	401596	386242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
888029	contig_16322_pilon	-	1069	3	Intergenic	novelGene_87509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	777	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAAAGTTTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57666	31701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_57465
888030	contig_12635_pilon	-	1300	10	Intergenic	novelGene_60819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_9	426.662239560365	927	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	146	1144	227344	180623	FALSE	20	TAATGAGCCTGTGTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSRYVFFQG	252440	180466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_252396
888031	contig_9955_pilon	+	4236	4	Intergenic	novelGene_21263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	865	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACACCGCACCCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39590	49839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_39707_44348_47737_48794_49380_49692
888032	contig_10734_pilon	+	6147	3	Intergenic	novelGene_51427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	495	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGAGCTAAAAGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2131814	2262309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2132347_2185677_2185798_2256814
888033	contig_5003_pilon	-	1039	7	Intergenic	novelGene_120212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	403	junction_4	196.942179896086	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	318	995	139635	135725	FALSE	35	TTTTTTTTAGCAAGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVRTLQEQLEKAKESLKNVDENIRKLTGRDPNDVRPIQARLLALSGPGGGRGRGSLLLRRGFSDSGGGPPAKQRDLEGAVSRLGGERRTRRESRQESDPEDDDVKKPALQSSVVATSKERTRRDLIQDQNMDEKGKQRNRRIFGLLMGTLQKFKQESTVATERQKRRQEIEQKLEVQAEEERKQVENERRELFEERRAKQTELRLLEQKVELAQLVSSVLKS	139952	135680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
888034	contig_13780_pilon	-	1787	5	Intergenic	novelGene_149123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	317.534545364752	12	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	342	815	822910	821461	FALSE	25	TGTTTAGACATACTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	823798	820488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_821551_821973_822109_822400_822566_822826_823062_823608
888035	contig_15518_pilon	-	3428	4	Intergenic	novelGene_127596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	433	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2377	2727	38282	37285	TRUE	35	CAGGAAACACAGGGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILICLGNLTFSHTLGKWSESVLKSSDGDFALEALSTVRRNSRRVCTGRFPEQGGTWSRVCGSCHQTSSLRLGHQRRKEGASGLLLPVDIDGRDTNHQQHLEAYKEASEEEVRS	40658	11046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_11421_14885_15200_37271_37387_38033
888036	contig_9406_pilon	-	3476	14	Intergenic	novelGene_136145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	860.430345058927	159	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	378	2207	155571	34953	FALSE	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHRTSSISGPLSPAYTGQVPYNYNQLEGRFKQLQDEREAVQKKTFTKWVNSHLARVSCRITDLYTDLRDGRMLIKLLEVLSGERLPKPTKGRMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLIWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNIHNFTTSWRDGMAFNALIHKHRPDLIDFDKLKKSNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTKLLDPEDISVDHPDEKSIITYVVTYYHYFSKMKALAVEGKRIGKVLDNAIETEKMIEKYESLASDLLEWIEQTIIILNNRKFANSLVGVQQQLQAFNTYRTVEKPPKFTEKGNLEVLLFTIQSKMRANNQKVYMPRDGKLISDINKAWERLEKAEHERELALRNELIRQEKLEQLARRFDRKAAMRETWLSENQRLVSQDNFGFDLPAVEAATKKHEAIETDIAAYEERVQAVVAVARELEAENYHDIKRITARKDNVIRLWEYLLELLRARRQRLEMNLGLQKIFQEMLYIMDWMDEMKVLLLSQDYGKHLLGVEDLLQKHALVEADISIQAERVRGVNASAQKFATDGDGYKPCDPQVIRDRVAHMEFCHLL	155948	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34965_82908_82968_83738_83893_86062_86366_87519_87679_88906_89025_90288_90477_91297_91411_95493_95610_96485_96567_98217_98310_102173_102348_112698_112851_155462
888037	contig_15449_pilon	+	3951	15	Intergenic	novelGene_33579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	846	junction_1	465.624558621897	5058	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	250	2784	37166	54621	FALSE	5	CTGGTGCTGGTGGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27841	55788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
888038	contig_11422_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_99043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTAGAACTGGGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744	1754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_1800
888039	SIRV3	+	345	3	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	6	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTTAACGTCTCGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4016	8937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4081_4568_4734_8821
888040	contig_15105_pilon	+	5199	1	Intergenic	novelGene_151042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	544	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAGCAAGGAGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835024	840223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_835000_840200
888041	contig_5003_pilon	-	1955	9	Intergenic	novelGene_120209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	318.802054573053	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	44	928	139635	134226	FALSE	10	CATCCTTTGTCATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACRQSSLEVCCGEKMAVAVRTLQEQLEKAKESLKNVDENIRKLTGRDPNDVRPIQARLLALSGPGGGRGRGSLLLRRGFSDSGGGPPAKQRDLEGAVSRLGGERRTRRESRQESDPEDDDVKKPALQSSVVATSKERTRRDLIQDQNMDEKGKQRNRRIFGLLMGTLQKFKQESTVATERQKRRQEIEQKLEVQAEEERKQVENERRELFEERRAKQTELRLLEQKVELAQLQEEWNEHNAKIIKYIRTKTKPHLFYIPGRMCPATQKLIEESQKMKLAKKWNQRWSLKLSQIKNVNIFLLGKRMLVL	139678	133198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134331_135544_135671_135748_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
888042	contig_5125_pilon	-	2754	8	Intergenic	novelGene_43428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGCCTCGCGGGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59988	25976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26500_35608_35766_49979_50109_53630_53706_53840_53984_54293_54522_58446_59031_59073
888043	contig_21404_pilon	-	2144	6	Intergenic	novelGene_169130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	412	junction_5	48.5567708975793	116	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1453	2037	5228	1446	TRUE	10	TTTGTACTTTTGGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAELKTFADRPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKVRLSFESPDGKAQMPTVERMTLTRYFYLFPGY	10164	285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_388_1440_1545_2004_2115_4453_4598_4996_6615_10098
888044	contig_4496_pilon	-	4442	3	Intergenic	novelGene_66626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGTGTAGAAATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644360	607384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_607538_632354_633493_641209
888045	contig_12677_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_110694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1000
888046	contig_7629_pilon	+	8239	25	Intergenic	novelGene_153584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	894	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3563	3862	367299	368695	TRUE	30	TGTACTATACTTCTAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKIVLQDVKAPYHLREDEHFMTSCFHFGKQLIDKDQFTSRLDHCLKMKIRSSWIICISKFSKYFLLSTFNKVWMITALPELHHSINQVRYISLSCSFG	345627	450176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_347776_348303_348410_350342_350432_350811_350975_353282_353479_353928_354130_356988_357098_360825_361007_361715_361883_365349_365544_367290_367507_368603_368854_368955_369104_370497_370675_374773_375019_378600_378722_387033_387175_387399_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391812_392731_392882_396941_397053_413488_413821_447709
888047	contig_10904_pilon	-	2377	6	Intergenic	novelGene_22718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_4	367.826807070937	7	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	54	887	662714	652201	FALSE	65	AGAGCCAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662767	650710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665
888048	contig_11386_pilon	-	1210	6	Intergenic	novelGene_82836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	231	557	244903	244577	TRUE	40	GAGCGAAACCAATTTAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSSLQWLLKSREFKSMVPPSGQPNQVAYWSKKVEVTGPTIWLPCLIQAIYSLPCGKKKKKNSNISQTTPPPELQSNHHQPMRKLLHMKLSSAHFSVGLPSPMAQQG	245133	231145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_231260_231604_231685_232027_232173_233457_233514_234766_234881_244432
888049	contig_7619_pilon	-	4133	6	Intergenic	novelGene_162145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_2	38.4915575159021	2022	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	278	763	30763	23773	FALSE	5	CTATTCTGCTTGCTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDLGKHCSEKTCKQLDFLPVTCDACKQDFCKDHFTFAAHECPFAFKKDIQVPVCPLCNSPVPVKKGELPDVVVGEHMDQDCKSNPGRSHEKIFTYRCSKEGCKRKEMLQVVCDECHSNFCIRHRHPLDHGCKQRGCPHQQSRVESKAMTPTTAPQPAH	32375	20402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_23824_25229_25383_27647_27780_30136_30232_30708_30809_32143
888051	contig_12414_pilon	-	1917	13	Intergenic	novelGene_59650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_12	395.293456392421	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	56	1477	787209	756525	FALSE	10	CTCTTTCGCTCATCAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	794977	756084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129_787233_794945
888052	contig_7272_pilon	-	5164	17	Intergenic	novelGene_25347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_15	645.80961481984	1096	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	2167	4581	610206	593320	FALSE	25	ATAGTTGCTGAAGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	618662	592736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610248_611629_611658_616565
888053	contig_15684_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_178538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGTTGGAATAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116477	118507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15684_pilon_+_116500_118500
888054	contig_9668_pilon	+	2597	13	Intergenic	novelGene_58178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCATCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503287	599483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_503937_504014_504125_511992_512102_522292_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551887_553924_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580715_585702_586000_598963
888055	contig_12429_pilon	+	1084	3	Intergenic	novelGene_136217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.5	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	106	354	327996	372953	FALSE	20	TGTCAGAGACTGTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVKVPRNFRLLEELEEGQKGVGDGTVSWGLEDDEDMTLTRWTGMIIGPPRTNYENRIYSLKVECGPKYPEAPPSVRFVTKWQNSYSIKVVLQELRRLMMSKENMKLPQPPEGQTYNN	327890	373683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_328041_334090_334176_372834
888056	contig_1244_pilon	+	3383	3	Intergenic	novelGene_38045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTGTGAGTGATCGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960518	1053697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_961791_962077_962892_1052400
888057	contig_9982_pilon	-	2822	15	Intergenic	novelGene_55754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	258.48768375507	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	163	1623	350166	339852	FALSE	40	ATAAAACAAGTCTCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353584	338652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349574_350163_350223_353478
888058	contig_15449_pilon	+	3696	1	Intergenic	novelGene_33617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52903	56599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_52900_56600
888059	contig_3449_pilon	+	5914	13	Intergenic	novelGene_73732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	419.456021731321	169	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1366	2100	517852	524800	FALSE	35	TAGTTGATTTTAATATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFIV	493432	528614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_506311_506457_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517655_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524008_524356_524565_524792
888060	contig_5794_pilon	-	2302	10	Intergenic	novelGene_69796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_1	4662.37470357577	2449	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	898	1413	746429	743712	TRUE	5	AGTGTCTGCTGCCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749533	742730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_747019_747097_747245_747330_747454_749495
888061	contig_10331_pilon	-	4497	1	Intergenic	novelGene_54089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6692	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTGCCACTGATCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114460	109963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_110000_114500
888062	contig_5899_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_146985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCAGTTCTTTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279548	281382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_279500_281400
888063	contig_10339_pilon	+	4576	8	Intergenic	novelGene_125263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	61.4129548255754	998	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	83	1204	308610	329813	TRUE	10	CTCTTCCGCAACCCCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQQGKRTSCTLTDCWMAGCGEIDHSINMLPTNRKTNESCSNTAPSLTVPECAICLQTCVHPVSLPCKHVFCYLCVKGASWLGKRCALCRQEIPEDFLDKPTLLSPEELKAASRGNGEYAWYYEGRNGWWQYDERTSRELEDAFSKGKKSTEMLIAGFLYVADLENMVQYRRNEHGRRRKIKRDIIDIPKKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292259	366819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292335_308602_308657_328738_332432_346584_346670_348534_348585_354101_354243_357037_357263_366566
888064	contig_10331_pilon	-	2431	1	Intergenic	novelGene_54062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAAAATACTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61773	59342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_59300_61800
888065	contig_4315_pilon	-	5231	22	Intergenic	novelGene_46784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	279.345087668524	2280	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1140	3423	137	3559	366414	335266	TRUE	5	CATCCTGTGTCTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEEPDEALGSPQEVEEGGESSPRLRYETGQDSEGNGSSSSVALGQDQARGWVASGNKASGDKLSEHSEVSPSVDLCSARSWSSGTVSLGHPSDILDSTWEGETHIPQPTPLVETLPQSLGCHLLNPDDRTRGSVAQATPTEFHDSSAAPPQSLQCPGDGWRETTSLSHLQPGDQAWKRTRIPAKPLPSRFIGSVSPPNPRPRPAQQDRLPRQGATLAGRSSSDASKYGQGRLNYPLPDFSKVGPRVRFPKDESYHPPKAKSHSWQSQGPAGPLIFKSPAEIVQEVLLTSEEASPAKDPPPAHPITRVPQEFQTPEQATKLVHQLQEDYHKLLTKYAEAENTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPVHHGGALGRAVA	376068	327067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328357_333521_333729_333991_334109_335206_335304_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155_363231_365433_366498_376015
888066	contig_2093_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_152983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAAGGTATCAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355019	1351736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1351700_1355000
888067	contig_11258_pilon	-	3537	8	Intergenic	novelGene_67846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	130.425050805246	1663	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1961	2536	372250	361510	TRUE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPNAVSGLEGGSLTVQCVYDPGWETYYKWWCRGAHWVNCKILVKTTGSEQQVKKDRVSIRDSQKNRIFRVTMGKLREDDAGIYWCGIERTGIDLAVKVNVSIDPAPATLEETTGSPTMTSQLSDVRSLLSSVYFWILVFLEMPLLLVMLSAVLWHSPREGVDVARRKEESENSERSINEPERKDILGTS	390327	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_354741_355099_360530_360777_361438_361618_370032_370118_370478_370543_371931_372952_389068
888068	contig_7428_pilon	+	2039	2	Intergenic	novelGene_77754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	247	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	243	608	516959	517324	FALSE	55	AAAAAAAAGAATATGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISSVRINGEKIEVVKDFVLLGSPINTHGSSSQEIKQCIALGTSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAVVFSFASYACESWPMNRENQRRIDVFE	515654	518755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_515833_516894
888069	contig_11855_pilon	-	4315	2	Intergenic	novelGene_66892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	955	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAAGAATTATTAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658045	653092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_655099_655736
888070	contig_5260_pilon	+	2778	1	Intergenic	novelGene_144353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAGTTTTCAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89490	92268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_89500_92300
888071	contig_7396_pilon	-	2769	15	Intergenic	novelGene_79539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3150.89862870378	981	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	101	1486	255163	246385	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257087	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
888072	contig_15518_pilon	+	2834	2	Intergenic	novelGene_127595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	0	131	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3	395	11049	38055	FALSE	45	AGAGAATGTACATTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAPSFLL	11046	40494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_38035
888074	contig_6766_pilon	+	2988	1	Intergenic	novelGene_178539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1423	1761	188473	188811	NA	30	CTAGCTAGAACTTCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQSGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLICASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	187050	190038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6766_pilon_+_187000_190000
888075	contig_4232_pilon	+	2531	1	Intergenic	novelGene_63271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTCTATCTTTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465501	468032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_465500_468000
888076	contig_5669_pilon	+	5991	6	Intergenic	novelGene_86068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	274.549084864619	1786	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	823	1734	186073	189257	TRUE	55	AAAAGTAACCAACCCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGTCRLSPTRSTRSAPTAVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	185250	195355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186133_187417_187512_187718_188112_188198_188318_189011_190044_191884
888077	contig_9481_pilon	-	881	7	Intergenic	novelGene_149696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	78.6180994145467	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	80	688	600300	583459	FALSE	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKSQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNYTFCLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKSGGKWIIRLRKGLASRCWENLILAMLGEQFMVGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKMPGRLGPQRLLFQNLWKTRVNVP	600379	583265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_583532_585236_585374_585465_585619_587035_587094_591558_591612_592669_592785_600280
888078	contig_6031_pilon	-	1854	5	Intergenic	novelGene_56751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_2	671.410083332087	3108	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	108	692	257696	256126	TRUE	10	GCCCTGATGACTTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGMSASPAPPEGR	257803	254458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_256375_256704_256814_257469
888079	contig_7695_pilon	+	3620	1	Intergenic	novelGene_41682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTAAGACCAGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041474	1045094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1041500_1045100
888081	contig_6227_pilon	-	4851	11	Intergenic	novelGene_49814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	351.496856315956	2451	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	203	1594	1409780	1361608	TRUE	40	AAGTATAATTTCCCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQGRSSPQLDPLRKSPTMEQAVQTASAHLPAPAPVGRRSPVSTRPLPSTSQKAIENQEHRRVEAHKVSRPENEQLRNDNKKQVVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKTTAFGP	1409982	1357446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360671_1361574_1361632_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373352_1375648_1375715_1376002_1376180_1378381_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
888082	contig_15112_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_124746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	827	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6415	8414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_6400_8400
888083	contig_14807_pilon	-	720	7	Intergenic	novelGene_124678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7481.81358732998	52	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	204	623	38402	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38411_38666_38741_38827_38887_39750_39796_39900
888084	contig_253_pilon	+	1698	3	Intergenic	novelGene_129697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	17.5	1062	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	828	1235	488776	490018	FALSE	5	GCTCTGAGCCTTTCTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHPFGGNRTDLAGGSELWEEASLPRADLFLAPVAAGSVPSPSGSGPGAAAPFRPLFNDFGPPSMGYVQAMKPPGAQGSQSTYTDLLSVIEEMGKEIRPTYAGSKSAMERLKRGIIHARALVRECLAETERNART	487948	490481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_488983_489064_489198_489950
888085	contig_4531_pilon	+	5615	12	Intergenic	novelGene_47876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	128	junction_7	163.164977606579	1258	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	238	1458	225395	330172	FALSE	20	CCTCCCTCCCCAGCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENGKSCDQRHVAMNKEQHNGSFTDPSSMNEKKRRDREERQNIVLWRQPLITLQYFFLEILVILKEWTSKLWHRQSIVVSFLLLLAVLIATYYVEGAHQQYVRRIEKQFLLYAYWIGLGILSSVGLGTGLHTFLLYLGPHIASVTLAAYECNSVNFPEPPYPDQIICPDEENIEGAISLWSIISKVRIEACMWGIGTAIGELPPYFMARAARLSGAEPDDEEYQEFEEMLEHAETAQDFASRAKLAVQNLVQKVGFFGILACASIPNPLFDLAGITCGHFLVPFWTFFGATLIGKAIIKMHIQKIFVIVTFSKHIVEQMVAFIGAVPGIGPSLQKPFQEYLEAQRQKLHHKSEMGTPQGENWLSWMFEKLVIVMVCYFILSIINSMAQSYARRIQQRLNSEEKTK	211505	334329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_211717_225368_225471_228604_228741_229766_229858_230729_230841_257190_257359_264246_264379_301983_302065_303610_303728_310531_310594_328808_328912_330028
888086	contig_16846_pilon	-	2398	3	Intergenic	novelGene_82922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	204.5	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTGTTGATCATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482234	477739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_478282_479461_479592_480508
888088	contig_5389_pilon	+	1984	7	Intergenic	novelGene_143027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	134.060517014601	4	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	24	437	437163	476160	TRUE	10	AACTTTTTTTTTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPPQPNMAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKRICAGSETSEGCFFHLLRGSSQQP	437139	482761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_476086_476188_480732_480767_481275
888089	contig_15114_pilon	+	3584	1	Intergenic	novelGene_121096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	2189	2569	32668	33048	NA	50	CCAGACCTTAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIYTLYTILTYINHTISGSKDTVPSYEFLYPACTRTINILILRQWIGAKYMECPSKIFFRKNTYHLTSKHILIKQDVEYHTEWNAISCLEYRHLFCFFPRLLLQGLVTETRPASTLTPEEMCSHI	30479	34063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_30500_34100
888090	contig_8462_pilon	-	3064	2	Intergenic	novelGene_159424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1535	junction_1	0	1311	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	77	355	232401	231765	FALSE	5	CAGTCTCCTTTGTTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLESMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQSSGASSSGFSSSRAGSSRSGGGGHGGSRGFGGGNVDFFFFLMLHLWEGLFTFFFNTIFFKA	232477	229055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_231994_232351
888091	contig_10103_pilon	+	4909	8	Intergenic	novelGene_86162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	658	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAGAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638350	682946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_638628_642594_642738_644399_644500_644796_644900_645102_645228_645627_648564_673592_674007_682135
888092	contig_6102_pilon	-	3864	23	Intergenic	novelGene_31901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.208298895225265	377	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1517	1864	380961	379986	TRUE	30	CACAGCTCCCACGATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVSHSESSIRAGRLGTFPERQVLSTLQVDRQQGCRQFCTFMSLDEIVHLQHLLQLCSSGTWGETLQAQVQAARWDILQGQPLKEAAVQHCGEAHLTPAQKIILVQILVKDLDF	395261	373701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373725_373902_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375730_375966_376037_376205_376292_378875_379031_379329_379485_379615_379793_379953_380037_380158_380205_380317_380408_380537_380635_380897_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393640_393779_393855_393928_394034_394219_394270_394465
888093	contig_11017_pilon	+	2461	2	Intergenic	novelGene_128063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	281	580	107559	108280	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKTRQYQVITDCLKLRKKRVNFTVTTKKVNKPTSKNKEEKHKFSVKTKPTKTKEMKKKNPQTKGIQHRRVRWMKLEVITLSEISQSQKDKYCMRPLL	107278	110161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_107777_108198
888094	contig_9429_pilon	+	1146	2	Intergenic	novelGene_155095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	346	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTCATTATTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44582	46178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_45395_45844
888095	contig_14666_pilon	+	2225	9	Intergenic	novelGene_39502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1640	junction_3	710.672733665082	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	843	1373	315481	322138	TRUE	25	GATGTGACTCTTGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQADYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRSEKGP	314551	323517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_315379_315465_315586_318296_318395_321444_321500_321626_321701_321805_321865_321998_322434_322677_322746_323028
888097	contig_13718_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_142891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGTAAAGCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139111	141954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_139145_139768
888098	contig_10140_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_148425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	871	1179	307431	307739	FALSE	30	TCCCAAACATGTTTATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIQESLYQNELVNVQSFQDEAAYDKELMVLKEEVQAALKALVKNKGPGIDGIPIEMFQQTDATPGVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVLIPKKGDPTE	306053	310011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_306530_307036
888099	contig_7179_pilon	-	4043	5	Intergenic	novelGene_78131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	47.3127889687344	578	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	100	540	933323	893275	FALSE	25	GTTGTAATGTGCACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVEASSCDGKGQGVETSVTYYRLEEVAKRNSSKEIWLVIHGRVYDVTRFLDEHPGGEEVLLEQAGVDASESFEDVGHSFDAREMLKQYYIGDVHPNDLETENSSKDTSKNNTCKSCWSYWVFPIVGAILLGFLYRYYTSESKSS	933422	889771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_893366_896320_896350_907840_907871_908411_908541_933161
888100	contig_15491_pilon	-	2113	6	Intergenic	novelGene_75945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	401.87291523565	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	197	604	45111	32303	TRUE	20	TCAAAGAGTCTTTGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	46980	30751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32225_32266_32436_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
888101	contig_10331_pilon	+	1749	16	Intergenic	novelGene_54141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	276.004074044006	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1581	167	1747	410802	546470	FALSE	25	GTAAGAAATTTGTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKS	409631	546472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296
888103	contig_7079_pilon	+	3178	9	Intergenic	novelGene_129242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	576.8778981509	1005	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	355	810	344635	345282	TRUE	25	TACTTGTAAGACGCAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAQMTKSRTRSKPQCQCASHLAPLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGGEEALGEVSVRVGGGKAPPLVLVPSPPVSPQTDASYSQHQHQPMRREEEGSHPCPHTQVET	344280	351009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_344803_344900_345138_345231_345286_346268_346444_347296_347340_347541_347643_347957_348085_348276_348706_349519
888104	contig_2798_pilon	-	5669	1	Intergenic	novelGene_120049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	713	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGAATAGCAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169936	164267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_164300_169900
888105	contig_5686_pilon	+	1347	4	Intergenic	novelGene_45281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1281.75539354781	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93822	172701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_103123_103205_170215_170343_171643
888106	contig_13349_pilon	-	1933	2	Intergenic	novelGene_161119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCATGATGCTCAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10968	3611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_4338_9761
888107	contig_5643_pilon	-	1729	9	Intergenic	novelGene_38926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_4	104.407854110694	514	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	678	1148	413958	412705	TRUE	10	GTAGGGTTTTGCCTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGGNCQTFSSSTVISYSNTGDGAPKVYQETSEMRSAPGGIRETRRTVRDSDSGLEQMSIGHHIRDRAHILQRSRNHRTGDQEERQDYINLDESEAAAFDDEWRRETSRFRQQRPLEFRRHEASGGGGRRAEGPPRLAIQGPEDSPSRQSRRYDW	417164	411861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_412418_412679_412893_413501_413662_413835_413965_414169_414418_415036_415073_415925_416053_416325_416404_416982
888108	contig_10973_pilon	-	1285	1	Intergenic	novelGene_150367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	91	603	2730	2218	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2820	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2800
888109	contig_8330_pilon	-	5151	2	Intergenic	novelGene_71885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	685	1086	1064973	1064572	FALSE	35	AAAATGCCTGGCAGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVFMAGQKSRGLLRSQARMTQVCKGGLGRVSCVLCLPPLTSHSKSYLLPWALQPAAPAMDLECGELPACRELPHIPLGVEAVSPHPSLPPHRHHRRWSTNTQLASSKQIFPPRLIGLLLHSGLTPLRQKQPW	1066097	1060506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1065073_1065512
888110	contig_5686_pilon	+	9054	1	Intergenic	novelGene_45439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1952	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	275	646	212162	212533	NA	25	TTCTGCCATCACAGGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSVPTYQFPELSTHGQSCFHLFFYLLTSFWITLEQIPDIVSFYLQLYLFFFFYYEDFTCIKKYQQKNKNMKKRTESICISNQVSCVLFLLSNVLMFSLVPSAFAVQATSKPQQVFQFKSYS	211887	220941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_211900_220900
888111	contig_1836_pilon	+	2635	3	Intergenic	novelGene_71071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	228	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	131	1099	970856	995162	FALSE	35	GTTCTGTTTAAAACAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTDWLLAPEEGRRRGASRATRRRPQPPGAAARGAALTALNLRTMGARRLLLVAVGLSLCGPLLSVRTRARRPDSKAEIATAVPRSFLVRSYVGDFEKISHEEFEEKNETKLHEDRLISVNKSHPLQKPPSVFISEEASGYLTSPWLTVFIPAIYTGVFVVSLPLNIMAIVVFIVKMKIKKPALVYMLHLAMADVLFVTVLPFKISYYTYYFTAFSAVFFFVPLSISTVCYVSIIRCLSSSKVANRSKKTRALFLSAAVFCVFIICFGPTNVLLIVHYSLLSYNSSVEAFYFAYLLCVCVSSISCCIDPMIYYYASSDCQRYLCSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSTNLNSSIYKKLLT	970725	996698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_970944_993966_994364_994678
888112	contig_3018_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_78924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633742	630534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_631633_632759
888113	contig_20365_pilon	+	4569	4	Intergenic	novelGene_85321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_3	41.4755617469158	711	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	15	1091	9641	15104	FALSE	30	GTGATAAATTTCTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPVQQPPQPADGKRKGKAQYVQAKRARRCDAGGPRQLEPGLQGILITCNMNERKCVEEAYSLLNEYGDDMYGPEKFTDKNQQPSGDEGEDDDVEAALKKEVDDIRAFTEMRLRRFQSVESGANNVVFIRTLGIEPEKLVHHILQDMYKTKKKKTRVILRMLPISGTCKAFIEDMKKYAETFLEPWFKAPNKGTFQIVYKSRNNSHMNREEVIKELAGVVGSLNSENKVDLTNPQYTVVVEIIKAVCCLSVVKDYMLFRKYNLQEVVKSAKDLSQLNPKQAAPVGNGREAKLESGDKSSQSDPAEGKCNQEEVPGNSEEVKQTKPMSETQVVNEGGSKPELGSQVPKEPKSNENDLA	9626	18582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_9872_12098_12274_13272_13522_14682
888114	contig_546_pilon	-	2148	2	Intergenic	novelGene_117171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAGAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66395	54804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_55486_64928
888116	contig_8773_pilon	-	2951	1	Intergenic	novelGene_74515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1437	1838	29392	28991	NA	15	CTATTTGTTCTGTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIAFDPAVPLLGIYPREIRFVTQIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	30828	27877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_27900_30800
888117	contig_20140_pilon	+	1925	3	Intergenic	novelGene_170561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	682	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAGAGGAAAGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31234	34117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20140_pilon_+_31274_31896_32102_32436
888118	contig_14546_pilon	+	4119	6	Intergenic	novelGene_157445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	154.574771550858	791	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGACTTGTTCATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518294	537449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_518332_523716_523761_528752_528835_529060_529190_529581_529692_533732
888119	contig_9594_pilon	-	2728	2	Intergenic	novelGene_73911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1275	2144	113553	112684	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHDDITIINIYAPNDRAPKYIKPTLTTLKIEIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILAHRAILKKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKIKEKQSATWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLDSNENENTSYQNLWDRAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQPK	115608	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_114744_115524
888120	contig_15236_pilon	-	8042	26	Intergenic	novelGene_141622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	810.982175883046	2	112	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	928	2787	527	3313	679773	618893	FALSE	20	CTCTCAGCAATGTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIVRPLGPESLLLRGARLKNTKEIFGVAVYTGMETKMALNYKSKSQKRSAVEKSMNTFLIIYLIILISEAIISTILKYTWQAEEKWDEPWYNQKTEHQRNSSKILKFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFFIGWDLDLYHEESDQKAQVNTSDLNEELGQVEYVFTDKTGTLTENEMQFRECSINGIKYQEINGRLLPEGPTPDFSEGSLSYLSSLSHPNNLSHLTTSASFRTSPEYEMELIKEHDLFFKAVSLCHTVQISNVPTNGIGDGPWQSSLTPSHLEYYASSPDEKALVEAAARIGVVFIGSSEETMEVKTLGKLERYRLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKCIDGEIEKTRIHVDGFALKGLRTLCIAYRQFTPKEYEIIDRRLFEARTALQQREEKLADVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKTDSECADRLRQLTRRITEDHVIQHGLVVDGTSLSLALREHEKLFMDVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIHSLLEQHIDPHILQSKPALYRDISKNRHLSIKTFFYWTILGFSHAFIFFFGSYFLLGKDISLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMFFVFIQLLSSGSAWFGIIVMVVTCLFLDIVKKVFERQLHPTSTEKAQLTETNSGIKCLDSVCCFSGGEAACTSVGRMLERVTGRCGPAPVSRSWSGSEPFCTNDRSFLTLSTMDSSTC	684476	614163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563_645692_648728_648875_650530_650634_654832_654987_656272_656477_657774_657957_660984_661089_661162_661237_662591_662661_663175_663352_663958_664202_667271_667470_668586_668738_675892_675975_677717_677783_679756_679805_682091_682301_683376_683475_684093_684223_684417
888121	contig_7816_pilon	-	6332	4	Intergenic	novelGene_66468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3559	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3119	3442	144096	143773	TRUE	55	AAAAAAAGGTACCAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGTGWALSGRHLLAASPLLLNQDPRPLAVPLAKRFQIVLPLSDVCVQMEQTEKQIKPADERNLSKTSVTNLFSINQNSLQERRQKEFENKGMEQTEDILGVKARSL	149071	140531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_140889_141239_146701_148222_148442_148776
888122	contig_15548_pilon	-	3491	6	Intergenic	novelGene_173477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	838	1419	96579	95998	TRUE	35	CTGGGATCTTCTAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANCHQKRAEVTILISDKIDFKTKSTITDKDGHYIMIKGMIQHEDITIINMYVPNDRAPKYIKQTLTALKRQTDSSTIIVGDFNTSLSRKDRTSRKKLNKDTEDLKATISQLELIDIYKTLHPTTAKYTFFSKAHELFSRIDHILDHRATLKKIQNIEIIQSFFSDHNAIKVEINNRKSKEKNQLYGN	139770	6070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_-_6446_7004_8275_9553_9617_93379_93679_95932_96751_139104
888123	contig_6740_pilon	-	3671	2	Intergenic	novelGene_142720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAATGTATGAACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733714	729695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_732864_733211
888124	contig_5988_pilon	-	2914	11	Intergenic	novelGene_16085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.9	288	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1967	2338	1224879	1222038	TRUE	15	CTTCTAACTCTCCCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIITEHATCNVCKEEMRGGGRSHQTEKGWMAISLLLFFLVLLIHSQDHHEFSEQSNKIQEEVNTMPDIILISIFSLFNNKLSIKKDKATHDHQPHIQVCLEKPNGSKEKVAQGGQDHQAHG	1226937	1209868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1209911_1218346_1218437_1218870_1218975_1219913_1220035_1221371_1221423_1221658_1221814_1222024_1222105_1222577_1222678_1223381_1223459_1224751_1225028_1225119
888125	contig_1435_pilon	-	4266	1	Intergenic	novelGene_115510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2815	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGGGACACAATCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566919	562653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_562700_566900
888126	contig_9098_pilon	-	2562	10	Intergenic	novelGene_75776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	433.429476513897	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	246	1046	288130	264388	FALSE	75	AAAAAAAAAAATCAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295267	262871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292840_292905_295200
888127	contig_9863_pilon	+	4014	7	Intergenic	novelGene_153997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_3	87.0529851425109	969	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	30	2087	45391	57415	FALSE	20	GTCACCTGTATTAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRGPAAEKMVLTRSARPQARIQATSAERSQQKNSAADGIKECPESRKESQSDDRSTAESHTTWEHSPVPRTPKTRKRKSRIEGSLPEMIEPSADGETSEAESNCSSVSELQDPIVRVTRRRQILVSRTPVSSVRKRLKITPISESHSEEEVSEAESHVSGISTFVPSTVITTRARRREAKPSQESHAEDISDAESSCSDISSFSGIAVRRATRSMHRKLQAQTEEKDTKIILGKEKWNCKGLDEKAKGIINKGKEINDKSSQLNSLSELQDASLQQLVSQKHSTPQSNKTTREPSNLNYEAVMKSLAQTFAVVEVDRWDEERKSTIKTSDSTQFGDDEECTIISVSKDMNNKKNVNLECDTTLCNPELNTSQDKGDSVLLVLSSDESQQSENSENEEDTVCFVENSGRRESSNGDLGNMSCDTALFVIDTTPGLSADKNFYLEEEDKASEAATEEEKEEGEDEKSEEPSDHDVNKDNELSDEEDLLNSTKSKLLKLTSSSIDPGLSIKELGGLYINFNADKLQSNKRTLTQIKEKTKNDLLQKTIITPDFEKNYSVPPYRESKFQLQKKRREERQKTAGNGWFGMKAPELTDELKNDLKALKMRASMDPKRFYKKNDRDGFPKYFQIGTIVDNPADFYHSRIPKKERKRTIVEELLADSEFRRYNRRKYSEIMAEKAANAAGKKFRKKKKFRN	45361	59342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_45463_46747_48130_49993_50133_52597_52694_53768_53934_55492_55603_57321
888128	contig_34_pilon	+	3267	7	Intergenic	novelGene_39979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2049	2417	212125	212493	TRUE	20	TCCAAGTCTCCTGGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	210076	243343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212559_212971_213048_214057_214151_215287_215458_224659_224818_230228_230389_243215
888129	contig_13004_pilon	+	2075	7	Intergenic	novelGene_112699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	357.753173757178	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	369	1073	898142	928299	FALSE	30	ATAAAATTGACCTTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQQPLWEPVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837769	929301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_861162_861282_898039_898169_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
888130	contig_8050_pilon	+	1950	3	Intergenic	novelGene_114876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	175	662	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	126	338	443928	446974	FALSE	30	TGTATTGGACATCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLQKNTALWIGTGGGHILLLDLSTRRIIRIIHNFCDSIRVMITAQLGSLKNVMLVLGYNRKSTEGTQHQKEIQSCLSVWDINLPHEVQNLEQHIEVRKELAEKMRRISVE	443802	448586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_443947_445955_446028_446852
888131	contig_15025_pilon	-	1879	8	Intergenic	novelGene_155964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_2	219.70936275369	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1842	37	1878	48018	29157	FALSE	40	GTAAGACTAAATATCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCEKWSRVAEMFLFFEDLEEDYKIRCLCTRAFVEDRILCNLGLKGYYVKGNSNNAANMLSIGDQTTEEEGGDLSRGSAETHGSKDIVLDESELDSEAELMRSMGLPLQFGGTSMHKNFEVSMNAKNKVKRKKKKHQKKYLDEIMRESWREEYDEDDILASEGPSSVEQYENTRTCKIQSGKDVETENLPVENTLSLKLEITEKWEKYWNEYGGGLLWQSWQEKHTGQTLSSEPWNFPDTKEEWEQHYSQLYWYYLEQFQYWEAQGWTFDASQSCDTDTCESQTEVDSNSDENCVKVDLISFPSSSVTISNKSSSSSDKDHNEILDRICNIILNSEEVEQNQLESSENHDGLQELSEVSSRRECPASGQSEPCDGGTKKSNMTRTRNTNPPAQDSQESSGANTSKERPHTNDIDGDESEEDPPECKPTKLKRSHELDIDENPHSDFDENGCLLGFKHGSGQKYGGISSISHRRVKYLEKNMKRKSKFLDLRRRIDTKNKQIFTEESEKQFCKKSKTLSKVEKFLKWVNEQMDEETSKESFSHNDTQDTCTSSGSEEQVSVTQGDSPFETSNREPDKCHTVYSPGEFETEKNGDSVVATVTEEQEKPDSLQVENE	48054	29155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_29442_32002_32175_34737_34825_36289_36408_38284_39105_39446_39638_41248_41314_47914
888132	contig_4364_pilon	+	1952	6	Intergenic	novelGene_558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	1401	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGACTGGCTCCTGTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
888133	contig_5961_pilon	+	3819	19	Intergenic	novelGene_144111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	493.541535145301	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	999	3000	559	3558	170241	214246	TRUE	30	CCTGATACAATGGTTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTELELLLLSTIILRSSLLFSTRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	113726	267951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_170100_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060_214260_267703
888134	contig_16125_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_155244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122496	124320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_122500_124300
888135	contig_18145_pilon	+	3059	17	Intergenic	novelGene_37337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	503.109937662734	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	223	2538	86893	100744	FALSE	15	TGGAGTCTGAGTCCTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86670	101265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90558_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98321_98541_98826_98983_100326_100482_100638
888136	contig_2009_pilon	-	4274	1	Intergenic	novelGene_165455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	331	672	69244	68903	NA	60	AAGAAATACGAGATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLNVKCVKFRIKKNKTTHLGYEKQHDALRKNWTERGVEFPVFAIWELRVHVLQLNTGLTKQKHKQKVGREAGSSGDFLTNPSSQNTFCYNISFQCLNIGYKVLQETNKKNT	69574	65300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_65300_69600
888137	contig_3948_pilon	-	2390	6	Intergenic	novelGene_53209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	282.866046035928	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	70	531	866476	842642	TRUE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKSTY	869637	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_852453_852636_856565_856712_866355_866480_869571
888138	contig_7051_pilon	-	3850	5	Intergenic	novelGene_64310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.848823745622	478	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	348	653	217897	216979	TRUE	35	CCAGCTCATATAACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	218244	211002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_211324_212779_214871_216193_217052_217573_217734_217824
888139	contig_11386_pilon	+	2196	6	Intergenic	novelGene_82833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_1	46.366367121007	230	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	151	609	231646	244538	FALSE	60	ATACAATAAAATTGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPNEDSEGSRITYIKGDLFACPKTDSLAHCISEDCRMGAGIAVLFKKKFGGVQELLSQQKKSGEVAVLKRDGRYIYYLITKKRASHKPTYENLQKSLEAMKSHCLENGVTDLSMPRIGCGLDRLQWENVSTMIEEVFEATDIKITVYTL	230680	246125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_230794_231608_231685_232027_232173_233457_233517_234770_234884_244435
888141	contig_12626_pilon	+	3489	1	Intergenic	novelGene_80419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCAGCAAAAATCGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102069	105558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_102100_105600
888142	contig_1986_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_64145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCAGTTGATTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384194	382897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_382900_384200
888143	contig_19352_pilon	+	1262	14	Intergenic	novelGene_122416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	330.773595677819	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1161	101	1261	337786	389220	FALSE	55	CAAGCAAGGAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYLQDTKSSNGTFINSQRLSRGSEESPPCEILSGDIIQFGVDVTENTRKVTHGCIVSTIKLFLPDGMEARLRSDVIHAPLPSPVDKVAANTPSMYSQELFQLSQYLQEALHREQMLEQKLATLQRLLAITQEASDTSWQALIDEDRLLSRLEVMGNQLQACSKNQTEDSLRKELIALQEDKHNYETTAKESLRRVLQEKIEVVRKLSEVERSLSNTEDECTHLKEMNERTQEELRELANKYNGAVNEIKDLSDKLKVAEGKQEEIQQKGQAEKKELQHKIDEMEEKEQELQAKIEALQADNDFTNERLTALQGIQVDDFLPKINGSTEKEHLLSKSGGDCTFIHQFIECQKKLIVEGHLTKVVEETKLSKENQARAKESDLSDTLS	337685	389221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_337789_338292_338441_353879_353953_358378_358416_360032_360096_363527_363624_363867_363940_365721_365863_366778_366917_368028_368198_368828_368880_373329_373393_385251_385312_389173
888144	contig_14970_pilon	+	2844	1	Intergenic	novelGene_45016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTCAAAGGTTGTGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145687	148531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_145700_148500
888145	contig_4180_pilon	+	2327	12	Intergenic	novelGene_8294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	189.813523105492	8	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	747	1613	811833	821915	FALSE	15	TGGAGAATCTGGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733026	822629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733157_733253_733329_735140_735216_790791_790890_791893_791965_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
888146	contig_6794_pilon	-	1962	5	Intergenic	novelGene_148998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	154.782710597793	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	186	797	19487	13983	FALSE	45	AACATCCAAAGGAGAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLNGIKLFGRPIKIQFRSGSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20402	12817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732_18827_19426_19590_20319
888147	contig_16635_pilon	-	3631	5	Intergenic	novelGene_153140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	349	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2302	2613	89422	89111	TRUE	65	AAAAAAATTACAAAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNWEPVLQCPLLSLGSKGPCAPAHWDSRSQTRGDPHGHTPQATPRRATDAVGAAGRSSGGKKHAGVTGQSINRKETLIKVIGYMLLKKKMLQECATETSLS	95724	53052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_53199_86052_86141_87472_87770_88623_90679_94679
888148	contig_9653_pilon	-	4145	12	Intergenic	novelGene_48182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_10	483.12996386425	2278	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	181	1548	196924	175913	FALSE	35	TTAGGTATTGTAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	201014	173315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194309_196881_196987_200896
888149	contig_8204_pilon	+	2165	4	Intergenic	novelGene_176997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_2	48.1109828071166	16	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	86	1255	19204	45115	FALSE	35	GGAGAGGGGAACTTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEGKRSSIHYIIPGSLTM	19118	46025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_45005
888150	contig_12079_pilon	-	4656	5	Intergenic	novelGene_67560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	366.129331657544	609	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	1095	1802	870319	869456	FALSE	15	GAGGAGTGGATGGGCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVQASPGQMKVQASPRPDEGSSLPTARRRFKPPRPDEGSSLPPARRRFKPPPGQTKVQASPRPDEGSSLPPARRRFKPPPGQTKVQASPRPDEGSSLPTARRRFKPPHGQTKVQASPRPDEGSSLPTARRRFKPPHGQTKVQASPRPDEGSSLPTARRRFKPPHGQTKVQASPRPDEGSMKVQASPRPDEGSSLPPARRRFKPPRPDEGSSLPTARRRFKPPRPDEGSSLPPAR	872420	866601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_869624_869779_871171_871500_871555_871641_871725_872314
888151	contig_1450_pilon	+	2853	20	Intergenic	novelGene_27374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	519.781032098748	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	1224	2657	345706	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244374	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_340824_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
888152	contig_20779_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_112355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTACAACAAACTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2312	79	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_-_100_2300
888153	contig_15304_pilon	-	1011	3	Intergenic	novelGene_30639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	332	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	388	393	102442	102437	FALSE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYIPAQRPSLTTM	105888	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102472_103571_103680_105638
888154	contig_6477_pilon	-	605	7	Intergenic	novelGene_154174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	2937.24676449827	110	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	69	566	773121	769365	FALSE	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	773189	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
888155	contig_5319_pilon	-	5078	2	Intergenic	novelGene_178540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1767	2252	264730	264245	FALSE	55	TGATAAAAATTCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNTILADSPVEENALELPDRKFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQKQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGLKTNTWIQHCFRKTQKKEQRKMKRP	282855	261418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5319_pilon_-_265091_281449
888156	contig_6412_pilon	+	4685	6	Intergenic	novelGene_149954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCTCTCTAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221728	254466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_223833_225670_225760_242176_242297_245458_245552_251634_251777_252329
888157	contig_9014_pilon	+	2029	3	Intergenic	novelGene_106811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3294	junction_2	725.5	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1	381	150979	151902	TRUE	30	CAAGTCTTTGTATAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGEGHVVLVCFCGLNHPNYVNHLVFLPKKQLGISKNGSSQNLWLLVI	150978	153642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151036_151578_152334_152425
888158	contig_7898_pilon	+	1254	9	Intergenic	novelGene_47608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	461.550647275031	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	249	1028	590160	599921	FALSE	10	TCTCTTCCTGCCAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATRRHSRSSSASGLRRVSVSVSETPVPDTKTTSLLPPRGGRACPAGRRGSHTLPCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	562994	600147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563161_590077_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
888159	contig_10581_pilon	-	1840	10	Intergenic	novelGene_41440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1044	1379	781231	771535	FALSE	20	CCATTCCCTGGGGAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGGWWALLEDLPVHLVAKRQLEGLQGQCLVWGLLGCMEGVERGLWPPYLQLHLLWHHWPHCIPVAVQLWASPFLTLQCLRVVIVGGDPHTRMRAPLGSTVERQAVAVPR	791871	771073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_771858_781218_781267_783465_783538_784027_784169_784288_784392_784879_784955_785618_785708_788800_788952_789972_790187_791708
888160	contig_826_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_154928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAAGCTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9278	7285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_7300_9300
888161	contig_6847_pilon	+	5362	12	Intergenic	novelGene_143870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	641.89484476473	11	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1230	1727	77788	101065	TRUE	30	TTATTTTCAAGTAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTLQCCGELTAHNQEHSMDAFVE	76558	114708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96791_100996_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608_113451_113719
888162	contig_5389_pilon	+	3757	7	Intergenic	novelGene_143029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_5	92.4351123761961	978	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	21	596	437163	481284	FALSE	10	CATTCTGTGACTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPQPNMAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKREPGSGTESDTSPDFHNQENEPSREDPEDLDGSVQGVKPQKAASSTCSGGHHSSHKKRKNKNRHRIDLKLNKKPRADY	437142	484445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_475994_476188_480732_480767_481275
888163	contig_6677_pilon	+	1326	3	Intergenic	novelGene_114169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCCCGCCCCCGGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418245	438650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_418373_426632_427709_438527
888164	contig_2078_pilon	+	3102	1	Intergenic	novelGene_100149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2184	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	914	1222	309781	310089	NA	30	TTGAAATCTCCACTCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQASRPFFLPCMLPVSCSGLLLAPEDRPLSAPSGQASLGLAICNHQLCCWTPSGPVSVTALDWWYSSFRRLLASFLSASSFFSLAFSPFCFFLLPVCLLLSV	308867	311969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_308900_312000
888165	contig_13558_pilon	+	1429	2	Intergenic	novelGene_123012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	542	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	228	752	41136	41660	FALSE	10	AGTTGTTGTTAGTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36709	42337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_41016
888166	contig_8628_pilon	+	1748	10	Intergenic	novelGene_164406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_6	176.234131585804	1056	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	173	1747	373219	414116	FALSE	25	ACCTAATCGGCCTGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIEDVDALKSWLAKLLEPICDADPSALANYVVALVKKDKPEKELKAFCADQLDVFLQKETSGFVDKLFESLYTKNYLPPLEPVKPEPKPPVQEKEEIKEEVFQEPAEEERDSRKKKYPSPQKTRSESSERRTREKKREDGKWRDYDRYYERNELYRDKYDWRRGRSKSRSKSRGLSRSRSRSRGRSKDRDPNRNVAEHRERSKFKSERNDLESSYVPVSAPPPNSSEQYSSGTQSIPSTVTVIAPAHHSENTTESWSNYYNNHSSSNSFGRNPPPKRRCRDYDERGFCVLGDLCQFDHGNDPLVVDEVALPSMIPFPPPPPGLPPPPPPGILMPPMPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGHSMRLPLPQGHGQPPPSVVLPIPRPPITQSNLINNRDQPGTSAVPNLAPVGARLPPPLPQNLLYTVSERQPMYSREHGAAASERLQLGTPPPLLAARLVPPRNLMGSSIGYHTSVSSPTPLVPDTYEPDGYNPEAPSITSSGRSQYRQFFSRTQTQRP	373046	414117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_373278_384736_384856_388162_388288_395395_395488_396165_396360_397107_397372_398836_399155_401467_401603_412199_412365_414012
888167	contig_3449_pilon	+	2778	2	Intergenic	novelGene_73728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTGATTTTAATATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493422	528614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493501_525914
888168	contig_9481_pilon	+	3809	3	Intergenic	novelGene_149624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	565	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2783	3283	137730	138230	FALSE	80	GTACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPLVCGPHFEEQRFRAMLSNRGIMCTLCIILNFLVATLKKKKVKRGEINLNNIFCSIQHIQNIRISLCNHLKNYYVLFYLLFHVKSLKSGVYFSFHTAQFGLAHFKGSMITCDWWLQLENLLGLPGKGAGPYLSSNPRERCREGKGLTGWEKEEGTRTRKSMFL	65278	138756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_65533_65662_65930_135468
888169	contig_8673_pilon	-	4232	6	Intergenic	novelGene_129923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_3	91.7941174585823	1081	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	206	871	338208	324321	FALSE	45	TCATAGCAATAAATGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	352835	320959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_352650
888170	contig_8598_pilon	-	5258	3	Intergenic	novelGene_22893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29564	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	4386	5258	177533	176661	FALSE	20	CATGAATCTCTCCTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSQRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKLGSSSTLEWSSTAPQEEAKMAHRAGYLSEGRGRWREASKKSKEAGKKKATLTANKWCSESQLVRAGVSGQETVSMGSRGGLVWVKKSREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGALSEVLERKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPADNKWHSESHPFGSVESKQPLFPGQETVAAGSRGGQVGVKKGGGWESVYRQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPCLPVSDRSPRWWIRAALAGRGLL	188209	176660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_178221_180888_184057_187679
888171	contig_57_pilon	+	9185	29	Intergenic	novelGene_44880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	256.994292400689	1617	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	161	3814	66895	147529	FALSE	35	AACACTACCAGACTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAALRRAAWQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQLMKLLGWTHCASFTENWLPIMYPPDYCIF	66734	152900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325_145446_147439
888172	contig_6847_pilon	+	2525	6	Intergenic	novelGene_143861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	516.973655034761	18	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	333	752	77788	111729	TRUE	35	AAGTTCCAGCAGCATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSLLFVGFSSYFRTMKTKKEL	74254	114720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74316_77516_77988_81026_81091_82021_82116_111667_112497_113714
888173	contig_397_pilon	+	5588	2	Intergenic	novelGene_178392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	4992	5564	189177	189749	FALSE	30	AGGAAAGGTGTGAGTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKKEVQAALKALAKNKATGIDGIPIKMFQQTDAVLDMLAHLCQEIWKTATWPSNWKRSIFVPIPKKGDPTECRNYQTMSLISHQVKFCLKSFKSCCSSTSTGKLQNIQARFSRGHGRRDIIADVTWILTESREYQKDVYLCFINYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYSDQEAVIQTE	179830	189773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_397_pilon_+_183199_187553
888174	contig_16496_pilon	-	925	2	Intergenic	novelGene_5227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	70	AAAAAAAGAAAAACTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888175	contig_6364_pilon	-	6328	11	Intergenic	novelGene_51701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1250.0912126721	2794	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	793	1281	440728	436151	FALSE	25	CATTGTAGCATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	490739	431103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440792_445010_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466268_477601_477736_490716
888176	contig_5062_pilon	+	1716	11	Intergenic	novelGene_157842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	231.467405912798	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	423	1667	723798	744018	FALSE	70	TTGACAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	625541	744067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_625665_706257_706312_716318_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
888177	contig_13026_pilon	-	2625	12	Intergenic	novelGene_146299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_9	103.275448107564	11	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1833	2243	14211	6494	FALSE	15	ATCTCCTGGACCAGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28151	6111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_21089_22370_22975_23008_28000
888178	contig_5669_pilon	+	7544	9	Intergenic	novelGene_86077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	412	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	217	561	188913	189257	TRUE	30	CGCTTTCACGTAATGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSTTRPLVGALLHTWIQQPAKSFLSCRLFSPQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	188696	214341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_194419_196364_196458_201969_202085_205123_205291_207172_207333_208494_208586_209480_209599_212408_212550_213404
888179	contig_6102_pilon	-	4615	11	Intergenic	novelGene_32320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.374123914345	1748	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	50	1288	1691438	1685481	TRUE	25	TAGTCCATTTTAGTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKWRRREEEEVSGGEKMGRGTGRLTTSFFPFPGRQSPSPSCQSPPCTVTWWNFAAVPGPHPQALHAPPLQRLDSWEQHLDPSSGRCFYINSLTGCKSWKPPRRTCSRETSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691487	1599587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1599611_1682176_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689531_1691159
888180	contig_8587_pilon	-	4679	4	Intergenic	novelGene_159147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	897	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4191	4490	510219	509920	FALSE	45	CAGATACTAAAAGCAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSCSACYQSLLPETPSPCCQVGIPQMHLTTHALPKHCQGLPERHSPNNPQTPSPGSPPSHTHPGPAFPVPLPNLVPTPHSSLLGHPAHAPVQTMAHT	516230	509730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_511475_512775_512964_513192_513628_513918
888181	scaffold_12124_pilon	+	1717	10	Intergenic	novelGene_22281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3150.78283041603	12	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	191	577	1490385	1508436	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGPPVLYSWPFTDCLEIKHI	1473577	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506665_1508376
888182	contig_20819_pilon	+	2088	9	Intergenic	novelGene_55642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	502.939965975065	3	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	407	1075	40335	42531	TRUE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQCARPCGSPPGGLQAVPQRCPRATLRDEQLRPASCLRELGQGPDSGAQLPAGPGRDLAHGQHVQPGPQPLQPSAATAGVSAGACSHHRGNSGADRPHLHPCPSSPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	30136	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_30155_30381_30643_40122_40161_40245_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519_42875_42947
888183	contig_6445_pilon	-	1591	16	Intergenic	novelGene_76953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	856.228432656198	3	34	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	623	1369	73306	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLESWRTPRTKRLQISTQRPRTQPKPPTALTSLRSSSRKKHLDSRGKQMGPQLLITLDHGHKIQRVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_67748_67825_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77920_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88604_96306
888184	contig_5623_pilon	-	2885	10	Intergenic	novelGene_154814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	413.38667517214	29	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	132	962	212514	210725	TRUE	30	GTTATGTCTCCACTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLR	212718	205940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208506_210715_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665
888185	contig_13800_pilon	+	1977	14	Intergenic	novelGene_153701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	284.881788003541	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	127	1662	109210	162575	FALSE	65	TGATGAAGGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFESPRLQADGWGFFRRWRQQRGWRRQRRQRLHLLSLQVQKWMKCLTAHESTGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94190	162890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_109046_109072_109203_109241_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
888186	contig_11363_pilon	+	5582	1	Intergenic	novelGene_160489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTAGACTTCAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155319	160901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_155300_160900
888187	contig_6576_pilon	+	3012	2	Intergenic	novelGene_42414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8439	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	89	1435	1301228	1302574	FALSE	30	GTTCAGGAGGAGAGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295688	1304151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211
888188	contig_16496_pilon	-	1526	2	Intergenic	novelGene_5207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	11	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888189	contig_12869_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_75341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGCAGCAGTGCACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69976	68044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_68000_70000
888190	contig_11422_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_99101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAGAATTGAAGATACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819	1885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1900
888191	contig_6546_pilon	-	1344	3	Intergenic	novelGene_140980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	690	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	65	421	599635	599066	TRUE	20	AAGGAGTCCGCACGCTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSDSSDSSFFASTFFSSAGAAAVEGAGPPAGAAPAAGAGPPAPTLQMRLPMLTLARACNTRGTGRKHFGYITQLVKKKILHLLPTYSQLFPTLLCLLLCWNHLTFCLLMNNFWFGF	599699	597578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_597774_598337_599363_599575
888192	contig_10106_pilon	+	3932	13	Intergenic	novelGene_73867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	627.24828395319	5	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	160	1140	151101	172575	TRUE	30	AGAGAAGTCCCTCTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	131628	176654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131684_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505_173939_175225
888193	contig_11512_pilon	-	8992	8	Intergenic	novelGene_43301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	451.99760700107	216	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	315	821	396169	374504	TRUE	45	ATTCCTGATTAAAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSGKQQPAR	409444	366042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_401723_401868_409314
888194	contig_7376_pilon	+	4421	2	Intergenic	novelGene_108093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1547	1891	140444	140788	TRUE	35	CCAAAACATTTTTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNREHVIEEIKKIREKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKINNKMSELDDSIESHRSRIEAMEVKISEIEDKALDTNLFEEKSDKRIKKNEETLRIMWNSIKRNNLQVIGVPERGG	138897	272227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_140804_269712
888195	contig_5686_pilon	+	2754	1	Intergenic	novelGene_45389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163725	166479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_163700_166500
888197	contig_3737_pilon	+	4428	3	Intergenic	novelGene_178339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3188	3745	322274	322831	FALSE	55	ATCTACCATAAAAGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGISEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSGYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	122133	323514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_+_122801_239284_239915_320383
888198	contig_11293_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_134663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAATTGGGTTGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19557	21699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_19600_21700
888199	contig_4402_pilon	+	11616	17	Intergenic	novelGene_140834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3444	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCAGGCACTATGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591776	625815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_593745_594178_594884_595168_597498_599323_599387_600516_600570_600682_600763_600896_600994_602002_602341_602446_602549_603815_603994_609496_609636_610039_610134_610248_610346_612403_617169_619559_619662_624647_625088_625749
888200	contig_8579_pilon	-	1032	2	Intergenic	novelGene_178541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	276	731	371717	371262	TRUE	80	CAGAAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLQVCASGGHRFQATKDRLDRTGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKLWDPTSTAVQTGKQLHTRTELHSPSGRSKDGTRSQVFERKEGEFVRDKEEIKRIGKIATPAANKWHSESQLVWAGGIQATGASCTRDCVHGKQRGPSVGDEV	371992	355479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8579_pilon_-_355650_371130
888201	contig_4803_pilon	-	5423	30	Intergenic	novelGene_150699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_8	495.909867726427	2154	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	537	2798	134971	15989	TRUE	20	ATGACATTTTTCTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQPGQKPAASPRPRRAAASRPTEEHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSASSAATSKSSSMNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	135507	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_101681_101754_119613_119677_134896
888202	contig_15666_pilon	-	3816	5	Intergenic	novelGene_70120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	304.689185892772	9	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	93	941	110619	107940	FALSE	25	ACACACCTGGAGCTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGYGPLLLCSPQLKLLHPLSPCA	110711	105064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108714_108859_109098_109378_109948_110246_110558
888203	contig_5779_pilon	+	3957	3	Intergenic	novelGene_106533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3709	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3619	3939	349557	358782	FALSE	10	CACCCCGGGCCCGCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFTPISLLTSGLQTAPPYPLQNHPEWAAGVPLLLPATAPPHSAGVQSLVPEPLPGDSRAERPGRRPEGGSRPRRCGSNSRAAGVGTPPCWCSRSSRVLAALAAS	345938	358800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_349632_357794_357867_358608
888204	contig_11100_pilon	-	2776	4	Intergenic	novelGene_175532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.4337123975383	25	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCATTTCAGAATCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200754	187890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_190368_197199_197286_197385_197498_200653
888205	contig_19476_pilon	-	2369	3	Intergenic	novelGene_116808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	15.5	24	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1589	1987	158970	146395	FALSE	75	AGAAAATTAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVFEKLQTYVSLLALPSTEPDGLLRTNYSSVLTNVGAALHGFHDVMKDISKHYSQKATIEHELPTATQKLITTNDCILSSAVALTNGAGKVNFLWFMLILNSFLKYAPLFFLNDMGELVCYKILVYQAFW	160558	146012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_146646_150618_150712_158915
888206	contig_16228_pilon	+	3956	6	Intergenic	novelGene_147934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	125	junction_4	210.368628839948	1685	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	58	1101	47816	72232	FALSE	10	TCCCACTTGTGGTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMGIRGQHMEEKETFATVYSEVQKPGQAINI	47758	75087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71817_72142
888207	contig_6227_pilon	-	3312	11	Intergenic	novelGene_49817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	489.506986671283	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	133	1347	1409780	1361608	TRUE	10	TGTTCGTCAGAGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQVEAHKVSRPENEQLRNDNKKQVVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKTTAFGP	1409912	1358541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360316_1360512_1360671_1361574_1361632_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373352_1375648_1375715_1378381_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
888208	contig_10341_pilon	+	3437	7	Intergenic	novelGene_47239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	75.3451318194407	46	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATAGTTTGAGCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136024	157292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_136124_136460_136507_137136_139323_147431_147491_149233_149368_151628_151693_156443
888209	contig_4857_pilon	-	13986	14	Intergenic	novelGene_48770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2789.77251728969	3771	164	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	11403	12125	1226315	1212207	TRUE	25	ATTTATTTTAAGCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1246174	1209602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210354_1211096_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1229480_1229524_1234361_1238553_1238943_1241784_1242271_1243122_1244339_1244775
888210	contig_6059_pilon	-	3976	12	Intergenic	novelGene_44814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4406.80988043665	101	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	724	1572	573432	569817	FALSE	35	AACCCCAGTTAACAGCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVI	581051	567412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575885_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921
888211	contig_12644_pilon	+	1363	10	Intergenic	novelGene_44673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	18	1289	2675526	2680545	FALSE	35	GAGGCAGTGAGAAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675508	2680619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
888213	contig_6199_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_126346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATCAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91552	88556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_88600_91600
888214	contig_15009_pilon	+	2687	3	Intergenic	novelGene_178542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGACAGAATGTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211518	265782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15009_pilon_+_212377_213762_213778_263968
888215	contig_9705_pilon	+	7184	33	Intergenic	novelGene_41759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_32	284.977190356417	96	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	2092	3822	534543	541303	TRUE	25	TTACTTTGGACAAGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKVSIA	492026	558730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_532229_532358_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229_542015_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695_550773_551228_551279_556608
888216	contig_6227_pilon	-	4279	12	Intergenic	novelGene_49815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	418.624390313428	2369	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	203	1594	1409780	1361608	TRUE	50	ATTTACTACTTAAAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQGRSSPQLDPLRKSPTMEQAVQTASAHLPAPAPVGRRSPVSTRPLPSTSQKAIENQEHRRVEAHKVSRPENEQLRNDNKKQVVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKTTAFGP	1409982	1357821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360316_1360512_1360671_1361574_1361632_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373352_1375648_1375715_1376002_1376180_1378381_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
888217	contig_9668_pilon	-	2291	13	Intergenic	novelGene_58189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	821.541775498294	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	248	1072	605373	545675	TRUE	30	AAGTTAAATGTTTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEENISRSGMFYTV	669944	503299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_573590_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866
888218	contig_13385_pilon	-	3631	2	Intergenic	novelGene_178543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTATTTTATTGAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80327	14434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13385_pilon_-_17067_79328
888219	contig_9239_pilon	+	1453	2	Intergenic	novelGene_137208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGTGTTAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271285	273217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_272656_273134
888221	contig_17964_pilon	+	4552	19	Intergenic	novelGene_33890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1099	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2623	3045	357690	370936	TRUE	50	CTGCTGCAAATTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDPCWSWENSIICPAISRSCKLGYRLFRKSSKSLLLPEGMTSDIPYRKREEEKRVLLGLKRLEALFARYLASAPGAAEMYLPLPFVSPPAVPNPPRADPRVAPRELLLPNPKDVLAGWAEPWEKRELLCELLLRELLP	339078	412497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_339162_339212_340914_344422_344618_347655_347778_348930_349052_351502_351644_355598_355734_357565_357696_359050_359318_370786_371082_371986_372129_373492_373632_380105_380266_384034_384136_385000_385092_395545_395820_397747_397914_411235_411414_412386
888222	contig_3956_pilon	+	2577	13	Intergenic	novelGene_14972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1290.51388074243	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	1078	2058	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284226_1286153_1286224_1286409_1286606_1287276_1287378_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
888223	contig_2114_pilon	+	3494	6	Intergenic	novelGene_104242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	123	junction_1	254.050703600679	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	13	1557	153620	165991	FALSE	45	GTAGAGAAAAATATGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAMEANWTAFLFQAHEASHHQQQAAQNSLLPLLSSAVEPPDQKPLLPIPITQKPQAAPETLKDAIGIKKEKPKTSFVCTYCSKAFRDSYHLRRHESCHTGIKLVSQRKKTPTTVVPLISTIAGDSSRTSLVSTIAGILSTVTTSSSGTNPSSSASTTAMPVTQSVKKPSKPVKKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPFECPVCNQRFKRKDRMTYHVRSHEGGITKPYTCSVCGKGFSRPDHLSCHVKHVHSTERPFKCQTCTAAFATKDRLRTHMVRHEGKVSCNICGKLLSAAYITSHLKTHGQSQSINCNTCKQGINKTCMSEETSNQKQQQQQQQQQQQHVTSWPGKQVETLRLWEEAVKARKKEAANLCQTSTAATTPVTLTTPFNITSSVSSGTMSNPVTVAAAMSMRSPVNVSSAVNITSPMNIGHPVTITSPLSMTSPLTLTTPVNLPTPVTAPVNIAHPVTITSPMNLPTPMTLAAPLNIAMRPVESMPFLPQALPTSPPW	153607	167928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_153653_158388_159084_159855_159920_161009_161194_162413_162555_165563
888224	contig_13428_pilon	+	4294	21	Intergenic	novelGene_143436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	336	junction_8	193.997783492493	1163	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	743	2212	50306	82244	FALSE	60	AAAAAAAAGCACAATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGRNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEDETSEEANCLALSGHDKTETKEQMDAETSTAQPETMQTAACLVASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR	40733	84326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921_51995_53267_53389_54327_54413_59775_59830_60343_60464_61923_62034_66264_66387_70359_70503_73401_73503_73731_73953_78061_78125_80039_80115_82148
888225	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	611	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
888226	contig_14519_pilon	-	3863	1	Intergenic	novelGene_66838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	759	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATTAATTAATTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387148	383285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_383300_387100
888227	contig_6227_pilon	-	3699	10	Intergenic	novelGene_49818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	323.538690036628	2443	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	203	1594	1409780	1360647	FALSE	10	TGTTCGTCAGAGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGTPYIGSKISLISKAEIRYEGILYTIDTENSTVALAKVRSFGTEDRPTDRPIPPRDEVFEYIIFRGSDIKDLTVCEPPKPQCSLPQDPAIVQSSLGSSTSSFQSVGSYGPFGRMPTYSQFSPSSIVGQQFGAVGVAGSSLTSFGTETPSSGTLAQSSAVGSAFTQDTRSLKTQLSQGRSSPQLDPLRKSPTMEQAVQTASAHLPAPAPVGRRSPVSTRPLPSTSQKAIENQEHRRVEAHKVSRPENEQLRNDNKKQVVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKDNKVAA	1409982	1358541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360671_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373352_1375648_1375715_1376002_1376180_1378381_1378505_1383188_1383319_1387233_1387398_1409659
888228	contig_7056_pilon	+	3317	14	Intergenic	novelGene_43665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	606.519910940164	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	155	1723	798314	810882	FALSE	20	GATGAAGGCTGTTATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRQQGWPRPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWANVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781777	812476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806778_808491_808570_808732_808813_810828
888229	contig_11548_pilon	+	2936	5	Intergenic	novelGene_66781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1502.68343306233	20	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	30	422	112832	119355	TRUE	30	AGAATTCCAGCAAGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQN	112802	121959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119351_119402_119491
888230	contig_12951_pilon	+	3430	2	Intergenic	novelGene_68245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	138	junction_1	0	20	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGATTTGGGGTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833627	839336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_833656_835934
888231	contig_14925_pilon	-	1582	9	Intergenic	novelGene_55218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	1441.86378950995	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	35	CTTCATTAAAAGTAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	25818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_103145_103312_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
888232	contig_15893_pilon	-	3149	2	Intergenic	novelGene_128514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1134	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTCCACAGAGGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89958	84504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_84916_87220
888233	contig_17337_pilon	+	5166	3	Intergenic	novelGene_144722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1069	1374	22169	22474	TRUE	25	CCGGAATCTCTATTTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDTLLKSSISCSSFLVDSLGFSVYKIISSANRDTLTSSLPIWMPFISFSSLIALARISSTMLNKSGDRGHPCLVPVLKGNAFKVSPFRMMLAVGFV	20144	26314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_+_20556_21511_23383_23430
888234	contig_3627_pilon	-	1066	2	Intergenic	novelGene_78522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAAATAAGGTACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634979	630849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_631009_634072
888235	contig_12079_pilon	-	1353	10	Intergenic	novelGene_67437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	63	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	472	1332	600738	579745	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKASTSVGSPGLSSFSWAALSFSVTISRAAAFHATAT	638840	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_579852_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
888236	contig_3975_pilon	-	2084	2	Intergenic	novelGene_54814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_1	0	291	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTGACAGCTTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2052438	2042921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2044931_2052363
888237	contig_6794_pilon	-	2091	5	Intergenic	novelGene_148993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	105.871089065901	600	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	102	911	20671	13983	FALSE	25	GCTACGTCTCATTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAAAEADRTLFVGNLETKVTEELLFELFHQAGPVIKVKIPKDKDGKPKQFAFVNFKHEVSVPYAMHLLNGIKLFGRPIKIQFRSGSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20772	12802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732_18827_19426_19590_20575
888238	contig_6175_pilon	+	4347	11	Intergenic	novelGene_16328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	204.557180269968	14	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	1185	2645	1493756	1520939	TRUE	15	TTCTGTGACAGTATTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLSAILKVGSVSIFKLFLLATLIFVSPTGAVASDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1492571	1523052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518667_1518761_1520852_1521186_1521596
888239	contig_987_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_72246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGAAAAAAAGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268311	269780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_268300_269800
888241	SIRV6	+	528	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3283	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
888242	contig_14158_pilon	+	3311	1	Intergenic	novelGene_136133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATAAATAAAGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42571	45882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_42600_45900
888243	contig_17768_pilon	+	3396	1	Intergenic	novelGene_140394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATGGAAAAATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48718	52114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_48700_52100
888244	contig_2703_pilon	+	8873	13	Intergenic	novelGene_101725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1091.44212703499	525	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	276	953	559489	596431	TRUE	35	CCTGACAAAAGGCAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHGKTRSPPRSF	526191	609943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320
888245	contig_10734_pilon	-	1318	4	Intergenic	novelGene_51525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_1	387.804933783296	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	161	619	2305085	2282442	FALSE	25	AATACACAGTCTTTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGTFCLFS	2305245	2281742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
888246	contig_15025_pilon	-	1991	8	Intergenic	novelGene_155965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_2	219.70936275369	1103	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1809	182	1990	47985	29157	FALSE	40	GTAAGACTAAATATCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFFEDLEEDYKIRCLCTRAFVEDRILCNLGLKGYYVKGNSNNAANMLSIGDQTTEEEGGDLSRGSAETHGSKDIVLDESELDSEAELMRSMGLPLQFGGTSMHKNFEVSMNAKNKVKRKKKKHQKKYLDEIMRESWREEYDEDDILASEGPSSVEQYENTRTCKIQSGKDVETENLPVENTLSLKLEITEKWEKYWNEYGGGLLWQSWQEKHTGQTLSSEPWNFPDTKEEWEQHYSQLYWYYLEQFQYWEAQGWTFDASQSCDTDTCESQTEVDSNSDENCVKVDLISFPSSSVTISNKSSSSSDKDHNEILDRICNIILNSEEVEQNQLESSENHDGLQELSEVSSRRECPASGQSEPCDGGTKKSNMTRTRNTNPPAQDSQESSGANTSKERPHTNDIDGDESEEDPPECKPTKLKRSHELDIDENPHSDFDENGCLLGFKHGSGQKYGGISSISHRRVKYLEKNMKRKSKFLDLRRRIDTKNKQIFTEESEKQFCKKSKTLSKVEKFLKWVNEQMDEETSKESFSHNDTQDTCTSSGSEEQVSVTQGDSPFETSNREPDKCHTVYSPGEFETEKNGDSVVATVTEEQEKPDSLQVENE	48166	29155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_29442_32002_32175_34737_34825_36289_36408_38284_39105_39446_39638_41248_41314_47914
888247	contig_12951_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_68246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCACAGCCCGAGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839124	836325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_836300_839100
888248	contig_7179_pilon	+	3306	2	Intergenic	novelGene_78107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	440	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2808	3146	652867	653205	FALSE	35	ATTATCAGATTATTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAVWLPTILSSDVIFLCAVNSTFMMLMRQDLICKIRLCFKSILLRYKRDKRAERQRGSHTTKKAALAAECILWTPGPCTEKLLVQGKIEDKALSPELTQRESLPPELTP	649627	653365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_650177_650608
888249	contig_4769_pilon	-	3411	9	Intergenic	novelGene_117959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_4	40.3453838747384	1319	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	9	791	437505	407585	FALSE	35	TGGCAAGTCCCAGGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTEASRSLPKSRRDPEGRALRQDKFSVLLPTYNERENLPLIVWLLVKSFTESVINYEIIIIDDGSPDGTREVAEQLEKIYGSDKILLRPREKKLGLGTAYIHGMKHATGNYIIIMDADLSHHPKFIPEFIRKQKEGNFDIVSGTRYRGNGGVYGWDLKRKIISRGANFITQILLRPGASDLTGSFRLYRKEVLQKLIEKCVSKGYVFQMEMIVRARQLNYTIGEVPISFVDRVYGESKLGGNEIISFLKGLLTLFATT	437513	404964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_417932_421085_421112_421195_421273_423624_423659_433960_434061_437344
888250	contig_8145_pilon	+	3618	1	Intergenic	novelGene_118672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915062	918680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_915100_918700
888251	contig_11574_pilon	-	3436	4	Intergenic	novelGene_64060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	113.956131910486	252	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1167	1865	451360	449890	FALSE	10	TAGTTGTCGCGTGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	453481	448318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780
888252	scaffold_19766_pilon	-	2810	10	Intergenic	novelGene_34442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_9	240.266415916341	1079	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	479	994	854081	852863	FALSE	30	AAACTACTTACCTAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKHTDLPVSVFESVIDIINGEATMLFAELTYTLATEEAERIGVDHVARMTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIKMLHSRVKLILEYVKASEAGEVPFNHEILREAYALCHCLPVLSTDKFKTDFYDQCNDVGLMAYLGTITKTCNTMNQFVNKFNVLYDRQGIGRRMRGLFF	855783	851046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_853004_853126_853228_853326_853420_853508_853624_853707_853756_854063_854127_854229_854320_854681_854814_855356_855483_855698
888253	contig_5649_pilon	-	4007	11	Intergenic	novelGene_82361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	68.60029154457	727	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	55	609	1064307	1057321	TRUE	25	CTGAGCCCAAGCAGTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064361	1052849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1053500_1053678_1053803_1053908_1056404_1057043_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061783_1061837_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
888254	contig_11160_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_168840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5547	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1712	2065	320725	320372	NA	0	GGCCTTGCTGTTGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLNNNNKNNKNERKPNGEGWGPTPSRVRVPSARPGLQSASGLCPAPCSPAGTRWPGTSSNTPRDTLPFFLLLLTGALFPQSSEMERRLKMGRRRPGSRLGDSEPLRLPELREPLR	322436	320205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_320200_322400
888255	contig_16496_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_5118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1345	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1300
888256	contig_6031_pilon	-	703	2	Intergenic	novelGene_56753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1563	junction_1	0	1393	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCCTGATGACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255546	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394
888257	contig_13145_pilon	+	3687	9	Intergenic	novelGene_116622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1055.19760442061	80	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	59	919	35323	57392	TRUE	35	TTAGTGAAGAGCAACTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35264	60218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324_57988_58045
888258	contig_8712_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_58828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATTCTCATGGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321719	323262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_321700_323300
888259	contig_15744_pilon	-	5137	2	Intergenic	novelGene_83617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1426	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGATGGACTACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196772	190390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_193030_194274
888260	contig_12278_pilon	+	2070	11	Intergenic	novelGene_152588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	248.617075037094	8	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	804	1661	197880	201939	FALSE	30	CTTGTGAAATCAGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	179626	202348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_179786_186248_186371_190255_190464_196716_196882_197627_197750_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
888261	contig_10990_pilon	+	2951	21	Intergenic	novelGene_7455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	388.518403682503	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	485	2935	722379	752144	FALSE	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708557	752160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_709348_709396_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
888262	contig_16496_pilon	-	1496	2	Intergenic	novelGene_5212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	20	TTCATCCTCTTCCTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	39	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888263	contig_8310_pilon	-	3219	5	Intergenic	novelGene_75600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326112	314993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320710_324736_324847_325070
888264	contig_18613_pilon	+	803	6	Intergenic	novelGene_80223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2012	junction_3	1150.88880435948	26	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	69	557	24385	31105	FALSE	15	TTCTTTGCCTAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETIMNQEKLAKLQAQVRIGGKGTARRKKKVVHRTATADDKKLQFSLKKLGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPKVQASLAANTFTITGHAETKQLTEMLPSILNQLGADSLTSLRRLAEALPKQSVDGKAPLATGEDDDDEVPDLVENFDEASKDEAN	23746	31351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18613_pilon_+_23815_24384_24454_27952_28067_28436_28639_30137_30195_31058
888265	contig_3155_pilon	+	1479	4	Intergenic	novelGene_26409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1052.66846104977	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCTCACTCCAAGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258135	262548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259776_261265
888266	contig_13800_pilon	+	2034	14	Intergenic	novelGene_153708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	290.735936229742	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	167	1702	95662	162575	FALSE	35	AAGAAAACACCTGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRFGDGGADLLRRSRCAGNPLRHGVVARFSQCLAEFRTWLRTNWLRFNADKTDVMLPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94531	162907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
888267	contig_6031_pilon	-	1568	4	Intergenic	novelGene_56759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	167.945096848808	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	11	652	256770	255380	FALSE	15	GAGTTGCCCTGATGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDEVSLD	256780	254463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255656_255778_255868_256163_256375_256704
888268	contig_6557_pilon	-	3091	9	Intergenic	novelGene_32944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	281.036919282859	463	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	114	1151	364319	345035	FALSE	15	CGAGCTGGGTCCACATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGAVNGFDPAPPPPGLGSSRPSSAPGMLPLSV	395158	343094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_345129_352014_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_395057
888269	contig_14925_pilon	-	1173	2	Intergenic	novelGene_55377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAGCCAAAGCAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136360	128501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_129528_136213
888270	contig_6503_pilon	+	1476	9	Intergenic	novelGene_145768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	149.900748413742	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	335	913	146777	154252	FALSE	15	GTTGTTCCCTTTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSEKDLQQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE	140423	154815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_140598_144426_144545_146734_146851_149655_149724_150052_150098_151127_151232_151798_151866_153032_153112_154110
888271	contig_7293_pilon	+	2048	3	Intergenic	novelGene_54253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACACTATTATAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335643	338178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335782_336110_336241_336398
888272	contig_2872_pilon	+	3263	4	Intergenic	novelGene_178545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	751	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2414	2722	22723	23970	FALSE	15	TTCCTGTCTTTTTAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNKKKTKTKSNTSSQRMALREPPARARRIQAAGSPGSRDCGPRKQRSKRTKAPGSHQCCSPDLEAAARPNVAPQPHRKGQRRRSVPGT	1373	24511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2872_pilon_+_2945_3811_3884_21952_22979_23917
888273	contig_7056_pilon	-	1870	11	Intergenic	novelGene_43637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	740	junction_4	903.60785742489	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	539	1138	725838	723226	TRUE	35	AAAAACTGCAATTTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730467	721902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906_729063_730383
888274	contig_7376_pilon	+	4592	3	Intergenic	novelGene_108094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	372	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1547	2041	140444	269676	FALSE	35	CCAAAACATTTTTTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNREHVIEEIKKIREKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKINNKMSELDDSIESHRSRIEAMEVKISEIEDKALDTNLFEEKSDKRIKKNEETLRIMWCGDICHLNMAALLTTAAPTGLYAAQHVETCPQHVETCPQHVETCHDLFSQTYCPFTDFLLGCLLYAVR	138897	272227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_140732_236970_237138_269636
888275	contig_19851_pilon	+	2830	2	Intergenic	novelGene_29858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8446	junction_1	0	1	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53476	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927
888276	contig_5302_pilon	+	1456	7	Intergenic	novelGene_81390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1094.85204479875	4559	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	270	656	161151	170054	FALSE	35	GACAGCATCCATCATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEEEEAQVRKENQWCEEK	152094	170854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152189_155421_155519_158281_158352_161142_161217_167388_167533_169186_169328_170018
888277	contig_5686_pilon	+	3730	22	Intergenic	novelGene_45213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	1406.42481236448	481	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1214	3645	7	3651	93669	265309	FALSE	25	TGATGTATTATTCATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMLKKPIHTNEAVFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGGPNAGQFAAEYMKEVYDLLKNHEMVPKVKILLLQSVACWCYLNPVSQRRAKHLNFIPLLVRFIEKRCESSIKSEINSHLLIKCWTCYVLSVMTCNNLSCMKALRDYSSVKYQLEILATEDWSGWPENFAEVLYFLVGFHRN	93662	265388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_264881
888278	contig_10734_pilon	+	500	1	Intergenic	novelGene_51362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCTTTTCCCTGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781471	1781971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781500_1782000
888279	contig_10973_pilon	-	1652	1	Intergenic	novelGene_150338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCCCTAATGACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2689	1037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2700
888280	contig_18272_pilon	+	8022	2	Intergenic	novelGene_7051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1489	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCAACTCTGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470688	489846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_477275_488410
888281	contig_401_pilon	+	4746	31	Intergenic	novelGene_42905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	367	junction_20	338.94047494443	71	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1134	3405	35	3439	1929703	1972939	FALSE	20	CATCACTTCTGTGTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSAYEHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKKTCSDPKSKPPFLLEKSMESSLKYINKKFPNIDIRNSTQHLGPVHREKSEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1929668	1974246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807
888282	contig_19082_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_175904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAGTTTTGCCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84113	86303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19082_pilon_+_84100_86300
888284	contig_13612_pilon	-	874	3	Intergenic	novelGene_157281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_2	257	108	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGCTGTCCTGTACGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38697	34878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_35126_36275_36418_38212
888285	contig_14970_pilon	+	6074	1	Intergenic	novelGene_45066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1420	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	4020	4358	203144	203482	NA	25	GTAAATTTTGTTTTTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEVAPVLMEKTGPRNHSLLSFTVSIMTMRRPSILPEQVRRMVVKSSGLDKLVKSSHRVEEILCRHWLHLLLPFSCQDYTQFLKTGKKMLTCQVVQKTKMFKKYIWDMIFV	199124	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_199100_205200
888286	contig_3822_pilon	-	2789	15	Intergenic	novelGene_133305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	1119.99329444057	66	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	851	1735	292774	277069	FALSE	20	CAAGCTTCACTTTTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	320796	276014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296237_296888_296998_299561_299679_305985_306208_320744
888287	contig_6102_pilon	+	4842	14	Intergenic	novelGene_32326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1227	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	1708	2769	1683885	1684946	TRUE	15	ATTTCCTGATTCTTCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSSGVNPYMDFPPADTLGYGGPEGTAVEPYGARGPGSLPFGPGPPTNYSPSPYPDPSPETWSEFPSHSGLYPGPKPSGGAYRQYPRLEHYGQVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCLNTHPSEGPPHPQPLFSHYPQPTPPQYPQAVPYVQPLPDYSPSEPRPGLDFDSPPHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGSRGEPPVQEPPYQNSKFPGGSQVSPSPAKSSMATYGPGFAPNLSHHKSGSYPTPSQCQENFVVGANRPPHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKAGGSNPSCGHPEVGRLGVGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEAQGLSPPPSHDQGGQL	1682177	1691040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1685652_1687189_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688302_1688478_1688581_1688896_1689007_1689103_1689252_1689470_1689567_1689732_1689828_1690052_1690144_1690265_1690328_1690548_1690654_1690852
888288	contig_3161_pilon	-	3731	9	Intergenic	novelGene_84505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	345	junction_8	92.898802468062	1372	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	11	898	450128	348693	FALSE	65	AAATAAAAAAAGGAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTAVPQFQPQKALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPDITYVYDIAKRMHACTASS	450138	345859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_348804_370060_370175_374317_374413_390456_390565_391487_391597_409839_409951_411483_411547_421101_421243_450092
888289	contig_13952_pilon	+	317	2	Intergenic	novelGene_133266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	930	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCATCCGCTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202026	215018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_202103_214777
888290	contig_11896_pilon	-	1848	1	Intergenic	novelGene_88026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151532	149684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_149700_151500
888291	contig_9609_pilon	+	1594	8	Intergenic	novelGene_23073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	901.096384343845	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	18	842	450245	454609	TRUE	65	AAAAAAAATACCAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	450227	456267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455880_456136
888292	contig_18916_pilon	-	1760	12	Intergenic	novelGene_136872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	270.542980193964	66	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	211	1593	42002	9122	FALSE	10	TACTGTTCAGCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPAASEGSPALGRGPAALRSSEVARLREEQEKVVTNCQEKIQHWKKVDNDYNALQERLSTLPDKLSYNIMVPFGPFAFMPGKLVHTNEVTVLLGDNWFAKCSAKQAVGLVEHRKEHVRKTIDDLKKVVKNFESRVEFTEDLQKMSDAAGDIVDIREEIKSDFEFKAKHRIAHKPHSKPKTSGIFEADFTDDVKSNKLLADTELWARLEELERQEELLGELDSRPNTVIANGEDTTSSEEEKEGPDPDVNVEHQETDTVIPSSCHKDLTNSELFSGQVNSQLNCSVNGSNSYYSNDDDDDEDDEDDEDGDSGNEHDALGVGDNSVPTIYFSHTVEPKRVRINTGKNTTLKFSEKKEEAKRKRKNSSGSGHSAHELPTIRTPADIYRVFVDIVNGEYFPRKSILKSRSRENSVCSDTSESSTAEFDDRRGLLRSISYEEAACSDSNENILEEEQEEENYQKKHLPLSGAPEAFSGTVIEKEFLSPCLPPHPAIAHPALPTIPERKEVLSEVSEETTKRVSKFKAARLQQKS	88122	8954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_9305_13045_13299_14082_14226_16159_16506_18526_18696_20454_20513_20722_20815_40932_41069_41999_42079_54887_54923_87714_87761_88069
888293	contig_7359_pilon	-	4694	12	Intergenic	novelGene_139841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	13.7990297898257	744	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAAAATTTTATAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56643	24716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38169_38256_38433_38651_41421_41667_42170_42373_42568_42677_45586_45717_46226_46270_48345_48444_49058_49085_51535_51580_55321
888294	contig_6847_pilon	-	4622	11	Intergenic	novelGene_143858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1126	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACTAACTCGACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114844	74059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_74106_77514_77955_98670_98756_99886_99982_101149_101274_102053_102183_102631_102748_104093_104159_109787_109889_110422_110608_111608
888295	contig_8377_pilon	+	2352	11	Intergenic	novelGene_35134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_1	1877.73465910389	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	238	1551	183306	197939	FALSE	40	CAAATATTATTTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	180473	198740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
888296	contig_16907_pilon	-	5680	19	Intergenic	novelGene_87436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1064	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	5368	5679	402655	392225	FALSE	10	TCAGCCCACTTCCTCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLFELLVGAIVRVVRRSRRQHERNQAGHEEETLPHVPGPATGSTSGGSLRQTGDRDTAHIRWKRKDPPRSAPQTSFSSRPAYRESSRTRFEAPGSAGSNLRAR	450327	392223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_392525_402643_402776_407730_407863_408679_408768_412266_412436_413546_413682_415759_415850_417769_417880_426485_426636_426747_426835_430395_430550_431718_431919_432788_432892_440618_440756_442409_442542_443748_443826_444588_444679_446373_446426_446986
888297	contig_14219_pilon	-	4649	1	Intergenic	novelGene_54289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1202	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCCCTAAAAGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619523	614874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_614900_619500
888298	contig_3103_pilon	-	3407	1	Intergenic	novelGene_146191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1254	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	1304	1813	72310	71801	NA	50	TAAACAGCCCAACTAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDFPLELPDRELKSLIFRAIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKKLEEFRKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLKIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISQIEDKHLDTTLFEEKSEKRTRKNKETLRIMWDTIKSKNSRVISVPERGRKQKTQNH	73613	70206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_70200_73600
888299	contig_5686_pilon	-	4585	5	Intergenic	novelGene_45450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1212	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTCAGAGCAGTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238133	220275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222914_224040_225307_230543_230751_230874_231139_237923
888300	contig_6361_pilon	-	4419	8	Intergenic	novelGene_23958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5003.98977551607	34	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	40	AATCTTTATGTAATCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	389195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_389346_389643_389883_399435_400556_408702_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
888301	contig_16098_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_46221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCTTTATTGTATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764906	768122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765133_767240
888302	contig_9837_pilon	+	1875	4	Intergenic	novelGene_178307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	1484	1873	332238	332627	FALSE	50	AGAAAATTATAGACCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITK	208353	332629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9837_pilon_+_208777_209665_209678_315726_315991_331453
888303	contig_11417_pilon	-	1271	2	Intergenic	novelGene_103295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502284	494297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_495401_502116
888304	contig_602_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_134955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	799	1134	493995	494330	TRUE	30	TTGTAGGAAAGCATGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFYLLVQGVVPGVLKACKWPSKLQQLVSIHLKQQKKEAVRNRRRKWNVWLIASENSCLLCHENRTGWCLAIITEHFDPRFCRRILIKKGKMQNRISNSHGSQSFWSHGG	493196	590101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_494465_589254
888305	contig_11227_pilon	+	2863	3	Intergenic	novelGene_163192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	769	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTTTGCACTTCTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210323	361421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_213037_354954_355090_361406
888306	contig_15029_pilon	-	3908	6	Intergenic	novelGene_128180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	1919	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	51	626	172327	163104	FALSE	25	AGTATTTTTAGTGTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172377	159821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
888307	scaffold_2602_pilon	+	4533	17	Intergenic	novelGene_127687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_11	473.487179736685	62	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	227	1864	25608	54259	TRUE	10	TACTTTTTTGTTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRLETFFGLIIGTCIRIT	25381	69585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_55579_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
888308	contig_13807_pilon	-	3086	1	Intergenic	novelGene_154568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1004	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGAAGAGAATTAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7544	4458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13807_pilon_-_4500_7500
888309	contig_4213_pilon	+	6700	3	Intergenic	novelGene_124796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	40.5	375	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4268	4633	28237	28602	FALSE	25	GAGGCCTCACACTACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLKGWKKMFPANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEAHYIMIKGSIHQEDISVINIYISNDSAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNVPLSVKDRTSRKKLNKDIEELNATIN	12954	30669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_24170
888310	contig_11396_pilon	-	2074	3	Intergenic	novelGene_71332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	63	junction_2	143	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	794	1249	492260	491454	TRUE	35	GACAGAGCCAGAGGTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPWNHPSPWGKGEKGPGWGESDLALGGSVPHPGVSLPPSPYPVPLASLHCESYRYPCPSHDHHHCPQTLWTLPGALRPGPELEAAWSHVADEDDGGEDLSDKWPLHHPDNPGLIRPLRRSPGGVISAGAGWGDAGSSPPHKTCGMLEEK	493053	477699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_478373_491301_491528_491878
888311	contig_2161_pilon	-	4506	2	Intergenic	novelGene_114971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGAGTACCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065733	1059522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_1060870_1062574
888312	contig_11422_pilon	-	1355	2	Intergenic	novelGene_99054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1791_1921
888313	contig_6477_pilon	-	389	4	Intergenic	novelGene_154172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4875.26562239319	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770634	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769736_769962_770106_770616
888314	contig_4426_pilon	-	3884	6	Intergenic	novelGene_15347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	385.670118106135	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	92	316	171430	25157	TRUE	45	TAATAAATATTTTAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGRDWDARSRARRRPGPEDAEPWLRPSPEQMMAIRELKVCLLGDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERRGSLEGR	171521	6446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6992_7179_10117_25070_25181_97613_97696_110145_110226_171391
888315	contig_15491_pilon	-	2299	6	Intergenic	novelGene_75952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	483.884118358931	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	71	640	46982	32425	FALSE	40	ATTAAAGTTGCTTATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELGFLALRLRNHGSGKMVQSSLQTCFK	47052	30765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37508_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
888316	contig_383_pilon	-	2056	2	Intergenic	novelGene_126128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	492	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	991	1371	141042	140605	FALSE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEKFMNSSRTLSDREPEDEPLRLEGTKNMTREELPPQSRVNLNDVDGVKLLGPSFADVAQLKMRKNSCKLVKNEIECINIDILGISELKWTVIGHFELDNHMVYHAGNDTLERNGVTFIVKKNI	142032	139919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_140772_140828
888317	contig_11872_pilon	-	2806	2	Intergenic	novelGene_143152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	224	400	84757	84581	TRUE	15	TGTGTATCAATTTGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLTFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICNKMKQDPYFTPYTKTNSKWIKHLNVKPKTIKFIEEKIGQTLHALIHGINRIQTITTVLVI	84980	82117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_82519_82575
888318	scaffold_2602_pilon	+	3948	17	Intergenic	novelGene_127686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.902274470886	540	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	248	2305	37326	68818	FALSE	25	AACCTGGATTCTAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRLETFFGLIIGTCIRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	25322	70461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25445_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54250_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
888319	contig_17440_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_7547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_800_3000
888321	contig_10078_pilon	-	3501	2	Intergenic	novelGene_160001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1837	2151	169606	169292	FALSE	15	GCCTTTGCTTTGATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRISGSGDKHLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNL	171698	167941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_170991_171246
888322	contig_20365_pilon	+	2322	4	Intergenic	novelGene_85318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_3	41.4755617469158	709	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	60	1136	9641	15104	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPVQQPPQPADGKRKGKAQYVQAKRARRCDAGGPRQLEPGLQGILITCNMNERKCVEEAYSLLNEYGDDMYGPEKFTDKNQQPSGDEGEDDDVEAALKKEVDDIRAFTEMRLRRFQSVESGANNVVFIRTLGIEPEKLVHHILQDMYKTKKKKTRVILRMLPISGTCKAFIEDMKKYAETFLEPWFKAPNKGTFQIVYKSRNNSHMNREEVIKELAGVVGSLNSENKVDLTNPQYTVVVEIIKAVCCLSVVKDYMLFRKYNLQEVVKSAKDLSQLNPKQAAPVGNGREAKLESGDKSSQSDPAEGKCNQEEVPGNSEEVKQTKPMSETQVVNEGGSKPELGSQVPKEPKSNENDLA	9581	16290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_9872_12098_12274_13272_13522_14682
888323	contig_3095_pilon	+	1157	5	Intergenic	novelGene_75128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	22	747	147280	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147258	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
888324	contig_16098_pilon	+	2368	17	Intergenic	novelGene_45841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	64	468	201479	202163	TRUE	55	AAAGGAAAACAGAGACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEAEKSVGCLRLLLAVATTAHVSLIFAVAILLISEVATIGTLLVVKDSLIILHQAAQLLSQLQRQVLLGSGLSAMHHHCLCWLVQGGHQLLINDHLANDGVHSGQVQLKHVRQCLHADGVIDTAVGEEVGPK	201415	227348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_201585_201675_201836_201935_202025_202113_202179_202271_202430_204666_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215394_215519_215659_226329_226377_226745_226860_226987_227044_227224
888325	contig_9471_pilon	-	2618	7	Intergenic	novelGene_21810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417514	411954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414934_415628_415714_416192_416271_416934_417026_417150
888326	contig_5649_pilon	+	6044	3	Intergenic	novelGene_82399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1853	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1601	2080	1501980	1502459	TRUE	40	ACAGGGAATCAGAGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVQVGVQNKTPDDFPVEENALELSDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDEFMENTDKKLEDFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKTNNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIKDKHLATTLFQENSEKRKTKRP	1196319	1506674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1197119_1501178_1504741_1504991
888327	contig_614_pilon	-	2403	3	Intergenic	novelGene_132650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_2	40.5	308	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	1959	2402	1030805	1027649	FALSE	20	TGAGACTGATGCCCAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITKRLEFIMRNLFSTSYPEGFGLEPKPRMTPYHQVFLSPNEEVRGKRGENVPSLSDVQHNIQRMVRTLWQQLVAQRRQALEDAFKIDLSVKPGESEVKIEEVTPLWEETMLKAWQHYLVSEKKMLASRSNVTHHSKVTSWSGSLSSA	1032763	1027647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1027735_1028986_1029173_1030633
888328	contig_5770_pilon	-	1382	2	Intergenic	novelGene_74165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	585	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGTTCTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256580	254292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_255058_255963
888329	contig_10331_pilon	+	1620	15	Intergenic	novelGene_54127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	322.894940897411	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	309	1475	410802	544992	TRUE	55	GATCAAAGAAATAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKK	409489	545860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544997_545719
888330	contig_2726_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_165889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATCTCACTGCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165206	163944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_163900_165200
888332	contig_5586_pilon	+	2232	14	Intergenic	novelGene_143498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_4	315.83525028952	1222	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	170	1774	368997	430164	FALSE	25	TCAATCAGGACAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVQCKDKEATKLTEERDCSLNQSSGYRYGTDPTPQHYPSFGVTSIPNYNNFHAAGGQGLTVFGGVNSSSHTGTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	197282	430622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_197331_224687_224728_298146_298217_368985_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
888333	contig_6445_pilon	-	1221	11	Intergenic	novelGene_76916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	662.823694507069	3	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	578	991	64152	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96374	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64893_80519_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
888334	contig_7050_pilon	-	801	7	Intergenic	novelGene_153615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	150.643803575041	1625	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	111	638	677188	585724	FALSE	15	TTGCTTTTCATTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGGVAPAGEGLRYAEYSPPSARRPDADIDPGLARSLIAVGLGVAAFAFAGRYAFQIWKPLEQVITETAKKISNPSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGEQRPIVPWMAAWKLLRPQTLCNELGGGSPYLATKINEAKDLLESSTKH	677298	585560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_595561_595640_631905_631977_637860_637938_651778_651853_654330_654383_677083
888335	contig_15732_pilon	+	3224	17	Intergenic	novelGene_88831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	147	junction_14	227.23974639959	919	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	172	2493	11208	398257	TRUE	20	AATTCTTCTGGTTACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYNKLTIVHHPGGNETSQNENILYSTPFGNKLPTRPQVEKEFGFSSRKDY	11036	399246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_393845_395326_395383_398197_398263_398520
888336	contig_6361_pilon	-	5133	11	Intergenic	novelGene_23911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4796.70876747797	87	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	25	CTCTTTCCTTTCCATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	200603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_200726_201406_201959_202211_203587_306316_306324_339805_339869_380368_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
888337	contig_14876_pilon	-	2118	4	Intergenic	novelGene_170239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCGGAAAAGGGCTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54520	38601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_39043_45400_45647_51659_52725_54154
888338	contig_4486_pilon	+	6396	12	Intergenic	novelGene_38580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1304.30074359868	2032	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	141	1217	343083	407797	TRUE	35	TTGGGGCAAAACTCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAEVISLTFPSLGILPILDTVFLFKIINIISNKIHR	311767	414083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_411318_412424
888339	contig_7428_pilon	-	695	3	Intergenic	novelGene_77752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	404	66	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	26	514	515511	514339	FALSE	30	TATATGTAAATTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSVVAAISHGRVFRRLGLGPESRIHLLRNLLTGLVRHERIEALIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515536	514157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515026_515379
888340	contig_2867_pilon	+	1508	2	Intergenic	novelGene_135192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844034	854265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_844616_853338
888341	contig_10990_pilon	-	2348	15	Intergenic	novelGene_7498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	944	1366	744373	743951	TRUE	20	CTTCCTGCCATAAGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	752170	723585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_743881_744386_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
888342	contig_9696_pilon	-	1671	11	Intergenic	novelGene_68809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	303.795803130985	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	261	1631	440408	378236	FALSE	35	GACACCAAAGGTCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRAEAVAAPLAQYLGSGRSEVGSGGSRAASVTQKAADVRPARGPAHAAAERCPPYRLSFPSNFDREAGPTRAAESPGEPAGGLEMPLLHRKPFVRQKPPPDLRPDEEVFYCKVTNEIFRHYDDFFERTILCNSLVWSCAVTGRPGLTYQEALESEKKARQNLQSFPEPLIIPVLYLTNLTHRSRLHEICDDIFAYVKDRYFVEETVEVIRNNGARLQCRILEVLPPSHQNGFANGHVSNVDGETIIISDSDDSETQNSSFQNGKKKDAVDPLLFKYKVQPTKKELYESAIVKATQISRRKHLFSRDKLKLFLKQHCEPQDGVIKIKASSLSTYKIEEQDFSYFFPDDPPTFIFSPASRRRGRPPKRIPVSQESIANKQTATGYRNKTTKERDKLLKQEEMKSLASEKAKLKREKADALEAKKREKEDKEKKREELKKIVEEERLKKKEEKERLKIEREKEREKLREEKRKYMEHLKQWSKPREDMECDDLKELPEPTPVKTRLPPEIFGDALMVLEFLHAFGELFDLQDEFPEGVTLGDS	440668	378195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_378247_379621_379761_380486_380583_382568_382736_383329_383427_385912_386048_396444_396533_399959_400062_410407_410552_429657_429937_440295
888344	contig_5302_pilon	+	1496	7	Intergenic	novelGene_81389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1326.87671075935	4159	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	106	492	155422	168411	TRUE	15	CTCGTGGTATGTCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSIKLQSSDGEIFEVDVEIAKQSVTIKTMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILNTVSNDRRIHILFKCILPRQTMF	152083	170747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152189_155421_155519_161142_161217_167388_167533_168339_168546_169186_169328_170018
888345	contig_16303_pilon	+	3366	1	Intergenic	novelGene_34047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	465	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAGTAGCTATAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32077	35443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_32100_35400
888346	contig_10861_pilon	-	2364	6	Intergenic	novelGene_39263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	686	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTCGCGAGACTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350236	1337585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1337766_1339481_1339589_1343175_1343280_1344610_1344774_1345017_1345070_1348478
888347	contig_13224_pilon	-	7995	24	Intergenic	novelGene_104087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.203931119992323	436	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2752	3066	255950	255636	TRUE	45	AGGGTAAGACAGTACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDMSGRGHLHLDNIPSSQSNTPSFQCKASAAPITQMGAPGEGISGPVQFSPAVVVIGYAACSPRVSSFMRLKNPRTVADYQEAPKSRAEGPSSLVAPLGEVLP	258701	211396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_211768_217730_217932_218812_218885_219632_219815_222441_222658_227333_227457_228920_229023_231290_231447_233550_233687_236325_236414_237803_237869_238601_238713_239984_240077_240977_241095_242343_242436_245179_245318_246691_246823_247556_247693_247889_247992_249056_249165_250727_250851_251507_251615_253630_254430_254474
888348	contig_11720_pilon	+	1309	10	Intergenic	novelGene_43830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	77	877	68064	98324	FALSE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYTFSSR	67987	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98306
888349	contig_5711_pilon	+	4871	5	Intergenic	novelGene_80300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1632	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3597	4010	692641	693054	TRUE	45	GAAGTAGTATATAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKEKRRNRKQNKLKKKKKNKKGPQKKRKKFKKQRKKKCPQGSLCMSLEAEGEFLAVQLRLAKKGSQLKRRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAQTGKQLHSRMELRSPSGRSKDGTRSQALERKEGEVARGK	632069	838074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_633887_635124_635333_691069_693609_781370_781653_838049
888350	contig_5718_pilon	-	4501	2	Intergenic	novelGene_110413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTGTTGTAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448866	1442337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1442862_1444889
888351	contig_8866_pilon	+	11997	1	Intergenic	novelGene_77817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1342	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2539	2973	561196	561630	NA	25	TTGCTAAAGTCTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPMWPETTPLQFPLEGRLQKEFELMSSLISCPVKSLVPQTFESIYFLLGVSICIFFGIQTPRSLGLKQVITQSPVRVSPWERACHDQGLRLKEGKMACLMARIHIHLHSPQLLSASNALLHSHQEVPSGPCSLCPFSGEEIQL	558657	570654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558700_570700
888352	contig_15118_pilon	+	3327	3	Intergenic	novelGene_74577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	538	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2948	3256	375682	376398	FALSE	10	CTCTGACTGCATGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMLVADLRKVVPVHTALMEKKFLLHWFTGHICSPLALHEKMPRVLILLISETLQISMPGKISTFSLISHASDILRGPCSDSGAQESAQHCETGCGDLVFLL	371676	376469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_371770_372827_375876_376283
888353	contig_1452_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_115147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
888354	contig_13004_pilon	+	1991	6	Intergenic	novelGene_112697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	349.600572081912	220	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	275	979	898142	928299	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQQPLWEPVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837744	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_898039_898169_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
888355	contig_7728_pilon	+	2298	2	Intergenic	novelGene_64726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAAAAAATTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752331	754670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752409_752449
888356	contig_7056_pilon	+	3747	15	Intergenic	novelGene_43662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	632	junction_1	490.379991143894	70	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	176	1957	798314	810882	FALSE	40	CAAGACCTGAAAATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVWWGSLARRQQGWPRPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781756	812672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828
888357	contig_7963_pilon	+	2485	9	Intergenic	novelGene_58560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_7	115.506493323969	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	598	2085	247659	253116	FALSE	15	TACAGTGGTTTCTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	247061	253516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
888358	contig_5958_pilon	+	4452	7	Intergenic	novelGene_140075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	136	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1	753	4596	7554	TRUE	35	CTGAGGTAGAATATCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTKVPFQLTQRGSTILDSYRRPANGVRESSLTEHPEGDKTAGNLRCALSHPPLLLAPAGAPLLPVSKVSWLGAPGGWIPCARAAALWGPFVGCWCCLFCFFWFLACLSLPPLRLLRCLAPSAVFALSCGAVGAALGCAAPSGSGLLRGRGTGAFVRLLICFPGPRALGSKLQAAWIPASGRAAPWVPLVGCRCCFFFFFFSSLFLFLLLLILACRRCLPPLLAQVPDSESCLGPFLRGCGATFGRTDCL	4595	202087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_4606_6811_8119_141361_141934_144393_144843_164302_164371_198438_199046_200648
888359	contig_4364_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532768	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
888360	contig_15787_pilon	+	2283	1	Intergenic	novelGene_143971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	632	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCTGAAGCCCACATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60104	62387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_60100_62400
888361	contig_15498_pilon	-	2787	13	Intergenic	novelGene_42688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_12	241.632066488609	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	188	1849	829154	785428	FALSE	5	TCTGTGGATTTTTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	837294	784489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058_829255_837207
888362	contig_9753_pilon	-	1987	6	Intergenic	novelGene_41320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	54	junction_2	352.348350357994	749	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	105	482	93294	70791	TRUE	50	GAGTGGAAAAATATAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQVPKSVLFVCLGNICRSPIAEAVFRKLVADQNLLDKWRIDSAATSTYEIGNPPDYRGQNCMKKHGIPMNHIARQVTREDFATFDYILCMDESNLRFLLIDCPEIYFTGEDVIIFWLKGVYCV	93398	69122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9753_pilon_-_70290_70452_70876_73254_73317_85980_86095_86172_86247_93251
888363	contig_9177_pilon	-	5803	40	Intergenic	novelGene_32603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	972.416890438455	80	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	2114	4405	16609	9832	TRUE	10	CCTGTAACCTCTGCCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNAAAQNAIKKKLVQRLEHTAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKCAQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENPVQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGEAIATASKALCGFTEAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAKHTSALCNSCRLASARTANPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRAATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARALAVNPRDPPTLVSASWPLPYCLGLHQEAYYKHEGQGSRAAGV	25003	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2743_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931
888364	contig_3956_pilon	+	2851	14	Intergenic	novelGene_15025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1144.81363047472	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	230	2329	1284132	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282814_1284101_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
888365	contig_3373_pilon	-	5791	5	Intergenic	novelGene_178546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTAATAAAAAGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181910	105291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3373_pilon_-_105407_105738_108325_108730_109157_126578_127312_179979
888366	contig_6599_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_175984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCGGCCGCCGCCGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	262055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262100_262700
888368	contig_8467_pilon	+	3906	2	Intergenic	novelGene_178547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2461	2937	91056	91532	FALSE	75	AAATAAAAGGAAAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTVKREIDSSTILVGDINTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDQKGTVSQLDLIDIHRTLLPTTARYKFFSNEHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTAWKLNNTLLTHQ	47058	92501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8467_pilon_+_49208_90744
888369	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888370	contig_7457_pilon	+	3527	9	Intergenic	novelGene_31644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_3	68.0385919901345	62	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	129	998	1005828	1013285	TRUE	80	AAAATTAAAAAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYR	1001550	1016699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1014498_1015382
888371	contig_6102_pilon	+	1479	8	Intergenic	novelGene_32333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	875	1372	1688502	1689412	FALSE	20	TCATGGTCTGACTGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSRTKLGTVFLSRWHSDSNWQPNTWSRSRPRSCRLCKGGLFAISLFSLLRTRFCSVPSGHRPGASTTAEPEQRLEQGLCLLFFLILPGTQLPQFRRPRARQTQLQGVLSILDPDGRGGPGRWKGETREICTPSSKQGDPNGLLGSHLSPTPRLYPDTRLPTPAL	1685171	1689519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1685652_1687189_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688302_1688478_1688581_1688896_1689007_1689103
888372	contig_6364_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_51753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCAAAGCTCCCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613940	615707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_613900_615700
888373	contig_11548_pilon	-	1100	3	Intergenic	novelGene_66787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGTTTCCACAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120481	119065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_119121_119346_119399_119488
888374	contig_14882_pilon	-	5513	2	Intergenic	novelGene_114984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2054	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTAAAGTTGTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51616	45977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_50237_50362
888375	contig_7919_pilon	-	4090	5	Intergenic	novelGene_28051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	668	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGGCGACGTCTCACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978234	972468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_972721_973856_974055_974360_974445_974589_977930_978018
888376	contig_14666_pilon	+	1600	5	Intergenic	novelGene_39565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	120	1298	477340	484940	FALSE	45	AAAAAAAATGTCTTGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	485242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484009_484185
888378	contig_854_pilon	+	2268	2	Intergenic	novelGene_36364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGACCCAGGGGCCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974691	977255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975017_975312
888379	contig_2036_pilon	+	3869	3	Intergenic	novelGene_131796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGTGTGCCTCTTAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102463	335592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_104592_266208_267026_334668
888380	contig_9297_pilon	+	2345	9	Intergenic	novelGene_69867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	321.87953880295	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	153	2117	909195	912790	FALSE	15	CAATGGGTTGGGAGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908959	913018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
888381	scaffold_13505_pilon	-	2830	1	Intergenic	novelGene_111620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTCTTTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673104	670274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_670300_673100
888382	contig_14357_pilon	+	5506	2	Intergenic	novelGene_121686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	127	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	5094	5504	648938	649348	FALSE	50	CACCAAAACAATACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKIGIEGKILSIIKGIYTKQTANIILNGETLKAFPLRTETRQGCPLPPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKCIQIGREEVKVSLFVDDMGLYIEKPKESTRKLLELIEDFSKVSGYMINIQKSVGFLYTNKENLEEE	572279	649350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_575848_647412
888383	contig_10297_pilon	+	2103	2	Intergenic	novelGene_112558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGAGTGTGCTTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686761	692684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_687825_691644
888384	contig_10404_pilon	+	1235	7	Intergenic	novelGene_138667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2582.44047473617	3999	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	278	619	1098040	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085382	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1093001_1093106_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
888385	contig_3747_pilon	+	2497	7	Intergenic	novelGene_24851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4393.17446601986	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	362	1102	202422	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200989	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201336_202406_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
888386	contig_4305_pilon	+	3761	12	Intergenic	novelGene_136658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	379.976032301995	3888	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	20	1339	490540	504013	TRUE	20	CTTCTCCAGTACGTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAAINMSVPSALMKQPPIQSTAGAVPVRNEKGEISMEKVKVKRYVSGKRPDYAPMESSDEEDEEFQFIKKAKEQEAEPEEQEEDSSSDPRLRRLQNRISEDVEERLARHRKIVEPEVVGESDSEVEGDAWRMEREDSSEEEEEEIDDEEIERRRGMMRQRAQERKNEEMEVMEVEDEGRSGEESESESEYEEYTDSEDEMEPRLKPVFIRKKDRVTVQEREAEALKQKELEQEAKRMAEERRKYTLKIVEEETKKELEENKRSLAALDALNTDDENDEEEYEAWKVRELKRIKRDREDREALEKEKAEIERMRNLTEEERRAELRANGKVITNKAVKGKYKFLQKYYHRGAFFMDEDEEVYKRDFSAPTLEDHFNKTILPKVMQVKNFGRSGRTKYTHLVDQDTTSFDSAWGQESAQNTKFFKQKAAGVRDVFERPSAKKRKTT	490520	507254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_490619_496273_496494_498155_498286_498553_498742_499264_499374_499476_499638_501232_501393_503641_503732_503830_505919_506055_506110_506434_506489_506845
888387	SIRV6	+	1154	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	372	2	122	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	ATGTGGAAAAACATGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
888388	contig_13592_pilon	+	3378	7	Intergenic	novelGene_33724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1447	junction_4	270.403813253849	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	1287	2195	266585	269322	FALSE	10	TGTTGTTTGTGTACTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	265047	270505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
888389	contig_11978_pilon	-	2812	14	Intergenic	novelGene_62942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	124.073417853106	13	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	76	1602	988620	978504	FALSE	0	CTTGGCCTTCTGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLLATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPNQLKPLVIQAMPTLIELMKDPSVVVRDTTAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLMQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFSSLAEAAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSAAYESLMEIVKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNILPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELREGCLEAYTVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA	990305	977293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_978505_979252_979415_980040_980150_980880_980945_981061_981206_981761_981870_982383_982467_983632_983778_985165_985238_985568_985717_986641_986773_987382_987575_988452_988678_990287
888390	contig_5988_pilon	-	1900	2	Intergenic	novelGene_15951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	830	1726	652858	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786799	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_786054
888391	contig_1759_pilon	+	2284	1	Intergenic	novelGene_171338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	338	736	75941	76339	NA	15	ATTGTCTTCTTGCCTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCYDPFYFIWICCNATHFISYLGYLHPLLFLFQQSGQWFVDFVDSFKPSPFRMMLAVGFVQMPLIMLRNFPSIPILLRVFILNGCWTLSKASSASIDKIMWFLSFYLCDGLYYIDCFLMLNHPCITGINPT	75603	77887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_75600_77900
888392	contig_18804_pilon	+	3276	13	Intergenic	novelGene_163792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.0239088518335	411	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	2184	3089	13328	24722	FALSE	5	TCTATTTCTGTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKWKNKERILIFSSRGINFRTRHLMQDLRMLMPHSKADTKMDRKDKLFVINEVCEMKNCNKCIYFEAKKKQDLYMWLSNSPHGPSAKFLVQNIHTLAELKMTGNCLKGSRPLLSFDPAFDELPHYALLKELLIQIFCTPRYHPKSQPFVDHVFTFTILDNRIWFRNFQIIEEDAALVEIGPRFVLNLIKIFQGSFGGPTLYENPHYQSPNMHRRIIRSITAAKYKEKQQVKDVQKLRKKEPKTILPHDPTADVFVIPAEEKPIEIEWVKPEPKVDLKARKKRIYKRQRKMKQKVNSGNAK	7488	24909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_7749_9512_9622_11035_11294_11771_13331_14602_14715_17739_17784_20348_20420_20696_20747_20842_20917_21080_21132_21273_21376_24074_24204_24452
888393	contig_1719_pilon	-	855	4	Intergenic	novelGene_87365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	244.439949453621	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGTTTCAGTTCGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803655	754677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_786510_786598_787980_788288_803536
888394	contig_5316_pilon	+	2430	11	Intergenic	novelGene_61198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	341.271167841645	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	437	1834	453918	550408	FALSE	60	AAAAAAAAAAATGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	389309	551004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_389510_391212_391310_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
888395	contig_4103_pilon	+	3170	3	Intergenic	novelGene_51950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98	199	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	105	1232	104499	105711	TRUE	35	CAGTCGCAAAATCGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSPSLLLLLLLPPQLAASEATPEPCELDDEDYRCACNFTDPQPDWSSGIQCMVAVEVEIRAGGHSLDKYLKHADPDSQQYADMIKALRLRRLTVGAARVPARLLFAVLRALGYSRLKELTLEDLEVTGTYPPQPLEATGPALSTLRLRNVSWATGGAWLAELQKWLKPNLKVLSIAQTHPLALSCEQFRTFPTLTTLDLSDNPGLGERGLAAALCPHKFPALQDLGLRNTGMETPNGVCAVLAAAAVQPHRLDLSQNALRATANPGGPRCVWPSTLSSLNLSFAGLEQVPNGLPAKLSVLDLSCNRLIRAPRPDELPQMENLILDGNPFRDLGDPKPQQDTMNSSVPLACVHSLLAIGISGTLALLQGVRGFV	104394	133058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_104502_104586_107550_132958
888396	contig_15114_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_121140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	653	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118944	120467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_118900_120500
888397	contig_5302_pilon	+	1292	6	Intergenic	novelGene_81397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1309.89532406219	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	67	513	155422	170068	FALSE	40	AAACCCAGACAGCATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSIKLQSSDGEIFEVDVEIAKQSVTIKTMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDDPPPPEDDENKEKRTDDIPVWDQEFLKVDQGTLFELILAANYLDIKGLLDVTCKTVANMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTEA	152122	170847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152189_155421_155519_161142_161217_167388_167533_169186_169314_170063
888398	contig_3153_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_104649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAGGAACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108920	110844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_108900_110800
888399	contig_366_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_51568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCATAAGAGTTCCCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750120	748025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_748000_750100
888400	contig_9161_pilon	+	7873	7	Intergenic	novelGene_160632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	529.998663520327	1580	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1109	1798	52934	63414	TRUE	35	CGGAAGGAAGCCCACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQTPKNKATVFKLCSICLYLPQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	51825	94044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_53063_54664_54842_56680_56804_60940_61076_63288_69167_72202_72397_93915
888401	contig_4486_pilon	+	3298	1	Intergenic	novelGene_38555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATCCTTTTAGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148469	151767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_148500_151800
888402	contig_16999_pilon	-	2297	5	Intergenic	novelGene_84962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCGGTGGGACGGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132905	50605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_50803_73923_74017_81567_81684_111466_111667_131214
888403	contig_10134_pilon	-	2480	5	Intergenic	novelGene_16199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.3181051518725	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39711	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33627_34922_35178_37632_37774_38558_39070_39584
888404	contig_16121_pilon	+	2842	4	Intergenic	novelGene_6880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	922	junction_3	148.155323900291	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	910	2316	57746	62826	FALSE	5	GCTCCTTGATTTTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	56836	63352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_58202_58867_59396_60693_60856_62565
888405	contig_7057_pilon	+	830	10	Intergenic	novelGene_123332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	661.517242200379	2070	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	146	616	938907	943233	FALSE	30	TCAGCCTCAGCACACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	937171	943447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
888406	contig_5696_pilon	+	5130	16	Intergenic	novelGene_117556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	609.43491494626	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	1185	3728	715128	738140	TRUE	45	ACTAAAACATTAATGGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFADTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	689685	739587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_715054_715097_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_734430_734596_737775_738712_738756
888407	contig_14970_pilon	-	7150	3	Intergenic	novelGene_45148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	102	110	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3312	3626	303700	303386	FALSE	25	TACTTTACATGCATTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEWSSKDTVTVLARWQYLAFNNVFQEAVYSLNQHAIYGAVSPIARIHGSRNQGVEMGVAPLTITPSDPLAKFLCPVPTSHTITTVIVIPSLYVCIKYFCFLHL	315713	299861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_306783_311919_312047_315611
888408	contig_19402_pilon	+	5180	16	Intergenic	novelGene_80781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_14	1509.24960604048	243	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	624	2255	29462	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23464	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_142957_143063_143802
888409	contig_9841_pilon	+	1503	4	Intergenic	novelGene_177938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_3	208.301597582821	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	653	1162	2768	6126	FALSE	30	TCCCCAGATGGTAAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAELKTFADRPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKMSLEFLC	2115	6467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9841_pilon_+_3000_3396_3541_5879_5990_6102
888410	contig_2125_pilon	+	5526	17	Intergenic	novelGene_147726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1300.67984477109	2217	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	112	2472	648096	682094	FALSE	20	ATTGGCCGGTGTAGCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARHPGGRASSREKQKPEPRSSRPEPTAPGTGRRAEKMNLQLIFWIGLISSVCYVFGQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNLTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCHPDDIENPRGSKDVKKNKNVTNHITQIQPQQLILQLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMKRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTDRGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGRCHLENDVYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENSKLPEGVTINYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVHFEISITSNKCPNKNSETIKIKPLGFTEEVEIILQFICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGEVCGGNGVCKCRVCECKPNYTGSACDCSLDTSSCMAKNGQICNGRGICECGTCKCTDPKFQGPTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDTCAHECSHFNLTKVENRDKLPQPGQVDPLSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEAIVHVVETPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK	611055	685148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_611167_648095_648163_649057_649144_651017_651157_651192_651241_657754_657926_658819_659059_664111_664268_665027_665124_669318_669409_671196_671338_671477_671678_673117_673357_673579_673803_674513_674747_676390_676558_682028
888411	contig_12886_pilon	+	4294	2	Intergenic	novelGene_135536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2046	2537	881241	881732	TRUE	45	AAAAATATCTAAGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSASSSTGRPCGVLFWTPTGTILSCVCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFTDCRFACFILLFYLVMSEQVGCAFFVVCLSVGTILFTSFSNRQGQSLRYGTAGQVQLKGSFWNRLFVARTRADSADWQSVQGRFQ	879195	883577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_881957_882044
888412	contig_11427_pilon	-	4136	8	Intergenic	novelGene_78991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	85.9662961958502	462	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640310	588953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_592615_597237_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_640241
888413	SIRV6	+	1197	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-92	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	38	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	160	645	1733	10736	TRUE	30	TTTAGAAAACCATTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVKIVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2011_2460_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
888414	contig_3270_pilon	-	6034	34	Intergenic	novelGene_104458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_19	279.386695495392	295	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1157	3474	2280	5753	133171	92759	TRUE	65	AATCAAACAATATAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPASGEDTRWERESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNSNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESMIKEREDLKSLYDSLVKDHEKLELLHERQASEFESLIAKHGTLKFAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAEEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSMIALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTGNSSTGFRSKQLVKNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGQTSTGNSNNNASLHEVKAGAVTSQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKTREALDSRAHHKIRTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQDNLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGRTPGDFCDRRTTKPEQFVRPGSRMTEDTHFTGPPGKSTAGTQGRIKSVKETSLPRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDGRPPASVDSAAATADSGVHAAPNVDKVQESRISKSRSREPQSS	299804	89262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_89509_92723_92824_96704_97168_97364_97634_99787_99869_100976_101049_101651_101856_102844_102929_106359_106575_106714_106808_110361_110508_115231_115419_117395_117540_117767_118046_118971_119134_121338_121504_127796_127939_130712_130841_132595_133667_135019_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492_209594_298477_298583_299719
888415	contig_6365_pilon	-	1000	5	Intergenic	novelGene_134009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	775.304133872637	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	216	581	50867	47435	FALSE	50	GCAATAATGAAAACTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEYKKIILLEELCVINDYSFKILKNFLAHDLQLTRKMEEEYDRIKIVDLMEEKFQGAAYRMLKRAKLKVAKDIEEKRTLIKSSKQDRTGPAMSTFTTQEGQEESERGPASTPVNENTAV	56712	47015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_47492_49511_49610_50656_50888_56431_56501_56586
888416	contig_11337_pilon	+	2513	11	Intergenic	novelGene_107163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	215.357586353488	115	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	276	1769	127468	172617	TRUE	5	TTAGTTGTGCCTTTTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102501	173408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102763_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509_173227_173273
888417	contig_10134_pilon	+	1707	3	Intergenic	novelGene_16185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	962	1444	30341	38820	FALSE	35	TAGCATCACATTGTAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRVDASKHFSALALVVCLWDGEVGIFTKKLLGFSILVERDLVQKPVLPAVAPQHNGLPLLKHQVRGLEQQPIGKHVQLHRVAEAGLACLAPVLPAAAGSGVKAVAGLDLSWDGDPSVEPLDGVVPRGVGPVALQSHIVPLEHIDPWGFKVHHCLREIC	29379	39083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_+_30389_35004_35178_38558
888418	contig_3426_pilon	+	2969	1	Intergenic	novelGene_57933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	244	657	317724	318137	NA	25	TTCTCTATCAGCCCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDMPFDPEIPLLGIHPKEIRVVTRTEICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWRNKVWYIHKMEYYATRKNNDDSVKHFITWMKLEDIMLSEVNQSQKDKYCMRALL	317480	320449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_317500_320400
888419	contig_10106_pilon	+	4465	2	Intergenic	novelGene_73872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1127	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAGTTTCAGTTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132462	177361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132569_173002
888420	contig_9272_pilon	+	4034	10	Intergenic	novelGene_125879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	146.023167449891	1453	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	621	2525	251187	279961	FALSE	30	AGATGGAGATGTCTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIVEDGGQTQYEATLQQGFQYQPTTEDLPPLTNGYPSSISMYETQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGSADRGVQGSVRFSDSSVSAAVEETVD	214931	281470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_215475_251109_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_279878
888421	contig_5331_pilon	+	2369	17	Intergenic	novelGene_112816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	368.623617113378	760	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	10	1437	711291	739211	TRUE	15	CAGTCATCCTGCTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGSAGERGGFNKPGGPMDEGPDLDLGPPVDPDEDSDNSAIYVQGLNDSVTLDDLTDFFKQCGVVKMNKRTGQPMIHIYLDKETGKPKGDATVSYEDPPTAKAAVEWFDGKDFQGSKLKVSLARKKPPMNSMRGGMPPREGRGMPPPLRGGIY	711281	741804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_733571_733610_734135_734169_734490_734610_737891_738022_739077_739254_739978_740114_740548_740647_740986_741240_741400
888422	contig_14522_pilon	-	2386	5	Intergenic	novelGene_147307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	256.746348562156	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	127	606	175672	66449	FALSE	15	CCAGGTAGTGGCTGTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSERAGCRQRPCGEQASGKTQPTFLTQPAESSFVFFLGSAPMPGPTQTLSPNGENNNDIIQDNGTIIPFRKHTVRGERSYSWGMAVNVYSTSITQETMSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHEGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	175798	64668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_79031_119007_119073_146750_146879_175553
888423	contig_14525_pilon	-	3679	18	Intergenic	novelGene_149749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.491389373094	4	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	1508	2512	141872	127683	FALSE	30	CATATCTACTGAAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIEAEQCRKISSSLQSQSPEHLLPVLIQAAQLCREKQHIKAIELLQEFSDQHPENAAEIKLTMAQLKISQGNISKACLILRSIEELKHKPGMVSALVTMYSHEEDIDSAIEVFTQAIHWYQNHQPKSSAHLSLIREAANFKLKYGRKKEAISDLEQLWKQNPKDIHTLAQLISAYSLVDPEKAKALSKHLPSSDSMSLKVDVEALENSPGATYVRKKGGKVAGDNQTKEQGSQGDLKKKKKKKKGKLPKNYDPKVTPDPERWLPMRERSYYRGRKKGKKKDQIGKGTQGATAGASSELDASKTVSSPPTSPRAPATKKKQQQKKKKGGKGGW	155744	126515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127748_127819_127861_128434_128595_132105_132147_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137069_138539_138605_140186_140260_141223_141353_141857_142375_145157_145216_145303_145429_148399_148536_148614_148759_153473_153598_155326
888424	contig_13224_pilon	-	7933	26	Intergenic	novelGene_104082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.195959179422654	2234	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2752	3066	255950	255636	TRUE	65	GGAAGAAAAAAAAGGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDMSGRGHLHLDNIPSSQSNTPSFQCKASAAPITQMGAPGEGISGPVQFSPAVVVIGYAACSPRVSSFMRLKNPRTVADYQEAPKSRAEGPSSLVAPLGEVLP	258701	200740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_200775_204793_204884_211547_211768_217730_217932_218812_218884_219632_219815_222441_222658_227333_227457_228920_229023_231290_231447_233550_233687_236325_236414_237803_237869_238601_238713_239984_240077_240977_241095_242343_242436_245179_245318_246691_246823_247556_247693_247889_247992_249056_249165_250727_250851_251507_251615_253630_254759_254837
888425	contig_2903_pilon	+	5514	8	Intergenic	novelGene_148986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	315.128415677398	107	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	157	591	221148	238492	TRUE	25	TATTTTGTGTGACAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKGKGGKNRRRGKNENESEKRELVFKEDGQEYAQVIKMLGNGRLEAMCFDGVKRLCHIRGKLRKKVWINTSDIILVGLRDYQDNKADVILKYNADEARSLKAYGELPEHAKINETDTFGPGDDDEIQFDDIGDDDEDIDDI	220991	243456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_221164_228693_228778_231689_231794_233695_233747_235105_235188_236334_236427_238486_239877_239917
888426	contig_9415_pilon	+	7149	28	Intergenic	novelGene_109714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	977	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTTTGTCTTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438139	477367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_441208_441719_441839_444542_444593_446109_446273_446893_446971_447787_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453357_454140_454214_454332_454413_455170_455312_456369_456514_460019_460255_462549_462678_464335_464475_464747_464874_466631_466800_467517_467618_469493_469885_470544_470841_471349_471474_473863_474020_474605_474875_475040_475194_476568_476658_477067
888427	contig_10990_pilon	-	4517	2	Intergenic	novelGene_7469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2664	3152	710709	710221	FALSE	15	CCGGCGAGGGCAGCAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	713629	708855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_711833_712089
888428	contig_7695_pilon	+	1983	15	Intergenic	novelGene_41665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	919	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1364	1807	905926	907373	TRUE	5	TGGCGGCTCTCCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQELGVLRCHIVHLHNVGPSHQLLELCHREAVHSAQFLLGQLGGLWLLFLLVVTAIIITVLVLFLKALLLGGHGILQFVEFLWLLFLFLLHIIGELESLKNPLEEDEVGLINFRLFSHILNFNISSWGVRATRPCCVFLSVPRAFR	896349	908139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_896566_896931_897114_897215_897320_901340_901445_901532_901674_901959_902068_903699_903809_903914_904004_904634_904788_905768_905995_906230_906311_906493_906633_907217_907436_907866_907959_908117
888429	contig_11337_pilon	+	4245	12	Intergenic	novelGene_107172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	247.933008813881	1002	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	216	1709	127468	172617	TRUE	20	TTCTCTGAGACAGTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	107142	183969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_107344_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509_174890_181341_181442_183805
888430	contig_6509_pilon	-	5095	3	Intergenic	novelGene_145615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84	8	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1648	4947	107	5053	74414	68979	FALSE	20	GGAGCCCAGCTACCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLLLGKGTYTSSEESSTDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEKLRLYKDERKKKSKDRPSKLEKKNDLKEDKMSKEKEKTFKEDKLKKEKVYRDDSAFDDYCNKNQFLENEDTKFSLSDDQQERWFSDLSDSSFDFKGEDSWDSPVPDYREMKSDSVAKLILETVREDSKEKRRDNKSREKRDHSERRSDRDSFFRKKDRDYLDKNAEKRKDQTEKHRSIPSYLSEKDKKRKESVDGAKERKDKDLSDICRDRKDSFESAKERKEVRAKPEEAYREGLKEFSCDSFFKDKSDSDFVKSLESWERHHSVKEKDKKDGIDKEKKEKVKSEKYKDKSSDKDKNEKSILEKIQKDKEFDKCFKEKKEIKEKHKDVHSKDKERKASVDPVKEKKEKTYPGILSEDFSEKKDEKKGKEKSWYIADIFTDESEDEKDTYAASGFKLTETGEGQRAEGPQDREEGKEPYPSDKHRKYSSDKQHSEKQKDKESKDKKKDKGATEGGKDRKEKIFEKHKEKKDKESTEKYKDRKDRTSAESTQEKKNKQKLPEKAEKKHAVEDKAKSRHKEKSDKEHSKERKSSKSAEMEKSLLEKLEEEALHEYREDSNDKISEISSDSFTDRGQDPGPTALLEVSFTEPPEEKAREGSCLQEKLKERHRHSSSSSKKSHDRERGRKEKAEKKDRSEDYKETGSRKDSSQYEKDFLDGDTYSISYNTKADIEDELEKTIELFSTEKKDKNDSEREPSKKIEKELKPYGSSAINILKEKKKREKHREKWRDEKEKHREKHPDGFLRHHKDEPKPGAKDKDNPPNSNFKDKSKEETLRLGEVKLKEKFKESQEKGDLAKISNGNEKLPPSRDSSRKDHRPREKLLVDGDLMMTSFERMLSQKDLEIEERHKRHKERMKQMEKMRHRSGDPKLKDKTKLAEDMRKKSLELPTKKPPGVDMQLRDKKLKDSIVLAPTPPTADSKMLPGAGSEPKDWLTGSQMKEVLPASPRPDQSRPTGVPTPTSVVSCPSYEEVMHTPRTPSCSADDYSDLIFDCTDSHHVMPMPVSTPASACSPSFFDRFSTASSSLPENPSQTPTRTLSTSLYRSVSVDTRRTPEEEFSVGDKLFRQQSVPATSSYDSPARHLLEDKAAAPLEKFPCLSPGYYSPDYGVPSPKGETLHCAPVAVVNATPSPEGIFSSLQAKSSPSHRDELVAPSLEGTLPPRPGPPS	76436	68936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73868_74356_74505_76420
888431	contig_17144_pilon	-	1717	6	Intergenic	novelGene_29124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	816	1283	12299	11832	TRUE	30	CCTCACCACCACAGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFSKSSRSLYLLGD	16029	9858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10113_11651_12356_13328_13501_14252_14365_15440_15525_15638
888432	contig_6946_pilon	-	3990	3	Intergenic	novelGene_59788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGACCCTATAGGACAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454075	449487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_450774_451325_452432_452477
888433	contig_10437_pilon	+	4038	7	Intergenic	novelGene_38256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	183.196615689264	59	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3014	3460	401482	407700	FALSE	30	TTAACATATATTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396449	408278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396578_397108_397230_398632_398756_398840_401557_405379_405546_405816_405923_407600
888434	contig_5084_pilon	-	5142	3	Intergenic	novelGene_64535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_1	18	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	220	324	503325	503221	FALSE	40	CAAGCAATATTCAGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEDGGVRGTLGSRPWGRGRAHPGRSSASDGLWGFLLTRRTFSLTFRCFIFSSSQKENKILNSGLGNLPPGSGMEKAAFLFVPPLKSNPEKPLGCSHPSSFSKEETS	516547	498402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_503345_514791_514891_516446
888435	contig_19777_pilon	+	3889	6	Intergenic	novelGene_29708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	552.282319108624	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	32	670	13455	21503	TRUE	25	ATGTCAACACATTGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNTLKDFWRMVWEKNVYAIVMLTKCVEQGRTKCEEYWPSKEAQDYGDITVAMSSEIIHPEWTIRDFTVKNVQTRESHPVRQFHFTSWPDHGVPETTDLLISFRYLVRDYVTQSPPETPILVHCSAGVGRTGTFIAIDRLIYQIENENTVDVYGIVYDLRMHRPLMVQTEDQYVFLNQCVLDIIRSRKDSKVDLIYQNTTAMTIYENFMPGPRFGKTNGYIA	13423	24985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_13518_15438_15559_16872_17034_18243_18380_21344_24265_24527
888436	contig_3469_pilon	-	1782	7	Intergenic	novelGene_34215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	847.234061848056	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	267	869	659538	545916	FALSE	20	CTATCAGCTGTCAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC	660050	545002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_546000_550259_550362_550975_551066_565792_565932_590930_590992_659411_659544_659789
888437	contig_8866_pilon	+	2425	6	Intergenic	novelGene_77822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	728.027362123155	39	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	75	464	558831	640866	FALSE	30	CATCAAGTCAATTCTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFIIPATAARASASQHHPGGKDKMKWKVFVIMAVLQTQFPITEAQSFGMLDPKICYLLDGILFIYGVVITALFLRAQFSRSADVPAYQPGSNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGWDPEMGGKQQRRKNPQEGVYNVKGKTMFFSEHLVHFTP	558756	642827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558889_632461_632566_633657_633715_634879_634961_636551_636592_640816
888438	contig_5649_pilon	-	1818	7	Intergenic	novelGene_82315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTTTGCCACTGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203518	189567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_190282_197009_197184_198338_198489_199800_199982_201360_201494_202871_203009_203189
888439	contig_7342_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_71168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1572	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	857	1225	470835	470467	NA	5	TCCACTTGTGGTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASACRYTLRLAVSWQSAVPGRSLEQRDRCTGTLEGPRPQQDDQGRVTGGKLAGLVGRLSEGFHGRGLAWSHTQVREEAQSQKQLEQQPKETVAPGILYLGPADGIHGSEKLGGGESREVS	471691	469246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_469200_471700
888440	contig_408_pilon	-	5788	3	Intergenic	novelGene_84905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.5	1625	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTGAATCCTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140287	131319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_132863_132906_133592_136727
888442	contig_6364_pilon	-	6800	14	Intergenic	novelGene_51714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	973.821703423769	5	129	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	972	2330	472628	436151	TRUE	45	AACAGAATTGATTAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	487416	431643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_432340_432376_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_486627
888443	contig_1836_pilon	+	2880	3	Intergenic	novelGene_71070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	228	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	170	1096	970856	994912	FALSE	35	CAGTTCTGTTTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLAYTQRALSVPRTDWLLAPEEGRRRGASRATRRRPQPPGAAARGAALTALNLRTMGARRLLLVAVGLSLCGPLLSVRTRARRPDSKAEIATAVPRSFLVRSYVGDFEKISHEEFEEKNETKLHEDRLISVNKSHPLQKPPSVFISEEASGYLTSPWLTVFIPAIYTGVFVVSLPLNIMAIVVFIVKMKIKKPALVYMLHLAMADVLFVTVLPFKISYYFSGSDWKFGSEMCRFVTAAFYGNMYASIMLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFICLAIWAVAIGAVMPLVLKEQTTQVPGLNITTCHDALNQTLHDSYYTYYFTAFSAVFFFVPLSISTVCYVSIIRSPDCALLSPFL	970686	996696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_970944_993966_994771_994877
888444	contig_34_pilon	-	1781	9	Intergenic	novelGene_39991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1470.00012223639	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	658	1509	224662	212049	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247113	211776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224820_228209_228270_230228_230387_243214_243354_246970
888445	contig_8587_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_159148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGGTGGATGGATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515938	513950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_514000_515900
888446	contig_13245_pilon	-	2314	5	Intergenic	novelGene_148801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGAAACCTGCGACCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18607	2176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_2553_2870_3787_17298_18122_18357_18441_18491
888447	contig_5380_pilon	+	3970	3	Intergenic	novelGene_178548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1573	1878	293340	293645	TRUE	15	GTTGTTGTCATTTACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLYPATLLNLSISSSRFLMESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWTPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSTLRMILAIGFA	291133	295843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5380_pilon_+_291731_292364_294302_294407
888448	contig_2215_pilon	+	5842	1	Intergenic	novelGene_163865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1325	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	501	1506	670	2175	244460	245965	NA	75	GGAATGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQSQQAQSQPQQLQKQPQQPQKQPQPQPQQPPQPQRPQQQQPHHPLTNNPQSEPINSYSSSGHTNLYMRRPNPVSPYPSSSHTSDIYGGANPMNLYSTSSQAAGSYFNSSNPINSYPGLLNQNNQYPAYQCNGNVSVDNCSPYLSSYSPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLNLPPIHTLYQQRYGNSQSFSSKYLGYGNQNMQGDAFSSCTIRPNVHHVGAFPPYSTREIDSHFMGAASRLPANLNNPNIDYKNGEHHSSSHIIHNYGAAPSIFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLLKMLPGLNPEGTISAQEGLHKLNDASNQEKQPSVPVQGVASASEDNDEVWSDSEQSFLDPDIGGVAVAPSHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSLNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKIHGKKVKREPPEPHESSEPTYLRFIKSLTERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNRYI	243790	249632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_243800_249600
888449	contig_4339_pilon	+	4300	16	Intergenic	novelGene_146075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	79.6646861678512	1205	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	280	2538	1037958	1076107	FALSE	10	CTTCCTTTCCAATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKLLPATGPAQGEPYRLLTGVEYVVGRKNCGILIDNDQSISRNHAVLTANFSVTNLSQTDEIPILTVRDTSKYGTFVNEEKVQNCVSQTLKTGDRVTFGVFESKFRVEYEPLVACSSCLDVSGKAALNQAIFQLGGLSVNSWTEECTHLVMTSVKVTIKTICALICGCPIVKPEYFTEFLQAVQSNKQPPQIESFYPPIDEPAIGNKNIDLSGRQERKQIFKGKTFVFLNAKQHKKLSSAVAFGGGETKLVTEENEEEDGFYLAPGTCVVDVGITNSQTLIPDSQKNCINSIMDLLKRQGLRPIPESEIGLAVIFMTTENYCDPRGQPSTGLRPTTPGPSLSQGLSFSEKLMSGVPVNTTVYVPNTESEQADTCMGFSERPKEMKSSRMEQKFRMLSQETSTVKEPPKTSCNNIISHTLVKMKVPDYQLSPAKFTGVSKGRDRASQQQQTNSIKNYFQPSTKKRGRDEENQEMSSSKSARIEMSCSLLEQTQPATLPTWKNEEQHPSQNEPVDKKSDNLFADTNLKSNVKNLTNKSLPTEKLISKRRKDIDDLAIEDEVLEQLLKNTKPELEIEMRVKKEEDVNIRKKPRLIIESNSIFNDEAIPKSNEVSQENEIGKKCETKEESLWSTKEELSNNHELQDDGEMLPKKVILTEFRSLVVSNSTSRNPSIVNNDYGQLKNFKKFKKVTFPGAGKLPHIIGGSDLIAHHARKNTELEEWLRQEMEVQNQHAKEESLADDLFRYNPNVKRRR	1037678	1077869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037995_1043334_1043469_1045034_1045184_1045635_1045796_1048186_1048291_1049800_1049919_1050550_1050745_1052479_1052578_1060595_1060726_1062166_1062437_1064441_1064884_1068673_1068746_1069966_1070123_1072078_1072193_1074868_1074919_1076076
888450	contig_5033_pilon	+	1990	7	Intergenic	novelGene_28935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTCGGTCGGAGCGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449440	477193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450370_450450_450711_451536_451744_456485_456627_464540_464664_464732_464981_477111
888451	contig_4876_pilon	-	4209	3	Intergenic	novelGene_137878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	966	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACATAAAAAAGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218784	22390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_22906_213385_213991_215695
888452	contig_14970_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_45093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230327	232860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_230300_232900
888453	contig_4125_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_25159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	181	366	897978	897793	NA	35	TTTAATACTTATTATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPGVKENEERQRHKESISPRDIKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDHSDREHNRESLMEQEKGEVQYLNSSKKTRLNGLTETGGSLESMAPGFSVSPELKHFPRPTLQTDWIGQWDIK	898158	896823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_896800_898200
888454	contig_8310_pilon	-	3378	5	Intergenic	novelGene_75603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATATACGAGATAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326109	315010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316586_316630_316755_317712_317884_320574_320710_324736
888455	contig_14559_pilon	+	2581	7	Intergenic	novelGene_83713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1169	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGACACCCTGCAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227933	354517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_229521_230386_230447_249374_249526_251347_251496_277453_277977_286562_286619_354461
888456	contig_15410_pilon	-	2711	2	Intergenic	novelGene_130597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2264	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAAGATGTAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140408	137412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_139554_139838
888457	contig_1276_pilon	-	2633	1	Intergenic	novelGene_159770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	394	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1626	2081	186534	186079	NA	45	TACCCGAACTATCACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEAKTIINIYVPNDRAPKYTKQTITALKRETDSSTIIVGDFNTLLSVKDRTSRKKLNKDIEDLKATIRQLEFIYRILHQTAAKYRFFCKVHGMFSRTDHILGHKVTLNKIQNNEIIQSNFSDHKAIKVEINNRKSKGKNQLHGN	188159	185526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_185500_188200
888458	contig_4213_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_124815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATATATATACATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44374	46437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_44400_46400
888460	contig_5945_pilon	+	1092	6	Intergenic	novelGene_104527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAGTAGAAAATGAACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2613	55430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_2733_12606_12645_16208_16358_16846_16949_32034_32248_54959
888461	contig_9036_pilon	+	2885	1	Intergenic	novelGene_155441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACGCATATTAAAATCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73790	76675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_73800_76700
888462	contig_16011_pilon	-	5052	4	Intergenic	novelGene_177373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1733	2047	29720	29406	TRUE	35	ACAATGGCTAATGATCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLVHGKQGSPSRG	31781	1557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_-_1995_2077_4293_29052_29779_30107
888463	contig_2062_pilon	-	3705	3	Intergenic	novelGene_139040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1625	2008	1207090	1206707	TRUE	20	TACGCGTGTACATCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIEKLEMIKTKRKKREENKTKKQNKTPKKEKKKKTRRKKCPQGCHYASVQSKGVAPKPCGTAQLEGAPKLRKRKQTKQNKPEQTNKKKPRVSHQCGGTGREAVSQSSGVLQPFREKQRWHTEQGI	1385859	1204849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1206489_1206648_1207356_1384500
888464	contig_14142_pilon	-	1742	11	Intergenic	novelGene_120525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_10	192.230616708161	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	14	1234	355495	349539	FALSE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355508	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
888465	contig_14450_pilon	-	3538	6	Intergenic	novelGene_48979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	456.305336370286	20	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	334	1278	1310917	1042054	FALSE	25	TTCAGACTTCCCTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRTPTVNPPYSFSCLIFMAIEDSPTKRLPVKEIYNWILEHFPYFANAPTGWKNSVRHNLSLNKCFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQVPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASEHTHTHKHAHT	1311250	1039793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042088_1042999_1043375_1065853_1065960_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
888466	contig_8375_pilon	+	5830	13	Intergenic	novelGene_141286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	354.711267559029	1181	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	967	2904	47	2950	156309	213078	TRUE	20	GTATTTCACGTGAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLNGSHAEKTTDMPRPSIPKVHVQRSVSRDTIAIHFSASGEEEEEEEEELREYLEEGLDDESIVTGLEAKEDLYLGHDPIGPAASLIRADRLSVSQPPAILPVSANTVKLLESPPLAAQVLSTVPLALSPGSSSSGPLASSPSVSSLSEQKTSSSSPLSSPAKSPVLSSSVSSSALSSAKPFMSLVKSLSTEVEPKESPHPPRHRHLMKTLVKSLSTDTSRQESDTVSYKPPDSKLNLHLFKQFTQPRSTGGDSKTAPSSPLTSPSDTRSFFKVPEMEAKIEDTKRRLSEVIYEPFQILSKIIGEESGSHRPKALSSSASELCNLSSLNGHLESNNNYSIKEEECDSEGDCYGSDSNIPRSDHPKSADDPPREVELKSSQVSSLKDLGLKTSSLVLEKCSLSALVSKEDEEFFELYTEDFDLDTEGESKVDKPPDIPLKPEVLVDNGMALDSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPSAHKYHRLHKNLQHWNTRSLDIKEPEILKGWMNEIYSYDPETYHATLTHSVFVRLEGGTLRLSKPNKNISRRASYNETKPEVTYVSQKIYDLSDSKIYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQPKQKELVGSVRQKMLLDYSVYMARCVPQENRSPQKSPVLSAESSPTAGKKLPEALPSEKEEQEAWVNALLGRMFWDFLGEKYWSDLVSKKIQMKLSKIKLPYFMNELTLTELDMGVAVPKILQAFKPYVDHQGLWIDLEMSYNGSFLMTLETKMNLTKLVAGPEHTVWPIAMRNLPALAPLMKMMPQSPVGETNSSSRGVKGMLEVIEQVRL	107110	224063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_107132_156283_157941_174313_174515_175721_176056_180330_180579_190050_190198_195209_195310_205385_205467_211516_211643_213043_213254_215395_215517_221066_223193_223605
888467	contig_16098_pilon	-	1643	11	Intergenic	novelGene_45994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1210.30002891845	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	134	1519	352350	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354122	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
888468	contig_1154_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_87099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAGTAGAACTACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351493	349223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_349200_351500
888469	contig_13481_pilon	-	2632	5	Intergenic	novelGene_119551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3068	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCGCTGGGAGCACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1587847	1568326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1568719_1576149_1576348_1576596_1576789_1578048_1578129_1586077
888470	contig_4364_pilon	+	1907	6	Intergenic	novelGene_642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	1530895	1532568	FALSE	25	CGGCGGTGTGTTAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530453	1533276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
888471	contig_2799_pilon	+	12199	36	Intergenic	novelGene_85495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	648.52392777596	5009	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1492	4479	3008	7486	607928	780522	TRUE	10	CTCGATTGTTGCTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSMSWCPSGVQYSAALSADFTCRSFSLEGLTGGADVRNKPSSSLEANSANTKELRHPFSVEARGDSLVSLSEEDLESGQRERRMFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANRRSQQSVLLSKSVSIQNIAGVGNDESMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGTDMNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYVFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMKDPEMVEVHASSKEERNSWIHIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTKARELKEQLQQKDQQILHLLEEKEMIFRDMTECSTPLPEDCSPTHSSRILFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGSLGGTLGPAVSSLIEQEGMVGPVSLPRRAETFGGFDSHQMNASKGGEKEEGDDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLGFMLKRNSEVIQSIVHLHELLSTLQGVVLQQDSYIEDQKLMLSERALTRSSSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQHLEEKRRREREWEARERELLEREARLAQWEEKVQRGQQDLERDREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLKRDTEQLSQRRIEGDVCQVSHQHTKTMRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGGEYTHPPAPGSEEWGLRFQKGIF	563909	786317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_563984_597623_597823_600566_602899_603362_603763_607925_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191_699246_702704_702771_704625_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302_755439_756998_757112_757718_757866_758463_758715_761269_761396_761508_761627_762150_762400_766302_766380_766964_767147_767272_767356_770118_770314_771765_771928_772374_772446_772916_772962_776043_776092_777677_778128_780120_780523_781548_783702_783757
888472	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888473	SIRV6	+	316	4	ISM	SIRV6A	SIRV614	459	5	266	-3	-241	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2782	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2829_3106_3165_7805_7924_10724
888474	contig_8673_pilon	-	3189	6	Intergenic	novelGene_129925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_5	188.870961240737	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	364	1029	338208	324321	FALSE	25	TAAAAGAGGCTTTTTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	350706	322160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_350363
888475	contig_18364_pilon	-	3413	2	Intergenic	novelGene_102568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGACTATCTTGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123506	119873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_121152_121371
888476	contig_11171_pilon	+	1582	9	Intergenic	novelGene_48540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1782.07648808209	52	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	437	1051	51117	65045	TRUE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	41753	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48814_49108_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_65170_65551
888477	contig_7843_pilon	-	5340	1	Intergenic	novelGene_152054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1008	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTCTCAATTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546834	541494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_541500_546800
888478	contig_14525_pilon	+	2181	3	Intergenic	novelGene_149745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	701	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGCTACTAAAAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125875	132140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_127860_128433_128597_132106
888479	contig_13123_pilon	+	2159	5	Intergenic	novelGene_136898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_1	57.2816506396246	137	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	130	618	434529	444679	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434399	446220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
888480	contig_11564_pilon	-	3626	1	Intergenic	novelGene_158543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2372	2773	41091	40690	NA	10	ACTGTTTGCTTGGCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQQIRLSVLRCGNKNKAPVWLPLSSPFLFFPQHLPPYPTFLPLSVSFQNCSIRHLGLGILPSPATSQTCRPLCCFMLHMSCSLPDFPPQPQPLVIAWHQHLRNCWQKALNCGRNVHTTEYPSLEDKPPIRL	43462	39836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_39800_43500
888481	contig_7356_pilon	-	3044	15	Intergenic	novelGene_60401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	461.204196885165	1	107	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	3	623	492390	491257	TRUE	20	TTTTATCCACATTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQDINSSKHGELAICGSTPTETDRTLDLEGFRNLTVRGRDGYVTIVVKADIDEESIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGLLRWYAVYANVRVI	492392	462422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_462659_462712_463448_475963_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_489627_489769_491151_491303_491815
888482	contig_14450_pilon	+	2619	3	Intergenic	novelGene_49035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATTTTTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278701	1294843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1278806_1291704_1292550_1293173
888483	contig_11719_pilon	+	1883	2	Intergenic	novelGene_154779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCCTCTAATCTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160690	163925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_162133_163484
888484	contig_6227_pilon	+	2447	9	Intergenic	novelGene_49650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1736	2254	431553	443572	TRUE	40	AGGAAGTGCCCACACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFLSRACRRASAPTQEMQLLDSFRTFKLEFLLSPSARKHTPSSWRWFSSRLSSSSTTFLSNISAKAWAPRLPMSFPTRLSHFKLRWLLKASAKAWAPLSPTLLPQNPRNWRETLSRSPWASTSAPAAVMRLFPSLSAKKFCLHARSSATERAQPSVSLLLNRANFCSCSQ	427730	446093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_429457_431543_431624_436286_436375_438966_439048_439707_439790_442024_442110_443268_443354_443545_443630_445957
888485	contig_13612_pilon	-	2235	6	Intergenic	novelGene_157269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	215.902200081426	277	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTACCTCTCTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38618	25995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_26141_32505_32630_33365_34560_34686_35126_36275_36418_38427
888486	contig_11849_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_171748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115168	112859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_-_112900_115200
888487	contig_11896_pilon	-	11681	3	Intergenic	novelGene_88020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	555.5	1415	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	9778	10152	154641	151203	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFPCRVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAKKHGSKCLVHCKMGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLAR	170825	149673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_151408_154471_156896_163302
888488	contig_7410_pilon	+	3607	8	Intergenic	novelGene_106079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_3	194.221838239111	873	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	176	892	405351	411936	FALSE	60	CTTTTTAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRSRSRSHSRSRGRRYSRSRSRSRGRRSRSASLRRSRSVSLRRSRSASLRRSRSGSVKGSRYFQSRSRSRSRSRSLSRPRSSRSKSRSPSPKRSRSPSGSPRRSASPERMD	405175	414651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
888489	contig_16594_pilon	-	5502	11	Intergenic	novelGene_53798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2646.89851713283	276	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	1110	2255	272836	121101	TRUE	25	TTATATTCGTGTATCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306322	115122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115312_115510_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_306046
888490	contig_960_pilon	-	2217	2	Intergenic	novelGene_108324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACTTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065516	1061356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1062290_1064232
888491	contig_6325_pilon	+	3742	12	Intergenic	novelGene_143351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	238.622943345583	929	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	6	1085	341662	426326	FALSE	45	TTTTAGTGGTTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVAAFDTKTELRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES	341656	428983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_341775_373164_373295_383622_383682_400737_400850_401501_401532_401886_401935_403111_403227_403811_403884_414067_414148_421391_421471_425278_425453_426258
888492	contig_19534_pilon	-	1261	4	Intergenic	novelGene_151616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	432.06558144183	30	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	84	761	68652	62461	FALSE	35	GTAACATGATGTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAVGSRALLWIALLLFAPAGSLVATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSADFWIHNLRQTPKRNDVTAQETFASAFLSSTSNFFLVSTIASPPLILEVSFQNLCTHLIICSLLRAALPSLFLFLIVICSMKERFHPSSSYRCNRDRSEICIEIMRGNQTGKQCV	68735	61960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62808_66767_67023_68150_68172_68597
888494	contig_16492_pilon	+	4778	23	Intergenic	novelGene_100298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	249.148802993428	382	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1307	3924	493	4416	159423	195042	FALSE	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDIEVTTTTSETPVVDETKTEAPESEVGNPASNVAIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDVAVEKPVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPSDSPTSDLVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLSNAGQSAAYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS	153429	195404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_153619_158439_158546_158928_159081_159184_159226_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337_170596_171328_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_191998_192072_192228_193409_193544_194014_194104_194433
888495	contig_14441_pilon	+	670	3	Intergenic	novelGene_100757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	326	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	187	630	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121201	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126496
888496	contig_6630_pilon	-	3117	11	Intergenic	novelGene_30699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	652.776715271003	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	33	1298	380081	357703	FALSE	35	TAAAAAGATGTTGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRKFADGEVVRGRWPGSSLYYEVEILSHDSNSQLYTVKYKDGTELELKENDIKTPFGNSIGRYNGEPERIERNDIPPRSIQEKPHLSQESSYVSTQYSLRPRREEIKFKEMDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVCLFLLFEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQALFLRDLFHHVAYPPRSSR	384141	355883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357758_360615_360720_364054_364152_366310_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_379916_380096_384123
888497	contig_3956_pilon	+	2983	1	Intergenic	novelGene_14800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1616	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTGCGCAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225052	1228035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1225100_1228000
888498	contig_7629_pilon	-	3181	1	Intergenic	novelGene_153603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	512	1539	1509	3047	449167	447629	NA	45	AAATCATAAGGTTTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFGETLEGLSDDAFVQPGPVSLVDELNLGAEFEPLHIDSLNHVQGTPTHQKMTDFEQLNQFDSLKFHQVNQSFGSPAEHVLSPHSQFNCSPIHPQNQSNGLFPDVADGSPMWGHHTATSISNLNGSPFHQQGHSHSMHQNKSFVAHHDFALFQANEQQTQCTSLRLQQNRNNLNPGQNSLSQSKNFMDVSVSGPHRVSVNHPPQITNASTSQQSLSMQQFSQTSNPSIHFLKCSNHQEGNFNGPSPNMTSCSVSNSQQFSSHYSFSSNHLSSNSLLQSSAVLASNHTNQTLSDFTGNNSFSPQRGIKQESTQHILNPNTSLNSNNFQMLHSSHPQGNYSSSKLSPVHMNFPDPVDSGTQMGHFNDRVETNGFSSLEENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPQYDESTFGQDSSSHVLDHHLDQQFTSHLVTRPSDMAQAQLQSHAQSWHSSLSNHQHLHDRNHLCLQRQVCSSLLLFWSFGVGWALVTELIVYEK	450675	447494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_447500_450700
888499	contig_8330_pilon	+	4037	8	Intergenic	novelGene_71911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	82.2522253281245	1042	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	25	624	1254118	1259138	FALSE	15	CACTTCCCAGCAGGCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPGPPGEMRFRFCGDLDCPDWVLAEISTLAKISSVKLRLLCSQVLRELLGQGIDYEKILKLTADAKFESGDVKATVAVLSFILSSAAKHSVDGESLSSELQQLGLPKEHAASLCRCYEEKQSPLQEHLRACSLRVNRLAGVSWRVDYTLSSSLLRSVEEPMVHLRLEVAPASGAKAQPVTMSLSAEKFQVLLAELKQAQTLMSSLG	1254093	1262551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1254121_1257178_1257251_1257473_1257540_1257753_1257794_1258088_1258209_1258387_1258469_1258831_1259009_1259097
888500	contig_19342_pilon	-	4271	2	Intergenic	novelGene_41107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2641	2991	5249	4899	FALSE	15	GGGCGGGGAGCGGCTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVSLLLSRGHHHGCPLLEGPVPRRPGLHKFHVLGLVLLVPLPGQGNIRWVEAESPAPHYGLTVRDGVMGHMCLWGISGERSENSETALCPMVHGSRAHVTMLTLGRTFGWREGV	9361	3618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_6466_7937
888501	contig_2798_pilon	-	4117	1	Intergenic	novelGene_120047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1010	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTTACTAAGAACTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167267	163150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_163200_167300
888502	contig_1239_pilon	-	4766	6	Intergenic	novelGene_150413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	203.998627446363	18	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	138	674	684171	650485	FALSE	55	ATTAATAATAAACATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNCLCALNLVYTLVSLLLIGIAAWGIGFGLISSLRVVGVVIAYMIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEILGVWLTYRYRNQKDPRANPSAFL	684308	646392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_650560_654555_654670_664901_665016_665573_665655_666361_666452_684108
888503	contig_3449_pilon	-	3214	13	Intergenic	novelGene_73706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_12	137.036770207448	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	1538	2686	328842	299208	FALSE	15	TATTGTGGTGTGTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFWLISAPGEKTCQQTWEKLHAATTKNNNLSVSSKFNIPDLKVGTLDVLVGLSDELAKLDAFVEGVVKKVAQYMADVLEDSKDKVQENLLANGVDLVTYITRFQWDMAKYPIKQSLKNISEIIAKGVTQIDNDLKSRASAYNNLKGNLQNLERKNAGSLLTRSLAEIVKKDDFVLDSEYLITLLVVVPKLNHNDWIKQYETLAEMVVPRSSNVLSEDQDSYLCNVTLFRKAVDDFRHKARENKFIVRDFQYNEEEMKADKEEMNRLSTDKKKQFGPLVRWLKVNFSEAFIAWIHVKALRVFVESVLRYGLPVNFQAMLLQPNKKTIKKLREVLYELYKHLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYKIDCNLLEFK	333571	298679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_299304_305148_305276_306287_306386_307835_307930_308022_308116_315283_315353_316944_317044_318314_318407_322018_322114_324625_324712_327360_327429_328710_328880_332071
888504	contig_6513_pilon	+	2279	3	Intergenic	novelGene_117765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_2	350	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2142	138	2279	163999	171998	FALSE	25	AATACTTCTGATTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDGTPKGSRPPLILQSQPLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKDQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRIRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSIATKQPQTSVVQNQQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGEGRPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKSGFKSPNSKDDKRTEGNRSKVDSNKAHPDSKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPKIKRDKDGNITQETKKMEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGK	159804	171998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_159826_163882_164510_170367
888505	contig_10258_pilon	+	3821	7	Intergenic	novelGene_155050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_6	105.20680691962	1184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	798	1670	99692	108468	FALSE	30	GCTGAATGTGTGGAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCIKIPRKKYSDVMKVINSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCVQNDGVYQTQANCAAGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDSEEKENKGVISSVDGRSLQGFLSEKVKLETDFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSISATRYQFAKEIAMACCAALCPHLKTLKGNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGHLLPQHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSTSLPLEIELVFFIIENLF	98894	110619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_99737_100091_100240_101521_101603_104821_104985_106038_106145_106931_107100_108306
888506	contig_8210_pilon	-	3665	6	Intergenic	novelGene_30210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1219.23408744999	204	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	107	661	24031	15712	TRUE	10	TTTACATTTGTGGTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	29769	12598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_13047_13155_15995_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712
888507	contig_16575_pilon	+	1373	11	Intergenic	novelGene_146493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAACAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7193	26224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_+_7422_9526_9626_11751_11831_13214_13320_15642_15817_17278_17347_17554_17649_20272_20351_21126_21261_24643_24866_26132
888508	contig_3601_pilon	-	2121	2	Intergenic	novelGene_132939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	474	1349	427195	426320	FALSE	45	TAGAGAATAACAGTCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASSCISVIKHSPQSLSDGSEVSSVEHTQESPVQSSCRSPENKFQIIKQEPMELESYTRETRDDREVTTPIYQNYIGNSFPGYSHSPPLLQVNRSSSNSPRTSETDDGVVGKSSDGEDEQQVPKGPIHSPVELKHGHATVVKVPEVNSSALPHKLRIKGKAMQIKVEALDGEFDAAQKLSSAIDMTSKRHFELEKHNTPNMVHSALTPFSVQVTNIQDWSLKSEHWHQKELIGKTQNSFKSGVVEIKDSVYRVSDPENLYLKQGIANLSAEVASLKRLITTQQISASDSG	427751	425547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_427252_427334
888509	contig_13798_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_178536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	277	831	765	1595	107207	108037	NA	40	CAGTGGGATGACATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILTAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARR	106442	108037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_+_106400_108000
888510	contig_5451_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_167167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTTTAACCACAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380574	378801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_378800_380600
888511	contig_6084_pilon	+	4462	3	Intergenic	novelGene_127038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	113	junction_1	147.5	1428	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	232	1125	335278	336171	FALSE	10	TCCAATTTGGTCTTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDSEAHEKRPPILTSSKQDISPHITNVGQMKHYLCGCCAAFNNIVITFPIQKVLFRQQLYGIKTRDAVLQLRRDGFRNLYRGILPPLMQKTTTLALMFGLYEDLSYLLRKHVSTPEFATCSMAAVLAGTTEAIFTPLERVQTLLQDHKHHDKFTNTYQAFKALKCHGIREYYRGLVPILLRNGSSNALFFGLRGPVKEYLPTATSHSAHLVNDFICGGLLGAMLGFLFFPVNVVKTRMQSQIGGEFQSFPRVFKKIWVERDRKLTNLFRGAHLNYHRSLISWGIINATYEFLLKVI	321723	339508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_321788_330689_330815_335235
888512	contig_11850_pilon	-	2023	9	Intergenic	novelGene_125188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1224.42455872136	43	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	349	1125	186097	181211	TRUE	15	CTATATATGTGTGTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGGPSQNWNQGYSNYWNQGYGNYGYNSQGYGGYGGYDYTGYNNYYGYGDYSNQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	198206	179134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182405_182553_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185929_186102_197694_197765_197932
888513	contig_5023_pilon	-	2566	11	Intergenic	novelGene_7352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2041	2412	625824	616488	TRUE	55	TGAAAGAGAAAGGATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWFSGLCRAGYLLKRLAMKAKFSLAFFISFRSHLFKQVVIHASYLDVATEVANFAAARVFQMVVCPSQQELLRGELHQILQALSFSQKSNQSFISAEFDVGEQANLDDLPQKPQDQVRLPLL	648300	614401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_614484_616415_616580_618522_618682_622541_622587_625748_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
888514	contig_17144_pilon	-	3183	18	Intergenic	novelGene_29431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	2021.44209033241	450	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	323	1759	179764	170834	TRUE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRDEETETQMFTYPRSPSLPTTGQTPCRGPRSSQHLGGLGLPQLPASGLRD	183404	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
888516	contig_9653_pilon	-	2005	16	Intergenic	novelGene_48219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	14	junction_15	206.496381458745	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1896	108	2003	529435	510308	FALSE	40	GAGTATGGAACGCTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQ	531441	510305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513575_513728_516115_516269_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_531409
888517	contig_4364_pilon	+	518	1	Intergenic	novelGene_800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532800	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
888518	contig_8075_pilon	+	2631	11	Intergenic	novelGene_42500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	246.067246906207	32	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	334	735	751419	781945	TRUE	40	GTGAGTTTAAGAGGCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGEMTILLLELMRKN	719827	796326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_744333_744430_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781904_781964_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794825
888519	contig_10074_pilon	+	966	3	Intergenic	novelGene_57192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGGTCAGCAGTACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577105	586906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_577200_583722_583871_586182
888520	contig_15405_pilon	-	734	1	Intergenic	novelGene_112108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTCTTGTAATGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145320	144586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_144600_145300
888521	contig_7106_pilon	-	8861	13	Intergenic	novelGene_148306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	211	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	4912	5529	232938	171705	TRUE	20	TCTTTATTTTGATGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPISFLIWVICVLSCFSFVSLASGLSILLILSKNQLLVLLILSIVFLFSISFISALIFTISFLPVVVGFFCCSLSICLSSVVNVLILSLSSFLICASIAINCPLRTAFAVAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERITKPKVGSLKESTKWTNHWPVVCRFC	872043	34393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_34496_34766_36117_97823_98628_170628_171725_218865_219132_232606_233638_391251_391659_552296_553180_553804_553876_567165_567514_750501_751208_806374_807301_871172
888522	contig_8594_pilon	+	1801	5	Intergenic	novelGene_140002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.444771682307	30	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1641	160	1800	106574	145375	FALSE	25	TAGGTGTTGATCCGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVCWNLREKTTIAVTSRGYYGLEDEKGTACTSTRRRSTPRSLAGLTSGVFESVMVQVLRQKEQLRAKEEKRLREQERKEAEEASQKEIEEWERKLLAQAAPTCMETMWEIPAIGHFLCLAQQILNLPEIVFYELERCLLMPQCNAFLSKIMTSLLSPPHRRPTLHRRPTLPYRTWEAALRQKVQQWYTAVGQTENPDSCAEKLGLCPQFFKVLGEVNPLEEKPFHELPFYQKVWLLKGLCDFVYETQKEVQDAVLGQPIHECREVILGYDYLENAYVHFPQFCGADVRIYKQRPFQAPEFPIPPIKIQRVPRIKLEKLKCDYVNASNGEHRCSREGLPPAFKKEQGINFDPACCPAKMILDNHDISAEMEVKSNCEIRIRRPCEIKKTDCCKENLEKPGSPGEVTGFGEPLSPGEIRFIENQEKFGEASRVKPEPSPLKENALKSCQIHVNGSHSDYPEMNCHKVVRDLLLEQSLQSHKKLKLTKMRAKKKKKKKKKLKDVLNENLQRKREGLHSLAFKSYKPEIQNKLLIIKKKAKHKKHKSGKKSISKKAITKKRKTVTKSPTVPEFQLICTNLDELRELITKIENELKDLENSRKKS	82789	145376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_82801_106425_106627_124865_126284_136959_137040_145285
888523	contig_10734_pilon	-	2359	3	Intergenic	novelGene_51032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	3.5	619	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1513	2292	385659	384880	FALSE	15	GGTTGGAGTAAGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	393093	384812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_385663_388027_388120_391676
888524	contig_12915_pilon	+	3344	1	Intergenic	novelGene_148333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1201	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTGGTTAAGAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43945	47289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_43900_47300
888525	contig_9177_pilon	-	7385	51	Intergenic	novelGene_32598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	1515.66009131335	1	210	19	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	5684	6949	6586	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	28450	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6769_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9399_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13694_13890_14089_14296_14417_14811_15111_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21683_21864_21967_22737_22894_23251_23348_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
888526	contig_3601_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_132950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTAGAAACCAGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453414	451033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_451000_453400
888527	contig_13915_pilon	+	3232	4	Intergenic	novelGene_178552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	1895	3028	61643	63071	FALSE	15	GGAGTCCTCTGGACATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAESKQPVAPGEETAAVGSRGANEQRPRDLTSAAAQTWEQLHAETYPHSPAGKGKDSARNQAPEQKEGEAVRGKQESKRSRKSNTSSQQTAPREPPTWARGIQAAGGPGSRDCSPRKQRSKRTKATGSHQRCSPDLEAAARPNVAQQPRRKWQRRCSESGTQAKGGGGSERQVRIQKKQKKKKGRKEKKKSNTCSQQTAPREPPAWARRIQAAGGPGSRACGPGKQRSKRTKAPGSHLRGSLDLEAAAHLNVAPQPRRKGQRRRLEPGTRAKGGGGSERQARNQKKQKKQHQHPTNGTQKAARPGRMESKQPELPSQETLDTGSRGAPSGGEDGWESAHRKSPAVLSPTGRSARLLSRTPICWSLMGVQDGGSAPR	1333	63275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13915_pilon_+_2282_2599_2823_60919_62287_62581
888528	contig_2596_pilon	-	582	5	Intergenic	novelGene_53524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	398.727350453916	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	154	582	1083525	1054938	FALSE	15	GAGGCCATGCAGTCCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNSDRYGAVWKNAGEAAQRADIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLAVLRVAGSLQKSTEVMRAMQSLVKIPEIQATMRELSKEMMKAGIIEEMLEDTFESMDDQEEMEEEAEMEIDKILFEITAGALGKAPSKVTDALPEPEPLGAMAASEDEEEEEAL	1120587	1054937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1055042_1055769_1055885_1059028_1059151_1083437_1083618_1120526
888529	contig_8312_pilon	-	3594	4	Intergenic	novelGene_152896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1698	2039	277552	277211	FALSE	55	CTAAAAAAAAAACCACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGATFQSFISWIRGSSTKNSDDIVSHAALSGQSPVCFSLPILPILGSEEKKISSNISRYGLRLTGTTRYKEKLGPFYAVTFLTMSSKSGTKYLTIFFFFLLEHQVFIFYDYF	400988	275655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_279100_280340_280348_345951_345960_400853
888530	contig_14142_pilon	-	1526	10	Intergenic	novelGene_120522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	349.433545140039	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	443	1018	350728	349539	FALSE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355503	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351733_353491_353631_354021_354071_355472
888531	contig_15518_pilon	+	4382	1	Intergenic	novelGene_127628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATCTGGATCTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36283	40665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_36300_40700
888532	contig_15407_pilon	+	1391	9	Intergenic	novelGene_123056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_1	632.084732749495	3612	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	336	1340	449761	470398	FALSE	15	GGTGGCTGCTTTCTAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIRRVVEVFKPGKFVTTLFVNQSSKCRTVLSSPQKIEGFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449425	470449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468308_470257
888533	contig_7963_pilon	-	2520	7	Intergenic	novelGene_58538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_5	141.261872657369	1199	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	238	828	243778	240504	FALSE	10	CCTATTTTTGTCATGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245708	238811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_244098_244225_245606
888534	contig_14060_pilon	-	2816	1	Intergenic	novelGene_156047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAAACTCTCTCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39180	36364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_36400_39200
888535	contig_7873_pilon	+	5178	7	Intergenic	novelGene_169572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_1	443.229593125529	880	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	771	1343	69396	74459	FALSE	45	AAACTAATGAAGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGKTETSKLKQNLEEQLDRLMQQLQDLEECREELDTEEYEETKKETLEQLSEFNDSLKKIMSGNMTLVDELSGMQLAIQAAISQAFKTPEVIRLFAKKQPGQLRTRLAEMDRDLMVGKLERDLYTQQKVEILTALRKLGEKLTADDEAFLSANAGAILSQFEKVSTDLGSGDKVLALASFEVEKTKK	63387	78294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_+_64150_69387_69497_71230_71367_71739_71839_73550_73647_73819_73902_74400
888536	contig_12528_pilon	-	2224	12	Intergenic	novelGene_81307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	537.041897806866	30	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	314	1189	966228	933323	TRUE	35	TCAAGAAGCAGACGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968117	931362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_931442_932366_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656_967736_967928
888537	contig_5686_pilon	-	4113	20	Intergenic	novelGene_45216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATTCGTGTGAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257518	93699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208414_212625_212664_215303_215415_221310_222914_224040_224201_241595_241799_250016_250101_253203_253296_257382
888538	contig_10734_pilon	+	1098	3	Intergenic	novelGene_51361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	14	218	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGAGTTGCTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781344	1787987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1783470_1783581_1787234
888539	contig_8322_pilon	-	1740	3	Intergenic	novelGene_143256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302952	300038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_300420_301315_301404_301681
888540	contig_4232_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_63394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACCTCTGCGCTCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467266	468109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467300_468100
888541	SIRV7	-	2221	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	6	-111	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAGGTTAAGATAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	1116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1509_1636_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114961_147608
888542	contig_7009_pilon	+	9839	5	Intergenic	novelGene_23607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_1	501.106026704928	1879	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	252	851	444955	518263	FALSE	35	ACCATATGACCCAGCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSNKCLRCPRLGAAPRAAATVATTPQSRRSGPKPGRDARPRRGGRGERTRQDRGIPSSKVTLHTRGSVLAPRVRRRNPHTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	430700	527251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430938_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991
888543	contig_2799_pilon	-	6393	22	Intergenic	novelGene_85498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	5580	5888	601100	600792	TRUE	45	AAAAACACCCAGGTCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCAWLCGQVFLQDVVSTTQRLLVCSHSTRFCSSFFISVSTGDKAFRALFSTVRHALRAAVLIRHSSRVHNGGGLHLFPISLHAFIFFLTGTDCVLFLNYT	762633	582461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_582543_597623_597822_600565_603760_607922_608056_681360_681435_687150_687272_696526_696898_699189_699244_704623_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302_755438_756997_757116_757722_757864_758459_758712_761266_761394_761506_761624_762147
888544	contig_5502_pilon	+	1640	6	Intergenic	novelGene_154969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	395.426554495269	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	81	647	357713	395706	TRUE	25	TATCTTGGTTGTCTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGSVQMPKSCISWDKPNRGITLTIPKQKA	357632	399295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_395620_395841_398436
888545	contig_1146_pilon	+	4790	1	Intergenic	novelGene_84815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1851	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	101	520	511257	511676	NA	25	TGTACGTACATAGCACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWLQERAPPGACYLKCLQLLKALRDLGARGLDPMAATHWGRILSSYVLKTALLAVLLREGVPAQVWDEVHLGERLEEVVQFLRDCLLQRRALFHCVLGPGGAAAEVGPLPKVLREAAPVDVLAAFDQRPPGTRSCAAAVHVAKAAPASPGLRGSPLPCQVPATPESAHPGIP	511156	515946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_511200_515900
888546	contig_10225_pilon	+	3807	2	Intergenic	novelGene_86840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	439	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCACATCCTCCCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24184	28149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_25216_25373
888547	contig_10311_pilon	-	4150	11	Intergenic	novelGene_50395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_10	996.442978800092	580	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	34	1122	71526	66744	FALSE	25	TTACCCCAGCAATGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRSR	71559	63715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_66754_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
888548	contig_14687_pilon	-	4294	6	Intergenic	novelGene_107914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	875.547508705267	43	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	706	3261	459974	450562	FALSE	50	ACTGAAATACAAATATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHNSPSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHMPVRPSSAEPHRPLKITAHSSPPLTKTLVDHHKEDLERKAFIEPLRSVASTSAKNDLDPNRSQTGKDGHLHRHFVDPLLNQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLDGERDNYSRVPSSSSSPKSHVIKQDKDLGSSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNSVVNEPPRSYPSKEVSNIYTEKQSSSLAAAVNPAVNPQTLTSFISSLSKPPPLIKHQTESEGLVGKIPEHLPHQIATQSVTTFQNDCRSPTHLTVSSTNTLRSMPALHRAPVFHPPIHHSLERKESSYSNLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWKSNNNLSKEKAEWHVEKSNGKSQAAMASVIVRPPSSTKYESMSAIQLASKDRLSERSSTEANKTDCRKHTEARETGRIILPSVNSDSAHIKSEKIFQSVSQGRVPSSVMSAVNTMCNTKTDVFTSVATTATGSSWGGSEVIYSLSNTTLASTSLECTSSKSVSQSVAQTQECKVSTTASITPASSKTVSAFQPSAGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNIGETEPNAVKNQTSSASLPLESTVVCSTVNKAISVGNGQASQTNQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSNDIQNSVDSKIIVDKYIKDDKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKEKSKLKLQSNSNSGM	527951	449528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_452789_453057_453231_458371_458516_459962_460088_523429_523544_527473
888549	contig_6488_pilon	-	369	3	Intergenic	novelGene_44764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAATTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197833	196111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_196165_197384_197478_197610
888550	contig_9239_pilon	+	3565	5	Intergenic	novelGene_137194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	746	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGATGATCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227534	285683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_227935_228450_228807_229052_230025_283765_284210_284290
888551	contig_15105_pilon	+	3289	5	Intergenic	novelGene_150994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	116	junction_4	212.3386151881	884	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	242	1195	789632	842210	FALSE	15	CATTCCTTGTGTAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFAGWLCLSLASVWLARRMWTLRSPLTRSLYVNMTSGPGGPAAAAGGRKENHQWYACNREKLCESLQAVFVQSYLDHGTQIFLNNSIEKSGWLFIQLYHSFVSSVFSLFMSRTSINGLLGRGSMFVFSPDQFQRLLKINPDWKTHRLLDLGAGDGEVTKIMSPHFEEIYATELSETMIWQLQKKKYRVLGINEWQNTGFQYDVISCLNLLDRCDQPLTLLKDIRSVLEPTRGRVILALVLPFHPYVENGGKWEKPSEILEIKGQNWEEQVNSLSEVFRKAGFVIEAFTRLPYLCEGDMYNDYYVLDDAVFVLKPV	789390	844304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_789797_810198_810390_814709_814920_820425_820611_842007
888552	contig_4125_pilon	+	3889	7	Intergenic	novelGene_25186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	208.079044809632	352	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	151	1866	1306136	1382601	FALSE	10	GGCTTGCTCTGAGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGGEKRLCLPQILNSVLRDFSLQQINSVCDELHIYCSRCTADQLEILKVMGILPFSAPSCGLITKTDAERLCNALLYGGAFPPPCKKELPGTGGLALGLELSERSFRVYHECFGKCKGLLVPELYSSPSAACIQCLDCRLMYPPHKFVVHSHKALENRTCHWGFDSANWRAYILLSQDYTGKEEQARLGRCLDDIKEKFDYGNKYKRRVPRVSSEPPASIRPKADDPSSQSPAAPEKDKQSSWLRTLAGSSNKSLGCVHPRQRLSAFRPWSPAVSTSDKELPSHLPALIRDSFYSYKSFETAVAPNVALAPPAQQKVVTTPPCATVVSRAPEPLSVSIQPRKRKLAEENPVVPETLVPLAAPEEDKDSEAEVEVESREEFTSSLSSLSSPSFTSSSSAKDLSSPSVHAPPTASAALDAAAHATEAPGGGLEAELEHLRQALESGLDTKEAKEKFLHEVVRMRVRQEEKLSAALQAKRSLHQELEFLRVAKKEKLREATEAKRNLRKEIERLRAENEKKMKEANESRVRLKRELEQARQVRVCDKGCEAGRLRAKYSAQIEDLQVKLQHAEADREQLRADLLREREAREHLEKVVKELQEQLWPRPRGEAASSESTAELEP	1305985	1384624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1306622_1377697_1377824_1377929_1378046_1378996_1379260_1379633_1379939_1381819_1382051_1382412
888553	contig_4232_pilon	-	2091	2	Intergenic	novelGene_63278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAGAAAATCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	465997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466071_466117
888554	contig_2125_pilon	-	3448	1	Intergenic	novelGene_147743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685347	681899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_681900_685300
888555	contig_2770_pilon	-	3341	6	Intergenic	novelGene_107432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	36	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	297	746	750561	743833	FALSE	45	TATATATATAAAGTGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750857	741237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
888556	contig_8312_pilon	-	4568	7	Intergenic	novelGene_152880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGCTTCTGCTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280270	262672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_263805_264909_264956_265065_265170_266970_267052_271659_271766_273128_275159_279201
888557	contig_20641_pilon	+	1841	8	Intergenic	novelGene_52797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1533.33506063198	1726	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	521	1549	38568	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14533	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16910_18544_18643_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
888558	contig_2219_pilon	+	3578	3	Intergenic	novelGene_67158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGCTGGTACGATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48874	418292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_50090_298291_299022_416659
888559	contig_15039_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_110166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	860	1351	329947	330438	NA	20	CACTTATATCCCCCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDCEFGYIYKLVQDYLKYVLQIPQPGAGSSKTSRVLQNVAFSVQKEVEENLKTCLDNFNVVSTDIAKTIFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFGGILIKKLLREQIVADMYTYKEISFFVAEFIVKNTAEWIRQNGGWVCAMQVFVIVLYCAIGTDSFLTN	329087	331404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_329100_331400
888560	contig_15518_pilon	+	2953	3	Intergenic	novelGene_127615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	254	51	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	379	507	15096	38216	FALSE	35	TCAGTAATCTGGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEGKVSITAFED	11252	40662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15192_38183
888562	contig_5033_pilon	-	3128	1	Intergenic	novelGene_28907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	669	1004	451758	451423	NA	10	GACAGTTTCTCTTGGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	452426	449298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_449300_452400
888563	contig_15327_pilon	+	1796	5	Intergenic	novelGene_70430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	103.456512603122	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	93	1082	36170	53863	FALSE	5	CTTCAGCCTCTGTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASRGGRRAGRAVSSLNGAPRGAVELSPGDMSAAAATGAPLPRLCCLEKGPNGYGFHLHGEKGKAGQFIRLVEPGSPAEKSGLLAGDRLVEVNGENVEKETHQQVVNRIRASLNAVRLLVVDPDVDEQLQKLGVTVREELLRAQVGSGPAELQAATEAQGDGGESEPREAEKSQAERRELRPRLCAMKKGPNGYGFNLHSDKSKPGQFIRAVDPDSPAEASGLRAQDRIVEVNGVCMEGKQHGDVVSAIKAGGDETKLLVVDRETDEFFKKCKVIPSQEHLDGPLPEPFINGEIQKLNSQDSPKKQDSAVPSSASSSSDPILDFNISLAVAKERAHQKRSSKQAPQMDWNKKNELFSNF	36077	54577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_36611_48133_48296_49305_49460_51741_51783_53671
888564	contig_11258_pilon	+	2598	8	Intergenic	novelGene_67772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	195.376455039172	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	346	1056	279290	289530	TRUE	50	AGAGAAGAAAAGAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKCALLLNCSPASTRLP	278944	293404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_289483_289961_291348_291387_291794_291915_292450
888565	contig_854_pilon	+	1522	7	Intergenic	novelGene_36263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	10	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	91	474	543600	557602	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKVSWTDRLHSTSYSLCSCITCALPAAPCPVVP	543509	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557079_557520_557752_562271_562405_563029
888566	contig_5171_pilon	+	2784	4	Intergenic	novelGene_161229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	761	1087	32713	33039	TRUE	60	ATAAATGAAATAGAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWGQQSISNHIKRQSMMASASSQNKESRNVPEEENFLELPEAEYKRLVYRTLQELRKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLQETIEREQSDIQKISNKISELDN	31952	35297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_33047_33435_34513_34561_35089_35211
888567	contig_6418_pilon	+	3696	11	Intergenic	novelGene_81188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_9	168.004880881479	357	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	21	1943	1158822	1173368	FALSE	20	CCTTAGATATGTGCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRSTSSTKSGKFMNPTDQARKEARKRELKKNKKQRMMVRAAVLKMKDPKQIIRDMEKLDEMEFNPVQQPQLNEKVLKDKRKKLRETFERILRLYEKENPDIYKELRKLEVEYEQKRAQLSQYFDAVKNAQHVEVESIPLPDMPHAPSNILIQDIPLPGAQPPSILKKTSAYGPPTRAVSILPLLGHGVPRLPPGRKPPGPPPGPPPPQVLQMYGRKVGFALDLPPRRRDEDMLYSPELAQRGHDDDISSTSEDDGYPEDMDQDKHDDSTDDSDSDRSDPESEGDEFVHRDDNERDTNEEKKSGLSVRFADMPGKSRKKKKNMKELTPLQAMMLRMAGQEIPEEGREVEEFSEDDDDDSDDSEAEKQSQKQHKEESLADGTSAGSSQQQPPPQSVPPSQLQAPPMPGPPPLGPPPAPPLRPPGPPTGLPPGPPPGAPPFLRPPGMPGLRGPLPRLLPPGPPPGRPPGPPPGPPPGLPPGPPPRGPPPRLPPPAPPGIPPPRPGMMRPPLVPPLGPAPPGLFPPAPLPNPGVLSAPPSLIQRPKADDTSAATIEKKATATISAKPQITNPKAEITRFVPTALRVRRENKGAAATAQRKPEDDSAVPLAKAAPKSGPSVPLSVQTKDDVYEAFMKEMEGLL	1158801	1175121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1158886_1159629_1159662_1160480_1160575_1163365_1163563_1164843_1164978_1165156_1165357_1165907_1166100_1168539_1168642_1169782_1170074_1171078_1171262_1172934
888568	contig_16949_pilon	+	1543	2	Intergenic	novelGene_178553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	885	1274	2205	2594	FALSE	25	GGCCGAGCCGGGGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPTRACGIQAAGAPWPRDRGCGKQRNKRTKAPGSHQRSSPDREAAAHSNGAPQPPRKKQKWRPEPGTRAKGGGGSKRQARNQKKQEKKKRKQHQQPTNGTQRASQCAPPDKRPCQREAEEAERG	1045	2863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16949_pilon_+_1900_2174
888569	contig_15407_pilon	+	1009	3	Intergenic	novelGene_123057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.5	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	335	709	449761	451267	TRUE	50	CAAGAGAAGAAAGGATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRALHRVLPALPRANVTVPRRNRRGHFIEKWQPMSSWTRQQPGPRVWANRRFRNVGCARRRPLTKSNWKRQSRQTRAAGTLRHVGQPSF	449426	451989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_451002_451493_451914
888570	contig_12677_pilon	-	589	2	Intergenic	novelGene_110878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCTAATGACACACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3787	2953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3504_3748
888571	contig_5023_pilon	+	2751	12	Intergenic	novelGene_7196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	104	junction_9	2198.73506084034	101	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	116	1066	607279	639083	TRUE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGTH	580813	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622586_639072_639197_643413_643539_646857
888572	contig_10323_pilon	-	1233	8	Intergenic	novelGene_123552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	178.472887096532	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	64	315	305132	278703	TRUE	25	GCAGTGAGAATCTGGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWCWAPGRLACLGVPRVKAAVMLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTENIRLTALAGLPRGR	309106	267695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_277887_277921_278700_278751_292643_292700_295187_295218_305014_305149_309059
888573	contig_15449_pilon	+	4067	15	Intergenic	novelGene_33581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	836	junction_12	493.284576557374	5182	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	239	2917	37166	54621	FALSE	20	CCTGAGTTTTAAACTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	27852	55771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51932_54570
888574	contig_2894_pilon	-	2627	2	Intergenic	novelGene_86552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	269	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314868	311905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_313891_314226
888576	contig_6738_pilon	+	3215	5	Intergenic	novelGene_166117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_1	405.427783335084	4149	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	106	576	23469	38015	FALSE	20	ATTTTGGAGTGTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPGAATKAATKDEDEWKEFEQKEVDYSGLRVQAMQISEKEEEDNEKREEPGDNWEEGGGGGGGGIEKSSGPWNRTAPIQAPPAPVIVTETPELAMTSGVYRPPGARLTTTRKTPQGPPEIYSDTQFPSLQSTAKHVESRKDKEMEKSFEVVRHKNRGRDEVSKNQALKLQLDNQYAVLENQKSHHTQYN	22701	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_22741_23402_23480_32606_32756_36540_36701_37864
888577	contig_5718_pilon	+	2238	9	Intergenic	novelGene_110443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_3	54.8485129698153	106	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	12	1067	1617860	1625636	FALSE	25	CTGTGAGCAGCCATCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIVIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKVSPAAD	1617848	1626807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1622890_1622963_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477
888578	contig_6365_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_134005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACCTCAGTTAAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46597	48206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_46600_48200
888579	contig_16686_pilon	-	3244	1	Intergenic	novelGene_162092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAAGTCCTCCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142278	139034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_139000_142300
888580	contig_11564_pilon	+	2377	10	Intergenic	novelGene_158550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1614	2105	52912	60773	TRUE	15	CTGGTACCGATCCACGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLESCFLPVSSDLLPGSGNRFRFSGTEPALPAVGMDPTTFLETEEEGDGTEAKRSKSFSKVLLVLLFAMEQATGASRPNKSMTGAVDFGELFRGSCGSSFFCGIFTFSKTTGSIFFSGAGSLPLFHLSSFSFLKALMSRLRSMYFFFSYLSRINPSTAGSI	39921	100721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_41171_52105_52426_52867_53032_53824_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761_60848_62470_62607_100659
888581	contig_4180_pilon	+	902	3	Intergenic	novelGene_8378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1858	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTTTGGAGCCGCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874282	888712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875333_888085
888582	contig_10793_pilon	+	1312	14	Intergenic	novelGene_83374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3304.11678841401	12	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	532	909	160548	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151480_159151_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
888583	contig_7457_pilon	-	1042	4	Intergenic	novelGene_31720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	26	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	1176842	1174926	FALSE	25	CTAGCTAAGGGATGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
888585	contig_383_pilon	-	1853	8	Intergenic	novelGene_126119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGACTGACTTCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169443	136331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_136795_141854_142032_143970_144207_145078_145159_157139_157282_159219_159372_164400_164584_169023
888586	contig_6005_pilon	-	2030	6	Intergenic	novelGene_158889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	110.738249941021	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTTTATATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327336	311411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_325326_325713_326277_326883_327174
888587	contig_1263_pilon	-	2863	6	Intergenic	novelGene_170399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	967.577511106991	6	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	314	1204	65189	59754	TRUE	40	AAAATTTTTGAAATGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKVII	76795	51879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53539_59753_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65284_76576
888588	contig_513_pilon	-	4695	21	Intergenic	novelGene_80129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	596.585557569072	706	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	138	1616	416603	318412	TRUE	25	AAATAAGTCCTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEERIVTWLISLGVLDSPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCPQTKADCTNNINDFLKGCAALQVEVFDPDDLYLGVSFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCGRSSSLSAANSSQTNPQGAVSSTAPGLQRQSKAVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGLETAPLTKNYYAVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEFTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLNLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDDLDQFMESQGASSPGILILTTSLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIIAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKTLGNVIFMSQVMVQYGACEVRGKRGAVPHVVFKCFDNAICKSSDEWLYLSGKNINSRNGGDKIR	416740	302424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_304851_306469_306525_308605_308706_311806_311885_313014_313116_315688_315830_316906_317050_318376_318456_319441_319531_322041_322194_324191_324252_327391_327531_336630_336754_338178_338275_345090_345186_356920_356992_368639_368842_370350_370476_373327_373413_415123_415196_416477
888589	contig_10404_pilon	+	2420	1	Intergenic	novelGene_138697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	431	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTACCATATGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136682	1139102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1136700_1139100
888590	contig_16228_pilon	+	3092	7	Intergenic	novelGene_147932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	242.696941792754	256	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	63	1106	47816	72232	TRUE	40	ATACAATGGAGTATTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMGIRGQHMEEKETFATVYSEVQKPGQAINI	47753	84206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71817_72142_72611_82598
888591	contig_10377_pilon	-	3588	1	Intergenic	novelGene_115403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGGTCATGAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234602	231014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_231000_234600
888592	contig_7293_pilon	+	936	3	Intergenic	novelGene_54239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	323	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	74	373	329270	330123	FALSE	20	GTAAGCAGTGGTTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRHNTTSCTSVSPFGVLQVWLLLSLLLTALVPGTSQETNCVEAELYTELRCMCVKTTSGVHPSYINTLKVIRAGAHCNKVEVISSHNQENSPENFAK	329196	330686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329388_329744_329881_330077
888593	contig_8978_pilon	+	2983	14	Intergenic	novelGene_49469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_8	228.093305936447	849	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	606	2951	1743830	1772377	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGICLGALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQVKHHVEPLTPPWHHNKKRYPPSYGPDGKPRPRFNNVQLSPTDEERDKAEEEVHLLNSTTL	1684431	1772409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1685023_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1754604_1754684_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1770477_1770554_1772218
888594	contig_10074_pilon	-	3652	10	Intergenic	novelGene_57174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_9	337.242448597152	1151	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	270	2042	596567	558945	FALSE	40	CTCAGAATACCCAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGGYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAVISRIRAGINPFSVPEPQLLDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALTPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFHKLWQDCGGNFPEGPRPGPLGSTTEGRFIKKEPNLFSPGAVATETPRPSSQAEPYYSPPVSVSRALPHHGSAASSMMSSPSSSWPSVARPSSQSVSTNPPNSFSTATLSSNSQAIPPFLGIPLASDLNASSACVYSNSNDIGRMEASSMSPADLYGISDASMLSDCSVDMMASCNESMRETDNHRLVSMHLDSPTCTSVLDPRNLRQLCPMASSGGSGASSTAAAFVSQPDAFEGSSFGCASNGLIHESGAADSTNPGSHGFVQSGQYSGISTMPNEQLGDSFAYEFFQV	596836	557334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_559724_560818_560891_561019_561089_561859_562073_562179_562285_563750_563892_577107_577200_583722_583872_586186_586330_596557
888595	contig_12119_pilon	+	15575	15	Intergenic	novelGene_88658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_6	391.097879079404	2121	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3406	10221	249	10469	319835	424012	FALSE	40	AAATAGTCCCTTTATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKPKQNVSEATTIELTILAETASPSLSKEPQIVPDRTTPIMPLITALSVITTKFSSVENIVNFEQKGPVQSQTVTDKLATESATPSGSTKKPWDMDYLPSAAGPLEKPDMSEIKEDVPKSTTVISHHTTDSWDDVTEDTKTQESVTQIEQIEVGPFVTSVEISKHTPSKEFSATEIPFLSTRMTMESKTEKKTVSPISESVTTNLYGFTLGNDDGEDRTLTVRPGHSTFIFSQIPDVITVSKTSEDITHTQLEESESISASTLVTSVTMPDNDGSSMDDRQEKQTTGRTTEDSWDQHVSTTPFSPQHQTEVELFPFPGDKRLTEEIPTVIYSSLETEMAQGRERIVTQRPAMRTDTYTNDEIQAKITKDPFIGKTEEEFSGMEVSTASSEQIHPTESSVEITKSFESPALTTTKPSVQPTEERAREEEFATTPVGDQDTTKYDEGITTVHLTHSTLSVEVVTVSKWSWDEDNITSKPSESTDHEVSPKLPTVGGNGKDEEIPRFTEHGDEFTLIPDSTQKPLEEITEEYLTDRGKFTARFQPTTSISTAEKSTLRDSTTEEGVPSISRTESKVVYATTEGSALDEEVDVDISKPVSTVPQFTHTSDGEGLAFVNFSSTQQPTTYVDISHTIPLSIIPKKEWEVLVQFVPSEGELLGEPSQDIRVIDETHLEATISPEILRTTTEITQGTTQEEVPWKEQTAEQPVPAPSSTAEILKEATVSLDEQESDGSAYPIPEEKLVTGSERVPILETTPVGKIEHSVSYPPCPITEHKVKMDEMVTLTPSVGTKISLSPRPDQKYEAESSSSTEFESPLSPFSTHVTRLIEETTTEKREKTSLDYIDLGSGLFERPKVTEHSEFSTIKTTVPSDITTMFSSVDKFHTTSASVPSSTSTEKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSRFLPTTPDDIVAKETETEIDREYFTTASTSTQPTKPPTVESKEPFRPQAVSTPEPPLGTKFHSDINVYVIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSESKEEEPCSEETDPEHDLIAEILPELIEIDIYHSEEDEEEDEDCANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDQEAAEARRGQFESVAPSQKISDSSESDSHQFVIAETELSTVVQLNESKESESLEITWKPETYSETPEHFSSGEHGVFPTVQFHEGEATEGPDSVTERGLELDNLVPNDTESVPLFPEESSGNDAIDQESQKIVFSRPTEVTFSEEAEKSTSITYTPSIVPSSVSANVSEEESVTPTGHPQPEDAFSTIESWVEVTPRHVGELLGTPSSIPMPEGSGEGEEDKNKMFTVVADLSQRNTTNTQGTLDTSKIMITESLFDVPVTTSYSVSEQPSAEIVPIKLISETDTSEGVFSTSLEEKKRKDEEEETPGTASTIEKDSPTQRSDQLILPSELESSNETTFSDSASTTGKSITSLTTSTQSEREMTSFTLFTETNVLGNLGAQVTEHSTSHQAEVQKGLTTVPGSPVSLFTEQSSGDAAVHPETTTVSSFSLNLESDIQTKKEAASTLSSLVENTFPFDPTEFILSTAVDRQVAEIMSQTSKENLISEISGEPSHGAEIKGFPTDFPLEEDFSGEFREYLTVSPPITKEETKIMEGSGDTTFMDTETSPSAVPTSDHVTRMPDSERPSNTMVSTSAFPWEEFTASAEGSGEQLVSISSSVDQVLPSVMGKVSGTESPFTDQGLGEMGAITEADKRLTILPTAEAEGMESPTEKGDVMVGGTVSVDFPQTLEPATLWSSQEVNLVRQEIENKTTSEEKIKEQMSFESPQRSVTPEQTIFDSQMSSETELLTTDYSILTTKKTYSYANEMEEEVIPLLHMSTPDPDTKGLEGLEPYTAVPEVTEKSHVFLATGSVTESVPSESIVTDSSIKEEESIKPFPKDVTPTIKESDTDLLLSGLGSGEEVLPTLATVSVNFTEMEQIISTLHPQTSRVESLETRVSSDETEDYEGMENVTNEVIPLISKTASTPKSSQTTSSSTMMGISSDTRAEGPTVAPLSFPTDAEHPQNQTLSWAEELQTTRAQTVTEQVSNKNSSTAETKETVTSSGVLARTYGLEMAKGFVTSPPKPSELFYEHSGEGSGELGIVDLVHTSETTQATRQGSTTFVSNRFLEKHPEASSAKAVTDDGFPTVSVVLSLHSEQNESSPQPTSAPSTTMLYERSTEGATGSFSDSFRGFEDSTLKPDRRKATENIIIDLDKEDKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDIDHTKPVYEDILGMQTDTDPEVQAGPHGSNEESSQVQEEYGAAVNLSLTEEKLEGSGGDTLLASYTQATHSESMTSEDRSQLDHMGFIFTTGIPIPSTETELDISLPTAASLPIPSQSTTVNPDIEEPKTEAKTLDDIFESSTLSDGQAIADQSEIISTLGHLERTQEEYEEKKYVGPSFQPEFSSGAEEALIDHTPYVSIGTIHLMAQRLTEAPTVMEGSNPPGYTDTTLAPSAFAKLSSQTPSSLVTVYLGSRASEHTEDLEPSALPGTDVGATQVSSGDSAKEAYENTEATFKPSLEKYFHITEPPSLSPNTELELSEDESKPKSLKEMEASPSELIAEERFEVHQKSRNKTDVQLSGETIKEFLSVRTPEAGTVVTAAGEIKLEGASQWPHSTSAPAIHGVKTGVVPQPSPQTSEKPTIPSSLEINPETQAALIRGEYSTVTASEQQVSAIILDSNTQATVSTAELNTELATPSFSLLGPSNESDFLIGINEESVEGTAVYLPGADRCKMNPCLNGGTCYPTDTSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCIDGFNTFTCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQIFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNPSAYQRTYSKKYFKNSSSAKDNSINSSKHDHRWSRRWQESRR	306498	429118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_355321_358301_378604_383876_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556_423740_423884
888596	contig_20779_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_112356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGACCCAACTGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2312	192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_-_200_2300
888597	contig_3866_pilon	-	5824	25	Intergenic	novelGene_112391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	290.050953378119	1534	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	2124	4193	177568	161587	FALSE	30	TACTCTTGTAAAATGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKREEERQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTPNSEGKSDSCSSDSETEDPLEKDLMNEELSPDIKEEVEKNENLNDDKLDEENPKIAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEQVVEVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFSQDEAGCEPQMEAQNLEFSSLDNKDFSSANEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEITNSLPQERTSDCIVSEGMKNLNFEQHFETENEGMPSLIAESNQCIQELTGEKFDSPAEETINIPLKEEEDAMPLIGPETLVCHEVDLDDLDEKDKNSMEDVVVESSESNSLVSVPPALPPVVPHNFSAASPLTLSQDESRSIKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFEASVASSTCSIIIQERESREKGQKRPNDGNSGLLAKKQKRTPKRTSAVAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKCTPVKHLSVSKSQKLARSPARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLNELDNMNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSSASSDTGMSPSSTSPPQNVLAVECR	223786	159955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_161691_164547_164695_165706_165914_169273_169379_169615_170750_172275_172418_174189_174275_177422_177621_180037_180262_180390_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
888598	contig_5018_pilon	+	3184	4	Intergenic	novelGene_47171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	121.672602594924	598	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	241	312	1548522	1548593	FALSE	75	GAAAAAAAAAAAAGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHLATKWLPEGDGRSLRAGKRRAPRPGDPKRKGGPGPTLSFVGKRRGGNKLALKTGIVAKKQKTEDEVLTSKGDAWAKYMAEVKKYKAHQCGDDDKTRPLVK	1545700	1551465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1545779_1546020_1546069_1548112_1548191_1548485
888599	contig_5686_pilon	-	8408	4	Intergenic	novelGene_45366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	7676	7981	131421	131116	FALSE	10	TCCCTTCTCCAGACCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDDVSGQTQRLVQKGYRSKSNRGSQLIGIPGWGVRRKRGTFSEPDKPDRKQKGRNGCMLDNNGPNSHKMPTPVEKASYSIFGNGATIDTVLELQPNAWT	436483	130688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_134705_136054_138270_229920_231125_435510
888600	contig_3602_pilon	+	2713	3	Intergenic	novelGene_60602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	40	714	902032	912941	FALSE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDAQGGGGCGQQLLCLLAALPGDRDVTGLT	901992	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912719_912852
888601	contig_6192_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_170331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	932	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAACGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133965	132165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_132200_134000
888602	contig_8453_pilon	-	3479	1	Intergenic	novelGene_125146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	5	18	407	424	293202	293185	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSWSSSCLCWGALSSVSCFCYSAVCVLKFACGFSTYSSHFRNYLSQPGFFVTSNENQAWTIKAEKELLTGYWEAHRTARKAADVGRQEGQEQGRPHTDGEDDTRSTSQSKCREGTLPPAAACASISAPAGLLVTRMCAHT	293608	290129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_290100_293600
888603	contig_12119_pilon	-	5219	1	Intergenic	novelGene_88695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	943	1290	427574	427227	NA	25	GTCAGGGCAATTTTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSCTKSTLNLFSIHFFSQFISKLQKFIAHDVYFWTNTHIQVAVEWISTHGNPMCVRVELCSIGFSVADSQKQIARLSFQGASVWTRTSNLRLAAKYVNRLHHAATLSGKTAHC	428516	423297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_423300_428500
888604	contig_18511_pilon	+	4151	11	Intergenic	novelGene_126859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	329.546491409027	1170	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	266	2041	47371	61308	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35373	63418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
888605	contig_8377_pilon	+	4324	29	Intergenic	novelGene_34909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_19	2284.90927425612	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1131	3396	129	3524	68257	197939	FALSE	45	ACAAATATTATTTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68047	198739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
888606	contig_4114_pilon	+	6948	2	Intergenic	novelGene_15602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1779	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	5845	6249	369282	369686	FALSE	0	GGTTCCCTGCTGTTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFRTVGLIPGAAFSVPMGPPEGARGFFFFSLGGLSGGRGASELAGAHQPEAGGSVGAGKVASWACSRKRLRLWWRCCCRAAWAFWWVSGSEDGGGASLWRMGDRDWAGEEAGASILILGLVGRASGRLNTDWM	304269	370385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_309974_369141
888607	contig_13244_pilon	+	3226	4	Intergenic	novelGene_86933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	533.689880819272	706	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	157	324	250894	252668	FALSE	15	TTGCCCCACTAATGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWRTGRRERRSRRIRNVLEPPEKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239758	255570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_247045_247121_250878_250935_252541
888608	contig_8594_pilon	-	1983	6	Intergenic	novelGene_140006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	835	1221	125742	125356	TRUE	5	CCCTCGGCCCAGGTCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQDHFCRAASWIKINSLLFLEGRGQAFSTTPMFSITCINIVTLQFLQFNPRYSLYFDGWNWKFGGLKGSLFINPNICTTELWKMHISILQIIITKNNFPTFMDRLSKYSILNFFLCFIHEVTKTLK	145376	83136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_83206_106423_106625_124863_126283_136958_137037_142134_142258_145283
888609	SIRV5	+	1954	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	41	34	13	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
888610	contig_6137_pilon	+	4660	7	Intergenic	novelGene_59168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	663.338379377792	10	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCCTGGTGGTGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239050	1310284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240523_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1308472_1308564_1309430_1309578
888611	contig_9091_pilon	+	4660	18	Intergenic	novelGene_32417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	591.993962140724	1955	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	4	651	2310	13675	TRUE	35	ATGCAAGATCAATGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVNVKANPKVIDTGGGFLLEEEEEEEHKIGQVVHQPGPVMEFDYTICEECGKEFMDSYLMNHFDLATCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCELEKREPALKFIVKKNPHNSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSLWKRETVAHQHEYGPEEKIEDDMYRKTCTVCAHELTYEKM	2306	44467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_2419_3892_3999_5988_6155_7078_7197_13526_16067_18581_18790_24579_24692_25320_25450_28659_28781_31154_31255_32012_32105_33092_33198_34423_34547_37956_38059_40451_40527_40774_40844_43445_43507_44146
888612	contig_11338_pilon	-	2918	2	Intergenic	novelGene_6321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_1	0	296	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCCCAGCAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250655	247011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_249784_250509
888613	contig_15029_pilon	-	2086	6	Intergenic	novelGene_128193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	51	626	172327	163104	FALSE	15	GTCGTTACAGTTTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172377	161643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
888614	contig_9981_pilon	+	3175	1	Intergenic	novelGene_121022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	262	456	10862	11056	NA	15	GTTTCTCACGTTACGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQEKLGLTRIRDRNWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYKS	10600	13775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10600_13800
888615	contig_9708_pilon	-	1652	4	Intergenic	novelGene_67258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	56.3698106751793	676	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	489	1361	50111	49239	FALSE	40	TAATAATAGTAATGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIEAYFERIGYTDSRKTLDLETLTDILQHQIRAIPFENLNIHCEEEMKLDLKTTFEQIVRGKRGGWCLQVNYLLYWALTTMGFETTMLGGYVYSTPDDRYSNNMIHLLLQVTIDGTNYIADAGFGCSYQMWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASVNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVKEVLKNLFNISLQKKLVPKLGDRFFTI	66334	48947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_50118_51271_51377_51992_52132_66096
888616	contig_2504_pilon	-	6003	4	Intergenic	novelGene_166846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	456	146	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	4583	4936	387514	387161	FALSE	55	AATACATCCTAGAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYMQNHKDSTRKLLELTERFSRVTGYKINIQKSVGFLYTNKENLEKEIRKTISFIIVSKKIKYLGINLTRDVKDLNKENYKTYCKKPKETYHIMLMDKKTQQCENVNPTQSDLQI	456789	386093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_390853_454975_455807_455972_456368_456771
888618	contig_9177_pilon	-	7071	49	Intergenic	novelGene_32608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	1531.6927793782	1	205	17	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	5375	6640	6586	2152	FALSE	15	CTACCTGTAACCTCTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	28453	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_6989_8959_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12854_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13694_13890_14089_14296_14417_14811_15111_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21683_21864_21967_22737_22894_23251_23348_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
888619	contig_14405_pilon	-	4311	10	Intergenic	novelGene_85638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	81.9671719894655	1074	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	30	1109	439454	434961	FALSE	5	TGCCGTCTCCCTCCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRLEDTGKMAAASGLVRRPLRQVSGLLRRRFHRTAPAALQVTVRDAINQGMDEELERDEKVFLLGEEVAQYDGAYKVSRGLWKKYGDKRIIDTPISEMGFAGIAVGAAMAGLRPICEFMTFNFSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGCQSVPIVFRGPNGASAGVAAQHSQCFAAWYGHCPGLKVVSPWNSEDAKGLIKSAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPEAAQSKDFLIPIGKAKIERQGTHVTVVAHSRPVGHCLEAAAVLSKEGIECEVINMRTIRPMDIETIEASVIKTNHLVTVEGGWPQFGIGAEICARIMEGPAFNYLDAPAVRVTGADVPMPYAKILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI	439483	431758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_435107_435411_435554_436262_436355_436694_436806_437339_437626_437761_437798_437895_437959_438043_438152_439270_439325_439412
888620	contig_14925_pilon	-	5100	5	Intergenic	novelGene_55206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	1548.89579620451	284	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCAAAGGCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97719	25800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_93556
888621	contig_6846_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_107302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGACTAAAGAGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211213	212603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_+_211200_212600
888622	contig_753_pilon	-	2674	13	Intergenic	novelGene_112961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	71	junction_12	236.955340377324	870	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	165	2255	1210648	1181585	FALSE	40	TTTATTAATACGCATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCGECAARRRVLTLAGFGCCRPEELGGGGSSKSSSGGGSSCEEVVTVATAASATMARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCDEHIQKLGSCITDPGNRETSGNTMHTVFHRDKTKDAHPESCCSSEKGGQPLPWFEHRKNVPQFAEPTETSFGPDSGKGAKSLVELLDESECTSDEEIFISQDEIQSFMANNQSFYSNREQYRQHLKEKFNKYCRLNDHKRPICSGWLTTAGAN	1210812	1181165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1181789_1182478_1182728_1183227_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755_1192870_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555
888623	contig_34_pilon	-	1983	9	Intergenic	novelGene_39992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_5	1466.36987468203	202	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	860	1711	224662	212049	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247115	211776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_228007_228270_230228_230387_243214_243354_246970
888624	contig_709_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_57529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAAAACAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1482538	1480079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1480100_1482500
888625	contig_5189_pilon	-	1742	7	Intergenic	novelGene_34843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1177.96670392484	5	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	111	632	244235	199210	FALSE	10	CTTCTCTAATGTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPELHSYWG	247751	198099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199230_220287_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
888626	contig_4531_pilon	+	3087	1	Intergenic	novelGene_47939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1616	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTCATTGTGGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701928	705015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_701900_705000
888627	contig_5669_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_86044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	304	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	75	434	117764	120224	FALSE	10	CTAAGCTGTGGGCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRGKLIAVIGDEDTVTGFLLGGIGELNKNRHPNFLVVEKDTTLNEIEDTFRQFLNRDDIGIILINQYIAEMVRHALDAHQRSIPAVLEIPSKEHPYDATKDSILRRAKGMFTAEDLR	117689	120509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_117922_120022
888628	contig_13740_pilon	-	3536	9	Intergenic	novelGene_34639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_5	3821.28777173023	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	173	661	165243	161045	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165415	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_160980_161270_161574_161722_161919_162031_165237
888629	contig_10599_pilon	+	3214	2	Intergenic	novelGene_49885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3005	junction_1	0	41	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATGAAGCCTGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160074	165611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_161488_163810
888630	contig_11422_pilon	+	783	1	Intergenic	novelGene_99108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCTGCTAGAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965	1748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_1000_1700
888631	contig_20819_pilon	+	2164	8	Intergenic	novelGene_55636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	511.03416555779	2087	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	20	1078	29817	42531	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	29797	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_40919_41309_41400_41530_41569_42519
888632	contig_7629_pilon	+	5623	27	Intergenic	novelGene_153585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1546	1845	367299	368695	TRUE	25	AAGCGCGCACCTCAAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKIVLQDVKAPYHLREDEHFMTSCFHFGKQLIDKDQFTSRLDHCLKMKIRSSWIICISKFSKYFLLSTFNKVWMITALPELHHSINQVRYISLSCSFG	347199	472634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_347207_347651_347776_348303_348410_350342_350432_350811_350975_353282_353479_353928_354130_356988_357098_360825_361007_361715_361883_365349_365544_367290_367507_368603_368854_368955_369104_370497_370675_374773_375019_378600_378722_387033_387175_387399_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391812_392731_392882_396941_397053_413488_413821_447709_449330_472386
888633	contig_9484_pilon	-	4469	1	Intergenic	novelGene_105648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	2	562	108921	108361	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHNEEDNSELSAIEQPSTSNPTPQIVQTAPSTPVLETDSSPPPYSSITVEVPTISDTEAYSEFYPVPPPYTVATSLPTYDEAKKTKAASVAAAAAETPQRIQECPPRDDFRDADQLRVGNDGIFILVFFVAFILNWFILCLSFCITNTTAGRYGAICGFGLSLIKSILNVRFSDYFTGYFNWQYWL	108922	104453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_104500_108900
888634	contig_12630_pilon	-	4439	6	Intergenic	novelGene_173072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	390	junction_1	30.1024915912288	845	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	52	942	100972	76619	FALSE	15	TTTTCTTGTGCAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRKCKPMKTETIQVSAEDEMQPYASYTEKNNQLYDTVNRVMTSQGLQTEVAGMDLHTLYVVGI	101023	73121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81810_81934_82253_100938
888635	contig_9468_pilon	+	3356	14	Intergenic	novelGene_59450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	279.012777803302	2157	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	217	2487	172913	207089	FALSE	55	AAAAAATTCTCACTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKAKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKMTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	150431	207958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189933_200359_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
888636	contig_299_pilon	+	5548	8	Intergenic	novelGene_129418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	225.236927410644	208	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	153	1685	841615	863323	TRUE	30	ATAAGCCCATTTCAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKFRSVHSLTICIYNLITLK	830681	875953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830734_832793_832887_841607_842679_860693_860915_863075_864197_867487_867619_869261_869497_873329
888637	scaffold_12124_pilon	+	2108	8	Intergenic	novelGene_22031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	581.872312243075	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	180	671	846536	852375	TRUE	25	CTATAAACTGGCGTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829556	858974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
888638	contig_6509_pilon	+	1890	2	Intergenic	novelGene_145622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	939	1634	72913	73608	FALSE	5	CGTCTTCCTCCTCTGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTLAWNALFFSESVPCRPPPFLCSRFFLTGFRDSTLEASEEQSDSLVSRVLVESDKELTSDQAGEEMVFQLSVLQCLECWSVWLGLCFWEAVLPWEEVEEAESELNREGSFNTSGDPLAQPELPTEPSSSSLPRGSLSDSEEQNLSLLFPNRTSLPFVSFFRFFFTLFFSFCCLELEDSRVLLPGSTACADSLSFSPVPMVTFTSSSSDVSDKMRCAAFFGAIVLFLV	71107	73864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_71996_72862
888639	contig_17522_pilon	-	1976	7	Intergenic	novelGene_160801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	602.685771267987	57	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	672	1031	94276	76631	FALSE	15	CTGCATATCTGTTTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWNAVIFGPEGTPFEDGTFKLVIEFSEEYPNKPPTVRFLSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTYDVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWNDS	96847	75685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_76760_79726_79816_87962_88053_92939_92966_94250_94332_95736_95890_96384
888640	contig_6304_pilon	+	4888	5	Intergenic	novelGene_122251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	246.428995858848	169	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	81	593	128711	180709	FALSE	15	TCTCGGGCTGTTCTGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELCGREYPPLPFSNAQVQGQPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPCVEIFSFHLVFGKTLWISGCFFSKQPLWLSCKRL	110495	185004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_110561_128695_128850_132145_132368_161430_161475_180601
888641	contig_1037_pilon	-	3288	2	Intergenic	novelGene_84615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1857	2492	539209	538574	TRUE	60	TGAAGCAGAAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILRRFSVSSSSVILSVFSVFSPFWNSSNSQIFAFDCIPHNSQGFFIFFLFLFLIFPHSCIQVFVFNFADPSSVVSNLLLSPCMTISISEILLFSFWISNCCFCMISGCEFILAFCSCIIFLNSSSLWSVFSMNLSAFSSFLSVFCFNSWIILNIRDSNFILCISSTISSAGKSSGVLFWMPAGTILSCFCICFDIVFCLRDVQ	541065	537417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_537649_538008
888642	contig_18850_pilon	-	3648	9	Intergenic	novelGene_142415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTCAGCACGACTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182363	171837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_171939_175234_175507_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_179146_180513
888643	contig_13863_pilon	+	1582	9	Intergenic	novelGene_42004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_6	310.713065986933	47	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	574	1470	69446	81541	FALSE	25	GTAAACTTGGTAGCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	68872	81653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
888644	contig_7051_pilon	-	5071	13	Intergenic	novelGene_64355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1784	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAATCCCTTCGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350422	321888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_328187_328266_330086_330163_331794_331924_334316_334504_335891_336116_337696_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343470_344164_344222_345362_345536_346865
888645	contig_9538_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_176456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCATACCCGGCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29731	28820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28800_29700
888646	contig_4305_pilon	-	2034	4	Intergenic	novelGene_136663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	672.042822709651	231	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGGAGCATTCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514683	511043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_512707_513070_513298_513934_514044_514648
888647	contig_8907_pilon	+	3982	7	Intergenic	novelGene_85858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3275	3760	1102900	1103385	FALSE	25	CCCAGCCGGAGCTAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTEPPVRARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPCRKGQRRLSESGTRAKGGGRQQVANENPKEVEKEKRGEKKIATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAALGPEPAAPGSRGAKEQRPRILARTAAQTWKQPHTRT	939506	1103607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_939782_1061997_1063282_1067056_1067162_1067744_1068336_1068533_1069011_1098730_1098859_1102485
888648	contig_5083_pilon	+	1783	2	Intergenic	novelGene_151703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1641510	1647134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_1642127_1645967
888649	contig_15899_pilon	-	3994	2	Intergenic	novelGene_128900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2517	2900	10603	10220	FALSE	5	TGCTTTTTTTCCCTGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIQFFHQDSLFPAVLAGKPLPGPWPLHCSGECYKTFLALPISDQRYPTPPVSLGPKELSFLALWAREPTAPSPAGLSCCCFSVTASLCLHVTAFFLCLLVPGVSQHRDAGFKGCALLLAVLPRWW	21788	9125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_-_12999_21667
888650	contig_6202_pilon	-	5357	9	Intergenic	novelGene_139833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	61.2943716828878	727	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	98	988	819326	787342	TRUE	25	CAGTTCAGTGGTAGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARRPGRVCPARRLLGELELGVRSQPLKEEAEMNVEPERKFGVVVVGVGKAGSVRIRDLRDPHASSAYLNLIGFVSRRELQSIDEVQQISLEDALSSQEVEVAYICSESSSHEGYVRQFLNAGKHVLVEYPMTLSRAAAQELWELAEQKGKILHEEHVELLMEEFAFLKKEVVGKDLLKGSLLFTAGPLEEERFGFPAFSSISRLTWLVSLFGELSLVSATLEERKEDQYMKMTVCLETENKRPLTWTEEKGPGLKRNRYLSFHFKSGSLENVPNVGINKNIFLKDQNIFVQKLLGQFSEKELAAEKKRILHCLGLAEEIQKHCRPEK	842341	781388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_783662_785245_787601_793402_793575_796822_796931_802319_802418_805202_805323_807584_807707_819314_819348_842265
888651	contig_4782_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_73660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	57	356	539213	539512	NA	70	AAAAAAAAAAAGGAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELVDVQPFQEVAYDRELMVLKEEVQAALKALAKNKAPEIDGISIEMFQQTDVELEVLTHLCQEMWKTATWPNNWKRSIFMPIPKKGDPTECGNYRTISLISHASKILLKIIQKRLQ	539156	541178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_539200_541200
888652	contig_12938_pilon	+	1843	8	Intergenic	novelGene_99713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	964.0583647333	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	493	1065	78117	85540	FALSE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51950	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_53392_53773_78099_78180_79040_79230_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
888653	contig_5247_pilon	+	3766	20	Intergenic	novelGene_81802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	166.643664155959	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2769	36	2804	144244	161215	FALSE	55	AGAAGGCACTTAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	144208	162177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
888654	contig_7963_pilon	-	2919	8	Intergenic	novelGene_58536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	143.031893118212	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	238	828	243778	240504	TRUE	20	TTGTACAGAGGGTTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245708	238101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_239114_239424_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_244098_244225_245606
888655	contig_1239_pilon	-	3646	6	Intergenic	novelGene_150414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	203.998627446363	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	99	662	684171	650485	FALSE	35	GGATAAGAGAGGGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNCLCALNLVYTLVSLLLIGIAAWGIGFGLISSLRVVGVVIAVGIFLFLIALVGLIGAVKHHQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEILGVWLTYRYRNQKDPRANPSAFL	684269	647500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_650560_654555_654670_664901_665016_665573_665619_666298_666452_684108
888656	contig_8729_pilon	-	3820	3	Intergenic	novelGene_40160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_2	327.5	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTCTAATTCTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770346	765007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_768822_769446
888657	contig_11316_pilon	+	507	2	Intergenic	novelGene_122651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137831	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138135_138665
888658	contig_10793_pilon	+	1303	15	Intergenic	novelGene_83380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3184.70673368708	11	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	518	895	160548	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152878_159196_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
888659	contig_6576_pilon	-	3955	10	Intergenic	novelGene_42257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	726	junction_7	386.645721016342	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	151	1302	339439	323781	TRUE	65	TAAAAAAAAAAAAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	339589	320978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_324102_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
888660	contig_16103_pilon	-	390	3	Intergenic	novelGene_118683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1097	34	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	56	319	18020	17614	FALSE	5	GCTCCCTTAGTCTCTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLSSLLRGDLVRQNLGTMLTDLENAMDSLITVYHKYSLVKGNAHALYKDDLKNLLQIEGPCYLKDADTWFKELDINSDNAINFQEFLILVIKMGVIAHHDIHKE	18584	17542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_17737_17879_18042_18550
888661	contig_7202_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_18568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27939	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28169_28486_28634_29797
888662	contig_14333_pilon	+	3391	1	Intergenic	novelGene_49133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCATGTGAAATACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422285	425676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_422300_425700
888663	contig_5031_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_133173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23286	21949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_21900_23300
888664	contig_9653_pilon	-	2493	8	Intergenic	novelGene_48292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1102.48106096927	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	125	1174	1016667	1006903	TRUE	15	AAAGTGTGTTCTGGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHLQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1016791	1005452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006170_1006300_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595
888666	contig_9815_pilon	-	1967	2	Intergenic	novelGene_164247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	0	774	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGAGTCCGAATTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85671	80057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_81269_84915
888667	contig_9527_pilon	-	1320	2	Intergenic	novelGene_134035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAAACACAACATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256032	249332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_250631_256010
888668	contig_9389_pilon	+	3571	22	Intergenic	novelGene_83946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	87	junction_15	656.922230044417	1755	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	411	2267	193753	201567	TRUE	5	GTCTGTCTTCTCTGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFSFPQELPRKDGADTASLGPGLESPAAALNVKATGTLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAGSWTLGRGHRSPLTAASPAELSAEGPCPDAIDDIAHLLADVARFAEGLEKLKECVLREDLLEARRPLAHECLGEALRVMRQVIFKHPLLNTVETLTAAGNLINKVKGFHYESNNEADKREFEKALETIAVSFSSTVSEFLMGEVDVSTLLSVPPGDPSQAMEHLYGQGGEGTPPSTEDCDGGCPPPEEVDMLLQRCEGGVDEALQYTKNMAKYMKDIIAYLEKRTVLELEFAKGLQKLVHNCRQSVTQPHMPLLSIYSLALEQDLDMVQAAGGLQTQSFLQPLTQRRLEHEKRRKEIKESWHRAQRKLQDAEANLRKAKQGYMQRSDDHTKARLLVAKAEDEQAGGGPGAGGAASKSLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQELEDTKVTALRQLQDVVRQSDQTIKAATISYYELMHKQTAPLPVNFQMLCESSKLYDPGQQYASHVRQLQRGGGAGRALRLRAPRLGRRLVPGNARSQGQLQCQRCGGGGSRQPLRGRRIRRGGGDQGAEGWARTPGAQVLAQLRLRIRQQPGSGARLRGLEEVRADLVQRHHVVQRGGGPGGWPGGIGLRAGRPQRRGPRAARGRAQRALPQRGAVQGGADPPPAQAAHACQVSRVQQLRVLPGRRVRGVLPGLSQEVPGDAGHPVWPQEAAGPAAALRPGLRQGGRQHRRRRALHHQEVRGRD	190637	204698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_190989_193693_193838_194772_194858_194934_195008_195108_195176_195406_195545_195633_195696_195814_195914_195998_196080_198373_198563_199478_199617_199851_200044_200523_200646_200730_200815_200899_201002_201105_201279_201400_201590_201664_201803_201954_202194_202333_202545_203757_203852_204098
888669	contig_6364_pilon	-	6385	16	Intergenic	novelGene_51715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1075.14639003254	420	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	557	1915	472628	436151	TRUE	45	AACAGAATTGATTAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521240	431643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_432340_432376_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_486627_486722_490716_490802_521045
888670	contig_3956_pilon	+	3129	15	Intergenic	novelGene_14875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1104.50174610222	663	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	506	2605	1284132	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282875_1283810_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
888671	contig_11396_pilon	-	1803	4	Intergenic	novelGene_71333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	63	junction_3	120.593900711806	99	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	905	1360	492260	491454	TRUE	30	TAAAACCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPWNHPSPWGKGEKGPGWGESDLALGGSVPHPGVSLPPSPYPVPLASLHCESYRYPCPSHDHHHCPQTLWTLPGALRPGPELEAAWSHVADEDDGGEDLSDKWPLHHPDNPGLIRPLRRSPGGVISAGAGWGDAGSSPPHKTCGMLEEK	493164	477749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_477984_478315_478373_491301_491528_491878
888672	contig_2087_pilon	+	4029	3	Intergenic	novelGene_65548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	522	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2346	2828	7310	8404	FALSE	35	CGACAACTAAAATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPARARGIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPRRKGQRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKATPAAYKRHPESRPPGRAESKQPAALGQEPAAPGSRGANEQRPRDLTRAAAQTWKQPHTRM	4694	9605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_6386_6655_7397_8008
888673	contig_14441_pilon	+	1079	7	Intergenic	novelGene_100435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435.204070906205	5	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	491	1039	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81902	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82200_82241_82358_121181_121239_125517_125902_126159_126283_126514
888674	contig_9161_pilon	+	7567	4	Intergenic	novelGene_160636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1026	junction_2	136.101269485466	18	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	488	1003	54710	63414	FALSE	25	ATAATTTCCTTACCGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQTPKNKATVFKLCSICLYLPQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	54222	69978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_54842_56680_56804_60940_61076_63288
888675	contig_5686_pilon	+	4268	5	Intergenic	novelGene_45246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2724	junction_2	1343.33454042543	40	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	55	402	93843	171803	TRUE	45	TCCATAAAGATTATAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLE	93788	179726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_172587_175535_175560_176667
888676	contig_11850_pilon	-	2926	7	Intergenic	novelGene_125215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1367	junction_6	533.675853554071	980	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	168	1430	286754	282879	FALSE	30	ATAATTAAGGCACGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLTSRSLSHWRSRAPRQLAPLLPSLAPSSSRQGARRVQRHVTAQQPSGLAGGTAIKGGRRRRPDLFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286921	281382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
888677	contig_11318_pilon	-	3335	18	Intergenic	novelGene_48131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_17	976.00032971235	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	138	2162	49795	14674	TRUE	35	TGCAGAATTGCACTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGMLSFPSFLPFLLFS	58326	9034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58237
888678	contig_8616_pilon	+	1172	9	Intergenic	novelGene_72500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_7	210.797147751102	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	479	1081	337780	339244	FALSE	10	TACGCGCTTGACTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336741	339335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
888679	contig_18916_pilon	-	1389	10	Intergenic	novelGene_136873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	295.146835187145	570	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1200	190	1389	42002	13046	FALSE	15	GTTTGTTTGTGTATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATGRQVGPGRFRGISCSRPRRRCAPRRWRGSARSRKRKKVDNDYNALQERLSTLPDKLSYNIMVPFGPFAFMPGKLVHTNEVTVLLGDNWFAKCSAKQAVGLVEHRKEHVRKTIDDLKKVVKNFESRVEFTEDLQKMSDAAGDIVDIREEIKSDFEFKAKHRIAHKPHSKPKTSGIFEADFTDDVKSNKLLADTELWARLEELERQEELLGELDSRPNTVIANGEDTTSSEEEKEGPDPDVNVEHQETDTVIPSSCHKDLTNSELFSGQVNSQLNCSVNGSNSYYSNDDDDDEDDEDDEDGDSGNEHDALGVGDNSVPTIYFSHTVEPKRVRINTGKNTTLKFSEKKEEAKRKRKNSSGSGHSAHELPTIRTPADIYRVFVDIVNGEYFPRKSILKSRSRENSVCSDTSESSTAEFDDRRGLLRSISYEEAACSDSNENILEEEQEEENYQKKHLPLSGAPE	88141	13045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_13299_14082_14226_16159_16506_18526_18696_20454_20513_20722_20815_40932_41069_41999_42079_87714_87766_88079
888680	contig_2069_pilon	+	2628	14	Intergenic	novelGene_23258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.41800930136	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1089	1805	341330	343975	FALSE	35	AAAACATCTCTTTGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324012	344798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332215_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334815_335675_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
888681	contig_14970_pilon	-	1931	8	Intergenic	novelGene_45105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	132.024271114312	340	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	453	1235	291083	264487	TRUE	10	TCTCGATAGCTGCCTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315850	254888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_255535_264436_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
888682	contig_5669_pilon	-	5519	4	Intergenic	novelGene_86081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	187	510	250853	250530	TRUE	15	GGGCAGTTTTACTCCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKIDEVSPSLLLKEHFGCTSSKTDLFVLLVVHGIFSILRQHHNSKVSIFLWSSLFIAQLLHVHEAVENTMAWVRHTLVFKVTSLLFNTLKRSFAADLANAMHYLIS	251077	190141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_193360_193691_195364_250410_250909_250946
888683	contig_10722_pilon	-	3441	9	Intergenic	novelGene_70962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	319.219751895148	40	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2129	2455	6730	5789	TRUE	30	TAGTACAATGGCTGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLSPLA	16275	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5804_6213_6328_6423_6529_6637_8562_9665_9787_14297_14446_16247
888685	contig_5586_pilon	+	2661	9	Intergenic	novelGene_143556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	589.594564086203	28	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	364	972	384614	391388	TRUE	20	CAAATCTGACGTGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLCCRLVVPCHKGMPRLTDLSVKTKDVWEIPRESLQLIKRLGNGQFGEVWMGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGWAIPVLLHLHGDLEGSLHRERNGAASLLSSWFLQESSIPIRKHQLCTH	369215	416942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_384729_387852_388018_391059_392877_392979_393128_416889
888686	contig_11924_pilon	+	2324	8	Intergenic	novelGene_128014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	200.858870140917	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	128	562	38821	58684	TRUE	25	ATAACCTCTTGTATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRNRGGRGAAAAAATTSIEVAEGAERRGESPTRKPNSEPGFTMKRIIQNHLLQSNRQLQTQHHRLSRLLLQHQYLRPTLPLHLTVVLLWKYLQLQIQKLTVSFIPCHLPTVLLPLFLHTMKLRRLKLLQWQLQQQKHLKQFRRKSVHQEMTSVMQTSLEWVMMASSCWRFSWHLFSTGLDFVYPFV	10965	72567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_11086_38813_38980_42072_42207_50560_50655_58636_58762_61408_61476_64467_64574_71055
888687	contig_5628_pilon	+	4281	6	Intergenic	novelGene_157568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1799	201	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	346	666	170593	170962	TRUE	45	ATCCAATGTCCCAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNILMVSILLRLALRPNMLSILENIPCALEKKVYLAAVGWSVLYMSMRSSGLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFSDSGVLKSPTTIILELCRWVCKYLL	170247	219574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_170872_170920_171191_174376_174932_215982_216236_216509_218138_218623
888688	contig_18162_pilon	-	1384	3	Intergenic	novelGene_122311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	430	762	10629	8472	FALSE	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGVGLTEKWPLRKDLQDMRELAMRMPGEGLPGRGTSSANTLGQERARVLGAARRAVGLEQTVAEMRPEVWSDHVGPLHQKVFFFLFPLSEMRSYKTILSRRETWYDGL	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8802_10626_10809_16363
888689	contig_10734_pilon	+	1132	4	Intergenic	novelGene_51360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	16.6733320005331	208	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACAGATGAGTTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781343	1787983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1781700_1781738_1783470_1783581_1787234
888690	contig_4093_pilon	+	2932	7	Intergenic	novelGene_27611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCGCAGACACGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39603	72547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_40826_40877_41797_45447_45543_45618_45782_46299_46428_68954_69260_72447
888691	contig_16322_pilon	-	3754	14	Intergenic	novelGene_87526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	154.512441811513	651	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	352	2058	103834	77890	FALSE	20	TCATTGAGGTATGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	106707	76193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_106379
888692	contig_9183_pilon	+	6173	7	Intergenic	novelGene_40275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	117	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2993	3361	304394	304762	TRUE	70	CATAAAAAAATACTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTIKDKEGQTITINAQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRIKRELRDWEKMFGQYKSDKGLVSIIYKKIQYLYNKKTNNPIKKWAREMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQI	300783	535527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_301059_301676_305029_368275_368373_383679_384810_412290_412751_520979_521395_535083
888693	contig_2062_pilon	-	2004	2	Intergenic	novelGene_139045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCCTCCGCCCAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216979	1214902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1215884_1215956
888694	contig_5003_pilon	-	2160	8	Intergenic	novelGene_120205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	270.066658438246	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	57	1766	139635	133447	FALSE	10	TTTTTGAGATGTCCTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPGAACRQSSLEVCCGEKMAVAVRTLQEQLEKAKESLKNVDENIRKLTGRDPNDVRPIQARLLALSGPGGGRGRGSLLLRRGFSDSGGGPPAKQRDLEGAVSRLGGERRTRRESRQESDPEDDDVKKPALQSSVVATSKERTRRDLIQDQNMDEKGKQRNRRIFGLLMGTLQKFKQESTVATERQKRRQEIEQKLEVQAEEERKQVENERREEEEKEVGIVHSDPEKEQEEEEQKQEIEVKMEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139691	133052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134580_135825_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
888695	contig_8866_pilon	-	4175	1	Intergenic	novelGene_77824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTGGCAGCAGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562969	558794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_558800_563000
888696	contig_8330_pilon	-	1936	13	Intergenic	novelGene_71794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	901	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGTAAGGGGATGGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857550	837516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837681_852602_852685_853008_853124_853232_853355_853899_854058_854993_855090_855283_855348_855432_855535_855624_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
888697	contig_4857_pilon	+	5794	6	Intergenic	novelGene_48764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6221	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	5217	5528	1436195	1436506	FALSE	35	AATTAAGGTATGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFEEFKTLVEEVTADVVEIARELELEVEPEDVTELLKSHDKTLMNEELLLMDEQRKWFLEMETTPGEDAVNVVEMTTKDLEYYINLVDKAAAGFERIRLQF	1209586	1436772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1212354_1213435_1213531_1214578_1214707_1216721_1217375_1273718_1274078_1434980
888698	contig_19032_pilon	+	3048	3	Intergenic	novelGene_172526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	79	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACCAGTCGGCAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144354	148299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_146727_146810_146875_147687
888699	contig_4924_pilon	-	6787	12	Intergenic	novelGene_84642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1089.7235224459	131	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	20	925	252576	82377	TRUE	15	AATACTTGTTTCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252595	60050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_60763_60854_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
888700	contig_13041_pilon	-	5759	4	Intergenic	novelGene_127722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3708994574027	1109	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCCGAGCGCTCACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270251	250249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_250643_256716_256871_262854_265638_267822
888701	contig_14970_pilon	+	4601	6	Intergenic	novelGene_45076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	450	junction_1	5198.43945814511	82	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTCTTTGTGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207464	232247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_207823_210762_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
888702	contig_11337_pilon	+	2627	10	Intergenic	novelGene_107165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_3	146.315573038485	1080	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	238	1731	127468	172617	FALSE	20	GTCTGGTAATTTTTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVLGVRRRQPGGRRGSAAEAAKAGEGLKVCTCLRGEGARERYLRDNKFSQPASLLPGVSQTPPISQLLKEEEEDLSKAMSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102513	173513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102737_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
888703	contig_18272_pilon	+	6632	3	Intergenic	novelGene_7052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	140	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2479	2778	473715	474237	TRUE	20	TGCTGGTACCATGTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGALRVREVKALPAVPGGFLIAESDGLLMTCVFGPLGEGPTGAVPGPATQRCCFRRMLKGSSRLTCSREAEDLGFRFFQCLPLRLLFMQQISFYFSKI	471236	489196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_473964_474186_477135_488239
888704	contig_11855_pilon	-	1590	3	Intergenic	novelGene_67054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	1179	1589	2007337	2002254	FALSE	45	TGACAGGGAAGAAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVLVRTGSQEGQVRTWGRRLFKYPHPLTAFWGLPFEDIAVIGPRGGSKGKDWRWAALFQEGRVTWRGGFVAGDGCQLLDCTPVLLVAGAARWLGGCQGHGGRAGQVARLQGKEGRIAAAALGRGGGTVPIGDIED	2008515	2002252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2002454_2004011_2004165_2007279
888705	contig_9668_pilon	-	2464	13	Intergenic	novelGene_58184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	940.080788490483	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	569	2110	585955	503644	FALSE	20	TTTTTCCTGAAAGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKDLNLALPSPMVRFPRLHILLVLFSLRSRDRWNHPRITCQPLVTRTSKRPEPITFPSPASRRLHLYDDHQTPAAVRCYPPSPRVPPESSQPRQTIFCRPRRRRPWKRSISRSRLRLRPRIFTKHPRTLCLPHRLRLPGSWGLYCLLPRPHPPSPLNPGSCPTLSPESYPFHQRGKRTRVHPAGEKVGSKILCQIS	669976	503289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599014_605301_605374_610344_610514_669741
888706	contig_12677_pilon	+	813	1	Intergenic	novelGene_110877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2953	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3000_3800
888707	contig_7129_pilon	-	3621	16	Intergenic	novelGene_169308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.468298956197	649	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	28	909	964522	945975	TRUE	25	CAAGGTTGACTTCCGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDDVIWDTLGNKQFCSFKIRTKTQSFCRNEYSLTGLCNRSSCPLANSQYATIKEEKGQCYLYMKVIERAAFPRRLWERVRLSKNYEKALEQIDENLIYWPRFIRHKCKQRFTKITQYLIRIRKLTLKRQRKLVPLSKKVERREKRREEKALIAAQLDNAIEKELLERLKQDTYGDIYNFPIHAFDKALEQQEAESDSSDAEEKDEDDDDEDVGRREFVEDESDISDFEDMDKLDASGDEDEDDKSSSEEEKALNAKHKGKTPLKGPLRRKRAYVEIEYEQETESTTKAQTT	964549	934189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_935465_936749_936936_939950_940042_941515_941705_941783_941926_944164_944330_945310_946167_946321_946376_947142_947257_948254_948330_960097_960153_961269_961422_961616_961682_961779_961890_961981_962032_964507
888708	contig_1450_pilon	+	2765	4	Intergenic	novelGene_27418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	835.328810841708	1352	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	60	AAAAATCAATAAACCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423301_423344_424776_424925
888709	contig_10345_pilon	+	1261	12	Intergenic	novelGene_158379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2553	junction_8	528.620346822159	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	348	1010	14227	24141	FALSE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	11700	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
888710	contig_16578_pilon	-	3760	3	Intergenic	novelGene_148694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	365521	360092	TRUE	45	GGAACAGAAGACAGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCNQVFELAQLVLVLRVVPDILLSEEGLLVLGKPSHDSRVHNPIQQHGERVNGEALVILVLVYHHQDLLVGRGHGLDGVLQGANCGLLKIRSPRRKGLSRLP	365521	352669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_354974_358947_360318_365435
888711	contig_8140_pilon	-	4264	3	Intergenic	novelGene_86446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2049	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	602	1351	773621	772872	TRUE	50	ATGTACAACAAAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTTPKYLQKQDRIVLVGIQNKTPDKFSVEETALELPDREFKSLILRIIQELKQKADINKEKKRQNLGKGRQLMENTDKKMEEFRNIMQEQNAKINSQLDIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVREGLRSRFETVADRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTFQLLGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDENLAIQEAQRTPNRIDAKRKSQRHIIITLIKTKDK	775154	764415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_766923_772465_773923_774854
888712	contig_2125_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_147744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATGTTTTGACTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682342	683271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_682300_683300
888713	contig_4836_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_178554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1108	1425	2307	1990	NA	5	TGTTCTTCTTACTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTINVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	3414	1611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4836_pilon_-_1600_3400
888714	contig_13481_pilon	+	2225	6	Intergenic	novelGene_119559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	526.909631720659	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	81	617	1568681	1586220	FALSE	20	ACTATTCCTTATGTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568600	1587828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576656_1576769_1576791_1578050_1578132_1586080
888717	contig_8317_pilon	+	965	2	Intergenic	novelGene_19337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	971	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16185	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
888718	contig_6291_pilon	+	2239	2	Intergenic	novelGene_164797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTGGCTATTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382926	386818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_383265_384917
888719	contig_7179_pilon	-	4016	1	Intergenic	novelGene_78064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	748	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTTGAATTGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402773	398757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_398800_402800
888720	contig_2798_pilon	-	4669	5	Intergenic	novelGene_120012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	68	junction_1	784.968590135937	146	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	502	939	116665	115557	FALSE	55	TGGCTAGTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASADL	193502	111826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115565_116235_116680_120452_120595_170381_170519_193294
888721	contig_6062_pilon	-	1776	4	Intergenic	novelGene_5318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	759	junction_3	22.1259023670348	550	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828606	821143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_822725_823326_823372_824526_824643_828572
888722	contig_6137_pilon	+	5504	2	Intergenic	novelGene_59229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATCCCAGCATCAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312279	1318008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1317328_1317552
888723	contig_10973_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_150388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	765	1277	2730	2218	NA	45	ATTAACATTAATCAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3494	1569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1600_3500
888724	contig_6102_pilon	+	3748	30	Intergenic	novelGene_31886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	488.865018123923	3486	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	96	2336	372568	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPGDISAPPPKSLGVSSPLWASDQHLSGKPEAEVCSSLSLPPCPQVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	372472	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378930_379396_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
888725	contig_20199_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_82555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	197	532	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44183	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
888726	contig_12786_pilon	+	2413	3	Intergenic	novelGene_103373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGACCATATGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478365	596967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_478730_517821_517915_595011
888727	contig_16187_pilon	-	3911	7	Intergenic	novelGene_101063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_5	54.5509445890312	766	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	330	815	47874	41457	FALSE	15	CCGTGGCGTCAACACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILRSVVQRPAGSLQTVTKGTESLICSDWIRHKFTRSRIPDKVFQPSPADHEKYGGDPQNPHKLHVVTRIKSTKRRPYWEKNIIKMLGLEKAHTPQVHKNIPSVNAKLKVVKHLIRIQPLKLPQGLPAKEDMSETCLRSTGELVLRWDLTPGPQEGIKS	53222	38360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_41962_42110_46088_46170_47823_47902_48721_48836_53034
888728	contig_4013_pilon	+	3052	3	Intergenic	novelGene_178556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	86	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTATTTAATTCCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176	5055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4013_pilon_+_1255_1951_4008_4137
888729	contig_3155_pilon	-	1571	3	Intergenic	novelGene_26441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	51	junction_1	212.5	768	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTATCATCTAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332689	319679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_321040_321619_321701_332559
888731	contig_18108_pilon	+	2837	7	Intergenic	novelGene_33471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_3	116.683927294589	2625	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	59	913	226815	260192	FALSE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLRLRQQRRESGASGSNSMAEKRHAPDNQARRLPDSFKDSPSTGLGPCGWILVAVSFLFTIITFPLSIWMCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226756	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
888732	contig_17829_pilon	-	5818	15	Intergenic	novelGene_157029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_14	76.8525290702251	1058	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	59	1900	57091	26860	FALSE	40	AAAAAGCCCTGGGTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRVRGGELAGCFAARARPAMLAGSCAPREREAEGNGAGAVPAPPAIDFPAEGSDPKYDESDVPAELQVLKGPLQQPTFPFAVANQLLLVSLLEHLSHVHEPNQGRSRQVFKLLCQTFIKMGLLSSFTCSDEFSSLRLHHNRAITHLMRSAKEKVRQDPCDENSHIQKIRPREVAFEAQTSRYLNEFEEIAILGKGGYGRVYKVRNKLDGQYYAIKKILIKGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCPYVMVSVATKIFQELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACTDILQKNTDWTNRNGKGMPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKSDMYSLGVILLELFQPFGTEMERAEVLTGLRTGQIPKSLSKRCPVQAKYIQHLTRKNSSQRPSAVQLLQSELFQNSGNVNLTLQRRVIEQEKEIEELKRQLSLLSQDKGV	57149	22941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_26959_28032_28267_29240_29324_29537_29653_36213_36315_39444_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439_44521_45061_45162_45846_45885_47172_47307_48431_48591_56973
888733	contig_13984_pilon	+	1317	8	Intergenic	novelGene_130230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	1801.37859905764	368	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	366	1316	6215	24085	FALSE	30	TAGGATATATATGTATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVAEYKQLKDTLNRIPSFRKPERAQEQTVPPAAAHSPQGYSTKEKLTEEQQQQEVSRNIDEGQKHEAVPGRTEDTQPYPPTQKGPEIQAPAELNQQEAEPREPEERQVEEEHRKALEEEEMEQVGQAEHLEEEHDPSPEEQDQEWKEQQEQKEEANRLEGHAHAEVYPSAKPVTKLQSPFEEQLEQQRLAARQAEEAQRLRERQEALHQQRLQGHLLWQRQQQQQQQNQQQQNQQQQQQLRERELSRQRQAKREEGQQQRQERLRQQAHYDAMDNDIVQGAEDQGIQEEEGGAYERDNQHQGEAEEDTDNGHEPREQRPREDNPESEADRAAVEDINPADDPNNQGEDEFEEAEQVREENVPDENEEQKQSNQKPENAEMEEHLVMAGNPDQQEDNVDEQYQEEGEEEIQEDLTEEKKRGLEHNAEETYGENKENVW	3690	24086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_3858_6016_6350_7981_8281_9101_9185_11084_11195_14292_14461_14791_14861_23998
888734	contig_11978_pilon	-	1993	2	Intergenic	novelGene_62848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCATAGGCCCTGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571204	564856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_564921_569275
888735	contig_253_pilon	-	3308	7	Intergenic	novelGene_129753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	247.841178983639	5	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	240	719	712630	703395	FALSE	40	CTAAAGTCACTATGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPARPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMECCICNEIVHPGCLQMDGEGLLNEELPNCWECPKCYQICSLPSGLPLVTPSPSSTWQVAIN	726433	700805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_703410_703697_703759_709863_709929_711519_711652_712423_712694_714364_714449_726341
888736	contig_4604_pilon	+	3537	19	Intergenic	novelGene_19133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	1299.15523003542	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	438	2612	358980	379856	TRUE	40	GAACACCACTAGCACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339842	381085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_380080_380383
888739	contig_15596_pilon	+	5797	8	Intergenic	novelGene_139543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1157	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCCAGGAAGTGCGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193524	217215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_198135_199636_199846_201847_201929_204475_204712_206208_206328_206575_206825_215681_215828_217068
888740	contig_7963_pilon	+	2181	4	Intergenic	novelGene_58422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	155.39269252088	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	31	534	89963	92106	TRUE	25	CTTCTTTTGACAAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSGVLTVGLHILMTLPSPQEAGAIQADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDGEQLFSVDLKTKEAVWRLPEFGNFAHFDPQGGLVSIALIKAHLDALVERSNRTRATNVPPKVTVLSKYRVELGQPNILICIVDNIFPPCNQHHLAAQWSDNHPGCGPDQLLFPA	89932	95518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_90045_91241_91491_91933_92221_93985
888741	contig_10003_pilon	-	3734	1	Intergenic	novelGene_88252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	2480	2905	734814	734389	NA	10	CGCCAGTTACCGGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAFSMNLSVLSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSAFPSTGKSSGVLFWMHTGTILLCFCKCFDIVCCLWSILCAQYFSPPSSVGRVSHSCTAGQVQLKGSGWDGVFLAHTRADSAESESEQSRFIKPYLCCLGV	737293	733559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_733600_737300
888742	contig_5728_pilon	-	2502	11	Intergenic	novelGene_126701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	372.669344057168	751	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	253	2418	371460	344906	FALSE	25	TTTGCATTGATGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVYGTCAPRNPCLWVLGSTRASLQRCFRQLSSLTCGAVVGVLIAMAPRGWRPRTLKRCLREVSKATEQPECFLTIQDGLASNFTSLTKVLYDFHKILEYRSIRASPLKKLVINNFDDEQIWQQLELQNEPILQYFQNTVSKTIKDEGISLLPETEEQECKEDGSEMEADGQEDLEQDLEEGEVSDLSGDDLKGHESTKHLSKSDLRESPDFSDEDSDRDFDIDKLEQQSKVQNKVPRKPREKSIVDDKFFKLSEMETFLENIEKEEEQKDGEEEEDIDFFEDTDSDEDEGGLSGSQKLKSGKNSRNLKYKDFFDPIETDEDIASDRDELGSNEEEEIAEEEEESVFEMDEDNDLEESEDSKQHKECLKRVTFALPNDEETEDTNTSNVKKNSDEVKSSFEKRQEKMNEKIASLEKELLEKKPWQLLGEVTAQKRPENSLLEETLHFDHAIRMAPVITEETTLQLEDIIKQRIRDQAWDDVVRKEKPKEEAYEYKKRLTLDHEKSKLSLAEIYEQEYIKLNQQKATEEENPEHVEIQKMMDSLFLKLDALSNFHFIPKPPAPEIKVVSNLPAIAMEEVAPVSVSDAALLAPEEIKEKNKAGDTKTAAEKTATDKKRERRKKKYQKRLKIKAQEKWRKLLEKSHPDQEGKYTKAVASEKLKKLTKAGKAALLKDEGKDKALKSSQAFFSKLQDQVKMQINDAKKTEKKKKKTQDISSHKLKL	371712	344821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_345056_345507_345739_346761_346870_350345_350457_353444_353583_354444_354513_355358_355501_367726_367899_368202_368349_368941_369618_371236
888743	contig_11337_pilon	+	3587	10	Intergenic	novelGene_107167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	192.065446664592	1285	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	1170	2696	103726	172617	FALSE	35	AAAAAGTCTGGTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFVQDLSKAMSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102556	173508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_103745_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
888744	contig_3822_pilon	-	2099	13	Intergenic	novelGene_133306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_11	1012.33117591143	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	1363	2097	292774	277219	FALSE	75	AGAGAAAAAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSE	306102	277216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296998_299561_299696_305985
888745	contig_5003_pilon	-	2282	10	Intergenic	novelGene_120207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.796149930569	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	990	2030	134487	133447	FALSE	20	CTTTGTCATCTTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139668	133194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134589_134727_134790_135531_135671_135748_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
888746	contig_10252_pilon	+	2747	2	Intergenic	novelGene_162915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1406	1846	107659	108099	FALSE	25	TCTTAACAGTGTCACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNTASGFVEEPLTTCNDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNRKKRKILVTGPVSNIMINKNIEVVKDFILLGSAISAHGNSSQEIKRHIALGISAAKDFFKVVKSKDVTLSTKVCLTHTIVFLFASYACKGWTMNKED	87978	109000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_88013_106287
888747	contig_7408_pilon	-	2359	7	Intergenic	novelGene_168730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	216.410617936264	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	432	1511	38514	12597	FALSE	35	AAGTTCTGAGTGTACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48342	11748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47312_47360_48039
888748	contig_10126_pilon	+	3614	7	Intergenic	novelGene_105754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	898	junction_1	1505.44585496199	1520	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	103	705	165426	166639	TRUE	25	GTAACAATGACCCCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	162219	186768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181575_184074
888749	contig_7272_pilon	-	938	2	Intergenic	novelGene_25337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	349	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAAGTGTTGAGAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595535	592730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295
888750	contig_5780_pilon	+	4192	5	Intergenic	novelGene_29783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_4	104.67897353337	93	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2337	2726	111869	112258	FALSE	20	AGGAGTTTTGCATGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	73990	113724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990
888751	contig_3822_pilon	-	1337	13	Intergenic	novelGene_133316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_11	1016.04145735081	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	606	1337	292774	277222	FALSE	70	GAGAAAGAGAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDS	306106	277221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296237_299561_299696_305985
888752	contig_10734_pilon	-	1351	4	Intergenic	novelGene_51528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	514.578360299856	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	100	600	2305085	2282506	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPECRREHCVQVPEWTQPPPVSVLVLPLLAPHRPISPIVPHPQDTLLQ	2305184	2281754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2282644_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
888753	contig_15787_pilon	+	3153	1	Intergenic	novelGene_143975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	973	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63916	67069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_63900_67100
888754	contig_11026_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_167668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACTTTTGAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167564	165341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_165300_167600
888755	contig_16978_pilon	+	1690	2	Intergenic	novelGene_168547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	551	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACTGCTGACCTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14715	18921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16978_pilon_+_14826_17341
888756	contig_4065_pilon	-	1655	2	Intergenic	novelGene_133412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	893	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852251	850160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_851400_851835
888757	contig_5684_pilon	+	3555	3	Intergenic	novelGene_81068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1329	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2280	2786	446533	447039	FALSE	15	TCACCTTCATATGCTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	443492	447808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_443624_444050_445328_445661
888758	contig_7839_pilon	+	2480	12	Intergenic	novelGene_45728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	594.330639535696	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	95	2197	952473	956984	FALSE	5	CACTTCTGCTCTCCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950904	957267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953983_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
888759	contig_2093_pilon	+	2238	2	Intergenic	novelGene_152986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGTTTGTTTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352499	1355071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1352596_1352929
888760	contig_6361_pilon	+	3336	6	Intergenic	novelGene_23929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	190	417	283552	283779	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHICAHSKKGGTTECGNCQTVSLISHTSKILLKIIKKWLQQYIDGELPEIQAGFRQGHGTRDIMADVRWILAESREYQNDIYLCFIDYAKAFDYVDHNKLWITFRRMGIPEHLIVLMGNLYIRPGGCSSNTTRGYCVV	283362	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_283802_405183_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
888761	contig_15172_pilon	-	694	1	Intergenic	novelGene_158746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCCATTTGAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238026	237332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_237300_238000
888762	contig_2798_pilon	-	3395	3	Intergenic	novelGene_120013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	107	junction_2	34	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	312	1244	116665	115733	FALSE	20	GGGCCAGAGTCTTCTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193449	113581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452_120595_193294
888763	contig_8476_pilon	-	1725	11	Intergenic	novelGene_121344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	261.190830620066	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	567	1442	209623	150598	FALSE	25	ACCTTCCTGCAGCATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGTSRARSPRSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRGAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYSFVQQLTERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRSKIYRGLEDLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQIQKAGGLKTSSIIIALTDGKLEGLVPSYAEKEAKTSRSLGARVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILDQSCTEILELRPSSVCVGEEFQIVLNGRGFMLGSRNGSVVCTYTVNETYTKSVTPVSVQLNSMLCPAPTLNKAGEYK	210189	150314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_150608_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187519_188560_188630_188745_188854_189298_189381_206168_206241_208667_208740_209471
888764	contig_14142_pilon	-	1853	11	Intergenic	novelGene_120518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	333.434011462538	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	232	1344	353594	349539	FALSE	5	CTGTTTGGGCTTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355498	349029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_353901_354071_355472
888765	contig_5196_pilon	+	6700	1	Intergenic	novelGene_38689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1022	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	5550	5861	245335	245646	NA	55	GAAAAGAAAAAATGTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINAHGSSSQKIKGHFAPGKSAAKDLFKVLKSKDATLRTKVCLTQAMVFSSALYA	239785	246485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_239800_246500
888766	contig_13894_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_62171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	921	1382	758396	655440	FALSE	50	GCAAGAGGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDIVPEDEPLRLEGTEKTTGEELPPQSRVDLNDMDGVKLSGPSFADAALLKIRRNSCKHPLIIRTWIVRTVNLGKLRIVKNEMEPINIDIIGISELKWTSIGHFELDNHMAYFAGKDNLKRNGIAFIIKKNISRSILKSTTLSVIG	759316	654829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_655468_757962
888767	contig_6137_pilon	+	7084	16	Intergenic	novelGene_59254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_3	1253.27866902067	5	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2421	3896	1328176	1353702	FALSE	20	GGTGGCAATGATCCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1319320	1356890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1324083_1324128_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
888768	contig_12948_pilon	-	7549	20	Intergenic	novelGene_126193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_19	420.585490863218	1538	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1346	4041	80	4120	261235	227252	FALSE	15	TTCCCAGTTCTCTTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKETLKGLHKMDDRPEERTIREKLKATCMPAWKHEWLERRNRRGPVVVKPIPIKGDGSEMSNLAAEPQAEGQMSAASPVPKGRRSPSPGSSPSGRTVKSESPGVRRKRVSPVPFQSGRITPPRRAPSPDGFSPYSPEETNRRVNKVMRARLYLLQQIGPNSFLIGGDSPDNKYRVFIGPQNCSCGRGTFCIHLLFVMLRVFQLEPSDPMLWRKTLKNFEVESLFQKYHSRRSSRIKAPSRNTIQKFVSRMSNSHTLSSSSTSASSSENSIKDEEEQMCPICLLGMLDEESLTVCEDGCRNKLHHHCMSIWAEECRRNREPLICPLCRSKWRSHDFYSHELSSPVDSPSSLRAAQQQTTQQQPLAGSQRRNQESNFNLTHYGTQQIPPAYKDLAEPWIQVFGMELVGCLFSRNWNVREMALRRLSHDVSGALLLANGESTGNSGGSSGSSPSVGATSGSSQTSISGDVVEACCNVLSMVCADPVYKVYVAALKTLRAMLVYTPCHSLAERIKLQRLLRPVVDTILVKCADANSRTSQLSISTLLELCKGQAGELAVGREILKAGSIGIGGVDYVLNCILGNQTESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLIDSTGQRLRIADFGAAARLASKGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSVGCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQDRPPSRELLKHPVFRTTW	302303	223822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_227402_230188_230321_231206_231350_232224_232357_233724_233888_234585_234739_235113_236399_236877_237068_237339_237432_240648_240771_245391_245671_248451_248636_248748_248831_249345_249468_256166_256316_256684_256802_257404_257606_259249_259451_261091_261243_302231
888769	contig_16103_pilon	+	1067	2	Intergenic	novelGene_118862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGACAGGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722287	723436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723105_723186
888770	contig_9921_pilon	+	2993	3	Intergenic	novelGene_23709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	46.5	51	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	143	487	3397	31180	FALSE	30	TTACCTATACTTAGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEEERLRNKIRADHEKALEEAKEKLKKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKTKENKPLPPVPVPNLVGINGGDPEDNDIRKKREKIKEMMKHAWDNYRIYGWGHNELRPIARKGHSTNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFQDGKKWIEDNLDFSVVSI	3254	33686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_3514_13617_13715_31049
888771	contig_6556_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_168493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1398	1751	314403	314756	NA	30	AGACTCAGCATAGTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQWHPCSRLFRWHPCSRLFRWHPCSRLFQWHPCSRLFRWHPYSRLFCPACQGMQQESQMETRELLEPAVTFPPYLSLSPSQAKSQRKANESREVSRSPTRFQAALQGEAPSSRPRC	313005	314959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_+_313000_315000
888772	contig_7009_pilon	-	7709	2	Intergenic	novelGene_23635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1513	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4499	4804	439562	439257	FALSE	25	ACTTAAATTTTCTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITPQSTAGANNNAKQDLKRKTGNHIWHSHQPTPYLTEPQRTLLVCSTVNLSEGKLAQICNSVPARLLRVGTDMQKRKGQREPRKPFKNTAKNRVVLEHFY	445921	436351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_441342_443202
888773	contig_2892_pilon	+	5600	4	Intergenic	novelGene_119019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1091	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCTAGAGTGTCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267537	274309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_267646_267718_272462_272883_273039_273715
888774	contig_13481_pilon	+	3090	2	Intergenic	novelGene_119334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCTCAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335866	406439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_336001_403483
888775	contig_16492_pilon	+	4632	21	Intergenic	novelGene_100304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	246.082359180824	8	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1332	3999	274	4272	159423	195042	FALSE	85	TAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDIEVTTTTSETPVVDETKTEAPESEVGNPASNVAIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDVAVEKPVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPSDSPTSDLVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLSNAGQSAAYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS	158469	195402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_158546_158928_159081_159184_159226_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337_170596_171328_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014_194104_194433
888776	contig_7359_pilon	-	2434	2	Intergenic	novelGene_139840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	0	510	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAAAATTTTATAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38491	24716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38230
888777	contig_10904_pilon	+	2546	4	Intergenic	novelGene_22466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	113	1093	149100	150130	FALSE	15	ACTTGTGTGTTCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSHQPAGLCGRPGVLRPPSLCQGLKGSHFPSRQPCCSLHLPGFS	143933	151583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_149951_150000
888778	contig_8045_pilon	+	2767	5	Intergenic	novelGene_35379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	32	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	16	657	116067	118722	FALSE	30	ATTCAAACAATGTTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGKGMRQGTMFLAVQHEYCGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116051	120832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
888779	contig_10252_pilon	+	2390	2	Intergenic	novelGene_162910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTCATCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70911	73429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_71223_71350
888780	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
888781	contig_678_pilon	-	5076	7	Intergenic	novelGene_167770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	469.95983870965	39	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	409	996	20774	16487	TRUE	60	AGGAGAAAAGACATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS	21182	11853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_12832_13133_13295_13545_16579_17500_17635_19596_19782_19988_20097_20705
888782	contig_6871_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_21569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126143	124684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_124700_126100
888783	contig_13674_pilon	+	7001	2	Intergenic	novelGene_140298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1042	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	6252	6632	13719	14099	FALSE	50	CTTCAAACTTAGAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKNFRVIGVPEQGEKRENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQIILRAAREKQEVTYREETIRQSSDYLAETMQAIRQWDDIYKILKEKIASQE	7232	14468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_13158_13392
888784	contig_4131_pilon	+	2572	8	Intergenic	novelGene_127831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	77.5912892228587	409	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	510	1916	87286	97745	FALSE	30	GTAGTTAATCTTCCAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85320	98401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85845_87139_87694_91474_91571_93097_93329_94308_94332_94426_94540_97209
888785	contig_6137_pilon	+	4351	6	Intergenic	novelGene_59171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	720.580710260828	42	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3296	3616	1309335	1309655	TRUE	35	TGGTTTTCCTCAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGPEYLKQYVEREQQTRGELILPDFNIVYSCCSPGGAVVKSSAANLRCSLETLWDSSTLSFRVTMSLNQLDGNGFGLDTAIVIKTVWYWYNNRYIDQWNRIESL	1239119	1310544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240550_1300358_1300431_1305872_1308563_1309117_1310284_1310437
888786	contig_11982_pilon	-	5703	8	Intergenic	novelGene_100260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_7	411.833679525894	1529	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	50	769	132917	111793	FALSE	40	AAAAAAGTTCCTCATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRIRALGGQRARRWRRMAQKKYLQAKLTQFLREDRIQLWKPPYTDENKEVGLALKDLAKKYSDKLECCENEVEKIIEEIRCKAIERGTGNENYKTTGIATIEVFLPPRLRKDRKNLLETRLHITGRELRSKIAETFGFQENYIKIVINKKQLQLGKTLEEQGVTHNVKAMVLELKQSEEDVRRNFQVEEEEQNEAELKEKRIQRTKRGLEILAERAEMVVDPETTPYLDIANQTGRSIQIPPLREKSSYVSYGIS	135941	106858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_111822_113127_113221_113402_113586_126690_126762_127789_127849_130101_130270_132800_132919_135893
888787	contig_20293_pilon	+	4261	1	Intergenic	novelGene_153538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	863	1192	140272	140601	NA	25	GCACACCTGTAATTTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDAEKAVDKVQHPFMIKTLNKTGTEGKFLNIIKGIYIKPIANIIPNGQTLKAFPWRMGIRQGCPLSPLLFNTALEVLARAISLEKEIKGIQIGREEEKYLSLQMI	139409	143670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_139400_143700
888788	contig_6361_pilon	-	4020	6	Intergenic	novelGene_23966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4521.2031584524	59	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	10	TAGTACTTTGGTTGTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	399445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_400568_408714_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
888789	contig_1150_pilon	+	434	3	Intergenic	novelGene_61450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCGGGCGGGGCGCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309116	311053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309387_309813_309927_311002
888790	contig_15893_pilon	-	1785	2	Intergenic	novelGene_128509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGCCAACAAATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62532	59951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_61310_62105
888791	contig_11126_pilon	+	3091	4	Intergenic	novelGene_138140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	117.140940750875	457	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	72	1445	734342	746917	FALSE	30	TCAGTGGAACAGAATTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQLLLQQGRAGALKTGLQAGALRGLASTVPLSAESGKSGKGLPPNPKKQSKPKHVVEAKAKGKLLAPHPAAGLSKKFSPPSAYPSVTNEGGMVASPDPDDVMLLTDEGGPRFLARKTLVAFPQKVASPFRKQGPELETHQRRRKAAKDSASSSSSSSDSESDEEEGVSEVGPRVASKAQGRFQKSQASFEDRTPKIVIAAKEKTWPQKPHTDSTYPEKPYQPEKKTVSQSEVDEGVMKQYVKEKQSQKIFRLNEIDKESQKPVERKQNLPDHTDSGLSSQPSPVPTLLAEETEAEKQLQAAPSETREKNVEEQVPEPKWKVASPQFREENLGEQVVVGNAKAARLTKEIVVEDGVPVGSLKAVPAQNKDISNEKIPVLHLEEKGEIIQDSATQTEDPDNVQETEQAAAPAGPSDITTYKNLQHHDYNAYTFLDLNLELSKFRMPQPSSGRESPRH	734270	748563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_734390_735748_735867_742362_743407_746753
888792	contig_9901_pilon	+	3729	2	Intergenic	novelGene_126946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_1	0	937	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	110	685	301993	302568	FALSE	20	TTTTTTTTTGTGAGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWDFTDSQKAAVRRSEPKKRSFPPQSNNTEDLAVASMGSVNSRGHQAKAQVVMMGLDSAGKTTLLYKLKGHELVETMPTVGFNVEPLEVPGRVSLTLWDVGGQTQLRASWKDYLEGTDILVYVLDSTDKDRLPEAVAGLREVLDNPNMASVPFLVLANKQEAPDALPLLDIRDRLGLERFQDHCWELQACSALTGEGLPEALQSLRSLLKSRSHLCLQERSEESKKS	301110	305612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_301202_301974
888793	contig_5023_pilon	+	2224	8	Intergenic	novelGene_7369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1432.69224232718	5	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	464	988	630306	646990	TRUE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	625712	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630053_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647658_647737
888794	SIRV6	-	1035	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACATACCCAATTTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11774	7271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7808_7944_10745_10825_11035_11109_11205
888795	contig_15893_pilon	-	5593	17	Intergenic	novelGene_128501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	411	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3578	3898	67894	51940	TRUE	20	ACCATGGTCCTTGCAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQFFKEVIDEVCLKQGFSDGCSVVLISKIVNQIKGPLKRHLANACKFKNVVDEVGSVFVTQNIRICFQLFNQCFPVLICIVYNIIAIHVYIDFDPLHFFCKIDDT	83683	22313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_22843_30317_30456_31948_32077_41636_41762_42441_42596_43550_43668_45063_45202_48947_49075_51467_51629_51861_51942_58229_58415_67760_67918_76309_76494_77503_77665_79275_79420_80109_80190_80698
888796	contig_13481_pilon	+	11002	11	Intergenic	novelGene_119365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	199.897498733726	19	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	972	2919	123	3041	468683	475322	TRUE	10	TGACCCTCCCCGGCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVHVPVSSPLTQHQSYIPYMHGYSYSQSYDPSHPSYRGMPAVMMQNYPGSYLPSSYSFSPYGSKVSGGEDADKARASPSVSCKSSSESKALDILQQHASHYKSKSPTISDKTAQERDRGGCGVIGGGGSCSSVGGTGGGERSVDRPRTSPSQRLMSTHHHHHHLGYSLLPAQYNLPYAAGLSSTAIVASQQGSTPSLYPPPRR	466833	494360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_466895_468621_470159_470353_470963_471858_472226_473981_474158_474390_474608_475248_482680_482910_482997_483788_483964_485389_485549_494176
888797	contig_17144_pilon	+	1244	8	Intergenic	novelGene_29495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	715	1032	167621	168283	TRUE	25	CACTCAATCACGTAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166078	170830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166576_166750_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168308_168996_169099_170744
888798	contig_7078_pilon	-	5049	3	Intergenic	novelGene_130217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	659	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAACTAAGTCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982403	960819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_965477_975278_975384_982116
888799	contig_19851_pilon	+	2762	3	Intergenic	novelGene_29840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8446	junction_1	474	1333	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927_53980_54061
888800	contig_6842_pilon	+	4166	21	Intergenic	novelGene_130655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	227.124035496026	1239	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	921	3065	347570	415814	FALSE	30	AAAAAGGCTTTACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKYLLERQEREIETFDVESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR	249416	416915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249600_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343871_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043_408257_414417_414601_415652
888801	contig_3018_pilon	+	3644	1	Intergenic	novelGene_78914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2083	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1211	1525	626477	626791	NA	20	AAGTTCCTACTACTCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGILGARGERHVHRRRSACDRAAFLWGLAQTQAWAGEGKGLGGGDCGAVRVGGLKRKRGLFERASPPPNSITAAVPGGRPPEGHSLWGCDGCWWRRFNALFS	625266	628910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_625300_628900
888802	contig_10583_pilon	+	2769	1	Intergenic	novelGene_167922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAATTATCTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222692	225461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_222700_225500
888803	contig_3627_pilon	-	3078	3	Intergenic	novelGene_78551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2010	2339	688311	687982	FALSE	60	AGGTAAATAAAAAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSTHQKDIIIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIGSSTKVVGDFTLGEGGNIQKEAQQRHGRSKCCNQPTLSHRHIPNTPPNSSQVYFLFQRTWNILQNRPHIRP	814598	687242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_688525_711422_711692_813071
888804	contig_11493_pilon	-	1915	2	Intergenic	novelGene_143722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	215	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATGAGACCAGTGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354288	324325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_325148_353195
888805	contig_21208_pilon	-	3307	5	Intergenic	novelGene_175767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAATTGTCTCCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25123	19190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_19563_20410_20634_21498_21632_22287_22441_22697
888806	contig_7963_pilon	-	6571	5	Intergenic	novelGene_58271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	182	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	368	1285	172554	171637	TRUE	40	CAACGTAATAAGGGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIHQANNTQKRAGVAILISGKIDFKVKSTTKDKEGHYIMITGAIHQEDITIINIYAPNDRAPKYIQQTLTALKREIDSTTVVVGHFNTPLSVKDRTSRKKLNKDMEELNATINQLDLTDIYQTLHPTAAKYTFFSSAHGPFSRIDHILCHKARLNKIQSIEILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKGKKSNTWKLNNTLLKNYGVIEDIKDGIKKFIESNKNENTSYLNLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAMIKTLTLQLEQVEREQQKKPSSARRKEIISRAELNEIENRKTIERVNKTKS	172921	9749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_10587_10644_11105_11622_12467_13005_13165_168650
888807	contig_12654_pilon	-	4161	1	Intergenic	novelGene_129290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACATGACTAATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758227	754066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_754100_758200
888808	contig_3822_pilon	-	2758	14	Intergenic	novelGene_133300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_13	944.439485000708	2234	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	93	1592	306185	277069	FALSE	25	TGTTCATGTTTCTGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLEDRGGLPVVGAGLVSWNSLKNENASSAMSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGVIPDETKALSLLAPANAVAGLLPGGGLLPTPNPLTQIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASSILWCRGYLKQHGIQPRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	320814	275902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_280890_280939_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985_306208_320744
888809	contig_5690_pilon	+	2075	3	Intergenic	novelGene_119694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	212	592	760094	760474	TRUE	20	GTTTTTGGAGAACTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAQHCECTKRHNGQFYVIWIFCYAYFTTVKKIFLTALVETGGLPKAIALRYSSNFTPDPTPEVILHLSNKLAQKIMNITHKYCVFKKITYMNCCVNLHQKHNKISLKKKNHLYETKQSTITLKQR	759882	782978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_761111_777223_777966_782873
888810	contig_14755_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_129397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAAACTCCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959549	957886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_-_957900_959500
888811	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	20	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	193	741	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121195	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
888812	contig_3727_pilon	-	1320	6	Intergenic	novelGene_146741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAAGAACACAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308298	300431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_300501_301345_301414_301685_301734_302573_302661_303621_303704_307332
888813	contig_2215_pilon	+	2649	1	Intergenic	novelGene_163852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	875	1213	178490	178828	NA	45	AGACTAACTTGAATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLVSLCIFTGALWLSKIYLFLQSFPHLYPLLLYIRRGPFGLEDIFPTSVSLSQSKQLREKSHSTVEFLFIVAISLSAMVQGWKTPIARFPYIGSLYSNHALQIRGSWSSL	177615	180264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_177600_180300
888814	contig_3956_pilon	-	2820	3	Intergenic	novelGene_14705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3217	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47642	32009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_32264_32383_33156_45848
888815	contig_14727_pilon	+	4236	6	Intergenic	novelGene_56659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	153.210182429237	329	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	98	1324	336140	342062	FALSE	65	TATTAGGAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGEGEEEEEDYFDKELVQLIKQRKEQSRFGIEMVPLVQNEQEGLDLDGEADLSNLEGFQWEGISISSSPGLARKRSLSESSVIMDRAPSVYSFFSEEGTGKENEPQLVVSPGNSLRATQSQKVTAGFKQEMIPVAASLRTGEMAENVAIRRRHSTQLPSDCTIPLVHSAKDLSSQESSAPASETPNGQESNGEGNSASSNLSSALANSSLVDAATDSSCTSGAEQTDGQSIRKKRRATGDGSSPELPSLERKNKRRKIKGKKERSQVDQLLNISLREEELSKSLQCMDSNLLQARAALQTAYVEVQRLLMLKQQITMEMSALRTHRIQILQGLQETYEPSERPDQVPCNLSRERRNSRSQTSADATLLPTPFFPVFLDPSQVSPSSTSSIFQVSGIVPAPDSSVQIKQEPMSPQRDENVNVVPQGSAGSVSKELSQTNSM	328731	344974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_328816_336126_336761_338200_338271_340710_340866_340949_341011_341742
888816	contig_11752_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_37664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACTTATTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87473	89963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87500_90000
888817	contig_16098_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_46235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCGTAAGGGGCTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768125	766687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_766700_768100
888818	contig_14876_pilon	-	1863	3	Intergenic	novelGene_170241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAAGTTGAGGGGAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53079	38825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_-_39033_45410_45647_51659
888819	contig_8153_pilon	-	4732	9	Intergenic	novelGene_34792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	945	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGACTAACTCGAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48645	25970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_26996_27082_27259_29108_29222_29961_30112_30200_30485_30602_30818_38001_38169_39359_39488_46171
888821	contig_10437_pilon	-	1311	6	Intergenic	novelGene_38330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	616	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	694	1017	446992	443860	TRUE	25	TGAATGTATTCCCATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHILSAGWVKVDATFVEEESWATCIHTNRHGPFVSHGLCQGNLTAIGKLSVLGTRGSSVFGVIPALSIHGFVGIGSFRIDAFVIDDVLESPGHEATVAAFIAVFFI	451706	440607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_440640_441716_441866_443746_443976_445308_445475_446950_447053_451073
888822	contig_3602_pilon	+	2172	7	Intergenic	novelGene_60509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	841.500973789626	13	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	96	545	161745	169451	TRUE	10	CTGACTTGGCTCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GANARRSSSCCSFCRRERSLDPRAPDTPGLAMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	161649	171128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161748_166015_166047_168468_168613_168749_168857_169145_169282_169422_170683_170732
888823	contig_7207_pilon	-	2011	3	Intergenic	novelGene_72033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	175	828	294802	291736	FALSE	30	ATAACTATTTTGGCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLGGLRISSDSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPGQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST	294976	290552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293406_294801
888824	contig_15666_pilon	-	2103	7	Intergenic	novelGene_70152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	593.714694856788	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	188	1357	110619	107816	TRUE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110806	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107224_107525_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
888825	contig_5669_pilon	+	4743	2	Intergenic	novelGene_86078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	61	405	188913	189257	TRUE	40	GTAACCAACCCAGAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSTTRPLVGALLHTWIQQPAKSFLSCRLFSPQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	188852	195359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_190121_191884
888826	contig_13800_pilon	+	3353	15	Intergenic	novelGene_153702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	299.236034062799	149	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	214	1803	98375	162575	FALSE	10	TGGTCTGTTTTTAATGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94190	164125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_95566_95668_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
888827	contig_9512_pilon	-	5255	5	Intergenic	novelGene_178001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	204	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1680	2402	718858	672311	TRUE	50	GGAAAGGAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLFVMD	720537	658497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9512_pilon_-_658940_659081_660566_661056_661514_671840_672327_718151
888828	contig_11850_pilon	+	2624	7	Intergenic	novelGene_125208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2081	2449	284312	286326	FALSE	5	GATCTGGGCGCCGCCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSIFSISPKAPKYSLICSSEVSGLNPPTKTFLGGSFPFKALALLGSINLPSSLCSFSSKTLSTLAASLKSTNPNPLDRPVTGSVLIVQSTTSPNRDKYSVRSFLLVSQLKPPINILPSSC	279928	286501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_281692_282856_282949_283934_284051_284202_284335_285098_285259_285359_285531_286311
888829	contig_12528_pilon	-	3692	5	Intergenic	novelGene_81343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	348.546266656236	92	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	521	1024	966228	956024	FALSE	30	TACATATGCACACCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGEFKCPFPW	968131	953355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
888830	contig_11846_pilon	+	3002	10	Intergenic	novelGene_105958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2392	2730	307497	308273	FALSE	45	TCTAACCATAAAAACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWRMLHARLPLLLLLLLLKGAHHPSKLLLLLLAHSLRNLSLVLQQLLLLLLLQEKLTCLQNKRGHWASPQLDLLRTLRGSVRCTKVTNAKVPTRKASSSFSPSGYIHLWLG	289212	308545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_290503_291703_291847_295011_295085_295497_295722_298106_298202_298461_298610_299885_300062_302252_302391_307392_307580_308017
888831	contig_7151_pilon	+	2213	7	Intergenic	novelGene_40735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	160.044438273319	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	171	821	502420	507901	TRUE	50	CTAAAAGTAATCCAATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSKSSASSCTEEGFFSSQVFVWTAAGVSILLLSACFVTRCVVTYHTFQLCDEENFQPHENITELSCYNDGSGSVKNCCPVNWEHFQSSCYFFSTNTMTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502249	509883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505440_505593_506568_506685_507738_508137_508726
888832	contig_3009_pilon	-	2845	1	Intergenic	novelGene_132513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAATTCACAGCAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65640	62795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_62800_65600
888833	contig_15236_pilon	-	7996	26	Intergenic	novelGene_141621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_25	849.704697880387	4	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	948	2847	421	3267	679773	618893	FALSE	20	CTCTCAGCAATGTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIVRPLGPESLLLRGARLKNTKEIFGVAVYTGMETKMALNYKSKSQKRSAVEKSMNTFLIIYLIILISEAIISTILKYTWQAEEKWDEPWYNQKTEHQRNSSKILKFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFFIGWDLDLYHEESDQKAQVNTSDLNEELGQVEYVFTDKTGTLTENEMQFRECSINGIKYQEINGRLLPEGPTPDFSEGSLSYLSSLSHPNNLSHLTTSASFRTSPEYEMELIKEHDLFFKAVSLCHTVQISNVPTNGIGDGPWQSSLTPSHLEYYASSPDEKALVEAAARIGVVFIGSSEETMEVKTLGKLERYRLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKCIDGEIEKTRIHVDGFALKGLRTLCIAYRQFTPKEYEIIDRRLFEARTALQQREEKLADVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKTDSECADRLRQLTRRITEDHVIQHGLVVDGTSLSLALREHEKLFMDVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIHSLLEQHIDPHILQSKPALYRDISKNRHLSIKTFFYWTILGFSHAFIFFFGSYFLLGKDISLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMFFVFIQLLSSGSAWFGIIVMVVTCLFLDIVKKVFERQLHPTSTEKAQLTETNSGIKCLDSVCCFSGGEAACTSVGRMLERVTGRCGPAPVSRSWSGSEPFCTNDRSFLTLSTMDSSTC	684176	614163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563_645692_647358_647419_648728_648875_650530_650634_654832_654987_656272_656477_657774_657957_660984_661089_661162_661237_662591_662661_663175_663352_663958_664202_667271_667470_668586_668738_675892_675975_677717_677783_679756_679805_682091_682294_683370_683465_684083
888834	contig_11160_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_168839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	320049	320768	FALSE	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQCAACLAASCANNAFAFGPELSSLITPLAIQTHSFAAVAAAYYRSQQQQQGLATPSQPPAPPSAPLPASATAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPLGPHPSPFGFLSFLLFLLLLFRSFIVVEQRKPTNILCW	320046	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_320338_320652
888835	contig_5788_pilon	-	2925	2	Intergenic	novelGene_178562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTCTCTGGCAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59312	1393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_-_3180_58173
888836	contig_5686_pilon	-	6760	2	Intergenic	novelGene_45364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	6028	6333	131421	131116	FALSE	10	TCCCTTCTCCAGACCCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDDVSGQTQRLVQKGYRSKSNRGSQLIGIPGWGVRRKRGTFSEPDKPDRKQKGRNGCMLDNNGPNSHKMPTPVEKASYSIFGNGATIDTVLELQPNAWT	138986	130688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_134521_136058
888837	contig_1532_pilon	-	1633	7	Intergenic	novelGene_37435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1788	junction_4	745.997914801971	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	9	1202	32217	13113	FALSE	45	ATAAAAGTTTCTCAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32225	12681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049
888838	contig_10159_pilon	+	3774	12	Intergenic	novelGene_30860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	117.687848786806	399	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	133	1980	902231	996016	FALSE	30	AAATGAAGGCTGAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIKKQKTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	902098	997810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_902258_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874
888839	contig_9484_pilon	+	4130	15	Intergenic	novelGene_105652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_1	279.752742504476	339	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	78	1088	126829	206935	TRUE	40	GGAGTGAAGCCAGTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	126751	214547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513
888840	contig_11160_pilon	+	1274	2	Intergenic	novelGene_168838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1	507	319312	320379	FALSE	55	AAAAAAACATTGCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTALLNKENKFRDRSFSENGERSQHLLHLQQQQQQKGSGGGSQINSTRYKTELCRPFEESGTCKYGEKCQFAHGFHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNADERRPAPSGGRLRGPAPPRRPRLLSAFNCRAACRSPRCSTRPLAPRTRCRTATAT	319311	321146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_319697_320257
888841	contig_20058_pilon	+	2995	1	Intergenic	novelGene_109290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53783	56778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_+_53800_56800
888842	contig_9290_pilon	+	2272	5	Intergenic	novelGene_77509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	213.589559669943	177	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1530	2057	46400	49973	FALSE	40	TTTTATATAATTGGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLTHQLDLFPECRVTLLLFKDVKNAGDLRRKAMEGAISGSLINPTVIVDPFQILVAANKAVHLYKLGKMKTRTLSTEIIFNLSPNNNISEALKNFGISANDTSILIVYIEEGEEQINQEHLISQVEGHQVSLASLPEITNITEVRKIYKLSSQEESIGTLLDGTICRMSTKDVL	34772	50188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_34892_44989_46541_47448_47572_49008_49186_49886
888843	contig_1150_pilon	-	488	2	Intergenic	novelGene_61442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAAAACCTGGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309857	308941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
888844	contig_16098_pilon	-	2244	3	Intergenic	novelGene_46212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4132	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1769	2107	766357	764972	FALSE	35	ACAAGGCGAGGTGGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTLTQRSPPCAQRAALELKASHCWSAPGLLSHRSEWLFPAHARRAQDSCLLGSAFSILVMNISLLIFRPLSSNLSRKIPEAPNVFHLCSFLLVLRTGVRKSHQAGSWRRV	768125	764834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765636_766288
888845	contig_4857_pilon	+	5794	6	Intergenic	novelGene_48765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	5217	5528	1436195	1436506	FALSE	35	AATTAAGGTATGTACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFEEFKTLVEEVTADVVEIARELELEVEPEDVTELLKSHDKTLMNEELLLMDEQRKWFLEMETTPGEDAVNVVEMTTKDLEYYINLVDKAAAGFERIRLQF	1209586	1436772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1212354_1213435_1213531_1214578_1214707_1216721_1217375_1273718_1274078_1434980
888846	contig_10235_pilon	+	956	5	Intergenic	novelGene_46602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.2651016552186	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	67	552	596541	598482	FALSE	20	AATGCTTCCTCCCACTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEEEDGGPEGPNRERGGAGATFECNICLETQWLETRPERQECPVCKAGISREKVVPLYGRGSQKPQDPRLKTPPRPQGQRPAPESRGGFQPFGDTGGFHFSFGVGAFPFGFFTTVFNTHEPFRRGTGVDLGQGRTASSWQDSLFLFLAIFFFIWLLSI	596474	598886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_596639_597619_597737_598026_598082_598160_598279_598384
888847	contig_5316_pilon	+	2453	9	Intergenic	novelGene_61214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	323.104472268646	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	343	1692	453918	550408	FALSE	40	GTAGTTTACTTAAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396017	551169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
888848	contig_11337_pilon	+	2575	10	Intergenic	novelGene_107168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	113	junction_1	178.238985080339	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	186	1679	127468	172617	FALSE	20	GTCTGGTAATTTTTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102591	173513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102763_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
888849	contig_10734_pilon	+	2154	10	Intergenic	novelGene_51172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	425.45943213785	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	252	1352	1129441	1142903	FALSE	25	CCTTATAACAAGTCCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123657	1143705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
888850	contig_5686_pilon	-	5554	2	Intergenic	novelGene_45337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1662	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACCAGGCGCTTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123835	116293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_120413_122400
888851	contig_1331_pilon	-	2676	1	Intergenic	novelGene_37857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATTCACAAGTCCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235157	232481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_232500_235200
888852	contig_15105_pilon	+	1472	5	Intergenic	novelGene_150995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.646157189232	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	396	977	814729	842210	FALSE	15	CTTTGGCATCATGTTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFSPDQFQRLLKINPDWKTHRLLDLGAGDGEVTKIMSPHFEEIYATELSETMIWQLQKKKYRVLGINEWQNTGFQYDVISCLNLLDRCDQPLTLLKDIRSVLEPTRGRVILALVLPFHPYVENVGGKWEKPSEILEIKGQNWEEQVNSLSEVFRKAGFVIEAFTRLPYLCEGDMYNDYYVLDDAVFVLKPV	789586	842705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_789772_810198_810390_814709_814920_820425_820611_842004
888853	contig_9633_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_139626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCCAGTACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037695	1039144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1037700_1039100
888854	contig_5586_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_143538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	313	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGCCTTGTAGATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323996	321504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_321500_324000
888855	contig_1759_pilon	-	3341	1	Intergenic	novelGene_171317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAATGTATGTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7735	4394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_4400_7700
888856	contig_5023_pilon	+	3130	16	Intergenic	novelGene_7214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1931.9836438231	5	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	437	1825	614407	646990	FALSE	5	GCTGTATTTTTGGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609643_611750_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
888857	contig_7291_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_106295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGCGGTGTCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174397	170558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_170600_174400
888858	contig_6027_pilon	+	3993	15	Intergenic	novelGene_74451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	104.317827736555	641	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	555	2666	293176	339364	FALSE	40	AAAAGTTTCCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEGAGGVGSAPSPPESSSLCASKSEEGLPDGLSPKDPAQKPKNLPLSSVSSQAVTKENNRNVHLEQPEQNPGSSAGDTSAVHRVILGENVVATALCLPGNGSQSDLKDLASTAEEEGDTCLQESLPPATQSLKTGCHTKELASTSSSEEKSPQASNLKEGIRDTGLDFQPVVPPSNGVEGVREDLDDDQDSSSLKLSQNIAVQTDFKTDQLEINTDHDIERNLDKMMSERTLLKERYQEVLDKQRQVENQLQVQLKQLQRRREEEMKNHQEILKAIQDVTIKREETKKKIEKEKKEFLQKEQDLKAEIEKLCEKGRREVWEMELDRLKNQDGEINRNIMEETERAWKAEILSLESRKELLVLKLEEAEKEAELHLTYLKSTPPTLDTIRSKQEWETRLNGVRIMKKNVRDQFNSHIQLVRNGAKLSSLPQIPTPTLPPPPSETDFMLQMFQPNPSLPPRMPFSIGQVTMPMVMPSADPRSLSFPILTPALSQPNQPSPPLPGSHGRNSPGLGSLVGPHGPHMPPAASIPPPPGLGGVKASTESPRPQPVDKLEKILDKLLARFPQCNKAQMTNILQQIKTARTTMAGLTMEELVQLVAARLAEHERVAASTQPLGRIRALFPAPLAQISTPVFLPSAQVSYPGRSSHAPATCKLCLMCQKLVQPSELHPMACTHVLHKECIKFWAQTNTNDTCPFCPTLK	291027	340691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_291576_293169_293283_295534_296046_296730_296791_299486_299628_302273_302414_334511_334609_334778_334868_335732_335824_336016_336116_336309_336687_336820_336954_337166_337272_338293_338390_339298
888859	contig_10482_pilon	+	1993	9	Intergenic	novelGene_152805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1329.93768651016	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	126	680	116203	123281	TRUE	25	TAGGTGCATTTTACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	77243	127269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942_126797_126840
888860	contig_3935_pilon	+	4323	5	Intergenic	novelGene_178469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1840	2175	191270	191605	TRUE	50	TAAAAGAATCACATGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTDKFMENTDKKMEDFRKIMQEQKAKINSKLKIIQKQQLEIQKIDNKISEMDSVIEGLRSRFEMVGDRISGIEDKHLDTTLFEENSEERTKKNEATLRVMWDTIESKNL	76128	202315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3935_pilon_+_76327_189628_192131_192180_192546_200563_200801_201294
888861	contig_6137_pilon	+	5057	15	Intergenic	novelGene_59227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1128.93824056961	5	168	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1780	3255	1328176	1353702	FALSE	50	AAGGAGAAAACAGAGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1312235	1355504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313821_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
888862	contig_8312_pilon	-	3251	2	Intergenic	novelGene_152895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	553	894	277552	277211	FALSE	60	CTAATTATCAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGATFQSFISWIRGSSTKNSDDIVSHAALSGQSPVCFSLPILPILGSEEKKISSNISRYGLRLTGTTRYKEKLGPFYAVTFLTMSSKSGTKYLTIFFFFLLEHQVFIFYDYF	280356	274853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_277887_280138
888863	contig_4924_pilon	-	8336	1	Intergenic	novelGene_84634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGAGTGGGGGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65934	57598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_57600_65900
888864	contig_401_pilon	+	4881	32	Intergenic	novelGene_42906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	414.580933807114	54	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1060	3183	279	3461	1932020	1973007	TRUE	15	TTTCTTTCCCACCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVCGGGVILPDPGHAGVLFPLCPASKCLSGGFPHLPPEPGACQYTLKALWAYRNPCHSGSCGHFLKGQ	1929668	1975740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931988_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968848_1972807_1973757_1975069
888865	contig_15353_pilon	+	1128	4	Intergenic	novelGene_151985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	323.854905783439	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTTTCATGTATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529402	537942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_529422_529767_529825_534501_534567_536955
888866	contig_2834_pilon	+	1699	6	Intergenic	novelGene_28001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2160.41394181763	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	53	529	274763	290707	TRUE	40	AAAATCCTTTACAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTFFPLGQEDYDRLRPLMVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274710	292115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_285310_285357_285395_285434_285547_285746_290617_291578_291815
888867	contig_513_pilon	+	665	6	Intergenic	novelGene_80117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.703634226444	368	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGTTATATGGTCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68746	72707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_68783_68858_68899_69029_69233_71646_71830_72041_72090_72552
888868	contig_11028_pilon	+	3295	2	Intergenic	novelGene_163954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	834	1445	770836	827661	FALSE	15	CCCTATGTGGCCTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKANKHEEKIDKFLENTDKKFGRIQENNAGTKCQNQFTTRNYTKTTIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFNNSLCIFCYPPLLWYSNHS	770002	829511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_771388_827601
888869	contig_10861_pilon	-	5077	18	Intergenic	novelGene_39224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	326.994312300408	207	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	2093	4663	609120	583577	FALSE	35	TGTAAGCTTGCCCAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRFVCFKVTCFSSCHVFLQNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRERKRSHSRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRMQMGKRWQSPMTKSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	614449	583162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_610847_611134_611258_611521_611612_614296
888870	contig_9471_pilon	+	1912	9	Intergenic	novelGene_21805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	527.127534378541	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	778	1671	412726	417283	FALSE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKRSLKASFLFPP	411948	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417247
888871	contig_10263_pilon	+	5233	13	Intergenic	novelGene_135837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	24.02891776358	45	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	273	1478	866420	876447	FALSE	55	AAAAAAAAGGGAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIEEAVLGSRDSHPAGGGNSVLCFGQCQYTAEEYQAIQNALRQRLGPEYISSRMAGGGQKVCYIEGHRVINLANEMFGYNGWAHSVTQQNVDFVDLNNGKFYVGVCAFVKVQLKDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQAVLPAPPVKHSTPVTAVPEPLAEKDSLADNLEMWDMTPDLGDIIKSLPKPEPPQTLATPVLKNHMVTRNRTPQRLCLQEPQSKSGPSHPQTHNTNQHLTGDCDSSRKSQDMKKRKLYPT	858826	880202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_865948_866046_866403_866504_867602_867705_868279_868374_868550_868619_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165_874273_875307_875392_875712_875926_876385
888872	contig_14959_pilon	+	2779	2	Intergenic	novelGene_166728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	348	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGAGGGAAGTACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64523	72168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_+_66880_71745
888873	contig_12951_pilon	+	3382	10	Intergenic	novelGene_68201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_9	299.953123909737	27	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	119	1426	755258	837330	FALSE	20	ATGATGGGTTTGCATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSST	755139	839286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934_836131_837306
888874	contig_18364_pilon	+	4392	27	Intergenic	novelGene_102546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	788.012811335198	2337	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	884	2655	517	3171	31533	45175	TRUE	10	TTTGTGTGTGTTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNARTYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGVNTIQVCPALQGDWRSVCFAVKGYA	16481	50545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_29679_31146_31203_31509_31590_32506_32678_35655_35894_36637_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41726_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_44703_44774_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
888875	contig_7915_pilon	+	2815	1	Intergenic	novelGene_42980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAACAGACATAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139395	142210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_139400_142200
888876	contig_7009_pilon	+	3142	5	Intergenic	novelGene_23665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	426.929956198906	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	73	717	518090	537231	TRUE	5	CTTCACGCCTTTTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGEKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDSKKSTITHEQKMHKRTAASSPSASSMDWMMMCLEVVFFFFLLLF	518017	539873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_518118_522866_523002_536325_536672_537095_538369_538585
888877	contig_5864_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_162780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	897	1493	109129	108533	NA	50	TAGGAAAATTCACACAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHLTKEDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYLPTPAVLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWERKMIQPFWKIIWRFLRKLEIEIPHELAIPLLGIYPRELRAVTRIDICTLMFMAALFRIAKMWKQPRYPSTDEWINKLCYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKVEDIMLSEVSQSQKDKYCMRPLL	110025	107304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_107300_110000
888878	contig_7457_pilon	-	2079	9	Intergenic	novelGene_31408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	165.953118379861	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473239	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472326_472533_472730_472768_473151
888879	contig_8616_pilon	+	1192	8	Intergenic	novelGene_72507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	225.164067166271	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	295	1101	337335	339244	FALSE	10	TACGCGCTTGACTCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDGNPSLRGKVALKVLTGRRAVVIQEGLGRSRRGNNTGGLFVGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336816	339335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336998_337137_337192_337275_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
888880	contig_4402_pilon	-	4288	5	Intergenic	novelGene_140832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	181.457123034617	746	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	2394	3887	593671	592178	FALSE	35	TCAGTAAACTTTTCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV	597640	591776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_594397_594442_595933_596736_596839_597128
888881	contig_10734_pilon	-	2271	12	Intergenic	novelGene_51494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_11	612.747086272581	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	237	1787	2285163	2265543	FALSE	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305178	2265058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2304960
888882	contig_4246_pilon	+	6405	5	Intergenic	novelGene_178566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21166	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1390	1989	319675	418349	TRUE	40	CTATATAATGATTAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILQSIFSDYKAIKVEINNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGINKFIESNENENTSYPNLWDTAKAVLRGLFIAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEQVEREQQKKPSGARRKEISRIKAELNDRGNTKTIERVNKTKSLFFEKINKSDKPLGKLTKEKQERKQITCRRNEMGDITTDPTEIKRSITEYYEKL	316340	445696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4246_pilon_+_317157_319101_320271_418345_419716_442031_442333_442947
888883	contig_6316_pilon	+	8250	12	Intergenic	novelGene_134716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	148.737330177833	1150	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	972	1877	147168	157164	FALSE	25	ATTTTCCCAGTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	142420	163537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_143045_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
888884	contig_7480_pilon	+	3827	4	Intergenic	novelGene_178567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	312	755	110534	110977	TRUE	25	TCCACACACTCTCACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSCLSIITLNVNLQKARINREWHIGLKKHDLSMCCLQEMHLRLKDTNKLELKGWEKVYQSNNTQKRAGVAILISEKIDFKVKSTTKDKEEHYILIKGSIHQEDITIINTYPPNDRAPKYINQTPTALKREIDSSTVVVRDFNS	110222	332128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7480_pilon_+_111549_129201_129713_215817_215877_330197
888885	contig_2377_pilon	-	2540	8	Intergenic	novelGene_67897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCCAGCCACTGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225044	197516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_197597_200790_200893_210563_210621_214764_214832_215419_215517_217152_217224_221863_221932_223046
888886	contig_8330_pilon	-	1623	10	Intergenic	novelGene_71822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1264	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGGGAAGACGGCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857547	853236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_853347_853836_854058_854993_855090_855283_855348_855432_855535_855624_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
888887	contig_6557_pilon	+	572	4	Intergenic	novelGene_32988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	5969.25238199894	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	92	529	435138	440040	FALSE	5	GCGCCTTTTTGTTACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRPSLKRQRVRICWQSACYPLPSIPSYAKMKFNPFVTSDRSKNRKRHFNAPSHIRRKIMSSPLSKELRQKYNVRSMPIRKDDEVQVVRGHYKGQQIGKVVQVYRKKYVIYIERVQRDKANGTTVHVGIHPSKVVITRLKLDKDRKKILERKAKSRQVGKEKGKYKEETIEKMQE	434248	440083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_434335_435132_435306_436630_436772_439911
888888	contig_7051_pilon	+	2150	5	Intergenic	novelGene_64365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1215	junction_1	55.1928437390211	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	109	537	338727	343526	TRUE	70	GAGAAACAAAAAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKGILWVSWFWFCGVFWFW	338618	347613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_338865_342961_343100_343373_344223_345366_345538_346867
888889	contig_9653_pilon	-	1758	10	Intergenic	novelGene_48191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	577.352578586084	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	254	1105	186221	175913	FALSE	15	GTTGATTCCTTATTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	196956	175259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192228_196903
888890	contig_15114_pilon	-	5310	1	Intergenic	novelGene_121099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGAAGTGTTCGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36808	31498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_31500_36800
888891	contig_9955_pilon	-	7039	16	Intergenic	novelGene_21326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.4143322214661	5353	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	17	1246	127957	86976	TRUE	35	CACTTAGTTTAAATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEFSPSVRACLPLCALVLETAFVLIFCFFTSYNDSANNQTLTQNSQVFQDITIMAALGLGFLTSSFPKNSWSSVAFNLFILAIGVQWAVLLDGFLNKFSSGKIVIELSSIQLATMSAMSVLISVGAVLGKTNLLQLMMMALVEVTAFSVMMMVSDRVFNVDNHTSMMHIHVFAAYFGLAVAWCLSSSQPKEKQREVKTAKGPDLFAMLGTLFLWIFWPNFNSALLSIENKRKAVFNTYYALAVSSVTATSVSAAAHPEGKISMTHIHSAVLAGGVAVGASCHLISSPWPAMLVGLLAGLISVGGAKCLPVGFHRMLMVHYAFGLPGLLGEITYITLMALQASQNQDTTNCYQIFLNMGILSFVMIMSLASGFLTGSILRLQIWKAPGVNKYYYDQDFWKFPHLADEF	127973	64904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_67858_69952_70058_71904_72016_73575_73644_75467_75561_78448_78510_84573_87003_91215_91290_96123_96204_105378_105495_107088_107227_108941_109106_109880_110029_113655_113807_118303_118491_127812
888892	contig_10074_pilon	-	1337	9	Intergenic	novelGene_57178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	488	junction_1	336.762063629501	420	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1329	9	1337	586279	559329	FALSE	15	TCTGATTGCTCTGTGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRYKCEGRSAGSIPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAVISRIRAGINPFSVPEPQLLDIEDCDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALTPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKDDIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKAITEPVTVKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFHKLWQDCGGNFPEGPRPGPLGSTTEGRFIKKEPNLFSPGAVATETPRPSSQAEPYYSPPVSVSRALPHHGSAASSMMSSPSSSWPSVARPSSQSVSTNPPNSFSTATLSSNSQAIPPFLGIPLASDLNASSACVYSNSNDIGRMEASSMSPADLYGISDASML	586287	559328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_559724_560818_560891_561019_561089_561859_562073_562179_562285_563750_563892_577107_577200_583722_583872_586186
888893	contig_4783_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_108393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAAGCGTGCTCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258193	260592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_258200_260600
888894	contig_4426_pilon	-	4123	2	Intergenic	novelGene_15348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGTTTAACACACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10679	6474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6823_6904
888895	contig_21208_pilon	+	2075	4	Intergenic	novelGene_175772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.9204172104755	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	129	782	21563	23129	FALSE	30	GTCTATTAGCCTTACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDALLGWPRVPYVLSPFHPAPRTTSFPIALIYLLLIFVGQNYMKARKGFNLQAPLILWSFCLAIFSIMGAVRTWSFMGTVLLRVGLKQSVCYSSFITHSTVKFWSSFFTFSKIIELGDTAFIILRKRPLIFVHWYHHSTVVIFTSFGYKNKMAAGGWFMTMNFGVHAVMYTYYTLKAARVNSPRMLSMLITSLQILQMFVGAMVSILTYIWRHEQGCDTTTMEQFFLSSILYSSYFILFAHFFRQAYIIPKVKNKTKSQ	20409	24422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20477_21501_21634_22289_22442_22698
888896	contig_1264_pilon	-	4813	13	Intergenic	novelGene_161304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_1	1216.41957251143	2689	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	1059	2267	143557	135270	FALSE	25	GAATGAACCTTTTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGSRRDSASYRDRSETDRAGYANGSSYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSGYTAQEYGAGTYGASTTTTTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK	152902	132723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_135776_136679_136923_140868_140929_141973_142036_142291_142403_143248_143422_143503_143665_144044_144187_145468_145535_146151_146287_147448_147549_148218_148370_152545
888897	contig_14353_pilon	-	2501	11	Intergenic	novelGene_82088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	483.409608923943	1270	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	675	1121	83281	80452	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104430	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87447_88547_88750_90961_91054_104333
888898	contig_11752_pilon	+	1674	4	Intergenic	novelGene_37592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	640.015798416119	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	147	650	87309	88933	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84087	89957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87188_87299_87547_88667
888899	contig_7056_pilon	+	2169	8	Intergenic	novelGene_43698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	73	junction_1	218.021249666454	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	34	1308	926284	937151	FALSE	25	GCAACTCAAGGGTACCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926250	938012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935498_935846_936043_936993
888900	contig_12576_pilon	+	4257	2	Intergenic	novelGene_178569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	645	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	3568	4047	19358	20451	FALSE	30	TCTAGAGTCATTGTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVALRCCSTAWLEGIEVYNARYSGNRKRRKIQRDEKLSNEERQKGKKRKKKTKQIKKKKTRKAPKETEEKKKTNIKRNALRDPSARLWKPKGSLPATQLSLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRWKLHEAAFSYPVCWSPIGVQDGGSTLR	15790	20661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12576_pilon_+_19749_20362
888901	contig_12638_pilon	+	3122	16	Intergenic	novelGene_33174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	188.070908613392	57	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	143	1741	269238	274265	FALSE	15	ACTTACCCCTTTTTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGNAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235651	275646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271750_273468_273584_273761_273999_274124
888902	contig_642_pilon	+	3966	7	Intergenic	novelGene_178572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATGACACATTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175504	412335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_642_pilon_+_176137_243921_244108_326155_326279_359887_360841_377230_377360_385000_385010_410401
888903	contig_7051_pilon	+	3377	14	Intergenic	novelGene_64292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	210.472952906841	54	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	543	1001	197633	206198	TRUE	40	GAATCAACTCAATGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184050	229488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_184992_185030_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191850_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143_207583_228496
888904	contig_7230_pilon	-	3116	6	Intergenic	novelGene_52539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	386.912186419606	5	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	145	633	177508	134622	FALSE	50	TAGCAAGAATACATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTMFADTLLIVFISVCTALLAEVEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177652	132138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_177438
888905	SIRV6	+	1301	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	225	2	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
888907	contig_8631_pilon	+	6792	5	Intergenic	novelGene_121952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3936	188	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	4627	4980	1015108	1015461	TRUE	35	GCCAACTCAGAACTTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKRNNKISETDSVIEGLGSRFEMMEDRISEIEDKHLDTTLRKNQKKEQRKMKKPANYEGYNQKQKSASDQSSRMGRKQKKQRGSLKNC	691325	1092495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_692688_709878_710477_837239_839566_1014767_1017043_1092264
888909	contig_610_pilon	-	3055	1	Intergenic	novelGene_76758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGAACTATCTCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223572	220517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_220500_223600
888910	contig_14450_pilon	-	4486	2	Intergenic	novelGene_48963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCACACTCACTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042670	1036855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039699_1041027
888911	contig_4604_pilon	+	3877	20	Intergenic	novelGene_19127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	1151.76228214447	310	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	447	2750	358980	379856	TRUE	30	CACCACTAGCACCCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339833	381088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_380320_380424
888912	contig_20140_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_170559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTATGACATACAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31221	33394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20140_pilon_+_31200_33400
888913	SIRV6	+	1206	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	49	273	-1	-138	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	209	700	1733	10736	TRUE	30	AACTTGTGCTTGTTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1136	11552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
888914	contig_16098_pilon	+	1451	4	Intergenic	novelGene_46218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	342	701	766291	767372	FALSE	25	GAATCTTTATTGTATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIELKIPDRQEITSIPATLAFLQCAPQVSSVRVKESHRC	764902	768122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766538_767259
888915	contig_7963_pilon	+	3982	12	Intergenic	novelGene_58457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCGGAAACAGAAGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118247	129559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118340_118611_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123131_123745_124053_125564_126910_129471
888916	contig_15273_pilon	-	3078	4	Intergenic	novelGene_140442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	252.192166589069	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	98	442	170693	165604	FALSE	35	ATGGAAATAAATTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AACLCFRSEQEDEVLLVSSSRYPDQWIVPGGGMEPEEEPGGAAVREVYEEQNQDRKHRTYVYVLTVTEILEDWEDSVNIGRKREWFKVEDAIKVLQCHKPVHAEYLEKLKLGCSPTNGNSAVPSLPDNNALFVSAAQTSGLPSGIR	183472	162967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_165807_166871_166960_170639_170751_183432
888917	contig_19778_pilon	+	1745	8	Intergenic	novelGene_143748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	314.150880167801	112	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	262	1122	9539	16019	TRUE	40	TTAGTAAATTATTCACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	5642	18616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920_16181_18154
888919	contig_7056_pilon	-	2241	13	Intergenic	novelGene_43609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	1071.31597100119	32	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	635	1498	726042	723226	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730443	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_726176_726938_727080_728561_728706_728906_729063_730383
888920	contig_10734_pilon	-	2070	9	Intergenic	novelGene_51471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	495.742482923342	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	144	1574	2305085	2265543	FALSE	65	AAAGAAAAAAATCACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305228	2265046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
888922	contig_7066_pilon	-	1127	3	Intergenic	novelGene_42155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	5.5	72	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGCTTACAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757861	748973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749885_750340_750424_757728
888924	contig_5461_pilon	+	2519	3	Intergenic	novelGene_156817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	38.5	371	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1173	1556	240040	264281	FALSE	65	TCTGTTAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGKFCFKHR	238867	265244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_240170_242392_242515_264149
888925	contig_5686_pilon	+	2822	14	Intergenic	novelGene_45222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1758.07724786696	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	59	1807	93843	211355	FALSE	65	AAACATGAAAAAAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93784	212370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199810_200512_200560_202871_203002_208031_208722_211283
888926	contig_15282_pilon	+	4094	11	Intergenic	novelGene_177716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_8	61.4059443376616	571	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	332	940	24048	51033	TRUE	40	GAAATAAAATGATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKKKPKLLNKFDKTIKAELDAAEKLRKRGKIEEAVNAFEELVRKYPHSPRARYGKAQCEDDLAEKRRSNEVLRGAIETYQEVASLPDVPADLVKLSLKRRSERQQFLGHMRGSLMTLKRLVQLFPNDTSLKNDLGVGYLLIGDNENAKKVYEEVLNVTPNDGFAKVHYGFILKAQNKIAESIPYLKEGIESGDPGTDDGRFYFHLGDAMQRVGNKEAYKWYELGHMRGHFASVWQRSLYNVKGLKAQPWWTSKETGYTELVKSLERNWKLIRDEGLAVMDKARGLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQGRKK	7077	65798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15282_pilon_+_7166_14531_14619_22323_22475_24042_24180_27219_27319_31511_31602_36305_36444_43841_43978_51019_51113_51486_51621_62857
888927	contig_7963_pilon	-	2731	10	Intergenic	novelGene_58548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2154	2540	246673	246287	FALSE	20	GGCGAGAAGAGCTGCGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQFGAVTVPGDAPRAQFSKQGKSRQGQAQCRRQRLQSSQPALALCAFALGVGRGPEDPAGPQPQHCPAAQAHCPDLEQRWHRGRQQEDYAGQRSPEQHPVHKKQHRRPQPRAASSGEEEAPVRSRGP	253523	246095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_246873_247602_247735_248511_248719_249144_249345_250118_250248_250405_250596_251106_251281_251519_251686_251957_252093_252902
888928	contig_408_pilon	-	2159	2	Intergenic	novelGene_84908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAAGGTGAATCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133549	131322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_132718_132785
888929	contig_15629_pilon	-	2564	2	Intergenic	novelGene_122464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	115	621	130557	130051	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAATAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTYSHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKRCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPRTIKFIKEKIGPTLQALIYGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDMQIANRHMRKCSGSAGRLELLCTAGGNAK	130671	128059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_129600_129647
888930	contig_6137_pilon	+	3584	21	Intergenic	novelGene_59161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	1255.11087558032	129	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	391	2346	1268914	1348329	FALSE	15	TTCTCTATTTTTGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNTLYNLFFLQDIFPTSKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRYLFFMKNFHGMIGTK	1239023	1349567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240523_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
888931	contig_8354_pilon	+	3882	9	Intergenic	novelGene_24139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2148	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCAAGGATGACTACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534804	618784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_537379_538000_538147_539084_539151_543399_543453_550959_551135_555797_555921_558329_558495_578571_578721_618353
888932	contig_7165_pilon	-	3336	8	Intergenic	novelGene_116913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_7	28.9080173894329	611	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	113	595	1233001	1227502	FALSE	55	GAATTAAAAATGATCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKIALQLKATLENVTSLRPVGEDFRWYLKMKCGNCGEISEKWQYIRLMDNVALKGGRGSASMVQKCKLCSRENSIEILSSTIKSYNAEDSEKFKTIVEFECRGLEPVDFQPQAGFAAEGVESGTVFSDINLQEKDWTDYDEKAQESVGIYEVTHQFVKC	1233113	1224760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1227580_1228037_1228104_1228838_1228917_1230701_1230734_1230938_1231021_1231363_1231421_1232685_1232770_1232995
888933	contig_4402_pilon	+	3445	2	Intergenic	novelGene_140831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAACGCTTGAGGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591776	595655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_593745_594178
888934	contig_17144_pilon	-	2977	15	Intergenic	novelGene_29388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	2157.31040148778	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1601	2686	170784	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179757	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
888935	contig_2062_pilon	-	3309	1	Intergenic	novelGene_139022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	772	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGACTTGATTGTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168146	1164837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1164800_1168100
888936	contig_11498_pilon	-	1784	12	Intergenic	novelGene_65531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	172.543155459345	1278	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	9	1451	312345	284981	FALSE	50	TATATAAATATTTTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKMADESETAVKPPAPPPPQMMEGNGNGHEHCSDCENEEDNSYNRGGLSPANDTGAKKKKKKQKKKKEKGSETDSAQDQPVKELFSVGQGPAKTMEEASKRSYQFWDTQPVPKLGEVVNTHGPVEPDKDNIRQEPYTLPQGFTWDALDLGDRGVLKELYTLLNENYVEDDDNMFRFDYSPEFLLWALRPPGWLPQWHCGVRVVSSRKLVGFISAIPAIIHIYDTEKKMVEINFLCVHKKLRSKRVAPVLIREITRRVHLEGIFQAVYTAGVVLPKPVGTCRYWHRSLNPRKLIEVKFSHLSRNMTMQRTMKLYRLPETPKTAGLRPMQKKDIPVVHQLFTRYLKQFHLTPVMSQEEVEHWFYPQENIIDTFVVENANGEVTDFLSFYTLPSTIMNHPTHKSLKAAYSFYNVHTQTPLLDLMSDALVLAKTKGFDVFNALDLMENKTFLEKLKFGIGDGNLQYYLYNWKCPSMGAEKVGLVLQ	312353	284647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_285002_285657_285796_286839_287008_287602_287774_290292_290402_291015_291187_292007_292125_292993_293086_293970_294090_296918_297016_300506_300616_312214
888937	contig_20951_pilon	-	1303	3	Intergenic	novelGene_43071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3166	junction_2	9254	40	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	43	714	28130	27149	FALSE	35	AAGAAGCAAGGAGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28172	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784
888938	contig_16724_pilon	-	4459	1	Intergenic	novelGene_105283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	112	345	517598	517365	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEEWGIKIGGRLINNLSYGDDTTFLAESEEDLKHLLMKIQDYSLQYGSHLNIKKTKSLRTEPISNIMIKEKRLNLSRISFYLDPQSTPMEAAVKKSKDTLHWANLLQKTSLKC	517709	513250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_513200_517700
888939	contig_3174_pilon	-	934	1	Intergenic	novelGene_144069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATAAGTAAATAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44761	43827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3174_pilon_-_43800_44800
888940	contig_15172_pilon	-	2755	9	Intergenic	novelGene_158757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	601	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2288	2587	258367	244684	TRUE	15	TCCCCGACGGGAAGTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLNVPDPVPDIVKRLLVRDVVDQHDALCAPVVGRGDRPEPLLASCVPYLQFDSLAIKLYSSDFKVNSFHVGYLGSICNQCTSCTASIHLSMEACVLL	269617	243162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_243295_244647_244776_248917_248980_252813_252874_256834_256913_258359_258453_258972_259039_260338_260391_267533
888941	contig_13740_pilon	-	3019	12	Intergenic	novelGene_34755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_2	217.510444320335	46	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	144	761	873748	745268	TRUE	60	GTAGTAAAATAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPGSVRTHSPAVLTGTASPSLGCRHSFTPSVPLSAQILSARPALSNMPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQVEVFMLP	873891	686309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
888942	contig_6418_pilon	+	2165	12	Intergenic	novelGene_81185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	173.058629534035	784	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	173	1864	1158822	1173368	FALSE	25	GATATTCTCTGTTGCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRSTSSTKSGKFMNPTDQARKEARKRELKKNKKQRMMVRAAVLKMKDPKQIIRDMEKLDEMEFNPVQQPQLNEKVLKDKRKKLRETFERILRLYEKENPDIYKELRKLEVEYEQKRAQLSQYFDAVKNAQHVEVESIPLPDMPHAPSNILIQDIPLPGAQPPSILKKTSAYGPPTRAVSILPLLGHGVPRLPPGRKPPGPPPGPPPPQVLQMYGRKVGFALDLPPRRRDEDMLYSPELAQRGHDDDISSTSEDDGYPEDMDQDKHDDSTDDSDSDRSDPESEGDEFVHRDDNERDTNEEKKSGLSVRFADMPGKSRKKKKNMKELTPLQAMMLRMAGQEIPEEGREVEEFSEDDDDDSDDSEAEKQSQKQHKEESLADGTSAGSSQQQPPPQSVPPSQLQAPPPRGPPPRLPPPAPPGIPPPRPGMMRPPLVPPLGPAPPGLFPPAPLPNPGVLSAPPSLIQRPKADDTSAATIEKKATATISAKPQITNPKAEITRFVPTALRVRRENKGAAATAQRKPEDDSAVPLAKAAPKSGPSVPLSVQTKDDVYEAFMKEMEGLL	1156957	1173669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1157082_1158773_1158886_1159629_1159662_1160480_1160575_1163365_1163563_1164843_1164978_1165156_1165357_1165907_1166100_1168539_1168642_1169782_1169977_1171212_1171262_1172934
888943	contig_5799_pilon	-	4879	2	Intergenic	novelGene_50334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTATGCAATTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712103	706675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_710802_711350
888944	contig_10940_pilon	+	3220	1	Intergenic	novelGene_49204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGATTTAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484891	488111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_484900_488100
888945	contig_13004_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_112584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12340	13963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_12300_14000
888946	contig_1472_pilon	+	2050	4	Intergenic	novelGene_86111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAGCTAAAAAAAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5828	289918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_5997_159179_159199_214337_214385_288102
888947	contig_11186_pilon	-	4983	1	Intergenic	novelGene_98866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	3174	3863	223036	222347	NA	55	TGATAAAAACTCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSDLSIITLNINGLNAPIKRWRVTEWIRKQDPSIYCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANSYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTKKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAASDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKVTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSD	226209	221226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_221200_226200
888948	contig_1150_pilon	-	691	3	Intergenic	novelGene_61415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36526	38	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309997_311002
888949	contig_6418_pilon	+	2005	11	Intergenic	novelGene_81183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	179.759311302642	232	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	191	1702	1158822	1173368	FALSE	20	TATTCTCTGTTGCTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRSTSSTKSGKFMNPTDQARKEARKRELKKNKKQRMMVRAAVLKMKDPKQIIRDMEKLDEMEFNPVQQPQLNEKVLKDKRKKLRETFERILRLYEKENPDIYKELRKLEVEYEQKRAQLSQYFDAVKNAQHVEVESIPLPDMPHAPSNILIQDIPLPGAQPPSILKKTSAYGPPTRAVSILPLLGHGVPRLPPGRKPPGPPPGPPPPQVLQMYGRKVGFALDLPPRRRDEDMLYSPELAQRGHDDDISSTSEDDGYPEDMDQDKHDDSTDDSDSDRSDPESEGDEFVHRDDNERDTNEEKKSGLSVRFADMPGKSRKKKKNMKELTPLQAMMLRMAGLPPGPPPRGPPPRLPPPAPPGIPPPRPGMMRPPLVPPLGPAPPGLFPPAPLPNPGVLSAPPSLIQRPKADDTSAATIEKKATATISAKPQITNPKAEITRFVPTALRVRRENKGAAATAQRKPEDDSAVPLAKAAPKSGPSVPLSVQTKDDVYEAFMKEMEGLL	1156939	1173671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1157082_1158773_1158886_1159629_1159662_1160480_1160575_1163365_1163563_1164843_1164978_1165156_1165357_1165907_1166100_1168539_1168642_1171198_1171262_1172934
888950	contig_2125_pilon	+	4172	17	Intergenic	novelGene_147727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	1334.5016391897	95	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	135	2531	648096	682094	FALSE	20	TGTTTCTCAGCATATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLQLIFWIGLISSVCYVFGQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNLTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCHPDDIENPRGSKDVKKNKNVTNRSKGTAEKLQPEDITQIQPQQLILQLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMKRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTDRGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGRCHLENDVYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENSKLPEGVTINYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVHFEISITSNKCPNKNSETIKIKPLGFTEEVEIILQFICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGEVCGGNGVCKCRVCECKPNYTGSACDCSLDTSSCMAKNGQICNGRGICECGTCKCTDPKFQGPTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDTCAHECSHFNLTKVENRDKLPQPGQVDPLSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEAIVHVVETPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK	611097	683735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_611167_614028_614094_648095_648163_649057_649144_651017_651241_657754_657926_658819_659059_664111_664268_665027_665124_669318_669409_671196_671338_671477_671678_673117_673357_673579_673803_674513_674747_676390_676558_682028
888951	contig_10126_pilon	+	3023	3	Intergenic	novelGene_105752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	449	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	14	727	162049	184466	FALSE	25	TTCTGGGTAACAATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVQPGHGPSQPGPQGFCPQARAFLLGIRQRPDPEEVNGLGRFRAVPHELPVPHGATMLGGSSPAPRTPGWPGPGTQE	162035	186762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162305_165408_165638_184237
888952	contig_14513_pilon	-	1227	3	Intergenic	novelGene_70247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	162	530	18880	11982	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19041	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
888953	contig_7457_pilon	+	2657	9	Intergenic	novelGene_31273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	827	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2135	2458	147561	148306	TRUE	15	TTCCACTTTCATTTCCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVTMGSSKGRTCTRSRHSSATSILCSFFWSTCSATGVIEGDQSRASRQRVADPQVGKQTLGRFLALLSAASKYQGDLRHREWDLELVLGGILGVLSQLLQLLKPLL	144168	156096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_144442_144696_144768_145316_146809_147049_147159_147270_147454_147554_147671_147753_147902_148240_148340_155930
888954	contig_8138_pilon	-	1663	4	Intergenic	novelGene_52500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_3	100.963139588444	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	38	376	481932	462914	FALSE	30	TTTGTTACATTTTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGDCVEKEYPNRGNTCLENGSFLLNFMGCAVCSKRDFMLITNKSFKEEDGEEIVTYDHLCKNCHHVVARHEYTFSIMDEFQEYTMLCLLCGKAEDTISILPDDPRQMTLLF	481969	461626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_463007_470224_470296_472816_472953_481893
888955	contig_4924_pilon	-	4563	1	Intergenic	novelGene_84768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1130	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTAAATACACAAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240594	236031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_236000_240600
888956	contig_6059_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_44795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTGATTTTTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387291	389937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_387300_389900
888957	contig_8377_pilon	+	4691	30	Intergenic	novelGene_34956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2801.88919662334	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1111	3336	181	3516	131448	197939	FALSE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCGKIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68096	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_136291_136373_137710_137742_140889_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
888958	contig_7898_pilon	+	3476	18	Intergenic	novelGene_47614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	383.130991178453	1341	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2433	112	2544	563445	599921	FALSE	5	TGTGAGCTGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPSPTPRQPAFSLHAVGERVRPAGGARTPSLISPSPLMPQSSPSAAATASDMDKNSGSSSSSASSGSSKGQQPPRSASAGPAGESKPKSDGKSSNGSRRFNRKREPSYTKNENFSNQSRRSNAQKSKTFNKMPPERGGSSSKLFSSSFNGGRRDEVAEVQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTFEPRGQAGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEAAIQELKTREEALSGLAESRGEVTGVVAALEQLVLMAPLAKEPVFQPRKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	563069	600853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563173_563436_563602_571601_571799_583823_584024_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587685_589142_589269_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
888959	contig_7963_pilon	+	2728	12	Intergenic	novelGene_58551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	163.745064905761	915	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	672	2321	247365	253116	FALSE	5	GTTTCTAGTGTGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246157	253523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246455_246507_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
888960	contig_13780_pilon	+	4605	5	Intergenic	novelGene_149044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1115	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTAGTGGGAGTGGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575906	682619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_576379_576750_577250_602102_602310_654556_655099_679734
888961	contig_14441_pilon	+	1043	5	Intergenic	novelGene_100724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	45	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	455	1003	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHLPSREARRQRWSPLGDVCARRGLSAPSPSHFKSPPPCLFLAPQLHQPLPLVLPAPAQGEGEGEGRGRRHFCSTVEHCGDLGPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120063	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120314_121183_121239_125517_125902_126159_126283_126514
888962	contig_5725_pilon	+	3856	6	Intergenic	novelGene_167153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCCAACATCATTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269971	466927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5725_pilon_+_270743_271074_271748_337011_337597_339746_339823_464907_465571_465839
888963	contig_9290_pilon	+	4144	9	Intergenic	novelGene_77506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	203	junction_7	116.508583374788	1060	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	76	1086	14582	34832	FALSE	25	CTGGCGCCCACTATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHWHHARSDWGRGRAFSGHSSSKKKGKNHIPERWKDYLPVGQRMPGTRFIAFKVPLKKSFEGKLAPEECFSPLDLLNKIQEQNEELGLIIDLTYTQRYYNPEDLPETIPYLKIFTVGHQVPDDDTIFKFKCAVNGFLKENKDNDKLIGVHCTHGLNRTGYLICRYLIDVEGMRPDDAIELFNRCRGHCIERMNYIEDLQNGPIRKNWGSSVSRSSGFEESAHLMEPVHTTNKFVRQRPRYNLHRTQDYPTPSRHFHSHTQSVRKFSQNQNVYQRGLIPPPGPPGQDYSQRRYSWNVKPDTTQAAQYKRLPPNIPYNRQCYRSFPIGDGPSDMNLF	14506	37890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_14683_16219_16296_19403_19536_24495_24620_28018_28080_29871_29919_30188_30265_30502_30677_34612
888964	contig_7457_pilon	-	5339	2	Intergenic	novelGene_31506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671982	666589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_670874_670927
888965	contig_753_pilon	-	2752	14	Intergenic	novelGene_112962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	248.731384781149	868	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	426	2333	1199692	1181585	FALSE	40	TTTATTAATACGCATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENSTKGKNKKKKKKSKMLKCDEHIQKLGSCITDPGNRETSGNTMHTVFHRDKTKDAHPESCCSSEKGGQPLPWFEHRKNVPQFAEPTETSFGPDSGKGAKSLVELLDESECTSDEEIFISQDEIQSFMANNQSFYSNREQYRQHLKEKFNKYCRLNDHKRPICSGWLTTAGAN	1211322	1181165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1181789_1182478_1182728_1183227_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755_1192870_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210749_1211180
888966	contig_2834_pilon	+	1924	7	Intergenic	novelGene_27982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2449.13037287388	6031	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	81	656	274763	290707	TRUE	15	GCCAGCCTGAGGGTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238728	292129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291662_291815
888967	contig_3509_pilon	+	2057	8	Intergenic	novelGene_160701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_4	62.9897950918582	76	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	207	1334	18763	42271	FALSE	10	GTGGTTATTTCTGTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYGAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETLFSKEKESTSAEVLPEIKAGPDESAEFTDPLKLCPREEFQRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFKKLSRRNGAEVDIEGMKRLLEGLGYSVDVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHKSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTMHSEEQPDMLSYDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGEKKGISWHKDSLSVSADSSSQSSENLEEETIHNAHMEKDFIVFWASTPHNLSWRDETQGSPFITRLITCLQKYSWCYHLEEVFQKVQQSFEKPSIKTQMPTIERVTLTRDFYLFPGN	18556	42994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_18770_23880_24130_36139_36250_37092_37267_38722_38958_39788_39933_40576_40687_42172
888968	contig_6735_pilon	-	2895	7	Intergenic	novelGene_15660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_1	930.484536261738	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	1434	2414	546049	542464	FALSE	30	GCTGAGCTAAATAGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDTSCNGPAPNTACWVPATPSLPPPPILFSHLQSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	548092	541982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_546634_547243
888969	contig_11293_pilon	+	4187	17	Intergenic	novelGene_134659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	202.150895063564	1200	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1174	3525	261	3785	12784	52126	FALSE	20	TTATTTCTGTTTGCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKANREMKRLYVGGLSQAISQADLQNQFSRFGDVSDVEIITRKDEQGNPQKIFAYVNIRVSEADLKKCMSVLNKTKWKGGTLQIEQAKESFLHRLAQEREEAKTKKENSRPGNTDLLKKMEVVDLHMKAVPGTEVPGHKNWVVSKFGRVLPVLHLKSQHKRNVIKYDPSKYCHNLKKIGDNSTNTIPVTNLTWKLEGGRDPMSKKRRGELSDFHSPPKKRVKVQCDAGATGPLAVHPRHSSVMDSPLLIQQQAAQNTPHDSISLSKLRCVPNSDCQKPKNVPFQTHGLEIGRNKNSMSDDDIDSEDELRAMITREENLQRTTWSSIKELENDPFVVVRDDFKSDVHKLYSLTSLGIKNNVSCQVKNDYVTGNDCEYDSGDTDEIIAMKKNSKVKNSTEFLNREKSICQKTLKDKKGCEFSDDSIKVQNRKKRVELAVSNGVRFLNCKSPSGSSNSEDANSVSESAESEGDEEYNAMMKNCLRVNLTLADLEHLGCSDAEAPKESTESNSQETTTCCQFVRASRSLKTPDSSHRGKQCIHPEDIVASLLEGEKNICSKQKPKENKFQAFKGIVSLYGKESRKNSLKEGIASNNINKDQNSLKLQDSSSISMEKGSSFADGLSRELTPCQHTKKANSPNHTKPQNRQAIFESQNPKVVSPSNSEKKSTTSSPLLLTGKKSLSLGAKSHKIDFDKDGRHSNPKIEDGLEKERTDSRSLTSPEKSPKVSSGKDRPSCMFSKQTQESRSDFPRSVSNPSDVTEDRHAQDNRKRLAALDARQKAKQIQKKLVHNALANLDDHSEIRPTHIIFGSDSESETKETYIQEQSHPREELVKESICKAPGKLFDSSSNEESDSEDDSNRFKIKPQFEGRAGQKLMDLQSRFGTDDRFHMDCRFLESDSEEEQKEVDEKKTAEEEELAAEKKKALDVVQHVLHINLSNSTSKGSITAKKFKDIIHYDPTRHDHATFERQRDDKQKESKAKRKKKRAECEKLPEVSKEMYYSIATDLKERLQTTKDSSEKKENIPWNVDCDGDKTEINDPTPLKNGDEEPAGFTFSFFDSDAKDVKEETYRVETVKPGKIAWQEDPCFQDSSSKEEDATEVIDHRRPNSGEVSLPEKETSRFFFFCKNDERLHVGSDLFWRGAGSDMSRNCWETRTNNLRMDCRKKHKDAKRKVKPK	11446	52528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_11682_12758_12923_13492_13556_14525_14605_25959_26096_26788_26853_29687_31586_32913_33028_33474_33598_33853_33945_37293_37433_38394_38473_44666_44936_46672_46800_47396_47468_51451_51535_52075
888970	contig_18916_pilon	+	2213	10	Intergenic	novelGene_136868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	933	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATGAAAACAGATAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8408	54925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_9309_13050_13301_14084_14223_16156_16509_18529_18696_20454_20512_20721_20810_40925_41065_41993_42082_54890
888971	contig_5200_pilon	+	4167	1	Intergenic	novelGene_140145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1864	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2247	2546	107162	107461	NA	40	TCAACAAACGGATGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLQWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWAELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDRRNPGSMAPRHPFSSVVKSFTRFTIQPGSGQPHKTKRD	104915	109082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_104900_109100
888972	contig_12429_pilon	-	2619	2	Intergenic	novelGene_136220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAATGAAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370637	335948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_336106_368175
888973	contig_9538_pilon	+	406	1	Intergenic	novelGene_176443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGCCCCGCTTTCACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26175	26581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_26200_26600
888974	contig_8597_pilon	+	5271	26	Intergenic	novelGene_158696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1026	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	4413	4895	185333	185815	FALSE	25	AAACGGAGACCGCCGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPLYLQRKAISTNFLCGGFAAAGRRSRNLRVTRCARFPLLPLTEGISALQTPGQQRPTAARTPKVASHPAAPHDSRQSRRHQPSRSGEVLQPSGPRPPSQWRVPRPEMGRRRERKRSRVETPSGQAREGEEEREKRRAGEELCQLLPPLGPPARPAPL	21086	186191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_21507_39990_41058_41324_41417_42546_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53379_55223_55387_58900_59054_60321_60427_72322_72570_72667_72760_74922_75058_80137_80188_83839_83929_86760_86822_92312_92473_97443_97540_101452_101585_101929_102078_104011_104098_104982_105159_107805_107941_108488_108593_148857_148939_185226
888975	contig_7272_pilon	-	3546	20	Intergenic	novelGene_25351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	85	junction_17	627.092119481492	53	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	966	2901	65	2965	633189	593320	FALSE	20	GTATAGTTGCTGAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALPPPPCSPPAAWAARRSPKMASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKDMAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633253	592738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_620502_620568_632105_632194_633027
888976	contig_16635_pilon	+	1718	5	Intergenic	novelGene_153142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_3	146.408674606391	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	174	626	86080	94700	FALSE	5	GAGCCTTTTTGTCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGAVAAKVRRHDMRVHPYQRVVTADRAATGN	53052	95792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_87773_90607_90683_94683
888977	contig_5260_pilon	+	1139	4	Intergenic	novelGene_144337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	152	junction_1	57.8676651219545	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTTAAAAAAAGAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61843	84817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_61996_62131_62217_70367_70468_84015
888978	SIRV5	-	646	3	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTCACCCAGGAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	7998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV5_-_8381_8453_8590_10863
888979	contig_8377_pilon	+	2814	2	Intergenic	novelGene_35040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGAAAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81211	84071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_83478_83523
888980	contig_5003_pilon	-	2326	10	Intergenic	novelGene_120206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.796149930569	165	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	25	2073	139635	133447	FALSE	25	TTTGTCATCTTTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVRTLQEQLEKAKESLKNVDENIRKLTGRDPNDVRPIQARLLALSGPGGGRGRGSLLLRRGFSDSGGGPPAKQRDLEGAVSRLGGERRTRRESRQESDPEDDDVKKPALQSSVVATSKERTRRDLIQDQNMDEKGKQRNRRIFGLLMGTLQKFKQESTVATERQKRRQEIEQKLEVQAEEERKQVENERRELFEERRAKQTELRLLEQKVELAQLQEEWNEHNAKIIKYIRTKTKPHLFYIPGRMCPATQKLIEESQRKMNAIFEGRRIEFAEQINKMEARPRRQSMKETGNQHNDVEIEEAGEEEEKEVGIVHSDPEKEQEEEEQKQEIEVKMEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139659	133193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134623_134709_134790_135531_135671_135748_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
888981	contig_4730_pilon	+	3683	7	Intergenic	novelGene_71698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	909	junction_5	250.64234146156	137	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	118	1197	84213	123105	FALSE	25	TTAATTTTGCCATGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYNAKDEVDGGPPGAPGGTTKNRRPDNTAFKQQRLPAWQPILTAGTVLPTFFIIGLIFIPIGIGIFVTSNNIREIEIDYTGTEPSSPCNKCLSPDITPCICTINFTLEQSFEGNVFMYYGLSNFYQNHRRYVKSRDDSQLNGDPSALLNPSKECEPYRRNEDKPIAPCGAIANSMFNDTLELFLIGNDSDPMAIPLKKKGIAWWTDKNVKFRNPPGEESLEERFKGTTKPVNWRNPVYALDSEADNNGFINEDFIVWMRTAALPTFRKLYRLIERKDDLHPTLPAGRYYLNITYNYPVHSFDGRKRMILSTISWMGGKNPFLGIAYITIGSISFLLGVVLLVINHKYRNSSNTADITI	84095	125591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_84444_112057_112166_114406_114515_118486_118575_119487_119632_120292_120500_122911
888982	contig_6509_pilon	-	3523	1	Intergenic	novelGene_145620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1094	3282	241	3522	73622	70341	NA	50	TCCTGAAAGAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEKLRLYKDERKKKSKDRPSKLEKKNDLKEDKMSKEKEKTFKEDKLKKEKVYRDDSAFDDYCNKNQFLENEDTKFSLSDDQQERWFSDLSDSSFDFKGEDSWDSPVPDYREMKSDSVAKLILETVREDSKEKRRDNKSREKRDHSERRSDRDSFFRKKDRDYLDKNAEKRKDQTEKHRSIPSYLSEKDKKRKESVDGAKERKDKDLSDICRDRKDSFESAKERKEVRAKPEEAYREGLKEFSCDSFFKDKSDSDFVKSLESWERHHSVKEKDKKDGIDKEKKEKVKSEKYKDKSSDKDKNEKSILEKIQKDKEFDKCFKEKKEIKEKHKDVHSKDKERKASVDPVKEKKEKTYPGILSEDFSEKKDEKKGKEKSWYIADIFTDESEDEKDTYAASGFKLTETGEGQRAEGPQDREEGKEPYPSDKHRKYSSDKQHSEKQKDKESKDKKKDKGATEGGKDRKEKIFEKHKEKKDKESTEKYKDRKDRTSAESTQEKKNKQKLPEKAEKKHAVEDKAKSRHKEKSDKEHSKERKSSKSAEMEKSLLEKLEEEALHEYREDSNDKISEISSDSFTDRGQDPGPTALLEVSFTEPPEEKAREGSCLQEKLKERHRHSSSSSKKSHDRERGRKEKAEKKDRSEDYKETGSRKDSSQYEKDFLDGDTYSISYNTKADIEDELEKTIELFSTEKKDKNDSEREPSKKIEKELKPYGSSAIN	73862	70339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_70300_73900
888983	contig_4114_pilon	+	2907	2	Intergenic	novelGene_15599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCTCAGCAACATGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273165	276367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_274346_274640
888984	contig_3975_pilon	+	3206	3	Intergenic	novelGene_54948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2800	junction_2	1365	21	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTGTGCATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2350923	2356697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2351635_2352983_2353059_2354277
888985	contig_6137_pilon	+	3201	19	Intergenic	novelGene_59197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1352	junction_18	839.643303161056	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	123	1994	1313656	1353702	FALSE	45	TATAAAATGAGATTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1300406	1354909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
888986	contig_10930_pilon	-	1577	2	Intergenic	novelGene_37066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGTTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	284950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_285066_287593
888987	contig_7963_pilon	+	3816	2	Intergenic	novelGene_58493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGCTAAATAAATAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131418	137315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_132502_134582
888988	contig_14970_pilon	+	4850	9	Intergenic	novelGene_45028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_4	5745.96425219475	85	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	130	735	177395	210890	TRUE	15	TTAACTCTTTGTGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATRKDGDSQPLY	177265	232247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
888989	SIRV7	-	2152	4	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	105	-167	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	102	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATCAAGTTATCTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147813	1172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3130_114680_114989_147608
888990	contig_34_pilon	-	2130	7	Intergenic	novelGene_40006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	882.106522290061	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	9	977	247052	212936	FALSE	80	AGAATGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNDFKRTHLFASLKLQICSSPGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKVSASDASVTML	247060	211782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243411_246970
888991	contig_3822_pilon	-	2711	11	Intergenic	novelGene_133310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_10	911.49808557122	58	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	1978	2709	292774	277222	FALSE	75	GAAAGAGAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDS	297863	277219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119
888992	contig_14925_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_55370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129484	128111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
888993	contig_16411_pilon	+	5335	3	Intergenic	novelGene_77295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_1	16.5	729	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATTCAATCCATAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75837	96536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_75894_89552_89629_91333
888994	contig_8729_pilon	-	2296	2	Intergenic	novelGene_40118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	390	482	401365	401273	FALSE	50	AAAAAAAGAACGGGGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWKGKRPQISKALLKKKNKVGGFTLPDLRTYHTALVVKTAWYWYNDRHIHQWNRIENPDINPSTYGQLIFDKGPKSNKWGKDSLFYKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKANSKWIKDLIIKSKTINIMEEKIGTTLGALIHGINIIQTISNNAQALE	468666	399458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_401505_468416
888995	contig_3822_pilon	-	1780	14	Intergenic	novelGene_133312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_11	1056.62002149424	84	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	254	610	306185	296975	TRUE	75	GAAAGAGAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEVLFPGSA	306438	277219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296237_296888_296998_299561_299696_305985
888996	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	232	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
888997	contig_7843_pilon	-	6158	1	Intergenic	novelGene_152056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	451	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTCTCAATTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547652	541494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_541500_547700
888998	contig_20293_pilon	-	6167	16	Intergenic	novelGene_153496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.838266358412	2848	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	123	1667	68656	19443	TRUE	20	TGTTGGCTGTGTACATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116224	14664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_18613_18890_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147
888999	contig_10404_pilon	+	1320	6	Intergenic	novelGene_138668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2838.00890766749	9831	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	66	365	1085448	1098548	TRUE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFLKYLSTCKP	1085382	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098291_1098519_1098859_1099839
889000	contig_6871_pilon	+	1761	4	Intergenic	novelGene_21552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	301	726	134107	135017	FALSE	20	AAACGAGTGTGTTCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121896	136052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134115_134599
889001	contig_9653_pilon	-	3815	11	Intergenic	novelGene_48284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1089.35104075775	105	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	733	2076	1018271	1006754	FALSE	30	AATAGATGGATTTGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKRFY	1020030	1005014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006766_1006965_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018923_1019949
889003	contig_14536_pilon	+	768	2	Intergenic	novelGene_69271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGGTTTCGGTTCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23331	24206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_23860_23966
889004	contig_5686_pilon	-	5467	2	Intergenic	novelGene_45341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1534	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCCTGAACACAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123383	117689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_120241_120467
889005	contig_1008_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_121540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2572	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	537	851	294495	294181	NA	65	AGCTAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRHSANLELKTFLKSTFQTKTQRPIKQTVTHVRNMLLSSIKYTRPNGQLLSKSKTRRQEGSGTGRMDTGNPRWKGGVCCHIVGTATNVKKQYVYRFLNEKLT	295031	292613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_292600_295000
889006	contig_6445_pilon	-	3280	16	Intergenic	novelGene_77016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1078	1518	672261	670252	TRUE	0	TGCCTGCGCGGTGGCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMHYRGCKNKQTKKPIQHPYRVESGQLNLVMFRSCWRYLAVWLTKSPACSCWDLINHASVGMQSQRGVPDPPHLSASWLRFRLPNQSYCLTDEYATVGLPTVGNGSPLLLQQPRGFHNSPAGTVLSARSAFPASIPEALAPVHHL	673338	522187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515_644717_656008_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663_665823_670245_670284_671852
889007	contig_5302_pilon	-	2589	11	Intergenic	novelGene_81422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	660.502392122845	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	87	995	209238	177220	TRUE	40	AAAACCTGACCCTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHASQRLFSDKLPESLEDGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209866	175556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176945_177013_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209809
889008	contig_2067_pilon	+	3203	5	Intergenic	novelGene_158925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	393.142070376601	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2679	523	3201	604648	607326	FALSE	50	TGATGAAACGTATATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQVTLPEMTQDWTKEHVKKWVTEDLKIDEKYGQILLREEVTGLVLQVLTEQDLRDMGLPQGPVLLIKRGYNKLNNSSPESHNQNSGQLDHTKTSKKEQRKKPQQTKKEELISSNIDHDLTETGDTKEEELILMKENATNEVGATKGKKKNKLKTEQLTCMPYPFDQFHDGRRYIEHYMLQPETGPLNLIDPIHEFKALTNTDMATEKDIQMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVKDKPHGEIVGVKVTSKDAFIDHFNLMIKQYFEESHIKEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPSDKFVIEVDIIPKHSVCKDKYFYINMQNCKDGSWRQDKDASLFVREGASSKNIFANVRQQDADFKAFLLNVKPLAASRRKAEEEYGVKANKKESEGLKLVKLLIGSRDSLDNSYYDWYILVTNKSHPKQTKHLDFLKEIKWFSVLEFDPESVSNGVVKAYKESRVANLHFPSQYEEKTTNIKDMISTLNLYEQPSWIFCNGRSDLNNETYKPLDPHLWQRERASEVRKMILFLTDENVMTKGKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFCAFYQALKGMENILCICINSQIYLRWKDLLQTRLTIADEITNHSISTLNLEQINSTILKLKSVIQSSRRFLPSLGSSSVILEKKEEDILTALEILCENECKDTDIEKDETKFLEFRKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSAFVKRDGYENLKELIQCGAESPRPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHILWDLKKKFRCAVLKNKATDFTEIGEQVTNLITYKATSHQEYIPVLLLVDDFEELENIYVLQDAINSSLAKKGLRYEKTLVIILNCMRSQNPDRRAKSADSVALIKQLSAKEQRAFEAKLEEIEKQHKNCENFYSFMIMKSN	590121	607328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_590224_592790_592905_593355_593454_594299_594487_604626
889009	contig_12079_pilon	-	2382	10	Intergenic	novelGene_67428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	15	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	459	1157	600738	580949	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMAGWV	638827	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580964_585317_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
889010	contig_9901_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_126948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	960	1337	302597	302220	NA	40	AAAGGTGAAGGGATATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDKLPYLSQDFLLSSLLSWRHRWLRDFRRLLRLCRASGNPSPVRALQAWSSQQWSWNLSRPSLSLISSSGRASGASCLLASTRKGTLAMLGLSSTSLSPATASGRRSLSVLSSTYTRISVPSR	303556	301314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_301300_303600
889011	contig_13798_pilon	+	3982	3	Intergenic	novelGene_178530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	812	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	2537	3376	107417	108256	FALSE	50	ATATATCAAGCTAACAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILTAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	103661	108862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_+_104338_105312_107143_107386
889014	contig_12677_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_110675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1741	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
889015	contig_9931_pilon	-	3963	1	Intergenic	novelGene_134828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	522	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCACAATAGCAGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320865	316902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_316900_320900
889016	contig_6291_pilon	+	3987	1	Intergenic	novelGene_164796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTGGCTATTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382831	386818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_382800_386800
889017	contig_5059_pilon	+	5376	4	Intergenic	novelGene_140747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_3	353.945695772043	207	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	843	2354	414332	443629	FALSE	65	GAAGAAAACTCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAERKKPANMEEKESLLNNKEKDCSERRPVSSREKPKDDIKLTAKKEVIKVPEDKKKKLEEDKRKKEDKERKKKEEEKVKAEEELKKREEEEKQKYEEEERKKQEEQAKRQQEEEAAQLKEKEESLQLHQEAWERHQLRKELRGKNQNAPDNRPEENFFSRLDSSLKKNTAFVKKLKTITEQQRDSLSHDFNGLNLSKYIAEAVASIVEAKLKISDVNCAVHLCSLFHQRYADFAPSLLQVWKKHFEARKEEKTPNITKLRTDLRFIAELTVVGIFTDKEGLSLIYEQLKNIINADRESHTHVSVVISFCRHCGDDIAGLVPRKVKGAAEKFNLSFPPNEIISPEKQQPFQNLLKEYFTSLTKHLKRDHRELQNTERQNRRILHSKGELSEDRHKQYEEFAMSYQKLLANSQSLADLLDENMPDLPQDKPTPEEHGPGIDIFTPGKPGEYDLEGGIWEDEDARNFYENLIDLKAFVPAILFKDNEKGCQNKDASKDDSKGKL	413489	446651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_414694_420161_420942_431285_431447_443420
889018	contig_11512_pilon	-	2660	14	Intergenic	novelGene_43357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1149.32820614644	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	91	1047	592804	556654	TRUE	5	AGTGGCCTGTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	592894	554959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556367_556447_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
889019	contig_5686_pilon	+	6681	10	Intergenic	novelGene_45421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1326.78131832893	2	137	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	2460	4262	189037	219782	TRUE	50	AAAAAAAAGTTCCAATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEGKHQMQTLSPFMQMMTQLAHPPACVCSLFYQDSRETF	186577	231134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_220930_229862
889020	contig_16098_pilon	+	949	6	Intergenic	novelGene_46064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	490.56848655412	923	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	101	448	436826	438580	TRUE	15	GACAGTTCCAGGCTCGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PADRAPARPSEALSSLCSPWAAPRVGPLPPAPAMVRISKPKTFQAYLDDCHRRYSCAHCRAHLANHDDLISKSFQGSQGRAYLFNSVVNVGCGPAEERVLLTGLHAVADIHCENCKTTLGWKYTLHILSVGANISTKTCHDPVSSTPW	436078	439226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_436113_436759_436943_437045_437090_437263_437373_438502_438605_438749
889022	contig_8587_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_159149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTAACTTTTACATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513950	516031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_514000_516000
889023	contig_16775_pilon	+	2045	15	Intergenic	novelGene_107779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	251.461118023346	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	1	1440	130643	174136	FALSE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHLPLAFLVLSPATRGRAFRLGPAVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130642	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130722_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
889024	contig_12951_pilon	+	2713	11	Intergenic	novelGene_68189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	334.818473206005	669	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	180	1487	755258	837330	TRUE	35	ATTGTTTTCTAAAGAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSST	755078	839320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934_836131_837306_837672_838435
889025	contig_11548_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_66797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGGAAGTGTTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168704	166672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_166700_168700
889026	contig_2854_pilon	+	5921	8	Intergenic	novelGene_120788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	160.275146073805	1352	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	127	2535	67576	86814	TRUE	20	TCGCACACGAGGACGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPLPARIWLQLRGAQEAVHSAKEYIKGICEPELEERECYPKAMHCIFVGAQSLFLKSLIQDTCADLCVLDVGLLGIRGSAEAVVMARSHIQQFVKLFENNENLPSSLKESEVKREFKQFVEARADNYTMDLLILPTSLKKELLTLTQGEDNLFETGDDGVLEVRDSKQTDLTQIAAPGQNISRDEIVLQEDERKKAGTPVSELTKQMDTIFSSSPAVPFVPVNGLPPDEEALLKERICHKRRSSDSEERHTKKQFSLENVQQGEPVCDGRTSARSVTADLSGSPDSEHVSPDAKDTTEEMEYNILVNFFKTMGYSQDVVEKAIREFGPSAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLRDMQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	30292	90726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_30359_67515_69192_77196_77328_78878_78976_82393_82502_84541_84650_86465_88148_88673
889027	contig_1925_pilon	+	3735	8	Intergenic	novelGene_162212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_7	376.34309140594	1169	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	293	925	254564	284492	FALSE	30	AGGCACATAATGTCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGKAINVFISANRLIHQTNLILQTFKTVA	225000	287302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225172_254442_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713_279797_284410
889028	contig_12139_pilon	+	885	2	Intergenic	novelGene_146458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	605	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGCGAGCGCTCCCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69203	173297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_69382_172590
889029	contig_7963_pilon	-	6616	14	Intergenic	novelGene_58432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	671.503382641821	2217	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	983	2053	123098	120628	TRUE	25	CCCAGTAAGTGATTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126298	113557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_114521_115838_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563_125775_125956
889030	contig_3151_pilon	-	4351	6	Intergenic	novelGene_139186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1530	1829	163026	162727	TRUE	25	AATGGCTGATTTTTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHTKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTIQLGIGQPHKTKQD	183200	153995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_156066_162274_163104_163765_164046_169388_170089_181652_181732_182807
889031	contig_6137_pilon	+	2806	4	Intergenic	novelGene_59166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	59.868374140461	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAATAAAAAGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239045	1308274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240538_1268908_1268973_1305910
889032	contig_16303_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_34122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	871	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCAGGGGGCAGCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48130	45222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_45200_48100
889033	contig_6489_pilon	-	1413	11	Intergenic	novelGene_128938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	137.355888115508	233	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	498	1412	270780	235581	FALSE	25	AGTTTGGATCAGCTCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESIAIKGTSLQIVASEPMVETEDLSETKVFTASSVPAENHVMPGQSIDLVALLQKPAPPSQVSEVNSFESSQQQGFGQALVFTNSQHNNQMAPGTGSSSAVNSYSTQSLSSVLGSGFGELAPSKTANITSSQILDQLKAPGLGQFTTQSSQQNNTSAATTTSSWDLKPTSSQSSVLSHFDFKSQPEPSPVLSQLSQRQQHQTQAVTIPPPGLESFPAQVKLRESASGDSTSTVNKILQLPSMAVENIAVSAHQPQPKHIKLPKRRIPPASKIPASAVEMPGSADVTGLNVQFGALEFGSEPSLS	308144	235579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_235680_236313_236589_238585_238797_241742_241933_245007_245076_248262_248272_270717_270796_272185_272343_277001_277113_279195_279274_308008
889034	contig_12837_pilon	-	5319	14	Intergenic	novelGene_57375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.265233347181	1433	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	492	1694	390102	371718	TRUE	35	CAATATTATTATTAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDLYQTPLHLAVITSQEDVVEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKILSILLKHKKAALLINQPNGEGLNAIHIAMMSNSMSCLRLLMAAGADIDAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTFDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWERDGEDEGVVPGTTPLDMAANWQVFDILNGKPYESELTSDDLLAQGDMKQLAEDAKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVKELVEALRQMGYTEAIEVIQTAFCSSGTATTSSVKTPSQAHSLPLSPSSTRQQIDELRDNESICDSGVETSFRKLSFTESLTSSGSLLTLNKMPHDYGQHGSIEGNV	399042	341564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_342111_348879_349397_369155_371879_375467_375649_376626_376800_377341_377409_378812_378938_381971_382075_382543_382714_383351_383554_390081_390197_396076_396254_397489_397580_398912
889035	contig_8587_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_159152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGGTTCCCTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514041	516648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_514000_516600
889036	contig_12733_pilon	+	2403	10	Intergenic	novelGene_129592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	443.940436445151	83	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	281	1858	332310	354319	FALSE	35	TGTATATTTACTAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTYRQREKQGTKVADSSKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGQQPSVGTEIFVGKIPRDLFEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLYNNHEIRSGKHIGVCISVANNRLFVGSIPKSKTKEQILEEFSKVTEGLTDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKTAAQARRRLMSGKVKVWGNVGTVEWADPIEDPDPEVMAKVKVLFVRNLANTVTEEILEKAFSQFGKLERVKKLKDYAFIHFDERDGAVKAMEEMNGKDLEGENIEIVFAKPPDQKRKERKAQRQAAKNQMYDDYYYYGPPHMPPPTRGRGRGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDYYGYDYHNYRGGYEDPYYGYEDFQVGARGRGGRGARGAAPSRGRGAAPPRGRAGYSQRGGPGSARGVRGARGGAQQQRGRGVRGARGGRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQNWGSQPIAQQPLQGGDHSGNYGYKSENQEFYQDTFGQQWK	329654	354864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_332031_332151_332282_332391_335125_335240_335339_335517_344594_344731_345322_345529_346808_346959_347505_347628_353727
889037	contig_14333_pilon	+	2893	2	Intergenic	novelGene_49131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTTTGTTCTCCCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422284	425221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_424962_425005
889038	contig_10339_pilon	+	4688	8	Intergenic	novelGene_125269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.4334530873973	965	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	316	1389	328740	329813	TRUE	15	TGCACTTCCCGCACTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCGEIDHSINMLPTNRKTNESCSNTAPSLTVPECAICLQTCVHPVSLPCKHVFCYLCVKGASWLGKRCALCRQEIPEDFLDKPTLLSPEELKAASRGNGEYAWYYEGRNGWWQYDERTSRELEDAFSKGKKSTEMLIAGFLYVADLENMVQYRRNEHGRRRKIKRDIIDIPKKGVAGLRLDCDSNTVNLARESSADGADSVSAQSGASIQPLGSSSVRPLTSVDGQVTSPATPSPDASTSLEDSFAHLQLSGDSIAERSHRGEGEEDHESPSSGRVPAPDTSIEETEPDASNDTEGVSALVAEHSLTQQRLLVPNANQTVSDLSDRSGTDRSVAGGGTVSVRSRRPDGQCTVTEV	292296	366773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_292505_308602_308709_328738_332432_346584_346670_348534_348585_354101_354243_357037_357263_366593
889039	contig_13633_pilon	+	2134	13	Intergenic	novelGene_15302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	395.664095400238	352	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	507	1787	22038	49142	FALSE	10	CTCTGCCTTTCGTAGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5022	49489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21641_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
889040	contig_10323_pilon	-	1798	8	Intergenic	novelGene_123548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	102	junction_2	278.195570615716	57	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	19	543	305132	268465	FALSE	5	TGCCTGCCTGGCCTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVKAAVMLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVPPKVKCLTRIWHPNITETGDICLSLLREHSIDGTGWAPTRTLKDLLNFDDPLNIEAAEHHLRDKEDFRNKVEDYIKRYAR	305150	267209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_278700_278759_279648_279720_285482_285551_292633_292700_295187_295218_305014
889041	contig_10437_pilon	-	2755	3	Intergenic	novelGene_38111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.5	12	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	106	660	80783	80229	TRUE	45	CACAAGTTTTTTAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLGASPFCQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82851	76956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_78671_79847_80788_82750
889042	contig_3747_pilon	+	2781	9	Intergenic	novelGene_24835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3826.39692628718	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	372	1379	201481	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200984	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201203_201327_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
889043	contig_11145_pilon	+	3312	3	Intergenic	novelGene_160507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1896	2483	5381	7676	TRUE	60	CTATCAAAAAAATAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKKKSEMESKNS	3485	87333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_5936_7643_8414_87241
889044	contig_4213_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_124814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCACTTCTATCCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45709	44211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_44200_45700
889045	contig_7876_pilon	+	5317	6	Intergenic	novelGene_144847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	161	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGCTTTTTCTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226811	395978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_227720_228322_228607_228771_229204_281074_282365_391044_391883_394413
889046	contig_546_pilon	+	5358	8	Intergenic	novelGene_117166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	902.867608438439	2507	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	169	1686	119834	152874	FALSE	40	AAAGACAAACCCCCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSYEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	9434	156546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_9565_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140638_146633_146841_147557_147672_152818
889047	contig_15047_pilon	+	2163	6	Intergenic	novelGene_52187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3061.42317231708	17	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	20	862	2194	3736	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPRERAFLSETVTVTGSSL	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_4434_4552_4687_21013_21062_21232
889048	contig_14682_pilon	+	2562	12	Intergenic	novelGene_139124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	339	junction_10	252.576704657293	11	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	307	1248	142535	174580	FALSE	45	AACAATCCTGAAACCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGARAPASRQLSAGPLPLLRPGDSSALPARCRRREERACLRAAPAAPPPRPACPVASSPLGWRRPGADRRQRGHFLTPRSLSRLPRLLFPPRLGAGRYSGPRMQNMINTVKGKALEVAEYLTPVLKESKFKETGVITPEEFVAAGDHLVHHCPTWQWASGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGIAGITEAVKEITLESKDSMKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYLLIFLKFVQAVIPTIEYDYTRHFTM	142228	175894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_151306_151357_157167_157239_158635_158744_162323_162374_165799_165879_169207_169243_169509_169666_170436_170565_172795_172865_174498
889049	contig_9389_pilon	-	2751	3	Intergenic	novelGene_83880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	234	25	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1495	2001	40460	39438	TRUE	0	CTGGCCTCGGGCTGGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGWCLLPSAPWLTICHHNCTCLPGDVRVRQNEDFKGIELGTLKGVSFPSLGETKQAVAMMGFWPGVLTCLGPEDHTLPPPGPQAPARLPACSGWLPGEEVLSLQAEAAFHQPGSAELRPCAQGQGAKEPPALGEHPVPPDLVGVKWGHAWPGGWGPGTSCSTRHFR	41954	35684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_36420_39422_39535_40050
889050	contig_8541_pilon	-	4365	3	Intergenic	novelGene_105578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	420	22	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGTATATCAGCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577544	546361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_548679_564850_566609_577254
889051	contig_1544_pilon	+	2597	3	Intergenic	novelGene_167930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGCTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28023	117266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_+_29967_30017_30449_117043
889052	contig_9177_pilon	+	4403	30	Intergenic	novelGene_32582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	37	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2938	3291	20739	21379	TRUE	20	AGCCATATACCCTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTWEWISCFDSSILFLRQALDAASWPRGGRVSKSSRVAWAACTACMLELMVPVSACWAEVKGGMCPRCIWPLVICCWAGGMLPIWKFSGPEAPERMMAGRATEPCSTFPMRLYCC	1713	26014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2822_13572_13696_13890_14096_14300_14415_14809_15020_15162_15267_15424_15553_15705_15848_16055_16163_16260_16302_17508_17611_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20809_20907_21023_21210_21390_21607_21689_21866_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327_25480_25583_25714_25970
889053	contig_960_pilon	-	2669	3	Intergenic	novelGene_108245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTTTTCTTTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552332	468802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_470848_540184_540288_551811
889054	contig_6364_pilon	-	4165	6	Intergenic	novelGene_51707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1018.11072089434	26	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	3	428	440728	436151	TRUE	20	TGCGTAGTGCATGGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	440730	431221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_431437_431919_432737_433445_436284_436419_436498_439827_439982_440667
889055	contig_7840_pilon	-	3688	2	Intergenic	novelGene_68948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	244	558	21439	20997	FALSE	50	TTTAATAGCAATGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRFTELPAGDRAPGNQRDTLSHPLSCLPLHRFPAGQSKASQWVDSQLPGGLIPHPHRPVSSLPFLCCWCCFFFTSFGFFPASHLLPILSLEYLTLCAISAAS	21682	17866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_21150_21277
889056	contig_7151_pilon	-	8206	1	Intergenic	novelGene_40738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2020	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACTGTGTGCTTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510463	502257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502300_510500
889057	contig_17464_pilon	-	1209	3	Intergenic	novelGene_178513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	0.5	599	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	234	587	42890	42537	FALSE	20	CTCTCGTTTAAGACTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSCEENEGKPQNMPKAEEDHPSEDVPQEADGNPQPSREGVSQEAQENFRGGLAQPGQRFKEDAPVRHLDPEEMIRGVDELERLREEIRRVRNKFVMMHWKQRHSRSRPYPVCFRP	44096	41914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17464_pilon_-_42933_43524_43598_43978
889058	contig_1264_pilon	+	2076	11	Intergenic	novelGene_161317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	659	1075	142014	143614	TRUE	10	TGGCGGCCGCCGCTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTHSWPTISAHSSSEVITASLGLHKYNCLIFLFGHYFLHELDQFVVFFTFHADIHNLEDVVVGTQLQIAHIDLSVITKKILSKLSYFFWPGCTPHQGLSIRPDLVNNFTDLGFKAHIKHSVCLIQYKVSTSAKICLS	140310	152902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_140929_141973_142036_142291_142403_143248_143422_143503_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148370_152545
889059	contig_2504_pilon	-	5869	4	Intergenic	novelGene_166847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	39	305	455518	455252	TRUE	35	TTATGCTCATCAAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KADKNEEKIDKFMGNTDETMEQFRKIIQEQNVKINSQLEMIQKQHLEIQNINNKISEMDSVIEGLRSRSKTIKDRISKIEDKHLDTTLLEEKSEKKNEEK	455556	386578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_391005_433344_433506_448859_449701_455115
889060	contig_3878_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_174794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAGCAATATCTGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239162	237458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_237500_239200
889061	contig_16322_pilon	-	3985	14	Intergenic	novelGene_87527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_13	153.527246391692	169	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	583	2289	103834	77890	FALSE	20	TCATTGAGGTATGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	106707	76193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_106148
889062	contig_17144_pilon	+	2695	15	Intergenic	novelGene_29181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1078	1395	167621	168283	TRUE	5	GCCACTGTCCTGTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	165966	183238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166576_166750_166838_167239_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_174955_181801_181852_183187
889063	contig_10292_pilon	+	5564	3	Intergenic	novelGene_178288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAGCGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105290	144285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10292_pilon_+_107638_108000_109129_142196
889064	contig_1275_pilon	-	2411	20	Intergenic	novelGene_108769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_19	525.009558018785	30	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2172	240	2411	513735	411437	FALSE	45	GAAGCCTCTAATGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTGVPARRMMKNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDI	546946	411436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470238_470266_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
889065	contig_8377_pilon	+	6319	29	Intergenic	novelGene_35071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2920.19912896469	497	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1059	3180	2267	5446	131448	197871	FALSE	35	TATTATTTATATTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKIKPRKKTKRLNVLNP	120149	198744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_122399_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196179_197823
889066	contig_3081_pilon	+	2141	14	Intergenic	novelGene_133912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	97.0532093430556	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	425	1627	201705	224890	FALSE	20	TATATGACTCTGTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLLCMNNDFPPRAHCLVRWYGLREFVVIAPAANSDAVLSESKCSLLLSSVSIALGNTGCQVPLFVQIHHKWRRMYVGECQGPGVRTDFEMVHLRKVPNQYTHLSGLLDIFKSKIGCPLTPLPPVSIAIRFTYVLQDWQQYFWPQQPPDIDALVGGEVGGLEFGKLPFGACEDPISELHLATTWPHLTEGIIVDNDVYSDLDPIQAPHWSVRVRKADNPQCLLGDFVSEFFKICRRKESTDEILGRSTFEEEGREITDITHALSKLTEPAPVPIHKLSVSNMVHTAKKKIQKHRGGEESPLNNDVLNTVLLFLFPDAASEKPLDAAASTDNNNPPSESEEYNLYNQFKSAPSDSLTYKLALCLCMINFYHGGLKGVAHLWQEFVLEMRFRWENNFLIPG	158612	225404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158811_163708_163785_193875_194009_201687_201767_207583_207704_208765_208932_214282_214383_216969_217052_217354_217424_218870_218945_221102_221196_221656_221827_223756_223847_224713
889067	contig_4803_pilon	-	4727	30	Intergenic	novelGene_150702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.240798412435	844	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	269	2359	66839	15989	TRUE	20	AAATTTTGGCTGTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPPMSEDLLLEALSEDFSGPRPADTSSLKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	93334	12592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_12701_12777_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
889068	contig_16125_pilon	-	1436	2	Intergenic	novelGene_155290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	45	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	59	1207	236934	208035	FALSE	80	AAAGATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGSC	236992	207805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_208046_235796
889069	contig_7253_pilon	+	6507	22	Intergenic	novelGene_140199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1117	67	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTTCCGGACTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161932	201093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_161998_162333_162420_165965_166088_169479_169599_170667_170807_170934_171130_172774_172939_175887_176025_178169_178300_178449_178512_178951_179099_179553_179669_179756_179843_181834_181924_183736_183886_184495_184632_187286_187370_188863_188946_189384_189487_194907_195023_196079_196148_196977
889070	contig_9297_pilon	+	2203	7	Intergenic	novelGene_69882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_1	189.761912230388	12	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	325	1848	910129	912790	FALSE	25	TTTTTGTGATAAGCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	909401	913145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
889071	contig_753_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_113044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1260	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGCTAATCAAAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501938	1499909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1499900_1501900
889072	contig_5023_pilon	+	2234	12	Intergenic	novelGene_7297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1592.83354253195	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	316	1326	622609	647385	FALSE	5	TTGCTGTATTTTTGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGASDKPVSLFESQEIWMVYKSSLITRNFPQNWGPKCHQFLCFPPGRSSLFLTVGFGLVLELTHL	580871	648293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_595648_595819_618636_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646890_647194
889073	contig_3747_pilon	+	2728	9	Intergenic	novelGene_24814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3826.39692628718	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	319	1326	201481	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201152_201330_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
889074	contig_10890_pilon	-	1167	2	Intergenic	novelGene_166786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	645	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGTAAGAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128225	125846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970
889075	contig_16187_pilon	-	3788	6	Intergenic	novelGene_101064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_5	57.2936296633404	652	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	229	714	47874	41457	FALSE	40	ATAACTAACACGGTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGILRSVVQRPAGSLQTVTKGTESLICSDWIRHKFTRSRIPDKVFQPSPADHEKYGGDPQNPHKLHVVTRIKSTKRRPYWEKNIIKMLGLEKAHTPQVHKNIPSVNAKLKVVKHLIRIQPLKLPQGLPAKEDMSETCLRSTGELVLRWDLTPGPQEGIKS	53235	38382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_41590_41667_41742_41962_42110_46088_46170_47823_47902_53034
889076	contig_7359_pilon	-	2296	3	Intergenic	novelGene_139844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.5	644	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAGTCACTGAGCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41902	25433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38291_38651_41421
889077	contig_9696_pilon	-	5708	27	Intergenic	novelGene_68796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	49	junction_16	244.28310765665	1675	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1552	4659	259	4917	440408	349705	FALSE	25	TCAAGGTATTCTGAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLHRKPFVRQKPPPDLRPDEEVFYCKVTNEIFRHYDDFFERTILCNSLVWSCAVTGRPGLTYQEALESEKKARQNLQSFPEPLIIPVLYLTNLTHRSRLHEICDDIFAYVKDRYFVEETVEVIRNNGARLQCRILEVLPPSHQNGFANGHVSNVDGETIIISDSDDSETQNSSFQNGKKKDAVDPLLFKYKVQPTKKELYESAIVKATQISRRKHLFSRDKLKLFLKQHCEPQDGVIKIKASSLSTYKIEEQDFSYFFPDDPPTFIFSPASRRRGRPPKRIPVSQESIANKQTATGYRNKTTKERDKLLKQEEMKSLASEKAKLKREKADALEAKKREKEDKEKKREELKKIVEEERLKKKEEKERLKIEREKEREKLREEKRKYMEHLKQWSKPREDMECDDLKELPEPTPVKTRLPPEIFGDALMVLEFLHAFGELFDLQDEFPEGVTLEVLEEALVGNDSEGPLCELLFFFLTAIFQAIAEEEEEVAKEQITDADTKDLTEALDEDADPTKSALSAVASLAAAWPQLHQGCSLKSLDLDSCTLSEILRLHILASGADVTSANAKYRYQKRGGFDATDDACMELRLSNPGLVKKLSSTSVYDLTPGEKMKILHALCGKLLTLVSTRDFIEDYVDILRQAKQEFRELKAEQHRKEREEAAARIRKRKEEKLKEQEQKMKEKLEKLKEDEQRNSTADISVGEEEREDFDTSTESKEIEQKELDQDTVTEDEDDPGSHKRGRRGKRGQNGFKEFTRQEEINCVTREPFTTDEEEALKQEHQRKEKELLEKIQSAIACTNIFPLGRDRMYRRYWIFPSIPGLFIEEDYSGLTEDMLLPRPSSFQNNVQSQDPQVSSKTGESESTSNTDRGPCDNSVQLPKPVHKPNRWCFYSSCEQLDQLIEALNSRGHREGALKETLLQEKSRICAQLARFSEEKFHFSDKSQTDSKPVYSRGRSSNAYDSSQVSAERQLELRLRDFLLDIEDRIYQGTLGAVKVTDRHIWRSALESGRYELLSEENKENGIIKTVNEDVEEMEVDEQAKVIVKDRLLGIKTETPSTVSTNASTPQSVSNVVHYLAMALFQIEQGIERRFLKAPLDASDSGRSYKTVLDRWRESLLSSASLSQVFLHLSTLDRSVIWSKSILNARCKICRKKGDAESMVLCDGCDRGHHTYCVRPKLKTVTEGDWFCPECRPKQRSRRLSSRQRPSLESDEEVEDHMEGEDDEVDDDDEESQSEEEEYGIEQDEDDSQEEEEVSPPKRGRPQVRLPIKTRGRLNSSFSSRGQRHDPGRYASRSQQSTPKTIVSSKTTGRSLRKIKSAPPTETKSLRIASRSTRQSHGPLQADVFVELLSPRRKRRGRKSANNTPENSPSFPNFRVIATKSSEPSRSLNVASKLSLQDSESKRRGRKRQSTESSPAILNRRSSGRQGGVHELSAFEQLVVELVRHDDSWPFLKLVSKIQVPDYYDIIKKPIALNIIREKVNKCEYKLASEFIDDIELMFSNCFEYNPRNTSEAKAGTRLQAFFHIQAQKLGLHVTPNVDQVSTPPAAKKSRI	441146	348913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_349899_350281_350370_351982_352126_353494_353965_356779_357007_357097_357346_363604_363754_364956_365112_365651_365816_366961_367550_368288_368414_370123_370238_371009_371176_372579_372805_372923_373020_378185_378333_379621_379761_380486_380583_382568_382736_383329_383427_385912_386048_396444_396533_399959_400062_410407_410552_429657_429937_440295_440467_440946
889078	contig_16594_pilon	+	3373	3	Intergenic	novelGene_53902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	775	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGAGCGCTCACCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254856	371576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_258095_371233_371268_371475
889079	contig_10549_pilon	-	6640	1	Intergenic	novelGene_110588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATGTCACCATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117716	111076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_111100_117700
889080	contig_7051_pilon	-	1788	8	Intergenic	novelGene_64360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	753	1133	345486	338844	TRUE	15	ATTTGGCATCATTCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVFAGFGAVILHHQCQMTQSLCRSSHLHCLLIHNHPVHLLRCFPVCIFGYVINFFICHIQKNFSQKHFCQQHHLVLFLFFSHLWFTLVFLRNWRWTSCDFSTACSLNIFSVFIFLITIKFTSLR	347568	334417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_334500_335887_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343472_345362_345536_346865
889081	contig_863_pilon	-	3765	4	Intergenic	novelGene_176614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	204.737772664341	568	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	2063	3319	7412	6156	FALSE	45	AAAACTCTCCCAACAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPFVMDPPSSMEPPPPMVSPSMELPASIVSPPQLEPPPQLEPPPQMEPSPQMEPPPQMEPPPQMEPLQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMELPPQKESPQMELIPKKSPPPKDDNKEVSDMQSEMARKEQVLIEVGLVPVNKDSQVLKESASTQEPLPPKENLKEEESKDQKIFSEEEGIKEAPLQKVGAEEANKSLAGLAASTEESTSISSCEQNLKMPEGDILDGKHQTDTMLGEMETDTDQNATENLSGKDSAVEEPILPLLLSPPIENHEAVSKTAVTSLSVTTAVSESQEIDEDEGIHSHDGSDLSDNMSEGSDDSGLNGARLVPQETSRKNAKEAVSVKVAEGDFVCIFCDRSFRKEKDYSKHLNRHLVNVYFLEKAAKGQE	20484	5709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_8380_14545_14630_17903_18811_20380
889082	contig_13481_pilon	-	691	4	Intergenic	novelGene_119377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	501.119635305671	407	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	21	314	536852	527468	TRUE	30	CACCAACGTTCACTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536872	520954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_521325_527460_527531_536157_536304_536767
889083	contig_4469_pilon	+	2916	5	Intergenic	novelGene_21948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_1	241.80260544502	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	248	1486	751887	755841	FALSE	50	TATTAAAAAGAAAATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIPSAQPPPACLPKAPGLEPGDLPGMDFAHMYQVYKSRRGIKRSDDSKETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELTLKHVKALTNLIDQQQQKILALQSGLQAGELSGRNVDAGQEMFCSGFQTCAREVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQDGTSRKPSDPAPKTMDFKEKPSSLAKGSEGLGKNCVPVIQRTFPHSSGEQSGSDTDTDSGYGGELEKGDLRSEQPYFKSDHGRRFATGERIGTIKQESEEPPTKKGRMQLSDDESHFSSSDLIGSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPVLYPGLNASAAALTSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPTHPSIDSSALLQALKQIPPLNLETKD	751639	757271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_751967_752133_752204_752461_752570_753495_753620_754984
889084	contig_10734_pilon	+	2364	12	Intergenic	novelGene_51184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445.466678870004	1840	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	452	1552	1129441	1142903	FALSE	15	AGTCCTTCGTATGCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123690	1143715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1124903_1124980_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
889085	contig_3155_pilon	-	4575	5	Intergenic	novelGene_26427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.7749907475931	434	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGGAGAGGGTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325084	265492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_266970_317290_317630_318047_318961_319933_321701_325005
889086	contig_6191_pilon	+	3347	10	Intergenic	novelGene_107817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	8	junction_1	55.7135531087365	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	330	2249	17002	43956	FALSE	15	TTTGTCTGAGTAACTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSKGAGAAASDEKPGIDTLNENYSWQISVTDNDFKIFKNHESQLCEILQDKFDCISTVVSPALEGHIKSLQVFRKMLTSQVALSVWKDDLTRHVVDAVVNAANEHLQHMGGLALALVKAGGPEIEEDSRRFIGRYGKVPTSRIAITRAGRLPCKEIIHAVGPQWIARDGQRCVEELKMAIINILEYVNCTNLDIKAVAIPALSSGIFQFPLDLCTRIIVSTIKLYFIKKQVVGNLKEIHLVSNEDPTVAAFKTASENILGRNQLESLAFSAEMAENKSMLPSHNSFSVSQWTREEKRENGLKANSPAINLMGSNMEKMREAEAWIHRLLKLQGHHVIENNHIFYLGTKEHDILSRLQKTSSVSISEIIDSGKAKLEIKGARADLIEVVMKIEHVLCDIQEEMAKRREQDLWSLLGQWTGQQPKKQDEMKGNSNRVKFPVMFSTQALQDKKKQFEKCGFQVIKVEKINNEVLNTVFQAKKKMMAGRSRNVLVSHGLFHRVPHQFCNMVCRVGFQRMYQMPCESRYGAGIYFTKNLKNLADQIRKTPATDKLIYVFEADVLTGSFCQSCQLNIVPPPLSPGAIDGYDSVVDNVSSPETFVIFSSTQAVPQYLWTCSQDEVWSRDYSSGQMMLSSQSYWG	13032	45054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_13052_13374_13597_16913_17017_17825_17860_20223_20982_26888_26950_34944_35326_36068_36212_36849_37025_43603
889087	contig_2730_pilon	+	3267	5	Intergenic	novelGene_135353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.650551831383	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACCACTGTGCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291561	393664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685_391121_391170
889089	contig_11258_pilon	+	1622	5	Intergenic	novelGene_67766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.560992278038	14	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	367	1104	279290	292963	FALSE	45	TCAGAAGAGCACAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSSGGMRREPSHPASSSFRICFSCPSFHLCIWRTGSKKRCDSHRLVPAHRFINHNWLTSCR	278288	293481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278454_279088_279351_283717_284075_285643_285783_292782
889090	contig_610_pilon	-	1774	2	Intergenic	novelGene_76759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	119	junction_1	0	33	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCCAGCAAGCAGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223389	220573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_220785_221826
889091	contig_13481_pilon	+	2762	1	Intergenic	novelGene_119531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1305	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1914	2213	1470475	1470774	NA	25	TTTGAGACACAGGCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPLVWEHLSAGTSGPKDVLCSWGCFLGGMRSPCLSACFSLLYLKRDWLKTLSNLIYLINITAVNPSYYIIVIGYTTHGEITSYDKMLDNHTILGIMT	1468561	1471323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1468600_1471300
889092	contig_19707_pilon	+	3553	2	Intergenic	novelGene_178573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	293	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAGGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136832	145645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19707_pilon_+_138420_143679
889093	contig_10864_pilon	-	5996	1	Intergenic	novelGene_107063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	852	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	608	1827	84	1910	832379	830553	NA	30	CTGGTAGAATTGAACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMTPKRSRMDIDESRVFRPEWTQCYLVVEAPEGNGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYDRYAAEGERAALVERLRQGDLPVAAQLTPEERAARAGLGLARLLALKGRGWGEGDFVYQCVEVMLREALPEHVGVLEGIDLSPETTAQRVRSIDRNLRAQLFKRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGHDLEVQEELLTIVNLTHHFSVGALMAAILEALQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQALLTECESEHGERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSVRKEIEAFLVSIGATTVHFTDKQWLCDFGFLVDIMDHLGELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLLQRHIEEENLTHFASFREVVDELKQHLKDDQKIFDPDRYRVVICRLQREFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISIRMELTKLQSNTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSADSYPIIKGVACKVASLFDSSQICEKAFSYLTRNQHTLSQPLTDEHLQALFRIATTEMEPHWDDLVRGRNESNP	832462	826466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_826500_832500
889094	contig_5649_pilon	+	2825	13	Intergenic	novelGene_82312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	167.130417306033	424	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	371	1789	187068	203268	FALSE	15	AGCAGCCATTGCTGGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVEISYRAQAEQQHNPAANPTIIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVLETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFKYLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVSSEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS	182560	204304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_182586_183103_183213_183315_183486_187001_187251_188083_188248_188451_188570_190181_190284_197011_197186_198340_198491_199802_199984_201362_201496_202873_203009_203189
889095	contig_12312_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_63922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	652	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTTTGGAAACATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44706	46395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_44700_46400
889096	contig_5125_pilon	+	2828	8	Intergenic	novelGene_43436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	1723.11059495581	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	995	1741	53912	58893	FALSE	15	TTGTCCTTAATGTTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	26046	59980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_36038_36148_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
889097	contig_16125_pilon	-	1096	1	Intergenic	novelGene_155231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTGAGGCCATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116654	115558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_115600_116700
889098	contig_6137_pilon	-	5811	11	Intergenic	novelGene_59218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	212	634	1556352	1555930	TRUE	20	TCCCCCAAGTGATTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNQKNSCKHPLIIGTWNVQSMNLGKLEVINKNEIECISIDILGISKQKWTGIDHFESDNHMVYYAGNDKLKTNGIAFILKKNVSRSILKYNAVSDRIIFICPQGRPVNTSVIQIYTTTTNAKDEEIEDFYQLLQSEID	1678193	1312050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331861_1332172_1334200_1362273_1362283_1555114_1556424_1647635_1647737_1678154
889100	contig_16635_pilon	+	1613	5	Intergenic	novelGene_153139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_2	318.069469613165	25	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	174	602	86080	94700	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPTAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGAVAAKVRRHDMRVHPYQRVVTADRAATGN	53052	95711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87496_87773_90607_90683_94683
889101	contig_5502_pilon	-	1767	7	Intergenic	novelGene_154962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGCTCAGCGTCAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399291	357628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_357718_360692_360829_362718_362893_363176_363342_377697_377826_395620_395840_398435
889102	contig_10106_pilon	-	9063	4	Intergenic	novelGene_73904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5529	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292185	178926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_187248_210886_211118_231118_231463_292018
889103	contig_6058_pilon	+	1334	1	Intergenic	novelGene_172392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCTCGGCACTGACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382783	384117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_382800_384100
889104	contig_7843_pilon	-	843	5	Intergenic	novelGene_152017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_4	199.133592093348	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	180	755	197188	178451	FALSE	30	TGGGCTAACATTTCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYKGRPSGCWGRRGPLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKVVTNKLLLSIVILLELAILGGLVYYKFFHRH	197367	178362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_197137
889105	contig_3410_pilon	-	2453	6	Intergenic	novelGene_58906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.272087415293	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	29	718	57649	15425	FALSE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRAADARTMVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQVGDSRGSMGGLASHAHPAGAPPPGAPAALSRGAVTEAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPFSPSQGHQRHCSRTPRRSRCLWVCRMPG	57677	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15520_30929_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
889106	contig_6885_pilon	-	4109	3	Intergenic	novelGene_83695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	461	junction_1	68	808	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	12	536	314045	278027	FALSE	85	AAAAAGAAAAGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNSLQWVGSPCGLHGPYIFYKAFQFHLEGKPRILSLGDFFFVRCTPKDPICIAELQLLWEERTSRQLLSSSKLYFLPEDTPQGRNSDHGEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGLHAGSMKTEVLGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGKYNFCF	314056	274453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_278276_313336_313592_314024
889107	contig_17829_pilon	+	3868	18	Intergenic	novelGene_157026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	24.3603285186455	273	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	51	890	17405	25781	TRUE	25	GAGCGCCACCGGATCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMYQGESDLSLQALESRQDDILKCLYELKAAVDGLSKMIQTPDADLDVTNIIRAEPTALKTSALDLNSVLGKDYGALKDIVINANPAEPPLSLLVLHRLLCDHYRVLSTVHTHSSVKSVPENLLKCFGEQTKKQSRHEYQLGFTLIWKNVPKTQMKFSVQTMCPIEGEGNIARFLFSLFGQKHNAVNLTLIDSWVDIAIFQLKEGSSKEKSAVLRSMNSALGKSPWLVGNELTVADVVLWSVLQQTGGANGTVPANVQKWMKSCENLAPFNTALKLLK	17354	57149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_17420_22114_22319_24361_24594_25392_26961_28034_28267_29240_29323_29536_29655_36215_36313_39442_39555_41387_41700_42845_42906_43467_43562_44435_44519_45059_45162_45846_45884_47171_47307_48431_48591_56973
889108	contig_3575_pilon	+	4120	4	Intergenic	novelGene_141132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTGTACCCAATTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826787	1018288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_829042_1014528_1015603_1016881_1017324_1017938
889109	contig_5669_pilon	+	5400	3	Intergenic	novelGene_86075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	251	595	188913	189257	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSTTRPLVGALLHTWIQQPAKSFLSCRLFSPQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	188662	195218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_190117_190940_193358_193689
889110	contig_13481_pilon	+	2256	2	Intergenic	novelGene_119406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	108	812	633155	633859	TRUE	20	TACTACGGAACTTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STPTSASTETHAESQEDSETPSGEGRGPEQPRNGIMPDKLKMSWENPSPEEPLAPESTGAPQLHCSETSEAAPKESRKPPTPPPKIISEKLRASMSGMEPSGLAQSPGVPDISAPGPAQVSVNGIDDNSEPTKLSKATAAPGIHQKDAAMSTALPVWDLPPQFHPRCSSLGDLLGEGPQRPRQPRERLYRAELEVRVASEQTEQLLNKVRGTEPAPDSPEALLSHAVEQLRQATQVLQEIRDLGALSQGAPGLREKRKELVTLYRRSAP	633047	635627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_634228_634551
889111	contig_9535_pilon	-	3848	6	Intergenic	novelGene_124471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1856	2524	416089	254094	FALSE	35	ATCAAACGATGTATTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGGTSPWRRTSCLVKYRVSENEEDPLRDGLTQWLQQWLKHNDCEDGTGLGSVSFCCAQGCYESKAKGRNDEVKKLNIRFQRAAQEEKVKFYNETCKDLELENQQGRNGSAFLKLKELKKKFKPQVVILKDSMGKILNDAGITKRKRKEYTESWYQKELVDIQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDGIPTEMFQKTHALLEVLTHLRQEI	578675	252769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_254570_406797_406876_415974_416340_485390_485837_531663_532046_577898
889112	contig_4486_pilon	+	2165	12	Intergenic	novelGene_38578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1368.69407504905	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	476	1156	389962	412464	FALSE	25	GTAATAGAGTGTGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311767	413473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342986_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377452_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
889113	contig_4232_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_63309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCTGAGGACTAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466800_468100
889114	contig_15165_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_145313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACCGCCCCAGTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2865	2314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_2300_2900
889115	contig_10307_pilon	+	1911	3	Intergenic	novelGene_170274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	324	junction_1	6	715	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	90	1406	389628	392058	FALSE	30	AAATCTTAAGTTGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387773	392563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387851_389615_390382_391495
889116	contig_10734_pilon	+	2324	11	Intergenic	novelGene_51186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_4	415.615254772969	1867	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	835	1443	1134427	1142903	FALSE	50	GCTAAAACAAGCAAACTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123698	1143784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
889117	contig_11316_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_122620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	374	886	137674	138186	NA	45	AGACGACCCACCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137300	138866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137300_138900
889118	contig_854_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_36759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	601	948	1738780	1738433	NA	25	CAGAAGCACCACGCTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLIILATGPLTCSTSSLPHLITHHSLPPPTLTFEDSLPPCTPRCICSCCFLLLECLHHLHCHVEAHPILEAQRKSTSAPAGFPQPCSHCMWCFPGCGPVCVMVLEASVSSMRL	1739380	1737235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1737200_1739400
889119	contig_8377_pilon	+	4933	30	Intergenic	novelGene_34947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	2953.01930093194	561	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	1659	3608	176583	197925	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVALRNQKVLPMVLQVQL	68095	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176346_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197772_197871
889120	contig_2204_pilon	+	2563	2	Intergenic	novelGene_71693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	90	326	322701	322937	TRUE	35	CGTTAATGAGAAGGATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDWSSRTGEKTENTDRIIEELLTENFPNIMKEEKLSIQEAQRTPYRRDPKRKSPEAYHNHTQQNQRQQRILRTAREKQEVIYKGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDI	322611	425077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_323956_423858
889121	contig_4131_pilon	+	2265	8	Intergenic	novelGene_127830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.4408937197508	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	733	2139	87286	97745	FALSE	55	TGAATATAAAGACTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	84869	97871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85219_85607_85845_87139_87694_91474_91571_93097_93329_94308_94332_94426_94540_97209
889122	contig_7254_pilon	-	3192	1	Intergenic	novelGene_145848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCACTATGTAGGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218961	215769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_215800_219000
889123	contig_5967_pilon	-	2378	11	Intergenic	novelGene_44358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	468.792662058612	3018	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	118	1359	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKGEWLQACDGSYLQPRGTRQLLKPVRDPVQSREVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517619	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_448769_448866_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
889124	contig_9406_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_136140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35520	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_33700_35500
889125	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	144	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
889126	contig_10734_pilon	+	1171	4	Intergenic	novelGene_51358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.624953392932	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCAGGAACGCCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1781308	1787937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1781580_1783470_1783581_1784314_1784402_1787234
889127	contig_16103_pilon	+	3673	2	Intergenic	novelGene_118754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1685	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2328	2678	437710	438060	TRUE	35	CAAAGGGAGTGAGGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRETSPPSLIPGKGMKIGRRGERNKTSATEPRATELHSSPSSFSVLDPEGTERETPPPPEPLSRPLIPGLPPHQAPSLNLTSKPHSKVAWLPGKGLSSGQDSPQPDGIAHSVPYF	435382	439215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_438787_438946
889128	contig_7898_pilon	+	3738	8	Intergenic	novelGene_47619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	925	junction_4	218.852760120235	26	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	2013	2915	590052	599089	FALSE	30	ACCAAGTGACACTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSGEGRELGCSAQGRQTYWTGGLFLSGASGSH	587823	599912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838
889129	contig_12074_pilon	-	3101	1	Intergenic	novelGene_53782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	602	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATTAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70192	67091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_67100_70200
889130	contig_5669_pilon	-	6479	22	Intergenic	novelGene_86056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.879208291487	349	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	170	1480	222000	196397	TRUE	5	CTAGGCTGCGCCTGGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSFMLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVFLDRLAVIFRHTNPIVENGQTHPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMVNVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLEQQNGLQNHPDTVDDLFRLATRFIQRSPVTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANCSVMRFLRDLIHTGVANDHEEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQLLHTCCFCLPPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWLENSLKGLPKETTVGAVTVTHRQLTDFHKQVTSAEECKQVCWALRDFTRLFR	226144	178265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_178329_182925_183133_185952_186141_186549_186626_187233_187512_187718_188111_188197_188315_189008_190117_191880_194420_196365_196458_201969_202083_205122_205291_207172_207330_208491_208587_209481_209599_212408_212550_213404_213466_215462_215540_216828_216921_219864_220057_221963_222104_226078
889131	contig_5551_pilon	-	2813	2	Intergenic	novelGene_134294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1683	1994	826523	826212	FALSE	30	CCCCAGCCAGCAGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPHKKRLAICFCKDYSQENPMEQFYCTTHGVAARVLQSRTALQGVIWYVLGMAGLVCLVCVLGIVLSTLPTSSRLTLMTTQQDRYYCYPYFTGKETEVSAKS	841900	825392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_826898_840592
889132	contig_1225_pilon	+	2688	5	Intergenic	novelGene_44165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	198	545	250814	274606	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQASVLHLQITELFLFCFFNFLFFF	250616	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274370_274534_275154_275201
889133	contig_10766_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_151231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGCCACATTTTGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215728	213283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_213300_215700
889134	contig_16492_pilon	+	2254	8	Intergenic	novelGene_100314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	231.415784479198	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	189	1271	172164	194090	TRUE	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSNCLQPF	171569	195403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_192003_194065_194104_194433
889135	contig_3956_pilon	+	911	3	Intergenic	novelGene_15283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2250	junction_1	27	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	39	395	1289647	1290491	FALSE	15	TGACTGTGTGGAGCCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1289608	1291007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1289677_1289758_1289892_1290297
889136	contig_5482_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_144492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACAGGACAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522191	521428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_521400_522200
889137	contig_9614_pilon	-	4430	16	Intergenic	novelGene_104420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	294.995593187424	961	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	1583	3073	136360	107861	TRUE	65	GGAAAGAGAAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDKVTEREKVTVMSTINPTKDLLADLIGCQRLPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQEKI	155672	106260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_107106_107348_108065_109251_109339_110641_110794_111390_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136391_140312_140490_145263_146464_155497
889138	contig_12970_pilon	+	3375	7	Intergenic	novelGene_50503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	114	junction_1	854.821943772828	551	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	190	792	15800	74509	FALSE	55	CTTTTGAAAGAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILVAGRGGDSTLRRARRPRWQWQHSCARVLIAEGGGSGGRGGGGGVGRSGGGGGGYESAAGGDMANIAVQRIKREFKEVLKSEETSKNQIKVDLVDENFTELRGEIAGPPDTPYEGGRYQLEIKIPETYPFNPPKVRFITKIWHPNISSVTGAICLDILKDQWAAAMTLRTVLLSLQALLAAAEPDDPQDAVVANQYKQNPEMFKQTARLWAHVYAGAPVSSPEYTKKIENLCAMGFDRNAVIVALSSKSWDVETATELLLSN	15610	77092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_15863_45022_45117_49409_49469_61722_61806_70870_70971_73993_74123_74434
889139	contig_3956_pilon	+	1539	12	Intergenic	novelGene_14788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.768067559584	903	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	82	1284	1143555	1176884	FALSE	20	GCAAGTGGTGCCCATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWLQRQPLLGLGGGGDSGPLTPARGAPMLARRKPVLPALTINTAIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEARRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELSIGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGAEGEPHSISPRPRPPGRPISGHGVDNRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFTQDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLMNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV	1143335	1177139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1143402_1143539_1143647_1147750_1147962_1156913_1157061_1163064_1163143_1164821_1164874_1165018_1165144_1166342_1166557_1169323_1169389_1172241_1172304_1173525_1173572_1176773
889140	contig_11978_pilon	-	10729	15	Intergenic	novelGene_63110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_14	186.542001617188	1209	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	290	1600	1979308	1884840	FALSE	35	TCTGACGATAGAAACTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGTHCPDLVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL	1979597	1875710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1884948_1886351_1886565_1887741_1887799_1891020_1891066_1891955_1892017_1894716_1894848_1900191_1900267_1901514_1901642_1903702_1903799_1918757_1918827_1919301_1919397_1920809_1920885_1925532_1925588_1940593_1940656_1979266
889141	contig_10774_pilon	+	4559	3	Intergenic	novelGene_158668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	47.5	859	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCCCTCCCCCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6646	24007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_6770_19492_19587_19665
889142	contig_7753_pilon	+	6567	1	Intergenic	novelGene_41516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1841	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1250360	1256927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1250400_1256900
889143	contig_10345_pilon	+	1409	13	Intergenic	novelGene_158355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	641.766588540309	2	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	72	1112	11670	24141	FALSE	25	ACAACTGGTATGTCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
889144	contig_5684_pilon	+	3379	3	Intergenic	novelGene_81046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56	1769	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	2148	2711	443906	447039	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403580	447707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441998_443949_446518
889145	contig_20875_pilon	+	1418	13	Intergenic	novelGene_153100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	122	junction_1	245.88427438307	35	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	225	1196	59053	64097	FALSE	30	TTACAGTTTGTTAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPGDPVRIHCNITESYPAVPPIWSVESDDPNLAAVLERLVDIKKGNTLLLQHLKRIISDLCKLYNLPQHPDVEMLDQPLPAEQCTQEDVSSEDEDEEMPEDTEDLDHYEMKEEEPAEGRKSEDDGIGKENLAILEKIKKNQRQDYLNGAVSGSVQATDRLMKELRDIYRSQSFKGGNYAVDLVNDSLYDWNVKLLKVDQDSALHNDLQILKEKEGADFILLNFSFKDNFPFDPPFVRVVSPVLSGGYVLGGGAICMELLTKQGWSSAYSIESVIMQISATLVKGKARVQFGANKSQYSLTRAQQSYKSLVQIHEKKRLVHTPKGRWLTPERHPILLPRRHWTNYLLNAVFGSHAASVVPSLGFPGRDSSACCRTVTAILNAKEKTHTQLSQVLQTD	56307	64319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_56352_58546_58652_58977_59083_59687_59739_61316_61458_61638_61724_61984_62046_62249_62341_62451_62511_62609_62659_62895_62992_63311_63380_63856
889146	contig_7119_pilon	+	4854	2	Intergenic	novelGene_40981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	987	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	117	950	138965	139798	TRUE	40	AATGATATTGTTCAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	138848	145494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_142349_144140
889147	contig_5954_pilon	+	1703	13	Intergenic	novelGene_28524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	239.633444034843	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	150	1703	465084	477253	FALSE	10	GTGAGTCCCTGCCCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTLDLDKGCTVEELLRGCIEAFDDFGKVRDPQLVRMFLMMHPWYIPSSQLAAKLLHIYQQSRKDNSNSLQVKTCHLVRYWISAFPAEFDLNPELAEQIKELKALLDQEGNRRHSSLIDIESVPTYKWKRQVTQRNPVAQKKRKMSLLFDHLEPMELAEHLTYLEYRSFCKILFQDYHSFVTHGCTVDNPVLERFISLFNSVSQWVQLMILSKPTAPQRALVITHFVHVAEKLLQLQNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHVSPETVKLWEGLTELVTAAGNYGNYRRRLAACVGFRFPILGVHLKDLVALQLALPDWLDPARTRLNGAKMKQLFSILEELAMVTSMRPPVQANPDLLSLLTVSLDQYQTEDELYQLSLQREPRSKSSPTSPTSCTPPPRPPVLEEWTSAAKPKLDQALLVEHIEKMVESVFRNFDVDGDGHISQEEFQIIRGNFPYLSAFGDLDQNQDGCISREEMVSYFLRSSSVLGGRMGFLHNFQESNSLRPVTCRHCKTL	463171	477253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_463252_465014_465157_465770_465874_466439_466503_466893_467026_467808_467960_468149_468324_468497_468615_470129_470412_471210_471289_471548_471672_472042_472159_477111
889149	contig_4900_pilon	-	2626	7	Intergenic	novelGene_159057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	706	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	20	GCACAAGCAGGCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1178022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1178089_1179744_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
889150	contig_12837_pilon	-	2608	14	Intergenic	novelGene_57378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_8	197.663661498322	1316	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	99	1913	399021	371718	FALSE	10	CCTCACCTTGTTTGATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYGFPPYGFPTYGGIAFHSGTTKSNAGMKHGDIGTPSKKDHKGCDDRDAINLSGKVTETTEQDKESSSEHEEVTLTYTVGVKEENCRFQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQDENGDSVLHLAIIHLHAQLVRDLLEVTAGVISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITSQEDVVEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKILSILLKHKKAALLINQPNGEGLNAIHIAMMSNSMSCLRLLMAAGADIDAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTFDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWERDGEDEGVVPGTTPLDMAANWQVFDILNGKPYESELTSDDLLAQGDMKQLAEDAKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVKELVEALRQMGYTEAIEVIQTAFCSSGTATTSSVKTPSQAHSLPLSPSSTRQQIDELRDNESICDSGVETSFRKLSFTESLTSSGSLLTLNKMPHDYGQHGSIEGNV	405180	371022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_371879_375467_375649_376626_376800_377341_377409_378812_378938_381971_382075_382543_382714_383351_383554_390081_390197_394554_394697_396076_396254_397489_397580_398912_399057_405117
889152	contig_5434_pilon	+	2460	5	Intergenic	novelGene_74671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTCCTGAAAGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323606	339565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_325458_326714_326886_331415_331515_333048_333163_339340
889153	contig_16098_pilon	-	1543	11	Intergenic	novelGene_45961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1404.8586441347	26	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	96	1418	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSKRLDRLEETVQTK	354084	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348455_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
889154	contig_10674_pilon	+	2869	2	Intergenic	novelGene_6448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301875	305777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_302276_303308
889155	contig_15787_pilon	+	5615	1	Intergenic	novelGene_143965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	867	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGATAAATGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56150	61765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56200_61800
889156	contig_8691_pilon	+	4046	2	Intergenic	novelGene_72682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	2711	junction_1	0	1937	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	19	1341	17110	20695	FALSE	30	CTAGACAATACCTTTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLANLCWLSSVVLAAQSFLVVANNETEEVRDEAVKDACSVRLESRGKCEEGGECPFQVSLPPLTLQLPKQFGRIEEVFKEVQNLKEIVNNLKKCCQDCKLQADDNRDRGTNGRLVPGTGALGEAADNRVRELESDVNKLSSDLKNAKEEIDGLHGRLEKMNLVNMNNIENYVDSKMANLTFVVNSLDGKCSSKCPSQEQIQSRPVQHLIYKDCSDYHTIGKRSSETYRVTPDPKNSSFEVYCDMETMGGGWTVLQGRLDGSTNFNRTWQDYKVGFGNLRREFWLGNDKIHLLTKSKEMILRIDLEDFNGVKLYALYDHFYVANEFLKYRIHIGNYNGTAGDALHFSKHYNHDMKFFTTPDRDNDRYPSGNCGLFYSSGWWFDACISANLNGKYYHQKYRGVRNGIFWGTWPGMNETHPGGYKSSFKEAKMMMRPKHFKP	17091	23400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_17726_19988
889157	contig_10752_pilon	-	6105	5	Intergenic	novelGene_153033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1090	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	256	633	322961	322584	TRUE	15	TCCTGCCTCTTCCTACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCIIWLFWILLRLALWPKMCSILENVPCALEKNVYFADVGWSVLHMSMRLSWLTVAFRSSVSILSFFLDVLYYTESEVLKSLTIIVELSVSLFNVVRVCFMYFGALSLGAYIFIVVMSSWCIDF	323216	27236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_29426_29662_31227_228392_228509_319578_320530_321931
889158	contig_9871_pilon	+	2896	7	Intergenic	novelGene_75646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	170.823170429411	746	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	561	1370	391952	419187	FALSE	5	ATCGGTTGTTCGCTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384449	420713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384991_391932_391973_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
889160	contig_7066_pilon	-	3376	8	Intergenic	novelGene_42191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	660	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	260	742	1003575	1003093	TRUE	10	ACTGCGGCCTCGTACGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGSEGVGDGEVKRGQRKAQKRRPLNLGAKQRTGPSPAQPGLLCPGSTEPGQKISGRSHSPQFPEKLSPFDRTATAMASGSPRKEVGLPSLPPSGQTARGQGEGYPSSSFRMLSRSFRVFQAWSFSFLVGVRFFCLAAMILRKASMTSLSAMRTRCLSS	1003834	993693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_993860_994552_994785_996684_996942_997046_998600_998705_998810_1000006_1000113_1000869_1001060_1003066
889161	contig_10003_pilon	-	1232	2	Intergenic	novelGene_88195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2017	junction_1	0	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATTCCAAACTTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473519	471231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_472140_473195
889162	contig_5954_pilon	+	5881	12	Intergenic	novelGene_28505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	65	junction_8	704.785859277849	1057	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	3743	5023	438796	443568	FALSE	5	CTGGGTCTGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQRSLPAAAMARAMRVRTFRAHW	430231	444426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408_435668_438686_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441229_441483_441740_441801_441925_442106_443503
889164	contig_8581_pilon	-	3365	18	Intergenic	novelGene_22834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	559.001637251473	8	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	594	2543	339602	307164	FALSE	35	AAGACTCGAGTCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVLPAVRRW	386113	306341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307191_308956_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340332_344703_344746_353025_353175_366650_366814_385995
889166	contig_16594_pilon	-	8335	3	Intergenic	novelGene_53908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	335	1362	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTCGAACTGCCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306534	263273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_271279_273523_273670_306350
889167	contig_5623_pilon	+	3366	3	Intergenic	novelGene_154802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCCCCTCCCAAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205549	209975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207768_208418_208540_208948
889168	contig_9415_pilon	+	4770	9	Intergenic	novelGene_109775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	413.472414436562	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	47	556	1620728	1704137	TRUE	40	GAAAATACTCATGACTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHVQQNNVARSCTIFMIVGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSTNVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDSNLSGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL	1620681	1708457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1620738_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1697965_1700428_1700495_1703219_1703271_1704044_1707680_1707785
889169	SIRV6	+	1118	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	5	40	5	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGACTTGCGTCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477	11650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
889170	contig_6199_pilon	+	1906	4	Intergenic	novelGene_126386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	232.035916760028	7	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGACCTTAGAATTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461110	514942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_461156_478402_478499_501060_501414_513530
889171	contig_15323_pilon	+	4366	1	Intergenic	novelGene_148518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2936	3241	87850	88155	NA	75	AGGAGAAGAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYETFAAESGKTSKRTKFSFLQELFLGHHGHTNHCILTWQLMFSPELFVLKFNKQLQTRELICIPEFSFQTISWTIPPKFPKGHYRFYWGIGSGIRGME	84914	89280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_84900_89300
889172	contig_3386_pilon	+	3448	15	Intergenic	novelGene_34572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	632.353899396242	1022	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	218	1615	476274	508362	FALSE	25	GTGGAAGTGTGTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470162	510195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_475713_475783_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231
889173	contig_16322_pilon	-	3583	14	Intergenic	novelGene_87528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_11	138.02945402165	456	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	130	1887	108570	77890	FALSE	20	TCATTGAGGTATGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108699	76193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
889174	contig_17454_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_177275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACCAATCAACAGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28742	31345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17454_pilon_+_28700_31300
889175	contig_13244_pilon	+	3171	1	Intergenic	novelGene_86945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAACACAACAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271899	275070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_271900_275100
889176	contig_1443_pilon	-	3022	10	Intergenic	novelGene_28276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	431.946613070655	920	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1427	2350	776427	748649	FALSE	15	GAACCTGGTTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809519	747976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_804491_805718_808694_808741_809399
889177	contig_14556_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_138532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2331	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCAGCTGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169125	166887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_166900_169100
889178	contig_8674_pilon	-	4752	3	Intergenic	novelGene_102885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1105	166	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2069	2620	174248	173697	TRUE	80	ATTAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKIEFKTKSTMKDKEGHYIIIKGMIHHEDITIINIYTPNDRAPKYINNSNSTEREIDSSTVIVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKDTISQLNLIDIYRTLYPTAAKYTFFSNAHGTFSRTDHILGHRATLNKIQNTEIIQSIFSDHSAIKVEINNRKIKEKKSIIWKLNNTLLTNHW	176316	78338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_78746_169571_170661_173060
889179	contig_10115_pilon	+	3060	4	Intergenic	novelGene_171928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	746	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2640	2975	15866	20336	FALSE	25	ACTCAACAATTGTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRVRSTAHFFVFIIGVSPTAFSRMSTFFLVSPAGSSVPGETAAEEGGSEVTASGETSVSPSPPTAVEGGSCSTDSGSSAILLSRRRGRKWRLSTCSGRALRGGASQRRCL	6118	20421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10115_pilon_+_8636_9256_9322_15808_15947_20081
889180	contig_5136_pilon	-	4430	12	Intergenic	novelGene_126633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	305.795642883628	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	201	1106	294435	279549	FALSE	40	TATCTCAGCAAATACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDGKSLSRFGTRQGPGLLETE	360172	276224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294570_360106
889181	SIRV7	-	2049	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	3	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147915	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2121_2526_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
889182	contig_9548_pilon	-	4213	2	Intergenic	novelGene_141090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	254	592	395886	395548	TRUE	60	AAAAAAAAAGTTGACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMYRYNPIPIQIPMAFFNEMEKQITNFVWKRKRLRINKALLKKKYKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYKNRYIDEWNRIENPEVSSSTYEQLIFEKGPKSIKWGKRQSL	396139	313533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_316214_394606
889183	contig_7428_pilon	-	845	3	Intergenic	novelGene_77751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	404	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	296	664	515037	514339	FALSE	30	TATATGTAAATTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSQLIDYGKLGDTNERAMRMADFWLTEKDLIPKLFKVLAPRYQGQNGGYTRMVQIPNRSEQDRAKMAVIEYKGNCLPPLPLPRRDSNVTLLNQLLQGLQRDLSQDKKASIHSSHTAKTPRI	515518	514157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_514627_514956_515152_515337
889184	contig_16594_pilon	-	5128	2	Intergenic	novelGene_53907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	252	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCAGTTTGAAGAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262022	255954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_256835_257774
889185	contig_2834_pilon	+	4147	1	Intergenic	novelGene_27993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1604	1984	259440	259820	NA	75	AAAAACATAAAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKKREVLDCGWSRSSSGPVGSEVCSEAANSCARSGGSFHIERDPAAEILLGHSEPVKSSFQVAKDKSMCVAFRGDLKKKQNAHLEKTSLPFTSSLRALHQESAGSEVDPKRRPDLFSWRWRGNK	257836	261983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_257800_262000
889186	SIRV6	+	513	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2303	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
889187	contig_7171_pilon	+	3569	7	Intergenic	novelGene_101383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1376	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3215	3526	1369629	1369940	FALSE	20	CCACCTCTCCCTCCTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCHVSVSSHVMPLPAVVHSFHHQFASDLWKGQPSPQGPLCKLGPGESLAHPAHCFPAARVSKTGLPRNQGLWPPRACEMSATSLLPQPMALSDVSDQGRQR	1363355	1369983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1363712_1364242_1364338_1364429_1364526_1365210_1365385_1365698_1365737_1367062_1367122_1367232
889188	contig_12938_pilon	+	1456	8	Intergenic	novelGene_99701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	916.00443364046	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	25	357	78117	81371	TRUE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFCWNVPA	51945	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_51953_78099_78180_79040_79230_80721_80782_81350_81459_83391_83470_84550_84635_85468
889189	contig_9389_pilon	+	2781	5	Intergenic	novelGene_84105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	458.24031631885	309	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	124	777	1408796	1423232	TRUE	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARGETTRSQRGARAPVDFLPPLGHCAWDASPGPEPWSPRMSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVGTPFPKNFLQAVKKILSRLFRVFVHVYIHHFDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVREFGLIDTKELEPLKEMTMRMCH	1390459	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1408698_1409217_1418063_1418267_1423202_1423613_1423728
889190	contig_5566_pilon	+	3309	4	Intergenic	novelGene_153659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_3	161.010006590343	66	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCAGTAAACGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176673	181802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_179774_180773_180832_181571_181632_181711
889191	contig_8850_pilon	+	2950	3	Intergenic	novelGene_172429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	554	1120	2219	42114	FALSE	15	CACCCTGGGTTGTAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKHNY	518	43944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_683_1829_2773_42101
889193	SIRV6	+	1161	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	0	159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	24	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	385	717	2002	10736	TRUE	45	ACCAGAAATGGTCATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889194	contig_6794_pilon	-	3349	2	Intergenic	novelGene_148996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	414	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1748	2179	15922	13983	FALSE	30	CCAAAGGAGAGCTACGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	17669	12812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853
889195	contig_1331_pilon	-	1238	3	Intergenic	novelGene_37811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1304	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGTTAGTTTCTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169948	158961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_159985_166406_166534_169860
889196	contig_11850_pilon	-	2046	4	Intergenic	novelGene_125222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1007.14988402367	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	105	635	286397	282848	FALSE	15	TTCTTCTGTGTCAGGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVGKAKTGTKDLITIMIKDMEITIVPMVVIKTIVAMADMIILGITMGTMDMDRDMQTTVANRARMARHLEGVAITKTITSHTKGGRWRKRCV	286501	281436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283292_283459_285353_285531_286311
889197	contig_16228_pilon	+	1805	2	Intergenic	novelGene_147949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTAAAGCCTCCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73200	75076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_74887_74957
889198	contig_9668_pilon	+	2434	10	Intergenic	novelGene_58115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	440.118165950918	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	531	1442	282781	359314	FALSE	20	TCTTGTATATTGGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214094	360306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_220571_220766_281470_281518_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
889199	contig_4426_pilon	-	2204	7	Intergenic	novelGene_15423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_6	672.092007590231	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2118	87	2204	904546	820598	FALSE	70	GAAAAAAAAGATTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTDSDPGHTSENWGERLISSYRTYSEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFRE	904632	820597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_895571_895641_904482
889200	contig_2854_pilon	+	6026	1	Intergenic	novelGene_120812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	881	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1765	2109	86470	86814	NA	15	CACGAGGACGGTGCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	84705	90731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_84700_90700
889201	contig_8452_pilon	-	2139	3	Intergenic	novelGene_48011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	218	517	316119	315820	FALSE	5	CCGGCAGGTCTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLPTSCCSTDGPEAPPQGPAVRCTLAREDHTLASSDVVMGEGGPRCFPAHNSEIVSVIVSKISLPLNQHGFSVFIFLLGGFLRLESHHPSPNAFKLMH	380631	314197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332114_380577
889202	contig_11924_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_128029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTGTATTTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70746	72571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_70700_72600
889203	contig_1230_pilon	+	2878	8	Intergenic	novelGene_28847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1317.48839595246	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	788	2665	405241	408779	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKNLNISRKSWRKSATPLLPSCTRVLEECLEECLGASLVVELLHLVVRLLDPPLKKLIKPNSEQIP	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408165_408584
889204	contig_7919_pilon	-	4414	5	Intergenic	novelGene_28052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	683	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGGCGACGTCTCACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	978544	972468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_972721_973856_974055_974360_977930_978018_978112_978242
889205	contig_8204_pilon	+	1424	4	Intergenic	novelGene_176990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	145.568616886409	89	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	3	1304	18967	26126	TRUE	55	AAGCAAGGAAAACCAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKG	18964	55781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26220_55754
889206	contig_3382_pilon	-	2918	2	Intergenic	novelGene_124117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_1	0	1740	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	128	469	735001	731562	FALSE	35	GAATTAGCTGAACTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALGSPARTLRGLLRELRHLSAATGRPYRDTAAYRYLMKAFRAHQVTSEKLCRAQHELHFQAATYLCLLRSVREHMALHQEFHGKGERSVEESAGLVGLQLPRQPGGKGCEP	735128	729112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_731766_734863
889207	contig_14450_pilon	-	6249	3	Intergenic	novelGene_48966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1457	1984	1043352	1042825	TRUE	30	CATTCACACTCACTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1044808	1036855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039698_1041027_1042081_1042454
889208	contig_4686_pilon	-	6453	6	Intergenic	novelGene_118525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_1	109.860638993226	199	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	805	1521	465007	460672	FALSE	70	TTAAAGCAAAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDHLNAFLEFSKEVDAKSSLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQVTWPSG	466676	455739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464565_464977_465111_465975
889209	contig_8122_pilon	-	1103	9	Intergenic	novelGene_40179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	123.434129700825	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	106	666	36501	32737	TRUE	30	GGAAATGGTGTATTCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGSCVNVKTRLQRRRNDFEVSTCFSYQGAK	37997	30733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_31136_32701_32826_33371_33468_33926_34016_34339_34418_35756_35920_36212_36256_36498_36525_37915
889210	contig_7051_pilon	-	2081	10	Intergenic	novelGene_64348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTACTTCTTCAAGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347608	321869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_334315_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343472_344137_344222_345362_345536_346865
889211	contig_5696_pilon	+	4444	15	Intergenic	novelGene_117546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	765	junction_9	388.581046362064	156	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1401	4206	91	4296	689252	738140	FALSE	35	CCTGCATACACAATCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFADTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	684328	738288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_734430_734596_737775
889212	contig_401_pilon	+	1678	10	Intergenic	novelGene_42813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_7	1349.77084474859	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	62	919	1711949	1715450	TRUE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGRKLWRQKLWPLRWWRSILCQTTKPRWLWRFKQQQ	1711887	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715157_1715234_1715419_1715486_1715716
889214	contig_11564_pilon	-	3416	5	Intergenic	novelGene_158554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	378.799666710519	879	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	362	814	100760	59632	TRUE	35	CTTAGGTGAAGGGAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEEDNKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRVGCKSFKFCSEKVVCL	101121	45786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_45810_57052_59762_60761_60848_62470_62605_100657
889215	contig_6497_pilon	-	6123	22	Intergenic	novelGene_35624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_21	335.460863484409	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1970	5910	213	6122	790005	689745	FALSE	55	AACGAAATGAAGAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEERQKKLEAGKAKLAQFRQRKAQSDGQNPSKKQKKKRKTSSSKQDVSAYHAMNIDQSQTDEMYINSSQRVGSAVTPESTVMRTLHSGEIVKRDQVFSVEPESEISTTADDYSSEEEFGVDDSYSEHGAQYSETHLEMMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLQKQMKEKEDDLQEKFTQLEAENSILKDDKKALEDMLKIYTPVNQEERFIFLDSSNSKSKDGSWQKEIDMLTEENENLKAQCIQLKEEIVKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKTDLEDSKNQQEVEYKSKLKALNEELHHLQRINPSVVKMKTSVFDDDKTFIPEMLEIGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSERLSDLSEQLKQKHGEISVLSEEVESLKQEKEQVLLRCRELEIIINHNRTENVNVFDVQSRSFKDRVVTVTSRDSEESLSKINKGFVEESRVMKEDKIPFENMTIGEESKQEQLLLDHLPSVTNESMLEATEPGENDKLQQELSVLKSEQNDLRLQMEAQRICLSLVYSTHVDQVREYMENEKDKALSSLKEELISAQEEMIKELQKIHQLELQNIKTQETDIKKIKQLEEQVQELENLTSSLQQRLKETEENYGAEIHSLQERLHAVSESSLQPSFSVDSMVIAESDVQKTIYPGSCLQQNIDGTVEFSGEFGLRQETNMTKLMEKQYQERLEEEVAKVIVSMSIAFAQQTELSRISGEKGDTTPSKQPHVLCQQEEHFLNEVKLSQDEVSFQTFETKDMKFKEEFKPLSKELGEDGKQVLLSNNDNLDEILESKDHELTISEEMFSRDKTFVFGESIHDEVLVSSMDASRQLMLNEEQLEDMRQELVRQYQEHQQATELLRQAHMRQMERQREDQEQLQEEIKRLNRQLAQRSSIDNENLVSERERVLLEELEALKQLSLAGREKLCCELRSSSTQTQSENENEGEVEEQPFKEKELDRKLEDAPPDILSSERYALQKANNRLLKTLLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKGQSSASLIWRSEAEAPIKSCIHEEHRGVTDESVPSYSGSDMPRDDSSMWSKVTEEGTELSQRLVRSGLTGTETDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEVTESLRCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADERTFFERQIQEKSDIIDRLEQELLCEGNRLQELEAERQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDDLQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNAELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQKLEQQLKVVPRFQPISEHQTKEVEQLTNHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQ	790217	689743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_689835_697016_697137_698069_698303_700719_700933_702457_702621_717343_717577_724043_724250_726416_726521_727015_727157_728256_728482_729767_730125_738389_738483_742431_742529_743590_743754_744892_745107_749822_752208_754320_754519_755398_755555_756694_756863_764427_764473_767272_767531_789957
889216	contig_4180_pilon	+	2244	11	Intergenic	novelGene_8301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	160.672959766104	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	183	1526	733322	821915	FALSE	10	GAATCTGGTTTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733042	822633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733157_733253_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
889217	contig_10196_pilon	-	1943	11	Intergenic	novelGene_132224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.255494451703	678	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	27	668	1411316	1395313	TRUE	10	GTCTATCGGCTTGGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRAGPGEMAAVLACFLLLLGFAARGPGPAGAAKMKVVEEPNTFGLNNPFLPQTGRLQPKRDPSPVSGPGHLLRLSGKCFSLVESTYKYEFCPFHNVTQHEQTFRWNAYSGILGIWHEWEIANSSFVGMWMRDGDSCGSRSRQTKVELTCGKSDRLAQVSEPSTCVYSLTFETPLVCHPHALLVYPVLPEALQQRWDQLEQDLAEELITPPGPCKAAAGAL	1411342	1393863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1394957_1395032_1395115_1395212_1395345_1395426_1395511_1395668_1395784_1395853_1395948_1396045_1396130_1396206_1396262_1410904_1410973_1411056_1411115_1411264
889218	contig_14970_pilon	+	3092	1	Intergenic	novelGene_45068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1572	1910	203144	203482	NA	70	AAACTGACAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEVAPVLMEKTGPRNHSLLSFTVSIMTMRRPSILPEQVRRMVVKSSGLDKLVKSSHRVEEILCRHWLHLLLPFSCQDYTQFLKTGKKMLTCQVVQKTKMFKKYIWDMIFV	201572	204664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_201600_204700
889219	contig_5788_pilon	-	3608	5	Intergenic	novelGene_178560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2280	2678	2719	2321	FALSE	20	GTCTCTGGCAACAGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQDVINAAAQT	97948	1390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_-_3554_37332_37765_58132_58714_97035_97189_97669
889220	contig_19098_pilon	-	4131	2	Intergenic	novelGene_65837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1237	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	505	1140	407806	407171	TRUE	50	GAACAGAGACAGAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	408310	403354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_403452_404276
889221	contig_10058_pilon	+	1575	2	Intergenic	novelGene_67678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	65	1201	45110	46246	TRUE	30	TTTACACGTAAATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREGSGEETEAKSKSQNEAENMEEAKGVEEPGGEQSKDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGNLGKSEEL	45045	47240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_46469_47088
889222	contig_10953_pilon	+	3151	9	Intergenic	novelGene_42585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	19090.4393807476	357	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	82	861	455261	463828	TRUE	10	TATGAGCGTCCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKALTKCQEEVSRIPAIHPGMFRPKCDENGNYMPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPHTRSRGHHNCSVFI	455179	466163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_462728_462921_463817_464894_464938
889223	contig_7956_pilon	+	4428	4	Intergenic	novelGene_176870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1727	2245	58462	58980	TRUE	25	TTATGGCCCCCAGACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGISEQGEKTKNTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLSKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLGETIQARRQWDDIYKILREKNFQPRIIYPAKLSFRFDVEIRSFPDKQKLREYVEVKPNLQELLKGVL	56115	63902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7956_pilon_+_56395_57014_59729_62426_63491_63531
889224	SIRV5	+	2664	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1033	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12704_12880
889225	contig_753_pilon	-	1870	12	Intergenic	novelGene_112967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_11	263.709927040744	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1578	293	1870	1210648	1183288	FALSE	80	ACAAAAGGAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEENS	1211417	1183287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755_1192870_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210749_1211225
889226	contig_11258_pilon	+	2875	7	Intergenic	novelGene_67781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	143.721277323699	90	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1085	2077	283618	292582	FALSE	35	TAAATTTTAAAATGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWGEEASGRLTSGALLTQACPGAERGLGLCFPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279220	293380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_282663_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
889227	contig_5686_pilon	-	3448	3	Intergenic	novelGene_45321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111631	102616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_102677_102750_104378_109870
889228	contig_16228_pilon	+	2379	7	Intergenic	novelGene_147936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	243.921720138973	159	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	55	1044	47816	71852	TRUE	20	TGCCCACCCCCAAACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47761	79610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71853_72142_72622_78754
889229	contig_8330_pilon	-	3731	17	Intergenic	novelGene_71854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.114485858369	52	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1851	2834	916108	896249	TRUE	25	ACAAGTCTGGTCCTAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	930414	894865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895738_896223_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051_916284_923794_923849_924642_924847_925607_925751_926083_926267_928091_928267_929178_929388_929707
889230	contig_9833_pilon	+	2904	3	Intergenic	novelGene_68514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1698	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	158	475	214494	214811	TRUE	5	GCTTCCTGAGTTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIVLGFIFRSLIHFEVVFVYGVRYESCFIFFADGYPVLPAPFVKKTVFSPFDGLWALVEDQVTIGGWIYIWVLNSVPWVNVSVVVPVPGCFDYCSCIVGSQVR	214336	221929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_216720_217382_217711_221736
889231	contig_16121_pilon	+	3683	6	Intergenic	novelGene_6859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_5	430.376114578865	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	115	1521	57746	62826	TRUE	15	CTTTCTAGTTCTGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	65995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565_62890_63896
889232	contig_3449_pilon	+	2575	2	Intergenic	novelGene_73731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAATCTGGTAAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493432	527253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493778_525023
889233	contig_13481_pilon	+	2770	1	Intergenic	novelGene_119405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1012	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	296	891	105	995	632969	633859	NA	15	GAACTTCTCTGCTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLDLDVLDSGPPVFTPSDDGSVAQPQEKFQPLMPPTKTSSAPETPSVGDRVETSAGERASTPTSASTETHAESQEDSETPSGEGRGPEQPRNGIMPDKLKMSWENPSPEEPLAPESTGAPQLHCSETSEAAPKESRKPPTPPPKIISEKLRASMSGMEPSGLAQSPGVPDISAPGPAQVSVNGIDDNSEPTKLSKATAAPGIHQKDAAMSTALPVWDLPPQFHPRCSSLGDLLGEGPQRPRQPRERLYRAELEVRVASEQTEQLLNKVRGTEPAPDSPEALLSHAVEQLRQATQVLQEIRDLGALSQGAPGLREKRKELVTLYRRSAP	632864	635634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_632900_635600
889234	contig_7840_pilon	-	4360	11	Intergenic	novelGene_69026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	419	junction_2	183.637251122968	871	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	198	1595	427684	365958	FALSE	35	CAAGGATATGACACATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVGKASATASGDWNTTIACFVAILIGLCLTLLLLAIFKKALPALPISITFGLVFYFATDYLVQPFMDQLAFHQFYI	445752	363192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609_427738_445608
889235	contig_5686_pilon	+	2288	6	Intergenic	novelGene_45259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1884.02966006377	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	88	1260	93883	211355	FALSE	40	AGAACTGAAAGCATTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93795	212383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93889_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
889236	contig_3747_pilon	+	2282	10	Intergenic	novelGene_24916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4642.08115311428	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	75	938	202144	203804	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201499	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203020_203070_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204099_204156
889237	contig_10263_pilon	-	8869	22	Intergenic	novelGene_135846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	412.765503093727	44	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1812	5439	802	6240	926104	880676	FALSE	10	GCTGTGGGGTTTCATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKRKQEESSLKQQVEQQSSASQVGIKQLPSTSSAGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQLQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQAHSTGTIPGHTASVVQAQSQPHGVYPPSSVAQGQSQGQPTSSSLTGIPSSQPLQHPQQPQGIQQTAPPQQIVQYSLPQTSASSEATTTQPVSQPQAPQVLPQVSAGKQLPVSQPVPTIQGEPQIPVATQPSVVPAHSATHFLPMGQPLPTSLLPQYPVSQIPISTPHASSAQTGFSSLPVTMAAGINQPLLPLASSATAAAIPGGSTVVPSQLPTLLQPVTQLPSQVHPQLLQPAVQSMGIPANLGQAAEVPLPSGDVLYQGFPSRLPPQYPGDSNIAPSSNAVSVCIPSTVLSPPMPTEALATPGYFPTVVQPYVESNILVPVGGIGGQVQMPQPAVSLAQQAPSASSQQAVLESTQGVSQVVPPEPIPTAQPQPIQPTTLVSSIDSAHSDVASGMSDGNENVPSSSGRHEGRTTKRHYRKSVRSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGDRVVECQLETHNRKMVTFRFDLDGDNPEEIAAIMVNNDFILAIERESFVDQVREIIEKADEMLSEDVTVEPEGDQGLESLQGKDDYGFSGSQKLEGQFKQPTPVSSMPQQIGIPTSSLTQVVHSAGRRFIVSPVPESRLRESKVFTNEISDTVAATTSHGPEMNLSHSASSLSLQQAFSELKHAQMTEGPSTAPPNFSHTGPVFPVVPPPMSSIAGVTTTGAATLSVSVPATSIPLTDISTSVIQSQVTVPTEKGVTGIVITSGGLPIPSVSEPPILTSVVSSITVPTVVSISTTSQSVLTPTCGSIVSSTSTLPSITVSTASASAVGSTVVPGAKPPTVLSQQAAGSTTGVATLTSVSTTTPFPSIVSQPFLQLSSSSSASTLAETVVVSAHSLDKTSHSSAAGLALSLSAPSSSSSPGAGVSSFVTQPGGVHPLVIPSAIASTPILPQAAGPMSTPLLPQVPSIPPLVQPVASVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHAHCPEIDVDAQPKAGIDDIKTLEEKLRSLFSEHSSSGTQHASASLETSLVVETTVMPGISTTAVAPSKLMTSTTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVRSSQQPLEDLHAQLRRALSPETTAVTFAVGLVSVVAPTAVSEAGAHPQKDVSQVTEAPVLATSSGAGVFKTGRFQVSITTDDVQKEGKIKSEDAKSVHFESSTSESSALSSSSPESTLVKAEPDGVTIHGISSDVPEITHKTPASEAKSETGQPTKVGRFQVTTATSKVGRFSVSKTEDKITMAKKEGPVASPPFTDLEQAVLPAVIPKKDKPELSEPSHLNGPSSDLEAAFLSRHVDDGSGSPHSPHQLCSKSLPIQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLREKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYSKLGKVPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSAQSAASVLHPQQTLHPPGNIPETGQNQLLQPLKPSPSSDNLCSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGGTVNSQAPQAQPTAMTSSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAMNLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	926905	878046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_880994_881454_881646_888387_888583_890018_890222_891327_891990_893222_893297_897062_897124_897769_897854_900403_901819_902513_902637_902770_902829_903040_903215_903551_903669_904814_904978_905074_905173_905859_906142_906867_907327_908477_908628_914657_914742_923075_923264_924533_924871_926101
889238	contig_14665_pilon	-	5503	13	Intergenic	novelGene_171036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_11	305.416962255428	529	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	27	1913	65493	32580	FALSE	20	CTTCCTTGGAGTATGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDAIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKHAAELIKTVASRYDEYVNVKDFSDKVSRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKSTPINIPISQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVYNQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIRELPELLQRNREILDESLRLLDEEEASDSDLRSKFKERWQRTPSSELYKPLRAEGANFRTVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVNVLKSLLTNLDEVKKEREGLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRVYGGLTAKVQESLKKQEGLLKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIVFARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPTPTYQSSPAGGPSPTPPTPAPRTMPPSKPQPPARPPPPVFPANRAPSAAAPAPAPAPAPVATGTAASAPSQTPGSAPAPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYSMPYPPVYHQSPGQAPYLGGQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ	68409	28989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_32755_33687_33894_34680_34805_38439_38535_40416_40552_41344_41594_43690_43861_44989_45102_50142_50321_52453_52578_53744_53968_65397_65499_68388
889239	contig_15498_pilon	-	3133	14	Intergenic	novelGene_42681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.189944108728	1218	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	210	1871	829154	785428	TRUE	30	TTTAAAAGCTGCTGAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	837864	783961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785138_785341_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058_829255_837755
889240	contig_16978_pilon	+	1039	2	Intergenic	novelGene_168546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	360	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGACTGTTTGTAGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14715	18270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16978_pilon_+_14826_17341
889241	contig_15047_pilon	+	1610	5	Intergenic	novelGene_52249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	234	509	3242	4178	TRUE	35	TGAGCATGAAAAAGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2612	21725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
889242	contig_13740_pilon	-	3168	10	Intergenic	novelGene_34616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4302.52532506661	739	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	170	850	165243	158742	TRUE	30	GTATATTCAGCGTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDRWQFWR	165412	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_157536_158270_158394_158640_158765_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
889243	contig_8850_pilon	+	3997	3	Intergenic	novelGene_172436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	972	1781	95044	95853	TRUE	75	AAACTAAAAAAGAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKSDKHEEKIDKFMENTDKKLEELRKIMQEQNAKINSQLGIIQRQQLEIQRINNKVSEMDGVIKGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPQQGEKTENTERIIQELLTENFPNIMKDEKLATQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYREETIRLSSNYS	94072	408282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_96187_271708_272217_406907
889244	contig_10958_pilon	+	2744	5	Intergenic	novelGene_5394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	382	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	99	422	888255	895282	TRUE	40	CTAAATTATAAAGTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVPLRVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSP	888156	902207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893920_895279_895855_900457
889245	contig_13571_pilon	-	3931	2	Intergenic	novelGene_128101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3254	3568	50965	50651	FALSE	40	ACTCGGGCACAGGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQEDITIINIYAPNNRAPKCIKQTLKALKRERDTSTVIVGDLSTPLSMKDRTSRKKLSKDTEYINASVNQLDLIDNSQVYFLFQPTWNILQSRPHIRR	54451	50287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_51634_51866
889246	contig_15047_pilon	+	1405	6	Intergenic	novelGene_52254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3077.58024428284	17	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	512	967	4112	4686	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNAEFLNFLTFFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2756	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3633_4080_4434_4552_4687_21013_21062_21232
889247	contig_610_pilon	-	2307	4	Intergenic	novelGene_76715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	1236.0293955512	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	96	653	252557	214199	FALSE	40	ATGACAAGAAATTTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTCSILWSSLDCNVASGHGTCCS	252652	212544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220675_220785_234998_235302_252475
889248	contig_15327_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_70606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	56	171	181	351	898735	898905	NA	20	GTCTGTGAACAGTCACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898554	900742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_898600_900700
889249	scaffold_880_pilon	+	5103	5	Intergenic	novelGene_121530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	168	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	442	834	1185040	1243528	TRUE	25	ACCTGCACTGTGAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSVASGCEEGSLTVCYADNTILLAESEEDLKYLLMKIKDHSLQYGLHLNIKQTKILSTGPISNIMINREKTEVVKDFILLGSTINTYGSSSQEIKQRWGQDGGVVDASGGPFYNKDPKKQVNRLYTTI	1055988	1389941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_1056363_1184972_1185332_1243427_1246210_1299991_1300259_1388620
889250	contig_8375_pilon	+	2927	3	Intergenic	novelGene_141299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	170	892	157143	221615	TRUE	20	GTATTTCACGTGAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQESDTVSYKPPDSKLNLHLFKQFTQPRSTGGDSKTAPSSPLTSPSDTRSFFKVPEMEAKIEDTKRRLSEVIYEPFQILSKIIGEESGSHRPKALSSSASELCNLSSLNGHLESNNNYSIKEEECDSEGDCYGSDSNIPRSDHPKSADDPPREVELKSSQVSSLKDLGLKTSSLVLEKCSLSALVSKEDEEFFELYTEDFDLDTEGESKVDKPPDIPLKPEVLVDNGMALDSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPMHN	156973	224063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_157855_221604_223193_223605
889251	contig_3269_pilon	-	4934	1	Intergenic	novelGene_117000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAAGTGTCTGTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47519	42585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_42600_47500
889252	contig_5434_pilon	-	1943	2	Intergenic	novelGene_74673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	448	804	326870	325255	FALSE	20	TAATTTTTTTTTTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	327317	324115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720
889253	contig_5686_pilon	-	6631	5	Intergenic	novelGene_45296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATCGACCAGGAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180958	93881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_163295_163412_170213_170341_171641_172586_175534
889254	contig_10500_pilon	-	4378	6	Intergenic	novelGene_41265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1016.2788987281	9	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1892	2404	1635203	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1638418	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635617_1636940
889255	contig_7051_pilon	-	2130	2	Intergenic	novelGene_64368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCATTAAAGCCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348516	345056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_345536_346865
889256	contig_19816_pilon	-	1484	7	Intergenic	novelGene_156479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_6	246.333558863226	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	562	1053	125593	123459	FALSE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126539	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125780_126164
889257	contig_7695_pilon	+	4650	4	Intergenic	novelGene_41537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	932	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGGCGACCGAGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370883	397125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_373987_375819_376520_379663_380088_396702
889258	contig_835_pilon	-	1224	1	Intergenic	novelGene_152174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	697	1176	387074	386595	NA	35	ACAGTCTAGTAGGCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNNDNRRPTANIILNRERLKPFPLRMGRRRRCSLSPFLLNIMLEVLAGEIRQEKEIKGIQIGKEKVKLFLFADNMILYIENLKDSRRKLLEQIERFSKVAGYKINIQKSVGFLYANEENFEKEIRKTIPFIIAPKKIKYLGINLTRDWLCHLVLL	387770	386546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_386500_387800
889259	contig_9299_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_178576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1446	1754	313828	313520	NA	40	GAATCACATGATCATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENIEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKLPIKKSLAQMASLENSTKHLQKILYQYYSRYFRA	315273	313241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9299_pilon_-_313200_315300
889260	contig_17274_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_26523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAACTCTATATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125271	127745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_125300_127700
889261	contig_7898_pilon	+	2528	16	Intergenic	novelGene_47606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.909520905691	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	552	2309	571794	599921	FALSE	25	CAAGAGATCTCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEAAIQELKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	562993	600140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563175_563423_563602_571601_571799_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587685_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
889262	contig_19032_pilon	-	2704	3	Intergenic	novelGene_172525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCAGTAGGGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147931	144337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_146726_146808_146884_147690
889263	contig_4232_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_63370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAATAGAAGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
889264	contig_755_pilon	+	4180	3	Intergenic	novelGene_119780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3534	3893	636536	636895	FALSE	20	AGCTGTTTCCTGGTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRESPCHTAQPGQKGLPTQEKEKKTNNSKQTNEQKPRDPTSTAAQTRKQLHTRTELRSPSGRSRDGARSQVRERIGGGCERQVRNQKKQKRKEKKQHWQPTKWHSAS	530120	637182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_530891_630020_630494_634245
889265	contig_12450_pilon	-	9008	35	Intergenic	novelGene_162322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	668	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1760	2632	450359	440971	TRUE	50	TATATATATATATATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGGPMRTGSTVIHHKRHGDRKGKGLVGHGAGEGQGSGQGPLAAGRGVGDADRVRDKAGQSERLLLHEGQYSRGAGFHLQVLQDLHGTKDLDLGVGIVVAQQDFCLVSIQPWAEGHLGPHLLSRGAAGQEGCDHQRCLLHTEVLLLLVRQPVHHDGTEVLALSCVKPGFCSEDVPCREVKDIPLELELAADEGLRVQTLDDIHLGRSALAYQVRASVSQGDGHSGGCDLLGASLDSADVTGHDPRRDTDRDLLVGPQVPGHLVVNGHRSYILGHGHACLGVDEEDAVG	453474	371745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_-_374406_379295_379463_379891_379955_381291_381398_382311_382453_383386_383529_384597_384750_386662_386861_391797_391945_396873_397095_398047_398223_402680_402869_403394_403511_404627_404732_404815_404919_418963_419092_420029_420160_420273_420406_422052_422115_422339_422523_425401_425483_428618_428751_430000_430160_433706_433799_435511_435687_437113_437287_439205_439427_440945_441083_443603_443728_444676_444825_447111_447359_448208_448428_450336_450431_450510_450596_451871
889266	contig_13300_pilon	-	3410	2	Intergenic	novelGene_125757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1481	junction_1	0	1647	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	387	686	49737	47432	FALSE	0	TGTTGGCTCTCTCGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	50123	44707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_47630_49635
889267	contig_5125_pilon	+	3321	1	Intergenic	novelGene_43459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1772	2224	58441	58893	NA	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	56669	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_56700_60000
889268	contig_16578_pilon	+	4499	1	Intergenic	novelGene_148668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTGTTTACTTCCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226906	231405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_226900_231400
889270	contig_13295_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_31238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTGAGCAATGAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99119	96543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_96500_99100
889272	contig_3095_pilon	+	1521	5	Intergenic	novelGene_75161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1529.24693476888	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	42	485	220513	226399	TRUE	15	GCCACCTATTTGTGGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAPTSFPRMIIPSPRSVTSPSSLLLMRFMTARWTSGAWMSHF	220471	227850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225700_226275_226409_226645_226824_227001
889273	contig_16411_pilon	+	3717	3	Intergenic	novelGene_77348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	791	3	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	83	478	238160	240447	TRUE	40	CAAACTCGTGAAATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPFHPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVVSQLVAEAWEVAGPDSQAFIRKA	238077	243775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_238336_240227_242861_242949
889274	contig_10482_pilon	+	1974	8	Intergenic	novelGene_152809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1228.43371321171	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	76	630	116203	123281	TRUE	30	TTTTTAAACGTAATAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPGGSARRGETLAAGTRFYQQVCTMREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	77278	127256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77332_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942
889275	contig_2227_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_142342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	690	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTTTGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245357	242530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_242500_245400
889276	contig_10009_pilon	-	4052	3	Intergenic	novelGene_82739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	874	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGCACAATAGCAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66306	54425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_55301_60319_60407_63216
889277	contig_10225_pilon	+	3735	1	Intergenic	novelGene_86873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	627	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	435	1308	29	1336	46329	47636	NA	15	CTAAGCCCCTCCCTCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	46300	50035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_46300_50000
889278	contig_5684_pilon	-	3871	3	Intergenic	novelGene_81032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1738	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2514	2861	442624	442277	TRUE	30	GGAGCAGAGGGGCCCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDCFFFLLLHIFAFHTQTKTTKAKPTQEERITALPGPVKHALCKSCAQTHNPQPPSQQQNYFSPCSQKRCNSAKRKRTGVKFPNPQKLKVVKVICAGENPLSAIKLLDLLKLS	447707	403479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_403819_441605_443947_446516
889279	contig_253_pilon	-	3720	5	Intergenic	novelGene_129749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	277	junction_4	136.721203549413	1362	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	96	908	707326	703228	FALSE	35	AGAACAAAACTTCTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAEEDDDSAEEGGVARLNGRGSWAQDGDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS	707421	700415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_703410_703697_703914_704490_704650_705222_705387_707234
889280	contig_15327_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_70647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCCTTCTGCAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899727	900682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_899700_900700
889281	contig_3588_pilon	+	3211	3	Intergenic	novelGene_72895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_2	271.5	50	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTATTTGGTGGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135297	141455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_136117_137170_138929_140821
889282	contig_10973_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_150379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACGACCCACCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2438	1539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2400
889283	contig_13863_pilon	+	1690	10	Intergenic	novelGene_42072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	278.316278031458	2	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	214	1383	474588	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455714	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_482069_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
889284	contig_7201_pilon	-	3634	1	Intergenic	novelGene_152523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATACCCTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333497	329863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_329900_333500
889285	contig_10058_pilon	+	2996	10	Intergenic	novelGene_67721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	152.47351520676	630	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	70	888	72602	99369	TRUE	25	GTTTGTTTAAATTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72532	101647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100615_100658
889286	contig_3018_pilon	-	3563	1	Intergenic	novelGene_78813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTGCAAGCACCTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540079	536516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_536500_540100
889287	contig_14142_pilon	-	1184	5	Intergenic	novelGene_120627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	485.736232434847	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	236	538	621457	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTSKGMISSFSLPIEVSSSDYLNLHSASFPICPQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	622924	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621286_621425_621531_622762
889288	contig_19744_pilon	+	7269	31	Intergenic	novelGene_120379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_13	100.82409875069	1170	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2103	6312	241	6552	151881	225076	FALSE	15	CAGTTGTGTAAGGTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQDMPFLRGGPGMYKVVKTGPSGHNIRSCPNLRGIPIGMLVLGNKVKAVGEVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAKKEKKKKEKAEVRPRGNLFGEMAQLAVGGPEKDTVCELCGESHPYPVTYHMRQAHPGCGRYAGGQGYNSIGHFCGGWAGNCGDGGIGGSTWYLVCDRCREKYLREKQAAAREKVKQSRRKPMQVKTPRALPTMEAHQVIKANALFLLSLSSAAEPSILCYHPTKPFPSQLPSVKEGISEDLPVKMPCLYLQTLARHHHENLVGYQDDNLFQDEMRYLRSTSVPAPYISVTPDASPNVFEEPESNMKSMPPSLETSPITDTDLAKRTVFQRSYSVVASEYDKQHSILPARVKAIPRRRVNSGDTEVGSSLLRHPSPELSRLISAHSSLSKGERNFQWPVLAFVIQHHDLEGLEIAMKQALRKSACRVFAMEAFNWLLCNVIQTTSLHDILWHFVASLTPAPVEPEEEEDEENKTNKENTEQEKDTRVCEHPLSDIVIAGEAAHPLPHTFHRLLQTISDLMMSLPGGSSLQQMALRCWSLKFKQSDHQFLHQSNVFHHINNILSKSDDGDSEESFSISIQSGFEAMSQELCIVMCLKDLTSIVDIKTSSRPAMIGSLTDGSTETFWESGDEDKNKTKNITINCVKGINARYVSVHVDNSRDLGNKVTSMTFLTGKAVEDLCRIKQVDLDSRHIGWVTSELPGGDNHIIKIELKGPENTLRVRQVKVLGWKDGESTKIAGQISASVAQQRNCEAETLRVFRLITSQVFGKLISGDAEPTPEQEEKALLSSPEGEEKVYNATSDADLKEHMVGIIFSRSKLTNLQKQVCAHIVQAIRMEATRVREEWEHAISSKENANSQPNDEDASSDAYCFELLSMVLALSGSNVGRQYLAQQLTLLQDLFSLLHTASPRVQRQVTSLLRRVLPEVTPSRLASIIGVKSLPPADISDIIHSTEKGDWNKLGILDMFLGCIAKALTVQLKAKGTTITGTAGTTAGKGVTTVTLPMIFNSSYIRRGESHWWLKGSTPTQISEIIIKLIKDMAAGHLSEAWSRVTKNAIAETIIALTKMEEEFRSPVRCIATTRLWLALASLCVLDQDHVDRLSSGRWMGKDGQQKQMPMCDNHDDGETAAIILCNICGNLCTDCDRFLHLHRRTKTHHRQVFKEEEEAIKVDLHEGCGRTKLFWLMALADSKTMKAMVEFREHTGKPTTSSSEACRFCGSRSGTELSAVGSVCSDADCQEYAKIACSKTHPCGHPCGGVKNEEHCLPCLHGCDKHATTLKQDADDMCMICFTEALSAAPAIQLDCSHIFHLQCCRRVLENRWLGPRITFGFISCPICKNKINHIVLKDLLDPIKELYEDVRRKALMRLEYEGLHKSEAITTPGVRFYNDPAGYAMNRYAYYVCYKCRKAYFGGEARCDAEAGQGDDYDPRELICGACSDVSRAQMCPKHGTDFLEYKCRYCCSVAVFFCFGTTHFCNACHDDFQRMTSIPKEELPHCPAGPKGKQLEGTECPLHVVHPPTGEEFALGCGVCRNAHTF	151640	225793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_152040_152925_153059_156119_156243_176506_178151_179325_179496_180253_180499_183378_183547_186060_186219_187302_187503_188368_188519_192998_193160_194331_194489_194667_194893_196382_196449_197840_198081_198377_198477_200500_200582_202345_202613_203115_203400_205236_205334_206948_207069_208659_208762_209569_209699_210065_210199_211799_211904_212700_212890_213864_213973_215587_215798_218459_218568_219217_219384_224960
889289	contig_9633_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_139627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCCAGTACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037695	1039144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1037700_1039100
889290	contig_12492_pilon	+	2541	7	Intergenic	novelGene_77499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	119.174125640687	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	77	529	276346	284053	TRUE	15	ATTTCTGTATCTGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTDEAAFSCCSDADPSTKDFLLQQTMLRIKDPKKSLDFYTRILGMTLLQKLDFPTMKFSLYFLAYEDKNDIPKDADEKVAWVFSRKATLELTHNWGTEDDATQSYHSGNSDPRGFGHIGIAVPDVHGACKRFEELGVKFVKKPDDGKMKGLAFIQDPDGYWIEILNPNKMININF	258806	286571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_+_258862_276324_276408_278688_278830_280154_280223_280846_280937_283961_285618_286123
889291	contig_10627_pilon	+	3267	14	Intergenic	novelGene_59966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	162.974459827953	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	199	1650	224634	239059	TRUE	10	TCTCAGAGTGCCGCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSLAILSEMGEVTEGMMDTKMVHFLTHYADKIESVHFSDQFSGPKIMQEEGQPLKLPDTKRTLLFTFNVPGSGNTYPKDMEALLPLMNMVIYSIDKAKKFRLNREGKQKADKNRARVEENFLKLTHVQRQEAAQSRREEKKRAEKERIMNEEDPEKQRRLEEAALRREQKKLEKKQMKMKQIKVKAM	218876	240733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232908_234198_234285_235606_235666_235983_236094_236314_236483_238978_240242_240298
889292	contig_34_pilon	-	1716	8	Intergenic	novelGene_39990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	12	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	59	1444	247052	212049	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247110	211776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
889293	contig_546_pilon	+	3790	2	Intergenic	novelGene_117244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACTACCTACCTAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437437	441649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_440639_441060
889294	contig_1225_pilon	+	2291	5	Intergenic	novelGene_44164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.083925693648	10	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	208	930	250814	275437	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQARNTGGRKQTQEEREKSCLKNTLSRELQPGNTPGAFALAARAPENKVFISLQSHPPSTLCFDFKCVSLSVCYGRRKGEQDHVDTLVQKSLLQLLPPRLLLSESDWRHPVGREFSQACPSLSSPAPSPALLLIPAA	250606	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274408_274792_275033_275268
889295	SIRV6	+	1440	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	86	2	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889296	contig_13542_pilon	+	1833	7	Intergenic	novelGene_131534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	82.768754168869	444	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	101	1114	535605	544291	FALSE	15	GATTCTCACACCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLSQTASGALARPATVLGAMEMGRRIDAPTSAAAVRAFLERGHTELDTAFVYSDGQSESILGGLGLGLGGSDCKVKIATKANPWDGNSLKPDSLRSQLETSLKRLQCTQVDLFYLHAPDHSTPVEETLRACHQLHQEGKFVELGLSNYASWEVAEICTLCKNHGWILPTVYQGMYNATTRQVETELFPCLRHFGLRFYAYNPLAGGLLTGKYKYEDKDGKQPLGRFFGNNWAEIYRNRFWKEHHFKAIALVEKALQAAYGPSAPSMTSAALRWMYHHSQLQGARGDAVILGMSSLEQLEQNLAASEEGSLEPAIVDAFNQAWHLVAHECPNYFR	535504	545010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_535837_540319_540508_540702_540808_541724_541822_542065_542166_542720_542851_544129
889297	contig_14807_pilon	-	699	7	Intergenic	novelGene_124705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	39	683	39773	37247	FALSE	10	GTCCCGCTTGACCAGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39916	37230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
889298	contig_5341_pilon	-	1977	2	Intergenic	novelGene_168002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1410	junction_1	0	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	778	1302	339444	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340221	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290
889299	contig_18096_pilon	-	4290	13	Intergenic	novelGene_58032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1240	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2526	2882	76607	71998	TRUE	35	ACAGCAGCCTCAAGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTRARLGVGDALFTESFSQGFRSTEENSYSCIWVLTCNCLELIIPVGTAIQGLLFQARDHVFLLVMVHSKVVGLRFIPASEVDVVAEEVGIVPFLHLSLQQLQQVCKPLKGMCVPA	79132	40308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_40427_42488_42584_44144_44256_53716_53800_57199_57353_59463_59657_62798_62927_66640_66734_69380_69637_70499_70661_71980_72128_75379_75507_76507
889300	contig_12626_pilon	+	3989	26	Intergenic	novelGene_80424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_17	347.04644991701	772	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1306	3921	23	3943	107206	196455	FALSE	40	TGTCTACAAGAACTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELSSCINKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	107183	196501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637_155785_156281_156450_156973_157111_157459_157601_157881_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_171116_171243_171350_171421_176134_176249_179387_179511_180235_180350_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
889301	contig_3270_pilon	-	2343	17	Intergenic	novelGene_104472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	211.692722108603	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	92	2026	209503	132651	TRUE	40	TTAAAACAGTAAGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMHQINPKLESQRVNKKVNNDASLRIHNLSILVRQIKLYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDVEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKAMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLAKTVEELRSTVDSVEGNASKILKIEKENQRLNKKVEILENEVIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKTEFEKRQIRKELEHYKEKGERSEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELEREKNPVQRDRHIQGILCSPERIRERK	209594	127804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_127939_130712_130841_132595_132724_133307_133667_135020_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492
889302	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
889303	contig_16622_pilon	-	2604	7	Intergenic	novelGene_48452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	783	junction_1	1225.06930642946	281	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	732	1214	115540	112684	FALSE	35	ATCTGTCATTGAACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	121971	111293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
889304	contig_20951_pilon	+	6028	17	Intergenic	novelGene_43104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	913	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	3533	4135	138757	210438	TRUE	10	TCGCGCCTGCGCACAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSIDRHSAEVAHLGTAAARHAVAAFGFDEPSPTLVAFPNASSSHFFLNRCSVLDVVFLSQLFTRETIVLFPESLTLPTGFLSAARIGTAEPLHVTVQQSRKATGGTPDKLISVGCSDLFFCFPLIVFIQDGLGKHLLQFTGWEGTCAAAFHAAELRLSRPEDCLLSISDETLFAEQVSICTLGQLLKWKFTIAAAALD	115455	268911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_118845_119711_119779_138680_138905_155043_155141_208038_208116_209203_209356_210309_210447_212024_212077_212792_212928_218275_218395_227945_228112_229223_229327_234046_234123_235969_236805_237770_237902_244509_244646_268779
889305	contig_383_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_126098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	667	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTCTAAGGAGGAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98347	97463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_97500_98300
889306	contig_15732_pilon	+	7434	15	Intergenic	novelGene_88838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_13	216.510510184629	2061	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	90	2366	11208	393915	TRUE	25	CACTAAATTCTTCTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRTPGESLWPRVPGFRRHLSTGPLASVAAMLPAAPGKGGGSRDRPPCGPVPPENTKDILMIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYNKLTIVHHPGGKFLASTEGFRTKTKHIVNQFQY	11118	399241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_386711_386776_393814_398263_398520
889307	contig_15327_pilon	-	1011	4	Intergenic	novelGene_70494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1937	junction_3	77.0468832739016	79	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	116	403	411438	401655	FALSE	10	TGAGCTGTTTTCTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STTAASFFCGSWCCLCARSVRTWYLFCEAAAEETPVLAMADEKPKEGVKTENNDHINLKVAGQDGSVVQFKIKRHTPLSKLMKAYCERQGLSMRQIRFRFDGQPINETDTPAQLEMEDEDTIDVFQQQTGGVF	411553	401046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_401718_404070_404143_409697_409830_411417
889308	contig_18108_pilon	+	3307	7	Intergenic	novelGene_33439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	135.547552131674	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1232	1843	122594	123205	FALSE	20	GGGATGGCCGTGGAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	43066	124669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_43154_94354_94474_103438_103528_108412_108449_110391_111072_116603_116742_122511
889309	contig_7452_pilon	+	2111	5	Intergenic	novelGene_109142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	746	junction_3	278.846732094891	3412	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	23	502	118756	196457	FALSE	20	CCCATTGCCATCGACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLTAALLIWALLLPKGGSGEAWPIHTACKDSSLEVLYQSCDPLQDFGFSIDQCSKDLKPNLSIRLGLILRENIKELFLDIALLTKGSSILNFSYPICEGDHPKFSFCGRSKGEQLYYVGPVNNPGLLVPEGEYQVLLELYDENRSTVACANATVICS	118733	198066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_118883_155887_155975_158022_158152_191492_191546_196373
889310	contig_11986_pilon	-	5651	16	Intergenic	novelGene_69213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1249.61564579763	25	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	2374	3477	748038	736169	FALSE	45	ACTGTTTAAAGAAAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	794743	733994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751584_751640_751692_753182_753293_755576_755810_756609_758101_758220_758371_792503_792597_794615
889311	contig_16041_pilon	-	3977	1	Intergenic	novelGene_178357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1355	1693	3812	3474	NA	40	ATGCTCACAAATGGACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAVVEAVCGSGWRLLIHVATRAGEPEIGRSAEQGSCSQAAKTNQIPRPQVSSSSSPKNCRSDEQKPAAGSRVSKSPQAFPECPLIFNAGHTPKETPFQLIGYSQQIPSWR	5166	1189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_-_1200_5200
889312	contig_18419_pilon	-	3037	11	Intergenic	novelGene_141461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	273.867413176522	1008	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	181	1416	41791	30259	FALSE	25	GAAAGTGTCCTAGTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGCACPGCSSKSFKLYSPKEPPNGNAFPPFHPGTMLDRDVGPTPMYPPTYLEPGIGRHTPYGNQTDYRIFELNKRLQNWTEECDNLWWDAFTTEFFEDDAMLTITFCLEDGPKRYTIGRTLIPRYFRSIFEGGATELYYVLKHPKEAFHSNFVSLDCDQGSMVTQHGKPMFTQVCVEGRLYLEFMFDDMMRIKTWHFSIRQHRELIPRSILAMHAQDPQMLDQLSKNITRCGLSNSTLNYLRLCVILEPMQELMSRHKTYSLSPRDCLKTCLFQKWQRMVAPPAEPARQQPSKRRKRKMSGGSTMSSGGGNTNNSNSKKKSPASTFALSSQVPDVMVVGEPTLMGGEFGDEDERLITRLENTQFDAANGIDDEDSFNNSPALGANSPWNSKPPSSQESKSENPTSQASQ	41971	28637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_30490_31209_31359_31556_31681_31773_31858_32101_32225_32718_32892_33077_33181_33276_33353_33459_33505_33626_33730_41766
889313	contig_16775_pilon	+	2480	17	Intergenic	novelGene_107767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	267.629926098988	384	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	687	1736	152231	174136	FALSE	70	ATCTTTAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130362	174880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_146028_146154_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
889314	contig_3270_pilon	-	6626	26	Intergenic	novelGene_104464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	256.426220188186	1521	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	2985	5318	133171	102831	FALSE	40	TGGAAGAATTCTCAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPASGEDTRWERESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNSNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESMIKEREDLKSLYDSLVKDHEKLELLHERQASEFESLIAKHGTLKFAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAEEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSMIALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMCKTL	210586	101522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_102929_106359_106575_106714_106808_110361_110508_115231_115419_117395_117540_117767_118046_118971_119134_121338_121504_127796_127939_130712_130841_132595_133667_135019_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492_209594_209691
889315	contig_504_pilon	-	3665	5	Intergenic	novelGene_54441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTCCTTGATCAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239022	231945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_232967_234124_234186_234983_235106_236050_236134_236644
889316	contig_10554_pilon	-	3515	3	Intergenic	novelGene_166965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	745	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	136	2136	500057	498057	TRUE	60	TTTAAAAAGCCAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGHEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPKHCSQ	500192	385551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_-_385790_481599_482033_497348
889317	contig_10904_pilon	+	2535	4	Intergenic	novelGene_22456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	324	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	168	1136	149100	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143878	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150305_150421
889318	contig_854_pilon	+	2808	13	Intergenic	novelGene_36524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2947.90726618054	10	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	156	1355	1649514	1702568	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRLNVNRK	1612790	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681838_1702545_1702644_1715027
889319	contig_4426_pilon	-	2200	7	Intergenic	novelGene_15427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_6	672.092007590231	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2112	87	2198	904546	820604	FALSE	65	GGAAGAAAAAAAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTDSDPGHTSENWGERLISSYRTYSEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSF	904632	820601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_895571_895641_904482
889320	contig_11422_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_99081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2028	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2000
889321	contig_3975_pilon	-	3258	8	Intergenic	novelGene_54815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_2	124.533906537742	104	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	404	1153	2064115	2056837	FALSE	25	GAAAGTTGGGGGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2065063	2054731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959
889322	contig_6048_pilon	-	3613	1	Intergenic	novelGene_73162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1707	2051	1180264	1179920	NA	35	GGTGAAGGGTAAGACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSSRTQQFCWVEKTAQSLRACGSWNLQGRALERRELCRERAKEIRRGVIGSLLLTAKVHMHQMNLHRLGSLRPGRFKLSNSQSSQRVGKMNYNQLGHLVETMEGHHQSGWLN	1181970	1178357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1178400_1182000
889323	contig_6509_pilon	-	2894	6	Intergenic	novelGene_145628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_5	45.0794853564235	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2109	786	2894	78961	72474	FALSE	40	CTGAGGCTATACAAAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPRSKKKEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEK	79746	72473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_78933
889324	contig_10627_pilon	+	1895	10	Intergenic	novelGene_59941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	336.100440601972	6	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	485	1018	165244	166905	FALSE	10	TTGGTGGTGCCCAGACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	162830	167782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164976_165068_165234_165337_165488_165651_166411_166535_166672_166775_166851
889325	contig_7321_pilon	+	3742	2	Intergenic	novelGene_53107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	198	704	11608	12114	TRUE	40	AAAAAAGTCCCTTTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKTACYLYNDRYTDQWYRIENPDVNPSTFSNLVFTRAQSPSNGEQTVFLTNGAGKTGCPSAKQMKQDPHLTPYTKTNSKWIKHLNIKPKTIKFIEENIGSMLEALIHSINRIKTITNNTRTPEDKLDNWDLLKIKHLSSSEDFTKRVKREPTDWEKFLDITSQTNV	11410	15640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_12654_13141
889326	contig_2312_pilon	+	3164	5	Intergenic	novelGene_160735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_3	143.363829120179	437	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	38	700	217853	243984	FALSE	30	GGTTTGATCTTGCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYENDSVEDLKEMTSVSSRKRGKRRYFWEYSEQLTPSQQERMLRPSEWNRDTLPSNMYQKNGLHHGKYAVKKSRRTDVEDLTPNPKKLLQIGNELRKLNKVISDLTPVSELPLTARPRSRKEKNKLASRACRLKKKAQYEANKVKLWGLNTEYDNLLFVINSIKQEIVNRVQNPREERGPNMGHKLEILIKDTLGLPVAGQTSEFVNQVLEKTAEGNPTGGLVGLRIPTSKV	217815	246448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_218013_219483_219674_221316_221391_236791_236915_243868
889327	contig_5031_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_133167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATGGCTCCTTGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15047	12851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_12900_15000
889328	contig_5686_pilon	+	1917	2	Intergenic	novelGene_45431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCCAGTTATATGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196755	216593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_196776_214696
889329	contig_16492_pilon	-	2315	10	Intergenic	novelGene_100315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGCAATGGCAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195385	173138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_173206_177799_177928_184044_184292_187437_187495_189447_189919_191926_192227_193408_193539_194007_194102_194431_194706_194838
889330	contig_8330_pilon	-	3665	15	Intergenic	novelGene_71850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	311.98342610348	66	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	2078	2836	916108	895691	FALSE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPIALGWSLGFQSL	930418	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895730_899577_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051_916438_923723_923849_924642_924845_925607_925751_926083_926267_928091_928267_929178_929388_929707
889331	contig_11924_pilon	+	2484	8	Intergenic	novelGene_128013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	244	junction_7	156.602968668919	743	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	244	972	11090	64571	TRUE	20	TTATAACCTCTTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARRPHCARELFHGSAADAELSAADPGATGSEAVLPGDRGGRNRGGRGAAAAAATTSIEVAEGAERRGESPTRKPNSEPGRMDLHQPGTGRYQVLHNEEDNSESSATEQPSTSNATPQIVQTAPSTPVLETNSSPPPYSSITVEVPTTSDTEAYSEFYPVPPPYSVATSLPTYDEAEKAKAAAMAAAAAETSQTIQEEECPPRDDFSDADQLRVGNDGIFMLAFFMAFIFNWLGFCLSFCITNTIAGRYGAICGFGLSLIKWILIVRFSDYFTGYFNGQYWLWWIFLVLGLLLFFRGFVNYLKVRNMSESMAAAHRKRYFFLL	10846	72565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_11129_38813_38980_42072_42207_50560_50655_58636_58762_61408_61476_64467_64574_71055
889332	contig_17796_pilon	+	2005	12	Intergenic	novelGene_33767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_4	210.864180171358	713	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	387	1709	12080	42369	FALSE	20	TCCCATCGTATTCTATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKCNNTNKKSKEAIIHLNPQEDSCVHPQTLQPNQENSRSTNPAQNSFTQEVVLNISSPK	8152	42665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
889333	contig_3745_pilon	+	3932	4	Intergenic	novelGene_85095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	400.866006984323	11	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	223	1476	434035	486871	FALSE	30	ACTTGTTACAGCAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIEAGLDVINNPDEDDDQEDEDNRLGEKLIFNENDFVEGYYRTERDKGTQYELFFKKADLMEYRHVTLFRPFGPLMKVKSEMIDITRSIINIIVPLAERTEAFAQFMQNFRVHKKDSGFWRDFGFGMTCQYRSDFLTVGGFDMEVKGWGGEDVHLYRKYLHGDLMVIRTPVPGLFHLWHEKRCVDELTPEQYRMCIQSKAMNEASHSHLGMLVFREEIETHLRKQAYRTDSEAVG	433812	489327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_434696_437841_438059_458773_458857_486578
889334	contig_13519_pilon	+	4292	15	Intergenic	novelGene_124630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	415.495603994525	947	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	245	1972	66179	120612	FALSE	10	CAAGTTGTGCTGGCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARESRISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57028	122932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_65514_65626_66165_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95188_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
889335	contig_6208_pilon	-	4890	19	Intergenic	novelGene_53010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	445.309813777906	1548	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	272	2782	513736	490249	TRUE	10	GTTGCTCTTCTGTCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETERWWEKLWKIPECIRGWDDQLKHHVPSQPAFQVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPSRPDKKQRTVNIENSRHRKQEQKYPQPQPHKREGKWHKHGRTNGRHMAHLEIELGQFPFDPKY	532627	460500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_460709_468305_468411_473519_473661_477713_477764_478856_479070_479912_479975_486600_486820_488843_489025_489319_490439_492897_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505104_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
889336	contig_10958_pilon	-	1937	8	Intergenic	novelGene_5377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_7	321.175265268682	110	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	75	1265	864848	839744	FALSE	5	CTAGTTGTTGCTTTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAAAVRARPRPVRLAAGRLRRFKMTNEEPLPKKVRLSETDFKVMARDELILRWKQYEAYVQALEGKYTDLNSNDVTGLRESEEKLKQQQQESARRENILVMRLATKEQEMQECTTQIQYLKQVQQPSVAQLRSAMVDPAINLFFLKMKGELEQTKDKLEQAQNELSAWKFTPDSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	872282	839071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692_841848_846744_846924_854419_854548_855728_855788_861055_861112_864818_864856_872215
889337	contig_10263_pilon	-	5671	7	Intergenic	novelGene_135848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.07828758753	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	2021	3268	891668	880676	TRUE	20	CCTTGGGAATTTCTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKEGPVASPPFTDLEQAVLPAVIPKKDKPELSEPSHLNGPSSDLEAAFLSRHVDDGSGSPHSPHQLCSKSLPIQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLREKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYSKLGKVPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSAQSAASVLHPQQTLHPPGNIPETGQNQLLQPLKPSPSSDNLCSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGGTVNSQAPQAQPTAMTSSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAMNLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	894921	878198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_878506_878579_880994_881454_881646_888387_888583_890018_890222_891327_891990_893222
889338	SIRV6	+	968	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1386	116	1	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	96	305	2569	10736	TRUE	20	CGATGCGGTCTTCAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2473	11709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889339	contig_8310_pilon	-	4524	5	Intergenic	novelGene_75593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGACATATCCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327262	314978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316149_316232_316755_317712_317884_320574_320710_324736
889340	contig_5779_pilon	-	6566	5	Intergenic	novelGene_106416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	335	142	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	997	1359	172807	172445	TRUE	70	TAGTTAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCIRASSIDPIFSSINFIVFGFLFRSLIHFELVFVYDVRYGSCFVFFADGHPVLPAPFVKKTVCSLSDGLWALVKDQVTVGGWIYIWVLNSVPLVSVSVVVPVPGCFDYGSCIVSSEVR	173954	53239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_56989_110915_111817_132488_132625_172023_173364_173514
889341	contig_3270_pilon	+	4678	15	Intergenic	novelGene_104491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	963	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAGCAGCGACATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339675	409007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_342734_357557_357762_359605_359793_360192_360333_362563_362731_365981_366143_367848_367891_369375_369479_370452_370584_375430_375548_376971_377092_380093_380170_396997_397100_407560_407614_408990
889342	contig_12864_pilon	-	6841	10	Intergenic	novelGene_76343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	103.333333333333	1260	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	12	2165	82648	68326	FALSE	15	TTGCTGCAGATGGTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLINFTPSQLSNHPSLLDLGSLNTSSHRTVPNIIKRSKSGIMYFEQAPLLPPSVGGTAATAAGTSTISQDTSHLASGPVSGLASGSSVLNVVSMQTTTTPTSSVSVPGHVTLTNPRLLGNPDIGSISNLLIKASQQSLGIQDQPVALPPSSGMFSQLGTSQTPSTAAMTAASSICVLPSTQTTGITAASPSGEAEEHYQLQHVNQLLASKTGILSSQRDLDSASGTQVSNFTQTVDAPNSMGLEQSKALPSAVQASSASPGGSPSSGQQSASPSVPGPTKPKPKIKRIQLPLDKGNGKKHKVSHLRTSSSEAHIPDQEANTAPLTSVTGTPGAEAEQQDTADVEQSSQKECAQPARQVAVLPEVQATQNPASEQESTEPKTVEEEESNFSSPLMLWLQQEQKRKESIAEKKPKKGLVFEISSDDGFQICAESIEDAWKSLTDKVQEARSNARLKQLSFAGVNGLRMLGILHDAVVFLIEQLSGAKHCRNYKFRFHKPEEANEPPLNPHGSARAEVHLRKSAFDMFNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYDSKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN	82659	63649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_68602_69093_69224_69639_69724_70321_70430_70589_70765_76726_76802_78235_78407_79823_79889_80937_81019_81659
889343	contig_6304_pilon	-	2767	8	Intergenic	novelGene_122249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1112	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAGTCCCACAAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182281	110478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_110557_128691_128849_132144_132366_161428_161598_162288_162389_166995_167125_168548_168689_180508
889344	contig_20614_pilon	-	3724	4	Intergenic	novelGene_107564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	883	1407	235202	234678	TRUE	25	TATGCACACGTGCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENPTFHFFSFQRDELCLLPLEQGILASLRSFEAEAARLLVSLVSSASAFVSCGLLALRPHARICPAGASVPKLGSSTNKSLETPHSARSLLRTDTQLSCSVGRLQRRLALVFWFCCCWFSATVASLLLQVLCCCWSFATATALSIHSFKTTSHFRYLLEQHPSLSVPNSALVI	237132	232233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_232494_232620_235534_235583_236086_237083
889345	contig_10861_pilon	-	2475	12	Intergenic	novelGene_39454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_11	304.045396784403	860	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1431	1787	2617695	2617339	FALSE	20	GCCCTTCCTGACAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGGAGTCSDFAQFFRPRWQRQQHNLDPRSPSPEPPSCGQRGQTTQPALGPRHGPDLRRDPVACTVFPGLRPTLSPGPPFRPGLPASPAPSSAPACSSQRESCQLGGGWSQRGRGHH	2642455	2616650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2627217_2627289_2628638_2628694_2629212_2629249_2629939_2629989_2630666_2630732_2638316_2638394_2638507_2638575_2642392
889346	contig_12080_pilon	-	6343	26	Intergenic	novelGene_128341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	590.963822919813	162	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	57	1721	164251	109469	TRUE	10	CCGCCTACAGCCTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPGGGLGPGRGTRDKKKGRSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVKSEQRRVSDH	164307	45131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45516_45893_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
889347	contig_20293_pilon	-	3504	16	Intergenic	novelGene_153503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.838266358412	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	120	1664	68656	19443	TRUE	75	TTAAAAAAATAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116221	17324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_18613_18890_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147
889348	contig_11281_pilon	-	2516	2	Intergenic	novelGene_125455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1819	2136	836902	827209	FALSE	25	AATTTTTACTTTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTWVHASGVLKASKQPSKMNQLFQPHGAKENEEHQRHRKSISPRDRRGHINQRLHQPETRKTRWCPVTTNDRPDREHNRESWMEQEKGGVQNSNSIRRPDLMV	838720	826828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_827455_836830
889349	contig_990_pilon	-	3083	24	Intergenic	novelGene_76024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	149.815437810752	1245	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	116	2032	865835	714549	FALSE	5	CTGTAGCTTTTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIRSNFKSNLHKVYQAIEEADFFAIDGEFSGISDGPSVTALTNGFDTPEERYQKLKKHSMDFLLFQFGLCTFKYDHTDSKYITKSFNFYVFPKPFNRSSPDVKFVCQSSSIDFLASQGFDFNKVFRNGIPYLNQEEERQLREQYDEKRLQSNGAGALSFASPNTSKCPVMVPEEQKKFIDQVVEKIEDLLQSDENKNLDLEPCTGFQRKLIYQTLSWKYPKGIHVETLETEKKERYIVISKVDEEERKRREQQKHAKELEGLNDAVGFSRVIHAIANSGKLVIGHNMLLDVMHTVHQFYCPLPADLNEFKEMTTCVFPRLLDTKLMASTQPFKDIINNTSLAELEKRLKETPFNPPKVESAEGFPSYDTASEQLHEAGYDAYITGLCFVSMANYLGSFLSPPKIHVSARSKLIEPFFNKLFLMRVMDIPYLNLEGPDLQPKRDHVLHVTFPKEWKTSDLYQLFSAFGNIQISWIDDTSAFVSLSQPEQVQIAVNTSKYAESYRIQTYAEYVGKKNEEKQIKRKWTEDSWKEVERKRLNTQCISCALQNHCYRTNSFTATGTVVKRNLSPSLEEAGLEDSASGEVSDAELEKTDSCAETLSEGRKKAKKLKRMKKELSPAGSISGSSAKLFEVPDTW	865950	713497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_714602_725871_726066_746125_746316_803705_803781_808861_808949_811850_811907_829146_829217_829886_829998_833877_833954_834528_834572_835681_835726_840429_840508_844875_844933_848178_848260_849297_849341_850680_850720_851837_851904_852663_852830_855580_855642_862222_862305_862389_862458_862958_863039_865355_865434_865816
889350	contig_3018_pilon	-	14723	4	Intergenic	novelGene_78920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	40.8982477212248	2867	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTACCATAAATAACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655826	629876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_641707_644372_644471_647183_647265_653112
889351	contig_1694_pilon	+	2717	5	Intergenic	novelGene_144939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	40.2399055664896	43	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	209	973	504163	522681	FALSE	65	AAGGAAAGAAAAGAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKIPKESKKVNISSSLESEDISLETTVPTDDISSSEERDGKIKITRQLIERKELLHDIQLLKIELSQKNMMIDNLKMDYLTKIEELEEKLNDALHQKQLLTLRLDNQLTFQQKDARKYQELLKQEMETILLRQKQLEETNLQLREKAGDIRRNLRDFELAEEQYMKLKAFPEDQLSIPEYVSIRFYELVTPLRKEICELQVKKNDLAEELSANKRQLKQLTEVCMVLITGGKRLQLFYEEFLKICVIECKVQ	502759	524425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_502922_504116_504415_511220_511322_513612_513812_522468
889352	contig_5003_pilon	-	3280	9	Intergenic	novelGene_120201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	403	junction_6	339.951099424608	1299	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	711	2136	82	2217	139635	133447	FALSE	35	TATGTGCAAATAAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLACRGAAQPGAACRQSSLEVCCGEKMAVAVRTLQEQLEKAKESLKNVDENIRKLTGRDPNDVRPIQARLLALSGPGGGRGRGSLLLRRGFSDSGGGPPAKQRDLEGAVSRLGGERRTRRESRQESDPEDDDVKKPALQSSVVATSKERTRRDLIQDQNMDEKGKQRNRRIFGLLMGTLQKFKQESTVATERQKRRQEIEQKLEVQAEEERKQVENERRELFEERRAKQTELRLLEQKVELAQLQEEWNEHNAKIIKYIRTKTKPHLFYIPGRMCPATQKLIEESQRKMNAIFEGRRIEFAEQINKMEARPRRQSMKEKEHQVVRNEEQKAEQEEGKVAQREEELEETGNQHNDVEIEEAGEEEEKEVGIVHSDPEKEQEEEEQKQEIEVKMEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139716	132383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134790_135531_135671_135748_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
889353	contig_8852_pilon	-	1779	8	Intergenic	novelGene_159836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2494	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTAAAGATTTAGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74090	14582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_-_14701_16896_17031_38980_39196_51613_51728_62592_62752_64504_64592_70050_70146_73233
889354	contig_11417_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_103247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGGATGGCTTAAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2616	4651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_2600_4700
889355	contig_10437_pilon	+	1516	8	Intergenic	novelGene_38318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	959.89952705521	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	29	985	431167	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431138	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432183_439724_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
889356	contig_14666_pilon	+	1315	1	Intergenic	novelGene_39650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCAGAGATGACCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485866	487181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485900_487200
889358	contig_12677_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_110853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCATCCATTGAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3800
889359	contig_11316_pilon	+	1189	2	Intergenic	novelGene_122614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137148	138868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138135_138665
889360	contig_3449_pilon	+	2356	3	Intergenic	novelGene_73729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435.5	22	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTATTCCTCATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493431	527114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_496982_525193
889361	contig_18081_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_23795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTAAATCCTGTGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113110	114993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_113100_115000
889362	contig_5698_pilon	+	2129	8	Intergenic	novelGene_55028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	852.735837269236	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	20	706	4103	19370	TRUE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229_20533_20628
889363	contig_17144_pilon	+	1147	3	Intergenic	novelGene_29112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	286	junction_2	336	62	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1110	38	1147	5087	11721	FALSE	65	GAGAAAATGAAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDK	5049	11721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_10116_11654
889364	contig_7272_pilon	-	4143	19	Intergenic	novelGene_25340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	675.768040413606	90	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	2280	3554	603574	593320	FALSE	25	GCTGAAGTGTTGAGAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633265	592730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603654_603920_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_611629_611658_616565_617709_620502_620568_632105_632194_633027
889365	contig_8375_pilon	+	4979	11	Intergenic	novelGene_141300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_6	351.568784166058	1118	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	66	2093	157656	221189	FALSE	30	AGCCCAGCAGCATAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESKVDKPPDIPLKPEVLVDNGMALDSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPSAHKYHRLHKNLQHWNTRSLDIKEPEILKGWMNEIYSYDPETYHATLTHSVFVRLEGGTLRLSKPNKNISRRASYNETKPEVTYVSQKIYDLSDSKIYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQPKQKELVGSVRQKMLLDYSVYMARCVPQENRSPQKSPVLSAESSPTAGKKLPEALPSEKEEQEAWVNALLGRMFWDFLGEKYWSDLVSKKIQMKLSKIKLPYFMNELTLTELDMGVAVPKILQAFKPYVDHQGLWIDLEMSYNGSFLMTLETKMNLTKLGKEPLVEALKVGEIGKEGCRPRAYCLADSDEESSSAGSSDEDDAPEPSGGDKQLLPGSEGYVGGHRTSKIMRFVDKITKSKYFQKATETEFIKKKIEEVSNTPLLLTVEVQECKGTLAVNIPPPPTDRIWYGFRKPPYVELKARPKLGEREVTLVHVTDWIEKKLEQEFQKVFVMPNMDDVYIPIMHSAMDPRSTSCLLKDPVVEAADQL	157590	224075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_157941_174313_174515_175721_176056_180330_180579_190050_190198_195209_195310_205385_205519_211516_211643_213043_213254_215395_215517_221066
889367	contig_9955_pilon	+	3891	5	Intergenic	novelGene_21257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCAGCCTTCCGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13460	27314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_13885_22538_22638_23437_23529_23860_27068_27244
889368	contig_14970_pilon	+	9101	6	Intergenic	novelGene_45071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_1	5253.42305168735	966	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204922	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
889369	contig_14522_pilon	+	2337	8	Intergenic	novelGene_147308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	390	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGACCAGGCATTGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64969	175659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_65849_65955_66526_78939_79090_85701_85844_110923_111142_118928_119072_146749_146879_175553
889370	contig_9313_pilon	+	2984	5	Intergenic	novelGene_86474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1005.88850649563	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGGAGTGTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387204	464820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432425_432583_457278_457316_461601_462528_463125
889371	contig_2069_pilon	+	5691	10	Intergenic	novelGene_23181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	198.382346884887	1533	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	88	828	70041	89492	TRUE	30	GGAGTGACTTATATAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVDTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69953	101724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75926_76120_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407_92192_99560
889372	contig_19032_pilon	+	2125	13	Intergenic	novelGene_172551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	791	1243	159243	160649	TRUE	45	TATAATACACAACACCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKVFSFYFCFLLCSLLIVFIFWANYNSFSLEACKQAHFSPLGSSRHVCLIQNEISLLTGGDLNKLPKTLWGSLQQCVQFSSICHLLLKTCHHHFIHNGVRPKNVVFTRIFCCVFSNPGSFSGSWQANHHYNFTIFLLFRPLWSSDSIL	157035	164950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159393_159618_159746_160163_160284_160593_160862_161306_161416_161874_161979_162425_162696_164676_164751_164837
889373	contig_9345_pilon	-	1753	7	Intergenic	novelGene_24626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1956.1874200143	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	245	826	955353	947957	TRUE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001319	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_947187_947333_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
889374	contig_13244_pilon	+	2573	5	Intergenic	novelGene_86926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	542.924200510532	817	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGGTGGTTGCTTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239741	254484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_244930_245347_247045_247121_250878_250935_252541
889375	contig_15450_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_178578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACCCTTATCAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18392	16150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15450_pilon_-_16200_18400
889376	contig_7861_pilon	+	5808	3	Intergenic	novelGene_77399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	3120	3668	112653	113201	FALSE	35	AGAACTATGTATGTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQQLKQKADKNEEKTDKFMEKADKFMKNTDKKLEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQKLEIQKINNKISEIDSGKEVLRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIEVPERGENRKHKEDH	755	115341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_1770_2321_4228_112453
889377	contig_753_pilon	-	1829	12	Intergenic	novelGene_112968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_11	264.81357858871	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	255	1829	1210648	1183291	FALSE	70	AGCACAAAAGGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLGGCWMDVWELMSQECRDEVVLIDSSCLLETLETYLRKHRFCTDCKNKVLRAYNILIGELDCSKEKGYCAALYEGLRCCPHERHIHVCCETDFIAHLLGRAEPEFAGGRRERHAKTIDIAQEEVLTCLGIHLYERLHRIWQKLRAEEQTWQMLFYLGVDALRKSFEMTVEKVQGISRLEQLCEEFSEEERVRELKQEKKRQKRKNRRKNKCVCDIPAPLQISEEKEVSQEKETDFIENSCKACGSTEDGNSCVEVIVTNENTSCTCPSSGNLLGSPKMKKGLSAHCNGSDCGYSSSMEGSETGSREGSDVACTEGICNHDEHVDDSCVHHCEDKEDDGDSCVECWANSEEN	1211409	1183290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1183377_1183460_1183587_1184145_1184294_1185655_1185851_1186952_1187128_1188205_1188410_1192755_1192870_1196905_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555_1210749_1211255
889378	contig_15407_pilon	+	2016	2	Intergenic	novelGene_123058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	0	2503	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	551	916	450902	451267	FALSE	40	GGTAGAGAAATATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQARIKSTGNNEDAWALVPAALTPFVIPCLPRALHRVLPALPRANVTVPRRNRRGHFIEKWQPMSSWTRQQPGPRVWANRRFRNVGCARRRPLTKSNWKRQSRQTRAAGTLRHVGQPSF	449426	452367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_450795
889379	contig_12938_pilon	+	1229	6	Intergenic	novelGene_99727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1043.42397902291	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51977	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52033_78093_78180_81371_81459_83405_83470_84550_84635_85468
889380	contig_11316_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_122640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1380	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCGCAGCCGTGTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137500_138900
889381	contig_15839_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_136420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133199	131271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_131300_133200
889382	contig_12570_pilon	-	2793	1	Intergenic	novelGene_79364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAGGAAACATGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223072	220279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_220300_223100
889383	contig_5686_pilon	+	3986	3	Intergenic	novelGene_45260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93796	99204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94099_95053_97738_98204
889384	contig_6375_pilon	+	2577	6	Intergenic	novelGene_73070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	239.810758724458	999	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	252	758	700205	703083	FALSE	0	TGCTTTGTCCTTTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGNGLESEELEPEELLLEPEPEPEPEEEPPRPRAPPGAPGPGPGSGAPGSQEEEEEPGLVEGDPGDGAIEDPELEAIKARVREMEEEAEKLKELQNEVEKQMNMSPPPGNAGPVIMSIEEKMEADARSIYVGNVDYGATAEELEAHFHGCGSVNRVTILCDKFSGHPKGFAYIEFSDKESVRTSLALDESLFRGRQIKVTPKRTNRPGISTTDRGFPRARYRARTTNYNSSRSRFYSGFNSRPRGRVYRSG	699606	704902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_699825_700171_700287_700997_701066_701386_701494_702745_702834_702921
889385	contig_6079_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_160117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1117	1416	498924	499223	NA	35	AAAGATGGTCATTTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTASWCPATTTDYSDRDHKRGFWTELKKDVEQNSNTQKKHQIYWPKGDWGNPENMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIGQPHKTKQD	497807	499647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_497800_499600
889386	contig_7752_pilon	-	5041	5	Intergenic	novelGene_178397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1649	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGAGCCACCAGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268877	129522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7752_pilon_-_129779_130205_133655_133781_134074_151082_151409_268159
889387	SIRV6	+	1154	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	372	2	122	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	ATGTGGAAAAACATGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889388	contig_6102_pilon	-	2121	16	Intergenic	novelGene_32335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_15	310.335187964383	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	376	1827	1690955	1685481	FALSE	45	TATATACAGACTATATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQGSRCLCGQTCRLDTSEPPPALQPPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1692444	1685186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1690853_1690968_1691159_1691386_1692307
889389	contig_13863_pilon	+	2617	20	Intergenic	novelGene_41991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	448.858317817197	18	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1273	2415	64621	77619	TRUE	35	TTGTTTATATTAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLSFQKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMVSWKDRPKRICEEENQNESIFKFHK	55099	81607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76266_77545_77708_81493
889390	contig_9161_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_160642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAACATTGATATTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62567	65522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_62600_65500
889391	contig_3018_pilon	-	1945	14	Intergenic	novelGene_78847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	486.690891294093	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1248	698	1945	583440	561556	FALSE	60	GATATAGAAGAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFID	625084	561555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583598_585135_585179_600008_600194_624772
889392	contig_10737_pilon	+	3978	2	Intergenic	novelGene_133892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	411	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3514	3885	280575	280946	FALSE	50	GTAAAAGGAAGGACACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDWFKLRKIGVNIKLTTKETNKPTHQNKKQKHSGNTKSTTMKKMKRKYKKKNDSTRKMKWKKETNNNTKDIKMTARNSYLSIIMLNVNGLNAPIKRVAEWIKKHNPSICCLKETHLRHKDTN	268255	281039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_268390_277195
889393	contig_11846_pilon	-	5869	23	Intergenic	novelGene_105967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_16	136.024555695162	54	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1808	5427	24	5450	467861	290118	FALSE	5	GCACTGGGTGTGTTTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTNEGEISEESSSKVEQEDFVMEGHGKTPPPGEESKQEKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPTGSSPSPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPSTAPGANPSNAQVTGTLLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGPGASSNNGASSNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSALPGSTTSNKGKGSQCQSASSGSECNLGVWKSDPKSKSVQSSSSTTESSNGLGNWRNASGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQDGNSRKGALETDNSNSSAQVSTGGQASREQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMESKGMPFGMGLGNASRSTDAPSQSTGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKDREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSEVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTMWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAPSQSNQTKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTSSSWNENSSKDQGWGGGRQPNQGWTSGKNGWGEEVDQAKNSNWESSASKAVSGWGEGGQNEIGTWSNGGNANITSKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWSKPHQQQQQPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNGRPSNSNWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTGKSASVWSKSTPPAPDNGTSAWGEPNESSPGWGEMDDTGAPTTGWGNAPSNAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGSVTGTRHPSWEEEDDGGVWNTAGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNSDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVDKKFDVDKRAVNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGNHGLFGNSTAQSRGMHTPVQPLNSSPNLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	467884	289698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308786_319253_319380_324471_324609_326101_326148_327241_327317_329615_329792_332588_332748_334951_337301_339601_339944_352209_352232_356675_356764_437088_437157_467816
889394	contig_401_pilon	+	1907	11	Intergenic	novelGene_42812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	1406.7722488022	844	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	68	1180	1711949	1715475	TRUE	35	TCTTGAATGGAATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYNNGGGGGGFGGGSGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711881	1716433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1714325_1714476_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
889395	contig_10958_pilon	-	2030	8	Intergenic	novelGene_5381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_7	320.904397995822	88	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	173	1363	864848	839744	FALSE	10	CTTCACTAGTTGTTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNEEPLPKKVRLSETDFKVMARDELILRWKQYEAYVQALEGKYTDLNSNDVTGLRESEEKLKQQQQESARRENILVMRLATKEQEMQECTTQIQYLKQVQQPSVAQLRSAMVDPAINLFFLKMKGELEQTKDKLEQAQNELSAWKFTPDSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	872602	839076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692_841848_846744_846924_854419_854548_855728_855788_861055_861112_864818_864856_872437
889396	contig_8878_pilon	-	5326	3	Intergenic	novelGene_147876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	678	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3430	3846	758280	757864	FALSE	30	TGCACAATGGAGTACTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDTEKAFHNVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKQMANIILNGERLKTFPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQTGNKEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNRLELIKDSAEWQDTR	847073	756383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8878_pilon_-_758999_801750_802933_845544
889397	contig_17753_pilon	-	5515	10	Intergenic	novelGene_105061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3831	4196	139139	137754	TRUE	30	TTTGCAAAGTGTCGAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLVVALTTHCRSIVLKGTRTMLTFSPSSLKLSGYTRWWVVLLPTSASNPTVGALFILSTKSCSSIWEPYCDSFRLPELPTTAQRRQPTNSFSSIGSTSPRTTRNSSLMVLFRFLGFFSC	147531	45499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_45683_75017_75168_96132_96231_130841_131723_137746_137944_138963_139144_140837_140881_141747_141868_143091_143441_144217
889398	contig_11328_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_88433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAGTTTTTCCAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705385	708159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_705400_708200
889399	contig_500_pilon	+	1639	12	Intergenic	novelGene_31017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1063.50307634178	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	247	1224	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1490856_1490903_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
889400	contig_10986_pilon	+	1941	2	Intergenic	novelGene_71508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172212	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_173328_174229
889401	contig_4079_pilon	+	3511	3	Intergenic	novelGene_167479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127984	133129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_129399_130703_131162_131490
889402	contig_18859_pilon	-	6293	12	Intergenic	novelGene_150532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1145	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	5726	6100	48035	47661	FALSE	25	GCTTATCAATGCTGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTHRCKGKPKTPELIAGMAMDRYLCFSAKQRLSSTTFLNRYTHLGGSSAFHWGPTAWITWRYGRFPAFEMMALPGAILPFLFTIWSQSDWSSGPAAFERAAARPPLCLRLSFDAFTTTSTGN	93958	47467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_48309_50959_51196_51816_52036_54985_55068_57385_57536_63023_63082_63422_63598_67347_67552_67633_68234_69515_69650_90031_90207_90539
889403	contig_13074_pilon	-	4288	1	Intergenic	novelGene_153430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCTAAATACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413638	409350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_409400_413600
889404	contig_10500_pilon	-	3062	2	Intergenic	novelGene_41295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAATGTCTATGCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640221	1637105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1639651_1639704
889405	contig_12638_pilon	+	3091	18	Intergenic	novelGene_33109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_3	581.888900084477	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1687	2790	182987	199604	FALSE	50	AAAGGCAGACAGGAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170807	199905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_176021_176961_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
889406	contig_19402_pilon	-	1989	7	Intergenic	novelGene_80859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.176122684598	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	25	1431	193194	167101	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193218	166542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167752_167850_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
889407	contig_17108_pilon	+	2631	5	Intergenic	novelGene_109495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	477	1028	13842	17305	FALSE	40	GGACTTCCTAGCAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSPGFTYSAPSSLLLSVPSKLLSHTTVDLFLFFIFFPFSMGLSVPWIHSTLNHKDTLKPSARCGQQFCPSSGKRTGAMCQEESSWWGKFSLSVFFLLRETRALRNNATALLFRIPGHFWDETPLLTFGVCSKGKDRYCEGLTEISVSTIFTIPRRRISYRKRKMKCYSHVINYIIILKFRL	6901	18908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_6949_7968_8130_12652_12828_13748_13894_16805
889408	contig_15491_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_75929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAATGTGAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32058	30494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_30500_32100
889409	contig_6208_pilon	-	4101	5	Intergenic	novelGene_53022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	533.749473067656	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	744	1676	493640	490249	FALSE	25	CCCAGCAATGTCATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPSRPDKKQRTVNIENSRHRKQEQKYPQPQPHKREGKWHKHGRTNGRHMAHLEIELGQFPFDPKY	503098	487823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_490439_492897_493955_494031_494298_496608_496731_503057
889410	contig_9471_pilon	+	1310	7	Intergenic	novelGene_21760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	127.297115268004	128	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	561	1046	385781	401578	FALSE	20	TTTTAAATGCTGAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTLHTDVGDIKIEVFCERTPKTCENFLALCAGNYYHGCIFHRNIKGFMVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGKVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	384511	401842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_385008_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_401451
889411	contig_7963_pilon	-	5952	13	Intergenic	novelGene_58436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	638.164207360108	62	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1960	3030	123098	120628	TRUE	35	GAGGTTAAAATTCAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	127493	116516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563_126910_127309
889412	contig_5686_pilon	+	6805	4	Intergenic	novelGene_45340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	1477	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATGTTTTACTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117389	166359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120286_122626_123283_123336_123585_163354
889413	scaffold_8345_pilon	-	1816	5	Intergenic	novelGene_107018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGGGTTTCCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602747	582508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_583931_591069_591078_598123_598200_602215_602322_602543
889414	contig_10734_pilon	+	9864	33	Intergenic	novelGene_51068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	360.640260454844	1881	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	2240	4162	481400	495551	TRUE	10	GCGTATCTTGTGGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGDDDDFNPFRDESSEDDEDDPWLIRKDHKKNKDKKKKKSIDPDSIQSALLASGLGSKRPSFSSAPVISPAPNSASANSNTNSNSLITSQDAVERAQQMKKDLLDKLEKLAEDLPPNTLDELIDELGGPENVAEMTGRKGRVVSNDDGSISYESRSELDVPVEILNITEKQRFMDGDKNIAIISEAASSGISLQADRRAKNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVTAPEYVFLISELAGEQRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSRFNFDNKYGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPGEFFKDVRQGLIGVGLINVEDRSGILTLDKDYNNIGKFLNRILGMEVHQQNALFQYFADTLTAVVQNAKKNGRYDMGILDLGSGDEKVRKSDVKKFLTPGYSTSGHVELYTISVERGMSWEEATKIWAELTGPDDGFYLSLQIRNNKKTAILVKEVNPKKKLFLVYRPNTGKQLKLEIYSDLKKKYKKVASDDALMHWLDQYNSSADTCTHAYWRGNCKKASLGLVCEIGLRCRTYYVLCGSVLSVWTKVEGVLASVSGTNVKMQIVRLRTEDGQRIVGLIIPANCVSPLVNLLSTSDQSQQLAVQRKQLWQQHHPQSITNLSNA	452646	501958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_452711_460764_460818_461380_461486_463215_463526_466146_466245_469398_469496_471472_471634_472997_473132_473331_473423_474648_474811_476100_476237_476315_476422_476554_476709_477478_477666_478248_478347_479657_479810_481268_481467_481858_482027_482122_482296_483014_483147_484714_484851_485510_485624_485723_485796_486328_486429_487935_488011_489271_489419_489502_489598_489677_489771_492001_492140_492654_492732_494129_494324_495408_500782_501486
889415	contig_4845_pilon	+	3860	1	Intergenic	novelGene_53606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGTACATTCCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76986	80846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_77000_80800
889416	contig_7207_pilon	-	3494	3	Intergenic	novelGene_72028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	65.5	1005	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1187	2290	294505	291736	FALSE	15	TGTGTGTGTGTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISKTVAWVNEQLELGNERLLLMDCRAQELYESSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFIRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFALHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPGQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST	295691	290531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293496_294144
889417	contig_14445_pilon	+	1623	7	Intergenic	novelGene_137369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	439	junction_1	84.3795986401136	22	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	5	826	330880	360205	FALSE	15	GCGGCTGCTCCCACAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMVQIERNLFVLSICYKGVNAQFFPIFPPHLPAPPSLSCLFGFSLEPFSSYRDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGIYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	330875	361002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095
889418	contig_6175_pilon	-	6300	17	Intergenic	novelGene_16310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	2483	3358	1505229	1490025	TRUE	10	TCTGTGGATCCCTCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLEGQLDKGIWARPALLDQAFPKSIERERVKIYVISQKVCAVQGSLYHLSPGSPTAAWWGTGYSGWCPLYNARLLHSPAGNCQTHLPQVAYDGGVRPGVLCIHAHFAVFEDNKRERLVKPPVKTLAMQQRLGIGVHGHVRVILPVPLLSFIQRHEEGCLFHGIKRLLIFPTCKVRLAAPGPGHLSRSECRQLRFSRLGLRWIVQNPLYLLLDLPGLQQPAVMVEPDLEVAPSVVHNNVLAVFYVLDGICLLPRDPGSVEHPLPLGRAEWNGGSQKTKLGLSSSRSSWRL	1522833	1466191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1466945_1471079_1471222_1478853_1479025_1481903_1482006_1484446_1484586_1488389_1490062_1491421_1491509_1493858_1494055_1495309_1495497_1498490_1498606_1502645_1502746_1505075_1505234_1514156_1514293_1516650_1516803_1517889_1518004_1518665_1518761_1520852
889419	contig_8420_pilon	+	1934	14	Intergenic	novelGene_69330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_12	235.812306267044	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	43	1686	10943	51079	TRUE	25	GCTGAACTTGATTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10900	58691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
889420	contig_6137_pilon	+	7396	16	Intergenic	novelGene_59246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1352	junction_15	815.072910167482	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	2733	4208	1328176	1353702	FALSE	20	GGTGGCAATGATCCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1317108	1356890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
889421	contig_7839_pilon	+	761	6	Intergenic	novelGene_45720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	698.006131778224	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	50	760	952545	954373	FALSE	65	AGGACAAGAAAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSG	950900	954374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950908_952502_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238
889423	contig_5434_pilon	-	2186	9	Intergenic	novelGene_74677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	160.096796891755	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	54	1169	351427	325255	FALSE	15	CAATGTTTTCATCTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFPRWYFAVISVSGVFAVTFSVVFAYVADITQEHERSMAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQIMKFSPESVAAFIAVLGILSIIAQTIVLSLLMRSIGNKNTILLGLGFQILQLAWYGFGSEPWMMWAAGAVAAMSSITFPAVSALVSRTADADQQGVVQGMITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	351480	324237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326885_331417_331516_333049_333163_345064_345137_345931_346046_347592_347812_350267_350383_351413
889424	contig_3382_pilon	-	11308	18	Intergenic	novelGene_123994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2174	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	9441	9794	88864	82551	FALSE	30	GTAATGATGTAATGATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQVSLCQLATMHLYDDFIGTWEDTGAQLGDEGPRPGLHGLGAVVDLRAVMPMPVPPLLHCQGGAMENCTAGTVIQVNVKGIMFFYSNTAKIKGGKKSQYVNKLKILTKIDRLEFS	129590	81036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_82720_86825_86945_88798_88959_91152_93631_97714_97804_98981_99089_105989_106082_108765_108856_116175_116386_117740_117868_118059_118215_119463_119559_120171_120322_120456_120670_121874_121957_122477_122755_123289_127890_129009
889425	contig_14333_pilon	+	5368	13	Intergenic	novelGene_49076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	396.779421999456	1339	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	466	2307	262547	294370	FALSE	40	AATACCTAGATATTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGLASRDQILGSSDSEGNFETPEAETPPIRSPLKGSCDSSLGLTGPGAKTQESQEDDEQLVAEVVEKYSSETCPRPSENEVPQQAIASHSVKDFKEEPEHDTSKISIVRPFSIETKNSTDVPAALGTKTAHGFVTAVLEEALLSRAPEAIQDKAMTEGNMGVTLEASTETDVKTLNSCSESVPSRSKLRKPKPVSQRKKTISGEFSETETMVEGTPLPKAPYQVSLDELDENTYSSLIGGARIQKPPTEVKETSSTPSSDTNDSGVELLEESRSSPLKLEFDFTEDVENVEAKKALPRKLGRKLGNKLTPKAQKDGISKPVGGKGVEQPADIKAEDTPVLHTSSKLDPSQWDNPNFNPFGVHSTLQNSPSLSSKSSYHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTCNDFRSTTGNHVNEILESPKKAKSRLITSGCKVKKYETQSLALDPCSQDEEAVISQISDISNRDGHATDEEKLASTSSGQKLAGPEVKGEPEEDVEYFECSNVPVSTINHAFSSSEAGLEKESCQKMEKDEPAVPGLVESSVEKTPVSVACGDESPLDGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTNMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD	227211	297431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_227241_228217_228346_262238_263362_268099_268161_269945_270154_274012_274066_282470_282597_285902_285980_287700_287745_288874_289036_290056_290164_292809_292931_294301
889426	contig_19032_pilon	-	2489	14	Intergenic	novelGene_172545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1008.35249073036	68	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	225	2171	166531	157239	FALSE	20	CCTGGTGTCTTTTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166755	156920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_166371
889427	contig_5229_pilon	+	1915	4	Intergenic	novelGene_117692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	62.7587975240656	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	599	1417	466703	472935	FALSE	30	AGATTGACTTAGTACTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFPPLLLATSLLGLVLLALLLYLWHRSQHWYLIIWNELVVQPVRNMLMGDSKEQRILRYVQQHAQSGDPQSVLNAIDTYCSQKEWAMNVGDEKGLIVDEVVRERNPMVLLELGAYCGYSAVRMARLLPHGSHLLTIELNPAFAAITQQMVDFAGLQDKVTVLVGASQDIIPQLKKKHDIDKLDMVFLDHWKDRYLPDTLLLEECGLLQKGTVLLADNVICPGAPDFLAHVRGSDRFECTHYPAHLEYRQMVDGLEKAIYVGPGLGGPAQP	466104	473433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_466989_468072_468267_468592_468725_472728
889429	contig_12464_pilon	-	2849	8	Intergenic	novelGene_68678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	659.94835914236	65	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	202	1251	242297	181993	FALSE	10	TTGGTTGAACCCTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENVILNL	242566	180394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_182007_182083_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_234642_234945_242051_242303_242370
889431	contig_15219_pilon	+	6012	8	Intergenic	novelGene_40817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	220.031166623536	1510	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	125	1213	19617	24591	FALSE	30	AGGATGTGGTAGACATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19492	29390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
889432	contig_15666_pilon	-	2132	4	Intergenic	novelGene_70123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	804.016721771935	119	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAATGGACTTTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110772	106242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108734_110621
889433	contig_12279_pilon	+	2493	5	Intergenic	novelGene_50103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1843.62677554325	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	203	772	68297	69754	TRUE	10	TGGTTGCTGCTGGCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGKWTYLFCSARPDDIAVITWSLCPVPAEANPSKVNPSAIYAGTSSQIIPFRVHSILPRLMKSPTSVSISQKRVQGKHLMYLLLWYLLQIFDIHMIAEELLLI	57549	77511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_58288_58438_68290_68475_69362_71122_77157
889434	contig_8377_pilon	+	4198	29	Intergenic	novelGene_34907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	2835.7210471312	4	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	2088	3401	183306	197939	FALSE	50	GAAACAAATATTATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68043	198736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164503_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182900_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
889435	contig_10642_pilon	+	4636	5	Intergenic	novelGene_78734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	651	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCCTCGATCTCCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273292	1292184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1273358_1276023_1280000_1288347_1288657_1290369_1290608_1292136
889436	contig_6795_pilon	+	3021	3	Intergenic	novelGene_27674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	554	943	54149	56790	TRUE	35	TGGAACACCAGACAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTSKKKGQNQNINYTTQTEREQQKKPTATRHMRQCLRSPAIREMQINTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGKTGTLMHCWWECKMIQLFWKMIWRFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPRETRVVT	53595	71318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_54241_56492_56857_69306
889437	contig_3424_pilon	-	3666	1	Intergenic	novelGene_55495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	618	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGACCATCACCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160750	157084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_157100_160800
889438	contig_4232_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_63313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468084	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
889439	SIRV6	+	1117	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	399	12	95	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	241	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	20	GAGACCTATTCGTGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889440	contig_4426_pilon	-	4038	7	Intergenic	novelGene_15349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	596.705585322909	7	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	133	621	171430	10019	TRUE	35	AAAGCCATCCCCTCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEIARVSAARLPGDGRDWDARSRARRRPGPEDAEPWLRPSPEQMMAIRELKVCLLGDTGVGKSSIVCRFVQDHFDHNISPTIGASFMTKTVPCGNELHKFLIWDTAGQERVKELKEHGPENIVMAIAGNKCDLSDIREVPLKDAKEYAESIGAIVVETSAKNAINIEELFQGISRQIPPLDPHENGNSAGINIGNPTASGTRRCC	171562	6513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6670_6757_10117_25070_25181_71325_71406_97613_97696_110145_110226_171391
889441	contig_7207_pilon	-	1889	3	Intergenic	novelGene_72029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTGTGTGTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294998	290534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293309_294866
889442	contig_18208_pilon	-	459	3	Intergenic	novelGene_176191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3047	junction_2	856	26	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2	415	155499	154421	FALSE	20	GAAATGCTTGTGTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS	155500	154376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353
889443	contig_10404_pilon	+	2054	5	Intergenic	novelGene_138677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_3	2512.7879312628	21	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1101	1442	1098040	1099868	FALSE	20	CCAACTGTTGCTCGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1090659	1100480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
889444	contig_17144_pilon	-	2690	18	Intergenic	novelGene_29444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2063.13135875063	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	95	1441	179764	170834	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKHLGGLGLPQLPASGLRD	183176	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170888_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
889445	contig_14666_pilon	+	2067	5	Intergenic	novelGene_39575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_2	1764.62141832179	30	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	637	1776	483256	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477250	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_477933_478265_479834_479944_483205_483317_483861
889446	contig_1263_pilon	-	2840	9	Intergenic	novelGene_170400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1008.68967446633	2254	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	395	1711	65303	55502	TRUE	25	ATTCTGACAATACCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76810	53141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53516_54746_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_75483_75612_76564
889448	contig_10134_pilon	-	1330	2	Intergenic	novelGene_16265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGAGCACCCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39594	37479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_37774_38558
889449	contig_8377_pilon	-	721	1	Intergenic	novelGene_35054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTCATACCATCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93212	92491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_92500_93200
889450	contig_18162_pilon	-	2747	3	Intergenic	novelGene_122326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGGAGTTGTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
889451	contig_1719_pilon	-	2783	7	Intergenic	novelGene_87265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_3	263.420871526072	972	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	214	1503	358441	352154	TRUE	5	TTTGTTTTAGTGTTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRFLERILAGEIQKAHGEEDLKWNLNGEEVHQKKTGDVKDGTRKGPLEGMKTDRGAWGTMKRVSLLSDQRTIGFPGEAQMKIVALDVVLMKIASPAEGWMTTGLPGVIQMTTGLPDELVMKIGQAGVMLMMTDHSDEGWMMTEEPGEQLMRTEDQDVGWMRTGGRGEEVLMMSEHPGAVVMMIGVPGGAWMRTGVPGGAWMRTGVPGGAWMRTGVPGGAWMRTGVPGGAWMTTGVPGGAWMRTGVPGGAWMTTGVPGVGLMMTEDLGGIRMMIEFPGVVQTMTGGLGEALMMIGSRDVLMTIGFPGEVMTPDLVPGDHLASQVDGEIEKKPEKTVGVHAKNQDYQKTLNGIEKKKGIEIIQIGTRTTGILSEKGTETESETRIASDDLGMRVAGDEDQLRNLRAGEIRVAGMIGIGMTVVVRETTAVI	359095	349836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_351057_352093_352276_353049_353249_355121_355988_356639_356723_358421_358607_359047
889452	contig_11896_pilon	-	2118	10	Intergenic	novelGene_88005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1194.81600422434	17	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	18	1886	181620	132219	FALSE	35	AACATGAACACATGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVLPLWSDTLIHLDGDGGFSVSTDNRVHIFKPVSVQAMWSALQSLHKACEVARIHNYYPGSLFLTWVSYYESHINSDQSSVNEWNAMQDVQSHRPDSPALFTDIPTERERTERLIKTKLREIMMQKDLENITSKEIRTELEMQMVCNLREFKEFIDNEMIVILGQMDSPTQIFEHVFLGSEWNASNLEDLQNRGVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAKKHGSKCLVHCKMGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLASKQRHNKLWRSHSDSDLSDHHEPICKPGLELNKKEITTSADQIAEVKTMESHPPIPPVFVEHVVPQDTNQKGLCTKERMICLEFTSREFHAGQIEDELNLNDINGCSSGCCLNESKFPLDNCHASKALIQPGQAPEMANEFPDLTVEDLETDALKADMNVHLLPMEELTSRLKDLPMSPDPESPSPQPSCQAEVSDFSTDRIDFFSALEKFVELSQETRSQSFSHSRMEELSGGRSESCRLSVVEVAPSEVTADDQRSSSLSNTPHASEESSIDEEQSKDFFRIWKTSPEDSLTDCYLCPRPPQTFMLMFY	181637	131986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_132318_141210_142046_151206_151408_154471_154619_160037_160085_173160_173290_173423_173518_177241_177437_180738_180805_181564
889453	contig_10734_pilon	+	2282	11	Intergenic	novelGene_51178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	190	junction_10	389.278255236534	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	297	1394	1129441	1142903	FALSE	35	CAAGCAAACTACGTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123674	1143791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127682_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
889454	contig_14288_pilon	+	1935	3	Intergenic	novelGene_153845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524470	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_525078_563235_563912_660212
889455	contig_9177_pilon	-	7167	50	Intergenic	novelGene_32612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_37	863.94748893677	52	46	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	4335	6857	9494	2152	FALSE	25	CAGTCCCCACAACTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	24035	1841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295_10479_10572_10714_10959_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963
889456	contig_5961_pilon	+	3062	15	Intergenic	novelGene_144140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	499.511501164806	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	924	2775	122	2896	175005	214246	TRUE	25	TGACTGCTGGTGAATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTEDVLTLLRAECALSPGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	174883	267856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_175060_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060_214260_267703
889457	contig_11630_pilon	+	4472	1	Intergenic	novelGene_147181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	295	888	2404	3291	124642	125529	NA	50	TATAAAACAATATGCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPKDKLDNWDLLNIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYKKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMTNRYMRKCLRSVATREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTPMYCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDSAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRGKQPRCPSTEEWINYGAYTQWNTMQQERTTKNL	122238	126710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_+_122200_126700
889458	scaffold_9100_pilon	+	1657	8	Intergenic	novelGene_83258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	349.780105850775	180	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	113	1111	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
889460	contig_11548_pilon	-	2252	10	Intergenic	novelGene_66731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1670	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAGGGAGGGGGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120481	63629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_63880_84700_84810_86979_87079_101977_102178_102442_102573_112801_112902_117681_117854_118973_119121_119346_119399_119488
889461	contig_3155_pilon	+	1883	4	Intergenic	novelGene_26386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1141	junction_3	654.274322351786	671	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	56	562	258156	261211	FALSE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258100	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082
889462	contig_10307_pilon	+	2140	5	Intergenic	novelGene_170266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.054536441747	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	362	1312	389628	391738	FALSE	20	TCTTAAGTTGTGAGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSTKRHPPRPAATLRKNKKMRKKSMLFLWKRGSPLPKGQKRGHTLPEATANLLTVRWSSSDAMSPPISTTTQPHPPPGRTTPPPRGRSWTVAES	387435	392566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387528_387593_387851_389615_390296_390341_390382_391495
889463	contig_4305_pilon	-	770	3	Intergenic	novelGene_136677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	814.5	25659	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514702	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514379
889464	SIRV3	-	711	4	Fusion	SIRV3B_SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	-966	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	33	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCAAGTATTTGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	1966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Fusion_SIRV3_-_2005_4567_4784_6061_6334_8755
889465	contig_6031_pilon	-	2303	3	Intergenic	novelGene_56755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1563	junction_1	472.5	100	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	107	475	257696	256672	TRUE	10	GTTGCCCTGATGACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQVRRPPALCPF	257802	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_256814_257469
889466	contig_11417_pilon	+	2957	1	Intergenic	novelGene_103332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAGGTCATTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585876	588833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_585900_588800
889467	contig_10930_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_37071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1736	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	287332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_289100
889468	contig_6048_pilon	-	3143	7	Intergenic	novelGene_73246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2436	2741	1952677	1944143	TRUE	10	GGTCTCTCTACTGGCCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFDFQILLNFRVAGLAEIAQVDSAWHYFNRVWLKCIQFLRHPDDLLGPEEVIHGREELIAPSQDVDGAAGEVGQDSATLNGRSKHQSLIMIVRIFIIVVF	1961216	1917122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1917261_1929982_1930088_1940521_1940583_1944044_1944184_1949118_1949262_1952555_1953110_1959213
889469	contig_10734_pilon	+	2623	2	Intergenic	novelGene_51136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAACCATGGTCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852478	855154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_853750_853802
889470	contig_10990_pilon	+	2423	19	Intergenic	novelGene_7445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	402.201380675507	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	455	2401	722379	752144	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708540	752166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
889471	contig_17195_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_168973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCTTCTCCACTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55152	56845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_+_55200_56800
889472	contig_4232_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_63325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTCGCACAGCTCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466945	468134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466900_468100
889473	contig_5623_pilon	-	1453	3	Intergenic	novelGene_154816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	273	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTATGTCTCCACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211112	205941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207235_210755_210808_211004
889475	contig_10861_pilon	-	2123	3	Intergenic	novelGene_39289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	667	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	218	610	1355687	1354790	FALSE	20	TGAGTTGTATTTCTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILSVEAEGGGQIGDAGVVLSCLVGARGLRSFRASSLPGRGGRLRPRVGAAAAVVPSLKSLGLLSDLCAEETQMLASAPRLNSADWPMKTSVFRQRKGSVRKQHLLSWAWQQGRLFIRKRKEDMVIIHQQLHGRPCKMGGRTKYIFQIIKIGTLAYQAPAYFLSLKLTRTMLEPNLVSHHHQVFFLNHQAIGFLFPLILLIKK	1356827	1353276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355061_1355565_1355727_1356649
889476	contig_14526_pilon	-	4790	9	Intergenic	novelGene_111201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	558	102	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	983	1405	413355	412933	TRUE	60	AAAGAAGTTAGAGAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFETPEVMAIPFETEAARLLVSLVSSASASCGLSALHTCICPAGASVPKLSSSTSKCPEAPHSSRKPSAHRHSAPSLCGLASLAPPISAQRDCTLPGSLLLTGTQLSRSMGRLQCHLSQVSWFCCCWFSAAAASLLL	414337	112545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_112933_115126_115408_205128_206192_213942_213947_274925_275682_302692_302799_303065_303257_391848_391852_412338
889477	contig_14871_pilon	+	2182	13	Intergenic	novelGene_63704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	788.181711106152	4	84	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	161	1588	201945	233218	TRUE	5	CTGTCTGTGTGGCCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	194902	234216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_194925_198171_198245_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233451_233854
889479	contig_11896_pilon	-	1725	1	Intergenic	novelGene_88035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATTTACCCAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159000	157275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_157300_159000
889480	contig_11548_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_66800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGTAGAGCATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169911	167819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_167800_169900
889481	contig_835_pilon	+	4935	3	Intergenic	novelGene_152148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	4608	4934	376145	376471	FALSE	40	GACACAGAGAGGATCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNAKINSQPEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRINGIEDKHLATTQLAEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNPRVIGVPERGENR	193999	376472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_194175_194599_197215_374327
889482	contig_7057_pilon	-	996	6	Intergenic	novelGene_123223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_5	24.749949494898	385	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	470	838	538082	537131	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539739	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538404_539420_539484_539654
889483	contig_12919_pilon	-	5919	6	Intergenic	novelGene_75867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1942	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	5538	5858	274198	247200	FALSE	15	CGACGAGCCTCGCGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHFIHRKLVKDGSFPCIIQPNNDNFVLLVIEQSPYPGEENSHSRAADPPPATRAAWPPLAQAEAEERDVPEPPPLLLLLLLLPCLPPVRFQGTGGRPKPRPPCRA	306808	247138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_247437_273722_273785_274176_274323_276178_276263_298075_298229_301632
889484	contig_4924_pilon	+	3276	3	Intergenic	novelGene_84638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAACAGGTAACTAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58170	62223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_59046_59688_62032_62165
889485	contig_8538_pilon	+	1896	2	Intergenic	novelGene_4635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8832	junction_1	0	42	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	67	1896	841232	843061	FALSE	10	GGTGTTCCCTCTTAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRGRCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840311	843061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228
889487	contig_6929_pilon	+	1109	5	Intergenic	novelGene_139404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_3	4883.60297321557	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	330	710	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	126550	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
889488	contig_6163_pilon	+	4252	3	Intergenic	novelGene_103867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	285	junction_2	184.5	44	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	145	411	521450	521716	TRUE	55	ATTTGGGAAACAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAITLPGSAGPPGFTQAQTPAATISESLRLSPRCPPSALRRPSSQAVMLEALGSLPTQMVRAGQGTARDPCTPLLSPAAPNPCLKTDPVQCGYLPASSLSCASLVLFSLPRRGSHCLCSVRMLSCPGKPRIGLLA	521305	526142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521895_521976_522064_522566
889489	contig_5005_pilon	-	4442	2	Intergenic	novelGene_84313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	776	junction_1	0	1088	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACGAATTGTTATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518558	511512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515555
889490	contig_9653_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_48337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAGTATTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071270	1073915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1071300_1073900
889491	contig_10000_pilon	-	2491	14	Intergenic	novelGene_139307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	364.524883283082	16	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	75	1451	310672	162621	TRUE	15	CAAGAGTGTGGTGTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDDSSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQEMEEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQSTKTPLSCSQCLKVPGRKSPKRKRAKMKAMRRRKRRMKRSLSLRRNLLR	310746	158966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_273234_273441_280591_280703_281388_281456_283019_283184_284782_284931_285837_285939_286746_286805_287001_287133_291412_291467_306629_306801_310657
889492	contig_7512_pilon	-	724	3	Intergenic	novelGene_153188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	43	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	161	682	80122	76348	FALSE	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQMDSKRGLPCYQSRFCSMLPVGVASTQGAYFLAHSGLIQQSSALTKRMSRQTLTDSAVFKNSWCQEWDPKRFTNIPQSTCWTQTWCHKSSFSLLSPRSIWRSSRYKREKRAETHGKLILPRKQCREHSVSFGPEVPVQRSSQTKGRLMTLSFLQSRWRKCSPGADDLNLDL	80282	76305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7512_pilon_-_76553_78808_78949_79945
889493	contig_4962_pilon	+	2083	3	Intergenic	novelGene_107387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATCGACTCGATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211841	257079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_213025_220908_221617_256887
889495	contig_9463_pilon	-	3732	5	Intergenic	novelGene_83806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	186.829300432239	490	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1202	1513	33533	33222	FALSE	55	AACGGTGAAAATGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLGAEADWPPPDLAKGYMKQDPPGMTLLPSGAPTGQWNQPAEEWPLLGLTSCGDLGTSDWSFVPDLAPVDCVAASCSLLSSFDSDLVALPLISSLHANEDPG	42286	31002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_34158_37753_37876_39339_39491_41370_41556_42167
889496	contig_19692_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_174888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	556	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	385	927	68407	68949	NA	25	CTGTATATATTTTCAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNKLWITLQRVGIPEHFIVLMRNLYIDQEAVIRTEQGDTAWFRVRKGAHHGCILSPYLLNLYAEQIIQEAGLYEEEWGIRIGGRLINNLHYAADTALLAESEEDLKHLLMKIKVHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINTCGSSSQEIKRCMIASIV	68022	70427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_68000_70400
889497	SIRV6	+	658	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	54	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGGGAAAGAGCAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10291	11327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11093_11257
889498	contig_15135_pilon	-	8907	46	Intergenic	novelGene_119851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	64	junction_45	416.483797500271	715	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1296	3891	4412	8302	94763	25230	FALSE	25	ATTTGGTTTTCTCATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEISTPVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRTYKERTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGFVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQELCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESIQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDIRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYKEPEKHSQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFAVNTSNQGSRDDLSTNGGFQTQTTVKHNSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRVSLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISEETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHTTTSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTILDLLSLFTQVHQRQLQQSDCQNSMMKRVFDTYMLFFQVNQSAAALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNTNRFVFETPFTLSGKKHGGVEEQCKRRTVLTTSHFFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQLEYQEELRSHYKDMLSELSAVMNEQITYRDDPSKRAVERTCPRVISKATPTLPAVSVSSSAEVLSPQHLTHL	122822	24624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_25374_28489_28629_28803_28905_31519_31711_34145_34357_36726_36874_44525_44640_44777_44901_46298_46406_49385_49485_49803_49862_51681_51898_53360_53472_54019_54203_55059_55198_57048_57162_58967_59093_62133_62236_62839_62888_63101_63169_63261_63377_63466_63589_64779_64889_65955_66073_66198_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92251_94677_94797_95329_95423_95825_98713_100999_101066_101588_101777_103604_103685_105120_105244_110796_110880_113400_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
889499	contig_6175_pilon	-	3402	10	Intergenic	novelGene_16324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	457	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2699	3013	1505229	1495460	TRUE	25	CCACTGGGCAGAGCAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLEGQLDKGIWARPALLDQAFPKSIERERVKIYVISQKVCAVQGSLYHLLTLLRDLPLQPGGVRDIQVGVPFTMPVFCIAQLETVSGHDILSKHWPCSRDLA	1523049	1491468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1491509_1493858_1494056_1495307_1495496_1502628_1502747_1505068_1505234_1514156_1514294_1516651_1516803_1517889_1518004_1518665_1518761_1520852
889500	contig_13481_pilon	+	2276	5	Intergenic	novelGene_119560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	573.908257041141	280	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	62	667	1568681	1586220	FALSE	20	CTATTCCTTATGTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568619	1587829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576641_1576791_1578050_1578132_1586080
889501	contig_4295_pilon	+	2852	1	Intergenic	novelGene_169980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	A	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122393	125245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_122400_125200
889502	contig_14322_pilon	+	3580	4	Intergenic	novelGene_115651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2958	3293	460717	461052	FALSE	35	AGGTCATGTCTGAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELEKQKGRTYSISQAKRNEEKIQASSCNSEGFYGENIKGRRKHQKKMEGIHRVTIPKELVDVQPFQEVAYDQEPTVLKEEVQAALKALGKTRLQELTEYQLRCFSK	450510	461339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_452056_452115_452565_455890_456015_459877
889503	contig_2739_pilon	+	2086	3	Intergenic	novelGene_165831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	426	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	283	372	65967	66056	TRUE	85	AAAAATAAAAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKTAWYWYNNRYIDQQNRIENPEVISSTYEQLIFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTACKKINSKWIKDLNIKSKTIKIMEQKIGTMLGALIHGINRIQTISNNAQTT	65684	152070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_67634_106276_106359_152015
889504	contig_366_pilon	+	2880	2	Intergenic	novelGene_51553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAATTAAATCACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596460	768106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_597226_765991
889505	contig_13740_pilon	-	3266	12	Intergenic	novelGene_34629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4190.40816765745	29	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	221	1126	161718	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165347	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_156929_157015_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162027_165237
889506	contig_5472_pilon	+	3373	1	Intergenic	novelGene_130037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	6	305	417699	417998	NA	40	GTGGGAAAAATATGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMGKGNGHFTKENIQVANRHMRKCSLSLAIRKMQIKTTMRYHLTLALLARIKKTGNNKCQRGCGEIGTLTHCWWECKMIQPFWKMRWRVLRKLEIEIPYD	417693	421066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_417700_421100
889507	contig_2703_pilon	+	1649	9	Intergenic	novelGene_101776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	628.846252572916	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	190	783	602068	610870	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	596359	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
889508	contig_10437_pilon	+	4196	15	Intergenic	novelGene_38205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	633.406597982171	1396	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	34	1305	229668	232823	TRUE	15	CGTACCCCTCCTTGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKVKAPRLQLGEEQRAGPWPTAIPFSTTTIIRMTEPWSPLPPRWMHTAKDCPALPTGSLQALGRKEREESSLCCFVTRSPLNQILTNPVLT	225739	237122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232329_232564_234191_234334_234425_234684_235444_235710_235850_236586
889509	contig_7342_pilon	+	2389	16	Intergenic	novelGene_71233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	300.520629722635	1445	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2007	382	2388	723009	749131	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPEEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVSSSSGRNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCINHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSERKECEVKKEKSSSVDRHHSVEIKTEKTIIKKEEKSERKEEKKPGDIKKEEKDQDELKPAPPSRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSKSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHERKEKSRLQRERMELDCQRQRLERERWERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEKLRYEQERRPAFRRPYDVDGRRDDVYWPEGKRAALEDRYRSDFPRPEHRFHDFDHRSRGQYQDHVVDRREGSRSMMG	716950	749132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718459_722958_723168_726444_726508_727543_727572_728492_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034_738166_739511_739604_743088_743226_744985_745280_746617_746759_749103
889510	contig_13481_pilon	+	12143	15	Intergenic	novelGene_119308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	192.238478596407	2109	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1162	3489	694	4182	414928	475322	TRUE	10	TGACCCTCCCCGGCCACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSYTQSSPGALNPSSQAGVESQSLKTKKDEEPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVHVPVSSPLTQHQSYIPYMHGYSYSQSYDPSHPSYRGMPAVMMQNYPGSYLPSSYSFSPYGSKVSGGEDADKARASPSVSCKSSSESKALDILQQHASHYKSKSPTISDKTAQERDRGGCGVIGGGGSCSSVGGTGGGERSVDRPRTSPSQRLMSTHHHHHHLGYSLLPAQYNLPYAAGLSSTAIVASQQGSTPSLYPPPRR	248564	494360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_251968_252071_283655_283932_284302_284530_414927_415154_466806_466895_468621_470963_471858_472226_473981_474158_474390_474608_475248_482680_482910_482997_483788_483964_485389_485549_494176
889511	contig_16204_pilon	+	3990	10	Intergenic	novelGene_154514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	457.493412217293	935	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	44	1471	369321	395754	TRUE	55	AAAAAAAAAAAGCCCGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSWLRLKQEEVAPMGSQQPPLTTVYLLGVLEIQIRLSNSSSRCQGRLEVRHLDRWLSVCSESWGHSRYHEEDATRLAKNLCPQLRCGRALELALSLFSSTQNKVLCHGSLGSFSNCTSQGASPCRTLILICLEPTTAAPLPTSPPPTTTPEPTAPPRLQLVEGPGGLSCAGVVEFYHGSLGGTISNGTQNLTQGLGDLICRHLRCGSFLRHLPEATLKATPDTRQEWMQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNISFHRNHTATVRSQVENRTASHVDNEYSQPPRNSHISAYPALEGALHRSSAQPDNSSDSDYDLHGTQRL	369277	399279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_387991_388298_388738_388802_389404_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394977_395098_395665_395758_396763
889512	contig_7151_pilon	+	2904	1	Intergenic	novelGene_40805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1686	2057	563678	564049	NA	65	CCCAACAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMVKRSVYQEDITIINIYTPSNRAPKYIKQTLTALKREIHSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDMY	561992	564896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_562000_564900
889513	contig_9051_pilon	+	3806	4	Intergenic	novelGene_170805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	920	1288	1042239	1042607	FALSE	10	AGAGCTGGGCCTTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETEFGTERVGGCSNRSLKCGSGFETVNGYRISSSRETAVAEERQWQRKTAAEPGDQCEMAREPTHGVRELSASAQEASWRSGVPPGTYQWSYRALEHLPQWGRCGHEARGAEKPRNQKTS	1032670	1045125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1032746_1035644_1035709_1038812_1039339_1041984
889514	contig_5145_pilon	-	3564	12	Intergenic	novelGene_131424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	94.5500872990843	864	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	696	1370	925621	916397	FALSE	25	CTGAAACCTCTTCAGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947088	914202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
889515	contig_6020_pilon	-	2283	5	Intergenic	novelGene_155566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_4	540.498843662038	163	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	323	778	349599	293623	FALSE	55	GACTAAAAATAATTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVS	349921	292117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
889517	contig_4759_pilon	-	1714	4	Intergenic	novelGene_106329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.297723388781	433	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	49	453	589639	587401	TRUE	20	TTGGAGCCTGACTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEMYQTPMEVAVYQLRNFSISFFSSLLGGDVVSVKLDNSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	589687	586090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_586463_586511_587632_588757_588810_589517
889518	contig_4924_pilon	-	5809	1	Intergenic	novelGene_84640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAACTATTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64911	59102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_59100_64900
889519	contig_4232_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_63276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAGAAAATCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466548	465997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466000_466500
889520	contig_610_pilon	+	5245	1	Intergenic	novelGene_76716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAGAAAGAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212709	217954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_212700_218000
889521	contig_2890_pilon	+	2071	1	Intergenic	novelGene_60294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1329	1628	363714	364013	NA	70	AAAAATAGAAAATTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLPKTESSTARWCLATTTECSDQDHNRGFWTELEKDVKQNSNTHKKDQIYWPERDWRNSETMDPKHPFSSVVKSLLRFTVQPGTGQPHKTKQD	362385	364456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_362400_364500
889522	contig_3602_pilon	+	2134	2	Intergenic	novelGene_60621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	81	422	912847	913188	TRUE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	912766	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_913459_913498
889523	contig_7057_pilon	+	895	8	Intergenic	novelGene_123338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_7	568.913859553304	171	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	77	547	938907	943233	FALSE	15	TGTCACGCCTGTTCCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	938678	943581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
889524	contig_6079_pilon	-	2300	1	Intergenic	novelGene_160085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	777	1199	404751	404329	NA	45	CAACATAATAAAGGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITMINIYTPNDRAPKYITQNLTALKREIDSSTIIVGDFNTPPSVKDRISRQKLNKDTEDLKATINKLDLINIHRTLHPTAAKHTLFSHAHGMLYRIDHILGHKATLNKIENIELIQSIFSDHSTIKVEIN	405527	403227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_403200_405500
889525	contig_5643_pilon	+	1379	11	Intergenic	novelGene_38780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2020.36461065819	5206	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	71	1006	233973	237822	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720
889526	contig_9668_pilon	-	5684	9	Intergenic	novelGene_58218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	958.703934682131	136	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	265	1248	585955	545572	FALSE	40	AGGCAAGAAGGCAATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKVCCKKSLI	610495	541135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_605301_605374_610344
889527	contig_13026_pilon	-	1178	10	Intergenic	novelGene_146291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	114.254859150524	19	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	378	788	14211	6494	FALSE	10	GACCAGGCCTGTGCTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28140	6103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17238_22325_22370_22975_23008_28000
889528	contig_5758_pilon	-	8432	22	Intergenic	novelGene_119048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	758.033483366508	1968	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1163	3492	676	4167	93038	27391	FALSE	20	AGCATGGATTTTGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRGHGADVKCVDWHPTKGLVVSGSKDSQQPIKFWDPKTGQSLATLHAHKNTVMEVKLNLNGNWLLTASRDHLCKLFDIRNLKEELQVFRGHKKEATAVAWHPVHEGLFASGGSDGSLLFWHVGVEKEVGGMEMAHEGMIWSLAWHPLGHILCSGSNDHTSKFWTRNRPGDKMRDRYNLNLLPGMSEDGVEYDDLEPNSLAVIPGMGIPEQLKLAMEQEQMGKDESNEIEMTIPGLDWGMEEVMQKDQKKVPQKKVPYAKPIPAQFQQAWMQNKVPIPAPNEVLNDRKEDIKLEEKKKTQAEIEQEMATLQYTNPQLLEQLKIERLAQKQAEQIQPPPSSGTPLLGPQPFPGQGPMSQIPQGFQQPHPSQQMPMNMAQMGPPGPQGQFRPPGPQGQMGPQGPPLHQGGGGPQGFMGPQGPQGPPQGLPRPQDMHGPQGMQRHPGPHGPLGPQGPPGPQGSSGPQGHIGPQGPPGSQGHIGPQGPPGPQGHLGPQGPPGPQGMQGPPGPRGMQGPPHPHGIQGGPGSQGIQGPVSQGPLMGLNPRGIQGPAGPRENQGPAPQGMMMGHPPQEMRGPHPPSGLLGHGPQEMRGPQEIRGIQGPPPQGSMLGPPQELRGPPGSQGQQGPPQGSLGPPPQGGMQGPPGPQGQQNPARGPHPPQGPIPFQQQKTALLGDGPRAPFNQEGQNAGPPPLIPGLGQQGAQGRIPPLNPGQGPGPNKGDSRGPPNHHMGPMSERRHDQSSGPDHGPERGPFRGGQDCRGPPDRRGPHPEFPDDFSRPDDFHPDKRFGHRLREFEGRGGPLPQEEKWRRGGPGPPFPPDHRDFSEGDGRGATRVPPGVWEGRRPGDERFPRDPEDPRFRGRREESFRRGAPPRHEGRAPPRGRDGFPGPEDFGPEENFDASDEAARGRDLRGRGRGTPRGGRKGLLPTPDEFPRFEGGRKPDSWDGNREPGPGHEHFRDAPRPDHPPHDGHSPASRERSSSLQGMDMASLPPRKRPWHDGPGTSEHREMEATGGPSEDRGSKGRGGPGPSQRVPKSGRPSSLDGDHHDNYHRDEPFGGPPGSGTPSRGGRSGSNWGRGSNMNSGPPRRGASRGGGRGR	179147	23125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_27621_29664_29881_30725_30819_30929_31094_35968_36408_39293_39403_42628_43718_44345_44499_45401_45542_45763_45851_46830_46926_47492_47604_48269_48349_48445_48601_49701_49829_91145_91244_92931_93084_93307_93404_110248_110354_111275_111345_113759_113987_179014
889529	contig_5222_pilon	+	6049	2	Intergenic	novelGene_58989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	879	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5104	5409	176959	177264	FALSE	30	CAGGGAGCATCTAACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCPFPSDVPLRTDLKETPGVWAAQAWAAGWPGGLCRWLFHAVDARGLLPDIGLEGVSTQGAEELLLTDLLRAEKEEMWQKLMVNGFRGIFCFVFLNCMS	171752	177904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_175661_175763
889530	contig_16303_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_34070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCTATGTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33088	35045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33100_35000
889531	contig_6066_pilon	-	763	3	Intergenic	novelGene_149277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	7	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	354	761	32472	31815	FALSE	25	AACCACAGTGTGGCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPETLTGKRSSPARPTMGSRLPCWLAFCLLGATSVSAGHTGAGVSQVPRHRVTKKGQAVALSCDPISGHVGLYWYRQNLGQGLELLTYFQNKFPGDTSGMPEARFSADRPDGSSSTLRIQPVEPGDSAVYLCASS	33715	31812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6066_pilon_-_32123_32372_32552_33441
889532	contig_8674_pilon	+	8136	5	Intergenic	novelGene_102918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	943	junction_4	199.64468437702	502	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1747	5244	883	6126	451273	456516	TRUE	35	CTACATATGAAGCCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWNAKPESATMPSSYPKSQSSFLQQALINPLASASQSSFNYPGSNQEACMYSSNSNLISQPLLNIKNYTTPQQISVSDMHNGANVASQTSVERKTYVNVQGPKQLNHNLQMSSGVAQNAWLNSQMRNPMLSHTGTTVVSNQTGVTVVSNQTGFGANRSNINTLQNQFIPSDTYSLQLQTIPSNSVRVPVTYQGNQGLNPSLSEQQVDWAQHCTANGLIFPDNSSLPKQYCYSQQGFLQDTALQKRNPMLSALLEVKNSQFPNPALSLQLQQNAAVQSHQYAVTQIDNRPPPPSYDCIYARQPLQNTQQVSKHSPMEVPQNQETHLPEVLKDLCSGFQQQWQNPNKGINTIGNFCNLKVNGKVSTNGNFCNLKVNGSVNQPANKPVRSLVDGVQTFAQNNKDKRMDSGSSTSNPILDTNVTKEGLVRDIKKLVDTRKKLLELARKIKINQNILMAAGCSKATNTSHSESAQNSELSLKQTSKIQSGSQVTPVTPEISEGQQSTVMKSAEEANRTHCTLNPNIHDINCKKSNQGNSILLNSDCSEKLAMPDQFHDLQALTSLKTSTVEITQTTLNNTQLSSENVRDDQNLSTDSKTITAPQSVLFQEYVSKYPNKNTLLRFLMPREKTKNESVKNVNETIQDPKPKSFEMNQNTQISGDLPNLKTMETQSTCNINAKASDKSCLLDYKPSTNGMSSKSDSHCSMELLATCLSLWKKPPSEPTEEKHDESRTNRTTSHISKPVEVYDKSPCAVVGPSQNKMFNNSEQETALPMVVQNYESAGANTTKGSELQIAVVSPLILSDVKTISVKGITPEALPEIMYPVIKEGSVCSLQDQLAENMSVSPLKANVSELVASTTSSTKISPLIQKEKQDKSTNCNLEGVPNTNQGKHIKSKSHVHSSPNVDTLICPDVSGNQQVLDESRGSTVVSGDTLQIANICSLVEGDISYNSQIAKIFNSPYLDKVEPQKPCLPDHQVISCRQQKEQLDKTTENKNFGFQKEKIVQVTDVSPKITHQPESLPPSESSLKNVKANGEILEENKLECITNKEIMTSNMYCSAAIQQDSPEIDAPCNYISQDPTSSEIFSDKTSLLYLHDQLSELLKEFPYGIEAVNSREGSAGQQITEQVKNQSYDKTSCDSKDSTSTDQIKITIISSEQMKELFPEQDEQPSDGDKLTEPQKEKPITKVESQCDPKAHTEGESHDSVVSNLKRDDIHCCALGWLSMIYEGVPQCQCNSMKNSASEEEKKSHCSALETNRCKQGERTSDRDIPGVECNRSPNKDLKTPLILPDGKNSFPEIKQDKNMKDNTETKHSNSLKTEKELPSQFSSKCDKKLDPLQSHKRKRKLQFHEVTFHSSSKLMKFCEQDSQESLQKKHTAQNSRPLKAKTVILTNKDLYKKNGSLIQSISPEKIKLKFRAGGSRYKLLENRKLDQGNIFDMERKKKKYDKREQNKNAGSSFKLCNSLSNLNERTSIKEKTVSIEVKSTNLEINIHRSLMKSSNINSSDSKDISCKINRVMAPKEYLQRQKHKEAIGNKASKKSCVIEKIKNVPCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQGPV	427059	460932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_445723_445790_451215_457844_460249
889533	contig_3394_pilon	-	9939	26	Intergenic	novelGene_152703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1213	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2980	3333	543685	543332	TRUE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPCVLSAELPPVLGFCPPTLPLNPEEEVVLIWLMPGAEEDDETGGTEEPGAELLAAGFAELPLEVGLNALPAGGTADPEFEAKGPAFPGVACPCAAGGVWYLGGINRLLSSCRVAK	564003	504009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_504572_507351_507546_507933_508123_511664_514068_517866_518600_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529593_530177_530385_534253_535191_538870_539051_540033_540257_542471_542663_543324_543750_544534_544755_545942_546132_549986_550211_550388_550532_553267_553427_554593_554772_556303_556460_558672_558836_561416_561532_562635
889534	contig_9921_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_23732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTAAGCTTGCAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151649	149732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_149700_151600
889535	contig_14209_pilon	+	1520	3	Intergenic	novelGene_88356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_1	260	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	858	1247	36969	37358	TRUE	20	TCTCCCCCAACATCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPEQLVLLGALTLQPRCPFCVSEGRLAPEGPSGAGNPTPAPQAAWTLVWSMSATASAWPSSANCGTCSVTLRPNVRRCSSLVRQSVGPRPGWGLAKPARPLTLCASLCSGLQTWHLCEGPDHRAAPS	36111	38021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_37421_37712_37812_37909
889536	contig_5480_pilon	+	3967	8	Intergenic	novelGene_107226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_7	137.48973987694	183	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	16	774	79527	90022	TRUE	25	TACTTGTGAAGAATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKVCFFSGHSDQGGGEHSFHDGQNSIFIPDTTPCYF	79511	103844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_79761_81790_81962_82535_82590_89722_92469_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
889538	contig_4486_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_38546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAACAACCCCATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136263	134427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_134400_136300
889539	contig_10307_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_170279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	592	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393005	391054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_391100_393000
889540	contig_10437_pilon	+	2732	11	Intergenic	novelGene_38195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	536.222192752221	1410	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	102	1244	229668	232651	FALSE	15	GCCCACCTCGTAGTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRARPRGPQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225671	234139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
889541	contig_12080_pilon	-	4013	13	Intergenic	novelGene_128331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	695.09009707775	1676	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	235	1449	59953	46981	TRUE	45	CAAAGCCATATTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTEGGEKEKSVQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKTVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFIEQVENIKPEIVSVTAACEELRKSKNFSSLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFDISFLCKLRDTKSADQKMTLLHFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAATDEKDKFVEKMTIFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKVSVEEFFMDLHNFKNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMDSLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLALELTKDDAMTAVPAKIPKNSEGVSTILEETKELVGRAS	107807	43893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_46055_46577_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62691_106812_106909_107777
889542	contig_12414_pilon	-	3719	2	Intergenic	novelGene_59545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	TRUE	25	GAAGTTTCTGGCAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	370805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_372387_372443
889543	scaffold_9100_pilon	+	1472	8	Intergenic	novelGene_83276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	513.153794029169	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	88	930	647136	654304	FALSE	30	GTGACAACTCTGTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKKSADTLWGIQKELQF	644852	654846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653410_654256
889544	contig_2703_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_101789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3795	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGTTAAAAACAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613528	611471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_611500_613500
889545	contig_16322_pilon	-	2141	10	Intergenic	novelGene_87530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_1	66.0955163679853	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	446	1822	91959	77890	FALSE	10	TCATTTTTGGCTTTAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	92404	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948
889546	contig_11422_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_99035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16246	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1400
889547	contig_6291_pilon	+	4096	2	Intergenic	novelGene_164791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATAAACTCACGTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382459	386794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_385152_385390
889548	contig_6871_pilon	+	2658	2	Intergenic	novelGene_21535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATCTTTTCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121892	124647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_123186_123282
889549	contig_11850_pilon	-	2272	8	Intergenic	novelGene_125214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	943.647439352176	416	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	105	1010	286397	282879	TRUE	20	CGAGGCTTCTACTATCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	281238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282480_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
889550	contig_7909_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_155895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	608	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCAACTGTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394442	397014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_394400_397000
889552	contig_7428_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_77753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	223	32	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	278	643	516959	517324	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAGAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISSVRINGEKIEVVKDFVLLGSPINTHGSSSQEIKQCIALGTSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAVVFSFASYACESWPMNRENQRRIDVFE	515644	518751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_515833_516155_516181_516894
889553	contig_854_pilon	-	3615	15	Intergenic	novelGene_36690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.06031501455085	1760	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	3134	3613	1706853	1704575	FALSE	15	CCTTGCCCTGCATCAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGV	1716403	1704572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704687_1704891_1704997_1705283_1705436_1706742_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
889554	contig_12920_pilon	-	7908	3	Intergenic	novelGene_166345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1425	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTAATGAGGTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234985	211526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_212843_217525_217635_228502
889556	contig_20819_pilon	+	1718	5	Intergenic	novelGene_55650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	779	junction_2	247.165303997143	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	171	632	40888	42531	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	40371	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
889557	contig_6661_pilon	-	2250	2	Intergenic	novelGene_174112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_1	0	775	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTGCTAACTGAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411972	406264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_-_408404_411861
889558	contig_9785_pilon	+	2697	1	Intergenic	novelGene_157910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	166	531	576141	576506	NA	35	CAAATTGGATTGAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILLKAMYEYSAIPIQIPKSFFKEMEKLIINFIWKGKRPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTAMVVETACYWYNNRYIDQWNRIGNPDVNPSTYSHLVFDKGPKSIKWGTDSLFNKW	575975	578672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_576000_578700
889559	contig_6434_pilon	+	3348	15	Intergenic	novelGene_61894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	380	junction_3	1120.46636837214	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	98	1996	904814	932457	FALSE	60	ATACAAATAAATGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	904716	933809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
889560	contig_7078_pilon	-	2233	2	Intergenic	novelGene_130213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	959996	956739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_957001_958024
889561	contig_12492_pilon	+	3358	6	Intergenic	novelGene_77498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_5	67.7129234341569	1367	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	24	581	258778	284053	FALSE	25	CGGGGGTTTGAATTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPQPESSGLTDEAAFSCCSDADPSTKDFLLQQTMLRIKDPKKSLDFYTRILGMTLLQKLDFPTMKFSLYFLAYEDKNDIPKDADEKVAWVFSRKATLELTHNWGTEDDATQSYHSGNSDPRGFGHIGIAVPDVHGACKRFEELGVKFVKKPDDGKMKGLAFIQDPDGYWIEILNPNKMININF	258754	286830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_+_258862_276324_276408_278688_278830_280154_280223_280846_280937_283961
889562	contig_2703_pilon	-	3964	19	Intergenic	novelGene_101739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGACACACTCCGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611747	526233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526411_559432_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584602_594573_594672_596349_597818_599670_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_608246_608366_609319_609400_610754_611425_611515
889563	contig_10126_pilon	+	3120	6	Intergenic	novelGene_105751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2133.97812547364	1838	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	52	687	162049	184341	FALSE	15	ATGACCCCTTTGGGTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSDTPVQTKPIFIVVGLVCALLVALLIAVLYLLRIRQKKAKGSTSSTRLHEPEKNAREVTQVQIQDTNNMNNDITYAELNLPRGKKPAPQAAEPNNHTEYANIEASPPRRSEDTLTYANLDMVHLNQVPKDSAPKPEPSCSEYASVRIQRK	161997	186774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162153_162221_162305_169472_169584_172549_172575_181522_181569_184074
889564	contig_4654_pilon	-	1906	2	Intergenic	novelGene_103080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTGTGAGTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494532	492558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493456_493523
889565	contig_6058_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_172400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACGTAGTTTGACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385823	384088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_384100_385800
889566	contig_5023_pilon	+	3385	16	Intergenic	novelGene_7242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2041.54939418298	21	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	1156	2076	622609	646990	FALSE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580845	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618737_622487_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
889567	contig_8823_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_53063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTTCTACTCTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66015	63894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_63900_66000
889568	contig_13863_pilon	+	2329	22	Intergenic	novelGene_41981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	500.583460027911	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	1459	2328	69446	81514	FALSE	65	TGAAAAAGAGAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDAL	48550	81515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54958_55222_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67852_67988_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
889569	contig_5515_pilon	-	2800	6	Intergenic	novelGene_52314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	103.258123167139	896	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	518	1117	60874	59717	FALSE	40	TGAAGGAGGTGCTGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLERPLPAQDLFDYITEQGPLGEGRSRCLFAQVVAAVRHCHACGVVHRDIKDENILMDLRRGCVKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFERDQEILEAELHFPDHVSPDCCALIRRCLAPKPSARPSLEEILLDPWMQTPAEDAPLSTPKGDPTPLAWSLLP	64036	58033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_59881_59978_60156_60615_60989_62830_62882_63556_63668_63795
889570	contig_14536_pilon	-	4031	3	Intergenic	novelGene_69268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	3	840	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2186	2560	23184	17390	FALSE	35	CTTTTGAATATATGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIRNFYGKLRSVAITLDSETARLQRALNGEESGFEDYAVKILHDLHSEVWTLKEDVTILLHKASLESQENTDFIKATKVLMKRNSVDIMKIREFFQKYGYNPRAKENSGLNHFHFIAFVFVF	25369	15918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_17600_17711_17774_23081
889571	contig_13292_pilon	-	4177	2	Intergenic	novelGene_142968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439178	429221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_431389_437168
889572	contig_8377_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_34995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAAAAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68121	69351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
889573	contig_19402_pilon	-	3795	7	Intergenic	novelGene_80850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_6	600.386819753177	1052	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	1603	3123	182202	167101	FALSE	20	TTTGATGGTGCTTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSECGNGSPHWENKTHILLMVAEDCHVHIQRKACGTVLGQRYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	184472	166428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_182080_182255_182922
889574	contig_12951_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_68248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGATTTGGGGTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837577	839336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_837600_839300
889575	contig_16575_pilon	+	1389	9	Intergenic	novelGene_146496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAATTTTTTTCTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11370	26184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_+_11831_13214_13320_15642_15817_17278_17347_17554_17649_20272_20351_21124_21261_24643_24866_26132
889576	contig_13301_pilon	+	1834	7	Intergenic	novelGene_153123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_3	135.112812946153	1965	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	33	602	169218	171678	TRUE	40	TTTGAAGAAGGAAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSGGSTVLNMTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPSE	169185	174510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_172378_172631_172824_172974_173087_174281
889577	contig_8885_pilon	-	2276	6	Intergenic	novelGene_115564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	154.477700656114	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	104	493	75477	56347	TRUE	30	TTAGAAAACTCATTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLHCGGSRKLPACSASPEAGRSTRECRRGRDSGMESVALYSFQATESDELAFNKGDTLKILNMEDDQNWYKAELHGAEGFIPKNYIRVKPHPWYSGRISRQLAEEILMKRNHLGAFLIRESESSPGGVLHLREAGFSGEAKPVKHINIYIKRFISKKQLTRL	75580	45840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_47248_49094_49264_56139_56437_58183_58308_63031_63130_75399
889578	contig_8866_pilon	+	4507	5	Intergenic	novelGene_77809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1177.57385649478	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	25	690	511301	523466	TRUE	20	CGACTCCTAGCAACCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGRGRGSARVLLAPLLALALALALLALLAPPALARGGRDHGNWDAVALLPPREDAARVARFVAHVCDWGALATLSTVPAVRGRPFANVFSLSDGPPGAGSGVPYFYLSPLQLSVGDLQENPYATLTMSLAQTNFCRKHGFDPQSPLCAHIMLSGSITKVNETEMDFAKHSLFTRHPEMKDWPSDHNWFFAKLNITNIWVLDYYGGAKTVTPEEYYNVKFQ	511276	527428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_511658_516974_517095_518480_518666_523462_523978_524122
889579	contig_10475_pilon	-	5234	3	Intergenic	novelGene_148726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30	3	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	238	1236	84427	83305	FALSE	35	GGACGTTCAGCAAAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAAETTPTMRNYRAGKHIRGGLPETTLKSAFERKISREERATLYSSNKYKLKKETKNL	90156	79306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_83344_83467_84503_89994
889580	contig_401_pilon	+	3204	26	Intergenic	novelGene_42904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	371.715706420915	2	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	931	2796	35	2830	1929703	1972939	FALSE	15	CACTGGAGCTGCTATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSAYEHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKKTCSDPKSKPPFLLEKSMESSLKYINKKFPNIDIRNSTQHLGPVHREKSEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1929668	1973313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1955923_1964489_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807
889581	contig_7050_pilon	+	1429	12	Intergenic	novelGene_153629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	253.899863126918	481	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	53	892	714322	846716	FALSE	15	TGGTTTGTTCTTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRSRPPSQRRGLESAPEDPPRESSERAGQGLVRTGAYTLITPNENRRSQLRRIAEKELEDLEKWKEQNRAKPVNLVPRQLGGSQSEAEVRQKQQLQLMQSKYQQKLKREESVRIKKEAEEAAIRKMKAIQREKSNKLEEKKRLQENLRRDAFREHQQYKTAEFLSRLDKDLPNRSTCQVALRDPQYSTWARSRSYKDSLKEEENRKLQKMKDEQHRKSELLELKRQQEEEERTKTRQTEHRRVNNAFLDRLQGKSQPGGLEESGGYWNMNRGNSWDM	714269	847253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_714340_714420_714507_732208_732268_734460_734545_738683_738758_739460_739545_760439_760514_799721_799816_810822_810907_830795_830870_834426_834527_846707
889582	contig_16775_pilon	+	2321	16	Intergenic	novelGene_107757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	293.346090631678	14	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	775	1716	152231	174136	FALSE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130274	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_146028_146154_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
889583	contig_3394_pilon	+	1947	2	Intergenic	novelGene_152685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	531	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGATGAGGTTTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446060	453356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_446457_451805
889584	contig_6792_pilon	-	5595	5	Intergenic	novelGene_178579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	179	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2556	3026	40182	30328	FALSE	55	CACCACATAACTAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILDRYLVIFHDIRERIQENNAGTKCQNKFTTRNIQKQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEHKHLDTTLFQENSEKRIKKNEETLRVIWDTIKSKNFPVIGVPEWGEKTENTERIIEELLTENYPNIMKNEKLAIQEAQRTLH	124422	27758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6792_pilon_-_30751_40134_41183_101829_101837_122691_124091_124273
889585	contig_16041_pilon	+	3977	1	Intergenic	novelGene_178358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTATGTTAATGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189	5166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_+_1200_5200
889586	contig_7593_pilon	-	4762	2	Intergenic	novelGene_127303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGTATCACTTTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200192	195186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_198169_198412
889587	contig_2114_pilon	+	3071	4	Intergenic	novelGene_104245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_2	166.743982066987	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1768	2331	162419	165991	FALSE	70	AAAAAAGAAGAAGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETSNQKQQQQQQQQQQQHVTSWPGKQVETLRLWEEAVKARKKEAANLCQTSTAATTPVTLTTPFNITSSVSSGTMSNPVTVAAAMSMRSPVNVSSAVNITSPMNIGHPVTITSPLSMTSPLTLTTPVNLPTPVTAPVNIAHPVTITSPMNLPTPMTLAAPLNIAMRPVESMPFLPQALPTSPPW	158789	166731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_159084_159855_159920_161009_162555_165563
889588	contig_12327_pilon	+	1919	4	Intergenic	novelGene_140638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1075	junction_1	424.426148529465	3	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	23	568	168930	171003	FALSE	15	TCATGAGCTTTTCAGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK	168907	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_169078_169396_169508_170312_170438_170841
889589	contig_7057_pilon	+	935	7	Intergenic	novelGene_123230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	596	934	538053	539738	FALSE	10	TTCCGTTGCGTAGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQVVAHIHLFNLPVFLLQFREHLLKEVIIVFLHFHVADMTVRSIRSLGRVLWIPVQIEQHYGLAERRFVVKPGAPVPVPAGPDLSFSVPNIEAKYSAIFTRTLQLGLLLTS	536977	539739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_537213_537515_537852_538028_538127_538200_538250_538334_538404_539420_539484_539654
889590	contig_9415_pilon	+	7145	28	Intergenic	novelGene_109716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1215	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTTTGTCTTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438143	477367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_441208_441719_441839_444542_444593_446109_446273_446893_446971_447787_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453357_454140_454214_454332_454413_455170_455312_456369_456514_460019_460255_462549_462678_464335_464475_464747_464874_466631_466800_467517_467618_469493_469885_470544_470841_471349_471474_473863_474020_474605_474875_475040_475194_476568_476658_477067
889591	contig_960_pilon	-	5953	2	Intergenic	novelGene_108321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1703	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATGGGATTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065541	1057538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1062099_1064148
889592	contig_854_pilon	+	5436	30	Intergenic	novelGene_36498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	3308.21516912547	26	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	1860	4061	1704560	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612771	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1686992_1704479_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715151_1715198
889593	contig_4732_pilon	+	2651	1	Intergenic	novelGene_75454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	666	1001	673831	674166	NA	10	AGCGTGTTCTGCCTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFRVTFTSALLTFTFLGSLASTVFGRRWRSPIVQRSQAESCSHGRMASQWQSQTLPRLGRLVQCPHECLHARQVPGVRSAGSGPVAAYVQIQPNDSGLGSWAAACLCC	673165	675816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_673200_675800
889594	contig_16411_pilon	+	5375	22	Intergenic	novelGene_77314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	1203.96690878957	4	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	422	3139	131665	241370	TRUE	25	TGAAATCAGCATCTTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSWLRFQSFVVLERLQVLPCLLTHVPGKYLDGVPGKVCGWDLEEASPKGGRGRTVTQPAVPTALDLAGSLAEVLGCLLGSTKGSWPWWLRVGGARSSYCVEGACPTQALQTGPAPTHDFLPRWTCTQSSISPQYNICEQMVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	131243	243783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241546_241722
889595	contig_4783_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_108361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	736	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	1769	2335	127662	128228	NA	80	AAAAAAAAAAAGATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVIIDWFKSRKIRINFKVTTMKVNKPTHQNKEEKHKVSEKTKPIKTKEMKKNPQTKGTQHRRVRGPKKTSAPQKKSTKNANPLLEIYPREIRAVTRIDVCTPIFTAALFTIAKRWKKPRCPSTDEWINKLWYIHTTEYYAKIKNNDESMKHPTTWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	125893	129336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_125900_129300
889596	contig_11564_pilon	+	3983	4	Intergenic	novelGene_158530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	811	1377	1133	1699	TRUE	70	GTAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKAPDDSLVEENALELPHREFKSLILKILQELRQRADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQRQQIEIQKTNNKLSEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKCLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGILERGRKQKT	0	19426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_179_500_2536_17606_18142_18191
889598	contig_13519_pilon	+	2342	12	Intergenic	novelGene_124617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	366.853270823704	904	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	235	1542	72535	120612	FALSE	30	AATCTTCTACATTCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRWAGLRGRTSLEAPQLCSPDVCSSAGAPNRRLHPGPELSPGRHDAEESVTPERGWSAGGRNPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	56962	121412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
889599	contig_8420_pilon	-	2087	15	Intergenic	novelGene_69342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	973	1359	36957	33852	TRUE	35	GCATACCCACAATCGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKILEETVLDNMYMSLRALRSWFFSFQEVKSHHPKRAPNSLPENTLHSPLSCFSATASLSASGSFAKTIWALVLSAKPKDKVTKTPFPSSGFGYFTVGNSGSGSFCSGTATGGAKSKALKADCTKS	59215	10938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_11034_14730_14882_21351_21438_26935_26995_29016_29101_29240_29435_33792_33990_35333_35427_36801_36984_37071_37169_39051_39176_41726_41916_51044_51180_58543_58888_59158
889600	contig_6710_pilon	-	1711	2	Intergenic	novelGene_97052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	533	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAATGCCTTGCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659352	653370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
889601	contig_2924_pilon	+	4417	16	Intergenic	novelGene_140258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_8	411.14423530219	1541	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	16	1824	66050	303804	FALSE	25	AGCTGCGGATGTGAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIKKEMKKDPLTSKAPEKPMHEVSGGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPETLPNRTEEKEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSVSRPIAMPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEDDKEEHVSLAHRGADASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGAMAAGGGPAPLSAAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	66034	306397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_66159_125503_125608_135679_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847_221956_236286_236339_239711_239793_242630_242782_259354_259441_287622_287733_293259_293389_297301_297568_302765_302830_303762
889602	contig_5085_pilon	+	1702	2	Intergenic	novelGene_178580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1058	1441	351871	376406	FALSE	20	GCAATTGGCTGAGTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNGKKRHLRKFLTSNEEHQRFKENIIPRDRKCHINQRLHQPEIRRTRWFPATTNDCPDSEHNRESLTEQEKSGMQNSNSSKKTRHNGLTETGGTLEDMAPRHSVIPGLKPFLNPTLQTKIRLNYGT	350813	376667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5085_pilon_+_351916_376067
889603	contig_20641_pilon	+	1665	7	Intergenic	novelGene_52863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	25	1356	14659	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14634	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
889604	contig_4631_pilon	-	3405	1	Intergenic	novelGene_177943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1407	1934	46299	45772	NA	15	TACCCATTTGTGTGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRFQRAAREDKVKYCNDVQGAGNRKSKGKNTLSISQAERTEEKFRPRVAILKESMGKILNDPGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQETAYDQEPIVLNEEVQMVLKALAKNKAPGIDGIYTEMFQQMEAALEMLTHLCQEIWKTATWPTDWKGSIFTPIPKKGNPTECGNY	47705	44300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4631_pilon_-_44300_47700
889606	contig_602_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_134941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGGCAACATCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271950	269716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_269700_272000
889607	contig_11677_pilon	+	4735	3	Intergenic	novelGene_85907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	48	546	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	334	1641	567342	568649	FALSE	60	ATTATAAACCAGTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPPVAPYATVAPSTLAHPQAQALARQQALQRAQTLAHAPPQTLQHPQGIPPPQALPHPQSLQQPQGLGHPQPIAQTQGLVHPQALAHQGLQHPPNPLLHGGRKMPDSDAPPNVTVSTSTIPLSMAATLQHSQPPDLSSIVHQINQFCQTRAGISTTSVCEGQIANPSPISRSLLINASTRVSTHSVPTPMPSCVVNPMEHTHVATAALPAAGPVNLPTGISRAPTGYPSDLKSVAWNQHQLAHLQQMCSEAGGTPVAPGLTGKHATGRELAGLGFVGKAPAYPQELCLAQSFHLKPPLEKPTPSPPVNGLAAPLAYPNGHYFQPLWNNILPTPNSDSSGSQDLAMPFHGGQPTGAPLDCAAAAGAHYRAATGGGPVASQNSLMQTVDYLSGDFQQACFREQSLAMLSKAHRAPGSRAPDPTDSRSLHVQHPGYR	500991	571743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_501013_560503_560626_567151
889608	contig_4857_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_48905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	50	412	1505646	1505284	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRALSDTVLENEPLRLEGTQNMTGEELPPQSRVDLNDVDGIKLLGPSFGDAALFKMRRNICRHPLIIGTCSTQSMNLGKLKVVKNEMECIKIDVLGISELKRTGIGHFESYGLLCQE	1505695	1503161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1503200_1505700
889609	contig_3386_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_34586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAACCAGCTGAGCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509838	507961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_508000_509800
889610	SIRV6	+	1426	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	88	14	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	10	TGAAGTTTGCGTTTGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889611	contig_2009_pilon	+	2732	10	Intergenic	novelGene_165442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	605.574291249408	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	253	849	35627	61708	TRUE	35	GCTACTATAAAATTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSYSPQENSHNHSALHSSNSHSSNPSNNPSKTSDAPYDSADDWSEHISSSGKKYYYNCRTEVSQWEKPKEWLEREQRQKEANKMAVNSFPKDRDYRREVMQATATSGFAGGKSTSGDKSVSHSCTTPSTSSASGLNPTSAPPTSASAVPVSPLPQSPIPPLLQDPNLLRQLLPALQATLQLNNSNVDISKINEVLTAAVTQASLQSIIHKFLTAGPSAFNITSLVSQAAQLSTQAQPSNQSPMSLTSDASSPRSYVSPRISTPQTNTVPIKPLISTPPVSF	28020	67782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_28129_34914_35031_35598_35712_56316_56563_58031_58155_59129_59266_61701_61836_63289_63477_64660_64789_66341
889612	contig_6975_pilon	+	3636	1	Intergenic	novelGene_74292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1927	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACTCCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431396	435032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_431400_435000
889613	contig_1948_pilon	+	4642	6	Intergenic	novelGene_31193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	698	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGCTCCTGAGTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553109	569639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_557284_557739_557796_558682_558833_563198_563298_568284_568362_569553
889614	contig_3270_pilon	-	7424	33	Intergenic	novelGene_104462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	277.943661037516	1493	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1317	3954	2633	6586	133171	96160	TRUE	60	AAAGAAATAAACTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPASGEDTRWERESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNSNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESMIKEREDLKSLYDSLVKDHEKLELLHERQASEFESLIAKHGTLKFAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAEEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDLNRERQKSLTLTPTRSDSGEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQALGTKKSSMIALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTGNSSTGFRSKQLVKNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGQTSTGNSNNNASLHEVKAGAVTSQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKTREALDSRAHHKIRTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQDNLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGRTPGDFCDRRTTKPEQFVRPGSRMTEDTHFTGPPGKSTAGTQGRIKSVKETSLPRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDGRPPASVDSAAATADSGVHAAPSEYCLHPWSPRVLPSPAPAVGSPAPSELPADMSASCPESLCAQARSSRTERSQFLNPAFATVGVSGDSFGMSAKDSMGSSTMTHSSQPFLSLNTELVSNISGLPPRAVTKVPDQASTSWGKAAQKGNEQLSDNQTPSNSNPQSPLAGNSLITAACLSPGDTDAALLVSEDNQTVWYEYGCV	210586	95221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_95727_95826_97168_97364_97634_99787_99869_100976_101049_101651_101856_102844_102929_106359_106575_106714_106808_110361_110508_115231_115419_117395_117540_117767_118046_118971_119134_121338_121504_127796_127939_130712_130841_132595_133667_135019_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492_209594_209691_210059_210410
889615	contig_18843_pilon	-	3417	11	Intergenic	novelGene_165615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2576	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCACCCGCAGCTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47922	28518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_-_28583_31085_31137_31228_31338_32863_32953_36856_36935_37160_37296_38393_38561_40032_40122_44188_44575_45142_45495_46025
889616	contig_11386_pilon	+	1386	6	Intergenic	novelGene_82831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	28	junction_5	39.6555166401851	149	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	333	791	231646	244538	FALSE	10	TGAGGTTTTGTGCTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPNEDSEGSRITYIKGDLFACPKTDSLAHCISEDCRMGAGIAVLFKKKFGGVQELLSQQKKSGEVAVLKRDGRYIYYLITKKRASHKPTYENLQKSLEAMKSHCLENGVTDLSMPRIGCGLDRLQWENVSTMIEEVFEATDIKITVYTL	230367	245133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_230663_231608_231685_232027_232173_233457_233517_234770_234884_244435
889617	contig_5794_pilon	-	2185	8	Intergenic	novelGene_69792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2109.72136664962	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	37	930	749501	743712	FALSE	10	TACTGGCTGGTATGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749537	742456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743765_743856_743980_745136_745278_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749495
889618	contig_16125_pilon	-	1997	10	Intergenic	novelGene_155260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1151.02010579773	14	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	57	1463	303204	153038	TRUE	40	GTAAGTATAATCAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTASSESLCQAHQLFPIKMAGRADVKSLMAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEGTGE	303260	144626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_144710_148090_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153468_153490_155570_155618_179440_179598_235796_236962_303201
889619	contig_10437_pilon	+	1804	10	Intergenic	novelGene_38200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	549.096024793883	8	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	78	926	229668	232676	FALSE	25	AGTGACGCGAACACGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPF	225695	233554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232675
889620	contig_12414_pilon	-	5519	11	Intergenic	novelGene_59653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	514	junction_10	366.616639011379	665	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	4237	5517	787209	759122	FALSE	5	GTATCTGTTTTTGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEK	791445	759119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129
889621	contig_4180_pilon	+	2477	5	Intergenic	novelGene_8333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1335	junction_1	1310.11495201757	484	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	96	557	865772	886190	TRUE	65	CTAGAAAATAACAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKRGRGTRLVVLLPENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPK	865676	889728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886468_888085
889622	contig_8866_pilon	+	2176	8	Intergenic	novelGene_77816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	800	junction_1	500.446005161029	903	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	178	678	558831	639994	FALSE	35	AGAGGCAAGCCTAGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWKVFVIMAVLQTQFPITEAQSFGMLDPKICYLLDGILFIYGVVITALFLRAQFSRSADVPAYQPGSNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGWDPEMGGKQQRRKNPQEGVYNALQKNKMAEAYSEIGLKGDNQRRRGKGPDGLYQGLSTATKDTYDALHMQTLPPR	558653	641492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558889_632461_632566_633657_633715_634879_634961_636551_636588_637577_637635_638570_638613_639928
889623	contig_2161_pilon	-	3147	4	Intergenic	novelGene_114940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCGGGTCTGCGGGGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955415	938049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_938197_941023_941368_951468_951831_953121
889624	contig_11318_pilon	-	2031	17	Intergenic	novelGene_48146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_15	1062.20544262574	207	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	252	1103	49795	30548	TRUE	65	GGAAGAAGAAAAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKRSYGD	58276	14980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_30503_30566_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071_52142_58143
889625	contig_14525_pilon	-	3382	19	Intergenic	novelGene_149750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	236.056549251328	6	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	854	2215	148448	127683	FALSE	30	CATATCTACTGAAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQIIKLKPTDVGLLAVIANNIITINKDQNVFDSKKKVKLTNAEGVEFKLSKKQLQAIEFNKALLAMYTNQAEQCRKISSSLQSQSPEHLLPVLIQAAQLCREKQHIKAIELLQEFSDQHPENAAEIKLTMAQLKISQGNISKACLILRSIEELKHKPGMVSALVTMYSHEEDIDSAIEVFTQAIHWYQNHQPKSSAHLSLIREAANFKLKYGRKKEAISDLEQLWKQNPKDIHTLAQLISAYSLVDPEKAKALSKHLPSSDSMSLKVDVEALENSPGATYVRKKGGKVAGDNQTKEQGSQGDLKKKKKKKKGKLPKNYDPKVTPDPERWLPMRERSYYRGRKKGKKKDQIGKGTQGATAGASSELDASKTVSSPPTSPRAPATKKKQQQKKKKGGKGGW	155824	126515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127748_127819_127861_128434_128595_132105_132147_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137069_138539_138605_140186_140260_141223_141353_142242_142375_145157_145216_145303_145429_146713_146746_148423_148536_148614_148759_153473_153598_155326
889627	SIRV6	+	1095	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	335	164	159	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	45	ACCAGAAATGGTCATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889628	contig_6228_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_164501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGTAGAAGTCATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215201	217349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_215200_217300
889629	contig_5649_pilon	+	2235	15	Intergenic	novelGene_82304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	175.858593472026	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	830	1975	188174	203268	FALSE	35	GAAAACCTTTGTCTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLELNAPEHVLETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFKYLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVSSEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS	178705	203528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_178873_179498_179640_179732_179838_180469_180590_181691_181817_187169_187251_188083_188248_188451_188570_190181_190284_197011_197186_198340_198491_199802_199984_201362_201496_202873_203009_203189
889630	contig_13021_pilon	+	1867	10	Intergenic	novelGene_8180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2694.32546816361	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	710	1564	178184	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174510	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176690_177668_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
889631	contig_567_pilon	+	8774	31	Intergenic	novelGene_33997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_5	178.410889677608	1902	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1907	5724	405	6128	578555	660604	FALSE	5	CCCTGGCTTTGTTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDSTDFGSLFDLEHDLPDELINSTELGLTNGGEISQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGGPGQSMASQPQQNSPGLGLINSMVKSPMAQAGLTSPNMGMGTSGPSQGPTQSATGMMNSPVNQPAMGINTGMNAGMNPGMLAAGSGQGMMPNQVMNGSIGAGRGRPNIQYPNPGIGNPGNLLTEPLQQGSPQMGGQAGLRGPQPLKMGMMSNPPNPYGSPYTQNSGQQIGASGLGLQIPSKSVLSNSLSPFAVDKKAVPGGGMPSMGQQQAPQVQQPGLVAPVAQGMGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVKQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNAGDKRNQQSILTGAAVGLGNAGSLGVGQQSTPSLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQMPAQTPVQAKSQQNQQSGQSPQGMRPMSNMSASPMGVNGGVGVQTPNLLPDSMLHSAINSQNPMINENTSVASLGPMPTAAQPSSTGIRKQWHEDITQDLRNHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYARKVEGDMYESANNRAEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRTRLQKQSMLPNAAGMVPVSMNPGPNMGQPQPGMTSNGPLPDPTMIRGSVPNQMMPRITPPGLNQFGQMSMAQPPIGPRQTSPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSSQSQFLPQTPFSTQGMNVSNMPLGQSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCATLPQPALHQNSPSPVPSRTPTPHHTPPSIGAQQPPAAAIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPPQVQPSLPAAPSADQPQQQPLSQQSTAASVPTPTAPLLPPQPATPLSQPAVSIDGQASNPPSTSSTEVNSQTIPEKQPSQEVKMEAKMEVGQPEPVDTQPEDIPETKTEDCKVEPTETEERGTELKTEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHFCEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVLHHEVIWPTGFVCDGCLKKTGRTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGEVTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQEYGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNKSSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIPCDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESSNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTGQQPTTPQTPQPPPPLSPSLLLPAACLPTCPELRLLVLCPRARQQAR	578150	663250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_578649_603637_604276_613467_613648_615308_615571_616360_616475_618295_618542_629211_629306_629870_630009_631984_632103_632774_632950_635948_636024_636376_636487_638170_638309_638917_639356_640637_640818_641259_641405_643230_643350_644447_644688_645326_645416_647348_647430_649002_649060_649752_649831_651517_651586_652502_652654_652765_652913_653597_653712_654923_655090_656043_656209_657400_657563_659406_659689_659944
889632	contig_14956_pilon	-	1815	2	Intergenic	novelGene_102955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1148	1774	668	42	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQIACALGTLRKEQIGCTEPGTRVKGMGGGERQGRNQEKQEKKEKKKKQHQQPTNDTQKAARSCAQNPSSRRPPVKRLQPQEVEEKTNKGPGISPAQQPRPGSSRTPKCIPTALQERAKTALGTRHPSKRRGRQQEASEKPKEAEKATPAANKRHPESRPHGRAESKQPAALGEETAAPGSRGTNEQRPRDLISAAAQAWKQSHTQT	1914	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14956_pilon_-_1429_1527
889633	contig_7357_pilon	-	1804	11	Intergenic	novelGene_36771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2320.90573914582	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	234	1124	166824	137874	TRUE	20	CACCTGGAGCGCTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMKECKF	167057	89617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_89717_110059_110218_136364_136564_137565_137737_137820_137892_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
889634	contig_7396_pilon	-	2948	17	Intergenic	novelGene_79568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3320.05635247261	32	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	378	1763	255163	246385	FALSE	25	TAGATATGGTGCGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257490	245199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257137_257294_257381
889635	contig_5686_pilon	+	3187	14	Intergenic	novelGene_45354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	1776.09230329465	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	295	2133	170242	211355	FALSE	5	TCAGGTGTCGTGTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	129724	212409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_129993_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
889636	contig_10861_pilon	-	4248	6	Intergenic	novelGene_39384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1065	1388	1733846	1733523	TRUE	20	GAGTCTCAAGTTGCCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKSGQISALNSFLLHLAGPFFLFSNSVLGGSLDGAQGKEVKHLCPWGTDQMAAQQRPQNGNVISSSTCPEPDPTEHPTPALIQVPRWSFGPGHAGAQAGLLMRPL	1734910	1719440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1719505_1721309_1721530_1722792_1722950_1724251_1724365_1726728_1726921_1731408
889637	contig_5321_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_153878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTCTTTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62898	64042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_62900_64000
889638	contig_11978_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_62862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	200	607	598893	599300	NA	45	GGCAGAAGGGGGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGRGSGQEGEEPHTQEPPCGAMWNASSTALLPALALSGEELWQQEGRMPHCLKEGMLFLISIPRAHSYRQNKALVPHWTEHTASLQHSRGTLWWLKPWGQGAITKGKERIPKKKEAHSNPAEKIATSLLYNQK	598693	600836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_598700_600800
889639	contig_11574_pilon	-	2605	11	Intergenic	novelGene_64071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	281.682108058002	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	486	1913	454111	449890	FALSE	15	GAAGGGCGCTGTAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463729	449197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454546_454793_454889_456384_456540_462651_462686_463675
889640	contig_5954_pilon	+	2887	13	Intergenic	novelGene_28503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	68	junction_12	640.700918265821	733	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	729	2030	438796	443568	FALSE	5	TCTGGGTCTGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQRSLPAAAMARAMRVRTFRAHW	430192	444425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408_432538_435590_435668_438686_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441483_441740_441801_441925_442106_443503
889641	contig_1036_pilon	-	4520	6	Intergenic	novelGene_178581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	789	1298	260441	259932	TRUE	40	AAAGAATGTCTTGAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNRRDPESYVGHN	261229	122600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1036_pilon_-_122735_160890_161124_206821_208053_223429_223677_227196_227624_258981
889642	contig_8050_pilon	+	1651	7	Intergenic	novelGene_114813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	986	junction_2	212.390102301297	400	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	662	1513	294062	316055	FALSE	40	TGGAATTTTAAAGGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGEL	293400	316193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912
889643	contig_2577_pilon	-	1878	1	Intergenic	novelGene_172056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1313	1777	101414	100950	NA	45	TAAAAATTTTTAATGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTPNFSQQLKILSVCLESSHILSSSERKLLNFLTCSNLHCRPLSRSVTELFVVLGSLPIIILETPFCLRFPISGILLLYFGRSPGDTMVKHLAAKHKVGAKQKVSGLQLNWRKDQLNWRKDQLNWRKDRAICSRKDYSLGDPMGQFYSFIEG	102726	100848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_100800_102700
889644	contig_5084_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_64545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAGCCAATATGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510651	512488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_510700_512500
889645	contig_1867_pilon	-	2464	5	Intergenic	novelGene_54495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	260.092651760868	127	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	2062	2463	14356	6648	FALSE	35	GTAACATTAGAAGCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLALHQGKIHHEMQVLEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILATAVYQAKEKLKSIEKARKGAISSEEIIKYAHRISASNAVCAPLTWVPGDPRRPYPTDLEMRSGLLGQMNNPSTNGVNGHLPGDALAAGRLP	46996	6646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_6779_10434_10522_12025_12084_14230_16175_46753
889646	contig_16204_pilon	+	2026	11	Intergenic	novelGene_154512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	422.871150588451	805	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	69	1538	369321	395754	TRUE	15	GGACTATAGCGTCCCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARHPHLRVLSWLRLKQEEVAPMGSQQPPLTTVYLLGVLVTSCLGGFIREDSEIQIRLSNSSSRCQGRLEVRHLDRWLSVCSESWGHSRYHEEDATRLAKNLCPQLRCGRALELALSLFSSTQNKVLCHGSLGSFSNCTSQGASPCRTLILICLEPTTAAPLPTSPPPTTTPEPTAAPPRLQLVEGPGGLSCAGVVEFYHGSLGGTISNGTQNLTQGLGDLICRHLRCGSFLRHLPEATLKATPDTRQEWMQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNISFHRNHTATVRSQVENRTASHVDNEYSQPPRNSHISAYPALEGALHRSSAQPDNSSDSDYDLHGTQRL	369252	397248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_387991_388298_388738_388802_389401_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394977_395098_395665_395758_396763
889647	contig_19402_pilon	-	3469	2	Intergenic	novelGene_80749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	376	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32289	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298
889648	scaffold_4438_pilon	+	4610	7	Intergenic	novelGene_174527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	31.3049516849971	78	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	654	1019	194054	194419	TRUE	15	CGGCCTCAGATATTGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAPLTITPCDPLAKFLLLFPMTLCSVGLEVLVKKGGMLPPGNTTLIPLNQKLRMPPGHFGLLLPLDQQVRKGVTVLDGVIDPDNQEKFGLILHNGSREEYVCNTGDPLGHLLVLPCPVF	75379	414069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_75807_77004_77007_193829_194867_229008_229532_304643_305617_410548_412098_413970
889649	contig_9538_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_176454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	306	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCGGAGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29731	28315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28300_29700
889650	contig_12677_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_110783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
889651	contig_11815_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_50882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGAGCTAAAAGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49310	47614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_47600_49300
889652	contig_8020_pilon	+	3208	2	Intergenic	novelGene_114434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCTCCTTTTTGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286506	303363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_286836_300484
889654	contig_17783_pilon	+	2545	1	Intergenic	novelGene_165904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	338	1017	273	1289	19343	20359	NA	50	AGTAAAACCATGAGAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKKKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTTKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQNPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFRQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKTTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMAYRHMRKCS	19070	21615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17783_pilon_+_19100_21600
889655	contig_9235_pilon	+	2079	3	Intergenic	novelGene_156222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	378	872	45805	47109	FALSE	30	TGAAAGATCCCTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYGGAAASQKEGGREYEKPGAGG	45029	48316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46234_47043
889656	contig_5794_pilon	-	2412	10	Intergenic	novelGene_69794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_9	4445.36472972094	2345	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	33	1166	749501	743712	FALSE	15	TGAACCCTTTACTGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGRGESGLKMEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749533	742465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749429
889657	contig_13481_pilon	+	6375	9	Intergenic	novelGene_119303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	19	junction_1	160.906805325319	118	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1411	4236	234	4469	283783	475322	FALSE	55	AAGAAAGAGATAGAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSSGASGGKGVDANPVETYDSGDEWDIGVGNLIIDLDADLEKDQQKLEMSGSKEVGIPAPNAVATLPDNIKFVTPVPGPQGKEGKSKSKRSKSGKDTSKPTPGTSLFTPSEGAASKKEVQGRSGDGASAGGLVAAIAPKGSEKAAKASRSVAGSKKEKENSSSKSKKERSEGVGTCSEKDPGVLQPVPLGGRGGQYDGSAGVDTGAVEPLGSIAIEPGAALNPLGAKPEPEDGENECRPLKKVKSEKMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSYTQSSPGALNPSSQAGVESQSLKTKKDEEPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVHVPVSSPLTQHQSYIPYMHGYSYSQSYDPSHPSYRGMPAVMMQNYPGSYLPSSYSFSPYGSKVSGGEDADKARASPSVSCKSSSESKALDILQQHASHYKSKSPTISDKTAQERDRGGCGVIGGGGSCSSVGGTGGGERSVDRPRTSPSQRLMSTHHHHHHLGYSLLPAQYNLPYAAGLSSTAIVASQQGSTPSLYPPPRR	248546	477228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_283655_284530_414927_415154_466806_466895_468621_470963_471858_472226_473981_474158_474390_474608_475248
889658	contig_11413_pilon	+	5021	23	Intergenic	novelGene_103189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_21	146.920798644644	1854	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	70	2715	542360	653355	FALSE	15	TTCTAGTCCCATTCTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKASHHIYPYPSSQEDEEWLRPVMRKDKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSSDVDAEIEDPPIPEKSWKVHAKWILDTDVFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAAANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEEEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNPKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTTGGKEDEDPSKGDQSRSVDPGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQDAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPEEPEKLEGAEEEKVEADTDGQQPEKTENKGENEMNDGDKAQDGENEKNSEKEHDSEVSEDIKSEEKEAEENKELTDTCKERESNIGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMVPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQSMSGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPQQQPPPPPTDGVPPLPAPGPPASAAP	532860	655661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_532910_542339_542410_546060_546137_549824_549951_551873_551996_557203_557329_565027_565088_574680_574719_577758_577881_579279_579352_581382_581497_582114_582269_583013_583128_590107_590168_596827_597087_598034_598197_607530_607587_610793_610909_611582_611738_620301_620437_629137_629400_651824_652002_653263
889659	contig_13780_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_149115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGTCTCTGCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820910	819267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_819300_820900
889660	contig_546_pilon	-	5629	1	Intergenic	novelGene_117226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACTGCCTGTCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147637	142008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_142000_147600
889661	contig_11386_pilon	+	1252	6	Intergenic	novelGene_82838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	49.7007042203629	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	202	660	231646	244538	FALSE	10	CTATGAGGTTTTGTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPNEDSEGSRITYIKGDLFACPKTDSLAHCISEDCRMGAGIAVLFKKKFGGVQELLSQQKKSGEVAVLKRDGRYIYYLITKKRASHKPTYENLQKSLEAMKSHCLENGVTDLSMPRIGCGLDRLQWENVSTMIEEVFEATDIKITVYTL	231198	245130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_231363_231608_231685_232027_232173_233457_233517_234770_234884_244435
889662	contig_7707_pilon	+	2871	1	Intergenic	novelGene_72163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257640	260511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_257600_260500
889663	contig_16185_pilon	-	3087	11	Intergenic	novelGene_144730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	70.285489256318	449	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	177	1481	127403	82386	FALSE	15	CGCCCAATTTGACTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134439	80779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127364_127464_134323
889664	contig_8377_pilon	+	3595	13	Intergenic	novelGene_34910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3913	junction_2	2699.19581645266	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	127	1587	68257	173800	FALSE	45	TGGAAAATATTTATGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERGKYANFLLMNIHTLTFESIQFKKEFSAFDLTQIFSVDET	68049	175808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646
889666	contig_10774_pilon	+	4540	4	Intergenic	novelGene_158669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	38.4794317352357	1111	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCCACTGTTAGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6668	23933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_6770_19302_19380_19492_19587_19665
889667	contig_10331_pilon	+	6224	3	Intergenic	novelGene_54087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	177.5	12	133	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATCCACTTGTGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106495	114407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_107884_108299_108372_109643
889668	contig_11363_pilon	+	2591	3	Intergenic	novelGene_160480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2196	2561	143116	143481	FALSE	60	CGATGTCACAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPAEVKRIITEYYEKLYSNKCENLEELDKFLETHYLPKLTQSDVENLNRPVTREETDKVIEKLATKKTKQKKTKKPWHRCLHWRILSNIQRIACTSTTQTISEHRKGSDTSEFIL	95589	143511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_96929_141614_142197_142841
889669	contig_13863_pilon	+	2152	22	Intergenic	novelGene_41982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	436.996230207332	26	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	51	1628	48604	75943	TRUE	45	AAAACCATAGTAAACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRNNNKLPSNLPQLQNLIKRDPPAYIEEFIQQYNHYKSNVEIFKLQPNKPSKELAELVMFMAQVGHCYPEHLSNFPQELKDLLSYNHTVLDPDLRMTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQH	48553	81644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_48694_54758_54864_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74805_75937_76070_76176_76262_77545_77708_81493
889670	contig_14666_pilon	+	1479	2	Intergenic	novelGene_39602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	85	1188	477340	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477255	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477365_483861
889671	contig_11896_pilon	+	7392	7	Intergenic	novelGene_88029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1176	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151257	184827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_151407_154470_154616_160035_160084_173159_173290_173423_173518_177241_180805_181564
889672	contig_2069_pilon	+	5737	11	Intergenic	novelGene_23308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_9	879.036313243088	1127	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	407	1414	514200	521807	TRUE	15	GGCAGTGAGTGGGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNITLANVIRQLGSLSKYAEDIFGELFTQANTFASRVSSLAERVDRLQVKVTQLDPKEEEVSLQGINTRKAFRSSTIQDQKLFDRNSLPVPVLETYNTCDTPPPLNNLSPYRDDGKEALKFYTDPSYFFDLWKEKMLQDTKDIMKEKRKHRKEKKENPNRGNVNPRKIKTRKEEWEKMKMGQEFVESKEKLGPSGYPPNLVYQNGSIGSVENMDAGGYPPPPPQSDSTSPPSPSFSEDNLPPPPAEFSYSADNQRGSGLAGPKRSSVVSPSHPPPAPPMGSLPGPKPGFAPPPAPPPPPPMIGAPPPPPPAGFGTPGTPPPPSPPSFPPHPDFAAPPPPPPPPAVDYPTLPPPPLSQPAGGAPPPPPPPPPPGPPPPPFSGADGQPAMPPPLSDAPKPKSSLPPVSDARSDLLSAIRQGFQLRRVEEQREQEKRDVVGNDVATILSRRIAVEYSDSEDDSSEFDEDDWSD	504405	533824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_504453_510937_511073_511590_511745_514129_514248_515265_515397_518070_518230_520112_520625_521649_525373_532115_532268_533110_533174_533281
889673	contig_5686_pilon	+	2705	2	Intergenic	novelGene_45215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3078	junction_1	0	162	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	159	350	93843	170346	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTNEAVFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSR	93684	172701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215
889674	contig_12919_pilon	+	3013	6	Intergenic	novelGene_75868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	77.6592557265391	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	252	791	247392	301682	FALSE	45	GAAATTATAGCTGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGGDVRESGERRGCSGGASRAAGRPGLRPPSGSLEADRRQAREQQQQQQQRRRLWHVSLLRLSLSQGRPGGPGGWRGVRCPRMGILFTRIWRLFNHQEHKVIIVGLDNAGKTTILYQFSMNEVVHTSPTIGSNVEEIVVNNTRFLMWDIGGQESLRSSWNTYYTNTEFVIVVVDSTDRERISVTREELYKMLAHEDLRKAGLLIFANKQDVKECMTVAEISQFLKLTSIKDHQWHIQACCALTGEGLCQGLEWMMSRLKIR	247140	303904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_247438_273723_273785_274176_274325_276180_276265_298077_298230_301633
889675	contig_12279_pilon	+	4758	1	Intergenic	novelGene_50088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1100	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2735	3043	60269	60577	NA	70	AACCCAAGTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQCSILEDVPRKRFASIPHSECSCSWVNITAAWYSVLESTLAYTRDGSHVVPETNSIYPFDKHLLNAVVLCYTLWFPQSEPIKTHLGFLIDSDILVICTTL	57534	62292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57500_62300
889676	contig_10861_pilon	-	2434	10	Intergenic	novelGene_39221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_4	324.685755009629	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	142	1473	596335	583577	FALSE	25	TTTAAAATCGTTTGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRMQMGKRWQSPMTKSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	603051	582615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011
889677	contig_12278_pilon	+	3429	11	Intergenic	novelGene_152591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	298.106423949569	29	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	230	1618	190419	201939	FALSE	25	TTCCCAGAGCTCCTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQATQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLLAKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	186304	203750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_186371_190255_190464_191700_191959_193856_193932_194886_195013_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
889680	contig_6102_pilon	+	3196	23	Intergenic	novelGene_31872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	528.2128472344	20	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	38	2050	370803	393578	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTEVKCTSDPCIRGPGPDSQLQGLWAR	370765	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379491_379617_379662_393551_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
889681	contig_10890_pilon	-	1828	6	Intergenic	novelGene_166782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	526.073378912106	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	521	880	130273	126635	FALSE	30	CAACTGTAAATATTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAQQPVYCASKHGIIGFTRSAAMAANLMNSGVRMNAICPGFVNTAILESIEKEENMGQYIEYTAPIKDMMKFYGVLDPSMIANGLITLIEDDAFNGAIMKITVSKGIHFQDYDTTSA	161065	125686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_126759_127970_128135_130201_130279_156819_156927_160559_160684_160781
889682	contig_9098_pilon	-	4154	10	Intergenic	novelGene_75842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	131.298453725157	62	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	2838	3707	345261	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	351199	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546
889683	contig_13004_pilon	+	2534	2	Intergenic	novelGene_112617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	285	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGGTCTCATACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174951	237120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_176296_235930
889684	contig_20293_pilon	-	2999	14	Intergenic	novelGene_153504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_8	295.035189958095	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	281	1564	50045	19443	FALSE	15	AATCTCCTCTTGTGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116224	18007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_116147
889685	contig_15787_pilon	+	3395	1	Intergenic	novelGene_143974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACTTTTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63162	66557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_63200_66600
889686	contig_2793_pilon	-	1205	8	Intergenic	novelGene_142869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	573	junction_4	411.7412502323	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	125	805	118367	79566	FALSE	25	CAATATCCTAGACTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKVIEEIQKFYKDTYEKLKGKEEPQRETLKAIHYALNCCGMHGGAEQFIVDICPKKELIATITIKPCPEAIEEVFTNKFHIIGAVGIGIAVVMIFGMIFSMILCCTIRRSREMV	118491	79165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_81932_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
889687	contig_8377_pilon	-	6015	26	Intergenic	novelGene_35008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.17575507653593	34	104	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3785	4120	164142	163807	TRUE	55	CTGTAAAACTGAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLEKRQKEGRKEQNGRERKGTERKGKRSKGKERRGGKRRERGRGEGRGGKGRKGKGRGGKGGEGREGRVGKGREGKGREGKGREGMIAGKPLRVDKETIKETEKPQTDR	199248	68178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68327_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161950_163485_164589_169245_169304_172899_173004_173644_173685_176607_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182893_183046_183256_183403_185675_185806_189174_189212_192226_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660
889688	contig_8375_pilon	+	4249	8	Intergenic	novelGene_141306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	148.55920279368	22	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	45	944	175812	213078	TRUE	30	AGCCCAGCAGCATAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQPKQKELVGSVRQKMLLDYSVYMARCVPQENRSPQKSPVLSAESSPTAGKKLPEALPSEKEEQEAWVNALLGRMFWDFLGEKYWSDLVSKKIQMKLSKIKLPYFMNELTLTELDMGVAVPKILQAFKPYVDHQVAGPEHTVWPIAMRNLPALAPLMKMMPQSPVGETNSSSRGVKGMLEVIEQVRL	175767	224075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_176056_180330_180579_190050_190198_195209_195310_211516_211643_213043_213254_215395_215517_221066
889689	contig_5718_pilon	+	4058	1	Intergenic	novelGene_110416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	937	1371	1445826	1446260	NA	55	AGCCCCATAAAACAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAVPFETKAAQLLVSLVSSPSASVSCGLLALGPHARICPAWASVPKLSSSTGKCPEAPYSTRRPSAHRHSAPSLRGLASLAPPISAQRHPTPPESLLLTDIQLSRSVGWLQRHLSPVSSFCCCWFSAAAASLLL	1444889	1448947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1444900_1448900
889690	contig_5222_pilon	-	3779	1	Intergenic	novelGene_58988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGCAGATCGGCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175531	171752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_171800_175500
889691	contig_4496_pilon	+	9557	9	Intergenic	novelGene_66668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	122.349333365573	1572	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	389	2773	911498	998163	FALSE	30	AATCAATGTGTTCTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859283	1004947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_891913_891995_899756_899893_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
889692	contig_14167_pilon	-	2611	5	Intergenic	novelGene_105528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	119.436960359848	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	107	748	64418	23509	FALSE	5	GAGGCTTGGTCGGTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCVDIKDNVVDEGFSFTPKGDDLCLSCTCHGGEPEMCVAALCERPQGCQQYLKDPKECCKFMCLDPDGSSLFDSMASGMRLIISCISSFLILSLLLFMVHRLRQRRRERIESLIGANLHHFNLGRRIPGFDYGPDGFGTGLTPLHLSDDGEGGTFHFHDPPPPYTAYKYPDIDQPDDPPPPYEASINPDSMFYDPADDDAFEPAEASPPVPGNSSSAGVGCQHCLGSGSASGQAVFEGATMAAWRMVR	64524	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_23610_24285_24343_26706_26944_28236_28390_64324
889693	contig_854_pilon	+	4552	23	Intergenic	novelGene_36646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	3771.93448954093	39	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1090	3273	53	3325	1698226	1714980	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1697760	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714477_1714862_1715360_1715559
889694	contig_12638_pilon	+	2186	18	Intergenic	novelGene_33164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	175.254456626569	1000	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	373	1986	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235649	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
889695	contig_13217_pilon	-	3545	8	Intergenic	novelGene_140893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	270.737315266202	1071	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	128	886	38899	26025	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLWLWSLYFLPVSGALKILPAVNLEGELGGSVTFECPLPKTYSRIYLCREMAAPGVCATVVSNGNFAKKEYIGRVSLNVCRKKNLFLVEMTGMTEDDSGVYACGVGLNTDRGKTQQITLSISKYYPFWEEEMALQTPGWFHRLLYLTAASTAPWFQMPEDAIPSEFVFKVTPAPRTQAPPADHPLPATPITHHSPISRASSVAAGKPPTLLPATTASKTSAREEEVRPQPAGYNHQTRLHRESLQPWTVWC	39026	19459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_21803_25100_25160_25379_25539_25926_26053_29411_29632_31492_31634_32322_32656_38862
889696	contig_5153_pilon	-	4218	4	Intergenic	novelGene_74349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	269	592	1146564	997713	TRUE	40	TAATATATATATATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKQLHGASSRRQNNQPPMIYAFPSPTLLHSHSAFSASYGHSLLAGKHWLHPVSLGFHLPVLAESLSAICWLTVLHFAASLDFFLTSHHLHLPSLKYLAPCAIFASS	1146832	872099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_873624_883584_884075_996100_997818_1146345
889697	contig_15087_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_37233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162751	164977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_162800_165000
889698	contig_9014_pilon	+	1862	5	Intergenic	novelGene_106795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2229.35577858268	92	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAAGTCTTTGTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150634	153639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151763_152234_152334_152425_152517_152851
889700	contig_13800_pilon	+	2083	15	Intergenic	novelGene_153704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	310.164118834279	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	17	1756	94219	162575	FALSE	60	AAAAAAAGAAAACACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCRRMDGASSGGGGSSEGGGDSGGSGYGVVARFSQCLAEFRTWLRTNWLRFNADKTDVMLCLRTADGPIISRIWPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94202	162902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_95566_95668_95759_95802_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
889701	contig_9706_pilon	+	382	1	Intergenic	novelGene_20769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCCTATGTAGACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161	543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_500
889702	contig_9297_pilon	+	2214	8	Intergenic	novelGene_69865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	390.00062794298	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	166	1875	909195	912790	FALSE	25	ATTTACACTGGTCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908946	913129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910132_910803_911101_911207_911446_911700_911869_912227
889703	contig_10861_pilon	-	2441	11	Intergenic	novelGene_39218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	355.074766774548	2	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	225	632	596335	588724	TRUE	10	TCGTTTGCCACTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSRVSVSPGRTSGKVTKHKVTEKRESPSPAPKPRKVELSESEEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQQSSSDSGSSSSSEDERPKRSHVKNGEVGRRRRHSPSRSASPSPRKRQKETSPRMQMGKRWQSPMTKSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP	603134	582608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588728_588810_588850_590763_590875_593286_593329_593734_593880_596268_596356_596851_596933_603011
889704	contig_10734_pilon	-	2721	7	Intergenic	novelGene_51053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	194.352557654039	1099	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	174	1061	431406	419688	FALSE	10	AGGCGAGGCCTCCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWQRQSVPADLSWAEQLATVVATFFESSVSREIPGSDRAGPWLEENVFTGQSKIYTYMSPNKCSGMRSPLQEENSVAHHEVKCQGKPLAGIYRKREEKRNTGNAIRSPVKSEEQKIKDARRGPLAPFPNQKSEAAEPPKTPASSGDATSAAIAKPSLKKPIKGKQAPRKKAQGKTQQNRKLTDFYPVRRSSRKSKAELQSEERKKIDELIESGKEEGMKIDLIDGKGRGVIATKQFSRGEFVVEYHGDLIEITDAKKREALYAQDPSTGCYMYYFQYLSKTYCVDATRETNRLGRLINHSKCGNCQTKLHDIDGVPHLILVASRDIAAGEELLYDYGDRSKASIEAYPWLKH	437420	418027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_419899_420740_420932_422333_422394_427399_427488_427836_428057_431288_431446_437286
889705	contig_1735_pilon	-	3128	3	Intergenic	novelGene_106900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTGGTCTTGGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261112	142165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_144588_155348_155976_261033
889706	contig_3956_pilon	+	1546	7	Intergenic	novelGene_15274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1412.41798188622	12	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	44	1027	1287318	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHAGTLVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1287274	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1287338_1287447_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289834_1290335
889707	scaffold_19766_pilon	-	4622	6	Intergenic	novelGene_34394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_3	46.6244571013969	791	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	93	833	830565	825937	FALSE	50	AAGGCACTATGTAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLPLNLKGPLPCRSWFESKRVVVCGPRFVMGPVRLGKLFFILAVFGAWSGTPKEQDDDSERLPSKCEVCKLLSQELQEKLSHTGRSREVLELGQVLDTGKRKKHIPYSVSETRLEEALENLCERILDYSVHAERKGSLRYAKGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQCETMLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	830657	822147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826309_827289_827413_827987_828085_828182_828310_830450
889708	contig_10990_pilon	-	2267	7	Intergenic	novelGene_7428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGCAGAAAGAAAAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689282	670569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_670768_671342_671551_674203_674315_674955_675067_675622_675715_680709_681655_688680
889709	contig_7428_pilon	+	1990	2	Intergenic	novelGene_77755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	186	551	516959	517324	FALSE	20	GAATATGTGTGGGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISSVRINGEKIEVVKDFVLLGSPINTHGSSSQEIKQCIALGTSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAVVFSFASYACESWPMNRENQRRIDVFE	515711	518763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_515833_516894
889710	contig_19777_pilon	+	3120	2	Intergenic	novelGene_29711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGCCTTTGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21817	24994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_23541_23597
889711	contig_804_pilon	-	3339	4	Intergenic	novelGene_138777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_3	496.840909033152	1010	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	446	799	36578	33688	TRUE	15	AGGTTGGTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIVRVKRYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAKSKSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQCCTTCVVQ	37144	21022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_23523_33647_33967_36503_36665_36785
889712	contig_935_pilon	+	6093	29	Intergenic	novelGene_45523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	236.100773516526	19	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2490	3	2492	32331	342978	TRUE	25	CTGGAATATGGCAGATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGDGGVAVAGLGALGSGAAAATVREILQDECYSDFLNEDFDVKAYTSQSIHQAVIAEQLAKLAQGISQLDKELHLQVVARHEDLLAQATGIESLEGVLQMMQTRIGALQGAVDRMKAKIVEPYNKIVARTAQLARLQVACDLLRRIIRILYLSKRLQGQLQGGSREITKAAQSLSELDYLSQGIDLSGIEVIENDLLFIGRARLEVENQAKRLLEQGVETQNPTQVGTALQVFHNLGTLKDTITSVLEGYCATIEENINSALDIKVLTQPSQSAVRGGPGRSTMPTPGNTAAFRASLWTNMEKLMDHICTVCGQVQHLQRVLAKKRDPVSHICFIEEIVKDGQSEILYMFWNSVTQALSSQFNMATNSSMFLKQAFEGEYPKLLRLYNDLWKRLQQYSKNTQGNFNASGSTDLYVDLQHLEDDTQDIFIPKKPDYDPEKALKDSLQPYEAAYLSKSLSRLFDPINLVFPPNGHNPPSSDELDSIIKTIASELNIAAVDVNLTLAVSKNVAKTVQLYGVKSEQLFSTQGDASQVIGPLTEGQRRNVAVVNSLYKLHQSVTKVVSSQNSFPPAAEQTIISALKTIHALMGNALQPLLTSVGDAIEAIIITMHLEDFSGSSYSSGTLDVPCSLYMKELQGFIARVMSDYFKHFECSDFVFDNTEATAHRAIELFVRHASLIRPLGESGKMRLAADFAQMELAVGPFCRRISDLGKSYRMLRSFRPLLFQTNECVASSPVLGDIIPFSVIIQFLFTRAPAELKSPFQRAEWSHARFSQWLDDHPSEKDRLFLIRGALEAYVQSVRSREGKEFAPVYPIMVHLLQKAMSTLQ	32328	368232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_32425_38644_38785_42660_42719_54776_54832_54940_55011_69923_70045_180131_180263_203784_203951_224594_224708_224960_225039_247370_247453_271835_272041_275731_275894_277978_278079_297805_297917_299379_299443_306936_307041_312307_312546_318261_318339_332052_332180_332648_332729_342863_345497_346641_346785_352424_352741_358168_358312_359245_359404_361934_362043_362703_362749_368062
889714	contig_3130_pilon	-	3548	1	Intergenic	novelGene_103580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGACCTACCTGTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159002	155454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_155500_159000
889715	contig_20561_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_166373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	438	788	96934	96584	NA	25	AACTATGTTCTCTATTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNGEKTDVVKDFILLRSPINTRGSSSQEIKRRTALGKSAAKDLCKVLKSKDVTLRTKVHLTQAMVFSIASYSCKNWAMNKEDRRRIDAFELWCWRRMLDIPWTAKRMNKSVLEEV	97371	95435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_-_95400_97400
889717	contig_18081_pilon	+	2351	3	Intergenic	novelGene_23780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	60	368	90717	113098	FALSE	25	CACACCCTTGTAGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDGDIK	90657	115081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104654_113077
889718	contig_4364_pilon	-	1918	6	Intergenic	novelGene_692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	753	1142	1532546	1531972	TRUE	40	ACCAGCAGCGAAGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPDSSYSCLLIHICWKVDSEARMEPPIQTEYLRSGGAMILIFIVLGASAVISFCILSAMPGYMVVPPDSTVLAYRSFRMSTSHFMMELKVVSWMPQDSIPKKEGWKRASGHRKRSLPMVITWPSGSS	1533298	1530464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093_1531335_1531616_1532054_1532156_1532341_1532422
889719	contig_10864_pilon	-	734	7	Intergenic	novelGene_107085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_6	398.922994518435	416	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	59	733	976495	911645	FALSE	30	TATGTGCATGAACTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPGSGRKRTPMKDRFSAEDEALSHIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKELDEKSDKQYAENYTRPSSRNSASATTPLSGNSSRRGSGDTSSLIDPDTSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMDELKEGLRQRDELIE	976553	911643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_911738_919440_919612_924360_924433_927814_927932_929301_929347_958175_958263_976405
889720	contig_2932_pilon	-	3266	1	Intergenic	novelGene_47957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1616	1939	325554	325231	NA	70	AAAAAAAAAACTATGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKLENTERITEDLLTENFPDTMKDEKLIIQETQRTPYRIDPKRKSPRHIMSTLTKTKDKERILRAAGEKRKVTYRGETIRLRFGSNCAARRQWDDRYKTFKEIFG	327169	323903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_323900_327200
889721	contig_16766_pilon	-	2117	9	Intergenic	novelGene_153356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	268.70426936504	52	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	611	2116	161044	125948	FALSE	65	ACATGAACAAAATTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQKTHPDPFGFDSDDESLPVSSKNLAQGKGSSYSESSEAAQLEDVTSVLEANSKISHPVGEDSVVSDKCLPLEDTLVGKEKSTNRIFEGDSSKSSCAKLITSGKVENFSEEHEKNIHHIYKNAEDSSKKPSAETTVTSGYKPDEVKETNDAWNSQVGKRSESPSETSQIKGSVRTGLYEWDNDFEDNRSEDCILSLDSDPLLEMKDEDFKKRLENLNEAIEEDIVQSVLRPSNCRTYCRANKAKSSQGASNFDKLMDGTSQALAKANSESSKDGLNQAKKGGVSCGTSFRGTVGRTRDYTVLHPSCLSVCNVTIQDTMERSMDEFTASTPADLGEAGRLRKKADIATSKTTTRFRPSNTKSKKDVKLEFFGFEDHDETGGDEGGSGSSNYKIKYFGFDDLSESEDDEDDDCQVERKKSKKRTKTAPSPSFQPPPESSDNSQDSQSNTNNAENLDFTEDLTGVPESVKKPTNKQGDKSKENTRKIFSGPKRSPTKAVYNARHWNHPDSEELPGPPVVKPQSVTVRLSPKEPNQKDDGVFKAPAPPPKVIKTVTIPTQPYQEIVTALKCRKEDKELYTVVQHVKHFNDVVEFGENQEFTDDIEYLLSGLKSTQPLNTRCLSVISLATKCAMPSFRMHLRAHGMVAMVFKTLDDSQHHQNLSLCTAALMYILSRDRLNMDLDRASLDLMIRLLELEQDASSSKLLNEK	194844	125946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_126095_129300_129413_130659_130797_131084_131238_132813_132910_157012_157132_160302_161347_187915_188204_194824
889722	contig_4213_pilon	-	3205	5	Intergenic	novelGene_124795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2054	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCTTTTAAATAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45589	12842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_13041_19189_19276_40540_40644_42732_44012_44050
889723	contig_6058_pilon	+	1633	1	Intergenic	novelGene_172391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGGCGCCCTTCCAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382679	384312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_382700_384300
889724	contig_9881_pilon	-	5765	6	Intergenic	novelGene_178240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	706	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTATACCAATCACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143801	1094824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9881_pilon_-_1096637_1131533_1131685_1133240_1133732_1135733_1136639_1141341_1142513_1142566
889725	contig_19061_pilon	-	5968	6	Intergenic	novelGene_173502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	356.400897866434	84	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	167	571	78343	42284	TRUE	10	AGTTCTGCCTAGCTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSGGGDGRPRGSAQHRSRPPRRGPSPRPTAELPRASVHSSPRPRSLLPLRPVLEIMNPVYSPGSSGVPYANAKGIGYPGYTPGTPYKVSCSPTSGTVPPYSSSPNPYQTAVYPVRSAYPQQSPYAQQGTYYTQPLYAAPPSCHPPHHGGAAQRHAGDSVPCTHPPLPEAMELPWVWWLGPLWPCQQGPY	93387	36365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_41649_42169_42296_43730_43911_44036_44180_78273_78355_93232
889726	contig_15327_pilon	+	2298	3	Intergenic	novelGene_70421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	27.5	1	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTAGCATTTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31771	34331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_32409_32488_32566_32747
889727	contig_20199_pilon	-	865	4	Intergenic	novelGene_82566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	397.525960018826	5231	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44193	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906_43951_44118
889729	contig_1008_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_121539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATTGTGAGTTGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292613	295004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_292600_295000
889730	contig_6677_pilon	-	2540	7	Intergenic	novelGene_114206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	2053	2538	594991	584600	FALSE	10	CCCGCTTCTCCTGAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFLFLLYFLQDKIISSLGFTIFIWCFCLGGLDHWHPPTPLAVFLLVLVLEIARKTGSRVTIRAAVVMVPVPLLVALMFGPGRAHRQGREGEEGRGAWGRELGSDSRPGGCQRRWWRRRQKQRLNRAWNGWGCIRWRQRPGMLAATTPPVRGRKRGVLARP	627231	584597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_585000_594905_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624540_625422_625530_626325
889731	contig_12079_pilon	-	1880	8	Intergenic	novelGene_67456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1215.10058372607	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	219	1043	600738	580996	FALSE	20	GCCACGGAATTCGTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKGIMDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLTNELSQARDDNKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM	601854	580158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_581996_585933_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782
889734	contig_5125_pilon	-	3665	8	Intergenic	novelGene_43469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	223.068763993052	524	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	182	1288	110365	75819	FALSE	25	TGGTTTTGTTCTAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGASRAQPRARRVGGESVPEPEQRLLVSRRAPGRSRSRSRNGRGRGKTICETGIGKSTLMDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINKDDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	182181	73441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_110198_110395_182029
889735	contig_9297_pilon	+	2399	9	Intergenic	novelGene_69873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	303.369308764087	27	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	153	1538	909195	912273	FALSE	20	CACTGGTCTAATTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTAQSSSGYV	908959	913134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911828_912248
889736	contig_4486_pilon	+	2219	13	Intergenic	novelGene_38570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1311.55860418901	5	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	430	1206	385395	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311762	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377382_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
889737	contig_7009_pilon	+	5154	10	Intergenic	novelGene_23634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	566.166925609684	119	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	150	1679	444955	537035	TRUE	5	TGCCTGCCCTCTCCTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKREKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	435108	541003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_435244_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_522972_536325_538722_539091_540420_540542
889738	scaffold_12124_pilon	+	1681	3	Intergenic	novelGene_22376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2523	junction_1	1107	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	734	1513	1508626	1509405	FALSE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497060	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1508010
889739	contig_6208_pilon	-	6225	9	Intergenic	novelGene_53021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	507.147352847277	909	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	110	2299	510910	492858	TRUE	20	TGAGTGTCCTAGGTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	531928	486612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_486820_488843_489025_489319_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_531834
889741	contig_8106_pilon	+	3693	1	Intergenic	novelGene_139737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	2693	3355	118625	119287	NA	65	AGAAGAAAGGAAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDLNLLKVKGWKKIYQANNYQKKGVAILISDKINFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQTLR	115932	119625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_115900_119600
889742	contig_13428_pilon	+	4196	20	Intergenic	novelGene_143435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	247.170772102442	14	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	743	2143	50306	82244	FALSE	35	TATTTCTCCATTGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEDLGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGRNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEEQMDAETSTAQPETMQTAACLVASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR	40733	84297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921_51995_53267_53378_54322_54413_59775_59830_60343_60464_61923_62034_66264_66387_70359_70503_73401_73503_73731_73953_80039_80115_82148
889743	contig_19777_pilon	+	3047	2	Intergenic	novelGene_29714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATTGTGCCTTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21833	24993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_+_24178_24290
889744	contig_6513_pilon	-	4560	21	Intergenic	novelGene_117764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	382	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3094	3396	171186	170884	TRUE	25	AGCAGGGGAGCATACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQNLSYFHAYVLVFQVGLHFFALGFQVGPHLSALEFQAVHHPSVLGFQDAHHSFALEFQAGFHPSALGFQVLTLLFLPCHYFVCCHLVLGQTVYFHSV	225019	159803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_159825_163882_164508_170365_171992_198971_199157_203369_203567_203802_203874_203963_204055_205628_205732_207918_208008_210569_210800_211563_211712_212244_212331_213106_213214_215598_215734_217492_217573_218549_218684_219546_219690_222540_222632_223705_223922_224032_224133_224937
889745	contig_7657_pilon	-	4899	3	Intergenic	novelGene_30056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388245	382321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_385084_385348_385434_386193
889746	contig_233_pilon	-	2300	12	Intergenic	novelGene_14587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1004.7439540615	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	269	1861	105485	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	107350	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300
889747	contig_5429_pilon	-	2298	12	Intergenic	novelGene_127814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTCTTCTAAAAACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499870	457979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_458043_459226_459345_460504_460677_463724_463810_467272_467391_472128_472239_474436_474547_476954_477055_479553_479619_491571_491722_495584_495687_498765
889748	contig_12605_pilon	+	982	5	Intergenic	novelGene_64208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_3	1827.76767875461	23643	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	21	389	3897	4829	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3876	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5034_5728_6005_6124
889749	contig_17171_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_147367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGATAGAGAATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250636	252898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_250600_252900
889750	contig_10241_pilon	+	4154	7	Intergenic	novelGene_142830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	67.1259181604907	720	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	388	705	133217	140032	FALSE	30	TTCATAAGGACTTTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPERSVNKRQEVAPPAQAATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	92698	143481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_100329_100391_105211_105323_116154_116192_130963_131026_133187_133277_139774
889751	contig_6227_pilon	+	7478	16	Intergenic	novelGene_49620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1557	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTCGGTCGAGCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336301	406738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_341549_342963_343183_343465_343585_344676_344785_345744_345879_349057_349124_349955_350052_352948_353075_354369_354511_355149_355317_356187_356565_359403_359520_361756_361857_392432_392538_395031_395334_406683
889752	contig_14220_pilon	-	2800	3	Intergenic	novelGene_159879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGACTTCATCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390270	386827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_386960_387089_388947_389459
889753	contig_11982_pilon	+	4505	5	Intergenic	novelGene_100253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	347	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACTAGCTATACGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89932	193875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_92719_137940_138237_182216_182357_191987_192656_193260
889754	contig_4232_pilon	-	1719	2	Intergenic	novelGene_63281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	913	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAAACTGTTTTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468081	466299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467456_467518
889755	contig_17144_pilon	-	1955	9	Intergenic	novelGene_29498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2345.44201257993	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	110	1069	179764	166965	FALSE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMELCPPWPGACQLVSCSPHGHQPGRGHQQYRPIVGKSNCGESVKHPACVRHIRGALQM	183191	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167047_167942_168031_173633_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
889756	contig_383_pilon	+	4654	12	Intergenic	novelGene_126127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	920	junction_7	216.505759280563	1145	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	2086	3960	141861	169172	FALSE	30	TCTGACCCTCCATGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	139775	169866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
889758	contig_5479_pilon	+	7930	9	Intergenic	novelGene_133611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	147.104342220072	2394	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	91	1050	356946	446821	FALSE	20	AACTCTCTGGTTTACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS	356855	453701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_356949_375219_375394_395880_395973_398958_399022_403751_403891_409404_409486_409800_409909_415695_415837_446662
889759	contig_4093_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_27606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTTAATAGCAGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40305	38353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_38400_40300
889760	contig_19098_pilon	-	4482	2	Intergenic	novelGene_65838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	856	1491	407806	407171	TRUE	50	GAACAGAGACAGAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	408661	403354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_403452_404276
889761	contig_5485_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_37726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	10	429	260264	259845	NA	40	TTGAAACTACAGACACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLIMAGEEINEDYPVKIHEYLSTFENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKHELGRIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKAVNKGKK	260273	257563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_257600_260300
889762	contig_12630_pilon	-	2082	6	Intergenic	novelGene_173081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	390	junction_1	30.1024915912288	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	52	942	100972	76619	FALSE	20	TGTGTGTACGAATCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRKCKPMKTETIQVSAEDEMQPYASYTEKNNQLYDTVNRVMTSQGLQTEVAGMDLHTLYVVGI	101023	75478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81810_81934_82253_100938
889763	contig_6047_pilon	-	2307	8	Intergenic	novelGene_24241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_7	287.945360463135	568	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	132	755	295666	281640	FALSE	40	TTTATAAAAATGGGCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDGDSSTTDASQLGISADYIGGSHYVIQPHDDTEDSMNDHEDTNGSKESFREQDIYLPIANVARIMKNAIPQTGKIAKDAKECVQECVSEFISFITSEASERCHQEKRKTINGEDILFAMSTLGFDSYVEPLKLYLQKFREAMKGEKGIGGTVTATDGLSEELTEEAFTNQLPAGLITADGQQQNVMVYTTSYQQISGVQQIQFS	297303	280087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_281673_282295_282376_283168_283251_284772_284971_286830_286962_288457_288552_295660_295740_297245
889764	contig_12864_pilon	+	3256	7	Intergenic	novelGene_76382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.74535599249993	908	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCTGGCTCCGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214630	223363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_217248_217816_217908_218501_218546_219172_219307_219915_220137_220625_220652_223240
889765	contig_9161_pilon	+	2827	2	Intergenic	novelGene_160641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1120	junction_1	0	8	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTGCTTTGTGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59894	64934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_61076_63288
889766	contig_18511_pilon	+	1625	7	Intergenic	novelGene_126891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	469.517719462097	23	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	583	1374	55332	61308	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	51938	63418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_52462_55272_55497_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191_61361_63219
889767	contig_1836_pilon	-	2644	3	Intergenic	novelGene_71072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	721	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1872	2237	994673	994308	TRUE	10	GCAGCAGCCGCCGCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLIERIMTGGYVEARNLGGLLLEDKGHHRSDGHSPNGQTNEGSPPQGAPGEGLHGIHHSQKAVNAYDCHEHDGGVHVTVKRCCDEATHFRPKFPVTSRKVIADLKGEYSHKQHICHGQM	996698	970877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_970941_993963_995345_995498
889768	contig_4812_pilon	+	2796	3	Intergenic	novelGene_103633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCCCGTCCGCGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78700	82288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_81286_81547_81739_82268
889769	contig_202_pilon	+	4660	4	Intergenic	novelGene_127071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	292	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2212	2511	183166	183465	TRUE	20	CCATGAATTTGTCTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPTALCPAIQSLREFGCVYGTSMTFPCTSCASFPCIVYCLNLHPRYHLSIAYLVFPPPPLPSLVTNRDCYILCVNFIMGFYSRGLIQYLSFCD	180954	278384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_183528_206557_207345_211248_211267_277102
889770	contig_11548_pilon	+	1616	5	Intergenic	novelGene_66775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	197	787	112832	119638	FALSE	35	AACTCTGGAAACCATTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112635	120467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
889771	contig_8544_pilon	+	602	6	Intergenic	novelGene_55922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	461	junction_5	213.633892442187	1080	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	226	600	90532	120355	FALSE	25	TGAGTTTTAAACATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQ	83414	120357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523_92618_120265
889772	contig_14293_pilon	-	2092	3	Intergenic	novelGene_178583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	703	1215	3037	2525	TRUE	25	TTGTCATAGGGCAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	85282	232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14293_pilon_-_529_1943_3086_84628
889773	contig_7816_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_66520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1045	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGAGGCACCTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188797	187166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_187200_188800
889774	contig_6063_pilon	-	2083	16	Intergenic	novelGene_27574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_13	521.837752562997	1421	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	557	1651	45585	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70251	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_48688_48772_52947_53066_70135
889775	contig_7035_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_83527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	851	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGTGCCAAACTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397779	396021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_396000_397800
889776	contig_20527_pilon	+	6545	6	Intergenic	novelGene_138616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1353.36626232517	30	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	610	1086	24977	27453	TRUE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	24367	34939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25023_25434_25614_26238_26346_27308_29978_30943_31742_32802
889777	SIRV6	+	965	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	533	-7	13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	30	TGTTGGTAACAATGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889778	contig_15353_pilon	-	2073	9	Intergenic	novelGene_151986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGCCTCCTCAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537908	531081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_531233_531813_532116_532207_532304_532973_533167_533265_533353_533691_533812_534315_534363_534442_534566_536954
889779	contig_11983_pilon	+	5490	3	Intergenic	novelGene_172083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	4038	5087	59543	60592	FALSE	65	CACAAAAAAAAGCACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	8982	60995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11983_pilon_+_11110_57022_58106_58715
889781	contig_6164_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_121253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	406	972	12924	12358	NA	30	TCCAAAACTTTTTTATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFYESTYFIVLIPSIVIAAIFLFFWLFMKETLYDEVLAKQKREQKLIPTKTDKKKAEKKKNKKKDIQNGNLHESDSESVPRDFKLSDALAVEDEQVVPVPLNVVESSSSVRERKKKEKKHKLVLEEQVTKESDVSKIPGKKVEPVPVTKQPTPPSEAAASKKKTGQKKSKNGSGTIIFLTLSRFYLF	13329	11856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_11900_13300
889782	contig_12540_pilon	-	1010	5	Intergenic	novelGene_148116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	25.1793566240283	444	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	194	679	1142284	1136936	TRUE	5	CTCTGCAGTTTGGGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKWGKARVGGVLLLLLLVMALGVALIIIVNSKACKDGLEVQKEGQNATHLKRQLTQAQEGFWEAQAQADACNHTVVNLTASLEVEKAQGQKKQALVEELEEEIKKLNQKLQEKMAEVEQLRKEKEARGNSHTSSSSTTLSPSVAAGLLQLLGLIMAVLL	1142477	1136435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1136745_1136913_1137054_1137298_1137360_1137757_1137834_1142053
889783	contig_19960_pilon	+	3185	2	Intergenic	novelGene_164183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	160	516	5228	5584	TRUE	35	GGGAAGAAGTTCCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWSEKILCIISTFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVPFRFSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIAELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGV	5068	8383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_6154_6283
889784	contig_10307_pilon	+	1540	3	Intergenic	novelGene_170264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAAGTTGTGAGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387434	392566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387801_390278_390382_391495
889785	contig_11071_pilon	-	2255	6	Intergenic	novelGene_131026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_5	301.26068445783	1162	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGCAATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189037	90444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_92144_96150_96200_104797_104900_106647_106797_111264_111381_188897
889786	contig_10732_pilon	-	3229	2	Intergenic	novelGene_114678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	645	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAGTGGCTAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65022	61744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_62646_62694
889787	contig_5210_pilon	-	4484	11	Intergenic	novelGene_65439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	599	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACCCGCCGGAACTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625234	565726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_565823_591286_591358_606726_606861_608378_608456_610961_611101_613061_613146_613241_613337_614669_614847_616478_616651_617260_617407_621941
889788	contig_5961_pilon	-	5345	1	Intergenic	novelGene_144156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACCACAATATGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223715	218370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_218400_223700
889789	contig_12520_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_161079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGTGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545439	542505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_542500_545400
889790	contig_5669_pilon	-	508	3	Intergenic	novelGene_86045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAGTCTACCCGATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120513	117740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_117920_120020_120107_120270
889791	contig_4891_pilon	-	3764	13	Intergenic	novelGene_124510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	115	junction_1	323.46959113476	1273	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	185	1360	68026	30210	FALSE	45	CAAAAAAAGACCCAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMGGGSTPVSSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ	92793	27805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_30326_32227_32315_33408_33558_34387_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
889792	contig_5954_pilon	+	2578	12	Intergenic	novelGene_28506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_11	694.498392027603	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	421	1722	438796	443568	FALSE	5	TTCTGGGTCTGATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQRSLPAAAMARAMRVRTFRAHW	430423	444424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408_432538_438686_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441483_441740_441801_441925_442106_443503
889793	contig_15666_pilon	-	2081	7	Intergenic	novelGene_70145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	593.714694856788	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	39	1208	110619	107816	TRUE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110657	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107224_107398_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
889794	contig_5145_pilon	-	2471	5	Intergenic	novelGene_131456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	412.750757116204	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	33	1151	956111	951288	TRUE	5	TGTGTCTGTGTGTCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAYEQVQKAPLKLKGVAELGVTKRKKKKDKDKAKLLEAMGTSKKNEEEKRRGLDKRTPAQAAFEKMQEKRQMERILKKASKTHKQRVERKSSASAGGASKKRRTITIENKVEIIKRSERGETPSVIGKALGYSRSTIGTILKDKVRIMEHVKGCALMKATVITKQRSGLLIEMERLLIMWLDDQNQRNMPISLTLVQRKARSLFNDLKAARAAREGDCDEEFVASRGWFNRFKVRANLHNIKVRGEAANANVSAASDFPEMLKNDGELLNSHAEELTNEGLKELEQQMIAFEEEDQDQKTPVPKKFLTKELAEAFRLIEAGMAKLEEQDPNTERFTKVYRVVTEGLSCYKAIYDEKKKSSVQTSRMPTSGN	956143	948694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_949817_951089_952140_952957_953012_955790_955930_956037
889795	contig_5669_pilon	+	4114	1	Intergenic	novelGene_86085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	478	810	191570	191902	NA	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKNAILGKQIHCICGALVRFKSPSSLCPCILPSQSLTFTIISLQTKNLLLSIPTHGDPTGQSRTAPQGSQGAAGGFKLPTFSLAVELLTAVPPGLLPGNPMGQFYSVL	191092	195206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_191100_195200
889796	contig_2438_pilon	+	1660	4	Intergenic	novelGene_112018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	403.209622901041	30	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	83	544	310588	312412	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	305083	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305
889797	contig_10904_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_22486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	918	1376	150657	150199	NA	40	GAGACAGGAGGTGGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGGGVRELSTFGGGEGRKKSQGSQGNRKEEDGKGNSEEGRWEEETGREIQRRKMAGGTGGRKLGTENRKKIERGNRKEKDGKMWVGNRQMRKQTGKAGEQTKRRKRSEKKREMAQNKIDVGNKTKQRKQNRKKEEKRKQRNGREQDERERQ	151574	150179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_150200_151600
889798	contig_3601_pilon	-	5090	1	Intergenic	novelGene_132942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10514	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	3416	4798	427702	426320	NA	30	ACACAGAACTTCTCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLRTMQTVKKEQAPIDTSSNVDKMIVLSSALTEVSEDLTTGEDLLLNEGSVGKNKSSACRRKREFIPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTAYAQEIQKLSNSTAVYFQDYPTSKSNVSSFVDEHERSMVASSCISVIKHSPQSLSDGSEVSSVEHTQESPVQSSCRSPENKFQIIKQEPMELESYTRETRDDREVTTPIYQNYIGNSFPGYSHSPPLLQVNRSSSNSPRTSETDDGVVGKSSDGEDEQQVPKGPIHSPVELKHGHATVVKVPEVNSSALPHKLRIKGKAMQIKVEALDGEFDAAQKLSSAIDMTSKRHFELEKHNTPNMVHSALTPFSVQVTNIQDWSLKSEHWHQKELIGKTQNSFKSGVVEIKDSVYRVSDPENLYLKQGIANLSAEVASLKRLITTQQISASDSG	431117	426027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_426000_431100
889799	contig_14666_pilon	+	2004	3	Intergenic	novelGene_39620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1754.5	29	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	57	623	477340	484940	FALSE	20	GCCACCTGGCCATGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477283	486321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479865_484460
889800	contig_9049_pilon	+	2028	7	Intergenic	novelGene_83133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1585.15130718385	107	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	43	426	88356	108337	TRUE	65	AATAAAATGTAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSH	88313	113659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108330_108724_111558_111685_112569
889801	contig_18735_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_132683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77037	75319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_75300_77000
889802	contig_10722_pilon	-	3668	10	Intergenic	novelGene_70970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_7	283.178432602764	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1994	2377	6730	6142	TRUE	25	CTGCTTCAAATATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPCKIFFRIEMTCRAL	16871	3717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_6328_6423_6529_6637_8262_8496_8562_9665_9787_14297_14446_16247_16358_16853
889803	contig_18419_pilon	-	2819	2	Intergenic	novelGene_141463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	549	junction_1	0	987	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	9	302	31647	31156	FALSE	20	TGAAAGTGTCCTAGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMSRHKTYSLSPRDCLKTCLFQKWQRMVAPPAEPARQQPSKRRKRKMSGGSTMSSGGGNTNNSNSKKKSPASTFALSSQVPVSISAFFSLLGCPTADP	31655	28638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_31359_31556
889805	contig_6059_pilon	-	1435	9	Intergenic	novelGene_44847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5219.58005973661	4	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	549	992	571435	569146	TRUE	30	CTTAAACCGTGCACATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584570	567802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571460_571545_571651_572866_572958_573165_573439_584515
889806	contig_2093_pilon	-	5824	4	Intergenic	novelGene_152987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	314.935266717181	26	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1	435	1387010	1384575	TRUE	35	TGATGATACAACTTGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFPLHLHPDDKAEAARPAQEFSPHTHLSSFLLFDPQQAGHSPNSRRLCRRQGARQKHPPAFHKPSAEARGHRPKQTRGRLQHLGGPETESGSGLSPFTSRSRPGTPGSIGTWTIAAARRAVLSPLERLEPWSRDHILKRDCNQQ	1387010	1352507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1357752_1372530_1372620_1384518_1384610_1386610
889807	contig_14030_pilon	-	1856	6	Intergenic	novelGene_62231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	366.664424235567	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	381	698	394370	337442	FALSE	55	TGTTAAACTAAATAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKRIHKELNDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKGTTE	394750	336283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_337456_344002_344109_344193_344272_344350_344383_350784_350849_394346
889808	contig_4891_pilon	-	1671	10	Intergenic	novelGene_124605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.8459705765817	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	652	1062	1040402	1031913	TRUE	15	CAATGGCGTTCTGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADEDRARFYLESAGWDLQIALASFYEDGGDEDIVTISQATPSSVSRGTAPSDNRVTSFRDLIHDQDDEEEEEEGQRFYAGGSERSGQQIVGPPRKKSPNELVDDLFKGAKEHGAVAVERVSKSPGETSKPRPFAGGGYRLGAAPEEESAYVAGERRRHSGQDVHVVLKLWKSGFSLDNGELRNYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKPKGAFKAFTGEGQKLGSTAPQVLNTSSPAQQAENEAKASSSISINESEPTTNIQIRLADGGRLVQKFNHSHRISDIRLFIVDARPAMAATSFVLMTTFPNKELADESQTLKEANLLNAVIVQRLT	1053768	1030341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_1030839_1031800_1032076_1034013_1034179_1040319_1040458_1040851_1040962_1042044_1042138_1042773_1042940_1045430_1045506_1051070_1051169_1053714
889809	contig_5947_pilon	+	2811	11	Intergenic	novelGene_101612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_5	82.9928310156968	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	374	1171	995846	1005780	FALSE	15	GGAAGGAGGCTGTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLIQVSIQEDPWNLPNSIKTLVDNIQRYVEDGKNQLLLALLKCTDTELQLRRDAIFCQALVAAVCTFSEQLLAALSYRYNNNGEYEESSRDASRKWLEQVAATGVLLHCQSLLSPATVKEERTMLEDLWVTLSELDNVAFSFKQLDENYVANTNVFYHIEGSRQALKVVFYLDSYHFSKLPSRLVSGASLRLHTVLFTKALENVEVLPPPGSPASEDLQQEINAQSLEKVQQYYRKLRAFYLERSNLPTDASTAAVKIDQLIRPINALDELCRLMKSLVHPKPGASGSLGAGLIPISSELCYRLGACQIAMCSTGMQRSTLSVSVEQAAILARSHGLLPKCIMQATDIMRKQGPRVEILAKNLRVKDQMPQGAPRLYRLCQPPVDGDL	990836	1007420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_990932_992359_992402_993750_993972_995830_995931_998186_998331_998421_998537_1000065_1000133_1001270_1001444_1003322_1003426_1003735_1003804_1005737
889810	contig_5871_pilon	-	743	6	Intergenic	novelGene_160172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	500.659964446929	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	198	743	342910	311833	FALSE	40	GTAAGTTATAGTGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIHHQRHSLSKTAYQASLSPCSVNVQVLNRHFAAATKPAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIAT	364225	311832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113
889811	contig_17440_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_7553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACAAGAATTATTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225	2051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1200_2100
889812	contig_15666_pilon	-	2235	6	Intergenic	novelGene_70130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	697.404158289869	3	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	187	1092	110619	107816	FALSE	40	TAATTCCTTTAATTAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110805	106672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108603_108859_109098_109138_109948_110246_110558
889813	contig_8597_pilon	+	4838	17	Intergenic	novelGene_158691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	980	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCAAGTGAGAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17686	60428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_20351_23015_23220_24270_24533_24693_24773_29196_29286_29492_29564_36373_36534_37783_37972_40965_41058_41324_41417_42546_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53379_55223_55387_58900_59054_60321
889814	contig_8462_pilon	-	3909	8	Intergenic	novelGene_159423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	642.189558130174	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	515	1450	233773	231564	TRUE	10	TCTCCTTTGTTGCTGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLEEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEEPDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNVNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLESMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQSSGASSSGFSSSRAGSSRSGGGGHGGSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN	234287	229052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_230615_230666_231644_231853_231994_232351_232506_232811_232930_233055_233238_233431_233577_233656
889815	contig_15353_pilon	+	2006	8	Intergenic	novelGene_151989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5463.94571491246	856	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	531	1157	533056	537093	FALSE	15	TCCTTTTCATGTATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLMRRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRMGYMDPRERDMRMGGGGAMNMGDPYGSGGQKFPPLGGGGGIGYEANPGVPPATMSGSMMGSDMRTERFGQGGAGPVGGQGPRGMGPGTPAGYGRGREEYEGPNKKPRF	531906	537942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_532116_532207_532447_532973_533171_533269_533355_533693_533812_534315_534365_534444_534567_536955
889816	contig_9479_pilon	+	5826	6	Intergenic	novelGene_176670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1869	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2585	2923	13615	13953	TRUE	30	TAGCACCACCGAATGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPRLLNIKSYHTGFQSFGKRLAKFRIGAGAAPAGEIVSSLCGPRAVALSRVVDGAIDVRFQLCLRSLCFVWCRRNAGFRKHLRLLLSGGGSPLASGALRRPVGLQVTGD	7762	31757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_+_9978_11355_11489_13378_14905_15745_15865_19302_21081_31702
889817	contig_6593_pilon	+	4432	3	Intergenic	novelGene_49848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1547	109	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCAGTTTTATGACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205602	1213113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1205730_1205828_1209689_1212668
889819	contig_5229_pilon	-	2008	5	Intergenic	novelGene_117690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTCACACAGGTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474024	455642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_455741_466700_466987_468070_468265_468590_468723_472726
889820	contig_8310_pilon	+	1816	2	Intergenic	novelGene_75613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1185	1526	325484	325825	FALSE	45	CTAGCAGATAAGCACAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPVCPWPWGQQSRHPGCLPQHHLLPAPLSVASDSPLRLKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDCKFSEKHFGI	324174	326115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_324836_324960
889821	contig_16303_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_34135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	58211	58567	NA	10	CTTTATGTATGTCTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQDQEACRQILPSSEQDSSLSSSWQLLLQASRPFSLLCTPPLGHAGLLSATSGQALLSPAICRHQLCHRAPSGPLAVFSITAFDQCYSSFRRCLAASLSASSLISLAFAPFCFFLLPV	58208	60526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_58200_60500
889822	contig_10594_pilon	+	2993	1	Intergenic	novelGene_142319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGTGTCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255032	258025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_+_255000_258000
889823	contig_6102_pilon	-	2109	16	Intergenic	novelGene_32330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	310.811382602947	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	335	1786	1690955	1685481	FALSE	15	ATACTTCGCATCGTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQGSRCLCGQTCRLDTSEPPPALQPPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691585	1685157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1690853_1690968_1691159_1691386_1691489
889824	contig_9706_pilon	+	4273	3	Intergenic	novelGene_20957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCTTTTTAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302088	332927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_303821_303987_304542_330940
889825	contig_7748_pilon	-	2756	2	Intergenic	novelGene_101041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	0	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATACATTCCCCAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151191	147971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_150506_150969
889826	contig_7753_pilon	-	3582	10	Intergenic	novelGene_41459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_7	117.369733411079	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1659	2456	562350	527304	FALSE	25	AATTTGGGTTGAGAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRIHFVVDPHGWCCMGLIVFVWLYNVVIIPKIVLFPHYEEGHIPGILIIIFYGISIFCLVALLRASITDPGRLPENPKIPHGEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRNLDLFVIRHELAIMRLAAFMGIIMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEEISRPRKPWQQTFSEVFGTSWKILWFIPFRQRQPLRVPYHFANHV	574069	526177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_527437_527981_528026_535563_535681_550197_550337_553390_553503_560672_560772_562196_562398_564972_565139_567959_568101_572765
889827	contig_15165_pilon	-	2724	6	Intergenic	novelGene_145315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.8485701552087	465	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	1083	2222	224352	216810	FALSE	15	TGTCCTTTATCTGAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLEAKKPSVCESKPLTRERLRTTLSVLKGIVASCYGPSGRLKQLHNGAGGHVCTTSQSSALLRGLSVTHPVLKILTTSMQNHVSCFSDCGLFMAILCCNLIEYVEGIDLAPTTVIELNKQLLSLCTSYLKSEACACRIPVDFSSTQILLCLVRSILTSKPACMLTGKEVDHISALVLRAFLLTIPEKAEDHIILGKSIIVPLKGQRVIDSTVLPGMLIETSEVQLMRTLPIKKSSALKVALFCVSLSGDFSDTGEGTLAVSYGVSLESAVLDQLLNLGRQLVWDHIDLVICQKVIHPSLKQFLSTHHVIAIDRVGVALMEPLSKMTGTQPIGSLGSISPSSYGSVKDLCSAKFGSKHFFHLIPNLILDLAYVIEDKN	246876	216307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_216857_220082_220191_223367_224773_232817_233041_246278_246461_246619
889828	contig_1263_pilon	-	3980	8	Intergenic	novelGene_170380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1016.00259119065	263	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	206	1345	65303	55502	TRUE	35	CTGCAAATTCAAATATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPEKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76749	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53551_54738_55637_58131_58321_59765_60012_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
889830	contig_15866_pilon	-	4200	1	Intergenic	novelGene_63650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	539	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATATTCAAGCATGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528118	523918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_523900_528100
889831	contig_1725_pilon	-	2931	20	Intergenic	novelGene_24251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1557	1883	246650	244943	TRUE	10	GCGCTTCCCCAAGGCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKQLLHQLQRPALQGFGKHCVVGIRKGLLGDFPCLRPGQFFNIHENPHQLRDGKCRVSVIQLDGNLIWKGIKHSLGAVGGAKLGGFETPDDILQGSSHHEVLLLQS	255741	201308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_201726_207388_207488_209776_209855_218440_218546_235997_236132_239623_239738_240047_240131_244924_245067_245295_245389_246540_246690_247022_247187_247639_247759_248347_248446_248573_248724_248851_248911_249014_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252777_255364
889832	contig_12790_pilon	-	2717	2	Intergenic	novelGene_35278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTAATGCACTTAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438690	408800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_409843_437015
889833	contig_7151_pilon	+	2809	8	Intergenic	novelGene_40749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	193.450515741924	15	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGGGTAAAAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502502	559015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503041_503212_503293_503387_504052_504143_505033_505118_506637_506685_507738_509609_558745
889834	contig_7898_pilon	-	1006	4	Intergenic	novelGene_47592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	373.725686685955	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	355	630	502396	500592	FALSE	20	GTAATTGACATGTGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTDVREKDLEDLFYKYGRIREIELKNRHGLVPFAFVRFEDPRDAEDAIYGRNGYDYGQCRLRVEFPRAYGGRGGWPRGGRNGPPTRRSDFRVLVSASFLYVLCLGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVQKDGMGMVEYLRKEDMEYALRKLDDTKFRSHEGETSYIRVYPERSTSYGYSRSRSGSRGRDSPYQSRGSPHYYSPFRPY	508312	500215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_500736_502264_502465_505661_505823_508187
889835	contig_10581_pilon	-	2285	2	Intergenic	novelGene_41367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	120	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAATGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374772	372187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_373882_374181
889836	contig_13347_pilon	+	6676	8	Intergenic	novelGene_178584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	706	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTTAGAAAATATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6922	357322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13347_pilon_+_7351_12227_13625_18471_18608_163680_165043_176959_177037_177080_177743_178120_179708_356295
889837	contig_6199_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_126347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATCAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91552	88556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_88600_91600
889838	contig_4857_pilon	-	2682	4	Intergenic	novelGene_48788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5680	junction_2	1051.33322764743	387	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2110	2487	1243185	1234290	FALSE	35	TAAATTCCAGCAGTTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKVRC	1245294	1234094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122
889839	contig_5461_pilon	-	2215	1	Intergenic	novelGene_156838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGTATCCACCCTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833332	831117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_831100_833300
889840	contig_546_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_117210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAGTCCACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109098	107072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_107100_109100
889841	contig_2798_pilon	-	4248	2	Intergenic	novelGene_120014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	175	junction_1	0	48	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	1299	2231	116665	115733	FALSE	0	GTTTGCCTGTTCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	121736	113715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452
889842	contig_12951_pilon	+	3303	10	Intergenic	novelGene_68190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	308.223944559796	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	148	1341	755258	837374	FALSE	10	CATGGATTTGGGGTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEHCPPRS	755110	839336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934_836020_837353
889843	contig_7173_pilon	+	2746	3	Intergenic	novelGene_37533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	107	1	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2145	2579	225253	225687	FALSE	35	TACCAATTTTTATTGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHCLKTGTFKDSLIRPSCRRLPSKPGVLHVEALGDFERSTYTVQRLLVLCLPTLFSPLDPDLCRKHALPDPLSGQEAPEHKLVTPFLVSSLVQIVLECGCLWPPGSLFLHSHKSFWRVATRPLKSFFSFLVFKMLWIRDWLNP	213028	225854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_213250_220273_220563_223618
889844	contig_6589_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_25712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTGTGACTCATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447057	446159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_446200_447100
889845	contig_3469_pilon	-	3460	2	Intergenic	novelGene_34184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	284	721	453468	453031	TRUE	70	AGGGGAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQNRTPDDLPVEEKALNLSDREFKSLIFRITQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMKNTDKKLEEFKKIKQEQNAKINSQLEIIQKQQLENQKINNKISEMDSVIEGQRRRFEKRWKIGSVKLKTNTWTQLCLRRSQKKE	453751	450167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_451931_452054
889846	contig_15720_pilon	-	2825	10	Intergenic	novelGene_41906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	1971.59495502161	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1830	2783	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	297368	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785_284401_284497_284723_296270
889847	contig_10642_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_78686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCTCTGCCTTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212710	215621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_212700_215600
889848	contig_5419_pilon	-	2644	15	Intergenic	novelGene_15491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1766	2356	244823	241857	TRUE	20	TCAGGCTGAGATGTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWFTSWVPRNRWRTICLAFSSSFLLMSKNLGLSGQNGRAALCRTAGMMVNPSSTGHSSSDPKMTSRPNIWATRMPMTMPSWLRVPKAPRRAVGDISPMYMGTKPVHSPQKRPIIKRPRISISTDLANLQNPIRQPPATANMLTISIELRLPKRLTNSPTEKEPIIPPTEKTATDTDQREVSNIAEGSSSNLISKV	265521	238758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_238931_240578_240672_241833_241996_243789_244031_244281_244447_244777_244969_247536_247641_248008_248112_248673_248878_249614_249997_254896_255295_255450_255623_263272_263376_264136_264265_265495
889849	contig_6446_pilon	-	3163	5	Intergenic	novelGene_149211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	721	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	60	308	488954	488706	TRUE	35	AATTCTAGTTTTTAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVFISVAKLSDKVLPVAMQSSEDQEQGKAWPQQYMSPKSQQTKQKALGRACAAMQVPSPVAVRAEPPNRNQGGSCVARTWMGRVTPAMQRALCTEPPSF	489013	335245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_335300_375153_375340_397016_397080_437777_437944_486319
889850	contig_4876_pilon	+	6765	10	Intergenic	novelGene_137874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	408	118	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	4	1008	14	58932	TRUE	80	AAATTAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKKTLTALKREINSSTITLGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFFRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIERPNCSDTTK	10	436209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_991_58904_60320_222952_222961_275602_275837_280469_280713_406683_407614_407664_408636_411978_413220_431455_431463_435473
889851	contig_16643_pilon	-	4923	4	Intergenic	novelGene_158122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3125	junction_1	490.232824505074	1286	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2018	2359	239718	239377	TRUE	25	TAAAGCCTAGTTGTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLLELGACPVGKLLCKLHDTKAALPMVRGHRDSFLENSGPTYISTLFDPQTLESLYVCVLRGTAFACCCNPALCSLPGSEGFSVRINKRGNLFLNQKGEDSSRAGVSNAFL	241735	230852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_231433_232651_232722_234526_234649_237584
889852	contig_16685_pilon	+	5765	2	Intergenic	novelGene_115044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1388	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCAAACCAACAGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443826	498269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_448089_496766
889853	contig_16125_pilon	+	3787	12	Intergenic	novelGene_155229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	421	774	115227	115580	TRUE	60	TACCTAAAGGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCEGRLQRRQEEMRSSILTLNWRSDNLFSGIVSGYGLRLKVVGNSIWSSQFLSQNRKQRYWDTDGRFGLEQAVPHPLRLKQKAVRMGAEKDFCRYGIKLRKRKADGLNFFFVFLMK	114806	153486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_117615_118857_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138993_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_153471
889855	contig_11292_pilon	+	4150	14	Intergenic	novelGene_109422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1144	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1864	2244	215508	215888	TRUE	30	ACCCCAAAATGGCGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVSLLFAYVRRTYRCFIPRELLAPSWEREAEMQDKNLKNRWQKLSISTEGSYGGVSASSSKGPDWCQSAIPTLLKANLPCPVPRPHSSWMSVLISPTLMLREILRVRFLFHLVLSLGVATWGKF	213644	294591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_216146_216233_216400_216814_216956_218880_219068_220383_220499_220861_220993_222509_222584_225466_225628_225950_226035_226611_226745_227517_227567_227929_228012_237041_237234_294457
889856	contig_13888_pilon	-	5020	10	Intergenic	novelGene_151819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	62	junction_5	30.6847772609735	684	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	33	1178	381770	369361	FALSE	15	CTCCTGGTACCTGGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGTTGSSGNMASSSSNVPATVTGRSQLRKPKSKQENRDDSELLTVPDGWKEPAFSKEDNPRGLLEESSFATLFPKYREAYLKECWPLVQKSLNEHHVNATLDLIEGSMTVCTTKKTFDPYIIIRARDLIKLLARSVSFEQAVRILQDDVACDIIKIGSLVRNKERFVKRRQRLIGPKGSTLKALELLTNCYIMVQGNTVSAIGPFSGLKEVRKVVLDTMKNIHPIYNIKTLMIKRELAKDSELRSQSWERFLPQFKHKNVNKRKEPKKKTVKKEYTPFPPPQPESQIDKELASGEYFLKASQKKRQKMEAIKAKQAEALSKRQEERNKAFIPPKEKTVVKPKEASIETKIDVAAIKEKVKKAKNKKLGAFTAEELKLKMEANEKKKKTKK	381802	365518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_369504_371205_371300_371407_371486_374689_374861_375937_375995_377335_377420_377510_377637_377810_377946_378829_379003_381685
889857	contig_19851_pilon	+	2844	2	Intergenic	novelGene_29841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8446	junction_1	0	1834	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCGTGTAAGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53462	56531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927
889858	contig_9706_pilon	+	2766	3	Intergenic	novelGene_20958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCTCCAGCACACATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302121	331440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_303821_303987_304555_330940
889859	contig_4213_pilon	-	5420	1	Intergenic	novelGene_124802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1503	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	4685	5068	32739	32356	NA	35	CTAAGATAATTCTTATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPVPNPLCLPISPLDRSCSFSFLNLLELRDTFLTSITLCPTVQSNPCLKSWPQKLFYFWADRESRGHAFQGSSSLSQTIKSGLFLEFELHALPFSCSIRNSLLCSLSGRSSVVAGHHLVLLVSG	37423	32003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_32000_37400
889860	contig_602_pilon	+	4646	7	Intergenic	novelGene_134951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1307	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3138	3641	484283	484786	TRUE	5	CGAGGTCCTGTCGGGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSHRPTVGLGCDLCFRSMEASSWSLFSSCPGLSKKVWIISSTPKKKDQVQKTLSKGSPKQNTVAAGPGSLKGRKSTYKNVLKIRVKKMVLSFNTPISSLLYTVTPQKRGHLGLTGRSGSGSCGQALTAPRRPFPSPVCSFPFGKSTILSSRPRAGWFGLFLWNHQ	481145	598028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_485250_490711_490841_509630_509682_510969_511014_528025_528099_528733_528816_597865
889861	contig_5479_pilon	+	5857	9	Intergenic	novelGene_133609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	188.544424473385	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	70	606	344638	409469	TRUE	20	CCTAGCAGTCAGTGCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKTPEEKTTNTISKCDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDNCLSALWEVCGLVGIWSPAV	344568	451731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_344695_375219_375394_395880_395973_398958_399022_403751_403838_409404_409486_409800_409909_415695_415806_446714
889862	contig_18163_pilon	-	1148	3	Intergenic	novelGene_35307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.5	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	430	771	9586	9125	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWEPPPQSIMGIVAGLVVFGPAGCWRCGGCSCDLRKKSLGREGWGLSFLIQLEGFDPQVGVFASSASL	10455	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9325_9444_9811_10250
889863	contig_6270_pilon	+	2617	9	Intergenic	novelGene_99797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	368.34528638222	403	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	92	1081	27433	45668	TRUE	30	ATATCAATCTACATCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLREESVKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27341	48794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_47302
889864	contig_13244_pilon	-	1564	4	Intergenic	novelGene_86972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3731	junction_1	740.454965244717	286	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	39	371	299402	297251	FALSE	25	CTATAACTCTAGATTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRHLPCSLSVGTMKVELCSFSGYKIYPGHGRRYARTDGKVFQFLNAKCESAFLSKRNPRQINWTVLYRRKHKKGQSEEIQKKRTRRAVKFQRAITGASLADIMAKRNQKPEVRKAQREQAIR	299440	296057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_297392_298566_298678_299204_299281_299397
889865	contig_5643_pilon	+	1369	11	Intergenic	novelGene_38798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2020.36461065819	142	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	68	1003	233973	237822	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233607	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720
889866	contig_10197_pilon	+	7350	9	Intergenic	novelGene_115200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1320	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATACCACAGCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646558	923586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_647025_647546_647749_753589_753931_763869_764223_828662_828956_851612_852016_852580_852968_918391_919188_919477
889867	contig_4336_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_152374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCTGTTTGAACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399604	401812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_399600_401800
889869	contig_11026_pilon	+	2273	6	Intergenic	novelGene_167639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	214.630286772394	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	85	714	43170	125017	FALSE	30	ATACACCAGTTTTGACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEKAINSKSEVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	43085	126576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89085_122204_122246_123351_123427_123810_123967_124915
889870	contig_19701_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_147879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAAAAAAACCCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19841	17285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_17300_19800
889871	contig_2093_pilon	-	3537	2	Intergenic	novelGene_152985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAATAAATTCTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356154	1352387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1355410_1355639
889872	contig_11267_pilon	-	4260	3	Intergenic	novelGene_175380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1827	2135	79273	78965	TRUE	30	CAAGATAGCTCTCATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLDGQLFIFHDIGQVFFQQFFNDPLCVFCFLPLFWNSNHLKIFAFDCIPQNSQGLFIFLCSFFWVFLKQSWSQVFVFNSADPVFHRFKSPSHPFYDTVHF	164745	76608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_-_78567_78797_80011_163656
889873	contig_9935_pilon	-	1034	2	Intergenic	novelGene_164850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCACAGTGCTTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7022	5706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9935_pilon_-_6001_6282
889874	contig_6227_pilon	+	3827	2	Intergenic	novelGene_49621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTTACAGAACTGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338235	343477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_341549_342963
889875	contig_8304_pilon	+	5394	3	Intergenic	novelGene_153179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1103	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATTGAATTCAGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151493	160967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_156407_158009_158047_160523
889876	contig_12327_pilon	-	4335	14	Intergenic	novelGene_140680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_4	195.719761015772	886	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	99	2162	1155014	1139988	FALSE	40	GTGCAGGAAGAAGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFCLLSASGVSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLESWRNFEDEFGTVSDKERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155112	1137814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
889877	contig_6871_pilon	+	2029	4	Intergenic	novelGene_21539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	357	1064	134310	135017	FALSE	25	CACACAAGTTTTCCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	135982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134057_134207
889878	contig_15105_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_150981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAGGACATTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630819	629824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_629800_630800
889879	contig_2933_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_111319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTAGTCTTCCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441519	421933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_423065_440630
889880	contig_15498_pilon	+	3318	7	Intergenic	novelGene_42639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	143.937100460197	20	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	388	729	679496	682277	TRUE	30	CTACAGAATGCACATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLQRQFVLQARGGASPCGRAVFLAFGLGLGLIEEKQAEGRRAAWACQEIQAIFTQKNKLLPGLLDSRRCQGFRLEEYLIGRSIGKGCSAAVYEATVPTVPQNSEGAESSGLLTGRGPDIIPQGETEESMAQPPAFPLAIKMMWNISAGSSSEAILSTMSQELVPASRAALAGEYGAVTYRRSKGGLKQLAPHPNIIRVFRAFTSSVPLLPGALVDYPDVLPPRLHPDGLGHGRTLFLVMKK	675304	687369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_675458_679261_679550_681329_681431_682090_682999_683984_684113_684485_684723_685866
889881	contig_14209_pilon	-	1570	6	Intergenic	novelGene_88323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCGGATGTAAACACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36803	32307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_32421_33873_33935_34047_34105_35208_35354_35502_35661_35767
889882	contig_11422_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_99111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACACTTAATCAAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2100	1157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1200_2100
889883	contig_10258_pilon	+	3821	7	Intergenic	novelGene_155051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_6	105.20680691962	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	798	1670	99692	108468	FALSE	30	GCTGAATGTGTGGAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCIKIPRKKYSDVMKVINSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCVQNDGVYQTQANCAAGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDSEEKENKGVISSVDGRSLQGFLSEKVKLETDFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSISATRYQFAKEIAMACCAALCPHLKTLKGNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGHLLPQHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSTSLPLEIELVFFIIENLF	98894	110619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_99737_100091_100240_101521_101603_104821_104985_106038_106145_106931_107100_108306
889884	contig_8375_pilon	+	2650	5	Intergenic	novelGene_141301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	491.390565131241	5	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	73	1053	157737	221196	FALSE	45	CAAATACTAGATAAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPSAHKYHRLHKNLQHWNTRSLDIKEPEILKGWMNEIYSYDPETYHATLTHSVFVRLEGGTLRLSKPNKNISRRASYNETKPEVTYVSQKIYDLSDSKIYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQPKQKELVGSVRQKMLLDYSVYMARCVPQENRSPQKSPLWRLLISCDG	157664	222793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_157941_174313_174515_175721_176056_180330_180540_221163
889885	contig_12701_pilon	-	2732	7	Intergenic	novelGene_169544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	55.4246234889231	77	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	189	1106	40561	24829	FALSE	60	GAATAAAATATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKRLGFTLRHFSMDWGILSLCIPQCCVHF	52393	23202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_24911_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_52219
889886	contig_9871_pilon	+	3021	4	Intergenic	novelGene_75711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3308	junction_3	614.070752347715	178	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTACGTCTGTATTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575076	584412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_575175_579914_581826_582912_583630_584117
889887	contig_11258_pilon	+	2280	2	Intergenic	novelGene_67863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	240	617	373676	374053	TRUE	15	GCTTCAAGTCTTCTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSKSLGRLERTVGGITDMKGNSGEGSEGSEESSKAGDGTDCENQRQRNSGSRTRILMQDSIRADPWLKRAECLQTERTRNQEVEDEKTRTWLVPLIPSFPPISLIGKENVYLVPVLPLYFGSR	373436	375977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_374661_374921
889888	SIRV6	+	1151	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	22	355	-15	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	236	727	1733	10736	TRUE	30	CTGCCAAATTCGGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1109	11470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889889	contig_20739_pilon	-	2055	2	Intergenic	novelGene_83172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	702	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCTTTTTCACACCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121643	114888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_115497_120196
889890	contig_7009_pilon	+	9314	6	Intergenic	novelGene_23657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	459.33020802033	8	138	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	5589	6404	522896	537035	TRUE	45	AATACCAGAGAAAGGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGEKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	496604	539991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_496860_506372_506634_512647_512816_517991_523002_536325_539836_539881
889891	contig_6795_pilon	-	2291	5	Intergenic	novelGene_27754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	741.177610293241	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	551	577	374904	374019	FALSE	25	CAATTGTCTGATGCTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRNKYFFGEGYTYGAQLQKRGPGQERLYPPGDVDEIPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHIFERPIVSVSFFSDSALCFGCKFQFKPIRVSEPVLSLPVRRGSVTVLSGYAADEITHCIRPQDIKERRAVIILRKTRLDAPRLETKSLSSSVLPGPIGRQTLMLPTGHGS	395902	372304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_374033_374891_374930_374990_375048_387155_387237_395515
889892	contig_8761_pilon	-	4442	1	Intergenic	novelGene_167397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTACAAACAAACACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11300	6858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8761_pilon_-_6900_11300
889893	contig_11512_pilon	-	4262	1	Intergenic	novelGene_43340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559220	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555000_559200
889894	contig_15491_pilon	-	2419	6	Intergenic	novelGene_75939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	422.714750156651	2491	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	71	682	46982	37061	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47052	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37014_37200_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
889895	contig_9345_pilon	-	344	4	Intergenic	novelGene_24503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	356	junction_3	60.8659729788875	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	16	303	667606	667061	FALSE	25	AAGTAATGCCTGGTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLDAMDKHLSSQNRYFSEADKIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQLRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF	667621	667019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_667083_667170_667255_667334_667479_667568
889896	contig_6375_pilon	-	1412	4	Intergenic	novelGene_73024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_3	444.54496085573	771	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	229	798	464982	463642	FALSE	20	TTTAACTAGTGTGTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPKFLCADYAEQDELDYHRGLLVDRPSETKAEEQGVPRPLHPPPPPPAQPPQHPRAEQREQERAVREQWAEREREMERRERTRSEREWDRDKVREGPRSRSRSRDRRRKERAKSKEKKSEKKEKVQEEPPAKLLDDLFRKTKAAPCIYWLPLTDSQIVQKEAERAERAKEREKRRKEQEEEEQKEREKEAERERNRQLEREKRREHSRERDRERERERERDRGDRDRDRERDRERGRERDRRDTKRHSRSRSRSTPVRDRGGRR	465430	463027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_463969_464627_464729_464840_465166_465385
889897	contig_10331_pilon	+	2886	20	Intergenic	novelGene_54136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	329.146752205661	439	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2568	318	2885	429490	583261	FALSE	30	GGTCAAGTATTCAGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHGLLRPQTLLTKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNLSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQDDETSAQDIDNNGKQDSKTDHLAHNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHAELVISKPVSKSPERLRKDTEGLSEDTDYEEEDEVTKKKKDVKKDTIDKSSKPQVKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEEKVKNKESLCIENSSNSSSDEDEEEKSKAKMTPTKKYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNSDERLQNSRAKDRKDV	409519	583262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_429456_429535_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_573425_573511_575995_576195_582599
889898	contig_513_pilon	-	4773	5	Intergenic	novelGene_80146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1884	2189	404200	403895	TRUE	90	AAAAAAAACAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRSRGLNFKGRNPPTRRLNTDSTNWKLRMPPGHFGLLMPLKQQAKKGVTVLAGVIDPDYQEEIRLILHNGGTEEYVWNTVRPLGRLLVLPCHVIKISGN	526143	389069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_391217_403457_404498_524093_524801_525004_525290_525549
889900	contig_7151_pilon	-	7837	6	Intergenic	novelGene_40768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	726.4	207	122	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4	315	565547	565236	TRUE	0	TCTTGCTTGTGCTTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMHFISFSSLIALARTSSTMLNKNGDKGHPCLVPVLKGNAFKLSPFRMMLAVGFVYMPLIMLRNFPSIPILLRIFIMTGCWTLSIAFSALIDKIMWFLSFVLLT	565550	525755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_531590_531697_531784_532303_533184_542612_542928_564102
889901	contig_3956_pilon	+	3046	15	Intergenic	novelGene_14973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1082.49951689672	51	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	716	2527	1284838	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284814_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
889902	contig_18162_pilon	-	1693	3	Intergenic	novelGene_122318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	888	1199	10170	8472	FALSE	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISPLRKDLQDMRELAMRMPGEGLPGRGTSSANTLGQERARVLGAARRAVGLEQTVAEMRPEVWSDHVGPLHQKVFFFLFPLSEMRSYKTILSRRETWYDGL	16613	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8771_10157_10809_16364
889903	contig_5988_pilon	-	2029	9	Intergenic	novelGene_15842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	177.775094923333	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	507	1400	255359	242253	FALSE	25	CATCTGAATTGAATGCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTHICQDTNQVLFKCCQGSEEVPCNKAVPVSLSEDPCCPLHFQLPPQMYKPEQVLSVPDDLEAGPMDLYLSAAELQPTESLPLEFSDDLDVVGDGMQCPPSPLLFDPSLTLEDHSIKEIAEGPVDILGQIQMNVDGCRSQGSRNSEKASAPLPQSGVATANGEAEPTSIS	260597	241623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_249656_253927_254025_254689_254857_255235_255400_258760_258940_259719_259979_260569
889904	SIRV6	+	475	5	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2488_2540_2621_2740_2815_3106_3165_10724
889905	contig_16310_pilon	+	5983	3	Intergenic	novelGene_70063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5176	5526	214931	215281	TRUE	20	GATCAAACCGTTGTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRLLGLDSKTYYGVPRLRSPPVVPARFVSRVCRSSCGCLRMLQGSDQASSSAKHLTRKYTESWVSCSFFIACSKIIGFVSLVKHMFLVQGPLPRGSVPFSLPYLTTTVNLKLPT	209217	224699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_213960_214497_215520_224480
889906	contig_9177_pilon	-	516	3	Intergenic	novelGene_32595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2439.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	12	323	26442	1909	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATMVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDSKCLHALGPRKCLPLPRVLTLQEYYY	26453	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1993_25971_26070_26312
889907	contig_3747_pilon	+	1859	3	Intergenic	novelGene_24843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3797.5	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	448	774	203794	204120	FALSE	15	ATGTTGAGTTTTTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200986	205205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201351_203592_203651_203768
889908	contig_4091_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_173034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1009	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAATTTAGTCCCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19788	18101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_18100_19800
889909	contig_3380_pilon	+	7169	11	Intergenic	novelGene_60120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_9	329.976302179414	392	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	244	1908	443534	462606	FALSE	5	CCCCACCCTCCTCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSIALCNGISQWVQLMVLSRPTPQLRAEVFIKFIQVAQKLHQLQNFNTLMAVIGGLCHSSISRLKETSSHVPHEINKVLGEMTELLSSYRNYDNYRRAYGECTHFKIPILGVHLKDLISLYEAMPDYLEDGKVNVHKLLALYNHINELVQLQEVAPPLEANKDLVHLLTLSLDLYYTEDEIYELSYAREPRNHRAPPLTPSKPPVVVDWASGVSPKPDPKTISKHVQRMVDSVFKNYDHDQDGYISQEEFEKIAASFPFSFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASSIYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTFCDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKTPTAPAESSSSVGPVSSLGSLGARDLLHGPEEGPFTFPNGEAVGHSEESKDRTIMLMGVSPQKISVRLKRTVAHKATQTEPLPWIGGDSPSGPFVLSSPRKAAQDTLHLLPSPPSPCPSPVLVRKRAFVKWENKESLIKSKEELRHLRLPSFQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQEKIESLQLERSNYVLAQMEQGDCS	443290	467867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_443654_444669_444787_450090_450367_451860_451942_453466_453572_454444_454555_455360_455506_456179_456217_456914_457068_458949_459336_462471
889910	contig_5280_pilon	+	2139	9	Intergenic	novelGene_52603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	487.431725988369	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	21	1091	38343	78098	FALSE	25	ACATTGTCTCACGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38322	79146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
889911	contig_11364_pilon	-	3651	2	Intergenic	novelGene_65176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	801	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTATTTAGTATTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206192	134332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_136474_204682
889912	contig_16761_pilon	-	3086	1	Intergenic	novelGene_146902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTGTAATTCAAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349006	345920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_-_345900_349000
889913	contig_10437_pilon	-	2952	2	Intergenic	novelGene_38419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	0	117	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCCAGCAGTACACTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811478	797282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_799692_810935
889914	contig_3747_pilon	+	2580	8	Intergenic	novelGene_24900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	6	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	11	1186	201313	203804	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIMVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201302	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
889915	contig_11396_pilon	+	7666	5	Intergenic	novelGene_71290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1614	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACCCCCACCCCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301900	493797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_304408_317766_318300_480325_480456_481719_482039_489620
889916	contig_18108_pilon	+	2337	9	Intergenic	novelGene_33438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	168.168813993558	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	417	1520	103448	123205	TRUE	15	TATTCTGGTCATGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRVGAEWGAGRGCRALAGSLAPLPPPAASREAPDGRPAGSQAAHTARARPTGAPAEAARATGPSCRGRRQGGEYRRGPAPSAAASRPSAPSFCKSGVGTQHLSFLLALPPPAAQRSSTELCYFAFYTWGKDTDDEEKIMNVKGKVILSMLVVSTVIVVFWEYINSPEGSFLWLYHSKNSEVGDSSTQRGWWFQSWFNNGTQSYQEEDIDKEKGREDRKELQLSDWFNPKKRPEVVTVTGWKAPVVWEGTYNKAILENYYAKQKITVGLTVFAIGKYIEHYLEEFIISADKYFMVGHKVIFYIMVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	42865	125321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_43154_94354_94474_103438_103528_108412_108449_110391_110458_110981_111072_116603_116742_122511_123438_124736
889918	contig_13740_pilon	-	2845	9	Intergenic	novelGene_34620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3472.84036983778	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	169	636	165243	160666	TRUE	15	GCATACTGCCATTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165411	154988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_165237
889919	contig_91_pilon	-	3457	8	Intergenic	novelGene_127145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_7	57.8841206944653	584	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	1696	2787	1208028	1199198	FALSE	20	TTCTAAACTGGTTTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKVPTEESEASSVEADLECPSPRPPGNPDSETNSQPDSSDAGAQPQLQTDGQQTSQSPPPPELPSEENKSPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKLVNVELPIEANLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRGKLYGPYEKFICEQDHQSFLRLLTETEDWLYEEGEDQSKQAYVDKLEELMKIGTPVKLRFQEAEERPKLLEELGQRLQHYARIAADFRNQDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRALEIKAKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNADKKEEDLEGKSNFGAEPPRQNGDCYPNEKSSINMDLD	1209723	1198527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1199405_1200355_1200518_1200620_1200741_1201048_1201157_1202402_1202529_1203295_1203434_1206081_1206214_1207929
889920	contig_10074_pilon	-	5193	1	Intergenic	novelGene_57186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	874	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACCATTGGCTCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577847	572654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_572700_577800
889921	contig_19032_pilon	-	2500	1	Intergenic	novelGene_172529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAAAATATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149560	147060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_147100_149600
889922	contig_14341_pilon	+	2339	1	Intergenic	novelGene_111811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTTCTCTAGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480537	482876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_480500_482900
889923	contig_10437_pilon	+	2038	11	Intergenic	novelGene_38199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	557.984372541024	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	81	1166	229668	232651	FALSE	30	TAAACTAAGATGGTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLITGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225692	233523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231716_231969_232055_232163_232318_232510
889924	contig_7066_pilon	+	2009	8	Intergenic	novelGene_42161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	361.447035101512	828	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	477	947	832785	841366	FALSE	15	CCTCTAAGAGTGTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	823368	842428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823685_829906_829965_830302_830397_832776_832882_833878_833961_835771_835852_837208_837292_841237
889925	contig_401_pilon	-	2359	2	Intergenic	novelGene_42881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	0	432	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	143	1333	1779305	1778115	FALSE	30	ATTCATGAGATATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTSDANFSCYHESVLGYRYVAVSWGIVVAVTGTLGNVLTLLALAIQPKLRTRFNLLIANLTLADLLYCTLLQPFSVDTYLHLHWRTGANFCRVFGLLLFASNSVSILTLCLIALGRFLLIAHPKLFPQVFSAKGVVLALVGTWVVGVASFAPLWHIYILVPVVCTCSFDRIRGRPYTTILMGIYFVLGLSSVGIFYCLIHRQVKRAAQALDQYKLRQASVRSNHVAGIDEAMPGRFQELDSGLSSGGPSEGISSEPVSAATTQTLEGNSSEVGNEGKSKMAKQMAEGSPPEAPAKARPTKGAQKAQDSSSEFGKVTRMCFAVFLCFALSYIPFLLLNILDARVQAPRVLHMLAANLTWLNGCINPVLYAAMNRQFRQAYGSILQRGPQSFCRLR	1779944	1777088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1779314_1779810
889926	contig_10500_pilon	-	3644	10	Intergenic	novelGene_41155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	119.537999537107	1001	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	172	2730	1249065	1236976	FALSE	40	AAAAAATTCATTACTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPDLVEVSSGEENEQVVFSHRAKLYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMALQAMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKIAQEKDSLITPYVSRSATPRESPCGRIAVAVLEETTRERTDLTQGDDVADAASEVGEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKSIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKNNNSETSSVVQSGSERKVESNKCELSKNSNTKESSDGKAKNLFASTSKEESSTNYVFKTPEKAKEEKKPEDPPSDDEILIVYELTPTPEQKALADKLKLPATFFCYKNKPDYVSEEEEDDEDFETAVKKLNGKLYLGDSEKCRTSEENQADNEKECVIVWEKKPTLEEKAKADTLKLPPTFFCGVCSDTDEDNGNGEDFQSELQKVQEAQKSHGEELTEVTSTADSVCTDGTKVTVPFFYKSEEPDSMNKSVSSAPISSGTEDKPVDLSTKKENDADSTSQVESKTVPFGFGSSTGLSFADLASSTSGDFAFGSKDKNFQWANTGAAVFGTQSTSKVGEDEDGSDEEVVHNEDIHFEPIVSLPEVEVKSGEEDEEILFKERAKLYRWDRDVSQWKERGVGDIKILWHTMKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDYADGEAKVEQLAVRFKTKEMADCFKKKFEECQQNLLKLQKGQVSLAAELSKETNPVVFFDVCADDEPLGRITMELFSNIVPHTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRIIPDFICQGGDITKHDGTGGRSIYGENFEDENFDVKHTGPGLLSMASRGRDTNNSQFFITLKKAEHLDFKHVVFGFVKDGMDTVKKIESFGSPKGSVSQRISITECGQI	1249236	1236061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1237282_1237658_1237994_1238114_1238389_1239109_1239256_1239947_1240050_1241689_1241904_1243564_1243744_1244379_1244473_1245112_1245284_1248326
889927	contig_16776_pilon	+	1853	1	Intergenic	novelGene_130493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	19	312	33854	34147	NA	20	GAAACCTGTGTGTACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLYLQTMMNFILLSNSWSPGGTVVKSLTPNQKVGGSNQPVAPWKPYGAVLLCPVGSLGVGIDSTVRGFGSSSYVAVISCCRVNSDSWRPHVTEQSRTIEFSWL	33835	35688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_33800_35700
889928	contig_10437_pilon	-	3948	2	Intergenic	novelGene_38112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	138	692	80783	80229	FALSE	70	GAACAAAATAAATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRGGARPKGPHLGASPFCQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82883	76972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80788_82750
889929	contig_7230_pilon	-	2087	3	Intergenic	novelGene_52541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	732.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGACTCTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177649	132791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134612_176955_177012_177438
889930	contig_14744_pilon	-	3267	8	Intergenic	novelGene_65980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.521999064369	442	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	152	1405	969897	960824	TRUE	65	CAACGTACAATCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPKQIARTFFQGTSGWTQTSNLSVTVNPMHHPRTPSLQPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	970048	958919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_959199_959240_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
889931	contig_3426_pilon	+	2846	1	Intergenic	novelGene_57934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	229	642	317724	318137	NA	30	AACCCCCGATGGAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDMPFDPEIPLLGIHPKEIRVVTRTEICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWRNKVWYIHKMEYYATRKNNDDSVKHFITWMKLEDIMLSEVNQSQKDKYCMRALL	317495	320341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_317500_320300
889932	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	606	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
889933	contig_6102_pilon	+	4080	32	Intergenic	novelGene_31865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	493.815390564507	1068	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	836	2668	373928	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370752	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_372980_373022_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
889934	contig_19744_pilon	-	3991	15	Intergenic	novelGene_120380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1834	2178	179372	177853	TRUE	25	TTAGTTTTAGGTTCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNAIVTLSTGIPATTWVCLSHVIGHWVWMGFSTQLTDGVLLWSSNCELGHLTEQITPGPNFCLFFFLFFLFGLFILFLTFFLFKDCTGTRTWKNHILGSCFDSSQRDVFPKSH	198020	151828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_152037_152922_153058_156118_156241_176504_178147_179321_179494_180251_180496_183375_183545_186058_186218_187301_187501_188366_188519_192998_193159_194330_194486_194664_194893_196382_196446_197837
889935	contig_10973_pilon	-	2247	2	Intergenic	novelGene_150337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAATGACCAACATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3422	1033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2663_2804
889936	contig_7396_pilon	-	2180	11	Intergenic	novelGene_79565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3645.22149669948	31	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	121	936	255163	246442	FALSE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257474	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_248877_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
889937	contig_5031_pilon	-	3873	1	Intergenic	novelGene_133174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	76	738	25748	25086	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILANRIQQHIKEIIHHDQVGFIPAMQGWFNIRKTINVIHHINKTKHKNHMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKPKANIILNGETLKAFSLRMGTRQGCPLSPLLFNTALEVLARAVRPKKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRTLLELIEDFSKVSGHKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPFTIASEKIKYLRMNLTREIKDLYNENYRILL	25823	21950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22000_25800
889938	contig_10258_pilon	-	3001	7	Intergenic	novelGene_155049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3508	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGTAACAGGTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109796	98894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_-_99737_100088_100238_101519_101601_104819_104984_106037_106143_106929_107099_108305
889939	contig_5236_pilon	+	4066	19	Intergenic	novelGene_100887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	158.085849469423	11	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	238	2355	62791	84085	FALSE	35	AAGCTATCTTTAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60635	85796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_61920_62068_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
889940	contig_3449_pilon	+	4154	12	Intergenic	novelGene_73719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	426	junction_2	268.370164985874	344	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	589	1935	512166	524912	FALSE	10	CATTTTACTCTGGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQDAGITSDTMMKNFFFVPSCIQLNQEDSFSTEA	493419	527131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524008_524356_524572_524800
889941	contig_3095_pilon	-	1858	5	Intergenic	novelGene_75251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_2	960.701566564768	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	90	920	255481	247316	FALSE	25	ATTATCTGTACTCTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGNKSALIQLGAGKEV	255570	246377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_247387_247858_247970_248476_248759_253535_253806_255384
889942	contig_8712_pilon	+	1839	5	Intergenic	novelGene_58775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	513.886417411474	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	39	518	314974	321793	TRUE	25	CTCATGGTGTGAAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286982	323268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684_321919_322072
889944	contig_5690_pilon	+	2845	1	Intergenic	novelGene_119690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTCTCACCCACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490061	492906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_490100_492900
889945	contig_8964_pilon	-	6146	7	Intergenic	novelGene_168682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	562	133	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGAAGAAGTTAAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585192	234072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_235229_235632_236503_266760_266842_289850_290544_290616_291586_536255_538337_584896
889946	contig_12301_pilon	-	3115	1	Intergenic	novelGene_110005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGCATTTCTCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3763	648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_600_3800
889947	contig_15293_pilon	-	5530	1	Intergenic	novelGene_146526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	606	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2766	3149	95011	94628	NA	50	ACATTTTGAAATAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVVPSVASPGRWVGCPQTWGTWRALVLGTPGPFSLGLQPGPCGITWAEIISLEGWKKSESPRLSPTGRSPVWLHLGSVCLRGSLRKPHLPRPLQGAHQRQLAVPSELENALPSPGLVQGVSCYGL	97776	92246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_92200_97800
889948	contig_3601_pilon	+	2670	1	Intergenic	novelGene_132893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	912	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182285	184955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_182300_185000
889949	contig_821_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_149426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	238	645	438943	438536	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYYAGNDKLKRNGIAFIIKKNISRSILKYNVVCDKTISTCLQVRSVNMTLIQTYRTNKAKDEEIEDFYQLSQSEIDQTSNQDASIITGDWNAKVGNKEGLVVGKYGLGNRNDASDHMTEFCENNDFFTANTFFQ	439180	436247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_436200_439200
889950	contig_16492_pilon	+	3462	14	Intergenic	novelGene_100310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	173.987349060603	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	1093	3099	177832	195042	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFENISSPESSPAHRPESLSPELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPSDSPTSDLVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLSNAGQSAAYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS	168741	195405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_168803_169195_169262_170337_170596_171328_171650_172055_172299_173094_173208_177801_177932_184045_184294_187439_187497_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014_194104_194433
889951	contig_9177_pilon	+	1649	5	Intergenic	novelGene_32677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	594.010732226279	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	32	301	395377	415535	FALSE	20	TATCTTCCTCCAACGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKN	395345	416883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408041_415533
889952	contig_8020_pilon	+	6246	10	Intergenic	novelGene_114415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	335	junction_7	415.149980335829	1051	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1074	3225	260	3484	208884	300606	FALSE	15	TCCTTTTTGAAATCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTANCGAHDELDFKLVFGEDGAPAPPPPGPRPADLEPDDRAPIYIFNVDPPPSTLNSPHCLPHHGLPSHSSVLSPSFQLQGHKNYEGTCEVPESKYSPLGGPKPFECPSIQITSISPNCHQEIDAHEDDLHINDPEREYLERPSRDHLYLPLEPSYRESSLSPSPASSISSRSWFSDASSCESLSHIYDDVDSELNEAAARFTLGSPLTSPGGSPGGCPGEESWHQQYGVGHSLSPRQSPCHSPRSSITDENWLSPRPASGPSSRPTSPCGKRRHSSAEVCYAGSLSPHHSPVPSPGHSPRGSVTEDTWLNASVQGGSGLGPTLFPFQYCVETDIPLKTRKTSEDQAAILPGKLELCSDDQGNLSPSRETSIDDGLGSQYPSKKDLSGDQFLSVPSPFTWSKPKPGHTPIFRTSSLPPLDWPLPTHFGQCELKIEVQPKTHHRAHYETEGSRGAVKASTGGHPVVKLLGYSEKPINLQMFIGTADDRYLRPHAFYQVHRITGKTVATASQEIIIASTKVLEIPLLPENNMSASIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPQPNGKVLSLQTASIPVECSQRSAQELPHIEKYSINSCSVNGGHEMIVTGSNFLPESKIIFLEKGQDGRPQWEVEGKIIREKCQGAHIVLEVPAYHNPTVTAAVQVHFYLCNGKRKKSQSQRFTYTPVLMKQEHREEIDLSSVPSLPVPHPAQTQRSSSDPGHPHDSVLSAQRSLVCPVQQAYVSLVTSSHLPQLQCRDESTGKEQHVMPSPVVHQAFQVTPTPPVGSSYQPMQTNVYNGPTCLPVNAASSQEFDSILFQQDAAVPSLINLGCQPLSSIPFHSSNSGSTGHLLAHTPHSVQTPPHLQSMGYHCSNVGQRSLSSPVADQVKGQPSPQLQPIAYGPSRSGSATTAPPAASHPLASSPLSGPPSPQLQPMPYQSPSSGTASSPSPATRMHSGQHATQAQSTGQGGLSAPSTLICHSLCDTTSFSPDGATISIKPEPEEQEPNFATIGLQDITLDDVNEIIGRDMSQISVSQGTGVSREAPLPNPESLDSGRPDGL	208624	303368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_208987_246161_247297_249791_249955_262681_262882_266684_266858_269338_269480_275447_275504_276490_276618_280347_281353_300484
889953	contig_10627_pilon	-	2050	12	Intergenic	novelGene_59940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	874	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1158	1580	165917	164999	TRUE	5	TGGCGGGGGGGTCCCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDDNGVWMLQQPSQLHRNLGETESTTTEDLAEVPVAVDVLALVPVLQLVVFDVKPQGLHDGSPRLCVHSQQPCQSGVQLILGRLMIQHEQEGALDVEVSRPLHLEAICFLGGGHPVPLHQVVVRPIQLLVQLNDKALKE	167782	162771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_162892_163076_163121_163245_163368_164175_164333_164971_165066_165232_165334_165485_165648_165824_165924_166120_166176_166471_166533_166670_166773_166849
889954	contig_3866_pilon	-	2708	20	Intergenic	novelGene_112398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	260.102185331851	18	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	190	1971	222507	180267	TRUE	70	GAAGTAGAAAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPLRVGAIVETKTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVSVMSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQERYIILCLFSRSTCLGYSSTLFLFRDSGVRECFLIGTSIPLV	223786	170666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_170750_172275_172418_174189_174275_177422_177621_180037_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
889955	contig_3866_pilon	-	3540	23	Intergenic	novelGene_112395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_18	299.403873976384	31	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1070	3210	329	3538	217734	165861	FALSE	30	CCCAGTAAAGCACCTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGILWVFAHSSRIEVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSSLPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVVSVMSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKTQKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNKEDSEKDEKREEERQKSKRGRPPLKSTLSSNMPYGLSKTPNSEGKSGTRSARSNMPDSSPLSNGMEDSCSSDSETEDPLEKDLMNEELSPDIKEEVEKNENLNDDKLDEENPKIAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGNKMEQVVEVKKEAEKSPKGKGRRSKTKDLSLEIIKISSFSQDEAGCEPQMEAQNLEFSSLDNKDFSSANEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEITNSLPQERTSDCIVSEGMKNLNFEQHFETENEGMPSLIAESNQCIQELTGEKFDSPAEETINIPLKEEEDAMPLIGPETLVCHEVDLDDLDEKDKNSMEDVVVESSESNSLVSVPPALPPVVPHNFSAASPLTLSQDESRSIKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESANGFEASVASSTCSIIIQERESREKGQKRPNDGNSGLLAKKQKRTPKRTSAVAKNEKNGTGQSSDSEDLPVLDNSSKC	223672	165858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_165914_169273_169379_169615_170750_172215_172418_174189_174275_177422_177621_180390_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_209579_209608_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
889956	contig_14970_pilon	+	1904	9	Intergenic	novelGene_44996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	115	1203	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136030	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
889957	contig_6496_pilon	+	4467	6	Intergenic	novelGene_103473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	625	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTCCGGAAAAGGCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243429	285258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_244478_244780_247792_249542_249575_263147_263178_264935_265068_285044
889958	contig_3747_pilon	+	2215	4	Intergenic	novelGene_24753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4810.32271959654	168	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	803	1129	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200977	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201556_203338_203386_203498_203651_203768
889959	contig_9297_pilon	+	1578	4	Intergenic	novelGene_69884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	486.181721855796	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	555	1223	911763	912790	FALSE	25	TTTTTGTGATAAGCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	910742	913145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_911111_911321_911446_911700_911869_912227
889960	contig_8317_pilon	+	1735	8	Intergenic	novelGene_19251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6073	junction_1	11138.4392267572	57152	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	68	1456	14294	16506	FALSE	30	GTTTAATGAGAAACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETSKYYVTIIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVNKMDSTEPPYSQKRYEEIVKEVSTYIKKIGYNPDTVAFVPVSGWNGDNMLEPSANMPWFKGWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDSKNDPPMEAAGFTAQVIILNHPGQISAGYSPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDGPKYLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDKKAAGAGKVTKSAQKAQKAK	13258	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_13291_14258_14438_14730_14911_15092_15390_15467_15619_15712_15970_16047_16283_16381
889961	contig_8375_pilon	+	2683	8	Intergenic	novelGene_141307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_3	135.902125646003	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	24	1070	180492	221189	FALSE	35	GATAAGCACCTAAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDYSVYMARCVPQENRSPQKSPVLSAESSPTAGKKLPEALPSEKEEQEAWVNALLGRMFWDFLGEKYWSDLVSKKIQMKLSKIKLPYFMNELTLTELDMGVAVPKILQAFKPYVDHQGLWIDLEMSYNGSFLMTLETKMNLTKLGKEPLVEALKVGEIGKEGCRPRAYCLADSDEESSSAGSSDEDDAPEPSGGDKQLLPGSEGYVGGHRTSKIMRFVDKITKSKYFQKATETEFIKKKIEEVSNTPLLLTVEVQECKGTLAVNIPPPPTDRIWYGFRKPPYVELKARPKLGEREVTLVHVTDWIEKKLEQEFQKVFVMPNMDDVYIPIMHSAMDPRSTSCLLKDPVVEAADQL	180468	222802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_180579_190050_190198_195209_195310_205385_205519_211516_211643_213043_213254_215395_215517_221066
889962	contig_9945_pilon	+	3702	5	Intergenic	novelGene_104804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	287	junction_4	47.4394350725217	822	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	49	1236	42224	121510	FALSE	30	AGCAGTTTAACCTTGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDTPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIGDEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASMRTLWIKSVDEVFKNAQPPIREATDLRENMQNAVVSFKELCGLSSVANLMQCMLAVSPRFLGPDNTPLVVLNLSEQYPMMELQGIVPEVLKKIVTTYDTMIQSLKALIENADAVYEKIVHCQKAAMEFHEHLHSVGTKEGLKERKLQKAVESFTWNITILKGQADLLKYAKNETSENLKQIHYAAVSCGLNKPGTENADAQKPRRSLEVIPEKASDETGE	42175	123976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_42842_45616_45821_73300_73377_98555_98666_121330
889963	contig_6958_pilon	+	2379	2	Intergenic	novelGene_70006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCCCACAATGTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740824	744115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_742776_743687
889964	contig_12019_pilon	+	2313	6	Intergenic	novelGene_87636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34	280	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAAGCAAGAGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2043	10202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_4168_4266_5118_6226_8298_8686_9213_9483_10005
889966	contig_20199_pilon	-	955	4	Intergenic	novelGene_82534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.07816092788	55	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	110	505	43987	41171	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44096	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40785_40858_41250_42110_42347_43906
889967	contig_15744_pilon	-	4882	2	Intergenic	novelGene_83620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1804	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATATTTTATTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196768	190523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_192992_194354
889968	contig_5954_pilon	-	3026	1	Intergenic	novelGene_28775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1393903	1390877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390900_1393900
889969	contig_10135_pilon	-	2253	9	Intergenic	novelGene_106639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGAGGCTGCAGAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114960	106863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_107845_110507_110697_112341_112464_112696_112809_113076_113153_113341_113420_113529_113616_113892_114019_114477
889970	contig_11850_pilon	-	2877	9	Intergenic	novelGene_125212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	1095.98183721264	2247	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	105	1010	286397	282879	TRUE	45	GAATAAAGACTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286501	279951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282374_282480_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
889971	contig_6946_pilon	-	2470	4	Intergenic	novelGene_59784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1617	1919	442762	442460	FALSE	20	CCACCAGCCGCACCTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTVRWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDIEQNSNSHTKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQLGSGQPHKAKWD	532987	441908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_443115_517986_518155_531850_532413_532453
889972	contig_4742_pilon	+	5202	6	Intergenic	novelGene_130969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1496	junction_1	387.170556731785	1228	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	683	1204	135543	139907	FALSE	45	AAAAGTATCTGACACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARMNRPAPVEVTYKNMRFLITHNPTNATLNKFIEELKKYGVTTIVRVCEATYDTALVEKEGIHVLDWPFDDGAPPSNQIVDDWLSLVKIKFREEPGCCIAVHCVAGLGRAPVLVALALIEGGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFKESNGHRNNCCIQ	131182	143905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_131422_135099_135648_137327_137421_137943_138075_139008_139084_139789
889973	contig_9239_pilon	-	3723	3	Intergenic	novelGene_137193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2480	2779	228655	228356	FALSE	65	AAATAAATGAAGTAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHEDITIVNIYIPSDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVAGDFNTPLFLKDRTSRKKLNKDTEDVKTTVMDCIMSSKKCMYQFGWTMIPSIVWLSSIL	286070	227411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_229486_280701_281072_284791
889974	SIRV6	+	1269	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	241	18	-106	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	CTGGTTTTAGTAAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
889975	contig_15323_pilon	-	3144	1	Intergenic	novelGene_148519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAGAGCTGAAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88895	85751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_85800_88900
889976	contig_15244_pilon	+	2989	11	Intergenic	novelGene_118052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	63.782129158566	18	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	2041	2913	572462	583369	FALSE	20	TATTCTGGGTGTAACTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCILKYMKGTSIVVPEPLHFLLPGEKSLVTISYPSGIPDGQLQAYRKELHELFNLPHDRPYFKRSNAYHFPDEPHRDGYIRNPHTFLNPPNIESGMTYMVQGIYSYHHYMQDRIDDNGWGCAYRSLQTICSWFRHQGYTERSIPTHREIQQALVDARDKPATFVGSRQWIGSIEVQLVLNQLIGVTSKILFVSQGSEMASKGRELANHFQSEGTPIMIGGGVLAHTILGVAWNEITGQIKFLILDPHYTGAEDLQVILEKGWCGWKGPDFWNKDAYYNLCLPQRPQII	566101	583445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_567749_569829_570014_570094_570162_571877_571974_572415_572609_574208_574356_576308_576474_576690_576816_578417_578495_580848_580974_583282
889977	contig_10958_pilon	+	2014	4	Intergenic	novelGene_5419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	2481	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889005_895279_895855_900457
889978	contig_6873_pilon	-	3384	5	Intergenic	novelGene_129816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	79.6633541849701	812	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	99	743	386693	378223	FALSE	35	TGCTAACCAAAAGCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSNDDDIPQLSSHTLAALQEFYAGQKQQTDPGGDNKYSIGIIEENWQLSQFWYSQETAFRLAEEVIAVAGEGGRIACVSAPSVYQKLRELHREDFSICIFEYDKRFAIYGEEFIFYNYNNPLDLPEKIAAHSFDVVIADPPYLSEECLRKMSETIKYLTQGKILLCTGAIMEEAAAKLLGVKMCKFIPKHTRNLANEFRCYVNYDSGLDSEI	431628	375581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_378360_380399_380681_385638_385722_386549_386709_431545
889979	contig_11318_pilon	-	3978	22	Intergenic	novelGene_48126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	990.641229381997	153	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	415	2109	49795	15006	TRUE	35	GTTATCAACCACTACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRWEVLFRKGYVIGKRKWKQMSVIGRERRKSWRKLGSASWQKDTQTQMQSSKGWNKRLRGAGSHK	58282	8297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17596_18878_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_52071_52142_54570_54614_58143
889980	contig_12019_pilon	+	1020	4	Intergenic	novelGene_87641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	29	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	348	671	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	2058	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_5400_6114_6226_8298
889981	contig_2358_pilon	+	2933	2	Intergenic	novelGene_156100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	27	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTCGGAATCAACTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52975	56043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_53959_54093
889982	contig_11309_pilon	-	925	4	Intergenic	novelGene_149867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6620	junction_2	419.536516752581	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	303	854	61425	56293	FALSE	20	CATCTGTGTTAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	61727	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240
889983	contig_14546_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_157455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	771	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCATTTCTCAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538310	541051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_538300_541100
889984	contig_9484_pilon	+	4191	15	Intergenic	novelGene_105667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	399.700455443364	119	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	127	1152	138653	206935	TRUE	35	CAGGGAGTGAAGCCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWSTLSLGPHVLVRVSLHRRERGTSQGKIEGSWYPSAPRPCLMRLYVCILPGYDKWVTSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	138526	214544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_138701_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513
889985	contig_5033_pilon	+	1673	2	Intergenic	novelGene_28889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACTAATTTGCACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358456	442380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_358706_440956
889986	contig_5247_pilon	-	2799	4	Intergenic	novelGene_81815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	183.822982482846	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	82	720	416518	367100	TRUE	15	TGAGCATTTCTTTATGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGSAPGRALRVLRLICLLLSFDFISCVSEGVYGIMNKSVTLKPLQDTVFKEITWKKQKDKIVEWYRDSELRAFPPFQGRILLNTTSGDLTIFNLTSSDEDRYEIESQDLKDSIVFFLSVIELLPSPILNCTLTDKNIIVQCTIPEHYNSHVEFIEYSWNCGLQLCNSTSSKLEISFKENDLSQEIQCVLSNRVSKMKSSITLGTCVPNRE	416599	210798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_211203_365424_367372_376192_376490_416448
889987	contig_8772_pilon	-	4011	9	Intergenic	novelGene_21063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCACCAGTGCCCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24482	14158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_14327_15302_15918_16549_16609_19020_19119_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965
889988	contig_8691_pilon	+	3053	3	Intergenic	novelGene_72683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1355.5	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	7	1329	17110	20695	TRUE	40	ACATCTGCTCATATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLANLCWLSSVVLAAQSFLVVANNETEEVRDEAVKDACSVRLESRGKCEEGGECPFQVSLPPLTLQLPKQFGRIEEVFKEVQNLKEIVNNLKKCCQDCKLQADDNRDRGTNGRLVPGTGALGEAADNRVRELESDVNKLSSDLKNAKEEIDGLHGRLEKMNLVNMNNIENYVDSKMANLTFVVNSLDGKCSSKCPSQEQIQSRPVQHLIYKDCSDYHTIGKRSSETYRVTPDPKNSSFEVYCDMETMGGGWTVLQGRLDGSTNFNRTWQDYKVGFGNLRREFWLGNDKIHLLTKSKEMILRIDLEDFNGVKLYALYDHFYVANEFLKYRIHIGNYNGTAGDALHFSKHYNHDMKFFTTPDRDNDRYPSGNCGLFYSSGWWFDACISANLNGKYYHQKYRGVRNGIFWGTWPGMNETHPGGYKSSFKEAKMMMRPKHFKP	17103	22489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_17726_19988_21248_21317
889989	contig_19744_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_120388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	496	1488	720	2207	176494	177981	NA	85	AAAAAGGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHTGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKA	175774	177981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_175800_178000
889990	contig_13888_pilon	+	4903	2	Intergenic	novelGene_151816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	339	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTATTTCTAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360724	368470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_364841_367683
889991	contig_7876_pilon	+	7330	12	Intergenic	novelGene_144843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2489	220	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCGACAGAATCAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41013	270441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_42246_81467_82496_161540_162507_183266_183390_183652_184347_205684_206177_239225_239382_239834_240589_241314_241533_260475_260935_268994_269677_269915
889992	contig_1146_pilon	+	3230	2	Intergenic	novelGene_84814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	562	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	101	520	511257	511676	TRUE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWLQERAPPGACYLKCLQLLKALRDLGARGLDPMAATHWGRILSSYVLKTALLAVLLREGVPAQVWDEVHLGERLEEVVQFLRDCLLQRRALFHCVLGPGGAAAEVGPLPKVLREAAPVDVLAAFDQRPPGTRSCAAAVHVAKAAPASPGLRGSPLPCQVPATPESAHPGIP	511156	514473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_511970_512056
889993	contig_11318_pilon	-	2017	16	Intergenic	novelGene_48147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_14	1057.16229385821	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1716	300	2015	49795	14983	FALSE	65	GGAAGAAGAAAAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEE	58324	14980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071_52142_58143
889994	contig_13244_pilon	+	2261	5	Intergenic	novelGene_86919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	530.12940637169	887	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	353	520	250894	252668	FALSE	15	TAGTGTTCTTACTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRGCRRDRGGENGGREGGRGEAGESATCWSRRSNGGESSSRSAEKRSAEEEAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSSKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239725	254409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245183_245347_247045_247121_250878_250935_252541
889995	contig_2054_pilon	+	5052	2	Intergenic	novelGene_51676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	401	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4662	4994	85240	85572	FALSE	80	AAACTGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIVEPYIAWGYPNLKSVNGSGKINNGIALTDNTLTARSLGKYGIIYMEDLIHEIYTVGKCFKDANNFLWPFELSSLGGGMKKKTIHFVEGGDTGNREDQINRLIRRMN	80229	85630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_83644_83992
889996	contig_5324_pilon	-	2008	3	Intergenic	novelGene_102072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	227	547	444225	443560	FALSE	35	CACCAGACCCATGAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQVFFLFVLCSNTYN	444542	442098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443602_443946_444250_444340
889997	contig_9144_pilon	-	3843	3	Intergenic	novelGene_151130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCCATCTTAGCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143546	78154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_-_79305_88896_90565_142521
889998	contig_16110_pilon	+	5385	22	Intergenic	novelGene_126772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	225	junction_9	329.692875704419	1611	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	934	2805	115	2919	6170	131269	FALSE	45	ACCAGCAAGCCAAGGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPTKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVESPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLCDISEGTVVPEDRCKSPTSAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISALHFCETFTRKADSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTILRLKGAILRMAFLDTTGCLVPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCVYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPLETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGELARARLALDERGQKLSDLEERTAAMLSSADSFSKHAHEMMLKYKDKKWYQF	6055	133735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_6193_7704_7769_9530_9615_14413_14538_32691_32771_53175_53331_54084_54158_55828_55977_56201_56270_56530_56572_57352_57574_58499_58679_68233_68360_70187_70340_75391_75458_100046_100098_105752_105993_109402_109773_110061_110228_118994_119107_128398_128620_131227
889999	contig_8576_pilon	+	2406	7	Intergenic	novelGene_88794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	587.558058596955	25	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	555	911	914305	915551	FALSE	70	AGCAAAAAAAAAACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893611	917046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_909926_913398_913461_914198_914310_914837_914977_915338
890000	contig_2204_pilon	+	1904	5	Intergenic	novelGene_71671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	137.768601284908	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	592	906	38839	50221	FALSE	10	GGGCATCATGCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13177	51219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14956_25596_25715_38679_38845_49912
890001	contig_13481_pilon	+	2689	1	Intergenic	novelGene_119333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAATTAGAAGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333630	336319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_333600_336300
890002	contig_19032_pilon	-	3238	13	Intergenic	novelGene_172544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	224	junction_12	983.387353742156	84	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	165	2312	166531	158657	TRUE	20	CCTGGTGTCTTTTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVEPGNGSLDLGGDSAGRSGAGLEQEAATAGDEEEEEEEEEEEGIAALDGDQMELGEENGAAGAADSGPMEEEEAASEDENGDDQGFQEGEDELGDEEEAAGDENGHGEQQPQPPATPQQQPQQQRGAAKEAAGKSSGPTSLFAVTVAPPGSRQGQQQAGGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGGKLILSILFIWF	166695	156920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_165897
890003	contig_4924_pilon	-	2020	12	Intergenic	novelGene_84687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	699.613671433169	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	40	1335	252461	65524	FALSE	65	GGATTAATGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSTRSTSSGTGVRTLPRNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252500	64838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197812_252404
890004	contig_7378_pilon	-	5579	8	Intergenic	novelGene_120251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	220.918213696511	899	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	999	1601	423749	417606	FALSE	25	TCGTCCCAGTACTAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPGSSSVAAMERAGDNSQSVYIPMSPGPHHFDSLGYPSTALSMHRGPSRGSEIQPPPVNRNLKPDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPVTKSWSRAIHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVSMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKSTGSVDYLALDFQPNSPEPTEAQGSAWVQQVHYHKPGCAAGEGIEAV	442716	413627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_417699_419930_420042_421678_421782_422143_422235_423544_423806_425100_425205_426479_427074_442472
890005	contig_13565_pilon	+	3983	1	Intergenic	novelGene_162389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	967	1341	175191	175565	NA	45	GCAACAATTAACATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSGTLFDIVPEDEPLRLEGTQNTTEEELPPHSRIDLNGMDGVKLSEPSFDDMTQLKLRKKSCKHPLIIRMCDVRSMNLEKLEIIKNEMESININILGISELKWTGISHFELGNHIVYARNDK	174224	178207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_174200_178200
890006	contig_15327_pilon	-	4230	11	Intergenic	novelGene_70818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_10	78.8933457270003	833	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	98	2788	1480816	1470519	FALSE	10	TCTGCCATTCACTTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVNVQKKTAPRGEGSVAKKVKRLLKKQVVRIMSCSPDTPCPRDHSTEDLDKKGDAKARSELGSASPDETPDGSASPVEAQDEGPEEPPEAGEQLPPFLLKEGRDDRLHSAEQDADDEAADDTDDSSSVTSSASSTTSSQSGSGTSRKKSIPLSIKNLKRKHKRKKNKITRDFRPGDRVAVEVVTTMTSADVMWQDGSVECNIRSNDLFPVHHLDNNEFCPGDFVVDKRVQSCPDPAVYGVVQSGDHTGRTCMVKWFKLRPSGDDVELIGEEEDVSVYDIADHPDFRFRTTDIVIRIGNTEDGAPPKEDEPSVGQVARVDVSSKVEVVWADNSKTIILPQHLYNIESEMEESDYDSVEGSTSGASSDEWEDDSDSWETDNGLVEDEHPKIEEPPIPAAEPPAVPEEDKGVVISEEAATAAIQGAVAMATPMAGLMEKAGKEGPPKSFRELKEAIKILESLKNMTVEQLLTGSPTSPTVEPEKPTREKKFLDDIKKLQENLKKTLDNVAIAEEEKMEAAPDAERKEDKPEGQSPVKAEWPSETPVLCQQCGGKPGVTFTSAKGEVFSVLEFAPSNHSFKKIEFQPPEAKKFFSTVRKEMALLATSLPDGIMVKTFEDRMDLFSALIKGPTRTPYEDGLYLFDIQLPNIYPAVPPHFCYLSQCSGRLNPNLYDNGKVCVSLLGTWIGKGTERWTSKSSLLQVLISIQGLILVNEPYYNEAGFDSDRGLQEGYENSRCYNEMALIRVVQSMTQLVRRPPEVFEQEIRQHFSTGGWRLVSRIESWLETHALLEKSQALPNGVPKDSSSPEPPAGAELSDSGRDEPEDGGLAPGEASQGSDSEGGAQGPASARRDHTEQTPEAAPATSVPPSVKPKKRRKSYRSFLPEKSGYPDIGFPLFPLSKGFIKSIRGVLTQFRAALVEAGMPESTEDK	1481157	1469076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1471190_1471464_1471523_1471614_1471819_1475853_1475991_1476191_1476889_1477782_1477873_1479345_1479475_1479554_1479668_1479873_1480029_1480379_1480853_1481096
890007	contig_5125_pilon	-	3190	9	Intergenic	novelGene_43470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_8	165.297789988251	560	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	148	1425	182056	75819	FALSE	35	CACGTTTTAAGATTTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVGRPSSEELRNLSLSGHVGFDSLPDQLVNKSTSQGFCFNILCVGETGIGKSTLMDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINKDDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	182203	74053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_110198_110395_121095_121211_182029
890008	contig_7909_pilon	+	4238	3	Intergenic	novelGene_155876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2243	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1105	1470	2107	2472	TRUE	45	TACTTTTTGAAAACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAVCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKILSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSSVLVWMPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	1002	170725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_3208_24374_25574_169891
890010	contig_4426_pilon	+	1799	6	Intergenic	novelGene_15436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAGAAATCAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820933	904632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_821944_868806_868955_881692_881834_887174_887380_889993_890139_904482
890011	contig_4874_pilon	-	2726	2	Intergenic	novelGene_78640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	493	1089	409626	409030	FALSE	40	TAACTCAAGTTATATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTSASPAQIKNTGNKKCWRGCGEIGTLTHCWWECKMIQPFWKMIRCFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRVITQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSIDEWIKKLWYIHTAEYYAMRKNNDESVKHLITRMKLEDIMLSEISQSQNDKHCMRPLL	410270	407392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_409639_409790
890012	contig_20670_pilon	+	5299	7	Intergenic	novelGene_144831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACGAACACCAGGCGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48219	61591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_50820_51039_53012_54341_54424_56699_56793_57515_57693_60652_60894_61457
890013	contig_4426_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_15414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGACTCTGTTTCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818259	820535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_818300_820500
890014	contig_11227_pilon	-	4874	2	Intergenic	novelGene_163180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	270	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTGGCAATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131156	126130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_128004_128155
890015	contig_16211_pilon	-	6211	12	Intergenic	novelGene_150048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_9	279.209924283113	772	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	121	2013	121247	70073	FALSE	50	AATGAAAATCTTAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRDKRKDTREKIKEKERVKEKDREKEREKEREREKEREKEKERGKNKDKDRDKEREKDREKDKEKDREREREKEHEKERDKEKEKEQDKEKDREKDKSREIDEKRKKDKKSRTPPRSYNASRRSRSSSRERRRRRSRSSSRSPRTSKTIKRKSSRSPSPRSRNKKDKKREKERDHISERRERERSASTRKSSNDRDGKEKLEKNSTSLKEKEHNKEPDSSVGKEADDKDAPRTEENKVQQNGNCQPNEENLSAKTEVV	121367	65874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_70223_71545_71691_73420_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
890016	scaffold_12124_pilon	+	2365	5	Intergenic	novelGene_22064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	464.221391148663	27	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833792	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_834108_851769_852462_854703_854804_857165_857236_857793
890017	contig_5136_pilon	-	4176	16	Intergenic	novelGene_126613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	413	junction_14	223.959659065844	1165	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	1784	3655	224642	188263	FALSE	15	TACACATGGCTGCTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQLTEKEEEIVDWWSKFYASTGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYDCELEKVTEFEGLTDFSETFKLHRGKSDENDDPSVVGEFKGSFRIYPLSDDPSVPAPPRKFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLEFQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTCDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCISGVNTWRDQLKPTQLLHSVARFKGYLPPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANRILHQHLGAPDERLALHILRTQGLVPEHVETRTLRSTFQPNISQGRLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDIILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSVDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHHTIIPAKSSEKCHLDMVPDLKAMDPLKAKTASLFEQKSMRGWWPCYADKDGSRVLAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDPPNRPETSFLWFSNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLILLVLLLFMAVLLYSIPNYLSMKMVRPNA	226425	187741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_188302_190270_190419_190803_190914_193021_193213_195453_195554_197575_197718_201574_201671_201758_201848_204075_204216_206291_206441_207167_207339_211313_211406_211835_211992_220871_220998_223324_223424_224618
890018	contig_12019_pilon	+	2299	2	Intergenic	novelGene_87765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1553	1891	702142	702480	FALSE	25	GACCCTATCCAATCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISGFLRKCHIIFQNGCIILHSHQQCLRVLISPQPLQHLLLPVFLICASNAGVRWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	670008	702888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_670149_700729
890019	contig_7151_pilon	-	3877	17	Intergenic	novelGene_40715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	263.353374764783	868	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1115	3348	135	3482	268488	236361	TRUE	15	AAGTCGTTTTTTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKPKMVLLEDSGSADFRRCFVRLSPFAIALVSLLSACFITISLGETEKQLRLVAGENRCTGRVEVKVNEEWGTVCNNGWDMDDVSVICGQLGCPTVIKATGWTNSSAGSGRIWMEHVSCQGNESALWDCKHDGWGKNNCTHQQDAGVTCSDGSDLEMRLVNGGNRCSGRIEVKFQGQWGTVCDDNLNIDFASVVCKQLECGSAVSFSGSANFGEGSGPIWFDDLVCHGNESALWNCKHQGWGKHNCDHAEDAGVICLEGADLTMRLVDGVTECSGRLEVKFQGQWGTVCDDGWDSNDATVVCGQLGCPTAVTGIGRVNASEGSGPIWLDSVACKGHELALWQCRHQEWGKHYCNHNEDAGVTCSDGSDLELRLIGGGSRCAGTVEVKIQNLLGKVCDRNWGLKEASVVCRQLGCGSVRKTSYQTYSKVKATNTWLFVSSCEGNETSLWDCKNWQWGGLPCDPYEEAKITCSAHREPRLVGGDIPCSGRVEVKLGDTWGTVCDSDFSLEAASVLCRELQCGTVISILGGAHFGEGSGQIWAEEFQCQGDESHLSLCPVAPRPDGTCSHSRDVGVICSRYTEIRLVNGKTPCEGRVEIKTLGTWGSLCNSHWDMEDAHVICQQLKCGVALSTPGGAHFGKGSGQVWRHMFHCTGTEQHMGDCPVTVLGASLCSAGQVASVICSGNQTQILPLCNSSSSDPTSSPIPEESAAGCVGSGQLRLVNGGGRCAGRVEVYHEGSWGTICDDSWDLSDARVVCRQLGCGVAVNATGSAHFGEGTGPIWLDELGCNGKESRIWQCRSHGWGRHNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSETSRQTCAGRLEVFYNGAWGSVGRSDMSPATVGVVCRQLGCADRGSISPASSDKTLSRPMWVDHVQCPKGPDTLWQCPSSPWNQRLASPSEETWITCASKIRLQEGTTNCSGRVEIWHRGSWGTVCDDSWNLEDAEVVCRQLGCGSALAALKEAEFGQGTGPIWLNEVTCKGTESSLWDCPARPWGHSDCGHKEDAGVRCTGIVETKESPNSTGHSFLIALGILGVILLALLIAFLMWTQKRRQRQRLTVSSRGENSVHQVQYREMNSCLKADDLDALNSSGGHYEVH	268622	231647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_232012_236329_236384_237543_237640_239450_239559_239753_239790_240225_240535_241535_241857_243308_243624_243704_243798_244175_244491_244587_244903_254600_254922_255562_255884_262715_263037_266028_266350_267402_267490_268442
890020	contig_2087_pilon	+	2301	5	Intergenic	novelGene_65555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	464.554625420951	5	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	258	626	69092	70191	TRUE	35	ATTTAATTGCATTTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSQGRRQRCHGGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMSEDCSL	39327	71904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39365_39453_39637_69054_69264_69994_70723_70760
890021	contig_13300_pilon	-	3245	4	Intergenic	novelGene_125758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_2	284.999415204078	1677	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	90	521	56132	47432	FALSE	0	TGTTGGCTCTCTCGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSEKEVDSGNDIYGNPIKRIQYEIKQIKMFKGPDKDIEFIYTAPSSAVCGVSLDIGGKKEYLIAGKAEGNGKMHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	58673	44707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_47630_49635_49761_56023_56133_58584
890022	contig_8617_pilon	-	2017	1	Intergenic	novelGene_73373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTTTTGGCGAGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62027	60010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60000_62000
890023	contig_4952_pilon	+	1879	12	Intergenic	novelGene_145516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	170.667575970374	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	887	1618	400400	454157	FALSE	30	TAACTATTCTGCTTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSIVRLPEVIALKKKYKAYLYLDEAHSIGALGPTGRGVVDYFGLNPEDVDVLMGTFTKSFGASGGYIGGKKELIDYLRTHSHSAVYATSMSPPVVEQIITSMKCIMGLDGTSLGKECVQQLAENTRYFRRRLKEMGFIIYGNEDSPVVPLMLYMPAKIGAFGREMLKRNIGVVVVGFPATPISESRARFCLSAAHTKEILDTALKEIDEVGDLLQLKYSRHRLVPLLDRPFDETTYEETED	332694	454418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_332868_355900_356096_381347_381503_384289_384439_386788_386914_398188_398245_399640_399673_400398_400619_407004_407132_442835_442972_445583_445714_454037
890025	contig_10106_pilon	+	6265	13	Intergenic	novelGene_73864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	572.762912701815	2557	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	172	1152	151101	172575	TRUE	15	AAGCAGCCCCTTTTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	131580	180383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131648_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505_177593_180287
890026	contig_16846_pilon	+	2579	7	Intergenic	novelGene_82909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.3637852093265	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	209	790	459619	477213	FALSE	20	ACACGTATGTATGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEQGQGSKKKEQNSPGV	456129	479002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456295_459575_459710_464055_464156_464527_464615_465206_465311_475327_475478_477163
890027	contig_7830_pilon	-	3658	5	Intergenic	novelGene_177914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	892	1239	158666	158275	TRUE	20	GTAGTTTTCTTCGTATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMFWILLMLALWPNMWSILENVPCALEKKVYWAPVGCSVRYMSMRSSWLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFTESGVWKSPTTIVALSVSLFRAVRVCFIYVPLVY	196219	96387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7830_pilon_-_97629_118017_119132_158210_158297_158340_158771_195432
890028	contig_11304_pilon	+	6713	17	Intergenic	novelGene_156679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	179.379736435725	515	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	697	3030	447600	503955	TRUE	20	GGAGCATCCCTAATGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILDSPSKTMSIKERLALLKKSGEEDWRNRLNKKQEYGKASAASSLHIQEPEQSFKKKVILSMLGKGLTDITRGRASNRQACVT	271329	677362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_271608_319887_319991_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491072_491299_503744_506740_657631_657940_676771
890029	contig_8628_pilon	+	1985	12	Intergenic	novelGene_164407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	230.417838209825	1089	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1821	163	1983	373219	419349	FALSE	35	TAAACCAGGATTCTTGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIEDVDALKSWLAKLLEPICDADPSALANYVVALVKKDKPEKELKAFCADQLDVFLQKETSGFVDKLFESLYTKNYLPPLEPVKPEPKPPVQEKEEIKEEVFQEPAEEERDSRKKKYPSPQKTRSESSERSQYMAFMSVYYRTREKKREDGKWRDYDRYYERNELYRDKYDWRRGRSKSRSKSRGLSRSRSRSRGRSKDRDPNRNVAEHRERSKFKSERNDLESSYVPVSAPPPNSSEQYSSGTQSIPSTVTVIAPAHHSENTTESWSNYYNNHSSSNSFGRNPPPKRRCRDYDERGFCVLGDLCQFDHGNDPLVVDEVALPSMIPFPPPPPGLPPPPPPGILMPPMPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGPGHSMRLPLPQGHGQPPPSVVLPIPRPPITQSNLINNRDQPGTSAVPNLAPVGARLPPPLPQNLLYTVSERQPMYSREHGAAASERLQLGTPPPLLAARLVPPRNLMGSSIGYHTSVSSPTPLVPADTYEPDGYNPEAPSITSSGRSQYRQFFSRTQTQRPNLIGLTSGDMDANPRAANIVIQTEPPVPVSINSNITRVVLEPDSRKRAMSGLEGPLTKKPWLGKQGNNSQ	373056	419351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_373278_384736_384856_388162_388288_395395_395488_396132_396360_397107_397372_398836_399155_401467_401603_412199_412365_414009_414163_417265_417411_419330
890030	contig_2689_pilon	+	3952	3	Intergenic	novelGene_100823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTAGTCCTGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143011	156328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_144495_153485_153581_153954
890031	contig_16310_pilon	+	5983	3	Intergenic	novelGene_70064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5176	5526	214931	215281	TRUE	20	GATCAAACCGTTGTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRLLGLDSKTYYGVPRLRSPPVVPARFVSRVCRSSCGCLRMLQGSDQASSSAKHLTRKYTESWVSCSFFIACSKIIGFVSLVKHMFLVQGPLPRGSVPFSLPYLTTTVNLKLPT	209217	224699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_213960_214497_215520_224480
890032	contig_9609_pilon	-	3165	5	Intergenic	novelGene_22998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGGAAGAGAACTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319815	310633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_311590_313098_313264_314272_314431_317882_319370_319416
890033	contig_10674_pilon	+	2147	2	Intergenic	novelGene_6424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTATTGGTGGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188045	203154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_190056_203017
890034	contig_13633_pilon	+	2068	14	Intergenic	novelGene_15315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	426.970295379075	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	446	1726	22038	49142	FALSE	25	AAGAACTCTGCCTTTCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5037	49484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21641_21731_21776_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
890035	contig_9183_pilon	-	2560	6	Intergenic	novelGene_40285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	468.929163093958	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	292	975	320566	312131	FALSE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325999	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_325868
890036	contig_12278_pilon	+	3014	16	Intergenic	novelGene_152586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_12	290.028427725437	948	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	100	2481	179723	201939	FALSE	30	CAAATCTTTTCTGCATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGPVQAVPPPPPVATEPKQPTEEETSSKEDSTPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQATQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLLAKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDEKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	179623	202472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_179786_186248_186371_190255_190464_191700_191959_193856_193932_194886_195038_195380_195575_196480_196599_196695_196882_197627_197750_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
890037	contig_14815_pilon	-	4684	2	Intergenic	novelGene_127199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	900	junction_1	0	863	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	21077	19665	FALSE	15	TTCCTCTGGCCTAGCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQGNLGHLAFPSWPPGNLLILHIFNKVGH	21077	15376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_19901_20917
890039	contig_10627_pilon	+	5848	13	Intergenic	novelGene_59968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	133.024747071112	80	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	199	1650	224634	239059	FALSE	30	GATATGTAAGCTATTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSLAILSEMGEVTEGMMDTKMVHFLTHYADKIESVHFSDQFSGPKIMQEEGQPLKLPDTKRTLLFTFNVPGSGNTYPKDMEALLPLMNMVIYSIDKAKKFRLNREGKQKADKNRARVEENFLKLTHVQRQEAAQSRREEKKRAEKERIMNEEDPEKQRRLEEAALRREQKKLEKKQMKMKQIKVKAM	218876	243257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232908_234198_234285_235606_235666_235983_236094_236314_236483_238978
890040	contig_5928_pilon	-	4217	6	Intergenic	novelGene_40390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	218.382600039472	528	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	154	765	381340	359489	FALSE	40	AATTCCCTAATATTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAGGGWKSHTVEGEAVGRVCLSSWSRLTPSPPPVTLPRPHPSPAPPLPPAMACGATLKRTLDFDPLLSPASPKRRRCAPLSAPTSAAASPSAAAAATAASFSAAAASPQKYHRMEPSPFGDVSSRLTTEQILYNIKQEYKRMQKRRHLETSFQQTDPCCTSDAQPHAFLLSGPASPGTSSATSSPLKKEQPLFTLRQVGMICERLLKEREEKVREEYEEILNTKLAEQYDAFVKFTHDQIMRRYGEQPASYVS	381874	356036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_359500_359761_359834_360903_361054_364686_364831_381105_381403_381783
890041	contig_3095_pilon	+	1657	4	Intergenic	novelGene_75061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6759	junction_3	605.707483489808	89	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	64	759	147241	150781	TRUE	20	TTCATTAGGGCTTGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWGMNHPSISFVAWFPQMMHASGPLGPRVP	147177	152365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_151163_151848
890042	contig_9014_pilon	+	1641	5	Intergenic	novelGene_106806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1335.6856853317	4	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	37	414	150693	152329	TRUE	20	TTTGTATAGTCATACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCSCSSCSLSFVMPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150656	153648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425
890043	contig_7963_pilon	+	3203	5	Intergenic	novelGene_58419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	301.252800816855	878	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	57	593	89963	92897	FALSE	15	TCATTAAGTGTCTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSGVLTVGLHILMTLPSPQEAGAIQADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDGEQLFSVDLKTKEAVWRLPEFGNFAHFDPQGGLVSIALIKAHLDALVERSNRTRATNAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEPYLPTPLPDSTETLVCALGLAIGLMGFLVGTIFIISSTCLSSATR	89906	95507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_90045_91241_91491_92150_92217_92314_92451_92893
890044	contig_13707_pilon	-	3717	40	Intergenic	novelGene_43514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_12	240.010291802123	1812	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1054	3165	52	3216	181940	117289	TRUE	40	CAAATAAAGGGATGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENAEVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTALVHQLQEKEKLLAAVKEDAAAAKDRCKQLTQEMITEKERSNVVIARMKDRIGTLEKEHNVFQNKMHVSYQETQQMQMKFQQVREKLEAEIAHLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDCARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQGVTQLKVQLQEAERRWEEVQSYVRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKEKEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVVEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLANEHDHLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALTNEQAAAAHELEKMQKSVHVKDDKIRLLEEQLQCKISKKMEEFKILNDQNKSLKLEVQRLQTLVSEQPSKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEDELKALRTENSSLTKEVRDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIEALKEEIGNIQLEKAQQLSIASQVQELQNLLKGKEEQMNTIKAVLEEKEQDLANRGKWLQDLQEENKSLKAHVQEAAQHKLNEACSASRFKELETVLKEKENEMKKVEAMLKERESDLSSKTKLLQEVQDENKLFKSQIEQLKHQNYQQVLSFPPHEELLKVISEREREIIDLQSELDSLKDAVEHQRKKNNDLREKNWEAMEALASTEKMLQDKVNKTSKERQQHLEAVELEAKEVLKKLFPKVSVSSDLSYSEWLRGFEKKAKECMAETSGSEEVKILEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKDDESQKTIKQMQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESSSEKETVSVSLNQTITQLQQLLQAVNQQLTKE	181991	108277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_108760_117269_117388_119119_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906_125000_125128_125219_126019_126101_127930_128021_131443_131531_133608_133700_135226_135265_136413_136483_138446_138538_140267_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_143308_143971_144010_145177_145247_145940_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152162_152693_152763_153125_153217_154405_154441_155990_156060_156456_156624_159283_159372_160632_160766_169938_170046_172845_172987_174886_175004_181856
890045	contig_16594_pilon	-	2251	7	Intergenic	novelGene_53851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	674	junction_6	1775.04679907007	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	1016	2041	272836	124924	FALSE	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVGRCQLCFLIV	306532	124713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_306350
890046	contig_8377_pilon	-	14691	1	Intergenic	novelGene_35033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	443	742	89368	89069	NA	40	AAACCACGGGATCTGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIIHSIHCLNLSPHNTSKVIRLSLAACQSCYQNISHLDQPIHTKEAESLIWYRVISKSYRDLFIHAFNYLFNKYMFKGSSVMSGTADTKVNKEKCLP	89810	75119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_75100_89800
890048	contig_1275_pilon	+	1232	9	Intergenic	novelGene_108761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTTGTTCTGCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400569	459395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457707_459283
890049	contig_9653_pilon	-	4954	10	Intergenic	novelGene_48268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_1	700.667001444752	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	2107	3060	1016667	1006903	FALSE	15	TGGATTTGATGTGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1025396	1005008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286
890050	contig_13592_pilon	-	3631	6	Intergenic	novelGene_33725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1518	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGGTATCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270505	265047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_266682_267156_267281_267364_267491_267567_267704_267825_267999_269067
890051	contig_9809_pilon	+	5866	3	Intergenic	novelGene_176766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	25	junction_1	50	808	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	68	1102	115445	117674	FALSE	30	ACAACCAGTGTTCAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLELREKQAEKEERQKTKKIETSAEKLRKLLKEEKRLKKKKRKSTSSSSSISSADESVSSSSSSSSSHKRRKKRKRNRSESSRSSKRHSSKASSSQIDQNRQDEYYPLPVNTSASFLNQKQEVEKLLEKQDRLPYQKTQVKDKDRYPLSSSSVEIPDDSGGRSEDPRDFYNSCKTQASSSKTEKPYKSERHFSNRRDSADSFCRSSEDKIKNYGYRRVDRDVEGRKEQSRRWEPGSGRYSASPASSEYSWKSLEKYKKCTYSGSRDFSKHEQRYQLNTNQGEYEREDSCGEDAKTEVPEEDGLSSKEQSESRVKKNLPQNLLNIFNQIAEFEKEKGNKPKNL	115377	122438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_115448_115880_115991_116752
890052	contig_15219_pilon	+	3782	8	Intergenic	novelGene_40816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_7	280.022812481776	2162	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	125	955	19617	23972	TRUE	40	TTACAGAAACTAGACCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19492	27570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_24314_24453_24588_25218
890053	contig_6316_pilon	+	2693	14	Intergenic	novelGene_134714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	172.009391514623	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	758	1663	147168	157164	FALSE	60	TTAAAAAAAAAAATCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	139484	158194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_139564_140479_140644_142566_142734_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
890054	contig_14871_pilon	-	1322	4	Intergenic	novelGene_63731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	553	junction_1	206.707522843268	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	35	436	291378	288466	FALSE	45	GAAAAAGGTCTGTAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPKQLAEFARMKPRKIKEDDAPRTIACPHKGCTKMFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	299832	287579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288649_289458_289618_291318_291380_299799
890055	contig_15236_pilon	-	3447	19	Intergenic	novelGene_141626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	907.169354450601	25	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	68	721	664153	657925	TRUE	55	TTTAAATAATATTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEELGQVEYVFTDKTGTLTENEMQFRECSINGIKYQEINGRLLPEGPTPDFSEGSLSYLSSLSHPNNLSHLTTSASFRTSPEYEMELIKEHDLFFKAVSLCHTVQISNVPTNGIGDGPWQSSLTPSHLEYYASSPDEKALVEAAARIGVVFIGSSEETMEVKTLGKLERYRLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKCIDGEIEKTRIHVDGFALVKRAKNSMHSV	667290	617768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563_645692_647358_647419_648728_648875_650564_650634_654832_654987_656272_656477_657774_657957_660980_661089_661162_661237_662591_662661_663175_663352_663958_664202_667271
890056	contig_10319_pilon	-	1876	5	Intergenic	novelGene_147243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_2	68.1152515961	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	320	679	250190	79977	FALSE	40	GATGACAGCAAGAACACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRDGRDCFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPPAPRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESILLTVIQPYPVSVL	251660	78779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_80038_139207_139311_147871_148033_250155_250273_251423
890057	contig_13481_pilon	-	3461	6	Intergenic	novelGene_119367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	328	612	476241	475957	TRUE	15	CCGAACTTTGGGGGTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTILSESSEPSSGKEEERSVWGPPGKGTKGPGGEREKGKELGEKKQQTQWGRRFYFTDSIRVQLQLTPRSPGEPCAVAGTPALRLTGSSKPWWGKCFGSSFPGWALSIYMCSCEGGEVFMFEDLVFTITEKTAPNFFPEILSPPRAASSQSPNRWGDAGSGDGGNEAEGYGCCAVFRPYPGLGVPPGGLVLLWQLTRAWGTKQ	476568	469270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_470967_471860_472221_473976_474157_474389_474604_475244_475326_475638
890058	contig_13700_pilon	-	1915	9	Intergenic	novelGene_68284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	364.879774720386	10	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGAACCAGATAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163845	112593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_112642_117817_117894_118876_118973_121767_121824_122056_123164_123557_123682_132820_132924_163213_163239_163565
890059	contig_10930_pilon	+	1639	5	Intergenic	novelGene_37091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_4	5027.82206825182	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCATCAGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339417	342167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_341098_341522_341625_342020
890060	contig_12733_pilon	+	1039	9	Intergenic	novelGene_129594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	518.803536394077	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	218	613	332310	344683	TRUE	50	AGACTTAGAGGGAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASTRLPQHDPCGQDSSAAAQRGGLVAHSDLDERAIEALKEFNEDGALAVLQQFKDSDLSHVQNKSAFLCGVMKTYRQREKQGTKVADSSKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGQQPSVGTEIFVGKIPRDLFEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLTGLNRGYAFVTFCTKEAAQEAVKLAFCGLHS	329717	347528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_329789_332031_332151_332282_332391_335125_335240_335339_335517_344659_344731_345322_345529_346808_346959_347505
890061	contig_5758_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_119062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	716	1015	63940	64239	NA	30	ATCAGCAGTTCGAATCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPGNTLCLKTIIVLLEKMDCFILPSSLSSSKSESQEFSLPLTIYYSLFPEEENTQEMKLALSSSTSTESKVLCSVLTCYVKVNSKNSGVNQICLNSR	63224	64420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_63200_64400
890062	contig_253_pilon	+	4700	10	Intergenic	novelGene_129750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1657	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3468	3908	707538	709869	TRUE	20	TTCCTGTGCCTGCGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSLGTMDVPWSSLVGLCSVTVRYDPRILAFSTSDSSFFPLGLFSFSRTMVRSVACSRSNCRRLKRSSRLALWWSLGPAPGDDRVTIPRGETGSWMSCSMEVGECGGGVRGSSQLRRGRRTLACTASSSLSSIFRFWAFSELSSW	700785	716818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_703412_703699_703912_704488_704649_705221_705389_707235_707948_709838_709939_711529_711652_712423_712694_714364_714449_716571
890063	contig_10263_pilon	-	11365	25	Intergenic	novelGene_135849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	448.120325793072	2298	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1354	4065	4874	8938	905226	880676	TRUE	20	CCTTGGGAATTTCTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINKIYYYQDSNCPFHSQSTQGVSQVVPPEPIPTAQPQPIQPTTLVSSIDSAHSDVASGMSDGNENVPSSSGRHEGRTTKRHYRKSVRSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGDRVVECQLETHNRKMVTFRFDLDGDNPEEIAAIMVNNDFILAIERESFVDQVREIIEKADEMLSEDVTVEPEGDQGLESLQGKDDYGFSGSQKLEGQFKQPTPVSSMPQQIGIPTSSLTQVVHSAGRRFIVSPVPESRLRESKVFTNEISDTVAATTSHGPEMNLSHSASSLSLQQAFSELKHAQMTEGPSTAPPNFSHTGPVFPVVPPPMSSIAGVTTTGAATLSVSVPATSIPLTDISTSVIQSQVTVPTEKGVTGIVITSGGLPIPSVSEPPILTSVVSSITVPTVVSISTTSQSVLTPTCGSIVSSTSTLPSITVSTASASAVGSTVVPGAKPPTVLSQQAAGSTTGVATLTSVSTTTPFPSIVSQPFLQLSSSSSASTLAETVVVSAHSLDKTSHSSAAGLALSLSAPSSSSSPGAGVSSFVTQPGGVHPLVIPSAIASTPILPQAAGPMSTPLLPQVPSIPPLVQPVASVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHAHCPEIDVDAQPKAGIDDIKTLEEKLRSLFSEHSSSGTQHASASLETSLVVETTVMPGISTTAVAPSKLMTSTTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVLPVGTELPAGTPPSEQPPPLPGASLTQSQQPLEDLHAQLRRALSPETTAVTFAVGLVSVVAPTAVSEAGAHPQKDVSQVTEAPVLATSSGAGVFKTGRFQVSITTDDVQKEGKIKSEDAKSVHFESSTSESSALSSSSPESTLVKAEPDGVTIHGISSDVPEITHKTPASEAKSETGQPTKVGRFQVTTATSKVGRFSVSKTEDKITMAKKEGPVASPPFTDLEQAVLPAVIPKKDKPELSEPSHLNGPSSDLEAAFLSRHVDDGSGSPHSPHQLCSKSLPIQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLREKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYSKLGKVPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSAQSAASVLHPQQTLHPPGNIPETGQNQLLQPLKPSPSSDNLCSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGGTVNSQAPQAQPTAMTSSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAMNLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	988367	878198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_879329_879378_880994_881454_881646_888387_888583_890018_890222_891327_891990_893222_893297_897062_897124_897769_897854_899261_899346_900412_901819_902513_902637_902770_902829_903040_903215_903551_903669_904814_904978_905074_908628_914657_914742_923075_923264_924533_924871_926101_926322_927974_928064_965321_965480_967567_967789_988192
890064	contig_17144_pilon	+	3587	10	Intergenic	novelGene_29167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2650	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGCAGCCTTCCTGCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157616	183409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_157756_158010_158207_159471_159529_161422_161510_162016_162066_162876_162954_164217_166838_167239_167303_181803_181852_183158
890065	contig_8204_pilon	+	4634	8	Intergenic	novelGene_176998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_4	101.59141856737	1303	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	86	1768	19204	63532	FALSE	35	AAACCATTCTGAATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGPFQSQKKNLFHKIVSKYKHKKEKPNVPEKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEAIFSEEKNTTEPAYKVKNAPSIPNTPEPTITQEPLVGSQKRKARKTKITHLVRTADGRVSPAGGTLDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	19118	66398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_43538_43629_45005_45066_55658_55857_57899_58087_63444
890067	contig_6842_pilon	-	3139	22	Intergenic	novelGene_130658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	355	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1547	1942	373297	363465	TRUE	35	AAAAACAGCGTGACTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELEFIVLSSSCIMTSSELLSSMTSCMLFTLLLWLLVLTDMLGMEWLLPRLSISLLRLVPCSLSSSSSCDSFKGPFRVSWKRIFFIFRYCRLSSSRTASFVLCIRSIRTRSGRSRRTKSCRNSSADVGLS	415844	249457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_249599_311499_311581_329517_329614_334910_335123_339829_339902_340280_340383_342591_342638_343775_343871_346227_346345_347567_347659_362300_362395_363414_363498_371854_372024_373103_373309_383701_383838_392826_393063_394640_394770_398289_398494_406344_406585_408041_408256_414416_414599_415650
890068	contig_14333_pilon	+	2908	1	Intergenic	novelGene_49094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAATAAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293859	296767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_293900_296800
890069	contig_5502_pilon	+	1873	8	Intergenic	novelGene_154972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	407.829045817294	1256	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	55	744	357713	382071	TRUE	25	TATCTTGGTTGTCTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVVYDALRKSGAAPSINQTPSDLWASRG	357658	399295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_381989_382122_395620_395841_398436
890070	contig_12624_pilon	-	3941	15	Intergenic	novelGene_61049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	958.564839236454	387	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	291	1007	903621	877414	TRUE	30	CAAGGCACCCAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFR	903911	862027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875461_875623_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
890071	contig_8843_pilon	-	1676	1	Intergenic	novelGene_156658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATTTAGTTGGCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93217	91541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_91500_93200
890072	contig_2768_pilon	-	3306	7	Intergenic	novelGene_57481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGAGCCTCGCGCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680993	656176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_656502_664570_664689_668729_668859_671910_672004_672643_672756_677131_677264_678596
890073	contig_11512_pilon	-	4564	1	Intergenic	novelGene_43278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2284	2610	368293	367967	NA	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKLFVFFLPFLLLLSTIPSSLLSLSSFLYPVLPTLRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	370576	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366000_370600
890074	contig_11160_pilon	+	1663	2	Intergenic	novelGene_168814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACAAAAAGTTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318180	322427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318305_320888
890075	contig_13217_pilon	-	2264	4	Intergenic	novelGene_140895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.1294301989582	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	43	351	25452	21626	TRUE	25	GTGCATTTTGCAATTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEASQRPRLSQRPRMSQRPRSQNIYSACPRRARGADAAGPEQAPLPGPGATEPSAPPQVSEAPWFHAPSLKTSCEYVSCYHQPPAKTEDYDSDDYINVPRLAHLPSYPPRPRPLCQ	25494	19597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_20984_21098_21803_25100_25160_25379
890076	SIRV7	-	1566	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112269	81	112091	-76	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAACTATTTAATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2647	1081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1100_2600
890077	contig_2214_pilon	+	5589	36	Intergenic	novelGene_144252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_33	243.825364068764	1387	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1577	4734	57	4790	277368	312714	TRUE	10	GTGAGTTTTAGTTCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSGLVPRSRQKGRPMTARGFEGSRRGSLRRAGTREPPSEATEATAQTPGFSWSSSFLSTSAPSAAAAPAPADMAAVLQQVLERTELNKLPKSVQNKLEKFLADQQSEIDGLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSHSQERLVNETRECQNLRLELEKLSSQLKAVTEKNKELEIAHDRSIAIQSQFTRTKEELEAEKRDLIRTNERLSQELEYLTEDVKRLNEKLKDSNTTKGELQLKLDELQASDVSVKYREKRLEQEKELLHNQNTWLNTELKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVSRMEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHMKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEESKDQMEKEMLEKIEKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSVKLEQAMKEIQRLREDTDKANKHCSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKTDNEKIQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLSCQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTETNLHLNTKELLKNAQKEIAALKQHLSNMEVQLTSQSSQRSGKGQPSDKEDVDELRSQLRQTEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEESLNKEKQVTEEVRKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSSVQNEVQEALQRAGTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQASKMASVRQHLEETTQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKCVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVASVKEGIQGPLNVSLSEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNAEREKVQVTAKTIAQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQDLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKKLLEEDVKRWKARNQHLVSQQKDPDTEEYRKLLSEKEVHTKRIQQLTEELGRLKAEIARSNASLTNNQNLIQSLREDLNKVRTEKENIQKDLDAKIVDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQYEELKAQQDKVMETSAQSSGDHQEQHVSVQEMQELKETLSQAETKSKSLESQVENLQKV	277311	315176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_277438_277803_278107_279612_279718_281612_281687_284756_284854_286124_286229_286560_286726_287108_287202_287621_287703_287780_287869_288604_288746_289158_289251_289492_289691_292870_292979_293993_294221_294869_295034_295646_295781_295859_296009_297123_297287_298554_298690_299215_299357_300375_300542_301977_302145_303181_303335_303793_303911_305039_305244_305351_305537_306027_306176_308090_308229_308333_308466_309976_310108_311476_311688_312564_313047_313252_313452_314704_314911_315114
890078	contig_5684_pilon	+	3751	2	Intergenic	novelGene_81064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	66	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2673	3230	445054	447039	FALSE	50	AAAAAATAGGGCTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPCQKGELEIKVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	442381	447560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_445091_446518
890079	contig_11422_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_99098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAGAAGAAGAAGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1800
890080	contig_11719_pilon	+	3386	5	Intergenic	novelGene_154729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3152	junction_4	1656.92689941349	461	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	40	447	13921	16333	TRUE	20	AATTGAGTGTCCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSASAWDAPVATMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPRK	12994	20087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14504_16247_19183_19997
890081	contig_4223_pilon	-	5764	7	Intergenic	novelGene_117264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2361	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4588	4929	127816	127475	FALSE	50	TAGTAAAAAGACCAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANKHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLTHCWWECKMVQSLWKSIGHFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYPRERRAIT	294104	126639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_131003_148406_148426_202088_202350_202468_202691_275910_276424_293653_293766_293830
890082	contig_10377_pilon	+	5352	6	Intergenic	novelGene_115366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4867	5178	340351	340662	FALSE	45	TACACACACACCACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHQPEPRRTRWCPATTTDRSDSDHNGGSWTDREKNVEQNSNSQKKTRLTGLTETGGTPETMAPGHSANSEVRPLPKSAFQPKFRQAYKTNSHAREDRAS	200411	340836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_200485_230999_234602_267569_268065_336233_336346_338736_339153_340182
890083	contig_10930_pilon	-	2554	6	Intergenic	novelGene_36970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	374	1222	276835	268388	FALSE	90	AAGAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279104	267055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278495_278637_279049
890084	contig_16125_pilon	-	3705	9	Intergenic	novelGene_155255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	934.969217407718	268	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	48	1958	236934	144623	FALSE	35	ATGTTAATTCTACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDG	236981	142875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
890085	contig_2799_pilon	+	7627	8	Intergenic	novelGene_85464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_1	399.853697734355	1735	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1416	4251	210	4460	490477	608119	FALSE	40	TTTTCCCCAACCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKVEDDVVFYLVFSGSTLHHCTSTRKISSDTLETIAPGHDCCETVKVLLCASKEGLPVFVVAEEDFHFIQDEAYDAAQFLATSAGNQQALNFTRFLDRSGPPSGDVNSLDEKVALAFRHLKLPAEWNVLGTDQTLHDGGPRETLMHFAVRLGLLRLTWFLLQKPGGRGALSIHNQEGATPVSLALERGYHKLHQLLTEENAGEPDSWSSLSYEIPYGDCSVRHHRELDIYTLTSASESHHEPPFPGDSCTGHIFKLRNIQQQLMKTNLKQMDNLMPLMVTAQDPSSLPSTPGIDGQSLPCASEPMDSLQPSPPPPKYTGSTPCCQGSSAKGQIESSCDLSSVVKEENTVCSCQEEDKGVERNGEEVEPTPVVDSGTVSDQDSCPQSMPDCGKKGTEGFVSCGNRNEETGTKSCGMTADQESLSSGDNVLQEDLAAEPGTAQHFSGGELTVSSTTDVSVPETVGETEHGLMNPDSTFQKNVLEVGESTKERIENFHLSTAGASDIKATSKPVDKASVPNCVSATSSLDDHKPAESLLAFSNGENSTEKTTETETSRRSYEESADVPVGQNSLVIPAASKDKILDGSKPDTPSASICEAVSASDLTFPGPEKDLIPNQKSETNSSHVESQSSRSPIYPITGDDKLCADSACQQQNTVTSSGKLMAKHCDDIVAQPEDSITGQPITQHPPSAVLCEDPQINAIISDPVRDTQEHADLCPPEVTDKEGQGEDLNLDIPLTNMCEVALDPHPVVPKAEKEVVQDQAVTSDSTFSPASRPGSESVTKDDALSPVPSQKEKGTATPELHQATDCRDDPGGDSSDPNKQPLEDSTASLDTSFSATDLQPRMGNTSSLGLGGQHEEPCPSAASEVLSIEGLDTESSLLSVSKASLATDSVLTGEGKQLVVPESSAAQGQDDKDKAVICHFIEEDSLSSGVLQEEQRTPPPGKEALGFCEEPSSAACAEGNTLQHSNSLDTSSAFLNVETENNKKVAPQGSLLTEGGAAQSLVPPGASLTVASRQEALGPEQSNPPLLLGLVPDSSEALNYSQSFVQDAGVKDAQTQGETAACEVNENVTLDVAMVSTQQDTVGARRKDISHNTQDIPASKVLLSPEKNMILGLPEALPDKSMTDLQVAVTPEVLPLDWEKGKLEGAGHSCTLGNSKEAQMDDEANQVPLQPVAKELTADRGLSTTENRAPPGMKEVRQAAAPRKERSVPTLSSTVSAKAVTLPEGADLIEEAASQIVAVVIERVKASGALITDREISHILPPSPSESGPVTEQLENVSPEKVNAFLPGQTPQVVSIHGEATVNVAGCCAGKEEPEKSILPVQGPEPATEMPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVVSGINKSVWAQNVLSLFCCI	390006	611286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_390205_490465_490510_533842_533991_551040_551338_563609_563794_597623_597823_600566_603763_607925
890086	contig_10958_pilon	+	3445	5	Intergenic	novelGene_5393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	40	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	105	506	888255	894000	TRUE	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAVPLRVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888150	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_895136_895279_895855_900457
890087	contig_6870_pilon	+	4223	5	Intergenic	novelGene_103942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1178	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3697	4005	1204860	1209211	TRUE	30	CCAAGGACAAGGTAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPHSSRTQSMGESMQILHRFSSRPGDAAPSVQPLTQVLQSFLVFVQPCHPLHQLPLLTAALVVDEVASQDLLQLPHSQRFNVLHVGQVRQRGPPAWDKAVL	1201116	1214093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1201194_1201240_1204953_1208995_1209221_1210173_1210260_1213970
890088	contig_4364_pilon	+	1912	6	Intergenic	novelGene_383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	36	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	20	AACGCGGCGGTGTGTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
890089	contig_14925_pilon	-	1462	6	Intergenic	novelGene_55264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	10	CTTTGGCTTGATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	112089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113017_113238_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
890090	contig_14559_pilon	+	1476	6	Intergenic	novelGene_83714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTCCTCCACTGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228934	277742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_229521_230386_230447_249374_249526_251347_251498_271374_271607_277445
890091	contig_10904_pilon	-	2033	7	Intergenic	novelGene_22632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	290.555024431212	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	65	1357	515110	499813	FALSE	25	AAGACTACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPHPLHARGPRRRSVDPGPRTMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLVSLASEVQDLHLAQRKEMATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGPFFRYRTYLDWLEQPFPGAVPSLRPLLRRAWPAPLFGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSSPEKAAALEYDYETIRNIDCYSTDFCVRVRDGMRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	516230	499136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006_505184_507170_507532_510099_510260_514793_514925_515034_515114_516169
890092	contig_14666_pilon	+	1915	5	Intergenic	novelGene_39604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	95	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	439	1098	484281	484940	FALSE	5	TGATGGTCTTTGCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477256	485757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483939_484279
890093	SIRV6	-	1417	10	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-9185	434	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAATTTCCCGACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11732	1110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1185_1466_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
890094	SIRV6	+	1501	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	17	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	377	709	2002	10736	TRUE	25	GTATACTTAGTTCAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1125	11838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
890095	contig_7201_pilon	+	2784	3	Intergenic	novelGene_152533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1874	2260	554245	554631	FALSE	35	GTAAGTGAAGATCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKKGIRERRKLHKEMKTKTNQKHKKKEVPPGMSLCICAEEGTSFQATWYCPARRGFQAKKRKRKQTNKSKQNKSEQTSKQKSPRGPTSMGAQAGKQFHSRVVFAAFQEEAKMVHGARYLREMRERW	410230	555155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_411074_450658_450740_553295
890096	contig_17603_pilon	-	1352	4	Intergenic	novelGene_152783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	165.374322875913	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCTACCCACTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59783	52597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_52718_52765_53776_55756_55877_59681
890097	contig_7207_pilon	-	1839	8	Intergenic	novelGene_72076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	247.03779765329	20	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	845	1567	696514	675867	TRUE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGRYKKNNTPDTTSKIIVILFTIV	758020	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_746740_746860_757787
890098	contig_6418_pilon	+	1714	5	Intergenic	novelGene_81205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	102.103807470633	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	353	817	1375762	1390427	FALSE	5	TGTCCGCCATGGGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKVRLLRSCLEFMWYDRDIKICL	1341078	1391324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222
890099	contig_9389_pilon	+	308	3	Intergenic	novelGene_84026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	1991	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	19	306	584401	585853	FALSE	35	CAATGGCAAGACCTTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGTDEMAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGV	584382	585855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654
890100	contig_16775_pilon	+	2169	15	Intergenic	novelGene_107782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	251.163293496482	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	132	1430	134135	174136	FALSE	50	TGAGGATCTTTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130802	174875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130872_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
890101	contig_9058_pilon	+	1762	6	Intergenic	novelGene_149356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	340.023881514225	1084	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	54	1163	41923	56652	FALSE	10	CCCCAGTGTCTGCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLQEELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILDEVQIGTECSHEDFSQERAEPGLLIPEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNDEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPPPSHRSQARGHRPPPPGHRVQHQQQKRPPPPSGTQVHQQKGPPLPRPRVQQKPLPGAAENS	41869	57251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_46572_46651_47264_47502_51837_51961_56353
890102	contig_16594_pilon	-	5674	2	Intergenic	novelGene_53903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1286	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262029	255070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_260430_261714
890103	scaffold_2602_pilon	+	4160	17	Intergenic	novelGene_127683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	476.600686994627	288	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	320	2512	25608	68818	FALSE	20	GGATTCTAGTTTCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDSFTNLIPNRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	25288	70466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_56687_56771_57959_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
890104	contig_6445_pilon	+	4814	1	Intergenic	novelGene_76978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1427	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	218	538	394819	395139	NA	20	GCAGGAGGGGACTGGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLIKRAHYSGVTLYFISQVIIWLKGDLRVWLQFQVKRVILGVLLVSISQIWSFLGINILFHIFLPFYPGPSTASLVRAVGSGSWAPSTSGLRQLRLEEVVVHEGY	394601	399415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_394600_399400
890105	contig_11832_pilon	-	2892	13	Intergenic	novelGene_106925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_12	942.700450243283	221	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	935	1279	86997	85898	TRUE	5	TGAGTGTGTGTGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQIEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTM	92470	83797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_84343_84635_84691_84795_84879_84967_86040_86309_86383_86637_86723_86952_87089_87233_87302_87725_88281_88490_88536_88646_88708_89418_89450_92387
890106	contig_7396_pilon	-	2161	13	Intergenic	novelGene_79551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3383.69949168067	40	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	29	1378	255163	245904	FALSE	45	ATACAGTAATTTTAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDVSIFRRKSNNNNSPRPWHSIQSSVQNVMLFCKKRFMIFKINLVNLFLVVFFFFF	255191	245120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246056_247705_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105
890107	contig_6470_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_145605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGGAAAAAGAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020078	1021262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_1020100_1021300
890108	contig_4213_pilon	+	6681	3	Intergenic	novelGene_124808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160	370	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2243	2545	39681	39983	TRUE	50	TGATAATAGAATTATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFKFPISVLALDFPIVLVQRLQVLVAINCSACQPHVKCPQHADILEVFIFDNFYNDPSRVEFAASSRSNTEKELALCCCHKRHPQTLTPWLYQLQVQL	37222	46208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_37770_37985_40646_42734
890109	contig_12869_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_75340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGAGCCAAAGACAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69976	68030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_68000_70000
890110	contig_11678_pilon	+	2571	3	Intergenic	novelGene_160846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	97	junction_1	69.5	767	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	60	590	235651	249959	FALSE	30	TCTTCAAAGTAGGATGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVLGVRRGLEWLLGVYFLSHIPVTLLIDLQALLPRELYPIELRNLQQWYAKEFKDPLLQDPPTWFKSFLLCELVFQLPFFPFATYAFFKGGCKWIRTPAIIYSVHTMTTLFPVLSTLLFENFSKASGFKGEGPKTFHERLTLVSVYVPYFLIPLTLLLFMLRSPHYKYEEKRKKK	235591	251940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_235777_248121_248267_249699
890111	contig_2689_pilon	-	3171	1	Intergenic	novelGene_100819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	539	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTATAAAAGTATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145774	142603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_142600_145800
890112	contig_17796_pilon	+	3479	10	Intergenic	novelGene_33786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	408	junction_7	263.413396174057	951	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	386	1462	53527	110323	FALSE	40	ATGATAACAGTATTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53141	112340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237
890113	contig_6291_pilon	-	8012	8	Intergenic	novelGene_164774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4518	165	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	3882	4490	444950	444342	TRUE	25	ATTTCTTTCTGTATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDTKILNKILANSIQQHSKKIIHQDQVGFIPGMREWFNIRQTISVIHHMNKTKNKNHMILLINAEKAFNKVQHPFMIKTLNKIRTEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGETLKAFLLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLKVLARAIRLEKEIKGIQIGREEAKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQK	448944	108065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_108413_302110_302590_304377_304583_418103_418367_418500_419330_419632_420490_443799_447418_447530
890115	contig_7744_pilon	+	3947	17	Intergenic	novelGene_62567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	197.183765812503	479	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2935	3504	889342	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	880360	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_880663_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
890116	contig_9415_pilon	+	3242	8	Intergenic	novelGene_109777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_4	358.53113034794	1246	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	64	687	1634159	1704137	FALSE	35	TAATGTACATACAGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPRLSPPPPLAPRSEGRSEKMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSTNVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDSNLSGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL	1634095	1706692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1634283_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1697965_1700428_1700495_1703219_1703271_1704044
890117	contig_6102_pilon	-	1901	8	Intergenic	novelGene_32149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	555.558259403851	3401	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	867540	847043	TRUE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCCVTSRRPASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867541	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845006_846122_846188_846753_846824_846979_847094_867237
890118	contig_19402_pilon	-	4057	3	Intergenic	novelGene_80854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1052	junction_2	166	29	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	2253	3389	171006	167101	FALSE	30	CAAATTTGATGGTGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	173258	166432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797
890119	contig_2550_pilon	+	2120	4	Intergenic	novelGene_135637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTGACTCAACAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453790	732119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_455458_597611_597703_714216_714442_731982
890121	contig_5686_pilon	+	1852	3	Intergenic	novelGene_45257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	30	junction_2	1524	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTTAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93795	172680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170544_171264
890122	scaffold_12124_pilon	-	3179	2	Intergenic	novelGene_22129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAAACTCTTTATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987330	936989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_939915_987076
890123	contig_9484_pilon	+	1688	11	Intergenic	novelGene_105623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	516.572560246864	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	52	1545	95848	104965	FALSE	15	TTTTCTGTAGTTAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95796	105108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_104283_104412_104883
890124	contig_20293_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_153520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGACCCCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64337	66251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_64300_66300
890125	contig_11978_pilon	-	4580	5	Intergenic	novelGene_62877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	69.535512509796	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	586	2814	660350	651178	FALSE	30	AAAGCGGATGATTCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRNTLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPSSGLTLESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFSEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREIFDYSHRQKEQDVDKELQDGGEQGDTWPGEDAEALARNLLVDGETGESFPAQFPADISSIAEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSTSEILYNTPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFSLFSPEVESLPVAGSSTLLPLVPSNSTSLNSTFGSTNLAGLFFPPQLNGTTNDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPSQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSANLPPPSTLKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQQDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTLADQQARRQERKPKDRRK	662450	649411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_652522_653703_653863_654629_654846_659840_660863_662377
890126	contig_2689_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_100813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTTAATTGAATTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2552	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_1900_2600
890127	scaffold_12124_pilon	+	2126	11	Intergenic	novelGene_22349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3172.38362119085	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	327	704	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483835	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508544_1508659
890128	contig_8145_pilon	-	2327	6	Intergenic	novelGene_118644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	138.215773340093	555	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	126	545	735820	731044	FALSE	10	CATTGGATTGCTGCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELERIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKGANKGKK	756951	729261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_731203_733967_734024_734339_734407_735682_735830_737277_737363_756920
890129	contig_8570_pilon	+	1920	18	Intergenic	novelGene_120137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	564	junction_11	493.03155145147	127	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1836	85	1920	284365	379707	FALSE	45	CAGAACGGTAAAGTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWRKTDKERQGVAIYNFQGQGVPQLSLQIGDVVRIQETCGDWYRGHLIKHKMLEGIFPKSFIHIKEVTVEKRRNTENIIPAEIPLAQEVTTTLWEWGSIWKHLYVASKKERFLQVQSMMYDLMEWRSQLLSGTLPKDELKELKQKVTSKIDYGNKILELDLIVRDDDGNILDPDNTSVISLFHAHEEATEKITERIKEELSKDQPDYGMYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAVMDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLT	284280	379707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594_361731_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530
890130	contig_5217_pilon	-	777	5	Intergenic	novelGene_135757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3198.79941345187	24	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	77	727	559890	557689	FALSE	5	TCTTGTGTTTATGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDARLPTLRCVRGRFFSACASQVPSLSSVPLLDNLVPVSCVSQIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	559966	557638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559442_559823
890131	contig_5732_pilon	+	4467	13	Intergenic	novelGene_119572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	105.912175357175	902	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	152	1489	94651	147013	TRUE	25	CTCCTGGGCGTAAACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLASQSGEAGSGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECNDTEDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPQEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGASDGYLYMYNLDPQEGGECTLMKQHKLDGSMETANEILDSASHDCPLVTQPYSTAVAKGTYVPPSPTRPGKGCDTHLEAYTDDLGAAGGACLEEETGALRLDEDSEHPPMILRTD	94499	150194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_94725_107353_107437_127216_127387_129362_129460_130295_130394_130807_130901_138270_138342_141205_141314_143404_143570_144429_144538_145382_145541_146900_149143_149345
890132	contig_9484_pilon	-	3794	10	Intergenic	novelGene_105682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4151	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACTAGTATCTAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214547	196417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_196759_197341_197387_198349_198439_201123_201221_202520_202616_202732_202821_204857_204893_206883_206943_211512_213381_213470
890133	contig_6102_pilon	+	409	4	Intergenic	novelGene_31762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4182.73549513022	229	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	337	342	298449	298454	FALSE	20	TAGCATGTTAAGTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQVLNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCARCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEASVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIHSKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPRPPPKPM	296177	298521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296189_296439_296604_297810_297942_298418
890134	scaffold_12124_pilon	-	1993	6	Intergenic	novelGene_22348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATACACAGATACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509577	1483745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491984_1507995_1508120_1508220
890135	contig_8729_pilon	+	3565	6	Intergenic	novelGene_40143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	19	junction_5	457.677877988439	1495	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	301	690	672364	676873	TRUE	0	CTTGGCGTGTCTCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESTVTSGQARVSTQSPQALEDSGPVNISVAITLTLDPLKPFGGYSRNVTHLYSTILGHQIGLSGREAHEEINITFTLPTAWSSDDCALHGHCEQVVFTACMTLTAALGVFPVTVQPPHCVPDTYSNATLWYKIFTTARDANTKYAQDYNPFWCYKGAIGKVYHALNPKLTVIVPDDDRSLINLHLMHTSYFLFVMVITMFCYAVIKGRPSKLRQSNPEFCPEKVALAEA	670224	679823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_670415_672253_672405_673741_673926_675394_675539_676852_678952_679026
890136	contig_960_pilon	+	3585	2	Intergenic	novelGene_108318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1782	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1635	1946	1053919	1055549	FALSE	50	AGTCTTTAATAGCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAEVTEAIYHHLPPTSLRFSAVPVLKMMQGKTQHYWKQAGVTPSVEDPSPRAHSHGRQAASWTQLQLELKDILFFYLSTLFVYLKVIYILLLFRFWLDIQKG	1052284	1057188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1054030_1055348
890137	contig_6446_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_149226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	205	570	415891	415526	NA	30	GTTTTGAAACTAGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLCIKGHYQECEKKPTEWDKISANHISDKGLISRIHKELLQLNNKKINNPTKKWANDLNRCFSKEDIQMANKHMKRCSTSAVIKEMQIKTTMRYHFTFNMMAIIFSKRKITSVGRGVEK	416095	413957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_414000_416100
890138	SIRV3	+	668	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5626	14	3567	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATTTGCGTTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7570	8925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
890139	contig_4180_pilon	+	1042	6	Intergenic	novelGene_8382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1690.80009462976	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	69	515	875290	888134	FALSE	70	GACACAAGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874311	888661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874319_875228_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
890140	contig_1535_pilon	-	4143	7	Intergenic	novelGene_127211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	381	junction_6	554.291339359446	765	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	76	1080	52303	40062	FALSE	25	CCTGGGTTTTGATACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWRSCAGESGCCCGGGGGSVKTAGMVGRETELSIHFLPGNCRLVEEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAAAIGAFLIYISSDYVFDGTNPPYREEDIPNPLNLYGKTKLEGEKAVLENNLGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52378	36998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_52240
890141	contig_8310_pilon	+	2848	19	Intergenic	novelGene_75570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_18	321.890633984454	586	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	78	2003	279605	324814	TRUE	65	ATGAAACAGACAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRSFSRLTWFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	279527	328679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279640_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739_324848_327867
890142	contig_15244_pilon	+	2024	5	Intergenic	novelGene_118071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	72.3822319357451	671	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	133	1749	758088	780769	FALSE	15	TCAGCTGTCTTGCTGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRFGDISEGEVDHSFFDSDFEEAKKCESNSVFDKQIDDPKERIDKDIENINLKFGIQTKENHLTEKGNEKKEKILPEKHSIENDIIQTRSCSSLTTSSGSKKQRDATTGHKMRLPIPSRTPKIVKEGKDDYYTDSEESSDDGKRRHVRSKSAKPSNNFKKGVNKKYPKISSSSSSSSLSSSSSSVTDCSDTGSDVCISDSSPSLKKHVSGITLLSSKQKCNPGIKSTGIQPLSTKPKVSDHAEESEDTVTDVTPLSTPDISPIQSFELAASNDQKIKVKRQENVSQEVYENSEDLKSNSNNLKSARKGKEKCGPSLSSTSKSSSLDFNLDQRHKQKVLHDTMDLNHLLKAFLQLEKKGPQKHHLDPPPVAPRKNYSFTREEVRQIDRENQRLLKELSKQAEKPGSKSTVPRRSVGHPPKLYHSAINRQREQQRIERENLALLKRLEAVKPTVGMKRSEQLMDYHRNMGYLSSSPSSTRVRSTLGQYSTLGQYSPLRGASRTSSATSGLSCKSERSVLDTPSGLLLRPKPSNVRAAWL	749538	781044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_749655_758071_759139_769552_769822_779366_779536_780641
890143	contig_16496_pilon	-	905	2	Intergenic	novelGene_5234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	45	CAGAGTTAACACATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
890144	contig_4211_pilon	+	4581	14	Intergenic	novelGene_80236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	377	junction_12	435.0438731871	640	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	188	2083	1125098	1146161	FALSE	20	CCACTGTATCCATCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYAHFVLSKRGPLAKIWLAAHWDKKLTKAHVFECNLESSVESIISPKVKMALRTSGHLLLGVVRIYHRKAKYLLADCNEAFIKIKMAFRPGVVDLPEENREAAYNAITLPEEFHDFDQPLPDLDDIDVAQQFSLNQSRVEEITMREEVGNISILQENDFGDFGMDDREIMREGSAFEDDDMLVSTSTSNLFLEPEQSTSNLNEKINHLEYEDQYKDDNFGEGNDGGILDDKLISNNDGGIFDDPPTLSETGVMLPEQPAHDDVDEDDNVSMGGPDSPDSVDPIEPLPTMTDQTTLVPNEEEAFALEPIDITVKETKAKRKRKLIVDSVKELDSKTIRAQLSDYSDIVTTLDLAPPTKKLMMWKETGGVEKLFSLPAQPLWNNRLLKLFTRCLTPLVPEDLRKRRKGGEADNLDEFLKEFENPEVPREDQQQQHQQRDIIDEPILEEPSRLQESIVETSRTNLDESAMPPPPPQGIKRKAGQVDPEPVMPPQQVEQMEIPPVELPPEEPPNICQLIPELELLPEKEKEKEKEKEDDEEEEDEDASGGDQDQEERRWNKRTQQMLHGLQRALAKTGAESISLLELCRNTNRKQAAAKFYSFLVLKKQQAIELTQEEPYSDIIATPGPRFHII	1115587	1148659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1115744_1125066_1125242_1130898_1131029_1132267_1132368_1134443_1134551_1135272_1135480_1135975_1136102_1136452_1136576_1138704_1138929_1140214_1140375_1141031_1141181_1142862_1143013_1144661_1144746_1145969
890145	contig_7230_pilon	-	2453	7	Intergenic	novelGene_52545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	451.947913665576	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	324	638	164221	134622	FALSE	35	TCTGGGAATAATGAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177012	132806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_171452_171593_176933
890146	contig_854_pilon	-	5557	31	Intergenic	novelGene_36499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	2449	2958	1699021	1696580	TRUE	10	CTCTGCGCGCCTCACCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMLRLECLQLGESALSCQLLLSDLYQLLLLGHHLLLLPAHLQQRLDLGEEPPPLPVPQLEVGGTVPL	1716405	1612771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612925_1649492_1649847_1656036_1656198_1672788_1672896_1677513_1677608_1678130_1678196_1678749_1678848_1679248_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697810_1698224_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706810_1715168
890147	contig_7870_pilon	-	1452	6	Intergenic	novelGene_108963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	568.268809631498	129	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	240	557	496465	364867	FALSE	25	ACCCCTTTGAGTCTCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQASQIE	497931	363971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364884_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
890148	contig_14397_pilon	+	6362	6	Intergenic	novelGene_134641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	163	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	20	742	28535	41987	TRUE	60	AAAGGGCCAAAATCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACDQEPMVLKKEVQAALKALAKNKAPGIDGIPTEMFQQMDLVLEVLARLCQEIWKTATWPTNWKRSTFFRIKKFIHVVGPRWWSSQTASYVLLQQRPEKTSDLIVYEYLGALNKAKLKNWTEWWGEIKTVRKQQGVGRPNLVGAAALQPGSARFAQRGGHTAPLTCSGGSFHIERDPAAEILLGHSEPVKSSTQVAKDKYMHVAFHEDLKKKKHIWEIPLSHLAPPSPLCTGLASFKRSLSPLGQK	28515	190244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_+_28721_41450_43683_43909_45353_45883_46022_166665_166782_188016
890149	contig_10241_pilon	+	3887	5	Intergenic	novelGene_142833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	65.986267510748	192	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2752	3165	123022	123435	FALSE	30	ATAGTCCTATTTAGGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEERDGLKNELCKMKTEKDLENSAVQTKDTCTTMLTKDMATQLVVKRIKPVTDGSNQLPQQKNHELRLKGTENERKERTLSASWNSAGKKQAKGATSVVLIEKKKTIPAAAQRSAELLEGAQEAASSVSKCGATAS	92764	124157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_120082_120264_120620
890150	contig_7184_pilon	-	4313	5	Intergenic	novelGene_130024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1217	180	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	3139	3879	17001	16261	FALSE	30	GCTATTTCAGAGCATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRHEDITIINIYAPNDRAKIYKKQTLTARKRETDSSTIMVGDFNTPLSVKDRKSKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHRMFSKIDHMLGHRAILNKIQNVEIIQSNYSDHKAIKVEINNRKRKEKKSIKWKLNNTLLTNHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKQERDKIKTLTTQLKQIKREQQKKAHSHKNKGNNKDQSRYK	169065	15826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7184_pilon_-_17773_56468_57612_163274_163403_167842_168061_168187
890151	contig_4426_pilon	-	2290	7	Intergenic	novelGene_15420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.580907858087	222	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	87	1805	904546	820699	FALSE	50	ACTGATGACAGAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKT	904632	820213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_820712_820940_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
890152	contig_17144_pilon	+	2526	10	Intergenic	novelGene_29115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	498.531349237778	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2487	38	2524	5087	20693	FALSE	45	TGATTTTCAAAAGAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNKSKSGSRSSRSRSGSRSRSRSFSKSRSRSRSVSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNRERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNSPRRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWSDATTYGTGSTSRASAASDLSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTAQMGSTLSSGAGYQAGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPATGSMYGSSQKEETAASGGAAYTKRYLDEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKMKEKGSFSDTGLGDTKMTSDPFAPKTDAEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIAGVNKNQEEEKSGKWEGLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFSERSRKEDRGGAKRSESGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRGKGDFSTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGSYSGNNNNNSN	5049	20695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_5224_9209_9345_9428_10116_11654_12357_13329_13503_14254_14367_15442_15528_17464_17653_19971_20171_20624
890153	contig_7870_pilon	-	4061	2	Intergenic	novelGene_109003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3725	4039	488597	488283	FALSE	35	GGACTACTGGAAGACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTGPLSNIKIQREKIEVVKGFILLSSTINAHGSSTYEPKRCIALGKSTTKDLFKVFKNKDVTLRTKVPLTQAMVFSIASYAWESWAMNKADQRRTDVFELWC	492477	488260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_489580_489735
890154	contig_7049_pilon	+	1558	3	Intergenic	novelGene_171436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34.5	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1	486	91186	92038	TRUE	20	AGGCTGGGTTCTCTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAWGPWSASELPEVTLALQWGWVLLKGWRAVVGSLVLVLEPAYHRLQKQPVPRLGPPAHLPLLTPTCPHSHLPLPAPHLPPPVPTCPHSHLLPPVSPYPTCPHLSLLTPPAPTPTRPRCVSVTGSVASYGVTRVETQKCSNLWLFLETGRLPKDAGSDQHS	91185	93829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_91658_92024_92991_93709
890155	contig_6403_pilon	-	1694	3	Intergenic	novelGene_139898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.5	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	69	338	1136936	1118254	TRUE	25	TTTACCAAGTACCTCCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFWGWQLHAPSPLSGQERTAGMGVGGQPSACRDPQASHRRGLAQTEGASMTRGLRRLPETPPHTGYRIAPRNQGKTAAAREQTSWVSLDPVLDALLYRKSGARAGRLITY	1137004	1116796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1118140_1118240_1118341_1136753
890156	contig_5954_pilon	+	2350	11	Intergenic	novelGene_28517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	748.713990786869	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	57	1463	439069	443539	FALSE	5	CTGGGTCTGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMGKSVPGKYACGLWGLSPASRKRYDATAAYGHDAAAAAASQWAAAAPSLWSSSPMATAAAAASATSSAQQQYGFQHPLAMAAKYDDYHHERWHRVHPAMATAAGGCRSFSRSPSDARQPHYGAPAPRGPAASAARCPSPSAASATWFRRHDDPSPRRRWPEP	438814	444426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441487_441740_441801_441925_442106_442858_443064_443503
890157	contig_14300_pilon	-	4173	10	Intergenic	novelGene_133079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	136.256928694595	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	551	1297	180320	143271	TRUE	20	GATCACGACGGCGTGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPVTGQTCPRPHQAVFPGVP	185313	121521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_121685_140453_140554_140657_143327_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_184804
890158	SIRV5	+	1980	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	15	34	-4	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
890159	contig_7708_pilon	+	2656	7	Intergenic	novelGene_61534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.347759349662	3	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	190	1035	250654	264717	TRUE	45	CACGCACAAACAGTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAKLDFANNVQLSLTLAALSLGLWWTFDRSRSGLGLGITIAFLATLITQFLVYNGVYQYTSPDFLYIRSWLPCIFFSGGVTVGNIGRQLAMGVPEKPHSD	250336	266401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_250496_250623_251078_254843_254969_256619_256787_257187_257288_264687_266038_266100
890160	contig_5643_pilon	+	2246	15	Intergenic	novelGene_39080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	656.036214934909	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	585	1865	634983	641217	FALSE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631264	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102
890161	contig_15697_pilon	-	7005	6	Intergenic	novelGene_173296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_5	114.596684070701	1846	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	386	1423	47853	25654	FALSE	90	AAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMFDPVPVKQEAMDPVSVSYPSNYMEPMKPNKYGVIYSTPLPDKFFQTSEGLSHGIQMEPVDLTVNKRSSPPSAGHSPSSLKFQSSHRRTSPGLSVPSSSPPMKKYSPPPAGVQPFSVPLSMPPVMAAALSRHGIRSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMDNSNSSMQVPVIESYEKPILQKKIKIEPGIEPQRTDYYPEEMSPPLMNSVSPPQALLQENHPSVIVQPGKRPLPVESPDTQRKRRIHRCDYDGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFQCPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV	63981	20071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_25836_31845_32007_37744_37896_38505_38993_47796_47893_63635
890163	contig_10953_pilon	+	310	2	Intergenic	novelGene_42574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	455029	464451	FALSE	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSCPCPSGVFPALWLSLPLLPALGTFAILLSYLTSSLGFSSLFAWGRATLFPFPSTTHPGSQPFHPQPLLTLCQLHCPVFSAHQACPQPRPGSCKNKR	455027	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455096_464218
890164	contig_854_pilon	+	4658	28	Intergenic	novelGene_36553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3119.2386337568	9	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	1474	4047	1700894	1715383	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1649667	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684092_1698923_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
890165	contig_12279_pilon	+	3441	3	Intergenic	novelGene_50091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2120.5	446	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1206	1526	69434	69754	TRUE	25	TATTCTGACTGAGATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGKWTYLFCSARPDDIAVITWSLCPVPAEANPSKVNPSAIYAGTSSQIIPFRVHSILPRLMKSPTSVSISQKRVQGKHLMYLLLWYLLQIFDIHMIAEELLLI	57534	77626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_71188_77144
890166	contig_11422_pilon	-	435	1	Intergenic	novelGene_99023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATGCCAATTGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496	61	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_100_500
890167	scaffold_12124_pilon	+	2054	8	Intergenic	novelGene_22282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3181.74649768177	13	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	139	516	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473577	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1490337_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
890168	contig_10904_pilon	-	2077	8	Intergenic	novelGene_22539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_3	143.782573949101	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	249	1100	389522	375280	FALSE	40	AAGCTGCCACAAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLEPCNLTENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	389770	374302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359
890169	contig_11316_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_122691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139821	140702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139800_140700
890170	contig_13004_pilon	+	2251	2	Intergenic	novelGene_112663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCGACTCAACGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589459	617164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_591548_617001
890172	contig_8330_pilon	+	1488	7	Intergenic	novelGene_71792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	669.699787632903	42	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	252	791	852673	857111	FALSE	10	CACCGCTGCCCAGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPNAALLPAAP	837499	857808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855045_857082
890173	contig_14744_pilon	-	1071	2	Intergenic	novelGene_66160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	276	758	1695770	1695288	FALSE	10	TCTGAAGCCGCTTGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSEKYKLDKDNYPVFYLFRDGDFENPVVYSGTVKFGAIQRWLKGQGVYLGMPGCLPAYDTLAGEFIKASGKEARQALLKQGQDTLANVKETEKKWAEQYLKIMGKVLDQGEDFPASEITRITKLIEKNKMSDGKKEELQKSLNILTAFQKKGAEKVEL	1702983	1694974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1695791_1702728
890174	contig_7758_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_163549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAATAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193694	194884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_193700_194900
890175	contig_6020_pilon	-	2327	7	Intergenic	novelGene_155557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	503.550284369783	544	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	323	820	349599	289990	TRUE	15	TGTTTTTCATTAGTAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNVRWLLCGCLCCCCTLGCSMWPVICLSKRTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVILIEFLPKTPIFRPD	349921	287785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_288888_289584_290041_293631_293692_293857_293915_318269_318426_318550_318606_349480
890176	contig_7548_pilon	-	4546	8	Intergenic	novelGene_117615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	410	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3764	4093	206535	203199	TRUE	30	CACGGAATGTGTGAGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAWSLVVQTVPCGPSAPSSSYGLVEQGGDVLFLVPVGCAEHHHSILDRKRIEVVQHDVIGLREQGWITLNARVLVQDDLEQMWREDGGRFKPLLGFGDIGLLVVGSWR	212118	192668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_-_192736_198390_198555_200358_200453_200726_200843_203186_203320_206056_206126_206395_209991_211810
890177	contig_6102_pilon	-	4581	2	Intergenic	novelGene_32134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	818	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGAAATGAGATGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835111	830293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_831838_832074
890178	contig_7207_pilon	-	1730	9	Intergenic	novelGene_72072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_4	239.990624816887	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGGAAAAGAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758020	671665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_695223_695326_696315_696746_737456_737530_737916_738105_757787
890179	contig_6375_pilon	+	3606	19	Intergenic	novelGene_73027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	964	14	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1119	1634	467510	480632	TRUE	5	TCCCGTCCCGACGGCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLSESVVILMEGFFCVVAVLAPQRLFRPGWPPSVSLFPAGTPLLAATTEIFLLNDLGSELSFFSSSSALPSGRSSLLTWSAIGMGGSGISFSGLFSVVSMFTSSFSSLTCAESFLILVAERSESLRFGAVWQLVALPLQLHTSLGSLLAQVVTSHAFRVAQAGSHASLG	463926	497817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_463971_464629_464730_464843_465168_465387_465497_465629_465734_466162_466311_466665_466801_467355_467518_467614_467751_468664_468708_472154_472301_479909_480020_480559_480778_481265_482543_483228_483321_489767_489896_490316_490424_496145_496213_497661
890180	contig_5302_pilon	-	4594	1	Intergenic	novelGene_81408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1123	1455	178834	178502	NA	20	GGGCTTACTTGGGGCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLLSGPCSALLPARSPSVLLCPSGMSEQTLARLRNAVLALASTSRRIGVVRAGGFVPTTLPLLLQAASLTLHRFCWACSPLLAHQPPSTPRRLGNPCLLRMGVNTACE	179956	175362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_175400_180000
890181	contig_14666_pilon	+	1675	5	Intergenic	novelGene_39568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	81	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	512	1171	484281	484940	FALSE	10	CAGCCTCCTATCTCTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477226	485444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483904_484201
890182	contig_17753_pilon	+	3383	1	Intergenic	novelGene_105111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1543	1929	146485	146871	NA	5	TCTTTTGGGTGTGATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	144942	148325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_144900_148300
890183	contig_5023_pilon	+	2901	13	Intergenic	novelGene_7238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2273.80809283799	46	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	86	1531	607279	646928	FALSE	15	GTATTTTTGGTGTCTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKVNNMPFPWPEKLEHECMPFQKTWLK	580843	648298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630322_646857
890184	contig_12139_pilon	+	1210	2	Intergenic	novelGene_146477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	2	652	158498	172686	FALSE	10	CTCCTTCCCAGTTCACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNVLLLGADAFRGREQVVVFVRGDLDPNLHWLGHFPELGACGGWRAALIQAPVIANTQAAATLLLLVLYENQDVPQGEVHLTLSTGEQVRIGATHHQPQATGLLYLQTLIFLEDGGLHVVSLGDELPLGQVLRVALFAAGHCPGIYSGISPESCSDDEPGRGSSRRRRRRRRAAAAAAAPPPRPGVVWFFFFFFFSPSPLALSSSSSSSSLFCSFF	158496	173244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_158863_172400
890186	contig_3956_pilon	+	3376	3	Intergenic	novelGene_14757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.5	238	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	23	568	794009	795588	FALSE	30	GGAAAACCCTATGGGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRAFLGCWPTSRPCKSLTSATTSWRSCPLTS	793986	798396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007_795437_795503
890187	contig_19378_pilon	-	3207	3	Intergenic	novelGene_73771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAAGGCTCACCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18273	14822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_17502_17681_18121_18184
890188	contig_1575_pilon	+	2443	13	Intergenic	novelGene_45181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_2	368.52822898057	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1141	2226	160417	190565	FALSE	40	GTAATAGAAATTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFQLVDQAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLRGNAISA	148812	190782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_149638_150137_150247_160210_160444_166978_167135_167818_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_183574_183665_185018_185124_190388
890189	contig_8681_pilon	-	3579	21	Intergenic	novelGene_157207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	46	junction_20	65.5289821376771	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2184	1394	3577	251502	197712	FALSE	30	GGATGTGTCCCAAACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKVTLQIPASSLDANRKRDSVLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRELYQEWKECEEDSPVIRSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRISGEIGERIAGGDDAADISFDKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYNFWDQQEPVIVAPEVDTSSSPVSKEPQCMVVFDHSNEFSVNITEDFTEHLSEGALAIEVYGHKMTDPRKNPALWDLGIIQAKTRSLRDRWSEVTRKVEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRIQVEVKSVQESGTLPLMEECILSVGVGCIKVRPFRSPKTHETFHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEYLDQQLQKLVSKHDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMETHIPVIFLDLNADDFSSQDNLDDPEAGGWDATLTGEEEEEFFELQIVKQHDAEVKAEASWDSAVHNCPQLSKGTPSDERVFLIVRVTVQLSHPAEMQLVLRKRICVTVHGRQGFAQSLLKKMSHRSSIPGCGVTFEIVSNIPEDAQGVEEREALARMAANVENPASADSEAYIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVAVKEQLTGKGKLSRRSISSPNVNRLSGSRQDLTPSYSLGSNKGRWESQ	256561	197709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_197730_209535_209590_210862_210941_211745_211899_215083_215177_217803_217981_219759_219885_221436_221493_222247_222375_222925_223026_224476_224507_225106_225254_229705_229839_230866_231025_232264_232436_242855_242985_243301_243452_247899_248047_251364_252615_254117_254309_256471
890190	contig_2414_pilon	+	329	3	Intergenic	novelGene_158453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_2	33	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	85	327	123708	147859	FALSE	10	GTGCGTGTGGTAGTCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYEDTWAALHRRAKECAIAGELVDSEVVMLSAFWERKKTSLVELQEQLQQLPGLIADLESMQANLTHLEASFEEVENHLLHLEDLCGQCELERCKHTQSQQLENYKKNK	114176	147861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_114240_123686_123820_147728
890191	contig_7629_pilon	-	2175	6	Intergenic	novelGene_153595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_5	111.866706396497	402	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	349	1095	414991	391605	FALSE	40	CAGAAGAGCAGCTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKRPRGRPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVRVMSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIGKLIITLGKKQKRKNESSDEISDTEQMPQHALKDEDSQKRRSNRQIKRKKYVEEAEGKQCEEAVKGSMKIKKNSAPLPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSSRIVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKN	415339	390524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_391662_391743_391813_392732_392880_396940_397053_413488_413821_414961
890192	contig_11422_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_99028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25286	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGGGTCAAAGAAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743	1696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_700_1700
890193	contig_6544_pilon	-	3715	12	Intergenic	novelGene_142072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	301	junction_8	112.509687369871	1113	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	1203	2630	75261	40813	FALSE	25	TGACTCAGAGGGCACACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPAATFEKHGEHLSRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLRTTGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGGAYAGITGNPSGWHGSSRGHDGMSQRSGGGTGNHRHWNGSFHSRKGSAFQEKPPLEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQNQPCRPVGTPSGVWENPPSAKQPSKMLVIKKVSKEDPAAAFSAAFTSPGSHHANGNKSSTMVPSVYKNLVPKPAPPPSKPSAWKANRMEHKSGSLSSSRESGFTSPISVTKPVVLAGGAVLSSPKESPSSTTPPIEISSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSENRDCDKLEDLENSSTPEPKENGEESCHQNGLALPIVEEGEVLSHSLEAEHRLLKAMGWQEYPENDENFLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSRSSSLFSPWRSTHKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK	107159	39727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_40966_41800_41904_42755_42881_43861_44021_44710_44852_57553_57748_58980_59054_70893_71184_71956_72087_75201_75317_75995_77031_107047
890195	contig_6227_pilon	-	2187	3	Intergenic	novelGene_49816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCGTCAGAGTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369455	1358541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360325_1360494_1360671_1369227
890196	contig_10042_pilon	+	4960	1	Intergenic	novelGene_79241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1051	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGATTTGTCTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197276	1202236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1197300_1202200
890197	scaffold_16735_pilon	-	3865	1	Intergenic	novelGene_160357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1884	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1577	2068	365474	364983	NA	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNRPPAHSWALLGRQENRPPGSARQCRRTPASSALLGPPGRAGEPPSCACPRVQENRPPAPSFACRRTALLGLPAGAREPPSCACPWVQENRPPVRAGESALPGLPAGAGERPSWVLLGMQENRPPWSARGCRRTALQRTPAHTVRAADSVLKPCSPRLCRF	367050	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_363200_367000
890198	contig_4091_pilon	+	5653	1	Intergenic	novelGene_172982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	340	1023	4141	5163	14387	15409	NA	55	TGATAAAAACTCTCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIHAPNDRASKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAIFNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKRLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKELVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKKERTQITRIRNETGDITTDPTEIKRIITESYEKLYSNKFEDLEKMDKFLETHGLPKLI	10246	15899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_10200_15900
890199	contig_12626_pilon	+	4210	27	Intergenic	novelGene_80422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_1	300.972803917937	835	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1378	4137	24	4160	107206	196455	FALSE	40	TACAAGAACTTAGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAVGYGMDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELSSCINKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	107182	196505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_107389_118592_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637_155785_156281_156450_156973_157111_157459_157601_157881_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_171116_171243_171350_171421_173060_173277_176134_176249_179387_179511_180235_180350_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
890200	contig_5286_pilon	+	3952	1	Intergenic	novelGene_157328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAGAAAAAAAAATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483886	487838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_483900_487800
890201	contig_9653_pilon	-	2237	12	Intergenic	novelGene_48186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_11	330.714753124024	2165	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	163	1572	196924	175913	FALSE	20	TTTGGAGTACATTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200996	175247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200896
890202	contig_7548_pilon	+	2031	7	Intergenic	novelGene_117619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	127.889818029253	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	416	730	200810	206475	FALSE	15	TTGGGCATGTGCTTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGALLETVAISSRFLGLRLRLSEQAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192732	207776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192809_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
890203	contig_19179_pilon	-	2435	2	Intergenic	novelGene_142371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAGTTAGAATACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35121	32606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_33552_33631
890204	contig_16595_pilon	-	3539	4	Intergenic	novelGene_150137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3045	3344	174938	174639	TRUE	35	GCAGCACAATTGGAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGFWTEMEKDVEQNSNTHKKEQIYWPEKDWRNPDSMAPRHPLSSVVKSLPRFTVQLGIGQPHKTKQD	217040	100735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16595_pilon_-_100900_174607_175263_175992_176271_214598
890205	contig_5217_pilon	-	1521	4	Intergenic	novelGene_135761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_3	2050.38164469176	25	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTTGTGTTTATGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	557639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_559374_559858
890206	contig_11292_pilon	-	2434	2	Intergenic	novelGene_109425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	85	465	217066	216270	FALSE	85	ATAAAAATAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLMGLRQFSTGENERRCKGMSVLDTDTFPINGCFEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	217150	214300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_216398_216813
890209	contig_10009_pilon	+	2557	1	Intergenic	novelGene_82741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATGTAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72360	74917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_72400_74900
890210	contig_12948_pilon	-	3527	13	Intergenic	novelGene_126201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	399.939049175691	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	794	2758	245613	235060	TRUE	35	CCAGTATATTAGTATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRRLSHDVSGALLLANGESTGNSGGSSGSSPSVGATSGSSQTSISGDVVEACCNVLSMVCADPVYKVYVAALKTLRAMLVYTPCHSLAERIKLQRLLRPVVDTILVKCADANSRTSQLSISTLLELCKGQAGELAVGREILKAGSIGIGGVDYVLNCILGNQTESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDVSIYRVFRRLENFLGPC	257530	233592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_233888_234585_236399_236877_237068_237339_237432_240648_240771_245391_245671_248451_248520_248563_248636_248748_248831_249345_249468_256166_256316_256684_256802_257404
890211	contig_11720_pilon	+	1482	9	Intergenic	novelGene_43785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2483.99562197682	61	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	266	868	68064	95013	TRUE	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGSAGGFRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQCCSLATPTPVPETTPST	67798	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_94959_95061_95383_95486_98298
890212	contig_960_pilon	-	3395	1	Intergenic	novelGene_108323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1423	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	717	1034	1063388	1063071	NA	30	GATGTTGCTCTAACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFGTIFSAPQPSTLTYRSGQCHFMLDKTRGFSATVSAFSTFLDSGSHVQAPAGLSGAVFKCRSLGPTRLSLTRTTLPPPGYIFSSPITSKLRLRELVGRDNSLC	1064104	1060709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1060700_1064100
890213	contig_3767_pilon	+	4242	3	Intergenic	novelGene_111145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1344	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCTAATAATTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498968	511535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_+_501450_508996_510392_511169
890214	contig_3900_pilon	-	2591	5	Intergenic	novelGene_84193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.19615242270663	139	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	256	306	687786	687736	TRUE	30	ATGACCCAGTAATTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALRRTHPAHHLFTHQRIDKDDKIFCISPQTDPKSGIFLSCGTTSLPYQTRNFFLENRYAQTECFLLSQANEDTALQPKRVKNLPMPSMMKLNCGLPTAGT	690545	455018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_455026_488019_488242_685679_687886_690062_690156_690482
890215	contig_9400_pilon	-	4885	1	Intergenic	novelGene_146573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1081	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3178	3522	119181	118837	NA	20	CAAGTCCATTGTGTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFVIFCNSLSSFSGQIRIFFPFKTFCTSPSSPLARPAICLCLSSRLSCLPLTLPSMSSVSAYLRWFLICFHSKNFFFLSLLLQCFAYVRLSVYKFDDLVLAVFRFPTIFNRVS	122358	117473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_117500_122400
890216	contig_16125_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_155214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51951	53753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_52000_53800
890217	contig_401_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_42885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	396	1191	224	1414	1779305	1778115	NA	20	TAATGCTCAGATGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNTSDANFSCYHESVLGYRYVAVSWGIVVAVTGTLGNVLTLLALAIQPKLRTRFNLLIANLTLADLLYCTLLQPFSVDTYLHLHWRTGANFCRVFGLLLFASNSVSILTLCLIALGRFLLIAHPKLFPQVFSAKGVVLALVGTWVVGVASFAPLWHIYILVPVVCTCSFDRIRGRPYTTILMGIYFVLGLSSVGIFYCLIHRQVKRAAQALDQYKLRQASVRSNHVAGIDEAMPGRFQELDSGLSSGGPSEGISSEPVSAATTQTLEGNSSEVGNEGKSKMAKQMAEGSPPEAPAKARPTKGAQKAQDSSSEFGKVTRMCFAVFLCFALSYIPFLLLNILDARVQAPRVLHMLAANLTWLNGCINPVLYAAMNRQFRQAYGSILQRGPQSFCRLR	1779528	1777920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1777900_1779500
890218	contig_13863_pilon	-	2913	9	Intergenic	novelGene_42066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTTTGCCACCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490717	455693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_455902_474561_474681_477706_477791_478582_478757_479276_479366_481368_481474_481992_482172_487478_487581_488864
890219	contig_16103_pilon	+	3555	5	Intergenic	novelGene_118794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATAATTTGGACCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588870	593551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_589420_589795_589876_590287_590371_590564_590606_590749
890220	contig_11316_pilon	+	819	2	Intergenic	novelGene_122667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139375	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139952_140283
890221	contig_20662_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_177648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1585	2079	95725	96219	NA	65	AAAAAGGAAAAACTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQNYHSLHQTESSTSRWCPATATNCSDRDHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKKTRLTCLMETGELQVYVPRYPFNSVLKSLLRFTLQPKIRQAHKTNNNTLSSIMYRRLTGHTSPGARARKQEGIGKLDERKWGTQGQKGESVDTSRGWQPTSQNNMCINCLMRN	94140	96260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_+_94100_96300
890222	contig_5423_pilon	-	2326	8	Intergenic	novelGene_85272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	180.556848416791	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	121	1131	573204	558772	FALSE	30	GCCTCATTGTAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	574261	557576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172
890223	contig_4125_pilon	-	3343	11	Intergenic	novelGene_25124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	454.014713417968	634	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	794	1312	813277	811045	TRUE	65	AAAAAAAAAAAAAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYQVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	816868	808966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_810188_810234_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_816642
890224	contig_4797_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_6930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656184	657729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_656200_657700
890225	contig_5686_pilon	+	2516	2	Intergenic	novelGene_45392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	30	junction_1	0	326	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATACCATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169471	172708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170544_171264
890226	contig_6375_pilon	+	1256	9	Intergenic	novelGene_73065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	303.128273178204	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	174	1175	688758	704040	FALSE	50	GAAAAACAGAAGATGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPASAPDTRALVADFVGYKLRQKGYVCGAGPGEGAAADPLHQAMRAAGDEFETRFRRTFSDLAAQLHVTPGSAQQRFTQVSDELFQGGPNWGRLVAFFVFGAALCAESVNKEMESLVGQVQEWMVVYLETRLADWIHSSGGWELEAIKARVREMEEEAEKLKELQNEVEKQMNMSPPPGNAGPVIMSIEEKMEADARSIYVGNVDYGATAEELEAHFHGCGSVNRVTILCDKFSGHPKGFAYIEFSDKESVRTSLALDESLFRGRQIKVTPKRTNRPGISTTDRGFPRARYRARTTNYNSSRSRFYSGFNSRPRGRVYRGRARATSWYSPY	687844	704121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_687919_688216_688308_688749_689190_700171_700287_700997_701066_701386_701494_702745_702834_702921_703074_704000
890228	contig_7513_pilon	-	2543	2	Intergenic	novelGene_88943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCAGGACGCCGCGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131678	128504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_130152_130782
890229	contig_9696_pilon	-	3551	21	Intergenic	novelGene_68799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_13	250.039496879993	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1004	3012	540	3551	383342	353772	FALSE	40	CCTACAGAAACTAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVLPPSHQNGFANGHVSNVDGETIIISDSDDSETQNSSFQNGKKKDAVDPLLFKYKVQPTKKELYESAIVKATQISRRKHLFSRDKLKLFLKQHCEPQDGVIKIKASSLSTYKIEEQDFSYFFPDDPPTFIFSPASRRRGRPPKRIPVSQESIANKQTATGYRNKTTKERDKLLKQEEMKSLASEKAKLKREKADALEAKKREKEDKEKKREELKKIVEEERLKKKEEKERLKIEREKEREKLREEKRKYMEHLKQWSKPREDMECDDLKELPEPTPVKTRLPPEIFGDALMVLEFLHAFGELFDLQDEFPEGVTLEVLEEALVGNDSEGPLCELLFFFLTAIFQAIAEEEEEVAKEQITDADTKDLTEALDEDADPTKSALSAVASLAAAWPQLHQGCSLKSLDLDSCTLSEILRLHILASGADVTSANAKYRYQKRGGFDATDDACMELRLSNPGLVKKLSSTSVYDLTPGEKMKILHALCGKLLTLVSTRDFIEDYVDILRQAKQEFRELKAEQHRKEREEAAARIRKRKEEKLKEQEQKMKEKLEKLKEDEQRNSTADISVGEEEREDFDTSTESKEIEQKELDQDTVTEDEDDPGSHKRGRRGKRGQNGFKEFTRQEEINCVTREPFTTDEEEALKQEHQRKEKELLEKIQSAIACTNIFPLGRDRMYRRYWIFPSIPGLFIEEDYSGLTEDMLLPRPSSFQNNVQSQDPQVSSKTGESESTSNTDRGPCDNSVQLPKPVHKPNRWCFYSSCEQLDQLIEALNSRGHREGALKETLLQEKSRICAQLARFSEEKFHFSDKSQTDSKPVYSRGRSSNAYDSSQVSAERQLELRLRDFLLDIEDRIYQGTLGAVKVTDRHIWRSALESGRYELLSEENKENGIIKTVNEDVEEMEVDEQAKVIVKDRLLGIKTETPSTVSTNASTPQSVSNVVHYLAMALFQIEQGIERRFLKAPLDASDSGRSYKTVLDRWRESLLSSASLSQVFLHLSTLDRSVIWSKSILNARCKICRKKGDAESMVLCDGCDRGHHTYCVRPKLKTVTEGDWFCPECRPKQRSRRLSSRQRPSLESDEEVEDHMEGEDDEVDDDDEESQSEEEEYGIEQDEDDSQEEEEVSPPKRGRPQVRLPIKTRGRLNSSFSSRGQRHDPGRYASRSQQSTPKTIVSSKTTGRSLRKIKSAP	410537	353771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_353965_356779_357007_357097_357346_363604_363754_364956_365112_365651_365816_366961_367550_368288_368414_370123_370238_371009_371176_372579_372805_372923_373020_378185_378333_379621_379761_380486_380583_382568_382736_383329_383427_385912_386048_396444_396533_399959_400062_410407
890230	contig_6710_pilon	-	1293	2	Intergenic	novelGene_93405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	0	501	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658918	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_658152
890232	contig_16098_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_45826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTGTGCATTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195130	193317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_193300_195100
890233	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
890234	contig_826_pilon	-	5464	4	Intergenic	novelGene_154929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_3	346.77658513804	868	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	12	866	16566	11894	FALSE	35	TTCAGTTTAACATAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFLVAFLLVSVAAPEVRSPVVNALDLEASAAGNMTNTSKKEETSAERHSDNHTTEPPSKEEHSSTPYLRPASTNGTSDSPDLEQTSQKVDPDRPVSEHATLKDPTDNEQSSISDPNAVPDKGDDQHASRTESGEKVSTDSEPASPQQKGEDKSSDLAEDVEPKEAEEDDAEPKEAEEDDAEPKEESPPKEGVSGQASSENREGPPLGSMSSEKDDLFKDNPGSASAESSHFFAYLVTAATLVAVLYVAYHNKRKIIAFVLEGKRSKVTRRPKASDYQRLDQKI	16577	7295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_11900_13256_13341_15627_16347_16520
890235	contig_8330_pilon	-	4971	8	Intergenic	novelGene_71960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	225	junction_1	261.151766024967	1206	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	343	1047	2056084	2038853	TRUE	30	CACAAGGATAATCTTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056537	2032055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2035974_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056297
890236	contig_11227_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_163178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGGCCAAAATCAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125945	127987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_125900_128000
890237	contig_8330_pilon	-	2178	11	Intergenic	novelGene_71810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	572	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCGGGACGGTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857810	837631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837681_852602_852686_853010_853347_853836_854058_854993_855088_855432_855535_855624_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
890238	contig_18055_pilon	+	2735	24	Intergenic	novelGene_117807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	349.911703688333	658	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1977	758	2734	77213	96072	FALSE	55	AAGAAAAGGATCGAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKEEEEEKQKSLLRERRRQRKNRESFQIFLDELHEHGQLHSMSSWMELYPTISSDIRFTNMLGQPGSTALDLFKFYVEDLKARYHDEKKIIKDILKDKGFVVEVNTTFEDFVAVISSTKRSTTLDAGNIKLAFNSLLEKAEAREREREKEEARKMKRKESAFKSMLKQAAPPIELDAVWEDIRERFVKEPAFEDITLESERKRIFKDFMHVLEHECQHHHSKNKKHSKKSKKHHRKRSRSRSGSDSDDDDSHSKKKRQRSESRSASEHSSSAESERSYKKSKKHKKKSKKRRHKSDSPESDAEREKDK	40641	96073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40863_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571_85706_90730_90846_91012_91105_91211_91329_91842_91981_92274_92371_94711_94799_94881_94979_95062_95125_96033
890239	contig_9415_pilon	+	4918	7	Intergenic	novelGene_109778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	503.047380140943	1041	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	19	591	1634159	1704137	FALSE	30	CTCATGACTCACTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRSEKMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSTNVEENDSNLSGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL	1634140	1708464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1634283_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1697965_1700428_1700495_1704044
890240	contig_8377_pilon	+	5817	31	Intergenic	novelGene_34954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_27	3240.46791357188	34	96	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	865	2598	1814	4411	136354	194052	TRUE	40	CAAATATTATTTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKLLNHVLSYLGELCSVLGRRKADVWRYRN	68096	198740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_128717_128934_131430_131572_135049_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192313_193965_194117_194346_194523_196081_196206_197698
890241	contig_3956_pilon	+	3101	15	Intergenic	novelGene_15046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1114.56946249872	3	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	81	1754	1281682	1288915	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPLCPLSVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287440_1287952_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
890242	contig_6227_pilon	-	5542	16	Intergenic	novelGene_49622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_15	223.567936480664	1445	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	217	2412	395173	341366	FALSE	20	TCTGTTAATGATTGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPDSVTQERRPPKLAFMSRGVGDKGSSSHNKPKPTGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQKVQDCYFYQIFMEKNEKVGVPTIQQLLEWSFINSNLKFAEAPSCLIIQMPRFGKDFKLFKKIFPSLELNITDLLEDTPRQCRICGGLAMYECRECYDDPDISAGKIKQFCKTCNTQIHLHPKRLNHKYNPVSLPKDLPDWDWRHGCIPCQKMELFAVLCIETSHYVAFVKYGKDDSAWLFFDSMADRDGGQNGFNIPQVTPCPEVGEYLKMSLEELHSLDSRRIQGCARRLLCDAYMCMYQSPTMSLYK	406558	338235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_344676_344786_345745_345879_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_359403_359521_361757_361857_392432_392539_395032_395336_406504
890243	contig_7254_pilon	+	1918	6	Intergenic	novelGene_145842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	380.257807283427	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	27	704	210141	216969	FALSE	70	AAAAAAAAAAATAAGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQPSCPNKSDENIPGGVMRPEITVYTSCCYFPTAAQLPSLWAENKKSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKSGKPVSKAVIVLNEGIKVHTKEGGYFHVLLAPGFHNINAIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKSLLSHEFQDETDTEEETLYSSKH	210114	218183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_210172_210260_210288_213932_214040_214551_214738_215027_215128_216742
890244	contig_854_pilon	-	3286	14	Intergenic	novelGene_36703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.13175484008477	11	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2137	2526	1710643	1709595	TRUE	20	TTGCTGTCAGACTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1716403	1704940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704999_1705284_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715071_1715208
890245	contig_10217_pilon	-	2121	10	Intergenic	novelGene_87407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	1178	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	25	TCCAAGTACCTCAGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	108411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
890246	contig_14970_pilon	+	1820	10	Intergenic	novelGene_44963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5359.27464918827	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	133	606	136145	192069	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEEPTLKTSIPATLQTMT	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188815_192019_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231706_231743
890247	contig_14333_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_49098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCTAGATATTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295721	297431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_295700_297400
890248	contig_10331_pilon	-	2347	2	Intergenic	novelGene_54155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	521	874	458445	458092	FALSE	15	GATGGTGCCTGGCTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCFSRDWSLLVTCSCTSDKVLEFSLPKSILAVLLPRQICSQSIHGIFNILHQHHDSKASILLQSSLFTVQLSHAYEVTENTMAWVRRTLVLKVTSLRFDALKRSFASDLPNEIRLI	459055	456618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_458529_458618
890249	contig_4364_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532810	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
890250	contig_16204_pilon	+	1154	3	Intergenic	novelGene_154524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1189	junction_2	25	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	451	774	394951	396848	FALSE	20	ATGCTTTATCTACTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSPAFAQYLSIATTRQLSGPRSRTAQPHTWITNTVSPPGIPTSRLIRLLKGPCTVLLPSLITLLTVTTICTGLRGCKRSGSRDRNSRARPISPENILHSPLGNDV	394500	397228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_395098_395665_395758_396763
890251	contig_18916_pilon	-	2424	4	Intergenic	novelGene_136870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	253.925185832363	801	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGTGAACTCTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17375	8492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_9305_13045_13299_14082_14226_16159
890252	contig_10023_pilon	+	1698	7	Intergenic	novelGene_123466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	119.74753534926	481	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	27	668	64176	67215	TRUE	70	TGAAAAAAAAAAAACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALAAPGRALLRGGVWALFRLRPGAGTPVPERDFSLSHSRGTVIVERWWKVPLAGEGRKPRLHRRHRVYKLVEDTKHRPKDSLELILTQSVEELGVRGDLVSVKKSVGRNRLLPQGLAVYASPENKKLFEEEKLLRQEGKLEKIQTKAGEVTVKFLRSCHLEVGMKNNIQWELNPEIVARHFFKNLGVVVAPPRSKVTGRAHHTMGRVLV	64149	68363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_64305_64514_64672_65151_65277_65489_65541_66539_66642_67137_67223_67340
890253	contig_8598_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_22875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTACATCCTACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15985	18017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_16000_18000
890254	contig_15498_pilon	-	1243	9	Intergenic	novelGene_42655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.489492211102	75	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	13	618	697708	688828	TRUE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGRCPPCGACVPSSGGRDSPSQRLHCHRPSGV	697720	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689580_691313_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
890255	contig_3747_pilon	-	2091	9	Intergenic	novelGene_24871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAAGACAGCTCGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205164	201046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766_204104_204815
890256	contig_6434_pilon	+	4408	1	Intergenic	novelGene_61829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1117	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3906	4217	700031	700342	NA	5	CCCCCTGTCTCACTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASALLGQVFQSSVAPPESARRHPTPPESLVHRHSALSLHGSAPAPSFTGLLVLLLWFSAAAGSLSLPYIYLFTILKPFPHFRYLLEQHPTPGTKFCLSGWF	696125	700533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_696100_700500
890257	contig_15491_pilon	-	2836	8	Intergenic	novelGene_75941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	440.459129656724	2594	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	83	832	46982	37061	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFCPQAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47064	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_33111_33419_37054_37200_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
890258	contig_6445_pilon	-	3237	14	Intergenic	novelGene_77017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCCCGATGATCCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667357	522241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515_644717_656008_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663
890259	contig_9293_pilon	+	807	3	Intergenic	novelGene_175190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	412	807	86333	86728	FALSE	20	GCAATGGGAAGCTGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGAPGAGEEEMVAAGKNPSPPGPEETTAGEAVAEHIIILAAAALSPRAGQADTRAHTALFQRRQLRRRPLPPAAGRLQRQRPPPPPPSSPPPRAALAATGAAHLTPPPGECEEEAVPSLPPPPPLPPPELP	34952	86728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_+_35102_44623_44699_86145
890260	contig_3745_pilon	+	2167	5	Intergenic	novelGene_85098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	285.444390381034	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	209	538	458820	486871	TRUE	50	AAAAGTTAAGTGAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCDVDIYFSAEFLNSCRLNAEPGKKVFYPVVFSLYNPAIVYANQDGPPPVEQQLVHKKDSGFWRDFGFGMTCQYRSDFLTVGGFDMEVKGWGGEDVHLYRKYLHGDLMVIRTPVPGLFHLWHEKRCVDELTPEQYRMCIQSKAMNEASHSHLGMLVFREEIETHLRKQAYRTDSEAVG	443281	488557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_443350_444954_445050_458774_458857_486578_486914_486970
890261	contig_2069_pilon	+	1375	2	Intergenic	novelGene_23380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	426	725	1058170	1058469	TRUE	20	GCCGAATGGGAACTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCETNEFINGDTEMSNSRDSYSVNSEWFSSTLARASSARAARRIMSTLVGSKGGFCMWSRLAWLCWNCVAARLSSRKPRRLPMLPFCTAMARAARLSP	1057744	1059169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1058939_1058988
890262	contig_5954_pilon	+	9047	2	Intergenic	novelGene_28745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	6409	6741	1291500	1291832	FALSE	45	AAAAAAAGGCCATGTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHNRDLGEVEQLGAHTQTTIQSNSPSSSARGTQVAKRYLNQGQQFTPLPHAGIVKQAQNLRTLLMKIKTSANRIKEKAVAKLAKQINQIINSKSSQLQFHRGAHRSRSQ	1280671	1294138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1283541_1287960
890263	contig_8866_pilon	-	4865	32	Intergenic	novelGene_77872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_12	104.23552535032	755	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1510	4533	121	4653	996895	912690	FALSE	15	TAATGTTTTTTGTATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLCLTVNTGDPPLGALLAVEHVKDSVSISVEEGKENILRVSENVVFMDINSILRYLARVATTARLYGSNLMEHTEIDHWLEFSATKLSSCNLFTSAINELNHCLSLRTYLVGNSLSLADLCVWATLKGNAAWQEQLEQSRAPVHVKRWFGFLEAQQAFRSVGSKWDVSTTKPKVAPEKKQDVGKFIELPGAEMGKVTVRFPPEASGYLHIGHAKAALLNQHYQVNFKGKLIMRFDDTNPEKEKEDFEKVILEDVAMLHIKPDQFTYTSDHFETIMKYAEKLIQEGKAYVDDTPAEQMKAEREQRIESKHRKNPIEKNLQMWEEMKKGSPFGQSCCLRAKIDMSSNNGCMRDPTLYRCKIQPHPRTGNKYNVYPTYDFACPIVDSIEGVTHALRTTEYHDRDEQFYWIIEALGIRKPYIWEYSRLNLNNTVLSKRKLTWFVNEGLVDGWDDPRFPTVRGVLRRGLTVEGLKQFIAAQGSSRSVVNMEWDKIWAFNKKVIDPVAPRYVALLKREVVPVNIPEAQEEMKEVAKHPKNPDVGLKPVWYGPQVFIEGADAETLSEGETVTFINWGNINITRIHKNTDGKIVSLDAKLNLENKDFKKTTKITWLAETAHALPVPAICVTYEHLITKPVLGKDEDFKQYVNKNSKREELMLGDPCLKDLQKGDIIQLQRRGFFICDQPYEPVSPYSCREAPCILIYIPDGHTKEMPTSGSKEKTRVETKSETPPCKEKPAPSLNNTCATSEDSLVLYNRVATQGDVVRELKAKKAMKEVIDEAVKQLLALKAEYKEKTGQEYKPGNPPAAAVQNVSSKSSESLLDSKSLHDEVAAQGEVVRKLKAEKAPKAKVNEAVECLLSLKAQYKEKTGKDYVPAQPPLSQNPDPSPTRSSEPSGPESPEAKALFDKVASQGEVVRKLKAEKASKDEVDGAVQGLLQLKAEYKSLTGVEYKPISATGAEDKDKKKKEKENKSEKQNKLLKQNDGQRKDSPKTPGSGQSSGGPGEGQGPKKQTRLGLEAKKEENLADWYSQVITKSEMIEYYDVSGCYILRPWAYSVWEIIKDFFDAEIKKLGVENCYFPIFVSQGALEKEKTHIADFAPEVAWVTRSGKTELAEPIAVRPTSETVMYPAYAKWVQSHRDLPIRLNQWCNVVRWEFKHPQPFLRTREFLWQEGHSAFATFEEAAEEVLQILDLYARVYEELLAIPVVKGRKTEKEKFAGGDYTTTVEVFVSASGRAIQGGTSHHLGQNFSKMFEIIFEDPKSPGEKQFAYQNSWGLTTRTIGVMTMVHGDNMGLVLPPRVACVQVVVIPCGITNALSEEDKEALITKCNDYRKRLLRVNICVRVDLRENYSPGWKFNHWELKGVPIRLEVGPRDMKSCQFVAVRRDTGEKLTVTENEAETKLQALLDDIHVNLYTRASEDLKTHMVVANTMEDFQKALDSGKIAQIPFCGETDCEDWIKKTTARDQDLEPGAPSMGAKSLCIPFKPLCELQPGATCICGKTPAKYYTLFGRSY	997015	912477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_912841_912937_913003_917539_917619_920825_920987_924675_924850_925525_925724_926761_926918_928906_929009_929261_929342_931270_931344_931707_931918_932407_932460_934654_934918_936207_936442_946075_946433_952103_952219_954227_954341_957171_957380_958384_958522_959456_959568_965260_965321_966842_966928_968177_968412_975572_975745_977436_977630_979294_979422_981584_981680_983435_983576_986596_986754_988721_988822_991424_991510_996849
890264	contig_5945_pilon	-	1606	8	Intergenic	novelGene_104558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	333.161663277081	1076	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	386	859	235639	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249746	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_246864_246957_249568
890265	contig_10014_pilon	+	1522	6	Intergenic	novelGene_174560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	102.318326804146	455	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	93	569	7285	31635	FALSE	40	TTAAATATTGATAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSQARPPPNQKKGSRTPIIIIPAATTSLITMLNAKDLLQDLKFVPSDEKKKQGCQRENETLIQRRKDQMQPGGTAISVTVPYRVVDQPLKLMPQDWDRVVAVFVQGPAWQFKGWPWLLPDGSPVDIFAKIKAFHLKYDEVRLDPNVQKWDVTVLELSYHKRHLDRPVFLRFWETLDRYMVKHKSHLRF	6909	32588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_6949_7231_7320_21234_21397_22313_22415_30533_30676_31598
890266	contig_18420_pilon	+	3549	16	Intergenic	novelGene_109342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	51.52017943378	988	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	101	1753	92356	103753	FALSE	35	GCACTACATACAATGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVEVVLLKKHKKKKDRKSLAEDDVAEIQHAEEFLIKPESKVARLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLPSGSNPLKREIADYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHDAIEGATQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSPVVPQLVKKEKKKNKKDKKAKAALESGGELGDARKRESDSESDKETSQAVPQLVKKEKKNKKKDKKDKKAKAALESGGEPGDADSDTTKKKKKKKAKVSSE	92255	105549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93032_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101756_102633_102775_103145_103296_103696
890267	contig_11512_pilon	-	2709	14	Intergenic	novelGene_43381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1185.27792161977	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	140	958	609650	556848	TRUE	30	GTATTTATTTCCAGACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTQPSLLRPSSTSCRAWDTCPLPA	622340	554995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556126_556226_556866_561325_561378_571055_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
890268	contig_14807_pilon	-	815	5	Intergenic	novelGene_124685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	5456.60253156669	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	229	720	38669	37247	FALSE	5	TGTGTCTGTGGTCTGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39907	37151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_39750
890270	contig_10500_pilon	-	1261	2	Intergenic	novelGene_41299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640213	1638743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1639495_1639703
890271	contig_19961_pilon	+	3405	1	Intergenic	novelGene_178585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATTCATTGTCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1692	5097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19961_pilon_+_1700_5100
890272	contig_12622_pilon	-	1937	9	Intergenic	novelGene_5883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_8	8.75267816156861	412	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	345	1184	1473059	1462438	FALSE	50	AAAAGAAAGACGAGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRRQPGRTIKVPSTHGDLSLGGEKEGLSLGCPPSASLNSRRSETSGNVLGKSLGGGLGGGWSGRRGPRPPARPAAIGLRRPRPFPGRGHDWGRGVTTDSAVLPLLPPLRSHPVMVRLRLQCLVWGCLLTTVHLEPPTPCKQEQYQIEGQCCDLCLPGTKLMKDCTDGVDTVCEPCQAGEFLDTLNREMRCHQHKYCDPNLGLRIQTEGTSETDTTCTCKEGQHCTSDTCESCAPHSSCHPGFGVEQIATGTSDTICTPCPVGFFSNVSSAFEKCHPWTSCKTKDLAELKAGTNTTDVLCGPWPRTRALVAIPITLGILFVIFVSAYINKVVKKPDNKAYPGEGVRKAPEEMIFLDDIPGHNPVAPVQETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ	1473403	1461684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1462606_1463320_1463350_1463458_1463543_1464886_1464949_1468407_1468502_1468831_1468979_1469211_1469338_1469677_1469757_1473008
890273	contig_2550_pilon	+	3701	6	Intergenic	novelGene_135622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_5	108.08959246847	91	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	26	652	397136	436202	FALSE	15	CCCTCCCATCCCTGGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKCLFGKMAAVSVYERPVGGFSFDNCRRNASLEAEFAKKGYKLPAARKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEVCKVPAVLLSSTYFPAVC	397110	439251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_397198_397613_397708_398493_398592_401128_401270_409544_409661_436086
890274	contig_16951_pilon	+	5994	7	Intergenic	novelGene_98623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	245.890501827315	2691	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	63	977	46585	91405	TRUE	25	ATGTCTGCTAACAATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLLPVSDLSPHSVRLAPAEMQSQRIPGRKRGRPPLHSTPLKMAVPNLYSSSPGCLPAVKTPKKRGRKPGYKLKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHVRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFPRGSSAFEKAQEKEDGRTESAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	46522	111506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_46741_65743_65874_68468_68670_74288_74484_91172_91463_103952_104099_106692
890275	contig_11720_pilon	+	1355	10	Intergenic	novelGene_43819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2175.9165345739	481	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	186	920	68064	95059	TRUE	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGCPRQHHQPDPHVSGLPALPHQVL	67878	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93248_94987_95061_95383_95486_98299
890276	contig_18511_pilon	+	1698	10	Intergenic	novelGene_126877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	337.27996942863	169	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1539	159	1697	47371	59827	FALSE	55	TGATGGAACAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQ	35413	59828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
890277	contig_12019_pilon	+	2446	12	Intergenic	novelGene_87742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	155.052963491845	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	4	1005	623205	637915	TRUE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623201	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637953_639701_639833_639942_640142_641782_641874_642082_642730_642886
890278	contig_5033_pilon	+	6022	3	Intergenic	novelGene_28970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	680	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	5400	5867	475531	475998	TRUE	40	CTGGGAAAACAGGTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALILSLNWTQEEMTLWSTKISVEGGGGEALSSSSLGLSATSWLFKTQFPKLGLLNREQPSKVRDKKRITWGRMGQGRWPVVVDASLPAYHHPLLLLEAMPSWCWDSTPVSQGQFSFPWLSSWGASRLRLRQLWSVGFGLLLPYQRPRLASKC	469447	476394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_469964_470647_476096_476336
890279	contig_8587_pilon	+	2490	2	Intergenic	novelGene_159150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATATATGTCATCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513950	516938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_516004_516501
890280	contig_14450_pilon	-	3429	7	Intergenic	novelGene_48978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	435.969959464589	35	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	159	1169	1310917	1042054	FALSE	25	TTCAGACTTCCCTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRTPTVNPPYSFSCLIFMAIEDSPTKRLPVKEIYNWILEHFPYFANAPTGWKNSVRHNLSLNKCFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQDPDIDAATAMMLLNTPPEIQAGFPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASEHTHTHKHAHT	1311075	1039793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042088_1042999_1043375_1065853_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
890281	contig_2310_pilon	+	1707	11	Intergenic	novelGene_71596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	248.206385896898	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	261	1538	107982	134479	FALSE	10	GATTTGTCGTCTCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRPVGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106050	134648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_108000_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
890282	contig_6102_pilon	+	3922	29	Intergenic	novelGene_31852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	511.737985013935	6	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	62	1495	370803	378892	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLPARPSKPGALCAGEG	370741	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_376251_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
890283	contig_6898_pilon	+	2556	14	Intergenic	novelGene_35711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	129	1862	59668	125646	TRUE	15	TTTACTGTGACTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59539	127702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125799_127160
890284	contig_10500_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_41304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGTTTTGAAAAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640215	1638756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1638800_1640200
890285	contig_6412_pilon	+	3009	1	Intergenic	novelGene_149957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACACCAGCCCAGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229551	232560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_229600_232600
890286	contig_18162_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_122271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10179	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_7200_10200
890287	contig_10793_pilon	-	1299	11	Intergenic	novelGene_83424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGAGAGAAATGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165013	146953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_146992_151413_151496_152862_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161472_162548_162689_163140_163288_163929_164068_164789
890288	contig_1348_pilon	-	5487	2	Intergenic	novelGene_174377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	113	junction_1	0	72	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	4600	5196	612307	611711	FALSE	60	AGCAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPGKLEVVKYETEYIKLDTLGISELKWTSIGHHELDSHMVYCDGNDKLKMNNVTFIVKKNISRSILKYNTVSDRIIFICQQRTPVSTNIIQMCTPTTNAKDEEIEDFYPFLQFEIDQACNQDALIITGDWRMKVGNKKGPVVGKCGVGDRNDTGDHVIELCKTNDFFIANNLFSTTESVTIHVDLARWNTQNQIDYI	619998	611419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_616737_619828
890289	contig_20739_pilon	+	3402	2	Intergenic	novelGene_83174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	39	junction_1	0	155	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	122494	122796	TRUE	20	AAATGAGTCCCTTTTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAARCSVGNGWGWLKSAQWSFNVRHVGHGVLKRARETGAERLRLPPSRLVLVPGRRALRSVPQVPGSGRRVGTEPPVLHDPAGRGRFPRAERYLLRLR	122493	127041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_122946_124091
890290	contig_16228_pilon	+	827	4	Intergenic	novelGene_147943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	154.620682819458	1085	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	37	501	47816	74763	FALSE	10	CCACTTGTGGTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQVLLCPPKYVLEY	47779	75089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60200_69497_69504_74730
890291	contig_4924_pilon	-	7402	14	Intergenic	novelGene_84637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1043.08561376003	2991	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	604	2070	252576	65524	TRUE	25	AAGCCCCAGCAGTTATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	253179	58162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_59050_59682_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
890292	contig_2114_pilon	-	2295	6	Intergenic	novelGene_104240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	785	1507	165948	159909	TRUE	10	CGGCGGCGGCAGCGGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTGLIAILRGAANVIGVGKFIGDVIVTGCAIFTGAVTGVGRLTGVVSVKGEVMDNGLVIVTGCPMFIGLVMLTALETFTGLLMLIAAATVTGFDIVPDDTEDVILNGVVRVTGVVAAVEVWHRLAASFFLALTASSHSLSVSTCFPGQLVTCCCCCCCCCCCCFWLLVSSLMHVLLMPCLHVLQLILWLCPCVFKWLVIYAALRSFPQILHDTLPSWRTMCVRSLSLVAKAAVHVFGI	166732	153528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_153656_158475_159082_159853_159920_161007_161194_162413_162553_165561
890293	contig_1225_pilon	+	3022	3	Intergenic	novelGene_44190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	45	22	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAGGTACATGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251398	277046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274232
890294	contig_15304_pilon	-	3190	6	Intergenic	novelGene_30652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4110.67135149479	142	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1051	1854	106308	103245	TRUE	20	TATGCGGTTTATCATGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	112620	101820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102671_102758_103329_103548_103680_105638_105960_106040_107223_112484
890295	contig_5643_pilon	-	2335	13	Intergenic	novelGene_38898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	357.787287442631	14	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	9	1040	278047	269360	TRUE	5	GTGCTCTGGTTCAGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGKEKKEEEEKKRSDASEWRDTEGPE	278055	263043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_263672_263844_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269040_269294_269434_274860_274975_275149_275388_275710_275836_276984_277103_277217_277350_277432_277575_277958
890296	contig_11337_pilon	+	2942	9	Intergenic	novelGene_107166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	203.372656716679	122	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	431	1597	159367	172617	FALSE	75	AGAAAAAGGCAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102519	173962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102737_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
890297	contig_2733_pilon	-	3029	3	Intergenic	novelGene_128548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATACATACATACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578074	527507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_528228_528746_529378_576396
890298	contig_8310_pilon	-	2250	4	Intergenic	novelGene_75608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326115	315880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320734_325069
890299	contig_6062_pilon	-	1577	6	Intergenic	novelGene_5317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	352.596426527553	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828595	821143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_822318_822369_822504_822639_822725_823326_823372_824526_824643_828572
890300	contig_1719_pilon	-	3889	17	Intergenic	novelGene_87269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	647.099671128799	305	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	971	2916	1	2916	370101	350827	FALSE	50	ATAAAATACTTACAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQEHVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDDPLSRKDSRWGDSESTWRRGPEVESEWRRGPPEKDWRREGRDEERSLRRDEDRPRRLGDDEESQSSVRPEDDRFPRRGTDEDRGLRRGPDEDRFSRRGVDDDRPSWRNTDDDRPPRRIGDEDRASWRHADDDRPLRRGLDDDRGPRRSVDEDRGPRRSVDDDRGPRRGFDDDRGPWRNTDDDRVPRRGTDDDRGPRRSIDDDRLSRRADDDRIPRRGDDSRPGPWRPFGKPGGWRDREKARENSWGPRQESRLSEDSEWDREKERDRDNPDRDENDRDPERERDRDRERDEDRFRRPRDEGGWRRGPAEESSSWRDSSRRDDWDRDDRRRERDDRRDLRDRRDDRDRRGPPVRSDREEASSWRRADDRKEDRAEERDTPRRVPPPALPRDRERERDREREGEKEKAAWKAEKDKESLRRTKNETDEDGWTTVRR	370101	349853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_351057_352093_352276_353049_353249_355121_355394_355666_355988_356639_356723_358421_358607_359047_359202_359740_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366908_370008
890301	contig_1264_pilon	+	1598	2	Intergenic	novelGene_161308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATATATATATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133327	135032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_134873_134979
890302	contig_12158_pilon	-	1346	2	Intergenic	novelGene_104845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	221	junction_1	0	84	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	552	1109	36693	36136	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLCSENEGKPENQGKMENQEQPQVKGKPEVAGTLEDKEKLGNEGKTEKKAKTEDEEMLKDKGKPEGEAKPRGKPASETRAAGKRPAQDDVPRKAKRKTNKGLAEYLKEYKEAIHDMHLSNEEMIREFDEMARVEDEVKKSKQKLGGFMWMQRSLQNPFHPRGPRELRGGCRAQQRGFEDIPYV	37799	35898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12158_pilon_-_37134_37688
890303	contig_19402_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_80840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAGCTCCAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	144427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_144400_146700
890304	contig_8452_pilon	-	2197	7	Intergenic	novelGene_48016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	232.15488125148	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	88	510	550776	380790	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPARSPGLAATASPPPSPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGLFPVCATTAGC	550863	314843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
890305	contig_5686_pilon	-	5209	2	Intergenic	novelGene_45324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	825	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATACCACAAGTGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111622	105032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_107242_108622
890306	contig_20527_pilon	+	4318	7	Intergenic	novelGene_138608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_5	1254.34729596268	50	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	2662	3408	23541	27453	TRUE	5	AT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	20879	37341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_23740_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36519
890307	contig_10930_pilon	+	3813	2	Intergenic	novelGene_36956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2988	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	557	976	278447	278866	FALSE	35	CTGCAAAGACCTCTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSKSSFNTDISISKSILVISHRDNNKNSMSLSVTKVDIKTTHKKDHTEKATDDIPHCIYGSSKSLFTCLYHQLSPLY	212727	281703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_212798_277960
890308	contig_7088_pilon	+	4792	12	Intergenic	novelGene_159794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTTTACCCGCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707387	749060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_707931_714278_717379_718594_718723_720117_720183_720632_720749_721379_721464_722784_722849_734068_734229_741620_741771_742561_742765_743346_743462_748996
890309	contig_10549_pilon	-	4396	5	Intergenic	novelGene_110589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	310	708	149166	148768	TRUE	40	AGGTCAATCCAAAATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYAFPPPTLLHPNSTSSDSCGHSLLARKHQLHPGVTLIPSARTGWLPDCHLLGAGVVFFRLIRFLSYLSPPPPPFSQIPGSVAIFASSCGTASRPVPPRWWDPLGLFVYLFVPVCPVLICLFDCFLFLFSA	149475	114441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_116349_117448_117542_118125_119445_119672_119833_148558
890310	contig_4151_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_65282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	215	715	663144	663644	NA	55	AAAAAAAAATGGATACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	662929	664814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_662900_664800
890311	contig_6102_pilon	+	2747	4	Intergenic	novelGene_31968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2756	junction_2	108.041144426042	239	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	265	933	413309	415170	FALSE	55	GAAACTGAAAGCAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPLFSEQCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEGEGPGGALMEEAAVWDRSRTSIWGFPYLWTWAPKGARRQGAGPSPAQARSGRSEYDRKGVMWCEGWGRNGK	413044	416984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413367_414219_414364_414613_414788_414877
890312	contig_3745_pilon	+	3715	8	Intergenic	novelGene_85082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	218.28216152681	1167	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	397	2025	434035	486871	FALSE	40	GTTAAGTGAAAATGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIEAGLDVINNPDEDDDQEDEDNRLGEKLIFNENDFVEGYYRTERDKGTQYELFFKKADLMEYRHVTLFRPFGPLMKVKSEMIDITRSIINIIVPLAERTEAFAQFMQNFRDVCIHQDKRIHLTVVYFGKEGLSKVKSILESVTSESNFHNYTMVSLNEEFNRGRGLNVGARAWDKGEVLMFFCDVDIYFSAEFLNSCRLNAEPGKKVFYPVVFSLYNPAIVYANQDGPPPVEQQLVHKKDSGFWRDFGFGMTCQYRSDFLTVGGFDMEVKGWGGEDVHLYRKYLHGDLMVIRTPVPGLFHLWHEKRCVDELTPEQYRMCIQSKAMNEASHSHLGMLVFREEIETHLRKQAYRTDSEAVG	393616	488561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393747_433768_434696_437841_438059_439636_439739_443170_443350_444954_445050_458774_458857_486578
890314	contig_9363_pilon	-	1875	12	Intergenic	novelGene_6556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.511256985441	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	285	1025	757196	754431	TRUE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	759001	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754113_754307_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930
890315	contig_12079_pilon	-	2741	8	Intergenic	novelGene_67525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	361.925801393443	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	821	1978	862522	861365	FALSE	35	GTACAAACGTTAACTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872429	860601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863546_867259_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
890316	contig_13740_pilon	+	1446	11	Intergenic	novelGene_34708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	757	1179	160875	161933	TRUE	15	CTACTGCCGCTAGAGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGMVFLQYNFIHGIMVIKSNKAKASFLSRLPISNYLNGINFSIFLEIISKMMFLSIFFNSTNKQLLHSYVSAWLSRFLCLLFRSPLLLQHVLAQPLAHQWNGVLQPWQNQPQPWMKRLQNQILLIFCLQDPSLPHSL	157086	165407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157299_157451_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161272_161554_161719_161916_162031_165237
890317	contig_11422_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_98976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
890318	contig_10106_pilon	+	3585	11	Intergenic	novelGene_73868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	748.698931480472	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	498	884	167085	172575	TRUE	30	AGAGAAGTCCCTCTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	131628	176654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131684_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155537_167037_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505_173847_175224
890319	contig_13800_pilon	+	2102	15	Intergenic	novelGene_153707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	301.977867819914	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	190	1779	98375	162575	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94531	162898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
890320	contig_6227_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_49811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGCCTTCCCATTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1322041	1323780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1322000_1323800
890321	contig_11816_pilon	-	6490	3	Intergenic	novelGene_98510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	619	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCTTTTGAATATATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981825	975092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_978332_978423_980990_981140
890322	contig_2377_pilon	+	1478	9	Intergenic	novelGene_67901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	737.313440386787	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	384	779	214801	224342	FALSE	30	AAACCATTGATGTACTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLTEHKRLLKVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFEESRDGRVDSWRNFQANTKGKKEKKNRTFLRPPKVKMEQRE	197522	225041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200082_200197_200792_200895_210565_210623_214766_214834_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224219
890323	contig_20527_pilon	+	2533	7	Intergenic	novelGene_138571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	1343.62884466739	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	832	1578	23541	27453	TRUE	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12872	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_23442_23740_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_28010
890324	contig_10050_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_119626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	462	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	591	1046	219879	219424	NA	80	GGAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHGCNLSLYLFNLHAEQTIQKGGLYEERGIRIGGRFINNLQYADDTTLLAESEEDFKHLLMKIKDHSLQYELHLNIKKAKILTTGPISNIMINGEKTEVAKDFILLGSTINIHGRSSQEIKRHITLGKSATKDLFKVLKSKDVTLRKRFT	220469	218145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_218100_220500
890326	contig_17618_pilon	-	2627	8	Intergenic	novelGene_173353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	109.039592135431	14	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	286	996	42895	21176	TRUE	20	CTTGTTCCACTGTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFCFYRFMNHRAPANGRYKPTCYEHAANCYTHAFLIVPAIIGSALLHRLSDDCWEKITAWIYGMGLCALFIVSTVFHIVAWKKSHLRTVEHCFHMCDRMVIYFFIAASYAPWLNLRELGPLASHMRWFIWLMAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMNNTDGLHELACGGLIYCLGVVFFKSDGIIPFAHAIWHLFVATAAAVHYYAIWKYLYRSPTDFMRHL	43180	19445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_19983_20028_20373_20425_21377_30667_30738_32593_32696_34769_34845_38040_38202_42793
890327	contig_1867_pilon	-	1826	2	Intergenic	novelGene_54565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	682	1641	449145	448186	FALSE	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFVLGLISNCVAIYIFICTLKIRNETTTYMVNLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLAILYPFKSKTLRTKRNAKIVCIVVWLTVLGGSAPAGFFQSTYSQGNNTSKACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLRTLNKPVTLSRSKINKTKVLKMIFVHLVIFCFCFVPYNINLILYSLMRTQTFVNCLVVAAVRTMYPITLCIAVTNCCFDPIIYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSESRFSEAHGTDSFIQHNLQTLKTKISDNELTI	449900	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_449703_449776
890328	contig_6557_pilon	-	2771	9	Intergenic	novelGene_32946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_8	320.129954081151	215	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	129	1166	364319	345035	FALSE	40	GTTTTAAAGCTATAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRTAEGSGAERLGGPGQASGADTSVERRRTCAFDTLEAFLIMDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGAVNGFDPAPPPPGLGSSRPSSAPGMLPLSV	374194	343429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_345129_352014_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_374078
890329	contig_6738_pilon	+	2767	5	Intergenic	novelGene_166118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	481.210647741714	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	106	447	23469	38334	FALSE	20	ATTTTGGAGTGTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPGAATKAATKDEDEWKEFEQKEVDYSGLRVQAMQISEKEEEDNEKREEPGDNWEEGGGGGGGGIEKSSGPWNRTAPIQAPPAPVIVTETPELAMTSGVYRPPGARLTTTRKTPQGPPEIYSDTQFPSLQSTAKHWSFQNLFMFRY	22701	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_22741_23402_23480_32606_32756_36540_36687_38298
890330	contig_12948_pilon	-	2828	2	Intergenic	novelGene_126215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTAAAAAAAAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268792	265844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_267232_267351
890331	contig_4742_pilon	+	2090	7	Intergenic	novelGene_130970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	850.383197936867	522	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	666	1187	135543	139907	TRUE	15	GATTGTTGTGCTTAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARMNRPAPVEVTYKNMRFLITHNPTNATLNKFIEELKKYGVTTIVRVCEATYDTALVEKEGIHVLDWPFDDGAPPSNQIVDDWLSLVKIKFREEPGCCIAVHCVAGLGRAPVLVALALIEGGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFKESNGHRNNCCIQ	131199	141208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_131422_135099_135648_137327_137421_137943_138075_139008_139084_139789_140525_140922
890332	contig_15105_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_150954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	253	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGGTAGTTATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438221	441169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_440340_441068
890333	contig_12079_pilon	-	3122	10	Intergenic	novelGene_67538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_9	193.544584457534	1495	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	253	2364	871530	861365	FALSE	45	TGAAAGTACAAACGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872459	860606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
890334	contig_821_pilon	+	4752	2	Intergenic	novelGene_149417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	349	1173	257580	258485	FALSE	40	GCTCCTAAGTATCCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMVSTPVTLPSISQSAPMASWGVPYDQLTEEEKTRAWFTDGSARYAGAARKWTAAALQPLSGTSLEDSGEGKSSQWAELQAVHLVVHFAWKEHDWKIGDKDLWGRGMWIDLYEWAKEVKIFVSHVNAHQRVTSAEDDFNNQVDRMTCSVETSHPLSPATPTIAQWAHEQSGHGGKDGDYARAQQHGLPLTKADLATATAECLICQQQRPTLSPRYGTIPQDDQPAIWWQVDYIGPLPSWKGQRFVLTGIDTYSGYGFASLHAMFLPKLPSGDL	257231	262064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_257856_257936
890335	contig_7285_pilon	+	2681	12	Intergenic	novelGene_143383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	187.734514498225	872	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	489	1484	220216	324708	TRUE	85	AAAACATAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWQGQPVYPITGGFRQPYPSSLSVDTSMSRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	219727	343297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_220225_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_310159_310244_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_342106
890336	contig_602_pilon	-	3248	7	Intergenic	novelGene_134952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	363.709782045459	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	57	515	597916	485125	TRUE	25	TGGCCCCAGCAGAGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPLVVEAARKRGGRGDTMSSPSPGKRRMDTDVVKLIESKHEVTILGGLNEFVVKFYGPQGTPYEGGVWKVRVDLPDKYPFKSPSIDLTNIFESFLPQLLAYPNPIDPLNGDAAAMYLHRPEEYKQKIKEYIQKYATEEALKEQEEGTGDSSSESSMSDFSEDEAQDMEL	598284	482179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_482746_482957_485250_490711_490841_528023_528099_528733_528811_597863_597943_598254
890337	contig_20527_pilon	+	6392	8	Intergenic	novelGene_138596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1337.18568307487	73	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	187	933	23541	27453	TRUE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13523	34939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_23436_23740_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_29978_30943_31742_32802
890338	contig_5623_pilon	+	2121	10	Intergenic	novelGene_154821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTTGCCCTGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206854	220990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207766_208417_208454_209013_209106_209280_209409_210046_210212_210730_210810_211008_211121_211206_211313_218118_218448_220827
890339	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
890340	contig_17603_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_152785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	316	678	55270	54908	NA	55	ACAAAACAATATGTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHKETEQHLAQKLVGYGRNQGRNTEAQHGFQWAGTEVSAGLPFWRLQERICLSASPAAKGCLHFLASGPFLHPPSQPHSISLTLLCPYVFSHVLSRLLSSSSTFNHPCDGILEPWWRGG	55585	52677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_52700_55600
890341	contig_1275_pilon	-	2919	12	Intergenic	novelGene_108759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_6	497.683078154152	11	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1629	1289	2917	468178	400560	FALSE	35	CCCAGCAACTACCAAAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLD	469466	400557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448522_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121
890342	contig_4402_pilon	+	2027	5	Intergenic	novelGene_140817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	643	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1418	1723	411648	411953	TRUE	5	CGCCGCCGCCACCGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVAKSWWYFTRISRQGLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLIVGCGSLGIIISAGCCGSAVIRVGRLRLAYTGLYLFWH	399770	462814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_401034_411493_411955_440938_441042_462246_462296_462663
890343	contig_6316_pilon	+	1843	13	Intergenic	novelGene_134697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	136.227826941977	149	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	627	1532	147168	157164	FALSE	20	CTTTAAAGTGATTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136266	157475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
890345	contig_20596_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_157226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAGTTGAGTTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33088	31630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_31600_33100
890346	contig_12021_pilon	+	4142	13	Intergenic	novelGene_172186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	293.8317144028	963	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	71	1306	39446	56241	FALSE	50	GGTATTGAAAAAAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTGTGRGRVVNRKWTLRKHLGKMTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPSAQQDAVFELISMGFNVALWYTKYASRLAGKENITEDEAKEVHRSLKIGAGIFKHLKENHIPKLITPAEKGRDLETRLIDAYIIQCQAEAQEVTIARAIELKHTPGLIAALAYETANFYQKADHALSSLEPAYSAKWRKYLHLKMCFYTAYAYCYHGQTLLASDKCGEAIRSLQEAEKFYAKAEALCKEYGETKGPGPTVKPSGHLFFRKLGNLVKNTLEKCQRENGFIYFQKIPTEAPQLELKANYGLVEPVPFAFPPTSAHWTPETLAMFDLTKRPKDDSTKPKPEEEVKPVKEPDVKPQKDTGCSIS	37563	59077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_37618_39429_39547_42150_42258_42601_42699_45782_45879_47758_47832_48829_48936_49815_49906_52417_52504_53477_53560_53876_54028_54991_55152_56154
890347	contig_6208_pilon	-	2274	5	Intergenic	novelGene_53027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	646.286846144961	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	827	1519	493640	490427	FALSE	35	AAAGGTCTTTATTTACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDG	503150	489671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_490428_492948_493994_494039_494298_496608_496731_503057
890348	contig_12019_pilon	+	2540	3	Intergenic	novelGene_87673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGGTGTCATGGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	9477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_6434_7726_8686_9213
890350	contig_6291_pilon	+	2972	4	Intergenic	novelGene_164780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	639	junction_3	278.761945434132	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	280	1149	355015	370728	FALSE	30	ATACCCCCCCAGCTATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEDVSSLTGDALTDLLAKITNTDVVGGQDQTFLFLSSEKDMVGFIVMHHRRFFGLFSKMNIHGSPKWNRWKCH	354735	372551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961_360122_370429
890351	contig_5018_pilon	+	3011	24	Intergenic	novelGene_47199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	476.840233931295	1288	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	46	2298	1595253	1606815	TRUE	20	TTTTTAAGGCGTGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPKVQPDMLNVHLVAHTHDDVGWLKTVDQYFYGIHNDIQHAGVQYILDSVVSALVAEPTRRFIYVEIAFFAQWWHQQTKAKQEVVRDLVRQGRLEFANGGWVMNDEAATHYGAIIDQMTLGLRFLEDTFGIDGRPLVAWHIDPFGHSREQASLFAQMGFDGFFFGRLDYQDKKIREEMLEMEQVWRASASLKPPAADLFTGVLPNMYSPPENLCWDMMCDDKPVVDDPNSPEYNAKELVNYFLQLAAAQGQHYRTNHTIMTMGSDFQYENANVWFKNLDKLIQLVNTQQASGSRVHVLYSTPACYLRELNKANLTWSVKQDDFFPYADGPHNFWTGYFSSRPALKRYERLSYNFLQVCQQLEALAGPAANPGPYGSGESVPLREAMAVLQHHDAVSGTSRQHVADDYARQLAEGWGPCEVLLNNALARLSGSKENFTFCRELNVSVCPLSQTAAHFQVTIYNPLGRKVDWMVRLPVQEGVFSVRDPNGLTVPSEVLTLPGSDSQEYPPELLFSALVPALGFSTYSVDRLPRQKPRARTRRPRPQSRVLVIQNEHIRASFNPDTGLLVEIENLDQNLLLPVRQAFFWYNASTGDNVSSQASGAYIFRPNQQEPLPVRHWAETRLVKTSLVQEVHQNFSAWCSQVVRLYPGQRHLELEWTVGPIPVGDGWGKEVISRFDTTLETDGRFYTDSNGREILERRRDYRPTWNFSQTEPVAGNYYPVNSRIYITDGNMQLTVLTDRSQGGQQPER	1594204	1608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1594250_1595252_1595356_1595526_1595701_1596050_1596245_1596895_1597029_1597282_1597429_1597973_1598091_1600267_1600351_1600430_1600552_1600631_1600711_1600895_1601006_1601161_1601270_1601654_1601772_1602713_1602891_1604030_1604129_1604212_1604331_1605512_1605632_1605720_1605823_1606004_1606093_1606293_1606354_1606809_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
890352	contig_13366_pilon	-	2611	15	Intergenic	novelGene_99761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_14	240.338207702464	382	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2442	170	2611	167329	26722	FALSE	20	GGAAGGCTCACCGAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKRNRAACRELYMHEEQLRWGWSGARTGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVITGDEVQILSNLVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAVCIEKVKLRVLKQYDYDSSTNRKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIQVENVYEEILYQTLLDETLKVIKEAAVLKKHNLFEDNVTLPSESVSSLTDLKTPTGSNQASPARRASAVLPGVLDSESLGNEVFQEPEEEQQPGAPSPLAEEESTSLPVSSPPSAGDGQVVVSSISGPGNLVATEDKTETLDKNSAELEFGEIPEEEDPAHEEPESVSASGSLKELRKLLTVTVEVPVESAVVIEKDIPEETLLPQEDEKEEEKPQIYTEAHEVAASHQDHCEEDEVNEREAHLSSTEASGMEWGSFPEASGSAPEPAC	177735	26721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_27468_29836_29949_35679_35788_38158_38270_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49267_56149_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113726_116845_116977_167244_167330_177566
890353	contig_17753_pilon	-	3027	1	Intergenic	novelGene_105107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2510	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	824	1150	146777	146451	NA	30	CGTTCCACAAATCTACCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIRILSTCCLVSIFDALFARSWNVPRSPARTACLIMPDKARVSRGINLKTFFPAQIPLQSQTLQIPKGGESRAWGRRGPQGCEAGVGFAAGGSSSMKPGPRPARGH	147600	144573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_144600_147600
890354	contig_2338_pilon	+	483	2	Intergenic	novelGene_177413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAGGAAAGAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53100	58361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2338_pilon_+_53170_57947
890355	contig_9415_pilon	+	2928	13	Intergenic	novelGene_109889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	93.9710357267363	73	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1658	1966	2077626	2080624	TRUE	45	ATCACTAGGCGACCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTVMFWASASPRAPVASMALAICRRENPISSKGTAIAGGGGEVESLLLGSDKAVRLAGLADWESGEVKLCLLPTSSEGEVGNDDIGGVCARRVGSTVVVG	2066550	2085227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2066725_2066865_2067137_2070648_2070822_2071860_2072067_2072758_2072808_2073775_2074049_2074974_2075178_2076196_2076322_2077442_2077670_2077877_2077997_2080478_2080642_2082733_2082931_2084479
890356	contig_14441_pilon	+	808	5	Intergenic	novelGene_100431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	9814	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	195	623	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	81888	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_112115_112154_116578_116963_117220_117344_117539
890357	contig_7151_pilon	+	5913	3	Intergenic	novelGene_40743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_1	95	59	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502274	509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503041_506685_507738
890358	contig_14925_pilon	-	1599	5	Intergenic	novelGene_55356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	10	CTGGGTCTTTGGTGTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
890359	contig_5959_pilon	-	1370	4	Intergenic	novelGene_150190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	165.507972281969	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	252	1361	216308	211902	FALSE	60	AAAAAAAAAATTCAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218755	211892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218587
890360	contig_11258_pilon	-	3475	5	Intergenic	novelGene_67834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	145.547243189282	177	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	368	919	360591	344690	TRUE	75	AATTAAAAAAAAATATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATLNREKIEVVKDFI	360958	342006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_342247_342373_344732_353059_353152_354741_355099_360530
890361	contig_9921_pilon	+	5423	4	Intergenic	novelGene_23753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	58.1893461039046	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	303	1478	321085	322260	TRUE	10	TCAAGTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPNATNVTCYYQPAPYVSDGNFNNYYVAHPPVTYSQPYPTWLPCN	299194	326290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_319519_319701_321058_324741_324825
890362	contig_8587_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_159104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGAAACCCTATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97844	96143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_96100_97800
890363	contig_11656_pilon	-	7382	10	Intergenic	novelGene_53936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	628.811754201702	1174	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1547	4644	5	4648	141070	111854	FALSE	35	TCCTTGTCTACACACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKQLYWNWISTFTSGIRLEERWASDGKALKQQAVLKQKVGVTGPPDPQVRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRLPKLYLCEFCLKYMKSRTILQQHMKKCGWFHPPANEIYRKSNISVFEVDGNVSTIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTQNDVKGCHLVGYFSKVSKYNVSCIMILPQYQRKGYGRFLIDFSYLLSKREGQAGSPEKPLSDLGRLSYMAYWKSVILECLYHQNEKQISIKKLSKLTGICPQDITSTLHHLRMLDFRSDQFVIIRREKLIQDHMAKLQLNLRPVDVDPECLRWTPVIVSNSVVSEEEEEEAEEGENEESQCQERELETNVGKPVSRENKEQDSYSLLESEKKPEVIAPASSTRLNKQVLPRDGLPANSQPSRRGRWGRKNKKTQERFGDKDSKLLLEETSSAPQEQDGECEEKSETSQEQYTESEEPLAASQEQPSHDGKPDVPKRRLSEGVELWRGQLKKSPEALKCRLPEGNDRLPRRYSDGDRPLLRGFSESSEEEEEPESPRSNSPPILTKPTLKRKKPILHRRRRVRKRKHHNSSVVTETISETTEVLDEPFEDSDSERLMPRLEPTFEIDEEEEEEDENELFPRGYFRRLSSQDVLRCRSSSKRKSKDEEDDEDSDDVDDTPILKPVSLLRKCDVKDSSLEPDTSTPMKKKKGWPKGKSRKPIHWKKRPGRKPGFKLNREIIPVSTQECIVEPIVPIPKPGRKPKIQENEETVEPKEDLPLTEERKEEEMHVEAEEVEEGEEEDTTSSEVRAASPVDSSNSPETETKEPEVEEEEEKPRILEEQRQSEEEQQELEEQEQEEEDEVAVETNQNEDHDADDEDDGHLESTKKKELEEQSVREDVKEELGSQESFLDTNMQNSRENVKDKDETEPDSEEEQTSHETSVVSEHMPGSEDDPEEDSNTKEELIELKEEEEIPHSELDLETVQAVQSLTQEESNEHEGAYQDCEETLAACQTLQSYTQADEDPQISMVEDCHASEHNSPISSVQSHPSQSVRSVSSPNVPALESGYTQISPEQGSLSAPSMQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNNSSQSSCSYGGLSSSSSLTQNSCVVTQQMANIGNSCSMMQQNNVQPAANCNIKSPQSCVVERPPSNQQQPPPPPPQQQQQQQQQQQQQPAPQPPPPQQQQQQPQQQQPQPQQPQPPPLPQQQPPLSQCSMNNSFTPAPMIMEIPESGSTGNISIYERIPGDFGAGSYSQPSATFSLAKLQQLTNTIMDPHAMPYSHSPAVTSYATSVSLSNTGLAQLAPSHPLAGTPQAQATMTPPPNLASTTMNLTPPLLQCNMSATNIGIPHTQRLQGQMPVKGHISIRSKSAPLPSAAAHQQQLYGRSPPAVAMQTGPRALAVQRGMNMGVNLMPTPTYNVNSMNMNTLNAMNSYRMTQPMMNSSYHSNPAYMNQTAQYPMQMQMGMMGSQAYTQQPMQPNPHGNMMYTGPSHHSYMNAAGVPKQSLNGPYMRR	141074	109119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_114523_117214_117528_120350_120957_122563_122772_123444_123677_129280_129357_130450_130619_132521_132664_139139_139256_140956
890364	contig_10930_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_37070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288719	287332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_288700
890365	contig_19534_pilon	-	1531	6	Intergenic	novelGene_151614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	409.525872198571	42	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	51	512	68652	64591	TRUE	30	CATGATGTTTCTAAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAAVGSRALLWIALLLFAPAGSLVATGKSTIFLNPPWNRIFKGENVTLTCDGGMSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDVAPYL	68702	61956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62953_64567_64608_64708_64823_66767_67023_68150_68172_68597
890366	contig_8452_pilon	-	2371	10	Intergenic	novelGene_48021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	201.461389248721	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	727	1194	380814	316088	FALSE	15	GTTACTTTTCAGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	550848	314910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509199_509284_509599_509728_550745
890367	contig_3627_pilon	+	5431	3	Intergenic	novelGene_78556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	4974	5429	871275	871730	FALSE	25	ATGGTTTTCTGAAAGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNKKKKKKQHQQSTNGTHRAARPGTQNPSSRRPWVKRLRPREAEEQMNKGPKAPGSNQCSSPDPEAVSRPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRDKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKATPAAYKRHLKSRSRGIQAWR	817186	871732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_820363_821787_822219_869908
890368	contig_5590_pilon	-	4549	13	Intergenic	novelGene_163021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.38192699598142	964	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	720	1154	366316	365882	TRUE	20	CATGAGACTAGGTGGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLNGQGEEPAGSAGVTACTLCGGSGGGTQAQHWEPNRTFPERRQWPGLPCGNLWAAALVLATLYWEEPGTGQRATQNSPSGQQSSPGTWELDQGQGEGQAGLGSDRLEGRGETCPRGNALSADLSPRRWQPLPRAVHVHTDPK	367035	318660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_318678_329392_329484_344680_345000_347922_348058_349278_349416_351541_351833_352338_352702_353454_353580_358766_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_364784
890369	contig_5327_pilon	+	3444	3	Intergenic	novelGene_178588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2416	2751	333532	432491	FALSE	20	TGGGATAGGATGGTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFMKIMQAQNAKINSQLEIIQKQQLEIQMINNKISEINGVIEGLRSRFEMVEDRITGIEDKHLDTNLLFYFSFLCLGAPPSQEVPPSLEATPLLSADAQGHP	270060	433184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5327_pilon_+_271771_332826_333759_432382
890370	contig_9233_pilon	-	3235	1	Intergenic	novelGene_78249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCCATTGTTGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611999	608764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_608800_612000
890371	contig_4900_pilon	-	2663	6	Intergenic	novelGene_159060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	147.579673397118	513	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	FALSE	10	CGTTGGGCCAGGTCCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1179641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
890372	contig_8312_pilon	+	3712	12	Intergenic	novelGene_152873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	506.853834864999	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	128	1009	221802	273150	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVCRDFAVLEDHTLAHSLQEQEIEHHLASNVQRNRLVQHDLQVAKQLQEEDLKAQAQLQKRYKDLEQQDCEIAQEIQEKLAIEAERRRIQEKKDEDIARVLQEKELQEEKRRKKHFPESSGSSASGDSYCYEDGGMKPRGIKEALSTPSRVTHRDQEWYDAEIARKLQEEELLATQVDMRAAQVAQDGEIARLLMAEEKKAYKKAREREKSSLDKRKHDTEWKPKTSKSANPKSKESDEPHRSKNNRPARPPPPAGTDAKDLDYPHFTNQRNSTRHFSKWESSHKGFHYKH	221674	275908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_221812_241031_241095_242165_242293_244964_245056_252632_252751_263690_263807_264911_264957_265066_265172_266972_267053_271660_271768_273130_275695_275749
890373	contig_2733_pilon	+	2017	7	Intergenic	novelGene_128542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	457.846195669341	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	479	784	571359	614101	FALSE	10	GTGTTCTTTTTTTATTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGSQGGQQAGGGCC	504541	615334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_504816_544501_544574_560425_560494_571294_571388_578069_578182_611519_611589_614005
890374	contig_8616_pilon	+	7948	6	Intergenic	novelGene_72616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	24.4	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2220	6663	556	7218	465045	480301	TRUE	10	CCTGATGCTTTGTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKMKMPKFSMPSFKAEGPELDVNLPKADIDVSVPKVDIDAPDVSLEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDADLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGEMKVPDVDIKGPKVDINAPDVDVQGPDWNLKMPKIKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDIDLHLKGPKVKGDMDVSLPKVEGDLKGPEVDIKGPKVGVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPKVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNVEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDFDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKAPEVDIEAAKVDVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPDLHLKAPKIAMPEVDLSLKGPKVKGDMDVPLPKVEGDLKGPEVDIKGPKVDVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFGMPGFKGEGPKVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDFDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEIDIKGPKVNIDVPDVDAHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKAPKISMPDIDLHLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDIKGPEVDIKGPKLDIETPDVNIEGPEGKLKGPKFKMPEMNIKAPKISVPDFDLNLKGPKVKGDVDLSLPKVEGDLKGPEVDIEGPEGKIKGPKFKMPDVHFKTPQISVSDIDLNLKGPKVKGDLDISIPNVEGDLKGPKLDVKAPKLDIDTPDIDIHGPEGKLKGPKFKMPDLHLKAPKISMAEVDLNLKGPKVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEVDIKGPKVGVDVPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFRGEGPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKAPKFKMPEMNIKAPKISMPDTDLHLKGPRVKGDVDVSLPKVEGDLKGPEVDLKGPKVNIDVPDVDVQGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFQMPEINIKAPKISMHDVDMGLEGPKVKGDYDVSVPKVEGTFKSPEVELIGPGLDFKGPDAKLSGPNLKMPSLDISAPKVTAPDIDLHLKAPKIGVSGPKLEGGELDLKGPKVDLETPSLDVHMESPDINIEGPDVKIPKFKKPKFGFGAKGPKADIKSPCLDVTVPEAELNGQTPEISVGGKGKKSKFKMPKIHMSGPKIKPKKQGFDLNVPGGEIDASLKTPDVDINVVGPDAALKVDVKSPKTKKPMFGKMYFPDVEFDIKSPKFKAEASLPSPKIEGEIQAPDLGISSPGINVEGPDIKLKAPKFKAPSVDVSGPKIEGNLKGPRVQANLDTTDINIEGPDAKVKAPSFGISAPQVSIPDVNVNLKGPKVKGDVPSVGLEGPDVDLQGPEAKIKFPKFSMPKIGVPGMKMEDGRAEVHAQLPGLEGGLSAPDVKLEGPDVSLKGPKVDLPSVNLSMPKVSGPDLDLNLKGPSLKGDLDASIPSMKVHAPGLNLKGVGGKVQMEGDGVKVPGIDATSLNVHAPDVTLKGPSLQGDLNVSGDINCPEVSVGAPDLSLEASEGGIKLPKMKLPQFGISTPGSDVDINIKGPQVTGELKGPGMDMNLGGVNLKGPQISAPHISAPDGDFSLEGPKVKGEMKGPSVGGGLAGINVQGLEGSLQMPGIKSSGCDVELPGVNVKLPTGQISGPEIKGDLKGTGLGFDGAAPDIGVKGPSFNMAAPESDFSVGLKGPKIKGAVDVSGGVSAPGISLGEGHISVKGSGAEWKGPQVSSALNLDATKFAGGLHLSGPKVEGDVKGGQIGLQGPGLSVCGPQGHLGSGSGKVTFPKMKIPKFTFSGRELVGREVGVDVNFPKAEASVQAAAAEGEWEESEVKLKKSKIKMPKFNFSKPKGKGGVTGSPEASISGSKGDLKSSKASLGSLEGEAEGETSSPKGKFSFFKTKKPQQRSNSFSDEREFSAPSIPTGTLEFEGGEVSLEGGKARGKHGKLKFGTFGGLGSKSKGHYEVTGSDEEAGKLQGSGVSLASKKSQLSSSSSSDSGTKVGIQLPEVEVAVSTKKE	464002	481104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_464481_464967_465627_468770_468778_470729_470814_474311_480655_480727
890376	contig_7910_pilon	+	4298	3	Intergenic	novelGene_178589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3512	3817	158156	158461	FALSE	5	GCCAGGGCTTTTTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCFIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	66030	158942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7910_pilon_+_66920_155211_156427_156748
890377	contig_11815_pilon	+	3549	2	Intergenic	novelGene_50950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	567	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	35	472	471445	471882	TRUE	15	CTTATGACTGTGGCCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDATLEALTRLYREIRKTATWPTDWKRSIYVPIPKKGDPAKCRNYQTISLVSHASKIMLKIIKKWLQQYIDRKLPEIQARFRRGCGMRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFYCVDCNKLWITLRRMRILEHLIGTCT	471410	475120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_474330_474490
890378	contig_5136_pilon	-	5210	36	Intergenic	novelGene_126612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	382.55918469685	1215	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	864	2595	263	2857	269426	223407	TRUE	20	ACACATGGCTGCTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFGPCYLNFYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELSTFLEKTAADKKLESISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAIFDGNFYYYLPWAYTKPVVTLTSHWEDISHRLDAVNTLLLMAERLQSNIEALKSGIQSKIPANQLANVWWRLIDEVTEDTRYTLPPLEGKSNVTILDTQIQKLRSRSLSQIHEAAVRMRSGDIDVKSALAEVEDWLYKLKQLTEEPQNSLPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEENNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQAFMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWIVDPERSLLTEADAGHMEFTDEVYQNESRYPGGEWKSAEDTYTDANGDKSASPSELTCPPGWKWEDDAWVYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNRPKSWVAAEKMYHTHRRRRMIRKRNKDLTQSASSTARAMQELEDQEGWEYASLIGWKFHWKPRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGTDTTEDGDEKRGEKQNHSTTTVFGANTPIVSCNFDRVYLYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEIEIYGEPQTVLQNPPKVIIELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPLVKLNSEIDITPKLLWHPVMCGDKACGDILVTAELILRDKDGSNLPILPSQRAPHLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASITSPSLIVECGGERIESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIEHRPFGQKPVVGQCTINHLDRFRCDPYVTKEDIVPQLKASLMAAPPCRDVVIEVEDTKPLLASKVGGRNS	276182	187740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_188302_190270_190419_190803_190914_193021_193213_195453_195554_197575_197718_201574_201671_201758_201848_204075_204216_206291_206441_207167_207339_211313_211406_211835_211992_220871_220998_223324_223424_227936_228018_232929_233096_235181_235344_237070_237170_237292_237452_237697_237880_240029_240108_241526_241636_242519_242694_245287_245434_247228_247335_248927_249043_251384_251549_254833_254966_257705_257862_258803_258997_261534_261642_267825_267951_269302_269481_274623_274741_276091
890379	contig_6217_pilon	-	2006	11	Intergenic	novelGene_109700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_10	198.471559675436	453	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	358	1791	1083143	1069910	FALSE	15	CTGGTGTAATCTTCGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHRKKKPFIEKKKAVSFHLVHRSQRDPLAADETAPQRVLLPTQKVNDDERRAEQRKYGVFFDDDYDYLQHLKEPSGPLELIPTSSFSAHNWKDEKEEILVIPSTGIKLPSSVFASEFEEDVGLLNKAAPVSGPRLDFDPDIVAALDDDFDFDNPDNLLEDDFILQANQPTGEEEGMDIHKSEAEDGSEWEDVDDEKESGCDSDDYDSEGPLSNEGDMSALGRPHGAIKNDLFWEEETKSRFTEYSMTSSVMRRNEQLTLHDERFEKFYEQYDDDEIGALDNAELEGSIQVDSSRLQEVLKDYYKEKAENCVKLHTLEPFEDQDLLMNELNESEEEEMVTVVVEEIKEKWDCESICSTYSNLYNHPQLIKDQPKPKQIRISSKTGIPLNVLPKKGLTAKQVERMQMINASDLPKASTQPRSKNESKEDKRERKQAIKEERKERRVEKKANKLAFKLEKRRQEKELLNLKKNVEGLKL	1083500	1069694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1070021_1070145_1070347_1070536_1070590_1071533_1071674_1072706_1072835_1074265_1074528_1074890_1075033_1076417_1076506_1080492_1080667_1081975_1082108_1083140
890380	contig_3155_pilon	+	1731	4	Intergenic	novelGene_26413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1215.04522092344	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	259	612	259780	261405	FALSE	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLTDEVLEGYLFTFRSHLRALRWFGRQPSRQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	258531	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258623_259209_259329_259731_259970_261241
890381	contig_15498_pilon	-	3154	13	Intergenic	novelGene_42680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	288.791290939014	1255	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	223	1131	829154	797169	TRUE	20	GCTGCTGAACTGTAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKASAVEERSAESSRERPVRANNWQRCFGDISAEEIRGETPAWWKPDGICNLVCHCCYE	837877	783954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_784562_784609_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058_829255_837755
890382	contig_11413_pilon	+	2649	3	Intergenic	novelGene_103203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1240	1596	653373	653729	TRUE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMPSTTSWSGDDKTCAPQLPWVSSGFFFSQPQARVLCLSIPSPLSPLCALTPLVSGPQPDLKEKPVVTVCPSHPKSNWRLPCPRVAGRLPVSSIGPVNIVCYNFCSSAVFSFVFCIY	650871	654961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_652002_653263_654327_654505
890383	contig_12128_pilon	+	2944	6	Intergenic	novelGene_131970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	167	340	199898	200071	TRUE	50	GACACACAGACACACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAKRKGVGSAAALPVTAGKERVYLQLKTEDHSLQYGLHLNIKKTNILTIGPISNIMINGENTEVVKDFILLESTINLHRSSSQETKRHFALGKSAAKDLLKVLKKQRCHFMN	185636	409375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_+_185710_199804_201025_298651_298659_328177_328766_338122_338398_408594
890384	contig_6503_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_145784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577812	575599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_577420_577506
890385	contig_7057_pilon	-	1460	2	Intergenic	novelGene_123381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209905	1182215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1183369_1209598
890386	contig_13295_pilon	-	2663	4	Intergenic	novelGene_31234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	861	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTGATGTAGTATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97083	93783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_93965_94308_94586_94750_96803_96930
890387	contig_6847_pilon	+	4023	12	Intergenic	novelGene_143874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	554.770058836829	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	155	1105	98613	110600	TRUE	35	AAGTTCCAGCAGCATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	82104	114720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608_113759_113959
890388	contig_3956_pilon	+	1966	9	Intergenic	novelGene_14974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1120.1747003816	87	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	467	1447	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283871_1287435_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
890389	contig_14744_pilon	-	5121	4	Intergenic	novelGene_65994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	519.492273496173	549	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	72	581	969897	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969968	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_966419_968114_968630_969717
890390	contig_4083_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_152329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCTTTACCTCTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77115	79824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_77100_79800
890391	contig_16643_pilon	+	2135	4	Intergenic	novelGene_158134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	53.7215040742532	286	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	1067	1957	315671	318119	FALSE	15	GAGCAACTGCCTTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHGTPVLDIKPYIADYDSPQNLIEPLGDVNLQDNKHKPKTSFEFRSSGVTDNCDQQQLSGCVEPHPCTSTKEKPTCPEDRTSEEIHVEHDDTAKIRHSLKHGEEIAAGYGSESRSDQSLSVAEKQVGSCHQEKSFSEEGTDKRSRRGQEAAILRGNSVQTEPGALRYPSGAADEARHSVVPAWVRDAPVTTLEVRFTPHAEMDLRHLSSDVGQTAFKYFQSAEEAKHAIEAVLSADPRSVYRRKLCQDRLFYFTVDIAHVTCWFGDGFAEVLRIQHASEPVQMTDPAESLVSLGS	305819	318297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306699_314690_314849_315641_316302_317859
890392	contig_6842_pilon	+	3236	13	Intergenic	novelGene_130682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_9	182.789724364728	994	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	15	2135	347594	415814	FALSE	30	AAAAAGGCTTTACTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKYLLERQEREIETFDVESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR	347579	416915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043_408257_414417_414601_415652
890393	contig_13863_pilon	+	1632	7	Intergenic	novelGene_42096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_6	311.488585487316	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	358	1320	479313	490279	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	478955	490591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
890394	contig_500_pilon	-	4231	1	Intergenic	novelGene_30984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3102	3458	1472041	1471685	NA	25	ATAGTTGTTTCTATGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLHIDQEAVVGTEQGDTACLKSGKMCQGCILSPYLFNLYAEPIIQEAGLYKEELGIRIGGRLTNNLICR	1475142	1470911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1470900_1475100
890396	contig_18081_pilon	+	1625	4	Intergenic	novelGene_23775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	40	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	76	627	90717	112338	FALSE	25	CAGCTGGGCCCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90641	113336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
890397	contig_16125_pilon	+	1651	15	Intergenic	novelGene_155237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCAAGGTAAATAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117222	235869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_117615_118857_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138993_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_153471_153486_155566_155618_179440_179596_235794
890398	contig_4088_pilon	+	3408	4	Intergenic	novelGene_178061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGATTTCAGAAATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73310	112163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_74543_90778_90858_91506_91858_110417
890399	contig_1719_pilon	+	763	3	Intergenic	novelGene_87363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTTGTCAGGGCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754672	774164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_755020_773533_773678_773892
890400	contig_6842_pilon	+	1931	11	Intergenic	novelGene_130684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_7	176.953779275832	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	126	1901	371958	415814	FALSE	70	GAAAAACAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKYLLERQEREIETFDVESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR	363475	415844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043_408257_414417_414601_415652
890401	contig_13937_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_167364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGGACCTGAGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104964	105817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_105000_105800
890402	contig_4232_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_63274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAATCCAGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467192	465993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466000_467200
890403	contig_10861_pilon	-	2736	2	Intergenic	novelGene_39284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1334	junction_1	0	386	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	710	1132	1355171	1354749	FALSE	10	CCAGTGGTTTGTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERYNIPVPQSRNVSKNQQQLNRQKTKDQNSQMKIVHKKKERGHGYNSPAVAWQAMQNGGKNKVHFPNNQNWNSSLSSPSLLFKSQTNQNYAGAKFSEPPSPSVLPKPPSHWVPVSFNPSDKEIMTFQLKTLLKVQV	1356803	1353144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1355727_1356649
890404	contig_8820_pilon	+	4570	4	Intergenic	novelGene_79292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3849	4235	170276	170662	FALSE	5	GGCGCCGCCATGTCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMSAPACKASMNALVPDLAMVPRLLIKSALVIPIPVSTIVRVRSCLFGMRLICSSFPESSLLGSVKLSYLILSNAYCKKHGIVKHTVPKAWTFRLKRKPNGGLTRDLHLMNLKSAPSEKSLCSNRKY	165789	170997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_166548_166838_167804_168032_168178_168295
890405	contig_7870_pilon	-	1261	7	Intergenic	novelGene_108916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_1	391.252263039249	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	240	785	496465	217271	FALSE	80	CAGAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTK	497931	216794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
890406	contig_5039_pilon	+	2796	2	Intergenic	novelGene_64978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1104	2096	1679067	1680059	TRUE	10	TTTCACCGTTCAGCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1677963	1683017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680625_1682882
890407	contig_5779_pilon	-	6064	7	Intergenic	novelGene_106482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	321	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCAGATACCTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434731	150848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_153270_153377_153464_153952_154937_254629_254713_342848_343382_393501_394044_433316
890408	contig_4604_pilon	+	7118	18	Intergenic	novelGene_19148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1064.59672173589	80	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	3734	6037	358980	379856	TRUE	30	CACCACTAGCACCCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	355246	381088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_380024_380174
890409	contig_11326_pilon	-	4705	3	Intergenic	novelGene_173913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	708	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCGCCCGCCCCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164297	147276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_-_147636_155266_155336_160020
890410	contig_3081_pilon	-	3694	1	Intergenic	novelGene_133926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	3238	3693	181718	181263	NA	40	TGTCAACAACTATAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNI	184955	181261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_181300_185000
890411	contig_15410_pilon	-	3492	2	Intergenic	novelGene_130594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGAGAGGACGCAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289376	136475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_138488_287896
890412	contig_13300_pilon	-	2448	3	Intergenic	novelGene_125759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTTGGCTCTCTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47387	44708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_44811_44924_46746_46862
890413	contig_4402_pilon	+	6578	15	Intergenic	novelGene_140837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	800	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592184	613953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_593745_594178_595931_596734_596838_597127_597498_599323_599387_600516_600577_600687_600763_600896_600994_602002_602341_602446_602549_603815_603994_609496_609636_610039_610134_610248_610346_612403
890414	contig_4686_pilon	-	6808	42	Intergenic	novelGene_118561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	58	junction_41	402.449515014782	590	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2162	6486	323	6808	883895	642119	FALSE	40	GTAAGGATAATCACCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRTVSRSRDIANVMQRLQDEQEIVQKRTFTKWINSHLAKRKPPMVVDDLFEDMKDGVKLLALLEVLSGQKLPCEQGRHMKRIHAVANIGTALKFLEGRKIKLVNINSTDIADGRPSIVLGLMWTIILYFQIEEVTSNLPQLQSLSSSMSSVDSTLSAETASPPSKRKVATKVQGNAKKALLKWVQHTVTKQAGIEVKDFGRSWRSGVAFHSVIHAIRPELVDLEKVKGRSNRENLEEAFTIAETELGIPRLLDPEDVDVEKPDEKSVMTYVAQFLKHYPDIHSTAVDGQESDREDRPVLKEMKVWIEQFERDLTKAQVTESNLQDKYQSFKHFRVQHEIKRKQIEHLIQPLHRDGKLSLDQALVKQAWDRVSSRLFDWHIQLDKSLPAPLGTIGAWLYRAEVALREEINIQQVHEETANTIQRKLEQHKDLLQNTDAHKRAFHEIYRTRSVNGIPVPPDQLEDMAERFHFVSSTSELHLMKMEFLELKYRLLSLLVLAESKLKSWIIKYGRRESVELLLQNYTSFIENSKFFEQYEVTYQILKQTAEMYVKADGSVEEAENVMKFMNETTAQWRNLSVEVRSVRSMLEEVISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKMLSQTEHAKKDFFRNLPHWIQQHTAMNDAGNFLIETCDEMVSLDLKQQLLLLNGRWRELFMEVKQYARADEMDRMKKEYADCVKTLSAFATEAQRKLSEPLQVSFMNVKLLIQDLEDIEQRVPVMDAQYKMITKTAHLITKESPQEEANEMFATMSGLKEQLAKVKECYSPLLYESQQLLIPLEELETQMTSFYDSLGKINETITILEHEAQCSALFKQKHQELLDCQESCKKTLTLIEKGSQSVQKFVTLSNVLKHFDQTTLHRQIADVHVAFQNMVKKTGDWKKHMETNSRLMKKFEESRAELEKVLQIAQEGLREKGDPEDLLRRHTEFFSQLDQRVLNAFLKACDELTDILPEQEQQGLQEAVRKLHKQWKDLQGEAPYHLLHLKIDVEKKRFLASVEECRTELDRETKLVPQEGSERMIKEHRIFFSDKGPHHLCEKRLQLIEELCLKLPMRDPVRNTPETCHTALRELREAIDSTYEKLVGDPDKWKDYTSRFSEFSSWISVKETQLKEIKDGTIDTANHGEVKRDVEEIRNGVTEKGETLSWLKSRLKILIEVSSETEAQKQGDELAKLSNGFKALITLLSEVEKMLNNFGDRVQYQEIVKSSLEDLISGSKEVQEQAEKILDTENLFEAQQLLLHHQQKTKRISAKKRDVQQQLAQARQGEGGLRGRAREELQQLQSTLDSVEHSREKQERRIQVTLRKWERFETNKETVVRYLFQTGSSHERFLSFSSLESLSSELEQTKEFSKRTEGVAVQAENLVKEASEIPLGPKNKQLIQQQAESIKEQVKKLEGTLEEDIKTMEMVKSKWDHFGSNFEALSVWITEKEKELNALESSSSALDVQISQIKVTIQEIESKISSITGLEEEAQSFAQFITTGESARIKAKLTQVRRYWEELREHAQCLKAAILGHLSQEQQFEENLRKIQQSVSEFEAKLADPVKICSSATETYRVLQEHMDLCQALECLNGTVTAFSASARKVVTRESSVQEAAALRQQYEAMRSRAKERQTALESRLAHWQRLEKELSTFLTWLERCEAIASSPEAGISADRVKVEGELQLIQALQSEVVSQASLYSNLLQLKESLFSVASGEDVKMMKLHLEQLDERWRVLPQIISKRINFLLSVVAEHQQFDELLLSFSVWIKLFLSELQTTSEISVVDHKAALIRHKDHAAEVESKKGDMKSLQGYLAKLASLGCADDLHLLQGKVEDCFQLFEEASQVVERRQLALCQLAEFLHSHASLSGVLHQLRQTVEATNSMNKKQSDLLEKGLNDAIQDAKTLESTAIGLDGVLTKAQYHLKSGSSEQRTSCRAMADQLCLELERIQNLLGTKLSEADALAVLKKAFLDQKEELLKSIEDIEERTDKEQLKEPTQQALQQRLRVFNQLEDELNSHEHELCWLKDKAKQMAQKDTAFAPEVDREINRLEVTWDDTKKLIHDNQGQCCGLIDLLREYQNLKSVVSKVLENSSSVIGTRTTIKDQEDLKWALSKHEAAKNEMNKKQKEFDNFTSKGKHLLSELKKIHSSDFTLVKTDMESTVDRWLD	893342	642118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_642278_642653_642805_645697_645878_648547_649177_650779_650934_652283_652451_657320_657445_658173_658362_660058_660158_660543_660772_663935_664087_666063_666225_670841_670983_671783_671955_674157_674326_677562_677728_679611_679721_680518_680728_680940_681100_683455_683591_685988_686154_686655_686815_688665_688840_691616_691761_693116_693270_693738_693904_696208_696412_697389_697487_702940_703110_703635_703749_730376_730542_731768_731907_734644_734753_741402_741513_745629_745827_751563_751743_753719_753813_760282_760367_767767_767864_788890_788953_883831_884109_893233
890415	contig_2783_pilon	-	2113	3	Intergenic	novelGene_119648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	42	564	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	71	658	517573	509193	FALSE	30	CTGAAGGCATTGTTACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREEEAASFRALPKPGPTFASEIMAAEDVVATGADPGELEGGGLLHEIFTSPLNLLLLGLCIFLLYKIVRGDQPAASGDSDDDEPPPLPRLKRRDFTPAELRRFDGVQDPRILMAINGKVFDVTKGRKFYGPDGPYGVFAGRDASRGLATFCLDKEALKDEYDDLSDLTPAQQETLSDWDSQFTFKYHHVGKLLKEGEEPTVYSDEEEPKDENDRKND	517643	507737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_509297_512463_512620_517245
890416	contig_6217_pilon	-	2574	2	Intergenic	novelGene_109652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	696	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	186	1049	739958	739095	FALSE	85	AAGAAAGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKRRGAGGREEPSLAKAAQTLAAERRESRHRFSCGRSVGAGRRPAGGGFSARALRAAPGKMKDRLAELLEYSKHYDQQFPDGDDDVGSPDEDIVFETDHILESWYRDIQNLQNENQQLTADVKRLGKQNTRFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKDIKARGEAIHRKLLTMKKLCEEAEAQHGAHSAVGRISRAHYNALTRAFQDAMHEYNQAEMKQCANCKIRIQRQLEIMGKDVSGDQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIENRHRELLRLESRIRDLHELFLHMARLVEEQAETLNVIEFNVLETCDYVGQAKAHVRKAVQYKKKNPCRTLCCCCCPCVN	797300	737569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_739964_797120
890417	contig_6227_pilon	-	4772	17	Intergenic	novelGene_49624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	224.275221547098	1349	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2862	218	3079	398743	341366	FALSE	40	AAATCCATGGATGAACGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLWSQEKVTSPYWEERIFYLLLQECSVTDKQTQKLLKVPKGSIGQYIQDRSLGHSRIPSAKGKKNQIGLKILEQPHAVLFVDEKDVVEINEKFTELLLAITNCEERFSLFKNRNRLSKGLQIDVGCPVKVQLRSGEEKFPGVVRFRGPLLAERTVSGIFFGVELLEEGRGQGFTDGIYQGKQLFQCEEDCGVFVALDKLEIIEVDDTGLESDYAGPVDTMQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPDSVTQERRPPKLAFMSRGVGDKGSSSHNKPKPTGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQKVQDCYFYQIFMEKNEKVGVPTIQQLLEWSFINSNLKFAEAPSCLIIQMPRFGKDFKLFKKIFPSLELNITDLLEDTPRQCRICGGLAMYECRECYDDPDISAGKIKQFCKTCNTQIHLHPKRLNHKYNPVSLPKDLPDWDWRHGCIPCQKMELFAVLCIETSHYVAFVKYGKDDSAWLFFDSMADRDGGQNGFNIPQVTPCPEVGEYLKMSLEELHSLDSRRIQGCARRLLCDAYMCMYQSPTMSLYK	405864	339672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_344676_344786_345745_345879_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_359403_359521_361757_361857_392432_392539_395032_395336_398239_398898_405801
890418	contig_6509_pilon	-	4228	5	Intergenic	novelGene_145626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_4	49.9668640200683	19	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	2738	4228	74414	72456	FALSE	70	GAAAGAAAGAAAAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEKLRLYKD	79746	72455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_78084_78289_78461_78933
890419	contig_9839_pilon	+	512	3	Intergenic	novelGene_88529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3525	junction_1	624.5	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	111	380	57778	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	57667	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_57850_59824_59927_61264
890420	contig_12677_pilon	-	782	1	Intergenic	novelGene_110814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTTTTAGTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
890421	contig_14101_pilon	-	2044	2	Intergenic	novelGene_122749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	818	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGTCTGGATTCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77739	75633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_76918_76979
890422	contig_11258_pilon	+	2411	8	Intergenic	novelGene_67777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	192.309062475496	3147	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	721	1179	285721	292582	FALSE	35	TGGTATTACAACCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	278960	293814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_278995_279146_279351_283717_284123_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
890423	contig_1264_pilon	+	978	9	Intergenic	novelGene_161321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	143191	143614	TRUE	5	CCGCCTCCGCGCATGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKGLYGFIKLTKYSEISFILVVFFTFHADIHNLEDVVVGTQLQIAHIDLSVITKKILSKLSYFFWPGCTPHQGLSIRPDLVNNFTDLGFKAHIKHSVCLIQYKVSTSAKICLS	143190	152581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_+_143422_143503_143667_144046_144187_145468_145535_146151_146289_147450_147549_148218_148276_148319_148370_152545
890424	contig_7151_pilon	+	2826	6	Intergenic	novelGene_40726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_3	120.12393599945	179	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	203	853	502420	507901	FALSE	45	CCATTGAACCTAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSKSSASSCTEEGFFSSQVFVWTAAGVSILLLSACFVTRCVVTYHTFQLCDEENFQPHENITELSCYNDGSGSVKNCCPVNWEHFQSSCYFFSTNTMTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502217	509874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505440_505593_506568_506685_507738
890425	contig_20602_pilon	+	1751	12	Intergenic	novelGene_133708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1736	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTCGCCCCCAGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9675	29534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_+_10090_13343_13515_17102_17274_19178_19327_19761_19855_21146_21278_23426_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26554_28880_28948_29482
890426	contig_16303_pilon	-	2791	7	Intergenic	novelGene_34033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_5	506.445373822949	782	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	96	1220	47976	33093	FALSE	50	AAAAAGATACAATTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKAALED	48071	31521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
890427	contig_11318_pilon	-	2121	18	Intergenic	novelGene_48145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_17	1041.02433252045	30	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1716	404	2119	49795	14983	FALSE	65	GGAAGAAGAAAAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEE	58231	14980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_52071_52142_52436_52520_58143
890428	contig_6227_pilon	-	3784	2	Intergenic	novelGene_49781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2157	2501	1236514	1236170	TRUE	20	ATACTTTGTATCTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVWAEAISGLSVGGQSLTAPAAPRRCSLYQSYKRGIAKLMSEACSQQYMEMTQPALSTCSMNQHLRYFHVWTEAWTEALSQSSQGRGVARGAAQETLVNWLRRQTNEDVDRN	1238670	1234792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1235629_1235722
890429	contig_567_pilon	-	5010	27	Intergenic	novelGene_34004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTGTACCATGCCAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656814	603762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_604274_613465_613647_615307_615569_616358_616475_618295_618542_629211_629306_629870_630009_631984_632103_632774_632947_635944_636021_636374_636486_638169_638307_638915_639356_640637_640816_641257_641405_643230_643348_644443_644686_645324_645414_647346_647430_649002_649060_649752_649830_651516_651586_652502_652658_652768_652911_653595_653711_654922_655088_656041
890430	contig_2799_pilon	-	4818	3	Intergenic	novelGene_85591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	4448	4816	781803	780338	FALSE	5	CCCTCGGGTACTCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGS	786317	780335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781547_785277_785343
890431	contig_11281_pilon	-	1292	3	Intergenic	novelGene_125442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1403	junction_1	128.5	20	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	44	328	808758	798705	FALSE	15	CCGACTGGGGCTGATGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	808801	797740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733
890432	contig_16091_pilon	+	3916	10	Intergenic	novelGene_112338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_2	253.019103363099	1225	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	313	1194	14294	37985	FALSE	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVEHYSYKPDGLLRVLTVPCQKIGADNGNINFGARPQLSSSHSVTWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKTPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	1462	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_1548_1933_1984_3659_3729_12750_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912
890433	contig_7357_pilon	-	2273	10	Intergenic	novelGene_36791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1973.93035888513	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	963	1391	139028	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKPGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167042	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_138970_139013_139060_139775_139973_154582_154721_154861_155066_159911_160034_166772
890434	contig_12150_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_6960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60444	61308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_+_60400_61300
890435	contig_3601_pilon	-	3544	1	Intergenic	novelGene_132853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1732	2037	130167	129862	NA	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131898	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_128400_131900
890436	contig_11816_pilon	+	4862	6	Intergenic	novelGene_98572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTGAATTTCTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279955	1390501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1280348_1284823_1284965_1286533_1286667_1302508_1303156_1312057_1312173_1387067
890437	contig_6304_pilon	+	2655	7	Intergenic	novelGene_122250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_4	208.632385362921	55	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	93	905	128711	180531	FALSE	10	TTTTCTCATCTGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGAPVELCGREYPPLPFSNAQVQGQPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGNSQYGQQQDAYQGPPPQQGYPPQQQQYPGQQGYPGQQQGYGPSQGGPGPQYPNYPQGQGQQYGGYRPPQPGPPQPPQQRPYGYDQGQYGNYQQ	110483	182281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_110561_128695_128850_132145_132368_161430_161599_167002_167126_168549_168684_180504
890438	contig_8377_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_35051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACAGCTACATAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91782	92861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_91800_92900
890439	contig_14142_pilon	+	3490	10	Intergenic	novelGene_120505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	660	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	11	334	337700	338023	TRUE	10	TGGCTACCATTTTTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSLFHLAPLTAAGTSAISTPFRLDLPEQELPHPSLRLCLSHPLSPLLLPSNWGPGDSQDGGGRQLQAPSPFHCLGSVLWGQKGRGEVGGQGKTFVQKRQEAGNCC	337689	349105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_338467_338609_338718_338824_338941_339075_339165_339486_339620_339798_339865_343475_344509_345354_345464_345567_345789_348267
890442	contig_15732_pilon	+	5083	4	Intergenic	novelGene_88923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_2	46.5403051128804	1576	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4592	4924	397980	398570	FALSE	30	GCACTGGCACTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLKIEIKFEFKDFDVVELYNDCISCKTVDHLARCLYKAIFSMAMKDNYAFVMFLCSALKWRNANSVSFFYSFLLDPKLKKNLVSPAGKITKEGYYKETQESASIVFSG	380619	398729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_380982_386711_386776_393814_398263_398520
890444	contig_10042_pilon	+	5326	6	Intergenic	novelGene_79235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	146.077513669969	1529	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	174	839	1187799	1213307	FALSE	20	GAAATTTTGTTTTCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGAQLTSLFPLPASVVAREAPSALLHGVHRGARVSGGGGEPVGSGSWSGGSGPRCRMATAGRMNIQLLLEAADFLERREREAEHGYASMLPYNNKDRDALKRRNKSKKNNSSSRSTHNEMEKNRRAHLRLCLEKLKGLVPLGPESNRHTTLSLLTKAKLHIKKLEDCDRKAIHQIDQLQREQRHLKRQLEKLGIERIRMDSIGSTVSSERSDSDREEIDVDVESTDYLTGDLDWSSSSVSDSDERGSMQSLGSDEGYSSSSIKRIKLQDNHKTCLGL	1187625	1217794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1187872_1188564_1188665_1194072_1194103_1210580_1210696_1212654_1212815_1213119
890446	contig_5988_pilon	+	2442	9	Intergenic	novelGene_15838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACGCCGCAGGACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241614	260293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_242384_243167_243288_249400_249658_253927_254024_254688_254861_255239_255400_257593_257709_258760_258939_259718
890447	contig_15112_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_124761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCATACATTTACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25496	24044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_24000_25500
890448	SIRV6	+	739	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	514	223	341	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	89	580	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1644	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
890449	contig_3866_pilon	-	3419	1	Intergenic	novelGene_112432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATGATATATTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247719	244300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_244300_247700
890450	contig_6589_pilon	+	3219	16	Intergenic	novelGene_25731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	55.7209715158186	305	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	173	1621	460735	507033	TRUE	25	GCAAAGTCATACTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	455369	510993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_455478_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
890451	SIRV7	+	945	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27661	12	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTAGTAAGAAAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56037	147957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679_114993_147610
890452	contig_10734_pilon	+	2615	17	Intergenic	novelGene_51417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_16	74.4166637504665	443	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	106	2373	2116886	2156004	FALSE	40	AGTGCAAGTGTCAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVHESLYFNPMMTNGVVHANVFGIKDWVTPYKIAVLVLLNEMGRTGEGAVSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2116780	2156246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
890453	contig_17144_pilon	-	2291	16	Intergenic	novelGene_29259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1755.19261874271	81	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	108	2207	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183189	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166332_167622_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
890455	contig_6102_pilon	-	4389	2	Intergenic	novelGene_32137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1066	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACAGAAGAAGCCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835111	830485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_831838_832074
890456	contig_10331_pilon	+	2824	5	Intergenic	novelGene_54201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	295	junction_2	107.143303570499	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	339	416	637613	639267	FALSE	15	ACGTTTTGCCACCTATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGVCGALFIGYCIYFDRKRRSDPNFKNRLRERRKKQKLAKERAGLSKLPDLKDAEAVQKFFLEEIQLGEELLAQGEYEKGVDHLTNAIAVCGQPQQLLQVLQQTLPPPVFQMLLTKLPTISQRIVSAQSLAEDDVE	628102	641675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_628202_631089_631137_633179_633262_637502_637646_639222
890458	contig_14666_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_39646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATTAACTAGAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485127	487006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485100_487000
890459	contig_4180_pilon	+	4154	8	Intergenic	novelGene_8288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	2142	2570	570756	571184	TRUE	40	TCTTCTTAAAACCACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRLINNLQYADDTTLFAKSEEDLKCLLMKIKDYSLRYGLHFNIKRTHLLTTGPISKIMINGEKIDVIKDFTLLGSTINTHGSSSQEINQHIALGKSAAEDLFEVLKSKDVTLRTTMCLTQAVIFSVTSYPCEIWTMNKED	132782	623053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_133299_234047_234383_337118_337851_520643_521096_570649_571187_572412_572796_577658_578194_622389
890460	contig_11846_pilon	-	1501	2	Intergenic	novelGene_105962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	459	956	291816	290118	FALSE	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	292274	289572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706
890461	contig_854_pilon	+	2331	14	Intergenic	novelGene_36510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	2460.04656472021	39	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	173	1720	1649514	1715794	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQAGHRGPAGTASSLPALLPILSGTKSI	1612773	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685162_1715713
890462	contig_4857_pilon	+	1384	4	Intergenic	novelGene_48850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	133	junction_3	56.1090208631573	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	41	379	1331453	1410064	FALSE	25	TCCTACTTTTTATTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYILSVKSLIDVISDMRWNLEHILPERYFYHKVCHLITWIPCAKKPAVKEEIIIVPGVIDPAHQEEVFSLKKVRRLLPSLHHSDSDWKQLLPLSCAKISAKGSYPGQKGVF	1331412	1411069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013_1407076_1409988
890463	contig_6898_pilon	+	2673	13	Intergenic	novelGene_35718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2285.18607314347	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	113	1669	59668	126699	FALSE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTPPARMIGTGTQKPSQPHSGIFSKREEMFTPGFSIFPAKGPPDHFPHQSYLGHSSCFSTI	59555	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_124817_126520
890464	contig_4654_pilon	-	1418	8	Intergenic	novelGene_103101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	828.695606458285	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	191	511	500418	499009	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVHLVFR	515980	494405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_496837_497031_497816_497941_498805_499030_500118_500422_515793
890465	contig_10003_pilon	-	1930	2	Intergenic	novelGene_88193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2017	junction_1	0	110	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGGCATCACTCTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473541	470555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_472140_473195
890466	scaffold_880_pilon	+	7143	6	Intergenic	novelGene_121417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	404.127900546349	105	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	88	495	352652	424949	TRUE	25	CTTTTCTATACTTAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLPSSERRAFALKINRYSSAEIRKQFTLPPNLGQCPRQSISTAGFPSLQLPQFYDPVEPVDFEGLLMTHLNSLDVELAQELEDFTDDDPDVVFTPKECRTLQPSLPEEGVELDPHVRDCVQTYIREWLIVNRK	352564	438527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_352705_406896_407000_420188_420365_424873_429702_432666_433598_437562
890467	contig_6533_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_114623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTGCTGAAATTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24391	25827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_24400_25800
890468	contig_12019_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_87773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	657	1169	702425	701913	NA	50	AAAAAGTTCACAAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGSNKCWRGCGEIRTLKHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKPEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTNEWINKLWYTHTMEYYATRKNNDESVKHFITWMKLEDIIFSEISQSQKDKYCMRLLL	703081	700734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_700700_703100
890469	contig_10042_pilon	+	4638	9	Intergenic	novelGene_79105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	244.292825058371	934	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	10	1680	6321	53427	FALSE	25	CTAAAAATTTGTTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	56385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
890470	contig_16103_pilon	-	2844	5	Intergenic	novelGene_118820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2305.39653584801	10	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	50	502	743628	734409	TRUE	15	GACCTGCTTGACTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLTSVKCASFIGIQTLCILALEGPAPHMLCGRGRRVVACSDYLGTPLPQDALQLSLHIGSIHVYMCLSLPFFILFLFPFPLL	743677	722275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_734654_737553_737630_743496
890471	contig_3394_pilon	+	4916	5	Intergenic	novelGene_152702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_3	186.076597131396	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3566	4087	518084	518605	FALSE	40	AATCTGGCAAGACAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTVLVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSDKRWHSYCLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKMEVNSESTALQR	504009	519434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_504573_507352_507548_507935_508125_511666_514071_517869
890472	contig_8914_pilon	-	2545	7	Intergenic	novelGene_112851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3000.91021839856	875	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	196	879	268130	264566	TRUE	20	TTATTTTCTCCAAAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNIRNIGKTLVTRTQGTKIASDGLKGRVFEVSLADLQNDEVAFRKFKLITEDVQGKNCLTNFHGMDLTRDKMCSMVKKWQTMIEAHVDVKTTDGYLLRLFCVGFTKKRNNQIRKTSYAQHQQVRQIRKKMMEIMTREVQTNDLKEVVNKLIPDSIGKDIEKACQSIYPLHDVFVRKVKMLKKPKFELGKLMELHGEGSSSGKATGDETGAKVERADGYEPPVQESV	268965	209470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_-_209986_263414_264688_264840_264951_265589_265799_267319_267508_268075_268189_268828
890473	contig_1804_pilon	-	1871	3	Intergenic	novelGene_177420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	87	683	569989	565127	FALSE	20	CGGTATGCATCAGCTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLYFLKLKKHWRVYHTRSRLDVNGLALKMAKERKVQDEIKCKADTEEECNNSAINQEEMSLSGVFPDISDPVIYNIRKKKENIHAQPQREENLCFENVFPLIDFLPINAVEPTSSSQISSREISEANKERKKTTSKSSESNIYSPLTSFITADSELCDIIKDLEDCLMVGLHTCGDLAPNTLRIFTSKREIKGVCSVGCCYHLLSEEFENQHKGTKLPLCHNFYII	572154	563938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_-_565316_569581_570060_572138
890474	contig_4114_pilon	-	2515	5	Intergenic	novelGene_15574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.29903810567666	138	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2106	2420	231494	53049	FALSE	60	TGTTCAAAAAATAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCKLLRPQALHTGGTPETMALRHPSNLELNPLPEITFQPNNKQAYKVNNNTHDESAPQNNQPHENKRAAFAQNQSSGGRKGQGRWANGNGEPGKEVGRVLSN	250455	52953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_53327_231457_232444_234099_234228_247833_247991_249584
890475	contig_3394_pilon	-	1051	1	Intergenic	novelGene_152708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514755	513704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_513700_514800
890476	contig_19098_pilon	+	5437	12	Intergenic	novelGene_65817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	40.3351660444668	84	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	134	1807	345322	404586	FALSE	20	CAGTCGTATTAACTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRGKRDLETPLLAQSCLEKLIFPGILAPASWRENGRRPCPWVAMNSAVTSCESPKLLESDDGVLDSHPDGQVRKKNGQPGTSSHLVYGIMDIPPWYLCIFLGIQHFLTALGGLVAVPLILAKNLCLQHDPLSQSYLISTILFVSGICTLLQVFFGVRLPILQGGTMAFIAPSLAMLSLPAWKCPEWMINASLVNTSSPEFTEEWQKRIRELQGAIMVASCVQMLVGFSGLIGFLMRFIGPLTIAPTITLVALPLFDSAGNDAGIHWGIAAMTIFLIVLFSQYLKNVTLPVPVYGGQKKCHTSKFHVFQVFPVLLALCTSWLTCFGLTVTDVLPSAPTAYGHLARTDTKGSVLSQAPWFRIPYPGQWGLPTISLAGVFGIIAGVISSMVESVGDYYACARLVGAPAPPRHAINRGIGIEGLGCLLAGAWGTGNGTTSYSENVGVLGITQYVDMNSSRNLFVFGFSIYCGLAIPNWVNKNSEKLQTGILQLDQVVQVLLTTSMFVGGFLGFLLDNTIPGSAEERGLLAWNQIQEESQETSKAFEVYGLPCGIGTKFCTSSCVQCLPFWPRLEGGGKGEVEVSSLTSCSTDCSGDRHKNRRTC	345188	408216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_345364_355805_355947_358015_358174_382756_382917_393940_394123_395034_395156_395416_395574_397037_397292_403128_403238_403357_403454_404278_404517_404570
890477	contig_6048_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_73172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	472	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCTAATTGCCCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1208710	1210798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1208700_1210800
890478	contig_3380_pilon	+	6723	7	Intergenic	novelGene_60125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_5	106.214798090159	373	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	488	1462	453563	462606	FALSE	5	CCCCACCCTCCTCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSVFKNYDHDQDGYISQEEFEKIAASFPFSFCVMDKDREGLISRDEITAYFMRASSIYSKLGLGFPHNFQETTYLKPTFCDNCAGFLWGVIKQGYRCKDCGMNCHKQCKDLVVFECKKRAKTPTAPAESSSSVGPVSSLGSLGARDLLHGPEEGPFTFPNGEAVGHSEESKDRTIMLMGVSPQKISVRLKRTVAHKATQTEPLPWIGGDSPSGPFVLSSPRKAAQDTLHLLPSPPSPCPSPVLVRKRAFVKWENKESLIKSKEELRHLRLPSFQELEQEINTLKADNDALKIQLKYAQEKIESLQLERSNYVLAQMEQGDCS	453075	467867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_453572_454444_454555_455360_455506_456179_456217_456914_457068_458949_459336_462471
890479	contig_6375_pilon	-	3770	8	Intergenic	novelGene_73035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_7	123.984692932768	912	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	10	2148	497798	479902	FALSE	45	AATCATATACAGAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEEASAESEDEMIHPEGVASLLPPDFQSSRERPELELSRHSPRKSSSVSEEKGESDDERPRKGERRSPRVRQARAAKLSECSQTAEEEEDQEAPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEEEEEEEEENEVQKSREAPILKQFEEEEEEEEMSRAKPEEVMDERPKTIRSQEEEGLEKGGRVTRSQEETRRSHLARHQQEKEMKTASPLEEKEREIKSSKGLEGNSKSPSPPQLTEDLEKVPLILQREQTASEEETLPPLLTKEPCSPSPNIQLRSEEEVDPVEGPAPPVLVQLSPPNADAEARELLVAQHTVRLVGGLSPLLSPTDTKVESPAEKMPEESVLPLVHKSTLAESSIQKGLETEPEKSAQPLPLKIEELAPPKGITEESLKQPSLEQKESKRASHTLRPSHSSKRSPDSSSSSRSSSSSSSTSRSRSRSPDSSGSRSHSPPRSKHRDGSRARSHSSPHSRLKMGSRSTSESRSRSRSHSRSRSASSNSRKSLSPRISRDSNTSYTETKDPSSGQEVATPPVPQLQVLEPKERTATSSSSIQVRRVSQPEPPEKHVRLQPEQGSPKKCEAEEAEPPAATQPQTSETQTSQQPESERIQHTV	497807	478279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_480022_480564_480778_481265_482547_483232_483322_489768_489889_490309_490422_496143_496210_497660
890480	contig_4825_pilon	-	2366	2	Intergenic	novelGene_178590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	435	824	248809	97933	FALSE	50	GAAAATATTTTTAATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGISLRSAQAKGRGPSRVALPDQKGLPTRERKRKQTNKQKPRDPTSMAAQTGKQFHIQMELCSPLGRSKDGTWSQVFEGKEGKVVRGKEEIKRSRKKQHQQPTNGTQGVGQCGRVGRMQQGDCYVWS	249243	96390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4825_pilon_-_97975_248461
890481	contig_12644_pilon	-	2095	13	Intergenic	novelGene_44479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	473.32801493491	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	8	850	1151228	1043285	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRLKRN	1151235	1025889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
890482	contig_5236_pilon	+	2769	18	Intergenic	novelGene_100884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_9	116.760660768575	511	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	96	2213	62791	84085	FALSE	0	GCCGTGTTGCCCTCGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNGWQTEPSGFLRNVGQLFECHLLPPTDVRMTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60630	84641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
890483	contig_7426_pilon	+	2409	3	Intergenic	novelGene_27551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACCCCCTCCCCGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158045	1185860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1160247_1163544_1163676_1185783
890484	contig_19727_pilon	-	2094	2	Intergenic	novelGene_168987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56117	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032
890485	contig_13456_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_153266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGCCGTCCAGTCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26559	27992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_26600_28000
890486	contig_1442_pilon	-	4254	4	Intergenic	novelGene_172170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	315.94232947732	1138	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3732	4091	626912	626553	FALSE	80	CTACTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLTVSSSNTSDLGVCQGLPCFPKGVSGFIPVVGGKKLTPSLILVLSCSSCSCRSFPLPQSSYRNCSHQIFGGHVSSPEASAVSAMYHHSLLRAIARGTPACKVELWAQFQVQSCQLW	642377	626389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_630284_631653_631715_636566_636772_642283
890487	contig_9406_pilon	-	4321	18	Intergenic	novelGene_136143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	572.154387904712	15	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	925	2778	679	3456	63329	34784	TRUE	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGKSTDEVDSKRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEILGRIQDKHKKLPEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQEDAARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKALLDACEGRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLWMEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	64007	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34128_34362_35003_35741_35785_37596_37771_38922_38985_39032_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51387_57753_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329_62420_63104
890488	contig_6137_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_59286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354909	1352649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1352600_1354900
890489	contig_6217_pilon	-	5486	37	Intergenic	novelGene_109605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_29	334.558197478406	793	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1787	5361	126	5486	559453	363073	FALSE	50	ATACAGAATATGTTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPVTTTFRWKTYRFDLPGQVALQACRRLPDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPISDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVDLVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKILLSWVRQSTRPYGQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTQRLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQQVTIDDIREVETLPRKYKKECEEGEINIQSTVPEEERESPRAETPSTVTEVDVDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDNVEEVKDQFAIHEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLTDEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDVLMELQKRQLQQLSAWLTLTEERIQKMEACPLDDDLQSIQKLLEEHKSLQNDLETEQVKVNSLTHMVVIVDENSGENATAILEDQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLREINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEEALNKVQTSNFKDQKELSVSIRRLAILKEDMEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGGLPAEEIKNTLEKVLSEWKRQSQHLEDLARKIQLQEEINSYFKQLDELEKTIKKKEEWVKHTPFSEPPQQSLPSLKDSCQRELTNLLGLHPKIEMLLASCLALKSQLSAPDFVQKSLDSFLGRYQALQRDLEDRQQQLENELKSQPGREYLETMKTLKDTLNDSENKAQASLSVLNDLAKVEKTLQEKKALDEILESQKPTLYKLAEETKALEKNAPPDVENTYRQEFDAVEGKWNKLKAKVSKDLYLLEEITPKLRTFETDSEAIAKWMDGVKDFLKKERAAQGDADGLQRQLDQCSAFVNEIEAVESSLKDMKEIEANLRSCPVAGIKTWVQTKLSEYQTQLEKFSKEIAIQKNRLSESQEKAVNLKKDLAEMQEWMAQAEEEYLERDFEYKSPEELESAVEEMKRAKEDVLQKEVRVKILKDNIKLLATKVPSGGQELTSELNVVLENYQLLCNRIRGKCHTLEEVWSCWIELLHYLDLETSWLNALEERMKSTEVLPEKAEAVSEALESLESVLRHPADNRTQIRELGQTLIDGGILDDIISEKLEAFNSRYEELSHLAENKQISLEKQLQVLRETDHMLQVLQESLAELDKQLTTYLTDRIDAFQVPQEAQKIQAEISAHELTLEELRRNMRPQPSTSPDGRTTRGGSQMDVLQRKLREVSTKFQLFQKPANFEQRMLDCKRVLDGVKAELHVLDVKDVDPDVIQTHLDKCMKLYKTLSEVKLEVETVIKTGRHIVQKQQTDNPKGMDEQLTSLKVLYNDLGAQVTEGKQDLERASQLARKMKKESASLSDWLSVTEAELVQKSTSEGLLCDLDTEISWAKNVLKDLEKKKADLNTITESSAALQNLIEGSETILEEKLCVLNAGWSRVRTWTEDWCNTLMNHQNQLEIFDGNVAHISTWLYQAEALLDEIEKKPASKREEIVKRLISEVDDANLQVENVRDQAIILMNARGGSSRELVEPKLAELNRNFEKVSQHIKSAKLLIDQEPLSYQYLVGTEAFEAGPPSSDLDRLESD	559578	363072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_363175_365507_365679_365971_366101_367307_367488_372128_372300_378275_378432_381393_381568_385955_386085_387012_387175_394367_394518_396315_396451_401238_401419_403360_403532_405744_405901_406545_406660_419704_419918_420541_420688_422340_422522_422682_422925_433377_433466_435488_435613_439647_439818_442456_442637_442733_442842_446014_446117_448529_448650_450336_450488_451198_451381_452301_452506_463055_463217_463889_464006_464380_464554_466580_466674_467013_467092_468429_468523_494619_494682_559359
890490	contig_9733_pilon	+	2361	6	Intergenic	novelGene_160571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_3	171.406650979476	383	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	79	765	6632	13736	FALSE	35	GGTTTTACTCTTAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIPFLGAGIKIHEKRVSENLRPFHDRMEECFKNLKVKVEKEYGVREMPDFDDRRVGRPRSMLRSYRQMSIISLSMNSECNTPSKPTLESFNLELAAPKTPKAEQEELFSPGSTLPEVKLRRSKKRSKRGSVVFADEKAAAELELKRLSRKHEFMSDTNLSEHAAIPARTSVLSEMSFASQSMPTIPGLTFSVAGGPGLDEVSTSSRLSQTFLHLLDGDKKTLKRKKVNQFFKTMLTSKSTEEGKQIPDFLPTDL	6553	15332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9733_pilon_+_6695_7597_7723_9171_9344_10827_10949_12534_12678_13673
890491	contig_6445_pilon	-	2352	16	Intergenic	novelGene_76905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	877.122467060457	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1424	2122	74005	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	91789	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74118_80519_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_89993_90046_91007
890492	contig_20878_pilon	-	2110	1	Intergenic	novelGene_173434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	648	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2110	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_-_0_2100
890493	contig_10722_pilon	-	1394	3	Intergenic	novelGene_70973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.5	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	553	963	7774	4150	FALSE	30	ACTGCTTCAAATATCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILFKHFRIWTFEMQIIYLSYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	8561	3718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4508_7721_8262_8496
890494	contig_13633_pilon	+	1942	12	Intergenic	novelGene_15327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	445.263020050839	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	731	1636	28398	49142	FALSE	35	TTCTGTGTGATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	20291	49448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_20313_21641_22177_22774_22866_23724_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
890495	contig_18108_pilon	+	2908	9	Intergenic	novelGene_33477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	253.235284616895	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	340	1041	244438	260242	FALSE	15	TTACTAATTTTCTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIARHRRGKTLSHTGQGRDESPLQRMK	226791	262109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_232751_232919_244349_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997_260113_260162
890496	contig_13863_pilon	+	1616	6	Intergenic	novelGene_42006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_3	364.845940089786	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1023	1490	75897	81541	FALSE	10	AGTGTGGTGGTGTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	72410	81667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
890498	contig_9161_pilon	-	2744	6	Intergenic	novelGene_160634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGCTGACACCAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64938	52540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_53061_54191_54331_54664_54841_56679_56802_60938_61069_63281
890499	contig_16622_pilon	-	2332	4	Intergenic	novelGene_48482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	831	junction_3	1049.29383661373	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	141	695	115540	113571	FALSE	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQVWGFCRVLGAEDPGGQLWGAMEPATHFPGIPKAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQGILLGGLRST	121380	111933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115559_118811_118884_121330
890500	contig_11825_pilon	+	3112	6	Intergenic	novelGene_155413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	32	junction_5	93.5628131257285	29	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	76	705	89110	118192	TRUE	80	GAAAATTAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHVKLLGPSSERTTPAFHPVCQVIAMYDYVANNEDELNFSKGQLINVLNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMDDLQLVLEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKVIPFRASQISLLA	88262	120673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_88321_89092_89285_113223_113346_116748_116856_117966_119186_119259
890501	contig_14666_pilon	-	1877	1	Intergenic	novelGene_39642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	737	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTCCAGCTGATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486859	484982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_485000_486900
890502	contig_10674_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_6460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCTTAGTGATACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345790	343032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_343000_345800
890503	contig_3700_pilon	-	1612	2	Intergenic	novelGene_138064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTACAAGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216930	133566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_134170_215921
890504	contig_16594_pilon	-	3959	9	Intergenic	novelGene_53829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_8	2277.09936102929	34	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	361	1230	165546	121101	TRUE	20	CATTGGGCCAAATCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306304	115839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306046
890505	contig_3111_pilon	-	3722	15	Intergenic	novelGene_129959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	154.629709107841	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	1627	2958	22919	16585	FALSE	25	GGAGACTTTCTGATGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQLTFSLPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	40586	15820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_23289_24071_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964
890506	contig_10323_pilon	+	4638	2	Intergenic	novelGene_123618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	612	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1419	1742	473519	473842	TRUE	10	GGGTGGGGAAGCTCCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLRSLSGRTSHPERQGWLQTSWACYETPRILQGIKYNSRQNQNDLKDQDYSAFPLTQSPGGTMAESLPANRKVGSLNPSAAPWKPYTVTTSWNRLDGNGSGFLVLL	472100	476857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_476229_476347
890507	contig_20234_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_174325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTGTGGTCCGTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163736	161120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_-_161100_163700
890508	contig_11417_pilon	+	5518	13	Intergenic	novelGene_103319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1513.76566878761	139	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	1781	3343	566123	586628	TRUE	5	TTCATGTTTGTGTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVTDKFLSAIISSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARDIRNQRRYRQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	564342	588848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_566182_566276_566362_567428_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597_570686_572533_572747_573469_573637_575930_576054_583804_583914_586514_588446_588490
890509	scaffold_2602_pilon	+	4059	16	Intergenic	novelGene_127685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_5	439.948613160926	709	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	302	2416	25608	68818	FALSE	25	AACCTGGATTCTAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYADQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	25306	70461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
890511	contig_16091_pilon	+	3916	10	Intergenic	novelGene_112339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_2	253.019103363099	1259	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	313	1194	14294	37985	FALSE	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVEHYSYKPDGLLRVLTVPCQKIGADNGNINFGARPQLSSSHSVTWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKTPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	1462	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_1548_1933_1984_3659_3729_12750_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912
890512	contig_5640_pilon	+	6647	1	Intergenic	novelGene_27255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	5500	5877	125569	125946	NA	20	TTTCGACTGATGCTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCISQTAFLLPLIPSEPLLCLQTYVKNKHDFCTCECKRTLEHVGIVHGQYDVVVSSTNPAARLPVFKLQICHLLAMRPEADHLTSLCFSFLIYKMEIKTVLTSNNVLYIDRYLGYTSVCIYQN	120069	126716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_120100_126700
890513	contig_8330_pilon	+	2019	13	Intergenic	novelGene_71813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	553.992246987467	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	274	1377	852673	856687	TRUE	45	ACAAGAAGTACGAATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	845729	857543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_845935_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
890514	contig_7056_pilon	+	2069	8	Intergenic	novelGene_43695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	257.252198975152	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	589	1314	929602	937151	FALSE	20	TCAAAGACGTTGTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926234	937906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929209_929382_929535_929678_930556_930638_935330_935546_935846_936043_936993
890515	contig_10019_pilon	-	2938	8	Intergenic	novelGene_86699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_6	204.405659093352	274	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	7	1269	490043	411355	FALSE	85	AAAAAGAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNAWFAERVHTIPVCKEGLRGHTEFCSCLSQQTSHADSSAPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEGTVSFLSDSEKKKQMPLTPTRFDNEEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLISADRYSLFLVREDSSNDKFLISRLFDVAEGSTPEEASNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPLNIKDAYEDPRFNAEVDQITGYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDEKDFAAYLAFCGIVLHNAQLYETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIISFMQVQKCTIFIVDEDCSDSFSSVFHMECEELEKSSDTLIRERDANKINYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTSENIGHVNQQHIGSLLCTPIKNGKKNKVIGKAFPLT	490049	409685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_411466_412900_413010_422404_422473_424571_424710_432453_432544_434548_434621_473610_473701_489458
890517	contig_10323_pilon	+	3677	3	Intergenic	novelGene_123619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGGGGAAGCTCCGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472456	476857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_473603_474207_476229_476347
890518	contig_15047_pilon	+	7378	1	Intergenic	novelGene_52275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1121	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTATGATCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6017	13395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_6000_13400
890519	contig_10241_pilon	+	2408	2	Intergenic	novelGene_142844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	739	1056	133217	140032	FALSE	15	CTCTTAGCTTGTCATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPERSVNKRQEVAPPAQAATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	132478	141384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_133277_139774
890520	contig_8674_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_102895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCATATGAAAAAGATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138076	135878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_135900_138100
890521	contig_1301_pilon	+	2072	4	Intergenic	novelGene_47288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCTAGGAATAATATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242838	258849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_244650_247691_247791_254403_254509_258792
890522	contig_11896_pilon	-	2483	8	Intergenic	novelGene_88021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1111	junction_1	1047.69856624617	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	18	956	181620	151203	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTCTMGLVLPLWSDTLIHLDGDGGFSVSTDNRVHIFKPVSVQAMWSALQSLHKACEVARIHNYYPGSLFLTWVSYYESHINSDQSSVNEWNAMQDVQSHRPDSPALFTDIPTERERTERLIKTKLREIMMQKDLENITSKEIRTELEMQMVCNLREFKEFIDNEMIVILGQMDSPTQIFEHVFLGSEWNASNLEDLQNRGVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAKKHGSKCLVHCKMGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLAR	181637	149675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_151408_154471_154619_160037_160085_173160_173290_173423_173518_177241_177437_180738_180805_181564
890523	contig_2730_pilon	+	2074	3	Intergenic	novelGene_135359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	341	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	182	397	379372	390814	FALSE	55	AAAAAGATATGGAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTAAATAASSSYYCWAGLGWAGRAAPEHSSTDQLQREEKSHSPQTKLQELSVSENTASSPMASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL	291590	392491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_379343_379459_390685
890525	contig_10042_pilon	+	2384	7	Intergenic	novelGene_79104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	226.367449564248	170	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	10	627	6321	49981	TRUE	10	GTGAGAGCTTTGCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNRLWRRGT	6311	54898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43928_49952_50060_53219
890526	contig_6576_pilon	+	4108	2	Intergenic	novelGene_42428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	1241	2587	1301228	1302574	TRUE	10	TTTCCATGTGCTTCTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1299987	1435873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1303837_1435614
890527	contig_3747_pilon	+	3036	7	Intergenic	novelGene_24809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1522.86915794569	2048	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	330	923	201313	202759	TRUE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPSA	200983	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_203128_203228_203386_203498_203651_203768
890529	contig_15105_pilon	+	2194	5	Intergenic	novelGene_150993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	235.790691080034	627	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	20	856	787537	842210	FALSE	45	AGAAATCATCAGCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRTKNWDTRFYDKWYACNREKLCESLQAVFVQSYLDHGTQIFLNNSIEKSGWLFIQLYHSFVSSVFSLFMSRTSINGLLGRGSMFVFSPDQFQRLLKINPDWKTHRLLDLGAGDGEVTKIMSPHFEEIYATELSETMIWQLQKKKYRVLGINEWQNTGFQYDVISCLNLLDRCDQPLTLLKDIRSVLEPTRGRVILALVLPFHPYVENVGGKWEKPSEILEIKGQNWEEQVNSLSEVFRKAGFVIEAFTRLPYLCEGDMYNDYYVLDDAVFVLKPV	787517	843548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_787582_810198_810390_814709_814920_820425_820611_842004
890530	contig_7840_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_69049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGATGGTTGTAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410184	411206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_410200_411200
890531	contig_1715_pilon	-	1414	9	Intergenic	novelGene_127190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	217.790466963088	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	268	363	284622	272221	TRUE	75	CTAAAAAGAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKLRNK	312158	252427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_269564_269631_271063_271241_271925_272236_284541_284644_311912
890532	contig_16999_pilon	-	2556	16	Intergenic	novelGene_85005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1995	2339	212198	210097	TRUE	20	TTCTGATGGGTTAGCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRTNSKTSAAAASLLSLRNSINTGITFAAISGNRTEQECNVRTRSCLYLSVSSCSDTLFVLITSFFRTITSSSTFLEDTRSSANCRVFLRTSKSGVLNTLRMSITRSCRTRS	237264	204918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_205036_209996_210113_211340_211450_211526_211675_212126_212274_213398_213494_219638_219799_220698_220823_224062_224289_224435_224616_229829_229973_230972_231094_234386_234533_235149_235240_236151_236308_236786
890533	contig_15498_pilon	+	3898	12	Intergenic	novelGene_42678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	603	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1503	1901	785456	795579	TRUE	30	TCCCTCTAAAAACCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLPLPGNFTSFLTVAAGFFEELPLGFLMTNGVGLAFLAGVLALGGAFLGRSLAFPLWAAGTLTVGLDPLCFMDAVFPGDLAGVFFCNLLGGGSSSSESSSDESSSSSSSPLESSGSFFGNRTPGLGVIWK	783953	829932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_785725_786214_786326_795560_795672_797091_797254_803539_803628_813228_813385_814785_814864_820915_821060_823748_823910_825235_825386_828510_828612_829067
890534	contig_6137_pilon	+	6020	4	Intergenic	novelGene_59189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	768.593665223844	74	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294865	1318085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1294950_1300358_1300431_1305872_1305924_1312272
890535	contig_15498_pilon	-	1648	12	Intergenic	novelGene_42661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	159.419867691816	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	626	1393	691001	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697724	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_695347_695405_697262_697374_697554
890536	contig_12119_pilon	+	2970	12	Intergenic	novelGene_88662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.797341236861	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	255	1796	325640	423789	TRUE	25	TTAATTTATTGGATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKRADRCKMNPCLNGGTCYPTDTSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCIDGFNTFTCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQIFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNRKWYFRKNGQPCYNNY	306602	425015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306659_325441_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556_424228_424279
890537	contig_7919_pilon	-	3891	1	Intergenic	novelGene_28137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2258	2617	1573865	1573506	NA	35	ATTATTGTATAATTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSCWRSVNRGYEKAASRSFQQETEQPVTSYTRLPTPHPSLPQLGLLCFLWPQSLGREAPASPWCCLDSTRLHWLAPLVPFVAAGVAFFCFFRFLPYLSPPPLLSLKYLAPCAIFASS	1576122	1572231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1572200_1576100
890538	contig_1575_pilon	+	2983	1	Intergenic	novelGene_45177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2212	2538	136344	136670	NA	35	CTACAGCTCACAGGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETMEDRISGIEDKHLDTTLFEENSGKRIKKNEETQRVMWDTIKSKNLRVIGIPEWGENRKHREDH	134132	137115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_134100_137100
890539	contig_11422_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_98958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_600
890540	contig_17964_pilon	-	3543	5	Intergenic	novelGene_33862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	6071.16516823583	27	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1597	2379	142487	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVLWQCARDTPTMLDLPFRTGRSTSCPSCPCKSWTSSCACSLCWAPTSSCLPTSSSPLGAEPPSKVPLMTLKLLDFCLSIMTLCSSYMEVPTFLNFKSMNHMNYLPSQEGMTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	144083	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520_139617_140844_140966_142296
890541	contig_8818_pilon	+	4461	6	Intergenic	novelGene_178227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2	706	4	708	TRUE	20	CTGTGTCCGCGGGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSKRGTREQPHGASRGRQNSRKFVVCAFSPPTPLSPGWGSPASRVQGFLAGGRRLLGFRAPGRAALWGPFVGCWCCFFCFFWFLACLSLPPPPFAQVPGSERRLCPFLWGCGAASGCAASSRSGLLRGRGTGAFVRLLLCFPGPRALGPGLPAAWILRARVGGSLGAVCGLQVLLFFFPLFSFSASFGFSLATRCLPPLLAQVPDSESRPGPFLRGCGATFGRATASRSGLLH	2	194518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_+_2069_35310_35357_43578_44396_44742_45362_193333_193877_194148
890542	SIRV6	+	935	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	541	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	62	553	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1671	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
890543	contig_2834_pilon	-	1968	5	Intergenic	novelGene_28007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	849	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1372	1677	290748	285565	TRUE	25	TGCATTGCTGAAATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPAVQKGLWRDVHSSTHLRLFFGSGGSRAANIASSNTFFRPFCAEHSTYLTAFRSRASFSAVSGVIGFCLFLASFSIVEGSSLRSIWVPTSKKGVFGQW	292119	274767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_274868_277842_277910_285325_285440_285554_285737_290614
890544	contig_2219_pilon	+	11516	34	Intergenic	novelGene_67167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	173	junction_1	299.70692142683	1611	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2472	7419	230	7648	88766	265510	FALSE	50	TAAATGCATTTGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALRPARLWALLALWLCRTAPAHALQCRDGYEPCVNEGICVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCAPGFTGEDCQYSTSHPCFMSRPCLNGGTCHMLSWDTYECTCQVGFTGKLCQWTDACLSHPCANGSSCTTVANQFSCECLAGFTGQKCETDINECDIPGRCQHSGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQHCDSPYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECSCLPGFEGSTCQRNIDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCTNRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGHCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGINCEINFDDCASNPCVHGVCKDGINHYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINDVNSFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGICDNLVNGYRCTCKKGFKGHNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKEAPNFESYTCLCTPGWQGQRCTIDIDECVSKPCMNHGVCHNTPGSYTCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCVDGVNTFSCLCLPGFIGDKCQTDMDECLSEPCKNAGTCSDYVSSYTCRCQAGFDGVHCENNIDECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPMGFTGPFCLHEINECNSHPCLNEGTCVDGLGTYHCTCPLGYTGKNCQTLVNLCSQSPCKNKGTCIQDKAEFRCLCPSGWAGAYCDVPSVSCEVAASRRGLPVDRLCQHSGICISAGNTHHCQCPMGYTGSYCEEQLDECTSNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTQGLLCEKNIDDCARGPHCLNGGQCVDRIGGYSCRCLPGFAGKRCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPEFSGARCQSSCGQVKCRRGEQCVHAASGPRCFCPNPQDCEPGCASSPCQHGGTCYPQRQPPYYSCQCPSPFWGSHCELYMAPTSMPPAICLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTAECLFDNFECQGNSKTCKYDRYCADHYRDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPEKLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARGFLRALGTLLHTNLRIKRDPQGALMVYPYYGEKSAAMKKQKMTRRSLPVEQEQEVAGSKIFLEIDNRQCVQDSDQCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVISESWTPKSTQLLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDSSNHKRREPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGSGTSDNWVDAEGPQPKKAKGEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIRRTPSFAPTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDMSDEDEEAEDSSANIITDLVGQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKHLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMGKKPRRPNAKSAMPTSLPHLAKEAKDAKGNRRKKSLSDKGQLSESSVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPPNPMLATAAPPAPAHSQHALSFSNLHEMQPLAHGTSTVLPSVSQLLSHHHIVPPGSGSAGSLGRLHPVTVPADWMNRMEMNETQYNEMFGMVLTPAEGTHPGIAPQNRPPDGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGASQPQSNCPPTVAGPLPTMYQIPEMARLPNVAFPTALMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMSEPPHSNMQVYA	88536	269378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_88839_141276_141359_174596_174857_178403_178740_189858_189982_210363_210598_212782_212939_213551_213741_217480_217595_218413_218528_221110_221345_225469_225581_230892_231086_232471_232618_234534_234649_239003_239124_239711_239865_241594_241824_242510_242713_244388_244543_244908_245094_246454_246588_249584_249822_253031_253145_254082_254589_255969_256318_257904_258048_258242_258454_258884_258982_260288_260458_261348_261651_262452_262601_263192_263291_264118
890545	contig_8452_pilon	-	2279	8	Intergenic	novelGene_48012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	212.530910116863	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	38	1027	550776	316088	FALSE	70	AAAAAAAAAAAATTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGFLAPVFALFVPFYCSIPRVQVAQILGQFSITNKTLIYILGLQISGMCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	550813	314835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
890546	contig_9571_pilon	+	3481	6	Intergenic	novelGene_136300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1138	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCCGCCCCCTTCTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565503	592725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_568082_570071_570247_577784_577879_578362_578441_580884_580992_592276
890547	contig_11071_pilon	+	2920	1	Intergenic	novelGene_131028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCCTCTCTGCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91056	93976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_91100_94000
890548	contig_2278_pilon	-	4929	3	Intergenic	novelGene_118156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	129	junction_1	52	1333	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	65	391	1510289	1505952	FALSE	30	ATCCCTTTAAATAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKFVFFNVPQIQYKNPWVQIVMFKNMTPSPFLRFYLDSGEQVLVDVETKSNKEIMEHIKKILGKSEETLKKEEQEKKQLSHPANFGPRKYCLRECICEVEGQVPCPALVPLPKEMRGKYKATLKAGAQD	1510353	1501413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1506145_1506894_1506983_1510243
890549	contig_12625_pilon	+	4182	9	Intergenic	novelGene_140479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_6	299.282866825016	875	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	345	1505	15248	30623	FALSE	40	AAGTGTAGCAAATATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQTNTTGSNVTTSSAPNSNSTSGSATSSPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTSNFSELQSQMQRQLMSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQASQTSSASSGTTSTVGGTGGSAASGTAGQSTTAPSLGPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALSTGGSSGTNGSSSAPSENTSPSAGTTETGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS	7474	33300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_7629_9288_9405_15173_15437_15913_16073_16678_16914_23321_23465_28478_28595_28844_29011_30470
890550	contig_19812_pilon	-	2649	17	Intergenic	novelGene_100979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	54	junction_2	95.5837329256396	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	497	2263	42636	15879	FALSE	40	AGGCAAAGCCAAAGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	43132	15492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567
890551	contig_57_pilon	+	6536	28	Intergenic	novelGene_44889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	272.561149555313	1116	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1172	3519	129	3647	66895	145460	FALSE	20	GTTGGTTTTAATTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQVSDI	66766	148349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82134_84099_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325
890552	contig_13519_pilon	+	1867	15	Intergenic	novelGene_124621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	379.040894891303	16	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	160	1809	66179	120612	FALSE	10	CTTGTACTGTTGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57000	120670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72544_72618_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
890553	contig_10134_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_16269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAATCTGCAACATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39680	38100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_38100_39700
890554	contig_5997_pilon	+	5621	4	Intergenic	novelGene_168606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	994	1353	116406	116765	TRUE	55	AAAATAAAAAGTTACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKQQTISKHLQKKDRMVPVGVQMKTPDDSPVEENALEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLETFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMMTS	115412	184987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_118094_158694_160015_174657_175061_183770
890555	contig_1406_pilon	+	3651	4	Intergenic	novelGene_25535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	607	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	760	1086	2137376	2141072	TRUE	25	ACATTTGTGTACAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYQKVCIQCLPSTLYYLIVFWYHQIPMLSWFLYLSLNLLNSSLRLHDVVSKQDHSTCWSTMEDETGSTTSLRRVLPLYCCQTNILIVLQFPIQSRSLVLNFRILAVL	2136616	2145771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2137453_2139835_2139992_2140978_2141122_2143255
890556	contig_6439_pilon	-	3179	2	Intergenic	novelGene_154237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACTGGTTCATACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339727	336485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_336726_336788
890557	contig_11855_pilon	-	3560	11	Intergenic	novelGene_66965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	349	junction_9	1919.75532034684	45	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	483	1553	1087425	1079293	FALSE	10	CTTGATTGTCTCTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102097	1077285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
890558	contig_57_pilon	+	4639	29	Intergenic	novelGene_44877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_4	256.994292400689	1428	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	168	3821	66895	147529	FALSE	25	AAGTTGGTTTTAATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRAALRRAAWQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQLMKLLGWTHCASFTENWLPIMYPPDYCIF	66727	148347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325_145446_147439
890559	contig_960_pilon	-	3152	8	Intergenic	novelGene_108327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	75.4669815622862	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	196	1164	1079358	1067673	FALSE	20	GTTGCAAGTCTGATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGVWPASYRRGAKGGPRSNPFAASFAHLLNPAPPARGGQEPDRPPLSGFLPPITPPEKFFLSQLMLAPPRELFKKTPRQIALMDVGNMGQSVDISGLQLALAERQSELPTQSKASFPSILSDPDPDSSNSGFDSSVASQITEALVSGPKPPIESHFRPEFIRPPPPLHVCEDELAWLNPTEPDHAIQWDKSMCVKNSTGVEIKRIMAKAFKSPLSSPQQTQLLGELEKDPKLVYHIGLTPAKLPDLVENNPLVAIEMLLKLMQSSQITEYFSVLVNMDMSLHSMEVVNRLTTAVDLPPEFIHLYISNCISTCEQIKDKYMQNRLVRLVCVFLQSLIRNKIINVQDLFIEVQAFCIEFSRIREAAGLFRLLKTLDTGEAPSEAKMSK	1082610	1065684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1067871_1067949_1068047_1072008_1072212_1073512_1073716_1075635_1075789_1079243_1079409_1082113_1082202_1082553
890560	contig_4232_pilon	-	762	1	Intergenic	novelGene_63277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAGAAAATCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466759	465997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466000_466800
890561	contig_7179_pilon	+	2783	9	Intergenic	novelGene_78088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	57.3318192629538	733	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	5	1249	576847	586612	FALSE	70	CGAAAATAACCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPVEHVVADAGAFLRDAALQDIGKNIYTLREVLSEIRDKATRRRLAVLPYELHFKEPFPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGVSHLKQEPEKVKVSSSVRHPETPLLISGFHLPSKLKPPREKVDHEHPASEPENLEFSSFMFWRNPLPNIDHELQELLLDKGESVPSEEEDEEENGFEERKDEDSDADGGGWITPSNIKQIQQELEQCCVPNNVRVGCMTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAVNPHLTEDQRFPQLRLSRKARQKTNVFAPDYIAGVSPFAENDICSRSATLQIRDSTLGAGRRRLNPNASRRKFVKKR	576842	588146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657_579730_579945_580075_580168_580373_580923_581022_583194_583340_586342
890562	contig_16666_pilon	+	2158	2	Intergenic	novelGene_61780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	8	1126	106098	117928	FALSE	75	AATAAAATTTAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMRTGWLIGTSRGLLPGPSEVASPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106090	118960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106159_116870
890563	contig_10904_pilon	+	1931	9	Intergenic	novelGene_22550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTTCAAGGAAATGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374480	419242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_375423_377963_378003_378679_378719_379274_379398_381162_381213_388756_389053_389358_389650_389760_389819_419149
890564	contig_15353_pilon	+	3083	10	Intergenic	novelGene_151978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	4919.67798805703	873	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	93	2240	529420	537093	FALSE	25	CATGAATCCTTTTCATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRHFERSKVAFTFPERLLRFCLDRPLITDMSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLHDFRSPPPGMGLTQNRGPMGPGPGQGGPKPPIPPPPPHQVQQQQQQQQQVPSQQPPPQQQPPPPPHQQPPPPHQQSHQQPHQQPPPPQDSSKPVVPQGPGPAPGVGNVPPAPGSAPPATPPTSGAPTGPGPTPTPPPAVTTAPPGAPPPTPPSSGVPTTPPQTGGPPPPPAGVPGPGPKQGPGPGGPKGGKMPGGPKPGGGPGLSTPGGHPKPPHRGGGEPRGGRQHHLPYHQQHHQGPPPGGPGGRSEEKISDSEGFKANLSLLRRPGEKTYTQRCRLFVGNLPADITEDEFKRLFAKYGEPGEVFINKGKGFGFIKLESRALAEIAKAELDDTPMRGRQLRVRFATHAAALSVRNLSPYVSNELLEEAFSQFGPIERAVVIVDDRGRSTGKGIVEFASKPAARKAFERCSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEKLAQKNPMYQKERETPPRFAQHGTFEYEYSQRWKSLDEMEKQQREQVEKNMKDAKDKLESEMEDAYHEHQANLLRQDLMRRQEELRRMEELHNQEMQKRKEMQLRQEEERRRREEEMMIRQREMEEQMRRQREESYSRMGYMDPRERDMRMGGGGAMNMGDPYGSGGQKFPPLGGGGGIGYEANPGVPPATMSGSMMGSDMRTERFGQGGAGPVGGQGPRGMGPGTPAGYGRGREEYEGPNKKPRF	529327	537936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_530272_531043_531233_531813_532116_532207_532304_532973_533171_533269_533355_533693_533812_534315_534365_534444_534567_536955
890565	contig_9098_pilon	-	4698	16	Intergenic	novelGene_75816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	166.059908868256	392	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	123	1616	355730	335775	TRUE	65	TTATCTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKVSGPAEVEDWGAGPAQTWARAPGTRGAMDGLGRRLRASLKLKRGSRGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355852	302672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_303079_309867_310015_311364_313368_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355579
890566	contig_15518_pilon	+	3439	4	Intergenic	novelGene_127600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	461	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	585	803	15096	37386	TRUE	35	TCTGGATCTTAAATTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	40669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
890567	contig_116_pilon	-	3974	20	Intergenic	novelGene_154897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	155.577042221794	682	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	142	2241	327496	262769	FALSE	65	CATACTAATGAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEAALLRRLNHRRSSPSAAPLQCARLPRLSEPPSLAPSQAVAQTCSMAGIAAKLVKDREAAEGLGLHERAVKYLNQDYAALRDECLEAGTLFQDPSFPALPSSLGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICTDPQFIVGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEVLARVVPLDQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKAPPNLFKIIQKALEKGSLLGCSIDITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGKWNDNCPNWDTVDPEVRERLTRRHEDGEFWMSFGDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVHQLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCVRVFSEKKADYQVVDDEIEANLQEFDVSEDDIDDGFRKLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSTETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYILWTKIQNYQKIYREIDVDKSGTMNSYEMRKALEEAGFRLPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIQLDLISWLCFSVL	327637	261035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_262793_264796_264856_265118_265236_266738_266818_267677_267747_268639_268705_271093_271152_272359_272426_273507_273545_275945_276167_278967_279138_281073_281235_281943_282019_283324_283411_285621_285706_286887_287057_288523_288658_289399_289519_321165_321236_327259
890568	contig_12021_pilon	+	4631	13	Intergenic	novelGene_172184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	288.439720257495	940	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	605	1840	39446	56241	FALSE	35	AAACATGTTTTGCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPSAQQDAVFELISMGFNVALWYTKYASRLAGKENITEDEAKEVHRSLKIGAGIFKHLKENHIPKLITPAEKGRDLETRLIDAYIIQCQAEAQEVTIARAIELKHTPGLIAALAYETANFYQKADHALSSLEPAYSAKWRKYLHLKMCFYTAYAYCYHGQTLLASDKCGEAIRSLQEAEKFYAKAEALCKEYGETKGPGPTVKPSGHLFFRKLGNLVKNTLEKCQRENGFIYFQKIPTEAPQLELKANYGLVEPVPFAFPPTSAHWTPETLAMFDLTKRPKDDSTKPKPEEEVKPVKEPDVKPQKDTGCSIS	36574	59032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_37163_39429_39547_42150_42258_42601_42699_45782_45879_47758_47832_48829_48936_49815_49906_52417_52504_53477_53560_53876_54028_54991_55152_56154
890569	contig_6642_pilon	-	4874	5	Intergenic	novelGene_178591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	706	130	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	3187	3732	41512	40605	FALSE	40	TATTAAAAGTCAAAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFGSCSSLLSPISILARHITISPLHPAKLHRALDITPPSRGVQIKTPDDSPMEENALEVPDREFKSLILGIFQELKQKADKHKEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDNVIEGQRSRFETVEDRITGTEDRHLDKLCFSKTQKKEQRKMSRP	136090	39462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6642_pilon_-_41030_41391_43049_62598_63086_132004_132163_135085
890570	contig_13612_pilon	+	7833	8	Intergenic	novelGene_157296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	109.860765312745	453	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	1042	2196	51083	57016	FALSE	40	AGAAAAAATTTATTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	50041	62653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56382_56881
890571	contig_4426_pilon	-	1679	4	Intergenic	novelGene_15424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	428.922163360932	101	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	87	1679	904546	820598	FALSE	70	GAAAAAAAAGATTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFRE	904632	820597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868895_890043_890139_904482
890572	contig_7207_pilon	-	1952	8	Intergenic	novelGene_72078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	261.98029213929	60	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	958	1680	696514	675867	TRUE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGRYKKNNTPDTTSKIIVILFTIV	758058	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_676193_686423_686622_696315_696746_734033_734228_737456_737530_737916_738105_757787
890573	contig_10446_pilon	+	4287	3	Intergenic	novelGene_162464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3781	4143	709538	709900	FALSE	35	CCAGCATAACGCTGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIRTQLNETENRKTIERVIETKSWFFEKINKIDKPLARLTKEKQERKPIRNEVGDITTDLTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLKEIDKFLETQYLPKLTKTEVEQLNKTITKEEYEKEI	586116	710044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_587923_707186_707591_707967
890574	contig_15974_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_164811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCACCCTTCACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145627	143533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_143500_145600
890575	contig_5574_pilon	-	11528	2	Intergenic	novelGene_155838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1674	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	8073	8456	110777	110394	FALSE	55	AATTGATAAAAGAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVCGQTIPPRLPTHLCWEPVVQQHPLFHPPTHAGAHRPVTPAPKPSHPSCVLQTGGICFSTWLPAPGAQGLAARHFCPANCTSGPRTCSSHSYAQPSAPGAHRPPVHVASPSQWHWKPMNRRPGA	133993	107321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_118708_133851
890576	contig_5415_pilon	-	4781	5	Intergenic	novelGene_146151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	3372	4121	327053	326304	TRUE	40	ATAACCCTGATACCATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKQDPSICCVQETHVTNKDINLLKIKGWKEIYQANSYQKGEVAILISDIIDFETKFSIKDKEGHYIMIKRTIHHEDITIINIYTPNNRAPKYIEQPLTALKRETDGSTIIVGNFNTPLSVKDRTPREKLNKDIEELKGAISQLDFKHIYRKFSPQLQSTHSFSNPHGMFSRTDHILGYRGTLNKIQNTEIIQSIFSDYNTIKVELTTRIPRGKKSITWKLNSILLKNHRVTERNQRWNQKIPRIKRE	342260	325598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_326237_326281_327186_329887_331325_331579_331937_340815
890577	contig_5260_pilon	+	1451	4	Intergenic	novelGene_144341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	42.7629122799964	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	37	351	62159	90110	FALSE	90	ATAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKQLSEPELREKMTGNSILLAAVSVLSACQQSYFAFQVGRARLKYKVTPPAVTGSPDFERVFRAQQNCVEFYPVFLVAFWMAGWYFNEVFATFLGLVYIYARHQYFCGYSEAAKNR	62122	91210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_62217_70367_70468_84015_84087_90024
890578	contig_6102_pilon	+	4058	31	Intergenic	novelGene_31878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_21	496.17505871304	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	877	2634	16	2649	370803	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEETHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370787	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380566_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
890579	contig_10638_pilon	+	11633	7	Intergenic	novelGene_164307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_5	20.4239782826189	1238	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2141	6426	36	6461	314408	407617	TRUE	40	GAGGATATTTGATGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVVVEATEPEPSGSLANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDILETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDTARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVIFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAELILPSGQEVDIPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSIQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPSVKQVKLKQRADSRESLKPATKPLPSKSVRKESKEETLDITKANLVEKPPKVESKEKVTVKKDKPTKTDTKPSVSEKEVPSKEDQPSVKTEVAEKQATDVKPKVTKEKTVKKETKPKPEEKKEEKEKPKKEVAKKEDKTPIKKEEKTKKEEVKKEVKKEIKKEEKKESKKEVKKETPLKEAKKEVKKEEKKEIKKEEKEPKKEIKKISKDVKKPSTPLPEAKKPAALKPKVPKKEEPVKKDDIAAGKPKEKGKIKVIKKEGKTTEAAAAAIGTVATAAAMSVAAGIAATGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDFEELKAEEVDVAKDIKPQLELTEDEEKLKETEPVEAYIIQKEKEVIRGPAESPDEGITTTEGEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEEDVYMRTSKHSPIEDEESVKAEADVHIKEKRESVASGDDRAEEDMDEAVEKGEAEQSEEEGDEEDKAEDAREEEYEPEKIEAEDYVMAVVDKAAEAAGAEDQYGFLTTSTKQPGAQSPVQEPASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPRDVMSDETNNEETESPSQEFINITKFESSLYSQEYSKPVTSLNGLSDVSKTDATDGRDYNASASTISPPSSMEEDKFSKSALRDAYCSEEKDVKASATLEIKDTSAVSDEKLSPSKSPSLSPSPPSPIEKTPLGERSVNFSLMPNEIKVSAEAAVPVSPEVTQEVVEEQCASPEDKTLEVVSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFDDAKDDSEKPSISPMDEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLTGSESAYESFLNADGETPDRCTESPFEGTNGKQGFPDQISPVSEITSTGVFQEKQEKKSTDFIPITEDFGEEKKTDDVEAMGSQPGLALDERKLAGDVSPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATSSFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSISPPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEHSLAMDFSRQSPDHPTVGAGMLHITENGPTEVDYSPSDLQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQIASPLQEDTLSDVVPPRDISLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLCSPSFSDSTSAVKEDTAACHTSSSPSVDAASAEPYGFRASMLFDTMQHHLALDRDLTTSGFEKDSGGKTPGDFSYAYQRSEKTARSPDEEGYTYESYEETSQTPDVGGYYYEKTERTTKSPCDSGYSYETTEKTSKTPEDDGYAYEITETTRTPEEGGYSYMISEKTMRTPEVSGYTYEKTERSRRLLDDVSNGYDDTEDGGHTLGDSSYSYETTERITGFPESESYSYETSTKTTRTPDTSTYCYETTEKITRTPQASTYSYETSDRCYTAEKKSPSEARQDVDLCLVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEVSEKPLIQSGGSPATSRRQATGATV	314372	417395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_314592_322304_322407_390302_390386_392936_393078_401701_408197_411567_411807_413041
890580	contig_14687_pilon	-	8148	24	Intergenic	novelGene_107897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_23	614.39711793393	19	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2324	6975	353	7327	459974	416161	FALSE	20	AAGTTGGCTTGTTCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHGHYTRAQANSPRPAMNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENELKNKNTSKINGEEGKSQSNEKTGEQTLIDGPAPWDQIQEGEKHEEVEKLKSVDSQLQEKKIIHPSEQAALSDHNPNDLLLQECNMEKIHTVELVPKEKFVSGPPTPKCVIDITNDTNSQKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSESKHSIANTKYLETTKQDSDPSWVSDVVKVDLTQSNTNASSGNNQLNLEKEKHQYVSYMSSLSTVSVTEDNKLHKQSPPPETIKSKLNTSVDVPKTKSSPSPEVVKSKITHSPDSVKSKATYVNSQAAGERRLANKIEHELSRCSFHPVPARGSTLETTKSPLIIDKNEHFTVYRDPALIGPETGANHISPFLNQHPFPLHSSSHRTCLNPGTHHPALTPAPHLLAGSSSQTPLPTINTHPLTSGPHHSVHHPHLLPTVLPGVPTASLLGGHPRLETAHASSLSHLALAHQQQQQLLQHQSPHLLGQAHPSASYNQLGLYPIIWQYPNGTHAYSGLGLPSSKWVHPENAVNAEASLRRNSPSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHMPVRPSSAEPHRPLKITAHSSPPLTKTLVDHHKEDLERKAFIEPLRSVASTSAKNDLDPNRSQTGKDGHLHRHFVDPLLNQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLDGERDNYSRVPSSSSSPKSHVIKQDKDLGSSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNSVVNEPPRSYPSKEVSNIYTEKQSSSLAAAVNPAVNPQTLTSFISSLSKPPPLIKHQTESEGLVGKIPEHLPHQIATQSVTTFQNDCRSPTHLTVSSTNTLRSMPALHRAPVFHPPIHHSLERKESSYSNLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWKSNNNLSKEKAEWHVEKSNGKSQAAMASVIVRPPSSTKYESMSAIQLASKDRLSERSSTEANKTDCRKHTEARETGRIILPSVNSDSAHIKSEKIFQSVSQGRVPSSVMSAVNTMCNTKTDVFTSVATTATGSSWGGSEVIYSLSNTTLASTSLECTSSKSVSQSVAQTQECKVSTTASITPASSKTVSAFQPSAGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNIGETEPNAVKNQTSSASLPLESTVVCSTVNKAISVGNGQASQTNQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSNDIQNSVDSKIIVDKYIKDDKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKEKSKLKLQSNSNSAGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPTHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAISLWTHENYEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDACEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDKELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNAQAGNFPIVNGVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKECTLEKQIKEEQEQDNPDSPNCRTSPPVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPNKASKINVKSELKEEPKESRKPAMNENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSNNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNGSVKEFWDGFEEVSKRQKTKSGETVVLKLKDCPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSAYGVAAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGVLSKAGILKKFEEEDLDDILRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKVSKEQGLEILPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIILPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVQSFHLTQELRLLKEEINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKTHEDEVEDMEEN	526956	415339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_416251_416567_416700_421409_421587_422834_422975_425040_425164_425356_425488_425837_425929_426487_426657_429457_429737_430476_430692_431201_431416_431602_431731_433569_433660_442444_442598_443640_443856_445842_446045_450569_452789_453057_453231_456291_457977_458081_458275_458371_458516_459962_460088_523429_523544_526831
890581	contig_13004_pilon	+	2725	1	Intergenic	novelGene_112711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTGAGTTAATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853685	856410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_853700_856400
890582	contig_4232_pilon	-	1718	2	Intergenic	novelGene_63458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGGTAAGAACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545925	542869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_543242_544579
890583	contig_16951_pilon	-	3877	4	Intergenic	novelGene_98642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3457	3804	91396	85905	FALSE	15	GGAGGTTTGCAGACTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGFQRTGGWCGHLQQWWQGLPEAAVSRVLPLAVWRGGGVQGAPVVKGGGGGVHTVAVHANRVHQALFGGDCFCLGGCVSATRQPSRTLLSGERQVPARAPCSGRQGRPSAADI	109936	85831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_86027_91170_91462_103951_104096_106689
890584	contig_16322_pilon	+	4894	13	Intergenic	novelGene_87541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	373	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGGAAAGAGAAACACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77579	108575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_77956_78553_78622_79821_79948_81563_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89957_90094_90171_91475_91557_91946_92049_93066_96081_103786_103858_108542
890585	scaffold_14325_pilon	-	6056	6	Intergenic	novelGene_162661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1147	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	4741	5211	98445	97975	FALSE	15	CGCCATCTTGCCGGACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGKSVPGFTAQPGQKAQRHTVPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPRCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	404231	97129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_100874_205024_205105_345159_346345_359023_359194_391543_391790_403600
890586	contig_12278_pilon	+	2343	13	Intergenic	novelGene_152587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	275.218398125319	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	98	1177	179723	197974	TRUE	25	ACCCTTCTTGTGAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGPVQAVPPPPPVATEPKQPTEEETSSKEDSTPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQATQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLLAKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDEKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGR	179625	202342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_179786_186248_186371_190255_190464_191700_191959_193856_193932_194886_195038_195380_195575_197965_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
890587	contig_9363_pilon	-	4986	30	Intergenic	novelGene_6552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	835.266031656098	88	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	973	2922	1081	4002	777144	754431	TRUE	35	ATATATGTGTCAGGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	787891	753384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754005_754066_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_781008_781246_781352_786541_786648_787826
890588	contig_15236_pilon	-	6054	12	Intergenic	novelGene_141620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	798.345334255341	1459	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	46	1212	654898	623299	TRUE	20	CTCTCAGCAATGTTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSLSLALREHEKLFMDVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIHSLLEQHIDPHILQSKPALYRDISKNRHLSIKTFFYWTILGFSHAFIFFFGSYFLLGKDISLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMFFVFIQLLSSGSAWFGIIVMVVTCLFLDIVKKVFERQLHPTSTEKAQMYSNTVALSDEFIALQPLSRARSQLSKLSLLKQIQASSAWTPCAVSQEGKQRAHLLEECWSE	654943	614163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_632963_633050_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563_645692_647358_647419_648728_648875_650530_650634_654832
890589	contig_7009_pilon	-	4599	9	Intergenic	novelGene_23630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2657	3058	537017	536616	TRUE	40	CCCAAAGTCAGAAATGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	539874	434856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_435243_444939_444992_453478_453601_506371_506631_512644_512815_517990_518116_522864_523001_536324_537709_537909
890590	contig_11338_pilon	-	5486	5	Intergenic	novelGene_6395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_4	217.910532099759	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	3	728	321458	315122	FALSE	50	AAAAAAAAGACCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHVSPGGI	321460	310363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_321311
890591	contig_10500_pilon	-	3606	6	Intergenic	novelGene_41271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_4	746.8495430808	238	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	537	992	1635143	1629460	FALSE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640221	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1636940_1637067_1639871
890592	contig_12871_pilon	+	3920	1	Intergenic	novelGene_140371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACCTGCCTCACAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19096	23016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_19100_23000
890593	contig_9468_pilon	+	1839	5	Intergenic	novelGene_59475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_4	222.440300979836	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	226	1638	201435	207089	FALSE	60	ATAAACTTGAAATGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSDSSDSESASEEKSKKRKKKHRKNSRKHKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKMTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	200445	207290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
890594	contig_16103_pilon	-	2129	8	Intergenic	novelGene_118838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	37	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	66	698	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743693	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
890595	contig_10726_pilon	+	4608	1	Intergenic	novelGene_132503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGCCAGTATTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99683	104291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_+_99700_104300
890596	contig_3747_pilon	+	3020	7	Intergenic	novelGene_24848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9986	junction_1	1130.86644510599	12268	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	325	1506	201313	203692	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVKIVICPKPSIGC	200988	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498
890597	contig_5951_pilon	+	1985	2	Intergenic	novelGene_153238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152922	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_153406_153604
890598	contig_10734_pilon	+	5979	1	Intergenic	novelGene_51036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1030	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTGAAGACAGTTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384839	390818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_384800_390800
890599	contig_16594_pilon	-	4395	9	Intergenic	novelGene_53830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_8	2257.07091367883	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	998	1867	165546	121101	TRUE	35	GTCTATAATTACAAGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	240116	116040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_239221
890600	contig_4857_pilon	+	12132	6	Intergenic	novelGene_48783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.2	2179	162	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGAAAAAATTATAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225631	1246174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1226317_1226404_1234363_1238554_1238940_1241781_1242269_1243120_1244340_1244776
890601	contig_12836_pilon	-	1669	2	Intergenic	novelGene_170415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTTCTCGAGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58112	56154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_56184_56472
890602	contig_5389_pilon	+	2938	1	Intergenic	novelGene_143023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1364	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATGAAAGAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413816	416754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_413800_416800
890603	contig_3960_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_138017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAGCAAGACCACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385514	383736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_383700_385500
890604	contig_2798_pilon	+	3811	2	Intergenic	novelGene_120067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTTCCATCCAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188865	193401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_192616_193340
890605	contig_11752_pilon	+	1747	3	Intergenic	novelGene_37635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1270	junction_1	80.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	79	726	87165	88933	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDQRPPLLSGEAKLKNPGGAQQSHDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84123	89954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667
890606	contig_6445_pilon	-	2205	15	Intergenic	novelGene_76931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	963.004206657903	6	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1130	1978	85463	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKSLWRNSSGLLSSLAHCMRTATSWAPLLLGPAQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96340	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_85358_85477_88146_88206_88473_88594_89656_89714_91007_91854_96306
890607	contig_5728_pilon	-	2050	7	Intergenic	novelGene_126704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_6	458.224350679398	242	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	29	1492	371325	353412	FALSE	65	AGTACACTTAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRGWRPRTLKRCLREVSKATEQPECFLTIQDGLASNFTSLTKVLYDFHKILEYRSIRASPLKKLVINNFDDEQIWQQLELQNEPILQYFQNTVSKTIKDEGISLLPETEEQECKEDGSEMEADGQEDLEQDLEEGEVSDLSGDDLKGHESTKHLSKSDLRESPDFSDEDSDRDFDIDKLEQQSKVQNKVPRKPREKSIVDDKFFKLSEMETFLENIEKEEEQKDGEEEEDIDFFEDTDSDEDEGGLSGSQKLKSGKNSRNLKYKDFFDPIETDEDIASDRDELGSNEEEEIAEEEEESVFEMDEDNDLEESEDSKQHKECLKRVTFALPNDEETEDTNTSNVKKNSDEVKSSFEKRQEKMNEKIASLEKELLEKKPWQLLGEVTAQKRPENSLLEETLHFDHAIRMAPVITEETTLQLEDIIKQRIRDQAWDDVVRKEKPKEEAYEYKKRLTLDHEKSKLSLAEIYEQEYIKLNQVRKPLRHSHY	371353	352853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_353583_354444_354513_355358_355501_367726_367899_368202_368349_368941_369618_371236
890609	contig_8576_pilon	+	2925	9	Intergenic	novelGene_88783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	519.968688961172	347	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	19	1467	893619	915551	TRUE	75	AAAACAGCAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893600	917055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338_915609_915654
890610	contig_2798_pilon	-	3187	5	Intergenic	novelGene_120016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	840.557367167762	446	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	428	991	116665	115914	FALSE	5	CAGTTTGCCTGTTCTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGLHHRVDGAEDTPLLAISPGVLGPAEKPLFYRGHLYLLPSLSVL	193424	113717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116048_116235_116680_120448_120595_170381_170519_193294
890611	contig_6165_pilon	-	1664	4	Intergenic	novelGene_167414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	683.778229155233	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1129	1578	493933	489749	FALSE	25	TAAAACTTTGTGGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKVVLKPRTPPGQNGLPTQEKEKKTSKQTKAPGSHQCGSPDREAAPHSNGALQRLRKKQDGSRSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKKATAAANKWHSESRPVQDVASECEVKCMPTFQFYKKGLKVGEFSGANKEELEATINKLS	496881	489662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_489812_490281_490348_493612_494302_496121
890612	contig_11100_pilon	-	3503	5	Intergenic	novelGene_175531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	60.4979338490167	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	251	1069	193642	190325	FALSE	25	TGGCATTTCAGAATCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAEPSWRKVQHVKNSSGKRQNKPQVPRISSQLKSSLVATSQQAEDEPPESTYPQGKLGRSPLSPRCQGASGNKLFLDFESMRIFKEDADEDSGSDLSDSERIPIHTSPLTPPDLQLRAEEINPACFHRSPDQDHSKPGYCYPDFLPPPFNSWNLQDMAVLLNSEGKLDAVPRAGGLLRRYINRLVQLEWLQIQTVQTEKGKGAKTRPPAAPGTSWALKSPRRRKLIAAALPKPLPQQEGASKPGPSQKKDLRQEDTCRSSWCFLADASLRA	200701	187890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_190368_192866_193647_197199_197286_197385_197498_200653
890613	contig_9177_pilon	-	5012	36	Intergenic	novelGene_32593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1548.72089052053	2	31	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1477	4434	143	4576	25986	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYHGVRRLPHHSRAYPRSPASDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSAGPQPLLVQSCKAVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKCAQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	26381	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16299_17505_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26322
890614	contig_15120_pilon	-	3677	1	Intergenic	novelGene_108024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1059	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2095	2412	252002	251685	NA	30	TGTAAACATGAATTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNCTISKRLGPNQGSGNMNAGKGKMWLYLENRLGETKLLSGCRRYSNQGSRRSLGRCFKVKENVEREMEKDGFHSKHLERSLQMEIANDNLKYRYDVSKEVEA	254096	250419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_250400_254100
890615	contig_5669_pilon	+	436	3	Intergenic	novelGene_86047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	152	140	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	168	401	120081	120478	FALSE	10	GCTGTGGGCTGGTGCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFLLGGIGELNKNRHPNFLVVEKDTTLNEIEDTFRQFLNRDDIGIILINQYIAEMVRHALDAHQPCHPPSVRSEPLISNSLPIPTPERLGEVLEGCWRSGIKTKAGEGVGNLTIFSPPPLPLLCALMQCHC	117812	120513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_117922_120022_120111_120274
890616	contig_5586_pilon	+	1699	9	Intergenic	novelGene_143559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	496	junction_3	304.404926660197	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	224	1246	384614	430164	FALSE	50	AAAAATCAATCAGGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	380634	430617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_380719_383470_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
890617	contig_20293_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_153519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	306	770	63643	64107	NA	40	AACTTCAAATGAATTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRDCGEIGTLTHCRWECKMIQPFWKMIWHFLRIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCPPTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNNESVNHLITWMKLENIMLSEIS	63337	65683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_63300_65700
890618	contig_8594_pilon	-	3656	8	Intergenic	novelGene_140004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	552	857	188273	187968	TRUE	5	TGCCCGGCCCGGACGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEAMGWGNVAVETAFLGFPASFWLVLTGGVNKLLMEVIGDKGCGLALLAFDNDAIVLLKTGLGSWAETVPVELTRTDVKEEFTFAVCGRDEQSCSVPFC	188824	82789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_82801_106424_106625_124863_126283_136958_137038_145283_145375_180567_180682_184914_185101_187268
890619	contig_5247_pilon	+	4080	18	Intergenic	novelGene_81803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_11	162.181473818149	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	578	3118	145538	161215	FALSE	55	AGAAGGCACTTAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	144960	162177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
890620	contig_854_pilon	+	4869	25	Intergenic	novelGene_36618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_24	3404.14974674498	757	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1236	3711	1	3711	1692680	1715249	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1692679	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713152_1715165
890621	contig_17737_pilon	-	1901	3	Intergenic	novelGene_72912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_2	18.5	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATACAATTTTTATGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56931	52880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_53672_55308_55430_55942
890622	contig_10973_pilon	-	972	1	Intergenic	novelGene_150350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2506	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2500
890623	contig_9752_pilon	+	2610	2	Intergenic	novelGene_122012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTACATTAAGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72198	74849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_72334_72374
890624	contig_4213_pilon	+	8155	3	Intergenic	novelGene_124807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160	573	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3717	4019	39681	39983	TRUE	50	TGATAATAGAATTATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFKFPISVLALDFPIVLVQRLQVLVAINCSACQPHVKCPQHADILEVFIFDNFYNDPSRVEFAASSRSNTEKELALCCCHKRHPQTLTPWLYQLQVQL	34954	46208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_36985_37994_40646_42734
890625	contig_5023_pilon	+	2302	14	Intergenic	novelGene_7332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2064.18382225785	7	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	16	1701	607309	646990	FALSE	10	ATCCTACTCTGCTTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607293	647591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625811_630254_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
890626	contig_2235_pilon	-	5430	6	Intergenic	novelGene_178476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	358	675	291308	290991	TRUE	50	AAGGCCCTGCAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	291665	85455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2235_pilon_-_86533_90472_91137_225848_227257_240795_240806_287315_288117_290195
890627	contig_18108_pilon	+	5370	4	Intergenic	novelGene_33483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	463	junction_1	76.7868623022338	2056	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2882	3451	247233	260192	FALSE	20	ACTAATTTTCTTTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	244351	262111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_247269_250797_251002_252193_252329_259997
890628	contig_3269_pilon	+	3367	2	Intergenic	novelGene_117022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAATTAAAGGAGCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125750	129165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_128908_128955
890629	contig_10734_pilon	+	1975	9	Intergenic	novelGene_51192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	411.431646813903	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	158	1234	1127664	1142903	FALSE	50	TATTCAAGAAATAGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFLLEPQSIIIQGHDRGQEKENESQKMKEENTGAGAEAKRQEDMNPKINPLRNTSLRNIMTKNILLIREESDLIHLKMVRTGTNAKKGSHQEAEVTPDLDPVKGAIVVEAGSGRSLGPEAERERNHDPEAGRGNGGSDLVPAQDQDTGIGVEAEVGQGVEVGRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123713	1143644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131281_1132609_1132788_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
890630	contig_15022_pilon	+	4909	31	Intergenic	novelGene_171813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	265.061745427153	48	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	712	2766	95677	110132	TRUE	10	CCATGGTGCTGAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELSGGTTPITPVIQAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDAEYLQYFDSNKDTYSKRFVPVACISRVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDAERKEWMQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAVKPLQDRRAREEFSRRWCVLSDGILSYYENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPNTHSFEHTFEVYTEGERLYLFGLENAELAHEWVKCIAKAFVPPLAEELLARDFDRLGRLPYKAGLSLQRTQEGWFSLTGSELRAVFPEGPCEEALQLRKLQELSVQGDSENQVLVLVERRRTLYIQRERRLDFTGWLWAIQKAAASSGDTLSEQQLGESDIPVIVYRCVDYITQCGEPRPICDCPNPRT	86846	121834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_87182_93727_93897_95301_95433_95600_95757_96127_96198_96524_96646_97088_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105950_107887_108024_108312_108416_109291_109488_109762_109815_109924_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_114652_114686_118370_118454_119220_119272_119455_119520_120780_120931_121229
890631	contig_10437_pilon	+	1342	7	Intergenic	novelGene_38314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1033.62894965048	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	368	811	443902	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431125	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439761_443797_443977_445309_445476_446951_447055_451075
890632	contig_5031_pilon	-	4841	5	Intergenic	novelGene_133177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	133	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1807	2259	47468	47016	TRUE	70	GAGAAAGAGAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYTENPKECTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIASKRIKYLGINLTRDVKDIYRENKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNVVKMSILPKAVYRYNAIPIQIPAVFFNEMKKQITNFIWKGKRP	145977	21960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_23098_23451_24355_46473_47534_137468_137856_144623
890633	contig_5062_pilon	+	1422	11	Intergenic	novelGene_157834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	198.838024532533	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	254	1369	723808	744018	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQNKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	622693	744071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706297_716403_716500_723733_723821_733944_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
890634	contig_7359_pilon	-	1570	2	Intergenic	novelGene_139847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGATTAAAATACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38481	25722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38078
890635	contig_6888_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_147058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAATGTCACTTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9040	11000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_9000_11000
890636	contig_6364_pilon	-	6624	14	Intergenic	novelGene_51708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1285.01262858437	3152	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1209	1697	440728	436151	FALSE	30	AATGCGTAGTGCATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521117	431223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440792_445010_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466262_472489_472641_477561_477736_486627_486725_490716_490802_521045
890637	contig_13607_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_170170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAACCCCTGTGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153688	152031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_152000_153700
890638	contig_16125_pilon	-	3894	15	Intergenic	novelGene_155230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	972.439875377645	223	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	87	1109	155583	117592	FALSE	20	CCCAGCCTGTGATTAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	179492	114806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440
890639	contig_14687_pilon	-	7873	21	Intergenic	novelGene_107893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	536.030901627882	30	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1567	4704	706	5409	459974	422829	TRUE	10	GTTGGCTTGTTCCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHNSPSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHMPVRPSSAEPHRPLKITAHSSPPLTKTLVDHHKEDLERKAFIEPLRSVASTSAKNDLDPNRSQTGKDGHLHRHFVDPLLNQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLDGERDNYSRVPSSSSSPKSHVIKQDKDLGSSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNSVVNEPPRSYPSKEVSNIYTEKQSSSLAAAVNPAVNPQTLTSFISSLSKPPPLIKHQTESEGLVGKIPEHLPHQIATQSVTTFQNDCRSPTHLTVSSTNTLRSMPALHRAPVFHPPIHHSLERKESSYSNLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWKSNNNLSKEKAEWHVEKSNGKSQAAMASVIVRPPSSTKYESMSAIQLASKDRLSERSSTEANKTDCRKHTEARETGRIILPSVNSDSAHIKSEKIFQSVSQGRVPSSVMSAVNTMCNTKTDVFTSVATTATGSSWGGSEVIYSLSNTTLASTSLECTSSKSVSQSVAQTQECKVSTTASITPASSKTVSAFQPSAGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNIGETEPNAVKNQTSSASLPLESTVVCSTVNKAISVGNGQASQTNQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSNDIQNSVDSKIIVDKYIKDDKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKEKSKLKLQSNSNSAGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPTHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAISLWTHENYEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDACEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDKELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNAQAGNFPIVNGVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKECTLEKQIKEEQEQDNPDSPNCRTSPPVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPNKASKINVKSELKEEPKESRKPAMNENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSNNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNGSVKEFWDGFEEVSKRQKTKSGETVVLKLKDCPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSAYGVAAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGVLSKAGILKKFEEEDLDDILRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKV	527951	415337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_416251_416567_416700_421409_422975_425040_425164_425356_425488_425837_425929_426487_426657_429457_429737_430476_430692_431201_431416_431602_431731_433569_433660_442444_442598_443640_443856_445842_446045_450569_452789_453057_453231_458371_458516_459962_460088_523429_523544_527473
890640	contig_19459_pilon	-	1031	7	Intergenic	novelGene_59872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8172.44724159579	10	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	357	698	11335	7003	FALSE	10	CTGTCTTCTTGTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19033	6669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11388_15503_15702_16203_16265_18988
890641	contig_18869_pilon	-	3541	3	Intergenic	novelGene_56486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	733	junction_1	224.5	1694	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	90	341	379346	336739	FALSE	60	TTGAATAAAATAAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKPPISASQHENHQTVSHLATGQPHFPNMAPDSHINHNGNPGTSNQIPANPLQHLVSGPNKEPEPRIQTDTLKQASKDRVGDFHKLKQNDEERELQMDPADYGKPRFNDVL	379435	333538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_336810_378128_378300_379336
890642	contig_15991_pilon	-	2055	5	Intergenic	novelGene_70940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	169.092245534797	252	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	199	381	124878	123001	TRUE	20	TGTTCTTTAAATCCACGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRGRIADDSEGAAGAAAASRCRRPSGNAHDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	136628	119786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_120254_120606_121057_122243_123124_124818_124986_136537
890643	contig_10352_pilon	+	4235	13	Intergenic	novelGene_49596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	193.262774480757	952	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	1310	2707	14085	34079	TRUE	15	GTCTACGCTCTTGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWEFTSWVPLVSRICPNDVCRIWKSGAKLRVDITLLGFENMSWIRGRRSFIFKGEDNWAELMEVNHDDKVVMTEHFDLSQEMERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	12775	35893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_14110_15251_15396_16073_16264_21362_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883_34194_34479
890644	contig_2703_pilon	+	2552	17	Intergenic	novelGene_101711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	971.777798595826	555	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	290	1678	559489	610870	FALSE	35	AAAAAAGTTTGGTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526177	611744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
890645	contig_6418_pilon	+	2421	11	Intergenic	novelGene_81208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	204.254742906989	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	632	1672	1388801	1441289	FALSE	15	GTCCCTGCAGGTTGCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNST	1341084	1442038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1379238_1379344_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095
890646	contig_10345_pilon	+	1324	13	Intergenic	novelGene_158353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1133.73835899941	746	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	72	1073	11670	24141	FALSE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18898_20454_20517_21588_21648_23046_23170_24084
890647	contig_11417_pilon	-	6347	29	Intergenic	novelGene_103302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAATCTCTGGAATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570651	524290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_526561_526711_527106_528492_528609_529167_529346_530871_530957_536806_536969_537760_537849_538884_539047_539277_539439_540488_540616_542616_542779_551050_551144_551338_551504_552202_552346_556568_556738_557383_557471_557567_557642_557739_557810_558178_558386_559104_559260_559487_559655_560664_560888_566038_566182_566274_566360_567426_567657_568274_568413_569457_569559_570058_570197_570597
890648	contig_5423_pilon	-	2913	2	Intergenic	novelGene_85308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2175	2480	731430	731125	FALSE	45	AAGTACATTTCTAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPETTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKKQIYWPKEDWRNPESMAPRQPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	733795	730691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_731817_732007
890649	contig_2799_pilon	+	18053	27	Intergenic	novelGene_85536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	552.042758398832	4510	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1154	3465	10202	13666	704804	780522	TRUE	35	ATGAACATTTCTGTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANRRSQQSVLLSKSVSIQNIAGVGNDESMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGTDMNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYVFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMKDPEMVEVHASSKEERNSWIHIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTKARELKEQLQQKDQQILHLLEEKEMIFRDMTECSTPLPEDCSPTHSSRILFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGSLGGTLGPAVSSLIEQEGMVGPVSLPRRAETFGGFDSHQMNASKGGEKEEGDDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLGFMLKRNSEVIQSIVHLHELLSTLQGVVLQQDSYIEDQKLMLSERALTRSSSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQHLEEKRRREREWEARERELLEREARLAQWEEKVQRGQQDLERDREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLKRDTEQLSQRRIEGDVCQVSHQHTKTMRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGGEYTHPPAPGSEEWGLRFQKGIF	694602	786068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302_755439_756998_757112_757718_757866_758463_758715_761269_761396_761508_761627_762150_762400_766302_766380_766964_767147_767272_767356_770118_770314_771765_771928_772374_772446_772916_772962_776043_776092_777677_778128_780120_780523_781548_783702_783757_785564_785640
890650	contig_9982_pilon	-	1729	15	Intergenic	novelGene_55756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	240.858805705156	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	446	1588	347427	339852	FALSE	20	GCCTCAACTGTCCGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353582	339710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347544_348100_348155_349531_349612_350163_350255_353478
890651	contig_12250_pilon	-	1711	8	Intergenic	novelGene_80645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	173.645663137697	932	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	94	633	379717	378582	TRUE	25	GAATCAGTATCTGATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRARCTRKLRNWVVEQVESGKFPGVCWDDKAKTMFRIPWKHAGKQDFREDQDAAFFKAWAIFKGKYKEGNSEGPATWKTRLRCALNKSPEFQEVPENGHMEGAEPYKVYRLLPPGTLPAQPGTQKSPSKRHHSYESSDREEDEGPVKSRALSPLSLQDPFNNVSWGGVGRGLRARQ	380574	375687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378359_378463_378758_379009_379194_379537_379760_380523
890652	contig_5423_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_85222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACAAAAAAAAAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397547	400004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_397500_4e+05
890653	contig_7513_pilon	-	3761	8	Intergenic	novelGene_89015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	60	AAATCTTTTCAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	673383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_674533_677437_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
890654	contig_3153_pilon	+	3936	9	Intergenic	novelGene_104634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.539645619178	175	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1024	3075	175	3249	63009	190713	FALSE	80	ACAAACAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVKENSQNLIQRMGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	57984	191400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_58079_62928_63010_66684_66946_67756_69752_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
890655	contig_9839_pilon	+	954	8	Intergenic	novelGene_88492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1440.62681935783	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	131	574	49467	57797	TRUE	20	AATCACTTGTTTTCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASV	45310	61490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57750_57790_57850_59824_59927_61264
890656	contig_9366_pilon	-	573	3	Intergenic	novelGene_166274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCAGAAAGACTTCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1084365	1043339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1043654_1045982_1046209_1084332
890657	contig_10722_pilon	-	3607	10	Intergenic	novelGene_70971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	293.158954902466	2	168	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	2282	3175	6730	4150	FALSE	25	CTGCTTCAAATATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	17312	3717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5639_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637_8562_9665_9787_16247_16358_16853_16929_17168
890658	contig_5502_pilon	+	3183	7	Intergenic	novelGene_154981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	241.802088493876	20	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2004	2498	394902	398610	FALSE	25	TATCTTGGTTGTCTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVHFCAVGLSLLEPAGYVGHILLQAEVAASQRFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	376553	399295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_377826_379456_379596_381989_382122_391084_391296_394652_395003_395620_395841_398436
890659	contig_7963_pilon	-	4098	12	Intergenic	novelGene_58441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	563.723087169813	18	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	639	1844	125592	121251	TRUE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKT	126298	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121257_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_125993_126060
890660	contig_10500_pilon	+	4237	2	Intergenic	novelGene_41164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	101	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2825	3181	1266117	1266473	FALSE	55	TAAAAGTGCTTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIQNTDKTKCWRGCRVTGTLMHCWWKCKMVGRYSESFFTKLNTDLPYDAAILLPGIYPNELKTHVHIKTCTRMFMAAVLSRQQLEATKTMSMEAAAKKSNDTLHWAILLQKTSLKC	1263210	1267529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1263651_1263732
890661	contig_9471_pilon	+	1195	8	Intergenic	novelGene_21762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	151.123142111434	125	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	439	924	385781	401578	FALSE	25	TGCTGAGCCTCTTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTLHTDVGDIKIEVFCERTPKTCENFLALCAGNYYHGCIFHRNIKGFMVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGKVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	384546	401849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_384923_385008_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_401451
890662	contig_19974_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_130463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAGCTACCCCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131776	131300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_131300_131800
890663	contig_12964_pilon	-	4418	5	Intergenic	novelGene_131703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	570.212241187437	225	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	188	616	560654	560226	TRUE	30	CCAAGAATGGTGTGCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPSKDTAVTDPSRTADPKNAWQEASPADPVSRPHLIRLFSRDAPGREDNTFKDRPSESDELQTIQEDSAAAEGLDVMASQKRSSQRHGSKYLATASTMDHARHGFLPRHRDTGILDSLGRFFAGDRAAPKRGSGKVSAQE	616018	555687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556628_559878_559921_560679_595757_595846_615943
890666	contig_13592_pilon	+	3731	8	Intergenic	novelGene_33700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	211.167792844207	299	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	517	1317	256608	261418	FALSE	35	AATTGTGTTTTAAAAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQVHIAQSEVTSD	249301	263832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274
890667	contig_8830_pilon	+	4862	2	Intergenic	novelGene_178592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1908	2216	28493	28801	TRUE	20	AACATTGCTTTCTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQTQDRMVPEGVRNKTPDDFPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSKLEIIQRQ	26585	45627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8830_pilon_+_29301_43480
890668	contig_19545_pilon	+	3785	1	Intergenic	novelGene_170835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	3486	3785	30584	30883	NA	30	TGGATGGGAAGGAGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLPASTQACSLSALQSRSFTSGGNVLNRSSSTTRPLRLSSGHSPSSTGRHSSRLPRSSIWVRLVSSPTREGSDCSTLLPRCRARSFRHWKSSGGRASI	27098	30883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_+_27100_30900
890669	contig_10197_pilon	+	2143	11	Intergenic	novelGene_115307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	106.29129785641	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	12	1304	1358313	1377360	FALSE	15	GGAGAAGCCCTTTGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGMGSTVSKAFGAPKTFGKAGGTSLVNTAGGTQSKVVPIASLTPYQSKWTICARVTNKSQIRTWSNSRGEGKLFSIELVDESGEIRATAFNEQVDKFFPLIEVNKVYYFSKGTLKIANKQFTAVKNDYEMTFNNETSVIPCEDGHHLPTVQFDFTGIDDLENKSKDSLVDIIGICKSYEDATKIIVKSNNREVSKRNIYLMDMSGKVVSATLWGEDADKFDGTRQPVMAIKGARVSDFGGRSLSVLSSSTIIVNPDIPEAYKLRGWFDSEGQALDGVSISDLKSGGIGGSNTNWKTLYEVKSENLGQGDKADYFSCVATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDREFPNFKYRMILSNEQAFEEAFQNASFRSFTFRIRVKLETYNDESRIKASAVDVKPVDYREYGRRLIMNIRKNAMQ	1358301	1378199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1358317_1360518_1360652_1362645_1362749_1364050_1364120_1364266_1364460_1364616_1364757_1365191_1365341_1367602_1367736_1369928_1370106_1375656_1375744_1377255
890671	contig_13021_pilon	-	1888	9	Intergenic	novelGene_8234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	504.83902137216	529	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	185	1042	231783	210494	TRUE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236218	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236132
890672	contig_9678_pilon	+	1533	6	Intergenic	novelGene_146373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	622	junction_4	429.346759624432	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	707	1366	261686	266767	FALSE	25	AAATCGGTCTTTATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGLKAKLYHKQRHAEKIQMKKTIKMHEKRNTKQKNDEKTPQGAVPAYLLDREGQSRAKVLSNMIKQKRKEKAGKWEVPLPKVRAQGETEVLKVIRTGKRKKKAWKRMVTKVCFVGDGFTRKPPKYERFIRPMGLRFKKAHVTHPELKATFCLPILGVKKNPSSPLYTTLGVITKGTVIEVNVSELGLVTQGGKVIWGKYAQVTNNPENDGCINAVLLV	259386	266934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_+_259973_261565_261754_261842_261994_263530_263711_265596_265790_266699
890673	contig_5945_pilon	-	6123	15	Intergenic	novelGene_104582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_1	153.915776730427	1420	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1363	4092	39	4130	378690	269834	FALSE	25	GCATGTGGTTCCAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPKELVELHLKLMRKIGKSVTADRWEKYLIKICQEFNSTWAWEMEKKGYLEMSVECKLALLKYLCECQFDDNLKFKNIINEEDADTMRLQPIGRDKDGLMYWYQLDQDHNVRLYIEEQDDQDGSSWKCIVRNRNELAETLALLKAQIDPVLLKNSSQQDSSSRESPSLENEETKKEEETPKQEKQQENERMKVDEQPVDSENLSTPRVLEETTVKIEKDDEKELVKLPVIVKLEKLLPESEDKKIIKEESDSFKENVKPTKIEVKEYRVDPKDIKSSMEKLVAQEPERLEFGGNVKSSQEITEKSTEETEKLKNDQQAKIPLKKREIKLSDDFDSPVKGPLCKSVTPTKEFLKDEIKQEEETCKRISTITALGLEGKQLVNGEVGDEKVTPNFKTEQIESKLSDAKEDSCSPSKDKNVVVEGNGAESLNSVLTSTKIGELEKEVVLVGKDTDNSISVSETPSQKGQLGSPEMETSLKTSEMTKDLSLKSILSTNESCTMKIEEKSLKSKKDKRPPRLECLEKLEKSKKTFLDNDTQRLSPIPEEVPRSTEKEPEKPGSPEAAETSPSNMTGLCDKLASEKEVVECQSTSSGEGQPLEAGNSKILKENSESLKVEMDNLNNAQASVIEDSSETKGSIQKSKFKYKLISEEETTASENREITSERQKEGIKLTIRISSRKKKPDSPSKIVEPETKQEKMEKEEEKANVGRTLRRSPRISRPTAKVAEIRDQKADKKRGEGEDEAEAESAALQKTDKKENLKKTEKDTNSKVSKVKPKGKVRWTGSRTRGRWKYSSNDESEASDSEKSSAASEEEKEKESEEVIPADDDEPCKKCGLPNHPELILLCDSCDSGYHTACLRPPLMIIPDGEWFCPPCQHKLLCEKLEEQLQDLDVALKKKERAERRKERLVYVGISIENIIPPQEPDFSEDQEEKKKDSKKSKANLLERRSTRTRKCISYRFDEFDEAIDEAIEDDIKEADGGGVGRGKDISTITGHRGKDISTILEEERKENKRPQRAAAARRKKRRRLNDLDSDSNLDEEESEDEFKISDGSQDEFVVSDDNPDESEEDPPSNDDSDADFCSRRLRRHPSRPMRQSRRLRRKTPKKKYSDDDEEEESEENSRDSESDFSDDFSDDFIETRRRRSRRNQKRQINYKEDSESDGSQKSFRRGKEIRRVHKRRLSSSESEESYMSKNSEDDELTKESKRSVRKRGRSTGEYSEADEEEEDEGKRSRKRLHRIETDEEENCDNAHRDADQPARESQPRALPSEPESTKKPYRIESDEDEDFENVGKVGSPLDYSLVDLPSTNGQSPGKAIENLIGKPAEKPQTPKDNSTVSVSLAPNGTGGGQEAGAPEEEEDELLRVTDLVDYVCNSEQL	378728	267840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_270406_273060_273250_275322_275544_277110_277319_279661_279730_285739_285850_287295_287351_295379_295460_297011_297117_305613_305821_307602_309369_331936_332092_343035_343242_345424_345518_378633
890674	contig_2069_pilon	+	4707	11	Intergenic	novelGene_23183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_9	231.904376845285	1648	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	83	895	70041	89492	TRUE	30	GGAGTGACTTATATAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69958	101724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407_90998_92048_92192_99560
890675	contig_5033_pilon	-	1397	4	Intergenic	novelGene_28951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1057.50870760796	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	740	1075	451758	451423	FALSE	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	456728	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_452153_452916_453124_456495_456604_456698
890676	contig_9646_pilon	+	4750	6	Intergenic	novelGene_117467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	494	junction_2	348.328925011978	855	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	110	718	363456	425713	FALSE	35	ACCAATGTAACCTACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGITDAATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILMEDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGINWQDVYDKKLVPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKYDEDGMDCMDNERRPHFPQFSYSASGRE	355036	429745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_355134_363443_363573_377836_378052_385164_385253_416815_416919_425627
890677	contig_2257_pilon	+	985	6	Intergenic	novelGene_122488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	191.345760339758	510	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	208	984	288451	331956	FALSE	55	TACAAAAGAGAGAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAVVTPSGLEDGVSRSRGEGAGEVVVERGPGAAYHMFVVMEDLVEKLKLLRYEEELLRKNNLKPPSRHYFALPTNPGEQFYMFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLDMNESAKQEDILESTTDAAEWSLEVERVLPQLKVTIRTDNK	288243	331957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_288663_291408_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_331833
890678	contig_6879_pilon	-	5971	5	Intergenic	novelGene_178594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	4533	5027	138418	137924	FALSE	30	ACCTCCCAAAGAATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSERRGRWREASEKSKEAEKKSNTRSQLMAPREPPAWVCGIQAAGASRSRDRGRGKQRNKLTEAAGSHQRGSRDREAAAHSNGAPQPLMKKERWPSELGTRAKVGGGGERQARNQKKQEKKKATSAANKWHSESQPVRLVFLDKRLCPWESEEAECG	166526	136979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6879_pilon_-_139179_139357_139998_141205_142303_144883_145800_165407
890679	contig_5217_pilon	-	777	5	Intergenic	novelGene_135763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2613.5432845086	12	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	3	497	559960	558422	TRUE	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKVRAWSVLFSVPSLSSVPLLDNLVPVSCVSQIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLVSDSCSDS	559962	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558441_558666_558851_559273_559437_559831
890680	contig_2069_pilon	-	6416	19	Intergenic	novelGene_23379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_6	366.963436298832	1088	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1335	4008	162	4169	1101187	1059683	FALSE	40	AAAAAGGCTTTTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQARAQGTMGSLSYAQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQQPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLSSSQPPYSQQPSQPPHQQSPTPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQTQSPYQQQQPPQPASSTLSQQATYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSVPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQMHTGMGSYQQNSMGSYGPQGAQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGSMNPMGAGGQMHGQPGIPPYGTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVAMHVAANSIQNRPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYPMGGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSSSTTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMRSNSVGIQDAFPDGSDPTFQKRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQGPNGGMGDPYSRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNMGTGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPYPSQQTTMYQQQQQNYKRPMDGTYGPPAKRHEGEMYSVPYSTGQGQPQQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYSNAYPATAAAATERRPAGGPQNQFPFQFGRDRVSAPPGSNAQQNMPPQMMGGPIQASSEVAQQGTMWQGRNDMTYNYANRQSAGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGPWPSHGTRQPTYGPSAPVPPMTRPPPSNYQPPPSMQNHIPQVSSPAPLSRPMENRTSPSKSPFLHSGMKMQKAGPPVPASHIAPTPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDNSIMTFSLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRFSKASSPAPVEGGGGRRPPRS	1101348	1057435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1059872_1061667_1061799_1062377_1063270_1063763_1063861_1063954_1064090_1064171_1064323_1064713_1064887_1065069_1065203_1066633_1066842_1069498_1069709_1070773_1070884_1070982_1071129_1072279_1072593_1073289_1073458_1074009_1074100_1074379_1074621_1097778_1097896_1098973_1099427_1101136
890681	contig_5649_pilon	+	6808	43	Intergenic	novelGene_82292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_42	199.499680323001	1490	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2141	6426	126	6551	148696	203268	FALSE	35	AGAGAAAACCTTTGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYSEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGKDKSDGAQAHTWNVEVLIDVLKELNPSLNFKEVTYELDHPGFQIRDSKGLHNVVYGIQRGLGMEVFPVDLIYRPWKHAEGQLSFIQHSLINPEIFCFADYPCHTVATDILKAPPEDDNREIATWKSLDLIESLLRLAEVGQYEQVKQLFSFPIKHCPDMLVLALLQINTSWHTLRHELISTLMPIFLGNHPNSAIILHYAWHGQGQSPSIRQLIMHAMAEWYMRGEQYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDLAALASRREYLKLDKWLTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPPETLATMLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSASSLDAISPVQIDPLGGMASLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSPAKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGGLGTGSLTGIGTGALGLPAVNSDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEIDDEANSYFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYRFFPQYPDKELHITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKMYYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHLASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRDPPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVSTMVTTSTTTTVAKTVTVTRPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIAFIFNNLSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYSNFLDTLKNPDFNKMVLNETYRNIKVLLTSDKAAANFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKNKPILHTDLDVKSLLLEAYVKGQQELLYVVPFVAKVLESSIRSVVFRPPNPWTMAIMNVLAELHQEHDLKLNLKFEIEVLCKNLALDINELKPGNLLKDKDRLKNLDEQLSAPKKDVKQPEELPPITATTTSTTPATSTTCTATVPPQPQYSYHDINVYSLAGLAPHITLNPTIPLFQAHPQLKQCVRQAIERAVQELVHPVVDRSIKIAMTTCEQIVRKDFALDSEESRMRIAAHHMMRNLTAGMAMITCREPLLMSISTNLKNSFASALRTASPQQREMMDQAAAQLAQDNCELACCFIQKTAVEKAGPEMDKRLATEFELRKHARQEGRRYCDPVVLTYQAERMPEQIRLKVGGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMKQAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHAIPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSRNSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLLVLKALQDGRAYGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLNYMAVAFAMQLVKILLVDERSAAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGLPQLMEVVRSNYEAMIDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLREKAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQMHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTIIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVLETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFKYLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVSSEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS	147639	203525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_147697_148627_148797_149785_149913_150061_150173_152884_153056_153449_153578_154087_154329_156611_156732_157505_157629_157820_157973_164098_164250_165471_165674_166774_166922_168032_168158_168451_168739_169641_169721_171512_171744_172063_172205_173118_173299_175074_175192_175541_175653_175976_176055_176225_176404_177179_177311_178575_178873_179498_179640_179732_179838_180469_180590_181691_181884_182442_182586_183103_183213_183315_183486_184370_184603_187001_187251_188083_188248_188451_188570_190181_190284_197011_197186_198340_198491_199802_199984_201362_201496_202873_203009_203189
890682	contig_4812_pilon	-	2900	7	Intergenic	novelGene_103709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_5	660.076931543252	1207	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1839	1060	2898	944244	931924	FALSE	25	TAATTCCACTTCACTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTAFDKERMDKDLGSVQGFEDINKSERTESVEAGDDDSKLDDAQSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDWSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFTKVKETCQRLLEKPK	952245	931921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_932124_933365_933519_935594_936111_943274_944451_944834_944939_946403_946960_952052
890683	contig_4803_pilon	-	4846	29	Intergenic	novelGene_150704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	503.089845710627	23	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	192	1244	66839	41896	TRUE	25	ACGTTAAAATTTTGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDESTSRHVYLIRSSLQTYEVGKRSNFILHVFSRCFFLFFLLSSGKSQRRKSKEVW	93257	12598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20172_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_42058_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
890684	contig_10868_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_173893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406606	405611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_405978_406536
890685	contig_3414_pilon	+	4680	14	Intergenic	novelGene_80961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	919	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2768	3082	67134	70789	TRUE	70	ACGGTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKTRRKEVTVLIFKATECILHIFKKLCVVSLDLCLAIFHWILEFHGGKFIEDLPHVLTDNGPCDFIVTLGSGFNSSTGHIIKRNHVGQHSYCLVEWAEPRS	64366	101989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_67265_69035_69214_70783_70875_76897_77097_78450_78521_79117_79233_79321_79444_89138_89249_89785_89949_93529_93681_95072_95209_95420_95642_98057_98187_101892
890686	contig_6102_pilon	-	4557	2	Intergenic	novelGene_32135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	680	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGAAATGAAGCAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835111	830317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_831838_832074
890687	contig_13707_pilon	+	3476	37	Intergenic	novelGene_43511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAAAAAGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108254	181991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_108762_117271_117388_119119_119212_120857_120945_123492_123576_123738_123823_124055_124128_124906_124999_125127_125219_126019_126104_127933_128020_131442_131530_133607_133724_136406_136476_140260_140305_140788_140858_140952_141045_141609_141648_143000_143069_143215_143307_143970_144008_145175_145246_145939_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152164_152695_152762_153124_153216_154404_154441_155990_156059_159282_159370_160630_160765_169937_170046_172845_172986_174885_175004_181856
890688	SIRV6	-	1177	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCGTTCTTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11820	7178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7806_7923_10723_10825_11035_11109_11205
890689	contig_16594_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_53904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTCGGCGGCAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255179	256882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_255200_256900
890690	contig_4769_pilon	-	5454	29	Intergenic	novelGene_118014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.416601046646	879	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1039	3120	47	3166	1213770	1067603	TRUE	50	TGGAAAAAAAGGTGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAAAYCPVGFLEQEMQGGEDGEIQSGFTRCCEWLRCCGGGEPRPRTVWLGHPEKRDQRYPRNVINNQKYNFFTFLPGVLFNQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGFVLVVTIIREAVEEIRCFMRDKEVNSQVYSRLTARGTVKVKSSNIQVGDLIIVEKNQRVPADMIFLRTSEKNGSCFLRTDHLDGETDWKLRLPVACTQRLPTAADLLQIRSYVYAEEPNIDIHNFVGTFSREDSDPSVSESLSIENTLWAGTVIASGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSKIGLFDLEVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPISLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVRSSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEMVFKRLHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQQSQDPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVHEAVKAIALCHNVTPVYESNGVTEQAEAEKQYEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVGLTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGADVVMAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKLSVHDRSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETATCTAKNAHLVTRNQDIHIFRLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLKYYEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLCRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS	1213816	1063098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1064339_1066554_1067740_1072549_1072754_1075396_1075455_1076035_1076145_1077586_1077652_1080421_1080578_1084434_1084500_1086248_1086394_1086491_1086582_1088205_1088305_1091797_1091969_1093376_1093461_1094774_1094868_1102704_1102867_1116423_1116637_1127766_1127880_1129136_1129280_1130772_1130934_1132352_1132430_1139418_1139495_1141096_1141178_1146646_1146742_1148729_1148782_1150089_1150149_1162699_1162809_1173191_1173306_1176352_1176498_1213726
890691	contig_19402_pilon	-	2149	6	Intergenic	novelGene_80861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	575.148885072378	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	8	679	193194	168201	TRUE	35	ACTATATTGTTTTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGMPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSR	193201	166559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167989_168159_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
890692	contig_6673_pilon	+	2499	2	Intergenic	novelGene_164022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	831	1669	2499	258413	259243	FALSE	40	CAGTGGGATGACATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAARAKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARR	111208	259243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_112085_257620
890693	contig_4125_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_25225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	90.5	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	82	363	1707819	1708100	TRUE	35	CCATTAAAACCATTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRPPINTSPTPAAVSGSPFGIQTEGPMSGTSGHQGCSLAGAQGPDTKMPGLQSWLVLCYSALSQSRAGAPSPFSQACRCLAPPLFPSKDGELTTTVSSFSWTCSHGPRDPAEVLHHKGH	1707737	1712172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1708181_1708685_1708777_1711115
890694	contig_960_pilon	+	3931	4	Intergenic	novelGene_108295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	722.758296773932	106	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2787	3086	1046840	1055443	FALSE	15	TTTCTGGATTCGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEPEDVQETPAPESTSGSVSAANLSVAIQDEGRSDGSNLPSSSTNESALQCSASFKDDAGENTALLEAGRSDPQRGGPVSSCAFPRAAGGVVDTAPA	1037055	1056288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1039765_1046762_1046846_1053830_1054030_1055348
890695	contig_12123_pilon	-	3596	1	Intergenic	novelGene_144617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	469	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCTTTATTGTGAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174629	171033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_171000_174600
890696	scaffold_4438_pilon	+	3955	4	Intergenic	novelGene_174528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1311	1649	78907	79245	TRUE	15	TGGTGGAGGCCATGGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	75984	90931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_77123_78734_79653_82252_83676_90455
890697	contig_11269_pilon	-	5315	9	Intergenic	novelGene_145819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1798	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGGCCTCGTTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338538	323956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_324092_324356_324391_325396_325504_326054_326192_327158_327208_327815_327895_328843_328959_333520_333623_333981
890698	contig_5718_pilon	-	7283	3	Intergenic	novelGene_110357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2934	3248	715114	714800	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVVQRRPFFPLRLNSLLQKNKSPQQNIFTQLLDCQACVVFSYFPLDGTCKLVPRCWGLPNILDSLLSSCSGEPPSCVVLTAIFGGACWTSTYLSEVQQHLG	718089	689101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_692492_714154_717699_717740
890700	contig_12638_pilon	-	2605	16	Intergenic	novelGene_33091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	14	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAATACACATACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200474	170775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_171970_172046_180793_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191804_195500_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
890701	contig_9415_pilon	-	4353	16	Intergenic	novelGene_109828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1094	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGGGTTTCCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2017285	1925819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1926056_1952292_1952352_1956401_1956534_1976235_1976323_1980592_1980673_1981918_1982002_1983784_1983901_1986732_1986841_1993454_1993609_1999791_1999897_2000075_2000157_2010364_2010482_2010955_2011072_2011222_2011291_2013396_2014732_2015809
890702	contig_6137_pilon	-	3034	6	Intergenic	novelGene_59158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2456	2986	1300377	1239072	FALSE	30	CAAGTGAGCTTTGCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLLDARGSPFSLGVDSPVKPNETNEVQESSDKGLERCLVKRTSCRAYCLIPFYQKKYLDFTDLESSNKEPTTDCDPRSTCSEFLSLRNTQFPRLLQSTTTGNINQIFSSLQSWRLACPKVCGSGIGCRRLLTHVLQGLMNPEPTGQMAVCWLTGLWSWQIPKLAGQLTSYWLKS	1308274	1239023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1239268_1240379_1240549_1268907_1268969_1278795_1278880_1300356_1300429_1305870
890703	contig_3727_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_146742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	48	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	20	CCTGGACTGCCTCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	308298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
890704	contig_7963_pilon	-	3670	10	Intergenic	novelGene_58440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	568.223113022376	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	765	1835	123098	120628	TRUE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126294	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_125563
890705	contig_8674_pilon	+	4691	1	Intergenic	novelGene_102939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	795	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACATATGAAGCCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456241	460932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456200_460900
890706	contig_10855_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_124342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAGAAGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547766	550192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_547800_550200
890707	contig_9834_pilon	-	4579	3	Intergenic	novelGene_178596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2433	2885	106025	101285	FALSE	10	TTTTTCCATCTTCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGMSLCVCAEYISSFQAMWYCPARSGSQAEKRERKQANKLKQNKSEQTNKKVPGDFFIFLSDFSSNRVVSKCLSSIFMILSSIVSNVLLSPSMTLSISEMLLCIFWISNCCFCMISSCEFILAFCSRIIFLNSSSFLSVCSVNLSDFS	121564	99590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9834_pilon_-_101570_105857_106920_120026
890708	contig_405_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_135309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGGAAAATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371792	374162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_371800_374200
890710	contig_11855_pilon	-	3689	13	Intergenic	novelGene_66960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	2115.10182969993	123	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	524	1459	1087425	1080724	TRUE	25	CTAGTCCGTTGTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKGQKIRLLD	1102138	1077218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079208_1079312_1079454_1080623_1080750_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
890711	contig_7045_pilon	-	1530	1	Intergenic	novelGene_77483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542801	541271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_541300_542800
890712	contig_1248_pilon	-	3461	2	Intergenic	novelGene_178286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2886	3230	95243	94899	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDITTDPTEIKRIVTEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIYRRACTSTTQAISEHRRGSNTSKFIL	99799	94667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1248_pilon_-_96496_98166
890713	contig_6497_pilon	-	4389	7	Intergenic	novelGene_35563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTCTGCCTTTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171679	156420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_156526_161344_161443_163400_163479_165790_165866_165999_166547_166879_166973_168286
890714	contig_610_pilon	+	1834	2	Intergenic	novelGene_76779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1539	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATAGCTCTTACAACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235000	276409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_236776_276350
890715	contig_9759_pilon	-	877	4	Intergenic	novelGene_167231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	66.2436579773658	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	229	690	98155	97089	FALSE	10	TGTGGGATGGGCTTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRDENTRSTNRVLRISQLDALELNKALEQLVWSQFTQCFHGFKPGLLARFEPEVKAFLWVFLWRFTIYSKNATVGQSVLNIQYKNDFSPNLSYQPPSENQKLWYAICTVGGKWLEERRYDLFRNPHLTSFWKIQQCVNVVIGLLKLGTTKC	124233	96901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_97106_97710_98173_99886_100002_124137
890716	contig_11413_pilon	-	3445	9	Intergenic	novelGene_103197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2899	3342	610877	596948	FALSE	20	TTGTACATCTCCAGGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLTIFFIFSILCFITVIHFIFAFVFCLFRLLTISVCFHLFLFSSFYKLLWLLGPCACNATAFQTVGGIHFPRGSCCVLHFFDMSFNQFQWYFLPNPRKLLQSCFCCSRCHTWVYHRGQESNSAHDWVSRLTEGDRLVGQRPKGSI	655401	596844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_597086_598033_598194_607524_607585_610791_610905_611578_611736_620299_620437_629137_629398_651822_652002_653263
890717	contig_13123_pilon	+	2110	6	Intergenic	novelGene_136890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	205.780076781014	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	150	638	434529	444679	TRUE	60	AAAAAAAAAATCCACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDRSVPVRLHVSRIMLKNVEDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434379	446224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434618_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546_444879_444951
890718	contig_8310_pilon	+	2734	21	Intergenic	novelGene_75568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	387.458630049712	6	88	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	513	2426	283403	325825	FALSE	75	ACAAAAAAGGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFHSPLRLKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDCKFSEKHFGI	272454	326133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_272569_277845_277970_278167_278251_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320663_325589
890719	contig_12429_pilon	+	4078	2	Intergenic	novelGene_136221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1562	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACAGTGTTTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340124	370670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_341545_368012
890720	contig_7728_pilon	+	4422	9	Intergenic	novelGene_64708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4689	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCATGAAAATGGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713430	755356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_713815_716036_716171_724821_724914_724993_725101_726429_726578_729257_729336_730499_730551_735944_736057_752040
890721	contig_8954_pilon	-	7580	15	Intergenic	novelGene_130267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1077	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGGAATAAACTCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188688	102234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_102345_123639_123762_144171_144424_147207_147306_148184_148243_159257_159427_159661_159779_159873_162881_163395_163565_164940_165033_169408_169552_173746_173876_174333_174401_182928_183066_185778
890722	contig_4211_pilon	+	3024	1	Intergenic	novelGene_80247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2375	2728	1147019	1147372	NA	15	TTTTGGAGTGATGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLIFIVISFSTDLFFQCCTLLCLELYFNSFATEILYPVSCNLSEETHIQIKIFLLKDQIASEIMRLLWLSKRRNFLEQNHTESSSLSVGTFVGKKNHLKLRPKCIPNNVKLCEMF	1144644	1147668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1144600_1147700
890723	contig_10134_pilon	-	2276	3	Intergenic	novelGene_16181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	514.5	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTTAGACTCTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39681	29372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_30271_34922_35178_38558
890724	contig_8050_pilon	+	2039	4	Intergenic	novelGene_114875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_3	195.040166803319	162	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	32	427	443745	446974	FALSE	30	TGTATTGGACATCCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDCVHFLKEEMVKSSKESKHKMSYSGRVKTLCLQKNTALWIGTGGGHILLLDLSTRRIIRIIHNFCDSIRVMITAQLGNLKNVMLVLGYNRKSTEGTQHQKEIQSCLSVWDINLPHEVQNLEQHIEVRKELAEKMRRISVE	442714	448586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_442739_443737_443951_445959_446028_446852
890725	contig_6440_pilon	+	2941	5	Intergenic	novelGene_161652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	164.869645477874	1433	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	4	744	9806	12858	FALSE	5	TCACCTCTTCTGTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDEQREGLQEELIDIILLILERNPQLHYYQGYHDIVVTFLLVVGERLAASLVEKLSTHHLRDFMDPTMDNTKHILNYLMPIIDQVNPELHDFMQSAEVGTIFALSWLITWFGHVLSDFRHVVRLYDFFLACHPLMPIYFAAVIVLHREQEVLDCDCDMASVHHLLSQIPQDLPYETLISRAGDLFVQFPPSELAREAAAQQRAERERQPLPSKTLSWRQPSRGLTWCCGSGFGDFCGLRTQQKMS	9802	15055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_9991_10165_10268_11195_11338_12289_12478_12734
890726	contig_6497_pilon	-	2756	10	Intergenic	novelGene_35562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTTTTCCCACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181403	156415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_156526_161344_161443_163400_163479_165790_165866_165999_166547_166879_166973_168286_168338_174092_174192_176994_177038_179841
890728	contig_9389_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_84119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	251	334	1415249	1415166	NA	60	ATGTAAAAAAAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLFNVCAEQITQEAGLYDEEQGIRIGGRLINNLRYTEDTTLLAESEEDLKHLLVKIKDHSLQYGLHLNIKKTKTLTTGPVSNTMINGEKINVVRDFIILGSTINTHGSNS	1415499	1412872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1412900_1415500
890729	contig_8673_pilon	-	2567	1	Intergenic	novelGene_129909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	150931	150632	NA	30	AGTAAGGATGGCGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQWLYLWTLPDGIHRNQFDYICGKRRWKSSISSVRTRPGANCGADHQLLICTFELQLKKIRTSLQEPKYDLEYIPPEYRDHLKNRFDALNTNDRRPDEL	150932	148365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_148400_150900
890730	contig_6593_pilon	-	4555	2	Intergenic	novelGene_49855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCAATCATAAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259478	1254574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1254811_1255159
890731	contig_2917_pilon	-	3278	7	Intergenic	novelGene_147583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	194.118019657	821	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	103	1152	124032	93080	FALSE	45	GTGACAGTAGTAACAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGTSLRAVAGRGGPVGLTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124134	90953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
890732	contig_6027_pilon	+	3954	13	Intergenic	novelGene_74454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_10	100.195745917679	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	1200	2627	299493	339364	FALSE	40	AAAAGTTTCCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSERTLLKERYQEVLDKQRQVENQLQVQLKQLQRRREEEMKNHQEILKAIQDVTIKREETKKKIEKEKKEFLQKEQDLKAEIEKLCEKGRREVWEMELDRLKNQDGEINRNIMEETERAWKAEILSLESRKELLVLKLEEAEKEAELHLTYLKSTPPTLDTIRSKQEWETRLNGVRIMKKNVRDQFNSHIQLVRNGAKLSSLPQIPTPTLPPPPSETDFMLQMFQPNPSLPPRMPFSIGQVTMPMVMPSADPRSLSFPILTPALSQPNQPSPPLPGSHGRNSPGLGSLVGPHGPHMPPAASIPPPPGLGGVKASTESPRPQPVDKLEKILDKLLARFPQCNKAQMTNILQQIKTARTTMAGLTMEELVQLVAARLAEHERVAASTQPLGRIRALFPAPLAQISTPVFLPSAQVSYPGRSSHAPATCKLCLMCQKLVQPSELHPMACTHVLHKECIKFWAQTNTNDTCPFCPTLK	294912	340691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_296046_296730_296791_299486_299628_302273_302414_334511_334609_334778_334868_335732_335824_336016_336116_336309_336687_336820_336954_337166_337272_338293_338390_339298
890733	contig_5434_pilon	-	2748	12	Intergenic	novelGene_74672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_8	133.614160183915	606	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	127	1599	379651	325255	FALSE	20	TTTTTTAAGTCTTGATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQDGGGRPERLGPAVEAGRDSPLGPAGPGVAAAAPGIEDGKMTQGKKKKRAANRSIMLAKKIIIKDGGTPQGIGSPSVYHAVIVIFLEFFAWGLLTAPTLVVLHETFPKHTFLMNGLIQGVKGLLSFLSAPLIGALSDVWGRKSFLLLTVFFTCAPIPLMKISPWWYFAVISVSGVFAVTFSVVFAYVADITQEHERSMAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQIMKFSPESVAAFIAVLGILSIIAQTIVLSLLMRSIGNKNTILLGLGFQILQLAWYGFGSEPWMMWAAGAVAAMSSITFPAVSALVSRTADADQQGVVQGMITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	379777	324105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326885_331417_331516_333049_333163_345064_345137_345931_346046_347592_347812_350267_350383_352241_352370_353137_353201_363117_363214_379567
890734	contig_9668_pilon	-	6643	2	Intergenic	novelGene_58266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1323	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2512	2988	667373	666897	TRUE	45	AGATATAAAACCAGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVLAIPFGTEASRLLVSLVSLASASVSCGLLALGPHACICPAGASVPKLCSSTDKCPEAPHSARKPPAHGHSAPLLRGSASLAPPISVRRHTTPPGSLLHTGTQLSCSVGRLQCHLALVSWFCCCWFSAAAASLLLLVLCHCRMSIHSQF	669884	659160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_662776_666856
890736	contig_16098_pilon	-	1525	11	Intergenic	novelGene_45972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1404.8586441347	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1407	118	1524	352350	348289	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVKPQCRSYRSAWIDWRRQSRPSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFSG	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348476_348906_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
890737	contig_11281_pilon	+	2961	2	Intergenic	novelGene_125477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGAAGTGGCTTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868229	871277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_868362_868448
890738	contig_4232_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_63344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTGTTCTTGGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468081	466987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
890739	contig_3132_pilon	-	2693	10	Intergenic	novelGene_127418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	102.294901698864	364	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	149	1276	229252	210841	FALSE	30	TCAATATCTATTTACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229400	209423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
890740	contig_7707_pilon	+	3224	18	Intergenic	novelGene_72146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	32	junction_17	365.837948884873	612	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	924	2775	306	3080	182964	280854	FALSE	15	TTATATGTGTCTTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGLDHLKNDYRRRFCRPSRAPDINVEQGQNILEILQDCFEEKSLANDFSANSTKSVPYSTPKIKDTCIQSPNKERQKSHPKALPPSSRKKEGCLQLVVEPNEDVSKSVQAHEVYQKILATDVGSENTAHLKNVSSRKQNDHHNEADEEFYLSVGSSSVVLDSKTSLSQNAVPSIAQKRETYTSENSLNMLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPIKENQKKVKEEFKNKYFSNGPKKKNLVPEEATLTITKSQRISRRPSNWWEVTSEHSPVGSSSSLIKNELPLHHKSRQKLAEKNQSSKNTRRETTAFKRRKTATQGSSRAQTFLNAKDSGGIIDHDEISSSQNESLESDEANLAKKKHLDCSGATGSSQNQHSSDSISTEQNVRLKSQTSGYTWKKGSDSKKLGTSVLEGSGPSKLQKYMMSGKNNSDMGRKEAQESSVLPSNTPNVRRTKRTRLKPLEYWRGERIDYQASQSGGFVVGGVLSPDTVSPRGKKANRKTGKVNKITNKKRICHDSGERKNKLVANLNIPLGDPFQPTRVKDPETRESILMDLVRPRDTYQFFVEHEELRVYKTLDTPFFSTGKLILGPCQEKGKQHVGLDTLVFYVDFGDLLCTLHETPYLITTGDSFYVPSGNYYNIKNLLNEESVLLFTQIKR	182658	280998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_190409_190457_200052_200124_200805_200901_213078_213179_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626_240822_247976_248266_254333_254478_256572_256656_269222_269328_270102_270235_270865_270962_272829_272985_278604_278696_280783
890741	contig_5686_pilon	+	2343	14	Intergenic	novelGene_45232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_13	1558.76013921246	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	58	1950	93843	215344	FALSE	80	AAAAAACAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKLQVSTSGSQGAS	93785	215737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_215305
890742	contig_8310_pilon	+	3518	20	Intergenic	novelGene_75558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	342.881475689765	1822	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	96	2198	272460	324814	FALSE	75	CAAAAAAGGAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215095	326134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
890743	contig_8631_pilon	-	5293	21	Intergenic	novelGene_121960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	913	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2485	2829	845382	845038	TRUE	35	CCGCCTTAAAACATCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKPKVSIKGDPPSRPIPLSELRHKTHAVEEEPSAVMVLGQRWVVSRALEKGGLALLLARLLGRFFGNGLAEVFAAAFTLPLTVVFTRLHSLFQAVLQKCGRTADSTFFFPCLI	847866	739514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_739568_765459_765590_768275_768465_773520_773561_786351_786478_787692_787842_790569_790640_792115_792228_794051_794146_798996_799133_799249_799385_807739_807892_809943_810069_810150_810286_811011_811078_820244_820333_821709_821809_832095_832188_832698_832797_843966_844095_844790
890744	contig_10732_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_114689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	622	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGCACCTTTGTCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87333	84231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_84200_87300
890745	contig_12279_pilon	+	1129	6	Intergenic	novelGene_50107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3417	junction_3	967.051187890279	123	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	47	649	68297	77128	FALSE	60	AATAAAACAAAAGCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERHPGQRREPLNIKMTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57556	77608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
890746	contig_3077_pilon	+	1866	7	Intergenic	novelGene_26802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	735.990866489222	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	361	1137	476826	481662	FALSE	25	GATTTAACGTGTGGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467411	482391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474133_476799_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
890747	contig_6227_pilon	+	3575	15	Intergenic	novelGene_49627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGCTACCTGGGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340081	406532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_341549_342963_343183_343465_343584_349057_349124_349955_350052_352948_353075_354369_354511_355149_355317_356187_356565_359403_359520_361756_361851_389523_389674_392434_392538_395032_395333_406497
890748	contig_13798_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_178531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTTAATTATTCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107811	105310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_-_105300_107800
890749	contig_753_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_112977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191041	1192926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1191000_1192900
890750	contig_5732_pilon	-	2404	2	Intergenic	novelGene_119581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCCTTTCTGGTTCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150194	147745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_149646_149690
890751	contig_10722_pilon	-	6088	6	Intergenic	novelGene_70964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_3	223.600178890805	1239	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	4712	5611	6730	4150	FALSE	35	TAATAGTACAATGGCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	11441	3672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637
890752	contig_8210_pilon	-	4434	8	Intergenic	novelGene_30212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1371	junction_7	780.902852668706	26	125	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	215	1333	37758	15712	FALSE	30	AAAGGACTTTTTTTTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	53044	12610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37636_37803_52874
890753	contig_6102_pilon	-	1794	14	Intergenic	novelGene_32340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	322.79920297886	1	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	354	1568	1690301	1685481	FALSE	25	AGCAAGGCTTTCTGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGHVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691018	1685254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688299_1688478_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690711_1690853
890754	contig_8241_pilon	+	2744	5	Intergenic	novelGene_157477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACTTGCGTGTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7053	129281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_8140_53057_53145_112620_113123_128170_128315_128356
890755	contig_16775_pilon	+	1958	13	Intergenic	novelGene_107760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	284.541541587321	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	601	1356	158999	174136	FALSE	40	ATAGTACATTTGATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130319	174738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
890756	contig_7009_pilon	+	2409	9	Intergenic	novelGene_23620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	584.064088414105	151	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	177	1136	444955	528034	TRUE	55	AGAAGAAGAGGAAGCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVAPYIVPGVLKACKSLSKAQQLVSICLEEQRKKERQE	431116	565354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_523002_527924_528460_564506
890757	contig_12644_pilon	+	1500	9	Intergenic	novelGene_44597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4276.01495078946	20586	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	58	1122	2675526	2680255	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNVGDHLFYY	2675468	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107
890758	contig_5643_pilon	+	1150	9	Intergenic	novelGene_38902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	764	1072	269754	270903	FALSE	20	CTACTTCAGCCAGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRSIADFSSIFSTSATPLDSVSIGSSVLSFTSVFSTFSSPSGGSTRTFSSSEAGAGGCVHSTVASGTADLTSFSPSVFSSSLRLFSSILIPSWVGQVQEY	263841	270981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269045_269297_269434_269736_269807_270274_270407_270512_270610_270876
890759	contig_1435_pilon	-	3534	3	Intergenic	novelGene_115498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1076	1510	511880	511446	FALSE	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPLNPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIVKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDVMLSEISQSQKDKYCMRPLLSKLMKKFTHKM	664321	509421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_511958_598399_598926_663849
890760	contig_11986_pilon	+	2649	1	Intergenic	novelGene_69188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	2010	2549	617274	617813	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPLSTNFTNSDTNRTLLLCLVPPARFSATASQTTCVFIGVGGILSLLWNWLCFKAKLANPLGGPQLPYLHSPAQSLGWELEDHGDKGHTKAIHRTAKGNEILIDATTRMHLENRTLSGRSQTQKDRFCTTLLQEISRIGECIRIRVYPWSPGATGRRGGELLLHGCKVSVWSDKKFWK	615264	617913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_615300_617900
890763	contig_5574_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_155863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTTGTGTAACCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200764	198717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_198700_200800
890764	contig_5917_pilon	+	3502	4	Intergenic	novelGene_122155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAATTCACCATGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577625	681124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_577760_577987_578096_578755_580086_679194
890765	contig_12638_pilon	+	1775	16	Intergenic	novelGene_33158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	177.0517061953	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	55	1575	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235621	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269560_269802_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
890766	contig_8377_pilon	+	4551	3	Intergenic	novelGene_35059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.5	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAGAAAGATAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105331	122067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_106376_114758_116892_120693
890768	contig_2933_pilon	+	3353	2	Intergenic	novelGene_111318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1054	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1711	2031	425066	425386	FALSE	20	TTCATTTGGAATTGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLFLRAFLFYLVISEQAGCAFCVVCSSVGIILFTSFSNGDSQSLSFGTAGQVQLKGSCLDGLFVARTRADSVKQCRAGSSRLCLCCLGVLCSAHGAGRQEGGGRL	408124	426708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_408308_423538
890769	contig_5954_pilon	-	1838	2	Intergenic	novelGene_28765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACACAATAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392772	1390862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391499_1391570
890770	contig_13702_pilon	+	2481	2	Intergenic	novelGene_102627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2152	2451	211071	211370	FALSE	95	AACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	208824	211400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210636_210730
890771	contig_11978_pilon	+	2077	5	Intergenic	novelGene_62919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	100.452414107377	857	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	23	811	860845	866962	FALSE	40	CAAATGACATCTCTTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAGAGMLRGGLLPQAGRLPTIQTVRYGSKAVTRHRRVMHFERQKLMALTEYIPPKLAINPRCLPPPPSPPQEETGLIRLLRREIAAIFRDNRMIAVCQNVALSAEDKLLIRHQLRKHKILVKVFPNQVLKPFLEGSKYRNLLPLFVGHNLLLVSEEPKVKEMVRILKSVPFLPLLGGCIDDTILSRQGFINYSKLPSLDLVQGELVRGLSFLTAQTHSLLQHQPLQLTALLDQYIRQQHEGDSVQPASRKLDPPDSVLDS	860822	868228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_860897_862874_863045_865281_865447_865690_865836_866705
890772	contig_9400_pilon	-	3477	8	Intergenic	novelGene_146575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	500.67823387636	55	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	115	519	135537	121567	TRUE	5	TTGTTGGACTCTTTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRNN	158630	117724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_120654_121537_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_135452_135561_158539
890773	contig_7411_pilon	-	2633	2	Intergenic	novelGene_136990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATTAGACAGCAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221205	218051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_220658_221178
890774	contig_16575_pilon	-	1078	10	Intergenic	novelGene_146497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.9748455358353	551	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	35	991	26213	13212	TRUE	10	TGAGTTCTTGGTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRDNLVELSKAKYSRNVVKKFLMYGSKPQIAEIIRSFRGHVRKMLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQK	28068	11751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_11832_13204_13320_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_28044
890775	contig_17796_pilon	-	3071	9	Intergenic	novelGene_33761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1203	1577	15037	14663	TRUE	65	TAGAAGCAAAGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNNHTDVIAQYQQWKALNTEPDFSLCTRTQSLCRSFLTDEPLTSHLLVCHEEEQLLNWVCKAENIWKENRHCSPCHYICNVPEGGLQKHPGAVVLGKGRRVRGGVSLQKVTLKHPAYYWILLF	42438	8152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_8243_11783_12178_13652_15320_16867_17089_18021_18198_20415_20617_34897_34980_40842_40953_42308
890776	contig_4088_pilon	-	8029	11	Intergenic	novelGene_178053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3306	160	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	4242	4850	388605	386651	TRUE	15	CACCATGTTAGCTCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGRCFLDKRLCLRETEEAECGCRRVENGKAYITNCWRSGTPQEEGNMAYGARHLSEKRGRWGEASEKSKEAGKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQPALPGQETVATGSRGGQAGVKRGGEWEGTQRKLPAVLSPAVRSVRLLSRTRLLVSDRSRRWWIRAALAAGRLLCVELRWIWERGERNRSQKHTNKKEC	393003	23283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_23566_28860_29846_91972_92124_233457_233594_233731_233747_338420_339180_385537_385636_385897_386743_387787_388046_388346_389989_390145
890777	contig_610_pilon	-	7785	10	Intergenic	novelGene_76655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	495.589435812436	1280	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	207	1253	68933	32917	FALSE	55	GCCAAACAGTCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	93780	26384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887_68955_69978_70099_93715
890778	contig_4751_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_173735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389066	391101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_389100_391100
890779	contig_5794_pilon	+	2740	10	Intergenic	novelGene_69791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTCAATATGAGACCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741882	749530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_743602_743693_743763_743854_743984_746079_746134_746225_746321_746402_746495_746807_747018_747096_747243_747328_747453_749428
890780	contig_6031_pilon	-	2354	3	Intergenic	novelGene_56763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1109	junction_1	699.5	214	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	108	692	257696	256126	FALSE	15	GAGTTGCCCTGATGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGMSASPAPPEGR	257803	254463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_256375_256704_256814_257469
890782	contig_6137_pilon	+	2626	1	Intergenic	novelGene_59201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCTCCCAGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305005	1307631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1305000_1307600
890783	contig_3095_pilon	+	5444	3	Intergenic	novelGene_75195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	59	junction_2	1410.5	217	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	260	658	226165	226800	TRUE	20	CTGAACTAGAGGTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	225905	249139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_226409_226645_226824_244376
890784	contig_4211_pilon	-	2928	4	Intergenic	novelGene_80246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	907	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1340	1654	1146329	1146015	TRUE	75	AAAAAAAAAAAATCACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRNLKYWGKKRRKKKVETLYRQKSKFFKGFCVPCTWGQFVHTSEMNTSYNASSCSNDVESWSRCGNDVTVWFFLCQLNSLLLFKNQEAVELCCSLLSVRVST	1147668	1140187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1141181_1142862_1143011_1144657_1144740_1145963
890785	contig_10990_pilon	+	3792	19	Intergenic	novelGene_7452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_2	430.914001331136	11	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	1991	3775	723621	752144	FALSE	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708551	752161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_714557_715994_722232_722433_722635_722699_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
890786	contig_12677_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_110859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTAAAAGGTTAACGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3223_3343
890787	contig_6375_pilon	+	2084	7	Intergenic	novelGene_73066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	305.524003421444	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	99	1070	688758	703083	FALSE	85	AAAAAAAGAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPASAPDTRALVADFVGYKLRQKGYVCGAGPGEGAAADPLHQAMRAAGDEFETRFRRTFSDLAAQLHVTPGSAQQRFTQVSDELFQGGPNWGRLVAFFVFGAALCAESVNKEMESLVGQVQEWMVVYLETRLADWIHSSGGWELEAIKARVREMEEEAEKLKELQNEVEKQMNMSPPPGNAGPVIMSIEEKMEADARSIYVGNVDYGATAEELEAHFHGCGSVNRVTILCDKFSGHPKGFAYIEFSDKESVRTSLALDESLFRGRQIKVTPKRTNRPGISTTDRGFPRARYRARTTNYNSSRSRFYSGFNSRPRGRVYRSG	688217	704097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_688308_688749_689190_700171_700287_700997_701066_701386_701494_702745_702834_702921
890788	contig_17274_pilon	+	3050	1	Intergenic	novelGene_26491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTAGATACTGGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39608	42658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_39600_42700
890789	contig_2830_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_165854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1453	1851	700636	700238	NA	40	ACCTCATACCTCCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLKIENQKGRTLLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSMGKILNDAGNIKRRLKEYTGSLYQKGLVDVQPCQEVAYDQELMVLKEEVQAALKTLAKNKAVGVDRIPTEMFQQMDAELEVLTRLCQEIWKTAT	702088	699775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_699800_702100
890790	scaffold_19766_pilon	-	1736	6	Intergenic	novelGene_34396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	93.7200085360645	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	440	826	827397	825937	FALSE	30	ATACCTGGAATTTATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQCETMLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	830531	825026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826309_827289_827413_827987_828085_828182_828315_830336
890791	contig_7963_pilon	-	2371	9	Intergenic	novelGene_58463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_6	622.766797746155	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	703	2109	125592	120628	TRUE	35	GGGGTTGATGAAGATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126294	120242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122459_122993_123132_123746_124051_125563
890792	contig_20694_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_141246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCGTCAGCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45942	43982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_-_44000_45900
890793	SIRV6	+	1498	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
890794	contig_2214_pilon	+	2766	20	Intergenic	novelGene_144254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_7	272.354227954634	514	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1707	1060	2766	287679	299299	FALSE	55	AAGAAGAAGTTGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEESKDQMEKEMLEKIEKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSVKLEQAMKEIQRLREDTDKANKHCSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKTDNEKIQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLSCQIEKLEHEISHL	277744	299299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_278107_279612_279718_281612_281687_284756_284854_286124_286229_286560_286726_287108_287204_287621_287703_287780_287869_288604_288746_289158_289251_289492_289691_292870_292979_293993_294221_294869_295034_295646_295781_295859_296009_297123_297287_298554_298690_299215
890795	contig_960_pilon	+	2505	1	Intergenic	novelGene_108296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	25	351	1038574	1038900	NA	35	TAATCTTGAGAAAGGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGNTVVIMISYPKGRELLDLVQRGIPVKMTIGIGTRHVQEFISSQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQFGNQVISDNFLSLFFKRIVCKYFRYLLLKVVYLTIF	1038549	1041054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1038500_1041100
890796	contig_3956_pilon	+	1728	2	Intergenic	novelGene_14755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_1	0	30	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	23	1054	794009	796007	FALSE	25	TCCAAACAATCTGTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSGNRLQMLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793986	796681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007
890797	contig_7963_pilon	+	3433	5	Intergenic	novelGene_58420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_3	253.47090562824	1462	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	53	556	89963	92106	TRUE	30	TTGACAAGAAGTGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSGVLTVGLHILMTLPSPQEAGAIQADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDGEQLFSVDLKTKEAVWRLPEFGNFAHFDPQGGLVSIALIKAHLDALVERSNRTRATNVPPKVTVLSKYRVELGQPNILICIVDNIFPPCNQHHLAAQWSDNHPGCGPDQLLFPA	89910	95524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_90045_91241_91491_91933_92217_92314_92451_92893
890798	contig_5566_pilon	-	3053	4	Intergenic	novelGene_153679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.89949493661167	119	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1600	1950	253491	253141	TRUE	20	GAAGCCCATCTAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKIEAVKDFILLGSTINTHRSSSQEIKRRIAFDKSAAKDLFEVLKSKDVTLKTKVRLTRAMVFSIASYACKSWTMNKEDRRRIDAFELWCWQRILNIPWTARRTNKSVLEEV	269002	250769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_251566_252833_254729_255269_255560_268930
890799	contig_6027_pilon	+	4138	15	Intergenic	novelGene_74453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.426226278143	559	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	708	2819	293176	339364	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEGAGGVGSAPSPPESSSLCASKSEEGLPDGLSPKDPAQKPKNLPLSSVSSQAVTKENNRNVHLEQPEQNPGSSAGDTSAVHRVILGENVVATALCLPGNGSQSDLKDLASTAEEEGDTCLQESLPPATQSLKTGCHTKELASTSSSEEKSPQASNLKEGIRDTGLDFQPVVPPSNGVEGVREDLDDDQDSSSLKLSQNIAVQTDFKTDQLEINTDHDIERNLDKMMSERTLLKERYQEVLDKQRQVENQLQVQLKQLQRRREEEMKNHQEILKAIQDVTIKREETKKKIEKEKKEFLQKEQDLKAEIEKLCEKGRREVWEMELDRLKNQDGEINRNIMEETERAWKAEILSLESRKELLVLKLEEAEKEAELHLTYLKSTPPTLDTIRSKQEWETRLNGVRIMKKNVRDQFNSHIQLVRNGAKLSSLPQIPTPTLPPPPSETDFMLQMFQPNPSLPPRMPFSIGQVTMPMVMPSADPRSLSFPILTPALSQPNQPSPPLPGSHGRNSPGLGSLVGPHGPHMPPAASIPPPPGLGGVKASTESPRPQPVDKLEKILDKLLARFPQCNKAQMTNILQQIKTARTTMAGLTMEELVQLVAARLAEHERVAASTQPLGRIRALFPAPLAQISTPVFLPSAQVSYPGRSSHAPATCKLCLMCQKLVQPSELHPMACTHVLHKECIKFWAQTNTNDTCPFCPTLK	291928	340683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_292630_293169_293283_295534_296046_296730_296791_299486_299628_302273_302414_334511_334609_334778_334868_335732_335824_336016_336116_336309_336687_336820_336954_337166_337272_338293_338390_339298
890800	contig_8866_pilon	+	1825	4	Intergenic	novelGene_77820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	726.394291460682	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGCAAGCCTAGCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558686	641492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_558849_637577_637635_638570_638613_639928
890801	contig_14546_pilon	+	1954	2	Intergenic	novelGene_157456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAAATGAATCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539041	541039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_540302_540345
890802	contig_10299_pilon	+	2540	8	Intergenic	novelGene_79672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_6	32.1622163923027	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	472	918	184255	185123	TRUE	45	ATTCACAAAACTTGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVGYALLALKEVEEISLLLPQVEECVLSLGKFHNIVRLVAFCPFASSQVALENANAVSEGIVHEDLRLFLETHLPSKKKKVLLGVGDPKIGAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVRHGELRNVAM	182568	187672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_182635_183003_183119_183801_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185864_186084_186528_187233
890803	contig_9121_pilon	-	1517	4	Intergenic	novelGene_134466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGGTGAAAAGGGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278488	227767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_227968_246460_246583_261230_261319_277381
890804	contig_12837_pilon	-	2860	2	Intergenic	novelGene_57277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	0	96	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	25	477	60580	50880	FALSE	40	ACACTCCAACAAGGAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERTLLVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTVSEWLRLLPFLGVLALLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPKVVNEINIEDLCLTKAAYCRCWRSKTVRCLFTHTIEFCGVRIVLLPKFPILRFCKMRDLFIVFSIESLYS	60604	48496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_51230_60477
890805	contig_10861_pilon	-	2627	5	Intergenic	novelGene_39220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_4	424.644557247588	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	542	1663	590918	583577	FALSE	25	AAAATCGTTTGCCACTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTQRINYNSFWFSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKKAASPSPQSVRRVSSSRSVSGSPEPAAKKPQAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPARNSDQEGGGKKKKKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAATPAAIAAPTTTSAQEEAAAEPEPKKETESEAEDNLDDLEKHLREKALRSMRKAQVSPQS	591459	582612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_587827_588384_588850_590763
890806	contig_4180_pilon	+	2205	4	Intergenic	novelGene_8399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_3	449.393665583602	258	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATTAATTTCAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875269	889741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886468_888085
890807	contig_7695_pilon	+	6145	3	Intergenic	novelGene_41538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	675	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1285	1629	373812	375989	TRUE	25	GGAATGGCTGGCGACCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRREERQGREGLNLTSKLRSTVPEGLNAQSRERPGDRVPRKVYSHAQPQLGISAPTHPLTSSFKRLSTAPDPHTAPAHTEPCRTGNSARLPKLGTTRSHARNRSPLQQWGLGL	372527	397120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_373987_375819_380088_396702
890808	contig_8075_pilon	+	2521	9	Intergenic	novelGene_42499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	342.016721082464	43	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	473	943	780728	794834	FALSE	30	TAAAAGTCTTATCGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC	719819	796412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794825
890809	contig_8447_pilon	+	1650	2	Intergenic	novelGene_69393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	704	1048	15359	15703	FALSE	30	ATTCCATAGCTGGGAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSFIKQCCDKHACLWILESLCNHTLRGLLRSRVLGMYSVKGFRSYLWPLCPSDGLHQFTVLPPECEVLFCSIPAPPGFYLKKKKTEKANKQKNPEDSKTHKNKKLPHMHFNF	8780	16305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_9151_15025
890810	contig_10139_pilon	-	410	1	Intergenic	novelGene_177809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGTCACCAAAGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183688	183278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_-_183300_183700
890812	contig_13244_pilon	+	2479	5	Intergenic	novelGene_86924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	542.924200510532	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAATTGTCAAACTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239741	254390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_244930_245347_247045_247121_250878_250935_252541
890813	contig_12920_pilon	-	3351	2	Intergenic	novelGene_166350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	565	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2985	3341	236065	220301	FALSE	50	GACTGCTAGAAGAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKDSPQYGLHLNIKKTKLLNIMINGKRLKLSRTAFYLDPQSMPMDATVKKSNNVLHWASLLLFKVLKCKGVTLRTKVHLTQATVFSIGSYACESWTMNKEDQKELRPLNYGFGEEY	239049	220290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_220596_236003
890814	contig_10074_pilon	+	12684	83	Intergenic	novelGene_57087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_81	275.118410773362	1119	98	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3407	10224	20	10243	106531	358190	TRUE	20	GCTAAGACTTCCATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDNCADLVEVLNEISDIEGGDGLQLRKEHTLKIFAYINSWTQRQCLCCFKEYKHLEIFNQVVCALINLVIAQVQVLRDQLCKHCTTINIDSTWQDESNQAEEPLHIERECNEGSTERQKSIEKKSNSTRICNLTEEESSKSSDPFSLWSTDEKEKLLLCVAKIFQIQFPLYTAYKHNTHPTIEDISTQESNILGAFCDMNDVEVPLHLLRYVCLFCGKNGLSLMKDCFEYGTPETLPFLVAHAFITVVSNIRIWLHIPAVMQHIIPFRTYVIRYLCKLSDQELRQSAARNMADLMWSTVKEPLDTTLCFDKESLDLAFKYFMSPTLTMRLAGLSQITNQLHTFNDVCNNESLVSDTETSIAKELADWLISNNVVEHIFGPNLHIEIIKQCQVILNFLAAEGRLSTQHIDCIWAAAQLKHCSRYIHDLFPSLIKNLDPVPLRHLLNLVSALEPSVHTEQTLYLASMLIKALWNNALAAKAQLSKQSSFASLLNTNLPIGNKKGSPAASPQSSDNSDAHQSGGSDIEMDEQLINRTTHVQQRLSDTEESMQGSSDETANSGEDGSSGPGSSSGHSDGSSNEVNSSRASQSAGSPGSEVQSEDIADIEALKEEDEDDDHGHNPPQSSCGTDLRKRKLESQTGICLGDSQGPSERSGTSNGTGTDLVFNTESMPSVDNRIRMLDTCSHPEDAEHDISGEMNAAHIAQGSQDSCIARTGDFLGETIGNELFNCRQFIGPQHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHDGRVVDDMLSADDVSCSSSQVSAKSEKNMADFDGEESGCEEELVQINSHAELTSHLQQHLPNLASIYHEHLSQGTAVHKHQFNSNAVTDINLDNVCKKGNTLLWDIVQDDDAVNLSEGLINEAEKLLCSLVCWFTDRQIRMRFIEGCLENLGNNRSVVISLRLLPKLFGTFQQFGSSYDTHWITMWAEKELSMMKLFFDNLVYYIQAAREGRQNRALYSHSAEVQVRLQFLTCVFSTLGSPDHFRLSLEQVDILWHCLVEDSECYDDALHWFLNQVRSKDQHAMGMETYKHLFLEKMPQLKPETISMTGLNLFQHLCNLARLATSAYDGGSNSELCGMDQFWGIALRAQSGDVSRAAIQYINSYYINGKTGLEKEQEFISKCMESLMIASSSLEQESHSSLTVIERGLLMLKTHLEAFRRRFAYHLRQWQIEGTGISSHLKALSDKQSLPLRVVCQPAGLPDKMTIEMYPSDQVADLRAEVTHWYENLQKEQISQQAQLQEFGQSSRKGDFPGGLMGPVRMISSGHELTTDYDEKALHELGFKDMQMVFVSLGAPRRERKGEGVQLPASCLPPPQKDNIPMLLLLQEPHLTTLFDLLEMLASFKPPSGKMAVEDSESLRCEELHLHAENLSRRVWELLMLLPTCPNMLMAFQSISDEQNNDGLNWKELLKIKSAHKLLYALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLEIFNSGILEPKEQESWTVWQLDCLACLLKLICQFAVDPSDLDLAYHDVFAWSGVAESHRKRAWPGKSRKAAGDHAKGLHIPRLTEVFLVLVQGTNLIQRLMSVAYTYDNLAPRVLKAQSDHRSRHEVSHYSMWLLVSWSHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLIPETAVRHESCNGLCKLSLSGLDGGDSINRSFLLLAASTLLKFLPDAQALKPIRIDDYEEEPMLKPGCKEYFWLLCKLVDNIHIKDAGQTTLLDLDALARHLADCIRSREILDHQDGSIEDDGLTGLLRLATSVIKHKPPFKFSREGQEFLRDIFNLLFLLPSLKDRQQPKCKSHSSRAAAYDLLVEMVKGSVENYRLVHNWVMAQHMQSHAPYKWDYWPHEDVRAECRFVGLTNLGATCYLASTIQQLYMIPEARQAVFTAKYSEDMKHKTTLLELQKMFTYLMESECKAYNPRPFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIEEMSPELKNTVKSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDMTPYTEDFLMGKSDRKEGFKEAGDRSKATESYEYDLIGVTVHTGTADGGHYYSFIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFDSAQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMDFSFEKTHSAYMLFYKRMEPEEENGRDYKFDVSSELLEWIWHDNMQFLQDKNIFEHTYFGFMWQLCSCIPSTLPDPKAVSLMTAKLSTSFVLETFIHSKEKPTMLQWIELLTKQFNNSQAACEWFLDRMADDDWWPMQILIKCPNQIVRQMFQRLCIHVIQRLRPVHAHLYLQPGMEDGSDDMDASVEDIGGRSCVTRFVRTLLLIMEHGVKPHSKHLTEYFAFLYEFAKMGEEESQFLLSLQAISTMVHFYMGTKGPENPPVEVLSEEEGEEEEEEEDVLSLAEEKYRPAALEKMVALVALLVEQSRSERHLTLSQTDMTALTGGKGFPFLFQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAEHIVSMLFTSIAKLTPEAANPFFKLLTMLMEFAGGPPGMPPFASYILQRIWEVIEYNPSQCLDWLAVQTPRNKLAHSWVLQNMENWVERFLLAHNYPRVRTSAAYLLVSLIPSNSFRQMFRSTRSLHIPTRDLPLSPDTTVVLHQVYNVLLGLLSRAKLYVDAAVHGTTKLVPYFSFMTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKGRDDVYDRTLLDYFFSYHQFIHLLCRVAINCEKFTETLVKLSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAVSKTCIKLLWEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKVSRARVMKRQKKCLVEVVTAVKIVQLQPWRLTIQETQRRPSSCKSWAWTRLHGPAFLFRDGVRK	106511	429887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_106574_135033_135122_150517_150939_170277_170329_170513_170664_174140_174209_181391_181585_183237_183300_194635_194718_194801_194895_205009_205136_205306_205437_206507_206639_206932_207577_210958_211174_214089_214206_214300_214429_217569_217660_220222_220319_221555_221639_226364_226520_227729_227844_229102_229203_229332_229493_232309_232437_232532_232681_240641_240743_240940_241151_246045_246172_248293_248417_248550_248635_249137_249225_254655_254857_256017_256101_260116_260158_260286_260412_261466_261620_262593_262699_264116_264173_264266_264388_281395_281580_282029_282191_284838_284905_286190_286338_286423_286481_286570_286649_287025_287121_291088_291262_293461_293616_294713_294793_297590_297645_297758_297855_301177_301243_301337_301414_301495_301544_301662_301729_303593_303675_306785_306872_307261_307431_307536_307612_308912_309065_312508_312558_312638_312744_312821_312867_314083_314189_315818_315967_320557_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329877_330002_338513_338594_341265_341407_341507_341652_342585_342746_356964_357079_358110_358289_359407_361391_427076_427329_429779
890815	contig_6364_pilon	+	5687	7	Intergenic	novelGene_51745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	639	151	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	2890	3543	564338	615521	TRUE	10	CTGTTTTGCCCGTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLHVCGSRGAVSLACSSAWPERAPNSGKGKENKQTIQNKQTNKSSGIPPAQQPKPGSSSTLERSSAAPQEKAKIAHGGRYLSEGWRRWREASKKSKEAEKKKATPAANKWHSESHPFRCVESKHPLFPGQETVAAGSRGGPVGVKIWYSRAGIAEEELLGWVVCGTYYSHQSGSVISARQVPVGRACAAWWCDVKHTVQVGRMERGACYVWS	527171	773081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_527459_529235_531051_542851_543068_563766_564652_564913_565050_615317_616256_771671
890816	contig_8020_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_114419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	291	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTTTTCCCTCCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224546	226401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_224500_226400
890817	contig_16103_pilon	+	533	3	Intergenic	novelGene_118680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9294	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAGGACATGCGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17542	18573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_17745_17881_18042_18402
890818	contig_13300_pilon	-	2975	4	Intergenic	novelGene_125760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.835144426454	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	67	366	49737	47432	TRUE	5	ATGTTGGCTCTCTCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLDIGGKKEYLIAGKAEGNGKMHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	56066	44708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_44811_44924_47630_49635_49761_56023
890819	contig_17976_pilon	-	2579	3	Intergenic	novelGene_32497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	583	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACCTTCTCCTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48913	41654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41825_46463_46549_46589
890820	contig_8452_pilon	-	2251	10	Intergenic	novelGene_48015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	193.920054801769	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	72	1109	550776	316088	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLAATASPPPSPSHGGSGPGGTMFTSTGSSGLYKAPLSKSLLLVPSALSLLLALLLPHCQKFFLYDLQAVKDDFQIWRLICGRIICLDLKDTFCSSLLIYNFRIFERRFGSRKFASFLLGSWVLSAFFDFILVEALQYSFGITTASNLPSGFLAPVFALFVPFYCSIPRVQVAQILGQFSITNKTLIYILGLQLFTSGSYIWIVAISGLISGMCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	550847	314841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_315803_315906_316196_332026_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509728_550745
890822	contig_593_pilon	+	2145	7	Intergenic	novelGene_101984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	865.70923075951	94	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	361	864	148964	152494	FALSE	15	GCCACGCTTGTTTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQGSTPVCTPTFLEKRKSEVAKMNDDDEDNEITFKQPVVGVRAEIQETQTPTRSGKRRRRKSKQ	146131	153775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148176_148221_148891_149001_151208_151421_151590_151657_152305
890823	contig_9668_pilon	-	2302	4	Intergenic	novelGene_58175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	889	junction_1	105.868891664276	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1238	1936	522400	503644	FALSE	30	GTGGTATTTCTAGAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLFTITISGLCQELGLPLGGQTWELSTQLRQLNFLQDLNLALPSPMVRFPRLHILLVLFSLRSRDRWNHPRITCQPLVTRTSKRPEPITFPSPASRRLHLYDDHQTPAAVRCYPPSPRVPPESSQPRQTIFCRPRRRRPWKRSISRSRLRLRPRIFTKHPRTLCLPHRLRLPGSWGLYCLLPRPHPPSPLNPGSCPTLSPESYPFHQRGKRTRVHPAGEKVGSKILCQIS	524613	503277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377
890824	contig_14970_pilon	+	8707	1	Intergenic	novelGene_45074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1814	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAGTGAAATCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207294	216001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_207300_216000
890825	contig_5988_pilon	-	2235	11	Intergenic	novelGene_15845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	163.287507176759	909	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	37	1080	259970	251825	TRUE	35	TAATCATCTGAATTGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAAHRGSGGSGMNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTQKDAPAIGDLLTLYSGLMETALD	260597	241627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_249656_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260569
890826	contig_12677_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_110689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_800
890827	contig_4769_pilon	-	1622	9	Intergenic	novelGene_117961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	96.2665570174814	1310	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	441	866	418689	407585	FALSE	25	TTTCCTCAAAATATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTVRKWAHSLLEVKQKEGNFDIVSGTRYRGNGGVYGWDLKRKIISRGANFITQILLRPGASDLTGSFRLYRKEVLQKLIEKCVSKGYVFQMEMIVRARQLNYTIGEVPISFVDRVYGESKLGGNEIISFLKGLLTLFATT	437513	406828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_417932_418648_418746_421191_421273_423624_423659_433960_434061_437344
890828	contig_9471_pilon	+	3065	12	Intergenic	novelGene_21858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTCCGATCGGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432943	446616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437811_437960_438072_438967_439105_439752_439817_440613_440711_442736_442916_445217_445291_446493
890829	contig_8681_pilon	-	1938	14	Intergenic	novelGene_157208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_13	94.4967361134483	298	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1785	152	1936	254247	222262	FALSE	35	CCCAGCAGAATGGTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTFVNGSCVSSPIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEEHDNSMKNDNSSEQLDIDGDSSSEVSSEINFNYEYAQMEVTMKALGNNDPMQSILNSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPEKQNYRSSVDKFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKVTLQIPASSLDANRKRDSVLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRELYQEWKECEEDSPVIRSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRISGEIGERIAGGDDAADISFDKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYNFWDQQEPVIVAPEVDTSSSPVSKEPQCMVVFDHSNEFSVNITEDFTEHLSEGALAIEVYGHKMTDPRKNPALWDLGIIQAKTRSLRDRWSEVTRKVEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRIQVEVKSVQESGTLPLMEECILSVGVGCIKVRPFRSPKTHETFHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEYLDQQLQKLVSKHDKTEDDADREAQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPG	256561	222259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_222375_222925_223026_224476_224507_225106_225254_229705_229839_230866_231025_232264_232436_242855_242985_243301_243452_247899_248047_251364_251528_252400_252615_254117_254309_256471
890830	contig_4891_pilon	-	9114	13	Intergenic	novelGene_124518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	486	215	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	254	667	643652	642041	TRUE	70	AGGAAAAATCAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFLSDIWYPKICSQSVAYLFTLLVKSFDEHKFLIFMRSHLFILSFAVCAFVIKLDDPLLKSRPDRVAPAFFSKNFVVLVCTFRSLIHFEFVFVCGVRHGSCFNFLHMEIQFSQHHLLKRFSFPHQMDLAPLLKIS	643905	41916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_42855_49367_49989_339056_339064_510186_510354_521130_523683_588028_588393_625676_626088_627018_627046_637156_637759_638201_638334_638894_640061_640580_642450_643647
890831	contig_15118_pilon	+	5247	15	Intergenic	novelGene_74588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	257.505062363553	13	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	3594	4622	393544	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	376615	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151_380263_391630_392088_392169_392554_392644_392718_393423_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
890832	contig_9759_pilon	-	2455	3	Intergenic	novelGene_167230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	36.5	490	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	274	1191	98155	97238	FALSE	70	TAAAATAGTAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRDENTRSTNRVLRISQLDALELNKALEQLVWSQFTQCFHGFKPGLLARFEPEVKAFLWVFLWRFTIYSKNATVGQSVLNIQYKNDFSPNLSYQPPSENQKLWYAICTVGGKWLEERRYDLFRNPHLTSFWKIQQCVNVVIGLLKLGELINFLVFLQRGKFATLTERLLGICSVFCKPQNMREVGFEYMNRELLWHGFAEFLIFLLPLINIQKLKARLSSWCIPLTGAPNSDNTLATSGRECSLCGEWPVMPHTIGCEHIFCYYCIKSSFLFDMYFTCPKCGTEVHSLQPLKSGIEMSEVNAV	124278	95973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9759_pilon_-_98173_99886_100002_124137
890833	contig_4213_pilon	+	6312	10	Intergenic	novelGene_124791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	101.361959894135	1374	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	159	785	12984	42900	TRUE	40	CAAAAGTCTAGTTTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDTKNMEKDIEPTQMLANPGYISSKKNSNKATLNRVLSFSLLMCQIMVFGTIIGLVVTTAKFHQKLSGCLETACPDSCIGFQKKCFYFSHDTRNWTSSQRFCDTQGADLVQVETQEELEFLLRYKGPSDHWIGLKRKQSQPWKWKNGTELPTRLHSRGEGECAYLTDNGVSSARSYTERKWICSKPDTYAQMKQQSPNLSSKAVTPY	12825	325459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_24170_24356_40541_40646_42734_42978_44113_45490_62204_62303_62867_63718_243915_245532_323949
890834	contig_13037_pilon	-	2658	2	Intergenic	novelGene_155152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	156	320	74314	71709	FALSE	20	GTTTATTGTTTGACCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREAFGTTPRRKAVRLLNLPSPRGKANQQGKFQGWPIRKQRRELRQTPTPGMKSWVLCLDSFLSFLMEDYIVRLGRKYGQPVVLCQDWWLSFPQFTSTLRSYLVW	74469	69370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_71844_74284
890835	contig_748_pilon	-	6844	8	Intergenic	novelGene_176132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3196	3594	686822	686424	TRUE	35	CTTGAGTCATATGTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIGKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRACGPGKQRSKRTKAPGCNQCSSSDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	690657	576451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_748_pilon_-_576581_576785_578014_605292_605749_641445_642023_685563_687978_688160_689368_689681_690075_690217
890836	contig_7056_pilon	+	1915	7	Intergenic	novelGene_43701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	225.383192215687	214	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	27	662	926284	935406	TRUE	20	GACGTTGTCTTCTCCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEKKPFDIRLSKQF	926257	937911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929598_935363_935546_935846_936043_936993
890837	contig_9653_pilon	-	2182	12	Intergenic	novelGene_48190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_10	483.12996386425	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	151	1518	196924	175913	FALSE	25	ATTTGGAGTACATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200984	175248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194309_196881_196987_200896
890838	contig_7843_pilon	-	867	6	Intergenic	novelGene_152012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	267.048010664749	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	151	666	188122	178451	FALSE	25	GTGTACTAAATGTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKVVTNKLLLSIVILLELAILGGLVYYKFFHRH	197615	178249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_190893_190953_197533
890839	contig_5084_pilon	-	619	1	Intergenic	novelGene_64537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACACATCAGGACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499321	498702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_498700_499300
890840	contig_4232_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_63341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	677	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGATTTGGAAGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
890841	contig_11564_pilon	-	3699	5	Intergenic	novelGene_158536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	991	junction_2	176.997881343252	113	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	1745	2485	54984	41045	FALSE	5	TGCTTGGCTCTTACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	56728	39830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965
890842	contig_8861_pilon	-	2529	3	Intergenic	novelGene_178597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	1622	2527	5048	4038	FALSE	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDANLLKIKGWKKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITVINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVTDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAANIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGR	24080	4035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8861_pilon_-_4375_4479_5532_22942
890843	contig_9957_pilon	-	5858	2	Intergenic	novelGene_173838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1637	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	118	471	308248	307895	TRUE	10	TTTTCTTTTCCCACCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIIRVKRYERVPMILVGNKVDLEGEREVSYGEGKALAEEWSCPFMETSAKNKASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEGCCSACVIL	308365	302160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_307514_307860
890845	contig_9091_pilon	-	4783	10	Intergenic	novelGene_32436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	853	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1282	1590	85781	75379	TRUE	20	CTAATTGCTTTCCCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRLLVGDHIGANPHRHDFFKYTNTQFWKTVSSSFAGLKIVLTKIILKQWTGKHDFHIEFGGQFASTNCPIDSFCSNSNLAREMQMPTQSCLPGTDPMGIL	90167	64750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_67362_72066_72281_73532_73848_75325_75446_80353_80480_81358_81466_85772_85893_86396_86553_87127_87268_89293
890847	contig_15172_pilon	+	6749	2	Intergenic	novelGene_158745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	992	junction_1	0	139	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	954	1400	232680	233126	FALSE	25	CTACAACTTGTGTCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAPFKSITFALGDITGGQKITSGLAELCPFLVTVLLKGLLLCHYGNPLQNLKPHSNHSTDLSFLSAVFRMQLFIPVHALFSHFFFPSSRCSSVALHSDPCVLSPVPLPPNSLSGNLRALDELYSQKLKYKAISRELDHALNDMSSL	231640	238475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_231682_231767
890848	contig_10500_pilon	-	2530	8	Intergenic	novelGene_41238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	115	1023	1640040	1629460	TRUE	20	TATCTTGTATTTCTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640154	1626417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626853_1628387_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
890849	contig_9696_pilon	-	2590	3	Intergenic	novelGene_68754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCACTCCCCCTGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438636	80084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_81400_204769_205458_438049
890850	contig_2804_pilon	-	4974	6	Intergenic	novelGene_178598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2000	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	697	1002	88396	88091	TRUE	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSLRHIVITGTKTKDKQRILREAQEKQKITYRGETIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKKLPANYSISCKTLIQI	89134	14326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2804_pilon_-_14725_14908_16090_38393_38973_39026_39924_87173_88795_88836
890851	contig_16098_pilon	-	2712	4	Intergenic	novelGene_46252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	290	439	829639	828912	TRUE	30	ATATCTACTACTTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSLKISTMITSETSKNTITEHPYPTSSPSILILYLHPASSSSICILHLLNICELHA	829928	826337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_827500_827581_828105_828323_829024_829601
890852	contig_12050_pilon	+	3684	18	Intergenic	novelGene_62613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	351.335189277865	285	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	10	1734	321302	354706	TRUE	10	CAGTTGTGTGGCGTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVSLRLGDLVWGKLGRYPPWPGKIVNPPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKEPNNRHLFCAYCEVEHRSMHQCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIH	321292	356768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_321340_322363_322401_323514_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348643_348707_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631_354853_354964
890853	contig_7359_pilon	+	3515	2	Intergenic	novelGene_139839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2818	3177	27526	27885	TRUE	15	AATCCTGGCGGCGCAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNSTPYISHNHQMSQVISYVKINNRKVEVKEVFLGFFPLKGKKTADLHPDTFKKLESDGLDVMMCCPQGYDKAATVAGTHGGIHAFLRERTRKVFLMDVWTICLTCADSTPLLKMHRV	24708	62242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_28041_62059
890854	contig_2027_pilon	+	4584	7	Intergenic	novelGene_39940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	742	1101	532288	532687	TRUE	20	CATGGTTTGTTGATCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALTHGINRIQTISNNAQTPEERLDKWELLKIKDLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKFFGYDKSDQRLISKVYKTLQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNTLHQEDIQAANRHMRKCSLSLTIR	530914	624760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_531582_532213_532412_532451_532896_598341_599031_600468_600739_600931_601084_622596
890855	contig_6552_pilon	+	2477	2	Intergenic	novelGene_163595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCCCTCTCTCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114653	146024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_114683_143576
890856	contig_17074_pilon	+	2246	7	Intergenic	novelGene_145097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	215.983795688473	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	184	717	208015	224041	FALSE	30	GTATACAACCTTGCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGLLIKGLSLITC	207831	225570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215459_224003
890857	contig_10958_pilon	-	4341	2	Intergenic	novelGene_5379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_1	0	992	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	2860	3672	841921	839744	FALSE	10	TCACTAGTTGTTGCTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVSREACRGFCLHFVMNGSFLYSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	844780	839074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692
890859	contig_10482_pilon	+	1794	8	Intergenic	novelGene_152808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1378.4911893747	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	111	560	116203	123300	TRUE	20	GCCATGCAAGGGCTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLAKSRHVSCFNILNAL	77258	127165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122410_123252_123312_125942
890860	contig_15491_pilon	+	2148	7	Intergenic	novelGene_75935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	241	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATCCACATTTTCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30744	46946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_32234_37036_37203_37443_37562_38890_39042_40258_40317_45107_45206_46878
890861	contig_2689_pilon	-	4394	17	Intergenic	novelGene_100821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_3	364.707738298764	737	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	129	2417	292048	153572	TRUE	40	AGTATAAAAGTATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGFHGLVAYDSDYALCNIPYYFSAHALKLSRNGKSLTTSQYLMHEVAKQLDLNPNRFPIFAALLGNHILPDEDLASFHWSLLGPEHPLASLKVRAHQLVLPPCDVVIKAVADYVRNIQDTTDLDAIAKDVFQHSQSRTDDKVIRFKRAIGYYSATSKPMSFHPPHYLARPNQFGMPGIVPPYVPPQMLNIPQTSLQAKPVMPSPGGAPGQGPYPYSLSEPALTLETSGKNLAEQNNYSNIPHEGKHTPLYERSSPINPAQSVSPNHVDSTYFPGSSTSSSSDNDEGNGGATNHISGNKIGWEKTGSHSEPQARGDPGDQTKAEGSSTASSGSQVAEGKGSQIGTVQPIPCLLSMPTRNHMDITTPPLPPVAPEVLRVAEHRHKKGLMYPYIFHILTKGEIKIAVSIEDEANKDLPPAALLYRPVRQYVYGVLFSLAESRKKTERLAFRKNRLPPEFSPVIIKEWAAYKGKSPQTPELVEALAFREWTCPNLKRLWLGKAVEDKNRRMRAFLACMRSDTPAMLNPANVPTHLMVLCCVLRYMVQWPGMRILRRQELDAFLAQALSPKLYEPDQLQELKIENLDPRGIQLSALFMSGVDMALFANDACGQPIPWEHCCPWMYFDGKLFQSKLLKASREKTPLIDLCDGQAEQAAKVEKMRQSILEGLNFSRQNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVCGFGGPYGETVATGAYRAFRVAAAAGHSGAFSGNDNSRTSKLQGGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	292176	142603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135_157320_158472_158683_164367_164483_189343_189594_202969_203145_206550_206779_209356_209445_228553_228829_229088_229187_246774_246872_247779_247909_288962_289046_291981
890862	contig_16496_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_5203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
890863	contig_16846_pilon	-	2120	2	Intergenic	novelGene_82996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCTCCAGGACCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579369	577014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_577089_577323
890864	contig_4769_pilon	-	1759	7	Intergenic	novelGene_118015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.892393021703	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	44	703	1080508	1067603	TRUE	30	TCAGCTGAAGCCACACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFSITQFKHLCRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS	1080551	1064378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1064387_1066554_1067740_1072549_1072754_1075396_1075455_1076035_1076145_1077586_1077652_1080421
890865	contig_18850_pilon	-	1425	7	Intergenic	novelGene_142418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	181463	181095	TRUE	10	CTGCGCCACTCGTACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERDLPRLAGVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181463	171870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_172057_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177628_177738_177773_180668
890866	contig_10140_pilon	-	2935	1	Intergenic	novelGene_148426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	424	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAATGTCACCCCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310011	307076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_307100_310000
890867	contig_1225_pilon	+	1969	4	Intergenic	novelGene_44187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	86	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCACTCTGGCCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251385	276793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274595_275417
890868	contig_20165_pilon	-	5827	2	Intergenic	novelGene_54479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_1	0	1893	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAATAATGAAGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71269	64574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_70120_70987
890869	contig_9875_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_154395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	172	489	2321	2004	NA	10	ATGATCCTCTCTGTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTINVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	2492	766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_-_800_2500
890870	contig_5686_pilon	-	2456	9	Intergenic	novelGene_45404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1149	1820	208699	203000	TRUE	20	GTCCTAAATTGTGCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	212409	171720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198602_202859_203002_208029_208722_211283
890871	contig_11422_pilon	-	352	1	Intergenic	novelGene_98954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_400
890872	contig_10023_pilon	+	3852	6	Intergenic	novelGene_123474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCTGGCACAGCCGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129318	150561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_132681_136935_136996_137390_137520_137859_138010_144377_144429_150461
890873	contig_18592_pilon	-	1269	2	Intergenic	novelGene_114773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2399	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTGTATGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13679	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1645_12737
890874	contig_5217_pilon	+	630	5	Intergenic	novelGene_135773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCCCGGTCTTGCGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557642	559921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_557801_558300_558433_558677_558858_559279_559382_559863
890875	contig_13074_pilon	+	1759	2	Intergenic	novelGene_153454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTCCCTTTATCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604706	613364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_606185_613083
890876	contig_6084_pilon	-	2831	1	Intergenic	novelGene_127043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1979	2377	336108	335710	NA	30	CATGAAGGATTTTTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQMGTSEKICQFPVTFYPDFFENPGERLKFPTNLRLHACFYNINWKKQESQHGTQEASTDKIIDQMSTVRRCSRQILLNGASKAKKEGIAGSITEKNGHQASIIFSNSMTFQCLESLVSVCKFVMMLVVL	338086	335255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_335300_338100
890877	contig_16110_pilon	-	4215	7	Intergenic	novelGene_126797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1428	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTCATGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133735	99499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_100096_105750_105997_109406_109771_110059_110226_118992_119107_128398_128618_131225
890878	contig_3081_pilon	-	3698	1	Intergenic	novelGene_133927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	3242	3697	181718	181263	NA	40	TGTCAACAACTATAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNI	184959	181261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_181300_185000
890879	contig_10765_pilon	+	4615	9	Intergenic	novelGene_122850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_8	196.494553041554	319	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1177	3534	154	3687	18249	91849	FALSE	50	ACCCAACCACAACAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRESDLKETGHGPRRLKQKRNRKRNKTRTNYSEITAKAAWDTLGYLAPGAQEPSPSEEEDLEETRREPRCSLTGGLGNKLRGFVNGSKEESWKNIHPEESFPSVTSVVELYNTPKDYPPEDGDKLLLSLSSIPNGSSVACQAVTRNLSCVTRGDCSGMKVEKQTENMHAMALDVQDRFAEVSHSLMQKRETGHKSLLCRQHRSKTSRQVLIEERGVNTPQTNNWAFFSTSLSDEELQLGSVGQPWFGSWPEGPHTFICEQRPKKGRWRRQACPDGEGGLVTLISTSEGASGPGSSPELLIEKKLLIEDENLPSSTENIDSFIETNIFRSHLPGPDSPRSALVPTKSKRRQIRAFNLAPNFDLQGQAKNVKEREKGVQLTESHGLKLIWEAEEDRLSEINNEKEKKENRVPSDHHPLCFYRGIMKNPPLDIGGQLYPRFLSFIRLGSSVYFYKSLIPSLRLQYASSFWKVSFMSTTPFLTSGSQTRVDSKRDDMGLVSPEILCHQPLKVPSDLRFLNESVGEKLKREEEARPLKSSQTEDKQDFTRTSCTPPGLPLSQEFASQLVRLFGSPGVPMESLLPEDYVVPLDWKTLKGIYLQWKTSIEKRQKKIA	15613	92777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727_34875_84531_86250_90454_90541_91825
890880	contig_1719_pilon	-	2224	5	Intergenic	novelGene_87355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	426.14727501182	20	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1387	1695	786528	754873	FALSE	25	GTGTGTGATCGTAGTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	789638	754343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_788440
890881	contig_4364_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532745	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
890882	contig_17768_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_140393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGCAAAGATGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48718	51030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_48700_51000
890883	SIRV6	+	1889	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	-1234	225	4	137	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9003	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
890884	contig_16211_pilon	-	3368	5	Intergenic	novelGene_150080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.238058112146	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	296	832	193178	180100	TRUE	15	GTTGTGTGGTTTATTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKSMLSRSFNSNITAVSSFHYGSSRDLHGSQGSLALSVADRRGSGGHIFRNPQTCSPGDPCQDDVFISGQQNYSSATLSLKDVPPDSLMKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	193473	172936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_175451_180077_180208_182778_182899_185391_185536_193013
890885	contig_20199_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_82577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41071	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40600_41100
890886	contig_7548_pilon	+	2356	7	Intergenic	novelGene_117629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_1	109.122891986767	480	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	243	1055	193023	206475	FALSE	15	TTGGGCATGTGCTTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192780	207776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
890887	contig_5479_pilon	-	4111	1	Intergenic	novelGene_133624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGAGGACCTTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451713	447602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_447600_451700
890888	contig_4125_pilon	-	3522	12	Intergenic	novelGene_25123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_6	395.886827471298	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	99	779	822728	813780	TRUE	50	AAAAAAAAAAGCTGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846542	808963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
890889	contig_11656_pilon	+	4943	10	Intergenic	novelGene_53938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	559	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGACTTCCCCACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111560	141107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215_117528_120350_120955_122561_122772_123444_123675_129278_129374_130455_130617_132519_132666_139141_139258_141002
890890	contig_1275_pilon	+	1101	8	Intergenic	novelGene_108760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAAAGTTTTTTGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400562	457680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653
890891	contig_6220_pilon	+	1753	2	Intergenic	novelGene_177236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTACTATCCATCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72819	75157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6220_pilon_+_74530_75114
890892	contig_12079_pilon	-	2780	8	Intergenic	novelGene_67531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.147215468197	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	108	1460	868372	861925	FALSE	45	AAAGTACAAACGTTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTTPHHSPLPLTKEGRPKPPAVGLGSTKAFPETK	871169	860604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862024_862084_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103
890893	contig_15744_pilon	+	6374	1	Intergenic	novelGene_83618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1462	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTGCCCAGAGACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190397	196771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_190400_196800
890895	contig_15666_pilon	+	1723	5	Intergenic	novelGene_70168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2131	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1117	1425	108776	109324	TRUE	15	AAGTTGAGGGGCTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEACQESRASVTEKALHYFFNISVAIEHPADILGPTPCSWRRLPGIPLETQEICSLIRPFKEAF	107149	110193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108105_108198_108579_108859_109098_109378_109948
890896	contig_6361_pilon	-	3534	7	Intergenic	novelGene_23951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4913.11696719438	53	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	25	GTGCTATTCATAAAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	379401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_379912_380361_380740_408966_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
890897	contig_3068_pilon	-	4594	31	Intergenic	novelGene_137621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_17	248.991363080909	1239	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1105	3318	21	3338	300001	233625	FALSE	30	TTCAGTGAGTGACATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQAAADMNHQQQQQQQQQQKAGEQQLSEPEDMEMEAGDTDDPPRITQNPVINGNVAMSDGHNNTEEDMEDDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQCNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	300021	232368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972_252054_253023_253079_253805_253937_254871_254981_257505_257595_258489_258629_261251_261451_267379_267485_299913
890898	contig_9705_pilon	+	6069	34	Intergenic	novelGene_41746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	283.610598415357	92	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	2381	4189	530185	541303	TRUE	65	TAAATTAGGAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAHHISVKKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKVSIA	450114	548642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_462681_462741_468447_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524573_524661_528230_528349_529093_529276_530049_530210_534489_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229_542817_547853_547992_548330_548401_548483
890899	contig_2636_pilon	-	2428	1	Intergenic	novelGene_52095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAATGCCCTCCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74836	72408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_72400_74800
890900	contig_2002_pilon	-	5515	6	Intergenic	novelGene_178599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	151	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	3861	4694	43920	43087	TRUE	50	AAAAGACACCAAGAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYISIITLNVNRLNAQIKRQRVVYWIKKHDLSICCLQDTHFRLKGTNKLKLKGWKKIYQVNNTQKRAEVAILISDKIDFKVKSNTKEKAGHYMMIKGSIHQEDITTINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPFSVKNRTSRKKLNEDTEELNATIDQLDLIDIYRTLHPTATKYTFFSNARGAYSNSPEDHILGHKATLNKIQRNEILQRIFSDHKAIKVEINNRQKQGKKSSTWKMNNTLLKNYWVIEEIKERINKYIV	94300	654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2002_pilon_-_1218_42828_44192_66316_67010_74383_74700_74919_75938_92738
890901	contig_3015_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_163316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	213	302	195266	195177	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDCPDREHNRESLTEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTPEDMAPGLSVSSKLKPFPRPTLQTKIRLDYGT	195478	193315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_193300_195500
890902	contig_5324_pilon	-	2372	2	Intergenic	novelGene_102067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	109	612	444540	443781	FALSE	20	GTTATGGCATATGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQNAEMFSKMRLPFGLQRCPE	444648	442020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443841_444096
890903	contig_5996_pilon	-	4126	6	Intergenic	novelGene_169275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3449	3799	1652	1017	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGAKLDMGERREEQEPKNIQTNKKEKDKREKEGKENKTNKKKEEQERPPKKTGKKKKQRRKKCPQGSLCTYVEAEAESPWHAAPPVQKGLPTQEKEKKTDKQFKTKKSPGIPAAQ	55819	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5996_pilon_-_119_804_1290_1574_2583_5668_6687_40311_40793_54800
890904	contig_9696_pilon	-	3263	4	Intergenic	novelGene_68812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGACTGTTAGGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393396	388881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_390205_391209_392226_392349_392599_392721
890905	contig_6110_pilon	-	3820	5	Intergenic	novelGene_163274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTAGAATTTTGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487820	224463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_224471_226734_227496_402178_403519_485987_487309_487429
890906	contig_8254_pilon	+	5692	2	Intergenic	novelGene_48398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	486	junction_1	0	748	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	108	344	107734	109211	FALSE	80	AAATAGAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	107626	114559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_107756_108996
890907	contig_6079_pilon	+	3086	1	Intergenic	novelGene_160110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCATCATGGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483172	486258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_483200_486300
890908	contig_8145_pilon	-	2401	5	Intergenic	novelGene_118645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	134.20972393981	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	223	642	735820	731044	FALSE	40	TAAGGAACTGAATGGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELERIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKGANKGKK	753238	729284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_731203_733967_734024_734339_734407_735682_735830_753025
890909	contig_6738_pilon	+	3149	5	Intergenic	novelGene_166120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	445.280248832126	48	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	503	829	23469	38334	FALSE	20	ATTTTGGAGTGTAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISEKEEEDNEKREEPGDNWEEGGGGGGGGIEKSSGPWNRTAPIQAPPAPVIVTETPELAMTSGVYRPPGARLTTTRKTPQGPPEIYSDTQFPSLQSTAKHVESRKY	22871	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_23308_23402_23480_32606_32756_36540_36701_38327
890910	contig_14563_pilon	+	3334	23	Intergenic	novelGene_135014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAGGATAAAATAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31201	96740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_31366_38070_38323_43104_43321_46085_46180_48671_48856_53106_53242_55283_55424_56438_56568_57837_57969_59105_59239_59434_59571_65264_65405_66606_66647_75195_75374_76340_76511_80678_80773_81215_81316_82384_82531_83279_83434_89283_89356_91433_91588_91904_92086_96549
890912	contig_3861_pilon	+	1155	11	Intergenic	novelGene_57892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	597.312614968075	73	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	102	1154	141869	171805	FALSE	50	AAATTAAAAGAGAGAGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRLIVRKRCSQALATGQKSDQRRQGRRLRAFAMDFEDDYTHSACRNTYQGFNGMDRDYGPGSYGGMDRDYGHGSYGGQRSMDSYLNQSYGMDNHGGGGGGNSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKE	141767	171806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_147877_150282_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793
890913	contig_6885_pilon	-	3139	2	Intergenic	novelGene_83669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	515	817	285161	210010	FALSE	30	ACAGTCATTCATTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYHAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	285675	207687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_210303_285151
890914	contig_12864_pilon	-	3247	7	Intergenic	novelGene_76381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	312	junction_1	420.191887382684	228	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	63	605	223293	217842	TRUE	15	CCATTTGTTTTTCATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223355	214630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_217255_217823_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
890916	contig_5586_pilon	+	5127	4	Intergenic	novelGene_143569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1011	junction_3	131.314719493115	1272	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3643	4149	392865	430164	FALSE	35	TGGTCTAAAACCCATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	389222	431142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_392877_392973_393128_416881_417014_429955
890917	contig_10734_pilon	-	2674	7	Intergenic	novelGene_51052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	195.236110617091	1103	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	16	1014	437052	419688	FALSE	10	AGGCGAGGCCTCCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRFGNSSSKRLRGITVINTKDGENVFTGQSKIYTYMSPNKCSGMRSPLQEENSVAHHEVKCQGKPLAGIYRKREEKRNTGNAIRSPVKSEEQKIKDARRGPLAPFPNQKSEAAEPPKTPASSGDATSAAIAKPSLKKPIKGKQAPRKKAQGKTQQNRKLTDFYPVRRSSRKSKAELQSEERKKIDELIESGKEEGMKIDLIDGKGRGVIATKQFSRGEFVVEYHGDLIEITDAKKREALYAQDPSTGCYMYYFQYLSKTYCVDATRETNRLGRLINHSKCGNCQTKLHDIDGVPHLILVASRDIAAGEELLYDYGDRSKASIEAYPWLKH	437067	418027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_419899_420740_420932_422333_422394_427399_427488_427836_428057_431288_431446_436980
890918	SIRV6	+	1183	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	319	-11	175	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	35	GAAAATTCTTGCGTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
890919	contig_1939_pilon	+	1264	2	Intergenic	novelGene_144853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATTTCTAGTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25273	63796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_25631_62889
890920	contig_2892_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_119002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTCTAGTTCTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146296	147291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_146300_147300
890921	contig_3727_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_146743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	125	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	20	CCTGGACTGCCTCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	308298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
890922	contig_10331_pilon	+	1938	16	Intergenic	novelGene_54131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	315.52204360393	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	1161	1937	542032	551025	FALSE	60	GAGGGAAAAATCAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGDETNKDEDEDDEDAEEEDEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYG	409503	551026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719_545964_546296_546473_550874
890923	contig_20641_pilon	+	4498	8	Intergenic	novelGene_52820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1226.78038884267	961	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	64	1182	14599	85313	FALSE	40	CTTATAAGAACTGTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELGYHGLAEK	14535	88629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379_56583_85286
890924	contig_5929_pilon	+	4573	4	Intergenic	novelGene_178600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	137	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	4156	4458	88777	89119	FALSE	25	TCTTAGGCCCCAGAGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGWKKIYQANSYQERAGVARLISDKIDFKTKSTIKYKEGHRIMIKGMIHHEDITVIYIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKG	53759	89234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5929_pilon_+_54704_55302_56112_86374_89071_89110
890926	contig_11422_pilon	-	1618	1	Intergenic	novelGene_99072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	595	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2400
890927	contig_12644_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_44583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	475	1857	2078675	2080057	NA	25	AGACCTTCACCGGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVTPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIKEKIGQTLQAFIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWVLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWKKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSGSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFNPAIPLLGVYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDVMLSEISQSQKDKYCMRPLL	2078200	2080511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2078200_2080500
890928	contig_5711_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_80278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	265	798	7	804	104973	104176	NA	35	CTGTGTAATCCCAAACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQTLTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKRDPTDWETIFGQSKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKYWRGCGEIGTLIHCWWECKMIQPLWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREISHHSNRHMHTYVHGSIVYNSKTMETT	104979	102091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_102100_105000
890929	contig_6102_pilon	+	3412	25	Intergenic	novelGene_31889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	516.865054317856	7	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1804	2655	380930	394507	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	372730	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_380009_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
890930	contig_11564_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_158575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGTTCGAACCCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70727	72486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_70700_72500
890931	contig_4156_pilon	+	2336	2	Intergenic	novelGene_88115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACGCTGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388727	391236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_389237_389409
890932	contig_4845_pilon	+	3860	1	Intergenic	novelGene_53607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGTACATTCCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76986	80846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_77000_80800
890933	contig_6374_pilon	-	6065	11	Intergenic	novelGene_158420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	715	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAGCGGAACTCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61287	4670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_4932_17852_18007_25247_25376_25800_25898_41255_41410_41530_41642_41734_41844_44610_44747_52444_52557_54352_54404_56535
890934	contig_13888_pilon	-	3572	5	Intergenic	novelGene_151789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGAGCACGGCTGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373720	337483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_337762_338560_339360_342667_344245_349652_350345_373494
890935	contig_17440_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_7564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2414	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGTAAAAGGAACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1430	2199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2200
890936	contig_6063_pilon	-	2007	15	Intergenic	novelGene_27575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	398.949647735866	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	16	1575	70243	17150	FALSE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEREPPPLGDGKPTDFEELEDGEDLFTSTVSTLESSPSSPEPASLPAEVISTNSSGPKPTEVVLEDDREDLFAEATEEVSLDSPEREPILSSEPSPAVTPVTPTTLIAPRIESKSISAPVIFDRSREEIEEEANGDIFDIEIGVSDPEKVGDGMNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	70258	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52947_53066_70135
890937	contig_1244_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_38088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAAGCTCCATGGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569154	1566906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1566900_1569200
890939	contig_11564_pilon	+	4131	2	Intergenic	novelGene_158558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	800	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57050	61263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_59336_59417
890940	contig_513_pilon	-	5505	4	Intergenic	novelGene_80179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	203	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	45	347	763302	763000	TRUE	45	GACCTATACAATGAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTESSTARWCLATTTDCSDRDHNRGSWTELEKDVEQNSNTHTKKKTRFTDLTEWRNPKSMVPGHPFSSVMKLFPKFKVQLRIGQPHKTKQN	763346	573676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_576763_642991_643829_693089_693759_762433
890941	contig_14133_pilon	-	1469	5	Intergenic	novelGene_119956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_2	476.771105982735	99	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	45	497	209116	208182	TRUE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209451	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_208389_208585_208728_209012_209131_209421
890942	contig_6882_pilon	+	3447	2	Intergenic	novelGene_178601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTTAAAATATCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224932	267436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6882_pilon_+_225807_264863
890943	contig_14357_pilon	+	3377	1	Intergenic	novelGene_121681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCACCCTTTCTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562868	566245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_562900_566200
890944	contig_6445_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_77066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCATGGGATTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670989	673359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_671519_671853
890945	contig_6958_pilon	-	3784	2	Intergenic	novelGene_70010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	616	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773806	754297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_757213_772937
890946	contig_10734_pilon	-	1830	8	Intergenic	novelGene_51055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	203.121357110191	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	31	1050	437296	419688	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGRKMSKPRAVEAAAAAAAVAATAPGPEMENVFTGQSKIYTYMSPNKCSGMRSPLQEENSVAHHEVKCQGKPLAGIYRKREEKRNTGNAIRSPVKSEEQKIKDARRGPLAPFPNQKSEAAEPPKTPASSGDATSAAIAKPSLKKPIKGKQAPRKKAQGKTQQNRKLTDFYPVRRSSRKSKAELQSEERKKIDELIESGKEEGMKIDLIDGKGRGVIATKQFSRGEFVVEYHGDLIEITDAKKREALYAQDPSTGCYMYYFQYLSKTYCVDATRETNRLGRLINHSKCGNCQTKLHDIDGVPHLILVASRDIAAGEELLYDYGDRSKASIEAYPWLKH	437326	418907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_419899_420740_420932_422333_422394_427399_427488_427836_428057_431288_431446_432626_432710_437286
890947	contig_7119_pilon	-	2502	3	Intergenic	novelGene_40886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2281	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1324	2070	139626	138880	TRUE	15	TGACGGCCCACACCTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140949	127412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137048_138707
890948	contig_14450_pilon	+	3648	3	Intergenic	novelGene_48968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTAAAAGTTGGCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038721	1088634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1042098_1083749_1083979_1088591
890949	contig_17796_pilon	+	3302	9	Intergenic	novelGene_33796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_7	289.973274630611	924	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	145	1161	53527	110323	FALSE	25	CTCTAGCTTAATTTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53382	112464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_99617_99648_110237
890950	contig_14209_pilon	+	1518	3	Intergenic	novelGene_88357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	31	junction_1	69.5	106	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACATCTTTACCCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36113	38027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_37197_37300_37421_37712
890951	scaffold_7386_pilon	+	1779	5	Intergenic	novelGene_136581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	61.1228271597445	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	204	1109	287700	290321	FALSE	15	GGGGGAGGGCTGAGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKGDFDSEPPLKFVEGKDEITGDEYDGLQRVEMSCGHAVDQGSLTAWCRSLMDQGYFKLCCPADVNGEKCGAQWSYPEVRRCAVLSNEEQHQFEQKLALLAARLYCDFKECPRCKSLVERKELSTVRVLCTICTSTLGAGYEFCWQCLQSWKGTGTPPDHCANVGCQDPNLEVLASCATKDLPGSEILACPSIRACPTCGLLIEHKEKCKYVMCSRCHVEFCFACLELAQACQATRAGAWFKCCAKPLAPRQTHIPVWSRTGGGYGGDEVNTGHRVQSHIPPLREVRMREAEQTCMII	287355	290991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_287495_287635_287773_288862_288961_289390_289559_289754
890952	contig_15353_pilon	+	1487	2	Intergenic	novelGene_151979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	93	638	529420	537093	FALSE	15	TCCTTTTCATGTATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRHFERSKVAFTFPERLLRFCLDRPLITDMSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLHDFRSPPPGMGLTQNRGPMGPGPGQGGPKPPIPPPPPHQVQQQQQQQQQVPSQQPPPQQQPPPPPHQQPPPPHQQSHQQPHQQPPPPQDSSKPVVPQGPGPAPGVGNVRTERFGQGGAGPVGGQGPRGMGPGTPAGYGRGREEYEGPNKKPRF	529327	537942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_529828_536955
890954	contig_10930_pilon	-	4448	6	Intergenic	novelGene_37002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1710.11106072091	1675	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	2642	3490	276835	268388	FALSE	30	GACTACTTTGTTAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	281752	267429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277232_278443_278637_279700
890955	contig_9727_pilon	-	5467	21	Intergenic	novelGene_86363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	215.840705150813	441	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	271	1203	590077	578319	TRUE	15	CGAGCGCTACAGCTTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFAVAVHRFWTTGPRLTLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622875	562172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_562196_562769_562811_563392_563501_565090_565288_565395_565486_566768_566923_568546_568695_571536_571688_574168_574284_575081_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_622824
890957	contig_10861_pilon	+	2959	16	Intergenic	novelGene_39455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1086	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCGCCGCGCTCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2616650	2803773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2618433_2619317_2619430_2619872_2619964_2627217_2627291_2628640_2628693_2629211_2629249_2629939_2629988_2630665_2630730_2638312_2638393_2638506_2638575_2642389_2642453_2666291_2666386_2799031_2799115_2802236_2802301_2802524_2802596_2803596
890958	contig_5574_pilon	-	3641	1	Intergenic	novelGene_155865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCAAGTCCACTCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207448	203807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_203800_207400
890959	contig_12630_pilon	+	3405	4	Intergenic	novelGene_173076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAAAGGTACGGGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75368	101023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_78124_81562_81810_81934_82253_100938
890961	contig_1230_pilon	+	2008	9	Intergenic	novelGene_28827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1225.17967432332	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	76	1776	405241	408754	FALSE	20	TTGGCACCATATAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404450	408986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407214_407690_407788_408003_408237_408568
890962	contig_10135_pilon	+	4169	11	Intergenic	novelGene_106576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	44.776779696624	923	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	745	1620	26040	27694	TRUE	20	GTGGGGGAGGGGAGAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISSSSWELPLVAVCQVTSTPDKEQNFKTCAELVREAARLGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGNLLGEYTQLARECGLWLSLGGFHERGQDWEQTQKIYNCHVLLNSKGSVVAAYRKTHLCDVDIPGQAPMHESDSTMPGPSIEPPVSTPAGKIGLAICYDMRFPELSLALAQAGAEILTYPSAFGFVTGPAHWEVLLRARAIETQCYVVAAAQCGRHHQKRESYGHSMVVDPWGTVVARCSDGPGLCLARIDLSYLRQLRQHLPVFQHRRPDLYGSLGHPLS	25028	39684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_25763_26029_26285_26387_26492_26718_26853_27021_27148_27427_29444_29993_30143_30433_30540_30743_31132_37771_37794_39549
890963	contig_12279_pilon	-	4495	2	Intergenic	novelGene_50123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	955	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	450	752	77185	75050	FALSE	45	AAAAGAGCTTCAATCAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77634	71306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_75094_76926
890964	contig_6898_pilon	+	2544	13	Intergenic	novelGene_35665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2308.13360598029	52	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	691	1881	115973	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHNGAGGATGAALSWVGFVKSWPVSRKLSNRPDAREGPSPSPWPPSPSCVYCVPSAARQLPAKLCQLCRFIHHHAQDGECVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59444	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59688_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126024_127415
890965	contig_10286_pilon	-	3301	11	Intergenic	novelGene_98403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	238.07773940459	40	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	651	1865	406140	382865	TRUE	35	GAAAAAGCTGGTACTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHIILRKKLSCFVLAFFLFAIVCVWKEMKKGSYYDSLKWETEGSPLVMGLGKMAMGSGPQSKVSTQHLRRSNQALNCTKASAKAKPQPSFQVWNKDSSSKNLPSRLQNIRKNYLNMNKYKVSYKGPGPGVKLSAEALRCHLRNHVNVSMVESIDFPFNTSEWEGYLPKENIRTKAGPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIDDHDAVLRFNAAPTANFQQDVGTKTTIRLINSQLVTIEGRFLKDSLYNEGILIVWDPSVYHSDIPEWYQHPDYSFFNNYKSYRKMHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	507937	380016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380837_382248_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405539_406192_410089_410233_415379_415572_424800_424848_478071_478217_507865
890967	contig_16228_pilon	+	3562	7	Intergenic	novelGene_147938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	263.04287778907	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	159	1031	59945	72232	TRUE	10	CCACTTGTGGTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMGIRGQHMEEKETFATVYSEVQKPGQAINI	47763	75089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59908_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71817_72142_73821_74146
890968	contig_3018_pilon	+	5797	3	Intergenic	novelGene_78900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGTCCAAGAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593594	603388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_599184_600007_600189_603361
890969	contig_16703_pilon	-	2729	7	Intergenic	novelGene_72771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCAAACCTGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40786	24388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_26078_27098_27264_28511_28685_29678_29788_32821_33013_38541_38757_40599
890970	contig_6745_pilon	+	1328	1	Intergenic	novelGene_170741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTTACTTGCAGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18712	20040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6745_pilon_+_18700_20000
890971	contig_2312_pilon	+	1668	5	Intergenic	novelGene_160734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_3	143.363829120179	641	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	38	700	217853	243984	FALSE	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYENDSVEDLKEMTSVSSRKRGKRRYFWEYSEQLTPSQQERMLRPSEWNRDTLPSNMYQKNGLHHGKYAVKKSRRTDVEDLTPNPKKLLQIGNELRKLNKVISDLTPVSELPLTARPRSRKEKNKLASRACRLKKKAQYEANKVKLWGLNTEYDNLLFVINSIKQEIVNRVQNPREERGPNMGHKLEILIKDTLGLPVAGQTSEFVNQVLEKTAEGNPTGGLVGLRIPTSKV	217815	244952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_218013_219483_219674_221316_221391_236791_236915_243868
890972	contig_9272_pilon	+	3248	16	Intergenic	novelGene_125882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	221.046500889644	9	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	918	2754	495	3248	251187	298496	FALSE	10	TGCCCAGCTTCCTTCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIVEDGGQTQYEATLQQGFQYQPTTEDLPPLTNGYPSSISMYETQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVSFGKQVDSPSATADADISDVQSVDSSLSRRSFGMNKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLTLLPDGKFICMECQTGQHPCFSCKVSGTDVKRCSVGACGKFYHETCVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSVEKDIYKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSIFVSSYILICSNHSKRSSNSSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCES	214998	298496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_215416_251109_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_281875_282007_282540_282670_283486_283614_289341_289540_290013_290188_294983_295131_298470
890973	contig_3956_pilon	+	2025	10	Intergenic	novelGene_14917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1516.03576621544	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	82	858	1281682	1289095	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGVGPPGAQAEGPLPGREVRVGRG	1281600	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1284734_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1289024_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
890974	contig_11986_pilon	+	3373	1	Intergenic	novelGene_69086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	442	903	24509	24970	NA	30	GAGAACAGATCGCGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSVPLFSTCRSVRPPQGHVEATHRRKVSLLTLPEGADIGQGAHSASPQTVGCRRRPGSSSGDHLSTVMQMSWGGPAETHPTVPTSNHPEVERECCCSVQRPASGHECCARASCGHCTKRATVSRKHGHHLVSPNVPDAHTGPRWVTCGPRL	24067	27440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_24100_27400
890975	contig_8546_pilon	-	6002	4	Intergenic	novelGene_178408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4891	5196	3348	3043	FALSE	10	TTTTGTTGATTCTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLMESLGFSRYSIISSANRDSLNSSLPIWMLFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVLKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	182401	2236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8546_pilon_-_5784_6006_6153_41977_42352_180466
890976	contig_7151_pilon	-	2887	5	Intergenic	novelGene_40769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	974.694920218629	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	173	559	551180	529325	FALSE	35	GTTTTAAGAATCTAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQILA	551352	526996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
890977	contig_8310_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_75598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	460	816	316947	316591	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGICHLATWLPMKTPTSRDEVGLRERRRGTAGLGPRSVQGLAEPCDRCSWPHLQEWKELWQHYLAGGDQEVSHADGLRQGVALELDGYFSVGNGALCWPVLVAFFLGGKITILSPVVK	317406	314988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_315000_317400
890978	contig_12677_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_110857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTGAGGAGAGGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3800
890979	contig_20951_pilon	-	3230	17	Intergenic	novelGene_43105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_14	76.307765004618	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2589	202	2790	244576	118523	FALSE	30	CCCAGCCCCTCACAGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGNSNEEVIHLNNFHCHRGQDWISLRDGTITISDSSDEEGIPMLVTPVPQQHEEEDLDDVILTEDDSEDDYSEFLDLGPPGISEFSKPSGQRGREPQPGPSHSQATNDIVNPGSEKKIILEDSNLLYSESDTLNQLSEDSEIELGESAAIVDDQAIEEDCWLDHPYFQPLNQETRERTSQVVPQEQRPEAELGPLLYQHEPPGPAFPRPVFPRPEPQQDGIPGPSSPQPAHPLGELEDQQLAIDDDEPGPAFPLQGSQEPNLENIWGQGATAVDQELIALLVKETEARFPDVANGYIEEIIRLKNYYDLNVLCNFLLENPDYPKREDRVIINPSSSLLASQDETKLPKIDFFDYFKLTPLDQRCFIQAADLLMADFKMLSSQDIKWALHELKGHYAITRKAFSDAIKKWQELSPETSGKRKKRKEMNQYSYIDFKFEQGNIKIEKRMFFLENKRRHCRSYDRRALLPAVQQEQEFYEQKIKEMAEHEDFLLALQMNEEQYQKDGQLIECRCCYGEFPFEELTQCADAHLFCKECLIRYAQEAVFGSGKSELSCMEGSCTCSFPTSELEKVLPQTILYKYYERKAEEEVAAAYADELVRCPSCSFPALLDSDVKRFSCPNPRCRKETCRKCQGLWKEHNGLTCEELAEKDDIKYRTSIEEKMTAARIRKCHKCGTGLIKSEGCNRMSCRCGAQMCYLCRVSINGYDHFCQHPRSPGAPCQECSRCSLWTDPTEDDEKLIEEIQKEAEEEQKRKNGENTFKRIGPPLEKPPEKVQRIEVLPRPVPQNLHQPQIPPYAFVHPPFPLPPVRPMFNNFPLNMGPIPAPYVPPLPNMRVNYDFAPINVHLEHNLPMHFGPQPRHRF	268911	118082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_118843_119709_119780_138681_138905_155043_155142_208039_208119_209206_209356_210309_210448_212025_212077_212792_212933_218280_218396_227946_228112_229223_229327_234046_234124_235970_236634_237770_237902_244509_244646_268779
890980	contig_14133_pilon	-	2060	3	Intergenic	novelGene_119949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_1	170.5	22	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	9	440	209095	208182	FALSE	25	TTCTCAAGTAGTATCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209103	206561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_208389_208585_208728_209012
890981	contig_14970_pilon	-	2615	7	Intergenic	novelGene_45109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	126.986438471026	318	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	392	1174	291083	264487	FALSE	30	ATTTACTATTGAATAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315789	263045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
890982	contig_16103_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_118959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGATGTAATTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021015	1023048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1021000_1023000
890983	contig_253_pilon	-	1612	2	Intergenic	novelGene_129758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	654	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	31	399	703884	703228	FALSE	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQDNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS	703914	702014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_703410_703697
890984	contig_14397_pilon	+	3548	1	Intergenic	novelGene_134658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1159	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGCCTCCTTGAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123143	126691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_+_123100_126700
890985	contig_1575_pilon	+	1996	18	Intergenic	novelGene_45158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_1	372.115768718177	1136	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1653	343	1995	104391	190544	FALSE	30	GTAATGCCATTTCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSKGFLRIKCSNGSKAHSIPAGTQELKSVARFQKLPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVTSILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWRKYISQFKNPLIMLLLASAVISVIMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLR	40033	190545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_104379_104481_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167818_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_183574_183665_185018_185124_190388
890986	contig_5286_pilon	-	3165	2	Intergenic	novelGene_157395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	396	794	679000	678602	TRUE	30	CTTTGCACATGTCATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSFVWRFRVMVSWNIPVNWPNNMFSASIPLPSSLHCAWGLKSLQAAIQGTIGLYSPRTEEEGESRKGGGYGCVANCLHQQCLLCHNTRRTGWYVTTITEHFDQRFHRRILIKRRKIQNRISNSNGLQNS	679395	676065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_678060_678224
890987	SIRV5	+	1981	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	14	34	-5	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
890988	contig_17964_pilon	-	3718	20	Intergenic	novelGene_33896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_17	185.309369236609	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1091	3276	88	3363	468932	340782	FALSE	80	AAAAAAGTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEGPRDADSDENDKSEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAASNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAASGLAGTTNGPFRPLGSQQPQPQPQQQPNNSLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSELYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRANSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPADQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPAQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII	473105	340426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_347653_347776_348928_349055_351505_351644_355598_355734_357565_357696_359050_359316_369423_369661_370784_371082_371986_372131_373494_373634_380107_380260_384030_384133_385000_385095_395548_395820_397747_397915_431364_431434_468569_468944_473029
890989	contig_14790_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_127908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	873	1199	159734	160060	NA	45	CACTACTCAAAATAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWILLRLALWPNMWCILENVPCALEKKVYLAAAGWNVLYMSMRSSWLTTAFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVLKSPTIIAELSLFSLLLEFMYF	158861	162212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_158900_162200
890990	contig_12019_pilon	+	1407	3	Intergenic	novelGene_87672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAATTGATTTTGCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	9270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5465_6114_6226_8322
890991	contig_5623_pilon	-	2543	3	Intergenic	novelGene_154839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_1	33.5	69	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	21	530	210277	208956	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGATRSMGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFER	210297	206942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_209106_209280_209405_210041
890992	contig_14522_pilon	-	1977	4	Intergenic	novelGene_147312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	337.99704140717	1	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	111130	85735	TRUE	20	CAAGTGTGCCCACCCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGLNQVQHLNQDPHLLVPHQPKGLRPAAQHPNLIKI	111130	65038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_79089_85705_85842_110925
890993	contig_17144_pilon	-	1589	7	Intergenic	novelGene_29482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2224.24853727176	66	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	132	755	172736	168375	TRUE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKGSSAFSENKTIKQVEMGQESPWALFSHPPCSISQFLGLVGT	173353	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166755_168217_168490_168986_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305
890994	contig_5031_pilon	-	6048	1	Intergenic	novelGene_133160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	544	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3497	3892	5876	5481	NA	30	AATTTTTTTAAAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGVPEQWEKTENRERIIEELLTEDFLNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDLKRKSPRHIIVTLAKTKEKQRILRAAREKQNVIYRGETIGLSSEYSAETVQARRQWDDIYKTLREKKTVSQE	9372	3324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_3300_9400
890995	contig_9038_pilon	-	2352	13	Intergenic	novelGene_143316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	103	junction_6	73.9505747104105	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	488	2350	368754	343020	FALSE	50	TCGAACCAAGAGAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFLKQSAIESLFGASLTGIAYSLFAGQPLTILGSTGPVLVFEKILFKFCRDYHLSYLSLRTSIGLWTSFLCIVLVATDASSLVCYITRFTEEAFAALICIIFIYEALEKIFHLGEIYAFNMHNNLDELTTYSCVCIEPPNPSNETLELWKEKHVTARNISWGNLTVSECKTFHGVFVGSACSHHGPYIPDVLFWCVILFFTTFFLSSFLKQFKTKRYFPTKVRSTISDFAVFLTIVIMVVIDYLVGVPSPKLHVPEKFEPTYPNRGWIISPLGENPWWTLLIAAIPALLCTILIFMDQQITAVIINRKEHKLKKGAGYHLDLLMVGVMLGVCSVMGLPWFVAATVLSISHVNSLKVESECSAPGEQPKFLGIREQRVTGLIIFILMGLSVFMTSVLKFIPMPVLYGVFLYMGVSSLKGIQFFDRIKLFGMPAKHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKASSAAVVFPMMVLALVFVRKLMDLCFTKRELSWLDDLMPESKKKKEDDKKKKEKEEAERMLQAEDSDTVHLPFEGGSLLQIPVKALKYSVDPSVVNISDEMAKTAQWKALSVSTENARVTRANTSPEKPESVKINFEDEPTKRYMDAETSL	369241	343017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_343102_345036_345145_347572_347674_349921_350054_353248_353423_354823_354893_358381_358634_358811_358974_360920_361035_362372_362535_364926_365033_367342_367589_368599
890996	contig_4103_pilon	-	2759	16	Intergenic	novelGene_51983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_14	248.694672238872	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2421	337	2757	240104	200569	FALSE	35	AAGGTAATTGTGGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQEPDRSSQENSPALLGVQKAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREKRKEKRKKKKEEQKRKQEDEENKPKESLELPEDEDEEENDEDVEQEVPIEPPSATTTTTIGISATSATFTNVFGKKRANVVTTPSTNRKNKKNKTKETPPTAHLILPEQHMSLAQQKADKNKINGEPRGGGAGGNSDSDNLDSTDCNSESSSGGKSQELNFTMDVNSSSDRRYPSVLLHSQEEKTSTTTSKTQARLEGEVNPNSLSTSYKSVSLPLSSPNIKLNLTSPKRGQKREEGWKEVVRRSKKLSVPASVVSRIMGRGGCNITAIQDVTGAHIDVDKQKDKNGERMIT	240611	200566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_200714_201329_201477_201929_202387_203409_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_238934_238990_239972_240117_240287
890997	contig_4812_pilon	-	4344	9	Intergenic	novelGene_103705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_1	641.81188832866	965	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	1060	3237	944244	917313	FALSE	25	ATCCCAGCTTTGATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTAFDKERMDKDLGSVQGFEDINKSERTESVEAGDDDSKLDDAQSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDWSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFTKVKETCQRLLEKPKDTDSLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTVKQAYTNAPVVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNNKLSQSSIQQEVCVS	952245	916205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_917487_923613_923778_931922_932124_933365_933519_935594_936111_943274_944451_944834_944939_946403_946960_952052
890998	contig_5324_pilon	-	2422	2	Intergenic	novelGene_102066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	98	610	444540	443833	FALSE	20	GTTATGGCATATGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLCVLERYYSPETLSMPEC	444637	442020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443887_444081
890999	contig_9609_pilon	+	1932	4	Intergenic	novelGene_22997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	762	junction_3	113.051610632784	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	941	1411	311574	318014	FALSE	50	AGATATTGATGAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGENLIGSCYSGSLPHSHLSP	310633	318535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_311591_313099_313266_314274_314431_317882
891000	contig_6102_pilon	-	3094	6	Intergenic	novelGene_32037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	162.573798626962	7	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	973	1521	555780	553797	FALSE	30	TCGGTAACAAATTACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVPYARSEAHLTELLEEVCDRMKEYGEQIDPSTHRKNYVRVVGRSGESSELDLQGIRIDSDISGTLKFACESIVEEYEDELIEFFSREADNVKDKLCSKRTDLCDHALHISHDEL	556925	552223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554643_555412_555529_555692_556406_556578
891001	contig_1348_pilon	-	1798	3	Intergenic	novelGene_174379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	80	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619241	614649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_616249_616577_616737_619201
891002	contig_7839_pilon	+	2228	12	Intergenic	novelGene_45724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	608.063747201851	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	99	1943	952473	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKVENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950900	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954294_954969_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
891003	contig_10424_pilon	-	7259	28	Intergenic	novelGene_56797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_22	224.264510444071	1343	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1029	3090	10	3099	347192	291502	FALSE	40	AGCAAACTTAAGACTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKTPGGSQKASSKTRSSDVHSSGSSDAHMDSSGPSDSDLPSRTRPKSPRKHNYRNESTRENLCDSPHQNLSRPLLENKLKAFSIGKMSTAKRTLSKKEQEELKKKEDEKAAAEIYEEFLAAFEGSDGNKVKTFVRGGVVNAAKEEHETDEKRGKIYKPSSRFADQKNPPNQSSNERPPSLLVIETKKPPLKKGEKEKKKSNLELFKEELKQIQEERDERHKTKGRLSRFEPPQSDSDGQRRSMDAPSRRNRSSGVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQREKEKELERERERDKKDKEKLESRSKDKKEKDECTPTRKERKRRHSTSPSPSRSSSGRRVKSPSPKSERSERSERSHKESSRSRSSHKDSPRDVSKKAKRSPSGSRTPKRSRRSRSRSPKKSGKKSRSQSRSPHRSHKKSKKNKH	347201	287341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_291641_292818_292996_294205_294325_296963_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323828_324272_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
891004	contig_3747_pilon	+	2058	6	Intergenic	novelGene_24794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4644.22791861037	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	330	1037	201313	204173	FALSE	45	TAAATGACAAAATGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGLPKVFVEEIL	200983	205194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202967_204135
891005	contig_9668_pilon	+	2109	9	Intergenic	novelGene_58116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_6	333.643428677983	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	31	1374	214129	359314	FALSE	25	GAGAATTATGGTTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAATGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHINGGLLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214098	360049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_348325_348503_355527_355714_359138
891006	contig_10095_pilon	+	2781	1	Intergenic	novelGene_57245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTAAAATAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263265	266046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_263300_266000
891007	contig_5954_pilon	+	4753	11	Intergenic	novelGene_28512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_10	696.6680988821	226	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	1947	3521	438796	443196	FALSE	5	GGGTCTGATTTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQNTTTTTTSAGTGSIPPWQQQQAAAAASPGAPQMQGNPTMVPLPPGVQPPLPPGAPPPPPPPPPGSAGMMYAPPPPPPPPMDPSNFVTMMGMGVAGMPPFGMPPAPPPPPPQN	433830	444428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_435668_438686_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441483_441740_441801_441925_442106_442858
891008	contig_8065_pilon	-	2136	2	Intergenic	novelGene_107319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAAGAAAAGGCAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106840	104335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_104639_105007
891009	contig_15666_pilon	-	2786	5	Intergenic	novelGene_70149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_3	560.567123545432	3624	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	187	1152	110619	108530	TRUE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110805	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108859_109098_109378_109948_110246_110558
891010	contig_10627_pilon	+	3031	14	Intergenic	novelGene_59969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	167.996160846525	80	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	255	1706	224634	239059	FALSE	10	TGCTGCCTTTGTAACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSLAILSEMGEVTEGMMDTKMVHFLTHYADKIESVHFSDQFSGPKIMQEEGQPLKLPDTKRTLLFTFNVPGSGNTYPKDMEALLPLMNMVIYSIDKAKKFRLNREGKQKADKNRARVEENFLKLTHVQRQEAAQSRREEKKRAEKERIMNEEDPEKQRRLEEAALRREQKKLEKKQMKMKQIKVKAM	218908	240384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_220604_220693_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232908_234198_234285_235606_235666_235983_236094_236314_236483_238978
891011	contig_5253_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_61538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	634	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTCTTGAATTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54604	52352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_52400_54600
891012	contig_3747_pilon	+	2096	4	Intergenic	novelGene_24779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4257.29572485738	146	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	332	694	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202176_203616_203651_203768
891013	contig_17171_pilon	+	4001	10	Intergenic	novelGene_147360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	350.608817929436	1118	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	125	1300	186172	251079	FALSE	15	CTTAGGTTCTGACTCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRTRSSVGSRENKNNRLRFRGDPNAASGDEPSAAAAAASGMDQCVTVERELEKVLHKFSGYGQLCERGLEELIDYTGGLKHEILQSHGQDAELSGTLSLVLTQCCKRIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDKNFDSDISSVGIDGCWQADSQRLLNEVMVEHFFRQGMLDVAEELCQESGLSVDPNQKEPFVELNRILEALKVRVLRPALEWAVSNREMLIAQNSSLEFKLHRLYFISLLMGGTTNQREALQYAKNFQPFALNHQKDIQVLMGSLVYLRQGIENSPYVHLLDANQWADICDIFTRDACALLGLSVESPLSVSFSAGCVALPALINIKAVIEQRQCTGVWNQKDELPIEVDLGKKCWYHSIFACPILRQQTTDNNPPMKLVCGHIISRDALNKMFNGSKLKCPYCPMEQSPGDAKQIFF	185821	253780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_185913_186138_186314_211218_211362_230072_230208_231646_231748_243990_244158_244802_244969_247260_247364_249406_249562_251015
891014	contig_5153_pilon	+	2236	17	Intergenic	novelGene_74368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	315.357479447927	3	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	377	1519	1007835	1022174	FALSE	15	CTAGAATTTTTTCCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEPFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956672	1022891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_989836_989980_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010021_1010254_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019021_1020171_1020207_1020453_1020577_1022114
891015	contig_4315_pilon	-	3906	20	Intergenic	novelGene_46807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_8	177.911350828053	35	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	156	2795	358035	328205	FALSE	65	TTAAAAAAGAAAGAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQATKLVHQLQEDYHKLLTKYAEAENTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	365468	327093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155_363231_365433
891016	contig_11656_pilon	+	2422	3	Intergenic	novelGene_53962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	155	475	146685	147005	TRUE	35	TGCAAAGACCTGGAGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLILWTNLVSNFLNQGHSAEIEFKSTEAVLVPGLLTIILIFNKVVLNQKRSPGGTQVKCSAANRKVSGFKIPAAPREKDVAVCFHKDLQPWKPYRAVLLCPAGSL	146530	150248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_147092_148199_149443_149630
891017	contig_10304_pilon	-	4569	7	Intergenic	novelGene_166489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	301	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1636	2181	252476	250388	TRUE	20	CAGTTCTATGCATCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPCRKGQRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKATPASNKRPPESRPPGRAESKQLAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRGGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSALR	254111	22547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_-_23182_67121_67992_98637_98904_221353_221581_244895_245073_250173_250667_252209
891018	contig_6439_pilon	-	1197	8	Intergenic	novelGene_154239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_7	348.292159790353	415	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	372	1196	403758	347181	FALSE	25	GTAACTTTTAGTTCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGQQQPPPPRRVTNVGSLLLTPQENESLFTFLGKKCVTMSSAVVQLYAADRNCMWSKKCSGVACLVKDNPQRSYFLRIFDIKDGKLLWEQELYNNFVYNSPRGYFHTFAGDTCQVALNFANEEEAKKFRKAVTDLLNRRQRKSEKRRDLPNGPNLPMATVDIKNPEITTNRFYGPQVNNISHTKEKKKGKTKKKRLTKADIGTPSNFQHIGHVGWDPNTGFDLNNLDPELKNLFDMCGISEAQLKDRETSKVIYDFIEKTGGVEAVKNELRRQ	404129	347179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_347334_348495_348539_349143_349313_355055_355080_358917_359015_360536_360624_362716_362852_403641
891019	contig_3956_pilon	-	1341	2	Intergenic	novelGene_14752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	201	620	796094	795675	TRUE	5	TGGGTTCCTTTGACCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPQVSHLERVGLFAEWGAVSPQPRPRASLGPGHFQEYPPLHVFRPSAECVLPGEHRVIVGHEPAIEVVQVFVADPGVAGNVKAFLHGPGGLPQGCPEPRGHAGQQVVREVQHVQLLQALKGAGSHSGQAVILQEEVA	796294	793986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_794039_795005
891020	contig_8616_pilon	+	1366	7	Intergenic	novelGene_72510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_5	242.93460482653	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	343	1149	337335	339244	FALSE	15	TATTTTCTGGGTTTGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDGNPSLRGKVALKVLTGRRAVVIQEGLGRSRRGNNTGGLFVGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQRRRQGQELSAARQRLQEDEMRRAAEERRREKAEELAARQRVREKIERDKAERAKKYGGTVGSQPSPSPTDPGPVPSSPSQEPPTKREYDQCRIQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336908	339461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_337192_337275_337538_337778_337971_338065_338118_338231_338349_338836_339030_339194
891021	contig_3565_pilon	+	4001	3	Intergenic	novelGene_178602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1885	2394	371946	372455	TRUE	45	AAGGGTAAATTTCAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPPGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNANINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKKNKEKRRDPESYVGHN	369746	394921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3565_pilon_+_370600_370914_372663_393521
891022	contig_3948_pilon	-	2298	6	Intergenic	novelGene_53196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	282.866046035928	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	66	596	866476	840840	FALSE	20	TGTCATGTCTTCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAVAKDCGHSLCHRRRLCDT	869633	839137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842538_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
891023	contig_9471_pilon	+	1232	8	Intergenic	novelGene_21758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_7	140.049699633191	281	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	402	968	385781	401578	FALSE	20	TTTTAAATGCTGAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTLHTDVGDIKIEVFCERTPKTCENFLALCAGNYYHGCIFHRNIKGFMVQTGDPTGTGRGGNSIWGRKFEDEYSEYLKHNVRGVVSMANNGPNTNGSQFFITYGKQPHLDMKYTVFGNSPHRHNVGMTAPIKPSVWHSERRKDKRVIDGLETLDELEKLPVNEKTYRPLNDVHIKDITIHANPFAQ	384499	401842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_399156_399276_399693_399775_401451
891024	contig_11719_pilon	-	1944	6	Intergenic	novelGene_154780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	30.5587957877924	550	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	239	562	166426	162073	FALSE	10	GCTGTGCTAGGCACTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESSSKSSQPLASKQEKDGTEKRGRGRPRKQPPVSPGTALVGSQKEPSEVPTPKRPRGRPKGSKNKGAAKTRKTTTAPGRKPRGRPKKLEKEEEEGISQESSEEEQ	170277	160690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_162127_163481_163533_164244_164329_166291_166470_169847_169956_170190
891025	contig_15327_pilon	+	2410	6	Intergenic	novelGene_70418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	218.635770174965	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	514	891	31740	32853	FALSE	25	TGAAAAGTACGCCCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGNKATSRGRAIPTPGAKDGPAEAGEGPVGGKASFLRVTLLGFQADVNSERVIRSEDGETLAREYGVPFMETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRARGQADEPSFQIRDYVESQKKRSSCCSFV	30098	34372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_30511_30605_30659_31691_31758_32231_32409_32488_32566_32747
891026	contig_8377_pilon	+	9837	1	Intergenic	novelGene_35032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	932	1246	76051	76365	NA	20	CCAGCATACTCAGTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHNLIPSDCSSFIFRHIVYSLLITCISLNISYFPISELLAMLFFLPFTPFLNWENHNYFQNVIQKPLPLGSPPAYHLPSYPFYTWIGVLLDHPEFSLFVCASW	75119	84956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_75100_85000
891027	contig_7380_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_157520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	13	309	160512	160808	NA	70	AAGAAAGGAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDSMDKRVNDTGSVKRRWKERTESLYQKELVDVQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKVLAKNKVPGIDGIPVEMFQQTDAVLEVLTRQCREIWKTATWPAN	160499	162787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_160500_162800
891028	contig_7253_pilon	-	2913	1	Intergenic	novelGene_140203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTATGCACTATGTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201093	198180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_198200_201100
891029	contig_12113_pilon	-	3051	2	Intergenic	novelGene_134754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2060	2467	322434	322027	FALSE	15	TTCTGTTGTACACAGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNKLWTTLPRMGIPEHLNVLMRNLYIDQEAAIQTEQRDTEWFKIRKGMCQGCILSTYLFNLYAEQIIREAGLYEEQGIRIGGRLINNLQYADDTTVLAEHEKDLNHLLMKIKDYRLVDYISTYRKQKFSQVDQ	325262	321442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_323593_324361
891030	contig_13519_pilon	+	1894	13	Intergenic	novelGene_124622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	405.348169958727	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	159	1748	66179	120612	FALSE	15	TGACATTTTTTGTGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57001	120758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
891031	contig_14970_pilon	+	1805	6	Intergenic	novelGene_45041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4847.65229776229	100	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	421	525	231446	231550	FALSE	30	TTATCACCAGATAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLRGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	182420	232830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_182428_192102_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
891032	contig_10569_pilon	+	4610	4	Intergenic	novelGene_44055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	143.70417143872	1452	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	60	455	58628	81578	TRUE	0	TCTGTGGTGTTTGCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQQLADVADKWCSNTPFDLIATEETERRMDFYADPGVSFYVLCPDNGCGDNFHVWSESEDCLPFLQLAQDYISSCGKKTLQEVLEKVFKSFRPLLGLPDADDDAFEEYSADVEEEEPEADHPQMGVSQQ	58568	87024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_58790_68808_68932_81467_83982_85272
891033	contig_610_pilon	-	3649	3	Intergenic	novelGene_76763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5	92	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	893	1942	229060	228011	TRUE	80	AATAAAAGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	252668	225829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_226656_227129_229760_252475
891034	contig_1406_pilon	+	4356	3	Intergenic	novelGene_25621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_1	28	2645	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2004	2378	2608297	2608671	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSRALHRRSLLTWEVGSHTDVGRAVCCFPIPRDCVPTETSCTSPAFQVHTQHGSGHTGSGVFAFSPSVSFQLRDSADSLGTEGSSFLKSSAASQPVPGYPHPSPPLAEPTVTSVWFSQGILDG	2598932	2610649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2599007_2599096_2599201_2606471
891035	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
891036	contig_2867_pilon	-	11657	14	Intergenic	novelGene_135174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_12	103.95697790162	1588	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3510	10533	86	10618	866341	773461	FALSE	25	TGTCAAGTGTGAATGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARLPVLKGSYQAGEGEPAAAVAGTAPSMVRETRHLWVGNLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGSDSSSTSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSCLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLVERREERRTSYDYNQDRAYYENVRTPGAYPEDARRDYPARGREFYSEWETYQADYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERERERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPEASPSQSERLPSDSERRMYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKPRLERYTKNEKTDKERTFDHPERGERERRLIRKEKLEKDKTDKQKRKGKIHSPSSQSSETDQENEREPSPEKPRSSNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTAFEKLKSKLENDSVKSSALDQKLQVAQAEPAKADLSKLEPVRMKVPKEKGLSSHIEVVDKEGRLKPRKHLKPEQTADGVSTVDLEKLEARKRRFADSNLKAERQKSEVKKSSPEMEEARVLLKKQPDLSSRDVILLREGESERKPVRKEILKRESKKIKPDRLNTAPSPKDCQELASVSAGPGSRPNSDLQARLGEPVGESVENQEIQSKKPASSKPQLKQLQLLDDQGPEREDIRKNYCHLRDETPERKSGQEKPRLVNAEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTGGSPSIRHGSFHDDDDPLGSPRLMSVKGSPKVDEKGLPYSNITVREESLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDDLNRWDSQMKQDASRFDVSFPNSIIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKDDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQHLERKEEESDFISGRSYGRQTSDGANSTTDLTQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKERDQKPKEVEKQDDTENQPKTPESASENKESELKISSSVGPPSVTVVTPNSAPSSLEKTTNEKTTEVPSVVEEKTVEPPSVPEEAKPVSELTPIPADQPEQLNLAPGVETNKDDAVTPLVVEESSPADQLPYLDAKPPTPGASFSQVEITVDPEPDSTLPPYKLTQKSEEASEPKAEKPDSAANVEPNANQKAEVVPEVQPQASEDLEVEPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAASIVEKPVTRKSERIDREKLKRSSSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKTSAGDPEHPEPSLPLSRTRRRNVRSVYATMSDHESRSPVKEPMEQPRLTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEDEETEAKEPVETLKPAEGWRSPRSQKLVAAGGPQGKGKGKNDPKVDTVAERPEAATEVGSQINVKENNTKSKPDKEEAGSEQKCDRKEMGTDKNPPETPPVEVVEKKTAPEKTSKSKRGRSRNSRSAVDRSANLKNVDANAGAGAAAGLAGEKEAEVTAVSPEKSESPQKEDSLSSQLKGDPVDPNKEPEKEDVSDSKLCPEATQLAKQMELEQAVENIEKLAETSAASAYKAAAVDAPEGLATEDRDKPAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFTAPPTYPAESQADVQPHPQGLQPPEEGMEPETDEAVSGILETEAATESSGPPASAPDALAGPADTKEARGNGSEPSHPVQEAKGAKEAEVTRKDKGRQKTTRSRRKRNANKKAATVAEPHTSESDQAQSKSPAATEGTMVQAPETPEEEKPSEKPHATPPESCASDPSKTPPRENVSQESSVEEKTPTKGPAPPDLPAPSQPVPGDDDHQARFKVHSIIESDPVTPPGDSSIPTPTIPSLTAAKLPAPVTSGGIPHQSPPSKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDIDTSSSTLRKILMDPKYVSATGVTSTSVTTSIADPVSAAPCLHEAPPPPVEPKKPLSEEKPAAPVANTSDTQQALEVPVATDKEKTAPVIAPKIASVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALTGPVNALKGPVKGSVTTLKGLVNTPAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNATPAVVNTAAGTVNATAGAVTVTAGAVTAVSGGVTATAGTVTMAAGAVIAPPAKCKQRSSTNENSRFHPGSMSVIDDRPADTGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTPSQPPPKGPQAPSGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPASLGSTLTPHHPPALPSKLPAEVNHVNSGPSTPTDRTVSHLAVTKPDAHPPRPSGPAPSSFPRACHPSSTASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSITYSIRPETLHSPRAPLQPQQIEVRAPQRAGTPQPAPASVPALASQHPPEEEVHYHLPVARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAAEGVVKVPPASKAPPQPGKEAAKTTDAKAAPAPHSEARILTVTPSNQLQGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDIRAYHAPAQLAHAQFPAASTIGAPSRTKTPAQGPPPEGEPLQPAQPAPSSTQPTQPAPSTQPAQPVQPSQLSQPSQPLSSKMPQVSQEAKGTQTGVVEQPRLPTVPTNRPPEPHAQVQRAQVETGQTSHPSPVSVSMKPDLAASLPAQAAPKQPLFAATTSGPSTPPGLALPHPEAQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEASQLEGVARKMTVETDYCLLLALPCGRDQEDVVNQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPDLLASISNISPHLMIVIASV	866426	772421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_773593_773771_773931_774495_774691_774842_775350_775814_783982_788547_788649_789631_789742_790804_790923_791263_791390_793870_794023_797873_798075_799391_799553_828550_828872_866258
891037	contig_9809_pilon	+	4683	10	Intergenic	novelGene_176751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_1	97.4038303807376	1296	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	117	1430	108357	114954	FALSE	40	ATTTAATTAAAATAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVILYFLLEN	108240	118207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806
891038	contig_4232_pilon	-	168	1	Intergenic	novelGene_63416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAGTAGAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467694	467526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467500_467700
891039	contig_16098_pilon	-	1956	4	Intergenic	novelGene_46225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGTAAGGAAAGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768116	764978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765636_766288_766733_766867
891040	contig_3269_pilon	-	10210	34	Intergenic	novelGene_117003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	406	junction_30	626.023045897266	1048	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1215	3648	4597	8244	122624	45773	FALSE	45	TAAGATTTTTAAACAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQVMIQFLPVILMQLFRVLTNMTHEDDVPINCTMVLLHIVSKCHEEGLDNYLRSFIKYSFRPEKPSAPQAQLIHETLATTMIAILKQSADFLSINKLLKYSWFFFEIIAKSMATYLLEENKIKLPRGQRFPEAYHHVLHSLLLAVIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFVFNLINDYISGFSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQDSNLEYSLSDEYCKHHFLVGLLLRETSIALQDNYEIRYTAISVIKNLLIKHAFDTRYQHKNQQAKIAQLYLPFVGLLLENIQRLAGQDTLYSCAAMPSSASRDEFACGFTSPTSRGSLSTDKDTVYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPEQGNTGENTRQSSARSSVSQYNRLDQYEIRSLLMCYLYIIKMISEDTLLTYWNKVSPQELLNILILLEVCLFHFRYTGKRNIARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRNRSGVMQARLQHLSSLESSFTLNHSSTTTEADIFHQALLEGNTATEVSLTVLDTISFFTQCFKTQLLNNDGHNPLMKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFATLRAFISKFPSAFFKGRVNMCAAFCYEVLKCCTSKISSTRNEASALLYLLMRNNFEYTKRKTFLRTHLQIIIAVSQLIADVALSGGSRFQESLFIINNFANSDRPMKATAFPTEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLIDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMAKIHIKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMKEDAGMMDVHYSEEILLELLEQCVDGLWKAERYEVISEISKLIIPVYEKRREFEKLTQIYRTLHGAYTKILEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDKVNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERNTEFERNHNITRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPINYEQQIHLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSPADVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPLAYARTFLNDSQASKYPPKKVNELKDVFRKFIQACSVALDLNERLIKEDQIEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQILQEDTMHSPWMSNTLHVFCAISGTSSDRGYGSPRYVEV	139468	43806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_45893_50721_50861_52711_52813_53479_53671_53949_54161_55787_55935_56458_56573_61063_61187_65584_65692_72223_72282_72369_72586_80198_80313_82852_83036_89133_89272_91826_91943_93500_93644_95065_95114_96508_96576_102313_102426_104463_104574_105782_105859_107404_107522_112745_112925_115117_115230_116027_116112_118223_118371_119434_119507_120641_120768_120847_120918_122517_122637_131160_131251_132098_132186_132898_136216_138378
891041	contig_5247_pilon	+	3640	23	Intergenic	novelGene_81794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	186.450467576523	1245	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1021	3066	236	3301	130402	161215	FALSE	10	TTGTTCCTGTGCCTGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAQRSGGRRRTRGSSSGGSGCGGISLSHRLRSFPPRGSPSSLRSALPAPLARPGAAAFLSLLFSSDRTRRRAQTTATMGKGVGRDKYEPAAVSEHGDKKKAKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRGLTTARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYGILAATEEELENDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVVRNGEKMSINAEDVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVIYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLQAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKSSASWLALSRIAGLCNRAVFQANQDNLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPRHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDKEFPEGFQFDTDDVNFPLDKLCFVGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNARDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKHHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIDLLGMRVSWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY	130166	161554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_130414_141035_141141_141772_141833_144123_144328_144960_145075_145507_145643_145731_145850_146306_146576_147095_147295_148035_148146_150281_150417_150983_151177_152772_152949_153899_154037_154757_154909_155502_155672_155811_155967_156364_156489_157755_157902_158021_158153_158462_158565_160638_160731_161186
891042	contig_6102_pilon	+	3074	5	Intergenic	novelGene_32176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3070	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2627	3031	846793	867497	FALSE	5	TACCCGGGCCCTGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKIVTSSKATECKFGFLKIYINIFTVFNTKFNKDIVPSIVPLCRSRLHCERGRGMGGRASLAAAAGDLTPLRWQLRGFLPGRGLFSLPSDDGSSRLGLGPQNAPRGESGSSGRREEESVGKGARGQRMNVRAC	842512	867540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_845001_846088_846187_846752_846826_846981_847093_867236
891043	contig_3942_pilon	+	780	4	Intergenic	novelGene_128627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	458.534137830059	186	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	324	635	179125	179974	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHVSVQVPWGLEEGGDGSFREADGGSHTSVALEEVQRPLAGYSPRLLLLFP	176940	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714
891044	contig_1715_pilon	-	1595	8	Intergenic	novelGene_127191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	235.889026139541	7	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1257	338	1594	312293	252429	FALSE	75	CTAAAAAGAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARSWQDELAQQAEEGSARLREMLSVGLGFLRTELGLDLGLEPKRYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGK	312630	252427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
891045	contig_3380_pilon	-	3978	8	Intergenic	novelGene_60124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1862	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2703	3260	459277	455466	TRUE	40	AAAATCTGAGGCCTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSLFSHLTKARFLTKTGLGHGDGGLGSKWRVSCAAFLGEDSTKGPEGLSPPIQGRGSVCVALWATVRFSRTEIFCGDTPISMMVRSLLSSLCPTASPLGNVKGPSSGPWSRSLAPSEPRLDTGPTEELLSAGAVGVLARFLHSNTTRSLHCLWQFIPQSLHRYPCLITPQRNPAQLSQKVGFK	465216	453068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_453572_454444_454552_455357_455506_456179_456215_456912_457066_458947_459334_462469_463769_463869
891046	contig_11656_pilon	+	6303	17	Intergenic	novelGene_53940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	724	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTGAGCTCCGGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111978	227396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215_117528_120350_120955_122561_122772_123444_123675_129278_129374_130455_130617_132519_132666_139141_139258_157927_158047_160486_160802_162123_162259_164494_164577_165174_165290_169385_169499_223782_224704_227313
891047	contig_8065_pilon	-	2544	1	Intergenic	novelGene_107345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262800	260256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_260300_262800
891048	contig_5623_pilon	-	1869	11	Intergenic	novelGene_154803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	333.001876871588	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	63	1235	211595	207631	TRUE	5	GTGGCCGTGTGGGTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211853	205549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_206062_207508_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798
891049	contig_8330_pilon	-	3720	8	Intergenic	novelGene_71965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	370.221059170141	18	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	370	1074	2056084	2038853	TRUE	5	TCCTCCAGTTGTTTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056544	2032112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2034753_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056207_2056297
891050	contig_3081_pilon	-	963	1	Intergenic	novelGene_133965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	122	553	1145204	1144773	NA	45	TTCAGAATAGAGAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRSKDGETLSHILNMLSGGTSPCRRTSCLVKWRVRKRGRPSRRWTDTVAATMCSSIAKICEDGAGPGSVSFCCTQGHYKLEPTRWHLAMTTTVFTGADRQVFFLQRCWWVQTTDLLVSKQALNHCPTRAPSYLYIYSLCLL	1145325	1144362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1144400_1145300
891051	scaffold_12124_pilon	-	2673	2	Intergenic	novelGene_22128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGATACATCTGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940883	936975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937111_938345
891052	contig_4783_pilon	-	2406	1	Intergenic	novelGene_108394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	805	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1713	2015	258887	258585	NA	70	AAATAATACTAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYNREHGKSHSLYFHKMGFTLYVSDFCYLSSLHCRSQKYQTKPVAVKLILTHSEPIGQSRTLPWGFQGAADGFELLTFWLAAKCLTTVPPGLLFQERKV	260599	258193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_258200_260600
891054	contig_13592_pilon	-	2204	5	Intergenic	novelGene_33730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTTATAAATAAGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270220	266266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_266682_267156_267281_267364_267704_267825_267999_269067
891055	contig_8520_pilon	+	1223	3	Intergenic	novelGene_85457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAACAAATAATGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291653	387892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_+_292670_321750_321848_387782
891056	contig_7993_pilon	+	2021	3	Intergenic	novelGene_170957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	152	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	16680	33022	FALSE	45	TAATTATGTGATTATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPKRRTKVLYLKNLSPRVTERDLISLFARFQERKGPPIQFRMMTGRMRGQAFITFPNKEIAWQALHLVNGYKLRGKILVIEFGKNKTQLSDLQADSLISCATDNTAEISGS	16677	34702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_16704_31084_31233_32855
891057	contig_11269_pilon	+	4306	2	Intergenic	novelGene_145812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1518	1880	279513	279875	FALSE	30	AAGCCCTTCTAAGTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVGVQNKTPDDSPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKSDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFRKIMQERNAKINSQLQIQCNLNPNTNNILQRGGKTNHSLYMEGEEAPDK	277834	282301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_278773_278933
891058	contig_13740_pilon	-	3126	10	Intergenic	novelGene_34621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3705.48950132698	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	196	783	165243	160791	TRUE	20	TGAAAGGTTGCCATCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNF	165438	155036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
891059	contig_3426_pilon	-	1496	11	Intergenic	novelGene_57944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	269.552981805062	22	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	5	1198	470445	367255	FALSE	80	AGAAAAAAAAAAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YMENSVSYSAIEDVQLLSWENAPKYCLQLTIPGGTVLLQAANSYLRDQWFHSLQWKKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPQILPPPAPPDLTHSQCNCFIYI	470449	366956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367326_390105_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_457797_457849_470331
891060	contig_16204_pilon	+	1578	9	Intergenic	novelGene_154511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	410.60839007502	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	81	605	369321	392142	TRUE	20	GAGGACTATAGCGTCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARHQARHPHLRVLSWLRLKQEEVAPMGSQQPPLTTVYLLGVLVTSCLGGFIREDSEIQIRLSNSSSRCQGRLEVRHLDRWLSVCSESWGHSRYHEEDATRLAKNLCPQLRCGRALELALSLFSSTQNKVLCHGSLGSFSNCTSQGASPCRTLILICLAPGWAMGSPVRQLPSQEHSTVGGGVPGAAVWRRQYLSAAGCQ	369240	397246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_387991_388298_392014_392241_392978_393105_393877_393932_394977_395098_395665_395758_396763
891062	contig_8866_pilon	+	2458	3	Intergenic	novelGene_77845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	732.5	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1715	2032	640320	640682	FALSE	10	CTTTGCTCTAAGCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTFHLTAESVSCKVPRETPDVTYVLIVCPALPAFAWLHSCCKFGFCCQPPPYFKVTCNCTEEAVVSTCETSRQRGRWEEESRQVCSGQRWLRSCGDRGTTGIKR	637289	641108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_638613_639928_640599_640643
891063	contig_11248_pilon	-	2663	1	Intergenic	novelGene_142547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259744	257081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_257100_259700
891064	contig_17274_pilon	+	4177	3	Intergenic	novelGene_26495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3527	3904	67769	228914	FALSE	25	CCCAGAATCTCTAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPACVGGVNPSGTEPVSPSQETSAGGKWQRPRTGKNGRGWESVYRWFPGALSPAGSSMKLLFHTLCHRSQIGLLVSQESTCLEAADQPAGKLQRSSRGIRVGGGKGCLAGYQVLCLLLGAP	60665	229187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_61843_65419_67988_228755
891065	contig_1596_pilon	-	2845	1	Intergenic	novelGene_131610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1215	1535	152693	152373	NA	45	CAACAACAGCTCACAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFFQTSSLMPLSFLPSHSTAILRCRALGHMGVGNPEWAPAGSVLPALLPRGHGHEGGQHHVAARHGSQRVWSSTAQLPRDIPQGRGCSTTTATMLAALLIHKIIR	153907	151062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_151100_153900
891066	contig_13244_pilon	+	2236	4	Intergenic	novelGene_86920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	251.598887119955	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	34	495	239761	252668	FALSE	15	TAGTGTTCTTACTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAAGETAAGKMADGKAGEEKPENPQRAGAAGGPEEEAEKPVKTKTVSSSNGGESSSRSAEKRSAEEEAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSSSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239727	254409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245131_245347_250878_250935_252541
891067	contig_8138_pilon	+	3530	1	Intergenic	novelGene_52503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	373	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464001	467531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_464000_467500
891068	scaffold_13553_pilon	-	1950	14	Intergenic	novelGene_73744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_13	947.829679104699	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1854	96	1949	55965	7223	FALSE	35	GTGAGTAGTTAGAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANPDGDFRLAIVNSSVLDRPRALVLVPQEGMMFWTDWGDLKPGIYRSNMDGSAVHRLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLDCIERISFSGQWRSVILDNLPHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILASQLTGLMDMKIFYKGKTTGSNACVSKPCSLLCLPKANHSRICRCPDGVSSRVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEDSTCLHSQYRCRNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCHESGTCIPLSYKCDLEDDCGDNSDESHCETHQCQSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAVYHTCEASNFQCHNGHCIPQRWACDGDMDCQDGSDEDPVSCETKCNGFHCPNGVCIPSSKHCDGLHDCSDGSDEQHCEPLCTRFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDATFAGCSREPEFHKVCDEFSFQCQNGVCIGLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSHYFRFQCENGHCIPNRWKCDWENDCGDWSDEKDCGDSHILPFPTPGPSTCLPNYYRCSSGNCVMDSWVCDGYRDCADGSDEEACPSPANVTATSTTTQLGRCDRFEFECRQPKKCIPNWKRCDGHQDCQDGQDEANC	57239	7221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_7372_18356_18513_19438_19574_20376_20509_21226_21359_22477_22586_24972_25099_31395_31516_34118_34242_37786_37901_40258_40433_54887_55027_55719_55967_57145
891069	contig_10861_pilon	-	1672	14	Intergenic	novelGene_39459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	312.53156053647	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	429	1184	2666327	2618403	FALSE	90	AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPIPPGFFQPFMSPRYAGGPRPPIRMGNQPPGGVPGTQPLLPNSMDPTRQQGHPNMGGSMQRMNPPRGMGPMGPGPQNYGSGMRPPPNSLGPAMPGINMGPGAGRPWPNPNSANSIPYSSSSPGTYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSSDNIYTMINPVPPGGSRSNFPMGPGSDGPMGGMGGMEPHHMNGSLGSGDIDGLPKNSPNNISGISNPPGTPRDDSELGGNFLHSFQNDNYSPSMTMSV	2721640	2617914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2627217_2627289_2628638_2628694_2629212_2629249_2629939_2629989_2630666_2630732_2638316_2638394_2638507_2638575_2642392_2642453_2666291_2666384_2721268
891071	contig_1380_pilon	-	4921	9	Intergenic	novelGene_138881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_8	98.0510071340422	1098	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	322	1170	155131	132611	FALSE	55	ATAAAATTATTTTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKQISSNKCFGGLQKVFEHDSVELKCKMKFAIYLPPKAETAKCPALYWLSGLTCTEQNFISKSGYHQAASEHGLVVVAPDTSPRGCNIKGEDESWDFGTGAGFYVDATEEPWKTNYRMYSYVTQELPQLINASFPVDPQRMSVFGHSMGGHGALICALKNPGKYKSVSAFAPVCNPVLCNWGKKAFSGYLGSDQSKWKAYDATHLVKSYPGSQLDILIDQGKDDEFLSDGQLLPDNLIAACTEKKIPVVFRLQEGYDHSYYFIATFIADHIRHHAKYLNA	162018	128859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_132692_138023_138192_141553_141653_142466_142587_143646_143772_145515_145615_148555_148645_155063_155139_161704
891072	contig_12915_pilon	-	7183	2	Intergenic	novelGene_148334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1123	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1145	3438	34	3471	53693	50203	FALSE	35	CAAGGCTGAATAGTCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHQTPKLPPLMNAAVCPSSQPNSGGLSQNFTSTSSRVSVISGPQNARSSHLNKKGNSASKRRKKAVPPLIAPSASQNLVASDLTAMGLIAKSVEIPTANLHSNIIPNCEPQGLVENLTQKLNNVDNQLFMTDVKENFKTNLESRTVLAPLTLKTENGDSQMMSLNSCTTSVNSDLQISEDNVIQNFEKTLEIIKTAMNSQILEVKSGPQCVGETSQNAPISYNIQLPSVNTVQNNKLPDSSQFSSFIGVLPTKSNIPQSEILHKEDQIQELLEGLQKLKLENDLSSPASECVLINTSVTLTPTPVKSTPDASVVQPVSEMVNNIQFSDKVNKPFVCQNQGCNYSAMTKDALFKHYGKIHQYTPEMILEIKKNQLKFAPFKCVVPTCTKTFTRNSNLRAHCQLVHHFTTEEMVKLKIKRPYGRKSQNENLPTSRITQVKKQLAVTEEDKREFQPALELGAKKENALSSVAVVPENQLIEKKSPENTETSAQVITVTSEQYDINSLTNLQTKGRKIRRHKKEKEEKKRKKPVSQSLEFPTRYSSYRPYRCVHQGCFAAFTIQQNLILHYQAVHKSDLPAFSAEVEEESEAAKESEEIETKQTVKEFRCQVSDCSRIFQAITGLIQHYMKLHEMTPEEIESMTTAVDVGKFPCDQLECKSSFTTYLNYVVHLEADHGIGLRASKADEDGIYKCDCEGCDRIYATRSNLLRHIFNKHNDKHKAHLIRPRRLTPGQENISSRANQEKTKPKYRGTKHSRSGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNTKIVQIEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTSRFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKCHKLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETCSEQEVDKNDVKDSDICVSESNDNSGATSVPQKEAEKNEKDEMDELTELFITKLINEDSTSVEAQANTSSSVSNDIQENNSCQSEKQKASNLKRVNKEKNVSQNKKRKIEKTEAALAVDLNSMHKEEETAVAIQTTEDHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNSGTKRGSHSNSRKNIDKTAVTSGNHVCSCKESETFVQFANPSQLQCSNNVKIVLDKTLKDCTELALKQLQEMKPTVSLKKLEIHPKDPDVSAMKEISIGKATGRGQY	53726	46490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_53610_53662
891073	contig_5686_pilon	-	4235	5	Intergenic	novelGene_45459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTACTCAACCTTAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238133	220572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222912_224037_225324_230612_230751_230874_231137_237923
891074	contig_13519_pilon	+	2378	13	Intergenic	novelGene_124624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	406.140130442136	9	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	151	1656	66179	120612	FALSE	30	ATTAACTTTATTACTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57009	121334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100120_102309_102373_115513_115645_116672_116756_120484
891075	contig_11512_pilon	-	1762	12	Intergenic	novelGene_43375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.21749804771	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	10	804	582745	556654	TRUE	15	GTAACTTTGCAGTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	582754	554969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555879_556604_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716
891076	contig_12279_pilon	+	2478	4	Intergenic	novelGene_50099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2004.43214457916	777	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	61	630	68297	69754	TRUE	25	GCTGTATATTCTGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGKWTYLFCSARPDDIAVITWSLCPVPAEANPSKVNPSAIYAGTSSQIIPFRVHSILPRLMKSPTSVSISQKRVQGKHLMYLLLWYLLQIFDIHMIAEELLLI	57542	77620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_71131_77148
891078	contig_12756_pilon	-	2787	3	Intergenic	novelGene_153221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	574	junction_2	115	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	603	2185	2787	165413	164811	FALSE	55	TCAGAAAAACAGGGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKAPHQVPVQSEKSRPCPSLQIQDLKGTNRDPRLNRMSQHSSHGKDQSHRKEFLMNTLNQSDVKTSKTIPSEKLNSSKQEKSKSGEKITKKELDQLDSKSKSKSKSPSPLKNKLSHTKDLKNQESENVRVSDMSKRDPRLKKHLQDKTDSKDDDVKEKRKATEKKDKDEHMKSSEHRLIGSRNKIINGIVQKQDTVTEE	169079	164810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_165498_166624_166820_167174
891079	contig_4900_pilon	-	1891	7	Intergenic	novelGene_159066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1179992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181200_1181620_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
891080	contig_10140_pilon	-	4128	5	Intergenic	novelGene_148397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_3	239.83014822995	647	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1622	2164	231204	206537	FALSE	35	ATAGCGACCCTATAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	233132	204572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_206763_207479_207658_225873_226004_231195_231328_231634
891081	contig_14397_pilon	-	4444	1	Intergenic	novelGene_134653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	481	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCACATCCCCATATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116711	112267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_112300_116700
891082	contig_6102_pilon	+	1713	2	Intergenic	novelGene_31985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAAGGAGCATTACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416984	419300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_418371_418973
891083	contig_6445_pilon	-	5847	9	Intergenic	novelGene_77008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2106	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAGGGGAAAAAAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649303	522025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_522318_579449_579566_597275_597335_598043_598191_613497_613562_613988_614091_635360_635490_636695_636846_644515
891084	contig_2834_pilon	+	2047	5	Intergenic	novelGene_28003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3761	junction_3	1019.86331804806	134	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	53	628	274763	290707	FALSE	20	CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274710	292126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
891085	contig_610_pilon	-	6487	3	Intergenic	novelGene_76654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	430	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	27	422	68933	32450	FALSE	55	GCCAAACAGTCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTSWETAHTGCL	68959	26384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32481_44958_45278_68887
891086	contig_14361_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_139255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACTTTAGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25947	23585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14361_pilon_-_23600_25900
891087	contig_5988_pilon	-	1800	3	Intergenic	novelGene_16000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	29	7	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	118	1068	691474	690042	FALSE	25	TAAATGAGTTCAGTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSNTFEEYITRNAFRDLLKIQNANTAEFYIFFLFSFLQRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPRHLC	691591	689309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_690504_690859_691009_691134
891088	contig_10324_pilon	+	3644	18	Intergenic	novelGene_7782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	34	junction_13	140.520929003082	668	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	290	2368	124814	134610	FALSE	40	AAGTAACAAGCCCTCGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSENAESENMDVPPEDETKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAENVKQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS	102706	135886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_102858_119213_119313_124774_125005_125110_125289_127455_127604_128947_129040_129428_129525_130122_130235_130664_130763_131330_131443_131545_131657_132019_132220_132653_132822_133225_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_134560
891089	contig_16578_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_148663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATATGCATATGATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218268	216149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_216100_218300
891090	contig_12079_pilon	-	2361	7	Intergenic	novelGene_67537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.438566945355	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	167	1603	871668	861365	FALSE	45	TGAAAGTACAAACGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872424	860606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862346_867268_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
891091	contig_10602_pilon	-	8463	6	Intergenic	novelGene_159637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.182973141321	1107	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	15	1313	37611	30099	TRUE	25	AGATCTTAATTGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARCWGLLPRIRGLSLHTAAKVDVVAPETSGPDVASAPVARYPPIVASLTAKSKAARQRRIERWQAAVHAAESVDQKLRILTKMQFMKYVVYPQTFARNADRWYQGFTKTVFLSGLPSPLVEPAPALELASLRAAACDCLLQEHFYLRRKRRAPLYQDREAIASPFLDQLVAALVGLLSPHNPALAAAAIDCKRPVHFYWMRGEEIIPSGHRKGRVDALRYQIDDKPHNQIRISKQLTEFVPLDYSVPIEIPVMNCKPDKLPLFKRQYENTIFIGSKTADPYCYGHTQFHLLPDKLKRERLLKQNCADQIEVVFRANAIASLFAWTGAQAMYQGFWSEADVTRPFVSQGVITDGKYFSFFCYQLNTLALTAQADQNNPRKNICWGTHSKPLYETIEDNEVKGFNDDVLLQLVHFLLSRPKEDNKSQLLES	37625	21698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_28147_29396_30392_32554_32732_33691_33798_35529_35676_37034
891092	contig_1867_pilon	+	1471	6	Intergenic	novelGene_54519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	5516.5299020308	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	210	821	213588	220943	FALSE	20	TAAAGGACTGTGTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	195727	221593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195865_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
891093	contig_11846_pilon	+	1585	1	Intergenic	novelGene_105920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	62	189	184	372	152728	152916	NA	30	ATACATGGATATAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSQPPGVKENEEHQRHKESSSPRDRKGRINQRLHQPENGRTRWCPPTTSDRPGREHNRESRMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLPETGGTLESMAPGFSYQPRTKTLSMANSSDRVWTGLWDIK	152544	154129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_152500_154100
891094	contig_6898_pilon	+	2087	14	Intergenic	novelGene_35698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2370.10543544964	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	134	1765	59668	125542	TRUE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERILLSPHRPSLQSWPMPAMSPRRLPMI	59534	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_124990_125461_125578_127416
891095	contig_10531_pilon	-	1542	6	Intergenic	novelGene_114518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	85.9474257904214	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	85	651	390175	381292	FALSE	15	ATGCTTTATTTTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTRDGAGRGDGLVAAAEAAGGPGPTEGDMYVDTLRIRSNLTYEDLEKTASFWATQLLHKIIDGICGRAYPLYQNYHSVWDSTEWIHVLEDITTFFKVIVGKNLSDEEISQQLNQLNSFHQEAIMKCLKSRKDDIRQALLGEIVDISSAQLQNFDWQLKLALSSDKIATLQMPLLNLHLDVKENGEVKPYSVEMSKEELQNLINSLEAANKVVLQLK	390815	380400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_381313_382393_382550_386747_386901_388812_388969_390094_390184_390739
891096	contig_4874_pilon	-	3484	5	Intergenic	novelGene_78637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	371	670	408587	408288	TRUE	35	TAATAAGGGATACTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSYQGPHPAESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYSPKGDWRNPESMASRHPFSSVVKSLPSFTSQPGIGQPHKRKWD	408957	385095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_386093_392785_393219_399726_400401_407224_407501_407853
891097	contig_6048_pilon	-	1198	1	Intergenic	novelGene_73247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTAGGGGTAGAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1961220	1960022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1960000_1961200
891098	contig_19851_pilon	+	3355	1	Intergenic	novelGene_29815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1090	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGATTTAATTGTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53165	56520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53200_56500
891099	contig_20365_pilon	+	2203	4	Intergenic	novelGene_85319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	149.800608217131	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	141	1025	9735	15104	FALSE	65	AAACTTGTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPADPGSWSLDYRFTDKNQQPSGDEGEDDDVEAALKKEVDDIRAFTEMRLRRFQSVESGANNVVFIRTLGIEPEKLVHHILQDMYKTKKKKTRVILRMLPISGTCKAFIEDMKKYAETFLEPWFKAPNKGTFQIVYKSRNNSHMNREEVIKELAGVVGSLNSENKVDLTNPQYTVVVEIIKAVCCLSVVKDYMLFRKYNLQEVVKSAKDLSQLNPKQAAPVGNGREAKLESGDKSSQSDPAEGKCNQEEVPGNSEEVKQTKPMSETQVVNEGGSKPELGSQVPKEPKSNENDLA	9594	16282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_+_9774_12098_12274_13272_13522_14682
891100	contig_546_pilon	+	5328	1	Intergenic	novelGene_117217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTCCACCCCTAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126585	131913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_126600_131900
891101	contig_9848_pilon	+	1413	6	Intergenic	novelGene_79969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACCCCCGCTCCTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98509	106048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_99394_103649_103732_104028_104150_104468_104539_104843_104911_105859
891102	contig_615_pilon	+	2875	3	Intergenic	novelGene_80044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	569	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGCCACCCCAGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36427	39908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_37418_37918_38005_38109
891103	contig_9931_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_134829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCAGCCACTGATAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321701	319409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_319400_321700
891104	contig_5039_pilon	-	6060	1	Intergenic	novelGene_64781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	474	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAAGCCACCAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142343	136283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_136300_142300
891105	contig_15498_pilon	-	2457	11	Intergenic	novelGene_42690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	265.878938616807	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	129	923	828595	797169	TRUE	10	CATCTGTGGATTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGSARRTAARRRQEAAGAAPRGRPGHRRQEAGSAEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKASAVEERSAESSRERPVRANNWQRCFGDISAEEIRGETPAWWKPDGICNLVCHCCYE	837865	784491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_837755
891106	contig_7253_pilon	+	6217	27	Intergenic	novelGene_140190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	121	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGCCTATTCTGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144688	200158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_144941_147029_147191_148803_148938_154089_154182_157357_157470_161651_161811_161934_161998_165964_166088_169479_169599_170667_170817_172774_172931_175884_176017_178166_178300_178449_178512_178951_179096_179453_179511_179594_179676_179760_179841_181831_181924_183736_183886_184495_184632_187286_187370_188863_188946_189384_189487_194907_195023_196079_196148_196977
891108	contig_6439_pilon	+	2680	1	Intergenic	novelGene_154238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	711	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGACAACGAATTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338653	341333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_338700_341300
891109	contig_4151_pilon	+	1754	3	Intergenic	novelGene_65268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	137	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	137	685	620441	663644	FALSE	45	ACCAAAGAATATTTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSLQKLCDGVNKMLDEENI	620304	664713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_663078_663502_663591
891110	contig_233_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_14495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAGATCATAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58963	57235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_57200_59000
891112	contig_990_pilon	+	6079	32	Intergenic	novelGene_76136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	121.424925311868	654	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1514	4545	57	4601	1635906	1803142	TRUE	15	TGACTATGCCACTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRGFCTADGSDPFWDWNITWYTSNPDFTKCFQNTVLMWAPCFYLCACFPFYFLHLSRHDQGYIQMTHLNKAKTALGFVLWIVCWADLFYSFWERSRGVFLAPVLLVSPTLLGITMLLATFLIQLERRKGVQSSGIMLTFWLVALLCAAAILRSRIMAALKEDAQVDVFRDVTFYIYFSLVLVQLVLSCFSDRSPLFSETVNDPNPCPESSASFLSRITFWWITGMMIRGYRQPLEGTDLWSLNKEDTSEQVVPVLVKNWKKECAKSRKQPVKIVYSSKDLAKPKGGSKVDVNEEAEALIIKSPQKERDPSLFKVLYKTFGPYFLMSFLFKALHDLMMFAGPEILKLLIRFVNDKKAPDWQGYFYTALLFISACLQTLVLHQYFHICFVSGMRIKTAVIGAIYRKALVITNSARKSSTVGEIVNLMSVDAQRFMDLTTYINMVWSAPLQVVLALYLLWLNLGPSVLAGVAVMILMVPVNAVMAMKTKTYQVAHMKSKDSRIKLMNEILNGIKVLKLYAWELAFKDKVLAIRKEELKVLKKSAYLAAVGTFTWVCTPFLVALCTFAVYVTVDKNNILDAQKAFVSLALFNILRFPLNILPMVISSIVQASVSLKRLRIFLSQEELEPSSIERQPVKDGTCGGSNSITVRNATFTWARSDPPTLSGITFSVPEGALVAVVGQVGCGKSSLLSALLAEMDKVEGHVAIKGSVAYVPQQAWIQNDSLRGNILFGRPLQERYYKAVIKACALLPDLEILPSGDRTEIGEKGVNLSGGQKQRVSLARAMYCNSDIYLFDDPLSAVDANVGKHIFENVVGPKGMLKNKTRILVTHSISYLPQVDFIIVMSDGKISEMGSYQELLARDGAFAEFLRTYASVEQEQDAEDEGLMGSSGPGKEAKLMENGMLVTDTTGKQLQRQLSNSSSYSGDTHKHHNSTAELQKPGTQKEATWKLMEADKAQTGQVKLSVYWNYMKAIGLFISFLSVFLFLCNHVASLASNYWLSLWTDDPIVNGTQVHTKVRLSVYGALGISQGIFVFGYSMTVSIGGILASRRLHLDLLHNVLRAPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPQVIKMFMGSLFNVIGACVVILLATPIAAIVILPLGLIYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSRSPVYSHFSETLLGVSVIRAFEEQERFIRQSDLKVDENQKAYYPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVISRHSLSAGLVGLSVSYSLQVTTYLNWLVRMSSEMETNIVAVERLKEYSETEKEAPWQTEEMAPPSSWPQVGRVEFRDYSLRYREDLDLVLKHINVTIEGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRITESAGGQIIIDGVDIAQIGLHSLRFRITIIPQDPVLFSGPLRMNLDPFNQYSDEEVWTSLELAHLKSFVSALPDKLNHECSEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDDLIQSTIRTQFDDCTVLIIAHRLNTIMDCTRVIVLDRGEIREYGPPL	1635849	1805329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1635954_1693116_1693294_1693582_1693709_1699119_1699258_1700551_1700678_1713418_1713481_1715493_1715626_1726879_1727111_1727947_1728126_1731101_1731264_1735753_1735847_1738026_1738231_1750224_1750372_1752954_1753049_1756721_1756798_1759098_1759226_1761486_1761664_1763006_1763175_1765452_1765637_1774021_1774113_1777700_1777837_1780453_1780662_1782759_1783071_1787804_1788005_1790879_1791007_1791533_1791636_1795785_1795933_1797837_1797997_1798960_1799128_1800240_1800436_1803090_1803449_1804157
891113	contig_15327_pilon	-	942	5	Intergenic	novelGene_70684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	126	536	901528	900904	TRUE	55	CAGTTTCCTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902153	900450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900831_900877_901033_901126_901281_901400_901536_902035
891114	contig_6304_pilon	+	2840	9	Intergenic	novelGene_122244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_6	178.928058168639	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	32	1090	70293	180531	FALSE	10	TTTTCTCATCTGTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGNSQYGQQQDAYQGPPPQQGYPPQQQQYPGQQGYPGQQQGYGPSQGGPGPQYPNYPQGQGQQYGGYRPPQPGPPQPPQQRPYGYDQGQYGNYQQ	70261	182281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695_128850_132145_132368_161430_161599_167002_167126_168549_168684_180504
891115	contig_13004_pilon	+	2884	4	Intergenic	novelGene_112605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	936	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGTAATAAATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153239	160631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_155632_156913_157018_159232_159400_160410
891116	contig_5033_pilon	-	1849	5	Intergenic	novelGene_28911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_4	1106.20737206005	63	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456932	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_456698
891117	contig_14970_pilon	-	6025	5	Intergenic	novelGene_45110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	148.130010463781	1605	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	265	1008	291083	268709	FALSE	40	AAATTTTAACCAGATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315793	263691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_315615
891118	contig_12624_pilon	-	1518	9	Intergenic	novelGene_61056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1273.46208718595	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	682	1161	868029	862389	FALSE	40	CAAACAAGGCACCCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYTLKLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	876116	862031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_867976_868011_868051_874052_874133_875116_875186_875385_875518_875737
891119	contig_9653_pilon	-	2163	12	Intergenic	novelGene_48184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	563.719363390293	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	647	1498	186221	175913	FALSE	20	TTTGGAGTACATTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200971	175247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192228_194084_194351_196881_196987_200896
891120	contig_2219_pilon	+	6081	6	Intergenic	novelGene_67206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	333.795506260944	18	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	1126	3048	261366	265510	TRUE	10	GTGGCATTTCATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASLRGGSSDMSDEDEEAEDSSANIITDLVGQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKHLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMGKKPRRPNAKSAMPTSLPHLAKEAKDAKGNRRKKSLSDKGQLSESSVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPPNPMLATAAPPAPAHSQHALSFSNLHEMQPLAHGTSTVLPSVSQLLSHHHIVPPGSGSAGSLGRLHPVTVPADWMNRMEMNETQYNEMFGMVLTPAEGTHPGIAPQNRPPDGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGASQPQSNCPPTVAGPLPTMYQIPEMARLPNVAFPTALMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMSEPPHSNMQVYA	259349	268699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_260458_261348_261651_262452_262601_263192_263291_264118_267588_267743
891121	contig_7182_pilon	-	2606	3	Intergenic	novelGene_117100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	430	22	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94581	91574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_91989_92099_92612_92901
891122	contig_9345_pilon	+	3372	11	Intergenic	novelGene_24470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	103.231051530051	945	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	617	1126	628010	631320	FALSE	20	GTTTCTGATTATGAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	617069	633566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_617109_618458_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625795_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
891123	contig_13021_pilon	+	1944	10	Intergenic	novelGene_8186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2169.74100405817	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	163	1641	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174513	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_180124_180211_180440
891124	contig_8140_pilon	+	4860	7	Intergenic	novelGene_86426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.609708724216	709	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	115	1263	181766	192093	FALSE	35	AGAAAATTTTGCCCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVSAPARPGASGTRAAAAPADQGPASPRLAPDLEYPDIMGAFLDKPKMEKHNAQGQGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVIGLPSGLETWSFFAVYDGHAGSQVAKYCCEHLLDHITNNQDFKGSAGAPSVENVKNGIRTGFLEIDEHMRVMSEKKHGADRSGSTAVGVLISPHHTYFINCGDSRGLLCRNRKVHFFTQDHKPSNPLEKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDFDYKCVHGKGPTEQLVSPEPEVYDIERSEEDDQFIILACDGIWDVMGNEELCDFVRSRLEVTDDLEKVCNEVVDTCLYKGSRDNMSVILICFPNAPKVSPEAVKKEAELDKYLECRVEEIIKKQGEGVPDLVHVMRTLASENIPSLPPGGELASKRNVIEAVYNRLNPYKNDDTDSASTDDMW	150334	195690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_150383_150649_150696_181745_182600_184978_185097_189349_189459_191060_191119_192063
891125	contig_12677_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_110703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1400
891126	contig_5549_pilon	+	2000	5	Intergenic	novelGene_81587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2253	junction_4	507.217409007222	3787	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	49	723	82155	96749	FALSE	25	GAACTTGTAGTTCAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPQLCPLILRVTAAAMPGGLLLGDKAPNFEANSTVGRIRFHDYLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKMIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNGEEPTEKLPFPIIDDKNRDLAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82106	98026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82250_86661_86819_91687_91835_93264_93412_96620
891127	contig_1172_pilon	+	4556	5	Intergenic	novelGene_162021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2175	2585	58075	58485	TRUE	30	ACAGGGTTGTTAACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSIFSSFLCFFCFNSWIILKIRDLNSLSVRSSAFWSTGRSSGVLFWTPSGTILSCFCKCFDIVCCLQGIWWLFSSFIDCRSVCFILLFCFIWLCLSRWAVHSLLLACVWARYFSPPSPMGRVSHSRMVQQGMSS	55900	386294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_58794_199942_200616_213001_213797_318486_318645_386257
891128	contig_7049_pilon	+	484	2	Intergenic	novelGene_171443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCTGGTTCCTGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144106	145765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_144314_145488
891129	contig_4103_pilon	-	3301	24	Intergenic	novelGene_51991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_23	289.306713180174	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1008	3024	277	3300	289125	203540	FALSE	75	AGAAAAGAAAAGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGEGGASGSDEDEVSEVESFILDQEDLDNPVLKTSEIFLSSTAEGADLRTVDPETQARLEALLEAADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLDEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTALTYACAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLAAGADQEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKR	352426	203538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_238934_239038_239972_240117_240287_240416_243058_243147_264115_264226_269082_269275_269525_269764_276615_276711_282406_282641_286814_286963_287688_287837_289084_289200_300390_300542_352375
891131	contig_15022_pilon	+	2969	18	Intergenic	novelGene_171809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	256.145057843089	52	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	582	2384	94536	121247	FALSE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSQSRGRGAPASVMTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEDEDDHAYKGILNSGWHTGSLSLPLPSSPLIPELPPHPMDELSGGTTPITPVIQAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDAEYLQYFDSNKDTYSKRFVPVACISRVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDAERKEWMQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKHFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEIRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFAADPLSLLRNV	86784	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_87182_93727_93897_94520_94590_95301_95433_95600_95757_96127_96198_96524_96646_97088_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105855_119226_119272_119455_119520_120780_120931_121229
891132	contig_5485_pilon	-	2036	8	Intergenic	novelGene_37773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	167.643207133362	115	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATAATTTTATCAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653584	638530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638771_639400_639496_641107_641196_645870_645944_647923_648014_650867_651017_651981_653261_653562
891133	contig_12943_pilon	+	1408	12	Intergenic	novelGene_140353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_11	305.17311169101	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	93	1370	30166	82097	FALSE	35	GCAAGTAAACCTGAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGVEDNEKNFYESDDEEKEKTEKRKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLFWHLSPKSEASIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNISEITDACLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRRMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKILLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNTKATGYLELSNWPEVAPDPAVRNVEVIELAKEWTPAGKTKKENPSKKFYSESEEEDGSSDSNSDSVILKMERRKMKNLKLQNLPVLNQVQ	30073	82135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_30232_34949_35048_36609_36665_36751_36824_43126_43190_45748_45882_50600_50711_57186_57364_67008_67196_68162_68294_75000_75110_82020
891134	SIRV3	+	429	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5880	-1	3821	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7824	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
891135	contig_16103_pilon	+	339	4	Intergenic	novelGene_118806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9626	junction_1	8965.75243170737	101	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603902	605579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_603938_604249_604359_605006_605118_605495
891136	contig_9272_pilon	+	3107	11	Intergenic	novelGene_125881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	234.830598517314	565	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	708	2612	251187	279961	FALSE	20	CCCTTCGAAAGCCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIVEDGGQTQYEATLQQGFQYQPTTEDLPPLTNGYPSSISMYETQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGSADRGVQGSVRFSDSSVSAAVEETVD	214950	280456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_215475_232503_232610_251109_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_279878
891137	contig_16185_pilon	-	2208	12	Intergenic	novelGene_144738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	97.4356324931431	78	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	216	1538	127403	82386	FALSE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134384	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_129327_129422_134323
891138	contig_7963_pilon	-	3478	13	Intergenic	novelGene_58427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.669426041689	218	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	2418	3470	120716	118203	TRUE	20	TCTTAATATTTTTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	126196	102720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_102728_118201_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_125693_125742
891139	contig_1450_pilon	+	2383	3	Intergenic	novelGene_27420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	35	TTTTCAAGAAACCATGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	425079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_424325_424922
891140	contig_19744_pilon	+	2149	6	Intergenic	novelGene_120374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	122.928597161116	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2103	47	2149	139841	177978	FALSE	70	GCCAAAAAGGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRLNDETIKKYVPNMNGYTEAWCLSFNQHLGKSLLVPVDNIFNASQGVRDLDVFSWTSKAFFPQEPKTNTDDFFKDINSCCSQEATMQEQDMPFLRGGPGMYKVVKTGPSGHNIRSCPNLRGIPIGMLVLGNKVKAVGEVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKK	139794	177978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_139916_149009_149085_151814_152040_152925_153059_156119_156243_176506
891141	contig_1349_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_171637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTAATGCTTTATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26971	25483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_25500_27000
891142	contig_4900_pilon	-	2384	7	Intergenic	novelGene_159061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	35	CAGCCAACCAGTAATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1179781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181449_1181587_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
891143	contig_3018_pilon	-	6191	15	Intergenic	novelGene_78762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	52.022954117409	145	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	4286	4975	305687	135086	FALSE	50	TTCTAACTCACAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKRPQISKALLKKKNKAGSLTLPDLRTYFTAMVAKTAWYWYDDRYIDQWNRIENAVVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWRKDSLFNKWCWRNWISTCKTMKLDTYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKPIKIIEAKIESTLEALIHGINRTKTVTNNTQTPGDRLDNWDLLKIKQLCSSKDFTKRVKREPTDWEKKFWL	499419	133869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_135598_256898_256974_305584_305932_362165_362425_422850_422959_443226_444028_448160_450004_455278_455430_478862_478975_479809_479899_480125_480214_483780_483884_495532_495727_498505_498752_499372
891144	contig_11986_pilon	+	2267	2	Intergenic	novelGene_69229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	714	1136	770078	770500	TRUE	30	TCCCTATGTCTCAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWRILRKLETEIPYDPAIPPLGIYSREIRAVTQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYCATRKNNSESVKHLIAWMKLQDTMLSEIITNEQILYETSIVKTHKKVYTQKVTIFVG	769364	776079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_771238_775685
891145	contig_5302_pilon	-	2626	9	Intergenic	novelGene_81416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	711.224120794564	4	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	318	1076	209238	177300	TRUE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209555	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176887_177083_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209142
891146	contig_20889_pilon	-	3279	3	Intergenic	novelGene_127633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGCGCGGCGGGCGGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41934	20027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_20075_21104_21685_39282
891147	contig_8312_pilon	+	2713	2	Intergenic	novelGene_152892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGTCTCTGTCTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274615	280277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_275097_278045
891148	contig_18850_pilon	+	2747	10	Intergenic	novelGene_142428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_1	795.865426927051	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	32	1027	175491	180704	FALSE	30	GTAAAGCCCCAGACTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELRCLELEEMMEEQGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	175459	182424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_175508_176354_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515
891149	contig_11978_pilon	-	2903	9	Intergenic	novelGene_62941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_6	91.0562154660515	136	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	42	737	985601	980834	TRUE	0	CTTGGCCTTCTGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNILPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELREGCLEAYTGIVQGLKGDQENVHR	985642	977293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_978505_979252_979415_980040_980945_981061_981206_981761_981870_982383_982467_983632_983778_985165_985238_985568
891150	contig_4857_pilon	+	6315	2	Intergenic	novelGene_48782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	152	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAGATCTTAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225631	1232034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1226317_1226404
891151	contig_14970_pilon	-	8577	2	Intergenic	novelGene_45075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1302	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	6234	6551	209638	209321	FALSE	55	TGATCAACATGAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKANLIVLDMLISLMEFLSLHWYGDKILILKFFDWLSFSAGMSSEPPAAVCITRVLGLHVVLQSLSIMAPSQSFKLTFFYTTKENLPNGPTHFCQIHALAFLPL	216001	207294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_211933_212062
891152	contig_19730_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_142488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	476	844	121876	121508	NA	20	CCTGCCTTAATTATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEERANEKGETNNRRGNIVHKMNSCQGRRMYQKHRQRDLSVRSRDSSFCKKGRRVHGGVCKSLFVADSPFTGCSFRPLQVWSRRGENGSGTILFSCYSYYYLRLLVLSVVVNCHQVDSDS	122351	119778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_119800_122400
891153	contig_2703_pilon	+	651	2	Intergenic	novelGene_101652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354	3291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1458_2743
891154	contig_5083_pilon	-	3487	12	Intergenic	novelGene_151661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	570	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATCACCCCCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676180	461714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_461967_462226_462294_462499_462627_546411_546514_648611_648742_651097_651204_658025_658171_658766_658926_659474_659584_661693_661791_668087_668148_674047
891155	contig_9668_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_58267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCATGGGGTTGGGAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661086	659278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_659300_661100
891156	contig_16766_pilon	-	2180	6	Intergenic	novelGene_153360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_5	269.411506806966	51	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1863	316	2178	188414	131133	FALSE	35	CCAAGAAATAGTTACTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRFGKTYSRKGGNGSSKFDEVFSNKRTTLSTKWGETTFMAKLGQKRPNFKPDIQEIPKKPKVEEENAGDPFGFDSDDESLPVSSKNLAQGKGSSYSESSEAAQLEDVTSVLEANSKISHPVGEDSVVSDKCLPLEDTLVGKEKSTNRIFEGDSSKSSCAKLITSGKVENFSEEHEKNIHHIYKNAEDSSKKPSAETTVTSGYKPDEVKETNDAWNSQVGKRSESPSETSQIKGSVRTGLYEWDNDFEDNRSEDCILSLDSDPLLEMKDEDFKKRLENLNEAIEEDIVQSVLRPSNCRTYCRANKAKSSQGASNFDKLMDGTSQALAKANSESSKDGLNQAKKGGVSCGTSFRGTVGRTRDYTVLHPSCLSVCNVTIQDTMERSMDEFTASTPADLGEAGRLRKKADIATSKTTTRFRPSNTKSKKDVKLEFFGFEDHDETGGDEGGSGSSNYKIKYFGFDDLSESEDDEDDDCQVERKKSKKRTKTAPSPSFQPPPESSDNSQDSQSNTNNAENLDFTEDLTGVPESVKKPTNKQGDKSKENTRKIFSGPKRSPTKAVYNARHWNHPDSEELPGPPVVKPQSVTVRLSPKEPNQKDDGVFKAPAPPPKVIKTVTIPTQP	191597	131130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_131238_132813_132910_157012_157132_160302_161347_187915_188437_191304
891157	contig_7151_pilon	+	6985	8	Intergenic	novelGene_40712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	143	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5027	5377	335273	483130	FALSE	55	TTTTTAAAAAAGACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWQNWMSICKKMKQNPYLTPYIKTNLKCIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLEALIHGINRIQAITNNTQTPEDKLNNWDFLTIKHLCSSKDFTKRVKREPTRLGKKILAMTNLTKV	91177	484738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_92412_92509_92623_158342_158834_161025_162138_191224_191690_276543_277206_334323_335544_483050
891158	contig_17427_pilon	-	2246	14	Intergenic	novelGene_30362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1105.72168192083	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	61	1485	188879	178046	TRUE	10	ACTTGCTTCGTTGTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAVLAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204721	176953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177208_177538_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
891159	contig_7963_pilon	-	4849	14	Intergenic	novelGene_58437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	618.647360143901	28	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1432	2502	123098	120628	TRUE	40	AGCAATTTGTAAAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126890	116819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563_126466_126790
891160	contig_11292_pilon	-	2210	13	Intergenic	novelGene_109474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	255.082285198761	534	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	88	1944	481968	461999	TRUE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKSRAVPGRRPILQLSPPGPRSSTPGRDPEPEPDTETDSTAAAASQPVPMAVVPATTTALTAVAASEDSPSEDPDEQEVVVEVTRVVQHPPKPVMTTRPTAVKATGGLCLLGAYADSDDDESDALEKPAQSKEANGNQSTDIDSTLANFLAEIDAITAPQPAAPVAASAPPPTPPRPEPKESSTSALSSTASNGTDSTQMSGWQYDTQCSLAGVGIEMGDWQEVWDENTGCYYYWNTQTNEVTWELPQYLATQVQGLQHYQPSSVTGAEANFVVNTDVFTKEKTVSASSSRSGPVIAKREVKKEVNEGIQALSNSEEEKKGVAASLLAPLLPEGIKEEEEKWRRKVICKEVEPVSEVKEASTAVEEAATIVKPQEIMTDNIEDPSQEDVCSVVQSGESDEEEEQDTLELELVLERKKAELRALEEGDGSVSGSSPRSDISQPASQDGMRRLMSKRGKWNMFVRATSPESTSRSSSKTGRDTPENGETAIGAENSEKIDENSDKEVEVEESPEKTKVQTAPKVEEEQDLKFQIGELANTLTSKFEFLGINRQSISNFHMLLLQTETRIADWREGALNGNYLKRKLQDAAEQLKQYEINATPKGWSCHWDRTSGSNYS	482055	461644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_461833_461920_462024_462342_462477_463362_463468_464336_464462_472209_472421_474109_474452_475351_475473_475569_475718_476726_476914_477144_477282_480058_480158_481745
891161	contig_9995_pilon	+	3123	2	Intergenic	novelGene_47715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	517	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368580	374956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_371147_374399
891162	contig_9668_pilon	+	2237	10	Intergenic	novelGene_58111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	436.553618388847	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	370	1563	220737	359314	FALSE	15	AAAGGTCTTTGTCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRLDGNGDSLRWISKSEIAGPEGKPICNFAAYHQQCNRVSFALTLATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214041	359988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_220571_220766_281470_281586_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
891163	contig_11258_pilon	+	1857	7	Intergenic	novelGene_67792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_2	86.0569901609135	35	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	4	957	279290	292582	FALSE	45	CAGAAGAGCACAGAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279286	293482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
891164	contig_3948_pilon	+	2416	8	Intergenic	novelGene_53208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAACCCCGCCGGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839140	869633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_840654_840771_840859_842500_842653_847879_848004_852427_852636_856565_856711_866354_866480_869571
891165	contig_18208_pilon	-	496	4	Intergenic	novelGene_176198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1972	junction_3	1147.65161186757	61	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	29	460	155993	154421	FALSE	30	ATATGCCAGAAATGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS	156021	154384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155353_155514_155989
891166	contig_7548_pilon	+	2174	8	Intergenic	novelGene_117618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	131.787398363223	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	85	897	193023	206475	FALSE	40	TTCAATAAAGCTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192732	207752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192809_193014_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
891167	contig_10867_pilon	-	904	5	Intergenic	novelGene_159450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2670	junction_1	1575.11164286853	992	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	478	870	88232	86811	FALSE	10	TGTTAGGTCTTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	91456	86776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88683_91429
891168	contig_5479_pilon	-	6428	13	Intergenic	novelGene_133591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	5602	6060	395927	334192	TRUE	10	CCGTGCCGCACAGGCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPPFTYSITKYRRSMVWKQEWSWVRNGGFPGRASTRFSTMVHSTSSSWITTSFFRIFTAYSSSVPFRSESMNLAKAAFPQHHQEVKISQFHPVPVAIVVTFGYGVGCLFFWSLGTLTDLGPLKFLPQFLVALTSFWWHRHIEVLAFLLAQ	451731	261261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_261330_318100_318259_319625_319760_334183_334280_344545_344697_375220_375393_395879_395969_398954_399021_403750_403886_409400_409478_409798_409911_444698_444798_446660
891169	contig_4180_pilon	+	1980	11	Intergenic	novelGene_8306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	185.177995453024	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	588	1454	811833	821915	FALSE	55	GGTGGTGTATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733295	822441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_737977_738062_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
891170	contig_6102_pilon	-	3179	5	Intergenic	novelGene_32035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_4	167.847214751988	56	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	556685	555507	TRUE	20	TTACTTGTGATGTACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLARQRTRALLRRAVSVRGAGTGGLRGTPCLESALAFWRGQDSPFPLPPPTPQQGIESGACKATVGVRRSSSAWVTAAALGAEVERSRYSEDERLGLAGPASRGPAGNCLGSEEPGSTLWSLQGSGG	556687	552212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_555529_555692_555806_556436
891171	contig_9011_pilon	-	3641	8	Intergenic	novelGene_159337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	512	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	152	460	709267	708959	TRUE	55	GAAAAGACAAATGAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPHMYRSTQSPKEEPHLLGRWEPGKMSPTGGGPNLWWPGNLTSGVLADTAMLSARPSAMCLLLLGARQGSLGEIGGLENWLDDVCKCLHPGMPLLLKAREP	709418	652871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_653010_665505_665563_667558_667595_675967_676138_680782_680850_684811_685017_704495_704606_706560
891172	contig_14220_pilon	+	2880	15	Intergenic	novelGene_159850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1000	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTCCCGCCCCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285862	423113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_285941_289287_289576_291830_292233_293534_293873_294242_294375_313692_313755_319548_319834_325916_326126_331917_332087_355338_355461_359286_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393918_422839
891173	contig_11171_pilon	+	1770	10	Intergenic	novelGene_48534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	21	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	17	1009	31058	65045	TRUE	15	TTAACCTGCAGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	31041	65954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_65380_65527
891174	contig_10602_pilon	+	3680	6	Intergenic	novelGene_159638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3029	3619	35614	37563	FALSE	20	TCCGGGCCCAGAGGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTWNNFFTTHPVKVNWALTIDGRGCQGWVVRAEQAHQGGHQLVQKGRSDSLAVLVEGRAPLAPQVEVLLQETVTGGRAQGGQFQRRRGLHQRRRQARQEHGLGETLVPAVGVPGEGLRVNHVLHELHLRQDSQFLIHRLGRVHRRLPSLYPPLPRRLAFGSQGGHNRRVARNGSRRDIWARRLWSHDVHLGRGVQ	26570	37624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_+_28196_29358_30394_32556_32731_33690_33800_35528_35676_37034
891175	contig_9415_pilon	+	2601	12	Intergenic	novelGene_109891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.7431276779317	187	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1350	1658	2077626	2080624	TRUE	40	CCAGATTATACAACGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTVMFWASASPRAPVASMALAICRRENPISSKGTAIAGGGGEVESLLLGSDKAVRLAGLADWESGEVKLCLLPTSSEGEVGNDDIGGVCARRVGSTVVVG	2066999	2085208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2067137_2070648_2070822_2071860_2072067_2072758_2072808_2073775_2074049_2074974_2075178_2076196_2076322_2077442_2077670_2077877_2077997_2080478_2080642_2082733_2082931_2084479
891176	contig_7358_pilon	-	5288	6	Intergenic	novelGene_178265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	4792	5286	244592	244098	FALSE	25	CCGAGCTGGGGCAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSESRGRWREASEKSKEAENKSNTSSQQMAPREPPAWVCGIQAAGTSRSRDRGRGKQRNKRTKAPGSHQRGSPDREAAGQLNGAQQPCKKKLRWRTEPGTRAKGGGGSERQVRNQRKQKKKATLAANKWHPESHPLGCVESKQLVLPGQETVAAGSRG	370427	244095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7358_pilon_-_244788_245148_245516_365731_365962_366295_366851_366940_369140_369182
891177	contig_16622_pilon	+	4856	3	Intergenic	novelGene_48453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGTCTGAGACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111633	121971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_114444_117479_118889_121334
891178	contig_7106_pilon	-	1844	3	Intergenic	novelGene_148305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGGGATGAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6464	3713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_5034_5340_5486_6085
891179	contig_13041_pilon	-	3631	3	Intergenic	novelGene_127731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	633	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1344	1715	288728	288357	TRUE	60	AAAAAAAAGACTTGAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFRSKTGQKFLRAMIKVHCTQDGAVISLLHSNRIGMLYDTVKLRDAFRSVPKSVVMSVMQILLNIVRPGGPTSYAAAWTTVEMQRTAEIRVTAHSPLWLLGAINAPTRRSRNQSIANAIRSC	290071	273464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_275164_284998_285094_288234
891180	contig_11493_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_143729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATCTTTGTTGGTTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350801	353149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_350800_353100
891181	contig_3103_pilon	-	3558	6	Intergenic	novelGene_146194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_5	291.790746940337	26	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2001	2327	73737	73411	FALSE	55	AATAGACAAATTCATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVNREYKKAASWSFQQETEQPVTSDICFPTPHPSSSPLWPVSWLGSTTFTPVSLGFHPPALAGSLSAICWLLVLLFSDSLDLFLISHHLTLLSLKYLALCAIFASS	159812	72179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_75364_94341_94366_95012_95082_98603_98733_115721_115804_159742
891182	contig_2219_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_67179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117950	116574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_116600_118000
891183	contig_6599_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_175983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGCCCGCCGCGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262526	261325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261300_262500
891184	contig_17753_pilon	-	3116	2	Intergenic	novelGene_105104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCTCAGCAAGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145711	142512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_145116_145198
891185	contig_5033_pilon	-	2258	8	Intergenic	novelGene_28924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1082.02057772126	40	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	129	1067	477189	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477317	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_449663_449715_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
891186	contig_13481_pilon	+	1955	2	Intergenic	novelGene_119407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	111	638	633332	633859	TRUE	15	GAACTTCTCTGCTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPQLHCSETSEAAPKESRKPPTPPPKIISEKLRASMSGMEPSGLAQSPGVPDISAPGPAQVSVNGIDDNSEPTKLSKATAAPGIHQKDAAMSTALPVWDLPPQFHPRCSSLGDLLGEGPQRPRQPRERLYRAELEVRVASEQTEQLLNKVRGTEPAPDSPEALLSHAVEQLRQATQVLQEIRDLGALSQGAPGLREKRKELVTLYRRSAP	633221	635634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_634265_634722
891187	contig_10734_pilon	-	8404	31	Intergenic	novelGene_51070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAGAACAAAATATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499858	460684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_460823_461379_461486_463300_463525_466144_466243_469396_469496_471472_471631_472994_473131_473330_473421_474646_474809_476098_476236_476314_476420_476552_476706_477475_477662_478248_478345_479655_479808_481266_481466_481857_482024_482118_482294_483012_483145_484712_484849_485508_485623_485722_485794_486326_486427_487933_488009_489269_489417_489500_489596_489675_489769_491999_492138_492652_492731_494128_494322_495406
891188	contig_3797_pilon	-	2880	1	Intergenic	novelGene_120093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	325	618	351261	350968	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTLPDFRIYYTTTVVKTAWYWYYNRYIDQWNRTENPDINPSTYEQLIFDKGPKSVNWGKDSLFNKWCWHNCISICKELKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEGKIGTMLGALIHGINTIRTLSNNTQAPEERPDKWERLKIKNLYSSKDFTRRVKRQPTDWEKIFGYDKSNEHSISKIYKILQIKKWAKKMLTIISY	351585	348705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_348700_351600
891189	contig_10581_pilon	-	4182	1	Intergenic	novelGene_41418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639087	634905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_634900_639100
891190	contig_7992_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_115551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636326	637699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_636300_637700
891191	contig_13905_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_130435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228910	227678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_227700_228900
891192	contig_7408_pilon	-	2432	7	Intergenic	novelGene_168739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	197.130596869746	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	512	1591	38514	12597	FALSE	30	TGAATCAAAGTTCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48334	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_48039
891193	contig_9098_pilon	-	2486	10	Intergenic	novelGene_75795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_9	349.096859458733	582	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	1437	2237	288130	264388	FALSE	25	TACAACTTGTAGTTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295344	264138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_289280_292840_292905_294101_294181_295200
891194	contig_6047_pilon	-	3657	7	Intergenic	novelGene_24244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_5	232.854568346855	424	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1949	2572	295666	281640	FALSE	50	AACTAAACTTAGATAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDGDSSTTDASQLGISADYIGGSHYVIQPHDDTEDSMNDHEDTNGSKESFREQDIYLPIANVARIMKNAIPQTGKIAKDAKECVQECVSEFISFITSEASERCHQEKRKTINGEDILFAMSTLGFDSYVEPLKLYLQKFREAMKGEKGIGGTVTATDGLSEELTEEAFTNQLPAGLITADGQQQNVMVYTTSYQQISGVQQIQFS	297614	280554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_281673_282295_282376_283168_283251_284772_284971_286830_286962_288457_288552_295660
891195	contig_4388_pilon	+	1574	2	Intergenic	novelGene_161990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCGATGGAACTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308988	1310603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1309883_1309923
891196	contig_16635_pilon	-	3023	2	Intergenic	novelGene_153152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95535	92440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_94371_94442
891197	contig_9609_pilon	+	6645	12	Intergenic	novelGene_22993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	255.040622270776	25	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	4018	4842	320917	324561	FALSE	35	ACATTCCCAGCATGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGITNCCLFFFLQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGRKLYLPFTFCLGTYSWGDMTRCFK	309968	326364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310540_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411
891198	contig_9051_pilon	-	2607	2	Intergenic	novelGene_170801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	744	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	361	1359	815193	676777	FALSE	60	CAGAAGAAAGGCAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKESIHQEEITITNIYTPNDRAPKYIKQTLTALKRERDSSTIVAGDFNTPLPVKNRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDLYRTLHPTAAKYTFFSNTDGTFYRIDHILGHKASLNKIQNIEILHSIFSDHKAVKVEMNNRKSKEKKPNTWKLNNILLKNYWVIEEIKDGIKKFIDSNENENTFYQNLWDTAKAALRGQFTATNAHIQKEERAIIKTLTLQLEQAEREQQKKSSGTRRKEITRIRAELNETVNRKTIERVNKTKSWFFEKINKIYNPLAKLTKEKQKRKQITRIRNEMGDITTDPTETDRIITEYNKKLYSNIFHMERKPR	815553	675528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_676807_814224
891199	contig_6227_pilon	-	6663	15	Intergenic	novelGene_49779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	71.3176281268008	965	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	1553	2956	1254536	1244082	TRUE	35	TTTTTCATGAATTTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVVVDTAQIENKEAYAPQISLEGSRIVVQVPSTWCLKEDPATMSLLQRSLDPEKTLGLVDVLYTAVLDLNRWRAGREQALPCIQIQLQREICDFGNQADLPSGNGNKSSGLQKTFAKLTSRFTKKASCTSSSSSTNYSIPNTPSKNIFIAGCSEEKPKMSSNIDTRLQSILNIGNFPRTTDPSQSAQNAGNQMANGFLMERHENFLHGDDSKDEKGMNLPTDQEMQEVIDFLSGFNMGQSHQGSPLMTRRNSAATAMVTEQKAGAVQPQQPPLPVPPPRPPQAGTHTPLTPQLGLAPQQQSPKQPAPSPAPGTWKMGTWLIPAASTGTACWSRSISSWPMAWRI	1292063	1234226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1237378_1237900_1237980_1239862_1240001_1240778_1240945_1243908_1244204_1244256_1244943_1246112_1246239_1250370_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1291145_1291278
891200	contig_5502_pilon	-	2315	2	Intergenic	novelGene_155019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	967	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAATAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537394	534479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_536601_537200
891202	contig_4301_pilon	-	3035	1	Intergenic	novelGene_65107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGTGACTGTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541045	538010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_538000_541000
891203	contig_6710_pilon	+	3111	3	Intergenic	novelGene_89049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1224	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCAGCTGCTCATAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588250	711873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_590016_634081_634385_710830
891204	contig_3612_pilon	-	2255	11	Intergenic	novelGene_87799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	97.8472789606333	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	30	1214	830950	815098	FALSE	40	TCAAAGGATCTGTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVETLGAPKMPDYLGADQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTYGQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN	830979	814056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_815256_815341_815439_815532_815736_818129_818218_819092_819258_820136_820189_821430_821563_825044_825145_825858_825941_826555_826594_830880
891205	contig_8978_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_49308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	862	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTCATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129976	131793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_130000_131800
891206	contig_6364_pilon	-	2507	5	Intergenic	novelGene_51835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	678.998711338983	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	738	1121	1604482	1603291	FALSE	20	AAGTGATGGCTTCTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERPEDLNLPNAVITRIIKEALPDGVNISKEARSAISRAASVFVLYATSCANNFAMKGKRKTLNASDVLSAMEEMEFQRFVTPLKEALEAYRREQKGKKEASEQKKKDKDKKTDSEEQDKSRDEDN	1605219	1601904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1603295_1603357_1603467_1603752_1603872_1604236_1604323_1604416
891207	contig_5928_pilon	-	1551	5	Intergenic	novelGene_40392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_2	134.262801996681	495	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	185	796	381340	359489	FALSE	30	GCATTTTCCAAGAGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPLPCRGGSGGGGGSPLLTSAGAPRPTFLSLSPSVRLAPPPPPVTLPRPHPSPAPPLPPAMACGATLKRTLDFDPLLSPASPKRRRCAPLSAPTSAAASPSAAAAATAASFSAAAASPQKYHRMEPSPFGDVSSRLTTEQILYNIKQEYKRMQKRRHLETSFQQTDPCCTSDAQPHAFLLSGPASPGTSSATSSPLKKEQPLFTLRQVGMICERLLKEREEKVREEYEEILNTKLAEQYDAFVKFTHDQIMRRYGEQPASYVS	381524	358733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_359500_359761_359834_360903_361054_364686_364831_381105
891208	contig_17_pilon	-	7757	7	Intergenic	novelGene_173973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4449	4763	352991	352677	TRUE	20	TGAGTGGTGGCTTAATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTWRPQPRDLGHGKQGSPSRG	541978	169200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_169490_169668_170166_255568_257288_335403_335545_352328_354182_538677_540691_540733
891209	contig_1433_pilon	-	6892	6	Intergenic	novelGene_178603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	138	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	4582	4977	26706	25533	TRUE	60	TTAAAAAAAATATTAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKEKKPSISKALLKKKNKVGGLTLPDLRNYYAATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKSPETINEKTVFLTNRACKTGCPSAKK	63413	23384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1433_pilon_-_24178_24274_25109_25244_25596_26373_27709_55088_57116_61861
891210	contig_8058_pilon	-	2663	4	Intergenic	novelGene_149509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	17.0489491367259	205	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	180	1235	63142	61432	FALSE	30	AGACTGGCTATGGACTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKFFRYHNAVVYLDEYTEIFKMNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75183	60003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_63122_63189_63779_63819_75089
891211	contig_4213_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_124816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46093	44399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_44400_46100
891212	contig_7189_pilon	-	2231	14	Intergenic	novelGene_117641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_11	45.9617798513133	451	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	351	1769	537152	277726	FALSE	10	TTTCTTTTGTTTTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIYIQEPPTNGKVLLKTTAGDIDIELWSKEAPKACRNFIQLCLEAYYDNTIFHRVVPGFIIQGGDPTGTGTGGDSIYGAPFKDEFHSRLRFNRRGLVAMANAGPHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKEKPEEEVKKLKPKGTKNFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDDGEDQSAEHDEYIDGDEKNLMRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRSEELRKEARQLKRELLAAKQKKVENAAKQAEKRSEEEEAAPDGAVAEYRREKQKYEALRKQQAKKGTSREEQTLALLNQFKSKLTQAIAETPENDISETEVEDDEGWMSHVLQFEDKSRKVKDASMQDSDTFEIYDPRNPVNKRRREESKKLMREKKERR	537502	277263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_277889_305602_305707_311080_311191_396531_396636_501927_502086_505132_505164_506157_506238_520885_520956_523229_523334_524020_524120_526777_526922_529072_529186_532684_532782_537110
891213	contig_8310_pilon	-	3711	8	Intergenic	novelGene_75588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCGTGTCGCCATAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327569	308766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_308848_309219_309373_310948_311031_313065_313202_316634_316755_317712_317884_320574_320710_324736
891214	contig_18869_pilon	-	3724	4	Intergenic	novelGene_56485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	337	junction_1	387.733872076655	1335	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	90	509	379346	336739	FALSE	30	CATAGTGATGTTACAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKPPISASQHENHQTVSHLATGQPHFPNMAPDSHINHNGNPGTSNQIPANPLQHLVSGPNKEPEPRIQTDTLKQASKDRVGDFHKLKQSRFFDENESPVDPQHGSKLADYNGDDGNVGEYEADKQAELAYNEEEDGDGGEEDVQDDEERELQMDPADYGKPRFNDVL	379435	333523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_336810_343526_343695_378128_378300_379336
891215	contig_6102_pilon	-	4403	2	Intergenic	novelGene_32136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGGGCACCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835111	830471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_831838_832074
891216	contig_5744_pilon	-	2788	5	Intergenic	novelGene_149337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	147.887414947993	104	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	423	827	648812	642056	FALSE	40	AAACTTGTCATAATCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFQADAPNPGLIPDADAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYTETELRENPPVKPDFSKLQRNILASNPRVTRFHINWEDNTEKLEDAESSNPNLQSLLSTDALPSASKGWSTSENSLNVMLESHMDCM	655899	640094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642269_644567_644745_648797_648914_655342_655383_655618
891217	contig_10581_pilon	-	4906	10	Intergenic	novelGene_41393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.8717587303523	568	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	314	1183	627511	609845	TRUE	40	GATATTCTTAAGAACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649700	605525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_607059_607654_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_649645
891218	contig_960_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_108299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	380	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGTCCTTTGGACTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038952	1041039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1039000_1041000
891219	contig_4857_pilon	-	4157	5	Intergenic	novelGene_48768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1441.54413737492	24	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1787	2296	1216861	1212207	TRUE	25	ATTTATTTTAAGCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1218647	1209602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210354_1211096_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723
891220	contig_13453_pilon	+	6553	2	Intergenic	novelGene_146709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	2990	4006	86467	89066	FALSE	50	TACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVETAWYWYNDRHIEQWNRIENPDVNPSTNRHLIFNKGPKSTKWGKDSLFNKWCWQNWMSICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEGKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTYKLDNWDLLKIKHLCSSKVFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGIISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLNPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDE	83477	91613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_86653_88235
891221	contig_18108_pilon	+	2254	3	Intergenic	novelGene_33459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	452	junction_2	76	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1385	1996	122594	123205	FALSE	75	TAAAAGGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	109907	123463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_111072_116603_116742_122511
891223	contig_4426_pilon	-	2127	6	Intergenic	novelGene_15431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2040	87	2126	904546	820607	FALSE	60	TCAGGGAAGAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKS	904632	820605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
891224	contig_3449_pilon	+	4119	12	Intergenic	novelGene_73735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	435.788939740329	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	551	1240	512166	519579	TRUE	10	CATTTTACTCTGGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKDFMFRVLAKNLKYTYMLYLMPDVCLTWLENLASR	493457	527131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519224_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524009_524356_524572_524800
891225	contig_13699_pilon	+	13290	57	Intergenic	novelGene_158314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_29	206.81477713359	1634	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2446	7341	18	7358	41521	118308	TRUE	40	GTAAGAAGATTACTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLEQPMAERKSQLDALAFDIQFFISEHAQDLSPKQNRQMLRLLNELQRSFQDLAEQTAAQMDVLQGHLQQLEQAAQVKTLQKQQNTCHQKLEDLCNWVGQAEKTLVSHQGRAIQQDLSALQKDQSDLKDLQDDIQNHATSFASVVKDIEGFLEENQTKLSTHELTALREKLLQAKEQYEALQGRTRVAQKELEEAVTSALQQETEKCKAAKELAENRSKIDTLLDWVTSLGSSGRQLQASLPRMEQISGAGLEKEALDTTDGHTGVNQAPEKLDEQCEKMKAHHQELLSKQQNFILATQSAQAFLDQHGHNLTPEERQTLQEKLGELKEQYATCLAQSEAELKRVQTLRDELQKFLQDHREFENWLERSEKELENMHKGDSSPEALPSLLKRQGSFSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLDTENSFKKGGEPSATENLVKEKLRDATERYTALHSKCTRLGSHLNVLLGQYRQFQSSVDSLQAWMRTCRANVEKLLSDSVASDPGILQQQLATTKQLQEELAEHQVPVEKLQKVAHDLMEVEGEPSPDHRHVQETTDCILSCFQSLSCSLAERSALLQKAIAHSQSVQESLESLLQSIREVEKNLGGEQMASLSSGVIQEGLATNMKLKQDIARQKSSLEATREMVTRFMETADSTTAAVLQGKMAEVSQRFEELCLQQQEKESSLKKLLPQAEMFEHLSEKLQQFMENKIRILASGNQPDQDIAHFFQQIQELNLEIQDQQENLDTLEHLVTELSSCGFALDISQHQDRVQNLKKDFTELQNTVKEREKDASSCQEQLDEFRKLVRTFQKWLKEAEGSIPPTETFRSTKELEKEIEHLKGLLDDWASKGTLVEEISCKGTSLENLIMEITAPDSQGKPDLTEIQCDMSDVNLKYEKLGGVLRERQESLQAVLSRMQEVQKEASSVLQWLESKEEVLKAMDASSSPTKTETVRAQAESNKAFLEELEQNSPTIQKVKDALAGLLMTYPNSQEAENWKKIQEDLNSRWKRATEVTMARQRQLEESASHLASFQTAESQLRPWLMEKELMMGVLGPLSIDPNMLNAQKQQVQFMLKEFEARRQQHEQLNEAAQGILTGPGDVSPSFSQVQQELQSINQKWVELTDKLNSRSSHIDQAIVKSTQYQELLQDLSEKVKAVGQRLSGQSAISTQPEAVKQQLEDTSEIRSDLEQLDNEIKEAQTLCDELSVLIGEQYLKDELKKRLETVALPLQGLEDLAADRMNRLQAALASTQQFQQMFDELRTWLDDKQSQQAKNCPISAKLEQLQSQLQENEEFQKSVNQHSGSYEVIVAEGESLLLSVPPGEEKRTLQNQLVDLKSHWEELSKKTADRQSRLKDCLQKAQKYQWHVEDLVPWIDDCKAKMSDLRVTLDPVQLESSLLRSKAMLSEVEKRRSLLEILNSAADILINSSETDEDDIRDEKAGINQNMDTITEELQAKTGSLEEMTQRLKEFQESFKNIEKKVEGAKHQLEIFDALGSQVCSNKNLEKLRAQQEVLQALEPQVDYLKNFTQGLVEDAPDGSDASQLLHQAEVAQQEFLEVKERVNSGCVMMENKLEGIGQFHCRVREMFSQLADLDDELDGMGAIGRDTDSLQSQIEDVRLFLNKIQVLKLDIEASEAECRQMLEEEGTLDLLGLKRELEALNKQCGKLTERGKARQEQLELTLGRVEDFYRKLKVLNDMTTAAEEGEALQWVVGTEVDVINQQLADFKTFQKEQVDPLQMKLQQVNGLGQGLIQSAGKNCDVQGLEHDMEEINARWNTLNKKVAQRIAQLQEALLHCGKFQDALEPLLSWLADTEELIANQKPPSAEYKVVKAQIQEQKLLQRLLDDRKATVDMLQAEGGRIAQSAELADREKITGQLKSLESRWTELLSKAAARQKQLEDILVLAKQFHETAEPISDFLSVTEKKLANSEPVGTQTAKIQQQIVRHKALKEEIESHATDVHQAVKIGQSLSSLTCSAEQGVLSEKLDSLQARYSEIQDRCCRKAALLEQALSNARLFGEDEVEVLNWLAEVEDKLSSVFVKDYRQDVLQKQHADHMALNEEIVNRKKNVDQAIKNGQALLKQTTGEEVLLIQEKLDGIKTRYTDITVTSSKALRTLEQARQLATKFQSTYEELTGWLREVEEELATTGGQSPTGEQIPQFQQRQKELKKEVMEHRLVLDTVNEVSRALLELVPWRAREGLDKLVSDANEQYKLVSDTIGQRVDEIDAAIQRSQQYEQAADAELAWVAETKRKLMALGPIRLEQDQTTAQLQVQKAFSIDIIRHKDSMDELFSHRGEIFGTCGEEQKAVLQEKTESLIQQYEAISLLNSERYARLERAQVLVNQFWETYEELSPWIEETRALIAQLPPPAIDHEQLRQQQEEMRQLRESIAEHKPHIDKLLKIGPQLKELNPEEGEMVEEKYQKAENMYVQIKEEVRQRALALDEAISQSAQVLP	41503	160365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_41740_44567_44718_45400_45635_46778_47004_50324_50844_51604_51782_52041_52166_53003_53213_53587_53906_56103_56271_58071_58229_60106_60225_65340_65583_66406_66537_67776_67977_70769_71266_72689_74162_104575_104738_104916_105088_106270_106438_108464_108625_108983_109311_110257_110343_110881_111124_111803_112011_113511_113632_114097_114206_115118_115338_116365_116574_118300_118533_119181_119409_120422_120546_120643_120746_121371_121474_121584_121759_121851_122008_122147_122346_122899_123029_123750_123925_126297_126454_126560_126768_126902_127023_127467_127638_129029_129190_130128_130324_130676_130806_131648_131793_132306_132496_135026_135148_135725_135890_137532_137696_139002_139158_140354_140430_144855_144974_154115_154328_157696_157827_158650
891226	contig_3153_pilon	+	3487	10	Intergenic	novelGene_104623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	303	junction_9	232.756482717267	783	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1024	3075	388	3462	63009	190713	FALSE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVKENSQNLIQRMGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGAFFEKNPLKNFQQLDLAGNCVSSDGWLAFMGVLENLQQLVFFDFSTEGFLPDAALVRKLGHVLSKLTFLQEARLIGWQFDDEDLNVIKGTFKLVTA	57712	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_63010_66684_66946_67756_69752_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
891227	contig_2703_pilon	+	9214	13	Intergenic	novelGene_101714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1029.29292073086	520	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	7882	8352	603453	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526179	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
891228	contig_13702_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_102638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1067	1366	211071	211370	NA	15	CCAGGGGTGCTGCCAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210004	211811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210000_211800
891229	contig_13244_pilon	+	2010	3	Intergenic	novelGene_86921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	276.5	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCAATAGTGTTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239731	254402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_250878_250935_252541
891230	scaffold_13505_pilon	-	5402	4	Intergenic	novelGene_111607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCGAGAATCCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662824	655413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_656508_657884_660906_661240_661968_662264
891231	contig_10003_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_88139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGGTATCAGTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371396	369835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_369800_371400
891232	contig_7869_pilon	+	2982	2	Intergenic	novelGene_149994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1807	2109	94073	94375	TRUE	25	TTTCATACCATTGCCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLLLMSILVVLLPRQILFILLAINGIFKILCQHHNSKASILLQSSGFIVQLSHAYEATENTIAWVRGSLVPEVTSSLFNTVKRAFAANLPRAMCLLIS	92266	95693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_94870_95314
891233	contig_7376_pilon	+	3273	8	Intergenic	novelGene_108070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.791863943091	28	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	421	804	69009	70861	FALSE	65	ACAAAAAAAGAAAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVRLRKEIKRRGKDPTEHIPEIILNNFTTRLGHSVGRMFASLFPHDPQFIGRQVATFHNQRDYIFFRFHRYIFKSEKKVGIQELGPRFTLKLRSLQKGTFDSKYGEYEWVHKPREMDTSRRKFHL	54867	73330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_54926_57535_57598_63239_63336_64119_64274_68958_69042_69483_69666_69821_69949_70819
891234	contig_6191_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_107813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	48	392	12860	12516	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSASRSPAQAARRAMASEACPPSPLLVRVSESGPRLRRKLESYFQSRRSGGGECTVRAVGDSAPDTFRVEFRERAGELRAAGVRAQAGGARLSWASPADFQVEPVHADPGHRAGERMVLSVGDMNWGL	12907	11294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_11300_12900
891235	contig_6031_pilon	-	1490	7	Intergenic	novelGene_56756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	777.446175343062	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	107	754	257696	255580	TRUE	10	GTTGCCCTGATGACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGTAPPSISTPSCRPPTTMVTRVCTWPLSMAIWASWSIWCPWVPTSTLRSPVMAGLPSTSQWTCRILTWCRSC	257802	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256216_256279_256375_256704_256814_257469
891236	contig_19402_pilon	-	5059	18	Intergenic	novelGene_80784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTCATGATGTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146712	23467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_145589_145822
891237	contig_10312_pilon	-	3112	1	Intergenic	novelGene_159031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1605	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTGAGGAGGATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556724	553612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_553600_556700
891238	contig_5419_pilon	-	7225	6	Intergenic	novelGene_15539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	158	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	4822	5280	427305	426847	FALSE	75	ACCAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNNKKRAGVAILISDKINFKAKFTTKDKEEHYIMIKGSIQRRGQHGGVVRCCLYLSYNKDLENTSDLIEYLRALDKARLRNPSERYGRGRPFGRGEEGQSREWQNCSSTAILVHGEADKQLCSARPWEAVSRSRETRQQRCCLDTPNQ	473742	424901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_429961_434250_434756_459966_460160_471672_472197_472710_473195_473282
891239	contig_7201_pilon	-	3397	18	Intergenic	novelGene_152492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_1	312.227957713358	116	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	201	1763	255800	70168	TRUE	65	CAAAAATAACAAAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEVEEIVDIGSFAPEDIHIPKIYVHRLIKGEAYEKRIERLSIRKEEDGKAKSVKPGDSVRERIIKRAALEFEDGMYANLGIGIPLLASNFISPNMTVHLQSENGVLGLGPYPLKNEVDADLINAGKETVTVLPGASYFSSDESFAMIRGGHVDLTMLGAMQVSRYGDLANWMIPGKMVKGMGGAMDLVSSAKTKVVVTMEHSAKGNAHKIMEKCTLPLTGKQCVNRIITEKAVFDVDKKEGLTLIEIWEGLTVDDIKKSTGCDFAVSPKLMPMQQIAS	256000	66410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_67233_69355_70210_83641_83744_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161658_161708_163992_164088_169479_169595_171320_171429_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_238453_238545_239711_239821_255722
891240	contig_10042_pilon	-	3693	1	Intergenic	novelGene_79243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAAATGAAGTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202236	1198543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1198500_1202200
891241	contig_14759_pilon	+	3865	2	Intergenic	novelGene_178605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3005	3364	143223	143582	FALSE	10	TGCCCCTAGGGATGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAFSMNLSIFSSLLSAFCFKSWIILNIRDLNSLSVMSSVFSSTGRSFAVLFWMPTGTILSGFCKCFDIVCCLQGIQRLFYLFIDCRFVCFILLFCFIWLCLSRLAVRSLLFACLWA	122632	144083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14759_pilon_+_124515_142100
891242	contig_9848_pilon	-	1709	10	Intergenic	novelGene_79971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_9	283.048484264524	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCATTTCAGTTTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110492	98514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_99394_104028_104148_104467_104537_104841_104905_105852_105909_106409_106548_106837_106876_107128_107399_110003_110044_110455
891243	contig_7396_pilon	+	2007	15	Intergenic	novelGene_79601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAACAGGCCCCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245933	257077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246476_247186_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249062_249736_249861_250230_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254701_255104_255194_255298_255376_257022
891244	contig_5684_pilon	-	1949	2	Intergenic	novelGene_81072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1380	1715	446308	445898	FALSE	55	AAAAAAAGCCCAAGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLENPLQAGLADPICQIQRQWPLACPSVLLVPNPSTGLIYPHLLCVVCTSDSVFSVCVIVLLEETLELCLPRSSTTNSNKDISFVNTKANGGSKDMRQGRANYSPLCLKL	447687	445663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_446219_446293
891245	scaffold_12124_pilon	-	2220	13	Intergenic	novelGene_22090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	987.321752548558	1	113	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	102	419	899419	896020	TRUE	15	GGCCCCTTCTCCTTATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANWISPEPAWQPTLANRARSGSSGAWETVW	899520	860066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_860161_867259_867353_869989_870099_877119_877262_877341_877528_879041_879169_883674_883806_885382_885474_894072_894649_895139_895281_895908_896107_896275_896396_899308
891246	contig_9801_pilon	-	5808	1	Intergenic	novelGene_167562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	823	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	374	1125	1420	2544	103036	101912	NA	40	AATCCAATTATTGATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSEDEEEEEKHSSDSDYEQAKAKYSDMSPVYRDKSGSGQIQDPNITLLTPTQIPSDAGVETPKQEFDVFGAVPFFAMRAQQPQQGENEKNLSQQTHFPPVGLEQEEFDVFTKAPFSKKVNVQDCLKVGPKAHTLPGCPISVDVFGSTPFQPFPTPVSKSESNEDIFGLVPFEEITGSQQQKVKQRSLQKLSSRQRRTKQDMSKSNGKRHHGTPTSTKKTLKPTFRTPERARRHKKVGRRDSQSSNEFLTISDSKENISVALTDGKDRGNILQPEESLLDPFGAKPFHPPDVTRHPSHTGLSDIRADHNTVLPGRPRQNSLHGSFHSADALKIDDFGAVPFTELVVQSITSHQSQQSQSVELDPFGAAPFPSKQ	104455	98647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_-_98600_104500
891247	contig_2069_pilon	+	3487	6	Intergenic	novelGene_23204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1316	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2820	3119	109103	109402	TRUE	20	GAGACGCCCGCCAGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAWISYWGFRISELQGRVGQVTGRSLRAGSCTAWSRVRGTPGSHIQKSPFWDRGRCRVTCLAPALRTQRAQQVPRCISTASSKRGWSSGTTLFFMEML	95659	114417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_97261_97870_98025_102635_103696_109098_109511_111853_111992_114295
891248	contig_6576_pilon	+	2930	3	Intergenic	novelGene_42417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	7	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	89	1435	1301228	1302574	TRUE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295688	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303772_1303983
891249	contig_854_pilon	-	7061	1	Intergenic	novelGene_36542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1426	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATAGTGTTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1625930	1618869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1618900_1625900
891250	contig_20199_pilon	-	979	3	Intergenic	novelGene_82543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	153	455	43987	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44139	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43906
891251	contig_7359_pilon	-	1736	2	Intergenic	novelGene_139845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAATTGTTTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38505	25489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26890_38169
891252	contig_2703_pilon	-	8095	2	Intergenic	novelGene_101766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	610	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTGGACAAACTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599912	588536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_596399_599679
891253	contig_12943_pilon	+	1780	15	Intergenic	novelGene_140356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_14	267.034622841156	1041	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1689	92	1780	30166	103631	FALSE	40	TTCAAAATACATTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGVEDNEKNFYESDDEEKEKTEKRKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLFWHLSPKSEASIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNISEITDACLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRRMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKILLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNTKATGYLELSNWPEVAPDPAVRNVEVIELAKEWTPAGKTKKENPSKKFYSESEEEDGSSDSNSDSESESGSESGEQSEEGDSSDDSSEDSSSDSGSGSESELENKRTAKKNAKNKGRSDSEDGEKENEKSKTSESSSAESSSVEESSSDSESESESASKPESRKVTKEKEKTRQDRNPVTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSPSLIADLEGLNLSASSSVINVS	30074	103631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_+_30232_34949_35048_36609_36665_36751_36824_43126_43190_45748_45882_50600_50711_57186_57364_67008_67196_68162_68294_75000_75110_78701_78859_82020_82169_93054_93125_103518
891254	contig_5302_pilon	-	2630	10	Intergenic	novelGene_81442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_9	685.532414520294	28	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	48	899	209238	177300	FALSE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSCPGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209572	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209554
891255	contig_2894_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_86553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGGCAGTCTGCTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315236	313178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_313200_315200
891256	contig_753_pilon	+	3831	1	Intergenic	novelGene_113007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCTTACAGCTGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327690	1331521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1327700_1331500
891258	contig_8377_pilon	-	2898	7	Intergenic	novelGene_35142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAAGTTGATTCTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198744	188162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660
891259	contig_5302_pilon	+	1451	6	Intergenic	novelGene_81392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.46723791865	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTATAGAAAGTGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152098	170306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_152871_155421_155519_161142_161217_167388_167462_169176_169328_170022
891260	contig_10861_pilon	+	1166	8	Intergenic	novelGene_39234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.066031448137	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	46	348	603123	605721	TRUE	10	CTTCAGTAGCTTCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGNDEFLVVELLEVMVGAVALEDLLKETTYEFFEGGWMFSWVVSLAVTGNEMKRMMSYSQTRMLMSAFFCLTGDLLLLCLGGGGIRLGGVLLLGDGRLLGLGRLLGEYDLDRDL	603077	611554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605072_605190_605701_605897_606400_606601_607921_608038_608886_609058_611134_611260_611523
891261	contig_19816_pilon	-	2164	3	Intergenic	novelGene_156496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	148	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	199	309	125593	125483	TRUE	15	TTCCAGAATCCTGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	125791	123035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001
891262	contig_2987_pilon	-	4545	6	Intergenic	novelGene_125861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	210.898458979671	287	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	180	1445	545821	538100	TRUE	10	TCATTTGTCTGTGCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVLQCLARGLPADSLGDQGRGLEPRDENVQGRCEPGQQPADQSLKQAPRLGLPHPRPSMRLSVRRLLLVAGCALALVLAVQLGQQVLECRAVLAGPRSPRRVMRPEQEELVIVGTNHVEYRYGKAMPLIFVGGVPRSGTTLMRAMLDAHPEVRCGEETRIIPRVLAMRQAWSKSGREKLRLDEAGVTDEVLDAAMQAFILEVIAKHGEPARVLCNKDPFTLKSSVYLSRLFPNSKFLLMVRDGRASVHSMITRKVTIAGFDLSSYRDCLTKWNKAIEVMYTQCLEVGKDKCLPVYYEQLVLHPRRSLKLILDFLGITWSDAVLHHEDLIGKPGGVSLSKIERSTDQVIKPVNLEALSKWIGHIPGDVVRDMAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQVRNPNGNSEFWLSWLCTSFLYALGCSTSPVCHSFPFVKLRGGGHRISKWPNLTSPSA	593466	533290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_538325_539478_539678_544979_545901_553777_553850_593438
891263	contig_13888_pilon	-	3209	4	Intergenic	novelGene_151782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	722	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTTTGACAAAACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346637	337463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_337762_338560_338805_343106_345500_346363
891265	contig_3747_pilon	-	2043	5	Intergenic	novelGene_24949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCAGGAATGAACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205198	202692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
891266	contig_3410_pilon	-	2650	11	Intergenic	novelGene_58926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	509.543805771398	2	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	62	1081	34242	15425	TRUE	20	AGTTTGTTTTACACGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSAEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQWTSRSPSPRRSAPFSPSQGHQRHCSRTPRRSRCLWVCRMPG	34303	13700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14833_14987_15549_15609_15698_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30382_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217
891267	contig_7644_pilon	+	4990	1	Intergenic	novelGene_64258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAAAAATAAAGACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183145	188135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_183100_188100
891268	contig_3155_pilon	+	1843	5	Intergenic	novelGene_26411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1056.88442485449	165	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	250	576	259780	261211	TRUE	25	CACCTCACTCCAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258141	262549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258224_259209_259329_259731_259978_261082_261724_261794
891269	contig_2890_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_60295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1301	1600	363714	364013	NA	75	AAAAAAAATAGAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLPKTESSTARWCLATTTECSDQDHNRGFWTELEKDVKQNSNTHKKDQIYWPERDWRNSETMDPKHPFSSVVKSLLRFTVQPGTGQPHKTKQD	362413	364453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_362400_364500
891270	contig_2036_pilon	-	4217	9	Intergenic	novelGene_131798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTACATCTAGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297905	242063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_243220_243490_243593_244174_244455_244613_244718_258291_258607_258714_258813_259318_259358_295389_296819_297211
891271	contig_2377_pilon	+	1514	2	Intergenic	novelGene_67923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAAACAAACAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277197	279593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_278009_278890
891272	contig_6533_pilon	+	1418	3	Intergenic	novelGene_114618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	986	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAGACAAAATATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10484	26439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25212
891273	contig_5056_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_171164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCTTTTCAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139112	137618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_-_137600_139100
891274	contig_11822_pilon	+	4426	2	Intergenic	novelGene_178606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	514	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3331	3696	215478	215843	FALSE	65	GGAAAAAGAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISESLLFTFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCTIFLNSSNFLSVVSMNLSTFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGTSRAFSSTRESSGFLFWMPTGTILSSFCKCFDIVCCFRGIQ	209361	216573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11822_pilon_+_211334_214119
891275	contig_18272_pilon	-	8139	1	Intergenic	novelGene_7077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1768	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	6118	6495	527873	527496	NA	20	GTGCTCCACAGTACTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPRPGFLGMVGTHRPGLWEAEVLHWATWARGLPISLTRADWNRDAAGGPSSKVTLLPALLLRCQTCITDQGSPTLFCYLFCSFPVSCSDVPSINVLLVGLTLPWHLLLCGPRLPHYSYQTFSY	533990	525851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_525900_534000
891276	contig_9863_pilon	+	2981	7	Intergenic	novelGene_153996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_3	87.0529851425109	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	30	2087	45391	57415	FALSE	15	GTTGTAGCTTTCTTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRGPAAEKMVLTRSARPQARIQATSAERSQQKNSAADGIKECPESRKESQSDDRSTAESHTTWEHSPVPRTPKTRKRKSRIEGSLPEMIEPSADGETSEAESNCSSVSELQDPIVRVTRRRQILVSRTPVSSVRKRLKITPISESHSEEEVSEAESHVSGISTFVPSTVITTRARRREAKPSQESHAEDISDAESSCSDISSFSGIAVRRATRSMHRKLQAQTEEKDTKIILGKEKWNCKGLDEKAKGIINKGKEINDKSSQLNSLSELQDASLQQLVSQKHSTPQSNKTTREPSNLNYEAVMKSLAQTFAVVEVDRWDEERKSTIKTSDSTQFGDDEECTIISVSKDMNNKKNVNLECDTTLCNPELNTSQDKGDSVLLVLSSDESQQSENSENEEDTVCFVENSGRRESSNGDLGNMSCDTALFVIDTTPGLSADKNFYLEEEDKASEAATEEEKEEGEDEKSEEPSDHDVNKDNELSDEEDLLNSTKSKLLKLTSSSIDPGLSIKELGGLYINFNADKLQSNKRTLTQIKEKTKNDLLQKTIITPDFEKNYSVPPYRESKFQLQKKRREERQKTAGNGWFGMKAPELTDELKNDLKALKMRASMDPKRFYKKNDRDGFPKYFQIGTIVDNPADFYHSRIPKKERKRTIVEELLADSEFRRYNRRKYSEIMAEKAANAAGKKFRKKKKFRN	45361	58309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_45463_46747_48130_49993_50133_52597_52694_53768_53934_55492_55603_57321
891277	contig_5959_pilon	-	2104	4	Intergenic	novelGene_150188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_3	134.514765814844	461	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	596	1705	216308	211902	FALSE	40	AGTCTGAAAACTGAAACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218734	211502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218222
891278	contig_253_pilon	-	4421	4	Intergenic	novelGene_129752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	306.65108656075	38	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1617	1985	703884	703228	FALSE	15	TTTAAAGGGTTTGGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS	705894	700791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_703410_703697_704650_704909_705089_705222
891279	contig_5779_pilon	+	2550	1	Intergenic	novelGene_106502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	543	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCTAATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207280	209830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_207300_209800
891280	contig_5797_pilon	+	5550	29	Intergenic	novelGene_56945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	214.598209642188	669	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	1103	3943	341511	418675	FALSE	40	CTATATCAGAGTGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEVRYPVILNAREKLIAWKVCLAFKQTVCGFDLLRANGQSYVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNIVMRELAPQFHIPWSIPLEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAVIRHGDRTPKQKMKMEVRHQKFFDLFEKCDGYKSGKLKLKKPKQLQEVLDIARQLLMELGQNNDSEIEENKSKLEQLKTVLEMYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYSRGVLSPDRHVRTRLYFTSESHVHSLLSILRYGALCNESKDEQWKRAMDYLNVVNELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGSHCAGLFSTSVLGGSSSAPNLQDYARTHRKKLTSSGCIDDATRGSAVKRFSISFARHPTNGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	322625	420282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322819_332997_333395_334941_335138_338882_338969_340495_340651_341435_341538_342634_342797_344522_344645_345910_346013_347027_347115_348058_348135_348209_348320_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362793_363574_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_403978_404099_404978_405042_408614_408756_412625_412752_418562
891281	contig_7843_pilon	-	2082	6	Intergenic	novelGene_152009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_5	129.187305877938	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	115	813	197252	178451	FALSE	35	TATGTCTCCCAGCAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAASSEHFEKLHEIFRGLHEYLQGAPERLLGTAGTEEKKKLIRDFDEKQQEANETLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKVVTNKLLLSIVILLELAILGGLVYYKFFHRH	197366	177181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182917_183092_187939_188132_190893_190953_197137
891282	contig_8377_pilon	+	1125	3	Intergenic	novelGene_34922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2556.5	21	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAGAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68076	69354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68786_68857
891283	contig_2069_pilon	-	2173	2	Intergenic	novelGene_23372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	53	652	1058995	1058396	TRUE	20	GTAAGACGTTTGTGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1059047	1056792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1057983_1058064
891284	contig_6137_pilon	-	2707	12	Intergenic	novelGene_59258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGATAGTCTGCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354916	1319538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336781_1346639_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
891285	contig_4884_pilon	+	4981	11	Intergenic	novelGene_63809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	578.334366953927	928	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	672	1829	578494	593204	FALSE	25	GAAATAACTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKSREQDHSRSSSSSASPSSPSSREEKESKKEREEEFKTHHELKEYSGFAGVSRPRGTFFRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEWDPEYTPKSKKYFLHDDRDDGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGDGIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE	563263	596356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570207_578039_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_586137_586319_587339_587487_592827_593041_593198
891286	contig_11115_pilon	+	1125	5	Intergenic	novelGene_102832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	707.033724443184	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	135	1037	165608	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165473	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166438_172401_172595_172714_172964_173047
891287	contig_3018_pilon	-	5713	20	Intergenic	novelGene_78818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	571.061484287432	215	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1039	3120	372	3491	583440	545087	FALSE	25	TATCAGAGAGCTTTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKREKRREQALERISTAKTEVKTECKDAQIVSDAEVIQEQAKEETATKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRTVSMCSDIQPSSPDIEVAAQQNDIENAVLAIEPETETAVAEIIPETEVPALNKCPTKYPKTKKHLVNEWLSEKNEKTGKPSDGLSERPLRITTDPEVLATQLNSLPGLTYSPHVYSTPKHYIRFTSPFLSEKRRRKEPTENISGSCKKRWLKQALEEENSTILHRFNSPYQERSRSPTVNGESKSPLLLNDSCSLPDLTTPLKKRRLYQLLDSAYSETSTPTPSPYATPTHTDITPIDPSFATPPRMKSDDETYRNGYKPIYSPVTPVTPGTPGNSMHFENISSPESSPEIKRRTYSQEGYDRSSTMLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLIDGSCTPQNPPQKKKVTNLTIYTLLNSVFL	625103	542864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_545699_545829_545887_546200_546452_547000_547146_547311_547567_550198_550508_550843_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583598_624826_624903_624965
891288	contig_8140_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_86458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCCTTGCCTCATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853279	853955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_853300_854000
891289	contig_4232_pilon	+	730	1	Intergenic	novelGene_63406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCAAGCAGTCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467351	468081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467400_468100
891290	contig_16185_pilon	+	6294	1	Intergenic	novelGene_144758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	5456	5824	116139	116507	NA	35	CAGCCAGACACCAATCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGAIEGLRSRFEMVEDKISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGGNRKHREDH	110683	116977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_110700_117000
891291	contig_9727_pilon	-	4186	24	Intergenic	novelGene_86362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	204.447894092519	116	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	193	1386	598065	578319	TRUE	0	CTTGGTGCGCGGCGCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKLDRGRFLHTGTRIPQSIAGHLDNQAPVESPRAISRTSESDPVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKAPTEEGRKELLFLSNANPGQLERLCAYL	622892	562160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_562196_562769_562811_563392_563501_565090_565288_565395_565486_566768_566923_568546_568695_571536_571688_574168_574284_575081_575373_576848_578405_579372_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_591628_591752_598023_598078_598938_599051_622824
891294	contig_9239_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_137187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1044	1682	214573	215211	NA	30	AAAATTTTTTTTGTATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTKLGALIHDRNTIRTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLRSSKDFIKTVKRQPTDWEKIFGYDKSNQHLISKIYKILQNLNNKETNNPVKKWAKDMNWHFTKEDIQAANRHMKKCSQSLAIRETQIKTTMRYHLTPTRLALIKKTQNKKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQRLWKSIWRFLKKLEIEVPHDPAILEYILEKQEPSHE	213529	216392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_213500_216400
891295	contig_15893_pilon	+	2802	1	Intergenic	novelGene_128497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	520	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	909	25	933	22021	22929	NA	40	ATTTAAATCTATCTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLQLPRNMIENSMFEEEPDVVDLAKEPCLHPLEPDEVEYEPRGSRLLVRGLGEHEMDEDEEDYESSAKLLGMSFMNRSSGLRNSAASYRQSPDGSCSVPSARTMVVCAFVVVVAVSVIMVIYLLPKCTFTKEGCHKKNQSMGLIQPFATNGKLFPWAQIRLPTAIKPLRYELNLHPNLTSMTFRGSVTISVQVLQATWNIILHSTGHNISRVTVMSAVSSQEKQVEILEYPFHEQIAIVAPEALLEGHNYTVKIEYSANISTSYYGFYGISYTDENNEKKYVAFLNDSGSMLCDNFWSMDPFAHIGDSN	21996	24798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_22000_24800
891296	contig_6496_pilon	-	5582	1	Intergenic	novelGene_103535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	727	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	316	951	842	1792	1138042	1137092	NA	25	TGGAAAGTCAGGTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFCLFSPRFVGVNASDINYSAGRYDPSVKVPFDAGFEGVGEVVALGLSASARYTVGQAVAYVARGSFAEYTVVPANIATPVPSVKPEYLALLVSGTTAYLSLEELGELSEGKKVLVTAAAGGTGQFAVQLSKRAKCHVIGTCSSDEKSAFLKSLGCDRPINYKTENVRAVLKREYPKGVDVVYESVGGALFDLAVDALATKGRLILIGFISGYQTPTGLSPVEVGTLPAKLLRKSASIQGFFLNHYLSKYQAAMDHLLKMCESGELVCEVDLGALSPGGKFTGLESVFRAIDYMYMGKNTGKLVVELPHAVNSKL	1138883	1133301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1133300_1138900
891297	contig_5023_pilon	+	2438	11	Intergenic	novelGene_7186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2312.56893735084	6	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	151	1476	607279	647344	FALSE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNSRDFALHPPRKSPLCGPPLLAILVSGPLEHLTSQSACLSPKRFGWSTKVASLLETFPRTGVPNVINFYVFHQEEALCF	580778	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625761_647108
891298	contig_299_pilon	-	2903	3	Intergenic	novelGene_129448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGGGGTGTGTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935458	931953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_933788_933894_933984_934478
891299	contig_6881_pilon	-	2642	4	Intergenic	novelGene_164835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	197.671444574071	65	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1418	2296	97859	72233	FALSE	30	CTGGGTAGAAGACTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASMFDLSMKDKTRSPFAKLKDKMKGRKNDGTFSDTSSAIIPSTHMPDANTEFPSGEIQMKSKPKKPFLLGPQRLSSAHSMSDLTGSHISSEKLKSGTIGQTHLLGRQIDSFGAVPESGSLKSPHRRTLSFDTSKTNQHDNSVDEGESSFGRQNDQLTNVTASLPQKFATLPRKKNPFEESSESWDSSVNLFSKSIEVRKENKREKREKVSLFERVTGKKDSRRSDKLNNGGSDSPCDLKSPNAFSENRQDYFDYESTNPFTAKFRASNIMPSSSFHMNPTSNEDLRKILD	99276	71886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_72239_72598_72645_96351_96821_97501
891300	contig_252_pilon	-	1789	5	Intergenic	novelGene_99913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	362.009236760611	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1022	1321	42759	41771	FALSE	30	GACACATCTGATATCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMIFTLVSAVQEKLNEIVDQIKTRREEEKKQKEKEAEEAEKQLFHGTPVTIENFLSWKAKFDAELLEIKKKRMKEDEQAGKNKLSGMTSFPAPPSHLI	67964	41302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_67158
891301	contig_6062_pilon	-	1904	1	Intergenic	novelGene_5316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823047	821143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_821100_823000
891302	contig_9995_pilon	+	2164	2	Intergenic	novelGene_47717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369622	374956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_371144_374313
891303	contig_10323_pilon	-	2597	2	Intergenic	novelGene_123596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	13	1431	460768	459350	TRUE	50	AAGACCAAAACCTCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	460780	458093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_459099_459188
891304	contig_7078_pilon	+	6263	6	Intergenic	novelGene_130189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	68.4	564	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3885	4247	969910	970272	TRUE	20	AATTTCTGCCTTTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFSEKILYNISMLWILLRLALWPNVWSILENVPCALEKKVYLAAVGWSVQFMRSSWLIVVFRSSMSLLSFFLDILSFTESDVLKSPTLLWSCLSLLSMLLEFVSCILEPCRWVRKYLL	781184	982397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_782501_967111_967538_967719_968604_968651_971649_975024_975387_982119
891305	contig_8138_pilon	+	2072	6	Intergenic	novelGene_52451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	388.081640895315	146	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	195	506	280295	305581	TRUE	20	CTGCGGAAGAATTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGESES	280100	307862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364
891306	contig_10861_pilon	-	1606	17	Intergenic	novelGene_39457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_12	291.118418506542	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	273	1109	2666327	2618403	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPIPPGFFQGPPGSQPSPHAQPPPHNPSSMMGPHSQPFMSPRYAGGPRPPIRMGNQPPGGVPGTQPLLPNSMDPTRQQGHPNMGGSMQRMNPPRGMGPMGPGPQNYGSGMRPPPNSLGPAMPGINMGPGAGRPWPNPNSANSIPYSSSSPGTYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSSDNIYTMINPVPPGGSRSNFPMGPGSDGPMGGMGGMEPHHMNGSLGSGDIDGLPKNSPNNISGISNPPGTPRDDSELGGNFLHSFQNDNYSPSMTMSV	2802591	2617905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2627217_2627289_2628638_2628694_2629212_2629249_2629939_2629989_2630666_2630732_2638316_2638394_2638507_2638575_2642392_2642453_2643377_2643459_2666291_2666384_2799029_2799115_2802236_2802299_2802522
891307	contig_7119_pilon	+	4339	5	Intergenic	novelGene_40910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	357.668491762973	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	552	1130	139647	140225	TRUE	20	ACATCTTTCTGGTATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127458	145320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137046_139307_142349_144129_145028_145132
891308	contig_15327_pilon	-	2308	2	Intergenic	novelGene_70553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTCAGCAACAACAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565305	562230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_564169_564935
891309	contig_12626_pilon	+	6362	25	Intergenic	novelGene_80441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_12	355.315616740948	33	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1870	5613	700	6312	155638	196455	FALSE	40	TACAAGAACTTAGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGREEMETECNRRTSQIEAQFRADCQKVTERYEDALQSLEGRYRQELKDLLEQQREEKSQWEFEKDELTQECAEAQEQLKETLQREKATSLVLTQEREMLEKTYQEHLNSMVVEKEQLLKDLEDLKNVSESQQSLLSNQILELQSNHERELKDCEQVLCQAGASEQLASQRLEKLEMEHEQERHEMMSKLLAMESIHKETCEKADRERAEMSTEISRLQNKLKEMQQAVSSLSRLESGCQAMGVGEAEGNGTMSLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHERAVKENVKMATEISRLQQRLQKLEPGSVMSSCLDEPSTEFLGNSLEQTEPFLLQNRMKRIEDITKKRVLSDLQDDETRDLGSTDTSSVRRQEAKIDSEASIESFSELENSEETRAETWDLKIQISQLQEQLTILRADCDRASEKKQDLLFDVSVLRKKLKTLERIPEASPKYKLLYEDASRENDCLQEELRLMETHYDEALENNKELTSEVFRLQEELKKVEEVTETFLSLEKSYDEVRGENEELHVLVLRLQGKIEKLQGRSVLQCDCLSLWEAHLDNLQAEPDEKVLELNQTLEECAPKVTNAHHIIEEHKQENQYLEQENTRVLEKLKAHEVAWLQGTIQTHQEKPRIQNQAILEENTALLGLQDKHFQRQATIAELELEKKKLQELTRKLRERVTALVKQKDVPSQGEKEEELKSMMLDLQSTCSEMQQKVELLRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELSSCINKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	147260	196505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_147769_149282_149474_155637_155785_156281_156450_156973_157111_157459_157601_157881_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_167699_169842_171116_171243_171350_171421_173060_173277_176134_176249_179387_179511_180235_180350_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
891310	contig_11574_pilon	-	2670	11	Intergenic	novelGene_64074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	295.521911201183	65	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1286	1984	451360	449890	FALSE	20	GTTTTAGAAGGGCGCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463690	449203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452968_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
891311	contig_3155_pilon	+	3613	4	Intergenic	novelGene_26391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1215.28085459928	15	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	933	1253	259780	260100	TRUE	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPVSMTSSEKTQSFLCILSLRNDLVFIVSPSLDNSSQYWYNH	258103	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258364_258704_259329_259731_261787_261850
891312	contig_3900_pilon	-	3971	1	Intergenic	novelGene_84197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	725	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTTGTGTGTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535958	531987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_532000_536000
891313	contig_1442_pilon	-	3555	11	Intergenic	novelGene_172172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	249.527874194447	1117	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	6	1301	657855	630260	TRUE	35	TACTAACATTGTGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVLWWLYAKQRKSPKETVIPEQLQIAEDNLRALLIYAISATVFTVILFLIMLVMRKRVALTIALFHVAGKVFIHLPLLVCQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGTAVQNEEGFVEFKVSGPLQYMWWYHGVGLIWISEFILACQQMTVAGAVVTYYFTRDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMYIHSQLKGKENACARCMLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNAYTATAINSTNFCTSAKDAFVILVENALRVAAINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQQDYTVWVLPLIIVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLCFAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAMKEAGKGGAADARELKPMASGTSSA	657860	627941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_630144_630207_630284_631653_631735_636534_636772_642283_642422_648722_648807_649512_649670_650885_651052_651995_652183_653410_653551_657773
891314	contig_7066_pilon	+	1955	7	Intergenic	novelGene_42159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	326.964702478213	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	560	895	833917	841366	FALSE	20	TACCTCTAAGAGTGTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	823348	842426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823701_829906_829965_830302_830397_833861_833961_835771_835852_837208_837292_841237
891315	contig_10135_pilon	-	2270	5	Intergenic	novelGene_106587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	69.9446209511496	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	131	1087	31065	29065	FALSE	35	ATAAAATTCCACCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLKRQASQVWPEEHGEQEHGLYSLHRMFDIVGTHLTHRDVRVLSFLFVDVIDDHERGLIRNGRDFLLALERQGRCDESNFRQVLQLLRIITRHDLLPYVTLKRRRAVCPDLVDKYLEETSIRYVTPRALSDPEPRPPQPPKTVPPHYPVVCCPTSGPQMCSKRPARGRATLGSQRKRRKSVTPDPKEKQTCDIRLRVRAEYCQHETALQGNVFSNKQDPLERQFERFNQANTILKSRDLGSIICDIKFSELTYLDAFWRDYINGSLLEALKGVFITDSLKQAVGHEAIKLLVNVDEEDYELGRQKLLRNLMLQALP	39623	27881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_29442_29992_30140_30429_30538_30740_31130_39557
891316	contig_13074_pilon	-	5191	25	Intergenic	novelGene_153440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_24	326.305750345184	1333	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	902	2709	89	2797	715589	534315	FALSE	15	ATGTATGTCGTTGTTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAQLSLTQLSSGNPVYEKYYRQVDTGNTGRVLASDAAAFLKKSGLPDLILGKIWDLADTDGKGILNKQEFFVALRLVACAQNGLDVSLSSLNLAVPPPRFHDTGSPLLISGTSAAELPWAVRSEDKAKYDAIFDSLSPVNGFLSGGKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVPMSLPPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSALLAHIWALCDTKDCGKLSNDQFALAFHLINQKLIKGIDPPQILTPEMIPPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNAEQDLKEKEDTVKQKTSEVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQRISSLKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAHLGPLQQHLQDSQQEISSMQMKLMEMKELENHNHQLNWCSSPHSILVNGAVDYCSLSTSSSETANLNEQAEGQSNLEAEPIHQESPARSSPEIPPTGMTYEKEVVTAAVNGKACPEFNSDKHSKEEDPFNVESSSLTDPVADTNLDFFQSDPFVGSDPFKDDPFGKIDPFGGDPFKGSDPFASDCFFKQSSADPFATSSTDPFSAASSNSNTSVETLKHNDPFAPGGTIVVAASDSATDPFASVFGNESFGDGFADFSTLSEVNNEDPFSSATLSSASNMVTTKNVFEETSFKSEDVPPALPPKIGTPTRPCPPPPGKRPVNKLDSSDPFKLKDPFQPFPGNDSPKEKDPDMFCDPFTSTTTTTTTANKEADPSNFANFSAYPSEEDMIEWAKRESEREEEQRLARLNQQEQEDLELAIALSKSEISEA	715677	531920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_534462_537094_537289_539574_539738_541042_541120_556624_556695_560585_560723_563081_563118_564214_564306_564557_564675_566189_566394_572615_572814_583611_583774_596954_597028_623120_623207_627541_627699_629321_629468_630387_630478_661301_661362_664969_665096_666202_666269_667204_667301_669883_669932_670716_670807_679256_679299_715556
891317	contig_17074_pilon	+	5293	8	Intergenic	novelGene_145192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	228.643738562143	1084	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	620	1000	648945	657014	FALSE	15	GACACGTGTGGATTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQARGPLSVRFKYLLTPREPNRWAVEHEGALPYNSSSTVNGVLMKPTHIIVETMM	635238	661307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_635374_636631_636736_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873
891319	contig_10323_pilon	+	2795	3	Intergenic	novelGene_123578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1869	2372	459964	460578	FALSE	50	AAAGACCATTGAGAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRPLGPLAPQHELPLPHPHSLWGCHTARQCLYHLPFQRLVCAKEQIPDTVGC	458014	461001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_458526_458606_459993_460103
891320	contig_6364_pilon	-	4865	15	Intergenic	novelGene_51717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	949.010569606308	313	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	557	1915	472628	436151	FALSE	40	GCTCTTATAAAATGCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521240	433200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_477565_477736_486627_486722_490716_490802_521045
891321	contig_7840_pilon	+	5659	2	Intergenic	novelGene_69017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	822	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	59	415	304419	304775	FALSE	20	CTGTGAAGCTGGGCTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVSVVPPLQPAFVPAHSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	304294	310019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_304346_304411
891322	contig_10749_pilon	+	7991	5	Intergenic	novelGene_133491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1458	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	5195	5530	207839	208611	TRUE	50	TAAACACAGGTAAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCRSATCMTLMPLLARRAIPSGQMASMATILVVIRAEGVAVPLPSEPAPLSRGKVPTLRATPGPPFLFWWVLICFDRWSLLMKRLGHSGQANFFSPTCVYVCASATHLNV	202644	243341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_208132_208568_208766_211206_211372_240882_242397_242713
891324	contig_5260_pilon	-	3609	4	Intergenic	novelGene_144431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1416	1841	640391	639966	TRUE	40	CCTCAGGCACCAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSRNKESRNLLEEENFLELLEVEYKRLIYRTIQEIGKEIMQNAEQAKEHTDKAIEKLKKIREEHNDKFNRLQESIERQQTEIQKINNKISELDNSIKSHRSRIKAMEGRITEIEDKAHDTNLFEEKSYKSTLKMEKL	707058	637487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_637988_638458_639355_639593_640881_706132
891325	contig_6365_pilon	-	943	3	Intergenic	novelGene_134008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	955.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAATAATGAAAACTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56667	47015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_47492_50656_50888_56431
891326	contig_6025_pilon	-	4762	4	Intergenic	novelGene_178034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1211	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	4102	4740	189696	189058	FALSE	20	GTAGATTTGTTTGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGMPITRKFLLLIVSHMTLRFCSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSVPLILSSTVSNLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSVNLSIFFLMFVSFFLSSWRILSIRDLNSLGSSSAFSSTGESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	216508	189035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6025_pilon_-_190427_190679_191605_210401_211361_215021
891327	contig_5864_pilon	-	3334	3	Intergenic	novelGene_162781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1683	2279	109129	108533	TRUE	35	AGATTGCCTCAGGATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHLTKEDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYLPTPAVLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWERKMIQPFWKIIWRFLRKLEIEIPHELAIPLLGIYPRELRAVTRIDICTLMFMAALFRIAKMWKQPRYPSTDEWINKLCYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKVEDIMLSEVSQSQKDKYCMRPLL	115063	107412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_108277_108341_110559_114810
891328	contig_14415_pilon	-	3872	4	Intergenic	novelGene_77584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_3	170.771452207004	458	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	279	1562	19037	13005	FALSE	40	ACAAAAGCCCACTCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	23937	10694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_13232_16940_17037_18076_19097_23718
891329	contig_6870_pilon	+	4184	6	Intergenic	novelGene_104001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	139	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	933	3250	4182	1728206	1753335	FALSE	45	AACCTTACAACTGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLSIITLNVNGLNALIKRWRVTQWIKKQDPSTCCLQETHLRNNDVNLLKIKGWKKIYQANSYRKRAGMAAKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMSHHEDITITNIYAPNDRAPKYINSNSTKRENDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQLDLIDIYRILLPTAAKYIFFSNAYGTLSRIDHILGHRAILNKIQTVERIQSSFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKPNNNTLLTNHWVIEEIRDGIKKFIESNENENTSYQTLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAMIKP	1527840	1753337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1529226_1587126_1587302_1689336_1690217_1691314_1691566_1727647_1729004_1753200
891330	contig_13780_pilon	-	3073	1	Intergenic	novelGene_149056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGCGGTTCCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609934	606861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_606900_609900
891331	contig_593_pilon	+	2246	7	Intergenic	novelGene_101981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	864.021347472902	2392	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	462	965	148964	152494	FALSE	15	GCCACGCTTGTTTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNYLFGERLLKCDFMPPEKVHEDLFKDWDVPFSKPSLPAVKRYNKKRTLPAKLRMEKRFKNKEKLLRKKLAKKGIVYNFPSLILPKKKKGKVSKADLQNSTNSQGSTPVCTPTFLEKRKSEVAKMNDDDEDNEITFKQPVVGVRAEIQETQTPTRSGKRRRRKSKQ	146100	153775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_146247_147445_147575_148176_148291_148891_149001_151208_151421_151590_151657_152305
891333	contig_10263_pilon	-	4554	9	Intergenic	novelGene_135847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	159.40337982615	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	703	1950	891668	880676	FALSE	45	AATAAAACAAACTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVRSSQQPLEDLHAQLRRALSPETTAVTFAVGLVSVVAPTAVSEAGAHPQKDVSQVTEAPVLATSSGAGVFKTGRFQVSITTDDVQKEGKIKSEDAKSVHFESSTSESSALSSSSPESTLVKAEPDGVTIHGISSDVPEITHKTPASEAKSETGQPTKVGRFQVTTATSKVGRFSVSKTEDKITMAKKEGPVASPPFTDLEQAVLPAVIPKKDKPELSEPSHLNGPSSDLEAAFLSRHVDDGSGSPHSPHQLCSKSLPIQNLSQSLSNSFNSSYMSSDNESDIEDEDLKLELRRLREKHLKEIQDLQSRQKHEIESLYSKLGKVPPAVIIPPAAPLSGRRRRPTKSKGSKSSRSSSLGNKSPQLSGNLSAQSAASVLHPQQTLHPPGNIPETGQNQLLQPLKPSPSSDNLCSAFTSDGAISVPSLSAPGQGTSSTNTVGGTVNSQAPQAQPTAMTSSSRKGTFTDDLHKLVDNWARDAMNLSGRRGSKGHMNYEGPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	900565	878071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_880994_881454_881646_888387_888583_890018_890222_891327_891990_893222_893297_897062_897124_897769_897854_900403
891335	contig_8377_pilon	-	2850	2	Intergenic	novelGene_35043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84928	81932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_82124_82269
891336	contig_2215_pilon	-	1595	10	Intergenic	novelGene_163870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_9	203.101932688314	20	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	233	922	422718	325643	FALSE	0	CTCCTCTTCCCTTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIATKEPLNPIKQDVKDGKLRYVANIFPHKGYIWNYGALPQTWEDPHQKDKGTDCCGDNDPIDVCEIGSKIFSRGEVIHVKILGILALIDEGETDWKLIAINVNDPEASKIHDIDDVKKYKPGYLEATLDWFRHYKVPEGKPENKFAFNGEFKNKAFALEVIKSTHECWKALLMKKCDRGTINCTNVQIRDSPFRCTEEEARSLVELVPTSLHKESNEEEQVWHFLDK	452582	324969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_325672_326852_326890_338363_338434_345443_345530_355020_355149_382433_382561_410642_410730_419864_419985_422712_422767_452398
891337	contig_15897_pilon	+	997	2	Intergenic	novelGene_49550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAATTTGTCATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659179	660385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_660114_660322
891338	contig_6677_pilon	-	3341	7	Intergenic	novelGene_114207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	2970	3341	594991	584714	FALSE	25	CTCAACAGGGCCTGGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFLFLLYFLQDKIISSLGFTIFIWCFCLGGLDHWHPPTPLAVFLLVLVLEIARKTGSRVTIRAAVVMVPVPLLVALMFGPGRAHRQGREGEEGRGAWGRELGSDSRPGGCQRRWWRRRQKQR	628148	584713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_585000_594905_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624540_625422_625530_626325
891339	contig_10286_pilon	-	2740	11	Intergenic	novelGene_98402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	235.512122830227	33	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	846	2084	406140	380673	FALSE	35	GAAAAAGCTGGTACTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHIILRKKLSCFVLAFFLFAIVCVWKEMKKGSYYDSLKWETEGSPLVMGLGKMAMGSGPQSKVSTQHLRRSNQALNCTKASAKAKPQPSFQVWNKDSSSKNLPSRLQNIRKNYLNMNKYKVSYKGPGPGVKLSAEALRCHLRNHVNVSMVESIDFPFNTSEWEGYLPKENIRTKAGPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIDDHDAVLRFNAAPTANFQQDVGTKTTIRLINSQLVTIEGRFLKDSLYNEGILIVWDPSVYHSDIPEWYQHPDYSFFNNYKSYRKMHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKAIQGGEGCGTRPSLPAAQV	507447	380016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380729_382896_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405539_406192_410089_410233_415379_415572_424800_424848_478071_478217_507180
891340	contig_6885_pilon	-	2898	2	Intergenic	novelGene_83671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	286	588	210312	210010	FALSE	40	CAGCCTAAGACAACAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	543974	207699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_210323_543699
891341	contig_3862_pilon	+	1190	8	Intergenic	novelGene_137397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	225.889805174188	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	49	1086	429668	448739	FALSE	15	TTTCAATTTTACTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFRADLRLPAAAAFAEMPLENLEEEGLPKNPDLRIAQLRFLLSKMKKANEEELKRLDEELEDAEKNLGESEIRDAMMAKAEYLCRIGDKEGALTAFRKTYDKTVALGHRLDIVFYLLRIGLFYMDNDLITRNTEKAKSLIEEGGDWDRRNRLKVYQGLYCVAIRDFKQAAELFLDTVSTFTSYELMDYKTFVTYTVYVSMIALERPDLREKVIKGAEILEVLHSLPAVRQYLFSLYECRYSVFFQSLAVVEQEMKKDWLFAPHYRYYVREMRIHAYSQLLESYRSLTLGYMAEAFGVGVEFIDQELSRFIAAGRLHCKIDKVNEIVETNRPDSKNWQYQETIKKGDLLLNRVQKLSRVINM	429619	448843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_429748_431463_431603_435577_435724_435975_436196_436301_436411_442094_442264_448428_448507_448642
891342	contig_15152_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_126961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104062	106052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_104100_106100
891343	contig_7396_pilon	-	2042	16	Intergenic	novelGene_79606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3183.74859699834	2	43	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	206	1591	255163	246385	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257474	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
891344	contig_7201_pilon	-	4738	4	Intergenic	novelGene_152534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	140	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATACAAAGATAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568435	552031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_553623_553977_555165_557186_557659_566947
891345	contig_10323_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_123621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAAAACCCATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473795	475451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_473800_475500
891346	contig_11304_pilon	+	3957	14	Intergenic	novelGene_156675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	131.179537298761	446	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	943	3273	447600	503955	FALSE	50	AAAAGTCTTCAAGTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILDSPSKTMSIKERLALLKKSGEEDWRNRLNKKQEYGKASAASSLHIQEPEQSFKKKVILSMLGKGLTDITRGRASNRQACVT	270980	504639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_271608_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491075_491299_503744
891347	contig_7993_pilon	+	2103	3	Intergenic	novelGene_170958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	134	366	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTATGTGATTATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16677	34703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_16785_31084_31233_32855
891348	contig_8377_pilon	+	3837	26	Intergenic	novelGene_34992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_25	3106.25048674443	225	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	948	2847	142	2988	68257	197881	FALSE	60	TTAAAAGAAACAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMWH	68115	198730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_197872
891349	contig_960_pilon	+	1594	7	Intergenic	novelGene_108285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	560.538134295964	1	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	59	679	1020552	1055364	FALSE	25	GTAACCAATTTTCTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NASAVVIYNEERYGNLTAPMSHAVVIMISYPKGRELLDLVQRGIPVKMTIGIGTRHVQEFISSQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQFGNQSHRKEIKKIIGQLVLHTVNRGEKGIDVDAENCAVCIENFKAKDIVRILPCKHIFHRTCIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWTEPEDVQETPAPESTSGSVSAANLSVAIQDEGRSDGSRQE	1020493	1056279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1020565_1038565_1038802_1039695_1039765_1046762_1046846_1049013_1049111_1053830_1053938_1055348
891350	contig_11752_pilon	+	2900	2	Intergenic	novelGene_37656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1239	1886	87165	88933	FALSE	85	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	85926	89947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667
891351	contig_5551_pilon	+	2577	2	Intergenic	novelGene_134296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	610	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	2187	2576	828024	834260	FALSE	15	GGGGCGAGGTCAAGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPFPVEASLWDVVGHLCDEPGGFNLGHCCAVLCWQLLLSGLWALGRRGRFRSGMEGGEEGRVEASSHLQGWGLIDGLSLQGWALEGCVCSLAALPFLPSIMLSVHGGLPPGTAEGSTRCRLVRHRPGF	825837	834261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_828333_834179
891352	contig_1435_pilon	-	2095	1	Intergenic	novelGene_115497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511516	509421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_509400_511500
891353	contig_14101_pilon	-	2332	1	Intergenic	novelGene_122750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	818	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGTCTGGATTCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77965	75633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_75600_78000
891354	contig_5961_pilon	-	5345	1	Intergenic	novelGene_144157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACCACAATATGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223715	218370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_218400_223700
891355	contig_233_pilon	-	2733	16	Intergenic	novelGene_14619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1335.34895314546	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	122	2296	109959	78579	FALSE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCCSLWWDCSSSGLSCPRSAPSTRSAPAGSAIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127003	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108500_108763_108814_109914_109976_126898
891356	contig_9049_pilon	+	1770	7	Intergenic	novelGene_83125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_6	1535.4471028191	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	55	756	88356	113120	FALSE	50	AGAAACACAGATGAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMEFPDCRRSVGGEGCKTYPAVVQYNMFYR	88301	114134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_113028
891358	contig_14142_pilon	-	1485	8	Intergenic	novelGene_120527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	647	junction_7	177.448469093631	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	118	978	351794	349539	FALSE	5	GCCTGTTTGGGCTTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	352865	349031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763
891359	contig_19778_pilon	+	5099	7	Intergenic	novelGene_143751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_4	278.291014746953	888	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	262	1122	9539	16019	FALSE	70	AATAAAATAGAAGAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGANSGEPLVRDSPSVSEDSPSESSDNLEADAVHIAHVEKDFIAFWASAPYNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	5642	19996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_13559_13704_14323_14434_15920
891360	contig_9400_pilon	-	3348	8	Intergenic	novelGene_146576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	437.342531428077	117	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	25	390	135537	121571	TRUE	5	TGTTTTGTTGGACTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE	135561	117728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_120654_121537_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_135452
891361	contig_8322_pilon	+	4319	11	Intergenic	novelGene_143245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_10	369.397956139446	92	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	539	2170	292682	304580	FALSE	15	CATTTGTAGTGTTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGCRSHSSAQFLIGDQEPWAFRGGLAGEFQRLLPIDGANDLFFQPPPLTPTSKVYTIRPYFPKDEASVYKICREMYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	291388	306729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472_295648_299239_299326_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
891362	contig_13680_pilon	-	3784	1	Intergenic	novelGene_149612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	747	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACTGACAGACGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445537	441753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_-_441800_445500
891363	contig_854_pilon	-	2878	1	Intergenic	novelGene_36757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1053	1490	1734727	1734290	NA	55	TCGAAAGAGAACAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQPTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKTKNKQRILRATREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKHLQLSGRT	1735779	1732901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1732900_1735800
891365	contig_7869_pilon	+	2553	2	Intergenic	novelGene_149998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1378	1680	94073	94375	TRUE	25	TTTCATACCATTGCCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLLLMSILVVLLPRQILFILLAINGIFKILCQHHNSKASILLQSSGFIVQLSHAYEATENTIAWVRGSLVPEVTSSLFNTVKRAFAANLPRAMCLLIS	92695	95693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_94870_95314
891366	contig_753_pilon	-	7957	33	Intergenic	novelGene_113008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_18	836.85266435373	1455	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1578	4737	79	4815	1502312	1330857	FALSE	20	TCTTTTGTTGTTGTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQHCFIREVLGDGVPPKVAEVIYCSFGGTPKGLHFNNLIVGLVLLTRGRDEEKAKYIFSLFSSESGSYVVREEMERMLHVVDGKVPETLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLLLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPTFYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAFDENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELKDMVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGMMSLRMFPQHLPRGNVPSPNTPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHRLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSSKIDRHKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPIRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLKSEQILLAEVHSSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPIPGSPISSSSPVQTDFSSSPSTNGMFTLTTSGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHVPSLPDNRFTGYIIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESFDPSAFLVPKDPAVCHRKALTPQGDDLSEPRIPTEVKKVDAQNSAGEEDVLLSKSPSTLSANVISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKLSSSKENLDASRENGAGQVCELTDALSRGHMLGGSQPELVTPQDHEVTLANGFLYEHEACGNGYSNGQPENHSEEDSTDDQREDIRVKPIYNLYAISCHSGILGGGHYVTYAKNPNSKWYCYNDSSCKELHPDEIDTDSAYILFYEQQRIDYAQFLPKIDGKKMADTSSMDEDFESDYKKYCVLQ	1502390	1327714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1331031_1331525_1331619_1332572_1332998_1334166_1334453_1338034_1338227_1343515_1343637_1344508_1344596_1348266_1348452_1354812_1355025_1356199_1356312_1358352_1358505_1359925_1360101_1360850_1361025_1362329_1362436_1362718_1362858_1363389_1363465_1364499_1364582_1366859_1367015_1372845_1373006_1375808_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413398_1415056_1415165_1416768_1416901_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
891367	contig_5794_pilon	-	4192	2	Intergenic	novelGene_69773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTTGAAAACACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734495	730259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_734291_734334
891368	contig_7695_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_41642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCAGCAATAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764133	762903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_762900_764100
891369	contig_16303_pilon	-	3055	9	Intergenic	novelGene_34032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.0848307985	747	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	91	1203	47976	35759	TRUE	50	AAAAAGATACAATTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48066	31521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_32048_32098_33121_35454_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
891370	contig_10197_pilon	-	4010	11	Intergenic	novelGene_115296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	51.8560507559147	981	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	271	2142	1313622	1270593	TRUE	20	TAAATGTGCCCCTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPVDEWKAYVLRKWSLLPTPIQDTISAAETLSDIFLHCSSLFQPEDEMFLERLSRGYSLGKDSNASLFCKEGGNRKFQEKDYMGAAVLYSKGVSHSRPNTEAISLCYANRSAALFHLGQYETCLEDIIRAQSHGYPERLQPKMMLRKAECLVTLGRLQEASQTISDLEGIFAARPTLAASHFQVLQRNLHHLKTKVQEKENISETFPAAPTKAFKDMDLMEESEQIPSASSSVSLCTDPLKGRYLIATKDILPGEILVKEDAFVSVLNPGEMPQLHHGLESKWDTRVTNGDLHCHRCLKHTLATVPCDQCSYAKYCSQECMQQAWELYHSVECPQGGLLLTLGVFCHIALRATLLARFEDSGKVIRKLCGEISNKDICLPESENMLKTLSCNLGENEENGKIVETPIPGCDINGKYENNYNAVFNLLPHTENHSPEHKFLCALSVAALCRQLEAASFWALKPDLKSSKPKAAVTPALSPELNIWGVVMLRHVLQLQCNAQAITTIQQTGSKESIITDSRQVRLATGIFPVVSLLNHSCSPNTSVSFISTVATIRASQQIGKGQEILHCYGEPSFLLPVRPFPAEKDRVEKYEQAAVQVPIVCLLEEAGHSRVEKKKKGHPY	1315023	1265168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569_1268703_1269755_1269805_1269927_1270934_1280832_1281995_1283361_1283452_1287174_1287320_1313488_1313635_1314765
891371	contig_5797_pilon	+	5632	29	Intergenic	novelGene_56944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	40	junction_25	191.351673654045	1292	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1164	3495	526	4020	333281	418675	FALSE	40	TCAGAGTGACTTAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAPRFFVGPEDTEVNPGNYRHFFHHADEDDDDEDESPPERQIVVGICSMAKKSKSKPMKEILERISLFKYITVVVFEEDVILNEPVENWPLCDCLISFHSKGFPLDKAVAYAKLRNPFVINDLNMQYLIQDRREVYSILQAEGILLPRYAILNRDPNNPKECNLIEGEDHVEVNGEVFQKPFVEKPVSAEDHNVYIYYPTSAGGGSQRLFRKIGSRSSVYSPESNVRKTGSYIYEEFMPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEVRYPVILNAREKLIAWKVCLAFKQTVCGFDLLRANGQSYVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNIVMRELAPQFHIPWSIPLEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAVIRHGDRTPKQKMKMEVRHQKFFDLFEKCDGYKSGKLKLKKPKQLQEVLDIARQLLMELGQNNDSEIEENKSKLEQLKTVLEMYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYSRGVLSPDRHVRTRLYFTSESHVHSLLSILRYGALCNESKDEQWKRAMDYLNVVNELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGSHCAGLFSTSVLGGSSSAPNLQDYARTHRKKLTSSGCIDGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	322576	420287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322819_332997_333395_334941_335138_337618_337710_338882_338969_340495_340651_341435_341538_342634_342797_344522_344645_345910_346013_347027_347115_348058_348135_348209_348320_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362793_363574_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_403978_404099_408614_408756_412625_412752_418562
891372	contig_17198_pilon	-	4882	6	Intergenic	novelGene_62324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2810	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2516	2929	525738	525325	TRUE	40	ACCTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKFTKTKDTERILRAASDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIFKALKENNCQPRVIYPAKLSLKYNGKIRAFPDKLKFGEFAKTKPKLQEILKGVLQLDNQ	528253	239185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_239421_335090_335734_349716_349846_418607_418711_427759_428424_525145
891373	contig_16148_pilon	-	3002	13	Intergenic	novelGene_50359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_11	495.204419070213	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	1256	2677	111433	59018	FALSE	15	TGTTTTGCAAAGCTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153171	58692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_135109_135154_150789_151734_152961
891374	contig_13612_pilon	+	2966	1	Intergenic	novelGene_157282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	743	1066	36386	36709	NA	30	GAACGGCGACGAGCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTRRRPKDICKGSECSRELQGPGWQDHRRPGPLEAFPPVDPRPIISNLILKSLAKFRARKIIRRGAKVMVFMAIKVDTRKKSKKHSRHLKIRAQLGNSLQIPTNR	35643	38609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_35600_38600
891375	contig_4486_pilon	-	1460	10	Intergenic	novelGene_38640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	679	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGACCGCAACCCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037807	1014107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1014291_1016059_1016128_1016548_1016627_1016904_1016961_1023452_1023506_1026828_1026879_1027876_1028014_1029683_1029854_1033759_1033913_1037295
891376	contig_14441_pilon	+	1081	4	Intergenic	novelGene_100729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	532.692740288016	35	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	493	1041	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120475	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120819_125517_125902_126159_126283_126514
891377	contig_9098_pilon	-	2563	13	Intergenic	novelGene_75833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	156.379524093008	2	128	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	309	1718	350397	335775	FALSE	25	ACCTCGAGTTTTAGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355824	334929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330_350461_355579
891378	contig_755_pilon	+	4834	19	Intergenic	novelGene_119778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_4	129.151456691096	394	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	954	2865	219	3083	527565	581811	FALSE	30	TAAACGTGTTGTACTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSHRKLIFHIYIGFYCSAITLPKICVCSQFSTPFINQFSKDPEAFPVTTNGEPFPWRDLRLPHMAIPLHYDLLVHPNLTSLDFAASEKIEILVREATQFIILHSKDLEIMNATLHSEEDLRYKKPGKELKVLSYPAHEQIALLVPEELIADVRYYVAINFQAKLADGFEGFYKSTYRTSGGETRTIAVTDFQPTEARMAFPCFDEPLFKANFTIKIRRESRHIALSNMPKVRTIELKEGLLEDHFEATVKMSTYLVAYIVCDFNSVSGTTLSGVKVSIYASPEKWSQTHYALDTSLKLLDFYENYFHISYPLPKLDLVAIPDFGPGAMENWGLITYRETSLLFDPKTSSASDKLWVTEVIAHELAHQWFGNLVTMEWWNDIWLNEGFATYMELISINATYPELQFDDYFLNVCFEAIAKDTLNSSRPISNPAETPTEVQEMFDVVSYNKGACILNMLKDFLTDEKFQEGITHYIRKFSYRNAKNDDLWGSLSNSCLEGDFISGGFCYSNSKMTSNTLSFLQKNVEINEMMNTWTLQKGIPLVVVKQEGRSLRLHQELFLKGVFREDPEWGTLQERYLWQIPLTYSTSSSNMIHRHVLKSKRDTLELPEKTSWLKFNVDSNGYYIVHYEGHGWDHLITQLNQNHTLLRPKDRVGLIHDAFQLVSAGRLTLDKALDLTRYLQHETSSPALLKGLGHLELLYHMMDGRNISDVTENLKHYILRYFKAMIDKQSWSDEGSIFDRLLRSALLKLACDLNHPPCTQKAAELFSRWMESSGKLNIPADVLKIVYSVGAQTTGGWNYLLEQYGLSMSGAEKNKILYALSTSKHQENLVKLIKLGMEGKVIKTQDFAPLLHAIARNPKGQHLAWNFVRENWTHLLKKFDLGSFAMRVIISGTTSHFSSKDELQEVKLFFQSLKAQGSHLDIFQIVLETITNNIKWLEKNLNTLKTWLLVNV	525118	583562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_525220_527447_528122_542025_542165_546317_546453_547672_547794_552092_552248_555200_555315_556298_556431_556636_556769_561629_561699_562743_562920_565805_565886_568431_568616_572607_572765_573243_573429_576498_576661_577371_577513_580844_580927_581667
891380	contig_12644_pilon	-	2553	13	Intergenic	novelGene_44476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	352	junction_6	440.023831425324	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	20	1723	1123448	1026128	FALSE	35	GTAAAGCTGTCAGGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1123467	1025297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231
891381	contig_7919_pilon	-	4276	6	Intergenic	novelGene_28115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGATCTTTTGCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416991	1410314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1411233_1411860_1412213_1413207_1413377_1413782_1413903_1414196_1415150_1415227
891382	contig_6898_pilon	+	2219	4	Intergenic	novelGene_35774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2839.00385503241	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	35	472	124416	125646	TRUE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124381	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124464_124782_125008_125481_125773_126075
891383	contig_10599_pilon	+	3655	18	Intergenic	novelGene_49900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	261.634891803438	419	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	699	2195	315282	350466	FALSE	5	TTGTCCTTGTCCTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSAGRTIKLWVLETKEVYRHFTGHATPVSSLMFTTIRPPNESQPFDGITGLYFLSGAVHDRLLNIWQVRSEKKEKNAVMSFTVTDEPVCIDLTLSENKEEPVRLVVVCRDGQVHLFEHILNGFCKKPLSSNCTIQIATSGKGKKSTPKPIPILAAGFCSDKMSLLLVYGSWFQPTIERVAINSKEPHVCLVRDISSCWAPKVETAITKVRTPVMNSEAKVLVPGIPGHCAVVKPVTPQAEELESKRKLGENEVSIEERLGAMDIDSKKGKDDLPQTNSFPVLLTQGLESNDFEMLNKVLQTRNVNLIKKTVLRMPLHAVIPLLQELTKRLQGHPNSAVLMVQWLKCVLTVHASYLSTLPDLVSQLRTLYQLLDSRVRTFQKLSHLHGKLILLITQVTASEKTKGMTCPGQKAKLVYEEESSEEESDDEIADKDSDDNWDEDEEEKESDKDEDVDEEHEEEDAEEKDEENGEDRDVTSEKELNGDSDLDSENESEEE	298222	351926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_298603_302883_303022_307357_307480_315223_315345_316318_316459_323323_323427_326889_326955_329050_329223_330609_330697_331544_331677_332440_332573_339955_340043_341748_341781_342815_342880_345408_345523_346239_346310_350123_350174_350280
891384	contig_15118_pilon	+	4976	18	Intergenic	novelGene_74583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	273.246305103281	7	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	2606	4381	392042	398743	FALSE	40	TGTCTATAAATAAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	376597	399338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_376650_376716_376995_377310_377591_377789_377838_378493_379782_379884_380022_380151_380263_391630_392088_392169_392554_392785_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
891385	contig_5643_pilon	+	1198	12	Intergenic	novelGene_38806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2515.69416672533	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	68	1024	233973	238020	FALSE	15	ACCTCTTTGTTGATTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLGLAFPSTTTLSSSFPGMTMNLATATGWWTLWSTWPLRSKIPLDHQPQQQH	233607	238194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237602_237769_237819_237913
891386	contig_11709_pilon	+	7202	13	Intergenic	novelGene_168202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	111.067421966219	1099	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	71	2488	6373	65862	TRUE	65	GTGTATAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGINANSQMHGQGPSQPCGAMPLGRMPSAGMQSRPFPGNMSSMTPSSPGMPQQGGPGMGPPMPTVNRKAQEAAAAVMQAAANSAQSRQGSFPSMNQSGLMASSSPYSQPMNNSSGLMNTQAPPYSMTPNMVNSSTASMGLADMMSPGESKLPLKTDGKEEGPPQPESKSKDSYSSQGISQPPTPGNLPVPSPMSPSSASISSFHGDESDSISSPGWPKTPSSPKSSSSTTTGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDTKKQPKLQPPSPANSGSLQGPQTPQSTGSNSMAEVPGDLKPPTPASTPHGQMTPMQGGRSSTISVHDPFSDVSDSSFPKRNSMTPNAPYQQGMSMPDMMGRMPYEPNKDPFGGMRKVPGSSEPFMTQGQMPNSSMQDMYNQSPSGAMSNLGMGQRQQFPYGASYDRRHEPYGQQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDVYNMQYGGQQQEMYSQYGSSYSGPDRRPLQGQYPYPYNRERMQGPGQMQAHGLPPQMMGGPMQAASGEGPQQNLWAARNDMPYPYQNRQGPGGPAQAPPYPGVSRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSHRQPYMPSSASMQPITRPPQSSYQTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPAVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPPGSVEASQPVLKQRRKIT	6302	73199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_6633_28057_28204_36568_36673_37401_37561_41883_42094_45057_45263_53217_53357_53610_53784_58108_58260_61212_61310_62950_63722_65859_65991_68613
891387	contig_10861_pilon	+	971	6	Intergenic	novelGene_39232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	186.4	52	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	46	348	603123	605721	TRUE	20	CCCAGTCAGGTTGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGNDEFLVVELLEVMVGAVALEDLLKETTYEFFEGGWMFSWVVSLAVTGNEMKRMMSYSQTRMLMSAFFCLTGDLLLLCLGGGGIRLGGVLLLGDGRLLGLGRLLGEYDLDRDL	603077	609018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605072_605190_605701_605897_606400_606601_607921_608038_608886
891388	contig_8462_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_159422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGTTGCTGTCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231570	229050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_229000_231600
891389	contig_151_pilon	+	5309	1	Intergenic	novelGene_132559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	485	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACGATCTATTTATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157621	162930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_157600_162900
891390	contig_20293_pilon	+	4003	15	Intergenic	novelGene_153501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAAGGAAAGTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17107	116224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_19472_20436_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45338_45425_45495_48533_48674_49036_49172_49879_50102_52322_52469_68597_68701_116146
891391	contig_5686_pilon	+	2505	3	Intergenic	novelGene_45483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAACCTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233587	389714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_234561_388045_389336_389472
891392	contig_6418_pilon	-	6065	15	Intergenic	novelGene_81245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	55	junction_13	463.2611772719	1090	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1249	3750	54	3803	1506959	1449950	FALSE	35	AAAACTTTTTATTCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKELGSLSFISRPERFKMDSIEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEVVCKVKEELLKADVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIKDKEEVNGIEEVCFDPEESKTEWKETPCILNINVKNSQNDDLSSEPLFSNNKTPEPASQMTSEPPSGVPASNDLNFGDSASGILALPVPASSGPTSGDPTSDDRTSSDPISGEPASSEPASSESASGEPTSVESASGEPASGEPASDEPASDEPSSDEPTSGDLASDDPASGDLASSDLPSGDLSSGPSAASGPISDELASDEPASDQPTSGTLVSDDQTAFEPSTIPVCEAVPETTEPSSNKDDDFLENNRDDEKLDQIQSKDSFEEKNNGDSNTDANEETPKTDETTICSNLPPENEKKVEEDGILELALGEEAISSSMELDQGEKNEDENSSDLAETINENVIEDDKNENILENTDSMETDEIIPILEKLAPAEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMEGSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISAEVEGNEKDSKPEEDEQVIPEEDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNIQSKRRRYMEEEYEAEFQVKITAKGDINQKLQKVVQWLLEEKLCTLQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFGAAKEDLKKRQENPPNPPVSPGKPANDISSNSNVPYRNTGTVRQMLESKRNVSESALPSFQTPVNTVSSTSLITPPTVVSSQPKLQTPATSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNSPAGAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSLPTVGPSGLYSPSNNRGPIQMKIPISAFSTSSPAEQSSTATPRVENQTNKTTDNSVNKKAADSTSQTGRATASDSGGVIDLTMDDEESATSQDPKKPNHTPVSTIGSSQPVTRPLQPIQPAPPLQQSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNSGLTLGSAGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGIVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQSTDVISSSQSS	1568427	1447687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1450370_1454063_1454177_1455959_1456143_1458960_1459117_1460538_1460618_1467819_1467885_1472220_1472860_1476860_1476950_1477830_1477905_1482694_1482761_1491132_1491271_1496150_1496297_1497627_1497715_1505464_1506967_1568381
891393	contig_3394_pilon	-	4537	13	Intergenic	novelGene_152705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1133	1468	530369	529448	TRUE	55	AAAAAATACCTCAACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVAAGGMGSCSILGGIAHEGRNRQASGIFRGSRHWLGNIFSGANMEDPTKGWKVGTLCTYEKSFISSGLGLPNPSSTSILNSVSCVGTMLTIGLSIMPNAVTVSELIPSL	539050	506303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_507546_507933_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518600_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176_530385_534253_535191_538870
891394	contig_12622_pilon	+	2811	2	Intergenic	novelGene_5788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	262	447	177565	177750	TRUE	65	TCAAAAAAAAAAAACTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFTSFSLSNANSVFFPFSLLTPGFHTFHFNTLLCLPQPPFEIFCSTLFTSSFLPFALVNLRSRVSLKSLLVFFLLPCVFNDLLLSSCMMSLVSFHNSSGLLRSLVFNASNVFLRWFLNSGGIYSRSYFGSHGLALIFFGFNLNLRMSN	177303	180175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_178158_178218
891396	contig_5302_pilon	-	2593	9	Intergenic	novelGene_81420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	702.028622991969	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	285	926	185066	177220	FALSE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209572	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186067_209450
891397	contig_4180_pilon	+	1358	3	Intergenic	novelGene_8291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52.5	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	327	356	735156	735185	TRUE	20	ATGGAGAATCTGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAILKVESPVPAAAAAAAAVLAAAVAVGEKAKAGKPQSEIHHPAGWSARPSFLLPRPPTPSPTGAIRRHPPSLPPYPQVRGVSSGSRDPEEPSRLTICSATWQELEEGMIFSGVFLR	733017	822628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_821656
891398	contig_15353_pilon	+	1609	4	Intergenic	novelGene_151977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	323.854905783439	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	94	564	529420	534508	TRUE	15	TCCTTTTCATGTATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVIRHFERSKVAFTFPERLLRFCLDRPLITDMSRDRFRSRGGGGGGFHRRGGGGGRGGLHDFRSPPPGMGLTQNRGPMGPGPGQGGPKPPIPPPPPHQVQQQQQQQQQPHQQSHQQPHQQPPPPQDSSKPVVPQGPGPAPGVGNVPPAPGSAPPATPPTSGAPTGPGPTPTPPPEISTSRWWWWHRL	529326	537942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_529651_529716_529916_534467_534567_536955
891399	contig_675_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_136346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATTCGTCCCATCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153086	155048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_675_pilon_+_153100_155000
891400	contig_2933_pilon	-	2044	2	Intergenic	novelGene_111351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	373	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	142	1401	850204	848945	FALSE	35	GACCCAGCAATCAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874218	848301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_850290_874162
891401	contig_18544_pilon	-	3619	13	Intergenic	novelGene_152731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	538.418801264922	16	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	325	1974	64924	38474	FALSE	40	GTAAATTTAGTAAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQGGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSLITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAGRKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVKYCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGIDLSGLTLQSNAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	125133	36828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025_58239_62799_62830_63285_63461_64684_65064_121105_121271_125113
891402	contig_14288_pilon	+	3292	1	Intergenic	novelGene_153823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	843	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	102	491	323735	324124	NA	45	TTGGGGGGAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIHLQKNKTGPIPHTYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGLTLQALIHGINRIQTITINTQTPRDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKGGKREPTDWEKIFGQYKSDKDLISIIYKKIQQKDK	323633	326925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_323600_326900
891404	contig_10437_pilon	+	1629	10	Intergenic	novelGene_38203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	549.096024793883	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	55	963	229668	232807	FALSE	30	CATGGTAACAAGTGTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFMVTSGSGEKGERGEFSVLLRHPVAFKPNSD	225718	233473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232025_232716
891405	contig_854_pilon	+	4177	22	Intergenic	novelGene_36475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	2739.68511605757	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	181	3021	1649514	1715249	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1612765	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692788_1698971_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702682_1715165
891407	contig_1244_pilon	+	5358	23	Intergenic	novelGene_37914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_22	130.596090458234	297	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	3566	4930	281635	294829	FALSE	25	AGGGCAAACTGTGGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHYARDDTHYLLYIYDKTRLELWERGNGQPVQLQVVWQRSRDICLKKFIKPIFTDESYLELYRKQKKHLNTQQLTAFQLLFAWRDKTARREDESYGYVLPNHMMLKIAEELPKEPQGIIACCNPVPPLVRQQINEMHLLIQQAREMPLLKSEVAAGVKKSGPLPNPERLENVLFGPHDCSHAPPDGYPIIPTSGPVPVQNQASLFPDQKEEEASLDTKCLIATAVITLFNEPSAEENGKWPLTVAQKKAQSIMESFENPFRMYLPSLEHRAHISQAAKLDPSSKIYEISNRWKLASQVQVQKESKETAKKKAAEQTAAREQAKEEYKATAEQAMSVRQQATLENAAKKRERTISDPRTTDQKQGKKRLKISKKPKDPDPAEKEFTPYDYSRSDFKAFAGNSKSKPSQFDPNKQTQSGKKCIAAKKLKQPTGNKSMSFPTGKSDRGFRHNWPKR	261216	295257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_262724_266552_266677_273675_273781_274112_274279_274467_274583_278843_278920_279131_279243_279450_279595_280417_281776_281917_282067_282243_282295_282949_283062_284465_284517_284679_284759_284858_284969_287074_287171_287422_287498_289999_290088_291705_291780_292446_292619_293412_293472_294003_294081_294798
891408	contig_9333_pilon	+	3503	30	Intergenic	novelGene_120324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_25	78.316607957988	972	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1159	3477	27	3503	173519	393932	FALSE	45	AAAGGGAAAGCCCAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLQSWANMAAPESGPALISGTPSPEGEEETILYDLLVNTEWPPETEVQPRGNRKHGASFLITKAIRDRLLFLRQYIWYSPTPFLLPDGLVRLVNKQINWHLVLASNGKLLAAVQDQCVEIRSAKDDFTSIIGKCQVPKDSKPQWRRVAWSYDCTLLAYAESTGTVRVFDLMGSELFVISPASNFAGDLSYAIAGLIFLEYKASAQWSAELLVINYRGELRSYLVSVGTNQSYQESHCFSFSSYYPHGISTAIYHPGHRLLLVGGCETAEAGISKASSCGLSAWRVLSGSPYYKHVTNGGDRVTAVPKTLGLLRILSVKFYSRQEQEQDGIFKMSLSPDGTLLAAIHFSGKLSIWAIPSLKQQGEWNQNEQPGYDDLNPDWRLSTEKRKKIKDKESFYPLIDVNWWAESAVTLARCSGALTVSSVKTLKNLLGKSCEWFEPSPQVTATHDGGFLSLECEIKLAPKRSRLEIRSGEEDEGEEGSDSDHEISAKARYFGYIKQGLYLVTEMERFAPPRKRPRTITKNYRLVSLRSTTPEELYQRKIESEEYEEALSLAHTYGLDTDLVYQRQWRKSAVNIASIQNYLSKIKKRSWVLHECLERVPENVDAAKELLQYGLKGTDLEALVAIGKGADDGRFTLPGEVDIDSISYEDLSPDEEEPAKNKKEKELMKRRELLKLVNFSKLTLEQKELCRCRLKLLTYLDRLATYEEILGVPHTSEQRYDAEFFKKFRNQNIVLSARTYARESNVQALEILFTYHGSDLLPHRLAILSNFPETTSPHEYSVLLPEACCSADSLMIVPWHECKHRDKDWCEESECKMAVEPSLQDESEFLYAAQPELLKYRTAHLTVEKVTEWYQTRAEEIEHYARQVDCALSVIRLGMERSIPGLLVLCDNLVTLETLVYEAGCDLTLTLKELQQMKDIEKLRLLMNSCSEDKYVTSAYQWMVPFLHRCEKQSPGVANELLKEYLVTLAKGDLKFPLKIFQHSKPDLQQKIIPDEDQLMAVALECIYNCERKDQLSLCYDILECLPQRGYGHKTEVTTALHDMVDQLEQVLSVSELLEKHGLEKPISFVKNTQSSSEEARKLMVRLTRHTGRKQPPVSESHWRTLLQDMLAMQQSVYTCLDSDTCYEIFTESLLCSSRLENIHLAGQMMHRTACSINPPASVAH	173492	393932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_173642_175873_175929_177757_177795_189151_189230_190553_190602_196269_196314_211326_211461_213691_213826_214945_215045_254366_254506_266273_266343_277132_277262_290406_290471_292555_292750_293836_294095_294828_294955_298109_298262_299541_299683_299944_300024_304982_305088_305450_305588_349449_349534_355479_355634_361368_361555_363289_363464_372325_372460_378896_378960_380987_381111_389962_390066_393821
891409	contig_4079_pilon	-	6048	2	Intergenic	novelGene_167477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	543	junction_1	0	1759	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	387	1670	133022	131739	FALSE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKESKACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGLPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI	138824	127360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_133252_138667
891410	contig_998_pilon	-	3129	12	Intergenic	novelGene_153791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_3	432.829552465637	53	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	95	1087	365529	332161	FALSE	45	CTAGTCTAGACTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTG	373661	330118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_332329_335041_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
891411	SIRV6	+	1519	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8518	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	246	740	1733	10736	TRUE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891412	contig_10627_pilon	+	2255	13	Intergenic	novelGene_59936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	302.903300943093	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	160	1437	162810	166905	TRUE	10	TGTTTATTGGTGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTMMDPFRKRLLVPQPQPPMPAQRRGLKRRKMADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFAKVQQRRQELEQVLGIRLT	162650	167776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166775_166851_167265_167317
891413	contig_6027_pilon	+	3946	15	Intergenic	novelGene_74452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	104.317827736555	613	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	528	2639	293176	339364	FALSE	65	AACTGTTAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEGAGGVGSAPSPPESSSLCASKSEEGLPDGLSPKDPAQKPKNLPLSSVSSQAVTKENNRNVHLEQPEQNPGSSAGDTSAVHRVILGENVVATALCLPGNGSQSDLKDLASTAEEEGDTCLQESLPPATQSLKTGCHTKELASTSSSEEKSPQASNLKEGIRDTGLDFQPVVPPSNGVEGVREDLDDDQDSSSLKLSQNIAVQTDFKTDQLEINTDHDIERNLDKMMSERTLLKERYQEVLDKQRQVENQLQVQLKQLQRRREEEMKNHQEILKAIQDVTIKREETKKKIEKEKKEFLQKEQDLKAEIEKLCEKGRREVWEMELDRLKNQDGEINRNIMEETERAWKAEILSLESRKELLVLKLEEAEKEAELHLTYLKSTPPTLDTIRSKQEWETRLNGVRIMKKNVRDQFNSHIQLVRNGAKLSSLPQIPTPTLPPPPSETDFMLQMFQPNPSLPPRMPFSIGQVTMPMVMPSADPRSLSFPILTPALSQPNQPSPPLPGSHGRNSPGLGSLVGPHGPHMPPAASIPPPPGLGGVKASTESPRPQPVDKLEKILDKLLARFPQCNKAQMTNILQQIKTARTTMAGLTMEELVQLVAARLAEHERVAASTQPLGRIRALFPAPLAQISTPVFLPSAQVSYPGRSSHAPATCKLCLMCQKLVQPSELHPMACTHVLHKECIKFWAQTNTNDTCPFCPTLK	291054	340671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_291576_293169_293283_295534_296046_296730_296791_299486_299628_302273_302414_334511_334609_334778_334868_335732_335824_336016_336116_336309_336687_336820_336954_337166_337272_338293_338390_339298
891414	contig_7635_pilon	-	3527	1	Intergenic	novelGene_171370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTCTCTCTTCACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126323	122796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_122800_126300
891415	contig_3745_pilon	+	3613	7	Intergenic	novelGene_85083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	317.676328989114	1145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	397	1923	434035	486871	FALSE	40	GTTAAGTGAAAATGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIEAGLDVINNPDEDDDQEDEDNRLGEKLIFNENDFVEGYYRTERDKGTQYELFFKKADLMEYRHVTLFRPFGPLMKVKSEMIDITRSIINIIVPLAERTEAFAQFMQNFSESNFHNYTMVSLNEEFNRGRGLNVGARAWDKGEVLMFFCDVDIYFSAEFLNSCRLNAEPGKKVFYPVVFSLYNPAIVYANQDGPPPVEQQLVHKKDSGFWRDFGFGMTCQYRSDFLTVGGFDMEVKGWGGEDVHLYRKYLHGDLMVIRTPVPGLFHLWHEKRCVDELTPEQYRMCIQSKAMNEASHSHLGMLVFREEIETHLRKQAYRTDSEAVG	393616	488561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393747_433768_434696_437841_438059_443170_443350_444954_445050_458774_458857_486578
891416	contig_8571_pilon	-	2832	2	Intergenic	novelGene_169189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	327	626	502243	501944	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIKPKIIKLLAEKTGSTLEALIHCINRIQTITNNTQPPEDKLDNWDLLKSKHLHSSKDFATRVKREPTDWEKIFGHYKSDKGLISIIYKEIQHLYNNNKNLIKKWAKGMNRHFTKEDIQVANRHIRKCSRSLAIREMQIKTTIRYYLTPALLAQIKKTGNNKCWRGCGEIRTLMHCWWECNMMQQFWKMIWRFLRKLEIEIPYNPAI	502569	499477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_500101_500360
891417	contig_14970_pilon	-	1484	5	Intergenic	novelGene_45121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	148.130010463781	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	179	922	291083	268709	FALSE	55	AAAAAAAACACTATTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	312011	268146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919
891418	contig_960_pilon	-	5143	21	Intergenic	novelGene_108225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_10	373.658186047088	384	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	408	3059	487192	427816	FALSE	75	GTTGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVEDRFRKTNQSSPEAQSKQTGRVLEPPVPSRSESFSNGNSESVHPALQRPAEPQVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPADLTALAKELRAVEDVRPPHKVTDYSSSSEESGTTDEEDDDVEQEGADDSTSGPEDTRAASSLNLSNGETESVKTMIVHDDVESEPAMTPSKEGTLIVRQSTVDQKRASHHESNGFVGRIHLLPDLLQQSHSSSTSSTSSSPSSSQPTPTMSPQTPQDKLTTNETQSASSTLQKHKSSSSFTPFIDPRLLQISPSSGTTVTSVVGFSCDGMRPEAIRQDPTRKGSVVNVNPTNTRPQSDTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTESGLMLLDRSGQGKVYPLINRRRFQQMDVLEGLNVLVTISGKKDKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDLEGCVHYKVGEFWEGHRIVFFYGLISVP	490091	425731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_428010_430724_430869_436239_436411_436729_436848_438781_438974_440053_440175_440650_440827_442977_443076_443776_443929_445281_445389_449139_449302_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758
891419	contig_8992_pilon	+	1673	7	Intergenic	novelGene_174426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_6	59.9824048274899	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	644	1534	74535	108008	FALSE	30	TATGATTTGTGATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLCNRARLVSYLPGFCSLVTRVVNPKAFSTAGSSGSDESHVATAPPDICSRTVWPDETMGPFGPQDQRFQLPGNIGFDCHLNGTTSQKKSQVHKTLPDILAEPLSSERHEFVMAQYVNEFQGSDTPVEQEINSAETYFESAKVECAIQTCPELLRRDFESLFPEVTTSRLMIMTVTQKTKNDMTVWSEEVENEREVLLEKFINGAKEICYALRAEGYWADFIDPSSGLAFFGPYTNNTLFETDERYRHLGFSVDDLGCCKVIRHSLWGTHVVVGSIFTNATPDSHIMKKLSGD	73891	108147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_74544_90496_90642_96567_96786_100352_100459_102457_102589_106813_106901_107813
891420	contig_9400_pilon	-	1775	7	Intergenic	novelGene_146585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_4	558.361292832278	79	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1186	1536	131613	121571	FALSE	20	GAGATCCAATTTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSECESGATCVGGLDHRKSIYSLTRGALAMQWLRAMATNHSFWDDLFCHCHIDPSGAGLCTCCGWIKPLYPGMYPGAGPSSDFRFGYHSSSRITGTSFYEGCGFQSGDYTTSEE	158630	121331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_131168_131262_131485_132600_135452_135561_158539
891421	contig_12279_pilon	-	4008	2	Intergenic	novelGene_50076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	142	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	3513	4007	496	2	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTSDCVRGKQRRPSVSEEGWRVGKRMSQIACALGTLRKEQIGCTEPGTRVKGRGGGERQGRNQEKQQKKEKKKKATPAANKRHPETHPPVRAESKQPVAPGEETVAAGSRGANEQRPRDLTSAAAQTWEQPHTQMYPHSPAGKGKDSSRNQA	136467	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_2771_135229
891422	scaffold_12124_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_22393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1174	1509	1508404	1508069	NA	35	TGCGGGGTCAAAGAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509577	1508009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1508000_1509600
891423	contig_10734_pilon	+	4665	9	Intergenic	novelGene_51183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_8	414.469521647853	103	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	3250	3858	1134427	1142903	FALSE	30	TAACAAGTCCTTCGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123690	1143710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
891424	contig_821_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_149410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAAGAATTAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229895	227752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_227800_229900
891425	contig_12410_pilon	+	3719	2	Intergenic	novelGene_167272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGCAAAAAAAGGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86823	92095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_87702_89254
891426	contig_6137_pilon	-	4463	11	Intergenic	novelGene_59213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATGATGCTGACTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354916	1311685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1321458_1321503_1323816_1323939_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336781_1346639_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
891427	contig_2312_pilon	+	1660	5	Intergenic	novelGene_160733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_3	143.363829120179	518	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	38	700	217853	243984	FALSE	80	TGAAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYENDSVEDLKEMTSVSSRKRGKRRYFWEYSEQLTPSQQERMLRPSEWNRDTLPSNMYQKNGLHHGKYAVKKSRRTDVEDLTPNPKKLLQIGNELRKLNKVISDLTPVSELPLTARPRSRKEKNKLASRACRLKKKAQYEANKVKLWGLNTEYDNLLFVINSIKQEIVNRVQNPREERGPNMGHKLEILIKDTLGLPVAGQTSEFVNQVLEKTAEGNPTGGLVGLRIPTSKV	217815	244944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_218013_219483_219674_221316_221391_236791_236915_243868
891428	contig_7840_pilon	+	6125	9	Intergenic	novelGene_68977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_6	412.116317773271	995	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	137	1918	238014	304775	FALSE	65	ATGAAGAAATAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	183030	308982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_304059
891429	contig_383_pilon	-	3231	13	Intergenic	novelGene_126114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	285	479	169058	164424	TRUE	10	CCTTGAGCCATTCTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKVLHYKSFHIKFYSLIEKKRNTRKLLTLKIAIKYIANSKWFATLKGPCCLFKYQILVNITAKEFHAKCNTLIPCFRNDADKPGNDWWIEKVLHMSFVITISFENLVHHEEFLPVRFPFHSLVAIVDGIALHIHFRGQELAALCHNRSYLLDFEKINL	169342	135408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_136587_141853_142032_143970_144207_145078_145290_148650_148831_150745_150862_153253_153324_154229_154335_155145_155307_157139_157282_159219_159372_164400_164584_169023
891430	contig_9415_pilon	+	1224	4	Intergenic	novelGene_109894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAACTCTAAGACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2080478	2087242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2080642_2082733_2082931_2084479_2085228_2087126
891431	contig_2043_pilon	-	2374	1	Intergenic	novelGene_169903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	271	816	957	1772	682857	682042	NA	20	TTTTGTTTTGCAGATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPGGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY	683813	681439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_681400_683800
891433	contig_11986_pilon	-	2435	10	Intergenic	novelGene_69164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	898.876459191634	25	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	70	873	523776	517596	TRUE	15	TCATCTTGCGTGTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSSAAAQAQLLASEAAPGSTGDMADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHAYVQVLQWAALGPRPAGQQGCPMVCLPAPVVCSLCCPPAPMVCPPAPMVCPPCLHSLPTLSPQSVHSVPSTCPHCPHNLSTLSPVCPPCTLSLPTLSP	547589	507205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_517432_517561_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_547552
891434	contig_10323_pilon	+	1303	2	Intergenic	novelGene_123601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	834	1301	459964	460431	FALSE	20	CCCACTTGCTCCCCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFLQGLAIFSSCFSSSWSLSSSVMCPRSPPVGCSFLHGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRPL	459084	460433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459327_459372
891435	contig_5988_pilon	-	4197	16	Intergenic	novelGene_15867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	285.236198419641	665	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	820	2463	474	2936	398182	387838	FALSE	40	CAAGGACAGTATAAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGELADKKDRDASPSKEERKRSRTPDRERERDRDRKSSPSKDRKRHRSRDRRRGGSRSRSRSRSKSIERERRHKERERDKERDRNKKDRDRDKDGHRRDKDRKRSSLSPGRGKDFKSRKDRDSRKDEDDEHGDKKPKAQPLSLEELLAKKKAEEEAEAKPKFLSKAEREAEALKRRQQEVEERQKMLEEERKKRKQFQDLGRKMLEDPQERERRERRERMERETNGNEDEEGRQKIREEKDKSKELHAIKERYLGGIKKRRRTRHLNDRKFVFEWDASEDTSIDYNPLYKERHQVQLLGRGFIAGIDLKQQKREQSRFYGDLMEKRRTLEEKEQEEARLRKLRKKEAKQRWDDRHWSQKKLDEMTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQNRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA	398655	386576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498_388674_390323_390433_390653_390806_391212_391456_392440_392619_393678_393825_394138_394365_394464_394609_394837_394951_395088_395223_395505_395645_395796_395863_395972_396067_397411_397523_397973
891436	contig_8377_pilon	-	2736	7	Intergenic	novelGene_34900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTCAGTTTTACCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141805	68043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68139_68219_68327_124717_124736_131425_131569_135046_136360_137708_137737_140773
891437	contig_19518_pilon	-	3550	1	Intergenic	novelGene_170720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGTTCTGCGCCATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47487	43937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_43900_47500
891438	contig_9706_pilon	-	478	1	Intergenic	novelGene_20780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2099	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGTCCTTTAGACTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895	417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_400_900
891439	scaffold_2602_pilon	+	7465	10	Intergenic	novelGene_127709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1023	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	6537	7244	894253	894960	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWNLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAMDNLNHNIPISLDMLLGGGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASNAATKAWGKVPSKTPTGSFATIQQTANEPYTDFINHFQMAISPQVDNQQAAEVLCLQLAYKNANANCQALLTPLKVQNPNLAEMIRACQKVGTETHKAQVLAAALHPSTATCFGCGKPGHFKKDCHRLKNKNANTKLPT	153982	895181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_154172_165787_166271_218008_218116_271630_273056_280326_280648_359507_359511_518765_519503_688987_691091_893030_893546_893599
891440	contig_10437_pilon	+	1505	8	Intergenic	novelGene_38278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1155.32158258369	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	436	975	441779	451175	FALSE	30	CTATCATTGCCACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSQILIRYCLILVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431072	451705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439819_441717_441823_443849_443977_445309_445476_446951_447055_451075
891441	contig_9363_pilon	-	2253	14	Intergenic	novelGene_6570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	627.865615214936	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	260	1459	759562	754431	TRUE	30	TGAATATATGTGATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	759821	753402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754098_754331_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532
891442	contig_1452_pilon	+	1227	1	Intergenic	novelGene_115116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTTTGGTTAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21542	22769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_21500_22800
891443	contig_8330_pilon	+	2990	8	Intergenic	novelGene_71910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_6	82.2522253281245	872	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	42	641	1254118	1259138	FALSE	55	AAAAAAAAAAGGTGGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEEEIPGPGPPGEMRFRFCGDLDCPDWVLAEISTLAKISSVKLRLLCSQVLRELLGQGIDYEKILKLTADAKFESGDVKATVAVLSFILSSAAKHSVDGESLSSELQQLGLPKEHAASLCRCYEEKQSPLQEHLRACSLRVNRLAGVSWRVDYTLSSSLLRSVEEPMVHLRLEVAPASGAKAQPVTMSLSAEKFQVLLAELKQAQTLMSSLG	1254076	1261487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1254121_1257178_1257251_1257473_1257540_1257753_1257794_1258088_1258209_1258387_1258469_1258831_1259009_1259097
891444	contig_13004_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_112613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTGTGAGTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174922	176850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_174900_176800
891445	contig_10500_pilon	-	1895	8	Intergenic	novelGene_41229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	945.266769386358	66	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	531	1124	1635596	1629460	TRUE	15	TTTCTATATTGTATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640218	1626408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627133_1629412_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639834
891446	contig_17976_pilon	+	2629	4	Intergenic	novelGene_32462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	271	1161	41843	47385	FALSE	65	GAACAACAAAAAGATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41572	48853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46648_46773
891447	contig_7594_pilon	+	2547	4	Intergenic	novelGene_55395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	112	345	365753	365986	TRUE	70	AAAATAAAATAAAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLWSGQILSWWIGCFCLFAILWFRVFWLSVLVIEVAMVLTLKSLLTLGLISLIFLILFITVLSKLSLSRRNPVKLWSINPIHILSHWSTLSSCTLVVSTLHHFSQHRRVGIPW	365641	506709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_367260_411449_411502_493368_493627_506090
891448	contig_16103_pilon	-	1482	4	Intergenic	novelGene_118867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	69	437	743628	723350	FALSE	45	AAATAAAGAACCAGTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKGLSTFGNNI	743696	722304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_735901_735975_737495_737630_743496
891449	contig_401_pilon	+	2776	4	Intergenic	novelGene_42846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1943.60083922142	65	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAACCCTCCTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713608	1728769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1713704_1714021_1716273_1724169_1724348_1728517
891450	contig_8330_pilon	-	3865	1	Intergenic	novelGene_71869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	681	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCTAGCAGTGCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950582	946717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_946700_950600
891451	contig_10159_pilon	-	3394	13	Intergenic	novelGene_30871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2411	2779	982700	976422	TRUE	0	GTGCCTCCGCGCCTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGSMMGMLMLITPSSSRVSKCRTCKYSLSRIKPFRGVAQPSLKTWTHWRSTLVIDNEGRVSASARTWSSLFSGTKSSWMPLIVVCGTMFCSCRSSTTCWIQSLTEDTLVLSTHSGVSGFS	997796	958451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_958552_970012_970129_974246_974483_975157_975297_976397_976516_976640_976756_978441_978554_982652_982861_992071_992205_993297_993568_994445_994676_995872_996668_996974
891452	contig_6870_pilon	+	1562	5	Intergenic	novelGene_103977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	220.59734245906	27	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTTAAACACGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443606	1461011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1443718_1444620_1444758_1444878_1445027_1447022_1447295_1460117
891453	contig_3095_pilon	+	2099	4	Intergenic	novelGene_75167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_3	702.27360923092	7273	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	825	1223	226165	226800	TRUE	15	CCTATTTGTGGTATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220473	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_226409_226645_226824_227001
891455	contig_14925_pilon	-	1531	5	Intergenic	novelGene_55293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	154	348	115846	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPIVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129479	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_115957_129436
891456	contig_10734_pilon	+	5965	24	Intergenic	novelGene_51247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	433.300364699996	1151	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1393	4182	327	4508	1243300	1333513	FALSE	30	GTGGTACTTAAATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1240089	1334970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1240306_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
891457	contig_4686_pilon	-	9912	54	Intergenic	novelGene_118488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_38	193.796665965669	1582	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1964	5895	3124	9018	465007	353841	FALSE	85	GAAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDHLNAFLEFSKEVDAKSSLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQDLEDVIKAKEKEVETIEQNGLALIQNKKEDVSGVVKCTLQELTQTWENLDRMARQLKILLKSVLDQWSHYRAAFDEINSYLMEARYSLARFRLLTGSLEAVQVQVDNLQSLQDDLEKQEQSLQKFGSITNQLLKECHPPVTETLTNTLKEVNMRWNNLLEEIAEQLHSSKALLQLWQRYKDYSKQCASTVQQQEGQTNELLKAATNKDIADDEVATWIQDCNDLLKGLGTVKDSLFVLHELGEQLKQQVDASAASAIQSDQVSLSQHLCALEQALCKQQTTLQAGVLDYETFAKSLEGLEAWVVEAEEILQEQDPSHSSDLASIQERMEGLKGQMLKFSSMAPDLDHLNELGYRLPLSDKEIKRMQNLNRHWSLISSQTTERFSKLQSFLLQHQTFLEKCETWMEFLVQTEQKLAVEISGNYQHLLEQQRAHELFQAEMFSRQQILHSIIIDGQRLLEQGRVDDRDEFNLKLTLLSNQWQGVIRRAQQRRGIIDSQIRQWQRYREMAEKLRKWLVEVSYLPVSGLGSVPVPLQQARTLFDEVQFKEKVFLRQQGSYILTVEAGKQLLLSADSGAEAALQAELTEIQEKWKSASMRLEEQKKQLDFLLKDWEKCEKGIADSLEKLRSFKKKLSQPLPDHHEELHSEQMRCKELENVVGGWTEDLTQLTLLRDTLSAYISTGDISILNERMELLQRQWEELCHQLSLRRQQVSEKLNEWAVFSEKNKEICEWLTQMESKVSQNGEILIEEMIEKLKKDYQEEIAVAQENKIQLQQMGERLAKASNESKASEIEYKLGKVNDRWQHLLDLIAARVKKLKETLVAVQQLDKNMSSLKTWLAHIEAELAKPIVYDSCDSEEIQRKLSEQQELQRDIEKHSTGVASVLNLCEVLLHDCDACATDAECDSIQQATRNLDRRWRNICAMSMERRLKIEETWRLWQKFLDDYSRFEDWLKISERTAAFPSSSGVLYTVAKEELKKFEAFQRQVHESLTQLELINKQYRRLARENRTDSACSLKQMVHDGNQRWDNLQKRVTSILRRLKHFIGQREEFETARDSILVWLTEMDLQLTNIEHFSECDVQAKIKQLKAFQREISLNHNKIEQIIAQGEQLIEKSEPLDAAVIEEELDELRRYCQEVFGRVERYHKKLIRLPLPDDEQDLSDRELELDDSAALSDLHWHDTSADSVLSPQPSSNPSLSLAQPLRSERSGRDTPASVDSIPLEWDHDYDLSRDLESAVSRTLHSEDEESQEDKDFYLRGAVGLSGSHGALESRIRQLDKALDDSHFRIQQTENIIRSKTPTGPELDASYKGYMKLLGECSGSIDLVRRLEHQLKEEEESFPGFVNLDSTETQTAGVIDRWELIQAQALSKELRMKQNLQKWQQFNSDLNNIWAWLGETEKELERLQRLELSTDIQTIELQIKKLKELQKAVDHRKAIILSINLCSPEFTQADCEESRDLQDRLSLMNGRWDRVCSLLEEWRGLLQDALMQCQDFHEMSHGLLLMLENIDRRKNEIVPIDSNLDTEILQDHHKQLMQIRHDLLESQLKVASLQDMSCQLLVNAEGADCLEAKEKVHVIGNRLKLLLKEVSRHIKDLEKLLDMSSSQQDLSSWSSADELDTSGSMSPTSGRSTPNQQRTPRGKCSLSQPGPSVNSPHSRSTKGGFDSSLSEPQPAQSRRAFLLRVLRAALPLQLLLLLLIGLTCLVPMSEEDYSCALSNNFARSFHPMLRYTNGPPPL	532153	352946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_354082_363015_363075_364486_364580_366026_366240_367770_367900_369729_369931_373540_373753_375405_375533_377529_377673_381283_381618_382962_383155_384985_385124_385364_385548_388362_388514_389373_389562_398467_398631_413088_413256_417837_417997_425619_425776_430258_430385_434749_434945_437360_437596_441486_441582_443749_443898_444553_444709_447065_447213_447816_448000_450451_450657_451228_451363_453259_453431_455599_455756_460692_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464565_464977_465111_465975_466173_466705_466838_470265_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454_487587_491549_491707_495378_495486_496544_496677_506904_507097_509797_509972_511588_511784_521407_521570_521780_521949_531879
891458	contig_6445_pilon	-	2009	11	Intergenic	novelGene_76918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	835.750824109674	5	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	958	1779	88578	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96417	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49879_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88826_91254_91854_96306
891459	contig_2069_pilon	+	7121	6	Intergenic	novelGene_23196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	820	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	4374	4982	95516	96124	TRUE	25	CTGTGGAGAGGCAGCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNVYIDQEAVILTKQGDTSWFKIWKDVHQGCILSPYLFNLYAEQIIQEAGLYEKECGIRIGRRLTDNPGYADDTTILAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHFNIKKTKILRTGPIRNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINDHRSSSQEIKGHTALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSITSYACESWTMNKED	91142	111948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_97261_97870_98025_102635_102919_103636_103696_109098_109511_111853
891460	contig_11986_pilon	-	1411	10	Intergenic	novelGene_69160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	865.382310432722	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	567	1262	518553	507353	FALSE	15	ATCTTGCGTGTGTTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	547835	507203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518494_518588_519123_519181_523616_523809_547552
891461	contig_19722_pilon	+	1450	8	Intergenic	novelGene_171894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	87.4687116070889	19	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	122	1294	68446	90122	FALSE	25	ACCTTTAACAAGTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLGFGRLRGGGFWEPRQLRSSQAGESAPLSGGFGNPAAAMAPVSGSRTPEGEASGSGGKRRSRSRSPKPSRAARSPRGHHSRSHSCSRSGDRNGLSHQLGSLSQSSRNQPYRSRSRSRSRERPSGPRGTPFASASSSAYYGGYSRPYGGDKPWPSLLDKEREESLRQNSDEHTPVEDEEPKKSTTSASTSEEEKKKKKKSSRSKERLKKRRKKKSSKRKHKKYSDDSDSDSDSETDSSDEDTKRRTKKAKKKEKKKKHRSKKYKKKKSKKSRKESSDSSSKDSQEEFLENPWKDRSKPEEPSDLIGPEAPKTLASQDDKPLNYGHALLPGEGAAMAEYVKAGKRIPRRGEIGLTSEEIASFECSGYVMSGSRHRRMEAVRLRKENQIYSADEKRALASFNQEERRKRENKILASFREMVYRKTKGKDDK	68324	90278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_68832_76545_76617_76801_76943_81717_81782_83617_83728_83824_83901_85074_85225_89947
891462	contig_8145_pilon	+	3005	4	Intergenic	novelGene_118663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	550	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2425	2766	863400	867457	TRUE	10	CTTTCCTAGCCTTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLMLENVASQRKILPFKYTESIAGRLEQIFRDGEESKSVGWCSLKKSHTSTTIFLWISRPPTTAQNSSKDILPSPSLSAFIMVLSTICCNCVSFRLFPTIIFSTWKSSPLEI	860975	870084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_863589_867304_867492_868849_868910_869939
891463	contig_15732_pilon	-	6535	13	Intergenic	novelGene_88840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1724	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	4913	5248	343864	339863	TRUE	15	GAGTTCTTCTTTAAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFVWLDGSSYRPWWGERGSAAQEWLLRTILWIVSGNEHIQVIILVVRTLTVNLRWAVLRFTLIFFLCFIHLSSFCTQPASLPTSVMKCCILCGWENIQPLHSHVLAHYFC	398162	11130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_11276_53524_53924_97592_97748_110634_110774_126354_126489_153773_153880_184975_185175_339852_339916_343581_343875_348872_349180_380800_380980_386707_386771_393809
891464	contig_9653_pilon	-	6762	1	Intergenic	novelGene_48274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3400	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1011772	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1005000_1011800
891465	contig_12119_pilon	+	4285	7	Intergenic	novelGene_88684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	854	junction_3	203.859428692093	78	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	58	2208	382573	423789	FALSE	20	ATACTATGACTGGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGDTLLASYTQATHSESMTSEDRSQLDHMGFIFTTGIPIPSTETELDISLPTAASLPIPSQSTTVNPDIEEPKTEAKTLDDIFESSTLSDGQAIADQSEIISTLGHLERTQEEYEEKKYVGPSFQPEFSSGAEEALIDHTPYVSIGTIHLMAQRLTEAPTVMEGSNPPGYTDTTLAPSAFAKLSSQTPSSLVTVYLGSRASEHTEDLEPSALPGTDVGATQVSSGDSAKEAYENTEATFKPSLEKYFHITEPPSLSPNTELELSEDESKPKSLKEMEASPSELIAEERFEVHQKSRNKTDVQLSGETIKEFLSVRTPEAGTVVTAAGEIKLEGASQWPHSTSAPAIHGVKTGVVPQPSPQTSEKPTIPSSLEINPETQAALIRGEYSTVTASEQQVSAIILDSNTQATVSTAELNTELATPSFSLLGPSNESDFLIGINEESVEGTAVYLPGADRCKMNPCLNGGTCYPTDTSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCIDGFNTFTCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQIFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNRKWYFRKNGQPCYNNY	382515	425866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_383876_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556
891466	contig_7873_pilon	+	3034	8	Intergenic	novelGene_169571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.380125770186	751	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	769	1341	69396	74459	TRUE	20	GATGAACACTTGGGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGKTETSKLKQNLEEQLDRLMQQLQDLEECREELDTEEYEETKKETLEQLSEFNDSLKKIMSGNMTLVDELSGMQLAIQAAISQAFKTPEVIRLFAKKQPGQLRTRLAEMDRDLMVGKLERDLYTQQKVEILTALRKLGEKLTADDEAFLSANAGAILSQFEKVSTDLGSGDKVLALASFEVEKTKK	63387	76205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_+_64150_69389_69497_71230_71367_71739_71839_73550_73647_73819_73902_74400_75264_75316
891467	contig_1715_pilon	+	2335	6	Intergenic	novelGene_127175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGCAGTAGACCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246604	262569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_248324_248985_249143_251383_251524_252370_252480_256575_256701_262484
891468	contig_6509_pilon	+	3177	8	Intergenic	novelGene_145624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	403	1098	72913	73608	TRUE	10	TCTCACTTCCTTCCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTLAWNALFFSESVPCRPPPFLCSRFFLTGFRDSTLEASEEQSDSLVSRVLVESDKELTSDQAGEEMVFQLSVLQCLECWSVWLGLCFWEAVLPWEEVEEAESELNREGSFNTSGDPLAQPELPTEPSSSSLPRGSLSDSEEQNLSLLFPNRTSLPFVSFFRFFFTLFFSFCCLELEDSRVLLPGSTACADSLSFSPVPMVTFTSSSSDVSDKMRCAAFFGAIVLFLV	71640	91995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_71807_72676_73889_74356_74507_76422_77530_77879_78084_78289_78463_78935_79031_91925
891469	contig_3161_pilon	-	1562	2	Intergenic	novelGene_84540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	54	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	579	1502	592021	591098	FALSE	55	CAAAAAAAGCCTACAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETQLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVVILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGIIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKKEIDSSTIILGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHTAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKENKSTPWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIK	625012	591037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_592488_624900
891470	contig_12948_pilon	+	3691	2	Intergenic	novelGene_126192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCTGACCTCTTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223822	230300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_227402_230188
891471	SIRV6	+	680	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1404	386	19	108	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGTCAATGGCTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2491	11439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891472	contig_8375_pilon	+	2751	13	Intergenic	novelGene_141272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	92.3969020043421	616	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	149	1636	31124	64643	FALSE	50	CAACCACAGAGAGAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKAKQMPVEMSRPAAPLLNSNNEKISSDPSPEANSHYGCNEDVGNHAVKSLDENKEDLNLDVEYTEVEVSSPDPHRAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	30818	65758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_30926_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41507_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
891473	contig_14220_pilon	+	2501	14	Intergenic	novelGene_159852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	721	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCAACATGGCCGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291984	423093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_292233_293534_293873_294242_294375_313692_313753_319547_319834_323815_323977_325915_326126_331917_332087_355338_355461_359286_359601_361120_361198_380765_380815_393836_393918_422839
891474	contig_16594_pilon	-	1263	6	Intergenic	novelGene_53853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_5	1878.9627989931	495	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	307	1056	165546	124924	FALSE	70	GTGTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVGRCQLCFLIV	306554	124716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306350
891475	contig_12180_pilon	-	3480	1	Intergenic	novelGene_160352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	116	397	112420	112139	NA	85	ATAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFNIVLEVLAREIRQEKEKKGIQIGKEEVKLSLFADDMILYIENPKDSLRNLLKLIERFSRVAGYKINIQKSVGFLDTNKENDEKEIRKTISFIIAPKKIKHLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQKST	112535	109055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_109100_112500
891476	contig_5419_pilon	+	1800	11	Intergenic	novelGene_15490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	550.711140254126	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	161	1525	238919	249830	TRUE	25	CAAACACTGAGCCCGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREKVTASLVFAISIATIGSFQFGYNTGVINAPELIIRDFLNYTLDMRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238758	255005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240675_241836_241875_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614_249998_254897
891477	contig_935_pilon	-	3507	11	Intergenic	novelGene_45542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_7	267.737856867496	124	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	752	1546	361950	345477	FALSE	35	CTCAGACATTATAATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	377430	343515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362196_362606_362749_368062_368292_370637_370822_377395
891478	contig_16125_pilon	-	1095	14	Intergenic	novelGene_155246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	5	junction_13	1004.49179944285	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	90	1094	236372	135679	FALSE	70	TGAAAAAGCAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHSQSGSGGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKK	236461	135677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796_235867_236357
891479	contig_15407_pilon	-	3295	6	Intergenic	novelGene_123083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGTAAAAATGATTATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470971	463924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_466067_467556_467606_467708_467850_467976_468070_468151_468305_470254
891480	contig_13074_pilon	+	1790	4	Intergenic	novelGene_153425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1380.10080147148	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	34	528	403694	451702	FALSE	30	CACCTGAAGTTGTGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFPRSHTQPRKMGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDCKVLLKATFYNTGTKKSSFKLVCTVLFFHWKWNPLP	403660	452964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002_451096_451593
891481	contig_642_pilon	-	4023	5	Intergenic	novelGene_178570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1444	1764	571256	570936	TRUE	70	AAGAGAACCACAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTDPS	573678	102612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_642_pilon_-_103267_299393_300285_395443_395631_570408_571543_572521
891482	contig_401_pilon	+	3207	10	Intergenic	novelGene_42838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1541.10097729585	202	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	37	873	1711949	1714182	TRUE	10	CCCCAACCCTCCTCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGEYGFVAYLWGFYICVCKEHVGNLLSLE	1711912	1728769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1715234_1715419_1716273_1724169_1724348_1728517
891483	contig_10541_pilon	+	5163	1	Intergenic	novelGene_144630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	411	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	955	1566	118145	118756	NA	90	AAAAATAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKPTSKWIKGLNIKPKTIKFIEEKLGPTLQALIHGINRIQTITINGKTQVDKLGNWDLLKIKHVCSSKDFTNRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQYLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQIAIRHMRKCSRSLAIREMQSKTTMRYYLTPALLARIKNTGNNKCWRRAGRSELLCTAGGNAK	117190	122353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_117200_122400
891484	scaffold_880_pilon	-	4015	4	Intergenic	novelGene_121430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	971	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTGAGGAAGTGAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428557	408584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_408780_420187_420364_424872_426803_426843
891485	contig_7291_pilon	-	2041	8	Intergenic	novelGene_106299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	307.049952726568	91	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	158	559	206279	178208	TRUE	15	TCTGGGTAAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREFSLRLILWILMKYLKIWE	213297	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178265_180661_180758_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
891486	contig_6871_pilon	+	2447	3	Intergenic	novelGene_21594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	701	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTTGTATGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352630	471317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_352706_353354_354791_470381
891487	contig_7291_pilon	-	2105	8	Intergenic	novelGene_106300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	307.049952726568	70	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	175	573	206279	180608	TRUE	15	TCTGGGTAAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSVSI	213314	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_180603_180758_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
891488	contig_10962_pilon	+	2919	14	Intergenic	novelGene_103886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	358.956525198036	471	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	267	1769	394543	412410	FALSE	15	CACCTTTCTGTTTATAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKEIIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDVDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDTSQTKESLQYSLETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS	274016	413560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_274108_288889_288922_393706_393844_394536_394680_396324_396482_397805_397905_401835_401951_402637_402793_403811_403977_407192_407358_408898_409013_410807_410903_411426_411531_412213
891489	contig_13700_pilon	-	2170	8	Intergenic	novelGene_68282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_5	335.012762473922	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGAAAAAGAAGCCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163853	112579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_112642_117817_117894_118876_118973_121767_123164_123557_123682_132820_132924_163213_163239_163565
891490	contig_5779_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_106498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203116	205229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_203100_205200
891491	contig_11117_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_148597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	80	412	94537	94205	NA	35	AATGTATGTATAAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTSISPRDRKSYINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRPDREHNREYQMEQEKGGVQNSNSIKKTRLNGLTETGGTLESMAPGFSISPELKQLPRPTLQTGIGLDCGT	94616	93471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_93500_94600
891492	contig_14514_pilon	+	1647	3	Intergenic	novelGene_137455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_1	22.5	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGGTTACTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24701	36321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_24764_30105_30203_34833
891493	contig_7079_pilon	+	1502	4	Intergenic	novelGene_129240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	626.400830139935	32	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	99	503	342598	349800	FALSE	35	GGGCTGTGTCAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFPLVPALVPAPLAAPYSLHPGTKPCFFPVNPSSAVIPDWPTLTLAKFLNPPHSFLKQR	342499	350799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344781_349622
891494	contig_753_pilon	-	4514	25	Intergenic	novelGene_113012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_10	932.971841267046	18	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1060	3183	68	3250	1502312	1354804	FALSE	70	AAGAAATTGTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTDVELKRLKDAFKRTCGLSCYMGQHCFIREVLGDGVPPKVAEVIYCSFGGTPKGLHFNNLIVGLVLLTRGRDEEKAKYIFSLFSSESGSYVVREEMERMLHVVDGKVPETLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLLLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPTFYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAFDENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELKDMVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGMMSLRMFPQHLPRGNVPSPNTPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHRLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSSKIDRHKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPIRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLKSEQILLAEVHSSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPIPGSPISSSSPVQTDFSSSPSTNGMFTLTTSGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHVPSLPDNRFTGYIIAVHRKMVS	1502379	1353539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1355025_1356199_1356312_1358352_1358505_1359925_1360101_1360850_1361025_1362329_1362436_1362718_1362858_1363389_1363465_1364499_1364582_1366859_1367015_1372845_1373006_1375808_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413398_1415056_1415165_1416768_1416901_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
891495	contig_804_pilon	-	3416	3	Intergenic	novelGene_138778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_1	302.5	1087	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	331	882	36776	33688	TRUE	10	TTACTGAGGTTGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIVRVKRYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAKSKSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQCCTTCVVQ	37106	21028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_23523_33647_33967_36503
891496	contig_8636_pilon	+	3962	1	Intergenic	novelGene_141912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	945	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	549	3412	3960	367649	368197	NA	20	CTCGCTGTCATCCAGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVLLLQVPAPLPPKGAGVPLPWPSAPSKKRLGEPLPLYTNSLALGESWDCGAGLAVMKFRECIDKERLLCFNRLLVGDRARQGCCCGGCWPLPPPLATPPPLDAAPPFFILVEPNLVAAKEAVVKVMGWAERGMKVGLGDWPKDGDGELDRELSWLPMGTKTWASGLKLLLISLSSSGAPQ	364237	368199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_364200_368200
891497	contig_2703_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_101637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGTCCCTCCCCCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	1904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_1900
891498	contig_9653_pilon	-	3538	14	Intergenic	novelGene_48298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	978.884517912243	3	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	32	1681	1040020	1009521	TRUE	75	GCATGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDNSSQPLQSSHRRRTGRV	1040051	1005469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009573_1013606_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
891499	contig_7009_pilon	-	11673	8	Intergenic	novelGene_23656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2086	2460	538059	537464	TRUE	15	CGCCACCCCCCACCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEFGIKLWFLRSKESKGLQTLPFCPRQPETQLFPNNLFSYAESDLKQCFLLKRAAFSPRLMGSDAVASAPFPGQPSQPGTSQGVSLPACSPAVLALCSATHFVLRSLLMDTWNAHRVRESCA	540497	489474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_496860_506372_506631_512644_512815_517990_518116_522864_523001_536324_537801_538021_538797_539149
891500	contig_17127_pilon	+	6639	31	Intergenic	novelGene_168292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	863	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2065	2397	8672	10565	TRUE	25	GACCCAAAGCTCCTCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTFLLRTHKGNRQSVMESIPWLREKRRAFSPQVSSKGSAEELLLSHVSALFQPSCCVPHRDATGEQDLFRELRFHFGRHITLFSFHVTYQSVSQAPRRVEVHLLVGVL	6607	37101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_8961_10521_10700_10787_10878_11348_11545_12122_12200_13292_13496_13739_13919_14374_14465_14741_14870_16210_16464_17063_17155_18619_18801_19406_19568_20664_20760_22019_22057_23256_23338_23652_23896_24324_24434_25234_25358_26162_26357_26604_26818_27369_27485_29289_29388_29507_29676_30455_30638_30751_30855_32728_32852_34384_34565_35118_35333_35437_35593_37075
891501	contig_13453_pilon	+	2681	2	Intergenic	novelGene_146704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4681	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57365	91611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_57814_89378
891502	contig_15666_pilon	+	3994	3	Intergenic	novelGene_70201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1010	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCTCCAGCCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127351	132290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_130795_131446_131713_132005
891503	contig_6914_pilon	-	828	2	Intergenic	novelGene_151731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	64	456	123507	122623	FALSE	40	TACACAGCCAAAAGGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAGGDCKEVDNRLSSKVGLATVDSCSPAFLFLQPLPRMAALVLAGDTMGPERIFPNQTEELGPHVGSAEGTGDWSSEEHEEEPEEAGAGPAGYSYQPLNQDPEQEEVELAPVGDGEDVIADIQERIQNM	123570	122250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_122632_123123
891504	contig_17737_pilon	-	3350	1	Intergenic	novelGene_72917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	836	1498	104104	103442	NA	5	GTTTGTTGTACTGTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKSNTCSPQTAPKELPAPARGIQAACSFEPRARGPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNTAPTAPQERAKTVLGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRSGGWESAHRKLPAVLSPSGCSMRLLSRTPVCWSPIAVQDGGSALR	104939	101589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_101600_104900
891505	contig_5959_pilon	-	1468	5	Intergenic	novelGene_150193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	162.70890418167	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	355	1464	216308	211902	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218726	211897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218222_218328_218560
891506	contig_3602_pilon	+	2820	2	Intergenic	novelGene_60613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	25	1080	902032	913188	FALSE	35	TCACAAAATTAATTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	902007	914928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135
891507	contig_11656_pilon	+	6342	6	Intergenic	novelGene_53935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	467	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109119	124501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_112021_113266_114525_117215_117528_120350_120955_122561_122772_123444
891508	contig_13901_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_146630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	836	1141	102267	102572	NA	80	GTAGAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVLENVPRALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLFFTESGVLKSPAVIVELSVSLFSAVKVCFMYFGALSLGAYIFIMHMSS	101431	103378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_101400_103400
891509	contig_2924_pilon	+	4209	16	Intergenic	novelGene_140247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	459.129640370415	46	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	9	1616	17893	303804	FALSE	25	AGCTGCGGATGTGAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSAAKAASATDLAEIEIKKEMKKDPLTSKAPEKPMHEVSGGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPETLPNRTEEKEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSVSRPIAMPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	17884	306397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_17944_66034_66159_125503_125608_135679_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847_221956_236286_236339_239711_239793_242630_242782_259354_259441_287622_287733_297439_297568_302765_302830_303762
891510	contig_6871_pilon	+	2271	2	Intergenic	novelGene_21534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1073	1408	122965	123300	TRUE	25	CTGTCCCACCGAAAGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLDGSFSPASKAPRWPQSHKGLSLKSEGSLVHPVLSSHPSLPHHSLLAFIIFAFSIRPQPQVETQQTAVKGLKWPLPPTPQLRTSGRQGLILSSLCPQVFGACGQKMFVE	121892	124627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_123596_124059
891511	contig_9982_pilon	-	1827	15	Intergenic	novelGene_55758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	295	junction_1	196.280996512237	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	42	1688	353538	339852	FALSE	25	GAGCCTCAACTGTCCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVLAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIGCRKALEILPDLVCCSAKNLRDVDEVSSLLHTSVMSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353579	339712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
891512	contig_11709_pilon	+	4829	11	Intergenic	novelGene_168210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	108.115678788971	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	169	2106	41986	70476	FALSE	65	GTGTATAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLPLKTDGKEEGPPQPESKSKKSSSSTTTGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDTKKQPKLQPPSPANSGSLQGPQTPQSTGSNSMAEVPGDLKPPTPASTPHGQMTPMQGGRSSTISVHDPFSDVSDSSFPKRNSMTPNAPYQQGMSMPDMMGRMPYEPNKDPFGGMRKVPGSSEPFMTQGQMPNSSMQDMYNQSPSGAMSNLGMGQRQQFPYGASYDRRHEPYGQQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDVYNMQYGGQQQEMYSQYGSSYSGPDRRPLQGQYPYPYNRERMQGPGQMQAHGLPPQMMGGPMQAASGEGPQQNLWAARNDMPYPYQNRQGPGGPAQAPPYPGVSRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSHRQPYMPSSASMQPITRPPQSSYQTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPAVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPPGSVEASQPVLKQRRKITSKDIVTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDSTVATFNLSQLSGFLELLVEYFRKCLIDIFGILMEYEVGDPSQKALDHTAPIHYLPIGN	36606	73199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_36673_41883_42094_45057_45263_53217_53357_53610_53784_58108_58260_61212_61310_62950_63735_65859_65991_68613_68734_70446
891513	contig_8322_pilon	-	3098	1	Intergenic	novelGene_143254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCCCAAAGCAATGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302988	299890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_299900_303000
891514	contig_15029_pilon	-	2959	6	Intergenic	novelGene_128182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	3	569	172318	163104	FALSE	25	CCTAATCTGATTTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172320	160713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
891515	contig_11989_pilon	-	2575	21	Intergenic	novelGene_68432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	325.616937520148	27	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	30	1949	107068	46235	FALSE	10	TTTTTTTTTTTTAATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQRGRGPWRMAFLLATCGGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESRCLWKDVTFNLKIRDIDAATEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	107097	45608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48158_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_107041
891516	contig_20527_pilon	+	2706	4	Intergenic	novelGene_138550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	115	junction_2	1293.85547879197	14	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12763	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_26238_26346_27308
891517	contig_12292_pilon	-	3747	7	Intergenic	novelGene_166987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_2	112.114524780096	1177	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	28	1107	502418	164194	FALSE	85	AAACAAAAACAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQRRHFGRMTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEKVSAFESPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV	502445	161553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_-_164385_173906_174061_242659_242790_245298_245428_267465_267621_389968_390154_502282
891518	contig_2310_pilon	+	1829	13	Intergenic	novelGene_71598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	229.329139375411	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	107	1660	106726	134479	FALSE	10	GATTTGTCGTCTCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTQVRPRQYFHKTVSDLIDQKVYELQASRVSSDVIDQKVYEIQDIYENSWTKLTERFFKNTPWPEAEAIAPQVGNDAVFLILYKELYYRHIYAKVSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106057	134648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106753_107935_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
891519	contig_7932_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_128426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCTCTACTCAAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207831	210141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_207800_210100
891520	contig_5474_pilon	-	2872	3	Intergenic	novelGene_178607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAAGATATAGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30870	2427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5474_pilon_-_3269_5475_6744_30107
891521	contig_11363_pilon	+	2536	3	Intergenic	novelGene_160484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	368	733	140295	140992	FALSE	45	GAGGACAATTTATAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLSSTHHNLPSPPCLPAPCAEHHTTNQPRHGQIKQKSRMKQTNLQSVNEENNYQKPRKQTISKHLQKQDRMVPVGFQNKTQDDFLVEEKALELPDSEFKSLIFRAIKKLKQKADKIRKK	139080	142795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_139354_140200_140660_140991
891522	contig_8365_pilon	+	3595	5	Intergenic	novelGene_150910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1777	2244	195025	195492	TRUE	85	AATAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKYKNEKKKRVKEKKWINRETGNEARQKGNKREKKTNKQENQNQKKGKKNTRKKKCPQGCPCVSAQSKGVASKPRGTAQLEGAPKLRKQKENKQIKTEQIRANKQTNKKAPGVLPVWRHGPGSSFTVEQCFAAFQEEAKMAHGARYLRERRRRW	33570	198054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_34340_193405_194045_194570_194660_194745_195832_197042
891523	contig_233_pilon	+	1440	2	Intergenic	novelGene_14491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAAATCTTTTAGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40612	42097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_41062_41106
891524	contig_19792_pilon	+	3368	2	Intergenic	novelGene_168199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364	3832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19792_pilon_+_2014_2113
891525	contig_14684_pilon	-	2034	4	Intergenic	novelGene_99647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.0292851327566	377	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTATTTGTTTGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64746	58704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_58767_60109_61782_62953_63097_64589
891526	contig_4924_pilon	-	2112	2	Intergenic	novelGene_84653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65045	62875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64873_64930
891527	SIRV6	+	783	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	-26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	271	585	2021	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2028_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891528	contig_8365_pilon	-	886	4	Intergenic	novelGene_150917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	45.7262385167301	5	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTATTGGTGGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211156	110677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_110910_120063_120340_175907_176023_210893
891530	contig_11160_pilon	+	1961	3	Intergenic	novelGene_168833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	33	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	272	715	318478	320483	FALSE	55	CATCCAATTTTAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318206	321729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319213_320267
891531	contig_10176_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_72737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTGGGAACAACCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261943	264172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_261900_264200
891532	contig_7963_pilon	-	3918	1	Intergenic	novelGene_58418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3067	3381	61410	61096	NA	40	AACAATAAAGCTCTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLHGSCSFKLLFLSICSSFCLECLSFVFLSILYLFLKIYAFTLTRGLSSTLPNSCPLHLLCAARLQLTPLLQHFQYCILIIIFFYFTPWPQEMFVYHYIICT	64476	60558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_60600_64500
891533	contig_6164_pilon	-	4293	2	Intergenic	novelGene_121291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	375	junction_1	0	548	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	400	1722	591880	590558	FALSE	10	ATGGTTTGTATTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENIESNSKNVDVRPKTSRSRSADRKDGYVWSGKKLSWSKKSESCSDAETVDTVEKMEVPLRSQERKHSCSSIELDLDHSCGHRFLGRSLKQKLQDAVGQCFPIKNCSSRHSSGLPSKRKIHISELMLDKCPFPPRSDLAFRWHFIKRHTVPINPKSNEWVSTDLSQSELRDGQLKRRNMEEDVNCFSHTNVQPCVITTNNASCRGGSMTGSVINLVSNNSIEDSDMDSDDEIITLCTSSRKRNKPKWELDDEILQLETPPKYHTQIDYVHCLVPDLLQINNNPCYWGVMDKYAAEALLEGKPEGTFLLRDSAQEDYLFSVSFRRYSRSLHARIEQWNHNFSFDAHDPCVFHSPDITGLLEHYKDPSACMFFEPLLSTPLIRTFPFSLQHICRTVICNCTTYDGIDALPVPSSMKLYLKEYHYKSKVRVLRIDAPEQQY	608239	587986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_591973_607932
891534	SIRV6	+	1467	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-4	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	194	30	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	227	718	1733	10736	TRUE	30	GCAGTTTAGAAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1189_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891535	contig_202_pilon	-	3593	1	Intergenic	novelGene_127070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2349	2651	182199	181897	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPAANTHCSDQDNNRGFSTELEKDVEHNSNSPPKKKKKQIYWPKGDWRNLASMAPRHPFSSVVKVTPRFTVQPGSGQLRKIK	184547	180954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_-_181000_184500
891536	contig_10437_pilon	+	3102	6	Intergenic	novelGene_38436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_4	262.525122607342	865	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	119	871	858335	866122	FALSE	30	TAATGATTAGTTTCAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLLLQVTELVLDNCRCVNGEIEGLNDTFKELESLSMADVELSSLARLPSLNKLRKLELSNNSISGGLEVLAEKCPNLTYLNLSGNKIKDLSTVEALQNLKNLKSLDLFNCEITNLEDYRESIFELLQQITYLDGFDQEDNEAPDASDEEDDDDGDEDDEDEEDEAGPPEGYEEEEEDDDEEDEEEDDEAGSELGEGEEEVGLSYLMKEEIQDEDDDDDYVEEGEEEAEEEEEGLRGEKRKRDADDDGED	858216	868353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_858503_858971_859095_859810_859980_861103_861280_865323_865379_866060
891537	scaffold_13609_pilon	+	2206	7	Intergenic	novelGene_124423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	60.7273048599685	185	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	28	660	779035	794586	TRUE	30	TATCATTTCCTAAGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACEEALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGRVDVAVNCAGIAVAIKTYNLKRSQAHTLEDFQRVLNVNLIGTFNVIRLVAGEMGQNERDQGGQRGVIINTASVAAFEGQVGQAAYSASKGGIVGMTLPIARDLAPIGIRVMTIAPDVVDLIPVFSIW	779007	796265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780437_780559_780689_780768_780878_794548_794627_794759
891538	contig_13699_pilon	-	10470	46	Intergenic	novelGene_158323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	849	120	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	5152	5475	120711	119277	TRUE	20	CCCCCAATTTCTCATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSFSSLSFHVLFKFSQALFISSMLFFTSGFSVSPQAKIKSAPRIRINSSSSCRPSVSSLIVYISFNLLFDDGWVNAWAFQVMDNILGVFDGGQESCHVIPELLC	160112	65400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_65586_66407_66536_67774_67974_70766_71263_72686_74162_104575_104737_104914_105085_106265_106436_108462_108623_108981_109310_110256_110341_110879_111122_111801_112009_113509_113629_114094_114204_115116_115337_116364_116575_118298_118531_119176_119404_120416_120544_120641_120744_121369_121472_121582_121756_121848_122008_122147_122344_122897_123028_123749_123923_126295_126458_126562_126768_126902_127020_127463_127637_129028_129188_130126_130321_130673_130804_131646_131791_132304_132494_135024_135148_135725_135888_137530_137696_139002_139156_140352_140428_144853_144972_154113_154326_154867_154979_157694_157824_158647
891539	SIRV6	+	1303	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	391	116	175	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	149	640	1733	10736	TRUE	20	CGATGCGGTCTTCAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1478	11709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891540	contig_11512_pilon	+	2858	16	Intergenic	novelGene_43349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2292	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1817	2290	556850	580118	TRUE	40	CAAGGCAAACCGCAAGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGMYPMPCTKYLKASASLAGCKRKGHHCFACTLRRVVFVGSSLELHSTYSVHGRRIVPNHQQCRALQGDGVGARHGPLDLQVPPAVVGVDEQVQVGGVHVVHDVLAVGVDHLHVVMHFFLPEEVRHHHVRQGLGPPRDLGERPSPSSLLHKGSR	554958	622282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556152_556226_556866_561325_561394_567731_567802_570037_570086_571046_571107_573287_573391_576894_576961_580075_580156_581645_581706_582715_582776_586511_586637_592797_592903_608475_608515_609589_609669_622219
891541	contig_11574_pilon	-	2809	10	Intergenic	novelGene_64070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	507	junction_4	140.941104940072	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	240	2117	456525	449890	FALSE	15	GAAGGGCGCTGTAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	462876	449197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651
891542	contig_13453_pilon	+	4417	27	Intergenic	novelGene_146718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_8	191.204698389947	1344	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1242	3729	458	4186	132546	185512	FALSE	10	TCCATGTTTTGTCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQAFSFKTKDIEDAMTNTLLHGGDLHSALDWLCLNLSDDALPEGFSQEFEEQQPKSRPKFQSPQIQATISPPVQPKTRKQEEDSKIKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQNEEEKSENSKSLEEEEKFDPNERYLHLSAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKDAQEKIRKFQREMETLEDHPVFNPAIKILHQQNEKKKPLLATEGGSALNFNLFEKSAAATEEEKDKKKEPHDVRNFDYTARSWTGKSPKQFLIDWVRKNLPKSPNPSFEKVPVGRYWKCRVRVIKSEDDVLVACPTILTEDSMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKKEELSKMESNKPRDLFIARLLNKLKLQQQQQQQHSNSKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSVESANAEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQRLLKERQQLPVFKHRNSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWATSKCNIVCTQPRRISAVSLATRVCEELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRASESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEITINVTSKAGGIKKYQEYVPVQTGASADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLVYLDRSPQFKNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSTDRRFYSQRYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKFHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCSLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAVNLLRRIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLEPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNACLGWKKARQEGGYRSEMAYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSNSWEGNRASQTLSFKEIALLKAVLAAGLYDNLGKIIYTKSVDVTEKLACMVETAQGKAQVHPSSVNRELQTYGWLLYQEKVRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSVDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENNN	126441	185743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_129696_129771_131069_131184_132536_132667_136355_136502_139216_139346_141918_142046_145315_145475_147267_147434_147859_147984_149228_149838_151148_151293_154791_154969_155563_155705_156843_156989_157123_157242_159509_159595_161119_161209_163810_163940_164575_164652_166041_166267_167418_167556_167968_168063_173658_173962_175345_175478_182908_183006_185456
891544	contig_4982_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_172234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCGAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53380	51445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_51400_53400
891545	contig_4301_pilon	+	3936	7	Intergenic	novelGene_65093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	248	junction_4	80.2594750377383	1041	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	205	1611	459349	530958	FALSE	10	TATTTGGGACTGTGGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQPVTYQAYRECTLETAVHASGWNKILVPLVLLRQMLLELTRRGQESLSALLQFGVTYLEDHAAEYIIQQGGWGTVFNLESEEEEYPGIIAEDSNDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	449896	533283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450051_459298_459470_492399_492508_494596_494754_499139_499210_507918_508063_530151
891546	contig_8462_pilon	-	3076	1	Intergenic	novelGene_159430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	719	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2035	2397	238982	238620	NA	30	AACATTCTTCTGGTAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHIMVQLFGYCIFTKIGHLNFGGDREVRKTKDRKGGRYWVKKGELEGDRACTGARGLLCGSSVLCVFASLPLAIHGYKMCIVFYQKITHLIIFFLVQVTTVCLYHYECFQYSLECISWY	241016	237940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_237900_241000
891547	contig_7593_pilon	-	3605	2	Intergenic	novelGene_127353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	662	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1978	2328	653940	653590	TRUE	10	CCCTCAGGGAGGCCCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTWRPHWGAGSLLLGHHSMKIRHKIISTLDGFALFENGPTHSPGLPRETLNSKNLQQGCPGFKKAFACCCWGFCFDFAAQPYKYKRVREPLSGNTSLCLFELLPNIWDLFKHTIC	655917	650839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_651558_653030
891548	contig_11512_pilon	-	1293	9	Intergenic	novelGene_43336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1273.86512605338	20	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	32	580	592804	556769	TRUE	0	TGGCCTGTGTCTTTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNRFQRHLPGGCPQPLPH	592835	554957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555381_556478_556818_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
891549	SIRV6	+	1336	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	75	117	25	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	183	674	1733	10736	TRUE	20	CCGATGCGGTCTTCAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1162	11708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891550	contig_7378_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_120250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	53	162	136	297	413763	413924	NA	15	CCTCCTTGGACTTTAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEASDTSRGKSAFLSPEVPAALSSSEEPSASGGWVHRLGTTSWDTMEEIHLSISGFFRSRVLKTRYCPTIPATNTTSLLLPSEKLAECRGGGLWPLLG	413627	416082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_413600_416100
891551	contig_1301_pilon	-	1600	13	Intergenic	novelGene_47317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_3	432.190954131774	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1518	83	1600	322831	269175	FALSE	70	GAGAAAGAGGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEK	322913	269174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
891552	contig_3426_pilon	-	2770	14	Intergenic	novelGene_57940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282.029877975731	18	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	10	1167	443332	385096	TRUE	5	TTGATGGCTGGCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEEHLRKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPIPFPKEALAHEKFTQELKYVIQRFAEDPRQEVHSCLLSVRAGKDGWFQLYSPGGGSL	443341	366816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_367348_367383_368451_385090_385177_388422_388472_388767_388795_390086_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_443308
891553	contig_7051_pilon	+	3232	13	Intergenic	novelGene_64295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	202.74099171658	2	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	321	872	189176	206198	TRUE	25	TCACTTCTAGGTACCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184651	229453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184749_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199275_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143_207590_228484
891554	contig_13021_pilon	+	4160	4	Intergenic	novelGene_8260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACACAGTTAACTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224443	248540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_225101_225470_228783_236570_236675_248453
891555	contig_13004_pilon	-	1997	1	Intergenic	novelGene_112615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATACTGATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176930	174933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_174900_176900
891556	contig_4803_pilon	-	5385	31	Intergenic	novelGene_150706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_16	489.345340452141	17	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	537	1838	134971	41896	TRUE	25	TATTTTCATGTTTCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQPGQKPAASPRPRRAAASRPTEEHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSASSAATSKSSSMNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDESTSRHVYLIRSSLQTYEVGKRSNFILHVFSRCFFLFFLLSSGKSQRRKSKEVW	135507	12652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_42058_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_101681_101754_119613_119677_134896
891557	contig_3975_pilon	-	2827	7	Intergenic	novelGene_54817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	189.457705629046	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	97	810	2066301	2056837	FALSE	65	TCAGTAAAAAAAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079237	2054819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063917_2066258_2066307_2079146
891558	contig_14970_pilon	+	1922	9	Intergenic	novelGene_44964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	8265	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	133	1221	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
891559	contig_3469_pilon	+	3284	2	Intergenic	novelGene_34224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	212	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2719	3174	578406	578861	FALSE	55	AGATGCATACATCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKETIHHEDITIINIYTPNDRAKKYIKQTLTALNTPLSVKDRISRKKLNKDTEDLKGTIGELDLTDIYRMLHPKAAKYTVFSNTHGTFSRIDHILGHRATFNKIQNTEIIQTIFSDNTIKVDINNMKSREKKSITWKLNNTLLTNHWVIE	574936	578971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_575244_575994
891560	contig_14445_pilon	+	1778	8	Intergenic	novelGene_137372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	203.017944315978	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	5	547	331159	360205	TRUE	30	GTCTTAACCTTTCCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	331154	361570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095_360228_360361
891561	contig_11855_pilon	-	4033	1	Intergenic	novelGene_67051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3158	3463	1997689	1997384	NA	55	ACTAGCTTCCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLGSYKTQENSSHILTWRKRRGRRVRGRKHTLRAPRTAWSPWSGEPRSFSFPLRLSFVLCSCCFNLVIWQPREERGEAGKAKPKFTRSLLTSVAPAKSP	2000846	1996813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1996800_2000800
891562	contig_16110_pilon	+	3427	22	Intergenic	novelGene_126770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	225	junction_9	329.692875704419	21	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	934	2805	115	2919	6170	131269	FALSE	60	TGAAAAAGAAAAAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPTKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVESPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLCDISEGTVVPEDRCKSPTSAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISALHFCETFTRKADSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTILRLKGAILRMAFLDTTGCLVPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCVYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPLETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGELARARLALDERGQKLSDLEERTAAMLSSADSFSKHAHEMMLKYKDKKWYQF	6055	131777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_6193_7704_7769_9530_9615_14413_14538_32691_32771_53175_53331_54084_54158_55828_55977_56201_56270_56530_56572_57352_57574_58499_58679_68233_68360_70187_70340_75391_75458_100046_100098_105752_105993_109402_109773_110061_110228_118994_119107_128398_128620_131227
891563	contig_11316_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_122604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1706	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	705	1217	137674	138186	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136969	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138900
891564	contig_5928_pilon	-	1292	5	Intergenic	novelGene_40393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	240.633019346888	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	266	604	364792	359489	FALSE	10	TCTGCTTGTTTTTTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKRRHLETSFQQTDPCCTSDAQPHAFLLSGPASPGTSSATSSPLKKEQPLFTLRQVGMICERLLKEREEKVREEYEEILNTKLAEQYDAFVKFTHDQIMRRYGEQPASYVS	380547	358800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_359500_359761_359834_360903_361054_364686_364831_380320
891565	contig_7201_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_152510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTCACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243599	245419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_243600_245400
891566	contig_7057_pilon	-	747	7	Intergenic	novelGene_123237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	41.4504389468783	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	249	617	538082	537131	FALSE	40	AGGGAGCTAATAAAGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539281	537000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539195
891567	contig_15596_pilon	-	2085	2	Intergenic	novelGene_139544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	418	junction_1	0	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	879	1229	199828	197976	FALSE	35	TAGCCTGCATTCAGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVVRQTLSTEQSPAPKNVTSMINLKTVASSANPKTVNVASSEVLSSDPSSNKEKHTVHPTKKSKVLQGGNPEQNEVSRKNKKKKEKSKPKYEVLTVQEPPRIEVHLYYHSPCMM	200706	197119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_198135_199636
891568	contig_5023_pilon	+	2216	9	Intergenic	novelGene_7281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2367.1683208794	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	72	710	607279	643481	TRUE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHSARFH	580857	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616457_643456_643539_646857
891569	contig_14925_pilon	-	1678	5	Intergenic	novelGene_55303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	2578	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
891570	scaffold_13553_pilon	+	3306	1	Intergenic	novelGene_73756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1104	1409	50254	50559	NA	35	AGCTTAAAGACCCCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCEFAIPLKPRKAGRLEPRSARPRGMQCTQVVSAARCHRKCFALTRTDLSERLQTHFSGPVCVGMCVWAGGLSFGFPCSQPQENKKEPHRQMEEGAKRGR	49150	52456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_49200_52500
891571	contig_7272_pilon	-	4276	20	Intergenic	novelGene_25345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_14	666.630274168278	25	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	1886	3691	605006	593320	FALSE	30	AGTTGCTGAAGTGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633200	592734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_610094_610248_611629_611658_616565_617709_620502_620568_632105_632194_633027
891572	contig_11986_pilon	-	1962	10	Intergenic	novelGene_69194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1435.62035457468	851	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	288	1217	751619	734724	FALSE	5	GGTGTTTGTCTTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSL	755681	733978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734730_736207_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744202_751529_751692_753182_753293_755576
891573	contig_19032_pilon	+	2805	2	Intergenic	novelGene_172528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATACTGTTATTTTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147005	150425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_149036_149650
891574	contig_7426_pilon	+	1596	4	Intergenic	novelGene_27555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	577	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTCCCCCACCCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1158903	1185852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1160247_1163544_1163680_1165508_1165558_1185783
891575	contig_11512_pilon	-	2592	14	Intergenic	novelGene_43362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1149.32820614644	4	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	52	1008	592804	556654	TRUE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	592855	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556120_556227_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
891576	contig_10324_pilon	+	2249	8	Intergenic	novelGene_7801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_3	91.3124262281617	1	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	66	968	132046	134610	FALSE	25	ACAAGCCCTCGATACTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAEQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS	131617	135891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_131657_132019_132220_132653_132822_133237_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_134560
891577	contig_2550_pilon	-	4123	7	Intergenic	novelGene_135684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3671	4030	1537264	1520132	TRUE	25	TAACACCTCTTTTTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRLNGLTETGGTPESMPPGFSISPELKQFLRPTLQTEIGQAYKTTHVKNMLLSSIKYTRPNGQLLTKSKRRRHEGTGAGQMDTRNPGWKGGRCCHTAGIATDVTKQYVYTFFIEKLT	1740550	1488164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1488233_1520106_1520370_1537142_1538192_1555917_1556261_1566918_1567444_1608350_1608553_1738877
891578	contig_10241_pilon	+	3768	6	Intergenic	novelGene_142824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_5	29.2875400127768	862	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	221	784	92779	140032	FALSE	35	GATAGTAAGTTTCTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNVGCHFLVWGLIAFLGLALVISLIFNISHYVEKQRQDKVYGYSDDYIPRDDEYFLEDIPIYGNLDDVVSEPTDENCYEQMKARPERSVNKRQEVAPPAQAATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	92558	143016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_130963_131026_133187_133277_139774
891579	contig_6589_pilon	+	2045	17	Intergenic	novelGene_25718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.1370131344344	315	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	233	1681	460735	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451699	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_452179_452321_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
891580	contig_8377_pilon	+	4661	29	Intergenic	novelGene_34962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_28	2970.93732804024	7	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1114	3345	160	3504	68257	197939	TRUE	15	GTGGATTCTGCTTCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68097	199245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172947_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_198120_198268
891581	contig_10594_pilon	-	2587	2	Intergenic	novelGene_142313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1110	1523	256778	256365	TRUE	30	ATATATCTATCCATGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYQLRCFNKQMKHGKRTLIYAKKFGRQLPGQPTGKDSYLCPFQRKVTEQNVESIKQCHYDHMQVKLALRYFKNTLQQYIVKELPEIQAGFRRGAGTRDIIADVRRILAESRGYQKDVHLCFIDYAEAFNCVDHNKL	257887	237615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_-_237787_255471
891582	contig_14970_pilon	+	3414	1	Intergenic	novelGene_45019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1547	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAGAGCATATAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147725	151139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_147700_151100
891583	contig_18511_pilon	+	2078	11	Intergenic	novelGene_126864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	329.546491409027	91	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	251	2026	47371	61308	FALSE	40	GTGAATGAGCAACTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35388	61360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
891584	contig_7527_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_139575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGCTCACTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96092	98264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_96100_98300
891585	contig_11224_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_124458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	697	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAACAGTGTTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219434	217082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_217100_219400
891586	contig_9471_pilon	-	2963	12	Intergenic	novelGene_21856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	952.446749124252	170	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	83	1291	445281	434615	FALSE	20	CTTAGGTTTACAGGTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEGD	446566	432942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436448_437050_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
891587	contig_14563_pilon	-	2965	12	Intergenic	novelGene_135019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	527.934240207501	74	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	254	1846	59494	37931	FALSE	20	TCCCCAGCACAGTGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSLRCCINLSLWTLKKTAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVESDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGVVKGGEEAKLKKRKPRVKKENKAPRLKDEHGIEFSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSLRKDKDGDKERKKSKEKKEKPKGGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHIKLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVIGGKKPFRPEASGSSRDSLMSQPHTPHNLHSQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYSHPNKRHFSNADRGDWQRERKFSYGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDTHRSGSYRPNNLSRKRPYDQYSSDRDHRGHRDYYDRYAEGPKTPGADSARSLLFIRREGSNICINLCICQMYVEHPLRARHRP	66642	36811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_38323_43104_43319_46083_46184_48676_48856_53106_53242_55283_55425_56439_56569_57838_57962_59087_59213_59439_59573_65265_65406_66607
891588	contig_11720_pilon	+	1238	8	Intergenic	novelGene_43853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_7	1578.75961386379	16	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	60	956	78465	98482	FALSE	20	TACTTGAGAATTTGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	78405	98764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
891589	contig_15775_pilon	+	5495	10	Intergenic	novelGene_148367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	195.810439954211	785	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	15	821	172	5817	TRUE	75	TATAAAAAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPALTTMRTTTTSTSTIFTAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEAAGTSSEQVIQHLEGELCYANLTLHRTGTSPVSSQKKASAKSASSAQANKEEAEYVTMDPLPREEISYASLSLDTSNQEPFYSNMD	157	38483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1829_1945_2675_2789_4617_4641_4989_5140_5730_7524_15547_15716_20097_20225_26879_27248_36178
891590	contig_7914_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_165034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1498	1941	193177	193620	NA	45	GAAAAGCAAAGATGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTRLVFLKLKELKKKFKPRVAIVKDSMGKILNDAGSIKEDGKNTQSLYQKELVDIQLFQEVAYDQELMVLKEEVQAALKALVKNKALGIDGILIEMFQRTDALLEVLTLYAKKFGRQLPGQPTGRDPYLCLLPRK	191679	194432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_191700_194400
891592	contig_3449_pilon	+	2456	2	Intergenic	novelGene_73697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCGCTTGTTCTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287010	405902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_288976_405411
891593	contig_7707_pilon	+	2413	1	Intergenic	novelGene_72192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACGAGACTAAATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627047	629460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_627000_629500
891594	contig_4900_pilon	-	1524	4	Intergenic	novelGene_159070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	196.104280649069	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184682	1179997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181222_1181287_1181491_1181698_1181715_1184601
891595	contig_6576_pilon	+	3630	8	Intergenic	novelGene_42336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	445.354341840201	1267	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	147	1349	667094	708104	FALSE	25	CAATCATTGCTATGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKESASQTRDVLKQHFNDLKGTLEKLLDERLVTLLQEVDTIEQETIKPLDDCQKLIEHGVNTAEDLVREGEIAILGGVGEQNEKLWSFTKKASHIQLDSLPEVPLLVDVPCLSAQLDDSILNIVKDHIFNHGTVASRPPVQIEELIEKPGGIIVRWCKVDDDFTAQDYRLQFRKCTSNHFEDVYVGSETEFIVLHIDPNVDYQFRVCARGDGRQEWSPWSIPQIGHSTLVPHEWTAGFEGYSLSSRRNIALRNDSESLGVLYSSAPTYFCGQTLTFRVETVGQPDRRDSIGVCAEKQNGYDSLQRDQAVCISTNGAVFVNGKEMTNQLPAVTSGSTVTFDIEAVTLGTTNNNEGGNFKLRVTISSNNREVVFDWLLDQSCGSLYFGCSFFYPGWKVLVF	666947	710385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_667097_684676_684885_688932_689021_689512_689691_692096_692320_693449_693583_706165_706279_707847
891596	contig_4604_pilon	+	3249	18	Intergenic	novelGene_19145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	1056.03493244623	151	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	83	2386	358980	379856	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	350265	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_350348_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
891597	contig_2069_pilon	+	3207	5	Intergenic	novelGene_23314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	8.30662386291807	6	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	897	1220	523820	524143	TRUE	15	GGCAGTGAGTGGGCATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEDAPGCSPAVAGRGRQRAAVLPNRSPGAWPGQGFGLMALTKLPLPLLSRKGEASATFYHSALTLKGAVLAWLLEWTESTVERAGGRRRWGGALPVEGRIRSLAQ	522443	533824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_522768_523247_525373_532115_532268_533110_533174_533281
891598	contig_16594_pilon	+	1398	3	Intergenic	novelGene_53863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	26	472	135147	165559	TRUE	20	AGAGCCTTTCTCTTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKVNKRIACSEIELFTLLSGLLGKKERADASTHHGSCGSCSLCCCSLVDLVLGSLDLGLQMCGRMEVFALFSRASPFDVIHADSDCVVIGVNHGAVSRMSKPTIVLSSVAIATLVLSTYLRGCNGAPGIMALASCICWANMAMFFC	135121	273499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_135517_165482_165648_272661
891599	contig_11742_pilon	-	2239	1	Intergenic	novelGene_166548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	456	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1743	2066	139183	138860	NA	40	TTATGTTGGATACAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGQQKISKHLQKQDRTVTAGIQNKTPDDLPVEEKALDLAHREVKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFRKRQTNSWKIQTKKEFKKIIQEQNDKINSQLKNIQKN	140925	138686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_-_138700_140900
891600	contig_5023_pilon	+	2171	17	Intergenic	novelGene_7235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_16	1987.7684635902	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	86	1969	607279	646990	TRUE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580843	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647001_647400
891601	contig_10437_pilon	+	2037	11	Intergenic	novelGene_38201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	536.222192752221	1122	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	68	1210	229668	232651	FALSE	35	TAACAAGTGTCCGAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225705	233478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
891602	contig_4891_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_124525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTTTGACTATTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79056	80659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_79100_80700
891603	contig_16846_pilon	+	3980	6	Intergenic	novelGene_82907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	143.70052191972	845	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	322	1002	456424	477023	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAMPPPVTVQRMALNWKELDSSFLFSEASATGEASLLSEGLREALSSYIRLTDDISLDDAKAQSRGRKGNQGYSIQHPNSAQPD	456102	480001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_464527_464615_465206_465311_475327_475478_476253_476387_476830
891604	contig_10437_pilon	+	1510	7	Intergenic	novelGene_38324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1844	junction_1	603.239426393497	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	26	979	432132	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	432106	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
891605	contig_6654_pilon	+	2191	3	Intergenic	novelGene_85721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGACCCAGAAAATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296012	306847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_296450_302701_303292_305683
891606	contig_8681_pilon	-	3597	11	Intergenic	novelGene_157209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_10	82.5823225636092	520	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	1394	2605	251502	224468	FALSE	85	CAAAAAAAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKVTLQIPASSLDANRKRDSVLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRELYQEWKECEEDSPVIRSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRISGEIGERIAGGDDAADISFDKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYNFWDQQEPVIVAPEVDTSSSPVSKEPQCMVVFDHSNEFSVNITEDFTEHLSEGALAIEVYGHKMTDPRKNPALWDLGIIQAKTRSLRDRWSEVTRKVEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRIQVEVKSVQESGTLPLMEECILSVGVGCIKVRPFRSPKTHETFHEEEEDMDSYQVI	256561	223475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_224507_225106_225254_229705_229839_230866_231025_232264_232436_242855_242985_243301_243452_247899_248047_251364_252615_254117_254309_256471
891607	contig_15974_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_164817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTGCACTTGTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171641	173837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_171600_173800
891608	contig_1443_pilon	+	7441	8	Intergenic	novelGene_28157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	5547	6041	512189	512683	TRUE	35	CCAACTTGACCTCATAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVLVQNKIPDDLPVEEKALELTDREFKSLILRIIQKLKQKADKNEEKIEKFMEKADKFTENADKKMEEFRKIMHEQNSKINAQLEIIQKQQLETRKINKISEMDSVIKGLRGRFEMVEDRISRIEDKYLDTTLFEENSEKKNKGK	294850	514260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_294951_314028_318344_318434_318864_442226_442459_507350_507731_512098_512832_512957_513371_513421
891609	contig_11413_pilon	+	3551	8	Intergenic	novelGene_103184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	29.3938769133981	1695	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCCAGCATCCAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492440	742764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_492472_518747_518965_537492_537619_685869_686378_706543_706628_707507_707699_739222_740709_741856
891610	contig_18108_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_33449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCACCCTCTCACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80504	83173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_80500_83200
891611	contig_10861_pilon	+	2380	8	Intergenic	novelGene_39304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	152.995531480698	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	11	616	1437804	1443110	TRUE	45	CATCAAAAAGCATGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRCVSEDGYSVISFRVAIRYSIPSLLFCVF	1437793	1455004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443664_1445545_1445682_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
891612	contig_7963_pilon	-	2850	4	Intergenic	novelGene_58291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2245	junction_2	415.315408923012	190	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1747	2169	40241	38897	TRUE	35	TACCATGATAAATAGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVQPKVNISPSKRGPLQHHNLLVCHVTDFYPGSIQIRWFRNGHEETAGIVSTDLVHNGDWTFQILVMLEMTPQQGDVYTCHVEHPSLDSPVTVEWKAESDSAKNKMLTGVGGFVLGFITLGVGIFMHKRSKKVQQGSR	41987	37885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949
891613	contig_12464_pilon	-	3015	6	Intergenic	novelGene_68679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_5	545.105494377006	477	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	171	1358	242417	182052	FALSE	10	TTGGTTGAACCCTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENVSKILVHYSDA	242587	180394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_234642_234945_242051
891614	contig_9548_pilon	-	1514	2	Intergenic	novelGene_141044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTCAGGTGAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104052	29783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_31278_104032
891615	contig_2069_pilon	-	2229	3	Intergenic	novelGene_23170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTGTGACTGGAGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100598	24086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_24598_34686_34813_99006
891616	contig_10042_pilon	+	2478	1	Intergenic	novelGene_79177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	164	520	787282	787638	NA	40	AGAGACTAACTTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIPWAARRMNKSVLEEAQPECSLETRMARLCLTYFGHVIWRYQSLEKDITLDKAEGQQKRGRPLMRWTDTEAATMDSSITMIVRMARTGQCFILLYIGSLRVGMDSRAPNSSNIYL	787118	789596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_787100_789600
891617	contig_20641_pilon	+	2075	7	Intergenic	novelGene_52837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1323.86891974495	1428	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	59	955	14599	56057	FALSE	25	AGATCTCTGTGAAAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQDK	14540	57177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56049
891618	contig_13707_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_43545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272427	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_269700_272400
891619	contig_11816_pilon	-	1846	7	Intergenic	novelGene_98571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	290.465718000134	17	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	486	1673	1312104	1280129	FALSE	60	GTGAAAAAAATTAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEIKKENGEVKILLKGGKEKPKTNIEDLQIKKVKKKKKKKHKENEKRKHPKMYSKSIQTICSGLLSDVEDQEAKGILNDNIKDYIGKSLDTKTYDSKIPENSEFPFVSLKEPRVQNNLKRLDTLEFKHLIHIEHQPNGGASVIHAYSNELSHLSPVEMARFAEEFVGLVFSENENSAAFYVMGIVHGAATYLPDFLDYFSFNFPNSPVKMEILGKKDIETTTMSNFHAQVKRTYSHGTYRAGPMRQISLVGAVDEEVGDYFPEFLDMLEDSPFLKCTLPWGTLSSLKLESRKDSDDGPIMWVRPGEQMIPVADMPKSPFKRKRTTNEIKNLQYLPRTSEPREMLFEDRTRAHADHIGQGFERQTTAAVGVLKAVHCGEWYILTTFVLMKDFLGF	1347406	1279955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1280346_1284821_1284965_1286533_1286672_1302512_1303154_1312055_1312173_1346792_1346849_1347045
891620	contig_5686_pilon	-	3193	2	Intergenic	novelGene_45423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	213	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGGTCTTTTAAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190230	186661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_188161_188536
891621	contig_11316_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_122668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139375	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
891622	contig_5033_pilon	-	2780	5	Intergenic	novelGene_28955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_4	875.052105591433	33	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	82	789	477189	453092	FALSE	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDK	477270	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
891623	contig_7553_pilon	+	5119	3	Intergenic	novelGene_177678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1247	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	4305	4727	150096	150518	FALSE	70	TAAAAAGTGTAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFVLAFCSCIIFLNSSIFLSAFSMNLLFFSSFLSAFCFNSWVILNIRDLNSLSVRSSAFSSSGRSSGVLFWMPTGTVWSCFCKCFDIVCCLRGIQWLFSSFIDSRFVCFVLLFCFIWLCLSRKVKHSLLFAHLWA	64260	150910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7553_pilon_+_64526_139459_140698_147294
891624	contig_11318_pilon	+	3907	19	Intergenic	novelGene_48125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	33	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2075	2461	14788	17573	TRUE	25	GGGCTTCAAGTTATGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNNNTTGRLIPRSVGGCIATGRGNRWGRADGSQSRFETGLLLRFFFLFNGFFSFFFFFLLFFFLFLGFWFLLYLWLPAPLSLLFHPLELCIWVWVSFCQEALPNFLQLFLLSLPITLICFHFLFPIT	7876	58182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_9456_12148_12196_13449_13555_14072_14353_14724_15046_17444_17595_18879_18959_21088_21173_21294_21516_27451_27570_32282_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42743_44533_44578_49718_49848_52073_52140_58141
891625	contig_10134_pilon	-	2771	3	Intergenic	novelGene_16195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	500	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39628	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33627_34922_35178_38558
891626	contig_8014_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_178142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	804	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCCAGCACATCTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111380	113413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8014_pilon_+_111400_113400
891627	contig_8330_pilon	-	3617	10	Intergenic	novelGene_71970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_9	304.323293007069	39	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	153	1196	2066429	2038853	TRUE	25	TTTTTTAAGAAGTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLTHPEVSYSTGPTQSTNNPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2116610	2033558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2035974_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2057892_2058041_2066340_2066434_2116462
891628	contig_7748_pilon	+	4079	15	Intergenic	novelGene_101045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	799	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGCTTAAAATGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149468	190997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154899_157062_157222_157502_157842_157918_158028_161605_161748_163126_163329_163412_163650_163771_164037_164222_164450_164880_164938_190830
891629	contig_5423_pilon	+	2914	2	Intergenic	novelGene_85310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGTGAGATTGCGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756402	760600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_758668_759951
891630	SIRV6	+	1000	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	517	11	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891633	contig_6227_pilon	-	3858	2	Intergenic	novelGene_49778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	699	1016	1237909	1237069	FALSE	35	TTTTTCATGAATTTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQDNKTKTWPPKAPWQHSSPLPSTLPSPSTPLYAVASPSSQWNDTMQMLQSPVWAATSDCSAASFTYVQTPPQPPPPPAHKAAPKGFKAFPGKAERRPAYLPQY	1238607	1234226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1237378_1237900
891634	contig_6496_pilon	-	4680	2	Intergenic	novelGene_103536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	0	977	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	40	1158	1144299	1137092	FALSE	80	AAAAAAGAAAAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGPAALAGAERAMRALRTIVDMSYARHFLDFQGSAIPRAMQKLVVTRLSPNFREAVTLRQDCSVPLPGDGDLLVRNRFVGVNASDINYSAGRYDPSVKVPFDAGFEGVGEVVALGLSASARYTVGQAVAYVARGSFAEYTVVPANIATPVPSVKPEYLALLVSGTTAYLSLEELGELSEGKKVLVTAAAGGTGQFAVQLSKRAKCHVIGTCSSDEKSAFLKSLGCDRPINYKTENVRAVLKREYPKGVDVVYESVGGALFDLAVDALATKGRLILIGFISGYQTPTGLSPVEVGTLPAKLLRKSASIQGFFLNHYLSKYQAAMDHLLKMCESGELVCEVDLGALSPGGKFTGLESVFRAIDYMYMGKNTGKLVVELPHAVNSKL	1144338	1133569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1138017_1144105
891635	contig_9112_pilon	+	1542	4	Intergenic	novelGene_60216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	194.18605053459	1	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	215	1066	108641	114303	FALSE	90	AAAAACAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108426	114779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251
891636	contig_1735_pilon	+	3608	6	Intergenic	novelGene_106877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	16	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	591	935	55980	95688	TRUE	40	GAAAAGAACCTCTCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRCSDPFTLNVLYGWDTPSDWHYPLGANLTLSRNATSNPPAQYSWPINVNYLQSAQVLFIPNVTVSDSGNYICHVHSNVTGLNGNTVKIVTVSGKWLPGTSAPSSGGTPTVK	52823	116910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_53176_55741_56023_91477_91759_95667_95850_114113_114252_114536
891637	contig_11017_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_128064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108419	110161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_108400_110200
891639	contig_15371_pilon	+	3081	7	Intergenic	novelGene_151476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	398.578202280724	2	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	1675	2814	220726	230717	FALSE	15	CAGGTGGAGGGTCATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAEVGGAKVVPCIASHSMIGEGEKYPGKCMVLRVCVSPQRPSPDVKAELFELLFQTLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	219051	230984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_220877_222001_222117_222289_222543_225512_225702_226862_226962_227140_227372_230615
891640	contig_6445_pilon	-	2850	2	Intergenic	novelGene_77060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	28	345	672075	670187	FALSE	20	TTCAGTCAGGCTGTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLINHASVGMQSQRGVPDPPHLSASWLRFRLPNQSYCLTDEYATVGLRFQVLHSRADQSLFARVLSRPVETSRPSGFSWEGSPRGSGSCTPPLGIYNTKRKRKKNFLLERKAAS	672102	667681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_670395_671965
891641	contig_6881_pilon	-	1854	5	Intergenic	novelGene_164832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_4	161.994598675388	652	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	75	1613	105536	66513	FALSE	25	ACGGGCCAGATTCTCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KALGSPLARGTASVWELGAEKKGRMMLSEQAQKWFPTHVQVTVLQAKDLKPKGKSGTNDTYTIIQLGKEKYSTSVAEKTLEPVWKEEASFELPGLLMQGNPEKYILFLIVMHRSLVGLDKFLGQVAINLSDIFEDKQRRKTEWFRLESKQGKRAKNRGEIKVNIQFMRNNMTASMFDLSMKDKTRSPFAKLKDKMKGRKNDGTFSDTSSAIIPSTHMPDANTEFPSGEIQMKSKPKKPFLLGPQRLSSAHSMSDLTGSHISSEKLKSGTIGQTHLLGRQIDSFGAVPESGSLKSPHRRTLSFDTSKTNQHDNSVDEGESSFGRQNDQLTNVTASLPQKFATLPRKKNPFEESSESWDSSVNLFSKSIEVRKENKREKREKVSLFERVTGKKDSRRSDKLNNGGSDSPCDLKSPNAFSENRQDYFDYESTNPFTAKFRASNIMPSSSFHMNPTSNEDLRKILDSNPFDATAGYRSLTYEEVLQELVKHKELLRRKDSHIRELEDYIDNLLVRVMEETPSILRVPYEPSRKAGKFSNS	105610	66271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_66741_72598_72645_96351_96821_97501_97945_105183
891642	contig_8269_pilon	+	1606	2	Intergenic	novelGene_106258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCTTTAAAACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380233	382122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_381742_382024
891643	contig_610_pilon	-	3255	2	Intergenic	novelGene_76762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1421	2470	229060	228011	TRUE	35	CATGTGTAGTAACTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	230480	222888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_223611_227947
891644	contig_11396_pilon	-	4447	2	Intergenic	novelGene_71336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	493	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAATTCACCATGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594509	485174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_489380_594267
891645	contig_5623_pilon	-	2980	1	Intergenic	novelGene_154836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	1259	1789	208662	208132	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLQGKGRCSGEVAGQPGVGSGYKDQSHSLFLHRCRFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKVNQDHHSRQDTRCSQTSQGFAPRDASQEGLSVVDPMGHSYLMHPSSPPTGQQPKQDSCCLALVLGLLQTCSWPRSTHLPSSGHRLFIQRMRGWIR	209920	206940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_206900_209900
891646	contig_6842_pilon	-	3341	10	Intergenic	novelGene_130680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2365	2760	373297	363465	TRUE	50	GAGAAAAAAGGCAGACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELEFIVLSSSCIMTSSELLSSMTSCMLFTLLLWLLVLTDMLGMEWLLPRLSISLLRLVPCSLSSSSSCDSFKGPFRVSWKRIFFIFRYCRLSSSRTASFVLCIRSIRTRSGRSRRTKSCRNSSADVGLS	400141	345998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_346345_347567_347659_362300_362395_363414_363498_371854_372024_373103_373309_383701_383838_392826_393063_394640_394770_398289
891647	contig_11896_pilon	-	4914	2	Intergenic	novelGene_88043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1319	junction_1	0	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGCATATGGTACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181637	175963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_180805_181564
891648	contig_15034_pilon	+	5174	19	Intergenic	novelGene_143631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	210	junction_11	112.422099229029	1142	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	181	1992	26345	70986	FALSE	30	AATGTCATTAGTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQLQAYVAWVNAQLKKRPAVKPVQDLRQDLRDGVILTYLIEIVAGEKLSGVQLSPSNQQEMKNNVEKVLQFVASKKIRMHQTSAKDIVEGNLKSIMRLVLALAAHFKPGSSRMVSQGRDSSTPLQSHQPHCATAVAQGAAAALADVCHDMSRSGRDVFRYRQRNGSVDEEIENPYWSVRALVQQYEGQQRSPSESSCSSLTSPSPIHSAKSESIITQSEEKVDFVIIPSEGIENRTEEIDSPVFRDWRPGSPGTYLETSWEEQLLEQQEHLEKEMEEAKKMISGLQALLLNGSLPEDEQERPLALCEPGVKPEEQLIIIQSRLDQSMEENQDLKKELLKYKQEARNLQGIKDALQQRLAQQDTSVLQLKQELLRANMDKDELHNQNVDLQRKLDERNRILGEYKKELGQKDRLLQQHQAKLEEALRKLSEASYQQVDLERELEHKDVLLAHCMRREADEGTNYNSHNSQSNGFLLPTAGKGAASITHRGTSDLQLVRDALRSLRNSFSGHDPQHHTIDSLEQGISSLMERLHTMETQKKQERRVRGRSPRTQAGGEYPESRPPNSKLPHSQSSPAISSSCTKVLYFTDRSLTPFMVNIPKRLGEVTLKDFKAVIDREGNHRYHFKALDPEFGTVKEEVFHDDDAIPGWEGKIVAWVEDDHGEN	22580	74168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_22711_26294_26421_28678_28911_29872_29981_40329_40443_42130_42280_46231_46322_47600_47655_48789_48841_51084_51190_51620_51675_52161_52255_52325_52398_53266_53357_53707_53870_54595_54663_68457_68564_69650_69760_70905
891649	contig_3942_pilon	+	401	4	Intergenic	novelGene_128784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	200	307	795165	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793600	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
891650	contig_10345_pilon	+	2938	12	Intergenic	novelGene_158358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	661.709119385313	44	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	71	700	11670	17248	TRUE	30	TACCCGAGAATGATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARVSLLK	4368	24390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
891651	contig_8452_pilon	-	4795	3	Intergenic	novelGene_47995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2901	3284	179772	179389	FALSE	60	ATACAATTTAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQKPKCKPKTIKIIEGKIGSTLEALKHGINMIQSITNNTQMPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVTREPTDWEKKIGYDKSDKVLISKIYKKIQHLYYQKKNNSIKKMGKGYEQTRHKRRHSSS	270985	177877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_180467_212921_214093_269950
891652	contig_9112_pilon	+	1588	4	Intergenic	novelGene_60205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	535.995232151265	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	272	1000	108641	113691	TRUE	90	AAACAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQEKSLTDAHGKDASGVLQEVMS	108369	114781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112115_113625_113750_114251
891653	contig_5794_pilon	-	2898	11	Intergenic	novelGene_69780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	4587.37487131802	20	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	37	1170	749501	743712	TRUE	20	AGGGAATTTGGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749537	739201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740913_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747454_749429
891654	contig_15135_pilon	-	3506	12	Intergenic	novelGene_119855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	582	junction_1	173.565335305857	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	1535	3211	51924	25230	FALSE	35	AAGTGAATGTTTTTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQALSFPKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNTNRFVFETPFTLSGKKHGGVEEQCKRRTVLTTSHFFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQLEYQEELRSHYKDMLSELSAVMNEQITYRDDPSKRAVERTCPRVISKATPTLPAVSVSSSAEVLSPQHLTHL	53458	24934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_25374_28489_28629_28803_28905_31519_31711_34145_34357_36726_36874_44525_44640_44777_44901_46298_46406_49385_49485_49803_49862_51681
891655	contig_11986_pilon	-	2604	9	Intergenic	novelGene_69153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	763.027266468899	28	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	105	908	523776	517596	TRUE	15	CTTGCGTGTGTTAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNPRDAGLKQAPALRNEKAPVDFGYVGIDSILEQMRRKAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSQISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIEEKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHAYVQVLQWAALGPRPAGQQGCPMVCLPAPVVCSLCCPPAPMVCPPAPMVCPPCLHSLPTLSPQSVHSVPSTCPHCPHNLSTLSPVCPPCTLSLPTLSP	544184	507201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_518029_518494_518577_519051_519181_523616_523809_544112
891656	contig_15664_pilon	+	4127	2	Intergenic	novelGene_171510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAAATATGTCCTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129770	134045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_130260_130407
891657	contig_6871_pilon	+	2253	3	Intergenic	novelGene_21545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	833	junction_1	150	409	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	79	1215	121971	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940
891658	contig_13366_pilon	-	2198	16	Intergenic	novelGene_99765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	286.703672030122	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1620	578	2197	155540	29838	FALSE	20	GTAAGGAAGGTTTGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVITGDEVQILSNLVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAVCIEKVKLRVLKQYDYDSSTNRKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIQVENVYEEILYQTLLDETLK	176764	29836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_29949_35679_35788_38158_38270_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49267_56149_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113726_116845_116977_155530_155739_167244_167330_170541_170690_176618
891659	contig_10176_pilon	-	1590	9	Intergenic	novelGene_72726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	248.219377517147	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	406	1161	268640	261068	FALSE	35	TGGAGGCAATTTTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_271984_274871
891660	contig_10642_pilon	+	2485	1	Intergenic	novelGene_78737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275135	1277620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1275100_1277600
891661	contig_14959_pilon	-	1299	3	Intergenic	novelGene_166729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	245	797	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	41	421	72129	71749	TRUE	10	GTCAGGGTGGCTCTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK	72169	65649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_65786_66140_66880_71745
891662	contig_14687_pilon	+	4376	2	Intergenic	novelGene_107941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAGAACCCAGTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519746	528052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_523544_527473
891663	contig_8954_pilon	+	3910	1	Intergenic	novelGene_130275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2672	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	1595	2194	114717	115316	NA	70	AAAAAAACAAATCAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLPKQNRMVPVGIQNKTPDDFPIEEKVLKVPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMESTVKIMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLQIQKINKVSEMDCHRRAEEFEMVEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEWGENKTQRRSLKNC	113122	117032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_113100_117000
891664	contig_9609_pilon	+	3534	24	Intergenic	novelGene_22982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_23	228.922189007614	1376	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	2202	3020	328876	332820	FALSE	10	TACTGTGTCTCTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309939	333334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310032_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
891665	contig_2043_pilon	-	2570	10	Intergenic	novelGene_169907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	199.818683242683	130	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	10	2022	719639	682042	FALSE	20	CTTTCTCTTGATGCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCDFLRDVEPSKMPPPERFLHAEAMHHSKMAESLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTSTPQGVPPSSQLKSQGNSSVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQVPSQTVQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDLLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDVRMLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPGGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY	719648	681493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_682893_683464_683738_687031_687238_688769_688818_693329_693462_694008_694126_704762_704841_704936_705039_718409_718467_719490
891666	contig_10437_pilon	+	3659	5	Intergenic	novelGene_38328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1927	junction_1	696.273114517572	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	2397	3128	441733	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	439336	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
891668	contig_11987_pilon	-	2441	11	Intergenic	novelGene_168952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_8	19.5102537143934	630	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	250	1182	209422	175755	FALSE	20	TTATCTGTCTCTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAESSTEPAECAQSSRRKNLTNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDHQFRSMKTLYERKIAELKTKLDASERFLSKLEKERHRCQRESDRQRDLTRDQLQREQKEKESLNEELHELKKENKLLKEKNVLASKKKERYECEIKRLNKALQDALQIECSSFSEDYLGKSEMRCSHEEMRTQMEVLKHQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINQTSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMNFPICNCGLVFHPRDPWVPAGSGAVQDLRTHLPDYQWYAPDQFPPDVQHKANDFSSENKVNQ	209671	174495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_175787_180782_180844_184532_184632_186247_186299_189978_190105_194119_194240_199353_199483_202659_202792_204286_204353_206053_206135_209386
891669	contig_9538_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_176457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCATACCCGGCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29731	28820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28800_29700
891670	contig_5316_pilon	+	2481	10	Intergenic	novelGene_61199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	66	junction_1	304.04401890532	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	493	1890	453918	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	394503	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_394857_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
891671	contig_17769_pilon	+	1517	2	Intergenic	novelGene_124246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGACTTCAACCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25055	27198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_26463_27088
891672	contig_7057_pilon	-	928	8	Intergenic	novelGene_123226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	39.0190952729349	74	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	402	770	538082	537131	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPWELPSVILGGRRGPRTPSALRGFCARAKRPGAAANYTSQRSYATEVTVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539885	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539509_539734
891673	contig_755_pilon	+	4897	17	Intergenic	novelGene_119779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_3	133.460902514557	235	106	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	1654	3147	556655	581811	FALSE	30	ATAAACGTGTTGTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDFLTDEKFQEGITHYIRKFSYRNAKNDDLWGSLSNSCLEGDFISGGFCYSNSKMTSNTLSFLQKNVEINEMMNTWTLQKGIPLVVVKQEGRSLRLHQELFLKGVFREDPEWGTLQERYLWQIPLTYSTSSSNMIHRHVLKSKRDTLELPEKTSWLKFNVDSNGYYIVHYEGHGWDHLITQLNQNHTLLRPKDRVGLIHDAFQLVSAGRLTLDKALDLTRYLQHETSSPALLKGLGHLELLYHMMDGRNISDVTENLKHYILRYFKAMIDKQSWSDEGSIFDRLLRSALLKLACDLNHPPCTQKAAELFSRWMESSGKLNIPADVLKIVYSVGAQTTGGWNYLLEQYGLSMSGAEKNKILYALSTSKHQENLVKLIKLGMEGKVIKTQDFAPLLHAIARNPKGQHLAWNFVRENWTHLLKKFDLGSFAMRVIISGTTSHFSSKDELQEVKLFFQSLKAQGSHLDIFQIVLETITNNIKWLEKNLNTLKTWLLVNV	527488	583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_528122_542025_542165_546317_546453_547672_547794_552092_552248_555200_555315_556298_556769_561629_561699_562743_562920_565805_565886_568431_568616_572607_572765_573243_573429_576498_576661_577371_577513_580844_580927_581667
891674	contig_11525_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_171083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGACTTTCAAAGAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62095	60504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_60500_62100
891675	contig_2114_pilon	+	3272	5	Intergenic	novelGene_104239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	353.097985692357	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	105	668	153620	161106	TRUE	20	TATGTAGCTATGACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANWTAFLFQAHEASHHQQQAAQNSLLPLLSSAVEPPDQKPLLPIPITQKPQAAPETLKDAIGIKKEKPKTSFVCTYCSKAFRDSYHLRRHESCHTGIKLVSQRKKTPTTVVPLISTIAGDSSRTSLVSTIAGILSTVTTSSSGTNPSSSASTTAMPVTPLPPKTDCGHTWCATKARYRVISVGNF	153515	167939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_153653_158388_158836_161022_161194_162413_162555_165563
891676	contig_14209_pilon	-	2266	7	Intergenic	novelGene_88355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	493	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	332	700	38017	37176	TRUE	20	TGGGGGGATACAGGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCNGREAPRGLRLLLLSEVIIQQGPEIVTAAAEERLVAEEAAISHTEADVRAAVEAIGVGEGKLPQIATELGGAGRSQPAVPGPLAGGSQLGAARWSGPSHKCQVWRPQTRTPSHIWPQGH	41013	35502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_35661_35767_37217_37299_37421_37712_37810_37907_38073_40136_40328_40928
891677	contig_11335_pilon	-	4072	7	Intergenic	novelGene_104929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	125	junction_1	73.1947554283927	122	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	147	788	459255	420494	FALSE	50	TAAAAATTTAAGTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLIGLGLGDAKDITVKGLEVVKRCSRVYLEAYTSILTVGKEALEEFYGRKLIVADREEVEQKADNILEDADLSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVLRAAKRGIPYRVIHNASIMNAVGCCGLQLYKFGETVSIVFWTDTWRPESFFDRVKKNRQNGMHTLCLLDIKVKEQSLENLIKGRKIYEPPQYMSVNQAAQQLLEIVQNQRMRGEEPGT	459636	417209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_420606_422034_422075_427382_427504_442122_442232_451414_451540_459120_459279_459513
891678	contig_5590_pilon	-	1461	9	Intergenic	novelGene_163027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATGGGCGTCTGGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369176	351701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_351833_352338_352702_353454_353584_358863_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_368968_369022_369114
891679	contig_12951_pilon	+	1559	8	Intergenic	novelGene_68196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	332.317711271142	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	144	920	755258	833570	TRUE	35	CTTTATAAAAAGCAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLVRSPSESWSHTMENARNSSETTSG	755114	836488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832464_833502_833656_835934
891680	contig_19816_pilon	-	1541	8	Intergenic	novelGene_156492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	153.731677189279	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	30	1115	126795	123459	FALSE	15	CAGAATCCTGTGTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTRNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126824	123032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
891681	contig_5686_pilon	-	3079	6	Intergenic	novelGene_45443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	652	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAGAAGGTCTCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389720	214691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_215473_219531_220788_301715_301743_329442_329992_389118_389335_389470
891682	contig_7629_pilon	-	1212	10	Intergenic	novelGene_153593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_9	132.637164037651	311	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	200	1210	413751	378702	FALSE	60	GAAAAAAATAGATCAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIGKLIITLGKKQKRKNESSDEISDTEQMPQHALKDEDSQKRRSNRQIKRKKYVEEAEGKQCEEAVKGSMKIKKNSAPLPGEQPLQLFVENPSEEDAAIVDKILSSRIVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFSDMEEEPFNPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQASRPDTRRLDRPPSNI	414728	378699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_378723_387034_387173_387397_387485_390432_390551_391605_391662_391743_391813_392732_392880_396940_397053_413488_413821_414598
891683	contig_4486_pilon	-	6366	6	Intergenic	novelGene_38619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	182	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	199	363	591356	591192	TRUE	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFIYSFSFCFSSFLGFLSLDFNSKLPQHFFFLLLFLTPLSLPIHTQPSSTYHNLPLHLPPTSLHRMLNTALLSSTGMTYGNLPCTDYQFTLLAPVCDTNKPFQPLSFSWTCPAVPYLSN	591554	414531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_417313_431289_431985_516427_516931_584806_585951_589675_590461_591096
891684	contig_3223_pilon	+	2686	5	Intergenic	novelGene_151824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2268	2591	350424	350747	FALSE	45	GAAAATCACCAAGGCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEILQKQQLEIQKINKILEMDSVTEGLRSRFEMVEDRISGIEHRHLDTHLFEEISQKRTKKIEETLRVMRDIIKSKNFQVIGVPERGENRKHREDH	62159	350842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_+_62354_181034_181197_339584_339606_347969_348425_348988
891685	contig_12837_pilon	-	2933	2	Intergenic	novelGene_57276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_1	0	153	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	43	495	60580	50880	FALSE	10	GGCTTGTTTGTATCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGSGEERTLLVRMVLESVARIVKVQLPAYLKRLPVPESITGFARLTVSEWLRLLPFLGVLALLGYLAVRPFLPKKKQQKDSLINLKIQKENPKVVNEINIEDLCLTKAAYCRCWRSKTVRCLFTHTIEFCGVRIVLLPKFPILRFCKMRDLFIVFSIESLYS	60622	48441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_51230_60477
891686	contig_18487_pilon	+	3171	10	Intergenic	novelGene_172676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.9468374574279	397	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	415	1122	217276	236771	FALSE	20	GGTTTTTTGTTTTAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESELFGRTIRVNLAKPMRIKEGSSRPVWSDDDWLKKFSGKTLEESKEEEGSEPPKAETQEGEPTAKKARLNPQVYMDIKIGNKPAGRIQMLLRSDVVPMTAENFRCLCTHEKGFGFKGSSFHRIIPQFMCQGGDFTNHNGTGGKSIYGKKFDDENFILKHTGPGLLSMANSGPNTNGSQFFLTCDKTDWLDGKHVVFGEVTEGLDVLRQIEAQGSKDGKPKQKVIIADCGEYV	213077	238820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_213325_214325_214425_216739_216784_217251_217279_220713_220796_221282_221384_223712_223837_231245_231432_236308_236452_236702
891687	contig_3727_pilon	+	1313	6	Intergenic	novelGene_146738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	30	TAAAACCTGGACTGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	308293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
891688	contig_17976_pilon	+	3486	5	Intergenic	novelGene_32525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1283.883951142	27	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	126	611	41843	48401	TRUE	15	AGTCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQECKMVQLLWKTAWQFFKKLKIGLPYDPAIPLLGIYPKDLKAETPTET	41717	51395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46710_48256_51163_51281
891689	contig_14333_pilon	-	3263	2	Intergenic	novelGene_49132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2739	3068	422959	422480	FALSE	35	AAAAGCCAGCAGGATGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTTITLNTDKPILHTLQNIPFSPLMWSPGESTLVDSPLVPRGPPSSPDPQALTSPSEQIVVTLSLPPPHLLISAGLVTIPSYFTVKLQPINRNRIKPDDWPKIWDLA	425697	422284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_422765_422914
891690	contig_4496_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_66706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	519	1560	299	1858	996604	998163	NA	80	TAAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	996305	998434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_996300_998400
891691	contig_11293_pilon	+	1869	7	Intergenic	novelGene_134662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47.1793269228047	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1278	591	1868	12784	30484	FALSE	75	AAAACAGAAAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKANREMKRLYVGGLSQAISQADLQNQFSRFGDVSDVEIITRKDEQGNPQKIFAYVNIRVSEADLKKCMSVLNKTKWKGGTLQIEQAKESFLHRLAQEREEAKTKKENSRPGNTDLLKKMEVVDLHMKAVPGTEVPGHKNWVVSKFGRVLPVLHLKSQHKRNVIKYDPSKYCHNLKKIGDNSTNTIPVTNLTWKLEGGRDPMSKKRRGELSDFHSPPKKRVKVQCDAGATGPLAVHPRHSSVMDSPLLIQQQAAQNTPHDSISLSKLRCVPNSDCQKPKNVPFQTHGLEIGRNKNSMSDDDIDSEDELRAMITREENLQRTTWSSIKELENDPFVVVRDDFKSDVHKLYSLTSLGIKNNVSCQVKNDYVTGNDCEYDSGDTDEIIAMKKNSKVKNSTEFLNREKSICQKTLKDKKGCEFSDDSIKV	11665	30485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_12231_12758_12923_13492_13556_14525_14605_25959_26096_26788_26853_29687
891692	contig_15114_pilon	-	8756	11	Intergenic	novelGene_121086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	606.375758090641	2029	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	3377	4855	46974	35002	TRUE	40	CAAAAATTAATGGTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNWIELPGCQYITGTTCDFSSVKLSVFEKIQLRIRAEKGNRTSPWHEVGSFIPFRKAQIGPPKVHLKAEDKAIIVNISPPGTKDSLMWAMDILSFTYSVVIWKNSSSVDERTETVYPGGKIYKLSPETTYCLKVKARLRLHRKVGSYSPVYCVNTTVENKLPSPENIEVDVKDQSYVLKWDYTYENMTFQAQWLRAYFKKILGNHSDKWQQIPGCENVRATQCVFPQKVFSKGAYFLRVQASDGNKTSFWSEEKRLDTEMQTVILPPVISMKSVDNSLHIYIGAPRETENKSTSQHYPLIYEIIFWENTSNAERKILQKKTDFIVPNLQPLTVYCVKARAVIEDEKWNKSSVFSDILCEKTKPGNTSITWIIAGVCTALFSIPVAIYVVKGLLRCINYVFFPSCKPPPNIDQCFSEQSLKNLLLSASEEQTERCFIIENSYSLVTVEETSQVDEDHKQYSSQTSRDSGNYSNEDENSGSKTSRELLQQGLV	56360	24552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_24722_31269_35242_39509_39656_40366_40518_42847_43003_43108_43309_43981_44097_45363_45506_45615_45774_46802_50158_56167
891693	contig_5039_pilon	-	4716	1	Intergenic	novelGene_64879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	671	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1028	1330	419099	418797	NA	35	TAAATATCTAGGAATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERIRVIVGQYDEHNQCHTNLIRCTHLSNCLSLTLVLILDLQKKLWYKESKAPTASGQQQVSCPAQAGMRRAPGRGSGPPDCPQWTRGNGNLQCCVSHL	420126	415410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_415400_420100
891694	contig_6418_pilon	+	3757	3	Intergenic	novelGene_81196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	102	132	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCCAGCAGAGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341011	1379099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717
891695	contig_8204_pilon	+	1229	3	Intergenic	novelGene_176989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_2	58	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1227	3	1229	18967	26051	FALSE	35	TATGTTCCAGTCCCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRK	18964	26051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972
891696	scaffold_13505_pilon	-	4122	4	Intergenic	novelGene_111591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTAGTGTTGCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767346	644538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_648105_766455_766750_766799_766907_767191
891697	contig_4803_pilon	-	4683	30	Intergenic	novelGene_150708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_29	510.783557922527	93	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	106	2322	134257	15989	TRUE	40	TTCTCAGATAACCAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFASWWYKTHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSASSAATSKSSSMNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	134362	12676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_101681_101754_119613_119677_134227
891698	contig_6533_pilon	+	4141	7	Intergenic	novelGene_114627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2962	3327	99127	99492	TRUE	20	AGCCCTGGGATCCCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSVSEILLFIFWISNCCFCIISICEFLLAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSPAGSSSAFSSTGKSSGVVFWMPTGTILSCFCKCFDIVSCLRGIQ	66166	100462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_66406_66526_67501_92175_92577_94276_94517_98019_99657_99748_100272_100335
891699	contig_11318_pilon	-	2486	15	Intergenic	novelGene_48149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	484.496309035877	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	153	1004	49795	30548	TRUE	60	AATAAAGCAAGAACCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKRSYGD	58247	15010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21428_29548_30566_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58143
891700	contig_10140_pilon	-	6985	3	Intergenic	novelGene_148394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	314	1110	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2500	2808	207562	206537	FALSE	25	CTTTCACATGAGAGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	210289	202359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_206763_207479_209881_210108
891701	contig_10904_pilon	-	2612	2	Intergenic	novelGene_22698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1084	1443	620456	620097	TRUE	65	AAAAAAATGTTCACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNMFYQSRKKLIPKSDKKTIKHENLSHKLRCMFLKNVHTPMFMAALFTIAIRWKQPRSPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNDESVNHLITWTKPEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	621539	618599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_618902_619229
891702	contig_15449_pilon	+	4220	14	Intergenic	novelGene_33578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_13	605.541021726921	46	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	252	2627	37166	54584	FALSE	40	GCACAAAAAATCCTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVEISE	27839	56177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_54570
891703	contig_15114_pilon	-	2183	8	Intergenic	novelGene_121132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	209.536709559593	23	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	875	1591	112655	100551	FALSE	25	TCTGTACGTGTTCATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125331	99958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_115534_115955_123580_123705_125212
891704	contig_7050_pilon	-	3291	6	Intergenic	novelGene_153612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	108.972657120949	1403	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	214	663	677188	585724	FALSE	25	GGGCTCATCTTCCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGGVAPAGEGLRYAEYSPPSARRPDADIDPGLARSLIAVGLGVAAFAFAGRYAFQIWKPLEQVITETAKKISNPSLSSYYKGGFEQKMSRREASLILGVSPSADKAKIRTAHRRIMILNHPDKGGSPYLATKINEAKDLLESSTKH	677401	583095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_-_585795_631905_631977_637860_637938_651778_651853_654330_654383_677083
891705	contig_11982_pilon	-	4429	3	Intergenic	novelGene_100254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGCCTTTTCTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94489	89934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_-_90630_90676_94365_94443
891706	contig_4103_pilon	+	2583	13	Intergenic	novelGene_51890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	70	junction_2	42.694652280272	427	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	76	1605	53913	65973	FALSE	25	GGGCAGAGGAAGTATGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEVIRAKTAATAADLDSRQLELADGMAERAALEELVRLQGERVRALKQQKAKAEKIEEEVAKLLKLKAQLGPDEGKQKFVLKTPKGTRDYSPRQMAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53837	66951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
891707	contig_10461_pilon	-	3120	4	Intergenic	novelGene_178608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1068	1913	155754	132284	TRUE	30	AAGCACCACTTATTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSPL	156821	85603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10461_pilon_-_85854_116480_116703_131548_132311_154935
891708	contig_11269_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_145827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336430	337668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_336400_337700
891709	contig_8262_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_166107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAACAAAGGGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227875	225340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_-_225300_227900
891710	contig_4252_pilon	+	4241	3	Intergenic	novelGene_176363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1886	2725	522677	523516	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	517963	525032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_+_519164_521750_522406_522646
891711	contig_3153_pilon	-	2730	2	Intergenic	novelGene_104641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	27	779	78541	77789	TRUE	65	AACTCCCAACAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHIQKQDRMLPVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFTENTDQKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMMEDRISKIEDKHLDTTLRKRSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKSPPVIEVPEQGEKTENTERIIEELLTEIFPNIMKDEKLTIQEAQQTTYRINPKRKSQRHIITTLAKTKDKES	78567	75711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_76923_77048
891712	contig_5686_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_45440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCAGGGGGCATCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212426	215325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_212400_215300
891713	contig_567_pilon	-	11334	19	Intergenic	novelGene_34011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2031	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1259	1834	661992	661417	TRUE	20	TGGATTTTATAGATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLHGVGLGSYQSGVWGAGLWGHVVWRRLRLHPWGRAGVRGLGLWPWRRDRLGGTHLIGERRRDLLALQVWGLGLVWEHVLLGAHGVGLSRGSHLLLEEPLLISLQAGSSLGAQGLGKLAHLSHIPLLHLLHVMLHSLLLLLLLLWGIADSLGLLELVMVGHSRAYSWPCSLLLLLLLHHLLSSQDVSEL	663250	632818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_636021_636374_636486_638169_640816_641257_641405_643230_643348_644443_644686_645324_645414_647346_647430_649002_649060_649752_649830_651516_651586_652502_652658_652768_652911_653595_653711_654922_655088_656041_656209_657400_657561_659404_659687_659942
891714	contig_8674_pilon	+	6743	7	Intergenic	novelGene_102917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_6	622.422596704915	139	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1851	5556	883	6438	451273	460626	FALSE	40	ACTACATATGAAGCCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWNAKPESATMPSSYPKSQSSFLQQALINPLASASQSSFNYPGSNQEACMYSSNSNLISQPLLNIKNYTTPQQISVSDMHNGANVASQTSVERKTYVNVQGPKQLNHNLQMSSGVAQNAWLNSQMRNPMLSHTGTTVVSNQTGVTVVSNQTGFGANRSNINTLQNQFIPSDTYSLQLQTIPSNSVRVPVTYQGNQGLNPSLSEQQVDWAQHCTANGLIFPDNSSLPKQYCYSQQGFLQDTALQKRNPMLSALLEVKNSQFPNPALSLQLQQNAAVQSHQYAVTQIDNRPPPPSYDCIYARQPLQNTQQVSKHSPMEVPQNQETHLPEVLKDLCSGFQQQWQNPNKGINTIGNFCNLKVNGKVSTNGNFCNLKVNGSVNQPANKPVRSLVDGVQTFAQNNKDKRMDSGSSTSNPILDTNVTKEGLVRDIKKLVDTRKKLLELARKIKINQNILMAAGCSKATNTSHSESAQNSELSLKQTSKIQSGSQVTPVTPEISEGQQSTVMKSAEEANRTHCTLNPNIHDINCKKSNQGNSILLNSDCSEKLAMPDQFHDLQALTSLKTSTVEITQTTLNNTQLSSENVRDDQNLSTDSKTITAPQSVLFQEYVSKYPNKNTLLRFLMPREKTKNESVKNVNETIQDPKPKSFEMNQNTQISGDLPNLKTMETQSTCNINAKASDKSCLLDYKPSTNGMSSKSDSHCSMELLATCLSLWKKPPSEPTEEKHDESRTNRTTSHISKPVEVYDKSPCAVVGPSQNKMFNNSEQETALPMVVQNYESAGANTTKGSELQIAVVSPLILSDVKTISVKGITPEALPEIMYPVIKEGSVCSLQDQLAENMSVSPLKANVSELVASTTSSTKISPLIQKEKQDKSTNCNLEGVPNTNQGKHIKSKSHVHSSPNVDTLICPDVSGNQQVLDESRGSTVVSGDTLQIANICSLVEGDISYNSQIAKIFNSPYLDKVEPQKPCLPDHQVISCRQQKEQLDKTTENKNFGFQKEKIVQVTDVSPKITHQPESLPPSESSLKNVKANGEILEENKLECITNKEIMTSNMYCSAAIQQDSPEIDAPCNYISQDPTSSEIFSDKTSLLYLHDQLSELLKEFPYGIEAVNSREGSAGQQITEQVKNQSYDKTSCDSKDSTSTDQIKITIISSEQMKELFPEQDEQPSDGDKLTEPQKEKPITKVESQCDPKAHTEGESHDSVVSNLKRDDIHCCALGWLSMIYEGVPQCQCNSMKNSASEEEKKSHCSALETNRCKQGERTSDRDIPGVECNRSPNKDLKTPLILPDGKNSFPEIKQDKNMKDNTETKHSNSLKTEKELPSQFSSKCDKKLDPLQSHKRKRKLQFHEVTFHSSSKLMKFCEQDSQESLQKKHTAQNSRPLKAKTVILTNKDLYKKNGSLIQSISPEKIKLKFRAGGSRYKLLENRKLDQGNIFDMERKKKKYDKREQNKNAGSSFKLCNSLSNLNERTSIKEKTVSIEVKSTNLEINIHRSLMKSSNINSSDSKDISCKINRVMAPKEYLQRQKHKEAIGNKASKKSCVIEKIKNVPCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQVSGIKSTKEAWLKCVNTEKRMQEANQKIDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGRQTLKNGICQGETVRYLNVYIVEPGLPLF	427059	460931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045_430137_445723_445790_451215_456506_457759_457844_460249_460397_460534
891715	contig_15327_pilon	+	2423	9	Intergenic	novelGene_70406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	198.069392827362	853	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	522	899	31740	32853	FALSE	10	AGTACGCCCCCTGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGNKATSRGRAIPTPGAKDGPAEAGEGPVGGKASFLRVTLLGFQADVNSERVIRSEDGETLAREYGVPFMETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRARGQADEPSFQIRDYVESQKKRSSCCSFV	25192	34377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_28869_29900_29943_30392_30511_30605_30659_31691_31758_32231_32409_32488_32566_32747
891716	contig_10953_pilon	-	4438	3	Intergenic	novelGene_42598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGGAAGGAAGGAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465825	460339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_460401_461121_461222_461548
891717	contig_12923_pilon	-	2549	17	Intergenic	novelGene_30149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_16	149.383930172392	373	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	1172	2305	231778	225749	FALSE	0	CCCGTTTCTTGCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINKDGPVLSTVSQESQQGPSRKDKELVLDLNLHDNSYNFSFHVVIGSRAEEGQYNLNFHNCHNLIPGREQPFNISVMIWEKNPEGFLSAAEIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	236078	225504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607_230742_231381_231487_231566_231636_231724_231790_231928_232837_233022_233074_234497_234618_235997
891718	contig_16492_pilon	+	4827	22	Intergenic	novelGene_100300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_17	255.112166873857	574	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1351	4056	406	4461	159423	195042	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDIEVTTTTSETPVVDETKTEAPESEVGNPASNVAIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDVAVEKPVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFENISSPESSPAHRPESLSPELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPSDSPTSDLVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLSNAGQSAAYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS	154575	195408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_154662_158439_158546_158871_159081_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337_170596_171328_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_187439_187497_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014_194104_194433
891719	contig_8317_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_19259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	320	637	16026	15709	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKQVSAVKNVQCILKCYLSSEASCFHRWVIFAVTSHIATTNIFHRDILDIEAYIVPRQSFTQSLMVHFNRLDFSGDVDWSKGDHHPRLEDTSLHPAHRDSANT	16345	14245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_14200_16300
891720	contig_9305_pilon	+	2133	3	Intergenic	novelGene_148183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	26.5	403	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	116	493	48437	49489	TRUE	30	AATCCAATCTGCCCTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCVPVRPGPRPLGAHTSVRCQKLNKITSDKTTSCQREIRAKTGRRKQVMGQSLGAGSMGDFLSQDLGDEREQARKIRSKGIPEGTASAKALRGVADWTQRCVGDGGDRRLKRQGQALRAFQEVS	48321	51925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_48809_49483_50821_51616
891721	contig_7056_pilon	-	3126	10	Intergenic	novelGene_43606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_9	911.010075698777	63	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1637	2383	725925	723226	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730130	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561
891722	contig_11126_pilon	-	2512	3	Intergenic	novelGene_138121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331320	183652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_184919_184979_185428_330522
891723	contig_5039_pilon	+	5536	1	Intergenic	novelGene_64974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	3986	4978	1679067	1680059	NA	35	TTCAAGTCTGAAATTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1675081	1680617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1675100_1680600
891724	contig_13021_pilon	+	6479	33	Intergenic	novelGene_8118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3022.70675923811	39	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	3014	4690	174676	180717	FALSE	20	AATGCGATTTTTCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTI	147801	182506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_148147_148412_148487_148779_148925_150111_150269_151769_151844_151958_152130_152920_153049_154323_154417_155194_155333_157299_157478_158091_158224_158406_158517_160044_160225_160916_161043_163205_163323_166456_166569_169578_169690_171696_171824_173610_173970_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440_180672_180712
891725	SIRV5	+	1970	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	25	34	-2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1025	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
891726	contig_6316_pilon	+	2246	14	Intergenic	novelGene_134707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	165.528595645379	22	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1069	1974	147168	157164	FALSE	25	AATGTAATTGATCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136302	157436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_142566_143045_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
891727	contig_8462_pilon	+	3101	1	Intergenic	novelGene_159431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	974	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239615	242716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_+_239600_242700
891728	contig_9366_pilon	+	8963	30	Intergenic	novelGene_166254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_3	279.771568957016	2000	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2982	8946	17	8962	946880	1043596	FALSE	25	ATGTAACTGCTCCACCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNENKMEVTENIEVIAHQDIVQQEQLHSSEEPKVVVSPEESRPPKSTIESVSVPPETLKSPSEESTSVCSKEQLPTERLQAEMEQKENSKSSTGFMEFEMTPAIEGYVKDSSCQGDTSLKLPSETESSFSSVADISKANVSSPPTLPSDLPSHDMLHCYPSALNSSAGNIMPTTYISVTPKIGMGKPAITKRKFSPGRPRSKQGAWSTHNTVSLPSWSPDISEGREIFKPRQLSGSAIWSIKVGRGSGFPGKRRPRGAGLSGRGGRGRSKLKSGIGAVVLPGVSTADISSNKDEEENSMHNTVVLFSSSDKFTLHQDMCVVCGSFGQGAEGRLLACSQCGQCYHPYCVSIKITKVVLSKGWRCLECTVCEACGKATDPGRLLLCDDCDISYHTYCLDPPLQTVPKGGWKCKWCVWCRHCGATSSGLRCEWQNNYTQCAPCASLSSCPVCYRHYREEDLILQCRQCDRWMHAVCQNLNTEEEVENVADIGFDCSMCRPYMPASNVPSSDCCESSLVAQIVTKVKELDPPKTYTQDGVCLTESGMSQLQSLTVTVPRRKRSKPKLKLKIINQNSVAVLQTPPDIQSEHSRDGEMDDSREGELMDCDGKSESSPEREAVDDEPKGAEGAEGTKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRSRTGQGKTKRSMIRKDSSGSISEQLPSRDDGWSEQLPDTVVDESVSVTESTEKIKKRYRKRKNKLEETFPAYLQEAFFGKDLLDTSRQYKLSLDNLSEDAAQLSCKTNLNTNFLDPSLEPLLSSSSTPAKPATHGTADDPLADLSEVLNTDDDILGIISDDLAKSVDHSAGIDIGHVADDPSSLPQPSVNQSSRTLSEEQLDGILSPELDKMVTDGAILGKLYKIPELGGKDVEDLFTAVLSPATTQPIPLPQPPPPSHLLPVHNQDVFSRIPLMNGLIGPSPHLPHNSLPPGSGLGTFSAIAQPPYTDARDKNPAFNPMVSDPNSSWTSSAPTMEGENDTMSNTQRSTLKWEKEEALGEMATVAPVLYTNINFPNLKEDFPDWTTRVKQIAKLWRKASSQERAPYVQKARDNRAALRINKVQMSSDSMKRQQQQDNIDPSSRIDSDLFKDPLKQRESEHEQEWKFRQQMRQKSKQQAKIEATQKLEQVKNEQQQQQQQQQQFGSQHLLTQSGSDTPSSGIQSPLTPQPGNGNMSPAQSFHKDLFTKQLASTPTSSSSDDVFVKPQAPPPPPTPSRIPIQENVSQSQNSQPSSPQMFSPGSSNSRPPSPVDPYAKMVGTPRPPPGGHSFSRRNSITPVENCTPLSSVPRPIQISETTANRPSPVRDLCSSSTTNSDPYAKPPDTPRPVMADQFPKPVGLPRSPIVSEQTAKGPLTSGTSDPFTKPSPRADVFQRPRISDPYARPLLTSAPLESGPGPFKTPMQPPPSSQDPYGAVSQAPRRMSIDPYERPALTPRPIDNFSHSQPSDPYSQPPLTPHPAMNESFAHPSRAFSQSGTISRQISQDPYSQPPGTPRPVVESYSQPSGTARSNPDPYSQPPGTPRPTTVDPYSQQPQTPRPSTQTDLFATSATTQRHSDPYAHPPGTPRPGISASYSQPPATPRPRISEGFTRSSMTRPVLMPNQDIFLQAAQNRGPALSGPLVRPPDICSQTPRPPGPGLSDTFSRVSPSAARDPYDQSPMTPRSQSDSYGTSQVAHDVTDHPRPGSEGNFSASSNSPLNSQGQPFSSVSQIPGPVPTSGVTDTQNTINMSQADAEKLRQRQKLREIILQQQQQKKIAGRQEKGSRDSPVVPHPGPLQHWQPENINQAFTRPPPPYPGNIRSPVIPPLRPRYAVFPKDQRGPCPPDVASMGMRPHGFRFGFSGGNHGAMSSQERFLVSPQQIQGSGVPPQLRRSISVDLPRPLNNSQMTNPVGLAQHFSPQSLPVQQHNILGQAFIELRHRAPDGRPRLPFSAPASSVIEAPSHPRHGSFIPRPDFPGPRHTDPMRRPPQGLPNQLPVHPNLEQAPPSQQEQGHPAHSSSMDMRSLSHPLGGEFSETSLSTSTPAETTSDNLQITNQSSDGLEEKLDSIDPSVKELDVKDLEGVEVKDLDDEDLENLNLDTEDGKGDELDTLDNLETNDPNLDDLLRSGEFDIIAYTDPELDLGDKKSMFNEELDLNVPIDDNHCMSIEPKKKEPEDKTLVLSGKHSPQKKSTFSSEIKTEVLSPNSKEETKYDIEKSEGKGAVDIPCSQASTNTDLNDGEKASLQPCKPDLPEKRTNQETADSSISVQGSTLLPAEDVISSCGITGSTPVLSSLLASEKSDNSDIRPLGSPPPSLPASPSNHVSSLPPTLMTPPGHVLDNTVNSNVAVVSRVNHTFSQGVQVNPGFVQGQSASHSFGTGKSTNQTVPLTSQSSTSGMSGPQQLMIPQTLAQQNRERPLLLEEQPLLLQDLLDQERQEQQQQRKMQAMIRQRSEPFFPNIDFDAITDPIMKAKMVALKGINKVMAQNNMGMPPMVMNRFPFMGQPVAGAQNSEGQSLIPQAMTQDGSITHQISRPNPPNFGPGFVNDSQRKQYEEWLQETQQLLQMQQKYLEEQIGAHRKSKKALSAKQRTAKKAGREFPEEDAEQLKHVTEQQSMVQKQLEQIRKQQKEHAELIEDYRIKQQQQQCAMAPPTIMPGVQPQPSLVPGTTPPSVSQPSFPMVPQQLQHQQHTAVIPGHSSPARMPSLPGWQPTNAPAHLPLNPPRIPAPIAQLPIKTCTPAPGTVSNANPQSGPPPRVEFDDNNPFSESFQERERKERLREQQERQRIQLMQEVDRQRALQQRMEMEQHGMMGSELSSRASVSQIPFYSSDLPCDFMQPPRPLQQSPQHQQQMGQVLQQQNIQQGSMNSPPTHTFMQTNERRQVGPPTFVPDSLSIPGGSPNFPSVKQMHGSLSGISFQQSQVRPPFTPALPAAPPVANSGLPCGQEAAVTHGQSYPASNQSLIQLYSDIIPEEKGKKKRTRKKKKDDDAESTKAPSTPHS	946863	1043597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_947474_961777_961898_964177_964295_969000_969103_969273_969379_975723_975906_976157_976323_977280_977391_977890_977957_979025_979239_986838_986968_996452_996573_998922_999054_1001880_1002062_1005400_1005506_1006881_1007020_1007200_1007234_1007333_1007454_1021922_1022056_1022303_1022519_1024141_1024216_1025526_1025710_1026093_1027984_1028648_1028942_1030246_1032055_1032917_1033030_1035311_1035391_1036914_1036979_1038825_1039059_1042465
891729	contig_16103_pilon	+	3127	1	Intergenic	novelGene_118955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTGCTTGAGATGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019915	1023042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1019900_1023000
891730	contig_20842_pilon	-	2484	20	Intergenic	novelGene_160962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_10	74.2980074148505	637	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1599	884	2482	235273	8354	FALSE	40	AAACACAGGCAGAGGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPWKILMAAPLFFLLALHTSASPAYNDQPTTSHSGSRVCVGCVVVVSVIEQLAQVRNSTAQAAMERLCSYLPEKLFLKSTCYLVIHIFGSDIIKLLSADMNADVVCHTLEFCKQDAGRPLCHLYPPPKVAWELTLKKARHIVGKSQTLKYPRSNSSICSLPFLAKICQEIKSAIKKSVPFKDSDSDKYSVFPTLRGYHWRGRDCNDHSKTAYPGRRPDNWDAHQDSNCNGIWGIDPKDGIPYEKKFCEGSQPRGIILLGDSAGAHFHIAPEWITALQISLNSFLNLPTAVSNELDWPQFSGITGFLDSTSGIKEDSIYLRLRKRNHCNHRDYQNISKNGASSQNLEKFIESLSRNQLLDYPAIVIYAMIGNDVCNGKMDPVPGMTTPEKLYSKVMETLKYLNSHLPNGSHVIFYGLADGAFLWDHLHNRYHPLGQLNKDVTYAQLYSFLSCLQLSPCQGWMSANKTLRALTSERAELLSRTLKTVATREKFTNFNLFYLDFAFQEITEEWQRRGGQPWQLIEPIDGFHPNE	236156	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_8431_19914_20012_21899_21960_22050_22110_33082_33256_40783_40859_41604_41642_59928_60012_89827_89920_124655_124751_127280_127330_130216_130266_131009_131081_132234_132296_141520_141592_147843_147904_173524_173625_187148_187216_207155_207252_235146
891731	contig_6163_pilon	-	1605	4	Intergenic	novelGene_103803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	273	junction_3	119.15349577564	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	287	664	78436	76108	FALSE	10	CTTTTCCCCAGCTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGSEDGKIHVWNGESGIKVAVLDGKHTGPITCLQFNPKFMTFASACSNMAFWLPTIDD	78722	75166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_77811_77882_78301
891732	contig_11413_pilon	+	4396	27	Intergenic	novelGene_103183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	157.864113725593	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	87	2618	508645	651810	TRUE	35	GAATGCAGTATGGAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGTLCHVLGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTYTDEKSKASHHIYPYPSSQEDEEWLRPVMRKDKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSSDVDAEIEDPPIPEKSWKVHAKWILDTDVFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAAANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEEEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNPKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTTGGKEDEDPSKGDQSRSVDPGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQDAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPEEPEKLEGAEEEKVEADTDGQQPEKTENKGENEMNDGDKAQDGENEKNSEKEHDSEVSEDIKSEEKEAEENKELTDTCKERESNIGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAVL	491531	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_491606_508632_508719_526646_526729_527846_527940_532839_532910_542339_542410_546060_546137_549824_549951_551873_551996_557203_557329_565027_565088_574680_574719_577758_577881_579279_579352_581382_581497_582114_582269_583013_583128_590107_590168_596827_597087_598034_598197_607530_607587_610793_610909_611582_611738_620301_620437_629137_629208_651802_652002_653263
891733	contig_14871_pilon	+	2564	11	Intergenic	novelGene_63705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	673.061780225263	30	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	143	1570	201945	233218	FALSE	5	TGCCCTGTCTGTGTGGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRLQNLTATTWCLLCRASRFWKDTVFSRPLGKSSATLTSCEPRPREMADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	196857	234212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_196935_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
891734	contig_10323_pilon	+	3254	1	Intergenic	novelGene_123564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	826	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1401	1700	446588	446887	NA	15	CCTTACAGGTTCTCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEKRRLRDTTEVAPTVDSAMKGSSNTVTFPLNFQQDTMNRKRKSHLNRYGMTIASGIQRLPCRPDTELVRGPVYSCGHLQVLSVGPAWLSGSTDRGSG	445187	448441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_445200_448400
891735	contig_16303_pilon	-	1812	6	Intergenic	novelGene_34071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	707.134895193272	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	524	625	37218	35759	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	38743	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33555_35037_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579
891736	contig_10236_pilon	-	6344	6	Intergenic	novelGene_169110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.7224338297866	1228	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	747	1355	93475	83551	TRUE	40	GGAAGCGGAAGAGAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVPWKGDKAKSESLELPQAAPPQIYHEKQRRELCALHALNNVFQDGNAFTRETLQEIFQRLSPNTMVTPHKKSMLGNGNYDVNVIMAALQTKGYEAVWWDKRRDVGVIALTNVMGFIMNLPSSLCWGPLKLPLKRQHWICVREVGGAYYNLDSKLKMPEWIGGESELRKFLKHHLRGKNCELLLVVPEEVEAHQSWRADV	94221	77544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_77681_78469_78584_78811_83651_84299_84495_84650_84780_93290
891737	contig_6102_pilon	+	4850	5	Intergenic	novelGene_32303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	3204	3911	1647190	1647897	TRUE	30	AGGTGGGGTGCAGAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNTRKTINVIHHIEKTKDKNHMILSIDAEKAPDKVQHPFMIKTLNKTGEEGKFLNIIPGIYTKPTANIILNGTLEAFPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKGIQIGREEVKLSLFADDMILHTEKSKESIRKILELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKTKYLGIKLTRDVKDLHNENYKTLLQETKRDLRKWKNIPCS	1531552	1649861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1531876_1532400_1532858_1533365_1534252_1645652_1648540_1649564
891739	contig_12654_pilon	-	6171	15	Intergenic	novelGene_129293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	432.209392752718	7	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	105	1292	788119	759069	FALSE	15	GTCATGTATGCCAGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASSASTDSRSAASRSARLLLSAASLAAALVAAAMLGRDRLLSVLLAAAASCAMAQHVPPWTEDCRRSMYPPSGPTYRGPVPWYTVNLDLPPYKRWHELMADKAPALRIIVNSLKNLVNAFVPSGKVMQIVDQKLPGLLGPLPSPFEEEMKGIAAVTEIPLGEIILFNIFYEFFTICTSIVTEDKEGHLLHGRNMDFGVFLGWNINNNSWVITEELKPLTVNLDFQRNNKTVFKATGFAGYVGMLTGFRPGLFSLTINERFAMNGGYMGVLEWILGKKDATWIGFLTRSVLENSTSYEETKNILTKTKILAPAYFILGGNQSGEGCVITRDRKVSLDVYELNPKQGRWYVIQTNYDRWRNPFFLDDRRTTTKICLNQTTQEKISLPTIYDVLSTKPVLNKLTIFTALMDVTRGQFETYLRDCPDPCIGW	788352	754189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_759159_760271_760329_760744_760869_760973_761106_762759_762842_762972_763028_763532_763678_764438_764485_765434_765510_768979_769059_771246_771334_771768_771860_775941_775989_788041_788150_788278
891740	contig_7840_pilon	+	2744	4	Intergenic	novelGene_68982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGGCTAAGGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200928	308139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_201721_215198_216247_251577_251992_307649
891741	contig_3822_pilon	-	3907	14	Intergenic	novelGene_133299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_13	1117.8853240083	148	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	1554	2741	295852	277069	FALSE	25	TGTTCATGTTTCTGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYFSAGVIPDETKALSLLAPANAVAGLLPGGGLLPTPNPLTQIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRCTRPNGRLLSGGKMRRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	320796	275902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_282994_283043_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_296998_299561_299696_305985_306208_320744
891743	contig_21007_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_161546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	579	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	348	395	964	1011	NA	40	GTTTGACAATTTCTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	616	1844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1800
891744	contig_17753_pilon	-	3027	1	Intergenic	novelGene_105108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	824	1150	146777	146451	NA	30	CGTTCCACAAATCTACCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIRILSTCCLVSIFDALFARSWNVPRSPARTACLIMPDKARVSRGINLKTFFPAQIPLQSQTLQIPKGGESRAWGRRGPQGCEAGVGFAAGGSSSMKPGPRPARGH	147600	144573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_144600_147600
891745	contig_16110_pilon	+	2206	6	Intergenic	novelGene_126800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	310	junction_5	137.946946323578	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	856	1731	109438	131269	FALSE	20	TCCCTTAAACTGACTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLDTTGCLVPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCVYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPLETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGELARARLALDERGQKLSDLEERTAAMLSSADSFSKHAHEMMLKYKDKKWYQF	105172	131744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_105993_109402_109773_110061_110228_118994_119107_128398_128620_131227
891746	contig_12279_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_50110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAGATGACAGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57630	59974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57600_60000
891747	contig_15043_pilon	+	4489	6	Intergenic	novelGene_175500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3622	3966	104489	104833	TRUE	30	GTTAGTCCTCATGTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNKQRKKKERKKKEIPSGMSLCVCAELQTSFQATWYCPAKEAPKLRKEKENKQIKTEQIRANKQTTKNPQGVPLAEWHRLGSSFTVEWCFAAFQEEAKMARGARYLRERKRWW	100444	143897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_101963_102028_102172_102440_102539_102626_104972_143231_143275_143555
891748	contig_17074_pilon	+	2556	8	Intergenic	novelGene_145102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.615424750556	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	156	749	208015	223767	FALSE	25	ACAACCTTGCCATTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFGFQFHIPSTLQED	207859	225574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216324_223725
891749	contig_14522_pilon	-	868	3	Intergenic	novelGene_147316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	358.5	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGGAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175754	65853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66524_78937_78982_175600
891750	contig_10990_pilon	+	5338	9	Intergenic	novelGene_7422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	93.8794939004253	1321	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	337	1626	671463	681605	TRUE	35	ATTCAATCAGCAGACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHTAPARSETKRMTLEPSTLQETCGSLDGDKDQSTTIFSGFAGLLATLLVIAVLCILCNWNKRKKRPVPYLRVTVMPSLTLPQCRQRSKNIYDFLPRRQEEPGRHQSRSIRIFSTERLLSRNSDSPTPEHVLSRAGNALQVHAVHTCAMGYAVGVYDNTMVPQMCGTFTPSAPYVNVRASRDDLSISSEDSRDYVNVPRAEEIAENLASNSPRNLSVLPSTQELDFTEKRDVGCGDTSDCTRFWSPGTESSNELSDEESSSQTSNDYVNVSELDLGAAQREKPWTTFQCCRDYENVPPADVNGSQQQAEEEATSLNTDHVKGRTDALGTHTQPVMQSGSFLVLGDHMAFQPLAQSGNSQMKHGEETPSEDDSDYENVLAAKLGDKDSEQGSGTQLLPDELRPSDPAGKLHGMVYPAGSTATTESSDDP	670551	694674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_670770_671344_671552_674204_674315_674955_675067_675630_675717_680711_682280_683738_685392_693039_693593_693842
891751	contig_14142_pilon	-	1264	6	Intergenic	novelGene_120629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_1	247.10758790454	87	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	154	618	622927	620914	TRUE	15	GTCCCCAACTCAGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625170	620096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625038
891752	contig_2332_pilon	+	1922	4	Intergenic	novelGene_58680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_1	468.304032298107	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1524	1829	332930	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	331406	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_333048_333846_333928_334162_334280_334756
891753	contig_17427_pilon	-	2472	14	Intergenic	novelGene_30334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1105.72168192083	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	49	1473	188879	178046	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204709	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177675_177772_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
891754	contig_5286_pilon	+	6494	12	Intergenic	novelGene_157326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2003	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483644	567635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487675_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564479_566879_567032_567123
891755	contig_8801_pilon	+	2718	2	Intergenic	novelGene_66268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2066	2533	397689	398156	FALSE	60	CATTACACAAATCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIRHEDIIIINIYIPNDRALKYIKQTLTALKRKFDSSTIIVGDFDTALSVKNRTSRKKLSKDTEDLKGTISQLDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNAYGMFSRIGHILDHRATLNKMQNIEIIQSIFSDHNTVTVEINNRKSKEKKVNYMETE	395561	398341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_397314_397375
891756	contig_14450_pilon	-	4600	7	Intergenic	novelGene_48976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	502.42492529288	38	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	334	1419	1310917	1042825	TRUE	25	GTCATTCCAGTATCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRTPTVNPPYSFSCLIFMAIEDSPTKRLPVKEIYNWILEHFPYFANAPTGWKNSVRHNLSLNKCFKKVDKERSQSIGKGSLWCIDPEYRQNLIQALKKTPYHPYSHVFNTPPTSPQAYQSTSGPPIWPGSTFFKRNGALLQVPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1311250	1039005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039694_1039820_1042085_1042595_1043375_1065853_1065960_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
891757	contig_17_pilon	+	5291	7	Intergenic	novelGene_173968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	1166	2485	130409	306276	TRUE	55	AAAAAATACACTTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVIKKLPKIKSSGLDGFTGEFYQTFREELTPLLLKLFQSIEKYGILPNSFCEASITLIPKPGKDNTKKENYGSLSLMNIDANILNKILANRINQHIKKIIHNDQVGFIPGMQGWFNIRKTINVLYHINKTKDENHMILSINAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFHNIIKGIYTNPTASIILNEETLKAFPLRTGTRQQCPLSPLLFDIVLEVLARAIRLEKEIKGIQIGREEVKASLLADDMILYTENPKKSTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEGEITKSVPFTIAPKKIKYLGINLTRDAKTYTMKTTRHYCKKPKEYCLMEKHTLLMDRKTQHCEMSILPKAIYRYNAIPIQIPTAFFNDVEEQITNFIWKGKRPWISKPLLKKKNKVGDLSQPDFRTYYTTMVVKTAWYSYNNRYID	129243	842558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_131430_305977_306645_412394_412985_608437_608615_676108_676613_797357_797494_841527
891758	contig_11160_pilon	+	1092	2	Intergenic	novelGene_168837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	318909	319232	TRUE	45	AAAGTTCATATCTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGAESKYAKKKKILKAGSLCCSSPQFFASIFHPFPASLPLADGEISGQPQSEQHAGQEGGGDSRGRRPKLELHTGLPPTALGQQPARSRPPRTQPQQLLAQVPGRH	318908	321121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_319287_320407
891760	contig_5732_pilon	+	3463	3	Intergenic	novelGene_119579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	277	junction_1	44.5	1039	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACTCCTGGGCGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144522	150190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_144538_145382_145541_146900
891761	contig_7396_pilon	-	2228	10	Intergenic	novelGene_79567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2943.07058094848	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	321	986	248983	246442	FALSE	25	TAGATATGGTGCGTGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	255145	245199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250285_254671_254701_255105
891762	contig_987_pilon	+	5143	8	Intergenic	novelGene_72312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.1246543570001	308	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	329	2902	996011	1236483	FALSE	15	ATAGTTTGCTTTTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNLHELEDYIHNIEPVTFPHQIPSFPVSKNNVLQFPPPGSKDAEERKEYIPDYMPPIVSSQEEEEEEQVPTDGGTSAEAMQVPLEEDDELEEEEIINDENFLGKRPLDSPEAEEMPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPKEKERKKDKKEKKKKKEKEKEKEKKEKEREKEKREREKKEKEKEKHKHEKIKVEPVVPAPSPVIPRLTLRVGAGQDKIVISKVVPAPEAKPAPLSRPKTPPPAPAAAPVPLHLTPSLVPLPLLAQSTASPALVPSPSPAVSGAGSSKAPVRSVVTETVSTYVIRDEWGNQIWICPGCNKPDDGSPMIGCDDCDDWYHWPCVGITTAPPEEMQWFCPKCANKKKDKKHKKRKHRAH	991265	1238724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_991459_991537_991623_995960_996204_1169536_1171360_1193952_1194036_1231518_1231772_1235359_1235467_1236368
891763	contig_9972_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_162786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	777	1217	188687	188247	NA	30	TGTTCTAATCTAATATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHLYAAYKRNTLDLKTQLKFKGWKKMYQANNTQKRAGVAILISDEIDFQVKSTTKDNGEHYVIIKGLIHQEDMTIIIIYAPNDRAPKYIKQNVTAWKRERDSCTIVVGDFKHTTFGEGQNIQKEAQQRHGRAKCYNHQLDLLDLH	189463	187244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_187200_189500
891764	contig_8309_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_176434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6620	8745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8309_pilon_+_6600_8700
891765	contig_12139_pilon	-	3379	1	Intergenic	novelGene_146453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGAGAGCTTTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66017	62638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_62600_66000
891766	contig_6028_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_156565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244380	246759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_244400_246800
891767	contig_9415_pilon	+	4883	8	Intergenic	novelGene_109776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	369.404484906975	1003	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	47	556	1620728	1704137	FALSE	30	CTCATGACTCACTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHVQQNNVARSCTIFMIVGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSTNVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDSNLSGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL	1620681	1708464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1620738_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1697965_1700428_1700495_1703219_1703271_1704044
891768	contig_7408_pilon	-	3042	7	Intergenic	novelGene_168727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	197.130596869746	64	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	1113	2192	38514	12597	FALSE	25	GTTCTGAGTGTACTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48304	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_48156_48204
891769	contig_12080_pilon	+	4212	12	Intergenic	novelGene_128335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCAGCAACAAACTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43905	106895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45892_46201_47139_54876_54963_56918_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793
891770	contig_6795_pilon	-	2856	12	Intergenic	novelGene_27656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_11	85.7155588256496	268	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	307	1416	129029	46152	FALSE	30	TTTCTGGAAATAGGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134406	44711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
891771	contig_3975_pilon	+	3529	7	Intergenic	novelGene_54929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1940.33954645973	9	147	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	780	1283	2344841	2354386	FALSE	35	GCAGCCTGATTTGAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRPAPVEISYENMRFLITHNPTNATLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2327402	2356632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2327495_2327660_2327750_2344242_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277
891772	contig_11574_pilon	-	2312	3	Intergenic	novelGene_64068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	139.5	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	137	835	451360	449890	FALSE	40	CCCTAAATTTACATCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	451496	448412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808
891773	contig_6208_pilon	-	2482	8	Intergenic	novelGene_53033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	443	junction_5	336.167414560431	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	128	2392	513736	492858	FALSE	70	TTAGAAAAAAATTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	531950	492767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834
891774	contig_7870_pilon	+	6926	1	Intergenic	novelGene_109034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2490	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACATTCTGATTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593253	600179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_593300_600200
891775	contig_16411_pilon	+	3662	15	Intergenic	novelGene_77273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	318.388841013049	625	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	650	889	49565	57076	TRUE	15	GATGGTGTGGATGGCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKRTLKGSIELSRIKCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKYHPNFWIDGRWRCCAQLEKLAAGCAEYDPTKNASKKPLPPTPEDNRRSLQEPEETLVIALYDYQTNDPQELTLRRNEEYYLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSPNNLETYEWYNKSINRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTPGTYTVSVFTKGIVSENNPCIKHYHIKETNDNPKRYYVAEKYVFDSIPIRLPAQPAGGLCGGDPTGHVLGRV	18705	69481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18812_20432_20515_21951_22081_26146_26188_30832_30985_35170_35237_41191_41247_49546_49630_50890_50988_56998_57123_58327_58393_58481_58601_62460_62623_66390_68119_68828
891776	contig_8330_pilon	+	1856	10	Intergenic	novelGene_71811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	591.422954501354	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	119	745	852673	856374	TRUE	15	ACACCGCTGCCCAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEPGGLSAVAGTVGAGRRLSPQVLTRRL	837632	857807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855079_856200_856271_856362_856560_856667_856755_856968
891777	scaffold_880_pilon	-	3043	5	Intergenic	novelGene_121515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	541	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAGAAGAAAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579575	567413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_567906_569208_569318_575186_575357_575789_577473_578986
891778	contig_3095_pilon	+	2560	4	Intergenic	novelGene_75155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2880	junction_3	770.746103172475	3383	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	271	1038	220513	226800	FALSE	65	GAGAAATAAACTAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220242	228322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645
891779	contig_10063_pilon	+	1272	3	Intergenic	novelGene_127753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTTAGGAATTACAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537101	698515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_537533_693662_694328_698339
891780	contig_14720_pilon	+	3265	15	Intergenic	novelGene_164976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	428	junction_1	204.630478309223	293	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	95	2290	120703	228646	FALSE	70	GAAAAAAGAAAAAACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDERYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLACMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLQESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVRTHRD	120608	229621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_120769_157060_157259_175396_175511_195878_196040_196956_197072_199814_200044_204007_204154_204802_204980_206859_207031_207619_207728_212263_212389_212883_212981_215206_215342_220562_220750_228479
891781	contig_9058_pilon	+	1597	5	Intergenic	novelGene_149360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	349.24874731343	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	42	998	41923	56652	FALSE	10	CCCCAGTGTCTGCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTENGLNISLIISITGGGIILIIFVALLIFCISKKRKQSTRRNDEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPPPSHRSQARGHRPPPPGHRVQHQQQKRPPPPSGTQVHQQKGPPLPRPRVQQKPLPGAAENS	41881	57251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42364_47264_47502_51837_51961_56353
891782	contig_4686_pilon	+	20215	100	Intergenic	novelGene_118492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1807	144	20	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACCAAGGTGAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353111	642154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_354080_364484_364579_366025_366244_367773_367898_369727_369928_373536_373750_375402_375533_377529_377672_381282_381622_382964_383154_384984_385130_385370_385547_388361_388518_389375_389493_398482_398633_413090_413260_417840_417995_425619_425776_430257_430384_434748_434945_437360_437598_441488_441582_443749_443898_444553_444708_447064_447212_447815_447999_450450_450657_451228_451363_453259_453430_455598_455763_460699_460849_461778_461955_462938_463092_464383_464564_464976_465113_465977_466173_466705_466838_470300_470474_473493_473695_475794_475920_480575_480675_486303_486514_487108_487264_487453_487589_491547_491707_495378_495485_496543_496680_506904_507103_509804_509968_511579_511783_521406_521570_521780_521951_531880_532077_537683_537825_539164_539349_539905_540032_540578_540768_548544_548678_549555_549738_550508_550664_552626_552789_553085_553246_559095_559357_560087_560300_562070_562223_562873_563211_566141_568306_571256_571520_572588_572767_574131_574256_575091_575238_577180_577358_580231_580405_580640_580792_582625_582950_586712_586889_587036_587194_588133_588451_591981_592147_592934_593080_595239_595394_597469_597642_599581_599747_601995_602148_604952_605129_607759_607939_608383_608520_612693_613051_617805_617975_619267_619576_622421_622603_623065_623359_626352_626509_627519_627728_629027_629139_630007_630215_631181_631387_636501_636604_640392_640576_642118
891783	contig_7157_pilon	-	2058	5	Intergenic	novelGene_131313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	748	junction_4	141.023712545089	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	43	954	1004754	997010	FALSE	30	GAACCATTGGACTCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVIAVIAATLFPLWPAEMRVGVYYLSVGAGCFVASILLLAVARCILFLIIWLITGGRHHFWFLPNLTADVGFIDSFRPLYTHEYKGPKADLKKDEKSEAKKHQKSDSEEKSDSEKKEDEEGKVGPGNNGTEGSGAERHSDTDSDRREDDRSQHSSGNGNDFEMITKEELEQQTDGDCDEEEEEEDNDGETTKPSSEKS	1004796	995905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_997483_999546_999667_1003386_1003448_1004298_1004392_1004589
891784	contig_13878_pilon	-	3623	7	Intergenic	novelGene_165730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_6	320.049692322232	505	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	167	1120	60499	42986	FALSE	45	ACTATTTTAAAACTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGPRPAALGLLLLCAAAAGAGNVEELHYPQGEHRTDYDREALLGGQDEVDEYVKLNPEEQHKRLKSIIKKIDLDSDGFLTESELSSWIQMSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDDMVTWDEYNIQMYDRVIDFDENTALDDAEEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRRDPTATEDPEWILVEKDRFVNDYDKDNDGRLDPQELLSWVVPNNEGIAQEEALHLIDEMDLNGDRKLSEAEILENQDLFLTSEATDYGRQLHDEYFYHDEL	60665	40482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_43139_45954_46098_46987_47085_52427_52542_57053_57251_59806_59913_60355
891785	contig_18420_pilon	+	1376	13	Intergenic	novelGene_109346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	77.7211450564702	1	81	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	793	1335	97423	102650	FALSE	55	TGGTCAAGAAGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKVTETRE	92274	102691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97414_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101760_102633
891786	contig_1535_pilon	-	5718	6	Intergenic	novelGene_127241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	71	junction_5	335.720717263621	563	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	405	890	132614	129144	TRUE	75	AAAAGTAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136154	123467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_135888
891787	contig_3679_pilon	+	4504	26	Intergenic	novelGene_112120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	82.0102432626559	723	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	70	1581	1025707	1048171	TRUE	10	TCCCGCCACCGGGCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPEIRSTAAPLWYSVNQQKSKSMEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHCILTEDGNQHVYKKLCLCAGAKPKLICEGNPYVLGIRDTDSAQEFQKQLTKAKRIMVIGNGGIALELVYEVEGCEVIWAVKDKNIGNTFFDAGAAEFFTSKLITEKSEAHVAHKRTRYTTEGKRKEAKTKAKASNVGSALGPDWHEGLNLKGTKEFSHKIHIETMCEVKKIYLQEEFTILKKESLIFPRDHHNKLVKTTDKEMWPVYVELTNEKIYGCDFIVSATGVTPNIEPFVHGNNFNLAQDGGLEVDDHMHTSLPDIYAAGDICTASWHPSPVWQQMRLWTQARQMGWYAAKCMAADSLGDSIDMDFSFELFAHVTKFFNYKVVLLGKYNAQGLGSDHELMLRCTKGQEYVKVVMQNGRVMGAVLIGETDLEETFENLILNQMNLSSYGEDLLDPDIDIEDYFD	1025637	1078885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211_1032332_1034957_1035087_1037196_1037271_1040377_1040539_1041248_1041350_1042779_1042919_1043849_1043963_1044587_1044711_1046980_1047119_1047922_1049228_1049811_1049950_1050295_1050516_1051622_1051715_1053425_1053567_1054084_1054199_1054284_1054438_1055508_1055587_1056362_1056535_1060852_1061046_1065291_1065402_1069659_1069842_1070923_1071124_1076662_1076709_1078857
891788	contig_5020_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_27916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	595	942	124926	123330	FALSE	15	CCATGGTCAGGATGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126087	123234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656
891789	contig_10331_pilon	+	3695	2	Intergenic	novelGene_54092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112696	116485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_113628_113721
891790	contig_5125_pilon	-	1648	10	Intergenic	novelGene_43471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	253.261442041009	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	267	1373	110365	75819	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINKDDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	182099	75543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_110198_110395_121095_121211_147517_147570_182029
891791	contig_10958_pilon	-	3524	3	Intergenic	novelGene_5378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	376	1222	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	2134	2853	841828	839744	FALSE	10	ACTAGTTGTTGCTTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	847233	839072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692_841848_845119
891792	contig_9297_pilon	+	7388	2	Intergenic	novelGene_69891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1028	junction_1	0	237	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	91	402	939250	956082	FALSE	30	AGAGACCAAAGGGGCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFRLRPLPLPSLLQPSPPPQPYPLRLVISKMAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQVKCHEQIFRFCTVLGPCVFRLCCKIYKKEFQSRYTSFLNSHCQYSA	939159	963068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939325_955845
891793	contig_11292_pilon	+	2988	3	Intergenic	novelGene_109423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	338	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1229	1609	215508	215888	TRUE	15	TCCACTGTTGCAGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVSLLFAYVRRTYRCFIPRELLAPSWEREAEMQDKNLKNRWQKLSISTEGSYGGVSASSSKGPDWCQSAIPTLLKANLPCPVPRPHSSWMSVLISPTLMLREILRVRFLFHLVLSLGVATWGKF	214279	219607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_216400_216814_216956_218880
891794	contig_14970_pilon	+	4638	2	Intergenic	novelGene_45017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1428	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145687	150395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_149900_149969
891795	contig_9366_pilon	-	11476	43	Intergenic	novelGene_166237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	809	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2488	2853	1031119	1030754	TRUE	55	TAAAAGGTAGGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLSPKSSSGSVYAIISNSPDLKRSSKLGSLVSKLSKVSNSSPLPSSVSRFKFSRSSSSKSLTSTPSRSLTSSSFTDGSIESSFSSRPSEDWLVICKLSDVVSAGVDVDKEVSENSPPKG	1043529	766512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_767339_778772_778859_845089_845226_855677_855882_859063_859207_869111_869230_918087_918251_926693_926866_928718_928834_942410_942579_942982_943138_943922_944038_944953_945026_946753_947472_961775_961894_964175_964294_968999_969099_969269_969377_975721_975905_976156_976320_977277_977390_977889_977953_979021_979237_986836_986966_996450_996572_998921_999054_1001880_1002066_1005404_1005504_1006879_1007019_1007199_1007232_1007331_1007453_1021921_1022050_1022297_1022517_1024139_1024215_1025525_1025708_1026091_1027981_1028645_1028937_1030241_1032054_1032916_1033027_1035308_1035389_1036912_1036979_1038825_1039056_1042462
891796	contig_3394_pilon	+	4161	12	Intergenic	novelGene_152716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	187.765943628702	862	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	357	2195	543591	562769	FALSE	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEWFSQPWGSEENDNHSRLKLYAQVCRHHLAPYLATLQLDSSLLIPPKYQTPPAAQGQATPGNAGPLASNSGSAVPPAGSAFNPTSNGSSANPAASSSAPGSSVPPVSSSSSAPGINQMSTTSSSGFSGSVGGQNPSTGGSSADRTQGNIGCGGDTEPGQSSAQPSQDGQESVTERERIGIPTEPDSADSQAYPPAVVIYMVDPFTYTSEEDSTSGNFWLLSLMRCYTEMLDNLPEHMRNSFILQIVPCQYMLQTMKDEQVFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYSPPFILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCIVNIALPNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLGECSLQTISKQLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTALNMQSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNEDGFSPNNDDMFVDLPFPDDMDNDIGILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLSREAPEELKQQPLALGYFVSTARAENLPQWFWSSCPQAQNQCPLFLKASLHHHISVAQTDELLPARNSQRVPHPLDSKTTSDVLRFVLEQYNALSWLTCNPATQDRTSCLPVHFVVLTQLYNAIMNIL	542573	564735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_542667_543327_543752_544536_544757_545944_546134_549988_550213_550390_550534_553269_553429_554595_554773_556304_556463_558675_558838_561418_561532_562636
891797	contig_11378_pilon	-	1325	4	Intergenic	novelGene_112317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	49.7013301856421	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	82	741	1154702	1152565	FALSE	35	TAGGAATAAACTCAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSWVQETGFCLLGNLGCPLPGDPASPPPREEVPVSNVAELLHQVTMGMKYLEEKNFVHRDLAARNVLLVNRHYAKISDFGLSKALGADDSYYTARSAGKWPLKWYAPECINFRKFSSRSDVWSFGVTMWEAFSYGQKPYKKMKGPEVITFIEQGKRMECPAECPPEMYTLMRECWTYKWEDRPDFVTVEQRMRAYYYSLASKTEGPEGCGQGAEAVRA	1154783	1151980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1152689_1153987_1154101_1154188_1154330_1154420
891798	contig_12021_pilon	+	3706	14	Intergenic	novelGene_172188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	331.25533154133	39	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	387	1622	39446	56241	TRUE	25	GAATTTTGTTGGAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPSAQQDAVFELISMGFNVALWYTKYASRLAGKENITEDEAKEVHRSLKIGAGIFKHLKENHIPKLITPAEKGRDLETRLIDAYIIQCQAEAQEVTIARAIELKHTPGLIAALAYETANFYQKADHALSSLEPAYSAKWRKYLHLKMCFYTAYAYCYHGQTLLASDKCGEAIRSLQEAEKFYAKAEALCKEYGETKGPGPTVKPSGHLFFRKLGNLVKNTLEKCQRENGFIYFQKIPTEAPQLELKANYGLVEPVPFAFPPTSAHWTPETLAMFDLTKRPKDDSTKPKPEEEVKPVKEPDVKPQKDTGCSIS	37623	58367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_37994_39429_39547_42150_42258_42601_42699_45782_45879_47758_47832_48829_48936_49815_49906_52417_52504_53477_53560_53876_54028_54991_55152_56154_57912_57953
891799	scaffold_7386_pilon	+	1970	6	Intergenic	novelGene_136580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	58.6365073994009	416	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	235	1140	287700	290321	TRUE	10	CCCAGCTCCCCTCCCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKGDFDSEPPLKFVEGKDEITGDEYDGLQRVEMSCGHAVDQGSLTAWCRSLMDQGYFKLCCPADVNGEKCGAQWSYPEVRRCAVLSNEEQHQFEQKLALLAARLYCDFKECPRCKSLVERKELSTVRVLCTICTSTLGAGYEFCWQCLQSWKGTGTPPDHCANVGCQDPNLEVLASCATKDLPGSEILACPSIRACPTCGLLIEHKEKCKYVMCSRCHVEFCFACLELAQACQATRAGAWFKCCAKPLAPRQTHIPVWSRTGGGYGGDEVNTGHRVQSHIPPLREVRMREAEQTCMII	287350	292336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_287521_287635_287773_288862_288961_289390_289559_289754_290869_292053
891800	contig_9415_pilon	-	2032	6	Intergenic	novelGene_109935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	254.455811487967	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	128	445	2490739	2468122	TRUE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSGLLSWTLSRVLWLSGLSERGAARRPQIMEEKALEVYGLCLRVKLQRCLPFKHKLEIYISEGTHSTEEDINKQINDKERVAAAMENPNLREIVEQCVLEPD	2490866	2451883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2452132_2465531_2465660_2466910_2468220_2470587_2470634_2472695_2472746_2490615
891801	contig_4402_pilon	+	9262	13	Intergenic	novelGene_140842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1908	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCACCATCCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592355	615569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_594884_595168_597487_599314_599387_600516_600570_600682_600763_600896_600994_602002_602341_602446_602549_603815_603994_609496_609636_610039_610134_610248_610346_612403
891802	contig_6557_pilon	-	2646	1	Intergenic	novelGene_32945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTTAAAGCTATAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346075	343429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_343400_346100
891803	contig_513_pilon	-	3769	22	Intergenic	novelGene_80130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	557.515430981343	1012	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	269	2125	416603	313101	TRUE	25	AAATAAGTCCTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEERIVTWLISLGVLDSPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLVPGSVEKYCLEPQTKADCTNNINDFLKGCAALQVEVFDPDDLYLGVSFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCGRSSSLSAANSSQTNPQGAVSSTAPGLQRQSKAVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGLETAPLTKNYYAVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEFTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLNLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDDLDQFMESQGASSPGILILTTSLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIIAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKTLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSSVLIMLSASPRMSGFIYQGKISIAGMVVTRLDEIEGNDYTFEITGNLTERLVVHCNNSQDLQEWLEQLCRLTRGPASCSSLSKTSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKEVILLHLTGV	416871	302424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_302964_304064_304851_306469_306525_308605_308706_311806_311885_313014_313116_315688_315830_316906_317050_318376_318456_319441_319529_322046_322194_324191_324252_327391_327531_336630_336754_338178_338275_345090_345186_356920_356992_368639_368842_370350_370476_373327_373413_415123_415208_416438
891804	contig_3602_pilon	+	2830	2	Intergenic	novelGene_60614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	1746	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	25	1080	902032	913188	FALSE	35	AATTGTGTGTATAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	902007	914938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135
891805	contig_7932_pilon	-	2041	2	Intergenic	novelGene_128425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAGAGAAACTTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210141	52402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_-_52968_208665
891806	contig_11422_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_99049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2000
891807	contig_5316_pilon	+	2373	10	Intergenic	novelGene_61200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_4	303.512035272995	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	487	1782	453918	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDSSYALTPRTEEKYKKINEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	394509	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_394857_453778_453972_474052_474257_511666_511805_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
891808	contig_7057_pilon	+	945	3	Intergenic	novelGene_123348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	461	5	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	272	943	943044	943715	FALSE	5	CGTGGCATCTGCCTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLVAGRLPAQPCAPAPHSVLPSSFPSNLWVKAEKGIWYFWVPRPSRCAFPSPVAAADYVFLNGNPRPAPSVPRCGVTMDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLL	939057	943717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_939109_941375_941523_942970
891809	contig_7151_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_40707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	807	1331	59493	58969	NA	40	AAACTCTCATTCAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQGQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHVDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKRKNL	60299	58597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_58600_60300
891811	contig_8628_pilon	-	2901	1	Intergenic	novelGene_164440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1623	1952	655597	655268	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEFSTARWCPATTTDCSDRDLNRRFWTELEKDVEQNSNTQKKDQLYWPKGDWRNPESTAPRHPFSSVVKSLPGSPFSWGLDSPIKQNRTNEAQQSRDKG	657219	654318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_654300_657200
891812	contig_13021_pilon	+	3911	10	Intergenic	novelGene_8167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_9	2159.64371775863	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	169	1020	174676	177567	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRVIAFEHCIFKFGS	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177792_178170_178585_178670_180211_180440
891813	contig_10354_pilon	+	1975	1	Intergenic	novelGene_50831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTCCTCTAGAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389475	391450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_+_389500_391400
891814	contig_15267_pilon	+	3840	8	Intergenic	novelGene_151069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	29.1029138032042	319	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	180	1097	40182	56295	FALSE	30	TTAAATTTCCCATATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INKGSVILFSFQRTENSEFEIRRFKACTNNDVDGQRCDRNILYYGNRDLNINIYTCYISMSYNIMKEIGLPLGDICFQECEVFRCEDLLDQRKINMVTELSKSLSSDMRTYNPCRGLVHQIRILLLGPTGAGKSSFINSVKSVFRGRVTNQSVMGFDTKQFRTYSIKDGKDGNPLPFVLCDSMGLGEKEEGLCIDDIFYILKGHVPDRYQFNSIKPITPSHVNYIDCPLLKDRIHCVAFVLDANTVENLSQEMVAKIKRTRREVIKCGVVHVVLLTYVEDLHLITKADLVDPYRCMPVKFKIEAVHRELGFPLSDIFVVSNYTLEWELSLSKNFLILSSLKQMLRAADDFLEDLPPEETDGILK	40002	59038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_40264_44366_44404_45099_45284_45437_45588_49399_49572_50781_50883_55874_56050_56278
891815	contig_12528_pilon	-	1855	9	Intergenic	novelGene_81310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	463.165737074754	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	518	1180	966228	933323	FALSE	40	TGTCTGTAGGCAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968128	932647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_964909_964971_966191_966274_967656
891816	contig_12074_pilon	+	3275	3	Intergenic	novelGene_53774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_1	19.5	1087	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	72	1271	46021	52741	FALSE	30	ATACCTTGACTGGATAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQVFTAAVLLWPLCKLRFYRPSAMAEAMDLGKDPNGPTHSSTLFVREDGSSISFYVRPSPAKRRLSTLILHGGGTLCRVQEPGAVLLAQPGEALAEAAGDFISTQYVLDCVERNERLELEDYRLGSAADQASETKPGAQAEGAAAAVEPDPEPLTGRIAFTEADDVAILTYVKENARSPSSVTGNALWKAMEKSALTQHSWQALKDRYLKHLRGQEHKYLLGDAPVSPSSQKLKRKAEEDPEAADSGEPQNKRTPDLPEEEPEEEKIKENEEPVKKMLIEATREFEEVVGEENESPGFEIHITMCDDDPPTPEEDSETQPDEEEEEEKVSQPEVGAAIKIIRQLMEKFNLDLSTVTQAFLKNSGELEATSSFLESGQRADGYPIWSRQDDLDLQKDDEGARNALVKKFGAQNVARRIEFRKK	45949	54745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_46694_50487_50613_52339
891817	contig_12312_pilon	-	4652	18	Intergenic	novelGene_63959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	893.224426128465	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	98	2656	326065	215838	FALSE	45	AAATAATGCTTTAAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326162	213841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_229403_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241466_242312_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
891818	contig_9931_pilon	-	5530	2	Intergenic	novelGene_134830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	800	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326647	320033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_322531_323614
891819	contig_9668_pilon	+	5985	7	Intergenic	novelGene_58127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1058	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2465	2770	435166	451159	TRUE	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKKLYLSAVGWSVLYMSMRSSWLIVAFKSSMSLLSFFLDVLSFTESDVLKSSTIIVELSISVFNAVRVCFMYFGALSLGALMFIMVMSS	257339	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_257459_266442_266776_266899_267902_271395_272183_434942_435429_451116_451759_596874
891820	contig_14665_pilon	-	3587	18	Intergenic	novelGene_171037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_17	275.211098593293	446	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	874	2625	101	2725	101827	32580	FALSE	25	CAATGCTGTCTGATGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATFISVQLKKTSEVDLAKPLVKFIQQTYPSGGEEQAQYCRAAEELSKLRRAAVGRPLDKHEGSLETLLRYYDQICSIEPKFPFSENQICLTFTWKDAFDKGSLFGGSVKLALASLGYEKSCVLFNCAALASQIAAEQNLDNDEGLKVAAKHYQFASGAFLHIKETVLSALNREPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLKATRDKMKDAIIAKLANQAADYFGDAFKQCQYKDTLPKEVFPVLAAKHCIMQANAEYHQSLLAKQQKKFGEEIARLQHAAELIKTVASRYDEYVNVKDFSDKVSRALTAAKKDNDFIYHDRVPDLKDLDPIGKATLVKSTPINIPISQKFTDLFEKMVPVSVQQSLAVYNQRKADLVNRSIAQMREATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTKSTSVVEQGGIQTVDQLIRELPELLQRNREILDESLRLLDEEEASDSDLRSKFKERWQRTPSSELYKPLRAEGANFRTVLDKAVQADGQVKERYQSHRDTIALLCKPEPELNAAIPSANPAKTMQGSEVVNVLKSLLTNLDEVKKEREGLENDLKSVNFDMTSKFLTALAQDGVINEEALSVTELDRVYGGLTAKVQESLKKQEGLLKNIQVSHQEFSKMKQSNNEANLREEVLKNLATAYDNFVELVANLKEGTKFYNELTEILVRFQNKCSDIVFARKTERDELLKDLQQSIAREPSAPSIPTPTYQSSPAGGPSPTPPTPAPRTMPPSKPQPPARPPPPVFPANRAPSAAAPAPAPAPAPVATGTAASAPSQTPGSAPAPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYSMPYPPVYHQSPGQAPYLGGQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ	101927	31717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_32755_33687_33894_34680_34805_38439_38535_40416_40552_41344_41594_43690_43861_44989_45102_50142_50321_52453_52578_53744_53968_62957_63075_65397_65499_68388_68543_70813_70942_77254_77325_78927_78983_101618
891821	contig_10286_pilon	-	2348	6	Intergenic	novelGene_98405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	256.354910231889	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	325	687	383530	382865	TRUE	45	TAAAGAAAAAGCTGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIDDHDAVLRFNAAPTANFQQDVGTKTTIRLINSQLVTIEGRFLKDSLYNEGILIVWDPSVYHSDIPEWYQHPDYSFFNNYKSYRKMHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	405612	380020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_381013_382195_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405539
891822	contig_5502_pilon	+	1704	8	Intergenic	novelGene_154963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	458.912690108758	513	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	85	1077	357713	398670	FALSE	25	TCTTGGTTGTCTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDN	357628	399297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_398436_398592_398660
891823	SIRV6	+	1426	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	46	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	39	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	186	518	1673	2560	TRUE	10	TTGAAGTTTGCGTTTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1099	11736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
891824	contig_16999_pilon	+	3443	22	Intergenic	novelGene_84999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_17	130.58992262482	660	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2862	166	3027	195656	236848	FALSE	40	CTGAGTGATATAACATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAENVCYTLINVPMDSEPPSEISLKNDLEKGDVKSKTEALKKVIIMILNGEKLPGLLMTIIRFVLPLQDHTIKKLLLVFWEIVPKTTPDGRLLHEMILVCDAYRKDLQHPNEFIRGSTLRFLCKLKEAELLEPLMPAIRACLEHRHSYVRRNAVLAIYTIYRNFEHLIPDAPELIHDFLVNEKDASCKRNAFMMLIHADQDRALDYLSTCIDQVQTFGDILQLVIVELIYKVCHANPSERARFIRCIYNLLQSSSPAVKYEAAGTLVTLSSAPTAIKAAAQCYIDLIIKESDNNVKLIVLDRLIELKEHPAHERVLQDLVMDILRVLSTPDLEVRKKTLQLALDLVSSRNVEELVIVLKKEVIKTNNVSEHEDTDKYRQLLVRTLHSCSVRFPDMAANVIPVLMEFLSDSNEAAAADVLEFVREAIQRFDNLRMLIVEKMLEVFHAIKSVKIYRGALWILGEYCSTKEDIQSVMTEVRRSLGEIPIVESEIKKEAGELKPEEEITVGPVQKLVTEMGTYATQSALSSSRPTKKEEDRPPLRGFLLDGDFFVAASLATTLTKVALRYVALVQEKKKQNSFVAEAMLLMATILHLGKSSLPKKPITDDDVDRISLCLKVLSECSPLMNDIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIVYDVSGAASDRNCVVLSDIHIDIMDYIQPATCTDAEFRQMWAEFEWENKVTVNTNIIDLNEYLQHILKSTNMKCLTPEKALSGYCGFMAANLYARSIFGEDALANVSIEKPIHQGPEAPVTGHIRIRAKSQGMALSLGDKINLSQKKTSI	194807	237264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_194914_195596_195747_199226_199457_199865_200036_201658_201774_202990_203084_204894_205033_209995_210116_211343_211452_211528_211676_212127_212274_213398_213496_219640_219802_220701_220823_224062_224291_224437_224618_229831_229977_230975_231096_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
891825	contig_19707_pilon	-	1705	2	Intergenic	novelGene_178575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGCATTCTTTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145669	143771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19707_pilon_-_144766_144958
891826	contig_10134_pilon	-	2894	4	Intergenic	novelGene_16241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	693.05892005418	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTTAAGTGTGTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39716	32188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33103_33163_33731_34922_35178_38558
891827	contig_11816_pilon	+	4512	3	Intergenic	novelGene_98556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1536	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1416	3097	4512	1249097	1250512	FALSE	55	CAAAAAAAAACCCTGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALQNDSKKLTSINNYTECKWTQCTHKTTESDTMDKKTGSINMLSTTDTPQKQRHEFIKNQRWKNIYHANNYQKRTGVAMLISDKIGFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYVKQTLTIRKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTIKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLQPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIKNIEIIKSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKISTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDRIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTQLKQIEREQQKKPTATRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIGNEIGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNIFENLNEMDKFLETHYLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTPN	1156545	1250512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1158378_1158620_1159038_1248249
891828	contig_10331_pilon	+	5350	1	Intergenic	novelGene_54088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCCCCAGTAGGGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107971	113321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_108000_113300
891829	contig_14101_pilon	-	2918	1	Intergenic	novelGene_122752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	700	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCTTCATGTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78557	75639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_75600_78600
891830	contig_5217_pilon	-	981	5	Intergenic	novelGene_135764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3221.55004423337	25	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559966	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_558964_559374_559858
891831	contig_17068_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_172565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	112	474	9770	10132	NA	80	AAAAAAAGAAAAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9658	10516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10500
891832	contig_6557_pilon	-	1681	4	Intergenic	novelGene_32951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	212.086460356777	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	92	514	356924	345035	FALSE	20	AGGGTTGAGAGTGCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGAVNGFDPAPPPPGLGSSRPSSAPGMLPLSV	357015	343867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_345129_352014_352167_356204_356297_356839
891833	contig_610_pilon	+	3483	2	Intergenic	novelGene_76723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	518	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGATCCTGGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213488	223226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517
891835	contig_5684_pilon	-	640	4	Intergenic	novelGene_81019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	984.932823428414	200	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTGAACTCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361450	351255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351469_351551_351696_358661_358810_361315
891836	contig_10437_pilon	+	2644	8	Intergenic	novelGene_38432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	310.619525780203	30	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	299	1087	855599	866122	TRUE	25	CAATGCAGTACTCCCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSEQPLKGKELRECECVCVRARARVCAQGGGGSRVRVPTPWTPFAILSPHHTHLSGGGGRYICVSFHSFSNLFKFEGWGWWGQAGKGKAADGAEEEVGDMEMKKRINLELRNKAPEEVTELVLDNCRCVNGEIEGLNDTFKELESLSMADVELSSLARLPSLNKLRKLELSNNSISGGLEVLAEKCPNLTYLNLSGNKIKDLSTVEALQNLKNLKSLDLFNCEITNLEDYRESIFELLQQITYLDGFDQEDNEAPDASDEEDDDDGDEDDEDEEDEAGPPEGYEEEEEDDDEEDEEEDDEAGSELGEGEEEVGLSYLMKEEIQDEDDDDDYVEEGEEEAEEEEEGLRGEKRKRDADDDGED	855300	868235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_855653_858352_858503_858971_859095_859810_859980_861103_861280_865323_865379_866060_866360_866915
891837	contig_935_pilon	-	2631	11	Intergenic	novelGene_45545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	304.823621131959	62	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	55	1551	370806	345477	FALSE	5	TTTCTGACTTCTGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	377434	344396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362026_362157_362245_362606_362749_368062_368292_370637_370822_377395
891838	contig_10074_pilon	-	5680	31	Intergenic	novelGene_57116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.17950549357115	23	70	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	4565	4948	314121	307568	TRUE	40	CCATAAATTTATCTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVNNLKKGLAASGVNFAIDVKSIDTICSASRLLYRQRLKIRLQVCRILMPSRICWNKKGNPSLSETVQPKERPKRPSSQARLVCTSLLPEREHPLPPPLLPLLLLTTPQLEDFQALWFPCKNVPL	395680	297627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_297635_297751_297853_301175_301242_301336_301412_301493_301542_301660_301727_303591_303673_306783_306871_307260_307429_307534_307612_308912_309063_312636_312744_312821_312865_314081_314190_315816_315967_320557_321193_323132_323289_324791_324871_326376_326504_327137_327246_328515_328623_328738_328862_329875_329998_338510_338589_341260_341405_341505_341651_342584_342744_356962_357079_358110_358287_359405_361333_395536
891839	contig_10930_pilon	-	1716	1	Intergenic	novelGene_37075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289049	287333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_289000
891840	contig_8330_pilon	-	4319	17	Intergenic	novelGene_71848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.114485858369	2	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	2070	3053	916108	896249	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	930408	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_895329_895449_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051_916445_923731_923863_924653_924845_925607_925751_926083_926267_928091_928267_929178_929388_929707
891841	contig_9668_pilon	+	1162	3	Intergenic	novelGene_58148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	325	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	5	427	351736	359314	FALSE	25	GAGAATTATGGTTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMPQLTPQIPLTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	351731	360049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_351797_355527_355714_359138
891842	contig_11855_pilon	-	1814	10	Intergenic	novelGene_66966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_9	2007.82790320508	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	265	1335	1087425	1079293	TRUE	15	CAGACTTGATTGTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102138	1077289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1101936
891843	contig_7963_pilon	+	2140	3	Intergenic	novelGene_58567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_1	177	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1136	1738	251430	253116	FALSE	10	CAGTGGTTTCTAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIKILSLASQDKNSPVFLVLNIYRISSQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	250294	253518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_251683_251956_252094_252903
891844	contig_5502_pilon	+	1248	4	Intergenic	novelGene_154982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.955410846827	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	321	623	395703	398670	FALSE	25	TATCTTGGTTGTCTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDN	377704	399295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_377841_395518_395841_398436_398592_398660
891845	contig_6980_pilon	+	2010	8	Intergenic	novelGene_36057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	489	junction_3	552.180020926332	4	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	19	912	356720	372790	FALSE	30	TTACTGTGTCATTGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	356701	373888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
891846	contig_6304_pilon	+	3037	11	Intergenic	novelGene_122242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	132	junction_7	160.932936343062	142	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	34	1290	70293	180531	FALSE	15	TAATTTTCTCATCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGGGQHYQGQQPPMGMMGQVNQGNHMMGQRQIPPYRPPQQGPPQQYSGQEDYYGDQYSHGGQGPPEGMNQQYYPDGHNDYGYQQPSYPEQGYDRPYEDSSQHYYEGGNSQYGQQQDAYQGPPPQQGYPPQQQQYPGQQGYPGQQQGYGPSQGGPGPQYPNYPQGQGQQYGGYRPPQPGPPQPPQQRPYGYDQGQYGNYQQ	70259	182278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695_128850_132145_132368_161430_161599_162289_162395_166204_166298_167002_167126_168549_168684_180504
891848	contig_4103_pilon	-	3286	24	Intergenic	novelGene_51988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	308.900477056767	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1866	1420	3285	253282	203534	FALSE	75	GAAAAGAAAAGAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREK	300530	203532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_238934_239038_239972_240117_240287_240416_243058_243147_253240_253298_264115_264226_269098_269275_269525_269764_276615_276711_282406_282641_286814_286963_287688_287837_289084_289200_300390
891849	contig_2703_pilon	-	6197	8	Intergenic	novelGene_101772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTCCACATTGGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611736	595098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607653_607730_609318_609400_610754
891850	contig_4211_pilon	-	2845	9	Intergenic	novelGene_80244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1333	1647	1146329	1146015	TRUE	15	ACTGCCTTCTCTCATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRNLKYWGKKRRKKKVETLYRQKSKFFKGFCVPCTWGQFVHTSEMNTSYNASSCSNDVESWSRCGNDVTVWFFLCQLNSLLLFKNQEAVELCCSLLSVRVST	1147661	1135316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1135480_1135973_1136102_1136452_1136573_1138701_1138927_1140212_1140377_1141033_1141179_1142890_1143011_1144657_1144740_1145963
891852	contig_14047_pilon	+	9438	3	Intergenic	novelGene_176579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	147.5	6	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	56	610	27097	28355	TRUE	35	AATCTTCTTACGAACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSQQTAAVKAKTLEAFLAMTRPQLLEYATKVILDFNTAHNKVALSENYTTASVAETPQNYRPHPQRFTYCSQVLGLHCYKRGVHYWEVELQKSNFCGVGICYGTMERQGPESRLGRNSASWCVEWFNTKISAWHNNVEKTLPLTKATRVGVLLNCEYGFVIFFAVSDKIHLLYKYRVDFTEAVYPAFWVFSAGATLSVCFSK	27041	48821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_27122_27825_35613_47250
891853	contig_3463_pilon	-	2906	16	Intergenic	novelGene_61991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	171.521375409079	609	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	188	1810	597436	508757	FALSE	65	AACATGAAAAATAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	643590	507660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_597388_597532_643498
891854	contig_10135_pilon	-	3167	6	Intergenic	novelGene_106584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.8156234108661	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	14	886	30981	29065	TRUE	20	TTCCCTAGGGGGAGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHRMFDIVGTHLTHRDVRVLSFLFVDVIDDHERGLIRNGRDFLLALERQGRCDESNFRQVLQLLRIITRHDLLPYVTLKRRRAVCPDLVDKYLEETSIRYVTPRALSDPEPRPPQPPKTVPPHYPVVCCPTSGPQMCSKRPARGRATLGSQRKRRKSVTPDPKEKQTCDIRLRVRAEYCQHETALQGNVFSNKQDPLERQFERFNQANTILKSRDLGSIICDIKFSELTYLDAFWRDYINGSLLEALKGVFITDSLKQAVGHEAIKLLVNVDEEDYELGRQKLLRNLMLQALP	30994	26391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_26491_26713_26851_27019_29442_29992_30140_30429_30538_30740
891855	contig_6364_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_51834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACGCTACGGCGTCCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601903	1604526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1603405_1604402
891856	contig_3252_pilon	+	5826	17	Intergenic	novelGene_61498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1226	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	3940	4401	317166	320321	TRUE	15	GCGGGAGTTGGTCACTGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSAMLTASTRSFFRRSSSAYFSAFLTIFSISSLLNPPEDWITTLLLTSCALIFGRNMYNPVGINVKCNFNLRDSTRGWGNSNQSKLSKKFVISSHLSLTLAHFNLHLSLSISSCRKYLALLGWNSGVPVNKFSKDTSQSLNTQRQGSDIQE	312711	337066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_316457_316791_316931_317110_317203_317566_317665_318067_318185_319216_319319_320213_320443_321509_321733_330830_330916_332024_332188_332682_332789_332879_332955_333545_333671_334400_334585_335099_335188_335436_335492_336866
891857	SIRV5	+	716	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-389	878	-275	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCGCCAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7926	10988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
891858	contig_5758_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_119120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	134	493	432881	433240	NA	65	CATCAACCAAAAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKVTRKALARERKGPINRRLHQPETRRTRWCLATTNDRPDREHNRESLTEQEKSGVQNSNSSKNTRFNGLRWEEEQKAWPLDSVNPELKPFPRQLFRQRLDWTMGHKKDTREECVS	432747	434498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_432700_434500
891859	contig_5686_pilon	+	1319	2	Intergenic	novelGene_45332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAATAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110855	123289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_111280_122394
891861	contig_16303_pilon	-	2100	7	Intergenic	novelGene_34072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	720.089577760989	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	98	913	45428	35759	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45525	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33555_35037_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_45370
891862	contig_9705_pilon	+	5092	39	Intergenic	novelGene_41748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_37	250.751856956859	2407	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1594	4785	25	4809	450139	551256	TRUE	40	CATCCAGAAGCAGCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVVVPAEWIKNWEKSGRGEFLHLCRILSENKSHDSSTYRDFQQALYELSYHVIKGNLKHEQASNVLNDISEFREDMPSILADVFCILDIETNCLEEKNKRDYFTQLVLACLYLVSDTVLKERLDPETLESLGLIKQSQQFNQKSVKIKTKLFYKQQKFNLLREENEGYAKLIAELGQDLSGNITSDLILENIKSLIGCFNLDPNRVLDVILEVFECRPEHDDFFISLLESYMSMCEPQTLCHILGFKFKFYQEPSGETPSSLYRVAAVLLQFNLIDLDDLYVHLLPADNCIMDEHRREIVEAKQIVRKLTMVVLSSEKMDEREKEKEKEEEKVEKPPDNQKLGLLEALLKIGDWQHAQNIMDQMPPYYAASHKLIALAICKLIHITIEPLYRRVGVPKGAKGSPVTALQNKRAPKQAENFEDLRRDVFHMFCYLGPHLSHDPILFAKVVRIGKSFMKEFQSDGSKQEDKEKTEVILSCLLSITDQVLLPSLSLMDCNACMSEELWGMFKTFPYQHRYRLYGQWKNETYNSHPLLVKVKAQTIDRAKYIMKRLTKENVKPSGRQIGKLSHSNPTILFDYILSQIQKYDNLITPVVDSLKYLTSLNYDVLAYCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKDNLIELKESSAKLYINHTPPPLSKSKEREMDKKDLDKSRERSREREKKDEKDRKERKRDHSNNDREVPPDLTKRRKEENGTMGVSKHKSESPCESPYPNEKDKEKNKSKSSGKEKGGDSFKSEKMDKISSGGKKESRHDKEKIEKKEKRDSSGGKEEKKHHKSSDKHR	450114	557417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_462681_462741_466106_466199_468452_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229_541289_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695_550773_551228_551275_557152
891863	contig_1516_pilon	-	3211	2	Intergenic	novelGene_49921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	310	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTTTTCGATCCCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166826	88167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_90872_166319
891864	contig_13021_pilon	+	1577	6	Intergenic	novelGene_8217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3475.0335480395	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	951	1337	180464	180850	FALSE	55	ATTTGAAATACAATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	177722	181090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179585_180211_180440
891865	contig_14666_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_39636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	138	797	484281	484940	NA	75	TTATTAAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	484143	485227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484100_485200
891866	contig_9774_pilon	-	4211	3	Intergenic	novelGene_178244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1990	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1129	1563	24761	24327	TRUE	35	GAGGCGAAAAGTATTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKEQRKTKRP	26630	1075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9774_pilon_-_3583_24185_25577_26317
891867	contig_10953_pilon	+	642	1	Intergenic	novelGene_42604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463821	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_463800_464500
891868	contig_9633_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_139623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGATTACTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037204	1039404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1037200_1039400
891869	contig_7342_pilon	+	1612	13	Intergenic	novelGene_71232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.475485677385	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1461	150	1610	717166	738095	FALSE	70	AAAAGAAGAAAAAGACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPEEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVSSSSGRNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCINHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSERKECEVKKEKSSSVDRHHSVEIKTEKTIIKKEEKSERKEEKKPGDI	716948	738097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717032_717099_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727572_728492_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034
891870	contig_15491_pilon	-	1842	4	Intergenic	novelGene_75950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	505.412262965152	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	61	450	46982	32151	FALSE	25	TTGCTTATCAAAGAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDTMKRLLFLYIPTSIMF	47042	30758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32204_38904_39040_45107_45207_46879
891871	contig_8516_pilon	+	5869	3	Intergenic	novelGene_178609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2506	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	4483	4920	138425	139155	FALSE	40	GGAAGTCTCTCCAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRIKAPGSNQRSSPDPEAVACPNVAPQPRRNGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAARPVARNPSSRQPRVQSLQPREAEEQTNKGPGI	644	140104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8516_pilon_+_4184_137481_138831_139123
891872	contig_567_pilon	-	3265	12	Intergenic	novelGene_33951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_1	823.965186217945	64	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	38	1105	338158	308820	FALSE	15	TATTGACTTTCCCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKQDPSVLHMEEMRFLREWVESMGGKIPPATHKTKSEENIKEEKTDSKKPEENIKTDEPSSEESDLEIDNEGVIEPETDAPQEMGDESVEITEEMMDQANDKKVAAIDALNDGELQKAIELFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFIKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAAHDLALACKLDYDEDASAMLKEVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREVKERIERVKKAREEHERAQREEEARRQSGAQYGSFPGGFPGGMPGNFPGGIPGMAGGMPGMAGMPGLNEILSDPEVLAAMQDPEVMVAFQDVAQNPANMSKYQSNPKVMNLISKLSAKFGGQA	338195	306659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_308949_309471_309606_312031_312081_313588_313706_315085_315189_317467_317579_317714_317800_322254_322322_326925_326997_329281_329358_331040_331099_338090
891873	contig_16148_pilon	+	2935	13	Intergenic	novelGene_50358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	808	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAAAATGGCGCCGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58690	153083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_59177_63746_63847_74693_74884_75357_75527_77699_77841_78423_78609_84568_84628_85706_85775_88827_89048_89182_89311_111367_111490_150788_151736_152963
891874	contig_1150_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_61416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	210	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
891876	SIRV7	-	1921	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	23	518	18	-516	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACACAAACCTATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147900	1521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
891877	contig_18272_pilon	+	8568	3	Intergenic	novelGene_7050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.5	1915	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470688	481165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_473986_474040_478146_479999
891878	contig_9053_pilon	+	3520	1	Intergenic	novelGene_87934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTAAAAGTAAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133325	136845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_133300_136800
891879	contig_12654_pilon	-	4179	1	Intergenic	novelGene_129291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTACATGACTAATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758245	754066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_754100_758200
891880	contig_8476_pilon	-	2947	15	Intergenic	novelGene_121321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	315.499062064002	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	648	1334	160701	40454	FALSE	20	GAGCGATTTGGAGCATCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSRNGSVVCTYTVNETYTKSVTPVSVQLNSMLCPAPTLNKAGETLDVSVSFNGGKSVFSSSLIVTATECSNGIAAIIAILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPRPPPPPPKEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVTIPEETEEPIRPRPPKPKPTYQPPQALLRRQYDRVSLMRPQEGDEGRCINFSRVPSQ	208716	38840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_40493_104782_104843_106954_107099_113163_113254_114099_114145_130076_130173_144931_145011_158029_158100_160637_160737_163397_163459_187437_187511_188567_188843_189298_189381_206168_206241_208667
891881	contig_20293_pilon	-	3060	1	Intergenic	novelGene_153540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATAAGATCATATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	140610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_140600_143700
891883	contig_6227_pilon	-	1396	6	Intergenic	novelGene_49821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	363.916144187092	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	91	615	1373265	1361608	TRUE	20	CAAACAGCCTGTGTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVPGALSAPRRGRGGHRGGRGRFGIRRDGPMKFEKDFDFESANAQFNKEEIDREFHSKLKLKEDKLEKQEKPVNGEDKGDSGVDTQNSEGNADEEDPLGPNCYYDKTKSFFDNISCDDNRERRPTWAEERRLNAETFGIPLRPNRGRGGYRSRGGLGFRGGRGRGGGRGGTFTSPRGFRGGFRGGRGGREFADFEYRKTTAFGP	1373355	1359793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1360366_1360494_1360671_1361574_1361632_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168
891884	contig_6058_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_172390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCGAAGACCAGAATATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382679	384091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_382700_384100
891885	contig_9113_pilon	+	6218	1	Intergenic	novelGene_68598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1285	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1209	1511	357158	357460	NA	25	GATGCCCAATGCGACGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPLCSALIKFMKENFAYCFCYSCLLCLRNTNGSQEEAIPNHGKVSERSLDLYYECFPVLLGTALEIGFKKSSKSLFQLSNFMKSPIQWLLNISGYHRLV	355949	362167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_355900_362200
891886	contig_9415_pilon	-	466	6	Intergenic	novelGene_109741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2010	junction_1	826.127738306855	228	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	3	463	465	561640	561638	FALSE	25	TGACCTTATTTCAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGNVALDNLQIKENALSELDVPFKVKAGQIGKLTLKIPWKNLYGEAVVATLAGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELSRIEEALQKAAEKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVKITDIHIKYEDDVSDPTRPLSFGVTLGELSLLVM	583060	561636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_580082_580126_583012
891887	contig_6102_pilon	-	2550	6	Intergenic	novelGene_32036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	155.918440217955	540	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	585	977	555460	553797	FALSE	30	TCGGTAACAAATTACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFRINPDGSQSVVEVPYARSEAHLTELLEEVCDRMKEYGEQIDPSTHRKNYVRVVGRSGESSELDLQGIRIDSDISGTLKFACESIVEEYEDELIEFFSREADNVKDKLCSKRTDLCDHALHISHDEL	556839	552223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554643_555412_555529_555692_555806_556436
891888	contig_12437_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_169077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCCTTAGGATGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75462	77203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_75500_77200
891889	contig_10042_pilon	+	2930	8	Intergenic	novelGene_79112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	314.07343480304	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	308	1459	42711	53427	FALSE	10	GTGAGAGCTTTGCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6324	54898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
891890	contig_20460_pilon	+	2469	3	Intergenic	novelGene_163949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.5	30	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATGTTGTCTTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3321	18171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20460_pilon_+_3976_11079_11180_16456
891891	contig_8682_pilon	-	4911	10	Intergenic	novelGene_165264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	357.54940951834	722	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	583	1515	89446	55026	FALSE	35	ATGAGTCAGAACTGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFVAILLITLFAGDIELE	134572	51629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100234_100406_133589_133757_133955_134063_134506
891892	contig_5023_pilon	+	2053	10	Intergenic	novelGene_7355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_1	1217.46437573049	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	351	1451	618569	646990	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	616275	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
891894	contig_8354_pilon	-	3184	25	Intergenic	novelGene_24102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	20	junction_1	90.0137335200703	770	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2862	98	2959	327570	221213	TRUE	30	CAGATGGTCAAGAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHPGASSGGGASGPGADRYTALPGRRASAGAAMITSAAGIISLLDEEEPQLKEFALHKLNAVVNDFWAEISESVDKIEVLYEDEGFRSRQFAALVASKVFYHLGAFEESLNYALGAGDLFNVNDNSEYVETIIAKCIDHYTKQCVENADLPEGEKKPIDQRLEGIVNKMFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQCLIFLDDPQAVSDILEKLVKEDNLLMAYQICFDLYESASQQFLSSVIQNLRTVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEKESESMETEEKTVSALVGKTPEASPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAVSDVNDDVRRAAVESLGFILFRTPEQCPSVVSLLSESYNPHVRYGAAMALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKMPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAKAKKKEKEKEKKEEEKMEVDEAEKKEEKEKKKEPEPNFQLLDNPARVMPAQLKVLTMTETCRYQPFKPLSIGGIIILKDTSEDIEELVEPVAAHGPKIEEEEQEPEPPEPFEYIDD	327667	219060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_219277_221203_221360_230251_230399_231375_231463_232863_232957_240651_240822_247565_247669_256652_256770_259837_259953_296384_296450_297453_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296_307426_308574_308636_312425_312653_315101_315246_317291_317498_320772_320943_321129_321204_322339_322384_327554
891895	contig_6740_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_142688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	253	762	769	1530	624915	624154	NA	35	AGGCAGCCCTCAGAGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRWRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTVKDKEGHYVMIKGVIRHEDMNIINIYAHNDRAPKYITQTLTVLKREIDSSTIIVGDFNTSLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILSKIQNVEIIQSIFSDHSAIKVEINNRRSKGKKTNYMETE	625683	624040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_624000_625700
891896	contig_1639_pilon	+	3836	1	Intergenic	novelGene_74927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	118	561	375384	375827	NA	45	AAGTCCACAACCACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEETDREQRVRRNTRRGSYQLREHGFAILDSCQKSANGVWESSFTEFPGGNRTSSKQQYMLFRPPPFFTPSRPPILPAAAVSWLGGTAFSPLLLGFHPPTLASSLSAICFCWSCFFSPSFGFFHTSPHLPLLFLKHLAPCAIFASF	375266	379102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_375300_379100
891897	contig_8674_pilon	-	2188	3	Intergenic	novelGene_102944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	616	1434	676431	673939	FALSE	45	AAAATCACATGATCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMVQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLIENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKFKTSTTELKQIEREQQKSLQPPEERK	678122	673184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_674095_675768_676917_677992
891898	contig_4426_pilon	-	1828	4	Intergenic	novelGene_15422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	428.922163360932	22	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1740	87	1826	904546	820457	FALSE	50	GGAAAGTAAGGAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKRPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHI	904632	820454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868895_890037_890139_904482
891899	contig_8673_pilon	-	2935	6	Intergenic	novelGene_129926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_3	91.7941174585823	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	115	780	338208	324321	FALSE	45	GAAAATAAAAGAGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGESDWSGGVLAWRALRTSETFLRVKRLLLEDYCPEEKMFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	352744	322165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_352650
891900	contig_6497_pilon	+	3072	3	Intergenic	novelGene_35652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	116	463	808441	809538	TRUE	20	ATGCCACATTGTTTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIIKKNISRSILKYNTVIDRIISICYKEDQLIQLLFKFMHRTLRPKMKKLKIFFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNGKVGNKGGGSVVGKYGLGDRNNTGDRVIEFCKTNNLFIVNTFFQQHEQQLYKWTLLDGIHRNHIWERNNGEAQYH	808325	882455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_808550_809299_810200_880507
891901	contig_8310_pilon	+	1649	12	Intergenic	novelGene_75561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_7	421.737707840876	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	85	684	272460	295404	TRUE	20	TGCTACCACCTTCACGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDQR	215106	308484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295395_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971
891902	contig_10197_pilon	-	7020	13	Intergenic	novelGene_115262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_12	159.825599395786	1929	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	47	1756	1143371	1107972	FALSE	0	GCTTCCTCCTTGTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAGPPGRAVPRRAMAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTSGTVGGTAEPEHEETSWMNGWLSCKAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRLLGSACFAVSCLLIAYGASNPDSLSVLIFISLALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFIALMIGSYASSAVTFPGVKVIYDFGVSFIAILVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDMDYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQAALQEGHKLCLSTVDLEVKCQPDAAAAPSFMQSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQDIVSLYTSIFGVLQLLCLLTSPVIGYVMDWRLKECEDASEEPEEKDASQGEKKKKKRDRQIQKISNATRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGFIHSAAGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLGLSMLGFCLPLYLICYRRQLEQQLQQKREDDKLFLKINGSSNQEAFV	1143417	1102707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1108134_1108600_1108725_1109972_1110047_1112032_1112166_1113554_1113694_1116490_1116638_1117310_1117514_1117601_1117736_1118342_1118436_1131243_1131321_1132154_1132211_1133770_1133979_1143211
891903	scaffold_12124_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_22157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	622	927	982587	982282	NA	10	TTCCACTCATGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	983208	981788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_981800_983200
891904	contig_5018_pilon	+	2931	23	Intergenic	novelGene_47204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_19	472.894850105389	1242	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	233	2218	1596083	1606815	TRUE	20	TTTTTAAGGCGTGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVDQYFYGIHNDIQHAGVQYILDSVVSALVAEPTRRFIYVEIAFFAQWWHQQTKAKQEVVRDLVRQGRLEFANGGWVMNDEAATHYGAIIDQMTLGLRFLEDTFGIDGRPLVAWHIDPFGHSREQASLFAQMGFDGFFFGRLDYQDKKIREEMLEMEQVWRASASLKPPAADLFTGVLPNMYSPPENLCWDMMCDDKPVVDDPNSPEYNAKELVNYFLQLAAAQGQHYRTNHTIMTMGSDFQYENANVWFKNLDKLIQLVNTQQASGSRVHVLYSTPACYLRELNKANLTWSVKQDDFFPYADGPHNFWTGYFSSRPALKRYERLSYNFLQVCQQLEALAGPAANPGPYGSGESVPLREAMAVLQHHDAVSGTSRQHVADDYARQLAEGWGPCEVLLNNALARLSGSKENFTFCRELNVSVCPLSQTAAHFQVTIYNPLGRKVDWMVRLPVQEGVFSVRDPNGLTVPSEVLTLPGSDSQEYPPELLFSALVPALGFSTYSVDRLPRQKPRARTRRPRPQSRVLVIQNEHIRASFNPDTGLLVEIENLDQNLLLPVRQAFFWYNASTGDNVSSQASGAYIFRPNQQEPLPVRHWAETRLVKTSLVQEVHQNFSAWCSQVVRLYPGQRHLELEWTVGPIPVGDGWGKEVISRFDTTLETDGRFYTDSNGREILERRRDYRPTWNFSQTEPVAGNYYPVNSRIYITDGNMQLTVLTDRSQGGQQPERWLPGAHGAQKAAER	1595329	1608516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1595356_1595526_1595701_1596050_1596245_1596895_1597029_1597282_1597429_1597973_1598091_1600267_1600351_1600430_1600552_1600631_1600711_1600895_1601006_1601161_1601270_1601654_1601772_1602713_1602891_1604030_1604129_1604212_1604331_1605512_1605632_1605720_1605823_1606004_1606093_1606293_1606376_1606789_1607034_1607431_1607588_1607676_1607780_1608280
891905	contig_7730_pilon	+	4060	4	Intergenic	novelGene_156286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	156.276108929747	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	119	1582	357723	456360	TRUE	20	TCTGTTTTACTCCAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKCSSRRNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSPSQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPILASTELDDVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPPVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLADNLMDDLLDNITLPSSQSSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPPSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYSNQTLQDLLSSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLHNDPMMSFAAQPNQGSLVNQNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMGLSDSSSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMGHDKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG	357604	477095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_357786_454959_456396_472414_473997_476234
891906	contig_3956_pilon	+	1313	3	Intergenic	novelGene_14751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1	513	793983	795588	FALSE	45	ATTGAAGGAATCCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALGCWPTSRPCKSLTSATTSWRSCPLTS	793982	796388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_793990_795012_795437_795506
891907	contig_11363_pilon	+	2437	2	Intergenic	novelGene_160499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1722	2264	230590	231132	FALSE	55	AAGACAAACAAAGAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKRLQKQDRMVPVGIQNKTPDDLSVEEKALDLTDREFKSLIFRIIKELKQKTDKNKEKIDKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMNSIIEGLRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLRKNQKKRMKRNEETLRIMWDTIKSKNLQVTGVPE	185481	231305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_186784_230170
891908	contig_8365_pilon	-	423	4	Intergenic	novelGene_150918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	89.8109124772708	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAGATCAGACGTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210957	110719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_110902_175907_176023_188977_189040_210893
891909	contig_13217_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_140894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTCATTTTCGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20992	19549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_-_20571_20665
891910	contig_312_pilon	-	2700	1	Intergenic	novelGene_128309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1416	1754	417345	417007	NA	45	AAAACCTGATCAAATTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	418760	416060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_-_416100_418800
891911	contig_10581_pilon	-	5927	19	Intergenic	novelGene_41390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.658826110571	749	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	869	1738	627511	609845	TRUE	50	AAAGACCAGTCTCGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649937	592487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_592744_596205_596526_597485_598035_599668_600016_602751_602874_604714_604881_605093_605193_606918_607059_607654_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632160_633201_633384_649645
891912	contig_5696_pilon	+	4166	14	Intergenic	novelGene_117553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_10	548.847237344626	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1345	4038	27	4064	689252	738140	FALSE	45	TTAATAAAATGTGTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFADTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	684392	738242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_731914_732065_732417_732505_734430_734596_737775
891913	contig_15666_pilon	-	2435	6	Intergenic	novelGene_70148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	335.352113456886	313	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	186	1355	110619	107848	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQRLWPSSPLFPTAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110804	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
891914	contig_14970_pilon	+	3051	13	Intergenic	novelGene_44977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_5	6471.95119127317	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	132	1754	136145	231550	FALSE	55	GCTTTATGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATQQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136013	232847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_210762_210859_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
891915	contig_9706_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_20778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGGTTAATCTTTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643	314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_300_600
891916	contig_854_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_36406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGAACTGTGCATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986564	987915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_986600_987900
891917	contig_5556_pilon	-	2011	2	Intergenic	novelGene_173274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	771	1094	148925	148602	TRUE	50	AAAACTCATGAAAAGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGVQNKTPDDFPVEEKTLELSDREFKSLIFRIIQELNQKADKNEEKIDKFIDKADQFMENTDKKMEEFKKIQEQNAKMNSQLEIIQKQQLEIEKITRSQKWTVS	149695	147430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_148063_148316
891918	contig_2204_pilon	-	4157	5	Intergenic	novelGene_71692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	158	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGATACCAAAAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425074	203053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_204222_366324_367049_376168_376445_386524_387072_423632
891919	contig_4402_pilon	-	5841	16	Intergenic	novelGene_140843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	245.047659763474	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1234	3705	313	4017	624811	594180	FALSE	70	AAAGAAAAAGCACAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAIDDSSASISLAQLTKTANLAEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEESKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTR	625123	592355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610344_612401_612447_617131_617169_619559_619660_624645
891920	contig_3942_pilon	+	1997	4	Intergenic	novelGene_128705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	876	junction_1	152.513023123346	18	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1515	1823	428548	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	427033	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_428587_429453_429607_429798_429853_429936
891921	contig_7202_pilon	+	1167	3	Intergenic	novelGene_17544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4908	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGAGCGCCGGGTTCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	30046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
891922	contig_7253_pilon	+	6192	27	Intergenic	novelGene_140191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGAAGTGGGGCTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144688	239352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_144941_147029_147191_148803_148938_154089_154182_157357_157470_161651_161811_161934_161998_165964_166088_169479_169608_170672_170817_172774_172931_175884_176021_178169_178300_178449_178512_178951_179096_179453_179511_179594_179676_179760_179841_183738_183886_184495_184632_187286_187370_188863_188946_189384_189487_194907_195023_196079_196148_196977_200169_239298
891923	contig_11986_pilon	-	2629	4	Intergenic	novelGene_69154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1534	junction_1	26.1321428300262	14	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	3	722	517427	516708	TRUE	10	TCTTGCGTGTGTTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSLSTLSPQSAHPVPSVCPPCPHSLPTLSPQSVHPVPSVCPPCPHNLSTLSPQSVHPVPTIRPPCPLSLSTLSPQSAHPVPSVCPPCPHNLSTLSPQSVHPVPTICPPCPLSLSTLSPQSAHPVPSVCPPCPHNLSTLSPQSVHPVPTICPPCPLSLSTVPTICPPCPHSLSTLSPQSVRPVPSVFPLCPLSLSTLFCQSVCPILGRVAESRLWSAAVKWVTYGVVTACVPTPHQWPG	517429	507202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235
891925	contig_14300_pilon	+	3008	8	Intergenic	novelGene_133087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	766	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACACTTTAAAGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141448	185200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_143327_148561_148682_149579_149698_154430_154578_155812_155889_157171_157298_180214_180362_184804
891926	contig_15974_pilon	+	1226	2	Intergenic	novelGene_164813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTATATTTATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152081	189797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_153260_189749
891928	contig_12654_pilon	-	616	3	Intergenic	novelGene_129336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_1	9	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	109	426	827177	817652	FALSE	35	AGAGAATCTGGTTAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYSYVKSTKLVLKGTKAKSKKKKNKEKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTLGAPHKEGLCPVEAGEGKKPPKVRIL	827285	817461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_817837_823815_823887_827115
891929	scaffold_19766_pilon	+	3080	14	Intergenic	novelGene_34427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	137.919451666286	91	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	974	2809	845894	851417	FALSE	40	AGTAAAGCACCTACTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844402	851688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
891930	contig_3382_pilon	+	5542	3	Intergenic	novelGene_124177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1093	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCTTTGCTGCCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952504	993456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_952516_984536_985018_988406
891931	contig_5125_pilon	-	6524	11	Intergenic	novelGene_43467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	264.359527916056	890	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	219	1337	110365	72060	FALSE	10	GTTCTGTTTTATGTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINKDDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKNASFT	182051	66872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_72076_75822_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_110198_110395_121095_121211_147517_147570_182029
891932	contig_7056_pilon	-	2014	12	Intergenic	novelGene_43619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1075.78617802352	2	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	37	1275	730480	723226	TRUE	10	GCAATTTGTCTTGTCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAVFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730516	721895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725982_726980_727080_728561_728706_728906_729063_730383
891933	contig_10958_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_5327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	380	1027	101854	102501	NA	55	AATCAGAGCAGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEYITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKTETDSSTITVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTMSQLDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRNSNEKKSTAWKLNNTLLTHHWVIEEMRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLREQFIAKDAQIRKKEEGTKSKH	101474	102575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_101500_102600
891934	contig_18915_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_178610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCGCCATCTTGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2339	25	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18915_pilon_-_0_2300
891935	contig_17144_pilon	-	2009	11	Intergenic	novelGene_29279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1844.57448751738	11	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	243	1925	174597	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183208	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166765_168170_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_181820_181850_183158
891936	contig_20889_pilon	-	5908	2	Intergenic	novelGene_127646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1150	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	5502	5897	42818	42423	FALSE	55	GAAATCCAAAGAAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDEKGRGKRRQNKFFKKRTRKPPQKTEKKKKNPQKKKCAQGSLCASAQAEEVGLKPRSNAWPERAPNSRKEKENKERFENKQTKGPGIPSAWQHGPGSSSTLERSSIAPQEEAKMAHRAWYLSKRRRRW	48979	42411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_43246_43905
891937	contig_34_pilon	-	2781	6	Intergenic	novelGene_40034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1855.23191003173	3558	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	29	679	247052	224546	TRUE	25	GTTGGCAGAAAACTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	247080	221934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_222788_223245_224044_224094_224818_230228_230387_243214_243354_246970
891938	contig_10003_pilon	+	2344	7	Intergenic	novelGene_88163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAACAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401546	473541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_402905_416836_416923_430739_430845_460909_461114_466537_466695_472051_472140_473195
891939	contig_5236_pilon	-	4007	14	Intergenic	novelGene_100941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_10	175.662532840065	468	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	116	2032	1011714	1006770	FALSE	35	GTATCAGACATTTAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011829	1004794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
891940	contig_11564_pilon	+	2082	2	Intergenic	novelGene_158540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1537	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTTTTCTAGAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39835	42172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_41243_41497
891941	contig_10307_pilon	+	1735	2	Intergenic	novelGene_170278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	14	1222	389628	392058	FALSE	15	AGTTGTGAGTGTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAAMPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	389614	392571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_390349_391570
891942	contig_7056_pilon	-	5226	6	Intergenic	novelGene_43605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_3	743.67035708034	325	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	2404	3039	726042	725118	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	728445	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_725319_725471_725606_725661_725734_725813
891943	contig_9098_pilon	-	1929	12	Intergenic	novelGene_75852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	167.645730363439	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	620	1489	345261	335775	FALSE	20	CTTGCTATTTATATCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355831	335334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349641_349712_355579
891944	contig_7342_pilon	+	1567	12	Intergenic	novelGene_71226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	288.279048696494	153	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	76	1041	716998	728901	TRUE	50	TAAAGTGACTTTAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAILCSEPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPEEQTGDGERTDCGRSAPGSLKP	716922	734870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727572_728492_728790_728866_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756
891945	contig_14666_pilon	+	1461	5	Intergenic	novelGene_39585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	86	1168	477340	484940	FALSE	80	AAATAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484171_484443
891946	contig_12677_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_110763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTTACTGATTCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322	1115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_300_1100
891948	contig_8462_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_159420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAATTCAGTGAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231390	228873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_228900_231400
891949	contig_8075_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_42515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTTTGTTGCTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794213	796399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_794200_796400
891950	contig_5020_pilon	-	1684	7	Intergenic	novelGene_27868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	562	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	683	1024	124475	123330	TRUE	15	GCTTGCAGAGGGGTCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRATLGEVPIGRRAYVRTGNGGGRRKVRERKRLIHTFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126087	118467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118564_119436_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124544_124906_125090_125656
891951	contig_10377_pilon	+	6119	9	Intergenic	novelGene_115369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	674.668332868084	364	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	300	1127	208954	255047	TRUE	30	GTATCTTTTAAGAAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLKGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	208654	261739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_208967_219445_219615_227487_227752_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868
891952	scaffold_19766_pilon	-	2269	9	Intergenic	novelGene_34269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	340.865442660297	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	200	1054	325368	322994	FALSE	35	TTATTGCTTTAGAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDPLSPGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN	327845	321778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_323101_323179_323397_323489_323692_324034_324115_324460_324507_324827_324935_325050_325090_325311_325458_327735
891953	contig_8122_pilon	-	1009	7	Intergenic	novelGene_40178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	142.867848805189	84	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	71	502	35893	32807	TRUE	30	GGAAATGGTGTATTCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNGIYYSIRSQFPVSSWLQHYVISSKLIHSLEVNVPLVSLCCTLAGINTMAFSSIRATLAGIMAAGRPHASEITAPQLCQC	36256	30733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_31136_32701_32826_33336_33468_33926_34016_34361_34418_35756_35920_36212
891954	contig_8122_pilon	+	2154	5	Intergenic	novelGene_40263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2109	junction_4	458.430474554212	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	958	1479	742073	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	741115	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
891955	contig_7322_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_164919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	644	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGCAGAAAGCATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238099	240372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_238100_240400
891956	contig_8447_pilon	+	3681	2	Intergenic	novelGene_69395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	782	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	842	1285	14273	14716	TRUE	10	GGCTTGCCTCAGGGAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKGGECLHFAGTATNVTKQSVCKVLNEKLICTVNFHLKHNKKFLKSSKIEINLDHIQQTHKCFVRIMRNFYLICIVLIFNEQHCHCNQADRQTHTHTHTHTHRHTHSSSPARMRHCRLSPSVFSVHRKVGTYNGKEHRLDITSVP	13431	17297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_15944_16128
891957	contig_312_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_128311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTTCTATGTTGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417843	420287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_417800_420300
891958	contig_12257_pilon	-	4681	3	Intergenic	novelGene_152090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_2	108.5	890	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	185	541	148314	118587	FALSE	30	ATGGCAATTTTAGCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERLRPRKRRRNGNEEDNHLPPQTKRSSRNPVFQDSWDTESSSSESGGSSSSSSNNSPDRASGPESGLNQTITGSSPNTPQPAPEQSALCQGLYFHINQTLKEAHFHSLQHRGRPPT	148498	114446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_118821_138594_138695_148291
891959	contig_10990_pilon	+	4800	18	Intergenic	novelGene_7454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	392.41725374665	101	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	756	3077	722379	751283	FALSE	20	CTCTCCCAGCAAACTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVVRSGSNSWCFIPCGGKAGQISTRTALCICAHCFLLFPTHFGCLGCYCILHLQLDIYGVAGWDVFN	708553	753006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557_714612_715762_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918
891960	contig_11422_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_98990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
891962	contig_8045_pilon	-	2029	11	Intergenic	novelGene_35425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_10	165.927092423148	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	785	1402	401967	380007	FALSE	15	CTTTCTTAAAGTGTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLALSNSDVIRQVHNSFARQQMFEFDAKTSAKEEDAFHFVSYVPVNGRLYELDGLREGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEKRIQKYSEGEIRFNLMAIVSDRKMIYEQKIAELQRQLAEEEPMDTDQGNNMLSAIQSEVAKNQMLIEEEVQKLKRYKIENIRRKHNYLPFIMELLKTLAEHQQLIPLVEKAKEKQNAKKAQETK	419667	379379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_380052_388099_388199_390871_390986_392296_392400_399315_399380_401391_401523_401905_401968_402049_402176_413301_413408_414824_414889_419179
891963	contig_5791_pilon	+	1903	3	Intergenic	novelGene_35823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	11.5	158	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTCTTTTAATTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956429	962325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_956687_958408_958571_960841
891964	contig_9995_pilon	-	2424	2	Intergenic	novelGene_47716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	428	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAACAGTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374927	369429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_371148_374221
891965	contig_8075_pilon	+	2290	9	Intergenic	novelGene_42506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	346.435036298294	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	79	711	719960	794834	FALSE	30	AAAAGTCTTATCGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRMTTFVVCNECGNRWKFC	719881	796413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783022_793341_793386_794825
891966	contig_3095_pilon	+	1542	5	Intergenic	novelGene_75176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1529.24693476888	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	35	502	220513	226399	TRUE	15	CCTATTTGTGGTATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSAMGIQSQKVLLRPTSFPRMIIPSPRSVTSPSSLLLMRFMTARWTSGAWMSHF	220478	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225686_226237_226409_226645_226824_227001
891967	contig_6047_pilon	-	2403	7	Intergenic	novelGene_24242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	360	junction_5	232.854568346855	511	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	668	1291	295666	281640	FALSE	35	ATAATTTAGTAGTATGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDGDSSTTDASQLGISADYIGGSHYVIQPHDDTEDSMNDHEDTNGSKESFREQDIYLPIANVARIMKNAIPQTGKIAKDAKECVQECVSEFISFITSEASERCHQEKRKTINGEDILFAMSTLGFDSYVEPLKLYLQKFREAMKGEKGIGGTVTATDGLSEELTEEAFTNQLPAGLITADGQQQNVMVYTTSYQQISGVQQIQFS	296333	280527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_281673_282295_282376_283168_283251_284772_284971_286830_286962_288457_288552_295660
891969	contig_14563_pilon	+	4822	36	Intergenic	novelGene_135020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	979	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTGCTTTGAAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43225	158540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_43321_46085_46180_48671_48856_53106_53242_55283_55424_56438_56568_57837_57962_59087_59239_59434_59572_65264_65405_66606_66647_75195_75374_76340_76511_80678_80773_81215_81316_82384_82531_83279_83434_89283_89356_91433_91588_91927_92086_96549_96739_107763_107957_108805_108898_110643_110860_113623_113748_115996_116177_116346_116392_118159_118259_119823_120052_120931_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131744_133438_133529_136798_137029_158443
891970	contig_9839_pilon	+	1662	6	Intergenic	novelGene_88504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_5	1432.40670202286	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	100	747	49467	58040	FALSE	15	GGGATTCTATTGACCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTCLYSFRFGRLGEGKGYERKGDYMAEINVLGFGIISQ	45341	58955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_57929
891971	contig_3747_pilon	-	3845	4	Intergenic	novelGene_24738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	270	569	108631	108332	TRUE	40	AAAAATTGTGTAGCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCVTCNSASYPAALPCPSQDTKEYCGHFNSTSQILANVSFDPKLRRNGNSGKCIFSLAKLKHYKSTTVHLLFTWHPRTTSSALLPFLLFFRLLCFFF	108900	63204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_63348_91994_92464_92571_93039_106134
891972	contig_10958_pilon	-	2254	4	Intergenic	novelGene_5380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	484.360058909348	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	843	1586	846186	839744	FALSE	10	TTCACTAGTTGTTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQLDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTSSELVEPAEAASKDCSRLANGPSNGSSSHQRTSGSGFHREGNTTEDDFPCSPGNGNKVSNSSEERTGRGGGSYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLTHHSNDTDSNPDPQEEKAVSGKGNRTVASRHVHNGLDSSVNVQDSVL	854524	839075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_840328_841692_841848_846181_846924_854419
891973	contig_10861_pilon	+	4138	7	Intergenic	novelGene_39298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	136.225813347626	1705	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	2911	3687	1447236	1454668	FALSE	65	ACAGAATATAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFVLIISCLLRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437775	1455119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
891974	contig_5686_pilon	-	2128	2	Intergenic	novelGene_45306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCATAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97758	95560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_96838_96907
891975	contig_7644_pilon	+	3384	8	Intergenic	novelGene_64240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	96.4794574730067	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	79	672	162753	182983	TRUE	65	AATGTACAAAAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPPLTPPSPPPPPRSVATCAKRVRPMVLSRGAMAAFRLALIQLQVSSIKSDNVTRACGLVREAAAQGAKVISLPECFNSPYGLKYFPEYAEEIPGESTQKLSEVAKECSIYLIGGCQLLVYPGAFNLTTGPAHWELLQRGRAVDNQVYVATASLARDDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLARAGPEETIVYSDIDLKKLAEIRQQIPIFSQKRSDLYAVEAKKL	162674	187460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169247_169369_177755_177835_179596_179696_182476_182533_182891_185112_186876
891976	contig_8597_pilon	-	3659	14	Intergenic	novelGene_158695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	756.10796480256	23	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	797	2323	185320	40907	TRUE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGDSFETRFEKIDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSARITSLQEEVKHLKHNLERMEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKLLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHMTENKERMEDEVKNLALQLEQESNKRLLLQSELKTQAFEADHLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKEALATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHIVSQLEEMNSMLTKDIELLKKENEELTENMRKTEEEYKLKKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQVYMLSTFSVCLYLSIIYCT	186116	21086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_21506_39989_41056_41322_41417_42546_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53381_55225_55387_58900_59052_60319_60427_107870_107944_108491_108593_148857_148940_185227
891977	contig_5684_pilon	+	3620	4	Intergenic	novelGene_81047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	190.363395174131	289	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	2389	2952	443906	447039	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403580	447707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_442396_442545_443949_446518
891978	contig_116_pilon	+	3336	10	Intergenic	novelGene_154896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCAAGAGAAAGGAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261035	276969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_+_262795_264796_264858_265119_265241_266741_266818_267677_267747_268639_268704_271092_271154_272361_272426_273507_273545_275945
891979	contig_12278_pilon	+	2137	10	Intergenic	novelGene_152597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	300.184387779689	8	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	70	876	195476	198448	TRUE	20	CCTTCTTGTGAAATCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDEKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTWLSQCLPQAAG	195406	202344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_195575_196480_196599_196695_196882_197627_197750_197852_198099_198412_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
891980	contig_20641_pilon	+	1314	7	Intergenic	novelGene_52860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	27	1313	14659	56837	FALSE	30	TTGAGAGCATAGCATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECG	14632	56838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
891981	contig_2069_pilon	+	2577	13	Intergenic	novelGene_23239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	314.560495859788	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1021	1737	341330	343975	FALSE	15	ACTGATGTGGTTTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323987	344815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341184_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
891982	contig_4388_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_161961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464551	465612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_464600_465600
891983	contig_4812_pilon	+	2901	7	Intergenic	novelGene_103711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	890	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1197	1808	943600	944211	TRUE	55	AAACAAAGGATATTCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFFIGESSGNGGGRRGKGDGSNSISSGKSSSGSSHRRRRRKNRRQRRSTSRSSSVGSVLWFCCLCAVRHILIRPVTECCVFFFLRIFYSAILSTGNFNQFLFSCYRGSPWAFLLLTLLNCLFIRNIRIASGSFTFFFNTFLFLSFFGGKYLTIFRYYLCMTPLYSNIILFLFLNGLLLNFCFFLVFFMNSIRYISIFRLVVS	931921	952246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_932124_933365_933519_935594_936111_943274_944451_944834_944938_946402_946960_952052
891984	contig_11850_pilon	-	3611	6	Intergenic	novelGene_125209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	922.511441663463	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	106	780	286397	283925	TRUE	50	AAAAAAAATCCAAGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGKT	286502	279928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
891985	contig_20748_pilon	+	3821	5	Intergenic	novelGene_138173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_4	125.575425541783	570	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	162	794	149380	168022	FALSE	15	TTTCTGGTAATTGTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIARVADGLPLAASMQEDEQSGRDLQQYQSQAKQLFRKLNEQSPTRCTLEAGAMTFHYIIEQGVCYLVLCEAAFPKKLAFAYLEDLHSEFDEQHGKKVPTVSRPYSFIEFDTYIQKTKKLYIDSRARRNLGSINTELQDVQRIMVANIEEVLQRGEALSALDSKANNLSSLSKKYRQDAKYLNMRSTYAKLAAVAVFFIMLIVYVRFWWL	149218	171049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_149440_158593_158704_161658_161820_164010_164158_167867
891986	contig_18162_pilon	-	1768	3	Intergenic	novelGene_122316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16600	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8789_10087_10809_16364
891987	contig_1964_pilon	+	5426	21	Intergenic	novelGene_130898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	729	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGCACAGCATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105332	172735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_107200_107688_108289_110613_110807_111341_111463_111709_111834_112519_112661_115149_115279_115934_116069_119214_119292_138054_138299_142620_142909_143028_143169_148381_148520_150072_150216_152869_153000_154589_154682_154853_155125_157972_158142_158725_158915_166164_166274_172608
891988	contig_11924_pilon	-	2116	4	Intergenic	novelGene_128028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCTAAGCAATCAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72557	58315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_58761_61407_61477_64473_64572_71053
891989	contig_7025_pilon	-	3105	5	Intergenic	novelGene_104374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1256	junction_4	606.565072766311	2065	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1172	1537	58855	49239	FALSE	20	TTCTGGTTAACTGTATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	60941	47670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939
891990	contig_11417_pilon	+	2657	8	Intergenic	novelGene_103325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	1496.77022352825	17	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	106	945	570171	586628	TRUE	0	TGTTTGTGTTTTTCTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARDIRNQRRYRQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	570065	588852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_570197_570597_570686_572533_572747_573469_573637_575930_576054_583804_583914_586514_588231_588742
891991	contig_8377_pilon	+	3707	1	Intergenic	novelGene_35155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGCAAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196701	200408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_196700_200400
891992	contig_1301_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_47340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGGCGCTACAAGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290170	292461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_290200_292500
891993	contig_8210_pilon	-	5483	7	Intergenic	novelGene_30219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1371	junction_6	779.422863405995	74	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	83	922	37758	18141	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPE	52912	13579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37636_37803_52874
891994	contig_11719_pilon	-	1802	5	Intergenic	novelGene_154783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	42.1151694760926	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACTGGAGCCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166463	160794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_162127_163481_163533_164244_164329_164446_164610_166291
891995	contig_12414_pilon	-	3203	1	Intergenic	novelGene_59580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	NA	20	GGCGCCTTTGCCCAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	371378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_371400_374600
891997	contig_2215_pilon	-	1130	11	Intergenic	novelGene_163873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	193.917611371428	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	251	976	422754	325643	FALSE	30	AAATTTTTGAATTAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQPTPCARCCRYCAQAGAGLPAPSPPLSGCRDRAHGQGRAAPWPCTARRSTASPTRAIIASFSENGIPTKKARNAEYENLFNMVVEVPRWTNAKMEIATKEPLNPIKQDVKDGKLRYVANIFPHKGYIWNYGALPQTWEDPHQKDKGTDCCGDNDPIDVCEIGSKIFSRGEVIHVKILGILALIDEGETDWKLIAINVNDPEASKIHDIDDVKKYKPGYLEATLDWFRHYKVPEGKPENKFAFNGEFKNKAFALEVIKSTHECWKALLMKKCDRGTINCTNVQIRDSPFRCTEEEARSLVELVPTSLHKESNEEEQVWHFLDK	452591	325488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_325672_326852_326890_338363_338434_345443_345530_355020_355149_382433_382561_410642_410730_419864_419985_422712_422767_433675_433721_452398
891998	contig_12626_pilon	+	2965	13	Intergenic	novelGene_80452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_9	337.061185922609	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	765	2915	164931	196455	FALSE	40	TACAAGAACTTAGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELSSCINKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDEVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	164166	196505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_165021_166205_166712_171116_171243_171350_171421_173060_173277_176134_176249_179387_179511_180235_180350_181147_181295_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
891999	contig_6871_pilon	-	3102	8	Intergenic	novelGene_21586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	232	junction_1	556.546347337483	1060	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	351	1745	307935	284992	FALSE	20	CTACACGGGCCTCAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNSSSCPTPGGGHLNGYPVPPYAFFFPPMLGGLSPPGALTTLQHQLPVSSYSTPSPATIETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSACEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKKKKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKGACLDILILRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQPDRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRPSRPHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGSMPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGGRGRDRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNRSSPATHSP	308285	283634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_285216_286071_286231_287596_287802_289144_289322_289596_289758_291807_291950_293236_293386_307757
892000	contig_5556_pilon	-	5159	4	Intergenic	novelGene_173272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	4550	5005	87410	86955	FALSE	55	ACCCCAAAAAGAAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVSIQNKTADDFPVEEKALELPDREFKSPILRILQEMRQKADKHEEIDKFMENMDKKLEEFRKILQEENAKINSQPEIIQTQQLEIQKINNKISEMDNVIEGLRSRFETVEDRINGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKTEETPRVMQDTL	149702	86800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_89370_146812_147674_147852_149509_149629
892001	contig_12919_pilon	+	3969	2	Intergenic	novelGene_75904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1594	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACATCTGGTTTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733939	743738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_737737_743566
892002	contig_15105_pilon	+	1590	6	Intergenic	novelGene_151028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	347	703	828792	829148	TRUE	5	ATCTTGCCTCTGTTGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVLLPHCNIRGNNFRPDLILPLKSVLAPSLPPISLPPSSSLSFPSFRPSTQLSPIVPLLPQPIKTILPLRIEARVVTLNLLQDNGYHMPHMLKNIGYVIKIEVFEDVRLRFFPSKL	828445	839890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_829397_831005_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836550_839850
892003	SIRV3	-	308	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	4	532	4	-532	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTTTGCCCACAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1978	1532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_-_1765_1902
892004	contig_16622_pilon	-	12698	8	Intergenic	novelGene_48454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6609	170	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	8961	9443	115540	115058	TRUE	55	ATAATAGATAAGGCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQVWGFCRVLGAEDPGGQLWGAMEPATHFPGIPKAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQVPGTWGGERRQALASNETADELGAPKAAENI	183755	111633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_114360_114528_118625_157800_158395_158790_159652_175860_176798_176923_177690_179679_179915_181272
892005	contig_4686_pilon	-	6724	41	Intergenic	novelGene_118562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_40	405.366164720244	557	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2109	6327	398	6724	883895	642654	FALSE	35	GTAGTAATTTAAGATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRTVSRSRDIANVMQRLQDEQEIVQKRTFTKWINSHLAKRKPPMVVDDLFEDMKDGVKLLALLEVLSGQKLPCEQGRHMKRIHAVANIGTALKFLEGRKIKLVNINSTDIADGRPSIVLGLMWTIILYFQIEEVTSNLPQLQSLSSSMSSVDSTLSAETASPPSKRKVATKVQGNAKKALLKWVQHTVTKQAGIEVKDFGRSWRSGVAFHSVIHAIRPELVDLEKVKGRSNRENLEEAFTIAETELGIPRLLDPEDVDVEKPDEKSVMTYVAQFLKHYPDIHSTAVDGQESDREDRPVLKEMKVWIEQFERDLTKAQVTESNLQDKYQSFKHFRVQHEIKRKQIEHLIQPLHRDGKLSLDQALVKQAWDRVSSRLFDWHIQLDKSLPAPLGTIGAWLYRAEVALREEINIQQVHEETANTIQRKLEQHKDLLQNTDAHKRAFHEIYRTRSVNGIPVPPDQLEDMAERFHFVSSTSELHLMKMEFLELKYRLLSLLVLAESKLKSWIIKYGRRESVELLLQNYTSFIENSKFFEQYEVTYQILKQTAEMYVKADGSVEEAENVMKFMNETTAQWRNLSVEVRSVRSMLEEVISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKMLSQTEHAKKDFFRNLPHWIQQHTAMNDAGNFLIETCDEMVSLDLKQQLLLLNGRWRELFMEVKQYARADEMDRMKKEYADCVKTLSAFATEAQRKLSEPLQVSFMNVKLLIQDLEDIEQRVPVMDAQYKMITKTAHLITKESPQEEANEMFATMSGLKEQLAKVKECYSPLLYESQQLLIPLEELETQMTSFYDSLGKINETITILEHEAQCSALFKQKHQELLDCQESCKKTLTLIEKGSQSVQKFVTLSNVLKHFDQTTLHRQIADVHVAFQNMVKKTGDWKKHMETNSRLMKKFEESRAELEKVLQIAQEGLREKGDPEDLLRRHTEFFSQLDQRVLNAFLKACDELTDILPEQEQQGLQEAVRKLHKQWKDLQGEAPYHLLHLKIDVEKKRFLASVEECRTELDRETKLVPQEGSERMIKEHRIFFSDKGPHHLCEKRLQLIEELCLKLPMRDPVRNTPETCHTALRELREAIDSTYEKLVGDPDKWKDYTSRFSEFSSWISVKETQLKEIKDGTIDTANHGEVKRDVEEIRNGVTEKGETLSWLKSRLKILIEVSSETEAQKQGDELAKLSNGFKALITLLSEVEKMLNNFGDRVQYQEIVKSSLEDLISGSKEVQEQAEKILDTENLFEAQQLLLHHQQKTKRISAKKRDVQQQLAQARQGEGGLRGRAREELQQLQSTLDSVEHSREKQERRIQVTLRKWERFETNKETVVRYLFQTGSSHERFLSFSSLESLSSELEQTKEFSKRTEGVAVQAENLVKEASEIPLGPKNKQLIQQQAESIKEQVKKLEGTLEEDIKTMEMVKSKWDHFGSNFEALSVWITEKEKELNALESSSSALDVQISQIKVTIQEIESKISSITGLEEEAQSFAQFITTGESARIKAKLTQVRRYWEELREHAQCLKAAILGHLSQEQQFEENLRKIQQSVSEFEAKLADPVKICSSATETYRVLQEHMDLCQALECLNGTVTAFSASARKVVTRESSVQEAAALRQQYEAMRSRAKERQTALESRLAHWQRLEKELSTFLTWLERCEAIASSPEAGISADRVKVEGELQLIQALQSEVVSQASLYSNLLQLKESLFSVASGEDVKMMKLHLEQLDERWRVLPQIISKRINFLLSVVAEHQQFDELLLSFSVWIKLFLSELQTTSEISVVDHKAALIRHKDHAAEVESKKGDMKSLQGYLAKLASLGCADDLHLLQGKVEDCFQLFEEASQVVERRQLALCQLAEFLHSHASLSGVLHQLRQTVEATNSMNKKQSDLLEKGLNDAIQDAKTLESTAIGLDGVLTKAQYHLKSGSSEQRTSCRAMADQLCLELERIQNLLGTKLSEADALAVLKKAFLDQKEELLKSIEDIEERTDKEQLKEPTQQALQQRLRVFNQLEDELNSHEHELCWLKDKAKQMAQKDTAFAPEVDREINRLEVTWDDTKKLIHDNQGQCCGLIDLLREYQNLKSVVSKVLENSSSVIGTRTTIKDQEDLKWALSK	892880	642653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_642805_645697_645878_648547_649177_650779_650934_652283_652451_657320_657445_658173_658362_660058_660158_660543_660772_663935_664087_666063_666225_670841_670983_671783_671955_674157_674326_677562_677728_679611_679721_680518_680728_680940_681100_683455_683591_685988_686154_686655_686815_688665_688840_691616_691761_693116_693270_693738_693904_696208_696412_697389_697487_702940_703110_703635_703749_730376_730542_731768_731907_734644_734753_741402_741513_745629_745827_751563_751743_753719_753813_760282_760367_767767_767864_788890_788953_883831_884109_892696
892006	contig_12427_pilon	-	1490	6	Intergenic	novelGene_40467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2208.75887321364	111	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	134	667	316061	314393	TRUE	25	GGGGAGTTTGACTAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325972	313522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314291_314337_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325856
892007	contig_16575_pilon	-	1306	13	Intergenic	novelGene_146489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_12	72.0952302321188	609	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1266	40	1305	26213	2061	FALSE	25	TAAGTAATTCTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRDNLVELSKAKYSRNVVKKFLMYGSKPQIAEIIRSFRGHVRKMLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQKEAVIKHSLVHKVFLDFFTYAPPKLRSEMIEAIREAVVYLAHTHDGARVAMHCLWHGTPKDRKVIVKTMKTYVEKVANGQYSHLVLLAAFDCIDDTKLVKQIIVS	28073	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_2142_7368_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13320_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_28044
892008	contig_1715_pilon	-	1097	9	Intergenic	novelGene_127186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_5	220.704553645819	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	984	114	1097	284622	251453	FALSE	35	GAAAAAGCTTTTTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQ	312004	251452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
892009	contig_10023_pilon	-	1983	11	Intergenic	novelGene_123476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_3	117.654749160414	564	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	248	1315	159664	132633	FALSE	25	AGTCCGAGGAGCAAGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGVNVEGATHKQVVDLIRAGEKELILTVLSVPPHEADNLDPSDDSLGQSFYDYTEKQAVPISVPTYKHVEQNAEKFVVYNVYMAGRQLCSKRYREFAILHQNLKREFANFTFPRLPGKWPFSLSEQQLDARRRGLEEYLEKVCSIRVIGESDIMQEFLSESDENYNGVSDVELRVALPDGTTVTVRVKKNSTTDQVYQAIAAKVGMDSTTVNYFALFEVINHSFVRKLAPNEFPHKLYVQNYTSAVPGTCLTIRKWLFTTEEEILLNDNDLAVTYFFHQAVDDVKKGYIRAEEKSYQLQKLYEQRKMVMYLNMLRTCEGYNEIIFPHCACDSRRKGHVITAISITHFKLHACTEEGQLENQVIAFEWDEMQRWDTDEEGMAFCFEYARGEKKPRWVKIFTPYFNYMHECFERVFCELKWRKENIFQMARSQQRDVAT	200472	131964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_132681_136935_136996_137390_137520_137859_138010_144377_144468_150470_150635_152483_152563_155967_156073_157747_157813_159486_159680_200240
892011	contig_5279_pilon	-	1719	8	Intergenic	novelGene_105557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_4	341.834427040642	59	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	102	1229	353702	333051	TRUE	70	GAGAAGAAGAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKQEIMSDQRFKRVTKDPRFWEMPEKDKKVKIDKRFRAMFHDKKFKLNYAVDKRGRPINHSTTEDLKRYYDLSDSDSDLSDEDSKALNQKKMKKKKPQTKIGIDSKSLVEEKKKETKKINRMNSESKNELENSERIQKAKTSFKSKKLDSEIRPKKDSKEFAQKGTKEKEDIVQRSTDDFPKGKLKMVSLDITEVKSPKVKCSETRRKIQSGDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKVYTR	355022	292819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_292900_322494_322657_330139_330288_332950_333066_339168_339283_339885_340245_353062_353746_354964
892012	contig_1274_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_137776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCCTTTCTTTCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50217	52189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_50200_52200
892013	contig_12545_pilon	-	4135	3	Intergenic	novelGene_178135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAATTACAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46668	42293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12545_pilon_-_44032_44097_44874_45047
892014	contig_16846_pilon	+	3469	7	Intergenic	novelGene_82913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	23.5967276450688	181	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	37	681	459619	477213	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAMPPPVTVQRMV	459582	480001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_459710_464055_464156_464527_464615_465206_465311_475327_475478_476253_476360_477206
892016	contig_9706_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_20998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTAGCTAAGAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468680	471389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_468700_471400
892017	contig_11978_pilon	-	2842	13	Intergenic	novelGene_62949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_12	151.704390912795	703	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	142	1521	1062769	1041965	FALSE	25	AAATTGATGTCCTGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWIEYLCVDHCFPEYDIWTQFVSADYTRAQELDALDNSHPIEDFKKGMNMYLTKFQQKNAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTKQMGFPLIYVESEQVEDDRVLRLSQRKFCASGPYVGEDCPQWMVPITISTSEDPNHAKLKILMDKPEMNIVLKNVRPDQWVKLNLGTVGFYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSEEVRPQDTVSVIGGVAGGSKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKLSVEGFAVDKMAGEVKAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1064510	1040643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289_1044338_1044611_1044768_1045289_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699_1053835_1055522_1055663_1057598_1057663_1060456_1060567_1062723_1062785_1064384
892018	contig_15839_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_136413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	41	junction_1	30	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	102	449	106014	88629	FALSE	20	ACCCAGTATTGTGTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALEKSLHLGRLPSRPPLPGSGGSQSGAKMRMGPGRKRDFSPVSWSQYFESMEDVEVENETGKDTFRVYKSGSEGPVLLLLHGGGHSALSWAVFTVSKLLIVEVDLSTIVVYSR	106115	87435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_88781_89326_89422_105913
892019	contig_3018_pilon	-	1772	14	Intergenic	novelGene_78836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	420.520190679628	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1362	411	1772	583440	550973	FALSE	30	GCTTTTGCCAGACTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQ	600152	550972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585104_599989
892021	contig_6445_pilon	+	3822	1	Intergenic	novelGene_77002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	545	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTGCAGTCTCATAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489871	493693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_489900_493700
892022	contig_5419_pilon	+	5579	9	Intergenic	novelGene_15492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	735	junction_4	515.803363090044	278	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	1976	3295	241897	249830	FALSE	40	ACATATGACATCACAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTSLWSVSVAVFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238759	252114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_240675_241836_241998_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
892023	contig_9144_pilon	+	1987	8	Intergenic	novelGene_151134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	229.192994158697	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	177	1013	618610	624074	TRUE	20	AACCATGTTGGCCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYSCWRTGLLLLLLQAVAVKVSWQTEEKSCDLVGEKGKESETELALLKRLKPLFNKSFESTVGQGPDTYIYMFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRAVVMISCNRHTLADNFNPVSEERGKVQDCFYLFEMDSSLACSPEISHLSVGSILLVTFASLVAVYIIGGFLYQRLVVGAKGMEQFPHLAFWQDLGNLVADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPM	615283	625502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615459_618608_618789_620115_620283_621888_621999_622274_622406_622954_623082_623951_624164_624617
892024	contig_8978_pilon	+	5875	12	Intergenic	novelGene_49479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_1	211.619493235749	940	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	142	2517	1721282	1772309	FALSE	10	GTGCCAGGCACTGTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASSDPYLPYDGGGDNIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGICLGALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1721140	1775667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
892025	contig_4900_pilon	+	2087	7	Intergenic	novelGene_159072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	476	970	1180473	1180967	TRUE	45	GATAAAGGAAAGCCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKVTGLQNLVRECPHGVEGEASCVSRGQEEEGKICSSVKTVRTHASSGRIPGKALSWPLEDSPTAQASNPQLANIIALCRILFHACFMLLDFTCSSRLFCPPAESQTPGQRQPSSHGSHLLATPWPWSSIQGTHHFFPVHLSEGLVHLTQGPPECGAMVCPD	1179997	1188254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_1181318_1181542_1181698_1184581_1184685_1185056_1185197_1185924_1186024_1187603_1187677_1188057
892026	contig_3132_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_127439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	799	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	919	1257	280781	281119	NA	20	GAGCCAGACTATGGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSGHIAACTLDLSRGRYALWRCGICQTLLAILGRADVWAAASPSLSLKIQPSFCLKFHLHLLSQVVVDTSQGAGTEGQEQPREADMFRTCFHLQGTKHRPPSIHGAMCKLQ	279862	281927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_279900_281900
892027	contig_16666_pilon	+	3148	3	Intergenic	novelGene_61717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1809	2156	31798	32145	FALSE	45	CTACATTAAGAATATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNSKDIRQLNCTCALQPLLDNATGHPPDVNDLSQDVKVVYLPPNMAAVIQPMDQDAISTFKAYHLWTMAAQPIAAPDGRMVTLHDFWKNYNILQCIQNTASSWEEVMRKCMQEI	23998	33137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_24656_30557_30646_30734
892028	contig_3018_pilon	+	5824	20	Intergenic	novelGene_78823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2214	2516	547484	550418	TRUE	20	GGGAAAATGGCGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGLSERPSEGFPVFSFFSLNHSLTKCFFVLGYFVGHLLSAGTSVSGIISATAVSVSGSIARTAFSMSFCWAATSMSGEDGWISEHMLTVLCLRRCCPM	544110	625103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_545701_545831_545887_546200_546454_547002_547146_547311_547567_550198_550507_550842_551009_561477_561580_562782_563044_566733_566846_567964_568081_569956_570088_570203_570434_572320_572360_576712_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600196_624774
892029	contig_7119_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_40990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	39	488	139776	140225	NA	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	139737	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_139700_140900
892030	contig_10642_pilon	-	2638	2	Intergenic	novelGene_78738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	609	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277946	1275141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1275923_1276089
892031	contig_10674_pilon	+	2322	2	Intergenic	novelGene_6452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCGATTTACTGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303354	305897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_305414_305634
892032	contig_6227_pilon	-	5570	5	Intergenic	novelGene_49687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	214.370444558013	1597	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	63	494	889395	887861	TRUE	20	GAAGAGCTTTTGGTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLKPKFSGVEKIKTIGSTYMAAAGLSITSGHENQDLERQHAHIGIMVEFSLALMSKLDGINRHSFNSFRLRVGINHGPVIAGVIGARKPQYDIWGNTVNVASRMESTGELGKIQVTEETCTILQGLGYSCECRGMINVKGKGELRTYFVCTDTAKFQGLGLN	889457	882114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_886835_887504_888008_888158_888284_888902_889018_889350
892033	contig_7202_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_18569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27939	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28169_28486_28634_29797
892034	contig_4742_pilon	+	7779	15	Intergenic	novelGene_130976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	333.079455189581	1612	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1957	5874	365	6238	242124	285679	FALSE	0	TTTGGTCTGCTTTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGVVKESGNDTIDEEELILPNRNLRDKVEDNSVRSPRKSPRLMAQVEQVRSLRQSTIAKRSNSSPLSSTKKTSGKTVSAPKAGVRQPEKCQIKEEVCASLKPEYHTESRRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWTPSKQCGFCKKPHGNRFMVGCGRCDDWFHGDCVGLSLSQAQQMGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGLLKHTPTNEKNKYIDDTVKHKVKILKRESGEGKNSSECRDSEIKKWQLAPVRKMGQPVLPRRSSEEKSEKITKESTTVTCTGEKASKLGTHEKQEIKKKKVDKGGVPNVHPSAASTSKPSADQIRQSVRHSLKDILMKRLTDSNLKVPEEKAAKVATKIEKELFSFFRDTDAKYKNKYRSLMFNLKDPKNSILFKKVLKGEVTPDHLIRMSPEELASKELAAWRRRENRHTIEMIEKEQREVERRPITKITHKGEIEIESDAPMKEQEAAMEIQEPTANKSLEKIEESEKQKEEIDSMSKDTTSQHRQHLFDLNCKICIGRMAPPVDDLSPKKVKVVVGVSRKHSDNEAESIADALSSTSNILASDFFEDEKQESPKSTFSPVSRPEMPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGLELHRPNLLLGLIIRQKLKRQHSASASTGHAAEAPESVPMSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPKAEKIDKIEEVADGEAKEVKVKVDNHSEATGNSVAVEEETSVPGSSSISPGLLTNLSLRGKPPDISTEAFLTNLSIQSKQEETGDSKERTLKRQLLQDQENNSQDNWTSDTGSPGRSNVGKGSTDGNMSCNDSLVANTRSPQFINLKRDPRQAAGRSQQISTSESKDGENCRNGEKHAPPGLSQNKEHLTEQTSVDEKSSSVEKNSCVQQSDNSSIPQNSASEENIHTFQTEQAKPVQEDVLMQNIETVHLLRRGSAVTTSHFEAGNTCQPDFPSKSINFTSRSTSPRTNANFSPVRPQQPNLQHLKSSPPAFPFPGPPNFPPQNIFGFPPHLPPPLLPPPGFGFPQNPMVPWPPVVHLAGQPQRMLGPLSQASRFIGPQNFYQVKDIRRPERRHSDPWGRQDQQQLDRAFNRGKGDRQRFYSDSHHLKRERHEKEWEQESERHRRRDRTQDKDRDRKSKEEGHKDKERARLSHGDRGADAKASRDGRNVDKKPDKPKSEDHEKDKEREKSKHREGEKDRDRYHKDRDHTDRAKSKR	190848	287220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_242103_242266_246981_248768_254295_254606_263142_263327_267145_267297_267378_267536_268999_269117_270854_270987_271584_271721_276598_276795_278132_278281_280583_280674_283132_283329_283550
892036	contig_7272_pilon	-	3712	21	Intergenic	novelGene_25352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_15	666.402916785333	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1014	3045	87	3131	633189	593320	FALSE	20	GTATAGTTGCTGAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRPEPKLALPPPPCSPPAAWAARRSPKMASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633275	592738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610248_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
892038	contig_16633_pilon	+	2513	1	Intergenic	novelGene_165070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATACAGAGGAGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83455	85968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_83500_86000
892039	contig_6847_pilon	-	3632	10	Intergenic	novelGene_143891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	479	junction_2	116.769901415319	988	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	144	1679	266491	232193	FALSE	40	TAAGAATGTAATCTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSWQEAKRQRLLSGGQQVRSGRCSPSPDPSPIPSGAGVRVRPTTAFTMVLLAAAVCTKAGKAIVSRQFVEMTRTRIEGLLAAFPKLMNTGKQHTFVETESVRYVYQPMEKLYMVLITTKNSNILEDLETLRLFSRVIPEYCRALEENEISEHCFDLIFAFDEIVALGYRENVNLAQIRTFTEMDSHEEKVFRAVRETQEREAKAEMRRKAKELQQARRDAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTSAMITETIIETDKLKVAPAPTRPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIMSSNMGKRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	266634	230239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024_245190_246080_246287_246422_246603_247231_247496_266488
892040	contig_6215_pilon	+	6456	8	Intergenic	novelGene_21234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_1	182.442722350812	1053	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	369	1406	582949	600051	FALSE	25	TTTATCATCCTAAACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWTGDSPPHVPVQELSTDMVINVIANMTTTVQSLFPNLQVFPALGNHDYWPQDQLPVVTSKVYNAVANLWKPWLNEEAISTLRKGGFYSQKVTTNSSLRIISLNTNLYYSSNIVTLNKTDPANQFEWLENTLNNSWQNKEKVYLIAHIPVGYLPFSRNTTAMREYYNEKLIDIFRKYSDVIAGQFYGHTHRDSIMVLSDKKGRPVNSLFVAPAVTPVRSVLQKETNNPGVRLFQYDPRDYQLLDMLQYYLNLTEANMKGESNWKLEYILTQAYDIKDLQPESLYGLAKQFAVLDSKQFIKYYNYFFVSYASSAICDEKCKAFQICAVMNLDHVSYADCLKQFYI	571286	605101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571455_582748_582963_584025_584171_588153_588251_590620_590791_591255_591437_592971_593097_599745
892041	contig_15498_pilon	-	1376	11	Intergenic	novelGene_42676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	132.680405486266	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	392	1159	691001	688241	FALSE	45	CACTCATTTCTAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWRPAPGPVPGLSCGFCCPCFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697711	688023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697306_697650
892042	contig_20641_pilon	+	1297	7	Intergenic	novelGene_52832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1239	59	1297	14599	56729	FALSE	10	ACTGACTCGGCCTCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYG	14540	56729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
892043	contig_15977_pilon	+	3206	2	Intergenic	novelGene_137218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	257	706	78172	78671	FALSE	70	AGGAAAAGACAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASPSQDLFRTASNGTSGAPAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDVVAIIPYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPLDHCFASSRDCFQLQLLLPPRNRR	77915	81171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_78547_78596
892044	contig_9242_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_155078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	1018	1413	746412	746017	NA	40	AGATGACGTGAAAATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRNSINITHNINKRKEKNHMIISVNTEKAFGKIQHPFLIKTLSKIVTEGKFLNIIKGISAEPIVNFILNGERLKSFPLRMGMRQGCPLSPLPLLLDTVLAVLARVARKGNKGYPNLKGRNKTILIH	747429	746016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_746000_747400
892045	contig_10341_pilon	+	3633	8	Intergenic	novelGene_47222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	74.6034414044537	689	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	22	1161	67374	120280	FALSE	20	TAATCTTTTGAGCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKKAQAMEGNRDEAEKCVEIAREALNAGNREKAQRFLQKAEKLYPLPSARALLEIIMKNGSTAGNSAHCRKPSGRGVQNKTNCTKDSTSSSGESGKGYSRDQVDGVLSINKCKNYYEVLGVTKDAGDEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATDAFKKIGNAYAVLSNPEKRKQYDLTGNEEQGCNHQNNGRFNFHRGCEADITPEDLFNIFFGGGFPPGSVHSFSNGRAGYNHQHQHRHSGHEREEERGDGGFSVFIQLMPIIVLILVSLLSQLMVSNPPYSLYPRSGSGQTIKMKTENLGVIYYVNKDFKNEYKGILLQKVEKNVEEDYVTNIRNNCWKERQQKTDMQYAAKVYRDDRLRRKAEALSMDNCKELERLTSIYRGE	67352	122752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_67507_87472_87645_94305_94452_105635_105822_111077_111173_111962_112073_113062_113236_120155
892046	contig_233_pilon	-	2702	16	Intergenic	novelGene_14523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_11	1379.67140371257	1617	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	823	2259	104176	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105555_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
892047	contig_17074_pilon	+	2335	9	Intergenic	novelGene_145115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	239.941627015822	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	684	1034	220965	224256	FALSE	30	TAAGTATCTTTTGGTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATQPHHLLIPVTGDKCQDSATTIKPIYGPTGQTLVIAKLYWITDRQSTCTAMQEHQKPSVWVELHVILQKNKTKTLKVS	207920	225557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213475_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452_223522_224020
892049	contig_17144_pilon	-	2512	15	Intergenic	novelGene_29317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	1735.68879610913	13	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	343	2217	174597	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183238	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174933_181806_181850_183158
892050	contig_2867_pilon	+	2514	3	Intergenic	novelGene_135178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1111	1434	782746	783069	TRUE	20	CCATGCCTTTTAAGCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLDDRSGCFFKSTLASSISGLLFLTSDFCRSAFKFESAKRLFLASSFSRSTVLTPSAVCSGFRCFLGLSLPSLSTTSMWLERPFSFGTFILTGSSLDRSAFAGSA	781635	789717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_783982_788547_788641_789642
892051	contig_18850_pilon	-	2133	9	Intergenic	novelGene_142417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGCCACTCGTACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181124	171870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_172057_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178390_179148_180516
892052	contig_11986_pilon	-	3668	1	Intergenic	novelGene_69225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1537	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771614	767946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_767900_771600
892053	contig_602_pilon	+	3657	4	Intergenic	novelGene_134969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	170	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2951	3364	587558	587971	TRUE	30	TCACTACAAGAGTCCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFMWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWHNDRYIDQWNRIENPDGNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISSCKKMKQDP	559989	615729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_562302_577275_577701_587344_588244_615708
892054	contig_13037_pilon	-	4055	7	Intergenic	novelGene_155149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	557	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2519	2932	48553	48140	TRUE	15	GAGCCGCACGCGGCAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTPEGVGGTCGGPCGRYPARSFIRVTPASPQGLRHAWEAPHWGPDPFSLFSIFAVNSLYLIGYRFYVKKQKSMSLPEKLSGVISQGLGRPLVRPHRHLQDGHYLLVSPALWSSRAAQPPARNSRLSLSFRDLKSV	54931	46814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_47643_47844_48710_49601_49810_50205_50297_50956_51080_52710_52826_53106
892055	contig_15092_pilon	-	3000	20	Intergenic	novelGene_57767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_18	103.813544769275	609	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	510	2084	327971	296486	FALSE	30	TTATTATGATCTTTCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVEESAELPDPKENTSKPLGARVPSVTPPAPPAPPLPVGPAHSTGGPVRREGSWEEAENNMADGEEPEKKRRRIEELLAEKMAVDGGCGDTGDWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQFLFRPKDVGRPKAEVAAEFLNDRIPNCNVVPHFNKIQDFNDTFYRQFHIIVCGLDSVIARRWINGMLISLLNYEDGVLDPSSIVPLIDGGTEGFKGNARVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLIDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFT	338217	295569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304101_304383_304449_304779_304824_310062_310144_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319500_319543_319725_319889_327928_328267_338003
892056	contig_19778_pilon	+	1070	6	Intergenic	novelGene_143761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	161.106672735799	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	180	1070	25062	34222	FALSE	15	AATGGCAGGCCTCTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METIRRENATDMKKARALIDPVIRKGRRVCEICISHIYEADPFLAEKMGLSSGLQSGNDFNAQDLPAVTPFLPASWAAQDKPAECTSSEPGGMLKLCSPETAHRIWNEKSAKIYPIREKLNRTRLALIICNIDFENLPKRAGADADIRGMKTLLEGLGYSVDVKQNLTASDMTAELKTFADCPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPG	24882	34222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_25219_28501_28565_32062_32179_32846_33021_33442_33678_34076
892057	contig_14925_pilon	-	2216	5	Intergenic	novelGene_55255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	77	490	116065	114666	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129477	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
892058	contig_14441_pilon	+	1351	6	Intergenic	novelGene_100351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	439.406144699867	668	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	767	1315	125667	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	12947	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_13214_30842_31136_121813_121872_125517_125902_126159_126283_126514
892059	contig_1263_pilon	-	3748	8	Intergenic	novelGene_170394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1016.00259119065	11	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	254	1453	65303	55502	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76797	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53517_54889_55637_58131_58321_59765_60072_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
892060	contig_15267_pilon	+	2333	9	Intergenic	novelGene_151068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	75.4764035974158	526	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	62	1369	39792	56295	FALSE	40	CTTCATATAAAACCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAATLSSSPCTGLTNRLGSMAVTTQLTWMQEKVLQNCFGGKQFSLLYKATIHGSSSGDLLQRCSNQGPTITVIYSETYIIGAYVQESYQQINKGSVILFSFQRTENSEFEIRRFKACTNNDVDGQRCDRNILYYGNRDLNINIYTCYISMSYNIMKEIGLPLGDICFQECEVFRCEDLLDQRKINMVTELSKSLSSDMRTYNPCRGLVHQIRILLLGPTGAGKSSFINSVKSVFRGRVTNQSVMGFDTKQFRTYSIKDGKDGNPLPFVLCDSMGLGEKEEGLCIDDIFYILKGHVPDRYQFNSIKPITPSHVNYIDCPLLKDRIHCVAFVLDANTVENLSQEMVAKIKRTRREVIKCGVVHVVLLTYVEDLHLITKADLVDPYRCMPVKFKIEAVHRELGFPLSDIFVVSNYTLEWELSLSKNFLILSSLKQMLRAADDFLEDLPPEETDGILK	39489	57259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15267_pilon_+_39541_39781_40264_44366_44404_45099_45284_45437_45588_49399_49572_50781_50883_55874_56050_56278
892061	scaffold_12124_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_22131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTTCCACACCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939373	937254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937300_939400
892062	contig_6446_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_149179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157790	157024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_157000_157800
892063	contig_6102_pilon	-	2522	19	Intergenic	novelGene_31909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1499	1849	380961	379986	TRUE	15	GCCCTGGGACCTCATGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVSHSESSIRAGRLGTFPERQVLSTLQVDRQQGCRQFCTFMSLDEIVHLQHLLQLCSSGTWGETLQAQVQAARWDILQGQPLVKEAAVQHCGEAHLTPAQKIILVQILVKDLDF	395187	374917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_374973_375259_375312_375445_375524_378858_379030_379376_379485_379615_379793_379953_380037_380158_380208_380317_380408_380537_380635_380897_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
892064	contig_4769_pilon	-	6756	1	Intergenic	novelGene_117952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1115	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	874	2625	1719	4343	377799	375175	NA	30	TTTAAAAGAATGTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSYEALVQHVIEDHERIGYQVTAMIGHTNVVVPRSKPLMLIAPKPQEKKGMGLPPRIGSLASGNVRSLPSQQMVNRLSIPKPNLNSTGVNMMSNVHLQQNNYGVKSVGQGYGVGQSMRLGLGGNAPVSIPQQSQSVKQLLPSGNGRSYGLGSEQRSQAPARYSLQSANASSLSSGQLKSPSLSQSQASRVLGQSSSKPTAAATGPPPANTSSTQKWKICTICNELFPENVYSVHFEKEHKAEKVPAVANYIMKIHNFTSKCLYCNRYLPTDTLLNHMLIHGLSCPYCRSTFNDVEKMAAHMRMVHIDEEMGPKTDSTLSFDLTLQQGSHTNIHLLVTTYNLRDAPAESVAYHAQNTPPVPPKPQPKVQEKADTPVKSSPQAAVPYKKDVGKTLCPLCFSILKGPISDALAHHLRERHQVIQTVHPVEKKLTYKCIHCLGVYTSNMTASTITLHLVHCRGVGKTQNGQDKTNAPSRLNQSPGLAPVKRTYEQMEFPLLKKRKLDEDVDSPAFEEKPEEPVVLALDPKGHEDDSYEARKSFLTKYFNKQPYPTRREIEKLAASLWLWKSDIASHFSNKRKKCVRDCEKYKPGVLLGFNMKELNKVKHEMDFDAEWLFENHDEKDSRVNASKTADKKLNLGKEDDSSSDSFENLEEESNGSGSPFDPVFEVEPKLPNDNPEEHIPKVIPEEDLEAEEKLDQKEENSSKYETIHLTEEPTKLMHDASDSEVDQDDVVEWKDGASPFESGPGSQQVSDFEDNTCEMKPGTWSDESSQSEDARSSKPAAQKKATMQGDGEQLKWKNSSYGKVEGFWSKDQSQWKNASENDERLSNPQIEWQNSTIDSEDGEQFDNMTDGVAEPMHGSLTGVKLSSQQA	379517	372761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_372800_379500
892065	contig_7035_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_83528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATACTTCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397761	396514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_396500_397800
892066	contig_19402_pilon	-	1973	7	Intergenic	novelGene_80856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.176122684598	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	32	1414	193194	167101	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193225	166541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167459_167581_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
892068	contig_9366_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_166239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAACAATAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808404	805356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_807186_808124
892069	contig_7056_pilon	+	4142	15	Intergenic	novelGene_43669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	632	junction_1	490.379991143894	2	138	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	130	1911	798314	810882	FALSE	30	TTAAAGCCCTATGGTAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPLGAAARDGRAVSVAVSTAALGQVCGQEETQEPPAVPKRLETMEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHAKRPDADLKTYFTDKKTHLYTLILNPDNSFEILVDQSVVNSGNLLSDMTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781802	813113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828
892070	contig_500_pilon	+	1433	11	Intergenic	novelGene_31047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	921.99937093254	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	181	1158	1492663	1498065	TRUE	10	GGGGCTTTTCTTAGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485770	1499449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
892071	contig_12638_pilon	+	3839	19	Intergenic	novelGene_33101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_13	646.595461906457	185	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1699	2427	182987	194329	TRUE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAGKNRQIVL	170802	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_176021_176961_178085_178281_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194303_194442_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
892072	contig_5959_pilon	-	1158	5	Intergenic	novelGene_150199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	12.5772612281053	389	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	324	902	352442	324755	FALSE	25	CCAAGTGAGTCCCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQIPIVATSSAPGIARNSKKRPASPANNGISAGGYSTSKKKKTTASNYPQGISMEAISENKMLPSDFSTGPVERAAKPLPFKDPNFVHSGHGGAVAGKKNRTWKNLKQILASERALPWQLNDPNYFSIDAPPSFKPAKKYSDVSGLLANYTDPQSKLRFSTIEEFSYIRRLPSDVVTGYLALRKATSIVP	352765	324498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_324887_335814_335883_336844_336957_337953_338065_352286
892073	contig_10058_pilon	+	1722	2	Intergenic	novelGene_67676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	71	1279	45038	46246	TRUE	20	TAGTGTGGAGTCTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETKVEAGGSGEEGVEAEGGQDVMGSLREGSGEETEAKSKSQNEAENMEEAKGVEEPGGEQSKDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPDPLMPPQRRTYAFETQGNLGKSEEL	44967	47252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_46502_47064
892074	contig_18184_pilon	-	2708	1	Intergenic	novelGene_123873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1851	2195	227438	227094	NA	50	AAAAAAGAGTAGCTGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHLRYSTGLIPSGARENEENRIQGKDQSKGLIVHSYQGLHRTESSTASWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKKKTRFTGLKETEETSRVWPPDTLLAQW	229288	226580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_226600_229300
892075	contig_15327_pilon	+	2468	10	Intergenic	novelGene_70409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	186.601443631694	868	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	29	943	25249	32853	FALSE	5	GTACGCCCCCTGCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAYLSSRDMPGTPGAAATQDGEAPGRSPPCSQSYDLTGKVMLLGDSGVGKSCFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKFRGQTHLEASAQLIGLLKLWKWPLPRKEIQGCPAARPHEVIATSRGRAIPTPGAKDGPAEAGEGPVGGKASFLRVTLLGFQADVNSERVIRSEDGETLAREYGVPFMETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRARGQADEPSFQIRDYVESQKKRSSCCSFV	25220	34378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_28869_29900_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31758_31896_32020_32231_32409_32488_32566_32747
892076	contig_6233_pilon	-	4177	10	Intergenic	novelGene_74761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.821019545337	196	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	414	1253	149777	143464	TRUE	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250353	115576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118501_143463_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_199837_199941_200462_200546_250135
892077	contig_6873_pilon	-	11364	28	Intergenic	novelGene_129818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	72.7193903946465	1046	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1150	3453	10	3462	596047	440503	TRUE	20	ATTAGTGTTTCTTTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVSNEQRQHAEHIFLSFRKSKSPFAVCKHILETSKVDYVLFQAATAIMEAVVREWILLEKGSIESLRTFLLTYVLQRPNLQKYVREQILLAVAVIVKRGSLDKSIDCKSIFHEVSQLISSGSPTVQTLACSILTALLSEFSSSSKTSNIGLSMEFHGNCKRIFQEEDLRQIFMLTVEVLQEFSRRENLNAQMSSVFQRYLALANQVLSWNFLPPNLGRHYIAMFESSQNVMLKPTESWRETLLDSRVMELFFTVHRKIREDSDMAQDSLQCLAQLASLHGPIFPDEGSQVDYLAHFIEGLLNTINGIEIEDSEAVGISSIISNLITVFPRNVLTAIPNELFSSFVNCLTHLTCSFGRSAALEEVLDKDDMVYMEAYDKLLESWLTLVQDDKHFHKGFFTQHAVQVFNSYIQCHLAAPDGTRNLTANGVASREEEEISELQEDDRDQFSDQLASVGMLGRIAAEHCIPLLTSLLEERVTRLHGQLQRHQQQLLTSPVSGAIANKMLDDLYEDIHWLILVTGYLLADDTQGETPLIPPEIMEYSIKHSSEVDINTTLQILGSPGEKASSIPGYNRTDSVIRLLSAILRVSEVESRAIRADLTHLLSPQMGKDIVWFLKRWAKTYLLVDEKLYDQISLPFSTAFGADTEGSQWIIGYLLQKVISNLSVWSSEQDLASDTVQLLVTLVERRERANLVIQCENWWNLAKQFARRSPPLNFLSSPVQRTLMKALVLGGFAHMDTETKQQYWTEVLQPLQQRFLRVINQENFQQMCQQEEVKQEITATLEALCGIAEATQIDNVAILFNFLMDFLTNCIGLMEVYKNTPETVNLIIEVFVEVAHKQICYLGESKAMNLYEACLTLLQVYSKNNLGRQRIDVTAEEEQYQDLLLIMELLTNLLSKEFIDFSDTDEVFRGHEPGQAANRSVSAADVVLYGVNLILPLMSQDLLKFPTLCNQYYKLITFICEIFPEKIPQLPEDLFKSLMYSLELGMTSMSSEVCQLCLEALTPLAEQCAKAQETDSPLFLATRHFLKLVFDMLVLQKHNTEMTTAAGEAFYTLVCLHQAEYSELVETLLSSQQDPVIYQRLADAFSKLTASSTPPTLDRKQKMAFLKSLEEFMANVGGLLCVK	596056	378137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_378360_380399_380681_385638_385722_386549_386709_431599_431810_433555_440701_442825_442919_444602_444721_445213_445345_446937_447057_453774_453956_454937_455232_456413_456589_457451_457622_458344_458505_463695_463874_464700_464847_465350_465494_466157_466335_493010_493186_493441_493600_497111_497225_520993_521148_521907_522025_547917_548057_553144_553287_559119_559226_595981
892078	contig_11105_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_159832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCTTCTTTTCCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421249	418253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_418300_421200
892079	contig_9633_pilon	-	2801	1	Intergenic	novelGene_139638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGTTTCCCTCAGCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138521	1135720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1135700_1138500
892080	contig_13863_pilon	+	1673	6	Intergenic	novelGene_42097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_5	212.983567441247	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	973	1368	488993	490279	FALSE	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	480910	490584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
892082	contig_19032_pilon	-	4290	10	Intergenic	novelGene_172534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1539	junction_1	576.117036292256	65	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	68	1513	162559	157705	FALSE	55	GTAAAAGGGAGAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGVSSFLCTNVH	162626	154927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553
892084	contig_8447_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_69396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATTCTGGCAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15681	14620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_14600_15700
892085	contig_9133_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_109301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAGGAAGTTGGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235866	238299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_235900_238300
892086	contig_3449_pilon	-	4297	13	Intergenic	novelGene_73722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1125	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAAGCTGCGCTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527128	493420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_493774_496888_497027_506311_506455_512067_512265_514848_515024_515528_515704_517799_517935_519226_519307_519553_519631_520312_520476_523889_524006_524354_524571_524799
892087	contig_11328_pilon	-	2002	3	Intergenic	novelGene_88378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAACTTAAAAAATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585180	581865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_582151_583404_584125_584183
892088	contig_3004_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_127556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAGATGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823013	820988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_821000_823000
892089	contig_12179_pilon	+	1429	2	Intergenic	novelGene_127989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGAGGAAGTGGAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479990	485536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_481315_485431
892090	contig_9848_pilon	-	3060	2	Intergenic	novelGene_79927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	13	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGAAGAAATTAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205779	69132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_71899_205485
892091	contig_17074_pilon	+	2287	3	Intergenic	novelGene_145103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	342	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACCTTGCCATTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207859	225574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212371_223483
892092	contig_5954_pilon	+	924	5	Intergenic	novelGene_28416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2084.67359555399	2600	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	112	441	97851	98381	TRUE	20	CCATCTCATTGATTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGDVILPVCLPQVELQRGSRETEPEYSSRLGTYQNFV	97468	99028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98167_98275_98694_98857
892094	contig_15741_pilon	-	949	6	Intergenic	novelGene_159665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	21	junction_1	609.007192075759	26	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	291	806	60541	49713	FALSE	0	GTGGCCCCCGCCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQPPLSPGTSVLPGGKREGTEALPYPAASLISRGAETRCSWEGGGLQGVVPRAWT	60954	49569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_49875_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681
892095	contig_16231_pilon	+	3156	1	Intergenic	novelGene_176708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	850	1227	13943	14320	NA	60	GGGAAAGAAAGAAAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKGDPTKCRNYWTVSLISPASKIVLKVTQKRLPQYSNRELPGIPAGFRRGRGTRDIVADVRWILAQSREYQKEVYLCFIDYEKAFDCVDHNKLWITLQRMGIPEHLVVLMRNLYTGQEAFI	13093	16249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_13100_16200
892096	contig_14744_pilon	-	3437	9	Intergenic	novelGene_66118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	64.3533944326172	248	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	273	1469	1594088	1588029	FALSE	25	GAAGTCCAGTTTATCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604797	1586060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594306_1604742
892097	contig_1442_pilon	-	3991	13	Intergenic	novelGene_172173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_3	174.91307364898	1162	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	324	1673	659925	630260	FALSE	35	TACTAACATTGTGTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINRKIKSVALCVSACPSQELKTLSDVQKFAEINGSALCSYNLKPSEYTTSSKASVLCPKLPVPASAPIPFFHRCAPVNISCYAKFAEALITFVSDNSVLHRLISGVMTSKEIILGLCLLSLVLSMILMVIIRYISRVLVWILTILVILGSLGGTGVLWWLYAKQRKSPKETVIPEQLQIAEDNLRALLIYAISATVFTVILFLIMLVMRKRVALTIALFHVAGKVFIHLPLLVCQPFWTFFALVLFWVYWIMTLLFLGTTGTAVQNEEGFVEFKVSGPLQYMWWYHGVGLIWISEFILACQQMTVAGAVVTYYFTRDKRNLPFTPILASVNRLIRYHLGTVAKGSFIITLVKIPRMILMYIHSQLKGKENACARCMLKSCICCLWCLEKCLNYLNQNAYTATAINSTNFCTSAKDAFVILVENALRVAAINTVGDFMLFLGKVLIVCSTGLAGIMLLNYQQDYTVWVLPLIIVCLFAFLVAHCFLSIYEMVVDVLFLCFAIDTKYNDGSPGREFYMDKVLMEFVENSRKAMKEAGKGGAADARELKPMASGTSSA	679555	627941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_630284_631653_631735_636534_636772_642283_642422_648722_648807_649512_649670_650885_651052_651995_652183_653410_653551_657773_657864_659879_660050_667947_668042_679450
892098	contig_7272_pilon	+	3760	9	Intergenic	novelGene_25315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_6	229.786823762808	621	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	329	1339	507772	575049	FALSE	20	TTGGGTGTCTTGAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPSLDSLESFSNLHSFPSSSEFTSEEGAESRAPDEEEGAAGRPGAEEEAALVRAASRERFPGQSVYHIKWIQWKEENTPIITQNENGPCPLLAILNVLLLAWKVKLPPMMEIITAEQLMEYLGDYMLDAKPKEISEIQRLNYEQNMSDAMAVLHKLQTGLDVNVKFTGVRVFEYTPECIVFDLLDIPLYHGWLVDPQIADVVKAVGNCSYNQLVEKIISCKQSDNSELVSEGFVAEQFLNNTATQLTYHGLCELTSTVQEGELCVFFRNNHFSTMTKYKGQLYLLVTDQGFLTEEKVVWESLHNVDGDGNFCDSEFHLRPPSDPETVYRGQQDQIDQDYLMALSLQQEQQSQEINWEQIPEGISDLELAKKLQEEEDRRASQYYQEQEQAGAAAAVASPQAQQGQPAQASPSSGRQSGNNERKRKEPREKDKEKEKEKSSCVIL	489517	577470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_489831_507756_507815_517079_517145_520615_520775_547444_547548_555760_555904_569812_569987_573467_573663_574920
892099	contig_9345_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_24709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2064	2387	987245	986922	NA	20	TAAGACAGGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQGIWKKLLNYVNMLQAFDQDNMMEEIGGKIIHMARTLNLELDTTDVEQLIDHKEGGLTDQDLMDFEEERSAEEERNKKRKEKLSKIFTVKALAEVFSELNRALVA	989308	986635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_986600_989300
892100	contig_15185_pilon	+	1035	4	Intergenic	novelGene_99382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	400	junction_1	172.129795987408	75	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	230	751	64414	89897	FALSE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVVPDQRSKFENEEFFRKLSRECEIKYTGFRDRPHEERQARFQNACRDGRSEIAFVATGTNLSLQFFPASWQGEQRQTPSREYVDLEREAGKVYLKAPMILNGVCVIWKGWIDLQRLDGMGCLEFDEERAQVGQLQASLSTAPLFSSLSCSCLKTYFTQSLRVHTESIMFK	64184	90181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_64492_64731_64819_70100_70218_89657
892101	contig_5954_pilon	+	975	4	Intergenic	novelGene_28420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	2198.06055927088	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	60	305	97851	98188	TRUE	20	GCCCAGCCATCTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRLHLRRSGSRGHISVAVMQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGELGRSVH	97520	99022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97926_98017_98694_98857
892102	contig_14970_pilon	-	1571	7	Intergenic	novelGene_45127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	141.139903011948	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	202	1020	312002	268709	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQAKLMVEFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPPGYCLPNLWEDHCNQGLGVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315768	268157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291011_291104_291170_311919_312047_315611
892103	contig_13905_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_130434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228904	227678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_-_227700_228900
892104	contig_6275_pilon	-	4406	3	Intergenic	novelGene_142466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_2	70	2208	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1283	1858	153735	153160	TRUE	5	GCATTGTTGGTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRALLVSKDGPWPPGSQRVGPHPPRFQRVRYLLTRFWSVGLPLSGVRGMESLPKAEGAGCHAQGQKNRASWVKRMGLPLRWIKRMGPPKAKGAELPSQRAWKAELKPGLGDLTCNPESMDDTQSLEGRSIAQIVSEAEDYFQALRANIICSAEFWISLVRVILSFPPISPICNGNVYFVPVPPMYFGSR	155017	142399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_142649_149840_150062_151081
892105	scaffold_19766_pilon	-	1576	5	Intergenic	novelGene_34398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	86.020346430365	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	52	522	830565	826089	FALSE	55	AAAAGAAAATACCTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVRLGKLFFILAVFGAWSGTPKEQDDDSERLPSKCEVCKLLSQELQEKLSHTGRSREVLELGQVLDTGKRKKHIPYSVSETRLEEALENLCERILDYSVHAERKGSLRYAKGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQRV	830616	825034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_827289_827413_827987_828085_828182_828310_830450
892106	contig_9364_pilon	-	3263	2	Intergenic	novelGene_177739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2433	2738	130932	130627	FALSE	5	TCTCTTCTCCTGTTATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLIPVFRGNVFSLSPLRMMLAIGFA	164847	130101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9364_pilon_-_132224_163706
892107	contig_14333_pilon	+	6145	12	Intergenic	novelGene_49074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	482.913762983971	1813	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	354	1454	227093	294370	TRUE	5	GATTTGGGGGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSPWQILSPVQWAKWTWSAVRGGGSGEDEAGGPERDPEEEDSQAETKSLSFRSGCKVKKYETQSLALDPCSQDEEAVISQISDISNRDGHATDEEKLASTSSGQKLAGPEVKGLEKESCQKMEKDEPAVPGLVESSVEKTPVSVACGDESPLDGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTNMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD	226739	299126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_227254_268099_268161_269945_270067_274012_274066_282470_282597_285902_285980_287700_287745_288874_289036_290056_290164_292809_292931_294301_298144_298208
892109	contig_9415_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_109849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	910	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1974302	1972387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1972400_1974300
892110	contig_13021_pilon	+	2098	12	Intergenic	novelGene_8173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_11	2562.29269107	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	169	1794	174676	180850	FALSE	35	TAAGTGGAAATTGTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_180440
892111	contig_5023_pilon	+	3040	14	Intergenic	novelGene_7205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2108.59270773201	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	539	1720	611659	646990	FALSE	10	TCTGTAGATGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFNHLLTEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580840	648310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611566_611777_618605_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
892112	contig_20641_pilon	+	2945	7	Intergenic	novelGene_52831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_6	1301.4167920642	463	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	61	969	14599	85306	FALSE	55	AGCAAAAAGACATAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGVPWTS	14538	87282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_85286
892113	contig_2209_pilon	-	2199	9	Intergenic	novelGene_141002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_8	40.6132675366068	349	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	77	1033	248781	120917	FALSE	45	ATTGAGGCCCAGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRKAEELGGEGVCLRRPQTAAAACAMCAHNPGTEFDLSWISNIQVNQPAVLRRAEQIQARRTVKKEWQAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVVINRTLVLTGQWEALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAGSDFIKTSTGKEAVNATFPVAIVMLRAIRDFFWETGNKVGFKPAGGIRTAKDSLAWLSLIKEELGNEWLKPELFRIGASSLLSDIERQIYHQVTGRYAAYHDLPMS	248857	119750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_120974_122030_122181_125972_126086_184487_184617_202235_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248750
892114	contig_7904_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_160024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTAAAAAAAGGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408091	405869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_-_405900_408100
892115	contig_6189_pilon	-	3498	12	Intergenic	novelGene_164958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_8	276.563354868642	837	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	78	2168	206796	188226	FALSE	15	ACATTTCTTCACCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQGKDPSVDITQDLVDESEEERFDDMSSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEEKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSATNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFES	206873	186895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_188337_190412_190640_191061_191253_192144_192288_193662_193833_198484_198644_200065_200169_200270_200403_202036_202154_202625_202743_202820_202899_206253
892117	contig_11719_pilon	-	1667	5	Intergenic	novelGene_154785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	38.6741192530612	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2	394	170277	162073	FALSE	10	TTTTCTGGACTGGAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSPEPGLRSSNWDSEPGLFLALARLQEGIRICYQRRRSQAGPQRPAPSLPAALSAHRRPAAELAVSQKEPSEVPTPKRPRGRPKGSKNKGAAKTRKTTTAPGRKPRGRPKKLEKEEEEGISQESSEEEQ	170278	160799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_162127_163481_163533_164244_164331_169840_169956_170190
892118	contig_3004_pilon	-	2678	14	Intergenic	novelGene_127511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	135.151284945742	769	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	478	1884	330927	308249	FALSE	25	TCCCAGCAGATGTTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHKEALKIQKNKKEMLTKQKTWHIKARKAALLVEKERSAKITSLQPPPPTLFENIDVKKIPSIKTNSSTYHHLYTLVNREMDTKQPDPHLAAEEEAKRLEELQKQVAQERLEQFEKAHVRGFHAMKKIHLAQNREKLMKELKQLQQEDLARRRQNVARMPPQLVELPYKRSEMKEDWQRELEFAFEDMYNADKKVKGNLILHLEPEPLPTDQTQDEELDLSMEQEDLNETENPQVSEAEKIHPSEIDVPLAVNTQQIPSKILFKKLLNKIRSQKSLWTIKSMSEDESEIIGTVSEAESKVLTIESGTIASEEQTLPPGQEQVLESDAQTVESGPLATEDKPLSCNTDSEKQREVNETQCITTVAQNSVLLHPQEEAARIRMSARQKQIMEIEEQKQKQLELLEQIEQQKLRLETDCFKTQLEEEKRKSIQQTEVGIAPTSGTVISDEDSHRQMIHNYQRQLLEQNRY	339293	307454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_308354_308759_308898_311019_311124_311278_311372_313412_313635_316831_316994_317192_317377_319204_319346_324107_324204_329963_330058_330859_330987_332097_332299_333113_333231_339193
892119	contig_2799_pilon	+	2974	1	Intergenic	novelGene_85519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTATTTAGTATTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620774	623748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_620800_623700
892120	contig_8620_pilon	-	4565	14	Intergenic	novelGene_173876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	718	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2152	2460	170129	169821	TRUE	15	CAACCCTTCTCCCCGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIKALYVFYYVFILLKKKSVPQRSSFCIMCKIKGKKIKSKFLSFSHLLLYHLVSITRSTGTMQNFGINDKTLASQLREVVKRNGSGKRDSVTPPFIKTPPN	172280	82095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_82237_95444_95546_103844_103920_117605_117676_125934_126031_129106_129229_129388_129516_133509_133691_134326_134441_136637_136726_149879_150030_155159_155362_166436_166549_169294
892121	scaffold_2602_pilon	+	1669	10	Intergenic	novelGene_127700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	394.36647116641	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	70	408	47545	56468	TRUE	10	GCATGGTTGATGCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRLLFYASHSMRL	47475	69442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_47595_52863_52949_54040_54208_56431_56499_56687_56771_57959_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
892122	contig_16122_pilon	-	2974	19	Intergenic	novelGene_134550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_8	92.5018017842536	488	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	51	1334	291639	285885	TRUE	25	TAAATGTGGACGTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGPRRPQEQLPARYSTMGFSSELCSPQGHGAVQRLQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMFLQDSGAQSRGMAPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKSYSEQWQQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQARRKYQEASKDKDRDRAKDKYVRSLWKLFAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLMLPSLLQSLQDLHQEMACILKEILQEYLEISSLVQDEVMAIHQEMAAAAARIQPEAEYEGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGELLEPGELQLNELTVESVQHTLTAVTGDLAEATETVLSRQKVVTQLQYELQNEEQNTHPRERVQLLSKKQALQEALQGLQVTQCNQAKLQAQQELLQTKLEQLGPGEPPPVHLLQDDRHSTSSSEQEREGGKDAHPGDA	292137	280341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_281504_282123_282282_282524_282649_282739_282835_283182_283302_284184_284239_284662_284786_285120_285331_285847_285933_286052_286240_286371_286495_286657_286778_286852_286991_288662_288847_288978_289076_291084_291259_291426_291649_292096
892123	contig_3956_pilon	+	1308	6	Intergenic	novelGene_15085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1459.68700754648	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	80	1138	1281682	1290847	FALSE	20	GAGCCTACGCGACTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFARSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281602	1291017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284782_1290497
892124	contig_12079_pilon	-	2564	11	Intergenic	novelGene_67520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.743545829965	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	171	1799	871668	861365	FALSE	35	ACAAACGTTAACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861527_862060_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
892125	contig_14415_pilon	-	1834	4	Intergenic	novelGene_77587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	249.94932819807	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	13	1221	19037	13005	FALSE	25	CACTGAAGAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAETMSRLRPTRSGLLACTVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	19049	12391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_13232_16940_17037_18076_18917_18991
892126	contig_19816_pilon	-	1003	6	Intergenic	novelGene_156502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	262.767273456951	34	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	240	581	124800	123459	FALSE	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	125834	123036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125729
892127	contig_12528_pilon	-	2050	11	Intergenic	novelGene_81321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	564.023013714866	348	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	697	1497	966228	937460	TRUE	35	TATATTCTTCCAAAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLA	968152	932847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937462_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967137_967293_967656
892128	contig_9051_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_170810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	629	997	1042239	1042607	FALSE	45	AGCCTATATATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETEFGTERVGGCSNRSLKCGSGFETVNGYRISSSRETAVAEERQWQRKTAAEPGDQCEMAREPTHGVRELSASAQEASWRSGVPPGTYQWSYRALEHLPQWGRCGHEARGAEKPRNQKTS	1039275	1043664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1039339_1041673
892129	contig_12019_pilon	+	2659	12	Intergenic	novelGene_87746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	141.178686378657	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	202	990	633175	637915	TRUE	50	ATGCATAAAAATATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623216	643211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637933_638072_638139_639665_639833_639942_640142_641782_641874_642082
892131	contig_3956_pilon	+	2720	14	Intergenic	novelGene_15047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1531.03678373059	5	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	81	1505	1281682	1288915	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITINAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIHLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282907_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286602_1288028_1288077_1288874_1289229_1289493_1289545_1289758_1289892_1290297
892132	contig_16496_pilon	-	1452	2	Intergenic	novelGene_5218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	6	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	309	326	1225	1208	FALSE	20	TTTGTATTTGGTTAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3593	81	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
892133	contig_8050_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_114877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTATTTATAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446067	448463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_446100_448500
892134	contig_13592_pilon	+	3486	15	Intergenic	novelGene_33711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	395.668544287735	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	513	2441	256608	269322	FALSE	25	ACTTGGTGTCTAATGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	249305	270367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_267704_267825_268000_269068
892135	contig_16411_pilon	+	3312	8	Intergenic	novelGene_77335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	691.405755231577	7	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	32	784	185394	241060	TRUE	20	TCAGCATCTTCGTCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVSPLRAH	185362	243788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241039_243422_243621
892136	contig_9752_pilon	+	4060	3	Intergenic	novelGene_122002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	290.5	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1192	3579	477	4055	68566	72144	FALSE	60	GATAGAAAAATCTTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVMSLSRDLKDDFHSDTVLSILNEQRIRGILCDVTIIVEDTKFKAHSNVLAASSLYFKNIFWSHTICISSHVLELDDLKAEVFTEILNYIYSSTVVVRRQETVTDLAAAGKKLGISFLEDLTDHHFSNSPGPYVFCITEKGVVKEEKNEKRHEEPAITNGPRITNAFSITETENSNNMFSPLDLRASFKKVSDSMRTSGLCLERTNVCQEPEPVRTLAEHSYAVSSAAEAYRSQPVCEEASSSTGKAGKENGEALAAKPKPCRKPKTLSIPQDSDPPTENIPPPPITNLEVNQERSPQPAAILSQSKSPHNEGDVDIPREDENKSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKSFDSSALLSAHMQLHKPTEEPLVCKYCNKQFTTLNRLDRHEQICMRSNHMPIPGGNQRFLENYPTIGQNGASFTGPESLLSENRIGEFSSTGSTLPEMEHMVKFVNGQMLYSCVVCKRSYVTLSSLRRHANVHSWRRTYPCHYCNKVFALAEYRTRHEIWHTGERRYQCIFCLETFMTYYILKNHQKSFHAIDHRLSISKKTANGGLKPSVYPYKLYRLLPMKCKRAPYKSYRHSSYENVRENSQMNESVPGTYVIQNPHSSELPTLNFQDSVNTLTTSPAIPLEASACQDIPTSTNVQNAEGTKWGEEAVKLDVDNNFYSAEVSVSSTENAVNSDLQAGGVPVLPVSNGSEKSTSVISYSGSAPSVIVHSSQFSSVIMHSNAVAAMTSSNNRAPADLAVSQSLKDNSKPEPDKGTKVASIKEKKKTIQHNKGEIPEESKYVADPGGSLSKTPNVTEETSKIETYIAKPALPGTSTNSNVAPLCQITVKIGNEAIVKRHILGSKLFYKRGRRPKYQTQEESLLQDSYPETKGDSPLGLCQSECVEMSEMFDEASDQDSTDKPWRPYYNYKPKKKSRQLRKMRKVSWRKEHGNRSPSNKCKYPAELDCAVGKAPQDKAFEEDDNKEMPKLQCELCDGDKGATPGSQGRPHRHLTARPHTCELCAKQFQSPSTLKMHMRCHTGEKPYECKTCGRCFSVLGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCSKAFTLNETLKIHERIHTGEKRYHCQFCFQSFLYLSTKRNHEQRHVREHNGKGYACFQCPKICKTAAALGMHQKKHLFRSPGQQEKMEGDVYQENSNPLENPHCIDSEDNDQKDDAHAIVENVVL	17960	72149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_18332_19617_19723_68565
892137	contig_7119_pilon	+	6688	3	Intergenic	novelGene_40942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	8	junction_2	24	4508	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	97	1182	138713	139798	TRUE	40	AATGATATTGTTCAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127510	145494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_141008_141197
892138	contig_20142_pilon	-	4795	3	Intergenic	novelGene_178611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2000	2461	104647	104186	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRCTAVTEDQQRQRTNSSRTRRPVRDGAGADPRSERAECLCAEGFLAEWGASGHLSVDLGLLTHGVGELSVCVHEAFWWSGVSLGTYTSGATELWNICPSRADAGVRPKGRETIGSRSRRDKGHKKLSCFSLKRYGHDLRGFKGWSHGLWCF	122304	38601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20142_pilon_-_40302_103551_104955_120612
892139	contig_14546_pilon	-	1340	2	Intergenic	novelGene_157457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAATGTCCTTGGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541034	539609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_540284_540368
892140	contig_9180_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_109122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCTCACTTATCAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491033	487977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_488000_491000
892141	contig_3956_pilon	+	1434	6	Intergenic	novelGene_14975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1534.59154174653	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	169	585	1286460	1289755	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMEPLSP	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282751_1286427_1286606_1287276_1287530_1289737_1289892_1290297
892142	contig_6599_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_175994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCAAGAGGGCGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	262317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262300_262700
892143	contig_8673_pilon	-	2521	6	Intergenic	novelGene_129927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_5	188.870961240737	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	84	749	338208	324321	FALSE	25	GACTACACAGTGAGTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHNSDAHSTTSSASPAQSPCYSNQSDDGSDTEMASGSNRTPVFSFLDLTYWKRQKICCGIIYKGRFGEVLIDTHLFKPCCSNKKATAEKPEEQGPEPLPISTQEW	352372	322548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324481_330858_331010_335510_335638_336673_336774_338080_338229_352309
892144	scaffold_13505_pilon	-	1747	8	Intergenic	novelGene_111511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	445.902753194149	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	234	1235	603235	590218	TRUE	10	CGTGTCCATTCTCGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGLAARVTLDISSP	603468	588511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
892145	contig_776_pilon	-	3765	7	Intergenic	novelGene_139927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	108.397032554709	530	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	125	718	911734	833127	FALSE	20	ATACTTTGTTCTACTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSGGLATTLQTECILEQTYGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRYYGPIPYGLIRGRIFFKIWPLSDFGFLRDNPNGHRFSDD	932098	830079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834687_834799_857382_857510_861796_861886_863749_863884_911670_911784_932023
892146	contig_12079_pilon	-	3268	4	Intergenic	novelGene_67563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	27	junction_2	496.448050320138	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2735	3091	868372	867179	FALSE	30	CTAGTTCTATGATCCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKVSSRHACQNSLSVGSDTFILRK	872327	867001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_867410_868246_869258_870148_871171_871500
892147	contig_6898_pilon	+	3914	13	Intergenic	novelGene_35710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1082	junction_2	2050.17732803504	32	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	131	1864	59668	125646	FALSE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59537	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
892148	contig_8801_pilon	-	3670	1	Intergenic	novelGene_66289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	351	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1046	1504	471947	471489	NA	85	AAAAAAAAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQCWCPALCLSRETKQKEMYVTKNILLKHMLKGDRRNRITDCKLLGEALIRSEMNGYSNCSFKRVMVLLNFICILYFYTNNACHLRLFGGLALLPPPSSPHKAPSQVLPPCQSTSTCYCEKISMVCLGKYRGRLPSGEQMQKVHIICVKI	472992	469322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_469300_473000
892149	contig_116_pilon	-	2081	13	Intergenic	novelGene_154899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	167.512914095866	607	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	166	1185	281128	262769	FALSE	5	CCAGGCCGCGTGTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEVTPGGDICNLTPDTLTSDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVHQLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCVRVFSEKKADYQVVDDEIEANLQEFDVSEDDIDDGFRKLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSTETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYILWTKIQNYQKIYREIDVDKSGTMNSYEMRKALEEAGFRLPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIQLDLISWLCFSVL	285705	261872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_262793_264796_264856_265118_265236_266738_266818_267677_267747_268639_268705_271093_271152_272359_272426_273507_273545_275945_276167_278967_279138_281073_281192_285603
892150	contig_11304_pilon	-	2585	13	Intergenic	novelGene_156680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	359	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	330	428	490100	490002	TRUE	15	CTCCACCGACCCGCGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DALYHWCFDLSGSKHGTWILIELLLCLFSRVWLLTGHRGCGWSSGLPSHCVRLLTSGLPELRSLRENSLLLTSSISTFSSKGRLSSKSWSPGAELSAVENSFSSSQRWAMEGLASSMLPFLGMAYLGSLRLSPPLTLLRTG	491262	273036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_273227_351742_351860_433617_433674_441233_441326_447547_447606_447719_447873_457802_458479_484411_484450_485227_485282_485596_485743_488987_489224_489660_490241_491073
892151	contig_9668_pilon	+	5456	3	Intergenic	novelGene_58265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	975	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2509	2835	661800	662126	TRUE	35	ACTCCTAGCAACCCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIEYTMDCRKNESVLEEVQPECSLEARMARLSLTYFGHVIRRDQSWRRTSCLVESHRKRGRPSMRWIDMVAITMGKSIVMIVRMVQDWAVFCSVVHTVSMSQN	656520	668827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_658461_661231_662773_666852
892152	contig_6599_pilon	-	1123	2	Intergenic	novelGene_175971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
892153	contig_6227_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_49680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATTGGCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862095	864257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_862100_864300
892154	contig_20779_pilon	+	1903	4	Intergenic	novelGene_112364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_2	60.337937209244	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1863	39	1901	8301	94520	FALSE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENVECDNMNRFDRSDRNVRQSQEGFWKRSPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLS	8262	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_94359
892155	contig_3956_pilon	+	2031	10	Intergenic	novelGene_14876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1319.39875008596	121	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	84	1133	1281682	1289629	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKVRKPGAASMPVC	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285836_1289599_1289677_1289758_1289892_1290297
892156	contig_4091_pilon	+	2547	3	Intergenic	novelGene_172979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1122	2144	14387	15409	FALSE	65	ACCACATAAATAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIHAPNDRASKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAIFNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKRLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKELVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKKERTQITRIRNETGDITTDPTEIKRIITESYEKLYSNKFEDLEKMDKFLETHGLPKLI	0	15812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_298_543_848_13866
892157	contig_1715_pilon	-	2349	6	Intergenic	novelGene_127173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	390	junction_2	135.107364714141	206	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	565	699	249049	248253	FALSE	15	TAGCATTGTTTTTATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	262581	246602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484
892158	contig_1379_pilon	-	3955	21	Intergenic	novelGene_134590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	118.109895859746	923	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2589	680	3268	474282	436580	FALSE	40	TGCCAAAGACTGAGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQEEWRTAKGEEEIKIYRSEEKRKHFAVPKENKILTVSKNHAHEHFLDLGESKKQQANQHNYRTRSALEETPRPSEEIENGTSSSDEGEVVAVSGGTSEEEERAWHSDGSSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKHKTKKAESSSDEEDESEKQKQKQIKKERKKVNEEKDGPTSPKKKKPKERKQKRLAVGELSENGLTLEEWLPSTWITDTLPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQPEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDVECRSLIYKPLDGEWGSNPRDEECERIVRGINQLMTLDIASPFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEEEEKDADVPGTSTQKKKDHQPRRRLRNRAQSCDIQAWKKQCQELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKRRKKRNRSSSISSSAASSPERKKRILKPQLKADISTSPFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTESSSFVRTRSNRVVGDPVITEQPSTSSAGKTFISKANTATMPGKTILENSMKHSKTNLNTLSSPAQSSFSHGTRNNSAKENMEKPVKRKMKSSVLTKASTLSKSSAVIEQADCKNNALIPGSIQVNGHGGQPSKLMKRGPGRKPKVEVNTTSSGEVIHKKRGRKPKKLQYAKPENSQQNNVHPIRDEVVPSSTCNFLSETNIVKENLLQKKSRGGRKPKRKMKTQKLDSDLMVPTSVKMLRRSNRKKTDDPVDEEEEFEELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFEDTSLTFGTSSRGRVRKLTEKAKANLIGW	485889	435892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_437221_442820_443016_443782_444043_444499_444664_445291_445445_454158_454309_454569_454621_454859_454930_459279_459406_461733_461855_463209_463366_465455_465518_465697_465810_470262_470346_470464_470590_471166_471275_474270_474391_476981_477214_479324_479402_482411_482553_485768
892159	contig_5423_pilon	-	2703	12	Intergenic	novelGene_85274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	237.811752762697	5	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	167	1561	577052	558772	TRUE	30	GCCTCATTGTAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNFLWGNLDTSSSTSPFQRRLFCVIFPATQLFLFSKYTHSIRIQQCLFLRPEQSMCTWYLEAADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	579942	557576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_558014_558066_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172_574294_576973_577066_579789
892160	contig_7207_pilon	+	3204	1	Intergenic	novelGene_72094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710555	713759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_710600_713800
892161	contig_5331_pilon	+	3882	21	Intergenic	novelGene_112831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	560	12	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1304	1621	782483	789006	TRUE	10	GAGCCCCGCGGCTGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFTATWRLFRGSIFMTEPTVLRGKEISTVWLGLSGAWTWRGAAGARPKLLRLNWMAKSVMTCRALLVSWRSMEMEPTWRVKVPEISSPLAFMAGSQTCFGGNI	778536	835899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_779533_781125_781283_781386_781472_782417_782500_782796_782930_784285_784434_788986_789130_790520_790719_791289_791554_792044_792140_797682_797852_798192_798315_799350_799442_799918_800045_802653_802874_804438_804634_805856_806097_806906_807044_809720_809826_813311_813378_835789
892162	contig_8563_pilon	-	3398	4	Intergenic	novelGene_178612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1755	1643	3397	2990	1236	FALSE	75	TAAATAAAAGGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHH	115573	1234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8563_pilon_-_3133_38087_38094_47964_48527_114641
892163	contig_18096_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_58053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCAGTTAGGCTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79105	77260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_77300_79100
892164	contig_2069_pilon	-	6783	5	Intergenic	novelGene_23198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	222.069105235285	2675	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	26	715	114391	97981	TRUE	25	CAGCTGAGCTAGATGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQIFSSLRTGATTSAA	114416	91302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_97261_97870_98025_109097_109509_111852_111994_114297
892165	contig_8954_pilon	-	4479	7	Intergenic	novelGene_130293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	666	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188704	163888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_165033_169408_169552_173747_173876_174333_174401_182928_183066_185778_187186_187251
892166	scaffold_7386_pilon	+	2052	5	Intergenic	novelGene_136579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	60.9113084738786	377	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	477	1382	287700	290321	FALSE	15	GGGGGAGGGCTGAGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKGDFDSEPPLKFVEGKDEITGDEYDGLQRVEMSCGHAVDQGSLTAWCRSLMDQGYFKLCCPADVNGEKCGAQWSYPEVRRCAVLSNEEQHQFEQKLALLAARLYCDFKECPRCKSLVERKELSTVRVLCTICTSTLGAGYEFCWQCLQSWKGTGTPPDHCANVGCQDPNLEVLASCATKDLPGSEILACPSIRACPTCGLLIEHKEKCKYVMCSRCHVEFCFACLELAQACQATRAGAWFKCCAKPLAPRQTHIPVWSRTGGGYGGDEVNTGHRVQSHIPPLREVRMREAEQTCMII	286690	290991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_+_287103_287635_287773_288862_288961_289390_289559_289754
892167	contig_15112_pilon	+	7037	5	Intergenic	novelGene_124756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4797	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1790	2128	23547	23885	TRUE	20	AGATTTAACCTTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGRWQENRVHCRPQGLKPKLSHTQLTYNFNQCCCSTTAFSRFEIAFFSQPIKQKQVGKHPKGKAAEEKSRSSHAGSSKSCLQSPDCSCLSKLPQITKLNPRPQNSWQGRSR	21757	42143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_26491_34754_34829_34915_34956_36236_36316_40032
892168	contig_10199_pilon	+	3455	1	Intergenic	novelGene_178615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	591	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	299	900	2472	3371	130935	131834	NA	45	CAAGAATTATTAAAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELESLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLGTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPA	128463	131918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10199_pilon_+_128500_131900
892169	contig_19032_pilon	-	2629	3	Intergenic	novelGene_172553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	873	27	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	159	368	164883	164587	FALSE	20	AAATTTGGTTAGGTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQHEPTSSRSRRRSRRPGREAAAAAATSGRETAKQNRKAEIKREVLKDLEKIMVVDILSTLKRTNTAEPNLLSPLLKKKMNTLMIQWFVLILVSEAVSPSLQLFDVVIFGSVRKQCCMLNA	166676	162325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_164751_164837_164950_166584
892170	contig_11846_pilon	-	5902	21	Intergenic	novelGene_105963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	166.833412420894	17	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1633	4902	456	5357	339800	290118	FALSE	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPSTAPGANPSNAQVTGTLLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGPGASSNNGASSNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSALPGSTTSNKGKGSQCQSASSGSECNLGVWKSDPKSKSVQSSSSTTESSNGLGNWRNASGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQDGNSRKGALETDNSNSSAQVSTGGQASREQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMESKGMPFGMGLGNASRSTDAPSQSTGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKDREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSEVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTMWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAPSQSNQTKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTSSSWNENSSKDQGWGGGRQPNQGWTSGKNGWGEEVDQAKNSNWESSASKAVSGWGEGGQNEIGTWSNGGNANITSKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWSKPHQQQQQPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNGRPSNSNWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTGKSASDSKSMQDGWGESDGSVTGTRHPSWEEEDDGGVWNTAGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNSDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVDKKFDVDKRAVNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGNHGLFGNSTAQSRGMHTPVQPLNSSPNLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	417716	289572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308786_319253_319380_324471_324609_326101_326148_327241_327317_329615_329792_334951_337301_339601_339944_348261_348331_356662_356764_417574
892171	contig_9653_pilon	-	3108	6	Intergenic	novelGene_48246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_5	68.009999264814	491	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	21	707	916180	839279	FALSE	20	GAATACCCGAGTGCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPAVPMERVRMINVQRLLEAAEFLERRERECEHGYASTFPSMPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDCTRHTTLGLLNKAKAHIKKLEEAERKSQHQLENLEREQRFLKRRLEQLQGPQEMERIRMDSIGSTISSDRSDSEREEIEVDVESTEFSHGEVDNISTTSISDIDDHSSLQSIGSDEGYSSASVKLSFTS	916200	836877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_839443_844948_845121_845715_845831_879607_879638_913559_913693_916107
892172	contig_5434_pilon	-	2516	11	Intergenic	novelGene_74675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	152.025030833741	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	384	1385	350282	325255	FALSE	30	ATATTTAATAATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQIMKFSPESVAAFIAVLGILSIIAQTIVLSLLMRSIGNKNTILLGLGFQILQLAWYGFGSEPWMMWAAGAVAAMSSITFPAVSALVSRTADADQQGVVQGMITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	379691	324123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326885_331417_331516_333049_333163_345064_345137_345931_346046_347592_347812_350267_350383_353137_353201_363117_363214_379567
892173	contig_2854_pilon	+	2979	7	Intergenic	novelGene_120796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.809797324793	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	131	2047	68068	86814	FALSE	35	CAATAAATAGCGCTGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTIFSSSPAVPFVPVNGLPPDEEALLKERICHKRRSSDSEERHTKKQFSLENVQQGEPVCDGRTSARSVTADLSGSPDSEHVSPDAKDTTEEMEYNILVNFFKTMGYSQDVVEKAIREFGPSAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLRDMQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	67795	87746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_67905_68046_69192_77196_77328_78878_78976_82393_82502_84541_84650_86465
892174	contig_6847_pilon	-	2976	7	Intergenic	novelGene_143890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	479	junction_2	140.082614513325	874	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	82	1023	246139	232193	FALSE	40	TAAGAATGTAATCTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTSAMITETIIETDKLKVAPAPTRPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIMSSNMGKRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	246220	230239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024_245190_246080
892175	contig_7593_pilon	+	1637	2	Intergenic	novelGene_127265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACATACTCCCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879	3813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_2641_2937
892176	contig_8674_pilon	+	4217	5	Intergenic	novelGene_102934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_4	854.312406265998	134	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	527	2878	454414	476156	TRUE	15	CTAAGTTTTGGTATTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STNCNLEGVPNTNQGKHIKSKSHVHSSPNVDTLICPDVSGNQQVLDESRGSTVVSGDTLQIANICSLVEGDISYNSQIAKIFNSPYLDKVEPQKPCLPDHQVISCRQQKEQLDKTTENKNFGFQKEKIVQVTDVSPKITHQPESLPPSESSLKNVKANGEILEENKLECITNKEIMTSNMYCSAAIQQDSPEIDAPCNYISQDPTSSEIFSDKTSLLYLHDQLSELLKEFPYGIEAVNSREGSAGQQITEQVKNQSYDKTSCDSKDSTSTDQIKITIISSEQMKELFPEQDEQPSDGDKLTEPQKEKPITKVESQCDPKAHTEGESHDSVVSNLKRDDIHCCALGWLSMIYEGVPQCQCNSMKNSASEEEKKSHCSALETNRCKQGERTSDRDIPGVECNRSPNKDLKTPLILPDGKNSFPEIKQDKNMKDNTETKHSNSLKTEKELPSQFSSKCDKKLDPLQSHKRKRKLQFHEVTFHSSSKLMKFCEQDSQESLQKKHTAQNSRPLKAKTVILTNKDLYKKNGSLIQSISPEKIKLKFRAGGSRYKLLENRKLDQGNIFDMERKKKKYDKREQNKNAGSSFKLCNSLSNLNERTSIKEKTVSIEVKSTNLEINIHRSLMKSSNINSSDSKDISCKINRVMAPKEYLQRQKHKEAIGNKASKKSCVIEKIKNVPCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQVSGIKSTKEAWLKCVNTEKRMQEANQKIDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGEWRPVVVP	453887	477847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456506_457759_457844_460249_460397_476127_477378_477729
892177	contig_17144_pilon	-	2676	14	Intergenic	novelGene_29228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1869.594421733	509	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	255	2381	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176192	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
892178	contig_3386_pilon	+	3808	14	Intergenic	novelGene_34574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	631.216426841692	741	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	180	1298	476274	506163	TRUE	45	TAAACTGTGTGAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRYRSENTPDPGFLT	470197	510175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_475713_475783_476271_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506635_507645_507741_508231
892179	contig_10990_pilon	-	6103	3	Intergenic	novelGene_7431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1919	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCGAAGAGACTGTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686409	679691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_679942_680003_682961_683513
892180	contig_14970_pilon	-	1628	6	Intergenic	novelGene_45126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	132.930959524108	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	334	1077	291083	268709	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315731	268157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
892181	contig_14970_pilon	+	2301	4	Intergenic	novelGene_44938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	10459	junction_2	2657.12279647659	340	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	133	588	136145	188846	FALSE	5	GCTTGGCTCAGCCCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISKYLF	136012	190559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757
892182	contig_16578_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_148646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174657	171717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_171700_174700
892183	contig_10437_pilon	+	1163	2	Intergenic	novelGene_38489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGCTTTGCTGGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213562	1215716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1214297_1215287
892184	contig_14450_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_48924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	285	858	380	1237	21705	22562	NA	50	GAGCTCCAGAATAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPNREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNTLWITLRRMGIPKHLIVLMRNLYADQEAVIRTEHGDTSWFKVRKDVRQGCILSPYLFHLYADQIIREAGLYEEGRGIRTGGRLIHNLQYADDTTLLAESEEDLKHLLVKIKDHSLQYGLYVNIKKTKILTAVPISNIMINRENTEVVKDFILLGSTINIHGSSSQEIKRHIASGKSAAKDLFIVLKSKDITLKTKVCLTEAMVFSIASYACERWTMNKEDHGRMDAFELRCWRRILNIPGLPEERTNLSWKYSQNAP	21325	23769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_21300_23800
892185	contig_6630_pilon	+	3458	13	Intergenic	novelGene_30703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCGCGACGACAGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355893	384192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_357781_358548_358671_358778_358862_360552_360719_364053_364179_366328_366438_367654_367843_370545_370600_372510_372713_374301_374491_374844_374928_379914_380096_384123
892186	contig_10734_pilon	+	4848	18	Intergenic	novelGene_51255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	525.595401379766	25	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	564	2708	1279318	1321486	TRUE	25	TTGCCAGTGGTACTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKKTQGIRDSVLHLKSLAGIMAGRREICAQ	1274614	1334964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1275148_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1310195_1310254_1321457_1321506_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
892187	contig_17274_pilon	+	6938	4	Intergenic	novelGene_26456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	144.262107136821	196	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	72	527	7027	28053	TRUE	25	CCTTCTGCAATATGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNGNYTSQLLLGIQVYFIH	6955	42576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_32405_40516
892189	contig_18869_pilon	+	5068	14	Intergenic	novelGene_56458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.884336347392	85	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	732	1802	182555	189734	TRUE	55	AAAAAAAAGAAGGGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNGLPSLNFLIGRLLDDGCVREASRVCRYFGFYNRDVVLVLHCGALASGEAGADDLHAEVQALLQRAELLEEEEESAVAARKVRSTSSLDTQSLKTAPPSDQVVADLKTLTSKCLHGKNSCRQVLCLCELAQDLGCPYTDVAAWGGEAVLRAILASQQPDRCKRAQAFISTQGLKPDAVAELVAEEVTRELLTPSEGAGHKPTFSPAEESQTFLQLTMLCPDLTLVGRKLLDKISSVPHGELACTTELLILAHHCFTLTCHMEGIIRVLQAARLLTDNHLAPNEEYGLVVRLLTGIGRYNEMTYIFDLLHKKHYFEVLMRKKLDPSGTLKTALLNYIKRCHPGDSEKHNMIALCFSMCREIGENHEAAACIQLKLIESQPWEESLKDGHRLKQLLLKALTLMLDAAESYSKDFCVRQALRCHRLTKLITLQIHFLNTGQNTMLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	177089	194816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_177185_177229_177471_180985_181126_181983_182183_182498_182637_184431_184566_185235_185344_186722_186892_187841_187931_188134_188291_188948_189101_189553_191859_192206_192281_193748
892190	contig_16228_pilon	-	3991	4	Intergenic	novelGene_147945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2383	2904	72704	72183	TRUE	10	CCCTTGGCCCCAGTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPSTPNSASRSEILTPSSCHGQHLYTVLMPGLVFSERHIPVMQKRLWKFVRCTLGSGPLWEERRIFQEPGQWQKRAHSTRLSILSVQAAWGRLEGRGEQRKAQGHMCAGSCGQEGQGSTDHGPQELDHSWKCQYLHGDRLRVVVSQEFQILLPPLVKCLWPGLASGPHCRQ	75086	59868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_60220_69475_69789_71433_71816_72141
892191	contig_6599_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_175992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTGAAACCGTTAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	262306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262300_262700
892192	contig_6270_pilon	+	2959	4	Intergenic	novelGene_99876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	930	1244	1055962	1056276	TRUE	25	GCCTTGTCAGTCTGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEFSTARWCPATTTDCSDQDHNTGFLIELEKDVEHNSNSQKKKTRFTGLKETGEAPRVCPPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPLKPNGTNEVQ	1055032	1082177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1057608_1058855_1059017_1061613_1061676_1082016
892193	contig_10734_pilon	-	2776	6	Intergenic	novelGene_51119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	185.735726234885	407	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1938	2624	739047	737389	FALSE	10	TAGACTCCCTGTTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKQATRGDGLAFQMRAGLLP	741301	737236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737446_737526_737597_738019_738138_738215_738501_738890_739056_739372
892194	contig_3394_pilon	-	4677	15	Intergenic	novelGene_152680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2006	2341	530369	529448	TRUE	65	TGAAACAAACAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVAAGGMGSCSILGGIAHEGRNRQASGIFRGSRHWLGNIFSGANMEDPTKGWKVGTLCTYEKSFISSGLGLPNPSSTSILNSVSCVGTMLTIGLSIMPNAVTVSELIPSL	536243	431599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_431684_445592_445677_504424_504572_507351_507546_507933_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518600_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176_530385_534253
892195	contig_6062_pilon	+	5524	5	Intergenic	novelGene_5241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	740	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGCAATGTGCTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526323	699550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_526427_572682_573042_617954_618008_694375_699048_699213
892196	contig_14525_pilon	-	3076	18	Intergenic	novelGene_149751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	242.771611526805	138	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	583	1170	148448	137022	TRUE	40	TCTGAACATATCTACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGATGGASVPALWSEINRYGQNGDFTRALKTVNKILQINKDDVTALHCKVVCLIQNGSFKEALNVINTHTKVLANNSLSFEKAYCEYRLNRIENALKTIEGANQQTDKLKELYGQVLYRLERYDECLAVYRDLVRNSQDDYDEERKTNLSAVVAAQSNWEKVVPENLGLQEGTHELCYNAACALIGQGQLNQAMKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQIIKLKPTDVGLLAVIANNIITINKDQNVFDSKKKVKLTNAEGVEFKLSKKQLQAIEFNKALLAMYTNQAEQCRKISSSLQSQSPEHLLPVLIQAAQLCREKQHIKAIELLQEFSDQHPENAAEIKLTMAQLKISQGRYR	157405	126521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434_128595_132105_132144_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137036_140186_140260_141223_141353_142242_142375_145157_145216_145303_145429_146713_146746_148423_148536_148614_148759_153473_153598_155326_155448_157299
892197	contig_9924_pilon	+	4386	14	Intergenic	novelGene_175913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	393.554639710765	1265	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1297	3894	211	4104	15841	171041	TRUE	30	AACCAATTTGTTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETGSPPRSAINQNTDKISGAGTNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSSEEEKHNKKGMANQREKSLKTAREKSSDNVERKQEREKFFSAEGTVDKDKTIMELRDGLSKKQQPSVSSDGTDKPSSRRGEGFNSPEDKKVAETKEKSKHLKTKMCMKVQGGLSGVAEKFPKKEQTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDGEKKSKKIKEKISKKKNELSDNAEKLPGKGDSYDSSEDKKSRNGASDREKKRCNLPEKSSRRRQDCSSSDTEKYYLKEDGCDSSDKRLKRTELRERRNLNSKRSTKEIQSGSSSSDAEESCSEDNKKQKKQRPTAKKKTNNVKEKKRNSLRTSTKRKQAEITSSSSDIGDDDQNSVGDGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPLTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKMSVCKESRIGRKSAEL	15630	171888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_123901_124012_126980_127049_127352_130436_136325_136399_147476_147611_148061_148071_166286_166292_170996_171100_171664
892198	contig_14288_pilon	+	1934	3	Intergenic	novelGene_153846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524471	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_525078_563235_563912_660212
892199	contig_15775_pilon	+	3783	10	Intergenic	novelGene_148366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	197.495303897911	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	15	770	172	5817	TRUE	10	ATTTGTGTGTGTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEAAGTSSEQVIQHLEGELCYANLTLHRTGTSPVSSQKKASAKSASSAQANKEEAEYVTMDPLPREEISYASLSLDTSNQEPFYSNMD	157	36822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1880_1945_2675_2789_4617_4641_4989_5140_5730_7524_15547_15716_20097_20225_26879_27248_36178
892200	contig_7285_pilon	-	2424	11	Intergenic	novelGene_143380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	237	536	343050	342751	TRUE	45	GAGGAGGAAGGGGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIHCKPVSWKLPVKVYLFQKRTKKKKKKKKQKKNKVKSDCHNTVGLAVPLFSPTECLTKTKRPLQKIQRSHLSDKVFLKKRGLLLFFISNVSGSLNFI	343286	218692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_218983_221380_221448_222877_223014_301406_301533_308335_308429_310154_310242_312548_312674_313781_313944_320305_320415_323968_324016_342104
892201	contig_8377_pilon	-	6503	3	Intergenic	novelGene_35053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	4486	4908	96333	95911	TRUE	30	ACTCCTAGTCCGAGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFTSKTNFTQRFSSLSRVSFQMWEDGLFFFSYSGPQTMSTGNKMRARTLTSIIRGSLFLEHMSLYGYINTKLHIILNNIISLPVPLHKSLLFEILLLRRAERHVGEKWYSSETLEVFMVITNTEKYYFACVIILFLGS	100818	92420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_92428_93442_93510_94389
892202	contig_3861_pilon	-	1388	10	Intergenic	novelGene_57890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGCGCTACAGACTCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171806	141763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_141884_144426_144472_147763_147874_150015_150424_152747_152949_157484_157595_165472_165623_166767_166866_170341_170473_171791
892203	contig_12079_pilon	-	2772	11	Intergenic	novelGene_67518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.743545829965	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	169	1341	871668	862030	FALSE	30	CAAACGTTAACTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASGDCYLRPSPAAPWMSPPTAPPLFLLPVPKEISSPDTSPSPQRLTEVSPTEK	872426	860598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862186_862510_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
892204	contig_4180_pilon	+	4087	10	Intergenic	novelGene_8299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	130.570070115155	890	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	293	1636	733322	821915	FALSE	40	ATAGAATAAACCTAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733029	824366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
892205	contig_10437_pilon	+	3092	7	Intergenic	novelGene_38433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	323.380451893225	870	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	214	858	858443	866122	FALSE	25	TGATTAGTTTCAGTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVELSSLARLPSLNKLRKLELSNNSISGGLEVLAEKCPNLTYLNLSGNKIKDLSTVEALQNLKNLKSLDLFNCEITNLEDYRESIFELLQQITYLDGFDQEDNEAPDASDEEDDDDGDEDDEDEEDEAGPPEGYEEEEEDDDEEDEEEDDEAGSELGEGEEEVGLSYLMKEEIQDEDDDDDYVEEGEEEAEEEEEGLRGEKRKRDADDDGED	855522	868356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_855653_858359_858503_858971_859095_859810_859980_861103_861280_865323_865379_866060
892206	contig_10074_pilon	+	5678	15	Intergenic	novelGene_57122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_12	335.558421264662	47	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	1640	3769	320608	358190	TRUE	20	CCCCGAGACCATGGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRSTRSLHIPTRDLPLSPDTTVVLHQVYNVLLGLLSRAKLYVDAAVHGTTKLVPYFSFMTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKGRDDVYDRTLLDYFFSYHQFIHLLCRVAINCEKFTETLVKLSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAVSKTCIKLLWEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKVSRARVMKRQKKCLVEVVTAVKIVQLQPWRLTIQETQRRPSSCKSWAWTRLHGPAFLFRDGVRK	318968	361218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329877_330002_338513_338594_341265_341407_341507_341652_342585_342746_356964_357079_358110_358289_359407
892207	contig_14682_pilon	+	3260	2	Intergenic	novelGene_139123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	916	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACAAAAGCCCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131741	135357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_132149_132504
892208	contig_4769_pilon	-	4351	8	Intergenic	novelGene_117963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	27.6132177755213	1164	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	7	408	437505	421082	TRUE	15	GGCTGTTCCTGTATGAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTEASRSLPKSRRDPEGRALRQDKFSVLLPTYNERENLPLIVWLLVKSFTESVINYEIIIIDDGSPDGTREVAEQLEKIYGSDKILLRPREKKLGLGTAYIHGMKHATGNYIIIMDADLSHHPKFIPEFIR	437511	407176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_421112_421195_421273_423624_423659_433960_434061_437344
892209	contig_16123_pilon	-	4102	4	Intergenic	novelGene_164282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	421	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3180	3578	73676	73278	FALSE	10	CTCCTGCTCTTTATTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKKIRERRKQNKETKRKQNQNQNKTRKKKCPQGCPCASAQSKRVASKPCRTAQLEGAPKPRKEKKTIKQIKQNKSEQTKQTKKAPGVPPAWLHRLGSSFTVKQCFAAFQEEAKVAHGARYLRERRGQL	130706	72753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_-_74991_108321_108743_128821_129755_130195
892210	contig_4593_pilon	-	3634	4	Intergenic	novelGene_178616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3224	3553	105585	105256	FALSE	10	GTGGAGGGACGGTGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPACVCGIQAAGASWFRDRGRGKQRRPSRGEEGWGVGKCTPQITGCFVSRWMFCEAAFSYPRLLVSDRSPRWWIHATLAGWGPLHESLLALCSLSVFSLHLVLD	364516	105174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4593_pilon_-_105615_105867_107708_244477_245623_364307
892211	contig_16951_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_98661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGTTATAGTCTTTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111057	109513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_109500_111100
892212	contig_11986_pilon	-	3232	8	Intergenic	novelGene_69211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1366.79938960645	2907	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	42	1055	751681	736169	FALSE	40	GTTTAAAGAAAAAGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFFGSYALGTSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	753213	733991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_751646_751692_753182
892213	contig_5643_pilon	+	1059	12	Intergenic	novelGene_38794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	990	68	1057	233973	237971	FALSE	30	TAAGGAGTAAGATCCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMA	233607	237973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
892214	contig_7261_pilon	-	2753	3	Intergenic	novelGene_178618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	738	1577	215674	214835	TRUE	45	TACAACCACCGGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	216646	213415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7261_pilon_-_214271_214513_215701_215935
892215	contig_14525_pilon	-	2565	4	Intergenic	novelGene_149752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	444	junction_3	248.476692401253	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	984	1466	134712	127683	FALSE	15	GTGAGTATTTCCTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVDVEALENSPGATYVRKKGGKVAGDNQTKEQGQGDLKKKKKKKKGKLPKNYDPKVTPDPERWLPMRERSYYRGRKKGKKKDQIGKGTQGATAGASSELDASKTVSSPPTSPRPGSAATVSASTSNIIPPRHQKPAGAPATKKKQQQKKKKGGKGGW	135695	126583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434_128595_132105_132144_134605
892216	contig_14744_pilon	+	2189	3	Intergenic	novelGene_66028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGGATAGGCCCAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291732	1367063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1293342_1366347_1366608_1366743
892217	contig_11987_pilon	-	1886	13	Intergenic	novelGene_168954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	40.4683518320181	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	104	1198	233052	175755	FALSE	10	GATGGCCTTGTGGTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDNKIRDLIERNTSPDPKGVTPETIPSHRSPRSLKTPEKTASLAHFVQGTTRMSDAESSTEPAECAQSSRRKNLTNSLEQKIRCLEKQRKELLEVNQQWDHQFRSMKTLYERKIAELKTKLDASERFLSKLEKERHRCQRESDRQRDLTRDQLQREQKEKESLNEELHELKKENKLLKEKNVLASKKKERYECEIKRLNKALQDALQIECSSFSEDYLGKSEMRCSHEEMRTQMEVLKHQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINQTSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMNFPICNCGLVFHPRDPWVPAGSGAVQDLRTHLPDYQWYAPDQFPPDVQHKANDFSSENKVNQ	264076	175066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_175787_180782_180844_184532_184632_186247_186299_189978_190105_194119_194240_199353_199483_202659_202792_204286_204353_206053_206135_209386_209474_232941_233063_263983
892219	contig_2917_pilon	-	2728	7	Intergenic	novelGene_147581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	225.056597819798	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	58	1053	124032	93747	TRUE	45	AGTAACAAGATAGCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVVSVWLGFGVQL	124089	90945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_91775_92900_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
892221	contig_854_pilon	+	4576	26	Intergenic	novelGene_36511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2833.21847403267	12	132	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1067	3204	173	3376	1649514	1715205	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQVGADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRCCSPFSSTPSPPPRI	1612773	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681894_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701225_1715156
892223	contig_16103_pilon	+	1240	2	Intergenic	novelGene_118960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	562	888	1022326	1022690	FALSE	30	AATGTGCTTGAGATGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWNVLPSHFVVLSFMISSRALPKAEPVREDSNAQLQGAVDEIFILIWRHRDRQPVLPWSMSTAPSFPTQPSTVGRLLEGAGQVAQVLSPYPRSGQAPGSFHGNLNDH	1021764	1023042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_1022589_1022626
892224	contig_3747_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_24968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGACAAAATGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204206	205195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204200_205200
892225	contig_6227_pilon	-	1866	1	Intergenic	novelGene_49684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1019	1348	868988	868659	NA	65	AAAAAAAATCCAGTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYMLSSQVLYGWHSWTYQYSGYCFNMLIQVTAFSLTASGSCSLTLNLPPTTGSTGWRSPNVVVPSGFLLSNSHCNDPKYSNGLNCFLNTMCICSTLQESYFKLILHHH	870006	868140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_868100_870000
892226	contig_14196_pilon	-	4001	7	Intergenic	novelGene_169961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	78.0441470508128	876	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	386	1066	114010	10115	FALSE	40	CGAATACTCTGAAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPFLPTVSTMGDVGGELSSGDDSGDVDESPQSPETEASRSLTELFEKAAAHLQGLIQVASREQLLYLYARYKQVKVGNCNTPKPSFFDFEGKQKWEAWKALGDSSPSQAMQEYIAVVKKLDPGWNPQIPVKKGKEANTGFGGPVVSSLYHEEIIREEDKNIFDYCRENNIGHITKAIKSKNVDVNMKDEEGRALLHWACDRGHKELATVLLQYRADINCQGLPG	114395	7179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_10130_17875_17966_36878_36985_52120_52204_103247_103345_106756_106822_113785
892227	contig_11026_pilon	-	1827	7	Intergenic	novelGene_167653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	136	333	125967	125770	TRUE	15	TCTTTGTTCTCAGCACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNKYKTTEQGRKSCEHQQQLYKCYKDTCEGNKTLNAFHSVDRSNFMCNLEYPLFKRKQTSPCSILGHEQLLNAVFCEGMPEAGDKLRRAEKQKYKRVWGRTVQRGKRHHI	126102	112264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_112335_115708_115813_117393_117544_122158_122245_123350_123425_123810_123965_124913
892230	contig_9484_pilon	+	1945	11	Intergenic	novelGene_105622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_9	442.417280403919	3216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	52	1053	95848	101806	TRUE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQVKRNVFIGSVYIFALN	95796	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
892231	contig_1435_pilon	-	4040	1	Intergenic	novelGene_115515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	526	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTGTAATCTTTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571941	567901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_567900_571900
892232	contig_9471_pilon	+	1746	2	Intergenic	novelGene_21853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGCTCAAGGAAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432938	435141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_434647_435103
892233	contig_9363_pilon	-	4859	28	Intergenic	novelGene_6561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	846.737317618641	460	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	960	2883	932	3814	777144	754431	FALSE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGARSQFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	787913	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759891_761701_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_781246_781352_786541_786648_787826
892234	contig_11117_pilon	-	2852	1	Intergenic	novelGene_148602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	912	1343	107385	106954	NA	5	TCCTCTCATTTTCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSSILLILSSSISNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILALSSCIIFLNSSIFLSAFPMNLSIFSSFLSVFCFNSWIILSILDFNSLSGSSRAFSSTRKSSGVLFWTPIGTILSCFCKCFYIVCCLSGIQ	108296	105444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_105400_108300
892235	contig_20199_pilon	-	942	3	Intergenic	novelGene_82592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAGAGTGGCTGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44118	40651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43917
892236	contig_9696_pilon	+	4892	11	Intergenic	novelGene_68847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	362.693327757763	1710	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	72	788	646169	682150	TRUE	70	CTGAAACAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLPVSATSRHRDTVSDWAGRRRMDVGLSAITLYLASASSPVAATTMDREPVSGVEGGEADAASGTAAASAFRDKARQMSNERGFENVELGVVGKKKKVPRRVIHFVSGETMEEYSTDEDEVDSLEKKDVLPTVDPRKLTWGPYLWFYMLRAATSTLSVCDFLGEKIASVLGISTPKYQYAIDEYYRMKKEEEEEEEENRMSEEAERRYQEQQKQLQTDSVVQKDQPETVVSASFVNVSFEMEGDCEVITESKQNPVSVPP	646097	693691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_646334_669674_669849_674859_674927_676020_676119_681937_685656_687069_687130_689735_689872_691180_691318_692107_692185_692269_692325_693557
892237	contig_10930_pilon	-	2212	6	Intergenic	novelGene_37022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	1868.73101328147	62	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	25	1416	280370	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
892238	contig_9363_pilon	+	2039	2	Intergenic	novelGene_6614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1215	1556	785880	786221	TRUE	20	CAGGTGCTACTGAGCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTKDTKERLVQMTNGPQVLQPPQTVQQTRWCLAITTDRSDRDCNRGSWTEMEKNVEQNSNTHKKDQTYWSEKDWRNPKSMAPGHLFNSVMKSLLRFTLQPKIRQARKTKQD	784665	787883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_786648_787826
892239	contig_6199_pilon	+	3884	21	Intergenic	novelGene_126395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	185.213768386694	539	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	110	1210	559486	592948	TRUE	30	GGGCTTTTGAGAAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDIPKTNFRRLPFDHCSLSLQPFVYPVCTPEGIVFDLLSILPWLKKYGTNPSNGEKLDGRSLIKLNFAKNNEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAIKTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559376	606160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559518_564006_564057_565838_565885_568957_569021_570040_570093_574879_574932_585652_585745_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754_605725_605828
892240	contig_12948_pilon	-	4061	1	Intergenic	novelGene_126226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	898	1248	372558	372208	NA	80	AAAAAGAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIAHTSKILLKIIQKRLQQNINRELPEIQARIRGRSGTRDITADVRWIQAESREYQKDVYLCFIDYAKAFSCVDHNKLWITLQRMGIPKHLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQGHTV	373455	369394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_369400_373500
892241	contig_9112_pilon	+	3152	1	Intergenic	novelGene_60201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	632	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATCACATCCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108365	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108400_111500
892242	contig_15691_pilon	+	2145	14	Intergenic	novelGene_60748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAACTGGAGCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17535	114449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_18162_23914_24030_27939_28016_29700_29802_32386_32514_32812_32984_39822_39879_41356_41468_43424_43480_50441_50579_50661_50755_51871_51983_69380_69581_114283
892243	contig_11338_pilon	+	4512	4	Intergenic	novelGene_6263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	345	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3259	3657	247359	247757	FALSE	35	TCAGTGACATTAATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKKGIRERRKQNKETNKQKPQNNNNNKKQTNKQKNKRKEMPSGMSLCICAEKGSSIKLRGTAQLEGAPKPRKETENKQIRANKKALGVPPAWRHGPGSSFKVEQCFAAFQEEAKMAHRARYLRERRGRW	121078	248612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_121439_121657_122662_245397_245575_245641
892244	contig_8303_pilon	-	2239	6	Intergenic	novelGene_154911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	247.211164796414	17	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	503	889	36230	29167	FALSE	5	GTATTGTTTCTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54804	27816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36346_51333_51593_54676
892245	contig_19777_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_29713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23656	21831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_21800_23700
892246	contig_4151_pilon	+	1768	2	Intergenic	novelGene_65234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	0	9	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	111	677	528988	663644	FALSE	10	AGCAGTTTGTGTGTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528877	664735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078
892247	contig_5317_pilon	-	2522	15	Intergenic	novelGene_76586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	349.655873097874	116	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	121	1167	401580	377267	TRUE	10	GATTTTTCTTTTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESSDKLYRAEYAKSGRASCKKCKENIPKDSLRMAIMVQSPIFDGRVPHWYHFPCFWKVGHTLLHPDVDVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVAGKGQDGSDGKVEKTLSDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQMRLSKKMLDPEKPQMGVIDRWYHPNCFVQNREKLGFRPEYSVSQIVGFPLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKVRGSSPGTRRK	401700	355232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356329_357960_358093_361103_361172_375288_375418_375686_375760_376055_376299_377191_377299_381027_381209_381934_382052_384128_384229_386643_386859_388796_388913_394982_395149_401460
892248	contig_5758_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_119112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAAAAAAAATTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263800	261056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_261100_263800
892249	contig_11427_pilon	+	3343	3	Intergenic	novelGene_78958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	149	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	336	1385	55005	56054	TRUE	35	TATTGTTTAAAAACTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQTSSPMYDYIDYSASEPCQKLDLKQIAAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLTLINCKKLKSMTDIYLLNLAISDLLFLLTLPFWAYHAANGWVFGNSACKLFTGLYHTGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSGVSWVVVVLVSLPGIIFTRTQQEESHHICGPAFPVKWKNLHTIMRNILSLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKKHKAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLDLTTFQEFFGLDNCDSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYISVFFRKHIAKHLCKQCPVFYGETADRVSSTYTPSTGEQEVSAGL	49496	58436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_49821_54993_56765_57188
892250	contig_9924_pilon	+	4769	10	Intergenic	novelGene_175917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_6	140.897476078999	38	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1328	3987	205	4191	15841	136570	FALSE	15	TTTTAACGCCTTCCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETGSPPRSAINQNTDKISGAGTNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSSEEEKHNKKGMANQREKSLKTAREKSSDNVERKQEREKFFSAEGTVDKDKTIMELRDGLSKKQQPSVSSDGTDKPSSRRGEGFNSPEDKKVAETKEKSKHLKTKMCMKVQGGLSGVAEKFPKKEQTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDGEKKSKKIKEKISKKKNELSDNAEKLPGKGDSYDSSEDKKSRNGASDREKKRCNLPEKSSRRRQDCSSSDTEKYYLKEDGCDSSDKRLKRTELRERRNLNSKRSTKEIQSGSSSSDAEESCSEDNKKQKKQRPTAKKKTNNVKEKKRNSLRTSTKRKQAEITSSSSDIGDDDQNSVGDGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPLTVDDDDDDNDPENRYDSICKDFKKIITHSRCGRKQQLRNSKQVVKTRSACLRKTHSNILPASLKKGQKMG	15636	137148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352_130436_136325
892251	contig_10327_pilon	+	2754	1	Intergenic	novelGene_177842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAATAAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39855	42609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10327_pilon_+_39900_42600
892252	contig_13778_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_70841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCAGAGGATGTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26071	24206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_24200_26100
892253	contig_16594_pilon	-	2076	3	Intergenic	novelGene_53910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	62	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAGTCAACATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306162	269464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_271279_273523_273670_306046
892254	contig_8615_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_165216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93054	91544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_91500_93100
892255	contig_5686_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_45345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAAAGAGAATAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119104	123502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_120286_122626
892256	contig_15327_pilon	-	768	5	Intergenic	novelGene_70686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2717.15470437368	8	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	368	418	900954	900904	TRUE	35	GTAATTTACAGTTTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWFSRLLGKCYLLAGRLRLSFGPPEAARRSVKWPKTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902154	900458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900692_900786_901030_901126_901281_901400_901431_902046
892257	contig_4232_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_63405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACGAGAAAATTGTCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
892258	contig_6361_pilon	-	4412	27	Intergenic	novelGene_23861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	201	junction_12	243.691788679517	597	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1203	3612	74	3685	109608	55091	FALSE	35	CTGAGGTTTAAGTTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVAVKDSDQVAQSDGEENSAAEEQLLGERIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	119058	54363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73569_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_89922_90001_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529_109610_118986
892259	contig_13740_pilon	-	4340	17	Intergenic	novelGene_34617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4278.63383159201	320	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	2709	3734	165243	157474	TRUE	30	GTATATTCAGCGTTTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	178061	154900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_156090_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237_166215_167673_167726_170858_171002_173066_173230_176356_176452_176777
892260	SIRV7	-	2065	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	23	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114914	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2667_2993_3112_43028_43078_114680
892261	contig_9183_pilon	-	4340	6	Intergenic	novelGene_40331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_5	235.36065941444	15	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	163	1206	323783	322740	TRUE	35	CATTTGATATGAAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLK	325980	311853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_323834_325868
892263	contig_14142_pilon	-	1590	7	Intergenic	novelGene_120535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	475.928361789414	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	28	339	353554	350825	TRUE	20	ACTTGGAAACTGCCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVSFALFYRIASLESA	353581	349042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350868_351175_351291_351640_351792_353551
892265	contig_2798_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_120011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAAAGTTGCCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113539	111805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_111800_113500
892266	contig_8682_pilon	-	3208	9	Intergenic	novelGene_165265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_8	292.709940683606	738	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	333	1718	133808	55026	FALSE	25	CCACGAATTGTGTTATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQAVAGLLLLAAAGLGEAAAGHGLAFSEDVLSVFGANRSLSVPQLGRLLELLGSAPVKGAPELGQLHFNQCLSAEEIFFLHGFSNATQITSSNFSTICPAVLQQLSFHPCEAKSKHHTKPSLSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLVLTPMIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFVAILLITLFAGDIELE	134584	53535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589_134063_134506
892267	contig_10722_pilon	+	4098	8	Intergenic	novelGene_70961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1078	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	411	722	4077	4388	TRUE	25	AGTGAGCGACACCTCCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDYESIHHTADRQNQEGMLAWRRVSACAGRVLSGWRHGACLCGTSQRSETFPACPCDVPFHACVSWQHLSDPETCSEIENEIFSFCVHVYLNFSNHLWCAWP	3666	17312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_4499_5545_5645_5730_6529_6637_8562_9665_9786_16246_16367_16867_16926_17165
892268	contig_9982_pilon	+	3087	17	Intergenic	novelGene_55731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	116.064031357695	1165	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	356	2794	311199	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	307531	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307846_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
892269	contig_15456_pilon	+	6703	5	Intergenic	novelGene_139479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	124	junction_1	377.224319868165	1175	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	31	648	52300	101797	FALSE	50	GATTTGAGAGTAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHARRPAGRSMAHGPGALMLKCVVVGDGAVGKTCLLMSYANDAFPEEYVPTVFDHYAVSVTVGGKQYLLGLYDTAGQEDYDRLRPLSYPMTDVFLICFSVVNPASFQNVKEEWVPELKEYAPNVPFLLIGTQIDLRDDPKTLARLNDMKEKPICVEQGQKLAKEIGACCYVECSALTQKGLKTVFDEAIIAILTPKKHTVKKRIGSRCINCCLIT	52269	107852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_52442_53019_53079_96259_96425_96921_97018_101641
892270	contig_5954_pilon	+	745	4	Intergenic	novelGene_28427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	532	junction_1	1917.19013141629	34	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	327	728	97851	98983	FALSE	30	CTCGCTCTAATAAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETVAQIKAHVASLEGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97524	99000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97926_98017_98163_98637_98694_98857
892271	contig_7345_pilon	-	1869	9	Intergenic	novelGene_159168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.647521571249	492	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	158	892	139698	110483	TRUE	50	GACTATGAAGTAGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNSNRSETSTSDNTETYQENTSSGHPTFKCPLCQESNFTRQRLLDHCNSNHLFQIVPVTCPICVSLPWGDPSQITRNFVSHLNQRHQFDYGEFVNLQLDEETQYQTAVEESFQVNI	140200	109301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_109364_109567_110552_112842_112951_114471_114581_115415_115473_118503_118620_119857_120024_139588_139770_140114
892272	contig_15498_pilon	-	1476	10	Intergenic	novelGene_42656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	136.54628844787	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	13	1221	697708	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697720	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697554
892273	contig_16685_pilon	+	4981	2	Intergenic	novelGene_115063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_1	0	641	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	457	2574	613687	619492	FALSE	35	ATGATATTTTGGTTAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQGADGSRRRAGSRFRLPFLFPWRSPPGSSKFPTPAAPENSGNPKLASSSQPEVRTSYWMKLLSQLFTPLPSLFQKLLIWSQLFGGLIPTRWLELAAGYSALRGRDGPAAPTAQKSVSSLRLDLSDDSAASHLDWVEEGIHWQCLSPDVELALKAKGRALYPAAHAFLLEQQLWRVELLTSSLQAQLFSDQELGSSPSEALNIQRLSNFDVVSCLLKPSYLDCLPQVELSYQNSVGSGELVDCQTLTPESSCLIDEHCHPQPLNAEVTGASWQGCPPLSTEGLPEIHHLRMKRLEFLQQANRGQTLPTPDQDHGYHSLEEEHSLLRIDPQHCRENPAQFVSSVEAIPGTCQEVPEENIELLTKEVPLALEKQGPLGNCLSCEISVDKEPGEDQVSGVNYSIIEDDLPMSARPACSNKLIGYILGGGSSDLESSSDSEGEDWDEDVEDDGFDSDSSLSESDLEQDTEGLHLWNSFYSVDPYNPQNFTAAIQTAASIGPGGPSDSENDLSDKSDLEDSPQTRSPPESPDQSSGEEDDWESSADEAESLQLWNSFCNSDDPYNLLNFKAPFQTSGKNWKGHRDSERPSESFVAISECHTLLSCKVQQLGSQGNDCPDLVHCQFLSGERHRLIKRKKVTFLEEVTEYYISGDEDRKGPWEELARDGCRFQKRIQETEDAIGYCLTFEHRERMFNRLQETCFKGLNKQC	613230	621899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_615589_619276
892274	contig_15697_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_173297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23843	21065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_21100_23800
892275	contig_7151_pilon	-	3676	5	Intergenic	novelGene_40770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	888	junction_4	681.366045162217	163	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1402	1707	535543	529189	FALSE	35	ATATACTATTCTCCCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551357	527219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_536494_549638_549729_550996
892276	contig_10930_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_37072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	287332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_289100
892277	contig_4604_pilon	-	2982	7	Intergenic	novelGene_19164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1536	1850	378453	373700	TRUE	55	ATCCTGACAGATCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPNLIFHTLHCGPTQGCDVIGHSLCILAQDTQLELDTLPFLQAIPFVGHPNYAKWIHLTFHIPFFHNLNHSLVLSLCWINTPQRANDFTRVDGGISFFSNTIH	380719	371317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374926_377353_377535_378441_378604_379334
892278	contig_16622_pilon	-	2057	5	Intergenic	novelGene_48471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1708.17964146046	29	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGTTGAACATTTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121957	111887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115441_121467
892279	contig_3386_pilon	+	3263	15	Intergenic	novelGene_34569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	616.790971108378	7	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	152	1549	476274	508362	TRUE	20	GTAGTGGAAGTGTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGPYSRSRHAFLLLLPAAAAAGASPVLTSRPLAGPASGLPAALPPRGSAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470159	510192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231_508919_509034
892280	contig_17074_pilon	+	3374	7	Intergenic	novelGene_145196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	235.669731238915	80	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1463	2140	640995	657014	TRUE	15	GACACGTGTGGATTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKHREIFIALVCCASYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQARGPLSVRFKYLLTPREPNRWAVEHEGALPYNSSSTVNGVLMKPTHIIVETMM	639532	661307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873_657899_660957
892281	contig_5686_pilon	+	2722	2	Intergenic	novelGene_45410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4821	junction_1	0	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTGCTAACCAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176554	185193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_176722_182638
892282	contig_8045_pilon	+	2983	10	Intergenic	novelGene_35441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	123.878076259594	40	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	122	1738	452026	462377	TRUE	35	ATGACAAAATCTTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	434812	463665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_434913_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224_463074_463116
892284	contig_20641_pilon	+	2166	6	Intergenic	novelGene_52819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1851.48789896127	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	64	408	14599	45875	TRUE	70	ATCTGAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKAQTGASEQ	14535	86665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_45848_45965_54835_54968_73084_73243_85286
892285	contig_960_pilon	-	2591	19	Intergenic	novelGene_108226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	378.056159686022	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2244	347	2590	487192	427876	FALSE	15	GTGAGTTCTGGGAGGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPAVRDLTALAKELRAVEDVRPPHKVTDYSSSSEESGTTDEEDDDVEQEGADDSTSGPEDTRAASSLNLSNGETESVKTMIVHDDVESEPAMTPSKEGTLIVRQTQSASSTLQKHKSSSSFTPFIDPRLLQISPSSGTTVTSVVGFSCDGMRPEAIRQDPTRKGSVVNVNPTNTRPQSDTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTESGLMLLDRSGQGKVYPLINRRRFQQMDVLEGLNVLVTISGKKDKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDLEGCVHYKV	490030	427874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_428010_430724_430869_436239_436411_436729_436848_440053_440175_440650_440827_442971_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758
892286	contig_17427_pilon	+	2184	10	Intergenic	novelGene_30292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	198.115815984514	94	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	2	1012	147949	175706	FALSE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSETPAVCTRAQGAPSLPNLWETVPFMPKPELLSSLQLILLPSSA	147947	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453_175534_175573
892287	contig_11396_pilon	-	1010	3	Intergenic	novelGene_71331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.5	17	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	496028	492463	TRUE	30	GAGCCAGAGGTGCCAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAGDETHQFPSPAGPPTPRHHTWTPPGLGKTLLRGLQTTACLSPGGETRPQAGLSLLEGFQSPQWIQHSTAGQTLPSTPSSLAGNTPSPVSLLDSEVPRAWGGRGQASVYL	496028	477695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_478198_492296_492642_495865
892288	contig_5280_pilon	+	2480	9	Intergenic	novelGene_52576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	599.134375578634	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	57	1076	38343	78098	FALSE	5	TGCTTCATCTGTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGARRCCLQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38286	79502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56282_62043_62065_78042
892289	contig_13021_pilon	-	4988	6	Intergenic	novelGene_8270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	499.240783590443	28	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	129	974	270418	249907	FALSE	10	CATGCTTTTTTTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYEIF	270546	245892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249915_251082_251152_252257_252369_259754_260040_265837_266120_270327
892290	contig_863_pilon	-	3228	4	Intergenic	novelGene_176615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	199.739830779942	605	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	2248	3228	7412	6432	FALSE	40	GAAGATGAAGGCATTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPFVMDPPSSMEPPPPMVSPSMELPASIVSPPQLEPPPQLEPPPQMEPSPQMEPPPQMEPPPQMEPLQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMEPPPPQMELPPQKESPQMELIPKKSPPPKDDNKEVSDMQSEMARKEQVLIEVGLVPVNKDSQVLKESASTQEPLPPKENLKEEESKDQKIFSEEEGIKEAPLQKVGAEEANKSLAGLAASTEESTSISSCEQNLKMPEGDILDGKHQTDTMLGEMETDTDQNATENLSGKDSAVEEPILPLLLSPPIENHEAVSKTAVTSLSVTTAVSESQEID	21480	6431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_8380_14545_14630_17903_18811_21191
892292	contig_8377_pilon	+	8826	27	Intergenic	novelGene_35085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2956.09313674926	954	152	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	5560	8025	164377	197939	FALSE	40	CAAATATTATTTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	133045	198740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161947_163482_164590_169245_169307_172902_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
892293	contig_5210_pilon	-	2411	2	Intergenic	novelGene_65434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	795	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	469	942	477576	477103	TRUE	30	ACAGGGACGCTGAACTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFIREVTGSTQYQDQEACSRSLECTPEVESTSLPSSLQDSRFSSSWQCKQAGPSLCCARPLRTGLLLALVSALLREVLKSSLAPPISAQRHPTPLGSLLPEGSQPPLLEGSACPLLPPCSMGLEAHQAVLFQSPASSSLLPLLAVSSVIALSPGV	478044	475288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_475467_475811
892294	contig_9098_pilon	-	2780	12	Intergenic	novelGene_75780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	471.93563085385	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	475	1275	288130	264388	FALSE	85	CACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	294173	262882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_290715_290847_291720_291814_292840_292905_294101
892295	contig_12837_pilon	+	2173	9	Intergenic	novelGene_57314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2815.20334245592	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	379	735	153893	166049	FALSE	20	CAAGTGCTATCTGTGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	128844	167487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_128899_129646_129802_130402_130509_153829_153894_153981_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
892296	contig_8377_pilon	+	4207	31	Intergenic	novelGene_35013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3535.48948614851	16	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	1883	3337	179603	197686	TRUE	40	CAAATATTATTTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFVRAIPIPV	68216	198740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68334_131415_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177263_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196222_197663_197909_198026_198390_198455
892297	contig_973_pilon	+	5656	3	Intergenic	novelGene_178620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	161	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	3901	4290	171188	171577	TRUE	70	AAGAAACACAAAACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKEEIKRSGEKQHQQPRNGTHRAGPFRCMESKQLLFPGQEIVVSGRRGGRVGVKKGGGWESVYRQLQVVLSPTGSSVKLLSRIPFLLVSDRSPRWRIHAALASRGPLHESLLTLHFLSVFSLHLVLG	147966	187941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_973_pilon_+_150973_170293_171814_186811
892298	contig_12948_pilon	-	5782	16	Intergenic	novelGene_126195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	636.228351738238	1379	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	1197	2705	236292	233012	TRUE	15	GGTTACTTGTCACTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAECVP	261244	224763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_227402_230188_230321_231206_231350_232224_232357_232979_233026_233724_233888_234585_234739_235113_236338_248509_248636_248748_248831_249345_249468_256166_256316_256684_256802_257404_257606_259249_259451_261091
892299	contig_16098_pilon	-	3353	8	Intergenic	novelGene_45799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_7	19.3243000242847	1473	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	474	1265	60582	55863	FALSE	15	CTTGTGTATCCTTGAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVRKRGRASRGGGVGRRARGARRTRGGRGRGHHAQRSPARRTLDSVFVDLISDSDEDILEVATARGAADTAEAPLPEAPVPAASRDDSDSDSEGADARPEGAPRIAVRRRRRLLLDPGEAPVVPVYSEKVKSSLHFIPDHLPLLKLCPPGAEEDAEMADSSSSQPEDPAFPGSTWKKKLRGKDEEEEKKKVFLVQDVSPLPPPPPRTKSRKHTRALQKLREVNKRLQDLRSCLSPKQHQGQDRQSQEDDVVLVEGPILPESPRLFPLKIRCRADLIRLPVLMSEPLQRVVDHMAAHLGVSPSRILLLFGETELSPTATPRTLKLGVADIIDCVVLASSPEATKMSQQLQLRVQGKEKHQMLEVSLSPDSPLKTLMARYEEAMGLSGCKLAFFFDGTKLSGMELPADLGMESGDLIEVWG	81382	53774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_56022_56921_57032_57158_57304_59448_59636_59715_59797_60472_60591_80209_80283_80990
892300	contig_5434_pilon	-	2561	12	Intergenic	novelGene_74674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	165.342269597652	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	421	1422	350282	325255	FALSE	20	TAATTTTTTTTTTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQIMKFSPESVAAFIAVLGILSIIAQTIVLSLLMRSIGNKNTILLGLGFQILQLAWYGFGSEPWMMWAAGAVAAMSSITFPAVSALVSRTADADQQGVVQGMITGIRGLCNGLGPALYGFIFYIFHVELKELPITGTDLGTNTSPQHHFEQNSIIPGPPFLFGACSVLLALLVALFIPEHTNLSLRSSSWKKHCGGHSHPHSTQAPGEAKEPLLQDTNV	379777	324115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326885_331417_331516_333049_333163_345064_345137_345931_346046_347592_347812_350267_350383_353137_353201_363117_363214_379567_379617_379665
892301	contig_5643_pilon	+	1275	12	Intergenic	novelGene_38817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	67	1068	233973	237983	FALSE	15	AGCCACCTCTTTGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233608	238190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
892303	contig_165_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_117081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTGCTAGGTTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444330	441916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_441900_444300
892304	contig_7728_pilon	+	5899	7	Intergenic	novelGene_64696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6594	132	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	5228	5683	748580	749035	FALSE	25	AGATGGTAGTGAGAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVQCWLITSRDGAISRIQCWSLLLPDLAPSRGCSQADLGKHKSTLLSPRITSISATMATLFMSPLGNDRKGWGKKMTGFHRTHYPIHLIAPLPRSPFGEHSHKKQISSLLWRTQRGLSTYLFPIPPCLQFSNHVPYKSLPSSRTTGPCP	420522	749251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_420567_424168_424649_486635_486863_491196_491744_601286_601801_745016_746311_746458
892305	contig_2069_pilon	-	2457	4	Intergenic	novelGene_23381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.843538753663	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	1010	1807	1059636	1058396	FALSE	80	AAAAAAAAGGAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSSKDKPASENSEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1063020	1057745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1059086_1059528_1059872_1061667_1061799_1062377
892306	contig_10861_pilon	+	3318	4	Intergenic	novelGene_39257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_1	72.3924489616608	46	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	270	2792	1241650	1247956	FALSE	30	CTAAAGGCTACTAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAPAAKVIKKEPNSDHYGVDETSEKEQQEVIEHIDEVQNEIDRPNVQASEEILKVEEEYNKLHQPFFQKRSELITKIPNIWVTTFVNYPQESEIVTSSEPINNRNTDPALWNNFSSNDVNYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLDGKQTRFCSQNLFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVFCFVCKLFSPKSNSRFATDGFSDWRNLSMIDKHENSSIHRDCMLAYLNRRHGFGLTHELETQINEERQHWKAVLQRVVAVIITIAERGLSFQGKNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKFSNTGKINRSYMSKTTCEELINLISNKVRSTIFSEISIARYFSLFVDSTADLSHTDQLSIVLRYVSPTVGKPVERFITFASLRGHSGEEIADQVLHYLCEVCKIDFSKCRGQSYDNAANMSGCYKGMQQKILEHNEYAIFIPCAAHSLNLVGRSTVDCCPEAVDFFSTVQLLYTFFAASTHRWAVLKTYVGNDRVLKCLSTTRGEVHAVATSAILESYTQILDALENIAEDQTQKGDTRREAENITNKMQTLEYVFMLVMWNNILQHFHWASQALQDSEVNLKTCTDLYQSLTGYLHNLREDFENFENTTKQILPNTDYQAVHCRRTIRKKQVDEGSAPGVLSARDQFRITTYYTIIDTLESCMKRRVEAYEVLTDRFSFLNNVDIPDEECMKASKKLVQAYPDDLNTNLYGEVRQFHSYMRTKFTNPGKTNFTHEDMYDSIIEDKIQCVFPNVEIALRIFLTLMITNCTTERSFSSLKRLKSPQHTTMTQVRHDSLSLLCMEVDIVRQLNCDEIMEEFVRAKNRKKCFYL	1241380	1248482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1241723_1243368_1243427_1244090_1244234_1245707
892307	contig_12677_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_110784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	377	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
892308	contig_854_pilon	+	3012	1	Intergenic	novelGene_36405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1064	1492	986187	986615	NA	25	TCCGTGGACCAGACCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHVGNSERIRCKSVPFPTPQGLPDSLQNSVGQISIIYKKLQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHLRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKTTGNNKSWRVCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMI	985123	988135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_985100_988100
892309	contig_5967_pilon	-	1578	5	Intergenic	novelGene_44374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	550.32598294102	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	108	650	412501	388566	TRUE	40	GAACCAACAAATGTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	412608	387557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388441_388520_388931_389224_389306_403376_403471_412498
892310	scaffold_4438_pilon	-	6593	4	Intergenic	novelGene_174530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	4831	5139	114151	113843	FALSE	45	AAAGTAATAATGCACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENEKGRTHLAFLKLKELKKKFKPRAAILKDSMGKILNDIGSIKRRWKKYTESLYQKELVEVQPFQEIAYDQKLIVLKEEAQVALKGMAKKQDSRN	414807	112388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_114155_162801_163302_305544_305615_410550
892311	SIRV6	+	1394	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	27	107	-10	28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	231	722	1733	10736	TRUE	35	CTTCAAAGTCTAAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1114	11718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
892312	contig_7230_pilon	-	2200	3	Intergenic	novelGene_52540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	492.5	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGACTCTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162679	132791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134737_150873_151060_162610
892313	contig_7898_pilon	+	3591	15	Intergenic	novelGene_47610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_7	363.846745322303	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	729	2768	571727	599089	FALSE	30	ACCAAGTGACACTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPERGGSSSKLFSSSFNGGRRDEVAEVQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTFEPRGQAGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEAAIQELKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSGEGRELGCSAQGRQTYWTGGLFLSGASGSH	562998	599912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563602_571601_571799_583823_584024_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587685_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838
892314	contig_9415_pilon	+	6145	23	Intergenic	novelGene_109715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGATAAATGCAATAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438143	471440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_441208_441719_441839_444542_444593_446109_446273_446893_446971_447787_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453357_454140_454214_454332_454413_455170_455312_456369_456514_460019_460255_462549_462678_464335_464475_464747_464874_466631_466800_467517_467618_469493_469885_470544_470841_471349
892316	contig_5600_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_174957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAACACAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240434	242478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_240400_242500
892317	contig_9177_pilon	+	3598	24	Intergenic	novelGene_32611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	3255	3596	10465	11640	FALSE	30	CAAACTCTGACAGGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARPSGLIWAGMLENSGLDAKALRLSTASSRGAVAARHWARFSSVKAPSSALMVLTRLAVLLATSLADCTNWRLAVGLAVRAEARRQLLHSAEVCLATMVAAESTWAWVQPGS	1726	11642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2842_2945_3006_3138_3250_3367_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589_7741_8489_8611_8687_8789_8903_9056_9149_9315_9403_9509_9727_9861_10294_10478_10571_10713_10958_11120_11613
892318	contig_3975_pilon	-	3837	13	Intergenic	novelGene_54733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	396.127811514864	1048	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	73	1350	1731202	1719543	TRUE	35	TATGATGTGACACAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731274	1717010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719080_1719124_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
892319	contig_9633_pilon	+	5977	1	Intergenic	novelGene_139622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1516	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATACTAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033313	1039290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1033300_1039300
892320	contig_10235_pilon	+	3646	10	Intergenic	novelGene_46283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAATCTGCCTTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13980	27175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_14168_14491_14638_14779_14931_15029_15138_17494_19752_20850_21037_23723_23814_24170_24304_25124_25469_27131
892321	contig_5643_pilon	-	2750	5	Intergenic	novelGene_39166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_4	70.5797421361115	762	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	377	1222	775445	772569	FALSE	20	CATGTTTTATTTTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPGLTVGKLSLEKPPPRKLPRQDITASGTAPSRFCGQQGSLLGSPPGQREFVSSGRRLQLNFHTDASLENRTTCLHRGFLALYQAVGVNDSQPISQASESSEAISPRGDNSSKIQSHCQEPYYQAMLAGTTQGTWKHRQNREEAPQCVPVCGRPVSPITQNQESLGSSRAQLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWVLTAAHTIHPKDSIFPKKNPSVYVFLGHTNIDEMLKLGNYPVRRVIVHPDYHQNESHNFDGDIALLELQHSVPLGPHVLPVCLPDNETLYLSGLLGYVSGFGVEKGWLTTDLKYSRLPIAKREACEAWLRKRQRTEVFSDNMFCVENNMQQQSVCHGDSGSVYVVWDDCAHHWVATGIVSWGIGCGKGYDFYTKVLNYVDWIKRVMEGKD	784168	771040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_773342_775224_775288_775435_775562_776619_776810_784098
892322	contig_16870_pilon	-	1154	12	Intergenic	novelGene_155516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_9	93.6487193966266	837	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	93	1109	209166	200604	TRUE	30	GCAGTTACTCAAGCAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETRQSKLAAAKKKLKEFQQRNKTDVPAGVKKKRKIKNDGGTKTTTSDGCKPPEDIQDILKVLVSDLNRSNGVALSPLDKWKAPKDCAAPAPEPGNDTIFPGGVSPTSVGSLHDSNMASLQNHDADNGTTSMDENQSLSSTESLRQISQQLNGLVSESSSYINGEGLASSTNIKDLENRYQELSIALESSTVTNKQLSSKIEELKQQNQDVMDQREKDKKEFEQKFAKEQGALREQLQIHIQTIGILVSEKSDLHTALVHTQNAVRQKAGGSLGHPLTLPATLSALQWHSFFGLPSLFPSHSRRVGGCYQSPEDFPTAHRRAGEDSVIGLQTTKAD	209258	199539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_199581_200599_200901_200988_201052_201326_201366_202226_202308_202502_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_206376_206458_207462_207586_209118
892323	contig_13300_pilon	-	2837	2	Intergenic	novelGene_125753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAATAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47073	44194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45882_45923
892324	contig_8793_pilon	+	2636	3	Intergenic	novelGene_178079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	676	1062	52215	52787	FALSE	55	AGCAAAGGACAGAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFMEKAVKFMGNTDRKMEELKKTIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKVNNKISEMDSVTEGLKGRFETMEHRISEIEDKHLDTTLRKNSEEAQRTPYRIDPKRKSPRHIVITLNKTEVKQRILRAA	50598	54361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8793_pilon_+_50721_51661_52489_52674
892325	contig_10892_pilon	-	6587	1	Intergenic	novelGene_116752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	986	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3071	3373	171818	171516	NA	5	GCCGGCGTCGGCGCGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVTRETHIKTTMIPPHHNQDGYYQKNRKQQELGGMWRNRWQDCKMVQPLWKRVWQFFKKLNIQLPSNLEISIPKYTPKSLESRDTLDILHQGSLQPYS	174888	168301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_168300_174900
892327	contig_383_pilon	+	2492	10	Intergenic	novelGene_126130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	428.397790221503	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1072	2316	148663	169172	FALSE	25	ATGAGATGATGGCTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	144205	169348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_145266_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
892328	contig_20670_pilon	-	5112	6	Intergenic	novelGene_144833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	228.713270275251	1209	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	148	690	60880	52970	TRUE	40	CAGATATTTGAAAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGCRCPADSNFPSHVSAGSSSAWTEGGGLPVSQSQEIFSSLQPFRSQVYMHPSLSPPSTMILSGGTALKPPYSAFPGMQPLEMVKPQSGSPYQPMSGNQALVYEGQLGQAAGLGASQMLDSQLPQQLTMPLPGSQLPLPRYGSGQQPLILPQSIQLPQGPSLSVGAPRRVLPPGSQPSVLNTSRESSQMEMKGFHFADSKQNIPSGGSVPSPQTYRQNSEWMKNPAWDL	61591	48490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_48582_48638_53013_56700_56793_57515_57696_60652_60894_61457
892329	contig_5084_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_64543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACAAAAAAGAGTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511638	509676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_509700_511600
892330	contig_2125_pilon	-	2911	13	Intergenic	novelGene_147736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGACTTGGCATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	683252	649096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_649144_651017_651168_664121_664268_665027_665122_669316_669409_671196_671336_671475_671683_673120_673355_673577_673801_674511_674630_674676_674741_676384_676557_682027
892331	contig_8616_pilon	+	2949	18	Intergenic	novelGene_72533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	221.24118264838	918	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	287	2293	400633	407881	FALSE	5	GCTCCTTCTGGCTCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLADSNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLAEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGAARGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLTQNRGLGGIMVKRAYETMAGVGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPPLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED	400346	408537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_400661_401368_401437_401778_401873_403509_403628_403740_403805_403990_404109_404419_404523_404702_404803_404971_405161_405259_405335_405458_405518_405693_405792_405913_406054_406291_406521_406653_406744_407135_407255_407360_407510_407715
892332	contig_15034_pilon	-	5173	19	Intergenic	novelGene_143630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	339	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAAATGAAAGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74165	22580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_22709_26292_26419_28676_28909_29870_29979_40327_40446_42131_42277_46228_46320_47598_47653_48787_48839_51082_51190_51620_51675_52161_52251_52321_52403_53271_53356_53706_53869_54594_54663_68457_68562_69648_69758_70903
892333	contig_3948_pilon	-	2071	5	Intergenic	novelGene_53214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.075869399096	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	31	612	866476	840607	FALSE	25	ATTTCAAGAGTGTCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAHWFLFISKKYLFLKCTLQKSHSFFHKFELGAFTL	869598	839147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840714_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
892334	contig_6898_pilon	+	1391	3	Intergenic	novelGene_35783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	59	298	124933	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124874	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_125716_126677
892335	contig_5003_pilon	+	2732	1	Intergenic	novelGene_120188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAAGCAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24260	26992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_24300_27000
892336	contig_2799_pilon	-	3431	1	Intergenic	novelGene_85496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	409	753	578317	577973	NA	60	CAAATGAAAATTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRKQITNFIWKRKRPRISKALLKKKNKVAGLTLPDFRNYDTTTVVKTAWYWYNDRYTDQWNRIENPDINSSTYEQLIFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWHNWIYICKKTETRP	578725	575294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_575300_578700
892337	contig_6028_pilon	+	2449	6	Intergenic	novelGene_156603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	83.497544874086	483	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	280	855	384610	413558	FALSE	40	ATTTCACATCAAACAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILYSEPICQAAYQNDFGQVLRWAREDNDYINIQDGFNGDTPLICACRRGHLKIVSFLLRRNANVNLKNQKERTCLHYAVKKRFTFFDYLLIILLMPVLLIGYFLMISKTKKNETLVQMILDAGIEVNATDCYGCTALHYACEMKNQTVIPLLLEAHADPTIKNKDGESPLDIAQRLKFSQIELMLRKVS	384330	415152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_384631_402437_402630_407315_407424_409888_409967_412683_412783_413480
892338	contig_5222_pilon	+	5353	2	Intergenic	novelGene_58991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1003	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4856	5161	176959	177264	FALSE	30	CCTATCTTATTTGTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVCPFPSDVPLRTDLKETPGVWAAQAWAAGWPGGLCRWLFHAVDARGLLPDIGLEGVSTQGAEELLLTDLLRAEKEEMWQKLMVNGFRGIFCFVFLNCMS	172015	177456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_175676_175763
892339	contig_13292_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_142950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACAAAATTTACTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314823	312312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_312300_314800
892340	contig_854_pilon	+	2095	6	Intergenic	novelGene_36651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2702.26931300342	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	74	733	1698397	1715035	FALSE	15	ATGTGCTACATGCGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKVRTSQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRTGLRPKLPNKSPLLLLRRWTDDSTSPS	1698323	1716397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1698430_1698914_1699065_1702066_1702204_1702545_1702691_1704481_1704587_1714945
892342	contig_6137_pilon	-	3856	3	Intergenic	novelGene_59177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	898	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCACCATCTCAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1262550	1257329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1258600_1259456_1260662_1261169
892343	contig_6102_pilon	-	2033	16	Intergenic	novelGene_32338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_15	318.991995719851	126	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	585	1802	1690301	1685481	FALSE	10	GGCTTTCTGATGCAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691545	1685249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690711_1690853_1690968_1691159_1691386_1691489
892345	contig_8377_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_34988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAGAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68115	69353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
892346	contig_11267_pilon	-	4574	3	Intergenic	novelGene_175379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	48	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1910	2218	79273	78965	FALSE	30	CAAGATAGCTCTCATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLDGQLFIFHDIGQVFFQQFFNDPLCVFCFLPLFWNSNHLKIFAFDCIPQNSQGLFIFLCSFFWVFLKQSWSQVFVFNSADPVFHRFKSPSHPFYDTVHF	140324	76608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_-_80111_138614_138645_139282
892347	contig_13144_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_178462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1608	2198	102761	102171	FALSE	40	TCAGAGCAGTTAATCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	104632	101628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_-_103955_104218
892348	contig_17074_pilon	+	5924	15	Intergenic	novelGene_145176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	506.524129610378	956	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	95	1960	610974	657014	TRUE	15	GACACGTGTGGATTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKHREIFIALVCCASYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQARGPLSVRFKYLLTPREPNRWAVEHEGALPYNSSSTVNGVLMKPTHIIVETMM	579932	661307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_580016_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631_636736_636871_636997_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873_659049_659377
892349	contig_2069_pilon	+	1937	9	Intergenic	novelGene_23255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	202.330175702983	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	593	1099	342065	343975	FALSE	15	CTACTGATGTGGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324003	344813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335652_342007_342077_342574_342729_343519_343652_343766
892350	contig_10134_pilon	-	2287	5	Intergenic	novelGene_16197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	719.424075215724	14	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39682	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32621_32710_33731_34922_35178_38558_39043_39594
892351	contig_9144_pilon	+	2152	5	Intergenic	novelGene_151136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	252.155705864452	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	150	728	618610	624074	FALSE	40	AAAAAACCATGTTGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYSCWRTGLLLLLLQAVAVKVSWQTEEKSCDLVGEKGKESETELALLKRLKPLFNKSFESTVGQGPDTYIYMFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRAVVMISCNRHTLADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPM	615310	625498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615459_618608_618789_620115_620283_621888_621999_623951
892353	contig_8289_pilon	+	5840	25	Intergenic	novelGene_171172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	306.625574692581	1217	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	960	2883	106	2988	177819	215864	TRUE	35	TAAGCAGTTTTATGAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMDGGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNSFFDMNIFEDGPYEVGGESNHDESLVPVPANSYLGFSLDSGKGIVSKDEITFVSGAPRANHSGAVVLLKRDMKSTLLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKDGWQDIVIGAPQYFDRDGEVGGAVYVYINQQGRWSNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDINQDGYPDIAVGAPYDDNGKVFIYHGSANGVNTKPTQVLEGKSPYFGYSIAGNMDLDRNSYPDVAVGSLSDSVTVFRSRPVINVQKTITVTPDKIDLSKKMSCAAPSGICLKVKACFEYTAKPTGYNPSIVIVGTLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQGSEPKYTRQLTLSRQKQKVCMDETLWLQENIRDKLRPIPITASVEIQESSSRRRVNSLPEVLPILNSNEPKTVHTDVHFLKEGCGNDNICNSNLKLEYKFCTREGNQDKFSYLPISQKGIPELVLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTNDGDDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRSFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSSVTFYLILSTTEVTFDTTDLDINLKLETTSNQDNLASITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGGTVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLKNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVESKGLEKIACEPPSEINFLKLKESHNSRKKREIAEKQTDDSRKFSLFAERKYQTLNCSVNVNCVNIRCPLRGLDSKASVILHSRLWNSTFLEEYSKMNYLDVLMRASIDVTATAENIKLPNAGTQVRVTVFPSKTAAQYSGVPWWIILVAILAGILMLGLLVFLLWKCGFFKRNKKDHYDATYHKAEIHAQPSDKERLTSDA	175498	220913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_175569_177783_177864_179839_180096_182685_182818_185941_186153_186789_186984_187128_187218_187891_188011_192223_192323_192573_192636_197796_197958_198161_198306_199808_199925_200043_200237_200327_200412_200507_200588_200739_200818_200905_201009_203309_203484_204936_205036_205134_205246_205336_205436_212521_212648_215756_215887_218083
892354	contig_7035_pilon	-	1435	4	Intergenic	novelGene_83529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAGAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527448	396524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_397780_398950_399069_472534_472582_527433
892355	contig_9653_pilon	-	1314	6	Intergenic	novelGene_48248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	109.896314769878	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	198	776	913657	839279	FALSE	40	AAAAAACTCATTTCATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDCTRHTTLGLLNKAKAHIKKLEEAERKSQHQLENLEREQRFLKRRLEQLQGPQEMERIRMDSIGSTISSDRSDSEREEIEVDVESTEFSHGEVDNISTTSISDIDDHSSLQSIGSDEGYSSASVKLSFTS	920722	838740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_839443_844948_845121_845715_845831_879607_879638_913559_913693_920560
892356	contig_9112_pilon	+	4419	3	Intergenic	novelGene_60204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_1	23	636	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108365	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_112128_113625_113750_114251
892357	contig_854_pilon	+	2968	13	Intergenic	novelGene_36645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	4103.99352934296	215	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	53	1813	1698226	1715249	FALSE	10	ACATGCGTGTGTCCCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEEQ	1697760	1716404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709169_1715244
892358	contig_7378_pilon	-	5379	3	Intergenic	novelGene_120278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1026	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2692	3123	592364	591933	TRUE	45	CACCTATAGAAAGACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDNIYKTLKEKNCQPRIICPEKLSFKYDGEIRTFPDKQKIREYVKTKPNLQELLKGVLRCENKQLWLTG	595055	546588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_546753_586512_587789_591116
892359	contig_19098_pilon	-	3808	2	Intergenic	novelGene_65839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	696	1331	407806	407171	FALSE	20	CTGAGGGGGATCAGCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	408552	404693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_408346_408396
892360	contig_3426_pilon	-	3599	1	Intergenic	novelGene_57959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430931	427332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_427300_430900
892361	contig_15112_pilon	-	2332	3	Intergenic	novelGene_124771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_2	304	549	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	7	303	77988	74063	FALSE	15	TGTTTTGTTCATTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVMPSSFFLLLRFFLRIDGVLIRMNDTRLYHEANKTYMLREYTSRESKIANLMHVSPSLFTEPNEISQYLPIKEAVCEKLIFPERVDLNPADSQENKPVE	77994	72033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_74207_75804_75868_77898
892362	contig_1694_pilon	-	3112	3	Intergenic	novelGene_144916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_2	4.5	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGGGGTAGTATGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434933	413377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_416167_419568_419715_434756
892363	contig_3817_pilon	+	13828	18	Intergenic	novelGene_78278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	472.370851612679	5621	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	131	1546	77948	115746	TRUE	10	CTTTGTGGCAATGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFICDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTLLQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPDHRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLLGKDAN	77817	133575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82202_84237_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89662_94134_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_115722_124069_124111_124735_129754_129819_130302
892364	contig_10958_pilon	-	4651	11	Intergenic	novelGene_5372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.9798145887145	833	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	67	1260	830078	811341	TRUE	75	AAATACAAAAAATAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASPDPVVIVSAARTAIGSFNGSLSTVPVHDLGAAVIKEVLKRAGVAPAEVSEVIFGNVLTAGCGQNPVRQASVGAGIPYTVPAWSCQMICGSGLKAVCLAAQSVGTGDSNIVVAGGMENMSKAPHLVHLRTGVKMGEMPLLDSLLCDGLTDAFHHYHMGVTAENVAKKWQVSREDQDKVALLSQNRTESAQKAGHFDKEIVPVFVSSRKGLTEVKTDEFPRHGSNIEAMSKLKPCFITDGTGTVTPANASGINDGAAAVVLMKKSEAADRGLTPLAQIVSWSQAGVDPSVMGTGPIPAIKQAVAKAGWSLEDVDVFEINEAYAALSVAIVRELGLNLEKVNIQGGAIALGHPLGASGCRILVTLLHTMERTGGRRGVAALCIGGGMGIAMCVQRG	830144	807285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_809055_809419_809546_809844_811512_811885_811997_812547_812703_813842_813966_816412_816557_819639_819758_821546_821729_828081_828217_830023
892365	contig_11986_pilon	-	3566	2	Intergenic	novelGene_69244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	0	90	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1996	2310	798499	798185	TRUE	45	AAGTAAAATTCATATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALLVSATPHAHAFLKMPLRAIQKMQPKEPVYSWWGRLLSHARCFLSTDAGTHACVSRLLILNPDVTQRRSPRSGSCRLRLLVGTQLSNSRAPECLTADSRT	800494	796508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_797723_798142
892366	contig_19032_pilon	-	4289	14	Intergenic	novelGene_172547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1222.66313271263	5	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	2332	3435	162733	158922	TRUE	20	TACCTGGTGTCTTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKEYNVVFDIITDNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGKLYAARSS	166724	156922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159222_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_164751_164837_164950_165840_165911_166592
892367	contig_6208_pilon	-	7776	9	Intergenic	novelGene_53014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1742	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	1807	3195	494246	492858	TRUE	45	AGTAGTATTAAGGATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	496052	464392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_464510_468300_468411_469609_469740_473518_473661_477713_477764_478856_479070_479912_479975_486600_486820_489319
892368	contig_7730_pilon	+	3916	3	Intergenic	novelGene_156306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	889	1191	471855	472157	TRUE	20	TGTTTTACTCCAAGAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIWYPESLLKSSISSSSFLVDSLGFSLYKIISSANRDTLTSSLPISMPFISFSSLIALARTSSTMLNKSGDRGTLDILNLTGPAKTLLTCLSLLTSQSK	459062	477097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_459075_470978_474014_476228
892369	contig_12464_pilon	+	5611	7	Intergenic	novelGene_68659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1013	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	4756	5136	222571	242112	FALSE	30	CGCTACCAAAAGCCGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGRGVLDSKNAPSPHLSRAFRAGGFAANSTKPFPVALPRSSTTTTAFSTGPNWENACSRSSLETTGERFLTVKAAPCVAKRIRRGLLFKMVPSSSAFAISASVLDSRRMKPKPRSRLMKTSLGSP	123778	242587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_128067_182086_182194_192378_192464_218694_218891_222491_222597_234650_234944_242050
892370	contig_4955_pilon	-	1721	2	Intergenic	novelGene_178210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAGTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184473	176387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4955_pilon_-_177912_184276
892371	contig_5718_pilon	+	4702	2	Intergenic	novelGene_110364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2700	3035	716047	716382	TRUE	30	GCCTATAATTACATCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMKFSWIPACHRCLEFQECPAEPHTVIYCPASKMTDDEHREILIPEVLSNAWSLKNGVKGLEGEGGFLLRPLYESEIRDEGMMLLLPEDLTAATYPSRRISHFLLTESHS	713347	718089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_717692_717731
892372	contig_6410_pilon	+	2756	9	Intergenic	novelGene_108646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	850	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGAAGCGGAAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408584	419331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_409629_409696_410784_412674_412783_413932_414020_415789_415875_416092_416239_417146_417206_418579_418647_419258
892373	contig_7843_pilon	-	3831	3	Intergenic	novelGene_152040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2193	2492	412158	411859	TRUE	45	CGAGACTGGGAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPVTTTDCSDQHYNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESRAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPRKTEWD	446837	387499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_388402_411421_412370_444856
892374	contig_10990_pilon	+	2312	3	Intergenic	novelGene_7400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.5	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	130	618	119582	121424	TRUE	30	TGTGCAGCTTTATGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQARWTGKRTDMLPEIAAAVGFLSSLLRTRGCVSEQRLKVFSGALQEALTEHYQHHWFPEKPSKGSGYRCIRINHKMDPIISKVASQIGLSQPQLHRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEEAPVATSYGLLTCKNQMMLGRSSPPKNYVMAVSS	119452	123505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119736_121089_121757_122143
892375	contig_6497_pilon	+	1260	4	Intergenic	novelGene_35548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	119.200111856771	285	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1	402	90020	131456	FALSE	70	AAATAGGAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPHHSHHKARTGPDVWQDAEHTKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSPQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPTKRISAYSALSHPYFRDLERCKENLDSHLPPGQNTSELNTA	90019	132314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_90088_120471_120523_125061_125198_131309
892376	contig_10196_pilon	+	3806	8	Intergenic	novelGene_132047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	113.909022057616	610	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	2129	3046	643457	647887	FALSE	20	GAGCAGATACTGCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSKSKPPKRDEKERKRRSPSPKPTKVHIGRLTRNVTKDHIMEIFSTYGKIKMIDMPVERMHPHLSKGYAYVEFENPDEAEKALKHMDGGQIDGQEITATAVLAPWPRPPPRRFSPPRRMLPPPPLWRRSPPRMRRRSRSPRRRSPVRRRSRSPGRRRHRSRSSSNSSR	640368	648647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_642380_643339_643528_643749_643906_644528_644721_644998_645102_645445_645600_646997_647140_647787
892377	contig_6048_pilon	-	2939	23	Intergenic	novelGene_73113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	606	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2507	2818	1184085	909142	FALSE	35	AGACGGGAGGCGCCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHALDFELQLLPEVQCRHRIWNINQSLVDIQEGCLSLFTSFTQCINLALETLQQWCYLLAQILWSVLLELSALLDKPLSRLLALILPVSQYCRGGIQFSLQLL	1359401	909020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_909155_994642_994754_1108441_1108490_1156241_1156320_1184023_1184163_1187735_1187860_1192172_1192254_1193826_1193894_1238343_1238389_1251235_1251344_1258620_1258811_1269186_1269244_1272872_1272922_1273710_1273808_1350866_1350992_1351712_1351784_1352521_1352634_1354999_1355117_1356260_1356346_1356915_1356973_1357351_1357431_1358195_1358262_1358502
892378	contig_16322_pilon	-	2041	14	Intergenic	novelGene_87537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	157.243865177929	4	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	352	1728	91959	77890	FALSE	20	ATGTAATCATTTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGAVHATPGSPRFRRTLHGEWTTIFYENCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108571	77576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96071_103807_103858_108542
892380	contig_5415_pilon	+	3454	2	Intergenic	novelGene_146152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTAAGCCCATTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332302	342260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_333237_339740
892381	contig_20165_pilon	+	7110	1	Intergenic	novelGene_54481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3819	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGGATATACTGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64574	71684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_64600_71700
892382	scaffold_12510_pilon	+	3326	2	Intergenic	novelGene_151418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAACTGCTAAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650124	653882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_653048_653479
892383	contig_5434_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_74700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	719	1054	460025	459690	NA	25	ATCTTTTGAGACCGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNILMLWILLRLVLWPNMWSVLENVPCTLGKKVYLAAVGLSVHYMSMRSSWLIVAFSSSVSLLNFLLNVLSFAESGVLKTPTAIVELPISLSSAVRVCFMYFGALLLGV	460743	458150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_458200_460700
892384	contig_12119_pilon	-	4771	3	Intergenic	novelGene_88653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	3032	3628	260008	259412	FALSE	50	CCTGAAGTACAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWEYKMLQPFWKMIWRFLRKLVIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	414074	258268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_260406_402878_403900_412461
892385	contig_16322_pilon	-	2834	5	Intergenic	novelGene_87505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_4	409.581722614669	129	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1320	1808	33723	33235	TRUE	40	AAAAAGTTTCAATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFVKICFLSGYVSTYIISLSGSDRDYISSEARNIYCLVTYSLSALDLAPAHLSSPLYPSSPANLTFSLNVTSSFQAFTIPSASEVFWLLLPRTPLYFGDFSLSFRSPFKWHYFSDQLVLEACVVCASHSTFSPSSFNLSSWHDCNFVVNLCSSVSATRM	57644	31697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_34626_36310_36438_36986_37098_57465
892386	contig_1301_pilon	-	1624	13	Intergenic	novelGene_47325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_3	332.350331812014	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	83	1624	322831	269187	FALSE	70	AATGAAGAAAAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQE	322913	269186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
892387	contig_2215_pilon	-	1201	12	Intergenic	novelGene_163871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_4	178.750437784819	698	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	14	1036	452573	325643	FALSE	15	TTAGTCTCCTTTGGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALLPLLRTGWGWPTGALAAALRLQGPCSRPGPRRAMAVYRTEEHGQPHSRDYRLFFKNVAGHYISPFHDIPLNVDSTEENGIPTKKARNAEYENLFNMVVEVPRWTNAKMEIATKEPLNPIKQDVKDGKLRYVANIFPHKGYIWNYGALPQTWEDPHQKDKGTDCCGDNDPIDVCEIGSKIFSRGEVIHVKILGILALIDEGETDWKLIAINVNDPEASKIHDIDDVKKYKPGYLEATLDWFRHYKVPEGKPENKFAFNGEFKNKAFALEVIKSTHECWKALLMKKCDRGTINCTNVQIRDSPFRCTEEEARSLVELVPTSLHKESNEEEQVWHFLDK	452586	325477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_325672_326852_326890_338363_338434_345443_345530_355020_355149_382433_382561_410642_410730_419864_419985_422712_422767_433675_433721_437384_437450_452398
892388	contig_5526_pilon	+	4454	4	Intergenic	novelGene_111693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.0909191717569	1200	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	173	499	229264	247609	TRUE	20	TGTTAACTGAGCAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQPGSEKTHVLKVRRGACAVAALCLYLRTLLVPLFPLSARALFVLCILCTRLASDGAMSLTSNSGVRVEWIAAVTIAAGTAAIGYLAYKRFYDKDHRHKAMVNLHIQKDNPKVVHAFDMEDLGDKAVYCRCWRSKKFPLCDGSHTKHNEETGDNVGPLIIKKKET	229091	251764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_+_229295_236407_236614_247519_249147_249346
892389	contig_3394_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_152696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1015	1410	483707	483312	NA	25	TACATTTTTTCTTAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLTNPQNSHIKETFGKHTSLWSVFYLRKEQQNTTCKILKVNQNKSSKIIISFLEHEVILANKLPSAECVSCFHVVGMGLCGSIHTSLSRFLDKHLSNGLQGLEVPQIDTEMVRHHYETHKHIEAVIYKG	484721	482291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_482300_484700
892391	contig_9436_pilon	+	2105	7	Intergenic	novelGene_60902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	80.8711251862424	997	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCAAGCCTCTGCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414392	418511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_414711_414942_416064_416162_416277_416889_417022_417377_417456_417696_417870_418342
892392	contig_1225_pilon	+	2885	4	Intergenic	novelGene_44140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1658	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274856_274896
892393	contig_18419_pilon	-	1561	2	Intergenic	novelGene_141460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	177	311	30248	29888	FALSE	25	GAAAGTGTCCTAGTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGWRTPSLTRPTALTTRTALTTPPHWAPTAPGTASLRPAKKANRRTPRHRPPSKGPAMATEHSACLPHPLKPQGICPHPHWVPHPLDSTLFKPGVVYSHSP	30424	28637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29975_30200
892394	contig_6557_pilon	-	1146	4	Intergenic	novelGene_32950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	334.649401945114	31	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTGAGAGTGCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395142	343866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_344676_362507_362662_364233_364332_395057
892395	contig_5928_pilon	-	1451	6	Intergenic	novelGene_40394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	218.382600039472	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	341	763	381151	359489	FALSE	10	TCTGCTTGTTTTTTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSPFGDVSSRLTTEQILYNIKQEYKRMQKRRHLETSFQQTDPCCTSDAQPHAFLLSGPASPGTSSATSSPLKKEQPLFTLRQVGMICERLLKEREEKVREEYEEILNTKLAEQYDAFVKFTHDQIMRRYGEQPASYVS	381844	358800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_359500_359761_359834_360903_361054_364686_364831_381105_381281_381633
892396	scaffold_13505_pilon	+	4616	1	Intergenic	novelGene_111584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1192	1500	626656	626964	NA	20	GTTTTGCAGTATCTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKILLKIIQKRLQQYIDRERPEIQARFRRGHGTRDIIADVRWILVESREYQKDVYLCFTDYAKAFDCVDFNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLCIDQEAVV	625464	630080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_625500_630100
892397	contig_14219_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_54290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGTAAAAAGGAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619690	616913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_616900_619700
892398	contig_7368_pilon	+	6644	4	Intergenic	novelGene_158794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3062	3430	3182	3550	TRUE	30	TTTCTGAGGAAACGCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPVALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	120	375183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_4470_156743_156765_355969_356730_373669
892399	contig_15991_pilon	+	1078	2	Intergenic	novelGene_70941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	437	880	122851	124989	FALSE	15	TTAGGTCATTGTTAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSSFERLLELEPGLISLPEWGTEGSVSAWVPDCTSSYSRMVTGAVPSRSGFEAHLGHHLFVDCPCHRRHQGSAEGPGDPALEEATQPVVFKNECSCLANPPTFHRGKLHMSFDNVCGLSDQGGQNTSKYSTAEVHKGNQDRIQLV	122414	125187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_123123_124817
892400	contig_13481_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_119279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	567	893	150743	151069	NA	40	GACATGATTAGCATATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSHQGLHQTEFSTARWCPATTTESSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSKTHKKDHIYWPDRDWRNPKSMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQQGIGQPHKTKQNEAQQSRDKD	150176	151619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_150200_151600
892401	contig_10734_pilon	-	1125	3	Intergenic	novelGene_51033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	32.5	100	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	280	1059	385659	384880	FALSE	20	AGGTTGGAGTAAGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKWMPIAKEYDPLKAGSIDGTDEEPHDRAVWRAMLARYVPNKGVTGDPLLTLFVARLNLQTKEDKLKEVFSRYGDIRRLRLVRDLVTGFSKGYAFIEYKDERSLLNAYRDADGLVIDQHEIFVDYELERTLKGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRDRPFRKPINLPVVKNELYREGKRERRERSPSRERHWDSRPRDRDHDRGREKRWQEREPARVWPENDWERERDFRDNRIKGREKRDRSKWRLNSKIEDEDKA	391767	384813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_385663_387934_388120_391676
892402	contig_6227_pilon	+	2629	1	Intergenic	novelGene_49623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATGACTTACTGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339575	342204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_339600_342200
892403	contig_16121_pilon	-	5650	1	Intergenic	novelGene_6871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTCTCCAGGGACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41368	35718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_35700_41400
892404	contig_18859_pilon	-	6449	14	Intergenic	novelGene_150534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1887	2384	92786	92289	TRUE	35	CACACACCGGTGTAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLPQLRLLPRCGVGGRLWCWALVGLCRWLLPCFPGRMLLSLAAWACTTQGPEWLPPCCVPAWRHPAPPRRRKKASAQDLLSLCQRPRTGHLRPVPCSGKCYKSLAAQASLLPQGTHWRTLCGPTSPQHSLSIFSVTDLASGSRGFTAQGSCACPQDTLHSRLS	377219	48027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_48309_50959_51196_51816_52036_54985_55068_57385_57536_63023_63089_63427_63598_67347_67552_67633_68234_69515_69650_90031_90207_90539_93971_133168_133352_376700
892405	contig_5623_pilon	-	3979	7	Intergenic	novelGene_154806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	300.110535192174	1990	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1124	1900	210277	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211603	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_211121_211203_211383_211502
892406	contig_4812_pilon	-	3314	3	Intergenic	novelGene_103646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_2	1451.5	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCTAAGTATTGTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82806	78706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_81739_82268_82343_82598
892407	contig_14986_pilon	+	2359	2	Intergenic	novelGene_59722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	973	1887	151004	152053	FALSE	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150031	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151558_151692
892409	contig_12841_pilon	-	3860	1	Intergenic	novelGene_55852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1330	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAACTCACCTTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296237	292377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_292400_296200
892410	SIRV6	+	1339	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	184	-62	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	9	1	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	132	623	1733	10736	TRUE	25	TTATGGATTTAGTCGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1487	11762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1527_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
892411	contig_20641_pilon	-	1317	7	Intergenic	novelGene_52803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	54	386	56705	54963	TRUE	20	GCGAAGAGGTCCGGACCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDETVLVIQHLP	56758	14535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41615_45843_45968_54855_54994_56403
892412	contig_11427_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_79033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3995	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGTTCAGCCAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841501	843931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_841500_843900
892413	contig_17074_pilon	+	5529	17	Intergenic	novelGene_145165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	499.772557644975	36	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	346	2211	610974	657014	TRUE	15	CGACACGTGTGGATTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKHREIFIALVCCASYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQARGPLSVRFKYLLTPREPNRWAVEHEGALPYNSSSTVNGVLMKPTHIIVETMM	563442	661306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_578712_578754_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631_636736_636871_636997_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873_658122_658312_659935_660717
892414	contig_15152_pilon	-	2153	7	Intergenic	novelGene_126965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	472.912870763033	1042	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	789	1436	204362	203318	FALSE	25	TGAATCTGTTCTATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	206535	202600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512_204638_204985_205254_205925_206075_206295
892415	contig_11427_pilon	-	5947	7	Intergenic	novelGene_79019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	166.815017309594	930	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1659	4980	151	5130	852461	795233	FALSE	85	AACAAAAAAAAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSTRPLSKYQAKIENVQKTGFIKGPIFKGVASSRFLPKGTKTKVNLEEQGRQKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQNDTPNSPAIPLQADSTPKIKVDIGDTLSTTEESSLPKSRVELGKIHFKKHLLHVTSRPLLAATTAVTSPPPPTVPLPAVIAESTTVDSPPPSPPPPPPPPQATTPSPPAPVTEPVALPHAPVTVLMTAPVPSPVDVTVRALKEPPVSVVSESLEVDTKQDAVSNSSEEHITQNLNEQANIPSQKGDSHIGKEEEIPDSSRSSLGSKKTGSKKKSLQSEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASVEKERDAKKSLAPLKSEDLGKSSRSKTERDDKYFSYSKLERDTRYISSRCRSDRERRRSRSRSRSDRSSRTSLSYSRSERSHYYDSDRRYHRNSPYRERTRYSRPYTENRARESSDSEDEYKRTYSRRTSSHSSSYRDLRTSSSYSKSDRDCKTESSYIETEKRGKYSSKLERESKRTSENEVLKRCCSPSNDVGFRRGSSYSKHDNSASRYKVTPSKPIPKSDKFKNSFCCTELNEGIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKIPEREKTGSPSPSNQLKDSPTFKKLDESLIFKSEFIGHDSHDSIKELDSLSKGKYDQLRTYHPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTETLLMSSDDSVTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDATCMQHSKSESPFRETEPPVSPHQDKLVTLPVMVIDYSKTVVREPVDKRVSCCKTKDSDVYYTSNDSNPSLCHSEAENIEPSVTKISSNSFMNVHLESKTVICDNRNLTDQNSKFGCEEYKQSVGSTSSTSVNHFDDLCQPVGSSSIASSLQSLPPEIKADSLTHLRCAENTSPVLDAVLMSKTSTEFLKHTGEETIVEVGSGLPDSRRGFSSWENRHNNGLSEKCLQETQEEGNSRLPDRRRRSEISLDEGGRRHVRTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYTVKCDSSGHASEIVSTIHEDYSGSSESSSDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHCSDHWEDERLESRRHAYEEKFEVMANKTCPQTEKFFLHKGAEKNPEISFTQSSRKQVDNHLPEIVHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEEIVKVKIASRQQELPVYSSDDFEDVPSKSRQQTTFPHRPDSRLGKMELSFSSSCEISLVDGFHSSEELRNLGWDFSQAEKPTTTYQQPDSSYGACDGHKYQQSAEQYGGTHSYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGVVYDRIQGQVPDSLTDDREEEENWDQCGGSHFSSQSNKFLLSIQQKDRGSVQAPEISSNSIKDCLAVNEKKDLTKNLEKNDMKDRGPLKKRRQELESDSESDGELQDRKKVRVEVAQGETAATPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKEERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAARDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYG	852611	794415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_795335_798086_798165_800238_800363_809622_809752_812987_813120_815640_820020_852425
892416	contig_9955_pilon	-	3666	3	Intergenic	novelGene_21265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5597	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	137	709	49317	46301	FALSE	25	TTTAAGTGTAAGTATCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKVEWLIQMVRWLNRQMP	49768	43343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46351_48794_49378_49692
892417	scaffold_8345_pilon	+	2100	7	Intergenic	novelGene_107007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	405.892843001697	99	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	163	555	598162	602792	TRUE	20	TTCGCATTTCAATGTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQIQEMKRKEKEEMKKKREMDELRYVGDTVLTSRIGHC	570418	620962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_570505_583891_583932_598125_598202_602217_602322_602543_602889_612422_612539_619629
892418	contig_6048_pilon	+	3369	2	Intergenic	novelGene_73361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTGAGAAACTAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3043269	3046857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3045344_3045562
892419	contig_7009_pilon	+	3178	2	Intergenic	novelGene_23671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTAGAGCGTGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536529	540149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_536666_537107
892420	contig_21013_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_38527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	202	546	84993	85337	NA	25	ATCAATGTTGAACTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQPMNVMTQSFGAVNLSSQSNMLPVRPQTNPLMGGPMPVSMPNVMTGTMGMAPLGNTPVMNQSMMGMNMNIGMSSPGMGLSGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFTNFNK	84791	86719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_84800_86700
892421	contig_9706_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_20886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3469	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3500_4000
892422	contig_6842_pilon	+	2178	17	Intergenic	novelGene_130653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	189.465984743964	347	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1722	456	2177	335003	398318	FALSE	55	AGAAAGAAAAGCAAGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGVSKDPELADLFYKDDPEELFIDLHEIGHGSFGAVYFATNARTNEVVAVKKMSYSGKQMHEKWQDILKEVKFLGQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITQGALQGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTP	238724	398319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_238991_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343875_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291
892424	contig_12019_pilon	-	2210	5	Intergenic	novelGene_87635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGGGAAATTTGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10196	2043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_2298_5116_6226_8298_8684_9211_9477_9999
892425	contig_10930_pilon	-	2728	2	Intergenic	novelGene_37056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5002	junction_1	0	391	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1338	1640	280415	280113	TRUE	30	CTGTATTGTTTTCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKVFFYFCWSEFMGRA	281752	277960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_278637_279700
892426	contig_19647_pilon	-	3350	4	Intergenic	novelGene_144009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_3	353.823245263633	48	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGATTTAAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95521	73473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_-_74157_85271_85447_88284_88375_93119
892427	contig_8972_pilon	+	4833	3	Intergenic	novelGene_167630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	0.5	448	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	1203	3734	384256	386787	FALSE	40	CCCGTATCCACTAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQLSGAQKRKLTEDKKKRICESLKTIPKLTSSLKFNESEETSSIEHWSLMGANLCSNTSAEITNSSTIVTDFVPNAASIPCCSKKINSGVESETILESEMITSADPLNNRNTDPALWNNFSSNDINYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLGGKQTRFCSQNIFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVYCFVCKLFSPKSFNSRFATDGFSDWSNSNMIHKHENSSVHRDCMLSYLNRRHGFGLTHELESQVNEERQYWKAILQRVVAVITTIAERGLSFRGRNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKYGNTGKGNPSYISKTMCEELINLISDKVRSAIFSEISIARYFSLSVDSTPDVSHTDQLSIVLRYVSPTDGKPVERFITFTSLRSHTGEEIADQVLHYLCEVCKIDFSKCRGQSYDSAANMAGRYKGMQQKISERNEYAIFIPCASHSLNLIGRSAVDCCPEAVDFFSTVQLLYTFFATSTHRWAVLKTYLGSDRVLKCLSNTHWEAHAVATSAILESYTQILDALENIAEDQTQKGDTKREAENIANKMQTLEYVFMLVMWNDILQHFHWTSQALQDSEVNLKTCTDLYQSLTGYLHNLREYFEKFENTTKQILPNTDYQAVHSRRSIRKKQVDDGSAPEESLSARDQFRVTTYHTIIDTLESCMKRRAGVYEVLSDRFSFLNSVDIPDEECMKASRKLVQAYPDDLNTNLYGEVRQFHSYMRTKFTDSGKTNFTYVGMYESIIEDKIQCVFPNVEIALRIFLTLMITNCTTERSFSSLKRLRNPQHATVIQERPDSLSLLCMEVDIVRQLNYDEIIEEFVKSKE	378429	387886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_378476_380605_380649_383142
892429	contig_15092_pilon	+	2241	4	Intergenic	novelGene_57792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.242056920641	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	325	891	325159	351165	TRUE	20	TATCAAAGGTTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324834	352590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992_351695_351769
892430	SIRV7	-	2243	6	FSM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	2	2	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114914	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_4095_4180_4725_4811_43028_43078_114680
892431	contig_854_pilon	+	1395	7	Intergenic	novelGene_36273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	2	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	69	629	543600	562402	TRUE	35	AATATAACTTCAGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKVSWTDTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543531	563793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557079_557623_557752_562271_562405_563029
892432	contig_14666_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_39629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	335	1008	22	1029	483933	484940	NA	50	TCCCTTTATTAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	483911	485222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_483900_485200
892433	contig_12278_pilon	+	2566	15	Intergenic	novelGene_152589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	297.157769199996	754	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	79	2148	179723	201939	FALSE	25	TCAGTGTAGTAAGACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGPVQAVPPPPPVATEPKQPTEEETSSKEDSTPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQATQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLLAKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	179644	202357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_179786_186248_186371_190255_190464_191700_191959_193856_193932_194886_195038_195380_195402_196716_196882_197627_197750_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
892434	contig_11163_pilon	+	5691	7	Intergenic	novelGene_153053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	191	541	38085	38435	TRUE	45	AGCACAATGCCCAGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWSLLVTCPKYVRHSLAILASKEHSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILCQHHNSKESILLQSSLFIVQLSHAYDATENSMAWVRHTLVFKMTSLLFNILTRSFAADLPNAMHLLIS	37894	173445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_39355_66200_66536_103198_103686_113872_114039_157347_158315_166837_167180_171511
892435	scaffold_12124_pilon	+	2107	10	Intergenic	novelGene_22223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	19	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	FALSE	35	GGTAAACTTGACTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
892436	contig_10674_pilon	+	1917	3	Intergenic	novelGene_6430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_2	85	141	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	32	988	198581	211925	FALSE	90	ATAAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMEDLFGSDVDSDAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKGTPGMFLRVCFR	198549	212854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_198639_208607_209364_211782
892437	contig_8254_pilon	+	5911	16	Intergenic	novelGene_48365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	269.201155685153	963	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	114	2504	72814	109211	FALSE	25	AATCAGTTGCCCTGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKGLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFSSNLLTIPKQRSSSVSFTHHISLRRAGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	14902	112618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_15016_72813_72865_74714_74964_77451_77595_82136_82244_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341_102546_104501_104664_107499_107756_108996
892438	contig_3132_pilon	-	2197	5	Intergenic	novelGene_127434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	51.4028209342639	414	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	27	344	246078	239739	FALSE	55	AAGAAAAAAATCCTATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGTPDSQARFGQSVKGLLTEKVNTCGTDVIALTKQVLKGSRSSELLGQAARNMVLQEDAILHSEDSLRKMAIITTHLQYQQEAIQKNVEQSSDLQDQLNHLLK	246104	237885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_239791_240290_240312_241484_241529_241631_241695_245940
892439	contig_15725_pilon	-	4489	5	Intergenic	novelGene_178621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	144	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	682	990	70666	70358	TRUE	65	CAGAAGAAAGGAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVVLFCFLSLGAPSSRAVLRGLGATLLVCAAMPVGSLEAFFSSFFLFVFLHFSVSHLYIHTFFSCLLNTWCRVTSLPLLAKPYFEALEPLPLSSQPHQWDP	71347	38828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15725_pilon_-_39617_40196_40867_53987_54911_55856_56872_70254
892440	contig_2504_pilon	+	4229	5	Intergenic	novelGene_166848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2905	3264	390940	470612	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIELLGWSVFLLSGYLGSFLPAKSSKIFSVFSIFCPCSGTPIMCKFLLNCIPYNSSFIDCRFVCFVLLFCSIWLCLCRQVVCSLLTGCLWHLLQPPGRIINQCRAGSSRPCLCGLVV	388035	472151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_391108_455743_455836_470512_470846_471021_471399_471796
892441	contig_11867_pilon	+	1618	2	Intergenic	novelGene_178622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1041	1616	94510	95085	FALSE	65	TAAAGAAAAAAATCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITMDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFVETHGLPQLHQSDIENLNRLITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDITKKENYRPISLRNIDAKILNNILANRIQYHIKKIIHHDRVGFIPGMQGWFNIRKSIKVIHHLNK	81387	95087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11867_pilon_+_82166_94247
892442	contig_12638_pilon	-	3047	18	Intergenic	novelGene_33061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_12	80.1700614589091	472	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	103	2508	128535	19895	TRUE	20	TTGGCCAGGCTACCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKHPPNRRGISFEVGAQLEARDRLKNWYPAHIEDIDYEEGKVLIHFKRWNHRYDEWFCWDSPYLRPLEKIQLRKEGLHEEEGSSEFQINEQVLACWSDCRFYPAKVTAVNKDGTYTVKFYDGVVQTVKHIHVKAFSKDQNIVGNARPKETDHKSLSSSPDKREKFKEQRKATVNVKKDKEDKALKTEKRPKQPDKEGKLIGSEKGKVSEKSLPKNEKEDKENISENDREYSGDAQVDKKPENDLVKSPQENLREPKRKRGRPPSIAPTAVDSNSKTLQPITLELRRRKISKGSEVPLKRPRLDKNSSQEKSKNYSENTDKDLSRRRSSRLSTNGTHEILDPDLVVSDLVNAVDADPLQDTSSSAKESEEGHLKSPLKAGQVSSALTCHSLGDGLGATGLELNCKSMGENAMKTEPASTLAELQDISTVTVTNTFKKTGDFVTSKAPAVDLDHKFRCKVVDCLKFFRKAKLLHYHMKYFHGMEKSPEPEESPGNRHVQTRGSSSSDKASQDSLARKRVSASSPTAKDKEKNKEKKFKEFVKVKPKKKKKKKKKAKPECPCSEEVSDTSQEPSPPKTFAITRCGTSHKPGVHMSPPLHGSESGNHKGKGKVSEEDNLSESSSESFLWSDEEYGQDVDVTTNPDEELDGDDRYDFEVVRCICEVQEENDFMIQCEECQCWQHGVCMGLLEENVPEKYTCYVCQDPPGQRPGFKYWYDREWLSRGHMHGLAFLEENYSHQNAKKIVATHQLLGDVQRVIEVLHGLQLKMSILQSREHPDLQLWCQPWKQRSGGGTISFQTHPCC	150541	13254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_13305_17613_17798_19589_19992_23907_24104_26723_26824_38673_38853_39796_39962_40654_40754_51872_52152_77449_77630_78343_78533_79439_79554_83545_83934_87172_87253_96222_96308_97539_97712_128452_128568_150471
892443	contig_14682_pilon	+	4085	11	Intergenic	novelGene_139127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	254.657024250265	91	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	256	1164	142535	172922	FALSE	30	ATGCCGTCCCTCCACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRPGDSSALPARCRRREERACLRAAPAAPPPRPACPVASSPLGWRRPGADRRQRGHFLTPRSLSRLPRLLFPPRLGAGRYSGPRMQNMINTVKGKALEVAEYLTPVLKESKFKETGVITPEEFVAAGDHLVHHCPTWQWASGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGIAGITEAVKEITLESKDSMKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYPSVCVCACERDWGQTGT	142279	175843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_151306_151357_157167_157239_158635_158744_162323_162374_165799_165879_169216_169243_169509_169666_170436_170565_172795
892444	contig_614_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_132660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAGAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120694	1118315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1118300_1120700
892445	contig_14744_pilon	-	2994	11	Intergenic	novelGene_66041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	475.358191262126	540	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	1024	2118	1345024	1313534	TRUE	35	GTTTGATCCAATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQVRAWGAAWLCLKRAQLAQVTLHCPHFEQEGMS	1347416	1311990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1312646_1313312_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1346471
892446	contig_11564_pilon	-	2083	2	Intergenic	novelGene_158537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	642	1241	56090	40677	FALSE	5	TGTTTGCTTGGCTCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGMFMLCAGQRWEALWGGGMGIIPYFIIVPSTKDDPADGWDELLWSQRHDELRTVNERRKWTGSKSDSQSSDVEIKTKHLYGYHFPLPFSSFPNTSLPIPLSCLSLFRFKIAQYVIWGLAFCPALPLPKHADLSVALCCTCPVAFLTSLPSLSPWSSPGTSTLEIVGRRHLTVGETCIPLSTLPLRINLPSDSEKGL	56731	39834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_55984
892447	contig_8464_pilon	+	1275	7	Intergenic	novelGene_125371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	96.942279504639	839	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	200	880	792776	804080	FALSE	20	TCTCTCTCTCACTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPPGGLGRLAEGEVGAGGGGEDGVPESPAGVPADPTGQPRLHHRLRPYHRRCGEQLQHQLLVTPSSMCLGPNEAGIWASGRPRGQLELITPFQLYFNPELIFKHFQIWRLITNFLFFGPVGFNFLFNMIFLYRYCRMLEEGSFRGRTADFVFMFLFGGFLMTLFGLFVSLVFLGQAFTIMLVYVWSRRNPYVRMNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	792576	804475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_792830_793605_793672_796183_796258_797898_797993_798725_798922_799187_799279_803974
892448	contig_13707_pilon	-	2537	13	Intergenic	novelGene_43551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	873.729216093611	23	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	251	1246	276424	271622	TRUE	30	TTTACAAAAGTGGTGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGALARARLESLLRPRHKKRAEAQKRSESFLLSGLAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNGTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLVSSQDTSWKASCRRTGQRDLEPRMTL	278368	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270896_271535_271626_271738_271807_272354_272460_272853_272978_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_276315_276483_278176
892449	contig_4868_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_136765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	1984	2505	247772	247251	NA	30	CCCATATGGCAGCAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVPYRLRPPILSSGRQRWEEVRRSCETRPLLKCAFTHSEAWGRTQQGRPAHQPSCSWAGVSAQEERKHSGQGLLWAPEAAWHSAQSTVFRAEQVTSSLGYALGLPDIPGPDLPPVRCASQERMSRAGRGSAAALIPALTGRALLTPMGPLLTWSMQQGTAISPGKGKAQRD	249755	247221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_247200_249800
892450	contig_10241_pilon	+	3320	2	Intergenic	novelGene_142839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	717	1325	118350	118958	TRUE	45	AGTGAGAATAGCAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHLFTAWFTDYFKASVKTYCSEKKISFKILLLIDNAPGHPRALMEMHKEINAVFMPANTTSILQPMGQGVILTFKSYYLRNTFCKAIPAINSDSSDGSGQSKLKTFWKGFTILDAINNIRDSWEEVKISTLTGIWKKLIPTLMDDFERFKISVDKVTTDVVEIARELELEAEPEDVTELLQSHDKTLMDEELLLMDEQRK	117633	151740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_120413_151199
892451	contig_6902_pilon	+	1726	12	Intergenic	novelGene_135588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	538.055467354819	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1662	63	1724	460308	490136	FALSE	60	ACAAAGAGAAATGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKSGQSTKAKDGKKYATLSLFNTYKGKSLETQKTTVAARHGLQSLGKVGISRRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQE	445854	490138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_445863_460253_460420_461973_462152_463503_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
892452	contig_7207_pilon	+	2374	2	Intergenic	novelGene_72027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAACAGCGAGCGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290531	295006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_292046_294146
892453	scaffold_12124_pilon	-	3082	9	Intergenic	novelGene_22209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2180	2506	1508404	1508025	TRUE	75	AAAAAAATTACCAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCFLAGKFLVSKHHRPGRATGRAHHSIKTNKQIPMRANWGAGWGSSQPLCLCLSEMVSLANSRSPSSNPAVNTWVVFCRESLSLL	1510583	1450200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1450371_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494329_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1508275_1508327
892454	contig_8050_pilon	+	5378	14	Intergenic	novelGene_114821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	848	junction_10	205.368913257446	573	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	125	1792	294062	335684	FALSE	75	AAATGAAAATTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLTETIFLNQDLEEKNENQESDTEEEEDKLFWLEACYKALTWHRKNKHVQEAACWALNNLLMYQNNLHEKIGDEDGQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRVC	293937	339270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320926_321619_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562
892455	contig_13004_pilon	+	1652	4	Intergenic	novelGene_112733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	249.641075679998	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	84	719	922526	928378	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIALCPKPSGLPAARGPARPALPQMLQPSTCSPGEAPSSGHQKQGRGHCPTPPALQE	922442	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926884_928211
892456	contig_14333_pilon	+	3342	9	Intergenic	novelGene_49085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	491	junction_1	306.133038889957	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	204	935	274039	294370	FALSE	65	CAAAAAAAAAAAAACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNRDGHATDEEKLASTSSGQKLAGPEVKGEPEEDVEYFECSNVPVSTINHAFSSSEAGLEKESCQKMEKDEPAVPGLVESSVEKTPVSVACGDESPLDGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTNMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD	269976	296777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_270154_274012_274066_282470_282597_285902_285980_287700_287745_288874_289036_290056_290164_292809_292931_294301
892457	contig_16411_pilon	-	4560	20	Intergenic	novelGene_77311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3786	4235	146714	135033	TRUE	15	GGCACCACCTGCAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTMYSCVLEGPTARRGTLMSNPPLGSFSPLKHGSLGGSRPPSQSQMVFRIACRTLDEDVLLLPHCLPQGLAQSHLGKVLQGCVDSVPDGLVEDTFHPAHEDLQAFDHGNHLYKGELLLTGVIVARGSLILFCCARAVLVAELVCGVN	243402	129459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_129535_131612_131729_134142_134264_135019_135145_142144_142311_143073_143224_146692_146846_147894_148054_148956_149049_152589_152667_157182_157293_160869_160991_167135_167336_169239_169329_184037_184183_185347_185435_187180_187314_231224_231312_240221_240375_241201
892459	contig_6418_pilon	+	4510	2	Intergenic	novelGene_81241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	598	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATACTGAGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1445716	1450599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1449165_1449537
892460	contig_7840_pilon	-	2208	9	Intergenic	novelGene_69027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	297.391550611311	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	141	1130	403211	365958	FALSE	0	CTTTCTGTCCTGGCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVGKASATASGDWNTTIACFVAILIGLCLTLLLLAIFKKALPALPISITFGLVFYFATDYLVQPFMDQLAFHQFYI	427685	364879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403276_427609
892461	contig_233_pilon	-	2776	16	Intergenic	novelGene_14567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1489.77917230112	7524	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	900	2336	104176	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104231_105441_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109923_109976_126903
892462	contig_678_pilon	+	7896	29	Intergenic	novelGene_167767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.0372513014579	1998	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	250	558	12721	13583	TRUE	30	CAGGAGGAAGGCCGGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFIMYMAGNTISIFPTMMVCMMAWRPIQALMAISATFKMLESSSQKFLQGLVYLIGNLLGLALAVYKCQSMGLLPTHASDWLAFIEPPERMEFSGGGLLL	9131	126411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_9252_9596_9684_12678_12833_13135_13297_13547_16579_17500_17634_19595_19781_19987_20094_20696_20836_21639_21811_22619_22817_23880_24060_25344_25446_26392_26516_28138_28233_29695_29819_30103_30276_31115_31176_31453_31550_31719_31887_32703_32913_35730_35971_36681_36816_37326_37384_38796_38942_39923_40057_41345_41442_58505_58551_125173
892463	contig_4151_pilon	+	1732	3	Intergenic	novelGene_65270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	137	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	74	712	620441	663644	TRUE	25	ACATTTTAAGCAGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPFIFCRVRLQVLAAERTCSYSEYMSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	620367	664727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_663078_664499_664561
892464	contig_15491_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_75968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTATGAACATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80468	78709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_78700_80500
892465	contig_18843_pilon	+	4460	9	Intergenic	novelGene_165616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	643.639638598339	29	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	8	742	28527	44189	FALSE	40	GATCTAATGTTCAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSK	28519	47907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40085_44184
892466	contig_7728_pilon	-	3705	1	Intergenic	novelGene_64742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	510	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCCTAGGCCAAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881691	877986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_878000_881700
892467	contig_10642_pilon	-	2587	2	Intergenic	novelGene_78740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1803	2120	1276146	1275618	FALSE	70	AGCACCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCSSPSVLGGAKEALRALVVLWLSLRLLTKRLAVRIHQLLLGNPMRQFCSVTWVCYELKSTRWHRTTTTRKSLLSCIRICILCTRVKQANCNLGVEKRRENQLL	1277948	1275150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1275792_1276002
892468	contig_854_pilon	+	5039	27	Intergenic	novelGene_36503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3231.57125324399	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	1145	3868	1679334	1714980	FALSE	30	GGCAAAGAAGGCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKVDGKADGAEAKTAE	1612772	1716151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1672755_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687064_1702636_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713129_1714933
892469	contig_8330_pilon	-	2440	10	Intergenic	novelGene_71844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.721061664357	62	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	111	1094	916108	896249	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	916218	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896106_896146_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
892470	contig_6847_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_143895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTGCCAAAGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230909	231998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_230900_232000
892471	contig_19604_pilon	+	5768	2	Intergenic	novelGene_77245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_1	0	587	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2474	2956	273206	273854	FALSE	40	GATCTATTTTGTCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGKFSPALTRGDTVCPSLGLMGRASGYQPLLTEAMDAASWKPAGLCTPRRVCPFMCLVPSVNPCAGDRPHSAMRQGPGASPVPCALQVPIRSG	270732	276666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484
892472	contig_12278_pilon	+	2700	15	Intergenic	novelGene_152590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	309.996354488111	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	290	2287	190419	201939	FALSE	40	TGAAATCAGTGTAGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTEEETSSKEDSTPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQATQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLLAKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDEKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEMPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAIIHLALKERGGRKK	186244	202352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_+_186371_190255_190464_191700_191959_193856_193932_194886_195038_195380_195575_196480_196599_196695_196882_197627_197714_197852_198099_198665_198874_199321_199477_200775_200878_200988_201061_201837
892473	contig_7051_pilon	-	2518	5	Intergenic	novelGene_64312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	177.373017959328	607	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	22	501	231129	216979	TRUE	30	ATTTATTCTCTCACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231150	213638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_214871_216193_217052_217573_217734_217824_217999_231056
892474	contig_7201_pilon	-	3507	19	Intergenic	novelGene_152488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.035547766061	748	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	186	1937	255800	70168	TRUE	20	GTTCAAAGACTGGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGYAKEVLTTKGKQVIDLKVHQKYLQYQRAMKCFYTHFFIRNCMFFICKRSNMSFTCVYTLSPWRVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEVEEIVDIGSFAPEDIHIPKIYVHRLIKGEAYEKRIERLSIRKEEDGKAKSVKPGDSVRERIIKRAALEFEDGMYANLGIGIPLLASNFISPNMTVHLQSENGVLGLGPYPLKNEVDADLINAGKETVTVLPGASYFSSDESFAMIRGGHVDLTMLGAMQVSRYGDLANWMIPGKMVKGMGGAMDLVSSAKTKVVVTMEHSAKGNAHKIMEKCTLPLTGKQCVNRIITEKAVFDVDKKEGLTLIEIWEGLTVDDIKKSTGCDFAVSPKLMPMQQIAS	255985	66397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_67233_69432_70210_83641_83744_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161658_161708_163992_164088_169479_169595_171320_171429_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_234209_234399_238453_238545_239711_239821_255722
892475	contig_2757_pilon	-	3084	1	Intergenic	novelGene_164601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	539	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGAAACCCACTACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492355	489271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_489300_492400
892476	contig_3449_pilon	+	2379	3	Intergenic	novelGene_73726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435.5	22	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACATTTTACTCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493422	527127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_496963_525173
892477	contig_3975_pilon	-	2105	13	Intergenic	novelGene_54852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_5	239.51983216427	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	272	1648	2066301	2056837	FALSE	20	TGAACGTTGTACATCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTRYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079253	2056379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
892478	contig_17144_pilon	-	2080	10	Intergenic	novelGene_29213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2106.33404547121	10	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	54	1232	173640	166916	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKATVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEEHCKCNPLSSRRAAEMTPPLA	173693	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166982_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580
892479	contig_3747_pilon	+	3109	3	Intergenic	novelGene_24913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9986	junction_1	1296.5	91	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	710	1054	202676	203151	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLVSEWGWL	201396	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202740_202870
892480	contig_3751_pilon	+	3181	2	Intergenic	novelGene_158623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1063	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1200	1544	7064	7408	TRUE	60	AAAAGCTACTAAACAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKLLNSIINIIHQQNFAEDHSKAAAAVCQQGLPEIQARFRRGHGARDITADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKVFNCVDHNKLWITLRRMGTPEHLIVLTRNLDTDQEAVV	5864	13113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_8068_12135
892481	contig_12625_pilon	+	2558	3	Intergenic	novelGene_140487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_1	204.5	295	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	170	604	28479	30623	FALSE	15	GGAGCCCTGTTGGTGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALSTGGSSGTNGSSSAPSENTSPSAGTTETGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS	28309	32577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_+_28595_28844_29011_30470
892482	contig_4301_pilon	+	3823	7	Intergenic	novelGene_65094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	151.66272888661	776	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	212	1618	459349	530958	FALSE	35	CAGTGTTGAACACTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQPVTYQAYRECTLETAVHASGWNKILVPLVLLRQMLLELTRRGQESLSALLQFGVTYLEDHAAEYIIQQGGWGTVFNLESEEEEYPGIIAEDSNDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	450006	533163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450168_459298_459470_492399_492508_494596_494754_499139_499210_507918_508063_530151
892483	contig_10627_pilon	-	5410	24	Intergenic	novelGene_59952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	92.4753684059423	1013	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	281	1030	185577	180958	TRUE	35	GCACATGTACGCAGCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHKRIWLLFISARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENTDRGNNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTGSAQQGHNSPDSPPRQCCQEHTRLWQYWEHQQCSSDLPFCWSPRSQQHSSRE	185857	172558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_172592_172705_172800_172970_173077_173387_173435_173554_173634_174245_174346_174429_174626_174708_174823_174938_175045_175127_175228_175457_175538_175629_175782_175916_176052_177070_177254_177414_177536_177620_177893_178136_178220_178307_178408_178514_178699_178781_178877_178957_181231_182484_182587_183788_183900_185313
892484	contig_16951_pilon	+	5658	5	Intergenic	novelGene_98640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	300.341056134522	2727	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	344	694	86293	91405	TRUE	30	ACTTGAGAGAGAATCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDGANNNSYSTAISVCSAIRPTVLLYFLYTFGLRAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	85812	111453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_86165_86411_91172_91463_103952_104099_106692
892485	contig_5686_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_45371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTGCCTATGGATAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138793	136038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_136000_138800
892486	contig_9112_pilon	+	1880	3	Intergenic	novelGene_60220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	423.5	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	99	899	108641	113786	FALSE	70	CCTTAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDFGREFYISLTTDHTPPYFYNRIDFIFQPDMDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRYVNEVCACKEA	108542	114767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111589_112128_113625
892487	contig_7119_pilon	+	4684	12	Intergenic	novelGene_40860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_2	361.985502654777	941	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	87	1511	55132	112892	FALSE	25	GCCCCAGACAGCCAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSFPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVRKNILDNKPTANKKCDLINVPKKTADMASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA	27598	116065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_27638_54784_54827_55126_55327_77981_78105_90791_90922_95067_95250_98276_98397_99516_99622_102234_102381_111479_111538_111632_111879_112772
892488	contig_8954_pilon	-	5577	1	Intergenic	novelGene_130287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	900	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167078	161501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_161500_167100
892489	contig_6163_pilon	-	1342	10	Intergenic	novelGene_103815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	307.182697879524	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	594	1193	79431	76108	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGSEDGKIHVWNGESGIKVAVLDGKHTGPITCLQFNPKFMTFASACSNMAFWLPTIDD	93985	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_77811_77882_78301_78458_78698_78816_79347_79448_86079_86279_86907_86975_89577_89676_93772
892490	contig_18272_pilon	-	2827	11	Intergenic	novelGene_6978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	626.087286246894	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	214	1347	184469	122223	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDIPYMPSYHTHQQKMSPATLIPTCPHT	262699	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_122265_122376_122739_124244_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338_184551_214778_214872_262660
892491	contig_15093_pilon	-	4952	4	Intergenic	novelGene_143309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	721	152	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2067	2588	187364	186843	TRUE	60	AAAAATAAGTTTATACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQMISKNLQKQDRMVSVGVQNKTADNLPVEEKTLDLTDREFTSLIFRAIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKVEEFKKIIQEQKGKIDSQLETIQKQQLEIQKINNKISQMDSIIEGLRGKSETMEDRISEIEDRHLDTTLRKNQKKITEKNEETLRIMWDTIKSKNL	189524	184275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_184539_184665_185856_185931_187656_187749
892492	contig_18804_pilon	+	4155	13	Intergenic	novelGene_163793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.3739351185637	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	956	2017	12100	24722	FALSE	10	TCTCCCACCTCAGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVKRKRRGDPAIQTKKPKKNKKDAERPTKLHDTAEEAEEEDRDRIPGPVCKGKWKNKERILIFSSRGINFRTRHLMQDLRMLMPHSKADTKMDRKDKLFVINEVCEMKNCNKCIYFEAKKKQDLYMWLSNSPHGPSAKFLVQNIHTLAELKMTGNCLKGSRPLLSFDPAFDELPHYALLKELLIQIFCTPRYHPKSQPFVDHVFTFTILDNRIWFRNFQIIEEDAALVEIGPRFVLNLIKIFQGSFGGPTLYENPHYQSPNMHRRIIRSITAAKYKEKQQVKDVQKLRKKEPKTILPHDPTADVFVIPAEEKPIEIEWVKPEPKVDLKARKKRIYKRQRKMKQKVNSGNAK	7488	26860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_7749_9512_9622_11035_11294_11771_12259_14602_14715_17739_17784_20348_20420_20696_20747_20842_20917_21080_21132_21273_21376_24074_24204_24452
892493	contig_17857_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_178623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8052	5875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17857_pilon_-_5900_8100
892494	contig_14133_pilon	-	1316	6	Intergenic	novelGene_119940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_2	1880.514248816	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	66	524	209116	208001	TRUE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSTLAIIHGWSRVE	209414	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_208040_208214_208389_208585_208728_209012_209131_209363
892495	contig_6227_pilon	+	3318	12	Intergenic	novelGene_49819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1247	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGGGCCGCTCGCAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1358605	1409801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1360309_1360503_1360671_1361574_1361632_1369227_1369460_1372871_1373044_1373168_1373357_1375652_1375715_1376002_1376177_1378378_1378505_1383188_1383319_1387233_1387401_1409661
892496	contig_16098_pilon	+	2191	3	Intergenic	novelGene_46210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	528.5	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	361	1035	766291	766965	FALSE	25	GGAATCTTTATTGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPSAPSAPYAPPSALVSQAAPQAPVRSTFWVPQPWEERPHNPGMVSWAEPELRPGASVFLGNPQSRRQRPGSPEPDWGLQPRVTLEQISAFWRREGRTSVGF	764795	768121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765070_765551_765638_766290
892497	contig_3747_pilon	+	2044	8	Intergenic	novelGene_24833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	91	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	329	1435	201313	204590	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDNSLELILR	200984	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203591_204563
892498	contig_18419_pilon	+	1391	2	Intergenic	novelGene_141469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	943	1263	30173	30493	FALSE	40	TAAAACCCCAACTCCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFCLLLPGASKDGAGRQSARWPWQGLYWEACDVGFSDLLSWLDGGLLFQGLLAPSAGELLKLSSSSMPLAASNWVFSSRVMSLSSSSPNSPPIRVGSPTTITS	28870	30621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_29697_30056
892499	contig_15371_pilon	-	6582	7	Intergenic	novelGene_151464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	654	986	216466	215236	TRUE	25	CCATTCTGACAGGAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIYLPGLSIMILTVIQRHLPVWSNSTGFQVAVVSGECGDEASMVDGAHRPLLLILGKVWPWKQQDIREGSAHQHLSLVDKSLGRGIGNSVEHFLYCRDADQKDWPHSGG	217119	191585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_195543_196973_198175_205109_205269_208949_209036_212974_213118_215185_215336_216233
892500	contig_1337_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_84261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATTGGATGTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565129	562502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_562500_565100
892501	contig_7009_pilon	+	4460	7	Intergenic	novelGene_23603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	283	junction_5	467.154417725017	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	47	1480	444955	537035	FALSE	25	AGGAACAGGTTGACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLQPAAARTDTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGEKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	429997	540015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430030_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_522866_523002_536325
892502	contig_11498_pilon	-	1737	12	Intergenic	novelGene_65530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	178.152363057047	5	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	206	1396	297063	284981	FALSE	35	TATTTTAAATATCATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPAERIQEIQKAIELFSVGQGPAKTMEEASKRSYQFWDTQPVPKLGEVVNTHGPVEPDKDNIRQELKELYTLLNENYVEDDDNMFRFDYSPEFLLWALRPPGWLPQWHCGVRVVSSRKLVGFISAIPAIIHIYDTEKKMVEINFLCVHKKLRSKRVAPVLIREITRRVHLEGIFQAVYTAGVVLPKPVGTCRYWHRSLNPRKLIEVKFSHLSRNMTMQRTMKLYRLPETPKTAGLRPMQKKDIPVVHQLFTRYLKQFHLTPVMSQEEVEHWFYPQENIIDTFVVENANGEVTDFLSFYTLPSTIMNHPTHKSLKAAYSFYNVHTQTPLLDLMSDALVLAKTKGFDVFNALDLMENKTFLEKLKFGIGDGNLQYYLYNWKCPSMGAEKVGLVLQ	312357	284639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_285002_285657_285796_286839_287008_287602_287774_290292_290402_291015_291187_292007_292125_292993_293086_294030_294090_296918_297064_300506_300676_312321
892503	contig_8254_pilon	-	3034	3	Intergenic	novelGene_48394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111261	104151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_104661_107496_107755_108994
892504	contig_7396_pilon	-	1960	7	Intergenic	novelGene_79544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3564.24151585345	5	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	183	620	255117	246442	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRRALQWKALQTPLSSVSLLHRPRRFACIPLVRGLLVCPFSTRKWKLSSQRRPSPTLKPMVNLVNAPQKIWKRNKHLKDLGTWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVDSLFKSDYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257490	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247819_248188_248255_254644_254701_255105_255191_257381
892505	contig_13021_pilon	+	3577	12	Intergenic	novelGene_8168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_11	1961.07086195778	81	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	169	1389	174676	178735	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440
892506	contig_14208_pilon	-	3654	10	Intergenic	novelGene_129080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	216.260359774686	524	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	369	1940	214932	111815	FALSE	60	AGAGAAAGTAAAATTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSERKRSRKSQSFKLVNRDYHHEVYTISEFSSDVNGEAKETQPIFLGDESMEIKKQITGMRRLLNDSTGRIYQRVGKEGEKLKEEPQDSDLIWPQRLNSSAEAPQSLRPSSGGTWNELPSQSRQFSGQYGTRSRTFQSQSHTAGSSNGELPVVNSSGESNCCTCNCQSTLQAILQELKTMRKLMQIQAVGTQNRQQPPISLICSQRTAVSRKRNKKKKVPPKTVEPLTVKQKPSVLETEKKTTVASEQSDLQAAEHISTEENHVLGFGIVLESPSSDPEVQLAEGFDVFMPKSQLDSILSNYTRSGSLLFRKLVCAFFDDKTLANSLPNGKRKRGLNDNRKGLDQNIVGAIKVFTEKYCTANHVDKLPGPRDWVQILQDQIKLARRRLKRGSAEVADCDERLDRVSLPPTGKKKKAGGPDTLNDFPKVCLEWLSFCLKAWLEPRSHEAQPRHHIAFLYLNQCQLLSACFLKILRGDLSHRIHNWKFVVSLPTLNPFSWSTFSNFAQGCEVINGHRNRTRLH	215374	110100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_112150_113879_113934_132888_133009_157699_157926_168730_168997_172524_172648_175610_175914_212479_212564_214871_215193_215266
892507	contig_34_pilon	-	2224	6	Intergenic	novelGene_40036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1855.23191003173	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	108	758	247052	224546	TRUE	40	TATTTGGGCATATCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	247159	222576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_222787_223243_224052_224097_224818_230228_230387_243214_243354_246970
892509	contig_13041_pilon	+	5784	5	Intergenic	novelGene_127720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_3	66.9528752183205	719	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	209	1150	250442	285257	FALSE	10	GTTAGCTCCTGGGGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATGTGVEAGFSSEELLSLRFPLHRACRDGDRAALCALLQQAPTVHLAAEDSFYGWTPVHWAAHFGKLECLIELVRAGATLNVSTTRYAQTPAHIAAFGGHPRCLIWLIQAGANINKQDYEGETPIHKAARSGSLDCISALVANGAHIDLRNASGLTAADIAQTQGFQECTQFLLNLQNCHLNCFYNNGTLNGVHQNVFPNHVSMGTNRKRSLEDSESVGVKKARIEAHSSGLCMPLVNGEAEDDADKMHVDREFAAVTGGSGQFPGNCNNNQMVEDKQRESCSLGPKEIEIYTVSAMQTPCRCKNQYAYYF	250233	289891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_250646_256719_256873_262856_262949_274929_275166_285000
892510	contig_6316_pilon	-	3355	3	Intergenic	novelGene_134724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	70	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	737	1048	202259	201948	TRUE	60	AATAAAATACTTAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQPEIIQTQQLEIQKINNKISEMDGVI	202995	168714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_169296_199136_200127_201211
892511	contig_9482_pilon	-	3063	3	Intergenic	novelGene_44217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	2	538	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1541	2323	209792	203095	FALSE	5	CTTTTTGCGTCTGCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLNDPPNWNIRPNSRAEGGDGSRWNYALLVPMLGLAAFRWIWSRESQKEIEKEREVFHQRTAAFQRDLEAKYHAIISENRRAVAQLSLELEKEQNRTASYREALISQGRKLVEEKKLLEQERARVMQEKRQLQPLRSAYQSCLEREEDWQRRARLLLKEFEDALTERQNIYCSLVLPRSKRLEIEKSLLVRASVDPVAADLEMVTGLTDIFRHDTYCGDVWNTNKRQNGRLMWLYLKYWELIVELKKFKRVEKAILEK	211942	202354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_203757_209671_209803_210412
892512	contig_2933_pilon	-	2229	2	Intergenic	novelGene_111352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	20	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	384	1643	850204	848945	FALSE	5	TCTTTCCGCGTACTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874084	848358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_850290_873786
892513	contig_10196_pilon	+	3215	4	Intergenic	novelGene_132048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	58.1626073082087	474	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2652	2972	648084	648404	FALSE	20	GAGCAGATACTGCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSFPAGRPIGFQFPRESWFSSKARRDMPSCRAQCCPVGDTVCPPHMAWDQSDDLLAALQERQGGAVNQPARVPPPLGHSSPVEPASCPLVWAQTPHTRVSPLSL	640368	648647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_642380_643339_643528_643749_643906_647787
892514	contig_14970_pilon	-	1995	8	Intergenic	novelGene_45123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	133.079384011873	802	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	693	1436	291083	268709	FALSE	65	AAAAAAAAAAACACTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315822	268149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_299911_300051_311919_312047_315339_315469_315611
892515	contig_10044_pilon	+	4250	5	Intergenic	novelGene_156385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	31.4195400984801	240	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	273	1583	148993	156192	FALSE	15	CTTAATGTGGACTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAQDSLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLFWDVMLENYNNLVSLGYRVSKPDALSRLEQGEQPWTILDESHNQNFSEIWEVDHLLGHSQNESRVDSMEQCYEHNTLENIVHRHKNHSPLRENHDMFDLDEKAVKSNLALINQNRSIEIKNSAELNRSEKTFLHVDQEQFRTESKFRESQIPNTTKSQHIKHQKTQKIEKLPVCSECGKAFIKKSWLVRHQIIHPGKGPFVCSECGKSLTQKSSLVRHQKSHRREKLFQCNECSKAFSTKHKLIIHQRTHKERRHGCNECGKTFLYMSCLFRHKIKHTRKKHVDTGKVKNPSPASHSSSHTADLMRDKNPVSTVTMQIPSVAAQTSVNTSGLLTNRNVVLVGQPVARREPSGDNREFVQQRVLMNTVNVVVPMNAVNVVVPMNAVNVVVPSVSNCILFYVPQNP	142756	158859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_142845_148808_149008_151765_151893_152150_152247_155119
892516	contig_15775_pilon	+	2469	5	Intergenic	novelGene_148365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	194.215569664226	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	15	395	172	4964	TRUE	5	CACCCCCCTCCCCTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPALTTMRTTTTSTSTIFTALL	157	15653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1829_1884_4956_5140_5730_7524_15547
892517	contig_4686_pilon	-	691	5	Intergenic	novelGene_118580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_4	268.602866701009	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	239	619	883895	760208	FALSE	70	GAAAAGTTGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRTVSRSRDIANVMQRLQDEQEIVQKRTFTKWINSHLAKRKPPMVVDDLFEDMKDGVKLLALLEVLSGQKLPCEQGRHMKRIHAVANIGTALKFLEGRKVREKQKENKNLEKTWALSSFKYCL	893036	760135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_760367_767767_767864_788890_788953_883831_884109_893011
892518	contig_17144_pilon	-	1282	6	Intergenic	novelGene_29486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1811.14511842646	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	107	997	179764	166363	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183188	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167299_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
892520	contig_2726_pilon	-	1254	2	Intergenic	novelGene_165893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTATATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170865	164616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_165382_170376
892521	contig_5018_pilon	+	1009	7	Intergenic	novelGene_47185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	51.211977765623	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	8	898	1583103	1586783	FALSE	5	CTTCTGAGTCTGTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRMEGPSEGEAPAAALAAVLKHSSALPPESAQVRGYDFNRGVDYRALLESFGTTGFQATNFGRAVQQVNAMIEKKLEPLSQEEDQHADLTQSRRPLTGCTIFLGYTSNLISSGIRETIRYLVQHNMGVKWTPSKMIARLGKEINNPESVYYWAQKNHIPVLSPALTDGSLGDMIFFHSYKNPGLVLDIVEDLRLINTQAIFAKRSGMIILGGGLIKHHIANANLMRNGADYVVYINTAQEFDGSDSGARPDEAVSWGKIRVDAQPVKVYADASLVFPLLVAETFAKKVDAFMPEKNED	1583095	1586894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1583310_1583877_1584043_1584644_1584732_1585207_1585314_1585397_1585502_1586484_1586611_1586687
892522	contig_1301_pilon	-	1794	14	Intergenic	novelGene_47313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	562.437888747038	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	601	1794	296953	269064	FALSE	45	GTAATGGTATACCAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDE	322913	269063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_300568_300616_305264_305410_309751_309912_322794
892523	contig_18272_pilon	+	2400	3	Intergenic	novelGene_7084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGATGTGGGTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539169	541837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539225_539440_541696_541747
892524	contig_3394_pilon	+	2614	3	Intergenic	novelGene_152707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_2	94.5	79	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	593	1429	518084	519723	FALSE	45	GGAAATAATGGTCACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTVLVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSDKRWHSYCLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKMEVNSESTALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQMQPLHFLDPLPLTQQPGDSLGEVNDPYTFEDGDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKVPFNLERVPHGVGFYLSRHNTCGRRLRQNV	513692	520908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_514071_517869_518602_519404
892525	contig_7528_pilon	-	2903	3	Intergenic	novelGene_178624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACATACAAACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264911	148627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7528_pilon_-_150407_231076_231767_264477
892526	contig_12125_pilon	-	3403	4	Intergenic	novelGene_76258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_2	9.39266853573691	459	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	15	668	685980	680408	FALSE	80	GGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARCVWLVRRALPVLGRPLRPAPRLLCTATKQKNSGQNLEEDSGLNEQKADPPSAEKVLLEEKAKLEGQLKEMMEKYKRALADTENLRQRSQKLVEEAKLYGIQGFCKDLLEVADILEKATQSVPKEEVSEDNPHLKSLYEGLVMTELQIQKVFTKHGLLKLNPVGAKFDPYEHEALFHAPVEGKEPGTVALVSKVGYKLHGRTLRPALVGVVKDA	685994	677672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_680755_681835_681918_683240_683404_685918
892527	contig_7963_pilon	+	2186	11	Intergenic	novelGene_58556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	171.113558784802	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	307	1119	247365	251126	TRUE	15	TACAGTGGTTTCTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQILCLPNPARCSSAEGADVHP	246575	253516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250227_250554_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
892528	contig_13481_pilon	-	2045	2	Intergenic	novelGene_119366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTACTCGCTGTCTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472105	469166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_470967_471860
892529	contig_1715_pilon	-	3288	12	Intergenic	novelGene_127174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_7	286.543752879119	180	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	268	1638	284622	248253	FALSE	15	TAGCATTGTTTTTATTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYPGWVILVGTGTLGLLLLLLLGCGWAAACAGARKKRRSQPRKREEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIAAWSSVDRGMNTSEKNSASFASLTLNSAVSGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	312158	246602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_265651_265742_267998_268236_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
892530	contig_16776_pilon	-	3961	1	Intergenic	novelGene_130520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTTTAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39975	36014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_36000_40000
892531	scaffold_12124_pilon	+	1705	3	Intergenic	novelGene_22378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1261.5	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	860	1639	1508626	1509405	FALSE	15	ACTGGAAGGCTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497064	1509471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1507880
892532	contig_16999_pilon	+	2841	2	Intergenic	novelGene_84966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	45	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	252	317	81649	81714	FALSE	25	TTCCGACCTCATGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREPETQLTECVVAEQGAARPLEDRPGLGETGGDSLRLGRGQARHPGTLGVQVPLGEYSSLQKACVWSALSEASSRVIKALAYMAGSCPEPSVAAWVSLSSSEK	50633	84238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_81568
892533	contig_6375_pilon	-	3460	18	Intergenic	novelGene_73026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	57	junction_8	273.891158641543	1235	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1147	3441	20	3460	497798	463909	FALSE	55	GAGCAAGAAGAAGAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEGKSSSVSEEKGESDDERPRKGERRSPRVRQARAAKLSECSQTAEEEEDQEAPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEEEEEEEEENEVQKSREAPILKQFEEEEEEEEMSRAKPEEVMDERPKTIRSQEEEGLEKGGRVTRSQEETRRSHLARHQQEKEMKTASPLEEKEREIKSSKGLEGNSKSPSPPQLTEDLEKVPLILQREQTASEEETLPPLLTKEPCSPSPNIQLRSEEEVDPVEGPAPPVLVQLSPPNADAEARELLVAQHTVRLVGGLSPLLSPTDTKVESPAEKMPEESVLPLVHKSTLAESSIQKGLETEPEKSAQPLPLKIEELAPPKGITEESLKQPSLEQKESKRASHTLRPSHSSKRSPDSSSSSRSSSSSSSTSRSRSRSPDSSGSRSHSPPRSKHRDGSRARSHSSPHSRLKMGSRSTSESRSRSRSHSRSRSASSNSRKSLSPRISRDSNTSYTETKDPSSGQEVATPPVPQLQVLEPKERTATSSSSIQVRRVSQPEPPEKHVRLQPEQGSPKKCEAEEAEPPAATQPQTSETQTSQQPESERIQHTVEEKEEVNMDTTENRPENEIPEPPMPIADQVSNDDRPEGSAEDEEKKESSLPKSFKRKISVVSASKGVPAGNSDTEGGQPGRKRRWGASTATTQKKPSISITTDSLKEAVVDLHADDSRISEDETERNGDDGTHEKGLKICRTVTQVVPAEGQENGQREEEEEEKEPEAEPPVAPQVSVEVALPPPVEHEVKKVTLGDTLTRRSISQQKSGVSITIDDPVRTAQVPSPPRGKISNIVHISNLVRPFTLGQLKELLGRTGTLVEEAFWIDKIKSHCFVTYSTVEEAVATRTALHGVKWPQSNPKFLCADYAEQDELDYHRGLLVDRPSETKAEEQGVPRPLHPPPPPPAQPPQHPRAEQREQERAVREQWAEREREMERRERTRSEREWDRDKVREGPRSRSRSRDRRRKERAKSKEKKSEKKEKVQEEPPAKLLDDLFRKTKAAPCIYWLPLTDSQIVQKEAERAERAKEREKRRK	497817	463908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_463969_464627_464729_464840_465166_465385_465494_465627_465736_466164_466311_466665_466808_467364_467482_467614_467749_468662_468706_472152_472295_479905_480022_480564_480778_481265_482547_483232_483322_490309_490422_496143_496210_497660
892535	contig_132_pilon	+	4920	3	Intergenic	novelGene_178625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	4270	4698	96683	97111	FALSE	50	TGATAAAAACTCTCAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNITTDPTAIKRIITEYYENLYSNKFENLEEMDKFLETHYLTKLQQNDVENLNRPITRKEIEKVIKKITNKKIPGPDGFTREFYKTFREELVPVLFKLFQSIENEATLPNSFYQDSITLIPKPGKDATKKESCRPIPLNEI	18694	97333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_132_pilon_+_19521_65837_66345_93746
892536	contig_12279_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_50115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1512	1832	69434	69754	NA	45	CAGCTCCTGTAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGKWTYLFCSARPDDIAVITWSLCPVPAEANPSKVNPSAIYAGTSSQIIPFRVHSILPRLMKSPTSVSISQKRVQGKHLMYLLLWYLLQIFDIHMIAEELLLI	67922	70198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_67900_70200
892537	contig_5260_pilon	-	3609	4	Intergenic	novelGene_144432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1416	1841	640391	639966	TRUE	40	CCTCAGGCACCAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSRNKESRNLLEEENFLELLEVEYKRLIYRTIQEIGKEIMQNAEQAKEHTDKAIEKLKKIREEHNDKFNRLQESIERQQTEIQKINNKISELDNSIKSHRSRIKAMEGRITEIEDKAHDTNLFEEKSYKSTLKMEKL	707058	637487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_637988_638458_639355_639593_640881_706132
892538	contig_4924_pilon	-	1983	1	Intergenic	novelGene_84667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGAAGTAATTTGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64924	62941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_62900_64900
892539	contig_6915_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_162414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207789	205502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_205500_207800
892540	contig_7051_pilon	-	5033	10	Intergenic	novelGene_64330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1780	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3527	3898	343665	343020	TRUE	20	CCGATTGGTCTCACCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITNLCSSWSFNMVSTNLTFPRVKTCKKRIFKRLIIIQQGQQKSPIATKTKTPHKTKTKKPTIYLSLLSGVHLWLRNKFLHLSHPEEFQSEAFLSATSFGTLSLLQSSLVHFGLLEELEMDFL	348521	321837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_330163_331794_331924_334316_334504_335891_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_345536_346865
892541	contig_12391_pilon	+	3516	13	Intergenic	novelGene_103601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.377077443138	16	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	6	1316	56804	107379	FALSE	30	CTACCATAATTTTTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQNSDFLCQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56798	109579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82480_82553_82755_82834_94095_94222_96528_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
892542	contig_10042_pilon	-	4706	2	Intergenic	novelGene_79133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	421	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGACTCACCGAGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81246	76076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_80760_81223
892544	contig_16098_pilon	-	1905	4	Intergenic	novelGene_46200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_1	382.24279660388	464	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	235	990	709001	706282	FALSE	40	AAATAAAAACCTGGCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPPASATTIAAAAATAVVAPTSTVAVAPVVSALEKKTKSKGPYICALCAKEFKNGYNLRRHEAIHTGAKAGRVPSGAMKMPTMVPLSLLSVPQLSGAGGGGGEAGAGGGAAAVAAGGVVTTTASGKRIRKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPYQCPVCQQRFKRKDRMSYHVRSHDGAVHKPYNCSHCGKSFSRPDHLNSHVRQVHSTERPFKCEKCEAAFATKDRLRAHTVRHEEKVPCHVCGKMLSSAYISDHMKVHSQGPHHVCELCNKGTGEVCPMAAAAAAAAAAAAVAAPPTAVGSLSGAEGVPVSSQPLPSQPW	709235	705366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_706431_707721_707894_708172_708237_708630
892545	contig_5947_pilon	+	4796	8	Intergenic	novelGene_101532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	286.88446085062	689	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	2511	3392	537679	544234	TRUE	15	TGTTTGGTCATGTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPISRLAQIQQAKKEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPLSVCGRC	535168	545794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_537793_539875_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543545_543632_544218_544348_544503
892546	contig_177_pilon	+	3175	3	Intergenic	novelGene_41794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	27	45	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	76	363	393462	400091	FALSE	75	AGCCTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCQEESAQLQAELARKQQEAERRDAMYQEELGGQRDLVQAMKRRVLELIQEKDNLWQKVQHLSSVAPECCVSCSKIFGRLSRRYPCRLCGGLVCHACSTDYNKRERCCPLCSRREDSQVT	393386	402903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_393536_399296_399408_399988
892547	contig_13558_pilon	+	1687	3	Intergenic	novelGene_123015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.5	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	486	1010	41136	41660	FALSE	10	AGTTGTTGTTAGTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36735	42337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655_40917_40993
892548	contig_10861_pilon	-	1907	10	Intergenic	novelGene_39456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	339.746782976984	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	549	1301	2636596	2618403	FALSE	45	TAAACTGGACAATTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVISLAEGRMFRKFRTSSWLSGRLIMSVFLISSPAHFKEVKVPETEVLLKGPRGAVCGGGVSLKPRSVPEGAGDASTENYGSGMRPPPNSLGPAMPGINMGPGAGRPWPNPNSANSIPYSSSSPGTYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSSDNIYTMINPVPPGGSRSNFPMGPGSDGPMGGMGGMEPHHMNGSLGSGDIDGLPKNSPNNISGISNPPGTPRDDSELGGNFLHSFQNDNYSPSMTMSV	2637144	2617796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2618433_2619317_2619420_2619558_2619588_2619884_2619964_2627217_2627289_2628638_2628694_2629212_2629249_2629939_2629989_2630666_2630732_2636359
892549	contig_14815_pilon	-	2506	6	Intergenic	novelGene_127207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	705	junction_3	95.0675549280616	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	72	752	22749	18212	FALSE	15	TTTTTTTCTGTGCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPELNGDVMNYYSDNEDNLFFETDGPKQMKCCFQDLDLCSPGDGGIRLQISQQHHNRSFKRVVSVIVAVEKLKTILVPCSQSFLTTIFSFIFEEEPINYDDAYECDAAVLSLNCRLRDIDQKCLVLSGPCELQALHLNEQDIDRQVVFSMIFVQGEINQEKIPVALGLRGKNVYLSCVMSNGKPTLQLEVSEYQRLRVLLRHPSKHPHHHLLPRQPPSPSQKI	23306	16457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14815_pilon_-_18448_19747_19901_20917_21111_22059_22112_22702_22765_23250
892550	contig_12079_pilon	-	1281	2	Intergenic	novelGene_67571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_1	0	376	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAACTAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872424	870553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_871725_872314
892551	contig_14876_pilon	+	1660	4	Intergenic	novelGene_170240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	330.325428765163	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	142	816	38853	51898	FALSE	40	ACAAAGGAATAAGGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSGSAQRWAASAGRWGCRLLALLLLVPGPSGASEITFELPDNAKQCFYEDITLGTKCTLEFQVITGGHYDVDCRLEDPDGNVLYKEMKKQYDSFTFTASKNGTYKFCFSNEFSTFTHKTVYFDFQVGEDPPLFPSENRVSALTQMESACVSIHEALKSVIDYQTHFRLREAQGRSRAEDLNTRVAYWSVGEALILLVVSIGQVFLLKSFFSDKRTTTTRVGS	38605	52742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_38676_38781_39045_45402_45649_51661
892552	contig_14445_pilon	+	1706	8	Intergenic	novelGene_137371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	203.017944315978	13	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	11	553	331159	360205	TRUE	25	ACTGACGTTTCAGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	331148	361470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095_360238_360349
892553	contig_14792_pilon	+	6148	14	Intergenic	novelGene_170487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_13	88.5723052338476	888	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	215	1681	69356	101216	TRUE	25	AGCCTTGCAACCTTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVFEPYFEILEVYSTKAKNYVNGHCTKYEPWQLIAWSVVWTLLVVWVYEFVFQPESLWSRFKKKCFKLTRKMPIIGRKIQEKLNKAKDDINKNMSFLKVDKEYVKALPSQGLSSSAVLEKLKEYSSMDVCWQEGRASGAVYNGEEKLTELLVKAYGDFAWSNPLHPDIFPGLRKIEAEIVRMACSLFNGGPDSCGSVTSGGTESILMACKAYRDLAFEKGIKTPEIVAPQSAHAAFDKAANYFGMKIVRVPLNKMMEVNVRAMRRAISRNTAMLVCSTPQFPHGVIDPVPEVAKLAVKYRIPLHVDACLGGFLIVFMEKAGYPLEHPFDFRVKGVTSISADTHKYGYAPKGSSVVLYSDKKYRNYQFFVATDWQGGIYASPTIAGSRPGGISAACWATLMHFGESGYVEATKQIIKTTRFLKSELENIKGVFVFGNPQLSVIALGSHDFDIYRLSNLMTAKGWNLNQLQFPPSIHFCITLLHTRNRVAIQFLKDIRESVTQIMKNPKAKTTGMGAIYGMAQATVDRNLVAELSSVFLNSLYSTDTVTSGSQMNGSPKPR	38961	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_39129_69308_69377_77935_78084_80996_81074_83912_84042_90455_90545_94562_94669_95483_95583_96264_96415_97961_98201_99341_99489_100393_100515_101075_103917_105000
892554	contig_3009_pilon	+	5698	2	Intergenic	novelGene_132504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1302	139	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	2334	2780	21420	64326	FALSE	25	TCTAGGAAATTTTTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIQPAPNSLCLLISPLDRSCPFRLMYLLELRSTHFTSIILCPRIQSNFCRKSWPQKLFYFRVNRESGGHDFWGSSSLSQTIKSGLFTRICFLHPTFLLLHQGLSVVFPVRAVTGSSQAPFSSSGLRLMKPLVYVSLSVSWDYLFHSA	19086	67244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_21847_64306
892555	contig_8377_pilon	-	4756	19	Intergenic	novelGene_35112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.60104442460436	4	163	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3969	4304	164142	163807	FALSE	25	TCCACCAGCTCTTAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLEKRQKEGRKEQNGRERKGTERKGKRSKGKERRGGKRRERGRGEGRGGKGRKGKGRGGKGGEGREGRVGKGREGKGREGKGREGMIAGKPLRVDKETIKETEKPQTDR	199250	163354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_164589_169245_169304_172899_173004_173644_173685_176607_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182893_183046_183259_183403_185670_185811_189175_189270_191115_191253_192215_192393_194294_194521_196079_196217_197660
892556	contig_4211_pilon	-	2693	4	Intergenic	novelGene_80232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	71.6147098483731	378	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	215	733	525546	506929	FALSE	45	CAAAAGGTAAACTTTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSGMAPGPFAGPQAQQAAREVNTASLCRIGQETVQDIVYRTMEIFQLLRNMQLPNGVTYHTGTYQDRLTKLQDHLRQLSILFRKLRLVYDKCNENCGGMDPIPVEQLIPYVEEDGSKNDDRAGLPRFASEERREIAEVNKKLKQKNQQLKQIMDQLRNLIWDINTMLAMRN	525760	504968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_507025_516765_516871_519007_519167_525387
892557	contig_5549_pilon	-	1948	11	Intergenic	novelGene_81686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	781	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCTCCTTGACAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907962	752127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_752559_829984_830175_831602_831795_842369_842573_844241_844423_852661_852818_854421_854533_875989_876058_882458_882561_887195_887365_907817
892558	contig_10000_pilon	-	4632	29	Intergenic	novelGene_139296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_24	272.898921633215	390	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1173	3522	181	3702	313036	159846	FALSE	15	AATGTGGCCTCTTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDDSSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQEMEEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATGHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	324807	158915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_192582_192801_225789_226009_234052_234131_236640_236869_244288_244453_255345_255513_260138_260186_262201_262289_262894_263003_270842_270957_273197_273441_280591_280703_281388_281456_283019_283184_284782_284931_285837_285939_286746_286805_287001_287133_291412_291467_306629_306801_310657_310832_312886_313061_315101_315229_324778
892559	contig_6938_pilon	-	1781	11	Intergenic	novelGene_69062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_4	326.306006686975	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1082	1774	162386	137993	FALSE	45	CTGTGCAAGAAAGAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGKLIENVDPEKAVQLYQQTANVFENEERLRQAVELLGKASRLLVRGRRFDEAALSIQKEKTIYKEIENYPTCYKKTIAQVLVHLHRNDYVAAERCVRESYSIPGFNGSEDCAALEQLLEGYDQQDQDQVSEVCNSPLFKYMDNDYAKLGLSLVVPGGGIKKKSPATPQAKPDGTTTTAAEEEEDEYSGGLC	169237	137985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138137_139249_139380_139953_140034_141959_142039_157629_157701_157886_157954_158074_158185_162374_162406_163240_164090_165469_165538_169092
892560	contig_5944_pilon	+	4656	3	Intergenic	novelGene_178302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	3270	3728	192691	193444	FALSE	25	GGAAGTCATCACAGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVACPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRDLISAAAQT	45906	194372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_+_47002_190516_193095_193389
892561	contig_13702_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_102631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2057	2356	211071	211370	NA	40	CCAAGGATGGAAAGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	209014	211548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_209000_211500
892562	contig_14986_pilon	+	2033	2	Intergenic	novelGene_59727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	745	1308	151004	151800	FALSE	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIGIR	150259	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151557_151789
892563	contig_610_pilon	-	3223	8	Intergenic	novelGene_76672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_7	501.231585238616	62	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	47	760	68933	32982	FALSE	30	ATTACTTGATGGCAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EECLSCPQKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTCRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKFPSLEYAKREDKPSSVTGLYILEI	68979	30518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34112_34187_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_68887
892564	contig_5779_pilon	+	1826	4	Intergenic	novelGene_106484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153009	310577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_153592_279421_280043_281774_281808_309987
892565	contig_10765_pilon	-	4311	1	Intergenic	novelGene_122960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1931	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTTTAAAAAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374192	369881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_369900_374200
892566	contig_5429_pilon	+	2206	12	Intergenic	novelGene_127802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	216.586020168042	14	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	249	1367	460515	498957	FALSE	45	GGAAATTTCATACACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLVDTHIHAPQYSFAGSNLDLPLLEWLTKYTFPTEHKFQNIDFAEEVYTRVVRRTLKNGTTTACYFGTIHTDSSLLLAEITDKFGQRAFVGKVCMDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLGPVFKLRVKTLGFLRMFFWDSMVLGLPSAQEELESQKKKKNSTLFLG	427783	499796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_428022_460504_460677_463724_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495648_498812
892567	contig_5039_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_65030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGAATATGGAAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1786701	1789475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1786700_1789500
892568	contig_16492_pilon	-	3798	11	Intergenic	novelGene_100312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2711	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGAGCTGCTAAGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196355	171524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_171648_172050_172297_177799_177927_184040_184282_187435_187495_189447_189919_191926_192227_193408_193539_194007_194104_194182_194264_194431
892569	contig_14684_pilon	-	2108	4	Intergenic	novelGene_99648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.5221667458903	373	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTATTTGTTTGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64746	58704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_58807_60068_61782_62953_63097_64596
892570	contig_5238_pilon	-	2037	2	Intergenic	novelGene_176254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	67	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCAATCTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76296	50254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_51278_75282
892571	contig_8412_pilon	+	4928	1	Intergenic	novelGene_118403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	727	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGCTCAGTTTATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804983	809911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_805000_809900
892572	contig_15518_pilon	+	3736	5	Intergenic	novelGene_127605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	202.39982089913	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	556	1104	15096	37386	TRUE	30	GTAATCTGGATCTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11075	40665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_37273_37389_38035
892574	contig_5041_pilon	-	3300	18	Intergenic	novelGene_27061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	705.428869038797	234	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	126	2063	620136	532211	TRUE	15	TCAGAGTACCGTGTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSLSIIIDRYTMTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRWRRCCFLSR	636080	524621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532757_532940_554550_554623_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_620101_620169_635987
892575	contig_17989_pilon	-	2632	2	Intergenic	novelGene_150820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	956	1447	211223	210732	FALSE	70	CTCAGCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEELQAALKTLVKNKGPGIDGIPVEMFQQTVAVLEVLTHLCQEIWKTASWPTNRKTFIFVRIPKKGDPTECGNYQTVLLISHTSKILLKIIQKQLQQYIDRELLEVEARFRRGCGMRAIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCVVHNELWITL	267865	209546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_212162_267848
892576	contig_6364_pilon	-	1736	4	Intergenic	novelGene_51833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	782.155284383407	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	133	348	1603855	1603291	FALSE	10	GTGATGGCTTCTGTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVITRIIKEALPDGVNISKEARSAISRAASVFVLYATSCANNFAMKGKRKTLNASDVLSAMEEMEFQRFVTPLKKDKDKKTDSEEQDKSRDEDNDEDEERLEEEEQNEEEEEVDN	1604446	1601902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1603420_1603768_1603872_1604236_1604323_1604416
892577	contig_2799_pilon	+	1738	14	Intergenic	novelGene_85510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	759.176819843034	94	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	103	1737	607928	755379	FALSE	25	GACGGTCCCAGCAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSFSLEGLTGGADVRNKPSSSLEANSANTKELRHPFSVEARGDSLVSLSEEDLESGQRERRMFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFAN	604731	755380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_604832_607925_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191_699246_704625_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302
892578	contig_8914_pilon	+	937	6	Intergenic	novelGene_112867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	606	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	365	685	265577	267418	TRUE	25	CATCCTGCTGCTCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLQFIDHFFQVICLHLSGHDFHHFLPDLADLLVLSIRRLPNLIVAFFSKTNTEETKQITIGSLDINMSFNHGLPFFDHGAHFVTGKIHAMEVGQAVFALNILSN	264522	268941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264688_264840_264965_265501_265799_267319_267508_268075_268179_268881
892579	contig_960_pilon	-	2395	20	Intergenic	novelGene_108228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_18	365.11333192908	11	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2145	249	2393	487192	427969	FALSE	55	AAATAAAATACTTCACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITDLVKNTKGNTLKEDWIAYISREILRGLAHLHIHHVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPADLTALAKELRAVEDVRPPHKVTDYSSSSEESGTTDEEDDDVEQEGADDSTSGPEDTRAASSLNLSNGETESVKTMIVHDDVESEPAMTPSKEGTLIVRQTQSASSTLQKHKSSSSFTPFIDPRLLQISPSSGTTVTSVVGFSCDGMRPEAIRQDPTRKGSVVNVNPTNTRPQSDTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTESGLMLLDRSGQGKVYPLINRRRFQQMDVLEGLNVLVTISGKKDKLRVYYLSWL	495643	427966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_428010_430724_430869_436239_436411_436729_436848_440053_440175_440650_440827_442977_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758_489850_495560
892581	contig_10734_pilon	-	2558	2	Intergenic	novelGene_51527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	259	348	2305060	2283963	FALSE	75	AAAAAAAAAAAATACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTEVRPIGLGSSCLSSAVSGTAARARPHLAVSGGAPSYGFLLRTGTSHFCSTGACRGLGAGKGGHWSSPEWGAASLAPCRPAAAGKMFSSMRRTFICNRTKCCPVLHHLHDRWYV	2305318	2281752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2284029_2305036
892582	contig_14970_pilon	+	5543	1	Intergenic	novelGene_45065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	4020	4358	203144	203482	NA	70	CTGACAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEVAPVLMEKTGPRNHSLLSFTVSIMTMRRPSILPEQVRRMVVKSSGLDKLVKSSHRVEEILCRHWLHLLLPFSCQDYTQFLKTGKKMLTCQVVQKTKMFKKYIWDMIFV	199124	204667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_199100_204700
892583	contig_11378_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_112269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGATGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407279	409785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_407300_409800
892584	contig_7839_pilon	+	1771	9	Intergenic	novelGene_45722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	703.372489776932	38	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	99	1502	952473	956984	FALSE	20	GATGCTGTTTTATACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKNLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950900	957253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954506_956104_956153_956428_956763_956877
892585	contig_8597_pilon	+	4751	23	Intergenic	novelGene_158704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	545	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	4009	4491	185333	185815	FALSE	20	TCTGAAAGGGGCTGCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPLYLQRKAISTNFLCGGFAAAGRRSRNLRVTRCARFPLLPLTEGISALQTPGQQRPTAARTPKVASHPAAPHDSRQSRRHQPSRSGEVLQPSGPRPPSQWRVPRPEMGRRRERKRSRVETPSGQAREGEEEREKRRAGEELCQLLPPLGPPARPAPL	41371	186075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53379_55223_55387_58900_59054_60321_60427_72322_72570_72667_72760_74922_75058_80137_80188_83839_83929_86760_86822_92312_92473_97443_97540_101452_101585_101929_102078_104011_104098_104982_105159_107805_107941_108488_108593_148857_148939_185226
892587	contig_34_pilon	-	4820	6	Intergenic	novelGene_39988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	671.245528849169	362	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	3526	4548	235823	212049	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNIAMIEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	239348	211776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224810_235799
892588	contig_2069_pilon	-	2395	1	Intergenic	novelGene_23432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329498	1327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1327100_1329500
892589	contig_12622_pilon	-	2303	3	Intergenic	novelGene_5895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCCGTTCCTCACGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1541716	1535674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1535776_1538256_1538448_1539705
892590	contig_11719_pilon	-	1815	6	Intergenic	novelGene_154782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	34.8	589	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	170280	166362	TRUE	10	CTGGAGCCTTTTTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSSPEPGLRSSNWDSEPGLFLALARLQEGIRICYQRRRSQAGPQRPAPSLPAALSAHRRPAAELAHPSHCSICSVERREDERIELEVQPALGLQAGKGRH	170281	160790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_162127_163481_163533_164244_164329_166324_166470_169847_169956_170190
892591	contig_7138_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_120985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGCCATGTTCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159879	161932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_159900_161900
892592	contig_14441_pilon	+	1338	7	Intergenic	novelGene_100325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	409.474459928007	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	753	1301	125667	126705	FALSE	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5707	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_5900_5981_6042_6604_6905_121820_121872_125517_125902_126159_126283_126514
892593	contig_12869_pilon	+	2564	3	Intergenic	novelGene_75349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	557	junction_1	62.5	20	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	882	1463	85646	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	84764	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_85694_94365_94433_96917
892594	contig_9098_pilon	-	2135	13	Intergenic	novelGene_75830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	165.883744431655	6	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	183	1544	350397	335775	TRUE	55	CAATAAATGGAGACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350579	333366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_333559_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350378
892595	contig_19402_pilon	+	5321	17	Intergenic	novelGene_80767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1260	junction_11	1205.78468842648	4819	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	10	2391	23458	143056	TRUE	20	GGACTGACTGTGAGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802
892596	contig_6513_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_117761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGCTTTTAAGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151932	149918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_149900_151900
892597	contig_14807_pilon	-	849	6	Intergenic	novelGene_124655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	7451.73664054226	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	260	751	38669	37247	FALSE	5	GTCTGTGGTCTGCATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39743	37148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38893_39620
892598	contig_854_pilon	+	2121	5	Intergenic	novelGene_36754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	15.9275704361965	456	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	533	1537	1739485	1745937	FALSE	65	TTAAAAAAAAAGATAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSETQDIIEDVIEYLKNGISQEELQLLLSEDQDWERFQVEADLSRDEADILHEALNKLRMDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722262	1746521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722669_1737993_1738042_1739406_1739516_1743412_1743540_1745090
892599	contig_6374_pilon	-	5865	3	Intergenic	novelGene_158432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCACAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261611	34002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_39288_182492_182714_261252
892600	contig_16411_pilon	-	4002	17	Intergenic	novelGene_77272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3003	3380	54769	41235	TRUE	35	TGTGGGGAGAAAAGCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQPKLSAAYLLHKSELRGIDHPFPISQPCRDRGFLPPGTNGIPESGDQASSIVLVVIDEERDGIKHILFSHVVSLGVIICFFDVIVLYTGVVLTYDALGENRHSVCSWSPGISYHKGSFFACVQ	69477	18705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_18809_20429_20513_21949_22080_26145_26187_30828_30983_35168_35237_41191_41247_49546_49626_50886_51023_51402_51479_54694_54868_56905_57120_58324_58391_58479_58600_62459_62617_66388_68084_68825
892601	contig_6914_pilon	-	2831	5	Intergenic	novelGene_151714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	15	311	21771	19474	TRUE	35	AGACATACCATCACCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLPNMERAHSPTASASVPTAVQSDPASVTLTQLLQLVQQGQELPGLERHNIVATQGEPTASRLPRRPKPWEATDSVASRPPPTLGIWSQKTTRGRNLADQSW	21785	15157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_15329_16339_16482_17099_17210_17376_19529_21529
892602	contig_15407_pilon	+	2748	10	Intergenic	novelGene_123097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_7	19.4580904497491	292	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	52	975	535130	591712	FALSE	40	TTATTACTAAAAACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALDRVVKPKTKRAKRFLEKREPKLSENIKNAMLIKGGNANATVTQVLKDVYALKKPYGVLYKKKNITRPFEDQTSLEFFSKKSDCSLFMFGSHNKKRPNNLVIGRMYDYHVLDMVELGIEKFVSLKDIKNSKCPEGTKPMLIFAGDDFDVTEDYRRLKSLLIDFFRGPTVSNIRLAGLEYVLHFTALNGKIHFRSYKLLLKKSGCRTPRIELEEMGPSLDLVLRRTHLASDDLYKLSMKMPKALKPKKKKNISHDTFGTTYGRIHMQKQDLSKLQTRKMKGLKKRPAERKTVEKEENKSKRIKKN	535078	593485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_535153_537831_537965_542846_542885_547222_547263_555461_555544_556273_556351_566034_566135_584666_584770_590554_590700_591529
892603	contig_16622_pilon	-	2420	3	Intergenic	novelGene_48486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1664.5	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121966	111933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115273_121470
892605	contig_4924_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_84651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65045	62871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_62900_65000
892606	contig_5954_pilon	+	281	3	Intergenic	novelGene_28441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3853	junction_1	607.5	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGCCATTTAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98088	99008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_98163_98637_98694_98857
892607	contig_20875_pilon	+	1339	12	Intergenic	novelGene_153101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	275.465376324719	696	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	181	717	59053	62920	TRUE	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESYPAVPPIWSVESDDPNLAAVLERLVDIKKGNTLLLQHLKRIISDLCKLYNLPQHPDVEMLDQPLPAEQCTQEDVSSEDEDEEMPEDTEDLDHYEMKEEEPAEGRKSEDDGIGKENLAILEKIKKNQRQDYLNGAVSGSVQATDRLMKELRDIYRSQSFKGGNYAVDLVNDSLYDWNVKLLKVDQDSALHNDLQITFPLTRHLSGLCLQSSPEGMSWVEVPSAWNFSPNRAGAVPTR	58546	64339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_58652_58977_59083_59687_59739_61316_61458_61638_61724_61984_62046_62249_62286_62451_62511_62609_62659_62895_62992_63311_63380_63856
892608	contig_5084_pilon	-	3221	9	Intergenic	novelGene_64634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_4	65.4072578159335	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	941	2062	1337412	1328304	FALSE	30	GTAAACCCATCTGCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLEVVWNRFYKEVYFLPVNIRFLSMFQFNLCCCFLSPVPPPPPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQSVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTRKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCLGGNGYINDFPMGRILRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH	1338352	1327144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330262_1330746_1330841_1333776_1333874_1335200_1335338_1335727_1335822_1337106
892609	contig_2799_pilon	+	5088	6	Intergenic	novelGene_85581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	823	junction_2	28.4717403753266	47	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	936	2144	771735	780522	FALSE	25	AAACTTGCCACCTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVWHVSFFPVEILQGLVSGSLGGTLGPAVSSLIEQEGMVGPVSLPRRAETFGGFDSHQMNASKGGEKEEGDDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLGFMLKRNSEVIQSIVHLHELLSTLQGVVLQQDSYIEDQKLMLSERALTRSSSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQHLEEKRRREREWEARERELLEREARLAQWEEKVQRGQQDLERDREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLKRDTEQLSQRRIEGDVCQVSHQHTKTMRIPSFCPNPEESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGGEYTHPPAPGSEEWGLRFQKGIF	770799	783466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_771928_772374_772446_772916_772962_776043_776092_777677_778128_780120
892610	contig_6724_pilon	+	7001	4	Intergenic	novelGene_167989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	153	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3034	3468	580248	580682	TRUE	65	AAAAGAAATTGAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSVHQEDITIINTYSPNDRAPKYRKQTLTALKREIDNSTIVVGDFITPLLVKDRTSRKKLSKDTEELNATVNQLDLIDIYQTLHPIAAKYTFCSSAHGTLSRIDHVLGHKATLNKIQSIEILQSIFSDHKPIKVQINNRKS	424776	584683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_425169_577529_579209_579285_583709_584176
892611	contig_5317_pilon	-	3831	23	Intergenic	novelGene_76580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_14	254.529544957355	978	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	32	1960	401580	373913	TRUE	10	TTTGTGTATTGTGTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESSDKLYRAEYAKSGRASCKKCKENIPKDSLRMAIMVQSPIFDGRVPHWYHFPCFWKVGHTLLHPDVDVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVAGKGQDGSDGKVEKTLSDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQMRLSKKMLDPEKPQMGVIDRWYHPNCFVQNREKLGFRPEYSVSQIVGFPLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKIKKQDRLFPPEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGKPLSNMKILTLGKLSRNKEEVKTMIEKLGGKLTGTATKASLCISTKKEVEKMTKKMAEVREASVRVVSEEFLQDVSGSTRSLQELLSVHVLSSWGAEVKVEPAEVVAPKAKSGAALPKKSKGAVKEEGVNKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	401611	354927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356343_356925_356988_357964_358093_361103_361257_361766_361866_364146_364276_364800_364924_366581_366666_370358_370488_373902_374100_375290_375424_375690_375760_376055_376299_377191_377333_379075_379221_381031_381209_381934_382052_384128_384229_386643_386859_388796_388913_394982_395149_401460
892612	contig_7963_pilon	-	3903	14	Intergenic	novelGene_58460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	644.234374272347	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	1839	2993	123394	120628	TRUE	5	TCCTCCTCTTCATCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLTEVDGKLNRSGWEDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	129554	118256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123343_123500_123746_124051_125563_126910_129471
892613	contig_4496_pilon	+	3302	11	Intergenic	novelGene_66666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	178.365607671434	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	641	3025	911498	998163	FALSE	60	GGAAAAAAAAAAAGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859277	998440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_878530_878627_881174_881325_891913_891995_899756_899893_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
892614	contig_10074_pilon	-	2524	11	Intergenic	novelGene_57175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.8515230187	883	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1572	2015	559388	558945	FALSE	20	GAGGCCCGTGGCCAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASSMSPADLYGISDASMLSDCSVDMMASCNESMRETDNHRLVSMHLDSPTCTSVLDPRNLRQLCPMASSGGSGASSTAAAFVSQPDAFEGSSFGCASNGLIHESGAADSTNPGSHGFVQSGQYSGISTMPNEQLGDSFAYEFFQV	596859	558435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_559620_559669_559724_560818_560891_561019_561089_561859_562073_562179_562285_563750_563892_577107_577200_583722_583872_586186_586330_596557
892615	contig_6102_pilon	+	2694	19	Intergenic	novelGene_31914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	420.944605751293	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	472	1368	379014	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	375445	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393710_393856_393929_394036_394221_394272_394467
892616	contig_4402_pilon	-	2084	2	Intergenic	novelGene_140790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAAGTACTTCACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188050	182680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_184388_187673
892617	contig_11719_pilon	+	1714	5	Intergenic	novelGene_154784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1179	1604	161975	166233	TRUE	5	CGCTCATCTTCCCTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGPGERDRGVGAEQSCPVPEETAPRVGSGAGCHCSSSEDSCEMPSSSSFSYGFLGLPLGFLPGAVVVFRVLAAPLFLLPFGRPRGLLGVGTSLGSFSRSSAPSSLLWSQEALARVRMRVGYVHARARNDSAPLRSHFRLL	160796	166419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_162133_163484_163533_164244_164329_166097_166248_166323
892618	contig_12414_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_59588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	874	1944	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372110	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372100_374600
892619	contig_11709_pilon	+	2909	2	Intergenic	novelGene_168223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	222	1079	69472	70329	TRUE	45	AAAAAACTGTTATATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHPGNQAESSKFPFGIHQAKSHRNIKLLEDEPRSRDETPLCTIAHWQDSLAKRCICVSNIVRSLSFVPGNDAEMSKHPGLVLILGKLILLHHEHPERKRAPQTYEKEEDEDKGVACSKDEWWWDCLEVLRDNTLVTLANISGQLDLSAYTESICLPILDGLLHWMVCPSAEAQDPFPTVGPNSVLSPQRLVLETLCKLSIQDNNVDLILATPPFSRQEKFYATLVRYVGDRKNPVCREMSMALLSNLAQGDALAARAIAVQKGSIGNLISFLEDGVTMAQYQQSQHSLMHMQTAPLEPPSVDMMCRAAKALLAMARVDENRSEFLLHEGRLLDISISAVLNSLVASVVCDVLFQIGQL	69250	72200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_71328_71368
892620	contig_9468_pilon	+	1354	14	Intergenic	novelGene_59452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	286.746057994086	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	202	729	172913	200387	TRUE	60	GTAAAAGAGAGAAAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEERRKEKA	150446	206018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189671_189702_189792_189890_200363_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
892621	contig_15327_pilon	-	1519	12	Intergenic	novelGene_70787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	139	junction_11	98.880844897297	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	97	1239	1192720	1185925	FALSE	45	GGAAAGGAGAGAGAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASLGLRSGAGESLTAPTKRLRGPAVSAGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1192816	1185644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585
892622	contig_11855_pilon	-	2181	13	Intergenic	novelGene_67150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	242.285113840881	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	508	1353	2718660	2710017	FALSE	35	AATAACCCTGAATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731354	2709188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718745_2719642_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
892623	contig_3386_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_34577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACAACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480439	478749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_478700_480400
892624	contig_987_pilon	+	3991	7	Intergenic	novelGene_72314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_5	37.5455279183376	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	87	2876	991457	1236483	FALSE	85	CAAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DESEALLRLGGGAGEKWQQGLRWSQRNGMCESYSRSLLRVSVAQICQALGWDSVQLSACHLLTDVLQRYLQQLGRGCHRYSELYGRTDPILDDVGEAFQLMGVNLHELEDYIHNIEPVTFPHQIPSFPVSKNNVLQFPPPGSKDAEERKEYIPDYMPPIVSSQEEEEEEQVPTDGGTSAEAMQVPLEEDDELEEEEIINDENFLGKRPLDSPEAEEMPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPKEKERKKDKKEKKKKKEKEKEKEKKEKEREKEKREREKKEKEKEKHKHEKIKVEPVVPAPSPVIPRLTLRVGAGQDKIVISKVVPAPEAKPAPLSRPKTPPPAPAAAPVPLHLTPSLVPLPLLAQSTASPALVPSPSPAVSGAGSSKAPVRSVVTETVSTYVIRDEWGNQIWICPGCNKPDDGSPMIGCDDCDDWYHWPCVGITTAPPEEMQWFCPKCANKKKDKKHKKRKHRAH	991370	1237598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_991623_995960_996204_1169536_1171360_1193952_1194036_1231518_1231772_1235359_1235467_1236368
892625	contig_14142_pilon	+	4819	2	Intergenic	novelGene_120571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	991	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCCTTCCGCAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473512	478816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_478022_478506
892626	contig_5649_pilon	+	3924	2	Intergenic	novelGene_82451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	709	1104	1511291	1511686	FALSE	65	CACAATAAAATATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQPESSTATWCPATPTDCSDLDQNRGFWTELEKNVDQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESIAPRYPFSSVVKSLPRFTVQPGCGQPHMGLMGHSSPETRGRRQKGIGKLVIGNPRLSKDSVDVL	1510459	1514506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1510652_1510774
892627	contig_9415_pilon	+	6665	36	Intergenic	novelGene_109897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	812	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2997	3308	2101375	2104095	TRUE	30	AATAAGCTTGGGATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSHLDFNLNVSLSCSDPILNYTDAIGHSLRWLLHVQQCLNQSILLETAASQMSAVRMTGSLSLTCFLPERRYPFPPSPTTGQGSGEVPLSEVLPLAAVVPLQ	2080487	2158878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2080642_2082733_2082931_2084479_2085228_2087126_2087653_2088411_2088495_2088868_2089112_2090092_2090265_2095487_2095604_2096125_2096227_2097570_2097731_2100494_2100688_2100837_2101077_2101310_2101443_2102078_2102288_2104060_2104325_2111367_2111422_2116865_2116989_2117466_2117780_2120429_2120601_2122307_2122429_2122516_2122632_2125823_2125998_2127864_2128086_2130489_2130685_2133328_2133460_2133588_2133741_2137011_2137235_2138234_2138359_2148511_2148679_2149004_2149143_2150330_2150503_2150607_2150754_2154364_2154490_2155929_2156073_2156667_2156765_2158855
892628	contig_7870_pilon	-	1296	7	Intergenic	novelGene_108914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	466.341940592475	57	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	31	816	497901	217271	FALSE	80	AAGGAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFSRSQQYQEMSSFYSQILSSSHWIGSTLSKMQLTDCKIIRPNCYFQPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTK	497931	216790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496626_497821
892629	contig_8640_pilon	+	2636	1	Intergenic	novelGene_117727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	342	794	4186	4638	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKDSLFNKWCWLNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKSIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWENIFGQYKSDKGLICIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAK	3844	6480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8640_pilon_+_3800_6500
892630	contig_21013_pilon	+	3306	2	Intergenic	novelGene_38526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	414	junction_1	0	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1436	1924	84004	85337	FALSE	25	ATCAATGTTGAACTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQQQNMQQPMNVMTQSFGAVNLSSQSNMLPVRPQTNPLMGGPMPVSMPNVMTGTMGMAPLGNTPVMNQSMMGMNMNIGMSSPGMGLSGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFTNFNK	82568	86719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_84146_84990
892631	contig_9177_pilon	-	2032	13	Intergenic	novelGene_32601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	847.004706139359	4	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	359	1597	7310	2152	FALSE	10	CTGTAACCTCTGCCGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	8590	1716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2727_3466_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487
892632	contig_401_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_42845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCAGCAGCAGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713503	1715434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1713500_1715400
892633	contig_9903_pilon	-	4447	7	Intergenic	novelGene_172003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	37.4685052929642	790	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	211	801	106166	82602	FALSE	35	GAAGGAAATTTGAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCEKAMELIRELHHTPEGQLPAFNEDGLRQILEEMKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106376	78955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106091
892634	contig_7173_pilon	+	1963	1	Intergenic	novelGene_37536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	734	1150	223558	223974	NA	55	TCCTAAAAAAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMDCFCLVTFHLYLNNFILGLKCSSCEPFPDGATNNLSRSNSDESNFSEKLRASTVMYHPEGESSTAPFFPTDSSLNLPVLEVGRTENTIFSSAMLPRPGDPGAPPLPPELQLEEGGTCGSSSEMFLPLRSRAVSQQ	222824	224787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_222800_224800
892635	contig_11364_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_65183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	960	1298	206535	206873	NA	35	AACATTCAGTAATGGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKEDFKGWTRRERKQEEMRSILGRENSSSGKGVRREYHFGERRVGIHLVQCLQQAQSLCGRLCENPLPLNAPHHGQSPHCGLQHHELLVPSRAAIVSAAHVHSFYSTTFS	205575	207629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_205600_207600
892636	contig_12964_pilon	-	2394	2	Intergenic	novelGene_131699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558914	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556773
892637	contig_13542_pilon	+	1345	7	Intergenic	novelGene_131479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_3	1178.59346492145	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	289	588	487955	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346516	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454028_487923_488024_499871_499938_500886_500964_505501
892638	contig_4812_pilon	-	2900	7	Intergenic	novelGene_103710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_5	660.076931543252	461	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1839	1060	2898	944244	931924	FALSE	25	TAATTCCACTTCACTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTAFDKERMDKDLGSVQGFEDINKSERTESVEAGDDDSKLDDAQSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDWSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFTKVKETCQRLLEKPK	952245	931921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_932124_933365_933519_935594_936111_943274_944451_944834_944939_946403_946960_952052
892639	contig_16303_pilon	-	2107	8	Intergenic	novelGene_34073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	271	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	37	1149	47976	35759	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48012	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33877_35588_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
892640	contig_17144_pilon	-	3245	16	Intergenic	novelGene_29538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1807.5570180034	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	1367	2971	173384	166363	FALSE	20	GTTTTTTTCTTTCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
892641	contig_5871_pilon	-	743	6	Intergenic	novelGene_160173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	500.659964446929	329	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	198	743	342910	311833	FALSE	40	GTAAGTTATAGTGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIHHQRHSLSKTAYQASLSPCSVNVQVLNRHFAAATKPAKKKKGPKEKASDEKKNEIEKIKSYPCMEGEPEDDVYLKRLYPRQIYEVEKAVHLLKKYQILDFTYPKQGVYLDLTLDMSLQKKKKVEPFASVLNLPYPFTSEINKVAVFTGNASETKIAEENGAAFAGGTNLIEKILADEVHADFYVAVPEIMPELNPLRKKLKKRFPKLIRKSIGRDIPKMLELFKTGHEIEVDEERENFLETKIAT	364225	311832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_311940_332312_332425_338469_338542_339568_339653_342739_342996_364113
892642	contig_9481_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_149695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584221	583265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_583300_584200
892644	contig_2924_pilon	+	2664	17	Intergenic	novelGene_140242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	420.032955366302	98	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	95	1969	17893	303804	FALSE	30	AGTTTATTTAGCCACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSAAKAASATDLAEIEIKKEMKKDPLTSKAPEKPMHEVSGGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPETLPNRTEEKEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSVSRPIAMPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEDDKEEHVSLAHRGADASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGAMAAGGGPAPLSAAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	17798	304499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_17944_66034_66159_125503_125608_135679_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847_221956_236286_236339_239711_239793_242630_242782_259354_259441_287622_287733_293259_293389_297301_297568_302765_302830_303762
892645	contig_6544_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_142071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	492	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38192	40225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_38200_40200
892646	contig_7322_pilon	+	5127	10	Intergenic	novelGene_164907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	107.446225424743	1177	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	146	1681	221528	236335	FALSE	60	ATAAAGAATAAAATGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEAERDRRQRRVGRQGPPELQPRAKRRRPRRSCLARAAARGEARKGSSMASVLSRRLGKRSLLGARVLGPTASDGPPGTVQPLEPQVELLERAAPQPFLAYKDSSCPEQPKEVLKAPGISGLQQVAFQPGQKVYVWYGGQEYTGLVEQHSWAEDKVTVWLLDQKLQICCKAEEVWLAELQGSISQVPPTEQGAQVPAYRPVSRNIDVPKRKSDAVEMDEMMAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSARKARGEAKKCRKVYGIEHRDQWCTACRWKKACQRFLD	185062	239781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_185195_221514_221780_222894_223128_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236223
892648	contig_17274_pilon	+	3681	16	Intergenic	novelGene_26506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_14	144.628812251686	541	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	147	1757	87831	124457	FALSE	10	CATCTTCCTGGTATTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRRRKRGRPRKHLTQRNKAPLKRGRPRGSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87684	126381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_113142_113218_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
892649	SIRV5	-	1987	16	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	-8551	1168	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	795	4	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGTCCTGGACTGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10957	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV5_-_1149_1986_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3403_3481_3643_5379_5448_5538_5626_6110_6169_6326_6452_6825_6957_7143_7305_7678_7762_7869_8381_8453_8590_10863
892650	contig_7009_pilon	-	2708	1	Intergenic	novelGene_23640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTATTTCTGAGAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446251	443543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_443500_446300
892651	contig_8570_pilon	-	2978	1	Intergenic	novelGene_120177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	894	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACTACAGGGGAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438761	435783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_435800_438800
892652	contig_1452_pilon	-	4157	4	Intergenic	novelGene_115126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	175	junction_1	1014.06125171127	16	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	TRUE	10	GCTTTTTGTGTCTGTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	695158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_698093_699094_699953_700534_700690_715232
892653	contig_7894_pilon	-	4290	4	Intergenic	novelGene_170776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	918	3373	4290	131956	131039	FALSE	60	CAAAAAGGAAGAAAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNPHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETRLRNKDVNLLKVKGWKKLYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKMKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLTREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLIKDTEDLKGTISQLDLIDVYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLTHHWVIQEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKVVLRGQFIAIDAHI	163133	131038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_133010_133100_133607_134160_134303_161462
892654	contig_1450_pilon	+	2127	3	Intergenic	novelGene_27417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	10	TTCTTCTTCTTTGTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	424994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_424160_424928
892655	contig_11505_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_140927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	540	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGACACGAGTCAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142263	143908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_142300_143900
892656	contig_2799_pilon	-	3137	19	Intergenic	novelGene_85507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1415	1834	751411	718679	TRUE	20	GAGCAATCTGCTTGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	762633	604551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_604830_607923_608056_681360_681435_687150_687272_696526_696898_704623_704817_707591_707703_718655_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302_755438_756997_757116_757722_757862_758459_758712_761266_761394_761506_761624_762147
892657	contig_17074_pilon	+	3068	11	Intergenic	novelGene_145112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	198.518009258606	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	138	617	212372	216503	TRUE	45	AAATCACCATGAAATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPRPH	207919	225496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
892659	contig_16204_pilon	+	2162	12	Intergenic	novelGene_154518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	439.981066459655	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	893	1678	389626	395754	TRUE	20	CTGAGGACTATAGCGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNISFHRNHTATVRSQVENRTASHVDNEYSQPPRNSHISAYPALEGALHRSSAQPDNSSDSDYDLHGTQRL	369302	397244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_384218_384412_387991_388298_388738_388802_389404_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394977_395098_395665_395758_396763
892660	contig_20602_pilon	+	1751	12	Intergenic	novelGene_133709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTCGCCCCCAGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9675	29534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_+_10090_13343_13515_17102_17274_19178_19327_19761_19855_21146_21278_23426_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26554_28880_28948_29482
892661	contig_8464_pilon	+	1124	7	Intergenic	novelGene_125379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	104.9364887285	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	414	713	798819	804080	FALSE	20	TTAAAGCTTTTGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	793604	804491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_793672_796183_796272_797349_797427_798155_798244_798725_798922_799187_799279_803974
892662	contig_8570_pilon	+	2618	25	Intergenic	novelGene_120142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	626.595162975177	600	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	1153	2616	364113	439552	FALSE	30	GTGAGAGCTTATGATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLTQNVGLLGLLKWRMKPQLLQENLEKLKIVDGEEVVKFLQDTLDALFNIMMEHSQSNEYDILVFDALIYIIGLIADRKFQHFNTVLEAYIQQHFSATLAYKKLMTVLKTYLDTSSRGEQCEPILRTLKALEYVFKFIVRSRTLFSQLYEGKEQMEFEESMRRLFESINNLMKSQYKTTILLQVAALKYIPSVLHDVETVFDAKLL	284300	439554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_345667_345782_347293_347376_361594_361724_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530_379715_379853_379952_382407_382498_383493_383595_384451_384587_425585_425695_439483
892663	contig_13519_pilon	+	1895	14	Intergenic	novelGene_124620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	359.197148813818	987	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	161	1885	66179	120612	FALSE	20	TGTACCTCCCCCAAACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	56999	120622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
892664	contig_7963_pilon	+	1310	5	Intergenic	novelGene_58385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	898.86689086872	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51379	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51721_56717_56937_57301_57564_57782_57934_63003
892665	contig_20878_pilon	+	5179	11	Intergenic	novelGene_173440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	583.442207934942	789	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	149	1372	19061	34366	TRUE	5	GTCGTCATTTTGCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQKAVKLVINTVSFDKDSTVQVFEATIRVLGSLLSAHRIITDSKQPFGDMTIKDYDNELLHMAHDLAVRLLPAFENTKTGIPYPRVNLKTGVPPDSNNETCTAGAGSLLVEFGILSRLLGDSTFEWVARRAVKALWNLRSNDTGLLGNVVNIQTGRWVGKQSGLGAGLDSFYEYLLKSYILFGEKEDLEMFNAAYQSIQNYLRRGREACNEGEGDPPLYVNVNMFSGQLMNTWIDSLQAFFPGLQVLIGDVEDAICLHAFYYAIWKRYGALPERYNWQLQAPDVLFYPLRPELVESTYLLYQATKNPFYLHVGMDILQSLEKYTKVKCGYATLHHVIDKSKEDRMESFFLSETCKYLYLLFDEENPVHKSGTRYMFTTEGHIVSVDKLLRESPWKEFFSEEGEQDQEGKPMHRPRSHEVKVINSSSNCNRVPDERRYSLPLKSIYMRQIDQMVGLI	17346	38246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_17431_18996_19169_20154_20339_22275_22451_24095_24217_27107_27279_29535_29610_30551_30649_31645_31850_34276_36893_36965
892666	contig_6593_pilon	+	3182	14	Intergenic	novelGene_49837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_13	818.393468829319	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	100	1638	1180755	1277500	FALSE	30	TGTAATACTCAAGTACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGWDSRGTPTPSWSQFQVGCGACVLSGPAPGSAMNRCAEAAAVAATVPDAGVGDAGLRPPMVPRQASFFPPPVPNPFVQQTHIGTASRLRIFLLGIILLPIRALLVALILLLAWPFAAISTACCPEKLTHPITGWRRKVTEPALKFLGRALFFSMGFIVTVKGKIASPLEAPIFVVAPHSTFFDGIACVIAGLPSMVSRNENAQVPLMGRLLRAVQPVLVSRVDPDSRKTTINEIIKRATSRGEWPQILVFPEGTCTNRSCLITFKPGAFIPGVPVQPILLRYPNKLDTVTWTWQGYTFIQLCVLTFCQPFTKVEVEFLPVQVPNHEEKSDPVLFANRVRNVMADALGIPVTDHTYEDCRLMISAGQLTLPMETGLVEFTKISRKLKLDWDGIRKHLDEYASIASSSKGGRIGIEEFAEYLKLPVSDVLRQLFALFDRNHDGSIDFREYVIGLAVLCNPANTEEIIQVAFKLFDVDEDGYITEEEFSTILQASLGVPALDVSGLFKEIAQGDSVSYEEVRATPSIASNKVSPENHEESTSDKKDD	1180655	1279044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1180926_1191011_1191152_1193996_1194215_1195531_1195645_1198315_1198377_1199226_1199286_1209653_1209689_1212668_1212724_1232374_1232458_1236628_1236755_1238587_1238742_1266389_1266489_1273656_1273793_1277411
892667	contig_9121_pilon	+	2795	2	Intergenic	novelGene_134478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAAAGAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282899	286647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_285205_286157
892668	contig_15991_pilon	-	950	7	Intergenic	novelGene_70900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3203.87602062807	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	78	881	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106359	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100966_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
892669	contig_11978_pilon	+	4172	19	Intergenic	novelGene_62936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1894	2256	978493	980911	TRUE	45	AAGTCTGCAAAACCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTDQAWFFSFLSSFVAHVARVFALLVFDLRPSVNSSWIMGLASTNFSTSFPNAVHKSLYQSSSTSYYSICMILISSNVVNERQNKFYSGLDQHHIRVYVLLIPLQSLDDSSIGFQAAFP	976599	995166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_978505_979252_979417_980041_980156_980838_980947_981063_981206_981761_981868_982381_982467_983632_983780_985167_985240_985570_985716_986637_986772_987381_987591_988544_988681_990290_990388_991152_991270_991611_991698_992358_992423_993262_993415_994977
892670	contig_13244_pilon	-	3761	2	Intergenic	novelGene_87005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	523	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTTCTAGCCTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478120	472978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_473384_474764
892671	contig_9011_pilon	-	3047	1	Intergenic	novelGene_159350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATAGAGCAAACGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751799	748752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_748800_751800
892672	contig_4496_pilon	-	3149	10	Intergenic	novelGene_66671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCGCCTTTCTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998440	859303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_859438_891912_891993_899754_899891_911479_911831_934669_934787_941357_941486_951023_951146_952442_952526_996159_996280_996562
892673	contig_12603_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_105789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	1046	1513	568171	567704	NA	55	TAGTAAAAATCAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDPEDLKGTISQLDLIVIYRTLHPTAAKYTFFSNAHVTFSRIDDILLGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKNQLHGN	569216	567440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_567400_569200
892674	contig_11307_pilon	+	1562	6	Intergenic	novelGene_105233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	88.0781471194757	144	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	145	795	74141	87762	FALSE	15	TTCTAATTCTTTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGPAETHPAVCVCHWCSHVPFPVGKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEGVYELVSFQMKPGGPALWGDAFQRAVNSHVNLNYAKLVGVFHTEYGVLNRVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	73996	88529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748_76960_78974_79041_79683_79834_87512_87600_87685
892675	contig_10126_pilon	+	6845	6	Intergenic	novelGene_105704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	142	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2326	2649	83325	83648	TRUE	65	AAGGAAAGAAAAGAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSQVSGSHLFPINALTLTSDTSRGLQLSWLCNSVTLTIRLWVWFLAILALLLQEIRLSFKAQVEALRSCTWHLSLDSEALNASLSFISLSSESRTNQPACLYFSF	80999	306080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_84109_152279_153015_153350_154366_272568_272831_293145_293324_304534
892676	contig_16303_pilon	-	2171	4	Intergenic	novelGene_34080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.156280884762	33	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	63	563	47976	34697	FALSE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGSCSCWQESVHLGLLY	48038	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_34746_38779_38856_40433_40731_47897
892677	contig_11160_pilon	+	2268	3	Intergenic	novelGene_168816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	59	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	298	600	318478	320768	FALSE	35	GTTTTTAATGTAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSPRAAVGSARGGAGRAPRGRGGALFASLNFPPTPHSRALKPVHAASLSLFSSPPANFRSHLRPSPVIRRGSSPAAPPRGLLRTSPPAAPTITRPRNMSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALPHPSPFGFLSFLLFLLLLFRSFIVVEQRKPTNILCW	318180	322436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319176_320656
892678	contig_5894_pilon	+	1791	2	Intergenic	novelGene_83022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGCAGTTACCAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297010	299596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_297342_298136
892679	contig_16067_pilon	+	3149	2	Intergenic	novelGene_169849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2531	3061	75215	75745	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIQHEDIMTVNIYTPSDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNVPLSVKDRTSKKKLSKDTEDLKGTINQLEVIDVYRTLHATAAKYTFLSNARGTFSIIDHILGHRTILDKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKQSVTWKLNNTLLTNHWVIEEIRDEIKKNS	72684	75900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_+_75762_75828
892681	contig_10642_pilon	-	5227	9	Intergenic	novelGene_78667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.514394721455	1085	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	305	2602	222596	171910	TRUE	30	TATTGGTGTTCAGCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARATDSVLNGHRSKGLCDSAKKEDLPELAGQALSAGPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNGSGGVDKASPSESNAGGGSPSSGSGGNPSNTSGTTRRCAGPVGSVQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLRGGTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQAPAVGRIKFFSDHVSAPTAELERIKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRGPKEGLLCASSQASCCHVI	241350	169187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170808_170904_173129_177948_178084_181157_181371_185224_185367_222007_222703_225746_225809_237047_237098_241264
892682	contig_4857_pilon	-	4171	1	Intergenic	novelGene_48878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	888	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTGGAAAAGTGTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389662	1385491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1385500_1389700
892683	contig_15047_pilon	+	1228	4	Intergenic	novelGene_52262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	3477.79738723616	55	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTTTGTGGTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3296	9858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_3498_4158_4434_4552_4664_9217
892684	contig_546_pilon	+	3432	4	Intergenic	novelGene_117228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1269.49237449025	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCAAAAAAATCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147567	156561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_147672_152818_153413_153463_154720_155083
892685	contig_6434_pilon	+	4736	3	Intergenic	novelGene_61831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1332	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3906	4217	700031	700342	TRUE	15	CCAAGTCTGTCTGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASALLGQVFQSSVAPPESARRHPTPPESLVHRHSALSLHGSAPAPSFTGLLVLLLWFSAAAGSLSLPYIYLFTILKPFPHFRYLLEQHPTPGTKFCLSGWF	696125	829496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_700577_821590_821816_829436
892686	contig_3822_pilon	+	2647	12	Intergenic	novelGene_133315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2033	2503	296892	306216	FALSE	30	CTGGGAGGGGAAGACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRALKRNWISCRRKLLGGIFSRAWYIVQAEPGKRTSAYGTTIKALSTNTVFVRCCATTAESGSWNLTKQTRDETGKGESSGGKRRNSSILPRKPKRVRICSELALGETLVTWITSVPPPPLPPPPPPGPPLGPGPAVLGTTVVLLMALLAFSFLL	277220	306360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284719_285129_285216_290752_290879_292752_292805_293547_293643_295722_297000_299563_299696_305985
892687	contig_16098_pilon	-	1003	4	Intergenic	novelGene_46197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	318.641909777522	500	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	152	382	707803	706282	TRUE	5	GCTCTGGCTCTGGGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHLNSHVRQVHSTERPFKCEKCEAAFATKDRLRAHTVRHEEKVPCHVCGKMLSSAYISDHMKVHSQGPHHVCELCNKGTGEVCPMAAAAAAAAAAAAVAAPPTAVGSLSGAEGVPVSSQPLPSQPW	708233	705353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_705840_706146_706431_707721_707894_708172
892688	contig_9345_pilon	+	2294	2	Intergenic	novelGene_24731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	48	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGTGTAGGGTATTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073583	1089229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1073945_1087296
892689	contig_9484_pilon	+	2494	11	Intergenic	novelGene_105610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	608	junction_9	405.881374295495	42	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	85	1575	95848	103702	TRUE	5	ATGGCTTGGTGGTGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFLGARPFCPSQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYCELCFIWSSSYCMLRSGNTT	95763	105093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_104412_104883
892690	contig_4125_pilon	-	3382	9	Intergenic	novelGene_25132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	461.691929212543	6	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	367	918	815904	812993	TRUE	30	AATTCTTAGTATTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQITGWSCCEDVFCTVDRSCFSVEGTEMLVSVWGRQGPCSGKVSACSMGPPDLSQLSGILGNAAIVLRSRLKVRVVKELRGKKAAAPNGVRENGSLAPDAEVGKQVMQYQVRPERGGD	816884	809064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813261_813590_815228_815315_815466_815576_815898_816029_816642
892691	contig_9995_pilon	-	2633	3	Intergenic	novelGene_47785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAATTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760291	756181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_758418_759669_759819_760043
892692	contig_11338_pilon	+	3380	12	Intergenic	novelGene_6168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	526.803302009644	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	446	1501	6086	11728	FALSE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLH	745	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10550_11727
892693	contig_7322_pilon	+	2703	2	Intergenic	novelGene_164917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAATTTGTGCCTGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236998	239809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_238264_238371
892694	contig_12638_pilon	-	5846	8	Intergenic	novelGene_33348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	254.709598546731	322	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4821	5162	1411296	1394990	TRUE	30	ATGTTTTGATCACTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLHAQKVLHRMMMAPGPRMKQEQTQMDQMTLRMQGLVKIEGSMEIILHHSQMAVLNLLGLQDLHDHLHLPHVDQHLSTVRHLPLQKVTDLVQALCHQQIQMQIHLKALHLD	1463568	1387088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1416043_1463494
892696	contig_7083_pilon	+	2640	2	Intergenic	novelGene_125167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1321	1686	195454	195819	FALSE	35	AGCAAAGAGGGTGCACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCSFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSSFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSCAFSSTGESSGVLIWTPIGAILSCFCKCFDIVRCFRGIQ	194041	196773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_194160_194251
892697	contig_7840_pilon	-	2371	9	Intergenic	novelGene_69035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	301.337409517969	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	169	912	406713	373331	TRUE	50	AAAGAAGAGTAAAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSRKCGTKLCCSK	406881	364907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367653_373196_373365_378781_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624
892698	contig_7291_pilon	-	2571	6	Intergenic	novelGene_106296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	316.025695157846	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATTTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213257	171520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179492_179516_206210_206350_213210
892700	contig_3956_pilon	+	3040	16	Intergenic	novelGene_14877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1086.40744147345	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	810	2433	84	2516	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282734_1282877_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
892701	contig_3103_pilon	+	3493	1	Intergenic	novelGene_146177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	231	696	322	1017	15119	15814	NA	60	TATAGTAGTATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIPVILQARGTLTLQVGDTLTLPCVVSSLIPIGPVKWIIEKPERGQITVWDFRTTGSNQITPMADTTQSRNRDFSIMISDIPLSDAGTYYCVKYKMGSPRDAEISRGEGIQVVVVGYQEPAHLPDGWDWSSNGLVTMSQAVATGGNLSSCWVCHHLPQSRAPLSPLAAPVFDHNKDIPHCILIHSAPKAPIRARLVQYPFSIPCFSLTKLYNHTQSTDGKLNHKIPRRK	14797	18290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_14800_18300
892702	contig_9471_pilon	+	6742	11	Intergenic	novelGene_21697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	723	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	5145	5552	71195	74266	TRUE	10	CTTCTGGCTTTTGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDQVLQMITQRLNIPAAFLQVPKGYVAWDGGQAKQEISLNWNALPQVHLPGGRGYLLRIQSICFNGYRRLYLITLTGLDEKEFGFVSQTRALLGCEVRHDVPNGNEGPVCGVDSSKLPMGQDTAHEAVPVSVA	65429	105627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_65874_66494_71199_73862_74374_74922_75028_77001_77093_79127_79172_81091_81200_87353_87490_100470_100565_102735_103089_105475
892703	contig_16098_pilon	-	1338	10	Intergenic	novelGene_45959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1305.73547696402	11	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	92	1213	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354080	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349669_350339_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
892704	contig_10093_pilon	+	4068	14	Intergenic	novelGene_147496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	48	junction_10	101.366696210302	1359	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	139	1299	73194	125260	FALSE	50	ATAAAGTTTAATACACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQAAPSSVFLPPLPARRQGAPQAAWRSACGLGAPALASGGPLLAAMDRFLWTSGLLEINETLVIQQRGVRIYDGEEKMKFDTGTLLLSTHRLIWRDQKNHECCMAIPLSQIVFIEEQAAGIGKSAKIVVHLHPAPPNKEPGPFQSSKNSYIKLSFREHGQIEFYRRLSEEMTQRRWETMPVSQSLQTNRRPQSGRIRAVGIVGIERKLEEKRKETDKNISEAFEDLSKLMIKAKEMVELSKSIANKIKEKQGDITEDETIRFKSYLLSMGIANPVTRETYGSGTQYHMQLAKQLVGILQVPLEERGGIMSLTEVYCLVNRARGMELLSPEDLVNACKMLDALKLPLRLRVFDSGVMVIELQSHKEEEMLASALETVSEKGSLTSEEFAKLVGMSVLLAKERLLLAEKMGHLCRDDSVEGLRFYPNLFMTQS	73055	128029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90936_91006_93068_93140_101699_101815_102834_102925_103664_103752_108824_108858_108972_109051_109680_109816_118733_118800_122855_122921_123505_123591_124997_125075_125166
892705	contig_15273_pilon	-	4996	3	Intergenic	novelGene_140422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	23	252	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1096	1443	48096	47749	FALSE	35	GCTCTGAAGAGAGAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITQIYAPTSKAKDEEIEDFYQLLRSEIDRTCSQDALIITGDWNAKDGSKKGSVVGKYGLGDRNDARDHMIKFCKTNDFFIANTFFHHHKRRLYMWTLPDGIHRNQINYICGKK	55062	44195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_48820_53316_53480_54853
892706	contig_6418_pilon	+	3940	1	Intergenic	novelGene_81244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	903	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1447687	1451627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1447700_1451600
892708	contig_10042_pilon	+	2334	9	Intergenic	novelGene_79108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	244.292825058371	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	9	1679	6321	53427	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6312	54082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
892709	contig_16228_pilon	-	4443	8	Intergenic	novelGene_147941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1166	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2782	3303	72704	72183	TRUE	45	AGAGGAAGCAGAGACCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPSTPNSASRSEILTPSSCHGQHLYTVLMPGLVFSERHIPVMQKRLWKFVRCTLGSGPLWEERRIFQEPGQWQKRAHSTRLSILSVQAAWGRLEGRGEQRKAQGHMCAGSCGQEGQGSTDHGPQELDHSWKCQYLHGDRLRVVVSQEFQILLPPLVKCLWPGLASGPHCRQ	75623	47774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_47882_48929_49028_59832_60220_69475_69789_71433_71571_71758_71816_72141_74593_74730
892710	contig_15022_pilon	+	2529	18	Intergenic	novelGene_171814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	189.885177470063	501	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	6	1058	97106	111629	TRUE	10	TGGTGCTGAGGCCTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKTTRLAVWWKTSSATMWWCSMWTRRS	97100	121837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105852_111461_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_118370_118454_119220_119272_119455_119520_120780_120931_121229
892711	contig_7744_pilon	+	2495	4	Intergenic	novelGene_62451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	166.937779493505	282	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGTTTACTGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67208	71092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_67304_67644_67755_68255_68334_68880
892712	contig_17618_pilon	-	3511	7	Intergenic	novelGene_173349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_6	93.7259598806838	14	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	130	846	51441	21176	FALSE	50	CGTCAAAAGCAAACAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKNRFQRFMNHRAPANGRYKPTCYEHAANCYTHAFLIVPAIIGSALLHRLSDDCWEKITAWIYGMGLCALFIVSTVFHIVAWKKSHLRTVEHCFHMCDRMVIYFFIAASYAPWLNLRELGPLASHMRWFIWLMAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMNNTDGLHELACGGLIYCLGVVFFKSDGIIPFAHAIWHLFVATAAAVHYYAIWKYLYRSPTDFMRHL	51570	18510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_21377_30667_30738_32593_32696_34769_34845_38040_38202_42793_42876_51415
892713	contig_4180_pilon	+	2435	11	Intergenic	novelGene_8302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_2	180.208462620378	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	470	1747	769548	821915	FALSE	50	AACTACTGAATAAAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLQSDIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733057	822603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_769424_769564_790791_790890_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
892714	scaffold_19766_pilon	-	3822	3	Intergenic	novelGene_34294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	599	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATCAAGCCTTTTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604675	489685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_489815_489992_490186_601175
892715	contig_854_pilon	+	6737	39	Intergenic	novelGene_36497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_35	3046.97930896811	20	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1855	5568	175	5742	1649514	1714980	FALSE	15	AGGGGTTTTCTACCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612771	1715975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710621_1712329_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
892716	contig_13674_pilon	+	1928	1	Intergenic	novelGene_140317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1354	1692	17984	18322	NA	60	GCAAGAGATCACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQPTANAKYEGIEEFCYFLQSDSHQICNQDALIITSDWNAKVRNKEEGSVVVKYGLGDKNDARDYIIEFYKTNGFFIANTFFTNISGNNRWTSPDKIHRNQIDYICGKR	16630	18558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_16600_18600
892717	contig_15666_pilon	-	2192	6	Intergenic	novelGene_70153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	389.954151151132	72	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	184	1113	110619	107848	FALSE	35	ATAGCATGTAAACTACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQRLWPSSPLFPTAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110802	106768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108103_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110246_110558
892718	contig_401_pilon	-	6705	5	Intergenic	novelGene_42803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	83.2436183740231	1169	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	153	728	1694453	1684116	FALSE	30	TCTGTTTGAGAAATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKTKRTADSSSSEDEEEYVVEKVLDRRVVKGQVEYLLKWKGFSEEHNTWEPEKNLDCPELISEFMKKYKKMKEGENNKPREKSESNKRKSNFSNSTDDIKSKRKREQSNDIARGFERGLEPEKIIGATDSCGDLMFLMKWKDTDEADLVLAKEANVKCPQIVIAFYEERLTWHAYPEDAENKEKETAKS	1711262	1678138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1684267_1685885_1685987_1689458_1689646_1694316_1694496_1711152
892719	contig_11338_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_6394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	190	630	313440	313000	NA	45	AAAGACCTCTTTATTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	313629	310358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310400_313600
892720	scaffold_2602_pilon	+	3278	11	Intergenic	novelGene_127699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_5	363.489257062709	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1863	2516	55532	68818	FALSE	25	ATAGATACTTTTTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYTGRKCTTQTTRKRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDSFTNLIPNRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	45215	69580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_55579_56687_56771_57959_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
892721	contig_4469_pilon	+	3072	7	Intergenic	novelGene_21967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	348	junction_2	73.3590863871379	743	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	145	705	885461	933930	FALSE	35	TAAGAGATGCCTAAGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPPVSACVVPGPQAAVGGSGPWPARVEAAAAAAAHPPICPSSLPAAIMLALISRLLDWFRSLFWKEEMELTLVGLQYSGKTTFVNVIASGQFSEDMIPTVGFNMRKVTKGNVTIKIWDIGGQPRFRSMWERYCRGVNAIVYMIDAADREKIEASRNELHNLLDKPQLQGIPVLVLGNKRDLPNALDEKQLIEKMNLSAIQDREICCYSISCKEKDNIDITLQWLIQHSKSRRS	885316	936297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_885584_924587_924669_926168_926243_926658_926753_931156_931225_931508_931580_933880
892722	contig_6673_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_164025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1315	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAACATAATGATGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118387	121066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_118400_121100
892723	contig_12964_pilon	-	2670	2	Intergenic	novelGene_131695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	280	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATCTTGTTCTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558797	555435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556628
892724	SIRV7	-	2459	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	2	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
892725	contig_12312_pilon	+	3353	2	Intergenic	novelGene_63926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	352	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	131	358	177012	177239	TRUE	30	GCATTCATACTTGCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTRIDTCTPIFTAAQFTIVKRWKQPRCPSTDDWINKLSYIHTMEYYATTKNSDESAKHLITWMNLEGIMLSEFSQSQKDKYCMRPLLEELKKSLNRRKHSLMVTTVGREGGRGVFTS	176881	283783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_178162_281710
892726	contig_57_pilon	+	4485	31	Intergenic	novelGene_44884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	298.595164432082	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	859	2580	1140	3719	100664	147529	TRUE	20	AGTTGGTTTTAATTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQLMKLLGWTHCASFTENWLPIMYPPDYCIF	66761	148348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89448_89493_89558_93295_93451_94251_94333_99315_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325_145446_147439_147715_147767
892727	contig_12605_pilon	+	984	5	Intergenic	novelGene_64180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2967.48853199132	231	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	383	961	4816	6214	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRSHLLSPSWELLLAWLSLDCWLLELWWLQL	3869	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_5962_6124
892728	contig_7019_pilon	-	2513	5	Intergenic	novelGene_149471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1863	2270	1341816	1341409	TRUE	25	ACACACATCTGGCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWCHPYSSSGRKLTFTGNPDGRMEPSPLTTKTIPSLSPTPLKPPSILENQQTTIAPSFPYQGSLEQLRYTKNCLLGQNWAVVIGTLMSTLPLTRPPWACINGHPASLNRTPYLGITGGFSETHVGSLWRVCWGP	1466819	1302645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1302790_1331685_1331765_1341388_1343346_1372935_1373227_1466777
892729	contig_14208_pilon	+	4035	9	Intergenic	novelGene_129072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	692	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAAGAGCGCGTTGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97350	215360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_99717_113875_113933_132888_133009_157699_157926_168730_168999_172526_172647_175609_175908_212472_212564_214871
892730	contig_17502_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_178626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCAGGTACTTCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26707	25371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17502_pilon_-_25400_26700
892731	contig_9112_pilon	+	2376	2	Intergenic	novelGene_60225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTTAGAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110892	114766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_112128_113625
892732	scaffold_12124_pilon	+	1418	10	Intergenic	novelGene_22216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	3	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	FALSE	30	ACCTGTATCCTGCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1508882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
892733	contig_10196_pilon	-	1992	10	Intergenic	novelGene_132223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	25.8246699929915	680	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	6	734	1411316	1395296	TRUE	10	GTCTATCGGCTTGGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAAVLACFLLLLGFAARGPGPAGAAKMKVVEEPNTFGLNNPFLPQTGRLQPKRDPSPVSGPGHLLRLSGKCFSLVESTYKYEFCPFHNVTQHEQTFRWNAYSGILGIWHEWEIANSSFVGMWMRDGDSCGSRSRQTKVRPRGRGQAARTPSPPPATPPPPGGAHVREERPTSPGVGAQHLCVLADIRDAARLPPPRLASVPGAARGPAAEVGPAGAGPGGGAYYPPRAMQSGCGRSLRRLAT	1411321	1393863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1394957_1395032_1395115_1395212_1395345_1395426_1395511_1395668_1395948_1396045_1396130_1396206_1396262_1410904_1410973_1411056_1411115_1411264
892736	contig_2444_pilon	+	5113	2	Intergenic	novelGene_83792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	802	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2764	3153	269869	270258	FALSE	25	CACCCCAGGGAAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQVLPLLKSHPSLGCGLQPCIYVGALVRCSLSASGSSLSNLQFLGLEAVACRLTCQFWDSLASTTLWASSLSSNLIHRLLQPVSQQPVIWPADLGSCSLVSQEKPTPTHGFGTCQPPQPHEPFPCYSS	266568	272218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_266870_267406
892737	contig_12279_pilon	-	2862	3	Intergenic	novelGene_50122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	993	1295	77185	75050	TRUE	5	TCCTCCGCCTCCTTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	78177	70161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_71709_75029_75094_76926
892738	contig_5041_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_27039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTTTTAAGACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407479	409953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_407500_410000
892739	contig_116_pilon	-	2954	20	Intergenic	novelGene_154900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	164.571549831222	626	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	34	2058	327496	262769	FALSE	5	CCAGGCCGCGTGTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIAAKLVKDREAAEGLGLHERAVKYLNQDYAALRDECLEAGTLFQDPSFPALPSSLGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICTDPQFIVGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEVLARVVPLDQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKAPPNLFKIIQKALEKGSLLGCSIDITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGKWNDNCPNWDTVDPEVRERLTRRHEDGEFCDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVHQLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCVRVFSEKKADYQVVDDEIEANLQEFDVSEDDIDDGFRKLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSTETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYILWTKIQNYQKIYREIDVDKSGTMNSYEMRKALEEAGFRLPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIQLDLISWLCFSVL	327529	261872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_262793_264796_264856_265118_265236_266738_266818_267677_267747_268639_268705_271093_271152_272359_272426_273507_273545_275945_276167_278967_279138_281073_281160_281943_282019_283324_283411_285621_285706_286887_287057_288523_288658_289399_289519_321165_321236_327259
892740	contig_10106_pilon	-	4684	2	Intergenic	novelGene_73903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	689	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182782	177817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_181409_181689
892741	contig_8954_pilon	-	5539	7	Intergenic	novelGene_130288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188688	161501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_163569_164946_165033_169408_169552_173747_173878_174334_174401_182928_183066_185778
892742	contig_6102_pilon	+	2314	15	Intergenic	novelGene_31918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	440.147801010858	4	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	292	594	379014	380552	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRCCR	375966	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379734_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
892743	contig_854_pilon	+	2819	15	Intergenic	novelGene_36528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3091.79851645066	20	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	146	1789	1649514	1715375	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQPLSCQKAQDGESRRAGPWGWARVFSMNLVFFRLTEF	1612800	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649595_1687060_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701203_1715265
892744	contig_17144_pilon	-	2903	16	Intergenic	novelGene_29372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2129.46877465302	12	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	622	2100	174965	167278	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALAA	183409	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167286_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179710_181794_181850_183184
892745	contig_15112_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_124758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACTTACTTCTGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24994	22915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_22900_25000
892746	contig_14450_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_49039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCATTATTCTTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292634	1290970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1291000_1292600
892747	contig_678_pilon	-	6074	29	Intergenic	novelGene_167766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	532.676562421383	10	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	93	3353	99253	16487	TRUE	25	GGAGTCGGGGACCGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHFTVTKVEDPGKGAAASTSQERAPTSAGEKARKKDSGEPDDGHRKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLSRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPAKVPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVYLSNVVLLGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILVASLDLVAPILTMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMGIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLKEGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNVSFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS	99345	9131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_9250_9566_9665_12704_12832_13133_13292_13543_14244_14966_16579_17500_17635_19596_19782_19988_20097_20705_20838_21641_21812_22620_22817_23880_24050_25338_25444_26391_26512_28135_28235_29697_29817_30102_30278_31117_31176_31453_31553_31722_31882_32698_32914_35731_35974_36684_36816_37326_37382_38796_38944_39925_40058_41346_41442_99129
892748	contig_11896_pilon	-	8240	4	Intergenic	novelGene_88019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	523.730422598836	1359	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	6337	6711	154641	151203	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFPCRVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAKKHGSKCLVHCKMGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLAR	167473	149673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_151408_154471_156896_163302_166003_166091
892749	contig_18272_pilon	-	1975	8	Intergenic	novelGene_6977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	546.204417142632	3	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	77	832	184469	121886	FALSE	20	TGATGACACTGTTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVVSDDQSLFDSTYGAAAHLPKADMTASGNPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYGLLEIDTSFFQNMDGKELCKMSKEDFLRATSLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGGWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTMSKNTEQRPQPDPYQILGPTNYWNGFLWFWERKKL	184545	120742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_121933_124265_124293_126333_126394_128533_128600_157860_157927_168460_168665_172640_172796_184338
892750	SIRV6	+	986	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	524	18	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	35	CAATGTAATGGAAATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
892751	contig_10003_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_88194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	948	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471096	473548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_471100_473500
892752	contig_13021_pilon	+	3472	12	Intergenic	novelGene_8193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	233	junction_9	2557.69613209471	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	104	1288	174676	178735	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174572	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178246_178522_178585_178670_180211_180440
892753	contig_13201_pilon	-	2702	2	Intergenic	novelGene_130870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATAAGTGGTAACTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47567	43510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_43988_45342
892754	contig_3747_pilon	-	2638	8	Intergenic	novelGene_24894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCTTAAGCTGGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205167	201207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203646_203770
892755	contig_19402_pilon	-	2209	7	Intergenic	novelGene_80851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	580.176122684598	1139	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	92	1537	193194	167101	FALSE	20	TTTGATGGTGCTTGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193285	166428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167582_167641_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
892756	contig_12257_pilon	-	5015	9	Intergenic	novelGene_152086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	97.8927985093898	15	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCTTATGTGAAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148488	110066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_110542_110941_111727_112555_112645_113338_113604_114686_114952_115484_115596_116043_118821_138594_138675_148320
892758	contig_10246_pilon	-	2448	2	Intergenic	novelGene_46878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	18	1049	39053	37933	FALSE	15	CCATGGGATTTTCACTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGATMPGCITTWEDWQKPRLTWTGWRTLVRNGRAKACFEKALEVDPENPEFSTGYAITIYRLDDVTIETQRKGYSLQPLRQAIRLNPEDVYIKVLLALKLQDVGKEDEGEKYIEEALAGTSSQTYVFRHVGRFYRRKGSLDKALQFLEKALQATPTSVFLHHQIGLCYRAQVIQIKGGTNKQLRGQERKKANRMIKSAIFYLESAVEQKPTFAIAYIHLASMYIEAGDYGKAEDVYQKALSIKPLEEDHEQEIHLHYGRFQEFQRKSEVDAITHYLKAIKIEKESFSRNRSIDSLEKLASKKLQRKASDVEGLSLLGFIHKLKGKINEALEYYERALRLTGDLNPMF	39070	36533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_38884_38972
892759	contig_9653_pilon	-	1332	7	Intergenic	novelGene_48249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	128.598859507644	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	217	795	913657	839279	FALSE	45	AAAAAAACTCATTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDCTRHTTLGLLNKAKAHIKKLEEAERKSQHQLENLEREQRFLKRRLEQLQGPQEMERIRMDSIGSTISSDRSDSEREEIEVDVESTEFSHGEVDNISTTSISDIDDHSSLQSIGSDEGYSSASVKLSFTS	929028	838741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_839443_844948_845121_845715_845831_879607_879638_913559_913693_927811_927866_928901
892761	contig_16098_pilon	-	1865	4	Intergenic	novelGene_46227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCAGGAAGCTGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768121	764998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_765155_765548_765638_766289_766670_766881
892762	contig_10437_pilon	+	1958	10	Intergenic	novelGene_38204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	612.312576514663	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	55	1128	229668	232651	FALSE	30	CAAGTGTCCGAGACTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225718	233481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231363_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
892763	contig_5779_pilon	-	3553	1	Intergenic	novelGene_106535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGAGACCATGGTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350368	346815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_346800_350400
892764	contig_6710_pilon	-	524	1	Intergenic	novelGene_94381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
892765	contig_18272_pilon	+	4427	8	Intergenic	novelGene_7048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1866.51370971966	10	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	46	1026	507835	538332	TRUE	20	TCATAATGATGTGGGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPTYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQTDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	468562	541834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_468606_507832_507953_509541_509743_512634_512713_514111_514361_537077_537197_538116_540393_540493
892766	contig_14333_pilon	-	3175	3	Intergenic	novelGene_49135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATAGTCAACAAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425697	422387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_422635_422678_424730_424820
892767	contig_6137_pilon	+	4618	1	Intergenic	novelGene_59290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3466	3780	1361182	1361496	NA	30	CAACAGGCACCCTTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGWIMDTIFRIVFPRNFKVYMLLVNMIPDLILIVCGCKKEWRGYPYTIWINLQDTLLNFKKRCRTGLTGMPPFMLEMHVCLLIFKKKKKDKSKWFSIVGKEQD	1357716	1362334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1357700_1362300
892768	contig_4812_pilon	-	2555	6	Intergenic	novelGene_103708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_5	176.494305857158	496	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1839	715	2553	944244	931924	FALSE	25	TAATTCCACTTCACTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTAFDKERMDKDLGSVQGFEDINKSERTESVEAGDDDSKLDDAQSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDWSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFTKVKETCQRLLEKPK	946807	931921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_932124_933365_933519_935594_936111_943274_944451_944834_944939_946403
892770	contig_2114_pilon	+	7799	5	Intergenic	novelGene_104222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	182.310860894243	777	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	120	866	136332	138000	TRUE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPRHSRSRSRT	136212	145847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_137604_137805_138492_139405
892771	contig_6410_pilon	+	3075	2	Intergenic	novelGene_108617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	0	709	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGCAGTTAGAATCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299800	303636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673
892772	contig_20842_pilon	-	2029	20	Intergenic	novelGene_160961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_10	74.2980074148505	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1599	429	2027	235273	8354	FALSE	40	AAACACAGGCAGAGGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPWKILMAAPLFFLLALHTSASPAYNDQPTTSHSGSRVCVGCVVVVSVIEQLAQVRNSTAQAAMERLCSYLPEKLFLKSTCYLVIHIFGSDIIKLLSADMNADVVCHTLEFCKQDAGRPLCHLYPPPKVAWELTLKKARHIVGKSQTLKYPRSNSSICSLPFLAKICQEIKSAIKKSVPFKDSDSDKYSVFPTLRGYHWRGRDCNDHSKTAYPGRRPDNWDAHQDSNCNGIWGIDPKDGIPYEKKFCEGSQPRGIILLGDSAGAHFHIAPEWITALQISLNSFLNLPTAVSNELDWPQFSGITGFLDSTSGIKEDSIYLRLRKRNHCNHRDYQNISKNGASSQNLEKFIESLSRNQLLDYPAIVIYAMIGNDVCNGKMDPVPGMTTPEKLYSKVMETLKYLNSHLPNGSHVIFYGLADGAFLWDHLHNRYHPLGQLNKDVTYAQLYSFLSCLQLSPCQGWMSANKTLRALTSERAELLSRTLKTVATREKFTNFNLFYLDFAFQEITEEWQRRGGQPWQLIEPIDGFHPNE	235701	8351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_8431_19914_20012_21899_21960_22050_22110_33082_33256_40783_40859_41604_41642_59928_60012_89827_89920_124655_124751_127280_127330_130216_130266_131009_131081_132234_132296_141520_141592_147843_147904_173524_173625_187148_187216_207155_207252_235146
892773	contig_3004_pilon	+	1429	9	Intergenic	novelGene_127515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGCCATCGTCACTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316832	339305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_316994_317192_317377_319204_319346_324107_324206_329966_330057_330858_330986_332096_332305_333119_333231_338996
892774	contig_14923_pilon	-	4254	6	Intergenic	novelGene_157745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	144.817954687946	669	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	485	1810	364605	354615	FALSE	30	ATACTATTTTGCCTAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKASTGDEEGFDYNEEERYDCKGGEHFGNQRRFPGHLFWDFQINILGEKDDTPVHFCDKCGLPIKIYGRMIPCKHVFCYDCAILHEKKGDKMCPGCSDPVQRIEQCTRGSLFMCSIVQGCKRTYLSQRDLQAHINHRHMRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHIMPPQQHYAPPPPPPPPISHPMPHPPQAAGTPHLVYSQAPPPPMTSAPPPITPPPGHIIAQMPPYMNHPPPGPPPPQHGGPPVSAPPPHHYNPNSLPQFTEDQGTLSPPFTQPGGMSPGIWPAPRGPPPPPRMQGPPSQTPLPGPHHPDQTRYRPYYQ	369443	352170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_355651_358242_358317_360540_360625_361005_361107_364574_364743_369096
892775	contig_6163_pilon	+	4796	1	Intergenic	novelGene_103870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	104	370	521450	521716	NA	55	ATTTGGGAAACAGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTQAQTPAATISESLRLSPRCPPSALRRPSSQAVMLEALGSLPTQMVRAGQGTARDPCTPLLSPAAPNPCLKTDPVQCGYLPASSLSCASLVLFSLPRRGSHCLCSVRMLSCPGKPRIGLLA	521346	526142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521300_526100
892776	contig_10973_pilon	-	1153	2	Intergenic	novelGene_150352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	6	470	2746	2218	FALSE	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMTSIRHGRADTSVSPTINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2751	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2635_2698
892777	contig_11720_pilon	+	1383	10	Intergenic	novelGene_43814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	197	1258	68064	98482	FALSE	10	CCCTCTTTTCCAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67867	98607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
892778	contig_15664_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_171511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	719	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTTAAAGACAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151126	148286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_148300_151100
892779	contig_9668_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_58121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	791	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACTCCTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223164	220920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_220900_223200
892780	contig_16622_pilon	-	1800	4	Intergenic	novelGene_48485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1420.6170021039	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121954	111933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115294_121537
892781	contig_2646_pilon	+	3619	1	Intergenic	novelGene_69527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCCCAACATTCAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557462	561081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_557500_561100
892782	contig_3394_pilon	+	3337	9	Intergenic	novelGene_152718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_3	178.211251047738	850	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	72	1361	546113	562769	FALSE	70	AAAAAAAAAAGGCAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYSPPFILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCIVNIALPNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLGECSLQTISKQLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTALNMQSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNEDGFSPNNDDMFVDLPFPDDMDNDIGILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLSREAPEELKQQPLALGYFVSTARAENLPQWFWSSCPQAQNQCPLFLKASLHHHISVAQTDELLPARNSQRVPHPLDSKTTSDVLRFVLEQYNALSWLTCNPATQDRTSCLPVHFVVLTQLYNAIMNIL	546041	564745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_546134_549988_550213_550390_550534_553269_553429_554595_554773_556304_556463_558675_558838_561418_561532_562636
892783	contig_7009_pilon	-	3470	6	Intergenic	novelGene_23636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAACGTCATTTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523234	438264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_439276_443317_444992_453478_453601_512646_512815_517990_518116_522864
892784	contig_5988_pilon	-	1721	7	Intergenic	novelGene_15848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	174.805288503778	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	216	413	254719	251825	TRUE	55	AAAATGTAAAATAATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTQKDAPAIGDLLTLYSGLMETALD	255313	241638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243004_243289_249401_249656_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235
892785	contig_1719_pilon	-	3184	3	Intergenic	novelGene_87260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCGTAGTAAATATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232468	144147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_146921_223912_224041_232185
892787	contig_6740_pilon	-	4504	12	Intergenic	novelGene_142666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	493.324579253728	1204	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	673	1563	587763	565643	FALSE	25	TAATATATCTCCTTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLSYLSGNPIFAEKVMNIRTVLNNLEKPQGLYPNYLNPSSGQWGQHHVSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDLEAKKMYFDAVQAIETHLIRKSSGGLTYIAEWKGGLLEHKMGHLTCFAGGMFALGADGAPAGLAQHYLELGAEIARTCHESYNRTYVKLGPEAFRFDGGVEAIATRQNEKYYILRPEVVETYMYMWRLTHDPKYRKWAWEAVEALENYCKVNGGYSGLRDVYVRHESYDDVQQSFFLAETLKYLYLIFSDDDLLPLEHWVFNTEAHLLPVLHTDKKALEVKEQ	761111	562701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_565770_566455_566572_571301_571475_572176_572397_576661_576778_585621_585716_587718_587839_642255_642351_683857_683939_711686_711803_716031_716129_760903
892788	contig_13216_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_47454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	535	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTGCGTCCGAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153528	151306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_151300_153500
892789	contig_2933_pilon	+	737	2	Intergenic	novelGene_111369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	224	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGATTCTGACTCACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939175	940681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_939713_940481
892790	contig_5791_pilon	-	4313	9	Intergenic	novelGene_35865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_8	315.482071598371	754	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	2041	3801	1088908	1079821	FALSE	40	AAAAAAATTATTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESDDLSLIRKNRMALFQHLTCVLPILDSLLTARVINEQEHDVIKQKRQTPLQARELIDTILVKGNSAATIFRHFLHENDPVLYKNLFVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094572	1079308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1080455_1080711_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1090729_1094352
892791	contig_9177_pilon	+	5886	24	Intergenic	novelGene_32635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	37.1190288967557	217	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	116	1240	33469	36831	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELALGPTDQDLLDFLLEESEDLRVAPEEAVEAPLDWERPLSEVLSDWEADEFLSSLLSPPASLKALSSSIPCPVHHDHNYSLPQEHVSIDLDSGICEKEEAQMTPLQVKEPAEQPQEIENLILTEEEKRLLEKEGLTLPGTLPLTKKEEQALKRVRRKIRNKKSAQESRRKKKVYVGGLESRILKYTTQNLELQNRVQLLEEENMSLLDQLSKLQAMVIQISNQTSSSSTCVLVLLFSFCLLLVPAMYSSDIRRSLPTEHRVLSRQLRSLPSEDPHQLELPALLSEVPKDSTNQLLNNSDHFLQVPGNSCCFLNHVAQDPGAEPPLKLTLSDPFSMHSCLSPILPQQTNLTRKGGWLPTHSPSPVILQVRYSG	33353	46084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_33598_33698_33847_33922_33991_34098_34195_35243_35351_35451_35521_36142_36228_36325_36411_36493_37544_37810_37999_38093_38211_38303_38448_38596_38708_38826_38978_39079_39186_39396_39501_39728_39901_40107_40241_40329_40481_40640_40740_40987_41231_41535_41753_43877_43998_44206
892792	contig_7207_pilon	-	1459	3	Intergenic	novelGene_72034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	101.5	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCTGATACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293906	291271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293496_293654
892793	scaffold_9205_pilon	+	1608	2	Intergenic	novelGene_161101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCTATCTGAGAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220853	256448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_+_222445_256431
892794	contig_7321_pilon	-	8808	10	Intergenic	novelGene_53111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	173.290450535838	1987	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	40	1206	208319	169423	TRUE	30	ACTGGAGGACATTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYGWTFCSTFLHITYCVLE	208358	50123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_51101_162797_169617_173563_173702_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
892795	contig_6509_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_145619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	456	1368	393	1760	70868	69501	NA	20	GACTCCCACCACGTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGPQDREEGKEPYPSDKHRKYSSDKQHSEKQKDKESKDKKKDKGATEGGKDRKEKIFEKHKEKKDKESTEKYKDRKDRTSAESTQEKKNKQKLPEKAEKKHAVEDKAKSRHKEKSDKEHSKERKSSKSAEMEKSLLEKLEEEALHEYREDSNDKISEISSDSFTDRGQDPGPTALLEVSFTEPPEEKAREGSCLQEKLKERHRHSSSSSKKSHDRERGRKEKAEKKDRSEDYKETGSRKDSSQYEKDFLDGDTYSISYNTKADIEDELEKTIELFSTEKKDKNDSEREPSKKIEKELKPYGSSAINILKEKKKREKHREKWRDEKEKHREKHPDGFLRHHKDEPKPGAKDKDNPPNSNFKDKSKEETLRLGEVKLKEKFKESQEKGDLAKISNGNEKLPPSRDSSRKDHRPREKLLVDGDLMMTSFERMLSQKDLEIEERHKRHKERMKQMEKMRHRSGDPKLKDKTKLAEDMRKKSLELPTKKPPGVDMQLRDKKLKDSIVLAPTPPTADSKMLPGAGSEPKDWLTGSQMKEVLPASPRPDQSRPTGVPTPTSVVSCPSYEEVMHTPRTPSCSADDYSDLIFDCT	71260	69500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_69500_71300
892796	contig_1406_pilon	+	4093	3	Intergenic	novelGene_25441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	901	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2124	2426	483898	484200	TRUE	5	CTCTGCAGCCGGTCCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPDHHVPLGDNPQLYTKPEQGTALPGLSDTWGKERKNPTTLPRDLEAGTCNSKKQRGYHLKCSLKVLADRFLAISMNQHLAMDSWAVLFFFFFFEKKE	481774	585561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_484847_498645_498776_584670
892797	contig_10042_pilon	+	2131	8	Intergenic	novelGene_79098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	314.07343480304	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	321	1472	42711	53427	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
892798	contig_1719_pilon	-	3916	12	Intergenic	novelGene_87378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_11	275.249008225144	566	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	143	1204	859240	847238	FALSE	5	GTGGCTTTTTCTTATTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEQPDSRRVNSSVGFSVLQHTSNDPYCFVEFYEHRDAAAALAAMNGRKILGKEVKVNWATTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKSAFAPFGKISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVDYSQWGQWNQVYGNPQQYGQYMANGWQVPPYGVYGQPWNQQGFGVDQSPSAAWMGGFGAQPPQGQAPPPVIPPPNQAGYGMASYQTQ	863441	844525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848273_848617_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392_851469_853348_853437_853592_853648_853889_854040_859228_859326_863384
892799	contig_13780_pilon	-	2938	10	Intergenic	novelGene_149118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1041.31914202878	7	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	494	1144	823821	821461	TRUE	20	ATATTTTGTCTCTGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVVYSKTASVPKVETVKSDNKDDDIDIDAI	832042	819268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_820631_821028_821551_821973_822109_822400_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825203_825305_825624_825798_832026
892800	contig_13014_pilon	-	2762	15	Intergenic	novelGene_169323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	115	junction_2	203.131353903762	406	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	44	1360	308816	282922	FALSE	75	AAATTGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLAVAAPVGSRRRMEEEDEAARALLADGPGVLPALCDPSRLAHRLLVLALMCFLGFGSYFCYDNPAALQIQIQRDMQVNTTKFMLLYAWYSWPNVVLCFFGGFLIDRVFGIRWGTIIFSCFVCIGQVVFALGGIFNAFWLMEFGRFIFGTGGESLAVAQNTYAVSWFKGKELNLVFGLQLSMARIGSTVNMNLMGWLYSKVEASLGSAGHTTLGVTLMIGGITCILSLICALALAYLDRRAERILHKEQGKTGEVIKLSDVKDFSLPLWLVFVICVGYYVAVFPFIGLGKVFFMEKFKFSSQAASAINSVVYVISAPMAPVFGFLVDKTGKNIVWVLCAVATTLVSHMMLAFTLWNPWIAMCLMGVSYSLLACALWPMVAYVVPEHQLGTAYGFMQSIQNLGLAIVSIIAGVILDTRGYLFLEVFFIACVSGGNLNYSAKQREEIKLSHTE	308859	281519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_285401_285460_288244_288358_290339_290438_291850_292008_292340_292398_293457_293570_295240_295340_297483_297587_301155_301265_303161_303230_303537_303581_305334_305448_306899_306953_308686
892801	contig_2371_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_176554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCCATGGAGCAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251974	252976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_+_252000_253000
892802	contig_12570_pilon	+	4063	4	Intergenic	novelGene_79354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1122	1523	190479	196329	TRUE	20	GAACCCTAGCTGGCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVNVLLGRLLQLGNGDGLTHNSGDGLGVGHQPPGVRGEEASTMEDARGKANVLLELLLDPSAPGALLKDHLLIHFILPKGVGGNQVSSMAQGQFHKALAVAQSDGILAWHGAQRLGCAPHYDDDGIAAPIL	189357	200385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_190544_194619_194823_196195_196370_197885
892803	contig_18096_pilon	+	3045	14	Intergenic	novelGene_58039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	649.161288662706	26	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	58	1770	40382	76634	TRUE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40324	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77348_78557
892804	contig_6058_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_172394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCAAATTCTTGCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384490	383365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_383400_384500
892805	contig_854_pilon	-	3000	12	Intergenic	novelGene_36669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.29983829830428	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1566	2285	1714455	1710659	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFLRELTSRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLVSLSSCSSSCAILASRAAMEALYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAPLPLLLAISSASSSRSCWAWRLARSAAASSSCS	1716403	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1709119_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
892806	contig_5125_pilon	+	2681	8	Intergenic	novelGene_43426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	4274	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	454	1587	35654	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25971	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26083_26202_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
892807	contig_19816_pilon	-	1498	8	Intergenic	novelGene_156495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	273.61778794068	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	26	1045	126795	123655	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEFSVHCPHHGDHCCPGSPCGHCSCGGWSCDLEEEELRWKRRELCSGCKQRQFPGL	126820	123033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124549_124689_124935_125577_125854_126164_126435_126731
892808	contig_7376_pilon	+	2701	6	Intergenic	novelGene_108069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	182.004835100609	381	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	8	616	53088	71245	FALSE	65	ACAAAAAAAGAAAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGGENGGGGKKGLKRKATSEDPEETVVSGDGTAEGGAQSPKAAAFPPGFSISEIKNKQRRHLMFTRWKQQQRKEKLAAKKKLKKEREALGVKAPPKPVPKTIDNQRVYDETIVDPHDEEVAYDEATDEFAPYFNRQTSPKILITTSDRPHGRTVRLCEQLSTVIPNSHVYYRRGLALKKIIPHKSLVGYQTNSGTSVFLG	53080	73330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_53313_54868_54926_57516_57598_63239_63336_64119_64207_71182
892809	contig_5196_pilon	-	2023	5	Intergenic	novelGene_38655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_4	248.863793067614	1068	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	49	810	14523	9642	FALSE	5	TTGTGTTGAGTGTCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAGGAGGWASSLNARMDNRFATAFVIACVLSLISTIYMAASIGTDFWYEYRSPVQENSSELNKSIWDDFVSDEADEKTYNDALFRYNGTVGLWRRCITIPKNTHWYSPPERTESFDVVTKCMSFTLNEQFMEKFVDPGNHNSGIDLLRTYLWRCQFLLPFVSLGLMCFGALIGLCACICRSLYPTIATGILHLLAGLCTLGSVSCYVAGIELLHQKLGLPENVSGEFGWSFCLACVSAPLQFMASALFIWAAHTNRKEYTLMKAYRVA	16054	8428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_9863_10035_10174_11763_11875_14231_14542_16024
892810	contig_19352_pilon	+	2792	10	Intergenic	novelGene_122398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_1	274.715251006933	363	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	637	1806	269865	368232	FALSE	30	GAATAACTGATCCCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALAIFTCRPNSHPFQERHVYLDEPIKIGRSVARCRPAQNNATFDCKVLSRNHALVWFDHKTGKFYLQDTKSSNGTFINSQRLSRGSEESPPCEILSGDIIQFGVDVTENTRKVTHGCIVSTIKLFLPDGMEARLRSDVIHAPLPSPVDKVAANTPSMYSQELFQLSQYLQEALHREQMLEQKLATLQRLLAITQEASDTSWQALIDEDRLLSRLEVMGNQLQACSKNQTEDSLRKELIALQEDKHNYETTAKESLRRVLQEKIEVVRKLSEVERSLSNTEDECTHLKEMNERTQEELRELANKYNGAVNEIKDLSDKLKVAEGKQEEIQQKGQAEKKELQHKIDEMEEKEQELQAKIEALQADNDFTNERLTALQGKLANPEIGLI	269228	369218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_270063_338292_338441_353879_353953_358378_358416_360032_360096_363527_363624_363867_363940_365721_365863_366778_366917_368028
892811	contig_15666_pilon	-	4444	2	Intergenic	novelGene_70200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_1	0	1084	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	25	372	132068	131424	FALSE	25	GCAGCATCCCTACCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEILSPSEMLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMECESSPLT	132092	127351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_131711_132007
892812	contig_6175_pilon	+	3660	13	Intergenic	novelGene_16323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	241.592057448547	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	213	1457	1491475	1518707	TRUE	20	TCATTCTGTGACAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPTMVMVCRTFS	1491144	1523049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1491306_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518674_1518761_1520852_1521746_1521792
892813	contig_16411_pilon	+	5259	25	Intergenic	novelGene_77310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	1183.76188762657	29	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	986	2961	21	2981	124585	241370	TRUE	20	ATCAGCATCTTCGTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTPSEKHMLLKVMGFGLYLMDGNVSNIYKLDAKKRINLSKIDKFFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHYEENKSKWTCTQSSISPQYNICEQMVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	124564	243787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_124624_127063_127169_129442_129535_131612_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187296_231251_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241702_241840
892814	contig_3612_pilon	+	3849	29	Intergenic	novelGene_87803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	115.301617552418	849	10	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	172	2037	833026	868523	TRUE	15	AGGATATGCTTCCGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPSAADGQGTAITHALISASTLCQVEPVGRWFEAFVKRRNRNASASFQELEDKKELSEESEDEELQLEEFPMLKTLDPKDWKNQDHYAVLGLGHVRYKATQRQIKAAHKAMVLKHHPDKRKAAGEPIKEGDNDYFTCITKAYEMLSDPVKRRAFNSVDPTFDNSVPSKSEAKENFFEVFSPVFERNSRWSNKKNVPKLGDMNSSFEDVDAFYSFWYNFDSWREFSYLDEEEKEKAECRDERRWIEKQNRATRAQRKKEEMNRIRTLVDNAYSCDPRIKKFKEEEKAKKEAEKKAKAEAKRKEQEAKEKQRQAELEAARLAKEKEEEEVRQQALLAKKEKDIQKKAIKRERQKLRNSCKTWNHFSDNEAERVKMMEEVEKLCDRLELASLQCLNETLTSSTKEVGKAALEKQIEEINEQIRKEKEEAEARMRQASKNAEKSTGGGGNGSKNWSEDDLQLLIKAVNLFPAGTNSRWEVIANYMNIHSSSGVKRTAKDVIGKAKSLQKLDPHQKDDINKKAFDKFKKEHGVVPQAENATPSERFEGPCTDFTPWTTEEQKLLEQALKTYPVNTPERWEKIADTVPGRTKKDCMKRYKELVEMVKAKKAAQEQVMNASRAKK	832854	881814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_833090_835401_835593_840192_840269_845722_845822_852537_852680_854519_854601_857019_857086_857575_857668_857754_857877_858279_858430_861852_861942_862013_862084_863593_863779_864627_864729_864862_864971_867953_868109_868448_868914_869003_869073_869259_869348_869422_869510_871144_871309_872193_872340_872983_873094_873944_874028_874617_874816_878786_878916_879315_879402_880321_880465_881695
892815	contig_12019_pilon	+	716	3	Intergenic	novelGene_87682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	306	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	44	367	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKEHSSLSPSGILS	5181	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8298
892816	contig_953_pilon	+	1228	1	Intergenic	novelGene_130007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCTGAGGAGCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308877	310105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_308900_310100
892817	contig_3975_pilon	-	4866	12	Intergenic	novelGene_54732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	413.441272674141	41	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	207	1322	1730550	1719543	FALSE	50	CCAGACAATAAAAATTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731340	1715998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728381_1730543_1730603_1731186
892819	contig_14621_pilon	-	3189	15	Intergenic	novelGene_105858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	135.842589726762	14	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1772	2191	431670	411248	TRUE	25	TTTCTATTATGAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGSESRSPLKLASQMSISPLWIRIRALHLKPPG	461712	396064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397
892820	contig_10958_pilon	+	2000	13	Intergenic	novelGene_5364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	197.774633245913	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	315	1919	804900	811107	FALSE	15	TCAAGCCTTGAGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	803664	811188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804558_804701_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890
892821	contig_5686_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_45314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTTACAGCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99356	97128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_98140_98210
892822	contig_312_pilon	+	1916	10	Intergenic	novelGene_128306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	235.199731250371	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	56	967	402673	440781	FALSE	15	CTGTGTGAGCAATTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVEFKPRESGTAAGALSMARLVLSLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKVATALKDIVKVGAVDADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRAEDYQGGRTAEAIVDAAISAVRQLVKDRIGGRSGGYSSGRQGRSESSSKKDVIELTDDTFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAATEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLANRYGIRGFPTIKIFQKGEPPVDYDGGRTKSDIVSRAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	402617	441730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415_409558_414598_414657_415103_415231_424174_424282_428888_429020_429396_429512_430056_430148_439477_439531_440712
892823	contig_16703_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_72783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	857	1261	35093	35497	NA	65	AGGAAAAATTAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKDLELENQKGRTHSAFLKLKELRKKIKPLVAILKDSVDKILNDTGSIKRRWKEYTESMYQKKLVEVQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQTALEALAKNKVLGIHGIPTEMFPLTDAVLEVLTVKKFGRQLPGQTT	34236	36539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_34200_36500
892824	contig_7993_pilon	-	3553	3	Intergenic	novelGene_170964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	33	611	241222	240644	TRUE	15	GCTTCTGTCTACAGTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSKILSVFSVFSPCYGMPITRKFLLLIVSHITLRVSSFFLVLFSEFSSNRVVSKCLSSVPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISESLLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSIRDLNSLSGTSGAFSSTGESSGVLIWTPT	241254	21491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_22962_66914_67818_240074
892825	contig_233_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_14486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGGCGTTCCTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41497	40592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_40600_41500
892826	contig_1244_pilon	+	2426	20	Intergenic	novelGene_37917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_19	125.636418666288	343	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	94	1998	274581	294829	FALSE	25	AGGGCAAACTGTGGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPQDRPEDLDVPPALADFIHQQRTQQVEQDMFAHPYQYELDYFTPPDSVLQKPQPQLYRPVEETPCHFISSLDELVELNEKLLNCKEFAVDLEHHSYRSFLGLTCLMQISTRTEDFIVDTLELRSDMYILNESFTDPAIVKVFHGADSDIEWLQKDFGLYVVNMFDTHQAARLLNLGRHSLDHLLKHYCSVESNKQYQLADWRIRPLPEEMLHYARDDTHYLLYIYDKTRLELWERGNGQPVQLQVVWQRSRDICLKKFIKPIFTDESYLELYRKQKKHLNTQQLTAFQLLFAWRDKTARREDESYGYVLPNHMMLKIAEELPKEPQGIIACCNPVPPLVRQQINEMHLLIQQAREMPLLKSEVAAGVKKSGPLPNPERLENVLFGPHDCSHAPPDGYPIIPTSGPVPVQNQASLFPDQKEEEASLDTKCLIATAVITLFNEPSAEENGKWPLTVAQKKAQSIMESFENPFRMYLPSLEHRAHISQAAKLDPSSKIYEISNRWKLASQVQVQKESKETAKKKAAEQTAAREQAKEEYKATAEQAMSVRQQATLENAAKKRERTISDPRTTDQKQGKKRLKISKKPKDPDPAEKEFTPYDYSRSDFKAFAGNSKSKPSQFDPNKQTQSGKKCIAAKKLKQPTGNKSMSFPTGKSDRGFRHNWPKR	274487	295257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_274583_278843_278920_279131_279243_279450_279595_280417_280609_281618_281776_281917_282067_282243_282295_282949_283062_284465_284517_284679_284759_284858_284969_287074_287171_287422_287498_289999_290088_291705_291780_292446_292619_293412_293472_294003_294081_294798
892827	contig_5961_pilon	-	5571	1	Intergenic	novelGene_144138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAAAACTTATGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179726	174155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_174200_179700
892828	contig_2009_pilon	+	1427	5	Intergenic	novelGene_165454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	365.736500092621	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	59228	64730	TRUE	35	AAAAATTGTTATTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPIKPLISTPPVSSQPKVSTPVVKPGPVSQSAAQQPVPAEKPQGHEPVSPRSLQRSSSQRSPSPGPNPPSSSNAPSAAVVPQNSSARPSCSLTPTLAAHFNESLIKHVQGWPADHAEKQKYVLN	59226	67334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_59279_61716_61836_63289_63477_64712_64789_66341
892829	contig_8513_pilon	-	4688	8	Intergenic	novelGene_174914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	103	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1090	1521	169144	55145	TRUE	50	GGCCCCCAAAGAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLSLLNLGFPITSFPVLSCLLVLVPGLLCLITPVLFYFSFPYFFFLNCTLGEGLQNSFSLNSQYTYCFITLVNSPMTIQHSPFSTLEDLFLFFFVTIYITKDTPLQKFLHVQFSDIDYILPVVLLFSLSDGGLQNSFSLNS	206015	12047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8513_pilon_-_12424_12779_13508_13581_14690_54189_55188_55308_55581_169027_169616_180176_180185_205405
892830	contig_4079_pilon	-	2856	3	Intergenic	novelGene_167481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	271.5	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	398	1681	133022	131739	TRUE	40	TGCCATAGAAAGTATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKESKACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGLPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI	138835	129135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_129394_130821_133252_138667
892831	contig_2043_pilon	-	3357	13	Intergenic	novelGene_169908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_7	146.555450256891	602	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	301	2817	782192	682042	FALSE	30	ACACAAACCTTTCTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKLKTEHAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVDNNLIVDKATKKAVVAGKESKPAAAKEEPVSLQEKTRSLTPSVGGKEKEQHVTIVTSTLPPLPLPPMLPEDKDADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGEDLSKSPEEKKAATQSHSKRRPKICGPRYGEIKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCDFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTSTPQGVPPSSQLKSQGNSSVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQVPSQTVQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDLLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDVRMLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPGGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY	782492	681501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_682893_683464_683738_687031_687238_693329_693462_694008_694126_704762_704841_704936_705039_718409_718467_719490_719681_773230_773402_775086_775227_776673_776845_782163
892832	contig_15114_pilon	-	2264	7	Intergenic	novelGene_121131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	197.977622192229	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	668	1672	115515	100551	FALSE	25	TCTGTACGTGTTCATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNNILRETRVRTPIILFFCFCSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125316	99958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115955_123580_123705_125212
892833	contig_10958_pilon	+	649	3	Intergenic	novelGene_5407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5463	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCTGAAGGGTGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888220	1015338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889372_1015267
892834	contig_4857_pilon	+	3480	3	Intergenic	novelGene_48733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1080	1658	1194283	1194861	TRUE	70	AAAAAAAAAACCCACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	1192682	1196734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1193027_1193547_1195407_1195457
892835	contig_7396_pilon	-	1851	15	Intergenic	novelGene_79600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3309.96331134485	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	89	1534	255163	246251	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSLLLFKKPTFLCFIGVLHLRCSEIFAVHQM	257075	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246342_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
892836	contig_13740_pilon	-	465	4	Intergenic	novelGene_34703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2028	junction_1	639.028603080923	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATGCCTTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158683	157083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640
892837	contig_8964_pilon	-	1255	4	Intergenic	novelGene_168703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.575130337475	703	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACAGGTAGGAGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549672	542768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543520_547367_547457_548900_549078_549434
892838	contig_10331_pilon	+	1566	16	Intergenic	novelGene_54146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	326.964313377198	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	146	1147	410802	541426	TRUE	55	GAAAATGAATCAGAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVREITSDTAPKPDAVLKQAFDQALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEAEDDEKEKEDNSSEEEVASGPAPYYHSPWPQQQEASPSLVIDKSGNYFIT	409820	545846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409917_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541321_541453_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719
892839	scaffold_12124_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_22405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	163	942	1508626	1509405	NA	45	CTGGAAATTATATGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508463	1509582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508500_1509600
892840	contig_7548_pilon	+	2173	8	Intergenic	novelGene_117625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	132.690525321909	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	171	872	193134	206475	FALSE	15	TTGGGCATGTGCTTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192777	207776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192942_193127_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
892841	contig_4426_pilon	-	2306	7	Intergenic	novelGene_15421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.580907858087	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	924	1381	2304	821170	820247	FALSE	60	GAAGATAAAAAATAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEG	904632	820244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821620_821801_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
892843	contig_14142_pilon	-	1875	6	Intergenic	novelGene_120528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	901	junction_2	137.385006459948	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	681	1370	351273	349539	FALSE	5	CTGCCTGTTTGGGCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	351953	349033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180
892844	contig_12638_pilon	+	1873	16	Intergenic	novelGene_33155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	94	junction_1	158.195940388986	1055	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	60	1673	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235616	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
892845	contig_9955_pilon	-	5043	4	Intergenic	novelGene_21266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	824.856081723082	153	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	208	843	49317	47546	FALSE	30	CATTTAAGTGTAAGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	43345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794_49115_49192_49380_49692
892846	contig_5039_pilon	+	3719	1	Intergenic	novelGene_64770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATTTGAATGCCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120704	124423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_120700_124400
892847	contig_4402_pilon	-	1383	1	Intergenic	novelGene_140862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	103	402	613840	613541	NA	45	AGACTTGTAAGAAAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLRSFKMEQRNVCLNKCPSNNFHQTNFENLKLFVRCSLNLANIVFVYIYSVAKNFVLKLVTFLFRAFAFIFNTLYSLEYLQKTLMKTELLWVLFFLI	613942	612559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_612600_613900
892848	contig_5551_pilon	-	6858	4	Intergenic	novelGene_134282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.238207143479	1137	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	5074	5385	792284	791973	TRUE	20	CATTTCGTAGCCTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNRLHGKWFNQGLGRQAYSTGSPFVLSPPRQADISVVFPSPRTQTAETLHPAPCSFLQDIPKLSSTEEETLPRKPSGRSSCCTPAGKPGLNAVCPTHPAST	834225	788547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_789698_791649_797237_817301_817377_834179
892849	contig_16594_pilon	-	2023	3	Intergenic	novelGene_53911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	4	junction_1	319.5	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAGAAAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335653	269471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_271279_273523_273670_335583
892850	contig_9653_pilon	-	1905	12	Intergenic	novelGene_48196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_11	554.75371648184	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	151	1560	196924	175913	FALSE	40	AAATCACTGGTTTATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200698	175567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200610
892851	contig_7744_pilon	+	1660	4	Intergenic	novelGene_62450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168.738456395294	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2	418	64350	69015	FALSE	55	AAACAAAGGTTAACAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPLLPCHGPAPQARSPAEAQPNPDPQPPCSGTSSRRHGQRRPRVLKEIRKLQKSTDLLLRKRPFGLLAREVCAIFTRGVDFNWQAQALLALQEAAEAFLVHLFEDAYLLSLHAGRVTLYPKDVQLARRIRGIQEGLG	64348	70257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_64437_67637_67755_68255_68334_68880
892852	contig_16204_pilon	+	1876	10	Intergenic	novelGene_154513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	421.499205511604	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	607	1392	389626	395754	TRUE	20	CTGAGGACTATAGCGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNISFHRNHTATVRSQVENRTASHVDNEYSQPPRNSHISAYPALEGALHRSSAQPDNSSDSDYDLHGTQRL	369258	397244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_387991_388298_389478_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394977_395098_395665_395758_396763
892853	contig_17274_pilon	+	4822	4	Intergenic	novelGene_26494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	3653	4168	192697	193212	FALSE	60	AAACAAAAAGGGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARFSSFVILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGTPITRRFLLLIVSHIILSLLSFFFVLFSDFSSNRVVSKCLSSIPLMLSSTISNLLLNPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCILFLNSSFFLVCIFHEFVCLFHGFAYFLLIFVCFLLQLLDNSEY	56341	193866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_57363_57506_58102_134295_134912_191276
892854	contig_6007_pilon	+	2260	10	Intergenic	novelGene_87909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_2	33.8464214786967	857	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	28	1110	58259	80410	FALSE	30	CATGTGTTGCATTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIIQRDESPMEKGLSGLRGRDFELSDVFYFSKKGLEAIVEDEVTKRFSSEELVSWNLLTRTNINFQYISLRLTMVWVLGVIVRYCVLLPLRVTLAFIGISLLVIGTTLVGQLPDSSFKNWLSELVHLTCCRICVRALSGAIHYHNRQYRPQKGGICVANHTSPIDVFILTTDGCYAMVGQVHGGLMGVIQRAMVKACPHVWFERSEMKDRHLVTKRLKEHIADKKKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGGTIHPVAIKYNPQFGDAFWNSSKYNMVSYLLRIMTSWAIVCDVWYMPPMTKQEGEDAVQFANRVKSAIAVQGGLTELSWDGGLKRAKVKDTFKKEQQKNYSKMIVGNGSLNSQLD	58231	81560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_58504_63537_63613_64167_64258_68754_68849_72983_73100_74554_74611_75158_75245_76041_76171_76894_76975_80298
892855	contig_5023_pilon	+	2622	11	Intergenic	novelGene_7188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2137.61245552135	53	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	145	1311	607279	646990	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580784	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609694_625714_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
892856	contig_7457_pilon	+	2876	18	Intergenic	novelGene_31653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	173.831521663579	12	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	81	1001	1014473	1032699	TRUE	10	ACTGGTGTCTCATGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPTAAHTANFLLNASGSTSTPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQDSVPSPRPLQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGLVPTRLLKPQ	1014392	1041115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1019001_1019771_1019863_1021032_1021063_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026562_1032663_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
892857	contig_6576_pilon	-	809	1	Intergenic	novelGene_42446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTCAATTGACATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304262	1303453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303500_1304300
892858	contig_3123_pilon	-	4727	4	Intergenic	novelGene_162971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	116	469	258645	258292	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKRTQPSTKWNKKLTENTERGETHAEVPYQLLQHRSAMLDSYRRSANRGYQKAASRSFKQETEQPVTSDIRLPSPHTYSPPLGLLCYPQPQSLCWKASASPQCHLDSTRLHWLTP	258760	95821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_97147_188255_188277_251951_252251_255678
892859	contig_9183_pilon	-	3624	7	Intergenic	novelGene_40281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	442.674698722311	10	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	156	2039	323783	312131	FALSE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAAQDPELPCRLRPPQRASQAEELVQLLPCFCSLAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325948	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323859_325868
892860	contig_12948_pilon	-	6809	10	Intergenic	novelGene_126203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1118	junction_7	132.126295735146	253	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	4033	6699	249445	233708	FALSE	25	TTGCCCCAGTATATTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPICLLGMLDEESLTVCEDGCRNKLHHHCMSIWAEECRRNREPLICPLCRSKWRSHDFYSHELSSPVDSPSSLRAAQQQTTQQQPLAGSQRRNQESNFNLTHYGTQQIPPAYKDLAEPWIQVFGMELVGCLFSRNWNVREMALRRLSHDVSGALLLANGESTGNSGGSSGSSPSVGATSGSSQTSISGDVVEACCNVLSMVCADPVYKVYVAALKTLRAMLVYTPCHSLAERIKLQRLLRPVVDTILVKCADANSRTSQLSISTLLELCKGQAGELAVGREILKAGSIGIGGVDYVLNCILGNQTESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAGIFMC	253477	233597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_233888_234585_234739_235113_236399_236877_237068_237339_237432_240648_240771_245391_245671_248451_248636_248748_248831_249345
892861	contig_6292_pilon	-	4812	6	Intergenic	novelGene_178629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	974	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	4297	4605	138678	138071	FALSE	5	TGTCTCCCGCTGGACGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRNQKKQKRKATLAANKWHSESRPLGCVESKQPAPPSQETVALGSRGTNEQKPRDPTSAAAQTRKQLHSRMQPRSLSGRSKDGARSQALEQKEGEAARGK	310637	137863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6292_pilon_-_138159_138457_140763_190446_190790_209905_209978_308797_309351_309393
892862	contig_4604_pilon	-	2388	14	Intergenic	novelGene_19156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTCCAGGCTGTAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380718	364379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_364409_364510_364634_365238_365454_367055_367198_367287_367454_372054_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374926_377353_377531_378438_378604_379334_379468_379806_380107_380297
892863	contig_3956_pilon	+	2337	11	Intergenic	novelGene_15180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1101.67963129033	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	20	1813	1282731	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282711	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285074_1287475_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
892864	contig_7129_pilon	+	5882	5	Intergenic	novelGene_169291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	4640	5440	418220	419020	FALSE	65	CACAAAAAAAAAGCACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTGKKLEEFRKMMQEQTAKINSQLDIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHFDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYREETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVV	34	419462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_477_1140_2519_91762_92255_287394_287420_415917
892866	contig_14684_pilon	-	2576	2	Intergenic	novelGene_99665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2191	2547	314281	313925	FALSE	80	CAGCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMFSRIDHILGHGAILNKVQNTDIIQSIFSDHNVIKVEINNRKTEEKKSSTWKLNTTLLTHHWVIEEIRDGVKKFLESNENENTSYQNLRDTAKAVLRGQFIALDAHIKKEGTKSKH	317970	313895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_314843_316341
892867	contig_1893_pilon	+	3854	5	Intergenic	novelGene_172345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	500	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1592	1897	181414	181719	TRUE	15	ATATTTGTCCTTTTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTERKIRKKKCVHGCPCVFAQSKGVASKLRSTAQLEGAPKPRKKENRQIKREQIRANKQTEKPWGSHQHSGTGREAVSQLSSVLQPFTKKQRWHMEPCI	93182	307578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_+_94481_96259_96471_96775_96787_181342_182029_305930
892868	contig_9981_pilon	+	1035	2	Intergenic	novelGene_121020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	195	677	10529	11159	FALSE	15	TCAAACTGCCGTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVLSKIFGNKEMRILMLGLDAAGKTTILYKLKLGQSVTTIPTVGFNVETVTYKNVKFNVWDVGGQDKIRPLWRHYYTGTQGLIFVVDCADRDRIDEARQELHRIINDREMRDAIILIFANKQDLPDAMKPHEIQERNQKPIHRIIATITFFNCHFLFF	10334	11517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10937_11084
892869	contig_15047_pilon	+	1518	7	Intergenic	novelGene_52202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	21285	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20993_21062_21232
892870	contig_1301_pilon	+	5978	8	Intergenic	novelGene_47380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3227	3526	693850	694149	TRUE	25	GGAGCAGAAGCTACGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRRFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRLTIQPGSGQPRKTKWD	690623	746792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_695856_703496_703629_710363_710456_712726_712862_713946_714019_715056_715199_717953_718016_746681
892871	contig_10722_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_70967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATAGTACAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6317	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_3700_6300
892872	contig_12079_pilon	-	1356	1	Intergenic	novelGene_67569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAGAAAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871903	870547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_870500_871900
892873	contig_8065_pilon	+	9317	18	Intergenic	novelGene_107327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	210.59740367817	1227	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	979	2940	800	3739	193090	248583	FALSE	25	TGGAGCTAGGTTGTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRRKKVKELIEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEVEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSSVSSSPRQTVDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKIKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPKKKKLKLSADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKAAAAKVELVKENTEKKRERKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDWVQCDGGCDEWFHQICVGVSPEMAENEDYICINCEKKQGPDSPGQAPPPSFIMSYKLPMEDLKETS	125063	254161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139246_193046_193110_193450_193576_194049_194201_195650_195766_196153_196510_215370_215510_226319_226500_227129_227286_230281_230834_231201_231349_237535_237696_238861_239083_241012_241424_248376
892874	contig_10074_pilon	+	6098	22	Intergenic	novelGene_57081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	171	junction_4	139.084975412471	480	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1003	3012	2194	5205	36343	66719	FALSE	10	TTTTCCCTCTTTTGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFSNFQYYGLQILENVIKTRWKILPRNQCEGIKKYVVGLIIKTSSDPTCVEKEKVYIGKLNMILVQILKQEWPKHWPTFISDIVGASRTSESLCQNNMVILKLLSEEVFDFSSGQITQVKAKHLKDSMCNEFSQIFQLCQFVMENSQNAPLVHATLETLLRFLNWIPLGYIFETKLISTLIYKFLNVPMFRNVSLKCLTEIAGVSVSQYEEQFVTLFTLTMMQLKQMLPLNTNIRLAYSNGKDDEQNFIQNLSLFLCTFLKEHGQLIEKRLNLRETLMEALHYMLLVSEVEETEIFKICLEYWNHLAAELYRESPFSTSASPLLSGSQHFDVPPRRQLYLPVLSKVRLLMVSRMAKPEEVLVVENDQGEVVREFMKDTDSINLYKNMRETLVYLTHLDYVDTERIMTEKLHNQVNGTEWSWKNLNTLCWAIGSISGAMHEEDEKRFLVTVIKDLLGLCEQKRGKDNKAIIASNIMYIVGQYPRFLRAHWKFLKTVVNKLFEFMHETHDGVQDMACDTFIKIAQKCRRHFVQVQVGEVMPFIDEILNNINTIICDLQPQQVHTFYEAVGYMIGAQTDQTVQEHLIEKYMLLPNQVWDSIIQQATKNVDILKDPETVKQLGSILKTNVRACKAVGHPFVIQLGRIYLDMLNVYKCLSENISAAIQANGEMVTKQPLIRSMRTVKRETLKLISGWVSRSNDPQMVAENFVPPLLDAVLIDYQRNVPAAREPEVLSTMAIIVNKLGGHITAEIPQIFDAVFECTLNMINKDFEEYPEHRTNFFLLLQAVNSHCFPAFLAIPPAQFKLVLDSIIWAFKHTMRNVADTGLQILFTLLQNVAQEEAAAQSFYQTYFCEILQHIFSVVTDTSHTAGLTMHASILAYMFNLVEEGKISTPLNPGNPLNNQMFIQEYVANLLKSAFPHLQDAQVKLFVTGLFSLNQDIPAFKEHLRDFLVQIKEFAGEDTSDLFLEERETALRQAQEEKHKLQMSVPGILNPHEIPEEMCD	34149	67612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_36440_49863_49926_50153_50199_52215_52398_53286_53336_53414_53535_54721_54851_55791_55951_57925_58124_59042_59182_59387_59570_59652_59810_59886_60051_60343_60479_60822_61007_61334_61442_62886_63082_63906_64076_64619_64755_64835_64996_65085_65183_66572
892875	contig_13519_pilon	+	2462	13	Intergenic	novelGene_124623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.788728288218	81	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	905	1669	98653	120612	FALSE	25	GCTTATGAATCTTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57008	121405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79405_79476_82120_82231_98631_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116675_116756_120484
892876	contig_401_pilon	+	4419	4	Intergenic	novelGene_42759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	305.53995919792	550	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2338	2673	990079	998753	FALSE	5	GTACCTGGGGCTGTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYMNSLLSAVLPSVLNKFRIYLTLLRFLDYSISDEITKAVEDDFVEMRKNDPQSITADDLHQLLVVARFLSLSAGQTTLSRERWLRAKQLESLRRTRLQQQKCVNGNEL	987695	1000499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_987824_987869_990199_998223_998313_998626
892877	contig_253_pilon	-	5031	1	Intergenic	novelGene_129626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGATGGTACATATCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145093	140062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_140100_145100
892878	contig_11281_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_125421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACATACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54522	52616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_52600_54500
892879	contig_15092_pilon	-	3793	2	Intergenic	novelGene_57760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAGTAATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259791	254988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_258005_259014
892880	contig_1225_pilon	-	2583	4	Intergenic	novelGene_44171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	714	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGGCGCAGACAGACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276798	250742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_250837_253413_253517_274219_274446_274638
892881	contig_5959_pilon	-	6472	4	Intergenic	novelGene_150184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	147.657260799009	824	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	141	1250	216308	211902	FALSE	15	CCATGATTTGGCCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218732	206679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216392_218675
892883	contig_9801_pilon	-	4228	1	Intergenic	novelGene_167563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	374	1125	318	1442	103036	101912	NA	40	TTAAAAAGATCAGCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPEKKVENSSRHQENSTADSIKNGKLSPVSKDNWTEKKTSENSSVRGQVQKGTDESESDFESDSPSPKSSEEEEQEDDEVLQGEQGDFNDDDTEPENLGHRPLLMDSEDEEEEEKHSSDSDYEQAKAKYSDMSPVYRDKSGSGQIQDPNITLLTPTQIPSDAGVETPKQEFDVFGAVPFFAMRAQQPQQGENEKNLSQQTHFPPVGLEQEEFDVFTKAPFSKKVNVQDCLKVGPKAHTLPGCPISVDVFGSTPFQPFPTPVSKSESNEDIFGLVPFEEITGSQQQKVKQRSLQKLSSRQRRTKQDMSKSNGKRHHGTPTSTKKTLKPTFRTPERARRHKKVGRRDSQSSNEFLTISDSKENISVALTDGKDRGNILQPEESLLDPFGAKPFHPPDVTRHPSHTGLSDIRADHNTVLPGRPRQNSLHGSFHSADALKIDDFGAVPFTELVVQSITSHQSQQSQSVELDPFGAAPFPSKQ	103353	99125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_-_99100_103400
892884	contig_11396_pilon	+	2909	21	Intergenic	novelGene_71261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	511	834	125533	127412	TRUE	40	CAAAGGCCGGGAAGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNPARYSSRTDSNQRPGFLGFFRRDFSRIALALVSCPTFSSSRESKSHRGVEWGHFFNSLAVGLPGLLHQLLLLLYLPLHHPQLGKILIVLQGLLAQLLGSSEVP	121410	155242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_121630_122168_122296_124391_124514_125490_125576_126105_126244_127269_127443_127612_127735_128715_128855_130391_130515_133875_133998_137865_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144295_146253_146407_146608_146792_147260_147333_147885_148006_153256_153426_155157
892885	contig_14142_pilon	+	1267	3	Intergenic	novelGene_120549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	32	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGGACTGGTTGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432440	433889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_433026_433063_433631_433774
892886	contig_13365_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_168077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCTTTTTATACCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12999	15328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_13000_15300
892887	contig_3155_pilon	+	2943	3	Intergenic	novelGene_26392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	622.5	11	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	199	519	259780	260100	FALSE	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPVSMTSSEKTQSFLCILSLRNDLVFIVSPSLDNSSQYWYNH	258105	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259297_259731
892888	contig_252_pilon	-	1240	7	Intergenic	novelGene_99910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	320.140420579609	1052	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	629	1066	42753	37945	FALSE	15	TGTTTAATTCCTCTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFTLVSAVQEKLNEIVDQIKTRREEEKKQKEKEAEEAEKQLFHGTPVTIENFLSWKAKFDAELLEIKKKRMKEDEQAGKNKLSGKQLFETDHNLDTSDIQFLEDAGNNVEVDESLFQEMDDLELEDDEDDPDYNPADPESDSTD	68258	37770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_38067_41271_41335_41811_41945_42633_42778_49723_49855_60942_61009_67851
892889	contig_11816_pilon	+	5475	10	Intergenic	novelGene_98455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	624	junction_5	502.277725546581	850	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	143	2263	420896	449750	FALSE	15	GTATCTTCAGTCTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGAIVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSSAATGGSTSDSAHGGINTGITGILPGSLFRFAVPPALGSHLTDNVMITVDIIPSGWNSSDGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQECMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLQLNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGSTNEPSTRVRFINLARTLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA	400526	452962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433939_437138_437309_442782_442893_445555_445670_447166_447216_449691
892890	contig_7291_pilon	-	2035	9	Intergenic	novelGene_106301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	258.652487664434	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	32	763	197091	173628	FALSE	20	ATCTGGGTAAGTCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKRAERQGDLMLPRKMNWAVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEADIMDINEIFKDLGMMIHEQGDVIDSIEANVESAEVHVQQANQQLSRAADYQRKSRKTLCIIISVLVIGVAIIGLIIWGVNKKN	197122	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180758_181475_181570_183797_183868_197066
892891	contig_18194_pilon	-	3847	2	Intergenic	novelGene_55953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	0	2	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	1830	2558	5370	4642	FALSE	10	CCCTAAGCTCTTGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	8733	3352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034
892892	contig_7887_pilon	+	6196	4	Intergenic	novelGene_124950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	42.6249796350554	819	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	366	716	856987	866731	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRKLNDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLAAILEARGVSVAVGTTHAPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC	855100	872211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_855322_855408_855537_856970_857041_866434
892893	contig_3442_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_178630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1262	1615	4973	5326	NA	25	TACCTGTTTTCTATCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLASRGDLRGSQPPRHTYEHSHTQNQNSRVTRSPYLRAYSRGRSSGGTCRPRNQGLRFRSGNLGPALSTLALSATGRGVANSPWDPSYAGLAFLSPTSFGAVGDQRCCDRTRSGR	3711	5955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3442_pilon_+_3700_6000
892894	contig_3509_pilon	-	4470	1	Intergenic	novelGene_160699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	12	39	272	310	13812	13774	NA	55	AAAAAAAGTAACAATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISQLDLIDIYTTLQPTVAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLTNHWMIEEIRDGILEF	14083	9613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_9600_14100
892895	contig_6048_pilon	+	2446	1	Intergenic	novelGene_73167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1332	1778	1196591	1197037	NA	40	TTGCTAGTGAAGATCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEATLKLALEHRVAKANGTNDEVKELKGRFQRVALEDKVKYYNEKCTDLELENQKRRTCSAFPKLKELKKKFKPQVAIFKDKMLNDTRSIKRRWKEYTESLYQKELVNIQPFQEVTYDQEVEVEVQAALKALAKNKAPGIDGRRIEM	1195259	1197705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1195300_1197700
892896	contig_6513_pilon	-	3364	5	Intergenic	novelGene_117777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205736	196259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_199157_203369_203567_203802_203874_203963_204055_205628
892897	contig_6509_pilon	-	2555	11	Intergenic	novelGene_145625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	95.9779141261155	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2166	388	2553	91952	71643	FALSE	60	GAAAGAGAAAGTAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRKTRTQMPPVQSMLWHYQAGAPLQAPWHEMEAPRSKKKEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEVRAKPEEAYREGLKEFSCDSFFKDKSDSDFVKSLESWERHHSVKEKDKKDGIDKE	226694	71640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_71807_72676_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_78933_79031_91925_92065_110630_110775_172768_172837_226631
892898	contig_4962_pilon	-	2832	3	Intergenic	novelGene_107395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTAGCGCCTCCCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445617	440475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_440984_441365_441471_443398
892899	contig_10734_pilon	-	3419	3	Intergenic	novelGene_51130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTCAAAGAAAGAAACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860917	784060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_784304_784541_785592_858791
892900	contig_10958_pilon	+	1163	3	Intergenic	novelGene_5408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_2	5459	76	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTTACTATTGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	891760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_890856
892901	contig_6497_pilon	-	6547	7	Intergenic	novelGene_35636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	475.819789649634	74	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	952	2859	1062	3920	756796	749805	FALSE	50	AGTGCTATGAAGAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELLQKQMKEKEDDLQEKFTQLEAENSILKDDKKALEDMLKIYTPVNQEERFIFLDSSNSKSKDGSWQKEIDMLTEENENLKAQCIQLKEEIVKQRNTFSFAEKNFEVNYQELQEEYACLLKVKTDLEDSKNQQEVEYKSKLKALNEELHHLQRINPSVVKMKTSVFDDDKTFIPEMLEIGEVVEKDTTELMEKLEVTKREKLELSERLSDLSEQLKQKHGEISVLSEEVESLKQEKEQVLLRCRELEIIINHNRTENVNVFDVQSRSFKDRVVTVTSRDSEESLSKINKGFVEESRVMKEDKIPFENMTIGEESKQEQLLLDHLPSVTNESMLEATEPGENDKLQQELSVLKSEQVCLLV	790232	747177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_752208_754320_754519_755398_755555_756694_757280_764427_764473_767272_767531_789957
892902	contig_14868_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_150447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134674	132365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_132400_134700
892903	scaffold_13505_pilon	+	3155	1	Intergenic	novelGene_111582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1553	1861	626656	626964	NA	40	GCCAGTAGAAGACTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKILLKIIQKRLQQYIDRERPEIQARFRRGHGTRDIIADVRWILVESREYQKDVYLCFTDYAKAFDCVDFNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLCIDQEAVV	625103	628258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_625100_628300
892904	contig_6375_pilon	-	4233	19	Intergenic	novelGene_72948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.911111352321	762	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	181	1716	229189	202748	TRUE	15	ATCTGCGCCTGCGCACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	230627	196313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_196388_196741_196903_197538_197758_199548_199693_200148_200233_200429_200595_200800_200904_201014_201180_201260_201343_201427_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_230494
892905	SIRV6	+	1462	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	55	11	-54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	253	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
892906	contig_6079_pilon	+	6363	4	Intergenic	novelGene_160074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_2	141.530522817126	1618	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	41	859	394906	507353	FALSE	40	GCACCAGACGATCAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSRICCNFLNMWKKSKISTMYYLNQDAKLSNLFLQASSPTTGTAPRSQSRLSVCPSTQDICRICHCEGDEESPLITPCRCTGTLRFVHQSCLHQWIKSSDTRCCELCKYDFVMETKLKPLRKWEKLQMTTSERRKIFCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGNDNGVLEWPFWTKLVVVAIGFTGGLVFMYVQCKVYLQLWRRLKAYNRVIFVQNCPDTAKKLEKNFSGNANTDIKDAVVVPVSQTGTSAPPPAEGGPPEVVPV	394865	512857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_395097_439214_439396_484540_484689_507054
892907	contig_4426_pilon	-	4744	10	Intergenic	novelGene_15386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	190.321819720515	921	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	1092	3059	463307	434801	FALSE	50	GGGAAAAAAAAAAGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECFLPPTSSPSEHRRGEHGSGLTRTPSSEEISPTKFPGLYRTGEPSPPHDSLHEPTDVVSDDEKDHGKKKGKFKKKEKRTEGYAAFQEDSSGDEAESPSKMKRSKGIHVFKKPSFSKKKEKDFKIKEKPKEEKHKEEKHKEEKHKEKKSKDLTAADVVKQWKEKKKKKKPIPEPEVLQVDVPSLRPIFGIPLADATERTMMYDGIRLPAVFRECLDYVEKYGMKCEGIYRVSGIKSKVDELKAAYDREESPNLDEYEPNTVASLLKQYLRDLPENLLTKELMPRFEEACGRGTENEKVQEFQRLLKELPECNYLLISWLIVHMDHVISKELETKMNIQNISIVLSPTVQISNRVLYVFFTHVQELFGNVVLKQVTKPLRWSNMATMPTLPDTQESIKEEIRRQEFLLNCLHRDLQGGIKDLSKEERLWEVQRILTALKRKLREAKRQECETKIAQEIASLSKEDVSKEEMNENEEVINILLAQENELLTEQEELLAMEQFLRRQIASEKEEIERLGAEIAEIQSRQQHGRSETEECSSDSESESEDEEELQVILEDLQRQNEELEIKNNHLNQAIHEEREAIIELRVQLRLLQLQRAQSEQQVQDEEEPERRGGAAQPPRDGVLETKAAREQPKAAKEQAKPSPSKDRKETPI	511641	433115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_435068_436929_437054_437288_437411_439230_439339_451289_451422_452405_452568_454942_455293_458835_459295_463063_463362_510604
892908	contig_9017_pilon	-	2337	7	Intergenic	novelGene_130343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	868	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGGGGCCCTGGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619383	609351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_-_609401_609468_609852_610069_610383_614245_614524_614832_614936_616850_616931_618252
892909	contig_17427_pilon	-	2477	14	Intergenic	novelGene_30340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1169.59463973711	1195	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	390	1382	184471	178046	FALSE	15	TGCTTCGTTGTTTACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204713	176950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184577_186428_186496_188038_188140_188767_188811_188858_188890_204671
892910	contig_4797_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_6943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATAGCTTGGCTGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657701	656246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_656200_657700
892911	contig_5684_pilon	+	2222	2	Intergenic	novelGene_81036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	448	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	46	513	403611	441865	FALSE	70	AAAAAAAAAAAGATAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYPPTAVARPPGSWRMELRCGGVGSQAVGRGMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403565	443574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607
892912	contig_7051_pilon	-	4094	13	Intergenic	novelGene_64344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	768	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAGAACAAGACAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348526	321861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_330163_331794_331924_334316_334504_334735_336111_337633_337812_338671_338865_342961_343099_343372_343470_344164_344222_345362_345536_346865_347950_348189
892913	contig_11026_pilon	+	3593	17	Intergenic	novelGene_167640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_2	236.538051907087	918	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	76	2319	43170	125017	FALSE	35	ATACTTTAACTTCCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKEDDYNEESPTEPSSDGIISEKEITQDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKTMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEATLNDRRRVALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTVRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESDEILPFHPFHPFPSLPESEGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSKSEVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	43094	126291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104535_105665_105834_108820_108952_110007_110083_111253_111413_112211_112341_115713_115814_117394_117548_122159_122246_123351_123427_123810_123967_124915
892914	contig_7161_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_178038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	672	157	828	518992	518321	NA	50	CTTTTAAAGAAAAACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYAFFVQTCQEEHKKKHPDASVNFSEFFKKCSERWKTMSAKEKGKFQDMAKADKARYEREMKTYIPPKRETKKKFKDPNAPKRPPWAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGEVVKKLGEMCHNTAADDKQPYEKKAAKLREKYKRILLHTGLKESLMQPKRELSRLRKARKRRKRRKMKKMRRTKRRRRTKKMKMKKMMMNKLVLVQFFFLVYKAFNPPVHNSL	519148	518320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7161_pilon_-_518300_519100
892915	contig_2214_pilon	-	2209	14	Intergenic	novelGene_144261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGTTTCTTCCAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318622	305177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_305242_305349_305535_306025_306174_308088_308227_308331_308464_309974_310105_311473_311686_312562_312707_313250_313449_314698_314909_315112_315177_316107_316315_317507_317782_318519
892916	contig_2069_pilon	+	2395	3	Intergenic	novelGene_23465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	608	junction_2	164	17	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1265	2332	1436133	1439381	FALSE	15	TGATGAGTTGAGGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1434868	1439444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1436748_1437870_1438000_1439057
892917	contig_11855_pilon	-	2099	12	Intergenic	novelGene_67144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	237.267328395561	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	424	1269	2718660	2710017	FALSE	25	TAACCCTGAATTTATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2723889	2709186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718745_2719642_2719718_2719882_2719986_2723728
892918	contig_4531_pilon	+	3171	1	Intergenic	novelGene_47937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1534	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTGTGGTGTCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701847	705018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_701800_705000
892919	contig_5770_pilon	-	3330	8	Intergenic	novelGene_74151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	204.423030772475	34	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGAACATCTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256960	117601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_117846_118015_118122_150709_151125_221062_221789_234946_235197_253744_255058_255963_256152_256872
892920	contig_10134_pilon	-	3197	5	Intergenic	novelGene_16175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18.6195461813654	151	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	1660	2859	28070	26871	FALSE	25	TTAAAATGCCTTCTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHFVEEFRRKHVKDLMGNKRALRRLRTACERTKHTLSSSTQATLEIDCLFEGLDFYTPITRARFEELCSDLFRSTLEPVDAKLDKAQIHDIVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFSGRELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMRDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQRNATIPTRQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTTIDRSTGKANKITIANDKGRLSKEDVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRVAAKNSLEAYVFHVKSSLQEEGLRDKIPEEDRRRAQGKCQEVLVWLERNQLAEKDEYEHQKRELEQMCCPIFSRLYGGPDIPRGSSCGAQACQGASSTGPVIEEVD	39728	26532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_28449_29679_30271_34922_35221_38568_38817_39584
892921	contig_17274_pilon	+	2034	15	Intergenic	novelGene_26501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	72	junction_13	151.432429196143	325	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	169	1704	87831	124457	FALSE	10	CTTCATCTCACTCTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRSSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87662	124787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
892922	contig_8330_pilon	-	3262	8	Intergenic	novelGene_71966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	338.438310177672	7	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	246	968	2056301	2038853	TRUE	25	CCCACCAATTGTATACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056546	2032464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2034753_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056297
892923	contig_9945_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_104821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAGAAAACAAGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123260	121166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_121200_123300
892924	contig_6199_pilon	+	1837	5	Intergenic	novelGene_126385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	192.981054769633	2146	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	26	385	461129	503431	TRUE	40	TCATCAGATGAACTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSSTRSKMAASRRLMKELEEIRKCGMKNFRNIQVDEANLLTWQGLIVPDNPPYDKGAFRIEINFPAEYPFKPPKITFKTKIYHPNIDEKGQVCLPVISAENWKPATKTDQGGWDQLMHLRWPLASF	461103	514959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_461156_478402_478499_501226_501414_503381_503455_513530
892925	contig_8050_pilon	-	2658	1	Intergenic	novelGene_114868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	479	781	417795	417493	NA	35	AGGACTAGAAGGCAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLSFLNLGFPITSFHVPSCLLVLVPGPYRHFLTSLNFHFHICSLRIRSPGGAVVKRLAANQKVSSSNPPDVLQEKDVAVCFHKDYSLGNPMGQLYSLL	418273	415615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_415600_418300
892926	contig_15449_pilon	-	3078	1	Intergenic	novelGene_33655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGTTGGGTCTCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190533	187455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_187500_190500
892927	contig_9038_pilon	-	2409	17	Intergenic	novelGene_143322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_10	112.271277910915	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	55	909	398177	368724	TRUE	65	AGAAAAAGAAAGAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLHSLFELRSCILNGTVMLDMRASTLDEIADMVLDNMIASGQLDESIRENVREALLKRHHHQNEKRFTNRIPLVRSFADIGKKHSDPHLLEKNGILASPQSAPGNLDTSKSGEIKGNGAGGSRENSTVDFSKVDMNFMRKIPTGAEASNVLVGEVDFLERPIIAFVRLAPAVLLSGLTEVPVPTRFLFLLLGPAGKAPQYHEIGRSIATLMTDEIFHDVAYKAKDRNDLLSGIDEFLDQVTVLPPGEWDPSIRIEPPKSVPSQEKRKIPVFPNGSALTSGDPPKEAAHHAGPELQRTGRVQ	398231	349962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_350054_353248_353423_354823_354893_358381_358634_358811_358974_360920_361035_362372_362535_364926_365033_367342_367589_368599_368734_374589_374697_378299_378447_380857_380946_383130_383289_385189_385306_395504_395694_398137
892928	contig_11417_pilon	+	4392	33	Intergenic	novelGene_103285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	2172	junction_19	1054.76876723941	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1404	4212	179	4390	479699	570649	FALSE	45	TGAAATCCTAGAAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSARLGGAARARPAGRGRRRGAGTLETEQPAHSAGFSSAAAALPRSHRFLSRDPGLVAMSATDEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGEDLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWLNAMGEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEEEINNMKIELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDHRIPADTFTALKNPNAMLVNLEEPLASTYQDVLYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNINKVNAYSALANIDLALEQGAAQELFKALQSPALGLRGLQEQNSDWYLKQLLSDKQQKKQSGQTGPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVAAINAAIQRGVAEKTVLELMNPEAQLPQVYPFAADLYQKELATLQQQSPEHSLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDMNTVWKQLSSSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQETQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGVFAINEAVDSGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGATYQSDLAEAKKKKLAAGDNNSKWVKHWVKGGYHYYHNLETQEGGWDEPPDFVQNSVHLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITKLQACCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQSQWRGYKQRKAYQDRLAYLRSHKDEVIKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDIIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMIVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHDEVRTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIISSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETL	479520	570651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437_517516_521571_521649_527039_527108_528494_528609_529167_529347_530872_530958_536807_536972_537763_537849_538884_539049_539279_539441_540490_540616_542616_542781_551052_551144_551338_551507_552205_552349_556571_556743_557388_557473_557569_557642_557739_557810_558178_558388_559106_559263_559490_559655_560664_560890_566040_566182_566276_566362_567428_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597
892929	contig_14225_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_52753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1457	1765	368848	368540	NA	45	GCACTTTGAACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDTLLKSSISSNSFLVDSLEFSVYKIISSANRYTFTSSLPIWMCFISFSSLTALARTSSTMLNKSGDKGHPCLVPILKGNAFKLSLFRGSGQSWRRM	370304	367938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_367900_370300
892931	contig_5479_pilon	+	3394	12	Intergenic	novelGene_133604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_11	253.788419719007	11	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	4	1194	319705	444787	TRUE	25	GTGACTTGCCCAAGATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMGSLSFGISELQKAGVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEGNEELRQKFERAKISQGTKTPEEKTTNTISKCDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKAVLKFNNSPAFSHQHPLNCQMQWPILSAFPI	319701	448852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_319761_334184_334282_344547_344695_375219_375394_395880_395973_398958_399022_403751_403891_409404_409486_409800_409909_415695_415837_444694_444798_446662
892932	contig_7285_pilon	+	2489	12	Intergenic	novelGene_143382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	236.296738784797	950	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	80	1279	218772	324708	TRUE	45	AAACAAAAGGTGTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVDPFSFLLPPRVLPQRRGDYTAVGMPQLSGGGGGGGGDPELCATDEMIPFKDEGDPQKEKIFAEISHPEEEGDLADIKSSLVNESEIIPASNGHEVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWQGQPVYPITGGFRQPYPSSLSVDTSMSRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	218692	343309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_218985_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_310159_310244_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_342105
892933	contig_16722_pilon	+	2492	8	Intergenic	novelGene_118296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	748	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTAATGAAAATAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149991	184749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_151156_152222_152398_155147_155290_155908_156034_164406_164543_164933_165286_166754_166943_184539
892934	contig_5797_pilon	+	5419	28	Intergenic	novelGene_56946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	181.772600970688	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1124	3375	438	3812	333281	418675	FALSE	40	CTATATCAGAGTGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAPRFFVGPEDTEVNPGNYRHFFHHADEDDDDEDESPPERQIVVGICSMAKKSKSKPMKEILERISLFKYITVVVFEEDVILNEPVENWPLCDCLISFHSKGFPLDKAVAYAKLRNPFVINDLNMQYLIQDRREVYSILQAEGILLPRYAILNRDPNNPKECNLIEGEDHVEVNGEVFQKPFVEKPVSAEDHNVYIYYPTSAGGGSQRLFRKIGSRSSVYSPESNVRKTGSYIYEEFMPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEVRYPVILNAREKLIAWKVCLAFKQTVCGFDLLRANGQSYVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNIVMRELAPQFHIPWSIPLEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAVIRHGDRTPKQKMKMEVRHQKFFDLFEKCDGYKSGKLKLKKPKQLQEVLDIARQLLMELGQNNDSEIEENKSKLEQLKTVLEMYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYSRGVLSPDRHVRTRLYFTSESHVHSLLSILRYGALCNESKDEQWKRAMDYLNVVNELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	322631	420282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322819_333030_333395_334941_335138_337618_337710_338882_338969_340495_340651_341435_341538_342634_342797_344522_344645_345910_346013_347027_347115_348058_348135_348209_348320_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362793_363574_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_408614_408756_412625_412752_418562
892935	contig_1948_pilon	-	1325	6	Intergenic	novelGene_31195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	66.0908465674332	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	720	604	1323	568353	556938	FALSE	45	CAGTCAGGAAAGAGACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPLGKVLLRNVIRHTDAHNKIQEESDMWKIRELEKQMEDAYRGSKRKMLPSSSSRMRSDGFDEESQRDYWKPRHEISGTLEDDFLKAKSWNKKLYDYEANMPDRWGHSGYKELYPEEFETDSSDQQDVINGKKTSPQVKSTTHESRRHKKSKKSHKKKQKKKSHKKQKKSKKEAIDVAAHSSTEISEETEASSTRKRKQPHKRKKKSRKKSLKKPALFLESESDTFQSDDSASSSSE	569587	556935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_557284_557739_557794_558680_558831_563196_563298_568284_568362_568992
892936	contig_14970_pilon	+	3859	6	Intergenic	novelGene_45083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	5330.18318634548	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	519	623	231446	231550	TRUE	25	TGGATTGAGGAGTCTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	213685	234826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231704_231743
892937	contig_14441_pilon	+	760	4	Intergenic	novelGene_100755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	184	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	187	735	125667	126705	FALSE	10	ATGGTGTGCAGCCTGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121201	126730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
892938	contig_1452_pilon	-	5157	3	Intergenic	novelGene_115127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	3406	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	15	AAGCTTTTTGTGTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	695160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
892939	contig_10074_pilon	-	4168	16	Intergenic	novelGene_57120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.249443825784929	78	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGCTCGACCCAGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361263	315931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_315967_320557_321193_323132_323289_324791_324871_326376_326504_327137_327246_328515_328623_328738_328862_329875_329998_338510_338589_341260_341405_341505_341651_342584_342744_356962_357079_358110_358287_359405
892940	contig_7293_pilon	+	2344	3	Intergenic	novelGene_54243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	14871	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	403	729	335695	336451	FALSE	55	AAAATAAACCAATTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335292	338066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
892941	contig_755_pilon	-	3006	3	Intergenic	novelGene_119769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	492	junction_2	46.5	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	53	505	88997	85518	FALSE	70	AAAAAGATTAAATGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQ	89049	83016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_85704_87670_87817_88876
892943	contig_10042_pilon	+	2346	9	Intergenic	novelGene_79101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	244.292825058371	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	10	1680	6321	53427	FALSE	75	AAAAAAAAAAACAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
892944	contig_9931_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_134831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322384	320036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_320000_322400
892945	contig_7993_pilon	+	5238	3	Intergenic	novelGene_170962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	115	junction_1	94.5	1152	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	35	721	16712	33022	FALSE	60	TAGGAATAAATTTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKVLYLKNLSPRVTERDLISLFARFQERKGPPIQFRMMTGRMRGQAFITFPNKEIAWQALHLVNGYKLRGKILVIEFGKNKTQLSDLQADSLISCATDNTAEISGS	16677	37539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_17084_31084_31233_32855
892946	contig_16098_pilon	-	1176	6	Intergenic	novelGene_45937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	965.276623564458	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	109	795	352350	348487	FALSE	15	GTAGGGGGTTCGAGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVILGSPRTPCPGWRRR	354097	348105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348534_350232_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
892947	contig_15047_pilon	+	1604	6	Intergenic	novelGene_52232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	59	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	394	669	3242	4178	TRUE	35	TGAGCATGAAAAAGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATSPPPLPAPIDPGPGRRAGSGVGGLSRSPPAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2452	21725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
892948	contig_12866_pilon	+	4678	3	Intergenic	novelGene_174639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_2	39.5	1156	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	256	1464	636766	684533	FALSE	20	CCTTTGGGAATACTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFWRYSLFAFTVFSVVVFVIVYNSRLSLPKSYEQLNISGERYFRIQACDSISEERSTFLWEKPLVSPLGSVPCEDYLTQSHYITSSLSEEEAAFPLAYVMVIHKDFDTFERLFRAVYMPQNVYCVHVDEKAPATYKESVGQLLSCFQNAFIASKIEPVVYAGISRLQADLNCMRDLVASKVPWKYMINTCGQDFPLKTNKEIVQYLKGFKGKNITPGVLPPEHAIKRTKYVHREHIGKYGSFVQNTNILKTSPPHQMTIYFGTAYVALTREFVNFVFHDKRAIDLLQWSKDTYSPDEHFWVTLNRIPDVPGSMPNASWTGNLRAVKWSDMEGKHGGCHGHYVHGICIYGNGDLKWLINSPCLFANKFELNTYPLTVECLELRLRERTLNQSETAIQPSWYF	636510	687747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_637691_675017_675111_684342
892949	contig_10904_pilon	-	3030	4	Intergenic	novelGene_22764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1	417	875247	874831	TRUE	70	ATAAAAAAAAAAAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAASQSFQQETEQPVTSDIGLPSPHSPLPPLSLFCFLQPQSLGQEAPASPGVAWIPPTHTARLLSAFCWLLVLLFSASLDFFLPLTTSPFFLSNTWLCELSLLLPKRLRETPLDCETASRPVPPRWWDPRGFFVCLL	875247	673770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_675108_676899_677804_731424_731433_874466
892950	contig_9183_pilon	-	6275	4	Intergenic	novelGene_40332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	396.94360080775	31	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	2200	3243	323783	322740	TRUE	35	CATTTGATATGAAATCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLK	325982	311853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_320557
892951	contig_12869_pilon	+	2196	7	Intergenic	novelGene_75327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	333.255032470129	1261	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	100	1095	67431	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVWWTTVLVQCIALTLHSQAAFRWMIIGGFKCWQTLWPLCLGDESSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67331	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
892952	contig_9113_pilon	-	2101	6	Intergenic	novelGene_68593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	642.28199414276	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	326	1066	348512	347698	FALSE	35	TTCACAATGACTGGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGLWLHHRSVRKRSQLLPVRNV	364458	346662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_347761_347834_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364434
892953	contig_2710_pilon	-	5858	16	Intergenic	novelGene_161776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	209.462635225368	907	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	321	1724	1106645	944051	FALSE	25	TGACTGGTTTTAAATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAPTTPPSVDKVDGFSRKSVRKARQKRSQSSSQFRSQGKPIELTPLPLLKDVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFMDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGCLTEQTYPEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQEFQPSIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFVYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKVLIPLHTVRSLSLFHAQLAYCIVQFLEKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLKAFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIPT	1109377	939916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_944151_948310_948413_950426_950555_956497_956618_958356_958408_958511_958566_960067_960177_961169_961230_961353_961485_985987_986081_992008_992111_1019489_1019687_1106488_1106653_1108826_1108892_1108994_1109051_1109185
892954	contig_10777_pilon	-	1718	3	Intergenic	novelGene_101180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTTGGAAAACTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463906	461669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_-_461766_461878_462287_462692
892955	contig_12391_pilon	+	3282	13	Intergenic	novelGene_103606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	245	junction_1	252.251018608229	839	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	11	1339	56828	107379	FALSE	30	TCTGTGCCTATATTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQNSDFLCQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56817	109322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96528_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
892956	contig_16211_pilon	+	6826	4	Intergenic	novelGene_150078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1146	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGTGAAAAAGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170708	181278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_176084_178192_178268_178756_178851_179996
892957	contig_8357_pilon	-	4333	1	Intergenic	novelGene_39722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	700	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	297	596	503225	502926	NA	15	TACTTCCATCTCCTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTDRSDQDHNTGFWTELEKDVEQNSNTHTQKDHIYWPKGDWRNPENMAPRHPFSSVVKSLPRFTIQPGTGQPHKTKLD	503521	499188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_499200_503500
892958	contig_8674_pilon	-	10175	6	Intergenic	novelGene_102922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2429	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	5205	5792	455951	455364	TRUE	30	GAGTTAGTCAATTTAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLVGLMYSESHGTFLIFSITQLFFDALLPIASLCFCLCKYSFGAITLLILHEISFESEELIFEDFIKLLWILISRFVDFTSIDTVFSLILVLSFKFDKELHNLNELPAFLFCSRLSYFFFFLSISNIFPWSNFLFSRSLYLEPPALNFNFIFSGDIDCIKEPFFLYRSLFVKITVFAFSGREFCAVCFFCRLS	464815	427649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_427727_430044_430135_445721_445788_451213_456504_457757_457842_460247
892959	contig_6546_pilon	+	513	4	Intergenic	novelGene_140965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	9389	junction_1	322.54853209332	622	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	131	475	597703	599657	FALSE	20	TGCAGCTGTTGATTTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIKAAGVNVEPFWPGLFAKALANVNIGSLICNVGAGGPAPAAGAAPAGGPAPSTAAAPAEEKKVEAKKEESEESDDDMGFGLFD	597572	599695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_+_597775_598338_598414_599246_599365_599577
892960	contig_9955_pilon	-	3486	6	Intergenic	novelGene_21262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	785.102184432065	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	208	726	49317	46990	TRUE	35	TCAGCAGCCATCACACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEKS	49837	39590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_39711_44349_46999_47590_47737_48794_48962_49120_49380_49692
892961	contig_6102_pilon	+	11989	29	Intergenic	novelGene_32073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.371153744479045	1974	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	9301	9693	790637	791991	TRUE	30	CCCGAACGGAGCCAACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQSEKAPLGSIRPGIREKSGRGWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSALDFFLASFCFELLVSCFRLFLACPWIVV	778243	809022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_784556_784643_784790_784898_785127_785506_785654_785774_785908_786012_786302_786492_786649_786758_786914_787038_787261_787418_788073_788583_788731_788887_788941_789045_789230_789439_789515_789842_790060_790454_790708_790863_791097_791583_791653_791971_792073_793462_793672_793832_793936_794104_794212_795039_795099_795189_795644_796226_796448_797093_797278_798168_798761_800354_800497_808878
892962	contig_7356_pilon	-	3170	14	Intergenic	novelGene_60415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	370.131193756641	61	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	727	1647	489008	477760	FALSE	70	GCAAAGAAAAAAGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKRTG	492228	476236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_477773_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811
892963	contig_13863_pilon	+	6208	2	Intergenic	novelGene_42089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	5041	5385	462472	464278	FALSE	80	GAAAACCAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETVVPTALCPAIQSLREFGSVFGASVTFPCTSSTGFPSIVYCLNPSPELPLTCCLFSSPPPSLVTNKDCFFLCVNFYMSFYSMISGCEFVFSIWFLHYFLEFFHFFGLCSP	457431	465101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_462725_464186
892964	contig_7408_pilon	-	2325	8	Intergenic	novelGene_168741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	214.273523462753	8	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	458	1537	38514	12597	FALSE	40	AGTCAGAAGACTAGGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48761	11808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48682
892965	contig_2703_pilon	+	616	1	Intergenic	novelGene_101626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGGGGCCGGGGGTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_2000
892966	contig_8538_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_4644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	609	1830	700	2529	841232	843061	NA	25	TTTCTTTCAATAAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840532	843100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840500_843100
892967	contig_9091_pilon	+	2594	1	Intergenic	novelGene_32422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAAAATCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18240	20834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_18200_20800
892968	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
892969	contig_10734_pilon	+	4365	28	Intergenic	novelGene_51064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	52	junction_1	363.920833580402	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1251	3756	143	3898	460686	489905	FALSE	25	TTTATAATTTATTTTACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPGQDLLLAALSESGISPNDLFDIDGGDAGLATPTPTPPVHQSVPLGALELGLETEAALPVKQEPETVPTPALLNVRQPPSTTTFVLNQINQLPTLGSTIVMTKTPPVTTNRQTITLTKFIQTTANTRPSVSAPAVRNAMTSAPSKDQVQLKDLLKNNSLNELMKLKPPANIAQPVATAATDVSNGTVKKDSANKEVARIWINDMKMNFSSTVKVPVGKEEDEPEEEDEEEMGHAETYAEYMPIKLKIGLRHPDAVVETSSLSSVTPPDVWYKTSISEETIDNGWLSALQLEAITYAAQQHETFLPNGDRAGFLIGDGAGVGKGRTIAGIIYENYLLSRKRALWFSVSNDLKYDAERDLRDIGAKNILVHSLNKFKYGKISSKHNGSVKKGVIFATYSSLIGESQSGGKYKTRLKQLLHWCGDDFDGVIVFDECHKAKNLCPVGSSKPTKTGLAVLELQNKLPKARVVYASATGASEPRNMAYMNRLGIWGEGTPFREFSDFIQAVERRGVGAMEIVAMDMKLRGMYIARQLSFTGVTFKIEEVLLSQSYVKMYNKAVKLWVIARERFQQAAELIDAEQRMKKSMWGQFWSAHQRFFKYLCIASKVKRVVQLAREEIKNGKCVVIGLQSTGEARTLEALEEGGGELNDFVSTAKGVLQSLIEKHFPAPDRKKLYSLLGIDLTAPSNNSSPRDSPCKENKIKKRKGEEITREAKKARKVGGLTGSSSDDSGSDSDASDNEESDYESSKNMSSGDDDDFNPFRDESSEDDEDDPWLIRKDHKKNKDKKKKKSIDPDSIQSALLASGLGSKRPSFSSAPVISPAPNSASANSNTNSNSLITSQDAVERAQQMKKDLLDKLEKLAEDLPPNTLDELIDELGGPENVAEMTGRKGRVVSNDDGSISYESRSELDVPVEILNITEKQRFMDGDKNIAIISEAASSGISLQADRRAKNQRRRVHMTLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQVTAPEYVFLISELAGEQRFASIVAKRLESLGALTHGDRRATESRDLSRFNFDNKYGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPGEFFKDVRQGLIGVGLINVEDRSGILTLDKDYNNIGKFLNRILGMEVHQQNALFQYFADTLTAVVQNAKKNGRYDMGILDLGSGDEKVRKSDVKKFLTPGYSTSGHVELYTISVERGMSWEEATKIWAELTGPDDGFYLSLQVRLVFFKCSLFVHVMLFHVPHGNPPFCFVPVFQLCFIFCTSIIE	452568	490372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_452711_460685_460818_461380_461486_463215_463526_466146_466245_469398_469496_471472_471634_472997_473132_473331_473423_474648_474811_476100_476237_476315_476422_476554_476709_477478_477662_478248_478347_479657_479810_481268_481467_481858_482027_482122_482296_483014_483147_484714_484851_485510_485624_485723_485796_486328_486429_487935_488011_489271_489419_489502_489598_489677
892970	contig_14970_pilon	+	3212	1	Intergenic	novelGene_45015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	447	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAACAAAAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145307	148519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_145300_148500
892971	contig_11269_pilon	-	4216	6	Intergenic	novelGene_145821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCCACTTTAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337792	326131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_326192_327158_327208_327815_327895_328843_328959_333520_333623_333981
892972	contig_9235_pilon	+	2578	4	Intergenic	novelGene_156191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.12825877028341	41	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	567	1208	45805	46953	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	42668	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_42848_43708_43935_45643_45849_46355
892973	contig_13558_pilon	+	1688	1	Intergenic	novelGene_123019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	319	960	49	1008	40701	41660	NA	10	TGTTGTTAGTTGCTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	40652	42340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_40700_42300
892974	contig_18544_pilon	-	4403	6	Intergenic	novelGene_152735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	697	junction_5	50.4404599503216	908	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	808	1455	54710	40105	FALSE	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISKYAFGFVFVFFKCSSWSPTLIDSVE	55610	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895
892975	contig_4812_pilon	-	2459	5	Intergenic	novelGene_103713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	782.006553680978	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	1060	2457	944244	935683	FALSE	55	TGATAAAGAAAGAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTA	952245	935680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_936111_943274_944451_944834_944939_946403_946960_952052
892976	contig_16322_pilon	-	2920	14	Intergenic	novelGene_87529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_13	153.527246391692	450	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	583	2289	103834	77890	FALSE	40	AATATTTTCTAAGCATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	106707	77258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_106148
892977	contig_10765_pilon	+	3090	8	Intergenic	novelGene_122856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	197.160351190681	4	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	125	1999	18249	84624	FALSE	70	AAATAAATAATGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRYSQLDSCVFRPVSSACTVVVYIVKKRKRFEGNWTRAQETQTEEKQKKKQNTNQLQ	15642	85715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727_34875_82720_82797_84531
892978	contig_16103_pilon	+	5094	24	Intergenic	novelGene_118915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_4	340.606936315399	613	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	982	2949	1798	4746	771073	799889	FALSE	10	CTAACTCTGGCGTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	769275	800237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
892979	contig_4780_pilon	-	1305	2	Intergenic	novelGene_65393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	194	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGTCTCCCGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315772	311830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879
892980	contig_2251_pilon	-	2004	12	Intergenic	novelGene_128468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_11	97.2919267373427	13	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	64	1137	138003	66074	FALSE	5	TCTCTTCTTTTTCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIWIGHRGTIRDYSGFSPSVDAEAIHKAIRGIGTDEKTLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGNFKRTMVALVTLPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKEISQAYYTIYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKKDAQILYNAGEKKWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEYKNISQKDIEDSIKGELSGHFEDLLLAIVHCVRNTPAFLADRLHQAVKGAGTDELTLNRIMVSRSEIDLLDIRAEFKKHYGCSLYSAIKVSFLLKIAKHILPFLTYPFSFLFLKRQKSGDPLTDCVEHSLELSLHPGWSKGE	145204	65206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_66359_70007_70067_76931_77028_78774_78869_79958_80016_81836_81917_85625_85717_89942_90057_93873_93969_109197_109286_137988_138042_145179
892981	contig_2332_pilon	-	2915	1	Intergenic	novelGene_58625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTATTGTGTACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6194	3279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_3300_6200
892982	contig_15029_pilon	-	2993	6	Intergenic	novelGene_128189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	51	626	172327	163104	FALSE	45	AAATAAATCTACATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVVCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172377	160736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
892983	contig_5918_pilon	+	4390	1	Intergenic	novelGene_99551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	627	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTAACGAGACAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773812	778202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_773800_778200
892984	contig_16951_pilon	+	1782	4	Intergenic	novelGene_98647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	348.281814371957	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	316	705	86293	106818	FALSE	30	TTATTGAGTTTAATTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDGANNNSYSTAISVCSAIRPTVLLYFLYTFGLRASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	85840	107895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_86165_86411_103952_104099_106692
892985	contig_5021_pilon	-	3404	3	Intergenic	novelGene_167108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTTTTTAAAAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593528	499839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_-_501812_529703_529904_592296
892986	contig_14970_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_45095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231469	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_231500_232200
892987	contig_19816_pilon	-	1377	8	Intergenic	novelGene_156481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_5	228.10765449852	485	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	22	612	126795	124895	TRUE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCPKDTGDSPPRL	126816	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125854_126164_126435_126731
892988	contig_20293_pilon	-	4127	16	Intergenic	novelGene_153498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_14	350.251617491705	13	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	242	1786	68656	19443	FALSE	45	CCCAGCCAATTAAAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116224	17101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_91497_91617_116147
892989	contig_854_pilon	+	1354	4	Intergenic	novelGene_36469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	34.0293990543471	1185	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	58	558	1514567	1526706	FALSE	15	GACAGCTTCCAGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRLLLRRFLALAISRNPPQGRWAPLTSGALQSPQCHPGGLAATLSPARTVHTTRVCTTTFNIQDGPDFQDRVVNSDTPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG	1513636	1527502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1513694_1514566_1514830_1517440_1517565_1526592
892990	contig_3270_pilon	-	4049	7	Intergenic	novelGene_104469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_5	307.791415662548	44	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	3153	4049	133171	121453	FALSE	20	GTACAGAGCTCCCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERM	141959	121452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_121504_127796_127939_130712_130841_132595_135896_138789_138935_139534_139682_141823
892991	contig_6137_pilon	+	2800	6	Intergenic	novelGene_59157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	1089.8464846023	202	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	804	1175	1268914	1313802	FALSE	30	GTATAAGGAATCTTCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNTLYNLFFLQDIFPTSKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKVCFLYLVSSFSSKCISFKSY	1238637	1315427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240550_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654
892992	contig_17470_pilon	+	7824	56	Intergenic	novelGene_110463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_23	276.543210797185	954	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2472	7419	101	7519	38865	89971	FALSE	20	TCCCCCTAAAGGCTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWIQEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETIRTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQDLEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKAKQDEVNAAWQRLKGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETIGWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGLERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREELITNWEQIRTLAAERHARLNDSYRLQRFLADFRDLTSWVTEMKALINADELANDVAGAEALLDRHQEHKGEIDAHEDSFKSADESGQALLAAGHYASDEVREKLTILSDERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVDNWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYAMEDVATRRDALLSRRNALHERAMYRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEAYKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLWKKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKHALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMIARKQKLADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRIKAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLNELNQKWESLKSKASQRRQDLEDSLQAQQYFADANEAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIHALREQAQSCRQQVAPMDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELGEKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDLKANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPKDETESKTASPWKSARLMVHTVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDNYGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQAWNSLGKRADERKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLERHQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKEKLDILDQERTDLEKAWFQRRMMLDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEKIAALQSFADQLISAGHYAKEDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDVDEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERGACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEALLASEDYGKDLASVNNLLKKHQLLEADISAHEDRLKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVKDKRDTINGRFQKIKSMAASRRAKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIGKEEIQQRLAQFVEHWKELKQLAAARGQRLDESLEYQQFVANVEEEEAWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHEENISSKMKGLNGKVSDLEKAAAQRKAKLDENSAFLQFNWKADVVESWIGEKENSLKTDDYGRDLSSVQTLLTKQETFDAGLQAFQQEGIANITALKDQLLAAKHIQSKAIEARHASLMKRWSQLLANSATRKKKLLEAQSHFRKVEDLFLTFAKKASAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSLEEIKALREAHDAFRSSLSSAQADFNQLAELDRQIKSFRVASNPYTWFTMEALEETWRNLQKIIKERELELQKEQRRQEENDKLRQEFAQHANAFHQWIQETRTYLLDGSCMVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAFDYIEFTRSLFVN	28717	90276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_28815_38861_39102_40427_40554_44517_44659_45038_45186_46576_46711_46882_47028_47105_47261_47943_48080_49247_49350_50268_50407_50895_51007_51808_51887_52015_52172_52408_52614_53122_53305_53645_53890_54085_54209_54764_54983_55804_55898_56208_56344_57611_57761_58846_58907_60084_60284_60863_60969_61418_61443_61955_61992_64182_64231_65164_65257_65607_65753_65836_66019_67629_67730_67882_68081_68185_68333_69020_69125_69295_69459_71520_71653_71908_72047_73069_73175_76238_76448_77264_77386_77636_77759_78136_78270_79627_79727_81385_81546_82226_82304_82984_83195_83604_83902_84382_84496_84990_85009_87600_87656_88113_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88983_89845
892993	contig_4884_pilon	-	4087	7	Intergenic	novelGene_63828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	657	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTGTCATCCCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593495	578094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_578561_578696_581361_582394_582484_584841_585017_586134_586318_592827_593039_593196
892994	contig_10225_pilon	+	5458	12	Intergenic	novelGene_86821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	513.714105138434	270	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	1775	3049	39837	46881	FALSE	35	TGTTAACTCTGATAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLFSGLAGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPGRRNYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPAMRVISPTSSTSLPGTRSWTNLRRFTSASRTWRCLNLAGCTALGSSQGKTICRAPAAGSSRKPWSGSGSIRDSALTGLSARTFARQITRTCHPLMKRCLRSRCCRQEEGS	20739	49290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41532_42623_42726_45216_45259_46110_46492_46549
892996	contig_8682_pilon	-	2370	9	Intergenic	novelGene_165269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	306.920185064456	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	833	1765	89446	55026	FALSE	35	TAGTCCTACTAAGTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFVAILLITLFAGDIELE	134949	54420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589_134063_134824
892997	contig_13224_pilon	+	6458	14	Intergenic	novelGene_104127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	84.5258267313333	567	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	161	1600	393528	413551	TRUE	40	TAAAATTGTATGAATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAPLPVPSALANNFPCDGVEAGLAATPGTPRSHRTAPAGKPTIFSVPLTPGTMATDSWALAVDEQEAAAESLSNLHLKEEKIKLDANGAVVKTNTNTEKTDEEEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPTNRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	393367	420100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405040_405134_408438_408542_409052_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882_413075_413489_415577_416141_416218_417343
892998	contig_610_pilon	-	3740	11	Intergenic	novelGene_76668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	520.732983399362	1103	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	207	1262	68933	32982	FALSE	30	GATCCATGACTTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKFPSLEYAKREDKPSSVTGLYILEI	93780	30503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34112_34187_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887_68955_69978_70099_93715
892999	contig_854_pilon	+	2041	8	Intergenic	novelGene_36671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5067.00212459125	379	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	288	1019	1705343	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1699278	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1704571_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709526_1715226
893000	contig_6040_pilon	-	4491	2	Intergenic	novelGene_178217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3248	3652	279384	278980	FALSE	20	AGACCGCCATCTTGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	283017	278140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6040_pilon_-_281936_282321
893001	contig_9484_pilon	+	3900	14	Intergenic	novelGene_105651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	551.6527829164	61	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	78	608	126829	201152	TRUE	35	GGGAGTGAAGCCAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKNVNE	126751	214546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_201137_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513_213375_213461
893002	contig_13506_pilon	+	5237	4	Intergenic	novelGene_178631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATCCAAGAAGCTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63803	198875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13506_pilon_+_65558_114279_115326_196361_197776_197852
893003	contig_14651_pilon	-	2412	10	Intergenic	novelGene_157218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	47.8162635692961	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	94	885	112577	97836	TRUE	35	GCACCAGGAAAACAGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVAWGRFFARAWLCRRAWQGCSRQYRAAFCAELKQPLAIEKVDHRPVCPHEVRVNVHFCGVNFADILVCRGQYQEEPHLPFTPGMEFSGIVLETGTDVSTVKEGDRVIGVCGFNGMAEECITDQKSLWKIPEGVALREAAVLPISYGTAVLALEHRARTQPGETVLVTAAAGATGLAMIDVATNVLQAKPGLGGQDCGGGVCWRNHCFCASQRSTPEEYLCHGDVLGPVQKQELLPLLQYPVLGASVLPARAHPALHWSGV	112670	85291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_85641_86071_87240_97825_98055_106152_106235_107093_107204_107844_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
893004	contig_5019_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_109193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCAATTTTTTTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121938	120068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_120100_121900
893005	contig_10331_pilon	+	7716	22	Intergenic	novelGene_54060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	161	junction_14	480.487578325569	792	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1003	3012	32	3043	52192	109782	FALSE	35	CAATGAGTCAGAGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLVLYLSELMHNHQDELSEEELDTAELLMNALKLCGHKCIPPSAATKSDLIKMIKEEQKKYETEEGVNKATWQKTVNNNQQSLFQRLDSKSKDISKIAADITQAVSLSQGIERKKVIQHIRGMYKVDLSASRHWQELIQQLTHDRAVWYDPIYYPNSWQLDPTEGPNRERRRLQRCYLTIPNKYLLRDRQKSEDLVKPPLCYLFEDKTHSSFSSTVKDKAASESIRVNRRCISVAPSRETAGELLLGKCGMYFVEDNASDAVESSSLQGELEPASFSWTYEEIKEVHKRWWQLRDNAVEIFLTNGRTLLLAFDNTKVRDDVYHSILTNNLPNLLEYGNITALTNLWYTGQITNFEYLTHLNKHAGRSFNDLMQYPVFPFILADYISETLDLNDPSIYRNLSKPIAVQYKEKEDRYVDTYKYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGVRSMNSTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPINFIQSSQQYQVTSCAWVPDSCQLFTGSRCGVITAYTNRLTSSTPSEIEMESQIHLYGHTEEITSLFVCKPYSIMISVSRDGTCIIWDLNRLCYVQSLAGHKSPVTAVSASETTGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEGVSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSHKPIVSLTFSCDGHHLYTANSEGTVIAWCRKDQQRLKQPMFYSFLSSYAAG	52160	114455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_52333_52903_52981_53537_53727_55927_56074_56161_56259_59469_59532_60914_60971_64318_64472_67058_67304_70621_70689_71998_72156_75274_75416_79165_79384_83233_83465_88910_89101_92594_92732_96144_96244_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643
893006	contig_2215_pilon	+	5007	2	Intergenic	novelGene_163833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1003	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	452	844	85719	86111	TRUE	50	TAGAACAAAATTCTAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPIINFIWKGKRLWISKALLKKNKKGRLSLPDLRIYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTHGHLIFDKGPKTFKWGTDSLFNKWCWQNWMSICKKIKQDPYITPYTETNSKWIKGLNIK	85267	237333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_86873_233931
893007	contig_173_pilon	+	7339	13	Intergenic	novelGene_178633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	718	207	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3794	4240	156552	156998	TRUE	35	ATTCTATGGAGAAATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERETPQISKALLKKKKVGELTLPDLRTYYTAMVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYSHLIFDKHPKYIKWGKDSLFNKWCWQNWMSNCKKMKQDPYLTPYTNTNSKWIKDLNIKQKTIKFIEEKIASMLEALIHAINGYKP	56214	257229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_173_pilon_+_56629_89322_89517_93301_93418_117318_118554_119675_120851_155892_157176_157894_159048_162908_163180_165516_165772_197400_197494_226221_226450_230420_230746_256632
893008	contig_10225_pilon	+	4184	11	Intergenic	novelGene_86825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	568.360704130748	1186	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	1223	2530	46329	47636	FALSE	35	TGTTAACTCTGATAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21296	49290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21601_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_46319
893009	contig_6576_pilon	+	5652	8	Intergenic	novelGene_42331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	52	junction_1	434.844471375358	998	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	70	1386	665402	708104	FALSE	30	TGTAAAAATTTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQRPGQSGVRARSRRPRGGTRRRMEPEPELLLQEARENVEAAQSYRRELGQRLQGLREARRQIKESASQTRDVLKQHFNDLKGTLEKLLDERLVTLLQEVDTIEQETIKPLDDCQKLIEHGVNTAEDLVREGEIAILGGVGEQNEKLWSFTKKASHIQLDSLPEVPLLVDVPCLSAQLDDSILNIVKDHIFNHGTVASRPPVQIEELIEKPGGIIVRWCKVDDDFTAQDYRLQFRKCTSNHFEDVYVGSETEFIVLHIDPNVDYQFRVCARGDGRQEWSPWSIPQIGHSTLVPHEWTAGFEGYSLSSRRNIALRNDSESLGVLYSSAPTYFCGQTLTFRVETVGQPDRRDSIGVCAEKQNGYDSLQRDQAVCISTNGAVFVNGKEMTNQLPAVTSGSTVTFDIEAVTLGTTNNNEGGNFKLRVTISSNNREVVFDWLLDQSCGSLYFGCSFFYPGWKVLVF	665332	712370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_665519_684676_684885_688932_689021_689512_689691_692096_692320_693449_693583_706165_706279_707847
893010	contig_6102_pilon	+	2582	13	Intergenic	novelGene_31771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_1	189.439450895413	2687	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	329	1513	350018	357373	FALSE	15	ATGTGCATTTGTACGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKKASKTAENATSGETLEENEAGD	349689	358442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038_357093_357307
893011	contig_16411_pilon	+	5038	25	Intergenic	novelGene_77308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	1199.05923771745	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	270	3161	124585	241651	TRUE	40	TGTACAATGAATACATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTPSEKHMLLKVMGFGLYLMDGNVSNIYKLDAKKRINLSKIDKFFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHYEENKSKWTCTQSSISPQYNICEQMVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLPHPHHSQGWACACSPMTSPWWVSIVQMKKKQGSVCFFFSFFTLCCIKSF	124315	243609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_124624_127063_127169_129442_129535_131612_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240281_241502_243028_243108
893012	contig_1244_pilon	-	1787	14	Intergenic	novelGene_37999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	989.375159937115	6	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	79	1491	948448	923081	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELSAQFLIKCCQRLL	948526	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923122_923290_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
893013	contig_19459_pilon	-	1223	8	Intergenic	novelGene_59837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	102	887	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19065	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
893014	contig_8330_pilon	-	2237	7	Intergenic	novelGene_71845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	270.954126908761	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	112	747	916108	900688	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFR	916219	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896352_900687_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
893016	contig_8452_pilon	-	2370	10	Intergenic	novelGene_48017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	245.938916435126	2	54	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	722	1189	380814	316088	FALSE	15	CTTTTCAGTATGTTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	550822	314906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_384381_384488_412328_412377_416565_416690_504315_504426_504970_505091_509599_509723_550741
893017	contig_5084_pilon	+	4023	2	Intergenic	novelGene_64539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTAAAGGTCAAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499471	514849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_503436_514790
893018	contig_9653_pilon	-	1303	6	Intergenic	novelGene_48251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	110.650079078146	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	199	777	913657	839279	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDCTRHTTLGLLNKAKAHIKKLEEAERKSQHQLENLEREQRFLKRRLEQLQGPQEMERIRMDSIGSTISSDRSDSEREEIEVDVESTEFSHGEVDNISTTSISDIDDHSSLQSIGSDEGYSSASVKLSFTS	931134	838752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_839443_844948_845121_845715_845831_879607_879638_913559_913693_930971
893019	contig_2703_pilon	+	2481	1	Intergenic	novelGene_101630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCCGGAGAAGCCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	3825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_3800
893020	contig_5686_pilon	+	2240	3	Intergenic	novelGene_45217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1539	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	143	334	93843	170346	TRUE	60	AAAAAAAAAATACCATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSR	93700	172705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170674_171126
893022	contig_3018_pilon	-	4053	1	Intergenic	novelGene_78955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3370	3732	1426690	1426328	NA	25	TATCATATTCACACTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENAQNYREFKSLILRILQERRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNGKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIKG	1430059	1426006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_1426000_1430100
893023	contig_7253_pilon	-	4307	23	Intergenic	novelGene_140195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	154.53682462536	79	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1458	2849	4306	179610	161695	FALSE	25	CTATGACCCCAGTGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSHLMVQMGEEYYYAKDYTKALKLLDYVMCDYRSEGWWTLLTSILTTALKCAYLMAQLKDYITYSLELLGRASTLKDEQKSRIEKNLISVLMNESPDPEPDCDISAVKTAQKLWADRVSLAGSGIFTVGVQHFVPFVQCKTKFHAPSFHVDVPVQLDIYLKADCPHPIRFSKLCVSFNNQEYNQFCVIEEASKASEVLENLNQEKMCFVPGKTRKFLFKFVAKTEDVGKKIEITSVDLILGNETGRCVVLNWQGGGGDAASSQEALQASRSFKRRPKLPDSEVHWDSIVIQASTMIITRVPNISVRLRHEPPALMNEMYCLVVTVQSHEKTQIRDVKLTAGLKPGQDANLTQKTHVTLHGAELCDDSHPALLTDVPVGELHPGEQLEKMLYVRCGTVGSRMFLVFVSYLINTTVEDKEIVCRCHKDETVTIETVFPFDVAVKFVSTKFEHLERVYADIPFLLMTDILSASPWALTIVSSELQLAP	200414	161693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_161809_161932_161999_165965_166086_169477_169600_170668_170818_170940_171129_172775_172932_175885_176017_178166_178300_178449_178512_178951_179098_179455_179511_179594_179674_179758_179839_183737_183886_184495_184630_187284_187382_188871_188946_189384_189485_194905_195021_196077_196149_196978_198537_200006
893024	contig_610_pilon	-	2274	7	Intergenic	novelGene_76664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.327231057372	4	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	488	892	68933	31884	FALSE	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQCSSGELGITQSSKQETLKEVESFSRENVEDDGVDNETTRVHPTS	93795	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32019_45053_45278_68887_68955_69978_70099_72506_72694_81741_81821_93715
893026	contig_7963_pilon	-	3049	12	Intergenic	novelGene_58459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_11	450.849171238688	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	703	2139	125592	120628	TRUE	5	TCCTCCTCTTCATCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126294	118256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
893027	contig_11542_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_178634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	570	660	1229	4501	5070	NA	80	AATAAAAGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHI	3841	5070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11542_pilon_+_3800_5100
893028	contig_14353_pilon	+	2166	9	Intergenic	novelGene_82074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	561	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1366	1743	80437	82722	TRUE	50	CAGGACAAAGATCTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSPLAKGPGSFYACTLVSWMSPPHFQVVDGRQVLQAVAVFTQVLAIHGHLEAVAFTQYPHREVLAAAEGHFPRQAALLRPPGIVDLCVADHSILIEAGVEVEGDVTARAQVDVEPLGAGQDGT	79071	88568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80621_82377_82545_82695_82785_83259_83302_83903_83953_84505_84542_86256_86353_87359_87474_88544
893029	contig_17427_pilon	+	2119	10	Intergenic	novelGene_30285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	198.115815984514	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	16	936	147949	175576	TRUE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147933	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453_176170_176288
893030	contig_5686_pilon	-	6626	6	Intergenic	novelGene_45434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	4783	5454	208699	203000	FALSE	35	ATGGCTGAGGAAGTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	241665	201827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_203002_208029_208722_212480_215408_221310_222914_224040_224201_241595
893031	contig_6544_pilon	+	3520	3	Intergenic	novelGene_142090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	587	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	87586	87912	TRUE	10	GCCCTGTCCCAGATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKELSQAPNGVRKTDRERRARTDSCRGPLSANAVQIRHLGLLSDTSKQGYEKAASRSFQRETKQPTICDICFPTPPPPFFTPTQPPLLPAATVSCPGSTSCLDSTHLH	87584	91486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_88234_88320_90877_91171
893032	contig_1263_pilon	-	3706	8	Intergenic	novelGene_170392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1016.00259119065	52	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	151	765	65303	60088	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSGSCQKKYSSKDPTYSDGTESSRAI	76694	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53517_54889_55637_58131_58321_59765_60167_63319_63454_63985_64123_65038_65324_76564
893033	contig_13216_pilon	-	4484	1	Intergenic	novelGene_47451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGATTTCCAATCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132810	128326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_128300_132800
893034	contig_9653_pilon	+	6542	2	Intergenic	novelGene_48266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	144	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	5255	5575	1010469	1010789	FALSE	90	GAAAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSCEAAGGFKPWSFWLTAKCFNHCATRVPQVLHRRMQIRRMLVCLIRVLVSLRNWRHQVPLRVAVREKVENGGKLKVRIRNRFPSPLPYSTLPSIYLFPTLAED	1005008	1011756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1006765_1006970
893035	contig_13481_pilon	-	1253	8	Intergenic	novelGene_119380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_7	501.663925230379	493	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	265	879	556920	527468	TRUE	35	ATACACCAACGTTCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLKSEGEHSTGTSTGSGGSLEEEVRTLFVSGLPVDIKPRELYLLFRPFKGYEGSLIKLTSRQPVGFVIFDSRAGAEAAKNALNGIRFDPENPQTLRLEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	557184	520957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_521325_527460_527531_536157_536304_536767_536919_537232_537296_538013_538053_538608_538687_556845
893036	contig_8322_pilon	+	4440	12	Intergenic	novelGene_143241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_11	352.225463104961	880	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	192	2291	290111	304580	FALSE	15	CATTTGTAGTGTTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGCRSHSSAQFLIGDQEPWAFRGGLAGEFQRLLPIDGANDLFFQPPPLTPTSKVYTIRPYFPKDEASVYKICREMYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	289919	306729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472_295648_299239_299326_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
893037	contig_14513_pilon	-	3336	3	Intergenic	novelGene_70245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2339	2788	12282	11833	FALSE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVVDVYFWVFCGCVVSLQFRSSKIIFVTPHPINISCPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	15718	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12539_12712_13290_14213
893038	contig_16098_pilon	+	2568	2	Intergenic	novelGene_46213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1066	junction_1	0	787	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	746	1420	766291	766965	FALSE	35	TTTTAAAAGGAATCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPSAPSAPYAPPSALVSQAAPQAPVRSTFWVPQPWEERPHNPGMVSWAEPELRPGASVFLGNPQSRRQRPGSPEPDWGLQPRVTLEQISAFWRREGRTSVGF	764892	768113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290
893039	contig_10235_pilon	-	3748	6	Intergenic	novelGene_46520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_3	21.9034243898072	774	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	240	1490	331785	328214	FALSE	40	ATAAACAGTGTCACTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVELLRTAFLGRPGGPRMLGIWRDFAAQVFAATLLLLLSPAGFGARAKDDFSLVQPLVTMEQLLWVSGKEIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFSEARKMSASDMGAKFIALRRSIDQGSTWSPTEFIIDDGETPDGLNLGAVVSDAETGVVFLFYSLCAHKFGCQVASTMLVWSKDDGLSWSKPQNLSLDIGTEMFAPGPGSGIQKQREPWKGRLIVCGHGTLERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVTGIPYGQPKQEHDFSPDECQPYELPDGSVIINARNQNNYHCHCRMILRSYDACDTLRPRDVTFDEELVDPVVAAGALATNSGIVFFSNPAHQEFRVNLTLRWSFSNGTSWQKERLQLWPGPSGYSSLAVLEGSMSGEGQAPQLYVLYEKGRYQCTEGISLAKVSIYGIF	332024	325955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_328441_328537_328761_328943_329127_329763_330027_331063_331257_331623
893040	contig_12970_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_50522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCTCCCACATATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149097	151179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_149100_151200
893041	contig_12079_pilon	+	3001	1	Intergenic	novelGene_67486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	995	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACATACCAGTTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623614	626615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_623600_626600
893042	contig_6576_pilon	-	4172	10	Intergenic	novelGene_42258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	268	junction_2	580.741820199299	1052	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	130	1374	339439	323781	FALSE	65	GTTTTAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	339568	320982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
893043	contig_1735_pilon	+	2260	9	Intergenic	novelGene_106879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_8	509.996813715537	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	126	1688	126256	139773	FALSE	55	AAGCAACTAGAAAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSQDHSDTDNEVAYSSLNFNAQLPKKPTSAFPSQTATETIYSEIKRK	126130	140345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137757_138447_138468_139653
893044	contig_4422_pilon	-	2207	2	Intergenic	novelGene_155953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	1835	2206	47383	47012	FALSE	35	TGAATAATACTCTGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSTTWK	82972	47010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_-_48248_82002
893045	contig_9463_pilon	-	4040	7	Intergenic	novelGene_83807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	185.20049195999	504	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	70	1821	44553	33222	FALSE	55	AACGGTGAAAATGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRLLLPLVALLSLRLGSDAQGTELPSPLSVWFEAEFFHHMLHWTPILNQSQSTYYEVEFLCYGEESWKAIPTCNQTLAQSCDITAVTLGLYHNNGYRAKVRAVDGSRRSNWTISDTRFTRDEVTLKVDSVKLEIHNGCIFGTIQPLRPKIAPAGDMYEHIFKNFREYEIDIRKVPGEYTFTNKKVNHENFSLPASGEVGEFCIRVKPSVGSRTNKGVWSKEECITLTRQYFTPTILSICFTFVLPLCGALVYCLALQLYVRRGRKLPSVLVFKKPSPFSLVSQLPCPEAPDSIYHLDVEAFPKVSPELRNSELHGSTDSGFGSAKPSLQTEEPQFFLPEPHPEATGTRGQGEPPVLENSCSGDSSNSTDSGICLQEPSLSPSTGPGWELQVGSDSRDQDDSGIGLAQNSVRQPGGTQGSSALGEVSPPRPELPGEEDPAAVAFQGYLKQTRCAEEKTAKVGCLEVESSSTDGLGPKFRMCLGAEADWPPPDLAKGYMKQDPPGMTLLPSGAPTGQWNQPAEEWPLLGLTSCGDLGTSDWSFVPDLAPVDCVAASCSLLSSFDSDLVALPLISSLHANEDPG	44622	31002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_34158_37753_37876_39339_39491_40123_40294_41370_41556_42167_42289_44486
893046	contig_9161_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_160635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	500.573358759733	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	146	775	52934	63414	FALSE	40	GGGGAATACACAGAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	52788	64649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_53063_54664_54842_56680_56804_60940_61076_63348
893047	contig_6445_pilon	+	3177	3	Intergenic	novelGene_77028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	529	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGTTTGCATCATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538866	573493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_540918_572262_572599_572703
893048	contig_6847_pilon	+	6029	13	Intergenic	novelGene_143860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_1	470.304127371026	1395	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	334	1785	77788	110600	FALSE	15	TGCTTTGTGTGTGATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74253	114844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74316_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424
893049	contig_16103_pilon	-	403	2	Intergenic	novelGene_118697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGTGTCCTAACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199195	198304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
893050	contig_6005_pilon	-	1289	5	Intergenic	novelGene_158892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.893922980652	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATTAATACCTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327367	311419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_325326_325554_327174
893051	contig_5023_pilon	-	2568	4	Intergenic	novelGene_7157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	404	775	476976	365148	FALSE	60	AAAAAAAAAAACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTFWKMIWCFLRNLKKALQNAIRLPGIYPREIRAITRIHICTPIFIAALFTIAKTWKQPRCPSTDEWINKLWCVHTIEYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEVMMLSKRSQSQKDKYCMRLLL	496893	363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_365473_376523_376531_476936_477271_496784
893052	contig_9591_pilon	+	3929	5	Intergenic	novelGene_178635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	932	1237	24034	24339	TRUE	40	TGAAACCAGACTGGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVTEGLRSRFEMIEDGISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTGRIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQ	23102	273022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9591_pilon_+_24767_73060_73260_142513_142784_270766_272414_272873
893053	contig_10793_pilon	+	1885	13	Intergenic	novelGene_83357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3265.48261704487	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	179	976	146975	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130823	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_165377_166401_166473_167141
893054	contig_13014_pilon	+	3258	5	Intergenic	novelGene_169321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATACTGGGGCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281512	291964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_282926_285401_285458_286738_286793_288247_288358_290339
893055	contig_4402_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_140861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATCAGTTTGAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612417	612960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_612400_613000
893056	contig_960_pilon	+	2716	2	Intergenic	novelGene_108290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCCAGCACTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030580	1045791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1030855_1043349
893057	contig_8330_pilon	+	1727	11	Intergenic	novelGene_71798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	624.598623117278	52	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAAGTACGAATCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837598	857544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853788_854060_854995_855090_855283_855350_856228_856271_856362_856560_856667_856755_856968
893058	contig_7234_pilon	-	2680	14	Intergenic	novelGene_145922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	213	junction_1	113.670915027006	533	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	141	890	510034	411977	FALSE	40	GTTACAGATTTAAACTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	410186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
893060	contig_9183_pilon	-	3514	6	Intergenic	novelGene_40283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_3	369.176922355664	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	148	1929	323783	312131	FALSE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325965	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_320557_320727_322743_323834_325868
893061	contig_9833_pilon	-	3938	4	Intergenic	novelGene_68505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	100	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	35	CTGGACAGAGCTAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	213059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
893062	contig_4769_pilon	-	2346	8	Intergenic	novelGene_117960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	83.755474996186	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	9	401	437505	418729	TRUE	35	AAAATATTTGTTTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTEASRSLPKSRRDPEGRALRQDKFSVLLPTYNERENLPLIVWLLVKSFTESVINYEIIIIDDGSPDGTREVAEQLEKIYGSDKILLRPREKKLGLGTAYIHGMKHATGNYIIIMDADLSHHVNFITH	437513	406821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_407690_408379_408495_412412_412482_417835_418746_421191_421273_423624_423659_433960_434061_437344
893063	contig_9345_pilon	+	2020	16	Intergenic	novelGene_24465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	106.549018453167	439	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	198	1685	586748	631320	FALSE	65	AAAAAAAAAGGCAAACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDMNSQGSDSNEEDYDPNCEEEDEEEEEDEDPGDIEDYYVGVASDVEQQGADAFDPEEYQFTCLTYKESEGALNEHMTSLASVLKVSHSVAKLILVNFHWQVSEILDRYKSNSAQLLVEARVQPNPSKHVPAAHPPHHCAVCMQFVRKENLLSLACQHQFCRSCWEQHCSVLVKDGVGVGVSCMAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	581914	631655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_581954_585190_585252_586650_587009_614186_614255_617044_617109_618458_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
893064	contig_9471_pilon	+	3498	1	Intergenic	novelGene_21694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	434	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTATTACTGGGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62902	66400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_62900_66400
893065	contig_678_pilon	+	3304	7	Intergenic	novelGene_167773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2739	3074	19655	20795	TRUE	15	CGAGCATCTTCACTCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCTCLLSKSCAPSPDRSLSLHPHLTQCWSTAASGTSAPSSACARKCKPICHCRAATNTAQWAVSTKEEEGPSTFMSTHETEHLHHFHLCLDAQVVQEGGQVLLHLDTVVF	14031	22640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_16579_17500_17633_19595_19752_20030_20180_20705_20834_21639_21811_22619
893066	contig_12948_pilon	+	4428	2	Intergenic	novelGene_126179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTACAGCCTTCAACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168038	172547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_171924_172004
893067	contig_16303_pilon	-	2273	8	Intergenic	novelGene_34082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.462711419199	10	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	96	548	47976	38657	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAVHSCLIYRPLHQAKVGGQWELHKER	48071	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33555_35037_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38734_40433_40731_47897
893068	contig_1836_pilon	-	3272	1	Intergenic	novelGene_71079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	742	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2026	2391	994673	994308	NA	20	TCTCCTTCATATACTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLIERIMTGGYVEARNLGGLLLEDKGHHRSDGHSPNGQTNEGSPPQGAPGEGLHGIHHSQKAVNAYDCHEHDGGVHVTVKRCCDEATHFRPKFPVTSRKVIADLKGEYSHKQHICHGQM	996698	993426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_993400_996700
893069	contig_20641_pilon	-	4570	10	Intergenic	novelGene_52773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	167.389617212709	8936	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	476	871	56705	54898	TRUE	20	TTACTACTAATCTGGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57180	2347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_4642_5049_5228_12294_12338_14233_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54966_56377
893070	contig_3270_pilon	-	4117	1	Intergenic	novelGene_104499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	47	307	353333	353073	NA	25	CTAGCAATTTCACTCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRHFTKEDIQAANRHMRKYLESLAIREMQIKTTVRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGYGEIGTLTHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAVPLS	353379	349262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_349300_353400
893071	contig_7678_pilon	+	2265	2	Intergenic	novelGene_175955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1445	1852	282583	282990	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVCGSQRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLDRSSTAPQEEAKMVHGARYLSEGRGRWQEASKKSKEAEKKSNTSSQQMALREPASAGWCLWTGDCVHGK	113489	283403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_114507_282155
893072	contig_8600_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_125739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATTATCTACTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113911	111134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_111100_113900
893073	contig_10104_pilon	-	3056	2	Intergenic	novelGene_160139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509604	506502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_509263_509308
893074	contig_5280_pilon	+	2152	9	Intergenic	novelGene_52586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	487.431725988369	3	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	34	1104	38343	78098	FALSE	25	ACATTGTCTCACGTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQPVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38309	79146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
893075	contig_5341_pilon	-	1416	3	Intergenic	novelGene_168016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	705	77	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	217	741	339444	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKEAGAGVALRVVRAEGNSSRKLRRCGVSLDGPLLSTEAVFGSTQPDPGQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339515_340747
893076	contig_1596_pilon	+	7554	10	Intergenic	novelGene_131580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1071.65580894217	1247	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	555	1766	61053	168630	TRUE	10	TTTTTTGCATGTGGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAEARRRHLPLLERGGEAAAAAAAAAPGRGSESPVTISRTGNAGELVSPLLLPPTRRRRRRRHIQGPGPVLNLPSAAAGPPLARALEAAGGGSRFEDYSFSPHSAAAAARSLASEEKQAQSLQPSSSRRSSHYPAAVQSQAAAERGASATAKSRAISILQKKPRHQQLLPSLSSFFFSHRLPDMTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYPNIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSTSGPTRREDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYLVLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDHYRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV	60498	174471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_61132_93060_93146_120759_120805_127019_127064_128884_129124_154562_154705_159579_159747_162068_162294_168444_171748_171800
893077	contig_6361_pilon	-	4755	12	Intergenic	novelGene_23909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4687.5987350483	1966	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	30	CTGCAGTAATGTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	200415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_200726_201406_201471_202292_202644_256559_257507_306317_306324_339805_339869_380368_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
893078	contig_11548_pilon	+	2330	11	Intergenic	novelGene_66735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1026.1607281513	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	350	1492	87022	119638	FALSE	25	AACCATTACGCTGTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63637	120476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63895_84759_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
893079	contig_1301_pilon	-	5987	20	Intergenic	novelGene_47392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	552.130083231175	1019	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	81	2066	852486	800580	TRUE	50	TTATGAATATAAATTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPICPVVSFTYVPSRLGEDAKMATGNYFGFTHSGAAAAAAAAQYSQQPASGVAYSHPTTVASYTVHQAPVAAHTVTAAYAPAAATVAVARPAPVAVAAAATAAAYGGYPTAHTATDYGYTQRQQEAPPPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRLQYKKSKSRFASRSEAQYSSQKDSGRENEEADAEGGVLAKTRRRRTLENGNETL	852566	766765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_769630_773755_773854_774332_774445_790077_790174_791035_791134_795799_795942_798096_798248_799191_799398_800425_800589_804161_804308_805026_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469_822615_824145_824429_852066_852167_852449
893080	contig_9366_pilon	+	7957	38	Intergenic	novelGene_166236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	328.166705217699	135	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1457	4371	3586	7956	969049	1028672	FALSE	35	TCCAGCAGCAGCAGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTVVLFSSSDKFTLHQDMCVVCGSFGQGAEGRLLACSQCGQCYHPYCVSIKITKVVLSKGWRCLECTVCEACGKATDPGRLLLCDDCDISYHTYCLDPPLQTVPKGGWKCKWCVWCRHCGATSSGLRCEWQNNYTQCAPCASLSSCPVCYRHYREEDLILQCRQCDRWMHAVCQNLNTEEEVENVADIGFDCSMCRPYMPASNVPSSDCCESSLVAQIVTKVKELDPPKTYTQDGVCLTESGMSQLQSLTVTVPRRKRSKPKLKLKIINQNSVAVLQTPPDIQSEHSRDGEMDDSREGELMDCDGKSESSPEREAVDDEPKGAEGAEGTKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRSRTGQGKTKRSMIRKDSSGSISEQLPSRDDGWSEQLPDTVVDESVSVTESTEKIKKRYRKRKNKLEETFPAYLQEAFFGKDLLDTSRQYKLSLDNLSEDAAQLSCKTNLNTNFLDPSLEPLLSSSSTPAKPATHGTADDPLADLSEVLNTDDDILGIISDDLAKSVDHSAGIDIGHVADDPSSLPQPSVNQSSRTLSEEQLDGILSPELDKMVTDGAILGKLYKIPELGGKDVEDLFTAVLSPATTQPIPLPQPPPPSHLLPVHNQDVFSRIPLMNGLIGPSPHLPHNSLPPGSGLGTFSAIAQPPYTDARDKNPAFNPMVSDPNSSWTSSAPTMEGENDTMSNTQRSTLKWEKEEALGEMATVAPVLYTNINFPNLKEDFPDWTTRVKQIAKLWRKASSQERAPYVQKARDNRAALRINKVQMSSDSMKRQQQQDNIDPSSRIDSDLFKDPLKQRESEHEQEWKFRQQMRQKSKQQAKIEATQKLEQVKNEQQQQQQQQQQFGSQHLLTQSGSDTPSSGIQSPLTPQPGNGNMSPAQSFHKDLFTKQLASTPTSSSSDDVFVKPQAPPPPPTPSRIPIQENVSQSQNSQPSSPQMFSPGSSNSRPPSPVDPYAKMVGTPRPPPGGHSFSRRNSITPVENCTPLSSVPRPIQISETTANRPSPVRDLCSSSTTNSDPYAKPPDTPRPVMADQFPKPVGLPRSPIVSEQTAKGPLTSGTSDPFTKPSPRADVFQRPRISDPYARPLLTSAPLESGPGPFKTPMQPPPSSQDPYGAVSQAPRRMSIDPYERPALTPRPIDNFSHSQPSDPYSQPPLTPHPAMNESFAHPSRAFSQSGTISRQISQDPYSQPPGTPRPVVESYSQPSGTARSNPDPYSQPPGTPRPTTVDPYSQQPQTPRPSTQTDLFATSATTQRHSDPYAHPPGTPRPGISASYSQPPATPRPRISEGFTRSSMTRPVLMPNQDIFLQAAQNRGPALSGPLVRPPDICSQTPRPPGPGLSDTFSRVSPSAARDPYDQSPMTPRSQSDSYGTSQVAHDVTDHPRPGSEGNFSASSNSPLNSQGQPFSSVSQIPGPVPTSGVTDTQNTINMSQADAEKLRQRQKLREII	766512	1028673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_767339_778772_778862_845092_845229_855680_855882_859063_859213_869119_869230_918087_918251_926693_926866_928718_928834_942410_942581_942987_943140_943924_944039_944954_945027_946754_947474_950773_950886_961777_961898_964177_964295_969000_969103_969273_969379_975723_975906_976157_976323_977280_977391_977890_977957_979025_979239_986838_986968_996452_996573_998922_999054_1001880_1002062_1005400_1005506_1006881_1007020_1007200_1007234_1007333_1007454_1021922_1022056_1022303_1022519_1024141_1024216_1025526_1025710_1026093_1027984_1028648
893081	contig_9752_pilon	-	2514	3	Intergenic	novelGene_121997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70851	5133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_5255_19615_19721_68563
893082	SIRV6	+	531	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98449	11	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2285	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
893083	contig_9903_pilon	-	2777	3	Intergenic	novelGene_172020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAGCTCAAATTGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180337	158975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_159138_171481_173115_179355
893084	contig_7345_pilon	-	2164	8	Intergenic	novelGene_159171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	114.426163698586	449	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	199	1086	140430	110483	FALSE	15	TTTACCCCCCCCACGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAQGHLSTDKQQGQSSSARSAAEWLPRSRAPGRHRHLGHCRHRLDPPSPAMAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNSNRSETSTSDNTETYQENTSSGHPTFKCPLCQESNFTRQRLLDHCNSNHLFQIVPVTCPICVSLPWGDPSQITRNFVSHLNQRHQFDYGEFVNLQLDEETQYQTAVEESFQVNI	140628	109404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_110552_112842_112951_114471_114581_115415_115473_118503_118620_119857_120024_139588_139770_140348
893085	contig_9415_pilon	-	1808	4	Intergenic	novelGene_109942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	212.839532668785	682	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	136	489	2490739	2468205	FALSE	15	TGCCACTAAGTTTTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLSGLLSWTLSRVLWLSGLSERGAARRPQIMEEKALEVYDLIRTVRDPEKPSTLEELEVVTEGCVEVQEINEDYCLVIIRFTPTVPHCSLATLIGLCLRVKLQRCLPFKHKSISR	2490874	2466885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2468220_2472695_2472746_2481742_2481908_2490615
893086	contig_19032_pilon	-	3972	11	Intergenic	novelGene_172552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1198.62978437881	22	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	2981	3934	160279	157239	FALSE	35	ACCTTCACAAGAAGTCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	165237	157200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158349_158707_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_162553_164751_164837
893087	contig_15112_pilon	-	3874	1	Intergenic	novelGene_124750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1019	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAACTTGACCTCATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20292	16418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_16400_20300
893088	contig_3601_pilon	+	4629	3	Intergenic	novelGene_132848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	2256	3065	224165	224974	TRUE	50	CAAAATCCAAACATTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVGEKALDLNDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNKEKIHKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINSKISEMDSVIEGLRSRFETTEDRIREIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGDPEQGKKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQNPESSWRKTNRHKQRRNNKTKLGLFRRNHAGKKAMG	128345	331962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_130600_224163_225593_331016
893089	contig_4654_pilon	-	2326	3	Intergenic	novelGene_103083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.5	28	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGTTGCCTGTGAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515945	492561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494508_500193_500422_515793
893090	contig_12019_pilon	+	1966	3	Intergenic	novelGene_87669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	453	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_6434_7726_8013_8322
893091	contig_8210_pilon	+	2589	3	Intergenic	novelGene_30242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	564	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1738	2148	52152	52562	TRUE	25	GAGGACTGCAGCTTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIKRLIRHKNKIRPLKIAETAAIPLVLYASITKKKKKKLLTALKIPLQMSKLSPGERQREQDASTSADVNTSCAYTTAVNSGGTRRTTSRRRGRHTNKPAAKGHPRRASAPGRAKRPGRQRGHAQIPRHTGRLPS	38722	53095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_39810_51501_52784_52875
893092	contig_5033_pilon	-	5815	5	Intergenic	novelGene_28945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1112.83882480798	262	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	117	836	477189	456452	TRUE	65	GGAAAGAAAAAAAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRREYPCSAWVGGGRE	477305	451090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_455578_455959_456604_462973_463031_464547_464983_477113
893093	contig_7057_pilon	-	1829	1	Intergenic	novelGene_123429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	563	1030	1623287	1622820	NA	0	TTTGTGTGTGTCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEFKDLENSVVQTKDMCPRMFTKDVATQSFVKEIKPVTDGSNHLPQQKTHQLKLKGTEKEQEERMMQSASRNSTGRKQAKGAVSVFLQEKIHPWRSLEISRTVGKSTGSKDALVSKDGAVASKVSKGHIFTKSDPECEAAVKVCQGNGATTQS	1623849	1622020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1622000_1623800
893094	contig_233_pilon	-	3888	2	Intergenic	novelGene_14501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3300	junction_1	0	172	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82356	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974
893095	contig_5791_pilon	-	4193	8	Intergenic	novelGene_35843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	121.555228062752	441	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	173	1015	1057195	1048747	FALSE	25	AATCATACTTCGGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQEFADEIQARYPHLLEQLLSTSDTPGDESADPPIVHFAPGESSSEDAVMMNTPVVKAALEMGFSRKLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAENEKREEEKERQTEKMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLTANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLREIDSTLYKNLFVEKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS	1061294	1045568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1048941_1049054_1049097_1049372_1049628_1052379_1052623_1056491_1056541_1057135_1057215_1058982_1059083_1061241
893096	contig_5331_pilon	-	3568	5	Intergenic	novelGene_112800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1710	2150	600156	599716	TRUE	20	TCTGCTTACACATCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSKLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKRLDTTLFQENSEKTTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	826214	598158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_599247_599385_601166_770772_771221_825828_825881_826014
893097	contig_10196_pilon	+	1110	2	Intergenic	novelGene_132332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCATGGTGTCCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2397541	2400504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2397664_2399516
893098	contig_401_pilon	+	1655	9	Intergenic	novelGene_42821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1101.01691630965	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	59	928	1711949	1715475	TRUE	35	TCTTGAATGGAATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711890	1716433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
893099	contig_990_pilon	+	3530	10	Intergenic	novelGene_76151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	135.754680705062	37	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	37	1347	1782861	1803142	FALSE	30	TAAATGACTATGCCACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDLLHNVLRAPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPQVIKMFMGSLFNVIGACVVILLATPIAAIVILPLGLIYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSVIRAFEEQERFIRQSDLKVDENQKAYYPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVISRHSLSAGLVGLSVSYSLQVTTYLNWLVRMSSEMETNIVAVERLKEYSETEKEAPWQTEEMAPPSSWPQVGRVEFRDYSLRYREDLDLVLKHINVTIEGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRITESAGGQIIIDGVDIAQIGLHSLRFRITIIPQDPVLFSGPLRMNLDPFNQYSDEEVWTSLELAHLKSFVSALPDKLNHECSEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDDLIQSTIRTQFDDCTVLIIAHRLNTIMDCTRVIVLDRGEIREYGPPL	1782824	1805325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1783071_1787804_1787855_1787902_1788005_1790879_1791007_1791533_1791636_1795785_1795933_1797837_1797997_1798960_1799128_1800240_1800436_1803090
893100	contig_16622_pilon	-	2051	5	Intergenic	novelGene_48457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1762.1650568264	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCATGTCAATTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121966	111848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113158_113578_113739_115153_115292_115417_115446_121550
893101	contig_960_pilon	-	2835	2	Intergenic	novelGene_108305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1613	1933	1041515	1041195	FALSE	15	AAATGCCCTTTCTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSASVETYSLGNPMGSPGVRSDSMAVGLVFGVLHKCSYFFLRRNGDWRVEYTKSQQLSEMKGKSKQLSRSPKSTKSQTSRSTADRPGRQQTSLHSSTCPFKERI	1045791	1040292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1042102_1044765
893102	contig_1535_pilon	-	2404	6	Intergenic	novelGene_127212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_3	640.954725390179	16	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	89	940	52303	40062	FALSE	40	ATGTATATCGTAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQCCGSWRSCAGESGCCCGGGGGSVKTAGMVGRETELSIHFLPGNCRLVEEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52391	38597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_45799_45915_47293_47489_52240
893103	contig_4232_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_63336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468137	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
893104	contig_9345_pilon	+	1311	10	Intergenic	novelGene_24474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_1	83.4303139389432	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	67	999	619385	631320	FALSE	50	GTTGTACAATTATACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	619318	631632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
893105	contig_4686_pilon	-	2842	13	Intergenic	novelGene_118526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_6	184.812273371897	35	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	686	2773	487240	460672	FALSE	65	TTAGGAAAAAAAAAAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERALQDLADLLETGQEKMAGDQKIIVSSKEEVHQLLGKHKEYFQGLESHMILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLESQLNHLGEHWLTNTSKVAKELHRLETILKHWTRYQSESAALIHWLQSAKDRLEFWSQQSVTVPQELEMVRDHLNAFLEFSKEVDAKSSLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQVTWPSG	487925	460602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464565_464977_465111_465975_466173_466705_466838_470300_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108
893106	contig_6915_pilon	-	3785	30	Intergenic	novelGene_162401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	414	junction_12	491.188429955104	1088	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1181	3543	243	3785	254053	162327	FALSE	25	GTAAGTTTTTATTCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSDYSRFRACVYQTLGISPEEKFVITTTSRKEITCDNFDETVKDGVTLYLLQSVNQLLLSATKERIDFLPHYDTLVKSGMYEYYASEGQNPLPFALAELIDNSLSATSRNNGIRRIQIKLLFDEAQGKPAVAVIDNGRGMTSKQLNNWAVYRLSKFTRQGDFESDHSGYVRPVPVPRSLNSDISYFGVGGKQAVFFVGQSARMISKPADSQDVHELLLSKEDFEKKEKNKEAIYSGYIRNRKPSDSVHITNDDERFLHHLILEEKEKDSFTAVVITGVQPEHIQYLKNYFHLWTRQLAHIYHYYIHGPKGNEIRTSKEVGPFNNIDIEISMFEKGKAPKIVNLREIQDDMQTLYINTAADSFEFKAHVEGDGVVEGIIRYHPFLYDRETYPDDPCFPSKLKDEDDDDDCFIIEKAARGKRPIFECFWNGRLIPYTSVEDFDWCTPPKKRGLAPIECYNRISGALFTNDKFQVSTNKLTFMDLELKLKDKNTLFTRILNGQEQRMKIDREFALWLKDCHEKYDKQIKFTLFKGIITRPDLPSKRQGPWATYSAIEWDGKIYKAGQLVKTIKTLPLFYGSIVRFFLHGDHDGEVYATGGEVQIAMEPQALYDEIKTVPIAKLDRTVAEKAVKKYVEDEMARLPDRLSVTWPEGDELLPNEIRPAGTPIGALRIEILNKKGEAMQKLPGTSHGGSKKLLVELKVILHSSSGNKEIISHISQHGGKWPYWFKKMENIQKLGNYTLKLQVVLNESNADTYAGRPLPSKAIKFSVKEGKPEKFSFGLLDSPFRVGVPFNIPLEFQDEFGHTSQLVTDIQPVLEASGLSLHYEEITNGPNCVIRGVTAKGPVNSCQGKNFNLKVILPSLKEDSQILKIRLLPGPPRRLKVKPDSEILVIENGTAFPFQVEVLDESDNITAQPKLIVHCKFSGAPNLPLYVVDCSSSGTSILTGPAIQVQNIKKDQTLKARIEIPSCKDVAAVEKTIKLLPSSHVARLQIFSVEGQKAIQIKHQDEVNWIAGDVMHNLIFQMYDEGEREIDITSALAEKIKVNWTPDINKEHLLQGLLPDVQVPTSVKDMRYCQVSFQDDHVSLESAFTVRPLPDEPKHLKCELKGGKTVQMGQELQGEIVVIVTDQYGNQIQAFSPSSLSALGIAGVGLDSSNLKMTFQENTESISVRGIKFVPGPPGNKDLCFTWREFSDFIRVKLISGPPAKLLLIDWPELKESIPVINGKELQNPLIVQLCDQWDNPAPVPQVKISLIKANNLK	282947	162326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_162453_165125_165294_167241_167361_168147_168237_169169_169319_184729_184958_187091_187227_187850_187991_189810_189884_191669_191767_202492_202638_208528_208649_208727_208806_212539_212654_212815_212899_213613_213721_214286_214401_215734_215930_218630_218815_218892_219014_221206_221418_222134_222226_224790_224958_229063_229184_229303_229419_248087_248219_248877_248961_254013_254176_254845_254922_282903
893107	contig_6710_pilon	-	925	2	Intergenic	novelGene_93403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	485	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658191	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
893108	contig_16110_pilon	+	3487	23	Intergenic	novelGene_126771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_16	333.730665394706	19	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	954	2865	115	2979	6170	131269	FALSE	60	TGAAAAAGAAAAAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPTKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVESPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLCDISEGTVVPEDRCKSPTSGSSSPHNSDDEQKMNNFIEKAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISALHFCETFTRKADSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTILRLKGAILRMAFLDTTGCLVPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCVYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPLETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGELARARLALDERGQKLSDLEERTAAMLSSADSFSKHAHEMMLKYKDKKWYQF	6055	131777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_6193_7704_7769_9530_9615_14413_14538_32691_32771_53175_53331_54084_54158_55828_55977_56201_56270_56530_56572_57352_57574_58499_58679_68233_68360_70187_70340_75391_75458_81867_81928_100046_100098_105752_105993_109402_109773_110061_110228_118994_119107_128398_128620_131227
893109	contig_18419_pilon	+	5287	13	Intergenic	novelGene_141471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_7	190.186074820307	698	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	60	2150	75445	82012	FALSE	15	GTCCTGTTTGCTTATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAGFRRVVPSDLYPLVLGFLRDNQLSEVANKFAKATGATCQDANASSLLDIYSFWLKSSKAPKRKLQANGPVVQKAKKKTSSSDSSEDNSEEEKTEVPPVKKAAAKRASLPQHPGKAAAKASESSSSEESSDDEEGEEDKKKKPVQKGVKPQAKAAKASPKKAESSGSDSSSEDEAPKNQKPKTTSVTAKAQAKAPAKAGMPVQATPKVANGKAASSNSSSSSSSSSDDSEDENAAAISKKTVPKKQIVAKPPVKASAASAQNSSSSEDSSSEEEEEQKKPIKKKPGPYSSVPPPSAPLPKKTLGIQPPKKAAEKKQPEESSEDSSDESDSSSEEEKKPPAKAVICKATPKPAPGKKAAESSSDSSDSDSSEDEAPAKPASTTKSPSSKPVAITKQPAAKPAAAPKQPVGGGQKPLPRKADSSSSEEESSSSEEEEKMTKKTVATPKSKVMAKAPSSLPAKQTPQGGGDSSSDSDSSSSEEEEEEKTSKPPVKRKLQKAAGTVTPSKPASKKKVKAESSSSSSSGDSSEEEEAKPKAKATPKPQTPKVNGTSALTAQNGKAGRDNSEEEDGVAVSKPGKKRKQNEAAKEAETPQVKKPKLQTPNTFPKRKKGEKRASSPFRRVKEEEIEVDARMADNSFDAKRGAAGDWGERANQVLKFTKGKSFRHEKTKKKRGSYRGGAISIQVNSVKFDSE	75385	85149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_75565_77415_77472_77585_77726_77833_77962_78482_78643_79208_79334_79452_79589_79940_80070_80281_80393_80501_81135_81324_81426_81576_81670_81853
893110	contig_5959_pilon	+	2472	2	Intergenic	novelGene_150216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	373	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTCAATAAATATTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434486	465754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_434617_463412
893111	contig_7272_pilon	+	1918	10	Intergenic	novelGene_25314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	341.575904837317	13	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	231	1127	507775	573680	TRUE	35	AGGGGTTTAATATAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIITAEQLMEYLGDYMLDAKPKEISEIQRLNYEQNMSDAMAVLHKLQTGLDVNVKFTGVRVFEYTPECIVFDLLDIPLYHGWLVDPQIADVVKAVGNCSYNQLVEKIISCKQSDNSELVSEGFVAEQFLNNTATQLTYHGLCELTSTVQEGELCVFFRNNHFSTMTKYKGQLYLLVTDQGFLTEEKVVWESLHNVDGDGNFCDSEFHLRPPSDPETVYRGQQDQIDQDYLMALSLQQEQQSQEINWEQIPEGISDLELAKKLQEEEDRRASQYYQEQEQAGAAAAVASPQAQVKPVF	488939	575505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_489013_489691_489831_507756_507815_517079_517145_520615_520775_547444_547548_555760_555904_569812_569987_573467_573747_574780
893112	contig_10642_pilon	-	2812	2	Intergenic	novelGene_78735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	306	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1468	1887	1276146	1275618	FALSE	65	AAAAAAAGGAAAAAGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCSSPSVLGGSSTLSCRVTMSWNRLDGNRLRKPSDALVVQWLSTQLLTEKFTVQTHPAGPREKDMAIYFCKDCGQENPMSQFCSVTWVCYELKSTRWHRTTTTRKSLLSCIRICILCTRVKQANCNLGVEKRRENQLL	1277613	1274692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1276007_1276115
893113	contig_10424_pilon	-	6060	28	Intergenic	novelGene_56798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	235.371142581127	953	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	766	3120	319877	291502	FALSE	60	TTTAACCCAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSRRNRSSVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQREKEKELERERERDKKDKEKLESRSKDKKEKDECTPTRKERKRRHSTSPSPSRSSSGRRVKSPSPKSERSERSERSHKESSRSRSSHKDSPRDVSKKAKRSPSGSRTPKRSRRSRSRSPKKSGKKSRSQSRSPHRSHKKSKKNKH	347247	288561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_291641_292818_292996_294205_294325_296963_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319758_319792_319876_319950_320538_320607_323693_323828_324272_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
893114	contig_8289_pilon	-	3019	2	Intergenic	novelGene_171183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCTCTGCTCTGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236195	229542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_231158_234791
893115	contig_11896_pilon	-	5543	7	Intergenic	novelGene_88024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1319	junction_6	986.850827407849	56	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	18	755	181620	154468	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTCTMGLVLPLWSDTLIHLDGDGGFSVSTDNRVHIFKPVSVQAMWSALQSLHKACEVARIHNYYPGSLFLTWVSYYESHINSDQSSVNEWNAMQDVQSHRPDSPALFTDIPTERERTERLIKTKLREIMMQKDLENITSKEIRTELEMQMVCNLREFKEFIDNEMIVILGQMDSPTQIFEHVFLGSEWNASNLEDLQNRGVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAK	181637	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_154619_160037_160085_173160_173290_173423_173518_177241_177437_180738_180805_181564
893116	contig_6477_pilon	-	436	5	Intergenic	novelGene_154186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5825	junction_4	2599.50248845813	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	82	435	773121	770044	FALSE	30	GATCTTTAGCTAGAGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRH	773202	770042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_770106_770616_770699_771241_771341_772404_772479_773084
893117	contig_9363_pilon	-	3760	29	Intergenic	novelGene_6581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	875.748882881016	4	164	17	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	76	2550	786637	757151	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWVQPGRGKCNDLPRICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVMRTTCPRPKNLNSSWNCL	787891	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754167_754286_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758074_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780665_786589_786648_787826
893118	contig_11292_pilon	-	3591	13	Intergenic	novelGene_109424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_8	106.067850401943	247	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	157	1617	237220	216270	FALSE	85	AATAAAAAAGAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQMKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVWGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAAQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVSSLAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	294600	214295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_216398_216813_216958_218882_219069_220384_220496_220861_220991_222507_222584_225466_225629_225951_226032_226609_226745_227517_227567_227929_228013_237042_237231_294454
893119	contig_5988_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_16159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTCCCCAGTGATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982461	1983250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1982500_1983200
893120	contig_17108_pilon	+	5031	14	Intergenic	novelGene_109498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	485	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	164	775	13842	21844	TRUE	20	CCTTTCCCTTGGTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSPGFTYSAPSSLLLSVPSKLLSHTTVDLFLFFIFFPFSMGLSVPWIHSTLNHKDTLKPSARCGQQFCPSSGKRTGAMCQEESSWWGKFSLSVFFLLRETRALRNNATALLFRIPGHFWDETPLLTFGVCSKGKDRYCEGLTEISVSTIFTIPRRRISVQGDFSRNILKRRVRSSEHVLELIKDTKRSTSTLWHAWKSESA	12757	81241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_12828_13748_13894_16805_17232_19657_19769_21821_21888_22407_22635_24143_24299_25751_25914_27623_28653_30617_32699_34461_34555_48686_48888_53232_53318_81061
893121	contig_13004_pilon	+	3693	1	Intergenic	novelGene_112721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	393	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAACTTGAATTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893380	897073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_893400_897100
893122	contig_13021_pilon	+	2072	3	Intergenic	novelGene_8218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1990.5	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1388	1774	180464	180850	FALSE	35	CTGAATTAAGTGGAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	178734	181148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_179417_179528_180211_180440
893123	contig_5690_pilon	-	2648	3	Intergenic	novelGene_119665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134993	117492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_119919_120588_120780_134962
893124	contig_8636_pilon	+	2654	2	Intergenic	novelGene_141914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1576	2058	366522	367004	FALSE	20	GTCTTCTCCAGGAAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRPAEDSQPAPGPSPTSEKEAPAGTQNHIYRGSFTWLGIFYNRAANHTHARAHTFQLPPTTSGPGNGLLERGHRDRWLGLALSRPTSDSLGQVGMARWGHRIEMKGIQLDKVQLSAVTDISSRGRCRVASQCSLWPRPEREWGLGSDLLGVAGPQKAC	364753	367600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_365487_365679
893125	contig_8464_pilon	+	1368	5	Intergenic	novelGene_125378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	84.0576439117823	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	658	957	798819	804080	FALSE	20	TTAAAGCTTTTGTGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	793181	804491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_793672_796183_796258_798725_798922_799187_799279_803974
893126	contig_9683_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_151302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTATTTGTGCCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934085	936799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_934100_936800
893127	contig_15775_pilon	+	5952	7	Intergenic	novelGene_148364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	177.477385100813	1061	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	15	821	172	5817	TRUE	40	CAGCAGAGCTTCAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPALTTMRTTTTSTSTIFTAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEAAGTSSEQVIQHLEGELCYANLTLHRTGTSPVSSQKKASAKSASSAQANKEEAEYVTMDPLPREEISYASLSLDTSNQEPFYSNMD	157	11046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1829_1945_2675_2789_4617_4641_4989_5140_5730_6253_6350
893129	contig_17618_pilon	-	2641	3	Intergenic	novelGene_173352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	51	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	592	906	32637	21176	FALSE	30	TCCACTGTCTGTAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMNNTDGLHELACGGLIYCLGVVFFKSDGIIPFAHAIWHLFVATAAAVHYYAIWKYLYRSPTDFMRHL	33228	19440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_21377_30667_30738_32593
893130	contig_8317_pilon	+	913	2	Intergenic	novelGene_19362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	1138	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16237	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
893131	contig_17618_pilon	-	2713	7	Intergenic	novelGene_173350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_6	93.7259598806838	978	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	210	926	51441	21176	FALSE	10	ATTTGTTATTGTTGTTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKNRFQRFMNHRAPANGRYKPTCYEHAANCYTHAFLIVPAIIGSALLHRLSDDCWEKITAWIYGMGLCALFIVSTVFHIVAWKKSHLRTVEHCFHMCDRMVIYFFIAASYAPWLNLRELGPLASHMRWFIWLMAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMNNTDGLHELACGGLIYCLGVVFFKSDGIIPFAHAIWHLFVATAAAVHYYAIWKYLYRSPTDFMRHL	51650	19388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_21377_30667_30738_32593_32696_34769_34845_38040_38202_42793_42876_51415
893132	contig_16703_pilon	+	11232	2	Intergenic	novelGene_72780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1968	junction_1	0	192	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	32946	38816	FALSE	55	AAGAAGAAAGGGCCAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGKWGRGSWFFLLEETAQSQ	32945	49706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_33016_38544
893133	contig_16098_pilon	-	1817	9	Intergenic	novelGene_45960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_7	1320.36713052658	8841	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	649	1692	350530	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354081	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350889_352152_352352_353990
893134	contig_2890_pilon	-	3003	8	Intergenic	novelGene_60282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.81100213961	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	173	769	316048	307251	TRUE	30	AGAAAGTCAGTCTGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIFEWIYNGFSSVLQFLGLYKKSGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHEQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSRLMESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRADAISEEKLREIFGLYGQTTGKGNVTLKELNARPMEVFMCSVLKRQGYGEGFRWLSQYID	320207	304946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_305079_305148_307368_308618_308751_312123_312228_315241_315308_315746_315867_315990_316065_320051
893135	SIRV6	+	1418	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	108	2	27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
893137	contig_504_pilon	+	5247	4	Intergenic	novelGene_54439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_3	644.329798231379	90	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2879	3292	234151	236818	FALSE	35	TTTTTAATCTAAGAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV	231272	238773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_234188_234985_235108_236052_236135_236645
893138	contig_17274_pilon	+	3592	19	Intergenic	novelGene_26458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	469.376050244588	105	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	2118	3335	41446	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEGDSQELTPTLLPHDGQDTVDTGNNSTLRKQKRKRRKKKGHSWTKIKRKVLKNICQRDNREVDGHLVSRETKVKVNLQRSAKIWGRKRGRPRIHLTQKQKRGQPTGSRKHTDTTVDFHSPLLPVTCGEVKGTLYKKKLEQGASEKSIQSEDGKWFTPTEFEIKGGYARSKYWKLSVRCGGRPLLRLMEEGFLPNPPRMYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	6955	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26474_27831_28001_30127_31349_36255_36337_41218_41507_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54385_69751_69857_73734_73878_74919_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
893139	contig_11987_pilon	-	2446	8	Intergenic	novelGene_168951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	17.63924196622	522	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	765	1187	194173	175755	FALSE	20	TTATCTGTCTCTTGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCSHEEMRTQMEVLKHQVQIYEEDFKKERSDRERLNQEKEELQQINQTSQSQLNRLNSQIKACQMEKEKLEKQLKQMNFPICNCGLVFHPRDPWVPAGSGAVQDLRTHLPDYQWYAPDQFPPDVQHKANDFSSENKVNQ	203228	174495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_-_175787_180782_180844_184532_184632_186247_186299_189978_190105_194119_194240_199353_199483_202659
893140	contig_9653_pilon	-	2114	11	Intergenic	novelGene_48188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	602.518389760844	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	139	957	196924	182641	TRUE	25	ATTTGGAGTACATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQSCSGQGYCAPEYV	200972	175248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200896
893141	contig_8773_pilon	+	6522	2	Intergenic	novelGene_74527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1385	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2617	2955	45942	46280	FALSE	55	TATACAAGATACAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITSVIVLFLSLTTEVSFTPVYTNQDFMRARNKGQSPSSNPTSIKPFLIGSFTMIPFFPLNTKSTNCTIHLALAYAKLCSHKRILLLTCLLNDFEHPDCRNHHHYHQLPLG	43080	49847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_43578_43822
893142	contig_3153_pilon	-	3200	1	Intergenic	novelGene_104653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	745	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGATGGAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124814	121614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_121600_124800
893143	contig_3745_pilon	+	3768	9	Intergenic	novelGene_85087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_8	307.88306932178	30	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	363	1739	434035	461060	TRUE	25	TGTGTTAAATTAATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIEAGLDVINNPDEDDDQEDEDNRLGEKLIFNENDFVEGYYRTERDKGTQYELFFKKADLMEYRHVTLFRPFGPLMKVKSEMIDITRSIINIIVPLAERTEAFAQFMQNFRDVCIHQDKRIHLTVVYFGKEGLSKVKSILESVTSESNFHNYTMVSLNEEFNRGRGLNVGARAWDKGEVLMFFCDVDIYFSAEFLNSCRLNAEPGKKVFYPVVFSLYNPAIVYANQDGPPPVEQQLVHKKDSGFWRDFGFGMTCQYRSDFLTVDYQFTGIWVVSTS	393650	488573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393747_433768_434696_437841_438059_439636_439739_443170_443350_444954_445050_458774_458857_461019_461095_486578
893144	contig_4519_pilon	+	8820	13	Intergenic	novelGene_123671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	84.8395135273391	91	142	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	812	1189	69586	69963	TRUE	45	AAAAAAATCTGACTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGPAPCGPSPGSGSSLGVSPQRVLPFSGLPEHASGRMTCLKLNPDRVIPLHTPPSHLTGPKLLSVVPKAPPCLAPPTSPAQAPWAPTSTPSVAPYTSIKLVCFLFRETHSAGREQAADPSAGG	68330	229735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68480_68923_70919_77856_78014_78794_78937_79733_79866_79973_82507_137660_137770_186179_186537_217489_218600_220611_221123_221476_221572_228145_229543_229602
893146	contig_13021_pilon	+	2318	13	Intergenic	novelGene_8160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	3	89	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	169	2019	174676	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
893147	contig_10197_pilon	-	7209	43	Intergenic	novelGene_115280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	389.951782006762	944	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2186	6561	63	6623	1197388	1168440	TRUE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATDYISSQAFSRLILILRALHVNNDRAKVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPPAVTPGCHYPCQDHG	1197640	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168536_1168688_1168830_1170017_1170160_1170250_1170491_1171232_1171443_1171785_1171899_1171980_1172095_1172981_1173111_1173247_1173486_1173970_1174163_1174449_1174611_1174810_1174958_1175067_1175198_1175368_1175539_1175647_1175784_1175985_1176166_1176281_1176530_1186804_1186922_1187111_1187323_1187480_1187628_1187804_1188044_1188181_1188370_1188646_1188840_1188960_1189088_1189239_1189404_1189522_1189730_1189856_1190054_1190437_1190568_1190903_1191039_1191152_1191273_1191416_1191607_1191693_1191814_1191979_1192171_1193341_1193448_1193543_1193670_1193759_1193973_1194097_1194317_1194408_1194574_1196589_1196759_1197288_1197400_1197589
893148	contig_2933_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_111359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	419	1260	504	1763	850204	848945	NA	10	TGATCTTTCCGCGTACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	850707	848361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_848400_850700
893149	contig_7207_pilon	-	2784	3	Intergenic	novelGene_72031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	65.5	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	482	1585	294505	291736	FALSE	10	TTGAATGTGTGTGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISKTVAWVNEQLELGNERLLLMDCRAQELYESSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFIRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFALHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPGQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST	294986	290536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293496_294144
893150	contig_14720_pilon	+	5542	16	Intergenic	novelGene_164977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	428	junction_1	205.690338994216	773	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	8	2269	120748	231836	FALSE	55	ATCCCCAAAAGCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRAFPMTMDERYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLACMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLQESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA	120740	235109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_120769_157060_157259_175396_175511_195878_196040_196956_197072_199814_200044_204007_204154_204802_204980_206859_207031_207619_207728_212263_212389_212883_212981_215206_215342_220562_220750_228479_228626_231704
893151	contig_10904_pilon	+	4499	4	Intergenic	novelGene_22706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1258	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3158	3484	636835	637161	TRUE	55	AAAGAAATAGAGAACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTGYKGLMDDSYHGLHQIESSTARWCLYTTTDYSDWDHNRGCWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFGSVMKSLPRFTVQPGGGQPHKTKRD	632827	711885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_635591_636440_637577_649306_649406_711384
893152	contig_10437_pilon	-	1230	1	Intergenic	novelGene_38367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCCGAAGTTTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561345	560115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_560100_561300
893154	contig_12964_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_131705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGACCAAGAATGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557848	555693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555700_557800
893155	contig_5253_pilon	-	3363	9	Intergenic	novelGene_61539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_6	122.690413235917	907	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	107	964	132468	55151	FALSE	30	TAAGCAGTTGATGTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ	137332	52751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_55348_61449_61548_71439_71525_91665_91741_94234_94361_115128_115224_117780_117859_132364_132505_137262
893156	contig_7993_pilon	+	2330	3	Intergenic	novelGene_170959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	143	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	35	649	16712	33022	FALSE	50	AATTATGTGATTATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKERKGPPIQFRMMTGRMRGQAFITFPNKEIAWQALHLVNGYKLRGKILVIEFGKNKTQLSDLQADSLISCATDNTAEISGS	16677	34703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_17084_31156_31233_32855
893157	contig_9011_pilon	-	3750	15	Intergenic	novelGene_159285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAGAGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709855	317140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_317629_421426_421492_598549_598607_625096_625224_645918_646030_649707_649796_652875_653009_665505_665563_667558_667637_675962_676138_680782_680850_684811_685017_704495_704606_706560_706757_708062
893158	contig_9471_pilon	-	1654	4	Intergenic	novelGene_21806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATGCTTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415121	411950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_414084_414633_414728_414804
893159	contig_1150_pilon	-	778	3	Intergenic	novelGene_61438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36526	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGGTGTGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310298	308932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309186_309345_309385_309812
893160	contig_5041_pilon	+	2276	2	Intergenic	novelGene_27087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGGCCAGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539810	551930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_540185_550028
893161	contig_4924_pilon	-	3315	4	Intergenic	novelGene_84744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_3	1604.49479760938	463	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	417	761	252772	155803	FALSE	20	GACTCCTAGCATCCTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNGR	253188	153248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_155860_197778_197862_252398_252596_252764
893162	contig_10246_pilon	-	2189	2	Intergenic	novelGene_46879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	0	320	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	124	1545	45123	37933	FALSE	5	CATTTGCCTTTTCTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNADEHCIKERLEQLRCHFTWALLIVDTGMPDLENRILDEIEFLDTKYNAGIHNLLAYVKHLKGQNEEALESLKKAEELIQQEQADRSHLRSLVTWGNYAWVYYHMGRLAEAQAYLDRVENTCKKCGNGSRYRIECPEMDCEEGWALLKCGGQNYGRAKACFEKALEVDPENPEFSTGYAITIYRLDDVTIETQRKGYSLQPLRQAIRLNPEDVYIKVLLALKLQDVGKEDEGEKYIEEALAGTSSQTYVFRHVGRFYRRKGSLDKALQFLEKALQATPTSVFLHHQIGLCYRAQVIQIKGGTNKQLRGQERKKANRMIKSAIFYLESAVEQKPTFAIAYIHLASMYIEAGDYGKAEDVYQKALSIKPLEEDHEQEIHLHYGRFQEFQRKSEVDAITHYLKAIKIEKESFSRNRSIDSLEKLASKKLQRKASDVEGLSLLGFIHKLKGKINEALEYYERALRLTGDLNPMF	45246	37288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_39350_45118
893163	contig_10352_pilon	+	2857	11	Intergenic	novelGene_49602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	204.268450819014	1	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	121	1101	21413	34079	TRUE	15	GTCTACGCTCTTGAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLRGGSPAQSSTPASILKILHLKELNPDSGAGGQIKQKLLMVTKQSYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGADLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	16193	35893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_16264_21362_21430_22738_22819_23721_23778_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883_34086_34143
893164	contig_1239_pilon	+	6792	1	Intergenic	novelGene_150420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAAACCCACTGCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673334	680126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_673300_680100
893165	contig_20641_pilon	+	1605	7	Intergenic	novelGene_52839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	58	1449	14599	56882	FALSE	25	AGTATACCTCCCCATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14541	57038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
893166	contig_17829_pilon	-	2659	13	Intergenic	novelGene_157033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	99.6949165649327	14	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	858	1706	41494	26860	FALSE	25	CTATGATGCTTTTATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCPYVMVSVATKIFQELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACTDILQKNTDWTNRNGKGMPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKSDMYSLGVILLELFQPFGTEMERAEVLTGLRTGQIPKSLSKRCPVQAKYIQHLTRKNSSQRPSAVQLLQSELFQNSGNVNLTLQRRVIEQEKEIEELKRQLSLLSQDKGV	57113	25906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_26959_28032_28267_29240_29324_29537_29653_36213_36315_39444_39557_41389_41700_44439_44521_45061_45162_45846_45885_47172_47307_48431_48591_56973
893167	contig_8820_pilon	+	5708	34	Intergenic	novelGene_79270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_26	217.453510858658	703	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1172	3519	1042	4560	102737	130157	TRUE	0	GCCCGGCTCCCGCCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIQRDAATIMQPYFTSNGLVTKALEHAFKLEHIMDLTRLRCLGSLFSMLHQACRNVAQYNANHPDFPMQIEQLERYIQRYLVYAILWSLSGDSRLKMRAELGEYIRRITTVPLPTAPNVPIIDYEVSISGEWSPWQSKVPQIEVETHKVAAPDVVVPTLDTVRHEALLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDMEVVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRRTPNGVVLAPVQLGKWLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQMVEHGGFYRTSDQTWVKLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPVVYVDYPGPASLTQIYGTFNRAMLRLIPSLRTYAEPLTAAMVEFYTMSQERFTQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLPVEGLIRIWAHEALRLFQDRLVEDEERRWTDENIDMVALKHFPNIDKEKAMSRPILYSNWLSKDYIPVDQEELRDYVKARLKVFYEEELDVPLVLFNEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSVYQIKVHRKYTGEDFDEDLRTVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYATLMTQCKEGAQKEGLMLDSHEELYKWFTSQVIRNLHVVFTMNPSSEGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSTEALYQVGKEFTSKMDLEKPNYIVPDYMPVVYDRLPQPPSHREAIVNSCVFVHQTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFNEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKDQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMSVKEDLDKVEPAVIEAQNAVKSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLLGESTTDWKQIRSIIMRENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWWMGTRTSRCPMASGERSLCSGWSCSPTPRRPPGWACPTMPRESCSPRRAWT	99167	133589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_99195_99342_99527_99858_100073_100865_101105_101242_101400_102516_102746_103455_103687_104015_104157_104408_104643_104733_104941_105023_105146_105609_105776_106762_106927_109227_109358_111082_111217_111672_111788_111889_112052_112140_112356_112446_112652_114577_114752_114837_114958_115425_115547_116705_116902_117978_118097_118182_118399_119176_119359_128897_128939_129050_129155_130145_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132604_133235
893168	contig_13863_pilon	-	3576	2	Intergenic	novelGene_42074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2456	2764	460179	459871	TRUE	45	AACGACAAGGAACACGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICNTAKKKKGHLFKNTILHLLNSGHQLQGKVFSLSALEEGPCHQSSPAEELLNAETPGPKDTLFSWLLLLGDMRSPSLSAGLSLLYHKRDGLKTKPNLVD	462634	455717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_455902_459242
893169	contig_5136_pilon	-	2162	14	Intergenic	novelGene_126637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	309.815959876316	41	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	103	1314	360194	279596	FALSE	60	CTCTCAAGAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPPCLLSRSGAARSSSAATFLTSFAETYFLPVRAMLRVIVQSASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPIWNEILEFDLRGVPLDISSSLGIVVKDFETIGQNKLIGTATVPLKDLIGDQSRSLPYKLTPLLNERGQETGATIDLVIGYDPPSAPHPNDPSGTSMPGMEGEEEDDEGDEDRLDGTIRCSGPRVPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGISLKLLPLVGKWTVSL	360296	278747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_279646_285894_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_305916_306005_307058_307168_329056_329149_331432_331489_360106
893170	contig_16666_pilon	+	2037	2	Intergenic	novelGene_61788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	403	1059	117272	117928	TRUE	75	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	116869	118973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_118629_118695
893171	contig_6102_pilon	-	1932	15	Intergenic	novelGene_32336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	319.439400532002	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	238	525	1690955	1690304	TRUE	25	GCAGTTTCTTTATTATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPSPSCQSPPCTVTWWNFAAVPGPHPQALHAPPLQRLDSWEQHLDPSSGRCFYINSLTGCKSWKPPRRTCSRETNPGSMEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQPGTLKLKVPPPVSPIPSPRAHAASAVKPAGWTPQNRLQPCSPHDLCRSSWTTPTRWKNRGC	1691384	1685238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689774_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690711_1690853_1690968_1691159
893172	contig_9931_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_134832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322406	320036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_320000_322400
893173	contig_8375_pilon	+	2856	14	Intergenic	novelGene_141267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	89.2693550524439	608	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	152	1741	19906	64643	FALSE	50	CAACCACAGAGAGAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLGVLLTLLFCSSLEGQENSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKAKQMPVEMSRPAAPLLNSNNEKISSDPSPEANSHYGCNEDVGNHAVKSLDENKEDLNLDVEYTEVEVSSPDPHRAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	19754	65758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_19940_20025_20053_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41507_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
893174	contig_11171_pilon	+	3190	3	Intergenic	novelGene_48520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	481	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAATGTTTATGCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	7221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_706_934_2189_5990
893175	contig_12079_pilon	-	1210	3	Intergenic	novelGene_67565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_2	157.5	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAAGAAGGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872426	870539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_871555_871641_871725_872314
893176	contig_4131_pilon	+	1883	5	Intergenic	novelGene_127844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_1	29.7521007661644	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	704	1753	91424	97745	FALSE	50	TATAAAGACTGTAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHWQIEWTLLTQFFLQEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	90720	97875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_91571_93097_93329_94308_94332_94426_94540_97209
893177	contig_10196_pilon	-	4912	2	Intergenic	novelGene_132312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	547	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	929	1234	2359721	2359416	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGGGWNSRSKAGVSRWLTPRCTRMGLRGRAGGSSWPANLEAGTLGLTHLEHRTSSFSSQPGCLSLPVWVHPCGAQFPEGLQHSPRPMPTTQTVRETQCK	2360649	2353533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2356829_2359032
893178	contig_12638_pilon	-	5577	17	Intergenic	novelGene_33343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	340.45667285831	403	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	3765	5111	1412426	1373054	TRUE	30	GTGAGAGAGAATACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGQWTPDCLCSGLQGKGSVFPVLLQSSRSAKTFVGDFSRRRRFRLWRCSKVVII	1463551	1369746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373022_1373150_1375555_1375620_1378311_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1416043_1434422_1434514_1463494
893179	contig_12427_pilon	-	1541	6	Intergenic	novelGene_40457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2208.75887321364	36	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	119	460	316061	315376	TRUE	30	TGTGGAGGACTGAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQSAILVANLDTFKKTAPK	325957	313439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315431_315494_315565_315748_315842_315937_316079_325856
893180	contig_14034_pilon	+	3174	1	Intergenic	novelGene_72672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	720	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	772	1353	392701	393282	NA	40	GAAGATTACAGCCTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFVRLSPLKRLYLKRLQPSAWYWYNDRYIDQGNRIENPDVNPSTCSHLIFNKGRKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKNMKQNPYLTPYTKTNSKWLKDLNIKPKTIEFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQTSEDKLGNWDLLKIKQLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGVISIIYKKI	391929	395103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_391900_395100
893181	contig_11017_pilon	+	1736	10	Intergenic	novelGene_128090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	769.895487536065	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	539	1084	263840	283682	TRUE	5	TTTATTCTCTTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLLSVARLIAPCVEEGAVDWEFKGSDELYFEEGDIIYITDMSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGYFSWAALVRETEEMTVSHL	263301	295071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_263922_268807_268855_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_283620_283724_285452_285552_294559
893182	contig_6445_pilon	-	2004	14	Intergenic	novelGene_76923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	765.090542655925	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	976	1776	77905	43105	FALSE	20	GATACATTAGCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85320_91018_91854_96306
893183	contig_6870_pilon	+	8512	20	Intergenic	novelGene_103937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_18	56.5579153075281	1433	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1013	3042	116	3157	1178538	1198985	FALSE	35	CTGATGGGTGAAACACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPDLKRQELQPSWAGSGLWAPGPEAYGVRRSREGSCMTLAFKTLFPQSLRVLSRKELCVFRERHHQPDIRQFSQCSETDLIHGCGLLLRKKPVLSFQRGSLRPRATCLVFSPGSHVGLCSGSSEMAEQRFCVDYAKRGTAGCKKCKEKIVKGVCRIGKVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQYIADLSSKAASTPKKKAFVQAKLTATGQVTSPAKGASVTNTNRRKFSGFSAKPNNFGEAPSSPNLKTSLSSSKCDPKHKDCLLREFRKLCAMVAENPSYNTKTQIIQDFLQKGSAGDGFHGDVYLTVKLLLPGVIKSVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQGDVSETIRVFFEQSKSFPPAAKSLLTIQEVDEFLLQLSRLTKEDEQQQALQDIASRCTANDLKCIIRLIKHDLKMNSGAKHVLDALDPNAYEAFKASRNLQDVVERVLLNKQEVEKEPGQRRMLSVQASLMTPVQPMLAEACKSIEYAMKKCPNGMFSEIKYDGERVQVHKNGDHFSYFSRSLKPVLPHKVAHFKDYIPEAFPGGHSMILDSEVLLIDNKTGKPLPFGTLGVHKKAAFQDANVCLFVFDCMYFNDVSLMDRPLCERRKFLYDNMVEIPNRIMFSEMKQVTKASDLADMINRVMREGLEGLVLKDVKSPYEPGKRHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYGQGSKGGMMSIFLMGCYDPGSQKWCTVTKCAGGHDDATLARLQKELDMVKISKDPSKIPSWLKINKIYYPDFIVPDPKKAAVWEITGAEFSKSEAHTADGISIRFPRCTRIRDDKDWKSATNLPQLKELYQLSRERADFTVVTGDEGSSSAGGSNGENGGTLGPAVSRKAPTASSNKPSANAKKAERKLSSPNSKGGDKLTAKPSPVKVGEKPTLKPCPMKVGEKRKAPDEAPCQAKVLLDIFTGVRLYLPPSTPNFSRLRRYFVAFDGDLVQEFDMASATHVLGSGDKNPEAQQVSPEWIWACIRKRRLVAPC	1175945	1204340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1176057_1178533_1179088_1182795_1182937_1185741_1185940_1186570_1186723_1187409_1187577_1187702_1187781_1188288_1188458_1190034_1190191_1191799_1191932_1192310_1192391_1193421_1193510_1193908_1193987_1194481_1194606_1195224_1195368_1195685_1195761_1196179_1196327_1196840_1197049_1197468_1197591_1198751
893184	contig_7056_pilon	-	2108	15	Intergenic	novelGene_43627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	998.276926222665	711	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	67	1416	730480	723226	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	731013	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722519_722563_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
893185	contig_2577_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_172063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACCTTTCCTTGTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142951	194454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_143861_193775
893186	contig_9801_pilon	-	3961	1	Intergenic	novelGene_167564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	374	1125	318	1442	103036	101912	NA	70	AGGAAAGTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPEKKVENSSRHQENSTADSIKNGKLSPVSKDNWTEKKTSENSSVRGQVQKGTDESESDFESDSPSPKSSEEEEQEDDEVLQGEQGDFNDDDTEPENLGHRPLLMDSEDEEEEEKHSSDSDYEQAKAKYSDMSPVYRDKSGSGQIQDPNITLLTPTQIPSDAGVETPKQEFDVFGAVPFFAMRAQQPQQGENEKNLSQQTHFPPVGLEQEEFDVFTKAPFSKKVNVQDCLKVGPKAHTLPGCPISVDVFGSTPFQPFPTPVSKSESNEDIFGLVPFEEITGSQQQKVKQRSLQKLSSRQRRTKQDMSKSNGKRHHGTPTSTKKTLKPTFRTPERARRHKKVGRRDSQSSNEFLTISDSKENISVALTDGKDRGNILQPEESLLDPFGAKPFHPPDVTRHPSHTGLSDIRADHNTVLPGRPRQNSLHGSFHSADALKIDDFGAVPFTELVVQSITSHQSQQSQSVELDPFGAAPFPSKQ	103353	99392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_-_99400_103400
893187	contig_8045_pilon	-	1398	1	Intergenic	novelGene_35406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	721	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTAGTGCTTACCTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119423	118025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_118000_119400
893188	contig_6117_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_167303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGAACAGTCAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110761	108950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_109000_110800
893189	contig_4469_pilon	+	2270	1	Intergenic	novelGene_21935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629017	631287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_629000_631300
893190	contig_2214_pilon	-	4490	9	Intergenic	novelGene_144253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	639	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCGGAAGCTCTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291338	277730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_278106_279611_279714_281606_281685_284754_284852_286122_286227_286558_286724_287106_287201_287621_289249_289490
893191	contig_11978_pilon	-	3628	3	Intergenic	novelGene_62875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	65.5	1077	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	484	1839	653715	651178	FALSE	15	TGCAATGTTTTCCTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMQAMEVNTSTSEILYNTPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFSLFSPEVESLPVAGSSTLLPLVPSNSTSLNSTFGSTNLAGLFFPPQLNGTTNDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPSQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSANLPPPSTLKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQQDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTLADQQARRQERKPKDRRK	654965	649388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_652522_653703_653863_654629
893192	contig_18272_pilon	+	6159	6	Intergenic	novelGene_7045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1262	junction_3	2511.95812067001	647	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	5104	5724	514336	538332	FALSE	40	GAGGGTAAAAAAGGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	468416	538767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_468606_507832_507953_509541_514361_518778_519040_537077_537197_538116
893193	contig_5988_pilon	+	2597	2	Intergenic	novelGene_15843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	329	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGCAATACGAGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241624	244841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_242387_243006
893194	contig_6062_pilon	+	3058	1	Intergenic	novelGene_5285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	463	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCACAGGGTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742042	745100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_742000_745100
893195	contig_3975_pilon	+	3274	1	Intergenic	novelGene_54863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTTAAAAAAGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2070808	2074082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2070800_2074100
893196	contig_401_pilon	+	3954	5	Intergenic	novelGene_42804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	3423	3860	1685931	1711168	FALSE	25	AAAACGGATCCTTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSGSSPLSKPRAISLLCSLFLLDLISSVLFEKLDFLLLLSDFSLGLLFSPSFIFLYFFINSEISSGQSRFFSGSQVLCSSEKPFHFSRYSTCPLTTRLSSTFSTTYSSSSSEEELSAVRLVFFPMSHTVSPEELRPPGSWDRE	1680889	1711262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1684266_1685884_1685987_1689458_1689645_1694315_1694499_1711155
893197	contig_12479_pilon	-	4420	2	Intergenic	novelGene_56840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	588	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACCCACAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150091	145100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_149157_149727
893198	contig_7593_pilon	+	2080	6	Intergenic	novelGene_127291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	170.180374896755	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	124	555	166172	198685	FALSE	25	TTACTTTGTATTATAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVCSPGTAYLIPFLLITRGAESQSGGCGSKGGGGGGSCSDMSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKKIA	166048	200210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_166195_183166_183240_192341_192438_196398_196495_198038_198171_198673
893199	contig_5167_pilon	+	5201	4	Intergenic	novelGene_164096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3127	3441	10406	10720	TRUE	25	CATAGCCACATGGGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIEPHLRRSHKRSPRHIIIKLKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKALKEKNSQPKLYIQQNCLSNMMAKLGHFQINRSLGNL	2797	170614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_+_4948_5148_5293_9573_11434_169567
893200	contig_854_pilon	+	3052	13	Intergenic	novelGene_36642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	4103.99352934296	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	53	1978	1698226	1715249	FALSE	20	TGAGTTGCAGCTGTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKK	1697760	1716323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709334_1715244
893201	contig_5502_pilon	+	1347	1	Intergenic	novelGene_154986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATACACATACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393067	394414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_393100_394400
893202	contig_401_pilon	-	2953	5	Intergenic	novelGene_42848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	155.213562551731	312	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1212	1559	1715566	1715033	FALSE	35	CCACCAAAGTTTCCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSYIRVTGFISNYKKIKSKHEKVLTYLAAIKTFCHCHSYCCCLNRHSHLGFVVWQSIDLHHRKGQSFCLQSFLPSWVQNLKIDCYNCQNHCSFHHLQNCFLGRERGPLSVTWGR	1728750	1713638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1715232_1715417_1716278_1724174_1724346_1727923_1728018_1728515
893203	contig_17144_pilon	-	1263	6	Intergenic	novelGene_29325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1811.14511842646	176	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	480	968	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183263	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167339_176117_176271_179700_179786_181794_181850_183158
893204	contig_10775_pilon	+	3567	3	Intergenic	novelGene_157938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2349	2918	62187	62756	FALSE	50	AAAACAGGATGCATCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVPEGLRSRFEKVEDRISGIEDKHLDTTLEENSEKRTKKNEETMRVTWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPCRIDLKGKSPRHIIITLAKTKDTQRILRATHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETVQARRQWDDIYKILTEKKMPAKNNISCKTLIQI	13611	63405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_+_15801_34799_34807_62034
893205	contig_4876_pilon	-	3963	3	Intergenic	novelGene_137875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2769	3092	8239	7916	FALSE	55	GTATAATGATATAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGSRGGQEEVKKGGGWESVYRCLLVILSPAGSSMKLLSRTPCSLVCNRSPRWRIRAALADRGPLHESFLALCSLSVSHPIWCLAEFFISSFDVLGFQDCCFLCLA	60520	7044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_9082_52023_52062_58632
893206	contig_14727_pilon	-	1907	7	Intergenic	novelGene_56658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	417	566	344244	344095	TRUE	0	TCTTCTCGTTCCTGGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRTSRDESLSGSSLTLSCSWPVLPSSQVEVVTFPPLVNFPVFTFLTGLAVNTSCSVSLFSGTWAARRVFFFLSFFFFLFPLLSADVRVDSACCSGWSAGEWGSFSKEVSEAKGNLGKELVQASDSLLPLAGSSPSLFMSGRSVDWEEGEFSLFLIFPCSTGNFSSWLASWKLSVSSDKDNVAAMTG	344660	328731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_328815_336125_336761_338200_338269_340708_340864_340947_341009_341740_342055_344069
893207	contig_6795_pilon	+	3729	28	Intergenic	novelGene_27734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	422.667487763869	13	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	873	2622	481	3102	324332	332823	TRUE	45	AAAATCAGTATTTTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIENQLRLAGASPATVAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRISSTPCLTPPTASRSSTKARSPKTSSGWALGHRNLMTTTRST	320562	333736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322773_324009_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327187_327243_327430_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332174_332628_332671_332735_332843_332948_333055_333147_333214_333300
893208	contig_10324_pilon	+	3565	19	Intergenic	novelGene_7740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_16	862.081533839842	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	454	1083	69577	73452	TRUE	20	GTACAGACTCCAGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIICCVALLLAIVGYVAVGIIAWTHGDPRKVIYPTDSRGEFCGQKGTKNADKPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVYPPPDPWHG	67854	80759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
893209	contig_10749_pilon	+	5279	4	Intergenic	novelGene_133492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3107	3442	207839	208611	TRUE	55	GCCAGAAAATAAGGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCRSATCMTLMPLLARRAIPSGQMASMATILVVIRAEGVAVPLPSEPAPLSRGKVPTLRATPGPPFLFWWVLICFDRWSLLMKRLGHSGQANFFSPTCVYVCASATHLNV	204732	242400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_208132_208568_208766_211206_211375_240885
893210	contig_1225_pilon	+	2425	5	Intergenic	novelGene_44160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	226.465643089631	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	483	788	274362	275157	FALSE	10	TCCACTCTGGCCTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHKKKGKSHVLRTHLLWLLGHQKTKSSSLSNLTPPAPFALTSSVSLCLSVMGGGKESRSSWLLADQLEVMGEGGEERRTLFLLHPIPLLPAVVKTTSLR	250603	276794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253524_274222_274367_274817_274858_274896
893211	contig_10042_pilon	+	2292	9	Intergenic	novelGene_79095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	309.668774660927	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	486	1637	42711	53427	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8907_26614_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
893212	contig_3942_pilon	-	1421	2	Intergenic	novelGene_128724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAAAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750766	608395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_609001_749950
893214	contig_13700_pilon	+	2363	1	Intergenic	novelGene_68295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150482	152845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_150500_152800
893215	contig_4924_pilon	+	6936	3	Intergenic	novelGene_84729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	1172	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3552	3863	126666	127195	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMNTHREKPVYSLKVFQDSFKVEKKKRQEYVFEKKKKRLMGTCVLIYCTCCLPWHHVKLGYQHGRLHSRNDLLLITAPQLLLAQLIIKRNPSMSWLSNIVTL	120537	130268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_120902_123478_126782_126999
893216	contig_12638_pilon	+	3269	18	Intergenic	novelGene_33112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	679.927484429807	45	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	946	2115	173541	198154	TRUE	45	AAGGCATAAGAAATCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNVAKRGKKAKAEVVVTNEREAKVRNGNEVEIENGKRAKAVKGSEVEAKKGDGAAQEVETKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQT	170826	200472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_172976_173560_178085_178248_180802_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191799_195513_195554_198068_198155_198736_198843_199335_199415_199503
893217	contig_13041_pilon	+	6406	1	Intergenic	novelGene_127730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	868	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTCCGGCCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271192	277598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_271200_277600
893218	contig_16185_pilon	-	1821	10	Intergenic	novelGene_144746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	82.1664976333623	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	198	1157	105452	82386	FALSE	30	AGTGAACGTTGGTATCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALRTGSVPAALSGGTGLRNRGKNETVKAAANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134384	81721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110568_127428_127464_134323
893219	contig_4496_pilon	+	3172	10	Intergenic	novelGene_66661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	150.434514689537	853	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	519	2903	911498	998163	FALSE	75	GTTAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859249	998432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_878530_878627_891913_891995_899756_899893_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
893220	contig_5918_pilon	+	7888	22	Intergenic	novelGene_99530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_1	285.08912557972	973	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1337	4014	2690	6703	723163	775120	FALSE	10	CTTGTACTTGCACCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDIAVSKNTSVPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGALSPSLGNSSVLKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQAKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSVVSSPLSSPLHRSGIDITDFQAKREKVHSQYPPVQRLVTPKPVSVATNRTVYFKPSLTPSGESRKANQRVEKKHNTGYEKNRTPEQNREQRESGFSYPNFSMPAANGLSPGAGRGGGKMRRERTRFVASKPAEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFSFSSSEITASSPSPVSPSQLLTNKVQTTSPSSTGSPMFRFSSPIVKSTEADVLPPSSIGFTFSVPVAKTTELSGSSSTSEPITSSSAQDTTSVNSTSCKKKLDEDCEGLFVPAKVLKEGSVLDVLKNPGFLSPKVDSLAAQPTTTSPAVYTRPAISSFSSSGVGLGEGLKAGSSWRCDTCLVQNRVTDNECIACQATKSPPRDSAKQMGVGTASQSGKPAPPAAGTGFGDKFKPAAGAWDCDTCLVQNKPEAVKCIACETPKPGTGVKRALTLPAASESAVTVTASSSSCTVTTGTLGFGDKFRRPLGSWDCPVCCVSDNAGDDKCVSCMSEKPGISVPTSSSSTPPVSLSSGGSLGLDKFKKPEGSWDCEVCLVQNKPESARCVACESAKPGTKSEFKGFGTSSSSSNPAASSFKFGIQPSSSGPSQTSTNTGNCKFGDKGGFTAGVASDSESANPMSGGFTFSKPTGDFKFGVSSDPKPEEDKKDSKNDNNFKFGLPSGLSNPAPLAPFQFGVSNLGQQEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINPAPAATNTTVTSETKSSFSFGTIETKSVSVSPFTCQTAEASKEEKPAARVGFTFGSVEQASLPSTSAFVLGRTEEKQPEPVTSTSLVFGRKADGEEPKCQPVFAFGSSEPTKDESASKSTFSFSMAKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSATADQGAAKAVFSFLNNSSSNSSPPATSTSGVLFGSSTPSSSAPAAAFVFGQASNPAGGPAFGNSAESSPSQSLLFSPENKPAAASVTAAAVAPFVFGPGAGSSTTATAGFTFGAPTTSSSAGSSFVFGTGPSSTPSASPAFGASQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSIASSTALFSTGSQPAAPTFGTVSSSSQPPVFGQQPTQSAFGSGAAPNSGPVFQFGSTTTNFNFTNNNPSGVFTFGANSSTPAASARPSGSGGFPFSPPSAPFTVGSNGKSLFSSSGTSVSGRKIKTAVRRRK	696419	776305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_698797_712246_712476_723079_723329_723485_723626_723702_723832_730813_730931_731037_731083_731191_731246_733163_733311_737959_738013_738277_738405_744476_744615_745267_745367_746146_746235_750662_750789_753153_753772_760679_760875_764186_765072_767386_767744_768510_768787_774534_774704_775035
893221	contig_9955_pilon	-	4688	3	Intergenic	novelGene_21267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1010	13	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCACCTTTTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49838	43534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794_49163_49720
893222	contig_987_pilon	+	2288	3	Intergenic	novelGene_72309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	32	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2085	203	2287	991457	1171212	FALSE	70	AGAAAGAAAGGAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCESYSRSLLRVSVAQICQALGWDSVQLSACHLLTDVLQRYLQQLGRGCHRYSELYGRTDPILDDVGEAFQLMGVNLHELEDYIHNIEPVTFPHQIPSFPVSKNNVLQFPPPGSKDAEERKEYIPDYMPPIVSSQEEEEEEQVPTDGGTSAEAMQVPLEEDDELEEEEIINDENFLGKRPLDSPEAEEMPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPK	991254	1171213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_991623_995960_996204_1169536
893223	contig_4654_pilon	-	4176	7	Intergenic	novelGene_103089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	854.048674777316	149	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	223	543	500418	499009	TRUE	20	ACTAGATTTGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVHLVFR	516012	492661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493455_493523_494533_494873_494970_496408_497941_498805_499030_500118_500422_515793
893224	contig_5623_pilon	-	4206	16	Intergenic	novelGene_154810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	334.180882490639	257	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	952	2127	211595	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCSVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	275948	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211121_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_218040_218140_218220_218450_220829_221000_239340_239459_275886
893225	contig_9345_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_24734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	520	822	1089183	1088881	NA	45	CATTAGTAAACATAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQREIYSLTVQWATSPNSGHQLQRNAFSLCRLWRKVRVISLPLVWELLCAGTSGPKDALCSQHCFLGDMRFPYISAHFSLLYLKRDCIKTLILSTLSV	1089702	1088143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1088100_1089700
893226	contig_5711_pilon	+	5119	35	Intergenic	novelGene_80283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	337	junction_8	588.068888962926	1226	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1543	4632	159	4790	188734	249320	FALSE	0	GTGTTTTCTGTCTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAARKEESETANRNDSSKKLSVERVYQKKTQLEHILLRPDTYIGSVEPSTQLMWVYDDDVGMNCREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDKNMTCIKVSIDPESNIISIWNNGKGIPVVEHKVEKVYVPALIFGQLLTSSNYDDDERKVTGGRNGYGAKLCNIFSTKFTVETACKEYKHSFKQTWMNNMMKTSEAKIKHFDGEDYTCITFQPDLSKFKMEKLDKDIVALMTRRAYDLAGSCKGVKVMFNGKKLPVNGFRSYVDLYVKDKLDETGVALKVIHELANERWDVCLTLSEKGFQQISFVNSIATTKGGRHVDYVVDQVVGKLIEVVKKKNKAGVSVKPFQVKNHIWVFINCLIENPTFDSQTKENMTLQPKSFGSKCQLSEKFFKAASNCGIVESILNWVKFKAQTQLNKKCSSVKYSKIKGIPKLDDANDAGGKHSLECTLILTEGDSAKSLAVSGLGVIGRDRYGVFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKSYDDAESLKTLRYGKIMIMTDQDQDGSHIKGLLINFIHHNWPSLLKHGFLEEFITPIVKASKNKQELSFYSIPEFDEWKKHIENQKAWKIKYYKGLGTSTAKEAKEYFADMERHRILFRYAGPEDDAAITLAFSKKKIDDRKEWLTNFMEDRRQRRLHGLPEQFLYGTATKHLTYNDFINKELILFSNSDNERSIPSLVDGFKPGQRKVLYTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSAYHHGEQALMMTIVNLAQNFVGSNNINLLQPIGQFGTRLHGGKDAASPRYIFTMLSSLARLLFPAMDDNLLKFLYDDNQRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWACKLPNYDAREIVNNVRRMLEGLDPHPMLPNYKNFKGTIQELGQNQYAVSGEIFVVDRNTVEITELPVRTWTQVYKEQVLEPMLNGTDKTPALISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYETVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESSKLNNQARFILEKIQGKITIENRSKKDLIQMLVQRGYESDPVKAWKEAQEKAAEEEETQNQQDDSSSDSGTPAGPDFNYILNMSLWSLTKEKVEELIKQRDAKGRELCDVKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVEAQEREDILAGMSGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRVVPEITAMKADASKKLLKKKKGDLDTTIVKVEFDEEFSGTVEGTGEEALTPSAPINKGPKPKREKKEPGTRVRRTPASSGKSNTKKVKKRNPWSDDESKSESDLEETEAVVIPRDSLLRRAAAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDNNDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKPKATPEKPSHDKKSQDFGNLFSFPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKPTDKVPSKTVAAKKGKPSSDITPKPKRTPKQKKVEAVNSDSDSEFGVPKKTAASKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKTSKTTTSKKPKKSSFDQDSDVDIFPSDFASEPPSLPRTGRARKEVKYFAESDEEEDVDFAMFN	187671	249649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_187827_188730_188822_190152_190217_199256_199403_202165_202264_202933_203147_206280_206455_208086_208189_208276_208415_211797_211937_212274_212433_212562_212689_213615_213727_213812_213919_215290_215401_215757_215851_215947_216063_222208_222331_222538_222688_223274_223507_225166_225302_226378_226580_227663_227860_228004_228097_230875_231032_231179_231264_232672_232868_235431_235574_235807_235970_237916_238122_240295_240376_241604_241716_246411_246535_248135_248234_249152
893227	contig_11269_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_145823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGGCCATGAGGCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335213	334372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_334400_335200
893228	contig_5033_pilon	-	2221	3	Intergenic	novelGene_28953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	1143	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1564	1899	451758	451423	FALSE	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	456946	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_453124_456495_456604_456856
893230	contig_10892_pilon	+	2716	1	Intergenic	novelGene_116758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172172	174888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_172200_174900
893231	contig_14651_pilon	-	4096	2	Intergenic	novelGene_157213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	401	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	247	558	86685	86374	TRUE	20	TGCAGCTCCGAGTGACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWESKMVQPLWKLIWHFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIRAVTRIDICTPMFIAALFMIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTVEYYAMIKNNDEPET	86931	82739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_86198_86293
893232	contig_7357_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_36782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132352	134666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_132400_134700
893233	contig_8978_pilon	+	3185	13	Intergenic	novelGene_49454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_1	200.569744034892	287	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	1039	2871	1749586	1772309	FALSE	30	ACGTTACTCCACTATCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680773	1772623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1696766_1696943_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
893234	contig_5791_pilon	-	1638	7	Intergenic	novelGene_35846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	128.903064354576	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	88	930	1057195	1048747	FALSE	30	AGACCACATTTTCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQEFADEIQARYPHLLEQLLSTSDTPGDESADPPIVHFAPGESSSEDAVMMNTPVVKAALEMGFSRKLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAENEKREEEKERQTEKMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLTANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLREIDSTLYKNLFVEKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS	1062691	1048038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1048941_1049054_1049097_1049372_1049628_1052379_1052623_1056491_1056541_1057135_1057215_1062623
893235	contig_14428_pilon	+	2557	4	Intergenic	novelGene_178636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATTTCTAGTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71881	84025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14428_pilon_+_72242_72530_73462_82532_82863_83089
893236	contig_6374_pilon	+	3024	10	Intergenic	novelGene_158422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	91	junction_1	275.390631648936	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	682	1317	41580	56701	FALSE	15	GGTCTCCTTGAGCCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKSKLGLAPNKFFMAIPFIRPLRDWLSRRFGDSSDSDNGFSSAGSTPAKPTVEKLSRTKFRHGQQLFPEGSPGDQWVKHRQPLQQKPYNNHSEMSDLLKAKNQNMRGNGRKQYQDSPNQKKRTNGVHSQSAKQQNPLMKCEKKFHPRKLQDNFETDAVYDSPCSGEDQLLEHAEGQSVTCNGHCKFPFSSRTFLSFKFDHNAIMKILDL	4678	58408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_4934_21552_21679_25800_25900_41257_41411_41531_41645_41737_41846_44612_44749_52446_52558_54353_54406_56537
893238	contig_5084_pilon	-	5803	2	Intergenic	novelGene_64534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGCAATATTCAGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506732	498402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_503834_506360
893239	contig_12312_pilon	+	1272	2	Intergenic	novelGene_63948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAGCAGCGAAGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213836	215282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_214636_214809
893241	contig_3862_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_137404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468459	470676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_468500_470700
893242	contig_16525_pilon	-	5430	4	Intergenic	novelGene_133786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1522.53939923479	681	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCCCTTCCAACCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97666	90512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_96975_97069
893243	contig_9809_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_176767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTTGAAAGAGGTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115821	118073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_115800_118100
893244	contig_10711_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_118462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTAGTCTTTGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882318	881180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_881200_882300
893245	contig_854_pilon	+	3688	21	Intergenic	novelGene_36506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2866.88222464754	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	974	2925	173	3097	1649514	1715383	FALSE	20	AAGGGGTTTTCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPTDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612773	1715974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649617_1686995_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
893246	contig_1725_pilon	+	2742	17	Intergenic	novelGene_24253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	595.902620898541	185	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	379	2421	235987	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201386	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_235944_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
893247	contig_18162_pilon	-	3808	2	Intergenic	novelGene_122285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2327	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCGATCAGTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
893248	contig_5031_pilon	-	5699	7	Intergenic	novelGene_133175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_5	368.246030377639	1112	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	690	1151	31460	26499	FALSE	70	ATTAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIHAARAQHADYNTKKLFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSLRV	35658	21950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_26550_28333_28511_29750_29940_31415_31482_32666_32782_34524_34578_35158
893249	contig_20641_pilon	+	3016	3	Intergenic	novelGene_52795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	2143	278	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	66	419	14599	26895	FALSE	15	TTTTAATTTTTGTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKLLNRASVEGLF	14533	29492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_26859
893250	contig_1535_pilon	-	2047	7	Intergenic	novelGene_127218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_6	617.737471207092	61	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	302	1273	54886	40062	FALSE	20	CTGCTGGCATGGGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEMPEDMEQEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAAAIGAFLIYISSDYVFDGTNPPYREEDIPNPLNLYGKTKLEGEKAVLENNLGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	55187	39287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_54856
893252	contig_5794_pilon	-	2296	6	Intergenic	novelGene_69763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	677	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGACGGCGGCCCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734495	695472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_695549_730264_730525_731314_731407_731976_732168_732761_733501_733557
893253	scaffold_12124_pilon	+	2175	9	Intergenic	novelGene_22268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3258.43926404958	61	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	35	358	1473608	1496374	TRUE	40	AATATATATATATGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1473573	1510589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497096_1508874
893254	contig_5302_pilon	+	5394	1	Intergenic	novelGene_81381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACATGTCAGCGCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97850	103244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_97800_103200
893256	contig_10549_pilon	+	2320	12	Intergenic	novelGene_110634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_4	366.518013944001	499	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	92	1402	460776	488784	FALSE	40	AAAAATTAGCCTGAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVPEPPQVPDRSTRDHQQGSEEETSPVLKTMERSDARKMTSKSLEDISSDSSNQAKVDNLPEELVRSAEDVSTVPSQPGNQFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDESDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSMMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIDYVDSLKELHVFVAQCKDLAAVDVKKQRSDPYVKTYLLPDRGKMGKKKTVVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNISVWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLKWYPLKRKTAPVAIEAENRGEMKLALQYVPEPSPGKKLPTTGEVHIWVKECVDLPLLRGNHLNSFVKCTILPDTSRKSRQRTRAVGKTTNPVFNHTMVYDGFRPEDLTEACVELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWKKMVDSPNTWIEATLPLRTLLIAGISK	453868	489702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_453925_460740_460843_462832_462887_467933_468029_470941_471062_472637_472808_474650_474754_476851_477023_481782_481862_485320_485421_486938_487145_488638
893257	contig_15991_pilon	-	1664	7	Intergenic	novelGene_70912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3322.75804114594	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	71	610	105108	101983	TRUE	20	TAAAGGTTGTGTTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	106352	100379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101825_101919_102271_103583_103703_104975_105142_106315
893258	contig_5643_pilon	-	3517	22	Intergenic	novelGene_38899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	424.13414533922	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	483	2228	277015	269360	TRUE	15	ATTTTAGTGCTCTGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPAPPTEDGIKIEENSLKEEENTEGEKEVKSAVPEATVECTQPPAPASEDEKVLVDPPEGEEKVEKTEVKERTEEPMETESKGVADVEKMEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKRSDASEWRDTEGPE	278132	263049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_263672_263844_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269040_269294_269434_269736_269809_270276_270407_270512_270611_270873_271040_271138_271284_271619_271754_271857_271947_272033_272121_272204_272386_274798_274975_275149_275388_275710_275836_276984_277118_277285_277350_277432_277575_277958
893259	contig_6842_pilon	-	5442	10	Intergenic	novelGene_130641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	101.453875672095	496	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	4	384	218793	204220	TRUE	30	ATTCCCAGCACCCACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMYQDKLASLKRQLQQLQEGSLQEYQKRMKKLDQQYRERIRNAELFLQLETEQVERNYIKEKKAAVKEFEDKKIELKENLIAELEEKKKMIENEKLTMELTGGEGNLLLISICIKLKSLSLKTVVSY	218796	185007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_189732_192865_192951_201762_201871_203049_203072_203234_203300_204165_204297_210318_210476_212092_212113_215206_215279_218738
893260	contig_1639_pilon	+	2979	26	Intergenic	novelGene_74885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	73	junction_24	231.360165975044	37	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	300	2630	283593	331594	FALSE	25	GAAAACGTGGTGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQQLRFLQHQMAVAAAAAQRAQLRRHRHPGSQSGSKVKRGAPATPQL	279917	331943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
893261	contig_16303_pilon	-	3559	6	Intergenic	novelGene_34078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	659.038815245354	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	53	889	47976	35759	FALSE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48028	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_47897
893262	contig_9332_pilon	-	4998	10	Intergenic	novelGene_60697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_9	337.21638288922	720	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	166	1725	76565	41510	FALSE	75	AACAGAAAGAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFNGEKQCVGEDQPSDSDSSQFSESMASLSDYECSRQSFTSDSSSKSNSPASTSPPRVVTFDEVMATARNLSNMTLAHEIAVNENFQLKQDALPENSLAGRVKHIVHQAFWDVLESELNAEPPEYEHAIKLFEEIREILLSFLTPGGNRLRNQICEVLDTDLIRQQAEHSAVDIQGLANYVISTMGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRQIFHVLDLMRMDMVNFTIRSLRPHLQRQLVDYERTKFQEILEETPSALDQTTEWIKESINEELLSLSEATLTPGAEGSSKPTLSPTLVLNNSYLKLLQWNYRKKELPETLMTDGARLQELTEKLNQLKIIACLSLITNNMVGAITEGLPELANRLKRISAVLLEGMSKETFNLKEVLNSIGVQTCVEVNKTLEERGLSTLNAEVQANLVGQFSSIEEEANPIWSLIDKRIQLYMKSLLCLPSPPKCMPPIPGGLAVIQQELEVLGSHYANIVNLNKQVYGPFYANILRKLLFSEEAVGKTETLSPTN	86307	38236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66121_68156_68378_69415_69537_73753_73890_76408_76601_86177
893263	contig_2940_pilon	-	6076	4	Intergenic	novelGene_81896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_2	118.704113941627	510	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	4782	5195	454239	453111	FALSE	25	AATTTAGGTTTAATGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	459020	452229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_453874_454236
893264	contig_2480_pilon	-	4228	1	Intergenic	novelGene_63559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	856	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCCTATTTGAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354135	349907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_349900_354100
893265	contig_5954_pilon	-	2719	7	Intergenic	novelGene_28768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1859.926163409	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	431	640	1396561	1392942	FALSE	50	AAAACACACAATAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESAHEAGVKRLLSASCPVILFPLRLSRPCSRSHGGAVGGHSVSVHLLVVLRGRALRSRRRQELGSLPHPGGEELQLLLCGARSDFLARCEENRVCLRHHADRAAFTGSLQCHQCGVLPHPGSSLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462166	1390862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397046_1401578_1401709_1461926
893266	contig_14923_pilon	+	3838	6	Intergenic	novelGene_157746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGGAGACCGATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352510	370064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_355651_358242_358319_360541_360627_361007_361107_364574_364747_369798
893267	contig_16103_pilon	+	3493	26	Intergenic	novelGene_118911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	356.817098245025	116	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1002	3009	133	3141	771073	799889	FALSE	0	CTCTGGCGTTCTTTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTRLDFIGVEGSNYPRKFETAPGAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	766993	800241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767083_771029_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_780514_780575_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
893268	contig_5261_pilon	+	3311	3	Intergenic	novelGene_102474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_2	37	32	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	646869	650560	FALSE	60	CAAACACAAAATTGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSFQLFVEGYKEAEYWLRKFEADPLPENVRKQFQSQFERLVVLDYIIRNTDRGNDNWLIKYEKQKEVDSKETKWTDDKESLIKIAAIDNGLAFPFKHPDEWRACEYFRSF	646866	653536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_647020_648139_648199_650437
893269	contig_7066_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_42160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	354.870485141396	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	181	939	823546	841366	FALSE	15	CCTCTAAGAGTGTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPELLLDSNIRLWVVLPIVIITFFVGMIRHYVSILLQSDKKLTQEQVSDSQVLIRSRVLRENGKYIPKQSFLTRKYYFNNPEDGFFKKTKRKVVPPSPMTDPTMLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLISRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF	823365	842428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_823701_829906_829965_830302_830397_832776_832882_833878_833961_835771_835835_837218_837292_841237
893270	contig_13097_pilon	+	4342	17	Intergenic	novelGene_107709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	263	junction_8	487.427670916414	883	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	192	1931	184733	264394	FALSE	60	CAGCTCAACACTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184541	266805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
893271	contig_7758_pilon	-	2965	11	Intergenic	novelGene_163543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	656	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2302	2646	189116	173842	FALSE	40	TGGAAATGCAAGAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFSRGISYQKCPISCISKFFIHFFYLEISPQYHSASCKDILLFIPLLTTVVGFGGLGGSAGAGCRSFHSVEIKISITFMRCSVLSELAAGNLKSIGLKISESTLPFKRFLLAV	194966	173522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_-_173924_174124_174204_188330_188441_189042_189138_189239_189420_189672_189799_190752_190897_191129_191309_191409_191479_192171_192343_193555
893272	SIRV6	+	1287	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	227	14	-92	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	30	TTTAGAAAACCATTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
893273	contig_2867_pilon	+	3365	1	Intergenic	novelGene_135176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1703	2026	782746	783069	NA	45	GAAATGGACACCAGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLDDRSGCFFKSTLASSISGLLFLTSDFCRSAFKFESAKRLFLASSFSRSTVLTPSAVCSGFRCFLGLSLPSLSTTSMWLERPFSFGTFILTGSSLDRSAFAGSA	781043	784408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_781000_784400
893274	contig_8167_pilon	-	3267	1	Intergenic	novelGene_155645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1194	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	904	1257	53180	52827	NA	60	TTCAATTAAAAAAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAFQIQISTIFFKEMEKTIINFTWKGKRPWISKALLKKKKAGGHMLPDLRIYYTAMVVKSAWCWYNDRYIDQWNRIKNPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKKTVF	54083	50816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_50800_54100
893275	contig_12050_pilon	+	3168	6	Intergenic	novelGene_62708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	131.513649481717	55	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2758	3105	809452	811668	FALSE	10	CTTGTGTGTGCCCACCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQVVGRAFARALRQEFAASRAAADARGRAGHRSAAASNLSGLSLQEAQQILNVSKLSPEEIQKNYEHLFKVNDKSVGGSFYLQSKVVRAKERLEEELKIQAQEDREKEQVPRT	637958	811731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_638614_722651_722905_807602_809510_810579_810717_811004_811071_811581
893276	contig_12540_pilon	-	3318	3	Intergenic	novelGene_148045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	110	649	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	233	1072	117754	111276	FALSE	45	AAGATTAAATAAGGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPANGEQIHLVNYVEDYLDSIESLPFDLQRNVSLMREIDAKYQEILKELDEYYERFKRETDGTQKRRVLHCIQRALIRSQELGDEKIQIVSQMVELVENRTRQVDSHVELFEAHQEISDATGNSGKASQDKSKNETITQAEKPNNKRSRRQRNNENRENASNNHDHDDITSGTPKEKKAKTSKKKKRSKAKAEREASPADLPIDPNEPTYCLCNQVSYGEMIGCDNDECPIEWFHFSCVGLNHKPKGKWYCPKCRGENEKTMDKALEKSKKERAYTR	118369	109029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_111980_117618_117868_118250
893277	contig_1301_pilon	-	7399	15	Intergenic	novelGene_47286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	951.64435562443	330	156	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	166	798	284738	277659	TRUE	55	AAATGAATAAAACTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRCVKVLNSTADISCPVMKVFCFF	284903	242509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249993_250035_254399_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268657_268819_269063_269265_270310_270402_274190_277906_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684
893278	contig_4522_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_178637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	1119	1874	2777	3532	NA	55	CGGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDISTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGN	1658	3779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4522_pilon_+_1700_3800
893279	contig_12873_pilon	+	3992	3	Intergenic	novelGene_27152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2918	junction_1	271	194	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3089	3412	19035	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	15946	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_19264_19611_19703_19851
893280	contig_2726_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_165888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTATGATTTCAGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165197	163395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_163400_165200
893281	contig_15449_pilon	+	2622	13	Intergenic	novelGene_33571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	748.038471975577	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	386	2311	37166	55312	FALSE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQY	17214	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_17421_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49338_55306
893282	contig_6217_pilon	+	5574	2	Intergenic	novelGene_109616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1618	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1220	1759	428952	429491	TRUE	45	TTTTTAAAAAGATAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKIAEMDSVIEGLRSRYKMVKDRISITEDKHLDTTLIEEKLEKRMKKNEETLRLMWDTIKSKTVRVIGVPEQGEKTEDTERITEELLTENFPNIMKDKKLTIQEAQRTSYRIYPKRKSPRHTIITLAKTKDKQRLLRAA	427732	465172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_433138_465003
893284	contig_5331_pilon	+	4833	12	Intergenic	novelGene_112807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	361.875623581015	584	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	41	1018	711291	730788	TRUE	10	AGTGTGCCGAGTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMG	711250	741610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_711304_715044_715082_715221_715274_716509_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_734169_734490_734610_737891_737930_741171_741240_741400
893285	contig_10063_pilon	+	3017	4	Intergenic	novelGene_127748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGGTATTTCCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433367	440834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_435378_437231_437816_440371_440479_440518
893286	contig_8377_pilon	+	3120	22	Intergenic	novelGene_34917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	3258.98042150534	19	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	111	2420	68257	198034	FALSE	55	AAGAAACAAATATTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPKCIEKDINEATESLLLAVISNFLEVGEENRYTVE	68065	198734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_128717_128934_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180473_197925
893287	contig_10437_pilon	+	1703	8	Intergenic	novelGene_38274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	74	junction_3	936.91924597021	204	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	441	1172	441733	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431048	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439846_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
893288	contig_16594_pilon	-	5304	1	Intergenic	novelGene_53872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	936	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAGGGTCATAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163823	158519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_158500_163800
893289	contig_1301_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_47400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	384	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCAGCTCTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783437	781995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_782000_783400
893290	contig_17144_pilon	-	6006	12	Intergenic	novelGene_29355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1935.50716867699	2874	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	4107	5711	173384	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	205033	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173405_174876_177898_203968
893292	contig_5574_pilon	-	6518	1	Intergenic	novelGene_155864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	476	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTAAAAAAAAAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205334	198816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_198800_205300
893293	contig_6740_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_142685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTACAATCCTGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623150	625319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_623200_625300
893294	contig_15491_pilon	-	2626	5	Intergenic	novelGene_75971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	226.709616028963	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	46	777	91394	80831	FALSE	20	GAGATGGGGACTTCATGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEINCDDLKIKTMKDEPDEKLNAGKARVSQVSGLQKQQQANLTHQESELEGQMLAQQQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	91439	78981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80973_81236_81353_81674_81815_85966_86213_91306
893296	contig_5317_pilon	-	3147	20	Intergenic	novelGene_76582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_14	236.449077403542	523	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	220	1377	381997	373913	TRUE	20	CCAGGTTGCTGTGAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKIKKQDRLFPPEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGKPLSNMKILTLGKLSRNKEEVKTMIEKLGGKLTGTATKASLCISTKKEVEKMTKKMAEVREASVRVVSEEFLQDVSGSTRSLQELLSVHVLSSWGAEVKVEPAEVVAPKAKSGAALPKKSKGAVKEEGVNKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	386708	355028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356343_356925_356988_357964_358093_361103_361257_361766_361866_364146_364276_364800_364924_366581_366666_370358_370488_373902_374100_375290_375424_375690_375760_376055_376299_377191_377333_379075_379221_381031_381209_381934_382052_384128_384229_386643
893298	contig_14925_pilon	-	936	4	Intergenic	novelGene_55207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	30	TGGAAGAGCAAAGGCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
893299	contig_14681_pilon	+	3798	9	Intergenic	novelGene_134196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	176.830250522924	144	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	344	751	50409	58610	TRUE	15	TATTGTGAGCTGTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHLPEDMENALTGSQSSHASLRDVHSINPTQLMARIESYEGREKKGISDVRRTFCLFVTFDLLFVTLLWIIELNVNGGIESTLEKEVVQYDYYSSYFDIFLLAVFRFKVLILAYAVCRLRHWWAIAVSMPWMSG	23098	73211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14681_pilon_+_23226_45548_45707_50350_50634_56129_56208_58505_60616_60728_60847_62818_62915_71088_71167_72461
893300	contig_7272_pilon	+	2532	4	Intergenic	novelGene_25328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_1	345.881482591942	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	902	1414	555889	575049	FALSE	45	TTTATAGGATTCAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKYKGQLYLLVTDQGFLTEEKVVWESLHNVDGDGNFCDSEFHLRPPSDPETVYRGQQDQIDQDYLMALSLQQEQQSQEINWEQIPEGISDLELAKKLQEEEDRRASQYYQEQEQAGAAAAVASPQAQQGQPAQASPSSGRQSGNNERKRKEPREKDKEKEKEKSSCVIL	554987	576167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_555904_569812_569987_573467_573663_574920
893301	contig_11258_pilon	-	855	4	Intergenic	novelGene_67851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_2	119.15349577564	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	27	647	360591	352060	FALSE	60	ACAACAAAGAATATTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVPAQQHPLPAPSLSEGALVLEHAQCCPLGEQASEGS	360617	351851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354741_355099_360530
893302	contig_13592_pilon	+	2878	8	Intergenic	novelGene_33708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_7	363.105202049078	73	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	513	1178	256608	260292	FALSE	80	AAAAAAAAGTAAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVY	249305	261992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_260283
893304	contig_3386_pilon	-	2641	6	Intergenic	novelGene_34548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1670	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCGCGCATGCGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490100	470039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_475710_475782_476267_476403_485244_485297_486415_486539_488103
893305	contig_960_pilon	+	2406	1	Intergenic	novelGene_108319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATTTAGCAAGAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1054801	1057207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1054800_1057200
893306	contig_5623_pilon	-	3671	14	Intergenic	novelGene_154812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	341.26584754151	4	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	190	1611	220970	207631	FALSE	80	TAAATTAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	275928	205570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212185_220913_221000_239340_239459_275886
893307	contig_8365_pilon	-	786	4	Intergenic	novelGene_150919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	43.6526695123626	34	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAGAAAGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211341	110746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_110902_118266_118335_175907_176023_210893
893308	contig_8303_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_154910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	236.619187725763	13	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	220	822	51496	29167	FALSE	5	GTATTGTTTCTTTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGATRPNGPNTGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEFQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQTSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54799	27816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34038_35771_35895_36176_36329_51333_51593_54676
893309	contig_16098_pilon	-	2513	18	Intergenic	novelGene_45837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	528.201833081435	406	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	608	2428	215535	201500	FALSE	25	GCTACAGTTCCTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	228340	201414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215656_226325_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196
893311	contig_11056_pilon	+	1853	2	Intergenic	novelGene_130385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTTCTTTAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587986	610073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_588028_608261
893312	contig_10352_pilon	+	3363	12	Intergenic	novelGene_49598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	369	junction_11	143.123884383396	1023	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	154	1551	14085	34079	FALSE	20	TAGTCTACGCTCTTGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWEFTSWVPLVSRICPNDVCRIWKSGAKLRVDITLLGFENMSWIRGRRSFIFKGEDNWAELMEVNHDDKVVMTEHFDLSQEMERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	13931	35891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_14110_15251_15396_16073_16264_21362_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883
893313	contig_3018_pilon	+	7565	2	Intergenic	novelGene_78921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTCTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630517	638312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_631414_631643
893314	contig_11986_pilon	+	2475	2	Intergenic	novelGene_69236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGTGATATAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778115	790018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_779846_789273
893315	contig_1225_pilon	+	1567	2	Intergenic	novelGene_44135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTCTGGCCTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250591	276794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250764_275399
893316	contig_6227_pilon	-	3579	15	Intergenic	novelGene_49625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_12	246.226304153603	14	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	188	2284	395173	341366	FALSE	80	AAAAAAAAGAAAAATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGGCASEEEGRGQGFTDGIYQGKQLFQCEEDCGVFVALDKLEIIEVDDTGLESDYAGPVDTMQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQKVQDCYFYQIFMEKNEKVGVPTIQQLLEWSFINSNLKFAEAPSCLIIQMPRFGKDFKLFKKIFPSLELNITDLLEDTPRQCRICGGLAMYECRECYDDPDISAGKIKQFCKTCNTQIHLHPKRLNHKYNPVSLPKDLPDWDWRHGCIPCQKMELFAVLCIETSHYVAFVKYGKDDSAWLFFDSMADRDGGQNGFNIPQVTPCPEVGEYLKMSLEELHSLDSRRIQGCARRLLCDAYMCMYQSPTMSLYK	406529	340070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_344676_344786_345745_345879_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_359403_359521_392432_392539_395032_395336_406504
893317	contig_11978_pilon	-	3021	2	Intergenic	novelGene_62940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_1	0	2336	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	746	1066	980195	979249	FALSE	0	CTTGGCCTTCTGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDNFVRPSFSFIADVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQAW	980940	977293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_979415_980040
893318	contig_16125_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_155281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAGGAAAAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172518	170903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_170900_172500
893319	contig_11427_pilon	-	5285	9	Intergenic	novelGene_78982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	110.08178777618	1091	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	17	541	655701	597310	TRUE	50	GAGGGAGAGAGAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLARKMAGPAAGVGRLEEEALRRKERLKALREKTGRKDKEDGEPNTKQLREEEEEGEKHRELRLRNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAVEEKVKEQLEAAKPEPVIEEVDLANLAPRKPDWDLKRDVAKKLEKLEKRTQRAIAELIRKCRSGQGESLSSGWWPSTEPLPTHPVCPFSQGRD	655717	231718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_232306_436019_436412_456046_456139_593636_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_655605
893320	contig_602_pilon	-	6178	6	Intergenic	novelGene_134939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1808	118	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2656	3015	352112	351753	TRUE	25	GACCGCCTGGATGGATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWILLITCPKYVRPSIAIFTAKEHSGCTSSKRDLFNLLAVHGIFNILCQHHNSKVSILWSSLFTVQLSHAYEATENAMASVRHTLVLKVTPLPFNTLKRSFAADLLNAMCCLIS	500920	257041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_257840_267001_267230_269205_270183_306492_307035_351134_352361_498513
893321	contig_19848_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_173818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGAATGTATTCATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37725	35433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_35400_37700
893322	contig_5041_pilon	-	3778	1	Intergenic	novelGene_27117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	695	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGTAATGAAGAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610272	606494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_606500_610300
893323	contig_15697_pilon	-	4309	1	Intergenic	novelGene_173299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATGTGATCATGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26194	21885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_21900_26200
893324	contig_4232_pilon	-	2311	3	Intergenic	novelGene_63461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	24	722	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	478	786	557748	557440	FALSE	10	CCCTGGATGGTTTCCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTRVAQGLQVFQTMEQGLLGRGRYWGLQSQQVSLPSAPCIASLLPLDSGPNHPFHSETSFVPLSIWTVSPAVSPGGISGDRWPRIGLGTCRSGLCLWSFP	561643	555914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_557977_560612_560819_561600
893325	contig_10225_pilon	+	3972	11	Intergenic	novelGene_86807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	458.421901745543	449	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	1266	2930	42629	47636	FALSE	30	CCTAACAGCATTCAGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20689	48678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
893326	contig_6102_pilon	-	1706	12	Intergenic	novelGene_32080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	117.182276605352	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1668	37	1704	794131	788586	FALSE	15	AGGTAGGTAGGTGTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEKLKEKVKREKKEKVKMKEKEEIAKAKPACKADKTLATQRRLEERQRQQMILEEMKKPTEDMCLTDHQPLPDFSRIPGLILPSGAFSDCLTIVEFLHSFGKVLGFDPAKDVPSLGVLQEGLLCQGDSLGEVQDLLVRLLKAALYDPGLPSYCQSLKILGEKVSEIPLTRDNVSEILRCFLMAYGVEPALCDSLRTQPFQAQPPQQKAAILAFLVHELNGSTLIINEIDKTLESMSSYRKNKWIVEGRLRRLKTALAKRTGRPEVEMQGSEEGLGRRRSSRITEETSGMEEEEEEEAIAAGRGRRGRRDGEVDVPASSIPELERQIEKLSKRQLFFRKKLLHSSQMLRAVSLGQDRYRRRYWVLPYLAGIFVEGTEGN	794167	788583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_788727_788883_788944_789048_789230_789439_789515_789842_790058_790452_790708_790863_791098_791584_791651_791969_792071_793461_793673_793833_793936_794104
893327	contig_13004_pilon	+	2087	6	Intergenic	novelGene_112730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	376.136358253227	43	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	90	572	922526	925398	TRUE	25	TAAAATTGACCTTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLEIRVGRDLKELQSVQILVQQGR	922436	929302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_925329_925449_926828_926989_927531_927669_928134
893328	contig_504_pilon	+	3060	11	Intergenic	novelGene_54429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	117	junction_1	1021.15738747756	24	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	151	1296	222784	236818	FALSE	25	ATTAGCTTGAAGCTCGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSPAASEEERSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKEEAKQIQTLQKGSSRADSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFPVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGEMDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV	219679	238582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_219822_222775_222961_227468_227640_228461_228554_230991_231054_231902_231950_232809_232969_234126_234188_234985_235108_236052_236135_236645
893329	contig_14925_pilon	-	1685	5	Intergenic	novelGene_55282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_4	793.415520077595	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	89	502	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTTQLIFGTGTQIIVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121496	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_121443
893330	contig_16496_pilon	-	1328	3	Intergenic	novelGene_5176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1982	44	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_420_626_1354_3413
893331	contig_9653_pilon	-	5984	11	Intergenic	novelGene_48285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_5	703.726395696509	47	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	18	1520	1025386	1009481	FALSE	35	TAAATAGATGGATTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEG	1025403	1005016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286
893332	contig_1150_pilon	-	603	3	Intergenic	novelGene_61397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	18	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311035	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
893333	contig_3612_pilon	+	1133	2	Intergenic	novelGene_87829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	0	9	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	104	1060	955615	966013	FALSE	25	TACTTAATGATTTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRYVDF	955511	966086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_955909_965350
893334	contig_6847_pilon	+	4633	14	Intergenic	novelGene_143853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	473.886898847614	1126	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	329	1780	77788	110600	TRUE	25	TTGGATGAGAACCAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74050	114454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
893335	contig_5640_pilon	-	1056	9	Intergenic	novelGene_27231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_3	256.282772294589	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	85	768	63466	27237	TRUE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEDSTI	138281	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_27185_27252_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206
893336	contig_10658_pilon	+	3924	1	Intergenic	novelGene_130086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	1061	1702	285752	286393	NA	35	GGGTTTTGTTTAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLNLDQEAVVRTEQGDTAWFKVRKGVRQGCILSPYLFNLYAEQIIQGAGLYEERGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDDSLQYVQYGLHLNIKKTQILTTGPISNIMINGEKIEVIKDFILLRSIINTHGSSSQEIKRHTELGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVCLTQAMVFSVASYACESWTTNKEDQRKIDAFEL	284691	288615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_284700_288600
893337	contig_19237_pilon	-	2368	3	Intergenic	novelGene_162964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	82	419	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCTCTGTAAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71836	65842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_67816_68341_68467_71566
893338	contig_10599_pilon	+	3489	18	Intergenic	novelGene_49897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_11	249.546356581387	582	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	34	2073	295755	350466	FALSE	35	CATTATCTTTGTAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRGCRGARAAMAAGGGGSGDPLSPAGVPCAFSPQSQAYFALASTDGHLRVWETGNNRLHQEYVPSAHLSGTCTCLAWAPARLQAKESPQRKKRKSEAIGTSDQIDLLALGTAVGSILLYSTVKGELHSKLISGGHDNKVNCIQWHQDNGCLYSCSDDKHIVEWNAQTCKVKCKWKGDSSSVSSLCISPDGKMLLSAGRTIKLWVLETKEVYRHFTGHATPVSSLMFTTIRPPNESQPFDGITGLYFLSGAVHDRLLNIWQVRSEKKEKNAVMSFTVTDEPVCIDLTLSENKEEPVRLVVVCRDGQVHLFEHILNGFCKKPLSSNCTIQIATSGKGKKSTPKPIPILAAGFCSDKMSLLLVYGSWFQPTIERVAINSKEPHVCLVRDISSCWAPKVETAITKVRTPVMNSEAKVLVPGIPGHCAVVKPVTPQAEELESKRKLGENEVSIEERLGAMDIDSKKGKDDLPQTNSFPVLLTQGLESNDFEMLNKVLQTRNVNLIKKTVLRMPLHAVIPLLQELTKRLQGHPNSAVLMVQWLKCVLTVHASYLSTLPDLVSQLRTLYQLLDSRVRTFQKLSHLHGKLILLITQVTASEKTKGMTCPGQKAKLVYEEESSEEESDDEIADKDSDDNWDEDEEEKESDKDEDVDEEHEEEDAEEKDEENGEDRDVTSEKELNGDSDLDSENESEEE	295721	351882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_295980_302883_303022_307357_307480_315223_315345_316318_316459_323323_323427_326889_326955_329050_329223_330609_330697_331544_331677_332440_332573_339955_340043_341748_341781_342815_342880_345408_345523_346239_346310_350123_350174_350280
893339	contig_9571_pilon	+	7077	23	Intergenic	novelGene_136262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1210	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	6605	7075	465901	529190	FALSE	10	GAGGGGCTTCCGGCAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCLFATQKAFPLSIIAIQSFTSLSSFSSNSATSPSTSSNAALKRGESFRHSSKSTVIFILPPPRLAGGAGRAEGAKGAAALGTRTAKAGARPGLLLRGAAEGAWLAGHSSREGGGGDGSSGPSLAPLPPAPSRARASEKRPRSDSSRQPATKPAAS	374584	529192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_379109_384976_385046_387379_387499_395502_395617_396042_396235_398576_398669_399560_399747_401698_401791_405588_405661_406000_406208_413387_413494_414097_414198_416578_416632_424503_424616_429612_429689_434577_434674_437917_437963_441928_442113_444234_444294_463910_463965_465848_465969_479402_479460_528844
893340	contig_57_pilon	+	3643	15	Intergenic	novelGene_44900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_1	285.210126619885	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	1063	3066	106702	145460	FALSE	20	TGCCAAATTCTGCTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQVSDI	105639	146037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325
893341	contig_7869_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_149993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1884	2243	92722	92363	NA	20	AGGGGTAGTAACTTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPQKLASPRSAGQRAGLLLTGCEGWQILRSAGKTTRFLLIHLAAGAGEPKIGRSESRAMLTGCEDRRILSLADKLAAQVPRTRDEMTGSSRRIQREQKARTSAYIQMQATPPRRLPFI	94605	92265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_-_92300_94600
893342	contig_15047_pilon	-	3651	8	Intergenic	novelGene_52163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	577	876	6719	6420	TRUE	15	ACTGAGTTCTGGCAGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	262608	2167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2248_2548_2825_3220_3495_4155_4433_4551_6974_204574_204684_214779_214921_262536
893343	contig_5686_pilon	+	2954	14	Intergenic	novelGene_45248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1758.07724786696	37	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1050	1922	202891	211355	FALSE	30	CTGAAAGCATTTGCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93788	212387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199827_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
893344	contig_2245_pilon	+	6638	7	Intergenic	novelGene_178638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	589	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	4759	5481	249075	249797	TRUE	45	AAATCAATTACATGGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTQTNSWKNTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGIEYKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETYVAYNQKQKFSSDWSSRTGEKTENTERIIEKLLTENFPNTMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHMIITLAKTKDKQRILRAAREIQEVTYRGETIRLSSDYLAESMQARRQWDDIYKILKEKKLPAKNNISYKTLVQI	15448	251090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2245_pilon_+_17304_38326_38478_93398_94479_226894_227092_227226_227739_248111_249851_249986
893345	contig_6102_pilon	-	5013	28	Intergenic	novelGene_31989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_2	298.078280288414	1138	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1214	3645	67	3711	438578	418292	FALSE	10	GTTTCATCTTGTGGATGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEEAGAELSGADGGGGPEPEKMAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPCKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGTDEARAEGQATDEKKEPKDPREGGGVAEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPVVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGDRKAKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQQQQPPPTLPTGSQPVPPTGAAGPPSIHGLAVAPASLAPAPAGTGAPPGSLGPSEQIGQAGPIAGPQQQQPAGAPQPGAVPSGVPPAGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLTATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ	438644	416989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_418369_418971_419401_419718_420101_420538_420674_421184_421352_421432_421569_421802_421868_422138_422301_422537_422797_423161_423225_423318_423439_424435_424590_425298_425413_429166_429239_429548_429680_429962_430001_430140_430201_431438_431564_431940_432057_432161_432294_432427_432504_433389_433460_433715_433786_434353_434447_434547_434630_435076_435163_436270_436391_438467
893346	contig_11277_pilon	+	1199	8	Intergenic	novelGene_80312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	153.861586353131	156	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	39	1001	250372	269500	FALSE	20	GCACCACATTTCCACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	250333	269698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_250501_254697_254798_255953_256036_256538_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
893347	contig_20641_pilon	+	3100	4	Intergenic	novelGene_52791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_3	1999.83816011863	1047	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	93	506	14599	26870	FALSE	20	TAAGTTTTATTCTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKDVTDFISQLFVQLGTVGIYDLPPLRNKLVVK	14506	29464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_23896_23982_26859
893348	contig_8354_pilon	+	1605	2	Intergenic	novelGene_24095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	321	869	184446	184994	TRUE	55	AAAGAAGAAGACAACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTPALPAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDVPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKPWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSERSQSQKDKYCMRPLL	184125	186174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_185222_185665
893349	contig_6576_pilon	+	3354	7	Intergenic	novelGene_42333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	464.433496016623	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCTGTGTACAACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665388	710336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_665519_688932_689021_689512_689691_692096_692320_693449_693583_706165_706279_707847
893350	contig_10500_pilon	-	2511	9	Intergenic	novelGene_41283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	797.536519540015	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	102	1010	1640040	1629460	TRUE	25	AGGAATTTTTGGATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640141	1627393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627490_1627822_1627922_1628153_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
893351	SIRV6	+	1150	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
893352	contig_5125_pilon	+	2526	8	Intergenic	novelGene_43420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	300	1433	35654	58893	FALSE	20	TTAATGTTTGTATCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25957	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26045_26332_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
893353	contig_11171_pilon	+	2823	8	Intergenic	novelGene_48576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	139.684338011512	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	2	1165	70574	106205	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQVPQPKAMVPLHAHPAGMRINVVNNHQAKQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITGRDPPFCVVFHPVLFCSLMSLWYVFSVLHLVIKTGLCFSECVLPPSKLGPRLNSYVEM	70572	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_87274_87362_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93765_106023
893354	contig_34_pilon	-	4931	7	Intergenic	novelGene_39968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1848.49286958021	153	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3999	4574	220886	220311	TRUE	70	AAATCAATAAAATAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGQYVMIKGSIHQEDKTIINIYTPNDIAPKYMKRTLTALKREIDSSTRVVRVFNMPLLLKNRTSRKKLNKDTKELNATINQLDLIDFYQTLHPTADKYTFFSNTHGTVSRIDHVLGHEASLNKIQSIEILQSIFTDHKAIKVEINNRKGKEKESNT	247107	172040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_172271_220183_221342_221526_222053_222234_224818_230228_230387_243214_243354_246970
893355	contig_15353_pilon	+	3038	3	Intergenic	novelGene_151993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_2	61.5	776	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTACATCTGGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540436	544852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_543283_543791_543881_544749
893356	contig_8263_pilon	+	3500	8	Intergenic	novelGene_83092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	214.509692469281	1376	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1047	1766	188825	192899	FALSE	40	ATAAAATAGCCGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALENMRNVEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139600	194633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188695_188856_188939_189005_189258_189386_192402
893357	contig_10951_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_61633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTAGTAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181597	183102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_181600_183100
893359	SIRV6	+	1338	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	396	76	180	59	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	144	635	1733	10736	TRUE	35	TTGGTCGCAAAAATTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1483	11749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
893360	contig_3412_pilon	+	6326	7	Intergenic	novelGene_178331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3810	4109	257813	339819	TRUE	55	AACAGACTCAACTGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTDCLMRNYLFCKPSPKVQLKKKTPDDFPIEEKTLQQNDREFKSLIFRIIQESKQKADKNEEKIDKFIEKADKFMENTDKNGRIQEIIQEQNVKINSR	102544	342220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3412_pilon_+_103768_185285_185871_255765_256111_256156_257885_339591_340353_340406_341377_341506
893361	contig_20199_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_82593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	29	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAAGAGTGGCTGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43943	40652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
893362	contig_9484_pilon	+	3277	11	Intergenic	novelGene_105659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	729.137469891652	1	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	291	872	187875	211628	TRUE	15	CTGATTCCCGGTATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKRGTESSRIYSQSVTVTKTLNESLQ	126759	214091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_187787_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202600_211554_213399_213456
893363	contig_5727_pilon	+	3468	1	Intergenic	novelGene_7933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	667	2004	1401	3404	129759	131762	NA	20	TTCAGTTCCAGTATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTTNSLPTDLLLKEGSLKQEVESFCYQIVSESNDQKVGILQSEDEQLQPSVSKKSESELPRVKFMSNSNKITFSKKPKRRKYDESYLSFGFTYFGNRDAPHAQCVLCKKILSNSSLAPSKLRRHLETKHAAYKDKDISFFKQHLDSPENSKPAAPKIVNTDNESATEASYNVSYHIALSGEAHTIGELLIKPCAKDVVMRMFDEQYSKKIDAVQLSNSTVARRIKDLAADIEEELVCRLKICDGFSLQLDESADVSGLAVLLVFVRYRFNRSIEEDLLLCESLQSNATGAEIFNCINSFMQKHEIEWEKCIDVCSDASRAMDGKIAEAVTLIKYVAPESTSSHCLLYRHALAVKIMPTSLKNVLDQAVQIINYIKARPHQSRLLKILCEEMGAQHTALLLNTEVRWLSRGKVLVRLLELRRELLVFMDSAFRLSDCLTNSSWLLRLAYLADIFTKLNEVNLSMQGKNVTVFTVFDKMSSLLRKLEFWASSVEEENFDCFPTLSDFLTEINSTVDKDICSAIVQHLRGLRSTLLKYFPVTNDSNAWVRNPFTVTVKPVSLIARDYESLIDLTSDSQVKQNFSELSLNDFWSSLIQEYPSIARRAVRVLLPFATMHLCETGFSYYAATKTKYRKRLDAAPHMRIRLSNITPNIKRICDKKTQKHCSH	128358	131826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_128400_131800
893364	contig_3277_pilon	+	4854	13	Intergenic	novelGene_74714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	227	junction_11	589.132130057992	870	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	379	1926	240775	280211	FALSE	25	TTCCATTATAGTATTTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVEYHVISTFKRNPLEQAFRRPNVNLTSNHLLYHYWIAVSHKAPAFLYDIYLRMTGRSPRMMKAITRLHKAMMFLEYFTSNSWVWNTDNVNMLMNQLNPEDKKTFNIDVRQLHWAEYIENYCMGTKKYVLNEEMSGLPAARKHLNKLRNIRYGFNTILVILIWRIFIARSQMARNIWYFVVSLCYKFLSYFRASSTMRY	188598	283139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618_263687_265054_265227_272438_272569_278434_278563_280048
893365	contig_10225_pilon	+	2904	12	Intergenic	novelGene_86831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	497.259730592998	229	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	1202	2788	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21315	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21627_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
893366	contig_9161_pilon	+	2937	5	Intergenic	novelGene_160633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_2	394.88566383195	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1093	1413	52934	56781	TRUE	35	TACACAGAACTTGAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRVEGI	51841	64655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_53063_54664_54842_56766_56804_60940_61076_63288
893367	contig_2917_pilon	+	4140	1	Intergenic	novelGene_147600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAACTTTCTGGTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110978	115118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_111000_115100
893368	contig_13612_pilon	+	3644	10	Intergenic	novelGene_157284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.054823670523	123	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	358	1134	51633	53792	TRUE	15	GGTGGTGTGTCAGGGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLGQHFQNVSLNQLHPGCLGSWFPGPHPLL	49358	57739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_49845_49913_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_55301_56237_56382_56881
893369	contig_12812_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_178640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1422	1787	3770	3405	NA	65	GGAAAAAGAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGSSSAFSSTRESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	5191	2676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12812_pilon_-_2700_5200
893370	contig_5823_pilon	-	2511	2	Intergenic	novelGene_178641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1182	2231	1574	525	FALSE	50	AGATGAAAATCATAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	3079	244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5823_pilon_-_2296_2619
893371	contig_7009_pilon	+	8201	8	Intergenic	novelGene_23624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	556.141737916748	886	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	105	965	444955	518263	TRUE	25	TGCTTATAGAATGGTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	431188	539291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991_523002_536325_538537_539004
893372	contig_4180_pilon	+	1833	7	Intergenic	novelGene_8327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	191.578240471673	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	246	1112	811833	821915	FALSE	0	TCTGGTTTTCTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDPEQNLNRNNNILLPSQQFCNQVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	802497	822636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_802660_811147_811213_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
893373	contig_2036_pilon	-	5879	4	Intergenic	novelGene_131803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3922	4407	422313	421828	TRUE	55	AACCCCCCCAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRISESGSRAKGGRRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKATPTAYKQHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRILAHAAAQTWKEPHTRT	509619	314705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_315221_380155_380383_421097_424993_508377
893374	contig_8866_pilon	-	4326	1	Intergenic	novelGene_77837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1165	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTCTCTATATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613958	609632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_609600_614000
893375	contig_7051_pilon	+	3536	11	Intergenic	novelGene_64288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	185.985725258688	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	296	892	189176	206198	FALSE	5	TTTCACCTGGTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184033	208842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
893376	contig_863_pilon	-	2770	3	Intergenic	novelGene_176616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_2	66	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	1068	2375	18801	8054	FALSE	60	GATAAAAAGCAAAATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQVMGQSSGGGGGLFTSSANIGMALPNDMYDLHDLSKAELAAPQLIMLANVALTGEVNGSCCDYLVGEERQMAELMPVGDNNFSDSDAEVLEESPEIKGEPNGLENMELESLELSVVEPQPVFEVSATPEIYNSSKDLPTETPGTEDKCKNLKTKPFRCKPCQYEAESEEQFVHHIRVHSAKKFFVEESAEKQAKAREYGSSTAEEGDFSKGPIRCDRCGYNTNRYDHYTAHLKHHTRAGDNERVYKCIICTYTTVSEYHWRKHLRNHFPRKVYTCGKCNYFSDRKNNYVQHVRTHTGERPYKCELCPYSSSQKTHLTRHMRTHSGEKPFKCDQCSYVASNQHEVTRHARQVHNGPKPLNCPYCDYKTADRSNFKKHVELHVNPRQFNCPVCDYAASKKCNLQYHFKSKHPTCPNKTMDVSKVKLKKNQKEGN	19868	7658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_8380_14545_14630_17903
893378	contig_5669_pilon	+	4133	8	Intergenic	novelGene_86071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	268.443586594416	5	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	466	1431	186087	188350	TRUE	45	TTCTGAAAAAAGACTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVHLHPSPALA	185621	192899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188431_190137_191742_191881
893379	contig_1535_pilon	-	2550	7	Intergenic	novelGene_127244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_6	336.450920970982	410	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	278	1162	134839	129144	TRUE	25	TTACCTAATTATCACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVLTTDAQKLLHQLNALLEQESRCQPKVCGLRLIESAHDNGLRMSARLRDFEVKDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136165	126907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_134578_134840_135888
893380	contig_2550_pilon	-	3708	6	Intergenic	novelGene_135623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	385	684	438874	438575	TRUE	50	GAAGGCGGGGACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATITDCSDQDHNRGFWTELEKDAEQNSNSKKKDQIYRPKGDWRNLESMAPTHPFSSVVKSFPRFTIQPGSGQPHKTKWD	439258	397110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_397196_397611_397706_398491_398592_401128_401267_409541_409659_436084
893381	contig_12102_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_151063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	385	702	92205	92522	NA	50	AATATAAACTCTATGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPIGRGRGISPPPRKKSQEWSTSFRPRIPTLRSSWNQETKRERAVTLKMASSGRETVAAELRDQEETALWAACGARVPSGRRLPGRVWCLQVLGGARFANSRS	91820	94136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_91800_94100
893382	scaffold_880_pilon	-	4446	19	Intergenic	novelGene_121418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	91	396	490700	490395	TRUE	15	GTCCGCCCGGCTGGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFHRQSKASSEAQGPPQPEASRRRPPVWPAMTMGCTNSWKSLSSTRCRKSTSGSRREELRQMMLSFSSCSSMPSLIFWSSKRSGKVTWLSREWQRVKNFSRWLSWGGRGRRRGSHPICVSQWIHKQSQIAL	490790	352564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_352702_406893_407000_420188_420364_424872_424946_433473_433596_437560_437774_439123_439212_441361_441427_443430_443581_447598_447680_450969_451131_453829_453965_455113_455210_456015_456178_479494_479614_482288_482360_484796_484938_485540_485641_488539
893383	scaffold_880_pilon	-	8661	44	Intergenic	novelGene_121434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	40.2408782901139	729	46	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	4472	4987	546082	539183	TRUE	30	GGCGGTCACAGGAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRLHRSSSHLGREESGLHGRVLFCIGQNRPQGSSQMLLIKVWCFAHQGCQRHGHLHLYSCKVTDGSEAEPHEQVEGGAGLAPGDIYAAAAVMQHALAEVCTLLHLLLKQQVSELGNEGSERGEAVRQVRGALITAQRIHQDPQDTSQQAVFTVQSRGGLDDIFLHVQDD	579549	408730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_408780_420187_420394_443430_443581_447598_447680_450969_451131_453829_453965_455113_455210_456015_456178_479494_479614_482288_482360_484796_484938_485540_485641_488539_488633_490474_490712_492349_492516_493175_493346_496768_496865_501311_501407_506099_506251_509154_509269_510286_510443_514142_514285_525270_525440_528123_528271_534032_534215_534655_534785_535962_536058_539121_539215_541587_541725_542995_543151_544244_544409_546054_546151_547342_547530_554397_554548_556534_556672_557478_557604_559497_559590_563955_564193_567761_567906_569208_569318_575186_575357_575789_578232_578283_578363_579018
893384	contig_3948_pilon	+	4320	1	Intergenic	novelGene_53188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	917	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	831984	832361	NA	70	TGCAAAAAAAAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQFEECNQCHYIIHVKSIELVYVLMYIFSTIFKKRSGEKQLKYICNIIHVYVGRGKEFSARIWQCGKQQPLASTYPLIPSLSCVLMSQQTHPSCTSIPHVHCSLATSGLGRTALKNDRMEWGT	831982	836302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_832000_836300
893385	contig_3018_pilon	+	3098	2	Intergenic	novelGene_78913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1074	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625266	628473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_626574_626682
893386	contig_5331_pilon	+	2222	13	Intergenic	novelGene_112818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	432.56714315044	703	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	387	902	727514	734163	TRUE	15	CAGTCATCCTGCTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPAAPQAYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPARPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGTHGRRTRS	716507	741804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_716634_724560_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_734135_734169_734490_734610_737891_738022_739077_739254_739978_740114_740548_740647_740986_741240_741400
893387	contig_6881_pilon	-	1605	6	Intergenic	novelGene_164834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	180.4046562592	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	167	1267	105320	72233	TRUE	60	AAAGAGAATGAAAAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLQAKDLKPKGKSGTNDTYTIIQLGKEKYSTSVAEKTLEPVWKEEASFELPGLLMQGNPEKYILFLIVMHRSLVGLDKFLGQVAINLSDIFEDKQRRKTEWFRLESKQGKRAKNRGEIKVNIQFMRNNMTASMFDLSMKDKTRSPFAKLKDKMKGRKNDGTFSDTSSAIIPSTHMPDANTEFPSGEIQMKSKPKKPFLLGPQRLSSAHSMSDLTGSHISSEKLKSGTIGQTHLLGRQIDSFGAVPESGSLKSPHRRTLSFDTSKTNQHDNSVDEGESSFGRQNDQLTNVTASLPQKFATLPRKKNPFEESSESWDSSVNLFSKSIEVRKENKREKREKVSLFERVTGKKDSRRSDKLNNGGSDSPCDLKSPNAFSENRQDYFDYESTNPFTAKFRASNIMPSSSFHMNPTSNEDLRKILD	105486	66473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_66741_72161_72239_72598_72645_96351_96821_97501_97945_105183
893388	contig_16622_pilon	-	1465	6	Intergenic	novelGene_48456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1498.00534044442	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATGTCAATTTTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121963	111847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115436_121712
893389	contig_5988_pilon	+	2685	9	Intergenic	novelGene_16102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1749.53915360589	54	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	70	582	1219952	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1218943	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
893390	contig_854_pilon	+	1351	8	Intergenic	novelGene_36240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2608.86268128392	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	112	690	543600	562402	TRUE	35	GGAAATATAACTTCAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543488	563790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563254_563355
893392	contig_10377_pilon	+	5691	12	Intergenic	novelGene_115379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	657.636099731015	173	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	204	980	219517	255047	TRUE	25	CTTTTAAGAAGTCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	209080	261743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_235978_236012_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_258094_258300_261069_261146
893393	contig_1521_pilon	-	708	4	Intergenic	novelGene_145446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_2	99.3523471735262	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	21	707	191760	160875	FALSE	50	CAAGAGAAGAACGAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREETKGKRDREKD	191780	160873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669_163981_179059_179258_191614
893394	contig_14208_pilon	+	3674	8	Intergenic	novelGene_129079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110100	213006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_112152_113875_113937_132891_133009_157699_157926_168730_168999_172526_172647_175609_175913_212478
893395	contig_11896_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_88038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGTCATTGGTGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160886	158549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_158500_160900
893396	contig_3386_pilon	+	2464	4	Intergenic	novelGene_34573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	427.167414487575	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	122	307	476274	486472	TRUE	25	TATTGCCCGGGATAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLLPAAAAAGASPVLTSRPLAGPASGLPAALPPRGSAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRNNSGDQHMLGRKQNFFV	470189	490194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_486417_486541_488105
893398	contig_776_pilon	-	2213	5	Intergenic	novelGene_139928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	96.0270144282326	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	69	341	861870	833183	FALSE	45	AAAAAAATGCAGTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAESWVRVDPASLVPECSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRFGL	932076	831310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834739_834799_857382_857510_861796_861886_932023
893399	contig_11989_pilon	+	4512	1	Intergenic	novelGene_68459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1066	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTGCCAAATAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107404	111916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_107400_111900
893400	contig_18533_pilon	-	3070	1	Intergenic	novelGene_174052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAAAAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166125	163055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_-_163100_166100
893401	contig_12379_pilon	-	3995	1	Intergenic	novelGene_148933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	958	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCATTTGACTGCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114439	110444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_110400_114400
893402	contig_12566_pilon	+	3038	1	Intergenic	novelGene_86014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGAGGTGTGCATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55657	58695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_55700_58700
893403	contig_1275_pilon	-	2879	20	Intergenic	novelGene_108755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_19	503.56073941735	194	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	877	2631	249	2879	513735	400413	FALSE	30	GCTCAGCAAATCACTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVV	546955	400412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
893404	contig_9144_pilon	+	2386	7	Intergenic	novelGene_151135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	237.290024138301	15	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	163	588	618610	622285	TRUE	20	AACCATGTTGGCCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYSCWRTGLLLLLLQAVAVKVSWQTEEKSCDLVGEKGKESETELALLKRLKPLFNKSFESTVGQGPDTYIYMFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRQF	615297	625502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615459_618608_618789_620115_620283_621888_621958_622274_622406_622954_623082_623951
893406	contig_5551_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_134241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCTACAAATTAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433999	432169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_432200_434000
893407	contig_12050_pilon	+	4948	2	Intergenic	novelGene_62721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	0	20	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	302	628	666343	668408	FALSE	35	AATGGAAGATCTATTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDMPDKKLVVVFGATGAQGGSVARTLLEDGTFRVRVVTRDPGQQAAKALRLQGAEVVQGDQDDKASMELALTGAYATFIVTNYWENLSQEQEVKQVRAGGRLLGGQD	666041	672728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_666392_668130
893408	contig_14666_pilon	+	2116	5	Intergenic	novelGene_39596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	86	1384	477340	485019	FALSE	20	CATTAATGATGGTCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477254	485751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484827_484962
893409	contig_20742_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_150652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGAAGAAAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6650	8130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_6600_8100
893410	contig_7728_pilon	+	4241	3	Intergenic	novelGene_64717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3570	4025	748580	749035	FALSE	25	AGATGGTAGTGAGAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVQCWLITSRDGAISRIQCWSLLLPDLAPSRGCSQADLGKHKSTLLSPRITSISATMATLFMSPLGNDRKGWGKKMTGFHRTHYPIHLIAPLPRSPFGEHSHKKQISSLLWRTQRGLSTYLFPIPPCLQFSNHVPYKSLPSSRTTGPCP	743784	749251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_744244_745375_746042_746135
893411	contig_11292_pilon	-	4688	17	Intergenic	novelGene_109468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_6	219.130374648861	977	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	31	1887	481968	461999	TRUE	20	TTATACTTCTGATTGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKSRAVPGRRPILQLSPPGPRSSTPGRDPEPEPDTETDSTAAAASQPVPMAVVPATTTALTAVAASEDSPSEDPDEQEVVVEVTRVVQHPPKPVMTTRPTAVKATGGLCLLGAYADSDDDESDALEKPAQSKEANGNQSTDIDSTLANFLAEIDAITAPQPAAPVAASAPPPTPPRPEPKESSTSALSSTASNGTDSTQMSGWQYDTQCSLAGVGIEMGDWQEVWDENTGCYYYWNTQTNEVTWELPQYLATQVQGLQHYQPSSVTGAEANFVVNTDVFTKEKTVSASSSRSGPVIAKREVKKEVNEGIQALSNSEEEKKGVAASLLAPLLPEGIKEEEEKWRRKVICKEVEPVSEVKEASTAVEEAATIVKPQEIMTDNIEDPSQEDVCSVVQSGESDEEEEQDTLELELVLERKKAELRALEEGDGSVSGSSPRSDISQPASQDGMRRLMSKRGKWNMFVRATSPESTSRSSSKTGRDTPENGETAIGAENSEKIDENSDKEVEVEESPEKTKVQTAPKVEEEQDLKFQIGELANTLTSKFEFLGINRQSISNFHMLLLQTETRIADWREGALNGNYLKRKLQDAAEQLKQYEINATPKGWSCHWDRTSGSNYS	481998	449372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_450399_452333_452492_454730_455072_455314_455460_455592_455904_461178_462024_462342_462477_463362_463468_464336_464462_472209_472421_474109_474452_475351_475473_475569_475718_476726_476914_477144_477282_480058_480158_481745
893412	contig_8581_pilon	-	2554	12	Intergenic	novelGene_22811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	532.473147578882	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	3	1361	339377	312538	TRUE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNALPGADL	339379	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312561_314673_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264
893413	contig_12964_pilon	-	2150	2	Intergenic	novelGene_131697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGTGTGCTAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558525	555683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556628
893415	contig_4769_pilon	+	1723	9	Intergenic	novelGene_117962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGCGAAATGTCGGAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406829	437513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_407688_408377_408497_412414_412482_417835_417934_418648_418736_421171_421277_423628_423661_433960_434061_437256
893416	contig_8198_pilon	-	2632	2	Intergenic	novelGene_178072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACCCAACTGAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114571	89881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8198_pilon_-_91550_113607
893417	contig_9848_pilon	-	4388	3	Intergenic	novelGene_79926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTGAAGATCTAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206807	68671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_69013_69170_71942_205531
893418	contig_10722_pilon	-	1236	5	Intergenic	novelGene_70974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_3	168.348411040912	56	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	120	809	6315	4150	FALSE	35	TTAAACTGCTTCAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	6530	3722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423
893419	contig_10765_pilon	+	3392	6	Intergenic	novelGene_122845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_5	150.456106556032	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	161	1741	18249	32220	TRUE	70	AAATAAATAATGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMVTMRYERASAVCRALFVCCACFQRGLLVCLVL	15606	85715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18248_19517_28914_29040_32032_32541_34727_34875_84531
893420	contig_5136_pilon	-	2480	17	Intergenic	novelGene_126636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	309.326782858759	57	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	947	1672	290393	279549	FALSE	65	GAAGAAAAAAAGAAAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAAFGGEVDGKSLSRFGTRQGPGLLETE	360268	278740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_279691_282598_282643_282748_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405_294573_296535_296658_305916_306005_307058_307168_329056_329149_331432_331489_360106
893421	contig_8377_pilon	+	1874	2	Intergenic	novelGene_35049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCTCTTTAATGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90781	92939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_91820_92103
893422	contig_10549_pilon	+	5330	2	Intergenic	novelGene_110603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	740	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1711	2094	148596	148979	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKRRKQNKETKKTQKTKTRKKKWPQGCLSVSAQSKGVSPKPRSTTRPEGAPKPRKEKENNQTNKSKQDKLEQTNRQKAPGGPTSVVAQAGKQFHRKKQRWLQSQVFERREGEVVRGKKEI	146794	152215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_148217_148307
893423	contig_4952_pilon	+	4141	4	Intergenic	novelGene_145514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	349	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1638	1970	248482	248814	TRUE	15	AGTGGCCTCTATGCCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILQIIQALKQKADKNKEKIDKFMENTDKTMEGFRKIMQEQNTKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIAGLRSRC	83643	376825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_84462_247662_249875_255704_256418_376427
893424	contig_4845_pilon	+	3675	18	Intergenic	novelGene_53676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	705.136861240132	564	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	195	2297	803035	955709	FALSE	30	TGGAGAAAATGCTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQTLQEALKVEIQVHQKLVAQMKQDPQNADLKKQLHELQAKITALSEKQKRVVEQLRKNLIVKQEQPDKFQIQPLPQSENKLQTAQQQPLQQLQQQQQYHHHHAQQSAAPSPNLTASQTVTTASMITTKTLPLVLKAATATMPASVVGQRPTIAMVTAINSQKAVLSTDVQNTPVNLQTSSKVTGPGAEAVQIVAKNTVTLQVQATPPQPIKVPQFIPPPRLTPRPNFLPQVRPKPVAQNNIPIAPAPPPMLAAPQLIQRPVMLTKFTPTTLPTSQNSIHPVRVVNGQTATIAKTFPMAQLTSIVIATPGTRLAGPQTVQLSKPSLEKQTIKSHTETDEKQTESRTITPPAAPKPKREENPQKLAFMVSLGLVTHDHLEEIQSKRQERKRRTTANPVYSGAVFEPERKKSAVTYLNSTMHPGTRKRGRPPKYNAVLGFGALTPTSPPSSHPDSPENEKTETTFTFPASVQPVSLPSPTSTDGDIHEDFCSVCRKSGQLLMCDTCSRVYHLDCLDPPLKTIPKGMWICPRCQDQMLKKEEAIPWPGTLAIVHSYIAYKAAKEEEKQKLLKWSSDLKQEREQLEQKVKQLSSSISKCMEMKNTILARQKEMHSSLEKVKQLIRLIHGIDLSKPVDSEVSVGAISNGPDCTPPLPTPPPPRRPPPPPPRAAQRTVTRGKRLNNRAPLGEATGSRQQGAAKY	767050	957087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_767112_794494_794536_802942_803089_807471_807505_810596_810663_916632_916840_923065_923315_924518_924609_930192_930487_937530_937630_941043_941096_941861_941942_942423_942485_945067_945232_951798_951955_953267_953344_953723_953828_955391
893425	contig_14341_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_111810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTAAAAAAAGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478287	479843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_478300_479800
893426	contig_513_pilon	+	4431	1	Intergenic	novelGene_80141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338806	343237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_338800_343200
893427	contig_546_pilon	-	5127	11	Intergenic	novelGene_117181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2489	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCATGTGACACTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156561	61169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_61243_84737_84816_89661_89751_119793_119882_123931_124065_136648_136837_139865_140635_146630_146845_147555_147672_152818_154719_155082
893428	contig_14925_pilon	+	1443	7	Intergenic	novelGene_55326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGTGCTACAGAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112096	130947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_112881_113136_113276_114663_114781_115152_115207_115820_116101_129436_129485_130926
893429	contig_6361_pilon	+	2446	1	Intergenic	novelGene_24024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	423	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTCTTGACGGGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430142	432588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_430100_432600
893430	contig_15036_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_107151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97612	99741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_97600_99700
893431	contig_10864_pilon	+	2558	14	Intergenic	novelGene_107075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	681	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	346	678	893879	894211	TRUE	20	TGCAAGGCCCCTGGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVSVAKCGQQKGVFNSISRQISQPPALPPPMGFSEVSLFISTNKQQMKHLTKYTQLTLKDPPLTLIRVLGLGLSLPHAVSLIYTPHISFLTFSYINLNIIQKKAFPPDI	893533	1035222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_894801_895371_895481_896060_896140_896983_897106_902002_902056_903666_903798_911646_911740_919442_919611_924359_924432_927813_927932_929301_929347_958175_958262_976404_976551_1035153
893432	contig_5031_pilon	-	3884	33	Intergenic	novelGene_133190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.293456834092	3	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	664	3570	92364	26499	TRUE	45	AGGATCACATAACAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGAKLTLASQGTKRTVQMDHTFFPGYKKTLLNPEEILLSIEIPFSREGEFLSAFKQASRRDDDIAKVTSGMRVLFKPGTLEVKELAICFGGMADRTISALKTTQKQLSKFWNERLLQDVCAGLAEELHLSPDAPGGMVEFRRTLTLSFFFKFYLTVLQKLGEEDSEDNCGKLDPTFASATLLFQKDPPANIQLFQEVPKDQSEEDMVGRPLPHLAAAMQASGEAVYCDDIPRYKNELSLRLVTSTQAHAKIKSIDTSEAQKVPGFVRFFSADDVPGSNITGLFDDETIFAKDKVTCVGHILGAVVADTPEHAQRAGQAVKITYEELPSIITIEDAIKNNSFYGRELKIEKGDLKKGFDEADNVVSGEVYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEEGEVELFVSTQNTMKTQSFVARMLGVPANRILVRVKRIGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAHKTGCPVRCMLDRDEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGRIVALEVDHYSNAGNTLDLSQSIMERALLHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAEYWMSEVAVTCGLPAEEVRKMNMYKEGDLTHFNQKLEGFTLTRCWDECLASSQYQTRKDEVEKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGALVHVYTDGSVLVTHGGIEMGQGLHTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPNTSPTAASVSSDINGQAVYEACQTILKRLEPFKRQNPSGSWEDWVIAAYQDAVSLSATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTGDHKNLCTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIHAARAQHADYNTKKLFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSLRV	105970	22721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22974_26436_26550_28333_28511_29750_29940_31415_31482_32666_32782_34524_34578_35158_35234_35920_36050_36699_36796_41694_41777_42565_42712_42904_43097_70817_70905_72100_72189_72791_72926_73683_73809_75208_75306_75992_76113_77689_77814_80342_80513_84576_84661_87127_87303_88120_88306_90741_90852_92327_92422_93663_93816_94581_94624_98635_98726_99042_99112_102699_102762_103672_103800_105906
893433	contig_6007_pilon	+	4268	1	Intergenic	novelGene_87903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTTGTGAAGCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637	4905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_600_4900
893434	contig_9098_pilon	-	1879	12	Intergenic	novelGene_75854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	156.435290136209	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	38	1447	355822	335775	FALSE	30	AAAATCTTCTTGCTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTIHHPAKDPEMSWPAQVRRGLGWSLQGVLPAPGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355859	335342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355755
893435	contig_2161_pilon	+	4354	3	Intergenic	novelGene_114939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53	730	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	233	985	951496	953538	FALSE	20	TTTCCTTTTCCACCCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEPHKANGWRIPFNKYEGGCGAAMRAMCIGLRFPHCSQRDTLIQVSIESGRMTHHHPTGYLGALVSALFTAYAVNGKPPQQWGNGLMEVLPEAKKYIVQSGYFVEENLQHWFYFQDQWEKYLKLRGIWDGKSAPIFPKPFDVKERDQFYVSVSYSGWGGSSGHDAPMIAYDAILAAGDSWKELAHRAFFHGGDSDSTAAIAGCWWGVMYGFKGVSPSNYEKLEYRKRLEETARALYSLGSKEDTVTAL	937909	956907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_938119_951472_951834_953123
893436	contig_5686_pilon	+	4366	20	Intergenic	novelGene_45294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1786.77366584691	725	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	317	2593	170242	221370	TRUE	30	CCCAGCAAACTTCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVQSTSKRSQPLKTLWSTVLL	93854	241665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_129751_129993_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219630_221310_222917_224043_224203_241597
893437	contig_20527_pilon	+	3411	3	Intergenic	novelGene_138614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	1539	31	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23358	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25023_26238_26346_27308
893438	contig_16882_pilon	-	946	6	Intergenic	novelGene_148210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3649	junction_5	723.159733392284	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	334	918	189133	181967	FALSE	35	ACAATATTCTGTCTTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLVRELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDKAQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL	189466	181938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_182045_182659_182811_186960_187026_187480_187625_188683_188756_189058
893439	contig_7775_pilon	+	2205	1	Intergenic	novelGene_37500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAATATGAGTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267779	269984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_267800_270000
893440	contig_13633_pilon	+	1864	13	Intergenic	novelGene_15307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	429.218055175792	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	552	1562	23703	49142	FALSE	25	CTGATTCTGTGTGATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5026	49444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22987_23674_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
893441	contig_6076_pilon	+	2996	1	Intergenic	novelGene_81715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTGACAATAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3514	6510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_3500_6500
893442	contig_998_pilon	-	4523	15	Intergenic	novelGene_153789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	399.941577366148	401	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	127	1260	365529	330554	FALSE	55	TAAAAACCAAACCATACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTGMLHGIGKFIVEIICCRFRLGAYKPVNSITFEDDHTDNHLPLLENNTH	373626	327290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330869_332165_332329_335041_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_366888_366956_373607
893443	contig_1719_pilon	-	4898	22	Intergenic	novelGene_87267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	630.809730504986	26	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	1887	3623	364776	355334	TRUE	35	AATACTTACAGAATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQEHVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDDPLSRKDSRWGDSESTWRRGPEVESEWRRGPPEKDWRREGRDEERSLRRDEDRPRRLGDDEESQSSVRPEDDRFPRRGTDEDRGLRRGPDEDRFSRRGVDDDRPSWRNTDDDRPPRRIGDEDRASWRHADDDRPLRRGLDDDRGTWRAADEDRGPRRGMDEDRGPRRGGVDDERTSWRSGDDDRGPRRSMDEDRGPRRSMDEDRGPRRSRG	376224	349849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_349919_350443_351057_352093_352276_353049_353249_355121_355343_355461_355988_356639_356723_358421_358607_359047_359202_359740_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035
893444	contig_12920_pilon	-	3019	7	Intergenic	novelGene_166342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGTGGAAATAAACAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230691	191727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_191912_194847_195037_202355_202463_211428_211494_212708_212843_217525_217679_228504
893445	contig_8075_pilon	+	2540	10	Intergenic	novelGene_42498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	326.366188335877	17	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	164	649	719960	783013	TRUE	35	AATTCAATAAAGTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPRARIVREGLGPGLPCGRSLAPGFDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEDTYISRNKEHRHEIQK	719796	796388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780693_780756_781906_781962_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794825
893446	contig_15410_pilon	+	3973	1	Intergenic	novelGene_130598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	413	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	16	51	264	314	137677	137727	NA	20	CACCCTGGCAAGCCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSGAALTGIPQVDGFSKEKFILSQSSRLRVQIQGFRSRGTLSPSALEEGPCHQSSLGLGASLHRNLRSKGHALLPALLSWWYEVLMCLCSLLSFISQKRLH	137413	141386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_137400_141400
893447	contig_15304_pilon	-	2628	6	Intergenic	novelGene_30644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	664	junction_2	4387.38676662999	3448	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	399	1202	106308	103245	FALSE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	107225	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103329_103548_103680_105638_105960_106040_106371_106480_106523_106931
893449	contig_10196_pilon	+	1673	8	Intergenic	novelGene_132046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	104.921545033634	536	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	140	946	643457	647920	FALSE	20	GAGCAGATACTGCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSKSKPPKRDEKERKRRSPSPKPTKVHIGRLTRNVTKDHIMEIFSTYGKIKMIDMPVERMHPHLSKGYAYVEFENPDEAEKALKHMDGGQIDGQEITATAVLAPWPRPPPRRFSPPRRMLPPPPLWRRSPL	639767	648647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644721_644998_645102_645445_645600_646997_647120_647911
893450	contig_10197_pilon	-	556	1	Intergenic	novelGene_115299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAGAAAGGTTGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1270321	1269765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1269800_1270300
893451	contig_14970_pilon	-	1914	7	Intergenic	novelGene_45135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	128.744471294456	533	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	632	1375	291083	268709	FALSE	60	CTAAAGATTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315890	268169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_299911_300051_311919_312047_315611
893452	contig_10263_pilon	+	6226	9	Intergenic	novelGene_135830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGAAGGCTCTGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844428	891554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_844694_844820_845596_845686_846078_847610_848169_877572_880993_881453_881645_888386_888585_890020_890222_891327
893453	contig_9839_pilon	+	1140	7	Intergenic	novelGene_88493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1809.33087693275	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	379	1008	49467	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45310	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45469_49246_49614_52171_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
893454	contig_8682_pilon	-	3219	10	Intergenic	novelGene_165267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	343.032230426109	776	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	1212	2597	133808	55026	FALSE	15	GAATTTGTCTGCTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQAVAGLLLLAAAGLGEAAAGHGLAFSEDVLSVFGANRSLSVPQLGRLLELLGSAPVKGAPELGQLHFNQCLSAEEIFFLHGFSNATQITSSNFSTICPAVLQQLSFHPCEAKSKHHTKPSLSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLVLTPMIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFVAILLITLFAGDIELE	139650	54403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589_134478_134983_135107_139231
893455	contig_5696_pilon	+	2225	2	Intergenic	novelGene_117584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1978	junction_1	0	129	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1749	2123	734586	738140	FALSE	45	TTAATAAAATGTGTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	732837	738242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_734596_737775
893456	contig_8210_pilon	-	2663	5	Intergenic	novelGene_30233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1383.3540761497	161	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	292	780	37758	23927	TRUE	70	AGTTAGAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKVM	53121	21202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_21862_22702_24081_29712_29926_37636_37803_52874
893457	contig_2537_pilon	+	2232	18	Intergenic	novelGene_33428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_17	150.186366347542	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	45	1727	235526	297712	FALSE	10	TGGTCTCATCTATGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLTESGYVNLQRVQMIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRMHNNSSPSVSPNTSFTSDGSPSPVGGIKRKAEDSDSEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVLRYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIASLPSDFEKGTKPFKPLEQLMGVFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALLPFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFVLELYKTGSTEPMDVPPELCHGIQGKFSLDEEAVLPDQIVCSPVPLLRDLSQNTAISINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAPVLKPGDWEKSSNGRQWKPQLGFSRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGVYSNAAPPPATYQGSLYRPLLRGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFERGVGAEPLLPWNRMLQTQNAAFQPNQYQLLAGPGGYPPRRDDRGGRQGYPREGRKYPLPPPSGRYNWN	235481	298217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_235589_239846_239892_241320_241453_245173_245293_249123_249260_250522_250631_250723_250814_251426_251500_258097_258182_259021_259120_259201_259282_266057_266115_278243_278313_278407_278540_280631_280760_290367_290432_295098_295238_297646
893458	contig_16125_pilon	+	10025	5	Intergenic	novelGene_155262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	702	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTTCATTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147461	182547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_148240_148782_153486_155566_158177_180556_181890_181946
893459	contig_4686_pilon	-	6542	34	Intergenic	novelGene_118491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	214.812883317789	1	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1061	3186	277	3462	463083	388508	TRUE	30	TACTGTAAAATATTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQDLEDVIKAKEKEVETIEQNGLALIQNKKEDVSGVVKCTLQELTQTWENLDRMARQLKILLKSVLDQWSHYRAAFDEINSYLMEARYSLARFRLLTGSLEAVQVQVDNLQSLQDDLEKQEQSLQKFGSITNQLLKECHPPVTETLTNTLKEVNMRWNNLLEEIAEQLHSSKALLQLWQRYKDYSKQCASTVQQQEGQTNELLKAATNKDIADDEVATWIQDCNDLLKGLGTVKDSLFVLHELGEQLKQQVDASAASAIQSDQVSLSQHLCALEQALCKQQTTLQAGVLDYETFAKSLEGLEAWVVEAEEILQEQDPSHSSDLASIQERMEGLKGQMLKFSSMAPDLDHLNELGYRLPLSDKEIKRMQNLNRHWSLISSQTTERFSKLQSFLLQHQTFLEKCETWMEFLVQTEQKLAVEISGNYQHLLEQQRAHELFQAEMFSRQQILHSIIIDGQRLLEQGRVDDRDEFNLKLTLLSNQWQGVIRRAQQRRGIIDSQIRQWQRYREMAEKLRKWLVEVSYLPVSGLGSVPVPLQQARTLFDEVQFKEKVFLRQQGSYILTVEAGKQLLLSADSGAEAALQAELTEIQEKWKSASMRLEEQKKQLDFLLKDWEKCEKGIADSLEKLRSFKKKLSQPLPDHHEELHSEQMRCKELENVVGGWTEDLTQLTLLRDTLSAYISTGDISILNERMELLQRQWEELCHQLSLRRQQVSEKLNEWAVFSEKNKEICEWLTQMESKVSQNGEILIEEMIEKLKKDYQEEIAVAQENKIQLQQMGERLAKASNESKASEIEYKLGKVNDRWQHLLDLIAARVKKLKETLVAVQQLDKNMSSLKTWLAHIEAELAKPIVYDSCDSEEIQRKLHDCDACATDAECDSIQQATRNLDRRWRNICAMSMERRLNQN	464651	353111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_354082_364486_364580_366026_366240_367770_367900_369729_369931_373540_373753_375405_375533_377529_377673_381283_381618_382962_383155_384985_385124_385364_385548_388362_388518_389373_389491_398480_398631_413088_413256_417837_417997_425619_425776_430258_430385_434749_434945_437360_437596_441486_441582_443749_443898_444553_444709_447065_447213_447816_448000_450451_450657_451228_451363_453259_453431_455599_455756_460692_460849_461778_461956_462939_463090_464381
893460	SIRV3	+	1040	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4838	1117	2779	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	86	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTAACAGGTTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6782	7822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6800_7800
893461	contig_5302_pilon	-	2658	10	Intergenic	novelGene_81423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	673.581637384974	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	88	996	209238	177220	FALSE	40	CAAAACCTGACCCTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REHASQRLFSDKLPESLEDGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209867	175557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209809
893462	contig_4180_pilon	+	1148	6	Intergenic	novelGene_8376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1690.80009462976	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	66	569	874345	888134	FALSE	5	GCTTTGGAGCCGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874279	888713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874347_875234_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
893463	contig_1787_pilon	+	5865	6	Intergenic	novelGene_178643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	171	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	4526	4963	294653	295090	FALSE	55	AACTCAGCAAAGATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKISKEKNCQPRIIYPAKLSLRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	142136	295992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1787_pilon_+_144329_253967_254509_254777_255056_280786_281884_286562_286920_294592
893464	contig_3111_pilon	-	3589	20	Intergenic	novelGene_129953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_10	166.907790490186	627	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	222	2609	41679	16585	FALSE	15	CTTGGGCCTGTGTGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGKESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIREKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCNVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	63277	15604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21572_21752_21846_21975_22230_22382_22759_22838_23185_23289_24064_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964_40056_40855_41003_41524_41680_48564_48681_63172
893465	contig_7548_pilon	+	2284	8	Intergenic	novelGene_117632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	132.690525321909	146	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	672	986	200810	206475	FALSE	20	TAATTGGGCATGTGCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192787	207773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193080_193141_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
893466	contig_7919_pilon	+	7510	15	Intergenic	novelGene_28096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	542.849586413573	1667	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1470	4413	429	4841	1340625	1414343	FALSE	35	GATAAAGTAGTGTCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKTVHTLNVGDQEYEDIEGEGNRDNTAATVLLYSEADRCPICLNCLLKKEIGFPENCNHVFCMTCILKWAETMASCPIDRKPFQAVFKFSALGNYIKVQVKRQSRKTNGKKNESYFKKQLSCHENSKSYIRKKAIIREDLLSPQFYDLTMIHRNSSYSETQEKKNATIKINKPRRSNCTNQCFRHFFSNIFSSSSHTGESSYRVYCTEFIEVNEISTVIRQKRQELELSWFRDTLPGIGRNGFVPWNIETEVLPLISSALPRTIFPTSTISLENFGTSCMGYALAHTQGEEKKQTSGTSNTRGSRRKPAAATPTRRSTRNTRAETVSQSQKSPVSNNSGCDAPDSNNPSVSVSSSAESEKQTRQAPKRKSLRRGRKPPLLKKKFRSSVPPPEKSSSSDSVDEETAESDLPPVLEKEHQSDIESSNTCTVQTNAENKSANGLISCNEHVEAREEHTENHDTKETVKPSYSECYTHNPPVLVGENQKPNPLPSSREEEEVEKVENTGIEDNVLCIESDISKNISEKRGDLLENQDQISGSLESEVKTDTCTDHPPVDFLKCSGSEIEVHQPISSPVDELPENAESVVNEEKIVESSIIEIIDHKDSTVKIEQPLESPKLDSSEGQNIQTVDKKSIESSEVQLPQHVETGDAEIIAKCDSSRNENFSSTQDSENNLLKNDLDSTKLDKCLEEKTESLGEHLTSRDLPNTYTEDIQKHFSEDNNEMIPMECDSFCSDQNESEIEPSVNADSKQLNENSGEHSSENIMLPSDPAVEKVETVSQPSESPIDTVDKAKKPRTRRSRFHSPSTTWSPNRDTAREKKRSQSPSPKKETGKDNRKSRSPSPKKESARGRRKSRSQSPKKDYARERRRSQSRSPKRDSSREGKRSESLSPRRDTSRENRRSQSRVKDSSPREKSRSRSRERESDRDGQRRDRDRERRTRRWSRSRSRSRSPSRSRTKSKSSSFGRNDRDSYSPRWKERWTNDGWRCPRGNDRYRKSDPEKQNENTRKEKNDTNPEADDPNPDKCRNDCPSWVTEKINSGPDPRTRNPEKLKDTHWEENRNENSGNSWNKNFGSGWMSNRGRGNRGRGTYRGGFAYTDQNENRWQNRKPLSGNSNSSGNESFKFVEQQPYKRKSEQEFPFDTPADRSGWTSASSWAVRKTLPADVQNYYSRRGRNSSGPQSGWMRQEEETAEQDSNLKDQTNQQGDGSQLPINMMQPQVNVMQQQMNAQHQPMNIFPYPVGVHAPLMNIQHNPFNVHPQLPLHLHTGVPIMQVAAPTSVSQGLPPPPPPPPPSQQVSYIASQPDGKQLQGIPSASHVSNNMSTPVLPAPTAAPGNVGTVQGPSSGNTSSSSHSKASNAAVKLAESKVSVTVEASADSSKTDKKLQIQEKAAQEVKLAIKPFYQNKDITKEEYKEIVRKAVDKVCHSKSGEVNSTKVANLVKAYVDKYKYSRKGSQKKSLEEPVSAEKNIG	1296664	1417012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1297072_1340603_1340686_1344110_1344269_1352985_1353064_1372226_1372328_1374354_1374420_1402298_1402358_1402516_1402618_1403567_1403670_1407705_1407813_1408485_1411234_1411861_1412209_1413205_1413425_1413782_1413903_1414196
893468	contig_7396_pilon	-	2387	16	Intergenic	novelGene_79538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3278.53734054278	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	99	1484	255163	246385	TRUE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257085	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245890_246269_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
893469	contig_3822_pilon	-	1711	6	Intergenic	novelGene_133303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1275.17380776112	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2	496	285182	277128	FALSE	25	CTTAAACTTATGTTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGHVLGGGGLPHLLGTGDQGADHGGDHILSRGVGDDPKVQDGEDLIPGKEVEGQGAHQKPETKRKKTKKRNVPKHHQKVIAQPDVLEVQAERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKQVPLKQRNVLWKRELVIH	285183	275912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277188_277439_277510_277901_277996_281136_281227_284585_284718_285133
893470	contig_5041_pilon	+	2337	2	Intergenic	novelGene_27088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539838	551917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_540178_549919
893471	contig_17074_pilon	+	3132	1	Intergenic	novelGene_145203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACACGTGTGGATTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658174	661306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_658200_661300
893472	contig_1090_pilon	+	3521	6	Intergenic	novelGene_131162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	179.467657253334	394	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	175	720	887944	897591	FALSE	25	AACGAATTTGTCCTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGFFSSIFSSLFGTREMRILILGLDGAGKTTILYRLQVGEVVTTIPTIGFNVETVTYKNLKFQVWDLGGQTSIRPYWRCYYSNTDAVIYVVDSCDRDRIGISKSELVAMLEEEELRKAILVVFANKQDMEQAMTPSEMANSLGLPALKDRKWQIFKTSATKGTGLDEAMEWLVETLKSRQ	887769	900392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_887948_891823_891962_893773_893856_895637_895750_896230_896410_897560
893473	contig_7272_pilon	+	5309	14	Intergenic	novelGene_25341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTCAGTATCGTAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592733	609794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_593431_595297_595454_597542_597698_598019_598128_598173_598329_598894_599066_599907_600036_600992_601175_603503_603668_603885_603967_604438_604610_604708_604812_604920_605071_606906
893474	contig_804_pilon	-	1923	2	Intergenic	novelGene_138780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAGACATCTGTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23080	21043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_21907_22020
893475	contig_11173_pilon	+	2516	9	Intergenic	novelGene_156901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_8	252.710277541298	362	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1518	2357	434044	450103	FALSE	15	TATCATTGCTTTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVTSSGLTFIPDGSLTVLQ	430644	450262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936
893476	contig_12619_pilon	+	3781	8	Intergenic	novelGene_73584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_1	129.838046686428	712	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	285	884	1014183	1018995	TRUE	25	CGATGGCTAATGCTTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFLAENNLCGQAILRIVSCGNAIIAELLRLSEFIPAVFRLKDRADQQKYGDIIFDFSYFKGPELWESRLEAKPELQDLDDEFRENNIEIVTRFYLAFQSVHKYIVDLNRYLDDLNEGVYIQQTLETVLLNEDGKQLLCEALYLYGVMLLVIDQKIEGEVRERMLVSYYRYRYLWARTAHAKNTGIGKMQCVSIILLL	1005066	1026166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_1005229_1014060_1014369_1015003_1015150_1018106_1018192_1018812_1021485_1022320_1022474_1023667_1023782_1026025
893477	contig_15114_pilon	+	5291	4	Intergenic	novelGene_121083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	12.328828005938	51	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	323	661	29371	31422	FALSE	20	ACTGATGCAGCCACTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQLFRDQSPGGAVVKRSAANRKVSGTAHQPPRGRNTWQSASVKMTALEALWGSFTLSCRIAGEDVKGKKHANKLCLSKPWDRNGRMAPLGLSARDTGAPGTSISTWIISTF	24347	36052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_24450_24555_24722_29316_29557_31269
893478	contig_3679_pilon	+	4999	22	Intergenic	novelGene_112116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	85.6713384469539	6	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	76	1356	1025707	1047136	TRUE	50	ACCATGGAAAATCTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAFPEIRSTAAPLWYSVNQQKSKSMEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHCILTEDGNQHVYKKLCLCAGAKPKLICEGNPYVLGIRDTDSAQEFQKQLTKAKRIMVIGNGGIALELVYEVEGCEVIWAVKDKNIGNTFFDAGAAEFFTSKLITEKSEAHVAHKRTRYTTEGKRKEAKTKAKASNVGSALGPDWHEGLNLKGTKEFSHKIHIETMCEVKKIYLQEEFTILKKESLIFPRDHHNKLVKTTDKEMWPVYVELTNEKIYGCDFIVSATGVTPNIEPFVHGNNFNLAQDGGLEVDDHMHTSLPDIYAAGDICTASWHPSPVWQQMRLWTQARQMGWYAAKCMAADSLGDSIDMDFSFELFAHVTKFFNYKVRSAN	1025631	1069829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211_1032332_1034957_1035087_1037196_1037271_1040377_1040539_1041248_1041350_1042779_1042919_1043849_1043963_1044587_1044711_1046980_1049233_1049815_1049950_1050295_1050516_1051622_1051715_1053425_1053567_1054288_1054438_1054671_1054758_1055508_1055586_1056359_1056535_1060852_1061046_1065291_1065402_1069659
893479	contig_8354_pilon	-	3407	10	Intergenic	novelGene_24141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	592.585067081845	60	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	168	1193	578686	537192	TRUE	10	CAGCCTTGTCCGTGTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPFGKSHKSPADIVKNLKESMAVLEKQDISDKKAEKATEEVSKNLVAMKEILYGTNEKEPQTEAVAQLAQELYNSGLLSTLVADLQLIDFEGKKDVAQIFNNILRRQIGTRTPTVEYICTQQNILFMLLKGYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA	618485	534806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_536026_536196_537381_538002_538147_539084_539151_543399_543460_550970_551140_555802_555922_558330_558496_578572_578731_618362
893480	contig_20314_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_125650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1004	junction_1	0	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTACTTGGAGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21012	25527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_21647_24190
893481	contig_5620_pilon	-	3142	10	Intergenic	novelGene_161325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	73	junction_6	321.67251961668	783	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	169	1497	275802	78098	FALSE	75	AAAAAAAAAACTTTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREEDNKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNLGVHISRVKSVNLDQWTPEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAVEFFIRDKYEKKKYYDKNAIAITNKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTTEKLQKKEEQQLELKKSTSPKKTAEPTVDLLGLDGPAEAPVTNGNATTMPALNDDLDIFGPMISNPLPTTVMPPAQGTLTVPAAAPLSTVASGDLDLFTEQTTKAEESTKKQLSKDSILSLYGTGTIQQQNTPGVFMGPANIPFTSQAPTAFQGFPSMGVPVPAAPGLMGNVMGQSASMMVGMPMHNGFMGNAQTGVMPLPQNVAGPQGGMVGQMSASQSKFGLPQTQQPQWSLSQMNQQMAGMSINSANPTVGFGQPPSTTAGWSGSSSGQTLSTQLWK	275970	76452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_78233_80123_80432_81293_81466_95466_95595_116673_116765_162316_162398_179620_179697_189281_189368_214183_214318_275684
893482	contig_7962_pilon	-	4773	10	Intergenic	novelGene_149299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	481	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAATGACAAAAATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238847	196890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_197344_198704_198840_204398_204525_210052_210168_211245_211428_212336_212503_225521_225640_230381_230485_231794_231830_235507
893483	contig_1107_pilon	-	1971	6	Intergenic	novelGene_126548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_1	50.570347042511	103	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	160	951	209508	175271	FALSE	35	GAAGAAGACTATCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSSSPNSCLSVGSTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSDLKFAMKCYTPLVYKEIIPCKPSDIKYSVLNSEEVHYIIKQLSKESLQSVDVLREEACEILDEMGHKLRLGAIRFFAFTLSKVFKQIYSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYIDFLMLSFLLYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYVKTMLRNGYAPVEFFLEGTRSRTAKTLTPKFGRSLTD	209667	174250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_175367_175674_175803_178789_178920_181370_181548_193461_193645_209430
893484	contig_8102_pilon	+	2165	17	Intergenic	novelGene_85332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.841625076257	12	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	358	1884	153641	178724	FALSE	45	TTCGTAACCATTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLQRKDPSAFFSFPVTDLIAPGYSMIIKHPMDFSTMKEKIRNNAYQSIEELKDNFKLMCTNAMIYNKPETIYYKAAKKLLHSGMKILSQERIQSLKQSIEFMAGLQKTRKQKDQTDTSPRREDSGCWPREREHFGDAEAQAFEGPNKKNKKKDKDTSEDKFKSSNLEREQEQFDRIVKESGGKLTRRLVTSQCEFERRKPDGTTTLGLLHPVDPVVGEPGCCPVKLGMTTGRLQSGVNTLQGFKEDKRNRVTPVLYLNYGPYSSYAPHYDSTFANISKDDSDLIYSTYGEDSDLPSDFSIHEFWATCQDYPYVMADSLLDALTKGGHSRTLQELETSSAEGEGHTRTFDTTKDMEVTEIEPAGRLDCNNQDRLTALRAVTNFGVPLDVFDSEEAEVFQRKLEETTKLLRELQEAQNERLSAKPPPNRICLLGPSYREMRLAEQVTNNLKGLAQQVTPGDIVSMCGVRKAMGISIPSPSVENNFVDLTEDFEDSNKTDVPDCGPDGI	135724	179005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_135781_135876_136007_152026_152157_153599_153658_156968_157114_160047_160159_164864_165050_166061_166186_166860_166937_169618_169727_170126_170263_173535_173648_175152_175210_177242_177355_177862_178007_178204_178349_178668
893485	contig_5945_pilon	-	2486	4	Intergenic	novelGene_104593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	381	junction_2	191.013670249598	64	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	39	587	378690	331899	FALSE	30	ATTCCTCAATGAACCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPKELVELHLKLMRKIGKSVTADRWEKYLIKICQEFNSTWAWEMEKKGYLEMSVECKLALLKYLCECQFDDNLKFKNIINEEDADTMRLQPIGRDKDGLMYWYQLDQDHNVRLYIEEQDDQDGSSWKCIVRNRNELAETLALLKAQIDPVLLKNSSQQDSSSRESPSLENEETKKEEETPKQGFFLCVLFSFVL	378728	329999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_332092_343035_343242_345424_345518_378633
893486	contig_10627_pilon	+	4359	16	Intergenic	novelGene_59957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	117.671218042287	167	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	711	2018	175977	179152	FALSE	25	TAACACATGTATGGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTSLDSDLDLEEGAGGGGHQGLKDQQRVQFAEVEDDKEEEEEENPLLVPLEEKAVLQEEQANLWFSKDGFAGIEDDADEALEIGQAQLLYESRRKGQEQPQPQPPSSLKTERKSPQCQDEAPKGTETPKGTEAAPDPEGKDKDDSSDSDSSSSEDEEREPHRGKKRSRGPKSDDDGFEVVPIEDPVKHRILDPEGLALGAVIASSKKAKRDLIDNSFSRYTFNEDEGELPEWFVQEEKQYRIRQLPIDKKEVEHYRKRWREINARPIKKVAEAKARKKRRMLKKLEQTKKKAEAVVNTVDISEREKMAQLRSLYKKAGLGKEKRQVTYVVAKKGVGRKVRRPAGVRGHFKVVDSRMKKDQRAQQRKEQKKRHRRK	172705	181493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174348_174431_174605_175732_175784_175918_176055_177073_177256_177416_177538_177622_177895_178138_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178879_178959
893487	contig_5954_pilon	+	2547	13	Intergenic	novelGene_28508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	687.62576122481	25	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	575	1756	439492	443633	FALSE	5	TTCTGGGTCTGATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQIPPRGGDGPSHESEDFPRPLVTLPGRQPQQRPWWTGWFGKAA	430492	444424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408_432538_435590_435668_438686_438840_439037_439094_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441483_441740_441801_441925_442101_443503
893488	contig_16411_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_77391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAATATTTTTTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398436	395991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_396000_398400
893489	contig_12677_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_110793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3630	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3600
893490	contig_8310_pilon	+	2333	19	Intergenic	novelGene_75555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	353.023103675092	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	673	2112	296664	324814	FALSE	35	TGCTAATGTCAGTAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215094	325035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279710_279789_283388_283526_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
893491	contig_11318_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_48122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAAATAAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858	2867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_900_2900
893493	contig_16098_pilon	+	1657	11	Intergenic	novelGene_45977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4382	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	992	1441	350352	352279	TRUE	5	CGCCGACTGCCCGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPSVSTAAPVPTSHTRITLSQPALSSTFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSRRGSVKPPSGISHTMTVQSSEPLAMTLSLCGHQAMSSTGAVWPQTVGTFLSTRPVLPRGSTRKAPPPLASQIRATNLGLTAQKPLSQVVCETRTSS	348287	354113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349492_349603_349712_349956_350075_350235_350421_350511_350640_350762_350889_352152_352373_353990
893494	contig_11417_pilon	+	2467	4	Intergenic	novelGene_103329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1245.3865085007	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	17	340	575953	586628	TRUE	20	ACAATTGCCTTTGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKPREMKGRKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQENQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK	575936	588808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_576054_583804_583914_586514_588043_588095
893495	contig_15666_pilon	-	2005	6	Intergenic	novelGene_70128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	694.575150721648	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	173	850	110619	107816	FALSE	35	TTAAGATACATTTAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110791	106660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108831_108859_109098_109138_109948_110246_110558
893496	contig_14925_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_55240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGGCCCCCATGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70981	69632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_69600_71000
893497	contig_4604_pilon	+	3710	10	Intergenic	novelGene_19160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_9	965.353680469009	10	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	594	1646	365452	377582	TRUE	25	GAAATGAATCTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQVSGSIFGSKFDLFMN	364858	380715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_378607_379336_379470_379808
893498	contig_16722_pilon	-	1107	6	Intergenic	novelGene_118303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_5	260.388171774372	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	646	1107	165227	156002	FALSE	75	AAAGAGAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEILESIRAKKGDIDTDRSPEEIEKDKNETENTDSKDSEKSREEFEDQSLEKDNDDQTPDDDTEQGKYEEEPNKTSDNSNTSATTTSIQPNLENSNSSSELNSSPSESAKAADDPENGERESHTPVSSQEEIGDYKSEKSNGERSESPGAGRGGSGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVLVVNSQGEISRLSTKKEVVMKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTRLHRMTSIEREE	184749	156001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_156036_164408_164541_164931_165288_166756_166945_171616_171806_184541
893500	contig_12644_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_44638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	5	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	52	1323	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
893501	contig_10197_pilon	-	2248	6	Intergenic	novelGene_115298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	60.2249117890595	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	866	1411	1270071	1267124	TRUE	30	AATAAATGTGCCCCTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAERQQKLRSQYFFECNCPACHEEPRATAGPRWEAFCCHSCRAVMQGDDVLSCGNRSCMESVSRGHLVSRLQDLQQQVGMAQKLLRNGKLEQAIQQLLGCQRDAESFLSAEHTMVGEIEDDLAQAYAALGDWQKSATHLQKSLRVVEVRHGPSSIEMGHELFKLAQIFFNGRDLCLLCC	1270936	1265170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267064_1267152_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569_1268703_1269927
893502	contig_17274_pilon	+	3191	7	Intergenic	novelGene_26566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	514	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGGAAAAAAAATACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229424	247036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_231953_232796_232858_237117_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246310_246873
893503	contig_5686_pilon	+	4851	2	Intergenic	novelGene_45361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1773	2090	132358	132675	FALSE	15	CTCTATTCTCTTCAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLCKQQTFGLSLQISVLFYYSLYSVCWGKSKKLKRRQKSKTIFLLFWEEMVIEAKVRFIYTMGAPRGNGRFDFPVGLPLHWWLRAGPCACEQLLYQGYFHLPS	130540	135436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_130945_130989
893504	contig_8075_pilon	+	2562	10	Intergenic	novelGene_42501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	328.063039711412	27	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	129	1034	719960	794885	FALSE	30	AAAAGTCTTATCGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGLPCGRSLAPGFDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEEMASDELKEMRKNLTKEAIREHQMAKTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKL	719831	796413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783123_785918_786066_793313_793386_794879
893505	contig_20527_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_138623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAAATGGAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28644	31378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_28600_31400
893506	contig_14142_pilon	-	2590	7	Intergenic	novelGene_120532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_6	219.878754468609	5	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	15	578	355495	351591	TRUE	5	ACTGCCTGTTTGGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLCEYLLQVFQSPRSLPP	355509	349034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_350750_351180_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
893507	contig_14142_pilon	-	1404	8	Intergenic	novelGene_120536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	373.59947996293	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	134	910	351710	349539	FALSE	20	TGACTTGGAAACTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQVRGWLFCLRKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	352860	349044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351720_352736
893508	contig_13612_pilon	+	2116	10	Intergenic	novelGene_157298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	146.893091215733	184	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	239	1393	51083	57016	FALSE	15	GGTGGTGTGTCAGGGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	50044	57739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_50127_50415_50506_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56382_56881
893509	contig_17964_pilon	+	4004	13	Intergenic	novelGene_33904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	945	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	246	641	369586	372010	TRUE	20	AGTAGGCCATCGATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYKAHCCQSGSHGGSHCQCWSLQLLFQTLQGLIPGWRQENCYFQIPRMCWQAGQSPGRRGSCSVNCCSESCCRRKSWMRGCYWAAAGAGAGAAGFLKGEMVHLLFQRDHWLLHLLKLQPLQQLLEQLRN	359232	468596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_359315_369422_369661_370784_371082_371986_372129_373492_373632_380105_380266_384034_384136_385000_385092_395545_397914_411235_411414_412386_412501_431364_431435_468572
893510	contig_17144_pilon	-	2484	16	Intergenic	novelGene_29301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1755.19261874271	100	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	139	2400	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183220	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166484_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
893511	contig_8310_pilon	+	3391	16	Intergenic	novelGene_75559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	367.721174563313	25	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	94	1749	272460	313257	FALSE	20	GGCTGCAATCTCTCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQVGALPSPASRGRCLTQCC	215097	314899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065
893512	contig_17281_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_105174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2011	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_-_0_2000
893513	contig_17274_pilon	+	3558	4	Intergenic	novelGene_26466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	248.642089938306	133	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	50	544	7027	30219	FALSE	45	GAACAACATAAACGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVLHFLTGHDPRPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEGN	6977	33233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127
893514	contig_7720_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_155795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	667	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACATACTTTTATCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844293	846688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_844300_846700
893515	contig_8375_pilon	+	3412	16	Intergenic	novelGene_141266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_8	43.9118308533007	638	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	186	2375	19906	64643	FALSE	25	AGATCTGTGCAATGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLGVLLTLLFCSSLEGQENSFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKAKQMPVEMSRPAAPLLNSNNEKISSDPSPEANSHYGCNEDVGNHAVKSLDENKEDLNLDVEYTEVEVSSPDPHRAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	19720	65680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_19940_20025_20053_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41507_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
893516	contig_15021_pilon	-	4512	21	Intergenic	novelGene_26971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2653	2991	332281	325938	TRUE	30	GAGAAGAGGCTACGCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFGNSNSRRGLRLQSGNNVLPGFHDGIQLPRDHDGEALVFGEGQLQVRACPLHDLKADFCLLTFSELVHVLVLPLLQGHMEHLLRQDPREGGARRRRKECSCSTRALKAPP	353624	280083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_280167_321186_321249_322328_322445_324677_326242_332246_332453_332674_332892_333103_333313_333451_333560_334695_334802_335114_335195_336589_336729_338548_338653_338749_338865_339780_339868_340024_340165_343852_344064_346164_346387_346509_346728_346938_347079_348984_349054_353308
893517	contig_6497_pilon	-	5388	6	Intergenic	novelGene_35638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_5	542.20387309572	81	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1290	4098	5387	752243	750954	FALSE	60	TCAGACAAGAAGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLYFHFFFLKEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEI	790218	750952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_755555_756694_756863_757225_757280_764427_764473_767272_767531_789957
893518	contig_8177_pilon	+	2705	4	Intergenic	novelGene_86494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCATGAGTCCCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36783	41336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_38109_38234_39420_40644_40815_41311
893519	contig_12402_pilon	+	5257	1	Intergenic	novelGene_133347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1714	2220	253589	254095	NA	65	GATTCTTAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQPENIQKQQLEIQKINNKISETYSVIEGLRSRSEMMENRISKTEDKHLDTTLTKKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPQQGEKTENTERIIEELLTENYPNIIKDEKLTIQEAQRIPYRIDSKRKSRRHIISTLIKTRDKESCEQLEKNKKSHTEEKQ	251875	257132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_251900_257100
893520	contig_14687_pilon	-	2163	7	Intergenic	novelGene_107916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_4	947.283132613124	1012	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1362	801	2162	462787	457084	FALSE	45	AGACAAAATCCAGTCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPYSLNGYRVRVYRQDSATQWFTGIITHHDLFTRTMVVMNDQVLEPQNVDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHGHYTRAQANSPRPAMNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENELKNKNTSKINGEEGKSQSNEKTGEQTLIDGPAPWDQIQEGEKHEEVEKLKSVDSQLQEKKIIHPSEQAALSDHNPNDLLLQECNMEKIHTVELVPKEKFVSGPPTPKCVIDITNDTNSQKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSESKHSIANTKYLETTKQDSDPSWVSDVVKVDLTQSNTNASSGNNQLNLEKEKHQYVSYMSSLSTVSVTEDNKLHKQSPPPETIKSKLNTSVDVP	528060	457082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_457977_458081_458275_458371_458516_459962_460088_462780_462887_523429_523544_527473
893521	contig_6842_pilon	-	3281	8	Intergenic	novelGene_130691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	998	1312	373297	371902	FALSE	35	ACTTTCTAGTAAACTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELEFIVLSSSCIMTSSELLSSMTSCMLFTLLLWLLVLTDMLGMEWLLPRLSISLLRLVPCSLSFHLLVIHSRVHFVSLGKEFFSFFDTAGYLAHEQHLLSSV	408079	369932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_372021_373101_373309_383701_383838_392826_393066_394640_394770_398289_398494_406344_406585_408041
893523	contig_8617_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_73391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCACATGGGCTGGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61818	61269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_61300_61800
893524	contig_5423_pilon	-	3861	6	Intergenic	novelGene_85261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	634	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCGCCCCAACCTCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556617	534809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_535033_541107_541165_542199_542349_544404_544523_545684_545836_553454
893525	contig_11034_pilon	-	3283	19	Intergenic	novelGene_175017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	55	junction_5	24.339167235721	509	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	79	2460	171117	138985	FALSE	35	GGAACCTCTTTTTCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLLRLSSGRLWDDVSAVPRRLGDRAVMADAWEEIRRLAADFQRAQFAEATQRLSERNCIEIVNKLIAQKQLEVVHTLDGKEYITPAQISKEMKDELHVRGGRVNIVDLQQVINVDLTHIENRIGDIIKSEKQVQLVLGQLIDENYLDRLAEEVNDKLQESGQVTISELCKTYDLPGNFLTQALTQRLGRIINGHIDLDNRGVIFTEAFVARHKARVRGLFSAITRPTAVNPLISKYGFQEQLLYSVLEELVTSGRLRGTVVGGRQDKAVFVPDIYSRTQSTWVDSFFRQNGYLEFDALSRLGIPDAVSYIKKRYKTTQLLFLKAACVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDIAPLLPSSLSVEDAAMLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFSELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTTKKDKKDERRRKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDDDTDDEPQSSHPGKKKPEITFMFQDEVEDFLRKRIQDAPEGFISELAEYLIKPLNKNYLEVVRSVFLSSTSATGTGRKRTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGTKFFADDTQAALTKHLLKTVCTDITNLIFNFLASDLMMAVDDPAAITNEVRKKILSKLSEETKAALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSAAEACDIMVKKGDKKRERQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFLTHSMLHAPGRCVPQIIAFLNSKIPEDQHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGDDPLSDELGKEQEDITNTTRKELQELSSSIKDLVLKSRKSSVTEE	171195	138161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139204_139835_140017_140824_140911_141256_141338_142543_142675_142753_142918_144261_144380_147253_147377_149780_149902_151930_152111_153304_153481_154730_154878_158969_159029_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511_169658_171040
893526	contig_960_pilon	-	3373	7	Intergenic	novelGene_108326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_6	68.8783146006217	57	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	33	1385	1082447	1067673	FALSE	20	GTTGCAAGTCTGATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGPGSPAGKMSLTPKELSSLLSIISEEAGGGSTFEGLSTAFHHYFSKADHFRLGSVLVMLLQQPDLLPSAAQRLTALYLLWEMYRTEPLAANPFAASFAHLLNPAPPARGGQEPDRPPLSGFLPPITPPEKFFLSQLMLAPPRELFKKTPRQIALMDVGNMGQSVDISGLQLALAERQSELPTQSKASFPSILSDPDPDSSNSGFDSSVASQITEALVSGPKPPIESHFRPEFIRPPPPLHVCEDELAWLNPTEPDHAIQWDKSMCVKNSTGVEIKRIMAKAFKSPLSSPQQTQLLGELEKDPKLVYHIGLTPAKLPDLVENNPLVAIEMLLKLMQSSQITEYFSVLVNMDMSLHSMEVVNRLTTAVDLPPEFIHLYISNCISTCEQIKDKYMQNRLVRLVCVFLQSLIRNKIINVQDLFIEVQAFCIEFSRIREAAGLFRLLKTLDTGEAPSEAKMSK	1082479	1065684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1067871_1067949_1068047_1072008_1072212_1073512_1073716_1075635_1075789_1079243_1079409_1082113
893527	contig_2799_pilon	+	1750	11	Intergenic	novelGene_85561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	568.439275560723	136	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	196	1536	729325	762419	FALSE	45	AGGGGAAATATTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRFHEAPLITVRFIGPKHGEEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANRRSQQSVLLSKSVSIQNIAGVGNDESMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTKDNDVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSRVASYEKKVRLSEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKTLVRDGSVFLKNAAGRLKGKAYFV	725812	762633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_725873_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302_755439_756998_757112_757712_757866_758463_758715_761269_761396_761508_761627_762150
893528	SIRV1	-	382	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	523	0	-329	0	3prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1667	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGGCGCAAGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11120	10647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10792_10882
893529	contig_4937_pilon	+	7328	5	Intergenic	novelGene_178644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	282	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	6963	7328	556422	556787	FALSE	50	TCAGTAAAGGATAGAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKKQDPSMCCLKETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILIADKTDCKTKSTIKDKEGHNIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRDPKYIKQTITTLKREIDSSTIIVGDFNTPL	462698	556787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4937_pilon_+_465793_497666_498270_544288_545934_554622_555320_555498
893530	contig_233_pilon	-	2813	14	Intergenic	novelGene_14556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_13	1220.11666917165	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	271	2373	108522	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	108894	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108684
893531	contig_610_pilon	-	5809	5	Intergenic	novelGene_76808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	116.134620161259	436	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	135	887	334304	331286	FALSE	45	CTACCCAGAAAAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGQSAGGWYGPFSTVVLAPAWSFHGSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	343500	326363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334360_343421
893532	contig_3975_pilon	-	2087	13	Intergenic	novelGene_54742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	396.127811514864	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	95	1372	1731202	1719543	TRUE	20	ATAAGAGTTGCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731296	1718769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1718876_1718933_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
893533	contig_6159_pilon	-	5653	4	Intergenic	novelGene_128249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	455	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3270	3614	213557	213213	TRUE	40	GGGAGAAAATCCATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIQKSVRFLYTNIEILKEEIAKSVPFIIARKNIKDLGINLTRDIKDLYNENYRTLLQETIGHLHKWKNIPCSRIGRLNIVNMSVLPKVIYKYNAVRIQIPPAFLMRWRNKSPT	224532	210233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_211922_212861_213739_213784_216499_224158
893534	contig_6270_pilon	-	6074	4	Intergenic	novelGene_99870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	352	junction_3	17.9876500843094	656	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	130	525	1082152	1052540	FALSE	25	TATTTTCCCAGTATGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPYYHGPLSKRDCETLLLKEEVDGNFLLRDSESVPGALCLCVSFEKMVYTYRIFREKNGYYKIQTAEGTQKQLFPSLRELISKYQKPNQGLVVRLLNPVMSTHLRCRRLKIQLNDIYANANSDYMEVLP	1082281	1046990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1052578_1058856_1059017_1061613_1061678_1082018
893535	contig_15720_pilon	+	2815	2	Intergenic	novelGene_41963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2448	2747	308157	308456	FALSE	30	TGGAGGGAGGGAAGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGISLCVCAEKGTSFQATRYCLARRGSQTAKRKRKQTNQNRTNQSKQTNKQKSRGSSTSMVARARKQFHTRAVFHSLSGRSKDGAQTRYLRGRRGRW	305607	308524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_306861_306962
893537	contig_11846_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_105959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTGGTGCTCATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289558	298931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_290503_291703_291847_295011_295085_295497_295722_298106_298202_298461
893538	contig_151_pilon	+	2033	2	Intergenic	novelGene_132556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_1	0	490	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	18	668	147927	157675	FALSE	30	TTCAGAAAACTTGTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEIQMVILLIATSVVVLICSIPLVVRVFINQLYQPSLEEEISKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKVVEKIKCLFCRIGGARRDRPGQHCSDSRRTSSAMSSHSRSFFSRELKEISSTSQTLLYLSELSENGLGGKNLLPGVPGMGLAQTDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEVGGSSRAGSASKGNSLQVTFPSETLSLSEKCI	147909	159040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_147987_157084
893540	contig_3673_pilon	-	2392	3	Intergenic	novelGene_178299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	1982	2392	207984	207574	FALSE	60	ACCAAGGAAAAAATCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFHENNHNKYTPNNRAPKYIKQTVTAMKREIDSSIIIVRDFNTSLSVKDRTFRKKLNKDTEDLKGTISQLDLIDLYRTIHPTAAKNTFFSNTHETFSRIDHILGHRAIFNKIQNFEIIQSIFSEHNTIRLEINNRK	251018	207573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3673_pilon_-_208065_217748_218209_249577
893541	contig_15664_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_171512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATAGTTCTTAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151126	148292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_-_148300_151100
893542	contig_854_pilon	+	1792	6	Intergenic	novelGene_36724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_5	2042.41635324436	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	326	820	1712393	1714980	FALSE	50	CTGTTTTAAAAGTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1711568	1715952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
893543	contig_13244_pilon	+	3754	7	Intergenic	novelGene_87000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_4	136.065445854396	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	741	1283	470483	475123	FALSE	30	TGTTTAGTGAGAGACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCLTVLHYALLLGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	468476	477594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_468654_469348_469455_469834_469982_470172_470693_471757_471869_471962_472131_475069
893544	contig_4213_pilon	+	1701	4	Intergenic	novelGene_124789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	60.4997704311531	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAACAAAACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12825	44081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_40541_40623_42791
893545	contig_4857_pilon	+	3907	22	Intergenic	novelGene_48683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_16	302.058042807156	641	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	185	2323	1127714	1161886	FALSE	25	TACTCAGCTAAGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVLSFSCPESAERPTYTRVPRRLDPGPRRGYPERSERQHLRVSAAAPASTPVHPFRAWLAEMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEVRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPILMSMIICKCLKEERKILENAQRFNQAQSGSIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKTLEDLQDEYDFKCKTLQNREHETSGVAKNEQKQEQMLLQKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEQDPITKNKQVLWDRTFTLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNLTVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHKKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTRTNEGPLIVTEELHSFSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLVSEPRNLSFFLNPPCAQWGQLSEVLSWQFSSVTKRGLSVDQLNMLGEKLLGPNASPEGLIPWTRFCKENINDKNFSFWLWIESILELIKKHLLSLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPRGTGYIKTELISVSEV	1123476	1163470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1123660_1127712_1127842_1128631_1128777_1130171_1130271_1133432_1133523_1136158_1136238_1137333_1137426_1137634_1137787_1139973_1140133_1141539_1141633_1143089_1143150_1145737_1145768_1145858_1145953_1147161_1147204_1151576_1151661_1152123_1152223_1152754_1152891_1155450_1155501_1156468_1156564_1157635_1157782_1160368_1160555_1161806
893546	contig_9801_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_167568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2028	2447	102746	103165	NA	50	CTGTAAGTTCAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLREVLFILSLLGLLSTHGKEGDSAKHIKLLFGSLHPSIRRYLGWGEECYIGILDLSTARFVSVDRAHVTVLCFGLLIIRIRTMFFFFFLIFRIHEKRPMTQIFRFSIIIIKISLFSLKNFVILLLFFFTALRRRGI	100718	103350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_100700_103400
893547	contig_7032_pilon	-	3696	6	Intergenic	novelGene_178645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1784	2143	93322	92963	TRUE	5	CTTTTGTCGGTCTGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFGAQPRRPQAVPLNSLKRTYTHHLKALSARGSTVSSHGAPSVPAVAKVGAAETITNSTTLTEKWGLEGHSEESTPPPPSVRGVYFIVNTASNKAINRTMGFGCGQGRKNSGKQANQ	98334	47633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7032_pilon_-_47655_49641_50412_64602_65223_92820_94510_97633_97703_97807
893548	contig_5551_pilon	-	2821	1	Intergenic	novelGene_134281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	633	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	848	1150	790519	790217	NA	15	TTTCGTAGCCTTATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKAHTKVINPPHLVTCFHKDYSQENPTELSLVCNTWGHHESELTRSQEVWFCFASASSCLQHTHPRMTVPPGGQIKLFFTLEQISLRTPIQLDHWFSN	791366	788545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_788500_791400
893549	contig_7151_pilon	-	2329	8	Intergenic	novelGene_40737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1174	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACTGTGTGCTTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509870	502257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502454_503290_503385_504050_504140_505030_505169_505440_505591_506566_506683_507736_508139_508726
893550	contig_12864_pilon	-	1848	5	Intergenic	novelGene_76394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTCATGGGTACCCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230503	224942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_225068_227820_228028_228488_228622_228900_228939_229158
893551	contig_14441_pilon	+	1462	5	Intergenic	novelGene_100505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	489.459587197963	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	874	1422	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	107310	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_107931_108257_108362_125517_125902_126159_126283_126514
893552	contig_12151_pilon	-	5007	4	Intergenic	novelGene_54974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_2	139.429791173431	693	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	4018	4563	983481	975052	FALSE	35	ACTAATTTTGGCCAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY	987498	974607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980039_980231_983414
893553	contig_11978_pilon	-	3228	17	Intergenic	novelGene_62950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	132.488899888821	743	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	99	1907	1067968	1041965	FALSE	25	AAATTGATGTCCTGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKTLPFYKDYFNVPYPLPKIDLIAIADFAAGAMENWGLVTYRETALLIDPKNSCSSSRQWVALVVGHELAHQWFGNLVTMEWWTHLWLNEGFASWIEYLCVDHCFPEYDIWTQFVSADYTRAQELDALDNSHPIEVSVGHPSEVDEIFDAISYSKGASVIRMLHDYIGDKDFKKGMNMYLTKFQQKNAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTKQMGFPLIYVESEQVEDDRVLRLSQRKFCASGPYVGEDCPQWMVPITISTSEDPNHAKLKILMDKPEMNIVLKNVRPDQWVKLNLGTVGFYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSEEVRPQDTVSVIGGVAGGSKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKLSVEGFAVDKMAGEVKAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1068176	1040643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1042118_1044289_1044338_1044611_1044768_1045289_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699_1053835_1055522_1055663_1057598_1057663_1060456_1060567_1062723_1062785_1063404_1063510_1064384_1064550_1066985_1067101_1067939_1067974_1068083
893554	contig_3081_pilon	+	4540	23	Intergenic	novelGene_133913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	89.7737744472872	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	882	2649	425	3073	201705	252540	FALSE	5	TTCTGTGGCTGATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLLCMNNDFPPRAHCLVRWYGLREFVVIAPAANSDAVLSESKCSLLLSSVSIALGNTGCQVPLFVQIHHKWRRMYVGECQGPGVRTDFEMVHLRKVPNQYTHLSGLLDIFKSKIGCPLTPLPPVSIAIRFTYVLQDWQQYFWPQQPPDIDALVGGEVGGLEFGKLPFGACEDPISELHLATTWPHLTEGIIVDNDVYSDLDPIQAPHWSVRVRKADNPQCLLGDFVSEFFKICRRKESTDEILGRSTFEEEGREITDITHALSKLTEPAPVPIHKLSVSNMVHTAKKKIQKHRGGEESPLNNDVLNTVLLFLFPDAASEKPLDAAASTDNNNPPSESEEYNLYNQFKSAPSDSLTYKLALCLCMINFYHGGLKGVAHLWQEFVLEMRFRWENNFLIPGLASGPPDLRCCLLHQKLQMLNCCIERKKARDDGKKTSTSDNMTNTYPGNAGKARDQLGSDNPKDTDKEKGEVGKSWDSWSDSEEEFFECLSDTEELKGNGQESGKKGGPKEMVNLKPEGRLLQHGKLTLLHNGEPLYIPVTQEPAPMTEDLLEEQSEVLAKLGTSAEGAHLRARMQSACLLSDMESFKAANPGCFLEDFVRWYSPRDYIEEEVIDEKGNVVLKGELSARMKIPSNMWVEAWETAKPIPARRQRRLFDDTREAEKVLHYLAVQKPADLARHLLPCVIHAAVLKVKEEESLENISSVKKIIKQIISHSSKVLHFPNPEDKKLEEIILQITIVEATIARARSLKAKFGTEKCEQEEEREDLERFVSCLLEQPEVLVVGAGQGHAGRIVHKLFVNAQRAATMAPPEEDLKRMGSPEERRQNSSSDFPPPAGRELILRTTVPRPAPYSKALPQRMYSVLTKEDFRLAGAFSSDTSFF	158612	254007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158811_163708_163785_193875_194009_201687_201767_207583_207704_208765_208932_214282_214383_216969_217052_217354_217424_218870_218945_221102_221196_221656_221827_223756_223847_224713_224887_225584_225640_225871_226244_236013_236152_239888_240117_246409_246507_246603_246708_246840_246957_248590_248694_252303
893555	contig_4232_pilon	-	8736	1	Intergenic	novelGene_63439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCCCAGCCCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539001	530265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_530300_539000
893556	contig_8865_pilon	-	2655	3	Intergenic	novelGene_164447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGATTATGGAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371395	367759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_367932_368554_370586_370943
893557	contig_18544_pilon	-	2277	7	Intergenic	novelGene_152734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	337.381090163631	22	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	68	649	54710	39640	TRUE	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAIKLNS	54777	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_39540_39654_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685
893558	contig_3386_pilon	-	1198	6	Intergenic	novelGene_34521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	790.498728651729	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1	489	409598	404912	TRUE	25	TTGTTTAACTTCAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	409598	404156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404253_404298_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398
893559	contig_5041_pilon	+	2976	15	Intergenic	novelGene_27056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTTGTGTTGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520486	595037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_521618_525500_525658_526413_526496_532091_532242_532755_532937_554547_554623_565859_565981_569902_570014_570825_570918_572068_572213_572785_573010_576410_576599_580871_580969_581053_581199_594959
893560	contig_9833_pilon	+	3683	2	Intergenic	novelGene_68503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	3368	3682	216973	217287	FALSE	25	TTTCCCAGTCAAGAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAA	212955	217288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_214238_214887
893561	contig_9668_pilon	+	2626	11	Intergenic	novelGene_58068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGGACAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36298	51261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_37204_40521_40610_41283_41357_41445_41572_42458_42612_43440_43598_44472_44586_45889_45953_47221_47354_48098_48252_50598
893563	contig_11304_pilon	+	650	6	Intergenic	novelGene_156683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	148.189878196859	24	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3	12	286	297	351799	351810	TRUE	35	GGAGGAAGACACGCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAKPRVSSPDVTGEGREVQRPRRPCSGSPVQHFRKAGAGSKSPRSLWPRAGSTGRSGLSAVGAASSSRHLDVELQKAIAKCRVQVDDLEDAESCDMKI	273654	447817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_273886_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721
893564	contig_12079_pilon	-	2499	9	Intergenic	novelGene_67510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	339.723324927801	173	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	167	1729	871668	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872424	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862145_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
893565	contig_19076_pilon	+	3978	5	Intergenic	novelGene_74206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	295.934536679989	698	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	697	2187	102295	155254	FALSE	55	AGAAAAGATAATGTAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQPSPLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATSTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNEQIFSVAPGSESSNGTVSNVQYQVIPQIQSTDGQQVQIGFTGSSDNGGINQESGQIQIIPGSNQTLLASGTPPANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQITWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	94383	157045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_94504_101718_103079_146309_146503_152200_152398_154937
893566	contig_7356_pilon	+	2240	5	Intergenic	novelGene_60406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCATATAGAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462725	481014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_463445_475960_476290_479029_479145_479854_479948_480030
893567	contig_8289_pilon	+	4791	25	Intergenic	novelGene_171166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	314.869141690463	698	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1093	3282	156	3437	137586	218248	FALSE	60	GTAAAAATGGAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGQLWLLYLSAGLLSRLGAAFNLDTREENVIQKLGEPGSLFGFSLAMHWQLQPEDKRLLLVGAPKAKALPLQRANRTGGLYSCDITSQGPCTRIEFDNNADPSLESKEDQWMGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMDGGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNSFFDMNIFEDGPYEVGGESNHDESLVPVPANSYLGFSLDSGKGIVSKDEITFVSGAPRANHSGAVVLLKRDMKSTLLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKDGWQDIVIGAPQYFDRDGEVGGAVYVYINQQGRWSNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDINQDGYPDIAVGAPYDDNGKVFIYHGSANGVNTKPTQVLEGKSPYFGYSIAGNMDLDRNSYPDVAVGSLSDSVTVFRSRPVINVQKTITVTPDKIDLSKKMSCAAPSGICLKVKACFEYTAKPTGYNPSIVIVGTLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQGSEPKYTRQLTLSRQKQKVCMDETLWLQENIRDKLRPIPITASVEIQESSSRRRVNSLPEVLPILNSNEPKTVHTDVHFLKEGCGNDNICNSNLKLEYKFCTREGNQDKFSYLPISQKGIPELVLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTNDGDDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRSFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSSVTFYLILSTTEVTFDTTDLDINLKLETTSNQDNLASITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGGTVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLKNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVESKGLEKIACEPPSEINFLKLKESHNSRKKREIAEKQTDDSRKFSLFAERKYQTLNCSVNVNCVNIRCPLRGLDSKASVILHSRLWNSTFLEEYSKMNYLDVLMRASIDVTATAENIKLPNAGTQVRVTVFPSKTAAQYSGVPWWIILVAILAGILMLGLLVFLLWKCGFFKRSRYDDSVPRYHAVRIRKGEREIPDEKYNNDNLEKKQWITKWNENESYS	137430	219602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_137768_175619_175745_177783_177864_179839_180096_182685_182818_185941_186153_186789_186984_187128_187218_187891_188011_192223_192323_192573_192636_197796_197958_198161_198306_199808_199925_200043_200237_200327_200412_200507_200588_200739_200818_200905_201009_203309_203484_204936_205036_205134_205246_205336_205436_212521_212648_218083
893568	contig_17074_pilon	+	2387	4	Intergenic	novelGene_145132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	136.235906508608	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	217	627	220934	223810	FALSE	30	GTATACAACCTTGCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGHRLDSHVYGPQPHDPDPLYPRPGQHWPESLCLLRGHFTDPADCGCWLALLPAPVGPLHRLPGIGAHHHCSDTGTGQKAGVKQAWHLPDPSHHLPAPLTQHESGLVFNSTFPPLFRRTDSATCTRQDLVFIS	216898	225570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_216979_217591_217694_220899_221011_223476
893569	contig_10734_pilon	-	2154	14	Intergenic	novelGene_51474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	521.172846659028	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	137	1660	2305085	2265543	FALSE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305221	2265048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265667_2265954_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
893571	contig_7088_pilon	+	7498	18	Intergenic	novelGene_159788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	130.15558961739	598	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	580	1797	689743	712826	TRUE	20	GTCTGTTTACCCGCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRSPEFQSLFTEGLKSLTELFVKENHELRIAGGAVRDLLNGVKPEDVDFATTATPAQMKEMFQSAGIRMINNKGEKHGTITARLHEENFEITTLRIDVLTDGRHAEVEFTTDWQKDAERRDLTINSMFLGFDGTLFDYFHGYEDLKNKKVRFVGRAKQRIQEDYLRILRYFRFYGRIVEEPGDHDPETLEAIAENAKGLAGISGERIWVELKKILVGNHVNHLIHLIYDLDVAPYIGLPANASLGEFDKVSKNAEGFSPKPMTLLASLFKVQDDVTKLDLRLKISKEEKNLGLFIVKNRKDLIKATDSSEPLKPYQDFIIDSRESDATTRVCELLKYQGEHSLLKEMQQWSIPPFPVSGHDIRKAGISSGKEIGALLQQLREQWKKSGYQMEKDELLSYIKKN	688632	749060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_689098_689628_689804_698510_698705_701957_702097_706157_706285_710886_711081_712085_712340_712577_717379_718594_718723_720117_720183_720632_720749_721379_721464_722784_722849_734068_734229_741620_741771_742561_742765_743346_743462_748996
893572	contig_18364_pilon	+	2614	2	Intergenic	novelGene_102556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1370	junction_1	0	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1851	2285	49521	50216	FALSE	10	TTTGTGTGTGTTTTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISCKTKTVLTMRIFSYYRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	47670	50545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_49797_50057
893573	contig_17144_pilon	-	2069	11	Intergenic	novelGene_29335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1655.04841016811	36	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	242	1774	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183323	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170871_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
893574	contig_12951_pilon	+	1657	8	Intergenic	novelGene_68193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	27	junction_3	314.590371818364	36	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	147	1346	755258	836145	FALSE	55	AAATAGAATTACAACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRVCFH	755111	836456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934
893575	contig_12312_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_63979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGTTTTTTTAGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281716	283729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_281700_283700
893576	contig_7254_pilon	+	3028	1	Intergenic	novelGene_145847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATTTCATCTGACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215066	218094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_215100_218100
893577	contig_14441_pilon	+	1321	6	Intergenic	novelGene_100548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.986403956887	102	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	714	1142	116728	117610	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111196	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_111994_112154_112454_112665_116578_116963_117220_117344_117539
893578	contig_15977_pilon	-	3367	5	Intergenic	novelGene_137217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCGGGGCAGGGGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92041	77832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_78476_78612_80517_83876_83999_90410_90525_91457
893579	contig_7644_pilon	+	5376	9	Intergenic	novelGene_64239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	91.8605430802584	1382	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	82	567	162753	177794	TRUE	30	ATACGTCATAAGTCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFAPPLTPPSPPPPPRSVATCAKRVRPMVLSRGAMAAFRLALIQLQVSSIKSDNVTRACGLVREAAAQGAKVISLPECFNSPYGLKYFPEYAEEIPGESTQKLSEVAKECSIYLIGGSIPEADAGKLYNTCAVFGPDGNLLVKHRKIHLFDIDVPGKITFQESKTLSPGDSFSTFEAASCWYILVLLI	162671	187505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169247_169369_171093_171183_175984_176073_177753_177835_179596_179696_182476_182533_182891
893580	contig_15666_pilon	-	2076	6	Intergenic	novelGene_70142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.120562646007	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	26	661	110619	108856	TRUE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELER	110644	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107881_108147_108198_108603_108859_109102_109378_109948_110246_110558
893581	contig_10367_pilon	-	2550	6	Intergenic	novelGene_169453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	146.627964590661	637	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	345	1139	136272	131866	FALSE	35	GAGTTTAAAGCAAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYGVEWHSVRDSEGQRLLVGVGPEGISICTDDFNPINRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQSCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	146873	130454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133633_134055_134895_135061_136153_136352_137635_137822_146794
893582	contig_8820_pilon	-	3808	3	Intergenic	novelGene_79285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_1	622.5	56	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2775	3146	167103	166441	FALSE	20	TGGTGTGTGAAAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	170214	165778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_169799_170135
893583	contig_14516_pilon	+	2590	18	Intergenic	novelGene_153898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	92.9617624260448	350	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	152	1930	168834	422609	TRUE	40	TAAAAATTTAGTGACTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFKAGRTSFPASCSLLHHTDVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	118990	423448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_119050_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472_422614_422792
893584	contig_4654_pilon	-	718	5	Intergenic	novelGene_103098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1252	junction_1	427.508187056108	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	135	638	500181	494476	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQTTVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	500315	494395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873_494970_496408_496573_497816_497941_500118
893585	contig_3382_pilon	-	1639	1	Intergenic	novelGene_124168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCTTCACCAAAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944239	942600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_942600_944200
893586	contig_6740_pilon	-	2975	3	Intergenic	novelGene_142690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2253	2849	626335	625739	FALSE	55	GGAGAAACAATAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKFKEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISGMVGVIEGLRSRFETLEDRISGIEDKHLDTTQFEENSEKRTKRNEDTLRVTWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPTIMKDEKLTIQEA	784333	625612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_627332_731301_731308_783083
893587	contig_8934_pilon	+	3398	18	Intergenic	novelGene_167242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_5	67.8155956790253	327	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	952	2859	435	3293	629314	848715	FALSE	55	CAATAAAGTCATTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSSKRRQVKPLAASLLEALDYDSSDDSDFKVGDASDSEGSGNGSEDPSKDSGEGSCSDSEENILEEELNEDIKVKEEQIKNSAEEEILSSEKQLIKIEKKEEEENGERPRKKKEKEKDKEKGKEKEKEKEKEREKEKEKATVSDNVAASTTATTPAMSPHAVNASPSVPSTTNTTEEQVSEPKKWNLRRNRPLLDFVSMEELNDMDDYDSEDDNDWRPTVVKRKGRSASQKEGSDGDNEDDEDEGSGSDEDENDEGNDEDHSSPASEGVCKKKKSKVLSRNSADDEELTNDSLTLSQSKSNEDSLILEKSQNWSSQKMDHILICCVCLGDNSEDADEIIQCDNCGITVHEGCYGVDGESDSIMSSASENSTEPWFCDACKCGVSPSCELCPNQDGIFKETDAGRWVHIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVTLTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFARTGVCISCDAGMCRAYFHVTCAQKEGLLSEAAAEEDIADPFFAYCKQHADRLDRKWKRKNYLALQSYCKMSLQEREKQLSPEAQARINARLQQYRAKAELARSTRPQAWVPREKLPRPLTSSASAIRKLMRKAELMGISTDIFPVDNSDTSSSVDGRRKHKQPALTADFVNYYFERNMRMIQIQENMAEQKNIKDKLENEQEKLHVEYNKLCESLEELQNLNGKLRSEGQGIWALLGRITGQKLNIPAILRAPKERKPSKKEGGTQKTCTLPAVLYSCGICKKNHDQHLLLLCDTCKLHYHLGCLDPPLTRMPRKTKNSYWQCSECDQAGSSDMEADMAMETLPDGTKRSRRQIKEPVKFVPQDVPPEPKKIPIRNTRTRGRKRSFVPEEEKHEERVPRERRQRQSVLQKKPKAEDLRTECATCKGTGDNENLVRCDECRLCYHFGCLDPPLKKSPKQTGYGWICQECDSSSSKEDENEAERKNVSQELSVEQKNPKK	628879	848820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_629315_630046_630158_645269_646070_652765_652911_686645_686806_691864_691977_700519_700658_709478_709626_710268_710540_710853_710961_712065_712162_714022_714127_716254_716387_718988_719158_741220_741272_741399_741522_783544_783663_848640
893588	contig_2768_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_57495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTTTTGTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699426	701222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_699400_701200
893589	contig_18108_pilon	+	2943	8	Intergenic	novelGene_33470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	250.32533932905	2615	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	450	1019	247233	260192	FALSE	15	TTTTCTTTGGGTGAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226752	262116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_244345_244450_245849_245923_246447_246550_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
893590	contig_5791_pilon	-	4015	8	Intergenic	novelGene_35855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	323.473999838362	675	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	1988	3493	1088908	1079821	FALSE	15	TTGCTGTTTTTAATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESVHQDIKYIPTEDVSDLPMEEQLRRLQEERTCKVCMDREVSVVFIPCGHLVVCKECAPSLRKCPICRGTIKGTVRTYLS	1094519	1079298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1080015_1080126_1080169_1083751_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1090729_1094352
893591	contig_11448_pilon	-	7354	1	Intergenic	novelGene_66345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	959	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTTTTTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164921	157567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_157600_164900
893592	contig_4232_pilon	+	2489	11	Intergenic	novelGene_63241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_10	159.318674360541	730	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	84	929	302477	306735	TRUE	15	CAGAGCTTCGCCTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGEWLGCSARRGPSCDPGPAPGTPAMDDLFPLIFPSEPAQATGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVCFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPLCRSQPAGSRARLHAAAAAFRPGAQ	302393	311917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_302484_303089_303117_303212_303365_303528_303678_304720_304813_305173_305306_306230_306336_306553_306768_309524_309606_309695_309771_310545
893593	contig_15323_pilon	+	611	2	Intergenic	novelGene_148511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	847	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	116	349	65165	85109	FALSE	35	TAATGTCAAATGAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGEGLRIYWGSVEEQSLLSRWNPWSTEVPYATFAEHPMKDRSEKLLEICKLSEFTSKLVPAIQKAHKNSTGSGRKKELMVLNEPILIQTYIGLMSFIGNRNKLGYSLARGTIGF	65049	85371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_65204_84914
893594	contig_8310_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_75599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316424	314993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_315000_316400
893595	contig_4103_pilon	+	2152	9	Intergenic	novelGene_51902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_4	28.5807518270601	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	737	1846	61447	65973	FALSE	30	CGAAACCACTGAAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	60710	66279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
893596	contig_18328_pilon	+	5505	8	Intergenic	novelGene_132549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_7	129.496828422277	576	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	79	1173	15119	31074	FALSE	30	GTGACTATTAAACTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYSTAQECSLDDDTILIPIIVGAGLSGLIIVIVIAYLIGRRKSYAGYQTL	15040	35406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291_28457_30934
893597	contig_8262_pilon	-	3156	1	Intergenic	novelGene_166106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATAAAAGGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227657	224501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_-_224500_227700
893598	contig_6902_pilon	+	2451	10	Intergenic	novelGene_135573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	470.493305603049	11	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2052	398	2449	461986	496916	FALSE	45	GACAGAAAAGAAGGATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYRVLEKLVFHGIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRKEKEGEKVTEKVVKPE	434410	496918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462025_471622_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273
893599	contig_15105_pilon	-	1367	5	Intergenic	novelGene_151017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1094.10568502316	6	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACGTCTATTTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836478	828352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832210_836293
893600	contig_9332_pilon	+	2707	2	Intergenic	novelGene_60720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	221	junction_1	0	774	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	597	1544	151382	152329	FALSE	15	TTGAGCTTTGTTATGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAASSSASCSRRLGKALNFLFYLALVAAAAFSGWCVHHVLEEVQQVRLSHQDFSRQREELGQGLQGVEQKVQSLQATFGTFESILRSSQHKQDLTEKAVKQGESEINRISEVLQKLQNEILKDLSDGIHVVKDARERDFTSLENTVEERLTELTKSINDNIAIFTEVQKRSQKEINDVKAKVASLEESEGYKQDLKAMKEVVKEIQTSLKSKEKDLEALRSTLQTMESDVYTEVKELVSLKQEQQKFKEVADMEHVTLQTLTEKILQSEESISRLPGEIRRLEEELHQLKADSNRLEEDGVFRNSDAFEALQRTSQGLDSRLQSVEDGVQSMQSTSAQQTESLESLLSKSEEYEQRLSALQERVEGLGSSSEADKDGVDRTVRSLGEAQLSLHADVEELKRSVGELPSTVEALQKVQEQVHSLLSQDQAQAAHVPPQDYLDKLSSLDNLKSSVSQVESDLKMLRTAVDSLVAYSVKIETNENNLESAKALLDDLRNDLDRLFVKVEKIHEKI	142532	153492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_142748_151000
893602	contig_13123_pilon	+	2944	6	Intergenic	novelGene_136891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	258.066193059068	1718	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCTAGCCCAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434379	446885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434622_435907_436004_436397_436472_439024_439102_443433_443550_444546
893603	contig_10263_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_135860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACCCCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954590	956181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_954600_956200
893604	contig_5153_pilon	-	2234	2	Intergenic	novelGene_74394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994972	991461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_992685_993961
893605	contig_5324_pilon	-	1790	2	Intergenic	novelGene_102078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	80	517	444540	443560	FALSE	45	CAGCTGAAAAATAACTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDFLFVLCSNTYN	444619	442286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_443597_444139
893606	contig_14970_pilon	+	1472	7	Intergenic	novelGene_45039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_3	3776.56662488857	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	676	780	231446	231550	FALSE	15	CCACCTTAACTCTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	182400	232242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
893607	contig_6439_pilon	+	3292	3	Intergenic	novelGene_154234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3558	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGATGGAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305020	339730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_305114_305925_306365_336970
893608	contig_4847_pilon	+	2876	1	Intergenic	novelGene_156175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACAACATTTTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107189	110065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4847_pilon_+_107200_110100
893609	contig_2798_pilon	-	2262	4	Intergenic	novelGene_120022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_1	743.523742428953	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	277	714	116665	115557	FALSE	40	AGATATTTTTAAAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASADL	193419	114008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115565_116235_116680_170381_170519_193294
893610	contig_9415_pilon	+	4043	8	Intergenic	novelGene_109856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	270.659738190871	46	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	549	1319	1993493	2013564	TRUE	25	CTATTATTTCTCAACACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPENCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAFATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVLKAKAYILFYVERQAKAGSDKL	1992944	2017285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1993609_1999791_1999899_2000077_2000159_2010366_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398_2014806_2015802
893611	contig_4151_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_65300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	603	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTCAGCTTCCGTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787082	785390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_785400_787100
893612	contig_15697_pilon	-	5192	6	Intergenic	novelGene_173298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_5	114.596684070701	1570	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	386	1423	47853	25654	FALSE	35	TAAATGTGATCATGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMFDPVPVKQEAMDPVSVSYPSNYMEPMKPNKYGVIYSTPLPDKFFQTSEGLSHGIQMEPVDLTVNKRSSPPSAGHSPSSLKFQSSHRRTSPGLSVPSSSPPMKKYSPPPAGVQPFSVPLSMPPVMAAALSRHGIRSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMDNSNSSMQVPVIESYEKPILQKKIKIEPGIEPQRTDYYPEEMSPPLMNSVSPPQALLQENHPSVIVQPGKRPLPVESPDTQRKRRIHRCDYDGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFQCPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV	63981	21884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_25836_31845_32007_37744_37896_38505_38993_47796_47893_63635
893613	contig_12624_pilon	-	4506	3	Intergenic	novelGene_61100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1617	junction_1	81	103	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2872	3204	953006	948779	FALSE	20	CTTTTCTAATGCTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLISLTGNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV	955877	947476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_948842_950590_950768_952913
893614	contig_10058_pilon	+	1258	2	Intergenic	novelGene_67677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	14	1204	45038	47188	FALSE	35	TACACGTAAATAGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQDVMGSLREGSGEETEAKSKSQNEAENMEEAKGVEEPGGEQSKDEEKETETERKEEAEGGEETQVEAGKDPEYGAQEHQVDEESWEVVYKQEAEGGRQDDVKGQRGDGGQEAREDQGNDEDIRIPEEAAGGGGGEVSKEWDRGDGEAEGDQRAGGHHFEEGTLPEGSGGESLGVNSAKAGNDQSSDGEQAAPQPPQPEEMEPEGQLRPEGCDLCPCSPGLAGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPVVPPKPQFAKMPSALCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSFDAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTGGGDYSFIPRTVPCSMIAAHSHRPLSCLEQPSEGSEGSGSRSRLSLPPRELQPPILWKGNGVTQATGLLFQTG	45024	47242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_46168_47127
893615	contig_1150_pilon	-	1089	3	Intergenic	novelGene_61422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	40	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311521	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
893616	contig_10990_pilon	-	3314	20	Intergenic	novelGene_7440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	933	1355	744373	743951	TRUE	10	TGGCGCCCGGCTACAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	752159	708529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_708669_709186_709251_709347_709395_714556_714612_715525_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_743881_744386_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
893617	contig_9609_pilon	-	5423	1	Intergenic	novelGene_22964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	823	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250261	244838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_244800_250300
893618	contig_11855_pilon	+	1940	8	Intergenic	novelGene_67047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	216.948126970293	612	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	592	1053	2002362	2007496	TRUE	25	GCATGAGGTTCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSVCRPQPPQVRRTFSLDTILSSYLLGQWPRDADGAFTCCTNDKATQTPLSWQELEGEQASSCTHKRSASWGSTDHRKEITKLKQQLQRTKLSRSGKEKERGSPLQGDHAVRGALRTSPPSFPSGSTVLRLSPCLHRSLEGLNQELEEVFVKEQGEEELLRILDIPDGHRAPAPPQSSSCDPSLLPLEPGNLASSPSMPLASPQPSGCASHEEHRGAVEELASIPSDKASSPGHPAFLEEGSPSPVLAFAASPRPNHSYVFKREPPEGCERVRVFEEATSPGPDLTFLTSCPDKNKVHFNPTGSAFCPVNLMKPLFPSMGFIFRNCPSSPGSPLPPDQPQATSSEGSRGL	1986637	2008515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1986779_1995528_1995625_1997480_1997592_2000910_2001046_2002253_2002456_2004013_2004165_2007279_2008100_2008231
893619	contig_5428_pilon	+	4449	18	Intergenic	novelGene_160417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	201.37669774446	565	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	338	2464	177032	244245	FALSE	10	CTCTAATTGGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTAELFEEPFVADEYIERLVWRTPGGGSRGGAEAFDPKRLLEEFINHIQELQIMDERIQRKVEKLEQQCQKEAKEFAKKVQELQKSNQVAFQHFQELDEHISYVATKVCHLGDQLEGVNTPRQRAVEAQKLMKYFNEFLDGELKSDVFTNSEKIKEAADIIQKLHLIAQELPFDRFSEVKSKIASKYHDLECQLIQEFTSAQRRGEISRMREVAAVLLHFKGYSHCVDVYIKQCQEGAYLRNDIFEDAAILCQRVNKQVGDIFSNPETVLAKLIQNVFEIKLQNFVKDQLEECRKFDAEQYLKNLYDLYTRTTNLSSKLMEFNLGTDKQTFLSKLIKSIFISYLENYIEVETGYLKSRSAMILQRYYDSKNHQKRSIGTGGIQDLKERIRQRTNLPLGPSIDTHGETFLSQEVVVNLLQETKQAFERCHRLSDPSDLPRNAFRIFTILVEFLCIEHIDYALETGLAGIPSSDSKNANLYFLDVVQQANTIFHLFDKQFNDHLMPLISSSPKLSECLQKKKEIIEQMEMKLDTGIDRTLNCMIGQMKHILAAEQRKTDFKPEDENNVLIQYTNACVKVCAYVRKQVEKIKNSMDGKNVDTVLMELGVRFHRLIYEHLQQYSYSCMGGMLAICDVAEYRKCAKDFKIPLVLQLFDTLHALCNLLVVAPDNLKQVCSGEQLANLDKNILHSFVQLRADYRSARLARHFS	176694	246230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_177059_199551_199647_200448_200597_204094_204290_218513_218579_221479_221509_222581_222692_223937_223983_224084_224226_225226_225310_226340_226551_228104_228253_234515_234625_238132_238254_239776_239864_242911_243021_243192_243409_244056
893620	contig_7644_pilon	+	5373	10	Intergenic	novelGene_64245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	122.217474655268	1745	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGTCATAAGTCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162704	187505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169296_169369_171093_171183_175984_176079_176578_176654_177755_177835_179596_179696_182476_182533_182891
893621	contig_10126_pilon	+	3271	7	Intergenic	novelGene_105718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2080.83098384596	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	221	925	162049	184341	TRUE	5	CCCCTTTGGGTGTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSDTPVQTKPIFIVVGLVCALLVALLIAVLYLLRIRQKKAKGSTSSTRLHEPEKNAREVTQVQIQDTNNMNNDITYAELNLPRGKKPAPQAAEPNNHTEYANIEASPPRRSEDTLTYANLDMVHLNQVPKDSAPKPEPSCSEYASVRIQRK	139718	186778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_161932_162305_169472_169584_172549_172575_181522_181569_184074_186126_186216
893622	contig_5954_pilon	-	1349	2	Intergenic	novelGene_28760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACAATAATGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392657	1390858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391252_1391701
893623	contig_8020_pilon	-	2976	3	Intergenic	novelGene_114430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTCCATTGTACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302694	280690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_281351_293928_294034_300483
893624	contig_10000_pilon	+	3977	26	Intergenic	novelGene_139299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	867	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3519	3974	285841	306746	FALSE	15	CCTGTCTTTCTTTTGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLASFSDTSSLFGSRSIFSSISCLLDSSSYLFLVVGITLLTVRPRGNFVARVHFQPGVQLTCFGSFWSKEDLSGFRVGHLDRQVAHLAAVIYGLSIWPQGRLPSFCILFSLLLPPPPLLLLFGCLGLLVLPNQVGQVGYILVCLLQKVS	158922	306749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_159881_162494_162557_163720_163785_167964_168068_168529_168639_182893_182948_192584_192800_225788_226009_234052_234130_236639_236871_244290_244449_255337_255512_260137_260185_262200_262288_262893_263001_270840_270954_273194_273443_280593_280701_281386_281455_283018_283184_284782_284930_285836_285934_286743_286805_287001_287133_291412_291467_306629
893625	contig_9177_pilon	-	3420	25	Intergenic	novelGene_32609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1787.40309712085	69	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	70	2508	25986	16653	TRUE	20	ATTCTACCTGTAACCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	26055	1723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1968_15196_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971
893626	contig_8674_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_102905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	2069	2620	174248	173697	NA	50	AATAAAAAGCCCACAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKIEFKTKSTMKDKEGHYIIIKGMIHHEDITIINIYTPNDRAPKYINNSNSTEREIDSSTVIVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKDTISQLNLIDIYRTLYPTAAKYTFFSNAHGTFSRTDHILGHRATLNKIQNTEIIQSIFSDHSAIKVEINNRKIKEKKSIIWKLNNTLLTNHW	176316	173487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_173500_176300
893627	contig_18843_pilon	+	4503	9	Intergenic	novelGene_165613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	662.867822420126	896	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	147	962	31251	44366	FALSE	40	GATCTAATGTTCAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERFGFL	28507	47907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31232_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191
893628	contig_151_pilon	+	1937	3	Intergenic	novelGene_132555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.5	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	146176	146472	TRUE	25	TCTGAGTTCCATATCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPGHQERPQRQPSTQVAVRTARSWRGGRPERVQRLGVTCEPGRTPERTPAGSTKLGLIFGGKIKQEIQNRPSLSHLTTLLGSPNFLKLATLNPVPEN	146173	159019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_146617_147064_147095_157555
893629	contig_6902_pilon	-	3287	14	Intergenic	novelGene_135593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1601	1915	489984	471675	TRUE	50	AACTTAGAATGTTAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAFPQCQASHLIVSVSLHKLPSFVLPFFSLLLPAVYEHVPLLQKLLTVVFVFASKFHLHQVLAAWGGKGLLFQVLPVDLEEVDAVVQATLGVVAGVMMFHVPD	496871	461684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_462152_463503_463613_465110_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470530_470609_470697_471534_471681_473714_473768_489728_490355_493530_493700_494118_494369_495311_495523_496271
893630	contig_10734_pilon	-	6755	16	Intergenic	novelGene_51238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1679	1984	1298905	1298600	TRUE	10	TCCTGTCGGCTGCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTAQGPAPGGKARHATGTSRGVTAHTSRQVAGFRVRSPTQDEGFVMDLPLQNALPGNAGFWACGVVSCSQRNSCHVTDHAQDSQRVSSSFYYHRLPFKAF	1300583	1221115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1221440_1243183_1243382_1247252_1247830_1260391_1260515_1262351_1262578_1267422_1267618_1268185_1268291_1270216_1270278_1279285_1280231_1281765_1281884_1284376_1284434_1284977_1285061_1286266_1286426_1288094_1288258_1288358_1288578_1297381
893631	contig_5331_pilon	-	3659	2	Intergenic	novelGene_112801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3203	3643	600156	599716	FALSE	55	ATCCCAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSKLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKRLDTTLFQENSEKTTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	771615	599699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_601812_770068
893632	contig_6503_pilon	-	1896	2	Intergenic	novelGene_145774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	252	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	256	630	222490	222116	FALSE	35	TAGGTGAAAGTTTACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSHMNGHVTEESDSEVKNVDLASPEEYQKHREMAVDCPGDLGTRMMPVRRSAQLERIRQQQEDMRRRREEEGKKQELDLNSSMRLKKLAQIPPKTGIDNPIFDTEEGIVLESPHYAVKILGK	227522	220849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_222658_227434
893633	contig_11338_pilon	+	6724	5	Intergenic	novelGene_6280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.6078810084939	17	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	4708	5166	193602	194060	FALSE	25	ACAGATTATTCCCATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPAQWVRVCARQVCRSASLLPTSPYFLPDTKAGFLLGFLGTRETTHTYTHTGTDADLTQEVHRLLWPRLFLGWIVFCLYPTALFSISQGSHLMYGGEIPSPAVSSGAPPETETSLPSNCHGYQKTFGSKGTHTLGLGVEGNQGKFRWPFS	176855	195618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_177334_179754_179896_183194_183305_189440_192297_192479
893634	contig_15039_pilon	+	2277	3	Intergenic	novelGene_110183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	6.5	325	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAGAAAAACAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360309	418596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_360645_414582_415912_417983
893635	contig_397_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_178389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTCAGCTAGACCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2677	250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_397_pilon_-_200_2700
893636	contig_15160_pilon	-	1869	1	Intergenic	novelGene_178647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTGAATTCACCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6169	4300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15160_pilon_-_4300_6200
893637	contig_15114_pilon	-	3041	2	Intergenic	novelGene_121098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTCGTTTTTTATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34847	31490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_31668_31983
893638	contig_8303_pilon	-	2140	6	Intergenic	novelGene_154912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	269.027136177747	11	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	367	741	51360	29217	FALSE	10	AGTATTGTTTCTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFKRVPLGLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNE	54810	27817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29223_34007_34083_35771_35895_36176_36321_51333_51593_54676
893639	contig_6403_pilon	-	2505	6	Intergenic	novelGene_139883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	55.1383713941571	309	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	135	821	997035	956210	FALSE	40	TACTTGCCATTAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAAEPQRAPARPAPFSPPPALSRPAFHRPGHCQLPHSPAETRCMLSRYRRQLLHVLSLSFPLLTRRPLLLCPHHLMKPLVVFVLGGPGAGKGTQCTRIVEKYGYTHLSAGELLRDERKNPDSQYGELIEKYIKDGKIVPVEITISLLKREMDQTMAANAQKNKFLIDGFPRNQDNLQGWNKTMDGKADVSFVLFFDCNNEICIERCLERGKSSGRTDDNRESLEKRIQTYLQSTKPIIDLYEEMGKVRKIDASKSVDEVFDEVVKIFDKEG	997169	954525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_956252_957200_957298_957531_957609_959276_959430_962222_962370_996864
893640	contig_7056_pilon	-	3053	14	Intergenic	novelGene_43613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1031.45068748344	133	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	1557	2420	726042	723226	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	731069	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722306_722415_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
893641	contig_8682_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_165266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTACTTACTCGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53909	55755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_53900_55800
893643	contig_14525_pilon	+	1769	11	Intergenic	novelGene_149757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAACAAAATAATCAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128563	296138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_128597_132110_132147_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137066_138536_138602_140183_140259_141222_142336_266834_266842_296111
893644	contig_3948_pilon	-	2369	6	Intergenic	novelGene_53194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	324.599075784267	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	62	469	866419	847907	TRUE	20	TGTCATGTCTTCTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQENYCSFQGWPRCGEKESWCGQRG	866480	839137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_847978_852508_852636_856565_856712_866355
893645	contig_8377_pilon	-	5570	29	Intergenic	novelGene_34906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.12852348939305	6	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTCAGTTTTACCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198712	68043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68139_68219_68327_124717_124736_131425_131569_135046_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182893_183046_183261_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192352_194357_194521_196079_196217_197660
893646	contig_13760_pilon	+	1618	5	Intergenic	novelGene_61315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	68.7713603180859	10	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	664	1065	202899	204617	FALSE	0	GTGGCTGTGTCCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLTLLPAPPPILPASASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRSRNPATTNQTEFERVF	201002	205170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_201186_201650_201733_202500_203118_203240_203373_204566
893647	contig_13067_pilon	-	3796	4	Intergenic	novelGene_141331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	65.0743164901996	1070	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	195	551	75166	36326	FALSE	45	GATTTAGTTGAAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDKEFMWALKNGDLDEVKDYVAKGEDVNRTLEGGRKPLHYAADCGQLEILEFLLLKGADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVKLLLSKGADKTVKGPDGLTALEATDNQAIKALLQ	75360	33080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_36413_52559_52644_53605_53720_75094
893648	contig_2646_pilon	-	4208	1	Intergenic	novelGene_69544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	539	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTTAATTCCGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848769	844561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_844600_848800
893650	contig_14133_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_119977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTTTGCCCAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255607	252808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_252800_255600
893651	contig_5988_pilon	-	3139	10	Intergenic	novelGene_15839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	165.485145355507	198	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2130	2501	249521	242253	FALSE	10	TGAATGCGTGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKPEQVLSVPDDLEAGPMDLYLSAAELQPTESLPLEFSDDLDVVGDGMQCPPSPLLFDPSLTLEDHSIKEIAEGPVDILGQIQMNVDGCRSQGSRNSEKASAPLPQSGVATANGEAEPTSIS	260594	241614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_250665_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235_255400_258760_258940_259719_259979_260569
893652	contig_3627_pilon	+	2293	12	Intergenic	novelGene_78579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	45.1733118021421	16	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1122	1718	1327439	1343837	TRUE	50	TATGGAGATAATAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313526	1346048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1322960_1323036_1323423_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743_1344094_1345729
893653	contig_8330_pilon	+	1714	8	Intergenic	novelGene_71830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	162.02015495686	3	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	8	340	853991	855538	TRUE	15	ACACCGCTGCCCAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMT	853983	857807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
893654	contig_12951_pilon	+	4022	8	Intergenic	novelGene_68191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	457	junction_7	153.237177777004	24	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	147	1238	755258	833659	FALSE	75	TTGAAAAAAAAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMER	755111	836443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431
893655	contig_8262_pilon	+	2306	2	Intergenic	novelGene_166100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGCCCTCTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44483	227656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_+_44851_225717
893656	contig_11117_pilon	-	3696	1	Intergenic	novelGene_148590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	384	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCTAGATTCATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84927	81231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_81200_84900
893657	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
893658	contig_14474_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_144206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACGAAGAGAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41016	42835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_41000_42800
893659	contig_12886_pilon	+	4101	2	Intergenic	novelGene_135491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2517	2984	450223	450690	TRUE	55	CATAAAACAAACTCTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASASSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRLIYRTLLEIRKEIQQNTETARQHTDTVVAELKKVSQEHNAKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAVEVRISDIEDKALDANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNL	447706	452012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_451321_451525
893660	contig_10937_pilon	-	3408	1	Intergenic	novelGene_67316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1060	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	2482	2964	93774	93292	NA	80	CAAAAAAAGAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDFFLDELPGTVNAKMESRDAAPSIKEGKQMPQPKGGSVEETFRIVKETLSEDTVKAAQAVYQFELSGEDGGTWFLDLKSKGGNVGCGEPPAQADVVMSISTEDFIKMFSGKLNPTMAFMSGKWKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARLKENKMLTTELDK	96255	92847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_92800_96300
893661	contig_5033_pilon	-	2957	3	Intergenic	novelGene_28910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2315	junction_2	423	28	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1454	1786	451758	450600	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWILSLTPQTLKPSRPAGGQWAVVAEPGAGGFRPGLAL	456583	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_453124_456495
893662	contig_9633_pilon	-	2987	7	Intergenic	novelGene_139613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_6	88.3429240076545	688	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	90	1667	658714	641339	FALSE	5	CAGCCTGGGTGGTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLAFSRRPGPATSAAELSRPLADGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRWVAIKSIRKDRIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASQGDLYDYISERQRLSEPDARHFFRQIVSAVSYCHQNGVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNQYHQDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGNDHKTLVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYTTRVGEQDTLKESGHPSTDSARTSMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHVPGGGATAPGLERQHSLKKSRKENYVAPSLQGDPADDTAPRPGKGVLKLPKGILKKKALSSEEGLREGPCELGPAPASPGQVTALLPRKGILKKSRQRESGYYSSPEPSESGGAAGRRGRVCGRRPCGAEAPPGLRAAPPSQGHPQTQWQVFLHSIPAHSPCRLRLLG	658803	640018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_642094_643582_643716_644259_644380_646135_646202_646567_646720_649759_649881_658483
893663	contig_10106_pilon	-	4972	10	Intergenic	novelGene_73879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	4330	4656	168840	153329	TRUE	5	GGCTTCCCTGTCCCGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVQSELLRGILDLKFVEQQLQDLRGGHGAIDADVGDGAIGWSEHRRLMVVEMAVDGEAVASDSALVARCPHIATATHPNITPGAHQLRRVFLQGLQAPGLCKFWPS	176654	132642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_132829_151068_151160_153289_153351_165993_166153_167025_167128_168796_168850_169339_169463_170993_171096_172509_175190_175239
893664	contig_15498_pilon	-	1206	9	Intergenic	novelGene_42670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.489492211102	7	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	11	586	697708	688828	TRUE	20	TCAAACTTCCATCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPIPSQRLHCHRPSGV	697718	687990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689531_691294_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
893665	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
893666	contig_5623_pilon	-	2313	13	Intergenic	novelGene_154838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	336.714631484222	2	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	35	1624	239425	207631	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLIDSELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	239459	206941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212551_239407
893667	contig_3956_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_14798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGGACCCAGGCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226141	1224982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1225000_1226100
893668	contig_9579_pilon	+	7312	25	Intergenic	novelGene_150587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	187.114933300068	1356	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	492	2537	806241	823327	TRUE	50	TGGCAACAGAGAAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKENAELLEKLSNYEQKIKESKKHVQETKKQNTILSDEAVKFKDKIKELEENNEVLDDKAKSLRVMLESEREQNVKNQDLILENKKSIEKLKDVISVNASEFSEVQIALNEAKLSEEKVKSECHRVQEENAKLMKKKEQLQQEIKDWSRSHAELSEQIKVFEKSQKDLETALTHKNDNIDALTNCITQLNRLDCESESEDKNRGGSGSDELANGEMGGDRSEKMKNQIKQMMDVSRTKTAISVVEEDLKLLQIKLRASMSTKCNLEEQIKKLEEDRNSLQLTKAGLEDECKTLKQKVEILNELYQQKEMALQKKLSQEEYERQEKEQRLSAADEKAILAAEEVKTYKRRIEEMEDELQKTERSFKNQIATHEKKAHDNWLKARAAERAIAEEKREAANLRHKLLEITQKVATLQEEPVIVKPMPGRPNTQHPARTGPLSQNGSFGPSPVSGGECSPPPPTADPPLRPRSATLSRREMPRNEFGPVAGPPPRPRWPSEVSGKPSACDAGAGAGPMMNSSSGSSSPKVTDEGKVNMAAKGPPPFPGMPLMSSPVGGPLPPPIRYGPPPQLCRPFGPRPLPPPFGPGLHPPLGLREYAPGIPPGKRDLPLDPREFIPGPTPFRPLGPREYFIPGTRLPPPPHGPQDYPPSPAARDLLPSGSRHEPPSAPQSGSQDSSQALKQSP	796246	833340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_796545_797303_797459_806202_806292_806563_806642_806730_806842_807900_807973_808157_808263_808895_809019_809115_809228_810379_810436_810525_810617_810789_810929_816661_816764_817425_817487_817586_817623_817696_817765_817889_817991_818155_818297_818993_819063_819173_819251_821249_821401_823025_827740_827883_827998_831579_831705_833216
893669	contig_20527_pilon	+	2225	6	Intergenic	novelGene_138567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1157.57529344747	249	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	675	1325	13527	28042	FALSE	55	AAAAAATAATGACCATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRYSPCFAHMKL	12852	28942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27446_28010
893670	contig_11304_pilon	-	6929	34	Intergenic	novelGene_156678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	507	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1719	2102	548565	542590	TRUE	30	GTCGTGACGATGAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCFQGALFLDFICRGSSNLLCVGLCFAPVPQVNEGFIYVENNHGRSGPQATTVTSDFQQISFNGDFSAHTVQPPLTLHIFFFFFPSPGVHHHPSLETLQKTGGLLALENLDLGTPFFVQLHSHQC	558789	271268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_271605_351742_351860_433617_433674_441233_441326_447547_447607_447719_447873_457802_458455_484402_484458_485577_485743_488982_489229_489672_490234_491063_491297_503742_503873_514856_515007_519684_519775_519859_519947_522677_522858_523741_523915_525377_525532_527191_527329_527934_528083_528203_528350_530570_530746_534811_534958_535339_535615_542478_542631_545719_545830_546510_546719_548540_548672_550258_550415_552725_552871_554648_554775_557510_557666_557759
893671	contig_2480_pilon	-	4378	8	Intergenic	novelGene_63545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	525	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGGGTCGCCAGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281832	269642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_270428_271793_271872_274102_274184_274276_274407_277040_277110_277207_277281_278530_278781_278920
893672	contig_12540_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_148047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	821	1378	111833	111276	NA	40	CCATAAATAAAGTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELVENRTRQVDSHVELFEAHQEISDATGNSGKASQDKSKNETITQAEKPNNKRSRRQRNNENRENASNNHDHDDITSGTPKEKKAKTSKKKKRSKAKAEREASPADLPIDPNEPTYCLCNQVSYGEMIGCDNDECPIEWFHFSCVGLNHKPKGKWYCPKCRGENEKTMDKALEKSKKERAYTR	112653	110082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_110100_112700
893674	contig_10904_pilon	-	1902	9	Intergenic	novelGene_22552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	197.182656438136	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	288	1139	389522	375280	FALSE	25	GTTCTTGAACTTCATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLEPCNLTENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	396181	374516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389651_396022
893675	contig_10341_pilon	+	2540	9	Intergenic	novelGene_47226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	161.853280396166	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	126	1115	87490	120280	TRUE	20	TGTTTTCTCCTTTAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCVEIAREALNAGNREKAQRFLQKAEKLYPLPSARALLEIIMKNGSTAGNSAHCRKPSGRGVQNKTNCTKDSTSSSGESGKGYSRDQVDGVLSINKCKNYYEVLGVTKDAGDEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATDAFKKIGNAYAVLSNPEKRKQYDLTGNEEQGCNHQNNGRFNFHRGCEADITPEDLFNIFFGGGFPPGSVHSFSNGRAGYNHQHQHRHSGHEREEERGDGGFSVFIQLMPIIVLILVSLLSQLMVSNPPYSLYPRSGSGQTIKMKTENLGVIYYVNKDFKNEYKGILLQKVEKNVEEDYVTNIRNNCWKERQQKTDMQYAAKVYRDDRLRRKAEALSMDNCKELERLTSIYRGE	67398	121757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_67507_87472_87645_94305_94452_105635_105822_111077_111173_111962_112073_113062_113236_120155_120664_120715
893676	contig_20779_pilon	+	1906	4	Intergenic	novelGene_112357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_2	60.337937209244	378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1863	42	1904	8301	94520	FALSE	25	GTGAGTGCTATTCTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTQLKTLLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMSNGTPANLLGVSKSNNVKSYIKNNGSDSLLSHSFNWRKANKYQLSEQSAGEPNNTQNSHDKVIDPEKHAPIQGMFDKSRIKGDLKRVSVLTSKITKPSTMFVSSTEELNQKSLSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSVSAPKSQLNGFYGNRSAGNRQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDNIKSITCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLHIRVPLRSSMLTRNSRQSEVLNGNERLGYGFNRPYPAGGKKLALPNGPGMISTLGYRMIHPSLLKSSRPPFAGSITVDGNKNASADKCVKEHATVLANDKATNKDQELIENDGYRTENEQTIKNDAKIRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTQITPEEISVKEEKHENVPPKDIFDSPKENEKSFHKTDEWIAISVSDSDYTKHASGNNLISPDTDDRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDTSIENVECDNMNRFDRSDRNVRQSQEGFWKRSPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLS	8259	94522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_9718_10654_10849_66802_66894_94359
893677	contig_7051_pilon	-	3269	4	Intergenic	novelGene_64313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_3	142.098557346653	561	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	16	495	231129	216979	FALSE	80	AGAGAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231144	214204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_217052_217573_217734_217824_217999_231056
893678	contig_4884_pilon	+	2366	8	Intergenic	novelGene_63819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	754.483550895199	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	280	1557	576025	585023	FALSE	50	TTAAATAAAAAGGTAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEGVEGIIKEVEVDIIEVAIDLSGIEDTLGVLDEVGHVLEVQKEDLFLLRDPEADLAGHIDPLGLQDLPLLGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDR	563325	585832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_575041_575156_575923_576247_578052_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843
893679	contig_8365_pilon	-	2660	8	Intergenic	novelGene_150913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_7	82.8724123861124	1049	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	638	1528	175957	68201	FALSE	20	CTGAATGCATTGTCCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTKEEKKERKQSYFARLKKKKQAKQNAETPSATATRSHTGKEDANAVILEQDKYNIAVQEDEYITDEKKKRKNNQLKEIRRTELKRYYNIDDNQNKTHDKKEKKMVVQKPHGTMEYTTGSQDTLNSIALKFNITPNKLVELNKLFTHTIVPGQVLFVPDANFPSSTLRLSSSSPGATVSPSSSDAEYDKLPDADLARKALKPIERVLSSASEEDEPGVVKFLKMNCRYFTDGKGVVGGVMIVTPNNIMFDPHKSDPLVIENGCEEYGLICPMEEVVSIALYNDISHMKIKDALPS	211465	67068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_68390_70369_70496_71063_71178_76570_76679_80336_80417_110677_110902_175907_176023_210893
893680	contig_10749_pilon	-	2103	13	Intergenic	novelGene_133451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1334.36252726411	10	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	73	732	155250	147678	TRUE	45	AATAGAAACTGGATGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESLPVPPEGRDHPVPAQAVQFSSHLCRWSGQVQHRQRQCELSPHHPVHVPQP	155322	135876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143641_144588_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149681_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
893681	contig_12080_pilon	-	3085	25	Intergenic	novelGene_128339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	646.945386669797	126	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	26	1507	164251	62705	TRUE	10	CCGCCTACAGCCTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDSTNRDMEPPGGGLGPGRGTRDKKKGRSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164276	45131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45424_47031_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_107834_111440_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
893682	contig_16431_pilon	+	5435	3	Intergenic	novelGene_87613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGACCTGCACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220142	248330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_224504_246850_246858_247263
893683	contig_13674_pilon	+	2090	2	Intergenic	novelGene_140315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	110	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1516	1854	17984	18322	FALSE	60	GCAAGAGATCACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQPTANAKYEGIEEFCYFLQSDSHQICNQDALIITSDWNAKVRNKEEGSVVVKYGLGDKNDARDYIIEFYKTNGFFIANTFFTNISGNNRWTSPDKIHRNQIDYICGKR	15856	18558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_16481_17092
893684	contig_9910_pilon	-	4230	4	Intergenic	novelGene_178498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2425	3066	194777	194136	TRUE	10	TGTGGAGGGATGGCGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITRKFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	209864	192313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9910_pilon_-_192575_193232_195402_207536_208766_209293
893685	contig_6576_pilon	+	2065	2	Intergenic	novelGene_42441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	214	486	1302302	1302574	TRUE	20	CAGAGAAGTTTCCTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1302088	1304279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302657_1302782
893686	contig_11307_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_105236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	96.8762096698668	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	117	710	74141	87762	FALSE	15	TTCTTTTTATTTTCATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCVCHWCSHVPFPVGKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDNFAHRTEVRKALAKNKEWQEQFLIPNLPLIDKQEWEISYLVPWCKIEKPPKEVHVLWWHESPDSRAAGRHQSHEDPRVVAAVRESANHLVSQQNMLLIPTSFSPLK	74024	88535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748_76960_78881_79041_87512_87600_87685
893687	contig_2969_pilon	+	2450	4	Intergenic	novelGene_157089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	62.2949971238997	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1845	2243	1197990	1201364	FALSE	15	TATGTATGTTTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGTFADKEKKKEKKKAKTVEQTAATTNKKPGQGTPNSANTQGNSTPSPQVPDYPPNYILFLNNLPEETNEMMLSMLFNQFPGFKEVRLVPGRHDIAFVEFENDGQAGAARDALQGFKITPSHAMKITYAKK	1196145	1201571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1198089_1198880_1198932_1200570_1200660_1201204
893688	contig_8102_pilon	+	2145	17	Intergenic	novelGene_85331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	49	junction_15	57.8016205979556	543	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	13	1968	135088	178724	FALSE	20	GTTACATTGTGCATTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKHKKHKSDEHLSEEYVEKPLKLVLKVAGNEVAELSTGSSGHDSSLLEDKNDHDKHKDRKRRKRKKGEKQVPGEEKGRKRRRVKEDKRNRDRDHVENEAENDLQCQAPVRLDLPPEKPLASSLAKQEEVEQTPLQEALNQLMRQLQRKDPSAFFSFPVTDLIAPGYSMIIKHPMDFSTMKEKIRNNAYQSIEELKDNFKLMCTNAMIYNKPETIYYKAAKKLLHSGMKILSQERIQSLKQSIEFMAGLQKTRKQKDQTDTSPRREDSGCWPREREHFGDAEAQAFEGPNKKNKKKDKDTSEDKFKSSNLEREQEQFDRIVKESGGKLTRRLVTSQCEFERRKPDGTTTLGLLHPVDPVVGEPGCCPVKLGMTTGRLQSGVNTLQGFKEDKRNRVTPVLYLNYGPYSSYAPHYDSTFANISKDDSDLIYSTYGEDSDLPSDFSIHEFWATCQDYPYVMADSLLDALTKGGHSRTLQELETSSAEGEGHTRTFDTTKDMEVTEIEPAGRLDCNNQDRLTALRAVTNFGVPLDVFDSEEAEVFQRKLEETTKLLRELQEAQNERLSAKPPPNRICLLGPSYREMRLAEQVTNNLKGLAQQVTPGDIVSMCGVRKAMGISIPSPSVENNFVDLTEDFEDSNKTDVPDCGPDGI	135075	178901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8102_pilon_+_135137_135571_135781_152026_152157_153599_153658_156968_157114_160047_160159_164864_165050_166061_166186_166860_166937_169618_169727_170126_170263_173535_173648_175152_175210_177242_177355_177862_178007_178204_178349_178668
893689	contig_5419_pilon	-	3044	1	Intergenic	novelGene_15540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	2558	3016	427305	426847	NA	15	TACATGTGTGCACCCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNNKKRAGVAILISDKINFKAKFTTKDKEEHYIMIKGSIQRRGQHGGVVRCCLYLSYNKDLENTSDLIEYLRALDKARLRNPSERYGRGRPFGRGEEGQSREWQNCSSTAILVHGEADKQLCSARPWEAVSRSRETRQQRCCLDTPNQ	429862	426818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_426800_429900
893690	contig_7730_pilon	+	3311	3	Intergenic	novelGene_156284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	13.5	699	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2589	2957	487107	487475	FALSE	30	GAACATTTATTCACCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTISAHGSSGEDIKGCIALGKSAAKDLLKVLKSKDVTLRTKMHLTQAMVFSVASYACESWTMNMEEQRRIDAFEL	357595	487829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_357786_403495_405869_487081
893691	contig_12948_pilon	-	5977	17	Intergenic	novelGene_126194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	449.950257667445	1469	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	927	2784	706	3489	245613	227252	FALSE	15	GGTTACTTGTCACTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRRLSHDVSGALLLANGESTGNSGGSSGSSPSVGATSGSSQTSISGDVVEACCNVLSMVCADPVYKVYVAALKTLRAMLVYTPCHSLAERIKLQRLLRPVVDTILVKCADANSRTSQLSISTLLELCKGQAGELAVGREILKAGSIGIGGVDYVLNCILGNQTESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLIDSTGQRLRIADFGAAARLASKGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSVGCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQDRPPSRELLKHPVFRTTW	257441	224763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_227402_230188_230321_231206_231350_232224_232357_233724_233888_234585_234739_235113_236399_236877_237068_237339_237432_240648_240771_245391_245671_248451_248644_248799_248831_249345_249468_256166_256316_256684_256802_257404
893692	contig_10341_pilon	+	2394	7	Intergenic	novelGene_47230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	182.138607171083	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	559	939	111990	120280	FALSE	50	TGAATAAAACTGCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAHCRKPSGRGVQNKTNCTKDSTSSSGESGKGYSRDQVDGVLSINKCKNYYEVLGVTKDAGDEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATDAFKKIGNAYAVLSNPEKRKQYDLTGNEEQGCNHQNNGRFNFHRGCEADITPEDLFNIFFGGGFPPGSVHSFSNGRAGYNHQHQHRHSGHEREEERGDLMPIIVLILVSLLSQLMVSNPPYSLYPRSGSGQTIKMKTENLGVIYYVNKDFKNEYKGILLQKVEKNVEEDYVTNIRNNCWKERQQKTDMQYAAKVYRDDRLRRKAEALSMDNCKELERLTSIYRGE	87516	121735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_87645_94305_94452_105635_105822_111077_111173_111986_112073_113062_113236_120155
893693	contig_3866_pilon	-	1664	15	Intergenic	novelGene_112404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	262.582902360845	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	744	920	1663	199931	180510	FALSE	45	AAGAAAACGAGCTACTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEK	223784	180508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_200002_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211_209292_217713_217805_218726_218793_220622_220734_222501_222559_223648
893694	contig_2476_pilon	-	3723	9	Intergenic	novelGene_157632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	74.7993148364342	482	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	73	1584	485780	477046	TRUE	35	AGCTGACCAGAGAATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEFERQQREELEKLESKRKLIEEMEEKQKSDKAELERMQQEVETQRKETEIVQLQIRKQEESLKRRSFHIESKLKDLLAEKEKFEEERLREQQELELQKKKQEEESFLCVRELQWLQELNNDEKAEKIQIFRELDWLRKEKDEQYAKLELEKKRLEEQEQEQFMLVAHLEEQIREKQEMIQLLQRGEVQRVEEEKRDLEDIRESLLRAKEARAEGDDDGEEIEKAQLHFLEFKRRQLVKLANLEKDLVHQKDLLKKEVEEEQEILEHLKCENKDKSRLLAKNDGSVQHVTQVAQDLEKIKPAEYRLQYKERQLQYLLQNHLPALMEEKQRAFEILDRGLLDLDNTLYQVEKEMEEKEEQLTQYQASASQLQKLQATFEFTANIARQEEKVRKKEKEILESREKQQREALEQAVAKLERRHSALQRRSTLGLEMEEQRQKLANVNSSTNARAGLEAGLEAEQEALEKDQERLEHEIRQLKEKICEVDGIQKWDCGTLEGKASSSSLPLSTEKSQAHLMPLMDARDEG	487501	358123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_359920_411258_411343_438327_438418_462307_462431_476999_477051_477800_477809_480133_480293_484440_485797_487445
893695	contig_7376_pilon	+	2652	9	Intergenic	novelGene_108068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_8	138.816425541072	632	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	8	1054	53088	70861	FALSE	15	CTGAGCCTATTTCCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGGENGGGGKKGLKRKATSEDPEETVVSGDGTAEGGAQSPKAAAFPPGFSISEIKNKQRRHLMFTRWKQQQRKEKLAAKKKLKKEREALGVKAPPKPVPKTIDNQRVYDETIVDPHDEEVAYDEATDEFAPYFNRQTSPKILITTSDRPHGRTVRLCEQLSTVIPNSHVYYRRGLALKKIIPQCIARDFTDLIVINEDRKTPNGLILSHLPHGPTAHFKMSSVRLRKEIKRRGKDPTEHIPEIILNNFTTRLGHSVGRMFASLFPHDPQFIGRQVATFHNQRDYIFFRFHRYIFKSEKKVGIQELGPRFTLKLRSLQKGTFDSKYGEYEWVHKPREMDTSRRKFHL	53080	72459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_53313_54868_54926_57516_57598_63239_63336_64119_64274_68958_69042_69483_69666_69821_69949_70819
893697	contig_6397_pilon	-	2661	8	Intergenic	novelGene_146271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_7	74.9712870207723	14	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	199	879	554772	516719	FALSE	15	CAGTTTTTATTCGTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGELCHCVFIMPACCSDIISNLSEI	601761	514936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
893699	contig_15118_pilon	-	3863	15	Intergenic	novelGene_74595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	763	1263	395308	394326	TRUE	20	TGTTTTAAGTCATCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELTLKARGRRAPAWVQFFLRVFTMISMRQRKRRVVMPIPRNAPLEKAVETSPLSGNNRTVTLWAPWSFRTSQWSPRPRLSPSESLRELLAQGPAELEVTMTEALLLFPSTSQFPTLQCREGVGQALAEQLQRRPSVFQEQEGLSTWGGSSTERSRETCPEPSGF	399368	379067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_379781_379883_380020_380149_380320_391643_392086_392167_392551_392641_392926_393223_393276_393416_393459_393557_393680_393942_393988_394114_394374_394461_394747_395047_395141_395233_395342_398639
893700	contig_6497_pilon	+	2400	7	Intergenic	novelGene_35564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	362.313706920153	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	8	313	161352	166061	TRUE	25	CAAGTATCACTTATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRVSKSFPFF	161344	177039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_161444_163401_163481_165792_165868_166001_166549_166881_168340_174094_174188_176990
893701	contig_10139_pilon	+	333	2	Intergenic	novelGene_177804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAATCCTTCCGCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182993	183551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183111_183335
893702	contig_3956_pilon	+	2396	12	Intergenic	novelGene_14976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1229.36136077717	244	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	81	1877	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287497_1289854_1289892_1290297
893703	contig_11850_pilon	-	2878	5	Intergenic	novelGene_125185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	941	junction_1	832.563511090896	230	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	171	797	186097	181211	FALSE	15	TATGTGTGTGTGCTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	186267	179129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932
893705	contig_10148_pilon	-	2692	1	Intergenic	novelGene_172858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGTACCATGATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243547	240855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_240900_243500
893706	contig_14209_pilon	+	3121	2	Intergenic	novelGene_88354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_1	0	503	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1473	1862	36969	37358	TRUE	10	GGGCGTGGCTGTGTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPEQLVLLGALTLQPRCPFCVSEGRLAPEGPSGAGNPTPAPQAAWTLVWSMSATASAWPSSANCGTCSVTLRPNVRRCSSLVRQSVGPRPGWGLAKPARPLTLCASLCSGLQTWHLCEGPDHRAAPS	35496	38909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_37421_37712
893707	contig_10323_pilon	+	4324	1	Intergenic	novelGene_123635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCATAGGGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505863	510187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_505900_510200
893708	contig_610_pilon	+	5135	13	Intergenic	novelGene_76837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	221.753037684317	670	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	7	708	350011	375649	TRUE	45	AGGTATTCCAGGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIMANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350004	390351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583_379090_380220_380277_381346_381413_384549_384627_387145_387216_387815_387929_389658_389935_390022
893709	contig_19032_pilon	-	2561	3	Intergenic	novelGene_172554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	873	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	240	692	166531	164587	FALSE	30	ATGTGGTATTTGATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVEPGNGSETAKQNRKAEIKREVLKDLEKIMVVDILSTLKRTNTAEPNLLSPLLKKKMNTLMIQWFVLILVSEAVSPSLQLFDVVIFGSVRKQCCMLNA	166770	162717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_164751_164837_164950_166354
893710	contig_11656_pilon	+	2147	3	Intergenic	novelGene_53942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAGGAGAGGCCTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112782	120443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215_117528_120350
893711	contig_20493_pilon	-	2459	14	Intergenic	novelGene_86390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	67.8499039605482	112	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	66	1655	54655	36487	FALSE	25	CCATTGTCATCGAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQGGPRD	55267	35682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_36506_37391_37566_37953_38037_38198_38264_38354_38489_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
893712	contig_3584_pilon	+	4358	10	Intergenic	novelGene_108145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	112.498340179799	1273	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	641	1537	351589	366078	FALSE	15	AACGGTTTGGCTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESVDDINADKNVSSAQIVGPGSKPEASAKPPSRPADNYDNFVLPELPSVPDTLPTASAGAKTSASEDIDFDDLSRRFEELKKKT	340890	368899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353469_354411_354619_355225_355319_356498_356548_365878
893713	contig_6137_pilon	+	6962	1	Intergenic	novelGene_59208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1950	2270	1309335	1309655	NA	25	AAGAGTTGATTCTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGPEYLKQYVEREQQTRGELILPDFNIVYSCCSPGGAVVKSSAANLRCSLETLWDSSTLSFRVTMSLNQLDGNGFGLDTAIVIKTVWYWYNNRYIDQWNRIESL	1307385	1314347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1307400_1314300
893714	contig_11512_pilon	-	2853	16	Intergenic	novelGene_43373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1131.39877241502	336	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	47	1165	609650	556654	FALSE	5	CTTTGCAGTGGCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622247	554965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582744_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
893715	contig_11564_pilon	+	3092	2	Intergenic	novelGene_158581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTTTCACTCTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84757	89153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_85113_86416
893716	contig_7457_pilon	-	1780	7	Intergenic	novelGene_31420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	156.845731001304	377	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCCGAATGTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473227	468256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473120
893718	contig_16776_pilon	-	4684	2	Intergenic	novelGene_130528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAACAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57796	53020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_56751_56842
893719	contig_10197_pilon	-	3447	10	Intergenic	novelGene_115257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	194.891422763206	812	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	283	789	1077604	1060900	TRUE	15	CTCTCTGGAGTCCAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEDFLIKIETWHKPDVGTLENVHKLEPETWKHVEAVYIDIADRSQVLSKDYKAEEDPAKFKSIKTGRGPLGPNWKQEIVNQKDCPYMCAYKLVTVKFKWWGLQNKVENFIHKQEKRLFTNFHRQLFCWLDKWVDLTMDDIRRMEEETKRQLDEMRQKDPVKGMTADD	1091657	1057177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1059812_1060875_1060945_1070280_1070404_1073602_1073714_1073865_1073944_1075994_1076079_1077538_1077614_1083688_1083785_1086756_1086903_1091626
893720	contig_9937_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_129210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTAACGATCAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151810	149426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_149400_151800
893721	contig_6946_pilon	+	2846	1	Intergenic	novelGene_59787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2511	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATCACACTATGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442024	444870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_442000_444900
893722	contig_13481_pilon	+	3701	7	Intergenic	novelGene_119317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_1	109.135491731863	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1126	3378	323	3700	414928	474570	FALSE	30	TGCTCCCAGCACAGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEKAAKASRSVAGSKKEKENSSSKSKKERSEGVGTCSEKDPGVLQPVPLGGRGGQYDGSAGVDTGAVEPLGSIAIEPGAALNPLGAKPEPEDGENECRPLKKVKSEKMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSYTQSSPGALNPSSQAGVESQSLKTKKDEEPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVHVPVSSPLTQHQSYIPYMHGYSYSQSYDPSHPSYRGMPAVMMQNYPGSYLPSSYSFSPYGSKVSGGEDADKARASPSVSCKSSSESKALDILQQHASHYKSKSPTISDKTAQERDRGGCGVIGGGGSCSSVGGTGGGERSVDRPRTSPSQRLMSTHHHHHHLGYS	284207	474571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_284530_414927_415154_466806_466895_468621_470963_471858_472226_473981_474158_474390
893723	contig_7746_pilon	+	6096	6	Intergenic	novelGene_178648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3224	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	4313	4747	117513	118059	TRUE	30	CCATTAGAGAGGTCTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKKGKRGKRKQNKLKKKRTRKFPKRTEKQNHEKRNVLRDPQTNKQKPRDPTSMAARTGKQFHTRMELRSPLGRSKDGARSQVFERNEGDVVRGKEEIKRSRKKQHQQPTNGTQGACRCGRVESKQPVLPGQETMATGSRGG	3191	157425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7746_pilon_+_3761_110353_111609_114943_116667_116747_117642_117753_118423_156439
893724	contig_19061_pilon	+	2739	6	Intergenic	novelGene_173506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTCTCCGCAGCCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36880	93392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_37091_37996_40056_44031_44178_65869_65953_78273_78355_93232
893725	contig_7345_pilon	-	1868	7	Intergenic	novelGene_159169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	126.530628703093	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	153	674	139698	112878	TRUE	40	ACGCCCACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEELSAATSYTEDDFYCPVCQEVLKTPVRTAACQHVFCRKCFLTAMREGGIHCPLCRGNVTRRERACPERALDLENIMRKFSGSCRCCAKQIKFYRMRHHYKSCKKYQDEYGVSSIIPNFQISQDSVGNSNRSETSTSDNTETYQENTRRVLFVCLFLGEILARLLEILLVI	140195	109392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_110552_112842_112951_115415_115473_118503_118620_119857_120024_139588_139770_140114
893726	contig_6102_pilon	-	2912	10	Intergenic	novelGene_32022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	94.9736805646701	489	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	164	1156	545300	515245	TRUE	30	CTTGAGCCTGCTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLTAAARFFGAKHASCLVLAARHASVSSTNLKDILADLIPKEQAKIKTFRQQHGKTVVGQITVDMMYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGYSIPECQKLLPKAKGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTEEQVSWLSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPNNLHPMSQLSASITALNSESNFARAYAEGINRTKYWELIYEDCMDLIAKLPCVAAKIYRNLYREGSSIGAIDTKLDWSHNFTNMLGYTDAQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQKLLNTSWLFSLTLCRLSQAMAMQY	545463	513181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_514759_515065_515320_515835_515966_516535_516736_524312_524502_524748_524881_525203_525270_526218_526327_527234_527286_545258
893727	contig_16103_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_118889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGAGTATAGGGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729693	727578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_727600_729700
893728	contig_19402_pilon	-	2464	14	Intergenic	novelGene_80758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130563_146325
893729	contig_3747_pilon	+	3088	3	Intergenic	novelGene_24772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6234	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	332	649	201313	202759	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPSA	200981	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201396_202345_202458_202636
893730	contig_15244_pilon	+	2528	7	Intergenic	novelGene_118053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.8154908453672	2368	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	741	1574	567685	574376	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILFRIRGGLDLAFQLATPDEIFVKKALKHVLRDLSAKLSSNALVFRICRSSVYVWPNSDMNTIPGELTDSSACKNIMRFIQFEQEEDTQRKFMRKKEKKLPDMHQIVNIDLMLEMSTPLSAVTPIIERESGEHHYVNMTLPVDTVLAVAPEEPWGKVRKLLVDAVHSQLTNMEKCILKYMKGTSIVVPEPLHFLLPGEKSLVTISYPSGIPDGQLQAYRKELHELFNLPHDRPYFKRSNAYHFPDEPHRDGYIRNPHTFLNPPNIESGMVSLTND	566369	575330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_566430_567004_567749_569829_570014_570094_570162_571877_572036_572415_572609_574208
893731	contig_16103_pilon	-	329	3	Intergenic	novelGene_118714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	184	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	237	92	328	199173	198449	FALSE	30	TGGCTATGATCTACAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAGPAETRPIPCTAPLALCCIRELQAQPSAMACPLDQAIGLLVAIFHQYAGKEGDKNSLSKKELKELIKKELTIGPHLQDAEIARLMEDLDQNKDQEVNFQEYVTFLGA	199918	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035_199195_199848
893732	contig_6740_pilon	+	3579	2	Intergenic	novelGene_142687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	585	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTCTGACTTAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623667	628639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_625276_626668
893733	contig_3252_pilon	-	2027	13	Intergenic	novelGene_61499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	169.385080675824	17	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	88	1620	336955	316094	FALSE	65	AAAATAAATATGAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISASRAAAARLVGAAASRGSTVARHQDSWNGLSHEAFRIVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHAAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKIIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRESGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMDASGPKHLNMKLSRAQFEGIVTDLIRKTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGDVTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGEREMAGDNKLLGQFTLIIIKT	337042	315686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_316112_319216_319322_320216_320445_321511_321722_330822_330916_332024_332188_332682_332790_332880_332955_333545_333671_334400_334583_335097_335186_335436_335496_336874
893734	contig_9049_pilon	+	1996	8	Intergenic	novelGene_83138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1780.12466887426	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	623	925	108630	112652	FALSE	45	ATAGTTGAGTACTAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88320	113723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95970_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558_111685_112569
893735	contig_12046_pilon	-	6458	5	Intergenic	novelGene_83460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	937	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3803	4258	335885	335430	TRUE	40	AGTGGGGCACAGAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFSIRKSINVIHHANKRKEKNHIIISVDAEKAFNKVQHPLLIKTLDKLGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKKFPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRQEKERKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSMRKYWN	633102	231214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_232976_334990_336395_518843_520417_631207_631811_631985
893736	contig_14814_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_137721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	419	928	296185	295676	NA	0	TCGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIIIITTVITTITTIPITIITTTITITNIITTIVIPSPSSPSLPPLSSPSSSTSSSSSSSCHHHHRQHHHHHPITTTVNITIIIPSSSHHHHRQHHHHHHHRQHHHHYHQHHPIATIVNITIIITTIVNITIIITTIIIPSPSSASPSSPPPLYHHHHHHYPPHRPQ	296603	294204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_294200_296600
893737	contig_8687_pilon	+	2084	3	Intergenic	novelGene_169663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGTAATAAAAAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236794	364418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_237427_289944_290316_363337
893738	contig_8045_pilon	+	3309	2	Intergenic	novelGene_35375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTTCAGGCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116046	119418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116214_116276
893739	contig_13612_pilon	-	4184	4	Intergenic	novelGene_157275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.576966406035	183	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	118	441	38542	36280	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGAARWLALATVRSGALWSGPSLRKGGDVSAVRGGSGQSLVPSRSVIVTRSGAILPKPVKMSFGLLRVFSIVIPFLYVGTLISKNFAALLEEHDIFVPEDDDDDD	38659	31260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_34567_34692_35126_36275_36418_38356
893740	contig_5988_pilon	-	3621	11	Intergenic	novelGene_15841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	152.727502434892	197	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	404	1447	259970	251825	TRUE	20	AATTGAATGCGTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTQKDAPAIGDLLTLYSGLMETALD	260573	241617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_250665_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260178
893741	contig_8330_pilon	-	4919	21	Intergenic	novelGene_71926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_17	361.549011200418	7	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1095	3288	909	4196	1311328	1284042	FALSE	20	GTCTACCCTAGTGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHGIQPQPQPAPQHSSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASPRSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTYQKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAEKVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHSGTGTTPPVKKKPKLLSLKDSSMADASKHGVGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELFNWFKNFLGYKESVHLETFPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTPLCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEAIQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIVLKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIESIYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLVYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQIMHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEATGASKKHNGVGGSPPKSKLLFSNTAAQKLKGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLMRICSQAERQIEEENRERVWEHDMPGVRRDKSDSPAIQLRLKEPMDVEVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYEDSLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLSENNNGATGGQLNTQTSRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQDKVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDYVERYMNSDTTSLELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDSLDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEHVPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP	1345198	1283318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1284273_1286210_1286419_1286966_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295230_1297668_1298243_1299199_1299384_1300722_1300962_1303329_1303447_1303744_1303956_1304515_1304635_1306743_1306834_1308628_1308788_1308923_1309077_1309645_1309898_1311109_1311467_1312058_1312166_1318951_1319129_1323299_1323522_1344934
893742	contig_6557_pilon	-	2278	10	Intergenic	novelGene_32952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.425238338414	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	275	1222	364319	352011	TRUE	25	AAGGGTTGAGAGTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKG	395133	343868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_344925_352010_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_379693_379880_395057
893743	contig_17618_pilon	-	1058	7	Intergenic	novelGene_173348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_6	103.455975607448	113	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	25	552	51441	14550	FALSE	20	TTTATTGGGTACCAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKNRFQRFMNHRAPANGRYKPTCYEHAANCYTHAFLIVPAIIGSALLHRLSDDCWEKITAWIYGMGLCALFIVSTVFHIVAWKKSHLRTVEHCFHMCDRMVIYFFIAASYAPWLNLRELGPLASHMRWFIWLMAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMMRG	51465	14043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_14562_30667_30738_32593_32696_34769_34845_38040_38202_42793_42876_51415
893744	contig_5023_pilon	+	2542	12	Intergenic	novelGene_7224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1848.07527752658	7546	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	306	1226	622609	646990	FALSE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_607955_618613_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
893745	contig_11417_pilon	+	4606	22	Intergenic	novelGene_103289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2172	junction_17	818.261172816342	52	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1434	3171	4604	540507	559259	FALSE	15	GGTGAGTGGCTCCTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQETQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGVFAINEAVDSGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGATYQSDLAEAKKKKLAAGDNNSKWVKHWVKGGYHYYHNLETQEGGWDEPPDFVQNSVHLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITKLQACCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQSQWRGYKQRKAYQDRLAYLRSHKDEVIKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDIIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMIVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLL	479640	559261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_479754_481548_481649_514601_514759_517437_517516_521571_521649_527039_527108_528494_529347_530872_530958_536807_536972_537763_537849_538884_539049_539279_540616_542616_542781_551052_551144_551338_551507_552205_552349_556571_556743_557388_557473_557569_557642_557739_557810_558178_558388_559106
893746	contig_13740_pilon	-	2104	14	Intergenic	novelGene_34758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	328.889308909233	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	778	1344	745369	687607	TRUE	80	GAAACAAAAAAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873901	686466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_758391_758470_771284_771393_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
893747	contig_13481_pilon	-	3057	2	Intergenic	novelGene_119460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	2417	3055	1096654	1096016	FALSE	25	AAGGGCAGCCTGTGCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYKIISCANRGTLTPSLPIWMPFISFSSLIALARTSSTMLSKSGDKGHPCLVPVLKGRFHLLMEGKLKNCGHVFRHHRPTHEGQVEKEMWVGGRLGSMKAPPSGPGGVHRRERLRHPEGPGKCSQLLPQALLAGLVPIISAGRPWGPILRHRGWTRPLQTPGKGLLCCMLPFCPISPLSCAVRGEG	1099268	1096013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1098914_1099111
893748	contig_15952_pilon	+	5471	14	Intergenic	novelGene_154069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_13	240.488285337593	959	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1183	3552	567	4118	299094	347741	TRUE	0	TCTTTCTTTGTGCTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLNPSTKRKNTGSPDRKPSKKSKTDNSSLSSPLNPKLWCHVHLKKSLNGSPLKVKNSKNSRSPEEHLEEVMKMMSPNKLHANFHIPKKGPTAKKPGKHSDKPLKAKGRSKGILNGQKSTGNSKSPKKGLKTPKTKMKQMTLLDMAKGTQKMTRAPRNSGGTPRSSSKPHKHLPPAALHLIAYYKENKDREDKKSALSCVISKTARLLSNEDRARLPEELRSIVQKRYELLEHKKKWASMSEEQRKEYLKKKREELKEKLKEKAKERREKEMLERLEKQKRFEDQELTGKNLPAFRLVDTPEGLPNTLFGDVAMVVEFLSCYSGLLLPDAQYPITAVSLMEALSADKGGFLYLNRVLVILLQTLLQDEIAEDYGELGMKLSEIPLTLHSVSELVRLCLRRSDVQEESEGSDTDDNKDSAPFEDNEVQDEFLEKLETSEFFELTSEEKLQILTALCHRILMTYSVQDHMETRQQMSAELWKERLAVLKEENDKKRAEKQKRKELEARNKENGKEENGLGKTDRKKEIVKFEPQVDTEAEDMISAVKSRRLLAIQAKKEREIQEREMKVKLEREAEEERIRKHKAAAEKAFQEGIAKAKLVMRRTPIGTDRNHNRYWLFSDEVPGLFIEKGWVHDSIDYRFNHHCKDCTDSPDEDYCPRSKKANVGKNTSMNIQHGPAAEIAVETTIPKQGQNLWFLCDSQKELDELLNCLHPQGIRESQLKERLEKRYQDIIHSIHLARKPNLGLKSCDGNQELLNFLRSDLIEVATRLQKGGLGYVEETSEFEARVISLEKLKDFGECVIALQASVIKKFLQGFMAPKQKRRKLQSEDSAKTEEVDEEKKMAEEAKVASALEKWKTAIREAQTFSRMHVLLGMLDACIKWDMSAENARCKVCRKKGEDDKLILCDECNKAFHLFCLRPALYEVPDGEWQCPACQPATARRNSRGRNYTEESASEDSEDDESDSEEEEEDEEEEDYEVAGLRLRPRKTVRGKQGVIPAVARPGRRPGKKPHPTRRARPKAPPVDDTEVDELVLQTKRSSRRQSLELQKCEEILHKIVKYRFSWPFREPVTRDEAEDYYDVITHPMDFQTMQNKCSCAGYRSVQEFLTDMKQVFTNAELYNCRGSHVLDCTVKTEQCLVALLHKHLPGHPYVRRKRNKFPDRLPEDEGDSEPEPVGQSRGRRQKK	298527	349607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_300793_304019_304159_304720_304855_306883_306990_307702_307802_310218_310397_314817_315001_327535_327684_328687_328836_330661_330772_344969_345116_346376_346481_347383_347757_348269
893749	contig_610_pilon	-	3030	5	Intergenic	novelGene_76766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.37867541108654	63	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	1237	2103	229060	228011	FALSE	40	AAGGGCACAATCAGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	252614	227083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_228421_228603_229760_234998_235302_249279_249375_252475
893750	contig_7630_pilon	-	5579	1	Intergenic	novelGene_133633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1062	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	4849	5199	385035	384685	NA	45	ATAGTAAGAGGTTAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLPPGPLPCHPGQQRGEPRRLPHLGLLQFSLLMAWVRLGTSAQALSWEGQGAFSPSLDPHKLAVKLEAKRWPETQGISYYKRSPPFLWQPGSDGFFQPLGPEHLALDALPLTPL	389883	384304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_384300_389900
893751	contig_5947_pilon	+	3216	13	Intergenic	novelGene_101518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	319.420427841148	21	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	345	1832	509762	544234	FALSE	25	AATTTTTTTCTGTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGAYPPRYFYPFPVPPLLYQVELSVGGQQFNGKGRTRQAAKHDAAAKALRILQNEPLPERLEVNGRESEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFESFPLKQVARESGPPHMKSFVTKVSVGQFIGEGEGKSKKISKKNAAIAVLEELKKLPPLPTVERVKPRIKKKTKSIVKLHTGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPEYMLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGVGTNKKVAKRNAAENMLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPLSVCGRC	476323	545618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_476537_486781_486854_509702_509842_511128_511295_523233_523333_536175_536407_537648_537793_539875_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543545_543632_544218
893752	contig_7753_pilon	-	5549	17	Intergenic	novelGene_41500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	1500.8985212511	1048	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	61	1653	1266721	1230169	TRUE	40	AATTTTATGAAACTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSRLQPLAGLRTPRRRPRNMTRDFKPGDLIFAKMKGYPHWPARVDEVPDGAVKPPTNKLPIFFFGTHETAFLGPKDIFPYSENKEKYGKPNKRKGFNEGLWEIDNNPKVKFSSQQVSAKQSNASSDVEAEEKETSVSKEDTDHEEKASNEDVSKAIDVTTPKAARRGRKRKAEKQVETEEPGVVTTAVTSVNLKVSPKRGRPAATEVKIPKPRGRPKMVKQPCPSESEMVTEEDKSKKKGQEEKPPKKQLKKDEEGQKEEDKPRKEPDKKEGKKEVESKRKNLAKAGVTSTSDSEEEGDDQEGEKKRKGGRSFQTAHRRNMLKGQHEKEATDRKRKQEEQMETEQQNKDEGKKPEVKKVEKKRETSMDSRLQRIHAEIKNSLKIDNLDVNRCIEALDELASLQVTMQQAQKHTEMITTLKKIRRFKVSQVIMEKSTMLYNKFKNMFLVGEGDSVITQVLNKSLAEQRQHEEANKTKDQGKKGPNKKLEKEQTGSKTVNGGSDAQDSNQPQHNGDSNEESKDNHEASSKKKPSSEERETEISLKDSTLDN	1266781	1224008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1224401_1225505_1225708_1226866_1230230_1231006_1231119_1232454_1232669_1233234_1233337_1233554_1233626_1234220_1234277_1236889_1237009_1237955_1238185_1240520_1240597_1241690_1241788_1243639_1243703_1244402_1244508_1248046_1248186_1263202_1263280_1266649
893753	contig_9633_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_139624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTACAATTTCAGAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037254	1038842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1037300_1038800
893754	contig_16525_pilon	-	569	7	Intergenic	novelGene_133794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	46	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	31	459	97608	91591	FALSE	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKPLDRKAMSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97638	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
893755	contig_15047_pilon	+	1740	6	Intergenic	novelGene_52177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	1761	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	24	353	2194	3167	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYPRGRG	2170	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2810_3149_3498_4158_4434_4552_4687_21013
893756	contig_5033_pilon	-	2289	6	Intergenic	novelGene_28917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1559	junction_2	616.522635431985	776	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	596	1045	464569	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	465164	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547
893757	contig_14684_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_99664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAAGGCATTAAGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310943	308327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_308300_310900
893758	contig_10225_pilon	+	2293	13	Intergenic	novelGene_86822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	544.950934335683	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	1067	2179	42707	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTELKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20746	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39855_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46251_46724
893759	contig_10500_pilon	-	3099	5	Intergenic	novelGene_41154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	100.641380654282	916	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1403	2185	1238256	1236976	FALSE	40	AAAAAATTCATTACTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYYRILMRRDQVFKVCANHVITKTMELKPLNVSNNALVWTASDYADGEAKVEQLAVRFKTKEMADCFKKKFEECQQNLLKLQKGQVSLAAELSKETNPVVFFDVCADDEPLGRITMELFSNIVPHTAENFRALCTGEKGFGFKNSIFHRIIPDFICQGGDITKHDGTGGRSIYGENFEDENFDVKHTGPGLLSMASRGRDTNNSQFFITLKKAEHLDFKHVVFGFVKDGMDTVKKIESFGSPKGSVSQRISITECGQI	1241095	1236061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1237282_1237658_1237994_1238114_1238389_1239109_1240362_1241077
893760	contig_7728_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_64721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTGTTCATGAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746473	748758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_746500_748800
893761	contig_1339_pilon	+	399	5	Intergenic	novelGene_163132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3948.68100604493	82	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGGCCTCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430920	434175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431694_433729_433797_434046
893762	contig_8386_pilon	-	2950	2	Intergenic	novelGene_82227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	458	772	57535	57221	FALSE	60	AAAAAAAAAAAGGTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTRTLLAQIKKTENNTCWRGCGEIGTPMHCWWECKMVQPFWKMIWRFLKKPETEISHDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFTVALFTVAKR	58740	55042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_57846_58593
893763	contig_14142_pilon	-	3641	13	Intergenic	novelGene_120559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	172.022507409803	500	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	477	2531	447028	433555	FALSE	40	AAAAGTATTGTGCATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSDFPELLADVTQLLTNLSQLLANVSQLLANISQLLADVTQLFSHLPQLLTDISKLFTYISKLLANFPKLLTHQP	457324	432444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_433778_442870_442921_443005_443216_443747_443959_444068_444194_444641_444775_445000_445222_445364_445527_445868_446151_446345_446520_446613_446751_446901_447035_456854
893764	contig_6914_pilon	+	3430	2	Intergenic	novelGene_151715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	225	617	18277	18669	TRUE	40	GAAAACAAACACTTCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVRGSGWMLLLIHIVAGLVNPRSAGHRAGLLRTRCEHRQIPRSAGKTAGKLLTQVPGTGSQTNGSQLHDPEQAKAMSLARMSTQATHAQGNSLSADWLLTADPVMGVITTSHDCQTTENHSPAKLTQS	18052	21801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_20931_21249
893765	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5454	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
893766	contig_3956_pilon	+	1003	8	Intergenic	novelGene_14789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	229.134841327556	36	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	17	1003	1143555	1177138	FALSE	25	AGCAAGTGGTGCCCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGAPMLARRKPVLPALTINTAIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEARRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELSIGRYPIPLHPGPPWRAPSRKTLEHAPAPTPPTCQSAQLSGFRGRVAARLASLEPAYLGLRKKKRGERK	1143538	1177138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1143647_1147750_1147962_1156913_1157061_1163064_1163143_1164821_1164874_1165018_1165144_1166342_1166439_1176952
893767	contig_2799_pilon	+	5118	2	Intergenic	novelGene_85588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	40	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	64	345	780241	780522	FALSE	15	ATTGTTGCTGTGATTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGGEYTHPPAPGSEEWGLRFQKGIF	780177	786321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_780523_781548
893768	contig_6270_pilon	+	4055	6	Intergenic	novelGene_99862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	398	796	991173	991571	TRUE	15	TGAGGTTTCTCCGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYESGKIKIVRNEMEHIKINILGINKLKWTGISHFESDNHVVYYARNDNLKRNGIAFIIKKTISRSILKYNAVNDRIISICLQEGPVNTTLIQIYKLTTKAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCSQDALIITGD	990775	1082298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_991606_991662_992447_1055038_1056975_1058855_1059017_1061613_1061676_1082016
893769	contig_10042_pilon	+	4660	1	Intergenic	novelGene_79242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGATTTGTCTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197576	1202236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1197600_1202200
893770	contig_13760_pilon	-	876	3	Intergenic	novelGene_61300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	7	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	213	443	163312	161870	FALSE	5	TCTTTCTTCTGTCTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILYEKKLKPFLKSLNEGKEGPPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPAEGPEPWDNTEHGVEVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	164471	161436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411
893771	contig_6227_pilon	-	3719	7	Intergenic	novelGene_49780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.0713379977896	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	853	1674	1244038	1237069	TRUE	20	TACTTTGTATCTTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVMSEVLGQKPQGPRNNTWPNRDQSDGVFGMLGETLPFDPAVGSDPEFARYVAGVSQAMQQKRQAQHGRRSGNPRGNWLPMDDAHRTWPLPEFFMEGDGLSSGWSGAQGDSASSSDETSSANGDSLFSMFSGPDLVAAVKQRRKHSSGEQETNTLPSPPLLTTVEDMNQDNKTKTWPPKAPWQHSSPLPSTLPSPSTPLYAVASPSSQWNDTMQMLQSPVWAATSDCSAASFTYVQTPPQPPPPPAHKAAPKGFKAFPGKAERRPAYLPQY	1244943	1234791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1235057_1235288_1237378_1237900_1237980_1239862_1240001_1240778_1240945_1243908_1244204_1244256
893772	contig_4924_pilon	+	5566	3	Intergenic	novelGene_84641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCCCAGGTTAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60046	65934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_61489_61537_62876_63148
893773	contig_10752_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_153045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	356	727	217272	216901	NA	75	AAACAAAAAACAAAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYGEKIEVTKDFIVLESTINAHGSSRQEIKQHIALGKSTAKDLSKVLESKDVTLRTKMHLTQAMIFSIISSACESWAMNKEDQRIDAFELWCWQRILNTHTMECRKNEQVCLRRNSQNAPWK	217627	215216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_215200_217600
893774	contig_7457_pilon	-	2858	10	Intergenic	novelGene_31274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.2573309851517	693	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	312	1214	148885	146617	TRUE	35	AGCTGACTCAAAAATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNENSTNEPPMPQDRQITLHTLLEEQDRLKKRLEELQKLRKDPKNPSQDKLQVPFPMPEIPLVFRGRTQQGEEAPKCLLSNLRICYPLPGGSALVTFDDPKVAEQVLQKKEHKIDVAEECRLRVQVRPLELPMVTTIQVSSQISDRRVLVSGFPAGLKLSEEQLLDKLEIFFGKDSNGGGDVEIRELLQGGAMLGFTRDGVAQRLCQIGQFKVPLGGQQFLLRVSPYLSGEIQKAETCFQPAPCSVVVFNIPDILDGPELHDVLEIHFQKPTRGGGEVEALTVVPPGQRGLAVFTSASG	156096	144168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_144445_144699_144769_145317_146809_147049_147157_147268_147456_147556_147667_147747_147902_148240_148340_148831_149031_155930
893775	contig_2830_pilon	+	3547	1	Intergenic	novelGene_165856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5813	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1676	2128	705659	706111	NA	55	AAGGAGTAAAAGAGAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPSEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLEAHYLRKLTQSDVEKLNRPIKREETEKVIKTKTCNNNKKKSPASDDFTGEFYQTFREELTPVLLKPFQNIEKEATSLYEASITLIPKPGKDTTKKRKLQTNISHEYRCKNSSQ	703983	707530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_704000_707500
893776	contig_15144_pilon	+	4933	3	Intergenic	novelGene_177778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	715	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	C	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31702	36823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15144_pilon_+_32944_33073_34424_34481
893777	contig_14142_pilon	-	2211	10	Intergenic	novelGene_120519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	350.845891391324	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1013	1702	351273	349539	FALSE	5	CTGTTTGGGCTTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355506	349029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351810_352763_352904_353497_353631_353901_354071_355472
893778	contig_6954_pilon	-	2668	1	Intergenic	novelGene_64450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATACTAAGGGATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540275	537607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_537600_540300
893779	contig_1719_pilon	+	3620	18	Intergenic	novelGene_87271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2830	3129	364786	366401	TRUE	55	AAAATTAGCATAAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKGSIFSSGIVQIRSKAKGPRRVVNTNLQVTVPGCIYYGPFQLESINKRNQRSQTRKLNALINLCHLLQKAEDGVVLQLRDILLQLWFLLRLFPNPI	350569	371812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_351057_352093_352278_353049_353247_355119_355318_355437_355990_356640_356722_358420_358607_359047_359201_359739_359864_361990_362105_363207_363310_363712_364065_364686_364871_365091_365209_366303_366403_366800_366906_370006_370183_371603
893780	contig_2069_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_23368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCACCATCTAGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034165	1032650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1032600_1034200
893781	contig_1596_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_131605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141794	139451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_139500_141800
893782	contig_3277_pilon	-	2738	8	Intergenic	novelGene_74730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1756	2160	263633	258358	TRUE	20	CCCTCAGCACTTAGGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFLGLLTPEYQAAARLVLTTTSTGTRSARALLEARIVRRIPFPAAIKRPLGPLKLSIHPGKGSFQLAPTIDGLTIATFSFAPSCCTTYSANAFVYMYVLGLSPINFGVISFTRPSSIHLSKESISFLGSTGGG	265388	191005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_191075_240765_240962_250533_250710_258220_258403_261126_261307_262360_262407_262555_262673_263616
893783	contig_10225_pilon	+	2685	11	Intergenic	novelGene_86776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	474.704423826027	16	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	905	2569	42629	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20657	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
893784	contig_13592_pilon	+	4854	1	Intergenic	novelGene_33729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGAAAAAAAAATCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265412	270266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_265400_270300
893785	contig_10642_pilon	+	3607	1	Intergenic	novelGene_78694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	449	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTCAATGAATATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226085	229692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_226100_229700
893786	contig_9945_pilon	-	4374	5	Intergenic	novelGene_104803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	894	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGCTGCTGAATGATACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122881	40408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_42840_45614_45820_73299_73374_98552_98664_121328
893787	contig_8594_pilon	-	3001	3	Intergenic	novelGene_140054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_2	19.5	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACATTGATGTCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468755	460908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604
893788	scaffold_9100_pilon	-	2936	5	Intergenic	novelGene_83324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	162	junction_4	97.6534049585574	818	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	194	1981	869822	862779	FALSE	25	TTTTATCTTAAATTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRYSLAVGPPKKDPKVKGVQSAAVQAFLRRKEEELRRKSLEEKRRKEELVKKRIELKHDKKARAMAKRTKDNFHGYNGIPVEEKSKKRQAMESHTSQRTDQEYEMEEEDEFFEYNQAESEQEYEEEQEPPKVESKPKVPLKSAPPPMNFTDLLRLAEKKQYEPVEIKVVKKTEERPMTAEELREREFLERKHRKKKPETDARLPPTVSKKAPSQKESVGMKLSKGSGDKIPSSKGTPLPHAEKKPRPSTASEKHLVLSSSKSMSGERTKAGSGNCSQPSLREGHDRPVFNGAGKLHSSTYSPSVPKTSASRTQKSATEHKAKNSPSHPSHSRLGLMVTPNNKVKSPGVRQPGSSSSSALGRPSTGTARPTISSGSVSKRQDGSSSLGPERSTSGAKRPAGDSNPSSRTVSGTSGPGRPASSSSGPGRPISGSGGSGRPLGSSSGPGRPVSSLHDLRRPASGSGPPGRSVSGPGQSGSGSVSAGRTISRPVSSLRPGQTVNSSGAPIKPKCTVVSETISSKNIISRPSNGHMNGMKPPLSGYRSAQGPQRLPFSSGYKRQREYDEEDDDDEYDSEMEDFIEDEGEPQEEISKHIREIFGYDRNKYKDESDYALRYMESSWKEQQKEEAKSLRLGMQEDLEEMRREEEEMKCRKAKKLRRR	871836	861823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_862873_863856_863935_866860_867033_868378_869900_871720
893790	contig_16228_pilon	+	3742	8	Intergenic	novelGene_147927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	252.039355527453	558	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	63	1052	47816	71852	TRUE	10	TCCCACTTGTGGTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47753	75087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71853_72142_74547_74730_74893_74963
893791	contig_1964_pilon	+	2943	5	Intergenic	novelGene_130900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATAGTCATGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105567	112181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_106952_107515_108289_110613_110807_111341_111463_111709
893792	contig_177_pilon	+	1888	3	Intergenic	novelGene_41849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	361	765	418344	418748	TRUE	20	GTTATACTAGTTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	417753	420142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_417958_418187_419337_419607
893793	contig_19459_pilon	-	1171	8	Intergenic	novelGene_59854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7530.19177195701	38	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	106	648	16240	7861	TRUE	10	GTCTTCTTGTATTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKKLRENELHSQILTLLLSFLHLCITGPTLAL	19069	6667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10277_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
893794	contig_5020_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_27925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTTGAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136341	138367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_136968_137463
893795	contig_8377_pilon	-	4041	1	Intergenic	novelGene_35028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAACTTAAATAGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73192	69151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_69200_73200
893796	contig_4402_pilon	-	2806	2	Intergenic	novelGene_140863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1730	2029	613840	613541	TRUE	35	ACAAATTTCCTATGTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLRSFKMEQRNVCLNKCPSNNFHQTNFENLKLFVRCSLNLANIVFVYIYSVAKNFVLKLVTFLFRAFAFIFNTLYSLEYLQKTLMKTELLWVLFFLI	615569	612716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_613005_613051
893797	contig_12125_pilon	-	1519	1	Intergenic	novelGene_76259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTTCACAAAACGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680989	679470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_679500_681000
893798	contig_10904_pilon	-	3101	6	Intergenic	novelGene_22715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	360.429521543394	559	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	263	1294	662171	652299	FALSE	40	CTCATAAGTACATACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662743	650491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
893799	contig_610_pilon	+	5552	2	Intergenic	novelGene_76653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1039	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTGCACTGAAGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26384	32010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_30841_30914
893800	contig_7730_pilon	+	2285	2	Intergenic	novelGene_156295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	162	323	404511	404672	TRUE	50	CAGTCACAAAAGGAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHKESISPRDRKGHINQRLLQPETRRTRCPATANDHPDGEHNRESLLEQEKSGMQNSNSSEKTRLNGLTETGGTPETMASGLSVNPALKPFPRPTFQSKIRLDYGT	404349	489572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_406471_489408
893801	contig_11924_pilon	+	2471	9	Intergenic	novelGene_128017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	81	junction_2	190.409386257611	750	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	207	953	12009	64571	TRUE	10	CCTCTTGTATTTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIFMEAHCHIFSPAGQLLHNEEDNSESSATEQPSTSNATPQIVQTAPSTPVLETNSSPPPYSSITVEVPTTSDTEAYSEFYPVPPPYSVATSLPTYDEAEKAKAAAMAAAAAETSQTIQEEECPPRDDFSDADQLRVGNDGIFMLAFFMAFIFNWLGFCLSFCITNTIAGRYGAICGFGLSLIKWILIVRFSDYFTGYFNGQYWLWWIFLVLGLLLFFRGFVNYLKVRNMSESMAAAHRKRYFFLL	11008	72571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_11129_11922_12066_38813_38980_42072_42207_50560_50655_58636_58762_61408_61476_64467_64574_71055
893802	contig_1735_pilon	+	1612	8	Intergenic	novelGene_106894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_7	530.386228158696	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1152	1607	134293	139773	FALSE	5	CCTGTCCGGCTCGCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSQDHSDTDNEVAYSSLNFNAQLPKKPTSAFPSQTATETIYSEIKRK	127161	139778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137757_138447_138468_139653
893803	contig_12277_pilon	+	7336	14	Intergenic	novelGene_139709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_11	164.069872544971	649	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1145	3438	1460	4897	378343	421208	FALSE	30	AGGAGCATCAGCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSQLQLPLQYEWAPLKWYLHLDCIAICLLIDIYTCLASQRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRPPSKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVASFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACAADSRSSGSKLSTRNSSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNASGAESLVIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHTVDRDQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCLSPSTPVDDSCAPYPAPGTSPDDSPLSRLPKTRSFDNLTTACDNTVPLASRRSSDPSLNEKWQEQRRSLELSSLAGPGEESLDADSLGKPAKVLGGAELSVAAGVAEGQMENILQEASKEESGVEEPAHRGDIEMQEVKEEALLEKESRSKMPEGSAVVVYKESELDDAALRSHPGTNLSVFSQGIPEQQGVHSVLPSPLQEPCRGEGSQEIPVEQPQIGDIPEDREETVLPVSVDAKVGCGTSQSRSLLPLQVPLEARGPNVDSSMDMLMEDKVKPEDEPQGHHRPCVVNSGRLSDKDMPAQAMEPRASERSLAERPQVGSEVYRTSPGHTRSPTRSPCALPLAECKEGIVCNGAPETENKASEQPTGLSTPQKYPTPNGHCANGEAGRSKDFLSRQLSAVSCSSTHLHSRNLHHKWLHSYSGRPSVTSSPDQPSRSHLDDDGMPVYTDSIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLNSSLRFNGDFGDEVTSIPDSESNLDQNCLSRCSTEIFSEVSWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPASSSIDLELDKPIAATSN	376883	423647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_378632_389514_389612_392066_392181_403868_404075_404651_404784_405794_405907_408819_409016_409842_410029_412818_412990_414186_414333_415083_416501_417717_417829_418297_418387_421036
893804	contig_8377_pilon	-	2171	4	Intergenic	novelGene_35141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGGTTTGCAGTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194070	187448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_189270_191115_191253_192215_192350_193991
893805	contig_8357_pilon	+	3992	5	Intergenic	novelGene_39765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3435	3797	887778	891700	FALSE	25	ACAACATGGCGGGCCCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLKVDLVHHLVVGLELIELYFEVRRRQDVGQDHGVEVHGLLVAPQRQHIALLARDGRLGGAATAALLLLLSRGCGRLVLRLRVACQRGAVVSHVAAEGGKEKGGGRGPSSISLFGTTV	883651	891895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_884341_884645_887177_887255_887408_887715_887785_891344
893806	contig_7457_pilon	-	4028	9	Intergenic	novelGene_31257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.844964193619	627	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	77	862	26428	21912	TRUE	25	CAACTGATTTTCGACACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETFSQLGSLEEVNKSILSQDPAIGSKATSYSSTSSSKFFSSCVPCEGVAGGGFVTCPTCQGSGEIPQELEKQLVALIPYGDQRLKPRHTKLFVFLAVLICLVTSTLIIFFLFPRSITVQPAGLNSSSVAFDDVDIHLNTTNVLNISNRNYYPITVTQLAIDVLHLSLVVGQVSQSLFLPIGPLTSKQMFYTVTSSILDENTYKICTWQKIKVHHVLLHIQGTLTCSYLSHSEQLVFQSYEYVDCQGNSSVPHLLASHPP	27725	18513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_19958_20189_22033_22344_22399_22891_22936_23043_23185_23694_23849_25603_25668_26220_26448_27668
893807	contig_14142_pilon	-	2702	10	Intergenic	novelGene_120452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	162.412673591718	836	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	623	1471	100563	98719	FALSE	55	AAAGCAAAAAAAATCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRTEELAQAYDAFTLAPASTSR	101498	97487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98743_98845_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080
893808	contig_10042_pilon	+	1908	9	Intergenic	novelGene_79093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	273.987881803192	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	10	864	6321	49873	TRUE	85	TAAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSCPPSVPGG	6311	54077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_46928_49844_50060_53219
893809	contig_6208_pilon	-	2979	7	Intergenic	novelGene_52978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440.931463558177	2	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	344	859	383493	356816	FALSE	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYRANGPDGAVGRGQRIHLQLWDTAGQERFRSLTTAFFRDAMGFLLLFDLTNEQSFLNVRNWISNYKCTAYCENPDIVLCGNKSDLEDQRVVKEEEAKELAEKYGIPYFETSASNGANISQAIETLLDLIMKRMERCVDKSWIPEGVVRSNGHTSTHQLSEEKEKGTCGC	453190	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_357015_365092_365213_374159_374268_376173_376260_383490_383607_420587_420701_453073
893810	contig_5434_pilon	-	3263	3	Intergenic	novelGene_74679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1651	2025	339350	338976	FALSE	50	GGTTTTGAGATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGEEWESVYRWLPVVLSPAGSSVRLLPHTPHSLISDRSHRWLIRAALADGDLCMYLSLLSVLSQFLIPFSVWLSSLSLHLMLRVSGLTCDSDLVFLMFAVEGRRGAFDCGTMLPESLYPQNS	526177	337737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_340014_498296_499240_526133
893811	contig_8310_pilon	+	1811	6	Intergenic	novelGene_75552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	154.43522914154	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	103	492	272460	324814	FALSE	75	ACAAAAAAGGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215088	326133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279401_317844_317886_320576_320713_324739
893812	contig_19744_pilon	+	1888	1	Intergenic	novelGene_120348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTAAAACAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2413	4301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_2400_4300
893813	contig_4686_pilon	-	4595	30	Intergenic	novelGene_118522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_25	208.671011314795	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1253	3759	835	4593	491639	437544	FALSE	20	TCGCAGGGCCCAGCAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMKWESLHQEFSTKQKLLQNVLEQEQEQVLYSRPNRLLSGVPLYQGDGQAQAKSAVTSLLDGLNQAFEEVASQGGGTKRQNMHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERALQDLADLLETGQEKMAGDQKIIVSSKEEVHQLLGKHKEYFQGLESHMILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLESQLNHLGEHWLTNTSKVAKELHRLETILKHWTRYQSESAALIHWLQSAKDRLEFWSQQSVTVPQELEMVRDHLNAFLEFSKEVDAKSSLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQDLEDVIKAKEKEVETIEQNGLALIQNKKEDVSGVVKCTLQELTQTWENLDRMARQLKILLKSVLDQWSHYRAAFDEINSYLMEARYSLARFRLLTGSLEAVQVQVDNLQSLQDDLEKQEQSLQKFGSITNQLLKECHPPVTETLTNTLKEVNMRWNNLLEEIAEQLHSSKALLQLWQRYKDYSKQCASTVQQQEGQTNELLKAATNKDIADDEVATWIQDCNDLLKGLGTVKDSLFVLHELGEQLKQQVDASAASAIQSDQVSLSQHLCALEQALCKQQTTLQAGVLDYETFAKSLEGLEAWVVEAEEILQEQDPSHSSDLASIQERMEGLKGQMLKFSSMAPDLDHLNELGYRLPLSDKEIKRMQNLNRHWSLISSQTTERFSKLQSFLLQHQTFLEKCETWMEFLVQTEQKLAVEISGNYQHLLEQQRAHELFQAEMFSRQQILHSIIIDGQRLLEQGRVDDRDEFNLKLTLLSNQWQGV	511775	437541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_437596_441486_441582_443749_443898_444553_444709_447065_447213_447816_448000_450451_450657_451228_451363_453259_453431_455599_455756_460692_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464565_464977_465111_465975_466173_466705_466838_470300_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454_487587_491549_491682_495378_495486_496544_496677_506904_507097_509797_509972_511588
893814	contig_854_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_36748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTGGATGCTGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718448	1719825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1718400_1719800
893815	contig_8045_pilon	+	8597	9	Intergenic	novelGene_35442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_2	77.8426899265435	941	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	228	1844	452026	462377	FALSE	30	AAATAACTGTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	434910	469130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
893816	contig_14441_pilon	+	1721	9	Intergenic	novelGene_100357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	366.23788375863	549	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	518	1681	26678	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAHCSKNSSCSMEIQSTELGDSAVYFCASSLSTAVPLCSYERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	23048	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_25816_25950_26649_26781_26886_27094_31049_31145_122126_122188_125517_125902_126159_126283_126514
893817	contig_16907_pilon	-	2627	4	Intergenic	novelGene_87453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	54.168461508725	478	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCTTTGTACTTGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474506	448900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_449278_467610_467773_471189_471339_472567
893818	contig_3382_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_124174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTTTAGCGCACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946641	947070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_946600_947100
893819	contig_11378_pilon	-	3644	1	Intergenic	novelGene_112291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2786	3085	523319	523020	NA	50	AGACAATTTATAGCAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKVGKYQGNNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMKT	526104	522460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_522500_526100
893820	contig_12250_pilon	+	2894	6	Intergenic	novelGene_80609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	6	junction_1	48.5526518328299	492	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	815	2638	350196	354698	FALSE	50	TATTAAGAAAAAGAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGIIVMALLGMFNVHRHGAINSAAILLYALTCCISGYVSSHFYRQIGGERWVWNIILTTSLFSVPFFLTWSVVNSVHWANGSTQALPATTILLLLTVWLLVGFPLTVIGGIFGKNNASPFDAPCRTKNIAREIPPQPWYKSTVIHMTVGGFLPFSAISVELYYIFATVWGREQYTLYGILFFVFAILLSVGACISIALTYFQLSGEDYRWWWRSVLSVGSTGLFIFLYSVFYYARRSNMSGTVQTVEFFGYSLLTGYVFFLMLGTISFFSSLKFIRYIYVNLKMD	349078	354954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349876_350178_350544_351345_351968_352256_352443_353491_353766_354304
893821	contig_9091_pilon	-	7919	17	Intergenic	novelGene_32435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.6575439978873	796	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	100	690	119179	100303	TRUE	50	AAATTAAAATTGAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVLESVTLEPELEEALANASDAELCDIAAILGMHTLMSNQQYYQALGSSSIVNKEGLNSVIKPTQYKPVPDEEPNATDVEETLERVKNNDPKLEEVNLNNIRNIPIPTLKAYAEALKENSYVKKFSIVGTRSNDPVAYALAEMLKVNKVMKTLNVESNFISGAGILRLVEALPHNTSLVELKIDNQSQPLGNKVEMEIVSMLEKKTQRFSNSATTSPSRGPGCGRPMQ	129653	56059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_56306_56868_56958_66700_67233_72065_72281_73532_73848_75325_75446_80353_80480_81358_81466_85772_85893_86396_86553_87127_92313_100284_100432_113240_113385_116248_116357_118029_118161_119100_119191_129565
893822	contig_18420_pilon	+	1777	15	Intergenic	novelGene_109340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	59.1082110391179	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	960	816	1775	96447	103265	FALSE	25	AGAGAGTGGAGGCGAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVIYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKILLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKRMMIKQGLLDKHGKPTDSTPAAWVQEYVDYSDSVNKEVVAEAVETQKRKRESDSESDKETSPVVPQLVKKEKKKNKKDKKAKAALESGGELGDARKRESDSESDKETSQAVPQLVKKEKKNKKKDKKDKKAKAA	92252	103267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_92372_92926_93098_93509_93597_95283_95376_95506_95692_95969_96035_96350_96478_96700_96832_97407_97552_99557_99679_100625_100745_101208_101313_101706_101756_102633_102775_103145
893824	contig_6842_pilon	+	850	10	Intergenic	novelGene_130676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	520	junction_6	98.5747820404437	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	750	101	850	339874	371948	FALSE	65	TATCGAAAAATGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFIDLHEIGHGSFGAVYFATNARTNEVVAVKKMSYSGKQMHEKWQDILKEVKFLGQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITQGALQGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQ	335064	371948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343875_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855
893826	contig_4339_pilon	+	3749	15	Intergenic	novelGene_146076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	96.0013817927765	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	577	2382	1045769	1076107	FALSE	35	ATTTTGAAAAACCTGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVKVTIKTICALICGCPIVKPEYFTEFLQAVQSNKQPPQIESFYPPIDEPAIGNKNIDLSGRQERKQIFKGKTFVFLNAKQHKKLSSAVAFGGGETKLVTEENEEEDGFYLAPGTCVVDVGITNSQTLIPDSQKNCINSIMDLLKRQGLRPIPESEIGLAVIFMTTENYCDPRGQPSTGLRPTTPGPSLSQGLSFSEKLMSGVPVNTTVYVPNTESEQADTCMGFSERPKEMKSSRMEQKFRMLSQETSTVKEPPKTSCNNIISHTLVKMKVPDYQLSPAKFTGVSKGRDRASQQQQTNSIKNYFQPSTKKRGRDEENQEMSSSKSARIEMSCSLLEQTQPATLPTWKNEEQHPSQNEPVDKKSDNLFADTNLKSNVKNLTNKSLPTEKLISKRRKDIDDLAIEDEVLEQLLKNTKPELEIEMRVKKEEDVNIRKKPRLIIESNSIFNDEAIPKSNEVSQENEIGKKCETKEESLWSTKEELSNNHELQDDGEMLPKKVILTEFRSLVVSNSTSRNPSIVNNDYGQLKNFKKFKKVTFPGAGKLPHIIGGSDLIAHHARKNTELEEWLRQEMEVQNQHAKEESLADDLFRYNPNVKRRR	1037685	1077474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037995_1043334_1043469_1045635_1045796_1048186_1048291_1049800_1049919_1050550_1050745_1052479_1052578_1060595_1060726_1062166_1062437_1064441_1064884_1068673_1068746_1069966_1070123_1072078_1072193_1074868_1074919_1076076
893827	contig_13558_pilon	+	1793	2	Intergenic	novelGene_123013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_1	0	982	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	154	1113	40701	41660	FALSE	10	TGTTGTTAGTTGCTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36709	42340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655
893828	contig_16122_pilon	-	3164	2	Intergenic	novelGene_134564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	469	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCCCATCTTCCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548317	542932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_543712_545932
893829	contig_12312_pilon	-	2560	15	Intergenic	novelGene_63947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	844.955659384876	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	102	2099	326065	214297	FALSE	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTFPPTPSVC	326166	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214324_229445_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
893830	contig_4857_pilon	+	4076	1	Intergenic	novelGene_48867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGAAAGAAACTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355349	1359425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1355300_1359400
893831	contig_3410_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_58903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15492	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_13700_15500
893832	contig_9653_pilon	-	4298	1	Intergenic	novelGene_48264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATTCAAGCAAAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003886	999588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_999600_1003900
893833	contig_2730_pilon	+	2238	5	Intergenic	novelGene_135364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	482.661048252291	15	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	272	574	322752	390814	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGYGWTNRRYPAQLNFILVSENTASSPMASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL	291607	392478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_322657_322811_379343_379459_390685
893834	contig_14744_pilon	-	1388	6	Intergenic	novelGene_65983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_4	297.527544943321	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	2	1060	969810	960824	FALSE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	969811	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
893835	contig_17464_pilon	-	1149	3	Intergenic	novelGene_178514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	37	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	183	536	42890	42537	FALSE	25	TTACAGCTACTCTCGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSCEENEGKPQNMPKAEEDHPSEDVPQEADGNPQPSREGVSQEAQENFRGGLAQPGQRFKEDAPVRHLDPEEMIRGVDELERLREEIRRVRNKFVMMHWKQRHSRSRPYPVCFRP	44084	41923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17464_pilon_-_42933_43563_43598_43978
893836	contig_10324_pilon	+	4548	18	Intergenic	novelGene_7879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	142.092980913603	850	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	92	2692	538741	568878	FALSE	30	CCTGACTTCAGCACACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAGWGLCCAIALLFAAAGAAAGDKCGRNEFQCQDGRCISYKWVCDGSAECQDGSDEFQETCLSVTCKSGEFSCGGRVNRCISQFWRCDGQVDCENGSDEQDCAPKTCSQDEFRCRDGKCISQVFVCDSDRDCLDGSDEDACPVTTCSPAYFQCNISTCIPELWACDGDPDCEDHSDEWPQRCGGRNTSAPQGDSGPCSALEFHCLSGECIHSSWRCDGDPDCRDKSDEEDCAVATCRPDEFQCGDGTCIHGSQQCDKEYDCKDLSDELGCINVTLCEGPNKFKCHSGECITLDKVCNSVRDCRDWSDEPLKECGTNECLDNKGGCSHICNDLKIGYECLCPEGFRLVDQRRCEDIDECQDPNTCSQICMNLEGSYKCECHNGFQIEPHTKACKAIGTIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSVIPNLKNVVALDAEVASNRIYWSDLSQRKIYSTQIDRAHSFSSYDTVISRDLQAPDGLAVDWIHGHIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFKEKDSKPRAIVVDPTHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTEDIQWPNGITLDLSSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGRNRKTILEDENKLAHPFSLAIFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLVAGNLLSPEDIVLFHNLTQPRGVNWCEKTSLHNGGCQYLCLPAPRINPHSPKFTCACPDGMLLAKDMRSCLTEAEPAATTEGSSTARSTVRQTVSSVATEPKHTASPPAPSTSRQPTASPEFTTAEMATMSHQALGNIAGRGTEEKPGRVGALSIVLPIVLLVLLCFGAFLLWKNWRLKSINSINFDNPVYQKTTEDEVHICRSQDGYTYPARQMVSLEDDVA	538649	570734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_538808_549462_549586_550276_550400_551393_551781_554334_554458_555456_555580_556661_556782_556984_557111_559739_559912_559991_560220_562063_562183_563152_563293_563818_563961_564083_564237_565188_565372_567235_567314_567956_568115_568842
893837	contig_20527_pilon	+	3287	6	Intergenic	novelGene_138552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	1156.31528572444	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	722	1348	13527	27453	TRUE	40	CCCAGACTTGACACCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12805	29932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_28010
893838	contig_998_pilon	-	3382	2	Intergenic	novelGene_153778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	762	1151	303001	302380	FALSE	40	AACACTCCAACTAAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPWSSCADFLSIVYCLTLHQSYHCMYHHLFIHSSVDGHLGCFHLFAIVTNAAVNMDVHIFIRVTALISLECISRSGIAGSYGISISSFLSKCHIIFQNDCTILHSHQQCIRVLNSPQPLNICYFLFF	303762	300148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_302694_302925
893839	contig_11855_pilon	-	4316	1	Intergenic	novelGene_66918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	606	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1252	1602	811504	811154	NA	45	AAGAGTTCCAAGTACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEGVQNKTPDDLPVEEKALDLIDREFKSLIFRIIQGFKQKADKNEEKIDKFIEKADKFMEIQTINERIQENNTGTKCQNKFTSKKHTKTTIRNPKDKQQDFRNGQCHRRAKEQV	812755	808439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_808400_812800
893840	contig_10986_pilon	+	1678	3	Intergenic	novelGene_71509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25.5	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGGTGTCCGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172415	175055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_173328_174229_174586_174645
893841	contig_854_pilon	+	4001	1	Intergenic	novelGene_36108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	575	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2140	2526	100272	100658	NA	35	GTTAACTTCCCTAATAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKVEGQQKQGRPMRLTDTVAATMGSSIATIARMVQDRAVFCSVVQEVAMSQNRLDEPNNNNRKPNRNSKNEGTLKGAALEFHIYCQPCRPSILGIVLLLMHSLRSSFLHAPMILIYFPSPFPPVSP	98132	102133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_98100_102100
893842	contig_16228_pilon	+	4184	4	Intergenic	novelGene_147930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	184.420413427822	757	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	63	647	47816	79898	FALSE	40	TAAAAAGTTACAGGGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLVLPCHVQVF	47753	83435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69581_79864
893843	contig_5951_pilon	+	2718	3	Intergenic	novelGene_153233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_644_152736_153406_153604
893844	contig_15353_pilon	+	639	3	Intergenic	novelGene_151981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTATAATACTGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529341	537411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_529442_529718_529833_536986
893845	contig_2278_pilon	-	3893	5	Intergenic	novelGene_118085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	619	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2915	3388	662078	661605	TRUE	5	TGCCCGGGGCCGCGACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETILRRKQEFFCFPAYPDEAQIYHIPGTLLDILPFDRYPDVLGKKDNNKQKEQKFSRSRKKSSRFGGVRDVLSKNEVILEPKCRLAEVQATRGTVPGAGSGRRSEDSQDRSSSPVVVNSSSPRTGRARWTPPSDTRTWRGWEGVTSAFLLSLPGR	665063	637104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_637376_658554_658676_660062_660149_661577_664508_664578
893846	contig_7963_pilon	-	2386	11	Intergenic	novelGene_58458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	556.116318767935	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	463	1476	123041	120628	TRUE	5	TCCTCCTCTTCATCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126292	118256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123049_125837
893847	contig_3956_pilon	+	2812	13	Intergenic	novelGene_14847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1187.70296511095	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	84	1529	1281682	1288974	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRNPTRWSRTGRLSVRSRTCSASPSPRTSTTVCT	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
893848	contig_13224_pilon	-	7042	19	Intergenic	novelGene_104090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	2155	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2752	3066	255950	255636	TRUE	30	TACTTTCATCAGACAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDMSGRGHLHLDNIPSSQSNTPSFQCKASAAPITQMGAPGEGISGPVQFSPAVVVIGYAACSPRVSSFMRLKNPRTVADYQEAPKSRAEGPSSLVAPLGEVLP	258701	222613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_222658_227333_227457_228920_229023_231290_231447_233550_233687_236325_236414_237803_237869_238601_238713_239984_240077_240977_241095_242343_242436_245179_245318_246691_246823_247556_247693_247889_247992_249056_249165_250727_250851_251507_251615_253630
893850	contig_3449_pilon	-	4194	6	Intergenic	novelGene_73715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGCAGAACATTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532948	334345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_336548_475276_475789_475951_476220_495593_495719_531436_531551_531975
893851	SIRV6	+	1404	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	23	101	-14	34	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	235	726	1733	10736	TRUE	35	AGTCTAAAATTCTTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1110	11724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
893853	contig_10377_pilon	+	5844	11	Intergenic	novelGene_115355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	681.050519418347	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	183	926	219517	255047	TRUE	25	CTTTTAAGAAGTCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASREPAAGIPPRRRLSSPRPAPTYRLQDFDTLSTVGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	180503	261743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_180569_180908_180955_219445_219615_227487_227752_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_261069_261146
893854	contig_5023_pilon	+	7731	7	Intergenic	novelGene_7260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1736	junction_6	2034.72614182406	506	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	79	864	607279	616628	FALSE	35	AATTTACCCAGCCACACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEGTNKVSNVVHGLAFY	580850	623495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415
893855	contig_11422_pilon	-	286	1	Intergenic	novelGene_98952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_300
893856	contig_2069_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_23320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCTTGTTTTCTCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524138	525313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_524100_525300
893857	contig_6445_pilon	-	1564	15	Intergenic	novelGene_76942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	596.963387247732	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	143	805	88578	64923	TRUE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKPKPPTALTSLRSSSRKGSLCR	96433	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68054_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
893858	contig_12214_pilon	+	4014	3	Intergenic	novelGene_177328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	3534	4013	267313	267792	FALSE	5	AC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKRRIHHEDITIVNIYAPNDRAPKYIKQTLTALKRETDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTSKKKLSKDTEDLKGTISQLDLTDMYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQKAEIIQTIFSDHNAIKVEINKRKSKEKKSITWKLNNTMLT	13608	267793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12214_pilon_+_15596_120567_120886_266084
893859	contig_9051_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_170813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	2020	2349	1044795	1045124	NA	10	AGAGCTGGGCCTTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDTTPTSSKSRMDFALGYHLGWEGSSRDFQTALLTKMALPVRSESCGNSASCYVCPFQLYVAELKMQPRGGLCTHRGTCYLLPDSHKPSPDCGPGAICILDSKHYTHIQ	1042775	1045125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1042800_1045100
893860	contig_6825_pilon	-	2976	4	Intergenic	novelGene_155115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_2	33.2298393348843	548	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	232	1146	26633	24241	FALSE	40	TAAATCGTGTATAATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRWLEVLRTYLELVLCVLVSIRNNRNLQKFSLFGDISVLQQQGSLSNTYLSKADPDGKKIKQIQQLFEEILSNSRQMKWLSCGFMLEIVTPTSLSSLSNSIANTMEHLSLLDNNIPGNSTLITAVELERFVNLRSLALDFCDFTAEMARVLTDSNHMPLQRLSLLVHNVSVMHKSLDNMPNDEHWKALSRKSTSLRVYIMAFDIKSEDMLKILKPSIPLERIHFDSYITCVSGAIIDLISRQYDKFLSHFILMNDVIDTSGFPDLSDNRNEDPLVLLAWRCTKLSLLAIHGYTVWAHNLIAIARLRGPDLKVLEVTEESIDFDQGELADQDVDPVHNLIEQVSLGLGQPWHAVMDIESLSVFTEPNRHFYREMQSFSEGI	53707	22410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_24513_25990_26677_27243_27355_53630
893861	contig_8027_pilon	-	3832	10	Intergenic	novelGene_158827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_8	111.619835398199	1013	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	193	1887	256451	218475	FALSE	30	TGATTAGATTAGACTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEHCGTFSSAGISGGSGDSAMDSLQRLQPNYMSVCLFAEESYQKLAMETLEELDWCLDQLETIQTYRSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEYISNTFLDKQNDVEIPSPTQKDREKKKKQQLMTQISGVKKLMHSSSLNNTSISRFGVSTENEDHLAKELEDLNKWGLNIFNVAGYSHNRPLTCIMYAIFQERDLLKTFKISSDTFVTYMMTLEDHYHSDVAYHNSLHAADVAQSTHVLLSTPALDAVFTDLEILAAIFAAAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDESVLENHHLAVGFKLLQEEHCDIFQNLTKKQRQTLRKMVIDMVLATDMSKHMSLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYTDRIQVLRNMVHCADLSNPTKSLELYRQWTDRIMEEFFQQGDKERERGMEISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVQPDAQDILDTLEDNRNWYQSMIPQSPSPPLDEQNRDCQGLMEKFQFELTLEEEDSEGHEKEGEGHSYFSSTKTLCVIDPENRDSLEETDIEIATEDKSPIDT	256643	216529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_218841_221778_221962_222665_222789_222904_223060_225032_225133_227010_227176_227316_227416_228641_228821_234676_234771_256220
893862	contig_6283_pilon	-	2746	14	Intergenic	novelGene_100211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	173.818479757837	23	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	49	1848	641399	611758	FALSE	20	CTTGTCATGAATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLVARLIIHFRDIHPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQVSQSSLPMLPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	643987	610859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615121_615637_615664_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_643944
893863	contig_5643_pilon	+	917	5	Intergenic	novelGene_38932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	20.0546129356814	319	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	98	403	434173	438025	FALSE	5	CCTGTCTCCTGCTTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARFRPRPPSAVQGLSVPAPGPRLPASPGPGTMSEKSVEAAAELSAKDLKEKKEKVEEKASRKERKKEVVEEEENGAEEEEETAEDGEEEDEGEEEDEEEEEEDDEGPALKRAAEEEDEADPKRQKTENGASA	434075	438539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_434218_437168_437241_437505_437582_437736_437799_437974
893864	contig_8210_pilon	-	3739	9	Intergenic	novelGene_30216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1194.1657064139	26	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	541	1659	37758	15712	TRUE	50	AAAAAAAAACTAGTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	52631	13574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_14472_14528_15995_18144_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37636_37803_52135
893865	contig_8059_pilon	+	5598	16	Intergenic	novelGene_111089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_4	46.589269150739	725	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	430	1278	266127	341600	FALSE	35	TCGTATAAATATTCTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIN	90280	345920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_341596
893866	contig_1535_pilon	-	1988	8	Intergenic	novelGene_127217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_7	646.020281478556	366	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	799	1206	41781	40062	FALSE	25	ATGGGAATACTTAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52391	39279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_50216_50330_52240
893867	contig_12790_pilon	-	2710	3	Intergenic	novelGene_35280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1788	2105	429631	429314	FALSE	20	ATCTACTTGTAGTACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDLSLTPYTKTNSKWIKDLDIKPEMINIMEEKLGTTLGTLVHGMNSIQIITNNAQTPENKLDNWELLKIKLMLIQRIHQKRKKRTYRLGKKLWLQHIQLGSNL	485130	428708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_430998_484601_484920_485027
893868	contig_15518_pilon	+	2634	6	Intergenic	novelGene_127594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.218687358472	237	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	522	1070	15096	37386	TRUE	60	AAATAGTAAAAAGAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVYAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11266_11328_11422_14886_15202_15808_16139_37273_37389_38035
893869	contig_546_pilon	-	3512	1	Intergenic	novelGene_117235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATTGCTAGAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156141	152629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_152600_156100
893870	contig_15022_pilon	+	3860	11	Intergenic	novelGene_171818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	167.530325613007	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	823	1350	111402	113989	TRUE	25	ATATCTGTATATTTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAGGTPSALCGEGAADPARAGHRQLSGGEEAPVHGDHDALPGQPCR	109813	121816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112234_113609_113724_113973_114120_118370_118454_119220_120931_121229
893871	contig_18869_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_56225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCTAAGCATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74940	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73300_74900
893872	contig_15929_pilon	+	1445	7	Intergenic	novelGene_172466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	262.519628895737	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	871	1203	87373	92073	FALSE	15	TCCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKI	82321	92315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82703_83363_83512_83865_84057_84400_84489_87310_87623_89766_89844_92067
893874	contig_11056_pilon	-	4883	4	Intergenic	novelGene_130384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2357	2794	663102	650340	TRUE	25	CAGATATTTCTGCAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLFDVVLEDEPPRLEDTQSMTGEELPPQSRVNLNDMDGVKFSGPSFADVARLKMRRNSCKHPLIIRMWNVQSMNLGKLEVVKNEMEHLEIDILGISRLKWTDTGHFELDNHMVYYARNDSLKRNGVAFIIKKNISRSVLK	665458	464479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_464495_485524_486915_649655_650430_662754
893875	contig_9389_pilon	-	244	3	Intergenic	novelGene_84020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCTTACCCCCGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585788	584379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_584403_584804_584892_585654
893876	contig_3747_pilon	+	1977	6	Intergenic	novelGene_24815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4644.22791861037	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	330	944	201313	204173	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISKVFVEEIL	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202883_204144
893877	contig_1666_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_160586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATATTGTGACCCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714420	715633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_+_714400_715600
893878	contig_6842_pilon	-	3948	2	Intergenic	novelGene_130824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	909	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1990	2364	1776869	1776495	TRUE	35	CAAAGGAGCTGTATCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRVQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDREKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPI	1778858	1774710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1775814_1776013
893879	contig_21007_pilon	-	1128	3	Intergenic	novelGene_161527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1863	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564_735_928
893880	contig_16951_pilon	-	10274	1	Intergenic	novelGene_98660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1055	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	4209	4514	103355	103050	NA	30	GACCCTATAGGACAGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRGKVAPCLPPHSPAYPLSGAKCLVWPNASLLHLSLVLLLLFKKPVAVKLTLTHGSLICVRVELRSIEFSMSDFSEVDCQAFLLRCLGWTQTARLLVSS	107563	97289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_97300_107600
893881	contig_15500_pilon	+	2475	15	Intergenic	novelGene_128968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	131	junction_1	197.630556176655	641	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1965	509	2473	139535	255588	FALSE	40	CAAGTTACATACGTAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFSRMPKSEGCGSGGAAGGGASGAGASSGSGGSSVGVRVFAVGRYQVTLEESLAEGGFSTVFLVRTHGGIRCALKRMYVNNMSDLNICKREITIMKELSGHKNIVGYLDCAVNSISDNVWEVLILMEYCRAGQVVNQMNKKLQTGFTEPEVLQIFCDTCEAVARLHQCKTPIIHRDLKVENILLNDGGNYVLCDFGSATNKFLNPQKDGVNVVEEEIKKYTTLSYRAPEMINLYGGKPITTKADIWALGCLLYKLCFFTLPFGESQVAICDGTFTIPDNSRYSHNMHCLIRFMLEPDPERRPDIFQVSYFAFKFAKKDCPVSNINNSSIPTALPEPMTASEAAARKSQIKARITDTIGPTETSIAPRQRPKANSTTTTPSVLTIQSSATPVKVPAPGEFGNHRPKGALRPGNGPEILLGQGPPQQPPQQHRVLQQLQQGDWRLQQLHLQPPHSHQQQQQHQLLQDAYMQQLAAQQQQILHQQQFLMQSMYQQQPSASQYPAMMHQYQQAFLQQQMLGQHQQSQQQASPEYLTSPQEFSPALVSYTSSLPAQVGTIMESSYSANRSVADKEAVTNFTNQKNISNPPDMSGWNPFGEDNFSKLTEEELLDREFDLLRSNRFEERASSDKSVDPLSAPHNHPPEDPFGSVPFISHS	139026	255590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_139707_199432_199552_202724_202831_209319_209463_212672_212795_215034_215117_219045_219179_227721_227826_229528_229609_232914_233076_239354_239549_240602_240699_241303_241489_247127_247286_255478
893882	contig_14682_pilon	-	4455	4	Intergenic	novelGene_139101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	3489	4010	90861	90340	TRUE	50	AAACAAAGATGTGAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQKKTPDDSPLEENALEPHDRKLKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKITTRTYTKTTIRNPKGNNKISEMDDLIEGLRSRFEMVEDMISGIEDKHLGTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTMKRKNLRVIGIPEGGETRKHREDH	114387	89314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_89593_90172_91388_110882_112785_113327
893883	contig_4742_pilon	-	3664	3	Intergenic	novelGene_131014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1231	1605	284870	284496	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFQLQNEMLLLLILFATGAQFRYFALKHPPVQVLLVLFEKCVYFLLKLSFVEYLNYHSAEHMNFSLQKMTFHLHWFALLSAPCSVTGQEERVFLHSGNSLHLCFLTYLSADFVLLLAWDPFSG	286100	279754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_280672_283130_283326_283548
893884	contig_12313_pilon	-	1946	10	Intergenic	novelGene_171850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_9	51.2729322376526	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	310	1086	84299	73274	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	115449	72413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_115242
893885	contig_15350_pilon	-	4328	9	Intergenic	novelGene_164251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	88.5825003880563	748	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	437	1075	232656	228098	FALSE	5	GTTTTTGTGTGGTTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQFAEHLLGAGFVSSRDPQDPESNVNSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRPNLGKKRKMVKVYTKSDGLVSIHPKSVNVEQTDFRYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDDDQETIAVDEWIIFQSPARIAHLVKELRRELDVLLQEKIESPCPVDWKDTACRDCAVLSAIIDLIKTQEKAMPRKFPPRCRDECFS	240083	224844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_228284_228673_228827_229742_229864_232380_232472_232568_232669_235431_235516_236555_236617_236772_236951_239982
893886	contig_3426_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_57939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	845	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGAGAAAGAAGCATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366816	368321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_366800_368300
893887	contig_17603_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_152784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAAACCCACTGCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52598	54774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_52600_54800
893888	contig_6062_pilon	+	2933	7	Intergenic	novelGene_5311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_6	117.753980824429	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2314	2769	815981	822602	FALSE	50	AGCTGTTAAAAATTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	811780	822766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_813515_814664_814766_815502_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
893889	contig_2552_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_139015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTCTCAAAAAAAAAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228952	226861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_-_226900_229000
893890	contig_6871_pilon	-	3936	14	Intergenic	novelGene_21602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_5	128.84268652051	779	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	72	2183	445911	425563	TRUE	10	TGACTCCCTTCTCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRRRQRASQDTEDEESGASGSDSGGSLARGGGSCSGSAEGGGSGSLSSQRGGRAGALHLRRVESGGAKSAEESECESEDGIEGDAVLSDYESAEDSEGEEGEYSEDENSKVDLKSEANDAANSSTKEEKGEEKPDGKGTVTGERQSGDGQESTEPVENKVGKKGPKHLDDDEDRKNPAYIPRKGLFFEHDLRGQTQEEEVRPKGRQRKLWKDEGRWEHDKFREDEQAPKSRQELIALYGYDIRSAHNPDDIKPRRIRKPRFGSPPQRDPNWIGERPNKSHRHQGPGGTLPPRTFINRNAAGTGRMSTPRNYSRSGGFKEGRAGFRPVEAGGPHGGRSGETIKHETNYRSRRLEQTLVRDPSPEADAQVHGSPEKEEAASETPAPAPDTAPPAPDRPIEKKSYSRARRTRTKAGDAVKIAEELPPPPEGLTPAPPMPETTPPPPAKTGNWEAPVDSTTGGLEQDMAQLNITEQNWTPGQPSFLQPRELRGMPNHIHMGAGPPPQFNRMEEMGVQGGRAKRYSSQRQRPVPEPPAPPVHISIMEGHYYDPLQFQGPIYTHGDSSASLPPQGMIVQPEMHLPHPGLHPHQTPAPLPNPALYPPPVSMSPGQPPPQQLLAPTYFSAPGVMNFGNPSYPYAPGALPPPPPPHLYPNTQAPSQVYGGVTYYNPAQQQVQPKPSPPRRTPQPVTIKPPPPEVVSRGSS	445982	423330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_425044_425522_425587_425736_425860_427279_427495_427756_427856_428089_428205_428509_428575_429802_430489_430673_430851_431392_431545_431632_431792_444877_444916_445256_445285_445680
893892	contig_1435_pilon	-	5284	14	Intergenic	novelGene_115520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	262.19160526192	803	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	99	1748	625057	581903	FALSE	25	GGCAGGCTGTAATTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRLLFLLLINFSPSRHLRVPPPVPESPGALSAMRRLLLAPGGPWRGSFRRLPACSGCNPALLLLLLLFQGSCLGVSGAAASSRRPNVVLLLTDDQDEVLGGMTPLKKTKALIGYVPTALCCPSRASILTGKYPHNHHVVNNTLEGNCSSNSWQKIQEPNTFPAILSSVCGYQTFFAGKYLNEYGAPGAGGLEHVPLGWSYWYALEKNSKYYNYTLSINGKARKHGENYSVDYLTDVLANVSLDFLDYKSNSEPFFMMISTPAPHSPWTAAPQYQKSFQNVFAPRNKNFNIHGMNKHWLIRQAKTPMSNSSIQFLDNAFRGRWQTLLSVDDLVEKLIKRLEFNGELNNTYIFYTSDNGYHTGQFSLPIDKRQLYEFDIKVPLLVRGPGIKPNQTSKMLVANIDLGPTILDIAGYDLNRTQMDGMSFLPILRGASNVTWRSDILVEYQGEGHNVSDPTCPSVGPGVSQCFPDCVCEDSYNNTYACVRTTSALWNLQYCEFDDQEVFVEVYNLTADPDQITNIAKTIDPELLGKMNYRLMMLQSCSGPTCRTPGVFDPGYRFDPRLMFSSHGSVRTRRFSKHPL	625155	578366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_581982_589380_589542_591272_591384_592364_592473_595983_596086_605935_606040_607861_607981_609036_609120_611601_611770_613315_613415_613833_613900_615712_615920_618543_618577_624847
893893	contig_3465_pilon	+	5020	2	Intergenic	novelGene_173398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	889	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	11	490	784773	786168	FALSE	25	GTAAGTATGATTTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRMCWTVILAVLSQAVPGIRIVLAAAGQNEGNELASLTATPCPPAVETPPPTQEPPPWLGSLAWAGGWGAGLPRIQVVFTDQLCSQGRAPGIAQKRKLNAGCALGWGRSRVDLSLVISCAPQKNVGASGGGCPHQHRASPACASFLIDQWVTMKKALKRPI	784762	790698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_784788_785703
893894	contig_3956_pilon	+	2204	10	Intergenic	novelGene_15225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1283.99008688147	14	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	5	1189	1284120	1289507	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVGPRCRRSGHRGAV	1284115	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287567_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
893895	contig_10943_pilon	-	2889	2	Intergenic	novelGene_168268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAGTGACCATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62372	47377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_49096_61201
893897	contig_5590_pilon	+	3191	6	Intergenic	novelGene_163035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	348.608892600289	60	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	167	979	358785	364797	FALSE	40	GGAATAAAGATCACATCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSSTDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQPQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKKKEEVEETKKSKAKELPPKKTKKNNSSTTTSKKELAPMKSKPAAAYESEEEDRCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKKRKPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESTSESSSSDSEDSETGPA	355019	367009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_355174_358772_358983_359431_359629_360013_360310_361040_361152_364786
893898	contig_14415_pilon	-	2205	5	Intergenic	novelGene_77591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	257.619268495196	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	328	1611	19037	13005	FALSE	35	TGTTGTAATCCCAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	23824	12410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_13232_16940_17037_18076_19097_22156_22319_23718
893899	contig_7189_pilon	-	1962	11	Intergenic	novelGene_117653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.0768578798913	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	351	1313	537152	485813	FALSE	25	TGAACAATTATTTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIYIQEPPTNGKVLLKTTAGDIDIELWSKEAPKACRNFIQLCLEAYYDNTIFHRVVPGFIIQGGDPTGTGTGGDSIYGAPFKDEFHSRLRFNRRGLVAMANAGPHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKEKPEEEVKKLKPKGTKNFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDDGEDQSAEHDEYIDGDEKNLMRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRRWSSATAS	537502	485163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_485838_501927_502086_505132_505164_506157_506238_520885_520956_523229_523334_524020_524120_526777_526922_529072_529186_532684_532782_537110
893900	contig_5947_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_101605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980315	979872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_979900_980300
893901	contig_7272_pilon	-	2220	8	Intergenic	novelGene_25349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	335	junction_2	732.707392107504	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	365	1639	603574	593320	FALSE	20	GTATAGTTGCTGAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	603938	592738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503
893902	contig_11815_pilon	+	3716	2	Intergenic	novelGene_50888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	0	92	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAACTACCTCCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86438	90536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_88342_88723
893903	contig_11259_pilon	-	2181	8	Intergenic	novelGene_144528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	177.123616466591	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	183	467	153679	143798	TRUE	30	TTTATTCAGACTCATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLPLKL	155801	130598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_139870_139990_143646_143813_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716
893904	contig_8375_pilon	+	3839	6	Intergenic	novelGene_141285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	479.740596572773	108	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	871	2616	116	2731	156309	221694	FALSE	35	GATAAGCACCTAAGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLNGSHAEKTTDMPRPSIPKVHVQRSVSRDTIAIHFSASGEEEEEEEEELREYLEEGLDDESIVTGLEAKEDLYLGHDPIGPAASLIRADRLSVSQPPAILPVSANTVKLLESPPLAAQVLSTVPLALSPGSSSSGPLASSPSVSSLSEQKTSSSSPLSSPAKSPVLSSSVSSSALSSAKPFMSLVKSLSTEVEPKESPHPPRHRHLMKTLVKSLSTDTSRQESDTVSYKPPDSKLNLHLFKQFTQPRSTGGDSKTAPSSPLTSPSDTRSFFKVPEMEAKIEDTKRRLSEVIYEPFQILSKIIGEESGSHRPKALSSSASELCNLSSLNGHLESNNNYSIKEEECDSEGDCYGSDSNIPRSDHPKSADDPPREVELKSSQVSSLKDLGLKTSSLVLEKCSLSALVSKEDEEFFELYTEDFDLDTEGESKVDKPPDIPLKPEVLVDNGMALDSDDEVDSAEQPQELPVKTLGFFIMCVYAYLILPLPHYVSGLFLGIGLGFMTAVCMIWFFTPPSAHKYHRLHKNLQHWNTRSLDIKEPEILKGWMNEIYSYDPETYHATLTHSVFVRLEGGTLRLSKPNKNISRRASYNETKPEVTYVSQKIYDLSDSKIYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQRPFHCEVSFHASSDRCLDCLLQSFDSGQRRLQKYHHRLQKLRLTHTVAFLSLPVFVAAKEHIKSKAVQLEGFSLPSRLLQSFSLGSQCTTELFFFFTSTVNMCNCSPSHFQRMSVW	107041	222802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_107132_156283_157941_174313_174515_175721_176056_180330_180429_221343
893905	scaffold_12124_pilon	+	4608	3	Intergenic	novelGene_22124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.5	104	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	4021	4608	941551	942138	FALSE	20	CGTGTAGCAGGCCACCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSEASLTGLSPSAGARTALRRPPGPRLRAPRRAVALSEGMSSPAPAPGSEHALLPLEEGPAHRLQAVRLPTGARARRQRARGEEAVAARFQAVGAWAPVAQVPEHPQLELLGGEVVDEGVQAVVNAAEAERELVDVVEAAPEEEPAHHVDQQHEVVGCEAGDKGQYHDGRQVHRAPLLALPVAARGLQQLTDGG	936112	942138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_937109_938253_940258_940530
893907	SIRV6	+	983	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-7	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	228	722	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
893908	contig_12119_pilon	+	2580	9	Intergenic	novelGene_88683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	444.561230315915	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	58	2286	382573	424012	TRUE	25	CTGATTTAATTTATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGDTLLASYTQATHSESMTSEDRSQLDHMGFIFTTGIPIPSTETELDISLPTAASLPIPSQSTTVNPDIEEPKTEAKTLDDIFESSTLSDGQAIADQSEIISTLGHLERTQEEYEEKKYVGPSFQPEFSSGAEEALIDHTPYVSIGTIHLMAQRLTEAPTVMEGSNPPGYTDTTLAPSAFAKLSSQTPSSLVTVYLGSRASEHTEDLEPSALPGTDVGATQVSSGDSAKEAYENTEATFKPSLEKYFHITEPPSLSPNTELELSEDESKPKSLKEMEASPSELIAEERFEVHQKSRNKTDVQLSGETIKEFLSVRTPEAGTVVTAAGEIKLEGASQWPHSTSAPAIHGVKTGVVPQPSPQTSEKPTIPSSLEINPETQAALIRGEYSTVTASEQQVSAIILDSNTQATVSTAELNTELATPSFSLLGPSNESDFLIGINEESVEGTAVYLPGADRCKMNPCLNGGTCYPTDTSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCIDGFNTFTCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQIFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNPSAYQRTYSKKYFKNSSSAKDNSINSSKHDHRWSRRWQESRR	382515	425010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_383876_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556_423740_423884_424183_424886
893909	contig_16098_pilon	-	2476	11	Intergenic	novelGene_45933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1460.85428773714	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	196	1485	352350	348413	FALSE	15	CATCTTCGACTGCCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354184	347421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350342_350528_350643_350765_350889_352152_352352_353990
893910	contig_253_pilon	+	2567	1	Intergenic	novelGene_129696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	862	1287	488776	489201	NA	5	GCTCTGAGCCTTTCTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHPFGGNRTDLAGGSELWEEASLPRADLFLAPVAAGSVPSPSGSGPGAAAPFRPLFNDFGPPSMGYVQVSGTACLGMRAGSPPGARAHCPVLLGLGNEATRRSGLPEHLHGPPVCHRGDGQRDPAHLCWKQECHGAPEER	487914	490481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_487900_490500
893911	contig_4742_pilon	+	4330	11	Intergenic	novelGene_131007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_9	265.133947279484	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1102	3309	225	3533	267289	285679	FALSE	20	GCTTTAGTTCCTTCAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSEEKSEKITKESTTVTCTGEKASKLGTHEKQEIKKKKVDKGGVPNVHPSAASTSKPSADQIRQSVRHSLKDILMKRLTDSNLKVPEEKAAKVATKIEKELFSFFRDTDAKYKNKYRSLMFNLKDPKNSILFKKVLKGEVTPDHLIRMSPEELASKELAAWRRRENRHTIEMIEKEQREVERRPITKITHKGEIEIESDAPMKEQEAAMEIQEPTANKSLEKIEESEKQKEEIDSMSKDTTSQHRQHLFDLNCKICIGRMAPPVDDLSPKKVKVVVGVSRKHSDNEAESIADALSSTSNILASDFFEDEKQESPKSTFSPVSRPEMPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGLELHRPNLLLGLIIRQKLKRQHSASASTGHAAEAPESVPMSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPKAEKIDKIEEVADGEAKEVKVKVDNHSEATGNSVAVEEETSVPGSSSISPGLLTNLSLRGKPPDISTEAFLTNLSIQSKQEETGDSKERTLKRQLLQDQENNSQDNWTSDTGSPGRSNVGKGSTDGNMSCNDSLVANTRSPQFINLKRDPRQAAGRSQQISTSESKDGENCRNGEKHAPPGLSQNKEHLTEQTSVDEKSSSVEKNSCVQQSDNSSIPQNSASEENIHTFQTEQAKPVQEDVLMQNIETVHLLRRGSAVTTSHFEAGNTCQPDFPSKSINFTSRSTSPRTNANFSPVRPQQPNLQHLKSSPPAFPFPGPPNFPPQNIFGFPPHLPPPLLPPPGFGFPQNPMVPWPPVVHLAGQPQRMLGPLSQASRFIGPQNFYQVKDIRRPERRHSDPWGRQDQQQLDRAFNRGKGDRQRFYSDSHHLKRERHEKEWEQESERHRRRDRTQDKDRDRKSKEEGHKDKERARLSHGDRGADAKASRDGRNVDKKPDKPKSEDHEKDKEREKSKHREGEKDRDRYHKDRDHTDRAKSKR	263245	286476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_263327_267145_267297_267378_267536_268999_269117_270854_270987_271584_271721_276598_276795_278132_278281_280583_280674_283132_283329_283550
893912	contig_13021_pilon	+	5179	11	Intergenic	novelGene_8151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4139	junction_1	1952.10108344829	992	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	170	1390	174676	178735	FALSE	10	ATTCTCTCTCTCTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174506	182524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670
893913	contig_2917_pilon	-	4047	8	Intergenic	novelGene_147569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	228.046003235831	862	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	59	1108	124032	93080	TRUE	25	GAGGGTGTTGAGGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124090	75071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93004_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
893914	contig_14441_pilon	-	766	3	Intergenic	novelGene_100715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	FALSE	15	GCAGGGGGAGGGGCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	116576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_116961_117218_117343_117538
893915	contig_3009_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_132515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1337	1663	68341	98051	FALSE	50	TAAAAAAATTTTATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDNKGKREKRKKEMPPGIPPCTVVQIEEVAPKPRCTAEDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQLYWPKGDWRNPQSMAPRHPFSSVVKLPQRFTVQPGSGQPRKTK	67004	98503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_68461_97844
893916	contig_8330_pilon	-	2827	1	Intergenic	novelGene_71918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	572	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGCTAATGTTGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284504	1281677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1281700_1284500
893917	contig_2768_pilon	+	2787	13	Intergenic	novelGene_57510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.175027974693	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	82	1395	775814	792735	FALSE	5	TGTCTTGTGCTTCCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTPGSLSTSGILLDSERRKSDASSVISPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTVLIPYHILIVPSVIRRLVTISPNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFITAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI	771127	794127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_771183_775787_775922_778480_778634_779797_779883_781765_781851_782337_782467_786887_787010_788189_788221_789495_789537_790138_790222_790773_790898_791504_791674_792551
893918	contig_13300_pilon	+	2307	4	Intergenic	novelGene_125768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1089	1424	46526	46861	TRUE	25	ACCCCGCACACGGCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKRVHTAGPRRRTQPRQSQVLQLNLATQFREEESGVTSEAQERTLGTSQASLQDPARGVESQRFPLRGVCAWRWGRGRNDLAKLTRGSVGAPCFHTSPRPWLRLPLEFCN	45437	56064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_46903_46958_47625_49626_49763_56024
893919	contig_5352_pilon	-	3571	2	Intergenic	novelGene_177075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1566	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTGAGAATAATAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533782	516212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_517000_530998
893920	contig_501_pilon	+	6219	4	Intergenic	novelGene_134888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	467	junction_1	52.8961246217528	425	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	24	1157	721257	762255	FALSE	40	ATCCTATGACATTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGGGKMADFLPSRSVLSVCFPGCVLTTGEAEQQRKSKEIDKCLSREKTYVKRLVKILLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGQDFDQRAREEFRPTIYSNVIKGMRVLVDAREKLHIPWGDNSNQLNGDKMMAFDTRAPMAAQGMVETRVFLQYLPAIRALWADSGIQNAYDRRREFQLGESVKYFLDNLDKLGEQDYIPSQQDILLARRPTKGIHEYDFEIKNVPFKMVDVGGQRSERKRWFECFDSVTSILFLVSSSEFDQVLMEDRLTNRLTESLNIFETIVNNRVFSNVSIILFLNKTDLLEEKVQIVSIKDYFLEFEGDPHCLRDVQKFLVECFRNKRRDQQQKPLYHHFTTAINTENIRLVFRDVKDTILHDNLKQLMLQ	721233	767317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_721540_723922_724150_756265_756317_761682
893921	contig_5686_pilon	+	1975	3	Intergenic	novelGene_45240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1539	17	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAATTTAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93787	172679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170595_171199
893922	contig_14563_pilon	-	4649	30	Intergenic	novelGene_135029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	502.762676772816	48	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1245	3738	659	4396	158505	59430	TRUE	40	AATACATTAGTAAATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRNKDKSQEEDSSLHSNVSSHSASEEASGSESGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESSESLSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKREPSEDERDQGTSAESEPEQKKVKARRPIPRRTVPKPCVKKQPKPQRGKRRKQDSSDDEDEDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGLDEQQDNSETIEKVLDLRLGKKGATGASTTVYAVEANGDPSGDFDTEKDEGEVQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLEKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERIIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQSCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPTYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKSNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEVWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTVLENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVSTSATDELLSQFKVANFATMEDEEELEERPHKEWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETDDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCASAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKK	159503	58985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_59239_59429_59573_65265_65406_66607_66650_75198_75375_76341_76513_80680_80774_81216_81314_82383_82533_83281_83432_89281_89354_91431_91585_91924_92088_96551_96741_107765_107957_108805_108896_110642_110860_113623_113749_115997_116177_116346_116392_118159_118261_119825_120052_120931_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131745_133439_133527_136796_137029_158443_158575_158914
893923	contig_2215_pilon	-	1032	10	Intergenic	novelGene_163872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_7	203.76444885525	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	23	871	452573	325643	FALSE	20	TGAATTAGTCTCCTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQTTADAMRALLPLLRTGWGWPTGALAAALRLQGPCSRPGPRRAMAVYRTEEHGQPHSRDYRLFFKNVAGHYISPFHDIPLNVDSTEENGIPTKKARNAEYETWEDPHQKDKGTDCCGDNDPIDVCEIGSKIFSRGEVIHVKILGILALIDEGETDWKLIAINVNDPEASKIHDIDDVKKYKPGYLEATLDWFRHYKVPEGKPENKFAFNGEFKNKAFALEVIKSTHECWKALLMKKCDRGTINCTNVQIRDSPFRCTEEEARSLVELVPTSLHKESNEEEQVWHFLDK	452595	325481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_325672_326852_326890_338363_338434_345443_345530_355020_355149_382433_382561_410642_410730_433675_433721_437384_437450_452398
893924	contig_6513_pilon	+	3725	2	Intergenic	novelGene_117787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	640	junction_1	0	153	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1871	2185	262087	262401	FALSE	40	AAAGAACTGCTCAGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSNGFSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKDGTSS	259444	263941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_260517_261288
893925	contig_7056_pilon	-	1610	13	Intergenic	novelGene_43643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1203.40723457283	5	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	687	1403	725925	723226	TRUE	30	TGCTTACTCTAAGTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYANQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730454	722427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724534_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725995_726833_727080_728561_728706_728906_729063_730383
893926	contig_4232_pilon	+	1435	2	Intergenic	novelGene_63269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	53	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACCTCTGCGCTCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463713	468109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_463951_466911
893927	contig_10057_pilon	-	1740	5	Intergenic	novelGene_162334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	65	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	64936	35399	FALSE	50	AGCATTCCGCAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64958	34259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
893928	contig_5959_pilon	+	3980	12	Intergenic	novelGene_150206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	133.410569915915	774	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	292	1971	477198	515296	FALSE	45	CTAAGTACTTTGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDTLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMVEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRLGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF	407141	517305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_407326_477090_477337_485878_486054_492721_492889_498836_499045_501956_502128_504497_504616_506230_506412_507491_507632_510674_510774_511296_511432_515149
893929	contig_19402_pilon	-	1946	5	Intergenic	novelGene_80857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	622.921493849747	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	252	1388	171006	167101	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	174613	166542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174227_174542
893930	contig_10042_pilon	+	3507	3	Intergenic	novelGene_79187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	2777	3274	864168	944347	TRUE	5	TGACCCTCCGCCCCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPQLQTSSLKSEQQPYHYLDFSLAHLEVMLIVDKHAFQGTLHSIACPHQKHNSKSTFRQHLVHSDLLSPDAKDPSDVATAQARSAAPSSAGAGAQARAALLTPGVEKLLHLAKRKQQSKIPIVSRFKKKKKEERRPKDFFSDFSSEKSHPNPAVGVAAEEGCL	861391	944861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_864343_944024_944417_944697
893931	contig_8942_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_143204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTTTTATTTCCCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423441	425063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_423400_425100
893932	contig_1719_pilon	-	1599	12	Intergenic	novelGene_87383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	250.948547622255	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	223	1350	866135	847238	FALSE	25	CTCTGACTGCAAATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGHFVHPPPPPAPPGRSAVSGAGWGKRTREQDSVPFPLSPAGVRSPPPLPPHPLPSPALPSPLSRDLSVAPTMMEDDGQPRTLYVGNLSRDVTEVLILQLFSQIGPCKSCKMITEHTSNDPYCFVEFYEHRDAAAALAAMNGRKILGKEVKVNWATTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKSAFAPFGKISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVDYSQWGQWNQVYGNPQQYGQYMANGWQVPPYGVYGQPWNQQGFGVDQSPSAAWMGGFGAQPPQGQAPPPVIPPPNQAGYGMASYQTQ	866357	846988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848273_848617_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392_851469_853348_853437_853592_853648_853889_853989_859228_859326_866103
893933	contig_13244_pilon	-	3055	3	Intergenic	novelGene_87002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTAAGGAAGTCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476496	470408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_471867_471960_472128_475066
893934	contig_15114_pilon	+	3670	1	Intergenic	novelGene_121199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	190	573	893	1465	776353	776925	NA	15	TACCATGTTGACCGCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIPSRSKAQENTRSSPNPVLTSLTSTNPFTDRTAAPGNPFRADSQESEVASWSSKEGPVANSPSPSPQPLGPNKSKPSSSLDGFEDSFDLQSQSLDKSSNPKGWVTFEEEEDFSVKPKSKSACCPGSLSCSHLTFDDDWNKCTNVAFSVLPARRPPPPPLPPSGAAPPGDPFTAVAWKASPTLDFTER	775460	779130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_775500_779100
893935	contig_13456_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_153265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCTACACCACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26619	25599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_25600_26600
893936	contig_4091_pilon	+	5008	4	Intergenic	novelGene_172987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2542	2940	57287	57685	TRUE	45	TTTTTTTTTAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLIIQEAQRTPYRIEPKRKSPKHIIFTLAKTKDNQRILRAACEKQEVTCRGETIRISSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEINCQPRKIYPAKLLFKYDSEIRTFPDKQKLREYVKTKPKLQELLKGVL	10669	237612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_13145_57220_58145_61364_62187_236825
893937	contig_4213_pilon	-	1901	2	Intergenic	novelGene_124812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGGTCTGAGAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45642	43694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_44018_44064
893938	contig_15022_pilon	+	5292	33	Intergenic	novelGene_171803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	15	junction_3	271.782913643293	1009	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1136	3411	885	4295	94536	119275	TRUE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSQSRGRGAPASVMTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEDEDDHAYKGILNSGWHTGSLSLPLPSSPLIPELPPHPMDELSGGTTPITPVIQAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDAEYLQYFDSNKDTYSKRFVPVACISRVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDAERKEWMQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAVKPLQDRRAREEFSRRWCVLSDGILSYYENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPNTHSFEHTFEVYTEGERLYLFGLENAELAHEWVKCIAKAFVPPLAEELLARDFDRLGRLPYKAGLSLQRTQEGWFSLTGSELRAVFPEGPCEEALQLRKLQELSVQGDSENQVLVLVERRRTLYIQRERRLDFTGWLWAIQKAAASSGDTLSEQQLGESDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQISKTQRLLDSLRQDARSVRLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLAWLEASEIEDEEEKVSRYRELLARLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNHMNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSYLVVKKHQSMETMMLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQW	53219	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_53287_71582_71660_76979_77536_93727_93897_94520_94590_95301_95433_95600_95757_96127_96198_96524_96646_97088_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105950_107887_108024_108312_108416_109291_109488_109762_109815_109924_110089_110288_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_118370_118454_119220_119520_120780_120931_121229
893939	contig_826_pilon	-	2645	2	Intergenic	novelGene_154932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAATTGTAAAGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10110	7362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_8402_8504
893940	contig_5429_pilon	+	2717	14	Intergenic	novelGene_127805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	195.41962133411	29	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	290	1432	460515	498838	FALSE	35	ACCTTATAATGAATCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLVDTHIHAPQYSFAGSNLDLPLLEWLTKYTFPTEHKFQNIDFAEEVYTRVVRRTLKNGTTTACYFGTIHTDSSLLLAEITDKFGQRAFVGKVCMDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLINPKASDSPIDLFHGDIAGGISEAVIQKFLYLGDDRNIEEVYVAGKQVVPFSSSV	427809	500123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_428004_457962_458048_460504_460677_463724_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495718_497667_497696_498767
893941	contig_11337_pilon	+	2795	4	Intergenic	novelGene_107180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	498	junction_3	85.9470120998333	44	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1421	1900	168868	172617	FALSE	25	AGTCTGGTAATTTTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	167447	173512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_168892_169430_169674_171277_171383_172509
893942	contig_10602_pilon	-	1666	2	Intergenic	novelGene_159639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTCAGACTTCTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29798	27000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_28202_29333
893943	contig_9297_pilon	-	2948	7	Intergenic	novelGene_69868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1402	1965	911013	910033	TRUE	15	CTACAGCGCCGTCGCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRQGPFGLFYLTPEFLHSSVVFPNIFASLLFIELDKMFHDTLIKVFSTQVSISISGHDFKDTIVNGEKRHIEGSTTQVKHEDVLLTLPLIQAISNSSCCRLINDPHNIQSSNSSSIFGCLTLGIIEIGWYSNNCVGNLFSQISLSSFLHFSENHGRNFFRSKRLCLPTSNVNLNVWFGFLFNHLF	913133	908959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_909314_909403_910178_910504_910620_910709_911100_911206_911443_911697_911877_912233
893944	contig_15974_pilon	-	3441	1	Intergenic	novelGene_164828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1991	2518	341853	341326	NA	30	GTCGTATGCCTGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKELGKSKAQGIDGIPDEMFQQTDAVLEVLIHQCQEIWKTVTWPTDCKRSIFMLIPKKGDPTECRNNRIISLISHGSKTLLKIIQKRLQQYTDRELPEIQAGFRRGRGMRDITADVRWILAESREYQKDVYLCFTNYTNAFDYVDHNKLQRMGIPEHLIVFMRNLYTDQEAVV	343843	340402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_340400_343800
893945	contig_12969_pilon	-	2747	4	Intergenic	novelGene_61660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	47.1333804808817	649	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	267	1778	279414	269053	FALSE	45	AACCCTATAATCATAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQQKMIKAQESLTLEDVAVEFTWEEWQLLGPAQKDLYRDVMLENFSNLVSVGIQKVDRLPEHLEDESWVDGKEQCYEYNALENVVHWYKSHFPLRQIHGMFGLHEKAVKSNLSLINHNRSYEIKNFAEFNRDEKVYLHANHEKLHTEIKFCESEKSNSTKSQLIKHQKTHKIKKPYVCSDCGKAFIRKSWFINHQIIHTGEKPHRCSLCGKAFFKKYMLTEHQKSHTGEKPFECMECGKAFLYESLLNNHQKTHTGEKPHICTKCGKGFTQKGNLNIHQRIHTGEKPYVCGECGKAFSQKSSLIEHQRFHTEINPFLCNKCGKFYSQKSSLNRHQKIHTGEKHFKCDGCEKAFEEKPELIVHQRSHTGDTPYGCSECGKTFACPSSLLSHQRIHTNEKHVESIKGEDPSTSSHSKSHTGDLMQDKKPVNTLPVQMPSVAAQTSVNTSGFLTNGNIFLVGQPVARCEPSGDNGEIVQERNLMNAANVVVPLVINYVLFYVT	283535	268083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_270402_276639_276767_279378_279584_283438
893946	contig_14479_pilon	-	2011	3	Intergenic	novelGene_177989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2	43	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTCAACCTGTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37429	33773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14479_pilon_-_35544_36238_36416_37365
893947	contig_1443_pilon	-	8273	7	Intergenic	novelGene_28150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	966	141	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	5397	5696	256483	256184	TRUE	30	ACTGGTAGAAAATTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHHTESSAARWCPATTTDFSDWDHNRGFWTELQTDVEQNSNTHKKDEIYCPERDWRNPKSMAPSHPFSSVVKSLSRFTVQLGIGRPHKTKQD	330317	172934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_174740_240011_240349_255748_256906_259773_260701_323395_323906_323960_325234_328053
893948	contig_5222_pilon	-	3136	2	Intergenic	novelGene_58983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	412	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACCTCCCCCGCCTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163893	154944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_155435_161247
893949	contig_12654_pilon	-	2445	1	Intergenic	novelGene_129279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATAGTCCATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701731	699286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_699300_701700
893950	contig_5429_pilon	-	2628	14	Intergenic	novelGene_127804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1093	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCGGGCACTGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499901	427806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_428022_457958_458048_460504_460677_462742_462837_463722_463812_467273_467384_470447_470475_472132_472239_474438_474547_476954_477055_479553_479621_491571_491722_495584_495720_498735
893951	contig_11656_pilon	+	3781	22	Intergenic	novelGene_54005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	136.436092205237	558	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	164	2434	465719	536519	FALSE	40	CATTAATATTCCAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQAEEEEQNSLEQAS	464941	537866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
893952	contig_2043_pilon	+	4891	8	Intergenic	novelGene_169892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	552	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268302	509191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_269079_269133_270120_273454_274450_274577_274858_390605_391185_395564_395891_486022_486942_509161
893953	contig_8140_pilon	+	3657	3	Intergenic	novelGene_86434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_1	53.5	520	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAAATCTGTGGGAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187961	194165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_189459_191060_191119_192063
893954	contig_3627_pilon	+	4699	1	Intergenic	novelGene_78515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	643	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	132	341	622913	623122	NA	30	GCTTATCACAGCAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDQRQISLYIFKTSQKCCFPHLDSIGQIELKQTQKKKKNSFCSMYYSLERREEVKRERNQNNTKLDKILTFMSSPGRFRSLLQKEAKKETINELKNTEASKRKRHFALCSRP	622781	627480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_622800_627500
893955	contig_14519_pilon	-	2144	10	Intergenic	novelGene_66815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_8	130.169784664131	88	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	513	986	280959	270622	FALSE	75	CACCAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDVKPLGVIWGKFSEFYSKKNTIMFDDIGRNFLMNPQNGLKIRPFMKAHLNRDKDKELLKLTQYLKEIAKLDDFLELNHKYWERYLSKKQGQ	287178	269463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_283632_283842_287112
893956	contig_10603_pilon	+	1287	3	Intergenic	novelGene_173379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	100.5	185	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACTGAGTTGATGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179384	181352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_180254_180689_180759_181003
893957	contig_10575_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_141814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATAATGACAGGTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306656	308721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_306700_308700
893958	contig_15327_pilon	-	907	4	Intergenic	novelGene_70683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	44	454	901528	900904	FALSE	55	CAGTTTCCTAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902071	900450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
893959	contig_11855_pilon	-	1792	14	Intergenic	novelGene_66974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2034.09963217377	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	527	1708	1087425	1078618	TRUE	50	AAAGTGAAGATCGACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILSVGVVSGP	1102165	1077692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1078576_1078643_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090741_1091736_1091804_1101936
893960	contig_8020_pilon	-	3279	2	Intergenic	novelGene_114431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1078	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTGACCTGGTCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303368	280957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_281352_300483
893961	contig_9038_pilon	-	2148	15	Intergenic	novelGene_143319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_3	101.970408872939	22	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1974	173	2146	380869	349940	FALSE	65	GAAAAAAGAGAAAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVDFLERPIIAFVRLAPAVLLSGLTEVPVPTRFLFLLLGPAGKAPQYHEIGRSIATLMTDEIFHDVAYKAKDRNDLLSGIDEFLDQVTVLPPGEWDPSIRIEPPKSVPSQEKRKIPVFPNGSALTSGDPPKEAAHHAGPELQRTGRLFGGLILDIKRKAPFFLSDFKDALSLQCLASILFLYCACMSPVITFGGLLGEATEGRISAIESLFGASLTGIAYSLFAGQPLTILGSTGPVLVFEKILFKFCRDYHLSYLSLRTSIGLWTSFLCIVLVATDASSLVCYITRFTEEAFAALICIIFIYEALEKIFHLGEIYAFNMHNNLDELTTYSCVCIEPPNPSNETLELWKEKHVTARNISWGNLTVSECKTFHGVFVGSACSHHGPYIPDVLFWCVILFFTTFFLSSFLKQFKTKRYFPTKVRSTISDFAVFLTIVIMVVIDYLVGVPSPKLHVPEKFEPTYPNRGWIISPLGENPWWTLLIAAIPALLCTILIFMDQQITAVIINRKEHKLKKGAGYHLDLLMVGVMLGVCSVMGLPWFVAATVLSISHVNSLKVESECSAPGEQPKFLGIREQRVTGLIIFILMGLSVFMTSVLKFIPMPVLYGVFLYMGVSSLKGIQFFDRIKLFGMPAKHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKASSAAVVFPMMVLALVFVRKLMDLCFTKRELSWLDDLMPESKKKKEDDK	383226	349937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_350054_353248_353423_354823_354893_358381_358634_358811_358974_360920_361035_362372_362535_364926_365033_367342_367589_368599_368734_372219_372395_374589_374697_378299_378447_380857_380946_383130
893962	contig_14640_pilon	+	2418	1	Intergenic	novelGene_168042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGAGGTGCCTCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277037	279455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_277000_279500
893963	contig_10196_pilon	+	1120	9	Intergenic	novelGene_132155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	620	junction_4	223.494267264286	3	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	142	924	1038364	1050606	FALSE	0	CCTGTGGCCTCCTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034568	1050802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
893964	contig_1535_pilon	+	6713	6	Intergenic	novelGene_127220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	722	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	5871	6248	51764	52141	FALSE	10	GGTTTAGTGTGTACTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTELNNACNAHAIVLCTKNKFSQSVTREKPLLFFLRAKNWYDREYEPRMKKKLKNVIKMEATLKTVSAFLRTETRGTKVKPRPTLPAAGSGRKHCAEVNKLGGTALSSRGWEGGAEATPGRGYD	39412	52606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_40233_40592_40712_41661_41850_44499_44658_45799_45915_47293
893966	contig_20314_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_125652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTACTTGGAGTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23432	25529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_23400_25500
893967	contig_17964_pilon	-	3348	2	Intergenic	novelGene_33892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_1	0	92	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTAGCATATAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346566	339709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422
893968	contig_12965_pilon	+	2923	6	Intergenic	novelGene_65194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGAACGCTCGCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306100	315890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_+_308206_308853_308970_311951_312059_312888_313104_314852_314934_315591
893969	contig_15327_pilon	-	2309	3	Intergenic	novelGene_70817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	254	junction_1	51	964	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	284	856	1471091	1470519	FALSE	0	CTTGGGCTCTGCTGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNIYPAVPPHFCYLSQCSGRLNPNLYDNGKVCVSLLGTWIGKGTERWTSKSSLLQVLISIQGLILVNEPYYNEAGFDSDRGLQEGYENSRCYNEMALIRVVQSMTQLVRRPPEVFEQEIRQHFSTGGWRLVSRIESWLETHALLEKSQALPNGVPKDSSSPEPPAGAELSDSGRDEPEDGGLAPGEASQGSDSEGGAQGPASARRDHTEQTPEAAPATSVPPSVKPKKRRKSYRSFLPEKSGYPDIGFPLFPLSKGFIKSIRGVLTQFRAALVEAGMPESTEDK	1471741	1469065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1471190_1471464_1471523_1471614
893970	contig_20527_pilon	+	3824	4	Intergenic	novelGene_138553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1017.46187479761	32	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	722	1075	13527	28629	FALSE	65	TAATAAAATGGAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEGTRKLVIGNPRLSKDSVDVL	12805	31378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25530_28566
893971	contig_8059_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_111099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	495	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAAAAACAACAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190833	193307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_190800_193300
893972	contig_13854_pilon	+	4172	4	Intergenic	novelGene_154126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	438	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGCACCGTGAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757884	793277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_759174_759255_759612_790503_791705_791951
893973	contig_20889_pilon	-	3905	2	Intergenic	novelGene_127649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCTCTGACTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48979	44953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_45862_45982
893974	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
893975	contig_4742_pilon	-	2470	5	Intergenic	novelGene_130983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1120	1545	247753	247328	TRUE	10	CGCGGGAGGGGCGGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLDLSATSTAFFNSKLHSVASPTEVDKPSRFFSVLFGFVQAVSPESAAADPISSTIWSPSLDNFTVPFDSCSVFPFALISSTIILSILSEMESFCSCSSLPENLNNGLLTVLILHSIRMSFFFSSILTQVSERSGQLNS	254400	191296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_191446_201372_201642_242101_242264_246982_248765_254292
893976	contig_19778_pilon	+	2999	4	Intergenic	novelGene_143745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	311	junction_3	43.2768863123133	3186	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	262	780	9539	12720	FALSE	25	AACGTTCTTTGAATGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGGEL	5642	14939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480_10655_12474
893977	contig_10930_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_37077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCTTCTTATTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288975	287878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287900_289000
893978	contig_5423_pilon	-	6574	17	Intergenic	novelGene_85228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_1	189.102113618542	1020	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	3485	5605	532780	497362	FALSE	20	CAAGGGTTCAGCAGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWAQEDQNLQELMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	537567	496392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
893979	contig_14882_pilon	+	3763	4	Intergenic	novelGene_115000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	30.4302481094059	549	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	406	939	254706	264587	FALSE	50	AAAACTGAGCCAAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKASLEIEYQVLDGAGLDIDFHLASPDGKTLVLEQRKSDGVHTVETEVGDYMFCFDNTFSTISEKVIFFELILDNMGEQEQEQDWKKYITGTDMLDMKLEDILESINSIKSRLSKSGHIQTLLRAFEARDRNIQESNFDRVNFWSIVNLVVMVVVSAIQVYMLKSLFEDKRKSRT	254300	267411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_254742_257635_257734_261708_261890_264368
893980	contig_8354_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_24156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTAGCAGGAGCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562281	560540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_561899_562039
893981	contig_7843_pilon	-	3491	7	Intergenic	novelGene_152021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_5	27.2605738914075	559	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	40	990	214861	201305	FALSE	45	GAAGAAAACACTTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCCSSCRSFFAEMVAVLLLLIPLPFLLYIAAPQIRKMLTSGVCTSSVQLPGKVAVVTGANTGIGKETAKELAQRGARVYLACRDVQKGELVAKEIQTKTGNQQVLVRKLDLADTKSIRAFAKGFLEEEKQLHILINNAGLMMCPYSKTADGFEMHMGVNHLGHFLLTHLLLEKLKESAPSRVVNVSSLAHYLGRIHFHDLQSEKFYEAGLAYCNSKLANILFTQELARRLKGSGVTTYSVHPGTVKSELPRYSTFMTWMWWLFFFFLKTPQQGAQTSLYCALTEGLEILSGKHFSDCQVARVSAQARNETVARRLWDISCDLLGIPLD	214900	198803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_201408_207185_207376_208283_208494_209063_209169_211506_211663_213301_213421_214793
893982	contig_5686_pilon	+	5940	7	Intergenic	novelGene_45201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	633	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	4298	4615	241603	241920	TRUE	35	AAATGTCAGCAGTTCGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKVGYETMGIRLKAYLIFHHLSFLLSVVIKSALDSWRPQVL	48629	243764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_48918_49809_50962_229381_229487_229774_229995_230751_231199_239517_242563_243081
893983	contig_2332_pilon	+	1462	7	Intergenic	novelGene_58660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_4	1524.11205478979	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1064	1369	332930	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330768	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331303_331377_331494_332053_333048_333846_333928_334162_334280_334756
893984	contig_17964_pilon	-	5504	18	Intergenic	novelGene_33901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	245.154241399419	777	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	3474	5081	373501	347641	FALSE	30	TTTAGTAATTTATCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAASGLAGTTNGPFRPLGSQQPQPQPQQQPNNSLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSELYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRANSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPADQQNEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFARYEL	473128	347217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_347776_348928_349055_351505_351644_355604_355734_357565_357696_359050_359316_369423_369661_370784_371082_371986_372131_373494_373634_374249_374325_380107_380260_384030_384143_385000_385095_395548_397915_431364_431434_468569_468944_473029
893986	contig_6710_pilon	-	583	2	Intergenic	novelGene_92974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
893987	contig_6898_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_35733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCTAGCATTGCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61890	62917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_61900_62900
893988	contig_12106_pilon	+	2931	1	Intergenic	novelGene_83741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAAAATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154400	157331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_154400_157300
893989	contig_9098_pilon	-	3211	8	Intergenic	novelGene_75789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	558.457825495483	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2592	2957	267418	264388	FALSE	15	CTTGTAGTTTTTCTACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295261	264133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_287999_288160_289194_289280_290715_292905_295200
893990	contig_14744_pilon	-	5376	11	Intergenic	novelGene_66032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	509.819468047269	540	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	644	1279	1319720	1304013	TRUE	20	CCATTTTCTTATATTACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKRKGHEYTNIKYSLADQASGDQSPLPPCTPTPSCTEMREDNARVYENVGLMQQQKSFR	1344470	1299225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1303291_1303980_1304083_1306173_1306287_1313632_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319773_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215
893991	contig_15952_pilon	+	6077	19	Intergenic	novelGene_154061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_17	239.428950259199	905	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1304	3915	841	4755	265929	347741	TRUE	50	TGTTTATTATAAAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHHNTASLEKLVDSAWLEIMTKYAVGEECDFEVRKEKMLKVKIVKIHPLEKVDEEATEKKTDGACDSPSSDKENSSQIAQDHQKKETVIKEDDGRRESINDRARRSPRKLPTSLKKGEKKWAPPKFLPHKYDVKLQNEDKIISNVPADSLIRTERPPNKEILRYFIRHNALRAGTGENAPWVVEDELVKKYSLPSKFSDFLLDPYKYMTLNPSTKRKNTGSPDRKPSKKSKTDNSSLSSPLNPKLWCHVHLKKSLNGSPLKVKNSKNSRSPEEHLEEVMKMMSPNKLHANFHIPKKGPTAKKPGKHSDKPLKAKGRSKGILNGQKSTGNSKSPKKGLKTPKTKMKQMTLLDMAKGTQKMTRAPRNSGGTPRSSSKPHKHLPPAALHLIAYYKENKDREDKKSALSCVISKTARLLSNEDRARLPEELRSIVQKRYELLEHKKKWASMSEEQRKEYLKKKREELKEKLKEKAKERREKEMLERLEKQKRFEDQELTGKNLPAFRLVDTPEGLPNTLFGDVAMVVEFLSCYSGLLLPDAQYPITAVSLMEALSADKGGFLYLNRVLVILLQTLLQDEIAEDYGELGMKLSEIPLTLHSVSELVRLCLRRSDVQEESEGSDTDDNKDSAPFEDNEVQDEFLEKLETSEFFELTSEEKLQILTALCHRILMTYSVQDHMETRQQMSAELWKERLAVLKEENDKKRAEKQKRKELEARNKENGKEENGLGKTDRKKEIVKFEPQVDTEAEDMISAVKSRRLLAIQAKKEREIQEREMKVKLEREAEEERIRKHKAAAEKAFQEGIAKAKLVMRRTPIGTDRNHNRYWLFSDEVPGLFIEKGWVHDSIDYRFNHHCKDCTDSPDEDYCPRSKKANVGKNTSMNIQHGPAAEIAVETTIPKQGQNLWFLCDSQKELDELLNCLHPQGIRESQLKERLEKRYQDIIHSIHLARKPNLGLKSCDGNQELLNFLRSDLIEVATRLQKGGLGYVEETSEFEARVISLEKLKDFGECVIALQASVIKKFLQGFMAPKQKRRKLQSEDSAKTEEVDEEKKMAEEAKVASALEKWKTAIREAQTFSRMHVLLGMLDACIKWDMSAENARCKVCRKKGEDDKLILCDECNKAFHLFCLRPALYEVPDGEWQCPACQPATARRNSRGRNYTEESASEDSEDDESDSEEEEEDEEEEDYEVAGLRLRPRKTVRGKQGVIPAVARPGRRPGKKPHPTRRARPKAPPVDDTEVDELVLQTKRSSRRQSLELQKCEEILHKIVKYRFSWPFRKRNKFPDRLPEDEGDSEPEPVGQSRGRRQKK	263685	349576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_264480_265882_266028_281486_281689_287393_287516_290819_291018_299090_300793_304019_304159_304720_304855_306883_306990_307702_307802_310218_310397_314817_315001_327535_327684_328687_328836_330661_330772_344969_345116_346376_346481_347644_347757_348269
893992	contig_13888_pilon	-	4334	3	Intergenic	novelGene_151815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	333	881	364867	364319	TRUE	35	AAAGAGTTGCTGTCAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEVSVADRDAVWSLWQAPIGESQRRPLGFWSKALPSSADNYSPFEKQLLACYWALVETECLTTGHQVTIRPELPFMNWVLSDPQNHKVGRAQQHSIIKWKWYIRDWAQAGPKGTSKLHEEVDQMPMVSTPVTLPSISQCAPMALWGVPYDEMTEEEKTRAWFTDGCALKGGQRQHYSPFL	365199	360683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_361707_361809_364163_364241
893993	contig_6842_pilon	+	2022	17	Intergenic	novelGene_130657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	257.603377307053	393	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1536	486	2021	335003	393034	FALSE	40	AGAAGCAAGTGGCTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGVSKDPELADLFYKDDPEELFIDLHEIGHGSFGAVYFATNARTNEVVAVKKMSYSGKQMHEKWQDILKEVKFLGQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITQGALQGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLA	249452	393035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249600_255375_255452_311505_311579_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343875_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827
893994	contig_9363_pilon	+	2034	6	Intergenic	novelGene_6742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTACAATTTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504856	1544407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1505829_1505889_1506557_1538814_1538885_1539040_1539175_1543519_1543666_1544362
893995	contig_6557_pilon	-	2239	10	Intergenic	novelGene_32953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.975976119586	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	126	1163	364319	345035	TRUE	50	AGAAAAAAAGGGTTGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGAVNGFDPAPPPPGLGSSRPSSAPGMLPLSV	395170	343875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_344938_345020_345129_352014_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_395057
893996	contig_3747_pilon	+	2256	6	Intergenic	novelGene_24923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	114	854	202422	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202308	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
893997	contig_7707_pilon	-	2271	1	Intergenic	novelGene_72157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCCATTGAGTCTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237785	235514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_235500_237800
893998	contig_15327_pilon	-	1086	3	Intergenic	novelGene_70666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_2	1377.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	113	421	901528	901100	FALSE	80	AGAAAAAAGAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVRQKDGFV	902140	900434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901281_901400_901536_902035
893999	contig_10050_pilon	+	5496	4	Intergenic	novelGene_119618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.4277495608807	893	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	199	1599	194332	300728	TRUE	20	TGAAGCCTGGTGTCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGERASCPRRPSDRASVRGPCQQAPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRGRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTQQDDLGDGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLPSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPMQTLQDSKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQSNSRVLGQNVMMGPNSVMPTYGSQVPHNKMMTPNSHTHPGHAQQTSAVNGRALPHAVSTMPHTSGLNRLTPGKTPLQVPLPPPMQMNALGGYSSVSSCHGYGRMGVLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDSVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG	193402	305093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_193478_194208_194395_299390_300747_301214
894000	contig_8587_pilon	+	3992	2	Intergenic	novelGene_159151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1783	2097	515793	517382	FALSE	35	AAAAACGATCTTCTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVELDVPQDYGPPSPPPSNSVPQGVWKCLWSFHDLSLYKFSVSNSSMILSVFSVFSLYSGTLITCRFLLLIVSHIILRVSSFFFLLFSDFSSDLCPSVCLQFH	514010	519277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_515915_517189
894001	contig_1535_pilon	-	2272	8	Intergenic	novelGene_127249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	345.577304621394	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	156	1040	134839	129144	TRUE	0	TTGCTTTGCTGGGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVLTTDAQKLLHQLNALLEQESRCQPKVCGLRLIESAHDNGLRMSARLRDFEVKDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136147	127063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_134578_134840_135888_135944_136047
894002	contig_10930_pilon	-	3889	3	Intergenic	novelGene_37060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	98	junction_2	2428.5	62	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2246	2683	280415	279652	FALSE	45	AGGTAAGAAATAAAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRYFNSLGGLYKSSVIL	284680	278445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_279832_280157_281806_283825
894003	contig_11396_pilon	+	4298	2	Intergenic	novelGene_71330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	787	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAATTTTTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477271	482048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_480769_481247
894004	contig_7860_pilon	+	779	7	Intergenic	novelGene_147753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	142.254173928219	33	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	108	578	22810	92070	TRUE	20	GTAAATATCTCTCTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATSASDKPVCGELVSVAHALSLPAESYGNDPDIEMAWAMRAMQHAEVYYKLISSVDPQFLKLTKVDDQIYFEFRENFEKLRIDVLDPEELKSESAKEKWRPFCLKFDGIIEDFNYGTLLRLDCSQGYTEENTIFGEWLRACDGSYFWPRVLCSC	22702	113998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7860_pilon_+_22840_22927_22994_24606_24667_25168_25310_26911_27024_92008_92101_113827
894005	contig_3018_pilon	+	1335	2	Intergenic	novelGene_78922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGCCCAGCCATACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630519	632238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_631309_631692
894006	contig_753_pilon	+	4786	7	Intergenic	novelGene_113006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	3879	4370	1332772	1334432	TRUE	55	ATCACTGAAACAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPRLKASVSSQTCPAPFSLLASKFSLLLDSLFLLPIWGSRSLPLLLPKVRGLLLGLLFLLEGQLVPLFLDEEGEPFGLLMTFALSVDGLLLRSTSSSPAEFWASTFFTSVGIRGSERSSPCGVSAFRWQTAGSFGTKKALGSKLSRGNLTIFWDFIHRPFTN	1327444	1344591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1331030_1331524_1331619_1332572_1333000_1334168_1334456_1338037_1338225_1343513_1343637_1344508
894007	scaffold_4438_pilon	+	9267	6	Intergenic	novelGene_174536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	63.1176678910113	199	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	8539	9255	425376	426092	FALSE	55	AAAAAGAAGAAGGGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANSHQKRAEVAIPISDKIDFKTKSTIKDKECTPIMTKGMIQHEDITIINICPPNDGAPKYIKQTLTALEREIDSSTIIVGDFNTALSVKDRTSRKKLSKDTEYLKATISQLELIDIYRTLHPTAANYTFFYNAHGMFSRINHILGQNATLNKIQNTEIIQSIFSDHNVIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLKNHWVIDEIKKFLKSNESENTSHQNLWDTAKAVLRGQLQ	395350	426104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_413970_414114_416923_422598_422713_424621_425171
894008	contig_3747_pilon	+	3674	4	Intergenic	novelGene_24889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_3	1989.84125553327	152	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1529	2050	202819	203441	TRUE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTILSSNKSSSFLLLGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGEPDLMPFLPHSACCLGL	201111	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_203128_203228_203651_203768
894010	contig_10953_pilon	-	3958	4	Intergenic	novelGene_42531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCTGCCGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164079	154190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_155433_156486_156595_158743_158844_161571
894011	contig_17976_pilon	-	1518	4	Intergenic	novelGene_32512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGGACAGTCACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48865	41662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41855_45522_45583_46441_46791_47948
894012	contig_5727_pilon	+	3225	19	Intergenic	novelGene_7961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1015.22005307856	2	117	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	549	1262	173359	176277	TRUE	10	TGTAGTTGTGTGTGACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APQHYPKTTGNSEFLGKTPGQNAQKWIPARSTRRDDNSAANNSANEKERHDAIFRKVRGILNKLTPEKFDKLCLELLNVGVESKLILKGVILLIVDKALEEPKYSSLYAQLCLRLAEDAPNFDGPAAEGQPGQKQSTTFRRLLISKLQDEFENRTRNVDVYDKRENPLLPEEEEQRAIAKIKMLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQASAPDNYDSS	170312	180084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_176244_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178321_179257
894014	contig_12312_pilon	-	4808	21	Intergenic	novelGene_63968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	830.608692465953	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	974	2925	148	3072	278150	215798	FALSE	20	AGTTCTTCCAGTGTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTKQLQLKFEQMLDLHCAGLERLPGISRSRAKPGWHRNPY	324167	214061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215915_218250_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_324071
894015	contig_14986_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_59739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	540	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATAAATCTATTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171162	174563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_171200_174600
894016	scaffold_19766_pilon	+	2478	15	Intergenic	novelGene_34424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	138.503075925469	6	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	374	2209	845894	851417	FALSE	35	TGAGTAAAGCACCTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844362	851686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844446_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
894017	contig_17144_pilon	-	857	3	Intergenic	novelGene_29260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	119	562	166806	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183189	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166831_181790_181850_183154
894018	contig_15596_pilon	+	4458	16	Intergenic	novelGene_139514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	320.955074737883	61	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	347	2932	126064	157355	FALSE	20	TCTGGGCGAGACTTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVPARGLLTALAVVFGMAVAFAPVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLSLTAFKFLGKNEDGKGRCPFDPAQSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRHSSQSPLRTEYAIPWLNEPSFVFTDVIRRNPNDTEGEDDKVYFFFMEVSVEYEFMFKLMIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSNLVFNMLQDVFILRGPWLKEPVFYGVFTPQLNNVGLSAVCVYNLSSVEEVFSRGKYMQSATVEQSHTKWVRYNGAVPRPRPGACINSEARAANFTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSITPTDNRPRLIQKDVNYTQIVVDRVQALDETICDVMFISTDRGALHKAVSLENGVHVIEETQLFQDFSPVQTLLLSSKKGKRFVYAGSNSGMVQAPVAFCGKHSTCVDCVLARDPYCAWSPHTTACVTLHQEHGSGRGLIQDMSGDVSACPDKVQGSSQQHFFKHGGTAELKCSQKSNWARVVWKFQNGVLKADSPKYSLVGRKNLLIFNLSTGDSGVYQCLSEETVKNKTVSQELAKHVLEVKVVSSPPVAPTLLAVQTEGSRIATRVFAGATLGASPPKPAVRVTTPGAVMTPPSHLTPTSTPCQPKIVINTIPQIHSEKTMYLKSSDNRLLMFLFLFFFLLFLCLFSYNCYRGYLPSQCLKFRSAMLLGKKKSKSDFSDCEQTAKETLVEQGSSSQQNGEQPKPALDTGYETEQDTITSKLPTDREDSQRIDDLPIKDKPFDVKCELKYADSDADGD	15358	158881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_15415_55187_55261_125846_126164_128203_128350_136550_136614_138346_138446_141831_141926_142805_142920_144894_145047_148473_148650_148732_148890_150029_150253_151133_151250_154928_155102_155198_155243_156426
894019	contig_17427_pilon	-	1764	6	Intergenic	novelGene_30365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_5	801.027340357369	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	83	679	179819	178046	FALSE	25	ATACCAAACTTGCTTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	181329	176960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270
894020	contig_7691_pilon	+	4768	7	Intergenic	novelGene_178649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCACATAAATAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102601	241015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7691_pilon_+_102874_172805_173412_173524_173809_173845_175147_179194_181028_235039_235128_240631
894021	contig_9720_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_116773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232137	232965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_232100_233000
894022	contig_6576_pilon	+	2277	8	Intergenic	novelGene_42337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	486.419571974648	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	124	1023	667094	706237	TRUE	25	GCCTACAGATTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKESASQTRDVLKQHFNDLKGTLEKLLDERLVTLLQEVDTIEQETIKPLDDCQKLIEHGVNTAEDLVREGEIAILGGVGEQNEKLWSFTKKASHIQLDSLPEVPLLVDVPCLSAQLDDSILNIVKDHIFNHGTVASRPPVQIEELIEKPGGIIVRWCKVDDDFTAQDYRLQFRKCTSNHFEDVYVGSETEFIVLHIDPNVDYQFRVCARGDGRQEWSPWSIPQIGHSTLVPHEWTAGFEGYSLSSRRNIALRNDSESLGVLYSSAPTYFCGQTLTFRQVDVKIQKRQYRSVCRKTEWI	666970	709060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_667097_684676_684885_688932_689021_689512_689691_692096_692320_693449_693601_706188_706279_707847
894023	contig_14467_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_138283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATTCTGTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370357	368236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_368200_370400
894024	contig_2783_pilon	+	4187	2	Intergenic	novelGene_119645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	3476	4021	393123	393950	FALSE	10	ATTCTCCGTTCTCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKNKQERPPKKQKKKTYEKRNALRDPSAHLCKPRGKSPCHAAPPGQKGLPTQEKEKKTNNSKQTNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTRTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSRKKATLAANKWHSESQLVRAGVSRTRDCVRGKQRGPSRGEEG	389647	394116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_393649_393930
894025	contig_14744_pilon	-	1557	13	Intergenic	novelGene_66035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	103	junction_12	456.964622992488	171	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	270	1448	1345024	1304013	TRUE	25	GGAAGGTTTGCATTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKRKGHEYTNIKYSLADQASGDQSPLPPCTPTPSCTEMREDNARVYENVGLMQQQKSFR	1346662	1303213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1303291_1303980_1304083_1306173_1306287_1313632_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1346471
894026	contig_8377_pilon	+	2306	20	Intergenic	novelGene_34990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3656.36317577045	14	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	162	1559	131448	176351	TRUE	45	AATTGAACATTACAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERV	68115	180492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176346_176703_177253_177329_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
894027	contig_11825_pilon	+	2873	7	Intergenic	novelGene_155402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	793	junction_4	201.576632794798	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1062	1812	2873	31647	65127	FALSE	70	CAGGAAAAAAAAATACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMLRPDYWFLMCENVYDVSYSVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQL	29835	65127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051
894028	contig_11898_pilon	+	3021	7	Intergenic	novelGene_144304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	54.5863230733365	353	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	96	1868	346596	381031	FALSE	10	TTATGTGTTCGTGACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEETMECLQEFPEHHKMILDRLNEQREQDRFTDITLIVDGHHFKAHKAVLAACSKFFYKFFQEFTQEPLVEIEGVSKMAFRHLIEFTYTAKLMIQGEEEANDVWKAAEFLQMLEAIKALEVRNKENAAPLEENNAGKNEAKKRKIAETSNVITESLPSAESEPVEIEVEIAEGTIEVEEEGLETLEEVASSKQSIKYIQSTGSSDDSALALLADITSKYRQGDRKGQIKEEDGCAADPTSKQEHMKSHSTESFKCEICNKRYLRESAWKQHLNCYHLEEGGVSKKQRTGKKIHICQYCEKQFDHFGHFKEHLRKHTGEKPFECPNCHERFARNSTLKCHLTACQTGVGAKKGRKKLYECQVCNSVFNSWDQFKDHLVIHTGDKPNHCTLCDLWFMQGNELRRHLSDTHNISERLITEEVLSVETRVQTEPVTSMTIIEQVGKVHVLPLLQVQVDSAQVTVEQVHPDLLQDSQVHESHMSELPEQVQVSYLEVGRIQTEEGTEVHVEELHVERVNQMPMEVQTELLEADLDQVTPEIMNQEERKPCQADTAEDTREDHEDAEGIQTKPTVDSQAEKAGNEDRTAMPVLE	346500	382184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_346720_347820_347923_355150_355296_370825_371187_371288_371512_378807_378939_380344
894029	contig_6654_pilon	-	1080	2	Intergenic	novelGene_85684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	388	junction_1	0	735	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1017	62	1078	42803	6219	FALSE	35	GTAAGTAAATCTGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVNKVVYDDHESEEEEEEDMVSEEEEEEDGDAEETQDSEDEEEDEMEEDEDDSDYPEEMEDDDDDASYCTESSFRSHSTYSSTPGRRKPRVHRPRSPILEEKDIPPLDFPKSSEDLMVPNEHIMNVIAIYEVLRNFGTVLRLSPFRFEDFCAALVSQEQCTLMAEMHVVLLKAVLREEDTSNTTFGPADLKDSVNSTLYFIDGMTWPEVLRVYCESDKEYHHVLPYQEAEDYPYGPVENKIKVLQFLVDQFLTTNIAREELMSEGVIQYDDHCRVCHKLGDLLCCETCSAVYHLECVKPPLEEVPEDEWQCEVCVAHKVPGVTDCVAEIQKNKPYIRHEPIGYDRSRRKYWFLNRRLI	42864	6216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_7040_42607
894030	contig_3394_pilon	-	5746	25	Intergenic	novelGene_152682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1168	1521	543685	543332	TRUE	65	TGAAACAAACAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPCVLSAELPPVLGFCPPTLPLNPEEEVVLIWLMPGAEEDDETGGTEEPGAELLAAGFAELPLEVGLNALPAGGTADPEFEAKGPAFPGVACPCAAGGVWYLGGINRLLSSCRVAK	554761	431599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_431684_445592_445677_504424_504572_507351_507546_507933_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518600_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176_530385_534253_535191_538870_539051_540033_540257_542471_542663_543324_543750_544534_544755_545942_546132_549986_550211_550388_550532_553267_553427_554593
894031	contig_7840_pilon	+	5662	11	Intergenic	novelGene_68963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	409.631834700381	881	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	185	1543	238014	304863	FALSE	65	ATGAAGAAATAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVRVGVEVKGTKGTLLS	130658	308982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_304059_304306_304816
894032	contig_11378_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_112289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1653	2084	522190	521759	NA	75	AATAAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQITQIRNEMGDITTYPIEIKRIITEYYEKLYSKKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKTLPTKKSPGPDGFTGEFYKTVTEELVLVLLKLFQTIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKEN	523842	521590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_521600_523800
894033	contig_16211_pilon	-	5929	18	Intergenic	novelGene_150081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	940.545100728928	54	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1112	3339	55	3393	242940	180100	TRUE	15	GTTGTGTGGTTTATTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKNPQTCSPGDPCQDDVFISGQQNYSSATLSLKDVPPDSLMKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	242994	172936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_175451_180077_180208_182778_182899_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643_237708_242929
894034	contig_6199_pilon	-	5561	2	Intergenic	novelGene_126335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	77	808	87359	86628	TRUE	50	CGATAAAGATCATGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSVNRIQTKTNNTQTPEDKLDCWDLLKMRQLCSSKDFSKRVKREPTDWEKIFGHYRADRGLISKIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRQFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLARIQNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCRWECKMIQPFWKVIWYFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYTGEIRAVTRIDVCTPIFIATLFTIAKRWKQPRCPSTDELMNKLLYIHKLE	87435	77575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_78274_82572
894035	contig_7695_pilon	-	3727	20	Intergenic	novelGene_41635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_19	154.075259518094	728	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2229	6	2234	753900	716614	FALSE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMQHPNEGALVLGLHSNVKDVSVPVAEIKIYSLSSQPIDHEGIKSKLSDRSPDIDNYSEEEEESFSSEQEGSDDPLHGQDLFYEDEDLRKVKKTRRKLASTSAITRQPNIKQKFVALLKRFKVSDEVGFGLEHVSREQIREVEEDLDELYDSLEMYNPSDSGPEMEETESILSTPKPKLKPFFEGMSQSSSQTEIGSLNSKGSLGKDTTSPMELAALEKVKSTWIKNPDDSLTETDTLEITDQDMFGDISTSLIVPEKVKTPLKSSKPDLQGSASPSKVDVVHTPRQKRSTPLKERQLSKPLSERTNSSDSERSPDLGHSTQIPRKVVYDQLNQILVSDAALPENVILVNTADWQGQYVAELLQDQRKPVVCTCSTVEVQAVLSALLTRIQRYCNCNSTMPRPVKVAAVGGQSYLSSILRFFVKSLASKTSDWLSYMRFLIVPLGSHPVAKYLGSVDSRYSSTFLDAGWRDLFSRSEPPVAEQLDVVGRVMQYVNGASVTHQLPVAEAMLTCRHKFPDEDSYQKFIPFIGVVKVGLVEDSPSTTGDGDDSPVVSLTVPSTSPPSSSGMSRDATATPPSSPSMSSALAVMGSPNSPYGDVIGLQVDYWLGHPSERRRDGDKRDASSKNTLKSVFRSVQVSRLPHGGEAQLSGTMAMTVVTKEKNKKVPTIFLSKKPREKEVDSKSQVIEGISRLICSAKQQQTMLRVSIDGVEWSDIKFFQLAAQWPTHVKHFPVGLFSGSKAT	753905	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716730_716884_717005_718112_718340_720165_720302_720516_720560_724655_724699_725249_725353_726130_726242_726427_726583_727247_727355_727942_728048_739669_739806_739990_740107_743270_743352_748526_748621_748969_749131_750021_750082_753251_753333_753419_753512_753758
894036	contig_8269_pilon	+	2980	9	Intergenic	novelGene_106246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	422.226760757771	21	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1687	2502	344617	377795	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH	342930	378704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_377781_377904_378334
894037	contig_11258_pilon	-	5347	5	Intergenic	novelGene_67808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	170	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAGAAAACTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352883	303105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_303533_312245_313053_321104_321391_324569_325988_350474
894038	contig_3737_pilon	+	4197	4	Intergenic	novelGene_178337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	1209	2213	122930	238589	FALSE	40	TTGGAAGAATTCAGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEGRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLRETPARWRSRQKHHAVPPQQRSEKLSQTENQQP	121064	240573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_+_121327_121711_121833_122104_123836_238490
894040	contig_10549_pilon	+	2067	9	Intergenic	novelGene_110636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	105.992260920314	480	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	114	911	467993	487057	TRUE	20	TTAGCCTGAATTCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAKVDNLPEELVRSAEDVSTVPSQPGNQFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDESDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSMMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIDYVDSLKELHVFVAQCKDLAAVDVKKQRSDPYVKTYLLPDRGKMGKKKTVVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNISVWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLKWYPLKRKTAPVAIEAENRGEMKLALQYVPEPSPVPSFQIRVGKAARGRELWGKPPTLSSTTPWSMMGSGLKI	462832	489707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_462887_467933_468029_470941_471062_472637_472808_474650_474754_476851_477023_481782_481862_486938_487145_488638
894041	contig_17989_pilon	+	842	7	Intergenic	novelGene_150817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGCTACGGCCCCTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201141	206725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_201215_201544_201656_202346_202466_204531_204664_204858_205018_205678_205846_206644
894043	contig_9706_pilon	+	4564	23	Intergenic	novelGene_20901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	606.815303023474	721	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	222	2405	231608	737731	FALSE	20	CCAGCAATGGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNSRRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN	91313	739890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555638_688565_688730_698010_698124_709109_709218_717615_717699_731069_731148_737530
894044	contig_14945_pilon	-	5170	14	Intergenic	novelGene_178650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	637	junction_12	389.72941607156	1270	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	275	1693	45302	17288	TRUE	15	TTCTATTTTTTTAGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDMIIEKKIKKEAVLEEGTIAFKNWVKTGTEVYRQFWIFDVQNPEEVVVNSSNIKVKQRGPYTYRVRYLAKNNITHDPQSHTVSFLQPNAAVFEPSLSVGSENDSFTVINLAVAAAPHIYQNAFVQTILNSLIKKSKSSMFQTRTVKELLWGYKDPFLSLVPYPINTTVGVFFPYNNTADGVYKVFNGKDDISKVAIIDTYKGKKNLSYWPGYCDMINGTDAASFPPFVEKTRVLQFFSSDICRSVYAVFGSEINLKGIPVYRFVLPPKAFASPLQNPDNQCFCTETIVSKNCTSYGVLDIGKCKEGKPVYISLPHFLYASSDVMEPIEGLHPNEEEHRTYLDVEPTTGFTLQFAKRLQVNLLVKPARKIEALKGLKKNYIVPVLWLNETGTIGDEKAEKFRKQVTGKMRLLGLVEMVLLSVGVVMFVAFMISYCACRSKEVK	52411	11730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14945_pilon_-_15208_17287_17453_19060_19116_19860_19935_20276_20396_21362_21551_22695_22766_25622_25670_30038_30131_31394_31575_32034_32183_36257_36419_45182_45392_52226
894045	contig_20641_pilon	+	2868	5	Intergenic	novelGene_52864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	1870.89049652832	11	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	21	374	14659	25962	TRUE	30	ATAATATATCATTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKDVTDFISQLFVQLGTVGIYDLPPLRNKLGNH	14638	29319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_23896_23982_25951_25997_26859
894046	contig_21013_pilon	-	1209	8	Intergenic	novelGene_38522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	173	637	82218	69333	TRUE	40	GGATCGCAAATCATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPSPTVLVLIIEKFILWEDVMVAWDEPIRSNRSEEFEAAEGGPKAGCEPLKSSTAGWEALLKSSPLEAAGPDGAWLKALQSPKSPFPLAAVPWAGKLPDAAAEPKSANPPNKSADPPVDWLAPSNRSTRSPDDLPLGTEVLTEDCGVWVEAF	84099	58443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_-_58464_59401_59569_62439_62616_69123_69371_71482_71553_78663_78739_81936_82229_83937
894047	contig_18328_pilon	+	3270	9	Intergenic	novelGene_132548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	201.528185063529	475	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	79	1173	15119	31074	TRUE	10	CTTGCTCACATTTTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYSTAQECSLDDDTILIPIIVGAGLSGLIIVIVIAYLIGRRKSYAGYQTL	15040	33609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291_28457_30934_32076_32513
894048	contig_854_pilon	+	1635	5	Intergenic	novelGene_36188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	1286	1633	491503	509262	FALSE	20	GCGTCACCTCAGCTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWTLAVSSLCSMRYWMPLLGSMLNFLRPMHSSFFFWAIRLSSALSKQSIWANTSAISSFNFWMSSRSCFRCHLICCSSSVSPLLSSAGSGWHRSILKPVFQLPTDPAAAWDCLAV	490217	509264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_491558_493131_493199_495175_495241_497489_497571_509182
894049	contig_91_pilon	+	3590	18	Intergenic	novelGene_127141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	3256	3588	1224566	1224898	FALSE	5	ACTTCCGCTTCCTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPRPHSCRRCLPDARPRRLRPRLCHSARHTDSRPVKCRRLRGQRCSQVVPTGERGAGILREPRAPALLPAPPASRTRAQKGRAVSLSLMYRTDENFPESAAFTHRPLHV	1198520	1224900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1199404_1200354_1200517_1200619_1200741_1201048_1201159_1202404_1202531_1203297_1203433_1206080_1206214_1207929_1208138_1210194_1210330_1210592_1210700_1212325_1212553_1213433_1213679_1214072_1214209_1215818_1215917_1217852_1217969_1219020_1219171_1221436_1221493_1224458
894050	contig_14687_pilon	+	1915	4	Intergenic	novelGene_107886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	17.7951304200522	378	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	171	1028	375685	405666	FALSE	45	AACAGATGCAGTCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPLNLAHQQSRRADRLLAAGKYEEAISCHKKAAAYLSEAMKLTQSEQAHLSLELQRDSHMKQLLLIQERWKRAKREERLKAQQNTDKDIAAHLQTSHKPSAEDTEGQSPLLLQKYSPYTEKHLPENQRAFDRDPDTLLFLLQQKSEPTEPCIGSKAPKDDKTIIEEQATKIADLKRHVEFLVAENERLRKENKQLKAEKARLLKGPIEKELDVDADFVEKSELWSLPPHSETPTASSTWQKFATNTGKAKDIPIPNLPPLDFPSPELPLMELSEDLLKGLMNN	375514	406553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_375706_391200_391286_403751_403793_404955
894051	contig_6361_pilon	-	2853	5	Intergenic	novelGene_23986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	45	TCAGCATACAGATTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	408759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
894052	contig_3095_pilon	+	1634	6	Intergenic	novelGene_75158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1641.91529623181	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	45	758	220513	226800	TRUE	15	CCTATTTGTGGTATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVTNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220468	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226222_226275_226409_226645_226824_227001
894054	SIRV6	+	1305	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	393	112	177	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	147	638	1733	10736	TRUE	35	GCGGTCTTCAAAGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1480	11713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894055	contig_9073_pilon	+	5783	7	Intergenic	novelGene_177395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	224	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	4913	5575	381529	382191	FALSE	15	CGGAGGCTTCTTTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKDKKRKREKTKQTKKKCTQGSHCAIAQTEGVAPKPCSTAWLEGAPKSRKEKEDKQTVQNRTNQNRCPGNPTSREAWARKQFHSRPAFHSLLGRSKDGTRSQVFERKEEEVVRGMEETKRNRKKQHQQPTNGTKGAGQCSRVESKQRRGDAGASCPRDCGRRKQRNPNGGEEVWGVGKHILLVTSCSVSSWELCEAAFPYSLLANLRQECKVGDPRCGS	7728	382399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_+_9570_14273_14315_200640_201862_316437_317275_321505_322120_375805_376036_381400
894056	contig_10793_pilon	+	1760	4	Intergenic	novelGene_83443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1625	junction_3	1157.86710041447	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGGTGATATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164791	168751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_164820_165325_165377_166401_166473_167141
894057	contig_14441_pilon	+	1317	6	Intergenic	novelGene_100511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	481	1281	121136	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	108177	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_120686_120819_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
894058	contig_3747_pilon	+	2741	8	Intergenic	novelGene_24780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	3	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	332	1474	201313	203939	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPSDFPM	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203634_203919
894059	contig_2036_pilon	-	3096	2	Intergenic	novelGene_131825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACCTGGCTTTTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661552	614099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617097_661453
894061	contig_9058_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_149363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	345.976426220053	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	25	636	41923	56354	FALSE	10	CCCCAGTGTCTGCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNISHHQHYWRRHHPYHLCGTAHFLYQQEEKTEHQEK	41898	57251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47397_51854_51961_56353
894062	contig_3394_pilon	+	3804	16	Intergenic	novelGene_152681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	371	junction_10	159.775870796841	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1237	3711	94	3804	445602	539050	FALSE	15	GGTAGACCACTTTCCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEEGLWENGLSYECRTLLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTSVEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQYFYPMVLKKKEELKEEEELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSGASAGGHITVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQVLIGESGGTQSAVSHLGSQEGGMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKRSQVSTPTLEEEPANSPATWDFVDPTQRVSCSCSRHKLLRRCAAGPNRPPTISQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTTERQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTVLVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSDKRWHSYCLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKMEVNSESTALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQMQPLHFLDPLPLTQQPGDSLGEVNDPYTFEDGDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKSEDGFGTKDVTTPGHSTPVPDGKNAMSIFSSATKTDVRQDNAAGRAGSGSLTQVTDLAPSLHDLDNIFDNSDDDELGAVSPALRSSKMPTVGTEDRPLGKDGRTAVPYPPTVADLQRMFPTPPSLEQHPAFSPVMNYKDGISSETVTALGMMESPMVSMVPTQLTEFRMEVEDGLGSPKPEEIKDFSYVHKVPTFQPFVGSSMFAPLKILPSQCLLPLKIPDACLFRPSWAIPPKIEQLPMPPAATFIRDGYNNVPSVGSLADPDYLNTPQMNTPVTLNSAAPASNSGAGVLPSPATPRFSVPTPRTPRTPRTPRGGGTASGQGSVKYDSTDQGSPASTPSTTRPLNSVEPATMQPIPEAHSLYVTLILSDSVMNIFKDRNFDSCCICACNMNIKGADVGLYIPDSSNEDQYRCTCGFSAIVNRKLGYNSGLFLEDELDIFGKNSDIGQAAERRLMLCQTTFLPQLEGARKSQEPPISLLLLLQNQHTQPFASLSFLDYISSNSRQALPCVSWSYDRVQADNNDYWTECFTALEQGRQYVDNPTGGKVDEALVRSATAHSWPHSNVLDISMLSSQDVVRMLLSLQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQHVQGPLTWQQFHKMAGRGTY	431599	539050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_431686_445594_445679_504426_504573_507352_507548_507935_508125_511666_511833_513965_514071_517869_518602_519404_519631_520629_520736_521052_521178_524130_524231_529371_529593_530178_530385_534253_535192_538871
894063	contig_1090_pilon	+	2279	6	Intergenic	novelGene_131160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	179.467657253334	479	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	230	775	887944	897591	FALSE	45	AGTAATTACTGAAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGFFSSIFSSLFGTREMRILILGLDGAGKTTILYRLQVGEVVTTIPTIGFNVETVTYKNLKFQVWDLGGQTSIRPYWRCYYSNTDAVIYVVDSCDRDRIGISKSELVAMLEEEELRKAILVVFANKQDMEQAMTPSEMANSLGLPALKDRKWQIFKTSATKGTGLDEAMEWLVETLKSRQ	887714	899095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_887948_891823_891962_893773_893856_895637_895750_896230_896410_897560
894064	contig_5260_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_144359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAATCGTCCCAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140555	138443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_138400_140600
894065	contig_7051_pilon	-	3264	5	Intergenic	novelGene_64309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	177.061430017946	380	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	15	494	231129	216979	TRUE	15	GACTGATTGCTCCCTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231143	210887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_213540_216860_217052_217573_217734_217824_217999_231056
894066	contig_16205_pilon	+	2852	5	Intergenic	novelGene_156872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATTTAAAGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85128	105895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_87425_88540_88737_89467_89552_103299_103466_105785
894067	contig_6842_pilon	+	2080	12	Intergenic	novelGene_130663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_11	246.471496013449	29	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	233	1204	335003	370168	FALSE	25	TATGTTAGTCATGCAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGVSKDPELADLFYKDDPEELFIDLHEIGHGSFGAVYFATNARTNEVVAVKKMSYSGKQMHEKWQDILKEVKFLGQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITQGALQGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRVILASGYGVSFSEKTHFRGRYFIKNRSKSRSSPGSKVRVRSHKTCRLLFP	249556	371044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249600_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343875_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_370015
894068	contig_4868_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_136761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGTCACAAAACTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128228	130412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_+_128200_130400
894069	contig_3861_pilon	+	1144	10	Intergenic	novelGene_57886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	400.2494900946	134	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	463	1143	152753	170468	FALSE	25	AGCAGGTAAGTTTTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKA	141735	170469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_141885_144427_144473_147635_147672_147764_147877_150307_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343
894070	contig_15327_pilon	-	3265	16	Intergenic	novelGene_70759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	90	junction_6	61.5507017741381	479	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	24	1274	1169101	1135719	TRUE	30	CCTAGGCTATAATCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169124	1128914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
894071	contig_4496_pilon	-	3843	2	Intergenic	novelGene_66633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAGCAGCACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643937	632377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_633493_641209
894072	contig_5236_pilon	-	2590	12	Intergenic	novelGene_100960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	199.595707070547	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	62	1690	1011714	1006770	FALSE	15	AATTGCCTTTTAGGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011775	1005869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008170_1009013_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
894073	contig_6589_pilon	+	2244	8	Intergenic	novelGene_26009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	805.027214649623	60	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	127	1242	1725483	1730817	FALSE	35	AATAGCTTTATATTCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFVGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVSVVGLSLLLPRSALYREPQAQVPATSGSSPAPGLSADGGGGRGGMLSSSGRNSSLWGGWGMGGACPNWGDKAPQGKLPMALGPWPLWDQDEEQRETGSVGAEVEAEGEADEPLE	1725356	1731819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067_1730152_1730469
894074	contig_19986_pilon	+	3519	3	Intergenic	novelGene_159220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	19.5	891	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGGATGGTCAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2845	18034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_+_3016_9334_9483_14833
894075	contig_7182_pilon	-	1231	5	Intergenic	novelGene_117148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_4	1820.34399221686	6186	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	123	770	889318	887056	FALSE	15	ATTAGTACTGTTGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWLPLSQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891382	886594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
894076	contig_8312_pilon	+	1901	10	Intergenic	novelGene_152868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	665	junction_1	322.416225122468	89	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	427	918	263693	271808	FALSE	40	ACAACCCACCCATCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLPGVKEVCRDFAVLEDHTLAHSLQEQEIEHHLASNVQRNRLVQHDLQVAKQLQEEDLKAQAQLQKRYKDLEQQDCEIAQEIQEKLAIEAERRRIQEKKDEDIARVLQEKELQEEKRRKKHFPESSGSSASGDSYCYEDGGMKPRGIKEALSTPSRVTHRDQEWYDAEIARKLQEEELLATQVDMRAAQVAQDGEIARLLMAEEKKAYKKAREREKSSLDKRKHDTEWKPKTSKSANPKSKESDEPHRSKNNRPARPPPPAGTDAKDLDYPHFTNQRNSTRHFSKWESSHKGKKSIYSHISGSS	207748	272791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_207774_241031_241095_242165_242293_244964_245056_252632_252751_263690_263807_264911_264957_265066_265172_266972_267053_271660
894078	contig_2933_pilon	-	2133	3	Intergenic	novelGene_111355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2	126	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	288	1547	850204	848945	FALSE	5	TCTTTCCGCGTACTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874204	848358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_850290_860113_860274_874162
894079	contig_16594_pilon	+	4889	2	Intergenic	novelGene_53905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2850	3212	258770	259132	TRUE	40	TAAGAAATGATATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPALRGPLYFLLIVPQHVKKTTGISSEHVSDRPSTSNNTINFLPHTTSIHSITEWAIINSLNKMPVAWLSKSNCKCTARIQNRIITATTCIHTAKQDPEQAKRNNEAILFLKNQGVPEN	255920	262002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_260478_261670
894080	contig_18511_pilon	+	2003	11	Intergenic	novelGene_126868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	324.783758830395	25	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	176	1951	47371	61308	FALSE	40	GTGAATGAGCAACTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35396	61360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
894081	contig_15893_pilon	+	3304	1	Intergenic	novelGene_128516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1182	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGCTTCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86654	89958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_86700_90000
894082	contig_15897_pilon	+	3582	6	Intergenic	novelGene_49514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	20.0259831219344	251	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	639	1184	156970	161266	FALSE	30	ATGTATTAGAAGGAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFTANLEPVSLADREVISRLRNCIVSMVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG	156331	163664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_156994_158052_158119_158627_158697_159745_159923_160322_160452_161185
894083	contig_18419_pilon	-	2041	7	Intergenic	novelGene_141468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.156037068105	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	21	743	32730	30259	TRUE	45	AGGGGAAAGGTAGAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQHGKPMFTQVCVEGRLYLEFMFDDMMRIKTWHFSIRQHRELIPRSILAMHAQDPQMLDQLSKNITRCGLSNSTLNYLRLCVILEPMQELMSRHKTYSLSPRDCLKTCLFQKWQRMVAPPAEPARQQPSKRRKRKMSGGSTMSSGGGNTNNSNSKKKSPASTFALSSQVPDVMVVGEPTLMGGEFGDEDERLITRLENTQFDAANGIDDEDSFNNSPALGANSPWNSKPPSSQESKSENPTSQASQ	32750	28752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29779_29986_30490_31209_31359_31556_31681_31773_31858_32101_32225_32718
894084	contig_2933_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_111370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAACGCTCTCTCTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940065	939179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_939200_940100
894085	contig_13702_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_102632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAACATGTAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211548	209014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_209000_211500
894086	contig_2703_pilon	-	3927	2	Intergenic	novelGene_101791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3319	3621	612160	611858	FALSE	0	GTTTTCCTTTTCTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKHQRPSVKEVVSGMGNVASSKSLSWVHCVYADVAKKVQHSGTNIQAEMRLKSICAHTHTHTARQDGKAKLNQFEAIYFGVAGIEKEKNVPFPSLLLN	615901	611551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_614751_615173
894087	contig_5954_pilon	+	5952	13	Intergenic	novelGene_28809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_3	130.580647706908	918	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	27	1652	1469795	1519148	FALSE	0	TCTGCTTTTTCTTTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAEGGGSMLSRQRAVAAVLGGAGDAMECEKPGPVQVVCVHKDQHSFELEEKALASVLLQDHIRDLDVVVLSVAGAFRKGKSFFLDFMLRYLYFQKEGGHSSWLGDPEEPLTGFSWRGGSDPETTGIQIWSEVFTVEKPGGKKVAVILMDTQGAFDSQSTVKDCATIFALSTMTSSVQIYNLSQNIQEDDLQQLQLFTEYGRLAMDEISQKPFQTLMFLVRDWSFPYEYNYGLQGGMAFLDKRLQVKEHQHEEIQNVRNHIHSCFSSVNCFLLPHPGLQVATSPDFDGKLKDIASEFKDQLQTLIPFVLDPSNLMEKEINGSKVTCRGLLEYFKAYIKIYQGEDLPHPKSMLQATAEANNLAAAASAKDIYYNNMEEVCGGEKPYLCPDILEEKHGEFKQLALDHFKKTKKMGGKDFSLRYQEELEEEIKELYENFIKHNASKNVFSTFRTPAVLFTGIVALYIASAFAHFVGLEAVAQLFNCMVGLLLIALLTWGYIRYSGEYRELGGAIDNGASYVLEQATSYMCNSTQAALRDAIVGKQPVDKKAQ	1469768	1523448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1469841_1486579_1486795_1486935_1487080_1499976_1500082_1500567_1500619_1509130_1509188_1510011_1510105_1510817_1510957_1515176_1515305_1516087_1516145_1516976_1517049_1517903_1518336_1519061
894088	contig_14687_pilon	-	4188	5	Intergenic	novelGene_107953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	136	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTGAAAGTTTACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688281	592100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_592108_592357_592476_680035_681484_684921_687278_688022
894089	contig_5889_pilon	+	4569	4	Intergenic	novelGene_133691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2899	3498	245778	246377	TRUE	45	TCACTATACCAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILEHLIVLMQNLYIDQEAVIRTEQGDTVWFKTRKGVRQGCILSPYLFNLYAEQISQEAGLCEEELSIRIGGRLINNTPHADGTALLAEIEEDLKHLLMKIKDFSFHYGLHLNIKKTKVLTTEPISNIIINIENIEVVKDFILLGSTSSSEEIKQCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVILIEDRGAVEPSHDIFSHLTCM	242879	385912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_246499_261648_261776_304637_304827_385278
894090	contig_14514_pilon	+	4284	3	Intergenic	novelGene_137456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_2	9	505	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3859	4215	41431	41787	FALSE	25	GTCTCACTTCCTGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGKTSTWHTGRTPPVSPRSPGPQANRSQAEEDCQKLGVAGTFGGPEPQPSNGNWSQSLSVSPPACTPLTSLFSGTLPTGWPAYMSPIPVASHTSHTCIGLKATSADSSFLHTKLSF	24707	41856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_24764_30105_30203_37725
894091	contig_4105_pilon	-	3645	15	Intergenic	novelGene_21491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	751.552950053883	13	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	23	1726	137447	100151	TRUE	30	TTTTAATGCAGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNVSNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137469	98167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_99375_99438_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115333_119333_119547_121847_121986_137434
894092	contig_8710_pilon	-	1665	11	Intergenic	novelGene_73506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_10	53.4771913996986	260	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	73	1332	320458	272139	FALSE	30	AAATCTTAGGTTTTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTSGQGARGLICPSSAAGPRSSEMAGFGAMEKFLVEYKSAVEKKLAEYKCNTNTAIELKLVRFPEDLENDIRTFFPEYTHQLFGDDETAFGYKGLKILLYYIAGSLSTMFRVEYASKVDENFDCVEADDVEGKIRQIIPPGFCTNTNDFLSLLEKEVDFKPFGTLLHTYSVPSPTGGENFTFQIYKAEMTCRGFREYHERLQTFLMWFIETASFIDVDDERWHYFLVFEKYNKDGATLFATVGYMTVYNYYVYPDKTRPRVSQMLILTPFQGQGHGAQLLETVHRYYIDCPSVLDITAEDPSKSYVKLRDFVLVKLCQDLPCFSREKLMQGFNEDMAIEAQKKFKINKQHARRVYEILRLLVTDMSDAEQYRSYRLDIKRRLISPYKKKQRDLAKMRKCLRPEELTNQMNQIEISMQHEQLEESFQELVEDYRRVIERLAQE	320530	271805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_272307_278084_278202_280875_281028_285950_286058_286370_286476_286975_287098_287395_287576_302892_303014_307997_308074_318175_318281_320451
894093	contig_11316_pilon	-	2695	2	Intergenic	novelGene_122648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2551	junction_1	0	9	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTACTACTATAGTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	137730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138589_138689
894094	contig_10324_pilon	-	4531	23	Intergenic	novelGene_7811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	27.9700252779576	590	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	280	708	269976	268845	TRUE	15	CGAGCACCGAGCTCTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTVEPTEAGDYKLCFDNSFSTISEKLVFFELIFDSLQDDEEVEGWAETLGWPDAVEPEEMLDVKMEDIKESIETMRTRLERSIQMLTLLRAFEARDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT	271443	169197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_169212_200102_200176_218428_218582_219689_219893_222703_222803_228515_228676_232549_232695_235912_236049_238977_239046_239687_239827_242178_242264_244418_244494_247907_247964_252862_252981_258354_258466_260939_261054_261492_261664_263847_264079_265195_265442_267418_269064_269626_269829_269968_270067_271254
894095	contig_11171_pilon	+	1181	10	Intergenic	novelGene_48535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1503.87758892442	404	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	10	894	31058	65671	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEVGPDQLGAQLSSELQRVLAKGPPGWQDPQHTYIWLPWGF	31048	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64818_65551
894096	contig_14516_pilon	+	2551	20	Intergenic	novelGene_153889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	97.3243143344191	347	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	178	2163	34682	422609	TRUE	45	TATTTAATTTAAAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	33226	423176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_33366_34643_34736_36343_36417_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418336_421549_421780_422472_422614_422792
894097	contig_8375_pilon	+	3302	16	Intergenic	novelGene_141262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	84.2661392388557	664	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	159	2264	24694	64643	FALSE	20	GATCTGTGCAATGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKAKQMPVEMSRPAAPLLNSNNEKISSDPSPEANSHYGCNEDVGNHAVKSLDENKEDLNLDVEYTEVEVSSPDPHRAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	18685	65681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_18794_20025_20053_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41507_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
894098	contig_16322_pilon	-	1887	6	Intergenic	novelGene_87508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	503.975158117937	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	224	523	37060	34527	TRUE	55	AAATAAAAAGTTTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNGAF	57651	31701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34030_34626_36310_36438_36986_37098_57465
894099	contig_546_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_117192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATGTCTCAATGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64581	66223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_64600_66200
894100	contig_6164_pilon	-	3297	3	Intergenic	novelGene_121281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	238.5	29	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	350	877	569414	567664	FALSE	40	GGGCCATGAACACAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPSVPPTAPPPGPPAPFPPSGPSCPPPGGPYPAPTVPGPGPTGPYPTPNMPFPELPRPYGAPTDPAAAGPLGPWGSMSSGPWAPGMGGQYPTPNMPYPSPGPYSAPPPPQAPGAAPPVPWGTVPPGTWGPPAPYPAPAGSYPTPGLYPTPSNPFQVPSGPSGAPPMPGGPHSYH	580097	565243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_567676_568898_569629_579962
894101	contig_21299_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_175752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTCCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7834	6512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21299_pilon_-_6500_7800
894102	contig_8354_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_24149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTACTGTGGCATTCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537230	535150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_535200_537200
894103	contig_2867_pilon	+	2937	2	Intergenic	novelGene_135227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	936	1277	1193439	1193780	TRUE	25	CCCGTACATAGGTCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLASFLNTSRQTAEQNLEAIRPRDLVPGPVGFNPDEMRVVKQDPSRSTMGRLPTVVLRPDKLRPTELRPEVLRPQVPRPVTTGSGELRDACEYPEWLVSGHDEQPLGSDHWCS	1192503	1196223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1194977_1195759
894104	contig_9527_pilon	+	5613	3	Intergenic	novelGene_134024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	152	junction_1	72	622	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	853	2142	47849	55568	FALSE	55	AAAAAAGTACTTTTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYDKLSRALRYYYNKRILHKTKGKRFTYKFNFSKLVMPNYPFINIRSSGVVPQSAPPVPTASSRFHFPPLDAHSPTSDMQPGRFSASSLTTSGQESLSDGTDRKAELSELEDGSAADWRRGVDLMSSRNAVGGGGMGHQKRKPDIMLPLFTRPGMYPDPHSPFAVSPVPGRGGVLNVPISPALSLTPTLFSYSPSPGLSPFTSSSCFSFNPEEMKHYLHSQACSVFNYHLSPRTFPRYPGLMVPPLQCQMHPEESAQFSIKLQPPPAGRRNRERVESSEESAPVSAPTAAPVPPRIKVELASEKDPESLRQSVREKEELAQEEGTVPGRTTEEGKGTIFARPATPPVWPSVPSSAPSEEPLEVTEDGEDRPGREPSASEKKEDAVMPPKLRLKRRWNDGPEARELSKNGKFLWNGSGPRGLAAAAADA	46996	59039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_47881_49162_49279_54426
894105	contig_4857_pilon	+	2541	22	Intergenic	novelGene_48686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.021982121521	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	167	2305	1127714	1161886	FALSE	35	TCCAAAAGCTGATACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEVRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPILMSMIICKCLKEERKILENAQRFNQAQSGSIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKTLEDLQDEYDFKCKTLQNREHETSGVAKNEQKQEQMLLQKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEQDPITKNKQVLWDRTFTLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNLTVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHKKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTRTNEGPLIVTEELHSFSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLVSEPRNLSFFLNPPCAQWGQLSEVLSWQFSSVTKRGLSVDQLNMLGEKLLGPNASPEGLIPWTRFCKENINDKNFSFWLWIESILELIKKHLLSLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPRGTGYIKTELISVSEV	1123745	1162122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1123911_1127712_1127842_1128631_1128777_1130171_1130271_1133432_1133523_1136158_1136238_1137333_1137426_1137634_1137787_1139973_1140133_1141539_1141633_1143089_1143150_1145737_1145768_1145858_1145953_1147161_1147204_1151576_1151661_1152123_1152223_1152754_1152891_1155450_1155501_1156468_1156564_1157635_1157782_1160368_1160555_1161806
894106	scaffold_9100_pilon	+	1468	7	Intergenic	novelGene_83259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	520.707664839132	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	98	922	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651950_652069_653324_653449_654139
894107	contig_18544_pilon	-	2370	7	Intergenic	novelGene_152736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	309.408396065064	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1	1053	58227	38474	FALSE	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	58227	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54919_55016_58025
894108	contig_8594_pilon	-	1494	2	Intergenic	novelGene_140029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTCATCATCTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322985	321394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_322819_322915
894109	contig_8138_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_52398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117929	119546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_117900_119500
894110	contig_6375_pilon	-	2162	10	Intergenic	novelGene_72958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_9	159.765878091879	122	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	206	1741	229189	202748	FALSE	10	GCTTTCAGTGGCTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234086	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_233928
894111	contig_8693_pilon	-	2222	2	Intergenic	novelGene_150875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGAGACTAAACGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169472	1137281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_-_1138444_1168412
894112	contig_3469_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_34178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCATATTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434642	432918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_432900_434600
894113	contig_6557_pilon	+	2472	10	Intergenic	novelGene_32948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	697	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGATGAAACAAAGTCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343866	395122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_345131_352015_352166_356203_356297_356839_357014_359399_359536_361479_361629_362506_362662_364233_364334_379695_379877_395052
894114	contig_5623_pilon	+	3855	2	Intergenic	novelGene_154863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATCAAACACATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247148	251142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_250040_250178
894115	contig_5005_pilon	+	2403	6	Intergenic	novelGene_84319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1352	1672	512873	515304	TRUE	5	GGCAGGCGGGGCGGGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYVSWSPCTQTKHFLPRVSYSEIQRSCLLPRSILAVRFPRQFVYSSGSHGVFNILRQHHNSNASILLRSSLFIVQFSHACEAVENTMDWVRRTLVLKVISLLSNT	511521	539807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_512952_515062_515362_515555_515744_520411_520619_521919_522041_539649
894116	contig_5003_pilon	+	1786	6	Intergenic	novelGene_120211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1437	1769	135650	137095	FALSE	65	GTAGGAGAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPFFLQLCKLNFLFQKPQFCLFSTSLFKQFSPLIFNLLSLFFCLHFKFLFNFLAPLLPFSSNSGFLFKFLKGAHQQAKYSSIPLLSLFIHILILDKVSTCTLFGGSYN	133295	137112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_134146_134321_134790_135531_135671_135748_135905_136786_136859_137011
894117	contig_9571_pilon	-	562	3	Intergenic	novelGene_136248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	5	111	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	75	404	352858	275113	FALSE	15	ATCCACTTGTGGTACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSSTEKSRFFKPDYEAWLRIQRAERGGVIFHDVAVLTDKLFPIVEAMQKHFSAGSGTYYSDSIFFLSVAMHQIMPKDRSKQRHTGTSHHQESNAGSRACSLDLRFLC	352932	274954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_275208_321690_321839_352771
894118	contig_16578_pilon	-	5390	1	Intergenic	novelGene_148674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	710	1057	280036	279689	NA	10	AGGTTGGAGTCCCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHKDILAPLKIRAGHAPKHVHHAQSPFSLCSTSSCCLDHSPQGRGPVLESDSLYGLASACGPSYARVLPNGSTHGQVVVDQILFSSPKAVQLERMQWSSNGPAAEEHKEREGLE	280745	275355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_275400_280700
894119	contig_2310_pilon	+	2084	13	Intergenic	novelGene_71606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	229.329139375411	1289	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	1022	1915	124532	134479	FALSE	10	GATTTGTCGTCTCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106066	134648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106862_107780_108061_110704_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
894120	contig_10197_pilon	-	4548	4	Intergenic	novelGene_115264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_2	57.6020832956587	1577	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2696	3067	1107800	1107429	FALSE	75	TCTAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDPGQGQFSYCWRQGLPWALFCCPQGALGLHRACRRSQEDPQQAGCLLKVSPFCLLPKQRSLPSTACPPHLGCMPTKPRLPEDKGLHCLQPPRLAPHLLPWPVRLPEEGRTHFLLLVLTPL	1114196	1105947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1108134_1108600_1108725_1109972_1110047_1112032
894121	contig_20165_pilon	-	4663	2	Intergenic	novelGene_54478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAATAATGAAGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69749	64574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_69174_69685
894122	contig_960_pilon	+	3103	25	Intergenic	novelGene_108227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	435	20	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	202	567	430790	436845	TRUE	40	AAAAATCCCAGCAGGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYTFPWPLLSSSIRPLSVPTNKFTPHKAAQRISELNLFLYLRISGVSLCGLVLVGFTLTTEPFRVGSCLMASGLIPSQENPTTEVTVVPLDGEICSNRGSIKGVKEEEDLCFWSVLLAD	427874	647797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_428014_430727_430868_436238_436411_436729_436848_438781_438969_440049_440171_440646_440826_442976_443076_443776_443931_445283_445387_449137_449300_450482_450628_451325_451409_454131_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478896_483088_483167_484616_484672_487135_487269_489760_489849_495559_495678_497066_497195_545270_545322_647748
894123	contig_2033_pilon	+	3169	1	Intergenic	novelGene_71553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	173	310	452282	452419	NA	70	AAAAAAAAGAGAATCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHKGSISPRDKKGCTNQRLHQPGGAWLPPVTTLTREHNRESLIEQEKGGVQNSNSSKMTRLNGLTETGGTPESMAPRLSVNPELKQFLSPTLHTKIGLDCGT	452109	455278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_452100_455300
894124	contig_7056_pilon	-	3078	9	Intergenic	novelGene_43675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGGGTCTTGTCGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812762	801644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_801812_802369_802561_804903_804988_805252_805410_806603_806820_807439_807560_808440_808569_808731_808811_810826
894125	contig_12080_pilon	-	2497	7	Intergenic	novelGene_128421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_4	15.3451041776269	356	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	207	1076	590008	576497	FALSE	25	TGTGTCATTAATAGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLIILENYSQASEWAAKYIRNRIIQFNPGPDKYFSLGLPTGSTPLSCYKKLIEYYKNGDLSFKYVKTFNMDEYVALPREHPESYHSFMWNNFFKHIDIDPENTHILDGNATDLQAECDAFEEKIKAAGGIELFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSRTRVKTLAMDTILANARFFHGDLSKVPTMALTVGVGTVMDAREVMILITGAHKAFALYKAIEEGVNHMWTVSAFQQHPCAVFVCDEDATLELKVKTVKYFKGLMLVHNKLVDPLYSIKEKEAEKSQSSKKPYSD	591112	575075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_576598_577439_577615_583952_584138_585176_585360_586384_586487_589884_590015_590912
894126	contig_8050_pilon	+	2245	16	Intergenic	novelGene_114822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	714	junction_14	228.877512122872	13	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	111	2213	294062	342011	FALSE	40	AATCCCTAAAATCAGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLTETIFLNQDLEEKNENQESDTEEEEDKLFWLEACYKALTWHRKNKHVQEAACWALNNLLMYQNNLHEKIGDEDGQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRFIGNPGIQKCGLKVISSVAHFPDALEILSLEGAIDSVLHTLQMYPDDQEIQCLGLSLIGCLIMKKNLCVGTGHLLAKILVSSLQRFKDVAEVQMNVCALFWRKNLGACIDFSFKAVCNSHFALMVVFLLIENHLSFHSILIIEGEED	293951	342043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320926_321619_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_341428_341574_341712
894127	contig_6001_pilon	-	3712	9	Intergenic	novelGene_128049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	14.5945195193264	528	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	71	1720	758806	725516	FALSE	30	GCTTGGTAAAGTATAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDDSMKKEDCFDDDHSFEDIGLAAGRSQREKKRSYKDFLREEEEIAAQVRNSSKKKLKGSELYFLGTDTHKKKRKHSSDDYYFGDISSLESSQKKKKKSSPQSADTAMDLLKAITSPLATGSKPSKKTGEKSSSSSSHSESKKEHHRKKVSGSSGELSLEDGGSHKSKKMKPLYVNTETLTLREPDGLKMKLILSPKEKGSSSVDEESFQYPSQQATVKKSSKKSARDEQGALFLGHELQSFLKSARKKHKSSSDPHSSPGPEGSDVSQFPEPNSANLDLSGIEPILVESDSSSGGELEAGELVIDDSYREIKKKKKSKKSKKKKDKEKHKEKRHSKSKRSSGLSTAAVGEVTMTPAPPPSIPYAGAAAPPPPLPSLHTDGHSEKKKKREEKDRDRERGEKPKKKNMSAYQVFCKEYRVTIVADHPGIDFGELSKKLAEVWKQLPEKDKLIWKQKAQYLQHKQNKAEATTVKRKASSSEGSMKIKASSIGVLSPQKKSPPSTILLPTSPAKAPETEPIDVAAHLQLLGESLSLIGHRLQETEVLKIQ	758876	723523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_-_725534_725636_725807_728557_728664_729837_729903_730968_731051_755883_756834_757621_757701_757972_758122_758775
894128	contig_11719_pilon	+	520	6	Intergenic	novelGene_154735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2578.75222539894	350	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	36	470	13921	20039	FALSE	10	TTGAGTGTCCAGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASAWDAPVATMLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ	12998	20089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14071_14331_14465_16271_16326_19126_19183_19997
894129	contig_935_pilon	-	3216	9	Intergenic	novelGene_45551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	323.382489283202	15	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	765	1556	370806	358287	TRUE	50	AAGAGAAAAAAGTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKVGHHFIQA	371570	344412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637
894130	contig_15185_pilon	-	3335	1	Intergenic	novelGene_99471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	533	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAATAAATAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470049	466714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_466700_470000
894131	contig_5502_pilon	+	3049	2	Intergenic	novelGene_154957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	55	456	293429	293830	TRUE	25	CCGTCAAGTCGATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNTGNNKCWRGCREIRTLMRCWWECKMIHSFWKMIWRFLRKLEIEIPYVPAIPLLGIYPRKIRAVTRIDICTPTFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINELWYIHTMEYYATIKNSDDSVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYRMRPLL	293374	380135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_294663_378374
894132	contig_8210_pilon	-	3845	1	Intergenic	novelGene_30250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	865	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	360	827	52740	52273	NA	10	GGCCCACTATGTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVDPGSSRSPGLAEVHWDSAAPQVPRLLPVAVCLPAGVLPPWFPRIQRRTDCDPPNTLLSWGACLCVWESVRVRAVGLVAWLSPVRSRAADAPSRRAYSCVFHVASTWSCVFLQSSQLWCRHRTCSHLHLWTRPAHAAFRLEKVCSSGGVFSRL	53099	49254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_49300_53100
894133	contig_7416_pilon	-	5538	13	Intergenic	novelGene_134312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	77	junction_1	116.750773254637	515	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	912	2739	9	2747	104771	16629	FALSE	10	TTCTCCTGCTCTGTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAASALQQLSDEELFSQLRRYGLSPGPVTESTRPVYLKKLKKLREEEQQQQHRSGSRGNKTRNTNNNNTAATTVAAAGPAAAAVGMGVRPVSGDLSYLRTPGGLGRISVSGPESPSGGPGVASAAPAAGSKVLLGFSSDESDVEASPRDQAGGGRKDRASLQYRGLKPPPAPVAASEVTNSNSAERRKPHSWWGARRPGAPELQTPSGKDGAAEEEEREDGEERDLEAHEPLWPSRTVNGSRLLPYSYRENYSDSEEEDEDDVASTRQVLKDDSLSRHRPRRSHSKPLSPLTAKSAGSRLESSVQGGGGIAMNDRAAAAGSLDRSRNLEEAAAAAEQQPGGGCDPLDASPIPRYRVNAKKLTPLLPPSLTDMDSTLDSSTGSLRKTNNHIGGGAFSVDSPSIYSNSLSPSAAVATSGSLRINHSNHTGSKHTYLKNTYNKPKLSEPEEELLQQFKREEVSPTGGFSAHYLSMFLLTAACLFFLILGLTYLGMRGTGVSEDGGLSIKNPFDGTFGEIQESKKNLMMNTLYKLHDRLAQLAGDHECGSSSQRTLSVQEAAAYLKELGPEYGDIFNISLLWILENGKDVGIRCVGYDPDEELTNITHVQFLQSTRPQMSFWCRFRRAFITVTHRLLLLCLGVVMVCVVLRYMKYRWTKEEEETRQMYDMVVKIIDVLRSHNEACQENKDLQPYMPIPHVRDSLIQPHDRKKMKKVWDRAVDFLAANESRVRTETRRIGGADFLVWRWIQPSASCDKILVIPSKVWQGQAFHLDRRNSPPNSLTPCLKIRNMFDPVMEIGDHWHLAIQEAILEKCSDNDGIVHIAVDRNSREGCVYVKCLSPEYAGKAFKALHGSWFDGKLVTVKYLRLDRYHHRFPQALTCNTPLKPSNKHMNSMSHLRLRTGLVNSQGGS	104779	13837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_16793_16998_17078_17163_17270_18638_18721_36534_36714_37383_37487_37588_37691_38658_38805_38892_38973_54783_54852_57196_57264_62577_62616_103246
894134	contig_12950_pilon	+	4354	1	Intergenic	novelGene_114786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	717	2154	74	2227	102511	104664	NA	5	CTCTGTCTGGCTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFRAALFFWVVASWAKGDEPPGETDKAGFQKCKNALNLRVLEVLPGGGWDNLRNVDMGRVMGLTYTSCRTTEDGQYIIPDEIFTIPQKQSNLEMNSEILESWVDYQSSTSYSINTELNTFSEVNGKFSAEFQRMKTLQVKEHSITTRVQVRNLVYTVKINPTLELSWGFRKDLMAISDCLENNQTRMATYLAELLVLNYGTHVITSVDAGAALIQEDSIRTSFLQDSQNSRIAVTLSAGITFQNIINFKFEDNYILQNALTKSYLSNRTNSRVQSIGGVPFYPGITLQTWQEGIANHLVALDRVGLPLHFFINPNMLPGLPGPFVKKLSKIVELAVRRYYDFNTYPGCTDFNSPNFNFQANTDDGSCEGRVTNFTFGGVYQECTQLSGNEAVLLCQNLEQKNPLTGDFSCPSGYSPIRLLSQIHEEGYNHLECQRRCTLLVFCKKVCEVVFQVAKAEFRAFWCVAHNQVPEYSGLLFGGLFSSKSINPLTNSQSCPAGYLPLRLFESLKVCASQDYELGYRFSVPFGGFFSCAVGNPLADSAISRDSGAPAVKKCPGGFSQHLALISDGCQVSYCVKSGIFTGGSLPPVRLPPYTRPPLMSQTATNTVMVTNMETSNSWIKDYETHQWKLGEPLELRKALKVTHEDEHGLSGGTAAGVIVGVITVLVAAITLAIYGTRKYKKRQYRAIEDEKQSLTQGTAATGDAPHQEPEQNPV	102437	106791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_+_102400_106800
894135	contig_16411_pilon	-	4068	9	Intergenic	novelGene_77288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	3744	4067	54769	49591	FALSE	15	CTGGAGTCCTGGAATCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQPKLSAAYLLHKSELRGIDHPFPISQPCRDRGFLPPGTNGIPESGDQASSIVLVVIDEERDGIKHILFSHVVSLGVIICFFDVIVLYTGVVLTLTMPLVKTDTVYV	69476	49589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_49631_50889_51023_51402_51479_54694_54868_56905_57120_58324_58391_58479_58600_62459_62617_66388
894136	contig_294_pilon	+	6548	14	Intergenic	novelGene_166741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1169	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	6186	6548	162596	164731	FALSE	0	CCCTGGCCCCCGCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSTVWLSPKPFKCCPISLITSSSDCESRFFFLRMLPSSGVAKEEEAAVVAEAAATVAEAAAAAPPGTPLLTFRLLLLLLAAEGAEGRSPLAWAMSPADDDDEGDDSPFWADRQASSWVC	123992	164731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_128709_131506_131693_135503_135640_135893_135963_136433_136583_138345_138467_141877_142018_147443_147583_152755_152914_153968_154064_156952_157093_162359_162416_162515_162617_164389
894137	contig_19744_pilon	+	7716	40	Intergenic	novelGene_120351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	137.606223388766	2040	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1285	3855	3862	7716	97795	177984	FALSE	80	AAGGAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVQCPDGVTFTFSTCSLSSNGTNQTRGQIPQILYYRSEFDGDLQSQLLSKANEEDKNCSRALSVVSTVVRAAKDLLHRALAVDADDIPELLSSSSLFSMLLPLIIAYIGPVAAAIPKVAVEVFGLVQQLLPSVAILNQKYAPPAFNPNQSTDSTTGNQPEQGLSACTTSNHYAVIESEHPYKPACVMHYKVTFPECVRWMTIEFDPQCGTAQSEDVLRLLIPVRTVQNSGYGPKLTSVHENLNSWIELKKFAGSSGWPSMVLVLPGNEALFSLETASDYVKDDKASFYGFKCFAIGYEFSPGPDEGVIQLEKELANLGGVCAAALMKKDLALPIGNELEEDLEILEEAALQVCKTHSGILGKGLALSHSPTILEALEGNLPLQIQSNEQSFLDDFIACVPGSSGGRLARWLQPDSYADPQKTSLILNKDDIRCGWPTTITVQTKDQYGDVVHVPNMKVEVKAVPVSQKKTSLQQEQVKKSQRIPGSPAVTAASSNTDMTFGGLASPKLDVSYEPMIVKEARYIAITMMKVYENYSFEELRFASPTPKRPSENMLIRVNNDGSYCANWTPGAIGLYTIHVTIDGIEIDAGLEVKVKDPPKGMVPPGTQLVKPKAEPQPNKVRKFVAKDSAGLRIRSHPSLQSEQIGIVKVNGTITFIDEIHNDDGVWLRLNDETIKKYVPNMNGYTEAWCLSFNQHLGKSLLVPVDVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAK	9122	177984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_9330_11793_11940_12240_12343_21667_21776_28546_28667_29612_29695_41638_41757_47388_47594_48605_48760_66015_66189_67270_67397_67483_67612_72996_73089_75259_75395_77724_77809_81254_81352_84370_85334_88248_88471_92556_92749_94752_94960_96087_96220_97726_97908_100436_100580_101977_102079_102940_103160_107540_107767_109166_109286_109896_109985_112280_112331_115990_116164_117380_117526_122039_122256_130481_130538_133818_133935_137853_137952_138751_138869_139774_139916_152925_153059_156119_156243_176506
894138	contig_8978_pilon	+	2809	13	Intergenic	novelGene_49466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	232.376654856339	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	879	2711	1749586	1772309	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680858	1772407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1684923_1685023_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747297_1749561_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
894139	contig_1150_pilon	-	3359	4	Intergenic	novelGene_61456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_2	141.313677878525	766	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1026	3081	224	3304	335413	332333	FALSE	15	CTCTTCTGTCTCATGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVQSSLLICLFLLISGSCEFFAEANYSRSYPCDERKQNGSVLADCNSRRLQEVPQTVGRYVTELDLSDNFIKHITNESFQGLQNLTKINLNHNAVNNDGMNITDGAFLHLKNLRVLLLEDNQLHQIPAGLPKSLKELSLIQNNITVVTKKNTSGLKNLESLYLGWNCYFGHDCKKIFDIENGTFERLTHLKVLSLSFNDLSHVPPKLPRSLTELYLSNTNIQNIGQEDFKELKNLTILDLSGNCPRCFNAPFPCKPCYGNSSIQIHPLAFQTLTQLRYLNLSSTSLQKIPATWFYNMSQLKVLYLEFNYLVHEIASGAFLRYLPSLEILDLSFNYARTEYPQYINISENFSKLMSLQVLHLRGYVFQELRKEDFLPLLGLPNLKAINLGINFIKQIDFTIFQHFHKLSIIYLSENRISPLVNDIRQDYTNSSSSQSHILKPRSTHTEFDPHSNFYHDTRPLVKPQCSIYGKALDLSLNSIFFIGQKQFEAFGDIACLNLSANGNGQVLHGTEFSAVPHVKYLDLTNNRLDFDDDKALTELVELEVLDLSYNAHYFRIAGVTHRLGFIKNLTQLKVLNLSHNSIYTLTEYNLTSMSLEELVFSGNRLDLLWNDEDDRYWHFFTFLRNLTRLDLSFNNLRRIPNEAFSNLPQSLTELYINNNMLHFFNWTLLQQFPHLRLLDLSRNKLSTLTNSLSTFTSSLQTLLLRQNRISHLPSGFFSEARGLVHLDLSSNLIKMINKSTLQTKTATNLAVLELGGNPFDCTCDIGDFRRWMDENLNVSIPRLTDVICASPGDQRGKCIVSLELTTCVSDAIAAIFFFFTFFVTTMVMLTAVAHHLFYWDVWFIYHMCLAKIKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVLNELRYHLEESEDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTIFVLTKKYAKNWNFKTAFYLALQRLMEENMDVIIFILLEPVLQHSQYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQSLKNVVLTENDSRYNNLYVDSIK	349759	332277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_335420_341662_341732_346557_346616_349669
894140	contig_5917_pilon	-	4659	16	Intergenic	novelGene_122158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_15	195.016398170912	878	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	324	2366	759810	699492	FALSE	30	TAAGATAGTGAGTCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENIRQEIGIMNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	793010	697198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_792827
894141	contig_9177_pilon	-	2600	13	Intergenic	novelGene_32634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.973714386785	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	131	907	38494	37263	TRUE	20	CTGGGACATGAAGTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAGLTPKPMSLISAYCGGLWLAAVAVMVQMATLCEAQDIQEKFSSILSRGKEAYERLLWNGRYYNYDSSSQPQSRSIMSDQCAGQWFLRACGLGEGDTEVFPTPHVVRALQTIFEFNVQAFAGGAMGAVNGMQPHGVPDTSSVQSDEVWVGVVYGLAATMIQEGLTSEGFRTAEGCYRTVWERLGLAFQTPEAYCQQQVFRSLAYMRPLSIWAMQLALQQQQCKKASRPVVEQNTGLNTGPKSGPKEAMANLSPE	38624	33231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_33357_33456_33596_33696_33845_33920_33989_34096_34193_35241_35348_35448_35521_36142_36225_36322_36409_36491_37542_37808_38001_38095_38212_38304
894142	contig_11129_pilon	+	4382	3	Intergenic	novelGene_178654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	208	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTACAATACCAAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308458	468023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11129_pilon_+_309929_382683_383811_466238
894143	contig_10017_pilon	-	1748	16	Intergenic	novelGene_156982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	395.222379033487	9	23	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	108	1268	337686	304016	TRUE	10	TCGGCCCTGGACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKKDPSQPAECKQQ	345503	302902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303356_303988_304055_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_345413
894144	contig_8375_pilon	+	3450	17	Intergenic	novelGene_141261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	82.7195705002752	555	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	64	2418	18749	64643	FALSE	20	TTTCTAGATCTGTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYCRKCLTEGSTEEGKFLICGKCLLPQRHGSKAELTILAVEALTVQLRWPHRDKMWLGVLLTLLFCSSLEGQENSFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKAKQMPVEMSRPAAPLLNSNNEKISSDPSPEANSHYGCNEDVGNHAVKSLDENKEDLNLDVEYTEVEVSSPDPHRAPEIKGTETVYSEIRKADRDFMENRCSRTEGSLDGT	18685	65675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_18794_19785_19940_20025_20053_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41507_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
894145	contig_3153_pilon	+	2591	2	Intergenic	novelGene_104652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	371	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAACCCAATGGGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121027	124764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_121625_122770
894146	contig_11318_pilon	-	7698	13	Intergenic	novelGene_48141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	509.216118711452	521	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	7093	7698	29630	14971	FALSE	75	AAGCAAGAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLNNHGLSGYQRGRGRPFTARTSLKREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEE	54564	14970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21420_29539_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42731_44531_44582_49722
894147	contig_18843_pilon	+	8911	4	Intergenic	novelGene_165620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	528.704286177275	528	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTAGTTCATTTCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36682	47797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_36937_37162_37298_38395_46259_47138
894148	contig_18108_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_33465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	1652	2263	122594	123205	NA	75	GTTAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDDISRMPLVELGPLRSFKVFEIKPEKRWQDISMMRMKSIGEHIVGHIQREVDFLFCMDVDQVFQDNFGVETLGQSVAQLQAWWYKANPDEFTYERRRASAAYIPFGQGDFYYHAAIFGGTPIQVLNITRECFKGILQDKKNNIEAEWHDESHLNKYFLLNKPTKILSPEYCWDYHIGLPSDIKIVKISWQTKEYNVVRNNV	120942	123461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_120900_123500
894149	contig_6215_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_21248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	413	715	599749	600051	NA	15	ATTGCATTCTGTTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYYLNLTEANMKGESNWKLEYILTQAYDIKDLQPESLYGLAKQFAVLDSKQFIKYYNYFFVSYASSAICDEKCKAFQICAVMNLDHVSYADCLKQFYI	599336	602067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_599300_602100
894150	contig_5686_pilon	-	5584	1	Intergenic	novelGene_45412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	739	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTAGTCCATTCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184419	178835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_178800_184400
894151	contig_14970_pilon	+	3266	2	Intergenic	novelGene_45012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAGAGCATATAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140259	151139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_140699_148312
894152	contig_7870_pilon	-	1140	8	Intergenic	novelGene_108884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	429.215563557521	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	231	956	496465	143294	FALSE	25	CCTATATGTGTTCTACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497922	143109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
894153	contig_4202_pilon	-	2749	2	Intergenic	novelGene_147081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	288	374	295178	295092	TRUE	25	ACCATATTTACTGGCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYQDLHRTESSTARWCPATTAYCSDQYHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKDQIHWPKGDWRNPESTAPRHPFSSAVKLPSRFTVQPGSGQPSKTMRVTRYRSPVIRLRRQKGSRKLMIGNPK	295465	292553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_293706_293868
894154	contig_7898_pilon	+	4630	1	Intergenic	novelGene_47590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAGGGACGGAGTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499519	504149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_499500_504100
894155	contig_5779_pilon	+	4548	1	Intergenic	novelGene_106516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	837	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGACCTCCGACCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271043	275591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_271000_275600
894156	contig_3747_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_24964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAATAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203991	205172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204000_205200
894157	contig_12312_pilon	-	5143	22	Intergenic	novelGene_63951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	867.718953006039	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	974	2925	148	3072	278150	218134	TRUE	35	TAATGCTTTAAATGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQVRACSFWFLASSFCAILQQFNSALGNFYK	324167	213838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214983_215116_215989_218078_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_324071
894158	contig_10953_pilon	+	6626	13	Intergenic	novelGene_42525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	190.025491710981	429	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	12	908	126980	146990	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRDNHGGRVDESIDDTGLAMSC	126968	162309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408_145519_146927_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_161571
894159	contig_8377_pilon	-	6009	1	Intergenic	novelGene_35073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	518	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGCCACTCCATGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126699	120690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_120700_126700
894160	contig_13244_pilon	+	6651	7	Intergenic	novelGene_86990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_4	140.32897855476	1091	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	3763	4860	467911	470083	TRUE	5	ATTTTTCTTTTCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVHHSESKHDSNADLLQSIINIKNECSPVSLNTVQVSWMSPVVVPQSSPREQFQDFHGGQVFSPPQKYQPFQVSGSPPVMDQASLYQYSPQNQNVQQQQHHYIHDPNLEYTPYSRLQSPNYEPNLFDGQELQFCPNQSFVSLLSNHGESENVAVPIQTPPSIQQHSNAHLQTFSMMPNSACEALAEHKAGSPPLNTSLPFQNITENPVNTTQLGKSFFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHIAVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQVRGHEEGTLIMGPKTSGWSIRSCMYIVCCNHLF	464148	476258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_468654_469348_469455_469834_470237_470522_470693_471757_471869_471962_472131_475069
894161	contig_13144_pilon	+	3868	3	Intergenic	novelGene_178458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2832	3161	103596	103925	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKQH	99723	104632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_+_100622_101375_102479_102765
894162	scaffold_880_pilon	+	8455	50	Intergenic	novelGene_121419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_40	445.60418203498	596	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1243	3732	1667	5398	456080	556617	TRUE	40	TTAAGTACCATTTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLRPFSENRTRPHKEILEFPTREVYVPHTVYRNLLYVYPRRLNFASKLASGRNITIKIQFMCGEDASNALPVIFGKSSGPEFLQEVYTAVTYHNKSPDFYEEVKIKLPAKLTANHHLLFTFYHISCQQKQGALVESLMGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAERVPLQNPPIKWAEGHKGVFNIEVQAVSSVHTQDNHLEKFFTLCHSLESQVTFPLRLLDQKISEGMLEHELKLSIICLNSSRLEPLVLFLHLVLDKLFQLLVQPMVIAGQTANFSQFAFESVAAIANSFHNSKDLSKDQHGRNCLLASYVHYVFRLPEPHRDAPKSGGPTPVPDPRYHTYGRTSAAAVSSKLLQARVMSSSNPDLAGTHSAADEEVKSIMSAKIADRNCNRVSYYSAGNSDLPNSTSAPRPASKKHFHEELALQMVVSTGIVRETVFKYAWFFFELLVKSMAQYIHNLDKQDTFRRTRFSDRFKDDITTIVNVVTSEIAALLVKPQKENEQAEKINISLAFFLYDLLSLMDRGFVFNLVKHYCSQLSAKLNNLPVLISMRLEFLRVLCSHEHYLSLNLFFMNADTAPASPCPSISSQNSSSGSSLQDQKIASMFDLTPEYRQQHFLTGLLFTELAAALDAEGEGISKVQRKAVSAIHSLLSSHDLDPRCAKPEVKVKIAALYLPLVGIILDALPQFYDFTAADARGGKSRCNGSDEEQEGGSTINQNVALAIAGNNFNLKTSGVILSSLPYKQCNVLSADTTRNLMICFLWIMKNADQSLIRKWIADLPSMQLNRILDLLFICVSCFEYKGKQSSDKVSTQVLQKSRDVKARLEEALLRGEGARGEMMRRCRTPGNDRFPGLSENLRWRKEQTHWRQANEKLDKTKAELDQEALISGNLATEANLIILDMQENIIQATSALDCKDSLLGGVLRVLVNSLSCDQSTTYLTHCFATLRALIAKFGDLLFEEEVEQCADLCQRVLHHCSSSIDVTRSQACATLYLLMRFSFGAVSNFARVKMQVTMSLASLVGKAPDFNEEHLRRSLRTILAYAEEDTAMQTTLFPAQVEELLCNLNSILYDTVKMREFQDDPEMLMDLMYRIAKSYQTSPDLRLTWLQNMAEKHTKRKCYTEAAMCLVHAAALVAEYLSMLEDHSYLPVGSVSFQNISSNVLEESAVSDDTLSPDEDGVCSGRYFTESGLVGLLEQAAELFSTGACMRRLMRCTSWLSPSWKRIETSGS	352564	579521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_352705_406896_407000_420188_420365_424873_424946_433473_433598_437562_437776_439125_439212_441361_441429_443432_443583_447600_447682_450971_451132_453830_453969_455117_455212_456017_456181_479497_479616_482290_482362_484798_484938_485540_485643_488541_488638_490479_490715_492352_492518_493177_493348_496770_496867_501313_501410_506103_506254_509157_509272_510289_510446_514145_514286_525271_525442_528125_528272_534033_534217_534657_534791_535969_536058_539121_539219_541591_541727_542997_543151_544244_544404_546050_546152_547343_547537_554404_554549_556536_556668_557474_557610_559501_559592_563957_564195_567763_567909_569211_569319_575187_575359_575791_576931_577881_578360_579016
894163	contig_2332_pilon	+	607	7	Intergenic	novelGene_58661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_5	1504.97759304102	656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	25	603	331257	334269	FALSE	25	TAAGAGGTAGGTTCTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330769	334273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162
894164	contig_10197_pilon	+	1241	3	Intergenic	novelGene_115309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	113.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	36	350	1369983	1377360	FALSE	20	CTTATGAATCCTACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDREFPNFKYRMILSNEQAFEEAFQNASFRSFTFRIRVKLETYNDESRIKASAVDVKPVDYREYGRRLIMNIRKNAMQ	1369947	1378251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1370106_1375656_1375744_1377255
894165	contig_5515_pilon	-	3270	10	Intergenic	novelGene_52358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_9	132.421977960283	720	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	249	1970	172625	160151	FALSE	20	GGCAAAGAGTCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHAAEPARDGVEASAEGPRAVFVLLEERRPADSTQLLSLNSLLPESGIVADIELENVLDPDNFYELKSQPLPLRSSLPISLQATPATPATLSASSSAGGSRTPAMSSSSSSRVLLRQQLMRAQAQEQERRERREQAAAAPFPSPAPASPAISVVGVSAGGHTLGRPPPAQVPREVLKVQTHLENPTRYHLQQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPTSAQPLPAPETVHATGPAGSAPNSPMALLTIGSSSEKEIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTAGLQLPSTLPVSGNLLDVYSSQSVATPAITVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQLRIQELELQAQIHGLPVPPTPGLLSLATTSASDSLKPEQLDVEEEGRPGTFHVGGAPAPNASHQQPPAPPSDALLDLHFPSDHLGDLGDPFHLGLEDILMEEEESVVGGLSGGTLSPLRAASDPLLSSVSPAVSKASSRRSSFSMEEES	172873	158850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_160589_161061_161210_165496_165573_165751_165809_166171_166290_167741_167847_167931_168178_168842_169147_170133_170248_172509
894166	contig_14220_pilon	+	3697	3	Intergenic	novelGene_159874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	553	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1692	2021	387746	388075	TRUE	55	AAAAAAAGTCAAAGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHLRYSTGLTPSGARENENRIQGKDQSKGLMDHSYHSLHQTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGSWTELEKDVEQNSNTQKETSFTGLTGTGETPRVWPPDTLLAQC	368627	390263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_370015_387441_388953_389464
894167	contig_4402_pilon	-	3912	2	Intergenic	novelGene_140841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	1100	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1246	2088	595022	594180	FALSE	70	AAAGAAAAAGCACAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEESKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTR	597463	592355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_597128
894168	contig_7080_pilon	-	3038	2	Intergenic	novelGene_100112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGCAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516301	511705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_514603_516160
894169	contig_3975_pilon	+	661	5	Intergenic	novelGene_54945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_4	1008.53135796563	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	288	431	2353024	2354386	FALSE	15	GGATGATTTTGTTAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLNKFTEELKKYGVTTLVRVCDATYDKAPVEKEGIHVLDWPFDDGAPPPNQIVDDWLNLLKTKFREEPGCCVAVHCVAGLGRAPVLVALALIECGMKYEDAVQFIRQKRRGAFNSKQLLYLEKYRPKMRLRFRDTNGHCCVQ	2344913	2354616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2344937_2347069_2347163_2351503_2351635_2352983_2353059_2354277
894170	contig_5523_pilon	-	5988	6	Intergenic	novelGene_169107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	529	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	5127	5435	662123	624068	TRUE	10	CTGCCGGGAGGTGTCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRQQIAVGQCQLIPIQELATGPLVIVLTGIGVYLLWQRSFQVVIQFLQCLGQASLQGCTVLLLCVFDVGGELGEDINACCVGLPVFGSQSRLLFRSQGLL	675085	549500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_549842_615100_615211_623965_624098_630654_630755_661944_662131_669966
894171	contig_3320_pilon	+	3114	11	Intergenic	novelGene_133058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	164	junction_4	58.7911557974497	552	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	29	844	103751	174543	TRUE	30	ATATTATTATTGATCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGGSCEGKMVLIKEFRVVLPCSVQEYQVGQLYSVAEASKNETGGGEGIEVLKNEPYEKDGEKGQYTHKIYHLKSKVPAFVRMIAPEGSLVFHEKAWNAYPYCRTGKPNEYMKDDFFIKIETWHKPDLGTLENVHGLDPNMWKTVEIVHIDIADRSQVEPADYKADEDPALFQSVKTKRGPLGPNWKKELANNPDGPQMCAYKLVTIKFKWWGLQSKVENFIQKQEKRIFTNFHRQLFCWIDKWIDLTMEDIRRMEDETQKELETMRKKGSVRGTSAADV	103722	178024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_103771_109909_109941_113136_113283_125922_126023_127202_127278_129176_129261_154065_154144_169044_169156_170845_170969_174495_174582_175792
894172	contig_3382_pilon	-	8931	20	Intergenic	novelGene_123981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1991	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	8590	8931	88864	40359	FALSE	20	CACGCAGTACACCGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQVSLCQLATMHLYDDFIGTWEDTGAQLGDEGPRPGLHGLGAVVDLRAVMPMPVPPLLHCQGGAMENCTAGTVIQVNVKGIMFFYSNTAAVEPVLADVALDHEAAHVVRLPA	129604	40358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_40428_82631_82720_86825_86945_88798_88959_91152_91299_91598_91785_93469_93631_97714_97804_98981_99089_105989_106082_108765_108856_116175_116386_117740_117868_118059_118215_119463_119559_120171_120322_120456_120670_121874_121957_122477_122755_123289
894173	contig_12624_pilon	+	7508	11	Intergenic	novelGene_60977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	126.35647984967	732	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	141	1277	69828	98576	TRUE	70	AACAAAATAGAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKNFLYAWCGKKKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVRVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSNAARDFVNYLVRINEVKSEDVPAVGIAPPPPSLTDSSDGTASTDGSLPTTMGGPLPPHLALKAENNSGVGASGYGVSGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEAQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVIEAYSGLTKKKEGETLEPYKVNLSQDLEHQLQNVVQELNLEIVPPPEDPSVPVLLNIDKLAHFEPSQRQNQMGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAYVSASSFLRSDSCVLLSDTLHQDV	66555	105356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342_98726_99274
894174	contig_11338_pilon	-	3260	1	Intergenic	novelGene_6399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	190	630	313440	313000	NA	65	AATAATAAAAAAAAGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	313629	310369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310400_313600
894175	contig_13496_pilon	+	2079	2	Intergenic	novelGene_107620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1687	1998	214927	215238	FALSE	25	GCTGCTAACAAATCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRRWNQRPLYERGRTQSVRLGWVLGQFLLRYKRQKQENRDGDLIPPRKKHQEHSASFEPGDPVLRSSSTGRRLMTSTFSQSRQREKAFPWSRHPESVLLAS	209131	215319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_209358_213466
894176	SIRV6	+	1244	6	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	33	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAGTTTTTAAGATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3138	11801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_3165_7104_7430_7797_7924_10724_10819_11031_11109_11205
894177	contig_9049_pilon	+	2730	6	Intergenic	novelGene_83118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	772	junction_1	1310.52670327621	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	126	743	88356	111692	FALSE	25	AATTTGGCAATCTTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGARAPREDARARRGPGDCSRLPAALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGK	88230	113679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558
894178	contig_12414_pilon	+	2828	1	Intergenic	novelGene_59591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2788	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	874	1944	372984	374054	NA	30	TCGCTATGAGTCAGAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372110	374938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372100_374900
894179	contig_9653_pilon	+	2467	5	Intergenic	novelGene_48247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1710	2072	839361	845824	TRUE	25	GCGGGAGAACAGGGGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMLVVLILSTSPWENSVLSTSTSISSRSESERSEEIVEPMLSIRIRSISCGPCSCSSRRFKNLCSRSKFSSWCWLFLSASSSFLMCALALLSKPSVVCLVQSGPNGIRTFKRSKHRRR	837651	930658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_839443_844948_845121_845715_845829_913528_913693_930431
894180	contig_16098_pilon	-	2632	2	Intergenic	novelGene_46247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTTAGAAAAATATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829057	826321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_826739_826842
894181	contig_5020_pilon	+	2223	8	Intergenic	novelGene_27815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	220	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	365	1294	122915	125772	FALSE	30	CAGGAGCAAACTTCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118460	126701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
894182	contig_4782_pilon	-	2614	3	Intergenic	novelGene_73596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAAATGGCGCCGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67358	64181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_64367_64877_67238_67289
894183	contig_8317_pilon	-	4606	4	Intergenic	novelGene_19238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	366	692	303290	302964	TRUE	40	AAAGGGTTTTCCTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPFHGKLKKNVYLGKTSLPFTSYLCSLHRIWEKPLSLLPPISALCTGFGKNLSPFYLLPPCSPPDLGKTSLPLTASLPALHRESTEPEIDPKRRADPFCWPWRGNK	303655	5276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_5526_5649_6633_107066_107485_300699
894184	contig_366_pilon	-	1101	4	Intergenic	novelGene_51640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	308.909191978628	40	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	70	369	1408118	1406847	TRUE	15	AAAGCTGGCTCTCTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWDLEPTRRPTFKQICFLLREQAKVDRKEQDYANLTSSSSSGSSSGGSGSSEPEESSSEHLACCEQGDSSQSMLQPNNYQFC	1408187	1406042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_1406454_1406525_1407006_1407102_1407212_1408086
894185	contig_5033_pilon	-	2180	8	Intergenic	novelGene_29042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3687.59034756148	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	669	1415	536585	532125	TRUE	20	ACCAGACCTGGGCCTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	537253	530989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531168_531537_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504
894186	contig_3588_pilon	+	2045	7	Intergenic	novelGene_72853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	344	junction_6	475.236227809099	208	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	186	779	84577	117203	FALSE	25	GTATTTGCTTTTTAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRNVPFRSEVLAWDSDSLADYFKKLNFKDCEKAVKKYHIDGPRFLALTENDIQKFPKLRVPILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIGKGPLPDFCPWQPRAKLPTAAREAVA	84391	118469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96163_96211_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933
894187	contig_15491_pilon	-	2079	6	Intergenic	novelGene_75936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	424.968045857568	7	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	42	578	46982	37437	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNL	47023	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32246_37436_37560_38887_39040_40256_40317_45107_45207_46879
894188	contig_7408_pilon	-	2246	6	Intergenic	novelGene_168738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	243.298170975451	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	584	1405	36909	12597	FALSE	30	TGAATCAAAGTTCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGWTAINAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48329	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_36880_36938_38375_38596_47224_47360_48129
894189	contig_9429_pilon	+	4224	3	Intergenic	novelGene_155108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	649	junction_2	21	647	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	79	435	105216	107826	FALSE	35	TAAAGGCTTATCATCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYEQSPSPAHLPDDSKVIEKQRETQSMERLSSTLTTTACKSVQVNGTATELRKPSYAEICQRTSKEPPSSPLQPQKEQKPNTVGCGKEEKKLTEPVERYREPPPLKSNPGQPKDQRRQLGRRSSPPTVGKRLNREQNTPPKSPQ	105042	111615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_105081_105175_105285_107538
894190	contig_2311_pilon	+	12384	4	Intergenic	novelGene_169823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	860	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	10152	10502	500178	500528	TRUE	20	GCCCAACTTAACCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQGKQAAEPTESEPLNPKLRKVPLTAFSPGQASSVCCLPDNFYLLAATPSAHGKNLVVPFCSASFKRSFLGLLPYTLMNANISFSQYHPCPCACFFSILLQISTHTLKTPAVQT	490026	534794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_501763_508424_508551_512659_513017_534629
894191	contig_3414_pilon	-	6391	15	Intergenic	novelGene_80962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	335.246330391276	844	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	16	1557	101974	72816	TRUE	25	CAAGGTTTGTCTGAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKVSSLHRFQLHRFYCV	101989	64366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_67266_69036_69209_70780_70876_71147_72864_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
894192	contig_11850_pilon	+	3233	5	Intergenic	novelGene_125228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2701	3069	284312	286326	FALSE	20	GCGGCGGAAGAGATCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSIFSISPKAPKYSLICSSEVSGLNPPTKTFLGGSFPFKALALLGSINLPSSLCSFSSKTLSTLAASLKSTNPNPLDRPVTGSVLIVQSTTSPNRDKYSVRSFLLVSQLKPPINILPSSC	281459	286490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_284051_284202_284335_285098_285259_285359_285531_286311
894193	contig_14167_pilon	-	3283	4	Intergenic	novelGene_105531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	61.3840370128912	181	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	107	847	64418	24086	FALSE	20	GAAAGAGGCTTGGTCGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCVDIKDNVVDEGFSFTPKGDDLCLSCTCHGGEPEMCVAALCERPQGCQQYLKDPKECCKFMCLDPDGSSLFDSMASGMRLIISCISSFLILSLLLFMVHRLRQRRRERIESLIGANLHHFNLGRRIPGFDYGPDGFGTGLTPLHLSDDGEGGTFHFHDPPPPYTAYKYPDIDQPDDPPPPYEASINPDSMFYDPADDDAFEPAEASPPVPGNSSSDGALPQHLEQPLPSVGAPLTDLEDSADSSSALLVPPDPTQNESAPVAEALLGGGLHSRSSVNTVV	64524	21649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_24343_26706_26944_28236_28390_64324
894194	contig_610_pilon	-	2523	7	Intergenic	novelGene_76665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.327231057372	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	506	823	68933	32202	FALSE	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGMAVRVVALSHADTLSK	93813	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32255_45058_45278_68887_68955_69978_70099_72506_72694_81741_81821_93715
894195	contig_16411_pilon	+	3209	7	Intergenic	novelGene_77337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	537.281635230124	2373	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	218	844	231797	241370	TRUE	25	CGTGAAATCAGCATCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	187195	243781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241771_241816
894197	contig_10297_pilon	-	4967	11	Intergenic	novelGene_112560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_10	121.836119439188	616	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	41	1333	769869	730242	FALSE	30	AGTGACTCAATAGCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARLLRGCLRLWGGRCALRPPPDARCSHSGVEQRLETSSAKKLTDIGIRRIFSSEHDIFRASVRKFFQEEVIPHHTEWEKAGEVSRELWEKAGKQGLLGVNIAEHHGGLGGDFYSAAVVSEEQAYSNCTGPGFSLHSDIVMPYIANYGSEEQIKYFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIRTNAKKDGSDWILNGSKVFITNGWLSDVVIVVAVTNREASSPAHGISLFLVENGMKGFIKGQKLHKMGLKAQDTAELFFEDVRLPANALLGEENKGFYYLMKELPQERLLIAELAVSASEFMFEETRSYVKQRKAFGKTVAQIQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDSCLQLHESKRLDSATASMAKYWASELQNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIARDIIQDK	769909	726607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_730336_733901_733989_736234_736363_750933_751048_751979_752082_752891_753057_755182_755250_762686_762852_764079_764218_766101_766258_769792
894198	contig_19604_pilon	+	2927	2	Intergenic	novelGene_77253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	552	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1322	1702	275061	275441	FALSE	40	GATCTATTTTGTCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFAGASLQTVATKASPAPEHTGSRMPRNVHTFPHTHRSRYTHVFLGTAPRNGCVKKARCRGGQTISLDKDGLLLFSFMLSEWGHLCVCFPYSLKPDFGKEPMCQHLHLQSRGEQPKVIQVSADS	273482	276666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273577_273833
894199	contig_11026_pilon	+	3667	18	Intergenic	novelGene_167637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_14	269.659801054029	991	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	99	2378	43170	125017	FALSE	20	CAGAGACTCCTTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKEDDYNEESPTEPSSDGIISEKEITQDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKTMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEATLNDRRRVALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTVRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESDEILPFHPFHPFPSLPESEDSQPELYHPVKKGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSKSEVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	43071	126306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104535_105665_105834_108820_108952_110007_110083_111253_111413_112211_112341_115713_115814_117394_117548_118969_119006_122159_122246_123351_123427_123810_123967_124915
894200	contig_10861_pilon	+	2822	5	Intergenic	novelGene_39258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.072315630942	98	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	20	2296	1241650	1247956	FALSE	30	CTAAAGGCTACTAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRSSTMWAPAAKVIKKEPNSDHYGVDETSEKEQQEVIEHIDEVQNEIDRPNVQASEEILKVEEEYNKLHQPFFQKRSELITKIPNIWVTTFVNYPQESEIVTSSEPINNRNTDPALWNNFSSNDVNYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLDGKQTRFCSQNLFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVFCFVCKLFSPKSNSRFATDGFSDWRNLSMIDKHENSSIHRDCMLAYLNRRHGFGLTHELETQINEERQHWKAVLQRVVAVIITIAERGLSFQGKNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKFSNTGKINRSYMSKTTCEVCKIDFSKCRGQSYDNAANMSGCYKGMQQKILEHNEYAIFIPCAAHSLNLVGRSTVDCCPEAVDFFSTVQLLYTFFAASTHRWAVLKTYVGNDRVLKCLSTTRGEVHAVATSAILESYTQILDALENIAEDQTQKGDTRREAENITNKMQTLEYVFMLVMWNNILQHFHWASQALQDSEVNLKTCTDLYQSLTGYLHNLREDFENFENTTKQILPNTDYQAVHCRRTIRKKQVDEGSAPGVLSARDQFRITTYYTIIDTLESCMKRRVEAYEVLTDRFSFLNNVDIPDEECMKASKKLVQAYPDDLNTNLYGEVRQFHSYMRTKFTNPGKTNFTHEDMYDSIIEDKIQCVFPNVEIALRIFLTLMITNCTTERSFSSLKRLKSPQHTTMTQVRHDSLSLLCMEVDIVRQLNCDEIMEEFVRAKNRKKCFYL	1241630	1248482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1241723_1243368_1243427_1244090_1244234_1245707_1246410_1246655
894201	contig_4426_pilon	-	2657	6	Intergenic	novelGene_15418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	3	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	859	2577	81	2657	904546	820070	FALSE	70	AAATCAGAAAAAGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYI	904626	820069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
894202	contig_8045_pilon	+	2874	11	Intergenic	novelGene_35427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2059	2364	435287	435592	FALSE	65	ACAATAAAAAAAATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGTSIAVDTSSPSRAALSQWWALPEPETPSASNCRASCRPASRAPVLLLLFLLLPRLLRGGALPLVGGLGKSLWEEGERIYPRENDEGEEKDLSYGPW	379379	436102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_380051_388098_388199_390871_390985_392295_392396_399311_399379_401390_401523_401905_401968_402049_402178_413303_413407_414823_414887_434767
894203	contig_10861_pilon	+	5627	6	Intergenic	novelGene_39271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	290.401377407202	167	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	216	893	1339531	1345502	FALSE	75	CATACAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRFKHRNRSFSRSKSNSRSRSKSQPKKEMKAKSRSRSASHTKTRGTSKTDSKTHYKSGSRYEKESRKKEPPRSKSQSRSQSRSRSKSRSRSWTSPKSSGH	1337599	1350236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1345204
894204	contig_14563_pilon	+	5500	39	Intergenic	novelGene_135015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1025	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2024	2389	66644	80692	TRUE	30	CCCAGGTATTTACTGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSDLCISKSLHKVLPHASGAASALWLLIIIGVIRLAFRGRGSLGLPLRLSIRVTVICLSLFRGTPNSRQHINFFQLLLPLLLLYFLPLLFWNYLIPLLVRTLFQLFLIFHCCKVGNLKL	31201	158562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_31366_38070_38323_43104_43321_46085_46180_48671_48856_53106_53242_55283_55424_56438_56568_57837_57962_58194_58309_59087_59235_59424_59572_65264_65405_66606_66652_75199_75374_76340_76511_80678_80773_81215_81316_82384_82531_83279_83434_89283_89356_91433_91588_91927_92086_96549_96739_107763_107957_108805_108898_110643_110860_113623_113748_115996_116177_116346_116392_118159_118259_119823_120054_120935_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131744_133438_133529_136798_137029_158443
894205	contig_13481_pilon	+	2368	5	Intergenic	novelGene_119554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1041	junction_1	171.453164158612	84	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	129	779	1568681	1586220	FALSE	40	AATAAACAGTTTTAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGGALYPVRHLKLGARVTPAATPPGPTDTAAAPAPPLLGRAMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568552	1587809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080
894206	contig_16098_pilon	-	2931	21	Intergenic	novelGene_45831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_12	494.663461355294	1417	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	74	2815	230275	201500	FALSE	15	CAGGTGTGTGCTGGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230496	201383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
894207	contig_2646_pilon	-	1844	12	Intergenic	novelGene_69660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	353.091821925606	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	110	802	2178950	2174850	TRUE	25	ATTGTTGGCTAAACGATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2181024	2171579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2171964_2172013_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180956
894208	contig_15775_pilon	+	2129	5	Intergenic	novelGene_148361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	196.656267380422	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	15	494	172	5012	TRUE	20	GATACTATGTTGCAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPALTTMRTTTTSTSTIFTAPATPEENTTSPIMTSWLSDVSCWDIFRAGDPAPGG	157	7238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1829_1945_4617_4641_4989_5140_5730
894209	scaffold_2602_pilon	-	2772	8	Intergenic	novelGene_127701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	836	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATGTGCCTATTATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69583	54245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_55578_56430_56497_56685_56769_57957_57995_58066_58132_58240_58304_65343_65480_68593
894210	contig_12622_pilon	+	2460	7	Intergenic	novelGene_5854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	90.8706345428611	306	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	590	2050	1107540	1111730	FALSE	5	CAGCTTGGTTTTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISHGLVSFKDLIVDFTQEEWQQLDPAQRLLYRDVMLENYSNLVSVGCHVSKPDVIFKLEQGEEPWMEEEFSSQNYSEVDGALKKNEDVQNKHLMQIVFFSNNTLIAERADIFGNTFNLGMNIVPSIKIPYKDDSCGNSSKTNSEVIVKKSYFKRIPNEYSGCGKLLFHTKHEITHSGMKKYKYNQIRKARIQSEDLILHQNIQTLKQAYDYNKCGKTFKRTVLITQKKVNSERKPNECNECKKTFSKKSNLIVHQRIHTGEKPYVCNDCRKTFRVKTHLTRHQRIHTGERPYECSECGKTFTDKSALIVHQKIHRGEKSHECDECGKTFFRKSSLTEHFRSHTGEKPYECEECGNAFSKKSYLAVHQRTHRGEKPNECNECGKTFFCHSALTAHQRIHTGERPYECNECGKAFCHKSTLRVHRRIHTGEKPYECNECGKTYRQLWTFTEHQKIHTGEKPYECNICEKTFRHKSNFLLHQKTHKE	1098279	1112140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098707_1099890_1100008_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986_1109080_1109919_1110907_1111491
894211	contig_5961_pilon	+	7169	18	Intergenic	novelGene_144119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	491.765135096914	1474	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	2494	3804	207447	214246	FALSE	60	AAGAAAAAAAGCATTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	113767	217611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197889_201775_202352_206906_206988_207260_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
894212	contig_7909_pilon	+	3360	1	Intergenic	novelGene_155930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTCTTGCTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886374	889734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_886400_889700
894213	contig_2646_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_69528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTGTACCATGGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561496	559229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_559200_561500
894214	contig_610_pilon	-	4126	1	Intergenic	novelGene_76693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1359	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAACAGGATCAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136452	132326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_132300_136500
894215	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
894216	contig_21208_pilon	+	3251	3	Intergenic	novelGene_175769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_2	122	54	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	510	836	22803	23129	FALSE	80	ACAATTAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGWFMTMNFGVHAVMYTYYTLKAARVNSPRMLSMLITSLQILQMFVGAMVSILTYIWRHEQGCDTTTMEQFFLSSILYSSYFILFAHFFRQAYIIPKVKNKTKSQ	20363	25544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20637_21501_21634_22698
894217	contig_2027_pilon	+	4999	10	Intergenic	novelGene_39925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	189.719090587461	581	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	421	1119	167922	170260	FALSE	60	CAAAATAAAAATAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSEDGHGVSFSSQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGFVKHECVSYVLKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPNCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDILVEFPIRDLDLSEFIIKPRSESDPDLYKYDLIAVSNHYGGLRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVTEDEVESKAAYVLFYQRQDVARRLRSQPDLSGPPRTPCLWFPTQL	155998	174140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_156094_162155_162266_162426_162466_167745_167962_168038_168110_168346_168460_169410_169561_169655_169772_169964_170054_170140
894218	contig_13244_pilon	+	3737	9	Intergenic	novelGene_86999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_6	125.488047239568	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1850	2608	469410	475123	FALSE	30	TAAAAAATTTTTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	466923	476252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_467005_467521_467553_467672_469455_469834_469982_470172_470237_470522_470693_471757_471869_471962_472131_475069
894219	contig_3956_pilon	+	2747	12	Intergenic	novelGene_14878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1217.86708960128	5	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	1006	2223	1287290	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284061_1286105_1286224_1286409_1286721_1287202_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
894220	contig_2093_pilon	-	7911	9	Intergenic	novelGene_152988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	309	junction_6	135.968229285374	71	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	2092	3045	1384563	1357866	FALSE	65	TTTTAAAAAAAACAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLSLNNLQNVIHNPVIPYVGTIPEQLEPGTLIVIRGHVPSDSDRFQVDLQCGSSVKPRADVAFHLNPRFKRTNCIVCNTLINEKWGWENITYDMPFQKEKSFEIVIMVLKDKFQVAVNGKHTLLYAHRISLEKIDTLGIYGKVNIHSVGFRFSSDLQGTQASSVELIQINRENVQKSGISQLTLPFAARLNSSMGPGRTVVIKGEVNTNAKGFNVDLVAGKSRDIALHLNPRLNSKAFVRNSFLQESWGEEERNITCFPFSPGMYFEMIVYCDVKEFKVAINGVHSLEYKHRFKELSNIDMVEIDGDINLLEVRSW	1386654	1352999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1358016_1364609_1364776_1365572_1365662_1366409_1366437_1367575_1367633_1368504_1368625_1370810_1371022_1372530_1372620_1384518
894221	contig_6740_pilon	-	2641	2	Intergenic	novelGene_142667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATAATAGATTGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565683	562779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_564758_565020
894222	contig_8616_pilon	+	1096	8	Intergenic	novelGene_72505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	228.965642195772	80	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	61	672	336939	339244	FALSE	25	CCAACTTTTCCAAACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLVPTADPEPGPRGGGGDGAMAELTALESLIEMGFPRGRAEKALALTGNQGIEAAMDWLMEHEDDPDVDEPLATPLGHVLGREPISSGQGGPEGPGSTAGEGKPSLSEEERQEQTKRMMELVAQKQREREEREEREALERERQVRLPDGTSLTQTFRAREQLAAVRLYVELHRGEEPGGGQDPVQLLSGFPRRAFSEADMERPLQELGLVPSAVLIVAKKCPS	336783	339668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_336815_336909_336998_337137_337192_337275_337383_337467_337538_337778_337858_338836_339030_339194
894223	contig_13216_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_47452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130086	131403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_130100_131400
894224	contig_13409_pilon	-	10757	36	Intergenic	novelGene_128442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_35	236.647944837724	1128	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1711	5136	337	5472	107592	26632	FALSE	35	ACCAGCATTACCAAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGHSDEESVRNSSGDSSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSDGSSSQSGSSDSDSGSESGSQSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAVLKKQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSGSDSESEEERDKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRTKSKIGKKISGQKKRQIDSSEDDDDEEDYDNDKRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQTCIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPPYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASEMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWMHLQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISERKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSKDLARKEAQRLPGAGSSKRRKARAKKNKAMKSVKVKEEIKSDSSPLPSEKSDDDDDKLSECKSDSKERSKKSSISDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKRQESQQNSDQNSNSNAHMIRNPDVERLKENANHDDSSRDSYSSDRHLISQYHDHHKDRHQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYNDREKHRKLDDHRSRDHRSNLEGSLKDRSHSDHRSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSTRDYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLDQRSPYGSRSPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT	109933	21346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_26978_28459_28674_29265_29318_30933_31031_34497_34677_37831_37973_39052_39182_40022_40146_41442_41594_41834_41974_42920_43052_44166_44209_45529_45691_48687_48865_50527_50624_50708_50806_51147_51297_54197_54348_54884_54957_57754_57908_58766_58930_60929_61119_62733_62925_64190_64281_64956_65174_66197_66326_67170_67350_67561_67663_68046_68273_75231_75504_75643_75794_77746_77812_78662_78774_80026_80229_107539_107733_109737
894225	contig_14220_pilon	-	3965	5	Intergenic	novelGene_159878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	411	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATTCTTTTTTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406691	385971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_386813_387428_388947_389459_390125_400035_400455_406169
894226	contig_4924_pilon	-	5110	7	Intergenic	novelGene_84731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1409.25212632643	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	34	705	252576	127717	TRUE	25	CTCCAGCAGTACCGCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGW	252609	123133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_126780_126957_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
894227	contig_5602_pilon	-	3176	10	Intergenic	novelGene_133007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	114.202981518235	346	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	36	1097	516382	488176	TRUE	40	ATATGTAAATACTTGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQGKFCHGKTGSGAGTRLSSDTNENEVKSSEEPLLKKSSRRFVIFPIQYPDIWKMYKKAQASFWTAEEVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516417	485659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_487403_487839_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_511996_512153_516328
894228	contig_5523_pilon	-	4520	6	Intergenic	novelGene_169106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	534	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3659	3967	662123	624068	TRUE	10	CTGCCGGGAGGTGTCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRQQIAVGQCQLIPIQELATGPLVIVLTGIGVYLLWQRSFQVVIQFLQCLGQASLQGCTVLLLCVFDVGGELGEDINACCVGLPVFGSQSRLLFRSQGLL	673617	549500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_549842_615100_615211_623965_624098_630654_630755_661944_662131_669966
894229	contig_5959_pilon	-	2694	3	Intergenic	novelGene_150192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_2	16	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	1581	2690	216308	211902	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	217888	211897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888
894230	contig_14353_pilon	-	2254	8	Intergenic	novelGene_82102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	416.392671816949	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	429	764	83931	80586	FALSE	35	TAAATCTCTCAATTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGSTSTCALAVTSPSTSTPASMRMLWSATHRSTIPGGLRSAACLGKCPSAAARTSRCGYCVKATASR	87639	79095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82718_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365
894231	contig_2067_pilon	+	3700	1	Intergenic	novelGene_158933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1161	3483	216	3698	605050	608532	NA	40	TAGTTACAGGAAATATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVLLIKRGYNKLNNSSPESHNQNSGQLDHTKTSKKEQRKKPQQTKKEELISSNIDHDLTETGDTKEEELILMKENATNEVGATKGKKKNKLKTEQLTCMPYPFDQFHDGRRYIEHYMLQPETGPLNLIDPIHEFKALTNTDMATEKDIQMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVKDKPHGEIVGVKVTSKDAFIDHFNLMIKQYFEESHIKEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPSDKFVIEVDIIPKHSVCKDKYFYINMQNCKDGSWRQDKDASLFVREGASSKNIFANVRQQDADFKAFLLNVKPLAASRRKAEEEYGVKANKKESEGLKLVKLLIGSRDSLDNSYYDWYILVTNKSHPKQTKHLDFLKEIKWFSVLEFDPESVSNGVVKAYKESRVANLHFPSQYEEKTTNIKDMISTLNLYEQPSWIFCNGRSDLNNETYKPLDPHLWQRERASEVRKMILFLTDENVMTKGKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFCAFYQALKGMENILCICINSQIYLRWKDLLQTRLTIADEITNHSISTLNLEQINSTILKLKSVIQSSRRFLPSLGSSSVILEKKEEDILTALEILCENECKDTDIEKDETKFLEFRKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSAFVKRDGYENLKELIQCGAESPRPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHILWDLKKKFRCAVLKNKATDFTEIGEQVTNLITYKATSHQEYIPVLLLVDDFEELENIYVLQDAINSSLAKKGLRYEKTLVIILNCMRSQNPDRRAKSADSVALIKQLSAKEQRAFEAKLEEIEKQHKNCENFYSFMIMKSNFDETYIENVVRNILKGQNFDSKEAQLISFLALLNSYVADSTISGSQCETFLGITSTRTPWEPETLEDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIAIYCLKELENSYHLDKSQIALKLLHENLFYVSGIGRDKLLHDVQTLLLTRQRKEYGDETDTLFSPFIEALPNRKIENVLTAGSIRFPQNAFICQALARYFYIKEKNFSTALLWANQAKKIAPKNSYISDTLGQVYKSKIKWWLDENKTCRNITVNDLTHLLETAENASRAFKESQRQTDSKDYETEAWSPQKYQRKYDMYNTAGFLGEIEVGLYTITILQLTPLFHKENELALKPMVQFLSGIGDIPADPENEYHLTLRNFTSYLKSLQLDLKRCFDFFVDYMVLLKTRTTQKETVEIILSKKVS	604834	608534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_604800_608500
894232	contig_12630_pilon	-	1968	6	Intergenic	novelGene_173082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	167.217702412155	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	52	459	100972	81669	TRUE	25	TGTTTTTCTGTGGAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLGKEHHVSVSLSKKIKAMI	101023	75507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81706_81915_82253_100938
894233	contig_1521_pilon	-	1047	4	Intergenic	novelGene_145445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_2	99.3523471735262	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	21	1046	191760	160536	FALSE	40	TAAGGAGTGATTCCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREETKGKRDREKDTREERDYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDTRDARDRRELRDSRDMRDSRDMRDYSRDSKDSRDPRDSRSTRDAHDYRDRESRDAHRKEETYQEESRSYGRNHLREESSRAE	191780	160534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669_163981_179059_179258_191614
894234	contig_14333_pilon	+	2847	5	Intergenic	novelGene_49092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	349.359771582247	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	131	568	288895	294370	TRUE	30	TAGCTTGTACAGCTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD	288764	296699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_289036_290056_290164_292809_292931_294301_296394_296443
894235	contig_8491_pilon	+	3762	7	Intergenic	novelGene_154216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	124	junction_1	78.4127257245631	479	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	301	861	288066	294819	FALSE	15	TCTTTAAAGGTTTTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDADSDVALDILITNVVCVFRTRCHLNLRKIALEGANVIYKRDVGKVLMKLRKPRITATIWSSGKIICTGATSEEEAKFGARRLARSLQKLGFQVIFTDFKVVNVLAVCNMPFEIRLPEFTKNNRPHASYEPELHPAVCYRIKSLRATLQIFSTGSITVTGPNVKAVATAVEQIYPFVFESRKEIL	264271	297720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_264528_288021_288201_290189_290273_290436_290501_291970_292075_292172_292268_294739
894236	contig_4857_pilon	+	2526	22	Intergenic	novelGene_48690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_15	306.025572123721	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	1	2289	1127714	1163141	FALSE	0	GTGTCCTTTGGCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEVRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPILMSMIICKCLKEERKILENAQRFNQAQSGSIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKTLEDLQDEYDFKCKTLQNREHETSGVAKNEQKQEQMLLQKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEQDPITKNKQVLWDRTFTLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNLTVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHKKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTRTNEGPLIVTEELHSFSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLVSEPRNLSFFLNPPCAQWGQLSEVLSWQFSSVTKRGLSVDQLNMLGEKLLGPNASPEGLIPWTRFCKENINDKNFSFWLWIESILELIKKHLLSLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPRGTGYIKTELISVSEVHPSRLQSTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDTMVSIVVGVCSLRQQGCL	1127713	1163378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1127842_1128631_1128777_1130171_1130271_1133432_1133523_1136158_1136238_1137333_1137426_1137634_1137787_1139973_1140133_1141539_1141633_1143089_1143150_1145737_1145768_1145858_1145953_1147161_1147204_1151576_1151661_1152123_1152223_1152754_1152891_1155450_1155501_1156468_1156564_1157635_1157782_1160368_1160555_1161806_1161883_1162987
894238	contig_6304_pilon	+	2343	7	Intergenic	novelGene_122239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	216.589794055235	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	39	698	70293	180611	FALSE	45	AAGAATAAATTATTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGLADSGDGGNMSVAFAAPRQRGKGEITPAAIQKMLDENNHLIQCIMDYQNKGKTSECSQYQQMLHTNLVYLATIADSNQNMQSLLPAPPTQNMPMGLGGMNQSGPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPV	70254	182256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_70362_73345_73423_99473_99559_128695_128850_132145_132368_161430_161475_180602
894239	contig_13958_pilon	-	5655	5	Intergenic	novelGene_129535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	448	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACACATACTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195372	136690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_-_140868_146237_146899_153032_153311_174170_174624_195286
894240	contig_12479_pilon	-	5205	3	Intergenic	novelGene_56830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	369	731	173222	172860	TRUE	65	TTAAAAGGAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNDTTILENDMALPQKARNRHTIRSSNSLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEHYATRKNNNEFVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDK	173590	101701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_102272_142634_143328_169648
894241	contig_2799_pilon	-	4661	4	Intergenic	novelGene_85587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4133	4630	781803	780209	FALSE	30	CTCAGGATTGGGACAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGSTPRVLCLSGWLNSVCEKFYLCVSERCCSFLGTLKVLSPVTLI	786068	780177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781547_783702_783757_785561_785637
894242	contig_2143_pilon	-	4544	3	Intergenic	novelGene_178655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1289	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2756	3280	100483	53325	FALSE	15	GCCCAAGTTACTCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPARSGVWNLSSQFFPDKRLGHGKQRRQSGGEEGWGVGKNISQITGCFVSRWKIREAAFSYPRLLVSDRSPRWRTCPALAGRGRGLFVFCCLLVCGHNTFHLLLQLAGLVTQIWYGRAGLAEEESLGWVVCGTYHSQPGGSVISAGQVPVGRACAACWCDVKRSVQVGRM	103295	52060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2143_pilon_-_53588_100221_101127_101183
894243	contig_17917_pilon	-	4155	3	Intergenic	novelGene_178656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1664	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	3806	4153	62518	62171	FALSE	40	TATAGAAGGGCTGAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQQTITKHIKKQDRTVPVGVKNKTPDDFPVEEKALELPHSDFKSLIIRAIQEWKQKAEKNEEKIDKFMENTDKKWKNLEKIQQQNAEINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEMDS	234402	62168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17917_pilon_-_64060_231969_233069_233237
894244	contig_12079_pilon	+	3992	2	Intergenic	novelGene_67478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	768	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCCGCCCCGCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605432	638846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_609274_638695
894245	contig_12050_pilon	+	2952	8	Intergenic	novelGene_62628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	71.5575977511708	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	1	894	345213	354706	FALSE	20	GTAACAGTTGTGTGGCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKEPNNRHLFCAYCEVEHRSMHQCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIH	345212	356764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_345288_348643_348707_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631
894246	contig_17829_pilon	-	3989	16	Intergenic	novelGene_157031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	121.680273211761	40	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	81	1361	57091	38563	TRUE	35	CTTATGGTAATTGTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRIRWRSVRVRGGELAGCFAARARPAMLAGSCAPREREAEGNGAGAVPAPPAIDFPAEGSDPKYDESDVPAELQVLKGPLQQPTFPFAVANQLLLVSLLEHLSHVHEPNQGRSRQVFKLLCQTFIKMGLLSSFTCSDEFSSLRLHHNRAITHLMRSAKEKVRQDPCDENSHIQKIRPREVAFEAQTSRYLNEFEEIAILGKGGYGRVYKVRNKLDGQYYAIKKILIKGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCHQNQAKSEKLSQPRGDQRDMTD	57171	24913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_26959_28032_28267_29240_29324_29537_29653_36213_36315_38512_38634_39444_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439_44521_45061_45162_45846_45885_47172_47307_48431_48591_56973
894247	contig_12622_pilon	+	3015	7	Intergenic	novelGene_5839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	259.516698242457	532	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	252	989	460480	475513	FALSE	20	ATCAAAGTGTTTGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	454888	477539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_455116_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
894248	contig_10159_pilon	+	3284	5	Intergenic	novelGene_30885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_2	111.895877940164	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	479	1486	982630	996016	FALSE	15	GAAGGCTGAGTCTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHVAPSTDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	982151	997814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874
894249	contig_11493_pilon	-	3045	1	Intergenic	novelGene_143674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGCAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159285	156240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_156200_159300
894250	contig_9706_pilon	+	3071	5	Intergenic	novelGene_20889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	892.725881780068	166	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTTATTTAAACTACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90872	302803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91193_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317
894251	contig_10818_pilon	+	4821	3	Intergenic	novelGene_178657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1396	2100	60380	61084	TRUE	50	AAAAAGACCAGACTCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFKTVEGRISGIEDKHLDTPLFQENSEKRTKINEETLRVMWGTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKNEKLVIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQTRRQWDNIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLQSEDKQRQPTGRT	565	66488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10818_pilon_+_837_59255_61792_64474
894252	contig_10197_pilon	-	2062	12	Intergenic	novelGene_115274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	282.109673298515	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	63	788	1174035	1171302	TRUE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLTSHLAHSD	1174097	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168536_1168688_1168830_1170017_1170160_1170250_1170491_1171232_1171328_1171744_1171899_1171980_1172095_1172981_1173111_1173247_1173486_1173970
894253	contig_6102_pilon	-	2033	12	Intergenic	novelGene_31784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1452	1751	355700	353188	TRUE	20	CACCTTTTTCACACAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLCPASLALPSPELTRTSTAYTSCTSNSAFSWSFFCWSVGFWIMVFSPSMTCCFNWCDNIPSIGVQLNEWATLFQASVTCVFWFPGLTRRRAASAQR	358418	352324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_352383_352649_352758_352864_352935_353141_353235_354960_355025_355269_355351_355504_355582_355669_355804_356495_356558_356751_356873_357036_357087_357303
894254	contig_8668_pilon	-	4809	5	Intergenic	novelGene_178658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	193	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3415	3828	119122	108970	FALSE	30	TGAATTCCCACTCCTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVEEQALDLTDREYKYLIFRIIQELKQTTKKNVEKVDKFMKKTDKLMENTDKTIEKFKKIIQEQNFKINSQLENIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISKIEDTHLDTTLFEEKSEKKKNNGK	167728	107988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8668_pilon_-_109378_119116_120837_162570_162989_166341_166959_167063
894255	contig_9363_pilon	-	1995	14	Intergenic	novelGene_6551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	628.385288661278	35	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	115	1374	759796	754006	FALSE	35	ATATATGTGTCAGGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITWD	759910	753384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754015_755027_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760
894256	contig_2036_pilon	-	6403	10	Intergenic	novelGene_131799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2075	137	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	5604	6161	244889	244332	TRUE	50	GGAGAGTAAGAGGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQESKQKAYKKKEQIDKFVEKADKKMENKDKKMEELKEIIQEQNAKMNSQLENIQKQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRVSEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEWRRKQKTQRRSLKNC	536373	243506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_243593_244175_245575_259278_260296_270812_271170_295774_296475_315511_316134_476894_476911_481582_482492_531511_532783_536347
894257	contig_9443_pilon	-	4267	4	Intergenic	novelGene_167134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3126	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3572	3940	226123	160527	FALSE	20	CCATATAACTGTTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEETKRNRKKQHQQQTNGTQGASQCGWMESKWHRTEASASWPRDCVRKKQRRLSGGEEGWRVGKHILMITSCSVYCWELHEAAFPVLPVCQSPTGVQDGRILSALADKGPLHEAAKIEQRGG	296403	160199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_-_160560_225787_227623_290681_291672_295321
894258	contig_19185_pilon	+	3686	1	Intergenic	novelGene_163639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	563	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGGCAAAGGTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88941	92627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_88900_92600
894259	contig_11417_pilon	-	1798	13	Intergenic	novelGene_103291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCAAGCCCGGGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542968	479695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_479752_514599_514757_517435_517511_521567_521628_528471_528609_529167_529346_530871_530957_536806_536969_537760_537849_538884_539048_539277_539442_540494_540616_542616
894260	contig_5447_pilon	+	5638	5	Intergenic	novelGene_178326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1404	1742	310286	310624	TRUE	35	TAACTATAGCCACCAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSVSSFLRKGHIIFQNGCIILHSHQQCISVPISPQSLQHLLFPGFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLIASDHEHFLMCLLAI	308882	406124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5447_pilon_+_312104_368696_368705_402140_402551_403038_403669_404755
894261	contig_15327_pilon	-	1411	11	Intergenic	novelGene_70788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	90.1033295722195	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	353	1342	1192098	1185925	FALSE	15	TTGGCCGGGCGAGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1192450	1185855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963
894262	contig_9482_pilon	+	1541	4	Intergenic	novelGene_44235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	338	junction_1	36.0030862874591	224	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	50	430	263283	285606	FALSE	20	TTTTGAGTTTTATTAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHRFFSPSRLVSQARPMAAYSYRTGAAPAPGAALPDQSFLWNVFQRVDKDRSGVISDNELQQALSNGTWTPFNPVTVRSIISMFDRENKAGVNFSEFTGVWKYITDWQNVFRTYDRDNSGMIDKNELKQALSGFGNSLVLTA	263233	286717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_263372_264009_264072_278052_278098_285421
894263	contig_21025_pilon	-	2606	1	Intergenic	novelGene_76484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATACTTTCAGGCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20714	18108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_18100_20700
894264	contig_7963_pilon	+	2848	11	Intergenic	novelGene_58546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_9	113.761197251084	943	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	886	2448	247452	253116	FALSE	15	TACAGTGGTTTCTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246083	253516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
894265	contig_7009_pilon	+	2747	5	Intergenic	novelGene_23621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_1	572.984020283288	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	176	775	444955	518263	FALSE	35	AGAATTGGACAGGGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	431117	520235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991
894266	contig_13901_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_146671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCACACACATCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280124	278277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_278300_280100
894267	contig_9440_pilon	-	4326	2	Intergenic	novelGene_59024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	1113	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2165	2464	243128	238045	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVLQFGDLNAVSPGNLDKDEGSEVESEMDEELDDSSEPQAKREKTELTPAYSVGCMQPVLESSVQPSLLNPIHSEHIVSSTQTIRQCSATGNTYTAV	245292	236182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_238284_243067
894268	contig_6847_pilon	-	4207	4	Intergenic	novelGene_143865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	887	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAAAATGGCGGCGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85640	74262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_74315_77515_77988_81026_81090_82020
894269	contig_3601_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_132844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTGTAGATACAATCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125933	124054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_124100_125900
894270	contig_17047_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_177555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGAAAAATTCTAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73532	71477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17047_pilon_-_71500_73500
894271	contig_12425_pilon	+	2703	9	Intergenic	novelGene_46659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1926	2588	207185	211162	TRUE	20	CCCGGAGACAGCCCGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVFFVGWGIARLTGLAAFRSLFSFSLAWGPGAIDMVLTWRDGVGSAAYMGVIEATGNQAFLSPEIPSSSRKAPIAAVPTLHVTAGEQVLCRHLHIDVLTGVNADPVRNGLHSPKCPTRATGTLVSDLFDGWTVWPVFPGIKVFRQIHFLSKVNSLGQLGSIQQGATQSLHVAHINIVEVVSSLPCSVMFVDMVDQLIRQGIEIQSALGTDQHHQAAEGS	202468	226595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204322_204828_204880_207163_207327_207650_207738_208645_208764_209380_209497_210302_210388_211047_211198_226515
894272	contig_11594_pilon	-	3698	7	Intergenic	novelGene_80938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAACAGATAATAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570405	559605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_560432_560909_561096_563007_563102_563558_563656_566671_566776_567338_567455_568130
894273	contig_15456_pilon	+	6233	3	Intergenic	novelGene_139484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	548	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTAATATCAGGGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61668	68283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_62276_62421_67618_67853
894274	contig_15264_pilon	-	6894	1	Intergenic	novelGene_158860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	913	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACAGTTGTACTGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17119	10225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_10200_17100
894275	contig_753_pilon	+	7825	15	Intergenic	novelGene_113017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	941	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAATTCAGAAATAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366878	1502379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1373004_1375806_1375955_1376473_1376643_1378152_1378352_1393774_1393881_1398456_1398515_1409146_1409233_1411938_1412001_1413280_1413398_1415056_1415167_1416770_1416901_1435781_1435941_1442710_1442831_1445130_1445232_1502244
894276	contig_5947_pilon	+	3294	8	Intergenic	novelGene_101497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.978501860794	103	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	191	2842	399990	413932	FALSE	60	AAAAAAAAAGACACTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNPHQGRRNHEGQASDEARGQRHGQENDTRRRNGNQEVRNRRPPRPSENFQQWRAPFQKPAEQPQQVKRLGYKFLESLLQKDPSEVVITLATSLGLEELLSHSSMKSNFLELICQVLRKACSSKMDRQSILHVLGILKNSEFLRVCLPAYVVGMITEPVPDIRNQYPEHISNIISLLQDLVSVFPASSVQETSMLISLLPASLNALRASGVNIEEETEKNLEKVQTIIEHLQEKRREGTLRVDTFTLVRPEAEDHVESYQTMPIYPTYNEVHMDERPFLRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGIYKCQKTSIVRVGGRSNSEILKQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPVQDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAGQEEAAGEWQTQRSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRYCAHPPQPQPTPPPAFSNIN	397108	414384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_397148_399838_401644_405970_406103_407655_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728
894277	scaffold_13505_pilon	+	5761	6	Intergenic	novelGene_111595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3420	3932	659510	660022	TRUE	70	CAAAAAGAGAAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	652843	661922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_656131_656809_657049_658080_661614_661684
894278	contig_5033_pilon	-	2312	7	Intergenic	novelGene_28925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_6	883.719742527762	29	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	130	1068	477189	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477318	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
894279	contig_7678_pilon	-	6154	24	Intergenic	novelGene_175946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.998030121612	439	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	237	2558	84409	58711	TRUE	55	ACAAGAAGGAGAGAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRASNLQDLVYKNGQAGITKASVSVTFDNSDKKQSPLGFEVHDEITITRQVVIGGRNKYLINGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKKIAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKERSAEELKEMQDKVVKLQEELSENDKKIKELNHEIEELEKRKDKEIGGILRSLEDTLAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLESEENKRKELEKNMVEDSKTLAAKEKEVKKITDGLNALQQASNKDAEALAVAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAETEAKQAQMKLKHAQQELKAKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKKLKEKLEAEMKKLNYEENREESLLERRRQLSRDISRLKETYEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDTEVTGKKLLEKGELKRRYTIIPLNKISAKCIAPETLRVAQNLVGPNNVHVALSLVEYKPELQKAMEFVFGTTFVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAASILTKFQELKDVQGELRIKERELQALEEELAGLKNVAEKYRQLKQQWEMKTEEADLLQTKLQQSSYHKQQEELDALKKTIEESEETLKNTNEIKKKSRRKV	85940	39650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_-_42295_47216_47382_47653_47771_50528_50730_55437_55633_56635_56780_58580_58776_60285_60411_63122_63259_65390_65596_67310_67431_67793_67933_68874_68993_69500_69661_71310_71545_75582_75733_75964_76199_77782_77828_78015_78127_79503_79543_80711_80835_83526_83677_84241_84470_85764
894280	contig_13740_pilon	-	1549	9	Intergenic	novelGene_34685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2951.11744725621	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	190	690	165243	160632	TRUE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRHFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSGKLTF	165432	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160595_160726_161126_161270_161574_161722_161919_162031_165237
894281	contig_8447_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_69415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAGATCCACCGTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65068	63172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_63200_65100
894282	contig_18272_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_7030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAGCACCCCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224720	223351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_223400_224700
894283	contig_2380_pilon	-	2071	5	Intergenic	novelGene_117895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	374	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTTCCTCGGCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492412	466338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_466462_486768_486899_487416_487459_487543_487811_490903
894285	contig_7165_pilon	-	4595	5	Intergenic	novelGene_116835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	91.8568859694253	569	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1936	2481	269072	263040	FALSE	40	TAGGAGGAAGACTCATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMYNFPQSPPAQYSSMHNMGLLPMHPLQIPAPSWPIHGPVMHSAPGTAPSNIGLNDPSIIFAQPAARPVAIPSSSHDGHWPRTVPPNSLVNNGAVGNSEPGFPGLNPPIPWEHAPRPHFPLVPASWPYGLHQNFMHQGSARFQPNKPFYTQAGLPMHSNQPILLSQGYPYLSVSYIQQKK	279312	260925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_263129_264752_264912_268774_269223_276517_276619_277628
894286	contig_8729_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_40146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACGCTCCCTAGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678737	677153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_677200_678700
894287	contig_20944_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_167542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTGAGCAAGAGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52209	54485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_52200_54500
894288	contig_11100_pilon	-	785	1	Intergenic	novelGene_175534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAGTAGTTACACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189962	189177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_189200_190000
894289	contig_3529_pilon	+	2159	9	Intergenic	novelGene_105405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_1	82.117199020668	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	668	1225	792703	809557	FALSE	20	AAAGATGTGTGTTCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790543	810491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
894290	contig_12540_pilon	+	3350	7	Intergenic	novelGene_148132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	184.536130157033	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	908	1702	1299826	1306832	FALSE	15	CAAATCTGTTGGTCCGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVCNKEVYGFLPVPLRAHSTLQDEAESFMHVQLEVMVKHLPAEPSQFISVPDQTPDKMGFDEVFMINLKRRQDRRERMLRALRLQGIACRLVEATDGKAMNTSQVEALGIQMLPGYRDPYHGRPLTKGELGCFLSHYSIWKEVVDRGLQKSLVFEDDLRFEIFFKRRLMNLMRDVEREGLDWDLIYVGRKRMQVEHPEKAVPHVRNLVEADYSYWTLAYVLSLQGAHKLLSARPLNKTQSPCLLSGAAARLPHALHRGRWLRE	1298918	1308480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1299938_1304153_1304231_1304300_1304408_1304836_1304970_1305784_1305913_1306223_1306382_1306752
894291	contig_19534_pilon	-	1713	5	Intergenic	novelGene_151613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_4	449.195948334354	81	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	279	893	66936	62762	FALSE	20	TACTCAAGGCTTGCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEVNSTRWLHNGTVLSETTSSLNIVNAGMQDSGEYICQNQRHNPSKPVFLEVFSDWLLLQVSTEVVTEGQPFLIRCHSWKNLKAYKVIYYKDGEALQYWYENHNISIPKATLKDNGTYHCEGFVQKLHRISDSLNITVQEAEQIKNYWPQFFIPLLVGILFTVDTALFFFTRQQFKLLLKIKRTRRGSRLLDPQPKTDPQKK	68707	61941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19534_pilon_-_62953_64567_64823_66767_67023_68150_68233_68597
894292	contig_11855_pilon	-	2220	12	Intergenic	novelGene_67146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	241.430208247737	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	66	1262	2723908	2710145	FALSE	25	TAACCCTGAATTTATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLALPGCCCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGAYSFADLFAFSPRPPSQNAPPATCTLLMI	2731354	2709186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710234_2711784_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
894293	contig_13014_pilon	-	1656	2	Intergenic	novelGene_169320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	0	753	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGACTGAAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285638	281506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_285401
894294	contig_10765_pilon	-	4787	1	Intergenic	novelGene_122922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	508	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAGTTTTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201283	196496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_196500_201300
894295	contig_9366_pilon	+	2145	11	Intergenic	novelGene_166257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	434	junction_2	217.139793681398	50	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	42	1607	979076	1022616	FALSE	20	CCAGCTGCCTGTCAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYTQDGVCLTESGMSQLQSLTVTVPRRKRSKPKLKLKIINQNSVAVLQTPPDIQSEHSRDGEMDDSREGELMDCDGKSESSPEREAVDDEPKGAEGAEGTKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRSRTGQGKTKRSMIRKDSSGSISEQLPSRDDGWSEQLPDTVVDESVSVTESTEKIKKRYRKRKNKLEETFPAYLQEAFFGKDLLDTSRQYKLSLDNLSEDAAQLSCKTNLNTNFLDPSLEPLLSSSSTPAKPATHGTADDPLADLSEVLNTDDDILGIISDDLAKSVDHSAGIDIGHVADDPSSLPQPSVNQSSRTLSEEQLDGILSPELDKMVTDGAILGKLYKIPELGGKDVEDLFTAVLSPATTQPIPLPQPPPPSHLLPVHNQDVFSRIPLMNGLIGPSPHLPHNSLPPGSGLGTFSAIAQPPYTDARDKNPAFNPMVSDPNSSWTSSAPTMEGENDTMSNTQRSTLKWEKEEALGEMATVAPVLYTNINFPNLKEDFPGTLWVFYCYFINFLSCMYNDLFLNCNRKPSHH	979034	1023154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_979239_986838_986968_996452_996573_998922_999054_1001880_1002062_1005400_1005506_1006881_1007020_1007200_1007234_1007333_1007454_1021922_1022056_1022303
894296	contig_1339_pilon	+	269	3	Intergenic	novelGene_163146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9682	junction_2	756.5	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGCCTGGGCCTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431711	434172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431736_433677_433797_434046
894297	contig_8291_pilon	+	3473	8	Intergenic	novelGene_99934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	536	junction_2	173.685265433114	855	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	56	901	8126	32394	FALSE	40	CAACATTTTGTAAACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGVVEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVVEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELQELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEYHADKGVYPPIQVHITLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRIETSRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTESIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA	8070	34966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_8256_8542_8639_17013_17092_19124_19202_20886_20986_26950_27062_30085_30200_32253
894298	contig_5317_pilon	-	5085	3	Intergenic	novelGene_76538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	587	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	635	1195	205314	204250	TRUE	30	CAAATGCATCAAGTTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHQQWNVARNVDVKCASGGAFKENDKHIIGQRRKGNAFYVVAKNLSELCSSVWWKAELVSDELGYLADEISKQDLKGAMWFLLATYSKMREETGGLKIELCKMKTELKDLENSVVQTKDTCPRMFSKDAATQSFVKEIKLMDLTNYHSRKPISSDGRGQRKDERKECCLPLGILQAGNRPKELHL	205948	34362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_38009_204005_204372_204875
894299	contig_12964_pilon	+	3975	2	Intergenic	novelGene_131674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	825	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTCTTGGGTTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201581	210339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_205521_210303
894300	contig_12677_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_110887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTGAGGAGAGGCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3190	3787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3200_3800
894301	contig_19956_pilon	+	675	2	Intergenic	novelGene_178660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTGTTCGTTTGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42390	43167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19956_pilon_+_42806_42907
894302	contig_10437_pilon	+	3363	2	Intergenic	novelGene_38222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	252	551	274724	275023	TRUE	40	TGAGATAACAGCACAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDKIYWPKGEWRKPEGMVPRHPFSSVVKLSPRFTVQTRSRQPRETIWD	274472	308230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_277248_307642
894303	contig_8978_pilon	+	3038	14	Intergenic	novelGene_49459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	206.884354397993	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	1109	2941	1749586	1772309	FALSE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680802	1772406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1684923_1685023_1696766_1696943_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
894304	contig_2311_pilon	+	3998	6	Intergenic	novelGene_169815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	442	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1900	2331	275917	436094	TRUE	35	TACACTGGGTAGTATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNKVEEKADKNEEKIDKFMEKAEKFMENTDTKMEEFRKIMQEQNAKKNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIGGLKSRFEMVEDRISGIEDKHLDTDLFEEKSEKRRKKNEETLRITWDTIKSKNLQVIGVPEQREKT	272324	446691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_272888_273994_274080_274665_275931_435676_436297_436874_437073_445424
894305	contig_8954_pilon	-	1707	6	Intergenic	novelGene_130290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185920	163885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_165030_169462_169552_173747_173871_174324_174401_182928_183071_185787
894306	contig_12257_pilon	-	2699	4	Intergenic	novelGene_152092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.2409571424915	732	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	95	601	148314	118522	FALSE	15	TTTTGTCATTCACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGRGGRRNTTSPVPSSGGAAPRCSPPPAAMSERLRPRKRRRNGNEEDNHLPPQTKRSSRNPVFQDSWDTEKRSFQSGETVLSKTCLVCSMRVKKPHSWFFQQREWREQQQQQQQQPGQGKWARERLKPDHHWLQPQHPPACPRAVCALPRPLLPHQPDPEGGPLPQPTAPRTASDMMLRQSLAFCEGTALCRVDTST	148408	116423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_118821_133696_133782_138594_138695_148291
894307	contig_5018_pilon	-	2681	3	Intergenic	novelGene_47211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2136	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1418	1741	1631492	1631169	TRUE	65	AAAAAATCACAAACTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMAALFTIAKSWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCYETSIVKTHEKVYTQKVTIFVDYQGWEGWGGNTK	1633109	1630097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1630530_1630660_1631769_1631968
894308	contig_11498_pilon	-	1343	9	Intergenic	novelGene_65533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	199.062019230189	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	100	1050	293031	284981	FALSE	40	GGAATTAACGGGTGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFTWDALDLGDRGVLKELYTLLNENYVEDDDNMFRFDYSPEFLLCPCLLSRALRPPGWLPQWHCGVRVVSSRKLVGFISAIPAIIHIYDTEKKMVEINFLCVHKKLRSKRVAPVLIREITRRVHLEGIFQAVYTAGVVLPKPVGTCRYWHRSLNPRKLIEVKFSHLSRNMTMQRTMKLYRLPETPKTAGLRPMQKKDIPVVHQLFTRYLKQFHLTPVMSQEEVEHWFYPQENIIDTFVVENANGEVTDFLSFYTLPSTIMNHPTHKSLKAAYSFYNVHTQTPLLDLMSDALVLAKTKGFDVFNALDLMENKTFLEKLKFGIGDGNLQYYLYNWKCPSMGAEKVGLVLQ	294015	284687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_285002_285657_285796_286839_287008_287602_287774_290292_290402_291015_291187_292007_292143_292993_293086_293970
894309	SIRV6	+	802	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	806	418	-392	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	109	441	2002	10736	TRUE	50	CGCATGGAACAAGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1893	11407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894310	contig_4232_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_63300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCAGCCCAGGAGCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468109	466721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466700_468100
894311	contig_5935_pilon	-	3592	2	Intergenic	novelGene_102771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAAAATCCACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414003	1410285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1410409_1410534
894312	contig_5959_pilon	+	3773	13	Intergenic	novelGene_150221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	137.38275304176	642	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	289	1968	477198	515296	FALSE	40	ATCAATAAATTATTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDTLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMVEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRLGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF	459985	517101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_460112_461053_461109_477090_477337_485878_486054_492721_492889_498836_499045_501956_502128_504497_504616_506230_506412_507491_507632_510674_510774_511296_511432_515149
894313	contig_5041_pilon	+	2956	2	Intergenic	novelGene_27005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGTATTATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27239	30392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_29325_29521
894315	contig_13740_pilon	-	2223	14	Intergenic	novelGene_34756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_8	305.279792124028	18	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	746	1312	745369	687607	TRUE	60	TTAAAGGTAGTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQFTAASPKDAKEWVQQLKFVLQDMESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873896	686315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_744416_745291_745417_757233_757318_757593_757675_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
894316	contig_12119_pilon	-	5512	1	Intergenic	novelGene_88688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGAAATGAGCTGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408398	402886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_402900_408400
894317	contig_8330_pilon	+	5677	22	Intergenic	novelGene_71922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	824	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4621	4962	1311188	1314995	TRUE	5	GCCGCTTCTCTGTTACCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCWLRLRLDAMGGDLMNLARSCDVHHVIGLHLNFVARGQEGVEAHDQVRVAFEQLRHPTNHSWCVNALRLKFLHDVKEIIVDLRLTTKLQLHLVQIGQCILHLWCWCSTKN	1282573	1345196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1284273_1286210_1286418_1286965_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295232_1297669_1298241_1299194_1299387_1300724_1300962_1303329_1303449_1303746_1303955_1304514_1304633_1306741_1306834_1308628_1308788_1308923_1309077_1309645_1309898_1311109_1311393_1312058_1312164_1314963_1315042_1318948_1319133_1323298_1323520_1344932
894318	contig_9366_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_166284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTACTGCAGTGGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1067140	1093067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1067238_1090992
894319	contig_11055_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_142179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATCTGCCCAGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279090	277164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_277200_279100
894320	contig_3018_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_78923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632630	630528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_631364_631703
894321	contig_11338_pilon	-	6199	11	Intergenic	novelGene_6277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4686	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	4666	4992	190069	189743	TRUE	20	CTCTCCTACTCCAATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEISAEVRFHHLIWANLIKQVACQEYFASPTSQKLVHTRSEIRKRVQLIMFQRNQGISILGSMSNPVPKSHDEEFGVCPPDPRLETTAKSWVSLHLTIHLGKPMSLP	194734	172053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_172159_172307_172393_176282_176348_176429_176471_176648_176694_177541_177685_177767_177829_179435_179532_179741_179896_183194_183303_189438
894322	contig_13888_pilon	-	1728	8	Intergenic	novelGene_151821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_5	33.8935909900984	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	535	1386	377909	369361	FALSE	55	TATCAATAAAATCCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCTTKKTFDPYIIIRARDLIKLLARSVSFEQAVRILQDDVACDIIKIGSLVRNKERFVKRRQRLIGPKGSTLKALELLTNCYIMVQGNTVSAIGPFSGLKEVRKVVLDTMKNIHPIYNIKTLMIKRELAKDSELRSQSWERFLPQFKHKNVNKRKEPKKKTVKKEYTPFPPPQPESQIDKELASGEYFLKASQKKRQKMEAIKAKQAEALSKRQEERNKAFIPPKEKTVVKPKEASIETKIDVAAIKEKVKKAKNKKLGAFTAEELKLKMEANEKKKKTKK	378443	369018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_369504_371205_371300_371407_371486_374689_374861_375937_375995_377335_377420_377510_377637_377810
894323	contig_9727_pilon	+	4146	22	Intergenic	novelGene_86324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	191.734261964012	962	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	71	1795	343348	359820	TRUE	10	TGAGGTGCCGTCTCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIESLTRARIDRSKELASKTREKERMKEAKDARYTNGHLFTTISVSGMTLCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALTKNNTALQSVSLRCKTTTRERPTSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLSKSVSTTNIAGHFNDESSLGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEGAEVIYNELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELQLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHHLGDLLISQFSGPSAEQMRKTYSEFCSRHTKAVKLYKELYARDKRFQQFIRKVTRSAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPVLINRILQHSHGIEEERQDLTVALGLVKELLSNVDQDVHELEKEARLQEVYNRMDPRAQTPVPGKGPFVREELLRRKLLHDGCLLWKTATGRFKDVLMLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTVQDKPSVISLQQLLVRHIASQEKGMFLISGSPPVMYEVHTASCDDRDTWIRLIQQSVCV	343277	367165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_343411_351017_351163_353409_353478_353819_353884_354529_354660_354902_355013_355148_355296_355781_356033_356243_356370_356756_356875_357051_357301_359134_359212_359643_359825_361505_361574_362510_362712_363046_363167_363295_363364_363512_363549_363756_363808_364238_364683_365035_365220_365990
894324	contig_15225_pilon	-	2229	3	Intergenic	novelGene_178661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTAATCAGTGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28056	139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15225_pilon_-_291_492_2542_28027
894325	contig_11825_pilon	+	2354	14	Intergenic	novelGene_155388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	333.303831041562	68	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	13	1050	10468	30574	TRUE	60	AAAGAAAAAGATCAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAITSEERTKHDKQFDNLKPSGGYITGDQARTFFLQSGLPAPVLAEIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPMVLPPVMKQPPMFSPLISARFGMGSMPNLSIPQSLPPVAPITTPLSSVTSGTTLPPLMMPAPLVPSGSTSSLPNGTASLIQPLSIPYSSSTLPHTSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAVPQPSRLKYRQKFNSLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADIDGDGQLKAEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRSVSLEVKRCGFYHLTDVIITLEFPEA	10455	57112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21491_29629_29694_30354_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030
894326	contig_16541_pilon	-	6127	6	Intergenic	novelGene_126728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	195.776811701488	524	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	37	492	353170	290932	FALSE	35	GACTTGAGTACTAAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGLAGLVGDGSIMASMQKRLQKELLALQNDPPPGMTLNEKSVQNSITQWIVDMEGAPGTLYEGEKFQLLFKFSSRYPFDSPQVMFTGENIPVHPHVYSNGHICLSILTEDWSPALSVQSVCLSIISMLSSCKEKRRPPDNSFYVRTCNKNPKKTKWWYHDDTC	353206	285296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_290946_301648_301725_306336_306493_316655_316759_319826_319919_353155
894327	contig_8304_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_153166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	848	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCCCATGTTGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68728	67244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_67200_68700
894328	contig_9053_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_87933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAAAAAACATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133325	134788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_133300_134800
894329	contig_610_pilon	-	5033	6	Intergenic	novelGene_76809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_4	68.9770976484224	505	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	74	1423	343470	331286	FALSE	70	AAAAAATAAAATATTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCRLIHTHTQSSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	343543	327675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338808_343421
894330	contig_10023_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_123477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCTTGCTCTTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133802	132124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_132100_133800
894331	contig_17976_pilon	+	3724	4	Intergenic	novelGene_32476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	322	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	247	1053	41843	48725	FALSE	10	GTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRGGKRR	41596	51396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47156_48705
894332	contig_4232_pilon	-	3585	9	Intergenic	novelGene_63478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_3	300.792598811872	27	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	1452	2369	614173	608965	FALSE	10	GATCTCTGCTGGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKSKKGPDGLALPNNYCDFCLGDSKINKKTGQPEELVSCSDCGRSGHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS	620528	607748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_611787_611936_612075_613618_613698_613873_615392_615783_615945_620456
894333	contig_3627_pilon	+	6149	25	Intergenic	novelGene_78445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	279.356800923518	273	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	207	2516	294394	321982	TRUE	40	GAAGCTCATTAAAGCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLMGIFVSFTLMVKRMLIFQHF	292747	333451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589_318776_320225_320368_321920_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842_331029_331550_331757_332370
894334	contig_12923_pilon	+	4247	18	Intergenic	novelGene_30169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_9	75.0219345087785	114	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	740	2299	310286	348947	FALSE	15	TTATTCGTGGATTCCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQDSMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLADYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRIGWFPSNYVEEDYSEYC	309546	350895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_310331_310486_310556_311497_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893
894335	SIRV6	+	1485	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	14	29	14	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	244	735	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1101	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894336	contig_16525_pilon	+	2939	11	Intergenic	novelGene_133886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	44.69776280755	321	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	15	1079	219713	226764	FALSE	30	CAGCAGATTTGCAGAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAAPFLRLRSGLRLGARGLCTRLATPPPRAPDQAAGIGSRGSTQAQGSQQQQRRSEGPSYAKKVALWLAGLLGAGGTVSVVYIFGNNSVDETGAKIPDEFDNDPVLVQQLRRTYKYFKDYRQMIIEPTSPCLLPDPLREPYYQPPYTLVLELTGVLLHPEWSLATGWRFKKRPGIETLFQQLAPLYEIVIFTSETGMTAFPLIDSVDPHGFISYRLFRDATRYMEGHHVKDISCLNRDPARVVIVDCKKEAFRLQPYNGVALRPWDGNSDDRVLLDLSAFLKTIALNNVEDVRMVLEHYALEEDPLEAFKQRQSRLEQEEQQRLAELSKSSKQNLFFGSLTSRLWPRSKQP	219698	228624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_219821_220730_220885_221236_221269_221490_221513_223044_223104_223194_223315_223737_223843_223952_224052_225050_225208_225558_225666_226662
894337	contig_5686_pilon	-	3884	1	Intergenic	novelGene_45347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAGATGCTCTAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123383	119499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_119500_123400
894338	contig_3627_pilon	-	5812	22	Intergenic	novelGene_78451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	284	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGGGAGAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333232	294389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_294465_297721_297894_298388_298434_300292_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304726_309358_309490_309605_309769_312559_312785_313377_313492_314035_316054_318593_318774_320223_320416_323437_323678_326343_326456_329122_329208_329564_329710_330614_330737_330838_331027_331548_331755_332368
894339	contig_9363_pilon	-	3237	17	Intergenic	novelGene_6756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	247.742360818149	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	424	2076	1528505	1506537	TRUE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1528928	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506138_1506190_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378
894340	contig_11564_pilon	-	2028	8	Intergenic	novelGene_158551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	963	junction_7	190.029106256094	16	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	9	1052	60835	41045	FALSE	25	AACCTGCCAATCACTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAVEGFIRDKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPAPEKKMEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRKSSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQMTQQMAGMNFYGANGMMNYGQSMNGGNGQAANQTLSPQMWK	60843	40068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_41171_52105_52426_52867_53034_53826_53937_54965_55048_56119_56207_59682_59762_60761
894341	contig_7396_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_79534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247838	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245100_247800
894342	contig_12951_pilon	+	4286	3	Intergenic	novelGene_68151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	462	junction_2	155.5	39	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	862	1197	193177	197098	FALSE	40	ATAATTTATCCAACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVKATTKDASLQPRNIPNRYTFPCPYCPEKNFDQEGLVEHCRLFHSTDTKSVVCPICASMPWGDPNYRSANFIEHIQRRHQFSYDTFVVSLEPGLCSLPWGTAPFPRFT	192315	200187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_193224_193596_193712_196924
894343	contig_10711_pilon	-	3776	4	Intergenic	novelGene_118417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	993	1358	214526	214161	TRUE	40	GCAATACTCATCTCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRSAILDSYWRPANGVRESSYTELPAEDKTTGNLRYMPPHPPSFFNPDSASSASRGHNLLFGKHQLLGFHLPERAGSLSAICWLLVLLFSASFDFFLTSHHLPLLLLKYLVPCTIFASF	215518	211134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_212427_212526_212895_213119_213861_214143
894344	contig_19352_pilon	-	1511	4	Intergenic	novelGene_122360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1251	junction_3	208.240779441065	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	179	394	108447	104000	FALSE	45	AACTGCCCAAAAAGGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	112905	102882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796
894345	contig_18419_pilon	-	2683	3	Intergenic	novelGene_141459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	274.5	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCCTAGTTGGTCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31604	28633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29434_29523_31359_31556
894346	contig_5945_pilon	-	1471	7	Intergenic	novelGene_104561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	311.06412343581	906	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	59	724	249708	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNAASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249766	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224478_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
894347	contig_9049_pilon	+	1556	7	Intergenic	novelGene_83130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_6	1747.1323806614	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	50	298	88356	104397	TRUE	30	AAAGCTACATTTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKAHGENNHPLCGHHQSRRSPREICGVGFIHLLESIGYG	88306	113814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113028
894348	contig_7707_pilon	+	3287	19	Intergenic	novelGene_72147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	32	junction_18	360.331620237816	646	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	944	2835	306	3140	182964	280854	FALSE	10	TATGTGTCTTCTGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGLDHLKNDYRRRFCRPSRAPDINVEQGQNILEILQDCFEEKSLANDFSANSTKSVPYSTPKIKDTCIQSPNKERQKSHPKALPPSSRKKEGCLQLVVEPNEDVSKSVQAHEVYQKILATDVGSENTAHLKNVSSRKQNDHHNEADEEFYLSVGSSSVVLDSKTSLSQNAVPSIAQKRETYTSENSLNMLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPIKENQKKVKEEFKNKYFSNGPKKKNLVPEEATLTITKSQRISRRPSNWWEVTSEHSPVGSSSSLIKNELPLHHKSRQKLAEKNQSSKNTRRETTAFKRRKTATQGSSRAQTFLNAKDSGGIIDHDEISSSQNESLESDEANLAKKKHLDCSGATGSSQNQHSSDSISTEQNVRLKSQTSGYTWKKGSDSKKLGTSVLEGSGPSKLQKYMMSGKNNSDMGRKEAQESSDDSRVKRSKVILENKIHHKLVLPSNTPNVRRTKRTRLKPLEYWRGERIDYQASQSGGFVVGGVLSPDTVSPRGKKANRKTGKVNKITNKKRICHDSGERKNKLVANLNIPLGDPFQPTRVKDPETRESILMDLVRPRDTYQFFVEHEELRVYKTLDTPFFSTGKLILGPCQEKGKQHVGLDTLVFYVDFGDLLCTLHETPYLITTGDSFYVPSGNYYNIKNLLNEESVLLFTQIKR	182658	281001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_190409_190457_200052_200124_200805_200901_213078_213179_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626_240822_247976_248266_254333_254478_256572_256656_265663_265724_269222_269328_270102_270235_270865_270962_272829_272985_278604_278696_280783
894349	contig_3132_pilon	-	1783	9	Intergenic	novelGene_127421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	126.797821353523	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	299	1372	229326	210841	FALSE	20	GTTTTTCTATTTTGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPSCPRSSSFSTPSLSLNYSSQQWPPRVTLRSGRICRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229624	210429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_229210
894350	contig_3122_pilon	-	3979	20	Intergenic	novelGene_64383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_4	98.0527869592237	485	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	977	2934	139	3072	276393	250499	FALSE	0	TTTCTGTGTTTGTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQLKIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEKKENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRLMQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKEHLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENSVTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG	277624	249591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256546_257951_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277512
894351	contig_13674_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_140314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	2138	2476	17984	18322	NA	60	GCAAGAGATCACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQPTANAKYEGIEEFCYFLQSDSHQICNQDALIITSDWNAKVRNKEEGSVVVKYGLGDKNDARDYIIEFYKTNGFFIANTFFTNISGNNRWTSPDKIHRNQIDYICGKR	15846	18558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_15800_18600
894352	contig_18364_pilon	+	4146	16	Intergenic	novelGene_102554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1007	junction_14	504.282830694575	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	859	2580	8	2587	39107	50216	FALSE	35	GAAGTTTTCATAACAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	39099	51775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41726_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
894353	contig_1719_pilon	-	1572	12	Intergenic	novelGene_87380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	280.855599496601	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	289	1299	859240	847238	FALSE	25	TAGAAGTGGGTGATACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPPPPPAPPGRSAVSGAGWGKRTREQDSVPFPLSPAGVRSPPPLPPHPLPSPALPSPLSRDLSVAPTIYVGNLSRDVTEVLILQLFSQIGPCKSCKMITEHTSNDPYCFVEFYEHRDAAAALAAMNGRKILGKEVKVNWATTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKSAFAPFGKISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVDYSQWGQWNQVYGNPQQYGQYMANGWQVPPYGVYGQPWNQQGFGVDQSPSAAWMGGFGAQPPQGQAPPPVIPPPNQAGYGMASYQTQ	866336	846964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848273_848617_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392_851469_853348_853437_853592_853648_853889_853989_859228_859326_866133
894354	contig_2940_pilon	-	6201	2	Intergenic	novelGene_81952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1227	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTATTTTCAAATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140878	937562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_938139_1135253
894355	contig_17198_pilon	+	3762	1	Intergenic	novelGene_62418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTCTGTGCTCTTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121867	1125629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1121900_1125600
894356	contig_13800_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_153746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGAGAAATAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172417	174627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_172400_174600
894357	contig_5961_pilon	+	5210	18	Intergenic	novelGene_144102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	492.154088735249	93	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	620	2017	172953	207020	TRUE	35	CTGAACTCCATACAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKVKIKISTEIR	113671	215702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155766_170381_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
894358	contig_9363_pilon	-	2120	11	Intergenic	novelGene_6753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.7372598329	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	156	1286	1548961	1506155	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGVTMHLSLAVHRCLRLPH	1549116	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506205_1535771_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
894359	contig_14970_pilon	+	2337	10	Intergenic	novelGene_44954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5460.81810675486	32	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	133	633	136145	191822	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISNGLKPTASLWEKRCGSLLP	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191764_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
894360	contig_5988_pilon	+	3967	7	Intergenic	novelGene_16097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1957.31488410924	80	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	120	704	1218380	1221967	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGKYGLESRERVSPLAKILTRTLLLSSQFPCDCWVEIESLQFSFWKNKEWP	1216719	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1216807_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1224954_1226660
894361	contig_19744_pilon	+	4147	20	Intergenic	novelGene_120362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_19	116.4615661877	67	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1360	4080	68	4147	97795	177984	FALSE	80	AAGGAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENVKYAVRLRNYGSRTANGDGGMTTVQCPDGVTFTFSTCSLSSNGTNQTRGQIPQILYYRSEFDGDLQSQLLSKANEEDKNCSRALSVVSTVVRAAKDLLHRALAVDADDIPELLSSSSLFSMLLPLIIAYIGPVAAAIPKVAVEVFGLVQQLLPSVAILNQKYAPPAFNPNQSTDSTTGNQPEQGLSACTTSNHYAVIESEHPYKPACVMHYKVTFPECVRWMTIEFDPQCGTAQSEDVLRLLIPVRTVQNSGYGPKLTSVHENLNSWIELKKFAGSSGWPSMVLVLPGNEALFSLETASDYVKDDKASFYGFKCFAIGYEFSPGPDEGVIQLEKELANLGGVCAAALMKKDLALPIGNELEEDLEILEEAALQVCKTHSGILGKGLALSHSPTILEALEGNLPLQIQSNEQSFLDDFIACVPGSSGGRLARWLQPDSYADPQKTSLILNKDDIRCGWPTTITVQTKDQYGDVVHVPNMKVEVKAVPVSQKKTSLQQEQVKKSQRIPGSPAVTAASSNTDMTFGGLASPKLDVSYEPMIVKEARYIAITMMKVYENYSFEELRFASPTPKRPSENMLIRVNNDGSYCANWTPGAIGLYTIHVTIDGIEIDAGLEVKVKDPPKGMVPPGTQLVKPKAEPQPNKVRKFVAKDSAGLRIRSHPSLQSEQIGIVKVNGTITFIDEIHNDDGVWLRLNDETIKKYVPNMNGYTEAWCLSFNQHLGKSLLVPVDEPKTNTDDFFKDINSCCSQEATMQEQDMPFLRGGPGMYKVVKTGPSGHNIRSCPNLRGIPIGMLVLGNKVKAVGEVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAK	97727	177984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_97908_100436_100580_101977_102079_102940_103160_107540_107767_109166_109286_109896_109985_112280_112331_115990_116164_117380_117526_122039_122256_130481_130538_133818_133935_137853_137952_138751_138869_139774_139916_151814_152040_152925_153059_156119_156243_176506
894362	contig_10042_pilon	+	1913	9	Intergenic	novelGene_79096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	273.987881803192	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	10	930	6321	49939	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASERHSCQPQL	6311	54082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_46994_49910_50060_53219
894363	contig_11413_pilon	+	4812	19	Intergenic	novelGene_103150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	168.972347799833	825	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	899	2700	107	2806	280740	407029	TRUE	5	CCACGTGGGCCCTGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLSLADALTEPSPEIEEEIKRDFIATLEAEAFDDVVGETVGKTDYIPLMDVDEKTGNSESKKKPCSDISQVEGTPSSKPAVLANGDHEIKGNDTTGSPTEFLEEKVAYQDYMNNQNWPEDINFCYQPEQVVNPIQTDSFKMHKDDGLEDFLFIPSGTTNASTFTGQNDPLKDIYGMPHCDTFASATGDVHQGWLMEAPDSPHSASFISPESIKQPLQPTEEPAKEVEVASAKERTPTEVLEILPPRETEIAPAKDVGPATETEMALAKDMEPSTKSDVALAKDTEPFIDSDLTLVKDMVLPKETEVVPGKDVVLPTETNVSLDKDTVLSTETAVTLGKNLTLLKETEAALPIKMDLASAEGMVSLSEIEVAMAKDNVTSAEISLAKELSLYPETEVALASAVTLPAETKVVLTKDVAPPPEAEVTLVKDTAPPPKAEVAPLKVLTPSAETVVAPVKDVAASPETEMTPAKGMALPPETEVAPVKDVAPSSEAEVAPVKDVASSSETEVAPVKDLAPSPETEVAPVRDVAPSSETEVAPVRDVAPSSETEVAPVRDLAPSSETEVAPVKDVPLLPEEVALVMGMPLPPKTEVAVPKDVALPSATDVTQANNLTPTKDVAPPSKAEVTPAPVQDVEIARTQEGISEDSQLESLQDEGQSVAPTSVISPEPVTAMGQKYNLPTDENSASEKLEQKKQISSQLNELSSETSAKPEEGRPTVSTTGNDITAPPNKELPPSPEKKTKPLATTQPAKTSTSKAKPQSISSPKQPAPTTIGGPNKKPMSLASGLVPATPPKRPAAATARPSVLPSRDGKPKPVTEAKIPEKRASLPKPASAPATRPSSKSTQTVLKGPATATPAAAVPSSRTPPPCLYPKGPLPSRLRENLQTSRRWLRSLRQLT	199403	426371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_199491_280720_280963_312527_312597_351380_351504_364503_364618_366246_366385_367194_368533_369198_369322_401251_401353_402182_402399_406041_406228_406836_406897_407020_407314_408831_408946_410819_410913_419493_419576_421707_421821_423791_423877_425136
894365	contig_9332_pilon	-	3669	9	Intergenic	novelGene_60699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_8	373.476488550484	559	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	169	1533	73851	41510	FALSE	15	TCAAGGTGGCCAGTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFVGLVSFPGGCVVLSEETSRGPPPPSRFTQSPFSSAFLHAGPATSPPRVVTFDEVMATARNLSNMTLAHEIAVNENFQLKQDALPENSLAGRVKHIVHQAFWDVLESELNAEPPEYEHAIKLFEEIREILLSFLTPGGNRLRNQICEVLDTDLIRQQAEHSAVDIQGLANYVISTMGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRQIFHVLDLMRMDMVNFTIRSLRPHLQRQLVDYERTKFQEILEETPSALDQTTEWIKESINEELLSLSEATLTPGAEGSSKPTLSPTLVLNNSYLKLLQWNYRKKELPETLMTDGARLQELTEKLNQLKIIACLSLITNNMVGAITEGLPELANRLKRISAVLLEGMSKETFNLKEVLNSIGVQTCVEVNKTLEERGLSTLNAEVQANLVGQFSSIEEEANPIWSLIDKRIQLYMKSLLCLPSPPKCMPPIPGGLAVIQQELEVLGSHYANIVNLNKQVYGPFYANILRKLLFSEEAVGKTETLSPTN	86307	39373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66121_68156_68378_69415_69537_73753_73890_86177
894366	contig_15732_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_88925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGGGAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392727	394930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_392700_394900
894367	contig_8312_pilon	+	3917	1	Intergenic	novelGene_152888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTGTCAAGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273343	277260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_273300_277300
894368	contig_5684_pilon	+	1477	3	Intergenic	novelGene_81063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	31	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	9	809	441614	447039	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGGTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	441605	447707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_441837_443891_443949_446518
894369	contig_12327_pilon	-	4028	14	Intergenic	novelGene_140681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	178.447081642557	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	824	2140	1148769	1139988	FALSE	35	TCATAAAAATCATTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLESWRNFEDEFGTVSDKERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155097	1138099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148881_1151129_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
894370	contig_5758_pilon	-	5570	4	Intergenic	novelGene_119047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	26.5497436689865	1692	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	629	1252	31067	27444	FALSE	20	AGCATGGATTTTGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAVLPPEEGMAFLALKTLVQKRILMLLMKQPEEEISGVEVGVHHEEEGRAYFQLLMSSLALKEDGNQTPGMEIESQAQVMNISVMLPALIIPLTMVIPQPAENGPLLSKAWTWHHCHPESAPGMTGRGPLSTEKWKPLEGLQKIEVAKAEGAQDLPRECQNPGVPAPWMVIIMTTTTEMNLLGALRAVVPLLEGAGVAVTGVEGVT	31695	23125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_27621_29664_29881_30725_30819_30929
894371	contig_15327_pilon	+	3349	1	Intergenic	novelGene_70518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1224	1685	474338	474799	NA	50	AACAGAATGCGGAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGPAVSSHLPQRASPAPSERRTNQGRQWPGRPPFSSLPPQQHPHPSTSCLHLAVSLHNQKQSLLRAAAVQRMELGKAGSLLSHCVRRGVICEGKWRSKIKNGITLMVKKNISRSILKSNAVSDRIISIPLQGRPVNMDYYSNLPTNHECQR	473114	476463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_473100_476500
894372	contig_8362_pilon	-	2689	4	Intergenic	novelGene_150690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCCCAATGCAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282955	135239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_135478_154543_154667_173910_175003_281719
894373	contig_6227_pilon	+	6504	3	Intergenic	novelGene_49682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1200	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACTCAACAACAATAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862267	915331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_867362_871005_872257_915172
894374	contig_3382_pilon	+	2888	1	Intergenic	novelGene_123992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65456	68344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_65500_68300
894375	contig_10861_pilon	+	5209	6	Intergenic	novelGene_39260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_5	209.397803235851	662	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3514	3957	1343114	1348775	FALSE	35	GTATCATAAAATGTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIYYQSLQNFPSPLTFSTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRPNCSWNTQYSSAYYTSRKI	1337517	1350027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339656_1340022_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1348714
894376	contig_17198_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_62358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATTTCCTTGGCTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727355	729855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_727400_729900
894377	contig_8447_pilon	+	2712	14	Intergenic	novelGene_69384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	556.234933975877	21	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	52	1152	5825	44901	TRUE	25	GCGAGAAACTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDKGLTEPQIQVICRQMLEALDFLHGKKIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAKNLKTLQKRDSFIGTPYWMAPEVVMCETMKDTPYDYKADIWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKVALDKNPETRPSAAQLLEHPFVSSITSNKALRELVAEAKAEVMEEIEDGRDEGEEEDSGDVTSPLGNHTQDSSEVSQLSLNADKPLKESSSTLPTPSQPQDSVNGPCSQPSGDRSLQTTSPPDVAPGNENGLAVPAPLRKSRPVSMDARIQIAEEKQVTDWGDLGPVANRSQKASQSRPNSSALETLGDEKLANGSLEPPPRWLQAHPRATQTLAASPSPRAWTTAPPSLLTCP	5773	84483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69858_83912
894378	contig_20641_pilon	+	2151	5	Intergenic	novelGene_52799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_2	1896.29999934082	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	66	410	14599	45875	TRUE	35	TTTAATTAATTGGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKAQTGASEQ	14533	86806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_45848_45965_54835_54968_85286
894379	contig_15327_pilon	+	2562	9	Intergenic	novelGene_70513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	24.6801413083475	369	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	242	778	465424	468070	TRUE	5	GCCCGGGGGCCGCTCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSVKAVRGWSGLALGVRGVVLRLPGKFTNMMMKGGNKVLARNLMIQTLEAVKRKQFEKYHAASAEEQATIERNPYTIFHQALKNCEPVIGLVPILKGGHFYQVPVPLADRRRRFLAMKWMITECREKKHRRMLMPEKLSHELLQAFHNQGPVIKRKHDMHKMAEANRALAHYRWW	465182	472541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_465507_466347_466412_466777_466946_467848_469337_469722_469813_469923_470083_470267_470379_471591_471721_472512
894380	contig_6503_pilon	-	1791	8	Intergenic	novelGene_145751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	154.189784992127	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	411	1358	134980	118803	FALSE	10	CTATAGGCTTCTTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLSCRFYQHKFPEVEDVVMVNVRSIAEMGAYVSLLEYNNIEGMILLSELSRRRIRSINKLIRIGRNECVVVIRVDKEKGYIDLSKRRVSPEEAIKCEDKFTKSKTVYSILRHVAEVLEYTKDEQLESLFQRTAWVFDDKYRRPGYGAYDAFKHAVSDPSILDSLDLNENERRVLIDNINRRLTPQAVKIRADIEVACYGYEGIDAVKEALRAGLNCSTETMPIKINLIAPPRYVMTTTTLERTEGLSVLNQAMAVIKEKIEEKRGVFNVQMEPKVVTDTDETELARQLERLERENAEVDGDDDAEEMEAKAED	139871	118369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_118929_120377_120522_121210_121309_122650_122758_126273_126426_129781_129862_134739_134982_139462
894381	contig_4125_pilon	+	3509	1	Intergenic	novelGene_25194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1246	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAAACTGCTTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1382485	1385994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1382500_1386000
894382	contig_4114_pilon	+	3857	8	Intergenic	novelGene_15587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	493.014550433124	36	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	192	692	218346	247883	TRUE	40	AGAGGCAAGAGGAACAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLFSSRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRQAVMLPEGEDLNEWIAVNTVDFFNQINMLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGEFPVWSECVYVHIHVSHFPKTLCLWQRLF	218154	252702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_218360_222874_223042_232345_232440_234095_234230_247489_247534_247835_248000_249592_251621_251681
894383	contig_3588_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_72879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	882	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGCTCCCTTTATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99426	102531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_99400_102500
894384	contig_854_pilon	+	4965	26	Intergenic	novelGene_36593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3527.68817216035	40	151	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	75	2156	1685144	1702249	TRUE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRCAVGLTGQITEDGV	1680845	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1680914_1685137_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
894385	contig_11720_pilon	+	1254	9	Intergenic	novelGene_43833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2735.65364389847	6	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	12	512	68064	93186	TRUE	20	TACTTGAGAATTTGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAMILLEVNNRIIEETHFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQVWSPL	68052	98764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68107_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87171_93175_93261_94959_95061_95383_95486_98299
894386	contig_709_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_57612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	378	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	601	945	2398619	2398963	FALSE	20	TTAGTTCATTTAGTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVMKYLSTVERPLAGGDWGRPIWAVQKPCLLCSDTWPFAGWSWRVCVSVCLCVCVCVCVCVCVCVCVWWGRGGCPSPASLAWLALLSLLPAKCLWQRAGAPVGCVSRSWDLE	2397420	2400246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2397693_2398290
894387	contig_7408_pilon	+	1821	6	Intergenic	novelGene_168724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3421	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCCAATCCCAGACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11746	38462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_13075_13131_13227_24281_24445_26364_26456_36880_36936_38373
894390	contig_14577_pilon	-	2552	16	Intergenic	novelGene_164636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_15	288.244541241557	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	242	1771	73045	50623	FALSE	55	GGTGTAAAATAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPVMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL	78735	49841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_50709_51211_51348_54480_54583_59169_59321_64582_64651_65700_65812_66512_66718_67034_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628
894391	contig_18145_pilon	+	2384	13	Intergenic	novelGene_37359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	431.398525148151	53	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	720	1862	97254	100744	FALSE	15	GGAGTCTGAGTCCTGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	92807	101266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96774_97173_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
894392	scaffold_13505_pilon	+	9083	4	Intergenic	novelGene_111599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5348	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4778	5290	659510	660022	FALSE	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	652843	663815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_656035_656387
894393	contig_5222_pilon	+	2507	11	Intergenic	novelGene_59015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	556.771092999628	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	10	1056	367032	373255	TRUE	5	GTGTTTCTTTCTCTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWMPSLCLSFLTQPDQQPPPPPQPSKCPQHLESMELIWTPHGEMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKNRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTIMEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH	367022	374839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_367155_368440_368581_368774_368840_369127_369208_369626_369754_370977_371054_371430_371556_371926_372013_372146_372228_373111_374360_374492
894394	contig_401_pilon	+	5223	29	Intergenic	novelGene_42915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	433.6307722979	1223	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	364	3060	1940664	1972939	TRUE	15	CATGTATTTCTTTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1938769	1975734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1938812_1939252_1939396_1940389_1940465_1940560_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807_1974438_1975069
894395	contig_7548_pilon	-	2059	3	Intergenic	novelGene_117635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1224	1553	206535	203199	FALSE	70	TTTTAAAACAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAWSLVVQTVPCGPSAPSSSYGLVEQGGDVLFLVPVGCAEHHHSILDRKRIEVVQHDVIGLREQGWITLNARVLVQDDLEQMWREDGGRFKPLLGFGDIGLLVVGSWR	207758	202692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_-_203320_206056_206126_206395
894396	contig_4315_pilon	-	3627	20	Intergenic	novelGene_46804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.556825271086	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	79	2718	358035	328205	TRUE	65	TAAAAAAGAAAGAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEPDTTGAGPCSLHVDVDVNSVSSEVEDRPPELPAPLRHKELQMEQDFHGLLERYISVKSLPEAMSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	363188	327092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327516_327718_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119_347297_347399_347555_350049_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155
894397	contig_7840_pilon	+	2219	9	Intergenic	novelGene_69028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAATCTCGGCCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364879	445686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_366019_378784_378875_389411_389509_393093_393317_395376_395442_403143_403288_406624_406882_427609_427740_445612
894398	contig_4754_pilon	-	3129	1	Intergenic	novelGene_35927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2239	2559	267888	267568	NA	20	AGATTCTGACCTCTGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSVQRTNGPQLPRPLPTESSTSRWYLATTTNSSDRDHNRGSWTELEKDVEQNSNSQKQTRFTGLTDWRNPESMASGHPFSPVVKPLPKFTIQLGIGQPHKTKQD	270126	266997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_267000_270100
894399	contig_9706_pilon	+	4369	22	Intergenic	novelGene_20894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	575.684299506607	720	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	240	2423	231608	737731	FALSE	10	TACTCTGTTGCCTCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNSRRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN	91199	739677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555638_688565_688730_698010_698124_709109_709218_717615_717699_731069_731148_737530
894400	contig_16303_pilon	+	2398	8	Intergenic	novelGene_34049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	101	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1431	1736	37468	38653	TRUE	45	AGAACAATGAGGCTAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLLRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	32077	48060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33110_35588_35766_35982_36028_37168_37302_37424_37703_38582_38855_40432_40730_47896
894401	contig_3382_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_124202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCCAGTCACAACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392014	1391114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1391100_1392000
894402	contig_9706_pilon	+	2630	17	Intergenic	novelGene_20892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	725.162328271229	112	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	363	1580	231608	423751	TRUE	40	AAATAGCCTTTAATGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRVSTQGPVR	91172	454424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_424159_453616_453946_454110
894403	contig_4857_pilon	-	3171	1	Intergenic	novelGene_48818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATGCCATTTCCCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334516	1331345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331300_1334500
894404	contig_2854_pilon	+	2330	7	Intergenic	novelGene_120799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_4	160.593344265017	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1610	1954	86470	86814	FALSE	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	68190	87190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_80617_80778_82393_82502_84541_84650_86465
894405	contig_1813_pilon	+	2731	11	Intergenic	novelGene_105495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	423.730149977554	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	394	933	129358	149975	TRUE	10	AGCCGTGGTATTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDVYKLTSELLGEGAYARVQGAVSLQNGKEYAVKIIEKQAGHSRSRVFREVETLYQCQGNKNILELIEFFEDDTRFYLVFEKLQGGSILAHIQRRKHFNEREASRVVRDVAAALDFLHTKGIAHRDLKPENILCESAEKVSPVKICDFDLGSGIKLNNSCTPITTPELTTPGGGLHG	128964	156300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_129368_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149954_150119_152059_152225_153457_153502_154854
894406	contig_13014_pilon	-	2189	9	Intergenic	novelGene_169319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	272.309767314726	797	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	48	782	308816	282909	FALSE	30	AGGACTGAAAGTGCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGLAVAAPVGSRRRMEEEDEAARALLADGPGVLPALCDPSRLAHRLLVLALMCFLGFGSYFCYDNPAALQIQIQRDMQVNTTKFMLLYAWYSWPNVVLCFFGGFLIDRVFGIRWGTIIFSCFVCIGQVVFALGGIFNAFWLMEFGRFIFGTGGESLAVAQNTYAVSWFKGKELNLVFGLQLSMARIGSTVNMNLMGWLYSKVEASLGSAGHTTLGVTLMIGGITCILSLICALALAYLDRRAERILHKEQGKTDENFK	308863	281501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_295240_295340_297483_297587_301155_301265_303161_303230_303537_303581_305334_305448_306899_306953_308686
894407	contig_11281_pilon	+	3673	15	Intergenic	novelGene_125438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1450	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCAGCTGGCCCTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796814	847464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_798780_802862_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822127_824251_824358_830356_830433_833041_833124_835837_835913_838018_838127_841079_841203_843379_843456_844581_844697_846305_846455_847246
894408	contig_9415_pilon	+	4173	8	Intergenic	novelGene_109895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATTCACAAGCTGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2080478	2096149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2080642_2082733_2082931_2084479_2087653_2088411_2088495_2088868_2089112_2090092_2090270_2095490_2095604_2096125
894409	contig_9706_pilon	+	1876	14	Intergenic	novelGene_20891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	546.696999687629	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	269	1486	231608	423751	FALSE	65	CTACAACAATAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRVSTQGPVR	91170	424141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619
894410	contig_5718_pilon	-	5473	8	Intergenic	novelGene_110309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1542	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2885	3199	715114	714800	TRUE	15	CCACGGCCAGCCGGACGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVVQRRPFFPLRLNSLLQKNKSPQQNIFTQLLDCQACVVFSYFPLDGTCKLVPRCWGLPNILDSLLSSCSGEPPSCVVLTAIFGGACWTSTYLSEVQQHLG	717998	428101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_428207_544421_544554_651532_651695_669620_669757_692099_692646_708545_708689_710008_710110_713850
894411	contig_13481_pilon	-	3601	5	Intergenic	novelGene_119455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAAATCCACTCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076129	1066955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1067057_1071087_1071220_1071558_1073828_1074422_1075315_1075922
894412	contig_9883_pilon	+	3101	1	Intergenic	novelGene_87585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAGTGGAATTTTAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79650	82751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_79600_82800
894413	contig_13674_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_140303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	527	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1686	1991	11782	11477	NA	25	GAAGGGAGTCACTGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSSLSVFYQFSHSIWCLAEFFISSFDVLGFQDCCFSVWLSFSDLCCGRMAWCFCLECHFARSSDCMFVMREVPCRYLEKELSSVPCDIHQPSPNPSSEG	13467	10630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_10600_13500
894414	contig_1154_pilon	-	5816	15	Intergenic	novelGene_87030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	321	junction_14	468.354675476627	1064	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	108	1745	85715	34336	FALSE	10	TACTTCCCTTGGATGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGVAAAAALLLLLLPRAQADEHEHTYQDKEEVVLWMNTVGPYHNRQETYKYFSLPFCVGSKKSISHYHETLGEALQGVELEFSGLDIKFKDDVMPATYCEIDLDKEKRDAFVYAIKNHYWYQMYIDDLPIWGIVGEADENGEDYYLWTYKKLEIGFNGNRIVDVNLTSEGKVKLVPNTKIQMSYSVKWKKSDVKFEDRFDKYLDPSFFQHRIHWFSIFNSFMMVIFLVGLVSMILMRTLRKDYARYSKEEEMDDMDRDLGDEYGWKQVHGDVFRPSSHPLIFSSLIGSGCQIFAVSLIVIIVAMIEDLYTERGSMLSTAIFVYAATSPVNGYFGGSLYARQGGRRWIKQMFIGAFLIPAMVCGTAFFINFIAIYYHASRAIPFGTMVAVCCICFFVILPLNLVGTILGRNLSGQPNFPCRVNAVPRPIPEKKWFMEPAVIVCLGGILPFGSIFIEMYFIFTSFWAYKIYYVYGFMMLVLVILCIVTVCVTIVCTYFLLNAEDYRWQWTSFLSAASTAIYVYMYSFYYYFFKTKMYGLFQTSFYFGYMAVFSTALGIMCGAIGYMGTSAFVRKIYTNVKID	98171	30264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_34404_38846_38924_39049_39134_39653_39801_43010_43080_46021_46162_56156_56288_63325_63421_67264_67432_68210_68343_72795_72874_73916_74078_76323_76447_85549_85746_98094
894415	contig_2480_pilon	+	5463	1	Intergenic	novelGene_63560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	983	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTATTTAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350059	355522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_350100_355500
894417	contig_8671_pilon	-	3012	1	Intergenic	novelGene_126249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6048	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	76	312	442912	442676	NA	20	GTGCTAATCGCCAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAIPFLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	442987	439975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_440000_443000
894418	contig_15236_pilon	+	6091	8	Intergenic	novelGene_141525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	125.859169758285	594	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	59	1753	55447	118551	TRUE	30	TGTATATATTCATTAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQGGAWTMGEVVEKSLEGPLAPSTDEAAQKTGDLVEILNEDKVKFDDTGLSLILQNGLETLRMENALTDVILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFCNDLKEKREKRIVIKGVDAEIMHTLLDYTYTSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISERTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTRDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELDSENKKWVEFACVTLKNEVYISGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGRWRHKMAVLGGKVYVIGGFDGLQRLNNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAATSHKKKLYVIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWNLKSSMPVEAKCINAVSFRDRIYVVGGAMRALYAYSPLDDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGA	55388	124629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_82174_82341_100925_101376_109866_110105_115137_115341_116260_116475_118414_120399_122138
894419	contig_2161_pilon	-	4350	3	Intergenic	novelGene_114938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	544	903	956354	955995	TRUE	20	AGCGGCTCCCCAGCAGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQQQRTYSSRTRRPVRDGAGADPRSERAECVCNGGFLAEWGASTHLLVELGLLTHGAREVSACVQEASCQSGVPPGIYTGGDTELWNTCPSRADVGLRAEGLEAIGSRS	956897	937909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_938129_951477_951833_953121
894420	contig_9471_pilon	-	2790	2	Intergenic	novelGene_21726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTAGTCAAGTTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166965	164089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_166823_166908
894421	contig_6137_pilon	-	6707	17	Intergenic	novelGene_59228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1398	1742	1355493	1355149	TRUE	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFPSTLNSSKWSWNWKGIGDRNRTRNTYIWPIKLPYIMVTVLYKDLQMRKTYFFKSFLKVSNSHQNAGKSQCGQSIQNPCRILHFLNYFPLNISVTNTIPYDFKAYLDTIKI	1356890	1312235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1324160_1328100_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
894422	contig_5686_pilon	+	2194	12	Intergenic	novelGene_45265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1826.53981230917	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	45	884	93843	208515	TRUE	30	CTGAAAGCATTTGCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWNWTLLKATSQSSWSRD	93798	212387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199785_208460_208722_211283
894423	contig_9505_pilon	-	6433	13	Intergenic	novelGene_121865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	824	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	5469	6179	669240	652577	TRUE	30	GAAAGTGAGGCAGGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSANWVSRLCTDRPRRSSFWLTKVTMACFTALTFSGASLNNSSKTSFGDWSLSVLHSVSCSTDFSDFRPLLVLSMVITSTWTLAGRGRLGWKRLARATRRCKVASRSLLKIVSTLHGTWCVSTCRLWFMASRTTASLHLWLAAVKAISSTSSWSDVSFWKRWCRMSPSNMSSSRLRTTMCSGKSIVLTHSTSTFCSSSNLVSFREVAGKCFLFSLLGRSSSAGGSTAFTGCSRL	681156	650556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_650778_652543_652639_654124_654188_654609_654715_656279_656421_657761_657876_659015_659074_663426_663450_666184_666241_666441_666512_669221_669325_675219_675292_675844
894424	contig_4103_pilon	-	4931	1	Intergenic	novelGene_52036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	896	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	145	645	688949	688449	NA	30	GTCAATGGATCTATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFRDYLGDFIEHYAQLGPSQPPDLAQAQDEPRRALKSEFLVRENRKYYMDLKENQRGRFLRIRQTVNRGPGLGSTQGQTIALPAQGLIEFRDALAKLIDDYGVEEEPAELPEGTSLTVDNKRFFFDVGSNKYGVFMRVSEVKPTYRNSITVPYKVWAKFGHTFCKYSEEMKKIQEKQREKRAACEQLHQQQQQQQEETAAATLLLQGEEEGEED	689093	684162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_684200_689100
894425	contig_8600_pilon	+	4057	10	Intergenic	novelGene_125735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	131.161007454743	599	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	88	1509	102400	119760	FALSE	35	CTTCAGTATTTGAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVFLRRALSGRLTPSLKLPDPGASITSVTMGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSFYIPGGHFTTAWFAIGMGGAFFFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNKMEEGNPRCWYAALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQEHQPHSGLLQSSFITLYTMYLTWSAMSNEPDHSCNPSLLSIITHITVPTQAPGNSSTLAPTSAPPLKSGPFLDTESFIGLVVFVLCLLYSSIRTSSNSQVSKLTLSGSDSVILSDTATSGANDEADGKPRRAVDNEKEGVQYSYSFFHLMLCLASLYIMMTLTRWYSPDAEFQSLISKWPAVWVKISSSWVCILLYAWTLVAPLVLTNRDFS	102312	122308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109465_110132_110271_114212_114383_115526_115618_116405_116587_118721_118950_119621
894426	contig_14871_pilon	-	2996	5	Intergenic	novelGene_63734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	301.011939131989	10	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2225	2554	289605	288466	TRUE	80	CAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRDNSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPYVCPFDGCNKKFAQSTNLKSHILTHAKAKNNQ	300375	287931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288142_288233_288649_289458_291380_299799_299963_300088
894427	contig_6102_pilon	+	3186	26	Intergenic	novelGene_31883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	514.328041623243	2	98	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	20	1858	371166	380042	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGR	371146	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380047_380287_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393929_394036_394221_394272_394467
894428	contig_5797_pilon	+	5712	29	Intergenic	novelGene_56943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	193.685022020553	1219	45	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	842	2529	820	3348	333281	370191	TRUE	25	CAACTTTTATTTTTAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEAPRFFVGPEDTEVNPGNYRHFFHHADEDDDDEDESPPERQIVVGICSMAKKSKSKPMKEILERISLFKYITVVVFEEDVILNEPVENWPLCDCLISFHSKGFPLDKAVAYAKLRNPFVINDLNMQYLIQDRREVYSILQAEGILLPRYAILNRDPNNPKECNLIEGEDHVEVNGEVFQKPFVEKPVSAEDHNVYIYYPTSAGGGSQRLFRKIGSRSSVYSPESNVRKTGSYIYEEFMPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEVRYPVILNAREKLIAWKVCLAFKQTVCGFDLLRANGQSYVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNIVMRELAPQFHIPWSIPLEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAVIRHGDRTPKQKMKMEVRHQKFFDLFEKCDGYKSGKLKLKKPKQLQEVLDIARQLLMELGQNNDSEIEENKSKLEQLKTVLEMYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYCISPVKVMCILYSLFFAMVPYAMNQRMNSGNELWII	322346	420236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322819_331503_331568_332997_333395_334941_335138_337618_337710_338882_338969_340495_340651_341435_341538_342634_342797_344522_344645_345910_346013_347027_347115_348058_348135_348209_348320_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362795_363619_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_408614_408756_412625_412752_418562
894429	contig_13244_pilon	+	3375	12	Intergenic	novelGene_86991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_9	122.503027454578	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	387	2246	466876	475123	FALSE	30	TAAAAAATTTTTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGRQQRGPFQGVRVRNSVKELLLHIRSHKQKASGQPVDDFKTQGVNVEQFTELKNTVSYSGKRKGPDSLSDGPACKRPALLHTQFLTPPQTPTPGESMEDVHHSESKHDSNADLLQSIINIKNECSPVSLNTVQVSWMSPVVVPQSSPREQFQDFHGGQVFSPPQKYQPFQVSGSPPVMDQASLYQYSPQNQNVQQQQHHYIHDPNLEYTPYSRLQSPNYEPNLFDGQELQFCPNQSFVSLLSNHGESENVAVPIQTPPSIQQHSNAHLQTFSMMPNSACEALAEHKAGSPPLNTSLPFQNITENPVNTTQLGKSFFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHIAVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	464181	476252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_464557_466864_467005_467521_467553_467672_467777_467877_468654_469348_469455_469834_469982_470172_470237_470522_470693_471757_471869_471962_472131_475069
894430	contig_12528_pilon	+	2053	11	Intergenic	novelGene_81362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_3	263.303038341756	228	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	27	1952	1022635	1061722	FALSE	25	GTCATTTACTGATTTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVCICSVNIEDLFLGPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEVPDVAHLSLEKLGPCLPLDLSRGLEVTAPVVPDPSYRNEFPRVEKEEAQMLTYPSSKAVADGRGAPTASGISKTEKKVKLEEKSSTTFGKRKEKDKERKEKRDKGPYKPKQKKKKKKKKKSKQHDYSDYEDSSLEFLERCSSPLTRSSGSSLALRSMFTEKNTTYQYPRAILSVDLSGENLSDVDFLDDSSTESLLLSGDEYNQDFDSTNFEESQDEDDAINEIVRCICEMDEENGFMIQCEECLCWQHSVCMGLLEDSIPEQYICYVCRDPPGQRWSAKYRCDKEWLNNGRMCGLSFLKENYSHLNAKKIISTHHLLADVYGVTEVLHGLQLKIGILKNKHHPDLHLWACSGKRKDQDQVIAGVEKKMTVQGMVNLEEKTYHVQNHKEPPCLPPKMEGTYITSEHSYQKPQSFGQDCKSLADPGSSDDDDVSSFEDEQEFHMREKNRLQFSVKEDGMPEKNPAEGNTVFVYNDKKGTEDPGDSHLQWQLNLLTHIENVQKEVTSRMDLIEKEVDVLESWLDFTGELEPPDPLARLPQLKRHIKQLLIDMGKVQQIATLCSV	1022608	1061823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1022873_1023140_1023348_1037916_1037974_1039168_1039277_1046916_1047082_1050164_1050347_1052035_1052136_1053581_1053778_1058457_1058825_1060064_1060228_1061579
894431	contig_18168_pilon	-	1268	7	Intergenic	novelGene_122074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	165.592874242825	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	4	888	27110	23837	FALSE	25	GAAATATGTGGTGATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27113	23456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24858_25117_25315_25964_26241_26483_26754_27040
894432	contig_14744_pilon	-	2739	14	Intergenic	novelGene_66042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.868143157438	566	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	165	1862	1374233	1313534	TRUE	35	GTTTGATCCAATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDSKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQVRAWGAAWLCLKRAQLAQVTLHCPHFEQEGMS	1374397	1311990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1312654_1313319_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1347224_1347418_1349331_1349527_1355961_1356085_1374219
894434	contig_8377_pilon	+	1251	1	Intergenic	novelGene_34965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAGAAAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68098	69349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69300
894435	scaffold_9077_pilon	+	4879	3	Intergenic	novelGene_178662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	555	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1380	3500	4879	71093	72472	FALSE	55	GCAATAAAAAAACTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEK	24398	72472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9077_pilon_+_25316_25586_26606_69529
894436	contig_935_pilon	+	2667	11	Intergenic	novelGene_45549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAATAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344407	370822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_345497_346641_346785_352424_352741_355421_355458_358168_358309_359244_359404_361934_362048_362131_362248_362607_362749_368062_368292_370637
894438	contig_7594_pilon	-	7471	1	Intergenic	novelGene_55394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	540	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2422	2805	366007	365624	NA	45	AAAAACACTATGGAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRPCMPLPWYSNPPVLGEVMEGADHQGAGGQGRPVRQNMYRVYGPQFHRVPSRQRQLREDSDEEDKENQGNESQGQQRLQCQYHCNFNYQHRQPENPKPQDGKETKAADPPAENLSTPEAEQGRAE	368428	360957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_361000_368400
894439	contig_10609_pilon	+	13008	26	Intergenic	novelGene_123927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	517	junction_5	428.520345374639	914	122	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	958	2877	186	3062	386471	507649	FALSE	5	TTCCTGGTTGTCTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGIHSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVDCIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHYAAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASVINGHTLCLRLLLEIADNPEVVDVKDAKGQTPLMVAVAYGHIDAVSLLLEKEAKVDAVDIMGCTALHRGIMTGHEECVQMLLEQEVSILCKDSRGRTPLHYAAARGHATWLSELLQMALSEEDCSFKDNQGYTPLHWACYNGNENCLEVLLEQKCFREFIGNPFTPLHCAIINDHESCASLLLGAIDSSIVSCRDDKGRTPLHAAAFADHVECLQLLLSHSAEVNAADNSGKTALMMAAENGQAGAVDILVNGAQADLTIKDKDLNTPLHLACSKGHEKCALLILDKIQDESLINAKNNALQTPLHVAARNGLKMVVEELLAKGACVLAVDENGHTPALACAPNKDVADCLALILATMMPFSPSNTMTAVNFICFKRDNLSRTTLSNLGSMVSLCSNNVGSEDGYNENDSDSETF	361235	517595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_400432_400512_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314_420456_422067_422149_426657_426770_477871_477944_486428_486631_490592_490681_491948_492067_493322_493540_497627_497716_498779_498864_500774_500921_501395_501479_503653_503737_504833_504926_507401
894440	contig_10734_pilon	-	5961	23	Intergenic	novelGene_51240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	261	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	5172	5585	1247520	1243236	TRUE	10	TCCTGTCGGCTGCAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKGSHWKYRTPATEPSFLPIASSKTIPAHWPGANWVSPRNWINPGLLPFTQTRSPTRKSSTNSSCVSAEGVLDAFSLDVVLSTGTTTATGVFRAVLPGFRILVGALSPLGLSILIVLTVSELVSCRLLSLSFPNH	1334970	1221115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1221440_1243183_1243382_1247252_1247830_1260391_1260515_1262351_1262578_1267422_1267618_1268185_1268291_1270216_1270278_1279285_1280231_1281765_1281884_1284376_1284434_1284977_1285061_1286266_1286426_1288094_1288258_1288358_1288578_1299543_1299651_1306092_1306212_1321455_1321509_1327927_1328053_1328140_1328285_1328866_1328917_1332592_1332718_1333285
894442	contig_8954_pilon	+	854	5	Intergenic	novelGene_130295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_3	126.624197924409	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	334	852	169502	185915	FALSE	45	GTAGTATTTGCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVTINYSSDLKNLILYLLTDQNRMRSVNDIMPMIGARFYTQLDAAQMRNDVIEEDLAKEVQNGRLFRLLAKLGTINERPEFQKDPTWSETGDRYLLKLFRDHLFHQVTEAGAPWIDLSHIISCLNKLDAGVPEKISLISRDEKSVLVVTYSDLKRCFENTFQELIAAANGQ	169168	185917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_169552_173747_173878_174335_174401_182928_183068_185780
894443	contig_6470_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_145601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAGATAAAACTCGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991305	993170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_991300_993200
894444	contig_15731_pilon	+	3994	22	Intergenic	novelGene_171969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	254.115887645266	268	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1280	3843	105	3947	15182	48097	FALSE	15	ATGTTGTAGCTCATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSDHMPGPVCLIENIDGKLMVNQEALTILSALTQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKQGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPEKPNHTLVLLDTQGLGGVEKEDNENDSWIFALAILLSSTFIYNSMGAINQQAMDQLHYVTELTNQIRAKSSPDSNEVEDSADFVRFFPDFVWALRDWILKLEADGQSITADKYLENSLKLKPGTSQEEKIFNLPRVCIQKFFPKKKCFVFHPPTKWKKLVHLETLQDDELDSEFVQQVAEFSSYIFSHSKIKILSGGIKVNGPRLKSLVLTYVNAISNGSLPCIENAVLALAQIENSATVQKAIAHYDQQMGQKVQLPTETFQELLDLHRASEKEAIGVFIRNSFKDINHLFQKELAAQLEKKWNDFCEKNLRASSDHCLALLQDIFSPLEEEVKQGVYSKPGGYRLFIQKTQELKKKYLQEPRKGIQAEEILQKYLMSKESVTDAILQTDLTLTEKEKETEVERVKAESAQATAKMLKEMQIKHQQLMEQKEKSHQEHVKQLTEKMEDKNQLLAQQESILALKLQEQEQLLKEGFKEERIKLQKEIQDLQMRSIETSTSVKLVIAEFAQDAKKMLEEMQIKYQQMMEQKEKCHQKHVNQFIEKMERDTEQLFTEQNRTPALNFQEIMTFRPIMMAPICLVENHKEQLTVNPSALKILDEITQPVVVVAIAGLYRTGKSYLMNLLAGQNRGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPDHTLILLDTEGLGDVKKGDTKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMGTINQQALEQLHYVTELTELIRTKSSSGTEEVDDSTEFVGFFPDFIWTVRDFSLELKIDKSPITEDGYLEDALKLIPAGRNPKIQNSNLPRECIRRFFPKRKCFVFDRPTSDNSFLYQIEEVPEHQLDCNFQMKLKKFRSYIFSHAKTKTVREGIIITGKRLATLVETYVNTINSGAVPCLENAVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKEMAQCLRLPTDTLQELLDVHAACERKAIALFMEHSFKDDKREFQKNLLDIIGEKMEDFVLQNEEASDKYCQAELKQLSEPLMENISRGIFSVPGGHALYLEAKKKVEQDYAQVPRKGVKANEVLQTFLQSQAAIEESILQSDKGLTDAEKAIAVEQAKKEAAEKEQELLKHKNQEQQQKMEAQQRTFQEHIAQLEMKIKKERENLLRELERILEHNLKIQEELLMQGFRKQYEKLKKETDRQQEEYEKTKNNERSWFSRLLEEAFRALSTVSLQDLELFAEIMKYLSLLNK	11644	48144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_11691_15123_15369_15886_16015_17412_17523_17793_17991_18348_18592_19670_19952_20592_20806_21775_21879_22171_22363_23510_23614_24625_24820_26463_26660_35458_35587_39240_39351_39554_39752_42058_42308_43233_43515_44873_45087_46142_46246_46579_46774_47875
894445	contig_5988_pilon	-	3275	14	Intergenic	novelGene_16041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2076	2519	989590	953994	TRUE	45	AAGAGGAAAAGAGATCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANLLESGILLLASAAGFGLLFFFLFFFLPVTVHSLSTSLALPSMNACTVLSTQLSKCCKTRMISLLLLLGTIALTAFIFSFMFSKVPPWASTILDCKSKINPDESFWLCFLDIAVSLISKNTEEKCPFALSGLNVDIISDFKNGQ	1016854	877139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_877211_943073_943613_953847_954118_981233_981313_984811_984921_986632_986683_989508_989776_993266_993446_997206_997344_1005691_1005753_1009775_1009886_1012734_1012838_1014385_1014515_1015683
894446	contig_12837_pilon	+	3372	1	Intergenic	novelGene_57401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGCCAGGGACTATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448258	451630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_448300_451600
894447	contig_2100_pilon	-	1655	12	Intergenic	novelGene_50734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	962.379532012378	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	94	996	1182812	1173272	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVQGSRWWEMISQ	1185504	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172365_1172451_1173171_1173310_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
894448	contig_12624_pilon	+	4310	28	Intergenic	novelGene_60978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	206.602498998905	824	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1281	3846	141	3986	69828	130728	FALSE	15	GGCCATGTATTTGTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKNFLYAWCGKKKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVRVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSNAARDFVNYLVRINEVKSEDVPAVGIAPPPPSLTDSSDGTASTDGSLPTTMGGPLPPHLALKAENNSGVGASGYGVSGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEAQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVIEAYSGLTKKKEGETLEPYKVNLSQDLEHQLQNVVQELNLEIVPPPEDPSVPVLLNIDKLAHFEPSQRQNQMGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAYATPEQISTDLKNELMYQLEQDRNLQGILQERELLPVKKFENEILDAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAYERGEEPGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTFPVQEYFLEDCIQMTHFIPPPKDKKKKDKDEDGGEEDDANCNLICGDEYGPETRMSMAQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNAHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAVCTISAATCFPEPFISEGKRLGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINSGFPEECLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPCPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQLVLVDDWIRLQISHEAAACITALRAAMEALVVEVTKQPDIISQLDPANERMLNMIRQISRPSAAGITLMIGSVRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYGSGGYGSGGYGGGGGGYGGGGYGGGSNSYRGGYGGGGGGGFRGGSYRGGSGGDYRGSGGGGYRGSGGFHRGGGRGGFGGGYFGQGRGGGGY	66555	131052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342_98505_98647_98726_99274_99467_106808_106951_107597_107681_108512_108670_110973_111075_113175_113390_113572_113668_113965_114040_115188_115342_119007_119169_119969_120082_120704_120867_120980_121109_122612_122843_123005_123122_127215_127417_130346
894449	contig_9484_pilon	+	4032	15	Intergenic	novelGene_105669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	683.608373385863	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	91	1059	138653	206935	TRUE	35	GGGAGTGAAGCCAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRVSLHRRERGTSQGKIEGSWYPSAPRPCLMRLYVCILPGYDKWVTSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTAPPGKATGPGPTVASISLMFLCALPFAGDPDYSLLADYSLLYQ	138562	214546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_138701_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202600_202776_202823_206847_206944_211513_213165_213232
894450	contig_15153_pilon	-	3840	2	Intergenic	novelGene_166457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2854	3249	139402	139007	FALSE	35	CAAGCCCACAGCCACCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLSAPIKIRSDRMDKKTGSINMLSTRDIPWKQRCEFIKSRRLEKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKFTIKDKEGHYIVIKGMIHHEDITIININAPNDRAPRYIKQTLTRH	142745	138415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_-_140457_140946
894451	contig_4350_pilon	+	7084	9	Intergenic	novelGene_136369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4133	211	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2147	2791	59726	60370	TRUE	20	CTCCTTGCACAGGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNYQKRAGVAILISDKMDFKTESTVKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIYSSTITVGDFNTPLLVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQPDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNQKSKEKKSITWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLE	57315	248573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_59419_59682_60378_84023_84323_130136_130380_134417_134884_135051_136876_137463_137645_203622_204849_248526
894452	contig_10583_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_167912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTAGTCTTTTATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124057	121983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_122000_124100
894453	contig_16622_pilon	-	3095	8	Intergenic	novelGene_48440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	831	junction_7	940.672534055572	95	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	732	1160	115540	113571	TRUE	10	CTGACCAGTCTCTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQGILLGGLRST	121971	108208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_108467_110032_110147_110891_111029_112144_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
894454	contig_13145_pilon	-	1571	2	Intergenic	novelGene_116634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGTTACATTAACAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66029	64405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_65153_65205
894455	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
894456	contig_12915_pilon	-	3065	1	Intergenic	novelGene_148335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	394	1185	181	1365	51387	50203	NA	30	CAAGGAGTGAATTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSNLLRHIFNKHNDKHKAHLIRPRRLTPGQENISSRANQEKTKPKYRGTKHSRSGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNTKIVQIEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTSRFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKCHKLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETCSEQEVDKNDVKDSDICVSESNDNSGATSVPQKEAEKNEKDEMDELTELFITKLINEDSTSVEAQANTSSSVSNDIQENNSCQSEKQKASNLKRVNKEKNVSQNKKRKIEKTEAALAVDLNSMHKEEETAVAIQTTEDHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNSGTKRGSHSNSRKNIDKTAVTSGNHVCSCKESETFVQFANPSQLQCSNNVKIVLDKTLKDCTELALKQLQEMKPTVSLKKLEIHPKDPDVSAMKEISIGKATGRGQY	51567	48502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_48500_51600
894457	contig_7548_pilon	+	2122	7	Intergenic	novelGene_117633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.889818029253	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	509	823	200810	206475	FALSE	20	AATTGGGCATGTGCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKDGVMVLSATHRYKKKYVTTLLYKPI	192798	207774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_192937_198361_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
894458	contig_2069_pilon	+	4533	9	Intergenic	novelGene_23179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_8	213.454876671862	156	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	111	533	70041	81061	TRUE	35	CATGCTCCTTCGAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLGRQLKVDTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQVKSE	69930	99926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81709_87422_87531_87707_87803_89407_92192_99560
894459	contig_10058_pilon	+	2603	7	Intergenic	novelGene_67711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	169.270657692217	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	81	461	72602	99369	TRUE	25	TTCACATTGAGTTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72521	101637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97366_98485_98541_98697_98810_99353_99407_99532
894460	contig_408_pilon	-	2268	4	Intergenic	novelGene_84914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	442.042481618629	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAGCACTTTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138564	131342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_132006_132155_133592_136727_136832_138499
894461	contig_2854_pilon	+	2372	1	Intergenic	novelGene_120813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1595	1939	86470	86814	NA	15	TATTTTCTTGAGCTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	84875	87247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_84900_87200
894462	contig_18799_pilon	+	4915	8	Intergenic	novelGene_171413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_2	42.2601273938797	837	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	35	2635	6492	74299	FALSE	15	TCCTTGGGAGAGACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQAIHSRVKPIQLKGEHHSNIFCLAFNSGNTKVFSGGNDEQVILHDVESSETLDVFAHEDAVYGLSVSPVNDNIFASSSDDGRVLIWDIRESPHGEPFCLANYPSAFHSVMFNPVEPRLLATANSKEGVGLWDIRKPQSSLLRYGGNLSLQSAMSVRFNSNGTQLLALRRRLPPVLYDIHSRLPVFQFDNQGYFNSCTMKSCCFAGDRDQYILSGSDDFNLYMWRIPADPEAGGIGRVVNGAFMVLKGHRSIVNQVRFNPHTYMICSSGVEKIIKIWSPYKQPGCTGDLDGRIEDDSRCLYTHEEYISLVLNSGSGLSHDYANQSVQEDPRMMAFFDSLVRREIEGWSSDSDSDLSESTILQLHAGVSERSGYTDSESSASLPRSPPPTVDESADNAFHLGPLRVTTTNTVASTPPPPTCEDAASRQQRLSALRRYQDKRLLALSNESDSEENACEVELDTDLFPRPRSPSPEDESSSSSSSSSSEDEEELNERRASTRQRNAMRRRQKTPREERPSAPTKSTSTYIGEDNYDYPQIKVDDLSSSPASSPERSTSTLEIQPSRASPTSDIESVERKIYKAYKWLRYSYISYSNNKDGETSLVTGEADDGRAGTSRKDNPIPSSSKEVCLNTAVAQRNQDLPPEGRSKDAFKEGTSTRNPSNGPGHEHSSHTWAEVPEGTSQDTNNSGSVEHSFETKKLNGKALSKALSSRSEESPSPPVPKASGSTPSSGSGNCPRTQSDDNEERSLETICANHNNGRLHPRPLHPHNNGQNFGELEMMAYSSPGHSDTDHDNLSLAGTLLHRDCCGSEMASETPSAGMREDPTDPPATDSSSRGIHGHSGLKRHRVELEDGDPENSSSEKKLKT	6457	76579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_6604_8199_8237_9345_9486_11210_11341_35285_35500_53687_53755_65757_65886_72526
894463	contig_13295_pilon	+	3027	4	Intergenic	novelGene_31209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1147	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCCAACTTCCTATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53558	57410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_55782_55914_56026_56646_56736_56806
894464	contig_7993_pilon	+	2103	3	Intergenic	novelGene_170960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	134	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTATGTGATTATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16677	34703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_16785_31084_31233_32855
894466	contig_10627_pilon	+	2384	11	Intergenic	novelGene_59937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_10	276.322927025609	28	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	48	914	162810	165929	TRUE	20	AAATCCTTTTGTTTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATSPFGTAAPLRPGMPPTMMDPFRKRLLVPQPQPPMPAQRRGLKRRKMADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVIR	162762	167767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_166259_166411_166535_166672_166775_166851
894467	SIRV1	+	585	3	NIC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-64	-122	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5589	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTGATAGAGAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10647	11484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_+_10792_10882_11243_11403
894468	contig_7119_pilon	+	2196	4	Intergenic	novelGene_40960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1023	1472	139776	140225	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127546	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_138833_139053
894469	contig_854_pilon	+	3246	14	Intergenic	novelGene_36685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_13	3448.43978441636	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	22	2088	1702628	1715249	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1702606	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713152_1715165
894470	contig_14441_pilon	+	1196	6	Intergenic	novelGene_100457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	461.559703613736	142	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	7	420	85387	121200	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRMPRARRRPGDPAMRALPLACALLCLLQPGPAEPGVSQTPRHRIAKSGDSLTVACSQDLDYEVMYWYRQDPGRGLQLLHYSINVKIVQRGDLPDGYRVSREEKGRFLLTLESAVPNQTALYLCASSFATAPRGQLVLQ	85380	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_85573_85890_121187_121239_125517_125902_126159_126283_126514
894471	contig_5317_pilon	+	5076	3	Intergenic	novelGene_76530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	3334	731	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33703	41547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684
894472	contig_4496_pilon	-	6117	4	Intergenic	novelGene_66635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	956	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAGCAGCACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768457	632377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_633493_641209_643959_765949_767750_768004
894473	contig_5551_pilon	+	5389	1	Intergenic	novelGene_134297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	397	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1433	1759	828024	828350	NA	25	CCACAATTTGTTACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPFPVEASLWDVVGHLCDEPGGFNLGHCCAVLCWQLLLSGLWALGRRGRFRSGMEGGEEGRVEASSHLQGWGLIDGLSLQGWALEGCVCSLAALPFLPSIMLKNKL	826591	831980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_826600_832000
894474	contig_2341_pilon	+	4419	2	Intergenic	novelGene_84350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1818	2204	54344	54730	FALSE	20	TCCCTATCCCCTGAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKQRPPKKQKKKKATKKEMPSGIPLHICASRREITLPHSTAWPERDPNSRKGKENKQTTQNKQTNKSPGIPPAQQPRPGSSSTLEWSSTAPQEEAKMGHGARYLSEKRGRW	52297	56945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_53464_53692
894475	contig_4429_pilon	+	2832	10	Intergenic	novelGene_50800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	695	junction_2	263.609981264409	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	75	1985	165292	198515	FALSE	25	CCTAGTTTTGTTAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	165217	199362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
894476	contig_6902_pilon	-	1797	2	Intergenic	novelGene_135604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACATCATACGAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497994	495448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_495523_496271
894477	contig_19402_pilon	-	4524	18	Intergenic	novelGene_80771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTAAAAACAAGACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146715	23449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37109_55273_55354_57521_57753_70448_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144221_144356_145617_146267
894478	contig_16578_pilon	-	1950	2	Intergenic	novelGene_148613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	737	1126	92034	35448	FALSE	30	GAACACACAGTCCACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSYLPPFFTPSWPPLLPATTVSWPGSTGFTLVSLGFHPPTLAGSLSAICWLLVLLFFLLLLISSLPLTTSPSFRSNTWLHVPSLLLPEGLWSSILVWSCFPVWAAMLVGSRGFCSFVCFELFVFFSFS	92770	34623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_35699_91895
894479	contig_2438_pilon	+	1252	5	Intergenic	novelGene_112008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2465.96110826996	25	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	263	595	311995	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305064	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310698_311943_312083_312305_312409_312729
894481	contig_15500_pilon	-	2659	1	Intergenic	novelGene_128997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAACTTCCAACCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257036	254377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_254400_257000
894483	contig_4232_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_63317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468094	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
894484	contig_7342_pilon	+	1914	11	Intergenic	novelGene_71238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	280.811698474262	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	122	625	717166	728132	TRUE	50	GAAAAGTAAAGTGACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTKKFGN	717044	734864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727583_728105_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756
894485	contig_3627_pilon	+	2209	11	Intergenic	novelGene_78576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	43.7383127246582	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	957	1553	1327439	1343837	TRUE	20	GATGGTACCCAGTGATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313496	1345630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323217_1324743_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743_1344094_1345230
894486	contig_13004_pilon	-	8063	43	Intergenic	novelGene_112604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_16	169.678500850266	71	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1015	3048	28	3075	242710	184599	TRUE	10	CTTTCTCTCCCCCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLVHLSEDMIARTYNIFAIMFRYAVEILTWEKEGELPADLELTDKSDTYYCMLFNDEVHTYEQVIYTLQKAVNCTQKEAIGFATTVDRDGRRSVRYGDFQYCEQAKSVIVRNTSRQTKPLKVQVMHSSIVAHQNFGLKLLSWLGNIIGYSDGLRRILCQVGLQEGPDGENYSLVDRLMLSDSKLWKGARSVYHQLFMSSLLMDLKYKKLFAIRFAKNYERLQCDYVTDDHDREFSIADLSVQIFTVPSLARMLITEENLMTIIIKTFMDHLRHRDAQGRFQFERYTALQAFKFRRVQSLILDLKYVLISKPTEWSDELRQKFLEGFDAFLELLKCMQGMDPITRQVGQHIEMEPEWEAAFTLQMKLTHVISMIQDWCALDEKVLIEAYKKCLAVLMQCHSGFTDGEQPITLSICGHSVETIRYCVSQEKVSIHLPVSRLLAGLHALLSKSEVAYKFPELLPLSELSPPMLIEHPLRCLVLCAQVHAGMWRRNGFSLVNQIYYYHNVKCRREMFDKDIVMLQTGVSMMDPNHFLMIMLSRFDLYQIFSTPDYGKRFSSEITHKDVIQQNNTLIEEMLYLIIMLVGERFSPGVGMVNSTDEIKREIIHQLSIRPMAHSELVKSLPEDENKETGMESVIEAVAHFKKPGLTGRGMYELKPECAKEFNLYFYHFSRAEQSKAEEAQRKLKRQNREDTALPPPVLPPFCPLFASLVNILQSDVMLWIMGTILQWAVEHNGYAWSESMLQRVLHLIGMALQEEKQHLETVGEEHVVTFTFTQKISKPGEAPNNSPSILAMLETLQNAPYLEVHKDMIRWILKTFNTIKKLRENSSTSPVAETEGAIMEENSRDKDKAERKRKAEIARLRREKIMAQMSEMQRHFIDENRELFQQTLDLDASPSAVFDNSPVASDMTLTALGPAQTRVPEQRQFITCILCQEEQEVKVESKAMVLAAFIQRSTVLSKNRSKFIQDPEKYDPLFMHPDLSCGTHTGSCGHIMHAHCKGILIPFKLKNSEGNRDYAYIQAMM	242737	152159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_155632_156913_157016_159230_159402_160412_160491_163609_163667_164374_164484_166783_166915_168886_168978_169605_169742_170998_171067_171517_171615_177777_177834_178102_178252_180919_180999_181673_181778_184510_184679_185557_185642_193357_193558_194063_194243_194584_194666_194779_194890_198643_198747_200059_200215_200710_200760_201714_201818_206283_206337_208516_208642_209954_210019_210136_210260_213211_213278_213965_214077_214258_214321_217496_217681_219015_219145_220428_220529_220613_220778_231459_231559_232550_232640_233423_233532_237726_237848_239301_239365_239992_240132_242606
894487	SIRV6	+	1372	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	52	170	-51	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	173	41	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	25	GTCGATTATTGCCTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894488	contig_14142_pilon	+	4750	5	Intergenic	novelGene_120569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	67.5499814951862	936	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	379	549	472018	474078	TRUE	25	GTGGACAGCGGGAAGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPEHVVKVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHTGERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPMRAAKRPLELRGQAALCEIVVFPSPGKGSLMVPLSILLQGMASMRGRGSPLSLLQP	470729	478874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_470942_471851_472034_473923_478022_478506_478652_478761
894489	contig_2100_pilon	-	1626	13	Intergenic	novelGene_50715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	836.139687127031	242	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	90	1394	1182812	1170268	TRUE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185500	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170132_1170245_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
894490	contig_10331_pilon	+	4557	4	Intergenic	novelGene_54084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_3	295.069483342483	46	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	458	913	103733	108375	FALSE	40	TATATAACCATGGTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQIHLYGHTEEITSLFVCKPYSIMISVSRDGTCIIWDLNRLCYVQSLAGHKSPVTAVSASETTGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEGVSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSHKPIVR	103275	112019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_103858_104125_104224_107726_107884_108299
894491	contig_19459_pilon	-	2089	8	Intergenic	novelGene_59802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	65	850	16240	7003	FALSE	15	AATGTTGTGTTGTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19028	5763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
894493	contig_9995_pilon	-	5826	7	Intergenic	novelGene_47762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	361	junction_1	281.334172589585	915	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	202	975	819424	688273	FALSE	20	CCCACAGATGTTCGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNSTYLDDHGPPPSKVLPFPSQVVYNRVGKCGSRTVVLLLRILSEKHGFNLVTSDIHNKTRLTKNEQMELIKNISTAEQPYLFTRHVHFLNFSRFGGDQPVYINIIRDPVNRFLSNYFFRRFGDWRGEQNHMIRTPSMRQEERYLDINECILENYPECSNPRLFYIIPYFCGQHPRCREPGEWALERAKLNVNENFLLVGILEELEDVLLLLERFLPHYFKGVLSIYKNPEHRKLGNMTVTVKKTVPSPEAVQILYQRMRYEYEFYHYVREQFHLLKRKFGLKSHVSNPPLRPHLFIPTPLETEEPIDDEEQDDEKWLEDIYKR	900395	683421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_688557_742532_742691_744297_744396_806834_806989_819344_819425_840699_840856_900350
894494	contig_8954_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_130260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69767	67553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_67600_69800
894495	contig_20670_pilon	-	3937	5	Intergenic	novelGene_144832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	269.038101390862	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATATTTGAAAGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57668	48490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_48582_48638_51348_52120_53013_56700_56793_57515
894496	contig_10976_pilon	+	6217	5	Intergenic	novelGene_155579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_4	204.184199927418	623	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	287	1366	93612	234505	FALSE	65	TAAAAGACAAAGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSIRKRWTICTISLLLIFYKTKEIARTEEHQETQLIGDGELCLSRSLVNSSDKIIRKAGSSIFQHSVEGWKINSSLVMEIRKNILRFLDAERDVSVVKSSFKPGDVIHYVLDRRRTLNISHDLHSLLPEVSPMKNRRFKTCAVVGNSGILLDSECGKEIDSHNFVIRCNLAPVVEFAADVGTKSDFITMNPSVVQRAFGGFRNESDREKFVHRLSMLNDSVLWIPAFMVKGGEKHVEWVNALILKNKLRVRTAYPSLRLIHAVRGYWLTNKVPIKRPSTGLLMYTLATRFCDEIHLYGFWPFPKDLNGKAVKYHYYDDLKYRYFSNASPHRMPLEFKTLNVLHNRGALKLTTGKCVKQ	93325	239356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_93725_100551_100684_113737_113996_174122_174417_234222
894497	contig_960_pilon	+	2414	20	Intergenic	novelGene_108234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	423	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATAACTAGCGGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440648	648230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_440827_442979_443076_443776_443931_445283_445387_449137_449300_450482_450718_451321_451409_454131_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478896_483088_483167_484616_484672_487135_487269_489760_489849_495559_495678_497066_497195_545270_545322_647748_647815_648149
894498	contig_1225_pilon	+	2468	4	Intergenic	novelGene_44156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	107	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	217	534	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250597	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274836_275288
894499	contig_1535_pilon	-	1915	6	Intergenic	novelGene_127219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	707.608761958188	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	327	1145	54886	40062	FALSE	20	TGTACTGCTGGCATGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEMPEDMEQEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	55212	39291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_45799_45915_47293_47489_54856
894500	contig_2209_pilon	-	1609	10	Intergenic	novelGene_141003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	94.9305138990399	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	362	1054	207436	120917	FALSE	20	GTCCCTGCAGTTTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVVINRTLVLTGQWEALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAGSDFIKTSTGKEAVNATFPVAIVMLRAIRDFFWETGNKVGFKPAGGIRTAKDSLAWLSLIKEELGNEWLKPELFRIGASSLLSDIERQIYHQVTGRYAAYHDLPMS	248807	120361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_120974_122030_122181_125972_126086_184487_184617_202235_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248096_248168_248750
894501	contig_10437_pilon	-	1582	2	Intergenic	novelGene_38487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTTGAGAATGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215670	1213561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1214309_1214835
894502	contig_14516_pilon	+	2053	13	Intergenic	novelGene_153933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_10	101.834935884826	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	214	1710	317115	422609	TRUE	70	TCGAAAAAAAAAAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNSLMYYYNGKAVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	316901	423131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_317157_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418336_421549_421780_422472_422614_422792
894503	contig_1719_pilon	-	2404	15	Intergenic	novelGene_87278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	507.391327462023	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	762	1641	2402	364776	359759	FALSE	20	GCAGTCTGTTTATGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAA	382168	359756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366899_370030_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
894504	contig_12540_pilon	-	2878	7	Intergenic	novelGene_148134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2186	2557	1304872	1299786	FALSE	55	AAAAAAAAATCCCACAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSASTWLVFMALPSVASTSRQAIPCSRSARSMRSRRSCRRFRLIMKTSSKPILSGVWSGTEINWDGSAGRCFTMTSSCTCMKLSASSWSVLCARSGTGRKPYTSLLQTYICTSGAEKTISKN	1308477	1299464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1299937_1304152_1304229_1304298_1304408_1304836_1304968_1305782_1305913_1306223_1306431_1306724
894505	contig_12379_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_148932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTATGAATATTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109823	112689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_109800_112700
894506	contig_12677_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_110704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1400
894507	contig_13740_pilon	-	1308	5	Intergenic	novelGene_34757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	242.089859349788	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	133	666	873748	686961	FALSE	45	TGTTTAAAGGTAGTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDACASGECFGSNSVKAWVTPQNLSSFCWPSFVFRVILCGHLLYCSSDVKLYEGYSCKLDADGKLIIPVAFLQINNCTFYLPI	873880	686318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687209_855055_855143_863132_863159_863777_863884_873681
894508	contig_504_pilon	+	864	2	Intergenic	novelGene_54400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCGCCAGTGCCTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23515	39625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_24301_39546
894509	contig_16594_pilon	-	5375	3	Intergenic	novelGene_53909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	20.5	631	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCCCAGCATAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306531	268694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_273670_293668_293888_306350
894510	contig_5961_pilon	+	2696	10	Intergenic	novelGene_144149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_5	536.141357811124	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	222	2066	201974	214246	FALSE	40	TTTTTTAAAAGAGAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	197865	214876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
894511	contig_5640_pilon	+	3331	16	Intergenic	novelGene_27272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	224.036544637997	1973	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1200	2078	951397	955989	TRUE	30	GAAATGCCTGGCAATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENPYANAGKNPDEVSYAGDNFVRYTGDTISMAQTQLFAWEAYDKGSEVHLQADPTKLELLYKSFKVKKEDFKEQQKESILEKYGGQEHLDAPPAELLLAQTEDYVEYSRHGTVIKGQERAVACSKYEEDVKINNHTHIWGSYWKEGRWGYKCCHSFVKYSYCTGEAGKEIANAEECIPSDVTGEESMKKPQTLMEMHQEKLKEEKKKKKKKKHRKSSSDSDGEEKREKLKKALNAEEARLLHVKEIMQIDERKRPYNSIYETREPTEEEMEAYRMKRQRPDDPMASFLGQ	942197	957306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_942245_945857_946044_946911_947066_947410_947492_947857_948023_949186_949256_950704_950753_950947_951441_951611_951680_951814_951955_952838_953001_954372_954478_954630_954703_954816_954925_955809_956479_956542
894512	contig_9415_pilon	-	5734	27	Intergenic	novelGene_109708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_19	120.427787785901	1181	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1132	3399	201	3599	470731	425836	FALSE	35	TACAGGTATGAAAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKFVKNVKLLERIGVARPEEEFHVPLDSYRCQLFIQPAGVLEHQYETSTTYISWKEELHRSREVRSMLQCPSTEANFLPLVVNAVAVPDELSYICTCGEDWDPAYVIHLHPPLTLRNLLPYPLRYLLEGTAEVHGLAEGSVADVLHSRISGEIIELVLVKYQGKNWNGRFRISDTLPEFFLVCFSSDSAEVMTLDLSVHVRRVDSQMVLSVFSPYWLINKTSRVLQYRAEDTHVKHPANFRDIILFSFKKKNIFRKNKVQLKISTSAWSHSFSLDTVGSYGCVKCPANNMEYLVGVSIKMSSFNLSRIVTLTPFCTIANKSSLDLEVGEIVPDGSIPTNKWNYIASSECLPFWPERLSGKLCVRVVGCEESSKPFYYNRQDNGTLLSLEDLDGGILVDVNTAEHSTVITFSDYHEGAAPALIINHTPWDVLTYKQSGSQEEMELLPKQVRLFAWADPTGTRKLTWRYAANVGEHDLLKDGCGQFPYDANIQIHWVSFLDGRQRVLLFTDDVAVVSKARQAEEMEQADCELTLSLHSLGLSLVNNDSKQEVSYIGITSSGVVWEMKPKQKWKPFSQKQIILLEQSYQKYQVSGDRDWIKLDNNLEVNFGKVPMEMRLPVRCPIKRDFLSGIQVEFKQSPHQRSLRATLYWLQVDNQLPATVFPVIFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVIMRFNEYSKVLQFKYFMVLIQEMALKVDQGFLGAIVALFTPTTDPEAQRNRTKLIQQDIDALNTELMETSMTDISILSFFEHFHISPIKLHLSLSLGSGGEESDKEKQEMIAIHSINLLLKSIGATLTDVDDLLFKLAYYEIQYQFYRRDQLIWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPYGLIRGLSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLFGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAITMDKEYQQKRREEMGRQPKDFGDSLARGGKGFLRGVVGGVTGIITKPVEGAKKEGAAGFFKGIGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIQRAAESTEEVSSLRPPRLIHEDGIIRPYDRQESEGFDLFENHVRKLEEEIYRYHCAVPGVRKTILMVTNRRVLCIKEVEILGHVCIDWQCPFEDFVSPPSIHENMLTISVKDQSLFHKKDNVSQGYQRKIYLQDATTAERAYKAIEDAQSRRQQQKLVKQSSLKLLRPQPHLTH	471440	423700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_425944_426277_426362_427729_427854_435521_435611_441090_441206_441717_441842_444547_444594_446110_446275_446895_446972_447788_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453360_454143_454214_454332_454415_455172_455314_456371_456514_460019_460256_462550_462678_464335_464470_464744_464874_466631_466797_467514_467620_469495_469886_470545_470841_471349
894513	contig_6418_pilon	-	3228	2	Intergenic	novelGene_81243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTTTTATTCCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1450975	1447687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1449740_1449799
894514	contig_15325_pilon	+	2235	4	Intergenic	novelGene_157180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_3	733.441355680345	26	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	107	571	94114	95831	FALSE	15	TGCTGTGTTTGAGTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGRFSLFEEKFVTRPW	94007	97495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94117_94399_94567_95094_95233_95674
894515	contig_12079_pilon	-	1883	1	Intergenic	novelGene_67568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGAAAGAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872429	870546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_870500_872400
894516	contig_14744_pilon	-	2575	10	Intergenic	novelGene_66043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	490.403638235955	403	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	233	1339	1345024	1313534	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQALLQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQVRAWGAAWLCLKRAQLAQVTLHCPHFEQEGMS	1346625	1312297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1313785_1314309_1314378_1315775_1315943_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1346471
894517	contig_2214_pilon	+	2687	19	Intergenic	novelGene_144255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	285.893752387703	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1842	845	2686	287118	299293	FALSE	50	ATCTAAAGAAGAAGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHMKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEESKDQMEKEMLEKIEKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSVKLEQAMKEIQRLREDTDKANKHCSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKTDNEKIQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLSCQIEKLEHEIS	277755	299294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_278107_279612_279718_281612_281687_284756_284877_286540_286726_287108_287202_287621_287703_287780_287869_288604_288746_289158_289251_289492_289691_292870_292979_293993_294221_294869_295034_295646_295781_295859_296009_297123_297287_298554_298690_299215
894518	contig_2933_pilon	+	3679	1	Intergenic	novelGene_111331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	251	730	659340	659819	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANKNNNNCQIIFHHSCNEVVLRSFVGSSIPAPWSSGPAGEAGNRSTIFMGLFGSVPKSSEAPSHGAQVPRRSGYTVLICVHGDCFVPAMRHLSPGTHRSYTLTASQVCLFPSPFREQVQTLTKKLQELEEVKKEEKDDPMETAYEVQCGCVFSKSPV	659089	662768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_659100_662800
894519	contig_14522_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_147315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGGAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67100	65852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_65900_67100
894521	contig_7730_pilon	+	2517	2	Intergenic	novelGene_156292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTTAAACGTCCAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402829	441772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_404899_441324
894522	contig_4604_pilon	-	3869	7	Intergenic	novelGene_19117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	756	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAGGTAAACAACACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39199	5585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_5688_21250_21350_22722_22800_24239_24339_26061_26132_33234_33320_35862
894523	contig_11964_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_164718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	3	12	307	318	206010	206021	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKALQNDSNKLTSIVTLNVNGLSAPIKRWRVTEWIRKQDPSIRCLQEKHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANSYRNRAGVAILISDKINFKTKSTIKDKEEQYIMNT	205703	207358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_205700_207400
894524	contig_9809_pilon	-	5125	7	Intergenic	novelGene_176743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1144	1656	116913	115639	TRUE	10	CGCCCCTAGCGGCGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAFWNCEMTLIGSSYVSYAFCDWKRKMMMKKLTHQQKKYLKRKKLIFFFSSSTFSLPLRAYAIFLHLFLFSLFSVFLPFQLVFLLIPKISFRTQISGKNHTLKIAENIKPSIQKTNPQPATRFSIPKSPYYPALSKYFLTCEKLIMQMFGINHWNGQNGIEDHIAVGIP	118056	108222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_108510_108901_109027_109122_109325_110410_110494_110650_112589_114804_115989_116750
894525	contig_10003_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_88151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	573	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACCCTCACCAGAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377199	375014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_375000_377200
894526	contig_6661_pilon	-	4996	1	Intergenic	novelGene_174113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	709	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCAGAAATTTTGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412362	407366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_-_407400_412400
894527	contig_2036_pilon	+	4160	4	Intergenic	novelGene_131804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2107	2811	506727	507431	TRUE	35	ACAATTAGCCAACTCGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRCETVEDRISGTKDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENLPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRTAREKQEVTYTGETIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNSQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	378518	520623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_379503_422355_422949_506197_507834_519676
894528	contig_11003_pilon	+	2950	1	Intergenic	novelGene_105447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACCTTCTGACACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388817	391767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_388800_391800
894529	contig_10023_pilon	+	2060	2	Intergenic	novelGene_123483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171976	175857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_172154_173974
894530	contig_4782_pilon	-	2574	2	Intergenic	novelGene_73615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2859	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182318	159291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_161843_182295
894531	contig_17427_pilon	-	2559	13	Intergenic	novelGene_30332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	5393	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	38	1462	188879	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204698	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
894532	contig_498_pilon	-	2185	6	Intergenic	novelGene_148560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1676	2014	759911	757443	TRUE	15	CGCTCACTGTTGGTTCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVCLQHFLASLLSVQQHYGIRDLQALLLKNLNSFQNTRSTGNDIFNNQTGFTWINGAFYKTLLTIILAFFPSNKHWNLVGGTDNCSHGQSCVRHSTHGVKTDLGILGSLE	769125	755856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_756011_757425_757589_759718_760385_761734_761912_762925_763040_768214
894533	contig_4891_pilon	-	2402	11	Intergenic	novelGene_124513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	375.74879906661	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	192	824	68026	33546	TRUE	30	AAGGTTAGATTTAAGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQTLT	92800	28971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_30326_32227_32315_33408_33558_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
894534	contig_15952_pilon	+	5404	12	Intergenic	novelGene_154083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	3538	4131	545054	545647	TRUE	20	CAGTCTTCTTCTGGTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGLPNWNMEPRAGVKLAPEAGGAPKRKGWEVEVVLATLLMVLVTLFTPKPKAGFEAESVDVLAVVMEATAEVALDRPVKRGAVVVVVGVVVCLKEKGVDKGTDIGDPMLPKTGLKVGVEVLGITGRAELEDAAVVTEGLAGKGPSLSLLGGAPKMGLNMGDSEDTSEAAEGLEVGELSIPNRILGLGVEDGADGA	539219	562659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_541824_542262_542386_544243_545853_546748_546926_554053_554157_554317_554440_554934_555009_555666_555759_558670_558843_560348_560429_562091_562252_562571
894535	contig_10732_pilon	+	6116	3	Intergenic	novelGene_114693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1737	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	4920	5255	188138	188473	TRUE	30	ACTGGAGGACATTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQKISKHLQKQDRIVPISVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKQDKNEEKIDKFMENTDKKMEEFRKILQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINN	89107	189565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_92409_186519_188774_189004
894536	contig_2093_pilon	-	3410	1	Intergenic	novelGene_152936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCACCCTTTTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961174	957764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_957800_961200
894538	contig_2114_pilon	+	8081	4	Intergenic	novelGene_104221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	187.52125805418	723	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	120	866	136332	138000	FALSE	40	ATATTGATTGGCAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPRHSRSRSRT	136212	145215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_137604_137805
894539	contig_7151_pilon	-	3601	14	Intergenic	novelGene_40661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	110.648759274535	1276	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	171	1661	65162	13305	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	65332	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
894540	contig_10500_pilon	-	5018	6	Intergenic	novelGene_41273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	531	junction_1	557.692890397574	501	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2222	2737	1635203	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640229	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627490_1627822_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1637067_1639871
894541	contig_2703_pilon	+	2919	9	Intergenic	novelGene_101710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	1000.55421361114	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	290	964	559489	597957	FALSE	85	TTAAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHVLFEVMLFCFFKTKLRISFPELGLSIQRLLFYTKIYRPCLSEQQ	526177	599912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_597823
894542	contig_11422_pilon	-	1040	2	Intergenic	novelGene_99086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGGTGTTAGTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002	746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_757_972
894543	contig_20641_pilon	-	2580	10	Intergenic	novelGene_52779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	100.738139944641	8991	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	476	871	56705	54898	TRUE	15	CTGTGCCAATTTCTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57180	4869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_5228_11752_11877_12294_12338_14233_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54966_56377
894544	contig_7066_pilon	+	2048	5	Intergenic	novelGene_42193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	38.0328805114732	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1040	1663	998571	1003261	FALSE	45	TTTAAAAAAGTACCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	997531	1003646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
894545	contig_5469_pilon	+	3090	4	Intergenic	novelGene_176245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAATAAAGATCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107449	155725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5469_pilon_+_107891_107934_108285_108811_109506_154120
894546	contig_11574_pilon	+	3066	9	Intergenic	novelGene_64062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1930	2391	451502	452918	TRUE	5	CGCCCCGCCGCACCGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGLLENLEQELELLTGFTAAILRLLQLMGFLGSHQPMGKVHLILTKNLQISNLFIFNGERTGRKTAVRLLVTWFFRNFLLLTLEKPVFQAFSVAPDITEEIVGSGRSLTIIQGLLLGEPVLGVGAGYVRSLMTLGRFASKKPFTERDSCGAG	448318	463760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_449788_451041_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454887_456382_456536_463671
894547	contig_7744_pilon	+	2111	4	Intergenic	novelGene_62446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	151.270177717443	383	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	2	529	64253	69015	FALSE	35	CTTCAGAAAAACTTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTSHSHAAERSRSPAFRPRSPRSGTRRLAPGRARTPPALPWARAASPKPRGGAAQSRPPAPPRRGPSLGTSSRRHGQRRPRVLKEIRKLQKSTDLLLRKRPFGLLAREVCAIFTRGVDFNWQAQALLALQEAAEAFLVHLFEDAYLLSLHAGRVTLYPKDVQLARRIRGIQEGLG	64251	70597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_64458_67644_67755_68255_68334_68880
894548	contig_7031_pilon	-	4627	12	Intergenic	novelGene_132787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	396	junction_9	315.920431451124	668	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	158	2785	292050	212812	FALSE	35	AGAAATTTGTACGCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATACKRSPGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEVCTNEFCASCPTFLRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENNSKGAHNNSCSDIKMNKKEGPRDDFKDVTFLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKSLQGKDEDKDEDEKEKAACSVAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPEDVSVDIDAIRRVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENGNLHSPEYLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLVRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRNLVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDRNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNDVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKVFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVSLYSDYILNKSIEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML	294489	210969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_212933_213908_214053_241210_241285_241379_241536_243685_243851_244508_244715_247778_247924_257245_258493_268940_269246_288334_288380_292030_292151_294432
894549	SIRV6	+	1053	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	423	2	71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	45	ACATTCGCATGGAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894550	contig_6902_pilon	-	1690	2	Intergenic	novelGene_135603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACATCATACGAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497887	495448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_495523_496271
894551	contig_12915_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_148336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	530	1593	464	2056	51795	50203	NA	75	AAGGAAAAAAAAAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PENQLIEKKSPENTETSAQVITVTSEQYDINSLTNLQTKGRKIRRHKKEKEEKKRKKPVSQSLEFPTRYSSYRPYRCVHQGCFAAFTIQQNLILHYQAVHKSDLPAFSAEVEEESEAAKESEEIETKQTVKEFRCQVSDCSRIFQAITGLIQHYMKLHEMTPEEIESMTTAVDVGKFPCDQLECKSSFTTYLNYVVHLEADHGIGLRASKADEDGIYKCDCEGCDRIYATRSNLLRHIFNKHNDKHKAHLIRPRRLTPGQENISSRANQEKTKPKYRGTKHSRSGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNTKIVQIEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTSRFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKCHKLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETCSEQEVDKNDVKDSDICVSESNDNSGATSVPQKEAEKNEKDEMDELTELFITKLINEDSTSVEAQANTSSSVSNDIQENNSCQSEKQKASNLKRVNKEKNVSQNKKRKIEKTEAALAVDLNSMHKEEETAVAIQTTEDHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNSGTKRGSHSNSRKNIDKTAVTSGNHVCSCKESETFVQFANPSQLQCSNNVKIVLDKTLKDCTELALKQLQEMKPTVSLKKLEIHPKDPDVSAMKEISIGKATGRGQY	52258	50070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_50100_52300
894552	contig_11422_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_99103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATTCGAGGAACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1917	857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_900_1900
894553	contig_5033_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_28906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCCCAGAGCTAGCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449298	451384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_449300_451400
894554	contig_826_pilon	-	2404	7	Intergenic	novelGene_154940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	274	junction_6	105.636168048638	508	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	98	1243	419089	319233	FALSE	55	TCCTATGTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHEGVSCDACLKGNFRGRRYKCLICYDYDLCASCYESGATTTRHTTDHPMQCILTRVDFDLYYGGEAFSVEQPQSFTCPYCGKMGYTETSLQEHVTSEHAETSTEVICPICAALPGGDPNHVTDDFAAHLTLEHRAPRDLDESSGVRHVRRMFHPGRGLGGPRARRSNMHFTSSSTGGLSSSQSSYSPSNREAMDPIAELLSQLSGVRRSAGGQLNSSGPSASQLQQLQMQLQLERQHAQAARQQLETARNATRRTNTSSVTTTITQSTATTNTANTESSQQTTQNSQFLLTRLNDPKMSETERQSMESERADRSLFVQELLLSTLVREESSSSDEDERGEMADFGAMGCVDIMPLDVALENLNLKESNKGNEPPPPPL	419186	318071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_319495_325975_326259_328362_328538_331058_331161_352762_352903_363102_363271_419073
894555	contig_5023_pilon	+	2722	13	Intergenic	novelGene_7286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1986.2706732719	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	68	1408	607279	646990	FALSE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580861	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609639_618600_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
894556	contig_4426_pilon	+	1321	6	Intergenic	novelGene_15388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	194	337	452428	454946	TRUE	5	CTGCCATGCTCCCCCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFISSLETSSFERLAISWAILVSHSCLLASLSFLLRAVKILCTSHNLSSLDKSFIPPCLLISSLMLSWVSGSVGIVAMLDHRRGFVTCFSTTFPKSSCTCVKNTYRTRLLI	439263	463242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_439338_451288_451385_452404_452568_454942_455292_458834_459295_463063
894557	contig_2834_pilon	+	1428	7	Intergenic	novelGene_27980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2449.13037287388	29	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	82	657	274763	290707	TRUE	25	ATCCTTTACAAGCCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	238727	292118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291176_291815
894558	contig_13633_pilon	+	4531	11	Intergenic	novelGene_15299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	502.891200957026	1065	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	511	1323	22038	31785	TRUE	50	ATTATAGATAAGTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQVSIG	5018	64874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21641_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_33722_47750_48624_64475
894559	contig_10345_pilon	+	1209	11	Intergenic	novelGene_158364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1233.04024265228	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	67	657	11670	20454	TRUE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKSVSEIHQVQSA	4372	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_20418_20517_21588_21648_23046_23170_24084
894560	contig_7457_pilon	-	1759	7	Intergenic	novelGene_31413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_6	154.91978210961	63	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	26	670	473193	469327	FALSE	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473218	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
894561	contig_7963_pilon	+	1177	6	Intergenic	novelGene_58373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1368.62158393034	70	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	84	902	51450	62872	TRUE	30	AGCACTGGTGTGTATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPLFSVTPHCCSPGGQWQVQE	51366	63229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_62814_62922_63003
894562	contig_10904_pilon	-	1934	9	Intergenic	novelGene_22546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_8	189.115540080661	425	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	116	1129	396033	375280	FALSE	0	TTTTGTGTGTGGCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTLEQGRYCISWSREDILSNTNGKTEGISVEQAEGAAMISQFLFLLCFGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	396148	374474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389651_395999
894563	contig_7993_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_170966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAAGTGCTCAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31942	34486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_31900_34500
894564	contig_12786_pilon	+	2221	2	Intergenic	novelGene_103375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGTGACGAGCGGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519253	629490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_519272_627287
894565	contig_7568_pilon	-	2822	1	Intergenic	novelGene_174014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGTTTTTGTGTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136395	133573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_133600_136400
894566	contig_593_pilon	-	2549	2	Intergenic	novelGene_101976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTACGAGTTGAAATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153775	140652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_140682_151255
894568	contig_8636_pilon	-	4270	3	Intergenic	novelGene_141915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	96	1072	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	509	1546	368553	367516	TRUE	10	ATAGCTTTGTGTGTGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLEIKVALNFIISYLYNKLPRRRADLFGEELERLLKKKYEGHWYPDKPLKGSGFRCVHIGETVDPVVELAAKRSGLAVEDVRANVPEELSVWIDPFEVSYQIGEKGAVKVLYLDDSEGCGAPELDKEIKSSFNPDAQVFVPIGSQDSSLSNSPSPSFGQSPSPTFIPRSAQPITFTTASFAATKFGSTKMKKGGAASSGGGVASGGGSGQQPPQQQPCLARSPTNNLLKHKSLSLSMHSLNFITANPAPQSQLSPNAKEFVYSGSGSPSLFFDGADGQGSGTPAPFGGSGAGTCNSSTFDMAQVFGGGANSLFLEKTPFVEGLSYNLNTMQYPSQPFQPVVLAN	375055	364753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_365632_365669_368651_374644
894569	contig_5684_pilon	+	1659	3	Intergenic	novelGene_81037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	43	315	403611	442067	TRUE	70	TAGATAGTAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPPTAVARPPGSWRMELRCGGVGSQAVGRGMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTHTHFFFRSPPSLSEAWGNW	403568	443561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_442004_442396_442545
894570	contig_8330_pilon	-	2434	9	Intergenic	novelGene_71856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	235.06857377157	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	135	1229	916108	896082	FALSE	30	GACATTTTCAGACAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAAPAPERLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRGLHHPGDRLPESGEQWLARSPKCRKPLARVDHHDSGGWLLHPLCRACSHPPEAGALSIPPNRGQLSAGPGGVFPGHLQQQDFPQRCLICCPRGLPRELALLALSSLCPSFFSHLPSELHFPWVPYMMVMPSTDLRRVLPWLFLLPQQPALPST	916242	894876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899610_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
894571	contig_7091_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_131781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTACAAAATAAACAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358148	359920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_358100_359900
894572	contig_8820_pilon	-	6357	29	Intergenic	novelGene_79262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	385	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	4847	5533	81466	75667	TRUE	50	GCCAAGCTAAAAACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPDVVFHALDQLGLVLTDGPADVGPDKQGVEPGEDPEHLVSVLGSAKLVTEASSDAGFHSVDPFIVSLHRSLPRFRAFLGDVEPIHLLDVLVSKVDLLNGIRVGSIKENLCYLHILGFRYLSLILLCNRCDLWPQDPDNHSPQLLMLPSEFSHLVKARLQLPVSGVDAPHHLQIFFPLPFHDVSQQHLQFLILIIPSLENFKACYHNFFKFFISNMHQFSSAQHFE	99824	72413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_72579_72811_73069_73458_73646_75451_75727_75816_76043_81065_82143_83235_83416_84745_84898_85581_85727_86872_87014_87651_87829_87955_88067_88148_88269_88842_89085_91348_91503_91642_91757_92005_92117_92192_92402_92690_92838_93043_93212_93300_93475_94225_94392_94472_94660_94748_94945_96336_96625_96866_96966_97623_97787_98950_99195_99342
894573	scaffold_15027_pilon	+	2169	14	Intergenic	novelGene_163565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	148.897168757184	143	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2148	20	2167	48927	106778	FALSE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLWEDMAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLYLEQSDFHEKFAGGDICVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHINKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSS	48907	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_104978_105638_105828_106597
894574	contig_14450_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_48946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1705	2010	539504	539199	NA	70	TAAGTCAAAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHDYHGLHQTESSTARWCLATTTDCSDRDHNRGSQTELETNVEQNSNLQKKKKNQSYWRDRDWRNPNSIAPRHPFSSVMKSLPRFTIQLGTRQPHKTKQD	541208	538776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_538800_541200
894575	contig_6286_pilon	-	5584	3	Intergenic	novelGene_165653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1005	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	4482	4946	148115	147651	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTPKAGSGLSPLHQPVSQALRKLLKVEDRNSLAQGQQREGGRRGYYGKVIPVEVHGLWYQWFKIKAKGLQDENPSTRGHDSKPSLRSLGVSWSWAAAGSRGLSWVRAEAWGMLLRKVVPFCPRSFTIFLKVGWEVGFRFKALGEQGQKWWWS	160816	147012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_151405_154040_154334_159917
894576	contig_13329_pilon	-	2544	1	Intergenic	novelGene_177848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	434	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTTAAGAAATAAACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22812	20268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13329_pilon_-_20300_22800
894577	contig_5669_pilon	+	8104	9	Intergenic	novelGene_86058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	166.044751121497	44	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	178273	184919	TRUE	15	CTGCAATTCTAGGGGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGRPPGPGSARITQRPAHRHLCHEPARPRGSPRTPPGAAEALACGPGEQLPVPRASVGQRGQEVLLHPLAPRHAARPRPGRRQHHLQGDLRIVSVQDSSRLGH	178270	198559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_184869_184971_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187325_189243_194419_196364
894578	contig_10609_pilon	+	2648	3	Intergenic	novelGene_123943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	321	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTTGTGTACAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427005	583700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_427480_427764_429429_583190
894579	contig_7207_pilon	-	1750	9	Intergenic	novelGene_72070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	251.321507237244	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	838	1749	696514	671657	FALSE	50	AGAAAAGTAAGTATACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKE	757938	671655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_734033_734228_737456_737530_737916_738105_757787
894580	contig_13172_pilon	+	3706	2	Intergenic	novelGene_146311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2774	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	346	744	4539	4937	TRUE	45	AAAAAGCCCACAGCCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKATYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNKTENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSINGEKTVFLTNGAAKTGYPFAKK	4193	8201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_5705_6006
894581	contig_4496_pilon	+	2546	6	Intergenic	novelGene_66660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	173.31751209846	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	509	2278	952477	998163	FALSE	75	AGTTAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859244	998431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_941359_941486_951023_951148_952412_952529_996162_996282_996564
894582	contig_12414_pilon	+	2260	17	Intergenic	novelGene_59611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	107.858414136311	742	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	236	859	528421	591484	TRUE	15	TACTTTGTCTTTGTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527622	607456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_528357_528424_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
894583	contig_12079_pilon	+	1762	2	Intergenic	novelGene_67481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1384	1719	609040	638797	FALSE	10	GAGACTCGGGCCGCCCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNCLDSIWVYKETRKQTNQVNAFSQQNYLAVGKNSLLNGNDLSRVHTDLIKKLLPSSVWLDGELQLRIHGGDPDIDWFRHFRFLGGSPQSLGNTTLSSSRRRNPPDLER	607656	638840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_609274_638695
894584	contig_4678_pilon	+	5695	16	Intergenic	novelGene_126036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	137.208778468759	1061	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	93	1802	482896	496144	FALSE	25	CCCAGCTGATACGGTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENIVANTVLLKAREGGSGNRKGKSKKWRQMLQFPHISQCEELRLSLEHDYHSLCERQPIGRLLFREFCETRPELTRCIAFLDGVAEYEVTPDEKRKACGQRLMQNFLSHTGPDLIPEVPRQLVTNCAQQLEQGPCKDLFQELTRLTHEYLSMAPFVDYLDSIYFNRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKKLEKKRIKKRKGEAMALNEKQILEKVNSRFVVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQQRKKKIKREEVERLVKEVPEEYSDRFSLQACSLCSQLLCKDPAERLGCRGGGAQEVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGMVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFSRQRIAVGTAVTVRKSSPPVSSSPRILSSPPASSPQLEAPIGGWR	479083	500037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_479132_482851_482948_483810_483924_484042_484121_484497_484599_484863_484957_485062_485127_485276_485418_485671_485863_486714_486753_486834_486925_488121_488331_488422_488561_495093_495232_495312_495448_496015
894585	contig_4180_pilon	+	2101	9	Intergenic	novelGene_8290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	173.512202380697	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	691	1557	811833	821915	FALSE	70	AAAAGAAAGAAGGAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733010	822459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
894586	contig_5196_pilon	+	2158	1	Intergenic	novelGene_38690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTATTAAATTTGGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239823	241981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_239800_242000
894587	contig_15114_pilon	+	3664	3	Intergenic	novelGene_121125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	946	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1009	1503	100830	109812	FALSE	55	CCAAGCCTACATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAQKLFQVLWKRIPRGEGVLCLLVNVPHQGQATEEQEEDHENRSDEDDGNNPGGCRFVIGCLLTDWLTPFPSFVQIRKKSLNLNTVSCPQLQISEDLKIIRSGNLKLGTKMKIRKGLSREGTPSSCLVLTSHNLTQEGAGAGALPLTAGDPDALLRGGSGSL	99821	111973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_100850_106817_106974_109493
894588	contig_12626_pilon	+	2058	12	Intergenic	novelGene_80432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	606	junction_5	282.9992845244	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	437	1588	155638	162837	FALSE	25	GGAAGATTTTGAGCGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSNEEHFQEPDCSPEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEFAEVTVIEPLNEAARPSHITASDCNEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVEGEMLEDVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGKHTQTPPFQSLCL	118639	163307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_118675_132103_132274_147728_147769_149282_149474_155637_155785_156281_156450_156973_157111_157459_157601_157881_158057_160817_160929_161302_161393_162654
894589	contig_9161_pilon	+	2937	6	Intergenic	novelGene_160630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	464.760411394947	15	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1012	1701	52934	63414	FALSE	45	GGGAATACACAGAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQTPKNKATVFKLCSICLYLPQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	50758	64650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_51745_52908_53063_54664_54842_56680_56804_60940_61076_63288
894590	contig_2703_pilon	-	7649	11	Intergenic	novelGene_101767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTGGACAAACTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611726	588536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_594672_596349_596399_599679_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754_611520_611659
894591	contig_401_pilon	+	3630	16	Intergenic	novelGene_42751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_1	261.903459737023	594	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	175	1887	975645	998753	FALSE	15	CAAGTACCTGGGGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIVQGFFAQNGVNPDWEKKVIEYFKEKLKENNAPKWVPSLNEVPLHYLKPNSFVKFRCMIQDMFDPEFYMGVYETVNRNTKARVLHFGKYRDVAECGPQQEVDLNSPRTTTLERQTFYCVPVPGESTWVKEAYVNASQARVSPSTSYTPSRHKRSYEDDEDMDLQPSKQKEQHAGARQAGSVGGLQWCGEPKRLETEASTGQQLNFLNLSSPFDLNFPLPGEKGPACLVKVYEDWDCFKVNDVLELYGILSVDPVLSILNNDERDASSLLDPMECTDTTEEQRVHSPPASLVPRIHVILAQKLQHINPLLPACLNKEESKTFVSGFMSELSPVRAELLGFLTHALLGDSLAAEYLILHLISTVYTRRDVLPLGKFTLNLSGCPRSSTFTEHLYRIIQHLVPASFRLQMTIENMNHLKFIPHKDYTANRLISGLLQLPNNTSFVIDESLLEQGQLDTPGVHNVTALSNLITWQKVDYDFSYHHMEFPCSINVLITSEGRSLLPADCQMHLQPQIIPPNMEEYMNSLLSAVLPSVLNKFRIYLTLLRFLDYSISDEITKAVEDDFVEMRKNDPQSITADDLHQLLVVARFLSLSAGQTTLSRERWLRAKQLESLRRTRLQQQKCVNGNEL	962040	1000496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_962063_974912_974999_975578_975720_975851_975894_978106_978209_979566_979712_982126_982279_983714_983816_984711_984885_985463_985588_986749_986868_987406_987573_988970_989105_990033_990199_998223_998313_998626
894592	contig_5020_pilon	+	1406	9	Intergenic	novelGene_27883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1041.54536627072	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	229	729	122915	124469	TRUE	10	GCTCAACCTTGGTGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAHCPGGRVSGTLERDLSQCCS	118489	126076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118519_119498_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124269_124324_124363_124444_124547_124909_125091_125657
894593	contig_13780_pilon	+	1296	3	Intergenic	novelGene_149051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5	30	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	287	751	605685	607162	FALSE	65	AAAAAAAAAAATGAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFEEVGCCEDLEAVGEGQRALLGRNHLRLSCTRLSVGRVEAQRPGDGSPGLGAFGPRWGLGDRAEAGAVEAAETTGGARWRGRDSAGETGPNQSMAMGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGASHEAAAGPGRRGPAGRGTLQGCQEAGGEAGPEHPRLSRPEIRRMGVLRYQASQVQYCLFCTLYRLYVFLESCQFIELKCDLYTCLLQPQYL	603977	607707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_604236_605656_605869_606881
894594	contig_12919_pilon	+	4100	3	Intergenic	novelGene_75923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	296	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	37	864	855541	869458	FALSE	15	GTGGTGGTGGTAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWRQRWTPLSSAMASISNVKESEVSERTVVVAGLPVGSFSDQSLAKLVKIYFQDIKNEGGDVEDVIYPTRTKGVAYVTFKEKKGISKSNLLRESLLLKASSLLEKNRNFISEGKKLSRQSPKGSLQRSNDSLESFRTLVPETTGSGETLVLDTDVFLYLKQKCRCYEGTLKTFNVLSRERVDNDVTTIYLKSVQGGSQPDNVKHVKQLIKEYSYSLQLELRKDTIVLEGKENREQRTIKLACEQLSLIYLQVLVNCYRTHIDIIGSSSDIYLFRKQVMKLIGQKVSY	855504	872694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_855544_864196_864427_868863
894595	contig_19604_pilon	+	2217	5	Intergenic	novelGene_77246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	281.166654317328	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	172	531	273206	273988	TRUE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	270763	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270867_273137_273319_273484_273577_273833_274564_274708
894596	contig_11307_pilon	+	1686	7	Intergenic	novelGene_105240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	97.2259681818026	132	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	92	418	74141	78606	TRUE	40	CTTACCCTAATAAAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVPFPVGKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYDQEQLDLRYHICLSWYLQ	74049	88501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748_76960_78550_78663_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
894597	contig_20739_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_83173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	737	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATTTAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118938	121643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_118900_121600
894598	contig_9843_pilon	+	2926	2	Intergenic	novelGene_114309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9393	52775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_9533_49988
894599	contig_14300_pilon	-	1006	1	Intergenic	novelGene_133083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133075	132069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_132100_133100
894600	contig_7644_pilon	+	7018	8	Intergenic	novelGene_64250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	144.174922102512	867	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173493	232891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_176654_177755_177835_179596_179696_182476_182533_182891_185112_186876_187464_199679_199809_232203
894601	contig_8775_pilon	-	4782	1	Intergenic	novelGene_166823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1104	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTAATTGTATCTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94261	89479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_89500_94300
894602	contig_1339_pilon	+	483	5	Intergenic	novelGene_163139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4815	junction_1	2383.48657432762	59900	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	31	444	431340	434136	FALSE	0	TGCCTGGGCCTCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGQRKPATSYVRTTINKNARATLSSIRHMIRKNKYRPDLRMAAIRRASAILRSQKPVMVKRKRTRPTKSS	430930	434175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431736_433677_433797_434046
894603	contig_6630_pilon	-	2168	4	Intergenic	novelGene_30698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	515.532303115484	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAAGATGTTGCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360695	355883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357774_358618_358671_358778_358860_360550
894604	contig_6510_pilon	-	5597	5	Intergenic	novelGene_173518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	2844	3794	344758	150586	FALSE	25	CCACACAGTTCTTAGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENAIELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKLDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQPEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDITLFQENSEKRTKKNEETLRVIWDTIKSKTLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLRSDYSAETMLCNKSSTILSVFSVLPPCSGTPITRRLFFLIESHIILRVSSFF	364747	148782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_-_150710_307085_307093_343938_345725_345872_346650_363647
894605	contig_4803_pilon	-	4785	32	Intergenic	novelGene_150703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	499.671334226468	198	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2295	123	2417	134257	15989	TRUE	20	AAATTTTGGCTGTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFASWWYKTHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSASSAATSKSSSMNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPPMSEDLLLEALSEDFSGPRPADTSSLKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	134379	12592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_12701_12777_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_101681_101754_119613_119677_134227
894606	contig_11720_pilon	+	7539	9	Intergenic	novelGene_43800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1948.47850498152	1046	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	237	893	68064	87271	TRUE	20	TCTTTCTATCGTACTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQVWSAHHGGRGHHGMVINTFAQKHTVRQSGELAAFL	67827	98753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_93261_94959_95061_95383_95486_98299
894607	contig_709_pilon	-	1219	10	Intergenic	novelGene_57598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_8	112.262369056478	794	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	187	1218	2343009	2326818	FALSE	25	TGATCGACCCCACAGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHILITNRISEVYCKACLKSITISLVQNFLVFMTTQAKLMKKVWTGFLKIGERKLLGGTDFGRNTQQQMSYREQVIHKQLTRLLGAPDLVFLLFSSISTANSSTHALEYVLFRPNRRYNPRISLAIPNLGNTSQQEYKVSSVPNTSQSYAKVIKEHGTDFFDKDGVMKDIRAIYQVYNALQEKVQAVCADVEKSERVVESCQAEVNKLKRQITQRKNEKEQERRMQQAMLSRPVPSENLESGFSPRMPYSAFAAEGRSTLGDAEASDPPPPYSDFHPNNQESTLSHSRMESSVFMPRPQAVGSSNYASTSTGLKYPAGGADLPPSQRAAGDSGDESDDSDYEN	2349991	2326816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2327177_2329518_2329634_2332076_2332162_2333228_2333349_2334200_2334393_2337517_2337585_2340273_2340311_2342952_2343028_2345847_2345939_2349914
894608	contig_9098_pilon	-	2977	12	Intergenic	novelGene_75848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	168.193218286844	19	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1667	2536	345261	335775	FALSE	20	TTGCTATTTATATCTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	352615	335333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349641_350961_352565
894609	SIRV6	+	1467	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	59	2	-58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1142	20	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	20	GGATTTAGTCGATTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894610	contig_1090_pilon	+	2826	1	Intergenic	novelGene_131107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304813	307639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_304800_307600
894612	contig_15105_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_150955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCATGCTCATGATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441154	438605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_438600_441200
894614	contig_13144_pilon	-	4908	2	Intergenic	novelGene_178457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1602	2192	102761	102171	FALSE	50	TGATAAAAACTCTCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	104630	99454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_-_103850_104117
894615	contig_3465_pilon	+	3804	2	Intergenic	novelGene_173399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTATGATTTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785872	790698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_787018_788039
894616	contig_7078_pilon	+	2800	1	Intergenic	novelGene_130202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCCATCTTTTTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951290	954090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951300_954100
894617	contig_4782_pilon	-	6870	11	Intergenic	novelGene_73670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	901	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGCCGCCAGCCACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693146	588723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_588910_646368_646447_657909_658012_658644_658826_659619_659702_660215_660329_660708_660806_664146_664266_667194_667284_667789_667950_687483
894618	contig_11855_pilon	+	5577	14	Intergenic	novelGene_67121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	201.772207374155	515	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	88	738	2642479	2650139	TRUE	10	GCTGAGCGTGGGGTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCWGAAGGSQEAETRVPGSRTARGPSAGMHRRGVGAGAIAKKKLTEAKYKERGTVLAEDQLAQMSKQLDMFKTNLEEFASKHKQEIRKNPEFRVQFQDMCATIGVDPLASGKGFWSEMLGVGDFYYELGVQIIEVCLALKHRNGGLITLEELHQQVLKGRGKFAQDVSQDDLIRAIKKLKALGSGFSIIPVGGTYLIQSVPAELNMDHTVVLQLAEKNGYVTVSEIKASLKWETERARQVLGAV	2642391	2666852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2642533_2642911_2642963_2644485_2644625_2645566_2645672_2646491_2646565_2647812_2647955_2648833_2648909_2650127_2654351_2656329_2656417_2657308_2657425_2659634_2659745_2662496_2662685_2664670_2664746_2666800
894619	contig_9901_pilon	+	1745	2	Intergenic	novelGene_126947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	364	939	301993	302568	FALSE	30	ATAGTATCTTAGAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVNSRGHQAKAQVVMMGLDSAGKTTLLYKLKGHELVETMPTVGFNVEPLEVPGRVSLTLWDVGGQTQLRASWKDYLEGTDILVYVLDSTDKDRLPEAVAGLREVLDNPNMASVPFLVLANKQEAPDALPLLDIRDRLGLERFQDHCWELQACSALTGEGLPEALQSLRSLLKSRSHLCLQERSEESKKS	301114	303374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_301202_301716
894620	contig_10192_pilon	+	1991	2	Intergenic	novelGene_178664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGGCTCCAACAGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272911	276813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10192_pilon_+_274046_275956
894621	contig_11978_pilon	-	3109	5	Intergenic	novelGene_62880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.9653093217409	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	679	2040	40	2079	660350	651135	FALSE	70	TCACTGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKTKKHKHSGPSAMLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRNTLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPSSGLTLESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFSEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLGAGREIFDYSHRQKEQDVDKELQDGGEQGDTWPGEDAEALARNLLVDGETGESFPAQFPADISSIAEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSTSEILYNTPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFSLFSPEVESLPVAGSSTLLPLVPSNSTSLNSTFGSTNLAGLFFPPQLNGTTNDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPSQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSANLPPPSTLKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQQDKARLLREKVEFLRSLRQMKRVDAHQDRN	660389	650104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_651164_651362_652522_653703_653863_654629_654813_659840
894622	contig_9903_pilon	-	2623	7	Intergenic	novelGene_172005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	56.6992553351061	365	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	148	633	101500	82602	FALSE	55	TTCACAAACAATATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106369	80611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106252
894623	contig_7357_pilon	-	1616	5	Intergenic	novelGene_36817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2593.97214711338	23	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	250	822	166824	136344	FALSE	10	TCTTTGTTTTTCTGGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEEVYIHFP	167073	135549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136367_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
894624	contig_7151_pilon	+	4979	5	Intergenic	novelGene_40728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	134.483037963901	114	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTGAACCTAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502229	509874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440
894625	contig_8241_pilon	-	2848	10	Intergenic	novelGene_157499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	36.2522029981934	518	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	39	1166	638530	621106	FALSE	55	ACAAAGATGGGAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFLEKFQSQPYRGGFHEDQWEEEFEKIPLFMKKAPSEIDPKENPDLACLQSIIFDDERSAEEQAKTYKDEGNDYFKEKDYKKAVISYTEGLKKKCADPDLNVVLYTNRAAAQYYLGNFRSALHDVMTARKLKPCHLKAIVRGALCHLELKNFAEAVSWCDEGLQIDAKEKKLVDTRAKADKLKRTEQRDIRKAKLKEKKEQNQNETLIQAVKARNIRLISEAAGEDEDSASEGLGELFLDGLISENPYGARMSLDDQGRLSWPVLFLYPEYGQSDFISAFHEDSRFIDHLMVMFGEMPSWDLEQKYCPDNLELYFEDEERAELHQVPPESTLLHTLQHPRYSVKALTPAFLVCVGSSPFCKNYLRGRRVHQIK	638568	619423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_621209_623391_623475_624988_625071_625693_625912_628198_628286_629875_630001_631482_631561_636647_636810_637739_637858_638458
894626	contig_567_pilon	+	7669	16	Intergenic	novelGene_34010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_9	201.134603907157	14	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	5288	6835	640752	655116	FALSE	10	TTCTGTGTTCAGTTACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKMEVGQPEPVDTQPEDIPETKTEDCKVEPTETEERGTELKTEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHFCEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVLHHEVIWPTGFVCDGCLKKTGRTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGEVTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQEYGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKVSWSTEIK	632818	655950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_636024_636376_636487_638170_638309_638917_640818_641259_641405_643230_643350_644447_644688_645326_645416_647348_647430_649002_649060_649752_649831_651517_651586_652502_652654_652765_652913_653597_653712_654923
894627	contig_14682_pilon	-	2650	1	Intergenic	novelGene_139098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	262	789	443	1231	86165	85377	NA	30	CCACCTAGTAGAGCTGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRYMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLIPALLARIKYTGNNKCWWGCGEIRTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFFRKLEIDIPYNPAIALLGIYRREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKGWKERRCPSTDEWINKLWYIHTMEYCAARKNNSESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQEDKYCMRREWRKPPAVISRVIWLAGIGGNFVIKIFINALSCFTTLMCGRMWSSVNFNKWNETSFKIFSSVEFDF	86607	83957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_84000_86600
894628	contig_6658_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_168406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	899	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAGAAAAGCTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166075	164057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_-_164100_166100
894630	contig_5945_pilon	-	1699	7	Intergenic	novelGene_104560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	294.226481170921	20	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	611	952	225769	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249758	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226709_235617_235755_249568
894631	contig_17144_pilon	-	2520	18	Intergenic	novelGene_29497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.25036233754	22	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	98	2470	179764	166129	FALSE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPTH	183179	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_166525_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
894632	contig_1719_pilon	-	1653	12	Intergenic	novelGene_87382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_2	248.253469510432	463	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	223	1401	866135	847238	FALSE	35	TGACTGCAAATTTTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGHFVHPPPPPAPPGRSAVSGAGWGKRTREQDSVPFPLSPAGVRSPPPLPPHPLPSPALPSPLSRDLSVAPTMMEDDGQPRTLYVGNLSRDVTEVLILQLFSQIGPCKSCKMITEQPDSRRVNSSVGFSVLQHTSNDPYCFVEFYEHRDAAAALAAMNGRKILGKEVKVNWATTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKSAFAPFGKISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFYNKLDAENAIVHMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTQENNTKQLRFEDVVNQSSPKNCTVYCGGIASGLTDQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPEKGYSFVRFSTHESAAHAIVSVNGTTIEGHVVKCYWGKESPDMTKNFQQVDYSQWGQWNQVYGNPQQYGQYMANGWQVPPYGVYGQPWNQQGFGVDQSPSAAWMGGFGAQPPQGQAPPPVIPPPNQAGYGMASYQTQ	866357	846985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_847365_848132_848273_848617_848742_848986_849072_849177_849274_849857_849967_851392_851469_853348_853437_853592_853648_853889_854040_859228_859326_866103
894633	contig_12790_pilon	+	2056	2	Intergenic	novelGene_35181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCTCACAACAAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59363	233037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_59532_231149
894634	contig_11258_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_67864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAGGGAAAAACTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374719	373561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_373600_374700
894635	contig_10404_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_138710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAACAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1236533	1238494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1236500_1238500
894636	contig_13481_pilon	-	1951	7	Intergenic	novelGene_119398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_4	556.873713990285	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	265	507	556920	536905	TRUE	25	TCTGTCAGATGAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAVKRRRRRSLGLGSGSQRLPRAPPKLDVTPSPARRLPLSLPAPSPHRHSAPHSRSARLTAPLPAYPPGPGAALALHVPCPSPPPPCTMSSLKSEGEHSTGTSTGSGGSLEEEVRTLFVSGLPVDIKPRELYLLFRPFKGYEGSLIKLTSRQPGRSRSGQECIERYSL	557184	526369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527531_536157_536304_536767_536919_537232_537270_538013_538053_538608_538687_556845
894637	contig_6503_pilon	-	5959	15	Intergenic	novelGene_145770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	62.1906220373117	534	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	284	2311	222490	159904	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSHMNGHVTEESDSEVKNVDLASPEEYQKHREMAVDCPGDLGTRMMPVRRSAQLERIRQQQEDMRRRREEEGKKQELDLNSSMRLKKLAQIPPKTGIDNPIFDTEEGIVLESPHYAVKILEVEDLFSSLKHIQHTLVDSQSQEDISLLLQLVQNKDFQNAFKIHNAVAVHMNKASPPFPLISNAQDLVQEVQTVLKPIYQKEGQELTALLNAPHIQAFLLAHDKVAEQEMQLEPITDENAYESIGQYGGETVKIVRIEKARDIPLGATVRNEMDSVIISRIVKGGAAEKSGLLHEGDEVLEINGIEIRGKDVNEVFDILSDMHGTLTFVLIPSQQIKPPPAKETVIHVKAHFDYDPSDDPYVPCRELGLSFQKGDILHVISQEDPNWWQAYREGDEDNQPLAGLVPGKSFQQQREAMKQTIEEDKEPEKSGKLWCAKKNKKKRKKVLYNANKNDDYDNEEILTYEEMSLYHQPANRKRPIILIGPQNCGQNELRQRLMNKEKDRFASAVPHTTRSRRDHEVAGRDYHFVSRQAFEADIAAGKFIEHGEFEKNLYGTSIDSVRQVINSGKICLLSLRAQSLKTLRNSDLKPYIIFIAPPSQERLRALLAKEGKNPKPEELREIIEKTREMEQNNGHYFDTAIVNSDLDKAYQELLRLINKLDTEPQWVPSTWLR	268354	156255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_160081_174409_174521_177132_177336_178035_178204_180995_181068_181415_181488_185065_185250_195415_195494_196831_196994_198143_198291_198828_198907_206140_206350_222123_222658_227434_227521_268324
894638	contig_6410_pilon	+	4599	6	Intergenic	novelGene_108647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGTGCGAGAGAAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409840	419321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_414020_415789_415875_416092_416239_417146_417206_418579_418647_419258
894639	contig_1964_pilon	-	5899	20	Intergenic	novelGene_130899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	388.47794477088	619	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	245	2071	158906	119262	TRUE	20	TTGTGTTTTTCTCTAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAEKESSHSSGPQEGTLQLANPPLLQNSVFQRVCHFQRTDLRLLPTKKFWEPDDSTKDGQKGIFLGDDEWRETAWGTSHHSMSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGTFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDLKQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPPEVLGPLPNPTANKPLVEEFSNAETQNLDAMEQVGLDSLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQLFQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGVPWGVYPANLFQQQAAAAANNTASQQAASQAQPGQQQVLRAGASQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYYDQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTAGSLTGTTNGLFRPIGTQPPQQQQQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLSNSSQSTSLFSHGPGQPGSASLGFGSSGSLGAAIGSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRPSSSLAPIGQPFYNSLGFSSSPSPIGMPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLEKQPLPKPST	172735	105349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_108289_110613_110807_111341_111464_111710_111837_112522_112661_115149_115279_115934_116065_119210_119294_138056_138294_142615_142907_143025_143170_148382_148522_150074_150218_152871_152998_154587_154682_154853_155125_157972_158143_158726_158915_166164_166274_172608
894640	contig_5686_pilon	-	3408	1	Intergenic	novelGene_45370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTCCAGGGCTAGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138793	135385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_135400_138800
894641	contig_8476_pilon	-	2043	4	Intergenic	novelGene_121319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336.111423324006	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGCCTTTGCTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107098	38595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_39996_40065_40476_104798_104864_106930
894642	contig_20004_pilon	+	10348	26	Intergenic	novelGene_167522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	167.763853079261	1121	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2891	8676	135	8810	13715	66494	TRUE	50	CCAAAAATTTTAAGTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYQNLRQRVDNFVVNHLATHTWSPHLNKNQLRNNIRQQVLKSGMLESGIDRIISQVVDPKINHTFRPQVEKAVHEFLATLNHKEEASASTAPDDEKPDSSIIIQGIPAPGPSANVANDAMSILETITSLNQEASAARASTETSNSKANERVYKKLPFQPSTDINTEKDRTSEDVADKEKSPPDSAGEGLEAAPKSEESNDFPGPVEEIKNHAKENNSLILVSKEVQQEGSDQKNKSTDKGEKKLDSNEKGERKKEKKEKTEKKFDHSKRSEEMQKIKDEKQVKEKEVESSKLPTEKNSNKAKTVEGTKEDCSLVDSDVDGLTDITVSSVHTSDLSSFEEDTEEEVVMSDSTEEGEITSDDEEKSKLNKTQTQTSDPSEGKAKGVRHAYVHKPYLYSKYYSDSDDELTVEQRRQSVAKEKEERLLRRQINREKLEEKRKQKAEKTKSSKAKSQGKGSVDLEESSAKSLEPKAPRIKEVLKERKVLEKKVALSKKRKKNSRNIEENSKKKQQPEEDSKETLKPSEHFEKEKVSSSKELKHVHAKSESSKPARRLSESMHSADENKSESKVEREHKRRTSTPVVVEGAQEETDVRDGKRQVERSEIGTEEPQKQKSTLKNERHLKKDDSETPHSKSLPKKEVKSSKEKPEKEKTLSEDKLSVKHKYKGDSVHKTGDEAELHSSEKGLKADENIQKQSQQTKLFSDDKADRKSKHRNERKLSVLGKDGKPVSEYIIKSDENVRKENNKKERHVSAEKTKAEHKSRRSSDSKVQKETLSSKQHGITLQKRSESYSEDKCDMDSTNLDINLKPEEAVHKEKRRTKSLLEERLVLKSKSKSQGKQLKGIEIELQESVTKQATTPKPDKEKNTEESDSDKQRKSKSEDKPCEEAGVESVLESASSSAHTAQKDSSHRAKLSLAKEKYKGDKDSSSSRLERRLSDGHKSRSLKHSGKDVKKREENKSDDKDGKEVDSNHEKAKGNSLVEKKLSRRLYENRRGSLSQEVTKGEEKLAANTLGTSSISSLQRPKKSGDATLIPEQEPMEVDSESSVENVSIVSKTQDSSNNGSQQDTDSENVMKQKTTSTLLKEELRTSTVDLRTAALACKSGRGMVLGNSEKHAGHKSTLTKKVHIQSAVSKPNPEEKEAIQQGTHEMNVDCETSHRMLPSAPSENDSIQKNLKNMSKPTEEHVAQGDAALEHSTNSDPSPPLSSVTVVPQKGPHDSDVIPLANKRTVLESGAASTSLLDHSAIPNQSLTLGDSEVPQTSDSKEDGEGSTVDTPTKASIDSIRHIPEDSQTALLHSKQGKVNKPHGSKSTDMAVGNADVNKEVVLTDMAKKESDLITKPSLKENIRSTVDNGKKDGVAVDHVVGITTEKDAESIELTEKISINRGPGEMENLSIDGERRNENSEVDTSAGGDNASSVLHQRNETAENVTAGSGRPEKTFIATSTEGKDKAVTLSSVKTGAATTTSSETGDSEVALPCTSIEADEGFVTGACSRNNRLHVGAEPSECTVFAAAEEGGGVVTEGFAESETFLTSTKEGESGECTMAESEERTAAPVTVHIGKIEDNVNSVGTEEKDDAVTSAGSEEKCDGSSNRDSEIVEGTVTFISEVESDGAVTSAGTEIREGSLSSEEVEEFQKIMTRLGPKKETEGTVTCTVAEGRSDNFVICSVTGAGPQEERMVTGANVVLVDNDGPPATSANQEGDGSVNDGTEGESAVTSTGITEEDGEGPASCIGSEESSEGFALSSESEENGENAMDSTVAKEVTNVPLVAAAGPCDDEGIVTSTGAKEEDDEGEGIVTSTGRGNEIGHASTCTEIEESEGALICESAEGNSQIGTAVEHVEAEAGAAIVNANESNVDSMSGAGKEIKDTEICSSAKGFVESSVTSAVSGKGEVAPVPEACEGPMTSAASDQSDSQFTRKEKVEDATISTGMVGGSYEVLISGAVPECEVDHTSSEKEDEGFITSVENEECDGLMATTASDGITNQNSLAGGKSQGKGLMISTSTTNDYTTQLSMIVNVEEGHSSALRTGENVEDARINVEEFEAPMPSAVSDEGQPTATRNEEKDECAMISTSIGEEFEVPISSVTTIKSAESQQLDATVEERDKGPSESSEDFEAPMPSAPTEVESPLASTSKEEKDECALISTSIAEECEASISGVAVESENERSVTVMEEKDGSAIISTSSVEDCEGPVSSAAPQEEVHPSVTPAEEISDTAMISTSTSEGCEAIMISAVLQDEDQPTIARVEDLSDTAIISTSTAECALIVASLDRHEENRLTANNPEGNDYLPALSAAKVSKRAVPTPSLIAEHSHQCPEPFTGGKEVDPMMAGSTKEGHESTSISMLSAAGGQPSAAVVGEKDRHGEDCSGKVPFAERGQRENALSLVNTGDRNVPLSSVQREDKSQEAGMAGSSSTASYSTRRDLKISACSLLNLQGPEEASGQMAEDSSVSIHCLTVVNTSTKKANLPDTQDAAAGQPGPEDHLKTTTTECINGQESEIAPSSATILPAANDVALSTPKSEQDLTVKSDPSGKRTAEASSGKTGDGNGMTKSLQEEGDLFLVTVSSEGNVCEIGNEESPPHALGGLELKTNLKTETLEPSEEEKTEILAPPESACVEKQSGVVGPPRESSLVTESLNVENSDSRTNEEILSKPYDKEEISNGKKGNTEAVRGHSVEANLKEVEISIQEEERHVAKRKRKKHYPSSDDELDDNPGVLHSRIEAAQRQCVETEPQDAKEESSGDLEELSTASCKTNSSISKAMEEKDEYSSSEATGEKTEQNEDDNIKSQEEDQPVIIKRKRGRPRKHPIETVLKTKEDSKTDTGIVTVEQPPPSSKVKIMQTDESNKETANLQERSISNDDGEEKAVASVRRRGRKPKRSLTLSDDAESSEPERKRQKSVSDAAEDKKDQESDEEEEEEEEDEPSGATTRSTTRSEAS	7925	71365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_+_8053_13707_13899_14411_15027_15813_15964_18693_18861_21291_21404_22280_22420_23473_23547_27115_33258_35380_35446_36608_36691_44695_44740_46642_46704_50846_50918_51518_51604_53320_53401_57188_57274_57651_57726_59005_59082_59162_59198_60479_60526_63272_63323_63418_63504_63919_64067_66486_66624_69956
894643	contig_7993_pilon	-	1398	2	Intergenic	novelGene_170965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATACAAACCAATGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34103	31082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_31233_32855
894644	contig_5684_pilon	-	2664	1	Intergenic	novelGene_81087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAGCACGTTCAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491700	489036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_489000_491700
894645	contig_3077_pilon	+	1863	7	Intergenic	novelGene_26805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	812.52787986355	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	655	1134	479489	481662	FALSE	25	GATTTAACGTGTGGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467417	482391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_479457_479646_481023_481218_481533
894646	contig_7151_pilon	-	4443	3	Intergenic	novelGene_40688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	241	501	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1706	2131	13837	13305	TRUE	55	AGTCTGGAAAGAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	15542	10898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12398_12491_13676_13782
894647	contig_9706_pilon	+	2693	22	Intergenic	novelGene_20897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	620.842661209202	3	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	221	2194	231608	738407	FALSE	15	TGTGATGAGTTGGGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNSRRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYCDCAQPSLLAT	91218	738906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555638_688565_688730_698010_698124_709109_709218_717615_717699_731069_731099_738367
894648	SIRV3	+	889	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5420	-1	3361	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7364	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
894649	contig_6361_pilon	+	2900	5	Intergenic	novelGene_23971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405180	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
894650	contig_3956_pilon	-	816	1	Intergenic	novelGene_14804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGATGTGGTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226139	1225323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1225300_1226100
894651	contig_3068_pilon	-	2776	6	Intergenic	novelGene_137624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_1	278.212436817623	65	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1918	2265	234898	233625	FALSE	5	CTGTGTGCATTGTCGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	238107	233113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332
894652	contig_7869_pilon	+	1034	2	Intergenic	novelGene_149995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAACTATACTGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92439	94635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_92958_94119
894653	contig_11855_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_66984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	395	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGCCCATATTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117879	1120435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1117900_1120400
894654	contig_3233_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_56493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTTAAGGCAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33123	30283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_30300_33100
894655	contig_14219_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_54291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAGACTGGACTATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621500	619064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_619100_621500
894656	contig_4180_pilon	+	1886	8	Intergenic	novelGene_8324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	162.422477583892	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	302	1168	811833	821915	FALSE	10	GAATCTGGTTTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	790818	822633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_790890_802560_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
894657	contig_8065_pilon	-	8812	17	Intergenic	novelGene_107328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1168	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	7243	7614	215424	196192	TRUE	20	TGGGTTCGACGACTCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLASFTMLSKLATLCRGLACKQTLAFSSHRSDTVRSSCSSAIAFSTAWWGANPTPESISFFMTSKVTCCGSDRVSLTSSNHRACCSSCFSRGNSGSSTYRLEPMSINIWSLEESGVSSIIAS	253707	125070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_125556_128247_128326_129482_129608_193025_193105_193449_193574_194047_194197_195645_195764_196151_196508_215368_215502_226312_226504_227133_227284_230279_230832_231199_231347_237533_237693_238858_239081_241010_241422_248374
894658	contig_18544_pilon	-	7650	9	Intergenic	novelGene_152727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	299.857856950589	1322	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	13	861	58227	38652	TRUE	15	TCATTATGTGCCCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYPWPGISRWNSSSYQFVCCCRNWCG	58239	31668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38279_38472_38686_40184_40226_47755_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025
894659	contig_6576_pilon	+	2432	3	Intergenic	novelGene_42429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300421	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1301111_1302246_1303078_1303369
894660	contig_5247_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_81831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACATATTACCTTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371295	369241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_369200_371300
894661	contig_6361_pilon	-	2910	5	Intergenic	novelGene_23982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	215	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	25	TTGCATTATTTACTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	408702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
894662	contig_15787_pilon	-	3793	5	Intergenic	novelGene_143991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGTCACCCCTAGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111947	83887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_84298_88284_88424_90619_90766_95811_98320_111357
894663	contig_1596_pilon	-	2051	1	Intergenic	novelGene_131608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	417	737	152693	152373	NA	40	AACAGCTCACAACTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFFQTSSLMPLSFLPSHSTAILRCRALGHMGVGNPEWAPAGSVLPALLPRGHGHEGGQHHVAARHGSQRVWSSTAQLPRDIPQGRGCSTTTATMLAALLIHKIIR	153109	151058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_151100_153100
894665	contig_3270_pilon	-	5418	16	Intergenic	novelGene_104492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_14	213.049123182633	994	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	813	2442	14	2455	409133	342639	FALSE	15	TCTTGACTGGACTGCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAATMSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEERFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHREFLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVIIEQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLANTSEDKCEKDNIVGSNKNNTICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVVELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSNRFRRDAKALEEDEEMWFNEDEEEEGKAVVAPVEKSKPEDDFPDSYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSSGGFKFTFSHSASAANGTNSTNSKSVVAQTSPASSNGSSSKTTNLAASVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEETSPRKRPRLGS	409146	339675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_342735_357558_357762_359605_359770_360190_360331_362562_362733_365983_366143_367848_367891_369375_369479_370452_370585_375431_375549_376972_377090_380092_380171_385747_386372_396998_397098_407558_407615_408991
894666	contig_7201_pilon	-	4183	8	Intergenic	novelGene_152505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1527	2060	376035	311317	TRUE	25	AAGGTGCTTCTGACCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIIKNEMGHININILGISELKRTGIGHFESDKHMVYYDRNDNLKRKGIAFIVKKKISKSIMKYNTVSDRIISIHLKGRPVNTTIIQIYTPSTKAKDEEIENFYQLLQSEIDQTRNQDALIITGDWNAKVRNKEEGSVVGKYGLGDRNDAGDCMIEFCKTNDLFIANLFSTT	542577	221306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_222078_222732_223488_310719_311370_375060_375508_376001_376302_418565_418714_528801_529351_542014
894668	contig_2798_pilon	+	4068	2	Intergenic	novelGene_120045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	552	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCATCAGAGGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158395	162655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_159185_159376
894669	contig_15047_pilon	+	6609	5	Intergenic	novelGene_52144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_2	3210.94277432657	112	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	27	650	2194	4178	TRUE	25	CACTCATCTGTCAGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	10256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552
894670	contig_14357_pilon	-	4535	16	Intergenic	novelGene_121648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	288.456859859494	561	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1100	3303	229	3531	589649	454808	TRUE	5	CTTCCTGTCATTTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPALTDAAAEAHHIRFKLAPPSSTLSPGSAENNGNANILIAANGTKRKSIAAEDPSLDFRNNPTKEDLGKLQPLVASYLCSDVTSVPSKESLKLQGVFSKQTVLKSHPLLSQSYELRAELLGRQPVLEFSLENLRTMNTSGQTALPQPPVNGLAKKLTKSSTHSDHDNSTSLNGGKRALTSSALQGGEVGGSESGDLKGGMTNCTLPHRSLDVEHTTIYSNNSTANKSSVNSMEQPALQGSSRLSPGIDSSSDFGGVKLEGKKPPLSSILFSALDSDTRITALLRRQADIESRARRLQKRLQVVQAKQVERHIQHQLGGFLEKTLSKLPNLESLRPRSQLMLTRKAEAALRKAASETTASEGLSNFLKSDSISEELERFTASGIANLRCSEQAFDSDVTDSSSGGESDIEEEELTRADPEQRHVPLRRRSEWKWAADRAAIVSRWNWLQAHVSDLEYRIRQQTDIYKQIRANKGLIVLGEAPSPEQTTDFLLPLSSEVKTDHGTDKLVESVSQPLENHGASVIGHPSESLSTKSCGTLRPVNGVINTLQPVLADHIPGDGSDAEEQLHKKQRLNLISSSLDGTCVAARTRPVLSCKKRRLVRPNSIIPLSKKVHRNSTVRSGCDVNPSCALCGSGSVSTMPPEIHYEAPLLERLSQLDSCVHPVLAFPDDVPTSLHFQSMLKSQWQNKPFDKIKPPKKFSLKHRAPMPGSLPDPTRKDRHKLVNSFLTTAKLSYHQIRPDRTHRQHLDDVGAVPMVERVTAPKAERLLNPPPPVHDPNHSKMRLRDHSSERSEVLKHHTDMSSSSYLAAAQHPPHSPLVRQLSTSSDTSAPTSSSSQVTAGTSPIRRRRGESSFDINNIVIPMSVAATTRVEKLQYKEILTPSWREVDLQSLKGSPDEENEEIEDLSDAAFAALHAKCEEMERARWLWTTSVPPQRRGSRSYRSSDGRTTPQLGSANPSTPQPASPDVSSSHSLSEFSHSQSPRSPISPELHSAPLTPVARDTLRHLASEDTRCSTPELGLDEQSVQPWERRTFPLAYSPQAECEDLLDAQERAARCTRRTSGSKTGRETEVAPTSPPVVPLKSRHLVATVTAQRPTHR	636378	451920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_451928_453810_455036_455317_455571_456379_456493_456691_456750_457400_457520_461010_461160_461503_461693_462177_462361_468377_468550_487291_487488_488234_488354_494961_495064_508525_508668_588369_589742_636242
894671	contig_57_pilon	+	4040	26	Intergenic	novelGene_44888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_8	292.515397201583	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	1241	3463	103077	145460	FALSE	20	TGCCAAATTCTGCTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHLCLLLTHVEALPLYFQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKDSEKEKDLKEEFTEALRDLKIQWMTKLDSSDIYNELKEMYPSYLPLYVARLHQLDAEKERMKRLNEIVEAANAVISHIDQTGLAVYIAMKSDPRPDAATIKNDMDKQKSTLVDALCRKGCALADHLFHLQAHDGAVLDDAEVKEEEGESVLDSLTETFWETTKWTDLFDNKVLTFAYKHALVNKMYGRSLKFATKLVEEKPTKENWKNCIQVSDI	66766	146037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_100637_100738_102984_103134_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464_129617_135169_135267_136312_136444_143094_143303_145325
894672	contig_6557_pilon	-	2511	11	Intergenic	novelGene_32949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	334.217055220107	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	271	1257	364319	345121	FALSE	15	GGGTTGAGAGTGCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGQEKVIFPTLFMGQ	395129	343866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_345129_348571_348607_352014_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_379693_379880_395057
894674	contig_13904_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_165506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAAAATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208721	207232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_207200_208700
894675	contig_12982_pilon	-	2336	2	Intergenic	novelGene_178665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1458	879	2336	168628	167171	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIIGDFNTPLSVQDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRATLNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEETTLPNSFYEGSIMLIPKPGKDIPKKENYRRVSLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHNQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINK	171190	167170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12982_pilon_-_169001_170684
894676	contig_8210_pilon	-	2517	2	Intergenic	novelGene_30243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	53075	52767	TRUE	50	GGAAGGTAAAGAACAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESNSQRARSQLLAVVWESKRGSCHSRNYPAPHPAGAGERVLSWPPAWSGTGAPLEGAAPRGPAAARAVSVLPCPRPCWAWRVGSGLRTLNQLPSPSVQGPRK	53075	38894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_39808_51471
894677	contig_11224_pilon	-	3663	2	Intergenic	novelGene_124448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	242	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1430	1768	16439	16101	FALSE	40	TAATATTTACCCCTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILEKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGTLITCKFLLLIVSHIILRVSSFFFILFSDFSSNRVVSKCSPSILLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLPFGFLIVVFV	17998	14205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_17282_17411
894678	SIRV6	+	1342	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	184	2	-49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	AACGACAAAGAAGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894679	contig_6208_pilon	+	1565	2	Intergenic	novelGene_52988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAATAATAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382533	402174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_382871_400946
894680	contig_15720_pilon	+	3323	4	Intergenic	novelGene_41955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAGAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305250	371322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305498_305624_307000_365769_366280_370131
894681	contig_9435_pilon	-	5833	31	Intergenic	novelGene_156947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	90	junction_30	77.6803707509175	898	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1325	3978	132	4109	495827	150347	FALSE	25	ATTCAGAGATCTGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGVRCSSISAGASTSSGSGNRRLSSASPARDPPLPTRPRPAKMLPVYQAVKPNPLQDANLCSRVFFWWLNPLFKIGHKRRLEEDDMYSVLPEDRSEHLGEELQGYWDKEVLTAEKDAQKPSLIKAIIKCYWKSYLVLGIFTLIEESIKVIQPLFLGRIINYFENYDPSDSAALHTAYVHATVLTVCTLFLAILHHLYFYHVQCAGMRLRVAMCHMIYRKALHLSNAALGKTTTGQIVNLLSNDVNKFDQVTIFLHFLWAGPLQAIAVTVLLWMEIGISCLAGMAVVIILLPLQSCIGKLFSSLRSKTAAFTDVRIRTMNEVITGIRIIKMYAWEKSFADLITSLRRKEISKILRSSYLRGMNLASFFVASKIIVFATFTTYVLLGNVITASRVFVAVTLYGAVRLTVTLFFPAAIEKVSEAIVSIRRIKNFLLLDEISQHNTQLPSDGKTIVHVQDFTAFWDKASETPTLRDLSFTVRPRELLAVVGPVGAGKSSLLSAVLGELPPSQGLVSVHGRIAYVSQQPWVFSGTVRSNILYGKKYEKERYEKVIKACALKKDLQLLEDGDLTVIGDRGATLSGGQKARVNLARAVYQDADIYLLDDPLSAVDAEVSRHLFELCICQTLHEKITILVTHQLQYLKAASQILILKDGKMVQKGTYTEFLKSGLDFGSLLRKENEETDQSPVPGTPTLRSRTFSESSVWSQLSSRPSLKEGTQEDQTTENVQATLSEESRSEGKVGLKAYKSYFAAGAHWLIIVFLMLLNAAALVAYVLQDWWLSYWANEQSALNITVNGKGNVTETLDLNWYLGIYSGLTAATVVFGIARSLLVFYVLVNSSQTLHNKMFESILKVPVLFFDRNPVGRILNRFSKDIGHMDDLLPLTFLDFIQTFLQVVGVVAVAVAVIPWIAIPLIPLAIIFFILRQYFLETSRDVKRLESTTRSPVFSHLSSSLQGLWTIRAYKAEQRFQELFDAHQDLHSEAWFLFLTTSRWFAVRLDAICAIFVISVAFGSLILAKTLDAGQVGLSLSYALTLMGMFQWCVRQSAEVENMMISVERVIEYTDLEKEAPWEYQKRPPPTWPHEGVIVFDNVNFTYSLDGPLVLKHLTALIKSREKVGIVGRTGAGKSSLISALFRLSEPEGRIWIDKILTTEIGLHDLRKKMSIIPQEPVLFTGTMRKNLDPFDEHTDEELWNALNEVQLKETIEDLPGKMNTELAESGSNFSVGQRQLVCLARAILRKNRILIIDEATANVDPRTDELIQKKIREKFAQCTVLTIAHRLNTIIDSDRIMVLDSGRLKEYDEPYVLLQNKESLFYKMVQQLGKAEAAALTETAKQVYFRRNYPDITHNGPVVMNAFNGQPSALTIFETAL	495958	148622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_150455_167126_167262_180031_180138_180586_180760_188656_188747_202165_202322_214557_214750_216012_216114_217710_217822_219030_219151_227100_227252_279014_279095_326475_326623_328823_328919_329315_329354_329723_329865_332043_332254_336034_336132_352219_352307_352854_352950_365573_365766_367071_367162_372040_372143_382782_383033_384752_384879_386588_386753_387895_387986_410274_410500_422354_422476_423052_423164_495753
894682	contig_7051_pilon	-	9488	6	Intergenic	novelGene_64350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4154	4522	337753	337385	TRUE	30	CTTCTACTTCTTCAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMAFLFDSGEEPEVLEVLVANKEDEIHLAVDQKQPHAERVLQFIFPLINTIYSLGHTCVMNWDSRNPCVQQIQEFHGSNIHRYFCSPKNLGLLSLRKIKIFCPCKCKEPSKSHLIYYFQKV	347607	321871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_321937_330090_331924_334316_338865_342961_343099_343372_345536_346865
894683	contig_11028_pilon	+	3295	2	Intergenic	novelGene_163955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	834	1445	770836	827661	FALSE	15	CCCTATGTGGCCTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKANKHEEKIDKFLENTDKKFGRIQENNAGTKCQNQFTTRNYTKTTIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFNNSLCIFCYPPLLWYSNHS	770002	829511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11028_pilon_+_771388_827601
894684	contig_2798_pilon	-	4027	1	Intergenic	novelGene_120032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	67	327	125993	125733	NA	25	CCTGTACTATATGTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYKENYKTLLQETERHLQKWKNMPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKETEELIINFIWKRKKPRISKALLKTNKVGGLALPDLRTYYTAIVVKTAW	126059	122032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_122000_126100
894685	contig_7009_pilon	+	3162	7	Intergenic	novelGene_23616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	556.471323010749	70	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	387	986	444955	523012	FALSE	25	TTAGATGGCTTCACTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVGKS	431111	525188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_435038_435244_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991_518118_522866
894686	contig_5041_pilon	-	3334	17	Intergenic	novelGene_27060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	835	junction_3	385.636846454991	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	3	2429	616721	525456	FALSE	15	CTTTGGAGGTTTGTGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	616723	524550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559
894687	contig_4884_pilon	-	3375	13	Intergenic	novelGene_63817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	716	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGGGAGGAAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593612	563316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_563388_570113_570218_575038_575154_575915_576825_577899_578561_578696_578872_581254_581361_582398_582484_584841_585018_585150_585316_586137_586319_592827_593039_593196
894688	contig_5959_pilon	+	2108	13	Intergenic	novelGene_150205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	146.708327416454	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	418	2097	477198	515296	FALSE	85	CAAAAAAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDTLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMVEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRLGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF	407070	515307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_407326_461053_461109_477090_477337_485878_486054_492721_492889_498836_499045_501956_502128_504497_504616_506230_506412_507491_507632_510674_510774_511296_511432_515149
894689	contig_3277_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_74745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAGAGGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296221	298318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_296200_298300
894690	contig_14415_pilon	+	2356	4	Intergenic	novelGene_77589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAATCTTGTTTACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12391	25290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_13234_16942_17037_18076_19096_24889
894691	contig_10345_pilon	+	1123	12	Intergenic	novelGene_158378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1470.75042407519	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	213	875	14227	24141	FALSE	30	CTACCCGAGAATGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLLTDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	11698	24389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_11714_11901_11941_13157_13253_14163_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
894692	contig_15236_pilon	+	3546	8	Intergenic	novelGene_141579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	421.87521126223	301	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	69	521	419232	426053	TRUE	20	TCTCTCGACTCGTAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRAAAEVQQSDPQQGRRLPAPAMSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQTVTPSHPTSPYNPNPSLNSQPHS	419163	452791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_425929_425981_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_451241_451438
894693	contig_18364_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_102564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATACTCAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120180	118051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_118100_120200
894694	contig_7051_pilon	-	1018	3	Intergenic	novelGene_64317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	219.5	71	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	15	320	231129	216979	FALSE	50	CTGCAATTAGAAAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLVVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNSAQHYAGGWKEWASYEFSENKQGN	231143	216280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_217052_217573_217734_231056
894695	contig_294_pilon	+	3642	14	Intergenic	novelGene_166742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	3280	3642	162596	164731	FALSE	0	CCCTGGCCCCCGCCGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSTVWLSPKPFKCCPISLITSSSDCESRFFFLRMLPSSGVAKEEEAAVVAEAAATVAEAAAAAPPGTPLLTFRLLLLLLAAEGAEGRSPLAWAMSPADDDDEGDDSPFWADRQASSWVC	126946	164731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_128709_131506_131693_135503_135640_135893_135963_136433_136583_138345_138467_141877_142018_147443_147583_152755_152914_153968_154064_156952_157093_162311_162416_162515_162617_164389
894696	contig_7357_pilon	-	2071	11	Intergenic	novelGene_36773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2172.06843584635	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	246	1496	166824	136424	TRUE	35	TTGTAGGCTTCCACAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167069	102367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_102726_110059_110218_136364_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
894697	contig_14727_pilon	-	1226	2	Intergenic	novelGene_56657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCTCGTTCCTGGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337268	328731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_328815_336125
894698	contig_9415_pilon	-	6537	51	Intergenic	novelGene_109725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	256	junction_3	828.171041271065	920	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2156	6468	68	6535	598837	481927	FALSE	25	AATTAAGGTTAGTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFASLGAPGGSGSSLARCLSRTMVLESVVADLLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGNVALDNLQIKENALSELDVPFKVKAGQIGKLTLKIPWKNLYGEAVVATLAGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELSRIEEALQKAAEKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVKITDIHIKYEDDVSDPTRPLSFGVTLGELSLLTANEHWTPCILNEAEKIIFKLIRLDSLSAYWNVHCGISYQGSREQILAQLKSEIITSSNRSPHHQYIFQPISASAKLYMNPYAETELKTPKLDWNIEVQNIAIELTRPQYLSMIDLLESVDYMVRNTPYRKYKPYLPLHTNGRQWWKYAIDSVLEVHVRRYTQMWSWSNIKKHRQLLRSYRSAYRNKLTQTKVSEEIQKQIQDLEKTLDVFNIILARQQAQVEVIRSGQKLRKKSADPGEKRGGWFSGFWGKKEAKKKDEESLIPEAIDDLMTPEEKAKLFTAIGYSESTRDLTLPKQYVAHIVTLKLVSTSVTIREKENIPEILKIQIIGLGMQVSQRPGAQALKVEAKLKHWYITGLRQQNIVPSLVASIGDTASSLLKIEFETNPENSPADQTLVVQSQPVEIVYDAKTINAVVEFFQSNKGLNLEQITSATLMKLEEIKDRTATGLTHIIESRKVLDLRINLKPSYLIVPQTGFYHENSNLLVLDFGTFRLNSKDQGLQQTASSSLEEIMDKAYDKFDVEIKSVQLLFARAAENWKKYRFQYPSTMHVLQPMDIHVELAKAMVEKDIRMARFKVSGGLPLMHVRISDQKMKDMLCLINSIPLPQKSPAQSPERQISSIPIISDGTKDLVGTSLLLDGVESESDDEYFDAEEGDSQAGKSVKGSELKKAAEVPNEELINVLLKFEIKEVIFELTKQQKEEDTILVFNVSQLGTEATMRTFDLTAVSYLKKISLDYHQVQGFKKKPHHLISSSDKPGLDLLKVEYIKADRNGPRFQTTFEKTEQTVKVAFSSLNLFLQTQALLSSINYLTNIIPSDGQKMGDVKKAQISTEKQQKNSTLQKVIVSSKDSDIINFRLFAKLNAFCVTVSDEKNNIAEIKVQGLDSFVSLQSRKQSLFARLENIIVTDVDPKTVHKKAVSIMGNEVFRFNLDLYPDATEGDSYTDMSKVDGVISLNVGCIQIVYLHKFLMSLLNFLNSFQTAKEPLRAATAQAAEKAATSVKDLAQRSSRVSISVDLKAPVIIIPQSSISTSAVVVDLGLIRVQNQFSLISDEDCSNPPVIDRMNVQLTKLKLSRTVIQPGIPHPDIQLLYPINLDFYVNRNLAASWYHKVPVVEIKGHLDSVNVSLNQEDLNLLFKILAENLGETTEELDKMKPGIQETDESKDLGISTSQQNGHASQDTLTVGVEEVRSVDIINVLLNFEIREVVVTLMKKAEKKGKPLHELNVLQLGVEARVKTFDMTANAYLKKIALRCFDFTDSKGEPLHIINSSNVTDEPLLKMLLTKADSEGPEFKTVHDNTKQRVKVSFSSLDLVLHLEALLSFMDFLSSAVPSAATFTSEKGSELQPLGGESRSTALKAVSSSVSQSDVFDLKVKAELNAFNIFICDQKCNIADIRIQGMDASVSMKSEQTDVFARLKDIIVTNVDLLSIHKKAVSILGDEVFRFQMTLYPGATEGEAYADTSKVDGRLSLRVGCIQIVYVHKFFMSLLDFLNNFQTTKEALSAATVQAAEKAASSMKDLAQKSFRLLMDINLKAPVIIIPQSSVSPNAVIADLGLIRIENKFSLVPVEHSSLPPVIDKMNIQLTQLKLSRTILQAGLAQHDIEILKPVNMLLSIQRNLAAAWYVQIPGMEIKGKLKPMQVALSEDDLTVLMKILLENLGEASSQPRPTQSTQEALRVRKEDVSSGSDLLEEQDLTNSEIPMDHSAALQFDFHFESLSIILYNNDISQESELSFHNDSLRLGELRLHLMASAGKMFKDGSVNVSVKLKTCTLDDLREGIERATSRMIDRKKDQDNRSSMIDVSYKQDRNGSRVDAVLDKLYVCASVEFLMTVADFFIKAMPQSPENMAKETQIALRQTGTARIKSEKDDSVRPNMTIKAMITDPEVVFVASLTKADAPALAASFQCKLSLSTSKLEQMMEASVRDLRVLACPFLREERGKNVTTVLQPCSLFMERCTWASGKQNINITVKEC	598904	481924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_482011_483293_483524_484756_485005_486224_486395_488788_488899_490909_491064_494231_494380_499779_500085_501282_501451_501881_501986_503313_503431_504806_504970_505656_505717_506405_506486_507956_508114_510273_510408_511756_511866_512564_512713_513970_514276_514948_515117_515335_515440_516334_516452_517197_517361_518567_518628_520555_520636_522579_522734_524049_524190_524852_524932_526457_526588_529247_529366_530763_530888_532767_532905_533629_533745_534850_535044_537182_537326_540958_541054_541866_541997_550108_550172_551526_551699_552261_552369_553463_553592_555373_555432_556367_556449_557255_557316_561643_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_580082_580126_583012_583057_598737
894699	contig_15888_pilon	-	1534	8	Intergenic	novelGene_84417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1603.49924750051	3134	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	465	824	253673	252475	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259781	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254056_254229_254282_254527_254685_259659
894700	scaffold_4438_pilon	+	1550	6	Intergenic	novelGene_174532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_5	50.3849183784195	71	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	449	1042	395703	419036	TRUE	40	GATCACAACCCAGACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQTTTLIVKKRPDFSSSGQWEIVTKSNGKEQSEVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVSYERASTE	395254	422000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_411934_412098_413970_414114_419006_419363_421818
894701	contig_9528_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_172336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	434	733	100194	99895	NA	80	AAAAGGTAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLQQTKSSIARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	100627	98998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_-_99000_100600
894702	contig_960_pilon	-	2762	23	Intergenic	novelGene_108232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	360.575037180913	4	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	869	2607	156	2762	545280	436301	FALSE	40	CCTGAGATTCGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAKSLVDIDLSSLRDPAGIFELVEVVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTEDEEEEIKLEINMLKRYSHHRNIATYYGAFIKKSPPGHDDQLWLVMEFCGAGSITDLVKNTKGNTLKEDWIAYISREILRGLAHLHIHHVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLEFRWREMEEHQQAERLQRQLQQEQAYLLSLQHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPAVRDLTALAKELRAVEDVRPPHKVTDYSSSSEESGTTDEEDDDVEQEGADDSTSGPEDTRAASSLNLSNGETESVKTMIVHDDVESEPAMTPSKEGTLIVRQSTVDQKRASHHESNGFVGRIHLLPDLLQQSHSSSTSSTSSSPSSSQPTPTMSPQTPQDKLTTNETQSASSTLQKHKSSSSFTPFIDPRLLQISPSSGTTVTSVVGFSCDGMRPEAIRQDPTRKGSVVNVNPTNTRPQSDT	648197	436300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_436411_436729_436848_438781_438974_440053_440175_440650_440827_442971_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450719_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758_489850_495560_495672_497062_497189_545265_545323_647749_647816_648150
894703	contig_2646_pilon	-	4429	5	Intergenic	novelGene_69682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	690	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3151	3528	2331629	2331252	TRUE	30	CGCAGGCGCGCGACACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRSDSKNLNSPLASSGLTRHRTVQQHVLTLPPWPMPRIQYVTTASSPALPHNTPLAHSQHCRDTAVPNQDCHFTSTHHRGAQSCSEPESVQFHPRPREASQFHFSTGNVAPFSFQLLTNHQPL	2334779	2309545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2309646_2313141_2313327_2329775_2329936_2330114_2330268_2330948
894704	contig_8636_pilon	+	2938	1	Intergenic	novelGene_141913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	633	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	1770	2252	366522	367004	NA	15	CCAAAGGGGGCTGGGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRPAEDSQPAPGPSPTSEKEAPAGTQNHIYRGSFTWLGIFYNRAANHTHARAHTFQLPPTTSGPGNGLLERGHRDRWLGLALSRPTSDSLGQVGMARWGHRIEMKGIQLDKVQLSAVTDISSRGRCRVASQCSLWPRPEREWGLGSDLLGVAGPQKAC	364752	367690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_364800_367700
894705	contig_5031_pilon	+	6485	36	Intergenic	novelGene_133193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	654	34	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	4871	5218	92363	97386	TRUE	20	GACCTCAGATTGAGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLRSEMGLALMIFPPMDATDLICFPANQRSCSRMPRNTSVLWAGSLATASTRVFSTELRGQAAPKEIPSGTCSTEFSSGIQAGQMITGNSLFLNFISMPISVFPTTSLASGY	24543	117056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_26554_28336_28510_29747_29942_31417_31482_32666_32782_34524_34574_35154_35233_35919_36047_36696_36795_41693_41776_42564_42708_42900_43097_70817_70902_72097_72188_72790_72926_73683_73806_75202_75304_75988_76117_77691_77812_80340_80512_84575_84663_87129_87301_88118_88305_90740_90851_92326_92422_93663_93813_94578_94674_97341_97488_98638_98725_99041_99111_102698_102764_103674_103799_105905_106016_107368_107466_110278_110335_116497
894706	contig_8820_pilon	+	2157	13	Intergenic	novelGene_79275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	238.399175054501	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	13	1938	112520	133364	FALSE	10	AGCATGGCCCGGCTCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTSKMDLEKPNYIVPDYMPVVYDRLPQPPSHREAIVNSCVFVHQTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFNEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKDQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMSVKEDLDKVEPAVIEAQNAVKSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLLGESTTDWKQIRSIIMRENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRSWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERVKQLQSISLAAASGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQANSWSLEELCLEVNVTTSQGATLDACSFGVTGLKLQGATCSNNKLSLSNAISTILPLTQLRWVKQTNAEKKASVVTLPVYLNFTRADLIFTVDFEIATKEDPRSFYERGVAVLCTE	112507	133583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_112652_114577_114752_114837_114958_115425_115547_116705_116902_117978_118097_118182_118399_119176_119378_130909_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132604_133235
894707	contig_7106_pilon	-	6296	6	Intergenic	novelGene_148325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	133	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3210	3713	661635	661132	FALSE	15	CTTCCTTGCTTATATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRARYLRERRGRWREVWKKPKEAEKSNMSNKQMLLREPASVDGWNLSSTRLKPAPPSQETVAAGSRGGHVGVKKGGGWESVWHWLPVVLSPAGSSMKLLSGTPCFPVFNRSPRWRIRDALADGDLCTYLSSLSVLCQFLIPFGAWLSSLSLHLMLRVSGLMFVPV	863629	658548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_662098_676652_677000_712939_712959_856714_856901_859954_861728_863207
894708	contig_8330_pilon	-	2559	9	Intergenic	novelGene_71841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_3	234.549268545012	950	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	102	758	916108	899728	TRUE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRFCSSHIQ	916209	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899753_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
894709	contig_14516_pilon	+	2205	16	Intergenic	novelGene_153914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	101.83219311964	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	236	1849	285367	422609	TRUE	40	ATATAATTAATTTGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	212662	423144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_212812_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418336_421549_421780_422472_422614_422792
894710	contig_13888_pilon	-	4308	4	Intergenic	novelGene_151807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1112	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCTCCTTTACTCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361986	349809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_353714_355080_355197_358598_358709_361808
894712	contig_10345_pilon	+	1240	12	Intergenic	novelGene_158354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_11	1194.92604287206	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	72	989	11670	24141	FALSE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKDETKGDYEKILVALCGGN	4367	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_24084
894713	contig_3817_pilon	-	7108	4	Intergenic	novelGene_78302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1799	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAAACTACCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133575	120921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_124071_124113_124732_129751_129818_130300
894714	contig_19957_pilon	-	6524	2	Intergenic	novelGene_57679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	0	762	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	163	594	38581	38150	FALSE	10	CTGATTTTCTCTGCCGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFIHDVRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLECEIRKLVCEKEKLLSERNQLKACMGELLDNFSCLSQEVCRDIQSPEQIQALHRYCPVLRPVDLPTASSINPAPLGVEQNLAASQCAMGENVACCLEQGAAPPAVPWVPSNASENCTSGRRLEGPEPGTFSERAPPLEPRGQTVTVDFCQEMTDKCTTDEQPRKDYT	42806	32219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_38633_42695
894715	contig_5419_pilon	-	4859	4	Intergenic	novelGene_15498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	636	1091	244823	243786	TRUE	40	TCCTCCAGTCAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWFTSWVPRNRWRTICLAFSSSFLLMSKNLGLSGQNGRAALCRTAGMMVNPSSTGHSSSDPKMTSRPNIWATRMPMTMPSWLRVPKAPRRAVGDISPMYMGTKPVHSPQKRPIIKRPRISISTDLANLQNPIRQPPATANMLTISIELRL	245458	238855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_240672_241833_244031_244281_244447_244777
894716	contig_1719_pilon	-	3802	21	Intergenic	novelGene_87275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	655.542714092682	38	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1223	3669	133	3801	382036	353061	FALSE	20	GACGACCTAGGTTTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDINLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQEHVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDDPLSRKDSRWGDSESTWRRGPEVESEWRRGPPEKDWRREGRDEERSLRRDEDRPRRLGDDEESQSSVRPEDDRFPRRGTDEDRGLRRGPDEDRFSRRGVDDDRPSWRNTDDDRPPRRIGDEDRASWRHADDDRPLRRGLDDDRGTWRAADEDRGPRRGMDEDRGPRRGGVDDERTSWRSGDDDRGPRRSMDEDRGPRRSMDEDRGPRRSVDDDRGPRRSVDEDRGPRRSVDDDRGPRRGFDDDRGPWRNTDDDRVPRRGTDDDRGPRRSIDDDRLSRRADDDRIPRRGDDSRPGPWRPFGKPGGWRDREKARENSWGPRQESRLSEDSEWDREKERDRDNPDRDENDRDPERERDRDRERDEDRF	382168	353059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_353249_355121_355409_355468_355988_356639_356723_358421_358607_359047_359202_359740_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373586_375203_375358_375730_375868_376035_376227_381987
894717	contig_3956_pilon	+	1869	9	Intergenic	novelGene_15073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1379.55431548562	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	81	1343	1281682	1290491	FALSE	20	GAGCCTACGCGACTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1289833_1289892_1290297
894718	contig_4232_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_63312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTATCTGCGAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466912	468066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466900_468100
894719	contig_8544_pilon	-	819	8	Intergenic	novelGene_55915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAACGAAAGAGAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152825	54106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_54154_83411_83520_83788_83834_90453_90624_91486_91584_92521_92616_120263_120357_152660
894720	contig_10711_pilon	-	5822	4	Intergenic	novelGene_118424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.450793488832	656	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	81	458	897614	713627	TRUE	25	TTGTAAATTGGTTTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPVVHLTLRQAGDDFSRRYRRDFAEMSSQLHLTPFTARGRFATVVEELFRDGVNWGRIVAFFEFGGVMCVESVNREMSPLVDNIALWMTEYLNRHLHTWIQDNGGWDAFVELYGPSMRPLFDFSWLSLKTLLSLALVGACITLGAYLGHK	897694	706221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_706886_708383_712167_712709_713762_897371
894721	contig_7051_pilon	+	2381	12	Intergenic	novelGene_64289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	209.024732610701	6	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	597	953	199288	206198	FALSE	30	GCTATGAGTCAGAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184043	207626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_198953_199025_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
894722	contig_312_pilon	+	948	6	Intergenic	novelGene_128315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	270.706483114092	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	228	560	433938	440781	FALSE	35	TGGACAATGCTGATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	430172	441169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_430198_433659_433797_433872_433946_435041_435201_439433_439531_440712
894723	contig_7321_pilon	+	8823	9	Intergenic	novelGene_53132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1518	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAGGCGAGAGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161842	208394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_169616_173560_173704_174647_174726_175744_175899_183966_184155_186240_186353_203989_204076_207653_207860_208311
894724	contig_1301_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_47433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCAGTTTCACAAACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993087	995115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_993100_995100
894725	contig_10159_pilon	+	5367	11	Intergenic	novelGene_30877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	132.760536305033	201	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	2800	3834	978504	996016	TRUE	15	TGAAGGCTGAGTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	972117	997813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874_996602_996865
894726	contig_401_pilon	+	1221	9	Intergenic	novelGene_42820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1306.33800540863	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	59	883	1711949	1715475	TRUE	30	TTAAATGTGCTGTGTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVRQDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711890	1716044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712633_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
894728	contig_1450_pilon	-	3677	1	Intergenic	novelGene_27389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	420	1263	40	1302	297149	295887	NA	25	CCAGGGGAGGTACTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKAGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKRNIQKSVGFLYIDKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQSDLHKWKNIPCSWTGRLNIVKMTILPKGIYKYNAIPIQMPTTFFKEMEKLIINLIWKGKPRISKALLKTKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYDDRYIDQWNRIESPDVNPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQHPYLMPYTKTTSKWIKDLNIKPKIIKFIEDKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPKNKLDNWDLPKNQTPMLFKRLHQKSKKRTYRLGKSFWTVQVRRSSNLHKLQENPTPLQQKDIQSY	297188	293511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_293500_297200
894729	contig_13021_pilon	-	3706	1	Intergenic	novelGene_8262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1417	1791	227291	226917	NA	55	GGAAATAATAAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKKSRNFPEEENFLELSEAEYESLIYKTLHEIRKEINQNAEHAIEKIKKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKISNKTSEADISTESHRSRIEAMEVRISEIEDKALHTNLFEEKSDKRI	228707	225001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_225000_228700
894730	contig_10734_pilon	-	2650	13	Intergenic	novelGene_51256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATGAAAAGTGTCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328287	1274787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1275147_1279286_1280231_1281765_1281884_1284376_1284434_1284977_1285061_1286266_1286427_1288094_1288258_1288358_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1321457_1321509_1327927_1328053_1328140
894731	contig_8304_pilon	+	3348	1	Intergenic	novelGene_153182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCACTTCAAATCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151597	154945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_151600_154900
894732	contig_3132_pilon	-	2862	10	Intergenic	novelGene_127417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	102.294901698864	387	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	310	1437	229252	210841	FALSE	30	TATTTACCCAGCATATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229561	209415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
894733	contig_7051_pilon	+	3088	6	Intergenic	novelGene_64335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	511.326901306786	238	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTCTAGTTATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321843	337243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_322784_322886_330091_330170_331803_331924_334316_334506_334737
894734	contig_13718_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_142910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACCTTTTATCTTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274187	266275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_266757_270910_271298_273105
894735	contig_16594_pilon	-	4379	10	Intergenic	novelGene_53818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	126	junction_6	2749.8538547025	3	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	325	1524	272836	121101	TRUE	70	GAAAAAAGAGAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	273160	115713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_134026_134081_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
894736	contig_13014_pilon	-	2728	14	Intergenic	novelGene_169322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	224.658557494749	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	66	1337	308816	282909	FALSE	70	ATTGGAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAFCRPGLAVAAPVGSRRRMEEEDEAARALLADGPGVLPALCDPSRLAHRLLVLALMCFLGFGSYFCYDNPAALQIQIQRDMQVNTTKFMLLYAWYSWPNVVLCFFGGFLIDRVFGIRWGTIIFSCFVCIGQVVFALGGIFNAFWLMEFGRFIFGTGGESLAVAQNTYAVSWFKGKELNLVFGLQLSMARIGSTVNMNLMGWLYSKVEASLGSAGHTTLGVTLMIGGITCILSLICALALAYLDRRAERILHKEQGKTGEVIKLSDVKDFSLPLWLVFVICVGYYVAVFPFIGLGKVFFMEKFKFSSQAASAINSVVYVISAPMAPVFGFLVDKTGKNIVWVLCAVATTLVSHMMLAFTLWNPWIAMCLMGVSYSLLACALWPMVAYVVPEHQLGTAYGFMQSIQNLGLAIVSIIAGVILDTRGYLFLEVFFIACVSDENFK	308881	281517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_288244_288358_290339_290438_291850_292008_292340_292398_293457_293570_295240_295340_297483_297587_301155_301265_303161_303230_303537_303581_305334_305448_306899_306953_308686
894737	contig_18592_pilon	-	11989	1	Intergenic	novelGene_114766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2097	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTGTATGTAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13305	1316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1300_13300
894738	contig_3942_pilon	+	666	5	Intergenic	novelGene_128647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1074.72563359213	520	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	308	649	179125	180102	FALSE	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYREYRDLTTAGAVTQCYRDMGARHRARAHSIQIMKVEEIAASKCRRPAVKQFHVKASRWLLTSPAPPLPLGLQDQVPTASPGPPSPAQATLHHQVAQHLLLAAAPPPPWSAQ	176956	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179829_179926
894739	contig_383_pilon	+	2664	12	Intergenic	novelGene_126095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	103	junction_1	668.46051083475	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	809	2427	236	2662	89998	135240	FALSE	20	GGACCTTTCTAGCAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHFKNKADKPLSIYPQGIKYSKFSEGASYPDHTFPVEKIDDAIAPGQEYTYVWNIMEDSGPTQDDPPCLTHIYYSYENLIQDFNSGLVGPLLICKKGTLTEDGTQKMFDKQHVLMFAVFDESKSWIQSSSLMYTVNGYVNGTLPDITVCAYDHISWHLIGMSSGPELFSIHFSGQVLEQNHHKISAIILTSAMSTTANMTVSPQGRWAISSLIPKHFQAGMHAYINIENCPKKTRSPKKLTRDQRRHIKRWEYFVAAEEVIWDYAPIIPANMDKKYRSLHLDNFSNQIGKLYKKVVYKQYQDESFTKRMENPNAQEDGILGPIIRAQVRDTLKIVFKNMASRPYSIYPHGVTFSPYEDEVNSSSISGGTFMIRPVQPGETYTYKWNILESDEPTENDAQCLTRPYYSDVDITRDIASGLIGLLLICKSRSLDKRGIQRAADIEQQAVFAVFDENKSWYIEDNINKFCENPNKVKRDDPKFYESNIMSTINGYVPESIRALGFCFDDTVQWHFCSVGTQDDVLIIHFTGHSFIYGKRHEDTLVLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTTMSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPW	86230	135242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_86425_89956_90080_116750_116964_118130_118275_123646_123869_125164_125331_126209_126388_127895_127996_128779_128992_130280_130432_132625_132839_134494
894740	contig_12951_pilon	+	3144	8	Intergenic	novelGene_68199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	377.818820632972	6	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	137	559	755258	833086	TRUE	80	TTAAAAAAATAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFALIQV	755121	839126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827887_833063_833656_835934_836131_837306
894741	contig_16860_pilon	-	2579	1	Intergenic	novelGene_155346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	627	1138	1764	135700	135074	NA	35	TGCACGTGAACCAGACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFKTMLIHPLKTFHGKKKKSTLALRIVFEVIVEKQNLILLRGKRNLICKLKCVNHKHKWRYRLPPLVIAPSPLLSALHLGSEDPNLSDNTCPRALRPPSREGLGSQKHNGFSRGTVTFTVNLADPSGSSGDLSIWGPRCESPWEAVGHWALWLPVPWFSVACAVFRELKPSCCTASFRGGILSLILSKPFASSKLQILCGGENPRIA	136837	134258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_-_134300_136800
894742	contig_14441_pilon	+	737	3	Intergenic	novelGene_100787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	152	700	125667	126705	FALSE	5	CTGGCCGTGTGTCCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125515	126742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
894743	contig_14666_pilon	+	3045	13	Intergenic	novelGene_39520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	85.7092549780296	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1558	2643	444587	448893	FALSE	55	AAAAATAAAAAAGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	440223	449295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_440824_441064_441175_441955_442067_443650_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446215_446600_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
894744	contig_12948_pilon	+	4095	2	Intergenic	novelGene_126166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGCAGAAAACTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41380	171665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_41739_167928
894745	contig_16846_pilon	+	4998	16	Intergenic	novelGene_82863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_4	368.566749570398	880	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	202	2079	179165	228852	FALSE	30	AATTTTAGGCAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPEQVAICLQLLDFIAPRAELSVRLRSRPVGRQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVWTYKGRPKEKSFLYEIVANKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARVCEVDNKKHICTREKEVGNLYDMFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQDGDVIAPLITPRKQQWNCPDLAQSSTHHQEAPKPRVRLFKD	178963	231771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_224514_224620_225189_225328_228726
894746	contig_9415_pilon	+	1311	3	Intergenic	novelGene_109899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGAAAAGAAGGGGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2082897	2087656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2082931_2084479_2085228_2087126
894747	contig_18081_pilon	+	1653	4	Intergenic	novelGene_23781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	1670	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	50	601	90717	112338	FALSE	30	ATCTAAGAGGTCAGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90667	113390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
894748	contig_13863_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_42090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	297	2456	2752	460179	459883	NA	25	TTGTAGACTGAATCGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICNTAKKKKGHLFKNTILHLLNSGHQLQGKVFSLSALEEGPCHQSSPAEELLNAETPGPKDTLFSWLLLLGDMRSPSLSAGLSLLYHKRDGLKTKPN	462634	459881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_459900_462600
894749	contig_8581_pilon	-	2693	13	Intergenic	novelGene_22813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	515.105726741824	5	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	16	1869	339605	307164	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRW	339620	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307174_309038_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553
894750	contig_20527_pilon	+	2248	6	Intergenic	novelGene_138583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	1345.92713027117	91	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	64	753	13547	27453	FALSE	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKLLSSGWSSEGEDVSCGRFMGNVTKRPCIRRQNAGERIRVDGKLRDSNNAVIYILAKGTPAKAGIFGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13483	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_13994_14078_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
894751	contig_3382_pilon	+	5795	2	Intergenic	novelGene_124011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1306	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2062	2382	125820	126140	TRUE	0	GTTCTGCCTTTCTGTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNAALDLVTPLVSPRADWLWCVLFSCMERAGLGGDHSVWVDRDRRPSVFPSVSSVNSAATRTLPQEDRSDSVSPVTSKQMCEAESPGLLYAVSVAAVDDTRLLT	123758	129612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_129123_129181
894752	contig_12102_pilon	-	7308	6	Intergenic	novelGene_151048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.868930091209	1876	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	96	434	72894	49949	TRUE	45	GACAAGGCGAATCCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGLRPAAVAEWPRPPGNCIFSRRLVCRGSSMSAEISEAASAEEQKEMEDKVTSPEKAEEAKLKARYPHLGQKPGGSDFLRKRLQKGQKYFDSGDYNMAKAKMKNKQLPTAAPDKTEVTGDHIPTPQDLPQRKPSLVASKLAG	72989	13170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_13180_40146_41260_42653_43442_44984_50120_54841_54965_72849
894753	contig_7840_pilon	+	2069	4	Intergenic	novelGene_69014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	17.4419672692682	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	62	826	300936	304863	FALSE	20	GATTTGCTCACGAAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKCTLVHVLLTFYTFPSEKPMKMMISKFSKTAVYLHLTVDAFSSTNKRFSIKCHLVSCCYIFRSIQFSCLEPMSVCLAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQANGTDSAFHVLAAKPAHTALAPVAMPVRETNPWANAPDAANKEIAAIYSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVRVGVEVKGTKGTLLS	300874	306106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_301261_303007_303155_304059_304306_304816
894754	contig_16211_pilon	-	5307	17	Intergenic	novelGene_150085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	838.642371540903	34	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1123	3372	7	3378	237703	175977	FALSE	25	GCTTCTTTAAGATAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKIRVRVEKDPELGFSISGGVGGRGNPFRPDDDGIFVTRVQPEGPASKLLQPGDKIIQANGYSFINIEHGQAVSLLKTFQNTVELFIVREVSS	237709	174047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_176085_178193_178269_178757_178851_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643
894755	contig_1154_pilon	-	2333	9	Intergenic	novelGene_87031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	647.21507968758	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	59	1066	68279	34336	FALSE	30	TTGTTTTGTGAAAATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILMRTLRKDYARYSKEEEMDDMDRDLGDEYGWKQVHGDVFRPSSHPLIFSSLIGSGCQIFAVSLIVIIVAMIEDLYTERGSMLSTAIFVYAATSPVNGYFGGSLYARQGGRRWIKQMFIGAFLIPAMVCGTAFFINFIAIYYHASRAIPFGTMVAVCCICFFVILPLNLVGTILGRNLSGQPNFPCRVNAVPRPIPEKKCKLCLYCILFRYFIFTSFWAYKIYYVYGFMMLVLVILCIVTVCVTIVCTYFLLNAEDYRWQWTSFLSAASTAIYVYMYSFYYYFFKTKMYGLFQTSFYFGYMAVFSTALGIMCGAIGYMGTSAFVRKIYTNVKID	68337	33068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_34404_38846_38924_39049_39134_39653_39831_46021_46162_56156_56288_63325_63421_67264_67432_68210
894756	contig_15293_pilon	+	3420	1	Intergenic	novelGene_146538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1014	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134224	137644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_134200_137600
894757	contig_10074_pilon	+	3905	21	Intergenic	novelGene_57117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_20	225.807855266375	515	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1094	3285	7	3291	307416	343546	FALSE	10	TGGTGACTTTTCATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEESQFLLSLQAISTMVHFYMGTKGPENPPVEVLSEEEGEEEEEEEDVLSLAEEKYRPAALEKMVALVALLVEQSRSERHLTLSQTDMTALTGGKGFPFLFQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAEHIVSMLFTSIAKLTPEAANPFFKLLTMLMEFAGGPPGMPPFASYILQRIWEVIEYNPSQCLDWLAVQTPRNKLAHSWVLQNMENWVERFLLAHNYPRVRTSAAYLLVSLIPSNSFRQMFRSTRSLHIPTRDLPLSPDTTVVLHQVYNVLLGLLSRAKLYVDAAVHGTTKLVPYFSFMTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKGRDDVYDRTLLDYFFSYHQFIHLLCRVAINCEKFTETLVKLSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAVSKTCIKLLWEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKDDEGATPVKRRRVSSDEEQGGDVCVGDVKTEAREALTPASASDNETRDSSIIDPGTEQDLPSPENSSMKEYRMEAPSSFSEEVAGARPQHLGEQSSSGRFEDCKEFKDLHCSKDSSLAEEESEFPSTSISAVLSDLADLRSCDGQALPSQDPEALSLSCGHSRGLFSHMQQQEILDTLCRTIESTIHVVTRISGKGNLATS	307409	344160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_307431_307536_307612_308912_309065_312508_312558_312638_312744_312821_312867_314083_314189_315818_315967_320557_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329877_330002_338513_338594_341265_341407_341507_341652_342585_342746_342941
894758	contig_11850_pilon	+	1400	7	Intergenic	novelGene_125200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	592	1062	181235	185962	TRUE	10	ACCATGGCTCCCTCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSPGYFPITTLLLTTTSSTSSSCKSSSRSPLLLLLILFLRHGYFYFTFTKTNIVIFLFHYLLHWLLFLKSNKAESTPLIGLVVHGELYGFHLTKTTKVLPYFLFRCIWRKATNKNFFNRLFCFHGFGPFRINHFPIQFMFLLIHDLIYTLRLFK	180643	197835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_181277_182659_182765_183240_183371_184499_184662_185930_186104_195718_195775_197694
894759	contig_6375_pilon	-	2180	11	Intergenic	novelGene_72961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	205.823808146677	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	230	1765	229189	202748	FALSE	15	TCCTAAGCTTTCAGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	230592	202332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_230125_230210_230494
894760	contig_13366_pilon	-	2182	14	Intergenic	novelGene_99764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	242.731058712941	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2163	19	2181	177621	26929	FALSE	30	AGACCCTTTTGCCCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HASTRAMGGSASSQLDESKCAYIRGKTEATIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRSDVEQQRDLQSQFLKTKPLEPGTVLYEAELSQFAEDIKKWKDRYIVVKNDFAVESYENKEAYQKGAAPKSRILPAGGKVLTSEEEYNSLSDRHFLDPVASSEKENAQPFVVLPKEFPVYLWQPFLRDAYFCFQEPTDQKKFSALLNDCIRHLNHDYMKQTTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEVMEELLPTLQKDLLPKMKGKKNDRKRAWFSLLEEAYNLVQLQLSEGLSALKEECRSLTKGLEGTIRSDMDQIVNSKNFLTGKIKAMVAQPVERSCAESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRSLFEKEVDELSQSFQTARDSAQLKEHLDQLMNLPLDSVKMEPCYIKVNLLQERLQDLRSRFRFPHVDLVVQRTQNCMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAVCIEKVKLRVLKQYDYDSSTNRKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIQVENVYEEILYQTLLDETLKVIKEAAVLKKHNLFEDNVTLPSESVSSLTDLKTPTGSNQASPARRASAVLPGVLDSESLGNEVFQEPEEEQQPGAPSPLAEEESTSLPVSSPPSAGDGQVVVSSISGPGNLVATEDKTETLDKNSAELEFGEIPEEEDPAHEEPESVSASGSLKELRKLLTVTVEVPVESAVVIEKDIPE	177639	26927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_27468_29836_29949_35679_35788_38158_38270_40144_40307_43544_43733_48682_48846_49161_49252_56173_56266_101335_101504_109702_109818_113593_113723_116845_116977_177566
894761	contig_990_pilon	+	2739	15	Intergenic	novelGene_76147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	118.642233592582	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	824	2260	1782783	1803142	FALSE	20	GAAGCTCCCAGCCCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSIGGILASRRLHLDLLHNVLRAPMSFFERTPSGNLVNRFSKELDTVDSMIPQVIKMFMGSLFNVIGACVVILLATPIAAIVILPLGLIYFFVQRFYVASSRQLKRLESVSRSPVYSHFSETLLGVSVIRAFEEQERFIRQSDLKVDENQKAYYPSIVANRWLAVRLECVGNCIVLFAALFAVISRHSLSAGLVGLSVSYSLQVTTYLNWLVRMSSEMETNIVAVERLKEYSETEKEAPWQTEEMAPPSSWPQVGRVEFRDYSLRYREDLDLVLKHINVTIEGGEKVGIVGRTGAGKSSLTLGLFRITESAGGQIIIDGVDIAQIGLHSLRFRITIIPQDPVLFSGPLRMNLDPFNQYSDEEVWTSLELAHLKSFVSALPDKLNHECSEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKILVLDEATAAVDLETDDLIQSTIRTQFDDCTVLIIAHRLNTIMDCTRVIVLDRGEIREYGPPL	1759196	1803621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1759226_1761486_1761664_1763006_1763175_1765452_1765637_1774021_1774113_1780510_1780662_1782759_1783071_1787804_1788005_1790879_1791007_1791533_1791636_1795785_1795933_1797837_1797997_1798960_1799128_1800240_1800436_1803090
894762	contig_10286_pilon	-	4179	8	Intergenic	novelGene_98398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	221.305772400901	1055	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	963	1325	383530	382865	FALSE	10	GCTGGTACTTCTCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	424849	380010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405864_406192_410089_410233_415379_415572_424800
894763	contig_12292_pilon	+	3399	1	Intergenic	novelGene_167019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374255	377654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_374300_377700
894764	contig_7009_pilon	+	10890	1	Intergenic	novelGene_23626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1543	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432937	443827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_432900_443800
894765	contig_10627_pilon	+	1660	12	Intergenic	novelGene_59939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	292.163516992038	52	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	47	1537	162810	167664	FALSE	15	GGTGCCCAGACCTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATSPFGTAAPLRPGMPPTMMDPFRKRLLVPQPQPPMPAQRRGLKRRKMADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQPWAQEAVGRHIFSFGYLHYLGSRFFYAGATFFVQGSSWGFSGSPIFFPQSMQAALAAIISWGARGLPPQLLRPREVMPRRGRGHCSSLAWHEVLVCAWYRGQ	162763	167787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166767_167389
894766	contig_7898_pilon	+	3724	16	Intergenic	novelGene_47605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	743	junction_7	256.515314682509	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	736	2901	571727	599089	FALSE	30	ACCAAGTGACACTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPERGGSSSKLFSSSFNGGRRDEVAEVQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTFEPRGQAGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEAAIQELKTREEALSGLAESRGEVTGVVAALEQLVLMAPLAKEPVFQPRKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSGEGRELGCSAQGRQTYWTGGLFLSGASGSH	562991	599912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563602_571601_571799_583823_584024_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587685_589142_589269_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838
894767	contig_10437_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_38223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	505	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	201	500	274724	275023	NA	70	ATTAGAAAAAAAAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDKIYWPKGEWRKPEGMVPRHPFSSVVKLSPRFTVQTRSRQPRETIWD	274523	277232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_274500_277200
894768	contig_10904_pilon	-	2200	12	Intergenic	novelGene_22541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	181.665663302509	559	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	248	1297	396033	375280	FALSE	30	TTCCATTGATGATTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	419246	374376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389651_389761_389798_395999_396156_417965_417999_419154
894769	contig_10766_pilon	+	4607	8	Intergenic	novelGene_151244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_5	60.0533776174605	679	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	1289	3472	593736	607996	TRUE	65	AAATATTAAAACAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSADSCDSETTVTSFGEGLVTPKAQDQPYFNESEEESLITLQKGREKAAASADKRKSDSQNFPKSETAEDDGNEQSTCHQEDCVTKITETQEVSSPAQRVELPREESAESDVDKSSECEFAQYTTHHILKSLASIEAKCNDKGSEETVVPPASSVDRVNIALQRAQMKVCSLSSQRVGRSLIKSKDLLKQRYLFAKAGYPLRRSQSLPTTLLSPVRVVSAVNVRFSPGKETRCSPPSFTYKYTPEEEQELEKEVTEHDGQSLVKSTVFISPSSVKKEEASQSEVNRLEEGHHRRTPTCSFCAQAPISQSTCSLHSLHSECQERPLCEHMRTLSTHSVPNISGITCSAFSSPFGCPYAHRHAAYPYRAYSVNPPSAIEMQLRRVLHDIRNSLQNLSQYPMIRGPDLAAAPYSTQKSSVLPLYENTFQELQVMRRSLNLFRTQMMDLELAMLRQQTMVYHHMTEEERYEVDQLQSLRNSVRMELQDLELQLEERLLGLEEQLRALRMPSPFRSSALVGMCGSRSADNLSCPSPLNVMEPVTELMQEQLYLKSELGLALGETGFEIPPGESSESVFSQATSESSSVCSGPSHVSKRIGVPSSDSVAKPKTQLVSSKKVFRASVALTPTAPFRVGSVQTPPDLESSEEVGAAEEASEAVGAKSEVEEGHRNIPLMPAAEEMHKNVEQDELQQVIREIKESIVGEIRREIVSGLLAAVSSSKASSSKQDK	592447	610012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_594930_596992_597071_598087_598216_598634_598786_599840_599907_600803_601269_607894_608017_608897
894770	contig_4604_pilon	+	4182	7	Intergenic	novelGene_19183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	116.325692203686	582	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	99	668	381869	387507	TRUE	20	TTAGTCATAATTTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNSKSFADINLYREQIKRVKDSDDVPMVLVGNKCDLPTRTVDTKQAHELAKSYGIPFIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQYRMKKLNSSDDGTQGCMGLPCVVM	381273	391483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_381355_381851_381980_384089_384269_386585_386746_387387_387512_387870_387903_388005
894771	contig_3956_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_14807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCTTAATCTCATAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228652	1227612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1227600_1228700
894772	contig_7730_pilon	+	6743	3	Intergenic	novelGene_156299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	61	junction_1	154.5	1172	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	666	2027	454999	456360	TRUE	20	TCTGTTTTACTCCAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSPSQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPILASTELDDVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPPVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLADNLMDDLLDNITLPSSQSSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPPSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYSNQTLQDLLSSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLHNDPMMSFAAQPNQGSLVNQNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMGLSDSSSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMGHDKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG	406013	477095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_406640_454959_456396_472414
894773	contig_9995_pilon	+	3058	1	Intergenic	novelGene_47734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2490	2801	513909	514220	NA	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDTTEIKRIVTEYYEKLYSNKFENLEAMDKFLETHHLPKLQQSEVENLNRPITREEIEKVIKKNPNKKKALAQMASLENSTKHSQKSLYQYYSNYFRA	511419	514477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_511400_514500
894774	contig_10526_pilon	+	3534	10	Intergenic	novelGene_142567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	90.5489431805314	71	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	259	978	273810	310016	FALSE	20	GGTGAATTGAATCTTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLTAMPAGLICASIVVRAAKEESKKQLVKPEQLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKGSRFKKIAYPLGLATLGATVCYPVQSVIIAKVTGKKAYATSQQIYEAVKSWTKSNKKETLPEPKEKTKVGSYAEIEIPTKTAQVLKRSVPLPTELGSETKTKSELTSGITNLGI	223327	312572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_270558_270760_273809_273912_279949_280070_283141_283197_284658_284758_291360_291453_307400_307512_307714_307833_309993
894775	contig_4812_pilon	-	1624	2	Intergenic	novelGene_103672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	17593	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACATGTCTTGTAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81666	79058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221
894776	contig_7619_pilon	-	4621	3	Intergenic	novelGene_162166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3388	3708	654940	654620	FALSE	20	AGACCGCCATCTTGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKEKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSRKT	764826	653706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7619_pilon_-_656381_737833_739459_764504
894777	contig_13004_pilon	-	4537	5	Intergenic	novelGene_112674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	843	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3984	4283	669402	657276	TRUE	35	ATACATACCAAACTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAWPFSACRELNTAPQLGISQMKEPEGWLRACMAGPSAGARAGNGGGSSGDFGPSLSSSLVDFLSSSRSSSSSSSSSSSSLVYTIVHDVREACPMFPP	677228	655117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_655308_657211_657325_666513_666724_669361_669574_673416
894778	contig_7728_pilon	+	4809	13	Intergenic	novelGene_64709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	4175	4606	779579	811320	FALSE	30	GTGCTATGCAGATGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAALKVLTRLCQEIWRTAAWPTDWKRSIFMPIPKKGDLTECGNYQTISLISHTTKILLKITQKQLQQYIDQELPEIQARFKRERGTRDIITDVRRIMAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWMSLQRMGIPEH	713430	811523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_713815_716036_716171_724821_724914_724993_725101_726429_726578_729257_729336_730499_730551_735944_736057_752040_753319_753369_754663_756896_757186_779370_779948_811257
894779	contig_18328_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_132545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACACATTGATAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9820	12320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_9800_12300
894780	contig_7051_pilon	+	2314	13	Intergenic	novelGene_64279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_12	188.648905966142	28	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	203	1051	184159	205558	TRUE	25	TATATTGACTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNRNSMSDSPLVAGPEAAR	183956	207363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_205506_205602_206143
894781	contig_6710_pilon	-	896	2	Intergenic	novelGene_97484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAATAAAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658190	653382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
894782	contig_6361_pilon	-	3515	4	Intergenic	novelGene_23867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	541	junction_1	30.9228430488243	41	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	2469	3104	62823	55091	FALSE	20	ATCCTACTTTACGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	65291	54679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559
894783	contig_4783_pilon	-	7977	15	Intergenic	novelGene_108338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	340.27330701862	419	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	426	1376	272647	35758	TRUE	50	TTTTAAAAAAATCAGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQNEGMAQLDSIGFSVIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQETRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDAPLSNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVVSSNANSILNSSSSLQPNMNSSDPDLDVVKPTRPNSL	302221	29109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_29607_29653_35916_56452_56592_81553_81714_155408_155515_157883_157943_159655_159744_173638_173714_178145_178212_203798_203836_272584_272664_284594_284684_292845_292937_300778_300880_302093
894784	contig_8576_pilon	+	2621	8	Intergenic	novelGene_88800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	650.242529321772	5	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	398	1315	909976	915750	FALSE	70	AAACAGCAACAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRACPPQVLLSSYPGSVSSALTFPPGVWCFLCLKTLQK	893652	917056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902847_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915639
894785	contig_7333_pilon	-	3223	1	Intergenic	novelGene_142807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	300	903	260	1162	395360	394458	NA	30	TCTTGTGGAAAAGCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNFKNSILISGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	395619	392396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_392400_395600
894786	contig_11986_pilon	-	515	4	Intergenic	novelGene_69167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1534	junction_1	26.1321428300262	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	101	382	514917	507353	FALSE	30	CAAGATTACATGTCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	515332	507219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235
894787	contig_3077_pilon	+	2924	9	Intergenic	novelGene_26869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	78.9109466424019	20	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	433	1002	1342107	1346705	FALSE	55	TTACCAAAACAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336609	1348627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
894788	contig_12543_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_168372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAGGGCTCCAGGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260524	265602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_261693_264735
894789	contig_12540_pilon	-	5070	2	Intergenic	novelGene_148119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1142	1846	1217724	1217020	TRUE	80	ATAAAAAAAAAAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEQRVAKAKGKNDEVKEMNRRFQRVAQEDKVKYYNDMCKDLELENQKGRTRSAFLNLKELKKKIQASSCNSERFHGENINAGSTKRRWKEYTESLYQKELVDIQSFQEAAYDQEPMVLKEEVQAALKTLVKKKRLQELIEYQLRCFNKRKQHWKYTLVYAKKCGRQLPGQPTGINLYMYSKKGDPTKCGNYRIISLILHPSKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQA	1218865	1211648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1214564_1216710
894790	contig_7840_pilon	+	4469	11	Intergenic	novelGene_69037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCAGAGCTGCCCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364935	445699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_366116_367533_367652_373195_373370_378784_378875_389411_389509_391191_393317_395376_395442_403143_403288_406624_406882_427609_427738_445608
894791	contig_14643_pilon	+	7088	30	Intergenic	novelGene_99116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	572	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1436	1738	27086	29282	TRUE	10	TTTCCATATTTGTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPVNYVHFTDPSSEVGILLHCLHNFLVLVGQFSEGCSCDVLLGLYTAVHEHGYSVGTEIQVSGGITGHLLVEVTRAHLGHLGHPAPPLDRVHKLLQVSS	25650	80555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_27249_28761_28857_29237_29451_29639_29798_34352_34439_34525_34746_35218_35414_40990_41116_41616_41841_42995_43122_43495_44249_45617_45758_48084_48268_52010_52201_53787_54009_56215_56438_57091_57239_57837_57986_58214_58324_64086_64256_65222_65348_66318_66442_68605_68889_69087_69223_75576_75696_76478_76629_76932_77174_78257_78467_78948_79046_80271
894792	contig_17964_pilon	+	3140	17	Intergenic	novelGene_33895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1329	1751	357690	370936	TRUE	70	ACAAAAAAGATACACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDPCWSWENSIICPAISRSCKLGYRLFRKSSKSLLLPEGMTSDIPYRKREEEKRVLLGLKRLEALFARYLASAPGAAEMYLPLPFVSPPAVPNPPRADPRVAPRELLLPNPKDVLAGWAEPWEKRELLCELLLRELLP	340423	411417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_340914_344422_344618_347655_347778_348930_349052_351502_351644_355598_355734_357565_357696_359050_359318_370786_371082_371986_372129_373492_373632_380105_380266_384034_384136_385000_385092_395545_395820_397747_397903_411235
894793	contig_13780_pilon	+	2305	2	Intergenic	novelGene_149050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	39	junction_1	0	376	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	293	1636	605685	607028	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRRFEEVGCCEDLEAVGEGQRALLGRNHLRLSCTRLSVGRVEAQRPGDGSPGLGAFGPRWGLGDRAEAGAVEAAETTGGARWRGRDSAGETGPNQSMAMGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGDIQQARKRAAQETERLLKELEQNANHPRRLEIQNIFKEAQALVKEKIVPFYSGGNHVTDEFEEGIQDVILRLTHVKTGGKISLRKARYHTLTKICAVQEIIEDCMKRQPSLPLSEDAHPSVAKINSVMCEVNKARGTLIALLMGVNSNDTCRHLSCVLSGMMADLDALDVCGRTEIRNYRREVVEDINKLLKYLDLEEEAGSTHAFDLGQNHSILKIEKVLRRMREIKNELLQAPNPSELYLSCKTELQGLIGQLDEVSLEKNPCIREARRRAVIEVQTLITYIDLKEALEKRKLFVSEEHPPLKAVWSVLGNLSEIQGEVLSFDGNRTDKNYIRLEELLTKQLLALDAVDPQGEERCKAARKQAVKLAQNILGYLDLKSDEWEY	603971	607697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_604236_605656
894794	contig_1535_pilon	-	1644	5	Intergenic	novelGene_127215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	722.637876117769	159	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	448	855	41781	40062	FALSE	10	TACTTAGTTTTCTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52421	39272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_47293_47489_52240
894795	contig_3817_pilon	+	4591	3	Intergenic	novelGene_78404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34.5	860	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	129	1313	1278701	1279885	TRUE	25	GTTTCTTTACAAATGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLNRENLNNNNSKRSCPEDFEHDAIFGILNKVKPSYKSCADCMYPTASGAPEAFGEQRENPHAPAICTQPTLLPHLASSPVAHTSSRSRALEKLASGSTETPPPLPPAGARQPDTSGSGPGAALLASLLEPSRETEKPLPKSLLLKNSHCDKTPPSMEVVKEEPPPKKDLKPAKDLHLLFSKESERPATNSYLMQHQESIIQLQKAGLVRKHTKELERLKSMPADMASPSRDGITSRLEASIPEENQELAPPCPSGPPALLLQAGSDEKSEAVPPPLEGASLKSPTPWLCRLDHTSHFSKDFLKTICYTPTSSSMSSNLTRSSSSDSIHSVRGKPGLVKQRTQEIETRLRLAGLTVSSPLKRSHSLAKLGSLNFSTEDLSSEADVSTIADSQDAKLSESSFLYEPQPTPRNTITTSKPSGKSAPGNLTSPSQGSKS	1274649	1285436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1274715_1278637_1282835_1285107
894796	contig_10331_pilon	-	507	1	Intergenic	novelGene_54091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCACACGCAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111601	111094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_111100_111600
894797	contig_7744_pilon	+	4015	17	Intergenic	novelGene_62454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	75	junction_10	105.088931832758	540	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	47	2113	399829	407779	FALSE	20	CTAAGGCTGCTGATTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARTLGGGRWEVVKKGRRPAAGGNNKGGGRGDRRALGEANGVWKFDLTPAIQTTSTLYELGFEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALKALDVAALQKELDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKAAGSLELFFDHCLFTMLQELDKTPGESLHGYRICIQAILQEKPKIATTNLGKFLELLRSHQSRPAKCLTIMWAIGQAGFASLTEGLKVWLGIMMPVLGIKSLSPFAIAYLDRLLLMHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLDFAYMPNNSLTPSLQEHLCQLYPRLKVLAFGAKPEATLHTYFPSFLSRATPSCTPEMRKELLSSLTECLTVDPLSASVWRQLYPKHLLHSSLLLDHLLKSQERIPKKVWKSLQETIQSFRLTNQDLLRKSTSNNQDVITCEAACKALLQQAWGPRLPWTRLLLLVLVFAVGFLCHDFRSHSSFQASLSGRLLQSSGFLPAGQQACAKLYSYSLQGYSWLEETLLTWSSHLFTMARPSLQLAWTHTNATVSFLSAHCASHLAWFGNGLTSLAQRIQTQLPDALSQLLHSLTELLLLLYQNVLLPLWHLLLEGLARAQEHCHKACRGEVTWDCMKTQLSEAAQWTWTYLQDITVAFLDWALAMISQQ	399782	409681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_399977_400930_401131_401634_401786_402086_402222_402436_402520_402945_403052_403158_403241_404091_404194_404555_404698_405079_405172_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652
894798	contig_2278_pilon	+	2047	4	Intergenic	novelGene_118086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	159.26986183484	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	146	625	658591	661886	FALSE	60	TAAAAAAACTCCATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMTATLYLKNGSICHSLPYQMVHTTTKKILCIFTCRPEMEMEPQCMVSLVTDKLKPRTRLGSDRESSPGQGKEEGGCNPLPPPPCPCVTRRGPPGAAGPGAAAVDDDRAAASVLGVFAAPARPSSRDCSSCRLHLGQAALGFQNNFVFGKHIANPSKS	637516	663308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_637628_658556_658678_660064_660151_661579
894799	contig_5023_pilon	+	2296	15	Intergenic	novelGene_7236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2123.9872412565	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	86	1627	607279	646923	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNGGEAQQCKICHFHGPKNWSTSVCPSRRPG	580843	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631501_643515_643539_646857
894800	contig_12464_pilon	+	5771	7	Intergenic	novelGene_68698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	357	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACTGTGTTGGCATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336462	379182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_337899_344406_344618_345550_345708_346256_346554_357014_357111_357349_357836_376094
894801	contig_12790_pilon	-	4955	9	Intergenic	novelGene_35196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	257.629579047127	560	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	260	637	456865	455080	TRUE	50	AGGAAATGTATAGAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKFGITAAFSMIYVYTAELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTILTAILTLFLPESFNIPLPDTIDQMLRVKGIKYRQSPTHTRVLKDEEESPTILKSTAF	462261	284108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_284691_410244_410489_428864_429088_451321_454580_455068_455168_455548_455685_456711_456895_460276_460378_462132
894802	contig_6497_pilon	+	4887	5	Intergenic	novelGene_35556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	445.25863270688	132	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	98	433	156503	166061	FALSE	30	ATTCAGTAAGGGGGCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRRNCGGPALAVCEAWSPLASDRAVLKPSSTMGKRDNRVAYMNPIAMARSRGPIQSSGPTIQDYLNRPRPTWEEVKEQLEKKKKGSKALAEFEEKMNENWKKELEKHREKLLSGSESSSKKRQRKKKEKKKSGRVSKSFPFF	156405	170515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_156527_161345_161444_163401_163481_165792_165868_166001
894803	contig_18859_pilon	-	6759	12	Intergenic	novelGene_150533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1071	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	2197	2694	92786	92289	TRUE	35	CACACACCGGTGTAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLPQLRLLPRCGVGGRLWCWALVGLCRWLLPCFPGRMLLSLAAWACTTQGPEWLPPCCVPAWRHPAPPRRRKKASAQDLLSLCQRPRTGHLRPVPCSGKCYKSLAAQASLLPQGTHWRTLCGPTSPQHSLSIFSVTDLASGSRGFTAQGSCACPQDTLHSRLS	94982	48027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_48309_50959_51196_51816_52036_54985_55068_57385_57536_63023_63089_63427_63598_67347_67552_67633_68234_69515_69650_90031_90207_90539
894804	contig_10973_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_150392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCCGATGAACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1749	3004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1700_3000
894805	contig_11855_pilon	-	1719	11	Intergenic	novelGene_66967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1958.31058823671	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	128	979	1102035	1080724	TRUE	15	CAGACTTGATTGTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKGQKIRLLD	1102162	1077289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1080623_1080750_1082885_1083047_1084332_1084507_1085877_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
894806	contig_13428_pilon	+	3496	4	Intergenic	novelGene_143459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCAGTCAGACCATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157951	226465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_158142_158282_159606_220029_221639_226091
894807	contig_18108_pilon	+	3019	9	Intergenic	novelGene_33479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	247.435850272348	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	399	1100	244438	260192	FALSE	20	ACTAATTTTCTTTGGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIKIIKEYERAIIFRLGRILQGGAKGPGLFFVLPCTDSFIKVDMRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIAAEGEMNASRALKEASMVITESPAALQLRYLQTLTTIAAEKNSTIVFPLPIDMLQGIVGAKH	226802	262111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_226876_230734_230801_232751_232919_244345_244450_245849_245923_247185_247269_250797_251002_252193_252329_259997
894808	contig_2703_pilon	+	2325	16	Intergenic	novelGene_101715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1024.32056614237	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	288	1463	559489	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDMKKKAKLF	526179	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609381_610843
894809	contig_13428_pilon	+	3043	16	Intergenic	novelGene_143438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	290.873855820698	15	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	907	1758	61940	82244	FALSE	65	TTTAAAGACAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGRNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEEQMDAETSTAQPETMQTAACLVASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR	46698	83529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_53267_53389_54327_54413_59753_59830_60343_60464_61923_62034_66264_66387_70359_70503_73401_73503_73731_73953_80039_80115_82148
894810	contig_7066_pilon	-	6054	4	Intergenic	novelGene_42139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	283.908827305919	1331	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	63	722	738550	734318	TRUE	5	ATTTTTTCCTCCTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAGPANPEATRSWLCRVLEIMPRKAGNVEEAEAGADESGAEEYGPEESDPEESGAEESGPEESGPEESGTEQMMEAGRPRPVLRSVNSREPSQVIFCNRSPRVVLPVWLNFDGEPQPYPTLPPGKGRRIHSYRGHLWLFRDAGTYDGLLVNQTELFVPSLNVDGQPIFANITLPVYTLKERCLQVVRSLVKPENYRRLDIVRSLYEDLEDHPNVRKDLERLTQEHIENQRMEQETVDFH	738612	727786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_727889_729087_734515_735774_735898_738210
894811	contig_7056_pilon	-	1681	9	Intergenic	novelGene_43630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_8	963.626216110272	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	406	945	725582	723226	TRUE	15	ACTGCAATTTGTCTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	728636	721898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725734_725813_725993_728561
894812	contig_9058_pilon	+	1618	5	Intergenic	novelGene_149357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	345.976426220053	16	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	47	724	41923	56354	FALSE	15	TATCCCCAGTGTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQEELRITTRKLTPTMNLPCKILASFLLICNIPTKGAFPAKVEITCGILDHDVNLTISDFPMNDSIDDIRWYIAQTKTKIGQFRKGKDIYQLNETYHIFSDGTLQIKNLTRNSNGTYQVMLFDIHGKNVLERTIDLRILEMVSKPVISWKCINRTLTCEVMNGSDTELKLYLNNKPVNTSHQNIITHEWPNYPNPSFSCCVAKNEVLEETCVANISCTGALCGTAHFLYQQEEKTEHQEK	41876	57248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_41984_42126_42439_47264_47506_51897_51961_56353
894813	contig_17207_pilon	+	2753	2	Intergenic	novelGene_178666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2295	2606	5897	6208	FALSE	35	GTCAGGCACCTGAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPGARNPSGLQL	2205	6355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17207_pilon_+_4343_5739
894814	contig_8140_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_86435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTTGTGTATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191125	193648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_191100_193600
894815	contig_5341_pilon	-	1967	3	Intergenic	novelGene_168004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_2	381	16	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	768	1292	339444	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340470	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_340028_340286
894816	contig_15666_pilon	-	1373	5	Intergenic	novelGene_70172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	713.692992469451	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	276	707	108757	107816	FALSE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110748	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108775_110177_110246_110558
894817	contig_12638_pilon	+	3003	2	Intergenic	novelGene_33259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAGAAAGAAAAAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815952	819113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_817265_817422
894818	contig_12790_pilon	+	6351	25	Intergenic	novelGene_35189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1993	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGACCTGGAGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140445	243986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_141487_142891_143026_145401_145545_146092_146183_165295_165521_167487_167616_185868_185983_186058_186154_186598_186708_188727_188923_189359_189487_189927_190117_196550_196790_197692_197869_199630_199791_199930_200112_201576_201785_202200_202393_202956_203121_203347_203481_215516_215720_216249_216437_220405_220557_240645_240732_242305
894819	contig_11285_pilon	+	3879	2	Intergenic	novelGene_5718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTTTTCGCTGACCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818198	843546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_818742_840210
894821	contig_5023_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_7114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	84	509	99525	99100	NA	40	ACTGATGATATTGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHASVSLSYCGSLHVAMILEAMPLVFQMPTESPMVDRFQWSFQNKTDWEEGPGGLLLKKLVAENLMNSSGTLSDIVPEDELFRLEGTQNVNGEELPPESRLDLNDMDGIKLLGPSFADVAQLKMRRNSCRHPLIIRVWNV	99608	97856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_97900_99600
894822	contig_16701_pilon	-	5453	3	Intergenic	novelGene_177597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	22.5	1020	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	1555	2586	99126	71919	FALSE	20	CTTCACCCAGCAACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIHRSTPITIARYGRSRNKTQDFEELSSIRSAEPSQSFSPNLGSPSPPETPNLSHCVSCIGKYLLLEPLEGDHVFRAVHLHSGEELVCKVFDVSCYQESLAPCFCLSAHSNINQITEIILGETKAYVFFERSYGDMHSFVRTCKKLREEEAARLFYQIASAVAHCHDGGLVLRDLKLRKFIFKDEERTRVKLESLEDAYILRGDDDSLSDKHGCPAYVSPEILNTSGSYSGKAADVWSLGVMLYTMLVGRYPFHDIEPSSLFSKIRRGQFNIPETLSPKAKCLIRSILRREPSERLTSQEILDHPWFSTDFSVSNSGYGAKEVSDQLVPDVNMEENLDPFFN	100680	69051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_72388_93637_93931_98856
894823	contig_11855_pilon	-	1664	11	Intergenic	novelGene_66970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1899.01421795625	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	104	1261	1102035	1077702	FALSE	20	TTTCTGTTACAGACTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1102138	1077298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084557_1085876_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
894824	scaffold_15027_pilon	+	2454	16	Intergenic	novelGene_163555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_9	130.762277944877	568	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2325	128	2452	48927	106778	FALSE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKTDAHYSILSLLLCLSDSPSNSNYVGTPRDKEVEKKDDFDWGKYLMEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLYLEQSDFHEKFAGGDICVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHINKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSS	48799	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_104978_105638_105828_106597
894825	contig_19730_pilon	-	2399	2	Intergenic	novelGene_142478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	20	388	121876	121508	TRUE	40	CACTTCCTTAAAAAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLEHVMSQEERANEKGETNNRRGNIVHKMNSCQGRRMYQKHRQRDLSVRSRDSSFCKKGRRVHGGVCKSLFVADSPFTGCSFRPLQVWSRRGENGSGTILFSCYSYYYLRLLVLSVVVNCHQVDSDS	121895	28575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_28854_119774
894826	contig_10904_pilon	-	3240	3	Intergenic	novelGene_22765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1181	1483	874025	873723	TRUE	60	CAACAGAAAGAGCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQRTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQNADKNEEKIDKFMENTDKKMKEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQ	875247	674436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_675029_872557_874633_874674
894827	contig_12313_pilon	-	2330	13	Intergenic	novelGene_171846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	54.4951577869284	829	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	575	1351	84299	73274	FALSE	20	GGTTGTGTGAAACTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	115462	72294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_100064_100114_100522_100590_111097_111234_115242
894828	contig_4924_pilon	-	1477	9	Intergenic	novelGene_84674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	1247.30659823477	50	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	47	925	252576	65308	FALSE	25	TACTTGATGTTTCTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPGSVFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALVFIK	252622	64755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65324_114595_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
894829	contig_4678_pilon	+	3760	9	Intergenic	novelGene_126038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	161.473633683645	14	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	150	1037	485729	495614	TRUE	40	AGGAAACTCCCAGAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRLFGVAGANPATRQACNPCLRLRSLRPQVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQQRKKKIKREEVERLVKEVPEEYSDRFSLQACSLCSQLLCKDPAERLGCRGGGAQEVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGMVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFSRQR	485579	498659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_485863_486714_486753_486834_486925_488121_488331_488422_488561_495093_495232_495312_495448_495608_495696_496017
894830	contig_13021_pilon	-	4811	1	Intergenic	novelGene_8215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAAGCTGTCTTACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182489	177678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_177700_182500
894831	contig_5686_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_45441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATGCACGTAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213717	215704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_213700_215700
894832	contig_3737_pilon	-	4128	2	Intergenic	novelGene_178335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2797	3267	122344	121874	FALSE	40	ACCCAAAAACCAAGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPRCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	325014	121012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_-_123091_322964
894833	contig_1301_pilon	-	1524	12	Intergenic	novelGene_47331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	510.172212052375	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	83	547	322831	296717	TRUE	65	GAGAACAAGAAAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLQRDIDYRTREKCILY	322913	269197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
894834	SIRV6	+	1075	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1	452	1	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	257	748	1733	10736	TRUE	20	AGTAATTGGCATCGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894835	contig_11422_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_99092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGAGGTGTTAGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1824	748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1800
894836	contig_7840_pilon	-	2431	10	Intergenic	novelGene_69032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	276.056265511933	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	183	1088	427684	367644	TRUE	5	ACTTTCTGTCCTGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTVRSQNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSYLVRIQRKGE	445737	364880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367653_373196_373220_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427597_427738_445608
894837	contig_12000_pilon	-	1737	2	Intergenic	novelGene_43182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTATTAAAACTCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529015	510729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_512334_528882
894838	contig_10674_pilon	-	2120	3	Intergenic	novelGene_6418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	10.5	42	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	22	1470	104377	97346	FALSE	25	GTTACTACATCACCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISQEALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPTDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHVYNWERYHDCQFSDHDWPIHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYSPEPCWQYPDHHENKYCDLECSHTCNYKTSSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWKEQSKEKSDKRGKSKCERNGLVKAQIALEEASQQLAEKEREKNQGFDFDSFIAGTIQLSSQHDPTDVVDKLNDLNSSVSQLELKSLISKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSGGEDCFLINQFCCEVRKDEQDGKENTYTSYLDKFFSRKEDAEMLETEPVEDGKLGERGNEEGFLNNSGEFLFNKQLESIGIPQFHSPVGSPLKSIQATLTPSAMKSSPQIPHKTYSSILKHLN	104398	96695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_98448_100324_100527_104232
894839	contig_8330_pilon	-	3668	8	Intergenic	novelGene_71967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_7	325.932007433127	1054	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	260	964	2056084	2038853	TRUE	25	TTTTAATGTGGCAGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056547	2033275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2035974_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2056390
894840	contig_15899_pilon	-	1910	2	Intergenic	novelGene_128901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTCCTCTAACTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12873	10831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15899_pilon_-_12642_12773
894841	contig_16951_pilon	+	1870	5	Intergenic	novelGene_98629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	301.66403083563	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	19	798	65762	106818	FALSE	25	TGCTATTATTGAGTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHVRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFPRGSSAFEKAQEKEDGRTESASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	65743	107890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_65874_68468_68670_74288_74484_103952_104099_106692
894842	contig_5033_pilon	-	2252	3	Intergenic	novelGene_28927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	1566.5	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	710	1009	451991	450673	FALSE	30	AGGAGAGAAGTACGGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPQGGAGVSSDGCPASLSSRSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	452700	449429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_451926
894843	contig_20614_pilon	+	4147	10	Intergenic	novelGene_107521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	64.4291169511977	197	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2115	136	2250	58672	64723	TRUE	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGSCSRSSPWPLAQLFEGEELPPHFGIRTSHDGCHLKPSGSPGVMAQKHPGGRGLCGAHHSGGASLRTFGPSVEPDILSFSGPRDSAGTTLNGTRCLTEQSDPKYTQPPNPAHWSDPSHGPPRGPGPPRDGEDPDQSEISSEEESGMDQELSRENEAGYQEDGNPSFLSIPPTCNCQRTPGIPEGLYSEGGDSSSSNFCHHCTSPALGEEEELEEEYDEEEPLKFSSDFSRVPSGKKPPPRRQRHRFPTKEDTRETGRRDPRSPGRHRLGRKRSQADRRRGLGLWGAEELCQLGQAGFWWLIELLVLVGEYVETCGHLIYACRQLKGSDLDLFRVWVGVWAGRLGGWAQVMFQFLSQGFCYGIGLLTRFLRLVGALLLLALALLLGCLQLGWQFLVGLGDRLGWRGKATWLFSRLDSPALQRCLTLLRDSRPWQQLVRMVQWGWLELPWVKQRTNRQGNAHVASGRYCQPEEEVARLLTMAGVPEDELNPFHVLGVEATASDVEMKKAYRQLAVMVHPDKNHHPQAEEAFKVLRAAWDIVSNPERRKEYEMKRMAENELSRSVNEFLSKLQDDLKEAMNTMMCSRCQGKHRRFEMDREPKCARYCAECNRLHPAEEGDFWAESSMLGLKITYFALMDGKVYDITEWAGCQRVGISPDTHRVPYHISFGSRVPGTSGRQRATPDTPPADLQDFLSRIFQVPPGQMSNGNFFAAPQSSPGTTTASKPNSTVPKGEAKPKRRKKVRRPFQR	58124	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_58204_58615_60085_62355_62463_62673_62794_63625_63787_63881_63985_64512_66206_67449_67601_67866_68042_68861
894844	contig_11986_pilon	-	6125	11	Intergenic	novelGene_69087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	209.044134096128	1098	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	1603	3096	47052	28315	FALSE	25	TTTCAAAGACAGCTGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQPQPPPAQPLSSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPSTFTPYPLAGLNPNMNVNSMDITGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSVDNLPSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIRPPAKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSAGPASHTQASLSHELWKVPRNTTAPTRPPPGLANPKPSSTWGASPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVCWGTPPSWPSSLARKK	48654	25285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_28371_29179_29322_30356_30428_31251_31447_38987_39132_39598_39791_41122_41291_42013_42246_42365_42450_44628_44749_46962
894845	contig_6227_pilon	-	5871	26	Intergenic	novelGene_49689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	250.190180462783	315	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	20	2170	917083	893778	TRUE	20	AAGAGGCTCCTGTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKGRYFLNEGEEGPDQDALYERYRLTSQHGPLLLTFLLVAITACTALIIIEFINWDTSKLKSLLGTAIVVLVVFVALYLLVYVDCLVRRGLRALALLIWACLMTLGYVLLYDSRMKGACAWEQVPFFLFVIFVVYTLLPFSMWGAVAVGVVSTVSHLLVLSILAGVHEMPSDHIELKLLANAIIFLCGNLTGAFHKHQMQDASRDLFTYTVKCIQVRSKLRIEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHRDRRYMPDNNFHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTRLASDCSPKELVVMLNELFGKFDQIAKANECMRIKILGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCEAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLCGVIGLLKWQYDVWSHDVSLANRMEASGVPGRVHITEATLRHLDKAYEVEDGHGQQRDPYLKEMDIRTYLVIDPRSQQPPPPCQHLPKPKGDAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFAHLSHRESVSVSETPVPSSRRPRAIPLRRHRTPDKSASLKGRSEDDSYTDEMWSAIEGLTSTRFSCSRSDDFHACTCVSIFQEKGLEREYRLAPIPRARHYFACAGLIFLCILLIHVLLMPRMVALGVSFGLVACVLGLVLGLSFADEFLRCCPARGDAPGHLPESGDAAPAEGVPGHPDHRQPAHHRHHQPAAAASPSAGAAWWEQDKRERCEQPDLV	917102	885244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_886962_887018_888008_888158_888284_888902_889073_889350_889456_890103_890251_890889_891046_891437_891526_892464_892659_893767_893861_894651_894779_895268_895354_896256_896355_897772_897852_898047_898132_898644_898680_899052_899245_902807_902941_903114_903274_904608_904737_908272_908385_910077_910227_911080_911231_913313_913476_914730_914935_916912
894846	contig_5590_pilon	-	693	5	Intergenic	novelGene_163040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTCCTCCTCGGAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364843	358952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361150_364784
894847	contig_10404_pilon	+	1134	6	Intergenic	novelGene_138656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_4	2454.47851895265	184	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	69	518	1085448	1099868	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085379	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
894848	contig_13044_pilon	+	8045	32	Intergenic	novelGene_99984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.176684695969409	1512	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	7696	8043	142817	176488	FALSE	50	ATCCAAAATGAAAGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLRTAFTSPSEQASAKLRLSDCPAFAVLSALIRVSAAAASSNAQLTDEVNLRRTSGSAKALPSAVDNLPIPAASSKASRRACVSGSTVLRSAPSAVPDKSNLEAVSSIGFSKSS	56012	176490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_57471_58197_58368_58774_58955_59472_59722_73384_73581_77002_78632_80313_80459_90727_90890_91552_92006_93099_93272_105834_105949_107273_107370_110271_110434_110877_111059_111872_112088_112593_112731_114807_114954_115085_115202_123014_123159_129643_129746_130153_130298_130546_130678_132216_132307_134201_134311_134681_134871_136216_136455_138438_138532_141015_141256_142336_142479_142724_142877_145328_145485_176356
894849	contig_15022_pilon	+	1998	13	Intergenic	novelGene_171820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_9	155.777864459478	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	186	1010	111402	119275	TRUE	20	TATATTTTACCCCATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGLFTRAQRLAWLEASEIEDEEEKVSRYRELLARLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNHMNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSYLVVKKHQSMETMMLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQW	110450	121823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_114652_114686_118370_118454_119220_119520_120780_120931_121229
894850	contig_7396_pilon	-	1961	10	Intergenic	novelGene_79579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4212.57031886211	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	504	818	248211	246442	FALSE	45	AAGATGAAAAAAGTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257077	245298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248283_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
894851	contig_11846_pilon	-	7058	1	Intergenic	novelGene_105949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	923	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	870	1301	281737	281306	NA	20	CTTCCTAGACTTAGTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLALHHSFLSNGLEMYYYANVNFDTEFRKRLLASLFLCFAPPPKSPICGHHCFLILNHELIVTMHSAKGGEERAEGRGKWLCILVLQFLCPWCPMFWRGRGVRWSGQDSEVGETPEGVLSGVAGRPDMIVWQIPRACSSYQ	282606	275548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_275500_282600
894852	SIRV6	+	1462	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	7	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	10	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1183_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894853	contig_11115_pilon	+	2840	26	Intergenic	novelGene_102878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	103.919014621964	893	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	886	2658	182	2839	278265	312829	FALSE	15	GAGTATTGGCCCTGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARTAPARVPALASPAILLPDDVRRRLKDLERDSLTEKECVKEKLNLLHEFLQTEIKNQLCDLETKLHKEELSEEGYLAKVKSLLNKDLSLENGAHAQEVNGCLENGSHTSKEDRRMAEANKPSKPVSKPRASRRSKSEGETKSDVSPSPRITRKTTRQTTITSHFAKGPAKRKPDEEPEKAKSEDSVDEEDKDQDEKRRRVTSKEPVVRPLPAEEPERVKPGTHTEKEEERDEKEEKRLRSQTKELTPKQKPKEEPDREAVPGTHTEVDEEGDEKDEKRHRSQPKDLAAKRRPEEKEPEKVKPQISDEKDEDEKEEKRRKTSSKELIEKKVSRTKTIVSSKTHPPKCVQCGQYLDDPDLKYEQHPPDAVDEPQMLTNEKLSIFDANESGFESYEALPQHKLTYFSVYCKHGHLCPIDTGLIEKNVELSFSGSAKPIYDDDPSLEGGVNGKNLGPINEWWITGFDGGEKALIGFSTSFAEYILMDPSPEYAPIFGLMQEKIYISKIVVEFLQNNPDLTYEDLINKIETTVPPSGLNLNRFTEDSLLRHAQFVVEQVESYDEAGDSDEQPIFLTPCMRDLIKLAGVTLGQRRAERRQTIRHSAKEKDRGPTKATTTKLVYQIFDTFFAEQIEKDDREDKENAFKRRRCGVCEVCQQPECGKCKACKDMVKFGGSGRSKQACQERRCPNMAMKEADDDEEVDDNIPEMPSPKKMHQGKKKKQNKIRISWVGEAVKTDGKKSYYKKVCIDSETLEVGDCVSVIPDDSSKPLYLARVTALWEDSSNGQMFHAHWFCAGTDTVLGATSDPLELFLVDECEDMQLSYIHSKVKVIYKAPSENWAMEGGMDPEPMMTEDDGKTYFYQLWYDQDYARFESPPKTQPTEDNKYK	278083	312830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_278345_285869_285907_286400_286509_286701_286910_288130_288207_289275_289355_293202_293238_293630_293716_295231_295267_296296_296385_298117_298153_298855_298938_300321_300357_300616_300663_303906_303988_304062_304173_306938_307058_307305_307399_307882_308035_308200_308389_308488_308673_310525_310624_310882_311031_312099_312216_312410_312616_312694
894854	scaffold_4438_pilon	-	4059	3	Intergenic	novelGene_174554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1423	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1953	2297	425734	425390	FALSE	10	TCTTGTCCGATGGGCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSWLIVAFRYSVSLLSFFLDVLSFTESAVLKSPTIIVELSISLSSAVKVCFMYFGAPSLGGQIFIMVMSSCWIIPLVMIGVHSLSFMVDFVLKSILSEIGIATSALFWWLFA	439326	423627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_426893_427746_428012_438797
894855	contig_14923_pilon	+	2645	5	Intergenic	novelGene_157749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAACAACTGACATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354209	365518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_355651_358242_358319_360541_360627_361007_361107_364574
894856	contig_4315_pilon	+	4944	7	Intergenic	novelGene_46828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	297	659	370646	371008	TRUE	60	CAACAAACAAACAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGRRGGGQGKEGLLEFQVHPGVWEGALRVSGIGEYHQKYSLEVSLCLLWENEPEQVDWPQRNPLGGRGRGRTAGELFPAFLPTSHLLYLPPFPSSCYPKHSPNASSVPSTVPGPGSTHR	370349	590365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_371119_372839_374105_434186_434414_448197_448736_448801_448884_524909_525430_588822
894857	contig_5686_pilon	-	6604	1	Intergenic	novelGene_45269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAGCTGTGAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100408	93804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93800_100400
894858	contig_6137_pilon	+	2562	2	Intergenic	novelGene_59291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2072	2386	1361182	1361496	FALSE	70	GACCACACAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGWIMDTIFRIVFPRNFKVYMLLVNMIPDLILIVCGCKKEWRGYPYTIWINLQDTLLNFKKRCRTGLTGMPPFMLEMHVCLLIFKKKKKDKSKWFSIVGKEQD	1359017	1361672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1359835_1359927
894859	contig_12920_pilon	-	4309	5	Intergenic	novelGene_166337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2170	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGAACTTTTTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406857	175982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_177741_351940_352181_371409_371427_379445_380694_405811
894860	contig_12479_pilon	-	2360	5	Intergenic	novelGene_56831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	446	751	174708	174403	TRUE	65	TTAAAAGGAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVTVGVQNKTLDDLSVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFVENTDKKMEEFKKTIQEKNAKINS	175153	101701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_102253_138196_138461_152535_152551_169563_169882_173941
894861	contig_2062_pilon	-	5208	3	Intergenic	novelGene_139023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_2	89.5	862	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	49	1092	1183257	1168954	FALSE	25	AAGGACTTGATTGTATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQGHLKKDTDWYQVKRMQDEKKKKSGLEKNTGKPLAEAVEEVKKCRPQNKPQKGLNHDLPRRHSMDRQNSQEKAVSAVAYGARSPCASPGQSPPTGYSILSPAHFSGPRSSRYLGEFLKNAIHLEPHKKAMAGGHVFRNAHFDYSPAGLSVHRAGHFDAPVQFLRRLDLSELLTHIPRHKLNTFHVRMEDDAQVGQGEDLRKFILAALSASHRNVVNCALCHRALPVFEQFPLVDGTLFLSPSRHDEIEYDVPCHLQGRLMHLYAVCVDCLEGVHKIICIKCKSRWDGSWHQLGTMYTYDILAASPCCQARLNCKHCGKPVIDVRIGMQYFSEYSNVQQCPHCGNLDYHFVKPFSSFKVLEAY	1183305	1164837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1169119_1174187_1174343_1182533
894862	contig_10793_pilon	+	1546	13	Intergenic	novelGene_83375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3682.04147311274	178	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	132	869	146975	163940	TRUE	30	AATTTTAGTTCTCATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054_165377_166401_166473_167141
894863	contig_6361_pilon	+	4774	13	Intergenic	novelGene_23910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2054	2398	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	200415	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_200727_201407_201486_201812_202035_211216_211909_257120_257504_306314_306324_339805_339859_380362_380594_405285_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
894864	contig_3948_pilon	+	2334	4	Intergenic	novelGene_53376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	92.8954011539622	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	407	1108	1813956	1860572	TRUE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQVVNELFRDGVNWGRIVAFFSFGGALCVESVDKEMQVLVSRIAAWMATYLNDHLEPWIQENGGWDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813290	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814520_1860434_1860770_1861011
894865	contig_3414_pilon	-	4354	15	Intergenic	novelGene_80960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.825581170295	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	22	1344	98088	71431	TRUE	25	CAAGGTTTGTCTGAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKQH	98109	64366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65413_65851_67266_69036_69209_70780_70876_71147_71440_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057
894866	contig_6509_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_145617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	478	1083	69757	70362	NA	10	CTCTTTGGAATGTTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSFLSLSCMSTPGGFFVGSSRLFLRMSSANLVLSLSFGSPDLCLIFSICFILSLCLLWRSSISRSFWESILSKLVIIRSPSTSNFSRGRWSFLLESLDGGSFSFPLLIFAKSPFSWLSLNFSFSLTSPSLRVSSLDLSLKLEFGGLSLSLAPGFGSSLWCLRKPSGCFSRCFSFSSLHFSLCFSLFFFSFRMLMALDP	69279	70892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_69300_70900
894867	contig_9579_pilon	-	4457	3	Intergenic	novelGene_150595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_1	80.5	5	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAACAGTCTTTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831949	823766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_827738_827881_828000_831581
894868	contig_11186_pilon	-	1595	1	Intergenic	novelGene_98860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTTGCAGAGGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40563	38968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_39000_40600
894870	contig_13894_pilon	-	4360	5	Intergenic	novelGene_62199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_4	134.222529777977	75	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	3150	3698	753211	750013	FALSE	20	TCTATTGAGTAGCGGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	764605	749350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753097_753240_761484
894871	contig_2414_pilon	+	5985	12	Intergenic	novelGene_158472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	52.6088010737103	887	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	9	350	219799	228716	TRUE	10	ATGTGGCCCTCCAGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQMKLKERQKFFEEAFQQDMEQYLSTGYLQIAERREPIGSMSSMEVNVDMLEQMDLMDVSDQEALDVFLNAAGEDNAALSPVSGRVVTHIHFIPPQRGQRDVTRDSVSPVNVLFH	219790	258021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_219899_228474_233015_237979_238084_240800_240989_242494_242623_243141_243326_244212_244317_249399_249516_250628_250703_250828_250946_254277_254370_257791
894872	contig_11105_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_159815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	752	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCAGCTATTCTCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256624	254918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_-_254900_256600
894873	contig_14514_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_137468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATATAGGAGCCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40167	38918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_38900_40200
894874	contig_10990_pilon	+	7985	5	Intergenic	novelGene_7424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_2	47.4730186527042	1817	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	3052	4275	674182	681605	FALSE	30	CCCCCTAAATATTTATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGFPPRDKDQSTTIFSGFAGLLATLLVIAVLCILCNWNKRKKRPVPYLRVTVMPSLTLPQCRQRSKNIYDFLPRRQEEPGRHQSRSIRIFSTERLLSRNSDSPTPEHVLSRAGNALQVHAVHTCAMGYAVGVYDNTMVPQMCGTFTPSAPYVNVRASRDDLSISSEDSRDYVNVPRAEEIAENLASNSPRNLSVLPSTQELDFTEKRDVGCGDTSDCTRFWSPGTESSNELSDEESSSQTSNDYVNVSELDLGAAQREKPWTTFQCCRDYENVPPADVNGSQQQAEEEATSLNTDHVKGRTDALGTHTQPVMQSGSFLVLGDHMAFQPLAQSGNSQMKHGEETPSEDDSDYENVLAAKLGDKDSEQGSGTQLLPDELRPSDPAGKLHGMVYPAGSTATTESSDDP	670555	685315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_670770_671344_674315_674955_675067_675630_675717_680711
894875	contig_8322_pilon	+	3734	6	Intergenic	novelGene_143239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	476	junction_5	350.292106676699	58	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	192	1688	290111	295697	FALSE	30	TGTACAGATGGGAGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGRCTRNNLFSSNIVSL	289919	297743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472
894876	contig_9389_pilon	+	515	4	Intergenic	novelGene_84019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	85871	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	46	483	584401	586236	FALSE	20	GCCCGAGTCCAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK	584355	586268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
894877	contig_6589_pilon	+	884	7	Intergenic	novelGene_26102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3506	junction_4	2566.73851089926	50	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	23	571	1876599	1880297	FALSE	0	CTGGCCTGGCCTGCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMVRGPGLG	1876576	1880610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150
894878	contig_5125_pilon	-	1945	7	Intergenic	novelGene_43473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	226.857823806503	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	729	1682	102758	75819	FALSE	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSQCYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSVHLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	103486	75555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387_79521_89595_89765_90998_91096_95372_95535_98796_98984_102744
894879	contig_10307_pilon	+	1307	3	Intergenic	novelGene_170263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	516	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	2	802	387329	392058	FALSE	30	AAATCTTAAGTTGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGLEKAGLYRALAGKTGGRDLLSRIKATISAFSECRCSNSSERLRERAGGPRRCKNRASRTSTAALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387327	392563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387524_390338_390382_391495
894880	contig_3382_pilon	+	2804	10	Intergenic	novelGene_124173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	270.555441478415	47	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	206	2233	951880	977747	FALSE	15	CAAAGCGTGTGGGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGMIQTNTASKTQKDVARRPQFVSSRGVEELLKGAGAKESEENQKTQGSN	945165	978318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_945244_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_977701
894882	contig_9646_pilon	+	4420	2	Intergenic	novelGene_117464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	332	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTAGATCCCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344938	395540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_346879_393060
894883	contig_513_pilon	-	5018	9	Intergenic	novelGene_80153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_1	319.445124395412	1070	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	116	1021	453421	450583	TRUE	20	GCATTTTTTGTGGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPTFESGRRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGTRGPPSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMGGRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKDSYSSRDYPSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSSRDDYPSRGYSDRDGYGRDRDYSDHPSGGSYRDSYESYGKILVEGLGTSPA	454687	445778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_447023_447829_450707_450793_450920_451013_451129_451621_451775_452192_452365_453009_453117_453312_453443_454593
894884	contig_2636_pilon	-	2836	5	Intergenic	novelGene_52048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	302.771365885217	194	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	123	512	85555	46939	FALSE	25	TGTGATGTAGCAGTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQLLIIQKLNRHSAYYVGLSDPEGMRQWQWVDQSPYNESVVGICE	85677	44614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_46955_61644_61761_62471_62624_81113_81216_85551
894885	contig_2100_pilon	-	1555	12	Intergenic	novelGene_50763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	94	1398	1182812	1170268	FALSE	30	CCAAGCTTGACCATCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185504	1170110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
894886	contig_1244_pilon	-	4702	6	Intergenic	novelGene_37928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	301	junction_4	116.119937995161	622	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	128	1372	349752	344680	FALSE	65	AAGAAAAAAAACTATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDIKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSPDEPLRSRKVFVGRCTEDMTADELRQFFCQYGEVVDVFIPKPFRAFAFVTFADDQVAQSLCGEDLIIKGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLGNNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQNQSGPSGNNQSQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGWGSASNAGSGSGFNGGFGSSMDSKSSGWGM	350869	341349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_345211_345598_345770_347073_347215_347810_347975_349514_349764_350753
894887	contig_7119_pilon	+	2939	11	Intergenic	novelGene_40858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	282	junction_1	272.459923658508	607	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	96	1520	55132	112892	FALSE	20	CCCAGCCTGCAGGGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSFPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVRKNILDNKPTANKKCDLINVPKKTADMASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA	27547	114311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_27638_55126_55327_77981_78105_90791_90922_95067_95250_98276_98397_99516_99622_102234_102381_111479_111538_111632_111879_112772
894888	contig_15087_pilon	-	2416	17	Intergenic	novelGene_37136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	427.118762758088	1	36	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	700	1587	58989	38999	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	89772	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41753_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533_66592_69146_69205_71087_71174_72506_72642_73969_74142_89687
894889	contig_15118_pilon	+	4196	14	Intergenic	novelGene_74592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	249.798024921011	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	2681	3445	393544	395136	TRUE	55	AATCGAAAGAAGACGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEIKDSFQQLSPRGHFWELASQPSFSSASY	378496	399279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_379782_379884_380022_380151_380263_391630_392088_392169_392570_392808_392927_393224_393283_393429_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394700_395049_395141_395233_395346_398644
894890	contig_7272_pilon	-	3944	17	Intergenic	novelGene_25342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	760.894906405444	249	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	1299	3233	609996	595312	TRUE	25	GTTGCTGAAGTGTTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETSTILKNDMWLNVMDGTQADQGKNGTVHLLKGLDTTMQGGWVMAGRGQA	618661	592733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610068_611629_611658_616565_616614_617510
894891	contig_14060_pilon	-	2019	3	Intergenic	novelGene_156045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	192.5	271	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67030	36282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_38161_47974_48085_66999
894892	contig_13447_pilon	+	2797	1	Intergenic	novelGene_176318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	140	598	38021	38479	NA	40	AACCCACATAAGCAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDVHLQKKNIQDPYLVPYTKTNSKWIKYLSIKPETIKIIEEKTGPMLEALKHNISKIQTITNNIQTPEDKLNNWDLLKIKQLGSSKDLTKRVKREPTDWEKNFGFDKSDKGLISKIYRKIQHLYNKKANNPIKKWAKEMNRHFTKED	37881	40678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13447_pilon_+_37900_40700
894893	contig_17_pilon	+	2801	6	Intergenic	novelGene_173974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1077	1586	358178	366915	TRUE	20	GGAGTGTGCTGTCACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTNLKWIKDLNINSKMIMIMEEKIGTTLRVLIHGIKSIQTITNMHKHQRRN	204175	626451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_205199_358124_358525_366752_367248_491247_491723_625577_625814_626279
894895	contig_2646_pilon	-	4773	17	Intergenic	novelGene_69545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_8	74.0902901448631	658	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	198	1961	877063	847374	FALSE	10	CCCCTTTAATTCCGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGSKSPDGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCSRRPGGRRHGRGNPEGPLTWKPREQAITEMISEEGGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRRLLERLKEGGHGNPAPPAASNPHSSQRSQMDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPVFRKKMVWEILHQQLL	877260	844561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847437_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863816_863997_864102_865297_865467_867268_867360_869457_869525_869942_870077_874678_874735_876962
894896	contig_177_pilon	+	1950	3	Intergenic	novelGene_41835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	67	705	417672	418882	FALSE	30	CAATAAATTTCTGTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIAVSRQPPVVVTGRS	415664	420127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418267_418838
894897	contig_12313_pilon	-	2056	12	Intergenic	novelGene_171849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	46.4774005332762	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	159	1094	115291	73274	FALSE	60	AAAAAAAAGTGGGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPASSQPPSAPPSKGKSRKKKDLRITCVCKPPPPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	115449	72311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82734_83677_83734_84287_84402_100064_100114_100522_100590_115242
894898	contig_3975_pilon	-	2293	12	Intergenic	novelGene_54737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	366.922357630229	23	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	196	1368	1730513	1719543	FALSE	15	CCCCATGCTGATGGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGRARGASARSFPAPPATFDPQLPPGSPARHGRLAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731296	1718617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730607_1731194
894899	contig_7056_pilon	+	3082	16	Intergenic	novelGene_43666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	613.191628557773	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	837	1820	802444	810882	TRUE	20	TTTTAAGTATGTGGTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPVNPSREIEDPEDQKPEDWDERPKIADPDAVKPDDWDEDAPAKIPDEEATKPEGWLDNEPEYVPDPDAEKPEDWDEDMDGEWEAPQIANPKCESAPGCGVWQRPMIDNPNYKGKWKPPMIDNPNYQGIWKPRKIPNPDFFEDLEPFRMTPFSAIGLELWSMTSDIFFDNFIISDDRRVVDDWASDGWGLKKAADGAAEPGVVGQMIEAAEERPWLWVVYILTVALPVFLVILFCCSGKKQPSAVEYKKTDAPQPDVKEEEEEKEEEKDKGDEEGEGEEKLEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781793	812192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801101_801682_801812_802369_802560_804875_804990_805254_805412_806605_806822_807441_807562_808442_808570_808732_808813_810828_811812_811859
894900	contig_8447_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_69377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTGCAAAGTACACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3341	1057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_1100_3300
894901	contig_11285_pilon	+	2670	25	Intergenic	novelGene_5657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.199826313471363	854	10	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1445	1825	789939	790626	TRUE	25	CCCAAGCACCAGCTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSMQHKSRCQSSLLRLQGHVEAEHNGAQLVPEVSLIPKEGLGGVADRAVLPAQVQAQGGARLLRGQQQHPPALAWLLPVQLQLSIQVQLFRNVVPGGSHTYLDVEAAHCCAGLGQDTILHSRIQ	784058	795599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_784307_785381_785498_785701_785813_786071_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787621_787742_787832_788124_788208_788488_788581_789132_789284_789442_789509_789926_790052_790181_790335_790427_790487_790570_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793963_794414_794467_794607_794664_794776_794820_794965_795009_795334_795477_795579
894902	contig_7457_pilon	-	2073	5	Intergenic	novelGene_31411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	136.507325810742	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472033	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471138_471290_471559
894903	contig_10017_pilon	-	1793	17	Intergenic	novelGene_156983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	388.704900920994	13	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	108	1235	337686	307398	TRUE	10	TCGGCCCTGGACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	345503	302902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303364_303985_304055_307369_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_345413
894904	contig_9091_pilon	-	5489	31	Intergenic	novelGene_32421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_23	148.57360689795	578	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	2679	5051	66734	18674	FALSE	25	GTATTTCATGATTTATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRHSDENDGGQPHKRRKTSDANETEDHLESLICKVGEKSACSLESNLEGLAGVLEADLPNYKSKILRLLCTVARLLPEKLTIYTTLVGLLNARNYNFGGEFVEAMIRQLKESLKANNYNEAVYLVRFLSDLVNCHVIAAPSMVAMFENFVSVTQEEDVPQVRQDWYVYAFLSSLPWVGKELYEKKDAEMDRIFANTESYLKRRQKTHIPMLQVWTADKPHPQEEYLDCLWAQIQKLKKDRWQERHILRPYLAFDSILCEALQHNLPPFTPPPHTEDSVYPMPRVIFRMFDYTDDPEGPVMPGSHSVERFVIEENLHCIIKSHWKERKTCAAQLVSYPGKNKIPLNYHIVEVIFAELFQLPAPPHIDVMYTTLLIELCKLQPGSLPQVLAQATEMLYMRLDTMNTTCVDRFINWFSHHLSNFQFRWSWEDWSDCLTQDPESPKPKFVREVLEKCMRLSYHQRIIDIVPPTFSALCPANPTCIYKYGDESSNSLPGHSVALCLSVAFKSKATNDEIFSILKDVPNPNQDDDDDEGFSFNPLKIEVFVQTLLHLAAKSFSHSFSALAKFHEVFKTLAESDEGKLHVLRVMFEVWRNHPQMIAVLVDKMIRTQIVDCAAVANWIFSSELSRDFTRLFVWEILHSTIRKMSKHVLKIQKELEEAKEKLARQHKRRSDDDDRSSDRKDGALEEQIERLQEKVESAQSEQKNLFLVIFQRFIMILTEHLVRCETDGTNVLTPWYKNCIERLQQIFLQHHQIIQQYMVTLENLLFTAELDPHILAVFQQFCALQA	90167	18235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_18788_24577_24692_25320_25450_28659_28775_31150_31255_32012_32107_33094_33198_34423_34547_37956_38061_40453_40529_40776_40840_43441_43507_44146_44258_45908_45973_46704_46803_48851_49068_49505_49576_51483_51606_52150_52259_54490_54648_56204_56306_56868_56958_66700_67362_72066_72281_73532_73848_80354_80480_81358_81466_85772_85893_86396_86553_87127_87268_89293
894905	contig_5686_pilon	+	2340	7	Intergenic	novelGene_45221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2724	junction_2	1130.18426472068	39	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	59	736	93843	182815	FALSE	35	ACCCTATAGGACAGGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTEVCAYPFRC	93784	184419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638
894906	contig_3424_pilon	+	3152	1	Intergenic	novelGene_55496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	579	881	157789	158091	NA	55	GAAGGTGAAAGAGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSVEYHLPFMFLGEMGTFAHCTCAYSFWRVPPPDKSINICNTIQRPGGAVVKHLAAHQKVGSSNPPPALQGKDLQPWKPYEAVLLCPGRQWIFNTTYL	157210	160362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_157200_160400
894907	contig_5574_pilon	-	2644	1	Intergenic	novelGene_155870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATTCTCTTAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232146	229502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_229500_232100
894908	contig_6361_pilon	-	5320	5	Intergenic	novelGene_24017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5888.69834938079	12	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1301	1681	426756	426376	TRUE	45	AGCAAAAACTCTTGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKWPGGILSFQLNGISDVFPGGDIPPFASKTSRPTKHKVTGTGRKNFASGSLVVRVSGVTPISTPRILYPSILARRDAAPYIGHTHAASWRTLPQSCKVLPPSWCRNCVFRRSFHHSIKPAASG	450425	414648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_415504_419465_419591_420870_422159_425004_427837_450205
894909	SIRV6	+	1155	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	627	134	411	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	19	510	1733	10736	TRUE	25	ATCTAAAATGGGGTTTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1714	11691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
894910	contig_6102_pilon	+	5422	20	Intergenic	novelGene_32076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.446593756538872	92	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	5005	5307	790637	791991	TRUE	25	GTCTTATTCAATAGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQSEKAPLGSIRPGIREKSGRGWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFLV	781751	793496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_782025_782812_784556_784643_784790_784898_785127_785506_785654_785774_785908_786012_786302_786492_786649_786758_786914_787038_787261_787418_788073_788583_788731_788887_788941_789045_789230_789439_789515_789842_790060_790454_790708_790863_791088_791983_792073_793462
894911	contig_7056_pilon	+	2006	8	Intergenic	novelGene_43706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	248.551723356877	197	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	199	1218	928641	937151	FALSE	15	TCTGTTTGACTGTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKGKGLLWEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGNGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926337	937939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928707_929255_929442_929535_929678_930556_930642_935358_935546_935846_936043_936993
894912	contig_13428_pilon	+	2445	20	Intergenic	novelGene_143434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_8	226.261254139222	5	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	856	2139	53295	82244	FALSE	25	TTTGTATCCGTAATTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGRNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEDETSEEANCLALSGHDKTETKEQMDAETSTAQPETMQTAACLVASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR	40733	82550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_53267_53389_54327_54413_59775_59830_60343_60464_61923_62034_66264_66387_70359_70503_73401_73503_73731_73953_78061_78125_80039_80115_82148
894913	contig_7840_pilon	+	4087	11	Intergenic	novelGene_68966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	409.74071069397	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	942	1898	299444	304775	FALSE	30	TGGTAATAAAGTCACCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	130673	306964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299273_299325_299535_301110_301261_304059
894915	contig_13699_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_158343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	791	1216	158855	158430	NA	30	CAGCAAGGGATGTTCGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGILEGLFSPLLELPWPPAVLLSEVSEQADCVSKRSKSEASLPRRLLARLPARLPARLPGRLADFLGSEIQVQSSRLNRDRMGWKTRGQGSDPINLIPCVTLDCGFLIHTVVALCLFDSTGALFWLYGSEFLLRSLTPKD	159645	157769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_157800_159600
894916	contig_6842_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_130801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCAGGCAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1662748	1660397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1660400_1662700
894917	contig_9038_pilon	-	3101	22	Intergenic	novelGene_143321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_21	120.756928694234	99	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1033	3099	2	3100	417803	349958	FALSE	65	AGAAAGAAGATGACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILSYLLLFAMLEYFSVLDVQGLKGPDEEAVVDLGKTSSTVNTKFEKEELESHRAVYIGVHVPFSREGRRRHRHRGHKHHHRRRKDKESDREDGRESPSYDTPSQRVQFILGTEDDDEEHIPHDLFTEMDELYYRDGEEYEWKEAARWLKFEEDVEDGGDRWSKPYVATLSLHSLFELRSCILNGTVMLDMRASTLDEIADMVLDNMIASGQLDESIRENVREALLKRHHHQNEKRFTNRIPLVRSFADIGKKHSDPHLLEKNGILASPQSAPGNLDTSKSGEIKGNGAGGSRENSTVDFSKVDMNFMRKIPTGAEASNVLVGEVDFLERPIIAFVRLAPAVLLSGLTEVPVPTRFLFLLLGPAGKAPQYHEIGRSIATLMTDEIFHDVAYKAKDRNDLLSGIDEFLDQVTVLPPGEWDPSIRIEPPKSVPSQEKRKIPVFPNGSALTSGDPPKEAAHHAGPELQRTGRLFGGLILDIKRKAPFFLSDFKDALSLQCLASILFLYCACMSPVITFGGLLGEATEGRISAIESLFGASLTGIAYSLFAGQPLTILGSTGPVLVFEKILFKFCRDYHLSYLSLRTSIGLWTSFLCIVLVATDASSLVCYITRFTEEAFAALICIIFIYEALEKIFHLGEIYAFNMHNNLDELTTYSCVCIEPPNPSNETLELWKEKHVTARNISWGNLTVSECKTFHGVFVGSACSHHGPYIPDVLFWCVILFFTTFFLSSFLKQFKTKRYFPTKVRSTISDFAVFLTIVIMVVIDYLVGVPSPKLHVPEKFEPTYPNRGWIISPLGENPWWTLLIAAIPALLCTILIFMDQQITAVIINRKEHKLKKGAGYHLDLLMVGVMLGVCSVMGLPWFVAATVLSISHVNSLKVESECSAPGEQPKFLGIREQRVTGLIIFILMGLSVFMTSVLKFIPMPVLYGVFLYMGVSSLKGIQFFDRIKLFGMPAKHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKASSAAVVFPMMVLALVFVRKLMDLCFTKRELSWLDDLMPESKK	417804	349956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_350054_353248_353423_354823_354893_358381_358634_358811_358974_360920_361035_362372_362535_364926_365033_367342_367589_368599_368734_372219_372395_374589_374697_378299_378447_380857_380946_383130_383289_385189_385306_395504_395694_398137_398299_398863_399003_399607_399755_406292_406375_417728
894919	contig_12479_pilon	+	3345	2	Intergenic	novelGene_56844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGTTTATCCATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169301	172992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_169682_170027
894920	contig_3095_pilon	-	2474	2	Intergenic	novelGene_75199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1974	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	393	932	248927	248388	TRUE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIQLISGGAQILIQDLESRNLSPLVPMRVLSPGETGYVVSRLTHCAFFCLLLPSVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	249319	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_247387_247858
894921	contig_8552_pilon	-	3046	7	Intergenic	novelGene_80091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCTCAGGTAAGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521184	511115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_511204_512078_512138_512711_512790_513298_513384_513740_514000_517909_517984_518781
894922	contig_15031_pilon	-	2454	2	Intergenic	novelGene_138422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	407	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1328	1636	152779	152471	FALSE	45	TATTCCAGAACGTAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSRTELQNTFKKKLIKLKREIDNSTIIVGEFNTPLLMMDRTTRKKLSKDTEDLNNTINQFDLIDMYRTYHPTAAQYIFFSNVPGSFSRIDYILDHPQSKPQ	156565	151652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_154005_156463
894923	contig_6048_pilon	+	2951	1	Intergenic	novelGene_73304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAATATAACAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2013158	2016109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2013200_2016100
894924	contig_16098_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_46216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.975685900658	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	348	662	766291	767278	FALSE	30	AGGAATCTTTATTGTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPREPASLPSKLRTQDTR	764896	768120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765158_765551_765638_766290_766559_767231
894925	contig_5686_pilon	-	2867	5	Intergenic	novelGene_45426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACCAAGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201900	187466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189096_198548_198595_199758_199883_200408_201400_201823
894926	contig_7009_pilon	-	3639	6	Intergenic	novelGene_23609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2275	2676	537017	536616	TRUE	10	CCGCCCCCAGGCGCGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	539291	430742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_430938_444940_444995_453480_453601_512646_512815_522865_522987_536310
894927	contig_6005_pilon	-	1598	6	Intergenic	novelGene_158891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	110.738249941021	12	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCTTTTATATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327345	311412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_325326_325554_326558_326883_327174
894928	contig_1452_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_115138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAGGAAAATAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700182	698253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_698300_700200
894929	scaffold_12124_pilon	+	2121	3	Intergenic	novelGene_22151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTAGGCACCTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971615	1092303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_973577_1071617_1071753_1092278
894930	contig_11413_pilon	+	4989	26	Intergenic	novelGene_103188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_24	147.193608556894	1756	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2880	64	2943	526678	653355	FALSE	30	AATTCTCAACACTGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTYTDEKSKASHHIYPYPSSQEDEEWLRPVMRKDKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSSDVDAEIEDPPIPEKSWKVHAKWILDTDVFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAAANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEEEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNPKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTTGGKEDEDPSKGDQSRSVDPGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQDAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPEEPEKLEGAEEEKVEADTDGQQPEKTENKGENEMNDGDKAQDGENEKNSEKEHDSEVSEDIKSEEKEAEENKELTDTCKERESNIGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMVPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQSMSGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPQQQPPPPPTDGVPPLPAPGPPASAAP	508686	655401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_508719_526646_526729_527846_527940_532839_532910_542339_542410_546060_546137_549824_549951_551873_551996_557203_557329_565027_565088_574680_574719_577758_577881_579279_579352_581382_581497_582114_582269_583013_583128_590107_590168_596827_597087_598034_598197_607530_607587_610793_610909_611582_611738_620301_620437_629137_629400_651824_652002_653263
894931	contig_9272_pilon	+	3319	1	Intergenic	novelGene_125897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATATATATTGTGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256343	259662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_256300_259700
894932	contig_7870_pilon	-	1262	7	Intergenic	novelGene_108915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_1	391.252263039249	64	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	240	785	496465	217271	FALSE	85	AGAAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTK	497931	216793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821
894933	contig_6440_pilon	-	3637	13	Intergenic	novelGene_161659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_11	106.62590366948	587	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	160	1662	42364	19626	FALSE	35	TAAAACATTTGCCATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSLSRAVAGGDEQVAMQCAIWLAERRVPLSVQLKPEVAPSQDIRLWVSVEDAQMHTVTIWLTVRPDMTMASLKDMVFLDYGFPPALQRWVIGQRLTRDQETLHSHGVRQDGDSAFLYLLSACNTSLNPQELQRERQLRMLEDLGFKDLTLQPRGPLEPAAPKPGVPQEPGRGQPEAAPEPPLVGWQCPGCTFINKPTRPGCEMCCRARPEAYQVPASYQPDEEERARLASEEEALRQYQQRKQQQQEGNYLQHVQLDQRSLVLNTEPTECPVCYSLLGPGEAVVLRECLHAFCRECLQGTIRNSQEAEVSCPFIDNTYSCSGKLLEREIRALLTPEDYQRFLDLGVSIAENRSALSYHCKTPDCKGWCFFEDDVNEFTCPVCFHVNCLLCKAIHENMNCKEYQDDLAQRAQNDVAARQTTEMLKVMLQQGEAMHCPQCQIVVQKKDGCDWIRCTLCHTEICWVTKGPRWGPGGPGDTSGGCRCRVNGIPCHPSCQNCH	43912	17650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_19707_21064_21209_21594_21694_22690_22871_26344_26457_27658_27820_28973_29148_29277_29400_30489_30689_30801_30896_42227_42373_43419_43511_43852
894934	contig_4402_pilon	-	6243	16	Intergenic	novelGene_140845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	272.876740590977	4	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	910	2733	1431	4163	612442	594890	TRUE	70	GAAGAAGAAAAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLRLFLWPSLQSEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTVEMMLHLLEMNQWMQNPSLLNQCLKKTREKRTSQKQKVTRPNGKMTDLLCPKKKM	613872	592373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_595057_595099_595933_596736_596839_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610330_612401
894935	contig_19032_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_172555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTTTGGATTTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165235	163327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_163300_165200
894936	contig_9724_pilon	+	7433	10	Intergenic	novelGene_172579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	210.873199275867	706	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	10	2061	8746	34106	TRUE	25	CTTTCCAATTAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHSPQVRQQFPAPLGWSGTEAPTQVTVETHPVQETTFHVAPQQNALHHHHGNSSHHHHHHHHHHHHHGQQALGNRTRPRVYNSPTNSSSTQDSMEVGHSHHSMTSLSSSTTSSSTSSSSTGNQGNQAYQNRPVAANTLDFGQNGAMDVNLTVYSNPRQETGIAGHPTYQFSANTGPAHYMTEGHLTMRQGIDREESPMTGVCVQQSPVASS	8736	39614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_+_8833_10521_10711_14397_14546_16315_16603_19172_19320_21133_21275_28374_28682_29138_29264_33485_38333_38468
894937	contig_7078_pilon	-	4952	1	Intergenic	novelGene_130221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	275	828	1088	1915	968635	967808	NA	35	TCAGCTCCAAATACCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFITTLIQHVLEVLARAIGLEKEINGIQIGRVEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIDFSKVSGYKINIQKSVAFLYTNKENLKEEITKSIQFTVAPKKIKYLGINLAREVNDLYNENYKALLQETRRDLHKWKNIPYSWIGRLNIVKMSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	969722	964770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_964800_969700
894938	contig_10627_pilon	+	4725	13	Intergenic	novelGene_59967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	169.539982173986	1542	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	199	1125	224634	234227	TRUE	50	ACCATGAAACATAACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSSDGSLSYTLC	218876	242184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232854_234194_234285_235606_235666_235983_236094_236314_236483_238978
894939	contig_10990_pilon	+	4014	7	Intergenic	novelGene_7470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.689369199359	9	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1756	2289	722379	752144	FALSE	25	TTGACGTCGTAAGTAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDLLLELSEMIDS	709196	753869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_709396_714583_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731406_752096
894940	contig_17144_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_29180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	992	1435	166806	166363	NA	20	ATTCCCAGCCAGTGCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	167797	165959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166000_167800
894941	contig_9668_pilon	+	1895	8	Intergenic	novelGene_58113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	445.339586089958	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	69	710	214129	339368	TRUE	25	TGGAGAATTATGGTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKVSISSMEITSLQELAHCREQILPLRSHQVLPCQAGERWDGILLTKPWNLLNPRQFLMTT	214060	360047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_282642_282811_331983_332173_337928_338032_339303_339445_342688_342756_355580_355714_359138
894942	contig_9133_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_109298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGTTTCCCATATGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246186	232525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_234386_245774
894943	contig_7622_pilon	+	1766	4	Intergenic	novelGene_132406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	111.416136872338	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTTAGCAAATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251980	256684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252974_254222_255063_255135_256374
894944	contig_11708_pilon	-	719	2	Intergenic	novelGene_138948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGAACCTAAACTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344883	202392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_202864_344635
894945	contig_16411_pilon	+	2381	7	Intergenic	novelGene_77274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	362.248265082879	24	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2	514	18707	30988	TRUE	20	TTTATCTGTTGAAGGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKRTLKGSIELSRIKCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKYHPNFWIDGRWRCCAQLEKLAAGCAEYDPTKNASKKPLPPTPEDNRRSLQEPEETLVIALYDYQTNDPQELTLRRNEEYYLLDSSEIHWWRVQDRNG	18705	94240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18812_20432_20515_21951_22081_26146_26188_30832_32481_57335_57683_94212
894947	contig_15327_pilon	-	1659	4	Intergenic	novelGene_70650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	11	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	77	487	901528	900904	FALSE	55	AAAAACCTAAATTGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902104	899731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
894948	contig_6227_pilon	-	5418	14	Intergenic	novelGene_49688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_13	283.472800110287	996	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	699	1721	892604	887861	FALSE	75	AGAATGAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLELKFVLLTVALVAYLVLFNVSPCWQWACCGHGPDNLTETNDTLSSPHPWNDLKTMINFYLVLFYVALVMLSMQTDYYCRLDCLWKKKFKKEHEEFETMESVNRLLLENVLPAHVAAHFIGDKLNEDWYHQSYDCVCVMFASVPDFKVFYTECDINKEGLECLRLLNEIIADFDELLLKPKFSGVEKIKTIGSTYMAAAGLSITSGHENQDLERQHAHIGIMVEFSLALMSKLDGINRHSFNSFRLRVGINHGPVIAGVIGARKPQYDIWGNTVNVASRMESTGELGKIQVTEETCTILQGLGYSCECRGMINVKGKGELRTYFVCTDTAKFQGLGLN	898209	884163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_888008_888158_888284_888902_889018_889350_889456_890103_890251_890889_891046_891437_891526_892464_892659_893767_893861_894651_894779_895268_895354_896256_896355_897772_897852_898047
894949	contig_9335_pilon	-	3427	4	Intergenic	novelGene_147457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	26.0426999794995	584	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	109	1050	758602	642197	FALSE	35	TAAAGAAGGACCAGGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVEAGGIFHRARGRTLDAFSAEKEREWKGPFYFIQGADPQFGLMKAWSVGDCDGGGDEWGQEIRLTEQAVQAINKLNPKPKFFVLCGDLVHAMPGMPWRKEQTEDLQRVLKDVDREIPLVFVSGNHDIGNVPTAESIAEFCQTWGDDYFSFWVGGVLFLVLNSQFFYDASRCPALKQAQDQWLDEQLSIAGERKCQHAIVFQHIPLFLQSLDEEDDYFNLSKSVRQEMADKLTEAGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758710	639819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_671128_671552_737269_737489_758532
894950	contig_5145_pilon	-	1285	4	Intergenic	novelGene_131435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	135.413769199771	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCCGTCCTGCCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	920443	915556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_920223
894951	contig_12050_pilon	-	3188	17	Intergenic	novelGene_62608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCGTCGGGAACTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356347	321274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_321339_322362_322399_323512_323595_334038_334175_334707_334952_340477_340565_341362_341420_342202_342254_342344_342421_345187_345286_348909_349021_349697_349797_350554_350719_350994_351178_351507_351631_354629_354827_354967
894953	contig_11564_pilon	+	1947	2	Intergenic	novelGene_158562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGTATGCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57052	59328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58706_59034
894954	contig_15049_pilon	+	4969	6	Intergenic	novelGene_160722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2476	2775	266820	267119	TRUE	65	AAAAAAAAAAAAGTAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLSRLEGMSLLATRTSGSIWPKELLLTGRFPPRDELTELTSIVKIPEFTNAMSDATVELLLSPDALEKRDTRSILLSSLCPELVSSLLGVRELAASS	227024	272149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_+_228769_230120_230220_232552_232720_264487_264573_266439_267128_269963
894955	contig_9609_pilon	-	292	4	Intergenic	novelGene_23024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322679	320952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321038_321844_321907_322283_322351_322601
894956	contig_18272_pilon	+	7191	4	Intergenic	novelGene_7063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1262	junction_1	2771.32848207418	664	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	6181	6801	514336	538332	FALSE	30	TGAGGCTGTTGAAAGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMGRTSRGKLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHTMLDVKPDADE	508155	538722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_514361_518778_519040_537077_537197_538116
894957	contig_6361_pilon	-	3547	22	Intergenic	novelGene_23870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_13	270.843412685284	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1034	3105	32	3136	105450	55091	FALSE	20	ATCCTACTTTACGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVRIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	105481	54679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73524_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426
894958	contig_3018_pilon	-	1451	2	Intergenic	novelGene_78925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632246	630677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_631449_631566
894959	contig_16098_pilon	-	1700	10	Intergenic	novelGene_45973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1659.13632150385	18	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	555	1226	350530	349201	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVLQAARAEV	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349369_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350643_350761_350889_352152_352352_353990
894960	contig_16328_pilon	+	5003	8	Intergenic	novelGene_178158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	654	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCGAGGCCACGCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76535	133001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16328_pilon_+_80644_81923_81991_86806_86906_97982_98029_100662_100792_102405_102450_110516_110637_132611
894961	contig_6199_pilon	-	3360	1	Intergenic	novelGene_126332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	615	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAACCTTTGTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66973	63613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_63600_67000
894962	contig_20527_pilon	+	2038	6	Intergenic	novelGene_138565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	1149.23477148927	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	423	530	13271	13378	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSGRPRPPLIPRTLSPPVSPLSSWTGGGAIFNKAKNAKEEGALSDTYPASDFIRVECLENESYILCLVDSGRRVNLVLVILSWQERTTSTSGRNFAFYNSKGCVSVADILLTTHSTLYRIIAFILEGIFFQGQLLCPLSMAEAQEIFTVLIDFYKPLISKVVVVRPRPHCAHSQ	12848	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36519
894963	contig_1244_pilon	+	2786	25	Intergenic	novelGene_37910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_24	132.413388883283	394	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	863	2592	91	2682	260557	294829	FALSE	25	GAAGAAAGCTGGTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPGFPDADSFVKFALGSVVAVTKASGGLPQSGDEYDFYRSFAGFQAFCETQGDRLLQCMSQVMQYHGCRSNIKDRSKVTELEDKFDLLVDTNDVILERVGILLDEASGVNKNQQPVLPAGLQVPKTIVSSWNRKAGEYSKKTKSETFRLLHAKNIIRPQLKFREKIDNSNTPFLPKIFIKPNAQKPLPQALSKERRERPQDRPEDLDVPPALADFIHQQRTQQVEQDMFAHPYQYELDYFTPPDSVLQKPQPQLYRPVEETPCHFISSLDELVELNEKLLNCKEFAVDLEHHSYRSFLGLTCLMQISTRTEDFIVDTLELRSDMYILNESFTDPAIVKVFHGADSDIEWLQKDFGLYVVNMFDTHQAARLLNLGRHSLDHLLKHYCSVESNKQYQLADWRIRPLPEEMLHYARDDTHYLLYIYDKTRLELWERGNGQPVQLQVVWQRSRDICLKKFIKPIFTDESYLELYRKQKKHLNTQQLTAFQLLFAWRDKTARREDESYGYVLPNHMMLKIAEELPKEPQGIIACCNPVPPLVRQQINEMHLLIQQAREMPLLKSEVAAGVKKSGPLPNPERLENVLFGPHDCSHAPPDGYPIIPTSGPVPVQNQASLFPDQKEEEASLDTKCLIATAVITLFNEPSAEENGKWPLTVAQKKAQSIMESFENPFRMYLPSLEHRAHISQAAKLDPSSKIYEISNRWKLASQVQVQKESKETAKKKAAEQTAAREQAKEEYKATAEQAMSVRQQATLENAAKKRERTISDPRTTDQKQGKKRLKISKKPKDPDPAEKEFTPYDYSRSDFKAFAGNSKSKPSQFDPNKQTQSGKKCIAAKKLKQPTGNKSMSFPTGKSDRGFRHNWPKR	260466	294933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_260599_262586_262724_266552_266677_273675_273781_274112_274279_274467_274583_278843_278920_279131_279243_279450_279595_280417_280609_281618_281776_281917_282067_282243_282295_282949_283062_284465_284517_284679_284759_284858_284969_287074_287171_287422_287498_289999_290088_291705_291780_292446_292619_293412_293472_294003_294081_294798
894964	contig_7408_pilon	-	2425	7	Intergenic	novelGene_168725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_6	182.591909885284	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	496	1575	38514	12597	FALSE	25	GTTCTGAGTGTACTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48106	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47827
894965	contig_4496_pilon	+	2422	6	Intergenic	novelGene_66670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	173.891230371172	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	326	2152	951076	998163	FALSE	80	TTAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVSTAMLPLERTITYRDMSSFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859291	998433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_941359_941486_951023_951148_952491_952529_996162_996282_996564
894966	contig_13074_pilon	-	5490	24	Intergenic	novelGene_153439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	342.648916200178	1204	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	123	2501	715589	534451	FALSE	5	TCTCTGTTCTGCTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAQLSLTQLSSGNPVYEKYYRQVDTGNTGRVLASDAAAFLKKSGLPDLILGKIWDLADTDGKGILNKQEFFVALRLVACAQNGLDVSLSSLNLAVPPPRFHDTGSPLLISGTSAAELPWAVRSEDKAKYDAIFDSLSPVNGFLSGGKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVPMSLPPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSALLAHIWALCDTKDCGKLSNDQFALAFHLINQKLIKGIDPPQILTPEMIPPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNAEQDLKEKEDTVKQKTSEVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQRISSLKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAHLGPLQQHLQDSQQEISSMQMKLMEMKELENHNHQLNWCSSPHSILVNGAVDYCSLSTSSSETANLNEQAEGQSNLEAEPIHQESPARSSPEIPPTGMTYEKEVVTAAVNGKACPEFNSDKHSKEEDPFNVESSSLTDPVADTNLDFFQSDPFVGSDPFKDDPFGKIDPFGGDPFKGSDPFASDCFFKQSSADPFATSSTDPFSAASSNSNTSVETLKHNDPFAPGGTIVVAASDSATDPFASVFGNESFGDGFADFSTLSEVNNEDPFSSATLSSASNMVTTKNVFEETSFKSEDVPPALPPKIGTPTRPCPPPPVSL	715711	531461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_534462_539574_539738_541042_541120_556624_556695_560585_560723_563081_563118_564214_564306_564557_564675_566189_566394_572615_572814_583611_583774_596954_597028_623120_623207_627541_627699_629321_629468_630387_630478_661301_661362_664969_665096_666202_666269_667204_667301_669883_669932_670716_670807_679256_679299_715556
894967	contig_4742_pilon	+	2775	5	Intergenic	novelGene_130978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	376.260880241356	127	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	813	2439	335	2773	201400	254545	FALSE	65	TGAAAAAAACAAATATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVDTFNHLIPTEHLDDALFLGSNLENEVCEDFSTSQNVLEDSLKNMLSDKDPMLGSASNQFCLPVLDSNDPNFQMPCSTVVGLDDIMDEGVVKESGNDTIDEEELILPNRNLRDKVEDNSVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRSNSSPLSSTKKTSGKTVSAPKAGVRQPEKCQIKEEVCASLKPEYHTESRRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWTPSKQCGFCKKPHGNRFMVGCGRCDDWFHGDCVGLSLSQAQQMGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGLLKHTPT	190883	254547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_201374_201644_242103_242266_246984_248768_254295
894968	contig_1406_pilon	-	3164	3	Intergenic	novelGene_25442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	14.5	771	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	584906	484814	FALSE	30	AATTATATTTAGTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKVPVVVSYRPAKGVLQPDTLSIASHASLPNIWTAWQAITPLLEELNVLLQEWPGLLYTVHILCSKCLKRGSPNPHAFPGELLSQPRPEGVAEIICPKNGSERVNVALVYPPTPTVISPCSKKNVGEKHRNQ	584908	482050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484848_498646_498774_584668
894969	contig_11279_pilon	-	3612	2	Intergenic	novelGene_136526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACATGAAGTAAGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32132	26645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11279_pilon_-_26848_28722
894970	contig_14553_pilon	-	3822	1	Intergenic	novelGene_125007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAAGGTATTTTTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19957	16135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_16100_20000
894971	contig_19604_pilon	+	2658	2	Intergenic	novelGene_77254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1267	1647	275061	275441	FALSE	45	GACACAACCAAATCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFAGASLQTVATKASPAPEHTGSRMPRNVHTFPHTHRSRYTHVFLGTAPRNGCVKKARCRGGQTISLDKDGLLLFSFMLSEWGHLCVCFPYSLKPDFGKEPMCQHLHLQSRGEQPKVIQVSADS	273501	276452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273579_273871
894972	contig_17066_pilon	+	4028	1	Intergenic	novelGene_130959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	216	767	317030	317581	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYTKPTTNILLNGQSLKAFTLRTGTRQGCHLSRLLFNIALEVLARAVKQEKEIKGIQIDREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRRLLELIEDFSRVSGYKINIQKPVGFLYTNKENFEKEITKSIPFTTAPNKIKYWGIKLTRDVKDLYEENYKTLLQETKRDLHKWKNIPRSWIGRLNIVKMSILPKVIYRYNEIPIQIPTAFVNEMEKQITNFIWKGKRLWISKALLKKNKVGSLIIPDFRTYYTATVAKTV	316814	320842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_316800_320800
894973	contig_9471_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_21727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCTGTGTTTGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167007	165434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_165400_167000
894974	contig_10437_pilon	-	2396	10	Intergenic	novelGene_38190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1041	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	937	1302	232615	231948	TRUE	0	CTCCGCCCCTCCTCTGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGQGPALCSSPSCSLLALGAFRFFAVTAFIFYQLSSYELVGHAQNEVGPEDMQQLQHSHHGVEEVIAKEGRIELQGVHHCAVQDPEGQDDEPSDDEDNGEGDEDVVAGVLPSRVVEHLG	233551	225098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_225261_229662_229839_230247_230367_230560_230681_230900_230962_231067_231116_231342_231749_231945_232052_232160_232316_232508
894975	contig_13592_pilon	+	3773	7	Intergenic	novelGene_33694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	207.015834069657	674	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	556	1224	256608	259906	FALSE	35	CTAACTCCTAACAGTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVSF	249262	262455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768
894976	contig_6241_pilon	-	3616	2	Intergenic	novelGene_156399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	0	493	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	650	1066	189992	182242	FALSE	30	GCAATTTGAATACCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	190641	179691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818
894977	contig_5145_pilon	+	3083	5	Intergenic	novelGene_131455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGTAAACTACTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948694	956128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_949118_949309_949819_951090_953012_955790_955929_956036
894978	contig_7428_pilon	+	3608	6	Intergenic	novelGene_77709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	25.491959516679	831	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	33	347	322115	322832	TRUE	45	CCAAAAGGCATCAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQQQQQQQQQLRNLRDFLLVYNRMTELCFQRCVPSLHHRALDAEEEACLHSCAGKLIHSNHRLMATYVQLMPALVQRRIADYEAASAVPGVAAEQPGASPSGS	322082	350122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_322157_322350_322447_322655_325759_326588_326733_338091_338264_350103
894979	contig_8312_pilon	-	1475	2	Intergenic	novelGene_152893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGTTAAAAACACGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280274	274799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_275159_279158
894980	contig_13952_pilon	+	3936	1	Intergenic	novelGene_133274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	910	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	26	394	214233	214601	NA	35	GGAGAAATTGGAACCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNVKYTMDFQKNEQICLGRSTARILLKASMARLHLMYFGYVIWRDQSPEKDIMLGKVEGQQKRGKPTMRWIDTVAATMGSNIAMIVRMEQDRAVFRSVVYRVAMNCVPQKMCSNLARS	214207	218143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_214200_218100
894981	contig_1154_pilon	-	4436	17	Intergenic	novelGene_87053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_16	204.397284717777	884	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	117	2534	241558	106481	FALSE	25	GCATGGGTCTTATGAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPSRSPAPAPPPRAGTPPGPRTSHAASRGCELRPRGMAASGVLGGCDILIIYSPDAKEWCKYLQDLFLSSRQVRTQKILTHRLGPGASFSAEDVSLFLRTRCIMVLLSAELVQHFYQPAMLPLLQRAFHPPHRVVRLLCGVQDSEEFLNFFPDWAHWQELTCDDEPEIYLAAVTKALSEDSGCDSVTDTETEDEKALPYSKQQHLPLENSPGNLMVVQPDRIRCGAETMVYIIVKCKLDERVTTEAEFSPENSPSRRVEAKLENEYTISVKAPNLSPGNVSLKVYSGDLVVCETTISYYTDMEEIGNLLSSAANPVEFMCQAFKIVPYSTETLDKLLTESLKNNIPANGLHLFGINQLEEENMMTNQRDEELPTLLHFSAKYGLKNLTALLLTCPGALQAYSVANKYGHYPNTIAEKHGFRDLRQFIDEYVETVDMLKSHIKEELMQGEEADAVYESMAYLSTDLLMKCSLNPGCDEELYESMAAFAPDASEDLYVEMLQASTSNPISGDSFSRTTKDSMIRKFLEGNSVGMANSERKLHRLSREEDVYHIVDDDDTLSVDMASRPPVPVPRPEASPPGAHQLPDNEPYISKVFAEKSQERPGNIYVSSESIRKEPPVRPWRDRPQSSVYDPFAGMKTPGQRQLITLQEQVKLGIVNVEEAVLHFKEWQLNQKKRSESFRFQQENLKRLRDSITRRQREKQKSGKQTDLEITVPIRHSQHLPGKVEYAVYESGPRKSVFPPRTELRRGDWKTDSTSSTASSASNRSSTRSLLSVSSGMEGDNEDNEVPEVTRSRSPGPHQVDGTPTVPLERPPRVPPRAASQRPPTRETFHPPPPVPPRGR	241674	104578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_106539_118505_118625_119813_119885_124948_125105_133770_133844_137278_137485_140501_140568_141386_141585_143945_144042_161832_162023_164788_164986_166867_167001_167130_167274_169518_169664_172218_172356_231046_231464_241545
894982	contig_7165_pilon	-	4495	5	Intergenic	novelGene_116836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	83.8491949871911	402	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1936	2460	269072	263150	FALSE	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMYNFPQSPPAQYSSMHNMGLLPMHPLQIPAPSWPIHGPVMHSAPGTAPSNIGLNDPSIIFAQPAARPVAIPSSSHDGHWPRTVPPNSLVNNGAVGNSEPGFPGLNPPIPWEHAPRPHFPLVPASWPYGLHQNFMHQGSARFQPNKPFYTQDRCAIRRCRERCPHPPRGNVSE	279312	261114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_263218_264752_264912_268774_269223_276517_276619_277628
894983	contig_5125_pilon	+	1851	8	Intergenic	novelGene_43440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1542.87632263211	8	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	286	1128	35654	59263	FALSE	20	TTAATGTTTGTATCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVIFLFFCLLLH	26259	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_58567_59227
894984	contig_1786_pilon	-	4007	22	Intergenic	novelGene_142588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_17	274.319128255731	701	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2718	94	2811	79935	41015	FALSE	50	ATTACCACAGAAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSRRVSRLVGLSGPESAVASEGPWTWTDGAMPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTAMALRNKSFGSAQEFAWAHDSSEYAIRESNSVVKIFKNFKEKKSFKPDFGAESIYGGFLLGVRSVNGLAFYDWDNTELIRRIEIQPKHIFWSDSGELVCIATEESFFILKYLSEKVLAAQETHEGVTEDGIEDAFEVLGEIQEIVKTGLWVGDCFIYTSSVNRLNYYVGGEIVTIAHLDRTMYLLGYIPKDNRLYLGDKELNIVSYSLLVSVLEYQTAVMRRDFSMADKVLPTIPKEQRTRVAHFLEKQGFKQQALTVSTDPEHRFELALQLGELKIAYQLAVEAESEQKWKQLAELAISKCQFGLAQECLHHAQDYGGLLLLATASGNASMVNKLAEGAERDGKNNVAFMSYFLQGKLDACLELLIRTGRLPEAAFLARTYLPSQVSRVVKLWRENLSVVSQKAAESLADPTEYENLFPGLKEAFVVEEWVKETHADLWPAKQYPLITPNEERNVMEEAKGFQPSRAAAQQELDGKPVSPTSVIMASHTTSKEKSLLELEVDLDNLELEDIDTTDINLDEDILDD	80028	39818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_41111_41550_41620_41783_41853_42041_42223_42309_42403_43584_43800_44712_44824_48995_49204_49487_49619_50251_50396_52199_52307_52383_52473_54358_54470_55558_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_68182_68321_79932
894985	contig_960_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_108300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAATTTAAAAAAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041061	1038952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1039000_1041100
894986	contig_10159_pilon	+	2310	9	Intergenic	novelGene_30879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	113.403042287233	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	826	1860	978504	996016	FALSE	80	ACAAACAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	974766	996466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874
894987	contig_10722_pilon	-	3598	11	Intergenic	novelGene_70976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	254.812872516284	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2190	2732	6730	5640	TRUE	30	TTTTTTAAACTGCTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGCVYTAGLRSLGCLVSNLRYLIKMVCFWAV	17382	3726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5843_6185_6328_6423_6529_6637_8262_8496_8562_9665_9787_14372_14446_16247_16358_16853_16929_17168
894988	contig_11629_pilon	+	4295	6	Intergenic	novelGene_161192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	182.941083412119	424	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	51	725	165444	423629	FALSE	20	TGGGTATATGCTGATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYR	165393	427199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420443_423627
894989	contig_11088_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_85060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	792	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCATCTCCCCTCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17939	15161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_15200_17900
894990	contig_10722_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_70987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	284	855	1311	2165	31560	32414	NA	45	ACCCTGTCAAAGGCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKKTVKEAVIKFKCGKSQIYSIMKEKDKIIEKYMSSTNVNIKKGRDGNYAEINKSVFEWFLQASAKNVPISGPILQAKAKEMAKLLKVDGFSASNGWLQSFKKKHGITCNVRKCFKNCDFLFGSGDSIQNETVTEPDNIMQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30249	32597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_30200_32600
894992	contig_854_pilon	-	5894	3	Intergenic	novelGene_36189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	308	junction_2	173.5	609	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	165	551	497521	497135	TRUE	30	TCATAAGCCCAGCTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGPAAAEVTHHCQAIPSSSWVSGQLEHWLQNGPVPPRSSGTEQWGDGGATADQMAPEAASGGHPGTGTCTRSHSHTHAHIYTHAHTHIRADTLSDHTGSEAFIHTQPPPHSLLAQPRACGSVLPPRNGKNNTIVEVPGDSPLLGSAVGSRAPEQARRARRGKGGAPIKVLCTYLAFTHFIT	509297	490217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_491556_493129_497571_509182
894993	contig_5479_pilon	+	3250	11	Intergenic	novelGene_133605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.217163128378	3	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	205	975	344638	415751	TRUE	25	GTGACTTGCCCAAGATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDCEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGADDQTPGQTSGLRTRRRA	319736	448852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_319761_334191_334282_344547_344695_375219_375394_395880_395973_398958_399022_403751_403891_409404_409486_409800_409909_415694_415837_446662
894994	contig_1275_pilon	+	2662	19	Intergenic	novelGene_108753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	184	405	400596	400817	TRUE	45	TCAAGTCCAACTAACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNQILIPRLSLLSGSLQVSFFGVTFNFSCTVSQHPHFSIYRVGFGSCWEIENRIHFSIVLLMIHVHWLCCFNTDVICLGFHTFIFSMFCTWACWGGRCTLCGFRVGLELSHRFRVSSRSTVFSAIFTGLDSFNW	400412	513768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448522_456870_456973_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409_464583_468120_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486075_495660_495854_505867_506006_513629
894995	scaffold_13553_pilon	+	6743	2	Intergenic	novelGene_73746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3501	3839	15688	16026	FALSE	20	GGGTAGCTGGGAGAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKQHPGRQVCPRNRGQLVQTRAANVKRDTARHKCRNSDSKSGERQREFLGGQCKSQGNGQAAGWENNQPREEKPMAGRPFSKRKTGTDESPNYSDPVENYIKKLLEDGKN	12141	18930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_12215_12260
894996	contig_12113_pilon	-	2862	1	Intergenic	novelGene_134730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211274	208412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_-_208400_211300
894997	contig_6509_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_145616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	496	1101	69757	70362	NA	0	GGGCTCTTTCCCCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLSFLSLSCMSTPGGFFVGSSRLFLRMSSANLVLSLSFGSPDLCLIFSICFILSLCLLWRSSISRSFWESILSKLVIIRSPSTSNFSRGRWSFLLESLDGGSFSFPLLIFAKSPFSWLSLNFSFSLTSPSLRVSSLDLSLKLEFGGLSLSLAPGFGSSLWCLRKPSGCFSRCFSFSSLHFSLCFSLFFFSFRMLMALDP	69261	71222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_69300_71200
894998	contig_6552_pilon	-	7376	18	Intergenic	novelGene_163593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.844265284214	777	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	51	1946	201623	118556	TRUE	25	AGCGCAGATTTAAGCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIGIFNGRRRSDQKTEMNLNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDISKIKCVEIVKNDDCVIPCQNKYPFQVVHDSNTLYIFAPSVQSRDRWVKKLKEEIKNNNNIMIKYHPKFWADGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNIFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPPEEEDNSEEVVVAMYDFQATEPHDLRLDRGQEYIILEKNDVHWWRARDKYGREGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGMYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIVEYHKHNAAGLATRLRYPVSVKVKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKTIREGAMCEEDFIEEAKLMMKLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVAEFMERGCLLNFLRQRQGHFNRDVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVNEAGIVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKNTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASKYIYEVMLRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEESFGR	201673	105321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_109851_117654_118640_120607_120766_120845_120965_123920_123986_129130_129348_129465_129638_130619_130695_131249_131384_132497_132578_136022_136078_140430_140497_147956_148133_149263_149305_151491_151621_152321_152404_157736_157842_201485
894999	contig_14704_pilon	-	4045	1	Intergenic	novelGene_82697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1578	1877	78565	78266	NA	25	CCTGACCTCAGAGGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITWENLCVGEGGQTGSCTCVLPLFMDFFIRTCSCFIFFMFIVVTLITNFYFGGRRQYKINTTNIAVKNYINIDFDFTTSKGHPLKSSNSSRNPVSVYF	80142	76097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_76100_80100
895000	contig_10982_pilon	-	3600	5	Intergenic	novelGene_87873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	2419	3249	131555	130725	FALSE	35	GTAATTCAGCACAGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENIEKKLEEFRKIMKTQNAKINSQLEIIQKQLEIQKINNKISEMDSVIEGLKSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTEDFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRIGLKRKSPKYIIITLVKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETVRLSSDYSAETMQARRQWNDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLLFKYDGEIRTFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGALRSENKELQLTG	281635	130373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_132276_247885_248019_279009_279891_280357_280677_281270
895001	contig_11896_pilon	-	4243	1	Intergenic	novelGene_88044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACTGTTCTACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181721	177478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_177500_181700
895002	scaffold_880_pilon	+	4234	3	Intergenic	novelGene_121517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573792	579535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_574767_575108_577823_578989
895003	contig_7457_pilon	-	1496	9	Intergenic	novelGene_31277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	96.4409631588154	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	471	1340	148852	146617	FALSE	15	GCATGATGTTCTTCCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQDRQITLHTLLEEQDRLKKRLEELQKLRKDPKNPSQDKLQVPFPMPEIPLVFRGRTQQGEEAPKCLLSNLRICYPLPGGSALVTFDDPKVAEQVLQKKEHKIDVAEECRLRVQVRPLELPMVTTIQVSSQISDRRVLVSGFPAGLKLSEEQLLDKLEIFFGKDSNGGGDVEIRELLQGGAMLGFTRDGVAQRLCQIGQFKVPLGGQQFLLRVSPYLSGEIQKAETCFQPAPCSVVVFNIPDILDGPELHDVLEIHFQKPTRGGGEVEALTVVPPGQRGLAVFTSASG	156100	146460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_146809_147049_147157_147268_147456_147556_147667_147747_147902_148240_148340_148831_148885_152072_152337_155926
895004	contig_14635_pilon	+	4248	12	Intergenic	novelGene_84365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2841	3335	595447	597691	TRUE	75	CTAGAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLLVFNKATDAAEILLLFTVCPGFLEVHSSLSLSCKFSSLGWKHCSRHDLILLNISERDSLFSQCLLEALVREKLQEKSTVWEELEKPFSISGSICFRTGSCSVDIRSIITYRPPLPIRLLANPIHLLGTVSVVRQCLYLNLSKSANSEFSNEWLVWSKRGA	580202	629546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_582407_583390_583724_584689_584850_586286_586428_595444_595785_595889_596040_597684_597771_603221_603420_605474_605606_606337_606487_612736_612944_629397
895005	contig_10500_pilon	+	1860	7	Intergenic	novelGene_41285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACCAGGCATACGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628557	1640089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637066_1639870
895006	contig_3602_pilon	+	2677	3	Intergenic	novelGene_60610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	34	1089	902032	913188	TRUE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_913385_913548
895007	contig_8452_pilon	-	1996	5	Intergenic	novelGene_48014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	269.37555104352	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	337	747	380757	316088	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	433853	314838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_416565_416690_433707
895008	contig_8650_pilon	-	3985	1	Intergenic	novelGene_162632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	624	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAATTGGTCTCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323075	319090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_319100_323100
895009	contig_5744_pilon	-	2370	4	Intergenic	novelGene_149340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_3	107.724958420352	481	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	447	1061	655451	642056	FALSE	50	CAAATAAAACAATTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVQVNNVVVLDNPSPFYNPFQFEITFECIEDLSEDLEWKIIYVGSAESEEYDQVLDSVLVGPVPAGRHMFVFQADAPNPGLIPDADAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYTETELRENPPVKPDFSKLQRNILASNPRVTRFHINWEDNTEKLEDAESSNPNLQSLLSTDALPSASKGWSTSENSLNVMLESHMDCM	655897	640746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642269_644567_644745_648797_648914_655342
895010	contig_12080_pilon	-	4550	1	Intergenic	novelGene_128342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	955	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTACCGCCTACAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49687	45137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45100_49700
895011	contig_12257_pilon	+	2485	2	Intergenic	novelGene_152098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	695	1003	117223	117531	TRUE	0	TTCCGGCGTCTCCTCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSNLDKQQSPLTKAIHVSQICRACCVGFRVEWTRGCEQAGGFSGTLRHFLCIQWQVVPPALSRADDPTHPGSLFRQLVNEEEDTSTPSLFKLGWLSSMTK	116528	148484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_118821_148291
895012	contig_8581_pilon	-	2778	14	Intergenic	novelGene_22812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	531.403144303031	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	9	2024	339602	307094	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	339610	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309026_309103_309147_312483_312616_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553
895013	contig_13037_pilon	-	2293	2	Intergenic	novelGene_155148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	443	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	757	1170	48553	48140	TRUE	15	GAGCCGCACGCGGCAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTPEGVGGTCGGPCGRYPARSFIRVTPASPQGLRHAWEAPHWGPDPFSLFSIFAVNSLYLIGYRFYVKKQKSMSLPEKLSGVISQGLGRPLVRPHRHLQDGHYLLVSPALWSSRAAQPPARNSRLSLSFRDLKSV	49309	46814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_47643_47844
895014	contig_16322_pilon	-	1905	5	Intergenic	novelGene_87511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_4	399.9789838229	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	798	1169	36469	32956	TRUE	55	ATAAGTTAAATAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFFFFFFDRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57634	31708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_37098_57465
895015	contig_5062_pilon	+	1666	9	Intergenic	novelGene_157857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_7	104.25382187239	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	870	1604	739675	744018	FALSE	65	AAAAGGAAAGAGAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	706254	744080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
895016	contig_5947_pilon	+	3181	24	Intergenic	novelGene_101543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	793	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCGGCGGCGATGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559342	601460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_559874_560648_560882_561839_561988_563237_563318_564662_564750_564851_564953_565374_565432_567162_567269_569246_569349_570702_570836_574330_574397_575558_575644_576110_576314_576729_576796_577854_577985_578099_578267_580780_580874_582248_582357_583917_584014_584450_584595_584681_584782_586372_586520_589103_589196_601354
895017	contig_6325_pilon	-	2725	1	Intergenic	novelGene_143359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAAAATTAAAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395748	393023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_393000_395700
895018	contig_7009_pilon	-	6043	13	Intergenic	novelGene_23631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1488	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAGTTCAGAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658008	434944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_435243_444939_444992_453478_453601_506371_506631_512644_512815_517990_518116_522864_525593_526288_526456_526498_526830_527253_527955_541584_541591_618055_618207_657075
895019	contig_3862_pilon	+	1209	8	Intergenic	novelGene_137399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.754973754789	126	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	575	1105	436118	448739	FALSE	15	TTTCAATTTTACTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYKTFVTYTVYVSMIALERPDLREKVIKGAEILEVLHSLPAVRQYLFSLYECRYSVFFQSLAVVEQEMKKDWLFAPHYRYYVREMRIHAYSQLLESYRSLTLGYMAEAFGVGVEFIDQELSRFIAAGRLHCKIDKVNEIVETNRPDSKNWQYQETIKKGDLLLNRVQKLSRVINM	429644	448843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_429813_431396_431530_435592_435724_435975_436196_436301_436411_442094_442264_448428_448507_448642
895020	contig_10749_pilon	-	1488	14	Intergenic	novelGene_133454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_13	1190.3330845066	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	159	1154	155250	136250	FALSE	65	CAAAAAAATTAAAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	160027	135915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_159942
895021	contig_6583_pilon	-	4160	7	Intergenic	novelGene_174582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_3	58.6420402858639	1105	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	254	1747	31453	2580	FALSE	5	GTTTTTATTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATAASFHTKDSANRKPLTKSQTCLTSLNSLDVTSSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVDHSLLGSEEPVEMHLGFIDDLPQESVSQEDTGLSMASDASLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSPMAPSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVMGLREVTKHMKLNKIRCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALGRCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKVPHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLETSENEREVSCKHSTSEKPSRFPCDTTPVGKQASLVTAGSTTSATNPGNSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTETGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEDDEDEEEEEDYTHEPISVEVQLNSRIESWVSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNAEQSGEEETEVPEPLEPGMDGEAWTADQQASREQQKPSNCGSLNKEHADSNYTPQNM	32516	166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_3263_10844_11065_26732_26888_27853_28075_29944_30108_31401_31535_32344
895022	contig_17144_pilon	-	3534	11	Intergenic	novelGene_29138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_4	205.530630320641	265	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	80	1387	71310	49700	FALSE	25	CTTCCTGCATGTCAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRASDRGAGETSARAKALGSGISGSNAKRAGPFILGPRLGNSPVPSIVQCLARKDGTDDFYQLKILTLEERGDQGIESQEERQGKMLLHTEYSLLSLLHTQDGVVHHHGLFQDRTCEVVEDTESSRMVKKMKKRICLVLDCLCAHDFSDKTADLINLQHYVIKEKRLSERETVVIFYDVVRVVEALHQKNIVHRDLKLGNMVLNKRTHRITITNFCLGKHLVSEGDLLKDQRGSPAYISPDVLSGRPYRGKPSDMWALGVVLFTMLYGQFPFYDSIPQELFRKIKAAEYTIPEDGRVSENTVCLIRKLLVLDPQQRLAATDVLEALSAIIASWQSLSSLSGPLQVVPDIDDQMSNADSSQEAKVTEECSQYEFESYMRQQLLLAEEKSSIHEARSWVPKRQFGGVPPVRRLGHDAQPMNPLDAAILAQRYLRK	96303	47552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_49919_51339_51425_51883_52004_52154_52300_56358_56475_64975_65029_66359_66588_68846_68991_69365_69452_71198_71319_96232
895023	contig_9235_pilon	+	2824	3	Intergenic	novelGene_156204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	355	1503	45805	46953	TRUE	30	AGATCCCTTTGTGAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43846	48320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_47133_47178
895024	contig_7165_pilon	-	1425	8	Intergenic	novelGene_116914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	41.6025901862382	600	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	203	595	1231420	1227502	FALSE	25	CTCTGCATACAAACCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCGNCGEISEKWQYIRLMDNVALKGGRGSASMVQKCKLCSRENSIEILSSTIKSYNAEDSEKFKTIVEFECRGLEPVDFQPQAGFAAEGVESGTVFSDINLQEKDWTDYDEKAQESVGIYEVTHQFVKC	1233058	1226671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1227580_1228037_1228104_1228838_1228917_1230701_1230734_1230938_1231021_1231363_1231421_1232630_1232770_1232995
895025	contig_19096_pilon	-	2569	2	Intergenic	novelGene_173097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	248	junction_1	0	1042	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	2157	2567	12826	12416	FALSE	0	TTTGTGTGTGTGTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRHLPSRSTLPPSIPCIVPQKTGLGGPELQKVSGWVWSMECAGRRLEEGRRVKRGYFFLYLPPFEAMGWLYPSNEGSYSFLQVFGNLSPLCLSQAWRMLTALHIATPTVHHHPCCFTPKCLHFCNKHFNKLTSFL	15992	12413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_14884_15893
895026	contig_4103_pilon	-	3018	11	Intergenic	novelGene_51990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_9	215.94270073332	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	404	1813	239007	221523	TRUE	80	AAAAGAAAAGAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQNLLPPFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKDTVSLHQQCAHKEVCPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFTDNDVVDESPPLAKQIDFVPVQPLPSPQCNFSSDIGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHGQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRYYLVIHFIIDD	239410	203536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_229274_230028_238934
895027	contig_5286_pilon	+	3824	1	Intergenic	novelGene_157339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAACTGTCTAATCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506479	510303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_506500_510300
895028	contig_4924_pilon	-	1489	6	Intergenic	novelGene_84682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	566.068335097451	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	18	803	146061	65524	FALSE	70	GATTAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	146078	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_145994
895029	contig_8210_pilon	+	7291	1	Intergenic	novelGene_30246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	173	499	44427	44753	NA	35	TGAAAACTACTTCCGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIEDQSLQYGLYLNIKKTKVLTTRPISNIMINRENTEVVKDFTLLGSIINTHASSSQEIKRHIAWSKSAAKGFFKVLKSKDVTLRTKICLSQAWYFQSPHRHAKAGQ	44254	51545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_44300_51500
895030	contig_7993_pilon	+	1734	3	Intergenic	novelGene_170956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	143	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	35	649	16712	33022	FALSE	65	GAAGTGAAAGAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKERKGPPIQFRMMTGRMRGQAFITFPNKEIAWQALHLVNGYKLRGKILVIEFGKNKTQLSDLQADSLISCATDNTAEISGS	16677	34107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_17084_31156_31233_32855
895032	contig_854_pilon	+	6103	2	Intergenic	novelGene_36541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1618411	1624691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1622986_1623162
895033	contig_8801_pilon	+	2547	2	Intergenic	novelGene_66267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	243	656	394653	395066	TRUE	50	AGACGTAAATTTATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQGVWESRFTELPGGNRAPSNQRYMLSHSPPFFPLFSLRRFTVVDQQFPGGPIHCFPLGQSKASQRANLLLTSRLISCLPVGRDRGTGGSSSVPRGFTLSTLADSFSAISLLLVLLFFGLFGFLPCLSPPLPPFS	394410	397536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_396679_397257
895035	contig_19032_pilon	-	2109	3	Intergenic	novelGene_172556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_2	797.5	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	94	876	166429	164669	FALSE	65	CCAGTCAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVEPGNGSLDLGGDSAGRSGAGLEQEAATAGDEEEEEEEEEEEGIAALDGDQMELGEENGAAGAADSGPMEEEEAASEDENGDDQGFQEGEDELGDEEEAAGDENGHGEQQPQPPATPQQQPQQQRGAAKEAAGKSSGPTSLFAVTVAPPGSRQGQQQAGGKKKAEGGGGGGRPGAPAAGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTCK	166522	163435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_164751_164837_164950_165840
895036	contig_19185_pilon	-	7151	1	Intergenic	novelGene_163665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	820	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	6205	6585	165957	165577	NA	90	AAAAAAAAAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWDRHTLVLKTRFWSIVMRESKSFYFWKLTCRVRVNTSSSKRLSCNKGGLNSRPKEAEHCELEVGGKEDFPKEEEKKKPGSESLGKSLQRHRCPLFSPRLILLTCLKKTGEIGKVSAREVYPLTM	172161	165010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_165000_172200
895037	contig_16917_pilon	-	3400	5	Intergenic	novelGene_161934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286830	137602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_139662_209170_209420_234820_235169_238313_238750_286522
895038	contig_5083_pilon	+	3869	13	Intergenic	novelGene_151658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	117.044032549958	812	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	432	1811	461780	674122	FALSE	20	TGTGCAGATACAGGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEGEQEEKSSENSSAERDLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPPYPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPTARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPAHIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISPYYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNEHSECFLNPCLSLPPITGEKKSAFATYKVKAAASAHPLQMEAY	461348	676180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_461969_462228_462296_462501_462627_546411_546514_648611_648745_651100_651204_653251_653339_658044_658171_658766_658927_659475_659584_666163_666213_666789_666841_674042
895039	contig_6171_pilon	-	4141	8	Intergenic	novelGene_178667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1963	2268	242882	242577	TRUE	15	GAATCTGTGCTTAGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSKFETVEDRISKTEDKYWDRTLFEENSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNFQVIGFPGEGEKTENTERIIEELLTESFPNVMTDEKLAIQEAQ	607447	232540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6171_pilon_-_233540_236770_237379_242310_243047_350248_350272_450004_450107_465247_466065_466357_467030_607263
895040	contig_14326_pilon	-	2514	8	Intergenic	novelGene_120729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	60.2708173876166	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	601	1380	444202	442066	FALSE	25	AACCTTATGTCAGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	514307	440931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_473560_473730_487113_487194_514085
895041	contig_7919_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_28114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCGTCCCCTTGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410735	1410209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1410200_1410700
895042	contig_7882_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_175009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGGAGTCCCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222274	223967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_+_222300_224000
895043	contig_610_pilon	+	3006	7	Intergenic	novelGene_76836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	219.812356846066	165	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	7	978	350011	375649	FALSE	45	TGCAAAGTATGGAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIMANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMGRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350004	377677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
895044	contig_11413_pilon	+	2952	7	Intergenic	novelGene_103205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	59.016946718718	592	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	98	898	729381	741985	FALSE	25	TCTTCAGAAACACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPELNNLLNTTPDRAEQGKLTLLCDAKTDGSFLVHHFLSFYLRANCKVCFVALIQSFSHYNIVGQKLGVSLTTARERGQLVLLEGLKSSVDVFFRAQEEPHPLQFLREANAETLQPLYEFVQEALKPVDSEEAVWRYPVLLVDDLSVLLSLGVGAVAVLDFVHYCRATVCWKLKGSMVALVHDTGDAEDEENDILLNGLSHQSHLILRAEGLVTGFCRDVHGQLTILWRRPLQPTAQREQSLTYQYKIQDKNVSFFARGMSPAVL	729283	744039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_729435_732105_732185_734375_734447_736698_736818_738069_738272_740561_740709_741856
895045	contig_10323_pilon	-	519	2	Intergenic	novelGene_123641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	55	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531382	523882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_524157_531137
895046	contig_5041_pilon	-	2791	17	Intergenic	novelGene_27065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_5	552.894962758524	12	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	101	2401	616721	525456	FALSE	25	TAGTCTCACGAAGTAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	636080	525065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
895047	contig_8357_pilon	-	4313	1	Intergenic	novelGene_39721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	277	576	503225	502926	NA	15	TACTTCCATCTCCTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTDRSDQDHNTGFWTELEKDVEQNSNTHTQKDHIYWPKGDWRNPENMAPRHPFSSVVKSLPRFTIQPGTGQPHKTKLD	503501	499188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_499200_503500
895048	contig_14326_pilon	+	4773	16	Intergenic	novelGene_120659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	57	junction_1	56.7613326912687	583	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	64	1980	54972	111976	FALSE	25	ACCTGTTAAACTCCCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGSSHRPRLLLLPFLWAVGTMNAQAGEDSWRCRGCGDHVTPSQRLYRTVNEAWHSSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCHKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPVMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNELVLAPMFERLSTESVQDQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNRMHISSNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVKDRISQTSQTLQLLIEHDPVSLRLDQLRLDARLSPHMQNAGHFPTLSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLLSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSVDPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKKPPVEKAATKKRTLRKSDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDVFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCKLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP	54908	114769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_54988_66314_66415_96069_96206_96884_96995_97587_97777_99064_99171_99480_99678_101712_101900_102772_102860_103545_103678_103915_103973_105794_105861_106993_107169_107861_107918_110001_110160_111831
895049	contig_1719_pilon	+	5547	3	Intergenic	novelGene_87353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_2	16	413	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	4325	4720	729919	730314	FALSE	40	CTGAAAATAATACTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAVHSGDKHMDAIFALKAQLRCLPVSLGQPLLTLRASPPEKPGGPRFVGEFSKEPSPSIKALLLPRCCLSLKGWVIGSGFPVPFSSELLAQIMYRLSYRGGRPWGASWEPHGLVERSIPHLAKATGCPG	722481	731141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_723217_724669_724802_726461
895050	contig_12622_pilon	+	2752	8	Intergenic	novelGene_5837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	233.729217126947	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	416	1474	455010	475513	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	454594	476791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
895051	contig_11720_pilon	+	1348	9	Intergenic	novelGene_43815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2565.92385591915	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	456	1064	86413	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67867	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78462_86315_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
895052	contig_5649_pilon	-	2174	2	Intergenic	novelGene_82450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAGATGGATATCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514296	1509862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1511361_1513620
895053	contig_7189_pilon	-	1298	12	Intergenic	novelGene_117647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.1905192832145	18	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	206	1171	537152	490606	TRUE	70	GCAAAACAAAAAAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIYIQEPPTNGKVLLKTTAGDIDIELWSKEAPKACRNFIQLCLEAYYDNTIFHRVVPGFIIQGGDPTGTGTGGDSIYGAPFKDEFHSRLRFNRRGLVAMANAGPHDNGSQFFFTLGRADELNNKHTIFGKVTGDTIYNMLRLTEVDIDDEERPRNPHKIKSCEVLFNPFDDIIPREIKKPKKEKPEEEVKKLKPKGTKNFSLLSFGEEAEEEEEEVNRVSQSMKGKSKSSHDLLKDDPHLSSVPAVESEKDTAGDSDDDGEDQSAEHDEYIDGDEKNLMRERIAKKLKKDTSVNLKSAGEGEVEKKSVSRRVGRIVPGV	537357	396586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_-_396636_490527_490634_501927_502086_505132_505164_506157_506238_520885_520956_523229_523334_524020_524120_526777_526922_529072_529186_532684_532782_537110
895054	contig_1264_pilon	-	2523	1	Intergenic	novelGene_161309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	36	581	135815	135270	NA	25	TTAGAAAGCATCCTTTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLALKTPCIFLSGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGSRRDSASYRDRSETDRAGYANGSSYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSGYTAQEYGAGTYGASTTTTTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK	135850	133327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_133300_135800
895055	contig_8581_pilon	-	1991	9	Intergenic	novelGene_22808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	555.926577323841	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	325	1392	326214	306939	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETFAPSFLPVSRAGRCRRRSLLPPQLGGKQNPTYGV	328034	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307042_312531_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807
895056	contig_14034_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_72677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGGGTCATATTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406683	409114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_406700_409100
895057	contig_13481_pilon	+	9647	6	Intergenic	novelGene_119492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCAGCCCGGCGCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366433	1501675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1367016_1448836_1457118_1459726_1459976_1462358_1462693_1473241_1473323_1501555
895058	contig_7748_pilon	-	3340	11	Intergenic	novelGene_101044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	370	junction_4	190.641784506965	183	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	1	1827	163627	150982	FALSE	75	CTAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	163627	149468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412
895059	contig_10019_pilon	+	1730	7	Intergenic	novelGene_86700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	125	370	410517	410762	TRUE	15	TGCCTGCACTTCTACTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRNNICLLLAPLASRVTQNVCQEKSGIISIVIFFAYLSGTVMVRIIQCESLTDLKGYLVQVPQRPKLSKITVAIESTLTHGDPCVRVELCSKGFAIADFSEVDRQAFLAKRLWVVSNFQSLG	410392	452161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_411466_412900_413012_422406_422472_424570_424708_432451_432541_434544_434624_451985
895060	contig_8310_pilon	+	2187	18	Intergenic	novelGene_75573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_1	302.948041041586	26	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	30	1955	279605	324814	FALSE	25	GTAAATATTCCCATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRSFSRLTWFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	279575	325046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279640_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
895061	contig_9668_pilon	-	7100	7	Intergenic	novelGene_58142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	935	160	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	6403	6915	331345	330833	FALSE	25	TCTGCTAATCTCCATAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNMASGLEEDSLTTCDMQMTQPCLLKVKRTWKHLVIKIKDYSLQYGFCLNIKKKKKKNLTIGPISNIMINQENIEIVKDFILFGSTINTHESSSQEIKRRTALANLLRKTSLKVLKSKDVTLRTKVRLTPAMVFSIALCACENWTMNKQARRIDAFELWCWQRTVNIP	566134	330647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_333920_450725_450850_452637_453512_453687_454596_548839_549092_563994_564323_564792
895062	contig_20234_pilon	-	7048	10	Intergenic	novelGene_174321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1684	129	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1912	2412	176208	175611	TRUE	45	TGTTCGAGGAAAAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFETEAALLLVSLVSSASASVSCGLLAFGPHARICPAGASVPKLCSSTGVSDWRHLTLPGSLLHTHSALSLCGSAPVPSRTGLWVLLLLVLCCCRFSAAAGPLSLPHVYPFTVLKPLPHFRYLLQQHPTLGTKFCLSHLVLPLTEIPQVDSFNEEKFISSQSK	198030	39351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20234_pilon_-_40321_50949_51909_97666_99976_175211_175909_176005_177183_177315_177439_196352_196523_196613_196863_197039_197203_197798
895063	contig_6102_pilon	+	3316	17	Intergenic	novelGene_32085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	658	1050	790637	791991	TRUE	55	GCAAGAATCAAAAAGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQSEKAPLGSIRPGIREKSGRGWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSALDFFLASFCFELLVSCFRLFLACPWIVV	789046	814682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_789230_789439_789515_789842_790060_790454_790708_790863_791097_791583_791653_791971_792073_793462_793672_793832_793936_794104_794212_795039_795099_795189_795644_796226_796448_797093_797278_798168_798761_800354_800497_814568
895064	contig_16211_pilon	-	2282	7	Intergenic	novelGene_150088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_6	575.037800689852	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	159	527	185532	180100	TRUE	45	ATGCAATCGTAAGAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKSMLSRSFNSNITAVSSFHYGSSRDLHGSQGSLALSVADRRGSGGHIFRNPQTCSPGDPCQDDVFISGQQNYSSATLSLKDVPPDSLMKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	193168	174600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_176085_178193_178269_178757_178851_179996_180208_182778_182899_185391_185536_193013
895065	contig_3077_pilon	-	2486	8	Intergenic	novelGene_26891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	83.6128102674245	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1639	2088	1501549	1498272	FALSE	35	GGAAAGTATTTAAGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAEELAQLWVTKELDMKAINAVAISPWKTYQLVYFLDKILQKSPLPPGNVKKLGETYPNISNARNAELRLRWGQIVLKNDHQEDFWKVREFLQSQGKQKYTLPLYHAMVSGSEVARALAKETFASTASQLHSNVVNYIRQILEPKGS	1517957	1497873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1498431_1499811_1499955_1501401_1501627_1503236_1503350_1504902_1505017_1508719_1509799_1517371_1517521_1517851
895066	contig_14441_pilon	+	1572	7	Intergenic	novelGene_100365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	403.531907040819	493	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	375	1532	26678	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQAVPLCSYERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	23055	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_26652_26781_26886_27183_122126_122188_125517_125902_126159_126283_126514
895067	contig_12677_pilon	-	1092	1	Intergenic	novelGene_110764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTCATCTGTTAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1619	527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_500_1600
895068	contig_16098_pilon	-	2308	17	Intergenic	novelGene_45849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	390.971546279266	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	151	2226	228343	201500	FALSE	25	GTTGCTACAGTTCCTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKVNSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISSMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230215	201417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202028_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212877_213142_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215632_227307_227347_228196_228387_228525_228592_230174
895069	contig_11338_pilon	+	6205	12	Intergenic	novelGene_6278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.7793438298164	314	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	64	1044	172117	189573	FALSE	10	CCTGACTGCTGCTTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTYINAGFQDPSGAREEEEDDDYENMTPPYKDLPPKPGSMAPPRPPRAEKKKKILSIPCKPQKMAGLNLTPVSCTSPQLGIGLEPSLSRPPPDTTPVPCLSQKPGGPGRCWEDRLIVCLCPLVVVSLLLGCISLAVTLIKYKAVVEELRMLTFQQMAWQANVTGMAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172053	194734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176221_176299_176351_176432_176475_176652_176695_177543_177685_177767_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
895070	contig_10197_pilon	-	3362	9	Intergenic	novelGene_115252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_8	92.7456198426643	518	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	449	1291	1049386	1039060	FALSE	25	CGTACCCATATACCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNFEEHDIPNILDHDLIFWFGDMNFRIEDFGLHFVRESIKNQCYGELWEKDQLSIAKKRDPLLREFQEGPLLFPPTYKFDRNSSNYDTSEKKRKPAWTDRILWRLKRQPQASLHTPSQPAPHFSLSLRSYISHMMYCISDHKPVTCTFDLEMKPLVSAPLITLIPEGLWTMENDMVISYSLAPDFLYSPWDWIGLYKVGLRHINDYMTYVWVGDNQVCSSDGLNQVYINISDIPETEDQFLLCYYSNNLHSVVGISKPFQIQPRSYFGEDAVGQAHLQM	1050186	1036988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1039120_1039304_1039410_1039571_1039656_1039916_1040055_1040920_1041108_1047738_1047849_1048627_1048740_1049339_1049517_1049868
895071	contig_17968_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_154548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATGAGGAAACAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83220	85319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_+_83200_85300
895072	contig_6710_pilon	-	4458	1	Intergenic	novelGene_96852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	556	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATGCCTTGCACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657827	653369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_657800
895073	contig_3727_pilon	+	1162	6	Intergenic	novelGene_146737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	75	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	10	CACAGTTCTGCTGGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	308142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
895074	contig_16205_pilon	+	2836	4	Intergenic	novelGene_156866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCAGAAGAGCTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78322	89555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_80431_86980_87425_88540_88737_89467
895075	contig_6738_pilon	-	3963	5	Intergenic	novelGene_166119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3539	3874	37114	23462	TRUE	0	GCCCGCGGCCCCCGTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLFRLSTCLAVDCREGNCVSLYISGGPCGVFLVVVNLAPGGLYTPLVIASSGVSVTITGAGGACIGAVLFQGPEDFSMPPPPPPPPSSQLSPGSSLFSLSSSSFSLICIA	40652	22710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_22739_23400_23478_32604_32755_36539_36701_37105
895076	SIRV1	-	1580	5	NIC	SIRV1A	novel	1561	6	NA	NA	57	-5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	60	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATTACTTTGAATCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10729	1011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7815_10282_10367_10444
895077	contig_4301_pilon	+	3831	7	Intergenic	novelGene_65095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	154.888580025198	106	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	218	1624	459349	530958	FALSE	30	GTGTTGAACACTTTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQPVTYQAYRECTLETAVHASGWNKILVPLVLLRQMLLELTRRGQESLSALLQFGVTYLEDHAAEYIIQQGGWGTVFNLESEEEEYPGIIAEDSNDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	450268	533165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450436_459298_459470_492399_492508_494596_494754_499139_499210_507918_508063_530151
895078	contig_2706_pilon	-	4452	3	Intergenic	novelGene_178668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1560	2609	34272	33223	TRUE	60	AAAGGAAATAGGAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLLQENKEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKYCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	36766	11452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2706_pilon_-_12886_32812_35053_35987
895079	contig_4686_pilon	-	3683	23	Intergenic	novelGene_118528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	230.555800778743	17	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1196	3588	95	3682	532086	460693	FALSE	25	TAACCTGGCCAAGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQELAQKIKGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMMTAGRCHTLLSPVTEESGEEGTNSEISSPPACRSPSPVANADASVNQDIAYYQALSAERLQTEAARIHPSAPSSQEFYEPGLESSTTAKLDDLQRSWETLKNVISEKQRTLYEALERQQKYQDSLQSISTKMEAIEMKLNESLELGKSPESQMAEHQALMDEILMLQDEINVLQSSLAEELVSESPESDPAEQLALQSTLTVLAERMSTIKMKASGKQQLLEEKLNDQLEEQRQEQALQRYRCEADELNHWLLSTKATLDITLGTPEEPMDMEAQLVDCQNMLVEIEQKVVALSELSVHNENLLLEGKAHTKDEAEQLAVKLRTLKGSLLELQRALHDKQLNIQGTSQEKEESDADLTASQSPGVQEWLTQARTTRTYQRQSSLQQQKELEQELAEQKSLLRSVASRGEEILSQHSAAETSGAGEKPDVLSQELGMEGEESSTEDQMRMKWESLHQEFSTKQKLLQNVLEQEQEQVLYSRPNRLLSGVPLYQGDGQAQAKSAVTSLLDGLNQAFEEVASQGGGTKRQNMHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERALQDLADLLETGQEKMAGDQKIIVSSKEEVHQLLGKHKEYFQGLESHMILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQ	532180	460691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464529_466076_466173_466705_466838_470300_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454_487587_491549_491707_495378_495486_496544_496677_506904_507097_509797_509972_511588_511784_521407_521570_521780_521949_530671_530813_531879
895080	contig_11417_pilon	-	2031	17	Intergenic	novelGene_103290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTCTGCTGAGGAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551472	479684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_479766_481543_481647_514599_514757_517435_517511_521567_521647_527037_527106_528492_528609_529167_529346_530871_530957_536806_536969_537760_537849_538884_539047_539277_539439_540488_540616_542616_542779_551050_551144_551338
895081	contig_12299_pilon	+	4313	1	Intergenic	novelGene_29758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTGTGGCAATATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641464	645777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_641500_645800
895082	contig_11026_pilon	+	3260	16	Intergenic	novelGene_167644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_6	271.949864660545	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	91	2007	88988	125017	FALSE	45	ACTGTTGAAACACATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKEDDYNEESPTEPSSDGIISEKEITQDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEATLNDRRRVALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTVRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESDEILPFHPFHPFPSLPESEGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSKSEVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	43238	126270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104535_108820_108952_110007_110083_111253_111413_112211_112341_115713_115814_117394_117548_122159_122246_123351_123427_123810_123967_124915
895083	contig_10734_pilon	-	1286	5	Intergenic	novelGene_51121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	187.991189953146	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	453	1139	739047	737389	FALSE	10	GGTTGTAGACTCCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKQATRGDGLAFQMRAGLLP	739499	737241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737446_737526_737597_738019_738138_738215_738501_738890
895084	contig_854_pilon	+	1716	2	Intergenic	novelGene_36729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1529	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713308	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713482_1714862
895085	contig_8820_pilon	+	5799	31	Intergenic	novelGene_79267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_15	172.577660457224	598	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1193	3582	343	3924	87684	101011	TRUE	10	TAGCGTGTCACCTCCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAENIYNRLGEDLNKWQALLVQIRKARGTFDNAETKKEFGPVVIDYGKVQSKVNLKYDSWHKEVLSKFGQMLGSNMTEFHSQISKSRQELEQHSVDTASTSDAVTFITYVQSLKRKIKQFEKQVELYRNGQRLLEKQRFQFPPSWLYIDNIEGEWGAFNDIMRRKDSAIQQQVANLQMKIVQEDRAVESRTIDLLTDWEKTKPVTGNLRPEEALQALTIYEGKFGRLKDDREKCAKAKEALELTDTGLLSGSEERVQVALEELQDLKGVWSELSKVWEQIDQMKEQPWVSVQPRKLRQSLDGLLNQLKNFPARLRQYASYEFVQRLLKGYMKINMLVIELKSEALKDRHWKQLMKRLHVNWVVSELTLGQIWDVDLQKNEAIVKDVLLVAQGEMALEEFLKQIREVWNTYELDLVNYQNKCRLIRGWDDLFNKVKEHINSVSAMKLSPYYKVFEEDALSWEDKLNRIMALFDVWIDVQRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVSKSPLVMDVLNIQGVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMFAGVSSIILNEDNSAVLGISSREGEEVMFKTPVSITEHPKINEWLTLVEKEMRVTLAKLLAESVTEVEIFGKATSIDPSTYITWIDKYQAQLVVLSAQIAWSENVESALSSVGGGGDAAPLHSVLSNVEVTLNVLADSVLMEQPPLRRRKLEHLITELVHQRDVTRSLIKSKIDNAKSFEWLSQMRFYFDPKQTDVLQQLSIQMANAKFNYGFEYLGVQDKLVQTPPDGPLLLDHDTSLGSQAGGGSPFGPAGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNPNYDKTSAPITCELLNKQVKVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTKPDRQLIAQVMLYSQGFRTAEVLANKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVLVSAGNVKRERIQKIKREKEERGEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPGVQYHRGGDDRPARRAQESVSGDVLDLRRWRGGWRDVGGKGPPALPDHPNQSRPHDGGALGQREEHGLASATQGSGETRGCGGRGPHH	87341	109358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_87831_87957_88069_88150_88271_88844_89085_91348_91505_91644_91759_92007_92119_92194_92405_92693_92841_93046_93214_93302_93477_94227_94394_94474_94664_94752_94948_96339_96626_96867_96969_97626_97787_98950_99195_99342_99527_99858_100073_100865_101105_101242_101400_102516_102746_103455_103687_104015_104157_104408_104643_104733_104941_105023_105146_105609_105776_106762_106927_109227
895086	contig_7457_pilon	+	4639	8	Intergenic	novelGene_31260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3478	3789	22002	23736	TRUE	35	AGGACTGCATGCAGAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVGTGQGALDVQKHMMDFDFLPGTDFVCIFIQYAAGHRVKHLFTGQRANGQEEALGDLPHHKGEMQNVNGQLGHSDGVVVAIGDVQDIRCVEVDINVIKGH	18524	27683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_22032_22343_22399_22891_22936_23043_23185_23694_23851_25605_25670_26222_26448_27236
895087	contig_12969_pilon	-	2171	5	Intergenic	novelGene_61662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	61.8991114637359	415	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	400	1911	279414	269053	FALSE	30	GAAAAGGTAATTGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQQKMIKAQESLTLEDVAVEFTWEEWQLLGPAQKDLYRDVMLENFSNLVSVGIQKVDRLPEHLEDESWVDGKEQCYEYNALENVVHWYKSHFPLRQIHGMFGLHEKAVKSNLSLINHNRSYEIKNFAEFNRDEKVYLHANHEKLHTEIKFCESEKSNSTKSQLIKHQKTHKIKKPYVCSDCGKAFIRKSWFINHQIIHTGEKPHRCSLCGKAFFKKYMLTEHQKSHTGEKPFECMECGKAFLYESLLNNHQKTHTGEKPHICTKCGKGFTQKGNLNIHQRIHTGEKPYVCGECGKAFSQKSSLIEHQRFHTEINPFLCNKCGKFYSQKSSLNRHQKIHTGEKHFKCDGCEKAFEEKPELIVHQRSHTGDTPYGCSECGKTFACPSSLLSHQRIHTNEKHVESIKGEDPSTSSHSKSHTGDLMQDKKPVNTLPVQMPSVAAQTSVNTSGFLTNGNIFLVGQPVARCEPSGDNGEIVQERNLMNAANVVVPLVINYVLFYVT	311912	268792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_270402_276639_276767_279378_279584_300631_300759_311809
895088	contig_6227_pilon	-	2457	2	Intergenic	novelGene_49803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	570	899	1275455	1275126	TRUE	35	GAATGTGCAGTAAAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGRHTFCTGRYPAPESLHSHPEPVRSSPPRKISTCVQLTVWIKNTPLREKPLSRLPPHSLLCTGSLTGFSSCRVPWAGSRICHTPGAILPALGSEQISKRGKINCRLP	1276024	1273396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1273915_1274085
895089	contig_9924_pilon	-	4698	16	Intergenic	novelGene_175910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1936	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTCAGGCAGGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171886	15627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_15868_60001_60101_99138_99250_114520_114577_115837_115891_116798_116930_119589_119698_123899_124010_126978_127047_127350_130434_136323_136397_147474_147610_148060_148071_166284_166379_170994_171098_171662
895090	contig_4232_pilon	-	1034	1	Intergenic	novelGene_63358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGACAGTTAAGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_468100
895091	contig_5003_pilon	+	4431	7	Intergenic	novelGene_120213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	36.5121745297221	736	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	307	744	143598	155300	TRUE	50	ATATTATGTTTAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGVYKSAEQGEVENGRCITKLENMGFRVGQGLIERFTKDTARFKDELDIMKFVCKDFWTTVFKKQIDNLRTNHQGIYVLQDNKFRLLTQISAGKQYLEHASKYLAFTCGLIRGGLSNLGIKSIVTAEVSSMPACKFQVMIQKL	143291	163964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_143640_149989_150058_150771_150890_152308_152393_154237_154332_155268_158783_163759
895092	contig_4686_pilon	-	4153	19	Intergenic	novelGene_118489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	207.331316234085	30	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	230	2653	417903	367741	TRUE	0	TTTTGTCTGTGCTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKVSQNGEILIEEMIEKLKKDYQEEIAVAQENKIQLQQMGERLAKASNESKASEIEYKLGKVNDRWQHLLDLIAARVKKLKETLVAVQQLDKNMSSLKTWLAHIEAELAKPIVYDSCDSEEIQRKLSEQQELQRDIEKHSTGVASVLNLCEVLLHDCDACATDAECDSIQQATRNLDRRWRNICAMSMERRLKIEETWRLWQKFLDDYSRFEDWLKISERTAAFPSSSGVLYTVAKEELKKFEAFQRQVHESLTQLELINKQYRRLARENRTDSACSLKQMVHDGNQRWDNLQKRVTSILRRLKHFIGQREEFETARDSILVWLTEMDLQLTNIEHFSECDVQAKIKQLKAFQREISLNHNKIEQIIAQGEQLIEKSEPLDAAVIEEELDELRRYCQEVFGRVERYHKKLIRLPLPDDEQDLSDRELELDDSAALSDLHWHDTSADSVLSPQPSSNPSLSLAQPLRSERSGRDTPASVDSIPLEWDHDYDLSRDLESAVSRTLHSEDEESQEDKDFYLRGAVGLSGSHGALESRIRQLDKALDDSHFRIQQTENIIRSKTPTGPELDASYKGYMKLLGECSGSIDLVRRLEHQLKEEEESFPGFVNLDSTETQTAGVIDRWELIQAQALSKELRMKQNLQKWQQFNSDLNNIWAWLGETEKELERLQRLELSTDIQTIELQIKKLKELQKAVDHRKAIILSINLCSPEFTQADCEESRDLQDRLSLMNGRWDRVCSLLEEWRGLLQDALMQCQDFHEMSHGLLLMLENIDRRKNEIVPIDSNLDTEILQDHHKQLMVGCVSSDNS	422895	353099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_354082_363015_363075_364486_364580_366026_366344_367691_367900_369729_369931_373540_373753_375405_375533_377529_377673_381283_381618_382962_383155_384985_385124_385364_385548_388362_388514_389373_389562_398467_398631_413088_413256_417837_417997_422759
895093	contig_10044_pilon	+	2251	5	Intergenic	novelGene_156387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_4	55.060761890842	272	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	245	1555	148993	156192	FALSE	40	GATGTAAAAATGGCACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAQDSLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLFWDVMLENYNNLVSLGYRVSKPDALSRLEQGEQPWTILDESHNQNFSEIWEVDHLLGHSQNESRVDSMEQCYEHNTLENIVHRHKNHSPLRENHDMFDLDEKAVKSNLALINQNRSIEIKNSAELNRSEKTFLHVDQEQFRTESKFRESQIPNTTKSQHIKHQKTQKIEKLPVCSECGKAFIKKSWLVRHQIIHPGKGPFVCSECGKSLTQKSSLVRHQKSHRREKLFQCNECSKAFSTKHKLIIHQRTHKERRHGCNECGKTFLYMSCLFRHKIKHTRKKHVDTGKVKNPSPASHSSSHTADLMRDKNPVSTVTMQIPSVAAQTSVNTSGLLTNRNVVLVGQPVARREPSGDNREFVQQRVLMNTVNVVVPMNAVNVVVPMNAVNVVVPSVSNCILFYVPQNP	142830	156888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_142891_148808_149008_151765_151893_152150_152247_155119
895094	contig_6445_pilon	+	2457	2	Intergenic	novelGene_77065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCCCTTGTATTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668174	672375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_668504_670247
895095	contig_20527_pilon	+	2277	7	Intergenic	novelGene_138599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_2	1358.08718628649	45	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	298	774	24977	27453	FALSE	35	ATGCTAGCTGAAACCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13584	28956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_13994_14051_18589_18739_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
895096	contig_14790_pilon	-	2005	6	Intergenic	novelGene_127907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_5	72.4944135778751	225	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1650	354	2003	178177	154646	FALSE	50	TAAGTTAAATAATACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHMHTKFCLICLLTFIFHHCNHCHEDHDHGPEEHHRHHCGMTESEPSKYSVLDAENQKKCYIEKLFYRYGENGRLSFFGLEKLLTNLGLGEIKVVEINHEDLGHDHVSHLDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNPENQTVTSISTKRNHKCDPEKETIEVSVKSDGKHTHDHNRRLRHHHRSHHHLDRNTTRHFHNDSITHGERGEPSHEPSTETNTTQEQREVKPQKQKRRRKGKKSNDNFEVITPGFPPNCDQGEHYEHNRVHKPDCVHNPVHSNAHLSEHNGHDPGHGHQDLDPDNEGELRHTRKREAPHVKKSAIYSAASHKDHNEDDHQHDECLNVTQLLKYYGHDASSPISPDLFTCLCPALLYQIDSRLCIEHFDRLLVEDLNKDKNLVPEDKSNIHASAWICGIISITVISLLSLLGVILVPIINQGCFKFLLTFLVALAVGTMSGDALLHLLPHSQGGHDHSHQHAHGHGHSHGHESKKFLEEYDAVLKGLVALGGIYLLFIIEHCIRMFKHYKQQRGKQKWFMKQSTEEATIGRKLSD	197957	154643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_154712_163440_163630_165586_165757_174902_175111_177160_178189_197615
895097	contig_11512_pilon	-	4250	2	Intergenic	novelGene_43277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	832	junction_1	0	2550	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370552	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470
895098	contig_9345_pilon	+	1923	15	Intergenic	novelGene_24466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	110.093281412831	107	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	541	1596	618498	631320	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFVRKENLLSLACQHQFCRSCWEQHCSVLVKDGVGVGVSCMAQDCLLRTPEDFVFPLLPNEELRDKYRRYLFRDYVESHYQLQLCPGADCPMVIRVQEPRARRVQCNRCNEVFCFKCRQMYHAPTDCATIRKWLTKCADDSETANYISAHTKDCPKCNICIEKNGGCNHMQCSKCKHDFCWMCLGDWKTHGSEYYECSRYKENPDIVNQSQQAQAREALKKYLFYFERWENHNKSLQLEAQTYQRIHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKKLFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT	586685	631647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_587009_601318_601365_614186_614255_617044_617109_618458_618610_619373_619496_619859_619970_622812_622931_625729_625781_625872_625895_627998_628151_629015_629160_629774_629844_630943_631028_631248
895099	contig_4202_pilon	-	2587	2	Intergenic	novelGene_147082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	288	374	295178	295092	TRUE	65	CAAACAAACAAAAGACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYQDLHRTESSTARWCPATTAYCSDQYHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKDQIHWPKGDWRNPESTAPRHPFSSAVKLPSRFTVQPGSGQPSKTMRVTRYRSPVIRLRRQKGSRKLMIGNPK	295465	292567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_293698_294008
895100	contig_9436_pilon	-	2439	6	Intergenic	novelGene_60901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.7650479754617	961	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	87	491	418405	417285	TRUE	50	AGATAAGAAGCAGCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNALCALNVVYMLVGLLLIGVAAWGKGLGLVPSIHIIGGVIVVGVFLLFIAVAGLVGAVYHHQVLLFFYMIILGLVFIFQFGISCSCLAINRSKQVRGYPLKYLPPTPPPNSLFSVWLQLPKDQF	418491	414392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_414708_414939_416064_416162_416277_416889_417459_417701_417870_418342
895101	contig_10225_pilon	+	2874	13	Intergenic	novelGene_86798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	523.919602610935	144	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	1120	2760	42707	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20684	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110
895102	contig_3956_pilon	+	3433	1	Intergenic	novelGene_14719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACGTCACCTTGAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232408	235841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_232400_235800
895103	contig_9579_pilon	-	2246	20	Intergenic	novelGene_150586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	146	631	819267	817610	TRUE	15	CACTGCCTCTGGACCGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAERTLPSSVTFGEELPELLFIMGPAPAPASQAEGLPDTSDGHRGRGGGPATGPNSFLGISLRLRVAERGLRGGSAVGGGGEHSPPLTGEGPNEPFWLRGPVRAGCWVLGLPGIGFTITGSSWSVATFWVISNNLCLKLAASLFSSAIALSAARALSQLS	819412	796246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_796543_797301_797457_806200_806290_806561_806640_806728_806841_807899_807971_808155_808260_808892_809019_809115_809226_810377_810435_810524_810615_810787_810929_816661_816764_817425_817484_817583_817622_817695_817765_817889_817988_818152_818296_818992_819061_819171
895104	contig_11269_pilon	+	2376	1	Intergenic	novelGene_145825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTTTTCTCTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335339	337715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_335300_337700
895105	SIRV5	+	2527	6	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-291	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCGACCATGTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7910	13601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8017_8277_8382_8454_8586_10858_10992_11133_11898_12312
895106	contig_10904_pilon	-	2466	6	Intergenic	novelGene_22511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	168.144699589372	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCATCTCCTTTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352550	345614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_348863_349922_350113_350832_350938_351954_352140_352530
895107	contig_8453_pilon	-	1083	2	Intergenic	novelGene_125145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTCTTGTAACTCGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348909	289926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_290656_348555
895108	contig_7056_pilon	-	3314	7	Intergenic	novelGene_43604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_4	686.074744875189	243	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1180	1815	726042	725118	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	727221	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_725319_725471_725606_725661_725734_725813
895109	contig_14546_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_157458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATCCTCATTTCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539784	541047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_539800_541000
895110	contig_1301_pilon	-	1878	3	Intergenic	novelGene_47393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	319.5	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	127	513	774441	769450	FALSE	40	TATAATGACTTAAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLVEKAISSASSPQSPGDALRRVFECISSGIILKGSPGLLDPCEKDPFDTLATMTDQQREDITSSAQFALRLLAFRQIHKVLGMDPLPQMSQRFNIHNNRKRRRDSDGVDGFEAEGKKDKKDYDNF	774567	768084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_769630_773755_773854_774332
895111	contig_10953_pilon	+	3236	12	Intergenic	novelGene_42535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	137.680970314626	546	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	62	1324	179555	188559	TRUE	40	AAGTCAGGCCAATGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLWRSSLLSRKPPQPPDALKMATSLGSNTYNRQNWEDADFPILCQTCLGENPYIRMTKEKYGKECKICARPFTVFRWCPGVRMRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMEREISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDPQRMGAHAGKHSSP	179493	193152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_179609_180035_180090_181091_181122_181995_182129_183136_183238_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328_187461_188428_190243_192923
895112	contig_11816_pilon	-	5831	7	Intergenic	novelGene_98522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254066	986085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_988984_1165345_1165817_1178875_1179013_1210288_1210597_1221021_1221514_1252460_1253746_1253826
895113	contig_15022_pilon	+	4766	32	Intergenic	novelGene_171810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	268.113942883182	75	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1136	3411	771	4181	95677	121247	FALSE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELSGGTTPITPVIQAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDAEYLQYFDSNKDTYSKRFVPVACISRVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDAERKEWMQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAVKPLQDRRAREEFSRRWCVLSDGILSYYENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPNTHSFEHTFEVYTEGERLYLFGLENAELAHEWVKCIAKAFVPPLAEELLARDFDRLGRLPYKAGLSLQRTQEGWFSLTGSELRAVFPEGPCEEALQLRKLQELSVQGDSENQVLVLVERRRTLYIQRERRLDFTGWLWAIQKAAASSGDTLSEQQLGESDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQISKTQRLLDSLRQDARSVRLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLAWLEASEIEDEEEKVSRYRELLARLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNHMNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSYLVVKKHQSMETMMLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEIRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFAADPLSLLRNV	86784	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_87182_93727_93897_95301_95433_95603_95757_96127_96198_96524_96646_97088_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105950_107887_108024_108312_108416_109291_109488_109762_109815_109924_110089_110288_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_114652_114686_118370_118454_119220_119272_119455_119520_120780_120931_121229
895114	contig_12638_pilon	-	3527	3	Intergenic	novelGene_33356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	138.5	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCAGTTCAACCGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463523	1412664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1416043_1434422_1434543_1463494
895115	contig_3163_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_168070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTTGTTGTTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352015	353307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3163_pilon_+_352000_353300
895116	contig_3018_pilon	-	2210	15	Intergenic	novelGene_78859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	471.186019854285	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1470	740	2209	600079	562932	FALSE	65	AAGGAAAAAAAGACAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	625103	562930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_601250_601468_603367_603441_624768
895117	contig_10864_pilon	-	1631	8	Intergenic	novelGene_107076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_7	306.056950816114	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	168	839	911716	894694	FALSE	20	CACTTGGCTACCGATACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSVLQHKMDELKEGLRQRDELIEKHGLVIIPNGTPNGDVSQEPVVGAITVVSQEAAQVLESAGEGPLDVRLRKLAGEKEELLSQIRKLKLQLEEERQKGPRSDSAVGDLAGLQNGTDLQLIEMQRDANRQISEYKFKLSKAEQDITTLEQSIGRLEGQVLRYRTAAENAEKVEDELKAEKRKLQRELRTALDKVEEMELTNSHLAKRLEKMKANRTALLAQQ	914891	893901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_894805_895375_895481_896060_896141_896984_897106_902002_902053_903662_903796_911644_911738_914745
895118	contig_15991_pilon	-	1578	7	Intergenic	novelGene_70946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_4	132.604361416458	69	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	104	1018	136606	123001	FALSE	35	ATTGGAAGCTGCTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTHQSPDLKRSHGRRLPTVSGPGLSPAPSGAASRMIRKARPALLQPQDVGDRVETLMLHPAIKAFLCGSISGTCSTLLFQPLDLLKTRLQTLQPSAHGSRRVGMFALLLKVVRTESLLGLWKGMSPSIVRCVPGVGIYFGTLYSLKQYFLRGHPPTALESIILGAGSRSVAGVCMSPITVIKTRYESGRYGYQSISTALKTIYRSEGHRGLFSGLTATLLRDAPFSGIYLMFYNQTKNIVPQDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	136709	122440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_123124_124818_124986_127319_127489_128766_128947_130089_130175_130819_130942_136537
895119	contig_2798_pilon	+	5992	1	Intergenic	novelGene_120034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1312	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	5508	5885	132966	133343	NA	30	TGTAAGGCTATAACTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPYSGRRLCRTFTAREKSMRGFKTSKSRLTFLLGANAAGEFQLKSMLIKHSESSRALKNYAKSTLPMLYKWNSKAWMIAYLFTTWLTEYFKPVVENYCSGKKKKRFLQKYYCSLTKHLVTQEL	127458	133450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_127500_133400
895120	contig_5039_pilon	-	2353	8	Intergenic	novelGene_65007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713550	1703011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1703243_1703621_1703728_1704331_1704535_1705709_1705962_1706187_1706339_1710620_1710830_1712082_1713141_1713407
895121	contig_16303_pilon	-	2935	2	Intergenic	novelGene_34031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATACAATTGATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35934	31518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33552_35032
895122	contig_8617_pilon	-	921	1	Intergenic	novelGene_73389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCAACCCCAAATACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61793	60872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60900_61800
895123	contig_6576_pilon	+	1755	3	Intergenic	novelGene_42278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAACTAAACTCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323100	329717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_324104_326530_326689_329123
895124	contig_9706_pilon	+	1512	2	Intergenic	novelGene_20997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGTGTGTTCCCGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465467	470105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_465558_468683
895125	contig_6902_pilon	-	1196	4	Intergenic	novelGene_135602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCTCTGCCGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496844	493537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_493700_494118_494369_495311_495523_496271
895126	contig_18869_pilon	+	5137	1	Intergenic	novelGene_56465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCACTAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187139	192276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_187100_192300
895127	contig_9109_pilon	-	1558	3	Intergenic	novelGene_175304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	93	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	95	1099	20698	17171	FALSE	30	GATTCGTGCTGAGCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVTGADVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYREVMTETFRNLASVVSRNPNDGEKLSTENIIVRFMRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19106_20664
895128	contig_8712_pilon	-	2179	5	Intergenic	novelGene_58742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGATGACTGGAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104147	89833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_90698_93510_93620_99331_99466_101387_101554_103241
895129	contig_16525_pilon	-	4449	3	Intergenic	novelGene_133792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1066	659	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCGCCAGTTCCGGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97558	91480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365
895130	contig_3095_pilon	-	2064	3	Intergenic	novelGene_75200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_2	381.5	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	490	1122	248927	247316	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIQLISGGAQILIQDLESRNLSPLVPMRVLSPGETGYVVSRLTHCAFFCLLLPSVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRAQSESAQSKLLSGVGGFVLGLIFLGLGLIIHHRNQKGPHGTPPTGNKSALIQLGAGKEV	249416	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_247387_247858_247970_248476
895131	contig_2703_pilon	+	2296	15	Intergenic	novelGene_101717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1049.40412878462	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	288	1430	559489	610870	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526179	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
895132	contig_17171_pilon	+	3944	10	Intergenic	novelGene_147359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	350.608817929436	256	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	431	1243	230151	251079	FALSE	15	CTTAGGTTCTGACTCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRCGCLQSSLFGSSDQLDFLSTLALSLPRLPRGTAHTFRAVARADGRSRGLEELIDYTGGLKHEILQSHGQDAELSGTLSLVLTQCCKRIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDKNFDSDISSVGIDGCWQADSQRLLNEVMVEHFFRQGMLDVAEELCQESGLSVDPNQKEPFVELNRILEALKVRVLRPALEWAVSNREMLIAQNSSLEFKLHRLYFISLLMGGTTNQREALQYAKNFQPFALNHQKDIQVLMGSLVYLRQGIENSPYVHLLDANQWADICDIFTRDACALLGLSVESPLSVSFSAGCVALPALINIKAVIEQRQCTGVWNQKDELPIEVDLGKKCWYHSIFACPILRQQTTDNNPPMKLVCGHIISRDALNKMFNGSKLKCPYCPMEQSPGDAKQIFF	185555	253780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_185701_186249_186314_211218_211362_230072_230208_231646_231748_243990_244158_244802_244969_247260_247364_249406_249562_251015
895133	contig_15172_pilon	+	4616	10	Intergenic	novelGene_158764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	205.368202907442	30	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	208	789	252873	267646	FALSE	40	ATTAAAGTGTACAGGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENTGKLRLGEAQLTGHPGPAQTLGMPPWCHTNRPAAPHNSASCQPGVPHVQTPSLVHPPSPDRPSSHLPETSKQKWTKNWKVTAPRGATRESRSRLTNRRGAASSDVSFCEARRLT	243209	271473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_259199_259309_259592_259666_260340_260392_267534
895134	contig_5988_pilon	-	3847	3	Intergenic	novelGene_16131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGCACTTCCGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1681710	1560358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1563185_1579650_1579824_1680862
895135	contig_4604_pilon	+	1782	7	Intergenic	novelGene_19182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	116.325692203686	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	99	668	381869	387507	TRUE	40	CAGTATATTAAGTGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNSKSFADINLYREQIKRVKDSDDVPMVLVGNKCDLPTRTVDTKQAHELAKSYGIPFIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQYRMKKLNSSDDGTQGCMGLPCVVM	381273	389083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_381355_381851_381980_384089_384269_386585_386746_387387_387512_387870_387903_388005
895136	contig_15450_pilon	+	3369	2	Intergenic	novelGene_178577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	531	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	24	536	593	1105	TRUE	35	TGATAAAGAAGGTGATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	569	4233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15450_pilon_+_2817_3111
895137	contig_8978_pilon	+	3169	16	Intergenic	novelGene_49461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	218.752361257097	13	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	1246	3078	1749586	1772309	FALSE	55	TTTCTCCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680822	1772400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1684923_1685023_1692825_1692861_1694209_1694332_1696766_1696943_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
895138	contig_5945_pilon	-	1363	6	Intergenic	novelGene_104562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	339.740253723341	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	62	616	249708	219523	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNAASWVCSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249769	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
895139	contig_12019_pilon	-	2070	7	Intergenic	novelGene_87755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	565	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	995	1339	641857	639762	TRUE	40	CAAAGAGCCTAGCACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEPVHLDVPVFHIGAGLAQLPLGSLHFLICLLPVLPHLFQLLLGLLQGAALLRHLLLQLLLLLLCLLDVALLILLQLQQLPQFLLLLLQQSGLGKAHSLLVPPSFHLQLQGLL	643222	637350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_637683_637835_638137_639663_639830_639939_640140_641780_641872_642080_642728_642889
895140	contig_16221_pilon	+	990	2	Intergenic	novelGene_176610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAAACTGTGAGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87855	90183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_+_87863_89200
895141	contig_17753_pilon	+	4200	5	Intergenic	novelGene_105057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	278.835973288957	52	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2832	3218	146485	146871	FALSE	20	ACTGCTCAGCCTTCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	45480	147853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_74923_75173_96134_96231_130836_131214_144578
895142	contig_12644_pilon	+	3629	1	Intergenic	novelGene_44700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	36	341	2681962	2682267	NA	30	ACTTTGGGGTCTAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRLQELRKEEETLLRLKAALHDQLNRLKVIPRLPPIPAVLPRDHLSYTLRVQLPPLPEPRPPGFTRTPALCGAHQHFPPKPLGGARMLLPVPSLVWPCR	2681926	2685555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2681900_2685600
895143	contig_1008_pilon	+	2483	5	Intergenic	novelGene_121600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	193.175438397328	118	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTTGGCTGATTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750486	768680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_750601_750930_751029_752457_752666_760935_762131_767812
895144	contig_11816_pilon	+	4268	9	Intergenic	novelGene_98458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	633.384744349751	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	117	641	420896	437159	TRUE	30	TTTTACCCCCAAAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSCIRL	400552	452896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431079_437149_437309_442782_442893_445555_445670_447166_447216_449691
895145	contig_10331_pilon	-	3612	5	Intergenic	novelGene_54202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGCTGTTCCGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642463	628102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_628202_631089_631135_633177_633260_637500_637642_639218
895146	contig_8452_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_48064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGATCCAGTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499097	501113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_499100_501100
895147	contig_11815_pilon	-	1236	3	Intergenic	novelGene_50909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	73.5	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGAAATGCATATCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156956	153853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_153979_154794_155618_156668
895148	contig_11318_pilon	+	962	7	Intergenic	novelGene_48143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTGTGGTTTTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14976	27855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_15046_17444_17589_18873_18958_21090_21173_21294_21453_21494_21516_27451
895149	contig_7396_pilon	-	5187	13	Intergenic	novelGene_79530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3596.67913575225	275	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	314	1267	252437	246385	FALSE	35	AAAAAACCCCGGCCCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFQSQTAVAPSGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257083	242464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250285_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
895150	contig_5643_pilon	-	1143	12	Intergenic	novelGene_38784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	545	1114	237140	233636	FALSE	30	ACACAGGAGAACGCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCGHESLHDAKVVMDDLGQGGQTVGGAGGIADNLEGVVILLVVHAHYKHGGIGRRGRDDYPFGATLQVSLSFLQGCEDTGGLYNILSTSITPLDVGGISLLEDSDGLPIDDKLSVLSLDGAMELAMGGIILEHVDHVLEVYERVIDGNNVHFAGLKCSPGDQASNTAKSVYSDLHHRVSGMRLTLHKR	238055	233606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_233654_233951_233995_236009_236110_236191_236300_236418_236508_236637_236752_236844_236930_237127_237280_237375_237454_237548_237631_237716_237816_237909
895151	contig_6364_pilon	+	5987	14	Intergenic	novelGene_51703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	671	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGAGAGTGGGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431219	521182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_432749_433455_436283_436418_436500_439765_439985_440671_440788_445010_445153_447070_447150_457077_457255_458660_458773_466203_466369_472493_472646_477569_477736_490716_490802_521045
895152	contig_20314_pilon	+	3265	7	Intergenic	novelGene_125619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	156	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	1353	2258	1353	24277	FALSE	20	TGAGGGGACCGTGTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCQTVFRAKFDKYHFTEHLFFIFVFSLPHLLLSSASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	0	25284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
895153	contig_4426_pilon	+	2230	7	Intergenic	novelGene_15416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAGAAATCAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819867	904632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_820383_821017_821944_868806_868955_881692_881834_887174_887380_889993_890139_904482
895154	contig_8628_pilon	+	2351	12	Intergenic	novelGene_164419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	235	junction_8	158.012553115722	447	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1779	573	2351	412208	444796	FALSE	35	ACTGAGACTGAGGAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSREHGAAASERLQLGTPPPLLAARLVPPRNLMGSSIGYHTSVSSPTPLVPDTYEPDGYNPEAPSITSSGRSQYRQFFSRTQTQRPNLIGLTSGDMDANPRAANIVIQTEPPVPVSINSNITRVVLEPDSRKRAMSGLEGPLTKKPWLGKQGNNSQSKPGFLRKNQYTNTKLEVKKIPQELNNITKLNEHFSKFGTIVNIQVAFKGDPEAALIQYLTNEEARKAISSTEAVLNNRFIRVLWHRENNEQPALQSPTQLLLQQQQTLSHLSQQHHHLPQHLHQQQVLVAQTPPSTVHGGIQKMMNKPQTSGAYVLNKVPVKHRLGHASGNQSDAAHLLNQSGGAGEDCQVFSTPGHPKMIYSSSNLKTPSKLCSASKSHDVQEVLKKKQEAMKLQQDMRKKRQEMLEKQIECQKMLISKLEKNKNMKPEERANIMKTLKELGEKISQLKDELKTSSAVSTPSKVKTKTEAQKELLDTELDLHKRLSSGEDTTELRKKLNQLQVEAARLGILPVGRGKTMSSQGRGRGRGRGGRGRGSLNHMVVDHRPKALTVGGFNEEEKDELLQHFSAANQGSKFKDRRLQISWHKPKVPSVS	411635	444796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_412365_414012_414163_417265_417411_419330_419485_424952_425250_430472_430614_435140_435261_436335_436411_436553_436719_438857_438963_439088_439281_444718
895155	contig_7594_pilon	-	2945	4	Intergenic	novelGene_55449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	186	548	577506	577144	TRUE	30	ACACCGACCGGAAACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSGDWSLLMTCPKYVKRNLTILASKEHSGCTSSKTDLILLLAVRGIFNILRQHHNSKASILLRSSLFIVQLSCACEAIENTMAWVRRTLVLTVTSLLFNTLKRSFAADSPNAVRCLIS	577691	559143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_559180_561091_561214_561536_561750_575117
895156	contig_8133_pilon	+	3385	9	Intergenic	novelGene_98667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	637	1086	193928	194442	TRUE	30	GTTATCTAGTACTGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDTLKLGLERQVAEAKGGNDEVKEVNRFQRAAREDKVKYCNDMCKDVEIENQKERTRLVFLKLKELKKKIQASSCNIEGFYGERNYERSIERRWKEYTESPCQKELVDVQQFQEVAYDQEPMVLKDGVPAALKALAKNKSPAIDNTS	193291	355661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8133_pilon_+_194039_194103_194519_195004_195094_213523_213570_219569_219843_277259_278510_316484_316757_355317_355522_355572
895157	contig_16205_pilon	+	4329	2	Intergenic	novelGene_156860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	326	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1430	1816	119064	119450	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELLEAEHKRLIYRTLQQIRKVEQNTEHAREEIKKTRQEHDKFNRLQESTERQQSEIQKINNKISELDNSMESHRSRTEAREVRISETEDKALDTTYLRKNEIKGFKK	55761	121963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_56355_118227
895158	contig_7758_pilon	+	5132	15	Intergenic	novelGene_163524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	272.707176439551	426	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	600	2684	113199	192442	FALSE	80	AAAAAAGAAAAAAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPPTPKPRPPRPLPVAPGSSKTEADSEQQALTLPDLAEQFAPPDIAPPLLVKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSSPAELRQLLDCDATSMDLEMIDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPVAVYSEMISLAQEVQSSEEYIQLLKKLIRSPNIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTASKNLLNGRVLSEIFSPMLFRFPAASSDNTEHLIKVIEILISTEWNERQPAPALPPKPPKPTTVVNNGMNNNMSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFSDPLTFNSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYNTQFQEKSREYDRLYEDYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFKREGNEKEIQRIMHNYEKLKSRISEIVDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQLRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNENTEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVYVSPADFPFFFKHLLRPLFIHSAVGSEDLKLV	99569	194890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_99787_112816_113533_166177_166271_166718_166794_172803_172936_173723_173926_174126_174207_188333_188437_189040_189140_189241_189423_189675_189802_190755_190899_191131_191309_191409_191479_192171
895159	contig_5797_pilon	+	5251	28	Intergenic	novelGene_56947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	189.468326940363	20	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	998	2997	648	3644	337687	418675	FALSE	40	CTATATCAGAGTGACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYLIQDRREVYSILQAEGILLPRYAILNRDPNNPKECNLIEGEDHVEVNGEVFQKPFVEKPVSAEDHNVYIYYPTSAGGGSQRLFRKIGSRSSVYSPESNVRKTGSYIYEEFMPTDGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPALDGKVERDSEGKEVRYPVILNAREKLIAWKVCLAFKQTVCGFDLLRANGQSYVCDVNGFSFVKNSMKYYDDCAKILGNIVMRELAPQFHIPWSIPLEAEDIPIVPTTSGTMMELRCVIAVIRHGDRTPKQKMKMEVRHQKFFDLFEKCDGYKSGKLKLKKPKQLQEVLDIARQLLMELGQNNDSEIEENKSKLEQLKTVLEMYGHFSGINRKVQLTYLPHGCPKTSSEEEDSRREEPSLLLVLKWGGELTPAGRVQAEELGRAFRCMYPGGQGDYAGFPGCGLLRLHSTYRHDLKIYASDEGRVQMTAAAFAKGLLALEGELTPILVQMVKSANMNGLLDSDSDSLSSCQQRVKARLHEILQKDRDFTAEDYEKLTPSGSISLIKSMHLIKNPVKTCDKVYSFIQSLTSQIRHRMEDPKSSDIQLYHSETLELMLRRWSKLEKDFKTKNGRYDISKIPDIYDCIKYDVQHNGSLKLENTMELYRLSKALADIVIPQEYGITKAEKLEIAKGYCTPLVRKIRSDLQRTQDDDTVNKLHPVYSRGVLSPDRHVRTRLYFTSESHVHSLLSILRYGALCNESKDEQWKRAMDYLNVVNELNYMTQIVIMLYEDPNKDLSSEERFHVELHFSPGAKGCEEDKNLPSGYGYRPASRESEGKRCSLKIDSDDEPHTSKKDEVDRAVLLFKPMVSEPIHIHRKSPLPRSKKMAANEVVSENTNYLRTPRNLVEQKQNPVGFELYSMVPSICPLETLHNALSLKQVDEFLASIASPSSDVPRKTPEISSTASRSSPVVRRKISLNTYTPAKILPTPSTTLRNTKASSKPATSGPSSAVTPSTSSRKKSISSKTEVHEHKKNTGKKK	322645	420282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_322819_332997_333278_335011_335138_337618_337710_338882_338969_340495_340651_341435_341538_342634_342797_344522_344645_345910_346013_347027_347115_348058_348135_348209_348320_349057_349144_351647_351774_351915_352038_352315_352499_355911_356054_357523_357748_362664_362793_363574_363690_370148_370257_370344_370462_398470_398642_402272_402343_408614_408756_412625_412752_418562
895160	contig_5640_pilon	-	962	8	Intergenic	novelGene_27234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	235.582560596371	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	306	962	58081	13928	FALSE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEVPSGTCRPDVPESPDSRQKSPLFQFAEISSSTSHSDVPSKQCQASALLQFAEISSNTSQLGGAEPGKRYGKSALFQLAE	138282	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63333_63476_138206
895162	contig_13041_pilon	+	2632	6	Intergenic	novelGene_127721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_5	76.4355938028874	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	198	1436	250442	288695	FALSE	10	GTTAGCTCCTGGGGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATGTGVEAGFSSEELLSLRFPLHRACRDGDRAALCALLQQAPTVHLAAEDSFYGWTPVHWAAHFGKLECLIELVRAGATLNVSTTRYAQTPAHIAAFGGHPRCLIWLIQAGANINKQDYEGETPIHKAARSGSLDCISALVANGAHIDLRNASGLTAADIAQTQGFQECTQFLLNLQNCHLNCFYNNGTLNGVHQNVFPNHVSMGTNRKRSLEDSESVGVKKARIEAHSSGLCMPLVNGEAEDDADKMHVDREFAAVTDMKNSSSVSNTLTNGCIINGHLDFPSTTQLSGMEDRNDQCLTGSNGISDGLVPGPPCGGVNSPEEPERTVSGNSDLCGSLHLNGSPSSCIASRPSWADDIEENLHYGHYHGFGDTAESIPELNSVIEHSNSVRVEERYDSAILGTMHLYHGS	250244	289891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_250646_256719_256873_262856_262949_274929_275166_285000_285097_288237
895163	contig_3386_pilon	-	4488	2	Intergenic	novelGene_34584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGACCACCAATCACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509848	504869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_507738_508228
895165	contig_6929_pilon	+	1786	4	Intergenic	novelGene_139402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_2	1547.29556179663	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1004	1384	127176	130939	TRUE	5	TTTGTGTATCTTTCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	126172	132319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130971_131948
895166	contig_5050_pilon	-	2471	7	Intergenic	novelGene_110236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_3	61.7056183287497	455	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	123	788	13652	6360	FALSE	25	CATACTTGTGCCTAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACHNYWHWALYLIEKGDYEAALTIFDNHILPSLQASGTMLDVVDSCSMLYRLQMEGVQVAERWQDVLPVTQKHSRDHVLLFNDAHLLMAFLGARDTRTTQELLTTLQEASESPGGSQQHHLARDVGLPLCQALVEAESGNADRAVELLLPIRYRIVQIGGSNAQRDVFNQLLIHAALNCSSSAHRHVARSLLMERDALKPGSPLTQRLIRKAAALHLMQ	13774	4676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_6454_8194_8269_8513_8674_9079_9246_12177_12260_13414_13454_13601
895167	contig_18272_pilon	-	3567	1	Intergenic	novelGene_7032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTATCTATGTGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227758	224191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_224200_227800
895168	contig_5551_pilon	-	5296	2	Intergenic	novelGene_134283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	548	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2416	2715	791511	791212	TRUE	15	TTCCATTTCGTAGCCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQAHRCQEHKVVPEGLTAWVEHREANTITMWCDHCFFRGSCKCGRLVPGQAVEESTQELSESCIVVRKEKKLGKQRLGNADRATACHRSGHCIDYSVK	793926	788550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_788810_788889
895169	contig_8712_pilon	+	2559	2	Intergenic	novelGene_58789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	353	442	292659	292748	TRUE	30	ACATAGGTCACTAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAVNKLYTCKKLNWQKLCDRYIYNSDQKKRVAAEAAFVQPNISWDLVPWFGGLGSWFHGTSQLIGLRTCLVLLFYLLIHCLVPGVLKACKWPSKAQQLAFIHLEQQRKKESQEWEEDMERVADCFHEQLPPLPCDEKNWMVPGYHY	292306	297484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_294781_297399
895170	contig_8818_pilon	+	4444	8	Intergenic	novelGene_178234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	279	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2811	3287	239601	240077	FALSE	35	GGCACAATCAGCCAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVIERLRSRFETVEERISGIEDKHLHTTLLQENSEKRTKKNEEILRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTKNTEKIVEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSSRHIIITLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSTDYSAETK	39383	241234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_+_40082_40169_40318_55729_55917_56216_56862_137103_137645_137712_137888_214246_214260_239197
895171	contig_9177_pilon	-	8902	11	Intergenic	novelGene_32709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_10	646.888313389568	1321	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	552	1835	597961	571122	FALSE	55	CCACCACAGAAATAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSNRQPPSVRPSQHHFSGERCNTPARNRRSPPVRRQRGRRDRLSRHNSVSQDENYHHLPYAQQQAIEEPRAFHPPNVSPRLLHPAAHPPQQNAVMVDIHDQLHQGTVPVSYTVTTVAPHGIPLCTGQHIPACSAQQVPGCSVVFSGQHLPVCSVPPPMLQACSVQHLPVPYAAFPPLISSDPFLLHPPHLSPHHPPHLPPPGQFVPFQTQQSRSPLQRIENEVELLGEHLPVGGFTYPPSAHPPTLPPSAPLQFLTHDPLHQEVSFGVPYPPFMPRRLTGRSRYRSQQPIPPPPYHPSLLPYVLSMLPVPPTVGPTFSFELDVEDGEVENYEALLNLAERLGEAKPRGLTKADIEQLPSYRFNPNNHQSEQTLCVVCMCDFESRQLLRVLPCNHEFHAKCVDKWLKANRTCPICRADASEVHRDSE	618498	564054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_571185_573608_573709_575781_575904_579673_579759_580660_580768_581259_581422_583495_583667_585881_586050_591999_592214_597869_598064_618049
895172	contig_5649_pilon	-	3274	7	Intergenic	novelGene_82455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	79	junction_1	94.4345746476834	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	94	1008	1573807	1566511	TRUE	30	GAATGATGAGGTGAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVHCRRWGCWGLRRGVCAISERSGAYSAADMEPEPQPELEQVTLLVKSPNQRHRDLELSCERSWSVGHLKAHLSRVYPERPHPEDQRLIYSGKLLLDHQCLRDLLPKQEKRHVLHLVCNVKMPSKTPETSAKVAESTEQPTGLNQGQYPGDSSSDGLRQREVLRNLSPSGWENISRPEAAQQTFQGLGPGFTGYTTYGWLQLSWFQQIYARQYYMQYLAATAASGPVVPPPSAQEIPVVTAPAPAPIPNQFPAENQPANQNAAPQVVVNPGANQNLRMNAQGGPIVEEDDEINRDWLDWTYSAATFSVFLSVLYFYSSLSRFLMVMGATIVMYL	1573900	1563421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1564300_1565122_1566866_1567380_1567504_1569704_1569836_1570663_1570739_1570825_1570904_1573654
895173	contig_4125_pilon	+	2604	5	Intergenic	novelGene_25223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_3	26.6023965085855	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1580	2155	1708054	1711283	FALSE	25	AAATTGAATTTGTGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTNCSGWLETETRPGTCTTEGACFSWLSLILGLSIPCVIIFGLVIWYLKKQKRPSGGLAKRMSFFQRWIRRDAERDTTVSEALQVGLDVTTVAVEETVREDTASCLTPQDLDMEIGLESRG	1706474	1711732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1708181_1708685_1708777_1709646_1709805_1710887_1710920_1711115
895174	contig_10140_pilon	-	4357	4	Intergenic	novelGene_148396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	296.042039056768	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2318	2626	207562	206537	TRUE	35	GACCCTATAGGACAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	211902	204567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_205393_205630_206763_207479_209858_211880
895175	contig_18364_pilon	+	2184	2	Intergenic	novelGene_102541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	0	203	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACACCCAGTGATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16420	22769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_20696
895176	contig_6445_pilon	-	2813	5	Intergenic	novelGene_77052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	334	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTCAAGGCTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666157	654188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663
895177	contig_9146_pilon	-	3439	1	Intergenic	novelGene_79482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGGGTGGAATGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126401	122962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_123000_126400
895178	contig_5423_pilon	+	3035	5	Intergenic	novelGene_85260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1029.88834346253	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	284	586	542216	553540	FALSE	15	CTATACTCACTTCCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENTHTHTHTHNLQYTGNDIFKRWQQKMHI	534809	555989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542213_542351_544406_544489_553454
895179	contig_4751_pilon	+	2245	10	Intergenic	novelGene_173719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	138.471907388475	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	211	2178	110424	177573	FALSE	50	CAAACCCCATGAAGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDAGELWRRDGFALWFGEGGRVEVGRFSDVVAYVDVWSSNGTENYSKTFTNQLVDMGAKVSKTFNKQVTHVVFKDGYQHTWDKARKKGIKLVSVLWVEKCRTAGVHIDESLFPAANTNEQLPSLIKKKRKCMQPKDFIPKTPENDKRLQKKFEKMTKELQRQKTTLDSDVPALLFAPNGSLLYSPTVKTNSYHHSAMEKRLQEMREKRENLSPTSSQVIENSQDSPVNSLCLSPLNVSHDTSCSDESFAGVLHSSFDICGNSRRRNQEVKLGGLINDIGGGICMSSPVSKTSSTHSSASCSHLNKLTPQRPMNKLSEEKLNWQGDIVGETVTPDKKQSEGMSEEMLDEKCSLSPVLSTTEGHSLVHSRPSSSFAKRRRTSGYLHSPPKEKLKKKKYSTKSSLPKWQLFKSENRPQLMTKSVTETPDCGESSYDDYFSPDNLKERNSRSLLSDFQLSSNLVQFNSRSLSKNERGSILKMSDFSFMGKKSIPVDITDLTAKTSSSLQTPTNDEGNTTLSFMTSKEACTAEETPRDCIQADPQKREGPSPEEYNFSYIFDKLVHPKESLEQGHHGNLTPLKGNTNKMKKLIEIKSIQKEEGTTSKMLNSSESETQNNYKLHVVDDCKVEKSTEEMKNSSRGYSEIYIRSQQNVSVKD	110213	184165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_110512_112256_112349_117475_117595_153643_153732_158296_158412_160614_160759_163417_163508_172925_174117_177532_177574_184098
895180	contig_7151_pilon	+	2831	7	Intergenic	novelGene_40733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	126.428394314287	30	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	651	1007	505515	507901	FALSE	50	CAGAGCCGATAGAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502249	509725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503438_504052_504143_505033_505169_505440_505593_506568_506685_507738
895181	contig_4538_pilon	+	2964	8	Intergenic	novelGene_153066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	217	junction_7	167.266132805399	720	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	15	770	19933	97533	FALSE	30	AGAGAGTTGGAGAATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPKMQVIRNYTGTPPPALHEGPPLYIQEGDTVELLRGDAHSLFWQGRNFASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKETEHSAGQKSSRAGNNLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE	19918	99727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_20059_43356_43423_49390_49426_56148_56266_56836_56925_72247_72378_96655_96808_97491
895182	contig_935_pilon	-	2755	12	Intergenic	novelGene_45552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	361.885489399639	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	246	1757	370806	345424	FALSE	60	TTCAAATAAAATGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRLTTTLNQDAMFLSLYLHKHFDS	377417	344425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346726_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637_370822_371713_371922_377395
895183	contig_11846_pilon	-	3233	1	Intergenic	novelGene_105954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	392	715	287807	287484	NA	15	TCTATGACTATGGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSKSFWPSLGRWSYLSWQRLVWSHRMPCRKMTVSSSSSPVSIATTLFHLFPRTQCLLPAPLVALWAAEQSPVVCGGLRGKSSYVPTSTEGEILVFLGQEHIPRLP	288198	284965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_285000_288200
895184	contig_15219_pilon	+	1793	10	Intergenic	novelGene_40815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	315.307609944462	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	125	1366	19617	26426	FALSE	20	CTGCGTCCACTATTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGPMSFLNSWCSYRETSFLQRAVLLAGRRKSLHT	19492	26853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24588_25218_25275_26325
895185	contig_4315_pilon	+	8171	14	Intergenic	novelGene_46814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3380	3682	347264	350163	TRUE	20	AAGCATCGCTCCCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRDFTLIYLLQEAMEILLHLQFLMPEWGWELRWPVLHLTADRIHIHIHMQRAGASPSGVRLRAGGLDGWHTGLFGRRGQACWLAGGRRRWRAFQSGI	339053	376108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_339142_340931_343698_344460_344567_345794_346069_347118_347299_347400_347555_350049_350257_350758_350887_353292_353354_357007_357162_357917_358079_363153_363228_365428_366305_373166
895186	contig_13021_pilon	+	2007	11	Intergenic	novelGene_8169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2721.70047764261	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	169	1704	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVDDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178234_180130_180211_180440
895187	contig_6059_pilon	-	2430	15	Intergenic	novelGene_44863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	3728.27138434236	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	502	2310	584374	569146	TRUE	55	AAAAGGAAAGGAAACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	568125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571608_572925_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
895188	contig_10235_pilon	+	1745	2	Intergenic	novelGene_46515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	127	708	298380	298961	FALSE	20	GCCTCACTTCCAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRSDSGFLQRQRCSSRLLPAVSRPEDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	296926	299998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_297005_298331
895190	contig_8330_pilon	+	3491	9	Intergenic	novelGene_71969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2529	2891	2038959	2052247	TRUE	25	ACAGCTTGACAGATTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTVGVSPLPEARACWQSCWSTPAAGSPSAAVGLCCGSAPGLHPPPASPLLCACSPRAFAGLHSSLQTPCWTSEADGALLPGLAVVQEFFCKYRDVKNRSFLYLCFFLMHLVLVLIPCL	2033558	2116574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2035976_2038847_2038995_2039683_2039898_2040611_2040688_2052210_2052370_2055973_2056101_2057894_2058039_2066338_2066434_2116462
895191	contig_5031_pilon	-	5793	1	Intergenic	novelGene_133203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68950	63157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_63200_69000
895192	contig_3825_pilon	+	1133	8	Intergenic	novelGene_77921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1356	junction_1	903.299620326297	8699	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	21	821	12232	15603	FALSE	25	CATCCAGTGACTCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTATQLLKLAHKYRPETKQEKKQRLLARAEKKAAGKGDVPTKRPPVLRAGVNTVTTLVENKKAQLVVIAHDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYCIIKGKARLGRLVHRKTCTTVAFTQVNSEDKGALAKLVEAIRTNYNDRYDEIRRHWGGNVLGPKSVARIAKLEKAKAKELATKLG	12211	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_13772_14056_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
895193	contig_2693_pilon	+	4161	7	Intergenic	novelGene_167596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	39.6670168051774	618	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	335	799	297517	301692	FALSE	10	CCCAGCCGCTTCCCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAVEEKAKDIIKFTAEKLSIDEVSQLVTSPLCGAISLFVGTTRNNFEEKKVISLEYEAYLPMAENEVRKICSDIRQKWPVKHIAVFHRLGLVPVSEASIIIAVSSAHRAASLEAVSYAIDTLKAKVPIWKKEIYEESSSSWKRNKECFWATND	291325	305054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_+_291386_292677_292800_293786_293932_297509_297638_298287_298439_299366_299491_301623
895194	contig_9614_pilon	-	1888	5	Intergenic	novelGene_104423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	514.699608995383	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	574	1152	146228	145607	TRUE	35	ACAAAGGCAGGCAATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPDPQLI	146801	133081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_133142_136325_136482_140312_140490_145263_145624_145666
895195	contig_17337_pilon	-	2467	2	Intergenic	novelGene_144724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1517	1954	24054	23617	FALSE	50	AATTTGAAAACCTAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIYQKDITIINIYAPNDRAPKYINSNGTERTDRQLHTVVGDFNTPLSVKDSTSGKKLHKDTEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRKDHILGNKASLNKMQSIKILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEK	26324	23103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_-_25253_26006
895196	contig_9653_pilon	+	4020	1	Intergenic	novelGene_48265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	1122	1661	1002954	1003493	NA	10	CCCTTCTTTTCATGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLEIPEVMTIPFETEVAQLLVSLVSSASVSCGLLALGPHARICPAGASVPKLSSSTSKYPEAPHSTRKPRAYTHSALAPWVDKPSSTDKYLEAPYSARKPPAHRHSALSLCGSAPVPSRTGLLGSAAVGSLPLPLLCCCWFSAAAADPLLLPLLPHFRYLLEQHPTLSVPNSVLVI	1001832	1005852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1001800_1005900
895197	contig_19564_pilon	-	7228	25	Intergenic	novelGene_29689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_11	144.962926294967	1203	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	842	2529	23	2551	128376	114561	FALSE	25	CACTCTATGCTTAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGPKQQPPEPEWIGDGESTSPTDKVVKKGKKDKKTKRTFFEELAVEDKQAEEEEKALKEKEQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPVSDEEDEVPTLVPRGGKKTKGGNAFAALIQDQSEEEEEEEEKHSPKPAKPEKNRINKAVSEEQQPGLKSKKGREEKSKGKAKAQNKFAALDNGQEDEKVVVLKEKELPKQGKEKGKKAEQGSEEEGEEEEEEGEPKADDLYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEVSSRQAMLENASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIANRTLSIPPNIDVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDAAAERLEKVYEELRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPELLKRPKEYTVRFTFPNPPPLSPPVLGLHGVTFGYEGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTRGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDALGEAINEYKGAVIIVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMVNRPRE	128398	109883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_114728_114826_114900_114987_115053_115243_115413_115497_115531_117009_117081_117180_117256_117387_117560_117686_117800_118002_118128_118344_118429_118747_118897_118982_119123_119402_119489_119589_119691_120095_120219_120459_120565_121632_121747_121828_121904_122581_122693_122776_122815_122956_123087_124204_124295_124504_124552_128303
895198	contig_960_pilon	-	3147	3	Intergenic	novelGene_108314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCCTCAATGGCTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057204	1050362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1051452_1053827_1054029_1055347
895199	contig_57_pilon	+	2914	23	Intergenic	novelGene_44882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	204.096598422422	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	154	1995	66895	113402	TRUE	65	GAAAAAGAAAAAGATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRAAWQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIACEAEGLSKS	66741	129545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107635_113370_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
895200	contig_10793_pilon	+	3887	14	Intergenic	novelGene_83385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3099.70680995676	672	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	132	1058	146975	163940	TRUE	15	TTTACTGGTGATATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	168751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054_165377_166401
895201	contig_9668_pilon	-	1594	11	Intergenic	novelGene_58220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_8	895.648932339005	8	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	391	1374	585955	545572	FALSE	35	TTTGAACAAATTTGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKVCCKKSLI	669923	545351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599014_605301_605374_610344_610514_669866
895202	contig_9345_pilon	-	1954	2	Intergenic	novelGene_24519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	355	junction_1	0	7	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCTAGTGAACAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676077	672624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_673591_675089
895203	contig_9955_pilon	-	1963	3	Intergenic	novelGene_21305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1010	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	25	78	497	574	47731	46293	FALSE	40	AAATGCCATTGTTAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANANAIVS	49285	44903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46314_47674_47737_48794
895204	contig_1535_pilon	-	1741	6	Intergenic	novelGene_127214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	796.040702476953	40	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	545	952	41781	40062	FALSE	10	TACTTAGTTTTCTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52405	39272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_47293_47489_50216_50330_52240
895205	contig_1379_pilon	-	2816	21	Intergenic	novelGene_134591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	118.109895859746	23	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2136	680	2815	474282	437033	FALSE	60	AAAATTCACAGCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQEEWRTAKGEEEIKIYRSEEKRKHFAVPKENKILTVSKNHAHEHFLDLGESKKQQANQHNYRTRSALEETPRPSEEIENGTSSSDEGEVVAVSGGTSEEEERAWHSDGSSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKHKTKKAESSSDEEDESEKQKQKQIKKERKKVNEEKDGPTSPKKKKPKERKQKRLAVGELSENGLTLEEWLPSTWITDTLPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQPEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDVECRSLIYKPLDGEWGSNPRDEECERIVRGINQLMTLDIASPFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEEEEKDADVPGTSTQKKKDHQPRRRLRNRAQSCDIQAWKKQCQELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKRRKKRNRSSSISSSAASSPERKKRILKPQLKADISTSPFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTESSSFVRTRSNRVVGDPVITEQPSTSSAGKTFISKANTATMPGKTILENSMKHSKTNLNTLSSPAQSSFSHGTRNNSAKENMEKPVKRKMKSSVLTKASTLSKSSAVIEQADCKNNALIPGSIQVNGHGGQPSKLMKRGPGRKPKVEVNTTSSGEVIHKKRGRKPKKLQYAKP	485889	437031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_437221_442820_443016_443782_444043_444499_444664_445291_445445_454158_454309_454569_454621_454859_454930_459279_459406_461733_461855_463209_463366_465455_465518_465697_465810_470262_470346_470464_470590_471166_471275_474270_474391_476981_477214_479324_479402_482411_482553_485768
895206	contig_8377_pilon	-	8107	31	Intergenic	novelGene_35064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.06128331116537	29	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTTCTATTCTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199114	114699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_116848_120685_122384_124720_124736_131425_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182894_183049_183259_183403_185670_185806_189181_189268_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660_197851_198238
895207	contig_11898_pilon	-	5578	4	Intergenic	novelGene_144288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTTTGCCTTGGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441381	240013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_240404_242221_246479_290614_291426_441261
895208	contig_9471_pilon	-	2697	8	Intergenic	novelGene_21808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1136	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATGCTTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417524	411950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412817_413708_413828_413916_414081_414631_414728_414804_415714_416192_416271_416934_417026_417150
895209	contig_2924_pilon	-	1368	10	Intergenic	novelGene_140246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCTGGGCAAGAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240088	17850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_17944_66032_66157_125501_125606_135677_135810_147478_147683_185697_185775_199571_199667_221845_221956_236286_236343_239715
895210	contig_8386_pilon	-	10103	13	Intergenic	novelGene_82200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	213.893843737703	546	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	1844	2584	31400	18699	TRUE	25	CTGGAGGACATTATGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSTAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPAGYRVAGYETQ	46189	10954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_12597_12821_18826_19753_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_35933_36104_36160_36681_36781_38376_38474_45978
895211	contig_19777_pilon	-	2038	15	Intergenic	novelGene_29699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.257539376818856	294	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	1717	2037	3298	175	FALSE	40	CAAGGCAAGCACAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGASAGGGGSVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAAS	18381	173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_462_3264_3398_4004_4207_4411_4541_5237_5446_5560_5687_6101_6189_9829_9882_10490_10583_12884_12976_13206_13283_13382_13517_15437_15559_16872_17031_18240
895212	contig_17074_pilon	+	3249	16	Intergenic	novelGene_145175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	512.247570353763	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	95	1189	610974	636982	TRUE	25	CTAGCAACTGTGACTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRQGLYAAGMPEQWYQFCVWLRNFFHPGLHGTRARGGHC	579932	660901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_580016_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631_636740_636871_636997_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873_657127_658578_658859_660008
895213	contig_10569_pilon	+	5751	2	Intergenic	novelGene_44056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	1075	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	4448	4765	85709	86026	FALSE	25	AGCCTTCCAAAATCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQGNNRCSANMVEFFSSMKQTASRGACLYEVLIDPRGGPVIWQIEHEPNSGLGSHWQLPRRLWVRNNPAASEPAQSPPLLACFRVVGRAQLKLQWIADPPSL	58583	87012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_58790_81467
895214	contig_13800_pilon	+	1850	12	Intergenic	novelGene_153721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	217.985934795333	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	180	1529	125058	162575	FALSE	80	AGGAAAAAAAAAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	99675	162896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_99821_109046_109072_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
895215	contig_14666_pilon	+	2471	5	Intergenic	novelGene_39598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	86	1288	477340	484940	FALSE	20	GTTTTGACGCACAGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	486123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484608_484760
895216	contig_10904_pilon	-	784	2	Intergenic	novelGene_22568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	354	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	143	538	411895	411229	FALSE	30	ACCAGACATGTTGCAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPGPVVARGANVSLRCAGLIGGMSFALYRVGEAAPLQYRNSARPWADFPLPAARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSQPLVVSWDGSLPSDYTRGNLVRLGLASLVLICLGALVAFDCRSQSYAPGVLLS	412037	410982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_411366_411636
895217	contig_7748_pilon	-	3752	16	Intergenic	novelGene_101047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_15	259.89609889766	777	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	331	2676	164891	150982	FALSE	10	GATTGTGTCACCTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	191003	149905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878_164940_169883_169996_190833
895218	contig_12081_pilon	+	1496	3	Intergenic	novelGene_166975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1230	junction_1	148	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	114	335	16400	16621	TRUE	15	TATTATTTTTATTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKVRPEGPRSWGFRCGFRLPPQTGR	15769	18650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_17245_18112
895219	contig_15304_pilon	-	1294	5	Intergenic	novelGene_30416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	1538.77857406451	247	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	198	1157	54100	49864	TRUE	20	CTTTCTCAGAGACCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLADWQKPCPWLVLDLPQDSLEEEAQGASLWPTTVTLLTLFLLSLVYSTALTVTSIWGPQGSKEVPQY	54297	49402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_49524_49847_50061_52986_53320_53491_53813_53991
895221	contig_5317_pilon	-	1074	1	Intergenic	novelGene_76633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTAGGAGGGGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895863	894789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_894800_895900
895222	contig_15371_pilon	+	6529	15	Intergenic	novelGene_151465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	527	junction_12	584.615925725809	903	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	689	2070	3823	5892	195408	230717	FALSE	35	ATAAACACTGGTTAAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFFLPYRYEDALVLLLTEVLNRIQFRYNQAQLEELDDETLDDDQQTEWQRYLRQSLEVVAKVMELLPTHAFSTLFPVLQDNLEVYLGLQQFIVTSGSGHRLNITAENDCRRLHCSLRDLSSLLQAVGRLAEYFIGDVFAARFSNALTVVERLVKVTLYGSQIKLYNIETAVPSVLKPDLIDVHAQSLAALQAYSHWLAQYYSEVHRQSTQQFVSLISTTMDAITPLISTKVQDKLLLSACHLLVSLATTVRPVFLISIPAVQKVFNRITDASAQRLVDKAQVLVCRALSNILLLPWPNLPENEQQWPMRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDTKMVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAERPSPDVKAELFELLFQTLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	191585	231354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_195543_196973_197067_198099_198170_205106_205267_208942_209036_212974_213120_215190_215338_216235_216426_220720_220877_222001_222117_222289_222462_225539_225702_226862_226962_227140_227372_230615
895223	contig_10734_pilon	-	4007	9	Intergenic	novelGene_51538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2577	2900	2362545	2362222	TRUE	25	TAGAGACCAGCTCCTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVRELASAGRWNPSDTRVKPVLPGPETVAAGSRGGRVGVKKGAGWESVYRWLLVVLSPAGSCFLVPRLLVSNRSPRWWVCAVLGDRDLCMYLTSLSVSFLFHLVLG	2365121	2338845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2338909_2341837_2342003_2342549_2342656_2343155_2343335_2348645_2348737_2352308_2352375_2352689_2352800_2354902_2354989_2361980
895224	contig_3270_pilon	+	1436	10	Intergenic	novelGene_104482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_9	73.5397767567464	370	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	199	1230	300302	338530	FALSE	25	CAATTCTGACTCCTAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEEEEEVEWVVESIAGFLRGPDWSIPILDFVEQKCEVFDDEEESKLTYTEIHQEYKELVEKLLESYLKEIGINEDQFQEACMSPLAKSRTSQAILQPVLAAEDFSIFKEMMVQKNIEMQLQAIRIIQERNGVLPECLTDGSDVVSDLEQEEMKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDVRTKQLENTEPQGTPAGEVEEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	300103	338736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_300417_307276_307342_308024_308127_320732_320848_324439_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337788_338428
895225	contig_12624_pilon	+	2006	12	Intergenic	novelGene_60979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_7	129.997774933278	655	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	136	807	69828	94458	TRUE	85	AACAAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKNFLYAWCGKKKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVRVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSNAARDFVNYLVRINEVKSEDVPAVGIAPPPPSLTDSSDGTASTDGSLPTTMGGPLPPHLALKAENNSGVGASGYGVSGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEAQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRWRRMRLSADFKPG	66560	99722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_94415_94553_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342_98726_99274
895226	contig_10140_pilon	-	4903	18	Intergenic	novelGene_148395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_17	298.934393515195	1180	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	268	2127	257472	206537	FALSE	70	AGAAAGGGAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSSQETRKTKSSSPKKQNDVRVKFEHRGEKRILQFPRPVKLEDLRSKAKIAFGQSLDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILLVVNGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSVIGSTSRDRNSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHQQDYNDGRKTFPRARRNQGTSFRSTVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	316469	203760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_206763_207479_207658_225873_226004_231195_231328_231634_231784_237110_237318_238205_238299_238478_238547_239767_239848_242173_242305_245466_245555_245924_246039_250302_250403_251965_252007_252675_252795_257468_257538_279919_280086_316433
895227	contig_4908_pilon	-	1384	1	Intergenic	novelGene_117376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGCATAGTGGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57866	56482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_-_56500_57900
895228	contig_10434_pilon	-	3417	13	Intergenic	novelGene_82054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	436	junction_5	105.369060396726	859	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	339	1883	191899	164413	FALSE	10	GAATTGGTTCTTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVGVASPEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFAPEFQVGDGIGMDLKLSNHVFNALKQHAYSEERRSARLHEKKEHSTAEKAVDPKTRLLMYKMVNSGMLETITGCISTGKESVVFHAYGGSMEDEKEDSKVVPTECAIKVFKTTLNEFKNRDKYIKDDFRFKDRFSKLNPRKIIRMWAEKEMHNLIRMQRAGIPCPTVVMLKKHILVMSFIGHDQVPAPKLKEVKLSSEEMKEAYYQTLHMMQQLYNECTLVHADLSEYNMLWHAGKVWLIDVSQSVEPTHPHGLEFLFRDCRNVSQFFQKGGVKEALNERELFNAVSGLNISADNEADFLAEIEALEKMNEDHVQKNGRKAASFLKDDGGPPVLHNE	192237	162878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167670_167762_167844_169239_169400_170625_170824_174791_174920_175623_175768_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_191854
895229	contig_8661_pilon	-	2167	8	Intergenic	novelGene_137927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	672.183405487107	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTTGAAGTGGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314783	299944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_301438_305325_305401_307639_307742_311874_312013_312318_312413_312782_312903_313805_313886_314718
895230	contig_2730_pilon	+	1861	2	Intergenic	novelGene_135394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_1	0	36	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAGTATTTGATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430714	433770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_430942_432136
895231	contig_8773_pilon	+	4676	2	Intergenic	novelGene_74511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	299	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTGGAGGCCTTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23852	139183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_27855_138509
895232	contig_10569_pilon	+	6029	4	Intergenic	novelGene_44080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	309.046202946348	958	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGTTTGAAAAACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293676	336773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_293764_323271_323378_327955_328036_331017
895233	contig_7207_pilon	-	3763	5	Intergenic	novelGene_72043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACCTGCACTGTGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592729	448486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_449525_456716_456742_555455_556941_591382_592347_592478
895234	contig_5423_pilon	+	2763	7	Intergenic	novelGene_85259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	840.010400067893	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	301	858	542216	553550	FALSE	40	GTACAGTCTACAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKIDMVHRNISEGFFLDASRHILETHTHTHTHTIYSTLAMTFLRDGNKKCIYNGH	534804	555455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_548788_548855_553454
895235	contig_19402_pilon	+	4758	17	Intergenic	novelGene_80761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	1559.75514404505	7	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	10	2262	23458	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144301_144721
895236	contig_11629_pilon	+	3393	8	Intergenic	novelGene_161184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	432	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	50	AGAAATGAAAAATTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	425484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
895237	contig_7201_pilon	-	3461	19	Intergenic	novelGene_152487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	7	junction_1	302.391175201106	730	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	63	1814	255800	70168	TRUE	20	GTTCAAAGACTGGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGYAKEVLTTKGKQVIDLKVHQKYLQYQRAMKCFYTHFFIRNCMFFICKRSNMSFTCVYTLSPWRVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEVEEIVDIGSFAPEDIHIPKIYVHRLIKGEAYEKRIERLSIRKEEDGKAKSVKPGDSVRERIIKRAALEFEDGMYANLGIGIPLLASNFISPNMTVHLQSENGVLGLGPYPLKNEVDADLINAGKETVTVLPGASYFSSDESFAMIRGGHVDLTMLGAMQVSRYGDLANWMIPGKMVKGMGGAMDLVSSAKTKVVVTMEHSAKGNAHKIMEKCTLPLTGKQCVNRIITEKAVFDVDKKEGLTLIEIWEGLTVDDIKKSTGCDFAVSPKLMPMQQIAS	255862	66397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_67233_69355_70210_83641_83744_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161658_161708_163992_164088_169479_169595_171320_171429_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_234209_234399_238453_238545_239711_239821_255722
895238	contig_6898_pilon	+	3838	14	Intergenic	novelGene_35683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2025.54050351035	10	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	134	1396	59668	123156	TRUE	5	TTTTTTTTTTATTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLVKL	59534	127604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123259_124314_124464_124782_125008_125481_126168_126324
895239	contig_14621_pilon	-	2246	17	Intergenic	novelGene_105863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	138.261471043093	1588	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	10	1704	463794	405134	TRUE	25	TATTTCTATTATGAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALVSSCN	463803	396066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405099_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463781
895240	contig_4832_pilon	-	3602	1	Intergenic	novelGene_163407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACACCAGTATCCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396640	393038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_393000_396600
895241	contig_16703_pilon	+	10162	16	Intergenic	novelGene_72751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_13	1128.24458735191	209	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	207	2123	6490	40668	FALSE	55	ACTCAGCAAATACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	48707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
895242	contig_10197_pilon	-	4063	23	Intergenic	novelGene_115272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	370	junction_4	281.946275874215	724	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1154	3465	10	3474	1187962	1168440	TRUE	0	GTCTTTTTTTTTTTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPPAVTPGCHYPCQDHG	1187971	1167595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168536_1168688_1168830_1170017_1170160_1170250_1170491_1171232_1171427_1171724_1171899_1171980_1172095_1172981_1173111_1173247_1173486_1173970_1174163_1174449_1174611_1174810_1174958_1175067_1175198_1175368_1175539_1175647_1175784_1175985_1176166_1176281_1176530_1186804_1186922_1187111_1187323_1187480_1187628_1187804
895243	contig_10140_pilon	+	3497	18	Intergenic	novelGene_148400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGGAGGGGCCGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205167	316469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_206766_207482_207656_225871_226003_231194_231327_231633_231784_237110_237316_238203_238301_238480_238549_239768_239848_242173_242303_245464_245554_245923_246039_250302_250403_251965_252009_252678_252795_257468_257537_279918_280083_316429
895244	contig_6544_pilon	+	6314	2	Intergenic	novelGene_142089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2720	140	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	3644	4396	92138	92890	FALSE	65	AAAAAAATAAATTGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIHNEEVKLSLFADDMILYIQNPKDSTRNLLELIERFSRVTGYKINIQKSVGFLYTNKKNDENEIRKTKPFIIAPKNIKYFGTNLTRDAKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGSLNIVKMTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFLWKGKRPRISKTLLKKKNKIGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYCYNNTHIDQRNNTESPKVNPSTYGHLIFDKGPKPIKWGKDSLFNKWCW	87558	94808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_87781_88716
895245	contig_10569_pilon	+	4100	5	Intergenic	novelGene_44078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	272.342041374445	60	149	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTCTTGGTTTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287104	334755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_287185_290798_290895_323271_323378_327955_328036_331017
895246	contig_9363_pilon	+	2182	14	Intergenic	novelGene_6544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	8	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGAAAGAGGGTGAGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753381	759584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_753987_754083_754505_755014_755120_755356_755465_755551_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757119_757203_758065_758146_758713_758844_758930_759075_759297_759373_759533
895247	contig_12644_pilon	+	4127	3	Intergenic	novelGene_44474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAACCAAAAACGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023448	1031182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1026422_1027249_1027290_1030068
895248	contig_10627_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_60021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAATAAATTAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397606	399266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_397600_399300
895249	contig_2798_pilon	-	6014	1	Intergenic	novelGene_120051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	573	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAGAAATGAACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175916	169902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_169900_175900
895250	contig_4962_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_107386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTTTACCTAAAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211841	213480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_211800_213500
895251	contig_7291_pilon	-	2567	10	Intergenic	novelGene_106302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_3	292.050646715452	921	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	144	710	206279	179463	TRUE	20	ATCTGGGTAAGTCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYTPGIGGDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQRKIQKDRLVAEFTTSLTNFQKVQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEVSLTLVELG	213283	172355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179132_179590_180125_180179_180619_180758_181475_181570_183797_183868_206194_206350_213210
895252	contig_17427_pilon	-	2289	3	Intergenic	novelGene_30307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2568	junction_2	48	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	122	592	179819	179167	TRUE	55	AGATGTAAAATATTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVGESFSLSQAVLVLEPERARTISPTLFLKILKGYTVDLFPFFSQITVRNSVWCSMTWWALWR	179940	176915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_179476_179657
895253	contig_14985_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_169088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2	445	133	576	NA	80	TCTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKGPQGSLRTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTKAPGSHQRSSPDREAAPHSNGALQPPRKRQRWRTEPDTRVKGGGGGERQARHPKKQEKKGKATPAANKWHSREPASAGWCFWTRDCACGKQRRPNVGEEG	131	2499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_+_100_2500
895254	contig_2114_pilon	+	1226	2	Intergenic	novelGene_104234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATGCATGGTTGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138631	139930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_138992_139064
895255	contig_13700_pilon	+	5592	1	Intergenic	novelGene_68292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCAGACACTGCCCGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147204	152796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_147200_152800
895256	contig_5799_pilon	-	4743	5	Intergenic	novelGene_50244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2263	2583	170855	170535	FALSE	20	GCCTCATCCAGGGCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQESSKENGRKTQSLYQKELVDVQPFQEVAYDQGLMILKEEVQAALKALAKNKSPRIDRIPIEMFWQMDAVLEALTHLCQEIWKTASYLANQLKETHIFAHSRER	500728	168374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_171384_305434_306386_409041_409049_433687_434133_500397
895257	contig_13349_pilon	-	2645	1	Intergenic	novelGene_161125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	751	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	504	803	230357	230058	NA	10	CTCAGCCCTGTGGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLSFRSIILAVLWRPWVAVATAGLILRVLPPALSSPPACGSTPALPCCLCKCWTRRQDHTNPQLCTELESGFLEFSIWESPIWEFICSVFCLPVWHL	230860	228215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_228200_230900
895258	contig_13481_pilon	+	3762	5	Intergenic	novelGene_119316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	215.78055982873	15	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2511	1252	3762	468683	472089	FALSE	0	GTGCCTGTGTCCTCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSYTQSSPGALNPSSQAGVESQSLKTKKDEEPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVH	284150	472089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_284530_414927_415154_466806_467052_468281_470963_471858
895259	contig_4857_pilon	-	3616	3	Intergenic	novelGene_48864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGGGATACAATCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356884	1352783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1353762_1354039_1356284_1356490
895260	contig_15135_pilon	+	6759	24	Intergenic	novelGene_119873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	535	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGTACAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66204	122822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_92250_94676_94799_95331_95422_95824_95913_96510_96635_96836_96950_98623_98715_101001_101065_101587_101745_103604_103687_105122_105244_110796_110880_113400_113528_113711_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
895261	contig_19209_pilon	-	2176	3	Intergenic	novelGene_169566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	207	561	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	240	521	186721	186440	FALSE	10	TGTGAATGCCTCTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQRGTEKQLQIQELQGTQPAPPQGLGFPGCGSAARRAGTCCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNVNRPLTMKKEGIQTRNRKMSNKSKKSKKGTECFEELSKCMQEKSSPFSAAALAGHMAPVGHLPPFSHSGHILPTPTPIHPSSSLSFGHPHPSSMVTAMG	187766	184784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19209_pilon_-_186740_187270_187397_187671
895262	contig_4678_pilon	+	4911	17	Intergenic	novelGene_126035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_16	140.459277350234	983	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	93	1679	482896	495614	TRUE	15	GTCAGGGTGTCTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENIVANTVLLKAREGGSGNRKGKSKKWRQMLQFPHISQCEELRLSLEHDYHSLCERQPIGRLLFREFCETRPELTRCIAFLDGVAEYEVTPDEKRKACGQRLMQNFLSHTGPDLIPEVPRQLVTNCAQQLEQGPCKDLFQELTRLTHEYLSMAPFVDYLDSIYFNRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKKLEKKRIKKRKGEAMALNEKQILEKVNSRFVVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQQRKKKIKREEVERLVKEVPEEYSDRFSLQACSLCSQLLCKDPAERLGCRGGGAQEVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGMVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFSRQR	479083	499168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_479132_482851_482948_483810_483924_484042_484121_484497_484599_484863_484957_485062_485127_485276_485418_485671_485863_486714_486753_486834_486925_488121_488331_488422_488561_495093_495232_495312_495448_495608_495696_496017
895263	contig_2799_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_85515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAACTGTATCTTATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608672	610126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_608700_610100
895264	contig_567_pilon	+	2031	2	Intergenic	novelGene_33982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	0	329	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCATATATGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413366	416795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_414113_415510
895265	contig_4232_pilon	-	827	2	Intergenic	novelGene_63364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAGCAGGAGGAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467382_467518
895266	contig_15031_pilon	+	2290	2	Intergenic	novelGene_138423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGCTGCAATGACTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151772	156599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_153970_156506
895267	contig_11318_pilon	-	3147	24	Intergenic	novelGene_48133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	999.909965701166	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	1805	2821	21085	9367	FALSE	20	TTCTTTTGCAGAATTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRPWINKKIIEYIGEEEATLVDFVCSKVMAHSSPQSILDDVAMVLDEEAEVFIVKMWRLLIYETEAKKIGLVK	58260	9040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17505_17555_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_30503_30566_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40174_40280_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44568_49814_49844_52071_52142_52436_52520_58143
895268	contig_15449_pilon	-	4085	17	Intergenic	novelGene_33566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAAGCGAAAGGCCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55782	11188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_11233_15756_15842_32835_32914_36984_38067_43214_43279_44271_44314_44648_44762_45019_45073_45573_45699_46861_46987_47159_47329_48211_48345_49036_49081_49185_49554_51103_51329_51808_51930_54568
895269	contig_19604_pilon	+	2501	6	Intergenic	novelGene_77242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	276.989097258358	47	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	359	718	273206	273988	TRUE	20	GAACAGCAGGTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEIRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	269899	275816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273577_273833_274861_274905
895270	contig_6059_pilon	+	3074	1	Intergenic	novelGene_44796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACATACATCTCATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387291	390365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_387300_390400
895271	contig_5643_pilon	+	1096	12	Intergenic	novelGene_38795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	68	1069	233973	237983	FALSE	45	ACAGCACTAGAGGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
895272	contig_9668_pilon	+	7231	12	Intergenic	novelGene_58082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1178	138	10	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101180	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_101432_101563_102438_102907_103254_210171_210399_256949_257106_271108_271951_329922_330271_451469_452334_460194_460361_541520_541769_590402_590711_596889
895273	scaffold_19766_pilon	-	2980	20	Intergenic	novelGene_34248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	78.8111104840813	628	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	234	2864	166070	152785	FALSE	20	TGCCTGACTGAGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSDDEYDRRRRDKFRRERSDYDRSRERDERRRGDDWNDREWDRGRERRSRGEYRDYDRNRRERFSPPRHELSPPQKRMRRDWDEHSSDPYHSGYEMPYAGGGGAPTYGPPQPWGHPDVHIMQHHVLPIQARLGSIAEIDLGVPPPVMKTFKEFLLSLDDSVDETEAVKRYNDYKLDFRRQQMQDFFLAHKDEEWFRSKYHPDEVGKRRQEARGALQNRLRVFLSLMESGWFDNLLLDIDKADAIVKMLDAAVIKMEGGTENDLRILEQEEEEEQAGKPGEPSKKEEGRAGPGLGDGERKANDKDDKKEDGKQAENDSCNDDKTKKSEGDGDKEEKKEDSEKEAKKSSKKRNRKHSGDDSFDEGSVSESESESESGQAEEEKEEAEEVLKEKEKPKEEEREKPKEAPGLECKPRPLHKTCSLFMRNIAPNISRAEIISLCKRYPGFMRVALSEPQPERRFFRRGWVTFDRSVNIKEICWNLQNIRLRECELSPGVNRDLTRRVRNINGITQHKQIVRNDIKLAAKLIHTLDDRTQLWASEPGTPPLPTSLPSQNPILKNITDYLIEEVSAEEEELLGSSGGAPPEEPPKEGNPAEINVERDEKLIKVLDKLLLYLRIVHSLDYYNTCEYPNEDEMPNRCGIIHVRGPMPPNRISHGEVLEWQKTFEEKLTPLLSVRESLSEEEAQKMGRKDPEQEVEKFVTSNTQELGKDKWLCPLSGKKFKGPEFVRKHIFNKHAEKIEEVKKEVAFFNNFLTDAKRPALPEIKPAQPPGPAQILPPGLTPGLPYPHQTPQGLMPYGQPRPPILGYGAGAVRPAVPTGGPPYPHAPYGAGRGNYDAFRGQGGYPGKPRNRMVRGDPRAIVEYRDLDAPDDVDFF	166602	152668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_153647_154068_154263_154454_154609_154706_154881_155442_155632_155935_156015_156138_156201_156535_156694_156873_156992_157076_157176_157390_157576_157717_157888_159685_159875_160118_160266_160520_160650_165948_166089_166387
895274	contig_10042_pilon	-	5129	6	Intergenic	novelGene_79237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCACCGGGGGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1217771	1187799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1187870_1188562_1188662_1194069_1194100_1210577_1210694_1212652_1212813_1213117
895275	contig_7396_pilon	-	1818	2	Intergenic	novelGene_79553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1849	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGTAAGGAAATACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247720	245131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186
895276	contig_13547_pilon	-	4932	12	Intergenic	novelGene_104867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.545741868636	21	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	162	1805	129319	75684	TRUE	30	GCATGACTCTAGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLVRCYANCLQPWASKLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRDSPLHFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADAGLKRGDQIMEVNGQNFENITFVKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKAGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDIEQTSQEKGNKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFR	129480	72382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_73352_73525_75929_84852_84962_88970_89175_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_103067_103246_114702_114835_129265
895277	contig_2757_pilon	+	2565	1	Intergenic	novelGene_164591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	585	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1849	2160	256063	256374	NA	30	ATTATTTTAAATTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPMSNIMINGEKIEAVKYFILLGSTVNAHGSSSQEIKCRIALGKSTGKGLFKVLRSKDVTLRTKVRLIQGLVFSVASYA	254214	256779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_254200_256800
895278	contig_1787_pilon	-	5245	4	Intergenic	novelGene_178642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	892	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	4663	5097	142774	141856	FALSE	35	TAACCCAATGCCAATTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVKGGGAGERQGRNKKKRKKSNTSSQQMALREPPIRVCGIQAAAVSRSRDCGRVEAEEAAVRVKKDGVWESVYRQLLVVLSPAGSSVRLLSHTPCLLVSDRSPRWRICAALAGMGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	281975	141707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1787_pilon_-_142267_142750_143218_254170_256759_280344
895279	contig_15857_pilon	-	3698	3	Intergenic	novelGene_152063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	17	391	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1661	2377	50262	48131	FALSE	30	GAAAGGCATGAATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEKVNDGKPDPESCLDFSEHFNQLELLETHGHLIPTGTQSLWAGNSDDDEEQDEKTEEWYQLQEKKMEKDPSKLLLWAAEQNRLTTVQRLLSEKATHVNTRDEDEYTPLHRAAYSGHLDVVRELITQGADVHAVTVDGWTPLHSACKWNNTRVASFLLQHDADINAQTKGLLTPLHLAAGNRDSKDTLELLLMNRYIKPGLKNTVDETAFDIARRTSIYHYLFEIVEGCTNSSPQC	53241	46809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_48593_50007_50361_51679
895280	contig_14182_pilon	-	2928	3	Intergenic	novelGene_76182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1075	junction_2	18.5	113	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	149	646	69537	65020	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIAFNTPTALQKEEARQDVEALVSRTVRAQILTGKELRVATQEKESSSGRCMLTLLGLSFILAGLIVGGACIYKYFMPKSTIYRGEMCFFDSEDPANALPGGEPYFLPVTEEADIREDDNIAIIDVPVPSFSDSDPAAIIHDFEKVTFTFLLIFQDILFFLVH	69685	62737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_65275_65549_65682_69426
895281	contig_9609_pilon	+	4155	23	Intergenic	novelGene_22991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	258.481324356949	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	2609	3721	325902	332820	FALSE	30	CATTTGTACAGAATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCGIIFAAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	309959	333254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310540_311500_311591_313099_313266_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
895282	contig_14871_pilon	+	1163	2	Intergenic	novelGene_63721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCGGTGTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287301	288567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_288119_288221
895283	contig_3386_pilon	-	3312	12	Intergenic	novelGene_34560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	772	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGCCGCGACGGAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510195	470080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470303_476262_476430_488110_488187_491943_492072_494391_494547_497714_497820_498658_498718_504778_504898_505994_506119_506536_506632_507642_507738_508228
895284	contig_16211_pilon	-	5034	19	Intergenic	novelGene_150086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	804.839538106053	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1072	3219	55	3273	242940	180100	TRUE	40	TCGTAAGAATTAATGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	242994	174594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_176085_178193_178269_178757_178851_179996_180208_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643_237708_242929
895285	contig_9593_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_59699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1090	1398	29634	29326	NA	45	GAAGCAGGAGGTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVKNEMKCIKIDILGISELKWTAIGHFESDNPMVYYAENDNMKKNGIAFIVRKNISRSILKYIVSDRIIFICLQGRPVNMTIIQIYALTTKAKDE	30723	28778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_28800_30700
895286	contig_19816_pilon	-	1419	8	Intergenic	novelGene_156498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	437	junction_1	150.317622902646	33	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	13	1104	126795	123351	FALSE	15	TTCCAGAATCCTGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKAGV	126807	123035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
895287	contig_6304_pilon	+	2032	4	Intergenic	novelGene_122252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	244.439949453621	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	31	480	128774	180709	FALSE	35	TAAATTATTTGTGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPPPPRSHNMSSDGIVGGGPPAPHMQNQMNGQMPGPNHMPMQGPGPNQLSMTNSSMNMPSSSHGSMGGYNHSVPSSQSMPVQNQMTMSQGQPMGNYGPRPNMNMQPNQGPIMHQQPPSQQYNMPQGEIFSFHLVFGKTLWISGCFFSKQPLWLSCKRL	128743	182261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_128850_132145_132368_161430_161485_180611
895288	scaffold_13553_pilon	+	3741	1	Intergenic	novelGene_73754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1843	2148	50254	50559	NA	5	GCCATGTCTTCTGGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCEFAIPLKPRKAGRLEPRSARPRGMQCTQVVSAARCHRKCFALTRTDLSERLQTHFSGPVCVGMCVWAGGLSFGFPCSQPQENKKEPHRQMEEGAKRGR	48411	52152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_48400_52200
895289	contig_12570_pilon	-	2755	2	Intergenic	novelGene_79339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGGGTCCTGTTTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136026	133069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_135691_135892
895290	contig_12078_pilon	+	2722	1	Intergenic	novelGene_74089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAATTTAGGTATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169431	172153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_169400_172200
895291	contig_4732_pilon	+	6184	10	Intergenic	novelGene_75493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1527	174	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTCTTATTATACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769955	1041426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_770344_806978_807138_812455_812868_858491_859199_859575_859763_866402_866534_904560_904917_995448_995674_1022140_1025144_1040810
895292	contig_11171_pilon	+	1983	7	Intergenic	novelGene_48570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	161.74946333416	13	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	25	1020	70574	106900	FALSE	10	CCTTTGAGCTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVELFCVCGALKRARLVHPGVAEVVFVKKDDAITAYKKTTGMLRGTYPAATKGYCPLPCGWLIHQ	70549	107863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91281_93673_93781_106815
895293	contig_4180_pilon	-	4561	1	Intergenic	novelGene_8309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741206	736645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_736600_741200
895294	contig_4426_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_15410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCTTTGCTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818258	820117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_818300_820100
895295	SIRV6	+	1301	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	225	2	-90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
895296	contig_12570_pilon	+	2805	2	Intergenic	novelGene_79392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	464	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGCTGTGACCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291412	300328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_294088_300198
895297	contig_7870_pilon	-	2767	7	Intergenic	novelGene_109069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	156	junction_6	1313.75780999899	330	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	164	700	824153	705680	FALSE	35	CTTTTCATCGCATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSTNSDTSVEPLSFTCQGIGAVQMRVKNANSHHDRLSQSKSMILTDIGKAPEPISRHRRNHSQHVLKDIIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWATSWIVLSSRKIEFYKESKQQALSNMKTGNKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQVRILHIFNLFLLSLNLNSLG	854073	703612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_705833_738946_739035_748845_748908_762132_762202_823988_824168_847511_847613_854025
895298	contig_9809_pilon	+	2726	11	Intergenic	novelGene_176755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	162.059371836374	21	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	115	1455	108357	116809	FALSE	40	AAAGAGGTTATATGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVEEEKKKINFFLFKYFFC	108242	118080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_114925_116752
895299	contig_6677_pilon	-	1442	7	Intergenic	novelGene_114210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCGGTGGTGATGGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626428	584892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_585000_594905_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624540_625422_625530_626325
895300	contig_6102_pilon	+	3588	12	Intergenic	novelGene_32088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1013	1426	790772	791991	TRUE	30	AACGGAGCCAACATGGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLYWRRLHSCPLPHGPPRPRTCYFPLTTWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSALDFFLASFCFELLVSCFRLFLACPWIVV	789759	809026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_791097_791583_791653_791971_792073_793462_793672_793832_793936_794104_794212_795039_795099_795189_795644_796226_796448_797093_797278_798168_798761_808874
895301	contig_8050_pilon	+	4047	4	Intergenic	novelGene_114874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	327.872265100637	676	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1924	2517	442548	446974	FALSE	40	TTATGAATTTTAAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGDILFFFCPRFSYSAFSDSNIIAVVVDTALYIAKKNSPIVEVWDKKTEKLCELIDCVHFLKEEMVKSSKESKHKMSYSGRVKTLCLQKNTALWIGTGGGHILLLDLSTRRIIRIIHNFCDSIRVMITAQLGSLKNVMLVLGYNRKSTEGTQHQKEIQSCLSVWDINLPHEVQNLEQHIEVRKELAEKMRRISVE	440624	448504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_442739_443737_443947_445955_446028_446852
895302	contig_15775_pilon	+	2239	6	Intergenic	novelGene_148360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	199.676137783161	117	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	15	833	172	5817	FALSE	40	GCCAAAGCAAGCTCAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEDLGSLRVLGMGFLILYFVCLSAAGTSSEQVIQHLEGELCYANLTLHRTGTSPVSSQKKASAKSASSAQANKEEAEYVTMDPLPREEISYASLSLDTSNQEPFYSNMD	157	7223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1880_1945_2675_2789_4554_4641_4989_5140_5730
895303	scaffold_2602_pilon	+	4120	17	Intergenic	novelGene_127684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	465.455048682201	733	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	309	2477	25608	68818	FALSE	25	AACCTGGATTCTAGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	25299	70461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
895304	contig_10197_pilon	-	4661	4	Intergenic	novelGene_115293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	42.2453153221356	1241	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	588	1079	1268666	1265795	FALSE	25	AACCCCATGGAGCTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVSRGHLVSRLQDLQQQVGMAQKLLRNGKLEQAIQQLLGCQRDAESFLSAEHTMVGEIEDDLAQAYAALGDWQKSATHLQKSLRVVEVRHGPSSIEMGHELFKLAQIFFNGRAVPEALNTIQKAEKVLSIHCDPWSDEIEELRKMRSCLLNLPPVPVGPSG	1269253	1262212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569
895305	contig_10163_pilon	-	3921	1	Intergenic	novelGene_82646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1805	2113	166728	166420	NA	90	AAAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQGGLPCCYQSLPCSMLTMSVDPTQDACFPAHSSLSSQHLSEGEADRPKLTPREVCPVGFRGLSYGVHKEAGRVLYMGADSTAVAFCSSLQHPGNEQLIR	168532	164611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_164600_168500
895306	contig_1786_pilon	-	3534	19	Intergenic	novelGene_142589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	310.743175287333	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1357	2394	49199	41015	FALSE	25	TCTTCTAAGTTTCACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLGYIPKDNRLYLGDKELNIVSYSLLVSVLEYQTAVMRRDFSMADKVLPTIPKEQRTRVAHFLEKQGFKQQALTVSTDPEHRFELALQLGELKIAYQLAVEAESEQKWKQLAELAISKCQFGLAQECLHHAQDYGGLLLLATASGNASMVNKLAEGAERDGKNNVAFMSYFLQGKLDACLELLIRTGRLPEAAFLARTYLPSQVSRVVKLWRENLSVVSQKAAESLADPTEYENLFPGLKEAFVVEEWVKETHADLWPAKQYPLITPNEERNVMEEAKGFQPSRAAAQQELDGKPVSPTSVIMASHTTSKEKSLLELEVDLDNLELEDIDTTDINLDEDILDD	62311	39874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_41111_41550_41620_41783_41853_42041_42223_42309_42403_43584_43800_44712_44824_48995_49204_49487_49619_50251_50348_52415_52473_54358_54470_55558_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57940_60869_61024_61894_62022_62222
895307	contig_5317_pilon	+	4186	2	Intergenic	novelGene_76541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	0	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCCAAGCATTGACGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34696	40157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684
895308	contig_5480_pilon	+	2024	6	Intergenic	novelGene_107228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	122.395097941053	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1279	1770	95632	103586	FALSE	30	GTGATACTTGTGAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKYDGYTSCPLVTGYNRVILAEFDYNGQPLETFPFDQSKERLSMYLMKADFMPFLYWNMMLRGYWGGPAFLRKLFHLGMS	91348	103840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_92469_95473_95635_96168_96353_101482_101551_101854_102034_103528
895310	contig_16411_pilon	-	2577	2	Intergenic	novelGene_77351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1170	1574	241559	241155	FALSE	20	GTTAGTGAGTGGGCCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMSWESMHRPTLGSGGDGLGEALVWFQSIPLAVQLDTTVGWLWCSLSGFSSSSRSKACRAIRLAGGGQGLVDGWLEAAHMLHGGTVRLYRLHVLVQDGKHLIVQDLVLPDAVCHLLQGLQEGRDVQVSCRGKR	242806	240151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_242648_242725
895311	contig_6557_pilon	+	5658	27	Intergenic	novelGene_32935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	10	junction_1	83.5967001981757	296	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1343	4032	112	4143	298161	336505	FALSE	20	GATATTTACGCCTGCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETAFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKESLTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACERMIRALELDPNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEEERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKKQQQLSALKVLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTKVKPLLQVTRQEEELQAKDEELLKVKEKQTKVEGELEEMERKHQQLLEEKNILAEQLQAETELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLESRVEEEEERNQILQNEKKKMQAHIQDLEEQLDEEEGARQKLQLEKVTAEAKIKKMEEEILLLEDQNSKFIKEKKLMEDRIAECSSQLAEEEEKAKNLAKIRNKQEVMISDLEERLKKEEKTRQELEKAKRKLDGETTDLQDQIAELQAQIDELKIQLAKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVVRELQAQIAELQEDFESEKASRNKAEKQKRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELRTKREQEVAELKKALEEETKNHEAQIQDMRQRHATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGLETDNKELACEVKVLQQVKAESEHKRKKLDAQVQELHAKVSEGDRLRVELAEKANKLQNELDNVSTLLEEAEKKGIKFAKDAASLESQLQDTQELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQEQQEEEEEARKNLEKQVLALQAQLTDTKKKVDDDLGTIESLEEAKKKLLKDVEALSQRLEEKALAYDKLEKTKNRLQQELDDLTVDLDHQRQIVSNLEKKQKKFDQLLAEEKNISARYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSKRALEQQVEEMRTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLLIKQVRELEAELEDERKQRALAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQMKDYQRELEEARASRDEIFAQSKESEKKLKNLEAEILQLQEELASSERARRHAEQERDELADEITNSASGKSALLDEKRRLEARIAQLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTLNTELAAERSAAQKSDNARQQLERQNKELKAKLQELEGTVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKERAAANKLVRRTEKKLKEIFMQVEDERRHADQYKEQMEKANARMKQLKRQLEEAEEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHIEGASLELSDDDTESKTSDVNETQPPPSE	289880	338020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_289957_298125_298320_298413_298536_301503_301574_301658_301820_305588_305698_305804_305937_306767_306975_310157_310296_310818_310943_312459_312632_313979_314193_316950_317096_318641_318849_321604_321710_322894_323048_323477_323727_323986_324200_325912_326126_328314_328477_329904_330034_331198_331288_332164_332289_332368_332578_333905_334015_335382_335556_336360
895312	contig_13021_pilon	-	5751	10	Intergenic	novelGene_8230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	561.993365805929	358	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	126	1172	236115	210494	TRUE	50	GAAAGAAAAATATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236240	204061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_208241_209344_209717_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
895313	contig_20878_pilon	+	4202	1	Intergenic	novelGene_173446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	836	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2470	2844	36512	36886	NA	10	GAGTCGTCATTTTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSWCLSFQTIRSKVGRYVVGALWGEMPECRLVLVIKRRFLEPSLKCTCFLFENQNIHNCDISCKAFAFPSLMCAEASGRGGLRRGLSGKSVAQQFAPGARESEWASSFGTAMSLNHPCISMCS	34042	38244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_34000_38200
895314	contig_14970_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_45081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAGTGAAATCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213104	216001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_213100_216000
895315	contig_15407_pilon	+	1500	10	Intergenic	novelGene_123098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29.4031156491373	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	474	1298	537908	591712	FALSE	15	TACTCTTGTGTGGTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKGGNANATVTQVLKDVYALKKPYGVLYKKKNITRPFEDQTSLEFFSKKSDCSLFMFGSHNKKRPNNLVIGRMYDYHVLDMVELGIEKFVSLKDIKNSKCPEGTKPMLIFAGDDFDVTEDYRRLKSLLIDFFRGPTVSNIRLAGLEYVLHFTALNGKIHFRSYKLLLKKSGCRTPRIELEEMGPSLDLVLRRTHLASDDLYKLSMKMPKALKPKKKKNISHDTFGTTYGRIHMQKQDLSKLQTRKMKGLKKRPAERKTVEKEENKSKRIKKN	535110	591914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_535508_537831_537965_542846_542885_547222_547263_555461_555544_556273_556351_566034_566135_584666_584770_590554_590700_591529
895316	contig_20452_pilon	+	3945	5	Intergenic	novelGene_167299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAGATAATCTTGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39301	47719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_+_39745_39965_40926_45040_47103_47148_47542_47632
895317	contig_1143_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_86574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATGTTATCTACAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100678	102978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_100700_103000
895318	contig_3986_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_52714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	76	312	78556	78792	NA	30	TTCTTCAAGTTGGAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMTALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNNEAVNHLITWLKLEDIMLSETSQSQKNKYCMRPLL	78480	81009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_78500_81000
895319	contig_11422_pilon	-	1217	2	Intergenic	novelGene_99083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2314	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1632_1983
895320	contig_10609_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_123918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAGAGACCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351448	348960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_349000_351400
895322	contig_12427_pilon	-	1662	5	Intergenic	novelGene_40468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1085.56284364379	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	276	677	316061	315376	TRUE	35	GGAAGGGGAGTTTGACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDAITAVEVVTLPRTARSPRESESSAATTVANQAILLVTVTMLMSRSAILVANLDTFKKTAPK	325750	313526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315374_315561_315748_315842_315937_316079_325492
895323	contig_10734_pilon	-	1093	5	Intergenic	novelGene_51118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_4	194.776795332504	404	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	174	941	739047	737389	FALSE	10	TAGACTCCCTGTTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKVGITILPVTHLSCTFHVPSPAHVLLLQQATRGDGLAFQMRAGLLP	739537	737236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737597_738019_738138_738215_738501_738890_739056_739372
895324	contig_5125_pilon	-	2479	8	Intergenic	novelGene_43438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGGAAATGGTGAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59988	26077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26146_26362_26500_35608_35766_49979_50109_53630_53706_53840_53984_54293_54522_58446
895325	contig_11752_pilon	-	3473	2	Intergenic	novelGene_37653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACCTTTCAGCTAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89951	85357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_87545_88665
895326	contig_7165_pilon	-	2022	5	Intergenic	novelGene_116917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	83	junction_2	16.7406690427832	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1335	1646	1227376	1227065	FALSE	15	ATTGGATCCCTCCTTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSVTASQAPQQSPCSCCTGAGTWAWATATSTTNKNAHKRSLTAPWHLPIVQNATPDPSCKLLRSTLLLRVLRLWGTSRLTQRTKDVEAIGTKGSWACGMML	1231893	1226688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1227580_1228037_1228104_1228838_1228917_1230701_1230734_1230938
895328	contig_5419_pilon	+	3964	2	Intergenic	novelGene_15550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	2283	2945	458684	459346	TRUE	55	GAAGAAATCAAAAGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFIILGKFSVSSSSIILSVFSVFSPCSGTLITHRFLLLKVSHIIVRVSLFFFVLFSDFSSNGVVSKCFSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTLSTSEILSFIFWTSNCCFCIISGCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDFSSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFYIVCRLQGIQ	456401	460433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_459369_459436
895329	contig_8317_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_19403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
895330	contig_3627_pilon	+	2362	11	Intergenic	novelGene_78577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	42.1207787202468	15	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1191	1787	1327439	1343837	TRUE	50	TATGGAGATAATAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313496	1346048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1319969_1322916_1323504_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743_1344094_1345729
895331	contig_10093_pilon	+	649	7	Intergenic	novelGene_147501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	144.779621801167	122	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAACTGGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73142	103703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90910_91006_93068_93140_101699_101815_102327_102420_102834_102925_103664
895332	contig_16622_pilon	-	2199	11	Intergenic	novelGene_48473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1112.33521925722	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	806	1438	125335	112684	FALSE	45	AACAAAAAACTTCTACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	128573	111922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_126121_126271_126420_128337
895333	contig_12021_pilon	+	3708	13	Intergenic	novelGene_172187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	301.516295395272	8	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	387	1622	39446	56241	FALSE	35	TATAATGAGTTATCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPSAQQDAVFELISMGFNVALWYTKYASRLAGKENITEDEAKEVHRSLKIGAGIFKHLKENHIPKLITPAEKGRDLETRLIDAYIIQCQAEAQEVTIARAIELKHTPGLIAALAYETANFYQKADHALSSLEPAYSAKWRKYLHLKMCFYTAYAYCYHGQTLLASDKCGEAIRSLQEAEKFYAKAEALCKEYGETKGPGPTVKPSGHLFFRKLGNLVKNTLEKCQRENGFIYFQKIPTEAPQLELKANYGLVEPVPFAFPPTSAHWTPETLAMFDLTKRPKDDSTKPKPEEEVKPVKEPDVKPQKDTGCSIS	37623	58327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_37994_39429_39547_42150_42258_42601_42699_45782_45879_47758_47832_48829_48936_49815_49906_52417_52504_53477_53560_53876_54028_54991_55152_56154
895334	contig_2798_pilon	-	9824	3	Intergenic	novelGene_120041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	837.5	1230	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	4200	4592	147243	146851	FALSE	70	AAAAAGAAATGAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRVEPLHRGFLAVIFYGRRSLGLPSMALLGWFTPPTFGLAANNKPFALLGDLLCHLKAVFKLSGTPESPVVVLCCCNRWTTQDLRVSPDCDRALVAQWLSVQLLAKMSAVRIHQLLLGNPMEQFNSVL	193406	141618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_151194_170381_170519_193294
895335	contig_7513_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_88985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCCATGATAAATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313680	311410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_311400_313700
895337	contig_2817_pilon	+	4321	18	Intergenic	novelGene_104333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	41	junction_1	50.6987848178526	443	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1396	4188	132	4319	191586	289855	FALSE	10	CTGTTTTTCTTTTGGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLKSRLRRQDAPGPASSGSAAAASAHVADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVSSILAKKGVNPGKLDVEGRSAFHVVASKGNLECLNAILLHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHVDQQGRTALHDAAMADCTSSVQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMCRPTLCQLLIDKGADINSRDKQNRTALMLGCEYGCKDAVEVLIKNGADVSFLDALGNDSFYYARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRHLTHMQEEVNRKSNQREHQSFQDLEIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEKEKLKSLLAAKEKQHEESLRTVEALRNRLKFSESDHLASGSHFSNRKEEMLLKQGQMYMTDSQCTSTGMPVHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRSFCDSTKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAATGNSRLTEELKEQLKDMKAKYEGTSAEVGKLRNQIKQNEMLVEEFKREEGKLIEENKRLQKDFSMCEMEQEKKGRQITEMEGQLKELVAKLALSVPTEKFENMKSLLSNEVNEKAKKLAEMEREYEKSFSEIRQLKRELENFKAKLAQHVRPEEHEQLKNRLEQKSGELGKKITELTSKNQALQKEIEKVYLDNKLLNQQVHDLTVEMKSHYVPLKVSEEMKKSHDVIVEGLNKKLLDVTQKYSDKKLEMGKLLMENDSLSKNVSRLESVFIPPEKHEKETVALKSSITELKKQLSELTKKCGEDQEKIHALMSENTNLKKTISNQYVPLKTHEEVKTALSSTLDKTNRELLEMRKKIEDKNQDSLKIKHENDILKRNLENTHNQMKAEYISLKEHEEKMSTVSKSMKKVEDNSAEILANYRKGQEEIVRLHAEIGAQKKELDTIQECIKLKYTPITSFEECERKFKAAEKELKEQLSEQTQKCSVREEEAKKCKQEIEKLRKEIVSLQKNLKEKNVLIENSHEMERALSRKTEDLNKQLKDLLQKYTEVKNEKEKLAEENAKRTPEILAAQTLLQKQPVPLEQVEALKKSLNDTIENLREELKNKQRCYEKEQQTVTKLHQMLENQKNSSVPLVEHLQIKEAFEKEVGIIKASLKEKEEESQNKTEEVSKLQSEVHNTKQALKKLETREVVDLSKFKAMKSDLETQISNLNEKLANLNRKYEDACEEVLHAKKKELSAKDEKELLHSSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELERRIQESAEQIEAKDNKITELLTDVERLKQALNGISQLTYTCASPSTRQSQLVETLQRQVESLQQQLADTDRQHQEVIAIYRTHLLSAAQVK	191454	289857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_191667_248907_249042_253093_253183_261105_261171_261967_262026_265495_265567_265666_265774_266805_266988_268559_268598_271269_271339_272893_273002_274655_274689_275372_275472_278941_278979_280049_280103_281923_284663_287013_287167_289783
895338	contig_10868_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_173894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAACGGCTTTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406621	405724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_405700_406600
895339	contig_12644_pilon	+	1974	7	Intergenic	novelGene_44446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	323.671343941488	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	75	338	335374	368092	TRUE	5	ATTTTTTTGGGGGTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPWVRGLLIEFRRRGSLCRESKREMEMDKRIHLELRNRTPSDVKELVLDNCRSIEGKIEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSVANLPKLNKGPGSIGRKVSEPHTSKLKWQQN	335299	376352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_335428_367593_367734_368022_368118_370700_370900_372113_372212_374741_374806_375102
895340	contig_1008_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_121554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTCTTCTCTCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539768	537677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_537700_539800
895342	contig_1786_pilon	-	3107	1	Intergenic	novelGene_142587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACCACAGAAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42925	39818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_39800_42900
895343	contig_13888_pilon	-	3504	2	Intergenic	novelGene_151802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	440	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCGTTTTCTAGGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346633	342817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_344769_345080
895344	contig_10324_pilon	-	3872	16	Intergenic	novelGene_7820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.7766520280241	637	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	308	1006	271114	268845	TRUE	10	GCGATTGATGCGGGCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGAALTLALGLLLPPVGVGWAGPPPIQDGEFTFLLPAGRKQCFYQSAPANASLETEYQVIGGAGLDVDFSLESPQGTLLVSESRKADGMHTVEPTEAGDYKLCFDNSFSTISEKLVFFELIFDSLQDDEEVEGWAETLGWPDAVEPEEMLDVKMEDIKESIETMRTRLERSIQMLTLLRAFEARDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT	271421	236014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_236049_238977_239046_239687_239827_242178_242264_244418_244490_247903_247961_252866_252981_258355_258466_260939_261054_261492_261664_263847_264079_265195_265442_267418_269064_269626_269829_269968_270067_270934
895345	contig_17964_pilon	-	1715	3	Intergenic	novelGene_33894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_1	80.5	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348685	340423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_347653
895346	contig_9332_pilon	+	2656	1	Intergenic	novelGene_60710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	849	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATTCAAAATTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77202	79858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_77200_79900
895347	contig_8045_pilon	-	2433	12	Intergenic	novelGene_35428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	180.916582759446	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	807	1820	434052	380007	FALSE	25	TTTATTTTAGCAAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYQLCRTTPHADCAGLTGHFAGSSAPCSFLASGCRGAQVEEIWSLEPENFEKLKPVHGLIFLFKWQPGEEPAGSVVQDSRLDTIFFAKQVINNACATQAIVSVLLNCTHQDVHLGETLSEFKEFSQSFDAAMKGLALSNSDVIRQVHNSFARQQMFEFDAKTSAKEEDAFHFVSYVPVNGRLYELDGLREGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEKRIQKYSEGEIRFNLMAIVSDRKMIYEQKIAELQRQLAEEEPMDTDQGNNMLSAIQSEVAKNQMLIEEEVQKLKRYKIENIRRKHNYLPFIMELLKTLAEHQQLIPLVEKAKEKQNAKKAQETK	435415	379393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_380052_388099_388199_390871_390986_392296_392400_399315_399380_401391_401523_401905_401968_402049_402176_413301_413408_414824_414889_433952_434213_434769
895348	contig_16766_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_153344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGACTAGGTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84975	129419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_85373_128452
895349	contig_4742_pilon	+	3589	2	Intergenic	novelGene_130974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTGTTCTCAAATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139123	143124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_140296_140707
895350	contig_16303_pilon	-	2360	8	Intergenic	novelGene_34041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_6	634.908767349407	232	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	60	1151	45428	35759	TRUE	25	GTCTTCAGACATGATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45487	32070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35588_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
895351	contig_7840_pilon	-	2702	4	Intergenic	novelGene_69013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	636	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCCTGTATATACCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306117	298008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_298207_299238_299530_301105_301255_304053
895352	contig_6191_pilon	+	5283	14	Intergenic	novelGene_107821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_11	244.055527681132	886	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	177	1790	93605	148147	FALSE	25	AAAGGTTTTCCTTGGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSNSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFVKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLSQQQYIFQQCEAPMEGFQL	55662	151640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_55834_93599_93734_112654_112760_121430_121531_123459_123555_130262_130395_131389_131479_132003_132104_132682_132847_134259_134339_140512_140639_142415_142544_146208_146388_147959
895353	contig_15105_pilon	-	1452	5	Intergenic	novelGene_151009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	916	junction_4	783.894922805346	8300	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2	466	836356	829338	FALSE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	836357	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187
895354	contig_10017_pilon	-	1705	17	Intergenic	novelGene_156986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	391.473014515369	1	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	51	1178	337686	307398	TRUE	15	TGAATCGGCCCTGGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	346605	302906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303350_303995_304052_307369_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346572
895355	contig_9484_pilon	+	5015	15	Intergenic	novelGene_105663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	468.127708024646	434	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	60	851	126829	201271	TRUE	35	CAGGGAGTGAAGCCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDVSQRHPEYCGSACWIH	126769	214544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513_212264_212657
895356	contig_11898_pilon	+	4225	2	Intergenic	novelGene_144277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	390	770	209914	210294	FALSE	55	GGAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQRMHTHLLRHSQLKQKSRMKQIYNQYTKKKTTECPKDNRQCENILKQDRMVPVGIQNKPPDDFPVEEKALELPDTEFKSLIFRAIQELKQKADKNKEKIDKFMEKADKFMENTDKKWKNSGK	209056	213749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_209366_209833
895357	contig_8729_pilon	+	4412	3	Intergenic	novelGene_40152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGGCGTTAGGTGGTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764836	770680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_768822_769438_769568_770382
895358	contig_4782_pilon	+	4889	1	Intergenic	novelGene_73592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2813	3115	66975	67277	NA	20	TTTCCCCCTTAGTACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGVPAVSVKPLSLVFLLEFEFCTPLFSCSIWDSLLCSLSKGVIGGSRAPSSLVLQADFRPMKSLVYVALSVSWANTSLCLLCSSFSFTPGGLGPITTS	64162	69051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_64200_69100
895359	contig_14744_pilon	-	3247	11	Intergenic	novelGene_66132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_10	81.8305566399252	9	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	795	2462	1597397	1588029	FALSE	20	AGCTGAGCCTCATGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLWSALTSRSKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1598191	1587243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1597362
895360	contig_16532_pilon	+	2741	13	Intergenic	novelGene_110034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_5	245.167332312715	413	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	271	1641	138093	185084	FALSE	15	ACACTTTGTGTATTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFAETNPAASSLPNGDCSRFRARPGGNRVTVVLGAQWGDEGKGKVVDLLSQDADIVCRCQGGNNAGHTVVVDSVEYDFHLLPSGIINPNVTAFIGNGVVIHLPGLFEEAEKNVQKGKGLEGWEKRLIISDRAHIVFDFHQAADGIQEQQRQEQAGKNLGTTKKGIGPVYSSKAARSGLRMCDLVSDFGGFSERFKVLANQYKSIYPTLEIDIEGELQKLKGYMEKIKPMVRDGVYFLYEALHGPPKKILVEGANAALLDIDFGTYPFVTSSNCTVGGVCTGLGMPPQNVGEVYGVVKAYTTRVGIGAFPTEQDNDIGELLQTRGREFGVTTGRKRRCGWLDLVLLRYAHMINGFTALALTKLDILDMFTEIKVGVAYKLDGEIIPHFPANQEVLNKVEVQYKTLPGWNTDISNARTFKELPVNAQNYVRFIEDELQIQVKWIGVGKSRESMIQLF	137822	186184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_138276_148401_148505_149545_149615_151217_151269_167915_167983_168227_168336_169389_169472_172265_172393_173580_173736_174902_175028_176253_176352_183467_183618_185031
895361	contig_20889_pilon	+	4726	1	Intergenic	novelGene_127642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGAGGACATCATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40229	44955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_40200_45000
895362	contig_11548_pilon	+	2294	11	Intergenic	novelGene_66750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	726.118723074953	1	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	114	1451	63836	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63722	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
895363	contig_4301_pilon	+	3459	1	Intergenic	novelGene_65103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	1203	1769	530392	530958	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	529189	532648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_529200_532600
895365	contig_8014_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_178140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	839	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTAAAAGGGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110666	112900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8014_pilon_+_110700_112900
895366	contig_2768_pilon	+	3901	20	Intergenic	novelGene_57498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_15	248.167511115793	283	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	965	2898	149	3046	736741	792735	FALSE	25	CAACATGGGTCACTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSTSELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKKNGNITGSPLHSCELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDHKVQCDEEEFRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDDAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPVSNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTPGSLSTSGILLDSERRKSDASSVISPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTVLIPYHILIVPSKKLGGSIFTANPWICISGELGETQILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNAGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFITAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI	724477	793590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_724612_736726_736915_749480_749799_754345_754562_763844_764080_770255_770407_771088_771183_775789_775922_778480_778634_779797_779883_781765_781851_782337_782467_786887_787010_788189_788336_788886_789006_789357_789537_790138_790222_790773_790898_791504_791674_792551
895367	contig_2161_pilon	+	3278	4	Intergenic	novelGene_114946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	142.045376161595	56	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	33	1121	941059	953538	TRUE	30	TCAAACTGTTGACGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRDSLSEPTMCGGLMEKYVAAMVLSAAGDALGYFNGKWEFLQDGEKIHQQLAQLGGLDAIDVGRWRVSDDTVMHLATADALIEAEKTRDLARLYSLFAKHYQNCMEDMDGRAPGATSAQNAMQLEPHKANGWRIPFNKYEGGCGAAMRAMCIGLRFPHCSQRDTLIQVSIESGRMTHHHPTGYLGALVSALFTAYAVNGKPPQQWGNGLMEVLPEAKKYIVQSGYFVEENLQHWFYFQDQWEKYLKLRGIWDGKSAPIFPKPFDVKERDQFYVSVSYSGWGGSSGHDAPMIAYDAILAAGDSWKELAHRAFFHGGDSDSTAAIAGCWWGVMYGFKGVSPSNYEKLEYRKRLEETARALYSLGSKEDTVTAL	941026	957192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_941372_951472_951834_953123_955051_956547
895368	contig_5434_pilon	-	2405	10	Intergenic	novelGene_74678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	99.1463564635635	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	135	959	379651	345133	TRUE	35	TAAAGTATTGTATAGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGPQDGGGRPERLGPAVEAGRDSPLGPAGPGVAAAAPGIEDGKMTQGKKKKRAANRSIMLAKKIIIKDGGTPQGIGSPSVYHAVIVIFLEFFAWGLLTAPTLVVLHETFPKHTFLMNGLIQGVKGLLSFLSAPLIGALSDVWGRKSFLLLTVFFTCAPIPLMKISPWWYFAVISVSGVFAVTFSVVFAYVADITQEHERSMAYGLVSATFAASLVTSPAIGAYLGRVYGDSLVVVLATAIALLDICFILVAVPESLPEKMRPASWGAPISWEQADPFASLKKVGQDSIVLLICITVFLSYLPEAGQYSSFFLYLRQR	379785	324256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_325462_326720_326894_345064_345139_345931_346046_347592_347812_350267_350383_352241_352370_353137_353201_363117_363214_379567
895369	contig_15744_pilon	+	4812	1	Intergenic	novelGene_83629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	598	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTGCAATTCAGCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242428	247240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_242400_247200
895370	contig_10235_pilon	+	3219	8	Intergenic	novelGene_46608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	542	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	2818	3219	606080	607638	FALSE	25	CCCACCAATCCCAGACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSGDTPPPEAAAAAAAAAEPPPFSGPATPSARSMLSKRISCGSTGSSSWELRMLRPVFSLISHRTLKRAGFIRWQFRACFLAWASSRLWSVMVIICCRMSPMSCFPRPPGTPPLPPPGSPPPGGSPGPPGSP	602627	607638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_604330_604456_604546_604670_605296_605421_605556_605714_605905_606002_606251_606486_606561_607481
895371	contig_3111_pilon	-	2450	3	Intergenic	novelGene_129954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	429	junction_1	138.5	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1161	1472	17218	16585	FALSE	10	TCCTTGGGCCTGTGTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	18378	15606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182
895372	contig_15666_pilon	-	2367	7	Intergenic	novelGene_70134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	593.714694856788	5025	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	877	1308	108757	107816	FALSE	10	CTACGTGTTTACTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110809	106756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110152_110203_110246_110558
895373	contig_10437_pilon	+	1244	6	Intergenic	novelGene_38313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1132.28017734128	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	270	713	443902	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431124	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432186_443797_443977_445309_445476_446951_447055_451075
895374	contig_16303_pilon	-	4867	7	Intergenic	novelGene_34048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_5	628.735437207097	1328	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	95	1186	45428	35759	FALSE	30	ATCCCAAGTCTTCAGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45522	32077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
895375	contig_15118_pilon	+	1226	3	Intergenic	novelGene_74576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	442	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCGTGTGAAAGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371667	373857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_371770_372476_372571_372827
895376	SIRV5	+	1978	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	17	34	-2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
895377	contig_5222_pilon	-	2269	9	Intergenic	novelGene_59016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	671	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	494	1078	374264	373680	TRUE	30	AGCTCTCCACCATCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNLRKISNGLITAGSGCRGYPVDQCLRGPRTITEWGKGGPGVQSSQSLCQCLLIPLHHRNPAKRPRPHVQGLAPNLEKLPRHFCGPNMGGAGPWREKVLEPKQGPFCSPACPWPLKRTVPGTDPGTCAWARTRTHTHTHAHTHTFSYPPGTLVMSEGCRWRWVAFWPQPSTALSPICLSQQGPQAVVGKQGG	374839	368792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_368839_369125_369206_369624_369753_370976_371054_371430_371554_371924_372012_372145_372226_373109_374337_374418
895378	contig_18145_pilon	+	3115	17	Intergenic	novelGene_37345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	452.996671483356	10	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1203	2186	96213	98834	TRUE	20	ATGGAGTCTGAGTCCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKAGC	86688	101264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96159_96301_96655_96769_97208_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98545_98826_98983_100326_100482_100638
895379	contig_7963_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_58543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAACTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241109	239206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_239200_241100
895380	contig_3818_pilon	+	6848	45	Intergenic	novelGene_99241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_34	287.625936305364	1063	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2136	6411	62	6472	424965	455535	FALSE	15	TTCTTCTGTCTTTGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGTRMGDKAQRTKPQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQNMDDNIDETYGVNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTLSANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDRECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEPEKERIMGKMEADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERCRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKAKPFGPEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKGGERTYTQLVRLVILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDMLNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPALYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKESIEEPSAKINVLLQAFVSQLKLEGFALMADMVYVTQSAGRLMRAIFEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPFERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKVELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEHLITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVSALRNSAFESLYQDQFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGKTICAEFAILRMLLQNSEGRCVYITPMEALAEQVYMDWYEKFQDRLNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIILSTPEKWDILSRRWKQRKNVQNINLFVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDVAHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSLCWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHANRPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCTHDHFNAETVTKTVENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	424903	455911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_425010_425468_425633_427646_427819_428719_428913_429408_429465_431334_431434_431785_431939_432065_432166_432340_432478_433015_433100_433189_433364_433760_433899_434113_434270_434796_434968_437161_437356_437543_437668_438704_438855_439107_439219_439731_439864_440027_440217_440562_440761_441159_441313_441423_441505_441777_441862_442575_442683_443096_443216_443440_443596_443701_443892_444526_444701_446045_446207_446495_446724_446985_447178_447263_447443_447733_447886_449717_449827_450934_451044_451469_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
895381	contig_12019_pilon	+	2606	11	Intergenic	novelGene_87750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	132.338240882974	18	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	317	1144	633175	639789	TRUE	50	ATGCATAAAAATATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAARCSSGYRRPCNWR	628115	643211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_628324_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637912_639746_639833_639942_640142_641782_641874_642082
895382	contig_990_pilon	+	2742	8	Intergenic	novelGene_76043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_1	51.0362016371812	467	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	249	1040	880846	890739	TRUE	45	TAAGACCTCTAATATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQKSDLNVTSLEKGDPLKSTSPQISVSEFSCHCCYDILVNPTTLNCGHSFCRHCLALWWASSKKTECPECREKWEGFPKVNILLRDAIEKLFPDAIRMRFEVIQQNNDIVQSLAAFQKYGNGHIPVAPNTGRANQLRGGGFFSGVLTALTAVAVVLLVYHWSSRESEHDLLVHKAVAKWTAEEVVLWLEQLGPWASLYRDRFLSERVNGRLLLTLTEEEFSRAPYTIENSSHRRVILMELERVKALGVKPPPKISGNIRP	870365	896293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_870541_880772_881109_882959_883165_884143_884314_887018_887166_890732_890907_893234_893438_894961
895383	contig_20314_pilon	+	1089	7	Intergenic	novelGene_125628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	379	junction_1	225.938536381517	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	27	803	1482	24277	FALSE	35	TCTACATAGCAAAATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGTVYTAMDVATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATKNNH	1455	24563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_1506_9149_9263_13078_13197_17633_17734_18795_18993_21508_21647_24190
895385	contig_1107_pilon	-	1779	2	Intergenic	novelGene_126559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	167	535	237184	236816	TRUE	80	AACAAAAAAAAAGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTINNNAQTPEQKLDNWELLKIKHLGSSKDFTKRIKRQRTHWEKVFGYDKSDQHLISKIYKILQNLHNKKTNNPIKKWAKDMKRHFAKDTQAANRHMKKCSQSLEKCKSKLQRDIISPQQG	237350	235374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_235531_235727
895386	contig_13740_pilon	-	2559	9	Intergenic	novelGene_34657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	3333.19690528102	77	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	164	1060	165243	158585	TRUE	30	CTTAATTTTCCTCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNKFTCNLYVEIGLELMT	165406	156350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
895388	contig_3948_pilon	-	2425	7	Intergenic	novelGene_53199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	300.421740595154	132	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	38	526	866476	847907	TRUE	20	GTGTCATGTCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSWPRCGEKESWCGQRG	869605	839138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_847957_852463_852636_856565_856712_866355_866480_869571
895389	contig_6283_pilon	-	3052	16	Intergenic	novelGene_100209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_8	160.96633188341	588	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	89	2149	641399	611758	FALSE	20	CATGAATCTGTTACTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEYLSLVARLIIHFRDIHNKKSQASVSDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQVSQSSLPMLSSPSPGQQVPTPQSMPPPPQPSPQPGQPSSQPNSNVSSGPAPSPSSFLPSPSPQPSQSPVTARTPQNFSVPSPGPLNTPVNPSSVMSPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	643997	610854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526_615664_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_642229_642260_643944
895390	contig_10753_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_105154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1131	1571	367545	367985	NA	30	AGAAGTTTGAACTGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGEPENDKSKPNPAISILGSIFAQRHASDFCSPGDLRNPRLETSNCARGAEGPQEALMVELRGEEEKLQASLHGLQGHVTCFVYRAPLMSSLGGKKFQRQRRKKRKTTKLVQPFHFTAEQTDGPREKGFTQDHRAWYQQAKPWL	366414	368196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_366400_368200
895391	contig_5136_pilon	-	4805	34	Intergenic	novelGene_126615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	415.32973613183	11	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	1234	2973	251530	223407	TRUE	55	AGTACAGAAAAAAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWIVDPERSLLTEADAGHMEFTDEVYQNESRYPGGEWKSAEDTYTDANGDKSASPSELTCPPGWKWEDDAWVYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNRPKSWVAAEKMYHTHRRRRMIRKRNKDLTQSASSTARAMQELEDQEGWEYASLIGWKFHWKPRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGTDTTEDGDEKRGEKQNHSTTTVFGANTPIVSCNFDRVYLYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEIEIYGEPQTVLQNPPKVIIELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPLVKLNSEIDITPKLLWHPVMCGDKACGDILVTAELILRDKDGSNLPILPSQRAPHLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASITSPSLIVECGGERIESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIEHRPFGQKPVVGQCTINHLDRFRCDPYVTKEDIVPQLKASLMAAPPCRDVVIEVEDTKPLLASKVGGRNS	275560	192723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_193213_195453_195554_197575_197718_201574_201671_201758_201848_204075_204216_206291_206441_207167_207339_211313_211406_211835_211992_220871_220998_223324_223424_227936_228018_232929_233096_235181_235344_237070_237170_237292_237452_237697_237880_240029_240108_241526_241636_242519_242694_245287_245434_247228_247335_248927_249043_251384_251549_252322_252423_254833_254966_257705_257862_258803_258997_261534_261642_267825_267951_269302_269481_274623_274741_275453
895392	contig_5258_pilon	+	4634	4	Intergenic	novelGene_100234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	536	907	133226	133597	TRUE	35	AAGGTACTCTTTATACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHLYNENYKTLLKEIKEDLNKWKDAPCSWIGRLNIVKMSILNTQSIVKMSILLKAIYRLNTNLIKIPTAFFTEIEKAILNFIWNGRRVRTAGIMLKENKVGGLTFPDFKLYYTAQVIKTTCY	132036	307045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_132256_132909_135633_140195_140508_305665
895393	contig_4114_pilon	+	2142	4	Intergenic	novelGene_15592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	818	junction_2	186.291885670489	17	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	914	1357	232372	249670	FALSE	15	TGTGTTGTTTTTGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGTITEFCTEASCLVMSAGPRYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDSVMQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLGSKDR	231458	250455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_232440_234095_234230_247835_248000_249592
895394	contig_4339_pilon	+	1549	2	Intergenic	novelGene_146077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_1	0	89	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTATGCTCTAAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037705	1044594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037995_1043334
895395	contig_1735_pilon	+	2717	8	Intergenic	novelGene_106892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	830	junction_1	373.700960880843	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1071	1460	134293	138521	FALSE	5	CCTGTCCGGCTCGCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGASNQRDNTEHKPSASNHSQDHSDTVSIASFIDSFSHGNISV	126292	139778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630_136761_137703_137757_138447
895396	contig_7056_pilon	-	1902	13	Intergenic	novelGene_43642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1071.31597100119	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	531	1394	726042	723226	TRUE	25	AACATTTGGCATGTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730443	722126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_726074_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383
895397	contig_7171_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_101247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACTCAATGTCAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750770	748077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_748100_750800
895398	contig_13014_pilon	+	3612	3	Intergenic	novelGene_169349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	337	80	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTACATTTCTAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398109	402486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_400990_401673_401737_401817
895399	contig_10734_pilon	+	2284	9	Intergenic	novelGene_51468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	417	776	2265456	2265815	TRUE	50	AAATATCCATCTATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265039	2281291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266074_2267089_2267192_2269290_2269431_2270438_2270557_2270956_2271050_2274374_2274509_2275753_2275884_2277108_2277192_2280841
895400	contig_5258_pilon	-	2051	14	Intergenic	novelGene_100229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	81.4232858541704	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	661	2049	227517	62405	FALSE	30	GTAATGTACGTTAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLRVFAYDHCFWSMDESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGLFARTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKNIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKSPELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVLLTPQKNT	248766	62402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_62534_70947_71083_75784_75896_97662_97876_112359_112472_113950_114064_116236_116372_117308_117397_120813_120995_122677_122771_124268_124330_227499_227605_237939_238400_248653
895401	contig_19986_pilon	+	2039	4	Intergenic	novelGene_159221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	8.49836585598797	841	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTAAGGCAAAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2858	16476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_+_3016_9334_9483_14462_14554_14833
895402	contig_13700_pilon	-	5353	2	Intergenic	novelGene_68293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	636	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCAGCATGCACATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152856	147206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_151876_152172
895403	contig_6885_pilon	-	5143	1	Intergenic	novelGene_83678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	830	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCTCAAGTGAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215639	210496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_210500_215600
895404	contig_8617_pilon	-	868	2	Intergenic	novelGene_73382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61821	60778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_61098_61272
895405	contig_14986_pilon	+	2132	2	Intergenic	novelGene_59728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	742	1584	151004	151974	FALSE	15	GCATAATGTGTCTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEEQISGSAG	150262	152522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151821_151948
895406	contig_11896_pilon	+	6268	2	Intergenic	novelGene_88018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4352	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTCAGTAATGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149673	159005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_151407_154470
895407	contig_4339_pilon	+	2507	15	Intergenic	novelGene_146079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	97.3817440880613	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	348	2153	1045769	1076107	FALSE	15	CATTTTTGTGAGTCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVKVTIKTICALICGCPIVKPEYFTEFLQAVQSNKQPPQIESFYPPIDEPAIGNKNIDLSGRQERKQIFKGKTFVFLNAKQHKKLSSAVAFGGGETKLVTEENEEEDGFYLAPGTCVVDVGITNSQTLIPDSQKNCINSIMDLLKRQGLRPIPESEIGLAVIFMTTENYCDPRGQPSTGLRPTTPGPSLSQGLSFSEKLMSGVPVNTTVYVPNTESEQADTCMGFSERPKEMKSSRMEQKFRMLSQETSTVKEPPKTSCNNIISHTLVKMKVPDYQLSPAKFTGVSKGRDRASQQQQTNSIKNYFQPSTKKRGRDEENQEMSSSKSARIEMSCSLLEQTQPATLPTWKNEEQHPSQNEPVDKKSDNLFADTNLKSNVKNLTNKSLPTEKLISKRRKDIDDLAIEDEVLEQLLKNTKPELEIEMRVKKEEDVNIRKKPRLIIESNSIFNDEAIPKSNEVSQENEIGKKCETKEESLWSTKEELSNNHELQDDGEMLPKKVILTEFRSLVVSNSTSRNPSIVNNDYGQLKNFKKFKKVTFPGAGKLPHIIGGSDLIAHHARKNTELEEWLRQEMEVQNQHAKEESLADDLFRYNPNVKRRR	1037873	1076461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037995_1043334_1043469_1045676_1045796_1048186_1048291_1049800_1049919_1050550_1050745_1052479_1052578_1060595_1060726_1062166_1062437_1064441_1064884_1068673_1068746_1069966_1070123_1072078_1072193_1074868_1074919_1076076
895408	contig_7076_pilon	-	2319	4	Intergenic	novelGene_178671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAGGACTAGAAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60079	41114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7076_pilon_-_41968_46399_46606_58774_59170_59214
895409	contig_13425_pilon	+	4227	3	Intergenic	novelGene_170840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	108	junction_2	280	476	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	697	1917	61112	62332	FALSE	35	CAGAGCTAGCAAATCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKLFLKKKVVVKICKRKYRGSEIEDLVLLDEESRPVNLPPALKHPQELP	59482	64642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60530_60980
895410	contig_16303_pilon	-	2522	6	Intergenic	novelGene_34029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	787.581767183573	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	33	593	47976	35759	TRUE	45	CAACTCATGGATAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48008	31496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35442_35764_35980_36029_37169_37302_40433_40731_47897
895411	contig_10953_pilon	+	2783	8	Intergenic	novelGene_42529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	173.503984545201	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	367	606	155405	160750	FALSE	35	AGCCCAGAATGCTGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRKCEHNLSKPEFNPTSIKFKIQLVAVNYIPEVRIMSIPNLRYLKESQVLLTLTNPVENLTHVTLLECEEGDPDNISSTAKVVVPPKELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFQDDPD	144753	162927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_144798_145018_145132_145408_145519_151635_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_160746
895412	contig_9696_pilon	-	2720	11	Intergenic	novelGene_68808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	343.515196170417	32	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	941	1525	383342	378163	FALSE	45	CCCCATATGAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGQRLGAAVPRPGEGIPVPGGRRRSGWASFPRSGVGDFFERTILCNSLVWSCAVTGRPGLTYQEALESEKKARQNLQSFPEPLIIPVLYLTNLTHRSRLHEICDDIFAYVKDRYFVEETVEVIRNNGARLQCRILEVLPPSHQNGFANGHVSNVDGETIIISDSDDSETQNSSFQNGKKKDAVDPLLFKYKVQPTKKELYESAIVKATQISRRKHLFSRDKLKLFLKQHCEPQDGVIKIKASSLSTYKIEEQDFSYFFPDDPPTFIFSPASRRRGRPPKRIPVSQESIANKQTATGYRNKTTKERDKLLKQEEMKSLASEKAKLKREKADALEAKKREKEDKEKKREELKKIVEEERLKKKEEKERLKIEREKEREKLREEKRKYMEHLKQWSKPREDMECDDLKELPEPTPVKTRLPPEIFGDALMVLEFLHAFGELFDLQDEFPEGVTLEVLEEALVGNDSEGPLCELLFFFLTAIFQAIAEEEEEVAKEQITDADTKGQSSNYC	439843	376967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_378333_379621_379761_380486_380583_382568_382736_383329_383427_385912_386048_396444_396533_399959_400062_410407_410552_429657_429937_439735
895413	contig_8614_pilon	+	4096	4	Intergenic	novelGene_178030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1313	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	155	409	167618	167872	TRUE	20	CGATCCATAGGCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPRWWCSQTLPISLLQQRPGKTSDLIIYEYLGALNKAKLRNRTEWWGESKMVRTKPAAPEWWRWDGNSSAVPATLQPHRVCSKADKHLCAHLESSFHIKTDPAAEILLGHSEPVESSSQVAKDKYMRAAFCRDF	167463	202501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8614_pilon_+_168476_168518_169384_200012_201712_201981
895414	contig_18162_pilon	-	3571	3	Intergenic	novelGene_122272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16567	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
895415	contig_3956_pilon	+	2938	15	Intergenic	novelGene_15018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1123.16386214323	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	81	2417	1281682	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286595_1287505_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
895416	contig_4674_pilon	-	3955	4	Intergenic	novelGene_174136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCTAGGGAGGGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374770	114447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_115110_115200_115989_300459_300747_372552
895417	contig_10009_pilon	+	2368	2	Intergenic	novelGene_82717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCAGCCCCTTGCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41118	43813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_42000_42326
895418	contig_4857_pilon	+	3268	2	Intergenic	novelGene_48737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	346	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	817	1395	1194283	1194861	FALSE	70	AAAAAAAAAACCCACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	1193155	1196734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1193206_1193516
895419	contig_9109_pilon	-	1529	3	Intergenic	novelGene_175310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	93	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	95	1099	20698	17171	FALSE	15	CACCTCAGTCTCTTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVTGADVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYREVMTETFRNLASVVSRNPNDGEKLSTENIIVRFMRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19106_20664
895420	contig_5236_pilon	+	2726	13	Intergenic	novelGene_100954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1468	1779	1007879	1008751	TRUE	15	TGCGCCAGGCTCGGGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLKPFSNNQKEILARLVDFPTPLTPQKVTTYGRWRRWASMMSRSMSTRRCGCRICTKDSCRACFTVDVTVLNVPITFPSNLLATDSQSWTAMSAATFLAMR	1005867	1011781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1006897_1007033_1007138_1007224_1007386_1007705_1007922_1008027_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009056_1009471_1009625_1010131_1010289_1010451_1010616_1010910_1010993_1011593
895421	contig_17753_pilon	+	2530	4	Intergenic	novelGene_105068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1223	1678	48916	49371	TRUE	65	CCAGATACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAGSPAPLLKPATITELAITYTGALVPEVWWGGSLCGWGSEGSSEVLDLGCSGALVRLVSVSFLHQGARPPPPVHHAVARFLAALRTGPLRCVSFEPPGQLTLLESVPVWKAADSEGLYLDRALLCGVLTLTLTSGPLPNHKKQQETEK	47614	56251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_48449_48527_49832_55654_55777_55981
895422	contig_2703_pilon	+	4410	16	Intergenic	novelGene_101718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	949.152229916548	1175	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	288	1571	559489	610870	FALSE	10	CCTCTCTGTGATGTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526179	613709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
895423	SIRV3	-	1500	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	1013	2045	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	14	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAATCTACCACATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8901	6714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
895424	contig_6503_pilon	-	2553	8	Intergenic	novelGene_145767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTACCGGAGTCAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154812	140414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_140538_144426_144543_146768_146845_149649_149722_150050_150098_151127_151230_151796_153110_154108
895425	contig_5803_pilon	+	5476	6	Intergenic	novelGene_178672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	172	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4244	4609	111344	111709	TRUE	20	CCCAGCCGGGGCGAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKCPGISPARQPRPGSSHTPERSPTAPQERAKTALGARHPSKRRGKQREASKNPKEAEKATPAANKRPPESCPHGRAESKQPVALGQEPVAPGSRGANEQRPWDLISAAAQAWKQSHAQT	19852	112869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5803_pilon_+_21603_78274_78703_82510_83385_110023_110210_110338_111910_112202
895426	contig_10642_pilon	-	2786	1	Intergenic	novelGene_78744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	852	1355	1288695	1288192	NA	20	ATTTCTGCAATTTTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPNLSISPSSRNEDRNKKPGTPGTPGSHDLETALRRLSLRRENYLSERRFFEEEQERKLRQLAEKGELLSGSLTPTESIMSLGTHSRFSEFTGFSGMSFSSRSYLPEKLQIVKPLEGDHKGPRPLSTLVSDSLWALIHHRKAGNPCNAYSFFFRDSHPRCWFEFL	1289546	1286760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1286800_1289500
895427	contig_7066_pilon	-	4883	5	Intergenic	novelGene_42138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.613947443815	771	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	443	472	734347	734318	TRUE	40	AAAACAGTAATTTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSVNSREPSQVIFCNRSPRVVLPVWLNFDGEPQPYPTLPPGKGRRIHSYRGHLWLFRDAGTYDGLLVNQTELFVPSLNVDGQPIFANITLPVYTLKERCLQVVRSLVKPENYRRLDIVRSLYEDLEDHPNVRKDLERLTQEHIENQRMEQETVDFH	738362	727628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_727894_729090_732670_733750_734515_735774_735898_738210
895428	contig_546_pilon	+	4897	8	Intergenic	novelGene_117206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1022.69956886823	122	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	240	1574	119834	152874	TRUE	60	CCCCAAAAAAATCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDNSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	103330	156561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_123934_124065_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_154720_155083
895429	contig_1516_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_49945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242349	243394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_242300_243400
895430	contig_13244_pilon	+	3500	11	Intergenic	novelGene_86989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_9	127.411498696154	859	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	421	2094	466876	471904	TRUE	35	CATTAAAAAATTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGRQQRGPFQGVRVRNSVKELLLHIRSHKQKASGQPVDDFKTQGVNVEQFTELKNTVSYSGKRKGPDSLSDGPACKRPALLHTQFLTPPQTPTPGESMEDVHHSESKHDSNADLLQSIINIKNECSPVSLNTVQVSWMSPVVVPQSSPREQFQDFHGGQVFSPPQKYQPFQVSGSPPVMDQASLYQYSPQNQNVQQQQHHYIHDPNLEYTPYSRLQSPNYEPNLFDGQELQFCPNQSFVSLLSNHGESENVAVPIQTPPSIQQHSNAHLQTFSMMPNSACEALAEHKAGSPPLNTSLPFQNITENPVNTTQLGKSFFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHIAVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKVMTFFTPSSSF	464147	476249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_464557_466864_467005_467521_467553_467672_467777_467877_468654_469348_469455_469834_469982_470172_470237_470522_470693_471757_472131_475069
895431	contig_15405_pilon	-	5984	11	Intergenic	novelGene_112097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	856	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGACACACACGGACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149107	68304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_-_68412_100550_100700_103491_103559_114074_114142_118483_118596_130537_130685_133278_133370_137789_137920_142530_142924_143068_143150_144467
895432	contig_6230_pilon	-	3267	12	Intergenic	novelGene_102103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	25.3089994773688	487	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	143	1615	181988	166056	FALSE	10	TGCTGTTTGCAGTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRIKSAAASRVEGSSGAPTKGKRKPRQEEDEDYREFPQKKHKLYGRKQRPKTQPNPKSQTRRIRKEPPAYAAGSLEEQWYLEIVDKGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDQRRSNEQLVVSTSCKEPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182130	164403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179926_180772_180857_181156_181253_181942
895433	contig_262_pilon	-	4163	2	Intergenic	novelGene_140613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3482	3802	29228	28863	FALSE	55	ACGCACACATCCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANNTQKTAEVAILISDKMDFKVKSTTKDKEGHYIMVKGSIHQEDVTTVNIYAPNDRAPNYIKQILKALEIDSSTIVVEDFNTPLSVKDRTFRKKLNKDIY	32709	28501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_-_28874_28918
895434	contig_5696_pilon	-	3365	6	Intergenic	novelGene_117596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	205	junction_5	434.889135297722	43	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	45	722	773050	764483	TRUE	55	AAAAAAAACCAAACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGGGGGVLEQEDSVLFRRGTGQSDDSDIWDDTALIKAYDKAVASFKHALKNGDICEASDKPRGTPKRKPIKKNKSQKKNTTTPLKQWKVGDKCSAIWSEDGCVYPATIASVDFKRETCVVVYTGYGNREEQNLSDLLLSTFGGVSNGDQNAQENAQENENESQISTDESENSSRSPGNKPNNLKSKAAPWNSFLPPPPPMPGLGVGPGKVNLLPREGFPGNSS	773094	756515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_756959_762282_764684_764836_765050_765887_766008_767711_767784_772978
895435	contig_7728_pilon	+	2334	1	Intergenic	novelGene_64727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAAAAAATTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752336	754670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752300_754700
895436	contig_5779_pilon	-	3959	2	Intergenic	novelGene_106530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	986	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2761	3243	340171	339689	FALSE	25	TTCCTAGGAATCTCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSIEVEEKATPAANKWHSESQLVRAGGIQAAGASRNRDCVRGKQRRPSVVWVKKGGAWESVYHNLPELRSPSGRSKDGAQSQVFERKEGEVLRGKEKNQKKWKKGTPATKKWHSESWPVGRVESKQPVLPGQETVATGSRGGRVGVKKVGGWLSVYHK	343016	338972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_342672_342756
895437	contig_1275_pilon	+	2679	20	Intergenic	novelGene_108764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCTCCCCCCACCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400576	546957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456934_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409_464583_468120_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486075_495660_495854_505867_506006_513629_513804_546775
895438	contig_3584_pilon	+	6090	8	Intergenic	novelGene_108144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	117.950006704674	227	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1437	1856	353361	355330	TRUE	25	AGAAAACGGTTTGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESVSA	340890	368895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717_353469_354411_354619_355225_356548_365878
895439	contig_8978_pilon	+	2792	12	Intergenic	novelGene_49456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	210.17269561832	61	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	851	2683	1749586	1772309	FALSE	75	AAAAAAAAGGAAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680785	1772418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
895440	contig_13780_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_149055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	445	1338	26	1363	605691	607028	NA	55	TAAGAACATTGTAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGDIQQARKRAAQETERLLKELEQNANHPRRLEIQNIFKEAQALVKEKIVPFYSGGNHVTDEFEEGIQDVILRLTHVKTGGKISLRKARYHTLTKICAVQEIIEDCMKRQPSLPLSEDAHPSVAKINSVMCEVNKARGTLIALLMGVNSNDTCRHLSCVLSGMMADLDALDVCGRTEIRNYRREVVEDINKLLKYLDLEEEAGSTHAFDLGQNHSILKIEKVLRRMREIKNELLQAPNPSELYLSCKTELQGLIGQLDEVSLEKNPCIREARRRAVIEVQTLITYIDLKEALEKRKLFVSEEHPPLKAVWSVLGNLSEIQGEVLSFDGNRTDKNYIRLEELLTKQLLALDAVDPQGEERCKAARKQAVKLAQNILGYLDLKSDEWEY	605665	607678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_605700_607700
895441	contig_6102_pilon	+	1629	6	Intergenic	novelGene_31970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1112.02273358057	13	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	37	669	413086	415242	FALSE	10	CAGATTTGGTCCTGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEGEGPGGALMEEAAVWDRSRTSIWGFPYLWTWAPKGARRQGAGPSPAQARSGRSEYDRKGVMSVSCLHH	413049	416202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413089_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_415137_415217
895442	contig_7051_pilon	+	5730	2	Intergenic	novelGene_64366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1226	junction_1	0	96	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	5021	5728	346903	347610	FALSE	70	AGAGAAACAAAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQDKR	341608	347612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_343100_343373
895443	contig_9049_pilon	+	2820	6	Intergenic	novelGene_83120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	190	junction_2	1677.53037528386	126	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	112	360	88356	104397	TRUE	15	TTAATGATCTTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APREDARARRGPGDCSRLPAALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKAHGENNHPLCGHHQSRRSPREICGVGFIHLLESIGYG	88244	114796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569
895444	contig_11427_pilon	+	4566	5	Intergenic	novelGene_78996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1042	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	4161	4478	597431	655629	FALSE	10	CTCCTCACTCGCCCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALCVRFSSFSSFLATSLLRSLEQGGTYHFLNDRLWLGGLQLLFHLLFHRNWFGLGYPPLLQVLILWDIVPQPELPVLLAFLLLFSELLGIWLPIFLVLAPSFLP	593270	655717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_597507_598871_598942_601035_601115_623518_623587_655604
895445	contig_10197_pilon	-	3215	6	Intergenic	novelGene_115297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	35.319116636745	347	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	180	1397	1281709	1270593	TRUE	25	ATAAATGTGCCCCTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEASQTISDLEGIFAARPTLAASHFQVLQRNLHHLKTKVQEKENISETFPAAPTKAFKDMDLMEESEQIPSASSSVSLCTDPLKGRYLIATKDILPGEILVKEDAFVSVLNPGEMPQLHHGLESKWDTRVTNGDLHCHRCLKHTLATVPCDQCSYAKYCSQECMQQAWELYHSVECPQGGLLLTLGVFCHIALRATLLARFEDSGKVIRKLCGEISNKDICLPESENMLKTLSCNLGENEENGKIVETPIPGCDINGKYENNYNAVFNLLPHTENHSPEHKFLCALSVAALCRQLEAASFWALKPDLKSSKPKAAVTPALSPELNIWGVVMLRHVLQLQCNAQAITTIQQTGSKESIITDSRQVRLATGIFPVVSLLNHSCSPNTSVSFISTVATIRASQQIGKGQEILHCYGEPSFLLPVRPFPAEKDRVEKYEQAAVQVPIVCLLEEAGHSRVEKKKKGHPY	1281888	1265169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1265949_1267278_1267403_1267602_1267720_1268569_1268703_1269927_1270934_1280832
895446	contig_610_pilon	-	2715	6	Intergenic	novelGene_76811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	106.38984913985	102	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	83	1447	338871	331286	FALSE	15	TACCATTGAGCGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLWLGQAAPEASPCCVSAGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	343502	330017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456_338873_343421
895447	contig_4486_pilon	-	3892	2	Intergenic	novelGene_38549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTCCTCCTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138868	134807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_135699_135867
895448	contig_16110_pilon	-	4782	1	Intergenic	novelGene_126781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2170	2538	49310	48942	NA	30	ATTCACTGAATACACGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKFSITSFHRCSQLYSCVFHLVRSTYIVTLYVVEKGICNEVAGLAKFYRAISGVVCVTKAIFSNYQSFFCVSNFCIPITSNYQCILIAHLINFRLQKLVKILNFLIFGLTGWINLNKSRY	51479	46697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_46700_51500
895449	contig_18163_pilon	-	3666	6	Intergenic	novelGene_35301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2381.99350125058	805	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	431	1006	10631	9401	TRUE	50	CTATATAGAAAATGGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11567	6305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_8779_9213_9721_10375_10681_10751_10821_10991_11226_11489
895451	contig_6364_pilon	+	4109	3	Intergenic	novelGene_51718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCTCGTGGCAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433207	437492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_433347_433386_436283_436418
895453	contig_7744_pilon	+	1386	2	Intergenic	novelGene_62447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	64262	69234	FALSE	60	AAAAATTTAAAACAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSHAAERSRSPAFRPRSPRSGTRRLAPGRARTPPALPWARAASPKPRGGAAQSRPPAPPRRGPSLEQVHFEGKTSSFSSWVGVSPEEFPFILSVVLSCLSLEKSGLGFKFTAWDSGSCLFVQC	64261	70248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_64458_69058
895454	contig_8964_pilon	-	926	3	Intergenic	novelGene_168704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	81	junction_2	33.5	95	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549571	542816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543520_547370_547457_549434
895455	contig_5845_pilon	-	2051	2	Intergenic	novelGene_98886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	558	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGAACATTTTCTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104197	71728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_-_72312_102729
895456	contig_4131_pilon	+	1517	8	Intergenic	novelGene_127839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	100.489414611588	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	440	1387	91526	97745	FALSE	50	TATAAAGACTGTAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85378	97875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85738_90247_90438_91474_91571_93097_93329_94308_94332_94426_94540_97209
895457	contig_10930_pilon	-	2315	7	Intergenic	novelGene_37023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	4	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	671	1519	276835	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276945_278443_278637_279700_279832_280157
895459	contig_9682_pilon	-	3132	4	Intergenic	novelGene_125296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	2645	3130	27240	22647	FALSE	10	TTCCAGGTGCTTTGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCRVIEGDSQSLGLEEWCAPSVLRGGCRGAASCGLLNGHLLNVVTEQLVLLFVQVPDHGLLLQKVIAQLLVQSESQHVVYECAQLSKGDILIEPQAVITLLLGHVAPLLLISNLLAHRMSLVLLQFSRGGPQDIRGVTVVGGITVSLIMLRHNNTQKYQEC	29884	22644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_22802_24144_24225_24853_24948_27083
895460	contig_3975_pilon	-	3702	12	Intergenic	novelGene_54790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_11	254.695280581351	29	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	2404	3102	2018590	2016131	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2052476	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502_2018612_2019775_2021739_2023262_2023338_2027088_2027207_2044817_2044931_2052363
895462	contig_4742_pilon	+	4822	14	Intergenic	novelGene_130981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_2	312.783627501722	28	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1313	3942	460	4401	254300	285679	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAACTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCGRCDDWFHGDCVGLSLSQAQQMGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGLLKHTPTNEKNKYIDDTVKHKVKILKRESGEGKNSSECRDSEIKKWQLAPVRKMGQPVLPRRSSEEKSEKITKESTTVTCTGEKASKLGTHEKQEIKKKKVDKGGVPNVHPSAASTSKPSADQIRQSVRHSLKDILMKRLTDSNLKVPEEKAAKVATKIEKELFSFFRDTDAKYKNKYRSLMFNLKDPKNSILFKKVLKGEVTPDHLIRMSPEELASKELAAWRRRENRHTIEMIEKEQREVERRPITKITHKGEIEIESDAPMKEQEAAMEIQEPTANKSLEKIEESEKQKEEIDSMSKDTTSQHRQHLFDLNCKICIGRMAPPVDDLSPKKVKVVVGVSRKHSDNEAESIADALSSTSNILASDFFEDEKQESPKSTFSPVSRPEMPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGLELHRPNLLLGLIIRQKLKRQHSASASTGHAAEAPESVPMSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPKAEKIDKIEEVADGEAKEVKVKVDNHSEATGNSVAVEEETSVPGSSSISPGLLTNLSLRGKPPDISTEAFLTNLSIQSKQEETGDSKERTLKRQLLQDQENNSQDNWTSDTGSPGRSNVGKGSTDGNMSCNDSLVANTRSPQFINLKRDPRQAAGRSQQISTSESKDGENCRNGEKHAPPGLSQNKEHLTEQTSVDEKSSSVEKNSCVQQSDNSSIPQNSASEENIHTFQTEQAKPVQEDVLMQNIETVHLLRRGSAVTTSHFEAGNTCQPDFPSKSINFTSRSTSPRTNANFSPVRPQQPNLQHLKSSPPAFPFPGPPNFPPQNIFGFPPHLPPPLLPPPGFGFPQNPMVPWPPVVHLAGQPQRMLGPLSQASRFIGPQNFYQVKDIRRPERRHSDPWGRQDQQQLDRAFNRGKGDRQRFYSDSHHLKRERHEKEWEQESERHRRRDRTQDKDRDRKSKEEGHKDKERARLSHGDRGADAKASRDGRNVDKKPDKPKSEDHEKDKEREKSKHREGEKDRDRYHKDRDHTDRAKSKR	190899	286100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_242103_242266_254295_254606_263142_263327_267145_267297_267378_267536_268999_269117_270854_270987_271584_271721_276598_276795_278132_278281_280583_280674_283132_283329_283550
895463	contig_13702_pilon	+	2669	2	Intergenic	novelGene_102633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2057	2356	211071	211370	TRUE	30	CCAATGCCCATTTCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	209014	266065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_211636_266017
895464	contig_5039_pilon	+	3577	1	Intergenic	novelGene_64878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACCAGTGTTAATGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415410	418987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_415400_419000
895465	contig_5765_pilon	+	2951	2	Intergenic	novelGene_141378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	24	356	547101	547433	TRUE	25	GTCACTGTATCTGACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRAPKYMKQTLTALKRETDSSTMIVGDFNTPLSVRDKTSRKKLNKDTEDLKATVSQLEPIDIYRTLHPTDAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGHKKPSTKTKTLRQYKIPSLITRPSK	547077	552299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_547740_550010
895466	contig_12379_pilon	+	3323	8	Intergenic	novelGene_148927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	223.917714478205	1109	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	213	920	79092	110292	FALSE	35	TGAATATTTTGTCTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWDKSENGDWHCTASWKVLASCSFDRTAAVWEEIVGESNDKLRGQSHWVKRTTLVDSRTSVTDVKFAPKHMGLMLATCSADGIVRIYEAPDVMNLSQWSLQHEISCKLSCSCISWNPSSSRAHSPMIAVGSDDSSPNAMAKVQIFEYNENTRKYAKAETLMTVTDPVHDIAFAPNLGRSFHILAVATKDVRIFTLKPVRKELTSSGGPTKFEIHIVAQFDNHNSQVWRVSWNITGTVLASSGDDGCVRLWKANYMDNWKCTGILKGNGSPVSGNSQQGNSNPSLGSNIPNLQNSLNGSSAGRKHS	75541	112695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_75595_78739_78833_79025_79238_99540_99640_105779_105921_106144_106303_108817_108969_110279
895467	contig_11982_pilon	+	2866	3	Intergenic	novelGene_100257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7627	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1301	1756	96245	96700	FALSE	60	AAAAGTATGTATTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTQPLSSVKEQDKQLDIGHCEGLCRGCCGQKEKGHLIRAGGQGGHCSKRLPAKGNISTEVGRMSKMSQEKKITSAEEAQRGKVQRAGRSTPRKHSSDSGAKSYRHHEQKGFLSRSGQPSIHLSFGGVMPSRLKMGTLLLTLMSLPHNTYS	94048	97810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_95015_95236_95417_96090
895468	contig_8354_pilon	-	3998	5	Intergenic	novelGene_24145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1161	junction_4	326.591487947864	8	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	912	1616	551216	537192	FALSE	20	AAACAGCCTTGTCCGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLCSKDSECLVLEQSRVFFSFCRYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKDLLTRHKLLSAEFLEQHYDRFFSEYEKLLHSENYVTKRQSLKLLGELLLDRHNFTIMTKYISKPENLKLMMNLLRDKSRNIQFEAFHVFKVFVANPNKTQPILDILLKNQTKLIEFLSKFQNDRTEDEQFNDEKTYLVKQIRDLKRPAQQEA	552127	534809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_537381_538002_538147_539084_539151_543399_543460_550970
895469	contig_10286_pilon	-	4414	7	Intergenic	novelGene_98401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_4	145.974598246864	388	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	352	1566	406140	382865	FALSE	35	GAAAAAGCTGGTACTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHIILRKKLSCFVLAFFLFAIVCVWKEMKKGSYYDSLKWETEGSPLVMGLGKMAMGSGPQSKVSTQHLRRSNQALNCTKASAKAKPQPSFQVWNKDSSSKNLPSRLQNIRKNYLNMNKYKVSYKGPGPGVKLSAEALRCHLRNHVNVSMVESIDFPFNTSEWEGYLPKENIRTKAGPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIDDHDAVLRFNAAPTANFQQDVGTKTTIRLINSQLVTIEGRFLKDSLYNEGILIVWDPSVYHSDIPEWYQHPDYSFFNNYKSYRKMHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	415536	380016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405539_406192_410089_410233_415379
895470	contig_9290_pilon	+	2457	3	Intergenic	novelGene_77516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115621	295952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_+_116725_294534_294765_294828
895471	contig_5684_pilon	-	2501	1	Intergenic	novelGene_81076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGTGTGTGTGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450404	447903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_447900_450400
895472	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
895473	contig_12414_pilon	+	1553	4	Intergenic	novelGene_59613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	114.845790325791	393	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	104	415	527729	534129	FALSE	35	TCTGACCTTAAAGACTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKERSEQRHRGTSYHQESSAGSGAHPLDLRFLL	527625	535267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_534034
895474	contig_16578_pilon	-	2856	1	Intergenic	novelGene_148609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTATTTGGGGGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16700	13844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_13800_16700
895475	contig_12635_pilon	-	2904	15	Intergenic	novelGene_60866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_7	468.898279948621	310	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	101	1822	656018	630724	FALSE	75	CAAGAAGGAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPKFYRWISERYPCLSEVVKEHQIPEFDNLYLDMNGIIHQCSHPNDDDVHFRISDDKIFTDIFHYLEVLFRIIKPRKVFFMAVDGVAPRAKMNQQRGRRFRSAKEAEDKIKKAIEKGETLPTEARFDSNCITPGTEFMARLHEHLKYFVNMKISTDKSWQGVTIYFSGHETPGEGEHKIMEFIRSEKAKPDHDPNTRHCLYGLDADLIMLGLTSHEAHFSLLREEVRFGGKKTQRVCAPEETTFHLLHLSLMREYIDYEFSVLKDKISFKYDIERIIDDWILMGFLVGNDFIPHLPHLHINHDALPLLYGTYITILPELGGYINESGHLNLPRFEKYLVKLSDFDREHFSEVFVDLKWFESKVGNKYLNEAAGAAAEEAKNYEEKKKSKGEENVCWAALDKNESEAATSKDNLEDETEDDDLFETEFRQYKRTYYMTKMGVDVVSDDFLADQAACYVQAIQWILHYYYHGVQSWSWYYPYHYAPFLSDIRNISTLKIHFELGKPFKPFEQLLAVLPSASRNLLPACYQHLMTSEDSPIIEYYPPDFKTDLNGKQQEWEAVVLIPFIDEVSM	656118	629641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_630856_632346_632504_633115_633206_637473_637580_637793_637858_639632_639771_640324_640393_641193_641363_641445_641534_642489_642573_643853_643965_644061_644172_645359_645458_649680_649914_655943
895476	contig_3386_pilon	-	3980	5	Intergenic	novelGene_34561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2593	2901	475077	474769	TRUE	10	CCCGGTCCGCCGCGACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSIGPNSPGAKENEEHQRHKESISPTDRKGLINQRLHQPQTRTRWCPATTNDHPDREHNRESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGIPEDTAPRLC	489195	470085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470410_474013_476403_485244_485297_486415_486539_488103
895477	contig_9955_pilon	-	3380	4	Intergenic	novelGene_21268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	824.856081723082	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	208	930	49317	46947	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFERNLECGLQTLMKKICGN	49837	44496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47001_47590_47737_48794_49380_49692
895478	contig_20614_pilon	+	4558	10	Intergenic	novelGene_107518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	64.4291169511977	175	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	169	2100	58672	64723	TRUE	30	TAAACCCTATTGAACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRKQSVSGRRSRGSCSRSSPWPLAQLFEGEELPPHFGIRTSHDGCHLKPSGSPGVMAQKHPGGRGLCGAHHSGGASLRTFGPSVEPDILSFSGQSGMDQELSRENEAGYQEDGNPSFLSIPPTCNCQRTPGIPEGLYSEGGDSSSSNFCHHCTSPALGEEEELEEEYDEEEPLKFSSDFSRVPSGKKPPPRRQRHRFPTKEDTRETGRRDPRSPGRHRLGRKRSQADRRRGLGLWGAEELCQLGQAGFWWLIELLVLVGEYVETCGHLIYACRQLKGSDLDLFRVWVGVWAGRLGGWAQVMFQFLSQGFCYGIGLLTRFLRLVGALLLLALALLLGCLQLGWQFLVGLGDRLGWRGKATWLFSRLDSPALQRCLTLLRDSRPWQQLVRMVQWGWLELPWVKQRTNRQGNAHVASGRYCQPEEEVARLLTMAGVPEDELNPFHVLGVEATASDVEMKKAYRQLAVMVHPDKNHHPQAEEAFKVLRAAWDIVSNPERRKEYEMKRMAENELSRSVNEFLSKLQDDLKEAMNTMMCSRCQGKHRRFEMDREPKCARYCAECNRLHPAEEGDFWAESSMLGLKITYFALMDGKVYDITEWAGCQRVGISPDTHRVPYHISFGSRVPGTSGRQRATPDTPPADLQDFLSRIFQVPPGQMSNGNFFAAPQSSPGTTTASKPNSTVPKGEAKPKRRKKVRRPFQR	58091	68691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_58204_58615_58787_58969_60085_62355_62463_62673_62794_63625_63787_63881_63985_64512_66206_67449_67601_67866
895479	contig_15449_pilon	+	2402	3	Intergenic	novelGene_33622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1972	junction_1	70	384	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	146	490	84815	86207	FALSE	20	ACTTGCAGTCCTAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDPSRSSTSPSIINDDVIINGHSHEDDNPFAEYMWMENEEEFNRQIEEELWEEEFIERCFQEMLEEEEEHEWFIPARDLPQTMDQIQDQFNDLVISDGSSLEDLVVKSYFSSF	62208	88119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_62328_84788_84953_86000
895480	contig_7963_pilon	+	2839	5	Intergenic	novelGene_58519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	235.062225804147	562	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	232	978	194098	199536	TRUE	25	AATGAGCTGGGCATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPLLLGLSLGCTGAGGFLAYVESQCLLDDEGTPKDFTYCISFNKAVLTCWDPEEAMMAPCEFGVLNGLAVYLSKYLNKQENLLQRLRNGLQDCAMHTQPFWGSLTHRTRLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSE	193866	209561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_194153_195026_195309_197688_197974_199411_201124_209287
895481	contig_11629_pilon	+	1716	8	Intergenic	novelGene_161180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	60	ACTAGAAAATGATAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	423807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
895482	contig_17144_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_29153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	240	723	1294	2016	104479	103757	NA	30	GAAATTGCCACAGCTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLTLLKPMLIYHSKNPRALKNYAKSTLPVLYKWNNKAWMTPHLFTTWLTEYFKPTVEIYCSEKKIPFKILLLIDNAPSHLRALMYKEINLVYVPANTASILQPMDQGLISTFKSYYLRIRFCKAIAAIDSDCSDGSGQSKLKTFWKGFSILDAIKNIHDSWEEIKISTLKGVWKKLIPALMDDFEGFKTSVEEVTANVVERARQLELEVEPEDVTELLQSPDKSLTDEELFLMDEQRK	105772	103508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_103500_105800
895483	contig_13680_pilon	+	6153	40	Intergenic	novelGene_149576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	263	junction_18	161.09749744111	863	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1526	4581	50	4630	270728	340245	TRUE	15	TAACACCTGGCTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTNAYDIGHAVIWITAMMGGPSKLVQKHLAGLFNSITSFYHPSNNGRWLNKLMKLLQRLPNSVVRRLHRERYKKPSWLTPVPDSHKLTDQDVTDFVQCIIQPVLLAMFSKTGSLEAAQALQNLALMRPELVIPPVLERTYPALETLTEPHQLTATLSCVIGVARSLVSGGIWFPEGPTHMLPLLMRALPGVDPNDFSKCMITFQFIATFSTLVPLVDCSSVLQERDDLTEVERELCSATAEFEDFVLQFMDRCFGLIESSTLEQTREETETEKMTHLESLVELGLSSTFSTILTQCSKEIFMVALQKVFNFSISHIFETRVAGRMVADMCRAAVKCCPEESLKLFVPHCCSVITQLTMNDDVLNEEELDKELLWNLQLLSEITRVDGKKLLPYREQLVKILQRTLHLTCKQGYTLSCNLLHHLLRSTTLIYPTEYCSVPGGFDKPLSEYFPIKDWGKPGDLWNLGIQWHVPSSEEVAFAFCLLDSFLQPELVRLEHCGDGGHEMSRDDVLQSLTIVHNCLIGSGNLLPPLKGEPVTHLVPTLVSLEETKLYTGLEYDLSRDNHRETIARVIRKLLNHILDNSEDDTKSLFLIIKIIGDLLQFQGSHKHEFDSRWKSFNLVKKSMENRLHGKKQHIRALLIDRVMLQHELRTLTVEGCEYKKIHQDMIRDLLRLSTSSYSQVRNKAQQTFFAALGAYNFCCRDIIPLVLEFLRPDRQDVTQQQFKGALYCLLGNHSGVCLANLHDWDCIVQTWPAIVSSGLSKAMSLEKPSIVRLFDDLAEKIHRQYETIGLDFTIPKSCVAIAELLQQSKNPSINQILLSPEEIEEGLKRQQERNADALRNYENLVNTLLDGVEQRNLPWKFEHIGIGLLSLLLRDDRVLPLRAIRFFVENLNHDAIVVRKMAISAVAGILKQLKRTHKKLTISPYEISGYPKPTQILAGDRPDNHWLHYDSKSVPRTKNEWESSCFVEKTHWGYYAWPRNLVVYAGVEEQPKLGRSREDMTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLINFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVLKPHLERLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGTCIATSCESRDPRKLHWLFELLLESPLSGEGGSFVDACRLYVLQGGLAQQEWRVPELLHRLLKYLEPKLTQVYKNVRERIGSVLTYIFMIDVSLPNTAPTTSPRVPEFTARILEKLKPLMDVDEEIQNHVMEENGIGEEDERTQGIKLLKTILKWLMASAGRAFSTAVAEQLQLLPLFFKIAPVENDNSYDELKRDAKLCLSLMSQGLLYPLQVPLVLQVLKQTARSSSWHARYTVLTYLQTVVFYNLFIFLNNEDAVKDIRWLVISLLEDEQLEVREMAATTLSGLLQCNFLTMDGPMQIHFEQLCKTKLPKKRKRDPGSVGDTIPSAELVKRHAGVLGLGACVLSSPYDVPTWMPQLLMNLSAHLNDPQPIEMTVKKTLSNFRRTHHDNWQEHKQQFTDDQLLVLTDLLVSPCYYA	270678	342294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_270734_272504_272598_273040_273307_275855_276043_276841_276932_277671_277737_278468_278620_279860_279960_280179_280250_280792_280861_289104_289321_290755_290914_292043_292140_299752_299809_301745_301803_301992_302049_302141_302241_303358_303422_303563_303660_305400_305533_307759_307970_308732_308870_309953_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314501_315204_315275_315942_316069_316638_316792_323626_323732_324256_324349_325027_325160_325535_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_334385_334549_338835_338970_340110_340250_340775
895484	contig_4180_pilon	+	2517	7	Intergenic	novelGene_8384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	1550.11251383748	68	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	112	648	875200	888134	TRUE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874313	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888217_889035
895485	contig_12677_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_110816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTTTTAGTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3765	2163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3800
895486	contig_8597_pilon	-	5325	15	Intergenic	novelGene_158694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_13	562.392647352291	367	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	1029	2675	53266	23008	FALSE	20	TTTCCCCCCAGCAGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKEALATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHIVSQLEEMNSMLTKDIELLKKENEELTENMRKTEEEYKLKKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANMQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLAEESTHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQEKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKEVEMEPVQQAEKANFQNHKGHEFIPTLYHFPANCEACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLISPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSSFVRASPRTLSTRSAANQSFRKVVKNTSGKTR	186173	20357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_23220_24270_24533_24693_24773_29196_29286_29492_29564_36373_36534_37783_37973_40966_41056_41322_41417_42546_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53267_148857_148940_185227
895487	contig_16766_pilon	-	3203	3	Intergenic	novelGene_153368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	157	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	316	1878	188414	160283	FALSE	10	CCACCCCTCCCCCCACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRFGKTYSRKGGNGSSKFDEVFSNKRTTLSTKWGETTFMAKLGQKRPNFKPDIQEIPKKPKVEEENAGDPFGFDSDDESLPVSSKNLAQGKGSSYSESSEAAQLEDVTSVLEANSKISHPVGEDSVVSDKCLPLEDTLVGKEKSTNRIFEGDSSKSSCAKLITSGKVENFSEEHEKNIHHIYKNAEDSSKKPSAETTVTSGYKPDEVKETNDAWNSQVGKRSESPSETSQIKGSVRTGLYEWDNDFEDNRSEDCILSLDSDPLLEMKDEDFKKRLENLNEAIEEDIVQSVLRPSNCRTYCRANKAKSSQGASNFDKLMDGTSQALAKANSESSKDGLNQAKKGGVSCGTSFRGTVGRTRDYTVLHPSCLSVCNVTIQDTMERSMDEFTASTPADLGEAGRLRKKADIATSKTTTRFRPSNTKSKKDVKLEFFGFEDHDETGGDEGGSGSSNYKIKYFGFDDLSESEDDEDDDCQVERKKSKKRTKTAPSPSFQPPPESSDNSQDSQSNTNNAGKFLFF	191597	158957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_161347_187915_188437_191304
895488	contig_1230_pilon	+	2223	9	Intergenic	novelGene_28867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1279.46040872705	5	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	51	1286	405241	407259	TRUE	40	TAAAATTGGCACCATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAGNKMMQPSYLETNLKMFKICCSWMSLLFPLVLKLLVES	404475	408981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406945_407156_407352_407588_407788_408003_408237_408568
895489	contig_14288_pilon	+	1942	3	Intergenic	novelGene_153844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524463	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_525078_563235_563912_660212
895490	contig_6191_pilon	+	5321	15	Intergenic	novelGene_107823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	281.900655536373	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	245	1858	93605	148147	FALSE	20	TCACTACCCCAACTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSNSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFVKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLSQQQYIFQQCEAPMEGFQL	55765	151610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_55834_86706_86878_93599_93734_112654_112760_121430_121531_123459_123555_130262_130395_131389_131479_132003_132104_132682_132847_134259_134339_140512_140639_142415_142544_146208_146388_147959
895491	contig_15666_pilon	-	2269	6	Intergenic	novelGene_70150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	642.644847485763	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	187	1221	110619	107816	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110805	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108859_109098_109378_109948_110246_110558
895492	contig_11318_pilon	+	3125	1	Intergenic	novelGene_48121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCAGTACTTACTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674	3799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_700_3800
895493	contig_10058_pilon	+	2830	10	Intergenic	novelGene_67725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	152.47351520676	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	67	885	72602	99369	TRUE	25	GTTTGTTTAAATTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72535	101647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100394_100600
895494	contig_14744_pilon	-	1999	3	Intergenic	novelGene_66123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	2.5	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	899	1213	1588791	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1589689	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600
895495	contig_6102_pilon	+	2783	21	Intergenic	novelGene_31880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	561.835652126136	6	34	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	98	1252	371022	380574	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLGAAGEQSHPDS	370924	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375492_380539_380577_381100_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
895496	contig_10042_pilon	+	1984	7	Intergenic	novelGene_79114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	385.814038394435	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	235	1173	42711	53270	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEAQ	8813	54081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_8936_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50046_53261
895497	contig_5551_pilon	-	1594	1	Intergenic	novelGene_134233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACTGGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360198	358604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_358600_360200
895498	contig_12923_pilon	+	1621	14	Intergenic	novelGene_30175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	185.161531910406	58	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	828	1388	332961	348947	FALSE	30	TGGGATAGTGTCATTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRIGWFPSNYVEEDYSEYC	314466	349180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332135_332197_332638_332964_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893
895499	contig_10904_pilon	-	1762	5	Intergenic	novelGene_22752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_4	360.83895299704	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	242	1417	662502	652299	FALSE	15	TCTCTACTGTTGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCVGGMNKLFTGNSLLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662743	651953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662408
895500	contig_14326_pilon	-	2499	4	Intergenic	novelGene_120686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1970	2329	139083	138724	TRUE	20	CTACCATTGCCATCGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDQLMFNKAAMPRLFKGERKVFQHMVPGQLNSHMRNNEVGLPTLHRIQILTQNGSKTLKVRAETIKPLEENIGINNFLDMTPKAQATKEKIHKWDFTEIKKFYASKDTIKNVKSRIYK	247210	137454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_137572_138670_139098_243365_243874_245763
895501	contig_20378_pilon	-	3359	21	Intergenic	novelGene_159569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_20	156.23420720188	662	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	172	2451	145646	69827	FALSE	45	ACTCCTGTCAATAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQQFQYDDSGNTFFYFLTSFVGLIVIPATYYLWPRDQNAEQIRLKNIRKVYGRCMWYRLRLLKPQPNIIPTVKKIVLLTGWALLLFLTYKVSKTDREYQEYNPYEVLNLDPGATVAEIKKQYRLLSLKYHPDKGGDEVMFMRIAKAYAALTDEESRKNWEEFGNPDGPQATTFGIALPAWIVDQKNSILVLLVYGLAFMVILPVVVGSWWYRSIRYSGDQILIRTTQIYTYFVYKTRNMDMKRLLMVLAGASEFDPQYNKDATSRPTDNILIPQLIREIGSINLKKNEPPLTCPYSLKARVLLLSHLARMKIPETLEEDQQFILKKCPALLQEMVNVICQLIIMARSREEREFRAPTLTSLENCMKLSQMTVQGLQQFKSPLLQLPHIEEDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHNLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGGDANKNRTKGGWQQKSKGPKKTAKSKKKKPLKKKPTPVPLPQSKQQKQKQANGVIGSEAVVKEDEEEVSDKGSDSEEEETNRDSQSEKEDGSDRDSDREQDEKQNKDDEAEWQELQQSIQRKERALLETKSKITHPVYSLYFPEEKQEWWWLYIADRKEQTLISMPYHVCTLKDTEEVELKFPAPGKPGNYQYTVFLRSDSYMGLDQIKPLKLEVHEAKPVPENHPQWDTAIEGDEDQEDSEGFEDSFEEEEEEEEDDD	145817	68918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_69971_71103_71209_74371_74471_78344_78447_80157_80317_87955_88127_88323_88384_91611_91695_94354_94503_97707_97863_98618_98712_103185_103319_103416_103512_106403_106513_107631_107683_109115_109175_109731_109794_122404_122518_123909_124025_124765_124866_145522
895502	contig_9099_pilon	+	2553	2	Intergenic	novelGene_149908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	793	1890	326318	327415	FALSE	60	GAAAGAAAATAATCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIKKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVMDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTTHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGRFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINREQKNNRKNQQNQKLVL	318126	328078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_318548_325946
895503	contig_4114_pilon	-	8859	2	Intergenic	novelGene_15601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	294	junction_1	0	1709	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	831	2861	313296	310268	FALSE	10	TTCAGTGTGAGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANTDEFGSEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRLPEPAKSCRQRQLEARKAAAEKKKIQKEKLSTPEKIKQEALELAGVPTDSGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQSHFSSFKYSSNAVVESYSVLGNCRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFGYYGFPSSNPVFPSQFLGPGTWGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPGQAVPTDTHHPTPHHQQPAYPGPKEYLLPKVPQIHPVSRDPSPFAQSSNCYTRSIKQEPVDPLAQAEPVPRDPGKMGKIPLPEASQNGGPNHLWGQYAGGPSISPKRTNSMGGSWSVFPPGESPTIVSDKLSSFGAGCLTPSHFPDGQWGLFSGEGQQLASQSGGRLRGKPWSPCKFGNSASALARPGLTEKPWGIGAGDFNSALKGGPGYQEKLWSPMKAEEGRIPTPGTSQLDKAWQSFGVPLGPSEKLFGALKCDEKLWDPFSLEEGTAEEPPSKGPMKEEKGGAEEEEEELWSDSEHNFLDENIGGVAVAPAHGSILIECARRELHATTPLKKPNRCHPTRISLVFYQHKNLNQPNHGLALWEAKMKQLAERARARQEEAARLGLGQQEAKLYGKKRKWGGALVAEPQHKEKKGAVPTRQALAMPTDSAVTVSSYAYTKVTGPYSRWI	314126	304269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_312046_313043
895504	contig_3095_pilon	+	1545	3	Intergenic	novelGene_75179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4222	junction_1	239.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	29	751	220513	226518	FALSE	15	AGTCTTTTATTGCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWGTYELHPILVSVKSRTSCLLASNSHDPKLVSHTLRF	220484	227312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126
895505	contig_8377_pilon	+	1887	19	Intergenic	novelGene_34979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3331.07862494351	2	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1716	172	1887	131448	180503	FALSE	30	ACAAACGTGAGTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPHEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNI	68105	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154947_164389_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
895506	contig_2403_pilon	+	2337	15	Intergenic	novelGene_71002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_14	264.614004596453	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	517	2292	114575	168834	FALSE	50	TAAATTTAGTGAAACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLQLLRKSILQRGKPVVEGSLEKKPPFEKPSIEQGVNNFVQYKFSHLPSKERQTIVELAKMFLNRINYWHLEAPSQRRLRSPNDDISGYKENYTRWLCYCNVPQFCDSLPRYETTQVFGRTLLRSVFTVMRRQLLEQARQEKDKLPLEKRTLILTHFPKFLSMLEEEVYSQNSPIWDQDFLSASCRTSQLGIQTVISPPPVAGTISYNSDSSSLEQLNGRSTSPACKASSGLEVNPGEKRKMNDTHPLEEAKKPRVTGDIPMELINEVMSTITDPAAMLGPETNFLSAHSARDEAARLEERRGVIEFHVVGNSLNQKPNKKILMWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYITRLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPSQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHDILNFLTYADEYAIGYFKKQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGIRETGWKPSGREKSKEPKDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMGILVYLQMYL	114058	168879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_114683_116065_116248_123831_124024_128861_128969_133770_133897_135756_135894_138651_138861_139830_139958_148218_148330_151046_151191_161000_161116_163533_163571_163812_163877_163974_164060_168802
895507	contig_15732_pilon	+	1265	2	Intergenic	novelGene_88892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTACAGAACTCAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220237	222229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_220309_221035
895508	scaffold_880_pilon	-	5048	10	Intergenic	novelGene_121503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCAGAGACTGCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579535	554448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_554547_556084_556276_556535_556672_557478_557604_559497_559590_563955_564193_567761_567906_569208_569318_575186_575357_575789
895509	contig_6361_pilon	-	3046	5	Intergenic	novelGene_23984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	205	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	25	TTGCATTATTTACTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436455	408702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
895510	contig_5467_pilon	-	4306	1	Intergenic	novelGene_111973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	647	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCAGGGCTGGTTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164938	160632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_160600_164900
895511	contig_10861_pilon	-	5418	6	Intergenic	novelGene_39265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	529	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGCCTCCTCTCGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350022	1337593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1337766_1339481_1339589_1343175_1343280_1344610_1344774_1345017_1345070_1345202
895512	contig_9098_pilon	-	3839	4	Intergenic	novelGene_75801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	151.803235216586	301	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGGAAACCCTTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295274	288191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_291814_292840_292905_294101_294181_295200
895513	contig_6576_pilon	+	3007	3	Intergenic	novelGene_42415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	89	1435	1301228	1302574	TRUE	35	GCTTGAGAACAGAGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295688	1304270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1303401_1303524
895514	contig_10196_pilon	+	1258	6	Intergenic	novelGene_132044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	100.478057306061	39	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	166	1023	643457	648404	FALSE	40	AGAAGGCAGAGCAGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSGVKKKSLLGVKENNKKSSTRAPSPTKRKDRSDEKSKDRSKDKGATKESSEKDRGRDKTRKRRSASSGSSSTRSRSSSTSSSGSSTSTGSSSGSSSSSASSRSGSSSTSRSSSSSSSSGSPSPSRRRHDNRRRSRSKSKPPKRDEKERKRRSPSPKPTKVHIGRLTRNVTKAVPVKMSFSFPAGRPIGFQFPRESWFSSKARRDMPSCRAQCCPVGDTVCPPHMAWDQSDDLLAALQERQGGAVNQPARVPPPLGHSSPVEPASCPLVWAQTPHTRVSPLSL	639741	648639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_639790_643339_643528_643749_643906_644528_644721_644998_645102_648068
895515	contig_10732_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_114679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63840	62711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_62700_63800
895516	contig_3233_pilon	-	6145	7	Intergenic	novelGene_56528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	210	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGCTCTCACCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763373	485010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_485229_491534_493993_572488_573029_574152_574896_618566_618987_726322_726942_762226
895518	scaffold_12124_pilon	+	2161	10	Intergenic	novelGene_22260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	3035.05361475616	159	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	195	623	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPTLPERPTGAVTLCLSLQAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494219_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
895519	contig_8210_pilon	-	1745	4	Intergenic	novelGene_30234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_3	1529.84726906534	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	295	783	37758	23927	FALSE	80	AAAAAAAACAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRRFDCRSISGMLTTTPQTPMKLENFHNFYTLTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKVM	52385	22964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_24081_29712_29926_37636_37803_52135
895520	contig_15022_pilon	+	2818	1	Intergenic	novelGene_171804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTCATGAATACCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67634	70452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_67600_70500
895521	contig_7457_pilon	-	4564	19	Intergenic	novelGene_31264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	393.328750757988	882	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	259	2100	42685	34602	TRUE	5	CGGGATTGGCTGGTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKQGNQLQMQVHEGYYVVDEAPTPVVSEKRLAARAGKKPLAHYSSLVRILGSDMRPPEEPAAQQFPLAPCDADQPQDKPPDWFTSYLETFREQVVKETVEKLEQKLHEKLVLQSPTLGSCPSEVSMPISDETLFLPENQFNWHIVCSSCQKRIIGVRYQCSLCPSYNICEDCEAGPYAHDSNHVLLKLRRPVVGSSEPFLHSKLSTPRLPAALEQVRLQKQVDKNFLKAEKQRLRAEKKQRKAEVKELKKQLKLHRKIHLWNSIHGLQSPKSPLGRPESLLQSNTLMLPLQPCAPVMPTLSAAFVDENLPDGTHLQPGTKFIKHWRMKNTGNVKWSADTKLRFMWGNLTLASTEKKDVFVPCLKAGHVGVVSVEFVAPTLEGTYTSHWRLSHKGQQFGPRVWCSIIVDPFPSTDSPGNNEKGIISSSKADDLTCQQEEAFLLAKEDTQLDEVTQQTERTGTCIPQKIKKITSERELYIPSVDLLTAQDLLSFELLDINIVQELERVPHNTPVDMTPCMSPLPHDSPLIEKPGLGQIQEESEGAGFKALPGSTVSVKSKAESTAPVEEAEDDLSGTQFVCETVIRSLTLDAAPDHHPPCRQKSLQSDEFCLV	53054	27899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_29703_31766_31873_32593_32652_33339_33435_34199_34621_35791_35961_36223_36335_36832_36909_37389_37540_38379_38671_38759_38920_40148_40359_40778_40947_41374_41590_42062_42141_42490_42705_46168_46247_49813_49925_53004
895522	contig_12414_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_59589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	874	1944	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372110	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372100_374600
895523	contig_3964_pilon	-	4093	1	Intergenic	novelGene_174208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	527	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGACCTCAAAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88241	84148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_84100_88200
895524	contig_1406_pilon	+	3248	4	Intergenic	novelGene_25444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2538	2936	586417	587013	FALSE	10	GGTGAGGTGGTGGCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHQEQLEAGLHRGLGMRQLLLVGCDVGDPLHTDLVGGLDQRVVLDLPQAHPRELAKVVRQHSDLVPLQHELLQARQLHNGVGQVADPVIIQPQGEKAAQAGQLTKAAGQEAKLSPTQPEDLEGTQGTDILR	484185	587325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_484847_498645_498776_584670_586717_586914
895525	contig_6677_pilon	-	3354	5	Intergenic	novelGene_114167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.946510146143	130	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	1204	3135	442130	410691	FALSE	20	CATATGTTTGTAACTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCLCPSKKREARAKDFLLSRHCLFLSKRKNFPRIFPADFLFIFHLPEPSPMPIPSRGTSRVGSASPRAVQSLGRVTLDCGDITLAEMTFYSRIPYRHQAPLNHRGGSRAEGAGNPAPPFHPRWLPTEAHPLPRPSVLCGRPSRPALPHFRLSMASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVPGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQANSSHQVANFNIPAYDQGLLLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATSTFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVDSNGSVQIIEEHPPLMLQNRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKYIRPILQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKVCLPNCTTHSCSYLRSPHTYICIQSLVINFLRWEREKERRKPCLWEDIL	443333	410471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_410961_418248_418373_426632_427711_438921_439212_441960
895526	contig_5423_pilon	+	7223	12	Intergenic	novelGene_85281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1022	1336	561527	565396	TRUE	60	AAAAAAAAGGCAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKGMIIAIQEKVIQNTTSSRKIFTFPSRVKNITDEMRNPSTSPTHSMQSMRIPNRHHVATKKIPPTLPAMAVRIRRTIILNRCQSCNQYIKEESHEDETYEE	558193	586451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_559035_560563_560729_561511_561608_564346_564503_565318_565402_567013_567098_569079_569257_573061_573236_574172_574294_576973_577135_579794_584074_585565
895527	contig_6137_pilon	-	2521	1	Intergenic	novelGene_59207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGCGACCCCATGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309114	1306593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1306600_1309100
895528	contig_7322_pilon	+	2266	2	Intergenic	novelGene_164921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGAGGTCGTTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253033	302797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_254718_302215
895529	contig_9445_pilon	+	4952	3	Intergenic	novelGene_178218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1592	2641	35841	36890	TRUE	55	CGAATCAAATGAGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNKETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKVKNCQPRIIYPAKFSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	8261	76458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9445_pilon_+_9061_35048_37583_74839
895530	contig_2596_pilon	+	2958	2	Intergenic	novelGene_53530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATTGAGAATAGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095830	1098952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1096316_1096479
895531	contig_14441_pilon	+	1418	6	Intergenic	novelGene_100399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.008174721303	1224	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	288	1232	67230	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLRERPPALPSLSSMDPTLLCLAVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVITTKQRATMDCVPIRQHNRVYWYRQKLGEELKFLTYLQNKEALDKSGLPDGRFSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	65846	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_66073_67168_67327_67434_67705_116578_116963_117220_117344_117539
895532	contig_4924_pilon	-	7051	2	Intergenic	novelGene_84699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1695	junction_1	0	400	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3492	3857	114708	82247	FALSE	50	ATCCATACAAAGGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSEYLLLWWTAFPQILHRKWSARNDLKRIHHGEN	118199	79052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575
895533	contig_16496_pilon	-	1489	2	Intergenic	novelGene_5214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	89	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	15	CATGATGTTCATCCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	46	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
895534	contig_8330_pilon	-	2402	10	Intergenic	novelGene_71968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	335.173513199682	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	55	1098	2066429	2038853	TRUE	5	TCCTACCTCTGTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLSLGPRSLPGRVVSREMENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLTHPEVSYSTGPTQSTNNPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2116512	2033454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2034753_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2057892_2058041_2066340_2066434_2116462
895535	contig_10134_pilon	-	2942	5	Intergenic	novelGene_16176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	445.334916102477	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	1596	2795	28070	26871	FALSE	25	AACTGAAGTCTCTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHFVEEFRRKHVKDLMGNKRALRRLRTACERTKHTLSSSTQATLEIDCLFEGLDFYTPITRARFEELCSDLFRSTLEPVDAKLDKAQIHDIVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFSGRELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMRDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQRNATIPTRQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTTIDRSTGKANKITIANDKGRLSKEDVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRVAAKNSLEAYVFHVKSSLQEEGLRDKIPEEDRRRAQGKCQEVLVWLERNQLAEKDEYEHQKRELEQMCCPIFSRLYGGPDIPRGSSCGAQACQGASSTGPVIEEVD	39728	26723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_28449_29679_30462_34922_35178_38558_38630_39619
895536	contig_17964_pilon	-	3984	22	Intergenic	novelGene_33899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	176	junction_21	175.064471441231	789	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1188	3567	88	3654	468932	340782	FALSE	15	AACTTTCAGGGTGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKSEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAASNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAASGLAGTTNGPFRPLGSQQPQPQPQQQPNNSLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSELYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRANSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPADQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPAQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII	473105	340451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_347653_347776_348928_349055_351505_351644_355598_355734_357565_357696_359050_359316_369423_369661_370784_371082_371986_372131_373494_373634_380107_380260_384030_384136_385000_385095_395548_395820_397747_397915_411236_411416_412391_412501_431364_431434_468569_468944_473029
895537	contig_13787_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_40609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGACATTGGTTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145217	142982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_143000_145200
895538	contig_10000_pilon	-	4128	26	Intergenic	novelGene_139297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_25	193.389869434777	45	28	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1001	3006	196	3201	287111	159846	FALSE	20	GCAAATGTGGCCTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDDSSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQEMEEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATGHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPGNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	306749	158918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_182891_182946_192582_192801_225789_226009_234052_234131_236640_236869_244288_244453_255345_255513_260138_260186_262201_262289_262894_263003_270842_270957_273197_273441_280591_280703_281388_281456_283019_283184_284782_284931_285837_285939_286746_286805_287001_287133_291412_291467_306629
895539	contig_7758_pilon	+	5629	1	Intergenic	novelGene_163535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1260	1616	133204	133560	NA	20	AACAGTGGTTGTACCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFKLQCFTDIERSLPLPTLPQTPHNGKSKNFLHKQGFFIFLKQKSQSLMGLFSCQNSHWFTVAIFTKGHDERGKPVLSPLPLCLVKHNLFLFLVSEELLFFNLSDRHVKPTRLSNH	131944	137573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_131900_137600
895540	contig_3241_pilon	-	5119	1	Intergenic	novelGene_146380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	475	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	4354	4722	711817	711449	NA	15	CGTTGCCGTCAAGTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSGVRVNSMEECTEHFDVKKKKKKKKAKENMQNSRCCTDVHGNSLKVRHTEGCSPMYHLQPLYHECCAHHAREMSALNIMPVQELFAWDQTDNSHTKGQTGTLGGSEFMLMGKEQLRKGG	716170	711051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_711100_716200
895541	contig_610_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_76778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	565	867	233450	233752	NA	30	CTAGGACCCGCAGGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNNASPLPIELIYQNPALLPGPSEFSTIYNGGMSERWTLASYRGIIWLVESEYRQYYTFVLCFSIFFNVFTFIMYFDPQNTLKCRYNFPHYIMRNPRL	232885	234926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_232900_234900
895542	contig_15114_pilon	+	4809	2	Intergenic	novelGene_121095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2048	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2835	3215	32668	33048	FALSE	35	AGTATTCCCTGACAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIYTLYTILTYINHTISGSKDTVPSYEFLYPACTRTINILILRQWIGAKYMECPSKIFFRKNTYHLTSKHILIKQDVEYHTEWNAISCLEYRHLFCFFPRLLLQGLVTETRPASTLTPEEMCSHI	29598	34642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_30437_30671
895543	contig_5999_pilon	-	4206	2	Intergenic	novelGene_45654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATGAGTGGAACCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278278	273151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_274551_275471
895544	contig_15867_pilon	-	3493	5	Intergenic	novelGene_170902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	6.86931583201704	544	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	580	1098	269630	266482	FALSE	25	TCAATGAGCTTAGATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAFLSGIKTVFAGSICNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREMELLGKVTALDLNPERTELLSCSRDDLLKIIDLRKNVVRQSFSAPGFKCSSDWTRAVFSPDGSFVTAGSAEGSLYVWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVSVDKGSKAVLWSDY	270209	264086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_266576_267613_267716_268416_268465_268577_268728_269505
895545	contig_14441_pilon	+	813	5	Intergenic	novelGene_100456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	225	773	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLCQHPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	82333	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_121182_121239_125517_125902_126159_126283_126514
895546	contig_11906_pilon	+	2631	4	Intergenic	novelGene_178673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCCGAAAGCATTACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31494	223444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11906_pilon_+_31711_49234_49520_137210_138376_222479
895547	scaffold_19766_pilon	-	1605	3	Intergenic	novelGene_34268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	403	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323450	321643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_322832_322954_323101_323179
895548	contig_8558_pilon	-	3661	2	Intergenic	novelGene_123151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCTCTGTGAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216051	165322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_167205_214272
895549	contig_3956_pilon	+	1240	5	Intergenic	novelGene_15237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1753.85238475192	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	80	433	1284763	1289798	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKSLSLPDSVQSKWSVVSMVS	1284683	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285800_1289738_1289892_1290297
895550	contig_14684_pilon	-	3240	3	Intergenic	novelGene_99645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	21.5	401	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTATTTGTTTGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64616	58704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_61782_62953_63097_64596
895551	contig_18096_pilon	+	2337	15	Intergenic	novelGene_58042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	729.337024219914	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	54	1766	40382	76634	TRUE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40328	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_76776_78635_78704_78770
895552	contig_9468_pilon	-	3918	1	Intergenic	novelGene_59512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGTTGGGTGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413362	409444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_409400_413400
895553	contig_3584_pilon	+	4354	27	Intergenic	novelGene_108192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_26	86.9207964302618	814	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1227	3684	270	3953	544597	562364	FALSE	20	TGTTATTGCACTTCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSSEDASIHRLEGTDLDSQVGGLICKTRSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRREREEKDDGEDKKKSRISSYKDWEEGKDDQRDAEEEDSDQSGRSSRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDRKKEKSRDRDYDRRRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERNSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGTSRRSQWESPSPSPSCRDSERSHRPSTRDRDRSVRSKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREDGEEGIPFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAFTEDGKVDYRTEQKFADHMKKKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGSLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL	542097	562765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_542347_544576_544920_545967_546156_547084_547190_547731_547880_548039_548159_548320_548398_548846_549003_549589_549752_549880_549989_552777_552891_554444_554583_554968_555156_555304_555491_555880_556022_556399_556511_556602_556720_556936_557045_557457_557571_558259_558469_558570_558726_558981_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
895554	contig_16303_pilon	-	2771	7	Intergenic	novelGene_34034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_5	505.859472141775	146	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	98	1201	45428	33093	FALSE	55	AAAAAAGATACAATTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKAALED	45525	31522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
895555	contig_13780_pilon	-	4277	8	Intergenic	novelGene_149117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1203.88525794019	9	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	605	1558	825822	822386	TRUE	20	ATATTTTGTCTCTGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQNFFQIDPTKYFGCELGAQTQFDVKNDRYIVNGSHEANKLQDMLDGFIKKFVLCPECENPETDLHVNPKKQTIGNSCKACGYRGMLDTHHKLCTFILKNPPENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKVGNT	826540	819268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_820631_821028_822566_822826_822989_823722_823882_824130_824274_825192_825305_825624_826320_826433
895556	contig_3018_pilon	-	540	4	Intergenic	novelGene_78845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	891	junction_2	418.671709099146	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	5	538	568034	561487	FALSE	40	GAAGATGGTAAGTTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERK	568038	561484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561574_562778_563044_566733_566844_567962
895557	contig_5050_pilon	-	2104	6	Intergenic	novelGene_110233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	92.0795308415502	465	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGTGCCTAACATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13703	4674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_6454_8194_8269_8513_8570_12205_12260_13414_13454_13601
895558	contig_7758_pilon	+	588	2	Intergenic	novelGene_163547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	599	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	192209	193745	FALSE	70	CAAAGAGAAAAAGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR	192208	194009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_192343_193555
895559	scaffold_12124_pilon	+	1846	11	Intergenic	novelGene_22286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	190	567	1490385	1508039	TRUE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473578	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509086_1509343
895560	contig_10602_pilon	-	3696	5	Intergenic	novelGene_159640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_2	27.8511669414407	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	15	1313	37611	30099	FALSE	40	CCAATATAAAACCTGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAARCWGLLPRIRGLSLHTAAKVDVVAPETSGPDVASAPVARYPPIVASLTAKSKAARQRRIERWQAAVHAAESVDQKLRILTKMQFMKYVVYPQTFARNADRWYQGFTKTVFLSGLPSPLVEPAPALELASLRAAACDCLLQEHFYLRRKRRAPLYQDREAIASPFLDQLVAALVGLLSPHNPALAAAAIDCKRPVHFYWMRGEEIIPSGHRKGRVDALRYQIDDKPHNQIRISKQLTEFVPLDYSVPIEIPVMNCKPDKLPLFKRQYENTIFIGSKTADPYCYGHTQFHLLPDKLKRERLLKQNCADQIEVVFRANAIASLFAWTGAQAMYQGFWSEADVTRPFVSQGVITDGKYFSFFCYQLNTLALTAQADQNNPRKNICWGTHSKPLYETIEDNEVKGFNDDVLLQLVHFLLSRPKEDNKSQLLES	37625	27715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_30392_32554_32732_33691_33798_35529_35676_37034
895561	SIRV6	+	1517	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	1	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2403	20	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1088	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
895562	contig_9482_pilon	-	3279	13	Intergenic	novelGene_44248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1534	1974	451047	434956	TRUE	15	GGGCGGTGCGGGAAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQVQEDLLQQAAATFLGNGIQDHVHAGLTHSHALFCVTFQILPFQADYGLSKGLAVVDDRDHVLDVAVWVLPVPEVLLFVQLCFLFVSNLRKNSFAEDTKPVPLFLNLHLSEQQLEDSVQTSGTRWREAWSGSSRPGRPPAPSP	458097	418927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_418966_420588_420779_422384_422602_424065_424751_433281_433402_434900_435025_436239_436340_436914_437028_437121_437273_451039_451163_454611_454775_455371_455498_456968
895563	contig_3414_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_80972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATTAACATTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66330	64967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_65000_66300
895564	contig_4079_pilon	+	5128	2	Intergenic	novelGene_167478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	113	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127954	133129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_131467_131513
895565	contig_10324_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_7831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	478	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAAAGCCTGGTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269692	267572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_267600_269700
895566	contig_20527_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_138624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATGACAATGGTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31247	28651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_28700_31200
895567	contig_9924_pilon	-	2858	3	Intergenic	novelGene_175929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAGCAGGGAGACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159765	153123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_154582_157864_158844_159344
895568	scaffold_13505_pilon	-	2104	2	Intergenic	novelGene_111401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1187	1591	219572	219168	FALSE	20	CACACTGCGCAGGTGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVQGEEAHVHPSAGTQGQGSKIRDPEREALRPSVWGRPGQSLVCVQTAQGGDPGVRGPLVSVWRCLTPRRDLHACAPGLRRLRKHTWVGGRERMGRKLSWKWWRPQSPHPVAGAVKKPGYPVTVLTAAGVTVR	221845	218654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_219584_220670
895569	contig_9183_pilon	-	3081	8	Intergenic	novelGene_40293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	173	1714	323783	312131	FALSE	20	AGCGCATCCATTGGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325990	310763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_322990_323331_323834_325868
895570	contig_20951_pilon	+	2821	14	Intergenic	novelGene_43109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	362	964	138757	210438	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSIDRHSAEVAHLGTAAARHAVAAFGFDEPSPTLVAFPNASSSHFFLNRCSVLDVVFLSQLFTRETIVLFPESLTLPTGFLSAARIGTAEPLHVTVQQSRKATGGTPDKLISVGCSDLFFCFPLIVFIQDGLGKHLLQFTGWEGTCAAAFHAAELRLSRPEDCLLSISDETLFAEQVSICTLGQLLKWKFTIAAAALD	138395	244911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_138905_155043_155141_208038_208116_209203_209356_210309_210447_212024_212077_212792_212928_218275_218395_227945_228112_229223_229327_234046_234123_235969_236636_237771_237902_244509
895571	contig_4339_pilon	+	1391	2	Intergenic	novelGene_146078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	391	junction_1	0	85	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037730	1044461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1037995_1043334
895572	contig_13244_pilon	+	2501	5	Intergenic	novelGene_86922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	542.924200510532	126	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTCTTACTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239738	254409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_244930_245347_247045_247121_250878_250935_252541
895573	contig_14666_pilon	+	1655	3	Intergenic	novelGene_39578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1754.5	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	361	1368	483933	484940	FALSE	75	TTATTAAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483823
895574	contig_20753_pilon	+	4418	3	Intergenic	novelGene_168251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32	40	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39907	69638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_+_40181_65434_65619_65677
895575	contig_6599_pilon	+	1181	2	Intergenic	novelGene_175966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260708	262715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_261472_262297
895576	contig_10050_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_119623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	555	1010	219879	219424	NA	65	AAAAAAAACCACCTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHGCNLSLYLFNLHAEQTIQKGGLYEERGIRIGGRFINNLQYADDTTLLAESEEDFKHLLMKIKDHSLQYELHLNIKKAKILTTGPISNIMINGEKTEVAKDFILLGSTINIHGRSSQEIKRHITLGKSATKDLFKVLKSKDVTLRKRFT	220433	218135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_218100_220400
895577	contig_8291_pilon	+	4983	1	Intergenic	novelGene_99967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	4263	4562	769837	770136	NA	70	AAAGTACTCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTIDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESTAPRHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPHKTKWD	765574	770557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_765600_770600
895578	contig_14925_pilon	+	1605	5	Intergenic	novelGene_55355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCACAGCACTCAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112165	129480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_113276_114663_114781_115152_115207_115820_116101_129436
895579	contig_9036_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_155466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196002	194536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_194500_196000
895580	contig_11428_pilon	-	3849	12	Intergenic	novelGene_138486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	894	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAATAATAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208708	42032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_42076_109418_109994_178843_178925_181977_182120_190531_190667_196900_197025_198813_198957_199907_200020_201407_201588_203601_203828_205568_205780_206831
895581	contig_9698_pilon	+	6605	24	Intergenic	novelGene_82486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	254.234950799333	786	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1592	4779	497	5275	190035	271775	FALSE	25	TCTATTTAATCTTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLYVFLVNTGTTLTFDTELTVQTVADLKHAIQSKYKIAVQHQVLVVNGGECMAADRRVCTYSAGTDTNPIFLFNKEMILCDRPPAIPKTTFSTENDMEIKVEESLMMPAVFHTVASRTQLAVEMYEVAKKLCSFCEGLVHDEHLQHQGWAAIMANLEDCSNSYQKLLFKFESIYSNYLQSIEDIKLKLTHLGTAVSVMAKIPLLECLTRHSYRECLGRLDSLPEHEGSEKAEMKRSTELVLSSDMPRTTNKSLLTSFHKSVENVVPDPTDAESGKEIRESCHSTVQHDETPIDAKDDDLPFFNVSLLDWINVQDRPNDVESLVRKCFDSMSRLDPRIIRPFLAECRQTIAKLDNQNMKAIKGLEDRLYALDQMIASCSRLVNEQKELAQGFLANQMRAENLKDASVLPDLCLSHANQLMIMLQNHRKLLDIKQKCTTAKQELANNLHVRLKWCCFVMLHADQDGEKLQALLRLVIELLERVKIVEALSTVPQMYCLAVVEVVRRKMFIKHYREWAGALVKDGKQLYEAEKSKREFFGKLFRKSFLRNRLFRGLDSWPPSFCTQKPRRFDCELPDISLKDLQFLQSFCPSEVQPFLRVPLLCDFEPLHQHVLALHNLVKAAQSLDEMSQTITDLLSEQKTSASQASPQSASSPRIESTTGITTATSPRTPSPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTLEQGSLDLDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQGTNICGKEDSGDHASNVQLEKCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCTAVEIRNIIEKVKCSLEITLQEKYQRELQTLKNEYEAKLDALIKESEENENKIKKLKGDLVCLEEVLQNKDNEFALVKHEKEVVICLQNEKDQKLLEMENIMRTQNCEIKELKESQEIVLGDLKKLHVENDEKMQLLRAELQYLEQSHLKELEDTLQVRHTQEFEKVMTEHRVSLEKLKEENQHRIDQIQESHATVVQEKDQQLQELKLKVSDLSDMRCKLEVELALKEAETDEIKLLLEESKAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELKTLMTIEKDQCISELISRHEEESNMLKAELNEVTSLHQQAFEIETKLKDQIVELQNKLESELSTLEKQKDEKMIQQEDRYEAIIHKLEKDKEKLVMSQDQDREQLIQKLNSEKEEAIKTALNEFKLGRDAAEKELLEKVRHLETQLAKSPATESAREESSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNVRTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLEEKKKLEEEVSKLRSSSFLPSPYVAAAPELYGACAPELPGETERSAMETAEEGRLDSAMETSMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSPRHSEKIAIRDFQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPGLDLKPGEGASGASRRPWVLGKVMEKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV	133045	273105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_133377_177483_177599_189984_190106_191298_191426_191631_191803_206425_206629_208375_208803_214786_214958_233675_233861_234077_234265_234400_234483_235375_235438_236560_236665_237096_237224_237309_239208_254502_254669_257699_257809_257920_258162_262139_262195_264719_264768_266734_266794_268646_268784_270843_270915_271697
895582	contig_7707_pilon	+	3135	9	Intergenic	novelGene_72150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	44	junction_4	459.391428277673	345	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	247	1932	182964	240898	FALSE	45	CTGAAGGAAAATGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGLDHLKNDYRRRFCRPSRAPDINVEQGQNILEILQDCFEEKSLANDFSANSTKSVPYSTPKIKDTCIQSPNKERQKSHPKALPPSSRKKEGCLQLVVEPNEDVSKSVQAHEVYQKILATDVGSENTAHLKNVSSRKQNDHHNEADEEFYLSVGSSSVVLDSKTSLSQNAVPSIAQKRETYTSENSLNMLSSNTESSCKTKKRLNFEDILKKVEIEDKVLEGPQGRKPSGRSQKRTQDSGYEIQPQAKKSFSVLFLETVKRKTESSSVIRHVAADPPHSTPNDVMLEDEFIIDESDISFGSQSLIKIPRNVKPPKQCTISPVESTVVLQGKKSRKKHHNVTSETLTSDKNSYKANPEEKSQPSEGKKVGESCALADKMENSCKSTKDALYSENTEKSSENKGTIKQNRRRKVKANVVEERLDMEQPKDKNINTSLTTQDKLQRNSDKSTEVCEEMRNDHISKTQMTRVGKKKSRTHVPIKENQKKVKEEFKNKYFSNGPKKKNLVPEEATLTITKSQRISRRPSNWWEVTSEHSKYFCLNYIHWELQRNYSVREYFYV	182717	242101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_182982_190409_190457_200052_200124_200805_200901_213078_213179_233686_233973_234921_235111_236384_236993_240626
895583	contig_10009_pilon	-	5273	7	Intergenic	novelGene_82733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75134	54398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_55301_56988_57106_60319_60407_63216_63355_68603_68814_70217_70384_71481
895584	contig_11850_pilon	-	2284	6	Intergenic	novelGene_125221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	105	junction_1	1040.91298387521	1350	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	106	840	286397	282879	FALSE	25	CTTCTGTGTCAGGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286502	281434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
895585	contig_6589_pilon	-	1836	8	Intergenic	novelGene_25686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.7721446105403	323	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	191	316	105830	104217	TRUE	40	AAAAGGTACATGGTGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGGGRRWRNSASPALADGGSSAQPGPGQRLSGRGCGKGGRGRKAEKARAAAQWGCCWSTLLRSMTPPTSGSGARCSGTSRMAPCPCHSGSSARRSGAVSGMWQP	108235	100523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_101428_101998_102249_103374_103469_103598_103782_104127_104233_105720_105831_107032_107107_108119
895586	contig_3469_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_34225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGGAAGCTAATATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589904	588238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_588200_589900
895587	contig_14970_pilon	-	1755	7	Intergenic	novelGene_45122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	142.099339274404	47	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	450	1193	291083	268709	FALSE	55	AAAAAAAACACTATTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315718	268146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315339_315469_315611
895588	contig_12425_pilon	-	2311	11	Intergenic	novelGene_46666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	660.877787491757	3	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	121	1161	211174	204102	FALSE	10	TAGTTGTGCTGGTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKIFYYLSSDKI	226612	202951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204131_204226_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210380_211048_211200_226517
895589	contig_3866_pilon	-	8082	12	Intergenic	novelGene_112400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	538	junction_6	175.017968380959	153	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	1874	2749	205942	182051	TRUE	75	AAAAAAAATAAATGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRVSS	210895	171797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_172418_174189_174275_177422_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209029_209125_209211
895590	contig_3584_pilon	+	2680	9	Intergenic	novelGene_108143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.671761964856	6	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	641	1348	351589	365933	FALSE	20	CTCCACTGTTTGGTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESIRSWVQARSLCKAAFQTCG	340890	367265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353469_354411_354619_355225_355319_365873
895591	contig_4924_pilon	-	2125	6	Intergenic	novelGene_84654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_1	482.741918627334	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	157	873	114708	65524	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	114864	62875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575
895592	contig_13878_pilon	-	3171	8	Intergenic	novelGene_165731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	337.514202271095	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	273	953	57227	42986	FALSE	25	GTGCTCACCAATATCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASVCEIWRGGGRSPRFVPLRLRRSAPLRPPGEHRTDYDREALLGGQDEVDEYVKLNPEEQHKRLKSIIKKIDLDSDGFLTESELSSWIQMSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDDMVTWDEYNIQMYDRVIDFDENTALDDAEEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRRDPTATEDPEWILVEKDRFVNDYDKDNDGRLDPQELLSWVVPNNEGIAQEEALHLIDEMDLNGDRKLSEAEILENQDLFLTSEATDYGRQLHDEYFYHDEL	60671	40767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_43139_45954_46098_46987_47085_52427_52542_57053_57251_59806_59913_60355_60404_60576
895594	contig_3956_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_14799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTAAAAATTGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226141	1225052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1225100_1226100
895595	contig_17796_pilon	+	4624	9	Intergenic	novelGene_33760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_3	152.924613780778	45	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	387	671	12080	13839	TRUE	35	ATATGTGCTTATTATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEGA	8152	42437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_40843_40949_42302
895596	contig_4232_pilon	-	550	2	Intergenic	novelGene_63382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAGAAGATAGACGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468066	467243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467464_467736
895597	contig_19098_pilon	+	3408	1	Intergenic	novelGene_65845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGTAGACTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406285	409693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_406300_409700
895598	contig_504_pilon	+	3382	10	Intergenic	novelGene_54434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	80	junction_2	1157.19642047301	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	132	1106	222784	236818	FALSE	30	TTAAACTCTTTAATCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEPPPSRYRSVEPGWEGSAEGAQHAAASHLQSRARRRPSPEKTMASGSPAASEEERSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFPVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGEMDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV	220115	239094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_220239_222775_222961_228461_228554_230991_231054_231902_231950_232809_232969_234126_234188_234985_235108_236052_236135_236645
895600	contig_16495_pilon	+	2646	1	Intergenic	novelGene_178676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1193	2242	25228	26277	NA	65	CACAAAAAAAGCACTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAACEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	24035	26681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16495_pilon_+_24000_26700
895601	contig_15629_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_122465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132995	135039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_133000_135000
895602	contig_18364_pilon	+	5951	25	Intergenic	novelGene_102545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_14	694.063906709766	106	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	1986	3635	31533	41575	TRUE	15	AATTTGTGTGTGTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNARTYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHVIL	16480	50543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_31203_31509_31590_32506_32678_35655_35894_36637_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41564_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
895603	contig_20527_pilon	+	2670	6	Intergenic	novelGene_138566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1158.2056121432	5	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	676	1302	13527	27453	TRUE	25	CTCTGTGAGTGACTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12851	29159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27638_27975
895604	contig_13760_pilon	+	3108	7	Intergenic	novelGene_61318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_5	43.5469095727048	605	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	88	1206	201094	204617	FALSE	40	GGGTAAAAAGGTGTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGGAWSTAAGPGAGAAAAGGGGGALEAAMAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKAKHRKTGKKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDKYELFEKLDLPKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKSMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF	201006	206519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_201186_201650_201733_202500_202592_202950_203118_203240_203413_203569_203719_204251
895605	contig_1380_pilon	+	3989	5	Intergenic	novelGene_138880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	770	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCCCTCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128859	142727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_132170_132540_132691_138022_138194_141555_141653_142466
895606	contig_17753_pilon	+	4046	4	Intergenic	novelGene_105045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	422.964143476331	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2678	3064	146485	146871	FALSE	20	ACTGCTCAGCCTTCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	45391	147853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_130836_131167_144583
895607	contig_5033_pilon	-	2049	8	Intergenic	novelGene_28922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1082.02057772126	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	126	1064	477189	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477314	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450152_450410_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
895608	contig_13780_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_149054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	447	1344	409	1752	605685	607028	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGDIQQARKRAAQETERLLKELEQNANHPRRLEIQNIFKEAQALVKEKIVPFYSGGNHVTDEFEEGIQDVILRLTHVKTGGKISLRKARYHTLTKICAVQEIIEDCMKRQPSLPLSEDAHPSVAKINSVMCEVNKARGTLIALLMGVNSNDTCRHLSCVLSGMMADLDALDVCGRTEIRNYRREVVEDINKLLKYLDLEEEAGSTHAFDLGQNHSILKIEKVLRRMREIKNELLQAPNPSELYLSCKTELQGLIGQLDEVSLEKNPCIREARRRAVIEVQTLITYIDLKEALEKRKLFVSEEHPPLKAVWSVLGNLSEIQGEVLSFDGNRTDKNYIRLEELLTKQLLALDAVDPQGEERCKAARKQAVKLAQNILGYLDLKSDEWEY	605276	607697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_605300_607700
895610	contig_13798_pilon	+	3742	2	Intergenic	novelGene_178529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	965	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2571	3620	107207	108256	FALSE	55	CAATGAAAGAGGGAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILTAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	103661	108378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_+_104338_105312
895611	scaffold_13505_pilon	-	3324	5	Intergenic	novelGene_111539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	79.1422769447531	29	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAACCGTTTCCCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626408	588586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_592023_625326
895613	contig_9293_pilon	-	3545	2	Intergenic	novelGene_175186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	805	junction_1	0	19	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	2265	3503	1794	556	FALSE	70	AAAAAAAGAAAATTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSATWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAEAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEKEQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINELENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQKRTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKLENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKTPNQKKPWSRWLHWRILQNIHRRACTSSTQAISEHRKGSNTSKFIL	6523	513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_2387_4851
895614	contig_7119_pilon	+	2647	2	Intergenic	novelGene_40890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	384	962	139647	140225	FALSE	35	AGGAGACAGTGGGTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127419	141910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_139445
895615	contig_10734_pilon	-	2544	15	Intergenic	novelGene_51482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	615.242908723615	34	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	661	2055	2282483	2265543	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305183	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282541_2282671_2282772_2283972_2284015_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
895616	contig_5350_pilon	+	1114	6	Intergenic	novelGene_99366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	57.7165487533688	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	301	732	222805	225433	FALSE	20	ACTTTATGTATGCTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITDFGWEDALHTVRAGRSCANPNLGFQRQLQEFEEHKVHQYRQWLKEEYGESPLQDAEEAKTILVNSVSNSQPLWLRSRNGKASIPLSSLMFLIWDPIRMLPASDSWSSEIFGLPQKSVMYLKLLKYWKATVFRPMLPKRT	218969	225815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_219149_220454_220530_222758_222931_223349_223423_224707_224826_225318
895617	contig_9011_pilon	-	3338	1	Intergenic	novelGene_159343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	561	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	152	460	709267	708959	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPHMYRSTQSPKEEPHLLGRWEPGKMSPTGGGPNLWWPGNLTSGVLADTAMLSARPSAMCLLLLGARQGSLGEIGGLENWLDDVCKCLHPGMPLLLKAREP	709418	706080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_706100_709400
895618	contig_15498_pilon	-	3551	12	Intergenic	novelGene_42683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	245.802245314507	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	779	1798	829154	797306	TRUE	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQELRPTWYRGVLS	829932	784409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797345_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058
895619	contig_6079_pilon	+	5569	3	Intergenic	novelGene_160080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_2	162.5	754	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	50	544	394969	484726	FALSE	80	AGAAAATTAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYLNQDAKLSNLFLQASSPTTGTAPRSQSRLSVCPSTQDICRICHCEGDEESPLITPCRCTGTLRFVHQSCLHQWIKSSDTRCCELCKYDFVMETKLKPLRKWEKLQMTTSERRKIFCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGNDNGKSTSVAFFPLE	394919	489751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_395097_439214_439396_484540
895620	contig_9807_pilon	+	2508	15	Intergenic	novelGene_32897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	540.19227491473	2	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	7	1878	109487	158783	TRUE	15	CTTCGTTGTGGATCACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWMLPPSLRSSAGAAPEVPAAFVSAEKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109480	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676_158976_159328
895621	contig_11742_pilon	+	4435	6	Intergenic	novelGene_166535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_1	368.642048605419	682	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	236	1024	115779	152752	FALSE	25	ATGTGCAACTTCTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPFGKTPGQRSRADAGHAGVSANMMKKRTSHKKHRSSVGPSKPVSQPRRNIVGCRIQHGWKEGNGPVTQWKGTVLDQVPVNPSLYLIKYDGFDCVYGLELNKDERVSALEVLPDRVATSRISDAHLADTMIGKAVEHMFETEDGSKDEWRGMVLARAPIMNTWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPDSNDSPPAEREPGEVVDSLVGKQVEYAKEDGSKRTGMVIHQVEAKPSVYFIKFDDDFHIYVYDLVKTS	72748	156163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_72827_115621_115831_129991_130041_148311_148566_151122_151357_152552
895622	contig_165_pilon	+	4648	18	Intergenic	novelGene_117051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	343.369715096825	29	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	3362	3880	62039	71673	FALSE	5	CCTTGTGGAGTGTTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	32823	72441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_34121_34512_34648_39826_40045_43237_43821_44422_44878_45111_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60411_61140_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
895623	contig_3111_pilon	-	3698	15	Intergenic	novelGene_129960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	189.366465255243	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	1636	2934	22919	16585	FALSE	25	GGAGACTTTCTGATGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQLTFSLPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGSVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGELVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPSQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPNLEEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARTNFDEMLPGTHFQRVIPENGPASQNPEKVKRLLLCTGKVYYDLTRERAARNMVEEVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTINRSRPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFNLDAFKNLA	40586	15820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_16706_16815_16971_17182_17347_18891_18965_20072_20202_20919_20992_21605_21752_21846_21975_22230_22382_22759_23289_24062_24218_24772_24953_37546_37676_39263_39444_39964
895624	contig_5389_pilon	+	1987	6	Intergenic	novelGene_143028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	133.460106398879	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	24	374	437163	480743	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPPQPNMAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKRLI	437139	482865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_480732_480767_481275
895625	contig_16622_pilon	+	9457	9	Intergenic	novelGene_48497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	145	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	937	1239	115175	115477	TRUE	35	TAACAGGCGTGAGGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELALQLSMLGPQGPPVLLQSLVLGPPLFTLLLCQGQGPLREIREERRCLGDSREMCSWLHCSPELPPGVLSPKDSAESPYLCALQLLLCTHFLLQHFLQ	114068	183480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_114357_114526_118623_157798_158399_158797_159660_175870_176773_176935_177689_179678_179915_181272_182786_183273
895626	contig_14684_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_99688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCAGGCACTGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477549	479290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_477500_479300
895628	contig_16098_pilon	+	2040	3	Intergenic	novelGene_46177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	204	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCAAGTCTAAGGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546717	558295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_546815_547802_547915_556464
895629	contig_5649_pilon	-	2911	20	Intergenic	novelGene_82302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTATTAATCGAAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203522	172080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_172203_173116_173299_175074_175190_175534_175652_175976_176053_176223_176404_177179_177309_178571_178873_179498_179640_179732_179838_180469_180588_181689_181882_182440_182584_183101_183210_183312_183485_184367_184415_199921_199982_201360_201494_202871_203009_203189
895630	contig_602_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_134948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAAAGGACATGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476863	475137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_475100_476900
895631	contig_10861_pilon	-	4817	6	Intergenic	novelGene_39206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGAATCTTCCTGTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531756	405018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_405991_420018_420186_428013_429553_453455_453588_475806_475865_529807
895632	contig_11590_pilon	+	531	3	Intergenic	novelGene_125582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_2	3.5	148	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472133	477517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_472276_472700_472842_477269
895633	contig_16666_pilon	+	2144	3	Intergenic	novelGene_61773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	85	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	28	1161	106098	117928	TRUE	75	AAATTTAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EALASATARMRTGWLIGTSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106070	118964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851_118458_118510
895634	contig_6283_pilon	-	3131	15	Intergenic	novelGene_100221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	189.551040458172	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	43	1434	641423	615333	TRUE	15	TGTCATCTGTGGTTCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLCPTDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQAPHTETGKPPRPVDSLSLSVPPSCLSSHPASPRLYGLCVTICSNAHPEIRSARAASPCCPRRHRASRCQPPSQCPRLPSHLHSLASLARSPTPTSAPALPHPPVVSCPAPHLSLPRAQSLHAPLRTSASLHLDL	641465	610899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526_615664_620004_620154_620765_620883_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212
895635	contig_6058_pilon	-	2283	9	Intergenic	novelGene_172402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	418.317761994396	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	88	882	398054	390826	TRUE	60	GACTAGATAAAAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGAETADRLFAAPTAQRVRRRPPARFEKMAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEARKSTVQFWAR	401379	384567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_390860_390917_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
895636	contig_7078_pilon	-	3931	17	Intergenic	novelGene_130151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_9	288.533028601146	647	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	250	2553	645721	541768	FALSE	20	TTAGAGGTTTTTCCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRSGKIVPGQVYIEVEYDYEYDAKDRRIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVPRKALMPPVKQAVGQPNNSVKMIQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKSSSSVQGTGLIRDANQNFGPSCSPGQTVSLSLDLTHNNGKFNSDSHSPKVPSQNRTRLFGHFPGPEFSDIEKTGFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSSSTEQIRASTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSAVPPLPGSPAVQINGEWETHKDISGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISKGDFQSSGDQEWRKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDANDKGQEKYGLLNVTKITENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKPQGSSTSWFGGNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDSDTIISDWFKVLGSTISNQAVEPDEGLEEEIPDSPGIEKHDKEKDHKEPKKLRPMKVSSVDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIAHVEEHGLDVDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIKQLPKPNQDTMQILFRHLKRVIENGEKNRMTCQSIAIVFGPTLLRPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR	671110	540389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_541943_543085_543189_543419_543555_543657_543736_545054_545154_547884_548002_549447_549551_554026_554126_557188_557291_563348_563431_567317_567380_576651_576778_585712_585794_593930_594195_645043_645800_647333_647376_670981
895637	contig_6503_pilon	+	2759	15	Intergenic	novelGene_145771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCCGCTCCTAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159407	268356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_160081_174409_174521_177132_177336_178035_178204_180995_181070_181417_181487_185064_185250_195415_195496_196832_196993_198142_198293_198830_198903_206136_206299_222123_222658_227434_227523_268326
895639	contig_9468_pilon	-	2696	3	Intergenic	novelGene_59476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATGCCATCAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207958	201217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_201503_203172_203264_205638
895640	contig_1239_pilon	-	2609	6	Intergenic	novelGene_150411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	174.25682196115	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	173	736	684171	647098	FALSE	35	GGAGACTGGGTCAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNCLCALNLVYTLVSLLLIGIAAWGIGFGLISSLRVVGVVIAVGIFLFLIALVGLIGAVKHHQVLLFFYMIILLLVFIVQFSVSCACLALNQEQQGQLLEVGWNNTASARNDIQRNLNCCGFRSFNPNDTCMASCVKSGHQCLPCAPIIEEYAGEVLRFVGGIGLFFSFTEASSHLLS	684343	645224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_647122_654555_654670_664901_665016_665573_665655_666283_666452_684108
895641	contig_16594_pilon	+	7317	1	Intergenic	novelGene_53891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	824	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGAGGTCCTATTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221321	228638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_221300_228600
895642	contig_2043_pilon	-	2425	9	Intergenic	novelGene_169906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	216.022532100242	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	39	1877	719582	682042	FALSE	20	CTTTCTCTTGATGCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGLFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCDFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTSTPQGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQVPSQTVQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDLLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDVRMLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPGGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY	719620	681493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_682893_683464_683738_687085_687238_693329_693462_694008_694126_704762_704826_704936_705039_718409_718467_719490
895643	contig_2069_pilon	-	2877	2	Intergenic	novelGene_23211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_1	0	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	1412	2719	109335	102624	FALSE	20	TGAGGTTGGTATGAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEDLIAQFSLPCEVKVVAKDTSHPDDPLTSFLGLRLEEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIEVSK	110746	102465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_103694_109097
895644	contig_14563_pilon	-	4894	34	Intergenic	novelGene_135025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_13	524.730181222121	100	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	931	3453	133526	82529	TRUE	70	ACAGAAGAAAAAAGAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKREPSEDERDQGTSAESEPEQKKVKARRPIPRRTVPKPCVKKQPKPQRGKRRKQDSSDDEDEDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGLDEQQDNSETIEKVLDLRLGKKGATGASTTVYAVEANGDPSGDFDTEKDEGEVQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLEKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERIIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQSCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPTYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKSNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEVWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEGFPGIRAYWTVKLFLRRPLHKVVYCIVYRTSVSCSRQGLVAWESIWLQQTQSSSLTLIGTPRTTCRHKPEPIELARRSR	159385	55389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_55425_56439_56569_57838_57962_59087_59239_59433_59573_65265_65406_66607_66650_75198_75375_76341_76513_80680_80774_81216_81314_82383_82533_83281_83518_89281_89354_91431_91585_91924_92088_96551_96741_107765_107957_108805_108896_110642_110860_113623_113749_115997_116177_116346_116392_118159_118261_119825_120052_120931_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131745_133439_133527_136796_137029_142923_143020_158443_158575_158914
895645	contig_5686_pilon	+	6064	2	Intergenic	novelGene_45359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	5349	5693	136974	137318	FALSE	55	AGGGAGAATGAAGAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPHSLFLTSAFQSYASVSGRGASITSGILAAEVCGKCFQLPSLSIRKAPCIGGLELMLTANQVYPVQLPWEVMGSVGSHRCMHGTQLSFSEGWWHVAEQKWMPEIFRKFKKCC	130020	137689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_134436_136040
895646	contig_10734_pilon	-	1215	3	Intergenic	novelGene_51469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	86.5	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	129	719	2267149	2265543	FALSE	65	AAAGAAAAAAATCACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2269376	2265046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290
895647	contig_9272_pilon	+	5956	1	Intergenic	novelGene_125975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	644	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTACTACCTGTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648778	654734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_648800_654700
895648	contig_6418_pilon	-	3869	5	Intergenic	novelGene_81248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	413	junction_1	213.359292040445	8	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	646	1767	1460788	1449950	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNILGRLFEQTLVSSGKSHLWVQIEPGYSISLYLLRYFIFSLYLPVSFANCKSFVFQTGRATASDSGGVIDLTMDDEESATSQDPKKPNHTPVSTIGSSQPVTRPLQPIQPAPPLQQSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNSGLTLGSAGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGIVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQSTDVISSSQSS	1461433	1447847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1450370_1454063_1454177_1455959_1456143_1458960_1459117_1460538
895649	contig_2830_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_165857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	1215	1598	705659	706042	NA	70	CACAAAAAAAAGAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPSEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLEAHYLRKLTQSDVEKLNRPIKREETEKVIKTKTCNNNKKKSPASDDFTGEFYQTFREELTPVLLKPFQNIEKEATSLYEASITLIPKPGKD	704444	706044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_704400_706000
895650	contig_3745_pilon	+	3253	6	Intergenic	novelGene_85086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	371.113675307176	19	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	379	1305	434035	458823	TRUE	50	AAAAGTTAAGTGAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRGLFLQTRTHWLLFGLALLCSLVLFMYLLECAPQTDGNASLPGVIGENYGKEYYQALLQEQEEHYQTRATSLKRQIAQLKQELQEMSERLRSLQERKNGVANGVGYQGNKEQAPSDLLEFLHSQIDKAEVSIGAKLPSEYGVIPFESFTLMKVFQLEMGLTRHPEEKPVRKDKRDELVEVIEAGLDVINNPDEDDDQEDEDNRLGEKLIFNENDFVEGYYRTERDKGTQYELFFKKADLMEYRHVTLFRPFGPLMKVKSEMIDITRSIINIIVPLAERTEAFAQFMQNFRFTKKILAFGEILALE	393634	488557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_393747_433768_434696_437841_438059_458774_458857_486578_486960_487023
895651	contig_13428_pilon	+	4190	22	Intergenic	novelGene_143437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	233.079794225477	1120	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	743	2212	50306	82244	TRUE	60	AAAAAAAGCACAATCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRILVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVFKKTENSENLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRRQLHQLLPNHVLQKKKKHSTEGVRLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSAMKTSPLNSSGSSQGRNSPAPAVTAASVTNTQAPEVPVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAAQPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNQPPRPSGNAATKIPNAVVGVKRTSSPHKEESPKKTKTEEDETSEEANCLALSGHDKTETKEQMDAETSTAQPETMQTAACLVASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR	40733	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921_51995_53267_53389_54327_54413_59775_59830_60343_60464_61923_62034_66264_66387_70359_70503_73401_73503_73731_73953_78061_78125_80039_80115_82148_83878_83982
895652	contig_3095_pilon	+	1204	5	Intergenic	novelGene_75119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	32	796	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147209	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
895653	contig_10197_pilon	+	3037	6	Intergenic	novelGene_115209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.8	2	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	2627	3037	920480	952416	FALSE	30	GCAGCAAAAATGGCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCLSSTSRMSQQINFSSVSTICRYSRIIFSLSSPPLFSSFCSMLLIILQEALLAPITFLYATDRRFLSSTVNSTSIPATFFIDSTISSYRSACSASFAWYTRSSRSSIAAVAQAGSARRMEADSVSDSLSLSLRVR	908347	952416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_910581_915126_915274_918066_918267_920433_920540_923906_924109_952267
895654	contig_8310_pilon	+	2177	16	Intergenic	novelGene_75578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	337.517696655384	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	16	1863	283403	325825	FALSE	70	AAGGAAAAAAATAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDCKFSEKHFGI	283387	326139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320610_325602
895655	contig_12479_pilon	-	8549	2	Intergenic	novelGene_56834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1050	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	301	669	128158	127790	TRUE	15	TGCCCCTATGCCATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGQGCSSGEGSGVRAGPPWGCRAQCGRGQVGDEGSGSKLVPLGATGCSTVGAKQEGKEMGFSLLGLRSMARQGLSRGKRSEVHASPPWGCRLRHVSDLESVLVPLRPWSTVRRGTSWQGGA	128458	119837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_120734_120805
895656	contig_9366_pilon	+	2566	4	Intergenic	novelGene_166289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	379.149047209669	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTACTGCAGTGGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088228	1093067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1088479_1088565_1088640_1088926_1089036_1090934
895657	contig_4125_pilon	+	3691	7	Intergenic	novelGene_25084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	563	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGTACATAACGATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533205	538267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_534429_534587_534678_534760_534869_535214_535354_535436_535547_535692_537667_538220
895658	contig_6137_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_59282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGTGGCATTTAGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347010	1349059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1347000_1349100
895659	contig_2768_pilon	+	1741	7	Intergenic	novelGene_57512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	289.961731191472	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	77	886	788324	792735	FALSE	25	CAACATGGGTCACTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANPWICISGELGETQILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNAGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKEAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFITAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI	788247	793590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_788336_788886_789006_789357_789537_790138_790222_790833_790898_791504_791674_792551
895660	contig_12464_pilon	-	2993	1	Intergenic	novelGene_68728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTTCATCCCAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378162	375169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_375200_378200
895661	contig_3320_pilon	+	2231	4	Intergenic	novelGene_133057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	108.02880274363	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTATTATTGATCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103713	178024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_103771_109909_109941_113136_113257_176001
895662	contig_16098_pilon	-	1390	11	Intergenic	novelGene_45768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_10	244.52772848902	58	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	707	1120	35038	31519	TRUE	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36331	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35749_35907_36011_36295
895663	contig_15498_pilon	-	1391	10	Intergenic	novelGene_42671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	138.841236269665	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	23	763	697795	689498	TRUE	20	CCTCAAACTTCCATCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPGAAIGQPWKGHFRCPSAGLFGRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILCPIIGWARQPLPTPTLSPT	697817	687992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689558_690959_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
895664	contig_13021_pilon	-	2506	6	Intergenic	novelGene_8273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	497.549756305839	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	11	853	270418	249890	FALSE	15	CCATTCTTGCAGCCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYEK	270428	248236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249895_251082_251152_252257_252369_259754_260040_265837_266120_270327
895665	contig_12969_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_61683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459908	461715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_459900_461700
895666	contig_6361_pilon	-	6477	8	Intergenic	novelGene_23940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4996.21540850305	2352	156	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	25	GCCCGGAAATCTTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	496323	336037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_338822_390342_391548_405724_407674_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
895667	contig_14344_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_178677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGATTAAAAAGGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22320	20198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14344_pilon_-_20200_22300
895668	contig_5669_pilon	+	6507	3	Intergenic	novelGene_86076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	251	595	188913	189257	TRUE	25	CTGTACTGACTGCTAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSTTRPLVGALLHTWIQQPAKSFLSCRLFSPQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	188662	198007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_190076_190967_194419_196364
895669	contig_14142_pilon	-	1825	10	Intergenic	novelGene_120526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_9	202.37777899784	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	14	841	355495	350546	TRUE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREVGPSTGGGPGNKLLGIAPD	355508	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
895670	contig_15047_pilon	+	1699	6	Intergenic	novelGene_52116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	5	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	32	655	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2162	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4681_21003
895671	contig_13702_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_102626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1	414	211385	210972	NA	10	TACTGGCTTGTCTCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKVALLWSGNLKYPNACFPRWSQPEELPPSLDVPGLRLDRIFLWTELHVPCLLTGGKRVGGSSCQSCAHNIPAVASFEADVLCLYTAASVVSSLCLLLSHARPHPAVTLLILPLEPKGQVCFRLLENRVGLDLEHS	211385	208824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_208800_211400
895672	contig_21007_pilon	+	296	1	Intergenic	novelGene_161547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCTTTCCTACAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618	914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_900
895674	contig_15449_pilon	+	4095	17	Intergenic	novelGene_33565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	749.437557334665	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	1583	3064	45599	54621	FALSE	40	AATGTAACCAATATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	11188	55652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_15759_15842_32835_32912_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45019_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51932_54570
895675	contig_12677_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_110753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCCCACATTCTGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	22	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
895676	contig_15327_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_70631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTAGACTCTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900679	898563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_898600_900700
895677	contig_8375_pilon	-	1853	3	Intergenic	novelGene_141313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGACATTGTGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222361	212816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_213253_215394_215515_221064
895678	scaffold_880_pilon	-	2345	2	Intergenic	novelGene_121519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACTTGGGGTCAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579535	576020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_577823_578992
895679	contig_17144_pilon	-	1500	7	Intergenic	novelGene_29376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1641.24137469173	21	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	16	1419	170784	166152	FALSE	25	AAATTCTTGAGTGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEESSRNDPTTGLTQERAVARADILKCTILSTHVLMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	170799	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166950_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744
895680	contig_2476_pilon	-	2611	9	Intergenic	novelGene_157633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	49.8696739010794	142	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	72	2174	485780	359761	FALSE	35	AGCATTTTAAATTATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFERQQREELEKLESKRKLIEEMEEKQKSDKAELERMQQEVETQRKETEIVQLQIRKQEESLKRRSFHIESKLKDLLAEKEKFEEERLREQQELELQKKKQEEESFLCVRELQWLQELNNDEKAEKIQIFRELDWLRKEKDEQYAKLELEKKRLEEQEQEQFMLVAHLEEQIREKQEMIQLLQRGEVQRVEEEKRDLEDIRESLLRAKEARAEGDDDGEEIEKAQLHFLEFKRRQLVKLANLEKDLVHQKDLLKKEVEEEQEILEHLKCENKDKSRLLAKNDGSVQHVTQVAQDLEKIKPAEYRLQYKERQLQYLLQNHLPALMEEKQRAFEILDRGLLDLDNTLYQVEKEMEEKEEQLTQYQASASQLQKLQATFEFTANIARQEEKVRKKEKEILESREKQQREALEQAVAKLERRHSALQRRSTLGLEMEEQRQKLANVNSSTNARAGLEAGLEAEQEALEKDQERLEHEIRQLKEKICEVDGIQKWDCGTLEGKASSSSLPLSTEKSQAHLMPLMDARINAYIEEEVQRRLRDLHRVVGSDSRASAEGMKDNEKLQNGTIQRKLKYKRMVSRCLGANPYDLKDPIKISIPRYVLCGQGKDEHFEFEVKISVLDETWTVFRRYSRFREMHKTLKLKYAELATLEFPPKKLFGNKDERVIAERRSHLEKYLRNFFSVMLQSATSPLHISKVGLTLSKHTICEFSPFFKKGVFDYSSHGTG	487500	359323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_359920_411258_411343_438327_438418_462307_462431_476999_477051_477800_477898_480133_480293_484440_485797_487445
895681	contig_16411_pilon	+	5974	16	Intergenic	novelGene_77363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	3333	3947	302001	302615	TRUE	10	CCATGAGCTTGTGTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPQSQELSPQITQPRPGQGPSSGWFPVLKRMHKCPASIQPETFRKAGNGTLSRVPSPIGHGFSRLSPGQRAEQDFPQLGLPAQDSLDHPHCHPWAKGPVEGRLEGDAVIHPPLCSPLHTLGCILHKTTLRFHRQLSLWAFEEAEEAMCPEGDFRRFGGSGRREEELGGGQTCFFQIPWPLDPLGYPESSRKGRNPLTRSRFSS	298668	346973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_302653_303441_303594_318786_319015_319330_319414_320725_320868_322115_322228_322352_322435_323336_323540_326024_326138_327786_327984_333818_333907_336334_336510_338776_338917_340149_340235_342214_342381_346949
895682	contig_4857_pilon	-	2406	5	Intergenic	novelGene_48853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGATGTGCTCAAGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1436408	1331527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1331549_1343174_1343251_1405450_1405553_1407010_1407073_1434263
895683	contig_57_pilon	+	3021	25	Intergenic	novelGene_44885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	198.102417219814	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2121	900	3020	93421	129542	FALSE	60	CAGAAAAAGAAAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKD	66762	129543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89448_89493_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
895684	contig_5482_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_144455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTTTGTAAACAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303265	301795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_301800_303300
895685	contig_5018_pilon	-	2603	3	Intergenic	novelGene_47210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1340	1663	1631492	1631169	TRUE	65	AAAAAATCACAAACTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMAALFTIAKSWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCYETSIVKTHEKVYTQKVTIFVDYQGWEGWGGNTK	1633031	1630097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1630530_1630660_1631769_1631968
895686	contig_19744_pilon	-	3447	2	Intergenic	novelGene_120383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGAATCGACTTGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177900	154189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_156241_176504
895687	contig_5686_pilon	+	5625	13	Intergenic	novelGene_45233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1432.96965105104	26	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	524	2095	176692	212669	FALSE	30	TCTGTAGGCCATTATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNR	93785	216199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176652_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480
895688	contig_567_pilon	-	1930	6	Intergenic	novelGene_34018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCTTCCCCCCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660489	653101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_653711_654922_655088_656041_656209_657400_657561_659404_659687_659942
895689	scaffold_12124_pilon	+	2892	6	Intergenic	novelGene_22213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3694.91859720887	91	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	921	1700	1508626	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473555	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1508010
895691	contig_2703_pilon	+	4688	10	Intergenic	novelGene_101768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	604.290789293277	248	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	3788	4381	602068	610870	FALSE	25	TGCTCAACCATAGCCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	591083	611177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_594674_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
895692	contig_11173_pilon	+	3332	12	Intergenic	novelGene_156905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_11	241.766740940092	354	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	592	1659	434044	455686	FALSE	40	TAGTGAAAAAAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVLSWKLVPDNFPPGDQPPPPSYIYGSQHLLRLFVKLPEILGKMSFSEKNLKALLKHFDLFLRFLAEYHDDFFPESAYVAACEAHYSTKNPRAMY	431570	457359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936_450047_452961_453062_453732_453818_455586
895693	scaffold_4438_pilon	+	8126	5	Intergenic	novelGene_174533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_4	42.2751404492049	1029	131	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	449	1042	395703	419036	FALSE	20	GACTCCGGCAAGATGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQTTTLIVKKRPDFSSSGQWEIVTKSNGKEQSEVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVSYERASTE	395254	426120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_411934_412098_413970_414114_419006
895694	scaffold_12124_pilon	+	1614	11	Intergenic	novelGene_22288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	190	567	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473578	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508411_1508901
895695	contig_4305_pilon	-	3665	13	Intergenic	novelGene_136690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	862.045387436184	120	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	94	1638	549869	528320	TRUE	30	GGCAGAGGACTCACAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRLRLCGRRPDFCSPRQARPSWPPPPHLAAMRLRRLALFPVVALLLAAARLAAASDVLELTDENFESRVADTGSAGLMLVEFFAPWCGHCKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFEKFISEKDASVVGFFSDLFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNKYDDNGGGITLFRPSHLVNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLVAYYDVDYEKNTKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNDELNDFISYLQREATNPPCNSRRQTQEEEEGTGGPLKQPDRPLCERPLSPEMGNGLGACSLRGIILRGQNGYDLNPVQLSLKFFLAALFMKHQDQFMFLVLEKIICVGGNVVGVGGIQLGVIF	549962	525628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_525928_526510_526556_526636_528686_529940_529983_531020_531130_532180_532364_532962_533089_533404_533522_536851_536982_538239_538348_541824_541943_543486_543566_549702
895696	contig_7840_pilon	+	2280	10	Intergenic	novelGene_68969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	452.983443406048	4	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	252	1166	238014	304985	FALSE	30	GGTAGAAGATTTGCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKPIPGKELPCS	130676	306099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299249_299505_304947
895697	contig_2114_pilon	+	3000	3	Intergenic	novelGene_104220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	86.5	344	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	120	740	136332	137672	FALSE	10	ATGCATGGTTGTCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEVGYTLNSFLWPELDTVVLNSGI	136212	139932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430
895698	contig_11138_pilon	+	4200	3	Intergenic	novelGene_178679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1524	1853	179340	179669	TRUE	25	GGCCCTAATTTCTTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDGFPVEEKTLELPDREFKSLIFRAIQELKQKPPQNEKKRQMYGKYRQKNGRNQENNAGTKCQNKFTTGNHTETIITNSKDKQQDFRNGQCHRRAEEQV	177641	212890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11138_pilon_+_179135_179309_180620_211493
895699	contig_6735_pilon	-	1697	4	Intergenic	novelGene_15808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2003	junction_1	120.9049213225	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	502	969	564868	552772	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKVSDSSLPVLPTSNHAGHTNTRP	565369	552043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_552952_554243_554374_564157_564232_564784
895700	contig_4924_pilon	-	4347	9	Intergenic	novelGene_84700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_8	1220.98011347442	387	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	118	1023	252576	82377	FALSE	50	ATCCATACAAAGGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	253934	79052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_253836
895701	contig_14353_pilon	-	1752	2	Intergenic	novelGene_82077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91162	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_90961
895702	contig_5988_pilon	-	2435	2	Intergenic	novelGene_15868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	0	781	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGAAAATGAAAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389932	387060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_388062_388498
895703	contig_7049_pilon	+	550	4	Intergenic	novelGene_171444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	82.0853214649245	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	27	407	144151	145581	TRUE	5	GCCTGGTTCCTGGACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGARRRNMATAADLAEIPDVDIDSDGVFKYVLIRVHSAPPSDAQAAESKEIVRGYKWAEYHADIYDKVSGEIQRRGYDCECLGGGRISHQSQDKKIHVYGYSMGYGRAQHSISTEKIKAKYPDYEVTWADDGY	144124	145768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_144314_144743_144869_145488_145596_145639
895704	contig_11316_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_122632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1828	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137400_138900
895705	contig_6102_pilon	-	4855	15	Intergenic	novelGene_32083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	171.374470629885	31	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	2073	3710	795596	790357	TRUE	45	AAAACTCAGCAAGGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEKLKEKVKREKKEKVKMKEKEEIAKAKPACKADKTLATQRRLEERQRQQMILEEMKKPTEDMCLTDHQPLPDFSRIPGLILPSGAFSDCLTIVEFLHSFGKVLGFDPAKDVPSLGVLQEGLLCQGDSLGEVQDLLVRLLKAALYDPGLPSYCQVRPFAREVGKAWDPVLCLSHVFSLRALEGPP	809055	788896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_788944_789048_789230_789439_790708_790863_791098_791584_791651_791969_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_796446_797091_797404_798168_798763_800356_800495_808876
895706	contig_3081_pilon	-	3473	8	Intergenic	novelGene_133970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	81	junction_1	309.833332418497	776	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	562	1527	1216116	1195826	FALSE	35	AATTGAAGTGGGTGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALVEDDICILNHEKAHRRETVTPVSVYSGDESVASHFALVTAYEDIKKRLKDSEKENSLLKKRIRFLEEKLIGAQLDEETSSVGREQVNKAYHAYREVCIDRDNLKSKLDKMNKDSCESLKVLNEQLQSKEVELLQLRTEVETQQVMRNLNPPSANWEVEKLSCDLKIHGLEQELELMKKECSDLKIELQKSKQMDLSQEDNLKSRDLQRLSISSDNMQHAYWELKREMSNLHLVTQVQAQLLRKLKTPTAIKKACAPVGCVEDLGRDSTKLHLTNFTATYKRHPPLSPNGKASSHATSPFARRYKDFIRESNSPIMDR	1227578	1193879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1196023_1198423_1198543_1205462_1205522_1210434_1210584_1211662_1211763_1212233_1212360_1215900_1216122_1227022
895707	contig_3817_pilon	+	3271	2	Intergenic	novelGene_78406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTGCAGTAGAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1280141	1285345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1282864_1284796
895708	contig_5947_pilon	-	4766	2	Intergenic	novelGene_101486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	660	junction_1	0	212	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACATAGTAGGTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393936	388812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_393497_393854
895709	SIRV6	+	1418	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	80	-7	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
895711	contig_11427_pilon	-	5200	19	Intergenic	novelGene_79010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_7	136.69585280044	882	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1489	4470	69	4538	816866	708281	FALSE	55	TAAAATCAATTAAAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHCSDHWEDERLESRRHAYEEKFEVMANKTCPQTEKFFLHKGAEKNPEISFTQSSRKQVDNHLPEIVHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEEIVKVKIASRQQELPVYSSDDFEDVPSKSRQQTTFPHRPDSRLGKMELSFSSSCEISLVDGFHSSEELRNLGWDFSQAEKPTTTYQQPDSSYGACDGHKYQQSAEQYGGTHSYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGVVYDRIQGQVPDSLTDDREEEENWDQCGGSHFSSQSNKFLLSIQQKDRGSVQAPEISSNSIKDCLAVNEKKDLTKNLEKNDMKDRGPLKKRRQELESDSESDGELQDRKKVRVEVAQGETAATPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKEERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAARDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTCLELIQNTHSQSCLKSFLECHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPQLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTETPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPIEEEEELQPQQLLTQQLPESRVDGEASVEVSKLPMSEPEADSEIEPKESNGTKLEEPIAEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKENTITERGRDAVGFRDQTAAPKTPNRSRERDPDKQIQNKEKRKRRGSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSAEPLAAPPPVPVVTHVTAPVEVSSSQYVAQSDGVVHQDSSVAVLPVPAPGPVQGQNYGVWDSNQQSVSSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPAVYGVTSPYSQTTPPIVQSYAQSSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAATVTTIVAPGQPQPLQPPEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKTSKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE	816934	707618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_708443_708806_708909_710851_710933_726944_727057_734616_734757_736713_736849_743033_743707_750704_750889_754726_754776_780957_781621_782920_783041_783856_783992_792106_792234_795236_795335_798086_798165_800238_800363_809622_809752_812987_813120_815640
895712	contig_11026_pilon	+	4692	19	Intergenic	novelGene_167664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	205.230802022419	706	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	490	2541	196513	222883	FALSE	45	TAAAGACCAAAAATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEERVVILPPRARAHHSTVLTSVVAYPTDPRTALKTRDNSCNFALHARGGEWMRFATPGFPDSPYPAHAHCQWALRGDANSVLSLTFRSFDLAACDQRGSAVVTVYDSLSPIEPHAVVRLCGTYPPSYNLTFLSSQNVFLVTLISKSKRRHPGFEATFFQLTKMSGCGGYLHQAQGTFSSPYYPGHYPPNIDCTWNIEVPNKQYVKVRFKVFYLVEPNVSPVICTKDYVEVNGEKHCGEKSEFVVTSNSSKITVHFHSDQSYADTGFLAEFLSYDSRDPCPGMFTCKTGRCIRNALRCDGWADCTDHSDELNCVCNATHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFKCGNGKCLPLSQQCDGKDNCGDGSDEASCDQVSTVTCTQHTYRCHNGLCVNKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGQRSFSKQSRVVGGQNADEGEWPWQVSLHALGQGHVCGASLISPTWLVSAAHCHIDDKGFRYSDPAMWTAYLGLHDQSKRSDPGVQEHKLKRIIRHPSFNDFTYDYDLALLELEQPAEYSSVVRPICLPDATHVFPAGKAIWVTGWGHTQEGGSSALILQKGEIRVINQTTCESLLPQQLSARMMCVGYLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCARRNKPGVYTRLSMFRGWIKEQTGV	159752	225034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_159807_194602_194763_195115_195244_195440_195512_196436_196595_196795_196832_197071_197313_199622_199763_200167_200266_200929_201040_201145_201277_203408_203514_203776_203888_203999_204114_204482_204606_205415_205603_220656_220932_221998_222136_222721
895713	contig_14682_pilon	-	6743	4	Intergenic	novelGene_139100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	282	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	5740	6402	89454	88792	FALSE	60	GAAGAAAGGAAATAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRWRVTECTRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGRKKIYQANNYQKRAGVAILISDKINFKTKSTVKDKQGHYMMIHGTIHHEDIVIINIYAPNDRAPKYINQTLTTLKREIDSSTVIVGDFNTPLSVKDRTTKKTLSKDTEDLKGTIRQLDLIDICRTLHPTTARYTYFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIKNV	175637	88450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_90306_96936_97317_109764_114018_175382
895714	contig_7279_pilon	+	3118	13	Intergenic	novelGene_145982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	264.57832016248	315	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	19	1329	64657	99452	FALSE	50	AAAATAGGTTTAGGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFEFLEMSSRKSKSNSLIHAECLSQVQRFLRERFCRQSSHSNLFGVQVQYKHLIELLKRTAIHGESNSVLIIGPRGSGKTMLINHALKELMQIEEVNENILQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGNRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPVAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	64638	101241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68712_75401_75478_76321_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
895715	contig_16125_pilon	-	4473	7	Intergenic	novelGene_155261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	1053.54364988937	136	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	56	1576	236934	150343	FALSE	10	ACCTCTTTCTCTCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFK	236989	147445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_150346_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
895716	contig_4769_pilon	+	4533	1	Intergenic	novelGene_118013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	968	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGAACCGCCTCCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063098	1067631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1063100_1067600
895717	contig_20058_pilon	-	3288	9	Intergenic	novelGene_109283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	644.332406448721	25	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	68	1723	59150	30516	FALSE	35	CTGATCCCATCTTATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAAPAAGGSAGGGGGGRGRRKMADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59217	28950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
895718	contig_6137_pilon	+	2923	2	Intergenic	novelGene_59298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	526	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAAAGAAAAGCCAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595171	1598353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1597200_1597458
895719	contig_1337_pilon	+	2968	1	Intergenic	novelGene_84222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	402	2567	2968	85632	86033	NA	15	TAATCCCTTTGGTGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTVTIRVQEHSGYSSSIRAPSSQPCLQACLSLVLSLCPEALSFLCLWAGKPTTPSPTARSLLSDLCCRFSLLSRLQLAVSLVQELLSTGILDPKDMLAADCSSLVVVGSFLSHPWGGPFQAQQNGKTD	83065	86033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_83100_86000
895721	contig_9332_pilon	-	7291	6	Intergenic	novelGene_60726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	179	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1131	1457	639419	639093	TRUE	75	AAATTAAAAATTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLFIHSSVDGHLDCFHLFAVVNSAAVNMGVHMSICVTALISVGNISRSRIAESYIYISRFLRKCHTIFQSGCTILHSHQQHIRVPINLPALSPTFVIFCFFDYCQ	640788	511091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_513067_516542_516668_569108_571787_637223_638255_639067_639747_639985
895722	contig_12391_pilon	+	3463	13	Intergenic	novelGene_103603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	41	junction_7	281.047284969787	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	3	1190	56804	107379	FALSE	20	AGCAAGTTTGTTCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56801	109652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719_98751_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
895723	contig_11277_pilon	+	2009	3	Intergenic	novelGene_80316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	312	junction_1	7.5	53	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	96	434	266875	269500	FALSE	50	GTGAAATGTATCAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	266779	271075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_266957_267437_267610_269415
895724	contig_3956_pilon	+	3036	15	Intergenic	novelGene_14977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	1116.30724137347	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	930	2793	81	2873	1281682	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGLPPVCVRPLADPARRPLRHHQPPQPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289790_1290335
895725	contig_3975_pilon	+	2419	12	Intergenic	novelGene_54736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGCGCGCGCGGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718383	1731274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1719608_1720250_1720363_1720453_1720512_1720627_1720703_1721299_1721384_1721492_1721526_1721711_1721871_1721982_1722097_1722625_1722804_1728239_1728388_1730456_1730603_1731186
895726	contig_9471_pilon	-	2893	12	Intergenic	novelGene_21861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	952.446749124252	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	89	1234	445281	434615	FALSE	20	GTCCATCCTTACACTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMELFPANKQSVEHFTKYFTEAGLKELSEYVRNQQTIGARKELQKELQEQMSRGDPFKDIILYVKEEMKKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEGD	446572	432955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436469_437134_437168_437641_437813_437962_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
895728	contig_20610_pilon	-	4228	1	Intergenic	novelGene_67657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	593	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATTCAGCAGAAACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116258	112030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_112000_116300
895729	contig_854_pilon	+	3227	19	Intergenic	novelGene_36606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2982.41290994927	841	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	36	2612	1687025	1715383	FALSE	40	GTCATAAATGATAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1686989	1715998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693201_1694493_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706866_1715305
895730	contig_3627_pilon	+	4791	25	Intergenic	novelGene_78442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	268.485021178505	60	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	955	2868	903	3770	304392	332430	FALSE	40	GAAGCTCATTAAAGCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSKKDERKDKKEERDDETDEPKPKRRKSGDDKDKKEDRDERKKEDKRKDDSKDDDETEEDNNQDEYDPMEAEEAEDEEDDRDEEEMNKRDDKRDVNRYCKERPSKDKEKEKTQMITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTVKQESKDVEENVGLIVYNGAMVDVGSLLQKLEKSEKVRAEVEQKLQLLEEKTDEDEKTILNLENSNKSLTGELREVKKDLSQLQENLKISENMNLQFENQLNKTIRNLSTVMDEIHSVLKKDNVKNEDKDQKSKENGASV	292739	333451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298536_300291_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842_331029_331550_331757_332370
895731	contig_15236_pilon	+	696	3	Intergenic	novelGene_141591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCTTGTCATTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450905	452553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_451172_451269_451423_452276
895732	contig_2798_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_120053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAACATATGAAGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172069	174478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_172100_174500
895733	contig_10732_pilon	-	1417	1	Intergenic	novelGene_114674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTCATATGGTAGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53069	51652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_51700_53100
895734	contig_8978_pilon	+	3185	14	Intergenic	novelGene_49460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	207.788724059208	73	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	1261	3093	1749586	1772309	FALSE	60	TTCTCCTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680803	1772401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681325_1684923_1685023_1696766_1696943_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
895735	contig_4364_pilon	+	1775	5	Intergenic	novelGene_748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	9017.8175852032	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	72	1070	1531103	1532568	FALSE	20	ACGCGGCGGTGTGTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530952	1533273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
895736	contig_12790_pilon	-	6381	6	Intergenic	novelGene_35284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	270.306788667987	692	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	318	695	456865	455080	TRUE	45	CCCAGAAATAGACCCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKFGITAAFSMIYVYTAELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTILTAILTLFLPESFNIPLPDTIDQMLRVKGIKYRQSPTHTRVLKDEEESPTILKSTAF	462319	449303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_451938_452027_455168_455548_455685_456711_456895_460276_460378_462132
895737	contig_6896_pilon	+	5305	7	Intergenic	novelGene_174224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3875	4279	590294	590698	TRUE	35	AGAGCCAGGTATTTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGRFSVGSFSMILSVFSVFSPCSGTPITRNFLLLIVSHILLRISSSFFVLFSEFSSDRFVSKCLFSILLILSSTISVLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNFCFCMISTCEFILAFCSCIIFLNASIFCLYFP	422891	591969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_423305_489710_490211_550291_551413_585506_586467_589271_589728_589869_590878_591122
895738	contig_6522_pilon	+	2729	2	Intergenic	novelGene_178680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1377	1820	16946	17389	FALSE	25	GGAGTTCCGGCAAAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRIIGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKQNEETLRVMWDTVKSKNFQVIRIPEWGENTERILEELLTENFPNIMKDEKLAIREAQRTPYRTDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAASEKQKVTYRRETIRLSSDYLAETMQARRQ	3510	18298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6522_pilon_+_4465_16523
895739	contig_408_pilon	-	2957	9	Intergenic	novelGene_84910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.76512915211	4	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	25	768	233759	133567	TRUE	35	ATGACTCACAAGGTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSHVQIPVMLMPDDFKAYSKIKVDNHLFNKENMPSHFKFKEYCPMVFRNLRERFGIDDQDFQNSLTRSAPLPNDSQARSGARFHTSYDKRYVIKTITSEDVAEMHNILKKYHQYIVECHGITLLPQFLGMYRLNVDGVEIYVIVTRNVFSHRLSVYRKYDLKGSTVAREASDKEKAKELPTLKDNDFINEGQKIYIDDNNKKVFLEKLKKDVETRLGKKCTLWQLLTFLLIMMQKRKLPTPQKPLSMALVQRSQR	233783	131327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131898_131947_133592_136727_136832_147687_147802_167538_167578_181038_181186_209757_209911_232035_232133_233694
895740	contig_18035_pilon	+	1703	3	Intergenic	novelGene_178683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGATACCTCTCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3032	5531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18035_pilon_+_3454_3695_4662_5215
895741	contig_13888_pilon	+	2437	3	Intergenic	novelGene_151808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTAAAACTCAAAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350490	482093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_351400_427212_427359_480711
895742	contig_10861_pilon	+	2070	7	Intergenic	novelGene_39269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_3	257.413253997018	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	845	1180	1344644	1348866	FALSE	45	ATATACTAGAGTTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTVLHAMMIMTDTDVLEAEVMKEGDQEVGLLITTIEDLIVLETVDRLEDRGVAEAIPTMIDQTAAGIPSTVLLTTLQERSEKAEKEPKKGSSSDQRVGGRCCSMNTVRIF	1337598	1349756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339656_1340022_1340386_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1348714
895743	contig_3018_pilon	-	1245	7	Intergenic	novelGene_78801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	116	460	517532	499636	TRUE	40	CTTCGAAAACCATGCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVKCLCTQQAFPRSAILTLILSAFRGSRGFTNKSAARVFVFGKSPVLEAETVLLLSWDGLLSSCSLRGDPSESAEPQATGSKGPGNNEVGNSGSCDSGILCCPFGNSPLNCS	522906	483801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_483884_495532_495727_498505_498752_499372_499857_517300_517401_517508_517617_522875
895744	contig_14687_pilon	-	4166	11	Intergenic	novelGene_107904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	444.952177205596	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1064	3195	561	3755	452049	426438	FALSE	35	CAAATCATTCATTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALHRAPVFHPPIHHSLERKESSYSNLSPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWKSNNNLSKEKAEWHVEKSNGKSQAAMASVIVRPPSSTKYESMSAIQLASKDRLSERSSTEANKTDCRKHTEARETGRIILPSVNSDSAHIKSEKIFQSVSQGRVPSSVMSAVNTMCNTKTDVFTSVATTATGSSWGGSEVIYSLSNTTLASTSLECTSSKSVSQSVAQTQECKVSTTASITPASSKTVSAFQPSAGFSGTTDFIHLKKHKAALAAAQYKSSNIGETEPNAVKNQTSSASLPLESTVVCSTVNKAISVGNGQASQTNQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSNDIQNSVDSKIIVDKYIKDDKVSRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKEKSKLKLQSNSNSAGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPTHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAISLWTHENYEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDACEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDKELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQIIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNAQAGNFPIVNGVSQVLQNVLNHSNKISLCMPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKECTLEKQIKEEQEQDNPDSPNCRTSPPVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPNKASKINVKSELKEEPKESRKPAMNENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSNNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNGSVKEFWDGFEEVSSMFFRFTVFLAYPSKK	452647	426026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_426657_429457_429737_430476_430692_431201_431416_431602_431731_433569_433660_442444_442598_443640_443856_445842_446045_450569_452352_452389
895745	contig_14167_pilon	-	2813	3	Intergenic	novelGene_105530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.5	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	150	425	26725	24086	TRUE	20	GAAAGAGGCTTGGTCGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPLHLSDDGEGGTFHFHDPPPPYTAYKYPDIDQPDDPPPPYEASINPDSMFYDPADDDAFEPAEASPPVPGNSSSDGALPQHLEQPLPSVGAPLTDLEDSADSSSALLVPPDPTQNESAPVAEALLGGGLHSRSSVNTVV	26874	21649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_23481_23528_24343_26706
895746	contig_7151_pilon	-	2472	5	Intergenic	novelGene_40783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1370	junction_2	553.885592879974	104	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1246	1551	535543	529189	FALSE	20	ATTACCATTTTTTTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551357	528267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_536494_549638_549729_551152
895747	contig_1154_pilon	-	3856	16	Intergenic	novelGene_87054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_15	214.463568519742	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	753	2262	117	2378	241558	106481	FALSE	20	ACCAATTACGGTGCCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGVLGGCDILIIYSPDAKEWCKYLQDLFLSSRQVRTQKILTHRLGPGASFSAEDVSLFLRTRCIMVLLSAELVQHFYQPAMLPLLQRAFHPPHRVVRLLCGVQDSEEFLNFFPDWAHWQELTCDDEPEIYLAAVTKALSEDSGCDSVTDTETEDEKALPYSKQQHLPLENSPGNLMVVQPDRIRCGAETMVYIIVKCKLDERVTTEAEFSPENSPSRRVEAKLENEYTISVKAPNLSPGNVSLKVYSGDLVVCETTISYYTDMEEIGNLLSSAANPVEFMCQAFKIVPYSTETLDKLLTESLKNNIPANGLHLFGINQLEEENMMTNQRDEELPTLLHFSAKYGLKNLTALLLTCPGALQAYSVANKYGHYPNTIAEKHGFRDLRQFIDEYVETVDMLKSHIKEELMQGEEADAVYESMAYLSTDLLMKCSLNPGCDEELYESMAAFAPDASEDLYVEMLQASTSNPISGDSFSRTTKDSMIRKFLEGNSVGMANSERKLHRLSREEDVYHIVDDDDTLSVDMASRPPVPVPRPEASPPGAHQLPDNEPYISKVFAEKSQERPGNIYVSSESIRKEPPVRPWRDRPQSSVYDPFAGMKTPGQRQLITLQEQVKLGIVNVEEAVLHFKEWQLNQKKRSESFRFQQENLKRLRDSITRRQREKQKSGKQTGSASNRSSTRSLLSVSSGMEGDNEDNEVPEVTRSRSPGPHQVDGTPTVPLERPPRVPPRAASQRPPTRETFHPPPPVPPRGR	241674	105002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_106539_118505_118625_119813_119885_133770_133844_137278_137485_140501_140568_141386_141585_143945_144042_161832_162023_164788_164986_166867_167001_167130_167274_169518_169664_172218_172356_231046_231464_241545
895748	contig_18592_pilon	+	4896	2	Intergenic	novelGene_114769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGTGATTCAACCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	6311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_+_3197_3294
895749	contig_16510_pilon	+	2522	4	Intergenic	novelGene_139067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTTTAAAAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44852	274301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_44906_73881_74472_74590_74833_272664
895750	contig_10589_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_129367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	1367	1717	1384	1734	NA	55	GAAAAAAATCACATGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLENSTKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGVQGWFNIRKSINVIHHINKRK	17	1734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_0_1700
895752	contig_12080_pilon	+	3354	22	Intergenic	novelGene_128350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	16	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1186	1635	107843	108292	TRUE	5	CCCGCCGGGGGGCTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	58422	164233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106911_107779_108293_108487_108589_109502_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118140_118502_118606_120731_120885_164134
895753	contig_10861_pilon	-	4813	11	Intergenic	novelGene_39350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	124.648345356046	847	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	7	2343	1535543	1517702	FALSE	10	CCACATGCTGTTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESALQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLSTLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHEHVGNFARDLVAQWKKLVPVERNTEPDEQDFEKSNSRKRPRDALQKEEEMEVDYQENWKASSSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSYSHERQDERKRCNRVSPAYSSDHESSDYGHVQSPPSSTSPQMCVDHYRSPEEDHEPIVLHQKPGKGHSNAFQDRLGVSQERHLGEPQSKGVVSQSKEHKSSHKEKRLLDAKGDEKSSAVSREKSHKAVSKEENRRPLSGDSTKEKPPPSGAKKEREREGSSIKKKSLPPLEVASDNHLKKPKHKDSEKTKSDKNKQGLDSLDIGKGAGDLVPKVKEKVSNSLKSQEGKLKTSSLDRKSAGSLPKAEEADMDDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGEKGLKKSDSKSTSKNLDSVRKLPKMNESKSEKLQPSGADSAKLKKVPTDILPVLPDLPLPMIQANYRPLPSFELLSSLQTKRKALSSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPYSVLEPVLERCTPEQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKTHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIRSAHANRPKGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPERVKIKSDLYATGSSHTPSSSGSSNSFNPSTEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSSVSYDPRKPAVKKIAPMMAKTIKAFKNRFSRR	1535549	1515231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1517764_1518732_1518915_1519500_1519613_1519942_1520124_1520947_1521046_1521152_1521309_1522064_1522180_1522550_1523743_1524776_1524884_1530182_1530240_1535468
895754	contig_5041_pilon	-	2345	8	Intergenic	novelGene_27100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	969.397814340934	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	665	1087	581169	576390	FALSE	40	AAACTCACAACTCCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKVSTIVKCI	636059	575131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_576603_580873_580965_581050_581200_594964_595120_598398_598528_605335_605439_616553_616729_635987
895755	contig_4538_pilon	-	2043	8	Intergenic	novelGene_153065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAACAACACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98869	19918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_20062_43357_43423_49390_49424_56146_56199_56834_56924_72246_72376_96653_96807_97490
895756	contig_15325_pilon	+	2032	3	Intergenic	novelGene_157164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACGAAAAATTATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75439	86497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_75964_76011_77501_86478
895758	contig_16303_pilon	-	3067	9	Intergenic	novelGene_34036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.80946444128	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	96	1187	45428	35759	TRUE	60	AAAAAAAGATACAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45523	31523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_32288_32436_33162_35367_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
895759	contig_4759_pilon	+	2478	7	Intergenic	novelGene_106316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	347.68839817029	474	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	167	1123	464361	499784	FALSE	15	TTAAGTGAGTTCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNIKIFSGSSHQDLSQKIADRLGLELGKVVTKKFSNQETCVEIGESVRGEDVYIVQSGCGEINDNLMELLIMINACKIASASRVTAVIPCFPYARQDKKDKSRAPISAKLVANMLSVAGADHIITMDLHASQIQGFFDIPVDNLYAEPAVLKWIRENISEWKNCTIVSPDAGGAKRVTSIADRLNVDFALIHKERKKANEVDRMVLVGDVKDRVAILVDDMADTCGTICHAADKLLSAGATRVYAILTHGIFSGPAISRINNACFEAVVVTNTIPQEDKMKHCSKIQVIDISMILAEAIRRTHNGESVSYLFSHVPL	464194	501139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_464483_473999_474184_475323_475423_485950_486076_494151_494326_498625_498786_499691
895761	scaffold_12124_pilon	-	2584	2	Intergenic	novelGene_22160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2096	2401	982587	982282	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	985714	982098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_984090_985121
895762	contig_2009_pilon	+	2508	9	Intergenic	novelGene_165445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	638.094024713443	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	206	517	35627	59162	TRUE	35	GCTACTATAAAATTACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSSNSHSSNPSNNPSKTSDAPYDSADDWSEHISSSGKKYYYNCRTEVSQWEKPKEWLEREQRQKEANKMAVNSFPKDRDYRREVMQATATSGFAGGKSTSGDKSVSHSCTTPSTSSASGLNPTSAPPTSASAVPVSPLPQSPIPPLLQDPNLLRQLLPALQPSHRISLQCL	28067	67782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_28129_34914_35031_35598_35712_56316_56511_59129_59279_61716_61836_63289_63477_64660_64789_66341
895763	contig_18392_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_143089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1629	1928	34948	34649	NA	15	TGTCTTTGGCTATGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCLATTTDCSDRDHNSGFWTELEKDVEQNSNTQKKDQIHWPERDWRNPESTAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKRE	36576	34387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18392_pilon_-_34400_36600
895764	contig_12379_pilon	+	3604	9	Intergenic	novelGene_148923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_7	170.702958380926	1170	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	100	1182	44672	110292	FALSE	40	AAATAGAATGTATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVARSIAADHKDLIHDVSFDFHGRRMATCSSDQSVKVWDKSENGDWHCTASWKTHSGSVWRVTWAHPEFGQVLASCSFDRTAAVWEEIVGESNDKLRGQSHWVKRTTLVDSRTSVTDVKFAPKHMGLMLATCSADGIVRIYEAPDVMNLSQWSLQHEISCKLSCSCISWNPSSSRAHSPMIAVGSDDSSPNAMAKVQIFEYNENTRKYAKAETLMTVTDPVHDIAFAPNLGRSFHILAVATKDVRIFTLKPVRKELTSSGGPTKFEIHIVAQFDNHNSQVWRVSWNITGTVLASSGDDGCVRLWKANYMDNWKCTGILKGNGSPVSGNSQQGNSNPSLGSNIPNLQNSLNGSSAGRKHS	44572	112714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_44783_75543_75595_78685_78833_79025_79238_99540_99640_105779_105921_106144_106303_108817_108969_110279
895765	contig_3153_pilon	+	2087	13	Intergenic	novelGene_104668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGGGCGGGGCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203812	247701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_204999_206342_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212283_214487_214582_217132_217170_217855_217937_221159_221229_224957_224999_229052_229140_233950_234036_247617
895766	contig_10861_pilon	+	5391	3	Intergenic	novelGene_39245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	741	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4827	5168	735624	737187	TRUE	25	TTGCTGAAATTTATTCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCAAFTPSLAYVQQQEVSAGVGAQVSIAEAHSSCLAPPSKVSQGTIKGLGLIQCCGRRVGAPCLGDFLFGVFCFFFLFSFTFADMNHHAWCRLSSCVKFVFLSWSQFGNSTK	730797	738462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_735937_737158_737325_738376
895767	contig_10765_pilon	-	3586	5	Intergenic	novelGene_122923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	22.5665681927935	546	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	538	1008	203841	199075	FALSE	60	TAAAAAAAAAGTTTTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLLNMSRELSDLKKNLKEAAAALAGDPFDTGGAWSEPTFTSTEAAIQAMLECLKNNDLGRALRQIRECRSLWPNDIFGSNSDDEVQTLLNIYFRHQTLGQTGTYALVGSNQSLTEICTKLMELNTEIRDMIRRAQSYRVLTAFLPDSSVSGTSL	226093	196496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_199334_202638_202842_203832_203944_222178_222263_225742
895768	contig_5669_pilon	+	5038	9	Intergenic	novelGene_86063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	249.326969058704	56	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	181	1359	186087	189257	TRUE	35	AGGAAACACTGCCTGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQRGQEVLLHPLAPRHAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	183043	197575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_183092_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_189011_189525_194163
895769	contig_16211_pilon	-	4563	16	Intergenic	novelGene_150084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	972.849619531314	39	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1079	3240	7	3246	237703	175355	FALSE	15	GATAAGCCTTGGTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKASVARHPSREQLIDYLFTFQGQIKTFPIKIWKQRMKKTAVDVFLLVE	237709	174037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_175451_180077_180126_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643
895770	contig_15866_pilon	+	1444	1	Intergenic	novelGene_63652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	914	1249	527131	527466	NA	50	TAACAAGAAGTAGACACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSSSSRREKMPLFNSSTEISGLSLLSCIGCIWVTFPSLNQSLWAGECGALIGRSGSEAHPCRSGEPGCTSQSTRTEEEERRTFLKETRRPFVNGGKAKAKHSQYSVVGF	526217	527661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_526200_527700
895771	contig_7272_pilon	+	1602	9	Intergenic	novelGene_25316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	379.197652122214	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	175	495	507772	539895	TRUE	75	AAGCAAAAAATAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVRAASRERFPGQSVYHIKWIQWKEENTPIITQNENGPCPLLAILNVLLLAWKVKLPPMMEIITAEQLMEYLGDYMLDAKPKEISEIQRLNYEQNMSDAMAVLHKLQTGLDVNVKFTGVRVFEYTPECIVFDLLDIPLYHGWLVDPQVCNDVVILHFRTKQIFT	489671	575529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_489831_507756_507815_517079_517145_520615_520775_539841_539922_547444_547548_569812_569987_573467_573663_574920
895772	contig_16525_pilon	-	2721	8	Intergenic	novelGene_133887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCACGCGGCCCCGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228624	219702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_219813_223043_223102_223192_223314_223736_223842_223951_224050_225048_225207_225556_225663_226659
895773	contig_16322_pilon	-	2003	14	Intergenic	novelGene_87535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	155.441725986026	2	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	15	1688	108570	77890	FALSE	20	GTAATCATTTTTGGCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYHIATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108584	77574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89621_89902_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
895774	contig_9579_pilon	-	2397	4	Intergenic	novelGene_150596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_1	65.7486797501584	19	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	37	462	833304	827641	FALSE	20	GCATTGTGTGATTAGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLLPRLPSEPGMTLLTIRIEKIGLKDAGQCIDPYITVSVKDLNGIDLTPVQDTPVASRKEDTYVHFNVDIELQKHVEKLTKGAAIFFEFKHYKPKKRFTSTKCFAFMEMDEIKPGPIVIELYKKPTDFKRKKLQLLTKKPLYLHLHQTLHKE	833340	825705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_827738_827881_828000_831581_831705_833216
895775	contig_2799_pilon	-	9942	11	Intergenic	novelGene_85506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	559	978	751411	718679	TRUE	15	GTGACTGATTTCCCTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	751969	603551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_603760_607922_608056_681360_681435_687150_687272_696526_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382
895777	contig_13592_pilon	+	4353	16	Intergenic	novelGene_33741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCACATACCCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297033	388484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_298361_308908_309039_326677_326867_332875_333037_337474_337606_339905_340070_341523_341669_348350_348448_351343_351532_351917_352021_353143_353273_354496_354561_359369_360109_381314_381377_383035_383113_387837
895778	contig_5423_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_85315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1527	1892	783076	783441	NA	55	AAAGAAACCACAGTGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANKNMKKCSTLLVIREMQIKTTMNSYHGFHQTESITARWCLATTTDCSDRDHNRGSWTELEKDVEQNSNSQKKKPRFTGLTDWRNPKSMAPGHPFSSEVKSLPRFTIQLGIGQPHKTKRD	781549	784024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_781500_784000
895779	contig_2646_pilon	-	1131	6	Intergenic	novelGene_69664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	270.274971094254	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	99	920	2178950	2171792	FALSE	30	AATTGTTGGCTAAACGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGGSEPASPPTLFHRPGSPRQPCISVFPSSALLPSLCTAPKSRSGPTPSRVAVAERSVGSLGRGFRGACSIHLSVLAQCQPLLRVL	2181013	2171580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172048_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180956
895780	contig_3509_pilon	-	8023	8	Intergenic	novelGene_160696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1592	2254	176027	104525	TRUE	70	AAAGGAAAAAAAAGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKQKGTDREYLQK	364143	8477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_8550_9685_11613_14305_14653_32143_34253_103210_104560_175399_176763_362752_363158_363692
895781	contig_2414_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_158476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGGAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233867	232034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_232000_233900
895782	contig_9305_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_148181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTGGCTGCTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44779	46068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_44800_46100
895783	contig_7919_pilon	-	4847	4	Intergenic	novelGene_28116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	869	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTGATGGTGACCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417012	1410516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1412207_1413203_1413423_1413780_1413903_1414196
895784	contig_8330_pilon	-	2434	8	Intergenic	novelGene_71971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_7	322.771417190404	2	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	171	875	2056084	2038853	TRUE	30	AAACCTAGCCAACTTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2056546	2034420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2035974_2038846_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056099_2056390
895785	contig_14441_pilon	+	1250	5	Intergenic	novelGene_100481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	420.323982185171	6749	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	635	1063	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	92100	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92735_116558_116963_117220_117344_117539
895786	contig_11855_pilon	-	2202	13	Intergenic	novelGene_67143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	218.685260261307	2	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	580	1371	2718660	2710017	FALSE	25	AACCCTGAATTTATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQLLIQEKEMEKLIQGDLKSGFFLQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731365	2709185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2716010_2716121_2716450_2716497_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719709_2719886_2719986_2723728_2723919_2731299
895787	contig_15105_pilon	-	1708	5	Intergenic	novelGene_151008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	1077.13006990799	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	43	570	839916	831035	TRUE	20	TTTTCTATCCCTTGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRVRIQQSKEQRNRRRLTKEERSADFSGHCSRTIP	839958	828287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_836187_836548_839849
895788	contig_4125_pilon	-	2759	2	Intergenic	novelGene_25146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_1	0	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	662	1129	854778	854311	TRUE	5	GGGTTTTCTGTGGTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWATIWHISIPCCWAVGAGSTPATLRRVTVVCCLLLPWVLVCIKALVTHKLKTFCVEDDMWALEFGNMGPDQIGRHAGLRGERGEQLWSLGHLTGLPAFQQVLLPCLLNTLPFIVFLLSNPQYWCRGEWRLPGLPKTMSSESPPCSCDNNEYRG	855439	852398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_853167_853448
895789	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
895790	contig_4255_pilon	-	2968	4	Intergenic	novelGene_178684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATTAATTTCCTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914806	719437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4255_pilon_-_719483_838383_839734_871678_872268_913822
895791	contig_11720_pilon	+	1219	10	Intergenic	novelGene_43776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2945.25157490938	8	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	490	843	86413	98387	FALSE	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTLATG	67786	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78522_86206_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95399_98372
895792	contig_7850_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_178480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	106	465	13549	13908	NA	70	GAAAAAAAAAAAGAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNKTTMRYHLILALLAQIKKTGNNKCWRDCREIRTLMHCWWECKVIQPFWKTIWHLLRKLDIEIPYTPAIPLLGIYPREIRVVTDICTPMFTAVLFTIVKRWKQPRCPSTDEWINELW	13443	15337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7850_pilon_+_13400_15300
895793	contig_1863_pilon	-	5688	10	Intergenic	novelGene_156530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_9	191.112984486942	893	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	23	1225	88899	68179	FALSE	15	TTTTTGCCTCATTTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLEKGWMQSLPVSPISVSGSALPPLRPGVWAPVSAAHRGERAPLGAAFCDLAVRPTSPAWRGEEDEGAEASSGDIGSLDYQGLVVDIEARLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSIDADILDITGPESQPDSLEVNGNKLRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDDLDESGEIDLDGLDTPSENSNEFEWEDDLPKPKTTEVIRKDSMTEYTAAEEKEDGRRWRLFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYLMDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQELNGKQDEPKSEQ	88921	63715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_68231_71638_71738_71837_71925_73209_73342_74067_74171_77381_77559_79249_79427_79924_79993_81144_81252_88698
895794	contig_709_pilon	-	3339	17	Intergenic	novelGene_57523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	237.285923255047	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1	606	1498098	1484961	TRUE	50	CAGAAACAATCACAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRSKRRAVGNGAPRPPGSQLQRDEEEEDEVEDEKEDSDEEDSDEEDDEVVDEEVNVEFEAYSISDTDYDGINKLLQQLFLKAPVNTAELTDLLIQQSHIGSVIKQTDVSEGSDDDVDVDEDEIFGFISLLNLTERKGTQCAEQIKEWILSCCDQSGEESLVEQLDKLLRDTARPVGFLLSERFINVPPQIALPMHQQLQ	1498098	1444900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1444928_1453884_1454076_1456986_1457366_1463803_1464048_1465348_1465448_1465536_1465697_1476151_1476343_1477154_1477308_1479128_1479315_1480215_1480398_1481378_1482161_1483364_1483504_1484960_1485153_1487576_1487673_1489760_1489842_1490541_1490617_1497936
895796	contig_7009_pilon	+	3108	9	Intergenic	novelGene_23604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	606.823993737064	36	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	246	1166	444955	518263	TRUE	30	AAACCCTGGTGGTGCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVVTYGADGFRDFHAIIPKSFSPSNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	430003	532858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430030_435038_435244_444940_444995_453481_453602_496799_496860_506372_506634_512647_512816_517991_519721_532373
895797	contig_854_pilon	-	1870	3	Intergenic	novelGene_36354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1490	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTATGTGTTGGAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993470	974686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976011_991918_992043_993048
895798	contig_9363_pilon	-	3907	25	Intergenic	novelGene_6757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.095527745548	11	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	825	2478	284	2761	1535817	1506537	TRUE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1539139	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505890_1505957_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039
895799	contig_16098_pilon	-	1751	10	Intergenic	novelGene_45978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1226.71032531002	8000	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	125	1135	352350	349343	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354113	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
895800	contig_14467_pilon	-	4086	12	Intergenic	novelGene_138219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	167.906556066903	702	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	613	2670	290371	92978	FALSE	5	CCTGTGCTGGCTTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVCPRLALWLLWGLLLHQGQSFSHSHSEKATGTGSGASSEESTAAEFCRIDKPLCDSEDEKLSFEAVRSIHKLMDDDANGDVDVEESDEFLREDLNYHDPTVKHSTFHGEDKLISVEDLWKAWKSSEVYNWTVEEVVQWLITYVELPQYEETFRKLQLGGHAMPRLAVTNTTMTGTVLKMTDRSHRQKLQLKALDTVLFGPPLLTRHNHLKDFMLVVSIVIGVGGCWFAYIQNRYSKEHMKKMMKDLEGLHRAEQSLHDLQERLHKAQEEHRTVEVEKVHLEKKLRDEINLAKQEAQRLKELREGTENERSRQKYAEEELEQVREALRKAEKELESHSSWYAPEALQKWLQLTHEVEVQYYNIKKQNAEKQLLVAKEGAEKIKKKRNTLFGTFHVAHSSSLDDVDHKILTAKQALSEVTAALRERLHRWQQIEILCGFQIVNNPGIHSLVAALNIDPSWMGSTRPNPAHFIMTDDVDDMDEEIVSPLSIQSPSLQSSVRQRLTEPQHGLGSQRDLTHSDSESSLHMSDRQRMAPKPPQMVRAADEAVSVVTSNGSHRPIEGVHAGSLLEKLPDSPALAKKALLALNHGLNKAHSLMELSPSAPPSGSPPLDSSRSHSPSPLDPDTPSSAGDSRVLQASRNTRIPHLAGKKAVAEEDNGSIGEETDSSPGRKKFPLKIFKKPLKK	290983	91561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_93495_98110_98178_101343_101580_101862_101964_102555_102724_107243_107422_111574_111753_128126_128243_131799_131912_150730_150846_184535_184667_290232
895801	contig_6873_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_129843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGTCAGAGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783288	785532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_783300_785500
895802	contig_5947_pilon	+	6100	15	Intergenic	novelGene_101494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	286.633601359944	809	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1118	3357	96	3452	397159	418186	TRUE	10	TCAATGGTCCGTTTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRRPRPEARPRNPRNNHRGPVDGELPPRARNQVNNPAASALRGGANQPGRHPRANDHPVAYRQREERFAAMGRNPHQGRRNHEGQASDEARGQRHGQENDTRRRNGNQEVRNRRPPRPSENFQQWRAPFQKPAEQPQQVKRLGYKFLESLLQKDPSEVVITLATSLGLEELLSHSSMKSNFLELICQVLRKACSSKMDRQSILHVLGILKNSEFLRVCLPAYVVGMITEPVPDIRNQYPEHISNIISLLQDLVSVFPASSVQETSMLISLLPASLNALRASGVNIEEETEKNLEKVQTIIEHLQEKRREGTLRVDTFTLVRPEAEDHVESYQTMPIYPTYNEVHMDERPFLRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGIYKCQKTSIVRVGGRSNSEILKQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPVQDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAGQEEAAGEWQTQRSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRLWLQMYQADTRRKILNFERQYRTSAERMAELRLQEDLHILKDAQVVGMTTTGAAKYRQILQKVEPRIVIVEEAAEVLEAHTIATLSKACQHLILIGDHQQLRPSANVYDLAKNFNLEVSLFERLVKVNIPFVRLNYQHRMRPAIARLLTPHIYQDLENHPSVLKYEEINGGLFQPFLCRTQLP	394528	421635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_394570_397104_397220_399834_401644_405970_406103_407655_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728_413869_415242_415398_415803_415950_416710_416822_417146_417243_418141_420383_421183
895803	contig_15135_pilon	+	4246	1	Intergenic	novelGene_119871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCAAAAGGCTTCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63784	68030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_63800_68000
895804	contig_6740_pilon	+	5067	1	Intergenic	novelGene_142717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	772	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	817	1449	729381	730013	NA	30	TTTGAATGTCAATAGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKESTRKLLELIEEFSKVAGYKVNKQKSVGFLYTSNEKSEREIRETIPFTIASKRIKYLGINLTRDVKDLYNESYKTLLKEIKDDLNKWKNVPCSYIRRLTVVKISILPKAIYRFNATHDKNSNSLLYRNTKTNPQLYMKWQEAPNSYSNIEREEQSTRITLPDFKTYYIATVIKTAWYWYNNRHIDHWNRISSPEINPHIYG	728564	733631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_728600_733600
895805	contig_5023_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_7178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCAGCACATTAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541269	543772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_541300_543800
895806	contig_16103_pilon	+	4055	27	Intergenic	novelGene_118914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	365.263390821687	271	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	97	3357	771073	806541	FALSE	25	GAACTCCTCTGACCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGVSVTSSNTGVPDISGSVYSKTQQSFEKQGFHSGTPAASFNLPSALGSGGPINPATAAAYPPAPFMHILTPHQQPHSQILHHHLQQDGQTGSGQRSQTSSIPQKPQTNKSAYNSYSWGAN	767381	807239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767435_771029_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_803231_803300_804931_805130_806445
895807	contig_10722_pilon	-	3866	10	Intergenic	novelGene_70972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_6	250.700352346515	29	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	2745	3434	6315	4150	FALSE	25	CTGCTTCAAATATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	17396	3717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6529_6637_8562_9665_9787_14372_14446_16247_16358_16853_16929_17168
895808	contig_10286_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_98400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAAGCTGGTACTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382602	380016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380788_381042
895809	contig_11512_pilon	-	2381	9	Intergenic	novelGene_43378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1197.83684589138	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	40	840	592804	556515	FALSE	20	ATTTGTAACTTTGCAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPAAAPTLAKVPAAALTPVRVLVSTSFPAPAPLGTVPGPSPWRCPARQPCGLRPWTWICSSPLPSSPFPPPACHAAHNLTLIQSLFSKSELW	592843	554973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556788_571078_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
895810	contig_4402_pilon	-	2728	1	Intergenic	novelGene_140860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	114	413	613840	613541	NA	5	GTTGTTTCTTTGTGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLRSFKMEQRNVCLNKCPSNNFHQTNFENLKLFVRCSLNLANIVFVYIYSVAKNFVLKLVTFLFRAFAFIFNTLYSLEYLQKTLMKTELLWVLFFLI	613953	611225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_611200_614000
895811	contig_13633_pilon	+	1617	13	Intergenic	novelGene_15308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	408.879592096907	33	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	355	1311	28347	49142	FALSE	35	TTCTGTGTGATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5027	49448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20298_22097_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
895812	SIRV6	+	703	7	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	1	624	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	21	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1628_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
895813	contig_12677_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_110802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3784	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3800
895814	contig_4924_pilon	-	2366	9	Intergenic	novelGene_84708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_8	1232.4137330357	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	99	1097	452629	82377	FALSE	25	AATTTTCAGGTTTTGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSFKLDFLPEMMVESRLLVSDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	452727	81107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_452555
895815	contig_14563_pilon	-	4811	5	Intergenic	novelGene_135046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	821	junction_1	355.907642514178	292	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3732	4133	133526	122808	FALSE	65	AAAAAAAAAAAATCGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKREPSEDERDQGTSAESEPEQKKVKARRPIPRRTVPKPCVKKQPKPQRGKRRKQDSSDDEDEDDEAPKRQTRRRAAKNVR	140527	122129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_122953_125258_125367_131682_131745_133439_133527_136796
895817	contig_10286_pilon	-	3395	1	Intergenic	novelGene_98426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1980	2333	443221	442868	NA	15	CCTGAGCATTTGAGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVKNPTDDLIHIPVPLLPLLPPSMSCLLLVSAAGIHFLHYKHFPNCIISCFQDHFHRCTSSSLSLMTGGQRTLGVGGCLKGSVCSTGFGCVVGACEKEEVCSRGNVTRDMRHRESG	445200	441805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_441800_445200
895818	contig_16594_pilon	-	2828	1	Intergenic	novelGene_53917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	258	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGGGCTCCTTAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277874	275046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_275000_277900
895819	contig_6673_pilon	-	4845	4	Intergenic	novelGene_164023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	134	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGTCCAAGATGGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192925	111440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_112036_112096_113579_118005_118911_191062
895820	contig_18607_pilon	-	1937	2	Intergenic	novelGene_175107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAAGATATTAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99729	16295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_-_17064_98560
895821	contig_13984_pilon	+	3792	8	Intergenic	novelGene_130231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	1768.23891404495	1007	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	11	1111	6215	24829	FALSE	60	ATTAAAAAGAATGAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEEMEQVGQAEHLEEEHDPSPEEQDQEWKEQQEQKEEANRLEGHAHAEVYPSAKPVTKLQSPFEEQLEQQRLAARQAEEAQRLRERQEALHQQRLQGHLLWQRQQQQQQQNQQQQNQQQQQQLRERELSRQRQAKREEGQQQRQERLRQQAHYDAMDNDIVQGAEDQGIQEEEGGAYERDNQHQGEAEEDTDNGHEPREQRPREDNPESEADRAAVEDINPADDPNNQGEDEFEEAEQVREENVPDENEEQKQSNQKPENAEMEEHLVMAGNPDQQEDNVDEQYQEEGEEEIQEDLTEEKKRGLEHNAEETYGENKENVWVDDKNNDGEERDIREDNRPKGREEHYEEEDEEEEDGAAVGEKSHRRAEM	6204	27510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_6350_7981_8281_9101_9185_11084_11195_14292_14461_14791_14861_23998_24086_24679
895822	contig_4151_pilon	+	3427	2	Intergenic	novelGene_65250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2776	3114	557928	558266	FALSE	45	AACATTAACCCTACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQENVIIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKRERDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATVSQLDLIDIIPITPPNSSQVYFLFQRTCNILQNRPQIRP	554984	558579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_556589_556756
895823	contig_7627_pilon	-	5407	5	Intergenic	novelGene_175560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6264	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	2668	3114	139493	139047	TRUE	25	CTGAGAGTGGAGATGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELQEAEYKRLTHRTLQEIRKEKIKQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLHESIERQKSEIQKINNQISELDSSIESHRSRIEAMEVRISEIEDKALDINLLEEKSDKRIKKNEETLRIMWDSIKRNNL	225152	115403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_-_117639_138988_140904_150330_150656_224073_224739_224885
895824	contig_15092_pilon	+	2193	3	Intergenic	novelGene_57809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	12	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	28	594	325159	351165	FALSE	35	ATAAAGGTTGAATTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325131	352764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
895825	contig_5961_pilon	-	5135	7	Intergenic	novelGene_144101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAAGTTTAATCCGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179726	113379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_113830_144007_144178_151578_151722_155725_155811_170311_170474_172934_172982_175648
895826	contig_3153_pilon	+	3476	11	Intergenic	novelGene_104632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	370.226214631001	6	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	309	2669	66726	99804	TRUE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLECNLNINDLCMIQETGK	57791	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_62973_66689_66946_67756_69752_95022_95116_99751_99862_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
895827	contig_15236_pilon	+	6896	7	Intergenic	novelGene_141530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	149.684854128785	421	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	582	1565	101184	118551	TRUE	45	AATAAAATTTGTATGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISERTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTRDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELDSENKKWVEFACVTLKNEVYISGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGRWRHKMAVLGGKVYVIGGFDGLQRLNNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAATSHKKKLYVIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWNLKSSMPVEAKCINAVSFRDRIYVVGGAMRALYAYSPLDDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGA	55410	124608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_100925_101376_109866_110105_115137_115341_116260_116475_118414_121414_122139
895828	contig_20527_pilon	+	3270	1	Intergenic	novelGene_138620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	538	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGACCATGCTAGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25679	28949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25700_28900
895829	contig_3463_pilon	-	5490	15	Intergenic	novelGene_61997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	201.416577657109	626	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	3065	4444	551994	508757	FALSE	15	CTCCTCACTGCAGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	583121	507710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531976_532125_542246_542314_551883_552007_579977_582465_582556
895831	contig_2703_pilon	-	4334	8	Intergenic	novelGene_101669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	449.418672127831	1142	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	41	928	191181	170212	TRUE	35	TACTAACTAGATCTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSLSLETDPAPVLESAGTAAATAAVSPATAAGATAEAPAETAAATASAEAATETATAEAAAEPAAPKAEVEAEAAASAEAATETGAASAEVANETAAVSAEAATETEAAAETEAATAVTEAAAEAQPATEAAAETEAPTGSEAGDAKSAMANKLLSLNGVFAVHKPKGPTSAELLNRLKEKLLAEAGMPLPKCNKRKKQTFKIGHGGTLDSAAKGVLVVGVGRGTKMLTSMLSGTKRYIATGELGKATDTLDSTGKVTEEKPYDKITQEDIEGILQKFTGNIMQVPPPSILH	191221	164081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_167305_168027_168085_170085_170226_172070_172146_180899_180982_185332_185389_188914_189014_190619
895833	contig_6654_pilon	+	5555	11	Intergenic	novelGene_85744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_10	183.244754358754	819	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	42	1412	485684	508816	FALSE	25	TCTCCCAGCAAGTCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGGSERADGRIVKMEVDYSATVDQRLPECEKLAKEGRLQEVIETLLSLEKQTRTASDMVSTSRILVAIVKMCYEAKEWDLLNENIMLLSKRRSQLKQAVAKMVQQCCTYVEEITDLPVKLRLIDTLRMVTEGKIYVEIERARLTKTLATIKEQNGDVKEAACILQELQVETYGSMEKKERVEFILEQMRLCLAVKDYIRTQIISKKINTKFFQEENTEKLKLKYYNLMIQLDQHEGSYLSICKHYRAIYDTPCIQAESEKWQQALKSVVLYVILAPFDNEQSDLVHRISGDKKLEEIPKYKDLLKLFTTMELMRWSTLVEDYGMELRKGSRESPATDVFGSTEEGEKRWKDLKNRVVEHNIRIMAKYYTRITMKRMAQLLDLSVDESEAFLSNLVVNKTIFAKVDRLAGIINFQRPKDPNNLLNDWSQKLNSLMSLVNKTTHLIAKEEMIHNLQ	485642	512959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_485792_495141_495202_495288_495418_499655_499764_502219_502325_503432_503583_503664_503800_504616_504730_505466_505642_507535_507614_508606
895834	contig_5429_pilon	-	7491	3	Intergenic	novelGene_127820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	312.5	584	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	728	1204	605763	605287	TRUE	40	GTTCCTAGCAAGTAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNQTPGPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQQNSGRMSPMGKLFPRKNTFEELVDRKYRANNWGLRLRISAKSPRSEDFPEELEIKETAQVLGLTTSGMNDYKHLIAFSIFHFEVLFHTCVHWITFLIYIFVGCSHKYSTVKVLNLLT	606490	597264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_598758_599113_600764_602142
895835	contig_1301_pilon	-	2883	7	Intergenic	novelGene_47341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	928	junction_5	156.40829759177	1427	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	83	895	322831	292159	FALSE	25	TTATGTCACAGCTAGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKVSQNCIC	322913	290170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
895836	contig_9415_pilon	-	2338	14	Intergenic	novelGene_109827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	2026	2337	1956420	1925761	FALSE	25	AACGTGGGAGTCCTAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVHIPLQHQDDGEPLGNLAESGAMQTLELRCGHSMATRRTAGRTAAPGPGEVGAEGFGRLCLGSLLAGRSADGGCVPSPCVKESKGFRAPGFPARRFPAPRSG	2014193	1925759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1926056_1956403_1956534_1976235_1976323_1980592_1980673_1981918_1982002_1983784_1983901_1986732_1986841_1993454_1993609_1999791_1999897_2000075_2000157_2010364_2010482_2010955_2011072_2011222_2011291_2013396
895837	contig_7396_pilon	-	2105	15	Intergenic	novelGene_79609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2841	junction_14	2573.28948536891	67	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	126	1253	255163	247859	TRUE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQGGSGYGKFSSL	257479	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247895_248193_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
895838	contig_6654_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_85761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	463	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTGAGATATCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579631	581908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_579600_581900
895839	contig_14405_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_85642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGACTAATTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435415	434590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_434600_435400
895840	contig_11629_pilon	+	1716	8	Intergenic	novelGene_161181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	60	ACTAGAAAATGATAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	423807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
895841	contig_8228_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_81782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	25	327	111118	110816	NA	35	ACTCTTGTATACGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFCKCFDMVCCLWGIQWLFSSFTDCRFVLSCILFYLVMSEQAGCAFFVVCSSVGTILFTSFSNGQGQSLRYGTAGQVQLKGSCWDRFFVPGTRADSTDQESVQGRFQ	111142	108510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_-_108500_111100
895842	contig_11281_pilon	-	3171	3	Intergenic	novelGene_125473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGGAGGATGAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873633	862010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_863662_871557_871970_872525
895843	scaffold_12124_pilon	-	2297	2	Intergenic	novelGene_22159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1809	2114	982587	982282	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	985429	982098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_984106_985139
895844	contig_11816_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_98477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTGCAACTCCTCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455545	457443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_455500_457400
895845	contig_13878_pilon	-	1809	8	Intergenic	novelGene_165734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	337.514202271095	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	386	1066	57227	42986	FALSE	10	CAGGTTTTGTTGTGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDDMVTWDEYNIQMYDRVIDFDENTALDDAEEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRRDPTATEDPEWILVEKDRFVNDYDKDNDGRLDPQELLSWVVPNNEGIAQEEALHLIDEMDLNGDRKLSEAEILENQDLFLTSEATDYGRQLHDEYFYHDEL	60677	42242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_43139_45954_46098_46987_47085_52427_52542_57053_57251_59806_59913_60355_60438_60503
895846	contig_10017_pilon	-	1853	15	Intergenic	novelGene_156985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	419.988878618548	533	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	37	966	337686	312564	TRUE	10	TCGGCCCTGGACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKGMSVGMKIPSSP	346591	302902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303508_303954_304055_309261_309319_309601_309632_312468_312589_316216_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346572
895847	contig_13244_pilon	+	2364	11	Intergenic	novelGene_86997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_8	122.577363326187	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	380	2239	466876	475123	FALSE	25	GTTCACTATTATATAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGRQQRGPFQGVRVRNSVKELLLHIRSHKQKASGQPVDDFKTQGVNVEQFTELKNTVSYSGKRKGPDSLSDGPACKRPALLHTQFLTPPQTPTPGESMEDVHHSESKHDSNADLLQSIINIKNECSPVSLNTVQVSWMSPVVVPQSSPREQFQDFHGGQVFSPPQKYQPFQVSGSPPVMDQASLYQYSPQNQNVQQQQHHYIHDPNLEYTPYSRLQSPNYEPNLFDGQELQFCPNQSFVSLLSNHGESENVAVPIQTPPSIQQHSNAHLQTFSMMPNSACEALAEHKAGSPPLNTSLPFQNITENPVNTTQLGKSFFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHIAVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	466496	475248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_467005_467521_467553_467672_467777_467877_468654_469348_469455_469834_469982_470172_470237_470522_470693_471757_471869_471962_472131_475069
895848	contig_7088_pilon	+	2176	6	Intergenic	novelGene_159787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	98.1150345258055	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1024	2091	689656	712351	FALSE	50	AACTTATTAAAACTAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYLNPWRRPLLSCSWSKLCLLKQCLFTMKLRSPEFQSLFTEGLKSLTELFVKENHELRIAGGAVRDLLNGVKPEDVDFATTATPAQMKEMFQSAGIRMINNKGEKHGTITARLHEENFEITTLRIDVLTDGRHAEVEFTTDWQKDAERRDLTINSMFLGFDGTLFDYFHGYEDLKNKKVRFVGRAKQRIQEDYLRILRYFRFYGRIVEEPGDHDPETLEAIAENAKGLAGISGERIWVELKKILVGNHVNHLIHLIYDLDVAPYIGLPANASLGEFDKVSKNAEGFSPKPMTLLASLFKVQDDVTKLDLRLKISKEEKNLGLFIVKNRKDLIKATDSSEPLKPYQDFIIDVSR	688632	712436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_689804_698510_698705_701957_702097_706157_706285_710886_711081_712085
895849	contig_17964_pilon	-	2639	4	Intergenic	novelGene_33897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_1	67.8249380554249	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350766	340427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_347653_347776_348928
895850	contig_9982_pilon	-	2486	15	Intergenic	novelGene_55746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2006	2377	322769	316112	TRUE	15	ATCTCGGTGTCATGTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVRGPGGSRVISKGSVRARSGGSIFTIVPDIFTSFSSSLSTGVCDKFCITALKKHVFPKLLSPFTVIWEVEFMEGFSLAMFSFFSLSCSFLFSFSNFLFSSSMFPLPFADCRDVMPACFLI	338633	315226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_315271_316046_316151_317258_317443_318514_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325074_326515_326610_326942_326998_327935_328113_330450_331130_332136_332231_333519_333607_337962_338121_338218
895851	scaffold_15568_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_122585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTCTCATAAAGCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87477	89306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_87500_89300
895852	contig_10732_pilon	-	5381	2	Intergenic	novelGene_114680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	645	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2576	2905	68963	68634	TRUE	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAIELEKVDHFRPYFGGRTGSTTKELDVENEIKEQSGLISKCLTLTHTHTETLLLRLRSTGRGTASGALCGRVECDMLVRHPRGDVKGGSEVKSLKLRSRKRPGDIYI	71538	62716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_63837_67277
895853	contig_8377_pilon	-	1964	10	Intergenic	novelGene_35111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	3	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTCTTAAGTAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180509	163350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_164589_169245_169304_172899_173004_173644_173685_176607_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
895854	contig_6048_pilon	+	3188	5	Intergenic	novelGene_73190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_4	234.810961200707	13	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1801	2112	1477687	1477998	FALSE	15	GAAACCCGCGTTTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLCAHPSPQQDSARGTERAVCCTFQDAAHSRTLHAGSSLFLLKGKMYSFLPLVCVFTCLNSDKFGAGFYERNFDSVKNRKPLGFVWTCETLITKAAGNAEK	1449622	1479074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1449778_1450546_1451816_1456961_1457048_1457767_1457836_1477464
895855	contig_5236_pilon	-	2858	14	Intergenic	novelGene_100953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	190.821766959543	784	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	64	1956	1011714	1006770	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTMLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011777	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007907_1008036_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
895856	contig_6316_pilon	+	1527	13	Intergenic	novelGene_134715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	171.913960230757	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	615	1520	147168	157164	FALSE	30	ATCAGTGGTCTTACTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	140507	157171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_140644_142913_143045_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
895857	contig_20550_pilon	+	6036	15	Intergenic	novelGene_142609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	291.395831494284	741	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	66	1343	3777	38200	FALSE	65	ATAAAAAAAATAAATGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNVVSQIIVQPGLSTIDNKQPTMPRQVHRECHSILQHLRANNKKWTIQYLLHCVGEKNLC	3711	42893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20537_37663_37774_38133
895858	contig_5419_pilon	+	3648	6	Intergenic	novelGene_15555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	41.9971427599545	117	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	2191	3087	572827	573723	FALSE	30	ACTGGAGGACATTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKAEKKQEKIDRFMEKVDKFMENTDQKMEEFRKIIQEQNAKMNSQPEITQKQQLEIQKMSNKISEMDSVIEGLRSRFQTVEDRISGIEDKHLDTALFEEKSKKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPKQGEKTEDTERITEELLTENFPNIMKDEQLTIQEAQRTPYRIDPRRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSAETMQASRQWDAIYKTLKEKNC	539450	574284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539481_540053_540147_541812_541927_550898_551051_551753_551870_571141
895860	contig_10437_pilon	+	3685	3	Intergenic	novelGene_38286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	870	305	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	58	420	431167	432425	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPCCFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKVDEIAMQAMRFQTVCFLPVQILFFQQCCNQYYSLISCQMPFLVLEIQQETKQSSCSYGTSILLRETARK	431109	439336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_434715_438360
895861	contig_8241_pilon	-	2638	9	Intergenic	novelGene_157500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	37.6362109543456	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	109	1140	637833	621106	FALSE	60	AAACAAAATGAAACATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAPSEIDPKENPDLACLQSIIFDDERSAEEQAKTYKDEGNDYFKEKDYKKAVISYTEGLKKKCADPDLNVVLYTNRAAAQYYLGNFRSALHDVMTARKLKPCHLKAIVRGALCHLELKNFAEAVSWCDEGLQIDAKEKKLVDTRAKADKLKRTEQRDIRKAKLKEKKEQNQNETLIQAVKARNIRLISEAAGEDEDSASEGLGELFLDGLISENPYGARMSLDDQGRLSWPVLFLYPEYGQSDFISAFHEDSRFIDHLMVMFGEMPSWDLEQKYCPDNLELYFEDEERAELHQVPPESTLLHTLQHPRYSVKALTPAFLVCVGSSPFCKNYLRGRRVHQIK	637941	619607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_621209_623391_623475_624988_625071_625693_625912_628198_628286_629875_630001_631482_631561_636647_636810_637739
895863	contig_6576_pilon	-	3146	2	Intergenic	novelGene_42306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCAAGATAAAATATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692807	513600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_514257_690317
895864	contig_9415_pilon	+	4868	8	Intergenic	novelGene_109774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	369.404484906975	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	47	556	1620728	1704137	FALSE	50	TACATAATGAAAATACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHVQQNNVARSCTIFMIVGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSTNVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDSNLSGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL	1620681	1708449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1620738_1689827_1689889_1692736_1692798_1696787_1696866_1697874_1697965_1700428_1700495_1703219_1703271_1704044
895865	contig_4093_pilon	-	2320	7	Intergenic	novelGene_27628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2252.73520168015	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	47	679	69245	41737	TRUE	35	ATACCCAAAGCTCACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRPPPPTPDTEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72470	39963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_39974_40105_41797_45447_45544_45619_45770_46391_46425_68951_69257_72435
895866	contig_3068_pilon	-	9691	4	Intergenic	novelGene_137651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1031	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGTTCTGGAAGAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439024	405757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_405784_406379_406461_417334_417612_429717
895867	contig_11629_pilon	+	1714	8	Intergenic	novelGene_161179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	55	ACACTAGAAAATGATAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	423805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
895868	contig_16622_pilon	+	2422	3	Intergenic	novelGene_48495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGTCTGAGACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114067	121971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_114444_117479_118889_121334
895870	contig_1150_pilon	-	257	1	Intergenic	novelGene_61385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309185	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309200
895871	contig_16724_pilon	+	2124	5	Intergenic	novelGene_105298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATATTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541140	569833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_542008_543918_544000_560937_561029_567595_567765_568917
895872	contig_15172_pilon	+	1922	8	Intergenic	novelGene_158759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_7	144.244548583017	9	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	8	631	243174	267627	FALSE	25	AATGACTCTTCCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243166	268918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534
895873	contig_6496_pilon	-	4772	5	Intergenic	novelGene_103474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	91.5843190726447	873	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	88	507	285171	247708	FALSE	60	AAAAAGAATAAAAACCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSDKAVKYYTLDEIKKHNHAKSTWVILHHKVYDVTKFLDEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDAREMSKAYIIGELHPDDRSKLAKPSVSVFQESLITTIDSNSSWWTNWVIPAISALIVALMYHLYTAED	285258	243442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247790_249540_249585_263142_263179_264936_265066_285042
895874	contig_15371_pilon	+	9186	2	Intergenic	novelGene_151463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1003	junction_1	0	982	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	5907	6239	195408	197171	FALSE	20	ATCCCCAGCACTGATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFFLPYRYEDALVLLLTEVLNRIQFRYNQAQLEELDDETLDDDQQTEWQRYLRQSLEVVAKVMELLPTHAFSTLVTNHLEGNEGSDYFPAHNNMMRNAFFARLYQTIF	189501	200118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_195543_196973
895875	contig_10962_pilon	+	6444	40	Intergenic	novelGene_103896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	289.247492242497	574	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1175	3528	51	3578	311769	386670	TRUE	15	TAATCCTGGGCTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRPSNNPGGSLRRSQRNSAGAQPQDDSTGGRSCSSSSAVIVPQPEDPDRANTSERQKTGQVPKKDSSRGVKRSASPDYNRTNSPSSAKKPKALQHTESPSETNKPHSKSKKRHLDQEQQLKSAQSPSTSKAHTRKSGATGSSRSQKRKRTESSCIKSGSVSESTGAEERSAKPTKLASKSAASAKAGCSTITDSSAASTSSSSSAVASASSTVPPGARVKQGKDQNKARRSRSASSPSPRRSSREKEQSKTGGSSKFDWAARFSPKVSLPKTKLSLPGSSKSETSKPGPSGLQAKLASLRKSTKKRSESPPAELPSLRRSTRQKTTGSCASTSRRGSGLGKRGAAEARRQEKMADPESNQETVNSSAARTDETPQGAAASSSVAGAVSMTTSGESESDDSEMGRLQALLEARGLPPHLFGPLGPRMSQLFHRTIGSGASSKAQQLLQGLQATDESQQLQAVIEMCQLLVMGNEETLGGFPVKSVVPALITLLQMEHNFDIMNHACRALTYMMEALPRSSAVVVDAIPVFLEKLQVIQCIDVAEQALTALEMLSRRHSKAILQAGGLADCLLYLEFFSINAQRNALAIAANCCQSITPDEFHFVADSLPLLTQRLTHQDKKSVESTCLCFARLVDNFQHEENLLQQVASKDLLTNVQQLLVVTPPILSSGMFIMVVRMFSLMCSNCPTLAVQLMKQNIAETLHFLLCGASNGSCQEQIDLVPRSPQELYELTSLICELMPCLPKEGIFAVDTMLKKGNAQNTDGAIWQWRDDRGLWHPYNRIDSRIIEAAHQVGEDEISLSTLGRVYTIDFNSMQQINEDTGTARAIQRKPNPLANTNTSGYSELKKDDARAQLMKEDPELAKSFIKTLFGVLYEVYSSSAGPAVRHKCLRAILRIIYFADAELLKDVLKNHAVSSHIASMLSSQDLKIVVGALQMAEILMQKLPDIFSVYFRREEGVMHQVKHLAESESLLTSPPKACTNGSGTLGSTTSVSSGTATAATNAAADLGSPSLQHSRDDSLDLSPQGRLSDVLKRKRLPKRGPRRPKYSPPRDDDKVDNQAKSPTTTQSPKSSFLASLNPKTWGRLSAQSNSNNIEPARTAGVSGLARAASKDTISNNREKIKGWIKEQAHKFVERYFSSENMDGSNPALNVLQRLCAATEQLNSFRWMVELSAL	311718	412724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_311867_331779_332580_349883_349990_353012_353150_359047_359132_360527_360624_363978_364128_367077_367114_367199_367296_368183_368277_368469_368632_370200_370270_370359_370526_373253_373372_373498_373656_375753_375908_377160_377390_377699_377819_380491_380703_383699_383801_384043_384219_385568_385701_386630_386835_388074_388227_390867_391041_391448_391523_391603_391804_392235_392364_393691_393844_394536_394680_396324_396482_397805_397905_401835_401951_402637_402793_403811_403977_407192_407358_408898_409013_410807_410903_411426_411531_412213
895876	contig_15118_pilon	+	3717	14	Intergenic	novelGene_74596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	237.000486854417	885	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	1176	3092	392042	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	379319	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_379782_379884_380022_380151_380317_391630_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
895877	contig_7748_pilon	+	3341	16	Intergenic	novelGene_101050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	737	1093	150644	153825	TRUE	35	TTAAAATGGCGCCGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVQTIQLKEDLQVSIKPGQLIAVAWRQPIHEVLGMPQIWQPINWIVSTRVVATHLMLHHGVHTQGILAVSTRVERTVAGIILAISKGFSLGTNIKSKVSSLIPSHRLRSEERTGQLN	149907	191003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_150667_150971_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154899_157062_157222_157502_157842_157918_158028_161605_161748_163126_163329_163412_163650_163771_164037_164222_164450_164880_164938_190830
895878	SIRV6	+	1344	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	86	164	49	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
895879	contig_1719_pilon	+	3523	16	Intergenic	novelGene_87327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_1	149.386508389777	391	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	185	1957	492762	726560	FALSE	15	CACCTGGTCTCAGCCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREEDAAAAAPLCRGGTPREPSRNNAVGGGLRLRHSGGSTAAAPQALTAPPAGSLADCRLSMELENIVANTVLLKAREGGGGKRKGKSKKWKEILKFPHISQCEDLRRTIDRDYCSLCDKQPIGRLLFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMLLTKDAKQRLGCQEEGAVEVKRHPFFRNMNFKRLEAGMLDPPFVPDPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	492577	728126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_492814_608501_608598_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_718062_718201_723078_723217_724669_724802_726461
895880	contig_19604_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_77256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	706	1086	275061	275441	NA	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFAGASLQTVATKASPAPEHTGSRMPRNVHTFPHTHRSRYTHVFLGTAPRNGCVKKARCRGGQTISLDKDGLLLFSFMLSEWGHLCVCFPYSLKPDFGKEPMCQHLHLQSRGEQPKVIQVSADS	274355	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_274400_275800
895881	contig_7009_pilon	-	5497	1	Intergenic	novelGene_23652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1314	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATTCCATTAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480545	475048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_475000_480500
895882	contig_1948_pilon	-	2672	5	Intergenic	novelGene_31151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	104.791161363924	511	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAAGTCCCCAAGTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414261	404361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_406719_406906_406978_409655_409713_411643_411724_414154
895883	contig_15087_pilon	-	4829	17	Intergenic	novelGene_37225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	814	junction_1	969.74125898355	107	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	137	1558	158925	132535	FALSE	50	GAGAATAACAGCATAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEVWLKGRVQSVWGASGSFSQARWVG	181176	129263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158952_181066
895884	contig_3018_pilon	-	4451	1	Intergenic	novelGene_78908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1010	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTTTCTATGCATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619045	614594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_614600_619000
895885	contig_5686_pilon	+	6056	13	Intergenic	novelGene_45197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1389.26442367495	13	128	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	2491	4623	189037	224324	TRUE	40	AAAAAAGTTCCAATCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQGGTCSFVTSWWWFNFELFLIFLIIVFSDGIFFFLTSQVNN	32008	231136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_32577_187114_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_225101_230479
895886	contig_12464_pilon	+	2644	7	Intergenic	novelGene_68680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1993	2373	222571	242112	TRUE	15	ACTCACGCACGCCGCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGRGVLDSKNAPSPHLSRAFRAGGFAANSTKPFPVALPRSSTTTTAFSTGPNWENACSRSSLETTGERFLTVKAAPCVAKRIRRGLLFKMVPSSSAFAISASVLDSRRMKPKPRSRLMKTSLGSP	180561	242553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_182194_192378_192464_218694_218891_222491_222597_234650_234944_242050_242190_242359
895887	contig_13097_pilon	+	2521	17	Intergenic	novelGene_107707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_8	507.20896827639	173	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	194	1909	184733	264394	FALSE	10	GTTTTGGTGGCCTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184539	265006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
895888	contig_3942_pilon	-	4597	24	Intergenic	novelGene_128612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	80.6041694709763	724	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	1591	3375	151625	143238	FALSE	15	GACGGTTTGTTGGACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFHKIPSDSLEWHENLGHGSFTKIYRGGRREAVDGEIWETEVLLKVMDAKHKNCMESFLEAASLMSQVSYQHLVLLHGVCMAGDSIMVQEFVHLGALDTYLRKRGHLVPASWKLQVVKQLAYALNYLEDKGLPHGNVSARKVLLAREGADGNPPFIKLSDPGVSPTVLSLEMLTDRIPWVAPECLQDARTLGLEADKWGFGATVWEVFNGVPMPISALDPAKKLQFYQDRQQLPVPKWTELALLIQQCMAYEPRHRPSFRAVIRDLNSLITSDYELLSDPTPGALAPRDGLWNGTQLYACQDPTIFEERHLKYISQLGKGNFGSVELCRYDPLGDNTGALVAVKQLQHSGPDQQRDFQREIQILKALHSDFIVKYRGVSYGPGRQSLRLVMEYLPSGCLRDYLQRYRTRLDSSRLLLYASQICKGMEYLGSRRCVHRDLAARNILVESEAHVKIADFGLAKLLPLDKEYYVVREPGQSPIFWYAPESLSDNVFSRQSDVWSFGVVLYELFTYSDRSCSPSAEFLRMMGCEREAPVLFCLLELLAEGQRLPAPAGCPAEVHELMKLCWAPSPQDRPPFSTLGPQLDLLWSASRG	160694	142015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_143346_144266_144378_144598_144717_145140_145314_145603_145729_146097_146288_146396_146537_146849_147001_147127_147280_147361_147495_148193_148322_149259_149345_150888_151021_151586_151715_152262_152450_152746_152860_153333_153492_153591_153715_154722_155024_155375_155522_155967_156080_156420_156545_157217_157415_160654
895889	contig_11413_pilon	+	1978	7	Intergenic	novelGene_103207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	65.118908331008	97	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	86	415	729381	737929	TRUE	30	TATACTAAGGAATTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPELNNLLNTTPDRAEQGKLTLLCDAKTDGSFLVHHFLSFYLRANCKVCFVALIQSFSHYNIVGQKLGVSLTTARERGQLVLLEGLKSSVDVFFRAQEEPHPLQFLRL	729295	742930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_729435_732105_732185_734375_734447_736698_736818_737922_738272_740561_740709_741856
895890	contig_16205_pilon	+	3946	3	Intergenic	novelGene_156850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	587	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATTTAAAGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10125	105895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_10222_99725_103466_105785
895891	contig_10734_pilon	-	4075	20	Intergenic	novelGene_50981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	55.9636308493233	391	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	236	1594	304571	292792	TRUE	30	CGAGCCACTGAGACTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLRREEKLKKCQVGAIIITPTRELAVQIDEVLSHFTKHFPQFSQILWIGGRNPGEDVEKFKAQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVKSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRISVKEKGVAASSTQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEALVKRVTILCIHGKMKYKRNKIFMEFRKLQNGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYVKFLAINQKCPLQEMRLQKNTADLLPELKAMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYVKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLKMPKMPELKGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKVREKQRQKVLEQKRKERTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKREKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKFKKGKITEEEFEKGLLTSGRRTIKTDFRISDLENDC	306622	282318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_282409_283467_283569_285418_285554_285634_285755_287995_288110_288655_288725_289708_289784_290303_290430_291140_292966_293236_293530_293959_294129_294544_294660_295378_295472_296402_296535_299615_299699_302298_302489_304461_304612_305497_305561_305639_305732_306582
895892	contig_11248_pilon	-	1266	2	Intergenic	novelGene_142538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCATTGCTTTCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154562	153149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_154282_154428
895893	contig_2799_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_85518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGAATAAAATACCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618503	617685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_617700_618500
895894	contig_10311_pilon	-	3146	3	Intergenic	novelGene_50497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	329	373	281588	281544	TRUE	80	CAAAATATAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDQNKELEGIQESNTQDFPRNQGKHRQNQGKHRQNQGKHKAIEEFRKTILEQNDKINRQLETIQKQQLEIQKINNKISELDNSIERYRSRVETLDDRISEFENESLDTNMFEEKNQKKRMKKT	281916	256530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_258697_280452_280624_281107
895895	contig_8978_pilon	-	2999	2	Intergenic	novelGene_49471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1897	2235	1690533	1690195	FALSE	35	ATATGTGTACTAACTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHVHCSIVASATIAKRWKQPRCLSTDEWINKLWYIHTVEYYTMIKNNDESVKHLITWMKMEVIMLSEISQSQKDKYYETTTVKTDKKVYTKKRQSLMVTRGGRGEILDNR	1694202	1689430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1691621_1693393
895896	contig_19076_pilon	-	3881	5	Intergenic	novelGene_74208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	459	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156673	101404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_103077_124490_124572_146307_146501_152198_152396_154935
895898	contig_11338_pilon	+	4178	14	Intergenic	novelGene_6174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	543.899431619464	2433	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	1130	2317	8000	11749	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVGRPGAGPGPGQDGALRPSESSM	745	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11477_11719
895899	contig_11026_pilon	+	2302	3	Intergenic	novelGene_167658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_2	17.5	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	946	1248	123382	125017	FALSE	0	TTCCTTGTTCTGTTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	122436	126071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_123427_123810_123967_124915
895900	contig_10324_pilon	-	4338	1	Intergenic	novelGene_7729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1064	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCTGCCAGGCCTAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57253	52915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_52900_57300
895901	contig_11173_pilon	+	2127	13	Intergenic	novelGene_156899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	237.389389447427	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	518	1585	434044	455686	FALSE	10	GACCTTGTCTTTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVLSWKLVPDNFPPGDQPPPPSYIYGSQHLLRLFVKLPEILGKMSFSEKNLKALLKHFDLFLRFLAEYHDDFFPESAYVAACEAHYSTKNPRAMY	430608	456228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430730_431765_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936_450047_452961_453062_453732_453818_455586
895902	contig_2867_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_135180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	702	1025	782746	783069	NA	20	CTTCAGGACTCTGTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLDDRSGCFFKSTLASSISGLLFLTSDFCRSAFKFESAKRLFLASSFSRSTVLTPSAVCSGFRCFLGLSLPSLSTTSMWLERPFSFGTFILTGSSLDRSAFAGSA	782044	783616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_782000_783600
895903	contig_14415_pilon	-	2439	4	Intergenic	novelGene_77585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_3	170.771452207004	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	149	1432	19037	13005	FALSE	45	ACAGAAACACCACAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	23807	11997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_13232_16940_17037_18076_19097_23718
895904	contig_3747_pilon	+	2903	8	Intergenic	novelGene_24758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	334	1509	201313	203804	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200979	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
895905	contig_14846_pilon	+	3077	2	Intergenic	novelGene_85372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1276	1767	128300	128791	FALSE	50	CCTTAACAAAATCCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATASSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRLIYRTLLEIKEIRQNAETARQRTHTVVAELKKVIQEHNAKFNRLSESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESRRSRIEAAEVRISDIEDKALDANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERWG	126549	130101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_126864_127338
895906	contig_8153_pilon	+	2793	5	Intergenic	novelGene_34809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	140.376280047592	203	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	89	1108	138411	158940	FALSE	30	TCAAGATTAATTTTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAGQMQNLESAGAGQSVSTQTGSMSGHIPRLSKVNLFTLLSLWMELFPVAETQRHKSQKKEEGKHGSLGDNEDRTRVPTDKKQVKRTGLVVVKNMKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTGELYS	138322	160625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680_148756_153002_153181_158353
895907	contig_5039_pilon	-	6315	7	Intergenic	novelGene_64956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	482.372867534373	187	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	3039	3497	1657705	1654623	TRUE	30	TCTTTCATAAATTATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSFASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR	1660743	1649338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1649878_1650331_1650528_1651496_1651713_1652755_1654782_1655315_1655432_1655538_1655611_1657593
895908	contig_7775_pilon	-	1816	20	Intergenic	novelGene_37452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	319.256520312073	3	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	783	1814	118842	33839	FALSE	25	TATGTTTCTGATTATACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDNISKTKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDSTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKRKGYNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTACKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVENCGRVNSGEQGTLKPPEKRTNGLRRASRQVDP	342051	33836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_33884_39625_39652_51909_52011_52316_52419_102447_102558_102918_103052_105394_105481_107933_108021_109679_109749_112751_112848_117094_117195_118765_118871_121912_121982_124527_124621_126218_126323_126573_126683_130757_130824_133695_133755_236131_236249_341914
895909	contig_7870_pilon	-	1881	14	Intergenic	novelGene_108913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	1022.65437775006	73	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	854	1399	496465	217271	FALSE	80	GGAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTK	854067	216788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496595_497821_497921_531581_531677_705742_705833_738946_739035_748845_748908_762132_762202_823988_824168_854025
895910	scaffold_13505_pilon	-	703	6	Intergenic	novelGene_111477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6158.2052255507	102	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	33	317	547805	542114	TRUE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASHWEHPLCGVCQLTQPLLGSTRSTSGSAFGKGAVCQ	548327	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541848_542227_547363_547465_547734_547806_548295
895911	contig_13542_pilon	+	1568	9	Intergenic	novelGene_131504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	987.919143642333	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	29	811	417080	505589	FALSE	5	GCATCGGCCTTGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346597	506346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346605_417058_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501
895912	contig_17171_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_147368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATTCCTGGCTCACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255292	252736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_252700_255300
895913	contig_990_pilon	+	3355	4	Intergenic	novelGene_75999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.5407887880287	277	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	17	853	205127	214845	FALSE	25	CCCAGCAATTTTATTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLLEYERQLVLELLDADGLVVCARGLGADRLLCHFLRLHCHPACLVLVLNTQPAEEEYFISQLKLEGVDHLPRRVTNEIASNGRYEVYTQGGVIFATSRILVVDFLTDRIPSDLITGILVYRAHRIIESCQEAFILRLFRQKNKRGFIKAFTDNAVAFDTGFCHVERVMRNLFVRKLYLWPRFHVAVNSFLEQHKPEVVEIHVSMTPAMLTIQTAILDILNACLKELKCHNPSLEVEDLSLENAIGKPFDKVLFSFSALSTVCYVVILKSASYFSI	205110	217347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_205301_206724_206906_213464_213661_214559
895914	contig_7963_pilon	+	2483	11	Intergenic	novelGene_58555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	160.666860304171	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	554	2083	247365	253116	FALSE	15	TACAGTGGTTTCTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246328	253516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248601_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
895915	contig_2867_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_135179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	964	1287	782746	783069	NA	30	CTCTCAGAATCACTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLDDRSGCFFKSTLASSISGLLFLTSDFCRSAFKFESAKRLFLASSFSRSTVLTPSAVCSGFRCFLGLSLPSLSTTSMWLERPFSFGTFILTGSSLDRSAFAGSA	781782	783573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_781800_783600
895916	contig_755_pilon	-	1884	4	Intergenic	novelGene_119764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	66.3777071011044	473	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	55	666	88997	83959	FALSE	25	CATATATATGGCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89051	82740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87817_88876
895917	contig_13542_pilon	+	1517	10	Intergenic	novelGene_131500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1003.03747329774	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	57	875	346638	505589	TRUE	80	AAAAACAACCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346581	506310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_487906_488024_499871_499938_500886_500964_505501_505591_505669
895918	contig_13004_pilon	+	2319	4	Intergenic	novelGene_112703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	196.876159608578	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	985	1311	927507	928299	FALSE	10	TTGACCTTGGCTTCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSPSFQDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837826	929307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_927669_928134
895919	contig_15732_pilon	+	2688	4	Intergenic	novelGene_88918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_3	58.8557558782486	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGCAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367302	394944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_368618_380802_380982_386711_386776_393814
895920	contig_7056_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_43719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACGCACTTTAATCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936522	937893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_936500_937900
895921	contig_6434_pilon	+	3280	17	Intergenic	novelGene_61890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1222.34442868766	2	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1005	2000	924065	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	900077	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_900192_902412_902537_904708_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_918976_921615_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
895922	contig_11986_pilon	+	1363	4	Intergenic	novelGene_69097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	818	1240	42112	42654	FALSE	90	ATGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLPAEGCRDRCGGGGGCFTSRAWASWRWCCWICCCRLVIVRATCCSCCLMGPETFRWACNICCWICKRWYACRQEREPACHTMATSPTPVRYLQGKTDDDQGAWLPDHAVAEACRGGTRHFQKDTSHLDVFRAWIFNE	39238	42777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_39787_41118_41294_42017_42244_42363
895923	contig_160_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_156318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTATGGAGCTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65589	64084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_64100_65600
895924	contig_5472_pilon	+	4113	3	Intergenic	novelGene_130040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2730	3182	438380	438832	FALSE	40	AGTAGAATTCAGCATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRAPKYVKQTLTTLKREIDSSTILVEDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLKDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKAILNKIQNVEIIQNIFSDHNAIKV	433561	439763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_433970_434822_436197_437432
895925	SIRV5	+	2802	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	68	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12971_13009
895926	contig_7179_pilon	-	3248	5	Intergenic	novelGene_78146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2030	2371	1008275	1007934	TRUE	45	TATGCAAACAAGATCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYVAPNRFHHFLGEGSTDYWGFKFKQTTKEGNINDILAYTSCVPVFSAKDIGVGLALLLSSLTSNSTEVKLGPPSHRRRFPRILIPAQLPKETADYQGLLLGTMLLLMLWK	1010304	997550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_997739_1000657_1001045_1005483_1005574_1007281_1007323_1007762
895927	contig_18272_pilon	+	5811	1	Intergenic	novelGene_7066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	654	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCCCCAGCAAAATCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509742	515553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_509700_515600
895928	contig_5961_pilon	-	2243	9	Intergenic	novelGene_144152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTTGGAGTAAATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214588	201918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_202349_206903_206986_207369_207635_209572_209784_210227_210441_210996_211228_211810_211953_213787_213927_214058
895929	contig_5686_pilon	+	6355	1	Intergenic	novelGene_45382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGCCTGCTGATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157939	164294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_157900_164300
895930	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
895931	contig_5302_pilon	-	3005	7	Intergenic	novelGene_81393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTACGACGGCGCGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172298	152098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_152227_152706_152840_155412_155517_161140_161215_167386_167530_169184_169332_170022
895932	contig_20641_pilon	-	4190	9	Intergenic	novelGene_52784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	106.003242874923	8841	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	476	871	56705	54898	TRUE	70	GAAAAGAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57180	9784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_11877_12294_12338_14233_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54966_56377
895933	contig_3382_pilon	+	3532	10	Intergenic	novelGene_124149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_9	207.250668288845	292	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	511	2961	931459	977747	FALSE	15	CAAAGCGTGTGGGTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGMIQTNTASKTQKDVARRPQFVSSRGVEELLKGAGAKESEENQKTQGSN	930948	978318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_977701
895934	contig_3018_pilon	+	3708	15	Intergenic	novelGene_78772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	649.906339405918	851	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	207	2267	371069	535107	FALSE	25	CAGAACACTGTCTTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVEQELANIDPSWIESPKTNGHIENGPFLLEQQLDDEEDDEEECPNPEEYNLDEPTAESDYTYSSSYEQFNGELPNGQHKIPESQLPEFPTSLFPGPLEPVACGSALSEGSPLNEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKTKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS	370862	536548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_371107_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373_499857_517300_517402_517509_517618_522876_522947_523589_523683_534922
895935	contig_13680_pilon	+	3436	18	Intergenic	novelGene_149583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	240.36345028996	9	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	1929	2717	326159	340245	TRUE	30	AAAGACCTGACTGGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGRAFSTAVAEQLQLLPLFFKIAPVENDNSYDELKRDAKLCLSLMSQGLLYPLQVPLVLQVLKQTARSSSWHARYTVLTYLQTVVFYNLFIFLNNEDAVKDIRWLVISLLEDEQLEVREMAATTLSGLLQCNFLTMDGPMQIHFEQLCKTKLPKKRKRDPGSVGDTIPSAELVKRHAGVLGLGACVLSSPYDVPTWMPQLLMNLSAHLNDPQPIEMTVKKTLSNFRRTHHDNWQEHKQQFTDDQLLVLTDLLVSPCYYA	309959	341490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314501_315204_316069_316638_316792_323626_323732_324256_324349_325027_325160_325535_325630_325684_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_334385_334549_338835_338970_340110_340250_340775
895936	contig_5083_pilon	+	2625	14	Intergenic	novelGene_151655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_12	120.908836507354	66	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	507	2303	461780	674466	FALSE	85	TAAAAAACAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEGEQEEKSSENSSAERDLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPPYPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPTARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPAHIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISPYYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNEHSECFLNPCLSLPPITDLSAPKKCRARFGLDQQNNWCGPCRRKKKCVRYIQGEGSCLSPPSSDGSLLDSPPPSPNLLGSPPHDAKSQTEQTQPLSLSLKPDPLAQLSMMPPPPALLLGEAAHGKAPALCPNGALDLPPASLQPPIAPSSSLAQPSTSSLHSHTALAGTQPQPLSLVTKTLE	461273	674788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_461969_462228_462296_462501_462627_546411_546514_648611_648745_651100_651204_653251_653339_658044_658171_658766_658927_659475_659584_666163_666213_666789_666841_668073_668147_674042
895937	contig_5917_pilon	-	3268	16	Intergenic	novelGene_122159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	238.465334075114	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	200	2194	759810	698735	FALSE	15	TGCATGCTGTTTGTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENIRQEIGIMNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIV	792973	697660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_698741_699545_699740_702350_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_792827
895938	contig_1639_pilon	+	2247	18	Intergenic	novelGene_74879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_11	259.599811794495	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	144	1685	283593	312997	FALSE	10	GAATCTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQSES	279685	313559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827
895939	contig_11924_pilon	+	2161	8	Intergenic	novelGene_128018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	116.95839134548	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	33	647	11090	64571	TRUE	25	ATAACCTCTTGTATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRKPNSEPGRMDLHQPGTGRYQVLHNEEDNSESSATEQPSTSNATPQIVQTAPSTPVLETNSSPPPYSSITVEVPTTSAAETSQTIQEEECPPRDDFSDADQLRVGNDGIFMLAFFMAFIFNWLGFCLSFCITNTIAGRYGAICGFGLSLIKWILIVRFSDYFTGYFNGQYWLWWIFLVLGLLLFFRGFVNYLKVRNMSESMAAAHRKRYFFLL	11057	72567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_11129_38813_38980_42186_42207_50560_50655_58636_58762_61408_61476_64467_64574_71055
895940	contig_9653_pilon	+	3962	1	Intergenic	novelGene_48311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2668	2988	1010469	1010789	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSCEAAGGFKPWSFWLTAKCFNHCATRVPQVLHRRMQIRRMLVCLIRVLVSLRNWRHQVPLRVAVREKVENGGKLKVRIRNRFPSPLPYSTLPSIYLFPTLAED	1007801	1011763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1007800_1011800
895941	contig_10581_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_41438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	58	378	769235	768915	NA	60	TCAAAAAAAAAAAAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIFISKCFKSSSFSASKVMSSAYQRLLMSLPPILMLRSSSYSPASQIICSAYRLNKYGERIQPSCTSFLILNHAVFPCSVQMTASWSMYRFCMSTIKCSGIPPFFPMLSIICYDPPSRMPLHNQ	769292	767747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_767700_769300
895942	contig_17311_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_57872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCACTCTGTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207057	204720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_204700_207100
895943	contig_18081_pilon	+	3554	13	Intergenic	novelGene_23762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	44.8800871458849	548	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	78	1643	33948	70642	FALSE	30	GTACCAGTTTTTGCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVGRVGSFSSSPPGLASTYAGGPLANELATGNGGAAADDEDGQNLWSCILSEVSTRSRSKLPAGKSVLLLGEDGAGKTSLIRKIQGVEEYKKGRGLEYLYLNVHDEDRDDQTRCNVWILDGDLYHKGLLKFSLEAVSLKDTLVMLVVDMSKPWTALDSLQKWASVIREHIDKLKIPPEEMKEMEQKLIRDFQEYVEPGEDFPASPQRRSAASQEDKDDSAVLPLGADTLTHNLGVPVLVVCTKCDAISVLEKEHDYRDEHFDFIQSHVRKFCLQYGAALIYTSVKENKNIDLVYKYIVQKLYGFPYKIPAIVVEKDAVFIPAGWDNDKKIGILHENFQTLKAEDNFEDIITKPPVRKFVHEKEIVAEDDQVFLMKLQTLLAKQPPIAAGRPVDASPRVPGGSPRTPNRSVSSNVASVSPIPAGSKKIDPNMKAGATSEGVLANFFNSLLSKKTGSPGGPGGGSPGGGAGGGSAGLPSSSKKSGQKPILSDVHAELDRIARKPVTVCPPTSTSPTEGEAS	33870	72553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_34091_34234_34309_52081_52199_52885_53117_53944_54115_58521_58616_60426_60563_61143_61256_63529_63590_63721_63767_64421_64543_65401_65552_70529
895944	contig_10968_pilon	-	2146	4	Intergenic	novelGene_84276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAACTACACACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142323	88378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_-_90009_90238_90581_93737_93878_142289
895945	contig_1804_pilon	+	905	2	Intergenic	novelGene_177419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTTTCTCCAGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544544	546611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_+_545203_546364
895946	contig_5947_pilon	-	3378	25	Intergenic	novelGene_101545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	57.3863006300284	811	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	971	2916	116	3031	589186	559786	FALSE	5	CTGTTGGCGTTTGTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDANLQTLTEYLKKTLDPDPAIRRPAEKFLESVEGNQNYPLLLLTLLEKSQDNVIKVCASVTFKNYIKRNWRIVEDEPNKICEADRVAIKANIVHLMLSSPEQMQKQLSDAISIIGREDFPQKWPDLLTEMVNRFQSGDFHVINGVLRTAHSLFKRYRHEFKSNELWTEIKLVLDAFALPLTNLFKATIELCSTHANDASALRILFSSLILISKLFYSLNFQDLPEFFEDNMETWMNNFHTLLTLDNKLLQTDDEEEAGLLELLKSQICDNAALYAQKYDEEFQRYLPRFVTAIWNLLVTTGQEVKYDLLVSNAIQFLASVCERPHYKNLFEDQNTLTSICEKVIVPNMEFRAADEEAFEDNSEEYIRRDLEGSDIDTRRRAACDLVRGLCKFFEGPVTGIFSGYVNSMLQEYAKNPSVNWKHKDAAIYLVTSLASKAQTQKHGITQANELVNLTEFFVNHILPDLKSANVNEFPVLKADGIKYIMIFRNQVPKEHLLVSIPLLINHLQAESIVVHTYAAHALERLFTMKGPNNATLFTAAEIAPFVEILLTNLFKALTLPGSSENEYIMKAIMRSFSLLQEAIIPYIPTLITQLTQKLLAVSKNPSKPHFNHYMFEAICLSIRITCKANPAAVVSFEEALFLVFTEILQNDVQEFIPYVFQVMSLLLETHKSDIPSSYMALFPHLLQPVLWERTGNIPALVRLLQAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQKLIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPESVDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVLEKIIIPEIQKVSGNVEKKICAVGITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDDTIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFSQLAFAGKKEHDPVGHMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGRVPSMVSTSLNADALQYLQGYLQAASVTLL	601460	559438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_559876_560650_560883_561840_561988_563237_563320_564664_564751_564852_564951_565374_565584_565722_565874_567168_567267_569244_569349_570702_570840_574334_574397_575558_575644_576110_576314_576729_576796_577854_577985_578099_578268_580781_580875_582249_582358_583918_584010_584448_584595_584681_584784_586374_586518_589101_589198_601356
895947	contig_15327_pilon	-	4962	1	Intergenic	novelGene_70504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	465	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2897	3229	432749	432417	NA	70	GAAGGAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHFHSLSLGSPSTEATNLNQVPYFSGQSVHRAKGQGGISFGFSQFSCELQHLSAAYSLSFSGFASQFFFNPLEAHKDSMGFIEEFSQDLRVNIHILPDDIDKGAAWNCL	435645	430683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_430700_435600
895948	contig_2043_pilon	+	2895	5	Intergenic	novelGene_169918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCATCAACTCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719771	792961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_721393_789558_789812_790198_790687_791362_791450_792515
895949	contig_3942_pilon	+	1339	4	Intergenic	novelGene_128602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	90	386	6711	7080	TRUE	60	AGAAAGACAGATAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGGRLINKLHYADDTALLAESEEDLKHLLMKIKYHSLQYALQLNIKKTKILATGPITYIMINGEKTEVVKDFILLGSTSLFKSKDVTLRTKVHLTQAKVFSTASYACKSWTMNKKDRRIDVFELWCW	6621	16636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_6858_6930_7414_8667_8878_16226
895950	contig_17603_pilon	+	2919	2	Intergenic	novelGene_152780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	933	1289	40952	41308	TRUE	10	ACGCTCACTTCCGCTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISQHLIVLTRNLYIEAVIQTEQGVTAWFKVRKGVCQGCILSPYLFHLYAEQIIREVGLYEEERSIRIGGRLINNLRYADDTTSLTESEEDLKHLLMKIKAYNRQHGLQVTEELSNK	40019	47149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_42695_46905
895951	contig_6327_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_147493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	362	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTTTTTTTTTCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79770	77132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_77100_79800
895952	contig_5145_pilon	-	1716	8	Intergenic	novelGene_131431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	121.91432254176	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	103	612	946991	936187	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGELLRGASALLNARPFPPLLPRLLPKLSAAAMSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	947093	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
895953	contig_19579_pilon	-	1691	8	Intergenic	novelGene_59373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	690.85856079259	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	88	969	13090	7943	TRUE	50	AAAAAAATCTATATGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGVFKDIPSLTAHPGPRVTSGENVTLLCHSVYHYDIFHLYKDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHIGATDGETKNQVKYKSSSPFLDVQEDNQYAAFKDFQPEEDEQMDTQVLTAEDPEEVTYAMLQQETLMRSVDLLSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13177	7170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_7746_7795_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012_12301_12900
895954	contig_13295_pilon	-	1854	2	Intergenic	novelGene_31214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGTGAAATAAAACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55609	53645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_55164_55273
895955	contig_12626_pilon	+	2457	4	Intergenic	novelGene_80453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_2	152.481692890218	18	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	932	1810	166269	173300	FALSE	55	AAAAAAGATATTAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQVWSIATL	165337	173947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_166712_171116_171243_171350_171421_173060
895956	contig_14300_pilon	-	4016	10	Intergenic	novelGene_133085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136.256928694595	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	438	1184	180320	143271	TRUE	10	CTGCTTCAGCTCTGGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHRRFLQLLMTHGVLEEQAVKRLQKHCYKVHDRNAAVEKLEDFINNINSVLESLYIEVKKGVTEDDGRPVYALVNLATTSISKMASDFAENELDLFRKALELIIDSESGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHSRAILEMEQYIRETYPDSVKMCNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNSEPRCPHCNDYWPHEIPVTGQTCPRPHQAVFPGVP	185200	139446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_139570_140457_140554_140657_143327_148561_148683_149580_149698_154430_154578_155812_155891_157173_157296_180214_180362_184804
895957	contig_16411_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_77393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1380	1685	397966	398271	NA	70	ATAATAAAGTACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQALHQTESSTARWCPTTTTVCSDRDHNRGFWTELEKDVQQNSNSQKKKKDQIYWPKGDWGNPESMAPRHPFSSVVKSLPRLTVLPGSGQPHKTKWD	396586	398719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_396600_398700
895958	contig_5961_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_144180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	420	758	289463	289125	NA	45	GGAAGAAGAAATTACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALFTVAKRWKQPRCSSVDEWLNKLWYNHTIEYYAMIKDNDEAVKYVIAWRKLGVIMLSEFSQSQKDKYKYCIIPLLKELKKRFKHRRQHSLIVTGVGREGEGYSVSRW	289882	287516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_287500_289900
895959	contig_6163_pilon	+	2133	3	Intergenic	novelGene_103842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430090	438036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_430240_434972_436661_437740
895960	contig_2798_pilon	-	6336	1	Intergenic	novelGene_120058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	788	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTGGGTTCCCCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187067	180731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_180700_187100
895961	contig_8464_pilon	-	1819	7	Intergenic	novelGene_125376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGCCTGCCCCCACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804491	792631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_792734_793604_793670_796181_796263_797902_797991_798718_798921_799186_799279_803302
895962	contig_6509_pilon	-	2684	1	Intergenic	novelGene_145639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	771	1124	109451	109098	NA	30	GAAGAAGAGCTGGGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRSWCEKERVESLGSELEIGCATKPVRKWSWPRQVDAWRVQGGCGVRAIAWGGGVLKGDGGDPWHLLETLWSMPQHLPSSGLAASGEGATGASDGHFHWHRCQQSGMQGWVLSCIT	110221	107537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_107500_110200
895963	contig_16846_pilon	+	2308	8	Intergenic	novelGene_82906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	22.3268850473676	37	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	386	1009	459619	477663	FALSE	15	TTTACCTCTTCTGGACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAWHHL	456095	478962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459710_464055_464156_464527_464615_465206_465311_475327_475478_476253_476327_477644
895964	contig_10953_pilon	+	4758	8	Intergenic	novelGene_42539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_7	154.745610863871	38	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	666	1742	182044	188559	FALSE	20	AGGCCCCAGCCCCAGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMEREISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDPQRMGAHAGKHSSP	181378	191575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_182129_183136_183238_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328_187461_188428
895965	contig_408_pilon	-	3168	1	Intergenic	novelGene_84935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGGAAAATAGAGATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225399	222231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_222200_225400
895966	contig_11720_pilon	+	1474	10	Intergenic	novelGene_43798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	62	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	242	1042	68064	98324	FALSE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYTFSSR	67822	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98306
895967	contig_10861_pilon	+	4803	3	Intergenic	novelGene_39256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_1	83	914	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	1998	4277	1245677	1247956	FALSE	30	CTAAAGGCTACTAGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFIFHFPILESEIVTSSEPINNRNTDPALWNNFSSNDVNYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLDGKQTRFCSQNLFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVFCFVCKLFSPKSNSRFATDGFSDWRNLSMIDKHENSSIHRDCMLAYLNRRHGFGLTHELETQINEERQHWKAVLQRVVAVIITIAERGLSFQGKNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKFSNTGKINRSYMSKTTCEELINLISNKVRSTIFSEISIARYFSLFVDSTADLSHTDQLSIVLRYVSPTVGKPVERFITFASLRGHSGEEIADQVLHYLCEVCKIDFSKCRGQSYDNAANMSGCYKGMQQKILEHNEYAIFIPCAAHSLNLVGRSTVDCCPEAVDFFSTVQLLYTFFAASTHRWAVLKTYVGNDRVLKCLSTTRGEVHAVATSAILESYTQILDALENIAEDQTQKGDTRREAENITNKMQTLEYVFMLVMWNNILQHFHWASQALQDSEVNLKTCTDLYQSLTGYLHNLREDFENFENTTKQILPNTDYQAVHCRRTIRKKQVDEGSAPGVLSARDQFRITTYYTIIDTLESCMKRRVEAYEVLTDRFSFLNNVDIPDEECMKASKKLVQAYPDDLNTNLYGEVRQFHSYMRTKFTNPGKTNFTHEDMYDSIIEDKIQCVFPNVEIALRIFLTLMITNCTTERSFSSLKRLKSPQHTTMTQVRHDSLSLLCMEVDIVRQLNCDEIMEEFVRAKNRKKCFYL	1241369	1248482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1241723_1243368_1243427_1244090
895968	contig_5423_pilon	+	3019	7	Intergenic	novelGene_85263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	436	junction_2	752.181364802104	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	261	908	542216	553344	FALSE	40	GTACAGTCTACAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	534832	555455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542213_542351_544406_544525_545686_545830_551350_551465_553206
895969	contig_8597_pilon	-	3743	17	Intergenic	novelGene_158692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_1	680.09631383632	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	59	2185	60370	20340	FALSE	15	TAATGGCTGCTATGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARITSLQEEVKHLKHNLERMEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKLLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHMTENKERMEDEVKNLALQLEQESNKRLLLQSELKTQAFEADHLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKEALATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHIVSQLEEMNSMLTKDIELLKKENEELTENMRKTEEEYKLKKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANMQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLAEESTHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQEKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKEVEMEPVQQAEKANFQNHKGHEFIPTLYHFPANCEACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLISPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSSFVRASPRTLSTRSAANQSFRKVVKNTSGKTSS	60428	18781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_20347_23011_23220_24270_24533_24693_24773_29196_29286_29492_29564_36373_36534_37783_37973_40966_41056_41322_41417_42546_42713_46738_46834_50003_50074_53195_53381_55225_55387_58900_59052_60319
895970	contig_854_pilon	-	2046	11	Intergenic	novelGene_36693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	41	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	1615	2046	1706853	1704620	FALSE	10	CTCCTGCAGCTGGGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQ	1716398	1704619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711776_1715755
895971	contig_3410_pilon	-	3690	2	Intergenic	novelGene_58892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	285	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1579	1887	9993	9685	FALSE	20	CTGGACAACTTCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILSLALTLSHYQEIGFALPEISLLLATLGDGWGGSQETSNVLVILRLLLQFLSSPTLCPGRLTSADGIPRPQASSKFGPSGLGLQPQSCHTAPTLPPLPR	11759	7881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_11192_11379
895972	contig_3509_pilon	-	7827	9	Intergenic	novelGene_160697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	606	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1592	2254	176027	104525	TRUE	75	ACAATTAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKQKGTDREYLQK	364143	8486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_-_8505_8723_9246_10349_11613_14305_14653_32143_34253_103210_104560_175399_176763_362752_363158_363692
895973	contig_7182_pilon	-	3052	2	Intergenic	novelGene_117094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	860	junction_1	0	22	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGGTGGTAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94204	90862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901
895974	contig_9127_pilon	-	3038	1	Intergenic	novelGene_103006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCTAATTCAATCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146755	143717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_143700_146800
895975	contig_2646_pilon	+	2433	6	Intergenic	novelGene_69549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCATTGAAATAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846150	859531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_847437_852063_852159_853819_853906_856264_856341_856902_857113_858851
895976	contig_7056_pilon	-	2798	11	Intergenic	novelGene_43618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_7	829.798776812789	5	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	69	623	730480	725835	TRUE	10	CAATTTGTCTTGTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGISKSLRAVELKLELTMIHLENLWPCSGQVPMTDLGLAEGITVLAEELALKG	731015	721894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
895977	contig_13542_pilon	+	12526	83	Intergenic	novelGene_131562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	168.805965227803	1117	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1516	4551	4389	8939	683046	720779	TRUE	40	TTGAAAAAGAAGGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNNLVHFTESKLPQTETEGVDEGKEPQKQLEGDCCSFITQLVNHFWKLHASKPKNAFLAPACLPGLTHIEATVNALVDIIHGYCTCELECINTASKIYMQMLLCPDPAVSFSCKQALIRVLRPRNKRRHVTLPSSPRSNTPMGDKDDDDDDDADEKMQSSGIPNGGHIRQESQEQSEVDHGDFEMVSESMVLETAENVNNGNPSPLEALLAGAEGFPPMLDIPPDADDETMVELAIALSLQQDQQGSSSSALGLQSLGLSGQAPSSSSLDAGTLSDTTASAPASDDEGSTAATDGSTLRTSPADHGGSVGSESGGSAVDSVAGEHSVSGRSSAYGDATAEGHPAGPGSVSSSTGAISTTTGHQEGDGSEGEGEGEAEGDVHTSNRLHMVRLMLLERLLQTLPQLRNVGGVRAIPYMQVILMLTTDLDGEDEKDKGALDNLLSQLIAELGMDKKDVSKKNERSALNEVHLVVMRLLSVFMSRTKSGSKSSICESSSLISSATAAALLSSGAVDYCLHVLKSLLEYWKSQQNEEEPVATSQLLKPHTTSSPPDMSPFFLRQYVKGHAADVFEAYTQLLTEMVLRLPYQIKKIADTNSRIPPPVFDHSWFYFLSEYLMIQQTPFVRRQVRKLLLFICGSKEKYRQLRDLHTLDSHVRGIKKLLEEQGIFLRASVVTASSGSALQYDTLISLMEHLKACAEIAAQRTINWQKFCIKDDSVLYFLLQVSFLVDEGVSPVLLQLLSCALCGSKVLAAMAASTGSSSAASSSPPVASSSGQATTQSKSSTKKSKKEEKEKEKEGESSGSQEDQLCTALVNQLNKFADKETLIQFLRCFLLESNSSSVRWQAHCLTLHIYRNSSKSQQELLLDLMWSIWPELPAYGRKAAQFVDLLGYFSLKTPQTEKKLKEYSQKAVEILRTQNHILTNHPNSNIYNTLSGLVEFDGYYLESDPCLVCNNPEVAFCYIKLSSIKVDTRYTTTQQVVKLIGSHTISKVTVKIGDLKRTKMVRTINLYYNNRTVQAIVELKNKPARWHKAKKVQLTPGQTEVKIDLPLPIVASNLMIEFADFYENYQASTETLQCPRCSASVPANPGVCGNCGENVYQCHKCRSINYDEKDPFLCNACGFCKYARFDFMLYAKPCCAVDPIENEEDRKKAVSNINTLLDKADRVYHQLMGHRPQLENLLCKVNEAAPEKPQDDSGTAGGISSTSASVNRYILQLAQEYCGDCKNSFDELSKIIQKVFASRKELLEYDLQQREAATKSSRTSVQPTFTASQYRALSVLGCGHTSSTKCYGCASAVTEHCITLLRALATNPALRHILVSQGLIRELFDYNLRRGAAAMREEVRQLMCLLTRDNPEATQQMNDLIIGKVSTALKGHWANPDLASSLQYEMLLLTDSISKEDSCWELRLRCALSLFLMAVNIKTPVVVENITLMCLRILQKLIKPPAPTSKKNKDVPVEALTTVKPYCNEIHAQAQLWLKRDPKASYEAWKKCLPIRGIDGNGEIPQQIRAPPSLFD	654957	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_655190_656655_656780_657756_657855_659035_659194_660153_660364_661399_661502_662289_662391_662622_662822_663180_663370_663792_663857_665016_665209_665809_665881_665967_666116_666565_666794_667491_667663_671174_671358_672225_672385_672735_672889_673336_673565_673890_674049_675035_675208_676226_676429_677500_677665_678117_678335_679169_679387_681302_681372_681800_681936_682928_682969_683041_683104_683952_684094_685216_685339_685992_686105_687911_688043_688163_688342_688804_688910_690404_690543_691589_691765_697703_697801_698463_698572_699046_699164_700254_700465_701653_701804_703172_703401_704442_704522_705368_705615_706513_706683_707136_707282_707884_707971_708668_708757_709024_709219_711676_711917_712344_712484_713198_713325_713441_713571_714472_714817_716491_716583_716918_717004_717193_717322_720463_720594_720717_720877_721833_721944_722576_722719_723109_723192_723489_723664_725724_725847_727172_727371_728851_728933_731968_732057_732553_732682_733588_733697_734108_734229_734972_735164_735629_735804_736742_736843_738267_738487_739643_739758_740763_740907_741377_741504_742661_742857_745740_745966_749174_749266_749994_750158_753491
895978	contig_4783_pilon	+	8387	5	Intergenic	novelGene_108433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	329	180	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1481	2002	460569	461090	TRUE	35	CTGGGTGGGAACAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTVSKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDLSVEENALELPDREFKSLILRIVQELRQKADKHDGKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTF	458671	472125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_459271_459532_459897_460051_461300_464733_467719_468934
895979	contig_16525_pilon	-	720	7	Intergenic	novelGene_133818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_2	86.7851753853541	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	34	720	144371	142228	FALSE	40	GAATTAGAAGCCCAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQQHAKVVPWMRKTEYISTEFNRYGISNEKPEVKIGVSVKQQFTEEEIYKDRDSQITAIEKTFEDAQKSISQHYSKPRVTPVEVMPVFPDFKMWINPCAQVIFDSDPAPKDTSGAAALEMMSQAMIRGMMDEEGNQFVAYFLPVEETLKKRKRDQEEEMDYAPEDVYDYKIAREYNWNVKNKASKGYEENYFFIFREGDGVYYNELETRVRLSKRRAKAGVQSGTNALLVVKHRDMNEK	144404	142227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_142319_143320_143450_143533_143651_143736_143841_143956_144026_144112_144219_144300
895980	contig_16411_pilon	-	878	1	Intergenic	novelGene_77356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	564	863	242905	242606	NA	45	ACTATAACCCAAACTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSQTSCHGPFLCSFHGVTNDPLALGRGFFFSFSIFLPELGRGISNVTLCMFFKAQDHRVSLKMTCSAMRHLLPKDICPSKQFPQAWWEILQRNFGSI	243468	242590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_242600_243500
895981	contig_12301_pilon	-	2613	5	Intergenic	novelGene_110006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158947	25524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_27652_45395_45720_96543_96683_141499_141506_158930
895982	contig_5917_pilon	-	2170	3	Intergenic	novelGene_122160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.5	14	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	338	382	699536	699492	TRUE	15	CACAGTGCATGCTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	702484	697665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699367_699404_699740_702350
895983	contig_14508_pilon	+	1232	1	Intergenic	novelGene_79059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTAACCACTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90702	91934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_90700_91900
895984	contig_8848_pilon	+	2290	4	Intergenic	novelGene_140461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	64.9461315245181	18	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	80	880	93887	95408	TRUE	45	AATAATTAAAATGCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEDSEKEAAEQEPREEQEEPEEEQAECSGKKRVVPGIVYLGHIPPRFRPLHVRNLLSAYGEVGRVFFQPEDGFVRRKKKAAAAATGAKKRSKYSKDYTEGWVEFRDKRVAKRVAASLHNTPMGARRRSPFRYDLWNLKYLHRFTWSHLSEHLAFERQVRRQRLRAEVAQAKRETDFYLRSVERGNRFLAADGDPARPNGSWTFAQRPTEQELRARKAARPGGRERARLATAQDQARSNRGLLAKIFGAPQPSEGMEGPSVARNS	93807	98470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_94104_94682_94886_95027_96086_97737
895985	contig_312_pilon	+	2222	12	Intergenic	novelGene_128307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_11	264.962526587946	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	48	1241	402673	440749	FALSE	15	CTGTGTGAGCAATTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFKPRESGTAAGALSMARLVLSLVSCTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKVATALKDIVKVGAVDADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRAEDYQGGRTAEAIVDAAISAVRQLVKDRIGGRSGGYSSGRQGRSESSSKKDVIELTDDTFDKNVLDSEDVWMVEFYAPWCGHCKNLEPEWAAAATEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLANRYGIRGFPTIKIFQKGEPPVDYDGGRTKSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIISEDIAKKTCEDHQLCVVAVLPHILDTGATGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLSFLWKMILISVM	402625	441730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_402692_409415_409558_414598_414657_415103_415231_424174_424282_428888_429020_429396_429512_430056_430198_433659_433745_433872_433946_435041_435201_440712
895986	contig_4931_pilon	+	2885	4	Intergenic	novelGene_138346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.4998316496599	154	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	106	1239	212295	231692	FALSE	35	GATTATTAATAGGTAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS	123249	233338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123337_212276_212521_228217_228931_231497
895987	contig_8978_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_49445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	1026	1565	1502602	1503141	NA	55	GCAAAAAGGTCATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQGKWEVVKNEMECLKIDVLGISELKWTGIGHFESDNHMVYYAGNDELKRNGVTFMIKKNNSRSILKYDAVGDRIISICLQRKPVNAPIIQIHTSTTNVKDEETEDFYQLLQSEIHQTCNQDALTITGDWNAKAGNEEGSVVGKYGLGDRNDARDCMTEFCKTKDFFTENTFLQQHKW	1501576	1503455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1501600_1503500
895988	contig_12630_pilon	+	4036	5	Intergenic	novelGene_173073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73440	82253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_76759_77428_77475_78017_78124_81562_81810_81934
895989	contig_6509_pilon	-	2935	12	Intergenic	novelGene_145629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	116.573815865547	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2109	827	2935	78961	72474	FALSE	40	CTGAGGCTATACAAAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPRSKKKEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSFTYEYEDSKQKPDKAILLDNDIPTENKLKVLKHDRDHFRKEEKLSKMKSEEKEWLFKDELIKVSKDEKSLKRIKDLSKDVTKCFREEKDRTNKSEKEKLMKEKSPKEEK	226716	72473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_78933_79038_79835_79994_91925_92065_110630_110775_192368_192478_193322_193438_226631
895990	contig_16722_pilon	-	2585	5	Intergenic	novelGene_118302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_4	289.98491340068	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	661	684	166681	166658	TRUE	75	GTTAAAAAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEILESIRAKKGDIDTDRSPEEIEKDKNETENTDSKDSEKSREEFEDQSLEKDNDDQTPDDDTEQGKYEEEPNKTSDNSNTSATTTSIQPNLENSNSSSELNSSPSESAKAADDPENGERESHTPVSSQEEIGDYKSEKSNGERSESPGAGRGGSGSTRIITRLRNPDSKLSQLKSQQVAAAAHEANKLFKEGKEVCSFYYLRKANRCLLLKKKKSLECEMILITIP	184749	155992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_156036_164408_164541_164931_166945_171616_171806_184541
895991	contig_10732_pilon	+	1141	9	Intergenic	novelGene_114670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	426.657631333368	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	67	681	47604	144247	FALSE	0	GCCGCCTTCCTTGTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAARDGAVRRAATGTAEPGGRTMEEDDSYVPSDLTPEERQELQNIRRRKQELLADIQRLKDEIAEVANEIENLGSTEERKNMQRNKHVAMGRKKFNMDPKKGIQFLMENDLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNGVFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPF	47537	144707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_47626_118293_118377_120070_120136_125785_125853_126167_126287_126667_126749_128089_128203_130562_130618_144237
895992	contig_10437_pilon	+	1477	8	Intergenic	novelGene_38321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	958.228680473316	7	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	5	946	432090	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	432085	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443885_443938_443977_445309_445476_446951_447055_451075
895993	contig_7188_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_108519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	440	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	26	81	312	392	37935	37855	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRVQAIQQAPEPQSLKKNLNPGLSTRTRAQVLNKNQNPTYYTATVVKSTWYWYHDTHIDQGNRTENSDVNSSTYGHLILHKGPKSIKWGKEHLFNKWCWQNLMSVCKKTKQDPNSTTLFKIAKKIETT	38246	36221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_36200_38200
895994	contig_12080_pilon	+	6841	27	Intergenic	novelGene_128330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	41	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4478	4927	107843	108292	TRUE	5	CCCGCCGGGGGGCTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	43889	164233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45876_46014_47139_54876_54966_56921_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118140_118502_118606_120731_120885_164134
895996	contig_7457_pilon	+	4323	28	Intergenic	novelGene_31636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_13	152.169333877886	840	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1091	3276	158	3433	1005828	1040226	FALSE	10	CTGGTGTCTCATGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKGIVRAIRDYQGPLKDHEVTIFVRRGGPNYQEGLRVMGEVGKTTGIPIHVFGTETHMTAIVGMALGHRPIPNQPPTAAHTANFLLNASGSTSTPAPSRTASFSESRADEVAPAKKAKPAMPQGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1001521	1041116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015445_1017678_1017797_1018845_1019001_1019771_1019863_1024029_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
895997	contig_12312_pilon	-	4067	13	Intergenic	novelGene_63955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	598.32336922994	7	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	468	2069	235110	215838	FALSE	40	ATAATGCTTTAAATGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	242327	213839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237882_241326_241490_242245
895998	contig_16703_pilon	+	3288	1	Intergenic	novelGene_72778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATCTGTTCTGTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30588	33876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_30600_33900
895999	contig_16098_pilon	-	1256	9	Intergenic	novelGene_45954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1499.98520305202	55	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	41	1057	352350	348487	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARRR	354029	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348497_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
896000	SIRV6	+	881	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-37	244	6	119	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	22	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCGTTCACAAAGAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	11087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
896001	contig_7452_pilon	-	2751	2	Intergenic	novelGene_109145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATAACAAGCCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158499	118743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_118882_155886
896002	contig_3588_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_72878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	909	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTTGTTGCTGTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101549	99426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_99400_101500
896003	contig_4900_pilon	-	2132	7	Intergenic	novelGene_159071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	3	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	45	572	1188120	1181643	TRUE	75	CAGTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAANLVIAVGTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188164	1179997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181062_1181146_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
896004	contig_2009_pilon	-	1515	5	Intergenic	novelGene_165453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGTAAGATCTTGGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67339	59194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_59277_61714_61834_63287_63475_64658_64793_66346
896005	contig_17976_pilon	+	2693	4	Intergenic	novelGene_32477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	98	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	246	752	41843	46972	FALSE	20	TGAGTGGCTGCCAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQHSRSQVTCGSSWVQSRRSQVKCGSSWVQSRRNQVKCGSSWVQSRRSQVKCGSSWVQSRRSQVKCGSS	41597	48913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46674_46770
896006	contig_19032_pilon	-	2239	3	Intergenic	novelGene_172557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	224	junction_2	761	18	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	182	1009	166531	164669	FALSE	50	TCTCCAGTCAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPVNVKKLKVSELKEELKKRRLSDKGLKAELMERLQAALDDEEAGGRPAVEPGNGSLDLGGDSAGRSGAGLEQEAATAGDEEEEEEEEEEEGIAALDGDQMELGEENGAAGAADSGPMEEEEAASEDENGDDQGFQEGEDELGDEEEAAGDENGHGEQQPQPPATPQQQPQQQRGAAKEAAGKSSGPTSLFAVTVAPPGSRQGQQQAGGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTCK	166712	163438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_164751_164837_164950_165897
896007	contig_7201_pilon	-	4551	5	Intergenic	novelGene_152532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1807	2151	573272	553085	TRUE	50	AGAACCATTACCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQQDFRNGRCHRRAEKDLKWWKTGSVELKTNTWIQLCLRKTQKKQQKNEETLRVMEYNQKQKFSSDRSSRTGGEKRKHGEDH	575148	393443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_394604_551594_551982_552231_553170_573012_573417_573486
896008	contig_12638_pilon	-	1765	4	Intergenic	novelGene_33357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	274	junction_3	11.4406682011537	349	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463574	1414525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1416043_1434422_1434514_1458588_1458666_1463494
896009	contig_4088_pilon	-	2614	5	Intergenic	novelGene_178064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1562	1999	111019	110286	TRUE	85	AAGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVCRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGREAVARPNVAPQPCRKEQRWLLESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAACTGARNPGSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGI	113162	74313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_74346_109540_109840_110001_110318_110613_111816_112397
896010	contig_3424_pilon	+	2787	1	Intergenic	novelGene_55491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	995	1354	152744	153103	NA	50	AAATGACTGAAAAATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFRLHRGRKGESRIPVMVPTSKVGTRSRTGTTDELNGATKPYADPGTPHFQPQVRKPPWSVLCRVPQQLCAATSKRDKQRRGLSPQETALGASVFSPWLFPQSPAEVHLGVQFVSSQ	151749	154536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_151700_154500
896011	contig_10437_pilon	+	2099	10	Intergenic	novelGene_38210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	488.264753116383	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	146	1288	229668	232651	FALSE	55	AAAGATTAAAACATGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	229522	233462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
896012	contig_2027_pilon	+	6562	21	Intergenic	novelGene_39926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_15	127.567031399182	709	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	407	2677	162961	170260	FALSE	45	TAAAAATAAAGTGTCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPHTAQFSHTDSLDLVLHTARERFLASPQEETRLWIKHSDGSFERLCNTHVTVLDARLKTGQVIVMETRNKDGAWPSAKQYVMKSVSKEDEDFQGQPGVCGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNRYLEELNFCNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHCSIVPHVFKTKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNNSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPVSPKRVMEVFYVSMDPRRKPEQHRLIVPKKGKISDLCVALSKHTGVQPDRMMVADVFSHRFYKIYQLEDSLNSILDRDDIFIYEVSARAGTGEGIREDVVLPIYLRERSPARDFNNSYYGLMLFGHPLLLSVPRDRLTWDALYHILLYRLSRYVARPSSDDEDDGDEKGDTENKGNIAKSGQTAGGSLQDPGPEQAGPSSGVVGRNRAPADNSPGPSNWPQRSRRKQLFTLQTVNSNGTSDRMTFSEDGHGVSFSSQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGFVKHECVSYVLKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPNCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDILVEFPIRDLDLSEFIIKPRSESDPDLYKYDLIAVSNHYGGLRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVTEDEVESKAAYVLFYQRQDVARRLRSQPDLSGPPRTPCLWFPTQL	156000	174145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_156094_162155_162266_162426_162558_162888_163007_163410_163557_163695_163758_163880_163981_164378_164553_164657_164817_165188_165414_165550_165635_165745_165841_166561_166769_167451_167505_167700_167962_168038_168110_168346_168460_169410_169561_169655_169772_169964_170054_170140
896013	contig_7378_pilon	+	2386	2	Intergenic	novelGene_120260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1088	1393	487721	488026	FALSE	30	TCAACTGCATCCGTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESSGFSVYSIISSANRDSLTSSLPIWMPLISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	434117	489019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_434805_487320
896014	contig_10765_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_122927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGACCGAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199947	197899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_197900_199900
896015	contig_10235_pilon	-	4261	10	Intergenic	novelGene_46607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	231.072112094156	677	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	88	1200	607523	604239	FALSE	55	GTGGAAGAAAAAGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLFSLSGSIFSAAGGRGLLWGAQPVPQIMTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQGGHSRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLGMPGLNGDSYSASQVESLRHSMGPGGYGDNLGGGQMYSPREMRANGGWQEAVTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN	607948	601177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_604332_604460_604548_604672_604762_605139_605294_605419_605556_605714_605906_606003_606252_606487_606562_607482_607527_607864
896016	contig_14142_pilon	-	1996	10	Intergenic	novelGene_120524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_9	202.148154933974	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	12	1190	355495	349950	TRUE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLVSRGKFGEDWEEGKIQGDSLSKGPASASLRKVATWNKIWHAQGLPGRRGCLSFCLLWLPT	355506	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
896017	contig_8050_pilon	+	9240	51	Intergenic	novelGene_114819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_49	355.335032891495	900	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2528	7587	128	7714	294062	446974	FALSE	45	ATGTTTATGAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLTETIFLNQDLEEKNENQESDTEEEEDKLFWLEACYKALTWHRKNKHVQEAACWALNNLLMYQNNLHEKIGDEDGQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRFIGNPGIQKCGLKVISSVAHFPDALEILSLEGAIDSVLHTLQMYPDDQEIQCLGLSLIGCLIMKKNLCVGTGHLLAKILVSSLQRFKDVAEVQMNGFQAILAILELSESFSKLLMHHSFDSVIFCHMSSSINEQKNQQFLNLCCKCFAKLAMDDELKSVMLERACDQNNSIMVECLLLLGADANQAKESTSLICQVCEKESSPKLVELLLNSGPREQDVRKALTISIGKGDSQIISLLLQRLALDLANNSICLGGFCMGKIEPSWLGPLFPDKTSNLRKQTNIGSTLARMVLRYQMKSAGEEGAASGSDGNFSEDVLVKFDEWTFIPDSSMDCVFGQSDDLDSEGSEGSFLVKKKSNSISVGEFYRDPALQHCSPNLQRHSNSLGPIFDQEDLLKRRRKILSSDDSLRSSKLQSHMRNSDSTSSLASEREYITSLDLSSNELRDIDALSQKCCISGHLEHLEKLELHQNALSSFPQQLCETLKCLTHLDLHSNKFTAFPSYLLKMNCIANLDVSRNDIGPSVILDPVVRCPTLKQFNMSYNQLSSMPENLAVVVEKLEQLILEGNKISGICSPLSLKELKVLNLSKNHISSLSENFLEACPKVESFSARINFLAAMPFLPSSITSLKLSQNKFTCIPEAILNLPHLRSLDMSSNNIQYLPGPAHWKSLNLRELLFSSNQISILDLSEKAHAWSRVEKLHLSRNKLKEIPPEIGCLENLTSLDVSYNLELRSFPNEMGKLSKIWDLPLDELRLNFDFKHIGCKAKDIIRFLQQRLKKAVPYNRMKLMIVGNTGSGKTTLLQQLMKTKKSDLGMQSATVGIDVKDWPIQIRGKRKKDLVLNVWDFAGREEFYSTHPHFMTQRALYLAVYDLSKGQAEVDAMKPWLFNIKARASSSPVILVGTHLDVSDEKQRKACISKITKELLNKRGFPAIRDYHFVNATEESDALAKLRKTIINESLNFKIRDQPVVGQLIPDCYVELEKIILLERKNVPVEFPVVDRKRLLQLVTENQLQLDENELPHAVHFLNESGVLLHFQDPALQLSDLYFVEPRWLCKVMAQILTVKVEGYPKHPKGIISRRDVEKFLSKKRRFPKNYMSQYFKLLEKFQIALPIGEEYLLVPSSLSDHRPVIELPHCENSEIIIRLYEMPYFPMGFWSRLINRLLEISPYMLSGRERALRPNRMYWRQGIYLNWSPEAYCLVGSEVLDYHPESFLKITVPSCRKGCILLGQVVDHIDSLMEEWFPGLLEIDICGEGETLLKKWALYSFNDGEEHQKILLDDLMKKAEEGDLLINPDQPRLTIPISQIAPDLILADLPRNIMLNSDELEFEQAPEFLLGDGSFGSVYRAAYGGEEVAVKIFNKHTSLRLLRQELVVLCHLHHPSLIFLLAAGIRPRMLVMELAPKGSLDRLLQQDKASLTRTLQHRIALHVADGLRYLHSSMIIYRDLKPHNVLLFTLYPNAAIIAKIADYGIAQYCCRMGIKTSEGTPGFRAPEVAKGNVIYNQQADVYSFGLLLYDILTTGDRIVEGLKFPNEFDELAIQGKLPDPVKEYGCAPWPMVEKLIKKCLKENPQERPTSAKVFDILNSAELVCLMRYILLPKNFAVECMVATNPNSKNASIWLGCGHSDKGQLSFLDLNTEAHTSEEVTDSRILCLALVYLPVEKESWIVSGTQSGNLLVINTEDGKRRHTLEKMTDSVTCLYCNSFSKQSKQKNFLLVGTADGNLAIFEDKAVKCKGVAPLKILNIGNVSTPLMCLSESMNSTEKNIMWGGCGTKIFSFSSDFSIQKLIETKTNQLFSYSAFSDSNIIAVVVDTALYIAKKNSPIVEVWDKKTEKLCELIDCVHFLKEEMVKSSKESKHKMSYSGRVKTLCLQKNTALWIGTGGGHILLLDLSTRRIIRIIHNFCDSIRVMITAQLGSLKNVMLVLGYNRKSTEGTQHQKEIQSCLSVWDINLPHEVQNLEQHIEVRKELAEKMRRISVE	293934	448500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320926_321619_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_341428_341574_341712_341853_343856_343986_344062_344234_350645_350905_353778_353968_359355_359475_360574_360645_361144_361363_364869_365121_365392_365542_368098_368193_370881_371069_372248_372431_374721_374952_375388_375517_376837_377057_380923_381126_382195_382285_387024_387213_388117_388273_389342_389490_389633_389826_390691_390839_394914_395016_403317_403509_409796_409958_427674_427846_429233_429335_434551_434747_436253_436448_437190_437264_438466_438652_442585_442739_443737_443947_445955_446028_446852
896018	contig_3081_pilon	-	4259	6	Intergenic	novelGene_133975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	378.860607611823	455	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	508	1167	1216116	1205457	FALSE	25	CTCAAGTATACTTCTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALVEDDICILNHEKAHRRETVTPVSVYSGDESVASHFALVTAYEDIKKRLKDSEKENSLLKKRIRFLEEKLIGAQLDEETSSVGREQVNKAYHAYREVCIDRDNLKSKLDKMNKDSCESLKVLNEQLQSKEVELLQLRTEVETQQVMRNLNPPSANWEVEKLSCDLKIHGLEQELELMKKECSDLKIELQKSKQMTGSVSRRQSEEQGSPKTKHFKV	1227524	1202364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1205526_1210434_1210584_1211662_1211763_1212233_1212360_1215900_1216122_1227022
896019	contig_3956_pilon	+	1939	9	Intergenic	novelGene_14962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1284.27785520696	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	81	728	1281682	1286416	TRUE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTCDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284226_1286153_1286224_1286409_1286606_1287276_1287455_1289758_1289892_1290297
896020	contig_8254_pilon	+	3964	7	Intergenic	novelGene_48391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	319.291272456149	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	195	1049	100810	109211	FALSE	30	AAGAGTGTGTGAGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFHLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	97765	112126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_97847_100696_100897_102341_102433_102501_102546_104501_104664_107499_107756_108996
896021	contig_5279_pilon	-	3807	12	Intergenic	novelGene_105572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	68.9951489491283	813	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1800	2489	353702	353013	FALSE	30	CACTTATAGCACATCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKQEIMSDQRFKRVTKDPRFWEMPEKDKKVKIDKRFRAMFHDKKFKLNYAVDKRGRPINHSTTEDLKRYYDLSDSDSDLSDEDSKALNQKKMKKKKPQTKIGIDSKSLVEEKKKETKKINRMNSESKNELENSERIQKAKTSFKSKKLDSEIRPKKDSKEFAQKGTKEKEDIVQRSTDDFPKGKLKMVSLDITEVKSPKVKCSETRRKIQSGWWERIRDSLVLHYLC	395343	351694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_353746_354964_355456_359417_359459_362127_362192_366352_366398_367732_367841_370228_370269_374030_374235_383265_383322_393731_393816_394393_394476_394802
896022	contig_14744_pilon	-	3651	12	Intergenic	novelGene_66120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_11	73.3745063480374	755	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	78	1757	1601809	1588029	FALSE	5	TTTTCTCCTGTGAGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604762	1586134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
896023	contig_3095_pilon	+	2498	3	Intergenic	novelGene_75187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2880	junction_2	671	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	807	1205	226165	226800	FALSE	30	CCCAGCAGCTCCACAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220491	228093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_226409_226645
896024	contig_6446_pilon	-	2843	1	Intergenic	novelGene_149193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	2183	2650	249549	249082	NA	60	GAACTCAAAGAAATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTVHHEDITIINIYVPNDRAPKYIKQTLTTLTREIDSSTIIVGDFNTPLSIKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLHLIDTYRTLHPTTAKYPFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIEVEINNRKSKEKKINYMETE	251731	248888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_248900_251700
896025	contig_11285_pilon	-	2698	24	Intergenic	novelGene_5675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	483.797427494878	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	124	1929	794634	786706	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVR	795387	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_786516_786712_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794965_795014_795339
896026	contig_13823_pilon	-	4866	13	Intergenic	novelGene_145253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_5	66.7825555232968	547	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	2529	3710	246041	226238	FALSE	45	CAAAAGAAGATGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGALIYLLDMFCNSTHPQVRAQTAELFAKMTADKLIGPKVRITLMKFLPSVFMDAMRDNPEAAVHIFEGTHENPELIWNDSSRDKVSTTVREMMLEHFKNQQDNPDVNWKLPEDFAVVFGEAEGELAVGGVFLRIFIAQPAWVLRKPREFLIALLEKLTELLEKNSPHGETLETLTTAAVCLFSAQPQLADHVPPLGQLPRIIQAMNHRNSAIPKSAIRVIHALSENELCVRAMASSETIGPLMSGMKKRADTVGLACEAINRMFQREQSELVAQALKADLVPYLLKLLEGIGLENLDSPAATKAQIVKALKAMARSLQYGEQVNEILSRSSVWSAFKDQKHDLFISESQTAGYLTGPGVAGYLTAGTSSSVMSNLPPPVDHEAGDLGYRT	253718	225081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_226345_232332_232433_234344_234489_236001_236143_236458_236639_238299_238474_238831_238875_239040_239211_245507_245621_246031_248211_250428_250521_252324_252503_253629
896027	contig_18180_pilon	-	3441	3	Intergenic	novelGene_178685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	969	1487	38483	2206	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEVDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQEEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKVKKGDPTEFTNFLTISLMSHTSKILLKIIQKQL	39451	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18180_pilon_-_1432_1682_2308_38066
896028	contig_5684_pilon	+	1994	2	Intergenic	novelGene_81077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	724	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	653	1042	448572	449461	FALSE	10	ATGTGTTGTGGACTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSFYEPSPEPVFKNEQEAHVCFHFGGSELGSSCWPGPSTAGPAKAVGLADAQARPPLGGVTSWEELRLHMVNFHLGTTHTVPPGELEFRVMWAGSQKAWSWPSSVWRGTDLWSGVTPLFCLPPGWL	447919	450413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_448833_449332
896029	contig_13519_pilon	+	1447	12	Intergenic	novelGene_124636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	385.670951258489	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1371	76	1446	66308	115630	FALSE	35	AAGATGGAGGCAGGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QARCRGISDPRERLERGRPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVF	57090	115631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66290_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513
896030	contig_9113_pilon	-	2161	4	Intergenic	novelGene_68591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	485	junction_3	481.176567269115	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	308	1552	348512	347268	FALSE	35	CAATGACTGGCACAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364113	346658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042
896031	contig_3956_pilon	+	2548	13	Intergenic	novelGene_15007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1185.7963920224	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	81	1847	1281682	1290310	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRPAPPHGAYLPCGDPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287506_1289630_1289677_1289758_1289892_1290297
896032	contig_9668_pilon	-	2348	2	Intergenic	novelGene_58242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	332	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAACCTCAGGAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591778	589006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_591098_591521
896033	contig_7165_pilon	-	5794	30	Intergenic	novelGene_116838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_5	193.914423921982	859	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1665	4998	255	5252	369520	263150	FALSE	25	AAATCCAGATTTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESKTSKNENHEPKKNAWAICEESKAVKVINNQTLKTRNDKPVKEIGTSSPNRNSSKRNKQNDICIEKTEVKSCKGNAASVAGPKDLGLVLRDQSHCKAKKSPNSPVKAEKAPPSHAKVEKIPSLQAKAEKSPKLPNSPVIAEKPPDLQTAAEKVLSLQRKVEKAPSSRTKSEKMPSTPAEAENVPSLLLKENMRQMELQQIGKKIPSSFTSMDKVNIEVVQGEKSALENSLRSQKQQTCTDNVDDSDDSASGIEDIPDDLSKMKNDESNKENSSEMEYLENATVIDESTLTPEQRLGLKQAEERLERDHIFRLEKRSPEYTNCRYLCKLCLIHIENIQAAHKHIKEKRHKKNILEKQEESELRSLPPPSPAHLAALSVAVIELAKEQGITDDELRVRQEIVEEMSKVITICLPECSLRLYGSSLTKFALKSSDVNIDIKFPPKMNHPDLLIQVLGILKKNVLYVDVESDFHAKVPVVVCKDRKSGLLCRVSAGNDMACLTTDLLAALGKREPVFTPLVLAFRYWAKLCHIDSQIDGGIPSYCFALMVMFFLQQRKPPLLPCLLGSWIEGFDPKRMDDFQLKGIVEEKFVKWECNSSSATEKNSIAEENKAKADQPKDDTKKTETDNQSNAMKEKHGKSPLTLETPNQVSLGQLWLELLKFYTLDFALEEYVICVRIKDILTRENKNWPKRRIAIEDPFSVKRNVARSLNSQLVYEYVVERFRAAYRYFACPQRKGGSKSTVDSKKKEKGKINNKKPVKSDSMAASCCILLGESTEKINTERDQPDKCDEMECTSQRCITDKDLLVNELDLAEHGQKSSSLITSEGSQLEPKSIKKQGDLAPSETCLKKGLSQCNCNEYKSPDPGESASTDCRSNLETESSHQIVCTDMSATSCNCKATEDSSDLNDDDKLLAEELHYVFDKFILTSGKPPTIVCSICKKDGHSKNDCPEDFRKIDLKPLPPMTNRFREILDLVCKRCFDELSPPFSEQHNREQILIGLEKFIQKEYDEKARLCLFGSSKNGFGFRDSDLDICMTLEGHENAEKLNCKEIIENLAKILKRHPGLRNILPITTAKVPIVKFEHRRSGLEGDISLYNTLAQHNTRMLATYAAIDPRVQYLGYTMKVFAKRCDIGDASRGSLSSYAYILMVLYFLQQRKPPVIPVLQEIFDGKQIPQRMVDGWNAFFFDKTEELKKRLPSLGKNTETLGELWLGLLRFYTEEFDFKEYVISIRQKKLLTTFEKQWTSKCIAIEDPFDLNHNLGAGVSRKMTNFIMKAFINGRKLFGTPFYPLIGREAEYFFDSRVLTDGELAPNDRCCRVCGKIGHYMKDCPKRRSLLFRLKKKDSEEEKEGNEDDKDSRDLLDPRDLHDTRDYRDPRDLRCFICGDAGHVRRECPEVKLARQRNSSVAAAQLVRNLVNAQQVAGSTQQQGDQPIRTRQSSECSDSPSYSPQPQPFPQNSSQSAAITQPPSQPGSQPKLGPPQQGAQPPHQVQMPMYNFPQSPPAQYSSMHNMGLLPMHPLQIPAPSWPIHGPVMHSAPGTAPSNIGLNDPSIIFAQPAARPVAIPSSSHDGHWPRTVPPNSLVNNGAVGNSEPGFPGLNPPIPWEHAPRPHFPLVPASWPYGLHQNFMHQGSARFQPNKPFYTQDRCAIRRCRERCPHPPRGNVSE	415207	262607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_263218_264752_264912_268774_269223_276517_276619_277628_277850_278806_278923_284950_285034_285127_285176_285668_285847_285977_286056_290630_290745_293425_293516_293804_293909_294000_294059_296639_296744_301857_301945_305702_305854_309811_310510_313695_313871_317440_317654_317820_317941_323804_323932_325237_325308_328631_328684_332778_332868_334397_334576_346283_346401_359141_359306_368733_369612_415044
896034	contig_12540_pilon	-	2804	4	Intergenic	novelGene_148070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGAATTATGTCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355253	324542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_326104_340209_340311_354060_355055_355105
896035	contig_2799_pilon	+	3020	15	Intergenic	novelGene_85503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	765.173809786818	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1614	1407	3020	607928	751441	FALSE	45	AGAAACAAGCGTAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSMSWCPSGVQYSAALSADFTCRSFSLEGLTGGADVRNKPSSSLEANSANTKELRHPFSVEARGDSLVSLSEEDLESGQRERRMFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIM	601894	751441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_602899_603362_603763_607925_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191_699246_702704_702771_704625_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947_749016_751384
896036	contig_12644_pilon	-	3392	1	Intergenic	novelGene_44451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	417	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1405	1770	345289	344924	NA	20	GGTCAAATCCATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQQVGPNLNRKAAGAGDVSSTSQQCMDSIYTGSEDQISRGGNTEYEGPGLSLDRVQYLMAAQRVGPGPKGHQKLRNDQSRRKTRERESTWGGGSGGGEIHFMRVPNAAAEESCNRRW	346693	343301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_343300_346700
896037	contig_6898_pilon	+	2723	12	Intergenic	novelGene_35720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2099.73825602184	33	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	107	1555	59668	126535	FALSE	15	TTACTGTGACTTGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQMPYESLGLCQVSSVGRGTLIILGPWAAASLLGICPPQSSPNLLQLE	59561	127703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124429_126395
896038	contig_401_pilon	+	1655	8	Intergenic	novelGene_42843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1447.96899279012	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	94	891	1712860	1715676	FALSE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGIVYILEY	1712533	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715247_1715663
896040	contig_11422_pilon	+	1849	2	Intergenic	novelGene_98996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGGTTCCCAGCTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_1484_1588
896042	contig_6842_pilon	+	1891	12	Intergenic	novelGene_130681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_10	187.550764477776	5	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1770	120	1889	347570	408226	FALSE	40	TATAAATGAAATGATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQ	346227	408228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043
896043	contig_14970_pilon	-	5617	3	Intergenic	novelGene_45128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	273	junction_2	54.5	124	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	4573	5067	285706	268709	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	290278	268158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611
896044	contig_1450_pilon	+	3054	22	Intergenic	novelGene_27353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	496.04959612327	29	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	179	2857	244426	355748	FALSE	85	AAAAAAGAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243377	355945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
896045	contig_5669_pilon	+	2373	8	Intergenic	novelGene_86100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_2	59.3099778231939	388	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	64	825	363954	384175	FALSE	15	CCTCCTCCCTTGAGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYGEDFSFVNPLVKYLLFFFNMLFWVISMVTVAVGIYARLMKHAETALASLALDPAILLMVVGILIFLLTFCGCIGSLRENICLLQTFSFCLTVVFLLQLAAGILGFVFSDQARGKVSEIINNAIVHYRDDLDLQNLIDFGQKEFSCCGGISYKDWSLNMYFNCSEDNPSRERCSVPYSCCLPTPNQAVINTMCGQGMQALGYSEASKVIYTNGCIDKLVNWIHSNLFLLGGMALGLAIPQLVGILLSQILVNQIKDQIKLQLYNQQHQADPWY	363890	385723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_363966_375963_376022_377014_377143_377415_377491_379437_379534_380447_380577_383686_383849_384073
896046	contig_7992_pilon	+	4474	4	Intergenic	novelGene_115540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	120	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	199	618	598809	599228	TRUE	30	GTTCTGAGGCCAAATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGPRVWESSFTELPAGDRVPGNQHYMPSHPLSFCLLDLCCFIAGCCSSARRKVRGPCRLDSPCPHQRSADREYGKAASRSSQQETEQLVTSSIRFPTPHPSSPLLSLLCFLWPQSLGQEAPTSALCHLDLPHSHWLAP	598610	645778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_601793_642041_643026_643249_643447_645667
896047	contig_9363_pilon	-	2644	19	Intergenic	novelGene_6550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	975.434789095498	10	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	102	2276	786587	754063	TRUE	30	TATATGTGTCAGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGQRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTFSTTSLAEENCLGFLVCVGEDTVGPSRMEVMAALVGKNKEKHNRSSLK	787939	753383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753494_753804_754208_759803_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766005_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786605_787855
896048	contig_19096_pilon	-	2655	3	Intergenic	novelGene_173093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124	533	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGACTTGGTGTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15992	9175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_10771_13922_14884_15893
896049	contig_15114_pilon	+	6796	27	Intergenic	novelGene_121184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	142.151582774189	930	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1005	3018	1563	4580	739702	776925	FALSE	25	CCGCTTTGCTCAAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFRNQTLTDWLLDAPRLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVNASTTNQKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAVAIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFVEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDLPNEEVKELIKQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQIFRGFLEGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTPAWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALIDIDIFEVEAEERQNIYKEVISVQGPPDGTVLVSIKSSLPENNFFDDALIDELLQQFANYGDVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLNLNGKELLGRTITITLKSPDWIRTLEEEMSLEKISVPLPSSTSSTLLGEDAEVTADFDMEGDVDDYSAEIEEILPQHLQPASSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTIAEGPVPPPPVRPSRAPSRTPGPPSSQSSPVDSQPATQLQQKDSSQTLEPKRPPPPRPVAPPTRPAPPQRPPPPSGRSQPSPQAGLPGPAPAGYSAARPTIPPRAGVISAPQSHARASAGRLTPESQSRPSEAPRGPAHLPEPLKPQAVLPGQPSLPPAVQKMQEPLVPVAAPLPQSAPQPSLETPPQPPPRSRSSHNLPSESPSQQQVKINGVSDVRQESPLKSDPFEDLSFNLLVSKAQLCVQTSPALTPNPKGLLQLPSATQSNVDRLSSVSCMPTMPPIPSRSKAQENTRSSPNPVLTSLTSTNPFTDRTAAPGNPFRADSQESEVASWSSKEGPVANSPSPSPQPLGPNKSKPSSSLDGFEDSFDLQSQSLDKSSNPKGWVTFEEEEDFSVKPKSKSACCPGSLSCSHLTFDDDWNKCTNVAFSVLPARRPPPPPLPPSGAAPPGDPFTAVAWKASPTLDFTER	688540	779141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_688689_711862_711950_713497_713766_716869_717096_718946_719031_724371_724434_725471_725569_726677_726848_728042_728125_729509_729663_732186_732349_739678_739871_742162_742248_746016_746158_746433_746627_746856_747016_747979_748137_748763_748882_748981_749198_753189_753269_754482_754646_758703_758914_761504_761649_767000_767072_768214_768324_768556_768775_776139
896050	contig_5566_pilon	-	5200	6	Intergenic	novelGene_153645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	3390	4172	126719	98731	FALSE	40	ACAGGATTCTGGACATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLVLEHQVAKAKGRNDEVKELNRRFQRAVPEDKAKYYNEMMCKDLDLENQKGRTSSAFLKLKELKKKFKPRVGIVKDSMGKKLNDIRNIKRRWKEYAESLYQKELVDIQPFQEIQYNQELIVLKEEVQAALKALVKNKASGIDRIPVEMFQQMDAMLEMLTHLCQEIWTTVTWPIDWKRSIFVSTGKKGDPTDGRTYSTISLISCTSKPLLKIIQKHLQQCINTELREIQAGFRRGHEIGDIIADVKWILTNYG	202281	97702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_99377_126582_127029_127221_127661_153920_154129_155160_155397_200084
896051	contig_15353_pilon	+	2094	2	Intergenic	novelGene_151960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAACCAAACCCATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217024	219163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_217930_217974
896052	contig_11413_pilon	-	4789	1	Intergenic	novelGene_103217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1136	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGGACTTTATCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822792	818003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_818000_822800
896053	contig_15118_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_74578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	20	310	371700	371990	NA	30	AGTTTGACTATCAAGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPCNTMDVPVLLGSVTVSPNRPLLLESRGRSDWASVILSHCTLFCSLYNNAELDIYLLIADVHCLLLVPGNKLEEVRAHICFVHHSVSSTYPRTWPLGGPQ	371680	374175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_371700_374200
896054	scaffold_12124_pilon	+	1787	11	Intergenic	novelGene_22283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	191	568	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473577	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508853_1509171
896055	contig_4924_pilon	+	2825	1	Intergenic	novelGene_84726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119926	122751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_119900_122800
896056	scaffold_12124_pilon	+	1873	9	Intergenic	novelGene_22225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1913.19194998829	5	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1052	1702	1508755	1509405	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473653_1486522_1486562_1489030_1489064_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508118_1508220
896058	contig_9682_pilon	+	3627	10	Intergenic	novelGene_125286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_5	112.972410048201	430	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	10767	27135	FALSE	30	CCTAGCGAGTAGTGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEEQYKLLSDHIEQMAIE	2375	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_27085
896059	contig_13984_pilon	-	2643	7	Intergenic	novelGene_130232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGCGATGGATCGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26516	6270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_-_6348_7979_8279_9099_9184_11083_11193_14290_14459_14789_14868_24688
896060	contig_4742_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_130989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTTTTGAGTCTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203293	201300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_201300_203300
896062	contig_7396_pilon	-	2709	14	Intergenic	novelGene_79556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3209.20259962561	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	798	1463	248983	246442	FALSE	15	TATGGTGCGTGCCCAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257472	245195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
896063	contig_13571_pilon	+	3430	2	Intergenic	novelGene_128098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAAATTGTACTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4267	7943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_5237_5482
896064	contig_1244_pilon	+	4437	1	Intergenic	novelGene_38041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	4092	4430	946690	947028	NA	25	AGTTCTGCAGACCCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPFGPRFGEGQTLLSPSSLLPKLFKCWLNTIKLSHLSRMKWQGTEYKAKVNCPQHIRLKSVTNWDSESDLEASQFHKEFCLLSLVTDMLTSKPTEYLHTKIFHSSYLTRQ	942598	947035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_942600_947000
896065	contig_16125_pilon	-	3824	3	Intergenic	novelGene_155210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTTTTCCTCCAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34014	30082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_32347_32386_33514_33581
896066	contig_2069_pilon	+	2368	13	Intergenic	novelGene_23276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	303.061634270435	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	814	1530	341330	343975	FALSE	15	CTACTGATGTGGTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	332941	344813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_332996_333885_333930_334033_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
896067	contig_13722_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_174627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_-_0_1600
896068	contig_10479_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_147105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	73	474	79028	78627	NA	25	TGGTCTCATATAGATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFIGLTKTGETPDTMAPRHPANSELNPFPKFTFQPKIRQAYEANNHTRKERASSIKYVRPNRQHLPKSKDEKAGRDRKLDGWKRGEPRVERERVLAHCRDCDQCHETVYKCLNEKLICSVHFHLKHNKIFF	79100	77019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_77000_79100
896069	contig_13519_pilon	+	2143	14	Intergenic	novelGene_124625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	388.811099386215	2	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	419	1726	72535	120612	FALSE	40	TCCATTTAAAATGAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57022	121029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67694_72520_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
896070	contig_11855_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_66885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGGAGCCCTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612564	614433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_612600_614400
896071	contig_3956_pilon	+	1629	7	Intergenic	novelGene_15048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1142.60001993504	14	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	617	1105	1289515	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283881_1289018_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
896072	contig_13172_pilon	+	2901	17	Intergenic	novelGene_146318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGGCGGAGGCGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13329	98680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_14190_18770_18997_20713_20841_31868_32003_32448_32604_33381_33479_34198_34241_34336_34437_35845_35919_41247_41349_41643_41865_58631_58797_81093_81214_81308_81468_97931_97990_98301_98394_98509
896073	contig_8310_pilon	+	2054	17	Intergenic	novelGene_75572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	327.982183205125	102	40	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2016	37	2052	279605	325795	FALSE	25	ATTTTCTGAGAAGCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVARPWSPRSAMSSRRSFSRLTWWVPAPGLQFPENLDLLPLTSLVPPRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDC	279568	325797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320610_325602
896074	contig_12923_pilon	+	3541	28	Intergenic	novelGene_30159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	150.48796715315	54	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	845	2538	74	2611	268067	348947	TRUE	40	GAACGCCAAGGATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCSPVRQAGGPVAEAERVCWLAAAMELWRQCGHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREVNLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVICTLSALSWTPIAQNKGIMPFPTEEETVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRTEPVAMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFMKPLQRFLKPEDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKETLATPGAPNLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDCVASTREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQDSMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLADYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKNFVNLHNFQVRDDSSGERDNKKWTHMFLLIEDQGTQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEDTTSCSACQMLLRGTLYQGYRCHRCHAPAHKECLGRVPMCGRHGQDFAGTMKKDKPHRRAQDKKRNDLGLPKMEVCQEYYGLPPPPGAFGPFLRLNSGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVKPYVHGPPQDLSVHLWYAGPMERAGAENILTNRSDGTFLVRQRVKDTAEFAISIKYNVEVKHIKIMTSEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPERRAISKPPAGSIKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRIGWFPSNYVEEDYSEYC	267993	350781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_268271_301862_301980_302349_302409_302511_302581_302813_302923_303004_303101_304581_304651_305707_305812_308539_308640_310234_310331_310486_310556_311497_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893_349533_350436
896075	contig_5845_pilon	+	4005	9	Intergenic	novelGene_98890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	107.837841224683	568	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	164	1240	135600	161337	FALSE	70	GTTACCAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRGLSSWFGLEQPAADGAPSEGDRQPEGNAPPKQRSEVVAESSEDEPQQTGDQELLLDQAKGLGNYLFNFATEATKKITESAAKTAQTIKKSVEEGKIDDLIDKTIIGDFQKEQKKFVQEQHTKKSEAAVPPWVDSNDEETIQQQILALSADKRNFLRDPPAGVQFSFDFDQLYPVALVMLQEDELLSRMRFALVPKLVKEEVFWRNYFYRVSLIKQSAQLTALAAQQQAAGKGGSNGREGDLPLTEAVRPKTPPVVIKSQLKTQEDEEEISTSPGVSEFVSDAFDACNLNQEDLRKEMEQLVLDKKEEETTVLEDDSADWEKELQQELQEYEVVTESEKRDENWDKEIEKMLQEEN	135436	164102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_135796_145353_145473_146405_146473_149064_149139_151638_151779_157490_157637_159049_159109_159564_159713_161209
896076	contig_1996_pilon	+	958	9	Intergenic	novelGene_131899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	205.282084885652	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	225	878	251625	255438	FALSE	10	GTCTGTGCGTCTATCCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGIPATPGLGAPGNKPELYEVSTGQQHALYDNMAELFAVVKTMQALEKAYIKDCVTPNEYTAACSRLLVQYKAAFRQVQGSEISSIDEFCRKFRLDCPLAMERVREDRPITIRDDKGNLNRCVADVVSLFITVMDKLRLEIRAMDEIQPDLRELMETMHRMSHLPPDFEGRQTVSQWLQTLSGMSASDELDDSQVRQMLFDLESAYNAFNRFLHA	249902	255518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_249951_251448_251662_252200_252256_252586_252677_253943_254050_254169_254272_254882_254937_255054_255147_255320
896077	contig_405_pilon	-	2808	1	Intergenic	novelGene_135316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCCTTCACCTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470385	467577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_467600_470400
896078	contig_2798_pilon	-	3615	1	Intergenic	novelGene_120060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACCCCATGACACGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184381	180766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_180800_184400
896079	contig_15991_pilon	-	1636	7	Intergenic	novelGene_70942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	143.948679126355	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	184	1050	136606	123001	FALSE	10	TAGTGTTGTCGCTCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPRRRREQRAGRDAQAGTPDGLALPEHTHQSPDLKRSHGRRLPTVSGPGLSPAPSGAASRMIRKARPALLQPQDVGDRVETLMLHPAIKAFLCGSISGTCSTLLFQPLDLLKTRLQTLQPSAHGSRRVGMFALLLKSIVRCVPGVGIYFGTLYSLKQYFLRGHPPTALESIILGAGSRSVAGVCMSPITVIKTRYESGRYGYQSISTALKTIYRSEGHRGLFSGLTATLLRDAPFSGIYLMFYNQTKNIVPQDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	136789	122414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_123124_124818_124986_127319_127489_128766_128947_130137_130175_130819_130942_136537
896080	contig_2087_pilon	+	2298	4	Intergenic	novelGene_65552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	441.504498529995	2282	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	238	963	39353	70580	FALSE	25	TTTCAAAGTGTTCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSCAIHWSFPGSWFGFWVSCAHIPTAAKAAAGTGSNFAHITLPASAGSTGRSPTLRPGASAPPWARLHSRGIAGAAAAMPWRVCLPVARGSLAAWLLVGLWVWALGGLCGLGAAARGAEGSPLPCQAPQQWEGRQVLYLQSSGRNSRSLISYDGLNQRIRVLDERKALIPCKRFFEYILLYKDRVMFQIEQATKQCSKITLQDPWDPLDIPQNSTFEDQYSIGGPQEQIMVQEWSNRKSARSYETWIGIYTLKDCYPVQETFTKNYSVILSTRFFDIHLGIKDPSVFTPPSTCQTAQPERMRAVCLGGKEYFITNIADN	39115	71915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_39637_69054_69264_69994_70172_70524
896081	contig_854_pilon	+	2374	12	Intergenic	novelGene_36481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3094.88530608991	7	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	179	1123	1649514	1702028	TRUE	35	ATGATAGAATTCCAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIRTWP	1612767	1716005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679312_1702012_1702204_1702545_1702644_1715027
896082	contig_5696_pilon	+	3928	1	Intergenic	novelGene_117566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1644	2201	701184	701741	NA	20	GGTCTTAAAGGCCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKFLNIIKGIYAKPTANIIFNGDRLKTSPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGVQIDNEEVKLYLFADDMILYIENTKDSTRKLLELIEKFSRVAEYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKAIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIHAHG	699540	703468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_699500_703500
896083	contig_10331_pilon	+	3684	2	Intergenic	novelGene_54093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	325	645	113021	113446	FALSE	85	TAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQQQRTYSSTEAAAAVGCLDLPTHRARELSACAQKPSWRSGCLQALTRGTIELWNTCPSRADAGVRPKGQRGHRKQKLKRQGTQEAKLLQPQKVWP	112696	116485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_113097_113201
896085	contig_14467_pilon	-	1425	4	Intergenic	novelGene_138220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.9983164840022	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	28	663	101391	92978	TRUE	25	TAGGAGATTTTAACCTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMIWMRRLCHPCPFSVAPSLQSSVRQRLTEPQHGLGSQRDLTHSDSESSLHMSDRQRMAPKPPQMVRAADEAVSVVTSNGSHRPIEGVHAGSLLEKLPDSPALAKKALLALNHGLNKAHSLMELSPSAPPSGSPPLDSSRSHSPSPLDPDTPSSAGDSRVLQASRNTRIPHLAGKKAVAEEDNGSIGEETDSSPGRKKFPLKIFKKPLKK	101418	91574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_92051_92691_93495_98110_98178_101339
896086	contig_9995_pilon	+	5953	2	Intergenic	novelGene_47678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	669	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	293	457	263701	263865	FALSE	45	GGAAAAGAAGCAGTGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRGPTARPSGFLWPVRLCPSRFALSDHAPLSDPQGGFCPTDLQSDLLPPRKQSKEAWVLPQELDRFPGRSAWAESGWGDCTFGEPSGYAPAAADCMLDKRTQVRTVLCCIFPPEQVDRVMALFPAQSDITRLILLIQRFQRAAAPLGTP	224633	269361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_224698_263472
896087	contig_15236_pilon	+	2842	7	Intergenic	novelGene_141570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	381.577864487272	480	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	170	1450	419232	450343	TRUE	30	ACTAAATCTCTCGACTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	419062	452785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_451233_452282
896088	contig_3252_pilon	-	3585	11	Intergenic	novelGene_61491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_10	216.581716679871	830	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	117	1430	304583	279957	FALSE	50	ATGTACAGAAATGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDPSAADRNVEIWKIKKLIKSLEAARGNGTSMISLIIPPKDQISRVAKMLADEFGTASNIKSRVNRLSVLGAITSVQQRLKLYNKVPPNGLVVYCGTIVTEEGKEKKVNIDFEPFKPINTSLYLCDNKFHTEALTALLSDDSKFGFIVIDGSGALFGTLQGNTREVLHKFTVDLPKKHGRGGQSALRFARLRMEKRHNYVRKVAETAVQLFISGDKVNVAGLVLAGSADFKTELSQSDMFDQRLQSKVLKLVDISYGGENGFNQAIELSTEVLSNVKFIQEKKLIGRYFDEISQDTGKYCFGVEDTLKALEMGAVEILIVYENLDIMRYVLHCQGTEEEKILYLTPEQEKDKSHFTDKETGQEHELIESMPLLEWFANNYKKFGATLEIVTDKSQEGSQFVKGFGGIGGILRYRVDFQGMEYQGGDDEFFDLDDY	304859	277801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_280040_280309_280458_281207_281273_281967_282124_282570_282701_283454_283646_283983_284123_287740_287881_288273_288450_304497_304602_304761
896089	contig_6576_pilon	+	2356	3	Intergenic	novelGene_42396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	122	1468	1301228	1302574	TRUE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295655	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302596_1303414
896090	contig_10711_pilon	+	3312	1	Intergenic	novelGene_118447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2218	2517	830608	830907	NA	30	ATCAGCCGTCTAGACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEQKLVHFLQSTGCTLRTNGSLLCCPHGPGPALGPPDTVAVSRESWSGASRSQLAAPWVHRPSTCVLHARGPHLKSKPKLCLGFLQTCIIDDDYFPC	828390	831702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_828400_831700
896091	contig_11986_pilon	-	3454	16	Intergenic	novelGene_69091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	210.784882443373	15	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	64	2166	73832	27552	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIQSSTSTSTTTTTTASNNPNMVETPPSHQASTQLNRSPLLGSVSSGWGEMPDVHSKAEKSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPAVTFGRAGAPTAAPALCKPASKSMQEGWGSGGDEVNLSTSQWEDEEGDMWNNAASQDSTSSCSSWGNAPKKGLPKGMKTAGKQDEAWILTRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMVTKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSNSALPGQTLGGIASGLGVQNLNSSRQIPSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPQPPPAQPLSSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPSTFTPYPLAGLNPNMNVNSMDITGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSVDNLPSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIRPPAKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSAGPASHTQASLSHELWKVPRNTTAPTNQGWSRC	73895	26263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_27577_31337_31447_38987_39132_39598_39791_41122_41291_42013_42246_42365_42450_44628_44749_46962_47110_48828_48979_50772_50916_51981_52040_53488_53570_57243_57411_58893_59110_73765
896092	contig_17144_pilon	-	1912	6	Intergenic	novelGene_29364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2339.94336683604	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	97	1035	179815	173536	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTNLLCLQVSTQVGAMAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	179911	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166939_173528_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
896093	contig_18544_pilon	-	3054	11	Intergenic	novelGene_152737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	526.70979675719	1069	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	139	1737	64924	38474	FALSE	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQGGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSLITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAGRKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVKYCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGIDLSGLTLQSNAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	65062	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_54988_58048_58239_62799_62830_63285_63461_64684
896094	contig_6208_pilon	-	3230	10	Intergenic	novelGene_53029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_4	406.129912925457	158	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	235	2595	513736	492858	FALSE	30	AATGAGACTGATTCTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETERWWEKLWKIPECIRGWDDQLKHHVPSQPAFQVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	532590	492222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505104_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834_531973_532505
896095	contig_8942_pilon	+	4253	5	Intergenic	novelGene_143191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3395	3757	140294	317420	FALSE	55	GGGAAGAGGAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLRSWRIVSIRDLNSLSGTSSAFSSRGESSGVLFWMPTGTILSCFCKYFDIVCCFRGTQ	39182	317916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_40018_106923_108128_108761_109557_139733_140529_317292
896096	contig_8462_pilon	-	2912	5	Intergenic	novelGene_159425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	901.70976483567	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	191	514	232394	231503	TRUE	10	ACAGTCTCCTTTGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTTTRGAVVDVLRVVDSVEDLVPETTDKVAVPAVLALVAVVRAAAVVVEAVTEAAEDLVEVAMEAFTTVMDMEEIITPKGLTGGVTEPALQQVTLPNKLIWKPHVT	232895	229056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_229644_229691_231644_231853_231994_232351_232501_232811
896097	contig_15491_pilon	-	2388	8	Intergenic	novelGene_75932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	394.850320387617	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	57	728	46982	37061	TRUE	10	TTTGGCCTCCTAATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47038	30741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32211_32250_32436_37054_37200_37440_37560_38887_39040_40256_40317_45107_45207_46879
896098	contig_960_pilon	+	4264	1	Intergenic	novelGene_108304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	648	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	2958	3353	1043247	1043642	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWMIWLAQNYSACGIQYSKVLLRTLSRMHYFISDLQLLQCYSCCHRDYSLENPIGWFYSVTWGHYESRLTRQPPTTTTFFVLLILLLLRIYTAKQPIQQFLHVQLGDIDYTLQVVQPFSPSSSESTTFLP	1040289	1044553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1040300_1044600
896099	contig_14744_pilon	-	1416	7	Intergenic	novelGene_66007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	309.455660080011	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	946	1095	961165	960824	FALSE	25	AATACCATTTATTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKVTSGLPDWGRIFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPKQIARTFFQGTSGWTQTSNLSVTVNPMHHPRTPSLQPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	969816	960502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968521_969686
896100	contig_6842_pilon	+	3394	22	Intergenic	novelGene_130660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	296.322685238319	2	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	1636	2877	392954	415814	FALSE	80	AGGAATAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKYLLERQEREIETFDVESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR	249480	416331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249600_255375_255532_258698_258753_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343785_343875_346231_346346_347568_347665_362308_362397_363416_363499_371855_371973_383773_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043_408257_414417_414601_415652
896101	contig_17144_pilon	-	3034	7	Intergenic	novelGene_29401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2261.82043201194	39	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	328	816	179764	174873	TRUE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFK	183409	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166405_172598_172740_173128_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
896102	contig_5686_pilon	+	2586	2	Intergenic	novelGene_45388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	576	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTTGTATGTGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163665	301488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_165634_300870
896103	contig_4496_pilon	-	3957	2	Intergenic	novelGene_66634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	693	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAGCAGCACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644051	632377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_633493_641209
896104	contig_4315_pilon	-	4038	3	Intergenic	novelGene_46775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_2	22	513	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1633	2082	299259	297453	FALSE	30	TACCTGATTAATTCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQAQSRPCPPTLLLSTPVMAEYGTLLQDLTNNITLEDLEQLKSACKEDIPSEKSEEITTGSAWFSFLESHNKLDKDNLSYIEHIFEISRRPDLLTMVVDYRTRVLKISEEDELDTKLTRIPSAKKYKDIIRQPSEEEIIKLAPPPKKA	300891	295496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_297518_297670_297827_299030
896105	contig_7979_pilon	-	4081	6	Intergenic	novelGene_125526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_1	35.3587330089753	496	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	725	2178	33	2210	426159	382568	FALSE	35	TCTAAATAAAGTCTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVGGILNAAMAQTVQNVTLSLTLPITCHICLGKVRQPVICINNHVFCSICIDLWLKNNSQCPACRVPITPENPCKEIIGGTSESEPMLSHTVRKHLRKTRLELLHKEYEDEIDCLQKEVEELKSKNLSLESQIKTILDPLTLMQGNQNEDRHPVADNPSKIDSETVAEWKKKLRTANEIYEKVKDDVDKLKEANKKLKLENGGLVRENLRLKAEVDNRSPQKFGRFTVAALQSKVEQYERETSRLKKALERSDKYIEELESQVAQLKNSSDEKEAVNSICQRVLCTDGKGNKGSEEDMASKSQGDGARKQPGSSTSGSSHLAKPSSSRLSDTSSARQESTSKTEPNCSNKDLYQKQMEIVLDVTDTSMDTYLESEWGNKTSECVPYKDEDLYDLPAPCTPLSLSCLQLSTPENRESSVVKAGGSKKHSNHLRKLVFDEFCDSPNVCNKDSSEDAISQSENEKKSDCFVSPKTGFWDCCSTSYAQSLGFESSEENTIANSVGEISSKSSERSSLCLSKRLSSIRSFEMNRTRTSSEASMDAAYLDKISELDSMMSESDNSKSPCNNGFKSVDLDGLSKSSQSTEFLDEPDKLEERTKPNLSKGSLTTDQLENGNEWKSTSFFLLPPSDQEMNEDFSLHPSSNPGTNEIKPPSCLFQTEFSQGVLLSSSRRLFEDQRFGSSLFKMSSEMHGLHNHLQSPWSTSFVPEKRNKNVNHSTKRKIQSSLSNASPSKATKS	426191	380696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_384108_404842_404932_408570_408820_410583_410676_412727_412864_426087
896106	contig_5574_pilon	-	10896	4	Intergenic	novelGene_155839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1273	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	7441	7824	110777	110394	FALSE	55	AATTGATAAAAGAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVCGQTIPPRLPTHLCWEPVVQQHPLFHPPTHAGAHRPVTPAPKPSHPSCVLQTGGICFSTWLPAPGAQGLAARHFCPANCTSGPRTCSSHSYAQPSAPGAHRPPVHVASPSQWHWKPMNRRPGA	133993	107321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_111245_111740_111997_112132_118708_133851
896107	contig_7644_pilon	+	5067	4	Intergenic	novelGene_64255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	41.7718671941881	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	168	545	177957	182983	FALSE	30	ATACGTCATAAGTCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLERMNLLRGLLLLSTSSSDATTLTSWILGCSFCTSKSIQCIKAVDNQVYVATASLARDDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLARAGPEETIVYSDIDLKKLAEIRQQIPIFSQKRSDLYAVEAKKL	177789	187505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_178088_179596_179696_182476_182533_182891
896108	contig_13172_pilon	-	2421	20	Intergenic	novelGene_146316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_5	327.116733507658	892	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	158	1714	98549	21411	TRUE	40	GTAAGGGAAATTGCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTYQNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVWKGSALAALHCGRPPESPINYGSPPSIVDTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMIAAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLWDAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISELEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMTTRPAGQNLQGIEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFDPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMVAGRNPFVLD	98706	13182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_13367_14047_14186_18768_18995_20711_20841_21380_21444_31868_32004_32449_32604_33381_33481_34200_34242_34337_34439_35847_35919_41247_41349_41643_41866_58632_58794_81115_81215_81309_81461_97928_97989_98179_98210_98334_98394_98509
896109	contig_1719_pilon	+	2164	17	Intergenic	novelGene_87325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	156.611768694916	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	99	1871	492762	726560	FALSE	25	GAACTGAATTTTGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELENIVANTVLLKAREGGGGKRKGKSKKWKEILKFPHISQCEDLRRTIDRDYCSLCDKQPIGRLLFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMLLTKDAKQRLGCQEEGAVEVKRHPFFRNMNFKRLEAGMLDPPFVPDPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	492406	726853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_492492_492748_492814_608501_608598_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_718062_718201_723078_723217_724669_724802_726461
896110	contig_11100_pilon	+	5850	4	Intergenic	novelGene_175533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1176	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGAGCCGCCCGCTTCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188021	200691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_+_193649_197201_197286_197385_197496_200662
896111	contig_6361_pilon	-	2505	10	Intergenic	novelGene_23860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	374.536783866599	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	375	1778	81698	55091	FALSE	35	CTGAGGTTTAAGTTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	82395	54363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_73569_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_82075
896112	contig_1276_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_159771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1411	1866	186534	186079	NA	50	GGATGCAAAATAACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEAKTIINIYVPNDRAPKYTKQTITALKRETDSSTIIVGDFNTLLSVKDRTSRKKLNKDIEDLKATIRQLEFIYRILHQTAAKYRFFCKVHGMFSRTDHILGHKVTLNKIQNNEIIQSNFSDHKAIKVEINNRKSKGKNQLHGN	187944	185679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_185700_187900
896113	contig_9471_pilon	+	4784	2	Intergenic	novelGene_21740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	765	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1500	1904	229401	229805	TRUE	55	AAAAAAAAACTCTGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTVSKHLQKQDRMVPVGVQNKTPVDIPVKEKALDLTDREFKSLIFRIIQEFKQKADKNEEKIDKFMEKADRFMENTAKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKIKQQDFRNGQCHRRAEKQV	227901	430435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_230141_427890
896114	contig_20614_pilon	+	3662	3	Intergenic	novelGene_107565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1069	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTGTTAAAGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232235	236073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_232496_232621_235534_235583
896115	contig_12622_pilon	+	4780	6	Intergenic	novelGene_5892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_5	30.7089563482708	617	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	1839	3011	1533411	1540666	FALSE	5	GCTGTGCTCATCTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPRDSRDMRDHRDSRDMREHRDSRSMRDARDMRDFRDFRDLRDSRDFRDHRDPVYDRYRDMRDSRDPMYRREGSYDRYLRVDDYCRRKSDSYFDRYRDSYDGRGPPGPESQSRTKERLKREERRREELYRQYFDEIQRRFDAERPVDCSVIVVNKQTKDYAESVGRKVRDLGMVVDLIFLNTEVSLSQALEDVSRGGSPFAIVITQQHQIHRSCTVNIMFGTPQEHRNMPQADAMVLVARNYERYKNECREKEHEEIARQAAKMADEAIIQERERGGPEEGVRGGHPPAIQSLINLLADNRYLTAEETDKIINYLRERKERLMRSSTDSLPGTISRQPLGGDLGCLTEDTAKLPTPPERPSSPLCSTHSSCNLHLPARASGQNPQPLQ	1531572	1542435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1533626_1534525_1534663_1535648_1535776_1538256_1538457_1539715_1540037_1540493
896116	contig_15866_pilon	+	5968	28	Intergenic	novelGene_63575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_23	223.610098149688	801	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1111	3336	12	3347	152413	425900	FALSE	20	ACACCTGAGCTCAGGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDQISVSEFIAETTEDYNSPTTSSFTTRLHNCRNTVTLLEEALDQDRTALQKVKKSVKAIYNSGQDHVQNEENYAQVLDKFGSNFLSRDNPDLGTAFVKFSTLTKELSTLLKNLLQGLSHNVIFTLDSLLKGDLKGVKGDLKKPFDKAWKDYETKFTKIEKEKREHAKQHGMIRTEITGAEIAEEMEKERRLFQLQMCEYLIKVNEIKTKKGVDLLQNLIKYYHAQCNFFQDGLKTADKLKQYIEKLAADLYNIKQTQDEEKKQLTALRDLIKSSLQLDQKEDSQSRQGGYSMHQLQGNKEYGSEKKGYLLKKSDGLRKVWQRRKCAVKNGILTISHATSNRQPAKLNLLTCQVKPNAEDKKSFDLISHNRTYHFQAEDEQDYVAWISVLTNSKEEALTMAFRGEQSTGENSLEDLTKAIIEDVQRLPGNDVCCDCGSSEPTWLSTNLGILTCIECSGIHREMGVHISRIQSLELDKLGTSELLLAKNVGNNSFNDIMEANLPSPSPKPTPSSDMTARKEYITAKYVDHRFSRKTCSSSSAKLNELLEAIKSRDLLALIQVYAEGVELMEPLLEPGQEIGETALHLAVRTADQTSLHLVDFLVQNCGNLDKQTALGNTVLHYCSMYGKPECLKLLLRSKPTVDIVNQAGETALDIAKRLKATQCEDLLSQAKSGKFNPHVHVEYEWNLRQEEMDESDDDLDDKPSPVKKERSPRPQSFCHSSSISPQDKLALPGLSTPRDRQRLSYSAFTNQIFASTSTDSPTSPTGEAPPLPPRNAGKGPTGPPSTLPLSSQTSSGSSTLSKKRPPPPPPGHKRTLSDPPSPLPHGPPNKGAVPWGNDVGPSSSSKTANKFEGLSQQSSTSSAKTALGPRVLPKLPQKVALRKTETSHHLSLDKANVPPEIFQKSSQLAELPQKPPPGDLPPKPTELAPKPQIADLPPKPGELPPKPQLGDLPPKPQLSDLPPKPQMKDLPPKPQLGDLLAKSQVGEVSPKAQQPLDIPQKSHPVDLSPNVQSRDALQKQASEDSNDLTPTLPETPVPLPRKINTGKNKVRRVKTIYDCQADNDDELTFIEGEVIIVTGEEDQEWWIGHIEGQPERKGGLPRVLRAHPV	152401	428521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_152539_279819_279893_298027_298174_320836_320912_321399_321450_325885_326016_327161_327248_336076_336153_337477_337565_345219_345321_351323_351394_368539_368628_371353_371403_374371_374536_376730_376865_378940_379033_381903_382091_382345_382432_386497_386614_386775_386844_388059_388168_389788_390018_402958_403130_411432_411503_414425_414485_421988_422489_424577_424701_425828
896117	contig_8377_pilon	-	1382	2	Intergenic	novelGene_35042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTGCCAAACCTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83361	81923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_82645_82700
896118	contig_2799_pilon	-	2058	6	Intergenic	novelGene_85580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAACAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780436	770799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_771926_772372_772444_772914_772960_776041_776089_777674_778125_780117
896119	contig_11422_pilon	-	441	1	Intergenic	novelGene_98957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_400
896120	SIRV5	+	2473	6	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8338	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11311_11738_11774_13009_13100
896121	contig_6557_pilon	-	2307	10	Intergenic	novelGene_32947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	320.046177223781	207	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	67	1053	364319	345121	FALSE	15	GGGTTGAGAGTGCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEDIPDFSSLKEETAYWKELSLKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKYEVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIVSLEDFEQRLNQAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRKSAPSSPTLDCEKMDSAVQASLSLPATPVGKGTENSFPSPKAIPNGFGTSPLTPSARISALNIVGDLLRKVGALESKLAACRNFAKDQASRKSYISGNVNCGVMNSNGTKFSRSGHTSFFDKGQEKVIFPTLFMGQ	395111	343866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_345129_348571_348607_352014_352167_356204_356297_356839_357014_359399_359537_361480_361630_362507_362662_364233_364332_395057
896122	contig_7322_pilon	+	2170	2	Intergenic	novelGene_164918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAGAATAAAATGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237540	239781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_238119_238189
896123	contig_13412_pilon	+	5812	22	Intergenic	novelGene_80024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	206.706579424372	719	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1074	3225	458	3682	726266	739587	FALSE	25	TTATATTTATACTTACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTRGTLLALERKDHSGQIFSVVSNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEDALLATGQWKGITLFVQEDRAQLYIDCEKVENAELEVPIQSIFTRDLASIARLRVAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTNVLLTLDNNVVNGSSPAIRTSYIGHKTKDLQAICGISCDDLSNMVLELRGLRTIVTTLQDSIRKVTEENKELANELRRSPLCYHNGVQYKNNEEWTVDSCTECRCQNSVTICKKVSCPIVPCSNATLPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSVTCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGDARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCIGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGANCTSYPDGSWKCGACPVGYSGNGIQCKDVDECKEVPDACFNHNGEHRCKNTDPGYNCLPCPPRFTGTQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHNCNKNAKCNYLSHYSDPMYRCECRPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNEDLVCVANATYHCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDMDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQLDSDSDRVGDTCDSNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDNDGVPDDRDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDQDNVPDIDDICPENVDISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAIGFDEFNAVDFSGTFFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDS	724954	741717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_725095_725671_725767_726043_726605_727440_727517_727780_727981_728092_728216_729203_729298_730774_730949_731461_731639_731930_732105_732371_732500_732612_732766_733396_733616_734079_734188_734774_734935_735096_735216_736837_737073_737246_737475_737657_737930_738360_738459_738561_738702_739579
896124	contig_6847_pilon	+	2786	4	Intergenic	novelGene_143864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	98.0521403245346	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTCAAGTAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74259	114708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74316_77516_77674_111866_113451_113719
896125	contig_11269_pilon	+	2883	10	Intergenic	novelGene_145820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_9	247.323050599868	45	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	204	1592	325432	341393	FALSE	25	AGTATGTTTGTTCTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRSSSRTSVSRHRDTENTRSSRSKTGSLQLICKSEPNTDQLDYDVAEEHHSPGGISSEEEEEEEEEMLISEEEIPFKDDPRDETYKPHLERETPKPRRRSGKMKEEKEKKEIKVEVEVEVKEEENEIREDEEPPRKRGRRRKDDKSPRLPKRRKKPPIQYVRCEMEGCGTVLAHPRYLQHHIKYQHLLKKKYVCPHPSCGRLFRLQKQLLRHAKHHTDQRDYICEYCARAFKSSHNLAVHRMIHTGEKPLQCEICGFTCRQKASLNWHMKKHDADSFYQFSCNICGKKFEKKDSVVAHKAKSHPEVLIAEALAANAGALITSTDILGTNPETLTQPADGQGLPLLPEPLGNSASGECLLLEAEGMSKSYCSGTERVSHQGLNKNINLDSVDGVPMASTDQWSELTEAERLQENLQAYRTFHVMLTKLLEDQRVHFTPTEGDFHQAIQTLLLQVAAFAYQLEELMMLLEHKIPPNEADRMPAVVGDGGLFEKKLWGLKVLQELSHWTVRSIHDLRVISSHRTEVPAHGS	323957	342684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_324093_324357_324395_325400_325506_326056_326192_327158_327210_327817_327897_328845_328961_333522_333623_333981_334355_340931
896126	contig_18491_pilon	-	4932	1	Intergenic	novelGene_176621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	258	581	24087	23764	NA	30	GAGTAGAAGTGCCCCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYEKVVSRSFQQETEQLVTSDICSPTPHTYSPPLSLLCFLRPQVSWPGSTDFTLVSLGFHAPTLAGSLSAICWQLVLLFPTSLDFFLTSHHLSLKYLAPCAIFASS	24344	19412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_-_19400_24300
896127	contig_11422_pilon	-	1432	2	Intergenic	novelGene_99075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1758_1948
896128	contig_1090_pilon	+	6092	14	Intergenic	novelGene_131138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	196.017841236047	603	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	475	3381	481924	513914	FALSE	40	ATTTTCTAATTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGKELTISPAYLLWDLSAISQSKQDEDVSASRFEDNEELRYSLRSIERHAPWVRNIFIVTNGQIPSWLNLDNPRVTIVTHQDVFQNLSHLPTFSSPAIESHIHRIEGLSQKFIYLNDDVMFGKDVWPDDFYSHSKGQKVYLTWPVPNCAEGCPGSWIKDGYCDKACNNSACDWDGGDCSGNSGGSRYVAGGGGTGSVGVGQPWQFGGGISSISYCNQGCANSWLADKFCDQACNVLSCGFDAGDCGQDHFHELYKVTLLPNQTHYILPKGECLPYFSFAEIAKRGLEGAYSDNPVIRHASIANKWKTIHLIMNSGMNATTIHFNLTFQSKNNDEFKIQITVEVDTREEPKLNSTTQKSYEHLVSPVTILPEAEILFEDVPLEKRFPKFKRRGNTTERLQEEVKIPLINISLLPKEAQLSLNNLDLQLEHGDITLKGYNLSKSALLRSFLMNSQDAKAKISEAVIIDERNDSLHVPLEKQVHKNVLANGLASERLQRSTFPAVTIKMKDHPQGQNPPQNLKSKAGFRSETQIQKIGGRGASNEKLSSLIVPLENHMTKEKKITGKEEEKNRVEGNVKNNIDVNEVLPGRKLQHYTEDYLGFLPWEKKKYFQDLLDEEESLKTQLAYFTDSKHTGRQLKDTFADSLRYVNKILNSKFGFTSRKVPAHMPHMIDRIVMQELQDMFPEEFDKTSFHKVRHSEDMQFAFSYFYYLMSAVQPLNISQIFDEVDTDQSGVLSDREIRTLATRIHDLPLSLQDLTGLEHMLINCSKMLPANITQLNSIPPTQEAYYDPNLPPVTKSLVTNCKPVTNKIHKAYKDKNKYRFEIMGEEEIAFKMIRTNVSHVVGQLDDIRKNPRKFVCLNDNIDHNHKDAQTVKAVLRDFYESMFPIPSQFELPREYRNRFLHMHELQEWRAYRDKLKFWTHCVLATLIMFTVFSFFAEQLIALKRKIFPRRRILKEASPDRIRV	481449	516625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_481996_482800_482981_483214_483386_485106_485231_486361_486566_487775_488876_491870_492071_492665_492886_493593_493708_497087_497174_497429_497529_500227_500396_503619_503711_513836
896129	scaffold_12124_pilon	+	3134	10	Intergenic	novelGene_22242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	18969	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1162	1941	1508626	1509405	FALSE	35	ATATGTGTTGAAATCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1510598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
896130	contig_960_pilon	+	12110	1	Intergenic	novelGene_108328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1353	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	6845	7147	1073163	1073465	NA	15	CTCTGCCTCTTATAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSPLTLRRVTVQFQRNNVCEVPSPRQQKQAKKGRSAYPPLPESKPVTDSFPSQNKSTRRGRWNKAAEIQKTFETSYVLAHVDSIILLVICHFRKNKNE	1066318	1078428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1066300_1078400
896131	contig_14353_pilon	-	3887	9	Intergenic	novelGene_82142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	148.236930283921	587	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2370	2909	405634	402843	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420569	401864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_407028_407877_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415447_420261
896132	contig_4812_pilon	-	2459	5	Intergenic	novelGene_103714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	782.006553680978	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	1060	2457	944244	935683	FALSE	55	TGATAAAGAAAGAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQKKKSVEKKRKRSRGDSDISDEEAVQQSKKKKGPRTPPITTKEELVEISRAKDGTVEDPQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEAAEPEHTANAATPTSTPPLSSILPPPPPVATATAAFATANTVAAITFTTSATTISATFTNEESHRKCHRARVEKVEAPHVTIEDAPHRKPVDQKRSSSLGSNRSNRSHTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSSSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRDRERERRDTRQREWDRDADKDWTRNRDRDRLRERERERDKRRELDRERERLIPDCTERDRDRDRTFENSFQIESVKRSETKLESEHERDLEGAPRDSTA	952245	935680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_936111_943274_944451_944834_944939_946403_946960_952052
896133	contig_13224_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_104131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAAAAAATGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393407	395525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393400_395500
896134	contig_2768_pilon	-	2575	14	Intergenic	novelGene_57508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1225	1557	790883	788318	TRUE	30	ATGTCAAGTAAATGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFLKSRGDLNPCWKACSRAETSPHSPQSSSVRLPRSFSGLWKCFTMPLTASPMDSWICPVFSSIVGMSCDLIPDHHILHQPFSIQSSVIMANLDSSELPQVLALKGHL	793590	770322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_770407_771088_771193_775795_775920_778478_778631_779794_779881_781763_781857_782341_782465_786885_787010_788189_788334_788884_789005_790134_790220_790771_790897_791503_791677_792552
896135	contig_6445_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_77055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660848	658612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_658600_660800
896136	contig_6677_pilon	+	1200	2	Intergenic	novelGene_114172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCCCCGCCCCCGGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426631	438650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_427709_438527
896137	contig_8065_pilon	+	3284	16	Intergenic	novelGene_107323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	185.298845712061	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	965	2895	389	3283	125393	241213	FALSE	55	AGAAACTGGCAAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRRKKVKELIEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEVEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSSVSSSPRQTVDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKIKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPKKKKLKLSADKSKELNKLA	125004	241214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139223_193462_193576_194049_194201_195650_195766_196153_196510_215370_215510_226319_226500_227129_227286_230281_230834_231201_231349_237535_237696_238861_239083_241012
896138	contig_7079_pilon	+	1115	10	Intergenic	novelGene_129244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	572.156932629113	13	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	501	791	347683	348688	TRUE	15	TCTGAGTTTGCTTATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPANEERRGGLPPLPPHPGGDLGGPPAGPLALGLVTVDIQNPDITSSRYRGLPAPGPGPADKKRSGKKKISKADIGAPCGFKHVSHVGWDPQNGFDVNNLDPDLRSLFSRAGISEAQLTDAETSKLIYDFIEDQGGLEAVRQEMRRQEPLPPPPPPSRGGNQPPRPPTMGGNKGRSGPLPPVPLGGTPPPANTTLLDQIRQGIQLNKTPGGPRELNAAATTTELRGAGGGPDARDAEEK	344958	349826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_345004_345095_345138_345231_345286_346268_346444_347296_347340_347541_347696_347909_348048_348276_348318_348589_348706_349519
896139	contig_1639_pilon	+	5134	25	Intergenic	novelGene_74892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_24	222.443996541202	716	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	147	1748	283593	314011	TRUE	35	ACTCACAGCAACCCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRHES	280070	333398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_313997_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_331456
896140	contig_12021_pilon	+	4358	13	Intergenic	novelGene_172189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	371.091436396297	35	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	387	986	39446	49860	TRUE	35	AAACATGTTTTGCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPSAQQDAVFELISMGFNVALWYTKYASRLAGKENITEDEAKEVHRSLKIGAGIFKHLKENHIPKLITPAEKGRDLETRLIDAYIIQCQAEAQEENIPQD	37623	59032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_37994_39429_39547_42150_42258_42601_42699_45782_45879_47758_47832_48829_48936_49840_49906_52417_52504_53477_53530_53876_54028_54991_55152_56154
896141	scaffold_2602_pilon	-	4688	5	Intergenic	novelGene_127702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	909	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTCCTTTCTAGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69580	54533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_57995_58090_58132_58240_58304_65343_65480_68593
896142	contig_9306_pilon	-	2439	13	Intergenic	novelGene_171475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	167.685138147528	2	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	231	1655	72772	63595	FALSE	30	AAGGATGGCGACACTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILTNGEATTQPPNSESKKKKKKKKRKKAETRVEKPGDEDDSEVPGLPLGLTGAFEDTSFTSLTNLVNENTLKAIKEMGFRNMTEIQHKSIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLKFMPRNGTGALILSPTRELAMQTFGVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLANGINIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLIPVRRQTMLFSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGVDDDKANATVDGLEQGYVVCASEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFSSCKSVKYHYELLNYIDLHVLAIHGRQKQNKRTTTFFQFCNADSGILLCTDVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLKQSKVPLSEFEFSWSKISDIQSQLEQLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLDLPQVALSFGFKVPPFVDLNVNSSEGKCKKRGGGGGFGYQKARKVEKSKIFKNISKKSPGSRQFSH	75930	62810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9306_pilon_-_63738_64915_65094_65466_65524_67454_67569_68298_68452_68722_68885_69401_69542_71704_71820_71911_72112_72229_72331_72710_72847_73517_73593_75849
896143	contig_9385_pilon	+	573	2	Intergenic	novelGene_178686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCGCAGCATCGCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1983	30199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9385_pilon_+_2072_29714
896145	contig_10500_pilon	-	3989	7	Intergenic	novelGene_41263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	805.477291217243	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	866	1459	1635596	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1637785	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627248_1627331_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940
896146	contig_1986_pilon	-	5564	2	Intergenic	novelGene_64146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	740	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCAGTTGATTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389167	382897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_383364_384069
896147	SIRV6	+	1007	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1383	80	-2	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896148	contig_165_pilon	+	2316	14	Intergenic	novelGene_117056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_5	319.451341777294	121	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	706	1551	60284	71673	FALSE	10	CTACCTTGTGGAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVFFSEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	44736	72438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_44878_45111_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60140_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
896149	contig_5794_pilon	-	8132	1	Intergenic	novelGene_69729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1091	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTCATTGTTACAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383873	375741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_375700_383900
896150	contig_8568_pilon	+	4335	1	Intergenic	novelGene_156939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1262	1585	84905	85228	NA	30	AGTTTTGCAGGATATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCHSENYLPNIILSLPLLPLARSWHTIFPFPPSTKHCTPTLLLSTGHTTFPWLESHRPALAWVPPTPTCQLLPCLFFFLLSSFSVFLPPSQVEQLYTLPPGHAVPP	83643	87978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_83600_88000
896151	contig_5999_pilon	-	3030	2	Intergenic	novelGene_45657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGGGCAGAAGCTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277164	273213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_274551_275471
896152	contig_8357_pilon	-	3559	8	Intergenic	novelGene_39743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_1	139.156056868773	600	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	2130	2909	784677	762891	FALSE	25	AAACTTTATCTTGATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHFRKQITKQVVHLNLAEDCMSKFKANIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQVRPPRKDRSAEETFQLSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVIIGSTHILTPKKLLDDIKLLNKSKDKISFIKDE	786806	762240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763768_763918_773765_773852_778744_778838_779502_779610_779899_780039_783786_783868_784647
896153	contig_15135_pilon	-	6394	50	Intergenic	novelGene_119852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	434.210663685431	708	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1933	5802	40	5841	122783	25230	TRUE	10	TACTTTGCATTTGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGTLQGRRSTELTDLGLDSLDNSIACECAPEETESSESSLHPDFAKYLAETEETVKMTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNKQFCSKLGKYHMPFAWAVRSVFKDNQGNVDKDSRFSPLYRQEASKISTEDLLKLVSDYRRADRVSKTQTIPGSLDIAVDNVPSEHPNCVTSSFIPVKPFNVTAQPEPTVEVEEFVYDSSKYCRPYRVYKNQIYIYPRHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDEEGAKPMKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHVLFSFYHVTCDINAKANSKKKEAPETSVGYAWLPLKRHDQIASQEYNIPVATSLPPNYLSFQDSASGKHNTSDIKWVDGGKPLFKVSTFVVSTVNSQDPHVNEFFKQCQEREKDTSQSPTSNFILSCKNLLNVEKIHAIMSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEISTPVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRTYKERTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGFVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQELCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESIQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDIRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYKEPEKHSQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFAVNTSNQGSRDDLSTNGGFQTQTTVKHNSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRVSLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISEETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHTTTSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTILDLLSLFTQVHQRQLQQSDCQNSMMKRVFDTYMLFFQVNQSAAALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNTNRFVFETPFTLSGKKHGGVEEQCKRRTVLTTSHFFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQLEYQEELRSHYKDMLSELSAVMNEQITYRDDPSKRAVERTCPRVISKATPTLPAVSVSSSAEVLSPQHLTHL	122822	24632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_25099_25142_25374_28489_28629_28803_28905_31519_31711_34145_34357_36726_36874_44525_44640_44777_44901_46298_46406_49385_49485_49803_49862_51681_51898_53360_53472_54019_54203_55059_55198_57048_57162_58967_59093_62133_62236_62839_62888_63101_63169_63261_63377_63466_63589_64779_64889_65955_66073_66198_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92251_94677_94797_95329_95423_95825_95913_96510_96633_96824_96949_98619_98713_100999_101066_101588_101777_103604_103685_105120_105244_110796_110880_113400_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
896154	contig_14326_pilon	-	3768	1	Intergenic	novelGene_120680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTAGCAGACAGAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120403	116635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_116600_120400
896155	contig_16836_pilon	+	383	2	Intergenic	novelGene_177791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACCAGGTAGGAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249	1857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_+_1515_1739
896157	contig_10148_pilon	+	4233	4	Intergenic	novelGene_172855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	89.9271309944273	495	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	444	1352	236960	336187	FALSE	75	AAAAAAAAATAATGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLASYSIFQELQLVHDTGYFSALPSLEETWQQTCLELERYLQTEPRRISETFGEDLDCFLHASPPPCIEESFRRLDPLLLPVEATICEKSSTVDILLSRDKLLSETCLSLQPTSSSLDSYTAVNQAQLNAVTSLTPPSSPELSRHLVKTSQTLSAVDGTVTLKLVAKKAALSSVKVGGVATAAAAVEAAGTVKSGQSDSEQGGAGAEACPENKKRVHRCQFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYKCSWEGCEWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFKCNHCDRCFSRSDHLALHMKRHI	236516	339068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_+_237062_285268_285900_327161_327286_336135
896158	contig_4486_pilon	+	1936	9	Intergenic	novelGene_38599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	955.964230175481	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	94	651	343083	407603	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETHKWKKKEGSM	342989	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390013_407570_407696_411177_411318_412424
896159	contig_20550_pilon	+	1697	15	Intergenic	novelGene_142612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	316.410608970982	1	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	65	994	3777	20013	TRUE	15	TCCTGTGTCGGTAAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKP	3712	38574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15553_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19759_19858_20009_20111_20470_20550_37687_37774_38133
896160	contig_2067_pilon	-	2050	5	Intergenic	novelGene_158921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCGTGTCTGAGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606115	590024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_590221_590967_591055_593362_593452_594297_594486_604625
896161	contig_4678_pilon	+	4805	11	Intergenic	novelGene_126037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_10	103.106546833846	977	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	31	1251	484886	495614	FALSE	15	GTCAGGGTGTCTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRLTHEYLSMAPFVDYLDSIYFNRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKKLEKKRIKKRKGEAMALNEKQILEKVNSRFVVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQQRKKKIKREEVERLVKEVPEEYSDRFSLQACSLCSQLLCKDPAERLGCRGGGAQEVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGMVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFSRQR	484855	499168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_484957_485062_485127_485276_485418_485671_485863_486714_486753_486834_486925_488121_488331_488422_488561_495093_495232_495312_495448_495608
896162	contig_11304_pilon	+	7061	36	Intergenic	novelGene_156682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	130.228809628065	685	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1792	5379	742	6120	447600	557848	FALSE	35	CACATTGAATTCCAAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILDSPSKTMSIKERLALLKKSGEEDWRNRLNKKQEYGKASAASSLHIQEPEQSFKKKRVTESRGSQMTIEERKHLITVREEAWKTKGKGAANDSTQFTVAGRMVKKGLASPTAITPVASPVCSKIRGTTPVSKPLEDIEARPDMPLESDLKLDRLETFLRRLNSKVGGMQETILTVTGQSVKEVMKLDDDETFARFYRSVDHATPRSPAELYQDFDVIFDPYTPKLTSSVAEHKRAVRPKRRVQASKNPLKMLAAREDLLQEYTEQRLNVAFMESKRMKVEKMSSNNNFSEVTLAGLASKENFSNVSLRSVNLTEQNSNNSAVPYKKLMLLQIKGRRHVQTRLVEPRASSLNSGDCFLLLSPHYCFLWVGEFANVIEKAKASELATLIQTKRELGCRATYIQTIEEGINTHTHAAKDFWKLLGGQTTYQSAGDPKEDELYETAIIETNCIYRLMEDKLVPDDDYWGKIPKCSLLQSKEVLVFDFGSEVYVWHGKEVTLAQRKIAFQLAKHLWNGTFDYENCDINPLDPGECNQLIPRKGQGRPDWAIFGRLTEHNETILFKEKFLDWTELKRGNEKNAGELSQQKEDPRAEVKSYDVTQMVSVPQTATGSVLDGVNVGRGYGLVEGDDRRQFEITSVSVDVWHILEFDYSRLPKQSIGQFHEGDAYVVKWKYMVSTAVGSRQKGEHPMRVAGKEKCVYFFWQGRHSTVSEKGTSALMTVELDEERGAQIQVLQGKEPPCFLQCFQGGMVVHSGRREEEEENVQSEWRLYCVRGEVPIEGNLLEVACHCSSLRSRTSMVVLNVNKALIYLWHGCKAQAHTKEVGRTAANKIKEQCPLEAGLHSSSKVTIHECEEGSEPLGFWDALGRRDRKAYDCMLQDPGNFNFTPRLFILSSSSGDFSAIEFVYPARDPSVVNSVPFLQEDLYSAPQPALFLVDNHHEVYLWQGWWPIENKITGSARIRWASDRKSAMETVLQYCKGKNIKKPPPKSYLIHAGLEPLTFTNMFPSWEHREDIAEITEMDTEVSNQITLVEDVLAKLCKTIYPLADLLARPLPEGVDPLKLEIYLTDEDFEFALDMTRDEYNALPSWKQVNLKKTKGLF	273626	558789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_273950_319887_319991_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491075_491299_503744_503875_514860_515009_519686_519777_519861_519949_522679_522858_523741_523915_525377_525534_527193_527331_527936_528085_528205_528352_530572_530749_534814_534960_535341_535619_542482_542635_545723_545830_546510_546719_548540_548675_550261_550418_552728_552873_554650_554776_557511_557668_557761
896163	contig_18916_pilon	-	2812	4	Intergenic	novelGene_136871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	405.273844318738	5	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGTGAACTCTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18278	8492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_-_9305_13045_13299_14082_14734_17182
896164	contig_7151_pilon	-	3669	11	Intergenic	novelGene_40636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_10	135.984594715725	50	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	605	1327	18419	13305	TRUE	20	TGTTTTTCTCTTAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	65221	1813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5717_5943_6259_6347_6390_12491_13676_13782_13876_18160_18880_65077
896165	contig_17440_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_7569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTAATAGAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432	2020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2000
896166	contig_4315_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_46777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAATCTGAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296743	295619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_295600_296700
896167	contig_13004_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_112638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTATGGTATATTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265293	264568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_264600_265300
896168	contig_2480_pilon	+	2888	14	Intergenic	novelGene_63535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.992790699908	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	242	1660	254318	279119	FALSE	25	AAGGGGATCACGTTCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251435	280347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254320_263321_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
896169	contig_15029_pilon	-	2178	2	Intergenic	novelGene_128191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGACCCATTTTCCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163256	160998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_161085_161164
896170	contig_7548_pilon	+	2116	5	Intergenic	novelGene_117621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160.737363422448	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	276	602	193023	198560	TRUE	20	AATTGGGCATGTGCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRR	192747	207774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198572_203264_203322_206058_206128_206397
896171	contig_11115_pilon	+	1366	7	Intergenic	novelGene_102846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	652.807781816363	3	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	370	1278	171704	173241	FALSE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLEPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	166249	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_166501_171225_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172788_172853_172964_173047
896172	contig_5039_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_64880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	347	649	419099	418797	NA	40	GTTCAGATCTTAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERIRVIVGQYDEHNQCHTNLIRCTHLSNCLSLTLVLILDLQKKLWYKESKAPTASGQQQVSCPAQAGMRRAPGRGSGPPDCPQWTRGNGNLQCCVSHL	419445	418029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_418000_419400
896174	contig_7816_pilon	+	1980	10	Intergenic	novelGene_66454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	199	junction_9	180.244963628891	245	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	27	1775	94386	148859	FALSE	70	TTTTGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGSAPGFKMESLSRAGQEMSLAALKRHDPYITSIADLTGQVALYTFCPKANQWEKTDIEGTLFVYRRSASPYHGFTIVNRLNMHNLVEPVNKDLEFQLHEPFLLYRNASLSIYSIWFYDKNDCHRIAKLMANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSAPSGHKHLTVEELFGTSLPKEQPMVVGLDSEEVEKLPGDASQKEPSPFLPFSFEHSGGAPQSESLGVQSAALYSVQPEVTTPVLITPASITQSNEKHAPSYTIPLSPVLSPTLPAEAPTAQVPPSLPRNSTMMQAVKTTPRQRSPLLNQPVPELSHTCLVASQSPFRAPLSVTSTAGTSLASVDLLQKLRLTPQHDQIQTQSLAKGSVAPSFPPAAGQLATPESFIEPPTKTAVARAAASASLSNMVLSPLQSMQQNQDSEVFSQPKVLSSAIPVAGPPLVTATTTVIPSVLLSPSVFQQTTTRSTDLERKANSPSPLTVGTSENQRKPSIVLSKAQLQDTLVHLIKNDSGFLSTLHEVYLQVLTKNKENLSL	94359	149064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_143942_144702_146636_146703_148224_148444_148778
896175	contig_10711_pilon	-	2301	2	Intergenic	novelGene_118425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTCTAATGACTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710007	706236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_706926_708395
896176	contig_16622_pilon	-	2480	3	Intergenic	novelGene_48477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1664.5	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAAAACTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121971	111924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115292_121443
896177	contig_2703_pilon	+	5240	16	Intergenic	novelGene_101726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1064.98412299068	7	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	276	953	559489	596431	TRUE	35	GCATACACAGCAGGAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHGKTRSPPRSF	526191	611132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_599822_602059_602152_603380_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
896178	contig_14522_pilon	-	2081	8	Intergenic	novelGene_147314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	319.979846304133	10	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	115	924	146829	66449	TRUE	50	GACTCATAAATATAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEEHEGHTEEPEAEEHVHEQQPQQQEEY	206295	65238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_65515_65567_66524_78937_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_206230
896179	contig_1575_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_45175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGGCCCCTAGAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107496	105617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_105600_107500
896180	contig_11656_pilon	-	4760	17	Intergenic	novelGene_53946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	565.513093211598	38	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1447	4341	420	4760	224380	113507	FALSE	35	AGTTACACTCAAGCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNRDKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGMWICQICRPRKKGRKLLQKKAAQIKRRYANPIGRPKNRSKGPFSKVRTGPGRGRKRKITLSSQSASSSEEGYLERIDGLDFCRDSSVPLKFNKKTKGLIDGLTKFFTPSPDGRKARGEVVDYSEQYRIRKKGNRKSSTSDWPTDNQDGWDGKQESEERLFGSQEIMTEKDMELFRDIQEQALQKVGVTGPPDPQVRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRLPKLYLCEFCLKYMKSRTILQQHMKKCGWFHPPANEIYRKSNISVFEVDGNVSTIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTQNDVKGCHLVGYFSKEKHCQQKYNVSCIMILPQYQRKGYGRFLIDFSYLLSKREGQAGSPEKPLSDLGRLSYMAYWKSVILECLYHQNEKQISIKKLSKLTGICPQDITSTLHHLRMLDFRSDQIIRREKLIQDHMAKLQLNLRPVDVDPECLRWTPVIVSNSVVSEEEEEEAEEGENEESQCQERELETNVGKPVSRENKEQDSYSLLESEKKPEVIAPASSTRLNKQVLPRDGLPANSQPSRRGRWGRKNKKTQERFGDKDSKLLLEETSSAPQEQDGECEEKSETSQEQYTESEEPLAASQEQPSHDGKPDVPKRRLSEGVELWRGQLKKSPEALKCRLPEGNDRLPRRYSDGDRPLLRGFSESSEEEEEPESPRSNSPPILTKPTLKRKKPILHRRRRVRKRKHHNSSVVTETISETTEVLDEPFEDSDSERLMPRLEPTFEIDEEEEEEDENELFPRGYFRRLSSQDVLRCRSSSKRKSKDEEDDEDSDDVDDTPILKPVSLLRKCDVKDSSLEPDTSTPMKKKKGWPKGKSRKPIHWKKRPGRKPGFKLNREIIPVSTQECIVEPIVPIPKPGRKPKIQENEETVEPKEDLPLTEERKEEEMHVEAEEVEEGEEEDTTSSEVRAASPVDSSNSPETETKEPEVEEEEEKPRILEEQRQSEEEQQELEEQEQEEEDEVAVETNQNEDHDADDEDDGHLESTKKKELEEQSVREDVKEELGSQESFLDTNMQNSRENVKDKDETEPDSEEEQTSHETSVVSEHMPGSEDDPEEDSNTKEELIELKEEEEIPHSELDLETVQAVQSLTQEESNEHEGAYQDCEETLAACQTLQ	227409	113506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_114523_117214_117528_120350_120957_122563_122766_123444_123677_129280_129375_130456_130619_132521_132664_139139_139256_157925_158045_160484_160802_162144_162260_164495_164578_165175_165292_169387_169497_223780_224705_227314
896181	contig_14450_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_48971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCTTCCTACTGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038734	1040886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1038700_1040900
896182	contig_17074_pilon	+	3282	12	Intergenic	novelGene_145099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	186	junction_10	154.929202706396	968	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	202	1362	212372	223655	FALSE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207855	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
896183	contig_11677_pilon	-	7561	40	Intergenic	novelGene_85878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.158061897512025	718	26	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	2831	3658	262562	258375	TRUE	10	GGCTGGAGCGCAGCGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSSASSETTFWVNPAMSMSFSSICCFRLNASASSMSFSRCSFSRCSFSRWASSCACESSLSNLLCFFSSSWLRTCWPSRCSLVSCSSAVSRWHFFLSCCRARWLSSLSACRSPSRLSSCLLFCCSTSSLSSNSCWSRFLVKSTSLIARSYFRRHSPPASSSTSPLISAARMRRASITSISITSICFFSASYWVCSSFISFSARSLSAVSASSSWEADSPVLRSSVSSDVSSEIRVSNRSLLSRSSFRSFSTFSSLLRSCWISSSLFRICSSDS	283115	179625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_179695_190659_191736_234979_235070_235297_235404_235513_235690_236057_236276_236546_236689_237365_237464_238304_238373_238590_238743_241291_241474_241671_241763_242052_242246_243300_243389_245514_245656_245816_245972_246738_246934_247229_247473_250482_250594_254105_254171_257415_257545_258259_258409_258827_258917_259059_259175_259412_259526_259911_260041_260343_260498_262279_262404_262492_262699_263283_263392_263940_264047_264373_264521_264898_265016_266361_266485_266667_266747_267197_267336_269935_270121_270503_270646_274601_274724_281688
896184	contig_8330_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_71933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	488	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	737	1036	1316216	1316515	NA	25	GAGGATAACGCTCATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRLKYLLCMDVSFKRILPIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVAKRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTRALLARIKDTGNNKC	1315479	1318116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1315500_1318100
896185	contig_7840_pilon	-	2551	11	Intergenic	novelGene_69029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	290.528070932913	33	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	159	1478	427684	365953	FALSE	0	CTTTCTGTCCTGGCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAALRAEISHRQGRSECSGRSLGCERPAAAATEKKPQEALCSVKKYFYTIAPMTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVVIAPRHFQESIAGASNLYHLWACFLLCHRLSCAALYGPISIPSILYLA	445717	364879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366099_367601_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609_427738_445612
896186	contig_13592_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_33743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2009	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAGAAAGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304030	306742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_304000_306700
896187	contig_13300_pilon	+	2942	4	Intergenic	novelGene_125756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	2125	2748	46980	47603	TRUE	20	CCCGCACACGGCCGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWKLHETRDMPLSRRKGPGRPATQSHNDPQKFLQNAHFQARDSPKCYLLSAGHSAKAGPGRDVCVSHPAPKAQRLRCLGWGTRCRVRPRTISPSRHTTRLKRKTGRDRNHANLGPPRRLFFMLLPGMMSELDQSKLLEASRRPRGLRPAYGSSMSRNSCLGGAAPRYQAQELSLRLMQAKNLAWCPLMFFSVTQSIQRHSSGEET	44194	56066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_45961_46621_47630_49635_49763_56025
896188	contig_15407_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_123102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_3	21.3878470164718	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	538	1116	556303	591712	FALSE	15	TACTCTTGTGTGGTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELGIEKFVSLKDIKNSKCPEGTKPMLIFAGDDFDVTEDYRRLKSLLIDFFRGPTVSNIRLAGLEYVLHFTALNGKIHFRSYKLLLKKSGCRTPRIELEEMGPSLDLVLRRTHLASDDLYKLSMKMPKALKPKKKKNISHDTFGTTYGRIHMQKQDLSKLQTRKMKGLKKRPAERKTVEKEENKSKRIKKN	555035	591914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_555544_556273_556351_566034_566135_584666_584770_590554_590700_591529
896189	contig_6079_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_160106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGAGAAAGACCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470931	472239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_470900_472200
896190	scaffold_15027_pilon	+	2333	16	Intergenic	novelGene_163560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	147.432184033504	570	13	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2301	31	2331	48927	106778	FALSE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRPGRLWEDMAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKTDAHYSILSLLLCLSDSPSNSNYVGTPRDKEVEKKDDFDWGKYLMEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLYLEQSDFHEKFAGGDICVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHINKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSS	48896	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56140_56226_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_104978_105638_105828_106597
896191	contig_6881_pilon	-	2056	1	Intergenic	novelGene_164837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATTATCTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83578	81522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_81500_83600
896192	contig_3956_pilon	+	1577	7	Intergenic	novelGene_14879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1336.32215011534	94	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	84	872	1281682	1290310	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1289833_1289892_1290297
896193	contig_7342_pilon	+	2360	6	Intergenic	novelGene_71240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_1	162.239329387174	8	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1481	1903	729008	734873	FALSE	45	TTAGTAGTCATTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVSSSSGRNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCINHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSERKECEVKKEKSSSVDRHHSVEIKTEK	726491	735330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_726508_727543_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756
896195	contig_5429_pilon	+	1632	8	Intergenic	novelGene_127815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_6	172.899404514974	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	817	1551	472157	498838	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLINPKASDSPIDLFHGDIAGGISEAVIQKFLYLGDDRNIEEVYVAGKQVVPFSSSV	471340	498919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495718_497667_497696_498767
896196	contig_20670_pilon	+	4887	5	Intergenic	novelGene_144830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGCCCCTGGGGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48219	57588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_50691_50845_53012_54341_54428_56701_56793_57515
896197	contig_20819_pilon	-	510	6	Intergenic	novelGene_55682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1637.18966524957	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	31	504	70235	65419	FALSE	15	GTTTATACATCTTCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLHAAAPVAAMSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHSFVFEASTQRLLAAVAVLWVCPRRNKSVGLVY	70265	65412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_65517_65657_65743_65860_65963_66048_66136_69625_69725_70232
896198	contig_10241_pilon	+	2098	5	Intergenic	novelGene_142827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.8624490455152	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	136	606	92779	140032	FALSE	15	GCCACTGTATTGGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNVGCHFLVWGLIAFLGLALVISLIFNISHYVEKQRQDKVYGYSDDYIPRDDEYFLEDIPIYGNLDDVVSATEPQVCYGALNHSCKAKLRKPRKQDVPVSHKDEDEQLRALDASISKTTLLDSLPPGGQEVEENIHDDPVRLFGLIRAKKDPIN	92643	141524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_130963_131026_139778
896199	contig_4213_pilon	-	5412	7	Intergenic	novelGene_124790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2155	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1704	2078	245477	245103	TRUE	40	TGTGATCAACCGTAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKRNNKISEMDSIIEGLRNRFETMEDRISETEDKPLDTTLLEGKSEKKNEETLRIMWDTIKSQNLRVIGVPEQGRKQKTQRGSLKNCQQKTSPVS	247180	12825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_13041_19189_19303_24168_24355_40540_40644_42732_42976_44111_45314_243830
896200	SIRV6	+	1408	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	108	12	27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896201	contig_2768_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_57514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAACATGGGTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791784	793586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_791800_793600
896202	contig_7963_pilon	-	4264	14	Intergenic	novelGene_58445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	618.647360143901	35	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1633	2703	123098	120628	TRUE	30	AAGTTCTGAGTCATAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	127509	117605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563_126594_127336
896203	contig_8065_pilon	+	5719	8	Intergenic	novelGene_107341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_2	209.687425294247	955	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	262	1965	227280	248583	FALSE	35	TCATAATGTGTGTAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRRKKVKELIEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEVEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSSVSSSPRQTVDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKIKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPKKKKLKLSADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKAAAAKVELVKENTEKKRERKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDWVQCDGGCDEWFHQICVGVSPEMAENEDYICINCEKKQGPDSPGQAPPPSFIMSYKLPMEDLKETS	226388	252337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_226500_227129_227286_230281_230834_231201_231349_237535_237696_238861_239083_241012_241424_248376
896204	contig_11318_pilon	-	4050	20	Intergenic	novelGene_48123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	984.011043673811	195	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	94	2511	49828	9367	FALSE	30	GTAATTGTGCAATGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPPHLNRPPMGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRPWINKKIIEYIGEEEATLVDFVCSKVMAHSSPQSILDDVAMVLDEEAEVFIVKMWRLLIYETEAKKIGLVK	52149	7827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27525_27632_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_52071
896205	contig_149_pilon	-	5071	6	Intergenic	novelGene_173778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	66.4457673595542	832	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	23	910	43979	33917	FALSE	20	TTTCTTTTAATATACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSSLFPMEDGFLDDGRGDQPLHSGLGSPHCFTHQNGERVERYSRKVFVGGLPPDIDEDEITASFRRFGPLIVDWPHKAESKSYFPPKGYAFLLFQDESSVQALIDACIEEDGKLYLCVSSPTIKDKPVQIRPWNLSDSDFVMDGSQPLDPRKTIFVGGVPRPLRAVELAMIMDRLYGGVCYAGIDTDPELKYPKGAGRVAFSNQQSYIAAISARFVQLQHGEIDKRVEVKPYVLDDQLCDECQGARCGGKFAPFFCANVTCLQYYCEYCWAAIHSRAGREFHKPLVKEGGDRPRHISFRWN	44001	29755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_34145_36861_37044_38205_38321_39818_39938_40303_40394_43825
896208	contig_6440_pilon	-	3639	12	Intergenic	novelGene_161658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	115.734806581881	583	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	327	1664	30867	19626	FALSE	35	TAAAACATTTGCCATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTVTIWLTVRPDMTMASLKDMVFLDYGFPPALQRWVIGQRLTRDQETLHSHGVRQDGDSAFLYLLSACNTSLNPQELQRERQLRMLEDLGFKDLTLQPRGPLEPAAPKPGVPQEPGRGQPEAAPEPPLVGWQCPGCTFINKPTRPGCEMCCRARPEAYQVPASYQPDEEERARLASEEEALRQYQQRKQQQQEGNYLQHVQLDQRSLVLNTEPTECPVCYSLLGPGEAVVLRECLHAFCRECLQGTIRNSQEAEVSCPFIDNTYSCSGKLLEREIRALLTPEDYQRFLDLGVSIAENRSALSYHCKTPDCKGWCFFEDDVNEFTCPVCFHVNCLLCKAIHENMNCKEYQDDLAQRAQNDVAARQTTEMLKVMLQQGEAMHCPQCQIVVQKKDGCDWIRCTLCHTEICWVTKGPRWGPGGPGDTSGGCRCRVNGIPCHPSCQNCH	43511	17650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_19707_21064_21209_21594_21694_22690_22871_26344_26457_27658_27820_28973_29148_29277_29400_30489_30689_30801_30957_42227_42373_43419
896209	contig_14959_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_166730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAAAAAGTGAGGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69562	72161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_+_69600_72200
896210	contig_8631_pilon	+	2061	4	Intergenic	novelGene_121936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	440.123467525496	285	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	187	708	638778	768468	FALSE	40	AATTTTATAGAATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALELRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVPSKGQPSLREAISMSCITNGSGGSRKPSHTSSVSIARKETFSSAAVQKKRKKNHKDREKKKRNLILMIKVHKFEHHLLPSPLHSLSKYTDKLKKARILLPPKGFNRS	638591	769821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_638803_739386_739570_765461_765585_768277
896211	contig_4364_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGTGTGTTAAGGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532821	1533278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
896212	contig_12935_pilon	+	1906	5	Intergenic	novelGene_165720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	293	junction_1	65.9943179372285	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	82	621	161610	245690	FALSE	45	GCAAGCCGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVPCHPDWRPSERTPGRANPIPASTAAMSSNSFAYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMMAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAAADLSPYVRKNAAHAIQKLYR	161528	246975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_161738_199297_199374_221271_221347_244806_244903_245525
896213	contig_13633_pilon	+	1736	13	Intergenic	novelGene_15301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	423.717574963953	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	57	1391	20259	49142	FALSE	15	AACTCTGCCTTTCGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLAGDPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5022	49487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22111_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
896216	contig_2100_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_50641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGCTTTCCATTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995653	997825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_995700_997800
896217	contig_15165_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_145307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGTTTTAATTAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2928	1759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_1800_2900
896219	contig_5889_pilon	+	2418	13	Intergenic	novelGene_133680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_12	82.2794611201497	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	129	1337	128188	323066	FALSE	45	AAAATTCAGATTTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVKLFPQETLFLEAKE	20478	324147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_322982
896220	contig_15518_pilon	-	2389	5	Intergenic	novelGene_127618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	14	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1309	1659	38282	37285	TRUE	20	CAGAAGTAGGTGCCGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCILICLGNLTFSHTLGKWSESVLKSSDGDFALEALSTVRRNSRRVCTGRFPEQGGTWSRVCGSCHQTSSLRLGHQRRKEGASGLLLPVDIDGRDTNHQQHLEAYKEASEEEVRS	39590	11347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_11420_14884_15200_15806_16136_37270_37387_38033
896221	contig_8671_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_126295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	506	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGAAGAACTGGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979559	977417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_977400_979600
896222	contig_19744_pilon	-	3521	3	Intergenic	novelGene_120417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	325	junction_1	34.5	536	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	81	902	283137	277519	FALSE	35	GGACTTTAGAATGACGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSFRPEPDPYCQAKYTFCPTGSSIPAMKGDDVIEVFRLQAPVWEFKYGDLLGHMKIMHDAIGFRSTLTGKNYTMEWYELFQLGNCTFPHLRPEMNAPFWCNQGAACFFEGIDDIHWKENGTLVLVATMSGNMFNKMAKWVKQDNETGIYYETWTVQASPEKGAETWFESYDCSKFVLRTYKKLAELGAEFKKIETNYTRIFLYSGEPTYLGNETSIFGPVGNKTLALAIKRFYYPFKPHLSTKEFLVSLLQIFDTVIIHRQFYLFYNFEYWFLPMKFPFIKITYEEIPLPNRNRTLSGL	283217	274899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_278031_281952_282179_283053
896223	contig_6589_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_25944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1042	1362	1240887	1240567	NA	50	TGAGAAACTGGAAACGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRLYVISLCVVNSVTDEVILMTLTRSDSVLMQSLLRYKRKRRAETHGSLIPSRKQRRAQSASFGPEVPVQRSSQTKGRLMHHKNLSSEPTETEPSPGADALNLDL	1241928	1239080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1239100_1241900
896225	SIRV6	+	1121	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	72	335	22	159	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	186	677	1733	10736	TRUE	45	ACCAGAAATGGTCATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1159	11490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896226	contig_14744_pilon	-	2089	16	Intergenic	novelGene_66034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_15	426.36617543557	171	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	193	1974	1374233	1304013	TRUE	15	TTTGCATTATTATGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDSKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKRKGHEYTNIKYSLADQASGDQSPLPPCTPTPSCTEMREDNARVYENVGLMQQQKSFR	1374425	1303207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1303291_1303980_1304083_1306173_1306287_1313632_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1347224_1347418_1349331_1349527_1355961_1356085_1374219
896227	contig_6325_pilon	+	2713	3	Intergenic	novelGene_143365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_2	64	79	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCTCAGCAGTGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419442	426769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_421471_425278_425453_426258
896228	contig_5574_pilon	+	5397	2	Intergenic	novelGene_155859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1163	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATGGCACCTAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188744	194232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_189308_189398
896229	contig_11978_pilon	-	4676	6	Intergenic	novelGene_62878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	76.833326102675	1124	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	772	2319	592	2910	660350	651178	FALSE	30	AAAGCGGATGATTCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGPSSAYTQTQFHNLRNTLDGYGIHPKSIDLDNYFTARRLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPSSGLTLESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFSEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREIFDYSHRQKEQDVDKELQDGGEQGDTWPGEDAEALARNLLVDGETGESFPAQVPGGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSIAEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSTSEILYNTPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFSLFSPEVESLPVAGSSTLLPLVPSNSTSLNSTFGSTNLAGLFFPPQLNGTTNDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPSQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSANLPPPSTLKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQQDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTLADQQARRQERKPKDRRK	662456	649411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_652522_653703_653863_654069_654160_654629_654846_659840_660863_662377
896230	contig_11285_pilon	+	5633	12	Intergenic	novelGene_5512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	49.7815060751223	914	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	200	1105	635700	636847	TRUE	15	CTGTACACATGGGGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSDVTLIEGVGNEVTVVAGVVVLILALVLAWLSTYVADSSNNQLLGTIVSAGDTSVLHLGHVDHLMASQGTPEPTELPHSSEGNDEKAEEAGEGGGDSTGEPGAGGGVEPSLEHLLDIQGLPKRQAGPESGSPESPLRSEDSTCLPPSPGLINVRLKFLNDTEELAVARPEDTVGALKSKYFPGQESQMKLIYQGRLLQDPARTLRSLNITDNCVIHCHRSPPGSAVPGPSASLAPSTTEPPSLGVNVGSLMVPVFVVLLSVVWYFRINYRQFFTAPATVSLVGVTVFFSFLVFGMYGR	633609	643811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_633784_635674_636242_636483_640403_640504_640667_640756_640827_641091_641138_641409_641496_642026_642107_642599_642712_642903_643077_643267_643400_643699
896231	contig_5640_pilon	-	991	8	Intergenic	novelGene_27237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	246.066027309579	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	154	780	63466	24907	TRUE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMAGSLGHLQA	143892	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206_138281_143822
896232	contig_16121_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_6873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1140	1484	50282	50626	NA	15	TCCACCAGGCGCTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKRQMPETFKDYTHHPWCSQHRRQGHKGKRQGASYGRDGAGLWAGNFIVDSTGNVTRRGQSTPGFESTIFETCILGLRTFTKGKTEGSSYLGIADMDGEGLLDVDAKTYYRS	49142	50742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_49100_50700
896233	contig_5125_pilon	+	2402	7	Intergenic	novelGene_43434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1657.76884865036	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	511	1305	35654	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	26034	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54388_58651
896234	contig_11396_pilon	-	3782	1	Intergenic	novelGene_71338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAAGGAAATAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489616	485834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_485800_489600
896235	contig_19744_pilon	+	2835	11	Intergenic	novelGene_120368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_9	171.80596613622	62	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	912	2736	100	2835	122160	177981	FALSE	85	AAAAAGGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSQKKTSLQQEQVKKSQRIPGSPAVTAASSNTDMTFGGLASPKLDVSYEPMIVKEARYIAITMMKVYENYSFEELRFASPTPKRPSENMLIRVNNDGSYCANWTPGAIGLYTIHVTIDGIEIDAGLEVKVKDPPKGMVPPGTQLVKPKAEPQPNKVRKFVAKDSAGLRIRSHPSLQSEQIGIVKVNGTITFIDEIHNDDGVWLRLNDETIKKYVPNMNGYTEAWCLSFNQHLGKSLLVPVDEPKTNTDDFFKDINSCCSQEATMQEQDMPFLRGGPGMYKVVKTGPSGHNIRSCPNLRGIPIGMLVLGNKVKAVGEVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDQLSAVLNSIQSRPNLPAPSIFDQAAKPPSSLVHSPFVFGQPLSFQQPQLQSDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKA	122060	177981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_122256_130481_130538_133818_133935_137853_137952_138751_138869_139774_139916_151814_152040_152925_153059_156119_156243_158877_159034_176506
896236	contig_13542_pilon	+	1334	7	Intergenic	novelGene_131538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	82.768754168869	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	53	1066	535605	544291	FALSE	15	GGAAATCGTCTCCTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLSQTASGALARPATVLGAMEMGRRIDAPTSAAAVRAFLERGHTELDTAFVYSDGQSESILGGLGLGLGGSDCKVKIATKANPWDGNSLKPDSLRSQLETSLKRLQCTQVDLFYLHAPDHSTPVEETLRACHQLHQEGKFVELGLSNYASWEVAEICTLCKNHGWILPTVYQGMYNATTRQVETELFPCLRHFGLRFYAYNPLAGGLLTGKYKYEDKDGKQPLGRFFGNNWAEIYRNRFWKEHHFKAIALVEKALQAAYGPSAPSMTSAALRWMYHHSQLQGARGDAVILGMSSLEQLEQNLAASEEGSLEPAIVDAFNQAWHLVAHECPNYFR	535552	544559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_535837_540319_540508_540702_540808_541724_541822_542065_542166_542720_542851_544129
896237	contig_8812_pilon	+	3453	13	Intergenic	novelGene_57254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	137	junction_11	156.1577505459	289	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	242	2584	3658	22770	TRUE	15	TTTGCACAGTCTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRRQRKDLANSDSQKTTEKLLKTFLKRQAIKTALKSKRDEALPSLTQVQREDDIYVLPPLQEEEKNSSEEEDEKEWQERMNQKQALQDEFFQNPHAIDIESEDFSSLPLEVKHEILTDMKEFTKRRRTLFEKMPEESDDFSQYQLKGLLKKNYLNQHIENIQKEMNQQHSGQIQRQYEDEGGFLKEVESRRVVSEDTSHYILIKGIQAKKTAEGDSESLPSSSRMHSMSFDVKSPPCEKLKPEKETDASPPSPRTLLAMQAAMLGNNPEEEVESGRKRPYNEKNASAAVDDGSVSPRTLLALQKALDDEEEVKGHAGNDVQTGGLGVKKLPTNNPDEESDEGHRDDGKGRLFTAVPHSAGVNFVEESATSTNSEKELTDSAGLSSAIFCQGSEPSVQKEQISFIHPVSEGLQTSDDSMEKDGKSPIPLQSTVLMSSDAPGLQNRKARIPASSTSTVVVSQDETYPEGLELQNDLGTSESKRDSSVLSSDDEMEGGENRACEISGTVCLQGTGGTAVVPSETLSNLESVVLFSDKQHENLLKTIQESEVTESASRDVISVPKSLELRETDSEDGESDGSFIEVDSVISNDESQAESLESWKPSSERGDQSVAEEGLVETEMEGAPGDVESLLRDSSESEGLGTEPRGEAEKDADDSLSEWQDINLEELETLESSLLEQQNSLKAQKQQQERAAATVTGQMFLESQELLRLFGIPYIEAPMEAEAQCAILDLTDQTSGTITDDSDIWLFGARHVYKNFFNKNKFVEYYQYVDFHNQLGLDRNKLINLAYLLGSDYTEGIPTVGCVTAMEILNEFRGHGLEPLLKFSQWWHEAQDNKKIRPNPYDTKVKKKITEVATHAWFP	1540	25771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_1658_2156_2244_3620_3682_6501_6646_10649_10858_11168_12285_14632_14896_15236_15357_15519_15734_17209_17355_22661_22864_23482_23568_25080
896238	contig_11448_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_66346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAAGAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162178	160664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_160700_162200
896239	contig_6557_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_32968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACGGTAATTACTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386855	384144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_384100_386900
896240	contig_2854_pilon	-	2430	5	Intergenic	novelGene_120797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	337	735	86829	84615	TRUE	35	ACAAATTGTTTAAATTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLSSIQHHGRERIQIFHVRVSHQNLVDFQSLLGVREDLQKGLPQLVGFRRRPLGWHGQVLLAAGKEWEGGLLRTPVARKGSLNPGWRLVAGAGCLDARDSEAGVKHAHIWQGSEEGLHISKEDFLPKKFF	87165	67808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_69190_77194_77326_82391_82500_84539_84648_86463
896241	contig_6440_pilon	-	2375	14	Intergenic	novelGene_161660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	111.258853779727	8	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	335	1786	42313	19626	FALSE	20	AGGAAGTGTGAGTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCAIWLAERRVPLSVQLKPEVAPSQDIRLWVSVEDAQMHTVTIWLTVRPDMTMASLKDMVFLDYGFPPALQRWVIGQRLTRDQETLHSHGVRQDGDSAFLYLLSACNTSLNPQELQRERQLRMLEDLGFKDLTLQPRGPLEPAAPKPGVPQEPGRGQPEAAPEPPLVGWQCPGCTFINKPTRPGCEMCCRARPEAYQVPASYQPDEEERARLASEEEALRQYQQRKQQQQEGNYLQHVQLDQRSLVLNTEPTECPVCYSLLGPGEAVVLRECLHAFCRECLQGTIRNSQEAEVSCPFIDNTYSCSGKLLEREIRALLTPEDYQRFLDLGVSIAENRSALSYHCKTPDCKGWCFFEDDVNEFTCPVCFHVNCLLCKAIHENMNCKEYQDDLAQRAQNDVAARQTTEMLKVMLQQGEAMHCPQCQIVVQKKDGCDWIRCTLCHTEICWVTKGPRWGPGGPGDTSGGCRCRVNGIPCHPSCQNCH	43895	19036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_19707_21064_21209_21594_21694_22690_22871_26344_26457_27658_27820_28973_29148_29277_29400_30489_30689_30801_30896_42227_42370_43159_43304_43419_43511_43852
896242	contig_7457_pilon	+	3211	3	Intergenic	novelGene_31299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	943	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTAAATTTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164885	185278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_167224_167654_168512_185262
896243	contig_7009_pilon	-	12252	2	Intergenic	novelGene_23647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2159	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3579	3941	469978	469616	TRUE	30	CCACTGGGCCAATATACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKYNSHTLSPEMQRRHQLVSGRHPLHRKAGSQLCTAKLGPMPGSQSTQAITDETRGVCAQAACRQLSSSLFTPTKAFPPPPLLQCFIRWHQHLLGSHQVALSSILFGKQYQHCDCVHP	473556	455670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_461092_466725
896245	contig_9752_pilon	-	7427	1	Intergenic	novelGene_122046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1679	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	301	630	239852	239523	NA	50	TAAAAAAATATTGGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQYFIPFYGRVILHCMHIPHFENIAFSSERHLRSRWLTAESVFTGLLTAEPVSIQVHGGMIKTEPVLVASAHPAEYIYPLVSFYTIICLDIEGFLRMYYLEHLHRQLR	240152	232725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_232700_240200
896246	contig_10140_pilon	-	4458	17	Intergenic	novelGene_148385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.4478716080323	160	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	71	2419	186175	141154	TRUE	25	TGGAATTTCTAGGTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRDRADRDKKKSKKRHYEDEEVEEDDTPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIIQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTLEGSGGPSTSRVTDPQNKSDIPTDLFDFYEQMDKDEEDEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSKSSQVSRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKTSSKHVHPLFKRFRK	186245	135638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_135654_139030_140573_140671_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163547_163751_178414_178600_180427_180743_181944_182150_182453_182619_182780_182917_183352_183403_184730_184968_185608_185815_186147
896247	contig_9839_pilon	+	4407	4	Intergenic	novelGene_88572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	295.488672465723	17	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3851	4267	266458	269866	FALSE	40	AAAAGCATGTTCTAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTYLNVNKDSPCVYTSDFNASIPVPGSVTPTNSPSSITVHYSVQINETYSTNVTVPNGSVFLNVMEAAKKQNITIFGFTMEETSWGPYITSVQCLKANNNDRTYWEILSGGHSLSQGVGSYVVHNGEYLMIRWSKY	262607	270006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_266513_267523_267705_269528_269648_269804
896248	contig_7695_pilon	+	3022	2	Intergenic	novelGene_41660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGTATGTATGCTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888105	891330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_889098_889300
896249	contig_6215_pilon	+	3121	8	Intergenic	novelGene_21237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	263.754601468711	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	306	1343	582949	600051	FALSE	25	AACTGCCCAACTTTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWTGDSPPHVPVQELSTDMVINVIANMTTTVQSLFPNLQVFPALGNHDYWPQDQLPVVTSKVYNAVANLWKPWLNEEAISTLRKGGFYSQKVTTNSSLRIISLNTNLYYSSNIVTLNKTDPANQFEWLENTLNNSWQNKEKVYLIAHIPVGYLPFSRNTTAMREYYNEKLIDIFRKYSDVIAGQFYGHTHRDSIMVLSDKKGRPVNSLFVAPAVTPVRSVLQKETNNPGVRLFQYDPRDYQLLDMLQYYLNLTEANMKGESNWKLEYILTQAYDIKDLQPESLYGLAKQFAVLDSKQFIKYYNYFFVSYASSAICDEKCKAFQICAVMNLDHVSYADCLKQFYI	571800	601829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571906_582748_582963_584025_584171_588153_588251_590620_590791_591255_591437_592971_593097_599745
896250	contig_8044_pilon	+	4910	35	Intergenic	novelGene_132361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_13	128.259185577958	585	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1421	4266	120	4385	237684	386963	FALSE	20	CCACCACCAGAGTGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTDSSLLLEDYSSKLSSKANRAKKSLLSGEEKENLPSDYMVPIFSGRQVHVSGITDTEEERIKEAAAYIAQRKLLASEEGITTAKQSTASKQSMVSKQSTSTLQQEKAVEKKSRKVAIREKAEHLSLRKTLEETEAYHKKLNEDSLLHAPEFNIKPRSHTVWEKESVKLHCSVSGWPEPRLTWYKNQVPINVHANPGKYIIESRYGMHTLQINACDFEDTAQYRASAMNVKGELSAYASVVVKRYKGEFDDTCFHARVSTLPLSFAVTPYGYASKFEIHFDDKFDVSFGREGETMSLGCRVVITPEIKHFQPEIQWYRNGAPVFPSKWVQTHWSGERATLTFSHLNKEDEGLYTIRVRMGEYYEQYSAYVFVRDADAEIEGAPASPLDVMCLDANKDYIIISWKQPAVDGGSPILGYFIDKCEVGTDTWSQCNDTPVKFARFPVTGLIEGRSYTFRVRAVNKNGIGLPSRVSEAVAALDPAEKARLKSRPSAPWTGQIIVTEEEPTEGIIPGPPTDLSVTEATRSYVVLSWKPPGQRGHEGIMYFVEKCEAETQNWQRVNTELPVKSPRFALFDLAEGKSYSFRVRCANSAGVGEPSEATEVTVVGDKLDIPKPPGKIIPSRNTETSVVVTWEESKDAKELVGYYIESSVVGSGTWEPCNNNPVKGPRFTCHGLVTGQSYIFRVRAVNAAGLSDYSQDSEAIEVKAAIATPSPPCDITCLESFHDSMVLGWKQPDKTGGAEISGYYVNYREVIDGIPGKWREANIKAVSDQAYKISNLKENMVYQFQVAAMNITGLGEFSAASTPFKCEEWTIAVPGPPHDLKYSEVRKTSLVLHWKPPVYSGRTPVTGYFVDLKEANAKDDQWRGLNKAAIKNKYLKVQGLKEGVSYVFRVRAINQAGVGKPSDLAGPVVAETRPGTKEVVVNVDDDGVISLNFECDQMSPKSEFIWSKDYISTEDSPRLEVESKGNKTKMTFKDLGMDDLGVYSCDVTDTDGIASSYLIDEEELKRLLALSQEHKFPTVPIKSELAVEILEKGQVRFWMQAEKLSGNAKVSYIFNDKEIFEGPKYKMHIDRNTGIIEMFMEKLQDEDEGTYTFQLQDGKATGHSTLVLIDDAYKKLQKEAEFQRQEWIRKQGPHFAEYLSWEVTSDCNVLLKCKVANIKKETNIVWYKDEREISVDEKHDFKDGICTLLITEFSKKDAGIYEVILKDDRGKDKSRLKLVDEAFKELMTEVCKTIALSATDLKIQSTAEGIRLYSFVPYYLDDLKVSWSQNGTAVKYTDRVKSGVTGEQIWLQINEPTPNDKGKYVMELFDGKTGHQKTVDLSGQAYDEAYAEFQRLKQAAIAEKNRARVVGGLPDVVTIQEGKALNLTCSVWGDPTPEVSWVKNEKPLASSEHCSLKFEAGKTAFITITGVTTSDSGKYGLVVKNKYGSETSDFTVSVFIPEEEARVLESQKGNKKSK	237564	387488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_237707_241425_241676_242276_242435_259234_259328_261222_261312_261424_261488_266713_266879_270386_270549_276776_276919_280693_280894_286102_286160_289525_289651_295118_295303_295793_295969_298865_298988_302457_302655_328019_328147_332573_332759_337549_337665_351368_351526_353078_353186_353303_353349_362064_362202_364428_364574_365301_365362_365647_365716_369683_369798_370456_370545_371764_371804_371893_372000_376995_377160_379265_379303_379545_379569_381994_382051_386675
896251	contig_12626_pilon	+	3509	18	Intergenic	novelGene_80448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	365.603894416425	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	897	2694	770	3463	157850	196455	FALSE	40	TGTCTACAAGAACTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVYQFFPPHRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQSSTLVSSLEAELSKVKIQTHIVEQENRLLKEELEKMKQLHRYPDLSDFQQKISSVLSCNEKLLKEKEALSEELSSCINKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNTKVELTHSREKVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	156731	196501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_157111_157459_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_171116_171243_171350_171421_176134_176249_179387_179511_180235_180350_181147_181295_183342_183523_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
896252	contig_10734_pilon	-	898	4	Intergenic	novelGene_51116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	204.14374020936	322	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTGTTGTGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739503	737232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737597_738019_738138_738215_738501_739372
896253	contig_20293_pilon	-	1154	10	Intergenic	novelGene_153506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_8	319.280788996492	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	330	890	31300	19443	FALSE	70	TGAAAAACAGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	48580	19178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533
896254	contig_4780_pilon	-	1426	11	Intergenic	novelGene_65391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	129.321923895371	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	297	1109	419847	312144	FALSE	5	TGTCTCCCGAGGTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLLRLGGGMPGLGQGPPTDAPAVDTAEQVYISSLALLKGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428907	311826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_362008_362081_419799_419852_422134_422260_428740
896255	contig_3018_pilon	-	5270	2	Intergenic	novelGene_78815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1592	junction_1	0	1178	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	581	2104	542313	539862	FALSE	30	TAAGCCTTTATGCATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPSSPGPIVPAQPHGKILTKPDSHWEATVTVPEAENGVHVKTELQQKQLSNNTQALSKNHPPQPHLRSSSEQLSQKLPSAPVKLHCPPSPHIENPPKSSTPHTPVQHGYLSPKPPSQQLGSPYRPHHSQSPQVGTPQREPQRNFYPAAQNLQANTQQATSGALFTQTPSGQSSATYSQFNQQSLNSTAPPPPPPPPPSSSSYYQNQQPSANFQNYSQLKGSLSQQTVFTSGPNQALPGTTSQQTVPGHHATPGHFLPSQNPTIHHQTAAAVVPPPPPPPPAPGPHLVQQPNSHQQHSVAHVVGPVHAVAPGSHIHSQTAGHHLPPPPPPPGPAPHHHPPPHPPTGLQGLQVQHQHVVNSVPPPPPPPPPSSVLASGHHPTSAQALHHPPPHQGPPLFPSSAHPAVPPYPSQATHHTTLGPGPQHQPSGTGPHCPLPVAGPHLQPQGPNSIPTPTASGFCPHPGSVALPHGVQGPQQASPVPGQIPIHRAQVPPTFQNNYHGSGWH	542893	536695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_541377_542304
896257	contig_10197_pilon	-	7566	32	Intergenic	novelGene_115278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	403.607752009039	573	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1555	4668	2266	6933	1194560	1174446	TRUE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSK	1197355	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168487_1174445_1174611_1174810_1174958_1175067_1175198_1175368_1175539_1175647_1175784_1175985_1176166_1176281_1176530_1186804_1186922_1187111_1187323_1187480_1187628_1187804_1188044_1188181_1188370_1188646_1188840_1188960_1189088_1189239_1189404_1189522_1189730_1189856_1190054_1190437_1190568_1190903_1191039_1191152_1191273_1191416_1191607_1191693_1191814_1191979_1192171_1193341_1193448_1193543_1193670_1193759_1193973_1194097_1194317_1194408_1196759_1197288
896258	contig_16098_pilon	-	1751	10	Intergenic	novelGene_46043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1479.19415832564	6	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	87	1097	352350	349343	TRUE	20	AAATGGCTTTATTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354075	348308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348434_348485_348518_348845_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
896260	contig_2689_pilon	+	1067	1	Intergenic	novelGene_100834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATATTAGCTCACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223877	224944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_223900_224900
896261	contig_20951_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_43039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACAGCGCCTCAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26508	27799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_26500_27800
896262	contig_2009_pilon	-	2985	2	Intergenic	novelGene_165436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1605	1913	12613	12305	FALSE	40	AAAGTGTATGGTCACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNGTTTLENDTALPSTRQDQLDSNGVFLVQKLEKEIPYDPAILLLGLYPREIRAITQIDICTTIFTAALFTTAKRWKQPRHSSTDEWINYGTYTLWSTTQR	78446	11232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_-_13188_77416
896263	contig_13863_pilon	+	3594	1	Intergenic	novelGene_42010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAATAAATAAATAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82838	86432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_82800_86400
896264	contig_16098_pilon	-	2837	20	Intergenic	novelGene_45843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_12	489.291199712751	1	92	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	913	2742	12	2753	230275	201500	FALSE	25	TGCTACAGTTCCTAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230286	201415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174
896266	contig_16525_pilon	-	3354	4	Intergenic	novelGene_133803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4251	junction_1	647.605504060063	576	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	31	309	97608	97330	TRUE	30	TAAAAGATCGCCAGTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKPLDRKAMVRGQGSYGKAGAEGWEGTWVRAGCGIGGQGLGRGFHCGRGLGWGKREGGSGFRPGQADLGVFLAVAQGCPPREPVGAEIQPLHCSPSCVPR	97638	91485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91862_93365_95725_96924_96975_97069
896267	contig_15021_pilon	+	3394	10	Intergenic	novelGene_26978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_2	120.445469450333	19	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1816	2469	326067	332947	TRUE	50	CCAGCACAAAAAAGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQFGEGEQAKICLEIMQRTGAHLELSLAKDQGLSIMVSGKLDAVMKARKDIVARLQTQASATVAIPKEHHRFVIGKNGEKLQDLELKTATKIQIPRPDDPSNQIKITGTKEGIEKARHEVLLISAEQDKRAVERLEVEKAFHPFIAGPYNRLVGEIMQETGTRINIPPPSVSRTEIVFTGEKEQLAQAVARIKKIYEEKVRGLAGQSPAPGREGQE	322018	338772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_322447_324679_326244_332248_332456_332677_333315_333453_333562_334697_334803_335115_335195_336589_336730_338549_338655_338751
896268	contig_5988_pilon	+	2666	5	Intergenic	novelGene_15897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1938	2573	563035	563670	TRUE	35	AACACTGCATCAAACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLQLLVAPVRWHREHLVSSPRCRATSTFISAPPWVSYTSVDHRAQLRCTHRSRSRFSRRAGPSVAPSPSSWQKQQRRMSRGTLSGRRAVPSCSINSATSRSSSCCPLPFWMVSSSRSRFQRTPFHFLRRGGRESSPSSGGRARGLGRADSGEEARGRGEGTGGSAEGSAGSSTMGSAGGLAGEGAKGEGGGEGSSGGGAESCRTSRLETL	554923	563952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_556144_560978_561096_561192_561329_562570_563714_563902
896269	contig_5005_pilon	-	4375	1	Intergenic	novelGene_84331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1042	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAATATCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600199	595824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_595800_600200
896270	contig_8712_pilon	+	2482	2	Intergenic	novelGene_58788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	292	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATTGTACTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291605	294193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_292211_292316
896271	contig_13097_pilon	-	3242	2	Intergenic	novelGene_107686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGAGCTTACTATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144608	139045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_140225_142545
896272	contig_13044_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_99981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGAAGATCCCAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47858	45244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_45200_47900
896273	contig_8330_pilon	-	2643	6	Intergenic	novelGene_71980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	642	junction_1	161.092520000154	486	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1277	1981	2056084	2038853	FALSE	30	TCATTTCTTAAATGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2057360	2038190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973
896274	contig_15918_pilon	-	2224	2	Intergenic	novelGene_132715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	669	983	42931	42617	FALSE	75	TAGAGAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQELSVVFPVRAVIGGSRPPSSSSGLGLMRSLVYVALSVSRANPFLVSMVFFILLYSRWVGTNGRILDGCSLAFKTPDAIHQSGMRNIFLINFVMPLDLDVP	73465	41375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_-_43370_73235
896275	contig_1734_pilon	-	3436	17	Intergenic	novelGene_164393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_11	62.1156934679152	516	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	83	1987	843584	804665	FALSE	30	TATTTAATGTTGATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRRKRCRVLLKCRLPVCSSVHLGANMAHYNFKKIMVVPSAKDFIDLTLSKTQRKTPTVIHKHYQIHRIRHFYMRKVKFTQQNYHDRLSQILADFPKLDDIHPFYADLMNILYDKDHYKLALGQINIAKNLVDNVAKDYVRLMKYGDSLYRCKQLKRAALGRMCTIIKRQKQSLEYLEQVRQHLSRLPTIDPNTRTLLLCGYPNVGKSSFINKVTRADVDVQPYAFTTKSLFVGHMDYKYLRWQVVDTPGILDHPLEDRNTIEMQAITALAHLRAAVLYVMDLSEQCGHGLMEQLELFQNIRPLFINKPLIVVANKCDVKKIAELSEDDQKIFIDLQTEGFPVVETSTLTEEGVIKVKTEACDRLLAHRVETKMKGNKVNEVLNRLHLAVPNKRDDKERPPFIPAGVVARKKRMEIEEPKKKRERDIELEMGDDYILNLQKYWDLMNSSEKYDKIPEIWEGHNVADYIDPDIMRKLQELEKEEELRTAAGEYDSDSESEDEEMMEIRQLAKQIREKKKLKILQSKEKNTQGPRMPRTAKRVQRKVLENEMRSLGVDMDDKDSAHYAVQARKSRSVTRKRKWEDSSPCSSLARSRSCSRTPRDVSGLRDVKMVKKAKTMMKKAQKKMNHLGRKGEADRHVFDMKPKHLLSGKRKSGKKDRR	843666	803215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_804818_813138_813283_815316_815383_816979_817178_818658_818760_819326_819379_819802_819881_822383_822495_824542_824633_827319_827386_827464_827657_834161_834255_835669_835771_838032_838170_838254_838359_840858_841030_843536
896277	contig_8377_pilon	+	1913	8	Intergenic	novelGene_34944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4426.06040332456	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	162	869	68257	197686	FALSE	60	TTAAAAGAAACAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEAIPIPV	68095	198730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154908_197666
896278	contig_6488_pilon	+	3318	2	Intergenic	novelGene_44704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACGACACCTCCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	6683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_3218_6582
896279	contig_4213_pilon	-	2441	1	Intergenic	novelGene_124811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACAAAAATAGCTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45642	43201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_43200_45600
896280	contig_4469_pilon	+	1725	2	Intergenic	novelGene_21865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	345	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	32	958	5835	20087	FALSE	10	ATTTCTCTCTGTCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAEAVEKKLLLGIAATEEGPEAPTEQQDVARGLENLPVSWWPPEVEPAPFQYTPDHVIGPGADTDPTQITFPGCICLKTPCFPDTCSCLRHEENYDDNSCLRDIGLEGKYAQPVFECNTMCQCSDHCRNRVVQRGLQFHLQVFKTDKKGWGLRTLEFIPKGRFVCEYAGEVLGFPEVQRRIQLQTVHDSNYIIAIREHVYNGQVMETFVDPTYIGNIGRYLNHSCEPNLLMIPVRIDSMVPKLALFAAKDILPEEELSYDYSGRFLNLMDSEDGEKLDKGKTRKPCYCGAKSCTAFLPYDSSLYHPL	5803	20854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_5991_19316
896281	contig_6509_pilon	-	2529	10	Intergenic	novelGene_145627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	86.6987120242664	30	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	357	2255	91952	72739	FALSE	65	TACAAAGACGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRKTRTQMPPVQSMLWHYQAGAPLQAPWHEMEAPRSKKKEKQGPERKRIKKEPATRKAGLLFGMGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKEKNKVKKKRKKDTKGKEVRFGKRSDKFCSSESESEPLGSDEDDGSVGSSGCAKGSPLVLKDPSLFSSLSASSTSSHGSTASQKHNPNHTDQHSKHWRTDNWKTISSPAWSEVSSLSDSTRTRLTSESDCSSEASSVESLKPVRKKREHRKGGGLQGTLSEKKSAFHASVDGAIPKLDKEGKVVKKHKTKHKHKNKEKGQCSVSQELKLKSCHTSRQ	192468	72464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_72759_72799_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289_78461_78933_79031_91925_92065_110630_110775_192368
896282	contig_7056_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_43715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	505	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	962	1309	935853	937151	FALSE	35	GTCTTCTCCACAACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	934891	937917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_936043_936993
896283	contig_7840_pilon	+	3470	11	Intergenic	novelGene_68962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_10	421.522763323643	143	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	201	2129	238014	304775	FALSE	10	CGAAGGGCTGTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQANGTDSAFHVLAAKPAHTALAPVAMPVRETNPWANAPDAANKEIAAIYSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	130642	306116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_303007_303155_304059
896284	contig_16532_pilon	+	5343	1	Intergenic	novelGene_110060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	469	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGTCGTAAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581607	586950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_581600_587000
896285	contig_13021_pilon	-	3095	2	Intergenic	novelGene_8226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1762	2277	253930	253415	TRUE	35	CGAGGAAACAAACTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFHEVLTRLCQEIWKTPTWPTDWKKYIFVPIPKKGDPTESENYRTISLISHTSKILLKIIQKRLQQYMDRELLKTQARLRRGHGTRDIIADDRWTMTESREYQKDVYLCFIEYAKALDCVDHNKLWITLRRVGMPEHLIVLRQNLYIDQEAVFRTEQGNTAWFKIRKGVS	255691	200230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_200705_253070
896286	contig_678_pilon	+	3858	2	Intergenic	novelGene_167824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	420	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTTTTGTGACATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147845	160502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_147853_156651
896287	contig_7188_pilon	+	4358	1	Intergenic	novelGene_108524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	735	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	227	684	33	716	93482	94165	NA	45	ACGAGTATATAATTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQFSQPVKFAMNGISDVKNTSEDSENFPLNSKKSEEWPDWSEPEEPDNKTVNIQIWPREPCDAAESPFTMKEESWDDFQPSNLDTKINLGGGVPAAIPVSLGKQKPIPAVLPSTEESGPLKSSPSPKTRLVESEDDPNHIKPPKVSSQERLLKVPSELGLGEEFTIQVKKKPVQDPELDWFADMIPEIKPSAAFLILPELRTEMMVPNQDDISPVMQFSSKFAAAEITEVRISKLCY	93449	97807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_93400_97800
896288	contig_3113_pilon	+	4066	4	Intergenic	novelGene_175795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCTGCAAAACATAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90015	112289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3113_pilon_+_90626_108706_110768_110818_111383_111458
896289	contig_10753_pilon	+	1839	13	Intergenic	novelGene_105123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	45.5603994714708	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	141	1400	10095	107882	FALSE	20	AAATGTCGTGCCTGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVECWDPRTRNRVGLLDCALSSVTADSEINSLPTISALKFNGALTMAVGTSTGQVLLYDLRSDKPLLVKDHHYGLPIKSVHFQESLDLILSADSRIIKMWNKNSGKIFTSLEPEHDINDVCLYPNSGMLFTANETPKMGIYYLPVLGPAPRWCSFLDNLTEELEENPESTVYDDYKFVTKKDLENLGLTHLIGSPFLRAYMHGFFMDIRLYHKVKLMVNPFAYEEYRKDKIRQKIEETRAQRVQLKKLPKVNKELALKLIEEEEEKQKSTWKKKVKSLPNILTDDRFKVMFENPDFQVDEESEEFRLLNPLVSKMSEKRKKKLRLLNQPELHEQEEVRKQRRLLHQEERMKRQERIKEDQQTVLKPQFYEIKAGEEFRSFKDSTTKQKLMNKTLEDRLKLEAKNGTLNVSDTAVGSKQLTFTLKRSEQQRKQQEAEKLHRQERKKLRRSASHLKSRHKRGWPFH	5778	108321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_5867_10042_10122_12297_12448_19661_19729_33694_33748_71554_71682_78358_78439_78624_78724_79749_79840_90187_90362_90704_90875_100539_100643_107762
896290	contig_16594_pilon	+	3808	10	Intergenic	novelGene_53833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCGTGGAGCCGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116040	306538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_242308_242430_306350
896291	contig_9112_pilon	+	1908	3	Intergenic	novelGene_60222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	216.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	82	918	108641	113786	FALSE	95	AAAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REFYISLTTDHTPPYFYNRIDFIFQPDMDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRYVNEVCACKEA	108559	114776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625
896292	contig_10861_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_39422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	849	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	665	1051	2205703	2206089	NA	35	AGAGGCATCACATCACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILWFIFWISNCCFCIISSSEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMHLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIKDLNSLSGSSSAFSSTGKSPGILFWTPTGTILSYFCKCFDIVCCLWGIQ	2205038	2207772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2205000_2207800
896293	contig_5023_pilon	+	3124	17	Intergenic	novelGene_7216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2014.98985341738	7	94	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	525	1973	611764	646990	TRUE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611684_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647131_647288
896294	contig_3386_pilon	+	4526	11	Intergenic	novelGene_34565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	690.654761802161	303	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	247	939	476274	494572	TRUE	25	GACTTGAATGAATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKVSTGRPG	470130	506156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_475713_475783_476271_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_497820_498658_498721_504781_504900_505996
896295	contig_5145_pilon	-	2253	13	Intergenic	novelGene_131432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_7	146.262511335688	886	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	737	1411	925621	916397	FALSE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947093	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_934779_934816_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
896296	contig_2854_pilon	-	3468	6	Intergenic	novelGene_120803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	362	760	86829	84615	TRUE	15	CTCCCGAATGGCCTTTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLSSIQHHGRERIQIFHVRVSHQNLVDFQSLLGVREDLQKGLPQLVGFRRRPLGWHGQVLLAAGKEWEGGLLRTPVARKGSLNPGWRLVAGAGCLDARDSEAGVKHAHIWQGSEEGLHISKEDFLPKKFF	87190	68424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_70722_77194_77326_78876_78974_82391_82500_84539_84648_86463
896297	contig_14882_pilon	+	6700	1	Intergenic	novelGene_114983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	5621	6046	50536	50961	NA	50	AGGTAATAAAAAATACTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYEDLTIINIYAHNDRAPKYIKQILTALKRETDSSTIIVRNFNTPISVKDRISRKKLNKDTEEPKGTISQLELTDIYRTLYPMAAKYTFFSNAHGTFSRAEHILGHRATLNKIQNSEIIQSIFSDHNTIKVEINNRKSK	44915	51615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_44900_51600
896298	contig_10752_pilon	+	3552	2	Intergenic	novelGene_153046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2168	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAATGATCACAACTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222318	316538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_225306_315973
896299	contig_3394_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_152687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTAGTCATCCTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453356	451581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_451600_453400
896300	contig_6048_pilon	+	2903	23	Intergenic	novelGene_73115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	350.514512614983	524	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	76	2076	909104	1358574	FALSE	15	CTGGATGCCCCAAGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDRCFNIGSALIYSSCRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDASKPLEVLLLEKNRSLQSENATLRISNSDLSGRCAELQVQVTEAAATVAEQRELIAHLEQDLSTIQTIQRPDAEGAAEHSLEKIPEPIKEATALFYGPSAPASGSLADDQVGSLLSIISSQRERFRTRNQELEAESRLAQHTIHALQGELDSLRADNIKLFEKIKFLQSYPGQGSGSDDTELRYSSQYEERLDPFSSFSKRERQRKYLSLSPWDKATLSMGRLVLSNKMARTIGFFYTLFLHCLVFLVLYKLAWSESVERDCATFCAKKFADHLHKFHENDNGAAAGDLWR	909028	1359401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994646_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187838_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258621_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1350868_1350997_1351717_1351785_1352522_1352636_1355001_1355119_1356262_1356347_1356916_1356974_1357352_1357434_1358198_1358264_1358504
896301	contig_19778_pilon	+	1136	6	Intergenic	novelGene_143747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	244.459894461239	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	262	978	9539	16019	FALSE	50	GAGGTAAGCAAAACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDNKENPFKVFESLGKEILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYDAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETFFSKEKESTSAEVPSEMWAGPDESAEFTDTLELCPPEEFLRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFNNLPPRSRAEVDIEGMKRLLEGLDYSVEVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHRSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTTHSEEQPDMLSLDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGDNLSWRDEREGSPFITRLISYFHKYSSRCHLVEVFRKVQRSFEKPPVKIQVPTIKRHTLIRCFYLFPGN	5642	16177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_5893_9527_9638_10480_10655_12474_12710_14323_14434_15920
896302	contig_9706_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_20775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACACAGGCATGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166	894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_900
896304	contig_2550_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_135670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228675	1227219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1227200_1228700
896305	contig_11898_pilon	+	6125	5	Intergenic	novelGene_144290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.866025403784439	630	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	137	472	240209	242117	TRUE	40	TCATCTTAAGACCGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQGKGQCYDQETANLAHSRKCCRHFLPVAAPHQYPGELENSYFIFMEESGSLTTEDCSRRPSEVRKGKEDGMRTAWAESGNKVEAPGSPSTSRGRIQPLRSVRTAENIWESLPVVLPTDLGIHQSLQPESESPALGPADLGFTSPCSCVTQEKPLS	240072	444261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_240406_241978_246479_290614_291426_441261_441273_443791
896306	contig_17769_pilon	-	2753	17	Intergenic	novelGene_124262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	718	1125	114768	111910	TRUE	10	CAGTTGCCGGGTTTCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLMVGHSCLLAGLKDLSLLLQASKDPLDGLLKVLLPHRGAQVAGGNQGCLVANVGDVSTCEPWGEGGQLPRQSVLTEAFIQFQWTQVDLEDGGPAFDVWGYQCISAGQSGPAASGLGQGCPGGWCPQAPRRWW	116822	97948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_98398_102096_102193_102689_102757_104161_104257_104698_104848_106406_106478_106926_107053_108443_108715_110385_110526_110819_110974_111899_112013_112760_112881_113493_113606_114695_114812_115331_115532_116108_116305_116544
896307	contig_5515_pilon	-	1897	5	Intergenic	novelGene_52316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.997351635476	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	750	1127	60642	59553	FALSE	30	AATGACTGCCCATTCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNPTLTLMVRVLLPCRLLCPNSPVPGSQAFCPALTGRDPAGPLDADTSRGCTPQHPQRRPHPLGLVPAALGLPRPSLAEIAIPWPCYRDSWTSVDLVLQVIKNPVLLGGSIVLLQGLGISGQRT	64036	58782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_59898_60609_60989_62830_62882_63556_63668_63795
896308	contig_14513_pilon	-	1249	3	Intergenic	novelGene_70313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	187	555	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
896309	contig_5023_pilon	-	2399	10	Intergenic	novelGene_7330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	994	1494	647301	643482	TRUE	10	TGGCCATTTTTTATTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648294	607285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608098_609592_609680_625771_625849_629214_629281_630184_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
896310	contig_1406_pilon	+	3471	2	Intergenic	novelGene_25661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATGGATGGAGAGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2800630	2810009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2801743_2807650
896311	contig_18735_pilon	-	3686	18	Intergenic	novelGene_132672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	222.895711645371	9	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	153	2084	101374	59686	FALSE	20	TTTATCTAAGGATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPSNQQHKTDEKGRANLGVFSVSAPRGEHIIQIKAIHNKNTIEGPVIKLMILPDPEKPIRLNVKYDKDASFLAGGLFTDFMISVISEDDSVIKNINPARISMKMWKLPSPGNRPPANAETFSCNKIKDNDKEDGCFYFRDKVIPHKVGTYCIQFGFMMDKAYTLSSEQVIVDVLPNQPVKLVPEIQPATPAVSNVRSVVSRTLVRDLHLNITDEYSNHTGIDLVGTVIATIKGSSEEDTDVPLFIGKVKTLEFPFVNGSAEITSLVLAENSPGRDSTEYFIIFEPQLPALSRTLEPYILQFMFYNDVKKQQQMAALTKEKDQLSKSIIMYRSLFEASKQLLDEMKCQVEEAKLKEAQLRNELKAHNIDIPATQQMTHIEALLKRKVTEQEELKKKPRRSCTLPNYTKGSADVLGKIAHLAQIEDDRAAMVISWHLASDMDCVVTLTTDAARRIYDETQGRQQVLPLDSIYKKTLPDWKRPLPHLRNGKLCFKPIGDPIFARDLLTFPDNKEHCETVFGMLLGDTIILDNLDAANHYRREKITHCPTLLTRDGDRIRSNGKFGGLQNKAPPMDKLRGMVFGAPIPKQCLILGEQIDLLQQYRSAVCKLGSVNKDLNGQLEYLHTPDMKKKKQELDEQEKNLKLIEQKLGMTPTRKCNDSLRPPTKDMTDCPIPPKRMRRETTRQNRIITKTDV	101930	58083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_59711_65767_65880_67037_67197_71407_71574_77769_77841_78099_78210_81403_81595_84587_84711_85317_85404_86459_86580_86748_86876_91897_92051_93119_93252_94117_94206_98279_98345_99621_99738_101286_101445_101848
896312	contig_14959_pilon	-	741	2	Intergenic	novelGene_166725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	26	406	72129	71749	TRUE	30	AAATCCACTTGACTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK	72154	25037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14959_pilon_-_25370_71745
896313	contig_4350_pilon	-	3621	3	Intergenic	novelGene_136382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_2	187	613	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATTTTTGCATATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270159	254055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_257236_258627_258878_269968
896314	contig_2312_pilon	-	4509	3	Intergenic	novelGene_160736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6999	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	242	637	229775	229380	TRUE	45	CCCCGTAAAACCAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPKAIYKYNAILIQKPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKAQLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNNRNIHQWNRIDNPDVNPSTFSHLIFDKGPKSIKWGEKTVFLTKGAGKTGYPSAKK	230016	225275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_228306_228356_228958_229138
896315	contig_16622_pilon	+	11847	6	Intergenic	novelGene_48496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	387	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	937	1239	115175	115477	TRUE	30	CAGCAGCCTTGCTGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELALQLSMLGPQGPPVLLQSLVLGPPLFTLLLCQGQGPLREIREERRCLGDSREMCSWLHCSPELPPGVLSPKDSAESPYLCALQLLLCTHFLLQHFLQ	114068	132345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_114357_114526_119351_120109_126120_126270_126422_128279_128678_132169
896316	contig_6063_pilon	-	4807	4	Intergenic	novelGene_27602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	3054	3449	92439	92044	FALSE	50	GTAATAATAATCAAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMWKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKPEIDIPYNPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTHMFMAALFTTAK	173135	90685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_92687_95387_97914_98301_98337_172890
896317	contig_6929_pilon	+	914	4	Intergenic	novelGene_139408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_2	1547.29556179663	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	135	515	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127041	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130971_131948
896318	contig_10324_pilon	+	3654	19	Intergenic	novelGene_7783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	141.059701921466	17	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	308	2386	124814	134610	FALSE	45	CATGTTAAAAGTAACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSENAESENMDVPPEDETKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAENVKQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS	102800	135878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_102858_119213_119308_119953_120071_124774_125005_125110_125289_127455_127604_128947_129040_129428_129525_130122_130235_130664_130763_131330_131443_131545_131657_132019_132220_132653_132822_133225_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_134560
896319	contig_12570_pilon	-	2513	2	Intergenic	novelGene_79393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	0	328	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	40	579	300289	293639	FALSE	35	AAATTGAGGACTACCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSVSTGSSGWGRVRATRPHISCVQGTEYWAGRQELDIHHYMTWGRVPDSLWYWFLHLYSRHEGPIWGLTNVQNLKVLRRAYSVAHICILQV	300328	291704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_294088_300198
896320	contig_19269_pilon	-	1968	2	Intergenic	novelGene_175631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1814	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1544	1864	17559	17239	TRUE	60	TTTAAAAAAAAAAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPEELDRASLPPLTALTGITIEGPRQSRRKMYNKIQIHTHTHTKEDQTYWSDRVEEPLRVLKKMRLMEHNSPGTRTTKQKGTGKLVLGNPRLRSDSVDTSWGC	19102	13139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_-_13209_17203
896321	contig_12951_pilon	+	2895	9	Intergenic	novelGene_68197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	280.974170298624	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	144	1190	755258	837408	FALSE	55	GAATAAACCATTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAGSWAAIYQDIRHEASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHHVRLARSACARLAGALW	755114	839113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833563_837356
896322	contig_5286_pilon	+	10824	8	Intergenic	novelGene_157344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGAAGTGGGCGTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518736	589405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_589214
896323	contig_513_pilon	+	3188	11	Intergenic	novelGene_80116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.003178774488	438	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	553	2205	72594	84905	FALSE	30	TTCATTATAGTGTCTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKFGIIMRDPQTEEFKVKLYKDSQGNLKGDGLCCYLKRESVELALKLLDEDEIRGYKLHVEVARFQLKGEYDASKKKKKCKDYRKKLSMQQKQLDWRPERKAGLSRMRHERVVILKNMFHPMDFEDDPLVLNEIREDLRVECSKFGQIKKLILFDRHPDGVASVSFRDPEEADYCIQTLDGRWFGGRQITAEAWDGTTDYQVEETTREREERLKGWEAFLSESEASRGFRRSNLASASERAGPSRVRHFSEHPGTSRMNAPEAAAEMTFEAPVNEKKFEKPEDGGECEDESSEKEGSEEGWSKRGSEGGCRERGPEEGSPGKESEENGAESEPKQKTLQRDSEENGLEKESKEDSPEKDSEEECSEKQCEDGSENEFEENGLEKESDEDDSEKEFENLLEKELEDSEKSECEDDGSEKVFDEEGSEREFEEDSDEKEEEEDADETVFDGESDEKEDEGNADEKGLEDADEEEDEAEEKLFEDSDKKEEIVEKLLEDDSSDKLFDEDSSDKLLESNERGTVGCFGNLQEEEPLSTGSSFVLSSDDDDEDM	68737	85888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_68782_68857_68899_69075_69271_71646_71830_72041_72090_72552_72708_74985_75150_76170_76271_81947_82038_83176_83315_83858
896324	contig_18163_pilon	-	3691	5	Intergenic	novelGene_35304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2571.59590526972	945	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	941	1516	10631	9401	TRUE	25	TTGTTCTATGGTTTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11822	6790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_8779_9213_9721_10375_10662_10732_11279_11458
896325	contig_4742_pilon	+	2511	5	Intergenic	novelGene_130982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	275.887091941613	119	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2211	301	2511	201400	248723	FALSE	20	CCCAGCAAGCAGTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVDTFNHLIPTEHLDDALFLGSNLENEVCEDFSTSQNVLEDSLKNMLSDKDPMLGSASNQFCLPVLDSNDPNFQMPCSTDPLVFCYMYLKTQTNHSRPLLSVVGLDDIMDEGVVKESGNDTIDEEELILPNRNLRDKVEDNSVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRSNSSPLSSTKKTSGKTVSAPKAGVRQPEKCQIKEEVCASLKPEYHTESRRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWT	190917	248723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_201374_201644_202148_202215_242103_242266_246984
896326	contig_6593_pilon	+	3681	2	Intergenic	novelGene_49845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAAAGGAGCTACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195391	1294606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1198161_1293694
896327	contig_16846_pilon	-	4267	2	Intergenic	novelGene_82850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	296	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTGCATCCCATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220100	65657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_65987_216162
896329	contig_3077_pilon	+	2078	8	Intergenic	novelGene_26793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	774.587579533358	2888	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	452	1351	475601	481662	FALSE	20	GAGATTTAACGTGTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467331	482389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475569_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
896330	contig_5423_pilon	+	2506	2	Intergenic	novelGene_85293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582158	586451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_583955_585741
896331	contig_15596_pilon	-	3525	17	Intergenic	novelGene_139540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_16	112.738202681034	501	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	102	2645	217105	182796	FALSE	25	TTAAGACTGCTGATCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGQGEETPGRLSHQPSVRLLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKKKTYSEPKFDNKRADGTISSDIKSAKGSHLSVHAENSLKSVTDVCHKRTDRKSRITEKSGSTSRPEFEFTRLDFPELQSPENSGILEIPEQPKWGPLHSAATSVSLLRERKPPAVLAEGEIAVKSKNPAASVADSAASSSSSCTRELSWTPMGYVVRQTLSTEQSPAPKNVTSMINLKTVASSANPKTVNVASSEVLSSDPSSNKEKHTVHPTKKSKVLQGGNPEQNEVSRKNKKKKEKSKPKYEVLTVQEPPRIEDAEEFPNLAVASERRNRVESTKFQSKQQQQNNFKSSRKKSEIPVQLDLGGMLTALEKKQHSQNAKQSSKPVVVSVGAVPVLSREATSGMKNHHLNQVLTPHNPLDSSAPLRKKGKQREVPKAKKPTSLKKIILKERQERKQQRLQENIASDAVQDVESSGDDQSLPQADPSAPGETEESVPSTLVEESGSEEPLRAEPQSDIEACHLGLDSASFPKIHSRRFRDYCSQMLSKEVDACVTDLLKELVRFQDRMYQKDPVKAKTKRRLVLGLREVLKHLKLRKLKCVIISPNCEKIQSKGGLDDTLHTIIDYACEQNIPFVFALNRKALGRSLNKAVPVSVVGIFSYDGAQDQFHKMVELTMAARQEYKTMLESVRRELAEEPGARSPPSPPPQGPSCSAEDAHPASTEKEEPHYIEIWRKHLEAYNRCAQELEETLGASTSQMMNLKL	217206	181915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_182900_183272_183466_183854_184010_188157_188379_189071_189229_190879_191004_191819_191987_194743_194877_196626_196717_198011_198135_199636_199846_201847_201930_204476_204710_206206_206328_206575_206826_215682_215829_217069
896332	contig_10500_pilon	-	3483	12	Intergenic	novelGene_41176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	492.705719085779	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	111	1199	1380886	1318487	TRUE	45	TTCATAATTATTAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIQLKELSQSGLYRRRRDRPDSLRLNGLPEEKLSNMANALANATCERCKGGFAPAEKIVNSNGELYHEQCFVCAQCFQQFPEGLFYEFEGRKYCEHDFQMLFAPCCHQCGEFIIGRVIKAMNNSWHPECFRCDICDKTLADIGFVKNAGRHLCRPCHNCEKARGLGKYICQKCHAIIDEQPLIFKNDPYHPDHFNCANCGKELTADARELKGELYCLPCHDKMGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1380996	1315953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1316214_1316419_1317657_1317699_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325523_1327651_1327802_1328581_1328703_1329515_1329583_1345183_1345344_1380779
896333	contig_18162_pilon	+	9027	3	Intergenic	novelGene_122279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17535	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	2265	3371	9632	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNIGSPFLLRPPGSAELSPSPARPRPAAPARPRDAAAGGRLPRGLRAAALHGVPAHQPQAPRAAPVRMWWLQEAPVASESVLLLSAIDKGCLSLWWHEMRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7243	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_9148_9271_15477_15695
896334	contig_5236_pilon	-	2141	6	Intergenic	novelGene_100961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	240.23455205278	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	61	606	1011714	1010108	TRUE	20	AAATTGCCTTTTAGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGEFGFL	1011774	1005870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007536_1010100_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
896335	contig_9653_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_48230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCAATCATAGGAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617409	618905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_617400_618900
896336	contig_1452_pilon	-	2043	3	Intergenic	novelGene_115155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	50	664	715391	699652	FALSE	75	ACTAAATACAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715440	698272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
896337	contig_2799_pilon	-	1575	5	Intergenic	novelGene_85541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	256	591	729375	718679	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTCTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	729630	703970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189
896338	contig_7188_pilon	+	2677	13	Intergenic	novelGene_108517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	36.1501498383248	702	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	101	2161	34871	95016	FALSE	45	ACTAGATTCAACTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSENSALKSYTLKEPPFALPSGLAVYPAVLQDGKFASVFVYKRENEDKVNKAAKHLKTLRHPCLLRFLSCTVEADGIHLVTERVQPLEVALETLSSAEVCAGIYDILLALIFLHDRGNLTHNNVCLSSVFVSEDGHWKLGGMETVCKVPEATPEFLRSIQSVRDPASIPPEETSPEFTTLPESHGHARDAYSFGTLVGSLLTVLSEQVSADILSSFQQTLHSTLLNHIPDCRPALCTLLSHDFFRNDFLEIVNFLKSLTLKSEEEKTEFFKFLLDRVSCLSEELIASRLVPLLLNQLVFAEPVAVKSFLPHLLGPKKDNVQGESPCLLSPALFQSRVIPMLLQLFEVHEEHVRMVLLAHIEAYVEHFTQEQLKKVILPQVLLGLRDTSDSIVAITLHSLAVLVSRLGPEVVVGGERTKIFKRTAPSFTKTTDLSPEGDQFSQPVKFAMNGISDVKNTSEDSENFPLNSKKSEEWPDWSEPEEPDNKTVNIQIWPREPCDAAESPFTMKEESWDDFQPSNLDTKINLGGGVPAAIPVSLGKQKPIPAVLPSTEESGPLKSSPSPKTRLVESEDDPNHIKPPKVSSQERLLKVPSELGLGEEFTIQVKKKPVQDPELDWFADMIPEIKPSAAFLILPELRTEMMVPNQDDISPVMQFSSKFAAAEITEGEAGGWGEEGELNWEDNSW	29629	95532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_29680_34820_35036_72177_72364_75084_75199_77073_77131_78609_78713_79929_80042_81933_82012_84114_84255_85547_85733_86632_86805_93449_94139_94956
896341	contig_4783_pilon	+	3456	2	Intergenic	novelGene_108348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1052	1540	63449	63937	FALSE	35	TATCGAAATGTATTGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFTSFMIFGKFSCQQFFNDPLCVFCFLPRSGIPITCRFLLLTVSHITLSVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFVFCISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFFVHIFHEFVYFFLMFVSFLPQFLENS	61310	65853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_61898_62984
896342	contig_8310_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_75591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTTCCACAGTGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313260	314847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_313300_314800
896343	contig_10719_pilon	-	2447	3	Intergenic	novelGene_178687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATGTGATGGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118789	62320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10719_pilon_-_62385_90736_92135_117804
896344	contig_6079_pilon	+	3260	1	Intergenic	novelGene_160112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	689	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2347	2652	487610	487915	NA	20	TGGGGCCCAGCAATATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSMLLSLSMLVPSALFMLITPKLTSSSYHTPTHAPQLLHLMIFQAPRHRHVQTHNPLSLPTLIYVGMASLHPVTHTRNPVVLPSFLPLAHFYLNSISKS	485263	488523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_485300_488500
896345	contig_3975_pilon	-	2448	12	Intergenic	novelGene_54821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	200.73472482873	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1228	1977	2064115	2056837	FALSE	10	CTCTCTGCTCCCCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079207	2056365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079039
896346	contig_7051_pilon	+	2152	12	Intergenic	novelGene_64284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	154.12230841255	31	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	134	985	184159	206198	FALSE	25	TATTGACTAGTGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAAAERSRADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184025	207365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
896347	contig_5669_pilon	-	5434	11	Intergenic	novelGene_86080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	153.964314047119	1898	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	14	1024	238583	202010	TRUE	15	GGGCAGTTTTACTCCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCETFLEKIVCTPGQGLGDLRTLELLLICAGHPQYEVVEISFNFWYRLGEHLYKTNDEVIHGIFKAYIQRLLHALARHCQLEPDHEGVPEETDDFGEFRMRVSDLVKDLIFLIGSMECFAQLYSTLKEGNPPWEVTEAVLFIMAAIAKSVDPENNPTLVEVLEGVVRLPETVHTAVRYTSIELVGEMSEVVDRNPQFLDPVLGYLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIARSLDSFMLSPEAAVGLLKGTALVLARLPLDKITECLSELCSVQVMALKKVSPWEPSQ	238596	190141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_194420_196365_196458_201969_202028_216819_216921_219864_220057_221963_222104_224247_224340_226078_226187_228431_228579_237834_237974_238509
896348	contig_3414_pilon	-	4033	15	Intergenic	novelGene_80970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	285.54845187349	803	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	16	1680	101974	69083	TRUE	5	CATTTCCTTCCTTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPWKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKTESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMVHYP	101989	64958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_67266_69036_69102_69151_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89785_89949_93529_93682_95073_95212_95426_95642_98057_98187_101892
896349	contig_7870_pilon	-	3763	2	Intergenic	novelGene_108999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1546	1869	654783	654460	TRUE	20	CTGGTGGATTCGAACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLVLQIDFLIFQTLGDCVKVIIGKIISSSSWHSLIALGPLRTLYECSLHLMRGTKNQAQHKPTWDKVPRDSIVHTFALDGDRCHFGPQALGIASLICSYVCTLN	656328	474222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_474264_652606
896350	contig_3382_pilon	+	3288	14	Intergenic	novelGene_124172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_13	308.836660453769	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	218	2776	951880	992942	FALSE	5	ATTTTGCTTTGCTGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGMIQTNTASKTQKDVARRPQFVSSRGVEELLKGAGCEPAPSPSVTSNVPPLDHPSLPLNGYKLSIIGDQLPEYTTISESFKASMKNFKIEKIKKIHNPKLLDAFQRKKSKMKNPNERILFSAANRSHVDSICAYNFDWTLHGTHDTRYGRGNYFTKEAIYSHKNCLCDDKNIVMFVARVLVGDFTEGNMTYTHPPRRFCDPETRYDSCVDTRLNPSVFIIFQKDQI	945153	993454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_945244_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_978965_979048_981257_981389_981763_981898_987357_987584_992938
896351	contig_15518_pilon	+	1104	3	Intergenic	novelGene_127584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	508	junction_1	93.5	190	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	585	1058	15096	16176	FALSE	10	CTCATGCTTGTTGTCGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGEASIPLHLALF	11046	16222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808
896352	contig_240_pilon	+	3377	1	Intergenic	novelGene_173812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGCAGCTCGTGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802651	806028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_802700_806000
896353	contig_9727_pilon	+	1827	7	Intergenic	novelGene_86335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	230.837364585738	24	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	153	812	425838	430935	TRUE	70	AAAAAAAAAAGAAGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILPGRGRGHRSAPAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425209	436581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704_430950_435580
896354	contig_6163_pilon	+	3695	2	Intergenic	novelGene_103868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	654	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	141	407	521450	521716	TRUE	20	TATTCATTTTTAGAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AITLPGSAGPPGFTQAQTPAATISESLRLSPRCPPSALRRPSSQAVMLEALGSLPTQMVRAGQGTARDPCTPLLSPAAPNPCLKTDPVQCGYLPASSLSCASLVLFSLPRRGSHCLCSVRMLSCPGKPRIGLLA	521309	525086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_521895_521976
896355	contig_4531_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_47872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	1135	1650	199143	198628	NA	30	GGCCCCATGTAGAAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLAHPGVCLAVGVACGMCLGWGLRVRFGMTPKSSMNETDRETGTEASILGESGEYKMILVVRNDLKMGKGKVAAQCSHAAVSAYKQIQRRNPELLKEWEYCGQPKVVVKAPDEETLAELLTHAKMLGLTVSLIQDAGRTQIAPGSRTVLGIGPGPADLIDKVTGHLKLY	200277	197976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_198000_200300
896356	contig_5791_pilon	-	6828	11	Intergenic	novelGene_35847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	131.075588879089	836	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	4340	6136	1060017	1048747	FALSE	55	TAAAAGTACTTTAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSKILSNWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNPTEKHKKLYPSCSFIQNLVSVTSLGSTSKNTSPMRNSFAHSLSPTLEHSGSFSGSYCNLSPNPVNSRAVEDISPLRTNPYSYAMSTEEARFLTYQMWPLTFLSPSDLARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRFSISNLSMQTRAARLRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFADEIQARYPHLLEQLLSTSDTPGDESADPPIVHFAPGESSSEDAVMMNTPVVKAALEMGFSRKLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAENEKREEEKERQTEKMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLTANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLREIDSTLYKNLFVEKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS	1142432	1048054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1048941_1049054_1049097_1049372_1049628_1052379_1052623_1056491_1056541_1057135_1057215_1058982_1059083_1059182_1061360_1062623_1065284_1114355_1114648_1142387
896357	contig_1856_pilon	+	5829	9	Intergenic	novelGene_84867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	599	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	4961	5404	285591	286034	TRUE	25	TAGTGGGGCAGGGAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNRFKHHSFTFKVLQSPPPSLPVLCHFSFPSLHEHFPPATLLTTASLKQHSISTFTQTHGVEECRHNPASLTRLQMLSFDFVFYKRHTMPFTICPEGILMGPCLSTPRAAVTKDYKVDGFKEQKCIISQFRGLKSGIQVSMPSYF	171306	287206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_174526_176910_176962_181398_181501_205259_205610_259395_259735_260037_260191_271176_271560_285227_286288_287034
896358	contig_10500_pilon	-	2635	8	Intergenic	novelGene_41237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	945.266769386358	104	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	533	1126	1635596	1629460	TRUE	20	TCTTGTATTTCTATATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640220	1626415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626853_1628387_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639834
896359	contig_9363_pilon	+	834	6	Intergenic	novelGene_6675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_4	36.7967389859482	269	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	390	764	1142637	1144893	FALSE	5	TTTTGTGTCATGTTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTATRVFIRKGPCKRALSPALGAPPQPSRPESPAGPPDGVPEEAQPPQLGQERDPGGITAGSTDEPPMLTKEEPVPELLEAEAPEAYPVFEPVPPVPEAAQGDTEDSEGAPPLKRICPNAPDP	1141299	1144963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1141501_1142026_1142106_1142434_1142544_1142636_1142800_1144219_1144306_1144767
896360	contig_12427_pilon	+	2304	20	Intergenic	novelGene_40495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	202.490613988557	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	927	2000	412488	419950	FALSE	20	TCTGAAATTTGTCTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPIAEQRTESTPITTVKQPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTDHMVFQFDCTNTLNDQTLENITVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAVACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKVNFEAAWDEVGDEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDILVRSRLLLLDTVTMQVTARSSEELPVDIILASVG	397761	420254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_397850_398775_398829_399258_399340_399599_399672_399853_399934_401068_401145_401423_401517_401946_402034_403281_403384_410306_410422_411285_411362_412484_412585_413035_413162_413426_413496_414080_414224_414538_414711_415809_415908_417571_417711_417961_418061_419819
896361	contig_3789_pilon	+	2081	2	Intergenic	novelGene_79809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13221	124725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_14052_123474
896362	contig_13674_pilon	-	1640	2	Intergenic	novelGene_140302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	221	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	483	818	12382	10593	FALSE	15	CCAGGCCTTGCCTTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLHICASRESRFQAMQHHLARMGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPWDPTSGSPDQEAAPHANRAPQPLRKKQRWCTEPGPRRKEPAEPEVPTVQGRESLWANMSIH	12864	9770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_10679_12132
896363	contig_10324_pilon	+	5546	16	Intergenic	novelGene_7788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_9	132.544667523401	524	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	122	2023	127582	138898	TRUE	30	CCCATTCTAACCCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEDKYEILQSVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAEQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSQFYSNGGHSGNAGGGGGGGGGGSSGYSSYYQGDDYNSPVPPKHAGKKQPHGGQQKPSYGSGYQSHQGQQQSYNQSQYSNYGPPPGQTERLQSWTRQLLLLLKLLQLPRGRGWIRLQLREQIQLQW	127460	143052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_127604_128947_129040_129428_129525_130122_130235_130664_130763_131330_131443_131545_131657_132019_132220_132653_132822_133237_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_137596_137964_138885_139015_139645
896364	contig_4924_pilon	-	2439	10	Intergenic	novelGene_84662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	1161.46842986809	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	31	1194	252576	65524	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252606	62882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
896365	contig_4845_pilon	+	2964	18	Intergenic	novelGene_53674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	700.641618947014	460	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	429	2531	803035	955709	FALSE	65	AAAAAAAAGGAAATTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQTLQEALKVEIQVHQKLVAQMKQDPQNADLKKQLHELQAKITALSEKQKRVVEQLRKNLIVKQEQPDKFQIQPLPQSENKLQTAQQQPLQQLQQQQQYHHHHAQQSAAPSPNLTASQTVTTASMITTKTLPLVLKAATATMPASVVGQRPTIAMVTAINSQKAVLSTDVQNTPVNLQTSSKVTGPGAEAVQIVAKNTVTLQVQATPPQPIKVPQFIPPPRLTPRPNFLPQVRPKPVAQNNIPIAPAPPPMLAAPQLIQRPVMLTKFTPTTLPTSQNSIHPVRVVNGQTATIAKTFPMAQLTSIVIATPGTRLAGPQTVQLSKPSLEKQTIKSHTETDEKQTESRTITPPAAPKPKREENPQKLAFMVSLGLVTHDHLEEIQSKRQERKRRTTANPVYSGAVFEPERKKSAVTYLNSTMHPGTRKRGRPPKYNAVLGFGALTPTSPPSSHPDSPENEKTETTFTFPASVQPVSLPSPTSTDGDIHEDFCSVCRKSGQLLMCDTCSRVYHLDCLDPPLKTIPKGMWICPRCQDQMLKKEEAIPWPGTLAIVHSYIAYKAAKEEEKQKLLKWSSDLKQEREQLEQKVKQLSSSISKCMEMKNTILARQKEMHSSLEKVKQLIRLIHGIDLSKPVDSEVSVGAISNGPDCTPPLPTPPPPRRPPPPPPRAAQRTVTRGKRLNNRAPLGEATGSRQQGAAKY	764634	956142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_764930_794494_794536_802942_803089_807471_807505_810596_810663_916632_916840_923065_923315_924518_924609_930192_930487_937530_937630_941043_941096_941861_941942_942423_942485_945067_945232_951798_951955_953267_953344_953723_953828_955391
896367	contig_10074_pilon	+	395	3	Intergenic	novelGene_57191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAAGAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577105	586335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_577200_583722_583871_586182
896368	contig_7963_pilon	-	1940	4	Intergenic	novelGene_58542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	71.6534871602368	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242948	239202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241568_241703_242713
896369	contig_5935_pilon	-	1662	2	Intergenic	novelGene_102735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	950	1360	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1216243	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237
896370	contig_5686_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_45394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCCAAACTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172711	169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_171800_172507
896371	contig_20004_pilon	-	6363	8	Intergenic	novelGene_167525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	596	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1594	2439	30882	30037	TRUE	15	AGTCCTTCCCCTGCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSSQGPAAATNGTLVTSLATVLSIAFSPFSSDSELRAKPSLLSSEPMQLAGPSPSSSVIPVLVTALSPSVPSFTEPSPSWLALVAGGPSLSTSTTFAPVTMRSSCGPAPVTEQITKLSLLPSATVHVTVPSVSFLGPSLVIIFWNSSTSSLLKDPSLISVPALVTAPSLSTSLINVTVPSTISESLFEEPSHFSSEPALVTASSFSSVPTLFTLSSILPMWTVTGAAVLSSDSAMVHSPLSPSLVLVRKVSLSANPSVTTPPPSSAAANTVHSLGSAPT	32586	14664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_15023_15809_15963_18692_18861_21291_21402_22278_22418_23471_23545_27113_31991_32101
896372	contig_7279_pilon	+	2134	13	Intergenic	novelGene_145981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	264.57832016248	360	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	19	1329	64657	99452	FALSE	25	CCCATCGCCATTGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFEFLEMSSRKSKSNSLIHAECLSQVQRFLRERFCRQSSHSNLFGVQVQYKHLIELLKRTAIHGESNSVLIIGPRGSGKTMLINHALKELMQIEEVNENILQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGNRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPVAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	64638	100257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68712_75401_75478_76321_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
896373	contig_5696_pilon	+	5887	25	Intergenic	novelGene_117601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	145.899413600223	872	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1890	5670	217	5886	806936	879786	FALSE	35	TTGCATCTGACTATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRRARLSVKPNVRPGIGARGPATPNLQRGKEPPRPSEPAAASAPKPAEPTDVPPVDFGGAEPQVKAPRSSDEKTEGENDVEECSKSSPTVSQRRKRISSTSSQDKPSVSVPSEPHPLSTVSQEVPQPSPVPTKEKQPCSDRYRIYKAQKLREMLKEELRKEKKQWKNKYAINESQRPPDRSKMTMRDFIYYLPNNNPMTSSLEQEKKTEKSLTPVQTREQENKSTPDAEENEEMEEETDDGPLLVPRVKVAEDGSIILDEESLTVEVLRTKGPCVVEENDPIFERGSTTTYSSFRKNYYSKPWSNKETDMFFLAISMVGTDFSMIGQLFPHRARIEIKNKFKREEKTNGWRIDKAFQEKRPFDFDFFAHLLQKVLAEEEKRKQKSVKNQNPKEKKSSKPRKKVKVKKVVSEGVNDGPDESVSTKISDTEGLLKDAQTVEEEQSSLTLSEQDSAEIALESDLNQKKRRRRNQDKADVKNLLGNATVQSGPSKGEKHKNKCESLRPEEKEDECCREQKLSCLQNTSDIVDIPSSEKDEKRTDPILSSSNQKDAMLVSTESSESSTSDLPSSEVGTKALSEVNNAESSCTEERNVDLKNKSLETDQTGNVKPMVRGRLQRPKPNLSRAVGKKPVSSQGKTDAENRSSHPETSVEKNHMEKDQMNIFDSLGMENSEKASTEAETVSNLSEKICLREDKQPKAFRPTQLMRGRLQRPKPNVGKVAERKEILASQEKIGADEEKNENESCIDRDAPEQMEDQSCKNFDCGDIVSQPEKKDTSFHNVQPDEPKTLNECLCIQEDNEANICKQAPIVRTRFQKPKPIIERGTGRREIFSREEVPEKILDPGEMESDLGEIARLETSPREKMPVEANTTKEMETDVKETGRRDISLREKIAEMIDITMEMETSLTETGREISPRENESEVIDALEEIETDFEETERTEISPWEKAPEEIKTVGEVEKGLKKTEKEVSPRKKLPEMIVASEEREADFKEPERRETSLQEEAPEEVKTVGEVEKGLKKTEREVSPRKKLPEMIAASEEREADFEETGREISAWEEAPEEVKTVGEVETDLEETKREVSPRKKIPEMIAASEEGKADFEETGREISPWEEAPEEVKTVGEVETDLEETEREVSPRQNIPEMIAASEEREADFEETGREISPWEKAPEEVKTVGEVETDLEETEREVSPRQNIPEMIAASEEGKGDFEETGRREISPWEETPEEVKTISEVETDLEETGREMSPREKVVKEVSAIREREIDLKETGKGNIFLMDKVSGKMTVIEETETDLKDTRREISLRETGSEEISAIEEMVADLKNTGKTDTAPRENEPEETATSRLIETNLIQSSSGDCSPMPSPDIQNISSDVLSVVRTSVEEERNSEKEVSSQLSHSKTSLQTSELGKTEDQGMQFPDVPEQFSDTNLSKSLTQEQKPLEVKTAPFVRSRFKRPKPNLARVSLKRETTEAEKYVPGKKLETDKMETVVLQQNSQQTNNYPSQDDVASLMTSRKKDESDHKEEKAVILPCIQPEKNLSHSGSREPNEESQSTQAQENDLVASTGTYNINTFQQEMKESSIQTTRPIRRRLQRPRPNIRKIEQRQIVEKGEAKDIIKEERPMSQKDETKNFLAVSNSQIGTEIEVVSSKVSECRINEDQSHVVLVESLHVNKINVLDEKIREEHKTYTPSPAQLVRRQFQKAKPNLRRTHSKKKEPGTEEDTADQSEARKLEDSLLQQEDSDIQLLLKKNTELLTSLESSARKDCVGPSEGVLAKKDAESEEPGPSGSVGKETLGDNSVSSIIGEQYLSKPKSCPQLLKESNYSKIALDRRMAVSSTSECEINHSERRIHRKSKPNVTKGRSSKRNRGKSSKKEPRPSKAMLVTLRASQEEEEDDAED	806719	879787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_807148_809874_810152_814643_814754_815988_816049_825042_825172_826241_826376_827364_827460_834339_834395_836788_836933_841072_841349_842653_842802_848833_848993_853128_853289_856802_856895_857832_858029_858822_858957_863077_864777_865435_865624_866009_866233_867817_867997_870445_870654_871491_871632_877588_877791_878034_878229_879530
896374	contig_10775_pilon	-	2972	1	Intergenic	novelGene_157937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	769	1113	15815	15471	NA	45	TAGATGCAGAAGACCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNTKINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEMASVIKGLRKRFETGEERISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEESLRIMCDTIRRKNLLVIGVPEQGENRKHREDR	16583	13611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_13600_16600
896375	contig_14525_pilon	-	1924	19	Intergenic	novelGene_149754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	232.639975121842	61	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1395	528	1922	148448	127722	FALSE	55	ACAGAAGAAGAAGAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGATGGASVPALWSEINRYGQNGDFTRALKTVNKILQINKDDVTALHCKVVCLIQNGSFKEALNVINTHTKVLANNSLSFEKAYCEYRLNRIENALKTIEGANQQTDKLKELYGQVLYRLERYDECLAVYRDLVRNSQDDYDEERENLGLQEGTHELCYNAACALIGQGQLNQAMKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQIIKLKPTDVGLLAVIANNIITINKDQNVFDSKKKVKLTNAEGVEFKLSKKQLQAIEFNKALLAMYTNQAEQCRKISSSLQSQSPEHLLPVLIQAAQLCREKQHIKAIELLQEFSDQHPENAAEIKLTMAQLKISQGNISKACLILRSIEELKHKPGMVSALVTMYSHEEDIDSAIEVFTQAIHWYQNHQPKSSAHLSLIREAANFKLKYGRKKEAISDLEQLWKQNPKDIHTLAQLISAYSLVDPEKAKALSKHLPSSDSMSLKVDVEALENSPGATYVRKKGGKVAGDNQTKEQGSQGDLKKKKKKKKGKLPKNYDPKVTPDPERWLPMRERSYYRGRKKGKKKDQIGKGTQGATAGASSELDASKTVSSPPTSPRPGSAATVSASTSNIIPPRHQKPAGAPATKKKQ	157407	127719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434_128595_132105_132147_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137069_138539_138605_140186_140260_141223_141353_142242_142375_145157_145216_145303_145429_146713_146746_148423_148536_148671_148759_153473_153598_155326_155448_157299
896376	contig_3233_pilon	-	3524	7	Intergenic	novelGene_56575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	92	580	747951	745302	TRUE	10	CCCCATCCCCACTCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLGRGGARTRPLGKGVGVEGNGIDVVVHGEEVPDVLSPKAGPTQGRGVPQLHQGEAGERVLSLHLSAMCQRQNETFLQQLPALPHRAHTQDGEANLPLEQDRVNLRQHGYNVSAQHLPSFPEDVPGEGVSLLSTTFCNFPAKPSKPAFIKVPIQVGEDS	748042	739193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_741901_742723_742834_743703_743816_745286_745381_746325_746423_746935_747014_747716
896377	contig_5696_pilon	+	3489	12	Intergenic	novelGene_117506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_11	312.959295534031	292	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	120	1160	319727	344587	FALSE	35	AGTCCCAGCAAGGTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLPDYVTFKSFPGIPLQHIFIAAGDDLLDLIQGLFLFNPCTRITATQALKTKYFSNRPAPTPGCQLPRPNCPVETLKEQPNPAVATKRKRTEALEQGGLPKKLIF	319607	346916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_319793_320115_320176_325481_325516_328900_328969_329757_329827_330561_330673_331781_331901_333678_333779_335425_335513_341540_341691_343997_344146_344558
896378	contig_4301_pilon	+	2766	4	Intergenic	novelGene_65101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	248	junction_1	70.0682207249161	1	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	48	1082	494740	530958	FALSE	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVSQELKEPLHKALQMLLSQPVTYQAYRECTLETAVHASGWNKILVPLVLLRQMLLELTRRGQESLSALLQFGVTYLEDHAAEYIIQQGGWGTVFNLESEEEEYPGIIAEDSNDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	494692	532642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_494754_499139_499210_507918_508063_530151
896379	contig_10569_pilon	+	3742	6	Intergenic	novelGene_44061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	269.540052682343	515	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTAATGAAAATGGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231728	334198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_231795_232306_232520_290798_290895_323271_323378_327955_328036_331017
896380	contig_6445_pilon	-	4185	1	Intergenic	novelGene_77033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	2528	3124	542546	541950	NA	20	GGGTTAAAATGTTGTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRCKQCRCPATDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	545073	540888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_540900_545100
896381	contig_10140_pilon	-	3106	20	Intergenic	novelGene_148401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.76898816475	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	521	2380	257472	206537	TRUE	80	ACGGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSSQETRKTKSSSPKKQNDVRVKFEHRGEKRILQFPRPVKLEDLRSKAKIAFGQSLDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILLVVNGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSVIGSTSRDRNSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHQQDYNDGRKTFPRARRNQGTSFRSTVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	283884	205697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_206163_206275_206763_207479_207658_225873_226004_231195_231328_231634_231784_237110_237318_238205_238299_238478_238547_239767_239848_242173_242305_245466_245555_245924_246039_250302_250403_251965_252007_252675_252795_257468_257538_264843_265061_279919_280086_283812
896382	contig_6047_pilon	-	4665	3	Intergenic	novelGene_24221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCAGCCAACAAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132504	126176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_127865_128440_128521_129607
896383	contig_8263_pilon	+	2402	7	Intergenic	novelGene_83090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	184.818529614562	23	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1679	2104	192474	192899	FALSE	80	ACAAAAAGAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139584	193197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_139714_140073_140168_179979_180107_184211_184297_187959_189005_189258_189386_192402
896384	contig_6102_pilon	-	1407	9	Intergenic	novelGene_32151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	8	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	178	660	867239	839973	TRUE	20	ATCTTTGAGCCGTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867416	838828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839527_839923_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
896385	contig_2770_pilon	-	1522	6	Intergenic	novelGene_107468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1801.97320734799	19	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	236	676	750561	743785	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVFPPPLEESN	750796	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743815_744044_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
896386	contig_9423_pilon	-	3366	10	Intergenic	novelGene_99170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	172.196270446127	412	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	761	2341	61283	33642	FALSE	35	GAGTGAACAAATGGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKKYGQLEEYLSLADYFQDEKFD	74920	32616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_33708_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_62246_62375_73820_74027_74502
896387	contig_7962_pilon	+	3126	2	Intergenic	novelGene_149291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159186	162948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_159471_160106
896388	contig_11281_pilon	-	2806	23	Intergenic	novelGene_125443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	918	junction_14	640.00198379083	344	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	43	2451	972015	798705	FALSE	25	TGGACTTTCCTGTGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKNLPTYPGPNKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIRKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLEMRLSEVITDTGVVCHKLATRIFECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPYRSEAKKTKVKKKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	972057	798349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558_859632_860043_860125_886942_887020_900630_900726_925832_925937_971938
896389	contig_10367_pilon	-	2832	6	Intergenic	novelGene_169454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	138.18914573873	643	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	627	1421	136272	131866	FALSE	35	GAGTTTAAAGCAAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYGVEWHSVRDSEGQRLLVGVGPEGISICTDDFNPINRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQSCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	156300	130454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133633_134055_134895_135061_136153_136352_137635_137822_155939
896390	contig_20951_pilon	-	1602	4	Intergenic	novelGene_43053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3166	junction_2	13406.7196833031	43	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	10	1008	28919	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28928	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685
896391	contig_10437_pilon	+	1658	8	Intergenic	novelGene_38296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1277.80631536702	105	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	219	1127	432090	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKTGSVNYRQPYVQTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431117	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_431946_432216_440635_440672_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
896392	contig_10263_pilon	+	6669	20	Intergenic	novelGene_135851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGCACAAACCAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893236	988367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_893297_897062_897124_897769_897854_899261_899344_900410_901819_902513_902636_902769_902829_903040_903217_903552_903667_904812_904978_905074_905175_905861_908628_914657_914741_923074_923264_924533_924868_926098_926322_927974_928063_965320_965476_967563_967785_988188
896393	contig_10437_pilon	-	422	1	Intergenic	novelGene_38368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTACTGGTCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560623	560201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_560200_560600
896394	contig_5057_pilon	-	3269	3	Intergenic	novelGene_151500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	71	junction_1	4	366	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	83	529	371370	365024	FALSE	40	AACAGTGTGTACATAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKWLCGVTCDRSEINPHSTPKARFSTAMERQQGQVSQATLPLAQAHFEKGQYAKAEALYSAFIRHCGWTASARAGPGSKCSPEDLATAYNNRGQIKYFRVDFYEAMDDYTSAIEVKPSFEVPYYNRGLTLYRLGYFDEALEDFKKVLDLNPGFQDAALGLKQTILDKEEKQMRNY	371452	362283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_365152_365902_366070_371218
896395	contig_13153_pilon	-	3047	3	Intergenic	novelGene_107279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	361	786	72012	71409	TRUE	45	CTAATATAAATTCAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNEKKQLQTSINNWNVESQSMNLGKLEVVRNEMQHIKTDILGISEMKWTSIDHFESDNHMVYYAGNEKLKRNSVIFIIKKNISKSILKFSAVSDRIIAMSYKEDHFNTTIMQIYTPTTNDKGEEIEDFCQFLQSDQTCN	72372	35499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13153_pilon_-_35510_69157_71484_71661
896396	contig_15952_pilon	+	2343	10	Intergenic	novelGene_154077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	14.5525866352954	372	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	27	1427	534671	539422	FALSE	20	TGTTTAAATATTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYVAAAAVLEGVENRQGSIKGLVYGRRFQNVKQLYALVCETQRYSVVLDAVIASAGLLRAEKKLRPHLAKVLVYELLLGRGFRGSGGRWKPLVARHQARLKAELARLKVHRSVSRNEDLLELASRPGPALQVPRFVRVNTLKTCSDDAIDYFKRQGFSYQGRASSLEDLRTLKGKHFLLDPLLPELLVFPAQTDLHEHPLYQAGHLILQDKASCLPAMLLAPPPGSHVIDACAAPGNKTSHVAALLKNQGKIFAFDLDAKRLASMATLLARAGVSCCELAEKDFLAVSPSDQRYRQVQYILLDPSCSGSGMLTRQLEEPGACAPSKKRLHALAGFQQRALCHALTFSSLQRLVYSTCSLCQEENEDVVRNALQNSAGTFRLVPVLPSWPHRGLGTFPGAEYCLRASPETTLTGGFFIAVLERKEVSSSASHTEAPGPELTASPTPKRKKKRRKLVAGASTLPGT	534644	540338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_534764_534916_535040_535482_535658_535745_535855_537602_537742_537826_537943_538401_538581_538774_538986_539092_539234_539307
896397	contig_10930_pilon	-	2540	7	Intergenic	novelGene_36989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	1714.95879445154	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	25	1344	280370	268573	FALSE	20	ATCACTTACTGTGCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKY	280394	267376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272895_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
896398	contig_4803_pilon	-	4908	28	Intergenic	novelGene_150698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	540.678580902152	1773	71	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	205	1257	66839	41896	TRUE	20	ATGACATTTTTCTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPTETKAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDESTSRHVYLIRSSLQTYEVGKRSNFILHVFSRCFFLFFLLSSGKSQRRKSKEVW	93270	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37523_39345_39436_40570_40619_41849_42058_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
896399	contig_5917_pilon	-	4237	17	Intergenic	novelGene_122161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	243.054255452872	13	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	185	2416	794139	699492	FALSE	25	GATACCACAGTGCATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAQPDSSSPSQARTGSLCSVSIERALPEDRGLYKCVAKNSAGQAECSCQVVVDDAPTSENAKAPGTKSRRPKSSLSTVLGTESDATVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGEPVELFGKVTGTQPITYTWMKFRKKIQESEHIKVESSESGSKLTILAAHQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSVEIWDSVDKMWKELATCRSTSYNVQDLLPDREYKFRVRAINVYGTSEPSLESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKEPTVDYRTVTVNTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTGKIWAGKFFKAYSAKEKENIRQEIGIMNCLHHHKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMKQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRVKLIDFGLARKLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLNCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKSRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETMEEGEGEGEEEEEE	794323	697670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_699687_702411_702483_703920_704051_710938_711063_713668_713822_727577_727702_730400_730619_737111_737316_739064_739159_739265_739299_748376_748680_757473_757628_759684_759813_760815_760867_781978_782066_793276_793394_794093
896400	contig_8014_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_178139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	837	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAACCATGGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109575	112930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8014_pilon_+_109815_111313
896401	contig_6230_pilon	+	3204	4	Intergenic	novelGene_102080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGCCTTCACCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22455	155578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_22859_23758_24597_153101_153801_154314
896402	contig_13699_pilon	-	3752	17	Intergenic	novelGene_158334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGAGACTGGACGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160086	126697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_126768_126902_127020_127463_127637_129028_129188_130126_130321_130673_130804_131646_131791_132304_132494_135024_135148_135725_135888_137530_137696_139002_139156_140352_140428_144853_144972_154113_154325_157693_157824_158647
896403	contig_14142_pilon	-	2580	11	Intergenic	novelGene_120453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	191.86505674562	831	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	501	1349	100563	98719	FALSE	55	AAAGCAAAAAAAATCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRTEELAQAYDAFTLAPASTSR	102673	97487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98743_98845_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080_101262_102558
896404	contig_10235_pilon	+	3403	1	Intergenic	novelGene_46507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	641	1926	1133	3058	297036	298961	NA	25	AATGTGTTAATTTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	295903	299306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_295900_299300
896405	contig_11422_pilon	-	314	1	Intergenic	novelGene_99022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATGCCAATTGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375	61	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_100_400
896406	contig_5092_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_62278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	433	759	234166	233840	NA	45	AACAGTGAATTGAATTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLWIIPQHKTKILTSGTISNMINGEKIEVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKGRIALGKSAAKDLFKMLKSKDGTLRTKVCLTQAMVFSVASYACESWAMNKED	234598	232748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232700_234600
896407	contig_6630_pilon	-	2733	1	Intergenic	novelGene_30695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTTGCTTGGATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358611	355878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_355900_358600
896408	contig_16525_pilon	-	534	7	Intergenic	novelGene_133802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1765.09525238725	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	100	429	97096	91591	FALSE	30	TAAAAGATCGCCAGTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97634	91485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97095_97167_97605
896409	contig_5832_pilon	+	3144	2	Intergenic	novelGene_134110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	710	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGAGCTATTTTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5403	23067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
896411	contig_5429_pilon	-	3780	7	Intergenic	novelGene_127821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281.208947621199	712	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	178	786	605730	600615	TRUE	40	GTTCCTAGCAAGTAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLRSALARSRKPRSFSGRGKSDGERLQRAFAAPRTPGAASARPRSPSSPPPETNQTPGPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQQNSGRMSPMGTASGSNSPTSDSASVQRADASLNNCEGAAGSTSEKSRNVPVAALPVTQQMTEMSISREDKITTPKTEVSEPVVTQPSPSVSQPSTSQSEEKAPELPKPKKNRCFMCRKKVGLTGFDCRCGNLFCGLHRYSDKHNCPYDYKAEAAAKIRKENPVVVAEKIQRI	610777	597264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_598758_599113_600764_602142_602269_604336_604441_605088_605201_605612_605755_610624
896412	contig_7593_pilon	+	3751	1	Intergenic	novelGene_127354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	725	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTCATTCTACTGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652166	655917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_652200_655900
896413	contig_19016_pilon	-	4436	4	Intergenic	novelGene_173333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	129	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	3225	4223	6021	5023	FALSE	50	CTATAAAGATAAGGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEEDTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQEQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	18244	4809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_8332_9834_10507_16153_16382_18230
896414	contig_9127_pilon	+	8177	35	Intergenic	novelGene_102996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	92	junction_16	137.541035084734	439	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2125	6378	1007	7384	33725	93013	FALSE	35	ATTAAAATGTTTGCAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPIYLKRLLPVFAQTFQQTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDVGHNLPTILVEITATVLDQEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSTLAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQEDAKELQQGKPYHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSALGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATILKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHFKAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVLLKDENTISPYEMCSSGLVQALLTVLNNSMDLDVKQDCSQLVERINVFKTAFSENEDDESRPAVALIRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFVFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGLWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQVSKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPPKDEKQGWRHVRIKQMGKNASGQTHYLSLSGFELYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGNPQGEGTVTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVKNNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLSSAENVPQAEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRTPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVSDLTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATATTVLSVGQTLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDENEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPAGAGSRPIGEQEEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALTLKVTGLGTTREVELPLTNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKENRKMGCWSVEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEHGTKSGLNQGAISTLQNSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSRISQEEGDEQLQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCDDNFPDDESRHVDLGGGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILNWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILSNKDLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLAATMEKGFHLN	32147	93806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_33146_33716_33892_38563_38703_38909_39081_41395_41619_42231_42496_42595_42673_44971_45107_45642_45790_47704_47800_49034_49141_52748_52884_53376_53517_53938_54263_55258_55426_55539_55717_58990_59828_60686_60909_66132_66267_75686_75810_77363_77521_79444_79668_80792_80848_81072_81256_81654_81863_81950_82037_82258_82387_84685_84888_86356_86495_86826_87435_88352_88432_88555_88650_89450_89602_91668_91814_92875
896415	contig_8636_pilon	+	2448	13	Intergenic	novelGene_141930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	159.822362327679	340	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	496	933	450918	453202	TRUE	25	CCTAGCCCTCTGAATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSAAVAKQALAHGLKCKSQFTITPGSEQIRATIERDGYAQILRDVGGIVLANACGPCIGQWDRKDIKKGEKNTIVTSYNRNFTGRNDANPETHAFVTSPEIVTALAIAGTLKFNPETDFLTGKDGTKFKLEAPEADELPPRGV	392434	457479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_392473_429634_429772_436550_436758_449665_449741_450879_451038_451238_451313_451844_451957_452835_452960_453194_453353_454293_454486_455494_455628_456086_456209_456561
896416	contig_1443_pilon	+	4380	15	Intergenic	novelGene_28358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	374	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCCTTTGATATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937779	950807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_939664_942216_942335_943113_943230_944101_944405_944695_944849_945070_945788_945880_946090_946553_946762_946940_946995_947482_947559_948675_948805_949929_950036_950306_950396_950485_950642_950745
896417	contig_8303_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_154918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTGGTATAAACAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29783	27835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_27800_29800
896418	contig_13565_pilon	+	4948	13	Intergenic	novelGene_162367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	148.877536362385	795	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	283	1254	173055	209032	FALSE	30	AAGATACCTCTATTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTREIENYPHFFLDFENAQPTEGEREIWNQISAVLQDSESILADLQAYKGAGPEIRDAIQNPNDIQLQEKAWNAVCPLVVRLKRFYEFSIRLEKALQSLLESLTCPPYTPTQHLEREQALAKEFAEILHFTLRFDELKMRNPAIQNDFSYYRRTISRNRINNMHLDIENEVNNEMANRMSLFYAEATPMLKTLSNATMHFVSENKTLPIENTTDCLSTMTSVCKVMLETPEYRSRFTSEETLMFCMRVMVGVIILYDHVHPVGAFCKTSKIDMKGCIKVLKEQAPDSVEGLLNALRFTTKHLNDESTSKQIRAMLQ	86249	212726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_86325_132326_132369_134059_134215_173044_173125_195305_195428_196635_196742_198595_198733_199214_199293_199471_199589_199677_199758_201420_201548_206798_206870_208968
896419	contig_938_pilon	+	6340	13	Intergenic	novelGene_143909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	184.201806602312	818	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1042	3129	93	3221	24323	97944	FALSE	30	TCAGGTTTTTAAAATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPGSEIIESVLPAEPEASESTADENEDDIQFVSEGPLRPVLEYIDLVSSDDEEPSTSHSDENVKHKDYIENQQDKVALTLARLARHVEVEKQQKEEKNRAFREKIDFQHAHGLQELEFIRGHSDTEAARLCVDQWLKMPGLKTGTINSGTKSSFRRGGQMRVSGKPISCPIMHCNKEFDNGHLLLGHLKSRFDHSPCDPTITLHGPFTNSFACVVCYKKFVTQQQYRDHLFAKEAANDGHKNNLLPQIIQCFACPNCFLLFSSKDECLKHMSGKNHFLQSFKLGDDKGIAHPISFPSLAKKLLIDLCKDVPFQVKCVACRQTLRSHMELTAHFRVRCRNAGPVAVAEKSIAQVAEKFVLRGYCPNCNQVFVDEASTRNHKQNSGHKVQIITSMEESVLLYCHSNQGNKPPSDLHLLLDKSKFSSLKRTMSIKESSTQDYNTIPKKKMNLENESCGAVVCVQRDKSTIKTWFCECHQRFPSEDAVEKHVFSANTMCYKCMVCGKVCEDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELIRKETIMAHVTEFHNGHRYFYETEEVEGETLPLSSTTLGTNSTKKPSSTITIIDHSPASNPPRGKWQCRICEDMFDSQECVKQHCMSLASHQFHRYSCARCKKTFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLVFNVEEAFLIHYKERHSIDYVFVSEKIETSIKTEDDFPVLETSNLLTCGCRESYICKINRKEDYSRCLQIMLDKGKLWYRCNLCSVTAQNLADMKTHIHQVHREEKKDEEEQHYVIKCGTCTKAFHDPESAQQHFHRKHCFLQKPSVANFGSEKGSLYKFTASASPTERKLKQAVSYPKNSDVEKGAENDLSCQNIDEEAVELPDLDYLRTMTHIVFVDFDNWSNFFGHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIFNYLNRIGCFFLHPRCSKRKDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHILNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKGMQLPSQCKPPKRRRFHC	24230	101063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_24344_24837_24922_32069_32151_64172_64299_68841_68954_74981_75133_76311_76442_82206_82361_82853_83002_91965_93570_95206_95351_96634_96766_97701
896420	contig_50_pilon	+	3242	1	Intergenic	novelGene_122211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGGATGGTTGTCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36654	39896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_36700_39900
896421	scaffold_9100_pilon	-	2367	8	Intergenic	novelGene_83303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	342.260015729777	38	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	95	1318	796487	765606	FALSE	40	AAAACCATAGCTTTTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETINVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPNVSASYPPYQATGPPNTSYMPGMPSGISAYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGQYPATTSSQYPSQPPVTTVADARRKQKQVWICGHSYVFWAEKRALKRSFGSQLGISVEDARLHWIGKSGMMWDQLTPTLVHARRRLPDPDVLVVHLGGNDLGVMELLDIITRIKKDLRFIKQMFKNVTIVWSNMIPRKVWYNSAKPHFMNKCVKKGNELIGSFMKFIGGSTISHASLVPESPGLFHLNGVLLSESGTDIFNLDLLSVLETLI	796581	764556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_766187_768983_769076_774460_774528_777866_777994_781780_781945_783998_784065_786207_786293_796445
896422	contig_4659_pilon	-	3295	2	Intergenic	novelGene_118175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	250	junction_1	0	589	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGAATGTACTTACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95320	91477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_94717_95264
896423	contig_10864_pilon	-	8802	18	Intergenic	novelGene_107041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	116.030928939607	504	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1829	5490	604	6093	762985	705550	TRUE	85	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSCTSWPPPPQDTPSDDRQRMCSCSCTLGRTPPCWTPTPAPPVDVLKRNKNFKAIKKINSHLEKLAPCSKDLPEASNDDGPVDESEIFQRACEQLEKCMDSGNRSLRKHFPKQDTVQRFLCLLSSLQEIPPDRVCNINRDCANVFIKFLLGKQKWPEVLLLLTGKASGEPPFRDCLIKDCSLSDLDLCAIIPHLSGWDQRKTQLLGCLIDSGASPEGLQENKESPLTLCLKFKDFELAFLLLTKGAAPHGVSFAEGDTPLHAALHIFLDVNADIGFSFLSHLLDLFLSNPTKYDYLNPNVQDGNGNTLMHILFQKGMLKRMKKLIDLLVKFNINFNLRNKEGKDARHRIKKNDPLLLAWNKALTESRRKSRQDSAAHLGKLPRPATPGRTSQPKSQGSFKSLPCDVTANPQPEGAGVADSWEIVPDAQVARQEPEDFRPCYLRDRLVQDITILIQRVELNTFLPEDCPQCAEPLVAGAGTEVEKDEFQQSPDTRSSDHTGSNPVPAEAEEGHAQAGLGATQLIPVVNRGTEDSKDQEDWSMQDIETCLQDFDNMTWEIECTSEMLKKLSSKAMTKVMKKKIILAIQHLGNGEWTQGLQKRLKHLKGKIRLFEAKLDKGARMLWELAIDFSPRCSESPEKIITTEQNVQSVDKSGQVYTEIIRIWDIVLDHGKLSDSIRAICSAYNRGLSCILRKKLKGIDKGQMSANMKIQKRIPRCYMEDTEAEKGRECMDPEYFPPASAVETEYNIMKFHSFSTSMAFNILNDMKAKVEYPFRVGELEYAVINLNPKPLEPIILIGRSGTGKTTCCLYRLWKKFHVYWEKAEQAGSPLLAKQTWLKRRLEVEPGKEGPGWEEEEEEEEDEEEEGSVEAETVDSIDEEQEGDTGVEGPDTELAGDGQAEELCVPDHAHQLEHLHQIFVTKNRVLCQEVQRNFTELSKSTKATSHYKPLEPNVHKLQDLKDENFPLFVTSKQLLLLLDASLPEPFFPRNEDGSLKRTIVGWSTQEEMTILHWQEDEEEVEVDRDSDEEDKTAEARTSDSDPRAYLTFEVFTNEIWPKMTKGKTSYNPALIWKEIKSFLKGSFEALSCPHGRLTEEAYKKLGKKRSPNFKEDRSEIYSLFCLYQQIRFQKGYFDEEDVLYNLSRRLSKLKVLPWSIHELYGDEIQDFTQAELALLMKCINDPNAMFLTGDTAQSIMRGVAFRFSDLRSLFHYASRNNTNKQCTVRKPERIHQLYQNYRSHSGILNLASGVVDLLQFYFPESFDPLPRGSGLFDGPKPTVLESCSVSDLAILLRGNKRKSQPIEFGAHQVILVANEMAKEKIPEELGLALVLTVYEAKGLEFDDVLLYNFFTDSEAYKEWKIISSFTSPSPDSREESQPLIDVPLEKLSSSKGRSLTLNPEMYKLLNGELKQLYTAITRARVNLWIFDENQEKRAPAFEYFIRRDFVQVVKTDENKDFDDSMFVKTSTPEEWITQGDYYAKHQCWKVAAKCYQKGGAGEKEKLVLAHSTALNMKSKKVSLKEKQLEYLKLAKTYLECREPKLSLKCLSYSKEFQLCAQLCEKLGKIKDAAYFYKRSQCYKDAFRCFEQIQEFDLALKIYCQEELFEEAAIAVEKYEEMLKAKALPVSKLSYSASQFYLEAAAKCLSANKIKEMMTLLSKLDIEDQLVFLKSRKCLAEAADLLNREGRREEAALLMKQHGHLLEAARLTANKDFQASCLLEVARLNVARDSDVENTKAILQEAFELCCQTNQLSGIAEAQFLQGVILRDFRKLQDAFFKFDRLNHSAGAVEALYAAASCCEAGPEMVLTLAPGGLGSPPQSGQGSQKRD	765942	698066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_698271_701748_701848_703143_706196_709614_709761_716494_716628_716737_716842_721036_721126_728101_728259_731309_731457_736516_736655_736959_737160_741987_744895_745545_745723_747814_748070_748676_748839_756674_756847_762928_763062_765415
896424	contig_2100_pilon	+	2989	4	Intergenic	novelGene_50590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	364	555	667755	667946	TRUE	80	AACTTAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATLPERLGAAGCCEGGLLPERPLGQPGLGRPGEGDQRTEGGPDAVAGAQPANCEGQVGPDCAGRAGHEAGLWSGQLARSEAAKEDVVRAAAEGAGRVPAGCGCGEQVPREPVAGSEAGRLMGSPGEGLQGQRVWPLEWRAGWLLVGLWRELGLPHWEPARLGAGPAASAAEPRSPSHSRCPGG	667391	672957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_668076_668331_668449_668940_670274_672102
896425	contig_18843_pilon	+	8547	3	Intergenic	novelGene_165622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5	941	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCACAGTGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37960	47918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_45498_46028_46259_47138
896426	contig_4125_pilon	+	1313	6	Intergenic	novelGene_25220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	60.7894727728412	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	115	648	1702282	1711125	FALSE	25	GAGATGCTTTGAGATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLQGWESFPGSPAPQPDILRLALYFLLLVPCHFTLSLPLCKEEEYPVGTECCPKCSPGYRVKQACDEATGTVCVPCLPGTYTAHLNGLTECLRCRICNPAMGLETRQKCSTIKDTECGCPRDHLCVREDTDPCAMCQPLETKGSEKKDTGCNNCPPGTFSPLETLEECQPSTKGG	1702167	1711790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1702351_1703187_1703297_1703843_1703970_1708051_1708181_1708685_1708777_1711115
896427	contig_8050_pilon	-	1341	2	Intergenic	novelGene_114835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACCAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336574	330449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_330777_335560
896428	contig_7204_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_176271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7517	5225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7204_pilon_-_5200_7500
896429	contig_4232_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_63390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGACGGAAGCGTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
896430	contig_10003_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_88144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCTTTGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371878	371206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_371200_371900
896431	contig_5782_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_162141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	1149873	1149568	NA	45	GTTAACCAATGTCATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGGPDYHEEEETRAQGVLWTWHPSAEKFLEPGNRKRESCNTRDRARWQEATTEKQWQQNQEAGVRQHSGCHGLNCVPQKYLSTWLGYDSQCCIIVYHFVI	1149875	1147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_1147700_1149900
896432	contig_177_pilon	+	2876	2	Intergenic	novelGene_41790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	382	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAATAATAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385531	402875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_385593_400060
896433	contig_9471_pilon	+	2479	8	Intergenic	novelGene_21807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_7	347.685290491976	36	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	776	1486	412726	415737	TRUE	30	ATTTATATGAATCTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPVSDNDLF	411950	417519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_416273_416936_417028_417152
896434	contig_16122_pilon	-	2516	7	Intergenic	novelGene_134484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	154.182431626376	1462	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	30	446	110548	105185	TRUE	55	TTTTTAAAAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSGARGAAMGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHKRFCELLPPNHRSVEESLQARVPFQQILSLPELKANPFKERICGVFSTSPTRDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDVKSHYAFRIFGKDQSLANATLAHMVLCGVWLGK	110577	91080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_91378_103061_104558_104828_104918_104996_105407_108757_108867_110332_110368_110497
896435	contig_4232_pilon	-	747	2	Intergenic	novelGene_63374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGGGGAAAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467734_467888
896436	contig_1090_pilon	-	3046	7	Intergenic	novelGene_131106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_3	33.6782158408402	494	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	21	716	366178	307135	FALSE	15	AGTAATTTGTGTCTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFVPFLLVTWSSAAFIISYVVAVLNGHVNPFLPYISDTGTTPPESGIFGFMINFSAFLGAATMYTRYKIVEKQNETWYFSTPVFNLVSFVLGLVGCIGMGIVANFQELAVPVVHDGGALLAFVCGVVYTLLQSIISYKSCPQWNSLTTCHVRMAISAVSCAAVVPMIACASLISITKLEWNPKEKDYVYHVVSAICEWTVAFGFIFYFLTFIQDFQSATLRISTEINDDI	366198	304804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_307180_308663_308757_315823_315883_321199_321378_327086_327230_330799_330868_366068
896437	contig_13800_pilon	+	5148	1	Intergenic	novelGene_153745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	659	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTCCTTGAGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168974	174122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_169000_174100
896438	contig_6101_pilon	-	4203	1	Intergenic	novelGene_114294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	3388	3753	356505	356140	NA	55	ACCAATGTCATAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKTDILSQSTRFLQSASQTIHRTYTLNSHAGENQIQVSNINCKMLFSKSCNSLWQLVRQSVGLKFLWMLLAIAVMTLSISHSTWLRAEVRGSESQQSLTQQCVVSLQVYYYVSLLFNNFF	359892	355689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_355700_359900
896439	scaffold_17907_pilon	+	3251	17	Intergenic	novelGene_150753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	98	junction_1	155.13803077824	390	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	122	2146	19269	81494	FALSE	25	GTAGTGTTTTCAGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAGLVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTSDQDTLISGILRVLEKDSEVIVDWRPLDDALDSSSILYARKDSSSVVEWTQAPKERAHRGMEHLNNYEAEWDMVNTVSFKKKPHTNGDAPSHRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQSREGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLIDSLEKYVVLCDSPQDKRTLLVNCQNKSLSQSFENLLDEPAYGLIQKIKKDPYTATMVGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLAEWSKHIDSEGRILNVDSVKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSVSEEQERRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDILSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQIQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWTELPCKNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDVLCKAEAISLQMAKCKELPQAVCEILGLQNSEVPTPDSDIGEDENVGMTSCPTPAFHSNSLPLLATSGSRDDNPPQISVSPNVSRLTPA	19147	82599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_19299_33766_33866_34290_34366_41628_41768_46177_46389_53576_53680_55156_55355_56657_56787_57275_57380_58385_58481_67571_67689_72988_73090_76862_76963_77368_77467_79542_79660_80188_80276_81272
896440	contig_13295_pilon	-	1905	2	Intergenic	novelGene_31252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTAGTATCTTAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142877	127038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_128326_142259
896441	contig_1380_pilon	+	3962	17	Intergenic	novelGene_138861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_15	164.682732378808	814	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	121	1644	3310	107161	FALSE	15	CCGTGTTTTGACTGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRNQLSTLPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPHQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLAIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHSMERPHLHQHVEDSKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEDQIKEDVCHHLSPVKAGECLQEFQPEPSLLGDNDNSGEERDQFTEGAEVLSSEFINYIKGRAEDCEELLRIEEDAHWPPEGLISSSKTQDMDMMMIEQLREAVDLLQDPTRLSTDITERRVVNLYPVESAEALELEYTALNGQMQLETSPLCEVQNDLTSRSNGSQYSPNEMSENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITVQALLDVTVKNALFT	3189	109479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_3319_21462_21569_26778_26916_29228_29357_30865_30930_34168_34272_36621_36753_41653_41722_43954_44042_47073_47164_47268_47306_50529_50584_51343_51417_64119_64230_76950_77089_85291_85370_107050
896443	SIRV6	+	1267	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	358	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	236	568	2002	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPNEQDAIAKRLYATVKDASTPHGILSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1661	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1741_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896444	contig_5961_pilon	+	2247	9	Intergenic	novelGene_144151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_4	117.581288371067	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	201	2045	201974	214246	FALSE	40	AGTACCATTTATTTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	201773	214448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
896445	contig_854_pilon	+	2160	9	Intergenic	novelGene_36640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2170.81146981952	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	96	1187	1697717	1714980	FALSE	55	TGTTTTAAAAGTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELLQGAAGGGGGGQAEPGEAALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1696589	1715953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1705356_1705416_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
896446	contig_11752_pilon	+	5072	2	Intergenic	novelGene_37674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2803	junction_1	0	11	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTCTTGTCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96474	105931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_96572_100956
896447	contig_9051_pilon	+	1873	2	Intergenic	novelGene_170811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCCACCTGCTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041094	1044432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1042114_1043578
896449	contig_14445_pilon	-	1992	5	Intergenic	novelGene_137389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8.8423695919137	264	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503556	399690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_400621_404094_404187_497997_498291_499117_499252_503013
896450	contig_12021_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_172195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTGGAATTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56154	58370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_56200_58400
896451	contig_7056_pilon	+	2510	11	Intergenic	novelGene_43632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACAGGCGGCGCCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721898	731013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724534_725319_725471_725606_725661_725733_725812_725989_728557_728706_728906_729066_730386_730520_730987
896452	contig_9633_pilon	-	2401	2	Intergenic	novelGene_139656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGATGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195611	1193075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1195181_1195315
896453	contig_6270_pilon	+	1588	8	Intergenic	novelGene_99812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	141.630735739537	297	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	777	1172	39429	45668	TRUE	20	AATTGCTGGGTTACTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	36322	47674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_36638_37407_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_47302
896454	contig_3394_pilon	-	6175	17	Intergenic	novelGene_152706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	476	829	543685	543332	TRUE	55	AAAAAATACCTCAACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPCVLSAELPPVLGFCPPTLPLNPEEEVVLIWLMPGAEEDDETGGTEEPGAELLAAGFAELPLEVGLNALPAGGTADPEFEAKGPAFPGVACPCAAGGVWYLGGINRLLSSCRVAK	546133	506303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518594_519396_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176_530385_534253_535191_538870_539051_540033_540257_542471_542663_543324_543750_544534_544755_545942
896455	contig_854_pilon	+	1848	5	Intergenic	novelGene_36755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	31.901214710415	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	470	1273	1745134	1745937	FALSE	80	TAATAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722277	1746512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722355_1737993_1738042_1739538_1739713_1743412_1743540_1745090
896456	contig_7022_pilon	-	2867	11	Intergenic	novelGene_142155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAAGGAAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298969	232289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_233358_235192_235612_240702_240890_244649_244742_252273_252369_257865_257901_261681_261725_261801_261905_262630_262809_272676_272817_298462
896457	contig_12250_pilon	-	1088	2	Intergenic	novelGene_80536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGCCATGATCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234030	232130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_233102_233913
896458	contig_6217_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_109680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTGTGCTAAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847081	849245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_847100_849200
896459	contig_9668_pilon	-	5845	6	Intergenic	novelGene_58123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3142	3654	331345	330833	TRUE	45	GGCTCAAATCCAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNMASGLEEDSLTTCDMQMTQPCLLKVKRTWKHLVIKIKDYSLQYGFCLNIKKKKKKNLTIGPISNIMINQENIEIVKDFILFGSTINTHESSSQEIKRRTALANLLRKTSLKVLKSKDVTLRTKVRLTPAMVFSIALCACENWTMNKQARRIDAFELWCWQRTVNIP	334486	225916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_226420_227309_228318_233801_233838_235343_235665_246568_246885_330825
896460	contig_11378_pilon	+	9006	16	Intergenic	novelGene_112217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	122.371383728205	866	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	271	1878	263434	334255	FALSE	30	GTTCCCAGCATAAGAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRNGTVATALAFITSFLTLSWYITWQNGREKLIAYQREFLALKERLRIAEHRISQRSSELNSIVQQFRRIGAEANGSKDAVHKFSDTTLKLLKELTSKKSLQVPSIYYHLPHLLQNEGSLQPAVQIGSGRTGVSIVMGVPTVKREVKSYLTETLHSLIDNLYPEEKSDCVIVVFIGETDVEYVRSVVATLEREFSKEISSGLVEVISPPESYYPDLTTLRETFGDSKERVRWRTKQNLDYCFLMMFAQEKGTYYIQLEDDIIVKQNYFNTIKNFALQLSSEEWMILEFSQLGFIGKMFQAPDLTLIIEFIFMFYKEKPIDWLLDHILWVKVCNPEKDAKHCERQKANLRIRFRPSLFQHVGLHSSLTGKIQKLTDKDYMKPLLLKIHVNPPAEVSTSLKVYQGHTLEKTYMGEDFFWAITPTAGDYILFKFDKPVNVESYLFHSGNQEHPGDILLNTTVEVLPFKSEGLEINKETKDKQLEDGYFRIGKFENGVAEGMVDPNLNPISAFRLSVIQNSAVWAILNEIHIKKASN	258350	341383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_258383_263195_263528_291897_292066_294203_294345_300760_300895_307115_307163_309082_309197_310018_310095_314822_314938_316246_316378_320448_320557_320679_320874_324159_324239_324904_324972_333988_334102_334228
896461	contig_5020_pilon	+	1931	9	Intergenic	novelGene_27796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_3	947.111785574966	5548	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	381	1616	121762	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118399	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
896462	contig_16121_pilon	-	3346	4	Intergenic	novelGene_6853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTCAGCTCTCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63353	33596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_33706_57740_58199_58864_60854_62563
896463	contig_16125_pilon	-	2608	18	Intergenic	novelGene_155238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1076.73942641084	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	680	1804	236037	140157	TRUE	70	AAAAAGAAAGAAATATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLGDPQQELWVLVPKDALHSRLSFLMVVRSP	236791	117227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_140135_140246_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796_236150_236224
896464	contig_5286_pilon	+	8293	1	Intergenic	novelGene_157343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCTCAACAAGTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518566	526859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_518600_526900
896465	contig_2596_pilon	-	2731	14	Intergenic	novelGene_53477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.1639135765528	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	119	1321	722501	669421	TRUE	55	TGAATAAAGCAACAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTAGKIVGAGLLFVGGGVGGTILYAKLDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGSAPYSVPLPKKQIQSGPLKISGVSEVVKESKQPASYLQKQKGDTPASTTAPTEAAQIISAADDTLSVPAPAVQHEESIKPDLPAAGEGELTPATSEDASSSSVRERPPEEVAARLARQEKQEQVEIESIAKSLEDALSQTASTTLQAVAAQNAAVQAVSAHSSILRAAMDNAEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEIAGAKPHITAAEGKLHNMIVDLDSVVQKVKAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWKGMSNSVQLTGCRPMT	722619	662402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_663354_664418_664549_665480_665613_669223_669458_674929_675064_675476_675613_677507_677612_681149_681287_683631_683728_684065_684204_685878_685991_694845_695036_696168_696243_722456
896466	contig_4402_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_140788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACTCATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154772	153601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_153600_154800
896467	contig_9297_pilon	+	2777	8	Intergenic	novelGene_69894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	297.843199399569	263	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	64	981	939250	970821	TRUE	65	GCATGAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLLQPSPPPQPYPLRLVISKMAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRTTTPYFL	939186	972938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939325_955845_955942_964903_964970_966037_966180_968984_969065_969260_969471_970572_970911_971231
896468	contig_15118_pilon	+	2367	9	Intergenic	novelGene_74604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	254.445843943264	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	818	1846	393544	398743	FALSE	55	GTTGGGAAAAAAAAAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391988	399264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392789_393444_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
896469	contig_16185_pilon	-	2009	11	Intergenic	novelGene_144736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	88.4468201802643	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	99	866	127403	96625	TRUE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLRCTLCPAAPTGTTTARSSSGTMPTSSTSAR	134361	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96718_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
896470	contig_14333_pilon	+	4281	13	Intergenic	novelGene_49073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	16	junction_1	415.87741082359	26	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	362	2704	227093	294370	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSPWQILSPVQWAKWTWSAVRGGGSGEDEAGGPERDPEEEDSQAETKSLSFSSDSEGNFETPEAETPPIRSPLKGSCDSSLGLTGPGAKTQESQEDDEQLVAEVVEKYSSETCPRPSENEVPQQAIASHSVKDFKEEPEHDTSKISIVRPFSIETKNSTDVPAALGTKTAHGFVTAVLEEALLSRAPEAIQDKAMTEGNMGVTLEASTETDVKTLNSCSESVPSRSKLRKPKPVSQRKKTISGEFSETETMVEGTPLPKAPYQVSLDELDENTYSSLIGGARIQKPPTEVKETSSTPSSDTNDSGVELLEESRSSPLKLEFDFTEDVENVEAKKALPRKLGRKLGNKLTPKAQKDGISKPVGGKGVEQPADIKAEDTPVLHTSSKLDPSQWDNPNFNPFGVHSTLQNSPSLSSKSSYHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTCNDFRSTTGNHVNEILESPKKAKSRLITSGCKVKKYETQSLALDPCSQDEEAVISQISDISNRDGHATDEEKLASTSSGQKLAGPEVKGLEKESCQKMEKDEPAVPGLVESSVEKTPVSVACGDESPLDGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTNMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD	226731	295947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_227254_228226_228346_262238_263362_268099_268161_269945_270067_274012_274066_282470_282597_285902_285980_287700_287745_288874_289036_290056_290164_292809_292931_294301
896471	contig_7045_pilon	-	2200	3	Intergenic	novelGene_77428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGCAACACCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210924	206870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_207111_208693_209295_209565
896472	contig_4924_pilon	-	1937	11	Intergenic	novelGene_84680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1136.30783241162	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	24	929	252576	82377	TRUE	70	TAAAAAAAAAAAAGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252599	64829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69153_74767_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
896473	contig_10753_pilon	+	2389	13	Intergenic	novelGene_105124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	29.8611369508932	424	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	141	1475	10095	107882	FALSE	20	TTTTCATTTGAATAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVECWDPRTRNRVGLLDCALSSVTADSEINSLPTISALKFNGALTMAVGTSTGQVLLYDLRSDKPLLVKDHHYGLPIKSVHFQESLDLILSADSRIIKMWNKNSGKIFTSLEPEHDINDVCLYPNSGMLFTANETPKMGIYYLPVLGPAPRWCSFLDNLTEELEENPESTVYDDYKFVTKKDLENLGLTHLIGSPFLRAYMHGFFMDIRLYHKVKLMVNPFAYEEYRKDKIRQKIEETRAQRVQLKKLPKVNKELALKLIEEEEEKQKSTWKKKVKSLPNILTDDRFKVMFENPDFQVDEESEEFRLLNPLVSKMSEKRKKKLRLLNQPELHEQEEEEPEGKPSDAESSESSDDEKDWVEEVRKQRRLLHQEERMKRQERIKEDQQTVLKPQFYEIKAGEEFRSFKDSTTKQKLMNKTLEDRLKLEAKNGTLNVSDTAVGSKQLTFTLKRSEQQRKQQEAEKLHRQERKKLRRSASHLKSRHKRGWPFH	5778	108796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_5867_10042_10122_12297_12448_19661_19729_33694_33748_71554_71682_78358_78439_78624_78724_79749_79840_90187_90362_90629_90875_100539_100643_107762
896474	contig_7410_pilon	-	2707	1	Intergenic	novelGene_106047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAACCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53328	50621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_50600_53300
896476	contig_10990_pilon	+	5866	7	Intergenic	novelGene_7426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	90.8441889537612	104	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	527	1588	674985	681605	TRUE	20	CCATTGCAGTCATTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLTLPQCRQRSKNIYDFLPRRQEEPGRHQSRSIRIFSTERLLSRNSDSPTPEHVLSRAGNALQVHAVHTCAMGYAVGVYDNTMVPQMCGTFTPSAPYVNVRASRDDLSISSEDSRDYVNVPRAEEIAENLASNSPRNLSVLPSTQELDFTEKRDVGCGDTSDCTRFWSPGTESSNELSDEESSSQTSNDYVNVSELDLGAAQREKPWTTFQCCRDYENVPPADVNGSQQQAEEEATSLNTDHVKGRTDALGTHTQPVMQSGSFLVLGDHMAFQPLAQSGNSQMKHGEETPSEDDSDYENVLAAKLGDKDSEQGSGTQLLPDELRPSDPAGKLHGMVYPAGSTATTESSDDP	670557	686409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_670770_671344_671552_674236_674315_674955_675067_675630_675717_680711_682979_683504
896477	contig_5261_pilon	-	3716	1	Intergenic	novelGene_102496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	306	921	1769	2689	823299	822379	NA	35	ATGGACCACAGCTACCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHQWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGIKPRISKAVLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWDWYNNRYIDQWNRTENPDVNPSTYGHLIFDKGPKAIKRGKDSLFNKRCWQNWISTCKKMKRDPYLMPYTKTISKWIEDRNIKPKTIKFVKEKTGPTLQALIHGINRIQTITINAENPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEQDFWTAQVRQRSNLHTTRKSNTSTTKRQIILLKNGQRK	825067	821351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_821400_825100
896478	contig_10734_pilon	-	2673	13	Intergenic	novelGene_51478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	529.327632998274	1402	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	1125	2183	2274500	2265543	FALSE	75	AAAAGGAAAGAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305238	2265052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282592_2282884_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
896479	contig_7426_pilon	-	3443	3	Intergenic	novelGene_27560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	145	junction_2	45	37	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	23	421	1185828	1161950	FALSE	40	TAAATACATGTTTTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLRAGRRRQTAGKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185850	1158927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1162053_1163424_1163677_1185784
896480	contig_14184_pilon	-	2987	2	Intergenic	novelGene_66605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	318	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126326	122520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_125411_126229
896481	contig_9863_pilon	+	1944	8	Intergenic	novelGene_153995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	137.77591981777	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1377	568	1944	47294	57352	FALSE	45	GCTGAAAAAGCAGCAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRKLQAQTEEKDTKIILGKEKWNCKGLDEKAKGIINKGKEINDKSSQLNSLSELQDASLQQLVSQKHSTPQSNKTTREPSNLNYEAVMKSLAQTFAVVEVDRWDEERKSTIKTSDSTQFGDDEECTIISVSKDMNNKKNVNLECDTTLCNPELNTSQDKGDSVLLVLSSDESQQSENSENEEDTVCFVENSGRRESSNGDLGNMSCDTALFVIDTTPGLSADKNFYLEEEDKASEAATEEEKEEGEDEKSEEPSDHDVNKDNELSDEEDLLNSTKSKLLKLTSSSIDPGLSIKELGGLYINFNADKLQSNKRTLTQIKEKTKNDLLQKTIITPDFEKNYSVPPYRESKFQLQKKRREERQKTAGNGWFGMKAPELTDELKNDLKALKMRASMDPKRFYKKNDRDGFPKYFQIGTIVDNPADFYHSRIPKKERKRTIVEELLADSEFRRYNRRKYSEIM	45349	57352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_45463_46747_47000_47091_48130_49993_50133_52597_52694_53768_53934_55492_55603_57321
896482	contig_567_pilon	+	5190	18	Intergenic	novelGene_34012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	235.96636321195	7	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	3548	4513	640752	651608	TRUE	80	AAAAAAGAATAATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKMEVGQPEPVDTQPEDIPETKTEDCKVEPTETEERGTELKTEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHFCEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVLHHEVIWPTGFVCDGCLKKTGRTRKENKFSAKSKFYSSK	634558	657429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_636024_636376_636487_638170_638309_638917_640818_641259_641405_643230_643350_644447_644688_645326_645416_647348_647430_649002_649060_649752_649831_651517_651616_652604_652654_652765_652913_653597_653712_654923_655090_656043_656209_657400
896483	SIRV6	+	875	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	884	267	-314	-132	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	21	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	31	363	2002	10736	TRUE	25	TGCTTGTTTAGAAAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1971	11558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896484	contig_14925_pilon	-	1679	5	Intergenic	novelGene_55268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	4302	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	79	492	116065	114666	TRUE	10	CCTTTGGCTTGATTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129479	112090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
896485	contig_20602_pilon	-	1552	11	Intergenic	novelGene_133714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	301.960278844751	5	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	21	1202	29552	10026	FALSE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29572	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19817_23494_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
896486	contig_2924_pilon	+	1595	7	Intergenic	novelGene_140275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_4	181.960313133264	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	508	1254	242732	303804	FALSE	30	TTTACAAGCTTTATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEDDKEEHVSLAHRGADASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGAMAAGGGPAPLSAAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	242224	304145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_242782_259354_259441_287622_287733_293259_293389_297301_297568_302765_302830_303762
896487	contig_6017_pilon	-	2042	3	Intergenic	novelGene_152553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	44	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1061	1513	462382	461930	TRUE	40	TGAAAAGCCTCCTAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPEHLIVLMRNLYIDQEAVIQIEQGDTVWFKVKKDVLVNLYAEQIIREAVLYEEEWDIRIGGRLINNLQYADNTTLPAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNVMINGEKIEGVKDFILLGSTVNVHGSSNQIK	468313	448811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_-_448909_461497_463389_468259
896488	contig_6361_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_24025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCACCCAGTTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433128	430747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_430700_433100
896490	contig_1301_pilon	-	5680	22	Intergenic	novelGene_47277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	753.047200491311	510	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	83	2266	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
896491	contig_10050_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_119624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	675	1130	219879	219424	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHGCNLSLYLFNLHAEQTIQKGGLYEERGIRIGGRFINNLQYADDTTLLAESEEDFKHLLMKIKDHSLQYELHLNIKKAKILTTGPISNIMINGEKTEVAKDFILLGSTINIHGRSSQEIKRHITLGKSATKDLFKVLKSKDVTLRKRFT	220553	218143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_218100_220600
896492	contig_3747_pilon	+	3023	6	Intergenic	novelGene_24885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1541.63168104447	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	226	819	201313	202759	TRUE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPSA	201087	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_203128_203228_203651_203768
896493	contig_10324_pilon	+	3108	16	Intergenic	novelGene_7746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1322.80217047835	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	110	1636	69577	79295	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGRTLNHPGFFPLSRDPGLLLLHPPYQNRPGHSTAPQLLLGPYTDGDRRLVLDCPRLLQCLWDVCGHAVPLLLGGPGAE	69276	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69339_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76400_76530_78365_78451_79273
896494	contig_6929_pilon	+	861	4	Intergenic	novelGene_139411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_2	1547.29556179663	76	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	82	462	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127094	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130971_131948
896495	contig_8322_pilon	+	3443	16	Intergenic	novelGene_143234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_15	327.87372908213	95	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	380	3025	280948	304580	FALSE	10	GTTTTCTGCATCCAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKESQAALEEQESELSSNPATASASAGASLETPAAQAPGDDNPTGASGGAVPGAAGGARRFLCGVVEGFYGRPWVMEQRKELFRRLQKWELNTYLYAPKDDYKHRMFWREMYSVEEAEQLMTLISAAREYEIEFIYAISPGLDITFSNPKEVSILKRKLDQVSQFGCRSFALLFDDIDHNMCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGCRSHSSAQFLIGDQEPWAFRGGLAGEFQRLLPIDGANDLFFQPPPLTPTSKVYTIRPYFPKDEASVYKICREMYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	280568	304998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_281156_285112_285165_285606_285705_287392_287524_290053_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472_295648_299239_299326_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
896496	contig_20409_pilon	-	5555	4	Intergenic	novelGene_178688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	4465	5049	26697	25537	FALSE	15	CTCCTCATTTGATTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLHVCGSRRGVFLVHSSRLARNGSQLKKRKRKQTNNSKRRKAPGSHQRRSPDREAAPHLNGALQPLRKKQRWRTEPGTRAKRGGGSERQARNPKKQKKKATPAANKWHPESHPLGCVESKQPAPPGQETVAAGSRGTNEQKPQDPTSAAAQTGKQLHTQMEPRSPSGRSKDGARSQAPEQKEGEVARGK	58451	25030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20409_pilon_-_25819_26394_28017_29828_30625_56102
896497	contig_9423_pilon	-	3119	9	Intergenic	novelGene_99174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	181.570922782256	350	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	537	2060	61283	39157	FALSE	10	ATCCCTTGGCCTGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKVK	74899	38097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_62246_62375_73820_73917_74595
896498	contig_9527_pilon	+	5044	6	Intergenic	novelGene_134021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	104.610515723803	612	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	76	1617	46999	55568	TRUE	15	GTAATGTTTGCTGAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGCSIVEKPEGGGGYQFPDWAYKTESSPGSRQIQLWHFILELLQKEEFRHVIAWQQGEYGEFVIKDPDEVARLWGRRKCKPQMNYDKLSRALRYYYNKRILHKTKGKRFTYKFNFSKLVMPNYPFINIRSSGVVPQSAPPVPTASSRFHFPPLDAHSPTSDMQPGRFSASSLTTSGQESLSDGTDRKAELSELEDGSAADWRRGVDLMSSRNAVGGGGMGHQKRKPDIMLPLFTRPGMYPDPHSPFAVSPVPGRGGVLNVPISPALSLTPTLFSYSPSPGLSPFTSSSCFSFNPEEMKHYLHSQACSVFNYHLSPRTFPRYPGLMVPPLQCQMHPEESAQFSIKLQPPPAGRRNRERVESSEESAPVSAPTAAPVPPRIKVELASEKDPESLRQSVREKEELAQEEGTVPGRTTEEGKGTIFARPATPPVWPSVPSSAPSEEPLEVTEDGEDRPGREPSASEKKEDAVMPPKLRLKRRWNDGPEARELSKNGKFLWNGSGPRGLAAAAADA	45012	59055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_45078_46988_47045_47642_47881_49162_49279_54426_58078_58137
896499	contig_11326_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_173915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	88	453	160003	160368	NA	20	TACATTTCTAGGTTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSFIRFNERSPTAATRHVVPCDWGYLQCYKGSRWCHHWWCGLDWWKESGGDQNSCYNCTFHGNRAGERGCVCCGWRCYSCWVCCCKQSALNRKEKRQIGLKFGDTCDLHSIMMPVALNC	159915	162950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_159900_163000
896500	contig_12923_pilon	-	2798	12	Intergenic	novelGene_30070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.308265542661	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	272	1780	68690	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	68961	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45982_46055_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_68687
896501	contig_3382_pilon	+	3635	3	Intergenic	novelGene_124158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	62	373	931459	947443	TRUE	35	AGACTGTAATCTTTATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGPLHSVSAKLRPPSGNGVAMADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRRLRS	931397	950855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_947427_950245_950394
896502	contig_6599_pilon	-	650	2	Intergenic	novelGene_175981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCCGAAACGATCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262714	261043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261280_262300
896504	contig_10163_pilon	-	2462	5	Intergenic	novelGene_82614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	542	889	23859	13963	TRUE	60	AAAAGAAATACCATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGGLNFFWVHSLMRLFTAARIDSEAKIFSGCVEIIFNACGIVGVVVGNQDIALGFLGAGIMHNSPWWKNTLLVLLSGSNHLGRKSAASINKNSPSLSSILATNSGNSSVICFIT	24400	9927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_11429_13890_14009_22627_22717_22831_23014_23828
896505	contig_8934_pilon	-	4905	2	Intergenic	novelGene_167245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	838	1242	670132	669728	TRUE	75	GGAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIEEAQRTRYRIDPNRKSPRHIIISLAKTKDKQRMLRAAQEKEKVIHRGETIRLSSDYSADTMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRVIYHTKLSFKYDSEIRSLPDKHKLRDYVKTKPNLTRLLKGSPSI	670969	662734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_665549_668878
896506	contig_11548_pilon	+	1657	5	Intergenic	novelGene_66770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	3879	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	227	817	112832	119638	FALSE	15	CCATTACGCTGTTCATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112605	120478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
896507	contig_6050_pilon	-	2227	8	Intergenic	novelGene_123123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	71.0125024921956	17	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	314	1084	394250	389438	TRUE	15	CAGTGTTTCACACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGAAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSGLIAQLEEKQQQPTRELLQVRHGALC	394563	377073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377904_379934_379962_381537_381571_381701_381818_382659_382683_389323_389693_392504_392601_393830
896508	contig_10424_pilon	-	3477	28	Intergenic	novelGene_56800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	247.355344932481	56	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	701	3058	319877	291502	FALSE	10	TAATGTTGTTTTTTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSRRNRSSGVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQREKEKELERERERDKKDKEKLESRSKDKKEKDECTPTRKERKRRHSTSPSPSRSSSGRRVKSPSPKSERSERSERSHKESSRSRSSHKDSPRDVSKKAKRSPSGSRTPKRSRRSRSRSPKKSGKKSRSQSRSPHRSHKKSKKNKH	347213	291082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_291641_292818_292996_294205_294325_296963_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320534_320607_323693_323828_324329_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
896510	contig_13021_pilon	+	5230	10	Intergenic	novelGene_8150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4139	junction_1	2007.10587662933	360	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	170	1342	174676	178601	FALSE	35	GGTTGTCTTAACTAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNGKYFK	174506	182489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522
896511	contig_4486_pilon	+	1161	9	Intergenic	novelGene_38645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	418.957560499867	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	266	691	1023477	1037335	FALSE	25	AACAGCTCTCCATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLITQGLISKGILSSHPKYGSIPKLIFACIMGYFAGKLSYVKTCQEKFKNLENSPLGEALRSGQARRSSPGHYSQKSKYDSNVSGHPSFVTSPAADNIEKDTLPHYEPIPFSASMNESTPTGITDHIAQVKVNKYGDTWDE	1014248	1037805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_1014292_1016060_1016124_1016547_1016629_1016906_1016962_1023453_1023508_1026830_1026879_1027876_1028010_1029679_1029856_1037297
896512	contig_10323_pilon	-	1430	8	Intergenic	novelGene_123551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_6	339.746724391412	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	87	581	305132	268465	FALSE	30	ATGAAGTAGATCTGGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRAGGAWCWAPGRLACLGVPRVKAAVMLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKGTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPDEGYYQGGKFQFETEVPDAYNMVPPKVKCLTRIWHPNITETGDICLSLLREHSIDGTGWAPTRTLKDLLNFDDPLNIEAAEHHLRDKEDFRNKVEDYIKRYAR	309129	267615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_278700_278759_279648_279720_285482_285551_292633_292700_305014_305149_309059
896513	contig_18869_pilon	+	3020	1	Intergenic	novelGene_56488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	613	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	163	486	360094	360417	NA	35	CCAAAGACCTCTTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTRSKGLMDHSYYGLHQTESSTARWCLATTTDCSDWEHNRGSWTELEKDVEQNSNSQKKTRFAGLTYWRNPQSMAPRHPLSSVVKSLLKFTVQPGIGQPHKTKQD	359931	362951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_359900_363000
896514	contig_3627_pilon	+	2356	11	Intergenic	novelGene_78574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.3959675546012	766	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	304	2052	1315436	1343837	FALSE	30	AAAGTCATTCTCTTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKREYASDLSPPRKKPAKSHFRNKQHDSKGSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313496	1344141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1313996_1314143_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323504_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
896516	contig_16622_pilon	+	1504	7	Intergenic	novelGene_48472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGAAAAGTCTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111887	121966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_112203_112975_113041_113602_113741_115155_115292_115417_115561_118813_118889_121334
896517	contig_5023_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_7182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576075	573761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_573800_576100
896518	contig_7644_pilon	+	5673	14	Intergenic	novelGene_64241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	133.05108686507	6	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTATTATCTATGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162681	408415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169296_169369_175984_176079_176578_176654_177755_177835_179596_179696_182476_182533_182891_185112_186876_187464_199679_200475_233131_234191_344769_345026_408352
896519	contig_2069_pilon	+	2702	12	Intergenic	novelGene_23275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	315.519144551503	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	371	1873	333898	343975	FALSE	15	TCTCTTTGACTACTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	332637	344804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341359_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
896520	SIRV6	+	1496	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	13	19	13	-18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1057	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	245	736	1733	10736	TRUE	25	GTTTTTAAGATAGTTACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1100	11806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896521	contig_5236_pilon	-	2167	9	Intergenic	novelGene_100962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	226.012409780968	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	71	946	1011714	1007317	TRUE	20	TAAATTGCCTTTTAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLVSSDRGQREAP	1011784	1005871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007325_1009440_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
896522	contig_8322_pilon	+	2911	3	Intergenic	novelGene_143247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_2	376.5	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	113	1030	292682	295189	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKVSMVNLPTFLARMIPLLVIWRSFINEYTGNWRKLTTS	292569	297070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_292713_293832_293992_294461
896523	contig_6189_pilon	-	2549	12	Intergenic	novelGene_164960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	308.579175314888	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	142	1962	206796	188226	FALSE	40	AAAGATTGAGTGGAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEERFDDMSSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDVSKKLTEQKITNKDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEEKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFES	211416	187638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_188296_191102_191253_192144_192288_193662_193833_198484_198644_200065_200169_200270_200403_201997_202154_202625_202743_202820_202899_206253_206872_211350
896524	contig_11896_pilon	-	3370	1	Intergenic	novelGene_88047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAAAGTCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182742	179372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_179400_182700
896525	contig_20641_pilon	+	2840	4	Intergenic	novelGene_52794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	1818.63263653402	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	84	428	14599	45875	TRUE	85	TTAAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGPLRFAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKAQTGASEQ	14515	57158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_45848_45965_54835
896526	contig_7201_pilon	+	3197	17	Intergenic	novelGene_152490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCCTCCGCGATAGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66402	255872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_67234_69356_70208_83639_83746_108086_108175_153031_153108_153714_153788_161657_161707_163991_164088_169479_169595_171320_171427_213981_214047_216547_216645_224237_224395_229523_229660_238452_238543_239709_239820_255721
896527	contig_9177_pilon	-	1458	7	Intergenic	novelGene_32559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2636.23743345617	129	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	251	1033	26442	2136	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLLRSLQHRKRCFGKNESWKRHGRSWLRFGSNSTSSCLQSFEMSTRALLI	32976	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2283_24949_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
896528	contig_18162_pilon	-	3219	2	Intergenic	novelGene_122303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
896529	contig_6589_pilon	+	718	8	Intergenic	novelGene_26101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2813.24047304593	5	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	23	298	1876599	1879541	TRUE	5	ACTGGCCTGGCCTGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPRQLPKMAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRAWPGCP	1876576	1880609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1876614_1878469_1878543_1878959_1879026_1879202_1879305_1879521_1879585_1879777_1879851_1880080_1880274_1880498
896530	contig_14727_pilon	+	2295	2	Intergenic	novelGene_56631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1548	junction_1	0	15	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1833	2171	54061	55271	FALSE	10	TCCTTTGTGGAAGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKGTVSPHSFSCLQTGSSSIPVYRLKFNESFAEMNRSTNEWKTVLGGALFFIGFTALLLIWEKQYVYGPVPHTFEKEWVAKQTKRMLDMKGNPIEGFSAKWDYDKNEWKK	52228	55395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_54263_55134
896531	contig_3975_pilon	-	2077	12	Intergenic	novelGene_54845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	202.003313940577	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	867	1616	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079276	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065346_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
896532	SIRV6	+	1032	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	378	400	162	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	162	653	1733	10736	TRUE	25	AGAGACCTATTCGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1465	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896533	contig_7398_pilon	-	5481	1	Intergenic	novelGene_166177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2477	2797	290685	290365	NA	40	ACCAAAGACAGTCTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLCLMYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRKRGRPSTRWIDTVAATMGSNIAMIVRMAQDWAVFRSVLHRVTMSWNQLASIYLTTTNNECACPLSQYFHFWDFN	293161	287680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_287700_293200
896534	contig_11186_pilon	+	3249	1	Intergenic	novelGene_98881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1099	1419	263345	263665	NA	15	TCATCCAGCCTTTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSLVLQNSIIQSPATSLSPRPYFPTTNPSSFPTFQFQSLIITDAILTACLINFRLQKLVKIFNLLIFGINGWCVNLNNTCINWSSLQAYGYYSITDSTVLQNRS	262246	265495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_262200_265500
896535	contig_12677_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_110695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1000
896536	contig_12468_pilon	-	3428	1	Intergenic	novelGene_164873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGAGCCCTCCGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4923	1495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_1500_4900
896537	contig_12307_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_178691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	435	1308	15	1322	18532	17225	NA	55	AAAACATAGAATACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKAGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGDLIFDNGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTLKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSLSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIRRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNEAVNHRITWMKLENIMLSEISRSQKDKYCMRPLL	18546	15853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12307_pilon_-_15900_18500
896538	contig_2114_pilon	+	3389	5	Intergenic	novelGene_104241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	123	junction_1	279.424408382661	11	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	16	834	153620	159946	TRUE	75	AAAAAAAGAAGAAGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAAAMEANWTAFLFQAHEASHHQQQAAQNSLLPLLSSAVEPPDQKPLLPIPITQKPQAAPETLKDAIGIKKEKPKTSFVCTYCSKAFRDSYHLRRHESCHTGIKLVSQRKKTPTTVVPLISTIAGDSSRTSLVSTIAGILSTVTTSSSGTNPSSSASTTAMPVTQSVKKPSKPVKKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPFECPVCNQRFKRKDRMTYHVRSHEGGITKPYTCSVCGKGFSRPDHLSCHVKHVHSTERPFKCQVRVKMTYP	153604	166730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_153653_158388_159084_159855_161194_162413_162555_165563
896539	contig_610_pilon	+	3602	4	Intergenic	novelGene_76714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCAGGCCTCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211368	252613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998_235302_252475
896540	contig_2917_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_147580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAGCAAAATTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91808	89830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_89800_91800
896541	contig_2703_pilon	+	2487	17	Intergenic	novelGene_101704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1054.44048403644	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	300	1625	559489	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLELCDLVGGRLTWPDQRHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526167	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610542_610585_610756
896542	contig_1275_pilon	+	3144	2	Intergenic	novelGene_108806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_1	0	142	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	814	1353	567270	567809	FALSE	60	CAAGAAAACAAAAATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDIVPEDEPPRLEGTQKTTGEELPPQSRVDLNDVDGVKLSGPSFADVAQLKMTRNSYKHPLIIGTGNVRGMNLGKLEIVKNEMECIKIDILGISELKWTGRSYFESDNHMVCCAGNDNLKRNGVAFIVKKNISGSILKYVAISDRIISVRLQGRPVNTTIIHIYAPTTKTKD	548369	569600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_548581_566667
896543	scaffold_13505_pilon	-	2334	19	Intergenic	novelGene_111427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	546.92041592724	497	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	277	1935	515685	508930	TRUE	15	GAGAGGTCTGTGTGTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCTLRPGTAQTKNQVLTPHWSWGTRPHRARQAWSPRRPQRAPRRVLTRRGAQGLSGRLGRSESLRVSDRRRPPRGSLGAKGRGGGRSRSDVDMDPSSATAVLGPARRATPEPGDEGEPGRSGLELEAEEPPGWRDLVPPGTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFYQPMADSGFFPLEELQNIFPNLDELIEVHSLFLDSLTKRRQDSGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKEPRFCAFVQDAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPAEREKVERAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVIFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPAFRPKSRPSPSSTREPLLSSSENSNGGREMPPADGRMERFLSDLLTFCRPGPEGQLATTALQKVLSLKQLLLPAEEDSGAGPPRESDGVLGGGPLRPAETQEVQENLLSLEEILKQLEEMEGEFCRLRLLLCQLGGKEPSCT	517512	507162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507544_508911_509005_509098_509263_509766_509854_509954_510023_510277_510365_510522_510611_511309_511478_511561_511638_511905_511984_512183_512285_512427_512543_512741_512868_513108_513192_513490_513638_515174_515321_515635_515804_517120_517237_517470
896544	contig_4151_pilon	+	1698	3	Intergenic	novelGene_65229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	105	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	177	743	528988	663644	TRUE	25	TTAACTGATAAGGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528811	664663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078_663762_663825
896545	contig_6165_pilon	-	430	1	Intergenic	novelGene_167406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGGGGCCATGCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478080	477650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_477600_478100
896546	contig_6929_pilon	+	1073	5	Intergenic	novelGene_139380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3792.5750074982	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	291	671	127176	130939	TRUE	5	TTTGTGTATCTTTCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	101622	132319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_101701_126963_127242_127703_127787_130707_130971_131948
896547	contig_11855_pilon	-	2002	11	Intergenic	novelGene_66962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2040.09446104831	461	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	130	1452	1102035	1079293	TRUE	25	CTAGTCCGTTGTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSNILTITNLLFQTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102164	1077218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085158_1085845_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
896548	contig_5961_pilon	+	5205	12	Intergenic	novelGene_144137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_7	489.249349125612	4	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	1532	2869	175680	207020	TRUE	60	TTCTAAAAAATAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKVKIKISTEIR	174148	214845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
896549	contig_9363_pilon	+	4038	8	Intergenic	novelGene_6636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1737	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882847	889043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_883342_883631_883779_883938_884041_884404_884528_884659_884760_884966_885100_885502_885610_886211
896550	contig_4962_pilon	+	2750	2	Intergenic	novelGene_107388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	301	705	242813	243217	FALSE	65	ACCAAAAAAAAAAAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKGDPTDCRNYQTIPLISHTSKILLKIIQKQLQQYINREQPEIQAGFRRGRGTKDITADVRWIMAESRQYQKDVYLSFIDYAKASDCVDHNTLCTTLRRMGIPEHLIVLMRNLYIDQKAVVRKERGYCVV	234610	245262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_234657_242558
896551	contig_3627_pilon	+	2505	17	Intergenic	novelGene_78444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	281.045564588734	14	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2376	129	2504	294394	323562	FALSE	70	AAGATGAAAGAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGANRDSVQVKVWSARLERWAAEPDRCCRRKTSRGFFFLPYIMAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSK	292747	323563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292823_294340_294467_297723_297897_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439
896552	contig_17440_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_7534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTCCTTTATGGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1254	491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_500_1300
896553	contig_1090_pilon	-	6305	20	Intergenic	novelGene_131128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	706	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	4645	5076	487999	486358	TRUE	70	ATTTAAAAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCGRIHSTVHYQMDGFPFIGNRSMSNDWIVTIGTFESSFGYFCKAEIRQAFTFWKNIVSLVWEKCDFIQFMKMILPTVASIKPTGQDVAGLVTELISKPGICTSLITVRDTTYPSTKLPGLSNSNTAGAPTSCNIATASTVA	516625	440787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_440875_457194_457314_458289_458334_460878_461086_465036_465108_465464_465532_481832_481996_482801_482979_483212_483383_485103_485228_486357_486564_487773_488876_491870_492069_492663_492889_493595_493705_497085_497171_497426_497532_500229_500394_503617_503709_513834
896554	contig_14060_pilon	-	2187	5	Intergenic	novelGene_156046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	210.650183954346	790	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGTAGCCCTTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67027	36299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_38161_40717_40871_43215_43251_47974_48085_66999
896555	contig_8691_pilon	+	3301	2	Intergenic	novelGene_72688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAATTTCCCTTAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74995	78502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_76786_76991
896556	contig_7171_pilon	-	3275	8	Intergenic	novelGene_101376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1075.91051141414	36	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	2239	2976	1367042	1363653	FALSE	15	CTAGAGCGCTTGCTGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPVGGHRRGPSRYGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSKMNCDRVFNVFCLYGNVEKVKFMKSKPGAAMVEMADGYAVDRAITHLNNNFMFGQKLNVCVSKQPAIMPGQSYGLEDGSCSYKDFNGSRNNRFSTPEQAAKNRIQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVKRPSSVKVFSGKSERSSSGLLEWESKSDALETLGFLNHYQMKNPNGPYPYTLKLCFSTVQHAS	1369516	1363353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1363712_1364242_1364339_1364430_1364489_1365180_1365383_1365695_1365818_1366841_1367123_1367233_1368659_1368783
896557	contig_8866_pilon	-	3667	2	Intergenic	novelGene_77836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1098	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1175	1516	612715	611784	FALSE	15	CTCCCTCTCTATATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNNKSQRAGRATGQSAWAFMALRPLSHLAPCCEHTNSPSPSEPTFSSHIPEQGPGWGWGCLPTPHADTRLPSRFPLHFSPTSTILRHPPAPPPLSCLTTPKAPSLPIAG	613889	609632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_611932_612521
896559	contig_13760_pilon	-	4525	9	Intergenic	novelGene_61307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	194.30967551823	13	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	2689	3723	170867	164456	TRUE	40	TCTGTAAATAGATGTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPLVRHCPTPGNPSATVHSAWIRSQTCTRPCPPSPRAPAPPAYSTVTRVHATPAAPSATVLPASPVTRRSSEPQLCPGSAPKPTGELDKGPHASPSHSLCKASPSPSLSSYSDPDSGHYCQLQPPMCGSREWAAAEASSRQARSYGEKLKELSENGVSEGDWGRAFTVPVVEATSSFNPATFQSLLIPKDNRPLEVGLLQKVKELLAEVDARTLARHVTKVDCLVARILGVTKEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLERFHTMSIMLAVDILGCAGSAEERAALLHKTIQLAAELRGDHGQHVQLRRGHGRSGHGSDHPAGADMGDPAAATHRGRHPV	174731	161494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_162046_163257_163465_164411_164524_165339_165513_166053_166170_167065_167602_169072_169199_170851_171307_172482
896561	contig_6915_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_162398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	576	2357	2932	156532	155957	NA	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINK	158888	155955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_156000_158900
896562	contig_15219_pilon	+	3436	7	Intergenic	novelGene_40825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	345.636329430548	13	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	116	946	19617	23972	TRUE	20	CTGCGTCCACTATTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQVRPYNGIHLLYFSVSFVMVT	19501	26853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_24577_24967
896564	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	153	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121198	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
896565	contig_9177_pilon	-	2181	11	Intergenic	novelGene_32600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37101	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2035_32790_33247_33457_33596_33696_33845_33920_33989_34096_34193_35241_35348_35448_35521_36142_36225_36322_36409_36491
896566	contig_12379_pilon	+	2601	4	Intergenic	novelGene_148931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	340.002287574004	28	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	241	345	108826	110276	FALSE	45	CTGTGTATAAAGCAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGRSFHILAVATKDVRIFTLKPVRKELTSSGGPTKFEIHIVAQFDNHNSQVWRVSWNITGTVLASSGDDGCVRLWKANYMDNWKCTGILKGNGSPVSGNSQQGNSNPSLGSNL	105846	112532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_105921_106144_106303_108817_108925_110270
896567	contig_4496_pilon	-	2982	10	Intergenic	novelGene_66662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.628539361054709	232	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTTCTCTTCCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998339	859263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_859438_873309_873371_891913_891993_899754_899891_911479_911829_941357_941486_951023_951146_952489_952526_996159_996280_996562
896568	contig_6479_pilon	+	5753	4	Intergenic	novelGene_160611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1668	2075	655019	655426	FALSE	65	AAAAAAATCCAAAGAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSSSREPAAAEPGDQCKMALEPTHGARELSAFSRGLPGRVGCLWVLISESKLVDPWSKRAECLLAEVYRWSGVPPGTYQWSYRTFGTLAPAGQMQEMRPDRPRGQGTRKQKLKRQGTQEAELPQSQTVESSLR	437205	659104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_437341_437578_438218_491344_491629_654409
896569	contig_6137_pilon	+	1858	17	Intergenic	novelGene_59196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	755	junction_3	905.571502474404	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	493	1827	1328176	1348329	FALSE	40	GTTAAATTAAAATTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRYLFFMKNFHGMIGTK	1300356	1348360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
896570	contig_15114_pilon	-	2503	3	Intergenic	novelGene_121224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	383	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTTCCATTTCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1664545	1661452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_1663031_1663128_1663208_1663699
896571	contig_9177_pilon	-	4423	28	Intergenic	novelGene_32588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	784.26600285701	7	56	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	2380	3987	15057	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITLFPSFLCLPGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	22761	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737
896573	contig_4900_pilon	-	2154	7	Intergenic	novelGene_159078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	312.438082754897	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	114	488	1188120	1184672	TRUE	45	ATTTAACAATCTGCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGVGIWLSVSQGNFATFSPSFPSLSAANLVIAVGTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMLWCHRLHRLVLSAGREHGSRPLLHRELPGLWAQRHHPPVANVR	1188233	1180010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181410_1181517_1181715_1184601_1184680_1185057_1185185_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
896574	contig_10793_pilon	+	1499	15	Intergenic	novelGene_83399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3173.18370433049	5579	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	291	1091	152890	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130875	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151375_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
896575	contig_5961_pilon	+	4165	20	Intergenic	novelGene_144121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	357.625719327699	5	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	1606	3537	201974	214246	FALSE	45	AATTTTTTAAAAGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	113775	214874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201706_202352_204380_204468_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
896576	contig_5084_pilon	+	762	1	Intergenic	novelGene_64536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTAGGAAACATAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498406	499168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_498400_499200
896577	contig_4364_pilon	+	1576	8	Intergenic	novelGene_133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.8132553229641	257	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	57	791	1109013	1110937	FALSE	75	ACAATAAACAAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGLAGRRALVTGAGKGIGRSTVQALHAAGAQVVAVSRTQADLDSLVRECPGVEPVCVDLADWEATEKALGVVGPVDLLVNSAAVALLQPFLEVTKEAFDMSFDVNLRAVIQVSQIVARNLIARGAPGAIVNVSSQGSQRALTNHSVYCSTKGAMDMLTKVMALELGPHKIRVNAVNPTVVMTPMGRANWSDPQKAKAMLDRIPLGQFAEVEHVVDSILFLLSDRSGMTTGSTLPVDGGFLAT	1108956	1111722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1109065_1109153_1109252_1109770_1109926_1110039_1110083_1110156_1110257_1110471_1110537_1110619_1110738_1110833
896578	contig_12250_pilon	+	3221	15	Intergenic	novelGene_80564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	130.074625362771	358	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	196	2322	291174	304188	FALSE	45	CATTAAATATTCTTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVASSLLVGPVPSHQFRPVSTPAPGLSAAATNAATRPDSRGSDSRQPGSRGTGVNTAGDGTIQEGMLVVTGVNLLSSHSDQNRQEHHTDEFEYDELIVRRGQPFHIVLFLSRPYESSDHIALELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKGGSGGWKAQVTKANGQNLNLRVHTSPNSIIGKFQFTVRTRSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDREDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPISVSRVVSAMVNSLDDNGVLIGNWSGEYSQGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTSFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLITTKAIGSNMRDDITHLYKHPEGSEAERKAVETAAAHGSKPNVYAMSNSAEDVVVQVETQDPVMGQDLTVCVVLSNRGSSHRTVNLHLYLSVTFYTGVTGPVFKDSKKEAVLAPGASERVVMPVAYQEYRSHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFRNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQTFVPVRPGPRQLIASLDSPQISQVHGVIQVDVAPASGGRGFSDTGGDSHSGETIPMASRGGA	289952	305087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_290060_290954_291038_291168_291358_292372_292622_292986_293106_293244_293353_293767_293943_294377_294517_294662_294767_297454_297544_298029_298184_298306_298589_298732_298894_299252_299390_303962
896579	contig_14353_pilon	-	4759	8	Intergenic	novelGene_82139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_7	121.852202211012	690	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	3236	3775	405634	402843	FALSE	60	AAAAAAAAACAACTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKYTMIRKLEGHHHDVVACDFSPDGALLATASYDTRVYIWDPHTGDILMEFGHLFPPPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	420585	401858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404705_405476_407979_409840_409973_414146_414413_415277_415447_420261
896580	contig_6241_pilon	+	1985	3	Intergenic	novelGene_156435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGAACTTCTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330848	512136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_332001_511250_511965_512017
896581	contig_5947_pilon	-	5125	1	Intergenic	novelGene_101572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	723	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	4658	5026	802092	801724	NA	65	AAAAAAAAAAAGTTGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTDVGSSSLTPMLQKEKGMIAHTPQEVKSGVTESGGEHEALPPRRQNHPLSSSPPHRTKRTTHKLEHASHTQMPTGASKQCKVGWVSFRRAMKSYILISEKCFSYKYIFPSKEKSATSYFS	806749	801624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_801600_806700
896583	contig_3817_pilon	-	7531	3	Intergenic	novelGene_78298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4200	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCAAGTGGGCATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130915	117880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_124732_129751_129819_130302
896584	contig_2703_pilon	+	2298	16	Intergenic	novelGene_101741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	949.152229916548	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	146	1429	559489	610870	FALSE	55	AAAAAAAAAAAGTTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKASPRCTSLKLGGALSPGLELEEKQLCRKAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526321	611739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
896585	contig_19402_pilon	-	2249	1	Intergenic	novelGene_80821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	450	770	89547	89227	NA	60	AAAAAAAAAGGGATATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSSIFFLLRETKEDANKRRDIPCPRTGKLNIVISVFSKLFYRVNSIPIKTLGLFLGKNRQSDSKIHKEMTKAKNSWDNLKRRIELENLQYQIKTYYKPRTIKIV	89996	87747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_87700_90000
896586	contig_8330_pilon	+	1799	2	Intergenic	novelGene_71727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	542	898	163425	163781	TRUE	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPDPLLIPSLPLTSGLSSPRTPGVRSFSSSSTPHNQGNRTTIERGPRCTKCQAREGLCPQGRGAEPEWLSVSASRGCCSSTGPAVEAAAVQSGWGKVMRFKLWQLSLSEVRYKLSVV	162883	165260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_164534_165111
896587	contig_91_pilon	-	1591	7	Intergenic	novelGene_127144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_6	49.0226704925611	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	181	921	1203313	1199198	FALSE	20	TTCTAAACTGGTTTTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPPPPELPSEENKSPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKLVNVELPIEANLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRGKLYGPYEKFICEQDHQSFLRLLTETEDWLYEEGEDQSKQAYVDKLEELMKIGTPVKLRFQEAEERPKLLEELGQRLQHYARIAADFRNQDEKYNHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRALEIKAKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERTPNGPNADKKEEDLEGKSNFGAEPPRQNGDCYPNEKSSINMDLD	1206141	1198527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_1199405_1200355_1200518_1200620_1200741_1201048_1201157_1202402_1202529_1203295_1203434_1206081
896588	contig_4803_pilon	-	1497	18	Intergenic	novelGene_150718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	567.620932041226	7	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	825	672	1496	48114	33808	FALSE	35	TAATGGCAGCTCAGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVK	93273	33806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50084_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
896589	contig_16496_pilon	-	812	2	Intergenic	novelGene_5216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATGATGTTCATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	49	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_767_3500
896590	contig_3414_pilon	+	3876	15	Intergenic	novelGene_80964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1995	2309	67134	70789	TRUE	30	GCTTGGAGAAATCCATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKTRRKEVTVLIFKATECILHIFKKLCVVSLDLCLAIFHWILEFHGGKFIEDLPHVLTDNGPCDFIVTLGSGFNSSTGHIIKRNHVGQHSYCLVEWAEPRS	64958	101958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_65127_65307_67265_69035_69214_70783_70875_76897_77097_78450_78521_79117_79233_79321_79444_89138_89249_89785_89949_93529_93681_95072_95209_95420_95642_98057_98187_101892
896591	contig_8712_pilon	-	3249	15	Intergenic	novelGene_58738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1650	1979	88608	87318	TRUE	65	AAAAAAAAAAAAACCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTDFGVFYCGLSQNVDKALIVFKFMLCNRVRTRSRIIFISFTYHSRLMIKTFLTKEYKFSKVLLEKFEYCQIYLSIATKESLSTEGPFSLQCPDVNLFLAISKCAVA	104149	79020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_79413_79915_80145_83637_83842_84376_84444_84967_85152_85941_86105_87286_87484_87970_88074_88547_88727_89377_89462_90064_90195_93510_93622_99333_99466_101387_101554_103241
896592	SIRV6	+	984	6	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	1479	16	50	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	246	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2566	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
896593	contig_7411_pilon	+	1372	1	Intergenic	novelGene_137008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAGGAGGAAGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289433	290805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_289400_290800
896594	contig_4604_pilon	-	6845	9	Intergenic	novelGene_19122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	155	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	4963	5355	57778	57386	TRUE	50	GACAACACACACGCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKMKQDPYLTLYTKINSKWIKDLNIKPKTIELIEEKIGATLEVLIHSINRIQTITSNTHTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKYFTKRVKREPTDWEKFFGHYKLDKGLISKIYKKMQHLYNKKANNPN	263215	55837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_56461_56518_59382_115950_116697_184703_185009_189569_190087_190200_190284_204051_204199_261507_261884_262030
896595	contig_12313_pilon	+	2145	12	Intergenic	novelGene_171853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCAGCGCCTCGGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72418	115464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_+_73357_73941_73989_75191_75332_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82777_83612_83736_84289_84402_100064_100116_100451_100589_115241
896596	contig_14744_pilon	-	1511	6	Intergenic	novelGene_66009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	325.30637866479	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	257	1192	969755	960824	FALSE	30	CAAATACCATTTATTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPTLCALVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	970011	960504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968580_969735
896597	contig_10009_pilon	-	3065	7	Intergenic	novelGene_82727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGGCCAGTGGTTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73439	41608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42018_55203_55301_60319_60407_63216_63355_68603_68814_70217_70384_71481
896598	contig_20889_pilon	+	3611	3	Intergenic	novelGene_127643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	339	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAGTATCAGACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40270	44541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_41018_41613_43068_43131
896599	contig_17144_pilon	-	1955	11	Intergenic	novelGene_29460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2295.21821184828	2	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	951	1667	167982	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183312	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166840_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169061_174933_175001_175973_176271_179700_179786_181790_181850_183158
896600	contig_13082_pilon	+	546	2	Intergenic	novelGene_178692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	93	323	35210	35850	FALSE	65	AAAAAAAAAAAGTTGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQVVSWVKGETVHNTGETNTTCTRKGHGGPMDRSKLPEGLSCWTEGSGDHGLGEHLAQLVKLPSMCTDQPASGQPSKTMRVTRYRSPVTRPRRQKGSRKLMIGNTE	35117	36073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13082_pilon_+_35295_35704
896601	contig_2798_pilon	-	2692	5	Intergenic	novelGene_120018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	828.139330064694	4	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	420	857	116665	115557	FALSE	15	AATTCAGTTTGCCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASADL	193422	113721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115565_116235_116680_120454_120595_170381_170519_193294
896602	contig_9955_pilon	-	2635	5	Intergenic	novelGene_21298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	714.724203801718	32	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	258	947	49296	47139	TRUE	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGKYLV	49866	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47152_47561_47737_48794_49380_49692
896603	contig_12677_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_110711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
896604	contig_5050_pilon	-	2303	7	Intergenic	novelGene_110234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	87.6446423538446	488	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	52	618	13652	6360	FALSE	25	TACTTGTGCCTAACATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACHNYWHWALYLIEKGDYEAALTIFDNHILPSLQASGTMLDVVDSCSMLYRLQMEGVQVAERWQDVLPVTQKHSRDHVLLFNDAHLLMAFLGARDTRTTQELLTTLQEASDVELLLPIRYRIVQIGGSNAQRDVFNQLLIHAALNCSSSAHRHVARSLLMERDALKPGSPLTQRLIRKAAALHLMQ	13703	4674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_6454_8194_8269_8513_8575_9079_9246_12177_12260_13414_13454_13601
896605	contig_7254_pilon	-	4677	8	Intergenic	novelGene_145852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	440	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2525	2920	287725	287330	TRUE	30	GGTGATAGGAGAGTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRITCKYPLISYSSLQPINTIVNSNHEEQPSFLVRQVDTGSLQTSVVVQLDKTGNTFPKTQKMVKPEKNSGGWWKILSLSRDGNRSQVQMETDSATCTFNSEAILCCLKFHRFGMNWFHRTQNSWYIRQ	290249	228439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_228487_230868_230991_242397_242488_243049_243151_247412_247513_250252_250353_283443_283529_286217
896606	contig_5136_pilon	-	1737	10	Intergenic	novelGene_126638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.167760566505	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	72	833	294435	279670	FALSE	30	AGAAGATATTGATTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAGTVSEAQLARRLTKGKKSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVNVCGQRHQTRIKRGNNPFFDELFFYNVRMTPSKLMDEIISIRVYNSHSLRAGCLMGEFKIDIGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSDAKGYLKVSMFVLGTGDELPPEREDRVNDSDDVESNLLLPAGITLQWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIALTCSFTQGSSYQK	294506	278765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_279715_282751_282818_285835_285940_287398_287526_288241_288358_288857_288889_290215_290267_290351_290415_293639_293769_294405
896607	contig_3612_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_87835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCCCTCGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966849	964643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_964600_966800
896608	contig_11224_pilon	+	2201	3	Intergenic	novelGene_124447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_2	92.5	328	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	151	456	19401	20398	FALSE	25	TTAAACTTGATTTTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRYRTLRNVGNESDIKKRKTNSDILQILQPRPPKHSTSFAEWTTKIDKSVMSKMNMHYRKTRNFYRNTVGDLLKFIRNLGEHINEEKNKDMKLKIGDPAWYFQKTFPDLVVYVYTKLQDTEYNKHFPKTQDPHNPQCHGGGNVKQARGPEC	11243	22143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_+_11379_19385_19520_20211
896609	contig_8177_pilon	-	4468	12	Intergenic	novelGene_86497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	174.978440230374	665	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1034	3105	140	3244	60217	39318	TRUE	40	AGAGAGAAAGTGGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVRWKLACLLEDLEDMDFKKFKMHLEDYPPQKGCISLPRGPTEKADHLDLVTLMIDFNGEKKSWDMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPEWDDAHDSTLTVMCREESIEEEWMGLLGYLSRISFCKKKEDYCRTYRKHIRSRFQCIEDRNARLGESVNLNKRYTQLSLVKEHLSQKEREHELLAIGQTAAKTRDSPMSSIKLELLFDPDEENAEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKIMLDWASGKIYKDKFDYLFYIHCREVSLMTKRSLGDLIISCCPDPNPPISKIVKKPSKILFLMDGFDELQGAFDENTGALCTDWQKADRGDILLSSLIRKRLLPEASLLITTRPVALEKLQHLLHHPRHVEILGFSEARRKEYFFKYFSDEHQAREAFRLIQENEILFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMDSGKSLAQTSKTTTAVYIFFLSSLLQTRGGTQEHHFSASLRGLCSLAADGIWNQKILFEEYDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKYYSFIHLTFQEFFAAMYYLLEEEEERETRSMSCSYSKPPNRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERSSYLEKKLSCKISQQIRQELLKWIEAKAKAKKLQTQPSQLELFYCLYEMQEDDFVQRAMDHFPKIEINLSIRMDYVVSSFCIQNCCCVESLSLGFLNNLPKEEEEEEEEGRRLHAVNCVSPCSHAACSYSLVNCYLIPSICRGLFSVLSTNTRLTELDLSDNTLGDPGMKVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLTRHCCLDISSVLSSNQKLVELDLSDNALGDSGVRHLCVGLRHLFCNLRKLWLVSCCLTSDCCQDLASVLTTNQSLTRLYMGENALGDAGVGILCEKAKHPQCKLQKLGLVNSGLTSVCCPALSLALSTNQNLTHLYLRGNALADKGIKMLCEGLMNPNCKLQMLELDNCNLTSHCCWDLSTLLTSNQSLRELSLGNNDLGDLGVVLLCEVLKQQNCFLNTLRLCEMYFNYETKCALETLQEEKPELTIVFEPSW	64057	37967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_38110_38235_39418_40643_40815_41311_41483_45742_45914_46558_46730_50693_50865_54614_56374_56883_56998_59940_60262_60804_60867_64024
896610	contig_13680_pilon	+	5745	37	Intergenic	novelGene_149578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_35	120.597007082614	8	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1349	4050	85	4134	273050	340157	TRUE	15	TAACACCTGGCTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQKHLAGLFNSITSFYHPSNNGRWLNKLMKLLQRLPNSVVRRLHRERYKKPSWLTPVPDSHKLTDQDVTDFVQCIIQPVLLAMFSKTGSLEAAQALQNLALMRPELVIPPVLERTYPALETLTEPHQLTATLSCVIGVARSLVSGGIWFPEGPTHMLPLLMRALPGVDPNDFSKCMITFQFIATFSTLVPLVDCSSVLQERDDLTEVERELCSATAEFEDFVLQFMDRCFGLIESSTLEQTREETETEKMTHLESLVELGLSSTFSTILTQCSKEIFMVALQKVFNFSISHIFETRVAGRMVADMCRAAVKCCPEESLKLFVPHCCSVITQLTMNDDVLNEEELDKELLWNLQLLSEITRVDGKKLLPYREQLVKILQRTLHLTCKQGYTLSCNLLHHLLRSTTLIYPTEYCSVPGGFDKPLSEYFPIKDWGKPGDLWNLGIQWHVPSSEEVAFAFCLLDSFLQPELVRLEHCGDGGHEMSRDDVLQSLTIVHNCLIGSGNLLPPLKGEPVTHLVPTLVSLEETKLYTGLEYDLSRDNHRETIARVIRKLLNHILDNSEDDTKSLFLIIKIIGDLLQFQGSHKHEFDSRWKSFNLVKKSMENRLHGKKQHIRALLIDRVMLQHELRTLTVEGCEYKKIHQDMIRDLLRLSTSSYSQVRNKAQQTFFAALGAYNFCCRDIIPLVLEFLRPDRQDVTQQQFKGALYCLLGNHSGVCLANLHDWDCIVQTWPAIVSSGLSKAMSLEKPSIVRLFDDLAEKIHRQYETIGLDFTIPKSCVAIAELLQQSKNPSINQILLSPEEIEEGLKRQQERNADALRNYENLVNTLLDGVEQRNLPWKFEHIGIGLLSLLLRDDRVLPLRAIRFFVENLNHDAIVVRKMAISAVAGILKQLKRTHKKLTISPYEISGYPKPTQILAGDRPDNHWLHYDSKSVPRTKNEWESSCFVEKTHWGYYAWPRNLVVYAGVEEQPKLGRSREDMTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLINFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVLKPHLERLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGTCIATSCESRDPRKLHWLFELLLESPLSGEGGSFVDACRLYVLQGGLAQQEWRVPELLHRLLKYLEPKLTQVYKNVRERIGSVLTYIFMIDVSLPNTAPTTSPRVPEFTARILEKLKPLMDVDEEIQNHVMEENGIGEEDERTQGIKLLKTILKWLMASAGRAFSTAVAEQLQLLPLFFKIAPVENDNSYDELKRDAKLCLSLMSQGLLYPLQVPLVLQVLKQTARSSSWHARYTVLTYLQTVVFYNLFIFLNNEDAVKDIRWLVISLLEDEQLEAP	272522	342294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_272598_273040_273307_275855_276043_276841_276932_277671_277737_278468_278620_279860_279960_280179_280250_280792_280861_289104_289321_290755_290914_292043_292140_299752_299809_301745_301803_301992_302049_302141_302241_303358_303422_303563_303660_305400_305533_307759_307970_308732_308870_309953_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314501_315204_315275_315942_316069_316638_316792_323626_323732_324256_324349_325027_325160_325535_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_340148_340250_340775
896611	contig_3155_pilon	-	3542	3	Intergenic	novelGene_26440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	238	261	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTCACAATATCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332665	317291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_318961_319933_321701_332559
896612	contig_8377_pilon	+	4164	19	Intergenic	novelGene_35072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2866.51674457234	50	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1932	2232	4163	131448	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	120184	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_122399_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
896613	contig_6795_pilon	-	1665	9	Intergenic	novelGene_27669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	97.168587388106	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	313	1080	129029	46152	FALSE	30	TTAACATGCTGTGGATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAENKSTDSRVCEGKRCFHHPNRFKIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134412	45566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
896614	contig_8822_pilon	-	3845	6	Intergenic	novelGene_117921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	129.240860411868	271	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTACTCAGTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104616	49374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_52744_57093_57174_61525_61653_77031_77173_103708_103778_104557
896615	contig_5889_pilon	+	1577	13	Intergenic	novelGene_133676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_12	82.2794611201497	17	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	33	1403	20445	323066	FALSE	25	CATCCATGAGTATATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVKLFPQETLFLEAKE	20412	323240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_322982
896616	SIRV6	+	950	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	567	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896617	contig_5669_pilon	+	6583	10	Intergenic	novelGene_86052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	229.331610673978	45	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	161	1666	182940	189257	TRUE	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQPAPGAPPAPRRVRLKPWLVAQVNSCQYPGLQWVNGDRKFFYIPWRHATRHGPGQEGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	177405	195206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_177555_182928_183135_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_189011_190881_191912
896618	contig_13740_pilon	-	2205	6	Intergenic	novelGene_34634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1862.98616205274	7	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165411	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157536_158270_158394_158640_158677_161996_162031_165237
896619	contig_15752_pilon	-	7372	12	Intergenic	novelGene_148769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	470.504002670461	949	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	191	1468	404541	327884	TRUE	5	TGTGGCTGGGTCTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAMLETPELPAVFDGVKLAAVAAVLYVIVRCLNLKSPTAPPELYFQDSALSRFLLKSCPLLTKEYIPPLIWGKSGHIQTALYGKMGRVRSPHPYGQRKFITMADGATSTFDLFEPLAEHCVGDDVTMVICPGIANHSEKQYIRTFVDYAQKNGYRCAVLNHLGALPNIELTSPRMFTYGCTWEFGAMVNYIKKTYPLTQLVVVGFSLGGNIVCKYLGETQANQERVLCCVSVCQGYSALRAQETFMQWDHCRRFYNFLMADNMKKIILSHRQALFGDRVKKPRCLEDTDLSRLYTATSLMQIDDNVMRKFHGYNSLKEYYEEESCMRYLHRIYVPLMLVNAADDPLVHESLLAIPKSLSGKRENVMFVLPLHGGHLGFFEGSVLFPEPLTWMDKLVVEYANAICQWERNKSQCSDTEQVEADLE	440906	321700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_322046_322324_328081_330870_330956_332465_332536_333157_333269_334073_334167_343267_343452_360195_360364_367196_367373_404347_404549_407733_407834_440823
896620	scaffold_12124_pilon	-	3520	9	Intergenic	novelGene_22333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1791	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2194	2529	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510597	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
896621	contig_3964_pilon	+	4551	3	Intergenic	novelGene_174205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	480	junction_1	328.5	777	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	333	836	82044	82547	FALSE	60	CAACAAAAAAAAACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERFVVTAPPARNRSKTALYVTPLDRVTEFGGELHEDGGKLFCTSCNVVLNHVRKSAISDHLKSKTHTKRKAEFEEQNVRKKQRPLTASLQCNSTAQTEKVSVIQDFVKMCLEANIPLEKADHPAVRAFLSRHVKNGGSIPKSDQLRRAYLPDGYENENQLLNSQDC	79045	86262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_79155_79760_79965_82024
896622	contig_14559_pilon	+	763	4	Intergenic	novelGene_83716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCCCTGTCCTTGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230190	277661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_+_230447_249374_249526_251347_251496_277453
896623	contig_6445_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_77003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492854	495485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_492900_495500
896624	contig_14176_pilon	-	2419	16	Intergenic	novelGene_74833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	161.513865933823	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	819	1955	229418	223488	FALSE	20	TTTGGAAACCACGTCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRTLKKRN	232520	223023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229874_229930_230207_230314_231182_231369_231790_231966_232443
896625	contig_8044_pilon	-	3610	5	Intergenic	novelGene_132396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	13.3111795119741	837	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	235	2355	598978	569783	TRUE	15	TTATTTTTCTGAAGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNEPNQIPGPKRTLAPTRTAEPSQVVDLKQGPQELQERKIQVLEEKVLRLTRTVLDLQSSIAGVNENLKHAIQDDASKMLVSWFSNVHPQPTPDSAVGGDTETVQLPGISNKESGMKDIKSELAEVKDTLKTKSDKLEELDGKVKGYEGQLKQLQEAAQGPTVTMTTNELYQAYVDSKIDALREELMEGMDRKLADLKNSCEYKMVGLQQQCDDYGSSYLGVTELIGEKETNLRKEINDLRAQLQNPSVQANCCDHEKNGDFGQQIKMLDQKIERVAEATRMLNVRLDNEFDRLVVLEPEVDFDARWNELDARINVTEKNAEEHCFYIEETLRGTISGEVDELKQLLDQKIQSLEDRLGSSLLEIANNTDAEFTPSGSALPGVSGSGNEQVMTDLNHLKDRVQVVEDICRHNSQGEPHGIEGTLPNGEDHIVGDSSRLLKSLNDTMHRKFQETERNIQKLQQDFSFLYSQLNHTENDVNLLQNEMSNCREGKNTEGGGFTKRDEQERTDETLPSRQDPTAHCSQLEERLQRLQSQVLSSLDTCKENTQGVQTEVSMVEGRVSQMEKTCSKLDSLSESLHKIKEGLNKHVSSLWSCVRQMNGTLRLHSRDISGLKSSVQQFYSHVFQISTDLQDLVKFQPLATEEPSEAPQLPPWGKGPQAPVRLPEAPTEPARPKLTLAPLPRPSGPPPPEDPGQRPVLPKRPLLPRPPRRNAASAGVARLDRAAVAAWVHGRHHGDGRGRASGQNGRVGQGPAPGGWMVKLVRPLSPTRKATQVHQDTPGHLP	599212	563544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_564662_567863_567993_569773_569807_571697_572105_597288
896626	contig_7695_pilon	-	4177	5	Intergenic	novelGene_41526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	587	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCCTACAAAATGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362190	349776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_349820_350482_350899_356266_356943_358527_358756_359376
896627	contig_14727_pilon	+	2105	8	Intergenic	novelGene_56661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	194.02829585356	81	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1572	534	2105	336140	344422	FALSE	65	AAGAAAAAGAAGAAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLVQNEQEGLDLDGEADLSNLEGFQWEGISISSSPGLARKRSLSESSVIMDRAPSVYSFFSEEGTGKENEPQLVVSPGNSLRATQSQKVTAGFKQEMIPVAASLRTGEMAENVAIRRRHSTQLPSDCTIPLVHSAKDLSSQESSAPASETPNGQESNGEGNSASSNLSSALANSSLVDAATDSSCTSGAEQTDGQSIRKKRRATGDGSSPELPSLERKNKRRKIKGKKERSQVDQLLNISLREEELSKSLQCMDSNLLQARAALQTAYVEVQRLLMLKQQITMEMSALRTHRIQILQGLQETYEPSERPDQVPCNLSRERRNSRSQTSADATLLPTPFFPVFLDPSQVSPSSTSSIFQVSGIVPAPDSSVQIKQEPMSPQRDENVNVVPQGSAGSVSKELSQTNREIGDSCPVYPVIAATLSLSELTESFHEASQELKFPVEQGNIRNRENSPSSQSTDLPDMNKEGEEPARGNSESEACTSSFPRLPFASETSLEKEPHSPADQPEQQAESTLTSAESRGN	334434	344422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_334848_334915_335023_336126_336761_338200_338271_340710_340866_340949_341011_341742_342055_344069
896628	contig_11855_pilon	-	3589	18	Intergenic	novelGene_66881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	69.2633008474954	124	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	1769	3436	644879	604768	TRUE	35	GAAAATAGGTGTACGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPERRNRMKPERSTRRKPDRKTPMKPGRRTRARPDGPDSKAAPSFQRKPPARPSAATATIAVAVEEERRLRQQNRLALEEDKPAVERCLEELVFGDAEDDEDALLRRLRRPRIQVHEDSGDSEVESEAKDKFSPQKKPVWVDEEDEDEEMVDMMNNRFRKDMMKNASESKLSKDKLQKRLKEEFQHAMGGVPAWAETNRRKTSSDDESEEDEDDLLQRTGNFISTSTALPKGILKMKNCQHANAERPTSARISSVQFHPRAQVVMVAGLDNAVSLFQVDGKTNPKIQSIYLEKFPIFKACFSANGEEVLATSTHSKVLYVYDMLAGKLIPVHQVRGLKEKIVRSFEVSPDGSFLLINGVAGYFHLLSMKTKELIGSMKINGRVAASTFSSDSKKIYASSGDGEIYVWDVNSKKCLNRFVDEGSLYGLSIATSRNGQYVACGSNCGVVNIYSQDSCLQERNPKPIKAIMNLVTGVTSLTFNPTSEILAVASEKMKEAVRLVHLPSCTVFSNFPVVRRKNISLVHTMDFSPRSGYFALGNEKGKALMFRLHHYSDF	683290	603174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_603314_604753_604793_606127_606271_614547_614723_625359_625484_629835_629927_630147_630249_634458_634634_634733_634860_636450_636540_639788_639857_641062_641162_642791_642905_644540_645331_676522_676727_679839_679973_681243_681356_682422
896629	contig_10734_pilon	-	4286	4	Intergenic	novelGene_51137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	710	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858649	852478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_853750_853802_855126_856731_857548_857773
896630	scaffold_12124_pilon	-	1321	4	Intergenic	novelGene_22114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1135.48120000093	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	99	707	899419	895164	TRUE	20	GACTTGGAACAGTGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGGA	899517	894058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894649_895139_895175_895908_896396_899308
896631	contig_13542_pilon	+	7345	40	Intergenic	novelGene_131569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_28	183.746752801303	28	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	900	2703	1305	4007	703179	720779	TRUE	30	AAAGAAGGTGTTGACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQTPFVRRQVRKLLLFICGSKEKYRQLRDLHTLDSHVRGIKKLLEEQGIFLRASVVTASSGSALQYDTLISLMEHLKACAEIAAQRTINWQKFCIKDDSVLYFLLQVSFLVDEGVSPVLLQLLSCALCGSKVLAAMAASTGSSSAASSSPPVASSSGQATTQSKSSTKKSKKEEKEKEKEGESSGSQEDQLCTALVNQLNKFADKETLIQFLRCFLLESNSSSVRWQAHCLTLHIYRNSSKSQQELLLDLMWSIWPELPAYGRKAAQFVDLLGYFSLKTPQTEKKLKEYSQKAVEILRTQNHILTNHPNSNIYNTLSGLVEFDGYYLESDPCLVCNNPEVAFCYIKLSSIKVDTRYTTTQQVVKLIGSHTISKVTVKIGDLKRTKMVRTINLYYNNRTVQAIVELKNKPARWHKAKKVQLTPGQTEVKIDLPLPIVASNLMIEFADFYENYQASTETLQCPRCSASVPANPGVCGNCGENVYQCHKCRSINYDEKDPFLCNACGFCKYARFDFMLYAKPCCAVDPIENEEDRKKAVSNINTLLDKADRVYHQLMGHRPQLENLLCKVNEAAPEKPQDDSGTAGGISSTSASVNRYILQLAQEYCGDCKNSFDELSKIIQKVFASRKELLEYDLQQREAATKSSRTSVQPTFTASQYRALSVLGCGHTSSTKCYGCASAVTEHCITLLRALATNPALRHILVSQGLIRELFDYNLRRGAAAMREEVRQLMCLLTRDNPEATQQMNDLIIGKVSTALKGHWANPDLASSLQYEMLLLTDSISKEDSCWELRLRCALSLFLMAVNIKTPVVVENITLMCLRILQKLIKPPAPTSKKNKDVPVEALTTVKPYCNEIHAQAQLWLKRDPKASYEAWKKCLPIRGIDGNGEIPQQIRAPPSLFD	701874	753892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_703401_704442_704522_705368_705615_706513_706683_707136_707282_707884_707971_708668_708757_709024_709219_711676_711917_712344_712484_713198_713325_713441_713571_714472_714817_716491_716583_716918_717004_717193_717322_720463_720594_720717_720877_721833_721944_722576_722719_723109_723192_723489_723664_725724_725847_727172_727371_728851_728933_731968_732057_732553_732682_733588_733692_734108_734229_734972_735164_735629_735804_736742_736843_738267_738415_740826_740907_741377_741504_742661_742857_745740_745966_749174_749266_749994_750158_753491
896632	contig_5797_pilon	-	2965	5	Intergenic	novelGene_56967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAGAATTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060042	815219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_815348_815834_816816_935681_935892_1058156_1058707_1058946
896633	contig_9332_pilon	-	3059	9	Intergenic	novelGene_60702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_8	378.103408474454	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	187	1551	73851	41510	FALSE	5	CCATTTTTTTCTCTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATARNLSNMTLAHEIAVNENFQLKQDALPENSLAGRVKHIVHQAFWDVLESELNAEPPEYEHAIKLFEEIREILLSFLTPGGNRLRNQICEVLDTDLIRQQAEHSAVDIQGLANYVISTMGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRQIFHVLDLMRMDMVNFTIRSLRPHLQRQLVDYERTKFQEILEETPSALDQTTEWIKESINEELLSLSEATLTPGAEGSSKPTLSPTLVLNNSYLKLLQWNYRKKELPETLMTDGARLQELTEKLNQLKIIACLSLITNNMVGAITEGLPELANRLKRISAVLLEGMSKETFNLKEVLNSIGVQTCVEVNKTLEERGLSTLNAEVQANLVGQFSSIEEEANPIWSLIDKRIQLYMKSLLCLPSPPKCMPPIPGGLAVIQQELEVLGSHYANIVNLNKQVYGPFYANILRKLLFSEEAVGKTETLSPTN	86285	40001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66121_68156_68378_69415_69537_73753_73890_86137
896634	contig_5945_pilon	+	1363	7	Intergenic	novelGene_104571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTCCCGTCCAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215593	249600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
896635	contig_9366_pilon	+	2708	7	Intergenic	novelGene_166286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	377	junction_2	205.67240672703	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	132	767	1070072	1091027	FALSE	5	GGCTGCCTTCTCGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPAYLKGEDLFGLTVSAVARIAESLPGVEACENYTFRYGRNPLMELPLAVNPTGCARSEPKMSTHVKRPHTLNSTSTSKSFQSTVTGELNAPYSKQFVHSKSSQYRKMKTEWKSNVYLARSRIQGLGLYAARDIEKHTMVIEYIGTIIRNEVANRKEKLYESQNRGVYMFRMDNDHVIDATLTGGPARYINHSCAPNCVAEVVTFERGHKIIISSNRRIQKGEELCYDYKFDFEDDQHKIACHCGAVNCRKWMN	1068592	1092968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1068667_1070014_1070146_1070429_1070599_1087906_1088024_1088565_1088640_1088926_1089036_1090934
896636	contig_16103_pilon	+	1384	2	Intergenic	novelGene_118875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATCTCTCAGCAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722335	733334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723674_733288
896637	contig_19237_pilon	-	2200	5	Intergenic	novelGene_162959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.925168182572	39	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAATTTAAACCTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71757	53909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_53917_65833_67115_67219_67816_68341_68467_71566
896638	contig_3588_pilon	+	3416	5	Intergenic	novelGene_72890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_4	416.204577101214	58	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	633	1109	131312	137260	TRUE	0	TTTGGTGGTTTTTTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNWGPWGAVLECSLVILWIVDPVSLPYFFLLPTVHQRPLPQPALPSMSSNTFPSRSTKLNPKHSLPLPHMPGAFSESNNNFPQSASLPPYFSQGPSNRPPPRITAEGRNYPLPVSNKPQPPSHEEEENSLNEEWYVSYITRLEAEAALRRINQVLC	130679	141460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_131548_134071_134122_136015_136117_137170_138929_140821
896639	contig_6137_pilon	-	2050	3	Intergenic	novelGene_59280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAATTAAATAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349048	1344905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1345188_1346607_1346749_1347421
896640	contig_14970_pilon	-	2065	4	Intergenic	novelGene_45141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	88.2433503947402	24	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	354	701	291083	285608	FALSE	30	ATTGAAGCTATTTTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVR	315751	284243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_285807_290934_291170_311919_312047_315611
896641	contig_12250_pilon	+	1937	6	Intergenic	novelGene_80568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_5	140.901951725304	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	776	1768	297511	304188	FALSE	5	GCTGCTCTTCTGTCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYDTSFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLITTKAIGSNMRDDITHLYKHPEGSEAERKAVETAAAHGSKPNVYAMSNSAEDVVVQVETQDPVMGQDLTVCVVLSNRGSSHRTVNLHLYLSVTFYTGVTGPVFKDSKKEAVLAPGASERVVMPVAYQEYRSHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFRNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQTFVPVRPGPRQLIASLDSPQISQVHGVIQVDVAPASGGRGFSDTGGDSHSGETIPMASRGGA	296735	304357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_297544_298029_298184_298306_298589_298732_298894_299252_299390_303962
896642	contig_4180_pilon	+	3384	7	Intergenic	novelGene_8371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1551.55725536207	6	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	320	856	875200	888134	TRUE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874105	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888928_889087
896643	contig_10424_pilon	-	2524	24	Intergenic	novelGene_56805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	241.190243292214	24	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1902	622	2523	319877	296982	FALSE	40	ATAAACTTCTTCAACGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPSRRNRSSVLDDYAPGSHDVGDPSTTNLYLGNINPQMNEEMLCQEFGRFGPLASVKIMWPRTDEERARERNCGFVAFMNRRDAERALKNLNGKMIMSFEMKLGWGKAVPIPPHPIYIPPSMMEHTLPPPPSGLPFNAQPRERLKNPNAPMLPPPKNKEDFEKTLSQAIVKVVIPTERNLLALIHRMIEFVVREGPMFEAMIMNREINNPMFRFLFENQTPAHVYYRWKLYSILQGDSPTKWRTEDFRMFKNGSFWRPPPLNPYLHGMSEEQETEAFVEEPSKKGALKEEQRDKLEEILRGLTPRKNDIGDAMVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYR	347206	296980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312429_312506_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319758_319792_319876_319972_323693_323828_324329_324388_327210_327310_329327_329460_341003_341049_347147
896644	contig_5988_pilon	+	2094	10	Intergenic	novelGene_16080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1715.79252825043	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	80	811	1218380	1225654	FALSE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKQKSQERKDRQGKG	1209864	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1225612
896645	contig_2069_pilon	+	1420	2	Intergenic	novelGene_23316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	861	1184	523820	524143	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAATTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEDAPGCSPAVAGRGRQRAAVLPNRSPGAWPGQGFGLMALTKLPLPLLSRKGEASATFYHSALTLKGAVLAWLLEWTESTVERAGGRRRWGGALPVEGRIRSLAQ	522725	524379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_523515_523748
896646	contig_10225_pilon	+	2619	12	Intergenic	novelGene_86779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	562.839275092612	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	1214	2521	46329	47636	FALSE	30	TAAACATCTTGATTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20661	47734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35619_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41507_42623_42726_45216_45259_46306
896647	contig_13633_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_15322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGGCACCTGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16850	19532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_16800_19500
896648	contig_9235_pilon	+	2577	3	Intergenic	novelGene_156229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	240	1388	45805	46953	TRUE	30	TGAAAGATCCCTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45167	48316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_47275_47448
896649	contig_13612_pilon	+	1712	9	Intergenic	novelGene_157286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	144.114537781585	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	199	1191	51083	57016	FALSE	20	GTGGTTGTAAGATGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	49360	57537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_55102_55301_56237_56382_56881
896650	contig_9400_pilon	-	1993	6	Intergenic	novelGene_146589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1076	junction_2	224.988355254222	121	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	115	312	135537	132487	TRUE	30	CCAATTGAGATCCAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTGIFVTA	158630	121337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_131168_132600_135452_135561_158539
896651	contig_6710_pilon	-	2907	3	Intergenic	novelGene_89052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	152	688	712509	711973	TRUE	30	ATATTGGGGAAGTCAGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGTRQECPLPPLLFNIVLDVPARAIRQEKEIKGIQIGKEEVKESLFADDMILYTENPRESTRKLLEQTEDFSKVSGYKINIQNSVEFLYTNKENFKEEITKSVSFKIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKEKYKTLLQEFKRDLHKWKNLPCSWIVRHNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQISTAFFNMMEKQITNFIWKGKRPRISKALLKKKNKVGDLTLILEPIIPPR	712660	589087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_590613_617295_617882_711864
896652	contig_5005_pilon	-	4618	11	Intergenic	novelGene_84333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_5	94.6340847686498	486	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	298	1773	667337	616685	FALSE	20	GTTTAGCCAGCCGTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAAAETEFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKTENAKVRKVKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGSLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRQLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVTENSEGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKKKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRENAKLNIELEAAPH	667634	613839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_616796_627291_627427_631840_631982_635774_635895_637691_637918_642393_642531_643088_643248_653670_653800_655985_656090_658274_658432_667280
896653	contig_2377_pilon	+	756	3	Intergenic	novelGene_67904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGGTGTTGCAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222894	224701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_222956_223856_224070_224219
896654	contig_2100_pilon	-	1733	12	Intergenic	novelGene_50712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	114	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	83	1387	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
896655	contig_5023_pilon	-	1420	2	Intergenic	novelGene_7176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCGGAGCCGGCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541805	538682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_538780_540482
896656	contig_6576_pilon	+	3619	3	Intergenic	novelGene_42315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3179	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1270	1827	532130	532687	TRUE	40	GAATGAGACTAAATGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKTVSLTSGAGVTGYPSAKKLKEDPYLTTCTKTNSKWTKDLNIKSKMIMIMEEKIETMLGALIYGINRIQNIINNVQTPEERLDNWELLKIKYLCSSKYFTKRVKRPPTDREKIFGYVKSDQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDIILTHNKKTRFTDLKETEETPRVWPPDTLLVQW	530801	602511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_531215_531273_533904_601935
896657	contig_177_pilon	+	2121	3	Intergenic	novelGene_41826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	146	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	73	1149	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415658	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419506_419936
896658	contig_8412_pilon	-	3920	5	Intergenic	novelGene_118407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	93.9823786674928	455	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	30	833	817194	814504	FALSE	20	TTTTACATGAGTTCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGQKISEQMVIGTPGTVLDWCAKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSVRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	817223	811416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_814566_814977_815170_815695_815859_816409_816648_817045
896659	contig_3721_pilon	+	2088	2	Intergenic	novelGene_123804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAATGAGAGTTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81606	83961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_83170_83436
896660	contig_10734_pilon	-	6013	25	Intergenic	novelGene_51074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCAGCCATTATCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496942	471594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_471631_472994_473131_473330_473421_474646_474809_476098_476236_476314_476422_476553_476706_477475_477662_478248_479808_481266_481466_481857_482024_482118_482294_483012_483145_484712_484849_485508_485623_485722_485794_486326_486427_487933_488009_489269_489417_489500_489596_489675_489769_491999_492138_492652_492731_494128_494322_495406
896661	contig_5988_pilon	-	4324	3	Intergenic	novelGene_15837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1148	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTTCAACTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421973	240951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_244603_289595_289765_421469
896662	contig_4812_pilon	-	2737	1	Intergenic	novelGene_103724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	836	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGATTGGAGCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957147	954410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_954400_957100
896663	contig_4315_pilon	+	3903	14	Intergenic	novelGene_46760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	308.856911394219	606	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	269	2074	265874	293317	FALSE	20	CGACTATACTCTGTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKGSSTDGKTDLANGSLSSSPEEMSGAEEGRETSSGIEVEASDLSSSLTGDDGGPTRTSTESRGTDTESSGEDKDSDSMEDTSRYSINDENRVHDHSEEEEEEEEEEEEEEEEEQPRRRVQRKRANREQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELGSSARFVYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVLDFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKLALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEKKVGLYTIYVNPANTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENENNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLVYSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGSDCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTELTGLKDVIKKNKRERDEDSLHHTDLFDSHMLWFLMHHLRQRRHHRRWREPGVGATDADSDESPSSSDTSDEEEGPDRVQCMPS	250370	295146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_250543_251445_251519_265850_265923_268802_269489_270465_270607_271713_271809_277695_277807_285725_285799_286277_286336_286848_286957_288344_288476_291955_292076_292480_292598_293200
896664	contig_10722_pilon	-	3147	2	Intergenic	novelGene_70975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	821	1201	9265	8885	TRUE	35	TTAAACTGCTTCAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLQTGSSVDPRRGMLGSGLSEIESWLSLPWCLPLTDVSLFPHLYNENDGNAGPERPDVNCSKAASVWFAFIPLYRDGSVQKPQCLVPCCNTHSVSHSLYHLLCNFFKIPSFWGIIRACRMYLGK	10085	3722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4506_7721
896665	contig_15047_pilon	+	1509	7	Intergenic	novelGene_52203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	8	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
896666	contig_10437_pilon	+	1774	9	Intergenic	novelGene_38300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	1089.26225033277	3883	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	49	483	431167	442746	TRUE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQFA	431118	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_442737_442910_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
896667	contig_14353_pilon	-	4298	7	Intergenic	novelGene_82148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	201.543557464771	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	53	625	420302	407845	TRUE	65	GACTTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPPEGQRERDRLLHGPKNVTNSSSLRLPRQNSDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGKLLLNLVDHTEVVRDLTFAPDGSLILVSASRDKTLRVWDLKDDGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVCIKVLVRSL	420354	401869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404691_405512_407979_409840_409973_414146_414413_420261
896668	contig_11563_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_142296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTCGGGTAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93302	95176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_93300_95200
896669	contig_12869_pilon	-	1429	2	Intergenic	novelGene_75352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	474	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTCCTAGGCTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97661	93747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_94432_96916
896670	contig_5780_pilon	+	3875	6	Intergenic	novelGene_29775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	15	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2337	2726	111869	112258	TRUE	45	AGATGCAATGTTTATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWHHCIFPPWCLLQWDPGSAQSVEVPCGGLPVARQALSSCHRLTPGNGSSALSVSQVISSPCLCSLCPKLQLPVPLFSPVMPGSCRLSTQVSGIPHLSCPGPLGTAQARPCFCTLSLSRSSSKGAVR	73990	113469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_112316_112377
896671	SIRV6	+	1366	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	160	2	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896672	contig_19352_pilon	-	1774	7	Intergenic	novelGene_122362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	581.975371758405	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	181	672	122754	104000	FALSE	40	AGCTGTAATAAAGTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123067	102897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738_122787_122919
896673	contig_9706_pilon	-	490	1	Intergenic	novelGene_20784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1662	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATAGTCCAGTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239	749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_700_1200
896674	contig_4232_pilon	+	970	2	Intergenic	novelGene_63356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCGCACAGCTCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467088	468135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467844_467920
896675	contig_16492_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_100292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTTGTAAGCATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132186	130238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_130200_132200
896676	contig_12622_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_5863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1214	1513	1120438	1120737	NA	50	CAGGAAAACAATAGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARRCLATTTDSSDRDHNRGFWTEVEKDVEQNSNSPKNDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIGQSNKTKWD	1119224	1121168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1119200_1121200
896677	contig_2054_pilon	+	6361	3	Intergenic	novelGene_51682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATCAAACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102560	109227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_107428_107677_108375_108430
896679	contig_10749_pilon	-	4320	6	Intergenic	novelGene_133494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_5	838.750833084534	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	53	2407	243911	207814	FALSE	25	CAAATGCCTTTCAGGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNSGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSGGGGGQESQPSPLALLAATCSRIESPNENSNNSQGPTPSGGTGELDLAATQLSQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAATPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQGLANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVTSGTAISSASLVSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTGGSAGTSSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQTGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQTITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGASGIQVHQLPGLPLTIANASGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDPQPQPGRKTRREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGF	243963	205900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_208128_208566_208767_211207_211377_240887_242398_242714_242870_243904
896680	contig_2704_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_75316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	183	467	280368	280652	NA	5	CTTGTTTTTGATTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYIGRELPEIQARFRRGRGTRDIADVRWILPESREYLCFIDYAKAFDGVDHNKLWITLQRMGIPEHLTVLPRNLYMDQEAVVRIEQGDIAWFEVRKGVLQGCILSPYLFSLYAEQIIQEAGLYEEERGITLRGRLINNLRYANDTTLLAESEED	280185	282572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_280200_282600
896681	contig_9113_pilon	-	1928	4	Intergenic	novelGene_68589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	709.772890124408	16	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	239	883	348512	347698	FALSE	20	CTGGCACAGACTATCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEWPQRQLWLHHRSVRKRSQLLPVRNV	354279	346652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_347776_347945_348568_352030_352088_354153
896682	contig_16211_pilon	-	4363	1	Intergenic	novelGene_150090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	586	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCCAGCCATCTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186297	181934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_181900_186300
896683	contig_19342_pilon	+	1266	5	Intergenic	novelGene_41053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	35	619	3263	5037	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSVSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRAQIPQRHM	3228	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4365_5016_5075_6164
896685	contig_10986_pilon	-	1655	3	Intergenic	novelGene_71496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30	153	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1070	1492	138095	137673	FALSE	10	CCCTGCCCCTCCACGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTRRSRARGCGHQAQTHFRYYFHHLETVFTGKHSSLYKLELQRHFPAIGSWEESARVTVRMGLSSAAGRAWGLAGTGLPDHSSTDLNKPFDTLKCEMKVQPPRSWSKQAGCKKADRYPETRLGLPVLGDAPRKAHGSLV	143617	137509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_139059_142461_142530_143579
896686	contig_14925_pilon	-	4215	1	Intergenic	novelGene_55246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTCTAAATTTATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97393	93178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_93200_97400
896687	contig_8464_pilon	+	1741	6	Intergenic	novelGene_125372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	100.172650958233	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	365	820	798819	803564	FALSE	25	ACTGTATTAAAGCTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLTLVAQWLKCLAANQMVGGSNLPAAPREKDVAICFCKDLQPWEPYEAVLLCPIGSLSVGIDLTAVGLVWFLVLYSIDSIVYPVNFLN	792603	804485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_792735_793605_793672_796183_796258_798725_798922_799187_799279_803302
896688	contig_5039_pilon	-	4249	1	Intergenic	novelGene_64813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1097	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224564	220315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_220300_224600
896689	contig_19687_pilon	+	4436	1	Intergenic	novelGene_170766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	496	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1726	2136	73773	74183	NA	65	CCAGAAGAAAGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKGNNKISEMDSVIEGLRSKFETMEDRIKTNTWIQLWLRKNRKKITKINEETLRMVSDTIKRKNLQVIGVPEQGEKTENTDRIIELLLTENFPNIMKHEKLTIQEVR	72047	76483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19687_pilon_+_72000_76500
896690	contig_16575_pilon	-	1296	13	Intergenic	novelGene_146488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_12	72.0952302321188	528	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1266	30	1295	26213	2061	FALSE	25	TAAGTAATTCTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLSDKTNYDIVVRAKQIWELLRRKDCDKEKRVKLMSDLQKLIQGKIKTIAFAHDSTRVIQCYIQYGNAEQRKEAFEELRDNLVELSKAKYSRNVVKKFLMYGSKPQIAEIIRSFRGHVRKMLRHAEASAIVEYAYNDKAILEQRNLLTEELYGNTFQLYKSADHPTLDKVLEAQPAKLELIIDEMKQILMPMAQKEAVIKHSLVHKVFLDFFTYAPPKLRSEMIEAIREAVVYLAHTHDGARVAMHCLWHGTPKDRKVIVKTMKTYVEKVANGQYSHLVLLAAFDCIDDTKLVKQIIVS	28063	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_2142_7368_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13320_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21124_21261_24643_24863_26131_26224_28044
896691	contig_6871_pilon	+	2115	4	Intergenic	novelGene_21560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	70	1077	121971	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121901	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134814_134942
896692	contig_15732_pilon	-	4193	3	Intergenic	novelGene_88888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3505	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3367	3669	218826	218524	FALSE	35	ACCAAAAGTAGGTGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVGKQFHIQVVFHSLSGRSKDGEWSQVFDRKEEEVVRGMEEIKRSRKKQHQQPTNGTQGAGQCRRVEFKQHWGEVGASWPRECGCRKQRGPSGGEEE	222480	217999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_219832_220054_221664_221728
896693	contig_709_pilon	-	6966	9	Intergenic	novelGene_57582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	113	junction_8	168.644550386308	1079	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	21	2114	2246128	2212176	FALSE	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERGIKWACEYCTYENWPSAIKCTMCRAQRPSGTIITEDPFKSGSSDVGRDWDPSSTEGGSSPLICPDSSARPRVKSSYSMENANKWSCHMCTYLNWPRAIRCTQCLSQRRTRSPTESPQSSGSGSRPVAFSVDPCEEYNDRNKLNTRTQHWTCSVCTYENWAKAKKCVVCDHPRPNNIEAIELAETEEASSIINEQDRARWRGGCSSGNSQRRSPPTVKRDSEMKMDFQRIELAGAVGSKEELEVDFKKLKQIKNRMKKTDWLFLNACVGVVEGDLAAIEAYKSSGGDIARQLTADEVRLLNRPSAFDVGYTLVHLAIRFQRQDMLAILLTEVSQQAAKCIPAMVCPELTEQIRREIAASLHQRKGDFACYFLTDLVTFTLPADIEDLPPTVQEKLFDEVLDRDVQKELEEESPIINWSLELATRLDSRLYALWNRTAGDCLLDSVLQATWGIYDKDSVLRKALHDSLHDCSHWFYTRWKDWESWYSQSFGLHFSLREEQWQEDWAFILSLASQPGASLEQTHIFVLAHILRRPIIVYGVKYYKSFRGETLGYTRFQGVYLPLLWEQSFCWKSPIALGYTRGHFSALVAMENDGYGNRGAGANLNTDDDVTITFLPLVDSERKLLHVHFLSAQELGTEEQREKLLKEWLDCCVTEGGVLVAMQRSSRRRNHPPGHTDGREMARPLPTDPALHIPV	2246148	2207323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2212362_2213472_2213703_2213866_2213997_2215315_2215437_2221959_2222159_2222683_2222756_2224147_2224302_2227044_2227233_2245314
896694	contig_2646_pilon	-	3161	18	Intergenic	novelGene_69548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	76.7754105675774	17	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	99	1934	877063	847374	FALSE	40	AGAACCTGAGAAGTATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVSIFELFVWWTDRFWILEQHAETGPVRWGEVGRSQSPEKCRGLYHTGSKSPDGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCSRRPGGRRHGRGNPEGPLTWKPREQAITEMISEEGGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRRLLERLKEGGHGNPAPPAASNPHSSQRSQMDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPVFRKKMVWEILHQQLL	877161	846146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847437_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863816_863997_864102_865297_865467_867268_867360_868912_868981_869457_869525_869938_870077_874678_874735_876962
896695	contig_9235_pilon	+	1750	3	Intergenic	novelGene_156202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGATCCCTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43707	48316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_43900_45834_46255_47178
896696	contig_7342_pilon	+	2395	18	Intergenic	novelGene_71235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	318.84570142136	1300	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1242	1153	2394	729008	749131	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVSSSSGRNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCINHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSERKECEVKKEKSSSVDRHHSVEIKTEKTIIKKEEKSERKEEKKPGDIKKEEKDQDELKPAPPSRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSKSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHERKEKSRLQRERMELDCQRQRLERERWERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEKLRYEQERRPAFRRPYDVDGRRDDVYWPEGKRAALEDRYRSDFPRPEHRFHDFDHRSRGQYQDHVVDRREGSRSMMG	716953	749132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_727572_728492_728826_728866_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034_738166_739511_739604_743088_743226_744985_745280_746617_746759_749103
896697	contig_14563_pilon	+	2655	7	Intergenic	novelGene_135045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	121509	121829	TRUE	35	AAAGATACTCCATCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSALGENLQHKLVPQLTHKYTNCFVTWVAIPVSVLPPFPHRVPCVHSSSFPVLSAFSSLLLGRCYPFGEAIFLILSFQPFILSPNDKSTKFKYSQIVENINKPTSS	121506	159503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_122953_125258_125367_131682_131744_133438_133529_136798_137029_158443_158577_158916
896698	contig_11563_pilon	-	3025	2	Intergenic	novelGene_142299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	131	junction_1	0	572	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACCCAGCTCTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108180	104656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_107282_107780
896699	contig_15114_pilon	+	4330	11	Intergenic	novelGene_121182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	120.887757858271	876	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	42	2114	688565	776925	FALSE	25	CCGCTTTGCTCAAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVETRHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVMDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDTSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEHTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDEWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTSPCQSPTIAEGPVPPPPVRPSRAPSRTPGPPSSQSSPVDSQPATQLQQKDSSQTLEPKRPPPPRPVAPPTRPAPPQRPPPPSGRSQPSPQAGLPGPAPAGYSAARPTIPPRAGVISAPQSHARASAGRLTPESQSRPSEAPRGPAHLPEPLKPQAVLPGQPSLPPAVQKMQEPLVPVAAPLPQSAPQPSLETPPQPPPRSRSSHNLPSESPSQQQVKINGVSDVRQESPLKSDPFEDLSFNLLVSKAQLCVQTSPALTPNPKGLLQLPSATQSNVDRLSSVSCMPTMPPIPSRSKAQENTRSSPNPVLTSLTSTNPFTDRTAAPGNPFRADSQESEVASWSSKEGPVANSPSPSPQPLGPNKSKPSSSLDGFEDSFDLQSQSLDKSSNPKGWVTFEEEEDFSVKPKSKSACCPGSLSCSHLTFDDDWNKCTNVAFSVLPARRPPPPPLPPSGAAPPGDPFTAVAWKASPTLDFTER	687581	779141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_687601_688542_688689_711862_711950_713497_713766_716869_717035_758812_758914_761504_761649_767000_767072_768214_768324_768556_768775_776139
896700	contig_500_pilon	+	1962	2	Intergenic	novelGene_31125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734922	1764274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1734930_1762319
896701	contig_14864_pilon	-	4195	3	Intergenic	novelGene_178693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5181	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	2281	3039	13592	12202	FALSE	50	TTAGAGAGATGGAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTFTVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPSVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWEKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDAYLMPCTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEIMGPTLQALIHGNNRIQTITISAQTPVDKLDNWDLLEIKHLCSSKDFTKKVKRGPTDWGKIFGQFKSDKGLISTIYKKIQHLYCKNR	16152	11045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14864_pilon_-_12225_12856_14617_14896
896702	contig_3602_pilon	+	2357	3	Intergenic	novelGene_60606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	34	1089	902032	913188	TRUE	40	ACAAAATTAATTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901998	914930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_914347_914820
896703	contig_5845_pilon	+	2044	9	Intergenic	novelGene_98889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	107.837841224683	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	164	1240	135600	161337	FALSE	15	CTAAGGCTGTGTTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRGLSSWFGLEQPAADGAPSEGDRQPEGNAPPKQRSEVVAESSEDEPQQTGDQELLLDQAKGLGNYLFNFATEATKKITESAAKTAQTIKKSVEEGKIDDLIDKTIIGDFQKEQKKFVQEQHTKKSEAAVPPWVDSNDEETIQQQILALSADKRNFLRDPPAGVQFSFDFDQLYPVALVMLQEDELLSRMRFALVPKLVKEEVFWRNYFYRVSLIKQSAQLTALAAQQQAAGKGGSNGREGDLPLTEAVRPKTPPVVIKSQLKTQEDEEEISTSPGVSEFVSDAFDACNLNQEDLRKEMEQLVLDKKEEETTVLEDDSADWEKELQQELQEYEVVTESEKRDENWDKEIEKMLQEEN	135436	162141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_135796_145353_145473_146405_146473_149064_149139_151638_151779_157490_157637_159049_159109_159564_159713_161209
896704	contig_5686_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_45372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGAGTGACTTCATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138793	137988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_138000_138800
896706	contig_1406_pilon	-	2331	7	Intergenic	novelGene_25520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	70.361960998508	77	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTACAGCCAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058908	1736713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1738155_1745212_1745264_1750141_1750260_1751245_1751389_1829371_1829712_2012379_2012515_2058805
896707	contig_5947_pilon	+	8039	11	Intergenic	novelGene_101499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	132.236757371012	733	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	4768	7011	418341	420584	FALSE	55	AATAAAAACGATGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKTFAGVKVHVVDKYQGEENDIILLSLVRSNQEGKVGFLQISNRICVALSRAKKGMYCIGNMQMLAKVPLWSKIIHTLRENNQIGPALRLCCQNHPDTHTLVSKASDFQKVPEGGCSLPCEFRLSCGHVCTRACHPYDSSHKEFQCMKPCQKIICGDGHRCPLVCFQQCRPCEVKVPKTIPQCGHEQMVPCSVPESDFCCQEPCPKFLPCGHRCSHPCGEKCVQWCSEMVTAELKCGHSQQVECGQVDAIKYGLPVKCTTKCGTILDCGHPCLGSCHSCFEGRFHEHCQQPCKRLLICSHKCQEPCIGECPPCQRTCQNRCVHSQCKKKCGELCSPCVEPCVWRCQHYQCTKLCSEPCDRPPCYVPCTKLLACGHPCIGLCGEPCPKKCRVCHQDEVTQIFFGFEDEPDARFVQLEDCSHIFEVQGLDCYMNEQKDDEVAIKLKVCPICQVPIRKNLRYGTSIKQRLEEIEVIKERIQGSAEEIAASQERLKDLLEKKNLFYLWLPEEFLMLKKKLAQKNLSVKGLGLVENCISFYDRLAGLWDSLKRVHVLEQNNVSTRLNQVHEWLAKKRLSFTSQELGDLQSEIQRLTYLVNLLTRCKMAEGKVKGSIAEEVCSVRKILMNTCKFTQEDEQLVQKKMEALKASLPCSGLGISEEERVQIVNAMGYPRGHWFKCPNGHIYAISDCGGAMQRGTCPDCKAVIGGVNHTLESSNQLASEMDGAQYAAWSETANNLMNYEEIQRLM	399883	421612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_401644_405970_406112_407672_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728_415398_415803_415950_416710_416822_417146_417243_418141
896708	contig_15031_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_138424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTACTCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154098	153265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_153300_154100
896709	contig_2867_pilon	-	1662	3	Intergenic	novelGene_135259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	352	5540	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATATTCCTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288035	1285025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1286328_1286442_1286781_1288013
896710	contig_11026_pilon	+	3908	5	Intergenic	novelGene_167662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	916	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3523	3837	316489	361385	FALSE	60	TGCCACAAAAAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPAEIKRIITEYYEKLYSKNFEDQEEMDKFLETHYLPELSQTDVENLNRPITKEEIEKVIKKTPNKQKKALVQMASLENSTKHSEKSLHQYYSNYFRT	146432	361456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_147353_151310_152092_152699_153295_315262_316633_361214
896711	contig_4091_pilon	+	2263	2	Intergenic	novelGene_173001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	76	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1511	1948	13212	13649	FALSE	70	AAAACCTACAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	10749	13964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_12242
896712	contig_9683_pilon	-	3309	3	Intergenic	novelGene_151266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	435	1433	3478	2480	TRUE	70	TAAATAAAAGGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQIKTPDNSPVEENALEVPDREFKSLILVIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEERTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPGKQKLREYVKVKPNLQELLKGILRSEDKQLQPSGRT	4240	302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_1447_1747_3575_3902
896713	contig_14288_pilon	+	2851	5	Intergenic	novelGene_153809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160594	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_161566_331081_331260_524703_525078_563235_563912_660212
896714	contig_16578_pilon	+	4497	1	Intergenic	novelGene_148667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGTTGTTTACTTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226906	231403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_226900_231400
896715	contig_8278_pilon	+	1779	5	Intergenic	novelGene_165301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGATTTGTCATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217266	230047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_217683_219894_220012_222966_223067_224070_224201_229031
896716	contig_2770_pilon	+	1340	5	Intergenic	novelGene_107454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCTACACGGAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742935	747794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744575_744685_746606_746748_747768
896718	contig_19412_pilon	-	3630	2	Intergenic	novelGene_178695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2456	3100	1193	549	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKRTRKAPKKTEKKKQRKKKCSQGSLCTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGRSKDGAWSQALERKEGRRREASKKSKEAEKKKKATPAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPALWSPSGRSKDGARSQALE	4068	18	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_1368_1787
896719	contig_9177_pilon	+	2329	7	Intergenic	novelGene_32796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	64.1649350415699	379	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	260	1006	1516958	1569099	FALSE	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEDGVNWFISDKDVEAHIGNNRSSGRWTHRYYSANKNVTCRNCDKCGHLSKNCPLPQKVRPCCLCSERGHLQYACPARFCLDCSLPMSSTHRCLKRSFWRKRCDRCDMIGHYADACPEIWRQYHLTTTPGPPKKPKTPSGQSTLVYCYNCAQEGHYGHECAERRMFNQTFPTSPFIYYYDDKYEIREREQRIKRKVKELQKNGDFPRQFKRPHMEAVDKKPHRDMRKSHGSWRNNRWPQEKKEAQKEMMSRNSRDGEKHRKADKYHEVDEDFPRGPKLHQKPDRSSRHSSHYHRPRGEKLPKEAKRGKHKKKERGLEDDDNDNLFLIKQRKKKI	1514215	1570422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1514262_1515807_1515934_1516870_1517042_1535922_1535959_1558471_1558568_1566718_1566837_1568686
896720	contig_3948_pilon	-	2361	6	Intergenic	novelGene_53203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	307.058691458164	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	155	697	866424	840803	FALSE	20	GTGTCATGTCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869670	839138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_866421_866480_869571
896721	contig_12181_pilon	+	3368	1	Intergenic	novelGene_178086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGAATCACCCTGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4916	8284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12181_pilon_+_4900_8300
896722	contig_2867_pilon	+	3032	3	Intergenic	novelGene_135223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44	36	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	60	650	1192534	1193780	TRUE	35	CAAGGATGGCGAAACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGQARKRTTAGRVQSRLSAMDEADRQLLRRCRLQLVCELQVAELWDALLSRGLFTPDMIEEIQGAGSGSRRDQARQLITDLETRGRQALPLFISCLQDTGQDMLASFLNTSRQTAEQNLEAIRPRDLVPGPVGFNPDEMRVVKQDPSRSTMGRLPTVVLRPDKLRPTELRPEVLRPQVPRPVTTGSGELRDACEYPEWLVSGHDEQPLGSDHWCS	1192474	1196943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1192666_1193321_1194979_1195759
896723	contig_3627_pilon	+	2200	10	Intergenic	novelGene_78578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	38.6810318143431	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	3	1916	1313510	1343837	FALSE	35	AAACATACATTTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPPLSKAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKREYASDLSPPRKKPAKSHFRNKQHDSKEFTLPFLGSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313507	1344121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323504_1324656_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
896724	contig_3018_pilon	-	5215	16	Intergenic	novelGene_78766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	559.072660751713	354	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	616	1773	600079	569929	TRUE	40	AGCAACTAGGGTCATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRYIPLFSCS	625095	329341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_329794_401491_401742_480825_481534_555124_555279_568050_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_600806_600912_603367_603441_624772
896725	contig_12391_pilon	+	2233	14	Intergenic	novelGene_103593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	304.115712951346	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	464	1534	94111	107379	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56775	108078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_84131_84306_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
896726	contig_9696_pilon	-	1921	4	Intergenic	novelGene_68748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	23.7954243967663	377	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	306	329	48344	48321	TRUE	15	TTTGCATCTATTCTTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTIGLIAGSGWRGWRWHGPGNRCPGSTTSTCLSRRSTCWSPGSGLCSILCWFPLWGWHCTQDTSSCHSTSWRYCTTLKLYSDRDVTRIQRFLREESPSEVGMGLHQMS	68505	25551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_26032_46789_46826_47244_48507_68362
896727	contig_3747_pilon	+	2898	7	Intergenic	novelGene_24881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1696.33933482923	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	231	1274	201313	203441	TRUE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGEPDLMPFLPHSACCLGL	201082	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203651_203768
896728	contig_3095_pilon	-	1603	3	Intergenic	novelGene_75175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTGAGGACTAAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227850	220478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_220594_226125_226407_226643
896729	contig_14621_pilon	-	1959	16	Intergenic	novelGene_105855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	147.93758443644	7	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	15	1664	463794	396356	FALSE	30	TATTATGAGAGTTTATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSNVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	463808	396060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403762_407287_407344_408572_408741_411209_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463781
896730	contig_9481_pilon	-	4571	26	Intergenic	novelGene_149617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_23	228.000154385913	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	901	3420	82249	33610	FALSE	5	GTTGGCGCCCACCCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAKFSQLTSLLSSIEDKVKAMLHEGHESPHRCSIIPPVNFEVKSESLGIPQKLHLKVDVETGKLIVKKSKDGSEDKYYSHKKILQLVKSQKFLNKLVIVVETEKEKTVRKEYVFADSKKREGFCQLLQQMKNKHSEQPEPDMITIFIGTWNMGNAPPPKKITSWFLSKGQGKTRDDSADYIPHDIYVIGTQEDPLGEKEWLEILKHSLQEITSMTFKTMAIHTLWNIRIVVLAKPEHENRISHVCTNHVKTGIANTLGNKGAVGVSFMFNGTSLGFVNSHLTSGSEKKLRRNQNYTNILRFLALGDKKLSPFNITHRFTHLFWLGDLNYRLELPISEADTIIQKIKQQQYADLLAHDQLLMERKEQKVFLHFDEEEITFAPTYRFERLTRDKYAYTKQKATGMKYNLPSWCDRVLWKSYPLVHVVCQSYGSTSDIMTSDHSPVFATFEAGVTSQFVSKNGPGTVDSQGQIEFLSCYATLKTKSQTKFYLEFHSSCLESFVKSQEGENEEGSEGELLVKFGETLPKLKPIISDPEYLLDQHILISIKSSDSDESYGEGCIALRLEAKETQFPIYTPLTHHGEMMGHFQGEIKLQTSEGKTREKLYDFVKTERDESSGPKSLKSFTSHDPMKLWEPTNRPSDLAKNIAEPLLQEDLPLTKQKPEMFENPLYGSVSSFPKLVPRKEQESPKMLRKEPPPCPDPGVSSPTILLTKAQEAESSKGTSKQVPTPRLRSFTCSSSTAEAGAAAGGEKNHGKPKPAASSQAPAPVPAKRPVKPSRSEMSQPIPPAPTQLRPPLPAKSLAVLHLQHSKGRDYRDNTELLHHGKHRPEEGPLGRTAMQ	170861	32458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_33613_34410_35015_44436_44534_46652_46803_50842_50931_53033_53117_54443_54558_56611_56702_63474_63557_64292_64382_64978_65088_68578_68718_69169_69267_72613_72732_73184_73382_75950_76054_76969_77077_80863_80988_81956_82029_82195_82277_89063_89152_100007_100149_105418_105592_114922_115074_149689_149751_170602
896732	contig_3382_pilon	-	3637	15	Intergenic	novelGene_124134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	243.958897926579	465	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	404	1960	842480	792482	TRUE	15	TATGCTTTACACGTCCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKKFEMKYGGKPRKHRKDRLQDLIDIGFGYDETDPFIDNSEAYDELVPASLTTKYGGFYINTGTLQFRQASDTEEEDITDNQKHKPPKVSKVKDDIEMKKRKRKEEGEKEKKPRKKVPKQLGVVALNSHKSEKKKKRYKDSLSLAAMIRKFQKEKDALKKESNPKVPVTLQTSSLNKPPSATVALGNDVSDLNLSGADPDLPIFVSTNEHELFQEAENALEMLDDFDFDRLLDAASDGSPLSESGGENGSTAHPACASQVMPKLVPTLPEGLPVLLEKRIEDLRVAAKLFDEEGRKKFFTQDMNNILLDIELQLQELGPVIRSAVYSHLEAFVPCNKETLVKRLKKLHLNVQDDRLREPLQKLKLAVSNVMPEQLFKYQEDCQARSQAKCAKLQTEEEREKNGSEEDDDEKPGKRVIGPRKKFHWDDTIRTLLCNLVEIKLGCYELEPNKSQSAEDYLKSFMETEVKPLWPKGWMQARMLFKESRSVHNHLTSAPAKKKVIPAPKPKVKHLYKSSL	847047	788444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_790000_792359_792506_793854_793898_795752_795804_796544_796689_797291_797406_797902_798022_804749_804880_812049_812121_818856_819347_821837_821939_822592_822731_830445_830548_842450_842544_846707
896734	contig_9436_pilon	-	2166	4	Intergenic	novelGene_60906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	48.3482735529983	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	353	376	418163	418140	TRUE	60	AAAAAAAAAGACCATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCARFKETEAVGVLEHGPYDPPPSPWDYLGPRSWEDGLRRLCLLQECAVRPQRGLHGEVLEVGDASGRKGEWRESPGDFRWGERCRGFREDSRELPAKRGFLGTSGDEGVRIGLGGMSGRLWT	418515	415394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_416277_416889_417459_417701
896735	contig_16103_pilon	-	6569	9	Intergenic	novelGene_118755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_8	215.57423315415	1807	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	642	1550	444621	440402	FALSE	15	AGGTGGGGGTGGGAGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPGAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKVCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQAALSPTTAPAVPSVSKQETIMRHHTLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSTFAQAPQLSVPGGLLGMPGVNIAYLSTGIGGHKAPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK	447437	435382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_440536_441204_441323_441494_441606_442490_442694_443771_444088_444594_444767_445744_445877_446221_446354_447205
896736	contig_9833_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_68476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAATATACAGCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80310	82331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_80300_82300
896737	contig_1406_pilon	-	1311	6	Intergenic	novelGene_25521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	73.4237018952327	48	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCAGTTCTTGGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058928	1737702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1738155_1750141_1750260_1751245_1751389_1829371_1829712_2012379_2012515_2058805
896738	contig_8375_pilon	+	3444	15	Intergenic	novelGene_141263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.377322996025	43	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1845	227	2071	19906	41535	TRUE	20	GATCTGTGCAATGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLGVLPFTINSIRMESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRSSFSIPKFHVSPTGMITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKGEDSYFIPF	19679	65681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_19925_24670_24965_28742_29049_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41539_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
896739	contig_14666_pilon	+	1677	2	Intergenic	novelGene_39645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAATAGCTAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485127	486859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485203_485257
896740	contig_13457_pilon	+	2328	14	Intergenic	novelGene_118322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_5	207.025082092447	480	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	86	2029	52406	57730	FALSE	5	CTTGTCTTTCTGGCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRRDAVEWFVQVLWWLAEVASGYVGTGYMEGDGSDPEPPDAGEDSKSENGENAPIYCICRKPDINCFMIGCDNCNEWFHGDCIRITEKMAKAIREWYCRECREKDPKLEIRYRHKKSRERDGSERDSSEPRDEGGGRKRPAPDPDLQRRVGSGTGVGTILARGSASPHKASPQPLVPTSSQHHQQQQQQIKRSARMCGECEACRRTEDCGHCDFCRDMKKFGGPNKIRQKCRLRQCQLRARLSPVTPSEPLPRPRRPLPTQQQPQPSQKLGRIREDEGAVVSSAVKEPPEATATPEPLSDEDLPLDPDLYQDFCAGAFDDHGLPWMSDTEESPFLDPALRKRAVKVKHVKRREKKSEKKKEERYKRHRQKQKHKDKWKHPERTDAKDPASLPQCLGPGCVRPAQPGSKYCSDDCGMKLAANRIYEILPQRIQQWQQSPCIAEEHGKKLLERIRREQQSARTRLQEMERRFHELEAIILRAKQQAVREDEESNEGDSDDTDLQIFCVSCGHPINPRVALRHMERCYAKYESQTSFGSMYPTRIEGATRLFCDVYNPQSKTYCKRLQVLCPEHSRDPKVPADEVCGCPLVRDVFELTGDFCRLPKRQCNRHYCWEKLRRAEVDLERVRVWYKLDELFEQERNVRTAMTNRAGLLALMLHQTIQHDPLTTDLRSIADR	52320	58029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_52409_53293_53413_53513_53615_53935_54172_54259_54440_54909_55156_55307_55416_55577_55763_56023_56232_56310_56422_56545_56596_56721_56819_57348_57502_57583
896741	contig_16098_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_45926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	143	592	345494	349061	TRUE	15	CTGCAGGGACAGCGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELSVECLREKLQRELEAEHVVSSAARARPTKGRELLVGGFSTIHTNSAPQEVEDTTLNRCASSFRVLVVSSKFEGKPRAGSATGIRRCPPAPSVQAPVDPQLPTLWGYIAILEGNEEGPSIPTPEPLLSCERRVRPCSRRIQIFLEQV	345351	349679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_345728_348845_349064_349174_349233_349348_349492_349603
896742	scaffold_13505_pilon	-	4462	8	Intergenic	novelGene_111520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_4	428.156418108321	333	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	42	1328	603235	596651	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGKWLPGTSALGSGVGVSLVFLKKFWKKLFSHLCPQVTHKSQNLSLSPPSTSLETVPSSYSSYFSEQTLGPAWNVGRGPSQAQKAPWNGRGLQSGGGKKCPQGQVFSLY	603276	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_597232_597627_597907_601873_602237_603171
896744	contig_7279_pilon	+	1492	10	Intergenic	novelGene_145987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	284.285893311298	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	184	1242	75429	99452	FALSE	35	ATATTTATTTAACAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIEEVNENILQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGNRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPVAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	75245	99702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_75478_76321_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
896745	contig_12119_pilon	-	4844	3	Intergenic	novelGene_88689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	622	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	218	739	612639	612118	TRUE	20	CTTCTCCATAATTCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAILIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNKIENSYVNPSTYGHLIFNKGPKSFKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLLA	612856	409477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_412502_527739_528015_611311
896746	contig_10159_pilon	+	3754	13	Intergenic	novelGene_30872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	135.049450819567	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	1187	2221	978504	996016	TRUE	15	TGAAGGCTGAGTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	958498	997813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_958899_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874_996602_996865
896747	contig_12102_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_151053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	355	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTTTCTTTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40133	42196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_40100_42200
896748	contig_12886_pilon	-	2800	1	Intergenic	novelGene_135547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATCAAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977653	974853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_974900_977700
896749	contig_18843_pilon	+	4340	10	Intergenic	novelGene_165609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	503.43658494564	635	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	366	761	35601	38569	TRUE	25	GATTTTTAAGCTCTGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSR	28504	47893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_35558_35611_36859_36937_37162_37298_38395_40125_44191_44351_46028
896750	contig_18055_pilon	+	2241	15	Intergenic	novelGene_117811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	404.538745905476	222	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	617	1147	77213	80793	TRUE	70	GAAGAAGAAGAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40656	85630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83085_83184_83360_83470_84605_84757_85571
896751	contig_19076_pilon	+	3540	6	Intergenic	novelGene_74205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	224.850706025131	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	724	2295	102295	155254	FALSE	35	GAGCTATATAATTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQITWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADGYPVLPAPCVKETFSSSFNGLQSFVKDIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	94356	156499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_94504_101718_103079_124492_124574_146309_146503_152200_152398_154937
896752	contig_7272_pilon	+	3810	16	Intergenic	novelGene_25338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGGGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592730	618660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_593431_595297_595454_597542_597698_598019_598329_598894_599066_599907_600036_600992_601175_603503_603654_603920_603967_604438_604610_604708_604812_604920_605071_606906_607027_609183_609237_616547_616618_617514
896753	contig_6062_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_5283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTAAATAGGCACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735356	737509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_735400_737500
896754	contig_16510_pilon	+	6140	6	Intergenic	novelGene_139068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTTTAAAAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116530	274301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_+_118351_183162_183652_224287_224716_240839_242519_244945_244970_272601
896755	contig_15897_pilon	+	1239	4	Intergenic	novelGene_49517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.8279464370496	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCCCATTGAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159315	161800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_159436_159547_159923_160322_160452_161185
896757	contig_10367_pilon	-	1648	7	Intergenic	novelGene_169459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	93.2213614051105	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	110	1447	157654	131866	FALSE	15	GACTTTTTTTTTTTATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCYVTRPDAVLMEVEVEAKANGEDCLNQVCRRLGIIEVDYFGLQFTGSKGESLWLNLRNRISQQMDGLAPYRLKLRVKFFVEPHLILQEQTRHIFFLHIKEALLAGPLQCSPEQAVELHALLAQTEFGDYNQNTAKHNYEELCAKELSSAALNSIIAKHKELEGTSQASAEYQVLQIVSAMENYGVEWHSVRDSEGQRLLVGVGPEGISICTDDFNPINRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQSCPVCRSQVERVQHVYLPTHPSLLNLTVV	157763	131664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_131956_133633_134055_134895_135061_136153_136352_137635_137822_156347_156539_157567
896758	contig_8483_pilon	+	3842	4	Intergenic	novelGene_178701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGAGTTTCTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499	76468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8483_pilon_+_2743_39386_39842_50750_50890_74463
896760	contig_6137_pilon	-	4983	13	Intergenic	novelGene_59253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349051	1319320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1321503_1323816_1323938_1328102_1328337_1331697_1331859_1332172_1332303_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337774_1339036_1339073_1341572_1341626_1345117_1345188_1346607_1346749_1347420
896761	contig_1435_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_115485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTAAATTCAAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383281	381444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_381400_383300
896762	contig_10017_pilon	-	2372	16	Intergenic	novelGene_156984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_15	385.944532572003	481	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	337686	307398	TRUE	10	TCGGCCCTGGACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRREVRSRGPRARPGDKNIQMADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	346588	302902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_304055_307369_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346541
896763	contig_12123_pilon	-	3115	1	Intergenic	novelGene_144604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGTCGAGTTGATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134697	131582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_131600_134700
896764	contig_10236_pilon	+	5097	7	Intergenic	novelGene_169113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	65.2901643094544	1798	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	157	426	77944	78660	TRUE	50	GAAAAAAAAATCCATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAVAAGPGAPVSPDELLPKGDAEKTEEDLEEDDDEELDETLSERLWGLTEMFPERVRSAAGATFDLSLFVAQKMYRFSRAALWIGTTSFMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQVSLEPWLFASGGDTNFSLQHLGNV	77563	93639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_77678_77901_78021_78467_82291_83284_83650_84298_84494_84649_84786_93294
896765	contig_9113_pilon	+	2115	6	Intergenic	novelGene_68594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCCAAGGCGGAGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346663	364464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_348294_348358_348568_352030_352087_354152_354276_364040_364105_364431
896766	contig_4364_pilon	+	1829	4	Intergenic	novelGene_145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	19.09624744987	417	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	338	826	1214184	1214807	FALSE	90	GACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPNKGSKALKVKREPGENGTSLTDEELVTMSVRELNQHLRGLSKEEIIQLKQRRRTLKNRGYAASCRVKRVTQKEELEKQKAELQQEVEKLASENASMKLELDALRSKYEALQNFARTVARSPVAPARGPLTAGLGPLVPGKVAATSVITIVKSKADARS	1213427	1215810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1213615_1213937_1214059_1214154_1214220_1214354
896767	contig_1856_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_84891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTACTGCCTCCTTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414176	416910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_414200_416900
896769	contig_6208_pilon	-	3699	1	Intergenic	novelGene_52994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	2504	2989	399696	399211	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSVSLNGICRNCGIGVFCCVYSQQQQNKCVHYIHNLDIFFDGLSVSTDIQERISNVASYRCALNGSLCWGFLSLGGCCLLVPFWPILPRVSQDCSALDLKLFLPCEYPTAALFPTVSSYFFKLQVAPYSLLEFSQGNDGNVSDFLSQMRTVLRWWLVGEI	402199	398500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_398500_402200
896770	contig_13093_pilon	+	4987	5	Intergenic	novelGene_105204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	453	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	776	1165	18504	18893	TRUE	75	CAATAAAAAGGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASAISQNKESRNFLEEENFLELLEAEYKRLMYRTLQEISKEIMQNAGHAIEELKKIREEHNDKFNRLQESIDRQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRVEAMEVRSSETEAKALDTNLFEEKSDNRI	17283	74876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_17621_17675_18054_18443_20888_72983_74098_74162
896771	contig_8303_pilon	+	1803	4	Intergenic	novelGene_154919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGCAGCTGAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27840	36319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_+_29273_33979_34085_35771_35897_36178
896772	contig_18970_pilon	-	483	1	Intergenic	novelGene_157811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	89	319	31726	31496	NA	15	TCTGATGTGTCCAATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQPKASPSVTLFPLPSEEFQANKSTLVCLMNDFYPGAVTVTWKEDGTTITQGVKTTKPSKPSIKKYAASSCLTLLTQWRSHNSYSCQVTHEGSTMEKKVVPAECV	31814	31331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18970_pilon_-_31300_31800
896773	contig_4131_pilon	+	1730	2	Intergenic	novelGene_127854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	219	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1123	1461	135114	135452	FALSE	35	TGTTACAGAGTAGAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVEGILPWDLTFKLLLQAQCHLTTTMLPTANMYILVRIVFLITAFNKLQDIDGFSVLFFIHVTLKMSKNFALCSPPKCLSQDLDLSCSLAYSAVQTSTLISHCCVNLPNT	133822	135721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_134040_134208
896774	contig_498_pilon	+	2211	6	Intergenic	novelGene_148554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_5	55.7974909830182	371	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	30	1472	755864	768386	FALSE	5	CGGTCCCAGCTTCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGGVFKIASWADLVNAHVVPGPGVVKGLREVGLPLHRGCLLIAEMSSAGSLATGSYTKAAVRMAKEHSEFVVGFISGSRVSMEPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKQGSDVIIVGRGILTAPNRLEAAELYRKAAWEAYLSRLGM	755834	769125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760387_761736_761913_762926_763042_768216
896776	contig_7898_pilon	+	939	5	Intergenic	novelGene_47622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	791	junction_4	168.303854679565	182	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	149	442	598694	599921	FALSE	10	CCCAGTTTGCAGTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	594320	600418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
896777	contig_13592_pilon	+	2768	14	Intergenic	novelGene_33693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	537.887551214452	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	437	2017	256608	267783	TRUE	30	ATCATTTCAAGAAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVQTLYYSADHKLLDGNLLDGQAEVFGSDDDHIQFVQKKPPRENGHKQISSSSTGCLSSPNATVQSPKHEWKIVASEKTSNNTYLCLAVLDGVFCVIFLHGRNSPQSSPTSTPRLVKSLSFEMQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRKLIFFSLKVGFEKKTSGSTVCAIHT	248499	269603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_248690_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_261274_261383_266078_266209_266459_266685_267159_267282_267365_267493_267571_268000_269068
896778	contig_11986_pilon	-	2553	2	Intergenic	novelGene_69256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	466	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTCCTCATTTTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842550	839882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_841746_841860
896779	contig_14577_pilon	-	3229	14	Intergenic	novelGene_164640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_9	272.928410319929	60	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	220	1734	127106	66465	FALSE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKVNKTYFIVKDLCLLL	127325	64969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_66718_67034_67178_67386_67479_68060_68125_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78628_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
896780	contig_10973_pilon	-	315	1	Intergenic	novelGene_150342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATCCCACTCCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539	1224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1200_1500
896781	contig_8050_pilon	+	2877	2	Intergenic	novelGene_114815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1042	junction_1	0	201	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	331	699	294062	294675	FALSE	50	AAAAAAGACTTCCAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVRSCSHSAHSPFLFGSECFPVSIIYPEFLVISVNEPLTVILR	293731	296853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460
896782	contig_15857_pilon	-	8555	20	Intergenic	novelGene_152071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1021	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	7226	7627	84972	77988	TRUE	40	TTAGGCGGGAGAGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVFWIGYTIHKFLAKTKHTERFKASTIVHSQSYERLLWLSGISQTFPFSIFKHFFNLLQTEALYGLSYFRIIWVKKVWMTSQNNVFRKKLPYCVKRNFLHVHLSPLNTQQTNMLLYSFSWGKRSNHRTSRL	132619	53415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_53495_54607_54686_56445_56581_62287_62449_68575_68663_70077_70219_71477_71593_77855_78044_79043_79214_80716_80800_84879_85012_87925_88025_89277_89458_94927_94985_98578_98790_100759_100845_106560_106619_108630_108699_115719_115796_126267
896783	contig_14546_pilon	-	1346	8	Intergenic	novelGene_157411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	21.498932104471	114	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	95	988	78938	40779	FALSE	15	ATATATTTCCCTTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTESVRGLQGAVSLKLDFMSPPESAKELQNKASSFLEGSPSESPGLQKTKGITGFQTLVHLVKGNMGTGILGLPLAIKNAGILMGPLSVLAMGFVACHCMHILVRCARHFCHRLNKPFMDYGDTVMHGLESSPSSWLQNHAHWGRCVVIFFLTVTQLGFCCAYIVFVADNLKQVVEAINGTTNNCHHNETVTLTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIQNLRVLSIFSLLANISMLVSLVIIIQYIVQGIPDPGRLPLVASWKTYPLFFGTAMFSFESIGVVNGDQFLCFGRLLASF	79032	40420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_40830_59343_59443_62207_62427_67589_67675_71344_71441_74551_74641_75454_75546_78774
896784	contig_990_pilon	+	4205	31	Intergenic	novelGene_76157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_7	147.699409462447	655	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1220	3663	48	3710	1871377	1932551	FALSE	15	TCTCAGATGTATTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDQVACRGSGGGGRAMLAGGRVGPPGPVVVAVVLLLSGVGPARGSEDIVVGCGGFVKSDVEINYSLIEIKLYTKHGTLKYQTDCAPNNGYFMIPLYDKGDFILKIEPPLGWSFEPTNVELYVDGVSDICTKGGDINFVFTGFSVNGKVLSKGQPLGPAGVQVSLRNTGTEAKIQSTVTQPGGKFAFFKVLPGDYEILATHPTWALKEASTTVRVTNSNANVANPLIVAGYNVSGSVRSDGEPMKGVKFLLFSSLVSKEDVLGCNVSPVPGFQPQDETLVYLCYVVSKEDGSFSFYSLPSGDYTVVPFYRGERITFDVAPSRLDFRVEHDSLKIEPVFHVMGFSVTGRVLNGPEGEGVPEAVVTLNNQIKVKTKADGSFRLENITTGTYTIHAQKEHLYFETITIKIAPNTPQLADIIATGFSVCGQISIKRFPDTVKQMSKYRVVLSSQDKDKSLVTVETDAHGSFCFKAKPGTYNVQVIVPEVETRAGLTLKPQMFPLTVTDRPVMDVGFVQFLASVSGKVSCLDTCGDLLVTLQSLSRQGEKRSLQLSGKVNSMTFMFDSVLPGKYKISIMHEDWCWKNKSLEVEVLEEDVSAIEFRQTGYMLRCSLSHAITLEFYQDGNGPENVGIYNLSKGVNRFCLSKPGVYKVTPRSCHRFEQAFYTYDTSSPSILTLTAIRHHVLGTITTDKMMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHFPPLLRDSENYVVLLDSTLPKSQYDYVLPQVSFTAVGYHKHITLIFNPTRKLPEQDIAQGSYIALPLTLLVLLAGYNHDKLIPLLLQLTSRLQGVRALGQTVSDNSGPEDAKRQAKKQKTRRT	1871329	1933046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1871536_1875290_1875381_1879069_1879116_1883527_1883629_1884968_1885076_1887670_1887744_1890852_1891006_1891989_1892128_1892648_1892739_1895689_1895796_1895977_1896129_1901768_1901944_1903810_1903953_1905047_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911080_1911145_1911719_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919670_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769_1929890_1930456_1930550_1932419
896785	contig_8581_pilon	-	3258	16	Intergenic	novelGene_22833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	551.700216502485	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	89	2506	353082	307094	FALSE	35	AAGACTCGAGTCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	353170	306341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312616_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025
896786	contig_10082_pilon	-	2954	13	Intergenic	novelGene_63919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_11	61.9804516673515	572	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	175	1677	605791	596177	FALSE	15	CAGGTGCCTCAGTTGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKGPNPGIDLSYKVIVTSEVGLQAADPNSIFLIDHAWTYRVEHARRQLQQTPGLLHRMANLMGIEFHGEVPSAEAVALVLEEMWKFNQTYQLAHGSAEEKVPVWYIMDEFGSRIQHADVPSVATAPFFYMPQQVAYTLLWPLRDLDTGEEVTRDFAYGETDPLIRKCMLLPWAPTDMLDVSSSTPEPPDAHYQAILEENKEKLPIAISPAAYPHEHIFKVCTDVHQVLSHLTHPRFTFTPREADADILYNFSHFKDYRRLSQERPNVLLNQFPCENLLTVKDCLASIARRAGGPEGPPWLPRTFNLRTELPQFVSCFQQRERRGEDNHWICKPWNLARSLDTHITRDLSSIIRHRESAPKVVSKYIESPVLFHREDVGMVKFDIRYVVLLRSVTPLRLFAYDVFWLRFSNRPFALNDLDDYEKHFTVMNYHADVALQQVHYDEFIPAFEKQYPEFPWKDVQAEIFRAITELFQAACAKPAPLGLCAYPSSRAVYAVDLMLKWDDRPDGKQVMQPQILEVNFNPDCERACRYHPTFFNDVFSTLFLDQPSNCHVIPLL	608712	594899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_596329_596909_597049_597530_597600_598699_598782_599204_599357_600449_600562_600929_601125_601209_601327_602148_602226_604504_604639_604723_604884_605677_605877_608623
896787	contig_3942_pilon	+	633	4	Intergenic	novelGene_128776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	24	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	151	537	793521	795407	FALSE	25	GAAGCAGTAACTGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793370	795503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
896788	contig_3942_pilon	+	1062	6	Intergenic	novelGene_128682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	397.273004368532	132	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	61	498	426591	428300	TRUE	40	CATTTGACAAGTCAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQVHGHWGNQGMREGGMCAHLAGHLSPHCFAGTKCQRQVGVHVPAWGA	426530	430178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
896789	contig_9468_pilon	-	2353	5	Intergenic	novelGene_59523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACCCCCAAAAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731631	508748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_509972_546559_546826_564363_564705_631806_632297_731598
896790	contig_5791_pilon	-	2691	8	Intergenic	novelGene_35844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	120.96246677109	422	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	799	1641	1057195	1048747	FALSE	30	TAGTTGTTGATTAGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQEFADEIQARYPHLLEQLLSTSDTPGDESADPPIVHFAPGESSSEDAVMMNTPVVKAALEMGFSRKLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAENEKREEEKERQTEKMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLTANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLREIDSTLYKNLFVEKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS	1063302	1047696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1048941_1049054_1049097_1049372_1049628_1052379_1052623_1056491_1056541_1057135_1057215_1058982_1059083_1062623
896791	contig_3270_pilon	+	4920	16	Intergenic	novelGene_104493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	606	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCCGCTCTAGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340176	409146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_342734_357557_357762_359604_359770_360190_360333_362563_362731_365981_366143_367848_367891_369375_369479_370452_370584_375430_375548_376971_377092_380093_380170_385746_386370_396996_397100_407560_407614_408990
896792	contig_13300_pilon	-	3186	2	Intergenic	novelGene_125754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAATAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47460	44194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_46504_46583
896793	contig_6048_pilon	+	2034	18	Intergenic	novelGene_73121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	351.929638689661	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1860	173	2032	910374	1355027	FALSE	15	ATGCCCTGCAGGGCGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAAGPLRNAFSGWVLESRPTGTPQDCGVLGRSSCSEPQARRGDRAGTLHPAPESPPLLGGAFLLVAPHPEERCALGVRPAHAISALAVPDQSRDSARWMLCVAGAKLKRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDASKPLEVLLLEKNRSLQSENATLRISNSDLSGRCAELQVQVTEAAATVAEQRELIAHLEQDLSTIQTIQRPDAEGAAEHSLEKIPEPIKEATALFYGPSAPASGSLADDQVGSLLSIISSQRERFRTRNQELEAVREPPGPAHH	910201	1355029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_910704_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258621_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1350868_1350997_1351717_1351785_1352522_1352640_1355001
896794	contig_15092_pilon	-	3727	2	Intergenic	novelGene_57759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	196	junction_1	0	1843	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAGTAATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259725	254988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_258005_259014
896795	contig_9113_pilon	-	2795	2	Intergenic	novelGene_68610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2312	2611	418465	418166	FALSE	50	AAGTGAGAATAGCAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTEPEKDVEQIVTHTKKDQIYWPDRGWRNPESMAPGHPCSSVVKSFTRFTIQLGTGQPHKTKRD	421729	417981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_418478_419430
896796	contig_4742_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_131003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	971	1396	247753	247328	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLDLSATSTAFFNSKLHSVASPTEVDKPSRFFSVLFGFVQAVSPESAAADPISSTIWSPSLDNFTVPFDSCSVFPFALISSTIILSILSEMESFCSCSSLPENLNNGLLTVLILHSIRMSFFFSSILTQVSERSGQLNS	248723	246121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_246100_248700
896797	contig_8712_pilon	+	2068	4	Intergenic	novelGene_58798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	577.82407934134	82	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	112	591	314974	321793	FALSE	25	CATGGTGTGAAGAAGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	304796	323270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_304902_314967_315188_318064_318222_321684
896798	contig_7088_pilon	+	1495	9	Intergenic	novelGene_159786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	120.233886654304	68	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	54	1358	689656	712826	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYLNPWRRPLLSCSWSKLCLLKQCLFTMKLRSPEFQSLFTEGLKSLTELFVKENHELRIAGGAVRDLLNGVKPEDVDFATTATPAQMKEMFQSAGIRMINNKGEKHGTITARLHEENFEITTLRIDVLTDGRHAEVEFTTDWQKDAERRDLTINSMFLGFDGTLFDYFHGYEDLKNKKVRFVGRAKQRIQEDYLRILRYFRFYGRIVEEPGDHDPETLEAIAENAKGLAGISGERIWVELKKILVGNHVNHLIHLIYDLDVAPYIGLPANASLGEFDKVSKNAEGFSPKPMTLLASLFKVQDDVTKLDLRLKISKEEKNLGLFIVKNRKDLIKATDSSEPLKPYQDFIIDSRESDATTRVCELLKYQGEHSLLKEMQQWSIPPFPVSGHDIRKAGISSGKEIGALLQQLREQWKKSGYQMEKDELLSYIKKN	688579	718555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_688606_689628_689804_698510_698705_701957_702097_706157_706285_710886_711081_712085_712340_712577_712860_718451
896799	contig_14445_pilon	+	2773	6	Intergenic	novelGene_137379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTACCGACCTCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346244	503556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_346255_368773_368884_431381_433065_497999_498291_499117_499256_503015
896800	contig_7291_pilon	-	2262	11	Intergenic	novelGene_106298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	354.244887048494	48	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	675	989	178244	173628	FALSE	15	TCTGGGTAAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDINEIFKDLGMMIHEQGDVIGSGEKSGLGYKYGSHHKEPWWCNDSIEANVESAEVHVQQANQQLSRAADYQRKSRKTLCIIISVLVIGVAIIGLIIWGVNKKN	213272	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_177261_177331_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180758_181475_181566_183797_183868_206194_206350_213210
896801	contig_13992_pilon	+	3281	2	Intergenic	novelGene_147620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	1787	2452	150711	224726	FALSE	45	CCTAACAACAACAGGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKEEVQAALKSLAKNKAPEVDGIPIEMFREMDTALEVLTCLCQEIWKTATWPTHWKRSIFMPIPKKGDPTECGNYQTVSLISHTSKILLKITQKQQYMDGELPEIQAGFRRGCGTTDIIADVRWILVESREYQKDVYLCFIDYAKAFDRVDHNKLWITFRTMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVRTEQGDTSWFKVRKAVRQGCILSSFHHTYPICMLSK	148924	225555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_150899_224248
896802	contig_610_pilon	-	2934	10	Intergenic	novelGene_76835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	425	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2024	2479	363972	361078	TRUE	15	CTACTTTCAGTTCTCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	376658	350004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_350134_360751_361082_363028_363298_363789_364137_366324_366595_368137_368245_369603_369656_373433_373715_374080_374152_375580
896803	contig_4315_pilon	+	1970	4	Intergenic	novelGene_46715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	11.5566238822398	355	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTTGTCCTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62148	68338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_62511_62740_63167_63254_63361_67262
896804	contig_6509_pilon	-	3422	1	Intergenic	novelGene_145641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1544	1843	118027	117728	NA	25	TCAGTTACCCGAGCGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMEPPLLRPLIWVGEEPATSKLKQLNLDFRYIPCCTVVMRAYAVEMGPHKSMQGERRSMSVDLLCLCLGKGAAPTAGSWLRRAGSLFLHLFVNLFIL	119570	116148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_116100_119600
896805	contig_6137_pilon	+	3553	21	Intergenic	novelGene_59162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	82	junction_1	1156.63171645083	112	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	250	2346	1268914	1353702	FALSE	45	TATAAAATGAGATTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNTLYNLFFLQDIFPTSKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1239023	1354909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
896806	contig_14426_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_170634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTCCACCACCTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221748	219468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14426_pilon_-_219500_221700
896807	contig_16121_pilon	+	1872	4	Intergenic	novelGene_6855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	517.568889671274	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	115	885	57746	62826	FALSE	30	TATAATTTGTCATAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIEKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	33596	63813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_57743_58202_58867_58981_62624
896808	contig_18898_pilon	+	3147	19	Intergenic	novelGene_77631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	448.21798392201	12	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	143	1837	39608	67349	TRUE	55	TTTTTAAAAGAAAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSATSHSGSGSKSSGPPPPSGSSGSEAGAGAAAPASQHPATGTGAVQTEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQEVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQWLALTMVPRTSPTK	38936	71069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_39072_39600_39818_53324_53388_53471_53559_56519_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66195_67304_67500_67957_68063_68476_68541_70078
896809	contig_21208_pilon	+	2524	3	Intergenic	novelGene_175770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	122	5536	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	905	1231	22803	23129	FALSE	30	GTCTATTAGCCTTACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGWFMTMNFGVHAVMYTYYTLKAARVNSPRMLSMLITSLQILQMFVGAMVSILTYIWRHEQGCDTTTMEQFFLSSILYSSYFILFAHFFRQAYIIPKVKNKTKSQ	20377	24422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20637_21501_21634_22289
896810	contig_9706_pilon	+	3280	18	Intergenic	novelGene_20890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	708.401495058199	21	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	394	2097	231608	737731	FALSE	10	GTTGGGAGCTGGTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN	90872	738914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91193_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346694_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555638_688565_688730_737604
896811	contig_1349_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_171645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGATGTTTATGTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247883	245592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_245600_247900
896812	contig_5415_pilon	+	4438	9	Intergenic	novelGene_146130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	72.7753392297143	290	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	81	839	139741	155049	FALSE	35	CACACAGTTAGAAACCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDSRNAGAQVRWPLVRSRGSKDPVATMLSRLFRMHGLFVASHPWEVIVGTVTLTICMMSMNMFTGNDKICGWNYECPKFEEDVLSSDIIILTITRCIAILYIYFQFQNLRQLGSKYILGIAGLFTIFSSFVFSTVVIHFLDKELTGLNEALPFFLLLIDLSRASALAKFALSSNSQDEVRENIARGMAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCCFGCMSVLANYFVFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSHFARVLEEEEKKKVSW	134793	158648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_134851_139717_139906_140372_140485_140773_140862_141682_141768_142724_142831_145035_145143_145266_145344_155030
896813	scaffold_13505_pilon	+	4827	4	Intergenic	novelGene_111590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	818	1255	644632	645069	TRUE	40	CTACATTGCAGACAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKEWESVYHKLLELCSPSGRSKDGARSEVLERKEGEVERGKEEIKRSGKKSNTSSQQMALRQPPVGMCGIQAAAVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKHISPITGCIVSRWKLHEAAFLYPLFAGLQLESEMADLHCVSW	643814	767346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_648102_766453_766757_766822_766908_767194
896814	contig_11986_pilon	-	3487	12	Intergenic	novelGene_69217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1240	junction_11	856.595596841897	12	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	122	1801	792566	742913	FALSE	25	CACCATTTGACGCAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCYSVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMVGIEANSRTFGCFKGAGVPFCTKNSQNVCSASLAAVVSLIRDQAPQNHLGNGLRHGRFSLLTTSEHC	794706	741226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757968_758101_758220_758371_792503_792597_794615
896815	contig_2932_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_47959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAAAACAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327970	325944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_325900_328000
896817	contig_11512_pilon	-	2256	8	Intergenic	novelGene_43356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	531.228418529225	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	32	562	586558	556654	FALSE	5	AGTGGCCTGTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSTLPSVTWMLLANRTEPPPSPWGTCTPPWTSWLKCFLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	586589	554959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571091_582732_582780_586515
896818	contig_9177_pilon	+	4658	32	Intergenic	novelGene_32590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	789	1217	2759	3724	TRUE	5	TGGTGTCCTGTTGGGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1715	25707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_13323_13368_13554_13696_13890_14089_14296_14415_14809_15020_15162_15267_15424_15553_15705_15844_16051_16170_18264_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20809_20907_21023_21210_21390_21607_21689_21864_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327_25480_25583
896819	contig_8284_pilon	+	4779	10	Intergenic	novelGene_125696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	431.286218733147	111	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	107	889	426599	458771	TRUE	60	AAAAAAAAAACCCACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKVKCVCLPLCLHCKNEFNFLDRSVFAMDFMGVLCLCVHVDGCVCVSVCVCGVQECVSACTRACGVCTVWCVE	425048	462724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_460146_460208
896821	contig_12886_pilon	+	3885	2	Intergenic	novelGene_135479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	180	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAAAAATGGTTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319875	337988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_323709_337936
896822	contig_18487_pilon	+	2469	9	Intergenic	novelGene_172675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_7	44.02556075736	8	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	1420	2127	217276	236771	FALSE	15	ACCTGCCGGCCAGGTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESELFGRTIRVNLAKPMRIKEGSSRPVWSDDDWLKKFSGKTLEESKEEEGSEPPKAETQEGEPTAKKARLNPQVYMDIKIGNKPAGRIQMLLRSDVVPMTAENFRCLCTHEKGFGFKGSSFHRIIPQFMCQGGDFTNHNGTGGKSIYGKKFDDENFILKHTGPGLLSMANSGPNTNGSQFFLTCDKTDWLDGKHVVFGEVTEGLDVLRQIEAQGSKDGKPKQKVIIADCGEYV	213073	237113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_214425_216739_216784_217251_217279_220713_220796_221282_221384_223712_223837_231245_231432_236308_236452_236702
896823	contig_6439_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_154253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATAAAGAGGAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398181	396253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_396300_398200
896824	contig_15453_pilon	+	2028	4	Intergenic	novelGene_112480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	226.133195754675	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	57	491	6981	17334	FALSE	20	CCCTTCGGTTTCAACATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVGVGGQSERLAGRRRKMAVESRVTQEEIKKEPEKPIDREKTCPLLLRVFTTNNGRHHRMDEFSRGNVPSSELQIYTWMDATLKELTSLVKEVYPEARKKGTHFNFAIVFTDLKRPGYRDHPSKSGTTSFWAHETILNFTYCFLNVFSSQLCKINLLFSSP	6924	18871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_+_7053_7229_7340_16200_16324_17204
896825	contig_7898_pilon	+	3304	9	Intergenic	novelGene_47620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	470.704508556058	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	2013	2708	590052	598961	TRUE	30	ATGGATTTAGGACACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKVSRIPSAKLLKQPS	587823	600404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598917_598998_599844
896826	contig_2332_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_58626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTATTGAAATAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3411	6194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_3400_6200
896827	contig_776_pilon	+	2139	4	Intergenic	novelGene_139929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCGCCAGGGCTTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831351	932095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_833198_834689_834803_911675_911783_932022
896828	contig_755_pilon	-	2940	3	Intergenic	novelGene_119765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	81	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1314	1724	87736	83959	FALSE	30	GACATATATATGGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	82742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670
896829	contig_4091_pilon	-	4919	5	Intergenic	novelGene_173000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2533	2835	56589	56287	TRUE	35	TCTTCCTTCATGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	150581	10729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_55003_57539_148998
896830	contig_10734_pilon	-	2794	6	Intergenic	novelGene_51342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52.1980842560338	383	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	88	699	1716571	1702974	TRUE	10	CTGATTTATCCCTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRLSRSYKSPQASAARKRGVQNPGPSSEMSGKECGESEGAPGAGAVTVSDIQELMRRKEEIEEQIKANYDVLESQKGIGMNEPLVDSEDYPRSDVDLYQVRTARHNIICLQNDHKAVMKQVEEALHQLHARDKEKQARDMAEAQNEAMSCRPDLSLGKSPCPLQAFAKVNSISPGSPASLAGLQVDDEIVEFGSVNAQNFQSLQNVGSVVQHSEGEATERDSDPKRGETAA	1716658	1700570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1702627_1702934_1703024_1706479_1706583_1708742_1708961_1711477_1711581_1716433
896831	contig_12951_pilon	+	1654	2	Intergenic	novelGene_68247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGATTTGGGGTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836920	839336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_837670_838431
896832	contig_11377_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_178702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCACAATTAGAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634121	633178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11377_pilon_-_633200_634100
896833	contig_10581_pilon	-	3499	10	Intergenic	novelGene_41397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	73.7007630159675	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	430	1299	627511	609845	FALSE	60	AGCATTTTGAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649717	607644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_632023_632160_633201_633384_649645
896834	contig_9955_pilon	+	2588	3	Intergenic	novelGene_21255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAACAGCCTATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13094	25136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_13885_22538_22638_23437
896835	contig_7396_pilon	-	2720	15	Intergenic	novelGene_79537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3307.50439939856	25	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	715	1380	248983	246442	FALSE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257044	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249077_249817_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
896836	contig_10013_pilon	-	1899	10	Intergenic	novelGene_125089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	196.448529369293	68	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	822	1463	524856	520669	FALSE	15	TTTGGCCCTGTTTGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRLEQVFKGLSSWSSRTLLLPCCPVSQVSKDLEGHKSDQMAQKSQAAQLLKKLEKIQAEQKSMKSRESEQSRYLDGLGADLSNLKSKSLNERRVASDSLERLQEEVAKLRMELKMLNGSACNTCPEKWVNFQSKCYYFGEGSRMWLQAKYACEDLHGRLVSIHSSEEQNFLNRRAKKDSWISLQDLDIEGKFIWSDESPVDYSNWRPGGAQ	528548	520232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_520697_521563_521668_521804_521957_524050_524141_524232_524296_524434_524498_524714_524949_525330_525801_526929_527050_528409
896837	contig_16310_pilon	-	1379	6	Intergenic	novelGene_70055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	7.22772439983706	287	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	583	1290	119847	103234	FALSE	50	CACACCATACAGCAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSPKEIEDGEDGMSEDKDNGSRDEIVIPPKKGRKVATPPEKKVEGKKSLAPTFAEKLVSPSRKRATWAKRAKDRCATPEDRESRRESYEEEEDQDEPVRKTADKRKKEMANQKASPETKKQKLEDRDARTLLIKNLPDKVTQHALKEVFEDAFQVRLVSKAGMSKRYERQKRAETHGNLKPPRKQCWEQSVAFGPEVPAQRSSQTKAILTAQTFLQSRRRKRSPGADALTLDL	120624	103144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_103439_108466_108591_115033_115121_116355_116570_119769_119875_120069
896838	contig_4803_pilon	+	5194	30	Intergenic	novelGene_150707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	4581	4904	119674	135217	FALSE	40	ACTGTCTAAATAAGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGGPGRCGAPGPRGGSGLLAGLGHGEAAGAASERAQRRLEGRPGRRALGGRERSRGAGEPAREADFPTQPRARAGVLSAHSGPSPSCRRVVAGPAVAVRDCWPET	12652	135507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_15020_15970_16039_17579_17650_19567_19664_20125_20170_21584_21678_23597_23714_27344_27441_30768_30847_31014_31065_33243_33328_33806_33910_37478_37574_39338_39438_40572_40623_45452_45566_46891_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48120_50055_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58574_59983_60023_66817_66877_101679_101754_119613_119677_134896
896839	contig_1301_pilon	-	1583	13	Intergenic	novelGene_47327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_3	432.190954131774	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1500	83	1582	322831	269193	FALSE	70	AAGAAAATGAAGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTRE	322913	269191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
896840	contig_4079_pilon	+	4097	3	Intergenic	novelGene_167480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2127	2453	131424	131750	TRUE	10	GAGCTGGTCGGGGCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKSNTRPRLACKFKFCKNTKQNIKTHNLSYNISAIRSCTDVFSALRESPSSQSFFETIVLASVPVAACLDPPRHQYRRLLSLLWAFDQQTVFESKYSREGISQSYF	127984	138810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_+_129403_130715_133251_138666
896841	contig_18272_pilon	+	3161	1	Intergenic	novelGene_7007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGACAGAGTGACCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164730	167891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_164700_167900
896842	contig_18592_pilon	-	3614	2	Intergenic	novelGene_114768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTGTATGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6308	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_3798_5174
896844	contig_1301_pilon	-	5539	21	Intergenic	novelGene_47278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	706.480450897263	2451	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	83	2125	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
896845	contig_16951_pilon	+	1911	5	Intergenic	novelGene_98621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	287.029941817923	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	63	821	46585	106818	FALSE	35	TTCAATTACAAATAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLLPVSDLSPHSVRLAPAEMQSQRIPGRKRGRPPLHSTPLKMAVPNLYSSSPGCLPAVKTPKKRGRKPGYKLKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	46522	107908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_46741_65743_65874_68468_68670_103952_104099_106692
896846	contig_17964_pilon	-	2498	3	Intergenic	novelGene_33857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10345	junction_1	1529.5	2	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520
896847	contig_14666_pilon	+	1409	1	Intergenic	novelGene_39649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485587	486996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_485600_487000
896848	contig_4426_pilon	-	2386	2	Intergenic	novelGene_15363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1266	1583	90885	90568	TRUE	55	TTTAAAAAATTTAGCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAKRSLFSHSPVGYKSKFRTSTPGERFLHQVWRKVHVINLPLVWELPCARTSGPKDTLCSWHCFLGGMRFLCVSARFSLLYLKRDCIKTLSNLVNLISITSSQ	92150	86110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_86779_90432
896849	contig_18511_pilon	+	2586	10	Intergenic	novelGene_126856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	334.696545810945	55	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1496	2344	55332	61308	FALSE	25	ATTTGAATGTTCTGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35352	61550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
896850	contig_4364_pilon	+	519	1	Intergenic	novelGene_768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGAACATTAGGCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532733	1533252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
896851	contig_19402_pilon	+	2096	3	Intergenic	novelGene_80774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3398.5	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	624	692	29462	29530	TRUE	30	CAATTCTTTGAGACATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEVSVF	23464	55123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_30582_54770
896852	contig_4732_pilon	-	4722	7	Intergenic	novelGene_75469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	271.814683603043	158	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	549	662	700764	700651	TRUE	30	ACTTCTCTTTGTTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLEERPELRQFLGKRERVDFADSITKYDRRFKPIKRDLILTSKYVYVIGREKVKKGPEKGQVREVLKKKLELQALRGVSLSTRQDDFFILQEDAADSFLESIFKTEFVSLLCKRFEEAARRPLPLTFNDTLQFRVKKEGWGGGGTRSVTFSRGLGDLCSHPPHPGAWPPLCHTRCPSLCFLMCPTGLTAEPTSQISSKLKMSRILSAKCQAESGILTS	706305	696251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_696314_696419_698767_698999_700840_703614_703694_703910_704058_704407_704554_706204
896853	contig_16622_pilon	-	1796	5	Intergenic	novelGene_48489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_1	1029.69106410612	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	172	783	115540	112952	FALSE	70	GTTTAAGAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWCFWRTDQRQGKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQVWGFCRVLGAEDPGGQLWGAMEPATHFPGIPKAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121411	111938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115559_118811_118884_121330
896854	contig_11525_pilon	+	9160	1	Intergenic	novelGene_171078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1107	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	4150	4521	56783	57154	NA	50	AAACACTAAATCACACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRPTSAQAKVTPQRPRFRLSVTKKAEWCCLVILTSDVKSFCSFFLTLNRIFPIKDVPLETEDDLTDWLYQRFIEKEDLLSHFYKTGTQYRIRDIYRCIFLKLLIVPKMYFRRNVHVLILQKL	52633	61793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_52600_61800
896855	contig_1735_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_106901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143400	145491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_143400_145500
896856	contig_10958_pilon	-	7768	5	Intergenic	novelGene_5417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	809	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3393	3767	893170	892796	TRUE	20	GCAGGTGCCGAGGCCAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIQSHLPTCAATPLAHTTGTSHPHHCQHLLTGLLLPHLPPHRLVSPQAPEGSSKNPGQPWPSSPQTPARAALLTQSQPQVLTISYKVAHHGTLCDLCLHLLIVVLSLTQIQPRRPPGTYMKN	901655	888221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_888275_888847_895088_895294_895852_900453_901075_901358
896857	contig_19352_pilon	-	1232	14	Intergenic	novelGene_122415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGCCACAAAGTGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389203	337685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_337788_338291_338439_353877_353953_358378_358416_360032_360094_363525_363622_363865_363940_365721_365861_366776_366915_368026_368196_368282_368331_368823_368878_385249_385310_389171
896858	contig_15172_pilon	+	3569	7	Intergenic	novelGene_158755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	199.457319299699	10	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	12	452	243174	258481	TRUE	20	ATGACTCTTCCCATCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECNMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKVGLVAGWV	243162	268919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_260392_267534_267682_267859
896859	contig_8377_pilon	+	1421	2	Intergenic	novelGene_35153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTTCCCAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196133	199129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_196195_197769
896860	contig_8386_pilon	-	2647	2	Intergenic	novelGene_82228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61873	55042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_57288_61471
896861	contig_12050_pilon	+	4015	1	Intergenic	novelGene_62712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3043	3429	653511	653897	NA	25	TCCTCCGAACTCACACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAIPENPQSPSNLSMDPGFQVKNPYSRRYPIMNDILFVGNMFSVRPLSALRGVSTVVLSLCPLSILLPFFFLLCHLPNPGFSSSSPSSRFSVHISSLISQNTEYENDNHKPYKAALLFRAFIACLPR	650468	654483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_650500_654500
896862	contig_7593_pilon	-	2606	5	Intergenic	novelGene_127290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTATCGCTTCCACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200188	166003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_166195_183166_183240_192341_192438_196398_196493_198036
896863	contig_19402_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_80744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTGTCTAAAAGATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3776	5393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_3800_5400
896864	contig_20199_pilon	-	576	4	Intergenic	novelGene_82575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	75.7935793234933	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44188	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_41934_42078_43906_43951_44118
896865	contig_16622_pilon	-	1511	7	Intergenic	novelGene_48466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	1046.54071694427	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	173	685	115540	112684	FALSE	30	GAACCCAGGATTTCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWCFWRTDQRQGKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	121412	111857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115322_115417_115559_118811_118884_121330
896866	contig_294_pilon	-	1982	10	Intergenic	novelGene_166743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_2	424.090661166794	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	90	953	162597	131639	TRUE	10	CCCCTTTTGTTTTATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSQSDEDVIRLIGQHLNGLGLNQTVDLLMQESGCRLEHPSATKFRNHVMEGDWDKAENDLNELKPLVHSPHAIVRMKFLLLQQKYLEYLEDGKVLEALQVLRCELTPLKYNTERIHVLSGYLMCSHAEDLRAKAEWEGKGTASRSKLLDKLQTYLPPSVMLPPRRLQTLLRQAVELQRDRCLYHNTKLDNSLDSVSLLIDHVCSRRQFPCYTQQILTEHCNEVWFCKFSNDGTKLATGSKDTTVIIWQVDPDTHLLKLLKTLEGHAYGVSYIAWSPDDNYLVACGPDDCSELWLWNVQITRFTSGTNGVSCQSQS	164459	127811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_128709_131506_131693_141877_142019_147444_147584_152756_152914_153968_154067_156955_157093_162359_162417_162516_162617_164389
896867	contig_12624_pilon	+	2167	18	Intergenic	novelGene_60981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_7	170.985986596729	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1248	918	2165	95386	113250	FALSE	25	AACTCCTTTTGAACTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVIEAYSGLTKKKEGETLEPYKVNLSQDLEHQLQNVVQELNLEIVPPPEDPSVPVLLNIDKLAHFEPSQRQNQMGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAYATPEQISTDLKNELMYQLEQDRNLQGILQERELLPVKKFENEILDAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAYERGEEPGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTFPVQEYFLEDCIQMTHFIPPPKDKKKKDKDEDGGEEDDANCNLICGDEYGPETRMSMAQLNEK	66560	113252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_94415_94553_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342_98505_98647_98726_99274_99467_106808_106951_107597_107681_108512_108670_110973_111075_113175
896869	contig_6730_pilon	-	4241	4	Intergenic	novelGene_178703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2929	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2647	3066	198210	197791	TRUE	50	AAGAGAAGGTAGACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKSTNKRNSAQESKRNKENISTTTTTTTTTKKALQNAIPLLGIYPREIRAVTRIDICTPIFIVALFTIAKRWKQPRCPSRDEWINKLWYIHTMEYYAKIKNSDESVKHLITWMKLEDVVLSEISQSQKDKYCMRPLL	248875	196488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6730_pilon_-_196747_196873_200146_247545_247963_248581
896870	contig_1516_pilon	-	3285	1	Intergenic	novelGene_49916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACACATCTGGAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72143	68858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_68900_72100
896871	contig_1263_pilon	-	2346	5	Intergenic	novelGene_170405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1043.33560636068	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	760	1488	60116	57943	FALSE	65	GGAAAAAGAAGAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVRTGEKNVSLPKRQIILFRFLLVESQSPAGAGSILSGGFFFKDIKDKIFLRASKGYDTFFKQ	76815	57084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_58321_59765_60193_63975_64123_65038_65324_76564
896872	contig_3980_pilon	-	4420	5	Intergenic	novelGene_172328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	149	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2170	2811	13946	13305	FALSE	20	GGATCCCACAAGTTCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQVVAYDQGTMVLKEKVQAALKALAKNKAPGIDGISIEMFQQMNAALEVLTCVCQEIWKTATWPTNWKRSIFVPIPTKGDPTKCGRYRTVSLISHASKILLKIIQKQLQQYVNRELPEIQAGFRQGRGTRDIIADVRWILAQSRVYQKDIYLCFIDSARAFDCVDHNKLWIHCKEWEFQHT	127329	11695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_14947_38306_38540_54384_54828_124455_124654_127034
896873	contig_9653_pilon	-	1899	11	Intergenic	novelGene_48187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	563.617609731988	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	191	1234	196924	175913	FALSE	20	TTTGGAGTACATTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	201024	175247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192199_196903_196987_200896
896874	contig_9972_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_162796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACCCCACAATATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311151	308713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_308700_311200
896875	contig_15977_pilon	+	2890	3	Intergenic	novelGene_137215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31.5	2	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	363	1049	78172	78918	TRUE	75	AAGAAATAAAAAATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPLPRRDFQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASPSQDLFRTASNGTSGAPAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDVVAIIPYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFSTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSTFPQTTFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV	77809	91698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_78401_78460_80519_91457
896876	contig_15897_pilon	-	2793	1	Intergenic	novelGene_49566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812184	809391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_809400_812200
896877	contig_6654_pilon	+	4444	3	Intergenic	novelGene_85778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	234	junction_2	159.5	640	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	293	1042	719937	752722	FALSE	40	ACCCAGCAAGCTCAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPQSRLLQYRQVQTRSPPAVPSPPSNSDHSSHFCNFNDNNRDVEVASNAAAFPQRLPPQIFSSPFSLPSEHIAPPPLKYLAPDGAWTFANLQQNHLMGPGFPYGLPPLPHRPPQNPFVQIQNHQHAVGQEPFHPLSSRTVSSSSLPSLEEYEPRGPGRPLYQRRISSSSVQPCSEEVSAPQDSLAQCKELQDHNHQSSFNFSSPESWVNTTSSAPYQNIPCNGPSRTAQPRELIAPPKTVKPPEDQLKSENLELSSSFNYNVLQHLGQFPPLMPNKQIAESASSSSQQSSVGSKPAMSYASALRAPPKPRPPPEQTKKSSDPLSLFQELSLGSASGGNGFYSYFK	719644	756124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_720099_748213_748467_752387
896878	contig_10494_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_102225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCATTCAAATAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243675	1242052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1242100_1243700
896879	contig_19016_pilon	-	3676	1	Intergenic	novelGene_173332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	332	999	2402	3400	6021	5023	NA	65	ATAAAGATGAAAATCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEEDTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQEQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	8422	4746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_4700_8400
896880	contig_8310_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_75563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAGAAAAAGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218163	219420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_218200_219400
896881	contig_7408_pilon	-	2269	7	Intergenic	novelGene_168736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	235.673090435789	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	606	1427	36909	12597	FALSE	35	GAATCAAAGTTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGWTAINAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48742	11754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48682
896882	contig_610_pilon	-	5526	1	Intergenic	novelGene_76768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	3664	4713	229060	228011	NA	50	GCACTGAAAAGAGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	232723	227197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_227200_232700
896883	contig_11855_pilon	-	2335	14	Intergenic	novelGene_67142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	257.669183807501	1104	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	57	1502	2723908	2710017	FALSE	15	CCCTGAATTTATGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPGCCCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTARSEAGPAEPAAANGDGAPGACSQHCHRDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731345	2709183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2714369_2714450_2716006_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
896884	contig_14970_pilon	-	3922	6	Intergenic	novelGene_45079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTACGAGTTGCCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232156	210864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_211933_212062_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
896885	contig_1719_pilon	+	2479	16	Intergenic	novelGene_87341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	153.342231625864	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	473	2116	631964	726560	FALSE	30	TTGTATATTTGTATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFPIQDRDYCSLCDKQPIGRLLFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMLLTKDAKQRLGCQEEGAVEVKRHPFFRNMNFKRLEAGMLDPPFVPDPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	608533	726923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_608598_631555_631983_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_718062_718201_723078_723217_724669_724802_726461
896886	scaffold_9100_pilon	-	3635	3	Intergenic	novelGene_83294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	262	junction_2	179.5	587	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2825	3382	749502	746337	FALSE	10	TTTCCTCTTCTTTATTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFAFFRSGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY	752326	746083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_746427_747666_747907_749274
896887	contig_9011_pilon	+	8094	31	Intergenic	novelGene_159288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_13	190.905549654506	738	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1323	3972	314	4285	317573	786869	FALSE	25	AGTCTGCTTGAACAGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTGDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLIKNTKGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPAPRLKSKKWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTKKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRRDFLRLQLANKERSEALRRQQLEQQQRENEEHKRQLLAERQKRIEEQKEQRRRLEEQQRREKELRKQQEREQRRHYEEQMRREEERRRAEHEQEYKRKQLEEQRQAERLQRQLKQERDYLVSLQHQRQEQRPVEKKPLYHYKEGMSPSEKPAWAKEVEERSRLNRQSSPAMPHKVANRISDPSLPPRSESFSISGVQPARTPPMLRPVDPQIPHLVAVKSQGPALTASQSVHEQPTKGLSGFQEALNVTSHRIEMPRQNSDPTSENPPLPTRIEKFDRSSWLRQEEDIPPKVPQRTTSISPALARKNSPGNGSALGPRLGSQPIRASNPDLRRTEPVLESPLQRTSSGSSSSSSTPSSQPSSQGGSQPGSQAGSSERTRVRANSKSEGSPVLPHEPSKVKPEESRDITRPSRPADLTALAKELRELRIEETNRPLKKVTDYSSSSEESESSEEEEEDGESETHDGTVAVSDIPRLIPTGAPGSNEQYNVGMVGTHGLETSHADTFSTSISREGTLMIRETSGEKKRSGHSDSNGFAGHINLPDLVQQSHSPAGTPTEGLGRVSTHTQEMDSGTEYGMGSSTKASFTPFVDPRVYQTSPTDEDEEDEESAAAALFTSELLRQEQAKLNEARKISVVNVNPTNIRPHSDTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTENGLMLLDRSGQGKVYNLINRRRFQQMDVLEGLNVLVTISGKKNKLRVYYLSWLRNRILHNDPEVEKKQGWITVGDLEGCIHYKVVKYERIKFLVIALKNAVEIYAWAPKPYHKFMAFKSFADLQHKPLLVDLTVEEGQRLKVIFGSHTGFHVIDVDSGNSYDIYIPSHIQGNITPHAIVILPKTDGMEMLVCYEDEGVYVNTYGRITKDVVLQWGEMPTSVAYIHSNQIMGWGEKAIEIRSVETGHLDGVFMHKRAQRLKFLCERNDKVFFASVRSGGSSQVFFMTLNRNSMMNW	317259	790678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_317630_421427_421494_598551_598609_625098_625225_645919_646031_649708_649800_652879_653011_665507_665563_667558_667638_675963_676140_680784_680852_684813_685019_704497_704609_706563_706753_716217_716383_719256_719497_722081_722189_731969_732134_733842_733941_739981_740167_757471_757602_763089_763255_764414_764527_765328_765500_767170_767315_770170_770306_779445_779547_781749_781900_784018_784179_784423_784564_786785
896888	contig_3233_pilon	+	4434	2	Intergenic	novelGene_56517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	3831	4262	231218	231649	FALSE	35	GAACTCTCAAGGGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIMQDTITSKNLQVIGLPEQGEKTENTERLIEEVLTENFPDIMKDEKLTIQEAQQNPYRIDPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILRAAQQKQKDTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQRDHIHKTLKEKNCQQRIIYPARLVQI	227301	231821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_229833_229918
896889	contig_5502_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_154988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATATCTTGGTTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395905	399291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_395900_399300
896890	SIRV6	+	1234	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	14	63	14	-63	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGGATTTAGTCGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3119	11761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
896891	contig_602_pilon	-	2077	3	Intergenic	novelGene_134953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	391	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGGTGATTTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490761	483106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_484318_484433_485250_490711
896892	contig_3463_pilon	-	2960	16	Intergenic	novelGene_61990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_15	166.413006970275	615	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	242	1864	597436	508757	FALSE	65	AACATGAAAAATAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	606397	507660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_597388_597532_606251
896893	contig_5445_pilon	+	5864	5	Intergenic	novelGene_135438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGAGGGCGGCGCGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166842	182318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_+_170156_171151_173521_173608_173663_175156_175195_182228
896894	contig_7915_pilon	-	2635	2	Intergenic	novelGene_42951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	811	1233	112012	111590	TRUE	30	TCAGGTTTTACTATAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERLQGAWNSYTLLVQSFWKMIWRFLKKLEIEIPYDPAILLLGIYPRQIRTVIQIGICTPMFTAVLFTIAKRWKQQPKCPSTDEWINKPWYIHTMQYYTMINNNDESVKHLTTWMNLEGSMLSEIGQSQKNKYYMRPLL	112822	5915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_5942_110213
896895	contig_2204_pilon	+	1712	6	Intergenic	novelGene_71658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	164.84659535459	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	30	728	13204	50221	FALSE	35	GTTAAATTTTTAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLSERPSKKGKKTKTEKEDRVKHIKQEPVESSLGLSNGVSDLSPEYAVLTSAIKNEVDSTVNIIVVGQSHLGSNIEDQEIVTNPPDICQVVEVTTESDEQPVKESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13174	51205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15422_15470_25596_25715_38679_38794_50051
896896	contig_9942_pilon	-	2189	3	Intergenic	novelGene_178704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	426	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTAGTATTTCCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145029	8792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9942_pilon_-_9872_100847_101606_144677
896897	contig_5423_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_85299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1376	1696	615084	614764	NA	60	AAAGAAGTTTTAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSLHQPKSRKTRQHPATTTDRSDRDHNRESQTEGEKNVEQNSNSWKKKKKTRVTGLTETGGTSKTMAPRQSANSELKPLPKPTFQTKIRQAYKTNNNTHEEHVS	616459	614527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_614500_616500
896898	contig_3397_pilon	+	3674	18	Intergenic	novelGene_154572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	273.030905636204	420	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	526	3153	124851	206594	FALSE	10	TTACTCTTGTGTGGTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQRSHLGTTYLDTAKGAVETFMKLRARDPASRGDRYMLVTFEEPPYAIKAGWKENHATFMNELKNLQAEGLTTLGQSLRTAFDLLNLNRLVTGIDNYGQGRNPFFLEPAIIITITDGSKLTTTSGVQDELHLPLNSPLPGSELTKEPFRWDQRLFALVLRLPGTMSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLPPRTSHPVVKFSCTDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQAKIESDRVIGSVGKKVVQETGIKVRSRSHGISMAYRKDFQQLLQGISEDVPHRLLDLNMKEYTGFQVALLNKDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	124325	207115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_124923_125314_125393_126209_126360_142138_142229_172322_172507_178078_178205_180374_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_190928_191145_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
896899	contig_5696_pilon	+	3637	11	Intergenic	novelGene_117569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	674.18075469417	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1175	3528	19	3546	704957	738140	FALSE	75	ACAAAAGAAAATTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIPSVNMNDTCHIKVFWSHHTLSIQAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFGSLQVGTDSMASNNMVFKIYTPDTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	704938	738231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_733586_733650_734430_734596_737775
896900	contig_11117_pilon	-	4365	2	Intergenic	novelGene_148591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	459	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCTAGATTCATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144625	81231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_85072_144100
896901	contig_3233_pilon	+	6489	28	Intergenic	novelGene_56596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	209	junction_1	222.976885255007	767	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1967	5904	291	6194	951492	1026478	FALSE	30	TGATTGTAGACAAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPRFNPRGNFPLQRPRAPNPSGMRPPGPFMRPGSMGLPRYYSAGRARGIPHRFAGHESYQNVGPQRMNVQVTQHRTDPRLTKEKLDFHEAQQKKGKPHGSRWDDESHISASVGVKQSSIAQATEQSPKVQSRYTKESASSILASFGLSNEDLEELSRYPDEQLTPENMPLILRDIRMRKMGRRLPNLPSQSRSKETLGSEAVSSNVIDYGHASKYGYTEDPLEVRIYDPEIPTDEVENEFRSQQNISASVPASNVICNSMFPVEDVFRQMDFPSESSNNQSYFPVESGTKMSGLHISGGQSVLEPVKSVSQRISQTVSQTTSQSLITPSMNQQPFSSELISTVSQQERIPHEPVINSSNVHAGSGGSKKNYQSEDEAPIQSPFGIVKASWLPKFSHADAQKMKRLPTPSMMNDYYAASPRIFPHLCSLCNVECSHLKDWIQHQNTSTHIESCRQLRQQYPDWNPEILPSRRNEGSRKEDQTPRRRSHSPTPRRSRRSSSSHRFHRSRSPVRYIYRPRSRSPRVGHRFFPRYRSRSRSPNPAYRIRVPFSPECYRSLRSERTSRRSSDRKKASEDTVQRSRHGSESSKKKHSEAVDKGHSPAQKPKTSSGSKPSVKSTSSTKSDSNIRYKSKNPEDGSLPECKQVSDKAVSLQRKLRKDQSLNYGSVLVVSELPEDSCTEEEIRKVFQPFGKVSDVLIVPYRKEAYLKMEFKEAITAVMKYAETMPLLIKGKSVKICVPGKKKSQNKEVKKKTSDSKKTSASTLKKDTDASKAIETVTPTSTAKSGQTKTSAKVNKSSGKSSSSVKSVVTVAAKGNKASVKTAKSSGKKSLEVKKVGSVKSKDSSKPVTVPENSEIKTSMEAKATENSIKETISDAALEATENQEPVSKETEEMCVILVSNLPIKGYSVEDVYNLAKPFGGLNDILILSSHKKAYIEISRKSGDSMVKFYTCFPISMDGNQLSISMAPENVNIKDEEAIFTTLIKENDPEANTDKSYSRFVHLNNLPEDGLQCVLCIGLQFGKVDHHIFMNNKNKAILQLDSPESAQSMYNFLKQNPQNIGDYVLTCTLSPKMDSSEAQVEKDSEQGKESPDLKDSPVDESEVQTAADSPSVKPSEVEEETTASIHTEPSVQQEEPCEEQLEKPLCEPDFALETLEVESQGEEIKVEIPLVVSTPGSIELFPENVEESALNQQVYTADFEKEEAEIVNPETELSVSDSAFIEERNIKGILEESPSEAEDFFSGITQPVVEAVAEVNKHETVSEVVPPACVVSLVPEISIGDENAMSKKGISEKSKMDEKEENEFNTKETTVDLQIGTEKTEKNKAGMVAEKLEKIVAVMKEKPAENTVSKAYPNKGVGQANKLDETSKTSMPTTSHVSSSKSAIKAAIVSSPKAKTTASKTENQKSFLKSVLRDQINAEKKLSAKELGLLKPTSAGSGLGEGSSKLKLTQSGVTRGGSGRISAPQGKDSKLDYRDITKQSQETETRSSIMKRDDTNTKTLVGQNTKNSKSTTGRSSKSKEEPLFPFNLDEFVTVDEVIEEVNPSQAKQNPPKGKRKEALKNTPSSELNLKKKGKSSAPHVVEGELSFVTLDEIGEEEDAAAHLAQALVTVDEVIDEEELNMEEMVKNSNSLLTLDELIDQDDCISHSEPKDVTVLSVAEEQDLLKQERLVTVDEIGEVEELPLNESTDITFATLNTKGDEGNTVTDSIGFISSQMPEDPSALVTVDEIQDENSDLHLVTLDEVTEEDEDSLADFNNLKEELNFVTVDEVGEEEDGENDLNVELAQSKNDHPTGKKGDRKKRAVDTKKTKLALSQVGQVNENVKEEDLKAMIERHLAAKTPTKRVRMGKTPPSETAVETEPAKGEEVFEISEADEESGLSDSEPEQKRMKIEDSSLSKSVETDVPADLDFLVPKAGFFCPICSLFYSGEKAMINHCKSTRHKQNTEKFMAKQRREKEQNEAEERSSR	925168	1026773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_925257_951289_952809_957745_957808_961023_961063_962266_962554_963815_964079_965123_965271_966206_966330_970629_970689_970913_970967_992949_992998_995532_995605_996424_996512_996788_996858_997058_997103_998426_998559_999396_999526_1001455_1001498_1001969_1002105_1003273_1003400_1009169_1009208_1015503_1016729_1017345_1017412_1019071_1020021_1020806_1020912_1023896_1023999_1024773_1024893_1026412
896902	contig_7593_pilon	-	3582	8	Intergenic	novelGene_127361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_6	101.383893580544	7	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	115	2838	738296	695591	FALSE	10	TGTTGTTCTGTTGTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDIIRMYSSSPPPLDNGAEDDDDDEFGEFGGFSEVSPSGVGFVDFDTPDYTHPKEEFVPSNHFMPIHDFSENVDSLTSFKPIKNGNDKDITAELSTPGKGQSDVLLSATSKEIIPSKILDTSIDGVESLGDLNKAVEQRQNVETPESFSPGDFRTDTNVVHQNKQLESCNGENAPCLEILTNGFAVLETVNPQGTDDLDTVADSKGLKPLSTQSTEYNFDSAPSPAEEFADFATFSKKERIQLEDIGCTVLNDREALTVQENNKINRVSELSSVKEVSLDRSFDNKGDADGEKQVCVSEVSTVSNRGFSVEKQGPTTLQQDELLNSSALSNTWSSVDTADNSEASRREQCETEEELDLFTSKCADLCMDYIKTNDADNEVGSSKEEIIKFTISQSPGIDPTEENVLDDSISIKNGDSSNDFVTCNDTNEDDFGDFGTASGTTPPFAPGTQDSMSDITFEESSEHFPHSSEPGDDFGEFGDTSIVSCQEEIIFTESDLKQTTDSLSEGCQLARKSTGAGVEPVSELENGQEGEFGDFDSVPNIQDDCSAFQDSDDFADFSSAGPNQVADWNAFEDGQKESCSWAAFGDQQATESHHRKEAWQSHRTDENTDTPGTPKTLSVPLATSRRAVATGQLQESATTVQTALLNRLERIFEACFPSVLVPDAEEEVTSLKHLLEASTWPGKTNETSAESGELLDVWTELQDIHDAHGLRYQWGGSHSNKKLLCSLGIDTRNILFTGNKKQPVIVPMYAAGLGMLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQESLPPVQFDWSSSGLTNPLDGVDPELYELTTSKLEISTSSLKVTDTFARLMSTVEKTSTSTRKPKREEHLSEEAIKVIASLPDLTFMHAKVLMFPATLTPSTGSQEKTDW	738410	694846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_711220_711282_717511_717635_720455_720513_720925_721053_725079_725232_736364
896903	contig_5317_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_76639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGTGAACCTCGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911424	910435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_910400_911400
896904	contig_11629_pilon	+	1720	8	Intergenic	novelGene_161182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	65	GAAAATGATAAGCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	423811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
896905	contig_13409_pilon	-	12225	24	Intergenic	novelGene_128441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_8	228.282740153074	1048	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	909	2730	39	2768	64959	34494	TRUE	35	ACCAGCATTACCAAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVYLGDINSRNMIRTHEWMHLQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISERKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSKDLARKEAQRLPGAGSSKRRKARAKKNKAMKSVKVKEEIKSDSSPLPSEKSDDDDDKLSECKSDSKERSKKSSISDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRK	64997	21346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_26978_28459_28674_29265_29318_30933_34677_37831_37973_39052_39182_40022_40146_41442_41594_41834_41974_42920_43052_44166_44209_45529_45691_48687_48865_50527_50624_50708_50806_51147_51297_54197_54348_54884_54957_57754_57908_58766_58930_60929_61119_62733_62925_64190_64281_64956
896906	contig_15219_pilon	+	2843	9	Intergenic	novelGene_40820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_8	262.574721507993	2208	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	124	1311	19617	25321	FALSE	20	CTGCGTCCACTATTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVRDLDLKKPIYQRTAAYGHFGRDSFPWEVPKKLKY	19493	26853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453_24588_25218
896907	contig_4654_pilon	-	3979	5	Intergenic	novelGene_103037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	2408	3232	186163	185339	FALSE	35	CTATATATTGATTAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKIDKFMENTDKKLEEFRKTMQEQTAKINSQLEITQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLNTTMFEDNSEKRTKKNEETLKVMWDTIKSKNLRVIRILEQRKKRENTERIIEELLTENVPSIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLVKTKHKQRILRAAREKQEVTYRGDTIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVL	283311	184591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_186736_191939_191947_223215_223592_281564_282171_282465
896908	contig_15420_pilon	-	5893	13	Intergenic	novelGene_175293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	263.625510378306	1002	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	421	1620	152252	135542	FALSE	20	CCCTTTAGGATTGGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEEIAARVNQSALEAITPSPSFQQRHESLRPAGQSRPLAARTSSSGSLGSESTSLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQAKASGQGGRRTNPFGESGGGTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDSPDVVYETMRQILAARAIHNIFRMTESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPSVVLYATHQENKRLFGFVLRTSGGRSESNLSSICYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELSKQKQIEKDLEEQSRLIAASSRPNQAGNEGQFVVLSSSQSEESDLGEEGKKRESEA	192622	131268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_135689_140935_141026_141287_141339_141833_141981_142800_142838_142941_143117_143708_143762_145600_145784_146231_146324_148698_148756_150086_150130_152127_152291_192240
896909	contig_8278_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_165294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	557	1012	202054	201599	NA	40	ATTCTAGCCAATAGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEEITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDIEDLKGTVSQLDFVDIYRTLHPTAAKCTFFSNAHGTFSRIDHILGHRVILNKIQNIEIMQSIFSDHNAVKVEINTRKSNEKKINYMETE	202610	200722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_200700_202600
896910	contig_12032_pilon	+	2811	1	Intergenic	novelGene_139280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGTCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102608	105419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_+_102600_105400
896911	contig_546_pilon	+	4956	8	Intergenic	novelGene_117207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1050.46720412337	136	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	443	1633	136801	152874	TRUE	60	CCCCAAAAAAATCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	103330	156561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_136648_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_154720_155083
896912	contig_13201_pilon	-	2466	3	Intergenic	novelGene_130894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	140	451	549153	521764	TRUE	55	CCTCTCAATAATAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPCKEGIWKLNEETGQFCHLTRLKGRHGEREAVTRKTARDGSTAGAKVRSSDRRHSKIRRPAGDGTVGFPDHGVRELSAFRLRLTDGVGYLQAFIGRVKRAL	549292	518908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_519983_520822_521808_548885
896913	contig_7963_pilon	-	2356	9	Intergenic	novelGene_58473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	693.306829170895	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	880	2145	123938	120628	TRUE	85	AAAAAGGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126298	120293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122459_122993_123132_123746_124083_125563
896914	contig_8377_pilon	+	2062	18	Intergenic	novelGene_34973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3439.61576272056	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1806	256	2061	131448	180506	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	68101	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68340_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
896915	contig_13295_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_31235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAACACTCTCCCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96950	94197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_94200_97000
896916	contig_14445_pilon	+	2430	14	Intergenic	novelGene_137357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	161.306463441268	175	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	106	1527	277789	360205	TRUE	20	GCCCGTCAAAGGTCTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRPSRRPLFRCGSPPLRSQPPGRGRHRRRRTGRRAMASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTRDDSGPEDNIWKGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLFLNFEQVKSIMYWLDPNLRYATREADIMEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGIYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	277683	361195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_277968_306298_306391_317729_317775_321012_321138_323271_323431_327188_327341_331031_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095_360404_360490
896919	contig_11906_pilon	+	2908	6	Intergenic	novelGene_178675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGGCGAGTGTTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141726	190504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11906_pilon_+_143088_143409_144452_153702_153888_158512_158643_160171_160238_190380
896920	contig_12079_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_67535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	487	813	861691	861365	NA	45	TGAAAGTACAAACGTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	862177	860606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_860600_862200
896921	contig_7963_pilon	-	2182	9	Intergenic	novelGene_58489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	586.790941796991	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	601	2010	125673	120628	TRUE	35	TCCCAAGGCCCAATATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDPSGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126273	120332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124038_125658
896922	contig_14720_pilon	+	3795	3	Intergenic	novelGene_164994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	534	junction_1	198	14	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAAGGATTCTCTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219866	234470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_220750_228479_228626_231704
896923	contig_10140_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_148421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCTTTCTCATACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295736	297144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_295700_297100
896924	contig_10197_pilon	-	3530	12	Intergenic	novelGene_115253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_8	83.0217535965601	542	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	617	1459	1049386	1039060	FALSE	25	CGTACCCATATACCTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNFEEHDIPNILDHDLIFWFGDMNFRIEDFGLHFVRESIKNQCYGELWEKDQLSIAKKRDPLLREFQEGPLLFPPTYKFDRNSSNYDTSEKKRKPAWTDRILWRLKRQPQASLHTPSQPAPHFSLSLRSYISHMMYCISDHKPVTCTFDLEMKPLVSAPLITLIPEGLWTMENDMVISYSLAPDFLYSPWDWIGLYKVGLRHINDYMTYVWVGDNQVCSSDGLNQVYINISDIPETEDQFLLCYYSNNLHSVVGISKPFQIQPRSYFGEDAVGQAHLQM	1055933	1036988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1039120_1039304_1039410_1039571_1039656_1039916_1040055_1040920_1041108_1047738_1047849_1048627_1048740_1049339_1049517_1049868_1049986_1053301_1053411_1053739_1053848_1055781
896925	contig_17964_pilon	-	2290	3	Intergenic	novelGene_33881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10345	junction_1	1529.5	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	FALSE	15	CAGCGTGGGCCCCAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520
896926	contig_13021_pilon	+	6156	5	Intergenic	novelGene_8271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1130	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGTAGGCTTAGCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245892	270546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_251151_252256_252369_259754_260044_265841_266120_270327
896927	contig_7457_pilon	-	2180	4	Intergenic	novelGene_31631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.4822146696874	4	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	97	849	960838	956902	FALSE	5	TGCATGGTTCCTGGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQFVSGDEPREKIDLVIYFGKRPPGMLHCTTKFCDYGKAAGAEEYAPR	962466	955570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956910_958242_958375_960225_960896_962427
896929	contig_19744_pilon	+	3265	18	Intergenic	novelGene_120395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	126.521385147547	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	171	1310	200531	209788	TRUE	25	TAACAGTTGTGTAAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETLRVFRLITSQVFGKLISGDAEPTPEQEEKALLSSPEGEEKVYNATSDADLKEHMVGIIFSRSKLTNLQKQVCAHIVQAIRMEATRVREEWEHAISSKENANSQPNDEDASSDAYCFELLSMVLALSGSNVGRQYLAQQLTLLQDLFSLLHTASPRVQRQVTSLLRRVLPEVTPSRLASIIGVKSLPPADISDIIHSTEKGDWNKLGILDMFLGCIAKALTVQLKAKGTTITGTAGTTAGKGVTTVTLPMIFNSSYIRRGESHWWLKGSTPTQISEIIIKLIKDMAAGHLSEAWSRVTKNAIAETIIALTKMEEEFRSPVRCIATTRLWLALASLCVLDQDHVDRLSSGRWMGKDGQQKQMPMCDNHDDGETAAIILCNICGNLCTDCDRFLHLHRRTKTHHRQVKICGLIPRTVPEAENILNKFWSQCGKEA	198039	225790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_198081_198377_198477_200500_200582_202345_202613_203115_203400_205236_205334_206948_207069_208659_208762_209569_209951_210065_210199_211799_211904_212700_212890_213864_213973_215587_215798_218459_218568_219217_219384_224969_225031_225076
896930	contig_521_pilon	-	1998	13	Intergenic	novelGene_174729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	133.340937283175	279	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	40	1266	34343	14411	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTFILQFFLQACADLLSHQKQLTVGLPPEPREKTISAPLPPEELTKLIYEASGQDISIAVLTQEIVVYLAMYVRAQPSLLAEMLRLRIGLIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQMTRRFSADEQFFSVGQAVSSSAHSSKSVRSSTPSSPTGTSSSDSGGHHIGWGERQGQWLRRRRLDGAINRVPVGFYQKVWKILQKCHGLSIDGYVLPSSATREMTPHEIKFAVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTLLSDTEMSSLGGIIHVDQIVRTANQLFLQDQMAIGTLDTLEKDQATGVCHFFYDSAPSGAYGTMTYLTKAVASHLQELLPNSGCQMQ	34636	13678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_14582_15140_15342_16164_16219_18320_18492_20380_20435_22208_22239_23050_23170_26338_26441_27053_27184_27277_27357_27553_27634_34307_34350_34603
896931	contig_3832_pilon	+	3584	1	Intergenic	novelGene_161503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	344	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2432	2752	597017	597337	NA	30	AACTGTTGCAGAGGGCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGTFNYGLPLRVIRNASGMKNIPSGTKLLKFSRSICRPIISFKSLGTSHSRNGLGEMTTGMSRTFPRKGCGIKKPRTCIYGYMEIFKFPKGRIVCYIHLPQLIGY	594585	598169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_594600_598200
896932	contig_6137_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_59274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCGATCTTTAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1341131	1339074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1339100_1341100
896933	contig_5050_pilon	-	2154	6	Intergenic	novelGene_110232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	94.9134342440521	470	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	50	334	13652	8244	TRUE	25	TACTTGTGCCTAACATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSDFSLTSSFFPQDRDMLACHNYWHWALYLIEKGDYEAALTIFDNHILPSLQASGTMLDVVDSCSMLYRLQMEGLRAGTLTVPWSCSCPSATGSSRSEAAMPRETSSTSC	13701	4674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_6454_8202_8269_8513_8602_12177_12260_13414_13454_13601
896934	contig_7744_pilon	+	3420	12	Intergenic	novelGene_62456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	129.331146498225	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	29	607	399829	405086	TRUE	20	CTAAGGCTGCTGATTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVAGRVGAMAARTLGGGRWEVVKKGRRPAAGGNNKGGGRGDRRALGEANGVWKFDLTPAIQTTSTLYELGFEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALKALDVAALQKELDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKAAGSS	399800	409681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_399977_400930_401131_401634_401786_402086_402157_405076_405172_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652
896935	contig_13101_pilon	-	6725	9	Intergenic	novelGene_172781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_7	116.967677159119	551	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	709	3063	241813	231499	FALSE	45	GGCTGTCACAAGGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVIPSENNGLSRGSPSKKNRLSLKFFQKKETKRALDFTESQENEEKVSEYSGSEIDQVVPAAQSSPINCEKRENLLPFVGLNNLGNTCYLNSILQVLYFCPGFKSGVKHLFNVISRKKEALKDEANQKDKGNCKEDSLASYELICSLQSLIISVEQLQASFLLNPEKYTDELATQPRRLLNTLRELNPMYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWLKSATKQPSILSKFCSLGKITTNQGSKGQLKENEYDLEEDAEKCENDNTLKVNGCGLDSPGNNVKPINVNEDKAINKGVEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERRENFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVGEDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLEFDCYGGGLSKINTPLLTPLKLSLEEWSTKPTNDSYGLFAVVMHSGITISSGHYTASVKVTDLNSLELDKGNFMVDQVCEIGKPEPLNEEEARGVVENYEDEEVSVRVSGNTQPNKVLNKKNVEAIGLLGGQKSKADYELYNKASNPDKVAGTAFAESRNSETNTTKGAHESDNNKESSDQTGINISGFENKISYVVQSLKEYEGKWLLFDDSEVKVTEEKDFLNSLSPSTSPTSTPYLLFYKKL	244732	227836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_232235_233532_233735_234695_234867_236439_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240024_241643_241883_244093
896936	contig_5482_pilon	+	5429	20	Intergenic	novelGene_144487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_8	287.395718772871	651	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	251	2851	504284	587931	FALSE	10	TTTTGTTTTTCTTTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVSLPPKENALFKRILRCYEHKQYRNGLKFCKQILSNPKFAEHGETLAMKGLTLNCLGKKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDLSLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQTSPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRLEDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNFLSGDKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFNPNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKHAGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLNEMQCMWFQTECAQAYKAMNKFGEALKKCHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRSYVDLLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQRRAQKKAQIEEEKKNAEKEKQQRNQKKKKDDDDEEIGGPKEELIPEKLAKVETPLEEAIKFLTPLKNLVKNKIETHLFAFEIYFRKEKFLLMLQSVKRAFAIDSSHPWLHECMIRLFSTAVCESKDLPDTVRTVLKQEMNRLFGATNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKMVYYLDPSSQKRAIELATTLDESLNNRNLQTCMEVLEALCDGSLGDCKEAAEVYRANCHKLFPYALAFMPPGYEEDMKITVNGDSSAETEELANEI	504033	590509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_504338_539005_539091_541033_541139_543298_543457_544275_544411_551225_551380_557431_557552_559642_559739_559893_560001_561778_561852_564657_564828_565908_566062_566605_566735_567989_568204_571622_571817_579686_579796_581713_581813_585112_585260_586235_586334_587730
896937	contig_5669_pilon	+	5932	11	Intergenic	novelGene_86055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	247.75191220251	9	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	508	1686	186087	189257	TRUE	60	CCTTAAGAACACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	178263	194535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_184869_184971_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_189011_190881_191912
896938	contig_18364_pilon	+	3628	19	Intergenic	novelGene_102552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	639.639503505251	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	959	2880	232	3111	36769	50216	FALSE	20	TGACGGAAGAGTTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL	35742	50733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_35875_36669_36851_37106_37229_39010_39209_39303_39406_39893_40074_40773_40861_40987_41259_41726_41873_41975_42123_42252_42379_42775_42998_43305_43489_43573_43686_45165_45287_46160_46293_47347_47621_49579_49797_50057
896939	contig_15047_pilon	+	2539	7	Intergenic	novelGene_52158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	63.2044741735548	83	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	27	869	2194	3736	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPRERAFLSETVTVTGSSL	2167	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_4542_19408_19672_19825_19951_21013_21062_21232
896940	contig_5551_pilon	+	2905	15	Intergenic	novelGene_134214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_9	203.384738957515	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	214	1695	66357	613622	FALSE	35	GAATTATATTTAACGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGRWHSNLGARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAGCHDNQAMLDRYRILITKDSAQESVITRDIHRTFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYKNNFEDLHCKFYQLEKLMQEQLPDLHSHFCDLNLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKRENRRLQEASMRLEQENDDLAHELVTSKIALRNDLDQAEDKADVLNKELLLTKQRLVETEEEKRKQEEETAQLKEVFRKQLEKAEYEIKKTTAIIAEYKQICSQLSTRLEKQQAASKEELEVVKGKMMACKHCSDLFSKEGALKLAAISRENQGIDTDDEKDLLKKQLREMELELAQTKLQLVEAKCKIQELEHQRGALMNEIQAAKNSWFSKTLNSIKTATGTQPLQPPPQATQPPKESA	40489	614832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_40585_66238_66390_259492_259607_301796_301872_315886_316013_318438_318583_380184_380227_445919_446049_579387_579481_591034_591146_598375_598481_601551_601636_605381_605454_612219_612418_613466
896941	contig_9332_pilon	+	4342	4	Intergenic	novelGene_60736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3168	3485	637715	638032	TRUE	40	GAGAGGACACTGATAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNQQLTLSSMKRDETESIPLENGNQKGCPLSSLSFNVVLEVLARAIRQEKEIKVIQIGKQEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRKLLKQIEGFDKVAGYKLNIQI	569112	639748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_570934_631373_632225_637219_638291_639149
896942	contig_5062_pilon	+	1816	6	Intergenic	novelGene_157862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_4	56.2586882179099	63	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1028	1762	739675	744018	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	738490	744072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
896945	contig_5145_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_131388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	477	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1034	1432	629715	630113	NA	15	AGGGACTCGAGGTTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METNQEYDCSILCARQDHSVLTTQSGFVLFMFGSQSCPRLGERGLHQTRICFAKSDSLAENKSEFGQNHVIRKMVRHSCVLRDRSGFTEGTTSLWGPQWWQCPLLNTVPSLTDAGAWGEQVTVTHPFSPGDS	628681	632082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_628700_632100
896946	contig_18511_pilon	+	1846	8	Intergenic	novelGene_126890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_7	373.850892463718	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	747	1595	55332	61308	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	51425	63418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191_61361_63219
896947	contig_10424_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_56790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	312	939	172	1110	228532	227594	NA	0	GTTGTGTGTTGTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKRQLVYVFTTWRSGSSFFGELFNQNPEVFFLYEPVWHVWQKLYPGDAVSLQGAARDMLSALYRCDLSVFQLYSPAGSGGRNLTTLGIFGAATNKVVCSSPLCPAYRKEIVGLVDDRVCKKCPPQRLARFEEECRKYRTLVIKGVRVFDVAVLAPLLRDPALDLKVIHLVRDPRAVASSRIRSRHGLIRESLQVVRSRDPRAHRMPFLEAAGHKLGAKKEGVGGPADYHALGAMEVICNSMAKTLQTALQPPDWLQGHYLVVRYEDLVGDPIKTLRRVYDFVGLRVSPEMEQFALNMTSGSGSSSKPFVVSARNATQAANAWRTALTFQQIKQVEEFCYQPMAVLGYERVSSPEEVKDLSKTLLRKPRL	228703	226602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_226600_228700
896948	contig_5423_pilon	-	5099	1	Intergenic	novelGene_85290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	700	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTGTTGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586451	581352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_581400_586500
896949	contig_19850_pilon	-	3063	1	Intergenic	novelGene_170857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	672	947	1618	27704	27033	NA	75	TTAAAAAAAAAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDTTDIRRIITEYYEKLYSNKFENQEEMDKFLETHYLPKLTQTFGEDSHQTKPALLKIFQNIEKEGILLNSFYEASISLLPKPGKDTTKKENYRPMSLMNIDAKILNKLLTNRIKHHIKKIIHQDQVRFIPGMQGWFNSRKSINVIHHINRIKEKNHMIISINTEKAFDKVRHQFLRKILNKTGIEGKFLNITKGNYTKPTANIILNGDRLKTFPLRT	28650	25587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_25600_28600
896950	contig_6189_pilon	+	3121	1	Intergenic	novelGene_164924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	76	399	78	401	NA	15	TTTGAATTTTTTCTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPFGCVESKQPVFPSQEIVATGSRGGRVGVKKGGEWESVYRKLLVVLSPAGRSMKLLSPTPCLLVSDRSPRWRIHAVLAGRGPLHESLLALRSLSVFSLHLVLG	2	3123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_0_3100
896951	contig_9436_pilon	-	2386	3	Intergenic	novelGene_60905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	57.5	22	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	329	352	418163	418140	TRUE	55	AAAAAAAAGACCATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAVGVLEHGPYDPPPSPWDYLGPRSWEDGLRRLCLLQECAVRPQRGLHGEVLEVGDASGRKGEWRESPGDFRWGERCRGFREDSRELPAKRGFLGTSGDEGVRIGLGGMSGRLWT	418491	415393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_416277_416889
896952	contig_7870_pilon	-	1022	7	Intergenic	novelGene_108889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	509.851421712465	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	483	842	295319	143294	FALSE	20	TTTACCTATATGTGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQITTVSGNEFLLQSDIEFITLDWFHAIKNAIDRLPKDPSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLNQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFERFVEAIKKQDNNVRIETIKSLVQKLPPPNRDTMKILFRHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAVHMVYQNQIAELMLSEYNKIFGSEED	497931	143113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_143478_217274_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_496464_496595_497821
896953	contig_18592_pilon	-	5423	2	Intergenic	novelGene_114777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATGTGTAGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13104	6185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_11242_12737
896954	contig_1535_pilon	-	2014	5	Intergenic	novelGene_127243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	391.296802312516	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1	618	136136	129144	TRUE	20	TTATCACCTTTCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAQESRRGLACSELVLTEGRSVSAALRRPPSRTASPSPGCSPPARESSRLVGLSDLISWGEVRAGPGRVVTIITAEEPQSRSRRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136136	126899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129751_129831_135888
896955	contig_13481_pilon	-	3014	3	Intergenic	novelGene_119453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	103	468	1074237	1073872	TRUE	25	ACTAAATCCACTCTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCCCKCFVIVCCLQGIQ	1074339	1066955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1067057_1071087_1071220_1071558
896956	SIRV3	+	1557	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4739	12	2680	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	62	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATTTGCGTTAGGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6683	8927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
896958	SIRV6	+	1284	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	232	12	-97	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	45	GTAAATTTAGAAAACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
896959	contig_7840_pilon	+	2912	12	Intergenic	novelGene_68964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	424.245952366282	56	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	310	1659	238014	304863	FALSE	10	CGAAGGGCTGTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVRVGVEVKGTKGTLLS	130659	306116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_230804_230931_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299249_299535_301110_301261_304059_304306_304816
896960	contig_3077_pilon	+	6419	27	Intergenic	novelGene_26840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_17	185.004050011642	826	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1544	4635	183	4817	640590	726369	FALSE	30	TAAGAATGACTCCTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPATVLPSGPRPALSLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKIPHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATRMGFAPGKAVGSHIRGHYERILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQLVQPLETCPPARRAKRMRAEAMNIKVEPEETPEAKTHNLRRRMGCPTLKCENEKEMKSNIKQEPIEKKEYIVESEKEKPKSRSKKTTNAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECNKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGRIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCIKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLISFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRFVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEEMPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRVRLEQARWLEEVQQACVDPNSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVERAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLSSLAAAVKELEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEALQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLELLVAEVQAWKECAANTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGPLGLKRKQRKLKEPLPSGKKRSTKLENLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPVQDVEMKVCLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTTCVAVPSISQGPQVWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSETNKVSQPTGTTSFSLPADWDSRTLYLHSPFSTGRSCIPLQGISPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREDLSSERWDRIKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELARSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK	640407	727971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_640794_667645_667724_669407_669531_670264_670436_676138_676274_679397_679495_680754_680865_682216_682376_687986_688107_689678_689838_690818_691001_692462_692626_695202_695323_696632_696828_699303_699486_699640_699766_700690_700842_701004_701120_701533_701890_703093_703233_705978_706159_706740_706900_721126_721613_723274_723387_724027_724183_725381_725703_726231
896961	contig_10734_pilon	-	2030	3	Intergenic	novelGene_51075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGACTGAAGCCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481898	478017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_479808_481266_481466_481857
896962	contig_1694_pilon	-	2883	3	Intergenic	novelGene_144969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTTTGCCAATAACGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609625	1573169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1573182_1601859_1604661_1609555
896963	contig_11605_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_178705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAGAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295365	293926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11605_pilon_-_293900_295400
896965	contig_13028_pilon	+	3134	3	Intergenic	novelGene_175958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	14	291	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	355	822	11637	13798	FALSE	20	CTATGTTTACGACTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHPVASSNPAFCGPGKPSCLSEEAMRAADQFDIYSSQQSKYNHTVSHKPMACQRQDPLNETHLQTTSGRSIEIKDELKKKKNLNRSGKRGRPSGTTKSAGYRTSTGRPLGTTKAAGFKTSPGRPLGTTKAAGYKVSPGRPPGKKQQAFRCSSDA	6770	16110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13028_pilon_+_7122_11633_12064_13757
896966	contig_13760_pilon	+	1952	2	Intergenic	novelGene_61313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAAGCCCTCTCGCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190519	194541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_192339_194408
896967	contig_12540_pilon	+	6115	38	Intergenic	novelGene_148079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_36	191.457025332856	806	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1599	4800	324	5123	935069	984215	FALSE	10	CATGTTTGTGTGTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGNAKTAHNNNSSRFGKFIQVNYLESGIVRGAVVEKYLLEKSRLVSQEKDERNYHVFYYLLLGVSEEERQEFQFRQPEDYFYLNQHNLKIEDGEDLKHDFERLKQAMEMVGFLPATKKQIFSVLSAILYLGNVIYKKKATGRDEGLEVGPPEVLDTLSQLLKVKREILVEVLTKRKTVTVNDKLILPYSFSEAITARDSMAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDMEESVSCLSIGVLDIFGFEDFERNSFEQFCINYANEQLQYYFNQHIFKLEQEEYQSEGITWHNIDYTDNVGCIHLISRKPTGLFYLLDEESSFPHATSQTLLAKFKQQYEDNKYFLGTPVMEPAFIIQHFAGRVKYQIKDFREKNMDYMRPDIVALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAVHAMAVLREAGRLRAERAEKAAGTDGSGIRNHPGEPQRTASTASEKLYRDLHDQIIRTIKGLPWQGEDPRRLLQSLSRLQKPPAFILKSKGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIISMTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLEALGKAEPFFIRCIRSNAEKKELCFDEELVLQQLRYTGMLETVRIRRSGYSAKYTFQDFTEQFQVLLPKNALPCREVISTLLEKMAVDKKNYQIGKTKVFLKELERQALQETLHREVMRKILLLQSWFRMVLERRHFLQMKRAAVTIQACWRSYRVRRALERTQAAVFLQAAWRGYLQRRAYRHRRQSIIRLQSLCRGHLQRKSFSQMVLEKRKAEEKEREAQLAAGEATEEASGEQELGHMPSEVPEPLAMSEPEPQPSDGPPTVISHPETETPIPEKPTPSQKLPAENHEKAPSSREKRESRRQRGLEHVKFQNKHIQSYKEESALREASGRAGPEQEENLLEDQKDSREEGTPLNAQLEAEPISPAKQPLDISQAVATSETPVDAQEGSPRPDRTERPSSLALDSRAGAPETPKDRSRPDASPRDQPDSPSTSAQIQRYREADLDRLASAVELWRGKNLMNTRPCAMLSQSLDLSEHRRDALTPTEERRISLSTSDVSGLLPSPAKTQSLSETVDGEPSSKKPVVQKKKSGDSASITDARLYPSPQADSKSAFKRLFLYKNKDKKYSLEGVEEVENTGSGPAVLEAATSKKSLEAPSSSQHRHPAGEKPAKEPGGKGKKNRNLKIGKITVSEKWRESVFRQITNANELKYLDEFLLNKINDLRSQKTPIESLFIEATEKFRSNLKTMYSVPNGKIHVGYKDLMENYQIVVSNMADERGEKDTNPVLNLFQTLLDEFTRGHSKSDFEAPKQSKSQKKRKQERAVQQHNGHVFASYQVSIPQSCEHCLSYIWLMDKALLCTACKMTCHKKCGYKIQTYCYYTCRQEVEPGAEPGHFGVCVDSLTSDKVSVPVVLEKLLEHVEMHGLYTEGLYRKSGAANRTRELRQALQTDPVAVKLENYPIHAITGVLKQWLRELPEPLMTFAQYNDFLHAVELPERQEQLAAIYAVLDHLPEANHNSLERLIFHLVKVALLEDVNRMSPSALAIVFAPCLLRCPDTSDPLTSMKDVLKITTCVEMLIKEQLRKYRVKMDEISQLEAAESLAFRRLSLLRQNTNKSPKACPEELGVLPEEEAAVAAGDDEDREKEILMERIQSIKEEKEDITYRLPELDPRGSDEENLDSETSASTESLLEERAGRGAAEDQANS	924410	985207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_924508_930422_930486_932606_932707_935005_935107_937837_937968_939379_939470_941457_941575_941792_941928_944555_944678_947808_947951_948990_949196_950806_950886_953923_954038_957543_957584_958647_958771_960893_960975_961437_961549_963670_963794_965075_965226_965306_965474_966214_967070_968471_968539_968690_968816_974995_975130_975340_975532_977627_977727_977830_978005_978247_978287_978424_978537_979123_979198_979742_979936_980128_980258_980497_980604_980822_980955_981206_981331_982398_982533_983560_983689_984198
896968	contig_5586_pilon	+	2104	11	Intergenic	novelGene_143552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	430.636041222748	265	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	627	1649	384614	430164	FALSE	40	AAATCAATCAGGACAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLSKDAWEVARDSLFLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQGFLEDYFTATEPQYQPGENL	369047	430619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_369244_373455_373553_380619_380814_383470_383575_384578_384729_388436_388593_391059_391240_392799_392877_392973_393128_416881_417014_429955
896969	contig_13021_pilon	+	2885	3	Intergenic	novelGene_8213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3238	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	860	1246	180464	180850	FALSE	35	GGTTGTCTTAACTAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	177496	182489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177526_177618_177682_179696
896970	contig_10197_pilon	-	3119	19	Intergenic	novelGene_115277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	334.332082453995	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	189	2936	1188824	1167782	FALSE	10	GAAGTCTTTTTTTTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA	1189285	1167598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167937_1168098_1168302_1168394_1168484_1174113_1174163_1174449_1174611_1174810_1174958_1175067_1175198_1175368_1175539_1175647_1175784_1175985_1176166_1176281_1176530_1186804_1186922_1187111_1187323_1187480_1187628_1187804_1188044_1188181_1188370_1188646_1188840_1188960_1189088_1189239
896971	contig_7396_pilon	-	2382	16	Intergenic	novelGene_79560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3204.91832865259	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	97	1485	255163	246442	TRUE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245855_246201_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
896972	contig_18869_pilon	+	1845	5	Intergenic	novelGene_56463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_2	175.450135366149	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	750	1424	186795	189734	FALSE	30	ATTTCAGGATGTCATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIALCFSMCREIGENHEAAACIQLKLIESQPWEESLKDGHRLKQLLLKALTLMLDAAESYSKDFCVRQALRCHRLTKLITLQIHFLNTGQNTMLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	186045	190155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_186892_187841_187931_188134_188291_188948_189101_189553
896974	contig_6795_pilon	+	4021	5	Intergenic	novelGene_27693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	3609	4019	109525	109979	FALSE	20	TAGGATTTCAGGATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHGARYLSSRNKQHQQPTNGTQGVSQRRRVEYKQPVLSGQVTVATESRGGRVGVMKGGGWESVYHCLPAVLSPAGSSVKLLSCTLYLLVSDRSPRRWIRAALVDRGPLRVCLLALCSLSVSSSIWCFAEFFISSFD	82977	109981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_83087_83406_84390_84523_85440_107924_109551_109594
896975	contig_1379_pilon	+	11241	16	Intergenic	novelGene_134596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	691	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTGATTGTAAACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448044	489156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_454308_454568_454623_454859_454925_459274_459405_461732_461855_463209_463366_465455_465518_465697_465805_470257_470346_470464_470592_471168_471273_474268_474391_476981_477221_479328_479401_482410_482553_485768
896976	contig_7179_pilon	-	1676	4	Intergenic	novelGene_78133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	106.24604567805	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	67	492	933323	893261	FALSE	0	TTTTCTTGGTTGTGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVEASSCDGKGQGVETSVTYYRLEEVAKRNSSKEIWLVIHGRVYDVTRFLDEHPGGEEVLLEQAGVDASESFEDVGHSFDAREMLKQYYIGDVHPNDLETENSSKLLVILGFPHRRSYSLRFPVSLLHVRKQILLRRPC	933389	892076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_893366_907840_907871_908411_908541_933161
896977	contig_13145_pilon	+	3174	9	Intergenic	novelGene_116624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1055.19760442061	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	57	437	35323	46351	TRUE	40	GAGGGAAAGGCAAATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSPRALADCEWTSAGRTMRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESELQRFEW	35266	59816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43469_43635_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324
896978	contig_18168_pilon	+	1832	6	Intergenic	novelGene_122081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	112	465	23573	24466	TRUE	20	GTACTGCAGTTCCTTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEISQSCLSWNRNMDQARDTVQCGEGVLVGGAGLFSPCPHIMLTGTQTHSDTSCRKRSQAFLMSQSPGVGGGGGEQILYHSVPHKAAVSCCSQSIVPSVSTCEKKISFERPGEEAGP	23461	27117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_+_23842_24381_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26757_27043
896979	contig_4402_pilon	-	5138	2	Intergenic	novelGene_140836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	502	junction_1	0	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	800	2400	2737	5136	595022	592187	FALSE	35	TGTGTAAAAGGACAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV	597758	592184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183
896980	contig_5286_pilon	+	2989	1	Intergenic	novelGene_157340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATTTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508809	511798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_508800_511800
896981	contig_2100_pilon	-	2551	7	Intergenic	novelGene_50704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	699.009457891824	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	468	1250	1176787	1173168	TRUE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQA	1177254	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765
896982	contig_1438_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_178706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	642	1154	99260	99772	NA	40	GAATTACTTAGAGAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKKTGNNKFWRGCGEIGTLMHFWWECKMIQPLWKMIWRFLRKLEIEIPDDPTIPLLGIYPREIRVVTLIDICTPMFMAALFTIANRRKQPRCPSTDEWVNKLWYINTMEYYATIKNNDEFVKHLITWIKLEDIILSEISQSQKDKYCMRPLL	98618	101090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1438_pilon_+_98600_101100
896983	contig_16211_pilon	-	5569	9	Intergenic	novelGene_150082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	233	junction_5	708.36959588551	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	102	2156	197162	180100	TRUE	20	CTTAAAGTTGTGTGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKNPQTCSPGDPCQDDVFISGQQNYSSATLSLKDVPPDSLMKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	201495	172942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_176085_178193_178269_178757_178851_179996_180208_182778_182899_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424
896984	contig_14744_pilon	-	1446	4	Intergenic	novelGene_66004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	499.371827621685	32	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	72	581	969897	968300	TRUE	20	TACCATTTATTGGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969968	960500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961278_968019_968630_969717
896985	contig_7020_pilon	+	795	4	Intergenic	novelGene_57056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9569	junction_3	1249.00636062787	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGGTTATGTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79466	81778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_80017_80159_80228_81324_81448_81724
896986	contig_13409_pilon	-	6617	9	Intergenic	novelGene_128440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	248.845710230255	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	220	1332	39136	26632	FALSE	35	ACCAGCATTACCAAACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSVKVKEEIKSDSSPLPSEKSDDDDDKLSECKSDSKERSKKSSISDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKRQESQQNSDQNSNSNAHMIRNPDVERLKENANHDDSSRDSYSSDRHLISQYHDHHKDRHQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYNDREKHRKLDDHRSRDHRSNLEGSLKDRSHSDHRSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSTRDYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLDQRSPYGSRSPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT	41551	21346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_26978_28459_28674_29265_29318_30933_31031_34497_34677_37831_37973_39052_39182_40022_40125_41479
896987	contig_4803_pilon	-	1720	22	Intergenic	novelGene_150717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_18	522.678037673059	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1650	70	1719	134971	33290	FALSE	45	AAGAAGAAACAATTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPPGPPFESALRPLGGSARRLAMSQPGQKPAASPRPRRAAASRPTEEHVSGKTGGSPSKPEEKKGADEKKAASVRSSQPSRTHTSGTAPTSKVSASSAATSKSSSMNPTETKIEGPLPPIKKRHKKQAVKTEPEKKSQSTKPSVVHEKKTQETKPKEHREPKSSPKHTTDTGSKHAHDKKAVPSSSEQLTTEKSTELKTASQDTVSGGGKSVVAGVTATSGKPDDKKKEKKPLAAAVPVESKPSKPSGKSDMDAALDDLIDTLGAPEVTEEDDTTYTGPEVSDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGE	135040	33288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_61254_61300_66818_66879_101681_101754_119613_119677_134896
896988	contig_2214_pilon	+	2136	17	Intergenic	novelGene_144257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	295.24888203641	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1368	767	2134	287118	295910	FALSE	45	ACAAAATGAGCAGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHMKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEESKDQMEKEMLEKIEKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSVKLEQAMKEIQRLREDTDKANKHCSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKTDNEK	277859	295912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_278104_279638_279718_281612_281687_284756_284848_286124_286229_286560_286726_287108_287202_287621_287703_287780_287869_288604_288746_289158_289251_289492_289691_292870_292979_293993_294221_294869_295034_295646_295781_295859
896989	contig_9727_pilon	+	6265	7	Intergenic	novelGene_86336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	232.91659212879	1426	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	148	807	425838	430935	TRUE	70	AAAAAAAAAAGAAGCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRGRGHRSAPAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425214	436581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704_432549_432736
896990	contig_5669_pilon	+	1922	8	Intergenic	novelGene_86061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	172.402945190052	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182941	195213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_183135_184869_184971_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187306_189293_189525_194163
896991	contig_7457_pilon	-	3485	5	Intergenic	novelGene_31262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	180.017186679495	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	143	361	22935	21912	TRUE	70	GAAAAAAAAAAGAATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVLNISNRNYYPITVTQLAIDVLHLSLVVGQVSQSLFLPIGPLTSKQMFYTVTSSILDENTYKICTWQKIKVHHVLLHIQGTLTCSYLSHSEQLVFQSYEYVDCQGNSSVPHLLASHPP	23185	18630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_19853_20009_22033_22344_22399_22891_22936_23043
896992	contig_15025_pilon	-	2154	3	Intergenic	novelGene_155970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_1	79	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAGAAAAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48171	39074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_39105_39446_41314_47914
896993	contig_1301_pilon	-	1678	13	Intergenic	novelGene_47316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_3	440.921163273234	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1662	16	1677	309870	269166	FALSE	75	AAAAAGAAAAACAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKE	309885	269164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751
896994	contig_7730_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_156289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384217	382320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_382300_384200
896995	contig_7272_pilon	-	3453	20	Intergenic	novelGene_25344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	679.361146863019	74	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	87	506	633189	610236	TRUE	25	GTTGCTGAAGTGTTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRPEPKLALPPPPCSPPAAWAARRSPKMASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKEIGAQEGEDDTFLTAQVLVMIHKKYLNLFLQKGA	633275	592733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595301_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_609934_610010_610293_616565_616614_620502_620568_632105_632194_633027
896996	contig_8377_pilon	+	7609	17	Intergenic	novelGene_34903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2215	junction_3	2880.10626702818	480	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	133	1752	68257	173800	TRUE	20	GTTTTGTTTTATTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGQDSNSGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERGKYANFLLMNIHTLTFESIQFKKEFSAFDLTQIFSVDET	68043	180294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720_124739_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_176703_177253_177345_177430
896997	contig_16594_pilon	-	3921	2	Intergenic	novelGene_53886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	810	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2453	2839	216710	215491	FALSE	75	AAAAGAAGAAGAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTRYFGQSPDDFTVFNYLWFPVPLFYYFVSIFTLTLQMRSLACSYSQIRTSSFPPVPWYLCHAYLNQKQLICYTNHSTNPTPSPQTLMVRMSDIRCQSNTHPAVISGNKPGVVESVLLYPVGLLSRN	219162	214408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_215529_216361
896998	contig_19564_pilon	-	3073	23	Intergenic	novelGene_29690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	164.552266308026	40	60	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	17	2359	128376	114561	FALSE	15	CTGCGCTGTAGAGAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGPKQQPPEPEWIGDGESTSPTDKVVKKGKKDKKTKRTFFEELAVEDKQAEEEEKALKEKEQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPVSDEEDEVPTLVPRGGKKTKGGNAFAALIQDQSEEEEEEEEKHSPKPAKPEKNRINKGSEEEGEEEEEEGEPKADDLYAHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEVSSRQAMLENASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGCKGKTTLLKHIANRTLSIPPNIDVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQLEQGDDAAAERLEKVYEELRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQKFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKTLLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMYQQKQKELLKQYEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPELLKRPKEYTVRFTFPNPPPLSPPVLGLHGVTFGYEGQKPLFKNLDFGIDMDSRICIVGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTRGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQLRMEETPTEYLQRGFNLPYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKARVVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDALGEAINEYKGAVIIVSHDARLITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMVNRPRE	128392	113846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_114728_114826_114900_114987_115053_115243_115413_115497_115531_117009_117081_117180_117256_117387_117560_117686_117800_118002_118128_118344_118429_118747_118897_118982_119123_119402_119489_119586_119691_120095_120219_120459_120565_122581_122693_122776_122815_122956_123087_124204_124295_124504_124552_128303
896999	contig_3747_pilon	+	2322	7	Intergenic	novelGene_24834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	137	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	329	1321	201313	204199	FALSE	30	ACAAAATGTTGAGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMAWSSQGFCGGDIIDCGNNIRP	200984	205200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203323_204131
897000	contig_1596_pilon	+	8079	10	Intergenic	novelGene_131579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1168.81549199221	1231	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	370	1527	61053	168630	FALSE	30	TTGAATATTTGGCTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYPNIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCRPTRREDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYLVLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDHYRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV	60237	175182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_60376_60821_61132_93060_93146_120759_120805_127019_127064_128884_129124_154562_154705_159633_159747_162068_162294_168444
897001	contig_6434_pilon	+	5894	3	Intergenic	novelGene_61866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	623	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTTCTGACTATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837112	843888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_840496_841109_842680_842947
897002	contig_5649_pilon	+	1304	11	Intergenic	novelGene_82281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	200.178145660309	320	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	342	1304	126523	150091	FALSE	50	AGTGATGGGAAAGATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSGKDFHQTQFLIQECASLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFGLALLNSSSSDLRGFAAQFIKQKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGAFGVGQEQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYSEKRDILMDRILPDSGGVAKTMMESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIW	94504	150091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_94599_107683_107757_126348_126625_145420_145529_146103_146203_146616_146686_146773_146829_147492_147697_148627_148797_149785_149913_150061
897003	contig_14397_pilon	-	5537	7	Intergenic	novelGene_134644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	491	junction_6	224.855818000978	904	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	47	622	126676	78163	FALSE	40	CTTAGATATAAAACCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKCSRFKEAEAQHSIMTEPRRADMKAPPAALVFALALALIRTGRGNHEDPELSTYTTPEEEGTDEETISSTFAAVTTETLTADTNSTLLDTGEANQLQFTLMVLIPLILLVLLLLSVVLFGTYYKRKRTKKEPSSQGSQSALQTNELGSENVKVPIFEEDTPSVMEIEMEELDKWMNSMNRNADYECLPTLKEEKESNHNPSDNES	126722	73247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_78179_91746_91805_93971_94058_95353_95382_102475_102515_102603_102865_126588
897004	contig_11572_pilon	-	5877	22	Intergenic	novelGene_100056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	830	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTAGGAGCTCCAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287925	255356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_255428_255957_256150_257657_257835_265154_265320_265590_265721_266166_266308_267008_267158_268758_268927_270241_270476_272057_272245_273710_273872_276117_276350_276436_276511_277132_277286_279164_279291_280385_280577_282471_282617_283276_283451_283881_284065_284193_284424_284862_285052_285520
897005	contig_16744_pilon	-	592	2	Intergenic	novelGene_178198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAATCAGACATATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17970	8548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16744_pilon_-_8927_17756
897006	contig_2940_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_81997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAAAGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156814	1155058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1155100_1156800
897007	contig_6795_pilon	-	2534	7	Intergenic	novelGene_27670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	35.9293287811875	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1103	1954	119175	46152	FALSE	30	GTGAATTAACATGCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	120277	45571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021
897008	contig_5779_pilon	+	3555	1	Intergenic	novelGene_106510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAAAAAAAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235185	238740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_235200_238700
897009	contig_12586_pilon	-	2921	1	Intergenic	novelGene_121801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	807	2424	192	2615	47643	45220	NA	30	CCATATGGTATTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDVRRFRYRTTVTRDRNTSVYSPSGTVNRRTTTPPDSGVLFEGLGISARPRDGEIPQLTRQIAMRRPATADERSMRKIQEQDIINFRRTLYRAGARVRNIEDGGRYRDISAEFFRRNPACLHRLVPWLKRELTVLFGAHGSLVNIVQHIIMSNVTRYDLESQAFVSDLRPFLLNRTEHFIHEFISFARSPFNMAAFDQHANYDCPAPSYEEGSHSDSSVITISPDEAETQDLDINVATVSQAPWDDETPGPSYSSSEQVHAAMSSLLNTSDSSDEELVTGGTTSQIQGAQTNDDLNNDSDSSSDNCVIVGFVKPLAERTPELVELSSDSEELGSYEKMDTVKTQEQEQSYSSGDSDVSRCSSPHSVLGKDEHINKGHCDSGTRIKSKKEEKQSSSSSPRDLSSSVRDRVYSPHNHRHRKRGRSRSSDSRSQSRSGHDQKNRRKHHGKKRMKSKRSRSRESSRPRGRRDKKRSRTRDSSWSRRSQTLSLSSESTSRSRSCSSDHGKRRSRSRNRDRYYLRNNYGSRYKWEYTYYSRNKDRDGYESSYRRRTLSRAHYSRQSSSPEFRIQSFSERTNARKKNNHSERKYYYYERHRSRSLSSNRSRTASAGPDRVRSEKPGGKRKYKTRHLEGTNEVGQPSREFASKVKDSRYQKSSSKLDGNYKNESDSFSDSRSSDRETKHKRRKRRTRSLSVEIVYEGKATDTTRHHKKKKKKHKKKHKKHHGDNASRSPVVITIDSDTDKDSEVKEDTEYDNSGPPDPVQNEIFAPSLDPFETKDVVTIEDEFGVLDKDCDITTLANNLDNANRTVNNIPPQASSTEQTLDVREESTFASDLENQSRNVSLQTEPSRQLPSSRTSLMSVSLGRDHAMS	47834	44913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_44900_47800
897010	contig_6102_pilon	+	4412	7	Intergenic	novelGene_32213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894898	904375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_900644
897011	contig_15327_pilon	+	1347	4	Intergenic	novelGene_70516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_2	7.58653778449403	380	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	413	853	466361	468070	FALSE	0	TTTTTGCTGTGGCTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMKGGNKVLARNLMIQTLEAVKRKQFEKYHAASAEEQATIERNPYTIFHQALKNCEPVIGLVPILKGGHFYQVPVPLADRRRRFLAMKWMITECREKKHRRMLMPEKLSHELLQAFHNQGPVIKRKHDMHKMAEANRALAHYRWW	465416	468564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_465507_466038_466412_466777_466946_467848
897012	contig_5423_pilon	+	5821	6	Intergenic	novelGene_85174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	562	156	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAAAAACAAGAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111637	227853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_115750_124673_124804_157784_158792_159015_159162_222407_222489_227508
897013	contig_17108_pilon	-	3743	5	Intergenic	novelGene_109510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_4	405.137939472472	264	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2445	551	2995	48876	30537	FALSE	60	TTAGAAAATACAGATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSNLLAREFLTDVNRLCNTMVQRAEAREEEEEETHMATLGQYLVHGRGFLLLTKLNSIIDQALTCREELLTLLLSLLPLVWKIPVQEEKATDFSLPFSANIILTKEKISSSRRFAQDKLYVEGSTPSGQVSAKVNVFQKSRRQRKTTHRYSIRDARKTQLSTSDSEANSDEKSIAMNKHRRPHLPQHFVTRSPKEDHLVAEVNYSATKDEQIPPDTMALENSREVIQRQQSNTDILSEPAALSIISNMNNSPFDLCHVLLSLLEKVCKFDMTLNHNSALAASVVPTLTEFLAGFGDCCNLSDSLENHVVSAGWTEEPVALIQRMLFRTVLHLMSVDISTAEMMPESLRKNLTELLRAALKIRTCLEKQPDPFAPRQKKTLQEVREDFVFSKYRHRTLLLPELLEGVLQILICCLQSAASNPFYFSQAMDLLQEFIQHHGFNLFETAILQMEWLVLRDGVPTEASEHLKALIKGVMKIISTVKKVKSEQLHHSVCTRKRHRRCEYSHFMHHHRDLSGLPVSAFKNQVSKNPFEETAYGDVYYPERCCCIAVCTHQCLHLLQQVSLSSTCVQILSGVHSVGICCCMDPKSIIIPLLHAFKLPALKHFQQHILNILNRFILDQLGGAEMSQKIKKAACNICTVDCDQLAKLEETLQRNACDAEPSSGLSSPSYRCQGILPSSGSEDMLWKWDALEAYQNFVFEDDRLHSIQIANHICNLIQKGNVFVQWKLYNYIFNLVLQRAVELARHCQHLNITTARTHVCSHHSQCLPQEVLQIYLKTLPTLLKSRFVCMCMCFFLLGVFECVIKYMHLNF	103865	29788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_32699_34461_34553_48684_48884_53229_53320_103412
897014	contig_20371_pilon	-	1784	1	Intergenic	novelGene_129176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTAAAATAATTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27219	25435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_25400_27200
897015	contig_10235_pilon	+	1842	2	Intergenic	novelGene_46513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	708	1493	298176	298961	FALSE	15	TGTTAATTTTTCTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	296830	299310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_297068_297705
897016	contig_5551_pilon	-	2546	3	Intergenic	novelGene_134242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATATAAAAGCTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744512	448644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_450817_564289_564410_744258
897017	contig_7359_pilon	-	1657	2	Intergenic	novelGene_139846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	72	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGAACTTAAGATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27990	25700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_26143_26775
897018	contig_6710_pilon	-	4160	1	Intergenic	novelGene_94560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657517	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_657500
897019	contig_11175_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_61175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGTCTTTGAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249539	247062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_-_247100_249500
897020	contig_14167_pilon	-	2927	4	Intergenic	novelGene_105533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.308181716354	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	40	594	28297	24086	TRUE	40	CTTAAGATGATGTGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CISSFLILSLLLFMVHRLRQRRRERIESLIGANLHHFNLGRRIPGFDYGPDGFGTGLTPLHLSDDGEGGTFHFHDPPPPYTAYKYPDIDQPDDPPPPYEASINPDSMFYDPADDDAFEPAEASPPVPGNSSSDGALPQHLEQPLPSVGAPLTDLEDSADSSSALLVPPDPTQNESAPVAEALLGGGLHSRSSVNTVV	28336	21702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_23254_23303_24343_26706_26944_28236
897021	contig_1301_pilon	-	2305	9	Intergenic	novelGene_47395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	672.68436134639	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	14	1123	800452	769450	FALSE	55	AAAAACAGAAAATTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPQGPAPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKIVSITERALKLVSDSLSEHEKSKNKEGDDKKEGGKDRALKGVLRVGVLAKGLLLRGDRNVNLVLLCSEKPSKTLLSHIAENLPKQLAVISPEKYDIKCAVSEAAIILNSCVEPKMQVTITLTSPIIREENMREGDVTSGMVKDPPDVLDRQKCLDALAALRHAKWFQARANGLQSCVIIIRILRDLCQRVPTWSDFPSWAMELLVEKAISSASSPQSPGDALRRVFECISSGIILKGSPGLLDPCEKDPFDTLATMTDQQREDITSSAQFALRLLAFRQIHKVLGMDPLPQMSQRFNIHNNRKRRRDSDGVDGFEAEGKKDKKDYDNF	800465	768267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_769630_773755_773854_774332_774445_790077_790174_791035_791134_795799_795942_798096_798248_799191_799398_800425
897022	contig_20819_pilon	-	2423	7	Intergenic	novelGene_55622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCCCTTTCACTTTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43609	29782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_29853_29982_30150_30377_30640_40119_40522_40867_41207_41306_41399_42518
897023	contig_11338_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_6285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTTTATTAAGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189195	191023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_189200_191000
897024	contig_14516_pilon	+	2630	20	Intergenic	novelGene_153887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	105.358956407563	7	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	382	2274	148477	422609	TRUE	40	ATATAATTAATTTGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMQKGKDVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	32295	423144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_36343_36417_148433_148499_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472_422614_422792
897025	contig_16594_pilon	-	5234	11	Intergenic	novelGene_53815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_10	2750.61007778275	19	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	970	1839	165546	121101	TRUE	45	CTGTATGGAAAAATAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306534	115173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_239221_239785_242309_242430_306350
897026	contig_14768_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_115081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAGCTCCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223782	222091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_222100_223800
897027	contig_15327_pilon	-	1900	2	Intergenic	novelGene_70821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGGAGAAGGCTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1583462	1533195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1534970_1583336
897028	contig_5602_pilon	-	3805	9	Intergenic	novelGene_133008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_8	94.822202041505	515	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	250	1305	516168	488176	FALSE	45	AAATATATGCATTTCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSERPEAARPKQDERLSSDTNENEVKSSEEPLLKKSSRRFVIFPIQYPDIWKMYKKAQASFWTAEEVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516417	485675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_511996_512153_516120
897029	contig_18081_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_23800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGAAGGATTTCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136493	133695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_134017_135208
897031	contig_7378_pilon	-	4530	5	Intergenic	novelGene_120252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.487270796264	82	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	141	413	421681	418800	TRUE	20	GCCAGAGAGGGCTGCCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKSPVTKSWSRAIHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVSMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKSTGSVDYLALDFQPNSPSPHRKPSTSSVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSSEPSKGAKL	422183	414620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_417792_417853_418944_419915_420042_421678_421782_422143
897032	contig_7568_pilon	+	3380	1	Intergenic	novelGene_174013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAAAAAATTACCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133015	136395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_133000_136400
897033	contig_2496_pilon	+	4803	13	Intergenic	novelGene_168511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.2071664466083	880	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	136	1899	48012	179861	FALSE	5	CCTATGTGTGTTTGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFIASDSDETSMSLSSDDYTKKKKTKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRSRGGGEGNVDETGNNPSVSLKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEGKWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAEEFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPVYVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNSEKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYHEHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEAEKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATNSVTAVRIQPLEDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQQMLISCVQRILMNRRLQQQYNQQQQQQMTYQQATLGHLMMPKPPNLIMNPSNYQQIDMRGMYQSVAGGMQPPPLQRAPPPMRSKNPGPSQGKSM	47167	182765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_+_47290_47998_48080_48208_48382_54940_55095_57992_58100_71731_71841_128913_129092_130240_130436_175988_176139_176960_177087_177845_177942_178432_178562_179582
897034	contig_8864_pilon	+	4766	24	Intergenic	novelGene_135954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	94.001830010743	659	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1050	3153	31	3183	11740	109422	FALSE	20	ATTTCTTATTGTACTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCWGYWSLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLGHEREGNKPEQIGALADQHIVHVACGESHNLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSVAIPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFSWGMNNAGQLGLSDEKDRESPCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKNGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACGRQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQAHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNANTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSLILEQILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDANPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVVYLLRGRKTFLIPVLFNNYITAVLKLLEKLYKVNLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARSSIIQDAVTLCSYPFVFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCFVEHNWFHLIGIICGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEEIFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGEKVTVCKDNRQEYVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVRLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA	11709	111005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_11966_47582_47743_50998_51076_51928_52151_53077_53170_54205_54337_55117_55279_67615_67693_71934_72060_73665_73726_77399_77512_77939_78130_79969_80134_80265_80380_83276_83301_83428_83519_84689_84861_87853_87998_88845_89013_91552_91620_92113_92197_106899_107084_107307_107411_109213
897035	contig_5020_pilon	+	4823	6	Intergenic	novelGene_27792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1211	1651	94956	95396	TRUE	55	AAAAGCAAAAAACCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRTLQEIRKETNQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFNWLQESKERQQSEIQKINKKISELDNSIESHMSRIEAMKVRISETEDKAIDTNLFEEKSEKMVLKSEETLRIMWDSIKRNNLRMIGVLEQVGDNRKYRELLKICWQKTSLIS	93745	138379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_95733_97661_97808_108535_108543_110192_111150_136504_137038_137186
897036	contig_9668_pilon	+	2580	15	Intergenic	novelGene_58182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2869	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTCCTCCGGGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503287	670000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_504125_511992_512102_522292_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551887_553924_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580715_585702_586000_598963_599018_605305_605374_610344_610510_669862
897037	contig_12938_pilon	-	2310	1	Intergenic	novelGene_99754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTTAATGGATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92659	90349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_90300_92700
897038	contig_17144_pilon	-	2531	16	Intergenic	novelGene_29248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2144.81079818244	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	77	2236	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181849	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
897039	contig_13707_pilon	-	2557	32	Intergenic	novelGene_43520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_4	244.764679189993	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2505	52	2556	181940	124964	FALSE	70	AAGAAGAAAACAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENAEVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTALVHQLQEKEKLLAAVKEDAAAAKDRCKQLTQEMITEKERSNVVIARMKDRIGTLEKEHNVFQNKMHVSYQETQQMQMKFQQVREKLEAEIAHLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDCARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQGVTQLKVQLQEAERRWEEVQSYVRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKEKEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVVEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLANEHDHLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALTNEQAAAAHELEKMQKSVHVKDDKIRLLEEQLQCKISKKMEEFKILNDQNKSLKLEVQRLQTLVSEQPSKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEDELKALRTENSSLTKEVRDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIEALKEEIGNIQLEKAQQLSIASQVQELQNLLKGKEEQMNTIKAVLEEKEQDLANRGKWLQDLQEENKSLKAHVQEAAQHKLNEACSASRFKELETVLKEKENEMKKVEAMLKERESDLSSKTKLLQEVQDENKLFKSQIEQLKHQNYQQVLSFPPHEELLKVISEREREIIDLQSELDSLKDAVEHQRKKNNERQQHLEAVELEAKEVLKKLFPKVSVSSDLSYSEWLRGFEKKAKECMAETSGSEEVKILEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVE	181991	124962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_125000_125128_125219_126019_126101_127930_128021_133608_133700_135226_135265_136413_136483_138446_138538_140267_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_143308_143971_144010_145177_145247_145940_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152162_152693_152763_153125_153217_154405_154441_155990_156060_156456_156624_159283_159372_160632_160766_169938_170046_172845_172987_174886_175004_181856
897040	contig_7426_pilon	-	3519	4	Intergenic	novelGene_27554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	84.2311634069534	800	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	15	473	1185835	1161950	FALSE	5	GCGCCTTGTCCGTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEEVAESWEEAADSGEIDRRLEKKLKITQKESRKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185849	1158903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1162053_1163424_1163680_1165508_1165559_1185784
897041	contig_7467_pilon	-	1428	3	Intergenic	novelGene_69470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_2	129	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	958	1386	70940	67563	FALSE	40	TAAAAGAGTAAACGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	71897	67520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794
897042	contig_4103_pilon	+	1778	12	Intergenic	novelGene_51897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	50.5233764731528	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	31	1470	53913	65973	FALSE	35	AAACCACTGAAGCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRQLELADGMAERAALEELVRLQGERVRALKQQKAKAEKGTRDYSPRQMAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53882	66281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
897044	contig_15991_pilon	-	1896	7	Intergenic	novelGene_70947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_4	130.50117070569	76	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	842	1336	128802	123001	FALSE	35	ATTGGAAGCTGCTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPITVIKTRYESGRYGYQSISTALKTIYRSEGHRGLFSGLTATLLRDAPFSGIYLMFYNQTKNIVPQDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	136759	122440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_123124_124818_124986_127319_127489_128766_129215_130089_130175_130819_130942_136537
897045	contig_10857_pilon	+	3024	12	Intergenic	novelGene_160912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	202.352895247081	10	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	20	553	450654	463722	TRUE	35	CAGTATCATTTCCTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGEHTDMGPWSRVRIAKCQMLLTGFFVLLLGLSVATMAVHTYFGAHFTAVSRASLERNPYKAMHHWAFSVGVSLAGLLTLGAVLCAAATVREAAGLMAGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQGIRLLTQLSREPRSGRRHSWGAAVPRVPKGSISAPVLLPPPTTHFRPRRACGRRRAGHL	450634	471501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_451725_451841_454214_454313_457543_457619_458753_458905_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484_470519_470601
897046	contig_9049_pilon	+	1273	8	Intergenic	novelGene_83147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1705.38372006216	170	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	206	562	90226	107948	TRUE	30	AATTTATATTGTGTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSGSQSVFAGSIASSSPGTCYKCKFSDST	89337	112891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558_111685_112569
897047	contig_7467_pilon	-	2305	11	Intergenic	novelGene_69465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_10	181.892303300607	81	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1611	2129	72454	67563	FALSE	35	GCTATACCATAATAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGHSFGGATVIQALSEDQRFRCGIALDAWMFPLGDEVYSRIPQPLFFINSEQFQFPANIIKIKKLYLPDRERKMITIRGSVHQNFDDFTFATGQVIGCIFKLKGDIDSNVALDLSNKASLAFLQKHLGLQKDFDQWDSLIEGEDENLIPGTNINTTYQHITTLQNSTGIGK	133043	67386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68510_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132905
897048	contig_10732_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_114718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTTGTCTGTGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143879	144712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_143900_144700
897049	contig_2227_pilon	+	1632	3	Intergenic	novelGene_142329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3432.5	7049	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	201	686	230399	231819	FALSE	25	CCAATCTCTTGTCATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGEIAAAVSFISKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230063	232765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230248_230382_230517_231451
897050	contig_9839_pilon	+	1214	3	Intergenic	novelGene_88531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3525	junction_1	624.5	24	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGAGCAATTCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57756	62283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_57850_59824_59927_61264
897051	contig_10904_pilon	-	1774	5	Intergenic	novelGene_22733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	410.186162004522	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	214	1008	661760	652299	FALSE	75	GGAAAAAACAAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662742	651532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_662310_662445_662665
897052	contig_6576_pilon	+	5805	8	Intergenic	novelGene_42262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	820	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	5210	5548	330902	337938	TRUE	50	GAAACAGACACAAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCLEAFLVLLGPVADLAVPLEGYNLAEVEQAVVEMKLMLQSHHHHIHQNHLVASFFDSLLAFSVQEVVVFHPCLFLEYLPYHIFPILYLFSQVLHLVQHLLSLYLPACNE	321661	339545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_326689_329123_329193_330287_330338_330838_330913_331027_331200_332093_332229_337917_338052_339401
897053	contig_12468_pilon	+	3801	1	Intergenic	novelGene_164872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	3181	3555	4303	4677	NA	45	GTAGTCACAAATATTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEEERNAEEERNNEEEERVKSNKFTVKGFAGVFSKLNQGLQLLENADCFAKVNRQIREAVTWYCKICEGKKRTRQTTLTNSLIRNAIPIPRDNPDDPESSTSGVITATDKMLMLSNSSSLLE	1122	4923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_+_1100_4900
897054	contig_2069_pilon	-	2022	11	Intergenic	novelGene_23277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	178	534	344113	343644	TRUE	10	CCCGGCTCCAGCTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTECPICSDVLGLCRILSLGALGRESWGLTRASGHAQRGAQCPSRLCLIPGLVLGFCGGEVVLQEGLQVLKGRPLIRVQTPGLLHGLIQGHRAAWGAWHVVAMLHLFHYFPVTHACR	344290	333932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_334100_334694_334920_335554_335707_339002_339105_339556_339708_341057_341218_341298_341474_341998_342074_342571_342734_343524_343647_343759
897055	contig_3077_pilon	-	2908	11	Intergenic	novelGene_26887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	123.734554591674	6	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	650	1936	1517445	1498272	FALSE	55	CACAAAAAAATTTAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQPIPSYLIALAVGDLVSAEVGPSRVWAEPCLIEAAKEEYNGVIEEFLATGEKLFGPYVWGRYDVLFMPPSFPFGGMENPCLTFVTPCLLAGDRSLADVIIHEISHSWFGNLVTNANWGEFWLNEGFTMYAQRRISTTLFGAAYTCLEAAAGRALLRQHMDITGEDHPLNKLRVKIEPGVDPDDTYNETPYEKGFCFVSYLAHLVGDQDQFDNFLKAYVDEFKFQSILADDFLEFYLDYFPELKKRKVDSIPGFEFDRWLNTPGWPPYLPDLSAGDSLMKPAEELAQLWVTKELDMKAINAVAISPWKTYQLVYFLDKILQKSPLPPGNVKKLGETYPNISNARNAELRLRWGQIVLKNDHQEDFWKVREFLQSQGKQKYTLPLYHAMVSGSEVARALAKETFASTASQLHSNVVNYIRQILEPKGS	1523371	1497299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1498431_1499811_1499955_1501401_1501627_1502946_1503056_1503236_1503350_1504902_1505017_1508719_1508956_1509681_1509796_1517371_1517502_1517837_1517993_1522933
897056	contig_14133_pilon	-	1892	3	Intergenic	novelGene_119939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3618	junction_2	415	98	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	608	919	208493	208182	TRUE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209385	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_208728_209012
897057	contig_12624_pilon	+	3173	10	Intergenic	novelGene_60980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	129.485305901652	182	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	136	1272	69828	98576	FALSE	45	AGAAAAAAAGGTTTCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKNFLYAWCGKKKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVRVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSNAARDFVNYLVRINEVKSEDVPAVGIAPPPPSLTDSSDGTASTDGSLPTTMGGPLPPHLALKAENNSGVGASGYGVSGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEAQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVIEAYSGLTKKKEGETLEPYKVNLSQDLEHQLQNVVQELNLEIVPPPEDPSVPVLLNIDKLAHFEPSQRQNQMGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAYVSASSFLRSDSCVLLSDTLHQDV	66560	100477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342
897058	contig_16622_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_48414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	548	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCAGAAAGCCCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110088	106971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_107000_110100
897059	contig_7051_pilon	+	2133	10	Intergenic	novelGene_64337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	474.179004591158	28	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1971	163	2133	334385	347667	FALSE	65	TTAAAAAGAAAACGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLVLEEVEASKGLEKVLQERWQQPCSATGVGQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQDKRKEKQKREEKDFKFSSQDDR	321843	347667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
897060	contig_9653_pilon	+	2503	2	Intergenic	novelGene_48346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	274	657	1101648	1102031	TRUE	70	TCAAAAAAAAAAAAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQYTFIKIIALETIWGSSTLSYSIALNQNQLDGNRFGLGYSKSWNNFAKYYISSPIIRKSILLLLKIICYYDSGVKKPNKKANSLQLRCHLQNTFTSQYKRRSRLILLILDLTSIFLLFINITVHV	1101374	1120910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1102800_1119832
897061	contig_6047_pilon	+	1777	6	Intergenic	novelGene_24204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	773	junction_2	365.250817932007	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	1136	1777	107251	115073	FALSE	65	GCAAAAGAGGAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGIGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEES	105134	115073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034
897062	contig_1146_pilon	-	4998	14	Intergenic	novelGene_84800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	36	junction_1	245.210258769728	215	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	129	1976	274691	265659	TRUE	35	TTTTCATCTTAAAGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKAAQDRAALCQYQLNHLLPDEARSEERKADGSVRDQCDCGKMEEYEKFCEKSLTRIQETSLSRESFLPAQSESISLIRFHGVAVLSPLLDIERRKEMQQEKQKALDIEARKHVNRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDHWETETIYSNSEVTNLNVPVTFPNSLPSPTEHSTSTKLEKITGVLPLDNEDQFKSNGIDVAGDSEGFSSLKQCDNSGITHAENEASPKTSSVTPQETLISDSLFPKNEEQDPSLLEEVSPDPYIMSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSRPSSACHILINNPVNACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQHLLEKKIP	279785	251993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_253987_257479_257540_258168_258232_258786_258861_259951_260069_260242_260345_260674_260792_261059_261200_261720_261899_262442_262571_265608_267237_270972_271102_274550_274707_279672
897063	contig_12021_pilon	-	3323	5	Intergenic	novelGene_172185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGCGCCCTAGAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47836	36601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_39547_42150_42256_42599_42697_45780_45879_47758
897064	contig_10904_pilon	-	3610	14	Intergenic	novelGene_22488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	374.41335572699	701	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	202	996	354975	352112	TRUE	25	GGGAAGGAGGGGGAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362581	235232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_235242_250815_250827_345626_347435_348254_348347_348716_348863_349527_349624_349922_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_354962_354999_362403
897065	contig_10930_pilon	-	2800	7	Intergenic	novelGene_36982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	66	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	634	1482	276835	268388	FALSE	60	ATTGATTAACAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280341	267069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278495_278637_279700_279832_280157
897066	contig_4783_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_108397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259653	260438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_259700_260400
897068	contig_2476_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_157621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTACCTACTTGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102907	104240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_102900_104200
897069	contig_854_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_36370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGTTCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974693	976401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
897070	contig_4812_pilon	-	1280	4	Intergenic	novelGene_103716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_2	856.827870695159	637	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	219	1060	1278	944244	944026	FALSE	60	GAAAAGTGTTGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRGTRGSQIDSHSSSSNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPKKGQK	952245	944023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944451_944834_944939_946403_946960_952052
897071	contig_7396_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_79574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245219	247902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246476_247186
897072	contig_15327_pilon	+	2844	11	Intergenic	novelGene_70578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	116.608790406213	466	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	76	1002	808394	843400	FALSE	20	CTCTCCCCTCAAATGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKKNVLSSLAVYAEDSEPESDGEGGVETAGSATEEKGGLVSEAYGEDDFSRLGGDEDGYEEEDDENSRQSEDDDSETEKPEADDPKDNAEIEKRDPQELVASFSERVRNMSPDEIKIPPEPPGRCSNHLQDKIQKLYERKIKEGMDMNYIIQRKKEFRNPSIYEKLIQFCAIDELGTNYPKDMFDPHGWSEDSYYEALAKAQKIEMDKLEKAKKERTKIEFVTGTKKGTTTNATATTTTTASTAVADAQKRKSKWDSAIPVTTIAQPTILTTTATLPAVVTVTTSASGSKTTVISAVGTIVKKAKQ	808318	845242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_808500_809869_809980_812492_812541_831760_831804_836724_836814_839110_839203_840064_840126_840599_840652_841633_841693_842872_842958_843218
897073	contig_2221_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_178707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTAAAAGAAAATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5982	7959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2221_pilon_+_6000_8000
897074	contig_7009_pilon	+	1673	5	Intergenic	novelGene_23601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	453	junction_1	467.71492385854	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	69	668	444955	518263	FALSE	85	AAGAAAAAGAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGPARASGLQPAAARTDTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	429975	519268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430030_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991
897076	contig_5551_pilon	-	2884	2	Intergenic	novelGene_134289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	387	junction_1	0	594	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGGAAGTGGTCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834247	814560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_817377_834179
897077	contig_3584_pilon	+	1747	5	Intergenic	novelGene_108147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	131.093478098645	62	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTTTGGCTTTTGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341231	368901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351051_351472_351654_352275_352364_367606
897078	contig_6028_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_156560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	170	559	221661	221272	NA	60	ATAAAAAAAAAATCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKKLNKDTEDLKATISQLDLIHIYRMLHPIAAKYTFFSNTHGTFFKIDHALDHKVTLNKIQNTEIIQSIFSDHDTIKVEINNRKSKEEKLITWKLNNTLLKNHWVIEEIKDGIKKFLKSNENENTSY	221830	220749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_220700_221800
897079	contig_8628_pilon	+	2168	11	Intergenic	novelGene_164428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	96.1199250936038	196	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	83	1837	636944	667851	FALSE	35	CCCAGCAAACACCATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRPPFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGTMPPPPGMMFPPGMPPVTAPGTPALPPTEEIWVENKTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQVQAQAVGASTPTTSSPASAVSTSTSSSTPSSSTSTTTTATSVSQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSTPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLEEKIKEPIKEPSEEPLPMETEEEDPKEEPIKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGMEEGKKLRHPTPTMLSIQKWQFSMSAIKEDQELMEEINEDEPVKAKKRK	630750	668182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_630832_636942_637169_639776_639930_641429_641872_646129_646373_651943_652145_653088_653202_654184_654274_666378_666540_667579_667637_667780
897080	contig_11548_pilon	+	4923	6	Intergenic	novelGene_66717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1084	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	458	1567	772	4697	TRUE	45	GTGAAAACCTATCAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHSLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENIEKDIKKTIPFIIALKR	314	197140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_1823_4638_4708_20745_21163_22180_22598_32919_33998_195706
897081	contig_3818_pilon	+	4086	27	Intergenic	novelGene_99240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	272.937971148528	8	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	62	3715	424965	455535	FALSE	0	CCGTTTTCTTCTGTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGTRMGDKAQRTKPQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQNMDDNIDETYGVNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTLSANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDRECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEPEKERIMGKMEADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERCRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKAKPFGPEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKGGERTYTQLVRLVILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDMLNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPALYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLSDSQMADVARFCNRYPNIELSYEVVEKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD	424903	455906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_425010_425468_425633_427646_427819_428719_428913_429408_429465_431334_431434_431785_431939_432065_432166_432340_432478_433015_433100_433189_433364_433760_433899_434113_434270_434796_434968_437161_437356_437543_437668_438704_438855_439107_439219_439731_439864_440027_440217_440562_440761_441159_441304_452786_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
897082	contig_8254_pilon	+	5097	15	Intergenic	novelGene_48384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	226.255691099919	977	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	4	2394	72814	109211	FALSE	15	GTTCTTTCATGATTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKGLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFSSNLLTIPKQRSSSVSFTHHISLRRAGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	72810	111914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_72865_74714_74964_77451_77595_82136_82244_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341_102546_104501_104664_107499_107756_108996
897083	contig_10103_pilon	+	5290	8	Intergenic	novelGene_86152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAGAGAAGAGGAAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464713	657001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_464955_648329_651475_651637_651738_653442_653647_654456_654569_654693_656052_656151_656220_656939
897084	contig_6544_pilon	+	1940	1	Intergenic	novelGene_142096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	865	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAAAAGAGCCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100812	102752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_100800_102800
897085	contig_1450_pilon	+	2667	2	Intergenic	novelGene_27427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1772	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	129	1145	419840	423253	FALSE	85	AAAGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419711	424775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293
897087	contig_9620_pilon	+	4444	6	Intergenic	novelGene_178709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	595	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3876	4316	212472	213536	FALSE	15	GAACTATCCTGTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRKQNKLKKKKTRKAPKETEKEKKSSVKNQRKKKNALRDPSAGLWKPKGSLPATQLSLAREGSNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPAGSSVRLLSHTLCLLVSDRSPRWRIHAALAGRGPLHESLLNLPSLSVFSLCLVLG	78856	213664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9620_pilon_+_79264_108335_109182_109308_109634_210040_210222_210355_212746_213369
897088	contig_8866_pilon	-	4123	1	Intergenic	novelGene_77835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1112	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCTCTCTATATCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613755	609632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_609600_613800
897089	contig_6191_pilon	-	3568	7	Intergenic	novelGene_107864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_6	94.4969135298432	320	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	155	1090	525515	476374	TRUE	45	ATTAAATTGATTTAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGICDSTMGLKSTLFVTALLLSGAVAAVKTQAYFNETAYLPCQFINSQNRSLDELVVFWQNQEKLVVYELYQGKEKYDNVDSKYKSRHISFDEENWTLQLHNVEIKDQGDYQCFIHHKSHKGLVPIHKMSSELSVIANFSQPEILEDSNTSSKSYRNLTCYSVQGYPHPEEMYFLLRTENSTTKYSPTMQKSQDNITELYKVSISWSYSGFHDPSNRSITCVLCVLGMCLFSKPYNIVPPKTHLPPKDNMLWIAAPSLVIVGVMVFFLAQWKRKKKQPDLSRERHESETIKMEGEESKNATHQQVPTLQHC	525669	472539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_475013_476368_476448_490107_490258_493011_493315_495376_495719_506852_506903_525498
897090	contig_14980_pilon	-	3909	1	Intergenic	novelGene_78236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	678	1145	570696	570229	NA	65	TAGATTAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLKGQKSYQCDECGKAFSRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRIHTGEKPYECNECGKTYRHSSHLIQHQRHHDGEKPYKCNECGKAFTQSSQLIDHQRTHTGEKPYECNKCGEAFIRSKSLVRHRVLHTGEKPYECNECGKAFCSNRNLTDHQRIHTGEKPYECNECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLVDHERMHTGEKPFECSECGKAFSLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCKECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKHSALARSVS	571373	567464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14980_pilon_-_567500_571400
897091	contig_12948_pilon	-	4103	7	Intergenic	novelGene_126196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	492.883578771115	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	42	1739	235917	227252	FALSE	30	CCTTTGTTATTTTAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLIDSTGQRLRIADFGAAARLASKGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSVGCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKLCVFLLQIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQDRPPSRELLKHPVFRTTW	235958	224887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_227423_230188_230321_231206_231350_232224_232357_233724_233888_234585_234739_235113
897092	contig_6533_pilon	+	935	2	Intergenic	novelGene_114628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	245	583	100348	100686	FALSE	35	TAGGAAGACAGGCCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKGLGSKPHSTAWPEQAPTSRKGKENKQTIENKQKPWDPTSAATHTGKQFHTQPELRSPSERSKDGALSQVFERKEGEVVRGKQEIKRSREKKKKQHQQPTNGSQRAS	69600	101038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_69609_100111
897093	contig_9290_pilon	-	3427	4	Intergenic	novelGene_77510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGCTAGTAACCTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50188	43715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_46540_47447_47572_49008_49184_49884
897094	contig_8377_pilon	-	4785	1	Intergenic	novelGene_35056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	2718	3140	96333	95911	NA	25	CTCCTTCACATATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFTSKTNFTQRFSSLSRVSFQMWEDGLFFFSYSGPQTMSTGNKMRARTLTSIIRGSLFLEHMSLYGYINTKLHIILNNIISLPVPLHKSLLFEILLLRRAERHVGEKWYSSETLEVFMVITNTEKYYFACVIILFLGS	99050	94265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_94300_99000
897095	contig_9363_pilon	-	4163	20	Intergenic	novelGene_6687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_19	414.314445601158	609	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	1099	3120	1280725	1272765	FALSE	20	GTCGGCATAGCCAGTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQVELQGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSTHSIPNLGHPEDSSLGAPAPGKEEGGPGPGGAPDGRKEMTSMPGATITASSVRKEELVPSEEDTQALTLGAQGPSSRGREPEGRPKRELREREGPGLGPPSAASALSRVDREKAKVEEAKRKESELLKGLRAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGNLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRVYIS	1283935	1271721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272942_1275152_1275255_1275337_1275479_1276490_1276617_1276695_1276909_1277098_1277249_1277385_1277504_1277594_1278023_1278113_1278236_1279286_1279423_1279616_1279797_1279887_1280008_1280716_1280792_1280883_1281032_1281154_1281277_1281845_1282053_1282733_1282876_1283009_1283178_1283569_1283763_1283883
897096	contig_9801_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_167567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGCCGCCCAGGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100718	102085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_100700_102100
897097	contig_5429_pilon	+	3244	15	Intergenic	novelGene_127803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	206.985802529979	47	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	429	1679	456862	498838	FALSE	20	TAATTTACCCAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKIVFLEEASQQEKLAKEWCFKPSEVRELSPHEFFMPGLVDTHIHAPQYSFAGSNLDLPLLEWLTKYTFPTEHKFQNIDFAEEVYTRVVRRTLKNGTTTACYFGTIHTDSSLLLAEITDKFGQRAFVGKVCMDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLINPKASDSPIDLFHGDIAGGISEAVIQKFLYLGDDRNIEEVYVAGKQVVPFSSSV	427793	500403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_428022_456661_456871_457958_458048_460504_460677_463724_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495718_497667_497696_498767
897098	contig_17989_pilon	+	2995	8	Intergenic	novelGene_150831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	168.429480186571	6	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	51	485	261854	265002	TRUE	40	AAGTCCAAATCCACATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIKPDPDGPEAPTEACCGERTYHELLVNLNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKGVKEVQKFINKGEKGIMVLAGDTLPVEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDLGAAAGSKRPTCVIMVKPHEEYQEAYDECLEEVQALPPPL	261803	269793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_262014_262114_262158_264163_264270_264876_266627_266710_266870_266955_267059_268253_268420_269335
897099	contig_6677_pilon	-	8028	17	Intergenic	novelGene_114157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	275.616064197554	386	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1210	3633	124	3756	427708	391707	TRUE	5	ATGGTTGTTTTTGGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARAGSRGGYDDPAAGPRISSPPPPPHSSPSSRLRTRHTGGMASQLQVFSPPSVSSSAFCSAKKLKIEPSGWDVPGQSSNDKYYTHSKTLPATQGQANSSHQVANFNIPAYDQGLLLPAPAVEHIVVTAADSSGSAATSTFQSSQTLTHRSNVSLLEPYQKCGLKRKSEEVDSNGSVQIIEEHPPLMLQNRTVVGAAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKYIRPILQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDPNLGYPLWRLKTPEEHELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFVTMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASSSTAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQICTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQATTKHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQGSCTPLMVATLHPQVATITPQYAVPFTLSCAAGRPALVEQTAAVLQAWPGGTQQILLPSTWQQLPGVALHNSVQPTAVIPEAMGSGQQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLTNHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQSAPVSSKSSLDVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQDQHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEEDNKFKPNSSGLKPRSNVISYVTVNDSPDSDSSLSSPYSTDTLGALRGNSGPLLEGPGRVVADGTGTRTIIVPPLKTQLGDCTVATQASGLLSSKTKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRGGTSAAQPLNLSQNQQSSAAPASQERSSNPAPRRQQAFVAPLSQAPYAFQHGSPLHSTGHPHLTPAPAHLPSQPHLYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSRHAAAYTTHPSTLVHQVPVSVGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSYIGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL	438650	387390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_387713_387756_392196_393287_393419_395899_396142_397786_397994_398497_398681_399090_399234_401862_401998_402896_403019_407403_407630_408423_408587_409063_409249_409927_410015_410840_410961_418248_418373_426632_427711_438529
897100	contig_15105_pilon	-	2107	7	Intergenic	novelGene_151002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.92118417676	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	37	708	839916	829338	TRUE	40	AAAGGCAAGCCCTAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839952	827896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828996_829037_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836497_839849
897101	contig_4093_pilon	-	2485	5	Intergenic	novelGene_27615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3703	junction_3	741.614244402034	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	17	523	69014	41737	FALSE	25	GGCAGTGAGTCTTGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	69030	39774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951
897102	contig_9415_pilon	+	2159	14	Intergenic	novelGene_109831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	283.771430648103	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	128	1543	1925966	2013564	FALSE	20	CAGTTGTACCTGTACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQPPSAERPARSDPRQSLPNPSAPTSPGPGAAVLPAVLLVAMECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRNGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPENCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAFATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVLKAKAYILFYVERQAKAGSDKL	1925838	2014180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1999791_1999899_2000077_2000159_2010366_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398
897103	contig_3588_pilon	-	2856	1	Intergenic	novelGene_72882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	576	1085	117206	116697	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNGLPCSSGELGSGLPRAEIRKWALTDVRGVGERLGRQDGILQGFLIVGGWWLVIGIVLHGFLFLLIGGLVVIIILPILILSGTFIVIFLLTHGDRKFVSAVHRDSMALHVPASTLSEKPPNSTPLRAGSPRVATLILQTGKLRSGSPVSQDQQVMGLRFPSESSNH	117781	114925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_114900_117800
897105	contig_2969_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_157056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1111	1605	4236	4730	NA	25	GGCCGACCCGGGACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPAWVCGIQAAGTSRSRDCGRGKQRNKRTKAQGSHQRGSPDREAAAHSNGAPQPLRKKQRWHTEPGTEAKGGVGSERQARNQKKQEKKKKATPAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSVGSRGGQVWVKKGGEWESIYHKLPALCSTSGRSKGGTRSQALT	3125	4897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_3100_4900
897106	contig_12352_pilon	+	2502	9	Intergenic	novelGene_57460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	258.380744977253	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	55	756	230286	284811	TRUE	20	TGAGTTGCTTGTTTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCRQFDLSGKSSLGEVRFMAPIRPRVKEIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	230231	286648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230316_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742_285727_285817
897107	contig_5189_pilon	-	3339	8	Intergenic	novelGene_34874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1484	junction_7	596.974856750129	71	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	111	920	244235	205685	FALSE	25	ATGAGGAATTTTTTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESAKVGDQAQRRVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKVSS	247751	203265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235848_244163_244289_247694
897108	contig_2414_pilon	+	5994	10	Intergenic	novelGene_158475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	884	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGACCTTCCCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228115	254357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_233015_237979_238084_240800_240989_242494_242623_243141_243326_244212_244317_249399_249516_250628_250703_250828_250946_254277
897109	contig_15498_pilon	-	3157	11	Intergenic	novelGene_42686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	254.960565578287	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	705	2210	825430	785428	TRUE	20	TGGCTTCCTTTTGAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLDPLLFTQFLEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	826134	784432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_784562_784609_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236
897110	contig_10044_pilon	-	2112	6	Intergenic	novelGene_156388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTACTTCTCGACCGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156834	142831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_-_142889_148806_149006_151763_151891_152148_152245_155117_155492_155575
897111	contig_4385_pilon	-	1351	9	Intergenic	novelGene_141514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	59.4199829602803	259	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	347	1024	443009	438211	FALSE	30	GGAACTGAGAGACATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELNQALEAFEGDPAMGAIVLTGGEKAFAAGADIKEMQNQTFQNCYSGRFLSHWDRVAHVKKPVIAAVNGYALGGGCELAMMCDIIYAGEKAQFGQPEILIGTIPGAGGTQRLTRAVGKSLAMEMILTGDRISAQEAKQAGLVSKVFPVETLVEEAIKCAEKIANNSKIVVAMAKESVNAAFEMTLTEGNKLEKKLFYSTFATDDQKEGMTAFVEKRKASFKDQ	444529	437883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_438277_439115_439184_440177_440298_440791_440897_441613_441714_442388_442517_442918_443117_444184_444323_444428
897114	contig_5936_pilon	-	2968	4	Intergenic	novelGene_53598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_1	129.027990072783	443	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560522	547102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_547823_548424_550095_555609_555898_560232
897115	contig_11989_pilon	-	2791	24	Intergenic	novelGene_68436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	361.747805079936	1	34	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	510	2168	90274	46235	FALSE	10	CTTTTTTTTTTTTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESIKHCIVLLQIAKDQSNAEKHADGIISTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIDSSGSASVLTHSSSGNSLKRPDTTESLNSSMSNGTSDADLFDSHDDRDDEGEAGSVEEHKSVIMHLLSQVRLGMDLTKVVLPTFILERRSLLEMYADFFAHPDLFVSISDQKDPRDRMVQVVKWYLSAFHAGRKGSVAKKPYNPILGEIFQCHWTLPDDTEENAELVSEGPVPGVSKNSVTFVAEQVSHHPPISAFYAECFNKKIQFNAHIWTKSKFLGMSIGVHNIGQGCVSCLDYDEHYILTFPNGYGRSILTVPWVELGGECNISCSKTGYSANIVFHTKPFYGGKKHRITAEIFSPNDKKSFCSVEGEWNGVMYAKYATGENTVFIDTKKLPTIKKKVRRLEDQNEYESTEAKHRLEERQRAEARERKEKEIQWETRLFHEDGECWVYDEPLLKRLGAAKH	191117	45611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46684_48165_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53867_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_71209_71370_74969_75075_76359_76451_80408_80448_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_164164_164315_166938_167018_191091
897116	contig_12964_pilon	-	2686	1	Intergenic	novelGene_131736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCAGAGCTACGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636801	634115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_634100_636800
897117	contig_16951_pilon	-	8866	2	Intergenic	novelGene_98658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1153	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2823	3128	103355	103050	TRUE	20	GGTCAGCAGTTTTGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRGKVAPCLPPHSPAYPLSGAKCLVWPNASLLHLSLVLLLLFKKPVAVKLTLTHGSLICVRVELRSIEFSMSDFSEVDCQAFLLRCLGWTQTARLLVSS	106177	95287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_97148_99171
897118	contig_13074_pilon	+	1507	2	Intergenic	novelGene_153436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	169	327	451016	451174	FALSE	20	TGACTTCATAGTTGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	449123	452354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_449279_451002
897119	contig_7179_pilon	+	2499	8	Intergenic	novelGene_78084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	59.7539171288786	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1419	2189	580021	586612	FALSE	30	GAAATAGCCTAATTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWRNPLPNIDHELQELLLDKGESVPSEEEDEEENGFEERKDEDSDADGGGWITPSNIKQIQQELEQCCVPNNVRVGCMTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAVNPHLTEDQRFPQLRLSRKARQKTNVFAPDYIAGVSPFAENDICSRSATLQIRDSTLGAGRRRLNPNASRRKFVKKR	576833	586922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_578226_579657_579730_579945_580075_580168_580373_580923_581022_583194_583340_586342
897120	contig_3948_pilon	-	6443	1	Intergenic	novelGene_53165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	427	206	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2727	3092	197316	196951	NA	35	TCCCAGCAGGAAGTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSVSEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSASCLSSWKILSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWTPTGTILSYFCKCFDIVCCFRGIQ	200042	193599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_193600_2e+05
897121	contig_18919_pilon	+	8873	2	Intergenic	novelGene_156038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	960	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1256	1570	152933	153247	TRUE	25	TGGCAAAAGCCCCCCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVNEHTLKILFKTSSNSGLKNTMTKYFNGVPVGKVGKKVQMKVQMSFKSALDLNCQCVCVCTRALLCEMREGGVANHQNIFTMYSLCSNHILVIGKAETVAI	151677	167472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_160218_167139
897122	contig_12935_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_165729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTGGCTTGCATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243177	242281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_242300_243200
897123	scaffold_19766_pilon	+	2232	15	Intergenic	novelGene_34428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	150.753684762223	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	622	2073	846636	851417	FALSE	15	CCACCTTCTAATCTGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844404	851576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844446_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846165_846543_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
897124	contig_12620_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_98805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	629	1171	226212	225670	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDSCFTLYTKTNSKWNKDLNVKTKTITLLEEKAGTTLSDLAFNNGLSNIITKERTAKDKIDKWDLKKIKNFCSSKDFTKKVKRQASNWEKILGNHIVNKNPLIKIYIKLGQLNNKKTNNPIIKWAKDLNRHFTKEDIRIATKHMKRCSMSLAIREMQIKTTMRYHFTPTRMAKIKKRK	226840	224155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_224200_226800
897125	contig_5727_pilon	+	2886	5	Intergenic	novelGene_7979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGCTCCCCTACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295133	471548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_295715_302391_302495_361876_362063_452974_453334_469891
897126	contig_12080_pilon	+	6626	27	Intergenic	novelGene_128332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	54	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4303	4752	107843	108292	TRUE	0	CCTTCTTCTTGTCCCGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	43893	164193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45892_46201_47139_54876_54963_56918_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118140_118502_118606_120731_120885_164134
897127	contig_13718_pilon	+	7024	5	Intergenic	novelGene_142906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_2	195.799004083269	313	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	5761	6231	262560	273278	FALSE	30	CTTTGTGATAAGTGACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDALPEKACQLDSRYWRITNAKGDVEEVQGPGVVGEFPIISPGRVYEYTSCTTFSTTSGYMEGYYTFHFLYFKDKIFNVAIPRFHMACPTFRVSIARLEMGPDEYEEMEEEEEEEEEEDDDSADMDESDEEDEEERRRRVFDVPIRRRRCSRLF	254719	274071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_255204_256435_256521_257368_262669_263921_264113_273107
897128	contig_16098_pilon	-	3722	10	Intergenic	novelGene_45929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1152.71669449947	222	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	119	1804	352350	348441	FALSE	30	AATCCCGAGCAATTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354107	346522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
897129	contig_5039_pilon	-	3299	1	Intergenic	novelGene_65033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	777	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCAATTGATTTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1797906	1794607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1794600_1797900
897130	contig_1301_pilon	-	5686	22	Intergenic	novelGene_47279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	749.369987846329	5	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	83	2272	322831	259065	TRUE	40	CTTCCAGCAAACATAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	241573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249989_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277876_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
897131	contig_11594_pilon	+	1737	11	Intergenic	novelGene_80928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	479.208524548552	582	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	13	1305	540415	568385	FALSE	30	GAGAGCTATACTTCAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVAEAASFGSHLNGDLDPDDREEGAASTNEEAAKKKRRKKKKSKGAAAGQETDKESGASVEEVARQLERQALEEKERDDDDEDGDGDGDGATGKKKKKKKKKKGPKVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGPYRIHAGKTVPIVKGGEATRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY	540402	568817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_540566_543390_543493_548949_549016_552857_552961_560272_560335_560952_561097_563008_563104_563560_563658_566673_566778_567340_567457_568132
897132	contig_6724_pilon	+	3481	5	Intergenic	novelGene_167986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1595	1897	399896	451996	TRUE	50	TTTAAAACAAAATCTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIDRRRSRFETKEDRISETEDKHFDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNVRVIRVPEQGEKTENTEWIVEELLTENFLNIMKGEKLTVIVV	390129	567029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_390711_390977_391195_399099_400181_451978_452483_565931
897133	contig_385_pilon	+	2791	2	Intergenic	novelGene_177046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	217	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAACAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260938	264649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_261109_262028
897134	contig_2069_pilon	+	1709	4	Intergenic	novelGene_23287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_3	140.533111954285	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	37	669	341330	343776	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGLPGVRCGREWGDGLGEGLPPGCSFGEVRLPTNRAPPCRHE	341293	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_341475_341999_342077_342574_342729_343519
897135	contig_4742_pilon	+	3664	1	Intergenic	novelGene_130995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	629	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204550	208214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_204600_208200
897136	contig_4924_pilon	-	2561	2	Intergenic	novelGene_84745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	2137	2559	155494	155072	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNNLMLYRECEWERNCPLRIKLFREEPSKTVASGHPSNSDLKPLPKFIFQPEIRQACLRQTCFLDQSSIRNQMSNTCTRKKAKKAGGDRRTGQMNAMNRGGKVKGESANTMRICSQVMKKLVYKFLNEKLICSVNFHLN	157840	155069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_156616_156825
897137	contig_13319_pilon	-	6510	3	Intergenic	novelGene_178416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1206	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2696	3085	27216	26827	TRUE	30	GGGGGAAGCAACACCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAWNPGSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGFSPARQPRPGSSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQHQHPTNGPQRAARPGARNPSSRQPWVKSLRPREAEEQTNKGPGI	29911	215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13319_pilon_-_2568_22216_22322_25858
897138	contig_7534_pilon	-	3573	7	Intergenic	novelGene_162116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	79.0627388006934	511	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	301	1245	66019	17901	FALSE	20	TTACTGCTTCTTTAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVLWTLCAVWVTVNAISVETPEQALQAARGENVTLPCTYRTSATDRNGFIQWDKLLMTHSEKVTTWTFSDKKYIYGSRYENRVSISSNAEQSDASITISQLTMEDNGTYECAVQLMADLDGTSKSRVRLLVRVPPSKPECGINGETVIGNNIELTCQSQEGSPAPTYSWKSYNVLNQERSLPLPVTGQTFLLKNISTDTSGYYICTSSNEMGTSSCNITVAVRPPSMNVVLYAGIAGGVVAALVIIGIIVYCCFCQSKGKTKEKEDARPRREIYREPPEEMTELSREHDEEDSYRHEDPRSSGRGSPDHPGR	66319	15572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_-_18034_18461_18595_19476_19597_28183_28340_41935_42153_44407_44563_65988
897139	contig_10241_pilon	+	2066	6	Intergenic	novelGene_142826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	60.3403679140258	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	189	500	92779	139824	FALSE	15	GCTTGTCATTTGTATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGNVGCHFLVWGLIAFLGLALVISLIFNISHYVEKQRQDKVYGYSDDYIPRDDEYFLEDIPIYGNLDDVVSEPTDENCYEQMKARPERSVNKRVLRGTKSQL	92590	141390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_92786_105211_105323_116154_116192_130963_131026_133187_133251_139792
897141	contig_2480_pilon	+	2585	14	Intergenic	novelGene_63533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	68.9234203288148	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	653	1825	265974	279119	FALSE	15	GTGTCACCCAAGTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251396	279879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
897142	contig_16535_pilon	-	2187	12	Intergenic	novelGene_167721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2	583	442205	441544	TRUE	10	TGCGTCCACTGGCCCGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPPGPPNSQSPRLGAAENTWSPPLPPAGPWSSEAACSQDGSISSLFIDSLVLGTEVLLAGWGQWGSGQGTIYTPQGAVPWLPAARPTNKLSLSGRAGGTLYKLKCWGPGPQYCQGQGVCKHGWVALPPSPVVCDTGSARWVRGLVRHPTGSSGSGRPTAGLRARPGHRSCKRGASSSRQRRPSHPRSWGHPW	442206	420813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_420958_421358_421538_422279_422382_422500_422690_422776_422902_422972_423104_423185_423418_440612_440729_440833_441041_441284_441372_441451_441591_441670
897143	contig_19362_pilon	+	5020	1	Intergenic	novelGene_157785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	4318	4677	25560	25919	NA	30	ATTCAGGCCGGATTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLPFKRGVAKAKGRSEKVKELNRRFQRATQEDKVKCYNDMCKELEIENQKGRIHLAFLKLKEPKKKFKPRVAVMKDSMGKILNNAGSIKRWEEYTVIIPKRIGQHSAISRGSI	21242	26262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_21200_26300
897144	contig_6589_pilon	-	2411	5	Intergenic	novelGene_26070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	39	608	1875143	1872476	TRUE	25	TAGGTCAATGGTTCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRALYRGLPGGLGVEPGFWCCLHPGERSKGAGRREGDQPVADFLHILAVCPLAEDSLLWASVSSSVKWDDRCKHSLCARAAMFKDLSARWDRESSAVSFARAGARQQPAAGAGQGAAVARGTAKGAEGLAGPWLPEPRDSVGAAGWRGLERESSLGEQEGLGPRKERKAGLVGSSSPLWASISSSVKWG	1875181	1759886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1760213_1855491_1855593_1869641_1869972_1871429_1872785_1874882
897145	contig_11855_pilon	-	1841	15	Intergenic	novelGene_66951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2094.95459134462	343	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	609	1799	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1102160	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1089856_1089920_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
897146	contig_20641_pilon	+	1396	5	Intergenic	novelGene_52823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1600.11694885093	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	491	1087	54874	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14536	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16882_45858_45965_54835_54968_56379
897147	contig_8065_pilon	+	4989	27	Intergenic	novelGene_107322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_11	151.24082445639	517	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1531	4593	397	4989	125393	241153	FALSE	65	CCTAAAAAGAAGAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMGIQMPNLDLKEKVEPEVLSTDIQASPEPGTRMNILPKRTRRLKSQSEPGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGAKDKEDEVSRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKMLPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRRKKVKELIEKEKDLDLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEVEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSSVSSSPRQTVDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKIKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDK	124996	241153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139356_143032_143168_167447_167554_168762_168855_169620_169780_170920_171041_171704_171864_178285_178468_182274_182438_183789_183910_186853_187049_192927_193110_193450_193576_194049_194201_195650_195766_196153_196510_215370_215510_226319_226500_227129_227286_230281_230834_231201_231349_237535_237696_238861_239083_241012
897148	contig_1008_pilon	+	2637	5	Intergenic	novelGene_121592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.246079007844	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAATTAATAGCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749706	762290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_750096_750244_750305_750403_751029_752457_752666_760935
897149	contig_4857_pilon	-	3850	8	Intergenic	novelGene_48763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_1	2027.43939238536	63	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	448	1083	1226315	1212354	FALSE	5	TTTTATTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRLGPFLHSSALINYVCCLNN	1226850	1209586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1212414_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
897150	contig_12786_pilon	+	1236	2	Intergenic	novelGene_103433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595653	600489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_596822_600421
897151	contig_1443_pilon	-	2206	9	Intergenic	novelGene_28268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_7	444.466375977981	2889	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	214	1137	776427	748649	FALSE	25	AATATTTATTTTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809532	747579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_808694_808741_809399
897152	contig_7840_pilon	-	2561	11	Intergenic	novelGene_69031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	272.129546356143	40	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	126	1484	427684	365958	FALSE	5	ACTTTCTGTCCTGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGASAREEALAASGRRRLRRKKVEPQEALCSVKKYFYTIAPMTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVGKASATASGDWNTTIACFVAILIVTLPALPISITFGLVFYFATDYLVQPFMDQLAFHQFYI	445680	364880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366071_367529_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609_427738_445608
897153	contig_4232_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_63273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7628	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATCCCTTAAACTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	465834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_465800_468100
897154	contig_960_pilon	+	3847	2	Intergenic	novelGene_108266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGGCGCGACAGCGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644087	648269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_647815_648149
897155	contig_19816_pilon	-	1937	7	Intergenic	novelGene_156507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	240.702905858839	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1176	1517	124800	123459	FALSE	20	ACCTTCCAGAATCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126798	123038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_125875_126400_126435_126731
897156	contig_5686_pilon	+	3136	15	Intergenic	novelGene_45229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	1906.01074477131	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	272	2110	170242	211355	FALSE	45	AAAGAACTGAAAGCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93785	212381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_129865_129993_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
897157	contig_4151_pilon	+	2425	1	Intergenic	novelGene_65252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTAGAATCCTGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561975	564400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_562000_564400
897158	contig_8377_pilon	+	5095	1	Intergenic	novelGene_34959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	106	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	3497	3964	71594	72061	NA	45	ATAAAATATTACAGCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTLIHAFIIFRLDYCNGFLISLKSLPFLFMLCSFRRNKRKKKSLISHYCLWYKFYSPGQSTGPTKEEPRACREFFFFLLSLTKREQAGVDSAPFLSTSSRPSGLCTHPVFSLMADSITLAQNFSTEIEHFLPPFFGIFHIVFHFTIIIILLLL	68097	73192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_73200
897159	contig_9668_pilon	-	4254	1	Intergenic	novelGene_58130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	3184	3726	271103	270561	NA	80	CTAAAAAAAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKETIHHEDITIINTYAANDRDSKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGHFNTPLSVKGKTFRNKLNKDTEDLKGTISQLDLTDVYRTLHPTATKYAFFSNGHGIFSRTDHILGQRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVAINNRKTKGKKSSTWKLNNPAYKSLASRRNQRWNQKIPRIKRG	274286	270032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_270000_274300
897160	contig_16578_pilon	+	2437	1	Intergenic	novelGene_148632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	683	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	245	355	125773	125883	NA	30	TGAAGATTCCACTTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSAAITEIPQVDGFTKRTLFSHSPVGYKSKFRASAPGERFLCRLWRKVHVISLPLVWELLCVGTSGPKDVLCSRHYFLGGMRFPCVSACFSLLYLKRDWTKTLSYLVNLISITSSK	125528	127965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_125500_128000
897161	contig_2988_pilon	+	5690	3	Intergenic	novelGene_136540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44737	51224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_45033_45706_47224_47346
897162	contig_3975_pilon	-	2083	11	Intergenic	novelGene_54739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	350.300513844899	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	110	712	1731202	1721549	TRUE	20	GAACCCCATGCTGATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQETIEAARAERAPAASPPLPQRSTPSSLPARLPAMADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDH	1731311	1718620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721552_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
897163	contig_16776_pilon	+	1191	2	Intergenic	novelGene_130524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCACATCTTTCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43241	44704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_43528_43799
897164	contig_8269_pilon	+	2180	11	Intergenic	novelGene_106242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	412.179621039178	222	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	222	1277	339921	377795	FALSE	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH	325214	378698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_325330_339814_339977_342676_342800_344516_344684_362641_362743_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_377781
897165	contig_6361_pilon	+	4289	9	Intergenic	novelGene_23908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1569	1913	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	177554	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_177585_183336_183528_255035_255672_379956_380546_405237_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
897166	contig_8812_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_57257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9924	8294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_-_8300_9900
897167	contig_7056_pilon	+	1797	7	Intergenic	novelGene_43702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	253.215817041511	9	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	27	1016	926284	937151	FALSE	30	AAGCAAATCTGTTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926257	937932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935498_937082
897168	contig_16525_pilon	+	3634	22	Intergenic	novelGene_133879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	139.560063549242	783	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	1321	2502	196340	211608	TRUE	15	AAAGTCTCGTTCCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYAKSSVGETVYGGSDELSDDITQQQLLPGVKDPNLWTVKCKIGEERATAISLMRKFIAYQFTDTPLQIKSVVAPEHVKGYIYVEAYKQTHVKQAIEGVGNLRLGYWNQQMVPIKEMTDVLKVVKEVANLKPKSWVRLKRGIYKDDIAQVDYVEPSQNTISLKMIPRIDYDRIKARMSLKDWFAKRKKFKRPPQRLFDAEKIRSLGGDVASDGDFLIFEGNRYSRKGFLFKSFAMSAVITEGVKPTLSELEKFEDQPEGIDLEVVTESTGKEREHNFQPGDNVEVCEGELINLQGKILSVDGNKITIMPKHEDLKDMLEFPAQELRKYFKMGDHVKVIAGRFEGDTGLIVRVEENFVILFSDLTMHELKVLPRDLQLCSETASGVDVGGPT	188332	218198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_189226_189477_189559_193299_193466_195002_195073_196106_196183_196305_196375_196476_196543_196864_196896_197223_197293_203126_203379_204739_204830_204934_205006_209617_209724_209962_210057_210339_210477_211295_211452_211533_211682_215450_215610_215699_215869_215975_216180_217584_217681_217767
897169	contig_8330_pilon	-	2855	13	Intergenic	novelGene_71925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.974397949692	8	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	758	2479	1299376	1284042	TRUE	30	AGAAGTATGATTTGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIESIYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLVYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQIMHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEATGASKKHNGVGGSPPKSKLLFSNTAAQKLKGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLMRICSQAERQIEEENRERVWEHDMPGVRRDKSDSPAIQLRLKEPMDVEVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYEDSLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLSENNNGATGGQLNTQTSRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQDKVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDYVERYMNSDTTSLELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDSLDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEHVPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP	1304569	1283200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1283273_1283737_1284273_1286210_1286419_1286966_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295230_1297668_1298243_1299199_1299559_1300768_1300962_1303329_1303447_1303744_1303956_1304515
897170	contig_8597_pilon	+	3236	1	Intergenic	novelGene_158712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	765	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1790	2215	98378	98803	NA	65	TAGGAAAACAAAAACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGNWNPYPSLQWWEYKMVQPLWKAVWQFLKKLKIELPYKPAIPLAGIYLKDLKVETQKETCTPMFTAALFTTAKRWKRPKCPSTAKWINKMWYIHTMEYFSASRRTEVLIHPTVWMELKDIMLSKISQLQKDKYCMTSLI	96588	99824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_96600_99800
897171	contig_20314_pilon	+	3090	3	Intergenic	novelGene_125638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1394	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCAGATATCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5744	26202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_7855_13633_14090_25678
897172	contig_14684_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_99666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTAGGCTGCTTGGTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313903	316622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_313900_316600
897173	contig_5286_pilon	+	2028	11	Intergenic	novelGene_157332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGCAGTTCTGAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487619	583352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487678_489780_489984_519309_519457_527920_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564482_583185
897174	contig_18869_pilon	+	1753	1	Intergenic	novelGene_55986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	251	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTACTCCTCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69664	71417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_69700_71400
897175	contig_11656_pilon	+	4371	3	Intergenic	novelGene_53934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	655	1122	150488	150955	TRUE	50	TTACATTAGAAAATAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKEEVQAALKALAKNKAPGNDGISIEMFQQVDAMLEGLTCLCQEIWKTATWPIDCKRSIFVPIPKKGDPTECGNYQTISLILHTSKILLKIIQKRLQQYIDRELPESQAGFRRGSGMRSIIADVRWILTESREYQKDVYLCFIDYVKAFNCES	58302	155329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_58952_150482_151907_153031
897176	contig_14871_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_63727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCGGTGTGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287475	288567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_287500_288600
897177	contig_11292_pilon	-	3070	2	Intergenic	novelGene_109444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	0	20	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	34	720	328232	327546	TRUE	50	TATAAATAAAAGTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSWQREKSAIMESPEEPGASMDENYFVNYTFRDRSHSGRVAQGIMKLCLEEELFADVTISVEGREFQLHRLVLSAQSCFFRSMFTSNLKEAHNRVIVLQDVSESVFQLLVDYIYHGTVKLRADELQEIYEVSDMYQLTSLFEECSRFLARTVQVGNCLQVMWLADRHSDPELYTAAKHCAKTHLAQLQGTEEFLHLSHHLLTDIISGKFWEQALHTAYLDMIRGCSSSREWSSQASWC	328265	324730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_326329_326793
897178	contig_16322_pilon	-	1759	6	Intergenic	novelGene_87497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_5	373.95957000724	3734	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	234	647	37060	32956	TRUE	40	TCTAAGCATAATTCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57661	31332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
897179	contig_13888_pilon	+	4364	3	Intergenic	novelGene_151788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	805	280	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	106	597	337589	338879	TRUE	45	TAGCTATAATAAATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVSICPIISLNYHFKGKEKTGILC	337483	345954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_339363_342670
897180	contig_15327_pilon	-	1074	4	Intergenic	novelGene_70663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2915.88709581759	110	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	902159	901025	FALSE	15	TTCACATGTGGTGGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAEWFSRLLGKCYLLAGRLRLSFGPPEAARRSVKWPKTSAFGESPPQTAGHQSCQKERSLYRRGEETSPLQTRNRGASRDSPLSEIDRASDPEVAFPEVGEGDRPGFQNRLEVSECGHRRPAGG	902159	900325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901490_902035
897181	contig_253_pilon	+	2195	4	Intergenic	novelGene_129756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACATGACAAACAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702003	705636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_703412_703699_703912_704488_704649_705221
897182	contig_11100_pilon	+	3922	1	Intergenic	novelGene_175538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	468	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1056	1454	202933	203331	NA	25	ATTTATGTTATTCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPFGSSLASKFPAVIFQKSGYHVGARKCLQQKPEHWGKNSPRVFLFLNCFKWRLCRPEIISYLPALFFVPSDGRVLLLVSLTFLDLFRRFEMVNAFFDLQSTSQGRCASQSATVIILPARVMISVGAEWSL	201877	205799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_+_201900_205800
897183	contig_1244_pilon	-	2769	5	Intergenic	novelGene_38036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	896	junction_1	946.008027185816	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	124	576	948448	933733	FALSE	20	CACCGGGGTCCCAGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAW	948571	931539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
897184	contig_11034_pilon	-	3856	18	Intergenic	novelGene_175021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.2446494380354	32	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	745	2238	1467	3704	169677	138985	FALSE	35	ATTTTTTTCAACATTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLISLRLSERNCIEIVNKLIAQKQLEVVHTLDGKEYITPAQISKEMKDELHVRGGRVNIVDLQQVINVDLTHIENRIGDIIKSEKQVQLVLGQLIDENYLDRLAEEVNDKLQESGQVTISELCKTYDLPGNFLTQALTQRLGRIINGHIDLDNRGVIFTEAFVARHKARVRGLFSAITRPTAVNPLISKYGFQEQLLYSVLEELVTSGRLRGTVVGGRQDKAVFVPDIYSRTQSTWVDSFFRQNGYLEFDALSRLGIPDAVSYIKKRYKTTQLLFLKAACVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDIAPLLPSSLSVEDAAMLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFSELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTTKKDKKDERRRKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDDDTDDEPQSSHPGKKKPEITFMFQDEVEDFLRKRIQDAPEGFISELAEYLIKPLNKNYLEVVRSVFLSSTSATGTGRKRTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGTKFFAASDLMMAVDDPAAITNEVRKKILSKLSEETKAALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSAAEACDIMVKKGDKKRERQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFLTHSMLHAPGRCVPQIIAFLNSKIPEHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGDDPLSDELGKEQEDITNTTRKELQELSSSIKDLVLKSRKSSVTEE	171143	138832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139198_139835_140017_140824_140911_141256_141338_142543_142594_142753_142918_144261_144380_147253_147377_149780_149902_151930_152111_153304_153481_154730_154878_158969_159029_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511
897185	contig_6576_pilon	+	2140	6	Intergenic	novelGene_42334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	551.240999926529	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1	612	665437	706206	TRUE	75	AACAAAATAAAAACCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRERGGGAELPARAGPEAAGAAGGAEAGEIAILGGVGEQNEKLWSFTKKASHIQLDSLPEVPLLVDVPCLSAQLDDSILNIVKDHIFNHGTVASRPPVQIEELIEKPGGIIVRWCKVDDDFTAQDYRLQFRKCTSNHFEDVYVGSETEFIVLHIDPNVDYQFRVCARGDGRQEWSPWSIPQIGHSTLVPHELKLWDNQTEETV	665436	709303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_665519_688932_689021_689512_689691_692096_692320_706165_706279_707847
897186	contig_6445_pilon	-	2749	15	Intergenic	novelGene_76911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	615.692923063278	78	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	49	906	88578	56825	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRDLKMED	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_56845_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
897187	contig_3956_pilon	-	2778	2	Intergenic	novelGene_14795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	978	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAGCCCACTTAGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226449	1217121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1217573_1224122
897188	contig_1225_pilon	+	3089	4	Intergenic	novelGene_44148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	13	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	30	ATACAGGTACATGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	277046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274456_274541
897189	contig_546_pilon	+	4274	8	Intergenic	novelGene_117176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1143.31478337226	8	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	125	727	119834	152874	TRUE	55	CCCCCAAAAAAATCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDNSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	61159	156560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_61246_119795_119885_123934_124065_139866_140055_146782_146847_147557_147672_152818_154385_154523
897190	contig_12080_pilon	-	4937	2	Intergenic	novelGene_128370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	3258	4046	130690	129726	FALSE	35	TGGACGAGCTAAATGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSKNKESGNFPEEENFLELPEAEYKRLIHRTLQEIRKEIDQNAEHAIEEIKKIREEHNDIFNRLQESIEETLRITWDSIKRNNLRVVEVPERGITENTERIVEDLLAENFPDIVKDDRISIQDALRIPHKVDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILREATDKRKVIYKGESIRISLDYSAETMQARRQWDDIYKALKEKYCQPRIIYLAKLSLKYDGEIRAFPDKQKFRAFPKTKPKLQEILKGVLWLENREHQITTQD	133947	128834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_130298_130473
897191	contig_16622_pilon	-	2468	3	Intergenic	novelGene_48483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	406.5	3	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121921	111933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_118811_118884_121330
897192	contig_1275_pilon	+	2500	3	Intergenic	novelGene_108733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTCCTCTCTGCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335963	342562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_338262_339757_339941_342543
897193	contig_7207_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_72025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	2	541	293586	293047	NA	15	TGTGTGTGTGTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCFLSLAAALTSCENYYEISGYAVAFLVLAGGFSKFQAEFALHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIGEAN	293587	290531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_290500_293600
897194	contig_10629_pilon	-	2333	2	Intergenic	novelGene_52929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTAGCCAGGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370648	312347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_312689_368656
897195	contig_19744_pilon	-	2490	12	Intergenic	novelGene_120397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1434	1817	212885	210104	TRUE	20	TCTCTGAGATCTGGGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAESASVKQIMHMSSASCFSVVACLSQPCRHGKQCSSFLTPPHGCPQGCVLLQAILAYSWQSASEQTLPTADNSVPLLEPQKRHASELLVVGLPMCSRNSTIAFIVLESASAINQNNLVLPQPS	225793	205301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_205334_206948_207067_208657_208761_209568_209951_210065_210196_211796_211902_212698_212888_213862_213971_215585_215796_218457_218571_219218_219382_224956
897196	contig_9682_pilon	+	4694	6	Intergenic	novelGene_125315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_3	70.0771003966346	692	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	50	1018	543207	551439	FALSE	40	TCATGTTAAGAGGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THISAERRKDTERLVEMLRAMKQKTLSAAVAGALTHAPRDSLAASLSEPATQQASLETDKPVGIAASLSDVPKAVEPGRLDPLRSQEPAPACSEKARLGEAPGSKKGLSLLHCIRGPAPKDIPVPLSHSINGKSKPWEPFLAEEFAHQFHESVLQSTQKALQKHKGHAAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRLPRPQHNGQQEPPPGRKGPITQEMDQDSEDDDDEEDGEEEDEEAPRRKWQGIEAIFEAYQEHIEEQNLERHVLQTQCRRLEAQHYSLSLTAEQLSHSMVELRSQKQKIVSERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYFKGYPR	541538	555115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_541568_543186_543301_544089_544444_545987_546270_550419_550524_551304
897197	contig_401_pilon	-	3497	3	Intergenic	novelGene_42809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	674	junction_1	111.5	542	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	1728810	1724305	TRUE	10	CCTCCTACTATTGGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRGGPRGKEEGWGKDRELRRRVSEKRLVRLPCPGAPLAQPQPPHSVLRNDSGAGRGSARFLEVVRNPHPRGVSPGPASSETTPGASSLSSPSLDSATGSWGPFGLRRNLN	1728812	1711765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1714795_1724174_1724346_1728515
897198	contig_9839_pilon	-	7254	5	Intergenic	novelGene_88520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTGCTGAAAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61483	47234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_47748_47900_54121_57650_57848_59821_59926_61263
897199	contig_3077_pilon	-	2447	6	Intergenic	novelGene_26889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	94.7535751304403	14	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	1133	2041	1505062	1498272	FALSE	25	TTTAAGTTGGAGTTACGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETNSWGLWFIFTAGAAYTCLEAAAGRALLRQHMDITGEDHPLNKLRVKIEPGVDPDDTYNETPYEKGFCFVSYLAHLVGDQDQFDNFLKAYVDEFKFQSILADDFLEFYLDYFPELKKRKVDSIPGFEFDRWLNTPGWPPYLPDLSAGDSLMKPAEELAQLWVTKELDMKAINAVAISPWKTYQLVYFLDKILQKSPLPPGNVKKLGETYPNISNARNAELRLRWGQIVLKNDHQEDFWKVREFLQSQGKQKYTLPLYHAMVSGSEVARALAKETFASTASQLHSNVVNYIRQILEPKGS	1506194	1497865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1498431_1499811_1499955_1501401_1501627_1502946_1503056_1503236_1503350_1504902
897200	contig_6842_pilon	-	3749	11	Intergenic	novelGene_130642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	83.2279400201639	911	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	121	531	233926	210427	TRUE	15	TACCTCTGTCACACCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGSRSLSWRPPRALLGGRRVPGAGGRGFPVVHSATAGGDMSAAGLLAPAPAPAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASETDLAKHDEEDYVEMKEQMYQDKLASLKRQLQQLQEGSLQEYQKRMKKLDQQYRERIRNAAYASLLLRLNKWKEITLKKRRQR	234046	186995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_189732_192865_192951_201762_201869_203049_203072_203234_203300_204276_204373_210318_210498_215206_215279_218738_218795_231309_231380_233784
897201	contig_2069_pilon	+	4623	2	Intergenic	novelGene_23166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	0	384	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8911	15468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_9014_10947
897202	contig_709_pilon	+	4497	6	Intergenic	novelGene_57560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	408	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	3913	4497	1575624	1580887	FALSE	35	TCAGTGGAGCAAGCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLHVTCEDLMNSSWMSSSSSKSVLPMRCTAMLTWDLLYGIFRSFLMFSESETTSTSFPTESIKSYAIPKLENGLLLLLLPRMVVPAGPSLALSRNQLAGGSFKSVFSWRRANAVRAGADEYFTTARLFTSLPPRNTADPCAEDSSGSPCGRRLSLPRAAAPAGGASASASLRSPITSAQGSRDQEPGPGGAAT	1571463	1580887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1575264_1575511_1575638_1576667_1576800_1577471_1577539_1578620_1578829_1580723
897203	contig_9027_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_156370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	433	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	152	328	204479	204655	NA	10	ATAGTGCCTGCCTTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSIPLLSPLVREKTRLGVVFWFCFHFFLPFSFFLFFKLVAPSDCQRHLRAMATCSKASGTRSQYSGNPVSCLSAIIINSISFVEETLTLILEEEIKGKKSSIEAGKDV	204327	207620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_204300_207600
897204	contig_6980_pilon	-	3523	1	Intergenic	novelGene_36053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGGTTGCAGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351189	347666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_347700_351200
897205	contig_17427_pilon	+	1205	2	Intergenic	novelGene_30403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACCCTTCTCCGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331917	368803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_367770
897206	contig_9177_pilon	-	697	5	Intergenic	novelGene_32629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3170.09435979436	427	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGTGTAAGCAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32817	25333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_25481_25584_25715_25971_26144_26285_26476_32759
897207	contig_2114_pilon	-	1885	5	Intergenic	novelGene_104223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGCCTTTATCTGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139933	136213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_136523_136910_137097_137427_137602_137803_138491_139404
897208	contig_9668_pilon	-	1945	8	Intergenic	novelGene_58132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAGAACAAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360029	282639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_282809_331981_332159_337928_338031_339302_339442_342685_342787_348322_348503_355527_355712_359136
897209	contig_15491_pilon	+	2425	6	Intergenic	novelGene_75946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.4	53	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCTTGAGTAGTTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30754	47108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_32434_37052_37203_37443_37562_38890_39042_45108_45206_46878
897211	contig_15991_pilon	-	3200	4	Intergenic	novelGene_70944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_3	115.111540110741	209	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2123	2617	128802	123001	FALSE	20	AAATAGTGTTGTCGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPITVIKTRYESGRYGYQSISTALKTIYRSEGHRGLFSGLTATLLRDAPFSGIYLMFYNQTKNIVPQDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	130924	122417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_123124_124818_124986_127319_127489_128766
897212	contig_7179_pilon	+	1354	8	Intergenic	novelGene_78170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGCGAATACTCTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057776	1065039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1058171_1058816_1058956_1060223_1060447_1061211_1061364_1061953_1062109_1062590_1062710_1062824_1062890_1064932
897213	contig_14687_pilon	+	3303	2	Intergenic	novelGene_107965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2415	2735	687447	687767	FALSE	35	GAGAATATGCACTTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKEKKGKEEKTKQRNKKTKTNKKNKCSQGCHCASAQGKGVSPKPHGTAWPEVAPKPRKQSKKQIKTVQIRTNKKKPRGSHQRVGRGQEAVPRSSGALQPPWKKER	684944	688335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_687290_687377
897214	contig_15687_pilon	+	3706	33	Intergenic	novelGene_129130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_4	152.717864356957	683	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1077	3234	59	3292	112984	186124	FALSE	20	CACAACAGTGTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRFSTIDLRAVLAELNASLLGMRVNNVYDVDNKTYLIRLQKPDFKATLLLESGIRIHTTEFEWPKNMMPSSFAMKCRKHLKSRRLVSAKQLGVDRIVDFQFGSDEAAYHLIIELYDRGNIVLTDYEYLILNILRFRTDEADDVKFAVRERYPIDHARAAEPLLTLERLTEIIASAPKGELLKRVLNPLLPYGPALIEHCLIENGFSSNVKVGEKFESKDIEKVLVCLQKAEDYMKTTLNFSGKGYIIQKRERKPSLATDKPTEDILTYEEFHPFLFSQHLQCPYIEFESFDKAVDEFYSKIEGQKIDLKALQQEKQALKKLDNVRKDHENRLEALQQAQEIDKLKGELIEMNLQIVDRAIQVVRSALANQIDWTEIGLIVKEAQAQGDPVANAIKELKLQTNHVTMLLRNPYLLSEEEDDDIDGNIGVEKNETEPPKGKKKKQKNKQLQKPQKNKPLPVDVDLSLSAYANAKKYYDHKRYAAKKTQKTVEAAEKAFKSAEKKTKQTLKEVQTVTSIQKARKVYWFEKFLWFISSENYLIIGGRDQQQNEIIVKRYLTAGDIYVHADLHGATSCVIKNPTGEPIPPRTLTEAGTMALCYSAAWDARVITSAWWVYHHQVSKTAPTGEYLTTGSFMIRGKKNFLPPSYLMMGFSFLFKVDESCVWRHRSERKVRVQDEDMETLASCTSELISEEMEQLDGGDSSSEEGKDELHETPVEIELMTQIDQEGITVQSGGDELNEDLIQEESSEDEGESEEVVKDEELVGEMKDEEEEILNYPDTTIDLSHLQSQRSLQKLASKEESSNLSDSKLQSRRHLSAKERREMKKKKLPNDSGDLEEIEGKDKEKESALHSETHQNTSKNFPAGQPVKRGQKSKMKKMKEKYKDQDEEERELIMKLLGSAGSNKEEKGKKGKKGKTKDEPVKKQPQKPRGGPRVSDSIKKETPSLEVLTPEFKDLAVDDPHDDKDEQDLDQQGNEENLFDSLTGQPHPEDILLFAIPICAPYTTMANYKYKVKLTPGVQKKGKAAKTALNSFMHSKEATAREKDLFRSVKDTDLSRNIPGKVKVSAPNLLNVKKK	112925	186538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_113043_113906_113976_114118_114222_122655_122782_125895_126045_129924_129993_131794_131882_133301_133376_134251_134323_134398_134475_134890_134954_136364_136443_136528_136738_136974_137167_137404_137469_140141_140231_151593_151698_152081_152145_157778_157892_159247_159306_159998_160058_160145_160267_161641_161922_162636_162680_162851_162902_164689_164844_182977_183056_183184_183383_184269_184303_185357_185459_185559_185604_185683_185764_186046
897215	contig_14563_pilon	+	7912	2	Intergenic	novelGene_135065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	714	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	371	712	166791	167132	FALSE	55	CTTATGATCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPTSTTLYRSFRELSLGIHISVKGKKNIILCIEKDKNRLNAMIYTKISYTNHSLVDQEIYVFMNNSPKRRSLCITPEQFTTISSSSLSCNLLSSLLKENSHYLPARHFSSIP	161671	174332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_162039_166787
897216	contig_7627_pilon	+	1023	2	Intergenic	novelGene_175563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	46	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGCTATGTATTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164453	165997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_164522_165042
897217	contig_9833_pilon	-	4556	4	Intergenic	novelGene_68501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	65	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	55	TAAAAAAATTGTTCAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	212441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
897218	contig_57_pilon	+	3160	25	Intergenic	novelGene_44891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_18	220.083124289942	147	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	126	2249	66895	113594	TRUE	65	AGAAAAAGAAAAAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLFVFRMPWGCIFCQC	66769	129544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_113549_113649_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
897219	contig_5988_pilon	+	2744	13	Intergenic	novelGene_16038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_1	31.3656747983453	241	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	439	2085	954094	1015967	FALSE	10	CCTTGTTTTCTGTTACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKQSQKDSSGFIFDLQSNIVLAQGGTFENMKEKINAVRAIVPNKSNNEIILVLQHFDNCVDKTVQAFMEGSASEVLKEWTVTGKKKNKKKKSKPKPAAEASNSIPDSSKLASIQEEQSAPSSEKGGINGYHVNGAINDTESVDSFSEGLETLSVDARELEDPEPATPDIQTLDRTGSTLENGISDFEPKSLAMHSTQNSQQSRNAAKSLSRPTTGAQFSNLGMEDVPLSSTNKKLGSNIEKSVKDLQRCTVSLARYRVVVKEEMDASIKKMKQAFAELQSCLMDREVALLAEMDKVKAEAMEILLSRQKKAELLKKMTDVAVRMSEEQLVELRADIKHFVSERKYDEDLGRVARFTCDVETLKKSIDSFGQVSHPKNSYSTRSRCSSVTSVSLSSPSDASAAAASTCASAPSLTSANKKISAPGEAPAAITSSSGRPYQHHREVFPGNRRGGQGYRPQGQKSNDPTNQGRHDGVGRYRNSSWYSSGSRYQNASPQASGNTSEQGQAHSSGTSGTGTNMEPSLPKPSFKKGLPQRKPRTSQAEAVNS	877017	1016626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_877211_953848_954119_981234_981315_984813_984923_986634_986685_989510_989779_993269_993450_997210_997347_1005695_1005755_1009777_1009888_1012736_1012840_1014387_1014603_1015655
897220	contig_9727_pilon	+	1943	2	Intergenic	novelGene_86345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	73	300	431604	431831	TRUE	25	AGGCACCCACTTATGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPEHHSQYEPGFSKKCAFDQSSGMDENKQRHVKCSERSSYEVILIFLSGFCLSLPLKVNTLGTIIDSSAFVLSELMVWTAIAQIPPAHPEMYTLTHLH	431531	433628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_432583_432736
897221	contig_11933_pilon	-	3742	15	Intergenic	novelGene_107256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_14	58.4622676150513	504	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	193	2016	269902	116206	FALSE	20	TAAGGGCATCATTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLSDTLKKLKITAVDRTEDSLEGCLDCLLQALAQNNMETSENIQGSGTLQLFANLLTPQSSCTAKVANIIAEVAKNEFMRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSHEGRSAVDQAGGAQIVVDHLRSLCGRTDPANEKLLTVFCGMLMNYSNENDSLQAQLINMGVIPTLVKLLGIHCQNAALTEMCLVAFGNLAELESSKEQFASTNIAEELVKLFKKQIEHDKREMIFEVLAPLAENDAIKLQLVEAGLVECLLEIVEQKVDSEKEDDIAELKTASDLMVLLLLGDESMQKLFEGGKGNVFQKVLSWLPSNNHQLQLAGALAIANFARNDGNCIHMVDSGIVEKLMDLLDRHVEDGNVTVQHAALSALRNLAIPVINKAKMLSAGVTDAVLKFLKSEMPPVQFKLLGTLRMLIDAQAEAAEQLGKNVKLVERLVEWCEAKDHAGVMGESNRLLSALIRHSKSKDVIKTIVQSGGIKHLVTMATSEHVIMQNEALVALALIAALELGTAEKDLESAKLVQILHRLLADERSAPEIKYNSMVLICAVMGSESLHKEVQDLAFLDVISKLRSHENKSVAQQASLTEQRLTVES	270094	114479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_116334_121189_121319_126412_126540_135963_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158485_162881_163011_176518_176666_207803_207930_214256_214380_245558_245667_269898
897222	contig_7728_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_64724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGGGCTCTGGGGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752330	753723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752300_753700
897223	contig_4105_pilon	-	2214	15	Intergenic	novelGene_21500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	792.797385135415	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	659	817	109032	105968	TRUE	5	TCTTTTATGTGTCCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDQTESKASEYS	121924	99390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_99514_99684_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106001_108802_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847
897224	contig_10609_pilon	-	7771	2	Intergenic	novelGene_123958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	796	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCATGCTACCCAGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515395	507576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_514443_514490
897225	contig_2069_pilon	+	6896	5	Intergenic	novelGene_23200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	6407	6706	109103	109402	TRUE	15	TTGATCAGGTCCCCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAWISYWGFRISELQGRVGQVTGRSLRAGSCTAWSRVRGTPGSHIQKSPFWDRGRCRVTCLAPALRTQRAQQVPRCISTASSKRGWSSGTTLFFMEML	92616	111935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_94084_94149_98025_102635_103696_109098_109511_111853
897226	contig_12119_pilon	+	7622	7	Intergenic	novelGene_88655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	770	junction_1	277.49859859506	618	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2124	6375	267	6641	319835	383934	FALSE	40	TGACAAGTAGACATCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKRRMSDLSVIGHPIDSESKEEEPCSEETDPEHDLIAEILPELIEIDIYHSEEDEEEDEDCANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDQEAAEARRGQFESVAPSQKISDSSESDSHQFVIAETELSTVVQLNESKESESLEITWKPETYSETPEHFSSGEHGVFPTVQFHEGEATEGPDSVTERGLELDNLVPNDTESVPLFPEESSGNDAIDQESQKIVFSRPTEVTFSEEAEKSTSITYTPSIVPSSVSANVSEEESVTPTGHPQPEDAFSTIESWVEVTPRHVGELLGTPSSIPMPEGSGEGEEDKNKMFTVVADLSQRNTTNTQGTLDTSKIMITESLFDVPVTTSYSVSEQPSAEIVPIKLISETDTSEGVFSTSLEEKKRKDEEEETPGTASTIEKDSPTQRSDQLILPSELESSNETTFSDSASTTGKSITSLTTSTQSEREMTSFTLFTETNVLGNLGAQVTEHSTSHQAEVQKGLTTVPGSPVSLFTEQSSGDAAVHPETTTVSSFSLNLESDIQTKKEAASTLSSLVENTFPFDPTEFILSTAVDRQVAEIMSQTSKENLISEISGEPSHGAEIKGFPTDFPLEEDFSGEFREYLTVSPPITKEETKIMEGSGDTTFMDTETSPSAVPTSDHVTRMPDSERPSNTMVSTSAFPWEEFTASAEGSGEQLVSISSSVDQVLPSVMGKVSGTESPFTDQGLGEMGAITEADKRLTILPTAEAEGMESPTEKGDVMVGGTVSVDFPQTLEPATLWSSQEVNLVRQEIENKTTSEEKIKEQMSFESPQRSVTPEQTIFDSQMSSETELLTTDYSILTTKKTYSYANEMEEEVIPLLHMSTPDPDTKGLEGLEPYTAVPEVTEKSHVFLATGSVTESVPSESIVTDSSIKEEESIKPFPKDVTPTIKESDTDLLLSGLGSGEEVLPTLATVSVNFTEMEQIISTLHPQTSRVESLETRVSSDETEDYEGMENVTNEVIPLISKTASTPKSSQTTSSSTMMGISSDTRAEGPTVAPLSFPTDAEHPQNQTLSWAEELQTTRAQTVTEQVSNKNSSTAETKETVTSSGVLARTYGLEMAKGFVTSPPKPSELFYEHSGEGSGELGIVDLVHTSETTQATRQGSTTFVSNRFLEKHPEASSAKAVTDDGFPTVSVVLSLHSEQNESSPQPTSAPSTTMLYERSTEGATGSFSDSFRGFEDSTLKPDRRKATENIIIDLDKEDKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDIDHTKPVYEDILGMQTDTDPEVQAGPHGSNEESSQVQEEYGAAVNLSLTEEKLEGSGGDTLLASYTQATHSESMTSEDRSQLDHMGFIFTTGIPIPSTETELDISLPTAASLPIPSQSTTVNPDIEEPKTEAKTLDDIFESSTLSDGQAIADQSEIISTLGHLERTQEEYEEKKYVGPSFQPEFSSGAEEALIDHTPYVSIGTIHLMAQRLTEAPTVMEGSNPPGYTDTTLAPSAFAKLSSQTPSSLVTVYLGSRASEHTEDLEPSALPGTDVGATQVSSGDSAKEAYENTEATFKPSLEKYFHITEPPSLSPNTELELSEDESKPKSLKEMEASPSELIAEERFEVHQKSRNKTDVQLSGETIKEFLSVRTPEAGTVVTAAGEIKLEGASQWPHSTSAPAIHGVKTGVVPQPSPQTSEKPTIPSSLEINPETQAALIRGEYSTVTASEQQVSAIILDSNTQATVSTAELNTELATPSFSLLGPSNESDFLIGINEESVEGTAVYLPGKATMFINLFLNLETVAWS	306480	384915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_378604
897227	contig_7840_pilon	+	2023	3	Intergenic	novelGene_68961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	291	698	304368	304775	FALSE	35	GTAGAAGATTTGCTCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	130636	306100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183134_304250
897228	contig_12901_pilon	-	2403	3	Intergenic	novelGene_142979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTATCATTAAATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150547	62140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_-_62259_122687_122922_148496
897229	contig_7119_pilon	+	4170	19	Intergenic	novelGene_41017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	79.9499843652267	530	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	8	2116	198227	225216	TRUE	15	CATTGAGCCTCAGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAASSASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKYANMWLEYYNLERAHGDTQHCRKALHRAVQCTSDYPEHVCEVLLTMERTEGTLEDWDIAVQKTETRLARVNEQRIKAAEKEAALAQQEEEKAEHRKKARAEKKALKKKKKIRGGDKHRADEDDEKEWGDDEEEQPSKRRRVENSVPPADEARGIGMEAELAGKRAPVHVDPPCQAEGKGCLPEEGHGQGAP	198219	230244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217142_217268_217328_218346_218457_221063_221177_222163_222241_223325_223495_225037_225494_226228_226382_227308_227500_228811
897230	contig_5779_pilon	+	2456	3	Intergenic	novelGene_106495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1551	1880	264842	279192	FALSE	65	AGGAAAACTCAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLSTLFCLCVCFGSCSSLLSLLFPIPTLAPHIIISPLLPAYLHCLLNITLPRSTGTAHCNLPCTDSQSALSALVHATNNPSQQLPFSWTCPAVPYLSDRPCPLEKR	191529	279768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_192798_264559_264850_278870
897231	contig_7870_pilon	-	2325	6	Intergenic	novelGene_109070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1349	junction_1	911.709734509838	399	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	84	620	824153	705680	FALSE	60	CTAAAAATAACAACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSTNSDTSVEPLSFTCQGIGAVQMRVKNANSHHDRLSQSKSMILTDIGKAPEPISRHRRNHSQHVLKDIIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWATSWIVLSSRKIEFYKESKQQALSNMKTGNKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQVRILHIFNLFLLSLNLNSLG	854094	703974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_705833_738946_739035_748845_748908_762132_762202_823988_824168_854025
897232	contig_12429_pilon	+	5717	1	Intergenic	novelGene_136198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACACCCACTCCTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5753	11470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_5800_11500
897233	contig_14142_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_120548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2	463	433343	432882	NA	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	433344	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_432400_433300
897234	contig_7593_pilon	+	2332	2	Intergenic	novelGene_127346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0	235	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	307	1248	650202	651143	FALSE	20	TCTCTGTGGCATAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGGKRKFDEHEDGLEGKIVSPSDGPSKVSYTLQRQTIFNISLMKLYNHRPLTEPSLQKTVLINNMLRRIQEELKQEGSLRPMFAPSSQPSDSLSDSYRETPPALSHPASPPTHPCDLGSTTPLEACLTPASLLEDDDDTFCTTQATPVVPTKLSPPALLPEKDSFSSALDEIEELCPTSTSTEATAATTDSLKGSSSEPSAPKPEGLPEGRTDDPKLMDSLPGNFEITTSTGFLTDLTLDDILFADIDTSMYDFDPCTSASGTASKMAPVSADDLLKTLAPYSSQPVAPSQPFKMDLTELDHIMEVLVGS	629828	652227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_630131_650197
897235	contig_10176_pilon	-	4707	8	Intergenic	novelGene_72694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_7	208.24690996556	544	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	177	1205	225371	214602	FALSE	20	ATTCCTTTTCATCTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRVCWLVRQDSRQQRIRLPHLKAVVIGRSPETKITDKKCSRRQVQLKAECNKGYVKVKQVGINPTSIDSVIIGKDQEVKLQPGQVLHMVNELYPYIVEFEEETESPGLETHRKRKRSGDSDSIERDVAQEGEPGTGLDPRSSPTQCSVPAKKGEDASTKKESLGHWSQGLKISMQDPKMQVYKDEQVVVIKDKYPKARHHWLVLPWAPISSLKAVTWEHLELLKHMHTVGEEVIADCAGSSKLRFRLGYHAIPSMSHVHLHVISQDFDSPCLKNKKHWNSFNTEYFLESQAVIQMVQEAGRVTVPDGMPELLKLPLRCHECQQLLPSIPQLKEHLRKHWPK	232705	211099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_214757_215722_215827_221287_221515_222316_222377_223007_223311_223831_223879_225238_225376_232533
897236	contig_11110_pilon	-	3055	15	Intergenic	novelGene_177256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_9	14.9360883330903	91	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2487	568	3054	79339	25092	FALSE	30	GTAAGTCCACTACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSKDKLGNTQSPENPSDDASVEEEKQGKSNRKVAKAAPQVSPQEIEPETTERKLDSTHPKAQTKSQSSVAHQKSKKANEGKENDFDGEEELMEVYQLQAAEEMAKEIKKKIRKKLKEQLTYFPSDTSLHDDKLSSEKKKKKKKKIPVQSKAETSTLTVSELERDKVEDEQKESPVGAVTSDSHQDDKINSIEQNVEDNMEDDKKSKPKKAKKKAKAVSDDNEGSDGDGVHEITSRDSPVYPRCLLDDDLVLGVYIHRTDRLKSDFMISHPMVKIHVVDENTGQYVKKDDSERPVSSYYEKESVDYILPIMTQPYDFKQLKSRLPEWEEQIIFNENFPYLLRDFDESPKVILFFEILDFLSMDEIRNNSEVQNQECGFRKIAWAFLKLLGANGNVNINSKLRLQLYYPPTKPRSQSNVVEIFDWWSKCPRNRYPSTLYVTVRGLKVPDCIRPSYRSMVALQEEKGKPVYCERHCESSPIDLEPGLEDSKEVVKWKRLPGQACRIPNKHLFSLNAGERGCFCLAFSHNGRILAAACASRDGYPIILYEVPSGRFMRELCGHLNIIYDLCWSNDDRYILTASSDGTARIWKNEINNTSTFRVLPHPSFVYTAKFHPAVKELVVTGCYDSVIRIWKVDMREEPAILIRQFDTHKSFINSLCFDTEGHHMYSGDCTGVIVVWNTYVKVNDVQHSVRHWSVNKEIKESEFKGIPVSYLEVHPNGKRLLIHTKDSTLRIMDLRILAARKFVGAANYREKIHSTLTPCGTFLFAGSEDGIVYVWNPETGEQVAMYSDLPFKSPIRDISYHPLEHMVAFCAFGQNEPILLYIYDFH	84416	25090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_25232_26909_27041_29459_29579_32578_32686_35214_35445_42477_42602_52204_52338_55589_55743_57097_57284_63981_64078_66406_66600_68372_68593_76741_76930_78872_79430_83939
897237	contig_7979_pilon	+	7117	10	Intergenic	novelGene_125533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038517	1081154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1043268_1047023_1047083_1047718_1048889_1050534_1050648_1061525_1061614_1065029_1065230_1077635_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080766
897238	contig_19061_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_173516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	1356	1943	74049	73462	NA	65	AAAGAAAAGGAAATCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKVLASRIQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFSIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISVDAEKAFDKVPHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYVKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYLENPKDSMKNLLELIERFSRVAG	75404	73410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_73400_75400
897239	SIRV6	+	812	8	NNC	SIRV6A	novel	1537	10	NA	NA	162	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	162	656	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1465	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11034
897240	contig_1337_pilon	-	1934	7	Intergenic	novelGene_84259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_6	67.9716035480177	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	4	876	655231	563456	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMAAPQTQGAAAGGEQGRDGSHSGVGDVGFEDSKDYILEPLSLPESPGGITTLERSPTVPCIFCEEHFPVAEQDKLLKHMIIEHKIVIADVKLVADFQRYVLYWRKRFTEQPITDFCSVIRINSTAPPEEQDNYFLLCDVLPEDRLLREELQKQRLKEILEQQQQERNDTNFYGICMFCNVECFGNRSVLLNHMAREHAFNIGLPDNIVNCDEFLYTLQKKLDNLQCLYCEKTFRDKNTLKDHMRKKQHRKINPKNQEYDRFYVINYLVSLSLHNLKSDCRSANRILLRAN	655234	562397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_563661_564516_564628_565297_565390_583671_583755_584028_584118_593253_593456_655140
897241	contig_3151_pilon	+	5608	35	Intergenic	novelGene_139176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	139.725967596439	471	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1722	5169	247	5415	42223	246022	FALSE	30	CCAAATTTGTGTGTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMTVGIFANCTFCLKVKYLPRQQKKKLQTDIKENGGNFSFSLHPQCTHIILDNADVLSQYQMKSIQEKHIHIVNPDFIWNSVKERRLLDVKNYNLNNSLEISLPPGQKESSSDVETDDPSLVNSTEKENIVEFAKFYTDNVEIPHFSQEFEVAKYDTLEKIETEGRKEIVVVEMQCFQEHWDCPFLITACFLLADGIETRRQFSGKKTSADASEYYENYIEELKKQGFLLRENFTPEATQLASEKLQALLLEEVINSDTLSQEVSDLVEMIWAETLGHLEHTLLKPVNKISLNDVSKAEGILLLVKAALKNGETAEQLQKMLTEFYRVIPHKGPTTEEVNLRLLSKKEDLCQLIRDMVNVCESNLYKPNPPSLAKYRALRCKIEHVEQNTEEFFSVMKEVLQNNHSRSPVNILQIYRVGRVNEATEFLSKLGNVKSLLHGSPARNIVGILSRGLLLPKVVEDHGVKRTDVGNLGSGIYFSDSLRTSIKYSHPGEIDGTRLLVICNVALGKCMDLYKKDFSLTEAPPGYDSVHGVSQTATVITDFEDDEFVVYKTDQIKMNYIIKFCIPGDQIKDFHPCGNTELEEYVPEFSSFPKAEDYQLPDTKPFSNIKAGLQDTSGNLVPLEDVHIKGRVIDVVAQVIVFQTYTNQSHVPIEAKYIFPLDDKAAVCGFEAFINGKHIVGEVKEKEEAHQEYQEAISQGHGAYLMDQDAPEVFTVSVGNLPPKAKVLIKITYVTELGVQGTAAVFFMPATVAPWQQDKALNENVQDTVEKICIKEIGTKQSFSLSMYIEMPYVIEFISSDTHKLKQKHTDCKAVISTVEGSSLDSNGFSLHIGLSDAYLPRMWVEKYPDKESEACMLVFQPDFNITLPETAKRSEVIICLDCSNSMKGEAFLQAKKIALYALSLVDKNQKINIVKFGTSYKELFSYPKYITSNEMPTEFIMAASPTMGNTDFWKTLRYLNLLYPSQGLRNILLISDGHIQNESLTFQLVKRNVQHTRLFTCGTGSTANHHILRTLSQCGAGVFEYFNSKSKHSWKTQIEDQMTRLHSPSCHSVSVKWQQLSTNLPEPLQAPAWVQSLFHNDRLLVYGFIPHCTQATLCALIQEKEFCTMVSTTELQKTTGTMIHKLTARALVRDFEYGILHENETHHQMKKQILKSLIIKISKENSLLTQFTSFVAVEKRDENESPFPNIPNILELIAKEDVDFLPYITWQEEQSGASMTQIISASSEWNEDLQHKSLTERKVKSPKPEVSEDVEVFNLATQLPVQPLILNSECGLVAKPLDLSWMNSLKKKKIKAQFRKSSLHTKNDVFKPSLSLGAAPILPGASHVDSGFLSPPVSPQNSLFGSPGSLKQFGPSKYDQDLETGSCTDVSLKLDFPSRLPPQNPPFRSPACSPFSAASFGSKQIDRSKIYQDREICGTGISLGTYSTPRPRLFLSLPRLPPPVSAVGFSVPSPLHFQNSLDPLSANYKQPIDLLGFASSESGVSFPLNISAGTALSDPPLHDLQTASSHESSSEMKSNERSVLQASRFSKRVAKSDETRSDFTSSFQAQNDEDDKVCKQSWRNFVPWTKLFSLQTEGGFWKLTPELGFILNLNTNFLNSFLEQKGIQSLGIKGQECLLNLIATLLVLQFLCTKFKEEGIVFKSLMKLDDTSISRNIPWAIEGIKKASEWVRRTEGQYPSICQRLELGKDWDSATKQILGIQPIDTTSPLYGVLNYSQG	39896	246215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_40028_42107_42228_95053_95187_97004_97207_102805_102873_103776_103853_104592_104707_107291_107442_120607_120746_122029_122204_125852_126014_127305_127444_135600_135697_140405_140590_140797_140955_142599_142725_147563_147696_148475_148563_166908_167074_168118_168166_168311_168391_178459_178598_194676_194873_195999_196068_196685_196874_199712_199813_200387_200559_201049_201131_202469_202551_203650_203747_206056_206180_222022_223091_224785_224886_234561_234695_245826
897242	contig_10263_pilon	-	4332	21	Intergenic	novelGene_135852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_12	402.492409866323	31	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1426	4278	54	4331	988314	893238	FALSE	25	CGGGACGATTTCAGGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRKLTKSERQRFKEEAEMLKGLQHPNIVRFYDSWESTVKGKKCIVLVTELMTSGTLKTYLKRFKVMKIKVLRSWCRQILKGLQFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDLGLATLKRASFAKSVIGTPEFMAPEMYEEKYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRRVTSGVKPASFDKVAIPEVKEIIEGCIRQNKDERYSIKDLLNHAFFQEETGVRVELAEEDDGEKIAIKLWLRIEDIKKLKGKYKDNEAIEFSFDLERDVPEDVAQEMVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKRKQEESSLKQQVEQQSSASQVGIKQLPSTSSAGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQLQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQAHSTGTIPGHTASVVQAQSQPHGVYPPSSVAQGQSQGQPTSSSLTGIPSSQPLQHPQQPQGIQQTAPPQQIVQYSLPQTSASSEATTTQPVSQPQAPQVLPQVSAGKQGFPSRLPPQYPGDSNIAPSSNAVSVCIPSTVLSPPMPTEALATPGYFPTVVQPYVESNILVPVGGIGGQVQMPQPAVSLAQQAPSASSQQAVLESTQGVSQVVPPEPIPTAQPQPIQPTTLVSSIDSAHSDVASGMSDGNENVPSSSGRHEGRTTKRHYRKSVRSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGDRVVECQLETHNRKMVTFRFDLDGDNPEEIAAIMVNNDFILAIERESFVDQVREIIEKADEMLSEDVTVEPEGDQGLESLQGKDDYGFSGSQKLEGQFKQPTPVSSMPQQIGIPTSSLTQVVHSAGRRFIVSPVPESRLRESKVFTNEISDTVAATTSHGPEMNLSHSASSLSLQQAFSELKHAQMTEGPSTAPPNFSHTGPVFPVVPPPMSSIAGVTTTGAATLSVSVPATSIPLTDISTSVIQSQVTVPTEKGVTGIVITSGGLPIPSVSEPPILTSVVSSITVPTVVSISTTSQSVLTPTCGSIVSSTSTLPSITVSTASASAVGSTVVPGAKPPTVLSQQAAGSTTGVATLTSVSTTTPFPSIVSQPFLQLSSSSSASTLAETVVVSAHSLDKTSHSSAAGLALSLSAPSSSSSPGAGVSSFVTQPGGVHPLVIPSAIASTPILPQAAGPMSTPLLPQVPSIPPLVQPVASVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHAHCPEIDVDAQPKAGIDDIKTLEEKLRSLFSEHSSSGTQHASASLETSLVVETTVMPGISTTAVAPSKLMTSTTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVLPVGTELPAGTPPSEQPPPLPGASLTQSQQPLEDLHAQLRRALSPETTAVTFAVGLVSVVAPTAVSEAGAHPQKDVSQVTEAPVLATSSGAGVFK	988367	893236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_893297_897062_897124_897769_897854_899261_899346_900412_901819_902513_902637_902770_902829_903040_903215_903551_903669_904814_904978_905074_905173_905859_906142_908477_908628_914657_914742_923075_923264_924533_924871_926101_926322_927974_928064_965321_965480_967567_967789_988192
897243	contig_10377_pilon	+	5906	10	Intergenic	novelGene_115399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	730.192989879481	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	377	988	227522	255047	TRUE	25	CTTTTAAGAAGTCTGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	219506	261743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_219621_226958_227187_227487_227752_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_261069_261146
897244	contig_1107_pilon	-	691	3	Intergenic	novelGene_126565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	5.5	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511671	489810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_490147_496762_496910_511463
897245	contig_10324_pilon	-	3699	12	Intergenic	novelGene_7796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	50	343	142286	141472	TRUE	35	TAGAAGGCAGAGGGTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKHTGGRSRENQQTGVMQLQVKEHQGLLSDSVPSCILLSQTQGTHSLLRGGPLLVPAPGHVWERKWVMDTFHQRPRDRRRLQADLNAVDRLSVLHSSCLVPCRALRHLGPPLV	142335	131397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_131442_131544_131655_132017_132218_132651_132820_133235_133362_133455_133630_133723_133879_134039_134097_137596_137964_138885_139013_139643_141737_142257
897246	contig_6199_pilon	+	3356	1	Intergenic	novelGene_126348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGCTGGATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89792	93148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_89800_93100
897247	contig_12677_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_110686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_700
897248	contig_15888_pilon	-	1433	8	Intergenic	novelGene_84454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_7	1285.85843636356	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	56	865	259726	252475	TRUE	20	AGTGGGGGACTGCCAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEHANEGENIVLKCKSDSFPPVTNWVWFKKTNAEEQVIMNGSQSRFLVSSSETRSELHITNLDMSTDPGTYVCNGTNAQGTSHAAVTLRVRSRLAALWPFLGIVAEVLVLVTIIFIYEKRWKPEEVLDDEDMGSTPLKSSAHHVNDKDKHIRQRNAN	259781	251738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253680_253928_254066_254198_254282_254527_254685_259659
897249	contig_1146_pilon	-	2274	6	Intergenic	novelGene_84803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_5	52.089922249894	257	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	220	2067	274691	265659	TRUE	45	AGAGAAGAAGGCGATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYEKFCEKSLTRIQETSLSRESFLPAQSESISLIRFHGVAVLSPLLDIERRKEMQQEKQKALDIEARKHVNRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDHWETETIYSNSEVTNLNVPVTFPNSLPSPTEHSTSTKLEKITGVLPLDNEDQFKSNGIDVAGDSEGFSSLKQCDNSGITHAENEASPKTSSVTPQETLISDSLFPKNEEQDPSLLEEVSPDPYIMSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSRPSSACHILINNPVNACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQHLLEKKIP	279876	261869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_261899_262442_262571_265608_267237_270972_271102_274550_274707_279672
897250	contig_13295_pilon	-	4263	2	Intergenic	novelGene_31222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	661	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76036	70996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_73067_73843
897251	contig_12503_pilon	+	9436	8	Intergenic	novelGene_143828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_7	177.735758923183	1160	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1835	5508	115	5622	146337	176685	FALSE	20	TTTAAGAGACGCCTGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFYSCFIQVTFLGFNEETDAAHIQDLAAVSLELPDLLNSLHFCSLNENEIICMKDIKKSSEINNGPLNQSRHSGMLCVMRVSPTLPRLRIDFIFSLLSKYATGIRYALETYLHQKGQLETTNEDDDDTNQSVSSIEDDFVTAFEHLEEEETSKPYNDGINISALRNQCDAASQTVSSHHLETHDLKILVSSGQQKSLAKPTTSLINILGHKEPPSVKAPVTTSVSEPWIQRSFYRSTNAPDKGSEIQETFFSSSPAYSSESECSSPSPVIFLDEEGYQKSLKAKLELPKIPVMKDDIEDSDSEVSEFFDSFDQFDELEQNLETPCLFIKDPAIGMPSQKKGHKHEKSCSVTTTMNPQKFKFDRPALPANVRKPTPRKPESPYSNPCDAPDSPRPVQASGEDSGLFSPIRSSAFSPLGGCTPAECFCQTHAGGDRVHENHDSIYYTYEDYANSVSCKVLDSVLHTQHSNALSNIDSIKGGENKTVAVKHGDLDQNNKSKNKSLMIKDSIQKFAADLVEQSFGGAFRDLQKGVSSCTSALCHLAIKLTSSVFQMAFNELRRQRAFSLKERAISGLANFLVSEALSNALKDLQYVKKQIFTNTVARFAADLAEELVFEGIMEVCQFSYPPTPAFPQRWSFDSEDKVVKSYAKDLSESVIQEAFIELSQVDVTFTTKAAVSVSTDNIKYVSAENVVPSTQTFTFSPPFNNQAIMVTKPIQEYKKEYTVQQALFCTSGIVTSIPVPLAGSALLPYHISSDIYQAKSHLSSDGSISSGDSSQACVTTKSKEKEVACLRNTCLPSGSEHNLSNQNDFKPSHDDIEMQNSSELTSDPAIISSFSAAMVHTIVNETLESVTSFRVTKTVDEHTDYLTKTVEGKSPPFYYDRATLQQNDASSKDMFADQLSKSIIKHSIDKSKSVIINIDKNVVNREGLPVPGEESRLTLEKCPKFLDTQVHYALSVGKDCAVESKGPVAHEFSLETPASCPVTTVQKSDLKELAKEKPVKRHSLNNTAFEPLSFGQENLFPHSHTFTSTVLTCVDGLHVEDKQKIRDGNVIPETPPSTPLVPSQAGSEWDIKKLTKKLKGELAKEFAPATPPSTPHNPSVGSLSENEQNTIEKEEFMLKLMRSLSEEVESSEGEEHPEVDVKSEHSGKKVQFAEGLATHIISLATEMAASHLDNKVIQEPKVKNPYLNVQSQTNISPPFLNCSDENLQALWNFAGDVAAEVITEAEKIAKLKSCVLSRQRKNSCYADGFYFKRADWHGRSEEKLDIEAVAHPREVDPYSLSLPSSACMSGLTYKYPSCESVTDEYAGHIIQILKQEGGNSELIMDQYANRLAYRSVKSGLQEAAKTAKTKCSSKTFPAQGSPEKTKNELLTFLTKEHHQEVDKKRRSKRKGGYFCKNQSCERTQDTYRNEYSELYSFSASLAHSITRDVKKELTASTVGLPKSLTDSCLYEKSECDEDPESHTEPEFPKPLQPSLQNHRFYHSIGSLNEYGCGENVVQTVEQYAKKVVDDMLELSLESAALQVSETTKSADRITYAEKLSPLISQPCRYCNLKELHDCTGSASQHFFRQDTVASSKLVSNSKYSNIYQKSRIFHLDVPQIHVNLDKKTVLAEKVVAEAIEKAERELSNTSLAADSGIGQDGITFAESLTAEIMTSAMTNVGLAVSSSKEKDDFQSTESFGSQQLNLSIGEDSTGSWSNLSFEDEHQDESSSFHHLSESDEPDDEDEEHEDDVEGLGQDGKTLLITNIDMEPCTVDPQLRIILQWLVASEAEVAELCFHDSAKEEFILLSKRLQEKGWKVGALLQAVLKYYEVTEKTSAEGRSQSLFDWLLENA	146222	180499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_146412_147874_148010_149571_149837_150416_154945_163947_164104_169088_169136_172705_172867_176544
897252	contig_5779_pilon	+	6957	35	Intergenic	novelGene_106452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	668	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	5007	5384	178758	184781	TRUE	10	AGCTAGCTGGCGCCCGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGLGYEETGRSCREMGKEEGFCTTKYFTTLLLRAVALKFNTRPGSAIKRGKKKTKDSDSLDFFKWENRVIPKTFLLQTSPFFNFFHLSYNLFASSESTSQVERSRERLLCQLGISALDFPMK	105464	358776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_107817_108774_108910_111754_111854_113169_113289_125878_125961_126872_126948_127353_127536_129209_129385_132104_132224_156802_156956_163901_164529_164893_165044_165624_165809_166002_166195_168165_168308_171096_171225_177329_177402_178737_178848_181057_181201_183539_183659_184755_184822_186319_186494_192963_193120_193833_193935_195522_195632_195921_195981_197652_197805_197995_198073_225515_225626_226484_226602_227920_228045_232245_232317_349588_349632_357794_357867_358608
897253	contig_5684_pilon	+	1672	3	Intergenic	novelGene_81034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	126	545	403659	441865	TRUE	75	GATAGTAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403533	443563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441975_442545
897254	contig_9696_pilon	+	2625	9	Intergenic	novelGene_68802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAGTTATGTAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363604	373862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_363754_364956_365114_365653_365816_366961_367549_368287_368413_370122_370238_371009_371178_372581_372804_372922
897255	contig_2854_pilon	+	2456	2	Intergenic	novelGene_120811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_1	0	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1661	2083	84576	86814	FALSE	90	TAAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDDPLGRSGPRLEEFLRKEVFLRDMQPLLRALPDVGVFDPSFRVPSIQAASTSHQPPARIQGALPSHWRPQQPPFPLLPSCQQNLPVPAQRSSAETNELREALLKIFPDSEQRLKIDQILVAHPYMKDLNALSAMVLD	82915	87187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_84650_86465
897256	contig_11173_pilon	+	2782	13	Intergenic	novelGene_156897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_12	288.569315763128	348	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	29	1594	430220	455686	FALSE	70	TTTTCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSEGMKFKFHSGEKVLCFEPDPTKARVLYDAKIVDVIVGKDEKGRKIPEYLIHFNGWNRSWDRWAAEDHVLRDTDENRRLQRKLARKAVARLRKGRKKKRCRLPGVDSVLRSPSVEEKDENAENSISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVLSWKLVPDNFPPGDQPPPPSYIYGSQHLLRLFVKLPEILGKMSFSEKNLKALLKHFDLFLRFLAEYHDDFFPESAYVAACEAHYSTKNPRAMY	430191	456874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430322_431765_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936_450047_452961_453062_453732_453818_455586
897257	contig_7898_pilon	+	3002	4	Intergenic	novelGene_47593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	280	660	500642	502551	TRUE	65	GCAGGAAAAAGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESHGPLTQTETVSSHSWCFSLDKLGCRMFHPHESGIWCHPVYAGHIPYLLFSDIQPSPFHPSAHLRNRHPQPLACDPSGPASCLMEEVLGKEHKEKRLHSLTTLPPYQEPAIPRVPPLSITTFKS	500231	592321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_500315_500445_500735_502263_504479_591906
897258	contig_4803_pilon	+	2222	12	Intergenic	novelGene_150722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1657	2025	51325	59986	TRUE	25	TTAGAAGGTGATCCACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYLRKCTAIFIPFQMAYSVWIQLVQLLLMVSFLFSCHLVCQMLQLHQQQHSFRHQKLYPVMQSLALLTSLLSAAHLSWELLFYHEHACFPCLLYAWVSSLALCVPLALFLEFSSHEPQMA	46804	119641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48120_50055_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58574_59983_60023_66817_66877_101679_101754_119613
897259	contig_9366_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_166290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGAAAAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1090536	1092331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1090500_1092300
897260	contig_8058_pilon	-	2194	2	Intergenic	novelGene_149510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	121	1107	62418	61432	FALSE	70	GAAAAAAAAGAAAATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75160	60344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_75089
897261	contig_20527_pilon	+	1839	5	Intergenic	novelGene_138590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1209.9168101568	24	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	41	643	13547	27453	FALSE	20	GGGCAACATTTGTGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSSEGEDVSCGRFMGNVTKRPCIRRQNAGERIRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13506	28649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24909_25023_25434_25614_26238_26346_27308
897262	contig_12964_pilon	-	884	2	Intergenic	novelGene_131704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGACCAAGAATGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556627	555693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555769_555818
897264	contig_13740_pilon	-	1538	2	Intergenic	novelGene_34721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCAGATAGCAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165415	163695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_164845_165026
897265	contig_2541_pilon	+	5650	4	Intergenic	novelGene_178710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1945	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	3486	3950	559958	560422	TRUE	20	TACCATGTTTGTTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSINAEKAFDKVQQPFMIKTLNKIVIEGKFLDIIKGIYTKPTASITLNGESLKAFPLRTGTRQGCPLIPHLFSIVLEVIARAVRLEKEVKGIQIGKEEVHVSLFADNMFLYTENPEESTRKLLELTRFQQSIRIQDKHTKITWIPLHQQREL	490725	562977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2541_pilon_+_491839_492469_494288_559403_561804_562658
897266	contig_10074_pilon	-	4799	3	Intergenic	novelGene_57187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	606	1032	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACCATTGGCTCAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586287	572654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_577200_583718_583872_586186
897267	contig_8447_pilon	+	3844	14	Intergenic	novelGene_69387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	605.493822619826	29	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	52	1152	5825	44901	TRUE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDKGLTEPQIQVICRQMLEALDFLHGKKIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAKNLKTLQKRDSFIGTPYWMAPEVVMCETMKDTPYDYKADIWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKVALDKNPETRPSAAQLLEHPFVSSITSNKALRELVAEAKAEVMEEIEDGRDEGEEEDSGDVTSPLGNHTQDSSEVSQLSLNADKPLKESSSTLPTPSQPQDSVNGPCSQPSGDRSLQTTSPPDVAPGNENGLAVPAPLRKSRPVSMDARIQIAEEKQVTDWGDLGPVANRSQKASQSRPNSSALETLGDEKLANGSLEPPPRWLQAHPRATQTLAASPSPRAWTTAPPSLLTCP	5773	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70912_82807
897268	contig_10642_pilon	-	2413	2	Intergenic	novelGene_78736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1188	1547	1275977	1275618	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAGGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLDGNRLRKPSDALVVQWLSTQLLTEKFTVQTHPAGPREKDMAIYFCKDCGQENPMSQFCSVTWVCYELKSTRWHRTTTTRKSLLSCIRICILCTRVKQANCNLGVEKRRENQLL	1277164	1274697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1275202_1275255
897269	contig_2377_pilon	+	1100	9	Intergenic	novelGene_67893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	617.725464911396	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	8	739	197521	224338	FALSE	30	TAAAATGGTGTTGCAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGESGTSGGGGGTEEAFMTFYSEVKQIEKRDSVLTSKNQIERLTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIKKRFRQLSILVHPDKNQDDADRAQKAFEAVDKAYKLLLDQEQKKRALDVIQAGKEYVEHTVKERKKQLKKEGKPTNVEEDDPELFKQAVYKQTMKLFAELEIKRKEREAKEMHERKRQREEEIEAQEKAKREREWQKNFELAKFPSKHQGEEREEKSDLPETTKSKNGAA	197513	224699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197599_200792_200895_210565_210623_214766_214834_215421_215517_217152_217225_221864_221957_222879_222956_224245
897270	contig_11307_pilon	+	1358	2	Intergenic	novelGene_105237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_1	0	330	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	113	457	74141	77033	FALSE	35	ATCTGTAAGAGAAGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVCHWCSHVPFPVGKQEGDAGEITGWFPLLCSPRSLAMLALRSGLTRALAARPLAPKVCSSFATGPRQYDGTFYEFRTYYLKPSKMSEFLENIKKNIHLRTAHSELIGFWSVEFGGRVNKVFHIWKYGMSRPSQGFSTDFHSVRYNMRLSS	74028	77934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_74201_76748
897271	contig_1443_pilon	+	5145	9	Intergenic	novelGene_28375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_1	204.339178817964	911	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	24	1883	1019442	1035448	FALSE	30	TATAATTGAAGGCATCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPGGNDNYLTITGPSHPFLSGAETFHTPSLGDEEFEIPPISLDSDPSLAVSDVVGHFDDLADPSSSQDGSFSAQYGVQTLDMPVGMTHGLMEQGGGLLSGGLTMDLDHSIGTQYSANPPVTIDVPMTDMTSGLMGHSQLTTIDQSELSSQLGLSLGGGTILPPAQSPEDRLSTTPSPTSSLHEDGVEDFRRQLPSQKTVVVEAGKKQKAPKKRRKKDPNEPQKPVSAYALFFRDTQAAIKGQNPNATFGEVSKIVASMWDSLGEEQKQVYKRKTEAAKKEYLKALAAYKDNQECQATVETVELDPVPPAQTPSPPPMATVDPASPAPAPTEPPALSPSIVVNSTLSSYVANQASSGAGGQPNITKLIITKQMLPSSITMSQGGMVTVIPATVVTSRGLQLGQTSTATIQPSQQAQIVTRSVLQAAAAAAASMQLPPPRLQPPPLQQMPQPPTQQQVTILQQPPPLQAMQQPPPQKVRFNLQQQPPPLQIKIVPRPTLKMQTTLVPPTVESSPERPMNSSPEAHTVEATSPETICEMITDVVPEVESPSQMDVELVSASPVPLSPQPRCVRSGCENPPVVSKDWDNEYCSNECVVKHCRDVFLAWVASRNSNTVVFVK	1019418	1038710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_1019448_1019657_1019727_1027898_1028142_1029077_1029339_1029699_1029931_1032308_1032390_1032765_1033510_1034492_1034657_1035387
897272	contig_10297_pilon	+	5839	6	Intergenic	novelGene_112542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	60.0553078420218	661	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	543854	557159	FALSE	55	GTAAGAAATAGAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTMASGCKIGPSILNSDLANLGTECLRMLDSGADYLHLDVMDGHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEAGANMIVSGSAIMRSEDPRSVINLLRNVCSEAAQKRSLDR	543842	562300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543976_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554385_554473_557036
897273	contig_18799_pilon	+	4609	8	Intergenic	novelGene_171411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_2	42.2601273938797	792	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	36	2636	6492	74299	FALSE	25	ACAATCACTCAGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQAIHSRVKPIQLKGEHHSNIFCLAFNSGNTKVFSGGNDEQVILHDVESSETLDVFAHEDAVYGLSVSPVNDNIFASSSDDGRVLIWDIRESPHGEPFCLANYPSAFHSVMFNPVEPRLLATANSKEGVGLWDIRKPQSSLLRYGGNLSLQSAMSVRFNSNGTQLLALRRRLPPVLYDIHSRLPVFQFDNQGYFNSCTMKSCCFAGDRDQYILSGSDDFNLYMWRIPADPEAGGIGRVVNGAFMVLKGHRSIVNQVRFNPHTYMICSSGVEKIIKIWSPYKQPGCTGDLDGRIEDDSRCLYTHEEYISLVLNSGSGLSHDYANQSVQEDPRMMAFFDSLVRREIEGWSSDSDSDLSESTILQLHAGVSERSGYTDSESSASLPRSPPPTVDESADNAFHLGPLRVTTTNTVASTPPPPTCEDAASRQQRLSALRRYQDKRLLALSNESDSEENACEVELDTDLFPRPRSPSPEDESSSSSSSSSSEDEEELNERRASTRQRNAMRRRQKTPREERPSAPTKSTSTYIGEDNYDYPQIKVDDLSSSPASSPERSTSTLEIQPSRASPTSDIESVERKIYKAYKWLRYSYISYSNNKDGETSLVTGEADDGRAGTSRKDNPIPSSSKEVCLNTAVAQRNQDLPPEGRSKDAFKEGTSTRNPSNGPGHEHSSHTWAEVPEGTSQDTNNSGSVEHSFETKKLNGKALSKALSSRSEESPSPPVPKASGSTPSSGSGNCPRTQSDDNEERSLETICANHNNGRLHPRPLHPHNNGQNFGELEMMAYSSPGHSDTDHDNLSLAGTLLHRDCCGSEMASETPSAGMREDPTDPPATDSSSRGIHGHSGLKRHRVELEDGDPENSSSEKKLKT	6456	76272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_6604_8199_8237_9345_9486_11210_11341_35285_35500_53687_53755_65757_65886_72526
897274	contig_7119_pilon	-	4400	1	Intergenic	novelGene_41002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	511	846	191857	191522	NA	20	GTGAATCCTGAAGGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGDVAWESGCWGHRTLLRAVGCVPHDKELPAPCPPGILFTLPVSGRPRSSGCPSSWPQSHLHTEGLGSNVEEILLYTGWNPPSLIPSPVSDTATVLDGHWLILHVPNLS	192367	187967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_188000_192400
897275	contig_15022_pilon	+	4729	32	Intergenic	novelGene_171811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	253.994248052401	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1212	3639	529	4167	94536	121247	FALSE	40	TATAAATATATCTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSQSRGRGAPASVMTKKEEPPPSRVPRAVRVASLLSEGEELSGDDQGDEDEDDHAYKGILNSGWHTGSLSLPLPSSPLIPELPPHPMDELSGGTTPITPVIQAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDAEYLQYFDSNKDTYSKRFVPVACISRVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDAERKEWMQALQQAMAGQRSRARLSDACLLGARGPELPDHAGSLELRGFKSKLYVVVVRDKVQLYRNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSAESELEKEQWLEAMQGAIAEALSTLEVAERIWAVAPNRFCADCGAAQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGPGISKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNCFWAANVPPSEALQPSSSPGARRRHLEAKYREGKYRCYHPLFGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGVSCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNQTTELPRLDPVKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAVKPLQDRRAREEFSRRWCVLSDGILSYYENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPNTHSFEHTFEVYTEGERLYLFGLENAELAHEWVKCIAKAFVPPLAEELLARDFDRLGRLPYKAGLSLQRTQEGWFSLTGSELRAVFPEGPCEEALQLRKLQELSVQGDSENQVLVLVERRRTLYIQRERRLDFTGWLWAIQKAAASSGDTLSEQQLGESDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQISKTQRLLDSLRQDARSVRLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLAWLEASEIEDEEEKVSRYRELLARLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNHMNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLPILHGLGTDSYLVVKKHQSMETMMLYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGGFHDRYFILNSSCLRLYKEVRSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEIRLGSVSLIPLRGSENEMRRSVAAFAADPLSLLRNV	86837	121809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_87182_93727_93897_94520_94590_95301_95433_95600_95757_96127_96198_96524_96646_97088_97292_97889_97997_99418_99619_101475_101562_103098_103282_104471_104647_105814_105950_107887_108024_108312_108416_109291_109488_109762_109815_109924_110089_110288_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112230_113609_113724_113973_114120_118370_118454_119220_119272_119455_119520_120780_120931_121229
897276	contig_8377_pilon	-	5608	1	Intergenic	novelGene_35055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	2718	3140	96333	95911	NA	20	CCATGCCACCAGGGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFTSKTNFTQRFSSLSRVSFQMWEDGLFFFSYSGPQTMSTGNKMRARTLTSIIRGSLFLEHMSLYGYINTKLHIILNNIISLPVPLHKSLLFEILLLRRAERHVGEKWYSSETLEVFMVITNTEKYYFACVIILFLGS	99050	93442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_93400_99000
897277	contig_9014_pilon	+	2135	2	Intergenic	novelGene_106825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCTGAGGAGAGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260069	262258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_260345_260398
897278	contig_5023_pilon	+	2264	10	Intergenic	novelGene_7364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1358.97346879506	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	130	1050	622609	646990	TRUE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	618619	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647638_647735
897279	contig_5236_pilon	+	2319	17	Intergenic	novelGene_100886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	140.020743440927	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	236	2077	67078	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60635	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64095_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
897280	contig_17790_pilon	-	4263	7	Intergenic	novelGene_128486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	898	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2689	3213	198769	198245	TRUE	30	ATCAGTCTAAGCCTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKERSHLHNIKVQGEAVSADVEAAVSYPEDLAKITDEGGYTKQQIFNVDKIALYWKKMPSRTFIAREEKSMPGFKASKDRLTLFLGANIADDFKLKPVPFYHSENPRALKNYATSTLPLIYEWNTKACMTAHLFTTRFTEYFKPIVETYCSEKRFLSRDYCSLTIHLVAQDL	315902	86153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_-_86351_197391_198992_206209_206373_240585_241577_267743_268363_268568_268849_315489
897281	contig_13021_pilon	-	5130	32	Intergenic	novelGene_8114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	176.588411912119	141	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	2629	4962	173629	147970	FALSE	15	GTTACTGCTTTTGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSEAEWITIANNLLLKCHIHLRIHALEDCDANVFIALYQSILGERVPDLIVIPRSQEDDAHNVQAVIDSLALDYLQVSLSHITGENIVRGDKESIKNLLEIFDGLLEYLTEHSSETSHEKSETEQHFKESHQGVPLEEPESTKESWKRVSFGRCSLSSEALGPSWDEDEAESTGELIRLGDTAHTFSLRSNVEIPSVSMTSSARKLGEPIRSAIRLHPPHHPSEPRAPCPIGKEYCLSAGISTGEPATFSAEPDDSVFSTSKLPKNSKQEICSAQVQGPRTRRLPKGSRHENRSAVSSWGSPFPQRLRRTLTEQELHAVSEKLSQRLSELDWMLKSALGDRIKEKTEHEEEDAGAGNEEVENGEVESGSAETLSQYSDSIMDYGPKKLRPGLAVSRKPPYRSHSLSPSPVNRRKPCHRERTKQRKPKETDIRRFRAQAISEAFERELRRNKVQENIGPLGINDEQEETEKTYREAVHKGTPKPCQPWKIYSRKTTTPSPRGGFPKPNKEVPMKVNEQSLLPLMLEQFPFLSVSDQTLSKMWKQQIAQVKQLKKDAYGENRSKKKLQDEIEEALRRHDLLTALVKKEYEHNRRLQDFKDRINRQRLTQSKIKENRQQIVRARKYYDDYRVQLRAKMMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	181149	147801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_150265_151766_151842_151957_152128_152919_153050_154324_154418_155195_155336_157302_157478_158091_158222_158404_158518_160045_160225_163208_163325_164974_165072_166458_166570_169579_169688_171694_171824_173610_173969_174538_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
897282	contig_11815_pilon	+	2589	1	Intergenic	novelGene_50887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTACCTGTAATGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86438	89027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_86400_89000
897284	contig_6589_pilon	-	1099	2	Intergenic	novelGene_25983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCTTCATCTAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326940	1325740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1326343_1326443
897285	contig_10225_pilon	+	1577	2	Intergenic	novelGene_86777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	118	1461	20776	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20658	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20896_46412
897286	contig_14353_pilon	-	2392	2	Intergenic	novelGene_82100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	691	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACATTAATCAAAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83230	79081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379
897287	contig_1076_pilon	+	887	3	Intergenic	novelGene_101131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	144.5	32	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	259	558	973982	980878	FALSE	30	TTATTACCCCAATAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSQNAISTSPTGEENLMNFNHRDSESITDVCSNEDLPEVELVSLLEEQLPQYKLRVDSLFLYENQDWTQSPHQHQHASDALSPVLAEETFRYMSEYF	945703	981207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945919_973938_974073_980669
897288	contig_16185_pilon	-	1781	9	Intergenic	novelGene_144735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	107.610916616299	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	91	948	127403	86149	TRUE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKR	134353	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_86018_86156_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
897289	scaffold_13505_pilon	-	1578	9	Intergenic	novelGene_111528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	290.197535094632	2	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	39	1352	603235	588797	FALSE	5	TCATTTTCTCTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNAELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEQLLKPDTNIYCQLHPKAEVAPQLPPGTAPYGLRRGATSDPKSWGKGRS	603273	588570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601912_602237_603171
897290	contig_5258_pilon	-	1612	13	Intergenic	novelGene_100227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	75.2612117893407	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	237	1610	158270	62405	FALSE	30	GTAATGTACGTTAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFAYDHCFWSMDESVREKYAGQDDVFKCLGENILQNAFDGYNACIFAYGQTGSGKSYTMMGTADQPGLIPRLCSGLFARTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRAKNIVNHAVVNEDPNARIIRDLREEVEKLREQLTKAEAMKSPELKDRLEESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVLLTPQKNT	227606	62402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_62534_70947_71083_75784_75896_97662_97876_112359_112472_113950_114064_116236_116372_117308_117397_120813_120995_122677_122771_124268_124330_158267_158411_227510
897291	contig_1107_pilon	-	505	3	Intergenic	novelGene_126563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	47.5	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496814	489810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_490147_492256_492374_496762
897292	contig_11896_pilon	-	4703	2	Intergenic	novelGene_88046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1319	junction_1	0	1002	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184827	179364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_180805_181564
897293	contig_8801_pilon	-	2748	1	Intergenic	novelGene_66255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1578	1904	354952	354626	NA	35	GGTCTCCGGAAACAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETEGIYINRCCGRLLSSHFILYSKLPGIKIHVIKNNKENRKENQTYPVKRFIIQKYAPLNFFTTAIFNQKIIIKIYFGGVFPITEFPPPSKIIRVKQKLKIFTQPK	356529	353781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_353800_356500
897294	contig_3077_pilon	+	2750	7	Intergenic	novelGene_26870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	93.4588441805031	21	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	104	745	1337784	1346622	FALSE	55	TTACCAAAACAATTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEMVCLFLPAEGG	1336609	1348627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1346586
897295	contig_12079_pilon	-	3632	2	Intergenic	novelGene_67386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	0	715	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1264	1602	465063	464725	TRUE	15	GTTTGTGGTTTCATTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILASAPVHSGSRSQQVSPILTKFSLRLTEGAEVRGLGEERNSVISRWWLVLGAVQSVPTQPPRAQQQGTQPTPAPSAPSLPCLSPLLQPLCQSISLRVFLFFTDPLLYPA	466326	462080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_463060_463673
897296	contig_8310_pilon	+	2429	20	Intergenic	novelGene_75554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	342.881475689765	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	101	2203	272460	324814	FALSE	35	ATGTCAGTAAATATTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLCPLLLAGFSWPLAGALKDNQTTTHNSNGTTIPGRPDPGATRPQLAWLLLPLLLVLGLLLLATAYFFRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215090	325040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
897297	contig_13863_pilon	+	3707	11	Intergenic	novelGene_42085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	329.292635811978	59	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	165	1334	474588	490279	TRUE	20	TTTATTTATCTATGTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455952	492980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_482069_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006_491270_491597
897298	contig_1535_pilon	-	1940	8	Intergenic	novelGene_127213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	648.38940176913	870	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	198	1151	48541	40062	FALSE	10	TACTTAGTTTTCTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSLEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAAAIGAFLIYISSDYVFDGTNPPYREEDIPNPLNLYGKTKLEGEKAVLENNLGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	52375	39272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_48529_48604_52240
897299	contig_3018_pilon	-	1773	14	Intergenic	novelGene_78863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	417.849042699881	8	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	310	1773	600079	562938	FALSE	75	AGGAAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625087	562937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772_624902_625021
897300	contig_10990_pilon	-	2239	7	Intergenic	novelGene_7427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	327	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1624	2019	675638	671353	TRUE	45	AAGAACAAACCACTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPWLFLSPRQEVINVFGSLPALRQGQRGHDSNSEVRNWALLPFIPVAQDAENRDDQEGGKEPRKPRLGCHKFPAACWAPRSSFWFLNGPGQYDSLSHGPLQWSPGSASPPKSSVGHNQLASMPVTSPGSS	689282	670557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_670768_671342_671551_674235_674315_674955_675064_675627_675715_680709_681655_688680
897301	contig_13481_pilon	-	1165	7	Intergenic	novelGene_119379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	592.663198340058	10	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAACGTTCACTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539357	520954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_521325_536157_536304_536767_536919_537232_537296_538013_538053_538608_538947_539299
897302	contig_14882_pilon	-	2476	2	Intergenic	novelGene_115034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	510	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAGTTACCACTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343513	337746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_340105_343395
897303	contig_14415_pilon	-	5800	3	Intergenic	novelGene_77586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	250	378	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	519	1082	18485	16882	FALSE	55	TTTATTTAATTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGKTTATTTRKPSSCTKTIQ	19071	12163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_17037_18076_18952_19019
897304	contig_3077_pilon	+	2776	10	Intergenic	novelGene_26864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	68.6666666666667	687	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	129	1211	1337784	1346705	FALSE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336584	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
897305	contig_5690_pilon	+	5807	15	Intergenic	novelGene_119711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	26.799329872828	257	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1031	3096	627	3722	949801	961270	FALSE	0	GTGCTGCTTTGTTGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFDLQNVWRVSHINSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEISWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGSSSSTGNSDASEACDTDFDSSLTACSGVESSTAPQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNSFQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENAEDQNEQCPVFLQWLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWALLRAGNKNFHNFLYTPGSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVTQSQEFSGHSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPLTRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNPEGSETTFVESGAGGPQLTVGEMGLPPPPSSSQKDYLSNKPFKSHKSCSPSYKLLNTAVPQEVKGNTSDPEIKVLEETKPPAPDPPAQDELSRTLDGIVEEPSEHFPEKDTVVALSKVIFGTCDGICDFPESSQNSLAASLQQTQLDSVLGVPSSCVSNPSLGALGSPQSAACQSPPDPSPGFLSQDPPGSVASVSHQEHPSSVPDLIHGEEDAGKRGTSRNGQLLENPRFGKMPLELARKTISQSQISEFSFLGSNWDSFQGMVTSFPSGETTSRRLLSYGCCSKRSSSKQMRAMGPCFGGQWAQREGVRSPVCSSHSNGHCTGPGGKNRMWLSGHPKQVSSTKSVPLSCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYKQEVEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCLSEASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCGNVFCAGCCHLKLPIPDQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQHLKKPIATASS	948203	963355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_948628_949482_949644_949759_949857_950056_950171_951059_951257_951462_951592_952106_952219_952699_952896_953130_953317_953395_953567_953681_953837_957592_958995_960427_960539_960784_960874_961092
897306	contig_5727_pilon	-	4503	25	Intergenic	novelGene_7973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_12	315.596877184944	636	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1173	3522	350	3871	228154	198938	FALSE	20	CCTTTACCAACTTTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSIEIPLRDTDEVIELDFDQLPEGDEVISILKQEHTQLHIWIALALEYYKQGKTEEFVKLLEAARIDGNLDYRDHEKDQMTCLDTLAAYYVQQARKEKNKDNKKDLITQATLLYTMADKIIMYDQNHLLGRACFCLLEGDKMDQADAQFHFVLNQSPNNIPALLGKACISFNKKDYRGALAYYKKALRTNPGCPAEVRLGMGHCFVKLNKLEKARLAFSRALELNSKCVGALVGLAVLELNNKEADSIKNGVQLLSRAYTIDPSNPMVLNHLANHFFFKKDYSKVQHLALHAFHNTEVEAMQAESCYQLARSFHVQEDYDQAFQYYYQATQFASSSFVLPFFGLGQMYIYRGDKENASQCFEKVLKAYPNNYETMKILGSLYAASEDQEKRDIAKGHLKKVTEQYPDDVEAWIELAQILEQTDIQGALSAYGTATRILQEKVQADVPPEILNNVGALHFRLGNLGEAKKYFLASLDRAKAEAEHDEHYYNAISVTTSYNLARLYEAMCEFHEAEKLYKNILREHPNYVDCYLRLGAMARDKGNFYEASDWFKEALQINQDHPDAWSLIGNLHLAKQEWGPGQKKFERILKQPSTQSDTYSMLALGNVWLQTLHQPTRDREKEKRHQDRALAIYKQVLRNDAKNLYAANGIGAVLAHKGYFREARDVFAQVREATADISDVWLNLAHIYVEQKQYISAVQMYENCLRKFYKHQNTEVVLYLARALFKCGKLQECKQTLLKARHVAPSDTVLMFNVALVLQRLATSVLKDEKSNLKEVLNAVKELELAHRYFSYLSKVGDKMRFDLALAATEARQCSDLLSQAQYHVARARKQDEEERELRAKQEQEKELLRQKLLKEQEEKRLREKEEQKKLLEQRAQYVEKTKNILMFTGETEATKEKKRGGGGGRRSKKGGEFDEFVNDDTDDDMPLSKKKKRRKGSGSEQEGEEEESGERKRKKRRRPTKGEEGSDDDETENGPKLKKRRPPKAEKKKAPKPERLPPSMKGKIKSKAIISSSDDSSDEDKLKIADEGHPRNSNSNSDSDEGERRKKHASSESDSDDNQIKSGSEAGSPRRPRRQRSDEDSDSDQPSRKRRASGSEQSDNESLQSGRSRSGASENDSRPASPSAESDRDSERGSDNEGSVQGSGNESEPEGSNNEASDRGSEHGSDDSD	228503	198305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_199365_200281_200395_200607_200705_201753_201912_202861_203009_203330_203467_203989_204062_205145_205292_205432_205550_207511_207661_207841_207930_208018_208205_209008_209098_209835_210020_210122_210252_210369_210460_211224_211462_211589_211698_219535_219644_222273_222423_224370_224461_224907_225026_225530_225771_226761_226861_228109
897307	contig_3956_pilon	+	3080	15	Intergenic	novelGene_15049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1122.4086640719	521	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	670	2556	1284763	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283880_1284059_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
897308	contig_610_pilon	+	2311	8	Intergenic	novelGene_76843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	206.485162781687	33	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	105	1319	350131	375649	FALSE	35	ACTCTTTCAGTAGAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMAAPPSPSSVSAELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYGRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350026	376641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360719_361083_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
897309	contig_8587_pilon	-	2732	1	Intergenic	novelGene_159154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGACAAAAAATGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520355	517623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_517600_520400
897310	contig_3747_pilon	+	1663	3	Intergenic	novelGene_24765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3797.5	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	299	625	203794	204120	FALSE	40	GGAGATATTCTTTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200981	205158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201180_203575_203651_203768
897311	contig_15929_pilon	+	1207	8	Intergenic	novelGene_172462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	248.40372010754	160	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	633	965	87373	92073	FALSE	15	TCCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKI	82253	92315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_82391_82663_83993_84057_84400_84489_85734_85824_87310_87623_89766_89844_92067
897312	contig_14353_pilon	-	1179	6	Intergenic	novelGene_82106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	691	junction_1	208.377925894275	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	59	553	83931	80452	FALSE	70	TAAAGAAAAAAAAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	84542	79825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505
897313	contig_11986_pilon	-	8276	2	Intergenic	novelGene_69235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTCACCAGTTCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787623	778072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_779717_780991
897314	contig_14341_pilon	+	3193	5	Intergenic	novelGene_111770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	15	junction_4	39.8151981032369	571	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	85	381	299952	302160	FALSE	25	GTGATTTGAACTCACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRGPPGAIVWRGRGIGILRILPTPTRDMLRSEERIVSGLPKAWSGEPVTFEDVTLGFTPEEWELLDPMQKTLYREVMLENYRNLVSVEHQLSKPDVVSQLEEAEELWLKEREIPQDTFPGCPTCT	299412	304972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_299457_299911_300006_300969_301097_301864_301961_302140
897315	contig_19402_pilon	+	1880	2	Intergenic	novelGene_80833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	720	1031	131338	131649	TRUE	35	ACTTCAGTATTTAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIIADARWILAESRKYQKDAYLCFIDYAKVFDCVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYLDQEAVVQREQGDAAWFKIRKVCIIRVVSFHHTYSICVRSK	130618	132892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_132315_132708
897316	SIRV6	+	723	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	47	13	47	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10284	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
897317	contig_11417_pilon	-	2952	8	Intergenic	novelGene_103320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGCATGCCAGGCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613943	565875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_566182_566274_566360_567426_567657_568274_568413_569457_569559_570058_570197_570597_572461_613852
897318	contig_4131_pilon	-	2877	2	Intergenic	novelGene_127861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	569	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1	645	350894	162755	FALSE	20	CATATTTTATCTCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETAPAAPAAPAPAEKTPVKKKAKKTGAAAGKRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAAPGEVKPKAKKAGAAKAKKPAGAAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPAAAAVAKKVAKSPKKAKAAKHKKAAKSAAKAVKPKAAKPKVAKPKKAAPKKK	350894	160522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_163024_350518
897319	contig_13366_pilon	-	1956	1	Intergenic	novelGene_99758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	474	929	26775	26320	NA	65	TGAATTTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSPLAEEESTSLPVSSPPSAGDGQVVVSSISGPGNLVATEDKTETLDKNSAELEFGEIPEEEDPAHEEPESVSASGSLKELRKLLTVTVEVPVESAVVIEKDIPEETLLPQEDEKEEEKPQIYTEAHEVAASHQDHCEEDEVNEREAHLSSTEASGMEWGSFPEASGSAPEPACGRLTEGASCPGPTGEQMEAGELPERASKLFHEEGGAQCALEGEASAGEDCILSSDHVHPSESQVSEEMMEGKISTGQREVSVDTEASKVASVHACQWVVENAPNTSSLGAHENNVKEREGCLESSPGQLVEEE	27248	25292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_25300_27200
897320	contig_17522_pilon	-	3477	1	Intergenic	novelGene_160808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	113	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2849	3337	82100	81612	NA	30	GAAACTGGAGGGCATTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARQYQVILDWFEPRKIRVNSKVTTKKVNKSPHKNKEEKRLSKNKTYKNKRNEKNIHKQKEFSTGERGTKKTSATQKKALQNDSSKLTPISSYTECKWPKCTHKEMENDRMDKKQDPSICCLQEAHLRNKDINLLKIKGWKKISKQLPKKSRSGNTNLR	84948	81471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_81500_84900
897321	contig_6227_pilon	+	1956	15	Intergenic	novelGene_49674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	562.395568537132	975	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	384	1805	848641	884115	FALSE	40	TTAAGTAATAAAGCTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYVEKPLKLVLKVGGNEVTELSTGSSGQDSSLLEDRNDHDKHKDRKRKKRKKGEKQVPGEEKGRKRRRVKEDKRKQDRDRVENEAENDLQCQAPVRLDLPPEKPLTSSLAKQEEVEQTPLQEALNQLMRQLQRKDPSAFFSFPVTDFIAPGYSMIIKHPMDFSTMKEKIKNNDYQSIEELKERIQSLKQSIEFMTDLQKTQKQKDQTDTSQSGEDSGCWPQEKEDAGDAEAQAFKSPNKENRKKERDTSEDKFKSSNLEREQEQIDRIVKESGGKLTRRLVNSQCEFERRKPDGTTTLGLLHPVDPVVGEPGYCSVKLGMTTGRLQSGVNTLQGFKEDKRNRVTPVLYLNYGPYSSYAPHYDSTFANISKDDSDLIYSAYGEDSDLPSDFRIHEFLATCQDYPYVMADSLLDALTKGGHSRTLQELETSSPEDEGETGTVDTTKDIEVTEVEPAGRLDRSNQDRLTALRAVTSFGAPVEVFASEEAEGFQRKLDETTKLLRELQEAQNERLSTRPPPNMICLLGPSYREMHLAEQVTSNLKELAQQVTPGDIVSTYGVRKAMGISIPSPSLENNFVDLTEAFEDPNKADVAECGCDEIGS	827417	884266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_827630_847470_847601_848599_848658_856400_856546_866496_866682_867783_867908_868767_868844_876026_876135_876537_876674_878770_878883_880390_880448_882426_882539_883250_883395_883591_883736_884053
897322	contig_13021_pilon	-	2008	10	Intergenic	novelGene_8233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	542.944941846356	53	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	32	754	236115	215441	TRUE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKLESLNQNMMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTGMIPLWEMCLVMTLGLCGLTS	236146	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_215421_215506_218018_218304_231599_231882_236024
897323	contig_2550_pilon	-	2564	2	Intergenic	novelGene_135634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1998	2312	443061	442747	FALSE	35	CATAATTCAAAGTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKTGSIDMLSTRDTPEKYVNLLKVKGWKKIHQANNYQKRAGVAILISDKIGFKTKSTLKNKEGCYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRASKYINSNNAEKRN	445904	442494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_444741_445586
897325	contig_9183_pilon	-	11233	3	Intergenic	novelGene_40290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	876	junction_1	288	1797	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	556	1599	323783	322740	TRUE	30	AGACAGGCACCAAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLK	324338	310551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_314891_315233_318347_320557
897326	contig_11855_pilon	+	3773	4	Intergenic	novelGene_67105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	180.813593392631	578	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	453	1202	2445507	2446256	FALSE	30	AGTATAAAGTTTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440095	2448827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440301_2441538_2441665_2443329_2443442_2445497
897327	contig_15172_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_158770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	254	765	876	1640	268023	268787	NA	35	AGCTCATTTTAAAGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYTSALSAPGPGHGHPATPAPARLCSRFWISDKPSPPPPPSFLLSNQREAQIKESPCKASRREEAWVGLLPVALTKLTGTAIVPAEEMVSLVSASHSDPENAAAPSHTHPRARTLPVDTKTALFPLHPPLSPNRTVFLTEICTPPDSPFHEVIQSSIPVAKSGDWVHQLLRPGRAQNGCTVQAETHTFHMARPLQSCLAALSGPRQVLCHQLPRDCVTWTRWPVGCRQGTFPQFRLFFFPLLPSCCQSKPLAS	267147	268902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_267100_268900
897328	scaffold_12124_pilon	+	2586	11	Intergenic	novelGene_22335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3397.85186404587	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1773	2423	1508755	1509405	FALSE	30	TGTGGTAAACTTGACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483576	1509568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1505409_1505504_1506629_1506687_1508010
897329	contig_18096_pilon	+	3441	8	Intergenic	novelGene_58038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.953362927302	13	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	443	943	70561	76634	FALSE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40321	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44236_69546_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507
897330	contig_5136_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_126635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTTCAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280440	278158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_278200_280400
897331	contig_8822_pilon	-	3774	1	Intergenic	novelGene_117928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTCAGCTTTGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66279	62505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_62500_66300
897332	contig_366_pilon	+	5577	9	Intergenic	novelGene_51575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	5212	5577	803172	803537	FALSE	20	CGATCTCGAGCTCTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFSRRYRTQNRPRKPDHRRSVRFLFARPQSVRGFSRLLGWATCFWAAAADSLSRRRVAGLEKGNGKLGRRYRCHHCRRLPPGGTPVTPPTPPSCSSGSSQHKMPPVSRSPFFTAQRTLGK	754192	803537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_758388_764199_764347_765319_765429_768020_768099_769051_769129_770343_770484_776793_776893_780057_780183_802930
897333	contig_7898_pilon	+	3815	17	Intergenic	novelGene_47609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	743	junction_7	269.074310135695	1438	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	733	2883	571727	599921	FALSE	5	TGTGAGCTGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPERGGSSSKLFSSSFNGGRRDEVAEVQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTFEPRGQAGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSENQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEVPSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYVVGDTITMQLMKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEAAIQELKTREEALSGLAESRGEVTGVVAALEQLVLMAPLAKEPVFQPRKGVLEYLSAFDEETVEVCSLDSSRPLALPLVEEEEVASEREPEQLLEACDDSELADDNLGEGTICTESRRQEPITKPGVTHLSSSPCYYFYQAEDGQHMFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	562994	600853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563602_571601_571799_583823_584024_584889_584981_586466_586652_586730_586868_587523_587685_589142_589269_589544_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
897334	contig_9724_pilon	-	4556	1	Intergenic	novelGene_172586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	564	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACAAAAGTCTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39643	35087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9724_pilon_-_35100_39600
897335	contig_10734_pilon	-	496	1	Intergenic	novelGene_51345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCGTGGTATCACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1702741	1702245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1702200_1702700
897336	contig_17144_pilon	+	1728	8	Intergenic	novelGene_29487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGTAAGTTCCTGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166077	183218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166576_173330_173754_174576_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181852_183158
897338	contig_4857_pilon	-	4007	1	Intergenic	novelGene_48761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTATTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213593	1209586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1209600_1213600
897339	contig_7744_pilon	-	1822	4	Intergenic	novelGene_62449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGAAGTCAGCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70264	64265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_64514_67642_67754_68254_68332_68878
897340	contig_4631_pilon	-	2653	1	Intergenic	novelGene_177942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	655	1182	46299	45772	NA	15	TACCCATTTGTGTGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRFQRAAREDKVKYCNDVQGAGNRKSKGKNTLSISQAERTEEKFRPRVAILKESMGKILNDPGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQETAYDQEPIVLNEEVQMVLKALAKNKAPGIDGIYTEMFQQMEAALEMLTHLCQEIWKTATWPTDWKGSIFTPIPKKGNPTECGNY	46953	44300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4631_pilon_-_44300_47000
897341	contig_10627_pilon	-	10239	12	Intergenic	novelGene_59972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1786	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGTCACCGCTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242184	219130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_224896_225350_225461_225940_226109_231146_231274_231502_231569_232497_232598_232792_232906_234196_234442_235604_235665_235982_236094_236314_236481_238976
897342	contig_14415_pilon	+	1968	4	Intergenic	novelGene_77616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	33410	37984	FALSE	25	TGGTGTTTATATATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	39508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
897343	contig_10734_pilon	+	1851	11	Intergenic	novelGene_51194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	408.174239755524	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	400	1377	1129441	1142903	FALSE	30	CTGGTGTTAATGTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123742	1143377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1124903_1124980_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
897344	contig_12019_pilon	+	2583	11	Intergenic	novelGene_87752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	132.338240882974	12	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	240	1028	633175	637915	TRUE	30	TATGTTACATTAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	628192	643222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_628324_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637949_639740_639833_639942_640142_641782_641874_642082
897345	contig_7915_pilon	-	7663	44	Intergenic	novelGene_42956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1148	1699	129993	126159	TRUE	15	CGCCCAGCAGCGCGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSCCIWMSSFIRRLARSWLSWATCSIVAISFCMQLFSCFCSRRFFSSWLRCVLRASFRVAICFSAFFLSVKNWFRRRLKSALMESISFWRARSSLDFSINSCSRSESCCLVWESVFSRVSFHLFSSCRVLTCSSATDTFVSTCSSSLFWSVNSFSSCCCCSFSVILLASNFSSSLSLSFWSF	138494	35904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_35974_39593_39845_41328_41461_44609_44739_46248_46393_48107_48294_53929_54125_60117_60237_61076_61303_63594_63706_67283_67481_72323_72476_74213_74437_76562_76739_80925_81054_84921_85075_97637_97848_98326_98505_100975_101156_101926_102044_102318_102463_102935_103084_104341_104530_105586_105903_107407_107617_109754_109948_114219_114349_114493_114637_114722_114847_118812_118979_119743_119906_121146_121262_121343_121562_123134_123293_124356_124430_125533_125727_126149_126380_128202_128409_129868_130008_133643_133918_134105_134168_135456_135668_137701_137784_137990
897346	contig_15172_pilon	-	2414	7	Intergenic	novelGene_158763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2111	2413	258367	243201	FALSE	30	AACAGGTAATCGTAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLNVPDPVPDIVKRLLVRDVVDQHDALCAPVVGRGDRPEPLLASCVPYLQFDSLAIKLYSSDFKVNSYGGDEGGVEGVLGEAEQDTGLPHPRVPDQQQL	268920	243199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_243296_248917_248980_252813_252874_256834_256913_258359_259039_260338_260391_267533
897348	contig_5959_pilon	-	2571	4	Intergenic	novelGene_150187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_3	159.399567823198	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	522	1631	216308	211902	FALSE	35	GGCAACAAGTATCAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218742	210961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_216310_218222
897349	contig_8027_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_158840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270493	269360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_269400_270500
897350	contig_5643_pilon	+	3566	9	Intergenic	novelGene_39022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	797.803547247065	15	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	2734	3354	634785	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPALGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631196	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_633013_633488_634992_635156_635274_635373_635464_640636_640729_641102_641244_641412
897352	contig_11558_pilon	-	3865	5	Intergenic	novelGene_178434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	3065	3706	1309	668	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITRKFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	62576	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11558_pilon_-_71_578_2540_5885_5957_41658_42863_62017
897353	contig_5374_pilon	-	5018	4	Intergenic	novelGene_166396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3340	3651	458836	458525	FALSE	35	GCCAAATTAATGACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSTAFSSTGRYLVFYFGHRLESSCPVFVNVLILSAVFGASSGYFACLLIVDLFVSSCSFVLSGYV	537024	457157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5374_pilon_-_459036_532735_533315_534415_535800_535847
897354	contig_9183_pilon	-	4924	5	Intergenic	novelGene_40300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	336.477711000298	10	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	556	1599	323783	322740	TRUE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLK	324338	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557
897355	contig_11572_pilon	-	3876	12	Intergenic	novelGene_100040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.294904236213	2	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	706	1773	174954	143399	TRUE	15	ACTTCTCTGCTCAATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTDTLNAQTVSLSNDTIAIKDKADEKIIFLFEAATGKPLGDGKLLSHKNEILEIALDQKGLTNDRKIAFIDKNRDLYITSVKRFGKEEQIIKLGTMVHTLAWSDACNILCGLQDTRLTVWYYPNTVYVDRDILPKTLYERDASEFSKNPHIVSFVGNQVTIRRADGSLVHISISPYPAILHEYVSSSKWEDAVRLCRFVKEQTMWACLAAMSVANRDMTTAEIAYAAIGEIDKVHYINSIKNLPSKESKMAHILMFSGNIQEAEIVLLQAGLVYQAIQININLYNWERALELAVKYKTHVDTVLAYRQKFLETFGKQETNKRYLQYAEGVSIIQYFITMCMFYYEYTQYSTRQT	181402	141072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_141430_141534_141885_142002_143601_152951_153125_153686_153777_156397_156570_157847_157996_158411_158548_170052_170118_174872_175037_178262_178338_180854
897356	contig_9436_pilon	-	2195	3	Intergenic	novelGene_60907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	16.5	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGACCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417932	415395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_417459_417701
897357	contig_610_pilon	+	2376	8	Intergenic	novelGene_76824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	211.257942731976	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	66	1367	350011	375649	FALSE	20	GTGTTTAAGATGACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYGRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	349945	376658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
897358	contig_10749_pilon	+	2097	15	Intergenic	novelGene_133507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_13	34.6583912152981	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	702	2075	292847	301943	FALSE	15	CGTACCAGACCTCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNWNSCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVYNANSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSLSTRPSSGCAQVLSHPGHTPVTSLAWAPSGGRLLSASPVDAAILVWDVSTETCVPLPWFRGGGVTNLLWSPDGSKVLATTPSAVFRVWEAQMWTCERWPTLLGRCQTGCWSPDGNRLLFTVLGEPLIYSLSFPERYGEGKGRVGGAKSATIVADLSETTIQTPDGETRLGGEAHSMVWDPSGERLAVLMKGNPRVQDGKPVILLFCTRNNPVFELLPCGIVQGEPGAHAQHITFHPSFNKGALLSVCWSTGRIAHIPLYFVNAQFPRFSPVLGRSRDPPVGGGVSIHDLPLFTETSPTSALWDSLPGLLPAQPHSHL	288862	301965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293798_293898_294233_294378_299644_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301389_301513_301599_301727
897359	contig_7457_pilon	-	3180	8	Intergenic	novelGene_31259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	192.630660665875	484	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	21	806	26428	21912	TRUE	25	TCTATGGACAACTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETFSQLGSLEEVNKSILSQDPAIGSKATSYSSTSSSKFFSSCVPCEGVAGGGFVTCPTCQGSGEIPQELEKQLVALIPYGDQRLKPRHTKLFVFLAVLICLVTSTLIIFFLFPRSITVQPAGLNSSSVAFDDVDIHLNTTNVLNISNRNYYPITVTQLAIDVLHLSLVVGQVSQSLFLPIGPLTSKQMFYTVTSSILDENTYKICTWQKIKVHHVLLHIQGTLTCSYLSHSEQLVFQSYEYVDCQGNSSVPHLLASHPP	26448	18521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_19603_20618_22033_22344_22399_22891_22936_23043_23185_23694_23849_25603_25668_26220
897360	contig_2867_pilon	-	4507	11	Intergenic	novelGene_135177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_9	65.9972726709218	58	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1445	4335	173	4507	828750	781293	FALSE	50	GATGACCATAAAGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLPENVREEKIIEHFKRYGRVESVKILPKRGSEGGVAAFVDFVDIKSAQKAHNSVNKMGDRDLRTDYNEPGTIPSAARGLDDTVSIASRSREVSGFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHYDQDYYRDPRERTLQHGLYYTSRSRSPNRFDVHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDITREVRGRRPDRNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLTSQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSTSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSCLEKDEPRKSFGIKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQIEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIVDIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVDFANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLVERREERRTSYDYNQDRAYYENVRTPGAYPEDARRDYPARGREFYSEWETYQADYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERERERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPEASPSQSERLPSDSERRMYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKPRLERYTKNEKTDKERTFDHPERGERERRLIRKEKLEKDKTDKQKRKGKIHSPSSQSSETDQENEREPSPEKPRSSNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTAFEKLKSKLENDSVKSSALDQKLQVAQAEPAKADLSKLEPVRMKVPKEKGLSSHIEVVDKEGRLKPRKHLKPEQTADGVSTVDLEKLEARKRRFADSNLKAERQKSEVKKSSPEMEEARVLLKKQPDLSSRDVILLREGESERKPVRKEILKRESKKIKPDRLNTAPSPKDCQELASVSAGPGSRPNSDLQARLGEPVGESVENQEIQSKKPASSKPQLKQLQLLDDQGPEREDIRKNYCHLRDETPERKSGQEKPRLVNAEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEMEIAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNYRSSRQISEDSERTGGSPSIRHGSFHDDDDPLGSPRLMSVKGSPKVDEKGLPYSNITVREESLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDDLNRWDSQMKQDASRFDVSFPNSIIKRDSLRKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSSLERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDSAPRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKK	866309	781292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_783982_788547_788649_789631_789742_790804_790923_791263_791390_793870_794023_797873_798075_799391_799553_825102_825580_828550_828872_866258
897361	contig_7079_pilon	-	3152	3	Intergenic	novelGene_129248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373954	370512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_-_371681_371775_373021_373215
897362	contig_1082_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_170418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	673	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAGAACTAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5642	7668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_5600_7700
897363	contig_12427_pilon	+	3407	7	Intergenic	novelGene_40508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_6	89.3229160592809	362	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	107	901	422215	462072	TRUE	30	AAAATGAACTTCCCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGRTSCHLPRDVLTRACAYRDRQGYQQLPEWRDPDKYCPSYNKTPQSNNPVLLSRLHFEKGADSSERIIAPMRWGLVPSWFKEDDPSKLQFNTTNCRSDTMMEKLSFKVPLGRGRRCVVLADGFYEWQRCQGTSQTQPYFIYFPQIKTEKLGSIGAADSPEEWEKVWDNWRLLTMAGIFDCWEPPKGGDILYSYTIITVDSCKGLNDIHHRMPAILDGDEAVSKWLDFGEVSTQEALKLIHPTENITFHPVSPVVNDSPKQHS	421391	466726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_421477_422193_422398_441520_441665_443412_443539_458708_458891_461912_462108_464255
897364	contig_7080_pilon	+	2697	9	Intergenic	novelGene_100102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	123.580692262181	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	284	1084	488513	540726	FALSE	10	TTTTTAGGCTCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSFRALLHPKRSGCVLRDFGDTCLRDVKLARSSPFRGSQRKSSSRVLAWWLARSVSGGVCAPFLSPALESGDLGSSGSECRACIGASSDPAFQKMHYYRYSNAEVSCWYKYLLFSYNIIFWLAGVVFLGVGLWAWSEKGVLSDLTKVTQLHGIDPVVLVLVVGVVMFTLGFAGCVGALRENICLLKFFCGTIVLIFFLELAVAVLAFLFQDWVRDRFREFFQNNIRSYRDDIDLQNLIDSLQKANQCCGAYGPEDWDLNAYFNCSGPSYSREKCGVPFSCCVPDPAQKVVNTQCGYDIRTQWDESIFTKGCIQALEGWLPRNVYIVAGVFIAISLLQIFGIFLARTLISDIEAVKAGHHF	461507	542339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_461774_488495_488594_525760_525812_527214_527362_529095_529267_534487_534614_536987_537033_538431_538540_540654
897365	contig_7593_pilon	+	1712	3	Intergenic	novelGene_127328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.5	201	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	394	1335	650202	651143	FALSE	70	GGTAAAAAAAAAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGGKRKFDEHEDGLEGKIVSPSDGPSKVSYTLQRQTIFNISLMKLYNHRPLTEPSLQKTVLINNMLRRIQEELKQEGSLRPMFAPSSQPSDSLSDSYRETPPALSHPASPPTHPCDLGSTTPLEACLTPASLLEDDDDTFCTTQATPVVPTKLSPPALLPEKDSFSSALDEIEELCPTSTSTEATAATTDSLKGSSSEPSAPKPEGLPEGRTDDPKLMDSLPGNFEITTSTGFLTDLTLDDILFADIDTSMYDFDPCTSASGTASKMAPVSADDLLKTLAPYSSQPVAPSQPFKMDLTELDHIMEVLVGS	532651	651520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_532925_605926_606043_650197
897366	contig_3463_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_61987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAATAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499854	501921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_499900_501900
897367	contig_12677_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_110742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
897368	contig_16685_pilon	+	3243	2	Intergenic	novelGene_115041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAGGGGAGAGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433796	437089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_436897_436946
897369	contig_21422_pilon	+	3246	13	Intergenic	novelGene_79078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_12	98.0029407155157	877	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	1959	3245	28409	40703	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEVDPTGDRTIGILTKPDLVDRGTEEKVVDVVHNLVYQLKKGYMIVKCRGQQDIQDRLSLAEALQREQAFFEEHDHFRVLLQEGKATIPHLAERLSTELITHICKSLPRLENQIKESHQKVTEELQKYGVDIPEEENEKMFFLIDKINAFTQDIFALVQGEELVGENESRLFTKIRNEFLRWSNEIEKNFQKGYDTMYREIRKFENQYRGRELPGFVNYRTFETIIKQQIKKLEEPAVDMLHKVTDMVRFAFTEVSKKNFDEFFNLYRTAKSKVEDIKLEQEREAEKSIRLHFQMEQIVYCQDRVYRDALQKVREKEAEKEKNNKGNFTFCQQSSSEESSVEEIFQHLLAYHQEISNRLSSHIPLVIQFFILRMYSQQLQKGMLQLLQDKDGYSWLLKERSDTSEKRKVLKERLSRLAQARRRLAKF	19944	40704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_20029_21467_21619_24358_24552_25736_25875_27016_28449_30700_30900_31900_31980_34198_34322_34742_34885_37054_37214_37428_37506_38751_38998_40481
897370	contig_6794_pilon	-	1691	3	Intergenic	novelGene_149000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	12.5	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	235	576	14324	13983	FALSE	25	TACTGACCATGGCATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20694	12867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_18732_18827_20575
897371	contig_7694_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_159934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1494	1796	205028	204726	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDYHLQYGLHLDIKETKILTNGPISNIMINREKPEVVKDFILLGSTIYPHGSSSQEIKQLRNPESMAPIHPFSSVVKSFPRFTIQPGSRQPHKTKWDS	206521	204358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_-_204400_206500
897372	contig_9681_pilon	+	2316	3	Intergenic	novelGene_178711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	206	577	350022	350393	TRUE	65	GAAATCAAAAGAAGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKFKKKKEQEKPPPPKKKLPTRKEMLSGIPVHVCASQVGRFQALQHHLARPGSQLKKRKTNKQLKTNKRTKPQDPTSAAAQTLKQLHTRMELRSPLGRSKDGTRSRVFE	349816	432070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9681_pilon_+_350561_404722_405489_431264
897373	SIRV6	+	921	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	509	164	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	176	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	30	TGGCGATGACTATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
897376	contig_14744_pilon	-	1559	6	Intergenic	novelGene_66044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	597.11318859995	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	327	995	1325356	1313534	TRUE	70	GAACTACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQVRAWGAAWLCLKRAQLAQVTLHCPHFEQEGMS	1325682	1312305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1312652_1313315_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293
897377	contig_9235_pilon	+	2247	3	Intergenic	novelGene_156200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	56	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	505	1011	45805	47087	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSCCQPEGGRERI	43696	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_46275_47050
897378	contig_18272_pilon	+	3343	1	Intergenic	novelGene_6998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	619	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTTGGCAGTTTGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128760	132103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_128800_132100
897379	contig_4924_pilon	-	5266	6	Intergenic	novelGene_84721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	1355.60442607717	431	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	24	671	252576	114572	FALSE	10	ATTTGTCTTCTGCCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPW	252599	109976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_114711_127720_127785_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
897380	contig_15047_pilon	+	1687	6	Intergenic	novelGene_52159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	30597	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	27	650	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
897381	contig_7308_pilon	-	4811	19	Intergenic	novelGene_159618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	148	junction_18	306.668518512927	643	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	251	2434	610005	582242	FALSE	10	TCCTTTGAGAGTGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRVPLRRALAGLAKSPKGCVRTTSTAASNLIEVFVDGQSVMVEPGTTVLQACEKVGIQIPRFCYHERLSVAGNCRMCLVEIEKAPKVVAACAMPVMKGWNILTNSEKSRKAREGVMEFLLANHPLDCPICDQGGECDLQDQSMMFGSDRSRFLEGKRAVEDKNIGPLVKTIMTRCIQCTRCIRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQVGTYIEKMFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETRKTESIDVMDAVGSNIVVSTRTGEVMRILPRMHEDINEEWISDKTRFAYDGLKRQRLTKPMVRNEKGLLTYTSWEDALSRVAGKLQSFQGKDVAAIAGGFVDAEALVALKDLLNRVDSDTLCTEEVFPTAGAGTDLRSNYLLNTTIAGVEEADVVLLVGTNPRFEAPLFNARIRKSWLHNDLKVVLIGSPVDLTYTYDHLGDSPHILQDIASEKHPFIQVLKEAKKPMVVLGSSALQRNDGAAILAAVSSIAQKIRTSSGVAGDWKVMNILHRIASQVAALDLGYKPGVEAVRKNPPKVLFLLGADGGCITRQDLPKDCFIIYQGHHGDVGAPIADVILPGAAYTEKSATYVNTEGRAQQTKVAVTPPGLAREDWKIIRALSEIAGITLPYDTLDQVRNRLEEVSPNLVRYDDVEGANYFQQANELSKLVNQQLLADPLVPPQLTIRDFYMTDSISRASQTMAKCVKAVTEGAQAVEEPSIC	614319	579864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_582334_584210_584284_584388_584524_585083_585260_586755_586911_588612_588774_591435_591566_592815_592945_593288_593435_594218_594334_595002_595138_602039_602226_602693_602825_602915_602998_603662_603740_606201_606310_609309_609402_609944_610010_614073
897382	contig_13481_pilon	-	3309	1	Intergenic	novelGene_119532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATACGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471873	1468564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468600_1471900
897383	contig_5018_pilon	+	1065	5	Intergenic	novelGene_47009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	290.9123579362	263	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	215	835	1256058	1257955	FALSE	15	TCCAAGTGGTGCTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPPQAQAEVGPTMTEKAEMVCGPSPAPTPPPEPASPGPPKVEEVGHPGSSPSRLPPGVPVISLGHTRPPGAGVPTTELTALRPPLLQLSALGTAPPPLALHYHPHPFLNSLYIGPAGPFGIFPSSRLKRRPSHCELDLAEGHQPQKVARRVFTNSRERWRQQNVNGAFAELRKLLPTHPPDRKLSKNEVILRHRHRGLSPGPLRL	1254894	1258185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1255087_1256035_1256390_1256470_1256563_1257474_1257618_1257901
897384	contig_3627_pilon	-	4409	15	Intergenic	novelGene_78450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGGGAGAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323996	294389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_294465_297721_297894_298388_298434_300292_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304726_309358_309490_309605_309769_312559_312785_313377_313492_314035_316054_318593_318774_320223_320416_323437
897385	contig_12923_pilon	+	3985	11	Intergenic	novelGene_30093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAAACCATTCCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45345	70398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_46397_48961_49725_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57334_57447_57631_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662
897386	contig_5947_pilon	-	3743	3	Intergenic	novelGene_101487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	529	junction_1	65.5	234	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCGCAATATAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393952	388964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_392503_393389_393497_393854
897387	contig_19076_pilon	+	3355	5	Intergenic	novelGene_74210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	280.493315428372	12	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	446	1315	102295	146375	TRUE	40	TAATAAAACACTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYVLPLQNLQNEQIFSVAPGSESSNGTVSNVQYQVIPQIQSTDGQQVQIGFTGSSDNGGINQESGQIQIIPGSNQTLLASGTPPANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQITWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADGYPVLPILGSRKRNLILKSGSSVVILH	101849	156653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_103079_124492_124513_146309_146503_152200_152398_154937
897388	contig_10609_pilon	-	8417	3	Intergenic	novelGene_123938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	814	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTGGGGGGAGTTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440828	402570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_403175_403219_403390_433185
897389	contig_8377_pilon	-	2897	2	Intergenic	novelGene_35044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84932	81932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_82944_83046
897390	contig_2312_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_160737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAGATACAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228290	226828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_226800_228300
897391	contig_9848_pilon	-	4683	2	Intergenic	novelGene_79925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	4140	4475	69084	68749	FALSE	50	CTAACAAAAAAAAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTQPTRTFGTQQKQCSEVSKCTYPKRRAIIKILILQLEQVEREQQKMPSVTRRKEIIRIRAELNEIENRKTTEEELRSKAGSLQRSTKLINHWPNCKRKTGEEADNLYKK	206812	68540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_72252_205840
897392	contig_10937_pilon	-	3775	1	Intergenic	novelGene_67317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	635	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	2849	3331	93774	93292	NA	80	CAAAAAAAGAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDFFLDELPGTVNAKMESRDAAPSIKEGKQMPQPKGGSVEETFRIVKETLSEDTVKAAQAVYQFELSGEDGGTWFLDLKSKGGNVGCGEPPAQADVVMSISTEDFIKMFSGKLNPTMAFMSGKWKIKGNMALAIKLDKLMTQMNARLKENKMLTTELDK	96622	92847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_92800_96600
897393	contig_17144_pilon	-	2215	14	Intergenic	novelGene_29332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1675.27574697492	98	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	195	2006	179764	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFWLPGTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183276	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
897394	contig_610_pilon	-	2943	10	Intergenic	novelGene_76829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1994	2449	363972	361078	TRUE	20	TCAGTTCTCAGGCTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	376628	349998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_350134_360718_361082_363028_363298_363789_364137_366324_366595_368137_368245_369603_369656_373433_373715_374080_374152_375580
897395	contig_9578_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_67995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225089	1227395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1225100_1227400
897396	contig_12630_pilon	-	1947	5	Intergenic	novelGene_173080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	216.500577366436	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	268	612	81986	77942	TRUE	30	TGTACGAATCATTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRALSKLEKYQKYRID	82253	75474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_77937_77986_81560_81810_81934
897397	scaffold_12124_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_22406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGGAAGTAGTCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509647	1508612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1508600_1509600
897398	contig_3077_pilon	+	2711	8	Intergenic	novelGene_26670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_7	2700.5510548775	263	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	57	1031	9676	16408	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	9619	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144
897399	contig_10734_pilon	-	3858	19	Intergenic	novelGene_50982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.722550422637	407	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	16	1815	308503	292792	TRUE	45	TCCTAGGGAGAAAAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALQELGFPYMTPVQSATIPLFMKNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKCQVGAIIITPTRELAVQIDEVLSHFTKHFPQFSQILWIGGRNPGEDVEKFKAQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVKSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRISVKEKGVAASSTQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEALVKRVTILCIHGKMKYKRNKIFMEFRKLQNGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYVKFLAINQKCPLQEMRLQKNTADLLPELKAMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYVKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLKMPKMPELKGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKVREKQRQKVLEQKRKERTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKREKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKFKKGKITEEEFEKGLLTSGRRTIKTDFRISDLENDC	308518	285640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_285755_287995_288110_288655_288725_289708_289784_290303_290430_291246_292966_293236_293530_293959_294129_294544_294660_295378_295472_296402_296535_299615_299699_302298_302489_304461_304612_305497_305561_305639_305732_306582_306670_306762_306814_308395
897400	contig_8140_pilon	+	2012	6	Intergenic	novelGene_86425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	367.935320402921	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	120	1082	181766	191071	TRUE	50	CTTGATTTAACAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGAGPARSFGNSGGCSSGTADQGPASPRLAPDLEYPDIMGAFLDKPKMEKHNAQGQGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVIGLPSGLETWSFFAVYDGHAGSQVAKYCCEHLLDHITNNQDFKGSAGAPSVENVKNGIRTGFLEIDEHMRVMSEKKHGADRSGSTAVGVLISPHHTYFINCGDSRGLLCRNRKVHFFTQDHKPSNPLEKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDFDYKCVHGKGPTEQLVSPEPEVYDIERSEEDDQFIILACDGIWDVMGNEELCDFVRSRLEVTDDLEKVCNEVVDTCLYKGSRDNMSVILICFPNAPKVSPEAVKKEAELDKYLECRVEGGM	150334	192946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_150398_150659_150696_181745_182600_184978_185097_191060_191119_192063
897401	contig_18592_pilon	+	4838	2	Intergenic	novelGene_114770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTCAAGAGATCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317	6394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_+_3188_3426
897402	contig_11173_pilon	+	2041	13	Intergenic	novelGene_156903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	237.450857488918	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	470	1537	434044	455686	FALSE	35	TGTTCGAGAGAAATATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSRVPPRAVHLRSWGPEPHPAAPQIVDVIVGKDEKGRKIPEYLIHFNGWNRSWDRWAAEDHVLRDTDENRRLQRKLARKAVARLRKGRKKKRCRLPGVDSVLRSPSVEEKDENAENSISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVLSWKLVPDNFPPGDQPPPPSYIYGSQHLLRLFVKLPEILGKMSFSEKNLKALLKHFDLFLRFLAEYHDDFFPESAYVAACEAHYSTKNPRAMY	430919	456190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_430993_431765_431849_432247_432344_432692_432791_433341_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936_450047_452961_453062_453732_453818_455586
897403	contig_10861_pilon	+	5160	3	Intergenic	novelGene_39244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	721	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4787	5128	735624	737187	FALSE	15	TCTGCTTCCACCCCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCAAFTPSLAYVQQQEVSAGVGAQVSIAEAHSSCLAPPSKVSQGTIKGLGLIQCCGRRVGAPCLGDFLFGVFCFFFLFSFTFADMNHHAWCRLSSCVKFVFLSWSQFGNSTK	730794	737219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_732212_732254_735937_737158
897404	contig_10434_pilon	-	2955	13	Intergenic	novelGene_82055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	194.248337616224	64	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	148	1407	191899	167742	TRUE	20	AAGAATTGGTTCTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPSAPSVTSAPAPAAFLPFSTVCLLLGGTRFPILPPLYPVLVAGFFPHMDLVGVASPEPRPAACPWATPQNTISCSLADVMSEELAKELQLEEEAAAFPEVGSAAEGPFIIGENIDTSSDLMLAQMLQMEFDREYDAQLRREEKKFNGDSKVSISFENYRKVHPYEDSDSSEDEVDWQDTRDDPYIPAKPVPTPKKGFTGKGKDITTKHDEVVCGRKNTARMENFAPEFQVGDGIGMDLKLSNHVFNALKQHAYSEERRSARLHEKKEHSTAEKAVDPKTRLLMYKMVNSGMLETITGCISTGKESVVFHAYGGSMEDEKEDSKVVPTECAIKVFKTTLNEFKNRDKYIKDDFRFKDRFSKLNPRKIIRMWAEKEMHNLIRMQRAGIPCPTVVMLKKHILVMSFIGHDQVPAPKLKEVKLSSEEMKEAYYQTLHMMQQLYNECTLVHADLSEYNMLWHAGKVRSICC	192046	162880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_163936_164297_164521_165465_165574_167579_167844_169239_169400_170625_170824_174791_174920_175623_175768_177361_177472_177681_177790_177878_178025_178827_178947_191854
897405	contig_16525_pilon	-	639	3	Intergenic	novelGene_133841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2163.5	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTATCCAGTCTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181486	178019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_178303_178427_178686_181388
897406	contig_1639_pilon	+	3773	26	Intergenic	novelGene_74880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_24	225.521922659417	743	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	142	1743	283593	314011	TRUE	20	GTTTTGAAAACGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRHES	279687	331938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_313997_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
897407	contig_16846_pilon	+	1573	4	Intergenic	novelGene_82932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	8.60232526704263	358	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAGATTTTAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518557	578247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_518861_520467_520574_574808_575051_577325
897408	contig_4751_pilon	+	3259	15	Intergenic	novelGene_173720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	122.914023377551	257	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	802	2409	637	3045	141431	398107	FALSE	40	AGTTAATTTAAATTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLLNQRDHWALVSSYKTCRTAGVHIDESLFPAANTNEQLPSLIKKKRKCMQPKDFIPKTPENDKRLQKKFEKMTKELQRQKTTLDSDVPALLFAPNGSLLYSPTVKTNSYHHSAMEKRLQEMREKRENLSPTSSQVIENSQDSPVNSLCLSPLNVSHDTSCSDESFAGVLHSSFDICGNSRRRNQEVKLGGLINDIGGGICMSSPVSKTSSTHSSASCSHLNKLTPQRPMNKLSEEKLNWQGDIVGETVTPDKKQSEGMSEEMLDEKCSLSPVLSTTEGHSLVHSRPSSSFAKRRRTSGYLHSPPKEKLKKKKYSTKSSLPKWQLFKSENRPQLMTKSVTETPDCGESSYDDYFSPDNLKERNSRSLLSDFQLSSNLVQFNSRSLSKNERGSILKMSDFSFMGKKSIPVDITDLTAKTSSSLQTPTNDEGNTTLSFMTSKEACTAEETPRDCIQADPQKREGPSPEEYNFSYIFDKLVHPKESLEQGHHGNLTPLKGNTNKMKKLIEIKSIQKEEGTTSKMLNSSESETQNNYKLHVVDDCKVEKSTEEMKNSSRGYSESVENGQTSRDVLPGSYEGFKELLKPHEEPNKRSEVKKPTRTLVMTSMPSEKQNVVIQVVNKLKGFSFSREVCETTTHVVTGKPLRTLNVLLGIARGCWILSYEWVLWSLEMGHWISEEPFELSNYFPAAPVCRLECHLSAGQYQGDLFSGQPVMFIAPASTPPAAKLCELVHLCGGQTTRVPRQASIFIGPYRGKKKATIKYLSEKWILDSITQHKVHPSENYLLCSEEDITQHLAITNSL	110213	398321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_110512_112256_112349_117475_117595_141303_141487_153643_153732_158296_158412_160614_160759_163417_163508_172925_174117_184098_184209_217923_217962_220285_220449_239280_239359_373781_374020_398009
897409	contig_1275_pilon	+	1097	8	Intergenic	novelGene_108758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAGTTTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400557	457708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448503_456885_456973_457653
897410	contig_4180_pilon	-	2672	1	Intergenic	novelGene_8409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAGAAAAAACCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889346	886674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_886700_889300
897411	contig_2480_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_63554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTACTAGCAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308824	306149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_306100_308800
897412	contig_8606_pilon	+	3662	3	Intergenic	novelGene_159403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	811	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1363	1857	114326	114820	TRUE	55	GGAAAGAAAACAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQKQLEIQNINNKISEMDGVIKGLRSRFEMVEDRISGIEEKHMDTTLFDENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQAIGVPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDKKLTIQEAQCIPCRIDPRRKSPRHIIITLVKTKDRQRILRAA	112963	131254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_114935_129432_129884_130014
897413	contig_19647_pilon	+	7091	5	Intergenic	novelGene_144016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	738	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	6624	7091	113141	146598	FALSE	25	TCCCACAATGCACAGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRGVTRPFLLSLAALPASSRISAVRYSRTAAMYTGAPTPILYLGWPFLMYRSIRPTGKMTPALADREVLVDFFFPPRLDMVVALDVDQQEHWRLGGGGCSSKVSRLVPSRPLAPFLSALLAGPPASSLPARTPRARPLRLVRCRVNWNQSPRPRD	96279	146598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_102668_112495_112694_113103_113213_137750_137956_146407
897414	contig_5423_pilon	-	2872	16	Intergenic	novelGene_85231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_14	226.353842958811	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	516	2561	532780	497362	FALSE	40	TGCAAAATATTGGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLLMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534598	497050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_532555_532792_534094
897415	contig_8823_pilon	+	5874	5	Intergenic	novelGene_53051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	31.8001572323157	550	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	208	576	64423	77224	FALSE	40	TGCCTAGCACATAATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIRKCFFPIPGFFRLMEGRENAGDLREEKAKRGGTRGWEEEKDLLQAIVSRARTWVCRLPLLLHSQVQTLTGDPLLRRNHGKYYGCQRYNFKTAIKAAPDAHCVSKHHSKHVTCSITHSS	51757	82522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_64281_64443_76219_76301_76878_76985_77062
897416	contig_9436_pilon	-	2090	3	Intergenic	novelGene_60908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	12	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418515	415406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_417423_418342
897417	contig_3320_pilon	+	2790	10	Intergenic	novelGene_133056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_9	89.7056916316413	500	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	38	856	103751	175843	FALSE	5	CTTGTGTGCTTGAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGSGGGSCEGKMVLIKEFRVVLPCSVQEYQVGQLYSVAEASKNETGGGEGIEVLKNEPYEKDGEKGQYTHKIYHLKSKVPAFVRMIAPEGSLVFHEKAWNAYPYCRTGKPNEYMKDDFFIKIETWHKPDLGTLENVHGLDPNMWKTVEIVHIDIADRSQVEPADYKADEDPALFQSVKTKRGPLGPNWKKELANNPDGPQMCAYKLVTIKFKWWGLQSKVENFIQKQEKRIFTNFHRQLFCWIDKWIDLTMEDIRRMEDETQKELETLRNQGQVRGTSAASDE	103713	177777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_103771_109909_109941_113136_113283_125922_126023_127202_127278_129176_129261_154065_154144_169044_169156_170845_170969_175792
897418	contig_9843_pilon	-	4694	1	Intergenic	novelGene_114333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	421	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	679	2040	302	2341	234488	232449	NA	25	CTAGAACCCAGGCCTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSREEAPRSRRLASPRGGRRPKRISKPSVSAFFTGPEELKDSAHSAALLAQLKSFYDARLLCDVTIEVVTPGSGPGTGRLFSCNRNVLAAACPYFKSMFTGGMYESQQASVTMHDVDAESFEVLVDYCYTGRVSLSEANVQRLYAASDMLQLEYVREACASFLARRLDLTNCTAILKFADAFDHHKLRSQAQSFIAHNFKQLSRMGSNREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIDSERTVCHVAMQWLEAAPKERGPSAAEVFKCVRWAHFTEKDQDYLEGLLTKPIVKKHCLDVIEGALQMRYGDVMYKTLVPKPNSSTSSIVSSAENPPQRMGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCYDPYSGDIYTMPSPLTSLAHTKTITSSAVCVSPDHDIYLAAQPRKDLWVYKPAQNSWQQLADRLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPVTGVKLKEVECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELIVVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRSDFQEACVFNDEIYCICDIPVMKVYNPARGEWRRISNIPLDSETHNYQIVNHGQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGTMLGLLQFDSGFICLCARVYPSCLEPGQSFITEEDDARSESSTEWDLDGFSELDSESGSSSSFSDDEVWVQVAPQRNAQEQQGSL	234789	230095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_230100_234800
897419	contig_1435_pilon	+	1197	1	Intergenic	novelGene_115517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTCCGTAACAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571129	572326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_571100_572300
897420	contig_10549_pilon	-	2717	2	Intergenic	novelGene_110590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	684	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCATTTATGTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117982	114987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_117466_117743
897421	contig_10159_pilon	-	3242	9	Intergenic	novelGene_30883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	869	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTTCGGGCATTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997817	975183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_975297_976397_976516_976640_976753_978440_978554_982652_982861_992071_992205_993297_993568_994445_994676_995872
897422	contig_6227_pilon	-	6284	13	Intergenic	novelGene_49782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	60.0964502556793	1123	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	1687	4008	1254536	1237069	FALSE	20	ATACTTTGTATCTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVVVDTAQIENKEAYAPQISLEGSRIVVQVPSTWCLKEDPATMSLLQRSLDPEKTLGLVDVLYTAVLDLNRWRAGREQALPCIQIQLQREICDFGNQADLPSGNGNKSSGLQKTFAKLTSRFTKKASCTSSSSSTNYSIPNTPSKNIFIAGCSEEKPKMSSNIDTRLQSILNIGNFPRTTDPSQSAQNAGNQMANGFLMERHENFLHGDDSKDEKGMNLPTDQEMQEVIDFLSGFNMGQSHQGSPLMTRRNSAATAMVTEQKAGAVQPQQPPLPVPPPRPPQAGTHTPLTPQLGLAPQQQSPKQQQPQVQYYQHLLQPIGPQQPPPQPRAPGKWVHGSSQQPAQAQPVGAGLSPLGQWPGVSDLSSDLYSLGLVSSYMDNVMSEVLGQKPQGPRNNTWPNRDQSDGVFGMLGETLPFDPAVGSDPEFARYVAGVSQAMQQKRQAQHGRRSGNPRGNWLPMDDAHRTWPLPEFFMEGDGLSSGWSGAQGDSASSSDETSSANGDSLFSMFSGPDLVAAVKQRRKHSSGEQETNTLPSPPLLTTVEDMNQDNKTKTWPPKAPWQHSSPLPSTLPSPSTPLYAVASPSSQWNDTMQMLQSPVWAATSDCSAASFTYVQTPPQPPPPPAHKAAPKGFKAFPGKAERRPAYLPQY	1292063	1234792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1237378_1237900_1237980_1239862_1240001_1240778_1240945_1243908_1244943_1246112_1246239_1250370_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774
897423	contig_6191_pilon	-	2039	7	Intergenic	novelGene_107865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_6	76.5079879634945	262	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	137	1069	554774	476374	TRUE	65	CAAAAGAGAAAGAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRKALEGKGCSFSLCNTDRPAQLRAGSFLSVSPRPSLSPRREAAKMDPQHTMGLKSTLFVTALLLSGAVAAVKTQAYFNETAYLPCQFINSQNRSLDELVVFWQNQEKLVVYELYQGKEKYDNVDSKYKSRHISFDEENWTLQLHNVEIKDQGDYQCFIHHKSHKGLVPIHKMSSELSVIANFSQPEILEDSNTSSKSYRNLTCYSVQGYPHPEEMYFLLRTENSTTKYSPTMQKSQDNITELYKVSISWSYSGFHDPSNRSITCVLCVLGMCLFSKPYNIVPPKTHLPPKDNMLWIAAPSLVIVGVMVFFLAQWKRKKKQPDLSRERHESETIKMEGEESKNATHQQVPTLQHC	554910	474047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_475013_476368_476448_490107_490258_493011_493315_495376_495719_506852_506903_554760
897424	contig_6138_pilon	-	3129	20	Intergenic	novelGene_159684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_8	97.427578046408	327	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	906	2721	146	2866	619342	569009	FALSE	25	TGAATCAGTGATTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSVAQIKHSSGHDRRENYNSHQRTSSPEDRYAEQERSPRERDYFDYSRSDYEHSRRGHSYDSGMESRSRDREKRRERDMDRKRSRKSPSPGRRSPEPSVTQSSSAQDEPTAKKKKDEVDPLLTRTGGAYIPPAKLRMMQEQITDKSSLAYQRMSWEALKKSINGLINKVNISNIGIIIQELLQENIVRGRGLLSRSVLQAQSASPIFTHVYAALVAIINSKFPQIGELILKRLILNFRKGYRRNDKQLCLTASKFVAHLINQNVAHEVLCLEMLTLLLERPTDDSVEVAIGFLKECGLKLTEVSPRGINAIFERLRNILHESEIDKRVQYMIEVMFAVRKDGFKDHPVILEGLDLVEEDDQFTHMLPLEDDYNPEDVLNVFKMDPNFMENEEKYKVIKKEILDEGDSDSNTDQDAGSSDEEEEEEDEEGEEDEEGQKVTIHDKTEINLVSFRRTIYLAIQSSLDFEECAHKLLKMEFPESQTKELCNMILDCCAQQRTYEKFFGLLAGRFCMLKKEYMESFESIFKEQYDTIHRLETNKLRNVAKMFAHLLYTDSLPWSVLECIKLSEETTTSSSRIFVKIFFQELCEYMGLPKLNARLKDETLQPFFEGLLPRDNPRNTRFAINFFTSIGLGGLTDELREHLKNTPKVIMAQKPDVERNKSSPSSSSSASSSSESDSSDSDSDSRDNSSESSSEESGSSSTGSRSSASAKNIRKKAQGKTRSKEVDKLIRKQQTNDRKQEERRPEQRHQETRTERERRSEKHRDQNSRDPNRREATTKYSSDRGVPSERDSYSRVANDRDQEMYIDLENKHSDPKKKREERRNSFSENEKHRHRTKDSENFRRKGRSKSREKNSKHSGSRSDDNRYQNGAERRWEKSSSYSEQSREPEKNQDRRREKSPTKQK	636869	568745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_569596_575307_575529_575621_575724_577345_577474_579122_579276_579911_579990_583601_583663_591382_591465_592701_592807_598577_598641_598732_598940_599038_599175_600629_600684_601111_601281_606576_606706_608024_608265_613332_613444_614956_615025_619315_619456_636837
897425	contig_3747_pilon	+	1948	4	Intergenic	novelGene_24953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_3	1653.18467073572	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	295	546	203322	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202926	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203128_203228_203386_203498_203651_203768
897426	contig_4659_pilon	-	3927	19	Intergenic	novelGene_118182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	185.813593038897	78	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	1739	3349	158021	123044	TRUE	55	AGGAAAAAATGGAAGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKSQDSDLKQYWMPDSQCKECYDCSEKFTTFRRRHHCRLCGQIFCSRCCNQEIPGKFMGYTGDLRACTYCRKIALSYAHSTDSNSIGEDLNALSDSACSVSVLDPSEPRTPVGSRKASRNIFLEDDLAWQSLIHPDSSNTALSAGLVSVQEDAGKSPARNRSASITNLSLDRSGSPMVPSYETSVSPQANRTYIRTETTEDERKILLDSVQLKDLWKKICHHSSGMEFQDHRYWLRTHPNCIVGKELVNWLIRNGHIATRAQAIAIGQAMVDGRWLDCVSHHDQLFRDEYALYRPLQSTEFSETPSPDSDSVNSVEGHSEPSWFKDIKFDDSDTEQIAEEGDDNLANSASPSKRTSVSSFQSTVDSDSAASISLNVELDNVNFHIKKPSKYPHVPPHPADQKEYLISDNGGQQLSISDAFIKESLFNRRVEEKSKELPFTPLGWHHNNLELLREENGEKQAMERLLSANHNHLMALLQQLLHNESLSPSWRDIIEPWQPPETVRAVQQLFCPVQQCPQCLRQSLDCNNGILWKE	162771	118410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_118485_118913_119028_120654_120834_122174_122347_123004_123077_124458_124549_134161_134247_134673_134804_136451_136512_142730_142899_143435_143584_144559_144672_145670_145829_147015_147155_150997_151088_152896_153105_157141_157314_158003_158123_161134
897429	contig_4315_pilon	+	3299	22	Intergenic	novelGene_46743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	161.873526398707	2	127	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	914	2329	207437	223875	TRUE	20	TTTCTACAAGAGCTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEIALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMMKIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDPEKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGSIASKGKGGALAADIDIDTVGTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLDLPPELDVPTGAGGGAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERWQPISLTQTCSLCT	185223	226136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_185299_186247_186315_188089_188166_190414_190498_191180_191321_191897_191984_192100_192240_207189_207575_214651_214842_214960_215057_216250_216340_216527_216652_218708_218799_218980_219091_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223485_223829_223992_225023_225219_225477
897430	contig_4469_pilon	-	5860	1	Intergenic	novelGene_21951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1171	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGTGTGCTCCCTGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757513	751653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_751700_757500
897431	SIRV6	+	1980	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	34	-45	34	45	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	82	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCGTCGTTGAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9033	11013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_9000_11000
897432	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	124	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
897433	contig_17768_pilon	+	2960	1	Intergenic	novelGene_140399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2295	2624	71414	71743	NA	35	CACCATCACCACCACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKILTTGPISNVMINREKIEVVRDFILLGSLNNAHRSSSQEIKQHIALGKYAAKDLFKALKSKDVTLKTKVHLTQTMEFPVASYAYKSWTMNKEKQRRVDAFELWCW	69119	72079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_69100_72100
897434	contig_7291_pilon	-	2052	10	Intergenic	novelGene_106297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	367.215078094905	42	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	449	601	178244	173921	TRUE	15	TCTGGGTAAGTCTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDPALLAQRISSNIQKITQCSVEIQRTLNQLGTPQDSPELRQQLQQKQQYTNQLAKETDKYIKEFGSLPTTPSEQRQAAEREKEFVARVRASSRVSGGFPEDSSKERNLVSWESQTQPQVQVQDEEIAEDDLRLILERESSIRQLEADIMDINEIFKDLGMMIHEQGDVIDSIEANVESAEVHVQQANQQLSRAADYQH	206256	172354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_173841_173927_176384_176468_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180683_181475_181570_183797_183868_206194
897435	contig_5020_pilon	-	4362	8	Intergenic	novelGene_27933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAACCCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458345	147172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_147633_316628_317015_332674_332772_333142_333252_406464_407719_411067_412088_448221_448476_457563
897436	contig_18108_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_33456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATAATAACAGAAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106714	104557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_104600_106700
897437	contig_14682_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_139117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTTACGAGTGATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110280	112625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_110300_112600
897438	contig_3424_pilon	+	11264	3	Intergenic	novelGene_55545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	997	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGTTCTACATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296433	521652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_306450_488367_489239_521275
897439	contig_4232_pilon	-	2872	3	Intergenic	novelGene_63448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72	6183	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAATTGCTGTATCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546386	542768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544060_544618_545650_545836
897440	contig_10009_pilon	+	4058	2	Intergenic	novelGene_82735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	0	119	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1645	1950	63985	64290	FALSE	45	AAAATGGACTGTTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHRARYSSERRGRWGEARKKSKEAEKSNTSSQQMALREPPVRVCGIQAATVFRSRDCGHGKQRRPSWGEEGWGVGKRISPITGMLSKTETNVSPGTLSIK	54421	66398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_+_55301_63219
897441	contig_11752_pilon	-	10102	1	Intergenic	novelGene_37673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1014	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCATAGGATTTCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105925	95823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_-_95800_105900
897442	contig_13700_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_68294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGACGTATATATGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150478	152783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_+_150500_152800
897443	contig_6365_pilon	-	1015	4	Intergenic	novelGene_134006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	882.912226668087	36	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	248	589	50867	47435	FALSE	45	TGAAAACTGAGTACTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEYKKIILLEELCVINDYSFKILKNFLAHDLQLTRKMEEEYDRIKIVDLMEEKFQGAAYRMLKRAKLKVAKDIEEKRTLIKSSKQDRTGPAMSTFTTQEGQVSLMNENTAV	56658	47008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_47458_49501_49610_50656_50888_56431
897444	contig_10986_pilon	-	2776	8	Intergenic	novelGene_71498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	18	junction_7	47.2703902661948	279	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	22	1539	149386	139251	FALSE	30	CTGTATTTACAGGTAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAAAATMHRPRPACCTLLLVLGLCSAHRARGRNVLLILADDGGFESGAYNNSAIATPHLDALAHRSLIFRNAFTSVSSCSPSRASLLTGLPQHQQGMYGLHQDVHHFNSFDKVRSLPLLLSRAGVHTGIIGKKHVGPEAVYPFDFAYTEENSSVLQVGRNITRMKLLVRKFLKSQDHRPFFLYVAFHDPHRCGHSQPQYGAFCEKFGNGESGMGHIPDWTPQTYDPQDVQVPYFIPDTPAARADLAAQYTTIGRMDQGIGLVLQELQGAGVLNDTLVIFTSDNGVPFPSGRTNLYWPGTAEPLLVSSPKHPRRWGQVSEAYVSLLDLTPTILDWFSIPYPSYTIFGSKTVQLTGRSLLPALESEPPWTTVFGSQSLHEVTMSYPMRSVYHQNFHLVHNLNFKMPFPVDQDFYVSPTFQDLLNRTRAGQPTGWYKDLHHYYYRERWELYDRGQDPHETQNLAADPRYAQLLEVLKTQLAKWQWETHDPWVCAPDGVLEEKLSPQCQPLHNEL	149407	138013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_139811_142325_142530_143579_143662_144669_144827_145833_145985_146233_146340_147138_147300_149289
897445	contig_13481_pilon	+	2492	7	Intergenic	novelGene_119476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1010	1495	1305851	1306336	TRUE	30	TCACTGCTAGCCCGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLRQQNLGTLSPRKLKLQPNQPTTFQNPSRLIESFKPATGVSEAAAGWSSGSYSKAEQTGKVFTLNQFHSGNEKEAPKSASHSFSAAPREVCLQRCDVLFICSVVRGAGAGQLELLGRVGQLEGSVGVGRVGQQCALPFQHVSHPFEQVQETKGQGSLS	1304841	1326153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1306348_1308588_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318788_1321351_1321443_1325725
897446	contig_2093_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_153004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	223	831	1418890	1419498	NA	15	CCCTATTTGCACTTAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLIFIPFGSEHRLTQPHFLQTPCAETGPSSLYPNCWRESSSDWAENPEQGSRSPPDSEGHWLPGPPAAVDAPITSAPLGYCCSWNQAQSFFAPLDITFAQQAGPPQGSCLQPHRVSPGMSHPAWPFLPSSPAMSRSCLIAESLRARKRCPPSVLSPKPSSVHIFSPFWSPLPQLYQSPLQGPPTRTEDPFSYHRQDQHRPW	1418667	1420224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1418700_1420200
897447	contig_13145_pilon	+	2402	4	Intergenic	novelGene_116631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1379.72050309716	42	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTTGTATAGCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47201	59595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_47281_48800_48895_57324_57489_57530
897448	contig_6189_pilon	-	4014	6	Intergenic	novelGene_164927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1253	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95601	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_2801_38538_38546_48324_48712_53271_53660_55082_55239_95323
897450	contig_20842_pilon	+	1981	20	Intergenic	novelGene_160960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	380	8	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACGTCATGAACCGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8351	235646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_+_8431_19914_20016_21901_21960_22050_22109_33081_33258_40782_40859_41604_41640_59926_60012_89827_89925_124659_124755_127282_127329_130215_130265_131008_131081_132234_132296_141520_141595_147846_147901_173521_173625_187148_187219_207158_207259_235154
897451	contig_5711_pilon	+	2143	15	Intergenic	novelGene_80292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_4	506.269192128021	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1980	164	2143	226406	249314	FALSE	50	AATTAACAATGTTTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNYKNFKGTIQELGQNQYAVSGEIFVVDRNTVEITELPVRTWTQVYKEQVLEPMLNGTDKTPALISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYETVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESSKLNNQARFILEKIQGKITIENRSKKDLIQMLVQRGYESDPVKAWKEAQEKAAEEEETQNQQDDSSSDSGTPAGPDFNYILNMSLWSLTKEKVEELIKQRDAKGRELCDVKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVEAQEREDILAGMSGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRVVPEITAMKADASKKLLKKKKGDLDTTIVKVEFDEEFSGTVEGTGEEALTPSAPINKGPKPKREKKEPGTRVRRTPASSGKSNTKKVKKRNPWSDDESKSESDLEETEAVVIPRDSLLRRAAAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDNNDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKPKATPEKPSHDKKSQDFGNLFSFPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKPTDKVPSKTVAAKKGKPSSDITPKPKRTPKQKKVEAVNSDSDSEFGVPKKTAASKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKTSKTTTSKKPKKSSFDQDSDVDIFPSDFASEPPSLPRTGRARKEVKYFAESDEEEDVDFAMF	225165	249314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_225302_226378_226580_227663_227860_228004_228097_230875_231032_231179_231264_232672_232868_235431_235574_235807_235970_237916_238122_240295_240376_241604_241716_246411_246535_248135_248234_249152
897452	contig_4732_pilon	-	3491	1	Intergenic	novelGene_75501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	420	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1383	1733	1024284	1023934	NA	30	CTCCGTATAAATTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLRDALRDFLYSRHTLRCLYYVISIRFPLGNRDKSHQPGNSFLCLLIQRHKEPKMAFLTSSSVESVMCLQVTAFFPLELRPLDLQSIRSRGQEGKNFVSGSLGVIVWCHSISTP	1025666	1022175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1022200_1025700
897453	contig_15666_pilon	+	2328	6	Intergenic	novelGene_70155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1526	1834	108776	109324	TRUE	15	CCACTCCCATCTGACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEACQESRASVTEKALHYFFNISVAIEHPADILGPTPCSWRRLPGIPLETQEICSLIRPFKEAF	106772	110702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_108006_108101_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
897454	contig_2043_pilon	+	2593	2	Intergenic	novelGene_169904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	583	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681439	687326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_683741_687034
897455	contig_13144_pilon	+	3222	1	Intergenic	novelGene_178460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1735	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2186	2515	103596	103925	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKQH	101410	104632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_+_101400_104600
897456	contig_17144_pilon	-	942	3	Intergenic	novelGene_29125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	192	659	12299	11832	TRUE	30	CCCAGAGCCATGGTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFSKSSRSLYLLGD	13463	9996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10124_11675_12356_13328
897457	contig_16948_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_166410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTACCAATGCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294048	295924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_294000_295900
897458	contig_13428_pilon	+	1039	11	Intergenic	novelGene_143433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	317.015078505739	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	653	1039	50306	59797	FALSE	55	AGTGCACCAACAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDEILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLA	40733	59797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40919_45024_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252_50392_51921_51995_53267_53389_54327_54413_59775
897459	contig_5023_pilon	-	2342	10	Intergenic	novelGene_7301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1016	1516	647301	643482	TRUE	10	TGGCGGGACTGGCGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648316	580885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580903_607252_607341_607933_608098_609592_609656_629236_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
897460	contig_12970_pilon	+	2242	8	Intergenic	novelGene_50502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_1	833.663344179514	535	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	272	856	16856	74509	FALSE	55	ATAGAAAGTCATAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLHQINMLLYLFIKTSKNQIKVDLVDENFTELRGEIAGPPDTPYEGGRYQLEIKIPETYPFNPPKVRFITKIWHPNISSVTGAICLDILKDQWAAAMTLRTVLLSLQALLAAAEPDDPQDAVVANQYKQNPEMFKQTARLWAHVYAGAPVSSPEYTKKIENLCAMGFDRNAVIVALSSKSWDVETATELLLSN	15610	75895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_15863_16836_16901_45022_45117_49409_49469_61722_61806_70870_70971_73993_74123_74434
897461	contig_16775_pilon	+	3260	16	Intergenic	novelGene_107749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	182.591054910511	1994	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	320	1804	130489	174136	FALSE	30	ATGAAATCTCCTATATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130169	175592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
897462	contig_6102_pilon	-	1469	7	Intergenic	novelGene_32167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	527.780073094424	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	186	578	867239	839973	FALSE	10	TTTGGTTGTCCTTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867424	839081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
897463	contig_854_pilon	-	3141	2	Intergenic	novelGene_36326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	772	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTCCCGCTCCGGCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669104	643848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_643918_666032
897464	contig_10500_pilon	-	3610	8	Intergenic	novelGene_41272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	3483	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	182	1090	1640040	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640221	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
897465	contig_14519_pilon	-	2088	10	Intergenic	novelGene_66816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	134.865731125808	85	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	126	779	283786	275412	TRUE	25	CATTGGTTACCAGCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKKTSWCYMGKVFRVLQQKKHHYV	287182	269514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275481_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283842_287112
897467	contig_4857_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_48873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGCTCATAAACACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362400	1364512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1362400_1364500
897468	contig_14666_pilon	+	1396	5	Intergenic	novelGene_39582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	92	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	86	1309	477340	485144	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSLGSSADM	477254	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484783_485118
897470	contig_7078_pilon	-	2121	7	Intergenic	novelGene_130152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_6	120.983010744852	573	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	41	745	547999	541768	FALSE	15	GCTTAGAGGTTTTTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKDHKEPKKLRPMKVSSVDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIAHVEEHGLDVDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIKQLPKPNQDTMQILFRHLKRVIENGEKNRMTCQSIAIVFGPTLLRPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR	549485	540391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_541943_543085_543189_543419_543555_543657_543736_545054_545154_547884_548002_549447
897471	contig_614_pilon	+	10039	61	Intergenic	novelGene_132635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	63	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	3761	4597	1040555	1048967	TRUE	65	AAACCAGCAAAAATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHETQEETSVGIIGGKDDVPVLLQIAQDAEEAEAFGEGLLGLGKAIQDDFIQTAIQSAEDGFPLRSDALNDHHDVLCDEEKDVSGVGCEHPTVQLLHQLLGEVGDVGEGWSSSSFCIRLRLLTASQYRRIAFTHNVKYLHGGEQDLRLEVSLLLASGTVRRSLQEHLQWQPLLGGGSRLQEPPQDKLCKHPQLLPSRSLELLCRAVTFGRSPRTPSIPGGLSHGPLLHSQREGDRSQGLEKLQGMPHRVLGVGTVDEAQELQHAGREALFPDVIFRIC	858003	1224588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_858467_859669_859777_863774_863864_864441_864627_866617_866796_871529_871685_872448_872636_874609_874758_877373_877586_886007_886105_887935_888090_898936_899044_901726_901846_904385_904506_906857_906903_943440_943502_945012_945098_948468_948591_966341_966489_982379_982549_983323_983372_985592_985803_993543_993618_1027592_1027734_1028984_1029173_1030633_1030759_1040530_1040766_1043107_1043267_1044338_1044454_1045123_1045313_1048804_1048971_1063954_1064080_1066592_1066764_1067682_1067888_1069788_1069890_1071834_1071926_1072503_1072664_1075664_1075746_1080283_1080430_1086303_1086502_1087761_1087872_1088852_1088998_1090361_1090597_1096275_1096453_1097275_1097497_1098549_1098628_1099062_1099266_1100162_1100258_1101482_1101700_1116092_1116190_1157199_1157782_1176740_1176932_1178352_1178457_1182622_1183080_1187941_1188099_1190468_1190658_1192334_1192530_1196189_1196321_1198470_1198588_1199504_1199613_1224236
897472	contig_10990_pilon	-	2406	3	Intergenic	novelGene_7463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	809	1297	710709	710221	TRUE	35	CGCAGCAGCAACACCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	711724	708575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_708653_709188_711258_711464
897473	contig_20293_pilon	+	1608	1	Intergenic	novelGene_153534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGACATCACCTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109722	111330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_109700_111300
897474	contig_5918_pilon	+	5578	21	Intergenic	novelGene_99532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	274.715029621606	10	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1310	3933	435	4367	723163	774707	FALSE	45	CCATTTGGAAATCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDIAVSKNTSVPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGALSPSLGNSSVLKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQAKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSVVSSPLSSPLHRSGIDITDFQAKREKVHSQYPPVQRLVTPKPVSVATNRTVYFKPSLTPSGESRKANQRVEKKHNTGYEKNRTPEQNREQRESGFSYPNFSMPAANGLSPGAGRGGGKMRRERTRFVASKPAEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFSFSSSEITASSPSPVSPSQLLTNKVQTTSPSSTGSPMFRFSSPIVKSTEADVLPPSSIGFTFSVPVAKTTELSGSSSTSEPITSSSAQDTTSVNSTSCKKKLDEDCEGLFVPAKVLKEGSVLDVLKNPGFLSPKVDSLAAQPTTTSPAVYTRPAISSFSSSGVGLGEGLKAGSSWRCDTCLVQNRVTDNECIACQATKSPPRDSAKQMGVGTASQSGKPAPPAAGTGFGDKFKPAAGAWDCDTCLVQNKPEAVKCIACETPKPGTGVKRALTLPAASESAVTVTASSSSCTVTTGTLGFGDKFRRPLGSWDCPVCCVSDNAGDDKCVSCMSEKPGISVPTSSSSTPPVSLSSGGSLGLDKFKKPEGSWDCEVCLVQNKPESARCVACESAKPGTKSEFKGFGTSSSSSNPAASSFKFGIQPSSSGPSQTSTNTGNCKFGDKGGFTAGVASDSESANPMSGGFTFSKPTGDFKFGVSSDPKPEEDKKDSKNDNNFKFGLPSGLSNPAPLAPFQFGVSNLGQQEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINPAPAATNTTVTSETKSSFSFGTIETKSVSVSPFTCQTAEASKEEKPAARVGFTFGSVEQASLPSTSAFVLGRTEEKQPEPVTSTSLVFGRKADGEEPKCQPVFAFGSSEPTKDESASKSTFSFSMAKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSATADQGAAKAVFSFLNNSSSNSSPPATSTSGVLFGSSTPSSSAPAAAFVFGQASNPAGGPAFGNSAESSPSQSLLFSPENKPAAASVTAAAVAPFVFGPGAGSSTTATAGFTFGAPTTSSSAGSSFVFGTGPSSTPSASPAFGASQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSIASSTALFSTGSQPAAPTFGTVSSSSQPPVFGQQPTQSAFGSGAAPNSGPVFQFGSTTTNFNFTNNNPSGVFTFGANSSTPAASARPSGSGGFPFSPPSAPFTVG	698968	775918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_699091_712246_712476_723079_723329_723485_723626_723702_723832_730813_730931_731037_731083_731191_731246_733163_733311_737959_738013_738277_738405_744476_744615_745267_745367_746146_746235_750662_750789_753153_753772_760679_760875_764186_765072_767386_767744_768510_768787_774534
897475	contig_7840_pilon	+	1374	3	Intergenic	novelGene_68978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACGAAGGGCTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183101	306112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_183152_237998_238036_304825
897476	contig_2036_pilon	+	5009	4	Intergenic	novelGene_131824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	916	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACCCAAGTAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614099	643430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_617231_631747_631867_636553_636731_641848
897477	contig_16742_pilon	-	4610	3	Intergenic	novelGene_176574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_1	55	233	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	833	2502	160	2661	39996	23171	FALSE	35	CGAAATCCTTGACAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSCTLPSSALSTIISVGHQAAERSHWCLRAAWSGYYSLSCFQRATAGHRNAGMMPFSHLAGTLIPAMTFLSYLRPESWEPCVEVVPNISYQCMEVNLYKIPDNIPSSAKNLDLSFNPLRHLGSHSFSNFPELRVLDLSRCEIQTIEDNAYQGLNHLFTLKLTGNPIQHLALGAFAGLSSLQKLVAVEINLTSLEDFPIGHLKTLKELNVAHNSIHSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSNNRIQNIYHKDLQILHQIPLLSLSLDLSLNMIDFIQPGAFKGIRLHKLTLRSNFDKMNVMKTCIQALAGLEVHQLVLGEFKNERNLDRFDKSALEGLCNLTIEEFQIAYLEDFSSNDIGVFNCLANVSAVSLVDLWLNKLESLPKDFRWQSLELVNCRFEQFPALALPSLKTFVLTANRDSKTVVDFELPSLEFLDLSGNGLNFRSCCSHSDFGTTRLKYLDMSFNNIIVMGSNFLGLEQLEHLDFRSSTLKQANDFSIFLSLTKLLYLDISHTHTRVVFHGIFHGLYSLKVLKMAGNSFRDNFLPAIFTDLTNLTFLDLSHCKVEQVSQGAFDSLLRLQVINMSYNNLLLLDILPFKYLHSLQVLDYSFNHIVAPKVQKLQHLPSNLTLLNLTQNDFACVCEHQSFLQWVKDQRWLLVEVEQMMCATPLDMQGMPVLSFRNTTCQMNKIIISVSVLSVLVVSLTVVLVYKFYFHLMLLAGCKRFGGDECTYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIQEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIILQKVEKSLLRQQMELYRLLNRNTYLEWEDSVLGKHIFWRRLRKALLAGKPQSPEGAADAENN	40155	21221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16742_pilon_-_25413_29307_29475_39903
897478	contig_8304_pilon	+	6092	1	Intergenic	novelGene_153183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGACTTTTTAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151761	157853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_151800_157900
897479	contig_9633_pilon	-	4077	14	Intergenic	novelGene_139601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_2	61.2713433408547	424	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	144	1760	482748	443534	FALSE	80	GAAACAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLELLESFGQNYPEEADGTLDCISMALTCTFNRWGTLLAVGCNDGRIVIWDFLTRGIAKIISAHIHPVCSLCWSRDGHKLVSASTDNIVSQWDVLSGDCDQRFRFPSPILKVQYHPRDQNKVLVCPMKSAPVMLTLSDSKHVVLPVDDDSDLNVVASFDRRGEYIYTGNAKGKILVLKTDSQDLVASFRVTTGTSNTTAIKSIEFARKGSCFLINTADRIIRVYDGREILTCGRDGEPEPMQKLQDLVNRTPWKKCCFSGDGEYIVAGSARQHALYIWEKSIGNLVKILHGTRGELLLDVAWHPVRPIIASISSGVVSIWAQNQVENWSAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIEDEDKSEPEQTGADAAEDEEVDVTSVDPIAAFCSSDEELEDSKALLYLPIAPEVEDPEENPYGPPPDAVQTSLMDEGASSEKKRQSSADGSQPPKKKPKTTNIELQGVPNDEVHPLLGVKGDGKSKKKQAGRPKGSKGKEKDSPFKPKLYKGDRGLPLEGSAKGKVQAELSQPLTAGGAISELL	482891	441216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_443563_450080_450273_454626_454857_455276_455347_456989_457108_457740_457813_457908_458063_458150_458271_459508_459619_460778_460942_461725_461867_471404_471578_472459_472486_482729
897480	contig_9839_pilon	+	961	7	Intergenic	novelGene_88490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1358.7690098844	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	131	838	49467	61360	FALSE	35	TTTAAAAAATCACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSAQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45310	61483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59916_61280
897481	contig_854_pilon	-	1756	6	Intergenic	novelGene_36407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_4	1418.09920668478	196	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	629	1165	993124	990972	FALSE	25	TTGGGAATTTTTTAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHGEDLGSLATAWSPVCTAVTRGGLASGGEPGSQCLPGVEVLAWGWVWVS	1001721	990380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_991309_991918_992043_993048_993301_994869_995130_999393_999546_1001681
897482	contig_2100_pilon	+	1472	12	Intergenic	novelGene_50764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCCTCTCCTAGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170207	1185518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1180284_1182725_1182824_1185422
897483	contig_593_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_101986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGAAGTTTTTGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151598	149948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_149900_151600
897484	contig_10196_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_132218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	2	499	1356674	1357171	NA	65	AAAAGGTAATAATAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRSGGCDELCPVCARDRVSSARGAEGGSRRGDWPSAHCCLSCRASRALRLVRWASQNLHPPSSGRARAQPVAEGEEEDDFNRPIQFSSSKANPSHWTVEHSLGRVQQRPWWKVLPLSVSCVALFVWCFLRQENSSDEWLSGVLGEEIESSDRSEEPGTGNGART	1356672	1358327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1356700_1358300
897485	contig_12427_pilon	-	3244	2	Intergenic	novelGene_40436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	407	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCAGCACCATTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438875	249115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_251470_437985
897486	contig_14525_pilon	-	5044	2	Intergenic	novelGene_149747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	473	junction_1	0	159	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGTTAACGAATGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132073	126455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434
897487	contig_1274_pilon	+	4871	1	Intergenic	novelGene_137786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	404	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCCTGTTCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88457	93328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_88500_93300
897488	contig_8145_pilon	-	2286	6	Intergenic	novelGene_118643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	121.719349324584	422	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	127	501	735820	731044	FALSE	5	TGGATTGCTGCCTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELERIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKGANKGKK	756952	729258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_731203_733967_734024_734339_734377_735697_735830_737277_737363_756920
897489	contig_10225_pilon	+	2663	13	Intergenic	novelGene_86784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	1519	2553	46602	47636	FALSE	20	TTCTGATCCTAGACTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20679	47746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46296_46453
897490	SIRV6	+	1298	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	358	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	47	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	99	300	250	549	2021	10736	TRUE	30	GCAGTTTAGAAGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALTAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1661	11795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2035_2492_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
897491	contig_4797_pilon	-	3705	5	Intergenic	novelGene_6937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	316.834637468822	5399	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	111	449	671697	659513	TRUE	20	CCTGGTTGACTTCAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAARESHPHGVKRSASPDDDLGSSNWEAADLGNEERKQKFLRLMGAGKKEHTGRLVIGDHKSTSHFRTGEEDKKINEELESQYQQSMDSKLSGRYRRHCGLGFSEVVINLF	671807	656185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_657746_657816_659644_661289_661351_665223_665308_671634
897492	SIRV6	+	1396	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	52	80	2	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
897493	contig_14744_pilon	-	2394	10	Intergenic	novelGene_66126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	60.8351344228556	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	94	1608	1597041	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1601791	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596969_1597106_1601762
897494	contig_5039_pilon	-	1675	8	Intergenic	novelGene_64754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	172	615	414873	414430	TRUE	85	GATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSESALEARTGGDPAACSPLAGAGPMEAPPDGSRALQEVVLPRRCHVASARPGNTGTHSRKPAGSLMTQKARASIWPPHGLFEARGGRHVGGRVAVAALGLHPVVLVREAGVEQGRARRSVGAGRQDARRGALATHHGELVGAG	415044	111364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_111393_111510_111626_299528_299569_311422_311579_334765_334873_368906_369098_407349_407513_414169
897495	SIRV7	-	2450	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	11	1	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCAAGCGTAATTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
897496	contig_12677_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_110765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATACGTATCACCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1675	661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_700_1700
897497	contig_4678_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_126076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAAACCTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774396	772225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_772200_774400
897498	contig_7342_pilon	-	3334	20	Intergenic	novelGene_71208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	565.249789119574	687	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	89	2506	716514	681080	TRUE	20	CCCTTTACTTAAAGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEAAPFCARSRDSTGPVLCEVGGGARAPGMAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPVEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSGEDDSDTKRLSKEEKGRSSCGRNFWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGRMISVEKAKNEPAGKKTSDKRESEGKKDKSSNSDRSAHLKRDDKADRKDDAKKGEDGSGEKGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSGSKERASKSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPRKSRDSESRRVRERSEREQRMQAQWEREERERLEIAREKLAFQRQRLERERWERERLERERMHVEHERRKEQERIHREREELRRQQELRYEQERRPGGRRPYDVDGRRDDAYWPEAKRAALDDRYHSDFSRQERFHDFDHRDRGRYPDHSVDRREGSRSMMGEREGQHYPERHGGPERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGRGLPPPSQGQT	716602	679922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_680656_680984_681092_681569_681690_686249_686293_686521_686660_687098_687390_688385_688493_690313_690403_690645_690726_691085_691169_691266_691417_693321_693417_694223_694274_694924_695445_696385_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
897499	contig_13481_pilon	+	2317	2	Intergenic	novelGene_119523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	635	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATAATCTTAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1437728	1489212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1439783_1488949
897500	contig_4402_pilon	-	5786	19	Intergenic	novelGene_140840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	238.11440994241	825	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1740	5220	567	5786	624811	592346	FALSE	70	CACAAGAAACATAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAIDDSSASISLAQLTKTANLAEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDEFLPYSGIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKK	625834	592345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_595933_596736_596839_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602567_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610344_612401_612447_617131_617169_619559_619660_624645_625193_625649
897501	contig_12635_pilon	-	9826	42	Intergenic	novelGene_60843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	342.723115428329	560	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1707	5124	44	5167	656018	544018	FALSE	5	GCTGTTTGTTCTTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPKFYRWISERYPCLSEVVKEHQIPEFDNLYLDMNGIIHQCSHPNDDDVHFRISDDKIFTDIFHYLEVLFRIIKPRKVFFMAVDGVAPRAKMNQQRGRRFRSAKEAEDKIKKAIEKGETLPTEARFDSNCITPGTEFMARLHEHLKYFVNMKISTDKSWQGVTIYFSGHETPGEGEHKIMEFIRSEKAKPDHDPNTRHCLYGLDADLIMLGLTSHEAHFSLLREEVRFGGKKTQRVCAPEETTFHLLHLSLMREYIDYEFSVLKDKISFKYDIERIIDDWILMGFLVGNDFIPHLPHLHINHDALPLLYGTYITILPELGGYINESGHLNLPRFEKYLVKLSDFDREHFSEVFVDLKWFESKVGNKYLNEAAGAAAEEAKNYEEKKKSKGEENVCWAALDKNESEAATSKDNLEDETEDDDLFETEFRQYKRTYYMTKMGVDVVSDDFLADQAACYVQAIQWILHYYYHGVQSWSWYYPYHYAPFLSDIRNISTLKIHFELGKPFKPFEQLLAVLPSASRNLLPACYQHLMTSEDSPIIEYYPPDFKTDLNGKQQEWEAVVLIPFIDEKRLLEAMESCNHSLKKEERKRNQHSECLMYWYDRDTDFTYPSPWPEKFPDIQRCCTRYKIISLDAWRVDISKNKITKVDQRAVYFCGFPTLKHIKHKFFLKKSGVQVFQQSSRGENMMLEILLNADSDELSIENVASSALGKSVFVNWPHLEEARVVAVSDGETKFYLEEPPGTQKLYLGKTTPPSKVVYLGDKEQSNWTKEVQGISEHYLRRKGIIINETSAVIYAQLLTGRKYQINQNGEVRLEKQWSKQVLPFVYQTVVKDIRAFGSRFSNIKTLDDLFPPRSMVFMLGTPYYGCTGEVQDSCDVITEGRIRVVFSIPCEPNLDALIQNQHKYSIKYNPGYMLASRLGVSGYLVSRFTGSIFIGRGSGRNPHGDHKANVGLNLKFNKKNEEVPGYTKKVGSEWMYSSAVEQLLAEYLERAPELFSYIAKNSQEDVFYEDDIWPGENENGAEKVQEIITWLKGHPVSTLSRSSCDLQILDAAIVEKIEEEVEKCKQRKNNKKVRVTVKPHLLYRPLEQQHGVIPDRDAEFRLFDRVVNVRENFSVPVGLRGTIIGIKGANREADVLFEVLFDEEFPGGLTIRCSPGRGYRLPTSALVNISHGSRSETGNQKLTAIVKPQPAVNHYSLNSSILSGHLGGLNHSPQLRFVPTQVPAKEDDEFCNIWQSLQGSGKVQHFQPAIQEKGAVLPQEISQVTQLHKSGINDSSIKGQQRKHDPHRKFKEECKSPKNECRSQKMSNKQPNPGIENFLASLNISKENEVQASHHKEPPSEEHLSPQSFAMKGTRMLKEILKIDGAETVDHKSEMKQFGNEVTVSSNRRDEYGPSSQPKQNKKLASYMNKSHSANEYHNVPSMDNVCWPTASQMPSVPTSVTELSRICSLVGMPQPDFSFLRTPQTMTVCQVKLSNGLLVHGPQCHSENEAKEKAAFFALQQLSSLGVNFSVPLPIFPNYPPAVPPGTIPPVFPQPTGWDHYGSNLAFGAASMMPSSSHLFASTPWAPPATVPGKPFHHASYPRTMPMAGGIAAGVHSQFIPLQVTKKRVANKKNFENKEAQSSSQAAPRQTSQPASSDITKVMPQESSSASVKSPHITQPVSSFQAEAASQGHSMSYHKSIPSSSSRRKPRKLAVNFGVSKPSE	656061	539358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_544324_544783_544945_545326_545366_549351_549455_549547_549662_551310_551493_553322_553483_553943_554067_555977_556040_567455_567565_573697_573794_574979_575188_578010_578081_581693_581827_581957_582015_586244_586381_586768_586859_590844_590992_591497_591614_594306_594406_596212_596327_597092_597256_611310_611443_617316_617421_621058_621158_621253_621375_622271_622442_630735_630856_632346_632504_633115_633206_637473_637580_637793_637858_639632_639771_640324_640393_641193_641363_641445_641534_642489_642573_643853_643965_644061_644172_645359_645458_649680_649914_655943
897502	contig_12427_pilon	+	7803	2	Intergenic	novelGene_40581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	991	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGACATATGTCCAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554381	572103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_557904_567822
897503	contig_1639_pilon	-	3441	25	Intergenic	novelGene_74890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.9817629144931	627	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCGCCCCCAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333181	280061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_280120_283495_283594_286377_286414_287045_287105_287385_287453_289008_289136_290190_290295_293136_293254_293369_293423_296203_296346_297968_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309320_311114_311154_311928_312049_312577_312679_312825_312985_314952_315024_315535_315687_321335_321392_324204_324321_328939_329046_331453_332568_333095
897504	contig_15866_pilon	+	7164	1	Intergenic	novelGene_63581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173261	180425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_173300_180400
897505	contig_9931_pilon	-	4765	2	Intergenic	novelGene_134809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_1	0	469	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	873	1280	291970	291563	FALSE	45	TGAAAACTTAATAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGARNPAKHPTMHMTAPTTKNYPVQNGSSAKLEKLVQMGMNLLPSWKRPDFLFHKYMLQGAATPAVVQCVCRKTSDMEVQNFHRDFPFRRGFMHPDPPLTTLLLVTQMYVVTSTAMQNIKTRDFKFHSLLRQAE	295696	288077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_292686_295539
897507	contig_5033_pilon	-	2167	6	Intergenic	novelGene_28946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1152.95973910627	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	120	830	477189	453092	TRUE	65	GGAAAGAAAAAAAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRAGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDK	477308	451090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_452154_452817_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464986_477113
897508	contig_11846_pilon	-	4502	14	Intergenic	novelGene_105956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.486536710706	6	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	1767	3548	308773	290118	TRUE	60	TTTTTACTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	339676	286951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_287770_289981_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308800_335635_337301_339601
897509	contig_13409_pilon	-	3510	11	Intergenic	novelGene_128444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_5	187.866016085933	29	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	86	1444	48846	34494	FALSE	25	TGAGGATGTGAGACTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISERKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSKDLARKEAQRLPGAGSSKRRKARAKKNKAMKSVKVKEEIKSDSSPLPSEKSDDDDDKLSECKSDSKERSKKSSISDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRK	50594	32427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_34677_37831_37973_39052_39182_40022_40146_41442_41594_41834_41974_42920_43052_44166_44209_45529_45691_48687_48865_50527
897510	contig_3386_pilon	-	3232	12	Intergenic	novelGene_34568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTGAGGACAACAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510195	470150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470318_486401_486539_488103_488201_491958_492064_494389_494547_497714_497820_498658_498718_504772_504898_505994_506118_506536_506632_507642_507738_508228
897511	contig_11338_pilon	-	3103	16	Intergenic	novelGene_6288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_15	202.834798679999	299	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	474	2012	227968	196726	FALSE	35	AATGGGAATAATCTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAFSYSSNLLSCPRVQSPVWPCIEACYNFLSRTWLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	245059	195634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_244957
897512	contig_11056_pilon	+	2252	7	Intergenic	novelGene_130397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGAAAAAGATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644751	684610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_645904_647058_647205_655568_655761_667860_668062_670513_670713_679002_679132_684377
897513	contig_10864_pilon	-	5913	11	Intergenic	novelGene_107040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_10	59.7478869919263	876	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	1591	4191	705547	698173	FALSE	5	CTCTTACCTGCTGCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRKWSSLALSFFGISQVDARYCQIAQNNPGPILRIVFDLDSNLRDKKTKDHFLIMTDQVKLALNKHLLSRLCQIAQSLLRKTFPGVCRRFIVGLKCEDENCEDFHRPLRRCEARCLVQSKIHLVAINGLLLEAKKVFPKTLAKELEEINCVLSTDMYGLCKSFLNVIFPKHFHQRVLSENPTVCKEILKPRSKSFRSYRFALKEYIHFLFENASAQNRRESTDLWLIAMQAFLASSNYPEEFEKLLRQEEDNYHRELKALEKEDRARGRGRGSRVKRVEGKFGMLTPNKGEASTEKTHLCFIRLLESCVDQFYMYRNPENYKRLFFRFMNVLVKRCKEPLIPSIANTVALLELQYIHCGAVLARLCKNTILCLPKSYISLLHYWEFLCSKKDKEPVDVFAIIQEFKPKDVTRAIQHFRFHLSYLAEVLCGHENVNFNVLLDAFDDIDCVVSGEAERTLVLCLVMLVNAKGILKPHCKRLLCSHFQEIEKQLQRMRENFPACVPERLLRVVRRVLVAVDVKSVAEALQDLLSDRDKEYLVDCRWCWDSVHAKGSVVRGLYHEEVKLNRLLCVGSLDGAAEPESEFDQDETGEPASEDRDHLLTAILSQRQRKASSRRKLRRVCLLVSLCISWRRWASAQAERGKEEAREPSAGNFKKADVDRTQCDLCGVKFIRGPENDFSPREVLEEVTFEAAALSGAEPERKEGLERNSESYEQHICLEGHQRQQAAYQKYSAFFREQVDPAVDEGKLVVQDMEQSVWIGSRLGWKEHSHVLQRKVQENIKKVLDTVEEVYRRKAWDSGQEVMTPLVNILILSVRDAQEWLRRTELSLKERGIVQEDEYENEVEDFDELCPIKPSRKRGKQRK	736987	696450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_698271_701748_701848_703143_706196_709614_709761_716494_716628_716737_716842_721036_721126_728101_728259_731309_731457_736516_736655_736959
897514	contig_17_pilon	+	4015	5	Intergenic	novelGene_173972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	629	1039	152786	153196	TRUE	50	GTGAAAAGAGAAATTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNGRAPKYTKQTLTTVRREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKGTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAANYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIESIFSDHNTIR	152157	408702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_153480_178669_179328_376581_376870_406901_407672_407725
897515	scaffold_13505_pilon	-	1844	7	Intergenic	novelGene_111510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	460.649903216459	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	32	1033	603235	590218	TRUE	10	CGTGTCCATTCTCGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGLAARVTLDISSP	603266	588511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
897516	contig_960_pilon	-	3782	3	Intergenic	novelGene_108312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCTTCTACAAAGTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057206	1047385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1049110_1053829_1054029_1055347
897517	contig_6439_pilon	-	2388	1	Intergenic	novelGene_154255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCAGGTGGGTTGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402225	399837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_399800_402200
897518	contig_16622_pilon	-	2519	9	Intergenic	novelGene_48479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1198.60940259953	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	445	873	115540	113571	FALSE	55	AAAACAAAAAACTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQGILLGGLRST	126406	111924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125460_125495_125765_125791_126056_126121_126271
897519	contig_13215_pilon	+	4019	2	Intergenic	novelGene_145872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1425	1955	9230	9760	FALSE	20	ACTACTGACTGCTCTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTIQELKQKADKNEEENRQIHGKYRKKNGTIQENNAGTKCQNKFHLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRIRETLGYNSEEKSEKRTKKNEETLIIMWDTIKSKNLQVIGIPEWGENRKHRSIEELLTENLPNITKDEKLAIHKAQRTPYRIDPKRKITKA	7461	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_8061_8404
897520	contig_15047_pilon	+	2713	6	Intergenic	novelGene_52161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	65.9806032103375	97	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	27	869	2194	3736	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPRERAFLSETVTVTGSSL	2167	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_4542_19408_19672_19825_19951_21013
897521	contig_11386_pilon	+	3816	7	Intergenic	novelGene_82757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_6	465.740628819661	544	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	898	1560	17940	34094	FALSE	15	TTTCTGTTCCAGAATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRV	7878	36350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_34087
897522	contig_1639_pilon	+	2916	26	Intergenic	novelGene_74883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	236.316452241481	182	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	237	2567	283593	331594	FALSE	25	GAAAACGTGGTGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQQLRFLQHQMAVAAAAAQRAQLRRHRHPGSQSGSKVKRGAPATPQL	279866	331943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280008_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
897523	contig_9633_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_139632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066736	1064386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1064400_1066700
897524	contig_4213_pilon	-	1555	1	Intergenic	novelGene_124803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	865	1248	32739	32356	NA	20	AGTTGTGCTGATATCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPVPNPLCLPISPLDRSCSFSFLNLLELRDTFLTSITLCPTVQSNPCLKSWPQKLFYFWADRESRGHAFQGSSSLSQTIKSGLFLEFELHALPFSCSIRNSLLCSLSGRSSVVAGHHLVLLVSG	33603	32048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_32000_33600
897525	contig_2036_pilon	-	3481	4	Intergenic	novelGene_131810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAACACCAGCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568341	422336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_423725_446729_447481_447597_448743_568144
897526	contig_5093_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_135088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1003	1368	571946	571581	NA	55	TAGAATGAGGTTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEWSIRIGGRLINNLHYTDDTTLLAASEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLTRKKAKILTTGPMSNIMINGKKIEVVKDFVLLGSTVNTHGSSSQKIKRHIALGKSVAKELFKVLKNKMSP	572948	570911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_-_570900_572900
897527	contig_1624_pilon	-	4206	6	Intergenic	novelGene_138362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	181	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2238	2687	24950	24501	TRUE	15	GTATGGCCTCCGGATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPRYHYNSSNQDHSSRSWTEWERNVEQNSNSEIKPDVLVCKRLVELLRLWPLDTLQTRSQNHSQRSRSSHTIAKPIKQKTTPVRNVHLRTINCTRPEGQHLPKSKVQQDRRGGKAGQMDTATQGGRGESADTFRGLQPMSKNNLRINC	134989	14020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_14028_22733_23195_23449_25109_64885_65385_100648_101107_133867
897528	contig_3095_pilon	+	2046	4	Intergenic	novelGene_75186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	1338.87871826474	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	23	541	220513	226800	TRUE	5	CATTGGTCTGGTTCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220490	245858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_226126_226409_226645_226824_244376
897529	contig_7182_pilon	-	1295	4	Intergenic	novelGene_117098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	656	junction_3	181.46073955542	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACTCCATAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102421	91555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_92612_92901_92980_97672_97760_102347
897530	contig_11304_pilon	+	2829	14	Intergenic	novelGene_156681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	157.165084879961	23	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2085	745	2829	447600	491260	FALSE	35	CTTGACTCACCCAGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGI	273559	491260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_273886_319887_319991_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491072
897531	contig_1406_pilon	-	1155	7	Intergenic	novelGene_25610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAGATCGACACAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2232121	2214529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2214577_2218158_2218224_2225345_2225454_2226994_2227084_2228826_2228875_2229813_2230054_2231563
897532	contig_8822_pilon	+	4512	1	Intergenic	novelGene_117920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1988	2287	51362	51661	NA	35	ATGTTGCTCTCTGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSPVGYKSKFRVSAPRECFLCWLWRKVHAINLPLVWELLCAGNSGPNDALCSWHCILVGMRFSCVSVHFFYISKEMGLRHYPILYTSSV	49374	53886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_49400_53900
897533	contig_5145_pilon	-	2058	11	Intergenic	novelGene_131433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	129.565581849502	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	103	612	946991	936187	TRUE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGGELLRGASALLNARPFPPLLPRLLPKLSAAAMSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPCHCHQCSILEVRGNQVPEK	947093	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
897534	contig_10236_pilon	-	3702	1	Intergenic	novelGene_169114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3362	3673	78746	78435	NA	30	ACATACCTGAATGTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTRSFTKTTLSRVRYLKAYKVPGPAPTYTLPKCWREKFVSPPLAKSQGSRLTCRCWSCCCCSICNFSVSKTTGRTRIIKEVVPIHKAALENLQREGSKMEK	82107	78405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_78400_82100
897535	contig_13740_pilon	-	3073	10	Intergenic	novelGene_34626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	488	junction_1	3889.89505713915	53	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	329	1234	161718	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	162244	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919
897536	contig_17074_pilon	-	3659	16	Intergenic	novelGene_145140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_15	137.200971813857	643	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	936	2811	52	2862	281636	227412	FALSE	45	TAAAAAGACTCAACTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRRATGGEPRRRELRGQKVKDQNPARREEEEADVLEDEKPPKKTLLSKISQGKKRRGCSDPRGPADDGPTKKKVAKVTAKSRHLKVVKDEAVSDGEDFRNFPAAHKKAHHPKREATIDKDSSEGEDEDESEGDWEEVEELSEPVPGDVGENAVFSKSVLPMNPVEIEIETPEQAKTRERSEKVKMEFETYLRRMMKRFTKEVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNRICSQPDLRAIALSIIPTRFTKVPQRDVDVCYLSNLVKWFIGTFTVNADLSYNEQDGLQTTLERRFAIYSARDDEELVHIFLLILRALDLLTRLVMSLQPIPLKLSAAKGKKPSKQRSIEGPGSSSETPSHVPENHTKPKASKGTKQEETFSKDTGNPGAKGKRGKAATGRKKQRAPSSSEETGKGEEQQENQRKRRGRERHMTSRVSYKEESGSDKANSDSDFELSSGEAHSPSDEDSDPDFLRQKRAPAPKRTKAGSKSDSQTSRQSCPNPAASSSSSSNKRGKKIPSGVEEVEGGKAAGVDQWLEVFCDKEEKWVCVDCVHSVVGEPLTCYRYATKPVTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPAWMTMTRKCRVDAKWWAETLRPYQSPFVDREKKEELEFQTKHLDQPLPTAIGTYKNHPLYALKRHLLKYQAIYPETAAILGYCRGEAVYSRDCVHTLHSKDTWLKQARVVRLGEVPYKMVKGYSNRARKARLAEPQLQDYNDLPLFGRWQTEEFQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPVGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIICEEYKEVLLDAWEKEQALIEKKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKLRYGAKSEASLHTDAGGGLSSDEEEGTSSQAEAARILAASWPQNRETEDQTQKRSKKTRRGKKEAASHLFPFEKL	281687	226614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233610_233689_233825_237417_237500_246242_246404_247627_248498_249342_249433_257668_257790_258271_258430_260179_260265_261810_261935_264317_264437_267691_267891_281533
897537	contig_12793_pilon	+	5098	1	Intergenic	novelGene_164131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTTAGCAGCTGAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264162	269260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_264200_269300
897538	contig_15112_pilon	-	1470	3	Intergenic	novelGene_124774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_2	304	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	7	303	77988	74063	FALSE	30	TTTTTAGAGGGCAGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVMPSSFFLLLRFFLRIDGVLIRMNDTRLYHEANKTYMLREYTSRESKIANLMHVSPSLFTEPNEISQYLPIKEAVCEKLIFPERVDLNPADSQENKPVE	77994	72895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_74207_75804_75868_77898
897539	contig_14445_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_137391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTGACCAGTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433064	431381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_431400_433100
897540	contig_16978_pilon	+	915	2	Intergenic	novelGene_168545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	27	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14715	18146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16978_pilon_+_14826_17341
897541	contig_5574_pilon	-	4359	2	Intergenic	novelGene_155837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1190	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	904	1287	110777	110394	FALSE	55	AATTGATAAAAGAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVCGQTIPPRLPTHLCWEPVVQQHPLFHPPTHAGAHRPVTPAPKPSHPSCVLQTGGICFSTWLPAPGAQGLAARHFCPANCTSGPRTCSSHSYAQPSAPGAHRPPVHVASPSQWHWKPMNRRPGA	112293	107321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_111229_111841
897542	SIRV6	+	478	4	ISM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	4156	714	-1738	142	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTAATTATGGTGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7261	11110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_7449_7805_7924_10724_10819_11031
897543	contig_14925_pilon	-	3595	4	Intergenic	novelGene_55260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_3	656.406547465483	10	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	FALSE	30	TTATTCCACACAACTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	111564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_114779_115150_115208_115821_116101_129436
897544	contig_11094_pilon	+	4148	1	Intergenic	novelGene_177015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	562	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCATCCCAGCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276865	281013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_+_276900_281000
897545	contig_8673_pilon	-	1299	2	Intergenic	novelGene_129924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCTTTTTGTGGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323538	322155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_323092_323175
897546	contig_10627_pilon	-	2182	3	Intergenic	novelGene_59993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66	86	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4	315	286902	285479	TRUE	15	CCAGAGGGGTCCTGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMRSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLVY	286905	283047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_283207_283770_285708_286819
897547	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	236	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
897548	contig_13982_pilon	+	1091	1	Intergenic	novelGene_163496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	196	495	507373	507672	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTETSTTRWCLATITDCPDRDHKRGSQAELQKNADQNSNSQKKTRLTGLTRGWRNTEDMALGHLFSSIMKSLLRFILRPKTRHARKTKRD	507177	508268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_+_507200_508300
897549	contig_7119_pilon	+	3081	4	Intergenic	novelGene_40941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	159	1253	137044	139798	TRUE	30	GACAGTGGGTCAAATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127510	141914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_140167_140454
897550	contig_13428_pilon	+	4817	8	Intergenic	novelGene_143427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	176.980109570747	609	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	744	851	50306	50413	FALSE	25	TTTTGAAGCTCCAAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTTQGSQQTRPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQRLIETLKPFGVFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVEEAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWYVFRLY	40732	54379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310_41378_44990_45073_46681_46792_47241_47296_49248_49361_50073_50164_50252
897551	contig_16951_pilon	+	2880	8	Intergenic	novelGene_98624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	245.666108233704	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	63	1016	46585	106818	TRUE	20	AATTTGCTTTGTGTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLLPVSDLSPHSVRLAPAEMQSQRIPGRKRGRPPLHSTPLKMAVPNLYSSSPGCLPAVKTPKKRGRKPGYKLKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHVRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFPRGSSAFEKAQEKEDGRTESASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	46522	111518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_46741_65743_65874_68468_68670_74288_74484_103952_104099_106692_108229_110476_110582_111169
897552	contig_13074_pilon	-	4673	24	Intergenic	novelGene_153441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_16	185.87458421904	9	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	21	2639	715589	534315	FALSE	40	AATATATATCTATATCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHDGNTMAAAAQLSLTQLSSGNPVYEKYYRQVDTGNTGRVLASDAAAFLKKSGLPDLILGKIWDLADTDGKGILNKQEFFVALRLVACAQNGLDVSLSSLNLAVPPPRFHDTGSPLLISGTSAAELPWAVRSEDKAKYDAIFDSLSPVNGFLSGGKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSALLAHIWALCDTKDCGKLSNDQFALAFHLINQKLIKGIDPPQILTPEMIPPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNAEQDLKEKEDTVKQKTSEVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQRISSLKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAHLGPLQQHLQDSQQEISSMQMKLMEMKELENHNHQLNWCSSPHSILVNGAVDYCSLSTSSSETANLNEQAEGQSNLEAEPIHQESPARSSPEIPPTGMTYEKEVVTAAVNGKACPEFNSDKHSKEEDPFNVESSSLTDPVADTNLDFFQSDPFVGSDPFKDDPFGKIDPFGGDPFKGSDPFASDCFFKQSSADPFATSSTDPFSAASSNSNTSVETLKHNDPFAPGGTIVVAASDSATDPFASVFGNESFGDGFADFSTLSEVNNEDPFSSATLSSASNMVTTKNVFEETSFKSEDVPPALPPKIGTPTRPCPPPPGKRPVNKLDSSDPFKLKDPFQPFPGNDSPKEKDPDMFCDPFTSTTTTTTTANKEADPSNFANFSAYPSEEDMIEWAKRESEREEEQRLARLNQQEQEDLELAIALSKSEISEA	715609	532280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_534462_537094_537289_539574_539738_541042_541120_556624_556695_560585_560723_563081_563118_564214_564306_564557_564675_566189_566394_572615_572814_583611_583774_596954_597028_623120_623207_627541_627699_629321_629468_661301_661362_664969_665096_666202_666269_667204_667301_669883_669932_670716_670807_679256_679299_715556
897553	contig_2710_pilon	-	3001	1	Intergenic	novelGene_161795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGCAAAGTGCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065714	1062713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_1062700_1065700
897554	contig_11681_pilon	-	4378	2	Intergenic	novelGene_102985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCGTTTCAAGTCTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202664	198243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_200929_200971
897555	contig_3068_pilon	-	3814	25	Intergenic	novelGene_137620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_17	268.512178365443	1085	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2436	123	2558	253056	233625	FALSE	30	TTCAGTGAGTGACATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	253905	232368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972_252054_253023_253079_253805
897556	contig_6847_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_143883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTCCTCCACGTAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113460	112308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_112300_113500
897557	contig_4857_pilon	+	2373	4	Intergenic	novelGene_48787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCGGGAACATCTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234092	1244351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1234363_1238554_1238940_1241781_1242269_1243120
897558	contig_2504_pilon	+	3642	1	Intergenic	novelGene_166851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	384	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAAAATAGCAACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389875	393517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_389900_393500
897559	contig_6938_pilon	-	3431	10	Intergenic	novelGene_69059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	354.97855960294	979	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	133	507	169148	158071	TRUE	40	ATAAATAAGATTACTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKEMQKLPEAVQLIEKASMMYLENGTPDTAAMALERAGK	169280	135756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138137_139249_139380_139953_140034_141959_142039_157629_157701_157886_158185_162374_162406_163983_164090_165469_165538_169092
897560	contig_5023_pilon	-	3384	1	Intergenic	novelGene_7101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18311	14927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_14900_18300
897561	contig_14353_pilon	-	2292	10	Intergenic	novelGene_82086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	495.961194220717	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	55	912	104372	80452	FALSE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSSTHTACPSTVWIPLQSKVLCSYIPSSSSRTVVLPPSSPSFPQCSSHSLLVFPPKPKGRRPKPPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104426	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87365_87451_90971_91054_104333
897562	contig_4315_pilon	+	4941	4	Intergenic	novelGene_46866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTATGTGTGTGTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847981	881050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_852309_855434_855506_870360_870404_880550
897563	contig_9653_pilon	+	5641	2	Intergenic	novelGene_48259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	142	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCCCGTGTGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951490	1034712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_951799_1029379
897564	contig_10627_pilon	+	6072	12	Intergenic	novelGene_59965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_1	136.779426706826	2147	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	206	1546	224634	236231	TRUE	45	AAAAGATATGTAAGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGDDGTNKEATSTGKLNQENEHIYNLWCSGRVCCEGMLIQLRFLKRQDLLNVLARMMRPVSDQVQIKVTMNDEDMDTYVFAVGTRKALVRLQKEMQDLSEFCSDKPKSGSKYGLPDSLAILSEMGEVTEGMMDTKMVHFLTHYADKIESVHFSDQFSGPKIMQEEGQPLKLPDTKRTLLFTFNVPGSGNTYPKDMEALLPLMNMVIYSIDKAKKFRLNREVRREAFIISWHLLLLLSFFSPGGSAISVFSDCKDLVDLKVLNIWE	218869	243253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_219070_224628_224898_225352_225461_225940_226116_231152_231275_231503_231570_232498_232601_232796_232908_234198_234285_235606_235666_235983_236483_238978
897565	contig_13699_pilon	+	2782	16	Intergenic	novelGene_158335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	177.189089205101	18	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	212	2395	129073	159727	FALSE	10	TGTTTTGTATTTCCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQKTLGGKQPVYDTTIRTGRALKEKTLLPDDTQKLDNLLGEVRDKWDTVCGKSVERQHKLEEALLFSGQFMDALQALVDWLYKVEPQLAEDQPVHGDLDLVMNLMDAHKVFQKELGKRTGTVQVLKRSGRELIENSRDDTTWVKGQLQELSTRWDTVCKLSVSKQSRLEQALKQAEEFRDTVHMLLEWLSEAEQTLRFRGALPDDTEALQSLIDTHKEFMKKVEEKRVDVNAAVAMGEVILAVCHPDCITTIKHWITIIRARFEEVLTWAKQHQQRLETALSELVANAELLEELLAWIQWAETTLIQRDQEPIPQNIDRVKALIAEHQMFMEEMTRKQPDVDRVTKTYKRKNVEPTHAPFIEKSRSGGRKSLSQPAPPPMPILSQSEAKNPRINQLSARWQQVWLLALERQRKLNDALDRLEELKEFANFDFDVWRKKYMRWMNHKKSRVMDFFRRIDKDQDGKITRQEFIDGILASKFPTTKLEMTAVADIFDRDGDGYIDYYEFVAALHPNKDAYRPTTDADKIEDEVTRQVAQCKCAKRFQVEQIGENKYRFGDSQQLRLVRILRSTVMVRVGGGWMALDEFLVKNDPCRARGRTNIELREKFILPEGASQGMTPFRSRGRRSKPSSRAASPTRSSSSASQSNHSCTSMPSSPATPASGTKVIPSSGSKLKRPTPAFHSSRTSLAGDTSNSSSPASTGAKTNRADPKKSASRPGSRAGSRAGSRASSRRGSDASDFDLLETQSACSDTSESSTAGGQGNSRRGLNKPSKIPTMSKKTTTASPRPLAREDSLVVV	127469	160114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_127638_129029_129190_130128_130324_130676_130806_131648_131793_132306_132496_135026_135148_135725_135890_137532_137696_139002_139158_140354_140430_144855_144974_154115_154328_157696_157827_158650_158886_159690
897566	contig_6436_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_134922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTTCCTTTCTAGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944119	946321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6436_pilon_+_944100_946300
897567	contig_149_pilon	-	3919	1	Intergenic	novelGene_173779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAGAAAAAAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35115	31196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_31200_35100
897568	contig_2093_pilon	+	3421	2	Intergenic	novelGene_152942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	543	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	877	1488	958641	959252	TRUE	65	GGAAAAAAAAAAAGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957764	1055876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_961109_1055799
897569	contig_5062_pilon	+	1897	10	Intergenic	novelGene_157833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	301	junction_1	121.177555677609	525	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	25	1110	622718	743107	TRUE	80	ACAAAAAAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGESLWKMAPVVTGKFGERPQPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQVRSLIHKLAFSSL	622693	744070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743527_743702
897570	contig_9924_pilon	-	3228	9	Intergenic	novelGene_175918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTGATGGAGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129823	15732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_15858_59993_60101_99138_99250_114520_114577_115837_115891_116798_116924_123899_124010_126978_127047_127350
897571	contig_7909_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_155940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	211	579	999558	999190	NA	50	TGGGCAATAAGAACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPSWTPIRDEQTGGKRKQLHGPSSRIQNNWQPAIYTFHPPPFFSPTQPPLLPTATVSWPGSTGFTPVSLRFHLPAVAGFLRAICWLLVLLFSTSLDFFLTSHHLLLLSLKYLAPCAIFAS	999768	998106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_998100_999800
897572	contig_9091_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_32425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19013	18393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_18400_19000
897573	contig_4315_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_46867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAAAGAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852897	850659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_850700_852900
897574	contig_7748_pilon	-	3116	16	Intergenic	novelGene_101046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_15	253.929771568615	18	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	159	2504	164891	150982	TRUE	10	GATTGTGTCACCTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	169993	149905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_150506_150969_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878_164940_169883
897575	contig_7457_pilon	-	2556	5	Intergenic	novelGene_31263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	180.017186679495	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAATATGGATGGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23086	18735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_19879_20760_22033_22344_22399_22891_22936_23043
897576	contig_12938_pilon	+	1358	7	Intergenic	novelGene_99698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	318	junction_2	746.464053610978	131	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	119	577	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51944	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
897577	contig_11110_pilon	-	1043	4	Intergenic	novelGene_177259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	37.4195433192633	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	394	1041	85579	78917	FALSE	60	GAAAAAAAAGAAAATTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVESEAKVKTKVRFEELLKTHNDLIRERKKLQKKIAKSGENISIDPFRRNLQHIKGTKSDNVSVPNTDNPEKSMRVSKDKLGNTQSPENPSDDASVEEEKQGKSNRKVAKAAPQVSPQEIEPETTERKLDSTHPKAQTKSQSSVAHQKSKKANEGKENDFDGEEELMEVYQLQAAEEMAKEIKKKIRKKLKEQLTYFPSDTSLHDDKLSSEKKK	97493	78914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_79430_83939_84065_85569_85638_97158
897578	contig_14441_pilon	+	778	4	Intergenic	novelGene_100761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	505.486124658454	353	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	196	744	125667	126705	FALSE	5	AGCCTGGCCGTGTGTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDPQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121644	126739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121691_125517_125902_126159_126283_126514
897580	contig_6881_pilon	-	3455	1	Intergenic	novelGene_164840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAGAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87782	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_84300_87800
897581	contig_546_pilon	-	4661	2	Intergenic	novelGene_117245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTGCTAAGAGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445412	440327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_440644_441067
897582	contig_5686_pilon	+	2390	2	Intergenic	novelGene_45264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	641	982	94439	94780	TRUE	55	AAAAAAAAGTTGGCATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93798	96832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_95482_96125
897583	contig_10930_pilon	-	2003	5	Intergenic	novelGene_37010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_3	1891.84129884089	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	372	1061	274277	268388	FALSE	35	TGCACTGGGAAACTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279831	267445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_278443_278637_279700
897585	contig_17144_pilon	-	1611	8	Intergenic	novelGene_29338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2452.8650303559	238	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	828	1316	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183398	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167590_174931_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
897586	contig_10973_pilon	-	1843	1	Intergenic	novelGene_150332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	141	653	2730	2218	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2870	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2900
897587	contig_3817_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_78405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAAGTGCTGAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279471	1277775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1277800_1279500
897588	contig_1337_pilon	+	3447	1	Intergenic	novelGene_84226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95881	99328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_95900_99300
897589	contig_9098_pilon	+	3704	3	Intergenic	novelGene_75802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	383	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGCTAGTTCCGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289423	295344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_292904_294100_294181_295200
897590	contig_5791_pilon	-	2091	7	Intergenic	novelGene_35845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_5	69.6293759845656	84	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	385	1380	1059116	1048747	FALSE	20	CCACATTTTCAATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIQFWPLFSLGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFADEIQARYPHLLEQLLSTSDTPGDESADPPIVHFAPGESSSEDAVMMNTPVVKAALEMGFSRKLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAENEKREEEKERQTEKMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLTANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLREIDSTLYKNLFVEKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS	1059500	1048035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1048941_1049054_1049097_1049372_1049628_1052379_1052623_1056491_1056541_1057135_1057215_1058982
897591	contig_9109_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_175311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	272	819	626	1444	17989	17171	NA	10	TCCCACCTCAGTCTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	18614	16743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_16700_18600
897592	contig_2834_pilon	+	6130	7	Intergenic	novelGene_27973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	2344.29987179304	377	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGAGGGTATATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238664	636585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_281031_364489_364968_365026_366316_487768_488264_636154
897593	contig_6885_pilon	+	2807	3	Intergenic	novelGene_83667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	984	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGTGTCTTACCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207686	285686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_209651_284473_285144_285513
897594	contig_10323_pilon	-	753	7	Intergenic	novelGene_123555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	136.91451104004	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	81	371	305132	278703	TRUE	15	TACTGTATTGGCTGTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGGAWCWAPGRLACLGVPRVKAAVMLTLASKLKRDDGLKGPRSSATASDSTRRVSVRDKLLVKEVAELEANLPCTCKVHFPDPNKLHCFQLTVTPGNVLTYLIYCENIRLTALAGLPRGR	309123	268198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_268516_275265_275329_278700_278759_292612_292700_295187_295218_305014_305149_309059
897595	contig_5003_pilon	-	7981	1	Intergenic	novelGene_120217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	677	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2718	3161	159499	159056	NA	80	AAAAAGGAAAAAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICNSYHAQTNSKLIKDLNIKLETIQIMEEKIGMWLGALIYGINRIPNVTKNAHIAEDELDNWDLLKIKHLCTTKDFSKRVKREPTDWETFFVYNISDKGLISKICRKLQHLKNRQSNLKMGKGAWLPPSTALEGIRIEGPRQWEKN	162216	154235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_154200_162200
897596	contig_15152_pilon	-	1604	5	Intergenic	novelGene_126966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	479.269952636299	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	245	892	204362	203318	FALSE	25	GTTACTGAATCTGTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKERANEGVIEFRSYSDMKRALDKLDGTEINGRNIRLIEDKPRTSHRRSYSGSRSRSRSRRRSRSRSRRSSRSRSRSVSKSRSRSRSRSKGRSRSRSKGRKSRSKSKSKPKSDRGSRSRSRSRSKDEYEKSRSRSRSRSRSPKENGNGDIKSKSRSRSQSRSNSPLPVPPSKAHSVSPPPKRATSRSRSRSRSKSRSRSSSRD	205201	202605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203679_203789_203874_204159_204369_204512_204638_205088
897597	contig_12970_pilon	+	3969	1	Intergenic	novelGene_50519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGACAAGGGGATAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112223	116192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_112200_116200
897598	contig_10990_pilon	-	5412	18	Intergenic	novelGene_7488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1913	2380	751953	749304	TRUE	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGQILLVVRDLSLVFSVSGTVTDLSSERSGTTATAALLAGLSCRMPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWVLQEATSP	753865	714807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715362_715413_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_743881_744391_744708_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751517_751914
897599	contig_14508_pilon	+	4193	6	Intergenic	novelGene_79036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1601	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAGGGTAAACCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24697	81857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_24790_36077_37085_49687_49733_54504_54541_54910_57263_81196
897600	contig_12630_pilon	+	3018	6	Intergenic	novelGene_173070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAACTACACATTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73111	101008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_74354_75718_76773_78011_78124_81562_81789_81938_82255_100940
897601	contig_9112_pilon	+	2005	3	Intergenic	novelGene_60218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	216.5	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	182	1018	108641	113786	FALSE	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQENPNLRRLIAVQLSLHETFTSSAGIDSCDFGREFYISLTTDHTPPYFYNRIDFIFQPDMDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRYVNEVCACKEA	108459	114773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625
897602	contig_14005_pilon	+	3269	1	Intergenic	novelGene_154719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	909	1256	1683	2030	NA	45	TCTAAAATACTTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPHTFSSGRVGWMDEVMSLFVSFEYSSEWIELEAPEISRFSGLTGVSGGRILTFHRGDPGSIPGRCTSCVVTTVCRWRLVCCCDAEQVSVALSRLRQTRKKCLCSIVHGVTMS	774	4043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_800_4000
897603	contig_7426_pilon	-	3460	3	Intergenic	novelGene_27553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	145	junction_2	45	770	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	16	414	1185828	1161950	FALSE	5	GCGCCTTGTCCGTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLRAGRRRQTAGKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185843	1158903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1162053_1163424_1163677_1185784
897604	contig_12869_pilon	+	1386	6	Intergenic	novelGene_75333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	417.964400397929	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	564	1145	85646	97384	FALSE	50	TGGTAATAAATTAGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67361	97625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67412_67470_67571_81602_81994_85623_85694_94365_94433_96917
897605	contig_13800_pilon	+	1923	15	Intergenic	novelGene_153710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	343.978026410207	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	164	1630	95662	162575	FALSE	15	GCAAGGTACTTTTTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFGDGGADLLRRSRCAGNPLRHGVVARFSQCLAEFRTWLRTNWLRFNADKTDVMLPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94534	162868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_109046_109072_114289_114436_125048_125092_125157_125211_125888_126022_127741_127807_131984_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
897606	contig_10003_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_88286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1162	1569	876382	876789	NA	25	CAGGATGTAGAACGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWHSASFPFHPRFSVSIHPVFLFLLACSSLLLGRYYPFGLVYLIELRSTFLTCVIVCFIGLPTLWLKGGFWEWLQFCVSGVSRGQSLRGSSSLCQISKSGLSFSFLVNVNFVLHFSPVLSGALYCDPCQISWWW	875220	876986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_875200_877000
897607	contig_20951_pilon	-	186	2	Intergenic	novelGene_43040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTGGCTCTGTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26854	26550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26559_26676
897608	contig_10627_pilon	+	3777	1	Intergenic	novelGene_60008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	470	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTTGCCAATCATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368361	372138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_368400_372100
897609	contig_10235_pilon	+	3672	25	Intergenic	novelGene_46352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	837	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1200	1667	133140	134218	TRUE	35	CCCCGCCCCAACATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKFWHKRESRAPKNPRAPSAPGSKMLLDPLRRCMKAAILSLLPARAPKEPSRELSTPCTTDVKNSGGRLSGPKPPGLPAPPEGDPGGGVACCSGARGGGGGGGGGGGAVCVACKKSVMPWRKAGTPGIATVMVGEAIPGPPAPGPAGPRRFPRS	130273	140535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_130459_130749_130897_131425_131535_131620_131764_131860_131927_132034_132178_132339_132467_132554_132656_132784_132839_133015_133185_133350_133643_134087_134375_134585_134674_134781_134894_135016_135122_135232_135312_135606_135860_136063_136264_136712_136841_137349_137591_138212_138290_138445_138498_138738_138939_139059_139178_140339
897610	contig_6375_pilon	-	4778	1	Intergenic	novelGene_72967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACAGGAGGCAGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214312	209534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_209500_214300
897611	contig_7272_pilon	-	4199	19	Intergenic	novelGene_25339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_4	710.947552805062	11	77	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	1229	3610	610299	593320	FALSE	25	GCTGAAGTGTTGAGAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	618660	592730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598126_598251_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_617510
897612	contig_9363_pilon	-	3177	16	Intergenic	novelGene_6751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	395.177068610459	1427	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	131	1684	1548961	1508323	TRUE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGGLLYVQALQLRLHLLQQQQALPPLWQQCLPGPGHHKS	1549091	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1530857_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
897613	contig_11281_pilon	-	5718	1	Intergenic	novelGene_125480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2310	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	5414	5716	869567	869265	NA	45	AATTTCAGAATTAGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASASPQNKEYRNFTGEENFLELPEAEDKRLIHRTLQEIRKEIKQNTEDTIEEIKKIRQEHTDEFNRLQESTERQQSDIKKINN	874980	869262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_869300_875000
897614	contig_11253_pilon	-	5599	17	Intergenic	novelGene_126850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	53	junction_15	119.002035171673	495	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	117	1763	320365	285594	FALSE	60	AAAAGAAATCTAAGGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGLSQGFFMEELNKYHQKHNVTVKYHELSNTGPPHDLRFTFQVIINDREFPTAEGKTKKKAKNAAAKIALEILDEESKVVSSLSLPTADTSEGLSIKNYIGRVNMYAQKKKLSVNYEQCFVNELRESEVKSSPRFHYTCQIGQKEYGIATGSTKQEAKQRAAKLAYDEIRAEETSAKADPTSSGSYTTASTDSSGISSVTSTSTTESLPENELSASESEQKHNGDSSKDSFSPSMDSPRNSQRKIKINLAPKFDCLEAEEVKNSKYTMNSRFVKDFEEIEPIGTGGYGQVFKAKHRIDKKTYVIKRVKYDNEKVEREVKALASLNHVNIVHYHNCWAGDDYDPEISINKSRSMTKCLFIQMEFCDKGTLEQWIDNRRDKKSDKDLALDLFEQITKGVAYIHSKRLIHRDLKPSNIFLVHTKQVKIGDFGLVTTLKNDEKRTVEKGTLLYMSPEQMSSPEYGNEVDIFTLGLILAELLHVCTTVQETVKIFGKLRKGFFPDVFDPKEKNLLQKLLAKDPKKRLPAPEILKTLNEWKTGPEEKKPNTC	330728	281757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_285717_285794_285849_287324_287427_291213_291343_297308_297490_298938_299056_302790_302914_305085_305158_307594_307630_309859_309957_310112_310193_310548_310685_317843_318002_319766_319888_320246_320382_329259_329328_330696
897615	contig_16205_pilon	-	3003	6	Intergenic	novelGene_156868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_2	578.598513651738	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	71	1597	105825	79834	FALSE	20	TTGAATTTTTGTTTTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKSKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIDDEDPSSSIESSDPSLSSTTTSSRNQASRSRVSSSTGIKGTTTVLKPGNAKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQTVPEGEATVTNSMQEETLNSSVQSIRTIQAPAQVPVVVSAGNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSSGAGSQKFILQAIPSSQPMTVLKENVMLQSQKPGSPPIVFSPAHVQQVLTSNVQSICNGTGSMASSPSFSATTPVVTFSRSSQLVAHPPGTVITSVIKAQETKTLIQEVEKKEVEDNLDEDTEKMEAQPQPFVMVVSSSNGLTSQVAMKQNELLEPNSF	105895	78427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_80432_86981_87429_88544_88738_89468_89553_103300_103466_105785
897616	contig_5669_pilon	+	2780	7	Intergenic	novelGene_86070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	246.307903513739	36	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	652	1782	186087	194361	FALSE	40	GTAACCAACCCAGAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQKQVHQETNFPPTMPARPQPFFLNRADFPSQSQTGTPLNGLRRLESLPVWRDALVAVKAPLPHGGF	185435	195359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_194163
897617	contig_9705_pilon	-	4118	19	Intergenic	novelGene_41703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	749.637774668457	615	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	708	2231	127727	99119	FALSE	25	CAATATGTTGTATGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFCQICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFILDHVFIEQDDDSNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALTEESSSSDSMWLSREQTLHTPVMMQTPQLTSTIMREPKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDYNRRGTSLMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIMDESVLGVSMF	135406	97231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_99143_103788_103867_104931_105059_108249_108440_111276_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624_118765_122724_122900_125531_125625_127537_127619_127715_127804_128161_128226_129482_129687_133472_133563_133701_133795_134811_134916_135330
897618	contig_3293_pilon	-	2826	3	Intergenic	novelGene_175080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	711	1523	149845	149033	TRUE	55	ATCCACACACAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFDTVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRTKDAGSYEPDTNLGNELSRNIQNQKKYNRESEQSIDG	150555	2843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3293_pilon_-_3288_70919_71182_148435
897620	contig_854_pilon	+	1020	1	Intergenic	novelGene_36540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCCCTGCAAGACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1617081	1618101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1617100_1618100
897621	contig_18163_pilon	-	1891	2	Intergenic	novelGene_35305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_1	0	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	21	347	10631	10305	TRUE	40	GTGAAAAATATCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHTFQWMFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVLLAGLP	10651	8325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_8779_9213
897623	contig_10777_pilon	+	3289	12	Intergenic	novelGene_101163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	254.713321271303	513	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	258	1145	8328	53404	FALSE	25	CAGGAAGGAGGTTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSDAAKPFSMVIFHCRHMFHKECLPVPSMNSPAQFCNICSAKSRGPGSAILEMKK	6467	55548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560_50606_52656_52737_53323
897624	contig_2069_pilon	-	5153	8	Intergenic	novelGene_23167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2481	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAATGTGAACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91969	15527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_15853_74658_75947_76068_76187_80971_81706_87419_87528_87704_87803_89407_90452_90531
897625	contig_4857_pilon	-	3918	2	Intergenic	novelGene_48807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAATTATTATTCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251094	1247111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1250893_1250957
897626	contig_18055_pilon	-	2450	20	Intergenic	novelGene_117817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1648	1995	78157	75206	TRUE	5	CTCCGCCGGCGGCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVTSGSGTTGTVPPTVLEVEVEALALAAAAAAAAAAAAATTAAAASAAAIVLIVVGISVVGTGAVDVVVDSSCLLVSYKILKFFRFGPAGFFCLRIIIVRLSRVRFVLLPRTFR	95107	40681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_40736_41919_42061_59718_59862_73607_73717_75197_75318_75559_75569_77930_78311_80663_80771_81238_81304_82068_82234_83358_83468_84603_84757_85571_85699_90723_90846_91002_91103_91209_91329_91839_92012_94685_94785_94868_94976_95058
897627	contig_12427_pilon	+	1852	7	Intergenic	novelGene_40509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_6	92.198457446725	9	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	126	920	422215	462072	TRUE	15	ACCCTGTAGAGTCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAGVRRCGAAWAAVRPRGAAGAGVRRRGATEAEVERQCWRMCGRTSCHLPRDVLTRACAYRDRQGYQQLPEWRDPDKYCPSYNKTPQSNNPVLLSRLHFEKGADSSERIIAPMRWGLVPSWFKEDDPSKLQFNTTNCRSDTMMEKLSFKVPLGRGRRCVVLADGFYEWQRCQGTSQTQPYFIYFPQIKTEKLGSIGAADSPEEWEKVWDNWRLLTMAGIFDCWEPPKGGDILYSYTIITVDSCKGLNDIHHRMPAILDGDEAVSKWLDFGEVSTQEALKLIHPTENITFHPVSPVVNDSPKQHS	421492	465152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_421597_422193_422398_441520_441665_443412_443539_458708_458891_461912_462108_464255
897628	contig_5649_pilon	-	3190	23	Intergenic	novelGene_82426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_6	91.1465648337431	418	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	183	1910	1442427	1421450	FALSE	15	GCCTCTAGTCTGAGCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGCGLLQEHVEPLCWKLSKCEDVSQLDLSGNLLGDDGLRSLLECLPQVSISGLLDLSHNSMSLESALYLVETLPSCPGAREALVNLGSEQSFWIHFSRQEEAEKTLRLSECSFLSEHVPRLATGLSQAPQLTDLTLTRCGLGLEQLIILLSLVKRPAGLIGLRVEEPWVGRVGVLELLRASAQASGNVTEISISETRQQLCVQLEFPRQEENPEAVALRLAHCDLGTHHSLLVRQLMETCTRLQQLSLSQVNLCDASSVLLQSLLLSLSELKKFRLTSSCMSIKALSQLTSGLSHCHNLEELDLSNNRFDKELMGTFEEKCRLKELDLSHLPLGGWSLDMLTRGLSHMAFLQRLTLSGNGIDDCCQLSETLRDATSLQELDLSHNQLGDAGAQLLAAVLPGLPELRKLDLTANGISPVGGVQLANSLSFCRRLEDLRLGYNALGDPTAQVLACGLPPQLRVLRLPSSRLGPEGALSLGRALDGCPQVIEISLAENSLAGGLPQFSEGLPLLRRINLISCEIDSQTAKSLAASLVLCPALEEILLSWNLLEDEAAAELARVLPRMGRLKRVDLEKNWITACGARHLVEGLAQGPGIQVIRLWNNCIPPDMAQHLQSQEPRLDFAFFEDKPQTPQST	1445616	1420169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1421562_1424782_1424867_1425199_1425284_1426423_1426508_1426795_1426868_1426952_1427037_1427778_1427857_1427992_1428077_1428411_1428496_1429326_1429405_1430698_1430783_1433300_1433373_1434012_1434097_1435976_1436061_1436380_1436465_1437226_1437308_1438322_1438410_1439996_1440081_1440167_1440252_1441886_1441953_1442353_1442444_1443212_1443297_1445534
897630	contig_8628_pilon	+	3302	18	Intergenic	novelGene_164431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_17	81.4176298465326	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	282	2432	646321	693676	FALSE	20	TTTTTATATATGTGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSTSTSSSTPSSSTSTTTTATSVSQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSTPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLEEKIKEPIKEPSEEPLPMETEEEDPKEEPIKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGMEEGKKLRHPTPTMLSIQKWQFSMSAIKEDQELMEEINEDEPVKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIKAARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERREKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKELERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRKKQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRKLIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK	641781	694546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_641872_646129_646373_651943_652145_653088_653202_654184_654274_666378_666540_667579_667637_667780_667848_670361_670498_671316_671407_677682_677802_682463_682615_686718_686884_687300_687484_689577_689758_690449_690534_692225_692327_693474
897631	contig_6658_pilon	+	3835	27	Intergenic	novelGene_168402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	35	junction_1	253.517596228808	444	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1090	3273	198	3470	156287	227120	FALSE	30	AGCACCTGAGTATATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRKEENFVSHVNAKRPRQEEVEDFDRDGDEFNGTSTLTAAEVGIIESIQLKNFMCHSMLGPFKFGSNVNFVVGNNGSGKSAVLTALIVGLGGKAVATNRGSSLKGFVKDGQNSADISITLRNRGDDAYRANVYGDSIIVQQHISMDGSRSYKLKSATGSVVSTKKEELIAILDHFNIQVDNPVSVLTQEMSKQFLQSKNEGDKYKFFMKATQLEQMKEDYSYIMETKERTKEQINQGEERLTELKRQCLEKEERFQSIAGLSTMKTKLEHLKHEMAWAVVNEIEKQLNAIRDNIEIGEERAARLDRKMEEQQVRLNEAEKKYKDIQDKLEKISQETNARAPECLALKADVTAKKRAYNEAEVLYNRSLNEYKALKKDDEQLCKRIEELKKSTDQSLEPERIERQKKISWLKEKVKALQDQESSVNQEIEQFQQAIEKDREEHSRIKREELDVKHILTFNQKQLKELKDSKTDQLKRFGPNVPALLEAIDDADRRGLFTYKPVGPLGACIHLRDPELALAIECCLKGLLQAYCCHNHADERVLQALMKRFYSPGTSRPQIIVSEFHNEIYDVRRRSAHHPEFPTVLTALEIDNAVVANSLIDMRSIETVLLIKNNSVARAVMQSQKPPKNCREAFTADGDQVFPGRYYSSENKRPKFLSRDVDSEISHLENDIENKKAQILNLQQHLSALEKDIKRNEELLKRCQLHYKDLKLKIRKSISEIRELENIEEHQSVDIATLEDEAQENKSKMKLVEKNMEQQEEKMEILKSVKIEAENKYDAIKLKINQLSELADPLKDELNLADSEVDNQKRGKQHYEDKQKERLDTLNKKKRELDLKEKELEEKMSQARQICPERIEVQKSASILDKEINRLRQKIQAEHASHGDREEIMRQYQEARETYLDLENKVRTLKRFIKLLEEIMTHRYRTYQQFRRCLTLRCKLYFDNLLSQRAYCGKMNFDHKNETLSISVQPGEGNKAAFNDMRALSGGERSFSTVCFVLSLWSIAESPFRCLDEFDVYMDMVNRRIAMDMILKMADSQRFRQFILLTPQSMSSLPSSKLIRILRMSDPERGQTTLPFRPITQEEEEDRS	145590	227485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_145783_156281_156404_159899_160018_162208_162315_169698_169836_170463_170526_174496_174578_175311_175414_178970_179091_179191_179291_184609_184757_185035_185125_185300_185466_185833_186013_187054_187260_192054_192170_193411_193573_195605_195742_196628_196710_198501_198673_204116_204255_206689_206836_210472_210599_214336_214443_222633_222787_226073_226172_227005
897632	contig_57_pilon	+	2891	23	Intergenic	novelGene_44887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	191.270745107254	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	921	2763	129	2891	66895	129542	FALSE	60	TCAGAAAAAGAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKD	66766	129542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_105917_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
897633	contig_9705_pilon	-	4040	18	Intergenic	novelGene_41704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	350	junction_4	758.848116336741	589	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	520	2154	127727	99119	FALSE	30	ACAATATGTTGTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKTQLDDRTKITELFAVALPQLLAKYSVDAEKVTNLLQLPQYFDLEIYTTGRLEKHLDALLRQIRNIVEKHTDTDVLEACSKTYHALCNEEFTIFNRVDISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLFACNYKLLKTGIENGDMPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFCQICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFILDHVFIEQDDDSNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISSRGSTVRSKKSKPATGKRKVVEGMQLALTEESSSSDSMWLSREQTLHTPVMMQTPQLTSTIMREPKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDYNTQVTWMLAQRQQEEARQQQERAAMSYVKLRTNLQHAIRRGTSLMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIMDESVLGVSMF	133779	97232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_99143_103788_103867_104931_105059_108048_108160_108249_108440_111276_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624_118765_122724_122900_125531_125625_127537_127619_127715_127804_128161_128233_129482_129687_133472_133563_133701
897634	contig_10482_pilon	+	1715	2	Intergenic	novelGene_152830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTGAACGAAGTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116195	127589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_116264_125942
897635	contig_11110_pilon	-	1037	5	Intergenic	novelGene_177260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_4	34.8532638356869	155	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	388	1035	85579	78917	FALSE	60	GAAAAAAAAGAAAATTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVESEAKVKTKVRFEELLKTHNDLIRERKKLQKKIAKSGENISIDPFRRNLQHIKGTKSDNVSVPNTDNPEKSMRVSKDKLGNTQSPENPSDDASVEEEKQGKSNRKVAKAAPQVSPQEIEPETTERKLDSTHPKAQTKSQSSVAHQKSKKANEGKENDFDGEEELMEVYQLQAAEEMAKEIKKKIRKKLKEQLTYFPSDTSLHDDKLSSEKKK	97746	78914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_79430_83939_84065_85569_85638_97071_97133_97478
897636	contig_14288_pilon	-	2611	3	Intergenic	novelGene_153805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	20.5	401	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	107	364	170157	147092	FALSE	45	AATCTAAAGTACAGCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVEVIAKEGQNLKELYLVSCKITDYALIAIGRYSMTIETVDVGWCKEITDQGATLIAQSSKSLRYLGLMRCDKVNEVTVEQLVQQYPHITFSTVLQDCKRTLERAYQMGWTPNMSAASS	328028	144844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_147233_170040_170184_327948
897637	contig_2033_pilon	+	1920	2	Intergenic	novelGene_71548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	0	80	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	292	636	413636	444420	FALSE	15	GTAGGCCCACATTCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPLFKSPCLPEVALPVTSLHFFILGCCSSWLALKMPHRPDMISIPFLETEHSRAALLEDLKGYLTFIGIHCVQEASFLWCLSSVSQTGSISDLLEGRKPKCWTYHTKPLNNLF	413344	445704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_413725_444164
897639	contig_15929_pilon	+	1457	8	Intergenic	novelGene_172459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	253.504981233514	163	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	887	1219	87373	92073	FALSE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKI	82239	92311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_82391_82703_83350_83512_83865_84057_84400_84489_87310_87623_89766_89844_92067
897640	contig_13295_pilon	+	9053	5	Intergenic	novelGene_31224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	984	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGTGCGCGTGCACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71006	134146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_79521_80246_80318_83128_83228_85560_85685_133901
897641	contig_9272_pilon	+	2209	2	Intergenic	novelGene_125929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356764	359435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_357965_358426
897642	contig_9014_pilon	+	5306	2	Intergenic	novelGene_106824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	858	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	5	298	260037	260330	TRUE	50	GCAAATTTAAACAAATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMSPPQSLMTQQNFMLMKQRSVGGEVYSQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLRQRSVSLDSQMGYLPRRVAWPICPSSSPCGRLQLGAILQIREP	260032	274516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_265193_274370
897643	contig_20550_pilon	+	2528	22	Intergenic	novelGene_142614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	258.802799229237	193	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	43	2094	3777	38142	FALSE	20	CTGTGTCGGTAAGTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDGSWTSPSSTTHWEGMPSPFKDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQQGQTQDYSKAWEEYYKKQGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ	3734	38576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_11580_11644_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37487_37548_37627_37774_38133
897644	contig_10861_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_39184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2017	2346	284913	284584	NA	10	GGAGGGATGGTGTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQGPCTSQPAKPPQPAMKWQGLSRREKDRGWEGIYRWLLGALFPAGSSVELLSCTPCSLIYDRSGRWQIHAALADRGPQHVSLFALHSLSVSYSILCLAEFFISSFDS	286929	284528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_284500_286900
897645	contig_6079_pilon	+	4905	3	Intergenic	novelGene_160081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	160.5	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	140	1108	395535	484726	FALSE	20	TGGGGCCCAGCAATATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDAFEHYTPVVVLSPARKESGKKPLKQRPRRRKRASERYEHADEQMKGRRNDCHLQISNPRWSELHTDSSGSSSTDESHWIQAKRRAQVKFRLSRRRRINNNKPCGNLDGSSTPNRIELADLGTKATKQQEQIQCESCSFNQRREGRRCQECSLSLPRESFETKRYSRIHEENKGRYHQRDPQLLPSFRQNETINKRFCERDSSSEPLEVPEVGKHADDTGLQVNNSVQKPPATCDDGADNLEVCRICHCEGDEESPLITPCRCTGTLRFVHQSCLHQWIKSSDTRCCELCKYDFVMETKLKPLRKWEKLQMTTSERRKIFCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGNDNGKSTSVAFFPLE	395395	488523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_396137_439214_439396_484540
897646	contig_3103_pilon	-	2292	2	Intergenic	novelGene_146208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	117	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1616	1945	138379	138050	FALSE	65	AAGAAAACAACAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPFSAICTNSETNCPSLSALYWVRQFIAVTTHNSQTILTIMGFIREVTVTIQADGTLKMQFFHKDSLSPAALTGTPLPGPQSLPKGTQLSLSVGREAHHAVSCCQIWC	229071	137702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_139656_228732
897647	contig_5566_pilon	+	2799	2	Intergenic	novelGene_153671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACCCTAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199200	203845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_201664_203509
897648	contig_9706_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_21013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAGTCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536282	538987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_536300_539000
897649	contig_5423_pilon	-	4973	1	Intergenic	novelGene_85172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1701	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	4453	4791	111297	110959	NA	30	AGTCGTTTGAAGAGCATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGVHMSIRVMTLISLGCISRSGIAGLYGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQTLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLIWISLMASDHKRLLMCLLPA	115749	110776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_110800_115700
897650	contig_7323_pilon	+	4201	2	Intergenic	novelGene_173211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	449	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1442	1771	50226	50555	TRUE	25	GGTCGAGAAGGGAGAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPGGLPVEEKALDQTDREFKSLIFRIIQEIKQKSDKNEEKTNKFMENTDQKMEEFRKIMQEQNVKTNSQLEIIQKQLESQKTTRFQKWTVS	48784	53109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_+_52868_52991
897651	contig_16701_pilon	-	3404	2	Intergenic	novelGene_177596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACCCAGCAACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99660	69051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_71736_98940
897652	contig_12765_pilon	+	2723	9	Intergenic	novelGene_106546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	50.6246913570838	311	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	259	1953	10145	211118	FALSE	30	AAAGGAGCTTTATAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILFAWGTLLFYIGGHLVRDNDHPDHSSRELSKILAKLERLKQQNEDLRRMAESLRIPEGPIDQGLATGRVRALEEQLVKAKEQIENYKKQTGNGLGKDHEILRRRIENGAKELWFYLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFISDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQIAIYPHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWNGYSKGVNRKLGRTGLYPSYKVREKIETVKYPTYPEAEK	9886	211888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_10315_73779_73896_74010_74174_87110_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
897653	contig_5423_pilon	-	2861	16	Intergenic	novelGene_85241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_7	227.704623483046	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	527	2557	532780	497362	FALSE	40	TCTGAAATGCAAAATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWAQEDQNLQELMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534609	497057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
897654	contig_5620_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_161361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCCAGCATAAAGAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427283	425318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_425300_427300
897655	contig_16103_pilon	-	2061	10	Intergenic	novelGene_118832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3868.40430624091	75	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	57	602	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743684	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722901_722951_723680_732167_732247_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735724_735934_735975_737495_737630_743496
897656	contig_13702_pilon	-	2409	3	Intergenic	novelGene_102628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2	433	211403	210972	TRUE	10	TACTGGCTTGTCTCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGYNIFLKVALLWSGNLKYPNACFPRWSQPEELPPSLDVPGLRLDRIFLWTELHVPCLLTGGKRVGGSSCQSCAHNIPAVASFEADVLCLYTAASVVSSLCLLLSHARPHPAVTLLILPLEPKGQVCFRLLENRVGLDLEHS	211404	208824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_210125_210233_210456_210517
897657	contig_16110_pilon	+	3564	1	Intergenic	novelGene_126782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1118	1465	49038	49385	NA	35	TTAAATTTTAGTGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNQDALIITGDWNAKVGNTEERLVVGKYGFGDTDDTGDSTIEFCKTSDFIANTFFNNVKSDYIRGPHQMEYTGIKLTTSVERGDRKLQYHQSEQVQGPAVKQTINCSYASSSLS	47920	51484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_47900_51500
897659	contig_4364_pilon	+	1938	6	Intergenic	novelGene_696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	483	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	61	1188	1530895	1532568	FALSE	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530464	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
897660	contig_9051_pilon	-	3220	1	Intergenic	novelGene_170812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	529	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1745	2143	1042691	1042293	NA	20	GGAGCCCCTCGGAGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFETEAAQLLVSLVSSACFLVSWLLGSSGLMPASAPLGQVFQSSVAPLVSARRHPTPPGSLLRTGTQLSHSMGRLSRHLALVSWFCCCFSLPLPLLCHCSFSAAADPVSIHSFKTASTF	1044435	1041215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1041200_1044400
897661	contig_5389_pilon	+	2391	2	Intergenic	novelGene_143040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	57	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCGAGAGTGGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500518	507718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_500633_505441
897662	contig_4087_pilon	+	1954	14	Intergenic	novelGene_156064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_13	210.24125336238	299	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	192	1352	16169	113477	FALSE	40	CCTTCTATAACATTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSEVWRLTSKFNSFRRTHIILQHLAMSKHTNAAEEVLLERKGCAGVITLNRPKLLNTLTFNMVRQIYPQLKKWEQDPETLLIIIKGTGGKAFCAGGDVRAVSEAGKANKKLSQDFFRDEYILNNAIASCRKPYVALIHGITMGGGVGVSVHGQFRVATEKTVFAMPETAIGLFPDVGGGYFLPRLQGKLGYFLALTGFKLKGRDVHKAGIATHFVDSEKLDTLEEDLLALKSPSKENIADVLETYHAKSKIDQDKPFILEEHMDKINSLFSANTMEQIIEYLQQDGSSFAVEQLKMINKMSPTSLKITLRQLIEGSSKTLQEVLTMEYRLSQACMGGHDFHEGVRAVLIDKDQSPKWKPADLKEVTDEDVNNYFKSLGSNDLKL	15977	114079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_16204_24107_24151_31783_31925_33898_33984_45559_45641_51815_51869_67942_68022_82056_82203_84893_84981_87655_87715_88598_88681_105957_106078_110391_110426_113361
897663	contig_755_pilon	-	1612	4	Intergenic	novelGene_119767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	66.3777071011044	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	55	666	88997	83959	FALSE	60	AGATTAAATGAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89051	83012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87817_88876
897664	contig_5286_pilon	-	2970	6	Intergenic	novelGene_157330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	383.95447646824	93	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	856	2535	539932	487171	FALSE	45	AAAAAAAGAGTTTGTTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYKCSPSLFMQSMISSIVNSTYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKTKDMMVEMDSLSELSQQGANHVNFGQQPVPGNTAEQPPSPAQLSHGSQPSVRTPLPNLHPGLVSTPISPQLVNQQLVMAQLLNQQYAVNRLLAQQSLNQQYLNHPPPVSRSMNKPLEQQVSTNTEVSSEIYQWVRDELKRAGISQAVFARVAFNRTQGLLSEILRKEEDPKTASQSLLVNLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDERERSLNAASAMGPTPLISTPPSRPPQVKTATIATERNGKPENNTMNINASIYDEIQQEMKRAKVSQALFAKVAATKSQGWLCELLRWKEDPSPENRTLWENLSMIRRFLSLPQPERDAIYEQESNAVHHHGDRPPHIIHVPAEQIQQQQQQQQQQQQAPPPAQPQPQQQAGPRLPPRQPTVASPAESEEENRQKTRPRTKISVEALGILQSFIQDVGLYPDEEAIQTLSAQLDLPKYTIIKFFQNQRYYLKHHGKLKDNSGLEVDVAEYKEEELLKDLEESVQDKNANTLFSVKLEEELSVEGNTDINADLKD	540787	486735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_487675_489780_489985_519310_519467_527930_528144_536997_537453_539784
897665	contig_7909_pilon	+	4403	1	Intergenic	novelGene_155894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	515	1147	392389	393021	NA	25	AAACCCAGCAGCCGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDRYLEQRISIKFCVKLNKSASETHHLLKEAYGDEVMSRARVFDWHKRFKEGREDVRDDARSGRPVTHRTDENIQKVKDLVCSNRQLTVRMMAEELNLDKETVRLILKENLNMRKVSAKVISGILKDEPKPRKLDFQPDLSKETRKNSSSVRKKVTSCETWSHLQSEAGGEMPLPVSHPRIHYPASQLLQASSSVSLPTRVAQDWFTPW	391874	396277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_391900_396300
897666	contig_13004_pilon	+	2321	5	Intergenic	novelGene_112673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_4	73.8863147003557	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	725	1621	655306	673741	FALSE	20	CACTTCCCCAGCAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSKTVAQCVEYYYTWKKIMRLGRKHRTRLTDIMDDCVTSEEEEELEEEEEDLEEDRKSTKEEESEGPKSPELPPPFPALAPAEGPAMQALSQPSGSFICEMPNCGADCRCHVTPFLPQVFSSRQALNGHARIHGGTNQVAKARGAVPSGKQKSGGAQSGYCSVKSSPSHSTTSGETDPTTVFPCKECGKVFFKIKSRNAHMKTHRQQEEQQRQKAQKAAFAAEMAATIERTTGPVGGPGLLPLDQLSLIKPMKDVDILDDDVVQQLGGVMEEAEVVDTDLLLDDQDSVLLQGDTEL	654581	674441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_655309_657212_657327_666516_666724_669325_669574_673416
897667	contig_12119_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_88691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAACTTGATTCCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412565	410343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_410300_412600
897668	contig_4783_pilon	+	5523	4	Intergenic	novelGene_108413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1968	2336	468963	469331	FALSE	40	CACAGCGACCCTACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPFFFLVSLATSPETNYKNWKETQFLKTLTIPQNQQPNSFLQNHIWFATECMRQPGMRSKTSFSYKANTERQQDQQQRGESSSSKKFENLSYQNVIRNRRDRRLTYFFLFNLLGFFGITTT	387702	472518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_387887_403054_403426_466298_467709_468960
897669	contig_9389_pilon	+	1218	2	Intergenic	novelGene_83972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	283	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	221	523	341591	341893	FALSE	40	TTGGCAATAAATAAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLSAAPALPPTLPAGPALPAARSAGCRPASSSEDAAGSLSAGALAWCHVPGPQSSHRLLARRQPGKDTATPSMLAAPLEVGSILEGQSPALCPGPPVHGTSRQRTRLPVDFCSSPQARGGTSGPGSEGRPCPPRPRPRAKPSRCTLCLDYWCLCPAQPVVLFLLCYVRAFHS	340419	342588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_340537_341487
897670	contig_9239_pilon	-	2883	10	Intergenic	novelGene_137157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_8	111.565404611702	647	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	502	1257	75386	73551	FALSE	25	CTAAGTTTGGGGATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EREKNALARERSLKKRQSLPASPRPRLSAGTASELSPKSKARPSSPSISWHRPASPCPSFSPGPGHALPPKPPSPRGTTASPKGRIRRKDESKESPSVAGPDDKSQSKGRASNEKESTAPASPAPSPVPSPIPAQPQKEQPTAEAPAGTAVLISPPAPAPPVTPSKPMAGTTDREEATRLLAEKRRQAREQREREEQERKLQAERDKRMREEQMAREAEAQAEREAEARRREEQEAREKAQAEQEEQERLQKQKEEAEARSREEAERQRLEREKHFQREEQERQERKKRLEEIMKRTRKSEAADHKKQDGKEINVNNSSQDPVKAVEARPLTLQKEALQKEELASQETQWSLPNKESPGSLVNGLQPLLSHQENGFSPKGPPGDKSLGRTPEALLPFAEAEAFLKKAVVQPPQVTEVL	76711	71924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_73562_73727_73922_74031_74123_74210_74254_74450_74505_74797_74903_75040_75180_75267_75446_75748_76084_76604
897671	contig_1150_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_61417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	177	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
897672	contig_10057_pilon	-	1365	5	Intergenic	novelGene_162336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_4	93.7186614287677	52	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	23	601	64936	35399	FALSE	20	AAGTTCTTATTCCTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCRVDKPSEIVDVGDKVWVKLIGREMKNDRIKVSLSMKVVNQGTGKDLDPNNVIIEQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRKKEKKKKKHRDRKSSDSDSSDSESETGKRARRTSKDSKAAKKKKKKKKHKKKHKE	64958	34634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35561_50228_50372_52130_52232_63462_63555_64855
897673	contig_14871_pilon	-	1136	3	Intergenic	novelGene_63728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	276.5	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGATTTTGCACTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289555	287475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_288127_288260_288649_289458
897674	contig_5698_pilon	+	1858	5	Intergenic	novelGene_55017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	861.249383163785	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	20	418	4103	19445	FALSE	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHYDK	4083	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11847_19433
897675	contig_1301_pilon	-	2922	2	Intergenic	novelGene_47268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	798	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTTCTCGTACCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228874	224977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_226757_227731
897676	contig_20356_pilon	+	7285	21	Intergenic	novelGene_159539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	748.054695527005	277	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	865	2598	172	2769	92632	159961	FALSE	45	GTAGGCATTCTAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEESSQQRRFSSCTVVSPVFFPPRIDGRKLVRNASFGGYNELSPSLPGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAVLEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLKLGKEVLATLEGHWDSEVFINDKKTDNSEVFWNPTPDIKQWRLIRHTVKFEEQEDFESEKLWQRVTKAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWACKLFELDPLTGEWHYKFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQTKVRHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVVKGYSSPEPDIQDSSGSETQSLKQSTRRKKGIELGDIQSSIESIKQTQEEIKRNVMALRNHLASSTPATDYFLQQKDYFIIFLLILLQVIINFMFK	92460	164477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_92777_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_134526_134624_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153177_156694_156798_159828
897677	contig_9682_pilon	-	3517	4	Intergenic	novelGene_125292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1077	1445	27128	26760	TRUE	45	GAAAAGAAATGCCTACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAICSMWSLSSLYCSGRENSIISQKIARQTGLSHSSDKRPLQIRGLVRSGECRYLTHTASPGNPGHPCLPSIVGRAEPQHDGLMQRPHLPTRWVSAMNLSPLDSWESGTHVRIQVMLQMMLY	28204	6598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_7131_8215_8484_9406_9640_25720
897678	contig_15491_pilon	+	2562	2	Intergenic	novelGene_75993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	493	795	231475	231900	FALSE	45	TAAAATGTAGCAAGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEVTRSLLQRWGASFRRGADFDSWGQLVEAIDEYQILARHLQKEAQAQHNNSEFTEEQKKTTGKIATCLELRSAALQSTQSQEEFKLEDLKKLEPIVKNILTYNKEFPFDVQPVPLRRILAPGEEENLEFEEDEEEGGAGAGSPDSFPATVPGTLLPRLPSEPGMTLLTTRIEKIGLKDAGQCIDPYITVSVKGAAIFFEFKHYKPKERFTSTKCFAFMETDEIKPGPIVIELCKKPTDFKRKKWQLLTKKPLYLHLHQTLHKE	230982	233667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_231563_231685
897680	contig_14526_pilon	+	3497	4	Intergenic	novelGene_111203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGTTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193382	358984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_194177_307444_307620_356342_357087_357200
897681	contig_5020_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_27940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACATTCTACTTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162476	164740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_162500_164700
897682	contig_5779_pilon	+	3764	6	Intergenic	novelGene_106483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATTCTCACACATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150848	461307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_153592_279421_280073_280656_280759_309194_309357_459863_459874_461211
897683	contig_12948_pilon	-	4761	3	Intergenic	novelGene_126170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATCGTTTCTATCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172547	109258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_109997_168443_171925_172005
897684	contig_17274_pilon	+	1931	15	Intergenic	novelGene_26508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	155.274625047602	109	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	133	915	87831	118632	TRUE	10	CTTCATCTCACTCTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRRRKRGRPRKHLTQRNKAPLKRGRPRGKEEKRNLKSKEVIQDQRIGR	87698	124787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_113142_113233_118582_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
897685	contig_19545_pilon	-	3721	2	Intergenic	novelGene_170836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	593	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1	6	366	371	30454	30449	FALSE	20	GGGAATGCACCCTGCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPCHQSSSSAGSCGPCTWATTCCSHCPRAGAGRVPTAQAQWPGGGRGPVQHVATRGEGTALEGRQGAGLSAGRQLEHGAGPEQPSWDQQGVLRPRRARLCSSQKSRDGQPSLLAEQDPGWM	30883	27098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_-_30729_30792
897686	contig_14970_pilon	+	2858	1	Intergenic	novelGene_45042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAAAAAAAAAAAATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186772	189630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_186800_189600
897687	contig_14923_pilon	-	3292	4	Intergenic	novelGene_157747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_1	35.9536738966502	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	1557	2876	361131	354615	FALSE	20	TGCTATTTTTACGTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTFFFSEGFDYNEEERYDCKGGEHFGNQRRFPGHLFWDFQINILGEKDDTPVHFCDKCGLPIKIYGRMIPCKHVFCYDCAILHEKKGDKMCPGCSDPVQRIEQCTRGSLFMCSIVQGCKRTYLSQRDLQAHINHRHMRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHIMPPQQHYAPPPPPPPPISHPMPHPPQAAGTPHLVYSQAPPPPMTSAPPPITPPPGHIIAQMPPYMNHPPPGPPPPQHGGPPVSAPPPHHYNPNSLPQFTEDQGTLSPPFTQPGGMSPGIWPAPRGPPPPPRMQGPPSQTPLPGPHHPDQTRYRPYYQ	362687	354198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_355651_358242_358317_360540_360625_361005
897688	contig_17_pilon	-	6045	4	Intergenic	novelGene_173966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	3575	4876	107603	106302	TRUE	15	CTATTTGTTCTGTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHINKRKEKNHMIISVDAEKAFDKVQHPFLIKALNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGVRLKTFPLKTGRRQGCPLSTLLFNIVLEVLARAIRQQKEMKDIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSMRNPLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYANKENNEKEIRKTKKISITPKKMKYLGINLTRDVKNPYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNLVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVRGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRDIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMNQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQTLIHGINRTQTITINAQNPTEKLDNWDLL	157479	104393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_105387_106125_108153_153823_155674_156304
897689	contig_4213_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_124817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCTGTGAGCAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46329	45089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_45100_46300
897690	contig_6031_pilon	-	1673	5	Intergenic	novelGene_56766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	844	junction_2	633.069111551022	85	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	108	773	257696	255749	TRUE	25	ACAGAGTTGCCCTGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQVSASCLQME	257803	254466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255868_256163_256375_256704_256814_257469
897691	contig_4426_pilon	+	2296	7	Intergenic	novelGene_15419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAGAAATCAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820209	904632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_820701_820927_821944_868806_868955_881692_881834_887174_887380_889993_890139_904482
897692	contig_9433_pilon	+	4820	4	Intergenic	novelGene_168506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1355	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2346	2939	2349	2942	TRUE	0	TTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQGARHLSERRGRWREASEKSKEAEKKSYTSSQQMAPRESPTWVCGIQAAGASRSRDRGHGKQRNKRTKAPGSHQHGSLDREAAAHSNGALQPLRKKQRWHSELGTQGKGAGGGERQARNQKKQKKKKSNTSSQQMALREPASAGWCFWTRDCVCRKQRRLSVNEEGWRVGKRISQIAGTLEPLRKKQRWRTEPGT	3	155967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9433_pilon_+_3412_37600_37658_41665_42677_155623
897693	contig_8801_pilon	+	8420	5	Intergenic	novelGene_66271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	48.499355665823	615	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	274	363	435860	435949	FALSE	10	CCCCCAGCTCACTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGTAIFVFILSLLFCCYLIRLRHQAHKEFYAYKQVILKEKVKELNLHELCAVCLEDFKPRDELGICPCKHAFHRKCLIKWLEVRKVCPLCNMPVLQLAQLHSKQDRGLPQGPLPGAENIV	414738	444006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_414798_427375_427419_429284_429327_434920_435001_435810
897694	contig_12540_pilon	+	1691	2	Intergenic	novelGene_148048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAGCAGACTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110417	112156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_111235_111282
897695	contig_2940_pilon	+	1964	2	Intergenic	novelGene_81919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	286	585	543771	544070	TRUE	15	TCATGTTAGTCCACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATSTDCSDHDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNRESTAPRHPFSSVVKSFPRFTIRPGSGQPRKTKCD	543485	546438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_544616_545604
897696	contig_6163_pilon	+	2065	3	Intergenic	novelGene_103801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAAACGAGGCCTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74240	77836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_76137_77093_77236_77809
897697	contig_15495_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_177757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	377	1134	70	1203	553961	552828	NA	15	TCTCCTAACGGGCACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPSPLANAPTAFIDGSGKTGKGAVTWQMDSAWQHFITQKASTTQCAELSAAVAAFEIFKSMPFNLIAGSAYVVHTIQHISDVTLRFSPNYELFTLFRRLQTLLNSRNSPFFVVHVRSHTPFPGPLSDGNSHADLLAGSAFSDARTSHNFFHQNARGLQKQFSLSLTEAQQIVRTCPDCQRFSPTSFAAGLKPRGLVANQLWQMDVTHFPPFGKLKYLHVSIDTCSGFLYATALSGERSTHACRHFTHVIATMGCPQALKTDNGPAYTSAKFQQFCATWNILHSTGIPYNPQGQAIIERAHHTLKQLLNKQKGGDDGSRVCDQNERLAKALFSFNFLSVAKDGRTAAERHFIPPDTRPRPQVLYNVLKIPLSGKDL	554030	551524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15495_pilon_-_551500_554000
897699	contig_7171_pilon	-	1964	2	Intergenic	novelGene_101371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	0	391	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	142	384	1360418	1360176	FALSE	25	TCATTTTCCAGCAGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLASSRCLQSILCPNGGAGGGFSRTPGAGDAAVLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLQVTSGPEHILHVQINWPEKRNAMNRAFWRSDLCILEACMQEEAEAEGRDRVECRG	1360994	1358595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1360465_1360899
897700	contig_16575_pilon	-	1213	12	Intergenic	novelGene_146487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	90.0589338724811	2	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	9	416	26216	20320	TRUE	25	TAAGTAATTCTGATGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMMEVKGRKKFTGKGTKPSQETSRFHKSSDSGSSKTFPGKVVKEGGPKVPSKNFEKSATKPGKKGVKQFKNKQQGDKVPKNKFQPASKFNKKRKFQPNSTSDESAAKKPKWDDFKKKKKELKQSRQLKKTVTKKKE	26224	2059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16575_pilon_-_2142_7368_7423_9527_9627_11752_11832_13215_13316_15642_15818_17279_17347_17554_17649_20272_20349_21185_21261_24643_24863_26131
897701	contig_10734_pilon	+	2540	17	Intergenic	novelGene_51421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.4196027097871	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	435	2405	2120928	2156004	FALSE	30	TATTTTGTTGCTAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2116837	2156139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120246_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
897702	contig_16303_pilon	-	1948	6	Intergenic	novelGene_34040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	559.056920178974	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	73	921	47976	33093	FALSE	35	CAGACATGATTGTCACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKAALED	48048	32065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33110_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_47897
897703	contig_18184_pilon	+	6327	3	Intergenic	novelGene_123864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	34	786	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	948	3077	96200	111721	FALSE	20	TGTGAAGCTGTTTCTCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFTESVTFKDVAVVFTEEELGLLNPAQKKLYQDVMVENFRNLMSVGGKNPRQVETVPQAGAQEDLSSLHIWQQIASDLTRWQDSMINKSQFYKQGDSPSSVPGGLFNIHTGETPHQCNECTETFSDVSSFDLHQRLHSEEKSLTCCECGKSFRYISRLRNHQRAHMGKNCYKHDECGKEFSQSSHPRSPLNVHAMAKLHKCEECGKCFRHRAALTVHCKGHKGVKSYKCKECGKAFIYLLHFQEHQRIHTGEKTFRCDTCGKNFRCRATFNTHCMAHMRGKPYKCEECGKSFACNAYLYNHQRVHRGEKPYKCEEGGKTFIHPLQFQDHQRVHIAENPYIFNLYGIDFIYNSDLHSHQGVHMGEKPYKCGMCGKGFSRSSYLKVHHKVHSVEKPFKCEECGQSFHWSSRLQVHQLIHTGVKPYKCEECGKGFRQAAHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSTRQNLHVHCRIHKGEKSYNCVECGKGFRQAAHLLTHQRVHSGEKPFKCEECAKYFSSRSNLKTHLRIHTGEKSYNCEECGKGFRHAANLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSSRTNLQTHGRIHTGEKSYSCEECGKGFRQAAHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSHLQAHQRVHNEEKPYKCEECGKGFKWSENLNTHRRVHTGAKPYKCEECGKYFSHASSLQHHELVHTGEKLYKRVW	95252	114971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_96215_104898_105026_109733
897704	contig_11815_pilon	-	5075	1	Intergenic	novelGene_50952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	702	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGAATTTCTGGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476755	471680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_471700_476800
897705	contig_12119_pilon	-	2475	2	Intergenic	novelGene_88629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	928	1341	30533	30120	TRUE	30	AATTGATTTGGCATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTVVKRWKQPRCPSTDEWINNLWYINTMEYYAMRKNNDL	31460	28850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_29290_29424
897706	contig_2114_pilon	+	2797	4	Intergenic	novelGene_104224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	187.52125805418	648	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	118	864	136332	138000	FALSE	5	TGCATGGTTGTCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPRHSRSRSRT	136214	139933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_137604_137805
897707	contig_8377_pilon	+	2305	21	Intergenic	novelGene_34912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3311.07108765427	3	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1827	477	2303	135175	180506	FALSE	20	CGTGAGTCTGTTTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	68051	180508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131574_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
897708	contig_10734_pilon	+	3873	3	Intergenic	novelGene_51526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGTGAGGGCGGGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2281747	2305230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2285181_2286276_2286447_2304960
897709	contig_6189_pilon	-	2458	7	Intergenic	novelGene_164956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_6	385.019227514102	786	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	349	1128	193770	188226	FALSE	15	ACATTTCTTCACCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSATNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFES	198614	186895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_188337_190412_190640_191061_191253_192144_192288_193662_193833_194666_194823_198484
897710	contig_7151_pilon	-	1072	7	Intergenic	novelGene_40791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	810.661338387095	13	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	178	810	551180	529138	FALSE	15	CAATGTCTTTGTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKRRTH	551357	528875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529156_529212_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
897711	contig_9653_pilon	+	4146	14	Intergenic	novelGene_48279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCATTAACAAACACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005010	1040051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1007198_1007814_1007912_1009487_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016082_1016538_1016781_1017927_1018023_1018134_1018276_1018769_1018921_1019947_1020029_1021004_1021157_1025284_1025425_1039824
897712	contig_17274_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_26567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGCATTTCTCTACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230100	232085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_230100_232100
897713	contig_11548_pilon	+	3540	2	Intergenic	novelGene_66757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2991	3332	91446	91787	FALSE	15	CAGAGCCCCGGGATCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMGERRVEQEPKTYKQKSARGACRWSGEMKNYEMEKSKKGTKKRKKKRMNKQKLEREKEQQSSQGSHRYGYEVWGSCSQVLKYSLARTLRGIQCQVSRGQEEKEGIERRETE	87822	91995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_88714_89346
897714	contig_8992_pilon	+	1279	7	Intergenic	novelGene_174427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	92.6074451050718	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	268	822	90606	108008	FALSE	25	GATTTAGTGTAGATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMWPLHHQIYGSDTPVEQEINSAETYFESAKVECAIQTCPELLRRDFESLFPEVTTSRLMIMTVTQKTKNDMTVWSEEVENEREVLLEKFINGAKEICYALRAEGYWADFIDPSSGLAFFGPYTNNTLFETDERYRHLGFSVDDLGCCKVIRHSLWGTHVVVGSIFTNATPDSHIMKKLSGD	73898	108465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_74000_74486_74544_90496_90642_100352_100459_102457_102589_106813_106901_107813
897715	contig_16122_pilon	-	4933	2	Intergenic	novelGene_134565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	464	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTGTACCTGCATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566844	543300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_548218_566828
897716	contig_10434_pilon	+	3487	18	Intergenic	novelGene_82040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1203	1556	142594	143658	TRUE	5	CTGGTGGCTGCGGCCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCPDGERRPSYPPRSGQTFLSYLTLICASFYRHLLCRTTERSKNTPTSFSSYFKIREKREESIKLPWEMIQDYLCSCTIGGPRMMPQEENIELSIANYRTDRHKTQSDRHSHLAI	132774	153453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_132935_133783_134011_134095_134168_134267_134370_134777_134858_135203_135321_136830_136939_137442_137570_139144_139201_139465_139509_142483_142598_143308_144959_145446_145582_148174_148269_149454_149511_150354_150441_152569_152645_153268
897717	contig_9682_pilon	+	3607	11	Intergenic	novelGene_125287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	162.264752796163	38	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	10767	27135	TRUE	85	GCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEEQYKLLSDHIEQMAIE	2375	30210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_27085_28005_28350
897718	contig_15067_pilon	-	3471	11	Intergenic	novelGene_154326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	29.145153971115	325	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	25	1329	156471	92165	FALSE	30	CAGCAGTATTTTCTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYGLAYSLMKFFTGPMSDFKNVGLVFVNSKRDRTKAVLCMVVAGAIAAVFHTLIAYSDLGYYIINKLHHVDESVGSKTRRAFLYLAAFPFMDAMAWTHAGILLKHKYSFLVGCASISDVIAQVVFVAILLHSHLECREPLLIPILSLYMGALVRCTTLCLGYYRNIHDIIPDRSGPELGGDATIRKMLSFWWPLALILATQRISRPIVNLFVSRDLGGSSAATEAVAILTATYPVGHMPYGWLTEIRAVYPAFDKNNPSNKLVNASNTVTAAHIKKFTFVCMALSLTLCFVMFWTPNVSEKILIDIIGVDFAFAELCVVPLRIFSFFPVPVTVRAHLTGWLMTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	156495	90022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92279_92840_92941_93755_93880_95079_95210_123279_123376_128049_128143_130832_130968_132899_133071_141285_141370_143912_144032_156332
897719	contig_753_pilon	-	3232	26	Intergenic	novelGene_113011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	367	junction_6	909.003586351561	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1055	3165	68	3232	1502312	1348419	FALSE	25	AAGAATCGCCCCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTDVELKRLKDAFKRTCGLSCYMGQHCFIREVLGDGVPPKVAEVIYCSFGGTPKGLHFNNLIVGLVLLTRGRDEEKAKYIFSLFSSESGSYVVREEMERMLHVVDGKVPETLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLLLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPTFYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAFDENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELKDMVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNTPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHRLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIANSSKIDRHKVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTTPIRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLKSEQILLAEVHSSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPIPGSPISSSSPVQTDFSSSPSTNGMFTLTTSGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHVPSLPDNRFTGYIIAVHRKMMRTELYFLSSQ	1502379	1348418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1348452_1354812_1355025_1356199_1356312_1358352_1358505_1359925_1360101_1360850_1361025_1362329_1362436_1362718_1362858_1363389_1363465_1364499_1364582_1366859_1367015_1372887_1373006_1375808_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413398_1415056_1415165_1416768_1416901_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
897720	contig_3727_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_146736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	21	431	300452	307411	FALSE	35	AACAAAGCGCCCACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300431	307955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
897722	contig_7031_pilon	-	3431	7	Intergenic	novelGene_132788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	600	junction_1	258.391606330822	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	1645	2649	247917	212812	FALSE	35	TATGAAAGGACAGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKVFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVSLYSDYILNKSIEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML	249561	212029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_212933_213908_214053_241210_241285_241379_241536_243685_243851_244508_244715_247778
897723	contig_5023_pilon	+	2378	14	Intergenic	novelGene_7211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2199.51241234756	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	88	1593	607279	631553	TRUE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRR	580841	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631604_646857
897724	contig_5499_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_57034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAGGAAAAGAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483358	1480681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1480700_1483400
897725	contig_14023_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_165386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1079	1393	296858	297172	NA	20	CACCCTTCCTCAAGGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQCKQGLESHRVKKKLPFMGSTERAVNLEWFKRGVTWLVCADVTASLSCPWHLLSPSGPQGPRARAQHVSLAQLCFYSGMSQSAGGNCSGAVERDFMLFMAR	295779	298195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_295800_298200
897726	contig_10500_pilon	+	6152	3	Intergenic	novelGene_41218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1269	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	5724	6041	1685743	1686060	FALSE	30	AGGTGTCTCCTCAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFLQSRLTIQIQGVSSRGRLSLSWSSHQCSPGLGASRRRDPGPKDALCSRHCFLDGMRSPCLTAQFCLLYLKRLPQDTIQSCKLSPASLTHLPPILPH	1622469	1686171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1628032_1628214_1628336_1685702
897728	contig_12079_pilon	-	2320	6	Intergenic	novelGene_67517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.020903337642	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	73	1554	871668	861365	FALSE	30	CAAACGTTAACTCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPSEGRTTVAGAQFITGQSAQPLMKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872330	860598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863547_871112_871171_871500_871555_871641_871725_872314
897729	contig_9406_pilon	+	2079	5	Intergenic	novelGene_136169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	12	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	110	385	82106	82381	TRUE	80	CATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGWPLCISCRAIWFTTATREAWLFISGSRLSNLCWMTSRSSSFSGICMLLSHCSFSSIQSSQASASLNILYRARVSWSACFRSRVSSATSLYRSSMPDSRPLTSRDSACSWGRAPACSCSVSMVGL	81903	88169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_82004_82096_82970_83739_83895_86064_86363_87516
897730	contig_11978_pilon	-	3836	24	Intergenic	novelGene_62948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	177.99083470807	550	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	921	2766	130	2895	1123828	1041965	TRUE	10	TTGATGTCCTGATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLAAAAPSLARRLLFLGPPPPPLLLLLLSRSSRRRRCLHSLGLAAMPEKRPFERLPADVSPINYSLCLKPDLLDFTFEGKLEAAAQVRQATNQIVMNCADIDIITASYAPEGDEEIHATGFNYQNEDEKVTLSFPSTLQTGTGTLKIDFVGELNDKMKGFYRSKYTTPSGEVRYAAVTQFEATDARRAFPCWDEPAIKATFDISLVVPKDRVALSNMNVIDRKPYPDDENLVEVKFARTPVMSTYLVAFVVGEYDFVETRSKDGVCVRVYTPVGKAEQGKFALEVAAKTLPFYKDYFNVPYPLPKIDLIAIADFAAGAMENWGLVTYRETALLIDPKNSCSSSRQWVALVVGHELAHQWFGNLVTMEWWTHLWLNEGFASWIEYLCVDHCFPEYDIWTQFVSADYTRAQELDALDNSHPIEVSVGHPSEVDEIFDAISYSKGASVIRMLHDYIGDKDFKKGMNMYLTKFQQKNAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTKQMGFPLIYVESEQVEDDRVLRLSQRKFCASGPYVGEDCPQWMVPITISTSEDPNHAKLKILMDKPEMNIVLKNVRPDQWVKLNLGTVGFYRTQYSSTMLESLLPGIRDLSLPPVDRLGLQNDLFSLARAGIISTVEVLKVMEAFVNEPNYTVWSDLSCNLGILSTLLSHTDFYEEIQEFVKDIFSPIGERLGWDPKPGEGHLDALLRGLVLGKLGKAGHKATLEEARRRFKDHVEGKQILSADLRSPVYLTVLKHGDSSTLDIMLKLHKQADMQEEKNRIERVLGATPSSELIQKVLTFALSEEVRPQDTVSVIGGVAGGSKHGRKAAWKFIKDNWEEVYNRYQGGFLISRLIKLSVEGFAVDKMAGEVKAFFESHPAPSAERTIQQCCENILLNAAWLKRDAESIHQYLLQRKASPPTV	1123957	1040640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1041348_1041730_1042118_1044289_1044338_1044611_1044768_1045289_1045398_1048400_1048458_1048852_1048996_1052219_1052440_1053699_1053835_1055522_1055663_1057598_1057663_1060456_1060567_1062723_1062785_1063404_1063510_1064384_1064550_1066985_1067101_1067939_1067974_1068083_1068181_1068635_1068837_1071054_1071163_1074083_1074206_1083505_1083584_1114111_1114197_1123567
897731	contig_13633_pilon	+	1709	13	Intergenic	novelGene_15298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	423.972548901721	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	407	517	22853	28350	TRUE	30	GATTCTGTGTGATAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAPGSILLVIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	5009	49446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28417_28691_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
897732	contig_15449_pilon	-	2946	3	Intergenic	novelGene_33607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTTTTTCATACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55789	48196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_49555_50960_51329_54569
897733	contig_12644_pilon	+	2378	6	Intergenic	novelGene_44444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	145	junction_5	232.775084577366	1016	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	141	884	335374	374861	FALSE	0	TTTTTGGGGGTGGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDKRIHLELRNRTPSDVKELVLDNCRSIEGKIEGLTDEFEELEFLSTINVGLTSVANLPKLNKLKKLELSDNRISGGLEVLAEKCPNLTHLNLSGNKIKDLSTIEPLKKLENLKSLDLFNCEVTNLNDYRENVFKLLPQLTYLDGYDRDDKEAPDSDAEGYVEGLDDEEEDEDEEEYDEDAQVVEDEEDEEEEEEGEEEDVSGEEEEDEEGYNDGEVDDEEDEEDLGGMAAFFLSVVAGWPLWLA	335233	376355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_335428_367593_367744_367994_368118_370700_370900_372113_372212_374741
897734	contig_5686_pilon	+	3763	2	Intergenic	novelGene_45311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAGAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96573	100401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_99389_99453
897735	contig_6842_pilon	+	2148	2	Intergenic	novelGene_130778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1326	2003	1354079	1354756	FALSE	35	CCAAAACCTTTGGGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGFNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDMNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSPIEDKEGHYIMIKGTTHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDAEDLKGTISQLDLIDIYSTPHPTAAKYTFFSNAYGTFSRIDHILGHRAIISLSSLTTMPSR	1351777	1354901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1352810_1353785
897737	contig_9119_pilon	-	3319	1	Intergenic	novelGene_169743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	404	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACTTCTTAGTCAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99778	96459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_96500_99800
897738	contig_10990_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_7474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1014	1502	710709	710221	NA	45	TAACAGCAAATGTTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	711722	709829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_709800_711700
897739	contig_10627_pilon	+	1308	11	Intergenic	novelGene_59942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	278.936569850567	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	12	1196	163094	167664	FALSE	10	TGTTTATTGGTGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVISVDPNDQKKTACYDIDVEVDDPLKAQMSNFLASTTNQQEIASLDVKIHETIESINQLKTQRDFMLSFSTDPQDFIQEWLRSQRRDLKIITDVIGNPEEERRAAFYHQLLRPREVMPRRGRGHCSSLAWHEVLVCAWYRGQ	163082	167776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_165926_166122_166259_166411_166535_166672_166733_167562
897740	contig_11574_pilon	-	1858	6	Intergenic	novelGene_64087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	325.273669392406	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	572	1270	451360	449890	FALSE	30	ATTGAGCTTACATATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	473954	449301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451628_454820_454889_456384_456540_473873
897741	contig_12620_pilon	-	3745	3	Intergenic	novelGene_98806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	1689	2231	226212	225670	FALSE	65	AAAAAAAAAAAATCCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDSCFTLYTKTNSKWNKDLNVKTKTITLLEEKAGTTLSDLAFNNGLSNIITKERTAKDKIDKWDLKKIKNFCSSKDFTKKVKRQASNWEKILGNHIVNKNPLIKIYIKLGQLNNKKTNNPIIKWAKDLNRHFTKEDIRIATKHMKRCSMSLAIREMQIKTTMRYHFTPTRMAKIKKRK	354713	224155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_226832_228531_228800_353912
897742	contig_5018_pilon	+	540	3	Intergenic	novelGene_47010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	369	144	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATAAAATCCAAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256467	1258177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1256563_1257474_1257618_1257875
897743	contig_18251_pilon	+	4236	5	Intergenic	novelGene_50154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_1	1036.85160461852	174	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	103	732	35708	50920	TRUE	40	TTATCAAGAATAGTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVTYATLKFPDSPKMKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVVGQRNYLVLLRCR	35605	55315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_35799_44812_44912_48577_48794_50696_54027_54917
897744	contig_6199_pilon	+	2165	2	Intergenic	novelGene_126337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGCAAGTAAGAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79622	92496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_81429_92137
897745	contig_13244_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_86941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATATCAAGAATGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257938	258311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_257900_258300
897746	contig_10286_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_98395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTACTTCTCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382716	380010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380736_381095
897748	contig_9051_pilon	-	1880	2	Intergenic	novelGene_170800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	48	632	814779	676777	FALSE	60	CAGAAGAAAGGCAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILHSIFSDHKAVKVEMNNRKSKEKKPNTWKLNNILLKNYWVIEEIKDGIKKFIDSNENENTFYQNLWDTAKAALRGQFTATNAHIQKEERAIIKTLTLQLEQAEREQQKKSSGTRRKEITRIRAELNETVNRKTIERVNKTKSWFFEKINKIYNPLAKLTKEKQKRKQITRIRNEMGDITTDPTETDRIITEYNKKLYSNIFHMERKPR	814826	675528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_676807_814224
897749	SIRV6	+	1408	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	34	86	-3	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	224	715	1733	10736	TRUE	20	AAGTTTGCGTTTGGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1121	11739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
897750	contig_7513_pilon	-	2141	2	Intergenic	novelGene_89017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAGAAAATCCTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677627	673439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_674603_676649
897751	contig_10890_pilon	-	5267	1	Intergenic	novelGene_166787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	331	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAACTTGTTATGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142405	137138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_137100_142400
897752	contig_5686_pilon	+	5619	2	Intergenic	novelGene_45362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4910	5254	136974	137318	FALSE	45	GGAGCAAGGGAGAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPHSLFLTSAFQSYASVSGRGASITSGILAAEVCGKCFQLPSLSIRKAPCIGGLELMLTANQVYPVQLPWEVMGSVGSHRCMHGTQLSFSEGWWHVAEQKWMPEIFRKFKKCC	130688	137683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_134678_136053
897753	contig_12624_pilon	-	3464	11	Intergenic	novelGene_61063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1005.38997408966	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	172	888	903621	877414	TRUE	55	AAAACAAACAAGGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVVFSEAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFR	903792	862035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_867982_875658_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
897754	contig_6137_pilon	+	3145	2	Intergenic	novelGene_59292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1993	2307	1361182	1361496	FALSE	30	CAACAGGCACCCTTAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGWIMDTIFRIVFPRNFKVYMLLVNMIPDLILIVCGCKKEWRGYPYTIWINLQDTLLNFKKRCRTGLTGMPPFMLEMHVCLLIFKKKKKDKSKWFSIVGKEQD	1359144	1362334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1359658_1359702
897755	contig_17768_pilon	+	2168	2	Intergenic	novelGene_140395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAGCAAAGATGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48728	51030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_49659_49792
897756	SIRV6	+	1270	9	FSM	SIRV6A	SIRV601	1435	9	3	162	3	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAGATTAACTGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003	11664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
897757	contig_990_pilon	-	3438	4	Intergenic	novelGene_76003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATCTGCAGTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221905	213963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_217123_219100_219230_220183_220295_221866
897758	contig_8628_pilon	+	4232	16	Intergenic	novelGene_164438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_14	101.111687422045	30	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	2159	3082	677746	693112	TRUE	40	ATAAACCAACTCTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKELERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRKKQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYS	651581	694534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_652145_653088_653202_654184_654274_666378_666540_667579_667637_667780_667848_670361_671407_677682_677802_682463_682615_686718_686884_687300_687484_689577_689758_690449_690534_692225_692327_693108_693203_693474
897759	contig_3285_pilon	+	3867	6	Intergenic	novelGene_153374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	391	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGACAGCGCCGCCGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43045	73445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_45933_48786_48949_50738_50906_55755_55852_63569_63687_73007
897761	contig_15991_pilon	-	980	6	Intergenic	novelGene_70915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	30	917	105108	100445	FALSE	15	TCTAAAGGTTGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	105137	100381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
897762	contig_18850_pilon	+	2887	10	Intergenic	novelGene_142439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_8	952.27281079155	303	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1	558	176431	178434	TRUE	25	GCCCCAGACTCCACCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRRCTDHSEDTVPAL	176430	182429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178391_178651_178948_179148_180515
897763	contig_2476_pilon	+	1571	3	Intergenic	novelGene_157643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1066	1482	485346	485762	TRUE	65	TAATAAAATCAAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHKHELLLLLLLQSLLFQFKLGILFIFFLSEPVQFSKYLNFLGLLIIVELLEPLEFSDTEKALLLLFLLLQFELLLLPQPLLFKLFLLSEQILQLALNMEAAAFEALLLLSDLELHNFCLLALSLHLLLHPLQFSLV	480132	487500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_480291_484438_485796_487444
897764	contig_6189_pilon	+	2791	7	Intergenic	novelGene_164959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAACACTCAAATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187627	200937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_188339_190414_191253_192144_192287_193661_193831_198482_198644_200065_200169_200270
897765	contig_859_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_132826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGGACCTGGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105671	107953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_105700_108000
897766	contig_19459_pilon	-	1227	8	Intergenic	novelGene_59812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_7	7389.79510361887	15	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	104	889	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	17287	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_17208
897767	contig_12920_pilon	+	4189	4	Intergenic	novelGene_166351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	669	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCCTCAGAAAAGGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228751	245466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_229314_229355_231281_237331_238846_245278
897768	contig_8820_pilon	-	7250	37	Intergenic	novelGene_79263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	497	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	6786	7250	81466	75979	FALSE	15	CTGGTCAAGGCGCGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPDVVFHALDQLGLVLTDGPADVGPDKQGVEPGEDPEHLVSVLGSAKLVTEASSDAGFHSVDPFIVSLHRSLPRFRAFLGDVEPIHLLDVLVSKVDLLNGIRVGSIKENLCYLHILGFRYLSLILLCNRCDLWPQDPDNHSPQLLMLPSEFSH	109358	75978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_76043_81065_82143_83235_83416_84745_84898_85581_85727_86872_87014_87651_87829_87955_88067_88148_88269_88842_89085_91348_91503_91642_91757_92005_92117_92192_92402_92690_92838_93043_93212_93300_93475_94225_94392_94472_94660_94748_94945_96336_96625_96866_96966_97623_97787_98950_99195_99342_99523_99854_100071_100863_101105_101242_101400_102516_102744_103453_103685_104013_104157_104408_104641_104731_104938_105020_105150_105611_105773_106759_106925_109225
897769	contig_14516_pilon	-	2285	16	Intergenic	novelGene_153912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCTAGTTCTTAGGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423035	212446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_212786_231881_231945_285343_285475_285938_285990_361653_361758_365815_365950_378663_378798_387105_387174_388338_388414_391021_391102_394145_394351_416429_416565_418182_418332_421546_421778_422470_422613_422791
897771	contig_2480_pilon	+	3002	16	Intergenic	novelGene_63534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_2	64.0543519208492	466	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	498	2231	261869	279119	FALSE	10	GTCTGCCTGTTCAGTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLLYIRLALFLPEVVWASLGAAWIQGVECDRTVVNGIIATVVVSWIIIASTVITIIIVFDPLGGKMAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251396	279890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261089_261237_261836_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
897772	contig_15047_pilon	+	1685	6	Intergenic	novelGene_52115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	25901	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	32	655	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2162	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
897773	contig_12919_pilon	+	4454	8	Intergenic	novelGene_75911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	144.083309234623	543	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	83	1021	821938	840209	FALSE	40	CTATGACCCAGAAATAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPKGLRAGYRARPGRGFPVLCWPKRGIMAANENQKHSVLDLCDRLLTDERNQTSIIDKIAKRNTELLEEIRKLEAELQINTRNFQIKEDIPETVIKFASVENPENDSQFLNVSCSFQVAVQVPYELQKGEVLITFEQEEVAQNVIRMGKHHVRIEDKDVEVVAQPVSLNSGVRFQVHVQVSKVKINVNGIPDGLPADQMRDKLELSFSKSRNGGGEVECVEYDNQSQSAVITFVEIGVADKILKKKDFPLYVNQNCHRVTVSPYIETHLEKFQVFSGICPRTVLLTGMEDIQMDEETVTDLVNIHFQRKKNGGGEVDVVKCSLSQPQIAYFEDETYGIV	807072	843642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_807149_821931_822013_822806_822906_825482_825646_828731_828839_829314_829502_839187_839295_840008
897774	contig_10594_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_142318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1428	1757	254143	254472	NA	10	TGGCTCCTGGATTCTCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYRLTPTRLAFIQKTQNNKCWRSCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWCFLKKLEIEVPYNPAILLLRIYPREITAVSRIDICTPMFIAALFMIAKRWKQPRCPSTDE	252715	255278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10594_pilon_+_252700_255300
897775	contig_12257_pilon	-	2493	5	Intergenic	novelGene_152094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121.141188288707	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	100	456	148314	118587	TRUE	15	TTTTGTCATTCACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERLRPRKRRRNGNEEDNHLPPQTKRSSRNPVFQDSWDTESSSSESGGSSSSSSNNSPDRASGPESGLNQTITGSSPNTPQPAPEQSALCQGLYFHINQTLKEAHFHSLQHRGRPPT	148483	116423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_117104_117229_118821_138594_138695_148291_148342_148411
897776	contig_11126_pilon	-	4441	1	Intergenic	novelGene_138119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	441	3999	4439	179124	178684	NA	55	CCTCGACATAAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESREYQKDVYLCFVDYAKAFDCVYHNKLWIKLQRMEIPEHLIVLMRNLYVDQEAVILTEQGDTAWFKVRRGVHQGCILSLYLFNFYAEQIIREAGLYKEECGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIRDYNLQYGL	183122	178681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_178700_183100
897777	contig_14537_pilon	-	3217	3	Intergenic	novelGene_158643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCATGGTCCCCAGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47906	4722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_5439_17418_17619_45605
897778	contig_6137_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_59204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCACCTGTCTCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307638	1305969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1306000_1307600
897779	contig_8284_pilon	+	1101	10	Intergenic	novelGene_125697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	696	junction_8	269.385216858179	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	105	872	426599	461340	FALSE	20	TAGCTGGTTCGTGGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	425050	461569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425144_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
897780	contig_2069_pilon	-	2396	4	Intergenic	novelGene_23365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	30.6267856622271	586	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1514	1837	972952	972629	FALSE	10	GAGTTGATTTGCTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVCVCVCVLFVCACARMWPAPTSPHPLGSPPSLLGPLGDRWQQQRQPRPWGWEACGLLTRDFWAPPGAQPPPSCWISDNQQHWTLPPPHHHPAPRLGFQLGPAQTG	977304	972069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_974048_974876_974990_976427_976531_977102
897781	contig_854_pilon	+	6214	2	Intergenic	novelGene_36191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	481	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	3309	3728	495261	495680	FALSE	25	TATGTATGTGCAAGCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGQSGGRSQERGISSTPTSRRDSQAPPLSLTAVLRPQPEEPSPDRPSHTPYFPSHTAKDPSKPILHRLLSGRCTAPKWVHPQPSHPTPQVLGFYLRSHSPPLSVSSLPIPSVCSCKVSCLQPSSSRQALRHQPAIFFF	490378	498166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_491558_493131
897782	contig_854_pilon	+	5757	31	Intergenic	novelGene_36548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	2618.87828065546	39	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	989	2970	92	3061	1649736	1709563	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVRVQPGGRGLSGVSGPWMLASPSGLTGFFWVGHHRGRGCEWTLGALRFLWSDQALWVRFMNWRSPSGPWSSRWRR	1649644	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695203_1698965_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702163_1709236_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
897784	contig_16703_pilon	+	3929	1	Intergenic	novelGene_72764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCATCTCATCCCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18368	22297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_18400_22300
897785	contig_10159_pilon	+	3144	12	Intergenic	novelGene_30868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_4	105.170699498757	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	855	1889	978504	996016	FALSE	30	AATCCCAGCGGATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKRGHCWVSCTSSASLQGQTQTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	957480	997271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874
897786	contig_11493_pilon	-	6605	32	Intergenic	novelGene_143646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_31	349.182163265193	741	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1244	3735	711	4445	276158	81106	FALSE	20	CTTGAACATGACTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCAISPYACFYGSPAVKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAVSTIRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNEWISILLNALKSQSLTPQSQTVAAPEKFGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVRLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTGPIFTFEIYLPSECVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPFVAENLTEADYDLVGQLYYKDCHALDQWRKGWFAMDKSTLRFCLQMQEAQEDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTIWRTAIEKAAGTDGNALEDQQLSKNDVPIIVNSCVAFVTQYGLGSKYIYQKNGDPLHVSELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTGVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGTFIRSLPVVNRATLAAVIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLAMAFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDTQVSQAGDLLVEVYVERKEPECSIIIPISPIMEAEELTNNILAIKNIIPEKGDLWATFEVIENEELERPLHYTENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKQFLTIDTIRHYSERSALESIKDGVLKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGYLFLFKDLKSSKHDKMFSLSSMKFYLGVKKKMKPPTSWGLTAYSEKHQWHLCCDSLQTQMEWMASVFIAQHENDIWPPAGEERKRSITKNPKIRGLPLIPIQQETNTTLARRNIESARAELERLRLSAKHDKESVDSSLKERATIVAHCLEHKEDKVRNRTRKHRSFNCLEDTGAEVPHGQQKFYKGVKTLRKTEDRNSKATLDSDNKLPSKVIEELNVVLQRTRTLPKEFEDEQILQKEIK	319895	78945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_81490_86865_87001_91512_91577_94186_94223_95325_95409_113510_113651_126283_126413_135824_135943_139148_139224_141334_141404_143264_143413_146901_147008_150637_150851_156774_156939_183434_183499_184764_184964_185815_185919_188014_188160_196944_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816_232996_241701_241823_256061_256132_276063_276418_278388_278457_279219_279297_280556_280616_319648
897787	contig_7179_pilon	+	2364	10	Intergenic	novelGene_78140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	93.9820051070981	519	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	95	1348	984541	1007924	FALSE	20	TGCTTCTCTCAGATTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNRWVLKFYFHEALRAFRGSRYGDFRQIRDIMQALLVRPLGKEHTVSRLLRVMQCLSRIEEGENLDCSFDMEAELTPLESAINVLEMIKTEFTLTEAVVESSRKLVKEAAVIICIKNKEFEKASKILKKHMSKDPTTQKLRNDLLNIIREKNVAHPVIQNFSYETFQQKMLRFLESHLDHSEPYLLTMAKKALKSESAASSTVKEDKEPAPEPVEKPLREPARELQNTPTTIGIMTLKAAFKALSNAKDSEAAFSRLDQKDLVLPNQASLPSSALKNKRPRKDEESSAPAEGESGSELQPKAKRMTISRLVLEEDSQSTEPSAGLDSSQEVVPASLSKPATLHQPLPKEKNLKVHKGKWNNSNGVEEKDTWIEEEELFRVQAAPDEESITSITKKQKWTVEESEWVKAGVQKYGEGNWAAISKNYPFVNRTAVMIKDRWRTMKKLGMN	984446	1008940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_984548_984653_984750_985430_985562_994924_995012_995987_996135_997633_997741_1000659_1001050_1005488_1005575_1007282_1007327_1007765
897788	contig_16098_pilon	-	1577	11	Intergenic	novelGene_46029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1210.30002891845	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	76	1461	352350	348413	FALSE	20	TTTCTGGTACCAGACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354064	348296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
897789	contig_8357_pilon	-	6866	9	Intergenic	novelGene_39726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1689	278	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	995	1294	599825	599526	TRUE	25	TGAATTGCTGAGCAGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNTGFWTELEKDVEQNSNSQKEDQIYWPKGDCRNPESMAPRHSFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKWD	665972	520848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_521368_521623_522747_523094_524354_553301_553816_559438_559709_592376_593154_598415_600162_641541_641853_665625
897790	contig_5125_pilon	+	5351	9	Intergenic	novelGene_43468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	3787	4497	72031	95450	TRUE	60	AGAAAAAAAAATATTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREHPWLARLYVKLAFSYPCLSWFAGPQIAGPGTVVTELLPSSSGNCSPPPQAPSSCLPLSSSLLGVSALGGQTSREALFLCLFKFSFFLLHSHNKHLSHFFFFLLKFSKEFIPFCFVCLLKTERLAVRISVLEPHLLKLTATIQFIVASVSLFSQVFHVHTDQHLSKFHKITMVFILNLHYTPRVLPGLCHLVADLHLFGAANHCKWEMDTHCCINLCHCFFICRKLIYLDTIAD	68176	103327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_69084_69151_72074_75821_76013_79387_79521_89595_89765_90998_91094_95370_95537_98798_98984_102744
897791	contig_8631_pilon	+	4843	3	Intergenic	novelGene_121986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	302	711	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1904	2281	844891	845268	TRUE	15	GTCTACGCTTTCTCTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIQWKLVEKLPLPQNEIAADTSLTKAPVSSIESAMQYDTPTPPPSQPLNETGEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEGQSEGGSEDLGEPVSEEPPQETSEEQSEAALLQGPRDHPPLS	842291	847866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_844099_844794_845995_846030
897792	contig_3269_pilon	+	3960	1	Intergenic	novelGene_117043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGCCACTGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224963	228923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_225000_228900
897793	contig_10129_pilon	+	5172	7	Intergenic	novelGene_128157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	777	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3979	4350	511940	513881	TRUE	20	TCGGTGCAGTTGGCCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIDKVTNLLTIHHEVNSVCSEDQEAVISMMELNPLCFRFCNHTTGFKIQISNTPCHCKSAIYMRLSQTIPSYKATTFLDPFFFIFPFWSMVNGQLYGFSFSTQNSPAVPNTGYNQFNTISQ	502770	531396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_506712_511902_512039_513426_513571_513752_513920_521503_521604_522939_523464_531236
897794	contig_854_pilon	+	4231	25	Intergenic	novelGene_36559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2866.23288354389	18	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	980	3031	1685144	1715205	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSPRI	1656127	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679378_1680828_1680904_1681768_1681880_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702206_1715191
897795	contig_3866_pilon	+	7926	15	Intergenic	novelGene_112396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	6496	6825	183346	200506	TRUE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINQPEEFEEIEIFIAQNRWFVDWNTSVFHKLIKLLEEVVPLFRIKFFLRLLLLLLPFWPLFPSLHHFLQPGHLHHHYWMTQGFHLYPFSNCQGQLLFLRRRLLFEALV	165872	209932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_165913_169272_169377_169613_170750_172275_172418_174189_174272_177419_182292_183051_183153_183327_183419_184713_184793_199818_199987_200496_200575_201701_201787_205906_206037_209029_209129_209213
897796	contig_10857_pilon	+	2515	8	Intergenic	novelGene_160908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	226.175568431036	5	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	578	796	468771	469576	TRUE	30	GTATCATTTCCTCAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGEGRLGQESTPTWGLGAESGSPNARCCSPASLSCCWACLWPPWLFIPTSGPTLLPSAVRPWRGTPTRPCTTGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREVRRAARASGPSGPRSPASPDTPSATPHSSTPMKCRLLMIIWVEEDLRMVLGCANTAGRLPQDLSCHPSAHRCAASATSNAPRRSWPCRCFDLLCPPTSSFRVS	450614	471503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_451725_451841_457543_457619_463693_463796_464688_464807_468708_468898_469484_470337_470544
897797	contig_15293_pilon	-	2706	2	Intergenic	novelGene_146522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1028	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3	377	95002	94628	TRUE	10	GTTTGCCAGAGCTGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVPSVASPGRWVGCPQTWGTWRALVLGTPGPFSLGLQPGPCGITWAEIISLEGWKKSESPRLSPTGRSPVWLHLGSVCLRGSLRKPHLPRPLQGAHQRQLAVPSELENALPSPGLVQGVSCYGL	95004	92216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_92537_92618
897798	contig_13428_pilon	-	1749	4	Intergenic	novelGene_143439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1288	1605	48663	48346	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSWFQKVACCYKQAFYKITLKSNILRACCKNLHIHLQDERGRQRNKHCCINEYLWHRAKFPMNQTSKSTISPSLERNKDVMLRTAGNSKNHSGMTHVKTQEELG	52282	48201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_49360_50072_50162_50250_50390_51919
897799	contig_15165_pilon	-	3290	7	Intergenic	novelGene_145317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_6	16.86877457184	626	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	1083	2795	224352	216810	FALSE	15	TTCTCAATGTCCTTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLEAKKPSVCESKPLTRERLRTTLSVLKGIVASCYGPSGRLKQLHNGAGGHVCTTSQSSALLRGLSVTHPVLKILTTSMQNHVSCFSDCGLFMAILCCNLIEYVEGIDLAPTTVIELNKQLLSLCTSYLKSEACACRIPVDFSSTQILLCLVRSILTSKPACMLTGKEVDHISALVLRAFLLTIPEKAEDHIILGKSIIVPLKGQRVIDSTVLPGMLIETSEVQLMRTLPIKKSSALKVALFCVSLSGDFSDTGEGTLAVSYGVSLESAVLDQLLNLGRQLVWDHIDLVICQKVIHPSLKQFLSTHHVIAIDRVGVALMEPLSKMTGTQPIGSLGSISPSSYGSVKDLCSAKFGSKHFFHLIPNEVAVSSLLLCNRNDTAWDELKLTCQTALHVLQLTIKEPFVFLGGGCTETHLAAYVRHKTLNEPGSILKDVGYTQTELHLIAEAFCSALESLAGSLEHDGGEILTDMKYGHFWSVQSHSPPVANWPDLLSRCGCGLHSNQEELSWSFLRSTHHPFVPQNSLPHEAASSANNLTLDCFTAKLSGLQVAVETANLILDLAYVIEDKN	246876	216314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_217251_219100_219212_220014_220191_223367_224773_232817_233041_246278_246461_246619
897800	contig_17074_pilon	+	2946	11	Intergenic	novelGene_145127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.417092394703	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	20	1048	212450	223655	FALSE	25	ATTTTAAGTATCTTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLLSFYGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	212430	225553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_212474_213454_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
897801	contig_5222_pilon	-	2679	10	Intergenic	novelGene_58979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	239	427	75903	75715	TRUE	30	GCAAGTGGTAAGTAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKTPFFSPSPGPLYSSPNGRGSRGERKGRQALPAGSRPPCIFPQVRAPVGERQASGDNQSASTPNTYPHRSPPRPCTVSMPAQLSASPASQTRPCESHAEMEKATFIPRLEGTGRLAPSGSGLTGLAAYADCTAQDLEMPW	76141	49129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_50032_50616_50694_51007_51119_53996_54073_68289_68333_69123_69224_70542_70640_71734_71856_72116_72187_75059
897802	contig_13699_pilon	-	6384	17	Intergenic	novelGene_158320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAAAAAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116467	63571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_65586_66407_66536_67774_67974_70766_71263_72686_74162_104575_104736_104914_105085_106265_106436_108462_108623_108981_109310_110256_110341_110879_111122_111801_112009_113509_113629_114094_114204_115116_115337_116364
897803	contig_6137_pilon	-	2855	3	Intergenic	novelGene_59299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_1	13.5	501	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	14	418	1599724	1597868	TRUE	10	CCGTGTGGACATTTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYVMSAYRCFVCPVEYNNDTNSFTVDCEPSDLFRLQEYSIPGVIQSVIGWKTVRMYPFQIHSIALSTFASLIGPFGGFFASGFKRAFKIKVGKPCCLFFSLSAPPPSHSFPHLHPSSAFFHQLHSVNHHSLQNIPGY	1599737	1595171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1597201_1597459_1598132_1599583
897804	contig_11656_pilon	+	2644	4	Intergenic	novelGene_53937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGAGACACCGGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111529	120933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_112021_113266_114525_117215_117528_120350
897805	contig_2476_pilon	-	1842	6	Intergenic	novelGene_157641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	49.8220834570374	5	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1770	73	1842	485780	462308	FALSE	20	GTAAGTGTACCTTCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLEFERQQREELEKLESKRKLIEEMEEKQKSDKAELERMQQEVETQRKETEIVQLQIRKQEESLKRRSFHIESKLKDLLAEKEKFEEERLREQQELELQKKKQEEESFLCVRELQWLQELNNDEKAEKIQIFRELDWLRKEKDEQYAKLELEKKRLEEQEQEQFMLVAHLEEQIREKQEMIQLLQRGEVQRVEEEKRDLEDIRESLLRAKEARAEGDDDGEEIEKAQLHFLEFKRRQLVKLANLEKDLVHQKDLLKKEVEEEQEILEHLKCENKDKSRLLAKNDGSVQHVTQVAQDLEKIKPAEYRLQYKERQLQYLLQNHLPALMEEKQRAFEILDRGLLDLDNTLYQVEKEMEEKEEQLTQYQASASQLQKLQATFEFTANIARQEEKVRKKEKEILESREKQQREALEQAVAKLERRHSALQRRSTLGLEMEEQRQKLANVNSSTNARAGLEAGLEAEQEALEKDQERLEHEIRQLKEKICEVDGIQKWDCGTLEGKASSSSLPLSTEKSQAHLMPLMDARINAYIEEEVQRRLRDLHRVVGSDSRASAEGMKDNEKLQNGTIQRKLKYKRMVSRCLGANPYDLKDPIKISIPRYVLCGQGKDEHFEFEVK	487501	462307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_462431_476999_477051_477800_477898_480133_480293_484440_485797_487445
897806	contig_17796_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_33777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTATTTAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25662	27999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_25700_28000
897807	contig_2834_pilon	+	1912	6	Intergenic	novelGene_28000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2294.97532884343	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	53	586	274763	290779	FALSE	60	ACAAACAAAAAAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAMFKSN	274710	292105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_290646_290759
897808	contig_1263_pilon	-	6182	6	Intergenic	novelGene_170393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	937.448025225932	9	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	1426	2130	64087	59754	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKVII	76753	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53517_54889_55637_58131_60189_63285_63454_63985_65324_76564
897809	contig_10235_pilon	+	2604	1	Intergenic	novelGene_46505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	641	1926	390	2315	286302	288227	NA	20	TCAAGCGTGTTGTGTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	285912	288516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_285900_288500
897810	contig_10482_pilon	+	3175	1	Intergenic	novelGene_152841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAACCTTTTTACACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138217	141392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_138200_141400
897812	contig_854_pilon	-	1438	7	Intergenic	novelGene_36408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1402.97367719031	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	639	1136	993124	990696	FALSE	30	AGAGTCATTTTTATTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHGRNFTACKTHSSTGSQPTCATTHFTDEALRPREVK	1001725	990393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_990803_991117_991309_991918_992043_993048_993301_994869_995136_999393_999546_1001681
897813	contig_12427_pilon	+	6532	2	Intergenic	novelGene_40580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	962	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGATCAAAGATTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554381	569904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_557873_566863
897814	contig_6898_pilon	+	2831	7	Intergenic	novelGene_35760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2445.41541574342	72	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	35	916	119670	125646	TRUE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119635	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126297_126441
897815	contig_9177_pilon	+	2927	1	Intergenic	novelGene_32720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGACTCTTCTTAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612161	615088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_612200_615100
897816	contig_6440_pilon	-	4281	6	Intergenic	novelGene_161657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_5	94.678403028357	618	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	39	914	29087	20999	FALSE	25	GTATTTTTCACATTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFINKPTRPGCEMCCRARPEAYQVPASYQPDEEERARLASEEEALRQYQQRKQQQQEGNYLQHVQLDQRSLVLNTEPTECPVCYSLLGPGEAVVLRECLHAFCRECLQGTIRNSQEAEVSCPFIDNTYSCSGKLLEREIRALLTPEDYQRFLDLGVSIAENRSALSYHCKTPDCKGWCFFEDDVNEFTCPVCFHVNCLLCKAIHENMNCKEYQDDLAQRAQNDVAARQTTEMLKVMLQQGEAMHCPQCQIVVQKKDGCDWIRCTLCHTEICWVTKGPRWGPGVSPLEQKVRERVGRVSLWALP	29125	17631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_-_21209_21594_21694_22690_22871_26344_26457_27658_27820_28973
897817	contig_8820_pilon	+	4761	31	Intergenic	novelGene_79276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	120	junction_29	168.202008179319	141	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1078	3237	98	3334	114614	128775	TRUE	0	GCCCGGCTCCCGCCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSHREAIVNSCVFVHQTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFNEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKDQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMSVKEDLDKVEPAVIEAQNAVKSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLLGESTTDWKQIRSIIMRENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQANIQFRTDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATEFIMNEYKDRKITRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDVESYDPVLNPVLNREVRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDLCSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERPDVDEKRSDLLKLQGEFQLRLRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRKVEETDIVMQEVETVSQQYLPLSTACSSIYFTMESLKQIHFLYQYSLQFFLDIYHNVLYENPNLKGITDHTQRLSIITKDLFQVAFNRVARGMLHQDHITFAMLLARIKLKGTIGEPTYDAEFQHFLRGKEIVLSTGSTPKIHGLTVEQAEAVMRLSCLPAFKDLIAKVQADEQFGIWLDSSSPEQTVPYLWSEDSPATPIGQAIHRLLLIQAFRPDRLLAMAHMFVSTNLGESFMSIMEQPLDLTHIVDTEVKPNTPVLMCSVPGYDASGHVEDLAAEQNTQITSIAIGSAEGFNQADKAINTAVKSGRWVMLKNVHLAPGWLMQLEKKLHSLQPHACFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGVKANMLRTFSSIPVSRICKSPNERARLYFLLAWFHAIIQERLRYAPPGVVQEVRVRGSQTCGQPVTPWTRGWMTRPREGITSLQTRSRGRRSRP	112590	133589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_112652_114577_114752_114837_114958_115425_115547_116705_116902_117978_118097_118182_118399_119176_119390_119528_119657_121126_121281_121899_122047_122133_122285_122429_122684_122779_122915_122999_123095_123227_123403_123536_123613_124231_124393_124608_124721_124822_124884_124982_125107_125955_126070_128313_128487_128720_128939_129050_129155_130145_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132604_133235
897818	contig_10404_pilon	-	3498	4	Intergenic	novelGene_138721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1903	2214	1285066	1284755	FALSE	20	TTTCCCAGCACCATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFIPSSVDGHLGCFSLLAIVNSATMNIGVQVSVRVSAFKFFGYIPRSGIAESCGSSNFEEPPHCFPQWLCHFAFPQAMDKGSDFPIYLPTSVIFCFFFKIS	1516180	1283470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1285663_1288315_1288821_1387370_1387975_1515983
897819	contig_12624_pilon	+	5153	10	Intergenic	novelGene_60954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	367.449400228651	486	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1266	1964	39740	55160	FALSE	55	GACCATAACAATGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6075	58349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
897820	contig_1813_pilon	+	2928	12	Intergenic	novelGene_105485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	427.386406540811	172	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGGTATTCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113653	156301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_113850_130943_131042_136483_136564_138158_138233_141498_141604_144965_145022_147589_147686_149922_150119_150260_150632_152059_152225_153457_153502_154854
897821	contig_2367_pilon	-	3687	2	Intergenic	novelGene_65304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	293	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	247	1167	130889	129969	FALSE	55	CCATAAAAAATAATATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEAFLIELSYKEQKYTKFCKPLTCKKTSNDKKETWKKQLLDIKDNSLSLAKMEYQEKVMKESLTEQCNDTNTIKSVDKKTVEKCKCVHLSGNVSLPIPKREGNDERQLDLYRSWSCTSICQNYPDLQIGGDHVGNMYDSGCFVEHTQEDAVNGPLLLSVDIPLGCSPVTEPLEKLPVSKLMDGDEIREKSMVSHKQPLSNSMLNNYMEKKVDELYKQFLEENLTRCHSISNLMASNLLMNNVNQISLQISQEQNIDPLKVRETLLHSLALCNLHNVSHENSSEFSTPNLQISNQTSRELVTHLQ	132258	127448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_130932_132054
897822	contig_4659_pilon	-	5944	9	Intergenic	novelGene_118227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	100	junction_1	152.498309416859	884	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	206	1189	860030	819799	TRUE	20	AACTTTCTAAGTCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884174	813756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_818087_819373_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_883977
897823	contig_11566_pilon	-	4944	19	Intergenic	novelGene_166688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	260.637087456917	61	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	637	1848	224032	177073	TRUE	15	TGTCACTTTATCTTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEEKNERYLLLFPNILLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHKNSFEISGSMIERILVSCNNQQDLHEWVDHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPITPSSKHADSKPVPLTPAYHTLPHLSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKASDEEFAVRKSEYSCFGRRCSNSKSY	259300	157393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_160291_164377_164433_164761_164862_177028_177119_183368_183467_186196_186422_189026_189167_189368_189448_191619_191707_194821_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203342_223964_224061_224290_224386_234704_234794_245828_246035_255113_255245_259213
897824	contig_2036_pilon	-	1915	6	Intergenic	novelGene_131833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_4	375.298068207125	571	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	112	576	661441	641984	TRUE	60	TAAAAAAAAATTTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDNQLLDLDYPSKREAAGQG	661552	616323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631747_631872_636558_636731_641848_642039_647832_647936_661134
897825	contig_6199_pilon	-	4069	20	Intergenic	novelGene_126396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	549	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	2789	3511	592951	586797	TRUE	15	ATGCGAGGCCCCGCCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRMPRPVCERLGRNSSLKGFPQNDSPPVPVPVGSPPLDLKVPDGPVEDGAIVVVLLAEPDEVFTGLWRLVAVQLQVEVASVGVEPHVALLLYKLVAQDIFIDGSCFMCRLRSHGGGGEGSTDLPSGIVSGIQLVHFLLLRGLHGGRQNLIPFELLVELLQGLPGLCVRVFQVVRWVLFGLFFIGVCHFHVVLHVKEVGDVKFVQIGGILEDDDVLPGEGLIGQQVPEVLGLNIQLLHCL	606175	559382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_559595_564010_564055_565836_565879_568952_569019_570035_570091_574877_574930_585650_585738_586796_586891_587897_587975_588613_588776_588949_589024_589666_589773_590253_590345_590818_590855_592868_592988_602081_602138_602797_602867_603003_603068_603214_603355_603752
897826	contig_13301_pilon	+	1493	9	Intergenic	novelGene_153116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	251.983506404685	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	64	1299	169218	173090	FALSE	45	AAAGTTCTTTGAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRWKGSWSEWSTWGLCMPPCGPNPTRARQRLCTAPFPNFS	169154	174503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171671_171809_172002_172203_172378_172631_172824_172974_173091_174309
897827	contig_14300_pilon	+	7341	37	Intergenic	novelGene_133121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	824	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	993	1529	354293	358030	TRUE	5	CTCTGTGCGCCTGCGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARGLEVDPLVPVDLMGEDSAQAEGAVQRGLVERCGALALAGGRLCLLYRGLREERDSRGLLQQALSNAAKGFQTLEELKHGNRLQDALVVLQQAALGDAGLGHDVVEQGLHHALAHRHVQVAVHNTPRAANEADALTVASLCCLREAAGCKTLGQTSGVFTASRKLGLTAQLLLTW	353300	442568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_354520_355665_355860_357184_357235_357964_358516_360499_360777_362092_362352_363567_363855_365229_365404_367130_367225_367932_367998_369362_369472_371447_371531_373466_373609_379170_379331_381804_381993_382130_382213_382837_382974_383356_383504_386241_386414_386531_386631_387139_387236_388355_388500_388812_389100_390573_390761_391532_391633_394188_394344_396027_396159_398864_399068_399605_399880_400885_401005_402565_402726_422707_422836_427259_427353_429716_429861_430486_430663_435726_435937_442322
897828	contig_9098_pilon	-	2576	10	Intergenic	novelGene_75779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	450.439319161764	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	439	1068	288027	264388	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFCLISGVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295278	262879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_287999_288160_289194_289280_292840_292905_294101_294181_295200
897829	scaffold_4805_pilon	-	5664	12	Intergenic	novelGene_161012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	71.9892094760856	410	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	6	1547	534111	385501	FALSE	20	TCTATACTGTTTTGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMASMVEYKGLKDGYHCGYCDSKEGKASCGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRLVPVSFEDPEFKSSFSQSFSLYVKYQMTIHQDPPDECGETEFTRFLCSSPLEAENPPDGPDCGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPHCVSSVYLYYDPDYSFLSLGVYSALREIAFTKQLHEKASQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKGQYRPSDLLCPETYVWVPIEQCLPLLENSKYCRFNQDPEAVDEGRSKDPDRLQVFYKKAIMPYGVYKKRQRDPSEEATVLQYARLVGQRCAESMLLFRS	534116	381383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_385680_406635_406757_469654_469755_474528_474711_495372_495406_511416_511546_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_534026
897830	contig_11318_pilon	-	5834	13	Intergenic	novelGene_48134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	386	junction_6	1103.85434262054	1445	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	4444	5511	21085	9367	FALSE	25	CAATTCTTTTGCAGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRPWINKKIIEYIGEEEATLVDFVCSKVMAHSSPQSILDDVAMVLDEEAEVFIVKMWRLLIYETEAKKIGLVK	40636	9043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_31211_32293_32348_33898_34085_40499
897831	contig_5316_pilon	+	3463	10	Intergenic	novelGene_61228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	329.669119565454	218	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	389	1216	453918	543422	TRUE	40	AGCAATATAGGACTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVESKDK	450340	552084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543404_543536_544132_544269_550086
897832	contig_9363_pilon	-	2290	11	Intergenic	novelGene_6744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	573	junction_9	123.637736957613	1518	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	52	1074	1519981	1506537	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1520032	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972
897833	contig_4783_pilon	-	3753	2	Intergenic	novelGene_108366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1432	1929	147198	146701	TRUE	25	CTACCCGGCTACCACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEEDFLKLLEAEYKRLIYRTLQDIKKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNGKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRTEAMKVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEDTLRIMWDCIKRNNVRVIGVPERRGNRKYRENC	148629	144813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_146354_146416
897834	contig_7020_pilon	+	2679	20	Intergenic	novelGene_57045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	22	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	557	877	43272	45232	TRUE	15	TGTTCCTTATGATCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLLLNLLYIRTSGGDHRTGNLEPTELVYSSSRTYLDRPKSDTLTTPWSFTKQFRAACLGEGTALTPGIPWLHRHPCTSPAAAESGSGGASPSGSSGGSHWPCTR	39055	66246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7020_pilon_+_39311_39408_39541_42143_42301_43259_43378_44002_44072_45086_45299_45810_45982_46831_46910_47790_47919_48093_48174_48470_48529_49077_49142_49543_49731_51550_51618_51943_52074_58674_58755_60330_60404_62375_62474_63004_63178_65897
897835	contig_12313_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_171851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGGTCCACTTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72414	73663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_+_72400_73700
897836	contig_5643_pilon	+	5451	37	Intergenic	novelGene_38903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2229	2567	277460	278307	TRUE	20	GGGAAAATGGCTCCGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAALLKIHHYIQQGDLVTTTSSIECFKISSEDVLVVFLLHRTQLHTHNQLCLGWHVLEHISFEPPQHVRSQHVMQFFNLVLLGNISKLLQEAFQIVKPLRSEKVEQMKQFF	264924	290425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_264946_268686_268820_268930_269045_269297_269431_269737_269807_270274_270402_270863_271038_271136_271286_271620_271750_271853_271947_272033_272121_272204_272385_274797_274972_275144_275393_275715_275836_276984_277103_277217_277349_277431_277574_277957_278133_278257_278383_278661_278798_278947_279152_279636_279826_280745_280842_280922_281056_281430_281644_281757_281956_282595_282835_283045_283225_283392_283530_283784_283911_284159_284407_284529_284643_285193_285414_285605_285728_289295_289476_290348
897837	contig_8377_pilon	+	5283	17	Intergenic	novelGene_35074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3544.75918996534	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1806	3477	5282	131448	180506	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGNLDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	127971	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179481_179574_179666_180383
897838	contig_18162_pilon	-	3610	3	Intergenic	novelGene_122286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCGATCAGTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
897839	contig_7179_pilon	+	1393	8	Intergenic	novelGene_78083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	65.0663711379483	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	549	1085	580349	586612	FALSE	35	ATGAAATAGCCTAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAVNPHLTEDQRFPQLRLSRKARQKTNVFAPDYIAGVSPFAENDICSRSATLQIRDSTLGAGRRRLNPNASRRKFVKKR	576833	586920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_577164_578094_578226_579657_579747_580229_580373_580923_581022_583194_583340_586342
897840	contig_20293_pilon	-	1930	15	Intergenic	novelGene_153507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_8	290.18112746127	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	122	1666	68656	19443	FALSE	70	TGAAAAACAGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	116223	19178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147
897841	contig_8312_pilon	-	2222	2	Intergenic	novelGene_152899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCCAACTAATTTAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280274	277712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_279627_279966
897842	contig_6137_pilon	+	3845	15	Intergenic	novelGene_59255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1454.23102795019	6	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	2375	3511	1328176	1347661	TRUE	30	TTAAAATTCTGTAGTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLCVTSR	1319322	1348366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336786_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1347643_1347749_1348119
897843	contig_8304_pilon	+	3588	1	Intergenic	novelGene_153158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	301	906	53	958	7612	8517	NA	70	CACTCAGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIKNQKGRTCLVFLKLKELKKTFKPQVAIVKDSMGKILNDTGSIKRTWKEYTKSLYQEELVNIQSFQEVAYDQELMVLNEEVQAALKALVKNRAPGIDGIPVEMFQQTDAALGVLTHLCREIWKTATWPTNRKRSIFMPILKKGDPTERGNYRTIALILHASKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQARFRRCGTRDLFADSRWILAESREYQKDVYLCFVDYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGILEHLIVLMRNLYMDQEAVVQTEQGDTAWFKVRKGVRQGCILSPYVFSLYAEQII	7559	11147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_7600_11100
897844	contig_6710_pilon	-	4070	1	Intergenic	novelGene_98162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTTGCAGCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657526	653456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_657500
897845	contig_8729_pilon	+	2916	1	Intergenic	novelGene_40136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCAGTGTTTGCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646271	649187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_646300_649200
897846	contig_12638_pilon	+	2695	9	Intergenic	novelGene_33376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	89.1473499325695	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	95	952	1515842	1530346	TRUE	40	GCGGAGATTCAGTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGR	1515747	1540133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530561_1534864_1535060_1538799
897847	contig_15500_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_128974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCCAGAAAACAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161760	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_159800_161800
897848	contig_4131_pilon	-	2689	6	Intergenic	novelGene_127843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCTACTTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97839	86567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_87993_90260_90434_91468_91569_93095_93335_94417_94538_97207
897849	contig_5981_pilon	+	5024	16	Intergenic	novelGene_35532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	91	junction_1	110.671164567229	360	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	48	1709	289114	311409	TRUE	30	TTGCTATTAACAATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARGGCSCCRLGGFAMPTTQQSPQDEQEKLLDEAIQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYELYMAISDELHYLEVYLTEEFAKGRKVADLYELVQYAGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFPQSRKDILKDLVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEPADEETTGDIGDSMDFVLLNFAEMNKLWVRMQHQGHSRDREKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLTGILEQVVNCRDALAQEYLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIIIALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLFDIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIATSSAVSKELTRLLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNVLDYNTEIVSQDQVDSIMNLVSTLIQDQPDQPVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRSEDPDQQYLILNTARKHFGAGGNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVVGLL	289066	317779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_289117_294391_294491_296426_296524_297238_297363_297842_298026_299492_299707_300849_300934_302162_302273_305007_305105_305209_305359_307394_307603_308170_308327_311271_313394_313869_314110_314545_314690_316832
897850	contig_16211_pilon	-	4632	11	Intergenic	novelGene_150049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_9	286.849368135961	6	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	1054	2598	91808	70073	FALSE	30	GAAATATTTGTTTATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRDKRKDTREKIKEKERVKEKDREKEREKEREREKEREKEKERGKNKDKDRDKEREKDREKDKEKDREREREKEHEKERDKEKEKEQDKEKDREKDKSREIDEKRKKDKKSRTPPRSYNASRRSRSSSRERRRRRSRSSSRSPRTSKTIKRKSSRSPSPRSRNKKDKKREKERDHISERRERERSASTRKSSNDRDGKEKLEKNSTSLKEKEHNKEPDSSVGKEADDKDAPRTEENKVQQNGNCQPNEENLSAKTEVV	93147	68038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_70223_71545_71691_73420_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_92147
897851	contig_9594_pilon	+	2995	6	Intergenic	novelGene_73924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1595	2434	222404	223243	TRUE	50	ACAAAGATGTAAATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	177815	272244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_178135_178295_178791_178935_179079_221527_222135_222373_223370_271809
897852	contig_6163_pilon	-	7215	30	Intergenic	novelGene_103838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	152.553805248634	608	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1595	4788	224	5011	482162	384015	FALSE	75	AAAAGGAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGHHSVSTPGPSRKRRRLSNLPTVDPIAVCHELYNTIRDYKDEQGRLLCELFIRAPKRRNQPDYYEVVSQPIDLMKIQQKLKMEEYDDVNLLTADFQLLFNNAKAYYKPDSPEYKAACKLWDLYLRTRNEFVQKGEADDEDDEEDGQDNQGAVTDGSSPSYLKEILEQLLEAIVVATNPSGHLISELFQKLPSKVQYPDYYAIIKEPIDLKTIAQRIQNGSYKSIHAMAKDIDLLAKNAKTYNEPGSQVFKDANSIKKIFYMKKAEIEHHEMAKSSLRIRTASNLAAARLTGSSHGKGSLSEERNPTSKYYRNKRAVQGGRLSAITMALQYGSESEEDAALAAARYEEGESEAESITSFMDVSNPFYQLYDTVRSCRNNQGQLIAEPFFHLPSKKKYPDYYQQIKMPISLQQIRTKLKNQEYETLDHLECDLNLMFENAKRYNVPNSAIYKRVLKLQQVMQAKKKELARRDDIEDGDSMISSATSDTGSAKRKSKKNIRKQRMKILFNVVLEAREPGSGRRLCDLFMVKPSKKDYPDYYKIILEPMDLKIIEHNIRNDKYAGEEGMIEDMKLMFRNARHYNEEGSQVYNDAHILEKLLKDKRKELGPLPDEDDVASPKLKLSRKSGISPKKSKYMTPMQQKLNEVYEAVKNYTDKRGRRLSAIFLRLPSRSELPDYYLTIKKPMDMEKIRSHMMANKYQDIDSMVEDFVMMFNNACTYNEPESLIYKDALVLHKVLLETRRDLEGDEDSHVPNVTLLIQELIHNLFVSVMSHQDDEGRCYSDSLAEIPAVDPSFPNKPPLTFDIIRKNVENNRYRRLDLFQEHMFEVLERARRMNRTDSEIYEDAVELQQFFIKIRDELCKNGEILLSPALSYTTKHLHNDVEKEKKEKLPKEIEEDKLKREEEKREAEKSEDSSGAAGLSGLHRTYSQDCSFKNSMYHVGDYVYVEPAEANLQPHIVCIERLWEDSAGEKWLYGCWFYRPNETFHLATRKFLEKEVFKSDYYNKVPVSKILGKCVVMFVKEYFKLCPENFRDEDVFVCESRYSAKTKSFKKIKLWTMPISSVRFVPRDVPLPVVRVASVFANTDKGDDEKNTDNSEDSRAEDSFNLEKEKEDVPVEMSNGEPGCHYFEQLRYNDMWLKVGDCVFIKSHGLVRPRVGRIEKVWVRDGAAYFYGPIFIHPEETEHEPTKMFYKKEVFLSNLEETCPMTCILGKCAVLSFKDFLSCRPTEIPENDILLCESRYNESDKQMKKFKGLKRFSLSAKVVDDEIYYFRKPIVPQKEPSPLLEKKIQLLEAKFAELEGGDDDIEEMGEEDSEVIEPPSLPQLQTPLASELDLMPYTPPQSTPKSAKGSAKKEGSKRKINMSGYILFSSEMRAVIKAQHPDYSFGELSRLVGTEWRNLETAKKAEYEERAAKVAEQQERERAAQQQQPSASPRAGTPVGALMGVVPPPTPMGMLNQQLTPVAGMMGGYPPGLPPLQGPVDGLVSMGSMQPLHPGGPPPHHLPPGVPGLPGIPPPGVMHQGVAPMVGTPAPSGSPYGQQVGVLGPPGQQAPPPYPSPHPAAPPVIQQPTTPMFVAPPPKTQRLLHSEAYLKYIEGLSAESSSISKWDQTLAARRRDVHLSKEQESRLPSHWLKSKGAHTTMADALWRLRDLMLRDTLNIRQAYNLENV	493234	381810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_384188_385145_385363_385471_385543_388525_388682_392039_392205_395508_395711_399790_400002_400431_400616_410965_411124_413703_413850_417924_418189_418826_418985_420380_420567_430028_430241_434973_435617_440311_440418_442055_442333_452001_452100_454451_454594_458380_458595_466765_466858_467489_467586_468682_468769_471124_471224_475009_475079_477398_477516_478143_478288_482060_482209_492090_492189_493155
897853	contig_11227_pilon	-	4039	1	Intergenic	novelGene_163193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	837	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTTGGACTGGTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215189	211150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_211200_215200
897854	contig_10109_pilon	-	2254	2	Intergenic	novelGene_131343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	31	1080	349020	347971	FALSE	25	GTAGTGAATTTCCCCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQIISKLLQKQDRMVPVGIQNKTPNDSPVEENALELPDTEFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMTEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGAIEGVRSRFETEEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEEILRVMWDTIKSKNLRVIGISEQAEKTENTERITEELPTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNFQPRITYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQITGRI	471541	346796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_349027_471517
897855	contig_13214_pilon	+	4503	1	Intergenic	novelGene_175711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	380	1143	69	1211	2510	3652	NA	25	TTTGCCGCCACTGCGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPSTLANAPTTFIDGSGKTGKGVVTWQTDGAWQHFITQKASTTQHAELLAAVAAFEIFKSMPFNLVADSAYVVHTIQHISDVTLRFSPDYELFTLFKRLQTLLNSHNSPFFVVHVRSHTPLPGPLSDSNSHADLLAGSAFSDARTSHNFFHLNAQGLQKQFSLSLTEAQQIVCTCPDCQHFSPMSFAAGINPRGLVANQLWQMDVTHYPPFGKLKYLHVSIDTCSGFLYATALSGECSTHACRHFTQAIATMGCPQALKTDNGPAYTSAKFQQFCATWNILHSTGTPYNPQGQAIIERAHHTLKQLLNKQKGGDDGSRVCDQNERLAKALFTFNFYRLPKMVALLQNDILSPLTPDLAHRSTIKILRIPLSGKDLQNY	2441	6944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_+_2400_6900
897856	contig_6794_pilon	-	1943	4	Intergenic	novelGene_148995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	131.469472586689	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	53	409	20671	14342	FALSE	20	GGAGAGCTACGTCTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAAAAEADRTLFVGNLETKVTEELLFELFHQAGPVIKVKIPKDKDGKPKQFAFVNFKHEVSVPYAMHLLNGIKLFGRPIKIQFRSGSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSR	20723	12807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_18732_18827_19426_19590_20575
897857	contig_15067_pilon	-	2115	3	Intergenic	novelGene_154334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	38	447	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	238	543	93847	92165	FALSE	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	94084	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92279_92840_92941_93755
897858	contig_9319_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_154648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTGGAATTATCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98418	97116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_97100_98400
897859	contig_10437_pilon	-	4105	1	Intergenic	novelGene_38326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2354	2764	436985	436575	NA	75	AAAGTACAATAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIEMANRHMSKCWRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAGIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYNPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKSWKQH	439338	435233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_435200_439300
897860	contig_9051_pilon	+	1459	4	Intergenic	novelGene_170809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	10.3708994574027	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCCACCTGCTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039107	1044432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_+_1039222_1040897_1040945_1041673_1042068_1043528
897861	contig_7022_pilon	+	4344	16	Intergenic	novelGene_142142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.8249898857488	256	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1003	3012	38	3049	119547	217392	FALSE	10	AGTTTTTTTTAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNKTASSVKSPSMSLSAHSTPLLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYWILPQCGGIFVEGMESGEGLEEIAKEREKLKKAESIQIKEEMFETSGDILNCLNTDHCEQKEDLKEKDNTNLFLQKPGSFSKLSKLLEVAKMPPESDSMTPKPNGSANGCTMSYQNSGKHSLGSLQSTATQSNVEKTDSNNLFSPGSGGPGKFYSPLPSDQLLKTLTEKNRQWFSLLPRTPCDDTSLTHADVSAASLVAPQSQPPPKSPSPAPAPLLGSSSSQNPIGLNPFALSPLQIKSGVSMMGLQFCGWPTGVLTSNIPFTSSPLPNLGSGLGLSEGNGNSFLTPNAASSKSESPVPQNEKVSSTQPAAIEVVKPVDFLSPKPIPEEMQFGWWRIIDPEDLKALLKVLHLRGIREKALQKQIQKHLDYITQACIKNKDVAIIELNENEENQVTRDIVENWSVEEQAMEMDLSILQQVEDLERRVASASLQVKGWMCPEPASEREDLVYFEHKSFTKLCKEHDGEFTGKEESSAHALERQSDNPLDIAVTRLADLERNIERRYLKSPLSTTIQIKLDNVGTVTVPAPAPSISGDGDGIEEDIAPGLRVWRRALSEARSAAQVALCIQQLQKSIAWEKSIMKVYCQICRKGDNEELLLLCDGCDKGCHTYCHRPKITTIPDGDWFCPACIAKASGQTLKIKKLHVKGKKANEPKKGKKVPLAGDTEDEDSASTSSSLKRGNKDLKKRKMEENTSINLSKQDSFTSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFAVDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHSMRKYFEKKWTDTFKVS	119509	218687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_119575_161668_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477_174623_196293_196950_197399_197677_197846_198003_198384_198546_203080_203392_203784_203921_207720_207868_213049_213316_213553_213698_217238
897862	contig_4931_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_138360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	807	1232	246283	246708	NA	55	GAGGAACAAAGAAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWVCHLGLQPTRNADREYGKATSRSSQQETGYLVTRNTCLLAPKLFSLYVASAAFQWATVPWLERHELISPGSTPPPPAGPFSAIFLLVDFFFAILYCFSFPFSCQCSPVHCPYNSRGTVLHHSPGESLHVASAGLRCHH	245476	247326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_245500_247300
897863	contig_8113_pilon	-	3774	5	Intergenic	novelGene_178712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	2967	3446	96858	96379	TRUE	30	GCAACTCTATGGCAGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKVASGLEEDSLTTCIMQMTQPCLLKVRGLEACTDEGQRLQLSVWITPQHKKKKKQTLTTGPVSNIMKNREKIEVVKDFILLGSAINAHGSLSQEIKRYTALGKSSVKDLFKALKSKDVTLKTKMHLTQALVFSIASYACESWTMNKEDQRIDIFEL	150682	95802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8113_pilon_-_95971_96218_98018_110700_111382_144531_145166_150190
897864	contig_5947_pilon	+	2773	8	Intergenic	novelGene_101498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	149.978501860794	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	265	2331	400575	413932	FALSE	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISLLPASLNALRASGVNIEEETEKNLEKVQTIIEHLQEKRREGTLRVDTFTLVRPEAEDHVESYQTMPIYPTYNEVHMDERPFLRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGIYKCQKTSIVRVGGRSNSEILKQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPVQDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAGQEEAAGEWQTQRSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRYCAHPPQPQPTPPPAFSNIN	399859	414374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_400079_400529_401644_405970_406103_407655_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728
897865	contig_7151_pilon	-	4794	7	Intergenic	novelGene_40724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	3322	4260	429177	428191	TRUE	40	ACTCCTAACTAAACATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVTLRCCSTAWLEGVEVCNAGYSGNRKRRKMQRDKKLSNEERQKGKKRKKKIKQIKKKKKQNQHKKKCPQRSLYMSVEAEGGVSLTRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLKRSSTASQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKATLVANKWHSESQLVRAGVSGQETVSVGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPATNKWHSDNHPFRCVESKQPLFPRQETVAAGSRGGRVGVKKGVG	589821	425818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_425996_427833_428933_428980_429644_586065_586548_587272_587464_587588_587736_587786
897866	contig_10943_pilon	-	3095	2	Intergenic	novelGene_168263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTAAAAAAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41432	38019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_38417_38734
897867	contig_6896_pilon	-	1985	2	Intergenic	novelGene_174229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	883	1341	650538	649844	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPSSTISSSSIVWESGPEGSGSGQTPSVAAPSFVAVTSISSVLSASSSSSSVSLAVISAVAVTLHFLWVMWEAISLRAAPSPLRKWWNMVCSCWLTYQENTQPAWIFQRIYYTTSSCLQQEEAGCQDFPEENRALSSSRSSSMKQPHMKG	651420	649199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_650192_650427
897868	contig_14450_pilon	+	2562	15	Intergenic	novelGene_48932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_10	93.9712559178364	79	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	101	1918	512549	556776	FALSE	40	TTATACAAATTTTTTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGGGGGGSAEWSRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRPSLPPSKQANKNLILKAISEAQESVTKTTNYSTVPQKQTLPVAPRTRTSQEELLAEVVQVQSRPPRISPPIKEEETKGDNIEKSQGPQQRQLLSRLQIDPVMAETLHISQAEMSELSVAQKPEKLLERCKYWPGCKNGDECAYHHPVSPCKAFPNCKFAEKCLFVHPNCKYDAKCTKPDCPFTHMSRRIPVLPPKPAVTTPAPPSSTQLCRYFPACKKMECPFYHPKHCRFNTQCTRPDCAFYHPTITVPPRHALKWIRPQTSE	512448	557420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523323_523742_523844_525728_525885_544457_544533_553725_553847_554738_554876_555156_555249_556073_556181_556769
897869	contig_7179_pilon	-	5376	2	Intergenic	novelGene_78098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	387	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2617	2979	633390	633028	TRUE	15	GCAGTGAGTAGCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEMEEAISESLQNYGDKIPFYQMQLDFECPCCFVNFAYIPVPYHKWWYLKKRPSATGQDGSTFGIELLFPCVSMTVSGTDVSKPLCNILSTLLILCTLIVPKKPRMLYSDDSFLMNTS	636006	630562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_631035_631102
897870	contig_5686_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_45352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122350	121388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_121400_122400
897871	contig_7051_pilon	+	2628	6	Intergenic	novelGene_64334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	511.326901306786	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCTTACAGTCTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321843	336783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_322784_322886_330091_330170_331803_331924_334316_334506_334737
897872	contig_960_pilon	+	1100	3	Intergenic	novelGene_108320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAGGAAGTAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057537	1060746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1057926_1058053_1058241_1060221
897873	contig_3018_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_78816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTGCAGCATCTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539143	536760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_536800_539100
897875	contig_17144_pilon	-	1750	10	Intergenic	novelGene_29249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1859.27369995868	456	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	77	1666	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	181849	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166434_172508_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
897876	contig_15974_pilon	+	2829	1	Intergenic	novelGene_164827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCCACAGCCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340402	343231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_340400_343200
897877	contig_9883_pilon	+	2525	3	Intergenic	novelGene_87581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	283	junction_1	21.5	64	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTATTTCTAGAGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65842	82547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_66004_67998_68098_80282
897878	contig_253_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_129694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATCTGAGATATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457644	458104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_457600_458100
897879	contig_7457_pilon	-	2823	6	Intergenic	novelGene_31404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_5	145.343180094561	47	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_472768_473151
897880	contig_10973_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_150353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	91	603	2730	2218	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2820	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2800
897881	contig_13044_pilon	-	8052	29	Intergenic	novelGene_99983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	56	junction_2	100.935446131249	1533	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2187	6564	88	6651	138523	57414	FALSE	35	GTGAGATAATGCTTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLEMVRFLLAAGADQEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGASLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLGQGANINAQTEETQETALTLACCGGFLEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLSAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHVCTVQFLISKGANVNRTTANNDHTVLSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTSVVCYLLDYPNNLLSAPPPDVTQLTPPSHDLNRAPRVPVQALPMVVPPQEPDKPPANVASTLPIRNKAASKQKSSSHLPANSQDVQGYITNQSPESIVEEAQGKLTELEQRIKEAIEKNAQLQSLELAHADQLTKEKIEELNKTREEQIQKKQKILEELQKVERELQLKTQQQLKKQYLEVKAQRIQLQQQQQQSCQHLGLLTPVGVGEQLSEGDYARLQQVDPILLKDEPQPNAAQMGFAPIQPLAMSQALPLAAGPLPPGSIANLTELQGVIVGQPVLGQAQLAGLGQGILTETQQGLMVASPAQTLNDTLDDIMAAVSGRASAMSNTPTHSIAASISQPQTPTPSPIISPSAMLPIYPAIDIDAQTESNHDTALTLACAGGHEELVQTLLERGASIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDNGADIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVELLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHTAAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRTEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLIGRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHLDVVQLLVQAGADVDAADNRKITPLMAAFRKGHVKVVRYLVKEVNQFPSDSECMRYIATITDKEMLKKCHLCMESIVQAKDRQAAEANKNASILLEELDLEKLREESRRLALAAKREKRKEKRRKKKEEQRRKLEEIEAKNKENFELQAAQEKEKLKVEDEPEVLTEPPSATTTTTIGISATWTTLAGSHGKRNNTITTTSSKRKNRKNKITPENVQIIFDDDPLPISYSQPEKVNGESKSSSTSESGDSDNMRISSCSDESSNSNSSRKSDNHSPAVVTTTVTSKKQPSVLVTFPKEERKSVSGKTSVKLSETINEVTSNSLSTCTKSGPSPLSSPNGKLTVASPKRGQKREEGWKEVVRRSKKVSVPSTVISRVIGRGGCNINAIREFTGAHIDIDKQKDKTGDRIITIRGGTESTRQATQLISALIKDPDKEIDELIPKNRLKSSSANSKIGSSAPTTTAANSSLMGIKMTTVALSSTSQTATALTVPAISSASTHKTIKNPVNNVRPGFPVSLPLAYPPPQLAHALLAQTFQQIRPPRLPMTHFGGTFPPAQSTWGPFPVRPLSPARATNSPKPHMVPRHSNQNSSGSQVNSAGSLTSSPTTTTSSSASTVPGTSTNGSPSSPSVRRQLFVTVVKTSNATTTTVTTTASNNSTAPTNATYPMPTAKEHYPVSSPSSPSPPAQPGGVSRNSPLDCGTASPNKGASSSEQEAGSPPVVETANGRPNNSTSSGSSSVHSNQQQPPGSVSQEPRPPLQQSQVPAPEVRMTVPPLATSSAPVAVPSTAPVTYPMPQTQVGCSQPAPKMETPAIRPPSHGTTAPHKNLAPVQNSSVAVLSVNHIKRPHSVPSSVQLPSTLSTQSACQNSVHPANKPIAPNFSAPLPFGPFSTLFENSPTSAHAFWGGSVVSSQSTPESVLSGKSSYLPNSDPLHQPDTSKAPGFRPPLQRPAPSPSGIVNMDSPYGSVTPSSTHLGNFASNLSGGQIYGPGAPLGGAPTAANFNRQHFSPLSLLTPCSSASNDSPAQSVSAGVRAPSPAPSSVPLGSEKPSNVSQDRKVPVPIGTERSARIRQTGTSAPSVIGSNLSTSVGHSGIWSFEGIGGNQDKVDWCNPAMGNPMIHRPMSDPGVFSQHQAMERDSTGIVTPSGTFHQHVPAGYMDFPKVGGMPFSVYGNAMIPPVAPIADGAGGPIFNGPHAADPSWNSLIKMVSSSTENNGPQTVWTGPWAPHMNSVHMNQLG	141095	56012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_-_57474_58203_58369_58775_58955_59472_59722_73384_73583_77004_78633_80314_80465_90733_90890_91552_92004_93097_93270_105832_105950_107274_107371_110272_110436_110878_111055_111867_112082_112589_112733_114809_114956_115087_115200_123012_123162_127456_128210_129643_129747_130154_130299_130547_130676_132215_132304_134198_134309_134679_134872_136217_136456_138439_138535_141019
897882	contig_3269_pilon	-	4848	1	Intergenic	novelGene_117024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	688	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCAGCATCCCAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131214	126366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_126400_131200
897883	contig_1406_pilon	-	4796	8	Intergenic	novelGene_25650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	888	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	189	488	2800360	2800061	TRUE	25	AAGTGGAAGTCACCTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFASTSSSKAVYLCQCPVSHNICSVSLYSLKFLALYGERYQGASGILCLFPCSHKLPPLYLHQDWLSLIFCTGLICSHGHLVEAMEKSFQSSMSSPCV	2800548	2778691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2778959_2783750_2783874_2786022_2786097_2789058_2789183_2791274_2791412_2792851_2792896_2795116_2795190_2796594
897884	contig_4857_pilon	-	2443	11	Intergenic	novelGene_48778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2244.577243046	137	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	428	1171	1249503	1220094	FALSE	20	CCGGAACACCCTTCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRSSRRCEEERPRTASEVAATAAGAGATPTSLPLSPPLWETAFPEELGKRGTQPQPGASPPAAPPAPIPTDSPGETDAFGNCEGKEPVAAGENKIKQGLLPSLEDLLFYTIAEGQEKIPVHKFITALKSTGLRTSDPRLKECMDMLRLTLQTTSDGVMLDKDLFKKCVQSNIVLLTQAFRRKFVIPDFMSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKVLNFCFYFKLFFYLVIYKDNMLTTQQ	1263945	1218821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122_1243253_1249432_1249555_1249909_1250007_1263360_1263504_1263809
897885	contig_7119_pilon	-	2352	11	Intergenic	novelGene_40859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1991	2335	78059	27570	FALSE	15	TGGCACTAAGCGCCGCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAPVYVKHRSCVATYCGEGFVNSTSLVQREHQECSSPTCFYDYGNKSGIDCTKGTIPGHTRNPDIIVTLVIFHRLPKYMPKLALSYHSPHCVCRKRAGIIRHRSPRCKAGRSL	113733	27552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_27613_55102_55325_77979_78103_90789_90918_95071_95267_98292_98396_99511_99620_102232_102379_111477_111536_111630_111878_112771
897886	contig_5222_pilon	+	2438	3	Intergenic	novelGene_58982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATTCGTTTGTTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154944	163872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_155437_161249_161856_162532
897887	contig_10861_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_39214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGACCCTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577085	579804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_577100_579800
897888	contig_5686_pilon	-	5521	3	Intergenic	novelGene_45302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.5	146	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACACATGAGGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100401	94169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_95480_96125_99389_99453
897889	contig_5083_pilon	-	2657	15	Intergenic	novelGene_151698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_14	286.907766235999	818	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2352	306	2657	1646782	1622765	FALSE	45	GACCACATAAAACAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETEHVASISSDKNTGKTSEFKEDSCSSFSDDESSSLENESKQLSPSFDKTLCQPNVHNNQTEAQENSIPDHGGGEDSCAKTDICPENSEQIANFPGGDFAKQVSKTNDTEQTVTQILAELRSSTLTEAAYQKTYAESPYDTDCTKKLISKIKNVSASEDLLEEIESELLSTEFADERQVPNGMNKGEHALIMFEKCVQDKYLQQEHTIKKLIKENKKHQELILDICSEKDNLREELKKRTETEKQHMSIIKQLESKIEELNNEVKASKDKLVAQDIAAKNAIQQLHKEMAHRMEQASKKCEEARQEKEAMVMKYVRGEKESLDLRKEKEILERKLRDANKEFEKNTNKIKQLSQEKGRLHQLYETKEGETSRLSREIDKLKEDVNSHIIKVKWAQNKLKAEMDSHKETKDRLRETTTKLTQAKEEADQIRKNCQDMIKTYQESEEIKSNELGAKLRVTKGELEKQMQEKSDQLEMHHAKIKELEDLKRTFKEGMDELRTLRTKVKCLEDERLRTEDELSKYKEIINRQKAEIQNLLDKLKVADQIQEQFQRGKQEIENLKEEVESLNSLINDLQKDIEGSRKRESELLLFTEKLTSKNAQLQSESNSLQSQFDKLSCSESQLQSQCEQMKQTNINLESRLLKEEELRKEEVQSLQAELTCRQTEVKTLNTQVEELKDELITQRRKHASSIKDLTKQLQQARRKLDHVENGSYDKEVSSMGSRSSSSGSLNARSSVEDRSPEITGSSVTVDNFPEVDKAMLIERIVRLQKAHARKNEKIEFME	1656589	1622764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_1622932_1628712_1628794_1629959_1630150_1630799_1631056_1633601_1633745_1634639_1634727_1634904_1635004_1635465_1635571_1638517_1638638_1640224_1640438_1641769_1641899_1643849_1643977_1646147_1646844_1648967_1649028_1656405
897890	contig_11338_pilon	-	3870	13	Intergenic	novelGene_6331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	192.738524662012	418	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	472	1620	315636	295354	FALSE	40	ACATCATGCTGAGTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	293103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319266_319381_319429_323165
897891	contig_12938_pilon	+	1325	6	Intergenic	novelGene_99707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	959.552895884328	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTCAACCGCAATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51946	86313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78186_79040_79214_83431_83470_84550_84635_85468
897892	contig_10973_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_150390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	350	862	2730	2218	NA	40	CCGAGTAATCTCAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3079	1621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1600_3100
897893	contig_13301_pilon	+	1356	8	Intergenic	novelGene_153128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	235.998443440041	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	9	1172	169218	174325	FALSE	40	CTTTGAAGAAGGAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCRCPLFPWSKGRVRRM	169209	174509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171671_171809_172002_172203_172378_172631_172824_174281
897894	contig_5686_pilon	-	857	1	Intergenic	novelGene_45349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAGTGAACAGGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121329	120472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_120500_121300
897895	contig_16496_pilon	-	1714	2	Intergenic	novelGene_5179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1503_3383
897896	contig_9471_pilon	-	3318	4	Intergenic	novelGene_21721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_3	225.857378793688	175	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	137	637	153444	150571	TRUE	5	CCTCTCTATGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKVTFLFLGSCS	166998	146973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_147847_148762_150710_153082_153495_166912
897897	contig_7066_pilon	+	2436	9	Intergenic	novelGene_42188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	66.2301857161823	149	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1240	1863	998571	1003261	FALSE	40	GAGTAACAGAATAGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993686	1003834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997150_998096_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
897898	contig_3147_pilon	+	4209	12	Intergenic	novelGene_142275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_1	102.118793245339	882	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	129	1643	115173	128976	FALSE	20	GTAGCTGGGCACCACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRGGAQRSCQGTQKTDFTGASTSPNTPAHGGHQAVHWFPGTMNAIVALCHFCELHGPRTLFCTEVLHAPLPQGAGSGDSPGQGEQAEEEEGGIQMSSRIHSHSPADGASAEASSPGPKKSDMCEGCRSLAVGHPGYISHDKETSIKYVSHQHPNHPQLFSIVRQACVRSLSCEVFEAEQFGCPQRAQRMNTAFTPFLHQRNGNAARSLTSLTSDDNLWACLHTSFAWLLKACGSRLTEKLLEGAPTEDTLVQMEKLADLEEESESWDNTEAEEEKTLVFPEGAEGQEQIKCPTDLSSLSDCGSWQPRKLPVFKSLRHMRQVLGAPSFRMLAWHVLMGNQVIWKSRDIDLVQSAFEVLRTMLPVGCVRIIPYSNQYEEAYRCNFLGLSPQVQIPHHVLSSEFAVIVEVHTVPRSSLYPVGPEDDQSLSKYEFVVTSGSPVSADRVGPTILNKIEAALTNQNLSVDVVDQCLVCLKEEWMNKVKVLFKFTKVDSRPKEDTQKLLSILGASEEDNVKLLKFWMTGLSKTYKSHLMSTVRSPTASESRN	102131	131542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_102176_114657_114718_115148_115422_116708_116856_119089_119251_121001_121094_123003_123192_125632_125747_126491_126616_127835_127968_128100_128207_128774
897899	contig_1301_pilon	-	4623	21	Intergenic	novelGene_47285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	708.912081996068	101	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	96	2147	322831	259065	TRUE	55	ATGAATAAAACTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCRFLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322926	242507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249993_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
897900	contig_4686_pilon	-	3076	22	Intergenic	novelGene_118567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_21	484.488275285263	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2712	364	3075	883895	686115	FALSE	35	AAACCAATAGTCGCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRTVSRSRDIANVMQRLQDEQEIVQKRTFTKWINSHLAKRKPPMVVDDLFEDMKDGVKLLALLEVLSGQKLPCEQGRHMKRIHAVANIGTALKFLEGRKIKLVNINSTDIADGRPSIVLGLMWTIILYFQIEEVTSNLPQLQSLSSSMSSVDSTLSAETASPPSKRKVATKVQGNAKKALLKWVQHTVTKQAGIEVKDFGRSWRSGVAFHSVIHAIRPELVDLEKVKGRSNRENLEEAFTIAETELGIPRLLDPEDVDVEKPDEKSVMTYVAQFLKHYPDIHSTAVDGQESDREDRPVLKEMKVWIEQFERDLTKAQVTESNLQDKYQSFKHFRVQHEIKRKQIEHLIQPLHRDGKLSLDQALVKQAWDRVSSRLFDWHIQLDKSLPAPLGTIGAWLYRAEVALREEINIQQVHEETANTIQRKLEQHKDLLQNTDAHKRAFHEIYRTRSVNGIPVPPDQLEDMAERFHFVSSTSELHLMKMEFLELKYRLLSLLVLAESKLKSWIIKYGRRESVELLLQNYTSFIENSKFFEQYEVTYQILKQTAEMYVKADGSVEEAENVMKFMNETTAQWRNLSVEVRSVRSMLEEVISNWDRYGNTVASLQAWLEDAEKMLSQTEHAKKDFFRNLPHWIQQHTAMNDAGNFLIETCDEMVSLDLKQQLLLLNGRWRELFMEVKQYARADEMDRMKKEYADCVKTLSAFATEAQRKLSEPLQVSFMNVKLLIQDLEDIEQRVPVMDAQYKMITKTAHLITKESPQEEANEMFATMSGLKEQLAKVKECYSPLLYESQQLLIPLEELETQMTSFYDSLGKINETITILEHEAQCSALFKQKHQELLDCQESCKKTLTLIEKGSQSVQKFVTLSNVLKHFDQTTLHRQIADVHVAFQNMVKKTGDWKKHM	893161	686113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_686154_686655_686815_688665_688840_691616_691761_693116_693270_693738_693904_696208_696412_697389_697487_702940_703110_703635_703749_730376_730542_731768_731907_734644_734753_741402_741513_745629_745827_751563_751743_753719_753813_760282_760367_767767_767864_788890_788953_883831_884109_893011
897901	contig_9554_pilon	-	3777	14	Intergenic	novelGene_170681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	277.568606583934	495	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	845	2538	251	2788	125007	78255	FALSE	15	TGTCTGCAGCATGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSEYYCGDQSDDGGATPVQDERDSGSDVEDAVNEQHSGSDTGSVERHSENEPSDREDGLTKRHHVIDSENDDHPNLNASDSESEELHGQKDSDSESEEHPEPPASDSENEDINHHGSDSESEETKKLPVSDSENEELLNGHASDSENEDVQKHPASDSGTEELQKSPASDSETEDALKPPVSDSESEEPPRHQGSDSENELPKPRVSDSESEELPKPQVSDSESEEPRRNQASDSETEELPKPRISDSESEDPPKHRASDSENEELPKPRISDSESEGPPRHPASDSENEELPKPQISDSESEDPPRNQASDSENEELPKPQVSDSESEEPQKGRASDSETEDSSRHKQKPESDDDSDGENRGEDVEVQNDSFNSNSHTERKRFHSSDSEEEEPKRQKIDSDEDEEKEGEEEKVAKRKAAVLSDSEDEEKASKKSRVVSDADDSDSDVISEKAGRREKTVASDSEEEVGKEELSDKKNEEKDLFGSDSESGNEEENLIADIFGESGDEEEEEFTGFNQEDLEEEKAETHIKEAEDSDSDDNIKRGKHMDFLSDFEMMLQRKKSLSGKRRRNRDGGTFISDADDVVSAMIVKMNEAAEEDRQLNNQKKPALKKLTLLPTVVMHLKKQDLKETFIDSGVMSAIKEWLSPLPDRSLPALKIREELLKILQELPSVSQETLKHSGIGRAVMYLYKHPKESRSNKDMAGKLINEWSRPIFGLTSNYKGMTREEREQRDLEQMPQRRRMSSTGGQTPRRDLEKVLTGEEKALRPGDPGFCARARVPMPSNKDYVVRPKWNVEMESSRFQGTSKKGISRLDKQMRKFTDIRKKSRSAHAVKISIEGNKMPL	125257	77265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_78387_82697_82810_85714_85772_86573_86686_88386_88505_89506_89637_91069_91153_92251_92403_95716_95815_101566_101625_102124_102315_104567_105715_122817_122934_124973
897902	contig_12292_pilon	+	4346	1	Intergenic	novelGene_167025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447990	452336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_448000_452300
897903	contig_15491_pilon	+	2484	2	Intergenic	novelGene_75994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	273	698	231475	231900	FALSE	10	TACACCGTTCTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLTTRIEKIGLKDAGQCIDPYITVSVKDLNGIDLTPVQDTPVASRKEDTYVHFNVDIELQKHVEKLTKGAAIFFEFKHYKPKERFTSTKCFAFMETDEIKPGPIVIELCKKPTDFKRKKWQLLTKKPLYLHLHQTLHKE	231089	233686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_231321_231433
897904	contig_11512_pilon	-	2450	6	Intergenic	novelGene_43283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	494.97054457816	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	28	531	396169	368073	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASSSSHPQTAGGARGSREHARRGRVPFQLWPSGKHRLVPLPDW	396196	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366169_366309_368197_368470_368604_374526_374659_378194_378275_396134
897905	contig_8866_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_77848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCAATTTCAAGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647361	644941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_644900_647400
897907	contig_10930_pilon	-	2469	1	Intergenic	novelGene_37069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTACACTGTGTCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	286586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_286600_289100
897908	contig_9653_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_48213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCCTGGCAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503640	501995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_502000_503600
897909	contig_7914_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_165013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGGAAAAGAAAATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4368	2396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_2400_4400
897910	contig_7840_pilon	-	2457	10	Intergenic	novelGene_69036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	280.50232718385	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	261	1415	406713	365958	FALSE	55	GTAGAATTAAAGAAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVGKASATASGDWNTTIACFVAILIGLCLTLLLLAIFKKALPALPISITFGLVFYFATDYLVQPFMDQLAFHQFYI	445700	364915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_445608
897911	contig_3095_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_75198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAACATTGGTCTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243462	245853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_243500_245900
897912	contig_7919_pilon	+	3329	1	Intergenic	novelGene_28120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	738	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCCTGGGAAACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432214	1435543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1432200_1435500
897913	contig_6199_pilon	+	3274	1	Intergenic	novelGene_126349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	545	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGCTGGATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89874	93148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_89900_93100
897915	contig_16701_pilon	-	2911	3	Intergenic	novelGene_177598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	42.5	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	306	929	93792	71919	FALSE	35	AAAATTCCGGGGTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSFVRTCKKLREEEAARLFYQIASAVAHCHDGGLVLRDLKLRKFIFKDEERTRVKLESLEDAYILRGDDDSLSDKHGCPAYVSPEILNTSGSYSGKAADVWSLGVMLYTMLVGRYPFHDIEPSSLFSKIRRGQFNIPETLSPKAKCLIRSILRREPSERLTSQEILDHPWFSTDFSVSNSGYGAKEVSDQLVPDVNMEENLDPFFN	99070	69936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_72388_93637_93884_98856
897916	contig_8210_pilon	-	3428	9	Intergenic	novelGene_30217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	973.476983549175	7	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	614	1348	24031	15712	TRUE	50	AAAAAAAAACTAGTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	53054	13574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_14472_14528_15995_18144_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37631_37803_52874
897917	contig_3588_pilon	+	1659	4	Intergenic	novelGene_72896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_3	223.387555606842	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTTGGTGGTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135327	141457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_136117_137170_137249_138772_138929_140821
897918	contig_4486_pilon	+	5244	9	Intergenic	novelGene_38532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1513	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTCACGCGCGGCACGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127386	178298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_130976_131463_131585_132281_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304_177724_177975
897919	contig_7410_pilon	+	3315	6	Intergenic	novelGene_106081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_5	236.394246968914	519	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	153	551	405351	407259	TRUE	25	TCCTAATACTCAATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRYLF	405198	413526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_408214_408298_408410_410366_410421_411881
897920	contig_8729_pilon	+	2466	3	Intergenic	novelGene_40122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	6	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1229	1867	509088	517968	FALSE	15	AGCACCCTGCAGCCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWHSSDSLALIPLACLRPLVVPFQFPEVVPLNIGGAHFTTRLSTLRRYEDTMLAAMFSGRHYIPTDAEGRYFIDRDGAHFGDVLNFLRSGDLPPWERVRAVYKEAQYYAIGALLEQLENMQPLKGEKTIWNGLWRSPGCVRCSGRPASLSSRSASSRRRCPLRPTSVRSSAPCASSGVRATGSSLSTTARWMCRLGPGRPWLTSTTCCIAW	507859	518567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_509333_516918_517058_517713
897921	contig_10013_pilon	+	3748	3	Intergenic	novelGene_125058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	111.5	465	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1	474	274476	277919	FALSE	20	GCCACGCATTTGTAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPAESRLAKNDVPIQLLSATNQIQRQAAVQQQIPTKLATFTKGSKDKGGKSRGSQRCESTASFDLKQQLLLSKLKGKDIVATARTRRPLSPGLLGGQSATQPPEPCLPSPSPVPANSTPEHVSPRLSAGTSSLPLPPPATPPPAEEETSKEDVIFF	274475	281193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_274660_277544_277674_277758
897922	contig_8045_pilon	+	4990	2	Intergenic	novelGene_35422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3307	3633	535178	535504	FALSE	50	ATCAGAAAAACAATCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTKTSLFSHNPVGYKSKFRASAPGEGFLSLSALEEGPCDASVFCWSGSISVQEPQVQRMCSAPGTYFLGSMRFPCVSACFCVLYLRSDWLKTPSNLVYLPHQYNCR	344120	536861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_345236_532986
897923	contig_12951_pilon	-	943	3	Intergenic	novelGene_68244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTGAAAGCCAGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836493	832893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_833052_833429_833654_835932
897924	contig_7744_pilon	-	3588	1	Intergenic	novelGene_62575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2004	2303	889219	888920	NA	20	TCATCTTAACCCCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVIVTRLQIRRRFLAEPRQLTLVSHNAVGSKEFERGHLKQCWVEQKFSGCWPAGRLRLQALLNELLEREQGTRADIWQTLHHIHFYISHFTLSTRLCT	891222	887634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_887600_891200
897925	contig_12837_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_57360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAGCAAATAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271872	273834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_271900_273800
897926	contig_11117_pilon	-	2845	4	Intergenic	novelGene_148592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCTCACTAACACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291186	81297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_82288_82711_83748_107571_107803_290598
897927	contig_14443_pilon	-	3943	5	Intergenic	novelGene_126660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	837.931679792571	7970	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	102	455	39405	29618	TRUE	40	AGACCCACACCTCACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSSLTMGQLYEKEKDEDGFLYVAYSGENTFGF	39506	11698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_12894_27324_29709_37689_37863_38988_39045_39371
897928	contig_19564_pilon	-	1192	7	Intergenic	novelGene_29691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_1	247.323955347817	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	691	1191	127675	120502	FALSE	40	CTCATCTTAGCAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMDTTTVDKVVKKGKKDKKTKRTFFEELAVEDKQAEEEEKALKEKEQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMERLKKLSVPVSDEEDEVPTLVPRGGKKTKGGNAFAALIQDQSEEEEEEEEKHSPKPAKPEKNRINKGSEEEGEEEEEEGEPKADDLY	128365	120500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_120565_122581_122693_122776_122815_122956_123084_124204_124295_124504_124552_127650
897930	contig_5988_pilon	+	3269	10	Intergenic	novelGene_16091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	1649.67242539575	12	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	395	1108	1218380	1224777	FALSE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210202	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
897931	contig_15952_pilon	+	1951	9	Intergenic	novelGene_154080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.8551826726456	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	497	1240	537845	539422	FALSE	35	TTTATAGAATGTGTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VENRQGSIKGLVYGRRFQVLVYELLLGRGFRGSGGRWKPLVARHQARLKAELARLKVHRSVSRNEDLLELASRPGPALQVPRFVRVNTLKTCSDDAIDYFKRQGFSYQGRASSLEDLRTLKGKHFLLDPLLPELLVFPAQTDLHEHPLYQAGHLILQDKASCLPAMLLAPPPGSHVIDACAAPGNKTSHVAALLKNQGKIFAFDLDAKRLASMATLLARAGVSCCELAEKDFLAVSPSDQRYRQVQYILLDPSCSGSGMLTRQLEEPGACAPSKKRLHALAGFQQRALCHALTFSSLQRLVYSTCSLCQEENEDVVRNALQNSAGTFRLVPVLPSWPHRGLGTFPGAEYCLRASPETTLTGGFFIAVLERKEVSSSASHTEAPGPELTASPTPKRKKKRRKLVAGASTLPGT	534708	540133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_534764_535482_535658_535745_535855_537602_537742_537826_537943_538401_538581_538774_538986_539092_539234_539307
897932	contig_9706_pilon	+	2462	12	Intergenic	novelGene_20977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	595.175215537477	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	66	629	363698	688656	TRUE	15	TGATGAGTTGGGAGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRANCRT	357522	738908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555613_688637_688730_698010_698124_709109_709218_717615_717699_731069_731148_737530
897933	contig_9871_pilon	+	2934	1	Intergenic	novelGene_75631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTCTTTTTTCACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338776	341710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_338800_341700
897934	contig_6001_pilon	+	5419	6	Intergenic	novelGene_128045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	330	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAGAAACAAAGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716283	758874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_718289_718935_719058_725635_725807_728557_728667_729840_729862_755883
897935	contig_5928_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_40391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTCACAAATGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358048	359807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_358000_359800
897936	contig_6191_pilon	+	1990	5	Intergenic	novelGene_107818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	68.3424282565377	72	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	273	989	26904	43956	FALSE	35	TGATTAATGTAATTGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILEYVNCTNLDIKAVAIPALSSGIFQFPLDLCTRIIVSTIKLYFIKKQVVGNLKEIHLVSNEDPTVAAFKTASENILGRNQLESLAFSAEMAENKSMLPSHNSFSGQWTGQQPKKQDEMKGNSNRVKFPVMFSTQALQDKKKQFEKCGFQVIKVEKINNEVLNTVFQAKKKMMAGRSRNVLVSHGLFHRVPHQFCNMVCRVGFQRMYQMPCESRYGAGIYFTKNLKNLADQIRKTPATDKLIYVFEADVLTGSFCQSCQLNIVPPPLSPGAIDGYDSVVDNVSSPETFVIFSSTQAVPQYLWTCSQDEVWSRDYSSGQMMLSSQSYWG	20724	44957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_20982_26888_26950_36068_36212_36849_37025_43603
897937	contig_11898_pilon	+	3602	1	Intergenic	novelGene_144287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3116	3421	242880	243185	NA	20	GACCTGCACACATCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECFLEARMVRLPLTYFGFVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSTRWIDTVAATTGSSLTMIVRMVHDQAVFRSVVHKVAMSRNQLNGT	239764	243366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_239800_243400
897938	contig_1719_pilon	-	512	3	Intergenic	novelGene_87272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_2	49.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	50	493	355244	352154	FALSE	25	AGACCGAAGAGGCCCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGLGEALMMIGSRDVLMTIGFPGEVMTPDLVPGDHLASQVDGEIEKKPEKTVGVHAKNQDYQKTLNGIEKKKGIEIIQIGTRTTGILSEKGTETESETRIASDDLGMRVAGDEDQLRNLRAGEIRVAGMIGIGMTVVVRETTAVI	355293	352134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_352276_353049_353249_355121
897939	scaffold_15568_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_122591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	2306	2839	265994	265461	NA	40	CAACCAACTGGAAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEALKLALEYRVAKANGRNDEVKELNRRFQKVAREDKIKYYNEMCKDLELENRKGRTCLAFLDVKELKKKFKPCIAILKDFMGKILNDIGSIKRRWKEYTESLYQYELVNAQPFQQAAYDQEPMVLKEEVQAALKALAKNKASGIDRILTEMFQQMDAALEVLPSLCQEIWKIASW	268299	265459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_265500_268300
897940	contig_13633_pilon	+	4421	3	Intergenic	novelGene_15332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1551	1868	40307	40624	TRUE	30	CCTTCTAATGGAGAGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYKKAASRSVQRETKKPVICDIRFPTPTLLHPDSASSASRGHYLLTRKHRLLGFHTTEWAGSLSAVCWLLVLLFSASFDFFLTSHHLPLLSLKYPAPCAIFASS	33654	126425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_34398_39499_41382_124629
897941	contig_16525_pilon	-	599	5	Intergenic	novelGene_133804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2148.18474240462	36	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	34	348	97608	91737	FALSE	30	TAAAAGATCGCCAGTTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVPSPRADGAGGLSAWV	97641	91485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91862_93365_93406_96924_96975_97069_97167_97605
897943	contig_16999_pilon	-	3327	1	Intergenic	novelGene_84949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAAAGATGTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26974	23647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_23600_27000
897944	contig_8045_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_35457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477399	479310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_477400_479300
897945	contig_5545_pilon	+	3543	3	Intergenic	novelGene_178713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATATATACTTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704	59273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5545_pilon_+_2328_17150_18995_58197
897946	contig_6102_pilon	-	1318	9	Intergenic	novelGene_32082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_4	130.681327568249	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1146	172	1317	792041	788896	FALSE	35	AACTCAGCAAGGTAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEKLKEKVKREKKEKVKMKEKEEIAKAKPACKADKTLATQRRLEERQRQQMILEEMKKPTEDMCLTDHQPLPDFSRIPGLILPSGAFSDCLTIVEFLHSFGKVLGFDPAKDVPSLGVLQEGLLCQGDSLGEVQDLLVRLLKAALYDPGLPSYCQSLKILGEKVSEIPLTRDNVSEILRCFLMAYGVEPALCDSLRTQPFQAQPPQQKAAILAFLVHELNGSTLIINEIDKTLESMSSYRKNKWIVEGRLRRLKTALAKRTGRPEVEMQGSEEGLGRRRSSRITEETSGMEEEEEEEAIAAGRGRRGRRDGEVDVPASSIPELERQIE	793603	788894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_788944_789048_789230_789439_789515_789842_790058_790452_790708_790863_791098_791584_791651_791969_792071_793461
897947	contig_20527_pilon	+	3729	9	Intergenic	novelGene_138576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1320.82187955076	48	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2093	2569	24977	27453	TRUE	30	TGACCCTAACTGACCGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13435	29204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13841_14742_16273_18652_18739_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27467_28010_28265_28311
897948	contig_7378_pilon	+	5292	7	Intergenic	novelGene_120253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1126	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	3142	3603	417762	418223	TRUE	25	CAAGGTCCCCAAACTCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSLHTAFLAHSSPSASPSHAGTLTPHAASPCTTSPSLLHCGTLRRGRGLSRRGLGKRTLSQSSIRKWQGGLWLKSSGDPDRTVSLSPQFSGLQALVLHHQSSLPFVLYPSASPTLQQLHCHILGLRVGDYCRYQLPCCVWGSSSFAPQGHL	414620	426764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_418943_419911_420042_421678_421782_422143_422235_423544_423814_425112_425205_426479
897949	contig_3956_pilon	+	1251	7	Intergenic	novelGene_15113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1642.05629894011	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	489	1052	1284120	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281606	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282745_1282796_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284777_1290491
897950	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
897951	contig_4604_pilon	+	1545	8	Intergenic	novelGene_19116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	59.0471966190727	271	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	56	598	5641	35929	TRUE	70	CCGACCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSAVIAFGLWFRFGGTMKDLSSEDKSPEYFYVGLYVLVGAGALMMAVGFFGCCGAMRESQCVLGSFFTCLLVIFAAEVTTGVFAFIGKGVAIRHVQTMYEEAYNDYLKDRGKGNGTLVTFHSTFQCCGKESSEQVQPTCPKELLGHKNCIDEIETIISVKLQLIGIVGIGIAGLTIFGMIFSMVLCCAIRNSRDVI	5585	37115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_5690_21252_21351_22724_22800_24239_24339_26061_26134_33236_33321_35863_36266_36504
897952	contig_15897_pilon	+	1596	9	Intergenic	novelGene_49510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	23.9318694422312	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1	882	153150	161266	FALSE	65	GAAAAATGGAGATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMEMRLPVARKPFSESLGRETKKHLVVPGDTITTDTGFMRGHGTYMGEEKLIASVAGSVERVNKLICVKALKTRYNGEVGDIVVGRITEVQQKRWKVETNSRLDSVLLLSSMNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFTANLEPVSLADREVISRLRNCIVSMVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG	153149	161980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_153272_154566_154669_156141_156188_156903_156994_158052_158119_158627_158697_159745_159923_160322_160452_161185
897953	contig_3948_pilon	-	2809	1	Intergenic	novelGene_53169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	359	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAAAGACAACATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277435	274626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_274600_277400
897954	contig_6919_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_163985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	172	330	56542	56700	NA	60	AAAAAAAAAAGCGATAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLKKLEIEVPYDPTIQLLGIYPREIRAVTRIDIHTPTFTAALFTIAKRWKQPRCLPMDEWIDNLWYIHTIEYYATIKNNDKPSKHLIAQMNLEDIMLSEISCKRTNIV	56370	58240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_56400_58200
897955	contig_13216_pilon	-	977	4	Intergenic	novelGene_47450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	5.43650214343336	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTCCTAGCATGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153322	70390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_70498_89641_89864_134873_135022_152822
897956	contig_13780_pilon	+	2553	15	Intergenic	novelGene_149068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	492	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	793	1224	657826	674000	TRUE	70	AGAAAAAAATATATTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGSMELVVFMLQVKRSERGLASLFSSFCSADTLRLEPSYLPFLSYSVGSLLVSFEVNLLKRLVEPRLRVWDKGVASWDRLGEAGGPLYVAVRRSRGWPWKVLRLAVPLGKRMRSGVAALLTLCVEATGVLWSGTALFSLPF	657033	713236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_657934_660148_660193_665728_665988_673979_674079_676392_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685834_686093_686214_686409_686640_688701_688760_694786_694856_699199_699266_702164_702217_713180
897957	contig_854_pilon	+	2393	10	Intergenic	novelGene_36653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3379.71120104501	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	18	1352	1698397	1715343	FALSE	40	AATAAAGAGTACCATGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEERALQPFLAKKHKMASQGGQAPGDGPECFL	1698379	1716384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705394_1715253
897958	contig_16742_pilon	-	5673	2	Intergenic	novelGene_176573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	0	349	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	632	2494	25033	23171	FALSE	30	TACTAAATTATGGCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDFIQPGAFKGIRLHKLTLRSNFDKMNVMKTCIQALAGLEVHQLVLGEFKNERNLDRFDKSALEGLCNLTIEEFQIAYLEDFSSNDIGVFNCLANVSAVSLVDLWLNKLESLPKDFRWQSLELVNCRFEQFPALALPSLKTFVLTANRDSKTVVDFELPSLEFLDLSGNGLNFRSCCSHSDFGTTRLKYLDMSFNNIIVMGSNFLGLEQLEHLDFRSSTLKQANDFSIFLSLTKLLYLDISHTHTRVVFHGIFHGLYSLKVLKMAGNSFRDNFLPAIFTDLTNLTFLDLSHCKVEQVSQGAFDSLLRLQVINMSYNNLLLLDILPFKYLHSLQVLDYSFNHIVAPKVQKLQHLPSNLTLLNLTQNDFACVCEHQSFLQWVKDQRWLLVEVEQMMCATPLDMQGMPVLSFRNTTCQMNKIIISVSVLSVLVVSLTVVLVYKFYFHLMLLAGCKRFGGDECTYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIQEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIILQKVEKSLLRQQMELYRLLNRNTYLEWEDSVLGKHIFWRRLRKALLAGKPQSPEGAADAENN	40155	19991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16742_pilon_-_25413_39903
897959	contig_10793_pilon	+	1946	12	Intergenic	novelGene_83381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3359.07379255081	3	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	132	869	146975	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
897960	contig_3018_pilon	-	2257	16	Intergenic	novelGene_78829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	506.954628695267	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1380	876	2255	583440	550955	FALSE	60	AAGAGAGAAGAGAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLE	625123	550952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585123_600008_600194_603367_603441_624772
897961	contig_16882_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_148225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGTCCTCGAGCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264069	261081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_261100_264100
897962	contig_7272_pilon	-	2678	7	Intergenic	novelGene_25366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_5	468.46644015933	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	318	2360	2677	605006	604481	FALSE	60	AATCGATTAAAAAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTS	618661	604479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_611629_611658_616565
897963	contig_4388_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_161979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCCACCTTTAGCCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259658	1258778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_1258800_1259700
897964	contig_20550_pilon	-	5318	18	Intergenic	novelGene_142610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	814	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGAAAATGGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32845	3712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_3889_10674_10766_11578_11642_12451_12493_12952_12991_15548_15602_15689_15768_15897_15954_18903_19067_19167_19264_19383_19491_19756_19858_20007_20107_20466_20611_21234_21398_24121_24274_24355_24434_29226
897966	contig_12414_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_59590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1161	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	874	1944	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372110	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372100_374600
897967	contig_5145_pilon	+	1818	9	Intergenic	novelGene_131352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	20.84428878614	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	39	1130	36550	60791	FALSE	20	GCATTCTCAGATGTTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEVHVQRTQPALQPGLPGVGGTRPPLLRLRNRAWGRIRLRGAGLRAEGGKMADSSGRGGGKPSAAGSNTPSGAKPKGKRVQGGRMVEPRYLQYEKKTTKKVPAADALKASGKMPEVGKKPNLLQKSRGTSDLSGVGKSDLQSTMLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLGRRWCLALYFFFIVVKIHMSSPHLKMYSSYDEPHLRLYCFFCTSYC	36511	61479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514_52606_57458_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509
897968	contig_6710_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_98338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATCAAATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657524	655538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655500_657500
897969	contig_5485_pilon	+	3405	6	Intergenic	novelGene_37727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	81	junction_3	111.413823199817	425	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	278	868	270269	274587	FALSE	50	AAACAGTGCAAGAACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPHGSDICTSWPRPIFGSLHHVPDLSCRGWHTILIVEKVLNSKTIRSNSSGLSIGTVVQSSSPGSGGGGGEEEDSRQESETPDPSRGFRGTMEADRGMEGLISPTEAMGISSGASSSCPGWLRKELENAEFIPMPDSPSPLSAAFSESEKDTLPYEELQGLKVASEAPLEHKPPVVAWPPRLTPAVTCAGKGTPLTPPTCACSTLQVEVERLQGLVLKCLAEQQKLQRENLQIFTQLQNKKLEGGQQVRMHSKGTQTAKEEMEVDPKPDLDSDSWCLLGTDSCRSSL	265969	277124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_266083_267076_267137_270164_270368_271448_271611_272861_273069_274464
897970	contig_6102_pilon	+	1077	7	Intergenic	novelGene_32081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	705	1043	790637	791617	FALSE	50	TGTAAACCAAAAAGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQSEKAPLGSIRPGIREKSGRGWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSAFGFLLSFLLL	788894	791651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_788941_789045_789230_789439_789515_789842_790060_790454_790708_790863_791100_791585
897972	contig_17687_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_177978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCCATACGCTCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32442	31304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_-_31300_32400
897973	contig_6915_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_162406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	2370	2684	175956	175642	NA	35	GAGAGGATCATTGAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEIDDVIEGLRSRFQTVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVRWDTIKSKNLRVIGIPKRGENRKH	178325	175640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_175600_178300
897974	contig_12313_pilon	-	1928	11	Intergenic	novelGene_171854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	52.4241356628796	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	172	1563	115291	72786	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPASSQPPSAPPSKGKSRKKKDLRITCVCKPPPPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMPEEEPHGAHELPGADGAPFLHLAQNQEDGHCCLREGDPGGGLVGVGPWTPPYPSEHLSPSAGAVLAHNHKLLPLGLRVPGRAGGLFPPDCAAGRLPRCQRTSPLGVPSQALGPLSLAVPLPLLLQGLPSPAPETLDSEGPGRSAEAPFQGSGHPHWTLLPLAACVDSRCTGPAPDATKLYIFLSLDKMDFAHFGPVWPYLLAHHR	115462	72420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_80410_80489_80885_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_100064_100114_100522_100590_115242
897975	contig_8452_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_48020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	692	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	179	478	316119	315820	FALSE	15	GTTACTTTTCAGTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLPTSCCSTDGPEAPPQGPAVRCTLAREDHTLASSDVVMGEGGPRCFPAHNSEIVSVIVSKISLPLNQHGFSVFIFLLGGFLRLESHHPSPNAFKLMH	324104	314910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_324002
897976	contig_9468_pilon	+	2349	6	Intergenic	novelGene_59472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	373.670228945256	5	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	736	2148	201435	207089	FALSE	60	ATAAACTTGAAATGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSPPKADEKERKTRERERERDCNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKMTDHRHMSESPNRKSEKEKKVKDHKSSSKDRDVRRNSEKDDKYNKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKEKDSKHNRHEEKRMSSRSKERDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSGSKEKSKQTESKSNGHDHNKSKEKDRRAQTRSREHDITKSKHSYNSRTRERSRSRDRGRRGRSRSQDRDRSRSKEYHRYREREYRRRGRSRSRERRATPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKEKYRNQESKTSHRKENSESEKRMYSKNRDHNSSANNREKKADRDQSPFSKIKQSSKDNELKSSTLKNKEDDKTRSSVEKEINQKSKGQENDHIHDKNKKFDHESSPGTDEDKSG	192442	207290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_192871_200363_200574_201337_201506_203176_203265_205639_205777_205972
897977	contig_8683_pilon	+	3867	7	Intergenic	novelGene_150277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	131	junction_1	94.6889645101265	587	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	178	909	722991	729151	FALSE	35	ACATGTACCATACGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLATLCYFRGLYLYLGHRLKWWIGYLQRKFKKNLSVEAEVDLLSYCAREWKGETPHAKLMKKAYEELFWRHHIKCVRQVKRDNYDALRSVLFQIFSQGLSFPSWMKEKDIVKLPEKLLFSQGCNWIQQYSFGPEKYTGSNVFGKLRKYVELLKTQWTEFSGMKDYHKRGSMCNMLFSDAILEYRLYEALKFIMLYQVTEVYEQMKAKKVIPSLFSLLFSRETSSDPLSFMMNHLNSVGDTCGLERIDMFILGYSLEVKIKVFRLFKFNSRDFEVCYPEQPLREWPEISLLTENDHHYLIPVF	722620	732109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_722683_722769_722802_722907_723000_723918_724069_726507_726637_727781_728052_728977
897978	contig_7870_pilon	-	2643	3	Intergenic	novelGene_109082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTACACTGATTGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796613	783113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_783636_793437_794204_795258
897979	contig_17144_pilon	-	2316	14	Intergenic	novelGene_29393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1759.13333624105	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	136	2025	179764	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGRTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183217	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173727_179700_179786_181794_181850_183158
897980	contig_7151_pilon	-	2408	4	Intergenic	novelGene_40754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTACTTTTCTGCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509826	502550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502688_503293_503385_504050_504138_507733
897981	contig_17144_pilon	+	2158	12	Intergenic	novelGene_29377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	898	1215	167621	168283	TRUE	25	CTGGTACAACAGTAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166070	174654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172645_173111_173211_173306_173463_173583_173747_174562
897982	contig_7644_pilon	-	5681	11	Intergenic	novelGene_64244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	391	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2287	2631	187417	187073	TRUE	30	GGCGTGAGAGGCGGAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSSVGSKSKFRVSAPGEGFSLLCWLWRKVLGISLPLVWEHLSAGTSGPLCSQHCFLGGMRSLTLCLLPFHLLRDERWCRPHTKETPFTLDQGCDLGKGGVTIPP	475108	162694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_162778_167118_167240_169246_169367_176576_176652_177753_177833_179594_179695_182476_182531_182889_185117_186881_187461_472593_474540_474811
897983	contig_12046_pilon	-	3033	2	Intergenic	novelGene_83490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	139	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1893	2201	485101	484793	FALSE	30	ATAGATGAGTGAGCACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVCKTKSREHSVCTFSNTDLFVLLAVRGVFIILHQHHNSKVSILQSSLFTAQLSHVYEATENTMAWVRCPLVFKVTPFLFNTLKRSFAADLPNAMCCLIS	503517	483960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_485359_501882
897984	contig_9708_pilon	-	1271	3	Intergenic	novelGene_67266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5	94	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	366	848	73531	73049	FALSE	40	AAAGAAACCCATTGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQPLELIPGKDQPQIPCIFRLREEGGIWYLDQIRREQCIPNEEFLNSDLLEKNKYRKIYSFTLEPRTIEDFASMNTFLQTSPASVFTSKSFCSLQTQEGVHCLVGLTLTSRRFNYKDNMDLVEFKTLKEDEVNEVLKNLFSISLQKKLVPKLGDQFFTI	85769	72625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_73588_73744_73928_85643
897985	contig_6552_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_163596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCAAAGCAATGAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117553	119587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_117600_119600
897986	contig_8650_pilon	-	4515	4	Intergenic	novelGene_162634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1449	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2740	3222	361294	360812	FALSE	65	TCCTCTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQRLHQPESGRTRWCLATTNDHPDREHNRKSQTEQEKNVEQNSNSCKKTRLNGLTETGGSPKTMAPGHIVNPELKPFPKPTLQTKIRQDYKTKNNTREECASYFNRIYETKWAASVWRQDEKAGRDRNWSNGHREPRVERGSVLSHCGDCNQCHITICV	464034	359518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_361668_403657_403703_422159_423021_462574
897987	contig_9705_pilon	+	4638	19	Intergenic	novelGene_41761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_14	331.26186445093	61	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	510	2183	522907	538335	TRUE	25	CAATATCCTTTTCGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMG	522397	550770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_539020_539266_539370_540595_541030_541229_541987_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695
897988	contig_11855_pilon	+	3375	8	Intergenic	novelGene_67006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	204.990492562012	384	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	209	1132	1375584	1387339	TRUE	15	TGCTGAATCTGTCTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKASSKGGSLRDKLDGNELDLSLNNLNEVPVKELAALPKATILDLSCNKLATLPSEFCGLTHLVKLDLSKNKLQQLPADFGRLVNLQHLDLLNNRLVTLPVSFAQLKSLKWLDLKDNPLDPALAKVAGDCLDEKQCKQCANKVLQHMKAVQADQERERQRRLEVERELEKKREAKQRAKEAQERELRKREKAEEKERRRKEYDALKGAKREQEKKPKKETNQAPKSKSGSRPRKPPPRKHTRSWAVLKLLLLLLLFCVAGGLVACRVTELQQQPLCTSVNAIYDNALQGLRSHEILRWVLQTDSQQ	1375375	1389833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1375689_1377515_1377576_1379236_1379396_1379626_1379732_1382983_1383057_1385406_1385581_1387091_1389515_1389765
897989	contig_6102_pilon	-	5102	29	Intergenic	novelGene_31988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	19	junction_2	310.898623479797	1143	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1245	3738	63	3800	438578	418292	FALSE	10	GTTTCATCTTGTGGATGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEAGAELSGADGGGGPEPEKMAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPCKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGTDEARAEGQATDEKKEPKDPREGGGVAEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPVVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGDRKAKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQQQQPPPTLPTGSQPVPPTGAAGPPSIHGLAVAPASLAPAPAGTGAPPGSLGPSEQIGQAGPIAGPQQQQPAGAPQPGAVPSGVPPAGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLTATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ	438640	416989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_418369_418971_419401_419718_420101_420538_420674_421184_421352_421432_421569_421802_421868_422138_422301_422537_422797_423161_423225_423318_423439_423672_423766_424435_424590_425298_425413_429166_429239_429548_429680_429962_430001_430140_430201_431438_431564_431940_432057_432161_432294_432427_432504_433389_433460_433715_433786_434353_434447_434547_434630_435076_435163_436270_436391_438467
897990	contig_14353_pilon	-	2670	10	Intergenic	novelGene_82098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_8	482.494674697153	1099	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	52	684	104372	83298	TRUE	45	TACATTAATCAAAGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104423	79079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
897991	contig_4759_pilon	-	1718	4	Intergenic	novelGene_106325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.297723388781	19	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	74	478	589639	587401	TRUE	25	CTGAGTGTAAATGGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEMYQTPMEVAVYQLRNFSISFFSSLLGGDVVSVKLDNSASGASVVALDNKIEQAMDLVKNHLMYAVREEVEILKEQIRELVEKNSQLERENTLLKTLASPEQLEKFQSRLSPEEPAPESPQAPEAPGGSAV	589712	586079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_586808_586888_587632_588757_588810_589517
897992	contig_8636_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_141917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	205	399	366810	367004	NA	5	CTGTGAGTGGGTGGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHIYRGSFTWLGIFYNRAANHTHARAHTFQLPPTTSGPGNGLLERGHRDRWLGLALSRPTSDSLGQVGMARWGHRIEMKGIQLDKVQLSAVTDISSRGRCRVASQCSLWPRPEREWGLGSDLLGVAGPQKAC	366605	367497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_366600_367500
897993	contig_7753_pilon	+	7812	15	Intergenic	novelGene_41502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1227	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGAGCCGGGCAGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224009	1266781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1230229_1231005_1231117_1232452_1232669_1233234_1233336_1233553_1233626_1234220_1234276_1236888_1237011_1237957_1238184_1240519_1240597_1241690_1241787_1243638_1243702_1244401_1244510_1248048_1248186_1263202_1263277_1266646
897994	contig_7568_pilon	+	4438	2	Intergenic	novelGene_174010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	530	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	68	463	122510	122905	TRUE	50	CACAAAAAATTACCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFVNFLCGYLEIYPYLPGLEPVYYHLASTDFLSIRRFYTYTVYSLFYCSDAVVIYRLTSLLPFCNSLGFAQSLRVHFLGWYLASTILCLIFSLWSDIICSQSEGLPLISLISLVWFLHSPLISVYLEMS	122442	136395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_124342_133856
897995	contig_3627_pilon	+	5762	14	Intergenic	novelGene_78564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	96.7188324184008	678	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	20	1399	1299272	1307800	FALSE	40	AAAAATTTACCTTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299252	1312163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
897996	contig_14536_pilon	-	4820	13	Intergenic	novelGene_69280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	144.644007442026	587	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	156	1253	137680	56449	TRUE	25	GAAGTCCTGTATTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVSPAFASVSPSVEEEDLGEDSPRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARSIGSNPPFPIKPLSESKNRLLDSESQWTETGSEEGIVRSGTNNHVTVTIEN	137835	51450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_56408_56487_57556_57673_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
897997	contig_9423_pilon	-	2317	10	Intergenic	novelGene_99175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	184.976741948085	351	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	369	1931	61283	38744	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKNSSCDLRVKKHLVPV	74936	38357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_38792_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_62246_62375_73820_74027_74910
897998	contig_17500_pilon	+	804	1	Intergenic	novelGene_157933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTATAAAATAATTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292924	293728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_292900_293700
897999	contig_12938_pilon	-	3737	1	Intergenic	novelGene_99733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAATAAAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57589	53852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_53900_57600
898000	contig_10953_pilon	+	1979	14	Intergenic	novelGene_42524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	199.171805946584	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1021	1470	155405	161785	FALSE	45	ATTGCCATTTGACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPNLRYLKESQVLLTLTNPVENLTHVTLLECEEGDPDNISSTAKVVVPPKELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFRKANKVGIFIKVTPQREEGEVTVCFKMKHDFKNLAAPIRPIEESDQGTEVIWLTQHVELSLGPLLP	126968	162294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408_145519_146927_147004_151635_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_161571
898001	contig_5586_pilon	+	3087	1	Intergenic	novelGene_143534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGAAAATTGTTAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309805	312892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_309800_312900
898002	contig_12019_pilon	-	3256	7	Intergenic	novelGene_87621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACCTCCCACAGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10532	1704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_2298_4166_4264_5116_6438_7731_8013_8322_8493_9215_9477_9999
898003	contig_10864_pilon	-	1497	9	Intergenic	novelGene_107086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	661.594652619714	199	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	823	1497	976495	911645	FALSE	25	GTATGTGCATGAACTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPGSGRKRTPMKDRFSAEDEALSHIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKELDEKSDKQYAENYTRPSSRNSASATTPLSGNSSRRGSGDTSSLIDPDTSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMDELKEGLRQRDELIE	993267	911644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_911738_919440_919612_924360_924433_927814_927932_929301_929347_958175_958263_976405_976552_991282_991466_992684
898004	contig_7866_pilon	-	5227	17	Intergenic	novelGene_171185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	63.4670189941201	377	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1444	2301	117377	100886	FALSE	55	CAATAAAACTGATTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDTVDAAVKVHSLKAGPSRTVGLFLQGGKDWSPTLYIRLVQDYGLESEVAQHLAATYGDKAFEVAKMASVTGKRWPIVGVRLVSEFPYIEAEVKYGVKEYACTAVDMISRRTRLAFLNVQAAEEALPRIVELMGRELNWSDRKKEEELETARKFLYYEMGYKSRSEQLTDRSEISLLPSDVDRYTKRFHKFDADQKGFITIVDVQRVLESINVQMDENTLHEILNEVDLNKNGQVELNEFLQLMSAIQKGRVSGSRLAILMKTAEENLDRRVVIPVDRSCGGL	276684	97959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_-_101012_103895_103995_104180_104260_104346_104460_115081_115241_116538_116671_117227_117404_117652_117784_136871_137037_143909_144073_144889_145055_184252_184417_185433_185532_186767_186893_205230_205403_242558_242669_276560
898005	contig_15092_pilon	-	2938	21	Intergenic	novelGene_57768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	113.642366659622	7	51	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1200	2057	304389	296486	FALSE	50	ACGAACAATGTTAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISLLNYEDGVLDPSSIVPLIDGGTEGFKGNARVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLIDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFT	338058	295604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297680_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944_304101_304383_304449_304779_304824_310062_310144_312362_312491_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319496_319543_319725_319889_327928_328267_338003
898006	contig_817_pilon	-	4637	12	Intergenic	novelGene_132484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	805	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCGCCGCCGCTGCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774327	740469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_740556_741435_741567_742354_742505_744525_744588_744719_744818_748221_748283_754757_754882_761578_761652_762303_762432_764832_764996_766194_766302_770873
898007	contig_14220_pilon	+	2893	2	Intergenic	novelGene_159849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTTAGATTAGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267923	317507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_268012_314702
898008	contig_7622_pilon	+	1686	5	Intergenic	novelGene_132408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	104.948797039318	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	135	464	252116	253380	TRUE	30	CTCTTTTAGCAAATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTVVAVGLTIAAAGFAGRYVLRAMKHVEPQVKQVFQSLPKSVRLSQHFCQFFAEEGKFPNISEVLFLTPLLSRFTRIDILSFIMMLSSKIQGYVTVLGGVANTSSVQ	251981	256684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_252119_252974_253027_253105_254222_255063_255135_256374
898009	contig_5302_pilon	-	2683	7	Intergenic	novelGene_81427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_4	755.382905110602	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	335	1030	209238	177220	FALSE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209572	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_185037_185126_185963_186076_209142
898010	contig_7708_pilon	+	2626	4	Intergenic	novelGene_61528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_3	114.786758818254	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	177	788	250654	255201	FALSE	25	GTAACATTGCATGGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAVRFLESCQFISGNRIIPDGE	249522	257039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_255138
898011	contig_10930_pilon	-	4407	7	Intergenic	novelGene_36993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	141	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	1795	3402	280415	268388	FALSE	25	GGTTAAATCACTTACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	282209	267382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
898012	contig_6497_pilon	+	1419	4	Intergenic	novelGene_35544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.4425950379461	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	4	561	1598	131456	FALSE	70	AAATAGGAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRNVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSPQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPTKRISAYSALSHPYFRDLERCKENLDSHLPPGQNTSELNTA	1594	132314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_1763_61858_61969_125061_125198_131309
898013	contig_4079_pilon	-	2351	2	Intergenic	novelGene_167482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAATGCCATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131548	129143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_130321_130374
898014	contig_5023_pilon	+	893	3	Intergenic	novelGene_7171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	18.5	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTACAAAATGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538663	541796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538780_540482_540573_541109
898015	contig_16211_pilon	-	4300	1	Intergenic	novelGene_150089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	584	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCCAGCCATCTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186234	181934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_181900_186200
898016	contig_8452_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_48031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAGAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407446	405486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_405500_407400
898017	contig_11896_pilon	-	8188	3	Intergenic	novelGene_88002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1528	junction_2	2	73	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1030	3093	159	3251	151373	136922	FALSE	30	CATGAACACATGTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLASKQRHNKLWRSHSDSDLSDHHEPICKPGLELNKKEITTSADQIAEVKTMESHPPIPPVFVEHVVPQDTNQKGLCTKERMICLEFTSREFHAGQIEDELNLNDINGCSSGCCLNESKFPLDNCHASKALIQPGQAPEMANEFPDLTVEDLETDALKADMNVHLLPMEELTSRLKDLPMSPDPESPSPQPSCQAEVSDFSTDRIDFFSALEKFVELSQETRSQSFSHSRMEELSGGRSESCRLSVVEVAPSEVTADDQRSSSLSNTPHASEESSIDEEQSKAISELVSPDIFMQSHSENAISVKEIITEIESISQGVGQIQLKGDVLPNPCHTPKKNTIHELPIERAQALENKPGNLEQNKGSCAAQPELAKDSGKWDPEGCLTTCSFTADLEEEEPAEGEQELRSPEMHPGAKWCPGSVRRATLEFEERLRQEQEHHGAAPVCTSLSTRKNSKNDSLVADLAPKGKSDEATLEHSVVPKESEMSKDKGECSGSKAGSLPLPEQKAIAPAPELLEFHPLPAPQEHPVSDARTQQEGVLKEQRTVLSCQGSETQAVPLSLPKRIEIIEYTHTVTSPDHHGPEAEVATTEKGGEQGLRKVKVEKSITVLCALDENLNRTVCPNQVSVHPQVLPLPHSSSPEHDRPTSPTSTLSSPDDRSNSPSTPLETAAPFVSCTTHVPSANLDYLHPQTVVHLEGFTEQSSSTDNEPSTQQGSWEESQEGPLCSGDELPHKGSQLSSEDLSLISKLDDNIEELQEKLDPSPMACQLPHSSSSDSIKGLSHSAGVVKERAKEIESRVICQAGLTNPSQIRRSASLVKLGYLDLCKDCLPEREPIFSESPHLKLLQPFIRTDSGMHAMEVQEPPENPGVPQNPEPTKYFVEQLKTTECIAQSKPVERPLVQYAKEFGHGQQCSLPRAGPELTSSEGGLALLQTQGLQCAGAAPGLAVAPRQQHGRTHPLRRLKKANDKRRTTNPFYNTM	151531	131984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_139013_141210_142046_151206
898018	contig_2940_pilon	-	5829	3	Intergenic	novelGene_81890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_2	142	560	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	4550	4942	453855	453111	FALSE	20	GGTTTAATGGCTGTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	458404	452223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741
898019	contig_4857_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_48725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	795	1190	1193569	1193174	NA	35	CCCAGATCTACCACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKKKNNIKRNAFRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKETIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLEWSSAAPQEEAKMAHGARYSSERKGRWGEARKK	1194363	1191854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1191900_1194400
898020	contig_15866_pilon	+	3552	12	Intergenic	novelGene_63631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	256	junction_3	512.431684622408	300	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	205	921	601021	624508	TRUE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTCTDLEQGPNFFLDFENAQPTESEKEVYNQVNVVLKDAEGILEDLQSYRGAGHEIREAIQHPADDKLQEKAWGAVVPLVGKLKKFYEFSQRLEAALRGLLGALTSTPYSPTQHLEREQALAKQFAEILHFTLRFDELKMTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETP	458966	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459068_519223_519277_581434_581475_601010_601094_608107_608230_613655_613762_619607_619745_620762_620841_623215_623333_624424_626331_627916_627988_633069
898021	contig_4884_pilon	-	2864	13	Intergenic	novelGene_63811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGACGCGCTACCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593612	563290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_563388_570113_570218_575038_575154_575915_576824_578418_578561_578696_578872_581254_581361_582398_582485_584843_585017_586134_586319_587339_587486_592826_593039_593196
898022	contig_10078_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_160008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCTGATCAGAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212046	214689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_212000_214700
898023	contig_9668_pilon	+	3282	2	Intergenic	novelGene_58226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	916	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATTTAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555860	559322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_556625_556804
898024	contig_4315_pilon	-	2121	8	Intergenic	novelGene_46789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	334.168844039253	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	89	574	339053	335266	TRUE	25	CAAAACATCCTGTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPVHHGGALGRAVA	339141	327072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335206_335304_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
898025	contig_7876_pilon	+	5771	5	Intergenic	novelGene_144849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	161	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	4147	4647	527668	530276	TRUE	20	GCCCCTCCCAAAGTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSARGTPYTKQTISKHLKKQDRTVLVGVQNKTPDDLPVEEKALNLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMESTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEITQKQQLEIQKINNNILEMDNVIEGLRSRFETMEDRISKIEDKHLDTTLRNNQKKE	391941	532212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_395371_526950_527701_529808_530564_531135_531245_531484
898026	contig_7622_pilon	-	5636	16	Intergenic	novelGene_132412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_3	189.081522688554	657	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	207	1817	297961	269125	FALSE	40	TTGACAGCAATGGAACGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEISEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNHTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRESRHQRDSRRRPGGRGRSVSGARGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSANRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAVNGPASASGDEISKLQRPPGEEKMSTLKEEATQEAAVLNGVS	306643	265305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_269296_270026_270119_274472_274674_276552_276757_280542_280606_280692_280751_282438_282526_288428_288539_292279_292359_295549_295721_296529_296647_297075_297170_297399_297549_297946_298019_305043_305138_306588
898027	contig_5222_pilon	-	2709	2	Intergenic	novelGene_58985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGTTTCATTTGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163520	154998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_155435_161247
898028	contig_11656_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_53944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATCCAACACCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112833	117424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215
898029	contig_3472_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_166952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGCAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989590	988270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_988300_989600
898030	contig_2093_pilon	-	6790	3	Intergenic	novelGene_152947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	599	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	326	439	968095	967982	FALSE	20	AAATCTGGGGTGGCGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKSCGLTVAASIWTWLACGVCATRASGPRLATPASLTTPRSSPCGDSLTSSPPQVNGITSNGTCLSSIRPLLLQFEVQILCCGENFQGSGRTCLWLRLRSGLDPFWDMIQTNFIFTFSILGDPQGNIIQSALKTATATNPLTSA	970583	961630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_968149_968594_968701_970417
898031	contig_14536_pilon	-	5430	4	Intergenic	novelGene_69313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	3320	4114	224132	223338	TRUE	35	TTGAACTATAAACTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKMSVLPKAIYRYSTVSIQIPVAFFNEIEKQITNFVWKGKRPWISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTCYTTMVVKTTWYWYNNRYIGQWNRIENPDVNSSIYEQLIFDKGPKSVNWGKDSLFNKWCWHSWISICKKPKQDPYLTPCTKTNSKWIRDLNIKSKTIKIMEEKIGITVGALIHGINRIQNITNSAQTPEQRLDNWELLKMKHLCSSKDFTKKSKKTTYRLGKNFGYNKSNQHLISTVHKILQNLNNKKTTELKNGQRI	227810	221798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_223102_223324_226694_226884_227031_227198
898032	contig_3068_pilon	-	2765	23	Intergenic	novelGene_137626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	316.750390555963	28	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	29	2254	251978	233625	FALSE	5	CTGTGTGCATTGTCGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	252006	233113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234622_234886_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972
898033	contig_854_pilon	-	2578	11	Intergenic	novelGene_36674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	13	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	1962	2576	1709514	1699281	FALSE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTLADIVLGAHEVLHLRAELLVEPLQLCLLLHGLLQGPGQRQRLGLLLSGLCLGPVTLLCILGRDGLLLCQELVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHHHTWACRVAICFSRFCLASSSSSSCSLKEFFSSSICFSLVLRLSFCRFSGLH	1716407	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699290_1705299_1705447_1706757_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710677_1711573_1711655_1711753_1711877_1712276_1712337_1715213
898034	contig_8354_pilon	-	3054	24	Intergenic	novelGene_24103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_21	97.2070461945412	680	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	376	2829	317393	221213	TRUE	30	CAGATGGTCAAGAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQRCLDDHKYKQAVGIALETRRLDVFEKTILESNDVPGMLAYSLKLCMSLMQNKQFRNKVLRVLVKIYMNLEKPDFINVCQCLIFLDDPQAVSDILEKLVKEDNLLMAYQICFDLYESASQQFLSSVIQNLRTVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEKESESMETEEKTVSALVGKTPEASPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAVSDVNDDVRRAAVESLGFILFRTPEQCPSVVSLLSESYNPHVRYGAAMALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKMPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAKAKKKEKEKEKKEEEKMEVDEAEKKEEKEKKKEPEPNFQLLDNPARVMPAQLKVLTMTETCRYQPFKPLSIGGIIILKDTSEDIEELVEPVAAHGPKIEEEEQEPEPPEPFEYIDD	327707	219060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_219277_221203_221360_230251_230399_231375_231463_232863_232957_240651_240822_247565_247669_256652_256770_259837_259953_296384_296450_297453_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296_307426_308574_308636_312425_312653_315101_315246_317291_317498_321129_321204_322339_322384_327554
898035	contig_11986_pilon	-	7400	20	Intergenic	novelGene_69088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.182149842346	1179	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1468	4407	728	5134	76136	27552	FALSE	25	TTTCAAAGACAGCTGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGSAQGNFTGPTKKTNGNNGTNGALVQSTSNQSALGAGGANSNGNSARVWGVATGSSSGLAHCSISGGDGKMDNMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTDPQTSTSQNVSFSVQPQNLNTDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGGGEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFNQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGNGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNSGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSSSDINGKGSTGWDSPSVSSQNPAMQPGSEQMNSWAKAASSGTATSEGSSDTSGHHNEGSTGREGAGEGRRRDKGVVDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQPSNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVSSPPAAVPANTGWGDSNNKAPNGPGVWGDSISSTAVNNAAAAKSGHAWSGTVSQEDKSPTWGEPQKPKSQNWGDGQKSSPAWSAGGGDWADSASVLGHLGDGKKNGSGWDADNNRSGSGWNDATRSGTSGWGNGTNAKVNPGTNWGESLKPSPQQNWANKPQDINVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTSTSTTTTTTASNNPNMVETPPSHQASTQLNRSPLLGSVSSGWGEMPDVHSKAEKSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPAVTFGRAGAPTAAPALCKPASKSMQEGWGSGGDEVNLSTSQWEDEEGDMWNNAASQDSTSSCSSWGNAPKKGLPKGMKTAGKQDEAWILTRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMVTKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSNSALPGQTLGGIASGLGVQNLNSSRQIPSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPQPPPAQPLSSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPSTFTPYPLAGLNPNMNVNSMDITGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSVDNLPSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIRPPAKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSAGPASHTQASLSHELWKVPRNTTAPTNQGWSRC	157425	25285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_27577_31337_31447_38987_39132_39598_39791_41122_41291_42013_42246_42365_42450_44628_44749_46962_47110_48828_48979_50772_50916_51981_52040_53488_53570_57243_57411_58893_59110_73765_76355_93382_93710_122397_122420_123193_123295_157366
898036	contig_15021_pilon	-	1184	11	Intergenic	novelGene_26981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACGCTGGGGGGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343874	332811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_332894_333110_333313_333451_333560_334695_334802_335114_335195_336589_336729_338548_338653_338749_338865_339780_339867_340024_340156_343843
898037	contig_9297_pilon	+	2237	10	Intergenic	novelGene_69875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	360.595940213926	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	227	2038	909271	912790	FALSE	40	ATTGGCAATCTTAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARWSALIWGPLTPASGCSRTAAWSDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	908961	912989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909437_909513_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
898038	contig_16622_pilon	-	1523	12	Intergenic	novelGene_48458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1086.98184768196	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	558	1256	125335	112116	FALSE	30	ATTTCATGTCAATTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKGQQIYDHTF	128591	111848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128337
898039	contig_3424_pilon	-	3561	1	Intergenic	novelGene_55539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	725	1045	277913	277593	NA	45	CCCGAAAAAACCAAACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPTQAMVFSIASYACESWTMNKEDRRIDASELRCWQRTLNIPWTAKRTNKSVLEKVQPECSLEARMVRLHLLYMFGHVTRRDQSLEEDIMVGKVEGQRKRRRPPT	278637	275076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_275100_278600
898040	contig_4857_pilon	-	2209	2	Intergenic	novelGene_48809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCAGATTTTCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252074	1249013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1251151_1252002
898041	contig_10482_pilon	+	2106	5	Intergenic	novelGene_152832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3149	junction_1	251.380563091103	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	16	417	118625	123281	TRUE	15	GTGGACTCGGTACTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	118609	127601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942
898042	contig_1639_pilon	+	2273	14	Intergenic	novelGene_74889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	252.418713847828	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	156	1307	283593	309304	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSQ	280061	310270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145
898043	contig_10135_pilon	-	2335	6	Intergenic	novelGene_106585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	63.8704939702207	664	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	187	1143	31065	29065	FALSE	35	CACCTTTCTGAAACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLKRQASQVWPEEHGEQEHGLYSLHRMFDIVGTHLTHRDVRVLSFLFVDVIDDHERGLIRNGRDFLLALERQGRCDESNFRQVLQLLRIITRHDLLPYVTLKRRRAVCPDLVDKYLEETSIRYVTPRALSDPEPRPPQPPKTVPPHYPVVCCPTSGPQMCSKRPARGRATLGSQRKRRKSVTPDPKEKQTCDIRLRVRAEYCQHETALQGNVFSNKQDPLERQFERFNQANTILKSRDLGSIICDIKFSELTYLDAFWRDYINGSLLEALKGVFITDSLKQAVGHEAIKLLVNVDEEDYELGRQKLLRNLMLQALP	39486	27872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_29442_29992_30140_30429_30538_30740_31130_37769_37803_39397
898044	contig_3721_pilon	+	3391	12	Intergenic	novelGene_123837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_11	63.2877463888169	739	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	990	2366	391088	408015	FALSE	20	GACATCAGTGTGTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLESALHYILRVEVGKFSVLEGQRLAALKKFVAVLAKYFPGQPSVQNFLYSTNDWLRRQQRKKISYSSFKAALDSRKEGAVIAKKVNWVGCQGSEPHFRGFPCSLWVLFHFLTVQATRQNLYHPQETAKPQEVLQAIRGYVRNFFGCEDCAGHFEQMAAASMHQVDSLDDAVLWLWRSHNKVNARLAGAPSEDPHFPKVQWPTRELCSACHSELRGDPVWDLRATLSFLKAHFSPSNIVLSLPQAGPGLRGDRELKRGVLELVTGVPELLTRNPGLGPEEAAVTVGPGTQPPRNTVPDVPGVPAEGPRASRPQEPSPGLRMTGAAPDQGPPEHVAEHPRDELEQIQGKRRLSKRDTGAILLAEFRAEKDLLRGPSELRRVGRNSKQLASFPEGEPEAGARQGRGQWLQVLEGGFSHLDISLCVGLYSLSFMGLLAVYTYFRARMRALKGRASHTAA	359996	409040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_360350_371548_371650_380774_380821_381386_381490_384444_384536_387047_387195_388928_389064_391074_391205_394630_394754_401354_401503_405020_405201_407206
898045	contig_18620_pilon	-	5558	8	Intergenic	novelGene_168572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	79.2227549253318	600	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	69	710	54276	37656	FALSE	35	TATTTTTTGGTAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSVGGSCGQFWGRGVREGGAAMATGESMAQRMVWVDLEMTGLDIEKDQIIEMACLITDSDLNILAEGPNLIIKQPDELLDSMSDWCKEHHGKSGLTKAVKESTITLQQAEYEFLSFVRQQTPPGLCPLAGNSVHADKKFLDKYMPQFMKHLHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEYEFAPKKAASHRALDDISESIRELQFYRNNIFKKKTDEKKRKIIENGENEKTGEDDHLAEMM	54344	32807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_-_37689_44571_44693_46638_46693_48072_48182_49498_49611_50211_50290_53171_53256_54225
898046	contig_15327_pilon	-	1220	3	Intergenic	novelGene_70475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	153	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	94	390	390867	372623	FALSE	20	GAAACATCGTGTCCCGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGSCSGRRLWRYSAPLGSGSPRLLVLLFGAMTTTTTFKGVDPNSRNSSRVLRPPGGGSNFSLGFEEPAEQPGEACACCPCAQPGGAGPRAVPKEPARRQVQPGPGLTPTVWTPSFCVFVFSMLVNCTT	390960	371792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_372797_382906_382974_390811
898047	contig_13224_pilon	+	2894	3	Intergenic	novelGene_104076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	16	327	123654	123965	TRUE	75	AAGAAAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISTLMVLWSEKILCIISVFWILLKVALWPKMSLYGEGSLCFGKECVLCSCWVECSIYVYEVRLTDCGLRSSVSLLSFFLDILSFTMSGVLKSPFIILELLISLFSCC	123638	126821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_124238_124373_125397_125549
898050	contig_7022_pilon	+	3660	2	Intergenic	novelGene_142157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275212	297679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_275522_294328
898051	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
898052	contig_4900_pilon	-	1972	5	Intergenic	novelGene_159073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	286.961996612792	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	135	635	1188120	1181335	FALSE	75	CAGTAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGGGTQRPQGAGGAGLHTCIYLCNCQRRQGGLGACSRRKVPWH	1188254	1179997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181464_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
898053	contig_6434_pilon	+	3335	17	Intergenic	novelGene_61891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1351.90985131914	175	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	310	1653	904814	928027	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGDGLFGFSAICSPGFSRKKCPC	900112	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_900192_902412_902538_904708_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_932690_932816
898054	contig_10904_pilon	-	3657	9	Intergenic	novelGene_22440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	450.799272819955	23	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	197	994	354975	347626	TRUE	60	TTTAAAAGAATAATAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGDGPLPKPSLSAWPSSVVPLKSNVILRCWSPTRNVNFALKKGRITMWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLAMPGFNQESPHDNQKYGCQNQAVEIKPGIIF	362576	69557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_69727_70374_70486_97603_97966_345604_347722_352595_352697_353957_354255_354560_354852_354962_354999_362403
898055	contig_14687_pilon	-	3193	2	Intergenic	novelGene_107964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	229	627	688053	687655	TRUE	75	AAAAAAAAAAAGCACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAGDRTASNQRYTLSHPPPFFTPIRPPLLPVASRLAGKHRLHASIALIPPAHTGRLPECHLLAAGVAFFHFIRFLPYFSPPPSPFSKIPGSVAIFPSSRGAARRHSTVELLPGPCRHAGGTPGAFFCLF	688281	684944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_687351_687494
898056	contig_3956_pilon	+	2705	14	Intergenic	novelGene_14902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1151.33016460483	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	83	2185	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281599	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289020_1289840_1289892_1290297
898057	contig_12948_pilon	-	5184	2	Intergenic	novelGene_126175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCCCATTTTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172547	167282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_171925_172005
898058	contig_15787_pilon	-	2023	2	Intergenic	novelGene_143976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTCCCTCATTCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66558	64484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_65677_65727
898059	contig_7408_pilon	-	2553	8	Intergenic	novelGene_168728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	218.991193560707	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	624	1703	38514	12597	FALSE	25	GTTCTGAGTGTACTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48324	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47827_48040_48129
898060	contig_3394_pilon	+	3453	5	Intergenic	novelGene_152664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2595	2921	349518	350176	FALSE	10	GTCTCTGCATTTGTTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKRKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSFEPRARGPGKQMSKRTKAPVLARAADQTRKEPHTRTQPPQPHRKGQRRRSEPGT	149237	350708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_150926_244472_244774_278677_278685_348919_349596_349927
898061	scaffold_9100_pilon	+	1443	8	Intergenic	novelGene_83260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	513.153794029169	153	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	98	934	647136	654341	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAEKSCSFKVFSCTTSLSRL	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653399_654288
898062	contig_16103_pilon	+	3035	22	Intergenic	novelGene_118909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	400.301133813566	105	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	880	2643	72	2714	771073	799889	FALSE	30	CTTCAATAAACTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGRECMHGALSKPAVVRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSVNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	766983	800210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_767012_771029_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776926_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_797812_797917_798357_798464_799839
898063	contig_15851_pilon	-	10812	2	Intergenic	novelGene_164091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_1	0	1360	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	745	1089	21760	21416	FALSE	90	AAATAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELLAWRAWNGIHLKRDEQWKSPADLSLKLSSEMQLSPSGNTLEFSMGKERLPRGSTADSLPATTQPSTGALGKPPCFFQGWDADHSSDLFVTACLSRCCPVNGSFLENATTD	23985	11692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15851_pilon_-_22407_23887
898064	contig_17500_pilon	-	3507	1	Intergenic	novelGene_157921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	559	921	250187	249825	NA	20	TCCTTGATGTTTTCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSMDLPQKLAIQLPYDPAIPLLDMDPRDVIEVMQTDICTPVFIAALFTVPKKWNQPKCPSTDEWISKLWYVHTMEYYAIIKNNGEPAKHIITWMDLEDIMLNEISQSHKDKYCTSLLL	250745	247238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_247200_250700
898065	contig_14744_pilon	-	2478	13	Intergenic	novelGene_66130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	82.1389405553514	19	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	91	1692	1601809	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604775	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594169_1594246_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
898066	contig_3754_pilon	-	3552	16	Intergenic	novelGene_146812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	239	junction_6	88.950672972284	565	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	766	2823	358540	40551	FALSE	10	CCTTTGCTGATGTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPEDVPELARLLEIDPYLKPFAPDLQRRYRQFNKTLNDIGENEGGIDKFSKGYESFGVHRCADGGLYCKEWAPGAEGVFLTGDFNGWNPFSYPYKKRDFGKWELYIPPKQNKSTVVPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVTREGCNVNYDWIHWDPEHPYKFKHSRPKKPRSLRIYESHVGISSHEGKVASYKHFTCNVLPRIKDLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQITSFFAASSRYGTPEELKELVDTAHSMGITVLLDVVHSHASKNSEDGLNMFDGTDSCYFHSGPRGNHDLWGSRLFAYSSWEVLRFLLSNIRWWLEEYAFDGFRFDGVTSMLYHHHGVGQVFSGDYHAYFGLQVDEDALIYLMLANHLAHTLYPDSITIAEDVSGMPALCSPVSQGGGGFDYRLAMAVPDKWIQLLKEFKDEDWNMGNIVYTLTNRRHLEKYIAYAESHDQALVGDKTLAFWLMDAEMYTNMSVLAPFTPVIDRGIQLHKMIRLITHALGGEGYLNFMGNEFGHPEWLDFPRKGNNESYHYARRQFHLADDDLLRYKFLNNFDRDMNKLEERRGWLSAPQGLVSEKHESNKIIAFERADLLFIFNFHPSKSYTDYRVGTTLPGKFKIVLDSDAAEYGGHQRLDHNTEFFSETFEHNGRPYSLLVYIPNRVALILQNVDLPN	359305	39821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_40608_48489_48606_81228_81362_83405_83591_126848_127021_131262_131374_135593_135693_140691_140820_146139_146256_195328_195539_197735_197827_200348_200485_201192_201319_250723_250840_294903_295074_358448
898067	contig_9809_pilon	+	2814	11	Intergenic	novelGene_176744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	167.977647322493	57	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	168	2246	108394	117674	FALSE	30	ACCCAGCTCAACAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRCSPCSGTSSRTIRTSGASWGRRLSLPGARRPSYRAEKRRELTTLKYRNSFPKKQISFLRFRGSQMRLQFLTLTRTVKALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQKSLELREKQAEKEERQKTKKIETSAEKLRKLLKEEKRLKKKKRKSTSSSSSISSADESVSSSSSSSSSHKRRKKRKRNRSESSRSSKRHSSKASSSQIDQNRQDEYYPLPVNTSASFLNQKQEVEKLLEKQDRLPYQKTQVKDKDRYPLSSSSVEIPDDSGGRSEDPRDFYNSCKTQASSSKTEKPYKSERHFSNRRDSADSFCRSSEDKIKNYGYRRVDRDVEGRKEQSRRWEPGSGRYSASPASSEYSWKSLEKYKKCTYSGSRDFSKHEQRYQLNTNQGEYEREDSCGEDAKTEVPEEDGLSSKEQSESRVKKNLPQNLLNIFNQIAEFEKEKGNKPKNL	108226	118242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_114925_115880_115991_116752
898068	contig_15720_pilon	-	2750	4	Intergenic	novelGene_41956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAAAAAAAAATGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470596	305251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305721_305846_306511_344794_345315_469499
898069	contig_2892_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_118989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTGCTCCCAATGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63981	65174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_64000_65200
898070	contig_15974_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_164816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTTTACTTTTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173837	171593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_171600_173800
898071	contig_10017_pilon	-	1388	17	Intergenic	novelGene_156989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	387.234984981665	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	58	1185	337686	307398	TRUE	20	ATGAATCGGCCCTGGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	346612	302907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303020_303991_304055_307369_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346572
898072	contig_9955_pilon	-	3168	1	Intergenic	novelGene_21252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCAATAGTTTTAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15869	12701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_12700_15900
898073	contig_12414_pilon	+	2138	15	Intergenic	novelGene_59610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	103.316336104812	698	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	109	735	527729	591484	TRUE	10	CTTTGTCTTTGTGTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEETSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527620	607458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_590501_590614_591473_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
898075	contig_3281_pilon	-	3262	1	Intergenic	novelGene_128521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATACTGTGTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14342	11080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_11100_14300
898076	contig_15361_pilon	-	4913	15	Intergenic	novelGene_167858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_1	420.535834091581	849	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	10	963	514053	472936	TRUE	30	ACTCTTCATTATTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAQMLLDQYRKKSKLFRTKVVLAPLGDDFRYSERTEWDQQFKNYQLLFDYMNSQPQLNVKIQFGTLSDYFDALDKADKNSGKSSQSVFPVLSGDFFTYADRDDHYWSGYFTSRPFYKRMDRVMESHLRTAEILYYFALRKAQKYKISKFLSSSHYTALSEARRNLGLFQHHDAITGTAKDWVVVDYGTRLFHSLMNLKKIIGDSALLLILKDKHTYDSYSSNNFLEMDLEQKSQDSLPQKKYNKAECGAKVPCDLQPFRTRPEFSGLSLCEFPHCASIFCYRNTCGNSSQRSLGYSRCYFTNSLRDLFSSTYTTAGIESV	514062	420114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_422939_425237_425349_435931_436127_444305_444440_446970_447113_449710_449845_468679_468795_471892_472016_472763_472983_474553_474720_498792_498862_500379_500495_504690_504874_508495_508699_513882
898077	contig_854_pilon	+	2186	5	Intergenic	novelGene_36752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	30.3840007240653	412	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	803	1606	1745134	1745937	FALSE	80	AAAATTAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVGAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1722258	1746517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1722669_1737993_1738042_1739538_1739713_1743412_1743540_1745090
898078	contig_11872_pilon	+	3423	9	Intergenic	novelGene_143144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_8	89.9874991318239	853	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	98	1345	42170	92509	FALSE	25	ATCAAGTGATTCATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRDVGQRLRRAGAGACQSSLLLEEVGGGSCIMSEADGLRQRRPLRPQVVTDDGQAPEAKDGSTFSGRVFRVTFLMLAVSLTVPLLGAMVLLESPIDPQPLSFKEPPFLLGVLNPNTKLQQAKRLYENQLIGPESIAHIGDAMFTGTADGRVVKLENGEVETIARFGAGPCKTRDDEPACGRPLGVRAGPNGTLFVADAYKGLFEVNPWKREVKMLLSSETPIEGKKISFVNDLTITRDGRKIYFTDSSSKWQRRDYLLLIMEGTDDGRLLEYDTVTKEVKVLMDQLRFPNGVQLSPAEDFVLVAETTMARIRRFYVSGLMKGGADMFVENLPGFPDNIRPSSSGGYWVGMATIRSNPGCSMLDFLSERPWIKKIIFKLFSQETVMKFVPRYSLILELSNSGAFQRSLHDPNGLVASYVSEAHEHDGHLYLGSFRSPFLCRLSLESV	42072	94587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_+_42262_52013_52131_60111_60228_62392_62486_64364_64482_68492_68668_70194_70330_70717_70911_92299
898079	contig_15160_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_178646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4246	3806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15160_pilon_-_3800_4200
898080	contig_13456_pilon	+	3977	15	Intergenic	novelGene_153278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_12	434.735651557005	805	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	140	2365	305013	354546	FALSE	15	CTCTAAGCCATTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDPQAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSMILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMSLGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITARVSSEQEHFLIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDVVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCIVHIHTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILRNHGLVSVGETVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLDPGKYKAKSRSPESPAGEGSTGSPPRWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVPGYSFASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDDASEEGQNGSSPKSKTKWTREDGHRVSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQNLQDIKTAGPQSQVLSGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFNTLTDRELEEYRREVERKHRGSEENVDETREQKDKSPPDPPAAPQTPPSTPIKLEEDLPQEQTVRDDSDAAALKPTLPDLSPDEPSEALGFPTLDEEEEEGLGEAPDPQSPPKSPLAASPEPAPAQVAEEAASPAAEEGAAVDPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS	250179	356158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_250299_304992_305208_307142_307306_319232_319385_330938_331020_332828_332979_334116_334261_334364_334464_335179_335360_338916_339169_341967_342070_342732_342823_349424_349582_352158_352258_354184
898081	contig_6445_pilon	+	3675	1	Intergenic	novelGene_76975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGACCGGGGAAAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92712	96387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_92700_96400
898082	contig_3956_pilon	+	3172	15	Intergenic	novelGene_14835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_8	816.551521800739	573	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	84	2660	1281682	1290491	FALSE	10	GTGGTGACTGTGTGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
898083	contig_17194_pilon	-	2182	3	Intergenic	novelGene_155368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAACTTTATATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204665	195298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_196764_196892_197541_204596
898084	contig_3942_pilon	+	817	5	Intergenic	novelGene_128640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1120.25563488875	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176952	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179515_179825_179974
898085	contig_938_pilon	+	3179	14	Intergenic	novelGene_143906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	187.967862039667	158	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	908	2724	454	3177	68947	104661	FALSE	40	TAACCTAATGGAATCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREVVAAVVVAAGTAAAALIIESVLPAEPEASESTADENEDDIQFVSEGPLRPVLEYIDLVSSDDEEPSTSHSDENVKHKDYIENQQDKVALTLARLARHVEVEKQQKEEKNRAFREKIDFQHAHGLQELEFIRGHSDTEAARLCVDQWLKMPGLKTGTINSGTKSSFRRGGQMRVSGKPISCPIMHCNKEFDNGHLLLGHLKSRFDHSPCDPTITLHGPFTNSFACVVCYKKFVTQQQYRDHLFAKEAANDGHKNNLLPQIIQCFACPNCFLLFSSKDECLKHMSGKNHFLQSFKLGDDKGIAHPISFPSLAKKLLIDLCKDVPFQVKCVACRQTLRSHMELTAHFRVRCRNAGPVAVAEKSIAQVAEKFVLRGYCPNCNQVFVDEASTRNHKQNSGHKVQIITSMEESVLLYCHSNQGNKPPSDLHLLLDKSKFSSLKRTMSIKESSTQDYNTIPKKKMNLENESCGAVVCVQRDKSTIKTWFCECHQRFPSEDAVEKHVFSANTMCYKCMVCGKVCEDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELIRKETIMAHVTEFHNGHRYFYETEEVEGETLPLSSTTLGTNSTKKPSSTITIIDHSPASNPPRGKWQCRICEDMFDSQECVKQHCMSLASHQFHRYSCARCKKTFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLVFNVEEAFLIHYKERHSIDYVFVSEKIETSIKTEDDFPVLETSNLLTCGCRESYICKINRKEDYSRCLQIMLDKGKLWYRCNLCSVTAQNLADMKTHIHQVHREEKKDEEEQHYVIKCGTCTKAFHDPESAQQHFHRKHCFLQKPSVANFGSEKGSLYKFTASASPTERKLKQAVSYPKNSDVEKGAENDLSCQNIDEEAVELPDLDYLRTMTHIVFVDFDNWSNFFGHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIFNYLNRIGCFFLHPRCSKRKDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHILNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKESDSDDNLGIKSTSIGEEFRSTE	24218	104663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_24276_24837_24922_32069_32151_64172_64299_68841_68954_74981_75133_76311_76442_82206_82361_82853_83002_91965_93570_95206_95351_96634_96766_97701_97889_104593
898086	contig_10324_pilon	+	2556	15	Intergenic	novelGene_7817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	320.88776727023	496	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	774	1787	252911	266158	FALSE	5	GATTCTGGTGGCTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGGSKEYWFVLTAESLSWYKDEEEKEKKYMLPLDNLKIRDVEKGFMSNKHVFAIFNTEQRNVYKDLRQIELACDSQEDVDSWKASFLRAGVYPEKDQAENEDGAQENTFSMDPQLERQVETIRNLVDSYVAIINKSIRDLMPKTIMHLMINNTKAFIHHELLAYLYSSADQSSLMEESADQAQRRDDMLRMYHALKEALNIIGDISTSTVSTPMPPPVDDTWLQTTSSHSPTPQRRPVSSVHPPGRPPAVRGPTPGPPLIPIPVGAVGSFAAPPIPSRPGPQSVFANNDPFSAPPQIPSRPARIPPGIPPGVPSRRPPAAPSRPTIIRPAEPSLLD	228648	266927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_228679_232552_232696_235914_236051_238979_239048_239689_239829_242180_242268_244422_244494_247907_247960_252863_252983_258357_258468_260944_261057_261498_261664_263847_264081_265197_265450_266088
898087	contig_6710_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_98341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAATAATCTAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658190	655829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655800_658200
898088	contig_10973_pilon	-	1488	2	Intergenic	novelGene_150364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	279	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	691	1203	2730	2218	TRUE	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3420	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1718_2115
898089	contig_5423_pilon	-	7698	1	Intergenic	novelGene_85171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	140	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	5633	5971	111297	110959	NA	40	TAAAATGAATTTGGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGVHMSIRVMTLISLGCISRSGIAGLYGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQTLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLIWISLMASDHKRLLMCLLPA	116929	109231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_109200_116900
898090	contig_10861_pilon	+	4437	10	Intergenic	novelGene_39399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	171	junction_1	372.237677954407	69	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	3235	4374	1928838	1934804	FALSE	55	AAAAAAAAATTGGCTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGCFWLIYLAVGLTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903800	1934867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1907039_1907206_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
898091	contig_11816_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_98607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGACGCCACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476777	1478971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1476800_1479000
898094	contig_8464_pilon	+	2126	6	Intergenic	novelGene_125373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	76.2154839911156	70	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	365	664	798819	804080	FALSE	35	AAACGTTGCTAGTACGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	792603	805542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_792735_793605_793672_796183_796258_798725_798922_799187_799279_803974
898096	contig_5023_pilon	-	1885	5	Intergenic	novelGene_7180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1282	1602	542356	542036	TRUE	35	CTCTAGTTCACACAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGDIFGLRFKDYLRAIVSGVYLPSMAPESLQFMRVLNSILNFPHFDQYSSMEFFIKMFSNGSWAASSSSDFLTKEGVVQGHNKPHIPYPPPISDSSSSSFAPGK	585954	541643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_541695_541803_542403_562881_563527_573175_573510_585698
898097	contig_12115_pilon	-	2487	1	Intergenic	novelGene_114469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	9	308	38987	38688	NA	45	AGCAAGCCTTAACAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQMDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSNRDHNRGFWTELEKDVKQNSNTHKKDQFYWPERDWRNPESMAGRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIGQPHKTKWD	38995	36508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12115_pilon_-_36500_39000
898098	contig_15092_pilon	-	1618	6	Intergenic	novelGene_57780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	51.6023255289914	201	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	8	463	319745	310035	FALSE	20	GATTCCCAGTATCGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGEEPEKKRRRIEELLAEKMAVDGGCGDTGDWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQFLFRPKDVGRPKAEVAAEFLNDRIPNCNVVPYPLDRKIT	319752	308879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_310144_312713_312797_316605_316687_317578_317700_319500_319543_319725
898099	contig_15327_pilon	-	2628	1	Intergenic	novelGene_70476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1334	1738	373095	372691	NA	30	CACATTTTGAAACATCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFSEVDHQAFLPRCLWVGFQLATECVAPPTPRTPLIPGGGNMLDDCFLLYTFRYISNHPQKKRNLRLLTGNGYAFYFCFSVILETADTELPASLGQSEEKPVPAAPVPSPVAPAPVPSRRNPPGGKSSLVLG	374428	371800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_371800_374400
898100	contig_8254_pilon	+	5207	16	Intergenic	novelGene_48364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	269.201155685153	47	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	114	2504	72814	109211	FALSE	15	GTTCTTTCATGATTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKGLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFSSNLLTIPKQRSSSVSFTHHISLRRAGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	14902	111914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_15016_72813_72865_74714_74964_77451_77595_82136_82244_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341_102546_104501_104664_107499_107756_108996
898101	contig_5649_pilon	+	2858	18	Intergenic	novelGene_82305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_17	141.256864364546	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	865	2598	44	2641	179619	203268	FALSE	25	ATGCTGTGAATATCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFIQKTAVEKAGPEMDKRLATEFELRKHARQEGRRYCDPVVLTYQAERMPEQIRLKVGGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMKQAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHAIPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSRNSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLLVLKALQDGRAYGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLNYMAVAFAMQLVKILLVDERSAAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGLPQLMEVVRSNYEAMIDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLREKAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQVELLERKMHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTIIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHSGEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLELNAPEHVLETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIARMLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFKYLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNLQVSSEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS	179575	203485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_179640_179732_179838_180469_180590_181691_181884_182442_182586_183103_183213_183315_183486_184370_184624_187001_187251_188083_188248_188451_188570_190181_190284_197011_197186_198340_198491_199802_199984_201362_201496_202873_203009_203189
898102	contig_8412_pilon	+	3954	6	Intergenic	novelGene_118374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	442	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	131	442	632377	632688	TRUE	35	GAGCTGCCCCACAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSWEQQASGDQHPPCEMQEPQEVLPAPSPGSWTANNTFTQTKSNILSTAQLGLSSPPPKNAFLGKTASKGNNICRTSAHGVRGKLRQLKTFQSFLKTQVTGT	632246	639963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_635025_635801_635906_636742_636887_637823_637919_638711_638930_639348
898103	contig_5967_pilon	-	2633	9	Intergenic	novelGene_44340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	376.984229610471	254	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	271	1335	488569	388566	FALSE	20	TATATGAGGTGTATGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517772	387267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
898104	contig_2917_pilon	-	2172	7	Intergenic	novelGene_147570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	215.091195129466	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	53	1072	124032	77876	FALSE	60	AAAGAAAAAATGATCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAGFKEPSGASAAVATMAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVNQSKRPHKGTHFTRWSQLL	124084	76775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
898105	contig_8702_pilon	+	2614	3	Intergenic	novelGene_157727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5	239	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	43	519	47137	50874	FALSE	30	CTAACATACTGTGCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWAGVKVAASPHAGMAEDEPDAKRPRKKSGGSKERNSTPEKSAAALDSAQPSRLTLETWGSGRESNSAGGSERPGLMGEARKGTVLAQGREDGAISKGVRGSSSRHTKEAEDKILLVAPKVSVIKGSRSQKEALRLVKGEEETAAQGNKDLKGHVLQSCLPHECKDPKATPP	46238	52969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_46268_47123_47163_50423
898106	contig_10225_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_86838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACAATTTAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23752	25826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_23800_25800
898107	contig_5039_pilon	+	4630	9	Intergenic	novelGene_64948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	107	junction_1	60.3353907337974	245	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	62	769	1617844	1636821	FALSE	35	CAAATTTTGAAGCTATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKVAVAKLQAFGAARRQVTMKGLYFQQNSTNEEITFVFQERENLPVTEDNFVKLQVKACALSQINTKLLAEMKMEKDFFPVGREIAGIVLDVGSKVSFFQPDDEVVGILPLDSEDPGLCEVVRVHEHYLVPKPEKVTWTEAAGTVGDGVRAYTALHYLSHLSPGKSVLIMDGASAFGIIAIQLAHHRGAKVISTACSLEDKQCLERLRPAIARVIDVSNGKAHVAESCLEETGGLGVDIVLDAGGWYNLCNFLV	1607259	1640682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1607315_1617837_1617910_1619956_1620035_1622007_1622081_1625157_1625203_1626528_1626598_1633305_1633440_1634411_1634524_1636690
898108	contig_14176_pilon	-	2239	15	Intergenic	novelGene_74837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	157.467213950675	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	179	1984	231844	224445	FALSE	40	ATGTCAAATAAGTTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLTKNGHVYKYDGFRESEFEKLSDFFKTHYRLELMEKELCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSLMEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEIFFAGQS	232500	224189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_224469_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_229930_230207_230314_231182_231369_231790_231966_232443
898109	contig_2854_pilon	-	3580	1	Intergenic	novelGene_120854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGACTCAGCGTGTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317108	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_313500_317100
898110	contig_13004_pilon	+	2024	11	Intergenic	novelGene_112667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	81.009937661993	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	73	1863	638711	673741	FALSE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFANSVVAAPSARDKPASSVSDDEMPVLVRMTLSPPRSPQGAAPCTPAEIPKKHQPGVAKAEEPLKPVQEKKKFRHRPEPLFIPPPPSYNLNPASSYSGATLYQSQLRSPRVLGDHLLLDPTHELPPYTPPPMLSPVRQGSGLFSNVLISGHGPGAHPQLPLTPLTPTPRVLLCRSNSIDGSSVTVTPGPGEQTVDVEPRINIGLRFQAEIPELQDASALAKDTHKATLVWKPWPELENHDLQQRVENLLNLCCSSALPGGGTNSEFALHSLFEAKGDVMAALEMLLLRKPVRLKFHPLANYHYAGSDKWTSLERKLFNKALATYSKDFIFVQKMVKSKTVAQCVEYYYTWKKIMRLGRKHRTRLTDIMDDCVTSEEEEELEEEEEDLEEDRKSTKEEESEGPKSPELPPPFPALAPAEGPAMQALSQPSGSFICEMPNCGAVFSSRQALNGHARIHGGTNQVAKARGAVPSGKQKSGGAQSGYCSVKSSPSHSTTSGETDPTTVFPCKECGKVFFKIKSRNAHMKTHRQQEEQQRQKAQKAAFAAEMAATIERTTGPVGGPGLLPLDQLSLIKPMKDVDILDDDVVQQLGGVMEEAEVVDTDLLLDDQDSVLLQGDTEL	638638	673902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_638783_642214_642600_643681_643749_644821_644962_645107_645212_646733_646810_655219_655309_657212_657327_666516_666724_669361_669574_673416
898111	contig_1076_pilon	-	6604	16	Intergenic	novelGene_101140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	748	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	5003	5416	1000700	993387	TRUE	25	GTTTAAGGTTTAACTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLERLEPGMGRRAGNGRERPRVSLAALTVSNTRFCWALCLKTEDSSSKLNFLRMVPSISAARDSQKNLHTTGRNRDEQQGQICYGVPLFLLGIHVAFPDILYSYLVTHAAPLLVVFEHPWKLVGEVLVLPSQSHVL	1013699	946260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_946353_973782_974070_980663_980865_988168_988244_989737_989855_990858_991066_991709_991796_993263_993395_993833_993907_995090_995229_1000198_1000278_1000584_1000787_1003256_1003558_1005221_1005476_1007332_1007441_1009446
898113	contig_5018_pilon	+	1556	8	Intergenic	novelGene_47183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	43.7712047737658	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	887	1447	1584525	1586783	FALSE	5	TTCTTCTGAGTCTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILDQMVLEQNTEGVKWTPSKMIARLGKEINNPESVYYWAQKNHIPVLSPALTDGSLGDMIFFHSYKNPGLVLDIVEDLRLINTQAIFAKRSGMIILGGGLIKHHIANANLMRNGADYVVYINTAQEFDGSDSGARPDEAVSWGKIRVDAQPVKVYADASLVFPLLVAETFAKKVDAFMPEKNED	1582988	1586892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1583310_1583877_1584388_1584469_1584567_1584644_1584732_1585207_1585314_1585397_1585502_1586484_1586611_1586687
898114	contig_7695_pilon	-	2119	4	Intergenic	novelGene_41540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	91.1201892496328	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	237	938	379725	375828	TRUE	30	CATACAGGGCAGTGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQGKRMHVQLSTSRLRTAPGMGDQSGCYRCGKEGHWSKECPIDRSGRVADFTEQYNEQYGAVRTPYTMSYGDSLYYNNAYGALDAYYKRCRAARSYEAVAAAAASAYDYAEQTLSQLPQVQNTAMTSHLTSTSLNPYDRQLLLLLLQLPLHITGGIGAPCVALQPQSPLLERATVTGMRARCPKLRQPRGIPCTTWLGMSGSSMRIGRGTQPFKA	379961	372810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_373991_375826_376059_376110_376521_379664
898115	contig_9389_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_83970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTCACAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253827	255661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_253800_255700
898116	contig_14273_pilon	+	3004	10	Intergenic	novelGene_21136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	560.512662162457	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	379	1989	135370	151187	TRUE	65	AAAAGAAAAGAAACAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHFAVSVFLVELYGNSLLLTAVYGLVVAGSVLVLGAIIGDWVDKNPRLKVAQTSLVVQNVSVTLCGIILMMVFLHKNELLTMYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	127910	152259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_128177_128236_128272_128777_128846_135360_135521_137935_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873_151989_152045
898117	contig_12654_pilon	+	3924	3	Intergenic	novelGene_129295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2186	2548	756394	756756	TRUE	30	TGCAGCAGTGGGTAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLAFEHRVAKVNGRNDDVKEMNRRFQRAAQKYKVKYYNDMCKHLELENQKGRTCSAFLKLKELRKKFKPRIAILKYSMGKIFKDTGGIKRRWKEYTELLYQKELVNAVFSGDSI	754208	792071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_757643_757739_758205_792046
898118	contig_8317_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_19563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
898119	contig_14219_pilon	-	2222	3	Intergenic	novelGene_54364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGAGCCTCTTGGTGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1077210	975847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_975920_1072739_1073367_1075687
898120	contig_5686_pilon	+	4477	3	Intergenic	novelGene_45224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	654	995	94439	94780	TRUE	85	AAAAAAGAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93785	100402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_95442_96125_98350_99805
898121	contig_177_pilon	-	2197	3	Intergenic	novelGene_41848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1459	1782	418661	418338	TRUE	30	GATTCTCGAAGCTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHNLEETMSKLLANEGIDDGVEAAVEEAQNLGNIQSPANVTAALTGLLDYPNPHEGICNQNQVVGQPAEQEDEHDGKDDPHGLVLLPHVGLEQCAQGESIAEQHD	420204	417696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_418079_418304_418812_418896
898122	contig_11281_pilon	-	2362	19	Intergenic	novelGene_125444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	518.756311875924	2	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	1184	2077	833098	798705	FALSE	20	GATGTGTTTTGTTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	860111	798419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838161_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558_859632_860043
898124	contig_14450_pilon	+	3454	14	Intergenic	novelGene_48931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_9	97.254743879672	368	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	116	1858	512549	556776	FALSE	55	AATGGAAAAAAAAGGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGRGRSGGGGGGSAEWSRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRPSLPPSKQANKNLILKAISEAQESVTKTTNYSTVPQKQTLPVAPRTRTSQEELLAEVVQVQSRPPRISPPIKEEETKGDNIEKSQAEMSELSVAQKPEKLLERCKYWPGCKNGDECAYHHPVSPCKAFPNCKFAEKCLFVHPNCKYDAKCTKPDCPFTHMSRRIPVLPPKPAVTTPAPPSSTQLCRYFPACKKMECPFYHPKHCRFNTQCTRPDCAFYHPTITVPPRHALKWIRPQTSE	512433	558372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523323_523742_523844_525728_525885_553725_553847_554738_554876_555156_555249_556073_556181_556769
898125	contig_6902_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_135551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	128	391	176665	176928	NA	25	AGACCTAGCAATCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFGESQSQILQTNYIDYLDELALEIGAKPDVLSLLLKDPKLAMKLYFGPCNSYQYRLVGPGKWEGARSAIFTQKQRILKPLKTRSLKTSFDFPVSFLLKILGLLAVVVCFFFSTSVVLVCLHKTFGFVS	176537	179034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_176500_179000
898126	contig_12638_pilon	+	2043	17	Intergenic	novelGene_33165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	181.548375096006	1054	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	230	1843	269238	274265	FALSE	5	CTGCTTGCCACTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235649	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
898127	contig_4924_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_84746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	411	2347	2757	155494	155084	NA	55	TTCACTTAAATCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNNLMLYRECEWERNCPLRIKLFREEPSKTVASGHPSNSDLKPLPKFIFQPEIRQACLRQTCFLDQSSIRNQMSNTCTRKKAKKAGGDRRTGQMNAMNRGGKVKGESANTMRICSQVMKKLVYKFLNEKLICSVN	157840	155082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_155100_157800
898128	contig_7593_pilon	-	3899	9	Intergenic	novelGene_127360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_6	100.562169825437	510	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	907	2724	194	2917	738296	695591	FALSE	50	TAATTTAAAAGAAATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDIIRMYSSSPPPLDNGAEDDDDDEFGEFGGFSEVSPSGVGFVDFDTPDYTHPKEEFVPSNHFMPIHDFSENVDSLTSFKPIKNGNDKDITAELSTPGKGQSDVLLSATSKEIIPSKILDTSIDGVESLGDLNKAVEQRQNVETPESFSPGDFRTDTNVVHQNKQLESCNGENAPCLEILTNGFAVLETVNPQGTDDLDTVADSKGLKPLSTQSTEYNFDSAPSPAEEFADFATFSKKERIQLEDIGCTVLNDREALTVQENNKINRVSELSSVKEVSLDRSFDNKGDADGEKQVCVSEVSTVSNRGFSVEKQGPTTLQQDELLNSSALSNTWSSVDTADNSEASRREQCETEEELDLFTSKCADLCMDYIKTNDADNEVGSSKEEIIKFTISQSPGIDPTEENVLDDSISIKNGDSSNDFVTCNDTNEDDFGDFGTASGTTPPFAPGTQDSMSDITFEESSEHFPHSSEPGDDFGEFGDTSIVSCQEEIIFTESDLKQTTDSLSEGCQLARKSTGAGVEPVSELENGQEGEFGDFDSVPNIQDDCSAFQDSDDFADFSSAGPNQVADWNAFEDGQKESCSWAAFGDQQATESHHRKEAWQSHRTDENTDTPGTPKTLSVPLATSRRAVATGQLQESATTVQTALLNRLERIFEACFPSVLVPDAEEEVTSLKHLLEASTWPGKTNETSAESGELLDVWTELQDIHDAHGLRYQWGGSHSNKKLLCSLGIDTRNILFTGNKKQPVIVPMYAAGLGMLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQESLPPVQFDWSSSGLTNPLDGVDPELYELTTSKLEISTSSLKVTDTFARLMSTVEKTSTSTRKPKREEHLSEEAIKVIASLPDLTFMHAKVLMFPATLTPSTGSQEKTDW	768504	694608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_711220_711282_717511_717635_720455_720513_720925_721053_725079_725232_736364_738329_768343
898129	contig_5945_pilon	+	6310	5	Intergenic	novelGene_104597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	187	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2694	3077	362154	362537	TRUE	45	AAAGAATTACCTACGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSFLSAFCFNSWIALNIRDLNSLSSSSSAFSSTGKSSGALFWKPTEPSCPVFLYVLILSAVFGTFSSYFLHLLTVDLFVSSYFFYLVMSEQAGCAFFVVCSPGDMIFFTSLSNGQGQLLSYGAAG	355388	372859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_357399_357916_358211_361764_363099_370112_371590_371664
898130	contig_10176_pilon	-	3350	10	Intergenic	novelGene_72718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	256.108966006924	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1170	1937	268025	261068	TRUE	25	GGTGTTAATAGTTGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYISEHCILLGSVGYSGHSVDKFLLFFIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	258802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_260160_261011_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
898131	contig_10976_pilon	+	2199	2	Intergenic	novelGene_155580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	88	junction_1	0	451	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGGAATCACCCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93342	95723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_93725_93906
898132	contig_8420_pilon	-	2443	14	Intergenic	novelGene_69335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1259	1645	36957	33852	TRUE	25	AAGTAGGAGGAGGGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKILEETVLDNMYMSLRALRSWFFSFQEVKSHHPKRAPNSLPENTLHSPLSCFSATASLSASGSFAKTIWALVLSAKPKDKVTKTPFPSSGFGYFTVGNSGSGSFCSGTATGGAKSKALKADCTKS	59226	10919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_11021_14727_14899_21334_21448_26918_26995_29016_29101_29240_29435_33792_33990_35333_35427_36801_36984_37071_37167_39045_39176_41726_41916_51044_51180_58543
898135	contig_6898_pilon	+	3917	13	Intergenic	novelGene_35689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1082	junction_2	2050.17732803504	2036	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	134	1867	59668	125646	FALSE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
898136	contig_1443_pilon	-	2119	9	Intergenic	novelGene_28317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_7	271.169890244105	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	912	1835	776427	748649	FALSE	40	TCAACTGTCTCCAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNVTNKTDPRSMNSRVFIGNLNTLVVKKSDVEAIFSKYGKIVGCSVHKGFAFVQYVNERNARAAVAGEDGRMIAGQVLDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	809544	748364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767556_776186_776462_804491_805224_809399
898137	contig_11413_pilon	+	3786	12	Intergenic	novelGene_103195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	63	junction_6	178.002692894478	44	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	100	1740	583032	653355	FALSE	30	AATTCTCAACACTGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQDAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPEEPEKLEGAEEEKVEADTDGQQPEKVKSVYLSYPTTGKPQRTCFSEHNSTENKGENEMNDGDKAQDGENEKNSEKEHDSEVSEDIKSEEKEAEENKELTDTCKERESNIGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMVPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQSMSGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPQQQPPPPPTDGVPPLPAPGPPASAAP	582187	655401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_582269_583013_583128_590107_590168_596827_597087_598034_598197_607530_607659_610793_610909_611582_611738_620301_620437_629137_629400_651824_652002_653263
898138	contig_12079_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_67480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATCAAAAAGCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607656	609189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_607700_609200
898139	contig_16594_pilon	-	5286	12	Intergenic	novelGene_53802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2701.17920683505	179	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	870	2015	272836	121101	TRUE	25	AACTTCTCTTTCTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335619	115138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_116155_116257_117116_117171_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662_273670_335583
898140	contig_6191_pilon	+	3549	7	Intergenic	novelGene_107838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_4	162.888168863044	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	511	1446	132032	148147	FALSE	40	GATTCATAGTAAAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFVKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLSQQQYIFQQCEAPMEGFQL	131521	150250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_132104_132682_132847_134259_134339_140512_140639_142415_142544_146208_146388_147959
898141	contig_7088_pilon	-	2399	12	Intergenic	novelGene_159797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_11	114.64569928103	360	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	160	1398	743430	717194	FALSE	40	CATAGTGTGAGGCCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEDQDSKEAKKPNVINFDTSLPTSHTYLGADMEEFHGRTLHDDDSCQVIPVLPQVMMILIPGQTLPLQLFRPQEVSMVRNLIQKDRTFAVLAYSNVQEREAQFGTTAEIYAYREEQDFGIEIVKVKAIGRQRFKVLELRTQSDGIQQAKVQILPECVLPSTMSAVQLESLNKCQIFPSKPVSLEDQYSCKWWQKYQKRKFHCANLTSWPHWLYSLYDAETLMDRIKKQLREWDENLKDDSLPSNPIDFSYRVAACLPIDDVLRIQLLKIGSAIQRLRCELDIMNKCTSLCCKQCQETEITTKNEIFSLSLCGPMAAYVNPHGYVHETLTVYKASNLNLIGRPSTEHSWFPGYAWTIAQCRICASHIGWKFTATKKDMSPQKFWGLTRSALLPTIPDTEDEVSPDKVILCL	749063	716192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_717375_718590_718723_720117_720183_720632_720749_721379_721465_722785_722849_734068_734229_741620_741771_742561_742765_743346_743460_745837_745898_748993
898142	contig_9471_pilon	+	933	7	Intergenic	novelGene_21761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	168.69243874249	286	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAAACTTTTCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384517	395492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_384923_385008_385716_385784_388128_388204_389420_389515_389786_389855_395266
898143	contig_7179_pilon	-	3857	2	Intergenic	novelGene_78099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	494	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1034	1396	633390	633028	FALSE	15	TTTTGCAGTGAGTAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEMEEAISESLQNYGDKIPFYQMQLDFECPCCFVNFAYIPVPYHKWWYLKKRPSATGQDGSTFGIELLFPCVSMTVSGTDVSKPLCNILSTLLILCTLIVPKKPRMLYSDDSFLMNTS	634475	630566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_634339_634390
898144	contig_11574_pilon	-	3720	12	Intergenic	novelGene_64063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	336.975880148198	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	274	2151	456525	449890	FALSE	15	CATAGTTGTCGCGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463658	448320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456545_460163_460234_462651_462686_463508
898145	contig_2596_pilon	+	3838	5	Intergenic	novelGene_53496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCATTGAGAATAGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967473	1098952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_967951_968061_968631_968716_969152_969303_969552_1096843
898146	contig_8377_pilon	+	3472	3	Intergenic	novelGene_35136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6793	junction_2	137.5	274	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAAGGAAACGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182793	188744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_183052_183262_183399_185666
898147	contig_10367_pilon	-	3416	3	Intergenic	novelGene_169457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91	27	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	268	1056	135131	133502	TRUE	40	ACATATTAGCATATAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKWHPSSDEYLLQTHLLTSPFRIAYPVVQMATQSGKNVYLTVTKESGNSIVLLFKMISTRAASGLYRAVTETHAFYRCDTVTSAVMMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQVSRCTGLAQTPTWNLDFHPEGFFISHDSKGTAWETFRISILVQ	135398	130582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_132640_133198_134055_134895
898148	contig_15118_pilon	+	2189	9	Intergenic	novelGene_74603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	254.445843943264	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	67	1653	392042	398743	FALSE	55	AATCGAAAGAAGACGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391975	399279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
898149	contig_10017_pilon	-	1606	13	Intergenic	novelGene_156981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	410.779027851012	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	236	850	325819	307398	TRUE	10	TCGGCCCTGGACTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	327882	302902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_303493_303916_304055_307369_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845
898150	contig_11978_pilon	+	3188	1	Intergenic	novelGene_62903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACCAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773949	777137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_773900_777100
898151	contig_12123_pilon	-	8338	13	Intergenic	novelGene_144582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	542	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	7989	8336	61831	61484	FALSE	0	GGCCGCGCGCGCCGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGCRAALRLLRSGFSSVRLAPQASPRAHSRSSRGSLCTTRKPRSWGKGARPPCSLGVQTSQRAPGGSSATRVKRKGSRDSLLLLPVAMFRRTLLHVAPPPGENVQRDAGRAGWA	174537	61481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_61845_82111_82240_91506_91627_98944_99105_100688_100755_109328_109513_131863_131967_133170_133339_138301_138495_141346_141464_143150_143232_154194_154285_167972
898152	contig_13172_pilon	+	5840	1	Intergenic	novelGene_146325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	633	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATTTTTCTAATAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65515	71355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_65500_71400
898153	contig_7272_pilon	+	1564	8	Intergenic	novelGene_25317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	381.498709442276	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	46	459	507772	569856	TRUE	75	AGACAAAAAAAAAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILNVLLLAWKVKLPPMMEIITAEQLMEYLGDYMLDAKPKEISEIQRLNYEQNMSDAMAVLHKLQTGLDVNVKFTGVRVFEYTPECIVFDLLDIPLYHGWLVDPQIADVVKAVGNCSYNQLVEKIISCKQSDNSELVSEGSAVFVGNRPGVSY	489800	575541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_489831_507756_507815_517079_517145_520615_520775_547444_547548_569812_569987_573467_573784_574882
898154	contig_13528_pilon	-	2750	11	Intergenic	novelGene_66863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	247.978305502719	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	206	865	67012	47592	TRUE	15	TTGTCTTATTCTTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPETSVPASVRRQERRTRRLGSTQAAVRSSGFESSKCVTRLGKAGASVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALQWPSLTVQWLPEVTKPEGKDYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVARVHIPNDDAQFDASHCDSEKGEFGGFGSVTGKIECEIKINHEGEVNRARYMPQNPHIIATKTPSSDVLVFDYTKHPAKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNSNLSGHLLSASDDHTVCLWDINAGPKEGKIVDAKAIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQKLMM	68110	39839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_40286_41024_41136_43268_43404_43525_43584_45852_45930_46533_47757_55922_56039_57053_57228_61351_61498_66953_67073_67965
898155	contig_6031_pilon	-	1933	4	Intergenic	novelGene_56761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1109	junction_2	582.746562028087	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	69	653	257696	256126	TRUE	15	GAGTTGCCCTGATGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGMSASPAPPEGR	257764	254463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_256375_256704_256814_257469
898156	contig_3942_pilon	+	557	5	Intergenic	novelGene_128745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	3169.00223848138	4479	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	77	463	793521	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	792238	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075_795179_795313
898157	contig_14925_pilon	-	1531	6	Intergenic	novelGene_55296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	80	493	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129480	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112866_113010_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
898158	contig_5023_pilon	-	4172	1	Intergenic	novelGene_7104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAATAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33474	29302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_29300_33500
898159	contig_1594_pilon	-	1440	1	Intergenic	novelGene_138805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	161	301	377316	377176	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFFNLYAEQIFREAGQYEEERGIRIGGRLINNLLYVDDTTLLAKSEKDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINREKIEVVKEFILL	377476	376036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_376000_377500
898161	contig_7188_pilon	-	1281	2	Intergenic	novelGene_108532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	473	877	131217	130813	FALSE	25	TATCCCTGTTTGCAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRFIRREESKKVIKKFPTKKSPGPDGFTGEFYRTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILASRIQHASYQKNNTP	132595	130408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_131304_132209
898162	contig_7914_pilon	+	3194	1	Intergenic	novelGene_165015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAATGAAAAAGAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23356	26550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_23400_26600
898163	contig_12943_pilon	-	1787	15	Intergenic	novelGene_140355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	192	548	93048	75057	TRUE	50	GCAAGGAAAGAAACCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLDSGLLADSDSDSESEELSSTELDSALEDSEVLDFSFSFSPSSESYLLPLFLAFFLAVLLFSSSDSLPLPLSLEESSLLSSLLSPSSLCSPLSLPDSLSLSLLLSEDPSSSSDSE	103631	30073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_30231_34948_35045_36606_36663_36749_36818_43121_43188_45746_45881_50599_50711_57186_57361_67005_67194_68160_68293_74999_75109_78700_78863_82021_82164_93047_93125_103516
898164	contig_2069_pilon	-	4167	9	Intergenic	novelGene_23218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	87.224476925918	372	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	134	937	218699	184400	FALSE	20	GATGGCAGTCTTCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRNPGPSGPQLRDFNSIIQTCSGNIQRISQATAQIKNLMSQLGTKQDSSKLQENLQQLQHSTNQLAKETNELLKELGSLPLPLSTSEQRQQKLQKERLMNDFSAALNNFQAVQRRVSEKEKESIARARAGSRLSAEERQREEQLVSFDSHEDWNQMQSQEDEVAITEQDLELIKERETAIRQLEADILDVNQIFKDLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVERATDQLQRAAYHQKKSRKKICILVLVLSVVIVILGFIIWLSSK	218832	181169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_184493_186018_186102_186863_186937_190692_190799_192108_192153_196226_196365_201208_201309_202852_202923_218602
898165	contig_8570_pilon	-	3809	3	Intergenic	novelGene_120136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	328	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACATATGAGGCAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318946	272685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_272971_273077_273292_315636
898166	contig_20356_pilon	+	5197	22	Intergenic	novelGene_159529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	738.681146865611	12391	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	88	2631	68419	159961	FALSE	20	TTATTCATGACTGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAVLEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLKLGKEVLATLEGHWDSEVFINDKKTDNSEVFWNPTPDIKQWRLIRHTVKFEEQEDFESEKLWQRVTKAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWACKLFELDPLTGEWHYKFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQTKVRHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVVKGYSSPEPDIQDSSGSETQSLKQSTRRKKGIELGDIQSSIESIKQTQEEIKRNVMALRNHLASSTPATDYFLQQKDYFIIFLLILLQVIINFMFK	37410	162527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_37451_68371_68510_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_134526_134624_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153177_156694_156798_159828
898167	contig_17274_pilon	+	2604	26	Intergenic	novelGene_26533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	352.562155654858	9	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	61	2148	131715	213531	TRUE	55	TCACTACACAAATGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEENTTPPENGRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQVNNGDARQEVSSPLPSNEEMISSGDSAESSEEGEPPAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGIKRVNTGPLKRRRRRRRPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	131654	237208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074_172159_177147_177298_177736_177821_179107_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_202343_202395_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439_215707_237173
898168	contig_14575_pilon	+	4058	3	Intergenic	novelGene_101902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	156	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTAGGAGCTCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52604	246644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_54620_57592_57857_244865
898169	contig_17074_pilon	+	2670	7	Intergenic	novelGene_145109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	207.682984912636	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	104	823	208015	223655	FALSE	30	CCATGAAATTTGTATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANLPLSHSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207911	225502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_216266_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
898170	contig_10904_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_22705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTACAAAAACAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632827	635077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_632800_635100
898171	contig_14483_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_133783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1137	1454	255526	255209	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVCAPARHSPFFPPTWQGAAAARMCTRLLPSCTPPVPVRGSGSMRACTPACHSPPICQEAVNVSPLAHDTCHFTHSVSDTARSCATGPTKDGSQCLPNPLSAIP	256662	254368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_254400_256700
898172	contig_11512_pilon	-	3710	2	Intergenic	novelGene_43259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	384	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTAGAAATTGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406828	318893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_318942_403166
898173	scaffold_19766_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_34353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAGGAAAGACCTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619770	617419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_617400_619800
898175	contig_610_pilon	-	2233	6	Intergenic	novelGene_76812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	104.497655476092	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	45	965	343470	331286	FALSE	15	TACCATTGAGCGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	343514	330017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334381_338764_338808_343421
898176	contig_10861_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_39278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTTTGTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347222	1344957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1345000_1347200
898177	contig_12970_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_50542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTACCATGTTCATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441446	438776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_438800_441400
898178	contig_11564_pilon	-	2220	2	Intergenic	novelGene_158561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCAAGGTTGAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59317	57052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_58703_58747
898179	contig_10756_pilon	+	3114	3	Intergenic	novelGene_170657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAGTAAAGATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18640	36515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_19773_19918_20774_35388
898180	contig_5003_pilon	-	2230	8	Intergenic	novelGene_120203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	270.066658438246	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	750	1790	134487	133447	FALSE	20	ATATCGTTTTCAGCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEIEVRESEKQQDSQPEEVMDVLEMVENVKNVIAEQEIMETNQVESVDPSENETSKEMEPEMEFEVEPDKERKYLSPGKENASAVEVEKESEENEVKESESQPEPMVQPQPQLQSQPQPVLQPPPVSQPETLPLAVKQLPPQVIQEQGHLLLERKEFLVESVKLTEVPIEPVLTVHPESKAKTKTRSRSRGRARNKTSKSRSRSSSSSTSSSSSTSSSSGSSSSSGSSSSRSSSSSSSSTSGSSSRDSSSSTSSSSESRSRSRGRGHNRDRKHRRSVDRKRRDTSGLERSHKSSKGGSSRDTKGSKDKNSRSDRKRSISESSRSGKRSSRSERDRKSDRKDKRR	139668	133006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_134620_135818_135905_136786_136863_137015_137111_137620_137694_138171_138241_138818_138891_139522
898181	contig_14727_pilon	+	4305	11	Intergenic	novelGene_56648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	134.46560898609	572	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1322	3966	339	4304	315073	344380	FALSE	35	AGGCAGAATCCACTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSMLHHRELENLKGRDSSHECRVCGVTEVGLSAYAKHISGQLHKDNVDAQEREDDGEGEEEEEDYFDKELVQLIKQRKEQSRQDEASSSSQEINPDDRRPQWRREDRFPYQDREGYSQPAWHHRAPPQRDWKWEKDGFSNTRKNSFPHPSRNSGGQRGCSGWHKGVGGGSSAWFHNHSNSGGGWHSNSGTVDWNHNGTGRNSSWHSEGTGGFSSWHMNSSNGNWKSSVRGTNSWNYNGPGDKFQPGRNRNSNCQMEDMTLVWNKKSNKSNKYNQERYNCQRQENDKVGTVATYPSPEGFANDNFSSEGLFDFNFEQLESPTTKQTDTIAPKIGGRNGSVAKEKLRRWTPYPSQKTLDSQSAVKDVAGNKSEKTDKPFFDFNLITTGTKEAQTDVTSNSPVLKTQKETRLESFHHKATSDCTVSYEVVRDCPITEKPEQEHISSKMPSLKSIRLPVPGTKSIPQKQDSKNPSRNIKSNSFFPGEHSHPLNKPIVEDNHSSPYVPKLRSVLKGNNKSTFGAQREPSENVSDTLQKAKEVLPCHESAQKPSLPTSKRTRSYAKASRNVEESEKGSLKIEFQVHTLEDESGGEISDTEKHGTTIGTLGSATTEVLSCSTRPADEKVGDDQILKTCRKLSTSPCNSIVHKKESELQMTSAGSPHPSLLLDLKTSLEDTQVDDPVKSHVSYETEGFESTSLDAELQKSDIGQPSGPLLPELSKLGFPASLQRDLTRHISLKSKTGAHLPEPNLNSARRIRNISGHRKSETEKESGLKPTLRQILNASRRNVNWEQVIQQVTKKKQELGKGLPRFGIEMVPLVQNEQEGLDLDGEADLSNLEGFQWEGISISSSPGLARKRSLSESSVIMDRAPSVYSFFSEEGTGKENEPQLVVSPGNSLRATQSQKVTAGFKQEMIPVAASLRTGEMAENVAIRRRHSTQLPSDCTIPLVHSAKDLSSQESSAPASETPNGQESNGEGNSASSNLSSALANSSLVDAATDSSCTSGAEQTDGQSIRKKRRATGDGSSPELPSLERKNKRRKIKGKKERSQVDQLLNISLREEELSKSLQCMDSNLLQARAALQTAYVEVQRLLMLKQQITMEMSALRTHRIQILQGLQETYEPSERPDQVPCNLSRERRNSRSQTSADATLLPTPFFPVFLDPSQVSPSSTSSIFQVSGIVPAPDSSVQIKQEPMSPQRDENVNVVPQGSAGSVSKELSQTNREIGDSCPVYPVIAATLSLSELTESFHEASQELKFPVEQGNIRNRENSPSSQSTDLPDMNKEGEEPARGNSESEACTSSFPRLPFASETSLEKEPHSPADQPEQ	284511	344381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_284749_306245_306332_315057_315120_328614_328816_332847_335023_336126_336761_338200_338271_340710_340866_340949_341011_341742_342055_344069
898182	contig_12424_pilon	-	1839	11	Intergenic	novelGene_174265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_10	118.127939116874	491	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1686	153	1838	130035	8627	FALSE	40	AGGTAGACGTAACACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTSVSTLSPQPSSVDGLDKASIANSDGPTSGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREEIVVKPEEGNGSVSEKTPPLEEKAEDKKAGSSHSKKTSGSKASTSPSISSTSSRPKASKETVSSKTGTVGTTKGKKKTGKQPSSRPSADAAASGTSSLKGDPSETRAESLKPEQTVPGTEEQTTGKSKSVVPPHPVAPLPLPPIPPLPPEDQCVTPSDTPIILVSNGADLPASALDPSRLLWTEEPTNKTTLHPGTGLSSRENAKCFTTKDELGKAAPQLLIPGLLGESSESFSAPEDEGQRDYQANDSDSDGPILYTDDDEEEDEDEDEDGSEESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTR	130187	8625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_-_8705_16015_16154_19617_19680_25046_25103_34032_34190_35725_35935_41888_42421_51666_51826_56992_57074_90195_90364_129989
898183	contig_15666_pilon	-	2339	6	Intergenic	novelGene_70158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	642.394707325644	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	187	1311	110619	107816	FALSE	55	AAAGGAAAAGAGTGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110805	106787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108153_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
898184	contig_5947_pilon	-	2536	1	Intergenic	novelGene_101492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATAAAAATGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393924	391388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_391400_393900
898185	contig_9098_pilon	-	9625	13	Intergenic	novelGene_75822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	165.845372259825	493	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	551	1420	345261	335775	TRUE	20	AAATGGGTGGAGCTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350583	316002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_323682_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_350330
898186	contig_5936_pilon	-	4343	2	Intergenic	novelGene_53599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAACCAGATACACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552612	547666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_547837_548439
898187	contig_12503_pilon	+	6338	12	Intergenic	novelGene_143821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_8	299.192577359645	324	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1913	5742	127	5868	138073	176685	FALSE	20	TATCTGGAAGATTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATFHTFRKSHMKTRASVRKSFSEGVFQSVKSLLQSEKELCNVSAEDCLKQDEHANLTEVTFLGFNEETDAAHIQDLAAVSLELPDLLNSLHFCSLNENEIICMKDIKKSSEINNGPLNQSRHSGMLCVMRVSPTLPRLRIDFIFSLLSKYATGIRYALETYLHQKGQLETTNEDDDDTNQSVSSIEDDFVTAFEHLEEEETSKPYNDGINISALRNQCDAASQTVSSHHLETHDLKILVSSGQQKSLAKPTTSLINILGHKEPPSVKAPVTTSVSEPWIQRSFYRSTNAPDKGSEIQETFFSSSPAYSSESECSSPSPVIFLDEEGYQKSLKAKLELPKIPVMKDDIEDSDSEVSEFFDSFDQFDELEQNLETPCLFIKDPAIGMPSQKKGHKHEKSCSVTTTMNPQKFKFDRPALPANVRKPTPRKPESPYSNPCDAPDSPRPVQASGEDSGLFSPIRSSAFSPLGGCTPAECFCQTHAGGDRVHENHDSIYYTYEDYANSVSCKVLDSVLHTQHSNALSNIDSIKGGENKTVAVKHGDLDQNNKSKNKSLMIKDSIQKFAADLVEQSFGGAFRDLQKGVSSCTSALCHLAIKLTSSVFQMAFNELRRQRAFSLKERAISGLANFLVSEALSNALKDLQYVKKQIFTNTVARFAADLAEELVFEGIMEVCQFSYPPTPAFPQRWSFDSEDKVVKSYAKDLSESVIQEAFIELSQVDVTFTTKAAVSVSTDNIKYVSAENVVPSTQTFTFSPPFNNQAIMVTKPIQEYKKEYTVQQALFCTSGIVTSIPVPLAGSALLPYHISSDIYQAKSHLSSDGSISSGDSSQACVTTKSKEKEVACLRNTCLPSGSEHNLSNQNDFKPSHDDIEMQNSSELTSDPAIISSFSAAMVHTIVNETLESVTSFRVTKTVDEHTDYLTKTVEGKSPPFYYDRATLQQNDASSKDMFADQLSKSIIKHSIDKSKSVIINIDKNVVNREGLPVPGEESRLTLEKCPKFLDTQVHYALSVGKDCAVESKGPVAHEFSLETPASCPVTTVQKSDLKELAKEKPVKRHSLNNTAFEPLSFGQENLFPHSHTFTSTVLTCVDGLHVEDKQKIRDGNVIPETPPSTPLVPSQAGSEWDIKKLTKKLKGELAKEFAPATPPSTPHNPSVGSLSENEQNTIEKEEFMLKLMRSLSEEVESSEGEEHPEVDVKSEHSGKKVQFAEGLATHIISLATEMAASHLDNKVIQEPKVKNPYLNVQSQTNISPPFLNCSDENLQALWNFAGDVAAEVITEAEKIAKLKSCVLSRQRKNSCYADGFYFKRADWHGRSEEKLDIEAVAHPREVDPYSLSLPSSACMSGLTYKYPSCESVTDEYAGHIIQILKQEGGNSELIMDQYANRLAYRSVKSGLQEAAKTAKTKCSSKTFPAQGSPEKTKNELLTFLTKEHHQEVDKKRRSKRKGGYFCKNQSCERTQDTYRNEYSELYSFSASLAHSITRDVKKELTASTVGLPKSLTDSCLYEKSECDEDPESHTEPEFPKPLQPSLQNHRFYHSIGSLNEYGCGENVVQTVEQYAKKVVDDMLELSLESAALQVSETTKSADRITYAEKLSPLISQPCRYCNLKELHDCTGSASQHFFRQDTVASSKLVSNSKYSNIYQKSRIFHLDVPQIHVNLDKKTVLAEKVVAEAIEKAERELSNTSLAADSGIGQDGITFAESLTAEIMTSAMTNVGLAVSSSKEKDDFQSTESFGSQQLNLSIGEDSTGSWSNLSFEDEHQDESSSFHHLSESNGNSSSWSSLGLEGDLYEDNLSFPTSDSDEPDDEDEEHEDDVEGLGQDGKTLLITNIDMEPCTVDPQLRIILQWLVASEAEVAELCFHDSAKEEFILLSKRLQEKGWKVGALLQAVLKYYEVTEKTSAEGRSQSLFDWLLENA	112241	177155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_112318_138022_138133_143427_143545_146363_146412_147874_148010_149571_149837_150416_154945_163947_164104_168058_168143_169088_169136_172705_172867_176544
898188	contig_6058_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_172375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTACAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358001	359290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_358000_359300
898189	contig_5023_pilon	+	2024	13	Intergenic	novelGene_7265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2349.58901104711	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	77	826	607279	618585	TRUE	25	AAGCAATCCTACTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALP	580852	647586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618574_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630292_646933
898190	contig_5279_pilon	-	1353	2	Intergenic	novelGene_105575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	136	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408351	395547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_396887_408337
898191	contig_7356_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_60430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	1180	1815	515934	515299	NA	45	TTTTAAAGCAATATATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFRCRVRKLQSKTMGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSGNVFQFVKLQPRSQHVFSSFSFK	517113	515067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515100_517100
898192	contig_6902_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_135549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175268	176937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_175300_176900
898193	contig_12964_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_131735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	306	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCAGAGCTACGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636243	634115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_634100_636200
898194	contig_16310_pilon	-	2614	1	Intergenic	novelGene_70058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127527	124913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_124900_127500
898195	contig_14882_pilon	-	4842	30	Intergenic	novelGene_114990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_29	213.807024018435	260	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1448	4347	403	4749	251664	166171	FALSE	30	GTATTGCTTTTGAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSSDYYNKDNEEESLLANVASIRHELKITEWSLQNLGEELSSVSTSETSDYACNSSRFERLILEDLAQPSHPGLLTYSPYKKVCKLSSGNTDSHKKPRDKVSFAFSTPMDQEIKSLREKLNKLRQQNACLVSQNHSLMTKVESIHFELTQSKAKVSMLESAQQQAANVPILEEQIINLEAEVSAQDKVLREAEDKLEQSQKMVIEKEQSLQKSQEECIKLKVDLLEQSKQGKRAERQRNEALYNAEELSKAFQQYKEKVAEKLEKVQAEEEILEKNLINCEKENKRLQEKCGIYKSEVEILKEKLRQLKEENNIGKEKLRTMAVKSSEVMAQLTESRQTVLKLESELVDQEEILREKFSVMNENKELKLRIATQNERLDLCQQEIESSRVELRSLEKIISQLPLKRAMFGFKSSLSKHQMSSLSNKEDSYISCCEANKMVISELRIKLAIKEAEIQKLQANLTANQLSQSLISCNDSQESGKLNSLETEPVKLGSNQVESIKDQNKHYEREKQRLAAGIEELRTKLMQIEAENSDLKVDMAHRTSQFQLIQEELLEKASNSSKLESEMTKKCSQLLTLEKQLEEKIVAYSSVAAKNAELEQELMEKNEKIRSLETNINTEHEKICLAFEKAKKIHLEQHKEMEKQIERLEAQLEKKDQQFKEQEKTMSVLQQDIICKHHHLESLDRLLTESKGEMEKENMKKDEALKALQNQVSEETIKVRQLDSALEICKEELALHLNQLEGNKEKFEKQLKKKSEEVYCLQKELKIKNHSLQETTEQNVILQHTLQQQQQMLQQETIRNGELEDVQTKLEKQVSKLEQELQKQRETSAEKLRKMEEKCETATHEADLKRQKIIELTGTARQVKLEMDQYKEELSRMEKEIMHLKRDGENKAMRISQLDMILEQTKTELDKKTNAVKELEKLQHHTETELTEALQKREALETELQNAHGELKSTLRQLQELRDVLQKAQLSLEEKYTTIKDLTAELRECKMDIEDKKQELLEMDQALKERNWELKQRAAQVTHLDMTIREHRGEMEQKIIKLEGTLEKSELELKECNKQIENLNEKLQNAKEQLREKEFMILQNEQEISQLKKEAERTQQKIKEMESVIKEQEQYIATQYKETVDLGQDLRLTQEQLQNSHTEMVEARRQQVQAQRDIERLSSELEEIKQLSKEKEVRGNHLAEELGASQVREAQLEARMQAEIKKLSTEVESLKEAYHCEMLSHQENHAKWKMSADSQKTSVQQLNEQLEKAKLELEDAQDTVSNLHQQVQDRNEVIEAANEALLIKESELTRLQAKISGRERAEDMKFLSVPTGIMPDIEDLEFAKHSNTPFFKCKKLRRSISASDLSFKTHVDEDLSEELLQDLKKMQLEQSSTLEESQKDLTSNQLDSFDPLMYNLEDDSSESNDFSTLSGMLRYINKEVRLLKKSSMLTGAGLTQGENL	254126	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_166186_166710_167167_170216_170418_177155_177294_179133_179338_181537_181682_182546_182664_183715_183816_188941_189156_189351_189516_193474_193618_198629_198798_203510_203628_208773_208852_209021_209157_214506_214639_215122_215234_216555_216762_222564_222726_223723_223849_227916_228209_230014_230137_233727_233825_237873_238003_239933_240041_247287_247450_250927_251103_251530_251667_253004_253176_253897
898197	contig_8045_pilon	+	3872	9	Intergenic	novelGene_35451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	102.877354165045	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	400	2016	452026	462377	FALSE	40	TTTAAAGTGTAAATCTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	438084	464233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_438463_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
898198	contig_10500_pilon	-	1074	2	Intergenic	novelGene_41297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTAAAATGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640223	1638734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1639033_1639447
898199	contig_7111_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_175939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77465	78429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_+_77500_78400
898200	contig_10479_pilon	+	2761	2	Intergenic	novelGene_147102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2383	2742	78732	79091	FALSE	15	TGGTGGTAGCTGGGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHSLPFHPGFPPFPSIQFPVPSCLLIFAFGQVLPIWSHILDRRSTLLTCVIVCFIGLSNLWLKGELWEWVQFRVSRVSGSHSVGSFSSLGQTNKSSHFYEFEFYSTFFFRSVRDPLL	63459	79110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_63838_76727
898202	contig_15498_pilon	-	961	6	Intergenic	novelGene_42657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	131.516690955939	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	13	591	697708	688356	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGEATAAHAV	697720	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688384_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
898203	contig_9945_pilon	+	3229	2	Intergenic	novelGene_104824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2189	2575	132993	133379	FALSE	35	CCAAAACCTTTGGGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTTKKVNKHTHKNKEEKHKVSAKTKPTKTKEMRKKSTNKSNSAQESKKNKENFSTTKKKHYKMTATNSHLTIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKNISS	129829	134033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_131919_132893
898204	contig_13295_pilon	-	4418	8	Intergenic	novelGene_31205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	276.900630522347	716	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	235	657	85663	79371	TRUE	60	GAAGACAAGAATAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGKC	134788	45037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_45319_45497_45520_75912_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_101889_102009_134686
898205	contig_13041_pilon	-	6890	4	Intergenic	novelGene_127723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1050	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCCGAGCGCTCACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275488	250249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_250643_256716_256871_262854_268635_274925
898206	contig_14814_pilon	-	6118	16	Intergenic	novelGene_137738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_3	107.09177787715	682	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	86	2368	419124	395214	FALSE	40	CTTCTAAGATACTACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAMQPAEIQFAQRLASNEKGIRDRAVKKLRQYISVKTQRETGGFSQEELLKIWKGLFYCMWVQDEPLLQEELANTISQLVHVVNNSEAQHLFIQTFWQTMNREWKGIDRLRLDKYHTLIRLVLRQSFEVLKRNSWEERQIKPFLDVLMKEILHPESQCPKGVKFHFIDIYLEELSKVGGKELLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTVVQTIARGVFGVMVAQSPFVPEEMVEEQRTRVGDSKLSEEEISENEMSWRETISRKKTALDKHHANDGISGDSERDSGGACEDPEPLLQFDYKAVADRLLEITNRKNIPPFNRKCLSKLIKKFQDLSEGSVSQPGFAEDNSADEDDHAVGQGRNKNKGSKPAEKTHLGKEKGSKFFRTEEEENEGSTQKKRRKKKKNHLQLENLGSGDKTTSPDQNGSEPEEGQRKDQKVPSVAETGAEEATSSIVEEGGLEHPPAIPPCNKRKRPKKRSLRVQEGVPGLPVPPSEDVTPSGPSSDCAQEPAARSTPAGGVQVLKRKRKLGALPVNGSSLSVLAWPLLGKQSPQTSPGEGEDGHPALPQGMRLKKKKVVPSSLDLCNLYDPSNPKTTILKKRKKVKEMLHSVEHNGVLEAKAKQVPVLGNGGTFSPLKKKLRAENDFVKFDTSFLPKPSFFRKAKSTACASFLSPTVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNTTAEFKKTDKSILVSPTGPSRVAFNPEQRPLHGVLKTPTSSPSNTPLAPKKVLATPPKRRPTAMDFF	419209	391463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_395408_396348_396413_397413_397564_397701_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402158_402251_404264_404447_405639_405705_406814_406945_407717_407780_408364_408451_409637_409696_411513_411597_418994
898207	contig_7051_pilon	+	3724	10	Intergenic	novelGene_64359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_2	448.65158744128	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1308	2416	3723	335902	347133	FALSE	20	GTTCTTCATACAGTTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVS	330861	347134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_331924_334316_334506_334737_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
898208	contig_755_pilon	-	1700	3	Intergenic	novelGene_119763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	228.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	53	367	88997	84074	FALSE	25	CATATATATGGCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYGGYDYSQQGRFVPPDMMQPQQPYTGQIYQPTQTYTPTTPQSFYGNNFEDEPPLLEELGINFDHIWQKTLTVLHPLKVADGSIMNETDLAGPMVFCLAFGATLLLRNGRNHSHCWNYWMV	89049	82740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_87670_87817_88876
898209	contig_10793_pilon	+	2105	13	Intergenic	novelGene_83404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3588.18695707023	4	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	653	1033	160548	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVFPK	130880	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_131015_151413_151500_152866_152970_159139_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163926_164068_164789_164820_165325_165377_166401
898210	contig_5569_pilon	-	3558	6	Intergenic	novelGene_86722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	124	junction_3	70.37329038776	499	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	58	1683	235594	138898	FALSE	20	TATCACCTGAGTATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSWMGRQAGGRERVGGADTVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFENKPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVDPKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISIIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALMWSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDLIKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVKTMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISSLMSLVSQEEMSMPTQLVQGGAFDGTTEGPFNQGYGEGAGEGADEEEWVVAKDKPIYDELFYTLSPVNGKITGVNAKKEMVSSKLPNSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRKCLPNAD	235651	137022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_139435_150598_150764_160093_160507_200103_200202_212039_212217_235358
898211	contig_12414_pilon	+	2081	15	Intergenic	novelGene_59612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_7	85.6359463433578	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	107	844	527729	594057	TRUE	15	TACTTTGTCTTTGTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSANASRKGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRLPVKEEPMYLLCHILKIMHTWLSPHSCISRCVFVLILRRFSVLDQCSELKTPIPTGI	527622	607456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_591474_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
898213	contig_11416_pilon	+	5175	2	Intergenic	novelGene_145358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1470	134	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2689	3096	362557	362964	FALSE	45	AATGAAATAGGACCCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGIIHHEDITIKNIYAPNDWAPKYIKQTVTALKREIDSSTIIVGDFNTPLLVKDGTSRKKFSKDTEDLNAKINQLDLIDIYRTLHPKAAKYIFFSNAHGMFSRTDHFLGKQPSTKSKTLRYCKVSSLITTPSK	359576	365043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_360825_361116
898214	contig_6445_pilon	-	1451	14	Intergenic	novelGene_76955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	111	junction_13	609.160534024503	82	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	42	1229	96360	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAAGPAPPPATNAWAPANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96401	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_96306
898215	contig_20357_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_178718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTTTCCCAATGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30215	32312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20357_pilon_+_30200_32300
898217	contig_10403_pilon	+	6405	21	Intergenic	novelGene_175797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	440	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	63	368	67769	68074	TRUE	15	ATTTTCGACCCCACCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKRLHQKSKKRTCKLGKNFWQYKSDKDLISIIYKKIQHVYNKKTNNPIKKRAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLA	67706	106909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_71478_72488_72630_73323_73407_73614_73728_75434_75632_78425_78538_78630_78704_79186_79385_81793_81912_83421_83523_84567_84711_86339_86499_87385_87608_93367_93436_96011_96164_96315_96439_98355_98453_99047_99148_99959_100069_101988_102134_106729
898218	contig_10324_pilon	+	4066	11	Intergenic	novelGene_7799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	96.7851228237067	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	68	1450	132046	139762	FALSE	30	CCCTATGTCCAAATAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAENVKQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSQFYSNGGHSGNAGGGGGGGGGGSSGYSSYYQGDDYNSPVPPKHAGKKQPHGGQQKPSYGSGYQSHQGQQQSYNQSQGAGVDQTTTTRANSTTVVVEAEAAGAATAQAGRPTTQGHMGATAEVLGAAPHTKANKATRHSRTTTPPGPARTTAAPPAPTSHHRAAMAETQTTA	131615	142378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_131657_132019_132220_132653_132822_133225_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_137596_137826_137920_137964_138885_139015_139645
898219	contig_15114_pilon	+	2860	1	Intergenic	novelGene_121126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATGGATAACACGGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99843	102703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_99800_102700
898220	contig_16322_pilon	-	4947	1	Intergenic	novelGene_87563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCATGATGGACATTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170958	166011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_166000_171000
898221	contig_12079_pilon	+	4132	12	Intergenic	novelGene_67417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1381	2013	581102	584370	TRUE	25	GCGCGCCGCCGCTTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWVLLLSSLAWDNSLVKVCSLPLHALILLGLGDPLLLIAVVHDALTGELGAVACVLGALLLQVVLDVVIHRLIHGGRGRRGRCHHQVQLLPGLHQVVLRLFGPVLPFLHLVLLAPPRLFQQGNLGCVLSELRGLLLLALYLIHSLSLQLLLGPQRGPHGQPPSALPPPGHASSPPPAAGLSGSARKVLEDTGQRCLSTQLLKDPGALA	579721	638857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582169_583661_583759_584145_585378_585891_586056_591616_591713_598002_598148_599457_599549_600609_600884_601783_601878_609187_609274_638695
898222	contig_16041_pilon	+	3977	1	Intergenic	novelGene_178359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTATGTTAATGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189	5166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_+_1200_5200
898223	contig_11978_pilon	+	2920	1	Intergenic	novelGene_63122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	178	312	1905588	1905722	NA	5	TGTTCCTCTTACTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFQGAAGGFKLLTFWLAAKLLTLIITRDQLLEDIIFGEVEGQCGRERPLVRWTGIVAATMNSNLLVTEKTMKDWAMFVLLYTRLPLVRVDTMVANNNIVGLTF	1905410	1908330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1905400_1908300
898224	scaffold_12510_pilon	-	4596	9	Intergenic	novelGene_151390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	54.2903076064227	634	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	96	1049	343862	312369	FALSE	60	GCCACTGTAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRFGTRLVGATANPSPPSKPRSNENLDKIDMSLDDIIKLNRKEGKKQNFPRLNRRLQQSGARQFRMRVRWGIQQNSGFGKNSLSRRGRVMPGKRRPYGVITGLAARKSTGVRKGISPMNRPPLSDKNIERYFPVLKRKANLLRQNEVQRKPVGVLKRPNQLNRKSNIPANFTRSGNKLSHQKDIRQATFLFRRGLKVQAQLNTEQLLDDVVAKRTRQWRTSTTNGGILTVSIDNPGAVQCPVTQKPRLTRTSVPSFLAKREPSDVKKVPKGVPLQFDINSVGKQTGMTLNERFGILKEQRATLTFNKGGSRFVTVG	343957	308821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_312468_315249_315377_316464_316540_316854_316917_317323_317421_319273_319387_326431_326581_337684_337814_343759
898225	contig_20742_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_150651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGAAGAAAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5841	8130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_5800_8100
898226	contig_10500_pilon	-	6099	6	Intergenic	novelGene_41233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	863.475766886367	117	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	3217	3606	1635143	1630500	TRUE	20	TATTTCTATATTGTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGFYTLFLVIILKELS	1638535	1626410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626521_1626583_1627032_1628564_1630728_1633135_1633231_1635076_1636727_1636902
898229	contig_9668_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_58077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	635	937	54080	53778	NA	20	TATGTTGTCAGTATGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHSPSGRSKDGTQSQVFDQKEGEVVRGKEEIKRSRKKQRQQPTNGTRGWPVRVGGIQVAGASQPRDCGHRKQRRPSGGEEGWGAGKRISLFTSFSVSC	54714	52957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_53000_54700
898230	contig_7056_pilon	-	2480	10	Intergenic	novelGene_43640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	1040.23541969838	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	67	621	730480	725835	TRUE	35	TCCTTTTAAAAACTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGISKSLRAVELKLELTMIHLENLWPCSGQVPMTDLGLAEGITVLAEELALKG	731013	721909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723723_723817_724504_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
898231	contig_4125_pilon	-	4325	1	Intergenic	novelGene_25148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	404	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGGTGAAAGTAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864141	859816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_859800_864100
898232	contig_6102_pilon	-	2328	14	Intergenic	novelGene_32093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	170.631926783559	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2181	146	2326	800492	791062	FALSE	50	GAAGGAAAAAGTCAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANDHFNFTGLSPVPAASGLKPSPSSGEGLYTNGSPMNFPQQGKSLNGDVNVNGLSTVSHTTTSGILNSAPHSSSTSHLHHPSVAYDCLWNYSQYPSANPGSNLKDSSLLSQFSGGQYPLNGILGGSRQPSSPSHNTNLRAGSQEFWANGTQSPMGLNFDSQELYDSFPDQNFEEVGSGIHPDETGEKELTSVVAENGTGLVGSLELEEEQPELKMCGYNGSVPSVESLHQEVSVLVPDPSVSCLDDPSHLPDQLEDTPILSEDSLEPFNSLAPEQVSGGLYGIDDTELMSGEDKLPLEDSPVISALDCTSLNNTTAFSLLADDSQTSASIFASPTSPPVLGESVLQDNSFDLNNGSDTEQEEMEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEK	809019	791059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_791098_791584_791651_791969_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_795644_796226_796446_797091_797278_798168_798284_798373_798763_800356_800495_808876
898233	contig_4982_pilon	-	2433	3	Intergenic	novelGene_172222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	11	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	2010	2432	18477	16406	FALSE	30	GTAAGTTGGGGACGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTAADTVIFFDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNKSVKVIRLIARDTVEEIVCRKASSKLQLTNMIIEGGHFTLGTQRPSANADLQLSEILKFGLDKLLSSEGSIIDEIDMESILGETKDGQWISDALPTAEEGSIEQEEG	20486	16404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_16571_17593_17748_18373
898234	contig_8376_pilon	-	2144	1	Intergenic	novelGene_153771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGATATATAATATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136143	133999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_134000_136100
898235	contig_6102_pilon	+	2340	16	Intergenic	novelGene_31907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	476.323540837061	1	89	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	170	931	375493	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	374902	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_374976_375262_375312_375445_375499_378932_379032_379330_379487_379617_379795_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
898237	contig_13481_pilon	-	2069	4	Intergenic	novelGene_119371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCTGAGGAGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474574	469622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_470967_471860_472221_473976_474157_474389
898238	contig_4350_pilon	+	1694	4	Intergenic	novelGene_136381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGACCTGTCGGGGCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246990	270076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_248175_258626_258876_269222_269374_269966
898239	contig_14397_pilon	-	2520	8	Intergenic	novelGene_134639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	431.68237567613	298	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	47	613	126676	38620	TRUE	40	GAGCACAACTGGAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKCSRFKEAEAQHSIMTEPRRADMKAPPAALVFALALALIRTGRGNHEDPELSTYTTPEEEGTDEETISSTFAAVTTETLTADTNSTLLDTGEANQLQFTLMVLIPLILLVLLLLSVVLFGTYYKRKRTKKEPSSQGSQSALQTNELGSENVKVPIFEEDTPSVMEIEMEELDKWMNSMNRNADYECLPTLKEEKESNHNPRQ	126722	4968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_4976_36719_38627_91746_91805_93971_94058_95353_95382_102475_102515_102603_102865_126588
898240	contig_5590_pilon	+	1180	2	Intergenic	novelGene_163045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	30	362	374514	374846	TRUE	15	TAATGCTGGCGTCTCCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHLRSWPFCMLCPGRPEGSEGHRACLPYRCRTHGCAQSTPPTSTSCRTPGRGLLAKCPHRVHMTPLPPLRQSSVHKNGTPGRLACRSPSHSATPPGSPGQAHELGALGEAHPPPALTLP	374484	375771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_374857_374963
898241	contig_10599_pilon	-	2997	6	Intergenic	novelGene_49898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGTCTGTGCGCAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318780	295726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_295978_302881_303022_307357_307478_315221_315345_316318_318449_318547
898242	contig_14508_pilon	-	5240	4	Intergenic	novelGene_79045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	165	junction_1	487.10642232131	608	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	655	984	57672	57343	TRUE	35	CAGAAGAATTCTTTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQIALKALAKNKASGIDGIPIEMFQQMDAVTHLCQEIWKTATWQTDWKRSIFVHIPKKGDPTECRNYQRISLTSHASKILQKIVQKRLQRYIDRKLPEIQVRL	58326	42139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_43883_49687_49733_54504_54541_54910
898243	contig_4232_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_63379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAGACGGGGAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
898244	contig_5894_pilon	+	4438	5	Intergenic	novelGene_83052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	768	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	28	504	521774	522250	TRUE	45	AAGTCATCTTAAAACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTKGREWQNGLKMHVPTICCLQETHLKLKDTNRLKVKRWKKIFHANSNQRTAEVTILISDKVDFKTKSVRRDKDGYYIVIKGLINQEDLTIINIYAPNFKAPKYIKQTLIELKGEIDSTTVIVGDFNTPLLILGRTSRKKINKETENLNDTIKQLD	521746	529253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_522851_523100_523447_523920_526226_526460_526910_529019
898246	contig_11413_pilon	-	4849	27	Intergenic	novelGene_103181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	4433	4849	532836	485096	FALSE	5	GGCTGCCGCCGTGCCACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDDIFQFVSQLQIDVWNEVDVRSGQTIVTCTNVFSMFINISTFRSIRDGFCRSNLRLREFGEGWISDMLPKGVLLELEKLHHQPSQGFIGRSISVNILLVVLAQPDPHRVQLGHRLRALPKLAGRAPVLPPINCQAR	654973	485095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_485214_491483_491604_526641_526733_527848_527936_532835_532909_542338_542408_546058_546135_549822_549949_551871_551995_557202_557328_565026_565086_574678_574717_577756_577878_579276_579352_581382_581495_582112_582267_583011_583126_590105_590166_596825_597086_598033_598194_607524_607659_610793_610905_611578_611736_620299_620437_629137_629398_651822_652002_653263
898248	contig_9400_pilon	-	2055	8	Intergenic	novelGene_146586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_2	525.183505344289	856	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	115	312	135537	132487	TRUE	20	TTGAGATCCAATTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTGIFVTA	158630	121333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_132600_135452_135561_158539
898249	contig_1532_pilon	+	5498	4	Intergenic	novelGene_37438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	613	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	330	683	24098	24451	TRUE	35	GAAGAGTTAGGTAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMVNNLTTHQQYPYSTLGSLSPASLSPSAFWPLSLDSCTSLVSFGFTGSTDLFITPSVSTMGSKYANLQARGMSEGTNVMVGRGRLSNKQSKHSAYLAYQIICSEQFHIFDVVKPI	23768	34930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_28963_29437_29507_32051_32225_34868
898250	contig_9839_pilon	+	1136	8	Intergenic	novelGene_88494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	1658.73337464563	37	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	270	1004	49467	61360	FALSE	10	TCACTTGTTTTCTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45310	61492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_48720_48860_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
898251	contig_8954_pilon	-	6235	3	Intergenic	novelGene_130298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	502	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	4523	5155	181438	180806	TRUE	60	TGTAAGGGGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLTQNDVENLNTPITREEIEKVIKKKKLPTKKKPWPRWLHWRILPNIQRRAYTSTTQIISEHKKRKGLFPNSFYEAGITLIPKPGKDTTKKENYRPTSLMNIDAKILNKILVNRIQHVKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIYHIKKERKESHDHLNRHRKGI	188673	179615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_180101_180210_183066_185778
898252	contig_4659_pilon	-	5277	25	Intergenic	novelGene_118184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	172.99973908137	249	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	2546	4504	142760	126705	TRUE	60	GCAAAACTAGAGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLTLLTKKYLISDNGGQQLSISDAFIKESLFNRRVEEKSKELPFTPLGWHHNNLELLREENGEKQAMERLLSANHNHLMALLQQLLHNESLSPSWRDIIVPLVCQVVQTVRPDVKNRDDDMDIRQFVHVKKIPGGKKFDSVVVSGFVCTKNIAHKKMNSCIKNPKILLLKCSIEYLYREETKFTCIDPIVLQEREFLKNYVQRIVDVRPTLVLVEKTVSRIAQDMLLEHGITLVINVKSQVLDRISRMTQGDLVMSMDQLLTKPRLGTCHKFYMQMFQLSNEQTKTLMFFEGCPQHLGCTVKLRGGSDYELARVKEILIFMICVAYHSQLEISFLMDEFAMPPTLTQNSSFHSLIEGCGEEGAAQEQFSGSTLPRDPDFPPDRPIMISEALPSDDGSSLESRIVFEKGDQENKSVLQDVVSLKHQECAATACVSGIPCALFPSLPESLLPLHMDDQQDVIGSEQPETLQQTDELHDPKSQMRAFRDPLQDDTGLYVAMEVTSSEDKRKTYSLAFKQELKDVILCMSPVITFREPFLLTEKGMKCSTRDYFAEQVYWSPLLNKEFKEMESRRKKQLLRDLTGLQGMNGSIQAKSIQVLPSHELVSTRIAEHLGDSQSLGRMLADFRARGGRIQQKKFRSFCSFKGCIRHFW	162363	118422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_118485_118913_119028_120654_120834_122174_122347_123004_123077_124458_124560_126631_127814_128062_128190_128865_129007_130218_130327_133348_133424_134065_134247_134673_134804_136451_136510_142730_142895_143435_143584_144559_144672_145670_145829_147015_147155_150997_151088_152896_153105_157141_157314_158003_158123_160701_160738_161134
898253	contig_13984_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_130239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACATGGAAGATACATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26518	24113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_-_24100_26500
898254	contig_13674_pilon	+	3104	1	Intergenic	novelGene_140311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	2220	2930	14675	15385	NA	10	TCCTGCCATCCACTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPAICCLQETNLRNKDVNLLKVRGWKKIYQATNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEGITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDTYRTLHPTAAKCTFFSNVHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHEHTVSL	12455	15559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_12500_15600
898255	contig_2419_pilon	+	4379	1	Intergenic	novelGene_137135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACAGGTTGTGCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174769	179148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_174800_179100
898256	contig_11855_pilon	+	2274	5	Intergenic	novelGene_67108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	163.182987777525	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	619	1368	2445507	2446256	FALSE	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440102	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443669_2445502
898257	contig_11413_pilon	-	1623	15	Intergenic	novelGene_103191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGGGAAGCTTTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597165	532877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_532909_542338_542408_546058_546135_549822_549949_551871_551995_557202_557328_565026_565086_574678_574717_577756_577878_579276_579352_581382_581495_582112_582267_583011_583126_590105_590166_596825
898258	contig_14441_pilon	+	1409	3	Intergenic	novelGene_100478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	797	1129	93021	93353	FALSE	45	TGAAACTTTAAAAAATGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKFCEVEIKCNTSCISYSKYSFFKGRINQRLQQPETRRSRWCPATTTDRPDGEHNREFLLEQEKSGVQNSNSSENTRLNGLTENGGTPESTAPRLSVNPALKQLPRPTL	87761	93633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_87795_89291_89438_92403
898259	contig_1717_pilon	+	7263	20	Intergenic	novelGene_146114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	77.0442906040509	22	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	917	2754	414	3167	138042	210906	TRUE	30	CAGCTCAAACTGTTAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASHLLAYFFTELNHDQVQKVDQYLYHMRLSDETLEEISKRFRKEMEKGLGATTHPTASVKMLPTFVRSTPDGTEDGEFLALDLGGTNFRVLWVRVTDNGLQKVEMKNQIYAIPEDMMRGSGTQLFDHIAECLANFMDQLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESYLVSWTKGFKCSGVEGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDVVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYMEEMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGVLNDIRTEFDHEIDMGSLNPGKQLFEKMISGMYMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLITGRFETKDVSDIEGEKDGVWKARETLVRLGLDPTQEDCVATHRICQIVSTRSANLCGATLAAVLRRIKENKGEERLRSTIGVDGSVYKKHPHFAKRLHKTVRRLVPDCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEPLMLSREQLLEVKRRMKVEMEQGLRKETHANAPVKMLPTYVCATPDGTEKGDFLALDLGGTNFRVLLVRVRNGKRRGVEMHNKIYPIPQDVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMKGVSLPLGFTFSFPCHQNRLDESILLQWTKGFKVSGCEGEDVVTLLKEAIHRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCGYEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDDFCTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCAVVARRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDTLKVTVGVDGTLYKLHPHFAKIMHETVKDLAPRCDVSFLESEDGSGKGAALITAVACRIREAGQR	137628	229984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_138105_160168_160332_176753_176903_186960_187081_187737_187834_189467_189568_190279_190464_193249_193406_195006_195241_196607_196913_198368_198518_198767_198888_202476_202573_203082_203183_204006_204191_204754_204911_206532_206767_210761_214229_219061_219705_229853
898260	contig_12414_pilon	-	2969	1	Intergenic	novelGene_59582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	NA	5	CCCACCCTGCGGCCGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	371612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_371600_374600
898261	contig_1452_pilon	-	2133	4	Intergenic	novelGene_115142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	54	junction_3	1071.08491208162	5	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	126	740	715391	699652	FALSE	70	AAAAAAATTAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	716478	698258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232_715442_716403
898262	contig_2768_pilon	+	2767	10	Intergenic	novelGene_57511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_6	228.004764949126	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	101	904	781846	790242	TRUE	25	CAACATGGGTCACTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLSTSGILLDSERRKSDASSVISPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTVLIPYHILIVPSKKLGGSIFTANPWICISGELGETQILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNAGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKEVSFPAL	779862	793590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_779883_781765_781851_782337_782467_786887_787010_788189_788336_788886_789006_789357_789537_790138_790898_791504_791674_792551
898264	contig_3627_pilon	+	3756	6	Intergenic	novelGene_78464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_3	130.305180250058	221	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	2749	3657	323470	331078	FALSE	45	CTGAGGTTCCTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSKKDERKDKKEERDDETDEPKPKRRKSGDDKDKKEDRDERKKEDKRKDDSKDDDETEEDNNQDEYDPMEAEEAEDEEDDRDEEEMNKRDDKRDVNRYCKERPSKDKEKEKTQMITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTVKQESKDVEENVGLIVYNGAMVDVGSLLQKLEKSEKVRAEVEQKLQLLEEKTGKEQHWMLVSYWDMYM	320721	331177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842
898265	contig_12528_pilon	-	1850	10	Intergenic	novelGene_81306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	584.713372854651	30	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	129	818	966228	933323	TRUE	35	GAAGCAGACGTCATTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968083	931358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_931454_932385_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_968000
898266	scaffold_19766_pilon	-	1639	6	Intergenic	novelGene_34402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	103.752397562659	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	46	429	830565	827812	TRUE	60	AAAATGGTTGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVRLGKLFFILAVFGAWSGTPKEQDDDSERLPSKCEVCKLLSQELQEKLSHTGRSREVLELGQVLDTGKRKKHIPYSVSETRLEEALENLCERILDYSVHAERKGSLRYAKTPSSHLEFTRVSCS	830610	825044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_827289_827413_827777_827857_827987_828085_828182_828310_830450
898267	contig_10011_pilon	-	3375	9	Intergenic	novelGene_68040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2791	3177	139789	136109	FALSE	20	ACTTGATATGGGTGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSCKSKLARLLLSCSACPRALAAFGLEEVPLQVKGGEGTVFSDGLGDGLGTLVAEEVGCQVQVLQRAVGAEGAGKSLGSLWIDGVFSEAEAEEGLVGVEGPHQCSHPSVADGIALQAADRGRAHLA	144397	135910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_136220_136710_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139855_140290_140376_141075_141162_141581_141666_141927
898268	contig_6137_pilon	+	3228	2	Intergenic	novelGene_59211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311028	1314330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1312720_1312793
898269	contig_12464_pilon	-	5000	8	Intergenic	novelGene_68702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	120.750882026609	4	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	1934	4333	357758	337140	FALSE	35	TATTAACTTAACCTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQCIMAPKRSKTSASNSSSKRQRKSIDLEVKQKVIKQHEGGKSVNAIARDLGMSHSTITTILKNKEKILQAVKGSAPLKATRLTKMREGPISDMERLLMTWIEDQTQKQIPLSTSTITAKARSLFEMLKEKAGPDYNIEFSASSGWFMRFKQRFSLHNVKLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	377950	336472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_343318_343793_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_376096
898270	contig_18511_pilon	+	1008	4	Intergenic	novelGene_126894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	499.957553753872	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTCATTAATTTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57660	61540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_58023_59151_59255_59753_59948_61191
898271	contig_7111_pilon	-	2259	1	Intergenic	novelGene_175937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1157	1546	65841	65452	NA	25	TCAAGCGATGTATTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILKASGSIKRRWNEYTESLFQKELVNIKTFQEVAYDQELMVLKEEIQAALKALVKNKTSGFDGIPVKMFQQMDAKLEVLTHLGQGTWKRTTWPTDWKRSIFAPIPKKSDPKKCRNYQPISLISHPS	66997	64738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_-_64700_67000
898272	contig_9482_pilon	+	5994	25	Intergenic	novelGene_44275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	15	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4044	4412	1116083	1120825	TRUE	35	CAGCGGGAGGAAGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLPHHRDGVVVSRVLVVVGLLVGAVLALLLVSQQVGVKVPRVPGSDRPGTHKPLQPLPRVALLQQRRQDHLEQQQLERQLTDRGVTVQHDVVRQEAGQQTLDDADGQPEHQEHDGAKDDH	1098277	1176180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1101485_1102676_1102826_1104141_1104269_1104680_1104776_1107734_1107867_1109556_1109739_1112505_1112576_1116001_1116209_1117003_1117140_1117345_1117447_1120819_1120938_1123440_1123581_1124781_1124857_1124938_1125005_1125228_1125309_1127057_1127119_1130324_1130400_1134928_1135004_1137263_1137445_1138421_1138593_1141362_1141436_1144321_1144469_1146647_1146723_1147551_1147650_1176027
898273	contig_10734_pilon	+	5899	24	Intergenic	novelGene_51222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_23	446.253604773291	530	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1405	4218	217	4434	1243300	1333513	FALSE	40	TAAATTCATATTATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDRDEFLIMHVNICSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198703	1334978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333251
898274	contig_10958_pilon	+	2176	11	Intergenic	novelGene_5333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTCCCCCACGGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502990	548686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_503693_533363_533541_534019_534102_535232_535411_535514_535665_536008_536179_538267_538463_541034_541139_542756_542864_547666_547843_548551
898275	contig_6189_pilon	-	2776	10	Intergenic	novelGene_164957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_8	283.592212886526	817	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	22	1446	202658	188226	FALSE	15	ACATTTCTTCACCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDVSKKLTEQKITNKDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEEKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSATNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFES	202679	186895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_188337_190412_190640_191061_191253_192144_192288_193662_193833_198484_198644_200065_200169_200270_200403_201997_202154_202625
898276	contig_5669_pilon	-	5087	5	Intergenic	novelGene_86069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	771	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3910	4215	188307	187915	TRUE	80	CAGCAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFSRGLRSGHSSPKQKKISNGGGVLVWPFWNRMSSWRNCSRLKSLVFTSRWMGLGRVASASAQGPLQNTLHWHRRMAYRSWPCSCRMSPRSSTSSSWLV	192910	185261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_185847_187420_187512_187718_188111_188197_188315_189008
898277	contig_8367_pilon	+	6612	7	Intergenic	novelGene_178719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1942	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2121	2588	27937	28404	TRUE	40	TAGTAGATTACACAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEPQQTPYTRDPKRKSPRHIIITLTKPKTNRILRAAHEKEEVPYRGKTIRVSSDYSAETMQERNQCDDIYKILKEKNCQPRIMYPAKLSFKHDGEIRSFPDKQKLREYVKVTPNLQEFLKGVLLSEDKQLELTGKPRMQVRISQIPV	7975	151019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8367_pilon_+_8297_25939_26360_26557_29290_70695_70730_110633_111082_134734_135785_149412
898278	contig_17144_pilon	-	3147	17	Intergenic	novelGene_29353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1761.80323882769	1060	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	330	2852	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183411	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
898279	contig_10074_pilon	+	1116	9	Intergenic	novelGene_57179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGCCTGGGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559546	586281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_559726_560820_560890_561018_561091_561861_562073_562179_562283_563748_563892_577107_577200_583722_583871_586182
898280	contig_4496_pilon	+	2907	9	Intergenic	novelGene_66667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_6	169.569860234654	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	1070	2731	996219	998163	FALSE	20	AGCATTCTTTGAACTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859278	998339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_891913_891995_899756_899893_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952491_952529_996162_996282_996564
898281	contig_4924_pilon	+	2262	8	Intergenic	novelGene_84706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGTTACTGTCAAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81032	252588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_82483_114578_114713_127723_127785_132966_133128_145996_146130_155810_155860_197778_197864_252399
898282	contig_1443_pilon	-	5021	25	Intergenic	novelGene_28347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	290.468560045661	635	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	884	2655	1194	3848	916453	897092	FALSE	0	TGTTGTTGTTGTTGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDVYNAVMDLVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKDGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGDLMVLPTGVPASFSPLGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEHSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSAPPKKKRK	919299	895918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_897238_898594_898673_898805_898936_899547_899581_903059_903109_903402_903516_903856_903983_905122_905242_905488_905616_905723_905860_906340_906469_908668_908823_908924_909041_909125_909222_909341_909408_910547_910661_910793_910868_911570_911662_913072_913246_913985_914138_914557_914705_915185_915339_916318_916490_917580_918459_919020
898283	contig_16999_pilon	+	3145	4	Intergenic	novelGene_84965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	74.4057942785521	436	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCGACCTCATGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50609	84238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_73925_74018_79797_79986_81568
898284	contig_6048_pilon	+	3085	3	Intergenic	novelGene_73362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	2104	2862	3166488	3167246	FALSE	50	AAAAAAAAGCCCGCAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLSTITLNINGLNAPIKRQRVTEWIKEQDPSICCLEETHLRNKDVNLLKIKGWEKIYQANNYQKIARVAILISDKTDFKTKSTIKDKEGHYIMIKEMIHHEDVTIINIYAPNDRAPKYVKQTLTALKGEIDRSAIIGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQKAEIIQSIFSDNNAIKVEINNRKIKEKKINYMETE	3043746	3167469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_3045186_3123145_3123661_3166338
898285	contig_9144_pilon	+	1689	5	Intergenic	novelGene_151141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	91.6296895116425	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	28	303	622338	624074	TRUE	40	AAAAAACCATGTTGGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQDCFYLFEMDSSLACSPEISHLSVGSILLVTFASLVAVYIIGGQFPHLAFWQDLGNLVADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPM	622310	625498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_622406_622954_622992_623033_623082_623951_624734_624771
898286	contig_9014_pilon	+	3437	2	Intergenic	novelGene_106827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	493	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCACACCTACTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260744	264359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_263392_263569
898287	contig_3068_pilon	+	5981	1	Intergenic	novelGene_137660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	758	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTGACCCCTTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423607	429588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_423600_429600
898288	contig_10323_pilon	-	1507	9	Intergenic	novelGene_123612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1800.68417119022	27	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1419	87	1505	513306	460250	FALSE	55	CGAAGACAACAAAACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELERQQKEVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGRYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPS	531362	460247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_471164_471237_473477_473604_474208_474245_513276_513353_531322
898289	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_91292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
898290	contig_8476_pilon	-	3039	1	Intergenic	novelGene_121348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	360	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTGAAACTTGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182085	179046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_179000_182100
898291	contig_5003_pilon	+	2153	6	Intergenic	novelGene_120204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1808	2137	135650	137095	FALSE	65	TGTAGGAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPFFLLCKLNFLFQKPQFCLFSTSLFKQFSPLIFNLLSLFFCLHFKFLFNFLAPLLPFSSNSGFLFKFLKGAHQQAKYSSIPLLSLFIHILILDKVSTCTLFGGSYN	133011	137111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_134621_134707_134789_135532_135671_135751_135905_136786_136859_137011
898292	contig_3960_pilon	-	5218	1	Intergenic	novelGene_138054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	597	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCCCACCTAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739250	734032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_734000_739200
898294	contig_11752_pilon	+	5032	2	Intergenic	novelGene_37593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4780	junction_1	0	501	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2240	2632	87165	87557	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTGRE	84087	89957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034
898295	contig_10074_pilon	+	4126	26	Intergenic	novelGene_57080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_25	796.860794869468	622	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	940	2823	466	3288	50184	66719	TRUE	10	TTTTCCCTCTTTTGGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVQILKQEWPKHWPTFISDIVGASRTSESLCQNNMVILKLLSEEVFDFSSGQITQVKAKHLKDSMCNEFSQIFQLCQFVMENSQNAPLVHATLETLLRFLNWIPLGYIFETKLISTLIYKFLNVPMFRNVSLKCLTEIAGVSVSQYEEQFVTLFTLTMMQLKQMLPLNTNIRLAYSNGKDDEQNFIQNLSLFLCTFLKEHGQLIEKRLNLRETLMEALHYMLLVSEVEETEIFKICLEYWNHLAAELYRESPFSTSASPLLSGSQHFDVPPRRQLYLPVLSKVRLLMVSRMAKPEEVLVVENDQGEVVREFMKDTDSINLYKNMRETLVYLTHLDYVDTERIMTEKLHNQVNGTEWSWKNLNTLCWAIGSISGAMHEEDEKRFLVTVIKDLLGLCEQKRGKDNKAIIASNIMYIVGQYPRFLRAHWKFLKTVVNKLFEFMHETHDGVQDMACDTFIKIAQKCRRHFVQVQVGEVMPFIDEILNNINTIICDLQPQQVHTFYEAVGYMIGAQTDQTVQEHLIEKYMLLPNQVWDSIIQQATKNVDILKDPETVKQLGSILKTNVRACKAVGHPFVIQLGRIYLDMLNVYKCLSENISAAIQANGEMVTKQPLIRSMRTVKRETLKLISGWVSRSNDPQMVAENFVPPLLDAVLIDYQRNVPAAREPEVLSTMAIIVNKLGGHITAEIPQIFDAVFECTLNMINKDFEEYPEHRTNFFLLLQAVNSHCFPAFLAIPPAQFKLVLDSIIWAFKHTMRNVADTGLQILFTLLQNVAQEEAAAQSFYQTYFCEILQHIFSVVTDTSHTAGLTMHASILAYMFNLVEEGKISTPLNPGNPLNNQMFIQEYVANLLKSAFPHLQDAQVKLFVTGLFSLNQDIPAFKEHLRDFLVQIKEFAGEDTSDLFLEERETALRQAQEEKHKLQMSVPGILNPHEIPEEMCD	27939	67612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_28074_32708_32811_33925_33990_36366_36440_49863_49926_50153_50199_52215_52398_53286_53336_53414_53535_54721_54851_55791_55951_57925_58124_59042_59182_59387_59570_59652_59810_59886_60051_60343_60479_60822_61007_61334_61442_62886_63082_63906_64076_64619_64755_64835_64996_65085_65183_66572_66949_67003
898296	contig_6241_pilon	-	3887	6	Intergenic	novelGene_156400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	154.17340886158	525	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	282	1337	194495	182242	FALSE	30	GCAATTTGAATACCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYQKAAKGGGGAEAATQQPSYVYSCDPYTLAYYGYPYNALIGPNREYFVKGSIRGRGRGAAGNRAPGPRGSYLGGYSAGRGIYSRYHEGKGKQQEKGYELVPNLELSAVNPVAIKPGAVAIPAIGAQYPMFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365511	179691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193300_194092_194526_365102_365246_365403
898297	contig_4604_pilon	+	1482	6	Intergenic	novelGene_19114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	53.7639284278967	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	56	523	5641	35929	FALSE	40	TACCAACTGTGGGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSAVIAFGLWFRFGGTMKDLSSEDKSPEYFYVGLYVLVGAGALMMAVGFFGCCGAMRESQCVLGSAIRHVQTMYEEAYNDYLKDRGKGNGTLVTFHSTFQCCGKESSEQVQPTCPKELLGHKNCIDEIETIISVKLQLIGIVGIGIAGLTIFGMIFSMVLCCAIRNSRDVI	5585	36888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_5690_21252_21351_24239_24339_26061_26134_33236_33321_35863
898298	contig_11427_pilon	-	1858	9	Intergenic	novelGene_78993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	86.5260076508792	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	101	601	655701	597239	TRUE	20	TTTTTTACCTTGTATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSPASLASGLAARLSLGLRGAGRVRRGLARKMAGPAAGVGRLEEEALRRKERLKALREKTGRKDKEDGEPNTKQLREEEEEGEKHRELRLRNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAVEEKVKEQLEAAKPEPVIEEVDLANLAPRKPDWDLKRDVAKKLEKLEKRTQRAIAELIRERLKGQDDSLASAVDATAEQEACDSD	655883	591358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_592615_597237_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_623519_623588_655605_655781_655862
898300	SIRV6	+	789	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	757	480	-441	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	158	490	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1844	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898301	contig_17753_pilon	+	8836	2	Intergenic	novelGene_105067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	815	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1690	2145	48916	49371	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPAGSPAPLLKPATITELAITYTGALVPEVWWGGSLCGWGSEGSSEVLDLGCSGALVRLVSVSFLHQGARPPPPVHHAVARFLAALRTGPLRCVSFEPPGQLTLLESVPVWKAADSEGLYLDRALLCGVLTLTLTSGPLPNHKKQQETEK	47226	56269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_55755_55961
898302	contig_11117_pilon	+	4804	6	Intergenic	novelGene_148583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	192	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3937	4254	84833	85150	FALSE	45	GGATCAACAAAATTGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTVHHEDITIMNIYIPNNRCPKYLIETLTPLKRKIDSSTVIVGDFNTPLVVKDRTCRKKLNKDTEDLKTTVSQLEIIDI	74543	85700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_74830_75118_75749_75904_76222_76329_76425_76925_78167_83465
898303	contig_11422_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_98964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
898305	contig_19769_pilon	-	8928	5	Intergenic	novelGene_102240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.90512483795333	941	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	84	2033	47710	39200	TRUE	20	GCGGCTGATCACGAGACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLDSTIRTDNEQAYEEMDILKSELNGMRIKIPPQDFSLSPGFADTSDSEVLLENNQSSSPRLTVMNSLFQKNRLNKGTVMLKKTFTQNSQECNEVRSTGSLDCKLSENQRDTAEETAERCDGCGRSFRSISDIAVCWEVNKQKKLNKCQECQKKLSHCFQGKHQSNCQEEKPYECEECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFKCTDCGKAFRLSSKLIQHQRVHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLIRHQRTHTGERPYTCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHTGEKSQMSRTADNPSLAPHQRIHTVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYACNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLECGKAFSMSTQLTIHQRIHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWYYEYGHALESSFVSRKKVNTIKKLHKCNECEKIFRWRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFNRSSRLTHHQKSHMG	48851	30885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_30942_32360_41020_47196_47324_47707_47758_48815
898306	contig_15952_pilon	-	4090	7	Intergenic	novelGene_154060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	672	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTAGGCCCCGCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302230	251137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_251301_264360_264480_265882_266026_281484_281686_287390_287513_290815_291016_299088
898308	contig_7151_pilon	+	3094	2	Intergenic	novelGene_40782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34174	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	999	1337	529141	530205	FALSE	50	GGTTGAAGCAAAAAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFMPEYHVWVKWRPVQPLPLPFTVLICKSQEIGKLGIQKLNNKVLCKKDKIL	528142	531962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529337_530062
898309	contig_17074_pilon	-	2640	6	Intergenic	novelGene_145137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	82.9322615150461	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1141	1839	233824	227412	FALSE	30	AAGACTCAACTCTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGYSNRARKARLAEPQLQDYNDLPLFGRWQTEEFQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPVGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIICEEYKEVLLDAWEKEQALIEKKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKLRYGAKSEASLHTDAGGGLSSDEEEGTSSQAEAARILAASWPQNRETEDQTQKRSKKTRRGKKEAASHLFPFEKL	235627	226610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233610_233689_234210_234872
898310	contig_7022_pilon	+	4909	26	Intergenic	novelGene_142127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	151.216422388575	550	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1635	4905	4	4908	34270	198001	FALSE	30	GTATGTATCTAAGAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGHLFRAAGDQPFNLSTVSSAFPMVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQERERRRQHMMLMKAMEARKKAEEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYWILPQCGGIFVEGMESGEGLEEIAKEREKLKKAESIQIKEEMFETSGDILNCLNTDHCEQKEDLKEKDNTNLFLQKPGSFSKLSKLLEVAKMPPESDSMTPKPNGSANGCTMSYQNSGKHSLGSLQSTATQSNVEKTDSNNLFSPGSGGPGKFYSPLPSDQLLKTLTEKNRQWFSLLPRTPCDDTSLTHADVSAASLVAPQSQPPPKSPSPAPAPLLGSSSSQNPIGLNPFALSPLQIKSGVSMMGLQFCGWPTGVLTSNIPFTSSPLPNLGSGLGLSEGNGNSFLTPNAASSKSESPVPQNEKVSSTQPAAIEVVKPVDFLSPKPIPEEMQFGWWRIIDPEDLKALLKVLHLRGIREKALQKQIQKHLDYITQACIKNKD	34266	198002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_148267_148334_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477_174623_196293_196950_197399_197677_197846
898311	contig_2636_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_52039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCTACTTATCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15040	12338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_12300_15000
898312	contig_10609_pilon	+	8087	1	Intergenic	novelGene_123959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGTTGTCTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509508	517595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_509500_517600
898313	contig_16594_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_53879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTGACTAGAAGTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185239	182569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_182600_185200
898314	scaffold_19766_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_34355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCCCCTCAGCTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617424	619770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_617400_619800
898315	contig_4931_pilon	+	2149	4	Intergenic	novelGene_138355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	77.9757797153848	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	105	1238	212295	231692	FALSE	15	CCTATTTTCATGTACTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS	199140	232603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_199227_212276_212521_228217_228931_231497
898316	contig_15039_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_110167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCGCAATACCTCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331404	329092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_329100_331400
898318	contig_9471_pilon	-	1315	2	Intergenic	novelGene_21696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAATACCTCTTTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66416	65030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_66008_66078
898319	contig_1596_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_131585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84676	83495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_83500_84700
898320	contig_11656_pilon	+	2067	12	Intergenic	novelGene_54010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	182.812915253466	11	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	152	1279	465719	536565	FALSE	30	AAAATTGTCTCTATCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGK	464953	537353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_536562
898321	contig_3956_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_14702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	732	1193	48016	47555	TRUE	25	TTAAAGTGGTTATTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPLWKMIWRFLRKLQTEIPYNPASPLLGIYPREIRAITQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWVNKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSRKDKYCETSIVKTHEKVYTQKVTTFVGYEGWEGWGRNTK	48747	31992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_32222_46704
898322	contig_13868_pilon	-	3729	7	Intergenic	novelGene_172650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.750084860799	603	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	125	874	98723	74161	TRUE	75	AAAAAAGAAAGAAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAGRGARGPWLWDARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKMKDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEAAIKFSGFDEKMFLKRGGKYVWSKADLKLDW	98847	69327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_71839_73816_74326_76205_76239_80320_80471_82044_82275_84692_84855_98713
898323	contig_935_pilon	-	5661	12	Intergenic	novelGene_45570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	220.469071686366	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1102	3309	86	3394	630665	601886	TRUE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTIDIKSLSVEKYDVSSQVISQLKQKLENLQNSNLPKSFRVPYDPGLKAGALVIEKCKVMASKKKPLWLEFKCADPTALSKETIGIIFKHGDDLRQDMLILQILRIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTGAFKDEILNHWLKERCPLEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNLFHIDFGHILGNYKSFLGINKERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSPYFQKFQDVCARAYLALRHHTNLLIILFSMMLMTGMPQLTSKEDIEYIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGWTVQFNWFLHLVLGIKHGEKHSA	632598	598973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_599781_600425_602165_614773_614932_615751_615864_617065_617197_618196_618288_619758_619906_621790_621895_623339_623566_623677_623744_628670_630678_632525
898324	contig_10904_pilon	-	2953	8	Intergenic	novelGene_22514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	341.385352913205	30	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	194	553	354123	352112	TRUE	40	CCAAGACAAACACCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	354622	345623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_348863_349527_349624_349922_350113_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560
898326	contig_8210_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_30248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAACTACTTCCGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49254	51545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_49300_51500
898327	contig_2892_pilon	-	3546	7	Intergenic	novelGene_118974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	69.3992074882703	253	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	21	530	187823	12538	FALSE	70	CAGAACAAAAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAGAAMEVYIPSFRYEESDLERGYTVFKIEVLMNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASDCPNVVIEGVLHGIFYPHVQPR	187843	9521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_187763
898328	contig_10930_pilon	-	2454	8	Intergenic	novelGene_36988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1643.30593869896	97	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	131	1510	280211	268321	FALSE	20	ATCACTTACTGTGCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLIIRFPHSL	280341	267376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268345_268435_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
898329	contig_826_pilon	-	2834	3	Intergenic	novelGene_154939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	401	junction_1	86.5	465	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1038	1673	328453	319233	FALSE	55	TCCTATGTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFTSSSTGGLSSSQSSYSPSNREAMDPIAELLSQLSGVRRSAGGQLNSSGPSASQLQQLQMQLQLERQHAQAARQQLETARNATRRTNTSSVTTTITQSTATTNTANTESSQQTTQNSQFLLTRLNDPKMSETERQSMESERADRSLFVQELLLSTLVREESSSSDEDERGEMADFGAMGCVDIMPLDVALENLNLKESNKGNEPPPPPL	329490	318071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_319495_325975_326259_328362
898330	contig_11281_pilon	+	4401	1	Intergenic	novelGene_125493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	520	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGCCTTCCCATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918272	922673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_918300_922700
898331	contig_6137_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_59275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	313	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	384	782	1339458	1339856	NA	35	TATCTTGAATTTAATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISNIESYSRDRLPGVSIQLYHLPAVTWERLLLLNHSVPHFPQSLPSLPTTSFCDFTLLCTPIELNSQYHLFEAYRILFFFLVYVMSLQLKYQLLKDRENIFYVLRDSCNALRIVGIQQIFVCTFDNCTV	1339074	1341131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1339100_1341100
898332	contig_935_pilon	+	8997	11	Intergenic	novelGene_45568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	887	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	7750	8211	629499	629960	TRUE	15	AACCTACCCCGTGTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVCLHKNCEVSVPGQDRDVNASDLHSELPVTVPQGHGEHTLMVLPMDGQLLMVASYSGAVIHKGPLFLPHLVQSWVRRSVKHQMNLFSILEAMPHPLEVFDGRFTHQIFIPATDAQHKILLALAFRDIHQRLLLGHLGEEALEDGVWGVIG	596279	632960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_602164_614772_614931_615750_615864_617065_617196_618195_618288_619758_619908_621791_621897_623341_623566_623677_623743_628669_630676_632889
898333	contig_15327_pilon	+	1880	11	Intergenic	novelGene_70581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	137.767194934063	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	195	788	836751	843400	TRUE	35	ATAAAACTCCGTAAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDDFSRLGGDEDGYEEEDDENSRQSEDDDSETEKPEADDPKDNAEIEKRDPQELVASFSERVRNMSPDEIKIPPEPPGRCSNHLQDKIQKLYERKIKEGMDMNYIIQRKKEFRNPSIYEKLIQFCAIDELGTNYPKDMFDPHGWSEDSYYEALAKAQKIEMDKLEKAKKERTKIEFVTGTKKGTTTNATATTTTTASTAVADAQKRKSKWDSAIPVTTIAQPTILTTTATLPAVVTVTTSASGSKTTVISAVGTIVKKAKQ	809902	844845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_809980_812492_812541_831760_831804_836724_836814_839110_839203_840064_840126_840599_840652_841633_841693_842872_842958_843218_844190_844542
898334	contig_15327_pilon	+	3136	9	Intergenic	novelGene_70410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	180.878369008016	50	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	25	351	25249	28991	TRUE	10	CGCCCCCTGCTTCTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYLSSRDMPGTPGAAATQDGEAPGRSPPCSQSYDLTGKVMLLGDSGVGKSCFLLRFKDGAFLSGTFIATVGIDFRVRCCRLLLPQPAGAQVTGVLPLQLLRTPVTRRLGGTKMLP	25224	34381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25342_28757_29943_30443_30511_30605_30659_31691_31758_32351_32409_32488_32566_32747_33337_33456
898335	contig_5515_pilon	-	3879	5	Intergenic	novelGene_52318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_4	114.702604591177	21	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2352	2951	60874	59717	FALSE	35	ATCAGAAATGACTGCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLERPLPAQDLFDYITEQGPLGEGRSRCLFAQVVAAVRHCHACGVVHRDIKDENILMDLRRGCVKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFERDQEILEAELHFPDHVSPDCCALIRRCLAPKPSARPSLEEILLDPWMQTPAEDAPLSTPKGDPTPLAWSLLP	64028	58788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_59881_59978_60156_60615_62882_63556_63668_63795
898336	contig_18096_pilon	+	2793	14	Intergenic	novelGene_58029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	649.161288662706	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	74	1786	40382	76634	TRUE	15	TCAATGAGCCCTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40308	79119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77090_78567
898337	contig_8620_pilon	+	4436	13	Intergenic	novelGene_173878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	133.218075183346	643	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	349	1677	117668	169521	FALSE	20	TTTCTTTCACACCCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPDQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEFKKASEDDIKKMPLDLSPLATPIIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKEVPLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNVLLTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQAPSSNRPIVPVPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPASITSSNVHVPATVPLVRPVTMVPSVPGIPGPSSPQPVQSEAKMRLKAALTQQHPPVTNGDTVKSHSSGLVRTQSEESRPQSLQQPATSTTETPASPAHTAPQTQNTSGRRRRAANEDPDEKRRKFLERNRAAASRCRQKRKVWVQSLEKKAEDLSSLNGQLQSEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTAMQKKSGYHTADKDDSSEDISVPSSPHGEAIQHSSVSTSNGVSSTSKAEAVATSVLTQMADQSTEPALSQIVMAPSSQSQPSGS	82126	172280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_82239_95446_95548_103846_103922_117607_117678_129109_129229_129388_129518_133511_133691_134326_134442_136639_136727_149880_150031_155160_155368_166442_166549_169294
898338	contig_16322_pilon	-	1892	3	Intergenic	novelGene_87565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	27.5	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	78	452	213230	170585	FALSE	30	ACTGCAGTTTTGTTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIAETKPAVKAAGPDALANPLQLAPMNSLATSVFSIAIPVDGDEDSASGGGVVAIDNKIEQAMDLVKSHLMYAVREEVEVLKEQIKELVERNSLLERENALLKSLSNSDQLSQLPAQQANLGSTSQQPAVIAQPPQPTQPPQQPNVSSA	213307	169144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_170846_171876_171929_213168
898339	contig_7009_pilon	+	3972	1	Intergenic	novelGene_23667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAACTACAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521377	525349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_521400_525300
898340	contig_12379_pilon	+	3292	9	Intergenic	novelGene_148924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_7	170.702958380926	21	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	37	1041	44750	110292	FALSE	50	GCAGCAAAACATAATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHDVSFDFHGRRMATCSSDQSVKVWDKSENGDWHCTASWKTHSGSVWRVTWAHPEFGQVLASCSFDRTAAVWEEIVGESNDKLRGQSHWVKRTTLVDSRTSVTDVKFAPKHMGLMLATCSADGIVRIYEAPDVMNLSQWSLQHEISCKLSCSCISWNPSSSRAHSPMIAVGSDDSSPNAMAKVQIFEYNENTRKYAKAETLMTVTDPVHDIAFAPNLGRSFHILAVATKDVRIFTLKPVRKELTSSGGPTKFEIHIVAQFDNHNSQVWRVSWNITGTVLASSGDDGCVRLWKANYMDNWKCTGILKGNGSPVSGNSQQGNSNPSLGSNIPNLQNSLNGSSAGRKHS	44713	112543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_+_44783_75543_75595_78685_78833_79025_79238_99540_99640_105779_105921_106144_106303_108817_108969_110279
898341	contig_3155_pilon	+	4296	3	Intergenic	novelGene_26452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3624	3956	376459	376791	FALSE	25	CCACCCCACTGGGCACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVLGLVLTLRWERQSSPAWHWASSPAVSNAHVFMVIELLLGARVGGQRAWTSYFSGDTALVRVCAMAARQSDQTVKCVGNFIPLWTAEISDYGSEAFFPPFPTELNIA	361283	377131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_361394_366403_366555_373096
898342	contig_12948_pilon	-	3616	1	Intergenic	novelGene_126217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3103	3429	277597	277271	NA	40	GAACAACAACCTATTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNIQNMNQGKLEVIKNEVERLKIDVIGFSELKWTGISYFELDNHMVCYAGNEKLKRNGIAFIIKKNISRSILKYSTVSDRIISIRLQGRPVNTTIIQIYAPASNAKE	280699	277083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_277100_280700
898343	contig_13295_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_31249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCATCTGAAGGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123756	120451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_120500_123800
898344	contig_14687_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_107911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2075	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGAACTGTCCCATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441764	439494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_439500_441800
898345	contig_14704_pilon	-	875	8	Intergenic	novelGene_82703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	197	junction_7	296.436385439178	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	63	812	116413	77600	FALSE	40	CATAAATTTATTTTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSAALRAGAAGLTAPWGRHIRNLHKTVVQNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILEAIQRKLGIKAGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGIQAGL	116475	77536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_77694_85371_85449_91385_91496_92429_92599_99008_99126_99216_99280_100845_100912_116359
898346	contig_12050_pilon	-	3912	17	Intergenic	novelGene_62616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	585	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAACCACCGCCGACGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356768	321294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_321339_322362_322399_323512_323595_334038_334175_334707_334956_340482_340567_341362_341420_342202_342254_342344_342421_345187_345286_347184_347367_348910_349021_349697_349797_350554_350719_350994_351178_351507_351631_354629
898347	contig_16303_pilon	-	3754	8	Intergenic	novelGene_34043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	1676	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	130	1221	45428	35759	TRUE	25	GTCTTCAGACATGATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45557	32070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33871_35025_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
898348	contig_6842_pilon	+	5834	9	Intergenic	novelGene_130723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	67.4081551075239	511	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	55	1269	501077	524589	FALSE	30	CCCCAGCAGTTCTAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARGAEAPAACRCSGASSMEAGEEPLLLAELKPGRPHQFDWKSSCETWSVAFSPDGSWFAWSQGHCIVKLIPWPLEEQFIPKGFEAKSRSSKNDPKGRGSPKEKTLDCGQIVWGLAFSPWPSPPSRRLWARHHPQVPDVSCLILATGLNDGQIKIWEVQTGLQLLNLSGHQDVVRDLSFTPSGSLILVSASRDKTLRIWDLNKHGKQIQVLTGHLQWVYCCSISPDCSMLCSAAGEKSVFLWSMRSYTLIRKLEGHQSSVVSCDFSPDSALLVTASYDTNVIMWDPYTGERLRSLHHTQLDTPMDDSDVHISSLRSVCFSPEGLYLATVADDRLLRIWALELKTPIAFAPMTNGLCCTFFPHGGVIATGTRDGHVQFWTAPRVLSSLKHLCRKALRSFLTTYQVLALPIPKKMKEFLTYRTF	501022	529154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_501090_509073_509243_512079_512325_512486_512619_521127_521229_522593_522767_523490_523602_523723_523832_524426
898349	contig_8898_pilon	+	7405	15	Intergenic	novelGene_137246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	524	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5665	6015	321757	323554	TRUE	10	ATGTGTCCGTCCGCCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERICNARSKLLFHPANHDTIQQDRVTFTVQSMWSSINWSDPCKLQSKAGIDVVYTNCVTTSHTAVKWFIRPQGSPSGVCTGQRKPQDSGSSLRTVVVLILAKSAPLCTQRKWER	302199	339803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_307077_307578_307836_308485_308677_309914_310077_310677_310851_321752_321888_323334_323614_324401_324575_329144_329318_330365_330595_331381_331508_333077_333217_334680_334828_335584_335753_339627
898350	contig_10068_pilon	-	6287	1	Intergenic	novelGene_148699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	610	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2372	2680	42803	42495	NA	40	ACAGGCTCAGGCATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSILGYIILRGNEDNIQHRCDSGAQHRILTHRPTHQSCPQWAFSSGGCVLISFALVSSFSFNIVLLFKRGYILWRMLVGLDQFPFPPLYTHLSGPYLMLRD	45174	38887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_38900_45200
898351	contig_7898_pilon	-	2166	5	Intergenic	novelGene_47548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	448.896633424667	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	133	498	293293	292088	TRUE	5	CCTGTGCTAGTGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPNWKPHLPGHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	302406	290165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_290528_290781_292355_293194_293344_293488_293538_302373
898352	contig_15518_pilon	+	2571	4	Intergenic	novelGene_127593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	126.323218592449	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	585	1040	15096	38055	FALSE	70	GAAATGAAAAAAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPAPSFLL	11046	39586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_38035
898353	contig_15543_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_164346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCAGCTATGTGCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56370	53738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_53700_56400
898355	contig_5602_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_133029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACCCAGCGCTCTGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542180	543329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_542200_543300
898356	contig_7321_pilon	+	2149	8	Intergenic	novelGene_53129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCCCACAAGGCGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152416	208390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_152958_153057_153074_174977_175899_183966_184155_186240_186353_203989_204076_207653_207860_208311
898357	contig_14516_pilon	+	2733	20	Intergenic	novelGene_153881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	96.0817691926577	75	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	571	2568	34682	422609	TRUE	55	GTTATCAGAAAACAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	32028	422953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_34643_34736_36343_36417_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472_422614_422792
898358	contig_20058_pilon	-	2458	11	Intergenic	novelGene_109278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_5	626.826642701154	398	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	71	1837	59150	30516	TRUE	15	TCTTGCCCTTGATTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAAAPAAGGSAGGGGGGRGRRKMADGVDHIDIYADVGEEFNQEAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPGNLIKHLVKGTRPLFLETRIPWHMGHSIEEIPIFGLKAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59220	23257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_23874_30510_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40135_40247_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540_49751_59090
898359	scaffold_13609_pilon	+	11362	61	Intergenic	novelGene_124413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	57	junction_43	132.612898442547	774	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3007	9024	1815	10838	647262	707591	FALSE	25	CTCACTCTTCACAATGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEDQMMRAIAMSLGQDIPMDQRAESPEEIACRKEEEERKAREKQEEEEAKCLEKFQDADPLEQDELHTFTDTMLPGCFHLLDELPDTVYRVCDLIMTAIKRNGADYRDMILKQVVNQVWEAADVLIKAALPLTTSDTKTVSEWISQMATLPQASNLATRILLLTLLFEELKLPCAWVVESSGILNVLIKLLEVVQPCLQAAKEQKEVQTPKWITPVLLLIDFYEKTAISSKRRAQMTKYLQSNSNNWRWFDDRSGRWCSYSASNNSTIDSAWKSGETSVRFTAGRRRYTVQFTTMVQVNEETGNRRPVMLTLLRVPRLNKNSKSSNGQELEKTLEESKEMDIKRKENKASDTPLALESTNTEKETSLEETKVGEILIQGLTEDMVTVLIRACVSMLGVPVDPDTLHATLRLCLRLTRDHKYAMMFAELKSTRMILNLTQSSGFNGFTPLVTLLLRHIIEDPCTLRHTMEKVVRSAATSGAGSTTSGVVSGSLGSREINYILRVLGPAACRNPDIFTEVANCCIRIALPAPRGSGTASDDEFENLRIKGPNAVQLVKTTPLKPSPLPVIPDTIKEVIYDMLNALAAYHAPEEADKSDPKPGVMTQEVGQLLQDMGDDVYQQYRSLTRQGSDFDTQSGFSINSQVFAADGASAETSTSGTSQGEASTPEESRDGKKDKEGDRASEEGKQKGKGSKPLMPTSTILRLLAELVRSYVGIATLIANYSYTVGQSELIKEDCSVLAFVLDHLLPHTQNAEDKDTPALARLFLASLAAAGSGTDAQVALVNEVKAALGRALAMAESTEKHARLQAVMCIISTIMESCPSTSSFYSSATAKTQHNGMNNIIRLFLKKGLVNDLARVPHSLDLSSPNMANTVNAALKPLETLSRIVNQPSSLFGSKSASSKSKSEQDAQGASQDSNSNQQDPGEPGEAEVQEEDHDVTQTEVADGDIMDGEAETDSVVIAGQPEVLSSQEMQVENELEDLIDELLERDGGSGNSTIIVSRSGEDESQEDVLMDEAPSNLSQASTLQANREDSMNILDPEDEEEHTQEEDSSGSNEDEDDSQDEEEEEEEDEEDDQEDDEGEEGDEDDDDDGSEMELDEDYPDMNASPLVRFERFDREDDLIIEFDNMFSSATDIPPSPGNIPTTHPLMVRHADHSSLTLGSGSSTTRLTQGIGRSQRTLRQLTANTGHTIHVHYPGNRQPNPPLILQRLLGPSAAADILQLSSSLPLQSRGRARLLVGNDDVHIIARSDDELLDDFFHDQSTATSQAGTLSSIPTALTRWTEECKVLDAESMHDCVSVVKVPIVNHLEFLRDEELEERREKRRKQLAEEETKMSDKGKEDKENRDQSAQCTASKTNDSTEQNLSDGTPMPDSYPTTPSSTDAATSESKETLVTLQPSQQQPTLPPPPALGEIPQELQSPAGEGESSTQLLMPVEPEELGPTRPSGEAETTQMELSPAPTITSLSPERAEDSDALTAVSSQLEGSPMDTSSLASCTLEEAVGDTSAAGSSEQPTAGSTTPGDAPPVVAEVQGRGDGSGEPAQPPEDSSPPASSESSSTRDSAVAISGADSRGILEEPLPSTSSEEEDPLAGISLPEGVDPSFLAALPDDIRREVLQNQLGIRPPTRTAPSTTSSAPTVVGNPGVTEVSPEFLAALPPAIQEEVLAQQRAEQQRRELAQSASSDSPMDPVTFIQTLPSDLRRSVLEDMEDSVLAVMPPDIAAEAQALRREQEARQRQLMHERLFGHSSTSALSAILRSPAFTSRLSGNRGVQYTRLAVQRGGTFQMGGSSSHNRPSGSNVDTLLRLRGRLLLDHEALSCLLVLLFVDEPKLNTSRLHRVLRNLCYHAQTRHWVIRSLLSILQRSSESELCIETPKLTTTEEKGKKSSKSCGSSSHENRPLDLLHKMESKSSNQLSWLSVSMDAALGCRTNIFQIQRSGGRKHTEKHASSGSTVHIHPQAAPVVCRHVLDTLIQLAKVFPSHFTQQRTKETNCESDRERGSKQACSPCSSQSPSSGICTDFWDLLVKLDNMNVSRKGKNSVKSVPVSAGGEGETSPYSLEASPLGQLMNMLSHPVIRRSSLLTEKLLRLLSLISIALPENKVSEAQANSGSSASSTTTATSTTTTTTTTAAATTPTPPATTTPVTSAPALVAATAISTIAVAASTTVTTPTTATTTVSTSTTTKGSKSPAKVGDGGSSSTDFKMVSSGLTENQLQLSVEVLTSHSCSEEGLEDAANVLLQLSRGDPGTRDTVLKLLLNGARHLGYTLCKQIGTLLAELREYNLEQQRRAQCETLSPDGLPEEQPQTTKLKGKMQSRFDMAENVVIVASQKRPLGGRELQLPSMSMLTSKTSTQKFFLRVLQVIIQLRDDTRRANKKAKQTGRLGSSGLGSASSIQAAVRQLEAEADAIIQMVREGQRARRQQQAATSESSQSEASVRREESPMDVDQPSPSAQDTQSIGSDGTPQGEKEKEERPPELPLLSEQLSLDELWDMLGECLKELEESHDQHAVLVLQPAVEAFFLVHATERESKPPVRDTRESQLAHIKDEPPPLSPAPLTPATPSSLDPFFSREPSSMHISSSLPPDTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSHCNPNHLSYFKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLVYLLENDVSTLGYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLKPNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELLISGLPTIDIDDLKSNTEYHKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQECSEGFGLA	633404	708115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_633433_634426_634604_636175_636422_638151_638286_638734_638830_641829_642022_643330_643548_643881_644005_644419_644658_645059_645291_646627_646752_647252_647349_647957_648228_649122_649276_652317_652446_652665_652748_653368_653546_653843_654004_654514_654874_657577_657774_659374_659543_660457_660604_661021_661089_662471_662687_674314_674527_674974_675158_678258_678432_678779_678929_679662_679739_680558_680658_681216_681351_681536_681706_683077_683307_684170_684350_684626_684717_684867_685023_686252_686299_688094_688383_689382_689639_689829_689961_690482_690698_690773_691063_691223_691327_692359_692907_693558_694163_694886_695009_695120_695278_696489_696623_696862_697066_697633_697762_699036_699134_700772_700929_701683_701930_702286_702405_703031_703173_704215_704504_704633_704740_705380_705499_705813_705996_706311_706503_707488
898360	contig_19012_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_159499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCACAACACTCCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122600	124728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_122600_124700
898361	contig_4496_pilon	-	3051	6	Intergenic	novelGene_66685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.8	12	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998411	911078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_911829_941357_941485_951023_951146_952442_952526_996159_996280_996562
898362	contig_9668_pilon	+	2042	2	Intergenic	novelGene_58212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	283	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCACATATGCATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533951	581736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_533989_579731
898363	contig_8322_pilon	+	2755	16	Intergenic	novelGene_143235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	358.454360956718	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	97	1419	285136	300333	TRUE	15	CTGATTATCCTTGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTAEEGNNQEGGARRFLCGVVEGFYGRPWVMEQRKELFRRLQKWELNTYLYAPKDDYKHRMFWREMYSVEEAEQLMTLISAAREYEIEFIYAISPGLDITFSNPKEVSILKRKLDQVSQFGCRSFALLFDDIDHNMCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSKPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLAFAAN	280585	305366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_280623_281119_281156_285112_285165_285606_285705_287392_287524_290053_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294917_295076_295472_295648_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
898364	contig_10861_pilon	+	1804	9	Intergenic	novelGene_39303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	168.583760709625	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	20	1333	1437804	1454668	FALSE	15	TTTAATCCCTTTGATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437784	1455139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1445010_1447273_1447380_1451750_1451818_1451898_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
898365	contig_5423_pilon	+	4256	3	Intergenic	novelGene_85170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCAGTACTGAAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107320	181793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_107668_111452_114127_180558
898366	contig_18055_pilon	+	2616	22	Intergenic	novelGene_117813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	383.621630719066	7	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1932	684	2615	77213	95106	FALSE	45	AGAGGAGACATAAATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKEEEEEKQKSLLRERRRQRKNRESFQIFLDELHEHGQLHSMSSWMELYPTISSDIRFTNMLGQPVFSLGSTALDLFKFYVEDLKARYHDEKKIIKDILKDKGFVVEVNTTFEDFVAVISSTKRSTTLDAGNIKLAFNSLLEKAEAREREREKEEARKMKRKESAFKSMLKQAAPPIELDAVWEDIRERFVKEPAFEDITLESERKRIFKDFMHVLEHECQHHHSKNKKHSKKSKKHHRKRSRSRSGSDSDDDDSHSKKKRQRSESRSASEHSSSAESERSYKKSKKHKKKSK	40661	95107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40863_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571_85706_90730_90846_91000_91105_91211_91329_91842_91981_92274_92371_94711_94799_94881_94979_95062
898367	contig_10377_pilon	+	4416	9	Intergenic	novelGene_115378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	739.05277213471	12	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	216	839	219517	255047	TRUE	10	GTCTGATTCTGATGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKRHRWFRTVDWEGVPNRRLKPPHRAQSDL	209068	261753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_257532_258960
898368	contig_14970_pilon	+	1964	7	Intergenic	novelGene_44987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_6	7072.36298716506	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	127	1074	136145	207836	FALSE	70	AAAGAAGATAAATCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTVTTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMGNNL	136018	208726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_196136_196257_207681
898369	contig_14516_pilon	+	2980	21	Intergenic	novelGene_153880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	108.807812219528	364	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	757	2637	148477	422609	TRUE	70	TCGAAAAAAAAAAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMQKGKDVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERSSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	32012	423131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_34643_34736_36343_36417_148433_148499_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418336_421549_421780_422472_422614_422792
898370	contig_15353_pilon	+	3600	2	Intergenic	novelGene_151991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1094	junction_1	0	59	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATTATTAAACATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534243	537923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_534365_534444
898371	scaffold_13505_pilon	-	2829	7	Intergenic	novelGene_111509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	479.51816093519	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	30	1016	603235	595273	TRUE	20	CATTCTCGCCTGGATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603264	588505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588957_590155_590259_594013_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
898372	contig_11378_pilon	+	8473	15	Intergenic	novelGene_112216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_4	140.618767435581	814	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	625	1746	294294	334255	FALSE	25	CGTTGAATTCAAGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAASSLLCRLAAEEQETDVEYVRSVVATLEREFSKEISSGLVEVISPPESYYPDLTTLRETFGDSKERVRWRTKQNLDYCFLMMFAQEKGTYYIQLEDDIIVKQNYFNTIKNFALQLSSEEWMILEFSQLGFIGKMFQAPDLTLIIEFIFMFYKEKPIDWLLDHILWVKVCNPEKDAKHCERQKANLRIRFRPSLFQHVGLHSSLTGKIQKLTDKDYMKPLLLKIHVNPPAEVSTSLKVYQGHTLEKTYMGEDFFWAITPTAGDYILFKFDKPVNVESYLFHSGNQEHPGDILLNTTVEVLPFKSEGLEINKETKDKQLEDGYFRIGKFENGVAEGMVDPNLNPISAFRLSVIQNSAVWAILNEIHIKKASN	258348	340982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_258383_263195_263528_291897_292066_294203_294345_307115_307163_309082_309197_310018_310095_314822_314938_316246_316378_320448_320557_320679_320874_324159_324239_324904_324972_333988_334102_334228
898374	contig_14450_pilon	-	3916	4	Intergenic	novelGene_48940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	433	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAGGAGAAATATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523281	517810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_520978_521521_521719_522076_522507_523159
898375	contig_14563_pilon	-	7172	1	Intergenic	novelGene_135056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	663	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGATTATCAGTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153066	145894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_145900_153100
898376	contig_10627_pilon	-	6830	36	Intergenic	novelGene_59958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	181.911559583783	839	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	1014	2525	190165	180958	TRUE	40	AGGGAAAAGGTCGGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENTDRGNNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTGSAQQGHNSPDSPPRQCCQEHTRLWQYWEHQQCSSDLPFCWSPRSQQHSSRE	218214	172705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_172800_172970_173077_173554_173634_174245_174346_174429_174626_174708_174823_174938_175045_175127_175228_175457_175538_175629_175782_175916_176052_177070_177254_177414_177536_177620_177891_178136_178220_178307_178415_178514_178699_178781_178877_178957_181231_182484_182587_183788_183900_185313_185541_186296_186574_187310_187409_187937_187986_188571_188672_189224_189354_190018_190196_191051_191174_192804_192910_196550_196701_197548_197586_199009_199072_200796_200948_203338_203575_218094
898377	contig_9332_pilon	-	3696	10	Intergenic	novelGene_60700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	432.372381799774	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	206	868	76565	66064	TRUE	10	GGCATGTTGTCTATTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFNGEKQCVGEDQPSDSDSSQFSESMASLSDYECSRQSFTSDSSSKSNSPASTSPPRVVTFDEVMATARNLSNMTLAHEIAVNENFQLKQDALPENSRSLAGRVKHIVHQAFWDVLESELNAEPPEYEHAIKLFEEIREILLSFLTPGGNRLRNQICEVLDTDLIRQQAEHSAVDIQGLANYVISTMGKLCAPVRDDDIRELKATSNIVEVLRHGQFYN	86307	39549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_41755_53718_53892_55663_55846_56053_56242_65983_66086_68156_68378_69415_69543_73753_73890_76408_76601_86137
898378	contig_10973_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_150311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
898379	contig_13542_pilon	+	2340	14	Intergenic	novelGene_131575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	199.555511993189	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	936	2009	739692	753556	FALSE	40	TTGAAAAAGAAGGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVALEEMENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFATCLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDMKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTTRATSREEKNLQGFLEQPKEKWVESAFEVDGPHYFTVLALHILPPEKWRPIRVEILQRLLVTSQARAVAPGGATRLTDKTMKDYSAYRSSLLFWALVDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPISEAADKALKTFQEEFMPVETFSEFLDAAGLLSEINDPESFLKDLLNSIP	734152	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_734229_734972_735164_735629_735804_736742_736843_738267_738487_739431_739559_739643_739758_740763_740907_741377_741504_742661_742857_745740_745966_749174_749266_749994_750158_753491
898380	contig_12622_pilon	+	12826	23	Intergenic	novelGene_5756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	922	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	8906	9205	80250	83313	TRUE	15	GCTGTGGAGGGGATGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQLSAALGNHLGIEKALLRLHHGPQHRSTPSSGIFHFHFKCLTALIQKLLALQSLLKLHPKLLGGVCPGSHDVGPRMHSLERKTALLAHLIHHRVKR	69856	194583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_78269_78578_78721_79079_79252_80070_80307_81625_81719_83163_83457_88913_89086_90302_90430_90531_90788_91168_91372_92347_92486_93418_94287_94457_94852_95807_95956_96242_96383_99903_100007_100175_100365_100739_100912_102622_102726_103190_103365_104264_104370_125265_125348_194479
898381	contig_17440_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_7568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAACATCACCTCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431	2242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2200
898382	contig_9903_pilon	-	1595	4	Intergenic	novelGene_172011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	58.3571380000387	25	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	116	451	106166	82602	FALSE	15	TGTTGTATTTGCTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCEKAMELIRELHHTPEGQLPAFNMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106281	81457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_106091
898383	contig_16125_pilon	-	2197	5	Intergenic	novelGene_155239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	495	junction_4	133.222323579796	5	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1454	1840	135765	117592	FALSE	70	ATGGAAGAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVLCVFCHPSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	137218	117234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630
898384	contig_5871_pilon	+	617	5	Intergenic	novelGene_160174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAACAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311846	342995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_+_311940_332312_332427_338471_338542_339568_339653_342739
898385	contig_3161_pilon	+	4612	1	Intergenic	novelGene_84510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2432	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGCACTGTTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360986	365598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_361000_365600
898386	contig_17108_pilon	-	5585	8	Intergenic	novelGene_109500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_2	191.743876788059	555	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1305	3918	80	3997	32324	16771	FALSE	50	TTAAAAAATAGTAGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPKEDHLVAEVNYSATKDEQIPPDTMALENSREVIQRQQSNTDILSEPAALSIISNMNNSPFDLCHVLLSLLEKVCKFDMTLNHNSALAASVVPTLTEFLAGFGDCCNLSDSLENHVVSAGWTEEPVALIQRMLFRTVLHLMSVDISTAEMMPESLRKNLTELLRAALKIRTCLEKQPDPFAPRQKKTLQEVREDFVFSKYRHRTLLLPELLEGVLQILICCLQSAASNPFYFSQAMDLLQEFIQHHGFNLFETAILQMEWLVLRDGVPTEASEHLKALIKGVMKIISTVKKVKSEQLHHSVCTRKRHRRCEYSHFMHHHRDLSGLPVSAFKNQVSKNPFEETAYGDVYYPERCCCIAVCTHQCLHLLQQVSLSSTCVQILSGVHSVGICCCMDPKSIIIPLLHAFKLPALKHFQQHILNILNRFILDQLGGAEMSQKIKKAACNICTVDCDQLAKLEETLQRNACDAEPSSGLSSPSYRCQGILPSSGSEDMLWKWDALEAYQNFVFEDDRLHSIQIANHICNLIQKGNVFVQWKLYNYIFNLVLQRAVELARHCQHLNITTARTHVCSHHSQCLPQEVLQIYLKTLPTLLKSRIIRDLFLSCNGVNQIIELNYLDGIRSHSLKAFETLIISLGEQQKDASIPGTDGLDSEQKESSFFNVGTPFNNQQVYSDSPQSLSKFYTGLKDAYPKKWKTVNQDVHINTINLFLCVAFLCVSKEAESDRDSANDSEDTSGYDSTASEPLSHMLPSLSVESLALPSPEHMHQAADIWSMCRWIYMLSSVFQKQFYRLGGFRVCHKLIFMIIQKLFRSHEERHEKKQEGINVNESQDLSRTQSEIAMEEDLLSLTVKSDPTPSELGSLRKSADGLGKLESQKISPTNVEQISATKAAPEEAKVFMSQENETSLQSIRLLEALLAICLHSARTSQQKMELELPNQSLSVENILLEMRDHLSQSKVVETELAKPLFDALLRVALGNHSVDFEHNDATTEKSHQPEELSSQPHDFSEEAEDSQCYSFKLLGEEEGYEADSESNPEDSESQDNGIDLKSEAEGFSASSCPNDFLENLTQGEIIYPEICMLELNLLSSGNAKLDVLTHVFESFLKVIRQKEKNIFLLMQQGTVKNLLGGFLSILIQADSDFQACQRVLVDLLVSLMSSRTCSEDLTLLLRIFLEKSPCTEILLLGIVKIVETDISVSPSQYLSFPLLHTPNVSNGVSSQKCPGILNSKAVALLRRARVSRSKKKTDSENFPHQLLSSWHIAPVLLPLLGQNCWPHLAEGFSVSLWFNVECIHGTESPIEKGKKMKKRNKSTVVWDSSFDGTGMMTEPPVLYT	32403	15182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_17233_19658_19769_21821_21889_22408_22636_24144_24299_25751_25914_27623_28651_30615
898387	contig_8354_pilon	+	1890	3	Intergenic	novelGene_24157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGACTTACTCATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560966	570221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_561218_566354_566984_569211
898388	contig_12250_pilon	+	3286	15	Intergenic	novelGene_80563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	130.074625362771	362	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	388	2514	291174	304188	FALSE	65	TAAACAATTGCAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVTGVNLLSSHSDQNRQEHHTDEFEYDELIVRRGQPFHIVLFLSRPYESSDHIALELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKGGSGGWKAQVTKANGQNLNLRVHTSPNSIIGKFQFTVRTRSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDREDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPISVSRVVSAMVNSLDDNGVLIGNWSGEYSQGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTSFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLITTKAIGSNMRDDITHLYKHPEGSEAERKAVETAAAHGSKPNVYAMSNSAEDVVVQVETQDPVMGQDLTVCVVLSNRGSSHRTVNLHLYLSVTFYTGVTGPVFKDSKKEAVLAPGASERVVMPVAYQEYRSHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFRNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQTFVPVRPGPRQLIASLDSPQISQVHGVIQVDVAPASGGRGFSDTGGDSHSGETIPMASRGGA	289952	304960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_290079_290781_291038_291168_291358_292372_292622_292986_293106_293244_293353_293767_293943_294377_294517_294662_294767_297454_297544_298029_298184_298306_298589_298732_298894_299252_299390_303962
898389	contig_5023_pilon	+	2462	16	Intergenic	novelGene_7321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2052.73192491264	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	27	2216	607279	647344	FALSE	15	AATCCTACTCTGCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGAWPLGPGHPQEAHGSVTSLSSFPFSTLSPRDFALHPPRKSPLCGPPLLAILVSGPLEHLTSQSACLSPKRFGWSTKVASLLETFPRTGVPNVINFYVFHQEEALCF	607252	647590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646975_647022
898390	contig_8254_pilon	-	2473	2	Intergenic	novelGene_48397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGAAGGGACTGATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111260	107545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_107753_108994
898391	contig_9363_pilon	-	2190	13	Intergenic	novelGene_6565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1007.42571755385	82	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	118	1068	786587	755452	TRUE	25	TTTTATATATGTGTCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGESRFSDFE	787883	753388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753601_753794_754503_755012_755124_755360_755466_774878_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
898392	contig_14326_pilon	-	2318	8	Intergenic	novelGene_120728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	53.2927992225928	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	405	1184	444202	442066	FALSE	25	AACCTTATGTCAGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493201	440931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444308_473567_473737_487113_487194_493151
898393	contig_7695_pilon	+	4706	1	Intergenic	novelGene_41589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	766	2301	99	2399	474382	476682	NA	25	ATTTAAAGTTATTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIATGAAESLPALSQQEELVDLPKDYPLSASEDEGASDGERKHRKLLETINSLDGKTRRKLAERSEAGLSVSEFSVSSEGTREKLVLSDLLQPIKTSSSLATVKKQLKRVKSKKTVELPLNKEEVARIHREVAFNKTSQALSRWDPIILKNRKAEQLAFPLKKERAVFAPIEHVLRGWKARSPLEQEIFNVLHKNEQPVTDPLLTPVEKASLKAMSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAKARRERKIRSKKYHKVMKKGKAKKAVKDFATLRKVSPTAALEELEKMEKARMVERMSLKHQNSGKWAKSKAIMAKYDLEACQAMQEQLAKNKELMRKLQAPSESEEEEGGVEEDGLFVPDVVNEVQMNINGPNPWIRTSCTSDTKEAEIQKDPEQLPERLACENSESEGEESPVAEETLLKEFEERRSLRKRPELNQDAQPLGREETQDSSSQEVLSELRALSRKLSKEDRQSRKQQVNSVGAVLPVQREEPDQEEEPLLLQRPERVQTLEELGKEDWFQSTELPRPASQGQQMEKNPNDQPDAPKKKRKEHMIDLQNLLTTKSPSGTSLAVPTTVEELEGEEERDQKQMIKEAFAGDDVIRDFLKEKREAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLQPSAKNRRRFLMKAPEGTPRKDKNLPNVIISEKRNIRATAHQVHVLPYPFTHHQQFERTIQTPVGSTWNTQRAFQKLTSPKVVTKPGHIIKPIEAEDVGYRSSSRSDLSVVQKNPKRLSIRHKRQLKKNSVD	474283	478989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_474300_479000
898394	contig_12630_pilon	-	1778	5	Intergenic	novelGene_173083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	189.146107546521	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	52	867	100972	76567	FALSE	30	TTTTTATGATGTACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRGYKLKLLGWISIHYTLLESSTRTNESRYGTITALIF	101023	75655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76679_78018_78122_81560_81810_81934_82253_100938
898395	contig_12464_pilon	-	3486	10	Intergenic	novelGene_68696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_9	128.064894814897	521	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	409	2808	357758	337140	FALSE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQCIMAPKRSKTSASNSSSKRQRKSIDLEVKQKVIKQHEGGKSVNAIARDLGMSHSTITTILKNKEKILQAVKGSAPLKATRLTKMREGPISDMERLLMTWIEDQTQKQIPLSTSTITAKARSLFEMLKEKAGPDYNIEFSASSGWFMRFKQRFSLHNVKLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	382246	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_343318_343793_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_378909_379024_381087_381156_382099
898396	contig_8628_pilon	-	3352	19	Intergenic	novelGene_164436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	441	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGATCTTGTGTTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694551	646151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_646371_650734_650799_651942_652143_653086_653200_654182_654270_666373_666540_667579_667637_667780_667848_670361_670497_671315_671405_677680_677800_682461_682613_686716_686882_687298_687483_689576_689757_690448_690534_692226_692322_693103_693200_693471
898397	contig_9235_pilon	+	2033	3	Intergenic	novelGene_156214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	610	990	46898	47278	FALSE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTQRPLCPLEMSTLLPKTESCQPMGGCSYVATTPVFGKILWASTAAREELLPARRREGENMRSLELVGRVSSWEQCTGKGGDRVLAWNIFPPSWSFDFALSQRSSIVRLLKGSSGPSSKTNVPM	44973	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_45779_46695
898398	contig_9609_pilon	+	5322	1	Intergenic	novelGene_22926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACCCATAACACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46913	52235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_46900_52200
898399	contig_13565_pilon	+	4514	15	Intergenic	novelGene_162370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.085792409003	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	438	1409	173055	209032	TRUE	45	ATTTAAAAAGATACCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLLKVLTREIENYPHFFLDFENAQPTEGEREIWNQISAVLQDSESILADLQAYKGAGPEIRDAIQNPNDIQLQEKAWNAVCPLVVRLKRFYEFSIRLEKALQSLLESLTCPPYTPTQHLEREQALAKEFAEILHFTLRFDELKMRNPAIQNDFSYYRRTISRNRINNMHLDIENEVNNEMANRMSLFYAEATPMLKTLSNATMHFVSENKTLPIENTTDCLSTMTSVCKVMLETPEYRSRFTSEETLMFCMRVMVGVIILYDHVHPVGAFCKTSKIDMKGCIKVLKEQAPDSVEGLLNALRFTTKHLNDESTSKQIRAMLQ	86298	212719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_86325_129720_129925_132326_132369_134059_134215_173044_173125_195305_195428_196635_196742_198595_198733_199214_199293_199471_199589_199677_199758_201420_201548_206798_206870_208968_211572_212153
898400	contig_5649_pilon	-	3090	19	Intergenic	novelGene_82294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2524	2877	153515	149907	TRUE	20	CCTGTCCATTAGAATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGIVSKTEDLWIYKGMLNEGELAFCVFPRSIYEVYREHFHSQTSLNTINHIMKSFTVTNLKSRMVQFISYFLEIQTWVQFFENINQDFYIPCMCLCSITFIFPITPDATSRSRDTL	175356	148704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_148795_149783_149911_150059_150172_152883_153052_153445_153577_154086_154327_156609_156730_157503_157628_157819_157972_164097_164248_165469_165672_166772_166922_168032_168156_168449_168737_169639_169719_171510_171744_172063_172203_173116_173299_175074
898401	contig_3900_pilon	-	5766	14	Intergenic	novelGene_84199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	209.165685578846	758	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	778	2337	9	2345	556466	536565	TRUE	25	AAATTTTTTGTGTGTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCQWDPGRKTYLETNYTLKSEWATEKFADCKAQRDTPNSCTLDYSPVYFVNIEVWVEAENALGNITSDHINFDPIDKVKPNPPHNLSVRSSEELSSILKLAWINPSIKSFLRLKYSIQYRTKDASTWSQIPPEDTSSTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGFWSDWSEEASGITYEARPSKEPSFWYKIDPSHTHGYRPVKLIWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHFQNYRVNDTKLTVNLTNDRYIATLTARNLVGRSDASVLTIPACDFRAAHPVMDLKAFPKDNKLWVEWTAPTESVNKYILEWCVLSDKSPCIPDWQQEDGTVHLTYLRGNLMESKCYLITVTPVYADGPGSPESVRAYLKQAAPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTILYKTAFGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGMYGPDFTFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPLRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEVNDKKPFPEDLKSMDLFKKEKNSTEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSGDENESGQNTLSTVQYSTVVHSGYRHQVPPVQVFSRSESTQPLLDSEERPEDLQLVDNVDSGDGVLPRQQYFKQNCSQHETSQDISHFERPKQVSSVNEEDFVRLKQQQISDHISQSCGSEQMKMFQEISTAAVFGPGTEGEVERFETVEMEAAIDEGMPKSYLPQTVRQGGYVPQ	556474	531987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_534946_536101_537306_538164_538247_542467_542565_543658_543800_544127_544275_544465_544568_547045_547229_547795_548007_548729_548813_550976_551137_552489_552645_553164_553332_556398
898402	contig_1349_pilon	-	3986	2	Intergenic	novelGene_171636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATCTGGGTTCTCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25135	21043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_21621_21726
898403	contig_10904_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_22483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	4	783	149289	150068	NA	20	CTTCCCCTACTCCCAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	149285	151520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_149300_151500
898404	contig_15022_pilon	+	4590	1	Intergenic	novelGene_171807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3505	3828	84474	84797	NA	40	CACAAATCCCCACAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRIGLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSTGKILNNTGRIKRRWKEYTGSLYQKELVDVQPFQEGAYDQELMMMKEKVQTVLKALAKNKDSRNWWSTN	80969	85559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_81000_85600
898405	contig_4924_pilon	-	3279	13	Intergenic	novelGene_84648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_12	1080.32802374505	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	148	1146	452629	82377	TRUE	55	GAAGGGAAAAAAATATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSFKLDFLPEMMVESRLLVSDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	452776	62475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_452555
898406	contig_14441_pilon	+	1374	4	Intergenic	novelGene_100647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	486.303288996578	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	302	1336	111703	126705	FALSE	5	TGGCCGTGTGTCCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQVPGDLSLCRPLVQATSLDDPQRGASVQTPFQNGARGPWLEVGSWQCPSLETALSWTSPRPTCPGGVSHRLRHCCPPPAPHLISAFLLSFRHCANTLPEFGEGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111401	126743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112040_125517_125902_126159_126283_126514
898407	contig_3721_pilon	+	3272	11	Intergenic	novelGene_123795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_6	209.663277662065	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	186	1589	63865	102235	FALSE	45	CAAGTACATTGCTAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEPPEVYGDFEPRVAKERSPAGRRTSPGEFRLDSATEEVKASAYYLRSRQRRQPRPQEATEMKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSDSSYKTNGNSKMSELEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTADQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	63679	103918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81608_81660_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
898408	contig_19362_pilon	+	3388	7	Intergenic	novelGene_157789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	357	junction_1	532.466717791409	543	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	2580	3386	32993	43561	FALSE	35	TTATCCCAGAATATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTTPLCNVSDIPSAGIKDRAVVVQWGACHFLEKARIAQTGGAEALLIANNSVQYPPSGNKSEFHDVKILIAFISDKDLKDMKQTLGSNITVKMYSPSWPNFDYTMVVIFAIAVFTVALGGYWSGLIELENLKAVTNTEDREMKKKEEYLTFSPLTVVIFVVICCVMMVLLYFFYKWLVYVMIAVFCIASATSLYNCLAALIHKIPYGQCKIVCRGKSVEVRLIFLSGLCIAIAVVWAVFRNEDRYEYFNIFAIISCSIMFFVCLFC	30096	43563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_32661_32977_33161_33774_33865_34380_34515_39711_39861_42896_42994_43392
898409	contig_3789_pilon	+	3034	2	Intergenic	novelGene_79879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAAGAGCGGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545848	563475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_546016_560608
898410	contig_13707_pilon	-	3285	8	Intergenic	novelGene_43513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_1	87.2671245109415	68	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2256	2771	124127	117289	TRUE	30	GCTTATTATTCAAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESSSEKETVSVSLNQTITQLQQLLQAVNQQLTKE	127161	108264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_108760_117269_117388_119119_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906
898411	contig_5125_pilon	-	2477	7	Intergenic	novelGene_43439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCGCCTGTCCCGCTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59985	26218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26500_35608_35801_50074_50109_53630_53706_53840_53994_54318_54522_58446
898412	contig_401_pilon	-	1474	9	Intergenic	novelGene_42835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGCAGAAAGAAGTAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716439	1711898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1711962_1712504_1712623_1712855_1713004_1713129_1713341_1713437_1713529_1713608_1713702_1714019_1714099_1715076_1715115_1715806
898413	contig_16846_pilon	+	2414	4	Intergenic	novelGene_82895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	389.83101752198	268	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAACAAAAAGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375901	415291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_375928_401042_401145_411066_411103_413041
898414	contig_10958_pilon	+	1515	2	Intergenic	novelGene_5477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895568	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
898415	scaffold_880_pilon	-	4954	13	Intergenic	novelGene_121435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	577	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTCCAACTCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456039	409331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_411496_418780_420364_424872_424946_433473_433596_437560_437774_439123_439212_441361_441427_443430_443581_447598_447680_450969_451127_453826_453965_455113_455210_456015
898416	contig_7275_pilon	+	1423	5	Intergenic	novelGene_111238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	49.3887639043538	455	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	13	567	279243	390154	TRUE	25	CAAAGTCTAGTGTCGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGAMGLRSRSVSSVAGMGMDPSTTGGVPFGLYTPATRESSDSERAPGGGGSASDSTYAHGNGYQETGSGHHRDGMLYLGSRASLADALPLHIAPRWFSSHSGFKCPICSKSVASDEMEMHFIMCLSKPRLSYNDDVLTKDTGECVICLEELLQGDTIARLPCLCIYHKSCIDSWFEVNRSCPEHPAD	279230	391658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_279538_377478_377575_388334_388441_390096_390189_390836
898417	contig_10857_pilon	+	580	5	Intergenic	novelGene_160884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	511.010946555942	59	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	32	580	21903	66895	FALSE	5	CCATGCGCTGCCTCTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAASDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRPQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLCLRPGSTGDLRLCSGPCIPPCPLLHPSAPANLLCVIKLPCV	21871	66895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56561_58201_58281_66784
898418	contig_4315_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_46818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAACCTCTGCCCCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349360	347587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_347600_349400
898419	contig_610_pilon	-	3512	7	Intergenic	novelGene_76659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	506.087497924574	55	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	49	879	68933	34694	TRUE	30	GAGTGACCAGCCAGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEECLSCPQKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASGASL	68981	30398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887
898420	contig_11986_pilon	-	2668	2	Intergenic	novelGene_69241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	73	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	966	1280	798499	798185	TRUE	15	TTGGTTGATGTCTCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSALLVSATPHAHAFLKMPLRAIQKMQPKEPVYSWWGRLLSHARCFLSTDAGTHACVSRLLILNPDVTQRRSPRSGSCRLRLLVGTQLSNSRAPECLTADSRT	799464	796486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_797723_798032
898421	contig_5039_pilon	+	3764	4	Intergenic	novelGene_64843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTAAGGGCGTGTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313397	504034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_316939_462757_462915_489452_489498_504013
898422	contig_13760_pilon	-	3116	6	Intergenic	novelGene_61335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	32.4061722515943	316	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	201	1109	333942	324174	FALSE	10	CCCTGCTCACGTCGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPGRLLLIILCSLVFLAVYILICGWACLPLCLATCLEPHLPTSSRPTMLGPLHFSGYSSVPDGKPLVREPCRSCAVVSSSGQMLGSGLGTKIDGAECVLRMNQAPTMGFEADVGRRSTLRVISHTSVPLLLRNYSHYFQQARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRRQSGSFLSTGWFTMILALELCEEIVVYGMVSDSYCREESHPSVPYHYFEKGRLDECQMYLAHERAPRSAHRFITEKAIFSRWAKKRPIVFAHPSWWAQ	334590	322166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325726_327791_328205_330568_330755_333930_334018_334465
898423	contig_8729_pilon	+	3196	3	Intergenic	novelGene_40144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	387	junction_1	91.5	1424	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCGTGTCTCTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673844	679823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_673926_675394_675539_676852
898424	contig_13680_pilon	+	3134	21	Intergenic	novelGene_149581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	249.819109557295	8	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	1023	2594	315266	340950	FALSE	30	AAAGACCTGACTGGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLINFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVLKPHLERLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGTCIATSCESRDPRKLHWLFELLLESPLSGEGGSFVDACRLYVLQGGLAQQEWRVPELLHRLLKYLEPKLTQVYKNVRERIGSVLTYIFMIDVSLPNTAPTTSPRVPEFTARILEKLKPLMDVDEEIQNHVMEENGIGEEDERTQGIKLLKTILKWLMASAGRAFSTAVAEQLQLLPLFFKIAPVENDNSYDELKRDAKLCLSLMSQGLLYPLQVPLVLQVLKQTARSSSWHARYTVLTYLQTVVFYNLFIFLNNEDAVKDIRWLVISLLEDEQLEVREMAATTLSGLLQCNFLTMDGPMQIHFEQLCKTKLPKKRKRDPGSVGDTIPSAELVKRHAGVLGLGACVLSSPYDVPTWMPQLLMNLSAHLNDPQPIELSCHRFGGFCVWSPRSAFHRFSAAI	303571	341490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_303660_305400_305533_307759_307970_308732_308870_309953_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314492_315221_315275_315942_316069_316638_316792_323626_323732_324256_324349_325027_325160_325535_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_334385_334549_338835_338970_340872
898425	contig_17470_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_110493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAGCAGAACAGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196415	199094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_196400_199100
898426	contig_10063_pilon	-	5910	2	Intergenic	novelGene_127749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439708	433369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_433670_434098
898427	contig_12950_pilon	-	4087	1	Intergenic	novelGene_114796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	340	1023	336	1358	192329	191307	NA	25	CAGACTCGTATTTATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENVTHKISPCGLIPSKKEVQDSERDRETEDVEHNRNFQSQSLRHDIKGKNRRTKSIISHHYKYRFYKKYRKLNSRVKRRPYLHRQHTINQDIQEDATYLWLKNFQKLDNTIMQQYPNFNKVPLLLGKCFREEQKRRKVTPFEQFKVYKKNFGKETANSNSVATYERLIPLSKSVGFITWDNNGNTGNGTGFHLKGGYVLTCLHVVHLIVGEGTHSTLWPDIVSKCAKVTFTYENFCPTYSSWFFFEPLLEVYDGNLDYVILKLKENGNAFPPGLYGQISPQPSSGLIYLIGHPEGQIKKIDDCAVIPLSQRLGKYPEYQDGLVETYVATNNACPMFTKRSFQSEVWSTNTLSYDTCFSSGSSGSPVFTASGKLVAMHAFGHFYKPVHKTYALIEYGYSLESIICDIQQKSESFYKFLNEEKNENHNEEKNEKQESSPQDHQNEPMEWMECS	192664	188577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_188600_192700
898428	contig_16999_pilon	+	2270	6	Intergenic	novelGene_84970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	65.0986943033422	11	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	228	632	53500	81714	FALSE	50	AGTAGGACTATGCAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDESHIRSQPLLLTFPVFWVHSLLEARRVKRLLEPSMIGATIQRSVSMASTVLSPQWFHWCNTPNLTSSTVQLFSSPGEKILLNLIEYSSLQKACVWSALSEASSRVIKALAYMAGSCPEPSVAAWVSLSSSEK	50672	83352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_53404_53556_55616_55692_56118_56155_73925_74018_81568
898429	contig_5317_pilon	+	944	4	Intergenic	novelGene_76522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	99	509	35282	43326	FALSE	30	CCTACATGCAAGTACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33690	43761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
898430	contig_12277_pilon	+	4812	7	Intergenic	novelGene_139717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	146.889603292934	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	214	2373	409864	421208	FALSE	30	AGGAGCATCAGCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHTVDRDQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCLSPSTPVDDSCAPYPAPGTSPDDSPLSRLPKTRSFDNLTTACDNTVPLASRRSSDPSLNEKWQEQRRSLELSSLAGPGEESLDADSLGKPAKVLGGAELSVAAGVAEGQMENILQEASKEESGVEEPAHRGDIEMQEVKEEALLEKESRSKMPEGSAVVVYKESELDDAALRSHPGTNLSVFSQGIPEQQGVHSVLPSPLQEPCRGEGSQEIPVEQPQIGDIPEDREETVLPVSVDAKVGCGTSQSRSLLPLQVPLEARGPNVDSSMDMLMEDKVKPEDEPQGHHRPCVVNSGRLSDKDMPAQAMEPRASERSLAERPQVGSEVYRTSPGHTRSPTRSPCALPLAECKEGIVCNGAPETENKASEQPTGLSTPQKYPTPNGHCANGEAGRSKDFLSRQLSAVSCSSTHLHSRNLHHKWLHSYSGRPSVTSSPDQPSRSHLDDDGMPVYTDSIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLNSSLRFNGDFGDEVMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPASSSIDLELDKPIAATSN	408823	423647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_409016_409842_410029_412818_412990_414186_414333_415083_416501_418297_418387_421036
898432	scaffold_4805_pilon	-	2186	12	Intergenic	novelGene_161014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	72.4184351672011	255	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	59	1621	533627	385501	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGAGGVRPGRGALVAEVMASWAALSPSIVEYFEGEDFYRCGYCKNESGSLSRGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRLVPVSFEDPEFKSSFSQSFSLYVKYQMTIHQDPPDECGETEFTRFLCSSPLEAENPPDGPDCGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPHCVSSVYLYYDPDYSFLSLGVYSALREIAFTKQLHEKASQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKGQYRPSDLLCPETYVWVPIEQCLPLLENSKYCRFNQDPEAVDEGRSKDPDRLQVFYKKAIMPYGVYKKRQRDPSEEATVLQYARLVGQRCAESMLLFRS	533685	384935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_385680_406635_406757_469654_469755_474528_474711_495372_495406_511416_511546_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_533521
898433	contig_14970_pilon	+	2265	6	Intergenic	novelGene_45138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1422	1766	285542	291014	TRUE	0	TCCCTTTCTCCTCTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELTWRGNRVEGCFSASPHPLHSPHSHNLTSVQDNTIHLGYKDGGHRFIKGCAIHVNRCSHREDKPGHALINPQIFFQATKSDWQSSSTGSSPQGSDPRLENASKKGERVFPCH	274566	315743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_274683_284236_285807_290934_291166_306694_306785_311920_312049_315613
898434	contig_2799_pilon	-	4270	3	Intergenic	novelGene_85590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1381	1704	784349	784026	TRUE	30	AGTGACACTGATTTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQHGERHQGIGSESQPRQLPLLTEEKGNRAVDSVTSTVLKVTSRSTGSDNPREFPKHDNAIPLGSVPKVERDDTCTTQKHSSRKVALFSTADEIPECSLGECRKF	785729	780224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781547_783289_783426
898435	contig_10857_pilon	-	972	5	Intergenic	novelGene_160880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	541	942	58214	21873	FALSE	0	GCGTGCGGTGGCCTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGPVLLVLLLLWAVSLRGLSAIHSELPLWPRFLGPVAKTLILVQFRGFRGFQVEQLVLLWFRGLVAEVLVLSLQLPVPLAPASLPGCLLLVLHAPLGGEPRGLVHQQLLLLPRTGVTRRLRHGPHSRPGGC	66893	21842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_21970_54429_54566_56404_56559_58199_58384_66522
898436	contig_12540_pilon	+	2869	13	Intergenic	novelGene_148095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	310.969038741087	608	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	75	1052	977712	980958	TRUE	10	CATGTTTGTGTGTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQKTPIESLFIEATEKFRSNLKTMYSVPNGKIHVGYKDLMENYQIVVSNMADERGEKDTNPVLNLFQTLLDEFTRGHSKSDFEAPKQSKSQKKRKQERAVQQHNGHVFASYQVSIPQSCEHCLSYIWLMDKALLCTACKMTCHKKCGYKIQTYCYYTCRQEVEPGAEPGHFGVCVDSLTSDKVSVPVVLEKLLEHVEMHGLYTEGLYRKSGAANRTRELRQALQTDPVAVKLENYPIHAITGVLKQWLRELPEPLMTFAQYNDFLHAVELPERQEQLAAIYAVLDHLPEANHNSLERLIFHLVKVALLEDVNRMSPSALAIVFAPCLLRCPDTSDPLTSMKDVLKITT	977637	985207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_977727_977830_978005_978247_978287_978424_978537_979123_979198_979742_979936_980128_980258_980497_980604_980822_980959_981206_981331_982398_982533_983560_983701_983788
898437	contig_12414_pilon	+	2561	1	Intergenic	novelGene_59585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	964	2034	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	372020	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_372000_374600
898438	SIRV6	+	1276	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	570	70	354	65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	35	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	76	567	1733	10736	TRUE	40	GCAAAAATTATGGATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1657	11755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898439	contig_16205_pilon	-	10699	1	Intergenic	novelGene_156875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	835	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCCACTACGCCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100219	89520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_89500_100200
898440	contig_16211_pilon	-	1927	11	Intergenic	novelGene_150051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_8	299.952012828719	540	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	128	1063	121247	85565	TRUE	75	ATAAAAAGAGAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPGWLHSTSLCNDFLGCF	121374	71676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_71691_73420_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85615_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
898441	contig_5899_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_146951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_3	292.091690322672	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	219	710	53130	12694	FALSE	20	GAGTCTGATGTCTTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVGSFEGFQAVSLKQEGGDHPSETDHLSTEEGDPGEDSEAMQISRQTSVTESTLYPNPYHSSYSSRKYFVTRPGTIETAMEDLKSHITKTSGETIQGFWLLTEIDHWNNEKEKIVLITDKTLFICKYDFIMLSCVQLQRIPLHAICRICLGKFSFPGMSLEK	84491	12692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_12872_43099_43192_52908_53140_84282
898442	contig_6137_pilon	-	2164	2	Intergenic	novelGene_59219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTCTCCCATGCACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314326	1312116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1312456_1312501
898443	contig_7919_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_28143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	523	825	1626814	1626512	NA	20	TTTTGCTTGAATTAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSPRIPPARQPRPGSSSTLEQSSTAPQEEAKMVHGARYLSERRGRWQEVRKKSKEAGKKATLAANKWHSESQLVRAGVSQRRDCVRRKQRGPSVREEG	1627336	1624952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1625000_1627300
898444	contig_7165_pilon	-	8219	9	Intergenic	novelGene_116810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	345	153	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	6770	7267	4286	3789	FALSE	65	CACAAAAAAAGCACTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKRDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRLKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQQQQLEIQKLNNKISEMGDVIDGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENAEKRTKNNEQTLRVM	563135	2836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_5114_5735_6778_35014_36050_137260_138402_149153_149363_298015_299024_320057_320158_401175_402495_563047
898445	contig_16776_pilon	-	3561	3	Intergenic	novelGene_130508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28.5	1347	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCAACCCTGTCTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44704	34683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_41422_43530_43840
898446	contig_5389_pilon	+	2236	8	Intergenic	novelGene_143031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	143.53069784715	123	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	18	563	437163	480087	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPQPNMAMHNKAAPPQIPDTRRELAELVKRKQELAETLANLERQIYAFEGSYLEDTQMYGNIIRGWDRYLTNQKNSNSKNDRRNRKFKEAERLFSKSSVTSAAAVSALAGVQDQLIEKREPGSGTESDTSPDFHNQENEPSREDPEDLDGSVQGVKPQKAASSTCSGGHHSSHKKRKNKNRHRYVY	437145	482869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_437253_438513_438630_443458_443547_443711_443758_475994_476188_480074_480133_480732_480767_481275
898447	contig_7308_pilon	-	7632	6	Intergenic	novelGene_159619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_4	85.4503364534043	644	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	4489	5256	588749	582242	FALSE	15	ATCCTTTGAGAGTGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVLGSSALQRNDGAAILAAVSSIAQKIRTSSGVAGDWKVMNILHRIASQVAALDLGYKPGVEAVRKNPPKVLFLLGADGGCITRQDLPKDCFIIYQGHHGDVGAPIADVILPGAAYTEKSATYVNTEGRAQQTKVAVTPPGLAREDWKIIRALSEIAGITLPYDTLDQVRNRLEEVSPNLVRYDDVEGANYFQQANELSKLVNQQLLADPLVPPQLTIRDFYMTDSISRASQTMAKCVKAVTEGAQAVEEPSIC	593237	579865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_582334_584210_584284_584388_584524_585083_585260_586755_586911_588612
898448	contig_16103_pilon	-	3801	26	Intergenic	novelGene_118920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.195959179422654	26	96	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	379	696	806712	805520	TRUE	25	CCGCAGTAGCCTAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWEWDRHEAEAWGGPLGVGGGGTPPHSFLSFDAVSIVARLRSPLRRWGREKRRAGASVGPPAVAVVGRLVGLGLLRDGAGLATLPAARLLLLLALATENHLQIW	807090	772629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_772698_773261_773372_776722_776925_777332_777433_777836_777880_778571_778686_782322_782378_784334_784418_785514_785688_788394_788594_789048_789327_789467_789646_790832_791015_791766_791830_792261_792430_792774_792842_793912_794114_794201_794297_795266_795321_795891_795972_797696_797917_798357_798461_803228_803298_804929_805127_805516_805567_806441
898449	contig_14034_pilon	-	3903	4	Intergenic	novelGene_72650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1334	1804	370146	369676	TRUE	10	AGTTTTTCGGATCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKEPRKFPEEKNFLELLEAEYKRLIYRTFQEIRKEIKQNAEHAIKEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQKINNKMSELENSIQSHRSRIEAMEVRITETEVKALDTNLFEEKSDKRMKKNEETLRITRDSIKRNNLRVIGVPEQG	399932	290103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_292168_369640_370490_398889_399490_399542
898450	contig_12923_pilon	+	3793	26	Intergenic	novelGene_30158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_17	126.25373816248	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	82	1194	268067	310576	TRUE	30	ATGGGATAGTGTCATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTSCCSPVRQAGGPVAEAERVCWLAAAMELWRQCGHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREVNLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVICTLSALSWTPIAQNKGIMPFPTEEETVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRTEPVAMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFMKPLQRFLKPEDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKETLATPGAPNLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDCVASTREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQDSMEKENLRLALDAMRVSGKEE	267985	349179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_268271_301862_301980_302349_302409_302511_302581_302813_302923_303004_303101_304581_304651_305707_305812_308539_308640_310234_310331_310486_311585_311683_311770_312433_312567_314394_314505_315560_315663_315906_316005_316227_316251_316435_316482_330852_330990_332130_332197_333473_333506_339130_339248_340557_340646_343972_344088_346601_346754_348893
898451	contig_6102_pilon	+	3535	25	Intergenic	novelGene_31869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	478.146246804608	3	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	40	2193	370803	393134	TRUE	25	TACTCAAACCAGCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAHWARYHCPSRSSSWLTSSAWIAGLHSTMVKGRCS	370763	395253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379722_393022_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
898452	contig_16846_pilon	+	2422	7	Intergenic	novelGene_82911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	19.3254294188311	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	324	905	459619	477213	FALSE	20	GAGTCTGGCTATATAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEQGQGSKKKEQNSPGV	456157	478730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459710_464055_464156_464527_464615_465206_465311_475327_475478_477163
898453	contig_3747_pilon	+	2607	7	Intergenic	novelGene_24907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4159.60537992087	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	618	1229	202676	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVVSSLFLQVDPCIVNNNVQ	201384	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203573_203744
898455	contig_14068_pilon	-	1778	2	Intergenic	novelGene_165961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_1	0	220	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	284	706	90824	37042	FALSE	30	GAGGGCCCCAGCATAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLSFRARALDAAKPLPIYRGKDMPDLNDCVSINRAVPQMPTGMEKEEESEHHLQRAISAQQVFREKKESMVIPVPEAESNVNYYNRLYKGEFKQPKQFIHIQRKFVNLLFSVCNLNLSTSKNHFLSQRDLIFRFIHTD	91107	35969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_37312_90671
898456	contig_16125_pilon	-	4103	16	Intergenic	novelGene_155233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	940.529174927014	20	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	636	2090	236037	117592	FALSE	65	ACTTCATCAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	236672	115578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
898457	contig_10861_pilon	+	4287	9	Intergenic	novelGene_39394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_1	361.751209396734	58	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	3085	4224	1928838	1934804	FALSE	55	AAAAAAAAATTGGCTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGGCFWLIYLAVGLTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVMAKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEFGKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKKRKERQAARQASRSTAYEDYYYHPPPRMPPPIRGRGRGGGRGGYGYPPDYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDGYAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGRGAPPPRGRAGYSQRGAPLGPPRGSRGGRGGPAQQQRGRGSRGARGNRGGNVGGKRKADGYNQPDSKRRQTNNQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYGYNNDNQEFYQDTYGQQWK	1903784	1934867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531_1924709_1926365_1929093_1933421_1933572_1933932_1934055_1934191
898458	contig_5084_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_64692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGGTGCCCCCTAGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1859932	1862130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1859900_1862100
898459	contig_16228_pilon	+	2074	8	Intergenic	novelGene_147929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	250.489154109575	56	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	337	1209	59945	72232	TRUE	25	TGCTTACACACCTCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMGIRGQHMEEKETFATVYSEVQKPGQAINI	47753	79236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71817_72142_72611_78749
898460	contig_19865_pilon	+	4275	7	Intergenic	novelGene_170148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	100.829476510261	487	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	161	1213	43592	81377	FALSE	25	AATGAGTGACCATCTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHWWFGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPD	43431	84439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191_79369_79927_80052_81132
898461	contig_2646_pilon	-	1769	10	Intergenic	novelGene_69656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	316.957760943351	1209	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	212	676	2176869	2174850	TRUE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2178933	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876
898462	contig_2062_pilon	-	4860	1	Intergenic	novelGene_139044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1427	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2837	3223	1213027	1212641	NA	75	TCCAAAAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLMESLGFSMYSITSSANRDSLTYSLAIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPWLVPVFKEDVFSLSPLRMMLGDIIPSRNQCQEQSASFGQRSLHQEAPSLGEH	1215863	1211003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1211000_1215900
898463	contig_12080_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_128374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGTTGTGCTAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146568	144763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_144800_146600
898464	contig_7446_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_101966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	472	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGTGATCGGAGTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256085	254677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_254700_256100
898465	contig_11318_pilon	-	6064	18	Intergenic	novelGene_48135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	605.694259781435	9	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	303	1262	49997	31091	TRUE	45	AAATATTAAAATGACTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQRKEGLCQLLWNTAVRMSFPPHLNRPPMGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKVVFLFFHLLPN	58177	9062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_27432_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955_50070_52071_52142_52436_52520_54570_54614_58143
898466	contig_12644_pilon	-	2142	14	Intergenic	novelGene_44482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	467.912612586743	250	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	10	1908	1151228	1026128	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1151237	1025893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037187_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
898467	contig_5574_pilon	+	10555	3	Intergenic	novelGene_155842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1577	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGGGCTCAAGTATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107454	133993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_111110_111945_118706_133853
898468	contig_5640_pilon	+	4020	4	Intergenic	novelGene_27286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	119.501743362458	543	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	23	1696	1236892	1269139	FALSE	30	GTTATTTAAAAACTTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGEARKKMAAVAAEAAATAASPGEGGAGEAEPEMEPIPGSEAGTDPLPVTATEASVPDGKADGQQSAPQADEPPLPPPPGELTRSPQAAGLELEAEEKLPVRLAEPAAAAPQEGPDLPPSPAPPPEQPLALEEREEPPLPQPAAPALVPPAGGDSAVSQLIPGSEVRVTLDHIIEDALVVSFRLGEKLFSGVLMDLSKRFGPHGIPVTVFPKREYKDKPEAMQPQSNTFQEGTEVDREANGAVPHDPPPVPPPEPSLAESLWTSKPPPLFHEGAPYPPPLFIRDTYNQSIPQPPPRKIKRPKRKMYREEPTSIMNAIKLRPRQVLCDKCKNSVVAEKKEIRKGSSASDSSKYEDKKRRNESVTTVNKKLKTDHKVDGKNQNESQKRNAVVKVSNIAHSRGRVVKVSAQANTSKAQLSTKKVLQSKNMDHAKAREVLKIAKEKAQKKQSETSTSKNAHSKVHFTRRYQNPSSGSLPPRVRLKPQRYRNEENDSSLKTGLEKMRSGKMAPKPQSRCTSTRSAGLNKRQLLHQTVTSPAAPLQCLTDHCGFRLGALKLTVKRAAQRH	1236869	1271463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1237467_1252955_1253921_1266328_1266449_1269125
898469	contig_19727_pilon	-	3117	3	Intergenic	novelGene_168996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58563	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032_56189_57611
898471	contig_11564_pilon	+	1500	2	Intergenic	novelGene_158563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTGGAACCCTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57177	59161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58597_59080
898472	contig_2892_pilon	-	2529	7	Intergenic	novelGene_118975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_6	66.3216070037175	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	148	576	100546	12538	FALSE	30	ATTCTTCACATGTACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASDCPNVVIEGVLHGIFYPHVQPR	100993	10584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_100867
898473	contig_14441_pilon	+	771	4	Intergenic	novelGene_100768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	23	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	191	739	125667	126705	FALSE	5	GCAGCCTGGCCGTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTFGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121830	126737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
898474	contig_8269_pilon	+	2463	12	Intergenic	novelGene_106214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	429.206744765347	227	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	538	1560	342693	377795	FALSE	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH	233278	378698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_233343_318457_318753_339814_339977_342676_342800_344516_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_377781
898475	contig_854_pilon	-	7023	15	Intergenic	novelGene_36391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1142.64476821387	868	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	3269	5623	993124	976194	FALSE	45	GAAGAAAGCCCAAGATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHVQPAAPKDLQVSDARDRFLLTWRVHLGGLQSSWLSEWHLESELVYRRLQDSWEEASILYSNSSQAVLGPEHLMPSSTYVARVRTRLAPGTGLSGRPSEWSPEVRWDSQPGDEAQPQNLQCFFNGADMLSCSWEVRSEVASSVPFTLFYKPSPDTEEKECSPVMKEKLSSPYTRHRCQIPVLDSGTHSQYTVSVQPKKEEKFIKSSEHIQMGRPTVNVTMDGDSYILRWEAQKQYYDHIVYTFEVQYRKDTVSWEESKTQPLKNMHSMSLPPLEPSTRYWARVRVKPTLSSYNGIWSEWSEECSWDTEWVLPTWVLVFMLVLITLALLPMLRFCFVYGYRLNQKWKEKIPNPSKSHLFQNGSAGLRLPDSTSTFTSRSLLYKGPWDSHVPELEGVFPAHCGDSEVSPLTTENPKDACDSPSEPDMTPATLEPMEQPPGPSSRTESEVSSFDFNGPYLRSPQSHSLPDIWGQLTSLDVGRSRKPLPPGSLEYLCLPAGGQVQLVPLSQAMGQRRAMDVDGVPSPGAEGSFSLGSGEGPAPPPPGPMTGTQDPKDSPSALHTGAGGPQDSVVASGYVTSADLVFTSAPEALSGSLTPPLGHPSHQNPSPCPGLASGPPGAPAPLQPGFEDYVELPPTTDQALPRVHEAGGHRWELVV	997961	974793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976253_977358_978087_978787_978892_979721_979780_980008_980100_980727_980891_981766_981907_984025_984184_984332_984469_985011_985181_985260_985419_991117_991309_991918_992043_993048_993301_994869
898476	contig_7019_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_149467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175630	1173729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1173700_1175600
898477	contig_15236_pilon	+	3734	3	Intergenic	novelGene_141546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2354	2761	122756	123163	TRUE	15	TGGGGCAGCTGTGAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	120402	360965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_123411_312712_313131_360657
898478	contig_12327_pilon	-	1931	13	Intergenic	novelGene_140685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	177.016536421507	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	84	1880	1155014	1139988	FALSE	15	CTCTTGTGACTCCTGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSASGVSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLESWRNFEDEFGTVSDKERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155097	1139936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148869_1151828_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
898479	contig_2069_pilon	-	5621	9	Intergenic	novelGene_23202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.929677841395	12	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	23	1345	114391	102880	TRUE	15	CTCCAACCGCCATTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEGENHRTLLGGQPGL	114413	93125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_94253_94303_96017_96222_97261_97870_98025_102635_102924_103060_103694_109097_109509_111852_111994_114297
898480	contig_720_pilon	-	2538	6	Intergenic	novelGene_155164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_5	73.5216974776834	472	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	12	1529	190635	162408	FALSE	15	TGTCCTGCTGTGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKKLGADFHGTFSYLDDVPFKIGDKFKTPAKVGLPIGFSLPDCLQVVREIQYDFSLEKKTIEWAEDIKKIQEAQREAERKAEEAEATKVNSKSGPEGDSKMSFSKTHSTATMPPPINPILASLQHNSILTPTRVSSSATKQKVLSPPHTKADFNPADFECEEDPFDNLELKTIDEKEELRNILVGTTGPIMAQILDNNLPRGGSGSVLQDEEEVLTSLERATLDFKPLHKPNGFITLPQLGNCEKMSLSSKVSLPPIPAVSNIKSLSFPKLDSDDSNQKTAKLVSTFHSTSCLRNGTFRNSLKPSTQSSASELNGHHTLGLSALNLDSGTEVPALSPSSQTPSLSVLSLYTEESSPPNTGPMVTPPNFSMSQVPNTSSCPQAYSELQTLSPSERQCVETVVNMGYSYECVLRAMKKKGDNIEQILDYLFAHGQLCEKGFDPLLVEEALEMHQCSEEKMMEFLQLMSKFKEMGFELKDIKEVLLLHNNDQDNALEDLMARAGAS	190646	161398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_162549_163166_163269_163993_164177_179283_180217_183857_183983_190601
898481	SIRV1	-	1252	4	FSM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	25	23	25	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	76	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCGACTGACGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10341	1029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7815_10282
898482	contig_13021_pilon	+	3036	10	Intergenic	novelGene_8146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3657.34301790484	16	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	170	1216	174676	178956	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAVSNFMWLHQCLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGAVFVARPRHDNRRTRGGWRTSDRLAASSRLER	174506	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176088_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_178855_180085_180461
898483	contig_11422_pilon	+	1019	1	Intergenic	novelGene_99099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAGAAGAAGAAGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751	1770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1800
898484	contig_15527_pilon	+	5570	2	Intergenic	novelGene_178720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3049	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	3693	4475	63101	63883	FALSE	20	TTGTACCAGTACCAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENNEKEIRKSIPFSIAPKKIKNLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIVNFIWKRKKP	13948	64978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15527_pilon_+_17288_62747
898485	contig_9609_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_22918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCCCAGTTTTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3523	1975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_2000_3500
898486	contig_18544_pilon	+	5193	11	Intergenic	novelGene_152729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCTAACGTTGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34810	65013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_38279_38472_38684_40182_40322_47684_47854_49128_49315_53228_53279_54684_54803_54895_55014_58023_58245_63276_63459_64682
898487	contig_14807_pilon	+	661	4	Intergenic	novelGene_124661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1195	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	144	488	37293	38373	TRUE	40	TGGAAAAGGCCACATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKFNLLIGNGRDRQVKLLAGTGQAGQCCQGPHECRARHLSKGPRLGMYLTPQPSGMRRFSATMSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLSAPAQDNILLMRMTWKGWSRTRM	37149	38741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37648_38297_38438_38632
898488	contig_12638_pilon	-	3346	19	Intergenic	novelGene_33057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_18	73.348483283569	447	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	1465	2637	77507	19895	TRUE	25	CCTAGCATGCTGAATGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTEPASTLAELQDISTVTVTNTFKKTGDFVTSKAPAVDLDHKFRCKVVDCLKFFRKAKLLHYHMKYFHGMEKSPEPEESPGNRHVQTRGSSSSDKASQDSLARKRVSASSPTAKDKEKNKEKKFKEFVKVKPKKKKKKKKKAKPECPCSEEVSDTSQEPSPPKTFAITRCGTSHKPGVHMSPPLHGSESGNHKGKGKVSEEDNLSESSSESFLWSDEEYGQDVDVTTNPDEELDGDDRYDFEVVRCICEVQEENDFMIQCEECQCWQHGVCMGLLEENVPEKYTCYVCQDPPGQRPGFKYWYDREWLSRGHMHGLAFLEENYSHQNAKKIVATHQLLGDVQRVIEVLHGLQLKMSILQSREHPDLQLWCQPWKQRSGGGTISFQTHPCC	137308	13084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_13305_17613_17798_19589_19992_23907_24104_26723_26824_38673_38853_39796_39962_40654_40754_51872_52152_77449_77630_78343_78533_79439_79554_83545_83934_87172_87253_96222_96308_97539_97712_100655_100742_128452_128568_137195
898489	contig_19007_pilon	-	2824	11	Intergenic	novelGene_168443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_3	134.301303046545	584	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	676	2388	63039	34922	FALSE	30	CCAGACTGCCACAGTAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTFLGIATFTYFYKKCGDLITLANKELLLCLLVFLSLGLVLSYRCRYRNGGLLGRQQSQSHFAAFSDILSALPFIGVFWAKSPSGSEKKEQPDSRRQKKEMNISETTLMGAAITFQNDPEIIIVGSGVLGSALAAVLSRDGRKVTVIERDLKEPDRIVGEFLQPGGYHVLKDLGLEDTVGGLDAQVVNGYIIHDQESKSEVQIPFPLSENNQVLSGRAFHHGRFIMSLRKAAMAEPNAKFIEGIVLQLLEEDDAVMGVQYRDKETGAIKELHAPLTVVADGLFSKFRKNLISSQVSVSSHFVGFLMKNAPQFKANHAELVLANPSPVLIYQISSNETRVLVDIRGEMPRNLREYVIEKIYPQIPDHMKKPFLEGIQNSRLRAMPASFLPSSPVNKRGVLLLGDAYNMRHPLTGGGMTVVFNDIKLWSKLLKGIPDLCDDAAVLQAKKSFYWTRKKSHSFVVNILAQALYELFSATDDSLHQLRRACFLYFKFGGQCVAGPVGLLSVLSPNPLILIGHFFAVAVYAMYFCFKSEPWISKPRAFYSSGAILYKAFSVIVPLIYSEMKYLVQ	63714	34485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_-_35115_43602_43691_45744_45842_46285_46429_50311_50408_52311_52484_52564_52679_53819_53917_55772_55954_59097_59339_62748
898490	contig_16210_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_147674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	563	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1561	1971	61447	61037	NA	10	TTCCCAGCCTCGTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLWVPIPSAQLLKGIMRLWLSLLVILISLCLLQSQKFVEFLLYTHLPFSTPILRFNLFALTVFFSLCINCFYFSGLSGETGGEFKSSLLSFIGSLSLASLSEDTESSELFVNALLAIEIMILCFSTMIFLQNWFM	63007	60473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_60500_63000
898491	contig_8317_pilon	+	588	1	Intergenic	novelGene_20739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6707	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16661	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16700_17200
898492	contig_7753_pilon	-	2489	11	Intergenic	novelGene_41460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_7	116.668119038579	549	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	566	1363	562350	527304	FALSE	25	AATTTGGGTTGAGAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRIHFVVDPHGWCCMGLIVFVWLYNVVIIPKIVLFPHYEEGHIPGILIIIFYGISIFCLVALLRASITDPGRLPENPKIPHGEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRNLDLFVIRHELAIMRLAAFMGIIMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEEISRPRKPWQQTFSEVFGTSWKILWFIPFRQRQPLRVPYHFANHV	576949	526177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_527437_527981_528026_535563_535681_550197_550337_553390_553503_560672_560772_562196_562398_564972_565139_567959_568101_572765_572882_576854
898493	contig_7593_pilon	-	2579	7	Intergenic	novelGene_127358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_2	142.695090626443	127	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	32	1342	737189	705567	TRUE	20	GAAATTTAGCCTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFTSKCADLCMDYIKTNDADNEVGSSKEEIIKFTISQSPGIDPTEENVLDDSISIKNGDSSNDFVTCNDTNEDDFGDFGTASGTTPPFAPGTQDSMSDITFEESSEHFPHSSEPGDDFGEFGDTSIVSCQEEIIFTESDLKQTTDSLSEGCQLARKSTGAGVEPVSELENGQEGEFGDFDSVPNIQDDCSAFQDSDDFADFSSAGPNQVADWNAFEDGQKESCSWAAFGDQQATESHHRKEAWQSHRTDENTDTPGTPKTLSVPLATSRRAVATGQLQESATTVQTALLNRLERIFEACFPSVLVPDAEEEVTSLKHLLEASTWPGKTNETSAESGELLDVWTELQDIHDAHGLRYQWGGSHSNKKLLCSLGIDTRNILFTGNKKQPVIVPMYAAGLGMLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQVWIQSCMS	737220	694598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_717511_717635_720455_720513_720925_721053_725079_725232_736364
898494	contig_401_pilon	-	2986	24	Intergenic	novelGene_42903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	628	17	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCGTGATCTCCCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1973304	1929668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1929803_1931103_1931216_1931937_1932031_1938753_1938812_1939252_1939394_1940367_1940459_1940550_1940690_1941957_1942009_1942104_1942261_1943852_1943908_1944533_1944632_1945197_1945310_1945464_1945593_1946389_1946475_1946689_1946745_1946931_1947080_1948358_1948493_1948787_1948908_1952091_1952240_1952522_1952631_1965464_1965583_1966090_1966203_1968751_1968843_1972805
898495	contig_4364_pilon	+	546	1	Intergenic	novelGene_779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532768	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
898496	contig_7151_pilon	-	4621	5	Intergenic	novelGene_40795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	786.35106663627	7748	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	274	348	587706	587632	TRUE	25	ATACAATGTCTTTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFYSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWMPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	587979	528878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_532456_585310_586191_586357_586878_587609
898497	contig_12102_pilon	+	2058	2	Intergenic	novelGene_151054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	375	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCAGGGCTCCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40134	43517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_41185_42509
898498	contig_9839_pilon	+	3539	2	Intergenic	novelGene_88540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	930	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGCTCTAAATATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73841	83196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_74696_80511
898499	contig_2278_pilon	-	4023	2	Intergenic	novelGene_118139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	609	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACTTGCCTTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387371	1383174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1383488_1383661
898500	contig_12624_pilon	+	3779	13	Intergenic	novelGene_61043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	3431	3778	900316	903778	FALSE	35	TAAAGACAACTTCTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVKAFSASGMFSRIVCMQPMLKQILECGSWTAVKASRAPFQSFLSAASTPSFQRLMASARDMVRWKPGGREAASRQLRLGGREWVRRGVSPSRAAQLPQVLIFLAWCSECGPAS	862027	903779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_862484_863770_863948_867655_867769_867898_868003_874051_874139_875121_875186_875385_877461_878873_878933_882972_883041_884762_884813_888693_888805_900249_900335_903449
898501	contig_1275_pilon	-	2122	17	Intergenic	novelGene_108781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_16	533.949260229846	211	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1866	255	2120	513735	444494	FALSE	30	ACCCCCAGAACCCAGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTGVPARRMMKNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLP	546961	444491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_444696_448396_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470238_470266_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
898502	contig_817_pilon	+	2797	2	Intergenic	novelGene_132495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAAACTCTGTGGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771333	774321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_773115_773305
898503	contig_12964_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_131727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCCACAGAGCAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617207	614852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_614900_617200
898504	contig_17144_pilon	-	5051	14	Intergenic	novelGene_29397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	1856.62275628939	261	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	3675	4760	170784	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183238	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_176271_179700_179786_181794_181850_183158
898505	contig_3018_pilon	+	3412	1	Intergenic	novelGene_78897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2663	3052	589503	589892	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSLLILLLLLAAIESPRLTATSGTTEESPARFCTIPIILCRWTPVIHRVFTDYFQIARPFFLVYLSVDTPLKPVHDQPNRQASTDRWVVAAHEVHWAGIEPRYSIWKARILPLNHNFLLQLIILQLYP	586840	590252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_586800_590300
898506	contig_8354_pilon	-	5575	2	Intergenic	novelGene_24144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1581	junction_1	0	17	151	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACAGCCTTGTCCGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541322	534809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_538147_539084
898507	contig_15412_pilon	-	3955	5	Intergenic	novelGene_165476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_1	315.11773593373	415	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	16	609	295338	285639	FALSE	20	GTGAGGTTCTCTAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQKEKMAAVGEPVRLERDICRAIELLEKLQRSGEVPPQKLQALQRVLQSEFCNAVREVYEHVYETVDISSSPEVRANATAKATVAAFAASEGHSHPRVVELPKTEEGLGFNIMGGKEQNSPIYISRIIPGGIADRHGGLKRGDQLLSVNGVSVEGEHHEKAVELLKAAQGKVKLVVRYTPKVLEEMESRFEKMRSAKRRQQT	295353	282292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_285795_286386_286597_289661_289734_290005_290125_295301
898508	contig_17753_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_105079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGAAAGATCACAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67190	65779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_65800_67200
898509	contig_4232_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_63403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCGAGAAGTACACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
898510	contig_8452_pilon	+	2564	2	Intergenic	novelGene_48057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGACTGCCAGAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454940	480122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_455211_477828
898511	contig_9705_pilon	+	4238	30	Intergenic	novelGene_41753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	236.618116751004	5	66	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	2321	4129	530185	541303	FALSE	40	TAGAAAATGAATTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAHHISVKKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKVSIA	462681	541412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_462741_466106_466199_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524573_524661_528230_528349_529093_529276_530049_530210_534489_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229
898512	contig_4136_pilon	+	4753	27	Intergenic	novelGene_161248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.317722463999	289	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1048	3147	784	3930	155065	238026	FALSE	10	TCATGCTGCTGTTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERGAHVFSCGYQNSTRFWFPCVDSYSELCTWKLEFTVDAAMVAVSNGDLVETVYTHDMRKKTFHYMLTIPTAASNISLAIGPFEILVDPYMHEVTHFCLPQLLPLLKHTTSYLHEVFEFYEEILTCRYPYSCFKTVFIDEAYVEVAAYASMSIFSTNLLHSAMIIDETPLTRRCLAQSLAQQFFGCFISRMSWSDEWVLKGISGYIYGLWMKKTFGVNEYRHWIKEELDKIVAYELKTGGVLLHPIFGGGKEKDNPASHLHFSIKHPHTLSWEYYTMFQCKAHLVMRLIENRISMEFMLQVFNKLLSLASTASSQKFQSHMWSQMLVSTSGFLKSISNVSGKDIQPLIKQWVDQSGVVKFYGSFAFNRKRNVLELEIKQDYTSPGTQKYVGPLKVTVQELDGSFNHTLQIEENSLKHDIPCHSKSRRNKKKKIPLMNGEEVDMDLSAMDADSPLLWIRIDPDMSVLRKVEFEQADFMWQYQLRYERDVVAQQESILALEKFPTPASRLALTDILDQEQCFYRVRMSACFCLAKIANSMVSTWTGPPAMKSLFTRMFCCKTCPNIVKTNNFLSFQSYFLQKTMPVAMALLRDVHNLCPKEVLTFILDLIKYNDNRKNKFSDNYYRAEMIDALANSVTPAVSVNNEVRTLDNLNPDVRLILEEITRFLNMEKLLPSYRHTITVSCLRAIRVLQKNGHVPSDPALFKSYAEYGHFVDIRIAALEAVVDYTKVDRSYEELQWLLNMIQTDPVPYVRHKILNMLTKNPPFTKNMESPLCNEALVDQLWKLMNSGTSHDWRLRCGAVDLYFTLFGLSRPSCLPLPELGLVLNLKEKKAVLNPTIIPEAVAGNQEVASNPSSHPQLVGFQNTFSNSQDEEEIDMDTVHDSQAFISHHLNMLERPSTPGLSKYRPASSRSALVPQHSSGCDGTPTTKPPWSMELARKGTGKEQSPLEMSMHPAVAPPLSVFSKESTSSKHSDTHTHTHTHTHTHTDTQTHTHTHRHTHTHTHIHIHSKLLVICLTGTGSRIHGLLSMCCGAKLCLKQKHLPNLW	135092	238849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_135454_135850_135904_143102_143264_153424_153544_154975_155118_156358_156591_158779_158965_160081_160196_161368_161469_163776_163863_168190_168327_169366_169522_170189_170305_170868_170979_180099_180166_181557_181811_183196_183338_186001_186113_188673_188868_189729_189870_195449_195520_196514_196625_211649_211880_215622_215729_226529_226653_237274_237371_237805
898513	contig_18869_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_56417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTTGCTTTTACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74948	73727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73700_74900
898514	contig_6710_pilon	-	1243	2	Intergenic	novelGene_93400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658187	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
898515	contig_2703_pilon	+	2285	17	Intergenic	novelGene_101716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	993.299229525021	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	288	1514	559489	610815	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHDAAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRDPPGWPHAWNADGPRSVHAQHVGTKDLSIRNAHGDQQRAQQNPKRRGQNQAGAPPVPGSVSGNLWNVHTGV	526179	611735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599674_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610756_611276_611424
898517	contig_16205_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_156890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGATGATGTGTTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111997	113911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_112000_113900
898518	contig_5019_pilon	-	1562	13	Intergenic	novelGene_109237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	471.936760123171	318	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	791	1423	432315	404842	FALSE	35	ATATTGGTATAATTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLVEKEERKKITQQESTEAAAEELNQLISLADENQSKESSSFKTEDGKGILSALDKSSAHNACSGPVDELLDMKPEEGACLGPMAGAMEPEGADKDDLLLLNEIFNASSLEEGEFSKEWAAVFGDSRLKEPAPAMAPGEPDPKPQAGSGFLPSQLLDQNMKALQASLQEPAKAASDLTAWFSLFADLDPLSNPDAVGKTDKEHELLNA	527764	404702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_404964_416367_416638_426878_426921_427019_427083_429674_429728_432232_432331_444197_444297_444642_444653_505172_505372_509192_509317_517865_517939_521461_521628_527660
898519	contig_8964_pilon	+	2246	3	Intergenic	novelGene_168701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGCGTCTTCAGTAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541925	549466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_543519_547369_547455_548898
898520	contig_12464_pilon	-	4476	6	Intergenic	novelGene_68701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	103.543227687763	98	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	1883	3808	357758	337140	FALSE	35	ATTAACTTAACCTTCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	359640	336471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347
898521	contig_14882_pilon	-	2858	9	Intergenic	novelGene_114994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_8	94.3341799137513	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	849	2008	2856	251664	230092	FALSE	70	AAAAGAAAATAAAAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSSDYYNKDNEEESLLANVASIRHELKITEWSLQNLGEELSSVSTSETSDYACNSSRFERLILEDLAQPSHPGLLTYSPYKKVCKLSSGNTDSHKKPRDKVSFAFSTPMDQEIKSLREKLNKLRQQNACLVSQNHSLMTKVESIHFELTQSKAKVSMLESAQQQAANVPILEEQIINLEAEVSAQDKVLREAEDKLEQSQKMVIEKEQSLQKSQEECIKLKVDLLEQSKQGKRAERQRNEALYNAEELSKAFQQYKEKVAEKLEKVQAEEEILEKNLINC	256190	230089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_230137_233727_233825_237873_238003_239933_240041_247287_247450_250927_251103_251530_251667_253004_253176_254356
898522	contig_9098_pilon	-	1716	11	Intergenic	novelGene_75843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	151.177412333986	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	38	868	355822	337551	TRUE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTIHHPAKDPEMSWPAQVRRGLGWSLQGVLPAPGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLRSCWSIFVKERF	355859	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355755
898523	contig_16369_pilon	-	2633	3	Intergenic	novelGene_98692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	26	301	16597	13251	TRUE	45	TATTTAGAAAATTAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTPPYQWMSLCSLTPPSTKSTTAWMTSLQVATVFWRDRAQRLTLKGTQKKILDIANMLGLSNTVMRLIEKQAFQDRYFMIGGMLLTCVVMVLVVHYLT	16622	10603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_11658_11972_13413_16483
898524	contig_10014_pilon	+	1410	2	Intergenic	novelGene_174559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	166	junction_1	0	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCAGCAGTTCTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6909	8602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10014_pilon_+_6949_7231
898525	contig_7963_pilon	+	1334	6	Intergenic	novelGene_58391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1368.62158393034	11	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	67	1041	51450	63047	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPLAVLHSVTNYPSFTFIPELSLFCGLSNVSTSLLRIFWRLEAFRLSSIGAKSYHFKVLCDKIYVKSEDLRDI	51383	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_62651_62822_63003
898526	contig_6102_pilon	+	1630	5	Intergenic	novelGene_32043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCAGTCTAGGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553677	556904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_553841_554182_554274_554433_555532_555694_555802_556733
898527	contig_3721_pilon	+	7941	11	Intergenic	novelGene_123787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.339212180586	672	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	5027	6385	63865	102235	FALSE	20	CTCTTTGTGTTGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTADQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	44210	103791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_49191_63818_63977_69505_69581_72136_72197_80561_80604_81608_81660_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450
898528	contig_9903_pilon	-	4368	8	Intergenic	novelGene_172004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	66.957799685888	454	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	211	801	106166	82602	TRUE	40	AGAAGGAAATTTGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCEKAMELIRELHHTPEGQLPAFNEDGLRQILEEMKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106376	78956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_81379_81456_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106091
898529	contig_6552_pilon	-	2484	17	Intergenic	novelGene_163597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_14	134.894967822191	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	51	1892	201623	118556	FALSE	25	CAAGAGCTGTCTTTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIGIFNGRRRSDQKTEMNLNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDISKIKCVEIVKNDDCVIPCQNKYPFQVVHDSNTLYIFAPSVQSRDRWVKKLKEDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNIFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPPEEEDNSEEVVVAMYDFQATEPHDLRLDRGQEYIILEKNDVHWWRARDKYGREGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGMYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIVEYHKHNAAGLATRLRYPVSVKVKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKTIREGAMCEEDFIEEAKLMMKLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVAEFMERGCLLNFLRQRQGHFNRDVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVNEAGIVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKNTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASKYIYEVMLRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEESFGR	201673	117963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_118640_120607_120766_120845_120965_123920_123986_129130_129348_129465_129638_130619_130695_131249_131384_132497_132578_136022_136078_140430_140497_147956_148133_149263_149305_151491_151567_152321_152404_157736_157842_201485
898530	contig_16385_pilon	+	1888	16	Intergenic	novelGene_86189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_8	143.183735885827	328	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	49	1707	3004	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
898531	contig_15687_pilon	+	2001	16	Intergenic	novelGene_129137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	103	junction_15	155.647750456671	12	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1626	376	2001	136562	183037	FALSE	25	ATCATGAAATTGCTGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLQIVDRAIQVVRSALANQIDWTEIGLIVKEAQAQGDPVANAIKELKLQTNHVTMLLRNPYLLSEEEDDDIDGNIGVEKNETEPPKGKKKKQKNKQLQKPQKNKPLPVDVDLSLSAYANAKKYYDHKRYAAKKTQKTVEAAEKAFKSAEKKTKQTLKEVQTVTSIQKARKVYWFEKFLWFISSENYLIIGGRDQQQNEIIVKRYLTAGDIYVHADLHGATSCVIKNPTGEPIPPRTLTEAGTMALCYSAAWDARVITSAWWVYHHQVSKTAPTGEYLTTGSFMIRGKKNFLPPSYLMMGFSFLFKVDESCVWRHRSERKVRVQDEDMETLASCTSELISEEMEQLDGGDSSSEEGKDELHETPVEIELMTQIDQEGITVQSGGDELNEDLIQEESSEDEGESEEVVKDEELVGEMKDEEEEILNYPDTTIDLSHLQSQRSLQKLASKEESSNLSDSKLQSRRHLSAKERREMKKKKLPNDSGDLEEIEGKDKEKESALHSETHQNTSKNFPAGQPVKRGQKSKMKKMKEKYKDQDEEEREL	136100	183037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_136443_136528_136738_136974_137167_137404_137469_140141_140231_151593_151698_152081_152145_157778_157892_159247_159306_159998_160058_160145_160267_161641_161922_162636_162680_162851_162902_164689_164844_182977
898532	contig_16067_pilon	-	4377	2	Intergenic	novelGene_169848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	805	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74651	69471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_-_73644_74446
898533	contig_12635_pilon	+	2244	15	Intergenic	novelGene_60865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1711	2010	644081	649791	TRUE	30	GAAACCAAACGCCCCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPCHDLSVEIFIFTKYFRCSCNLAMNSVPGVMQLESNRASVGRVSPFSIAFLILSSASFADLKRLPRCWFIFARGATPSTAIKNTFLGLIMRNKTSK	621126	656055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_621157_621260_621371_622265_622442_630735_630858_632348_632951_639638_639773_640326_640391_641191_641362_641444_641536_642491_642573_643853_643965_644061_644171_645358_645456_649678_649914_655943
898534	contig_7411_pilon	-	796	3	Intergenic	novelGene_136980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	14	165	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTTGTGTTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150076	146483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_147019_149590_149673_149897
898535	contig_4924_pilon	-	2570	13	Intergenic	novelGene_84657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	704.712722201986	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	119	1324	155859	65524	TRUE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252587	62881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197812_252502
898536	contig_17470_pilon	-	4725	17	Intergenic	novelGene_110491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.091939910294	1588	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	136	2436	194551	179466	TRUE	25	TTCCTCACAGGCCACACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDTPESLMALCTDFCLRNLDGTLGYLLDKETLRLHPDIFLPSEICDRLVNEYVELVNAACNFEPHESFFSLFSDPRSTRLTRIHLREDLVQDQDLEAIRKQDLVELYLTNCEKLSAKSLQTLRSFSHTLVSLSLFGCTNIFYEEDNPGGCEDECLVNPTCQVLVKDFTFEGFSRLRFLNLGRMIDGVPVETLLRPLNSLAALDLSGIQTSDAAFLTQWKDSLVSLVLYNMDLSDDHIRVIVQLHKLRHLDISRDRLSSYYKFKLTRKVLSLFVQKLGNLMSLDISGHMILENCSISKMDEEAGQTSIEPSKSSIMPFRALKRPLQFLGLFETSLCRLTHIPAYKVSGDKNEEQVLNAIEAYTEHRPEITSRAINLLFDIARIERCNQLLRALKLVITALKCHKYDKNIQVTGSAALFYLTNSEYRSEQSVKLRRQVIQVVLNGMESYQEVTVQRNCCLTLCNFSIPEELEFQYRRVNELLLSILNPTRQDESIQRIAVHLCNALVCQVDNDHKEAVGKMGFVVTMLKLIQKKLLDKICDQVMEFSWSALWNITDETPDNCEMFLNFNGMKLFLDCLKEFPEKQELHRNMLGLLGNVAEVKELRPQLMTSQFISVFSNLLESKADGIEVSYNACGVLSHIMFDGPEAWGICEPQREEVEERMWAAIQSWDINSRRNINYRSFEPILRLLPQGISPVSQHWATWALYNLVSVYPDKYCPLLIKEGGMPLLRDMIKMATARQETKEMARKVIEHCSNFKEENMDTSR	210789	177079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_179280_179376_179524_181354_181458_183189_183288_184336_184526_184938_185055_185744_185865_186031_186074_187132_187349_190267_190442_190817_190965_191133_191249_191780_191958_192291_192729_192918_193070_194393_194645_210747
898537	contig_16846_pilon	+	599	4	Intergenic	novelGene_82893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	389.83101752198	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTTCTCTATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375887	413462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_375928_401042_401145_411066_411103_413041
898538	contig_3627_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_78511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATAAATGAACTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621355	623050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621400_623000
898539	contig_10304_pilon	-	1805	3	Intergenic	novelGene_166499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	746	1636	252476	251132	FALSE	65	AAAAAAAAAAGCAACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPCRKGQRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKSNTCSLQTAPREPPARARRIQAAGSPGSRACGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKRGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKKQHLQPTNGTQGAARPGARNLSSRQPWVQSLRPRERQARNQKKQKKQHQHPTNGPQRAARPGARNPSSQQPWVKSLRPQEAEEQTNKGPGI	253221	250962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_-_251303_251461_251794_252088
898540	contig_15323_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_148521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAAACGGGGGTTTTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89270	86955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_87000_89300
898541	contig_14522_pilon	-	2401	8	Intergenic	novelGene_147311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	329.297024906459	2	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	55	1047	175672	66429	TRUE	15	GCCCACCCCACTTTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPTQTLSPNGENNNDIIQDNGTIIPFRKHTVRGERSYSWGMAVNVYSTSITQETMSRHDIIAWVNDIVSLNYTKVEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCISLKKVKFQAKLEHEYIHNFKLLQASFKRMNVDKVIPVEKLVKGRFQDNLDFIQWFKKFYDANYDGKEYDPVEARQGQDAIPPPDPGEQIFNLPKKSHHANSPTAGAAKSSPASKPGSTPSRPSSAKRASSSSSASKSDKDLETQVLQLNEQVHSLKLALEGVEKERDFYFGKLREIELLCQEHGQENDLVQRLMEILYASEGGPHRRTGSRGACPRTAAPAAGRVLNRLSSS	175726	65031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_65679_65721_66524_78942_79094_85705_85846_110925_111140_118926_119073_146750_146879_175553
898542	contig_11572_pilon	-	3545	16	Intergenic	novelGene_100075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_3	72.7871783580964	366	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	11	1504	405233	363076	FALSE	45	TGGACATAATAATATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDICEDSDIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQNVIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIANLIEECGGLEKIEQLQNHENEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGTFGFNSSANVPTEGFQF	405243	361034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_363175_365143_365239_368013_368177_369449_369522_378054_378160_379498_379628_384626_384759_391177_391223_391317_391488_394172_394260_397858_397945_398452_398549_403926_403980_404069_404100_404204_404295_405191
898543	contig_10642_pilon	+	3668	6	Intergenic	novelGene_78669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGGGCGGGCGGCCGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175625	241362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_178084_181157_181371_185224_185367_222007_222703_225746_225808_241263
898544	contig_5039_pilon	+	2855	1	Intergenic	novelGene_65051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	571	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1820361	1823216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1820400_1823200
898545	contig_18162_pilon	-	2747	3	Intergenic	novelGene_122327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	472	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGGAGTTGTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
898548	contig_20641_pilon	+	1743	7	Intergenic	novelGene_52828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	62	1453	14599	56882	FALSE	50	AAAAAAGATCTCTGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14537	57172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
898550	contig_13481_pilon	+	3133	1	Intergenic	novelGene_119280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159492	162625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_159500_162600
898551	contig_14508_pilon	+	4504	4	Intergenic	novelGene_79039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATACTGAGCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36077	58326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_37085_49687_49733_54504_54541_54910
898552	contig_5429_pilon	-	2259	7	Intergenic	novelGene_127824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	241.67385046794	583	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	127	768	605763	600615	FALSE	30	GAGGGAAACACTCACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRKPRSFSGRGKSDGERLQRAPPRAGTARARLLRTGPRRQKNMAQETNQTPGPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQQNSGRMSPMGTASGSNSPTSDSASVQRADASLNNCEGAAGSTSEKSRNVPVAALPVTQQMTEMSISREDKITTPKTEVSEPVVTQPSPSVSQPSTSQSEEKAPELPKPKKNRCFMCRKKVGLTGFDCRCGNLFCGLHRYSDKHNCPYDYKAEAAAKIRKENPVVVAEKIQRI	610753	599123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_600764_602142_602269_604336_604441_605088_605201_605612_605773_610291_610346_610690
898553	contig_3018_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_78938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGTCTTCCATCCTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675104	673358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_673400_675100
898555	contig_2480_pilon	-	2025	2	Intergenic	novelGene_63546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTCAGTTCTGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280444	278279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_278781_278920
898557	contig_18194_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_55962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	259	987	5370	4642	FALSE	70	CAAAAATAAAAATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	7162	4097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034
898558	contig_19744_pilon	-	4395	30	Intergenic	novelGene_120350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	908	1216	100560	96214	TRUE	40	ATTTAACAGATCCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVFSSSDNSAHHRESSATVFIFFIGFTQKLGLQISIKFTPIVQYLWNLSSGLVCAITTQAARAECKCDTIRALNCGHSSIPIGCTASIVPQAHSIFNIFL	116074	9122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_9329_11792_11937_12237_12341_28544_28662_29607_29691_41634_41755_47388_47592_48603_48758_66013_66185_67266_67397_67483_67610_72994_73085_75255_75394_77723_77801_81249_81351_84369_84562_85056_85332_88246_88469_92554_92747_94750_94960_96087_96215_97723_97906_100434_100579_101976_102076_102937_103160_107539_107765_109164_109285_109894_109979_112275_112329_115988
898559	contig_5794_pilon	-	1998	9	Intergenic	novelGene_69799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	788	junction_8	4574.12868581274	1070	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	521	1183	746889	743712	FALSE	45	TGAAAAATCTCAAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749537	742896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747245_747330_747454_749495
898560	contig_5423_pilon	+	4252	21	Intergenic	novelGene_85157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACCAGGAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16909	207763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_17100_17583_17693_56841_56948_63171_63316_70033_70226_95538_95660_96865_96993_124096_124223_127216_127471_129556_129758_130382_130508_134496_134621_134740_134830_165178_165352_166554_166723_168773_168832_171428_171559_178065_178259_204307_204458_205819_205967_206438
898561	contig_18420_pilon	+	1337	2	Intergenic	novelGene_109338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	294	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	207	521	75111	76037	FALSE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKIEVVKDFILLGSTTDLFVLLAVRGIVNILRQHHNSKASSLLSSSLYHCLAFTCIYQVIENTTAWVRCTSVLKVTSLLFNTLKRSFAADLPSAMCLLIS	74904	76853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_75168_75779
898563	contig_10765_pilon	+	2594	2	Intergenic	novelGene_122928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1364	1666	199313	202920	FALSE	25	ACTTCATGCACCTGGCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGHRLLHSLIWRRARPRSLFFRHSSMAWMAASVDVKVGSDQAPPVSKGSPARAAAASFRFFFRSLSSLDMFSSCWDGRKKMLTVLRLGRMARPQRQEI	197949	203848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_199339_202643
898564	contig_5684_pilon	+	2615	4	Intergenic	novelGene_81042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.2815043060443	36	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1333	1968	443165	447039	FALSE	15	TTTTGAATTTCTCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVILITWQCHHRGRKPKTKGIAGSMATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403578	447686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403748_442001_443223_443891_443949_446518
898565	contig_3252_pilon	-	6288	22	Intergenic	novelGene_61479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	3934	4686	189473	187808	TRUE	55	TGTAAAGTACAATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDPSCRKGSPDCFSFFTLLTSFSTDWPTFRGAVRGRPLGACFPLPLPSNSSALRSPLGPSFPIRCSGIPFRPVLACSCSSESLKSDRSLLVLESESCLQAKLRSSSENLFTASKGALFSCEKSVGEARKPPECLPKTVLKVLRRGLSCCPGPTVGLSSVGLEERVGISMGWVRLLVGELERPFPMVDRLGPPVLRVEPRTPGTSLEESVVMKRVFFFAKVAESAEECDSGQLGAALEVTVVAEEELPDA	223040	175225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_175338_176367_176475_178608_178731_180318_180396_183359_183960_187223_188474_189386_189589_194248_194466_195484_195637_207152_207259_208544_208674_209965_210246_211630_211890_214392_214658_215603_215778_216163_216253_216389_216525_217373_217491_218476_218617_218888_219064_219567_219702_221594
898567	contig_6137_pilon	+	10455	16	Intergenic	novelGene_59214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1352	junction_15	815.072910167482	11	155	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	7894	9369	1328176	1353702	FALSE	30	AAATGTATATGCATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1311947	1354788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
898568	contig_10437_pilon	+	1782	10	Intergenic	novelGene_38194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	547.779445568793	6	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	107	952	229668	232651	FALSE	30	CAAGTGTCCGAGACTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPRGPAGYISPLTERPEWLEEPPFCLPSPGAFSPRMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFGHPILNNNHHKND	225159	233481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225265_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232010_232608
898569	contig_11493_pilon	-	7118	4	Intergenic	novelGene_143691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	494.338840158134	723	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2273	2788	201170	196847	FALSE	35	AACATGATTTTGTTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEGIFSGTFRFCYLIKLYSIISTILNFDFFPLRC	395600	192516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_197080_197522_197698_201062_203060_395217
898570	contig_2799_pilon	-	3288	1	Intergenic	novelGene_85551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAACATCAGGGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712320	709032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_709000_712300
898571	contig_720_pilon	-	4067	1	Intergenic	novelGene_155172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	642	944	219718	219416	NA	30	GGAGCTGTCCCAGGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIQNSETILTVIGFIREVTGYNLGPRILRIQFFEQDSFLSAMSTGSPLCGPRPLEQASALLGQVSQSSFSSTSKCPETPCSASKPHPRVLSSRTVGQQT	220359	216292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_216300_220400
898572	contig_6929_pilon	+	1257	8	Intergenic	novelGene_139388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	5441.14094802979	30	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	478	858	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTESAAQETDLEEKRLSATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	102448	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_102501_102603_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
898573	contig_18592_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_114763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGTATCGCCCATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894	3438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_+_900_3400
898574	contig_11413_pilon	+	2221	3	Intergenic	novelGene_103153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGCTCCTTGGAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283811	305119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_284316_294622_294714_303493
898575	contig_3270_pilon	+	1936	5	Intergenic	novelGene_104494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATATTTAGTCTTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341089	360225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_341895_341944_342734_357557_357661_359586_359793_360192
898576	contig_12019_pilon	+	2489	11	Intergenic	novelGene_87732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	141.468017587015	29	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	30	1034	623205	639796	TRUE	50	ATGCATAAAAATATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRRAGASAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETGGES	623175	643211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637900_639777_639833_639942_640142_641782_641874_642082
898577	contig_7272_pilon	+	3056	1	Intergenic	novelGene_25283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	175	516	307261	307602	NA	25	GACTTTGTGCCATAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFRQSVDVTNMNCQKHKVLKAPHKTRLISSTVFPLNKAFPKPHEPLDAASGDSENSDLTLWLISELPEFRELWGEGCSKQRKCKHSIINKNKFAIIYINIDGFMNKHNITF	307086	310142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_307100_310100
898578	contig_9471_pilon	-	2328	2	Intergenic	novelGene_21741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1537	1950	229717	229156	FALSE	75	AAAAAAAAACCCACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLAVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCLNSWIILNIRDLNSLSVRSSAFSFTGMSTGVLFWTPTGTILSCFCKCFDTVCCLRGIQWLFSSFTYCRFVCFVLLFCFICLGLSRQAG	231253	228777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_229162_229309
898579	contig_4742_pilon	+	3924	15	Intergenic	novelGene_130979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	319.002207144818	54	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1036	3108	816	3923	254375	284920	FALSE	45	GCCCCAGAACAAATGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGLLKHTPTNEKNKYIDDTVKHKVKILKRESGEGKNSSECRDSEIKKWQLAPVRKMGQPVLPRRSSEEKSEKITKESTTVTCTGEKASKLGTHEKQEIKKKKVDKGGVPNVHPSAASTSKPSADQIRQSVRHSLKDILMKRLTDSNLKVPEEKAAKVATKIEKELFSFFRDTDAKYKNKYRSLMFNLKDPKNSILFKKVLKGEVTPDHLIRMSPEELASKELAAWRRRENRHTIEMIEKEQREVERRPITKITHKGEIEIESDAPMKEQEAAMEIQEPTANKSLEKIEESEKQKEEIDSMSKDTTSQHRQHLFDLNCKICIGRMAPPVDDLSPKKVKVVVGVSRKHSDNEAESIADALSSTSNILASDFFEDEKQESPKSTFSPVSRPEMPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGLELHRPNLLLGLIIRQKLKRQHSASASTGHAAEAPESVPMSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPKAEKIDKIEEVADGEAKEVKVKVDNHSEATGNSVAVEEETSVPGSSSISPGLLTNLSLRGKPPDISTEAFLTNLSIQSKQEETGDSKERTLKRQLLQDQENNSQDNWTSDTGSPGRSNVGKGSTDGNMSCNDSLVANTRSPQFINLKRDPRQAAGRSQQISTSESKDGENCRNGEKHAPPGLSQNKEHLTEQTSVDEKSSSVEKNSCVQQSDNSSIPQNSASEENIHTFQTEQAKPVQEDVLMQNIETVHLLRRGSAVTTSHFEAGNTCQPDFPSKSINFTSRST	190887	284921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_201374_201644_242103_242266_254295_254606_263142_263327_267145_267297_267378_267536_268999_269117_270854_270987_271584_271721_276598_276795_278132_278281_280583_280674_283132_283329_283550
898580	contig_18592_pilon	-	4691	1	Intergenic	novelGene_114778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTTTCTCCATTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	8106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_8100_12800
898581	contig_5039_pilon	-	4699	5	Intergenic	novelGene_64973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	397	junction_3	560.266175580857	306	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	4	1587	1676350	1674767	TRUE	35	TTAATAAACAGTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTHIIKGMNLIPSDSNLAPEIGMQEITMYSSEEPPAEEHLKSDSYGSEWGMSIDLNVNNHLIAKEMEHSTVSTASTGGVGEVGEEKILPVNETEQCTALLTCPGVSEAEVGGTLSSTDPLALELDAKGTSKGIEFATASAFSSVNTYDVEVSLTTQDTERDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDVHLGLPTNHNLIGEDAEGPLPVKESDQAVAVALSPKESSGEDKEVPVPTEEILPDSGFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTNLRAGIEGPLLPSEVERDKSAASPGVIGLPERASESSSEEKDDYEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRSRSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSVSPSRRSRTRAVGAAPRAVGAAPRADGAAPRADGAAPRAVGAAPRAVGEDQGLW	1676353	1669691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1670463_1670568_1670761_1670976_1672821_1673047_1673209_1674622
898582	contig_10263_pilon	+	4145	5	Intergenic	novelGene_135845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	679	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAGTGTGGACTACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877584	891474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_880993_881453_881645_888386_888585_890020_890222_891327
898583	contig_4079_pilon	-	5712	2	Intergenic	novelGene_167476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	105	1334	132968	131739	FALSE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVCVLTEHSKLFLQRVLQNVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKESKACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGLPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI	133129	127360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_133015_133071
898584	contig_4857_pilon	-	3582	4	Intergenic	novelGene_48762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	817.454993664279	14	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	698	1009	1214648	1212207	TRUE	5	TTTTATTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1215345	1209586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210577_1210623_1212354_1213435_1213529_1214576
898586	contig_1244_pilon	+	2281	22	Intergenic	novelGene_37911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	154.580993161229	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	813	2177	281635	294829	FALSE	25	GAAGAAAGCTGGTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHYARDDTHYLLYIYDKTRLELWERGNGQPVQLQVVWQRSRDICLKKFIKPIFTDESYLELYRKQKKHLNTQQLTAFQLLFAWRDKTARREDESYGYVLPNHMMLKIAEELPKEPQGIIACCNPVPPLVRQQINEMHLLIQQAREMPLLKSEVAAGVKKSGPLPNPERLENVLFGPHDCSHAPPDGYPIIPTSGPVPVQNQASLFPDQKEEEASLDTKCLIATAVITLFNEPSAEENGKWPLTVAQKKAQSIMESFENPFRMYLPSLEHRAHISQAAKLDPSSKIYEISNRWKLASQVQVQKESKETAKKKAAEQTAAREQAKEEYKATAEQAMSVRQQATLENAAKKRERTISDPRTTDQKQGKKRLKISKKPKDPDPAEKEFTPYDYSRSDFKAFAGNSKSKPSQFDPNKQTQSGKKCIAAKKLKQPTGNKSMSFPTGKSDRGFRHNWPKR	260480	294933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_260599_262586_262724_266552_266677_273675_273781_274112_274279_274467_274544_280538_280609_281618_281776_281917_282067_282243_282295_282949_283062_284465_284517_284679_284759_284858_284969_287074_287171_287422_287498_289999_290088_291705_291780_292446_292619_293412_293472_294003_294081_294798
898587	contig_1349_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_171643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTTTTAATAAGAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232047	230424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_230400_232000
898588	contig_7066_pilon	+	8631	2	Intergenic	novelGene_42142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	717	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCGACTGCGCAGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746973	757861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_749990_752246
898590	contig_854_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_36190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492135	490378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_490400_492100
898591	contig_11258_pilon	+	3475	7	Intergenic	novelGene_67796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	190.147676527716	60	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1185	1934	283618	289530	TRUE	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWGEEASGRLTSGALLTQACPGAERGLGLCFPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKCALLLNCSPASTRLP	282433	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_284075_285643_285795_288174_288270_289483_289961_291348_291387_291794_291915_292450
898592	contig_3463_pilon	-	2134	15	Intergenic	novelGene_62003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_12	158.081353377665	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	97	1719	597436	508757	FALSE	15	TGTGAAGATCCTTCTCGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTDGHTLSEKRNYQVTNSMFGASRKKFVEGVDSDYHDENMYYSQSSMFPHRSEKDMLASPSTSGQLSQFGASLYGQQSALGLPMRGMSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597532	508341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542314_551883_552007_597388
898593	contig_4924_pilon	-	4697	6	Intergenic	novelGene_84732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_2	1341.22192048892	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	69	740	252576	127717	FALSE	65	CAAACAAAAAAAAAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHRAALTLPPGSVFDSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGW	252644	123759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
898594	contig_7593_pilon	+	1210	5	Intergenic	novelGene_127299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	381	junction_2	74.119413786133	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	473	595	198490	198612	FALSE	25	CTGTATGGTGATAAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC	183166	199227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_183240_192341_192438_196398_196495_198038_198171_198414
898595	contig_14986_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_59726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1539	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	746	1756	151004	152053	FALSE	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150258	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151727_151765
898596	contig_1380_pilon	+	3644	17	Intergenic	novelGene_138860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_15	164.682732378808	98	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	121	1644	3310	107161	FALSE	35	TACACTGTATATATGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRNQLSTLPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPHQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLAIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHSMERPHLHQHVEDSKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEDQIKEDVCHHLSPVKAGECLQEFQPEPSLLGDNDNSGEERDQFTEGAEVLSSEFINYIKGRAEDCEELLRIEEDAHWPPEGLISSSKTQDMDMMMIEQLREAVDLLQDPTRLSTDITERRVVNLYPVESAEALELEYTALNGQMQLETSPLCEVQNDLTSRSNGSQYSPNEMSENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITVQALLDVTVKNALFT	3189	109161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_3319_21462_21569_26778_26916_29228_29357_30865_30930_34168_34272_36621_36753_41653_41722_43954_44042_47073_47164_47268_47306_50529_50584_51343_51417_64119_64230_76950_77089_85291_85370_107050
898598	contig_2892_pilon	-	2458	7	Intergenic	novelGene_118976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	53.8622213512299	245	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	174	602	100546	12538	FALSE	10	CATTTGAGTCTTCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASDCPNVVIEGVLHGIFYPHVQPR	130483	10681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_130331
898599	contig_10058_pilon	+	2088	10	Intergenic	novelGene_67712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	152.47351520676	9	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	81	899	72602	99369	TRUE	25	GTTTGTTTAAATTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72521	101647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100265_101227
898600	contig_401_pilon	-	4823	11	Intergenic	novelGene_42757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	619	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTAAGGCCCTACCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000783	978462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_979710_982124_982277_983712_983814_984709_984885_985463_985588_986749_986868_987406_987763_988966_989104_990032_990197_998221_998311_998623
898601	contig_19402_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_80860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	732	1076	167276	167620	NA	40	AGGGGATAAGGTACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAFSLSPWPSLWPDSDLACSRSFDTERDRDLDWERSVSSFFFLLLPDLLSRLPPRFLLRSLLLGLRLRLRLSSRLLFLPFLLSLLLLRLLLRLLLPPLLLLLLRLLLSRRLCS	166544	169062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_166500_169100
898602	contig_18544_pilon	-	2515	7	Intergenic	novelGene_152745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	364.593228437148	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	209	790	54710	39640	FALSE	80	CCAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAIKLNS	54974	37914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_39654_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54840_54895
898603	contig_11708_pilon	+	4702	8	Intergenic	novelGene_138984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	300.410603361874	727	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	240	908	368665	394863	TRUE	40	AAAATACTCAAGTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGGGGAAAGRAYSFKVVLLGEGCVGKTSLVLRYCENKFNDKHITTLQASFLTKKLNIGGKRVNLAIWDTAGQERFHALGPIYYRDSNGAILVYDITDEDSFQKVKNWVKELRKMLGNEICLCIVGNKIDLEKERHVSIQEAESYAESVGAKHYHTSAKQNKGIEELFLDLCKRMIETAQVDERAKGNGSSQPGAARRGVQIIDDEPQAQSGGGGCCSSG	368425	399320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_368815_381081_381142_381835_381944_384795_384860_391152_391208_391708_391798_394720_396654_397316
898604	contig_19990_pilon	-	4923	1	Intergenic	novelGene_30754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1663	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	4250	4555	43055	42750	NA	35	ACGCAGGAACACAGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPSLGSGFLILAWPQSAGFQTGLHIFLSQFSRSVHASKVIKRFLQCSLCRVPRNRRKGNKGCLRSQSQRRPWVVQMLTCRRLTERLELRTTQRHLRRTY	47304	42381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_42400_47300
898605	contig_8617_pilon	-	1016	2	Intergenic	novelGene_73377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAACCAGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61818	60677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60685_60809
898606	SIRV6	+	1002	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	508	18	-13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	113	26	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	30	GGCGATGACTATGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898607	contig_9809_pilon	-	5008	9	Intergenic	novelGene_176750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	4695	5006	108945	108242	FALSE	15	CCGGAAGTGTTCCTAGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFCISKSSTLFSFLPCNWGGGPRAGSAADPRRLRKCGLSCCSFRSRESSDGPWQFSDCRRRSRSMARTCWTRRPVGCQLLLFRAHYFSPSVSEAPIPFASTVA	118730	108239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_108510_108901_109027_110408_110494_110650_110781_111179_111336_111744_111818_112240_112362_112466_112589_114804
898608	contig_11253_pilon	-	2194	18	Intergenic	novelGene_126851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	107.828423238641	263	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	143	1924	323253	285594	FALSE	25	TATCTACTATTTCTAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDHKCSFGYFEFEVHSRCSGGDTGYKDLKLRERSKLQMLLEEEMAGGLSQGFFMEELNKYHQKHNVTVKYHELSNTGPPHDLRFTFQVIINDREFPTAEGKTKKKAKNAAAKIALEILDEESKVVSSLSLPTADTSEGLSIKNYIGRVNMYAQKKKLSVNYEQCFVNELRESEVKSSPRFHYTCQIGQKEYGIATGSTKQEAKQRAAKLAYDEIRAEETSAKADPTSSGSYTTASTDSSGISSVTSTSTTESLPENELSASESEQKHNGDSSKDSFSPSMDSPRNSQRKIKINLAPKFDCLEAEEVKNSKYTMNSRFVKDFEEIEPIGTGGYGQVFKAKHRIDKKTYVIKRVKYDNEKVEREVKALASLNHVNIVHYHNCWAGDDYDPEISINKSRSMTKCLFIQMEFCDKGTLEQWIDNRRDKKSDKDLALDLFEQITKGVAYIHSKRLIHRDLKPSNIFLVHTKQVKIGDFGLVTTLKNDEKRTVEKGTLLYMSPEQMSSPEYGNEVDIFTLGLILAELLHVCTTVQETVKIFGKLRKGFFPDVFDPKEKNLLQKLLAKDPKKRLPAPEILKTLNEWKTGPEEKKPNTC	330719	285323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_285717_285794_285849_287324_287427_291213_291343_297308_297490_298938_299056_302790_302914_305085_305158_307594_307630_309859_309957_310112_310193_310548_310685_317843_318002_319766_319888_320246_320382_323134_323305_329259_329328_330696
898609	contig_20314_pilon	+	2512	4	Intergenic	novelGene_125643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATATGTCTCTGTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5752	43780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_6825_6893_7804_11320_11576_43505
898610	contig_5791_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_35873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	795	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGGATTTCTCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094014	1092292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1092300_1094000
898611	contig_14142_pilon	-	2303	13	Intergenic	novelGene_120458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	184.195604815461	123	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	457	2124	102717	98719	FALSE	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATDPADTVDTAEPADSGTEQLPPPIQAKEESGGVVVAAGPGSSKRRQKEHRRHRRACKDSVGRRPREGRAKAPKEKSRRVLGNLDLQSEEIQGREKARPELSGASKAKPPTAPASSLVPAPSAQPTPPSAPVPGKKAQEEAPGPPGVSRADMLKLRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVVRASKNAKVKGKFRESYLSPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRTEELAQAYDAFTLAPASTSR	103173	98539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98743_98845_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080_101287_102074_102181_102304_102432_102541
898612	contig_14209_pilon	+	3080	5	Intergenic	novelGene_88359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	170	junction_2	143.981552637829	25	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2301	2696	40155	40625	FALSE	15	CTTAGGGGAGCCTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYDVLCVADMYLLPGLKRLCGRSLAQLLDEDSVVGVWRVAKLFRLARLEDQCTEYMAKVIEKLVEREDFTQAVREEAAAVAARQETDSIPLVDDIRFHVASTVQTYSAIEEAQQRLRALEDLLVAMGLDC	36119	41009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_+_37218_37300_37421_37712_38783_40142_40344_40418
898613	contig_10988_pilon	+	4750	1	Intergenic	novelGene_104719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	60	440	31782	32162	NA	30	AGACCCAGCCCTCCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQHKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKNRQIHGKCRQKNGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQDFRNGQCHRRAEEQI	31722	36472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_31700_36500
898614	contig_9112_pilon	+	1691	5	Intergenic	novelGene_60198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	433.055640189572	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108337	114773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_110461_110528_111553_112128_113625_113750_114251
898615	contig_4845_pilon	-	4047	17	Intergenic	novelGene_53628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_16	83.5235745164202	199	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	321	1763	265176	228128	FALSE	20	TTTTTTTCTGTACTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDLSSQDRKDLDKFIKFFALKTVQVIVQARLGEKICTRSSSSPTGSDWFNLAIKDIPEVTHEAKKALAGQLPAVGRSMCVEISLKTSEGDSMELEIWCLEMNEKCDKEIKVSYTVYNRLSLLLKSLLAITRVTPAYRLSRKQGHEYVILYRIYFGEVQLNGLGEGFQTVRVGTVGTPVGTITLSCAYRINLAFMSTRQFERTPPIMGIIIDHFVDRPYPSTSPMHPCNYRTAGEDTGLTYPSVEDSQEVCTTSFSTSPPTQLMVPGKEGGLPLAPNQPAHGAQADQERLATYTPSDGAHCAATPSSSEDTETVSNSSEGRASPNDVLETIFVRKVGAFVNKPINQVTLTSLDIPFAMFAPKNLELEDADPMVNPPDSPETGSPLQGSLHSEGSSGGSSGNTHDDFVMINFKPAFSKDDILPMDLGTFYREFQNPPQLSSLSIDIGAQSMAEDLDSLPEKLAVHEKNVREFDAFVETLQ	284075	225843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_228206_230043_230173_230552_230670_230890_230969_231554_231670_233978_234116_245973_246068_246923_247023_247373_247471_248206_248248_252334_252476_253656_253704_263479_263600_264064_264146_265107_265190_283256_283371_283882
898616	contig_5286_pilon	-	1594	3	Intergenic	novelGene_157347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	524	junction_2	135.5	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	386	1378	539932	527754	FALSE	85	TAAATAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYKCSPSLFMQSMISSIVNSTYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKTKDMMVEMDSLSELSQQGANHVNFGQQPVPGNTAEQPPSPAQLSHGSQPSVRTPLPNLHPGLVSTPISPQLVNQQLVMAQLLNQQYAVNRLLAQQSLNQQYLNHPPPVSRSMNKPLEQQVSTNTEVSSEIYQWVRDELKRAGISQAVFARVAFNRTQGLLSEILRKEEDPKTASQSLLVNLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDERERSLNAASAMGPTPLISTPPSRPPQVKSPFPPCCLYLSVVFFLPFFLCLRKDMTLNRWMDSWIYRFLKNNPTLLLEENLIPGH	540317	527537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_528144_536997_537453_539784
898617	contig_6361_pilon	+	4781	6	Intergenic	novelGene_23962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4845	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	905	1378	390196	390669	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKTRVVLLKDSTGKIVNDARSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYDREPMILKGEVQVALKALVKNKAPRIDGIPVEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	389291	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_391118_405272_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
898618	contig_20356_pilon	+	3065	21	Intergenic	novelGene_159536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	739.024578414007	127	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	49	2592	68419	159961	FALSE	40	AATAATTCAGTACACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSVNSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAVLEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLKLGKEVLATLEGHWDSEVFINDKKTDNSEVFWNPTPDIKQWRLIRHTVKFEEQEDFESEKLWQRVTKAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWACKLFELDPLTGEWHYKFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQTKVRHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVVKGYSSPEPDIQDSSGSETQSLKQSTRRKKGIELGDIQSSIESIKQTQEEIKRNVMALRNHLASSTPATDYFLQQKDYFIIFLLILLQVIINFMFK	68370	160434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_68510_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_134526_134624_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153177_156694_156798_159828
898619	contig_6612_pilon	-	5110	11	Intergenic	novelGene_148153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	16	junction_5	186.851384795511	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	44	2065	72592	16917	FALSE	20	TTATTGAGTTTTGAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEEEGERGVASTSVQNQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIENMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVIKTKEHNK	72635	13871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_61951_62141_64167_64576_67224_67264_67488_67657_71390_71525_72480
898620	contig_20614_pilon	+	3527	1	Intergenic	novelGene_107573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1450	1785	238889	239224	NA	20	TCTCACAGAGCTGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPDQKGLPSREKIKKINKSKQNQLEQTNKQKSLGGPTSMVARAGKQFHSQAVFCSLSGRSIDGAQSQALERKEGEVVRGKGGIQRSGKKQHQPPTTGTQGAGECGQVES	237439	240966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_237400_241000
898621	contig_3386_pilon	+	8412	9	Intergenic	novelGene_34570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	636.595718941779	792	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	60	917	476274	498744	FALSE	60	CTGCTTTAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPYSRSRHAFLLLLPAAAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLVSNSCGF	470161	506239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470216_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658
898622	contig_6375_pilon	+	3992	4	Intergenic	novelGene_72986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_3	107.809502776374	19	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	45	1226	290096	291823	TRUE	35	GATAATATTCTATAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVTITYTYVGGRAPMGQGFLLSYSQDWLMCLQEEFQCLNHRCVLWAQRCDGVDACGDGSDEAGCSSDSFLGPTPAPFPATPCNRTLEDFYGVFSSPGYSHLASGSHPQSCLWLLDPHDGRRLAVRFTALDLGYGDAVHVYDGAGPPETPRLLRSLTYFSNGKAVTVETLSGQAVVTYHTVAWSSGRGFNATYHVRGYCLPWDRPCSSGSGLGPGEGLVERCYSEAQRCDGSWDCADGTDEEDCPSCPPGHFPCGPASTPGTTACYLPGDRCNYQTFCADGADEKRCRHCQPGNFRCRDEKCVYETWVCDGQPDCADGSDEWDCSYALPRKVITAAVIGSLVCGLLLVIALGCTCKLYAIRTQEYSIFAPLSRMEAEIVQQQAPPLLRAAYCPGCHPTCRGLPYREPE	290051	294722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_290130_290298_291317_291693_291825_291957
898623	contig_8304_pilon	-	3610	2	Intergenic	novelGene_153177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATGGAGCCCCAGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154762	151106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_151724_151769
898625	contig_16951_pilon	+	1702	4	Intergenic	novelGene_98644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	318.587507601915	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGTTTAATTCAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85835	107898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_85930_91206_91463_103952_104099_106692
898626	contig_13863_pilon	+	3597	2	Intergenic	novelGene_42059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382723	386885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_382901_383465
898627	contig_11855_pilon	+	2196	4	Intergenic	novelGene_67106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_1	137.334142392439	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	546	1295	2445507	2446256	FALSE	35	AGGAAGAGGTGACTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440100	2447157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2445497
898628	contig_13984_pilon	-	2469	7	Intergenic	novelGene_130235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTTCTAACTGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26397	8046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_-_8279_9099_9184_11083_11193_14290_14459_14789_14859_23996_24085_24678
898629	contig_15327_pilon	+	1246	3	Intergenic	novelGene_70517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	8.5	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	314	754	466361	468070	FALSE	5	CATTTTTGCTGTGGCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMKGGNKVLARNLMIQTLEAVKRKQFEKYHAASAEEQATIERNPYTIFHQALKNCEPVIGLVPILKGGHFYQVPVPLADRRRRFLAMKWMITECREKKHRRMLMPEKLSHELLQAFHNQGPVIKRKHDMHKMAEANRALAHYRWW	466047	468562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_466412_466777_466946_467848
898630	contig_18898_pilon	+	4595	1	Intergenic	novelGene_77645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1156	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACCACCGCCACCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71715	76310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_71700_76300
898631	contig_1349_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_171646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	1607	2230	247219	247842	NA	90	ATAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYQKDVYLRFIDYTKAFDCVDQNKLWRTLERMGIPGHLIVLMRNLYIDPEAAGPTEQGDTAWFKVKKGVHQGCILSPYLFDLYAEQITQEAGLYDEDRGIRIGGRLTNNLRYADDTTLLAESEEDLKYLLMKIKDYSFQNGLHLNMKKTKVLTTRSISNIMINQEKTEVVKDFILLGSTINTHGWSSQEIKGRGNQCHKTICELIV	245612	247883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_+_245600_247900
898632	contig_10640_pilon	-	2846	1	Intergenic	novelGene_175153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	190	675	8809	8324	NA	40	ATACCAAGTAATGGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSPTSSCSTDLPSWTPIGDQQTGYEEAASRSFQRETKQPVIGDIRFPTPHPSSPRLSLLCFPRPQSLDWETAAAWIPHTQMGGSLSAICWLLVLLFFRFFLFLPCLSPPPPFHSSTSLRAPSLLLPEGLWSSVRVWSCFPVWAAALVGSRGFCLFVCFE	8998	6152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_-_6200_9000
898633	contig_8050_pilon	+	5531	9	Intergenic	novelGene_114817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	986	junction_2	188.16199802298	243	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	3711	4580	308779	322038	FALSE	30	GAAAATATTGTGTGTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVFFKIGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLTETIFLNQDLEEKNENQESDTEEEEDKLFWLEACYKALTWHRKNKHVQEAACWALNNLLMYQNNLHEKIGDEDGQSVVFILYDKIYDILFYVIKCPVVFLIDAYKIP	293928	322989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320926_321619_321763_321858
898634	contig_3018_pilon	+	2995	2	Intergenic	novelGene_78884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTTTTACTAGGCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568110	576567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_569667_575128
898635	contig_10515_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_174287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGGAAAAAAGCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75998	74011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10515_pilon_-_74000_76000
898636	contig_5095_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_74943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1046	1345	177512	177213	NA	35	ATGCATGTAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKSSPKFTVQPGSGQPHKTKWD	178557	176978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_177000_178600
898637	contig_2933_pilon	-	2784	1	Intergenic	novelGene_111321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442811	440027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_440000_442800
898638	contig_12919_pilon	+	1634	2	Intergenic	novelGene_75900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	103	516	730995	735115	FALSE	60	TGGAAAAAAAAAAGCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNGINKINQRNIRQNTRCSFNFLYRETTVPSHKAMNIIVTVIYLNIVSQTSWVIFKVKVQKNQVNPLSILESNVPVADLVIFILIWEAWRFKNSLWICKDTTTLLCMRIVAIGIPSFALVETDSVINNTSFSKSTVGPWLHNGVSNSALRHPSSSTHMKSCRERKGYRINR	730892	736233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_731210_734916
898639	contig_10958_pilon	+	2103	6	Intergenic	novelGene_5373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_5	164.056575607319	14	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	1230	2018	808966	811107	FALSE	15	GCCTTGAGTTCTTGTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	807370	811192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_807770_808135_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890
898640	contig_9698_pilon	+	7096	23	Intergenic	novelGene_82485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.497956053379	15	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	3442	6072	237185	270859	TRUE	15	GTATATGTGTGTGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTITDLLSEQKTSASQASPQSASSPRIESTTGITTATSPRTPSPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTLEQGSLDLDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQGTNICGKEDSGDHASNVQLEKCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCTAVEIRNIIEKVKCSLEITLQEKYQRELQTLKNEYEAKLDALIKESEENENKIKKLKGDLVCLEEVLQNKDNEFALVKHEKEVVICLQNEKDQKLLEMENIMRTQNCEIKELKESQEIVLGDLKKLHVENDEKMQLLRAELQYLEQSHLKELEDTLQVRHTQEFEKVMTEHRVSLEKLKEENQHRIDQIQESHATVVQEKDQQLQELKLKVSDLSDMRCKLEVELALKEAETDEIKLLLEESKAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELKTLMTIEKDQCISELISRHEEESNMLKAELNEVTSLHQQAFEIETKLKDQIVELQNKLESELSTLEKQKDEKMIQQEDRYEAIIHKLEKDKEKLVMSQDQDREQLIQKLNSEKEEAIKTALNEFKLGRDAAEKELLEKVRHLETQLAKSPATESAREESSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNVRTSLIAEQQTNFNTVLTREKMRKENIINDLSDKLKSTMQQQERDKDLIESLSEDRARLLEEKKKLEEEVSKLRSSSFLPSPYVAAAPELYGACAPELPGETERSAMETAEEGRLDSAMETSMMSVQENIHMLSEEKQRIMLLERTLQLKEEENKRLNQRLMSQSMSSVSPRHSEKIAIRDFRCI	133040	272666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_133121_133181_133377_177483_177599_189984_190106_191298_191426_191631_191803_206425_206629_208375_208803_214786_214958_233675_233861_234077_234265_234400_234483_235375_236665_237096_237224_237309_239208_254502_254669_257699_257809_257920_258162_262139_262195_264719_264768_266734_266794_270843_270915_271697
898641	contig_19769_pilon	-	2363	5	Intergenic	novelGene_102242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	44.6843093266529	321	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	94	2160	47710	39200	FALSE	25	TTCAAGGTGCACATCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGESAWRARRPGGRGLSWPGRVDAHHPQSLMEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLAGVLVFKPELISRLEQGQEPWVLDLQASEGRETSKTSQIDSTIRTDNEQAYEEMDILKSELNGMRIKIPPQDFSLSPGFADTSDSEVLLENNQSSSPRLTVMNSLFQKNRLNKGTVMLKKTFTQNSQECNEVRSTGSLDCKLSENQRDTAEETAERCDGCGRSFRSISDIAVCWEVNKQKKLNKCQECQKKLSHCFQGKHQSNCQEEKPYECEECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFKCTDCGKAFRLSSKLIQHQRVHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLIRHQRTHTGERPYTCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHTGEKSQMSRTADNPSLAPHQRIHTVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYACNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLECGKAFSMSTQLTIHQRIHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWYYEYGHALESSFVSRKKVNTIKKLHKCNECEKIFRWRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFNRSSRLTHHQKSHMG	48861	38996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_41020_44714_44832_47196_47324_47707_47758_48815
898642	contig_8161_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_156778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGGTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442979	444940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_443000_444900
898643	contig_14005_pilon	+	2453	1	Intergenic	novelGene_154718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	320	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1683	2030	1683	2030	NA	25	AATTAATGTGTTTCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPHTFSSGRVGWMDEVMSLFVSFEYSSEWIELEAPEISRFSGLTGVSGGRILTFHRGDPGSIPGRCTSCVVTTVCRWRLVCCCDAEQVSVALSRLRQTRKKCLCSIVHGVTMS	0	2453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_0_2500
898645	SIRV6	+	982	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	539	7	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898646	contig_6795_pilon	-	2625	2	Intergenic	novelGene_27695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACCCGGCCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94484	88774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_89284_92368
898647	contig_14687_pilon	+	419	1	Intergenic	novelGene_107960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633600	634019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_633600_634000
898648	contig_15039_pilon	+	1570	3	Intergenic	novelGene_110175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAACCTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337413	685016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_338120_580828_581286_684609
898649	contig_6276_pilon	+	2840	1	Intergenic	novelGene_174124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	548	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	689	1039	157769	158119	NA	40	AAGAACAGAGTGGACATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCMHCRAQPPIVLGANNFSSLCCLMHLPKLPMSLEQAPESQPPRFFACLLTWAVHRAPAHHTMPSPPFESALSHCNRLRRWRRNSYCIMRESEKNWEHTFSVKPLMNIAVQTQTQ	157080	159920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_157100_159900
898650	contig_9910_pilon	-	5309	4	Intergenic	novelGene_178496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1734	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4698	5063	192871	192506	FALSE	35	CATATTATATCTTTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEITGALQPLMKKQRWLMERGIRAKGGGSWGRQGRNKKKQKKPTPAANKWHSDSHSFRCVESKQPLFPGQETVTAGSRGGRVGVKKGGGWKIVYRKLPVVLSPAGSSMRLLSHTPFAGLG	395838	192259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9910_pilon_-_194225_320104_320556_340898_341107_393153
898651	contig_11338_pilon	-	4907	5	Intergenic	novelGene_6309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_4	176.716580999068	388	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAACCTTTCGGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250618	229321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_233736_242914_243038_244695_244747_249573_249784_250509
898652	contig_5317_pilon	+	2855	21	Intergenic	novelGene_76590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAATCTGGCTGACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355255	386713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355763_356222_356341_356923_356986_357962_358095_361104_361257_361766_361864_364144_364275_364799_364923_366580_366666_370358_370487_373901_374098_375288_375427_375693_375762_376057_376088_376159_376301_377193_377330_379072_379220_381030_381209_381934_382051_384127_384229_386643
898653	contig_6445_pilon	-	1593	14	Intergenic	novelGene_76964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	630.982993797407	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	594	1394	77905	43105	FALSE	40	TGGGGAGCAGTAAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	91432	42905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88168_91124
898654	contig_14441_pilon	+	766	3	Intergenic	novelGene_100716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	152	580	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116576	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
898655	contig_15122_pilon	+	4844	2	Intergenic	novelGene_162699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	476	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	373	2772	435073	437472	FALSE	60	AATCACAAAATTGAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKKEPAASAAAFPSQRTSWGFLQSLVSIKQEKPTDPEEQQSHHHHHHHHFGGLFAGAEERSPGLGGGEGGSHGVIQDLSILHQHAQQQPAQHHRDVLLSSSSRTDDHHGNEEPKQDTNVKKAKRPKPESQGIKAKRKPSASSKPSLVGDGEGAILSPSQKPHICDHCSAAFRSSYHLRRHVLIHTGERPFQCSQCSMGFIQKYLLQRHEKIHSREKPFGCDQCSMKFIQKYHMERHKRTHSGEKPYKCDTCQQYFSRTDRLLKHRRTCGEAIAKGAASAEPGSSNHNSMGNLAVLSQGNTSSSRRKTKSKSIAVENKEHKTGKTNESQISNNINMQSYSVEMPTVSSSGGIIGTGIDELQKRVPKVIFKKGSRKNADKNYLNFVSPLPDIVGQKSLSGKPSGSLGIVSNNSVETISLLQSTSGKQGQISSNYDDAMQFSKKRRYLPTASSNSAFSINVGHMVSQQSVIQSAGVSVLDNEAPLSLIDSSALNAEIKSCHDKSGIPDEVLQSILDQYSNKSESQKEDPFNITEPRVDLHTSGEHSELVQEENLSPGTQTPSNDKASMLQEYSKYLQQAFEKSNNAGFTLAPSFQFVSLSSPLHNHTLFPEKQIYTTSPLECGFGQSVTSVLPSSLPKPPFGMLFGSQPGLYLSTLDATHQQLTPSQELDDLIDSQKNLETSSAFQSSSQKLTSQKEQQKNLESSTSFQIPSQELASQIDPQKDIEPRTTYQIENFAQAFGSQFKSGSRVPMTFITNSNGEVDHRVRTSVSDFSGYTNMMSDVSEPCSTRVKTPTSQSYR	434478	439544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_434552_434773
898656	contig_3252_pilon	+	4144	2	Intergenic	novelGene_61487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	0	789	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	256	1878	244331	246628	FALSE	40	TTATTAAATGGAAGCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAAAASSHRQPPPQDGPLPQASLKRRVHTGQRLGQSWGPRLRSPQCALRPACDPARPPRVCPPQLRPRAAPTRANTSSPAHRSGMAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLGAAGAPEGSGGNSSSNGSGGSGGSGSNSSSSSAFNPQGEAGEQPYEHLTAESFPDISMNNEKVLVETSYPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLWPEPLFSLVSGLVSMTNPPATSTSAPSPAASSSSSASQSPPLSCAVQSNDSNPIYSAAPTFPNPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTTLQYPPPAYPAAKGGFQVPMIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRAQQPSLTPLSTIKAFATQSGSQDLKALNTTYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPMESCDRRFSRSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDICGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADKSVASSATSSLSSYPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSSVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTIEIC	244075	248894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_244629_245303
898657	contig_9653_pilon	-	1882	11	Intergenic	novelGene_48195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	719.835043603741	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	368	1273	186221	175913	FALSE	35	CAGTTCTAGAAGAATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARATSGHTGMVSLGGKAISRAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	194202	175303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_182976_183031_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047
898658	contig_4232_pilon	-	843	1	Intergenic	novelGene_63395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACAGCTATTGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468109	467266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
898659	contig_12765_pilon	+	2297	8	Intergenic	novelGene_106552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_6	53.9727822563354	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	289	1527	87118	211118	FALSE	30	AAAGGAGCTTTATAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIPEGPIDQGLATGRVRALEEQLVKAKEQIENYKKQTGNGLGKDHEILRRRIENGAKELWFYLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFISDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQIAIYPHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWNGYSKGVNRKLGRTGLYPSYKVREKIETVKYPTYPEAEK	73777	211888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_73896_74010_74174_87110_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
898660	scaffold_13505_pilon	-	2962	1	Intergenic	novelGene_111585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	880	1374	630777	630283	NA	20	TGAAGAGTGTGCTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIATAFFNEMEKQMTNFIWKKKRPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAKTVKNRKYIDQRNRIENPDINSSTYEQLIFDKGPKSANWGKDSLFNKWCSHNWISICKELRQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKLKTIKIME	631656	628694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_628700_631700
898661	contig_11316_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_122678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCAAGATTTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	139423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139400_140500
898662	contig_13674_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_140316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1586	1924	17984	18322	NA	60	GCAAGAGATCACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQPTANAKYEGIEEFCYFLQSDSHQICNQDALIITSDWNAKVRNKEEGSVVVKYGLGDKNDARDYIIEFYKTNGFFIANTFFTNISGNNRWTSPDKIHRNQIDYICGKR	16398	18558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_+_16400_18600
898663	contig_10766_pilon	+	2218	3	Intergenic	novelGene_151222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACATAAAAATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195350	340204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_196758_274597_274831_339626
898664	contig_567_pilon	+	2214	1	Intergenic	novelGene_33945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	742	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	1271	1816	2072	2617	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNTQAGVAILTSDKIDFKLKSTTKDKEEHYIMIRGSIYQEDITITNIYTPNDRAPIHKTNSNSTEKRDRQLHNSSRRLQHTTFGEGCRTPRKKLNKELNATVNQLDLRDIYQTLHPTAAKYTFSSNAHGTVYRIDHILGHKASLNKIQSIEILQTIFSDHKAIKAEINNRKSKEKKN	801	3015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_800_3000
898665	contig_13097_pilon	+	1870	9	Intergenic	novelGene_107727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_3	605.468826612898	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1203	1790	245536	264473	FALSE	35	GTTAAAAATCTGTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPFRTLLVLLLRGLVWWTPASSGTITPEERKTEIEKETETESEIVIVTENESAPERESESAIIVLHQAFSTVMKSDTDTGNMQKEGMSVIEQAERKKNGIEKDGTERKRKPDTSHLEAIVDVAMKVKKETVTGDTSTKNQKEAKKEKKLAMSLPLNRRAPKLHLRNRQGFGPLCILVPEVESINLVIFLDNV	205343	264553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
898666	contig_2069_pilon	+	3213	12	Intergenic	novelGene_23177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_10	244.451621065033	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	118	930	70041	89492	TRUE	20	CTTCCATCCCTCTACATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRGRSLGRQLKVDTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69923	100581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407_89567_89952_90998_92048_92192_99560
898667	contig_7230_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_52538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCCACCTTGGTCTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130888	128478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_128500_130900
898668	contig_9049_pilon	+	1226	8	Intergenic	novelGene_83127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1655.77270943391	1758	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	52	513	88356	107948	TRUE	25	TTTATATTGTGTGAAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSGSQSVFAGSIASSSPGTCYKCKFSDST	88304	112893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558_111685_112569
898669	contig_17797_pilon	+	4304	3	Intergenic	novelGene_177281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	35	613	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	11	1012	29293	55246	TRUE	55	GAAGTGAAAAAGATTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKGMKSYISYKLVPTHTQVPVHRRYKHFDWLYARLAEKFPVISVPHLPEKQATGRFEEDFISKRRKGLIWWMNHMASHPVLAQCDVFQHFLTCPSSTDEKAWKQGKRKAEKDEMVGANFFLTLSTPPAAALDLQEVESKIDGFKSFTKKMDDSALQLNHTANEFARKQVTGFKKEYQKVGQSFRGLSQAFELDQQAFSVGLNQAIAFTGDAYDAIGELFADQPRQDLDPVMDLLALYQGHLANFPDIIHVQKGALTKVKESRRHVEEGKMEVQKADGIQDRCNTISFATLAEIHHFHQIRVRDFKSQMQHFLQQQIIFFQKVTQKLEEALHKYDSV	29282	58893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17797_pilon_+_30041_54992_57115_57469
898670	contig_8310_pilon	+	4358	18	Intergenic	novelGene_75576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_17	353.457132671952	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	106	1914	283403	325125	FALSE	15	GACCCCTGCGTTTCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVIHIIQFHTFGTLKCWQS	281170	327569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_281262_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739_324767_325071
898671	contig_7025_pilon	+	4076	1	Intergenic	novelGene_104389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTAAAAGAGGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56178	60254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_56200_60300
898672	contig_10958_pilon	+	2032	6	Intergenic	novelGene_5434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	143	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	32	433	888255	894000	TRUE	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888223	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894144_895250_895335_895736_895855_900457
898673	contig_2069_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_23312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGCAGCCCTGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524629	522349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_522300_524600
898674	contig_7748_pilon	-	3553	13	Intergenic	novelGene_101048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	370	junction_3	180.547931462965	776	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	46	2007	164891	153973	TRUE	10	TGATTGTGTCACCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVGK	164936	149906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_151191_152257_152319_153771_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878
898675	contig_12638_pilon	+	1156	9	Intergenic	novelGene_33191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	181.86739674829	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	194	973	271042	274265	FALSE	45	AAGACCAGGAAAGACCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHFCGGEPGAPIQVRSLPPDFPHQAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	270460	274448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_270521_270814_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
898676	contig_5643_pilon	+	1250	12	Intergenic	novelGene_38799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2515.69416672533	3	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	68	1045	233973	237983	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237744_237819_237913
898677	contig_4531_pilon	-	2761	2	Intergenic	novelGene_47871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	462	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	151	666	199143	198628	FALSE	30	CACTAATAAACTTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRSSRDFSSALSSSPVGGARRKNDCSLRVSCSGSDCHETPEETLSKSLVMDYLAHPGVCLAVGVACGMCLGWGLRVRFGMTPKSSMNETDRETGTEASILGESGEYKMILVVRNDLKMGKGKVAAQCSHAAVSAYKQIQRRNPELLKEWEYCGQPKVVVKAPDEETLAELLTHAKMLGLTVSLIQDAGRTQIAPGSRTVLGIGPGPADLIDKVTGHLKLY	211544	196532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_199165_211415
898678	contig_11846_pilon	-	5734	21	Intergenic	novelGene_105966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	153.100253102338	653	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	3243	5315	326117	290118	FALSE	5	GCACTGGGTGTGTTTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLSVDKKFDVDKRAVNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGNHGLFGNSTAQSRGMHTPVQPLNSSPNLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	417772	289698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308786_319253_319380_324471_324609_326101_326148_327241_327284_329620_329792_334951_337301_339601_339944_352209_352232_356675_356764_417574
898679	contig_4924_pilon	+	2679	10	Intergenic	novelGene_84701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.314269680527355	124	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGGTAGTAATAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81006	253064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_82483_114578_114713_127723_127785_132966_133128_137219_137300_145996_146135_155810_155860_197778_197860_252396_252596_252764
898680	contig_8310_pilon	+	3266	17	Intergenic	novelGene_75574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	299	junction_10	289.826611690076	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	174	1976	283403	324814	FALSE	30	CCATTAGGTACCTAGCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTWWVPAPGLQFPENLDLLPLTSLVPPRFRKQRKAVVSANDKKIPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	279629	326104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
898681	contig_5669_pilon	+	2685	8	Intergenic	novelGene_86057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	226.687143932976	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	599	1375	187502	189257	TRUE	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLPAVTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	178270	195206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_185954_186145_187360_187512_187709_188112_188198_188318_189011_189525_194163
898682	scaffold_12124_pilon	-	3057	11	Intergenic	novelGene_22241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4165	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2117	2452	1508404	1508069	TRUE	5	GGCGCCGGAGGGCGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510597	1473570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473668_1486527_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1509157_1509233
898683	contig_1639_pilon	+	2199	6	Intergenic	novelGene_74908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_5	160.463578422021	182	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1329	1982	314903	331557	FALSE	20	CTAGGGATGGCTTGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTTIPLSTMVTSITTGTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAAVAILAASDGCGGGGGTKSSATSASPSRQPVRK	313574	331774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_331456
898684	contig_2933_pilon	-	3562	19	Intergenic	novelGene_111367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_1	204.551066701909	437	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	419	2047	955651	940497	TRUE	40	AAAGACTTTCTGAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSAEAEPRAVENGDAEDPSFSDPEDFVDDVSEEELLGDILKDRPQEADGIDSVIVVDNVPQVGPDRLEKLKNVVHKIFSKFGKITNDFYPEEDGKTKGYIFLEYASPAHALDAVKNADGYKLDKQHTFRVNLFTDFDKYMTISDEWDIPEKQPFKDLGNLRYWLEEAECRDQYSVIFESGDRTSIFWNDVKDPVSIEERARWTETYVRWSPKGTYLATFHQRGIALWGGEKFKQIQRFSHQGVQLIDFSPCERYLVTFSPLMDTQEDPQAIIIWDILTGHKKRGFHCESSAHWPIFKWSHDGKFFARMTLDTLSIYETPSMGLLDKKSLKISGIKDFSWSPGGNIIAFWVPEDKDIPARVTLMQLPTRQEIRVRNLFNVVDCKLHWQKNGDYLCVKVDRTPKGTQGVVTNFEIFRMREKQVPVDVVEMKEPIIAFAWEPNGSKFAVLHGEAPRISVSFYHVKSNGKIELIKMFDKQQANTIFWSPQGQFVVLAGLRSMNGALAFVDTSDCTVMNIAEHYMASDVEWDPTGRYVITSVSWWSHKVDNAYWLWTFQGRLLQKNSKDRFCQLLWRPRPPTLLSQDQIKQIKKDLKKYSKIFEQKDRLSQSKASKELVERRRTMMEDFRKYRKMAQELYMEQKNERLELRGGVDTDELDSNVDDWEEETIEFFVTEEIIPLGNQE	962640	938212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_939713_940481_940601_941363_941473_941930_942009_942507_942634_943585_943725_944598_944678_946245_946369_947433_947507_948839_949051_950136_950184_950596_950664_950754_950887_954516_954675_955276_955406_955597_955656_955980_956101_957125_957319_962539
898685	contig_10904_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_22772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGTTTTTCTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709511	706997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_707000_709500
898686	contig_1274_pilon	+	3619	5	Intergenic	novelGene_137765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	43.4532795079957	291	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	64	495	3825	89207	FALSE	40	GAGATGAGAAGAGTAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVRVWLKRDSGQYWPSIYHAMPSPCSCMSFNPETRRLSIGLDNGTISEFILSEDYNKMTPVKNYQAHQSRVTMILFVLELEWVLSTGQDKHFSWHCSESGQLLGGYRTSAVASGLQFDVETRHVFIGDQSGQVTILKLEQENCTLVTTFRGHTGRTESKTIMC	3761	92331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3832_33354_33429_66680_66736_78585_78737_89062
898687	contig_16098_pilon	-	1717	10	Intergenic	novelGene_45958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1226.71032531002	8442	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	91	1101	352350	349343	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354079	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
898688	contig_10904_pilon	+	2591	3	Intergenic	novelGene_22463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	916	2	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	113	1081	149100	150068	FALSE	15	GAAGGACTTGTGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143923	151578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146159_146226_149097
898689	contig_10042_pilon	+	2346	9	Intergenic	novelGene_79102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	244.292825058371	927	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	10	1680	6321	53427	FALSE	75	AAAAAAAAAAACAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
898690	contig_1274_pilon	+	3206	11	Intergenic	novelGene_137767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	54.9057374051201	343	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	64	1068	3825	118884	FALSE	20	CAGGCCCCAGCAAGCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVRVWLKRDSGQYWPSIYHAMPSPCSCMSFNPETRRLSIGLDNGTISEFILSEDYNKMTPVKNYQAHQSRVTMILFVLELEWVLSTGQDKHFSWHCSESGQLLGGYRTSAVASGLQFDVETRHVFIGDQSGQVTILKLEQENCTLVTTFRGHTGGVTALCWDPVQRMLFSGSSDHSVIMWDIGGRKGTAIELQGHNDKVQALSYAQHTRQLISCGGDGGIVVWNMDVKRQETPEWLDSDSCQKCDQPFFWNFKQMWDSKKIGLRQHHCRKCGKAVCGKCSSKRSSIPLMGFEFEVRVCDSCHEAITDEERAPTATFHDSKHNIVHVHFDATRGWLLTSGTDKVIKLWDMTPVVS	3761	121022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3832_33354_33429_66680_66736_78585_78737_89062_89176_98288_98416_108170_108277_113876_113979_115514_115646_117618_117728_118854
898691	contig_5649_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_82317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203522	201125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_201100_203500
898692	contig_20727_pilon	-	4563	5	Intergenic	novelGene_152569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	438	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAACAAAGGAAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25609	4130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_4680_14112_14238_16462_16528_20399_20471_21856
898693	contig_6576_pilon	-	6801	15	Intergenic	novelGene_42251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	665.326730383851	865	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	115	1602	339439	322526	TRUE	70	GAAAAGCACAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQAESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339553	310413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_315452_319388_319444_322201_322285_322502_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331200_332093_332233_337921_338049_339398
898694	contig_3233_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_56601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACAGGCCCCCTGGTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937946	938766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_937900_938800
898696	contig_18804_pilon	-	2685	7	Intergenic	novelGene_163800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGACGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59844	44102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_45252_46999_47084_50054_50220_50785_50823_54391_54565_58226_58304_58844
898697	contig_3627_pilon	+	2456	17	Intergenic	novelGene_78441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	299.781352613868	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	137	1843	294394	316047	TRUE	35	AAGGAAGGTCTGTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWMKKRRMMVKLKKFPRLPIGLNLILRQ	292739	323672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292823_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439
898698	contig_10068_pilon	-	2066	5	Intergenic	novelGene_148702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	189.218623554871	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	99	440	59848	44668	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEGSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61151	43041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51300_59831_59887_61091
898699	contig_383_pilon	+	2231	11	Intergenic	novelGene_126121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	920	junction_8	221.435679148596	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	322	1884	141861	159391	FALSE	40	AATATATAGCTGACTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQVDMQREVILTGVQTQGAKHYLKSYYTTEFYVAYSSDHTNWQIFKGNSTRNLMYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKVKYPL	136479	159738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233_154338_155148_155305_157138_157284_159221
898700	contig_12000_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_43201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGAGGGTGATGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620685	623203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_620700_623200
898701	contig_13425_pilon	+	2495	3	Intergenic	novelGene_170845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	108	junction_2	280	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	511	1731	61112	62332	FALSE	25	TTTACGTTTTCAAGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKLFLKKKVVVKICKRKYRGSEIEDLVLLDEESRPVNLPPALKHPQELP	59668	63096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60530_60980
898702	contig_7898_pilon	-	2002	4	Intergenic	novelGene_47551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.470336852616	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	73	438	293293	292088	TRUE	20	ATTTGCCATTATTTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	293510	290182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_290520_290860_292355_293194_293344_293488
898703	contig_6445_pilon	-	1156	13	Intergenic	novelGene_76901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	820.723901334805	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	68	925	89674	43105	FALSE	15	ACATTAGCCTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96334	42873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49780_68025_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
898704	contig_15264_pilon	-	5213	7	Intergenic	novelGene_158867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_2	121.656278095296	911	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	10	1149	115320	79253	FALSE	35	TCATTATATGACTCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGMRPDVSSPPSSSSTAMGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQTTTGVSQETSENPVNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSTVPDTTWRILTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWRSYRQAGGSLLCFAPDLIINEQRMHLPYMYDQCKHMLYVSSELQRLQVSYEEYLCMKTLLLLSSVPKEGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTFLDKTMSIEFPEMLTEIISNQIPKYSNGKIKKLLFHQK	115329	75188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_79406_79964_80123_93994_94126_99738_99884_100919_101199_107574_107692_115163
898705	contig_7744_pilon	+	3303	17	Intergenic	novelGene_62457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	111.330869483715	519	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	6	2036	399829	407779	FALSE	20	AATTTTTGGCTTGAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMAARTLGGGRWEVVKKGRRPAAGGNNKGGGRGDRRALGEANGVWKFDLTPAIQTTSTLYELGFEKIMKQQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVSTTTNQNQKQGRFRSLEAALDKSQSMFSGNPSVWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLSQHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKAAGSLELFFDHCLFTMLQELDKTPGESLHGYRICIQAILQEKPKIATTNLGKFLELLRSHQSRPAKCLTIMWAIGQAGFASLTEGLKVWLGIMMPVLGIKSLSPFAIAYLDRLLLMHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLDFAYMPNNSLTPSLQEHLCQLYPRLKVLAFGAKPEATLHTYFPSFLSRATPSCTPEMRKELLSSLTECLTVDPLSASVWRQLYPKHLLHSSLLLDHLLKSQERIPKKVWKSLQETIQSFRLTNQDLLRKSTSNNQDVITCEAACKALLQQAWGPRLPWTRLLLLVLVFAVGFLCHDFRSHSSFQASLSGRLLQSSGFLPAGQQACAKLYSYSLQGYSWLEETLLTWSSHLFTMARPSLQLAWTHTNATVSFLSAHCASHLAWFGNGLTSLAQRIQTQLPDALSQLLHSLTELLLLLYQNVLLPLWHLLLEGLARAQEHCHKACRGEVTWDCMKTQLSEAAQWTWTYLQDITVAFLDWALAMISQQ	399823	409046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_399977_400930_401122_401661_401786_402086_402222_402436_402520_402945_403052_403158_403241_404091_404194_404555_404698_405079_405172_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652
898706	contig_3942_pilon	+	1154	6	Intergenic	novelGene_128692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	374.346577385182	92	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	54	686	426591	429621	TRUE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGVRAL	426537	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429853_429936
898707	contig_3975_pilon	-	2219	6	Intergenic	novelGene_54927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGGGGAGTTAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2355398	2327150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2327254_2344239_2344935_2347067_2347163_2351503_2351633_2352981_2353058_2354277
898708	contig_1406_pilon	+	1688	3	Intergenic	novelGene_25443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCAGCCGGTCCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484179	585561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_484847_498645_498776_584670
898709	contig_5947_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_101574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	408	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1655	2026	805095	804724	NA	55	TGGCCATTATAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPGERELAKRTAHARLGGSNMLGAMEEWQGERGGRERCAGREIEMAMGTQSQSSLSWHMYSIMKLSFMLLTPKGSGGILFMLLSLPKHRCTTQQVRREASSPSLKPQHFKGKDANNCPFFN	806749	804319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_804300_806700
898711	contig_11548_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_66798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	696	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGACAGGGGATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167224	169669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_167200_169700
898712	contig_9098_pilon	-	4042	4	Intergenic	novelGene_75767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	66.0773956979406	384	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	454	2736	47858	24722	FALSE	30	ATCTGGACAATGGCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNLQRVFLKPAEENKGNASHCVSGCMYQVVQTIGSDGKNLLQLLPIPNSSGNLIPLVQSSVMSDALKGNTGSPVHVTFQTQISSSSTSASVQLPVFQPASSTNYFLTRTVDASEKVRVTSVGTKNFTSSVSKVQSHGVKIDGLTMQTFAVPPSTQNDSSYILVNTQSLPMTVKSPVLPSGHHLQIPAHAEVKSVPASSLPPSVQQKILAAAATSTSGTVEASQIPTVIYVSPVKTVKNVVTKNFQNIYPKPVTEIANPVILSTTQIPMNVATETKSGQHSQAAPVKWIFQETLQPCTPSLVPVKSSNNVASKILKTFVDRKNLGDNTVNMPPLSTISPSGTQSKSIPIKDNALVMFNGKVYLLAKKGSDVLPSQIDQQNSISPDILPRKDTSQIVSSSPVTDISREVVNIVLAKSKSSQMETKSLSNIQVASMASLRAEKNKKVEQPSLSTLNPHNMNQTINCLKPYKTLFTKPVFPDGFSTGQNTPRKGNIIQSIEKINSSIDATTVPSQQGVFRDQEPKIQNEMASTLKKDKKERNDMKDTQEGSNKALCLKNDAEFKKIFGLTRDLRVCLTRIPDHLDSGKSFDAFTSLVKGDTYKKSELMVEKEERKQGFDKKRKAKTIKKMYYTKKRKTESTCNTAINGETNVTSSQLLSNILPTSEVSQYNSLTSHKKTREGKRTEVDHCIHDNQEKGTLNSNATFEQSHSFNKNYYTEDVFPMTPPELEETIRDEKIRRLKQVLREKEAALEEIRKKMHQK	48311	23415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_25163_25987_26261_27695_29197_47790
898713	contig_5023_pilon	+	2906	1	Intergenic	novelGene_7102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAAAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17256	20162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_17300_20200
898714	contig_10930_pilon	-	5176	6	Intergenic	novelGene_36974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1818.8611381851	37	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2057	2575	276835	273918	TRUE	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVISAQVKSLV	281752	267058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_274325_276723_277013_278483_278637_279700_279832_280157
898715	contig_18544_pilon	-	2624	10	Intergenic	novelGene_152739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	530.122231421126	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	176	1165	58227	38623	FALSE	40	ATACAAAGTTGAATTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWRWPDLHKNELKHVKYCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGIDLSGLTLQSNAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVCLLLPELVWMTFVACAYSG	63419	37163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40239_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025_58239_62799_62830_63285
898716	contig_16622_pilon	-	8331	5	Intergenic	novelGene_48500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	665.378228904433	302	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	301	606	128619	126400	TRUE	30	TCTAAATCTGGATTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQASSRDQL	132414	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_119357_120091_126121_126271_126420_128333_128679_132173
898717	contig_11338_pilon	+	6331	2	Intergenic	novelGene_6393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	507	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGGAACAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310356	316911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_310483_310706
898718	contig_2311_pilon	-	2860	5	Intergenic	novelGene_169810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_4	36.9526724338038	379	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	34	675	285678	265420	FALSE	40	AAAATATCTCACAGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLANMKSGIWYLFLFCFQAEALTGEINDSAKPEMFTFHNGGVQIICKHPETIQQFKMRLLKGRQILCELTKTKESGNTVSTVKNLEFCQLSNNSISLFLRNLDSSHASYYFCEITIFDPPPYRVATLSGEYLHVYESQLCCQLKLWLLIIGAAFVVPYIFGCVFICWLTKKKYQSIVHEPNSEYMSMAAVNTAKIPGSRDVPINLELSGPQA	285711	263234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_265461_268232_268318_269574_269682_270605_270942_285605
898720	contig_12312_pilon	-	4378	23	Intergenic	novelGene_64028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	86	junction_12	87.2903509667639	690	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1097	3294	53	3346	592287	573769	FALSE	35	TTAAGATGTAACCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNQSAPPVPPYGQPQPVYPGYHQSSYGGQPGSAVPPTPYGTSYNGPVPGYQQTPPPGVSRAPPSSGPPPVSTAQAPGGQAAYGQFGQGDVQNGPSSTVQMQRHPGLQPFGSAPLAPVVSQPAVLQPYGPPPTSTQVTAQLAGMQISGAAAPTLPPAGLGYGPPASLASASGSFPNSGLYGSYPQGQAPPLSLAQGHPGAQPPQRFAPPQASSFTPPASGGPQMPSMTGPLLPGQGFGGPPVSQPNHVSSPPPPQALPPGTQMTGPPGPPPPMHSSQPGYQLQQNGSFGPVRGPQPNYGSPYPGAPAFGSQPGSPQPLPPKRLDPDAIPSPIQVIEDDRNNRGSEPFVTGVRGQVPPLVTTNFLVKDQGNASPRYIRCTAYSIPCTSDMAKQAQVPLAAVIKPLARLPPEEASPYVVDHGESGPLRCNRCKAYMCSFMQFIEGGRRFQCCFCSCINDVPPQYFQHLDHTGKRVDAYDRPELSLGSYEFLATVDYCKNNKFPSPPAFIFMIDVSYDAIRSGLVRLLCEELKSLLEFLPREGGAEESAIRVGFVTYNKVLHFYNVKSSLAQPQMMVVSDVADMFVPLLDGFLVNVNESRTVITSLLDQIPEMFADTRETDTVFAPVIQAGMEALKAAECAGKLFLFHTSLPIAEAPGKLKNRDDRKLINTDKEKTLFQPQTGVYQTLAKECVAQGCCVDLFLFPNKYMDVATLSVVPQLTGGSVYKYACFQVENDQERFLSDLRRDVQKVVGFDAVMRVRTSTGIRAVDFFGAFYMSNTTDVELAGLDVDKTVTVEFKHDDRLNEESGALLQCALLYTSCAGQRRLRIHNLALNCCTQLADLYRNCETDTLINYMAKFAYRAVLNSPVKTVRDTLITQCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECMKLLPVYLNCVLKSDVLQPGAEVTTDDRAYVRQLVTSMDVAETNVFFYPRLLPLTKSPIANTTEPPAVRASEERLCNGDIYLLENGLNLFLWVGASVQQGVVQNLFSVFSFSHITSGLSVLPVLDNPLSKKVRGLIDSLRAQRSRYMKLIVVKQEDKLEMLFKHFLVEDKSLSGGASYVDFLCHMHKEIRQLLS	594147	572736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_573910_574028_574119_574351_574544_574774_574955_575051_575171_575310_575450_575657_575804_575905_576003_576507_576679_576970_577088_577297_577392_577585_577778_577915_578041_578214_578331_578551_578691_579776_579905_580136_580249_582871_583009_583354_583727_583940_584117_589505_589642_592112_592316_594123
898721	contig_8682_pilon	-	1439	9	Intergenic	novelGene_165268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	317.303851812423	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	273	1163	89446	54687	FALSE	25	AAGTTCAGAATTTGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPELGQLHFNQCLSAEEIFFLHGFSNATQITSSNFSTICPAVLQQLSFHPCEAKSKHHTKPSLSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLVLTPMIKKPYFPKILTYFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDNYVEKAAAVFGGFYIFFFVERMLKMLLKTYGQNDHTHFASDDFGPPQEKTHQPKTLPAINGVTCYANPAVTEPNGHIHFDNVNVVSLQDEKSEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLSDALHNFIDGLAIGASFTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFSPYIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKKTIMKQEICILQSFRCQDPEKHTR	133627	54410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_54762_55142_55176_57580_57766_57933_58142_85761_85930_86642_86766_89347_89518_100242_100406_133589
898723	contig_13093_pilon	-	5248	1	Intergenic	novelGene_105210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	435	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCTTCCTCCAATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44610	39362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_39400_44600
898724	contig_11281_pilon	-	2314	21	Intergenic	novelGene_125446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	812.202468600041	21	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	900	2255	844638	798705	FALSE	60	GAAAAGGAAAAAAGAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	889982	798645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844642_846287_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558_859632_860043_860125_886942_887020_889823
898725	contig_9363_pilon	-	2162	16	Intergenic	novelGene_6547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	619.985268642194	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	12	1601	761820	754431	TRUE	30	TATATGTGTCAGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	761831	753383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753653_754138_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687
898726	contig_14923_pilon	+	1129	3	Intergenic	novelGene_157762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	705	1007	577929	578231	FALSE	20	AGATAATTTCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYVLEEVLAECSLEARMARLRLTYFVYVTRRDQSLEKDILGKVEGQGKRGRPSMRWTDTVAAMMGSRIATIVTMVQDHAVFCSFVHRVTMSWYRLDST	403150	578353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_403188_563805_563967_577422
898727	contig_6375_pilon	+	4895	7	Intergenic	novelGene_72983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_6	209.204379070378	763	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	38	1591	287680	291823	TRUE	15	TTTACTTCATCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWNAFCTSGPPRMLPASLLFLLLGGALAHPDRIIFPNPACEESPVVLLEAQGTLQRPLGRESRSSPANCTWLIVGSKEQTVTIRFQKLHLACGSEHLILHSPLQPLISLCQAPASPLQLPGGNVTITYTYVGGRAPMGQGFLLSYSQDWLMCLQEEFQCLNHRCVLWAQRCDGVDACGDGSDEAGCSSDSFLGPTPAPFPATPCNRTLEDFYGVFSSPGYSHLASGSHPQSCLWLLDPHDGRRLAVRFTALDLGYGDAVHVYDGAGPPETPRLLRSLTYFSNGKAVTVETLSGQAVVTYHTVAWSSGRGFNATYHVRGYCLPWDRPCSSGSGLGPGEGLVERCYSEAQRCDGSWDCADGTDEEDCPSCPPGHFPCGPASTPGTTACYLPGDRCNYQTFCADGADEKRCRHCQPGNFRCRDEKCVYETWVCDGQPDCADGSDEWDCSYALPRKVITAAVIGSLVCGLLLVIALGCTCKLYAIRTQEYSIFAPLSRMEAEIVQQQAPPLLRAAYCPGCHPTCRGLPYREPE	287642	295260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_287714_288127_288173_288683_288820_289938_290130_290298_291317_291693_291825_291957
898728	contig_9345_pilon	-	1859	6	Intergenic	novelGene_24643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1785.609811801	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	269	598	955353	949490	TRUE	10	ACTTCCTGTATCCTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLGLETRRIFGMMSTQGGS	1001343	946883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949543_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
898729	contig_8645_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_178721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	254	765	53	817	5893	6657	NA	25	TCCTAGCAGAACCTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKRLHQRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNLIKKWAKEMNRHFIKEDIQLANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPEIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	5840	7838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8645_pilon_+_5800_7800
898730	contig_233_pilon	+	1858	8	Intergenic	novelGene_14612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	336	845	78477	91651	TRUE	20	AAGCCGTCATCCGTGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78141	104249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_104057
898731	contig_6513_pilon	+	5787	29	Intergenic	novelGene_117742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	354.0933089294	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2481	3306	5786	171798	225018	FALSE	30	ACCCCAGTATTCTAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMKGEQKDKVEKMGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKSKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQCVVHLPSSEKDSNSEEDSNKKVDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHSKEVETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVVAV	48452	225019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290_136434_148509_148676_151555_151684_152058_152159_152690_152843_158569_158728_159728_159826_163882_164510_170367_171015_171112_171994_198973_199157_203369_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250_212332_213108_213210_215594_215734_217492_217576_218551_218685_219547_219692_222542_222633_223706_223922_224032_224136_224940
898732	contig_6710_pilon	-	840	2	Intergenic	novelGene_95674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658111	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
898733	contig_7318_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_152235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGATTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336946	335126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_335100_336900
898734	contig_6199_pilon	+	3524	2	Intergenic	novelGene_126338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGCTGGATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79768	93148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_80979_90834
898736	contig_19352_pilon	+	6980	6	Intergenic	novelGene_122384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	148	612	132141	132605	TRUE	20	ATCTCTGTTTAGATATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTQSKTDQIDKLDFIIIKNFCSSKDTVKKMEKQVTDWGKKTFAKYTSNKTCIRVYKKLSKLNHKKLNNPIKKMSKGFGNFTEEIVMLLLLLVATDSAPAHGDLMYNRREHCLVPCHLHGRWLCVNPLFWLLGQFISPRVSFVSTDSLLYQP	131993	144201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_137121_137625_137697_140866_140970_141089_141201_141307_141361_142686
898737	contig_19016_pilon	-	4782	2	Intergenic	novelGene_173330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	3503	4501	6021	5023	FALSE	45	GATGAAAATCATAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEEDTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQEQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	10614	4741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_8342_9432
898738	contig_8211_pilon	-	1493	3	Intergenic	novelGene_178722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	2.5	73	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGAAAGAATCTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46739	42560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8211_pilon_-_43876_45377_45486_46669
898739	contig_18898_pilon	+	3130	18	Intergenic	novelGene_77633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	382.343239695926	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	19	1722	39608	67419	TRUE	25	GTTGTATCTTGAAACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSATSHSGSGSKSSGPPPPSGSSGSEAGAGAAAPASQHPATGTGAVQTEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQEVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEHWISTKQSALLQ	39589	71241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_39818_53324_53388_53471_53559_56519_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66208_67378_67500_67957_68059_68476_68541_70078
898740	contig_16766_pilon	+	4034	2	Intergenic	novelGene_153350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	807	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100101	105574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_101880_103318
898741	contig_9484_pilon	+	1724	11	Intergenic	novelGene_105624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	516.572560246864	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	52	1359	95848	104276	TRUE	15	TGTAGTTAGTGTGATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVIFSHGY	95796	105113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103382_104260_104412_104883
898742	contig_10609_pilon	+	6656	1	Intergenic	novelGene_123957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCAATTGCTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507576	514232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_507600_514200
898743	contig_3077_pilon	+	2698	9	Intergenic	novelGene_26876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	75.845237160945	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	57	1133	1337784	1346705	FALSE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337727	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346617
898744	contig_709_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_57611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_1	0	241	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTGTACAATCTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2397384	2398590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2397626_2398290
898745	contig_4402_pilon	-	4814	15	Intergenic	novelGene_140839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	264.223824799803	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1587	4761	54	4814	610292	592346	FALSE	70	CACAAGAAACATAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANLAEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQIPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKK	610345	592345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_595933_596736_596839_597128_597406_597450_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254
898746	contig_17075_pilon	+	2917	1	Intergenic	novelGene_131745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	119	682	1860	2423	NA	25	GGGGTTGTTAACCAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKRNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYW	1741	4658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_1700_4700
898747	contig_15172_pilon	+	2614	8	Intergenic	novelGene_158760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	207.143842362189	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	8	448	243174	258481	TRUE	25	AATGACTCTTCCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKVGLVAGWV	243166	268918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_259041_259136_259309_260340_260392_267534
898748	contig_7898_pilon	+	1834	10	Intergenic	novelGene_47613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.692514102459	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	454	1341	590052	599921	FALSE	20	GACACCCAGTTTGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATADSLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	563021	600414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563169_589529_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598998_599844
898749	contig_3077_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_26914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAGAAAGCCCAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1992966	1991657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1991700_1993000
898750	contig_4803_pilon	-	2932	28	Intergenic	novelGene_150712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_8	520.55440004088	21	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1359	2345	39432	15989	TRUE	50	CTGCTAATAATAAATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	93274	14450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_42058_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48121_50056_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
898751	contig_14925_pilon	-	648	2	Intergenic	novelGene_55062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3898	junction_1	0	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27129	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018
898752	contig_9319_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_154639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	80	490	53853	53443	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVPTHQLLHRRKMWQFASVKITALETQCGKSILSYRITMRRNQLDGSGLGLGLVCHSHFRVSWFFGPFPGEDEKQEQSTPKTNFYTFPIMLTVTQAHIESSDHPDKKWMIRRDHYSSSALKFKENCENSREDPL	53932	51839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_51800_53900
898753	contig_13699_pilon	-	3668	12	Intergenic	novelGene_158324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTAGGACTTCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111109	65517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_65586_66407_66536_67774_67974_70766_71263_72686_74162_104575_104736_104914_105085_106265_106436_108462_108623_108981_109310_110256_110341_110879
898754	contig_13702_pilon	+	2638	4	Intergenic	novelGene_102635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1861	2160	211071	211370	TRUE	35	TTGAATTTAAATGTGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	209210	290772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_211607_256249_256356_273709_273802_290728
898755	SIRV6	+	999	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	11	-22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	32	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	187	519	1673	2560	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1098	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898756	contig_7151_pilon	+	4194	6	Intergenic	novelGene_40748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	169.999294116182	69	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1911	2267	505515	507901	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502502	509828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503041_503212_503293_503387_504052_505593_506568_506685_507738
898757	contig_5020_pilon	+	1474	4	Intergenic	novelGene_27935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	67.7314960380734	29	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGTATGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151400	181784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_151892_153014_153116_153223_153281_180959
898758	contig_5779_pilon	-	3832	11	Intergenic	novelGene_106460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	313.263227972898	29	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	2626	3696	129312	107541	FALSE	15	TCTAGGCACTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVRNWCIQENTGEVCKTDAEIGSLPAAQGEAEDYYRKPEKKCVEKFCSDSSSDCGSSSGSVRASRGSWGSWSSTSSLDGDKKPAVGPQHFLPTSDSVSQNDFPSESPISFSLSHNICNPIHVNALPQYAETACPGLPDGPAGDENKGLCPPGDLWPTQPVCLTSSLNCNLESSVPCVLQEPPPVHNSSFIDWSTTCEGQFPNVYCPLELNDYNAFPEENMNFPNGFPCPVEVQTDFIDNNPQSTWNTATSMPTAWGHASFINSTPYLASTRSLSPMSGLFGSIWAPQSDVYENCCSINPTTEHATHMENQAVMCKEYYPGFNPFRAYMNLDIWTTTANRNANFPLSRDSSYCGNV	166295	107404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113291_125880_125961_126872_126952_127357_127544_129215_129317_132147_132224_156804_156957_163902
898759	contig_13093_pilon	+	5511	2	Intergenic	novelGene_105203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	479	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1388	1777	18504	18893	FALSE	65	CAACTACAACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASAISQNKESRNFLEEENFLELLEAEYKRLMYRTLQEISKEIMQNAGHAIEELKKIREEHNDKFNRLQESIDRQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRVEAMEVRSSETEAKALDTNLFEEKSDNRI	17073	22627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_18163_18205
898760	contig_20602_pilon	-	1963	13	Intergenic	novelGene_133721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	331.645853618317	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	21	1298	29552	16186	TRUE	40	GAACCTGTTGGAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVTLEECILPIMALKILYICGHKMPAGVDTDL	29572	9706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_16076_16282_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
898761	contig_7548_pilon	+	2645	6	Intergenic	novelGene_117622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_1	117.852450123025	446	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	262	1116	193023	206247	FALSE	15	TTGGGCATGTGCTTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSEPIVTSQLGTVNNIIQVKKTDFEVFDALMVDSQKCSDVSELSSSPPGPYHQEPYVSKPEERFKAPPILPPHLLQVILNKDTGISCDPALLPEPNHVMLNHLYALSIKVMKRFFLLELCFSKCGLRTPASNYLGVLPGLDLRASPRT	192761	207776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_200728_200844_203187_203322_206058
898762	contig_17144_pilon	-	1004	4	Intergenic	novelGene_29128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	341	808	12299	11832	TRUE	20	TCCTCCTGAAGCAGCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFSKSSRSLYLLGD	14362	10098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10115_11651_12356_13328_13503_14252
898763	contig_854_pilon	-	6494	14	Intergenic	novelGene_36173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	222.730075181895	9	100	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	4494	5582	493192	471803	TRUE	20	CTCATGATCCAACTCGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509297	470038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470610_470680_470817_471597_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_497571_509182
898764	contig_10857_pilon	+	3496	9	Intergenic	novelGene_160911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	111.837423857133	530	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	20	973	450654	468931	FALSE	15	CCATCCATTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGEHTDMGPWSRVRIAKCQMLLTGFFVLLLGLSVATMAVHTYFGAHFTAVSRASLERNPYKAMHHWAFSVGVSLAGLLTLGAVLCAAATVREAAGLMAGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCRCSRPSALRDA	450634	471454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_451725_451841_454214_454313_457543_457619_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696
898765	contig_14326_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_120682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTATGCCACCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120396	119108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_119100_120400
898766	contig_19013_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_162091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAATATGTGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47603	49744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_47600_49700
898767	contig_6418_pilon	-	2601	3	Intergenic	novelGene_81268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTAAAAAGAGAACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1797780	1794650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1795005_1795148_1796325_1796709
898768	contig_14986_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_59734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	990	717	1706	151004	151993	NA	45	AGAAAAGGAACAGCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKED	150287	151995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150300_152000
898769	contig_7151_pilon	-	3954	6	Intergenic	novelGene_40690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	167.892108212387	16	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	60	818	65162	18521	TRUE	55	AGTCTGGAAAGAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSGETQSRTLTCPHILFW	65221	10898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12398_12491_13676_13782_13876_18160_18880_40400_40716_65077
898770	contig_14483_pilon	+	1150	2	Intergenic	novelGene_133735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCCTTTCCAGCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11521	16484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_12615_16427
898771	contig_12414_pilon	+	6897	13	Intergenic	novelGene_59655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.10554159678513	570	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACCTTCTAGAAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759119	793273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_759319_760668_760804_762804_762903_765743_765875_766736_766903_767635_767693_774262_774353_781926_782108_782791_782911_783428_783460_787131_788692_788768_790803_791177
898774	contig_7272_pilon	+	2461	2	Intergenic	novelGene_25291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACTCCAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340320	343284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_340348_340850
898775	contig_7272_pilon	+	2147	2	Intergenic	novelGene_25293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340914	344015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_340960_341913
898776	contig_3469_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_34144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	209	508	253975	254274	NA	40	AGCAGAAACACATTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATATDCSDQNHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPEGMAPRYPFSSVVKSSLRFTIQPGSGQPHKTKWD	253766	256188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_253800_256200
898777	contig_8822_pilon	-	2034	7	Intergenic	novelGene_117925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	102.01633856071	174	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	288	638	62425	52708	FALSE	35	TGTCTCTCAAAATCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLESVTFKDVALDFTQEEWSLLDTTQRNLFRDVMKENINHLVFIGNHLCKSDVISQLEQGEELWREGVGFLQDESLVISVRESGRKKQEVISCRKNISTIMAMKRVSLQITNQE	103782	51311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_52744_57093_57174_60739_60836_61525_61653_62413_62498_77031_77173_103708
898778	contig_10126_pilon	+	2878	1	Intergenic	novelGene_105739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	103	366	152382	152645	NA	45	ACACAGCCACTAATCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTDDRRPDELWKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEESLKLALEHRVAKAKGRNDEVKRLNRRFQRVAQEDKVKYYNEMCKDLEIENQKERTHLTFLKLKELKKNYKPRVAIVKDSTEKY	152279	155157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_152300_155200
898779	contig_8394_pilon	+	3522	1	Intergenic	novelGene_27322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2561	2905	80855	81199	NA	55	GATCTTAAAAACCCAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPHLGLPSPSISASQASEADLPGLPGSLWAHTAWGCRAYWVVLHCLYMHHSGMGCHAACCEPLLVPAFFIFLLIFQSFLGMGVRKWIPGNQKCQQNSQYLPKSQSTPSNMTH	78294	81816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_78300_81800
898780	contig_2710_pilon	+	5697	13	Intergenic	novelGene_161775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	707	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGCGGCGGCGGCGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939916	1109173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_944151_948310_948415_950426_950553_956495_956620_958358_958406_958509_958566_960067_960177_961169_961228_961351_961487_985989_986081_992008_992108_1106485_1106653_1108826
898781	contig_5039_pilon	-	1942	6	Intergenic	novelGene_65040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_5	139.245107633985	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	29	919	1829000	1806622	TRUE	50	AATAAAAGATTGTATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRAERPGAMRLPPLLPLLLLLGGRAVSPHDSLSQLPTPRNPKIRLYNAEQVLSWEPVSLSNDTRPVTYRVQYKYTASEWDDVSGVNCRKTTETRCDFTAAGLLQGFPRHFNVSLRVQAELGDRVSAWATVPWFQHYRNVTIGPPENMEVAPGEGSLIIRFSAPFDIDTSMVTFEYYVYYWEEAGTRKVKGPVKSNFISLDDLKPLRVYCLQVQAELVWSTQGISLPGNLSNTSCHKTTLDGKTYLRALSKPRRRDRGMRIKGGRVRDAENGLRGEQVPVGIMRLCELYSSKSGPTAKTAVIGLP	1829028	1801729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802442_1806310_1806976_1810198_1810345_1812911_1813106_1822685_1822819_1828936
898782	contig_11110_pilon	-	1124	4	Intergenic	novelGene_177261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	28.581268146968	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	481	1122	85579	78923	FALSE	85	GAAAAAGAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVESEAKVKTKVRFEELLKTHNDLIRERKKLQKKIAKSGENISIDPFRRNLQHIKGTKSDNVSVPNTDNPEKSMRVSKDKLGNTQSPENPSDDASVEEEKQGKSNRKVAKAAPQVSPQEIEPETTERKLDSTHPKAQTKSQSSVAHQKSKKANEGKENDFDGEEELMEVYQLQAAEEMAKEIKKKIRKKLKEQLTYFPSDTSLHDDKLSSEK	97493	78920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_79430_83939_84065_85569_85638_97071
898783	contig_9901_pilon	+	1752	2	Intergenic	novelGene_126926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	97	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATACTCTCGGGGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129679	131712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_131132_131412
898784	contig_11338_pilon	+	1130	1	Intergenic	novelGene_6282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	189	608	184456	184875	NA	15	GGTTCCTCCAGTCTCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKGSWLRCLQRVALNRMGDPSPRKFFYSHWVTHIQWLTTRSLNPLSQVGIALWCNSCSRAACGVGQRLDLVEFISLLTLFLCPILLPSPNLLPCRIAVHRVFFFNNLFLLWLRIYTADHTPVQQFLRVQFSDIDYIL	184267	185397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_184300_185400
898785	contig_9988_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_113070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCATCTGGGGACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561382	559177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_559200_561400
898786	contig_10642_pilon	-	3978	3	Intergenic	novelGene_78691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_2	588	413	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	278	874	222596	222000	FALSE	65	GTTAGAAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVGR	241373	218895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_222703_225746_225809_241264
898787	contig_3270_pilon	-	3562	15	Intergenic	novelGene_104495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_14	198.042821590871	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	232	2322	386296	342639	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEERFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHREFLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVIIEQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLANTSEDKCEKDNIVGSNKNNTICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVVELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNEDEEEEGKAVVAPVEKSKPEDDFPDSYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSSGGFKFTFSHSASAANGTNSTNSKSVVAQTSPASSNGSSSKTTNLAASVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEETSPRKRPRLGS	407615	341398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_342735_357558_357762_359605_359791_360190_360331_362562_362733_365983_366143_367848_367891_369375_369479_370452_370585_375431_375549_376972_377090_380092_380171_385747_386372_396998_397098_407558
898788	contig_8464_pilon	+	780	4	Intergenic	novelGene_125374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.6850424340815	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	36	377	798777	804080	FALSE	25	TCACTGTATTAAAGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEVFLGQAFTIMLVYVWSRRNPYVRMNFFGLLNFQAPFLPWVLMGFSLLLGNSIIVDLLGIAVGHIYFFLEDVFPNQPGGIRILKTPSVLKAIFDTPDEDPNYNPLPEDRPGGFAWGEGQRLGG	792608	804483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_792618_798750_798922_799187_799279_803974
898789	contig_14686_pilon	-	2581	2	Intergenic	novelGene_88059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTCCCTCAGGGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18456	15611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_16699_16962
898790	contig_13244_pilon	-	2102	3	Intergenic	novelGene_86964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3731	junction_1	585.5	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299440	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_297392_298566_299281_299397
898791	contig_6102_pilon	+	1301	8	Intergenic	novelGene_32084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	658	1044	790637	791991	TRUE	10	TTTCCTCTGCTGAGAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQSEKAPLGSIRPGIREKSGRGWWSVRHISSVGFFISSKIICCLCRSSKRLCVARVLSALQAGLALAISSFSFIFTFSFFSLLTFSFSFSCFVFTFSFSAYFLASFCFELLVSCFRLFLACPWIVV	789046	793638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_789230_789439_789515_789842_790060_790454_790708_790863_791102_791594_791653_791971_792073_793462
898792	contig_6241_pilon	-	1811	4	Intergenic	novelGene_156403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	171.651455636771	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	561	977	189992	182242	FALSE	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	194289	181407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193423_194088
898793	contig_5502_pilon	+	1827	5	Intergenic	novelGene_155008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	61.3697808371514	40	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	102	1274	490353	499445	FALSE	50	AACCAAGACAACTGGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSASAARVRCGGAPRGPVGGSWLYRAGLQAGGRMVHLYNLHPFGSQQVVPCKQEPEQFCGGGRDALFVAAGCKVEAFAVSGQELCQPRCAFSTLGRVLRLAYSEAGDYLVAIEEKNKATFLRAYVNWRSKRTENSRVCIRMIGHNVEAPFSETFRDQMSIIEMPLSEPPLCISCCPVKGDLLVGCTNKLVLFSLTYQIINEEFSILDFERSLIIHIDNITPTEISFCTGYVAVMSDLEVLVLKLESDPKNRGSVNHHPHKTNSPMKPAEEGISNETSHLESDDFVMCQKPMELLGEKSKQSGVSVTLESTGLTDEKIKYFHVQHLLYRRFAPDISSYVLPDDIKLHSLQLLPIYHTDLRVSTGNVWRMVRRCELCCRRNSYGPLLLSLDESGIDGWESSWACCLCLQSSPETRFSTKESRLQV	490251	499998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_490570_495943_496439_497093_497266_497365_497452_499242
898794	contig_11754_pilon	-	2723	2	Intergenic	novelGene_176973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	150	503	50018	49665	TRUE	50	GTATGAGATACAAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVSHITLRVSSFFFVLLSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCL	50167	42258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_-_42572_47757
898795	contig_13707_pilon	-	2864	35	Intergenic	novelGene_43519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	268.041165885012	11	73	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	52	2361	181940	126093	TRUE	25	GTAAGAAGCTTGTTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENAEVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTALVHQLQEKEKLLAAVKEDAAAAKDRCKQLTQEMITEKERSNVVIARMKDRIGTLEKEHNVFQNKMHVSYQETQQMQMKFQQVREKLEAEIAHLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDCARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQGVTQLKVQLQEAERRWEEVQSYVRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKEKEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVVEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLANEHDHLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALTNEQAAAAHELEKMQKSVHVKDDKIRLLEEQLQCKISKKMEEFKILNDQNKSLKLEVQRLQTLVSEQPSKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEDELKALRTENSSLTKEVRDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIEALKEEIGNIQLEKAQQLSIASQVQELQNLLKGKEEQMNTIKAVLEEKEQDLANRGKWLQDLQEENKSLKAHVQEAAQHKLNEACSASRFKELETVLKEKENEMKKVEAMLKERESDLSSKTKLLQEVQDENKLFKSQIEQLKHQNYQQVLSFPPHEELLKVISEREREIIDLQSELDSLKDAVEHQRKKNNDLREKNWEAMEALASTEKMLQDKVNKTSKVVKL	181991	123491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_123576_123738_123823_124055_124128_124906_125000_125128_125232_126025_126101_131436_131531_133608_133700_135226_135265_136413_136483_138446_138538_140267_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_143308_143971_144010_145177_145247_145940_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152162_152693_152763_153125_153217_154405_154441_155990_156060_156456_156624_159283_159372_160632_160766_169938_170046_172845_172987_174886_175004_181856
898796	contig_5945_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_104600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAACACAGACTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382865	380738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_380700_382900
898797	contig_7031_pilon	-	4221	3	Intergenic	novelGene_132793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	192	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	177	614	308428	307991	TRUE	55	AAGAGATTGAAAAGGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGFAILDSCRRLANTKYRRAASRSSQQETEQAVTSDVCFPILHRNSPPTWPTLLPGATVSWLGDTGFNHVPLRFHSPTNGHLFLAGVAVFCFFWFLPYFSPSPPPFSQTPGSVCHLFFFLKGCEMPIDCRTASQPVLPRWWDP	308604	304282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_305100_305154_306599_306644
898798	contig_9668_pilon	-	4804	7	Intergenic	novelGene_58129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2059	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	259	339	598116	598036	TRUE	45	ATAAAGAGACAGAGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIFTSTRPPLLPVATVSWLGSTSFSSVAWIPTACTGQLPKCHLLAVDVAFFRFFRFLPYLSPPPPPFSQIPGSVCHLCFFLKGCEMPLECETASRPVLPCWWDPGAFTCLF	598374	265884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_266976_267022_268055_271403_271995_436374_436376_452071_452536_596666_597002_597084
898799	contig_6497_pilon	+	2110	5	Intergenic	novelGene_35543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	128	junction_1	70.7862098151893	364	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	6	614	1598	131456	FALSE	15	CAGGCTTTGCTTGCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSPQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPTKRISAYSALSHPYFRDLERCKENLDSHLPPGQNTSELNTA	1592	132952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_1763_61858_61969_120471_120523_125061_125198_131309
898800	contig_12050_pilon	+	2394	2	Intergenic	novelGene_62725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTACAAAGCATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670643	673315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_671136_671413
898801	contig_10990_pilon	+	2539	19	Intergenic	novelGene_7456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	407.53656580623	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	563	2509	722379	752144	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708557	752174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708654_709189_709396_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
898802	contig_2480_pilon	+	2868	15	Intergenic	novelGene_63526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	58.6826904910239	450	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	96	2108	251468	279119	FALSE	15	GTGTCACCCAAGTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLVLFGRRWAIASDDLVFPGFFELFLRVLWWVGILALYLRHREKLDCAGGALLSSYLIVLIVLLAVVICAVSAIVYVSMKGTICNPGPRKSMSKLLYIRLALFLPEVVWASLGAAWIQGVECDRTVVNGIIATVVVSWIIIASTVITIIIVFDPLGGKMAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251372	279879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
898803	contig_7009_pilon	+	9041	2	Intergenic	novelGene_23629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_1	0	1215	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1235	1642	445486	445893	FALSE	50	ATAAATAGAAAAATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLVTLITFFELCNHSHPPSLSFSSFISINTCVFSNHVRNSPAHCKRPTKWGSTQLEVTPRDGAQTVPLGFSEGEESSPIETCAVHIFIGPRGPLLASHQRCEEQWLQWALEVSRFSILDFHRFIVNPRRLASV	434554	453292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_435244_444940
898804	contig_5585_pilon	+	7503	7	Intergenic	novelGene_143060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3675	4004	175970	176299	TRUE	40	GCCATTCATATACATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIWWESPPHASFKSLMVAVISAIPPGVRYCFLFTIFLGRGRSNGFHLAFPTIIACTPLFRDPMWGFCHLLSISIPVMHSGTWKITTGSVRGPTGPTVRQTQAKTPLIT	115921	455076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_118544_174917_176409_177296_178378_313205_313635_353329_353795_453596_454699_454763
898805	contig_19604_pilon	+	3317	5	Intergenic	novelGene_77239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	202.456168095714	562	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	41	853	269805	273988	FALSE	45	GACACAACCAAATCTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSTPWVPLAALNMRVRRRLSLFLNVQSLVAADWTTLAEELGFEYLEIRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	269764	276452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273577_273833
898806	contig_10017_pilon	-	2320	15	Intergenic	novelGene_156987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_14	389.901485464402	589	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	51	1211	337686	304016	FALSE	15	TGAATCGGCCCTGGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKKDPSQPAECKQQ	346605	302906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_304055_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672_337704_346572
898807	contig_14142_pilon	-	1259	6	Intergenic	novelGene_120637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	719	junction_1	247.10758790454	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	151	615	622927	620914	TRUE	25	AAGTCCCCAACTCAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDLDFETGDAGASATFPMQCSALRKNGFVVLKGRPCKIVEMSTSKTGKHGHAKVHLVGIDIFTGKKYEDICPSTHNMDVPNIKRNDFQLIGIQDGYLSLLQDSGEVREDLRLPEGDLGKEIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIKAMAK	625167	620098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_620732_620902_620977_621077_621210_621425_621531_622762_622949_625038
898809	contig_13074_pilon	+	2140	8	Intergenic	novelGene_153461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	69	368	659831	660130	TRUE	10	GGAGGACGGGGGCTCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWKELEKDAEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPGSMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGSRQPHKTKWD	659762	715626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_661360_664964_665096_666202_666269_667204_667300_669882_669932_670716_670805_679254_679299_715556
898810	contig_14814_pilon	-	4712	15	Intergenic	novelGene_137739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_3	106.50182043093	610	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	50	2149	411543	395214	FALSE	70	CAAAAAAAAAGAAATAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSQEELLKIWKGLFYCMWVQDEPLLQEELANTISQLVHVVNNSEAQHLFIQTFWQTMNREWKGIDRLRLDKYHTLIRLVLRQSFEVLKRNSWEERQIKPFLDVLMKEILHPESQCPKGVKFHFIDIYLEELSKVGGKELLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTVVQTIARGVFGVMVAQSPFVPEEMVEEQRTRVGDSKLSEEEISENEMSWRETISRKKTALDKHHANDGISGDSERDSGGACEDPEPLLQFDYKAVADRLLEITNRKNIPPFNRKCLSKLIKKFQDLSEGSVSQPGFAEDNSADEDDHAVGQGRNKNKGSKPAEKTHLGKEKGSKFFRTEEEENEGSTQKKRRKKKKNHLQLENLGSGDKTTSPDQNGSEPEEGQRKDQKVPSVAETGAEEATSSIVEEGGLEHPPAIPPCNKRKRPKKRSLRVQEGVPGLPVPPSEDVTPSGPSSDCAQEPAARSTPAGGVQVLKRKRKLGALPVNGSSLSVLAWPLLGKQSPQTSPGEGEDGHPALPQGMRLKKKKVVPSSLDLCNLYDPSNPKTTILKKRKKVKEMLHSVEHNGVLEAKAKQVPVLGNGGTFSPLKKKLRAENDFVKFDTSFLPKPSFFRKAKSTACASFLSPTVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNTTAEFKKTDKSILVSPTGPSRVAFNPEQRPLHGVLKTPTSSPSNTPLAPKKVLATPPKRRPTAMDFF	411592	392650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_395408_396348_396413_397413_397564_397701_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402158_402251_404264_404447_405639_405705_406814_406945_407717_407780_408364_408451_409637_409696_411513
898811	contig_6842_pilon	+	4873	19	Intergenic	novelGene_130724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	130.761976294504	516	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	55	1269	501077	524589	TRUE	20	GTAACTCTCGCGAGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARGAEAPAACRCSGASSMEAGEEPLLLAELKPGRPHQFDWKSSCETWSVAFSPDGSWFAWSQGHCIVKLIPWPLEEQFIPKGFEAKSRSSKNDPKGRGSPKEKTLDCGQIVWGLAFSPWPSPPSRRLWARHHPQVPDVSCLILATGLNDGQIKIWEVQTGLQLLNLSGHQDVVRDLSFTPSGSLILVSASRDKTLRIWDLNKHGKQIQVLTGHLQWVYCCSISPDCSMLCSAAGEKSVFLWSMRSYTLIRKLEGHQSSVVSCDFSPDSALLVTASYDTNVIMWDPYTGERLRSLHHTQLDTPMDDSDVHISSLRSVCFSPEGLYLATVADDRLLRIWALELKTPIAFAPMTNGLCCTFFPHGGVIATGTRDGHVQFWTAPRVLSSLKHLCRKALRSFLTTYQVLALPIPKKMKEFLTYRTF	501022	536935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_501090_509073_509243_512079_512325_512486_512619_521127_521229_522593_522767_523490_523602_523723_523832_524426_527150_528253_528311_529364_529438_529973_530111_530511_530592_531310_531471_532659_532733_533360_533442_534598_534736_535005_535074_536757
898812	contig_6299_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_172937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTAGGTCCAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952569	954527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_952600_954500
898813	SIRV6	+	1469	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	29	-7	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	35	CAGTTTAGAAGTTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898814	contig_12786_pilon	-	3878	5	Intergenic	novelGene_103408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	792.502839111634	216	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3505	3816	593240	590909	FALSE	10	TCTCCTTTTGTATGATTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLDFYEGQGRLDGAVCTYTEKDKQEYLRAAYAAGIRNIEMESSVFAALCSACGLRAAVVCVTLLNRLDGDQINSPHEVLKEYQQRPQILVGYFIKKCLRKA	652320	590846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_591049_592787_592935_593215_596130_631638_632147_652213
898815	contig_1331_pilon	+	1292	6	Intergenic	novelGene_37883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_5	163.562342854338	180	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	113	637	453734	483143	TRUE	15	TTCTATTAGCTGTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRSSKTFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEATLGSGNLRMAVMLPEGEDLNEWVAVNTVDFFNQINMLYGTITDFCTEESCPVMSAGPKYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDPVIQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLTSKDR	453621	488114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_453789_467369_467464_476544_476679_479882_480047_483065_483694_488009
898816	contig_9924_pilon	+	1646	16	Intergenic	novelGene_175915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	652.731511930186	5	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	1098	1646	147490	171886	FALSE	25	GTAACCAATTTGTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKMSSDDSEDSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSGEEEKEEEEEEEEEEDDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAEREREREKLRE	15631	171886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_51314_51359_60013_60101_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_123901_124012_126980_127049_127352_127479_136325_136399_147476_147611_148061_148071_166286_166381_170996_171100_171664
898817	contig_10403_pilon	+	5409	21	Intergenic	novelGene_175799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTCGACCCCACCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68702	106909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_71478_72488_72630_73323_73407_73614_73728_75434_75632_78425_78538_78630_78704_79186_79385_81793_81912_83421_83523_84567_84711_86339_86499_87385_87608_93367_93436_96011_96164_96315_96439_98355_98453_99047_99148_99959_100069_101988_102134_106729
898818	contig_960_pilon	+	2755	2	Intergenic	novelGene_108303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	109	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTTTCTCCCCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040288	1045784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1042069_1044809
898819	contig_5686_pilon	-	2139	2	Intergenic	novelGene_45395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAACAATGTCCAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172708	169964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_170604_171208
898820	contig_14711_pilon	+	2486	10	Intergenic	novelGene_68932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	43.4587927428578	12	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	206	1120	119007	135401	FALSE	30	AAGTTCAATTATATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLKPLSSLDGDPVATEALLWDVFRIIVDEAIRKGTSACEKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQEQILERCRTVIHYSVKTCHPRFFNQLFSGLDPHSLAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLILPNPAQNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGGLGLEQRVDRAFALARYLVEEIKKREGFELVMEPEFINVCFWFVPPSLRGKQESPDYSEKLAKVAPVLKERMVKKGSMMIGYQPHGARANFFRMIVANPMLTKADMDFLLDELERLGQDL	100591	136767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_100757_118709_118739_118995_119133_119769_119897_119981_120073_120449_120486_133479_133699_133925_133978_134106_134197_135227
898821	contig_8322_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_143286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCAGAGTAGCAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572969	571310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_571300_573000
898822	contig_2069_pilon	+	4947	9	Intergenic	novelGene_23376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3125	3454	1061714	1062622	TRUE	15	CCCACATTGAGGTTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMVSNAHVLSASSPDLRDIITRHASGVPMSFIVSRLLCFNTGCVASTEPGGKVISRRIMGGCTGVGAMCEAGTGGPAFCIFIPECRNGDLLGEVRFSIGRDRGAGLDT	1056793	1066791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1059872_1061667_1061798_1062376_1063270_1063763_1063861_1063954_1064089_1064170_1064323_1064713_1064886_1065068_1065205_1066636
898823	contig_9727_pilon	+	1708	8	Intergenic	novelGene_86337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	243.817680295113	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	139	798	425838	431817	TRUE	5	CTTTTTGGGCTTTTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRGHRSAPAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSYLNSWFGQPLHRFPPPTPRCTH	425223	432838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704_430863_431744_432626_432736
898824	contig_15165_pilon	-	3118	6	Intergenic	novelGene_145316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_5	22.7683991532123	590	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1083	2147	224352	219132	TRUE	25	CAATGTCCTTTATCTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLEAKKPSVCESKPLTRERLRTTLSVLKGIVASCYGPSGRLKQLHNGAGGHVCTTSQSSALLRGLSVTHPVLKILTTSMQNHVSCFSDCGLFMAILCCNLIEYVEGIDLAPTTVIELNKQLLSLCTSYLKSEACACRIPVDFSSTQILLCLVRSILTSKPACMLTGKEVDHISALVLRAFLLTIPEKAEDHIILGKSIIVPLKGQRVIDSTVLPGMLIETSEVQLMRTLPIKKSSALKVALFCVSLSGDFSDTGEGTLAVSYGVSLESAVLDQLLNLGRQLVWDHIDLVICQKVIHPSLKQFLSTHHVIAIDRVGVALMEPLSKMTAHMSNSTACLAVNNQGTFCVFGRWLY	246876	216310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_217251_219100_219212_223367_224773_232817_233041_246278_246461_246619
898825	contig_17274_pilon	+	6013	3	Intergenic	novelGene_26483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	406.5	6	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAGAAGTAAGTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26219	42700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_28001_30127_32295_40635
898826	contig_6137_pilon	-	4409	16	Intergenic	novelGene_59226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354909	1312235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
898827	contig_12756_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_153219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	41	697	165011	164355	NA	25	TTATCACCCCTATGCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKNQESENVRVSDMSKRDPRLKKHLQDKTDSKDDDVKEKRKATEKKDKDEHMKSSEHRLIGSRNKIINGIVQKQDTVTEESEKQGTKPGRSSTRKRSRSRSPKSRSPIIHSPKRRDRRSPKRRQRSMSPTSTPKAGKIRQSGVKQSHMEEFTPPSREERNAKRSTKQDVRDPRRIKKTEEERPQETTNQHSTKSGTEPKENVENWQSSKSTKRWKSGWEENKRYDVTFLIK	165051	163688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_163700_165100
898828	contig_5686_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_45482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGATTTTGTTTTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233257	234688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_233300_234700
898829	contig_5921_pilon	-	4074	2	Intergenic	novelGene_142234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	421	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	2226	3608	35698	34316	FALSE	25	CGGACTGAGTCCAGTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYSAIPIQIPATFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKFIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECTMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDLCTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	69597	33849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_35917_67590
898830	contig_610_pilon	+	3936	1	Intergenic	novelGene_76685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGTTATAGTTCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41007	44943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_41000_44900
898831	contig_14970_pilon	-	1078	1	Intergenic	novelGene_45070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTGGAAACCCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205629	204551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_204600_205600
898832	contig_854_pilon	-	4050	15	Intergenic	novelGene_36352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1233.97206869788	562	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	526	1959	993124	980754	TRUE	15	TGTATGTGTTGGAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHVQPAAPKDLQVSDARDRFLLTWRVHLGGLQSSWLSEWHLESELVYRRLQDSWEEASILYSNSSQAVLGPEHLMPSSTYVARVRTRLAPGTGLSGRPSEWSPEVRWDSQPGDEAQPQNLQCFFNGADMLSCSWEVRSEVASSVPFTLFYKPSPDTEEKECSPVMKEKLSSPYTRHRCQIPVLDSGTHSQYTVSVQPKKEEKFIKSSEHIQMGRPTVNVTMDGDSYILRWEAQKQYYDHIVYTFEVQYRKDTVSWERKTQLQWGLKGRKSSWLVWRWQRLVAVPTCTRQRASASAHPARPHPPTGEQDTAPKKYAQHVTATSRALHQVLGQSEGQAHPQQLQRDLERVE	995218	974685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975870_977458_978087_978787_978892_979721_979780_980008_980100_980727_981036_981766_981907_984025_984184_984332_984469_985011_985181_985260_985419_991117_991309_991918_992043_993048_993301_994869
898833	contig_13863_pilon	+	1888	12	Intergenic	novelGene_42060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	376.357421995248	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	232	1581	474588	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	392846	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_392934_393032_393153_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
898834	contig_14219_pilon	+	2211	2	Intergenic	novelGene_54384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTTGCCGTTATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072739	1077195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1073405_1075649
898835	contig_16578_pilon	-	2794	16	Intergenic	novelGene_148616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1950	2258	320160	295588	TRUE	50	GAAATGAAGGCAGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISFSNFLKSPLLSYSHSIMSKKIGMVAFRSSVSGMSVISNMGPTMPGMKQILFWPSLYHISRMEKPINRLMSPYLSRILLCLACENCSSCRDSWVIKATAR	345805	58777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_58927_99726_99825_267091_267190_270386_270480_284999_285079_295568_295676_295774_295829_308404_308553_320141_320226_330023_330181_332381_332425_335790_335887_336509_336626_341012_341102_342678_342781_344524
898837	contig_8140_pilon	-	2589	3	Intergenic	novelGene_86442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1434	1799	564348	563983	TRUE	60	AAAAGCAAAGACAAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERLGEIGTLMHCWRECKMIQPFWKMIWRFLRKLETEIPYDPAIPLLGIYSREIRSTTRIGICTPTFIAALFTTAKRWKQPKCPSTDEWINKLRYTHTHTMEYYAMIKNNDESVKNLQHE	565781	560938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_560946_563147_563206_563257
898838	SIRV3	+	1143	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5166	-1	3107	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1106	19	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7110	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
898839	contig_10159_pilon	+	3649	10	Intergenic	novelGene_30778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	529	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2331	2687	352738	353094	TRUE	15	GCCACTGCCAGCCTCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRDHHCGENKTGKCIKKGQKSLAPLHGVLGALWFWHGDLDHLLPIPIWHPVGFDLDVEAAVKGGEVCANAEVPVGMAILVCFHVVLHFQGLYHVQEPLPIVRGNSAQGGFFEILLR	316407	642192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_318144_318826_318997_319501_319656_338199_338316_352583_353442_431855_431939_456758_456901_597817_597912_606777_606838_641956
898840	contig_2332_pilon	+	3043	6	Intergenic	novelGene_58685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	156.635883500557	212	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	122	856	426955	505360	FALSE	50	GACAAGAAAGATCATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRKFFGVIPSGKKLVNETVKKNEKTKSTEETLKAKKGIKEIKVNSSCRDDDFKQKQPNKKKRIIYDSDSESEETVQVKNAKKQPEKMPLSSKPGKILRKDPVTYISETDEEDDLMYKKTAFKSKDNGGSANSYLGESNMKKNEENTKTKNKPLSPVKLTPTSVLDYFGTGSIQRSDKKMVASKRKKPSKNTDDFRLNDEAIAKQLQLDEDAEVLAFCLDIIDSLMLRLLISLAWQTIKIVLV	426833	507547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_426958_462517_462647_469677_469754_471303_471427_504089_504323_505189
898841	contig_5423_pilon	+	6371	5	Intergenic	novelGene_85253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_2	833.417474918783	469	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	358	780	542216	545856	FALSE	40	GAATATTTCAACTTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKVIHSINIT	534747	551447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686
898842	contig_5649_pilon	+	1198	9	Intergenic	novelGene_82282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	176.300125850778	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	265	750	126523	147588	TRUE	40	TAAAAGTGATGGAGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRCLFSHVDFSGDGKSSGKDFHQTQFLIQECASLITKPNFISTLSYAIDNPLHYQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVSDLLPSLSNRSFQIFCVLTLTQTSVEIKKVASKI	94508	150105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_94599_126348_126625_145420_145529_146103_146203_146616_146698_147492_147697_148627_148797_149785_149913_150061
898843	contig_18637_pilon	-	2649	2	Intergenic	novelGene_81856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189210	180123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_180997_187434
898844	contig_18162_pilon	-	2946	3	Intergenic	novelGene_122280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
898845	contig_14142_pilon	-	3669	14	Intergenic	novelGene_120553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_3	185.133279992947	514	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1012	3039	190	3228	440678	432882	FALSE	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNLGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	441273	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_434039_434143_434294_434457_434572_434695_434883_435061_435266_435485_435669_435748_435854_436534_436636_436944_437192_437299_437525_440116_440323_440419_440526_440624_440797_441202
898846	contig_9633_pilon	-	1861	4	Intergenic	novelGene_139644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1325	junction_1	651.562395750058	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGGAGGATGATGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149362	1140392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1140420_1141418_1141572_1144772_1144829_1147737
898847	contig_8354_pilon	-	1513	5	Intergenic	novelGene_24104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	85.5697814651878	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	820	1293	232956	221213	TRUE	35	ATCTCCAGATGGTCAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKVQYKSNCKPSTFAYPAPLEVPKEKEKEKVSTAVLSITAKAKKKEKEKEKKEEEKMEVDEAEKKEEKEKKKEPEPNFQLLDNPARVMPAQLKVLTMTETCRYQPFKPLSIGGIIILKDTSEDIEELVEPVAAHGPKIEEEEQEPEPPEPFEYIDD	233775	219065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_219277_221203_221360_230251_230399_231375_231463_232863
898848	contig_7898_pilon	-	2429	1	Intergenic	novelGene_47600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAGACTAAAACCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547845	545416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_545400_547800
898849	contig_10324_pilon	+	2869	20	Intergenic	novelGene_7710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1296.94849828442	38	29	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	362	1819	69809	79380	TRUE	20	AGACTCCAGGCCTGGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51791	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68752_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80177_80509
898850	contig_13730_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_178723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGACCATGAGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8490	9625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13730_pilon_+_8500_9600
898851	contig_10176_pilon	-	2366	9	Intergenic	novelGene_72727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	227.840816141446	270	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1170	1937	268025	261068	FALSE	35	TGGAGGCAATTTTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYISEHCILLGSVGYSGHSVDKFLLFFIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
898852	contig_5039_pilon	-	1689	8	Intergenic	novelGene_64753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1296	1610	305617	111557	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVLLQRQCVGSTEQRKLGLSVRTSSPGWSASTSTMLRSPLLSLPARAAPASGAPSGSASLILPGLSAVEGGVKRRLVLASLMKHCGYEGNDSNMLSEAMASS	414838	111359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_111393_111510_111626_305371_305626_311421_311579_334765_334873_368906_369098_407349_407513_414169
898853	contig_11281_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_125479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	1899	2219	869567	869247	NA	45	TTCAATAGAAAGTCATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASASPQNKEYRNFTGEENFLELPEAEDKRLIHRTLQEIRKEIKQNTEDTIEEIKKIRQEHTDEFNRLQESTERQQSDIKKINNKISELD	871465	869244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_869200_871500
898854	contig_3627_pilon	-	2568	19	Intergenic	novelGene_78436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	527	847	316019	314150	TRUE	10	TGCGCCAACTTCCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGNFFSFTIILLFFMPVLHQPPCVHPEASRPAAACILGRGFPTLSGWEGNAKHPGKIKPLSPHELELYAPCGSPQGDGSESLQNVTIVCTHLDQCLSEPYNNE	323557	292719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_292775_294338_294465_297055_297099_297723_297894_298388_298434_300292_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304726_309358_309490_309605_309769_312559_312785_313377_313492_314035_314209_314945_315156_315967_316054_318593_318774_320223_320416_323437
898855	contig_20199_pilon	+	1052	3	Intergenic	novelGene_82602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTCCAATGTGCAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40683	44157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42349_43909
898856	contig_15025_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_155971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAATTCAGTCTCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39449	41850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_39400_41800
898857	contig_11309_pilon	-	1066	8	Intergenic	novelGene_149868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2394.35483193793	72	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	63	995	65730	56293	FALSE	20	CATCTGTGTTAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGLLGLVTSEARGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65792	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65688
898858	contig_4091_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_173040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGCAAAGAGAACAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32994	34903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_33000_34900
898859	contig_16492_pilon	+	4871	21	Intergenic	novelGene_100303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	230.222604233381	6	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	246	2618	158414	173160	TRUE	25	GTTAAGGGTACATTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCFSPLCSPESVEASPAVNEKSVYSTHNYGTTQRHGCRGLPYATIIPRSDLNGLPSPVEERCGDSPNSEGETVPTWCPCGLSQDGFLLNCDKCRGMSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDIEVTTTTSETPVVDETKTEAPESEVGNPASNVAIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDVAVEKPVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKIWIQAAFLSVCHCPPPLASRT	158168	195268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_158546_158928_159081_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337_170596_171328_171650_172055_172299_173094_173208_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014_194104_194433
898861	contig_5686_pilon	+	4174	2	Intergenic	novelGene_45458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3597	junction_1	0	153	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2275	2625	222847	224324	FALSE	30	TGCCAATTGAGCTAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQGGTCSFVTSWWWFNFELFLIFLIIVFSDGIFFFLTSQVNN	220572	225873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_222917_224043
898862	contig_13780_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_149053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5	19	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	284	934	605685	607028	FALSE	65	ATTGTAAAAATAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFEEVGCCEDLEAVGEGQRALLGRNHLRLSCTRLSVGRVEAQRPGDGSPGLGAFGPRWGLGDRAEAGAVEAAETTGGARWRGRDSAGETGPNQSMAMGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGDIQQARKRAAQETERLLKELEQNANHPRRLEIQNIFKEAQALVKEKIVPFYSGGNHVTDEFEEGIQDVILRLTHVKTGGKISLRKARYHTLTKICAVQEIIEDCMKELLTKQLLALDAVDPQGEERCKAARKQAVKLAQNILGYLDLKSDEWEY	603980	607685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_604236_605656_606189_606881
898863	contig_5428_pilon	-	7412	5	Intergenic	novelGene_160400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	61.4918693812442	727	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	118	1200	51297	34939	FALSE	25	ATTATGGATGTGATTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVPPGPSSLLPPPAPPAPAAAEPGCVFPVGAAPACCSEDEEDDEEHEGGGCRSPAGGEAVAAAKGHPCLRCPQPPQEQQQLNGLISPELRHLRSAASLKSKVLSSADSATTAVTPDGGPRATATKGAGLHSGESPPNSLPNNARTALPSSAEAATVSGPAATRNGLAEGTEQEEEEEEQVQLLSSSLTAGCSLRSPSGREVEPGEDRTIRYVRYESELQMPDIMRLITKDLSEPYSIYTYRYFIHNWPQLCFLAMVGEECVGAIVCKLDMHKKMFRRGYIAMLAVDSKYRRNGIGTNLVKKAIYAMVEGDCDEVVLETEITNKSALKLYENLGFVRDKRLFRYYLNGVDALRLKLWLR	51678	28726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_35077_42932_42989_45029_45154_50532_51299_51562
898864	contig_7457_pilon	-	2977	5	Intergenic	novelGene_31434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_4	150.092263291617	55	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAACAATAAATATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471292_471559_472768_473151
898865	contig_5643_pilon	+	912	5	Intergenic	novelGene_38933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	20.0546129356814	320	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	93	398	434173	438025	FALSE	5	CCTGTCTCCTGCTTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFRPRPPSAVQGLSVPAPGPRLPASPGPGTMSEKSVEAAAELSAKDLKEKKEKVEEKASRKERKKEVVEEEENGAEEEEETAEDGEEEDEGEEEDEEEEEEDDEGPALKRAAEEEDEADPKRQKTENGASA	434080	438539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_434218_437168_437241_437505_437582_437736_437799_437974
898866	contig_3956_pilon	+	2285	10	Intergenic	novelGene_15109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1576.85830015428	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	549	1307	1284132	1289548	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEVSRHSGLPCRGRCVRRTCGVCALMSMM	1281606	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284058_1284183_1287373_1287536_1287968_1288077_1288874_1289240_1289475_1289677_1289758_1289896_1290297
898867	contig_7356_pilon	+	2973	1	Intergenic	novelGene_60421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAGGAATACATGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486108	489081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_486100_489100
898868	contig_9098_pilon	-	1846	12	Intergenic	novelGene_75844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_10	167.374277475156	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	530	1399	345261	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355862	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349641_349712_355700
898869	contig_4783_pilon	+	2340	1	Intergenic	novelGene_108408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATGGCAGATAATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359826	362166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_359800_362200
898870	contig_4091_pilon	+	5044	7	Intergenic	novelGene_172990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	138.953729309036	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1571	1942	27470	28511	TRUE	45	ATAATGAAGGTGAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSLNNIINITCNGVLSGNCQKFSRFQKRTWTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDRNKLWMTLQKNGNSKTFNCAHEETYIDQEAVFRTEQGDTAWFKIRKGVCQDCIL	10679	148741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_28180_30875_147862_147906_148045
898871	contig_8161_pilon	-	2365	7	Intergenic	novelGene_156745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.0765376089501	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	108	1127	254273	230026	TRUE	50	CAAGCAAACAAGGAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254380	226181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227420_230025_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
898872	contig_13542_pilon	+	2003	7	Intergenic	novelGene_131539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	103.586785944068	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTTATACACTTTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536427	547720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_536631_540319_540508_540702_540808_541724_541822_542065_542175_542728_542851_546541
898873	contig_17840_pilon	+	2253	1	Intergenic	novelGene_154299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGGAAGGAATACACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65287	67540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_65300_67500
898874	contig_20748_pilon	+	2508	5	Intergenic	novelGene_138176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224.576267668692	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	120	722	149380	168022	FALSE	25	CTTCTAGAATGTTCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIARVADGLPLAASMQEDEQSGRDLQQYQSQAKQLFRKLNEQSPTRCTLEAGAMCYLVLCEAAFPKKLAFAYLEDLHSEFDEQHGKKVPTVSRPYSFIEFDTYIQKTKKLYIDSRARRNLGSINTELQDVQRIMVANIEEVLQRGEALSALDSKANNLSSLSKKYRQDAKYLNMRSTYAKLAAVAVFFIMLIVYVRFWWL	149260	169808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_149440_158593_158694_161678_161820_164010_164158_167867
898875	contig_10345_pilon	+	2825	12	Intergenic	novelGene_158360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1197.20889593081	45	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	71	793	11670	20454	TRUE	45	TGATATCACAACAGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLGLIPSRRRKEGDRSESIQYHSDHKKLSSSSQSVSEIHQVQSA	4368	24957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17214_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046
898876	contig_6794_pilon	-	2468	4	Intergenic	novelGene_149001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	119.342643957081	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	862	1383	18797	13983	FALSE	40	TATTCATTAAAAACTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20644	12897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732_19590_20575
898878	contig_2100_pilon	-	3713	2	Intergenic	novelGene_50631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGCCTGGAGCCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913194	909330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_911368_911518
898879	contig_11338_pilon	-	3020	16	Intergenic	novelGene_6290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	203	junction_15	192.039185816044	321	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	103	2037	250534	196726	FALSE	35	ACTCAAGAAGAGCCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQDTTSSKTPPIKGKKMLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQDK	250636	195742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_196735_199028_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_250509
898880	contig_5023_pilon	+	2948	14	Intergenic	novelGene_7202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2166.88896234854	10	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	98	1336	607279	639146	TRUE	5	TGCTGTATTTTTGGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGLSTG	580831	648294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629261_639131_639197_643413_643539_646857
898881	contig_1694_pilon	-	5164	3	Intergenic	novelGene_144915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	54.5	687	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTATCTTGTGGGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434915	411329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_416167_419568_419737_434756
898882	contig_12157_pilon	-	3193	3	Intergenic	novelGene_135878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	78.5	246	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	673	1425	22929	22177	FALSE	15	GTAGATATCTTTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLHIQIKSPQESTGDPGNSSSVSEGKGSSERGSPIEKYMRPAKHPNYSPPGSPIEKYQYPLFGLPFVHNDFQSEADWLRFWSKYKLSVPGNPHYLSHVPGLPNPCQNYVPYPTFNLPPHFSAVGSDNDIPLDLAIKHSRPGPTANGASREKTKAPSNGKNEGPLNVVKTEKVDRSTQDELSTKCVHCGIVFLDDVMYALHMSCHGENGPFQCSICQHLCTDKYDFTTHIQRGLHRNNAQAEKNGKPKE	117477	20408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_23239_25954_26078_117237
898883	contig_7119_pilon	+	4564	1	Intergenic	novelGene_41032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCGACCCCTGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390701	395265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_390700_395300
898884	contig_10861_pilon	-	3516	4	Intergenic	novelGene_39277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATCACTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346593	1341369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1343280_1344610_1344774_1345017_1345070_1345202
898885	contig_5276_pilon	+	3964	3	Intergenic	novelGene_178724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAGAAGCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135436	143123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5276_pilon_+_136770_140202_142612_142901
898886	contig_6137_pilon	-	3889	14	Intergenic	novelGene_59215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCAAGTGATTCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348372	1312050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331861_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336791_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341652_1346614_1346749_1347420
898887	contig_3575_pilon	-	5661	5	Intergenic	novelGene_141098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	244	junction_2	59.7761449074796	848	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	48	1370	369911	363613	FALSE	0	CTTTGTGTCCTTTTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNSPLGSMPFASDLEDFDYSSWDAMCYLDPSKAVEEDDFVVGFWNPSEENCGVDTGKQSISYDLHTEQCIADKSIADCVEALLGCYLTSCGERAAQLFLCSLGLKVLPVIKRTDRENAVRSARENFSSQQKNLSVSCAVASVASSRSPVFKDLEYGCLKIPPRCMFDHPDADKTLNHLISGFENFEQKINYSFKNKAYLLQAFTHASYHYNTITDCYQRLEFLGDAILDYLITKHLYEDPRQHSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKYDYHKYFKAVSPELFHVIDDFVQFQLEKNEMQGMDSELRRSEEDEEKEEDIEVPKAMGDIFESLAGAIYMDSGMSLEMVWQVYYPMMRPLIEKFSANVPRSPVRELLEMEPETAKFSPAERTYDGKVRVTVEVVGKGKFKGVGRSYRIAKSAAARRALRSLKANQPQVPNS	369958	359321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_363779_364145_364222_364313_364477_367121_367391_369262
898888	contig_16776_pilon	-	3124	4	Intergenic	novelGene_130523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	197	junction_3	143.25501736414	36	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCCAGCTTCCACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57925	38913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_41567_42702_42804_43076_43228_57706
898889	contig_13305_pilon	-	1210	2	Intergenic	novelGene_146773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	542	898	118099	117743	FALSE	25	GTGAGCTGCAGATTGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKREHPADFVAQKLQGALFICFTCARSFPSSKALIAHQRSHGPGPRPPPPAAPTTAQPTFPCPDCGKTFGQAASLRRHRQVHEARTAPGPFACTECGQDFAQEAGLHQHYIRHARGEL	119927	117430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_118540_119826
898890	contig_4315_pilon	-	2045	8	Intergenic	novelGene_46795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	328.387153294674	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	66	866	339053	330731	TRUE	30	ACTCCCAAAACATCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCKEPWWYNIYELGC	339118	327077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_330723_330773_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
898891	contig_8259_pilon	+	3617	10	Intergenic	novelGene_148876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	564	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	804	1166	179771	180133	TRUE	50	GGATATGCAAAGAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVRFLNCPGENAGVGTFFVEPPVQIQASALLWVTSTPHQHSKQVASQEHWVFVVMVLLHQPQETAMPGAVSLGSGGCMKSGGELKPRLLDLEEILGPIKLNPVCHFAKGNDLLKATVS	178967	406656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_181479_185323_185415_230425_230534_245397_245537_292588_292786_301982_302067_341829_341945_363021_363068_392077_392237_406489
898892	contig_1450_pilon	+	2976	22	Intergenic	novelGene_27363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	500.91006067845	28	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	164	2782	244426	355748	FALSE	80	TGCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244262	355942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_340890_340949_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
898893	contig_13487_pilon	-	2727	2	Intergenic	novelGene_178725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	17	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	1432	2727	2305	1010	FALSE	35	CTAGAAACACACGGCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKF	53023	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13487_pilon_-_3020_52306
898894	contig_12424_pilon	-	524	4	Intergenic	novelGene_174264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_3	112.395136312327	67	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	91	339	19647	8624	FALSE	50	AATAAATCACCCCTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTR	25104	8438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_-_8705_16015_16154_19617_19680_25046
898895	contig_6291_pilon	-	4802	6	Intergenic	novelGene_164781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.2	21	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	4233	4640	357054	354898	FALSE	30	ACTCTGAGGCAGTGACGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRGRDPSQETVQVIHGQREDLFFTLLFFTDLQHPGGHHPPHVGLDVLLHAFEVGALRKVALLDGEQVLQNAVVVEQVGVRHGPADRVHLAAQQLHGEPGAHSFPCSLRTGKVSLFFFFLRGEGKGFPLPPSFG	386806	354735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_355208_356956_357172_359958_360119_370426_370578_381244_383707_385464
898896	contig_12951_pilon	-	2049	10	Intergenic	novelGene_68203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTCGTCGCTACCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836456	755155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_755319_769929_770269_813282_813374_816856_816955_819987_820089_827839_827979_832246_832454_832888_833052_833429_833654_835932
898897	contig_9008_pilon	-	5223	3	Intergenic	novelGene_58622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	372	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2604	3044	132526	132086	TRUE	15	GATCCGGAAGTGCTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAKWLKHLAANWKVNGSNPPAAPREKDTTVYFCKYLQPWKPYGANPVPYRVAMSWNRLNCNGLTYHIPLFDLISGSDFSERTQKQPYLRILNLKYLKIKTTSTTNHYQTNKIRWHATLSTMFKTTQGKSIGSGLKRNLGLGFSLE	135129	112617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_-_112657_125512_125982_130414
898898	contig_19974_pilon	-	4893	2	Intergenic	novelGene_130490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTTACAATACAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368541	363491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_366837_366993
898899	contig_859_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_132816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65772	67578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_65800_67600
898900	contig_11816_pilon	+	4742	1	Intergenic	novelGene_98473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	463	840	447507	447884	NA	60	GAAAAAAAAAATACAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKGRKNSDCESLTEAIGFLVFFFSFLVQVLVDLFMRTQLYQQLQYFKVIFQHQDLCVGSCVKALNAQIFTGICTAYQAYRLFKDLQTQGYFILGGLRYWWLRNSFWESEDYPTSPYLFYFLT	447044	451786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_447000_451800
898901	scaffold_19766_pilon	-	1953	6	Intergenic	novelGene_34397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	90.9263438173998	311	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	93	1043	830565	825937	FALSE	30	ATACCTGGAATTTATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVRLGKLFFILAVFGAWSGTPKEQDDDSERLPSKCEVCKLLSQELQEKLSHTGRSREVLELGQVLDTGKRKKHIPYSVSETRLEEALENLCERILDYSVHAERKGSLRYAKVRPFPRAAMVGDPASQRQCLTSPEVHKRCQPITPHLQCPLPIIRLPPLTWNSPESPVVDKADMVGKRKEEGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQCETMLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	830657	825026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826309_827289_827413_827777_828085_828182_828310_830450
898902	contig_1719_pilon	+	2183	15	Intergenic	novelGene_87328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	149.26616413341	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	25	1701	492762	726560	FALSE	45	AAAAACACACATCTCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELENIVANTVLLKAREDRDYCSLCDKQPIGRLLFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMLLTKDAKQRLGCQEEGAVEVKRHPFFRNMNFKRLEAGMLDPPFVPDPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	492737	727042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_492814_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_718062_718201_723078_723217_724669_724802_726461
898903	contig_19993_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_178726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1315	1953	19907	20545	NA	55	TAAAACTTGGGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGRFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGSPFTVRFLLLIVSHIIIRVFSFFFILFSECSSNRVVSKCLSSILWILSSTVSYLLLSPSMTLSIPEILLFIFWIYNCCFYIISICEFILVFCSCIVFLNTCILLSVFSMNLSAFSMNLSILSSFLSAFCFNSCIFVSITDLNSLSDSSSAFFSLGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDVCCLRCIQ	18592	21072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19993_pilon_+_18600_21100
898904	contig_13778_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_70852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGAAGATTCCATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257423	260151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_257400_260200
898905	contig_9345_pilon	+	3071	3	Intergenic	novelGene_24442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATTCGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376880	479976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_379371_421889_421900_479405
898906	contig_10904_pilon	+	2873	2	Intergenic	novelGene_22472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1839	junction_1	0	4119	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	389	1357	149100	150068	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	145839	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097
898907	contig_14353_pilon	+	4155	2	Intergenic	novelGene_82119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGACATGCTATTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136065	144383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_139196_143358
898908	contig_1090_pilon	+	3499	9	Intergenic	novelGene_131142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	439	junction_8	154.696830526679	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	760	2958	487733	513914	FALSE	20	ATGCTTCCTTATTTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFLKIMCVSFLLDHFHELYKVTLLPNQTHYILPKGECLPYFSFAEIAKRGLEGAYSDNPVIRHASIANKWKTIHLIMNSGMNATTIHFNLTFQSKNNDEFKIQITVEVDTREEPKLNSTTQKSYEHLVSPVTILPEAEILFEDVPLEKRFPKFKRRGNTTERLQEEVKIPLINISLLPKEAQLSLNNLDLQLEHGDITLKGYNLSKSALLRSFLMNSQDAKAKISEAVIIDERNDSLHVPLEKQVHKNVLANGLASERLQRSTFPAVTIKMKDHPQGQNPPQNLKSKAGFRSETQIQKIGGRGASNEKLSSLIVPLENHMTKEKKITGKEEEKNRVEGNVKNNIDVNEVLPGRKLQHYTEDYLGFLPWEKKKYFQDLLDEEESLKTQLAYFTDSKHTGRQLKDTFADSLRYVNKILNSKFGFTSRKVPAHMPHMIDRIVMQELQDMFPEEFDKTSFHKVRHSEDMQFAFSYFYYLMSAVQPLNISQIFDEVDTDQSGVLSDREIRTLATRIHDLPLSLQDLTGLEHMLINCSKMLPANITQLNSIPPTQEAYYDPNLPPVTKSLVTNCKPVTNKIHKAYKDKNKYRFEIMGEEEIAFKMIRTNVSHVVGQLDDIRKNPRKFVCLNDNIDHNHKDAQTVKAVLRDFYESMFPIPSQFELPREYRNRFLHMHELQEWRAYRDKLKFWTHCVLATLIMFTVFSFFAEQLIALKRKIFPRRRILKEASPDRIRV	486973	514455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_488876_491870_492071_492665_492886_493593_493708_497087_497174_497429_497529_500227_500396_503619_503711_513836
898909	contig_16999_pilon	+	2479	1	Intergenic	novelGene_84948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACCCCCCCCCGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23647	26126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_23600_26100
898910	contig_6137_pilon	+	2821	1	Intergenic	novelGene_59301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCACCTTGTCCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595856	1598677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1595900_1598700
898911	contig_14537_pilon	-	2986	2	Intergenic	novelGene_158662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1537	2088	107875	107324	FALSE	65	CTAAAAAGAAACTCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFCNIMKDEKLAIQEAQRTSYRIDPKRKSLRHITITLAKTKDRQRILRAAQEKQKVTYRRETTGLSSDYLAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKVLFRYDGEIRTFPGKQKLRDYVKTKPNFQELLKGVLRSENKQHQLTG	109550	106425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_109163_109301
898912	contig_6102_pilon	+	2667	22	Intergenic	novelGene_31740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	144.858645620081	31	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	168	1514	216236	221256	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQIPGRKKLKGSLFTPYFWPAPSATPAKAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGISGYPASELSKSKRIPYPALKGWRYQFLPNH	210328	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210415_216154_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221159_221521_221611_221702_226861_226951_227977_228161_228274_228396_228586_228648_228903
898913	contig_7157_pilon	-	2589	1	Intergenic	novelGene_131316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGACCCAGCATTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1004768	1002179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_1002200_1004800
898914	contig_12142_pilon	-	2578	2	Intergenic	novelGene_147839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	435	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1498	2010	226999	226487	FALSE	45	AGCATAATTCTAACTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNRCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	229017	225918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_228316_228836
898916	contig_4751_pilon	+	3581	10	Intergenic	novelGene_173717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	113.923084297268	423	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	700	2868	109893	202571	FALSE	20	AATGGCCACGCTTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPGTSGSSILKDVVAYVDVWSSNGTENYSKTFTNQLVDMGAKVSKTFNKQVTHVVFKDGYQHTWDKARKKGIKLVSVLWVEKCRTAGVHIDESLFPAANTNEQLPSLIKKKRKCMQPKDFIPKTPENDKRLQKKFEKMTKELQRQKTTLDSDVPALLFAPNGSLLYSPTVKTNSYHHSAMEKRLQEMREKRENLSPTSSQVIENSQDSPVNSLCLSPLNVSHDTSCSDESFAGVLHSSFDICGNSRRRNQEVKLGGLINDIGGGICMSSPVSKTSSTHSSASCSHLNKLTPQRPMNKLSEEKLNWQGDIVGETVTPDKKQSEGMSEEMLDEKCSLSPVLSTTEGHSLVHSRPSSSFAKRRRTSGYLHSPPKEKLKKKKYSTKSSLPKWQLFKSENRPQLMTKSVTETPDCGESSYDDYFSPDNLKERNSRSLLSDFQLSSNLVQFNSRSLSKNERGSILKMSDFSFMGKKSIPVDITDLTAKTSSSLQTPTNDEGNTTLSFMTSKEACTAEETPRDCIQADPQKREGPSPEEYNFSYIFDKLVHPKESLEQGHHGNLTPLKGNTNKMKKLIEIKSIQKEEGTTSKMLNSSESETQNNYKLHVVDDCKVEKSTEEMKNSSRGYSESVENGQTSRDVLPGSYEGFKELLKPHEEPNKRSEVKKRQDLYNPSAIYRDHQMVRPRNQGSDQRSWHQKSRKEYSKRIKILSMLLMDKSLEHGISS	109193	203284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_109933_112256_112349_117475_117595_153643_153732_158296_158412_160614_160759_163417_163508_172925_174117_184098_184209_202391
898917	contig_11088_pilon	+	2778	1	Intergenic	novelGene_85061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	2153	2581	17314	17742	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	15161	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_15200_17900
898918	contig_3721_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_123799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAAGGAGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75550	73706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_73700_75600
898919	contig_17074_pilon	-	3084	6	Intergenic	novelGene_145138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_5	56.1982206124002	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1589	2287	233824	227412	FALSE	45	TAAAAAGACTCAACTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGYSNRARKARLAEPQLQDYNDLPLFGRWQTEEFQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPVGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIICEEYKEVLLDAWEKEQALIEKKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKLRYGAKSEASLHTDAGGGLSSDEEEGTSSQAEAARILAASWPQNRETEDQTQKRSKKTRRGKKEAASHLFPFEKL	239005	226614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233610_233689_233825_237417
898920	contig_10982_pilon	+	4981	1	Intergenic	novelGene_87872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTTTAATCCTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119533	124514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_119500_124500
898921	contig_20550_pilon	-	2366	4	Intergenic	novelGene_142626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25741	19945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_20611_21234_21398_24121_24270_24351
898922	contig_9527_pilon	+	2807	3	Intergenic	novelGene_134027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1207	1590	57363	57795	FALSE	50	CTCAGAAATTAAAGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDGVHPLGHFLEVSSPLFDSDSTSDWSFLRREIGRVVPSNSGFQGAFGGYVFCQFLSLHLELPLNQKASPGRWRRNLCLALPGQQVYELRNRNMRPLREGEKSTMRTCNPLEPKCQNYFLDAASV	56091	59012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_56703_56767_57615_57663
898923	contig_4931_pilon	+	2641	4	Intergenic	novelGene_138344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	65.3758365147246	243	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	94	1227	212295	231692	FALSE	15	GTTGTCTAATTTATGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS	123210	233106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123286_212276_212521_228217_228931_231497
898924	contig_3252_pilon	-	2002	8	Intergenic	novelGene_61475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	317	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCGGCCGCCCCCCGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187858	153572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_153754_173807_173975_175224_175338_176367_176475_178608_178731_180318_180396_183359_183960_187223
898925	contig_3817_pilon	+	1666	2	Intergenic	novelGene_78305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	384	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128753	130903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_129819_130302
898926	contig_2444_pilon	-	1227	1	Intergenic	novelGene_83779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAGTCTGCAGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244844	243617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_243600_244800
898927	contig_1143_pilon	+	5794	6	Intergenic	novelGene_86623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_1	54.6208751303016	433	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1299	3900	393	4292	1334675	1357517	FALSE	40	AAGAAAACTGTAGTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDMKINADITGAKELLDDNNFISEKESGVHEPKDCQTSFQKNNALTLSEELSKDKSEKALSGGQSTLFIHAGAPAVSSENFTLPKGAAVNGPVSHSSLTKTSNMNKGSVSLTTGQPVDQPTTESCSALKVAADLQLSTPQNASQHQVLFLLSDVAHAKNPAHSIKKLPTSASVGCDIQNSVGNSIKSDSTLIDQVEVGEDSEDLLVKSDCVSTLTGISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTNEDTVDKAPVHSKVGQEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCISNKSKMLEVDFLEQNEELQAIDSQKYALSKVKPESTDEDLESVDAFRHLIYNPDKCGEDSSPVHTSTFLSNSLKKKCEESDSESPATFSTEEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLLKHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRYYCCEECNFMAVTENELECHRGVAHGAVVKCPIVSSDIAQRKMQKKTFMKDSVTGSSKKSTTYICKMCPFTTSARSILKKHMEYLHSSSCIDSFGSPLGLDKRKSDILEEPVDIVSTKPLSKQQPTTFPKNSALKQDVKRTFGSASQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSITQSGVNVCNQNNSPKTVMNKSSIDQKPKYFHQAAKEKSNVKANSNYLYRHKYENYRMIKKSGESYPVHFKKEETSSLNSLHLFSSSGNSHSDSFISDSHNSDTKRPESFKEHRRVAVKRVVKESKKESSVEGEDLDSYPDFLHKMTVVVLQKLNSAEKKDSYETEDESSWDNVELGDYTTQAIEEETYNDINQEHVNIFPLFKSKVEGQEPGENTALSYDQNDGFYFEYYEDTGTNNFLHDVHDPQHLENAETSLSKHSSVFHWSDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQIATSDKMQHFKRTGTGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRLGKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNNRRIIPRPFVAQKFASGDDYLSQNVIPLEAYRNGLKTEAVSVSASEEDGLSFLNECVETKPELSGGKKSLTLIELLKNKRMGEERNSALSPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDLTMHSALDCKQKKSRSRSGSKKKMLSLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVTSLLKKPASITETSFSLLMAEAAS	1244022	1359019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1244323_1269911_1269973_1334643_1337679_1337862_1338463_1355750_1355854_1357324
898928	contig_1331_pilon	+	3509	3	Intergenic	novelGene_37886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCTTTGGTTCATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469336	636621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_472462_480380_480523_636379
898929	contig_10953_pilon	+	2731	11	Intergenic	novelGene_42533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	144.019304261616	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	89	1207	179555	188559	FALSE	30	ATTTCTAGCAATATCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARCQLPGPTGLWRSSLLSRKPPQPPDALKMATSLGSNTYNRQNWEDADFPILCQTCLGENPYIRMTKEKYGKECKICARPFTVFRWCPGVRMRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDPQRMGAHAGKHSSP	179466	190083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_179609_180035_180090_181091_181122_181995_182129_183136_183227_183473_183514_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328_187461_188428
898930	contig_15327_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_70589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	0	39	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	1286	1969	844160	844843	FALSE	35	ATAAAACTCCGTAAGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARSWGILLLHPSSARYLCPTAAWQLPRPPGSSWGQCCFPSRGRPAASAGGSFIFRVLWQLSFPPAEEPSVREGSRAVKSHVVSMTGQGYGEGGLRWWPEECDEHCPQVPKIKLDLPLPPSPQRRTPSTPEEFSSRPPLRQQDYNPGRGAVRSAAGESLGSFLPSAPSWGLLLAQGACGGLWEMVWGREDTRKCGVRALVWSPHLKQGVWSWALHLCKPVALSVLSR	842613	844845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_842958_843218
898931	contig_12886_pilon	+	6308	2	Intergenic	novelGene_135474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	4956	5495	300709	301248	TRUE	35	TCTTGAACAGTTTAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQGGLPCCYQSPPHNMLAVGVASTQDACILAHAVSVSSPQHQLEGGADRPKLISREICPVGFGGLSYGVHKEAGRVLTIGAGSTAGAFCSNLQQPGNQLGGRGGVTLWSDPHGGLPRCHRSPLSRLLAVSAASTQGSCFLAHSSLSQQSSAPVRSGGRLTLTDPQGGLSCWFQRPEI	295753	302099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_301350_301387
898932	contig_11898_pilon	+	996	6	Intergenic	novelGene_144302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	66.865835820694	11	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	870	125	994	346596	371426	FALSE	55	AAAAAAAATTCACATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEETMECLQEFPEHHKMILDRLNEQREQDRFTDITLIVDGHHFKAHKAVLAACSKFFYKFFQEFTQEPLVEIEGVSKMAFRHLIEFTYTAKLMIQGEEEANDVWKAAEFLQMLEAIKALEVRNKENAAPLEENNAGKNEAKKRKIAETSNVITESLPSAESEPVEIEVEIAEGTIEVEEEGLETLEEVASSKQSIKYIQSTGSSDDSALALLADITSKYRQGDRKGQIKEEDGCAADPTSKQEHMKSHSTESFKCEICNKRYLRESAWKQHLNCYHLEEGGVSKKQRT	345463	371428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_345573_346580_346720_347820_347923_355150_355296_370825_371187_371288
898933	contig_12570_pilon	-	8452	3	Intergenic	novelGene_79381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	15.5	658	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	6289	6609	284104	283433	TRUE	35	TAAATGAAGGGATTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	290392	280001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_281087_282674_283699_284049
898934	contig_13021_pilon	-	5033	31	Intergenic	novelGene_8115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	180.297149789513	141	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	3132	4865	160204	147970	FALSE	15	GTTACTGCTTTTGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSARKLGEPIRSAIRLHPPHHPSEPRAPCPIGKEYCLSAGISTGEPATFSAEPDDSVFSTSKLPKNSKQEICSAQVQGPRTRRLPKGSRHENRSAVSSWGSPFPQRLRRTLTEQELHAVSEKLSQRLSELDWMLKSALGDRIKEKTEHEEEDAGAGNEEVENGEVESGSAETLSQYSDSIMDYGPKKLRPGLAVSRKPPYRSHSLSPSPVNRRKPCHRERTKQRKPKETDIRRFRAQAISEAFERELRRNKVQENIGPLGINDEQEETEKTYREAVHKGTPKPCQPWKIYSRKTTTPSPRGGFPKPNKEVPMKVNEQSLLPLMLEQFPFLSVSDQTLSKMWKQQIAQVKQLKKDAYGENRSKKKLQDEIEEALRRHDLLTALVKKEYEHNRRLQDFKDRINRQRLTQSKIKENRQQIVRARKYYDDYRVQLRAKMMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	181149	147801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_150265_151766_151842_151957_152128_152919_153050_154324_154418_155195_155336_157302_157478_158091_158222_158404_158518_160045_160225_163208_163325_166458_166570_169579_169688_171694_171824_173610_173969_174538_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
898936	contig_1143_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_86575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATGTTATCTACAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100678	102978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_100700_103000
898937	contig_20614_pilon	+	4061	11	Intergenic	novelGene_107520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	64.7939040342531	189	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	356	2164	58978	64723	TRUE	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRGSCSRSSPWPLAQLFEGEELPPHFGIRTSHDGCHLKPSGPSVEPDILSFSGPRDSAGTTLNGTRCLTEQSDPKYTQPPNPAHWSDPSHGPPRGPGPPRDGEDPDQSEISSEEESGMDQELSRENEAGYQEDGNPSFLSIPPTCNCQRTPGIPEGLYSEGGDSSSSNFCHHCTSPALGEEEELEEEYDEEEPLKFSSDFSRVPSGKKPPPRRQRHRFPTKEDTRETGRRDPRSPGRHRLGRKRSQADRRRGLGLWGAEELCQLGQAGFWWLIELLVLVGEYVETCGHLIYACRQLKGSDLDLFRVWVGVWAGRLGGWAQVMFQFLSQGFCYGIGLLTRFLRLVGALLLLALALLLGCLQLGWQFLVGLGDRLGWRGKATWLFSRLDSPALQRCLTLLRDSRPWQQLVRMVQWGWLELPWVKQRTNRQGNAHVASGRYCQPEEEVARLLTMAGVPEDELNPFHVLGVEATASDVEMKKAYRQLAVMVHPDKNHHPQAEEAFKVLRAAWDIVSNPERRKEYEMKRMAENELSRSVNEFLSKLQDDLKEAMNTMMCSRCQGKHRRFEMDREPKCARYCAECNRLHPAEEGDFWAESSMLGLKITYFALMDGKVYDITEWAGCQRVGISPDTHRVPYHISFGSRVPGTSGRQRATPDTPPADLQDFLSRIFQVPPGQMSNGNFFAAPQSSPGTTTASKPNSTVPKGEAKPKRRKKVRRPFQR	58120	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_58204_58615_58657_58746_60085_62355_62463_62673_62794_63625_63787_63881_63985_64512_66206_67449_67601_67866_68042_68861
898938	contig_9945_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_104818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGGAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108270	106084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_106100_108300
898939	contig_9332_pilon	+	3704	10	Intergenic	novelGene_60701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACAAACCCCAGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39555	86296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_41755_53718_53891_55662_55846_56053_56240_65981_66121_68156_68378_69415_69539_73748_73890_76411_76604_86148
898940	contig_12624_pilon	-	1725	9	Intergenic	novelGene_61029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1115.38858139215	15	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	458	1351	875571	862389	FALSE	35	GTCCAGGCCCAAGAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAKRRIPCLIPCRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPQQQPQEETSPESDIPAPPSSSAPGKPQLSPGQKQREEPKEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	876116	862014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_875799_875886
898941	contig_8544_pilon	+	764	7	Intergenic	novelGene_55923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_6	297.997436603442	51	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	226	762	90532	152821	FALSE	45	GGTAAATAATTTTTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQRQKKVKVKKPKPEFPVYTPLESTYIESYEHGTSIEEIEEQMDDWLENRNRTQKK	83414	152823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523_92618_120265_120357_152660
898942	contig_16594_pilon	+	5192	2	Intergenic	novelGene_53788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGTTTAAGAGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73271	254641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_73326_249503
898943	contig_7962_pilon	-	6730	6	Intergenic	novelGene_149281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	553	134	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTCCTCGTTCAGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95733	48951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_49276_75395_75552_85105_90137_90286_90992_91145_91623_95696
898944	contig_678_pilon	-	3656	1	Intergenic	novelGene_167830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	13	375	160332	159970	NA	5	CTTCTGCCTTCTAGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQVVQGVDALLVCHNGALSTEKEEVTGLCVRELNDDTRNDSKFAYTRTEMQTVAEKVDTVKSIHIHSVIILRRSDKRIEWKFLQSSCPWLQRRQRVSPHESCGLVSFPSSYNCLAFPC	160344	156688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_156700_160300
898945	contig_4951_pilon	-	4768	1	Intergenic	novelGene_122117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGATGGATATCCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17004	12236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_12200_17000
898946	contig_13481_pilon	+	3805	8	Intergenic	novelGene_119309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	182.223903537401	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2886	920	3805	414928	472089	FALSE	0	GTGCCTGTGTCCTCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSYTQSSPGALNPSSQAGVESQSLKTKKDEEPESIEGRMKNDVCEEKKAELSSSSQQPSVIQQRPNMYMQSLYYNQYAYVPPYGYSDQSYHTHLLSTNTAYRQQYEEQQKRQSLEQQQRGLDKKAEMGLKEREAALKEEWKQKPSIPPTLTKAPSLTDLVKSGPGKAKEPGPDPAKSVIIPKLDDASKLPSQAPEGLKVKLSEASHLGKEASEAKTGAECGRQAEVDPILWYRQEAEPRMWTYVYPAKYSDIKPEDERWKEERDRKLKEERSRSKDSVPKEDGKESTSSDCKLPPAEDSRLGSKEPRPSVH	248566	472089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_251968_252071_283655_283915_284057_284530_414927_415154_466806_466895_468621_470963_471858
898947	contig_15165_pilon	-	2947	7	Intergenic	novelGene_145314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	23.9194249280556	32	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	846	2441	224352	216810	FALSE	25	CTTTATCTGAGACTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLEAKKPSVCESKPLTRERLRTTLSVLKGIVASCYGPSGRLKQLHNGAGGHVCTTSQSSALLRGLSVTHPVLKILTTSMQNHVSCFSDCGLFMAILCCNLIEYVEGIDLAPTTVIELNKQLLSLCTSYLKSEACACRIPVDFSSTQILLCLVRSILTSKPACMLTGKEVDHISALVLRAFLLTIPEKAEDHIILGKSIIVPLKGQRVIDSTVLPGMLIETSEVQLMRTLPIKKSSALKVALFCVSLSGDFSDTGEGTLAVSYGVSLESAVLDQLLNLGRQLVWDHIDLVICQKVIHPSLKQFLSTHHVIAIDRVGVALMEPLSKMTVAVSSLLLCNRNDTAWDELKLTCQTALHVLQLTIKEPFVFLGGGCTETHLAAYVRHKTLNEPGSILKDVGYTQTELHLIAEAFCSALESLAGSLEHDGGEILTDMKYGHFWSVQSHSPPVANWPDLLSRCGCGLHSNQEELSWSFLRSTHHPFVPQNSLPHEAASSANNLTLDCFTAKLSGLQVAVETANLILDLAYVIEDKN	246639	216303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_217251_219100_219212_220014_220074_223367_224773_232817_233041_246278_246461_246619
898948	contig_9609_pilon	-	2711	4	Intergenic	novelGene_23000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCCTTGCTCTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319772	311094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_311599_313104_313264_314272_314431_317882
898949	contig_2093_pilon	+	1850	1	Intergenic	novelGene_152946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAACTGGGAAGTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961082	962932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_961100_962900
898950	contig_17144_pilon	-	1726	11	Intergenic	novelGene_29512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	328	1656	179764	166152	FALSE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183409	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
898951	contig_16594_pilon	-	1469	7	Intergenic	novelGene_53850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_6	2108.93667256485	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	510	1259	165546	124924	FALSE	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVGRCQLCFLIV	306333	124713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_242309_242430_306046
898952	contig_14682_pilon	+	5353	7	Intergenic	novelGene_139103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1010	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1330	1734	92182	92586	TRUE	15	TTCAATGTTCCGTTTCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGREWESIYHKLPELCSPSGRSNDGTWSQVLERKEGEVGRGKEEIKRSVKMALREPPVRVCGIQAAAFYRSRDCGLGKQRRPSRGEEGWGLGKHILPITSCSVSRWKLLEVAFSYRVCWSPIGVQDGRSALC	90852	142024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_94438_95775_96557_119739_119813_122399_122532_124154_124254_137167_137312_141485
898953	contig_7416_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_134318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACTACTGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79642	82375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_79600_82400
898954	contig_14814_pilon	-	3985	2	Intergenic	novelGene_137720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	410	955	296185	295561	FALSE	5	TGGTGATTCTGCTGCCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIIIITTVITTITTIPITIITTTITITNIITTIVIPSPSSPSLPPLSSPSSSTSSSSSSSCHHHHRQHHHHHPITTTVNITIIIPSSSHHHHRQHHHHHHHRQHHHHYHQHHPIATIVNITIIITTIVNITIIITTIIVRSRKISVLMRAAGLSQEVSFGDRCWSWVGWLWPRKQVGKG	296594	292530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_295687_295765
898955	contig_2689_pilon	-	2816	8	Intergenic	novelGene_100820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	137.031204549942	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	3	839	189383	153572	TRUE	40	AGTATAAAAGTATAGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLTSWCSAASYDIWCSGRECAYCVARSLMPSWLKHYPPNFTSLISSRSLSENLDPRGIQLSALFMSGVDMALFANDACGQPIPWEHCCPWMYFDGKLFQSKLLKASREKTPLIDLCDGQAEQAAKVEKMRQSILEGLNFSRQNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVCGFGGPYGETVATGAYRAFRVAAAAGHSGAFSGNDNSRTSKLQGGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	189385	142603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135_157320_158472_158681_164367_164483_189343
898956	contig_14925_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_55376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	431	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATCAGAGCAGAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129482	128141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_128100_129500
898957	contig_720_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_155160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	355	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAAGTCGCCATCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88537	86681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_86700_88500
898958	SIRV6	+	735	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8167	2	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTGTATGAGTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	3164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
898959	contig_9839_pilon	+	2537	11	Intergenic	novelGene_88597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	115.367933153021	401	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	117	1319	530160	549988	FALSE	30	TAAAAAGTCCCATTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKQHNHLERAFRGATVLPANTPGTAGSGKDQCCSGKGDMSDEDEENEFFDAPEIITMPENVGHKRTGSNISGASSDISLDEQYKHQLEETKKEKRTRIPYKPNYSLNLWSIMKNCIGKELSKIPMPVNFNEPLSMLQRLTEDLEYHELLDRAAKCENSLEQLCYVAAFTVSSYSTTVFRTSKPFNSLLGETFELDRSEENGYRSLCEQVSHHPPAAAHHAESKNGWTLRQEIKITSKFRGKYLSIMPLGTIHCIFHATGHHYTWKKVTTTVHNIIVGKLWIDQSGEIDIVNHKTGDKCNLKFVPYSYFSRDVARKVTGEVADPSGRVHFALLGTWDEKMECFKVQLASGDNGGDARQRGHEAEESRVMLWKRNPLPKNAENMYYFSELALTLNAWEGGTAPTDSRLRPDQRLMENGRWDEANAEKQRLEEKQTLPVAF	529796	551206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_529887_530133_530237_530614_530670_530844_530977_538162_538409_538676_538798_544665_544770_546481_546578_547653_547836_548602_548767_549962
898960	contig_14680_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_132731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7071	4251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_7100
898961	contig_19850_pilon	-	1833	12	Intergenic	novelGene_170851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_11	63.1002089032704	278	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1722	111	1832	39513	3450	FALSE	25	TAGGTTCTATACATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRQHTVFLKKMTQFILQEMPKARYSSLLNDFVESNYFVIDGDSLLVTCLGDKSFKRGQDLHFFYLVECYLVDLMRNGAQFGIIFFEDAECAYFPFPELLPLRTALILHLQHNTNIDVQTEISGCLSLEWELFLEERHPYFLIVSDEGLNDLQTHLFNFLIIHSWGMGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKENQMMSQSAYKSLIQHLEEDKILALTSHFGHLRWEDMVEEQAHETIFLLRQLWPQGSDIRSVLCVTLCSLSLGRYHCFLENKKKRASDQETSVRQVDTDCSALQEVEDLCRLHCLSIAFLLRLPLSQRAQTRVITSHWIQNIQTFLKMKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTSH	39623	3448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_29232_29398_30360_30478_32120_32463_38256_38447_39010_39081_39509
898962	contig_5302_pilon	+	3676	1	Intergenic	novelGene_81383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGGAAAAAAACTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102778	106454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_102800_106500
898963	contig_8882_pilon	+	3140	2	Intergenic	novelGene_178727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2475	2777	283234	283536	FALSE	30	CTTAACATTATTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGGRVWVKKGREWESVYHKLLELCSPSGRSKDGAQSQVFERKEVEVVRGKEEIKTSGKKQHQQPINGTQRAGPFGCVESKQLVFPGQEIVAAGSRGV	208514	283899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8882_pilon_+_210146_282390
898964	contig_6164_pilon	-	462	2	Intergenic	novelGene_121293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAAGCCATCCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608157	602026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_602264_607932
898965	contig_9609_pilon	-	2754	4	Intergenic	novelGene_23002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCCTTGCTCTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319815	311094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_311599_313104_313264_314272_314431_317882
898966	contig_7962_pilon	-	5229	3	Intergenic	novelGene_149303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2207	2692	380708	380223	TRUE	60	TTAAACAAAAAAAACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVLVGIQIKTQDDSPVEENALEVPDREFKSLILGIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRLKPWKTGSVELKTNTWIQLCFRKTQKKEQRKTKRP	382914	357134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_357315_374428_375619_379055
898968	contig_4659_pilon	-	5989	8	Intergenic	novelGene_118228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	366	junction_7	89.2595390203336	523	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	182	1165	860030	819799	FALSE	85	AAAGAAAAAAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884150	814974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_883977
898969	SIRV6	+	1248	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	268	12	-133	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	25	GTGCTTGTTTAGAAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
898970	contig_13740_pilon	-	1479	11	Intergenic	novelGene_34662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3306.90190964292	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	70	573	165243	160666	TRUE	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRPRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165312	156799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
898971	contig_11720_pilon	+	1027	6	Intergenic	novelGene_43861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_5	1586.12251733591	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	24	743	86302	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	86278	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
898972	contig_6546_pilon	-	550	4	Intergenic	novelGene_140987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCACCTTAGTCGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599649	597602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_597772_598335_598544_599263_599363_599575
898973	contig_9484_pilon	+	1705	12	Intergenic	novelGene_105637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	583.921977693131	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	716	1573	101609	104965	FALSE	5	CTTGGTGGTGGTTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95891	105097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100535_100673_100823_101219_101369_101601_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
898974	contig_7151_pilon	+	2261	4	Intergenic	novelGene_40777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	374	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1649	2047	529141	551143	FALSE	15	CTGAGGTTTCCTTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFMPEYHVWVKWRPVQPLPLPFTVLICKSQEIGKLGIQKLNNKVLKQLAIKQALRSKMKTTAMVEGISLGCW	527492	551357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529337_530062_530181_549639_549723_551141
898975	contig_6163_pilon	+	1099	2	Intergenic	novelGene_103806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCCTCTGAACCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75168	77224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_76137_77093
898976	contig_12886_pilon	+	2931	1	Intergenic	novelGene_135486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2107	2508	361068	361469	NA	25	GGAGCACACCCTCACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSSHLRYSTGLIPSGARENEENRIQGKDQSKGLIVHSYQGLHQTESSTAGWCPATTDRSDQDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQIKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	358961	361892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_359000_361900
898977	contig_17413_pilon	+	4751	1	Intergenic	novelGene_177199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACAAATCCAGATAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20762	25513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17413_pilon_+_20800_25500
898979	contig_11378_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_112320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCCTGAAAGTATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165407	1163993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1164000_1165400
898980	contig_6674_pilon	+	2506	3	Intergenic	novelGene_148038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	50	201	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	28	342	471251	485890	FALSE	95	AAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNYNSVTTSMNGYGTAAMSNLGGSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSSGIFSFSPANMVSAVKQKSAFAPVVRPQTSPPPTCTSTNGNSLQAISGMIVPPM	471223	488054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_471339_475651_475847_485858
898981	contig_14519_pilon	-	2137	11	Intergenic	novelGene_66817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	128.116704609508	107	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	126	836	283786	275404	TRUE	25	CATTGGTTACCAGCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWSATNMKWIEAKMKELGVSTNANYKITFMLDSAAMITVHTPRRGLIDVTPLCLMT	287182	269514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275427_277941_278045_278562_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283842_287112
898982	contig_11898_pilon	+	2617	1	Intergenic	novelGene_144293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2104	2409	242880	243185	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECFLEARMVRLPLTYFGFVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSTRWIDTVAATTGSSLTMIVRMVHDQAVFRSVVHKVAMSRNQLNGT	240776	243393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_240800_243400
898984	contig_9098_pilon	-	1966	12	Intergenic	novelGene_75846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	136.378787037131	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	305	1105	350397	337565	TRUE	25	ATTTATATCTATGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLHSRHCCTALPLQLGTHLHPCCPREPSGHRLLPYPLHGWSANAVSAGGYGQPHGRGPAGQSL	355820	335328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340781_345188_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330_350461_355579
898985	contig_8617_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_73383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATTTAGGTTAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61438	60779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61400
898986	contig_7695_pilon	-	3921	1	Intergenic	novelGene_41590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	372	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	2600	2992	476390	475998	NA	10	CCTCTGAAGCTCTGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRFSLIITFGKFLSFLGVPSGAFMRNRRLFLALGCRPTPPHSPQPGSVRSTSFGLLASTASLFSFKKSLMTSSPAKASFIICFWSLSSSPSNSSTVVGTAKDVPEGDFVVRRFCKSIMCSFLFFLGASG	478989	475068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_475100_479000
898987	contig_10436_pilon	-	2563	20	Intergenic	novelGene_108466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1951	2358	83056	81496	TRUE	5	CCGGCTCCCTCCCGCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPEGDAHAKVMHAHDFHQAGVLGVAEAHTAQLTGHLETKGPQLLEALQSGLLHLLQSVILGRIIHFLEETGHGPHQLFEELCLLLVEHYGYGNTWSVVSWPLNIPAAKDLDSALAWLSLAEASEERDSDLSTAA	87163	81215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_-_81347_81421_81498_81758_81826_81916_81988_82080_82146_82410_82544_82986_83133_83368_83500_83594_83722_84076_84277_84654_84756_85173_85262_85346_85412_85515_85618_85697_85797_85884_85956_86038_86114_86193_86266_86352_86428_86495
898988	contig_16999_pilon	+	3300	22	Intergenic	novelGene_85002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_17	130.58992262482	31	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2862	120	2981	195656	236848	FALSE	30	TTTTAGTTATGCAGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAENVCYTLINVPMDSEPPSEISLKNDLEKGDVKSKTEALKKVIIMILNGEKLPGLLMTIIRFVLPLQDHTIKKLLLVFWEIVPKTTPDGRLLHEMILVCDAYRKDLQHPNEFIRGSTLRFLCKLKEAELLEPLMPAIRACLEHRHSYVRRNAVLAIYTIYRNFEHLIPDAPELIHDFLVNEKDASCKRNAFMMLIHADQDRALDYLSTCIDQVQTFGDILQLVIVELIYKVCHANPSERARFIRCIYNLLQSSSPAVKYEAAGTLVTLSSAPTAIKAAAQCYIDLIIKESDNNVKLIVLDRLIELKEHPAHERVLQDLVMDILRVLSTPDLEVRKKTLQLALDLVSSRNVEELVIVLKKEVIKTNNVSEHEDTDKYRQLLVRTLHSCSVRFPDMAANVIPVLMEFLSDSNEAAAADVLEFVREAIQRFDNLRMLIVEKMLEVFHAIKSVKIYRGALWILGEYCSTKEDIQSVMTEVRRSLGEIPIVESEIKKEAGELKPEEEITVGPVQKLVTEMGTYATQSALSSSRPTKKEEDRPPLRGFLLDGDFFVAASLATTLTKVALRYVALVQEKKKQNSFVAEAMLLMATILHLGKSSLPKKPITDDDVDRISLCLKVLSECSPLMNDIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIVYDVSGAASDRNCVVLSDIHIDIMDYIQPATCTDAEFRQMWAEFEWENKVTVNTNIIDLNEYLQHILKSTNMKCLTPEKALSGYCGFMAANLYARSIFGEDALANVSIEKPIHQGPEAPVTGHIRIRAKSQGMALSLGDKINLSQKKTSI	194853	237167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_194914_195596_195747_199226_199457_199865_200036_201658_201774_202990_203084_204894_205033_209995_210116_211343_211452_211528_211676_212127_212274_213398_213496_219640_219802_220701_220823_224062_224291_224437_224618_229831_229977_230975_231096_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
898989	contig_9668_pilon	+	4205	2	Intergenic	novelGene_58149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	654	junction_1	0	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2131	2442	355578	359314	FALSE	20	CATTGATTGATTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	353447	361077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_355714_359138
898990	contig_14326_pilon	-	2540	9	Intergenic	novelGene_120721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	50.7660073277385	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	251	1399	473634	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTGSESWRSWDWRYHSNLLVPGRLQFPQLALRRRLGQLSCMSRPALKLRSWPLTVLYYLLPFGALRPLSRVGWRPVSRVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493219	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_445734_445901_473560_473737_487113_487194_493151
898991	contig_17144_pilon	-	3134	18	Intergenic	novelGene_29341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1799.45918442219	248	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	887	2839	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183399	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175145_175944_176271_179700_179786_181794_181850_183158
898992	contig_7229_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_39826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACTCAGTATATGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901423	899115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_899100_901400
898993	contig_15248_pilon	+	2299	3	Intergenic	novelGene_149152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAGGCATGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112295	245694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_112607_143272_143566_243999
898994	contig_18916_pilon	+	5453	3	Intergenic	novelGene_136869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATGAGAAAATGAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8483	18462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_9309_13050_13301_14084
898995	contig_12644_pilon	-	2682	3	Intergenic	novelGene_44471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	2338	2682	1013111	1012767	FALSE	0	CTGGGTGTCTCCTGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRQHLSLSFHPEPLSGLAFPCLILPTVLSHYGYHPPAKQTEAQSVQYPPKRWQGQEGGTPTSFRCSPLSLNCRKAAHVSAPPRPSSMPPLAARADGQEDGWMTPPEASGLSPS	1023613	1012766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1013441_1017032_1017341_1021913
898996	contig_3956_pilon	+	1661	9	Intergenic	novelGene_15184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1372.32813131554	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	18	1493	1282731	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGISGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1282713	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286416_1290491
898997	contig_12624_pilon	+	2570	11	Intergenic	novelGene_60982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_7	131.891773814746	218	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	133	804	69828	94458	TRUE	65	AAAAAGAAAAGGAGGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVKNFLYAWCGKKKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVRVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSNAARDFVNYLVRINEVKSEDVPAVGIAPPPPSLTDSSDGTASTDGSLPTTMGGPLPPHLALKAENNSGVGASGYGVSGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEAQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRWRRMRLSADFKPG	66563	99740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_66674_69805_69939_70780_70922_90479_90595_92182_92296_92892_93042_94415_94553_95369_95417_97916_98054_98150_98241_98342
898998	contig_19737_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_158982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	549	756	1304	76715	77263	NA	25	GAACATCTTTTCACATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNAAADICVQVFGVYVDIRFYFSCIYTSECICWVKSVFNFLRNGQAVLQGSCTISHSHQQCMRVPFCPHSHFQCLLLYVLLISAILAGVKGAPVAQWLRLSAANWNIGGLNPPGAPWGKDAAVSCPENSHTALETLWGSSILSYRIAMSQNRLNGYGFWFGMGVKWYLTVVLISFSLMTNDV	75959	77263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_76000_77300
898999	contig_15084_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_116672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	240	440	27036	26836	NA	45	GAAATACAGGTTAGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTTNTDYSYEEIQLSCSPCSPDLLLFCYHPVSGTYHSPTCQNKNKGVILDLTLSLSFTFSHQIPLILPLKYSFQSTPFSMLIRASLTLTWTIHSFIHLTILTECLSYAGHDSSRVQSNKGDGGEHREQGDNLGGSYNCPGEVMVP	27275	25144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_25100_27300
899000	contig_8050_pilon	+	2022	15	Intergenic	novelGene_114823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	435.52405683456	8	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	108	1085	294062	321637	TRUE	40	GGAGAACAGAGGAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLSKPFS	293954	336456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320930_321624_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_336199
899001	contig_2892_pilon	-	2403	7	Intergenic	novelGene_118977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	133.978439393144	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	53	547	130449	12538	FALSE	10	CATTTGAGTCTTCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNKAERIPARLLTVFKIEVLMNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASDCPNVVIEGVLHGIFYPHVQPR	130501	10681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_130404
899002	contig_6576_pilon	+	3832	4	Intergenic	novelGene_42307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTCCAGAGTCCAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513600	693012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_514226_676042_676622_690183_692204_692404
899003	scaffold_12510_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_151374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGATGATTTTGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219104	216786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_216800_219100
899004	contig_6914_pilon	+	3480	8	Intergenic	novelGene_151710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	96.532747959288	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	6	749	13603	17589	TRUE	40	GAAAACAAACACTTCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEEEPRRKIPLVPENLLKKRKAYQALKATQAKQALLEKKKQRKGKGLRFKRLESFLLDSRRQQRDRVRIRRLKVKPHGLEVPDGHSLAFAVRIQRINGVSGLVRKTIARLRLRKIFSGVFVKVTPVTLKVLRTVEPYVTWGFPNLKSVRELILKRGQAKVKNKTIPLTDNTVIEEHLGKFGVICLEDLIHEIAFPGKYFQVISQFLCPFYLSVARHATKNKVGFLKEMGLPGYRGESINQLIRQLN	13597	21801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_13617_14238_14348_15166_15331_16344_16483_17103_17214_17380_17596_18757_20931_21249
899005	SIRV7	-	2014	5	NNC	SIRV7A	novel	2247	6	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1159_1244_2676_2993_3112_43028_43078_114680
899006	contig_8600_pilon	+	3361	8	Intergenic	novelGene_125731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	148.100352078293	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	115	1173	102400	116590	FALSE	25	CGTGATCCTCAGTGATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSFYIPGGHFTTAWFAIGMGGAFFFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNKMEEGNPRCWYAALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQEHQPHSGLLQSSFITLYTMYLTWSAMSNEPDHSCNPSLLSIITHITVPTQAPGNSSTLAPTSAPPLKSGPFLDTESFIGLVVFVLCLLYSR	102285	118778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109465_110132_110271_114212_114383_115526_115618_116405
899008	contig_10857_pilon	+	2479	7	Intergenic	novelGene_160916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	90.8284402351794	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	424	549	467726	469527	FALSE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTLLPSAVRPWRGTPTRPCTTGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRFCDQQRSSEVLAL	451774	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_451841_457543_457619_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_469484
899009	contig_4103_pilon	-	2738	2	Intergenic	novelGene_51951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1802	2125	105659	105336	FALSE	15	AGTCAGGCTGCGGATCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSECTQARGTLEFIVSCWGLGSPRSRKGFPSSIRFSIWGSSSGRGALISRLQLRSSTLSLAGSPLGTCSSPANDRLRELNVLGQTHLGPPGFAVARSAFWLRSRR	107711	104722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_106261_106511
899010	contig_3986_pilon	-	3319	5	Intergenic	novelGene_52716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAGCAAAACCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235385	81399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_84141_171278_171523_175356_175460_176104_176264_235313
899011	contig_8285_pilon	-	1711	2	Intergenic	novelGene_174973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTGGGTTTCTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229971	89065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_-_89641_228835
899012	contig_9332_pilon	-	1979	2	Intergenic	novelGene_60711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCAGCCAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81658	77202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_78816_81292
899013	contig_6958_pilon	-	3683	1	Intergenic	novelGene_70011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	359	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759506	755823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_755800_759500
899014	contig_7758_pilon	+	3598	15	Intergenic	novelGene_163529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_1	233.567900803416	27	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	724	2175	281	2455	113199	193745	FALSE	80	TAAAAAAAGAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPPTPKPRPPRPLPVAPGSSKTEADSEQQALTLPDLAEQFAPPDIAPPLLVKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSSPAELRQLLDCDATSMDLEMIDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPVAVYSEMISLAQEVQSSEEYIQLLKKLIRSPNIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTASKNLLNGRVLSEIFSPMLFRFPAASSDNTEHLIKVIEILISTEWNERQPAPALPPKPPKPTTVVNNGMNNNMSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFSDPLTFNSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYNTQFQEKSREYDRLYEDYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFKREGNEKEIQRIMHNYEKLKSRISEIVDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQLRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNENTEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR	112918	194888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_113533_166177_166271_166718_166794_172803_172936_173723_173926_174126_174207_188333_188437_189040_189140_189241_189423_189675_189802_190755_190899_191131_191309_191409_191479_192171_192343_193555
899015	contig_401_pilon	-	1286	12	Intergenic	novelGene_42839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCGGCAGCGTCCACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1718330	1711914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1711962_1712504_1712623_1712855_1713001_1713125_1713341_1713437_1713529_1713608_1713702_1714019_1714096_1714921_1714977_1715076_1715232_1715417_1715484_1717897_1717968_1718175
899016	contig_5261_pilon	-	2872	3	Intergenic	novelGene_102479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	351	1019	662707	661985	FALSE	30	CAACGTGTATATAGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTPKKGDPTEGGNYQTISLTSHPSKILLKIIQKWLQQYMDRELAEIQTGFRRGHGMRDIIADVTWILAESKEYQKDVSLCFIDYEKAFNCVGHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLHIAEKVVVFQTEQRDTVWFKIRKGACQGCILTLYLFNLWTGGRLINNLRYADGTTLLTESEEDLNLLLMKIKDYSLHYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKI	663527	660131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_662188_662241_662708_663177
899017	contig_6048_pilon	-	3627	16	Intergenic	novelGene_73286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	95.6482909181108	16	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1614	2684	1985916	1979672	TRUE	15	AAGTTCTGTTTTCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGRSLPLSLQADLSSLAEIENSLAVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQEANVDLSGVKYAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGASRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDMDIAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLATVTTNRKLNQGTERHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSTLVNQLGEILGADLNVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASDPSEQEQLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCPPQLCAHLCRGRGVQDQD	2049105	1978468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1978968_1979070_1979157_1979236_1979383_1979459_1979731_1980096_1980191_1980499_1980682_1982312_1982432_1982533_1982651_1983748_1983848_1984383_1984474_1984963_1985089_1985730_1987061_1987366_1987496_1993750_1993800_2006110_2006303_2049006
899018	contig_12630_pilon	-	2038	7	Intergenic	novelGene_173078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.542121580987	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	52	426	100972	81783	TRUE	35	ATAAAAAATTGTGCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLALRRPYF	101023	75451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76613_76679_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81806_81934_82253_100938
899019	contig_5590_pilon	+	1597	10	Intergenic	novelGene_162991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	94.3497564554879	335	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	72	983	179215	183619	TRUE	15	TCTGTGGTTTCTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YARLCGALESALSAQAKEELAAAMVRVLRATGRAQALVTDLGTAELARCGGREALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCRLPELPQHQVRLREGCEDVFENIVHSYDWFPAELGTVFSGWREACKARGSEALGSRLVCASLFLRLLCPAILSPSLFGLAPEHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEDRGPAMAHFLDQVATVDVDAAPSSYQGGSDLAHQLAVLHAQLCTIFAELDQATRDSLEPLPTILQAIVGRAPAVAQGIPAHGSHAPQQALDRGLRLSAS	179143	185300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_179251_179886_180032_180251_180397_181504_181742_181846_182049_182152_182200_183519_183702_184110_184269_184806_184871_184990
899020	contig_6137_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_59307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGATTTATCTATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639416	1646061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1639578_1644652
899021	contig_11505_pilon	+	2488	2	Intergenic	novelGene_140935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	615	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	61	504	303540	303983	TRUE	45	TTGATCTGAGAACAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLCTTERNTARSCVILTIITMFELTVAAYYVNPSYPGSSSFSLIFYFTKHDVLLQGLVPNNTSKVCAMKSRHSSFQGAIWRISSKTDFFWQFKVHPIFSADTTNSKVSILLQSSLLIIQLSHVYETTENTMVWVRCTFVLKVTSLLFNTLKRSFAADLPNAIRCLIS	303479	315033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_305707_314772
899022	contig_16211_pilon	-	1605	10	Intergenic	novelGene_150060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	320.526303306158	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	534	1604	91808	79703	FALSE	60	ATGAGAAAAGAAAGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRDKRKDTREKIKEKERVKEKDREKEREKEREREKEREKEKERGKNKDKDRDKEREKDREKDKEKDREREREKEHEKERDKEKEKEQDKEKDREKDKSREI	121284	79701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_115114_115263_121086
899023	contig_19865_pilon	+	2369	7	Intergenic	novelGene_170156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	117.371797672562	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	447	965	79219	81377	FALSE	15	TGAACGTTGCCCGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHWWFGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPD	43509	82781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67674_67713_72650_72735_79191_79369_79927_80052_81132
899024	contig_15752_pilon	+	4241	22	Intergenic	novelGene_148753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_7	67.5181003698343	424	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1224	3675	140	3814	185139	203535	FALSE	25	CTTCATCTTCGCATCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLLWKKVAGVVVPGPVPAPGRWVSSSAPGPVSSDGQLQPLQQQVPSSEGGQQRHNPLHIQMLSRGLHDQIFGHGGEMPGEAAVRRSIEHLQRHGLWGQPVAPLPDVELCLPPLYGGNLDQHFRLLAQKQSLPYLEAANLLLQAQLPPQPPSWAWAEGWTRYGPGGEAVPVAIPEERALVFDVEVCLAEGTCPTLAVAISPSAWYSWCSRRLVEERYSWTSRLSPADLIPLEIPANAGSSTQRDWQEQLVVGHNVSFDRAHIREQYLIQGSCMRFLDTMSMHMAISGLSGFQRSLWMAAKQGKHKAQHLTQKVQKSQNKARGPAISSWDWLDISSVNNLADVHSLYVGGSPLGKEPRELFVKGSMKDIRENFQDLMQYCAQDVWATYEVFQQQLPLFLERCPHPVTLAGMLEMGASYLPVNQNWERYLAEAHSTYEELQREMKNSLMDLANDACQLLSGDRYKEDPWLWDLEWDLQEFKQKKAKKVKKKEPATTSKLPTTGAGAPGDPKDQEDPGPPSEEEEFQRDAAARACLQQLKGTTELLPKRPQHLPGHPGWYRKLCPRLDDPEWTPGPSLISLQMRVTPKLMALTWDGFPLHYSERHGWGYLVPGRRDNLAKVPVGTDLASAGVACPYGAIESLYRKHCLEQGKQQPEPQEAGMAEEFLLTDNSTMWQMVEELGCLELEAEAKMENFQAAVLGQPSVLTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEFMTSRVNWVVQSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTRCMFAHKLGLSDLPQSVAFFSAVDIDRCLRKEVTMDCKTPSNPTGMEGRYGIPQGEALDIYQIIELTKGSLEKRSQPGP	184999	203962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_185753_188617_188814_190274_190440_190550_190698_190848_190929_192171_192355_192460_192616_192771_192899_193849_194087_196001_196123_196336_196424_196724_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201812_202782_202944_203458
899025	contig_8316_pilon	+	3242	3	Intergenic	novelGene_178728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	156	530	66964	67338	TRUE	40	TTGATGTAGAATGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQGTEGEGIQRDKKPSNEERQKGKKREKKTKQIKKKKNKKSPPKNRKKKKPTRKEKPSGIPLHVCASQGGSLLAMHHCLARKGSQLKKRKIKQTDNSKQTNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHT	66808	185613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8316_pilon_+_67935_111758_112505_184243
899026	contig_8210_pilon	-	2191	4	Intergenic	novelGene_30244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	247	627	52756	52376	TRUE	25	TTTAGTTAAGGTCTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTVVTVSQTHRGPGHSCWLSSGKVKGGPVTLGTTRRLTRLAQENASCRGHRRGAGREPPWRGQPREDLLQPERDPESEGPQMRDPGDAGRSGVLSFPWSGGGALGLCRPSGAPTVARRCLPSGWGPASLVPSDSAEDGLRSSQHPSQLGSLPVCLGICACPRCRPGRLALPGALARRGCPFAAGLFVCLPRRLDVVLRVPPEFTAVV	53095	39157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_39745_40452_40526_51471_52782_52874
899027	contig_8210_pilon	-	4425	2	Intergenic	novelGene_30247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTCGAAAATAAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51545	47079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_48978_49018
899028	contig_10937_pilon	-	6891	1	Intergenic	novelGene_67321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	565	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	167	313	117428	117282	NA	60	GGAATTGTAAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHTVVLSLPDRVEPDILLNDYIEKEVKVSCHRQQEVTAKLKKKGNAFYPPGALKFMQHFHVNTFVDSPTCRLAYGNRSNTWKKQNSDPCLLVPFIIAYHVLFS	117594	110703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_110700_117600
899029	contig_610_pilon	+	2219	1	Intergenic	novelGene_76760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCCTTGCTCCCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221146	223365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_221100_223400
899030	contig_15897_pilon	+	5486	24	Intergenic	novelGene_49580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_23	263.750526567532	316	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	901	2706	2732	5437	878208	889144	FALSE	35	GTAGTTTTAGAAATGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRPSGAEDRTGAGAVVSENSPSVGALLVEMEAASVAGGILGARGLYNNSQRSSRGRGLREFNQPEDFPRAKPRRRIASETHSEGSEYEELPKRRRQRGSENGNEGSLLEREESTLKKGDFKDSWRSNKMYSDDHNGPDAKNRGPRAFGRALPPRLSNCGYGRRTFVSKESPHWQSKSPGNSWQEYSSSDTCGSRRSTDRDYIPDSYRHSDSFGGRGFEESRLEDKRSFFPDDHVADSENAENRPFRRRRPPRQDKPPRFRRLRQERESLSLWGPEEEPHLLAGQWPCRSKLCPGGKSSAVGRRSPELSYQNSSDHANEEWETASESSDFSERRERREGHVAEPDSQVDSGLSGASLGEKKELAKRSFSSQRPLVDRQSRKLEPGGFGEKSVRPGGGETSPRYESQQNGTPLKAKRSPEEALPGGLGGCSSGSSHSPYTLERAGHANSDIPEASSKKAEKESKLTAQRAGEQGETMKQFDLNYGNTIIENCGSSPGEESEVGSMVGEGFIEVLTKKQRRLLEEEKRKKEQAVQVPVKGRGLSSRIPPRFAKKQNNLCLEQGDVTVPGNSLGTEIWESSNQALPVQASTSDSWSKAVTAFSSTESGSAEGLKSSQGDSGVDLSAESRESSATSSQRSSPYGTLKPEEMNGPGLAEPKADSHKEQAQKQSEQKDSEQGSGQSKEHRPGPIGNERSLKNRKGSEGAERLQGAVVPPVNGVEIHVDSVLPVPPIEFGVSPKDSDFSLPPGSASGPAGNPVVKLQDALASNAGLTQSIPILRRDHHIQRAIGLSPMSFPTADLTLKMESARKAWENSPSLPEQSSPGGTGSGIQPPSSVGASNGVNYSAFGGVSMPPMPVASVAPSSIPGNHLPPLYLDGHVFASQPRLVPQTIPQQQSYQQVSF	843399	889193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_843491_846505_846609_849570_849644_853911_854056_856652_856775_857229_857373_860536_860628_862642_862836_866905_867224_868801_869008_871350_871547_876434_876652_877373_879458_880901_881108_881722_881869_882515_882658_884357_884441_885035_885225_885379_885578_886060_886148_887317_887423_887605_887796_888727_888826_889132
899031	contig_10197_pilon	-	4262	1	Intergenic	novelGene_115195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	524	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGGCCTCAGGGATCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556607	552345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_552300_556600
899032	contig_5472_pilon	+	2604	1	Intergenic	novelGene_130041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTCAGATACTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442209	444813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5472_pilon_+_442200_444800
899033	contig_546_pilon	-	3956	1	Intergenic	novelGene_117187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	2509	2847	63561	63223	NA	25	TCTCATTGGCCATAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTLYKPFLASQTQRNTAEVESQRQELEIPREREDVPSRNGNSFWKDAFAKKTSGPSGKYFNKIESPFLLWAPHQQTKKIPEQQSSMTNLKKQNKTERRVLSREVLLLGAVE	66069	62113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_62100_66100
899034	contig_11816_pilon	+	3609	9	Intergenic	novelGene_98454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_8	626.976474837773	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	154	2235	420896	449760	FALSE	30	AACATATTTGCTCAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGRGAGAIVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSSAATGGSTSDSAHGGINTGITGILPGSLFRFAVPPALGSHLTDNVMITVDIIPSGWNSSDGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQECMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLQLNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGSTNEPSTRVRLQRMIPKKMETITEHLILPNFI	400515	451134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433939_437138_437309_442782_442893_445555_445670_449691
899035	contig_5623_pilon	+	2263	12	Intergenic	novelGene_154824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1017	1400	209004	210200	TRUE	40	TTCTTATGTGCCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVIGEDEWDSFTVDSKLGLEIPQKVAKINVEQLPTFTDHDVVTVPIADAQHIGGHTVASTGKGELLDGSVQGLPGFLDLSQLSRASLLKAAVAAMLLLFSWMLAMVSEWSTTSMRPVRSPVERQP	206929	239447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207768_208418_208551_208957_209106_209280_209409_210046_210212_210730_210808_211004_211121_211206_211381_211501_211604_211801_211939_212136_212271_239335
899036	contig_18829_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_177705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25395	26429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_+_25400_26400
899037	contig_12969_pilon	+	5403	3	Intergenic	novelGene_61680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	3347	4120	457165	457938	TRUE	80	TAAAAAAATAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLMYDEIALPGKAFSTLVAHIRFLSCMHSLMFIQTALHGEAFSTIIAYIGFLPCVVSLMYDDIVLCGEAFPTFTAYVGLLPSMSSLMYDEHALPSKAFSTFTTYIAFLSCMSSLMYDEIALPRETFSTFTAHIGFLSSMSSLMFNQTTLYGEDFSTITAYIGFLSFMNSLMFIEPGLSGECFPTHTASIRFLSCMNSLMISELRLLHEGFPTFTAYVGFLYFVQSLMLNYLGLSADEFCTYREFNFRMKFFMITV	453145	461676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_454691_455363_458196_460650
899038	contig_7129_pilon	+	2482	5	Intergenic	novelGene_169292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	631	1398	93398	94783	TRUE	55	AAAAGTCAAAGGTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQKK	1240	134696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_1768_93294_94160_94777_95149_133331_133776_134421
899039	contig_17753_pilon	+	3100	1	Intergenic	novelGene_105072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	419	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53159	56259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_53200_56300
899040	contig_13292_pilon	-	3857	3	Intergenic	novelGene_142920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTTTGTTAATATCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71597	49103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_49243_49480_51122_69520
899041	contig_11416_pilon	+	3666	2	Intergenic	novelGene_145370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_1	0	606	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	108	860	587114	587866	FALSE	15	CTTAATGTGTTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFARGLKRKCFDHEEEGDGPLAGFRAVPSYDLQRQSLLDMSLVKLQLCHMLVEPNLCRSVLIANTVRQIQEEMTQDGTWRMAAPQGGGPAPLDRLVSTDVLCRSAREQEQGQPGPEDGSFPKGFEDGPAAGLTCDVPSVTVAQAPRHLPSSSSWDLDSSRESRGSFQKSLDQIFETLESKNPSSVEDLFSDVDSSYYDLDTVLTGMMGSSRASPCDTLEGFTPLTAAPPGPGCKADLGELDHVVEILVET	584742	590672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_584844_587107
899043	contig_18231_pilon	-	6537	21	Intergenic	novelGene_105902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	206	junction_1	199.127465458686	813	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	64	2448	545087	490501	FALSE	10	TTCCCAGTGAGGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAVVAEAKATAPGGGSGPESRMRVWVTLTLLLSAALLGLASASSDEEDSQDESLESKTSSLSDKSVKDHTTAGKVVAGQIFLESEESELKVPIQEEENSLEGREGESVTEEISFLDSPDPEDKDYEEPKKLQKPVLTAIEGTAHGEPCHFPFLFLDKEYDECTSDGREDGRLWCATTYDYKADEKWGFCETEEEAAKRRQMQEAEMLYQTGMKILNGSNKKSQKREAYRYLQKAASMNHTKALERVSYALLFGDYLTQNIQAAKVMFEKLTEEGSPKGQTALGFLYASGLGVNSSQAKALVYYTFGALGGNLIAHMVLGYRYWAGIGVLQSCESALTHYRLVANHVASDISLTGGSVVQRIRLPDEVENPGMNSGMLEEDLIQYYQFLAEKGDVQAQVGLGQLHLHGGRGVEQNHQRAFDYFNLAANAGNSHAMAFLGKMYSEGSDIVPQSNETALHYFKKAADMGNPVGQSGLGMAYLYGRGVQVNYDLALKYFQKAAEQGWVDGQLQLGSMYYNGIGVKRDYKQALKYFNLASQGGHILAFYNLAQMHASGTGVMRSCHTAVELFKNVCERGRWSERLMAAYNSYKDGDYNAAVIQYLLLAEQGYEVAQSNAAFILDQREATIVGENETYPRALLHWNRAASQGYTVARIKLGDYHFYGFGTDVDYETAFIHYRLASEQQHSAQAMFNLGYMHEKGLGIKQDIHLAKRFYDMAAEASPDAQVPVFLALCKLGVVYFLQYIKETNIRDLFTQLDMDQLLGPEWDLYLMTIIALLLGTVIAYRQRQHQDMPVPRPPGPRPAPPQQEGPPEQQPPQ	545150	486411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_490711_492207_492337_495984_496158_497088_497164_497729_497896_498738_498888_499190_499279_501014_501078_502374_502453_503748_503818_508627_508685_513049_513205_513567_513650_515942_516003_516091_516146_519105_519269_520109_520216_521483_521652_538073_538306_538720_538759_545017
899044	contig_19132_pilon	+	3077	1	Intergenic	novelGene_169983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGGGGGAAAAGGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279295	282372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_279300_282400
899045	contig_6445_pilon	+	1801	2	Intergenic	novelGene_77000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTCGCAAGTGGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483624	485653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_483777_484004
899046	contig_6361_pilon	-	4027	21	Intergenic	novelGene_23862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	321.990760737012	219	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	914	3610	98864	55091	FALSE	15	CTTTACGTGTATGTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVAVKDSDQVAQSDGEENSAAEEQLLGERIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTENQPIQDQAPMLEGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	102692	54673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_65598_65638_73524_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_89922_90001_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_99644_102558
899047	contig_14744_pilon	-	2504	12	Intergenic	novelGene_66131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	84.7418052304706	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	132	1718	1601793	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTLDCVTTGKKFLCLTLPSMRSTVKGTLVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604800	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1597043_1597098_1601757_1601822_1604697
899048	contig_9319_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_154638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	317	727	53853	53443	NA	65	AAAAAAAAAGCCAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVPTHQLLHRRKMWQFASVKITALETQCGKSILSYRITMRRNQLDGSGLGLGLVCHSHFRVSWFFGPFPGEDEKQEQSTPKTNFYTFPIMLTVTQAHIESSDHPDKKWMIRRDHYSSSALKFKENCENSREDPL	54169	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_51800_54200
899049	contig_13421_pilon	-	3021	2	Intergenic	novelGene_166809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	182	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1409	1834	221732	221307	FALSE	65	CAAGATTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGWGDLKNSSEPADLANHWPESWGHPCLAPPRASQRPHHQLAALPTAFLLCFPETSLSRLSGHGAAPPSRPQMYMRLFRLLASLLDPFLARLLKLSSSALPQRIRPHGLVILHCLLTAPALSHWLPPLATSSLCLQLLSI	226582	220119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_222920_226361
899050	contig_3986_pilon	-	2671	1	Intergenic	novelGene_52715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84023	81352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_81400_84000
899051	contig_3018_pilon	-	2195	15	Intergenic	novelGene_78862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	465.188419144461	7	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	731	2194	600079	562938	FALSE	70	GGAAAAAAGGAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625098	562936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_601250_601468_603367_603441_624772
899052	contig_3269_pilon	-	1845	12	Intergenic	novelGene_117004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	983.262506670926	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	8	1444	72486	45825	FALSE	50	TAGAAGCGAAGGGAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEMLIDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMAKIHIKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMKEDAGMMDVHYSEEILLELLEQCVDGLWKAERYEVISEISKLIIPVYEKRREFEKLTQIYRTLHGAYTKILEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDKVNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERNTEFERNHNITRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPINYEQQIHLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSPADVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPLAYARTFLNDSQASKYPPKKVNELKDVFRKFIQACSVALDLNERLIKEDQIEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQCYFQVSRKGAWTSTCLKSPTDITRRYHAFSLDEQHITCILCN	72493	45423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_45893_46698_46760_50721_50861_52711_52813_53479_53671_53949_54161_55787_55935_56458_56573_61063_61187_65584_65692_72223_72282_72369
899053	contig_7333_pilon	+	1589	1	Intergenic	novelGene_142806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	419	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	25	306	392257	392538	NA	30	CTATTCCAAACCTTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIDIIFINMVSLRGRLRCKQYSALQKRKLRQVDLLMRHLEKFTSVNTPSSAFPQDCTDILKTIIFFFFFLNYSTLPKPSQILRHCFRLVFLVPSCMQKQHN	392232	393821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_392200_393800
899054	contig_1379_pilon	-	7710	14	Intergenic	novelGene_134595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_3	121.626258454176	11	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	421	1611	474282	454144	FALSE	70	GAAGAAAAAAAATAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQPEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDVECRSLIYKPLDGEWGSNPRDEECERIVRGINQLMTLDIASPFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEEEEKDADVPGTSTQKKKDHQPRRRLRNRAQSCDIQAWKKQCQELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPVSIF	479404	448044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_454309_454569_454621_454859_454930_459279_459406_461733_461855_463209_463366_465455_465518_465697_465810_470262_470346_470464_470590_471166_471275_474270_474391_476981_477214_479324
899055	contig_15851_pilon	-	8117	2	Intergenic	novelGene_164092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	78	junction_1	0	8	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	745	1089	21760	21416	FALSE	45	CAGAAAATTTAAACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELLAWRAWNGIHLKRDEQWKSPADLSLKLSSEMQLSPSGNTLEFSMGKERLPRGSTADSLPATTQPSTGALGKPPCFFQGWDADHSSDLFVTACLSRCCPVNGSFLENATTD	23985	14387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15851_pilon_-_22407_23887
899056	contig_2377_pilon	-	3680	2	Intergenic	novelGene_67930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGAAGCCCTGGTGGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377502	373766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_377285_377340
899057	contig_11338_pilon	+	1593	11	Intergenic	novelGene_6273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	99.3851095486643	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	81	965	172117	189573	FALSE	10	TTTTACTTCTGTGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTYINAGFQDPSGAREEEEDDDYENMTPPYKDLPPKPGSMAPPRPPRAEKKKKILSIPCKPQKMAGLNLTPVSCTSPQLGIGLEPSLSRPPPDTTPVPCLSQKPGGPGRCWEDRLIVCLCPLVVVSLLLGCISLAVTLIKYKAVVEELRMLTFQQMAWQANECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172036	190201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176221_176299_176351_176432_176475_176652_176695_177543_177685_177767_177831_179743_179896_183194_183305_189440
899058	contig_5684_pilon	-	6135	13	Intergenic	novelGene_80998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_12	115.929097104892	670	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	293	2143	317651	299846	FALSE	75	CAGCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIGISCLLPASWHFSISPVGCLRILNTNLRQIIVISILAATVSLLYFSVVIIRNKYGRLSRDKKFQRYLARVTDIEATDTNNPNVNYGIVVDCGSSGSRIFVYCWPRHNGNPHDLLDIRQMRDKSRKPVVMKIKPGISEFATFPEKVSDYISPLLNFAAEHVPRAKHKETPLYILCTAGMRILPESQQKAILEDLLTDIPVHFDFLFSDSHAEVISGKQEGVYAWIGINFVLGRFEHIEDDDEAVVEVNVPGSESSEAIIRKRTAGILDMGGVSTQIAYEVPKTVSFASSQQEEIAKNLLAEFNLGCDVHQTEHVYRVYVATFLGFGGNAARQRYEDRIFANTAQKNRLLGKQTGLTPDTPYLDPCLPRDIKDEIQQNGQTMYLRGTGDFDLCRETIQPFMNKTNETQTSLSGIYQPPIHFQNSEFYGFSEFYYCTEDVLRMGGDYDAAKFTKAAKDYCATKWSILRERFDRGLYASHADLHRLKYQCFKSAWMFEVFHRGFSFPVNYKNLKTALQVYDKEVQWTLGAILYRTRFLPLRDIQQEIFRSSHTHWRGFSFVYNHYLFSGCFLVVLLSILLYLLRLRRIHRRTLRNGSAATLWMEEGLAAQKVAGTL	326663	295853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_300075_301353_301516_302452_302539_304368_304694_308102_308270_309973_310129_310411_310472_312163_312268_312910_313062_315407_315614_316151_316350_317643_317745_326464
899059	contig_6137_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_59173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	399	2163	2561	1252692	1253090	NA	35	CAACCGACTGGAAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIENQTGRTHSAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSMVKILNDSGSIKRRWKEYTESLYQKELVDDQPFQEVPYKQEPMVLKEEVQVSLKALAKNRAPGIDGIRIEMFQQIVAVLEVLTCLCQEILKTATW	1250529	1253091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1250500_1253100
899060	contig_34_pilon	-	1757	2	Intergenic	novelGene_39978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATGTATAAAATCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210857	209019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_209110_209190
899061	contig_12638_pilon	+	1751	11	Intergenic	novelGene_33064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGCCAATTAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40690	128569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_40754_51873_52152_77449_77628_78341_78533_79439_79554_82007_82096_83548_83934_87172_87249_96218_96307_97538_97709_128449
899062	scaffold_19766_pilon	-	2217	5	Intergenic	novelGene_34400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	41.5120464443756	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	804	1325	827532	825937	FALSE	60	AAAATGGTTGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLASSDAPLDLYLVANASLCAHLTPPCSASDPKFPISQGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQCETMLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	830574	825044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826309_827289_828085_828182_828310_830450
899063	contig_6871_pilon	+	4290	2	Intergenic	novelGene_21568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	2340	3287	134070	135017	FALSE	65	GAGAGGAAAAAGAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	124622	136020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_125710_132817
899064	contig_11126_pilon	+	2421	11	Intergenic	novelGene_138102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_10	71.7527002976195	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	380	1759	118054	180172	FALSE	75	ACCAAAATAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGETQLYAKVSNKLKSRSTSLLLEPLLALGFPAHTALKALAATGRKTAEEALDWLHCHCNDPSLDDPIPQEYGLFLCPTGPLLEKLQEFWRESRRQCAKNKAHEIFPHVTLCDFFTCEDHKVECLYEALKRAGDRILGSFPSVIPLVLHSSVSYLGFFIHDSSADIIREFAMSFATEASVLADCTVKPCTKQLHLTLAHKFYPHHQRTLEQLARAIPLSPGCQWTATLYSRDMRFVHYQTLKATFQYKPQNTDELNLSPGDYIFVDPTQQKEASEGWVIGISRWTGCRGFLPENYTERANESDTWVKHRTYTFSLAMDLNSRRDGEASSRRNGEFHPPQTSRSLSSVQALQATILRRSVLVVRHGERVDQIFGKSWLQQCSTPDGKYYRPDLNFPCSLPRRRNGIKDFENDPPLSSCGIFQSRLVGEALLDSGIRITSVFVSPALRCVQTAKHILEE	117674	180834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_118167_121480_121535_133242_133430_137634_137834_143405_143576_145083_145293_158694_158822_162964_163065_167736_167860_169695_169789_180167
899066	contig_7720_pilon	+	2688	2	Intergenic	novelGene_155796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	695	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGACTCTCTACTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844293	851039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_845494_849551
899067	contig_6102_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_31931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384680	382503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_382500_384700
899068	contig_7963_pilon	+	934	5	Intergenic	novelGene_58374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1296.79740129289	59	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	84	503	51450	57839	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPRPRSQSRCLRRQRLWSVL	51366	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57317_57782_57934_63003
899069	contig_14389_pilon	+	3181	1	Intergenic	novelGene_178732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATAAAAAGATCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8966	12147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14389_pilon_+_9000_12100
899070	contig_11986_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_69243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGAGAGGCAAAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796494	799449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_796500_799400
899071	contig_9363_pilon	+	2495	10	Intergenic	novelGene_6691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1908	2429	1277414	1278026	TRUE	25	TTGGAGGCTGCTGATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTLSLCSLGADLYISSSSFISFWLSWAFLSSARRPLRSSDSFLLASSTLAFSRSTLERAEAADGGPRPGPSRSRSSRLGLPSGSRPREEGPWAPRVRAWVSSSEGTSSSFLTDEAVMVAPGIEVISFLPSGAPPGPGPPSSFPGAGAPRLESSGWPRLGMEWVEPLAWARS	1271753	1278191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1272036_1272080_1272941_1275151_1275259_1275342_1275477_1276484_1276614_1276692_1276908_1277097_1277255_1277390_1277503_1277593_1278029_1278127
899072	contig_4754_pilon	+	3981	2	Intergenic	novelGene_35982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1193	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	3618	3980	494751	495310	FALSE	25	GAGTTGCCACTTAGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRAECFCAGGFLVEWGSSGHLSVELGLPTHGARELSAFWLKFTGRVECLQALISGATELWNTYPSRADVGVRPERPRNQEAEAEETRNTRSRAASVSKGMATTSGVSKGGAMASGVSKG	491133	495311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_494754_494950
899073	contig_4924_pilon	-	2325	9	Intergenic	novelGene_84702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	805.245769936111	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	109	1086	252536	82247	FALSE	65	AGAAGAAAAGAAAAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRCLSDRSPGRGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSEYLLLWWTAFPQILHRKWSARNDLKRIHHGEN	252644	81007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252496
899074	contig_17074_pilon	-	2142	10	Intergenic	novelGene_145139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	85.8163413601655	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	647	1345	233824	227412	FALSE	45	TAAAAAGACTCAACTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGYSNRARKARLAEPQLQDYNDLPLFGRWQTEEFQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPVGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIICEEYKEVLLDAWEKEQALIEKKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKLRYGAKSEASLHTDAGGGLSSDEEEGTSSQAEAARILAASWPQNRETEDQTQKRSKKTRRGKKEAASHLFPFEKL	247841	226614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233610_233689_233825_236604_236691_237417_237500_239108_239212_246242_246404_247627
899075	contig_11378_pilon	-	3958	8	Intergenic	novelGene_112257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_5	44.1227416026091	480	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	278	1285	407969	381087	FALSE	20	TATTAAACGTGGTCGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDKAKKAMVFLLMQDSAPTIAMYLSLQYRRDVVFCQTLTAVICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLSTYGEELAMLEDMSLGITDLRNVTFKVTQATSNSSADMLPVITGNRDGFNVRIPLPGSLFDSLPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEVLPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKDRTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKAFPKYYRPPEGTYGKVET	408246	378413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_381220_390332_390488_395099_395213_401731_401830_404291_404433_404801_404929_406646_406771_407852
899076	contig_8386_pilon	+	7384	15	Intergenic	novelGene_82203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	617	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACTACAAGATGGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12110	46183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_13293_13694_13868_14130_18829_19753_19900_20735_20858_21223_21318_21438_21528_21914_22023_31345_31423_34573_34662_35173_35316_36096_36156_36676_36781_38376_38472_45976
899077	contig_4305_pilon	+	3315	17	Intergenic	novelGene_136712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGCAGGAGAGTTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803871	833874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_805268_806042_806182_806777_806894_808303_808439_808999_809178_812295_812437_812807_812916_817212_817319_817741_817795_818487_818610_818860_819028_821210_821413_828152_828235_829814_829870_830330_830387_830788_830911_833737
899078	contig_19280_pilon	-	3100	3	Intergenic	novelGene_178734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	985	1575	4546	3956	TRUE	65	TAGAGAACAGAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	188453	2026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19280_pilon_-_2614_3017_4584_187506
899079	contig_14744_pilon	+	5273	25	Intergenic	novelGene_66144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	254.829269506511	228	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	944	2835	113	2947	1636671	1689166	FALSE	25	GCAATCGTATGTCATTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIQQADKLLKKHKDLHCAKVLKAIGLQRTGKQEEAFTLAQEVAALEPTDDNSLQALTILYREMHRPELVTKLYEAAVKKVPNSEEYHSHLFMAYARVGEYKKMQQAGMALYKIVPKNPYYFWSVMSLIMQSISAQDENLSKMMFLPLAERMVEKMVKEDKIEAEAEVELYYMILERLGKYQEALDVIRGKLGEKLTSEIQSRENKCMAMYKKLSRWPECNALSRRLLLKNSDDWQFYLTYFDSVFRLIEEAWTPPAEGEHSLEGEVHYSTEEAVKFIEDRITEESKSSRHLRGPHLAKLELIRRLRRQGCNDEYKLGDPEELMFQYFKKFGDKPCCFTDLKVFVDLLPATQCTKFINQLLGVVPLSTPTEDKLALPADIKALQQHLCVVQLTRLLGLYHTMDKSQKFNVVRELMLRYQHGLEFGKSCLKTELQFSDYYCLLAVHVLIDIWRETGDETAVWQALTLLEEGLTHSPSNAQFKLLLVRIYCTLGAFEPVVDLYSSLDAKHIQHDTIGYLLTRYAESLGQYAAASQSCNFALRFFHSNQKDTSEYIIQAYKYGAFEKIPEFIAFRNRLNNSLHFAQVRTERMLLDLLLEANISTSLAESIKSMNLRPEEDDIPWEDLRDNRDLNVFFSWDPKDRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLEDTTEIQERIENSLKSLLEQLKDVFSKCKGDLLEVKDGSLKTHPTLLENLVFFVETISIILWVSSYCESVLRPYKLNLQKKKKKKKETSIIMPPVFTSFQDYVTGLQTLISNVVDHIKGLETHLIAFKLEELILEDTSFSPEERKFSKTVQGKVQNSYLHSLLEIGELLKKRLETTKKIKI	1626227	1691492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626261_1627578_1627632_1636644_1636731_1637172_1637312_1639735_1639855_1643389_1643465_1644572_1644681_1645031_1645111_1647616_1647729_1648307_1648398_1649657_1649828_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324_1685472_1689043
899080	contig_6137_pilon	+	9469	5	Intergenic	novelGene_59232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_3	629.719133820785	543	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	5956	6303	1328176	1331883	FALSE	30	TTCTTAGCATTGCAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRGEFGESG	1313885	1335049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697
899081	contig_854_pilon	+	1625	7	Intergenic	novelGene_36234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2351.07715857127	13322	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	114	857	543600	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTVCRPTPSSLSSLCYPTPPASTWAAVPLRGCPDVRRAQAGRLPASPHRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543486	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556241_556876_557065_557591_557752_562271_562405_563029
899082	contig_9305_pilon	+	956	2	Intergenic	novelGene_148182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	116	448	48437	49514	FALSE	65	AAAAAAAAATAGGGCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCVPVRPGPRPLGAHTSVRCQKLNKITSDKTTSCQREIRAKTGRRKQVMGQSLGAGSMGDFLSQDLGDEREQARKIRSKGIPEGTASAKALRGVADWTQSLDPPLKTLN	48321	50022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_48739_49483
899083	SIRV6	+	964	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	837	225	-361	-90	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	78	410	2002	10736	TRUE	30	TAGAAAACCATTTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1924	11600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899084	contig_2310_pilon	+	1738	13	Intergenic	novelGene_71610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	230.684293040414	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	680	1573	124532	134479	FALSE	15	GCCAGATTTGTCGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106072	134644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106741_107849_107964_110753_110785_114930_114993_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
899085	contig_11885_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_159701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10922	9725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11885_pilon_-_9700_10900
899086	contig_4780_pilon	-	1656	13	Intergenic	novelGene_65392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	137.112560207541	762	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	527	1339	361784	312144	FALSE	5	TGTCTCCCGAGGTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428911	311826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_418007_418114_419799_419852_422134_422260_428740
899088	contig_1275_pilon	+	6729	3	Intergenic	novelGene_108730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAGAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333546	343381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_339941_342543_342757_343259
899089	contig_5467_pilon	-	2309	13	Intergenic	novelGene_111966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_12	166.668499989917	366	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	4	1689	141140	126326	FALSE	20	CGCAGTGCTCCTCACCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMGSRVNAAELHLGARSVPSREAAGDAEGRQRGQEAACCPAAGTENTMAEQVALSRTQVCGIYREELHQGGAFHQSDTHIFIIMGASGDLAKKKIYPTIWWLFRDGLLPENTFIVGYARSRLTVADIRKQSEPFFKATPEEELKLEEFFSCNSYVAGQYDDPASYKRLNSHVNALHQGSPANRLFYLALPPTVYEAVTKNIRETCMSQTGWNRIIVEKPFGKDLQSSDRLSNHIASLFREDQIYRIDHYLGKEMVQNLMVLRFANRIFGPIWNRDNIACVILTFKEPFGTEGRGGYFDEFGIIRDVMQNHLLQMLCLVAMEKPASTDSDDVRDEKVKVLKCISEVEANNVVLGQYVGNPDGEGEATKGYLDDPTVPQGSTTATFAAVVLYVENERWDGVPFILRCGKALNERKAEVRLQFRDVAGDIFHQQCKRNELVIRVQPNEAVYTKMMTKKPGMFFNPEESELDLTYGKRYKNVKLPDAYERLILDVFCGSQMHFVRSDELREAWRIFTPLLHRIEREKSRPIPYVYGSRGPVEADELMKRAGFQYEGTYKWVNPHKL	141143	125705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_126417_126492_126586_126698_126776_126883_127120_127540_127728_128061_128156_128423_128550_128773_128933_129359_129578_129945_130055_130148_130187_140065_140194_141010
899090	contig_9698_pilon	-	5241	22	Intergenic	novelGene_82488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGCGCAGTCAGGCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269045	133193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_133376_177482_177598_189983_190106_191298_191425_191630_191802_206424_206629_208375_208803_214786_214956_233673_233861_234077_234263_234398_234482_235373_235438_236560_236660_237091_237222_237307_239205_254499_254666_257696_257807_257918_258162_262139_262194_264718_264768_266734_266794_268646
899091	contig_11846_pilon	-	2528	3	Intergenic	novelGene_105961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	183	junction_2	57.5	59	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	27	392	295647	291703	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHM	295673	289566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_291847_295011_295083_295496
899092	contig_709_pilon	-	5429	1	Intergenic	novelGene_57581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	939	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	5110	5415	2207643	2207338	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLVGVLSIVPMFCGLVGRRGLGRVCHCGEVVSDGDASGDDAFHGCRKSSRGHAHDARWVSAEHKKKQGGQASVYGISFVTLSTPRAGQTLDFEMKCWYL	2212752	2207323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2207300_2212800
899093	contig_2438_pilon	-	3293	1	Intergenic	novelGene_112049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1360	1671	307898	307587	NA	20	CGCCCCACGACCCACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSGLRPRAHYDTGKERAEELLTRTPGLEGKSRDKSQTLPVSPQGKGRAASQTHLRAKGRGWMLRAPPTLWGLDTAGRAEASSCRVSVPLWGHCPRALKCQS	309257	305964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_306000_309300
899094	contig_6552_pilon	-	2463	17	Intergenic	novelGene_163599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_14	134.894967822191	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	51	1892	201623	118556	FALSE	50	AAGTTATATATTTATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIGIFNGRRRSDQKTEMNLNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDISKIKCVEIVKNDDCVIPCQNKYPFQVVHDSNTLYIFAPSVQSRDRWVKKLKEDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNIFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPPEEEDNSEEVVVAMYDFQATEPHDLRLDRGQEYIILEKNDVHWWRARDKYGREGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGMYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIVEYHKHNAAGLATRLRYPVSVKVKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKTIREGAMCEEDFIEEAKLMMKLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVAEFMERGCLLNFLRQRQGHFNRDVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVNEAGIVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKNTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASKYIYEVMLRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEESFGR	201673	117984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_118640_120607_120766_120845_120965_123920_123986_129130_129348_129465_129638_130619_130695_131249_131384_132497_132578_136022_136078_140430_140497_147956_148133_149263_149305_151491_151567_152321_152404_157736_157842_201485
899095	contig_5480_pilon	+	1756	9	Intergenic	novelGene_107217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_8	138.358908278434	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	64	1308	79527	103657	FALSE	20	AGTTTGTTGTTGATTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLVPVVSGSCTRLFACFLRLGTPQAGPLQLHTGASCAAKNHYEVLVLGGGSGGITMAARMKRKVGAENVAVVEPSEKHFYQPIWTLVGAGAKQLSSSGRPTASVIPSGVEWIKARVVELSPDKNCIHTDNGKEISYKYLIIALGIQLHYEKIKGLPEGFDHPKIGSNYSVKTVEKTWKALQDFKEGNAIFTFPNTPVKCAGAPQKIMYLSEAYFRKTGKRPKANIIFNTSLGAIFGVKKYADALLEIIQERNITVNYKQNLIEVRADKQEAVFENLGKPGETQVISYEMLHVTPPMGPPDVIKTSPVADAAGWVDVNKETLQHKRYPNVFAIGDCTNLPTSKTAAAVAAQSGILDRTISLIMKNQTPVKKGVLGRTGLSAEVVPSGYELRAAQPCSPWMASGPKSHSPIDQE	53840	104105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_53887_79509_79761_81790_81962_82535_82590_89722_89918_92258_92469_96168_96353_101482_101551_103528
899096	contig_2917_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_147582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCCTACACAAGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90950	91772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_91000_91800
899097	contig_9863_pilon	+	4854	7	Intergenic	novelGene_153984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	121.155088855382	422	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	56	880	5445	30596	FALSE	55	AAATCCAAACCATGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTDSRAAGALLARASTLHLQTGNLLNWGRLRKKCPSTHSEELRDCIQKTLNEWSAQISPELVREFPDVLECTVSHAIEKINPDEREEMKVSAKLFIVGSNSSSSTRNAVDMACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKPNSNQVNLASCCVMPPDLTAFAKQFDIQLLTHNDPKELLSEASFQEALQESIPDIQAHEWVPLWLLRYSVIVKSRGIIKSKGYILQAKRRGS	5389	34570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5571_13883_13950_15250_15336_18204_18265_20305_20509_21831_21947_30426
899098	contig_3095_pilon	+	2220	6	Intergenic	novelGene_75182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2004.05375177414	311	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	28	795	220513	226800	TRUE	30	ATGTGACTTCCCAGGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220485	245831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226409_226645_226824_244376_245561_245613
899100	contig_6076_pilon	+	3877	2	Intergenic	novelGene_81714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCTGACAATAACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2362	6510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_3064_3334
899101	scaffold_13505_pilon	+	3464	3	Intergenic	novelGene_111610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	812	1324	659510	660022	TRUE	30	GTAGCTACATATTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	657055	662482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_657111_658753_662066_662385
899102	contig_17964_pilon	-	2362	2	Intergenic	novelGene_33939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAGTACAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716043	699756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_701301_715225
899103	contig_5003_pilon	+	3838	8	Intergenic	novelGene_120202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3145	3477	135650	137095	TRUE	20	TCGAGACTGCTCTGTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPFFLQLCKLNFLFQKPQFCLFSTSLFKQFSPLIFNLLSLFFCLHFKFLFNFLAPLLPFSSNSGFLFKFLKGAHQQAKYSSIPLLSLFIHILILDKVSTCTLFGGSYN	132505	139654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_135671_135748_135905_136786_136859_137011_137113_137622_137693_138170_138240_138817_138890_139521
899104	contig_5302_pilon	-	2696	11	Intergenic	novelGene_81431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	661.795776656213	11	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	112	963	209238	177300	FALSE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRAEALGREHASQRLFSDKLPESLEDGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	210077	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209809_209877_210062
899105	contig_7733_pilon	+	2469	10	Intergenic	novelGene_147134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	47.3531518238683	222	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	23	1150	86820	107305	FALSE	75	AAATTACAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGRARAGGISGAPHSCLHLGRGLVKEFAGLQNWESVEGGERSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKGCKVVGAAGSDDKVAYLKKVGFDVAFNYKTVESLEETLKKASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86797	108624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86948_88168_88285_91178_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_97575_97732_100923_101033_106056_106176_107194
899106	contig_5935_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_102762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	478	819	1381475	1381134	NA	70	AAAGAAAAGAATATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDDSLQYGLHINIKKTKILTTGPISNITINGENTEVVKDFILLGSTVNTHGNSSQEIKKHITLGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQTIVFSVPSFACESWTINKKD	1381952	1379937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1379900_1382000
899107	contig_14744_pilon	-	2126	7	Intergenic	novelGene_65986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_5	406.462551233881	718	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	57	566	969897	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRSQLHHHWLSCPHPSVMEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969953	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_967273_967450_967855_968630_969717
899108	contig_13481_pilon	+	1208	4	Intergenic	novelGene_119394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGGTCTGTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526363	536879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_527242_527458_527529_536155_536304_536767
899109	contig_6361_pilon	+	2900	5	Intergenic	novelGene_23972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405180	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
899110	contig_3394_pilon	-	4690	7	Intergenic	novelGene_152663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTGTGGCCCCGGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340376	51491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_51982_52822_53246_55104_56433_149710_149758_168048_168922_306656_306720_338910
899111	contig_11056_pilon	-	2266	7	Intergenic	novelGene_130393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	190.6494747494	400	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	347	1222	679018	645779	FALSE	20	TGCCAGTGTCCTTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIPKNPYPASDVNTEKPSIHSSTKTILEHQPGQKGRKPGKKRGRTPKTLIPHPISTPSKSAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPTSPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPSSAMQAPTVCIYLNKNGNTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTVFSFLKQGHGGEVISAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHSHDRYLPGDTFVLGNSLSRSLEPHSDPMDSALNPNNLVVSTSQNLRAPAYRPLLPSCGLPQSTASAVRRLCSRGSDRYLESRDGSRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQLGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF	684610	644734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645905_647059_647203_655567_655766_667867_668060_670511_670713_679002_679130_684375
899112	contig_4091_pilon	+	2070	6	Intergenic	novelGene_172996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	127.848973402214	239	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTTTTATGACAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10691	27584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_25756_25821_26325_26378_26470
899113	contig_11338_pilon	+	1651	11	Intergenic	novelGene_6274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.0201066191541	79	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	81	1019	172117	189573	FALSE	10	ACTTCTGTGTGGACCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTTYINAGFQDPSGAREEEEDDDYENMTPPYKDLPPKPGSMAPPRPPRAEKKKKILSIPCKPQKMAGLNLTPVSCTSPQLATPVPCLSQKPGGPGRCWEDRLIVCLCPLVVVSLLLGCISLAVTLIKYKAVVEELRMLTFQQMAWQANVTGMAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172036	190205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176221_176299_176351_176432_176475_177543_177685_177767_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
899114	contig_14450_pilon	+	3839	16	Intergenic	novelGene_48933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	105.517054966905	7	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	95	1009	512549	523211	TRUE	45	AAAAAAAGGGCTTAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGGGSAEWSRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEVGRKLSEEKVACGKFGY	512454	558378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522513_523161_523323_523742_523844_525728_525885_549302_549466_550222_550456_553725_553847_554738_554876_555156_555249_556073_556181_556769
899115	contig_2770_pilon	-	551	6	Intergenic	novelGene_107485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1876.66080046448	45	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	214	549	750561	743708	FALSE	30	TCAAAAGTATCTTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADVDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDVHLFILFLYSKTE	750774	743705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743746_744058_744171_744572_744581_746600_746745_747765_747797_750558
899116	contig_7915_pilon	+	4137	9	Intergenic	novelGene_42952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_5	116.091558693989	431	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	241	1506	39717	61309	FALSE	35	ATGTAAAAGCATTTATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRSLSPLGGPETLPFHSGGQWCEQVEITEESSMPLDYHDHKEADSHPGVRYITEALIKKLTKQDNLALVKSLNLSLCKDGGKKFRYIENLEKCVQLEVLNLSYNLIGKIEKVDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVWLGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQNVSKLKPLQDLTSVILVENPIVALPHYRQFTIFHLRSLESLEGQPVTTQDRQEAFERFSLEEVERLERDLEKKVMETEELKSKQTRFLEEIKNQDKLNKSLKEEALLQKQSYEELESDLNTKNELLKQKTVELTRACQKQYELEQELAFYKIDAKFEPLTYYPSEYVEIDKAPDESPYIGKSRYKRNMFTTESHIIDNSQPVQIRKMEPDEGEQLRNEQVNLKTQVPLDIQLEDKEKISAG	35856	63940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_35976_39595_39847_41330_41462_44610_44742_46251_46394_48108_48296_53931_54126_60118_60239_61078
899117	contig_15697_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_173300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATTTTTCAGAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22533	24310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_22500_24300
899118	contig_11017_pilon	-	3846	2	Intergenic	novelGene_128068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	3190	3843	173458	172805	FALSE	50	CATAATTCCAGCAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGLIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQPVTALKREIDSSTIIVGNFNTPLSVNDRTSRKKHSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYSFFSKAPGTFSRIQHILGHRAILNKIQNVEIIKSTFSDHNAIKVEINNRKIKEKKNQFHGNSVLTHHWVIEEIKDGIKKFLESNENENTSCQNLWDTAKAVLRGQFIAIYAHIKKKKKGTKSKH	177980	172801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_176342_177674
899119	contig_4339_pilon	-	2405	15	Intergenic	novelGene_146080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCGTCCGTGTAACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1076243	1037930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1037991_1043330_1043468_1045033_1045182_1045633_1045796_1048186_1048289_1049798_1049917_1050553_1050737_1052474_1052576_1060593_1060722_1062164_1062439_1064442_1064882_1068667_1068744_1069956_1070116_1072078_1072222_1076068
899120	contig_19558_pilon	+	1653	4	Intergenic	novelGene_164746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	115.597001114504	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	27	407	25184	30130	FALSE	25	ATGGTGATTATGGATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWRVHVDQMHQHKSGIESALKETKGFLDKLHNEISRTLEKIGSREKYINNQLEHLVQEYRAAQAQLSEARERYQQGNGGVTERTRLLSEVTEELEKVKQEMEEKGSSMTDGGECTHLRRRSEQEKSNCLQKSVG	25157	31376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_25232_25976_26109_27488_27552_29992
899122	contig_10867_pilon	-	3561	3	Intergenic	novelGene_159443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5908	junction_1	276.5	174	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGTTATATGTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89785	85522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_87840_88193_88256_88603
899123	contig_10377_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_115368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCATTCTCTGTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210315	208654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_208700_210300
899124	contig_4496_pilon	+	4541	13	Intergenic	novelGene_66615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_10	106.93559847975	843	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	669	2933	573979	672858	FALSE	10	TGTCTTTGTCTGTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGEPVSTMKVSESEGKLEALATAVTPNKNSSNSSCGGGISSSSSSSSSSRGGSAKGWQYSDHMENVYGYLMKYTNLVTGWQYRFFVLNNEAGLLEYFVNEQSRNQKPRGTLQLAGAVISPSDEDSHTFTVNAASGEQYKLRATDAKERQHWVSRLQICTQHHTEAIGKNNPPLKSRSFSLASSGNSPISQRRPSQHAISFFNVGHSKLQSVSKRAHLPPDHLVEVREMMSHAEGQQRDLIRRIECLPASGHLSSLDQDLLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQHASHQKGSLPPGTTIEWLEPKIPLSNHYKNGADQPFAAEQSKPLAAPEQQSVAESGLLAREPEEINADEEVEDTCDNKEDDLGAVEEQRSVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTFILEKRSLLEMYADFMSHPDLFIAITNGATAEDRMIRFVEYYLTSFHEGRKGAIAKKPYNPIIGETFHCSWRMPKSEVTSNVISSSSTQAITNQPPLSEEPLSQVGSDCYMVRFVAEQVSHHPPVSGFYAECAERKICVNAHVWTKSKFLGMSIGVTMVGEGILSLLEHGEEYTFSLPCAYARSILTVPWVELGGKVSVNCAKTGYSASITFHTKPFYGGKLHRVTAEVKHNSTNTVVCRVQGEWNSVLEFTYSNGDTKYVDLTKLTVTRKRVRPLEKQDPFESRRLWKNVTDSLKEFEIDKATEHKRTLEERQRTEERHRTETGTPWKTKYFIKEGDGWVYHKPLWKTISATQPAE	573310	674466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_574164_600749_600819_605675_605852_606685_606766_608804_608982_617856_618059_622314_622461_627391_627533_640710_641210_645178_645366_662079_662263_665409_665564_672792
899125	contig_7253_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_140208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAATAAACAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209696	208014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_208000_209700
899126	contig_12638_pilon	-	3535	17	Intergenic	novelGene_33116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2311	2703	172943	172551	TRUE	30	GCACGGGGGAGCAGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPKNPRKSINNPPVQPKHFLFPYLFTWNYIHVKLRHKNLNIKIEQLFKSLSITKLHKNYQEFIQIGTTWSCYTLQNKCIIFKRFSAMFVLKFNYISYRSITANLQSLQFVTPVIMHAYCYFHHQLVKE	199752	170880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_171970_173559_176888_176959_178083_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191833_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
899127	scaffold_21177_pilon	-	6617	8	Intergenic	novelGene_145480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	234.105592781182	472	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	81	1343	221483	181818	TRUE	30	CTCAGCCAGTCAGATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGGTVDIVESEPENDHGVELLDQNSSIRVPREKMVYMTVNDSQQEDEDLNVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGISFMCILRRRKYCEKYTGFQAETFHLDYIWPMTLQFWETTRESMGQNADMCFFFFRFGS	254658	175720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_180678_181500_182000_182184_182341_182719_182864_183067_183218_217716_218287_221422_221512_254606
899128	contig_4742_pilon	+	2571	5	Intergenic	novelGene_130977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	296.730833416415	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	399	2477	201541	254322	FALSE	55	GCTGAAGAAGATAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDKDPMLGSASNQFCLPVLDSNDPNFQMPCSTVVGLDDIMDEGVVKESGNDTIDEEELILPNRNLRDKVEDNSVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRSNSSPLSSTKKTSGKTVSAPKAGVRQPEKCQIKEEVCASLKPEYHTESRRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWTPSKQCGFCKKPHGNRCVYGWLWEM	190868	254416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_191193_201466_201644_242103_242266_246984_248772_254295
899129	contig_4232_pilon	-	6484	4	Intergenic	novelGene_63150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	164	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	2414	3121	10145	9438	TRUE	35	GGAGACTAACTTGACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNISSKQHKTEVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKVFIHWEDITVINIYTPNDRAAKYINSNSTEKRDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLSKDTEELNATVNQLDLIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKESLNKMQKIEILQSIFADHKAIKVEINNKKSKEKKSNTWKLNNTFLKNYWVIEDIKDGIKKLIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRDHLK	12670	1117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_1621_2067_3916_8425_11185_11296
899130	contig_15775_pilon	+	2432	6	Intergenic	novelGene_148362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	181.740034114666	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	15	530	172	4993	TRUE	10	CCATCCATCTCTTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCYSMSGPGAVNGPKGGSLTVQCGYNPGWETYYKWWCRGADWGSCQILVKTTGSEQEVKKDRMSIRDSQKNRTFKVTMEKLREDDAGFYWCGIERFGSDLGVPVKVSIGPAPATPEENTTSPIMTSWLSDVRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEAVSSPR	157	7600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_491_1880_1945_2675_2789_4973_5140_5730_6247_6360
899131	contig_15236_pilon	-	3117	3	Intergenic	novelGene_141542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	18	275	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTTAGGGTAAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114067	106334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_106611_110951_113603_113877
899132	contig_7657_pilon	-	3460	3	Intergenic	novelGene_30030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	327	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1381	1749	193116	192748	FALSE	10	CCATACTCTTGGGCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLEMKKDKKGTRERRKRTKKEAKKAKQKQKRSAPGCPCMSAQRKGVSSKPHGTALPEGAPKPRKEKENKQADQNRTHQSKQTKKPGVPPAWGHGLENSFTVKQCFASFQEEAKMAHGARY	195125	191036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_193429_193541_193631_194146
899133	contig_11110_pilon	-	1165	5	Intergenic	novelGene_177258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	34.6734768951716	148	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	328	1164	85579	76785	FALSE	75	AAAAATCTAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIVESEAKVKTKVRFEELLKTHNDLIRERKKLQKKIAKSGENISIDPFRRNLQHIKGTKSDNVSVPNTDNPEKSMRVSKDKLGNTQSPENPSDDASVEEEKQGKSNRKVAKAAPQVSPQEIEPETTERKLDSTHPKAQTKSQSSVAHQKSKKANEGKENDFDGEEELMEVYQLQAAEEMAKEIKKKIRKKLKEQLTYFPSDTSLHDDKLSSEKKKKKKKKIPVQSKAETSTLTVSELERDKVEDEQKESPVGAVTSDSHQDDKINSIEQNVEDNMEDD	97751	76783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_76930_78872_79430_83939_84065_85569_85638_97482
899134	contig_18959_pilon	-	2464	2	Intergenic	novelGene_178735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	125	502	51818	51441	TRUE	80	AAATAAAACAAAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWRMIWPFLRKLEIEIRNDPATPLLGIYPREIRAITRIDICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNSDESVKLLITWMKLEDIMLSEISQSQNDKYCMRPLL	51942	47919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18959_pilon_-_48824_50382
899135	contig_11855_pilon	-	6736	9	Intergenic	novelGene_66972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_1	1824.14185303665	373	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	5500	6570	1087425	1079293	TRUE	35	TTTTTTTTTAATTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1093335	1077602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858
899136	contig_6434_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_61862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTGATTATATCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823341	826045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_823300_826000
899138	contig_11896_pilon	+	6507	4	Intergenic	novelGene_88011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	5734	6072	141443	141781	TRUE	35	CAGTGCACAAGGCATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVLKSETSAWQLGWGLGDSGSGDMGRSFSRDVNSSIGSKWTFMSAFSASVSKSSTVKSGNSLAISGACPGWIKALDAWQLSRGNFDSFRQHPDEHPLMSFRFNSSSICPA	133067	151377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_133915_134360_139014_141209_142048_151208
899139	contig_610_pilon	-	2874	6	Intergenic	novelGene_76853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_4	16.3829179330179	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2	463	387929	379011	FALSE	40	TGCAGTAAAAAGTAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVIFPRLLVIIFAILLVILCLGTLISFCVWRRKRKQSSESTEEECRTVYERINHLPLRRNQEQEQEQEQEQNSSREDRTIYSRIQSQKSASLLPKNENTVYSTVQSFQKSGSKKNHGPSSRCTVYEEVGKRQLRAQNPARLSRRELENFDIYS	387930	376599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_379092_380222_380277_381346_381413_384549_384628_387146_387218_387817
899140	contig_7045_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_77429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAGAATTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210056	211345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_210100_211300
899141	contig_15105_pilon	-	2385	6	Intergenic	novelGene_150972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	172	483	627431	619281	TRUE	25	ACTAGCCCAGCCCTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIAASAASVYKSPDLCRSFSSPQPPVNSISASLASSMYRGSSCIPSYSPPSSQSVVSRAVLYQCRASDQSRVPVWAKVLARVKSSRHHDHRLSVASFSCLQ	627602	614521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_616063_617327_617462_617623_617809_619238_619373_621246_621420_627384
899142	contig_2114_pilon	-	3010	1	Intergenic	novelGene_104248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	780	1193	165948	165535	NA	30	TTACTCTTCCTCTAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTGLIAILRGAANVIGVGKFIGDVIVTGCAIFTGAVTGVGRLTGVVSVKGEVMDNGLVIVTGCPMFIGLVMLTALETFTGLLMLIAAATVTGFDIVPDDTEDVILNGVVRVTGVVAAVEVWHRLAASKIRRQKGL	166727	163717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_163700_166700
899143	contig_7919_pilon	+	2840	1	Intergenic	novelGene_28109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2388	2708	1396378	1396698	NA	40	AAAGAAATTGTGAGACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGTFNYGLPLRVIRNASGMKDIPSGTKLLKFSRSICRPIISFKSLGTSHSCNGLGEMTTGMSRTFPRKGCDIKKPRTCIYGYMEIFKFPKGRIVCYIHLPQLICY	1393990	1396830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1394000_1396800
899144	contig_20693_pilon	+	1452	5	Intergenic	novelGene_60243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1478	junction_2	331.496134969927	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	32	466	14718	24004	FALSE	50	AGAAAAGAAATATGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVGTISSYCMTSQLPAVASMSLVLLSVLWLIAQTQAIAIKQTMELKLYEVVHPKKLHILHKRDIKDNQTENHGKEEKYVPEVQYQIILNGEEIILHLEKSKYLIGPDYTETYYSSRGEEITTSPQNMEHCYYEGYTLNEKDSVASISTCDGLR	14686	24990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_14797_19351_19471_20343_20421_21181_21261_23923
899145	contig_4857_pilon	-	1391	6	Intergenic	novelGene_48785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5593	junction_5	943.520556214861	13	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	443	1150	1250050	1234290	FALSE	50	TGAAAAAAAAGTCTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTQGLILFSFSFFSKIKQGLLPSLEDLLFYTIAEGQEKIPVHKFITALKSTGLRTSDPRLKECMDMLRLTLQTTSDGVMLDKDLFKKCVQSNIVLLTQAFRRKFVIPDFMSFTSHIDELFESAKKQSGGKVADYIPQLAKFSPDLWGVSVCTVDGQRHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKVRC	1250492	1234048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122_1243253_1249432_1249555_1249909
899146	contig_4865_pilon	-	3062	1	Intergenic	novelGene_158167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43694	40632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4865_pilon_-_40600_43700
899147	contig_8647_pilon	+	1378	5	Intergenic	novelGene_178118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTGAAGAAAGGATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962523	1013463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_962636_977994_978094_991565_992525_1009758_1009908_1013404
899148	contig_12079_pilon	-	969	3	Intergenic	novelGene_67566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	432	junction_2	272	325	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAAGAAGGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872429	870540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_871171_871500_871725_872314
899149	contig_9863_pilon	+	1391	8	Intergenic	novelGene_153982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	158.411760025213	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	308	868	15323	30596	FALSE	50	ACATGAATGCAAACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPLPPGLPRARVQAVVRPCGAGSLLARASTLHLQTGNLLNWGRLRKKCPSTHSEELRDCIQKTLNEWSAQISPELVREFPDVLECTVSHAIEKINPDEREEMKVSAKLFIVGSNSSSSTRNAVDMACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKPNSNQVNLASCCVMPPDLTAFAKQFDIQLLTHNDPKELLSEASFQEALQESIPDIQAHEWVPLWLLRYSVIVKSRGIIKSKGYILQAKRRGS	5266	31119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5340_5474_5571_13883_13950_15250_15336_18204_18265_20305_20509_21831_21947_30426
899150	contig_7963_pilon	+	1051	6	Intergenic	novelGene_58359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1176.26789465666	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	104	868	51450	63007	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYNFRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51346	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003_63130_63279
899152	contig_854_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_36747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATGCTGCGTGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1719820	1717584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1717600_1719800
899153	contig_4924_pilon	-	2270	10	Intergenic	novelGene_84652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	478.694624170647	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	3	845	146061	69091	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAGAGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAAKPLYLPPSTGVWRPGHSADVHAFWKCYLC	146063	62871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69181_74705_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994
899154	contig_3320_pilon	+	2905	10	Intergenic	novelGene_133059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_9	89.7056916316413	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	12	830	103751	175843	FALSE	20	TATTGCAGATTCTTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKMVLIKEFRVVLPCSVQEYQVGQLYSVAEASKNETGGGEGIEVLKNEPYEKDGEKGQYTHKIYHLKSKVPAFVRMIAPEGSLVFHEKAWNAYPYCRTGKPNEYMKDDFFIKIETWHKPDLGTLENVHGLDPNMWKTVEIVHIDIADRSQVEPADYKADEDPALFQSVKTKRGPLGPNWKKELANNPDGPQMCAYKLVTIKFKWWGLQSKVENFIQKQEKRIFTNFHRQLFCWIDKWIDLTMEDIRRMEDETQKELETLRNQGQVRGTSAASDE	103739	177918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3320_pilon_+_103771_109909_109941_113136_113283_125922_126023_127202_127278_129176_129261_154065_154144_169044_169156_170845_170969_175792
899155	contig_4151_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_65284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	620	1282	673102	672440	NA	60	AAAAAAAAAAAATGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKRPLSFLEPEKATGVEIYSGSKLHIWLCAQGCILGPDLQPFASKRTDCFVNAFFPRLTEFRAVIETREHEEPGGWQCLLNYGSVAGLATNMDRQRPSSLDQFNYVLLCPGLWPQETQIYFTVYEPRVYPALQVGLQSNFWTNDLKNKTKQNTSMLLFLRCSQILTFNLLAFTYSLLLSGVYNPHFAMDSLITIFISNLKNGLYSGDHGLGEHLAQLA	673721	671607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_671600_673700
899156	contig_5019_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_109208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAAAAAAAAAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188645	189626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_188600_189600
899157	contig_10734_pilon	+	2271	16	Intergenic	novelGene_51422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	77.5568608613491	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	49	1302	2116886	2146840	TRUE	30	TTTTGTTGCTAGAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVHESLYFNPMMTNGVVHANVFGIKDWVTPYKIAVLVLLNEMGRTGEGAVSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPHHGPPASPDAAEHEQPGVAKRRRAAEQHRVLCCRALPPRGATR	2116837	2156141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2146708_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
899158	contig_5686_pilon	+	6714	15	Intergenic	novelGene_45198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1523.57665259301	429	145	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	2672	4804	189037	224324	TRUE	45	AAAAAAAGTTCCAATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQGGTCSFVTSWWWFNFELFLIFLIIVFSDGIFFFLTSQVNN	32724	231135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_32886_63149_63693_105522_105568_187114_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_225481_230381
899159	contig_2892_pilon	+	5227	5	Intergenic	novelGene_119024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	149	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1699	2037	276653	276991	TRUE	20	TGTAATATTTCGATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIQVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQQLLFPVFLIRASNAGVSWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	274954	460355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_278568_322920_323190_360573_361065_366551_366909_459858
899160	contig_4845_pilon	+	1750	11	Intergenic	novelGene_53673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_2	882.536803765146	222	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	671	1750	803035	937617	FALSE	30	GAAAACCCTCAGGTAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELQTLQEALKVEIQVHQKLVAQMKQDPQNADLKKQLHELQAKITALSEKQKRVVEQLRKNLIVKQEQPDKFQIQPLPQSENKLQTAQQQPLQQLQQQQQYHHHHAQQSAAPSPNLTASQTVTTASMITTKTLPLVLKAATATMPASVVGQRPTIAMVTAINSQKAVLSTDVQNTPVNLQTSSKVTGPGAEAVQIVAKNTVTLQVQATPPQPIKVPQFIPPPRLTPRPNFLPQVRPKPVAQNNIPIAPAPPPMLAAPQLIQRPVMLTKFTPTTLPTSQNSIHPVRVVNGQTATIAKTFPMAQLTSIVIATPGTRLAGPQTVQLSKPSLEKQTIKSHTETDEKQTESRTITPPAAPKPKRE	764504	937617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_764930_794494_794536_795890_796003_802942_803089_807471_807505_810596_810663_916632_916840_923065_923315_924518_924609_930192_930487_937530
899161	contig_20641_pilon	+	1705	7	Intergenic	novelGene_52835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1643.05238470625	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	59	547	14599	38693	TRUE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEM	14540	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38697_41474_41619_45848_45965_54835_54972_56412
899162	contig_9505_pilon	+	3804	13	Intergenic	novelGene_121868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	181.40968061882	6	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	170	865	652560	665112	TRUE	20	CCACCCAGAGGTGTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECNTDKDQSPSADTTVGLTPSLCPSRILWEERDGSCISLGLLLDSQL	650624	677410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017_659074_663426_663450_664999_666244_666444_666514_669223_669326_675220_675294_675846
899163	contig_4105_pilon	-	3639	16	Intergenic	novelGene_21490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	783.717454755787	16	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	20	1720	137447	100151	TRUE	30	TTTTAATGCAGAAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137466	98167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_99375_99438_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_105999_108798_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
899164	contig_20165_pilon	-	4230	19	Intergenic	novelGene_54467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	86	junction_17	159.732260554117	586	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	426	2336	102709	48430	TRUE	15	CCATGCAGCCTCAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDVGSSVRSGPVTALGGLDSGPGSSSQEKAKAGECQPLESQLTDLRIPQELPICGDHAVMSPGIQAAAGNGDSLLDTGPTGEQSGNGKVPNRDSGIDSPSCSVAGESFPGEESSEAVQGPAMLGLHPGTDTQEAPQDTASDVDKGSSEAGQGPAMLGLHPETDSQDASQDTASDVDEGSSEGPDPGTILQTGGVEAGMAKSPKPQQLFNIAQELLHTEEAYVKRLHLLDQIFCTRLSEAGIPVEVTTGIFSNISSIYRFHRQFLLPELQARIVDEWDVNPRLGDILQKLAPFLKMYGEYVKNFDRAMELVGVWTQRSVLFKDIVHDIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLKRLPADAPDQRDAEKSLELISTAANHSNAAIRKMEKMHKLLEVYERLGGEEDIVNPANELIKEGHIQKLSAKNGTTQDRYLFLFNSMVLYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDIVKPNAAHTFVITGRKRSLELQTRTEEEKNEWIQVIRTTIEKHKQNSETFKAFSGPLGWNEDSTPPLQTHLWWVPAPWSPLWRPMAAEVLEGSTAESLPLKRGVRRRGRAARAAGRPSTPSPRGGTAASSAAQSSVGSAPSSRLRTAGRAGSARSVS	128156	40725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_42420_46775_46917_48370_48506_49897_50021_58020_58084_70009_70120_70987_71019_72217_72298_75017_75111_75354_75502_77719_77779_78298_78438_89208_89366_92258_92396_92999_93090_102103_102759_103987_104149_118295_118455_128100
899165	contig_12312_pilon	-	2055	10	Intergenic	novelGene_63960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	895.164554842803	13	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	82	1215	326065	214683	FALSE	45	TAAATAATGCTTTAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAALALKSV	326146	213842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214703_242315_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
899166	contig_6418_pilon	+	2604	1	Intergenic	novelGene_81249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGCAGCAGTAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448863	1451467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1448900_1451500
899167	contig_11416_pilon	+	3679	2	Intergenic	novelGene_145371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_1	0	645	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	107	859	587114	587866	FALSE	35	ATTTTCTAGACAAAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFARGLKRKCFDHEEEGDGPLAGFRAVPSYDLQRQSLLDMSLVKLQLCHMLVEPNLCRSVLIANTVRQIQEEMTQDGTWRMAAPQGGGPAPLDRLVSTDVLCRSAREQEQGQPGPEDGSFPKGFEDGPAAGLTCDVPSVTVAQAPRHLPSSSSWDLDSSRESRGSFQKSLDQIFETLESKNPSSVEDLFSDVDSSYYDLDTVLTGMMGSSRASPCDTLEGFTPLTAAPPGPGCKADLGELDHVVEILVET	584743	590686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_584844_587107
899168	contig_10377_pilon	-	2541	2	Intergenic	novelGene_115418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	602	910	261152	260844	TRUE	45	CCTCATTATAATCCAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEDTRPPPATHTPTPNKLSKYIKTTAYVLLFLFLLSEHPSLGLKEVLSPPPKTGINSIEKVPQAYKMHARLIDQIERTTEESHFKSLQLGQSRSARIVLT	261753	259152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_259545_259604
899169	contig_15135_pilon	-	4452	32	Intergenic	novelGene_119859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	504	junction_20	285.590244443195	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1175	3528	522	4049	94763	31499	FALSE	30	AATAAAATTTCTTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEISTPVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRTYKERTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGFVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQELCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESIQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDIRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYKEPEKHSQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFAVNTSNQGSRDDLSTNGGFQTQTTVKHNSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRVSLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISEETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHTTTSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTILDLLSLFTQVHQRQLQQSDCQNSMMKRVFDTYMLFFQVNQSAAALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNTNRFVFETPFTLSGKKHGGVEEQCKRRTVLTTSHFFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVSLAQS	96220	31095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_31711_34145_34357_36726_36874_44525_44640_44777_44901_46298_46406_49385_49485_49803_49862_51681_51898_53360_53472_54019_54203_55059_55198_57048_57162_58967_59093_62133_62236_62839_62888_63101_63169_63261_63377_63466_63589_64779_64889_65955_66073_66198_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92251_94677_94797_95329_95423_95825
899170	contig_17274_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_26522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1726	2109	126020	125637	NA	45	CCAAATCAAAAAGTCGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIQDYSLQDGLHLNMKKTKILTTGPINSIMINGEKIEVVKDLILLGSTINIHGSSSQEIKRRIALDKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVSLTQAMVFSVTSYACKSWTIRKTEEELMPLYYGGGEEY	127745	125261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_125300_127700
899171	contig_11493_pilon	+	3442	1	Intergenic	novelGene_143731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	535	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351831	355273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_351800_355300
899172	contig_11378_pilon	+	6107	15	Intergenic	novelGene_112220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	148.569660016946	2	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	976	1443	320692	334255	FALSE	35	TCTAGACAAGAGCCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLLLKIHVNPPAEVSTSLKVYQGHTLEKTYMGEDFFWAITPTAGDYILFKFDKPVNVESYLFHSGNQEHPGDILLNTTVEVLPFKSEGLEINKETKDKQLEDGYFRIGKFENGVAEGMVDPNLNPISAFRLSVIQNSAVWAILNEIHIKKASN	263387	338919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_263528_291897_292066_294203_294268_300832_300895_307115_307163_309082_309197_310018_310095_314822_314938_316308_316378_320448_320557_320679_320874_324159_324239_324904_324972_333988_334102_334228
899173	contig_19243_pilon	-	2340	2	Intergenic	novelGene_177408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	731	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	25	363	68823	68364	FALSE	60	CATTCTATTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAILVLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRTLC	68847	66386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19243_pilon_-_68377_68497
899175	contig_17108_pilon	+	2766	6	Intergenic	novelGene_109508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGAGTCGTCGCCGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28404	87076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_28653_30617_32699_34461_34555_48686_48888_53232_53318_87018
899176	contig_5586_pilon	+	3718	3	Intergenic	novelGene_143560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1334	junction_2	6.5	396	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	223	357	384614	384748	FALSE	55	CAGGAAGAAAATTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSGNFNSD	380635	388109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_380719_383470_383575_384578
899178	contig_7333_pilon	-	3550	3	Intergenic	novelGene_142741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	75	junction_2	16	485	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	449	883	43369	41089	FALSE	55	GTGTATATTTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSLLRCPRSADDERKHPVLCLFCGAILCSQNACCQEMVNGEEVGACIFHALHCGAGVCIFLKIRECRVVLVEGKARGCAYPAPYLDEYGETDPGLKRGNPLHLSHERYRKLHLVWQQHCIIEEIARSQETNQMLFGFNWQLL	43817	38421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_41231_42221_42324_43178
899180	contig_3424_pilon	+	7712	1	Intergenic	novelGene_55501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	968	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	547	1644	5837	7480	169035	170678	NA	25	GTCTCAAATATTTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALMLQNLSSLESVSLARNTIMRLDDSIFEGLGPLRELDLQRNYIFEIEGGTFDGLTELRHLNLAYNNLPCIVDFGLTQLRFLNISYNALEWFLASGGEAAFELETLDLSHNQLLFFPLLPQCSKLHTLLLRDNNMGFYKDLYNTSSPREMVAQFLLVDGNVTNITTVSLWEEFASSDLSDLRFLDMSQNQFQYLPDGFLKKMPSLAHLNLNQNCLMTLHIREHEPPGGLTELDLSQNQLSELQWAPGLTGCLQSLQVFNLSSNQLLGIPTGLLADASNITTIDMSHNQISLCPTPVHLDQVGPPSCVDFRNMASLRSLSLQGCGLGTLQDCAFQGTPLTHLDLSSNWGILNASIAPLQHIAPTLRVLSLRNVGLSSSFMELDFSGFGNLRDLDLSGNSLSSFPRFGGSLSLQTLDLRRNCLTALPQRAASEQLMRSLRTIYLSQNPYDCCGVEGWGALQRLQTLRIPDSAMVTCNLSSKVIRVVDMPRDVPRDCKWERVDMGLLYLVLILPSCLTLLVACTVIFLTFKKPLLQVIKSRCHWSSIY	163198	170910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_163200_170900
899181	contig_12864_pilon	-	7261	20	Intergenic	novelGene_76365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_19	121.297030174221	750	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1066	3201	96	3296	208748	181861	FALSE	35	ACTGGTAGGATAAAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQCDEPPASPDDSDNSVSESLDEFDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMAVDLDDQDWLDMNNIEQALFSRLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSTDRDAGEKHSFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDVLLEAIQGAHFEDVTEFLEEVIEALTTDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAYLDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPSNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDEERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLVLTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADSLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFPHAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTETYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKINKPGNMIVAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE	213570	177895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_181988_183586_183745_184956_185105_185524_185706_187944_188120_191141_191256_191350_191452_194814_195003_196047_196181_198165_198471_199369_199491_200619_200954_202138_202331_202552_202756_203081_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
899182	contig_2854_pilon	-	3314	15	Intergenic	novelGene_120831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	73	junction_8	128.937197970206	408	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	852	2559	75	2633	356512	257841	FALSE	25	CAGGACTTCTTGAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVNPIQIPSRLPLLLTHEGVLLPGSTMRTSVDSARNLQLVRSRLLKGTSLQSTILGVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGCREHILEDAKPESVDDTTDLALPPEMPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	356586	257159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368_274512_300455_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773_348009_356279
899183	contig_1090_pilon	+	4149	22	Intergenic	novelGene_131122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	208.302054794824	535	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	163	2526	406262	488591	TRUE	20	GAGATCCCAGCCTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKLLQRQTYTCLSHRYGLYVCFVGIVVTIVSAFQFGEVVLEWSRDQYHVLFDSYRDNIAGKSFQNRLCLPMPIDVVYTWVNGTDLELLKELKEVREQMEEEQKAMREILGKNTTEPTKKSEKQLECLLTHCIKVPMLILDPALPANITLKDLPSLHPSFHSASDIFNVAKPKNPSTNVSVVVFDSSKDVEDAHAGMFKADSKQTVWRGYLTTDKEVPGLVLMQDLAFLSGFPPTFKETNQLKTKLPENLSSKIKLLQLYSEASVALLKLNNPKGFQELNKQTKKNMTIDGKELTISPAYLLWDLSAISQSKQDEDVSASRFEDNEELRYSLRSIERHAPWVRNIFIVTNGQIPSWLNLDNPRVTIVTHQDVFQNLSHLPTFSSPAIESHIHRIEGLSQKFIYLNDDVMFGKDVWPDDFYSHSKGQKVYLTWPVPNCAEGCPGSWIKDGYCDKACNNSACDWDGGDCSGNSGGSRYVAGGGGTGSVGVGQPWQFGGGISSISYCNQGCANSWLADKFCDQACNVLSCGFDAGDCGQDHFHELYKVTLLPNQTHYILPKGECLPYFSFAEIAKRGLEGAYSDNPVIRHASIANKWKTIHLIMNSGMNATTIHFNLTFQSKNNDEFKIQITVEVDTREEPKLNSTTQKSYEHLVSPVTILPEAEILFEDVPLEKRFPKFKRRGNTTERLQEEVKIPLINISLLPKEAQLSLNNLDLQLEHGDITLKGYNLSKSALLRSFLMNSQDAKAKISEAVIIDERNDSLHVPLEKQVHKNVLANGLAARIHPRT	406099	514197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_406379_440789_440876_457195_457316_458291_458334_460880_461087_465037_465103_465397_465533_481833_481996_482800_482981_483214_483386_485106_485231_486361_486566_487775_488503_488566_488876_491870_492071_492665_492886_493593_493708_497087_497174_497429_497529_500227_500396_503619_503711_513836
899184	contig_11321_pilon	-	3062	2	Intergenic	novelGene_86656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	130	456	164673	164347	TRUE	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGCVTFQPGKASKCSIALCHPVDVWVGKNAYKRTKWPPPASDSRVWPILAVKDQTVNILGFVGHTVCRHHLALPLSRESSHRQYANTQAWLCSIKFYLQKHLGIVC	164802	160306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_162829_164262
899185	contig_5959_pilon	-	1418	5	Intergenic	novelGene_150194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	174.01221221512	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1071	1400	212248	211919	FALSE	80	AAATTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVENTSVRAQPLFFIKEFTVGRSPTDVLSAGKHSAEVPSLCNTRESILEKNLINVLNAGKPLARILGSLIIRESILGRNLMNVFSVGNRIVKAQIFLDIREDTMQKNF	218727	211900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212444_215174_215323_215888_215939_216137_216310_218222
899186	contig_11378_pilon	+	2897	16	Intergenic	novelGene_112215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_9	135.989149893986	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	286	1188	263434	316322	TRUE	25	GGTATTGTAGCAATTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRNGTVATALAFITSFLTLSWYITWQNGREKLIAYQREFLALKERLRIAEHRISQRSSELNSIVQQFRRIGAEANGSKDAVHKFSDTTLKLLKELTSKKSLQVPSIYYHLPHLLQNEGSLQPAVQIGSGRTGVSIVMGVPTVKREVKSYLTETLHSLIDNLYPEEKSDCVIVVFIGETDVEYVRSVVATLEREFSKEISSGLVEVISPPESYYPDLTTLRETFGDSKERVRWRTKQNLDYCFLMMFAQEKGTYYIQLEDDIIVKQNYFNTIKNFALQLSSEEWMILEFSQLGFIGETH	258335	335321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_258383_263195_263528_291897_292066_294203_294345_300760_300895_307115_307163_309082_309197_310018_310095_314822_314938_316308_316378_320448_320557_320679_320874_324159_324239_324904_324972_333988_334102_334228
899187	contig_6608_pilon	+	2010	7	Intergenic	novelGene_162535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159686	325531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_160132_161047_161199_161382_161468_162420_162742_162841_163221_300573_300717_325045
899188	contig_13265_pilon	+	6299	29	Intergenic	novelGene_145995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	51	junction_10	158.714715667413	571	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1352	4059	533	4591	18804	113433	FALSE	45	TGAAAGAAAAGTACTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSIPDCTSKCRSLQHALDILSVITKGSEGQIKAFLSSYCYNATTIKDAFGRNALHLVSSCGKKGVLDWLIEKGVDPLVKDKESGWTALHRSIFYGHIDCVWSLLKHGVSLYIQDKEGLSALDLVMKDRPTHVVFKNTDPTDVYTWGDNTNFTLGHGSQNSKHHPELVDLFSRSGVYIKQVVLCKFHSVFLSQKGQVYTCGHGPGGRLGHGDEQTCLVPRLVEGLSGHNCSQVAAAKDHTVVLTEDGFVYTFGLNVFHQLGLVPPPPSCNVPRQMQAKYLKGKTIIGVAAGRFHTVLWTREAVYTMGLNGGQLGYLLDPNGEKCVTAPRQVSALHHKDIGLSLVAASDGATVCVTTRGDIYLLADYQCKKMASKQLNLKKVLVSGGRMEYKVDPEHLKENGGQKICILAVDGAGRVFCWRSVSSSLKQCRWAYPRQVFISDIALNRNEILFVTQDGEGFRGKWFEEKRKSSEKKAEILSNLHNSSSDVSCVSEVNSVYERIRLERLPFAHRAVSVSTDPSGCNFAILQSDPKTSLYEIPVVSSSSLFEEFGKLLRETDEMDSIHDVTFQVGNRIFPAHKYILAVRSDFFQKLFISDGTTLDFADVYRKDEDSVGCHLFVVEKVHPDLFEYLLQFVYTDTCDFLTHGYKPRIHLNKKPEEYQNAPNSHLNKMNCHEDNNQKSTFEVYKSNQAQTISERQKRKPKSSKKGKSVGEDDPVRMLQNVAKKFGFNNLSSRLDGVRFENEKINVIVKKTGNKPKLNQKKCSFLCDVTMKSVDGKEFPCHKCVLCARLEYFHSMLSSSWIEASSCAALEMPIHSDILQVILDYLYTDEAVVIKESQNVDFICSVLVVADQFLITRLKEICEVALTEKLTLKNAAMLLEFAAMYNAEQLKLSCLQFIGLNMAALLEARSLDVLSDDVLKDLSVFYRKMIPAMDRRVITPYQDGPDISYLEVEDGDIFLKEEINMEQNYLETMFKKVKTKAKKKPRKRSDSSGGYNLSDVIQSPPSTGLVTSGKTYSVESLSELLTSDSEGSYAGVGSPRDLQSPDFTTGFHPDKIEGKVKPYVNGTPPTYSREDLKSWEKSPVLKTSAPQPIPSNTIDNTSSSSWVVGSFSPVSPPVMDLRTIMEIEESRQKCGATPKTNLGKMISHGIKLSQKQRKMIAVTTKENNSGMNSMETVLTTPSKSPKPVNAWAFSLHSVSSKSFWDFSLDEKKSVTGHSSGDHVKKICFKGIESSQDPKVIRYPTQGTPGEGNHISDLPLQDSANPWLSSSLTGPSVAPVTFASIVEEELQQEAALIRSREKPLALIQIEEHAIQDLLVFYEALSNPDEFVIVERTPQGPLAVPMWNKHGC	8635	115141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_8798_18433_19125_28028_28126_29217_29343_30645_30757_32293_32465_34153_34272_34356_34538_36223_36348_37698_37877_40592_40771_42059_42663_43919_44007_44871_44955_45034_45073_47162_47260_62547_62650_64862_64981_66860_66922_67476_67599_69565_69679_74623_74773_76338_76503_78667_78761_79357_79502_97722_97873_111915_111985_112372_112503_113301
899189	contig_5696_pilon	-	3170	9	Intergenic	novelGene_117590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	79	junction_1	395.913638783763	268	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	22	912	773050	756911	TRUE	15	TCTATCTTCATTATTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGGGGGVLEQEDSVLFRRGTGQSDDSDIWDDTALIKAYDKAVASFKHALKNGDICEASDKPRGTPKRKPIKKNKSQKKNTTTPLKQWKVGDKCSAIWSEDGCVYPATIASVDFKRETCVVVYTGYGNREEQNLSDLLLSTFGGVSNGDQNAQENAQENENESQISTDESENSSRSPGNKPNNLKSKAAPWNSFLPPPPPMPGLGVGPGKPGLKFNGPPPPPPPPPPPSFLSCWLPPFPSGPPIIPPPPPICPDSLDDADALGSMLISWYMSGYHTGYYMGFRQNQKEGKCSHFN	773071	750929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_753185_756907_756959_762282_762394_763244_763344_764527_764684_764836_765050_765887_766008_767711_767784_772978
899190	contig_3601_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_132906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAAACAAATACATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226115	228104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_226100_228100
899191	contig_7707_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_72104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGATCAGGGTCACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3463	5886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_3500_5900
899192	contig_12079_pilon	-	3098	13	Intergenic	novelGene_67449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1219.31527631518	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	931	1347	585999	583739	TRUE	20	GATCTGCAAGGCCATGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRVARAAGQGGAGETGCGSDKEPGAAGHGAR	638839	579737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582170_583662_583756_584142_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598060_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
899193	contig_6175_pilon	-	5022	24	Intergenic	novelGene_16337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_23	371.36405181332	420	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	874	2625	243	2867	1719710	1647652	FALSE	0	CCCTTTTCTCCTGTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTSSINGDLIELNSIGVILDMFFKYTWNNFLHTQVEICVALILASPFENTENGTLTDRDTTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCVVHSTDKGPNSTSVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQDLFESRGANAEDKMEVDLNEPPSWSANFDVPMETTHGAPLDSVGADVWSTEELMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPLDPLTTSVTALTAQAEVPGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKSEDGKLSTSQDAACKYVVEESPEMAEVKSAAPQLPSSSPEQRTDQPSVPGDTSVNGPV	1793698	1645496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1647704_1650560_1650684_1654371_1654523_1656082_1656190_1657674_1657829_1661563_1661686_1669608_1669740_1670848_1670904_1672947_1673046_1677386_1677474_1683753_1683840_1685585_1685702_1688442_1688508_1689437_1689588_1691807_1691961_1693918_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719717_1746007_1746156_1793610
899194	contig_12414_pilon	-	2954	9	Intergenic	novelGene_59644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	371.775806098245	10	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	1616	2437	766857	756525	FALSE	30	TCAGAATGATCCTATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	784126	756007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766905_767635_767691_781929_782108_782791
899195	contig_3627_pilon	+	1184	4	Intergenic	novelGene_78513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.0328687945364	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	501	869	631396	634316	FALSE	50	AAAATCAGTTTGAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERRHQGVSPYSLPWWHLWQGCVSSMASAFTRWPIPGLRMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621536	634631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621839_630851_631000_631345_631515_634066
899196	contig_8354_pilon	-	6559	13	Intergenic	novelGene_24113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.3471238589284	98	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	31	1458	307395	240640	TRUE	35	AATGAAGTAGGGGGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPEPKDQTLKMIKILSGEMAIELHLQFLIRNNNTDLMILKNTKDAVRNSVCHTATVIANSFMHCGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKFTATASLGVIHKGHEKEALQLMATYLPKDTSPGSAYQEGGGLYALGLIHANHGGDIIDYLLNQLKNASNDIVRHGGSLGLGLAAMGTARQDVYDLLKTNLYQDDAVTGEAAGLALGLVMLGSKNAQAIEDMVGYAQETQHEKILRGLAVGIALVMYGRMEEADALIESLCRDKDPILRRSGMYTVAMAYCGSGNNKAIRRLLHVAVSDVNDDVRRAAVESLGFILFRTPEQCPSVVSLLSESYNPHVRYGAAMALGICCAGTGNKEAINLLEPMTNDPVNYVRQGALISSALIMIQQTEITCPKVNQFRQLYSKVINDKHDDVMAKFGAILAQGILDAGGHNVTISLQSRTGHTHMPSVVGVLVFTQFWFWFPLSHFLSLAYTPTCVIGLNKDLKVCS	307425	234610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_235438_236365_240822_247565_247669_256652_256770_259837_259953_296384_296450_297453_297550_299402_299600_300179_300292_302295_302470_305548_305628_306065_306155_307296
899197	contig_11855_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_67127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	424	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	901	1248	2654108	2653761	NA	15	GGAGGAAGCGCCTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERHCVSPSKRDIILQDGKNQESSDPRVWEWGGCSSSDLLGSKQLGPCSSRIRGQGTYTGAPRARASGKQNNQHTSPQGQLLRNRWKTEIAIPRGNVPKWFMGISGRELGMGGCL	2655008	2652294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2652300_2655000
899198	contig_15021_pilon	-	1534	12	Intergenic	novelGene_26980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1	390	346323	340146	TRUE	20	TGCATGATCTCGCCCACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDQVLVLVLGRGEYDAGAGAITHLADLAAALADEELVVLRLGANVNREALGLLLLGQVQELLLGLLHIRGRPPDDNRVASRTFHRKVDVDATALLHDGADQAALGANEGVVQLGWDGDLHLGNVGLRSF	346323	332769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_332892_333103_333313_333451_333559_334740_334802_335114_335195_336589_336729_338548_338653_338749_338865_339780_339867_340024_340156_343841_344064_346165
899199	contig_11816_pilon	+	2558	6	Intergenic	novelGene_98563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	342	752	1219970	1220380	TRUE	40	AAGGTCTAACATAGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWCFLRKLETDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRTDICIPMFMASLFTTAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMENYATTKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQPQKDKYCMRPILEIPMKKFTHKM	1206845	1488184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1206853_1219635_1220511_1305798_1307222_1433495_1433529_1477758_1477928_1488133
899200	contig_10176_pilon	-	1739	10	Intergenic	novelGene_72728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1128	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	35	TGGAGGCAATTTTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
899201	contig_7066_pilon	+	1456	2	Intergenic	novelGene_42154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGTAAAGGAAGACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748973	754685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_749221_753476
899202	contig_16685_pilon	-	3156	2	Intergenic	novelGene_115062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2275	2625	614112	613762	FALSE	25	CAGAGACGTCTACGCCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLLYPIKVAGSRVVREVEPQRTYRFLGGGGGRSVPSPQGAIACSQLQPSGRNEPTEKLAPNQQLLKQAGKRRKELGKQLHPVAGPNLGLRRGSEFGVPGILRGGGCRELGRAWR	620661	613230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_615000_619274
899203	contig_19692_pilon	-	3123	1	Intergenic	novelGene_174884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	446	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCAGACCGCATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58470	55347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_-_55300_58500
899204	contig_4486_pilon	-	2639	1	Intergenic	novelGene_38530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCCCCAGTCGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122953	120314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_120300_123000
899205	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	580	12	-25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	188	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	45	AATTTACACATATGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899206	contig_8898_pilon	-	1197	2	Intergenic	novelGene_137263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	240	578	385031	384693	TRUE	55	TTCAAATTCCTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLFWKMIWRFLKKLEIDIPYDPAIPLLGIYPREIRAVTRIDICTPKFIAALFTIPKGWKQLRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAAIKNNDESVKHLTAWMNLEGIMLSEIS	385270	357833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_357921_384160
899207	contig_5419_pilon	-	1548	2	Intergenic	novelGene_15510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTCCACAAAACAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245380	243501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_244447_244777
899208	contig_15775_pilon	+	1992	4	Intergenic	novelGene_148372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	233.51802214533	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAAGAACCTGTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1919	6259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_2770_4177_4641_4989_5140_5730
899209	contig_2444_pilon	+	3974	3	Intergenic	novelGene_83753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1228	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1052	1351	198496	198795	TRUE	20	CCCTCTCCTCAGGAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTKSSTARWYLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPDSDWRNAKSMAPGHPFSSVVKSLPRFTVQPGNGQPHKTKWD	197444	202865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_199229_199407_199592_200859
899210	SIRV3	+	449	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5860	-1	3801	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7804	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
899212	contig_14176_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_74861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCGCCAACAGTCCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456310	454588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_454600_456300
899213	contig_14326_pilon	-	2392	6	Intergenic	novelGene_120715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	71.034076329604	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	874	1251	443129	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	451593	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443659_443792_443932_444094_444332_451352
899214	contig_2940_pilon	-	1394	4	Intergenic	novelGene_81993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_3	77.5986826921408	336	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	592	1236	1145442	1139071	FALSE	15	TCCACTTGTAGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPSGGEQFYEDPDPGGKSQDAEARKQTDSEQKLSKMTHNALENINVIGQGLKHLFQHQRRRSSVSPHDVQQIQADPEPEMDLESQNACAEIDGVPTHPTALNRVLQQIRVPPKMKRGTSLHSRRGKPEAPKGSPQINRKSGQEMAAVMQSGRPRSSSTTDAPTSSAMMEIACAAAACLPGEEVTAERREASRDTWEPHTTKKAVLGAEHVLWT	1176877	1138912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1139152_1144878_1145570_1149295_1149351_1176468
899215	contig_2069_pilon	-	5650	9	Intergenic	novelGene_23203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.929677841395	15	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	23	1828	114391	97205	TRUE	15	CTCCAACCGCCATTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEEMNDGRRYILEKITEPFLVVSLDSEPGMCFEIPPRWLDLTVVEAEGQPSQPAGPPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIESSQVLGLEQQPLLPEPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPVKEDHDYEEIHEHLRKSI	114413	93125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_94253_94303_96017_96222_97261_97870_98025_102635_102921_103028_103694_109097_109509_111852_111994_114297
899216	contig_3584_pilon	+	3932	25	Intergenic	novelGene_108193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	98.9570613953345	15	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1128	3387	178	3564	544597	562364	FALSE	35	CAGGATTTGGAGATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSSEDASIHRLEGTDLDSQVGGLICKTRSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRREREEKDDGEDKKKSRISSYKDWEEGKDDQRDAEEEDSDQSGRSSRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDRKKEKSRDRDYDRRRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERNSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGTSRRSQWESPSPSPSCRDSERSHRPSTRDRDRSVRSKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREDGEEGIPFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAFTEDGKVDYRTEQKFADHMKKKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGSLGEEVIDGIPAVFQTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL	542189	562732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_542347_544576_544920_545967_546156_547084_547190_547731_547880_548039_548159_548320_548398_548846_549003_549589_549752_549880_549989_552777_552891_554444_554583_554968_555160_556373_556511_556602_556720_556936_557045_557457_557571_558259_558469_558570_558726_558981_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
899217	contig_13004_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_112678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTCTTCCATAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675167	673670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_673700_675200
899218	contig_14882_pilon	+	3581	4	Intergenic	novelGene_115002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	30.4302481094059	27	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	191	877	254553	264587	FALSE	55	ACCTAAAATTTGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKIWLPFPVLLLAAVPPLLLPGAASFTPSLDSDFTFTLPAGQKECFYQPMPLKASLEIEYQVLDGAGLDIDFHLASPDGKTLVLEQRKSDGVHTVETEVGDYMFCFDNTFSTISEKVIFFELILDNMGEQEQEQDWKKYITGTDMLDMKLEDILESINSIKSRLSKSGHIQTLLRAFEARDRNIQESNFDRVNFWSIVNLVVMVVVSAIQVYMLKSLFEDKRKSRT	254362	267291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_254742_257635_257734_261708_261890_264368
899219	contig_8760_pilon	-	1692	1	Intergenic	novelGene_175045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	325	483	107891	107733	NA	40	GTGAGTATAGAACTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPALLPSHGAPSPVPGCHCPDSPAQSAGVSLPGIALPGGSGLATAGSALQLRLGVSDLPCAAAPLHAGTLCPTPPPLPFSEPPPPPLRRPSSDPTPELQLTPAPLPPGMNTEQRRSAIPVTWGGLKALSSKAEHILSTTGVPLTPENLFLAMVSLVTIYS	108215	106523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8760_pilon_-_106500_108200
899220	contig_16122_pilon	-	2585	8	Intergenic	novelGene_134533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	13.4982992125917	172	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	168	1163	222318	219244	FALSE	20	AGCACCGAGGTGAGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFCSWQSEERSVLFAVASALVNCTNSYDYEEPDPKMVELAKYAKQHVPEQHPKDKPSFVRARVKKLLAAGVVSAMTCMVKTESPVLTNSCRELLSRVFLALVEEVADRGTVVAQGGGKALLPLALEGTDVGQIKAAQALAKLTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRQKILKEKAVPMIEGYMFEEHEMIRRAATECMCNLAMCKEVQDLFVAEGNDRLKLLVLYSGEDDELLQRAAAGGPGHAHLFAAVALQPHPTSDHPLAGDLAGTASEPQPGAAAPGRCGGAEHGRGLEGDRQHLNGE	222485	217821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219630_219716_219835_220669_220786_221002_221117_221575_221643_221827_221956_222156
899221	contig_13481_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_119368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	654	124	777	469406	470059	NA	40	GAAGCCAGCTCAGTTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGA	469282	470059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_469300_470100
899222	contig_3081_pilon	-	5625	8	Intergenic	novelGene_133971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	358.791565891817	902	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	3067	3693	1212236	1195826	FALSE	25	TTATTTTTGTTTGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKDSCESLKVLNEQLQSKEVELLQLRTEVETQQVMRNLNPPSANWEVEKLSCDLKIHGLEQELELMKKECSDLKIELQKSKQMDLSQEDNLKSRDLQRLSISSDNMQHAYWELKREMSNLHLVTQVQAQLLRKLKTPTAIKKACAPVGCVEDLGRDSTKLHLTNFTATYKRHPPLSPNGKASSHATSPFARRYKDFIRESNSPIMDR	1506422	1193893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1196023_1198423_1198543_1205462_1205522_1210434_1210584_1211662_1211763_1212233_1214727_1357635_1357974_1506184
899223	contig_3797_pilon	-	2575	1	Intergenic	novelGene_120096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTAAGAGATTACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379069	376494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_376500_379100
899224	contig_6375_pilon	+	5064	6	Intergenic	novelGene_72984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	223	junction_5	222.28324273323	583	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	621	1760	290307	291823	TRUE	15	TTTACTTCATCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLQEEFQCLNHRCVLWAQRCDGVDACGDGSDEAGCSSDSFLGPTPAPFPATPCNRTLEDFYGVFSSPGYSHLASGSHPQSCLWLLDPHDGRRLAVRFTALDLGYGDAVHVYDGAGPPETPRLLRSLTYFSNGKAVTVETLSGQAVVTYHTVAWSSGRGFNATYHVRGYCLPWDRPCSSGSGLGPGEGLVERCYSEAQRCDGSWDCADGTDEEDCPSCPPGHFPCGPASTPGTTACYLPGDRCNYQTFCADGADEKRCRHCQPGNFRCRDEKCVYETWVCDGQPDCADGSDEWDCSYALPRKVITAAVIGSLVCGLLLVIALGCTCKLYAIRTQEYSIFAPLSRMEAEIVQQQAPPLLRAAYCPGCHPTCRGLPYREPE	287642	295260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_287714_288127_288173_288683_288820_289938_291317_291693_291825_291957
899225	contig_18511_pilon	+	3294	6	Intergenic	novelGene_126889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	423.842706673124	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCCTTTTGTGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51425	62758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_52462_55272_55554_57005_57119_59151_59255_59753_59948_61191
899226	contig_12078_pilon	-	3925	1	Intergenic	novelGene_74113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCCTTTCAAATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401227	397302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_397300_401200
899227	contig_5718_pilon	+	2541	1	Intergenic	novelGene_110350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2047	2370	660787	661110	NA	35	TGCAAAGACTTGCAGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDGIHRNQIDYICGKSRWKSSVSSVRTRPEADFGANHQLLICKFKLKLKRIRASPREPNRTLSISHLNLETISRINLMHLPLMTEDQMRCGMTSRTSYMKKAKGH	658740	661281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_658700_661300
899228	contig_10197_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_115301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATCCCAGCAACTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309805	1307675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1307700_1309800
899229	contig_4857_pilon	-	2283	3	Intergenic	novelGene_48813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252414	1249330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1251159_1251517_1251570_1252011
899230	contig_1275_pilon	+	992	10	Intergenic	novelGene_108787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTATGAGCTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448463	471170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_448525_456870_456973_457653_457707_459283_459467_463447_463536_464409_464583_468120_468189_470084_470266_470593_470647_471140
899231	contig_11708_pilon	+	4778	15	Intergenic	novelGene_138962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.1206300291017	225	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243895	284040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_243932_244261_244394_244650_244829_247677_248356_249277_249413_250376_250540_250737_250953_252345_252444_253646_253769_255578_255803_255956_256156_266615_266680_275494_275913_281626_283167_283464
899233	contig_6550_pilon	+	3345	8	Intergenic	novelGene_110658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2099	2530	54951	55859	TRUE	20	AGCAGCTGGGAGAGCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVVRRVSDTTFSLATSRSGVLRASNSDSLFFFLGGGAGRDGGGGLGGGTLVGGGGRAGTGFFVLATISGSGVSCLGGLAGATSSIAVKSLADEEFEDAGSRTSLRLTSVASLFTTSPSVSGTLSCSVELTSVNVVVSSAGFS	49602	97811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_+_51383_52419_52556_53691_53788_54864_54999_55475_56111_60069_60148_66156_66189_97357
899234	contig_7279_pilon	+	2691	8	Intergenic	novelGene_145988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	301	junction_1	283.494232025692	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1836	2495	84052	99452	FALSE	35	TAGATTATGTCATAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	77608	99648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
899235	contig_18843_pilon	+	2809	10	Intergenic	novelGene_165614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_9	623.624491318966	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	11	1003	28527	46092	FALSE	25	TTAAGCTCTGATCTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTKNFRVSDGDWICPDKKCGNVNFARRTSCNRCGREKTTEAKMMKAGGTEIGKTLAEKSRGLFSANDWQCKTCSNVNWARRSECNMCNTPKYAKLEERTGYGGGFNERENVEYIEREESDGEYDEFGRKKKKYRGKAVGPASILKEVEDKESEGEEEDEDEDLSKYKLDEDEDEDDADLSKYNLDASEEEDSNKKKSNRRSRSKSRSSHSRSSSRSSSPSSSRSRSRSRSRSSSSSQSRSRSSSREHSRSRGSKSRSSSRSHRGSSSPRKRSYSSSSSSPERNRKRSRSRSSSSGDRKKRRTRSRSPERHHRSSSGSSHSGSRSSSKKK	28516	47898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_28583_31085_31139_31230_31340_32865_32949_36859_36937_37162_37298_38395_38566_40037_40125_44191_44351_46028
899236	contig_20951_pilon	-	962	3	Intergenic	novelGene_43092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5302	junction_2	2993	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	90	659	29171	28479	FALSE	5	GCTGTGCTGTCCCTGTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQVSGQMGSRVASATLSYLSQPRPFSLVLLSAVLLGVSSLISVFCGTLQVLFAFPQMQSLSGVCLSDQVF	30023	28175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_28926_29048_29178_29940
899237	contig_20951_pilon	-	2650	15	Intergenic	novelGene_43111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_14	88.0468335487381	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	499	2649	244576	155040	FALSE	25	TAATGTTCAGAGGGGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGNSNEEVIHLNNFHCHRGQDWISLRDGTITISDSSDEEGIPMLVTPVPQQHEEEDLDDVILTETNKPQTSRPNLIKPAAQWQDLKRLGEERPKKSRAAFESDKNSYFSVCNNPLFNSAAQDDSEDDYSEFLDLGPPGISEFSKPSGQRGREPQPGPSHSQATNDIVNPGSEKKIILEDSNLLYSESDTLNQLSEDSEIELGESAAIVDDQAIEEDCWLDHPYFQPLNQETRERTSQVVPQEQRPEAELGPLLYQHEPPGPAFPRPVFPRPEPQQDGIPGPSSPQPAHPLGELEDQQLAIDDDEPGPAFPLQGSQEPNLENIWGQGATAVDQELIALLVKETEARFPDVANGYIEEIIRLKNYYDLNVLCNFLLENPDYPKREDRVIINPSSSLLASQDETKLPKIDFFDYFKLTPLDQRCFIQAADLLMADFKMLSSQDIKWALHELKGHYAITRKAFSDAIKKWQELSPETSGKRKKRKEMNQYSYIDFKFEQGNIKIEKRMFFLENKRRHCRSYDRRALLPAVQQEQEFYEQKIKEMAEHEDFLLALQMNEEQYQKDGQLIECRCCYGEFPFEELTQCADAHLFCKECLIRYAQEAVFGSGKSELSCMEGSCTCSFPTSELEKVLPQTILYKYYERKAEEEVAAAYADELVRCPSCSFPALLDSDVKRFSCPNPRCRKETCRKCQGLWKEHNGLTCEELAEKDDIKYRTSM	268891	155038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_155142_208039_208119_209206_209356_210309_210448_212025_212077_212792_212933_218280_218396_227946_228112_229223_229327_234046_234124_235970_236805_237770_237902_244509_244646_247820_248138_268779
899238	contig_8581_pilon	+	2759	1	Intergenic	novelGene_22850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2060	2443	335161	335544	NA	35	GTACTGGAGAAGACAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEKPGNPWVAQMVKHSTTNQTQPEAPQKKGLTICFQKITALKALWSSSTLHTWCHYESALTRQQLVWFFLRPSVMFFSMNDERYLLEILEAHSEDSNFKTGQKTPSLNQSKPQKRALGQFCPILVS	333101	335860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_333100_335900
899239	contig_18274_pilon	+	1339	2	Intergenic	novelGene_164037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	23	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	350	685	50313	50648	TRUE	35	GAAAGTCTGTTTAAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGFKWSVSGNGDGHAAAEMRQKKTSLRPRKLGARAETTGSGDATLGIFALRLAQAYPADVPQVSRKCGCGLGAEKGQGSGLGFFLLHSSFHTPEAASSRHGPDAPWPDV	49963	57700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_+_50886_57283
899240	contig_14577_pilon	+	2847	1	Intergenic	novelGene_164631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTGTCTGGAAACACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47986	50833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_48000_50800
899241	contig_13021_pilon	-	3400	2	Intergenic	novelGene_8263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1060	1485	227342	226917	FALSE	55	GGAAATAATAAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISKHIKRQSMMASASSQNKKSRNFPEEENFLELSEAEYESLIYKTLHEIRKEINQNAEHAIEKIKKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKISNKTSEADISTESHRSRIEAMEVRISEIEDKALHTNLFEEKSDKRI	229932	225001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_228118_229648
899242	contig_3866_pilon	-	3068	4	Intergenic	novelGene_112435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_3	52.7825728815866	6	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	21	359	268685	253743	FALSE	40	TGGGTATGTTTAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLRVS	268705	251033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_253854_257352_257477_265864_265948_268664
899243	contig_16625_pilon	-	4698	1	Intergenic	novelGene_171119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	596	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTAAGCACTGGGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82515	77817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_77800_82500
899244	contig_18162_pilon	+	2707	3	Intergenic	novelGene_122325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1624	2427	9935	10738	TRUE	25	CTTGAATCACACAGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	8110	16573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_9694_9894_10810_16364
899245	contig_11316_pilon	+	1139	2	Intergenic	novelGene_122628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAATCTCAATGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137408	138784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137807_138043
899246	contig_15350_pilon	-	3626	25	Intergenic	novelGene_164253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_5	109.483985383962	684	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1005	3018	58	3075	278296	228098	FALSE	25	TTCCGTTTTTAGAATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYDYHQSWSRDGCPRNSGGGFGGSRGGGYGGSRGFGGGGGGGRGGRGRHPGHLKGRQIGLWYARLQEQKNKEAERQERAVVHMDEHREEQIVQLLNSVQAKNDKDSEAQISWFAPEDHGYGTEVPAENRPSTEKKLEGQEKKLINQEKRTFRSRDKSYTDRDSEYLLQENEPDVTLDQQLLEDLQRKKTDPRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIANHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDDYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAEACGGGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPHLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVFMTIIKDLLTSRPDLKVVLMSATLNAEKFSEYFGDCPIIHIPGFTFPVVEYLLEDIIEKIRYVPEQKEYRSPFKRGFMQGHVNRQEKEAKEAIYEERWAGYVRELRRRYSARTVNVLQMMDDDKVDLNLIAALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISSLHDLLMSQVMFQSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKKTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILKLGGIAYFLGRLMDPPSSEAVWLSIKHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDSRSDHLTVVNAFKGWEEARQRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRDPQDPESNVNSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRPNLGKKRKMVKVYTKSDGLVSIHPKSVNVEQTDFRYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDDDQETIAVDEWIIFQSPARIAHLVKELRRELDVLLQEKIESPCPVDWKDTACRDCAVLSAIIDLIKTQEKAMPRKFPPRCRDECFS	278353	227546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_228284_228673_228827_229742_229864_232380_232472_232568_232669_235431_235516_236555_236643_236776_236951_239982_240082_240778_240897_247254_247399_248390_248456_250251_250308_253845_253934_254316_254420_254716_254858_258848_258931_261470_261638_261789_261865_262586_262667_265019_265191_266575_266615_269699_269935_270557_270683_278062
899247	contig_9146_pilon	+	3753	11	Intergenic	novelGene_79504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGGGAGGAAGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262277	359519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_+_264629_265841_265993_272236_272370_274743_274826_275937_276085_279327_279472_284519_284668_289798_289873_315718_315828_338451_338752_359405
899248	contig_6477_pilon	+	3481	5	Intergenic	novelGene_154150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATATATACATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482393	805222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_483030_483784_484466_650244_651231_716530_716795_804308
899249	contig_6123_pilon	-	4000	6	Intergenic	novelGene_177639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	986	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCATACCAAATATGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493117	338054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6123_pilon_-_338673_338837_339956_345371_345516_387821_388201_489934_490504_491945
899250	contig_14923_pilon	-	2033	7	Intergenic	novelGene_157748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	168.398997093873	21	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	712	1617	355520	354615	FALSE	20	TGCTATTTTTACGTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHIMPPQQHYAPPPPPPPPISHPMPHPPQAAGTPHLVYSQAPPPPMTSAPPPITPPPGHIIAQMPPYMNHPPPGPPPPQHGGPPVSAPPPHHYNPNSLPQFTEDQGTLSPPFTQPGGMSPGIWPAPRGPPPPPRMQGPPSQTPLPGPHHPDQTRYRPYYQ	369811	354198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_355651_357035_357174_358242_358317_360540_360625_361005_361107_364574_364743_369795
899251	contig_8954_pilon	+	2256	19	Intergenic	novelGene_130251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_12	332.014246496356	60	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	137	2245	49668	185921	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGARLAIPGIDGGALTDTSLTDSYFSTSFIGVNGFGSPVETKYPLMQRMTNSSSSPSLLNDSAKPYAGHDALTSPASSLFNDFGALNISQRRKPRKYRLEERLVPMGSKARKAKNPIGCLADRCKSGVPINMVWWNRVTENNLQTPNPTASEFIPKGGSTSRLSNVSQSNMSAFSQVFSHPSMGSPATAGLAPGLSLSAGSSPLHSPKITPHTSPAPRRRSHTPNPASYMVPSSASTPVNNPVSQTPSSGQVIQKETVGGTTYFYTDTTPAPVTGMVFPNYHIYPPTAPHVAYMQPKANAPSFFMADELRQELINRHLITMAQIDQADMPAVPTEVDSYHSLFPLEPLPPPNRIQKSSNFGYITSCYKAVNSKDDLPYCLRRIHGFRLVNTKCMVLVDMWKKIQHSNIVTLREVFTTKAFAEPSLVFAYDFHAGGETMMSRHFNDPNADAYFTKRKWGQHDGPLPRQHAGLLPESLIWAYIVQLSSALRTIHTAGLACRVMDPTKILITGKTRLRVNCVGVFDVLTFDNSQNNNPLALMAQYQQADLISLGKVVLALACNSLAGIQRENLQKAMELVTINYSSDLKNLILYLLTDQNRMRSVNDIMPMIGARFYTQLDAAQMRNDVIEEDLAKEVQNGRLFRLLAKLGTINERPEFQKDPTWSETGDRYLLKLFRDHLFHQVTEAGAPWIDLSHIISCLNKLDAGVPEKISLISRDEKSVLVVTYSDLKRCFENTFQELIAAANGQL	10472	185932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_10493_49551_49674_51999_52067_53962_54034_66240_66394_102198_102347_144169_144418_147202_147308_148186_148245_159262_159425_159661_159779_159873_159976_163399_163566_164944_165036_169411_169552_173747_173878_174335_174401_182928_183068_185780
899252	contig_9981_pilon	-	6927	1	Intergenic	novelGene_121049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTGTGAATGTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256376	249449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_249400_256400
899253	contig_4125_pilon	-	5412	11	Intergenic	novelGene_25261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2744480975276	199	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	108	773	3086875	3075243	TRUE	15	AAGGCCCGGCCGACCCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRKLTDGVRSSARLRSRGCPAAELASAQEVDVPKSSKALCLTSSSHKSTDKRTSKKFKYDKDNLVKSELQKLIPKSAGASLPKIAPKTPCANEPLELGGHHAEPPGNEAGASAQQEGEGPLLGHCGILKDGCPTQTDDGLSLPKHSAASEAEVSNSSSTARDESALEAEGAQKPPLQMDSSVFLDDDSNQPMPVSRFFGNVELMQVSAGFTKLKVHHFM	3086982	3051035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3051244_3054247_3054378_3058550_3058739_3059284_3059364_3061732_3061902_3063926_3064032_3069428_3073121_3075174_3075288_3079097_3079590_3080429_3080544_3086860
899254	contig_11855_pilon	+	3232	5	Intergenic	novelGene_67110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	190.411889072085	446	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	655	1404	2445507	2446256	TRUE	20	GGGGTGGAGGCAGGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440119	2448449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440421_2441556_2441665_2443329_2443442_2445373_2447992_2448356
899255	contig_14953_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_137291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACCAGATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315472	313478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_313500_315500
899256	contig_9571_pilon	-	4733	1	Intergenic	novelGene_136261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTATGCTCAGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379317	374584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_374600_379300
899257	contig_5643_pilon	+	4247	16	Intergenic	novelGene_39054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	702.997910539016	20	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	2557	4035	634785	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPALGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631213	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_633321_633956_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
899258	contig_14970_pilon	+	2487	13	Intergenic	novelGene_44951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	6522.74395864195	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	133	1794	136145	231550	FALSE	15	CACCTTAACTCTTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATTQVIPSITTEETATKKEQWFGNGGPGEHPQIPEEDSHSTTGTTVTTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_206161_206291_207681_207823_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
899259	scaffold_19766_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_34347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	822	1178	603005	603361	NA	85	AAAGGAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVRLWDTETLIHCWWDCKMVQPLWKMVWCFLNKLEIEIPYDPAIPLLGIYPRDIRAVTRIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPKCPPTDKWINKSWYIHTMEHYAMVKNNDESVKHLKT	602183	604657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_602200_604700
899260	contig_3818_pilon	-	2804	4	Intergenic	novelGene_99313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_3	101.226917807908	240	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTACAAAGCACTGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116984	1097631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1099428_1103682_1103806_1106298_1106467_1116267
899261	contig_6513_pilon	+	2354	11	Intergenic	novelGene_117740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_9	407.172248563185	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1872	482	2353	136370	203566	FALSE	35	GTAATTCATCAGTGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNTRIAEEVNCLLSCRDDNLVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDVPVLLQAVLARSPNVFREKSLQNRYVQSGMMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHSSSYPTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSDDYLHMVHRLSSDDGDSSAMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSDGTPKGSRPPLILQSQPLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKDQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRIRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSIATKQPQTSVVQNQQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSE	48452	203567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290_136434_148509_148676_151555_151684_152058_152159_152690_152843_158569_158728_159728_159826_163882_164510_198973_199157_203369
899262	contig_3529_pilon	+	2000	11	Intergenic	novelGene_105406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	99.0260571768865	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	510	1067	792703	809557	FALSE	20	GAAAGATGTGTGTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790556	810490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_791387_791493_792023_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
899263	contig_1575_pilon	+	2026	17	Intergenic	novelGene_45155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_1	314.644938780207	1137	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1671	355	2025	40257	190544	FALSE	30	GTAATGCCATTTCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLLPQSRFACLKKYPLHAIRKYLSTLRNQRAEEQVARFQKLPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVTSILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWRKYISQFKNPLIMLLLASAVISVIMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLR	39902	190545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167818_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_183574_183665_185018_185124_190388
899264	contig_7887_pilon	+	2414	8	Intergenic	novelGene_124939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	29.6351969448354	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	180	1853	680585	866731	FALSE	60	AAAATATATATGGACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAILHPSSRQGSQLNLNDHLLGHSPSSTATSGPGGGSRHRQASPLVHRRDSNPFTEIAMSSCKYSGGVMKPLSRLSASRRNLIEAEPEGQPLQLFSPSNPPEIIISSREDNHAHQTLLHHPNATHNHQHAGTAASSTTFPKANKRKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGLYSKDSMFSLALKCLISLSTIILLGLIIAYHTREVQLFVIDNGADDWRIAMTYERILYISLEMLVCAIHPIPGEYKFFWNARLAFSYAPSRTEADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRVCERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPHTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDTQLTKRIKNAAANVLRETWLIYKHTKLLKKIDHAKVRKHQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLSKMQNVMYDLITELNDRSEDLEKQIGSLESKLEHLTASFNSLPLLIADTLRQQQQQLLAAILEARGVSVAVGTTHAPISDSPIGVSSTSFPTPYTSSSSC	680405	867292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_680996_736823_736920_795640_796060_836782_836925_844030_844142_855408_855537_856970_857041_866434
899265	contig_11978_pilon	+	747	2	Intergenic	novelGene_63142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	0	112	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTTTTAACAGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2009325	2013964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2009498_2013389
899266	contig_16999_pilon	+	3301	22	Intergenic	novelGene_85000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	146.084869564395	644	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	1444	2982	212239	236848	FALSE	30	TTTTAGTTATGCAGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVFHAIKSVKIYRGALWILGEYCSTKEDIQSVMTEVRRSLGEIPIVESEIKKEAGELKPEEEITVGPVQKLVTEMGTYATQSALSSSRPTKKEEDRPPLRGFLLDGDFFVAASLATTLTKVALRYVALVQEKKKQNSFVAEAMLLMATILHLGKSSLPKKPITDDDVDRISLCLKVLSECSPLMNDIFNKECRQSLSHMLSAKLEEEKLSQKKESEKRNVTVQPDDPISFMQLTAKNEMNCKEDQFQLSLLAAMGNTQRKEAADPLASKLNKVTQLTGFSDPVYAEAYVHVNQYDIVLDVLVVNQTSDTLQNCTLELATLGDLKLVEKPSPLTLAPHDFANIKANVKVASTENGIIFGNIVYDVSGAASDRNCVVLSDIHIDIMDYIQPATCTDAEFRQMWAEFEWENKVTVNTNIIDLNEYLQHILKSTNMKCLTPEKALSGYCGFMAANLYARSIFGEDALANVSIEKPIHQGPEAPVTGHIRIRAKSQGMALSLGDKINLSQKKTSI	194811	237167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_194914_195596_195747_199226_199457_199865_200036_201658_201774_202990_203084_204894_205033_209995_210116_211343_211452_211528_211635_212127_212274_213398_213496_219640_219802_220701_220823_224062_224291_224437_224618_229831_229977_230975_231096_234388_234535_235151_235242_236153_236310_236788
899267	contig_16204_pilon	+	1678	10	Intergenic	novelGene_154515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	475.674284244332	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	692	1282	393020	396848	FALSE	20	CTGAGGACTATAGCGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNTTARATQRIEPSSCLPVHLLPPFPAQRPNPSRRLSVAVFSAIRRPSALAYWEYLSIATTRQLSGPRSRTAQPHTWITNTVSPPGIPTSRLIRLLKGPCTVLLPSLITLLTVTTICTGLRGCKRSGSRDRNSRARPISPENILHSPLGNDV	369282	397244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383946_387991_388298_392014_392241_392978_393105_393877_393932_394535_394691_394977_395098_395665_395758_396763
899268	contig_3081_pilon	+	1871	2	Intergenic	novelGene_133979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	1398	1871	1216063	1227437	FALSE	15	GATGTCGGGGGGGGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFMIQNADIIFHQCIHDSPEPGYVGLPVGLPSGPPSFDSPVFGNRSKSNRVARGHHGLPVSSKTPLLSQRWQPLRERQRGISIASASTAPGPARPGPASGIREVMEGAARLERRGRAAGGEGPLPSNARARPGPTAAGLVRACAGPQPRRLLRRRS	1214665	1227437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1216122_1227022
899270	contig_9051_pilon	-	793	2	Intergenic	novelGene_170807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	382	792	1039186	1038776	FALSE	15	GGAGGGAGGGCTGCAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPHLLSRWPAWLFSVAPGWWRKGHSHALVRTACAPGATLEQRRWPGGPQWVPGASPLTCRGCSSASKRPAEVMLTQERYPVRRLPFAAASEEDLAAFERILPGRVVTSPEELAAVNVDWLRTVRGKPGLQAPLVTL	1044439	1038774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1039337_1044208
899271	contig_4125_pilon	+	2778	2	Intergenic	novelGene_25149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	395	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAATAAGCTTTGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859816	898240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_861889_897534
899272	contig_2689_pilon	-	3443	12	Intergenic	novelGene_100817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.124178964272	659	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	163	1518	206682	153572	TRUE	25	GTATAGTGTGGCTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWEKTGSHSEPQARGDPGDQTKAEGSSTASSGSQVAEGKGSQIGTVQPIPCLLSMPTRNHMDITTPPLPPVAPEVLRVAEHRHKKGLMYPYIFHILTKGEIKIAVSIEDEANKDLPPAALLYRPVRQYVYGVLFSLAESRKKTERLAFRKNRLPPEFSPVIIKEWAAYKGKSPQTPELVEALAFREWTCPNLKRLWLGKAVEDKNRRMRAFLACMRSDTPAMLNPANVPTHLMVLCCVLRYMVQWPGMRILRRQELDAFLAQALSPKLYEPDQLQELKIENLDPRGIQLSALFMSGVDMALFANDACGQPIPWEHCCPWMYFDGKLFQSKLLKASREKTPLIDLCDGQAEQAAKVEKMRQSILEGLNFSRQNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVCGFGGPYGETVATGAYRAFRVAAAAGHSGAFSGNDNSRTSKLQGGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	209422	142594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_143896_143956_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135_157320_158472_158683_164367_164483_189343_189594_202969_203145_206550_206779_209356
899273	contig_7993_pilon	+	4871	2	Intergenic	novelGene_170963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	35	412	16712	33080	FALSE	60	TAGGAATAAATTTAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMSWVVFLVTETWI	16677	37539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_17050_33040
899274	contig_13481_pilon	+	2393	3	Intergenic	novelGene_119451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	23.5	214	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	240	629	1091943	1093268	FALSE	55	CAAACCAAAACCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066922	1095032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1091839_1092052_1092987
899275	contig_1861_pilon	+	3198	1	Intergenic	novelGene_77647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCTCAACAACAGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61187	64385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1861_pilon_+_61200_64400
899276	contig_3956_pilon	+	2546	10	Intergenic	novelGene_14978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1256.29456127588	181	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	81	2027	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVGPRCRRSGHSGGPSGGSAWACLRTCTLEVLGPPAPVQCAPCRSRSVPFQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283946_1286409_1286606_1287276_1287574_1287856_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
899277	contig_8386_pilon	-	3013	1	Intergenic	novelGene_82226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	521	835	57535	57221	NA	60	AAAAAAAAAAAGGTCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTRTLLAQIKKTENNTCWRGCGEIGTPMHCWWECKMVQPFWKMIWRFLKKPETEISHDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFTVALFTVAKR	58055	55042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_55000_58100
899278	contig_5794_pilon	-	2811	11	Intergenic	novelGene_69782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4603.97070364267	94	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	44	1162	749501	743712	TRUE	15	TGTGTTTTGTCACTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKPPPGRPQPDSGRRRRRRGEEEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGNYGGGNYNDFGNYSGQQQSNYGPMKGGGSFGGRSSGSPYGGGYGSGGGSGGYGSRRF	749544	739280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740913_743694_743765_743856_743980_745136_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747330_747439_749429
899279	contig_546_pilon	-	5038	10	Intergenic	novelGene_117182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2483	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCATGTGACACTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156561	61169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_61243_84737_84816_119793_119882_123931_124065_136648_136837_139865_140635_146630_146845_147555_147672_152818_154719_155082
899280	contig_8443_pilon	-	2652	1	Intergenic	novelGene_150622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1785	2423	842441	841803	NA	30	TACTTGGGTCGACAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIFSSFIILWKSSVSNSSVILSMFSIFSPYSGTPITCKFLLLIVSHIILSVSSFFFVLFSDFSSNKVVSKCLSSILLILSSIVSNLFLSLSMTLSISEILVFNFWISSCCFCMISNCECILAFYSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFSSVFSAFCFNSWLALNIRDLNSLSGSSSASSPTGKSSGVLFWMPTGNILSCFCKCIDIVCCLWDI	844225	841573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_841600_844200
899281	contig_10324_pilon	+	4404	10	Intergenic	novelGene_7823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	370.757482879457	503	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	2612	3625	252911	266158	FALSE	0	GCTGCTGTGTGGGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGGSKEYWFVLTAESLSWYKDEEEKEKKYMLPLDNLKIRDVEKGFMSNKHVFAIFNTEQRNVYKDLRQIELACDSQEDVDSWKASFLRAGVYPEKDQAENEDGAQENTFSMDPQLERQVETIRNLVDSYVAIINKSIRDLMPKTIMHLMINNTKAFIHHELLAYLYSSADQSSLMEESADQAQRRDDMLRMYHALKEALNIIGDISTSTVSTPMPPPVDDTWLQTTSSHSPTPQRRPVSSVHPPGRPPAVRGPTPGPPLIPIPVGAVGSFAAPPIPSRPGPQSVFANNDPFSAPPQIPSRPARIPPGIPPGVPSRRPPAAPSRPTIIRPAEPSLLD	239826	266937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_242268_244422_244494_247907_247960_252863_252983_258357_258468_260944_261057_261498_261664_263847_264081_265197_265450_266088
899282	contig_16882_pilon	+	1828	4	Intergenic	novelGene_148221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	26.5873821368124	187	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	81	620	236179	261108	FALSE	0	CTCTCGCTTTCGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEAWYMDESPDDQRKPHRLEPDCPVGLEQLRQLGVFYWKLDADKYENDPELEKIRRERNYSWMDIITICKDKLPNYEEKIKMFYEEHLHLDDEIRYILDGSGYFDVRDKEDKWIRIFMEKGDMITLPAGIYHRFTLDEKNYVKAMRLFVGEPVWTAYSRPADHFDARGQYMKFLAQTA	236098	262316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_236299_242556_242677_258258_258439_260988
899283	contig_6325_pilon	-	5424	4	Intergenic	novelGene_143357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1416	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4525	4836	388148	387837	FALSE	35	CAAGTTCCCACAAAGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQFSCNLREIVPTTTTLYTEQIIQEAGLYEKHGIRIEGRLINNLPYADDTTLLPENERGLEALTDEDQRLELSVWITPQHKENKNPHNWTNKQHHDNWRKD	483734	387248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_389891_390384_391406_481908_483463_483527
899284	contig_16776_pilon	+	5688	2	Intergenic	novelGene_130521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	777	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCACATCTTTCTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36016	44704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_36506_39505
899285	contig_11932_pilon	-	5079	1	Intergenic	novelGene_85428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1808	2227	467190	466771	NA	40	TCTGATAAAAACTCTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQGRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALKLPDREFKSLLLRILQELRQKAEKHEGKIDKFMENTHKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEITQRQQLEIQKINNKISEMDGVTEGLRSRFETVEDRISGIED	468997	463918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_463900_469000
899286	contig_8377_pilon	-	4203	18	Intergenic	novelGene_35069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.41176470588235	31	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACGCAATACATCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180510	120149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_122389_131417_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
899287	contig_17144_pilon	-	2153	12	Intergenic	novelGene_29306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1842.09839921669	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	119	1858	173640	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYPEEERRGETGRPGGCLAGSSSVNCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173685_183154
899288	contig_7695_pilon	-	2994	7	Intergenic	novelGene_41527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.0483888477412	494	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	431	865	380076	360143	TRUE	40	GAACCCTACAAAATGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLFIGNLPREATEQEIRSLFEQYGKVLECDIIKNYGFVHIEDKTAAEDAIRNLHHYKLHGVNINVEASKNKSKASTKLHVGNISPTCTNQELRAKFEEYGPVIECDIVKDYAFVHMERAEDAVEAIRGLDNTEFQAVQSFEL	397121	349776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_349820_350482_350899_356266_356943_358527_358756_359376_360166_379664_380089_396703
899289	contig_12119_pilon	+	13017	9	Intergenic	novelGene_88675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	531.807942306243	974	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2994	8985	3512	12496	355435	423789	TRUE	25	TTTAATTTATTGGATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLITALSVITTKFSSVENIVNFEQKGPVQSQTVTDKLATESATPSGSTKKPWDMDYLPSAAGPLEKPDMSEIKEDVPKSTTVISHHTTDSWDDVTEDTKTQESVTQIEQIEVGPFVTSVEISKHTPSKEFSATEIPFLSTRMTMESKTEKKTVSPISESVTTNLYGFTLGNDDGEDRTLTVRPGHSTFIFSQIPDVITVSKTSEDITHTQLEESESISASTLVTSVTMPDNDGSSMDDRQEKQTTGRTTEDSWDQHVSTTPFSPQHQTEVELFPFPGDKRLTEEIPTVIYSSLETEMAQGRERIVTQRPAMRTDTYTNDEIQAKITKDPFIGKTEEEFSGMEVSTASSEQIHPTESSVEITKSFESPALTTTKPSVQPTEERAREEEFATTPVGDQDTTKYDEGITTVHLTHSTLSVEVVTVSKWSWDEDNITSKPSESTDHEVSPKLPTVGGNGKDEEIPRFTEHGDEFTLIPDSTQKPLEEITEEYLTDRGKFTARFQPTTSISTAEKSTLRDSTTEEGVPSISRTESKVVYATTEGSALDEEVDVDISKPVSTVPQFTHTSDGEGLAFVNFSSTQQPTTYVDISHTIPLSIIPKKEWEVLVQFVPSEGELLGEPSQDIRVIDETHLEATISPEILRTTTEITQGTTQEEVPWKEQTAEQPVPAPSSTAEILKEATVSLDEQESDGSAYPIPEEKLVTGSERVPILETTPVGKIEHSVSYPPCPITEHKVKMDEMVTLTPSVGTKISLSPRPDQKYEAESSSSTEFESPLSPFSTHVTRLIEETTTEKREKTSLDYIDLGSGLFERPKVTEHSEFSTIKTTVPSDITTMFSSVDKFHTTSASVPSSTSTEKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSRFLPTTPDDIVAKETETEIDREYFTTASTSTQPTKPPTVESKEPFRPQAVSTPEPPLGTKFHSDINVYVIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSESKEEEPCSEETDPEHDLIAEILPELIEIDIYHSEEDEEEDEDCANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDQEAAEARRGQFESVAPSQKISDSSESDSHQFVIAETELSTVVQLNESKESESLEITWKPETYSETPEHFSSGEHGVFPTVQFHEGEATEGPDSVTERGLELDNLVPNDTESVPLFPEESSGNDAIDQESQKIVFSRPTEVTFSEEAEKSTSITYTPSIVPSSVSANVSEEESVTPTGHPQPEDAFSTIESWVEVTPRHVGELLGTPSSIPMPEGSGEGEEDKNKMFTVVADLSQRNTTNTQGTLDTSKIMITESLFDVPVTTSYSVSEQPSAEIVPIKLISETDTSEGVFSTSLEEKKRKDEEEETPGTASTIEKDSPTQRSDQLILPSELESSNETTFSDSASTTGKSITSLTTSTQSEREMTSFTLFTETNVLGNLGAQVTEHSTSHQAEVQKGLTTVPGSPVSLFTEQSSGDAAVHPETTTVSSFSLNLESDIQTKKEAASTLSSLVENTFPFDPTEFILSTAVDRQVAEIMSQTSKENLISEISGEPSHGAEIKGFPTDFPLEEDFSGEFREYLTVSPPITKEETKIMEGSGDTTFMDTETSPSAVPTSDHVTRMPDSERPSNTMVSTSAFPWEEFTASAEGSGEQLVSISSSVDQVLPSVMGKVSGTESPFTDQGLGEMGAITEADKRLTILPTAEAEGMESPTEKGDVMVGGTVSVDFPQTLEPATLWSSQEVNLVRQEIENKTTSEEKIKEQMSFESPQRSVTPEQTIFDSQMSSETELLTTDYSILTTKKTYSYANEMEEEVIPLLHMSTPDPDTKGLEGLEPYTAVPEVTEKSHVFLATGSVTESVPSESIVTDSSIKEEESIKPFPKDVTPTIKESDTDLLLSGLGSGEEVLPTLATVSVNFTEMEQIISTLHPQTSRVESLETRVSSDETEDYEGMENVTNEVIPLISKTASTPKSSQTTSSSTMMGISSDTRAEGPTVAPLSFPTDAEHPQNQTLSWAEELQTTRAQTVTEQVSNKNSSTAETKETVTSSGVLARTYGLEMAKGFVTSPPKPSELFYEHSGEGSGELGIVDLVHTSETTQATRQGSTTFVSNRFLEKHPEASSAKAVTDDGFPTVSVVLSLHSEQNESSPQPTSAPSTTMLYERSTEGATGSFSDSFRGFEDSTLKPDRRKATENIIIDLDKEDKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDIDHTKPVYEDILGMQTDTDPEVQAGPHGSNEESSQVQEEYGAAVNLSLTEEKLEGSGGDTLLASYTQATHSESMTSEDRSQLDHMGFIFTTGIPIPSTETELDISLPTAASLPIPSQSTTVNPDIEEPKTEAKTLDDIFESSTLSDGQAIADQSEIISTLGHLERTQEEYEEKKYVGPSFQPEFSSGAEEALIDHTPYVSIGTIHLMAQRLTEAPTVMEGSNPPGYTDTTLAPSAFAKLSSQTPSSLVTVYLGSRASEHTEDLEPSALPGTDVGATQVSSGDSAKEAYENTEATFKPSLEKYFHITEPPSLSPNTELELSEDESKPKSLKEMEASPSELIAEERFEVHQKSRNKTDVQLSGETIKEFLSVRTPEAGTVVTAAGEIKLEGASQWPHSTSAPAIHGVKTGVVPQPSPQTSEKPTIPSSLEINPETQAALIRGEYSTVTASEQQVSAIILDSNTQATVSTAELNTELATPSFSLLGPSNESDFLIGINEESVEGTAVYLPGADRCKMNPCLNGGTCYPTDTSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCIDGFNTFTCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQIFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSSGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWALPKITCMNRKWYFRKNGQPCYNNY	351923	425014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_358301_378604_383876_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556_424192_424895
899290	contig_5229_pilon	+	1691	4	Intergenic	novelGene_117689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	28.5345794120436	29	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	51	599	466703	468335	TRUE	30	TTAGATTGACTTAGTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFPPLLLATSLLGLVLLALLLYLWHRSQHWYLIIWNELVVQPVRNMLMGDSKEQRILRYVQQHAQSGDPQSVLNAIDTYCSQKEWAMNVGDEKGLIVDEVVRERNPMVLLELGAYCGYSAVRMARLLPHGSHLLTIELNPAFAAITQQMVDFAGLQDKVPYYPLTRRVTEMDAEARGWGR	455107	473431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_455158_466702_466989_468072_468725_472728
899291	contig_7179_pilon	+	2048	4	Intergenic	novelGene_78132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	446	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1571	1966	902383	933326	FALSE	30	CCGTAACCAGGGCCCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAFTCSEVGRQATWHRKHCFKGEFLPPSSVGPYRMDITNIVLLQHFSGIKGVAYIFKTFTCIYTSLFQQNLLSTRMLIEEAGDIVDSPVDHQPYFLRGVALRHLLQAVIGDGGLDPLPFPVAAASFHRSH	891806	933408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_893372_902377_902460_908386_908541_933161
899292	contig_3900_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_84201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCTGTCACTCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532778	534921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_532800_534900
899293	contig_8597_pilon	-	2853	11	Intergenic	novelGene_158693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	306	junction_1	522.419754603518	551	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	117	1355	41407	20340	FALSE	20	CTAATGACTCTGTGCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHIVSQLEEMNSMLTKDIELLKKENEELTENMRKTEEEYKLKKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANMQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLAEESTHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQEKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKEVEMEPVQQAEKANFQNHKGHEFIPTLYHFPANCEACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLISPCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSSFVRASPRTLSTRSAANQSFRKVVKNTSGKTSS	42653	18841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_20347_23011_23220_24270_24533_24693_24773_29196_29286_29492_29564_36373_36534_37783_37973_40966_41056_41322_41417_42546
899295	contig_4091_pilon	+	3089	4	Intergenic	novelGene_173037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2365	2664	62116	62415	TRUE	40	GATGATCTTGGCTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDAEQNSNTHKKNQVYWSERDWGDPETMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKQD	21642	154568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_22820_56156_56862_61633_62628_154355
899296	contig_20809_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_173788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTATAGCAAGCAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10235	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20809_pilon_+_10200_11300
899297	contig_13244_pilon	-	2293	5	Intergenic	novelGene_86928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCCTGCAGCCACGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254409	239745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_239822_245128_245347_247045_247121_250878_250933_252539
899298	contig_7359_pilon	-	1347	2	Intergenic	novelGene_139866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGATCTCTTCAGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346740	343323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_344521_346590
899299	contig_3747_pilon	+	1158	6	Intergenic	novelGene_24875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4644.22791861037	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	237	1007	201313	205055	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFEKRPLGPFPEHQKTQMFTAPLTVPLALGQSPSAIALCSLSCVIALNSTFFGEFYS	201076	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202904_204891
899300	contig_4857_pilon	+	2557	5	Intergenic	novelGene_48821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	65.9810578878514	86	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGTGGTAGCCGGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331354	1421684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1335236_1335517_1336704_1338523_1420478_1420510_1421453
899301	contig_3679_pilon	-	3910	21	Intergenic	novelGene_112122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.736027001093	2	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	969	1688	1053553	1049083	TRUE	45	TGTTTTACAAAAGTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQKLYEMVSYCQNISKCRRVLIARHFDEVWNSDACNKMCDNCCKDISFDRKNITEYCRDLIKILKQAEELNEKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVAPPVLPREDLEKLIAHFLLHQYLKEDYSFTAYATISYLKIGPKANLLNNEAHVITMQVKKPTQSCFRAESSQTCHSEQADRKRQEKKSGNFQKSANMLQQSDSKATGAKKRKLDDV	1069829	1028186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_-_1028268_1034955_1035085_1037194_1037271_1040377_1040537_1041246_1041348_1042777_1042916_1043846_1043963_1044587_1044708_1046977_1047116_1047918_1049233_1049819_1049950_1050295_1050516_1051622_1051715_1053425_1053565_1054286_1054436_1054670_1054756_1055506_1055589_1056364_1056532_1060849_1061049_1065296_1065404_1069661
899302	contig_804_pilon	-	2275	4	Intergenic	novelGene_138781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_3	496.840909033152	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	284	637	36578	33688	TRUE	15	TTCATGTGATTGATTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIVRVKRYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAKSKSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQCCTTCVVQ	36982	21924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_23523_33647_33967_36503_36665_36785
899303	contig_13571_pilon	+	2640	13	Intergenic	novelGene_128107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_7	101.794011775415	513	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	179	1354	88439	116333	FALSE	5	GTGTATGTTTCCTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKPCNHVLSLSFPIRRDDGSWEVIEGYRAQHSQHRTPCKGGIRYSTDVSVDEVKALASLMTYKCAVVDVPFGGAKAGVKINPKNYTDNELEKITRRFTMELAKKGFIGPGIDVPAPDMSTGEREMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGRISATGRGLFHGIENFINEASYMSVLGMTPGFGDKTFVVQGFGNVGLHSMRYLHRFGAKCVGVAESEGSIWNPDGIDPKELEDFKLQHGSIMGFPKAKPYEGSILEADCDILIPAASEKQLTKSNAPRVKAKIIAEGANGPTTPEADKIFLERNIMVIPDLYLNAGGVTVSYFEWLKNLNHVSYGRLTFKYERDSNYHLLMSVQESLERKFGKHGGTIPIVPTAEFQDRISGASEKDIVHSGLAYTMERSARQIMRTAMKYNLGLDLRTAAYVNAIEKVFKVYNEAGVTFT	71979	117619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_72102_88382_88464_92165_92222_93420_93485_98158_98254_102369_102550_103316_103455_103655_103794_104488_104570_107836_107961_108769_108862_115192_115256_116213
899305	contig_9839_pilon	+	5605	4	Intergenic	novelGene_88536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	4877	5218	71354	72224	FALSE	55	ATAGAAGAAATCAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDGSLECGLYLLTKKTKIITTGPISNIRINREKIKVVKDLILLESTINTHGSSSHEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVSLTQAMVFSIISYAFESWTTNKED	66207	72611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_66841_67018_67988_68079_71478_72006
899306	contig_16303_pilon	-	2401	8	Intergenic	novelGene_34075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	727.191241724497	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	48	596	47976	37644	TRUE	30	CCCTGCAACCACATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFITPALMERLL	48023	33088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33653_34921_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37674_38712_38856_40433_40731_47897
899307	contig_12622_pilon	+	2298	7	Intergenic	novelGene_5880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	51.2889418447637	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1045	1800	1223766	1229143	FALSE	25	GAGTTGCCTGAAACCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGLHLSTSEKIFRFQDTGLLLRVLGSLFLGGILAFGLGFSEFLLVSRTSSLTLSIAGIFKEVCTLLLAAHLLGDQISLLNWLGFALCLSGISLHVGLKALHTRGDGGQKPLKGLGSSPDLELLLRSSQQDEEDNEEEQYFVAQGQQ	1221914	1229641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1222144_1222950_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227159_1227336_1228537_1228668_1229012
899308	contig_5686_pilon	+	1788	6	Intergenic	novelGene_45292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2135.40390558789	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	78	533	170242	176763	FALSE	55	TACATAAAACAATGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYLEAEELLVDEDDNIFDEARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVSDILLYFFASVF	93843	178018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170224_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667
899309	contig_2033_pilon	-	4823	3	Intergenic	novelGene_71546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	2095	2712	305947	305330	TRUE	35	CGAGACTAATGAGGCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPIGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQEFKQKADKNEEKIDKFMEKADKCMESTDKKMEEFKKILQEQNAKINSQLENIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISKTEDKYLYTALFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVVGVPEQGEKTENTDRIIEALLT	308817	302977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_305043_305283_307355_308130
899310	contig_17618_pilon	-	2653	6	Intergenic	novelGene_173351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	76.203936906173	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	238	879	51441	21176	FALSE	20	ACAGTTTTTTTATATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFKNRFQRFMNHRAPANGRYKPTCYEHAANCYTHAFLIVPAIIGSALLHRLSDDCWEKITAWIYGMGLCALFIVSTVFHIVAWKKSHLRLNLRELGPLASHMRWFIWLMAAGGTIYVFLYHEKYKVVELFFYLTMGFSPALVVTSMNNTDGLHELACGGLIYCLGVVFFKSDGIIPFAHAIWHLFVATAAAVHYYAIWKYLYRSPTDFMRHL	51678	19401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_21377_30667_30738_32593_32696_38040_38202_42793_42876_51415
899311	contig_16098_pilon	-	1731	13	Intergenic	novelGene_45922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1578.77845492084	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	131	1657	352350	342471	FALSE	15	AAGGGTACCGTCTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDEEGPLCCPHPGCPLRAHVICLAEEFLQEEPGQLLPLEGQCPGCKNSLLWGDLIWLRQTGTEEDEEDSELEEEHWTDMLEN	354119	342396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_342501_342582_342671_342825_342954_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
899312	contig_160_pilon	-	5050	20	Intergenic	novelGene_156310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_18	127.944434788512	646	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	316	2619	50675	13989	FALSE	15	GGACTGTATTTTGCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYRKDENSINGMPNITVEIREHIQLSESKIVKQAGVTKKGPNEYIQEIEFENLSPGSIIVFRVSLDPHAQVAVGILRNHLIQFSSHFKAGSFAVDSSDPILKIPFASIASKLTLAELNQILYRCESEEQEDGGGCYDIPKWSSLKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCDNLRSGDWMIDYVSNRLISRSGTIAEVGKWFQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDIAWKQMSSFVQNGSTFVKHLSLGSVQLCGVGKFPSLPLLSPSLTDVPYRLNEITKEKEQCCASLAAGLPHFSSGLFRCWGRDTFIALRGLLLVTGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPNGTDILKCPVSRMYPKDDSLPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQRHLQGIEFRERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGVNDETGFVYGGNHLNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSTVHWLLELSKKKIFPYHEVTVKRHGKVVRVSYDEWNRKIQDHFEKLFYVSEDPSDPNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTAEKAWKALEIAEKKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGVYDNALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSKLMGPESYAKTVFLVKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENGQYCPFSCETQAWSIAAVLETLYDL	51207	11557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_14107_17841_17976_18083_18172_20272_20371_21590_21803_22887_23001_24095_24232_32876_32989_34621_34848_35771_35875_38306_38483_39184_39319_39566_39704_42870_43002_46261_46397_46513_46627_46710_46836_50662_50814_50914_51070_51185
899313	contig_11281_pilon	+	2654	10	Intergenic	novelGene_125423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	279.846827592489	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	436	1380	126667	237909	FALSE	20	GTTTAACTTGGCACTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDASLIEANGELKVFIDQNLSPGKGVVSLVAVHPSTVNTLGKQLLPKTFGQSNVNIAQQVAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEVERQRRLERIKQKQSQLQELILQQIAFKNLVQRNRQAEQQANRPPPSNSVIHLPFIIVNTSKKTVIDCSISNDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGSISGVFVTSSGSTSNGTRLSASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETPVSYVGEDDDDDDDFNENDDED	124063	239183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_124435_126602_126679_178695_178763_215057_215165_227028_227173_228437_228507_230872_231025_231738_231906_233428_233508_237761
899314	contig_6079_pilon	-	2052	2	Intergenic	novelGene_160076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGAAGTTAGAGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441049	394879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_395088_439205
899315	contig_6327_pilon	-	3313	1	Intergenic	novelGene_147494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTCATGGTTAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80686	77373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_77400_80700
899316	contig_7078_pilon	-	3995	1	Intergenic	novelGene_130216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAACTAAGTCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964814	960819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_960800_964800
899317	contig_1263_pilon	-	5135	7	Intergenic	novelGene_170389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	922.453612203165	26	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	1488	2504	64087	55502	TRUE	55	AAAACTGCAAATTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	76815	51682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53551_54738_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_65324_76564
899318	contig_16532_pilon	-	2761	3	Intergenic	novelGene_110061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1131	1630	2760	582739	581609	FALSE	15	TCTTCCCCAGCCCCCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLVGDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKDQLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQFKDLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGSSHMAGDLPSDEDEGEDEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAEPHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSSYFSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKGSVSTNNRVQYEPAHLASMREDSVLRELDREDKASDDEMMTPENERVQVEGNMDSSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNK	603409	581607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_584106_599573_599815_603387
899319	contig_10973_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_150391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	118	630	2730	2218	NA	25	TAACGCCCCCGAGTAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2847	1629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1600_2800
899320	contig_11898_pilon	+	2486	1	Intergenic	novelGene_144294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCCAAATCTCTCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243990	246476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_244000_246500
899321	contig_8330_pilon	-	1642	7	Intergenic	novelGene_71923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	562.70263016979	12	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	42	971	1295188	1284042	TRUE	35	GGAATAACTTCTCAGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVEVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYEDSLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLSENNNGATGGQLNTQTSRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQDKVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDYVERYMNSDTTSLELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDSLDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEHVPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP	1295229	1282974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1283267_1283662_1284273_1286210_1286419_1286966_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059
899322	contig_20614_pilon	-	1998	2	Intergenic	novelGene_107529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	0	30	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	888	1217	68041	67446	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVGVAHSEVNPNTRVMNSRGIWLAYIILVGLLHVVLLSIPFFSIPVVWTLTNVIHNLAMYVFLHTVKGTPFETPDQGKARLLTHWEQMDYGLQFTSSRKFLSISPIVL	68928	66664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_67602_67867
899323	contig_1443_pilon	-	4050	5	Intergenic	novelGene_28146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.9136007032304	167	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAATAGTTTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343416	138664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_138686_276432_276448_323392_327123_331883_331945_343193
899324	contig_9931_pilon	+	5544	1	Intergenic	novelGene_134827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	743	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTTCTGAATTGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312871	318415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_312900_318400
899325	contig_4900_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_159062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAAGAATCCATGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181374	1179980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1180000_1181400
899326	contig_11338_pilon	-	3199	2	Intergenic	novelGene_6283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	286	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	278	382	187406	187302	TRUE	40	CTCATCACTGGACAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSIPFTVAPKKIKYLGLNLTRDVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPMAFFNEMEKQITNFI	187683	184293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_186764_186954
899327	contig_10734_pilon	-	7078	6	Intergenic	novelGene_51195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1266	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCTTTCAACTGTACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140849	1123750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1123794_1127586_1127724_1128558_1128585_1131099_1131279_1132607_1132783_1134331
899328	contig_9242_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_155065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAAGAATGTAATCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429658	428324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_428300_429700
899329	contig_9609_pilon	-	3073	19	Intergenic	novelGene_22936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	22.0208234783958	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	887	2248	78975	76356	TRUE	35	TAAGTGGAGAGGATGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALECLPEDGEPLPSPEDCAPRGCRYDGQIAVFGAGFQEKLSCQHYFLVGAGAIGCELLKGFALMGLGASDSGSITVADMDHIERSNLSRQFLFRPQDIGSPKAKVAAEAASRLNQGLRVTPLTHPLDHTTEHIYGDSFFSRVDGVAAALDSFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTQGTRGSAAVFMPHVTEPYRAPASAATSEDAPNPVCTVRFFPSTVEHTLEWAKNEFEGLFRLSAETINRHQQASTSLADMDGPQVLTLLQPVLGVLRVRPQTWQDCVAWARGHWQLCFHDSIIQLLRCFPPEKVLEDGTPFWSGRKQCPQPLEFDANQDMHLLYVLAAANLYGQMHGLPGSKDQTALRGLLKLLPLPSSQHLAPIFASDLELAQASTKFGWGPSSGPSAGPFPSTLSTLSSLGRFSANK	80296	72839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_73060_73491_73593_73672_73766_75368_75561_75654_75748_76026_76110_76312_76448_76589_76774_77020_77096_77180_77365_77454_77520_77616_77823_77902_78069_78149_78306_78385_78467_78623_78732_78930_79102_79453_79601_79683
899330	contig_19032_pilon	+	2997	3	Intergenic	novelGene_172527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	79	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACCAGTCGGCAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144405	148299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_146727_146810_146875_147687
899331	contig_6375_pilon	-	2156	10	Intergenic	novelGene_72963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_9	159.765878091879	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	213	1748	229189	202748	FALSE	25	GATATGTTCCTAAGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234093	202339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_233928
899332	contig_12277_pilon	+	5379	11	Intergenic	novelGene_139715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_8	112.804077940472	540	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	370	2940	405824	421208	FALSE	30	AGGAGCATCAGCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHQSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACAADSRSSGSKLSTRNSSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNASGAESLVIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHTVDRDQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCLSPSTPVDDSCAPYPAPGTSPDDSPLSRLPKTRSFDNLTTACDNTVPLASRRSSDPSLNEKWQEQRRSLELSSLAGPGEESLDADSLGKPAKVLGGAELSVAAGVAEGQMENILQEASKEESGVEEPAHRGDIEMQEVKEEALLEKESRSKMPEGSAVVVYKESELDDAALRSHPGTNLSVFSQGIPEQQGVHSVLPSPLQEPCRGEGSQEIPVEQPQIGDIPEDREETVLPVSVDAKVGCGTSQSRSLLPLQVPLEARGPNVDSSMDMLMEDKVKPEDEPQGHHRPCVVNSGRLSDKDMPAQAMEPRASERSLAERPQVGSEVYRTSPGHTRSPTRSPCALPLAECKEGIVCNGAPETENKASEQPTGLSTPQKYPTPNGHCANGEAGRSKDFLSRQLSAVSCSSTHLHSRNLHHKWLHSYSGRPSVTSSPDQPSRSHLDDDGMPVYTDSIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLNSSLRFNGDFGDEVTSIPDSESNLDQNCLSRCSTEIFSEVSWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPASSSIDLELDKPIAATSN	403866	423647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_404075_404651_404784_405794_405907_408819_409016_409842_410029_412818_412990_414186_414333_415083_416501_417717_417829_418297_418387_421036
899333	contig_883_pilon	+	3502	4	Intergenic	novelGene_177685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	2427	2960	763694	764227	FALSE	20	ACTCCAGAGCGATGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPPHVCGSRRGVPCHAAPPGQKRLPTQEKEKKINKQFKTNKRTKALGSHQRGSADQEAAPHSYGAPQPLRKKQRWHTEPGTGAKGRGGGERQARNPKNQGKKKNKKTTSSQQMALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRPSVGEEGWRVGKRISQIASALEPLRKKQRWRTKPCT	623551	764769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_883_pilon_+_623845_756334_756963_762145_763623_763665
899334	contig_15857_pilon	+	2626	19	Intergenic	novelGene_152069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	116.084167527778	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1378	2574	79078	115809	FALSE	15	TGCTGTTTAATTTCGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMQKIPLHTVRQFFTEDVVLARHPDLFNPDNPKVTQAIQSFCLEKIEEMLENAERERLGNSRQPEKPLIRLRVDYSGGFEPFSVLRFSQKFVDRVANPKDIIHFFRHREQKEKTGEEINVGKLITRPSSEGTTLRVEDLVKQYFQTAEKNVQLSLLTERGMGEAVQEFVDKEEKDAIEELVKYQLEKTQRFLKERHIDAVEDKIDEEVRHFRESRQRNTNEEDDEVREAMNRARAHRSQLEDFASAFSADDFMSVDLTEEMADDSDDSISAAASKGRGRGRGGRGQNSTSRGGSQRGRGTGLVTSSRGRGSKAAASTSFRNMSIIDAFKSTKQQPSRSTATKNYSEIIEVDESDVEEDIFPTSSKTDPRSSSISSSKRSSQIQIAKGVDFESDEVIK	53415	115861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_53860_54609_54688_56447_56581_62287_62449_68575_68664_70078_70221_71479_71595_77857_78040_79043_79216_80718_80800_84879_85007_87922_88027_89279_89454_94923_94987_98580_98792_100761_100846_106561_106621_108632_108701_115721
899335	contig_4350_pilon	-	1906	4	Intergenic	novelGene_136383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	197.687182746435	545	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGACCGTGTCAGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270100	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_257236_258627_258878_265079_265231_269968
899336	contig_11656_pilon	+	6322	4	Intergenic	novelGene_53939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	870	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGGTTTCTATACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111978	124490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215_117524_120349_122772_123444
899337	contig_7593_pilon	-	2242	9	Intergenic	novelGene_127357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	179.150600054814	496	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	693	1250	720473	695591	FALSE	20	GAAATTTAGCCTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEPVSELENGQEGEFGDFDSVPNIQDDCSAFQDSDDFADFSSAGPNQVADWNAFEDGQKESCSWAAFGDQQATESHHRKEAWQSHRTDENTDTPGTPKTLSVPLATSRRAVATGQLQESATTVQTALLNRLERIFEACFPSVLVPDAEEEVTSLKHLLEASTWPGKTNETSAESGELLDVWTELQDIHDAHGLRYQWGGSHSNKKLLCSLGIDTRNILFTGNKKQPVIVPMYAAGLGMLEPTKEPLKPLSAAEKIASIGQTTTMSPEMNTCTSDRFQESLPPVQFDWSSSGLTNPLDASGGSTLLNLDFFGPVDDSSSSSSTTIPGVDPELYELTTSKLEISTSSLKVTDTFARLMSTVEKTSTSTRKPKREEHLSEEAIKVIASLPDLTFMHAKVLMFPATLTPSTGSQEKTDW	736738	694598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_695739_705469_705594_709599_709684_711220_711282_717511_717635_720455_720513_720925_721053_725079_725232_736364
899338	contig_11594_pilon	+	4056	3	Intergenic	novelGene_80896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGTATCTAGATAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117295	164820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_117928_140628_140978_161745
899339	contig_17171_pilon	+	2593	3	Intergenic	novelGene_147352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTCCACTCTCCCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58696	78000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_60977_67245_67360_77801
899340	contig_9682_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_125300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGATAGTCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27460	29293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_27500_29300
899341	contig_7119_pilon	+	3353	4	Intergenic	novelGene_40916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	188	1342	137033	139798	TRUE	35	AGGAGACAGTGGGTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127470	141910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_140018_140118
899342	contig_15741_pilon	-	898	5	Intergenic	novelGene_159678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	265.482932596429	29	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	266	418	50351	50105	FALSE	80	AAAATGGACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRQQIEELKNENALLRAQLQQHNLEMVGESTRQ	60515	49624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50195_50288_50418_50651_50747_60113_60173_60470
899343	contig_12464_pilon	+	2396	6	Intergenic	novelGene_68661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1571	1951	222571	242112	FALSE	20	ACGCACGCCGCGTCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGRGVLDSKNAPSPHLSRAFRAGGFAANSTKPFPVALPRSSTTTTAFSTGPNWENACSRSSLETTGERFLTVKAAPCVAKRIRRGLLFKMVPSSSAFAISASVLDSRRMKPKPRSRLMKTSLGSP	126766	242557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_128067_182086_182194_192378_192464_222492_222597_234650_234944_242050
899344	contig_15047_pilon	-	1532	7	Intergenic	novelGene_52129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTCTGGCAGGTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21661	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2248_2548_2825_3220_3495_4155_4433_4551_4683_20996_21070_21243
899345	contig_7979_pilon	-	3589	22	Intergenic	novelGene_125538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	157.924779017304	391	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	708	2897	1104746	1048799	FALSE	85	AAAAAAGGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISYSLNFSQKETQIFVEKLFDAVNTKSYLPPPEQPSSGSLKVEFFQHQEKDIKKEEITKEEEREKKFSRRLNHSPPQSSSRYRENRSRDERKKDDRSRKRDYDRNPPRRDSYRDRYNRRRGRSRSYSRSRSRSWSKERLRDRDRDRSRTRSRSRTRSRERDLVKPKYDLDRTDPLENNYTPVSSVPSISSSHYPVPTLSSTITVIAPTHHGNNTTESWSEFHEDQVDHNSYVRPPMPKKRCRDYDEKGFCMRGDMCPFDHGSDPVVVEDVNLPGMLPFPAQPPVVEGPPPPGLPPPPPILTPPPVNLRPPVPPPGPLPPSLPPVTDDISYSLVLTGPPPPLPPLQPSGMDAPPNSATSSVPTVVTTGIHHQPPPAPPSLFTADTYDTDGYNPEAPSITNTSRPMYRHRVHAQRPNLIGLTSGDMDLPPREKPPNKSSMRIVVDSESRKRTIGSGEPGIPTKKTWFDKPNFNRTNSPGFQKKVQFGNENTKLELRKVPPELNNISKLNEHFSRFGTLVNLQVAYNGDPEGALIQFATYEEAKKAISSTEAVLNNRFIKVYWHREGTTQQLQTASPKVMQPLVQQPILPVVKQSVKERLGPVPSSHTEPAEAQSASSDLPQNVTKLSVKDRLGFVSKPSVSATEKVLSTSTGLTKTVYNPAALKAAQKALLVSTSAVDNNEAQKKKQEALKLQQDVRKRKQEILEKHIETQKMLISKLEKNKAMKSEDKAEIMKTLEVLTKNITKLKDEVKAASPGRCLPKSIKTKTQMQKELLDTELDLYKKMQAGEEVTELRRKYTELQLEAAKRGILSSGRGRGIHSRGRGAAHGRGRGRGRGRGVPGHAVVDHRPRALEISAFTESDREDLLPHFAQYGEIEDCQIDDSSLHAVITFKTRAEAEAAAVHGARFKGQDLKLAWNKPVTSISAVETEEAEPDEEEFQEESLVDDSLLQDDDEEEEDNESRSWRR	1114405	1048106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1048889_1050534_1050649_1061526_1061614_1065029_1065231_1077636_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080767_1080894_1088414_1088487_1089707_1089840_1090379_1090545_1095872_1096033_1097020_1097133_1102867_1103009_1103395_1103567_1103979_1104220_1104715_1104977_1107317_1107536_1108699_1108789_1111104_1111242_1111876_1111885_1114380
899346	contig_10855_pilon	-	2242	9	Intergenic	novelGene_124313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	57.5628732344034	222	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	51	1256	401138	318530	FALSE	20	CTCCAGAGGGCCATTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRSQLRPPRCRSWGCFP	401188	317543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_318577_329151_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
899347	contig_10135_pilon	-	2115	6	Intergenic	novelGene_106586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	65.4168174095928	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	100	927	31065	29065	FALSE	25	ATTCCACCTTTCTGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLKRQASQVWPEEHGEQEHGLYSLHRMFDIVGTHLTHRDVLQLLRIITRHDLLPYVTLKRRRAVCPDLVDKYLEETSIRYVTPRALSDPEPRPPQPPKTVPPHYPVVCCPTSGPQMCSKRPARGRATLGSQRKRRKSVTPDPKEKQTCDIRLRVRAEYCQHETALQGNVFSNKQDPLERQFERFNQANTILKSRDLGSIICDIKFSELTYLDAFWRDYINGSLLEALKGVFITDSLKQAVGHEAIKLLVNVDEEDYELGRQKLLRNLMLQALP	37804	27876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_29442_29992_30140_30429_30538_30740_30814_30942_31130_37769
899348	contig_3269_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_117020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTCTGTAAGCCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109726	106638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_106600_109700
899349	contig_7678_pilon	-	3500	23	Intergenic	novelGene_175950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	108.641004084991	379	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	242	1921	84409	67785	TRUE	30	GAGTAATCCCTTTTCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRASNLQDLVYKNGQAGITKASVSVTFDNSDKKQSPLGFEVHDEITITRQVVIGGRNKYLINGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKKIAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKERSAEELKEMQDKVVKLQEELSENDKKIKELNHEIEELEKRKDKEIGGILRSLEDTLAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLESEENKRKELEKNMVEDSKTLAAKEKEVKKITDGLNALQQASNKDAEALAVAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAETEAKQAQMKLKHAQQELKAKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKKLKEKLEAEMKKLNYEENREESLLERRRQLSRDISRLKETYEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDTEVN	85450	47218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_-_47382_47653_47771_50528_50730_55437_55633_56635_56780_58580_58776_60285_60411_63122_63259_65390_65596_67310_67409_67784_67933_68874_68993_69500_69661_71310_71545_75582_75733_75964_76199_77782_77828_78015_78127_79503_79543_80711_80835_83526_83677_84241_84470_85269
899350	contig_7730_pilon	+	7954	3	Intergenic	novelGene_156297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	61	junction_1	154.5	1230	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	1877	3238	454999	456360	TRUE	20	TCTGTTTTACTCCAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSPSQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPILASTELDDVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPPVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLADNLMDDLLDNITLPSSQSSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPPSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYSNQTLQDLLSSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLHNDPMMSFAAQPNQGSLVNQNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMGLSDSSSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMGHDKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG	404802	477095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_406640_454959_456396_472414
899351	contig_3018_pilon	+	4491	2	Intergenic	novelGene_78917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	0	497	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	941	1744	648065	648868	FALSE	40	GTAAACTTTCACTTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKRVRNLSLKEKFDVVKMITEEKRTVKEAVNKFKCSKTQIYSIMEERDKIIEKYMNSINANIKKGRGDGNQQSVFEWFLQASASNVPISGPILQAKAKETAKLLKVDGFSVSNGWLQSFKKKHGITCNVACGESNGVGMQVQAAVNDIYSGVSENRVSATSYVVIDKEIATEMDDINLQEIVGLQSKDDNDEDIPLEEAEPVSQAQVFSYIKALKEFGKVKGDQEFFDKAIDLEICFSNFIKKPKQTKQLTLDVLLKSEFYPSLFD	626273	651615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_626378_647228
899352	contig_6654_pilon	+	6287	33	Intergenic	novelGene_85754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	129	junction_17	119.889271830302	539	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1941	5826	160	5985	600138	752722	FALSE	70	GAAAAAAAAGAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRRAEKSCEQACESLKRQDYEMALKHCTEALLSLGQYSMADFTGPCPLETERIKIESLLYRIASFLQLKNYGQADEDCRHVLGEGLAKGDGAFRAVLCCMQLKGKLQLVSSILAKSLTGESLNGMVTKDLTRLKTLLTETETATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEATIEEKTKEYIFLRISRECCEELNLRPDCDTQVELQFQLNRLPLCEMHYALDRIKDNGVLFPDITMNPTIPWSPNRQWDEQLDPRLNAKQKEAVLAITTPLSIQLPPVLIIGPYGTGKTFTLAQAVKHILQQQETRILICTHSNSAADLYIKDYLHPYVEAGNPQARPLRVYFRNRWVKTVHPVVHQYCLISSAHSTFQMPQKEDILKHRVVVVTLNTSQYLCQLDLEPGFFTHILLDEAAQAMECETIMPLALATTNTRIVLAGDHMQLSPFVYSEFARERNLHVSLLDRLYEHYPAEFPCRILLCENYRSHEAIINYTSELFYEGKLMASGKQPAHKDFYPLTFFTARGEDVQEKNSTAFYNNAEVFEVVERVEELRRKWPVAWGKLDDGSIGVVTPYADQVFRIRAELRKKRLSDVNVERVLNVQGKQFRVLFLSTVRTRHTCKHKQTPIKKKEQLLEDSTEDLDYGFLSNYKLLNTAITRAQSLVAVVGDPIALCSIGRCRKFWERFIALCHENNSLHGITFEQIKAQLEALELKKTYVLNPLAPEFIPRALRLQHTGNTSKQQQSPPKGKVLHHTQNDHFQNDGIVQPNPSVLIGNPIRAYTPPPTLGPPPNLGKSPSPVQRIDPHSGTSILYVPAVYGGNVVMSVPLPVPWTGYQGRFAVDPRIITHQAAMAYNMNLLQTHGRGSPIPYGLGHHPPVSIGQPQNQHQEKDQHEQNRNGKTDTNNLGPEINKIRTPEKKPTEPKQVGLESNPHNRSPESRPGGVYPSTKFHRKDNLNPRHINLPLPAPHAQYAIPNRHFHPLPQLPRPPFPIPQQHSLLNQQQNNLPEQPNQMPPQPNHVVQQQNQLNQQTQQPPPQLSPAYQPGPNNAFFNNAVSHRPQSPAEAAIPEQQPPPMLQEGHSPLRAIAQPSPVLPSHLNNFMDENSSGLPTGEALDRIHGSVALETLRQQQARLQQWNEHNAYLSQGSIPYPHHHHHLQHLPQPPIGFHPPPVRADWKLTSSAGDEAETTYSRFQDLIRELSNRDQSETRELAEMPPPQSRLLQYRQVQTRSPPAVPSPPSNSDHSSHFCNFNDNNRDVEVASNAAAFPQRLPPQIFSSPFSLPSEHIAPPPLKYLAPDGAWTFANLQQNHLMGPGFPYGLPPLPHRPPQNPFVQIQNHQHAVGQEPFHPLSSRTVSSSSLPSLEEYEPRGPGRPLYQRRISSSSVQPCSEEVSAPQDSLAQCKELQDHNHQSSFNFSSPESWVNTTSSAPYQNIPCNGPSRTAQPRELIAPPKTVKPPEDQLKSENLELSSSFNYNVLQHLGQFPPLMPNKQIAESASSSSQQSSVGSKPAMSYASALRAPPKPRPPPEQTKKSSDPLSLFQELSLGSASGGNGFYSYFK	573076	753024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_616762_616888_618597_618655_623021_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951_650286_652729_652861_657968_658149_658678_658781_671213_671393_674306_674426_675534_675681_679457_679606_683763_683948_685092_685322_694073_694279_704853_704906_705680_705872_707620_707829_712636_712717_717507_718076_718497_718730_719578_720099_748213_748467_752387
899354	SIRV6	+	1145	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	285	164	-150	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	325	4	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	40	ACGAAGAAGCTAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899355	contig_3004_pilon	-	3332	13	Intergenic	novelGene_127483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	435	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGATCACCACCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287267	275421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_275549_277769_277917_278895_279281_279691_279868_280774_280831_281228_281606_282578_284153_284373_284413_285295_285349_285713_285747_286375_286449_286736_286873_287111
899356	contig_16643_pilon	+	1885	5	Intergenic	novelGene_158141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	47.599238439286	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	320	1426	310941	318119	FALSE	15	CCTGTGTTTCAGAGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDQFSHVWILFVFHKNGRLSCKAKVQPPRLNGAKTGVFSTRSPHRPNAIGLTLAKLEKVEGGAIYLSGIDMVHGTPVLDIKPYIADYDSPQNLIEPLGDVNLQDNKHKPKTSFEFRSSGVTDNCDQQQLSGCVEPHPCTSTKEKPTCPEDRTSEEIHVEHDDTAKIRHSLKHGEEIAAGYGSESRSDQSLSVAEKQVGSCHQEKSFSEEGTDKRSRRGQEAAILRGNSVQTEPGALRYPSGAADEARHSVVPAWVRDAPVTTLEVRFTPHAEMDLRHLSSDVGQTAFKYFQSAEEAKHAIEAVLSADPRSVYRRKLCQDRLFYFTVDIAHVTCWFGDGFAEVLRIQHASEPVQMTDPAESLVSLGS	306525	318578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_306699_310794_310970_314690_314849_315641_316302_317859
899357	contig_9370_pilon	+	3236	3	Intergenic	novelGene_177242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	46	213	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGTAAAAGAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59873	78542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_+_59940_75275_75392_75488
899358	contig_366_pilon	+	3223	3	Intergenic	novelGene_51551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACAGAAAAAGCAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414046	597718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_415727_416007_416263_596430
899359	contig_9363_pilon	+	1524	8	Intergenic	novelGene_6564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3367	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGGATAAAGAAGGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753388	756797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_753601_753795_754505_755014_755120_755356_755465_755551_755664_755804_755886_756078_756197_756718
899360	contig_8373_pilon	-	3389	2	Intergenic	novelGene_176379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	193	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGTACATTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34923	24008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_27207_34732
899361	contig_12046_pilon	+	1927	2	Intergenic	novelGene_83454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	573	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144584	160470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_144593_158551
899363	contig_240_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_173796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGCACCAAAACTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487712	485563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_485600_487700
899364	contig_10990_pilon	-	1598	5	Intergenic	novelGene_7504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1225	1533	751051	744772	FALSE	30	TTTATACCTATATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWL	753007	744706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_744778_749330_749499_750916_751085_751450_751518_751883
899365	contig_3077_pilon	+	2707	10	Intergenic	novelGene_26868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	80.2662236975595	605	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	105	1142	1337784	1346705	FALSE	10	TTCATTCCTTCTCTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336608	1348270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342155_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
899366	contig_5586_pilon	-	2728	2	Intergenic	novelGene_143571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	448	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACTGCCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393469	390644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_392875_392971
899367	contig_4103_pilon	+	2179	13	Intergenic	novelGene_51896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	53.5684271645984	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	540	1862	58124	65973	FALSE	25	AAGCCTGCCAGTGTCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53863	66290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54403_54777_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
899368	contig_3529_pilon	+	1846	10	Intergenic	novelGene_105403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	97.6005970433064	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	464	949	806063	809557	FALSE	50	AAATAAAAAATGTAGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790447	810454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792077_792699_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
899369	contig_10904_pilon	-	4248	3	Intergenic	novelGene_22711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTTGAGTTTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732241	637737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_639350_639523_639951_730032
899370	contig_12619_pilon	-	6750	1	Intergenic	novelGene_73587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1079	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAGGGGGGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022415	1015665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_1015700_1022400
899371	contig_10434_pilon	-	4306	9	Intergenic	novelGene_82042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	544	junction_6	128.201440612031	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	3452	4237	137443	132856	FALSE	40	GCTCTTTAAACTACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	143869	132786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_139511_142485
899372	contig_4156_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_88108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATCACCAGTGCATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350477	348225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_348200_350500
899373	contig_9058_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_149366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1234	1578	56308	56652	NA	10	CCCCAGTGTCTGCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYHSELLRGFIVADEELEIRAHRVTTEERVRKPHQIPGSTSQKPAVSQPPPPPSHRSQARGHRPPPPGHRVQHQQQKRPPPPSGTQVHQQKGPPLPRPRVQQKPLPGAAENS	55074	57251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_55100_57300
899374	contig_8317_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_19368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATTCAGTTTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16249	17067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
899375	contig_14034_pilon	-	2899	8	Intergenic	novelGene_72657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2328	2720	377318	337560	FALSE	10	CGAGCCGGGGCGCGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVIKDVFPTLCSPRNTSLNFLSGFPKSPPADMMKPEELPPPQSRDLPDRPCSSRQTKTARGGQEPSSIGPCRARRRSKPGPQDTFTDTQAAVAAASRQSRLAPREAHGWEGKEGGVGNSHGCARGSQG	409113	337380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_337921_377286_377344_387753_387810_389246_389352_391382_391496_404224_404306_407083_408632_408714
899376	contig_8671_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_126246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGAACTGCGCCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420391	418194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_418200_420400
899377	contig_610_pilon	-	3969	12	Intergenic	novelGene_76669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	506.823277593624	574	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	510	1556	68933	32917	FALSE	30	GATCCATGACTTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	93813	30503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887_68955_69974_70099_72506_72694_81741_81821_93715
899378	contig_2733_pilon	-	4815	10	Intergenic	novelGene_128594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	840	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1710	2168	927284	924250	TRUE	35	AAACTGTTTAGCTAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPASWRDWRLWRFWRLVRSIPANRLFTSRGLMPDVEATAAAAAAALAISLFGRLPLRLAPSPRTTGPVRRRSNMDSGTKPDCLTISVQSGATANSGFSSSHLGRSFIGGAIAPPIFFPFRLLTTGTLSSPVKVFISNLLGFRHLCRFCFGF	928993	910491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_911173_911426_911635_911754_912426_913576_913738_915166_915395_915645_916088_922724_922952_924220_924360_924541_924649_927042
899379	contig_10446_pilon	-	2108	3	Intergenic	novelGene_162459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1504	1830	497157	496831	FALSE	15	GTCTTTCCTTTTATTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFLLPPSCSRRRLLLELPFANLGYTKKTKPIAVETIPTHSNSTGQRRTAPLGFQGAAGRFELLTFWLAAKLLTCTTRAPQSYQNPSLHYHHQSVKTPFPSVNRVCG	555672	496552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_498143_554986_555302_555469
899380	contig_14450_pilon	+	6057	16	Intergenic	novelGene_48937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	95.5616380493065	540	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	101	2212	518626	556776	FALSE	35	AGCACCACTTGACCAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRRQCRARRPRSHGDRHRDQPQDPDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRPSLPPSKQANKNLILKAISEAQESVTKTTNYSTVPQKQTLPVAPRTRTSQEELLAEVVQVQSRPPRISPPIKEEETKGDNIEKSQGPQQRQLLSRLQIDPVMAETLHISQDYYDMESMVHADTRSFILKKPKLSEEIVVAPNHESGMKTADTLRVLSGHLMQTPRDLVQPDKPASPKFIVTLDGVPSPPGYMSDQEEDMCFEGMKPVNQTAASNKGLKGLLHPQQLQLMSRQLEDPNGSFSNAEMSELSVAQKPEKLLERCKYWPGCKNGDECAYHHPVSPCKAFPNCKFAEKCLFVHPNCKYDAKCTKPDCPFTHMSRRIPVLPPKPAVTTPAPPSSTQLCRYFPACKKMECPFYHPKHCRFNTQCTRPDCAFYHPTITVPPRHALKWIRPQTSE	512507	560621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523323_523742_523844_525728_525885_544457_544533_549302_549466_550222_550456_553725_553847_554738_554876_555156_555249_556073_556181_556769
899381	contig_9484_pilon	+	1636	11	Intergenic	novelGene_105638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	539.064458112386	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	406	1503	100737	104965	FALSE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	97147	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_97228_98440_98611_100389_100464_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
899382	contig_7806_pilon	-	4454	3	Intergenic	novelGene_157540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	632	147	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAATAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384335	248710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_251741_291232_291629_383307
899383	contig_6479_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_160622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAGCACACAGAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627925	629466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_627900_629500
899384	contig_6446_pilon	-	3230	1	Intergenic	novelGene_149195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCATTCTTTTCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252503	249273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_249300_252500
899385	contig_18544_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_152763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	652	1071	209183	209602	NA	75	CAAAATAAACAGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSSTVTHEGYHESQLTRQHLEKDGYYQKITVGEGVEKLEHSYVDGGNVKWCSLCGKVWCFLKKLNTELPYQPEIILQGVYTILENSDSSRLRSINVHCSFSHNSQKVETTKMPISGEKDKQNVVYIHNGVLFCHIEK	208531	209994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_208500_210000
899386	contig_854_pilon	+	849	7	Intergenic	novelGene_36233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	114	692	543600	562402	TRUE	20	TGGTGTGAATTTGCAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543486	563184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
899387	scaffold_13505_pilon	-	3063	8	Intergenic	novelGene_111535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_4	436.660284525205	705	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	28	1014	603235	595273	TRUE	5	CCCTCATTTTCTCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603262	588573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
899388	contig_21007_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_161541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	22	444	589	1011	NA	15	CTACGTATCTGTCGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	567	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1900
899389	contig_1090_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_131130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450289	447972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_448000_450300
899390	contig_14474_pilon	+	3627	4	Intergenic	novelGene_144211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_3	141.530522817126	499	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	340	516	71288	75195	FALSE	35	TCTTTGAAAAACATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDFVCHQDTVLSCDISPDSTKFSSTSADKTAKIWNFEPLSLLHELSGHDSCVRCSVFSVDSTLLATGDDNGEIRIWNVSNGELLHLCAPISVEEGVATHEGWVTDLCFSPDSKMLVSAGGYLKWWNVVTGESLQTFYTNGTNLKKIHVSPDFRTFVTVDNLGILYILQILE	64658	78306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_64755_69012_69139_71170_71318_75048
899391	contig_8330_pilon	-	2772	10	Intergenic	novelGene_71972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.503601570336	58	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	271	1314	2066429	2038853	TRUE	25	CACATCAGATTTCCATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLTHPEVSYSTGPTQSTNNPEFVEDLSQGQLLQNESSNTAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDSNAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQRYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQATHDHEKEAEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERNAALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMPLPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVSRLDR	2116728	2034493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2035942_2038842_2038990_2039680_2039897_2040609_2040686_2051201_2051234_2052236_2052370_2055973_2056187_2057892_2058041_2066340_2066434_2116462
899392	contig_4486_pilon	-	2453	9	Intergenic	novelGene_38535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_8	188.199652961954	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	541	1761	177451	130815	FALSE	15	CTGTCTTATGGGATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMEHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	178243	130122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132279_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304_177724_177975
899393	contig_7201_pilon	+	5400	17	Intergenic	novelGene_152491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	664	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3789	4193	70193	153754	TRUE	15	CGCCTCCGCGATAGCGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGETAKSHPVLFFMSSTVRPSQISIRVSPSFLSTSNTAFSVMMRLTHCFPVRGNVHFSMILCAFPFAECSMVTTTLVLALDTKSIAPPIPFTIFPGIIQLARSPYLETCIAPSIVRSTCPPLIIANDSSLEK	66404	255874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_70208_83639_83743_93178_93263_108087_108175_153031_153108_153714_153788_161657_161707_163991_164088_169479_169595_171320_171427_213981_214047_216547_216651_224243_224395_229523_229660_238452_238543_239709_239820_255721
899394	contig_5686_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_45350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGACAGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122377	121380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_121400_122400
899395	contig_13456_pilon	+	4894	20	Intergenic	novelGene_153260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_14	94.8300710865043	310	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	3	2084	13362	80047	TRUE	20	ATCATGTCTTTCTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHRTPPYPAGDYCLLCRSERKDSSFLESGIKTASKLALSTAPKGSNVLHLPLWVCPDCRRTVEKEERHGLDHTSGQDFLLHNPLGGSQPEAGGSGRLALGAQTLPSAGLSNSTPADAACTCEACSERREISAETDRESQQLQNYWSEVRYMVRCIYRQAGTPLADDQDQSLVPDKEGMKELVDRLCERDPYQLYQRLEQQAREYVLEMKVRLLRQLSAAAKVKAPSALPGPPQAHQFISLLLEEYGALCQAARTISSFLGTLENEHLKKFQVTWELHNKHLFENLVFSEPLLQSNLPTLVSQIRLGTTTHDSRNEDTYSTLLQRYHHSEEELRRVAEDWLECQRRIDDYVDEQMTMKSKQRVLTEDWELFKQRRFTDEQLTNKKAVAGENHFTDTMRHMLSSRLGMPDCPNCNYRRRCACDDCSLSHILTCGIMDPPVTDDIHIHQLPLQMDSAPDYLSEMRPPSVSSASSGSGSSSPITIQQHPRLILTDSGSAPTFCSDDEDVAPLSAKFADIYPLSNYDDPEVVANMNGIHNELNGGGENMALKDESPQVSSSSSSSSEADDEEADGESSGEPPGAPKEDIALGNGNLGKHEDKVDSPPPSYPAQQAEQAQNTCECHVCKQEASGLTASATTAGTLPPGHQFLSPEKPTHPALHLYPHIHGHVPLHTIPHLPRPLIHPTLYAAPPLHAQ	13359	129151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_13587_37409_37571_38584_38753_45598_45834_52306_52432_66662_66811_68608_68687_69797_69911_70045_70289_72855_73010_73130_73311_79795_80049_95068_95268_96315_96589_97712_98033_98639_98824_100454_100686_104399_105217_119364_119447_128448
899396	contig_854_pilon	+	3192	11	Intergenic	novelGene_36629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3018.56006897328	66	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	551	1531	1694500	1701257	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEAPSKRREAASRAGEDPPEAGGRLHGP	1693949	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701177_1701348_1701990_1702204_1702545_1702695_1715198
899397	contig_20165_pilon	-	2767	18	Intergenic	novelGene_54466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	183.96212187224	26	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	505	1527	89310	48430	TRUE	20	CATGCAGCCTCAGTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGEYVKNFDRAMELVGVWTQRSVLFKDIVHDIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLKRLPADAPDQRDAEKSLELISTAANHSNAAIRKMEKMHKLLEVYERLGGEEDIVNPANELIKEGHIQKLSAKNGTTQDRYLFLFNSMVLYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDIVKPNAAHTFVITGRKRSLELQTRTEEEKNEWIQVIRTTIEKHKQNSETFKAFSGPLGWNEDSTPPLQTHLWWVPAPWSPLWRPMAAEVLEGSTAESLPLKRGVRRRGRAARAAGRPSTPSPRGGTAASSAAQSSVGSAPSSRLRTAGRAGSARSVS	128163	40724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_41403_42057_42420_46775_46917_48370_48506_49897_50021_58020_58084_70009_70120_70987_71019_72217_72298_75017_75111_75354_75502_77719_77779_78298_78438_89208_89366_92258_92396_92999_93090_118295_118455_128100
899398	contig_3956_pilon	+	2584	12	Intergenic	novelGene_14880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1210.56975862437	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	84	2060	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSACRSRSVPFQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285792_1287939_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
899399	contig_2278_pilon	-	1979	2	Intergenic	novelGene_118157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTAAATGTTGTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510353	1504275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1506145_1510243
899400	contig_12327_pilon	-	2116	14	Intergenic	novelGene_140690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	178.447081642557	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	766	2082	1148769	1139988	FALSE	40	AAATTAATACTTTGGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLESWRNFEDEFGTVSDKERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155091	1139953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148843_1151143_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
899401	contig_7644_pilon	-	3835	3	Intergenic	novelGene_64242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCGGAGCAAACAGAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172870	162685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_162778_167118_167234_169242
899402	contig_11428_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_138497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134779	133313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_133300_134800
899403	contig_7909_pilon	-	5936	6	Intergenic	novelGene_155900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	332	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1913	2494	483704	483123	TRUE	70	CTACAACAATAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMAPIGVQIKTQDNSPVEENALEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGGENRKRREDH	486209	414358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_415457_416533_417037_433775_433789_466146_466565_481712_485156_485748
899404	contig_4402_pilon	+	3087	19	Intergenic	novelGene_140784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	235.591506690482	391	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	80	2239	145647	245151	TRUE	40	TATGAAAACTTTATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDVVRSMCHQSHKRLTGCFQGQHGTDAERRHKKLPLTALAQSMQEASAQLEDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEREISDPLNVIAEVEIPNIQKQRKQLAKLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYDEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSEINKMTPSNIAIVLGPNLLWAKNEGSLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEIEFNVSETFVPLAIPNSNHSPHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESPPIPKDSVSAAVPTPGRNSSQVTPGPNQAQAATSSHQLSVGPAHNSAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSPGTSQHPPSLSPKPSTRSPSPPTQHTGQASGQPSAAPQLSAPRRYSSSLCPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPSSQGSPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNSGLPASQTQAVSNPETVQPHGGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPHPPGAHSAGDGSLTSTVPTASKIVTDALPNALTGGEGSRD	145567	253964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_145700_193471_193512_197144_197250_203276_203351_204868_204981_205222_205300_208980_209093_211528_211598_211755_211798_223678_223791_224379_224462_226245_226327_228336_228451_230977_231070_232549_232707_236194_236365_243517_244139_245104_245153_253117
899405	contig_3153_pilon	-	4544	2	Intergenic	novelGene_104638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAACATGGGCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74895	70126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_74270_74494
899406	contig_6445_pilon	+	2182	15	Intergenic	novelGene_77018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	885.171850027797	57	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	29	1879	522296	665844	FALSE	40	GAAAAAAGCTGTATTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSKEEEEYKYTSCKAFLSTLNEMNDYAGQHEVISENMTSQIMVELARYVQELKQERKSHFHDGRKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRHQMAEDSKADYLSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRIGESMKTYAEVDRQVIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKSDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYAQPMKRTVSDNSLSNSRGESKQEHKPGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSPKQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLTEVGQNIEKLRLEVQKFEAWLAEVEGRLPARSEQARRQSGMYDAQNPPSVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEVKVLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYMFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDEEGYVPTSYVEVYLDKNAKGAKTYI	522267	666147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_522320_579451_579568_597277_597335_598043_598192_613498_613562_613988_614094_635363_635493_636698_636846_644515_644714_645646_645830_656007_656118_661691_661825_663382_663505_663789_663927_665665
899407	contig_11850_pilon	-	1276	8	Intergenic	novelGene_125223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	813.400395919275	20	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	97	1002	286397	282879	TRUE	10	TTGTTCTTCTGTGTCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286493	281439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
899408	contig_7378_pilon	-	2760	2	Intergenic	novelGene_120273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	263	334	589417	589346	TRUE	35	TTAGAAAACAATTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNKIGIEGKFLNIIKSIYAKPTANIILNGERLKTFPSRTGTRQGCRLSPLLFNILLEVLAGAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRKLLKLIDSAE	589679	526890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_528271_588299
899409	contig_2924_pilon	-	1194	9	Intergenic	novelGene_140256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGAGGGCAGACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240009	66034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_66157_125501_125606_135677_135810_147478_147683_185697_185775_199571_199667_221845_221956_236286_236343_239715
899410	contig_17964_pilon	-	3380	1	Intergenic	novelGene_33938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAAAAAAAAAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701524	698144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_698100_701500
899411	contig_1263_pilon	-	2099	3	Intergenic	novelGene_170387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1275	72	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGCAAATTCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76729	51681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53559_65266_65324_76564
899412	contig_5286_pilon	-	2862	2	Intergenic	novelGene_157382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGTGGTGCTTCTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626882	609532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_611959_626446
899413	contig_8934_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_167246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	665134	664832	NA	50	TAAACTGAATATAGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEQPSDTPLVSPLRGARENEENRIQGKDQSKGLTDHSYHSFHQTESSTARWCPAITTDGSDRDHNIGSWTELEKDVEQNPNSQKKKKKNQSYWPDRLEKS	665134	663406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_663400_665100
899414	contig_11338_pilon	-	1706	3	Intergenic	novelGene_6315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	967	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGAGTCCTCTCAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247702	245349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_245892_246486_247401_247452
899415	contig_12479_pilon	-	4320	17	Intergenic	novelGene_56855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_16	104.988522438169	407	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	353	1759	516614	451002	FALSE	30	TAAAAAGGAGTCTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	518702	448440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_518437
899416	contig_17074_pilon	+	2097	7	Intergenic	novelGene_145122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	307.692712873665	3	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207945	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212465_213463_213554_214121_214243_215404_215475_216283_216324_224003
899417	contig_12622_pilon	+	3077	11	Intergenic	novelGene_5831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	214.747852142926	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	162	1799	446467	475513	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPASTKTGQAGSLSGSPKPFSPQASTPITTKADKTSTTGSILNLNLDRSKAEMDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	433571	476791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_433716_446449_446603_449207_449529_454887_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
899418	contig_835_pilon	+	2706	2	Intergenic	novelGene_152154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	504	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTATAATGGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224374	241198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_224763_238880
899419	contig_15092_pilon	+	2379	19	Intergenic	novelGene_57771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	322	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTTCCCATGAGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295793	319755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_296572_296914_296970_297063_297127_297247_297349_297679_297763_297848_297886_298415_298469_302765_302883_303031_303131_303942_304040_304383_304449_304779_304824_310062_310143_312140_312491_312713_312799_316608_316689_317579_317700_319500_319542_319724
899420	contig_854_pilon	-	1277	8	Intergenic	novelGene_36226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	289	645	563319	562338	TRUE	40	AGGAGGCAGAGGAAGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563795	543483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562404_563028_563350_563537
899421	contig_3747_pilon	+	1517	7	Intergenic	novelGene_24816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	156	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	330	1274	201313	204963	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVSLHKGHWAPFLSIRRPRCSQPLSLYP	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203263_204883
899422	contig_1150_pilon	-	603	3	Intergenic	novelGene_61398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311035	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
899423	contig_3153_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_104675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	503	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGCAGTTTCAACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209978	212447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_210000_212400
899424	contig_8310_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_75601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316609	314994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_315000_316600
899425	contig_4659_pilon	+	3059	16	Intergenic	novelGene_118186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1633	1989	128952	134185	TRUE	75	ATAAAGAAAATAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVAHQLFAERNSSRIPFLKHNRIYASKLGFFSVKILNGTLQQKNFGIFNTRIHLFMCNVLGTNKATDNHRIKLLSTWDFFDVDKLTDIHVIIPVLDIRSDCLNNLADQWHNDVPPGW	122941	151089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_123076_124457_124556_126626_127814_128062_128190_128865_129005_130217_130327_133348_133424_134065_134247_134673_134808_136453_136512_142730_142899_143435_143590_144565_144671_145669_145832_147018_147155_150997
899426	contig_8712_pilon	+	2262	4	Intergenic	novelGene_58766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	589.359539387178	109	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	86	529	314974	321793	FALSE	10	GCCGTTCTCATTCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPRCRPAAACAASSDLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286935	323526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318198_321696
899427	contig_10722_pilon	-	3329	2	Intergenic	novelGene_70977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	744	junction_1	0	39	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAAATCTTGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8115	3739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545
899428	contig_13924_pilon	+	2344	6	Intergenic	novelGene_147779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	20	junction_5	82.5382335648153	201	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	194	769	38863	60812	FALSE	35	TTTCCTCTATAGGGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKATSTPATGGACSVSVEETEKWMEAAMYMAKDALENLEVPVGCLMVYNNEIVGKGRNEVNQTKNATRHAEMVAIDQVLDWCHHSGKSPSEVFEHTVLYVTVEPCIMCAAALRLMKIPLVVYGCQNERFGGCGSVLNIASADLPNTGKPFQCVPGYRAEEAVEMLKTFYKQENPNAPKSKVRKKECQKS	38669	62387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_38959_45541_45647_48444_48596_51867_51975_60600_60674_60768
899429	contig_19692_pilon	-	1767	2	Intergenic	novelGene_174886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62216	57617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_-_58459_61290
899430	contig_6270_pilon	+	3505	1	Intergenic	novelGene_99873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2779	3093	1055962	1056276	NA	40	AAAAACTTTACGAAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEFSTARWCPATTTDCSDQDHNTGFLIELEKDVEHNSNSQKKKTRFTGLKETGEAPRVCPPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPLKPNGTNEVQ	1053183	1056688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1053200_1056700
899431	contig_11677_pilon	-	6312	37	Intergenic	novelGene_85958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	63	junction_36	112.741948331489	551	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1725	5178	149	5326	640992	616272	FALSE	45	ATTACAATCACTCACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDFVESEAEESEEEYNDEGEVVPRVTKKFVEEEDDDEEEEENLDDQDEQGNLKGFINDDDDEDEGEEDEGSDSGDSEDDVGHKKRKRTSFDDRLEDDDFDLIEENLGVKVKRGQKYRRVKKMSDDEDDDEEEYGKEEHEKEAIAEEIFQDGEGEEGQEAVEAPMAPPEEEEEDDEESDIDDFIVDDDGQPLKKPRWRKKLPGYTDAALQEAQEIFGVDFDYDEFEKYNEYDEELEEEYEYEDDEAEGEIRVRPKKTTKKRVSRRSIFEMYEPSELESSHLTDQDNEIRATDLPERFQLRSIPVKVAEDDELEEEADWIYRNAFATPTISLQESCDYLDRGQPTSSFSRKGPSTIQKIKEALGFMRNQHFEVPFIAFYRKEYVEPELHINDLWRVWQWDEKWTQLRIRKENLTRLFEKMQAYQYEQISADPDKPLADGIRALDTTDMERLKDVQSMDELKDVYNHFLLYYGRDIPKMQNAAKASRKKLKRIREEGDEEGEGEEAEDEEQRGPELKQASRRDMYTICQSAGLDGLAKKFGLTPEQFGENLRDSYQRHETEQFPAEPLELAKDYVCSQFPTPEAVLEGARYMVALQIAREPLVRQVLRQTFQERAKLNIAPTKKGRKDVDEAHYAYSFKYLKNKPVKELRDDQFLKICLAEEEGLLTIDISIDMKGVEGYGNDQTYFEEIKQFYYRDEFSHQVQEWNRQRTMAIERALQQFLYVQMAKELKNKLLAEAKEYVIKACSRKLYNWLRVAPYRPDQQVEEDDDFMDENQGKGIRVLGIAFSSARDHPVFCALVNGEGEVTDFLRLPHFTKRRTAWREEEREKKAQDIETLKKFLLNKKPHVVTVAGENRDAQMLIEDVKRIVHELDQGQQLSSIGVELVDNELAILYMNSKKSEAEFRDYPPVLRQAVSLGRRIQDPLIEFAQVCSSDEDILCLKFHPLQEHVVKEELLNALYCEFINRVNEVGVDVNRAIAHPYSQALIQYVCGLGPRKGTHLLKILKQNNTRLESRTQLVTMCHMGPKVFMNCAGFLKIDTASLGDSTDSYIEVLDGSRVHPETYEWARKMAVDALEYDESAEDANPAGALEEILENPERLKDLDLDAFAEELERQGYGDKHITLYDIRAELSCRYKDLRTAYRSPNTEEIFNMLTKETPETFYIGKLIICNVTGIAHRRPQGESYDQAIRNDETGLWQCPFCQQDNFPELSEVWNHFDSGSCPGQAIGVKTRLDNGVTGFIPTKFLSDKVVKRPEERVKVGMTVHCRIMKIDIEKFSADLTCRTSDLMDRNNEWKLPKDTYYDFDAEAADHKQEEDMKRKQQRTTYIKRVIAHPSFHNINFKQAEKMMETMDQGDVIIRPSSKGENHLTVTWKVSDGIYQHVDVREEGKENAFSLGATLWINSEEFEDLDEIVARYVQPMASFARDLLNHKYYQDCSGGDRKKLEELLIKTKKEKPTFIPYFICACKELPGKFLLGYQPRGKPRIEYVTVTPEGFRYRGQIFPTVNGLFRWFKDHYQDPVPGITPSSSSRTRTPASINATPANINLADLTRAVNALPQNMTSQMFSAIAAVTGQGQNPNATPAQWASSQYGYGGSGGGSSAYHVFPTPAQQPVATPLMTPSYSYTTPSQPITTPQYHQLQASTTPQSAQAQPQPSSSSRQRQQQPKSNSHAAIDWGKMAEQWLQEKEAERRKQKQRLTPRPSPSPMIESTPMSIAGDATPLLDEMDR	650993	615285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_616459_616780_616969_617520_617688_617803_617882_618160_618274_619914_620040_620208_620323_620855_621095_621666_621863_623083_623225_624072_624216_624657_624806_625310_625519_626645_626774_627299_627468_627544_627683_627975_628112_628414_628492_630986_631105_631227_631368_631726_631923_632353_632509_632691_632843_632926_633057_634400_634500_634653_634803_635435_635579_635756_635847_636188_636306_636591_636694_637097_637372_638933_639019_639233_639427_639780_639858_639959_640116_640883_641022_650874
899432	contig_12790_pilon	+	3834	6	Intergenic	novelGene_35248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	514	junction_5	116.297205469435	191	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	113	688	307252	310194	FALSE	15	TATAAGGGGTGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRDSGILRFLHFPHRSHSPRPHSSPRRAGTLGRWRANMPITRMRMRPWLEMQINSNQIPGLVWINKEEMIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	306031	313340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_306139_307246_307339_308741_308842_309578_309756_309873_309924_310032
899433	scaffold_12124_pilon	+	1975	11	Intergenic	novelGene_22257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	3217.77110590545	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	195	566	1490385	1508039	TRUE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494310_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509082_1509206
899434	contig_6102_pilon	-	1496	6	Intergenic	novelGene_32046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	181.781187145425	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	182	430	555780	555368	TRUE	60	TATGAAACCAAAAGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQVWVLLKAAGVLAPSSRFYGACSRENLEGWVWISLEWGSHGSAPERCLGARWSDPVTLKMKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVTVPPNKVAHPGCE	556799	553690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_555042_555151_555529_555692_555806_556643
899435	contig_7279_pilon	+	2127	13	Intergenic	novelGene_145983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	264.57832016248	357	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	18	1328	64657	99452	FALSE	45	AAAAAACCCATCGCCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEFLEMSSRKSKSNSLIHAECLSQVQRFLRERFCRQSSHSNLFGVQVQYKHLIELLKRTAIHGESNSVLIIGPRGSGKTMLINHALKELMQIEEVNENILQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGNRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPVAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	64639	100251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68712_75401_75478_76321_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
899438	contig_11269_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_145824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGCTCTTTTGATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335334	337084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_335300_337100
899439	contig_11386_pilon	-	2065	2	Intergenic	novelGene_82809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAACAGATGCGGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105664	100668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_100989_103919
899440	contig_2380_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_117899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTTGAGAGGATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491249	493188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_+_491200_493200
899441	contig_6102_pilon	+	1245	14	Intergenic	novelGene_31774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	236.065230178881	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1143	101	1243	350018	357331	FALSE	45	CAGTGGAGAAACATTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDEQQEQTIAEDLVVTKYKMGGDIANRVLRSLVEASSSGVSVLSLCEKGDAMIMEETGKIFKKEKEMKKGIAFPTSISVNNCVCHFSPLKSDQDYILKQGDLVKIDLGVHVDGFIANVAHTFVVDVAEGTPVTGRKADVIKAAHLCAEAALRLVKPGNQNTQVTEAWNKVAHSFNCTPIEGMLSHQLKQHVIDGEKTIIQNPTDQQKKDHEKAEFEVHEVYAVDVLVSSGEGKAKDAGQRTTIYKRDPSKQYGLKMKTSRAFFSEVERRFDAMPFTLRAFEDEKKARMGVVECAKHELLQPFNVLYEKEGEFVAQFKFTVLLMPNGPMRITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELKALLQSSASRKTQKKKKKKASKTAENA	349869	357333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_349961_350008_350106_352255_352385_352651_352758_352864_352935_353143_353237_354962_355027_355271_355351_355504_355584_355671_355806_356499_356595_356746_356875_357038_357093_357307
899442	contig_854_pilon	-	3709	14	Intergenic	novelGene_36377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1111.51563990413	469	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	19	2331	993124	976077	FALSE	15	CCCTGAACTTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLTREMVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISRRIFVIGDNDYFSFQPDRPLGTQLTVTLTQHVQPAAPKDLQVSDARDRFLLTWRVHLGGLQSSWLSEWHLESELVYRRLQDSWEEASILYSNSSQAVLGPEHLMPSSTYVARVRTRLAPGTGLSGRPSEWSPEVRWDSQPGDEAQPQNLQCFFNGADMLSCSWEVRSEVASSVPFTLFYKPSPDTEEKECSPVMKEKLSSPYTRHRCQIPVLDSGTHSQYTVSVQPKKEEKFIKSSEHIQMGRPTVNVTMDGDSYILRWEAQKQYYDHIVYTFEVQYRKDTVSWEESKTQPLKNMHSMSLPPLEPSTRYWARVRVKPTLSSYNGIWSEWSEECSWDTEWVLPTWVLVFMLVLITLALLPMLRFCFVYGYRLNQKWKEKIPNPSKSHLFQNGSAGLRLPDSTSTFTSRSLLYKGPWDSHVPELEGVFPAHCGDSEVSPLTTENPKDACDSPSEPDMTPATLEPMEQPPGPSSRTESEVSSFDFNGPYLRSPQSHSLPDIWGQLTSLDVGRSRKPLPPGSLEYLCLPAGGQVQLVPLSQAMGQRRAMDVDGVPSPGAEGSFSLGSGEGPAPPPPGPMTGTQDPKDSPSALHTGAGGPQDSVVASGYVTSADLVFTSAPEALSGSLTPPLGHPSHQNPSPCPGLAMLPSGAGSPRQGHQPRLSHPELTQQEAGG	993142	974698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976166_977430_978087_978787_978892_979721_979780_980008_980100_980727_980891_981766_981907_984025_984184_984332_984469_985011_985181_985260_985419_991117_991309_991918_992043_993048
899443	contig_13878_pilon	-	2165	7	Intergenic	novelGene_165732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	343.350849067766	458	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	609	1289	57227	42986	FALSE	35	TACACTTGACACATTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDDMVTWDEYNIQMYDRVIDFDENTALDDAEEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRRDPTATEDPEWILVEKDRFVNDYDKDNDGRLDPQELLSWVVPNNEGIAQEEALHLIDEMDLNGDRKLSEAEILENQDLFLTSEATDYGRQLHDEYFYHDEL	60675	42109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_43139_45954_46098_46987_47085_52427_52542_57053_57251_59806_60072_60355
899444	contig_13244_pilon	-	3482	1	Intergenic	novelGene_87004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCACTAACACATGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476381	472899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_472900_476400
899445	contig_12257_pilon	-	2653	3	Intergenic	novelGene_152095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	289	615	133724	118522	TRUE	15	ATTTTGTCATTCACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVKKPHSWFFQQREWREQQQQQQQQPGQGKWARERLKPDHHWLQPQHPPACPRAVCALPRPLLPHQPDPEGGPLPQPTAPRTASDMMLRQSLAFCEGTALCRVDTST	134012	116424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_116689_116747_118821_133696
899446	contig_610_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_76810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTGCCATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329119	331645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_329100_331600
899447	contig_2854_pilon	-	4768	3	Intergenic	novelGene_120804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	877	1191	80765	80016	TRUE	20	TGGCCCGAACTCCCGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLHGGSQAGLKRQRRESQQGTCRSTEENLPPFIFSDPFIFSDASRLATTGGGVKTESRCSAPGLIFPLLGHSDTPSTACLCVCLLLRSTSSSGKQVCPHHPCP	81641	68433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_69190_77194_80051_80485
899448	contig_6677_pilon	-	1392	7	Intergenic	novelGene_114211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCATCCGGGCCGCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626428	584904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_584996_594939_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624540_625422_625530_626325
899449	contig_12250_pilon	+	2707	15	Intergenic	novelGene_80562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	130.074625362771	359	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	412	2538	291174	304188	FALSE	5	GCTGCTCTTCTGTCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGVQPVSGSSPIPSVPTCFYPGSGTQRCCHQRSHQVRGSWPGGFSPSGQPTDTPSPEPEPEPDRHPRHSSSSFWARCFGCCSCRNADDDWGGGSGSRGPGSSSGGHRPDSRGSDSRQPGSRGTGVNTAGDGTIQEGMLVVTGVNLLSSHSDQNRQEHHTDEFEYDELIVRRGQPFHIVLFLSRPYESSDHIALELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKGGSGGWKAQVTKANGQNLNLRVHTSPNSIIGKFQFTVRTRSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDREDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPISVSRVVSAMVNSLDDNGVLIGNWSGEYSQGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTSFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLITTKAIGSNMRDDITHLYKHPEGSEAERKAVETAAAHGSKPNVYAMSNSAEDVVVQVETQDPVMGQDLTVCVVLSNRGSSHRTVNLHLYLSVTFYTGVTGPVFKDSKKEAVLAPGASERVVMPVAYQEYRSHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFRNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQTFVPVRPGPRQLIASLDSPQISQVHGVIQVDVAPASGGRGFSDTGGDSHSGETIPMASRGGA	289951	304357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_290097_290776_291038_291168_291358_292372_292622_292986_293106_293244_293353_293767_293943_294377_294517_294662_294767_297454_297544_298029_298184_298306_298589_298732_298894_299252_299390_303962
899450	contig_12032_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_139281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAGCTCTGTAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104738	103570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_-_103600_104700
899451	contig_5686_pilon	+	2987	1	Intergenic	novelGene_45449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	653	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATGACCCAGTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220222	223209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_220200_223200
899452	contig_1076_pilon	+	6581	16	Intergenic	novelGene_101138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	113.277751076232	7	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	1063	3009	993281	1010127	FALSE	5	TTTATTGCCCGTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRMTEELSGKSDELIRYQEEISSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELRLHLQASKDAQRQLTVELHELQDRNRECLGMLHESQEEIKELRSRSGPAAHLYFSQLYGDFSGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSVFKQKAQQKRVFDTVKAANDTRGRSLPFPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESSLQQTEDKTLLNQDSTSEEVPRNTQEMGQPGPSGDNDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAQEWERKIQILADQNEGLSGCGTPTKSLATLCTDQSEITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLHHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLPEDAIYHLSDLEEDEEEGITFQVQQPLQVEQEPSVSKPVTGIFLLPITSAAAASNPGKCLSCTNSTFTFTTCRILHPSDITQVTPSSGFPSLSCGSSGSSSSSTAVNSPAMSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTVSLAKLLQERGISAKVYHSPVSENPILQPPPKTLTIPSTPPNSPSHSLCPSPLPFEPRAHVSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKTPDTQENGRSQEADIGLQKPDSAVYLNSSGSLLGGLRRNQSLPVMLASFGTPVCTSSPKMGILKED	945802	1013699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_945915_973784_974073_980669_980869_988168_988246_989739_989857_990860_991034_991716_991796_993263_993395_993833_993909_995092_995231_1000199_1000280_1000586_1000791_1003260_1003560_1005225_1005478_1007337_1007444_1009448
899453	contig_3409_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_172312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	732	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCAATAAAAGCCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173186	170871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_170900_173200
899455	contig_11855_pilon	+	1910	3	Intergenic	novelGene_67116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_2	30	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	260	1009	2445507	2446256	FALSE	35	AGGAAGAGGTGACTGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440253	2447157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440407_2441567_2441665_2445497
899456	contig_13481_pilon	+	2844	6	Intergenic	novelGene_119446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_5	78.9490975249243	365	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	655	1044	1091943	1093268	FALSE	20	CCGACTTCCAGCGACCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066915	1095068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071054_1071222_1083899_1083990_1084549_1084701_1091839_1092052_1092987
899457	contig_13780_pilon	-	2777	16	Intergenic	novelGene_149074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_5	1565.87461396712	53	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	44	2233	761485	657588	FALSE	35	TCAGTAAAAACTCTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSVASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	761528	657043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_761434
899458	contig_7356_pilon	-	3014	2	Intergenic	novelGene_60427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_1	0	198	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	123	713	515889	515299	FALSE	55	AATATATGAGAAAGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSGNVFQFVKLQPRSQHVFSSFSFK	517170	512997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515921_517079
899459	contig_1618_pilon	-	1796	2	Intergenic	novelGene_141779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1285	1599	125526	125212	FALSE	25	TGTAGCTATAGGCAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHDLHQTESSTTRWFPATTTDCSDKDHNTGSQTELEKNIEQNSNSHTHTHTHKNQAYWPDRDWRNPKSMAPRHPFSSVMKSLLRFTLQSKIRQAHKTKQD	142291	125014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_125755_141235
899460	contig_10176_pilon	-	2858	9	Intergenic	novelGene_72720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_6	257.000486380863	225	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1127	1894	268025	261068	FALSE	35	GCAAAAATTGTCAAGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYISEHCILLGSVGYSGHSVDKFLLFFIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_268677_270329_270407_271918_272048_273752_273864_274897
899461	contig_19380_pilon	-	3455	1	Intergenic	novelGene_178736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1	444	70088	69645	NA	15	CTCTCTTAGGCAGTATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKFSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGHNKCWRGCGEMGTFVHSCWECKMIQPFWKMIWRFLKKLEIDIPFDPTIPLLGIYTREIRVVPRIDIRTPMFMAALFTIPKRWKQPRRPLTDEWINKLWYIHTMGVLGNEKEQ	70088	66633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19380_pilon_-_66600_70100
899462	contig_10466_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_173623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAGAAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82755	80691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_80700_82800
899464	contig_6215_pilon	+	2123	5	Intergenic	novelGene_21231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	337.316246273434	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	94	702	571336	599783	FALSE	50	TATCAAAAATCATTAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPGAVVCCLLAVWYHRPGFGMPLAPAGSRLPGPCSSRQFWHVTDLHLDPTYHITDDHTKVCASSKGANASNPGPFGDVLCDSPYQLILSAFDFIKNSGQETSFMIWTGDSPPHVPVQELSTDMVINVIANMTTTVQSLFPNLQVFPALGNHDYWPQDQLPVVTSKVYNAVANLWKPWLNEEAISTLRKGYVAVLPEPDRS	571242	601204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571451_582748_582963_584025_584171_588153_588251_599745
899465	contig_9668_pilon	+	3062	3	Intergenic	novelGene_58215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1856	2194	543697	544035	FALSE	40	AAAAGTCATTATCATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTGYPEASMKPIIFTNCYLVITMIGNNKWAGRGYLDIKIIKYDNWAQLLYLTKTNKHRQKLTSLKPRTLQTQKEPQFIRYVIIRITHLLKQIYDSNLKNTVIIMHIKIIS	539870	544903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_540337_540606_541578_543278
899466	contig_18850_pilon	+	1312	5	Intergenic	novelGene_142442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	524	junction_4	710.260647579464	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	3	548	177760	180704	FALSE	20	CCCCAGCCAGACGCAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	177757	181468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515
899467	contig_9609_pilon	-	2342	5	Intergenic	novelGene_22977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTACCTCGCACCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319815	309922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310031_311499_311590_313098_313264_314272_314370_317933
899468	contig_6325_pilon	+	3567	1	Intergenic	novelGene_143352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	316	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2935	3294	346807	347166	NA	30	TGCAGCAGGTATTATTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPADRPLSGPRPLALLQQVLQSSFSSVDKCPEPPHSSSKPQPEGTQLSQLQWVGTPTTPSPAGLLVLLLLLPLFLCHCFLPSYAVSSVTALSFCFSGLGGSQHRNPESKGCTPLPVLVS	343872	347439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_343900_347400
899469	contig_10734_pilon	+	5811	25	Intergenic	novelGene_51241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	459.863277915295	27	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	405	2672	1243300	1284988	TRUE	30	GTGGTACTTAAATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKSLLKRRRRLSLFRGACKKL	1221230	1334970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1221446_1240226_1240306_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280005_1281767_1281885_1284381_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
899470	contig_5020_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_27931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCAAAAAACCCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137088	138379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_137100_138400
899471	contig_2114_pilon	-	2415	6	Intergenic	novelGene_104237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	2103	2414	158530	153485	FALSE	20	AGCGCGGCCACTTCCGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAQPEVSELLVLEAMVSDQGAPQQSSGGAASCSVLPAVGDGRLHGYLEQERGPVGLHGCGGRPPLLPTPPARGASSAGGGDNKAAAAAAAAAAAAAPQHGSA	166723	153483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_153656_158389_159082_159853_159920_161009_161194_162413_162553_165561
899473	SIRV6	+	933	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	15	589	15	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	243	734	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1102	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
899474	contig_14768_pilon	+	5898	25	Intergenic	novelGene_115083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	232.803651024969	536	133	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	2962	5094	255388	260918	FALSE	20	CATGTTTCTGAAGTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLAELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGILEQVEAYQTEAREALASLPSSPGLLQSLLERGQRLGVEVPEDQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKARAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPNPLSSSTTASSATSICVCGQVPAGVGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRSSPISSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLRRLAELHQWVQAEPRPEEPPTYPSVPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPGEGLDLELLSSLLPQLTGPMLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGKPPDLERIRTLLELEKAEHHGSRARGRALEKRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEAQEEEELEEETGGEGPIPPLPTVGSPIPQENQNGLELGLVASAGLSTPFSTLAPRLHMPCSQQLPQQQL	227337	261722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_+_227739_231589_231668_233935_234059_234352_234524_235056_235192_235913_236038_236145_236330_237318_237478_239520_239641_239772_239932_240800_241024_241121_241285_248693_248814_248923_249119_254073_254256_254343_254743_255362_255469_256182_256542_257164_257304_257843_258024_258367_258506_258721_259322_260037_260108_260246_260447_260552
899475	contig_177_pilon	+	4332	6	Intergenic	novelGene_41788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	166.722044133342	459	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	124	996	385142	393448	TRUE	45	TTTCCGAGAACATCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQVTELVLRGVMGLGASLQISAACGGPKGVHQEEPHPNQASCLGDVPRGDCFAGLSGSQPHKHLPPFLEKKREDPRSPKAPRSRWEPEEELQQDQSEGAPRPGICLQNSTPSIQGQREGSKGAPKEVIGTEAEGRGGLPGAETQRSVEETHEGEAEWGHVQRLLTSSPRRTIEEVTWGRRQESEVPSIPGGALGPSGPGKRGRLHHREATKTNRSNQRGWERGASRSIPAGCGQEPQTSTPEGQGAGPAPEAAADGTGPGAEGLAEATQQVSGRERPAAGRASAETTGG	385018	403830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_385848_386533_386641_393388_393536_399296_399408_399988_402933_403636
899476	contig_11448_pilon	+	4214	2	Intergenic	novelGene_66347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCAGCATTCTATCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160669	164921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_161090_161127
899477	contig_12540_pilon	+	1944	5	Intergenic	novelGene_148128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	603.622139670175	740	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1142	1741	1250092	1252921	FALSE	5	GTCTCATCTGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLSTRSRLAESSGSFVGPPEQRVGDGCDFVPLSVQAQLLSRLPIPEGQVITINPSLSVEEAAEDYAKKLREAFQGDSIPVFDLLILGIGPDGHTCSLFPDHPLLQEKEKIVAPISDSPKPPPQRVTLTLPVLNAARTVIFVATGEGKAAVLKRILEDHEENPLPAALVQPHTGKLCWFLDEAAARLLTVPFEKHSTL	1248851	1253124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1249765_1249863_1250311_1251168_1251271_1251605_1251747_1252783
899478	contig_17171_pilon	+	1673	8	Intergenic	novelGene_147362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	430	junction_4	283.912389475978	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	100	912	230151	251079	FALSE	25	TCTGAAGTTAGAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKAIDKNFDSDISSVGIDGCWQADSQRLLNEVMVEHFFRQGMLDVAEELCQESGLSVDPNQKEPFVELNRILEALKVRVLRPALEWAVSNREMLIAQNSSLEFKLHRLYFISLLMGGTTNQREALQYAKNFQPFALNHQKDIQVLMGSLVYLRQGIENSPYVHLLDANQWADICDIFTRDACALLGLSVESPLSVSFSAGCVALPALINIKAVIEQRQCTGVWNQKDELPIEVDLGKKCWYHSIFACPILRQQTTDNNPPMKLVCGHIISRDALNKMFNGSKLKCPYCPMEQSPGDAKQIFF	211340	251840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_211362_230072_230208_231646_231748_243990_244158_244802_244969_247260_247364_249406_249562_251015
899479	contig_1719_pilon	-	2521	15	Intergenic	novelGene_87277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	506.763238200875	29	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1701	820	2520	373576	359753	FALSE	30	CTGTTTATGAGGTGAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQ	382168	359751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375439_375730_375868_376035_376227_381987
899480	contig_5954_pilon	-	1775	3	Intergenic	novelGene_28787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392957	1391022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391580_1391633_1391863_1391968
899481	contig_14807_pilon	-	8037	46	Intergenic	novelGene_124722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	149	junction_7	627.204924867286	500	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1791	5376	2435	7810	58006	45435	FALSE	5	CTCCTGTGGTGGTCTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFADQATPTSPIRVKVEPSHDASKVKAEGPGLSRTGVELGKPTHFTVNAKAAGKGKLDVQFSGPAKGDAARDADIVDHRDNTYTVKYTPVQQGPVGINVTYGGDPIPKSPFSVGVSPSLDLSKIKVSGLGEKVDVGKDQEFTVKSKGAGGQGKVASKIMGPSGTVVPCKVEPGLGADNSVVRFVPREEGSYEVEVTYDGAPVPGSPFPLEAVSPTKPSKVKAFGPGLQGGNAGSPARFTIDTKGAGTGGLGLTVEGPCEAQLECLDNGDGTCSVSYVPTEPGDYNINILFADTHIPGSPFKAHVVPCFDASKVKCSGPGLERATAGEVGQFHVDCSSAGSAELTIEICSEAGLPAEVYIQDHGDGTHTITYIPLCPGAYTVTIKYGGQPVPNFPSKLQVEPAVDTSGVQCYGPGVEGQGVFREATTEFSVDARALTQTGGPHVKARVANPSGNLTETYVQDCGDGTYKVEYTPYEEGLHSVDVTYDGSPVPSSPFQVPVTEGCDPSRVRVHGPGIQSGTTNKPNKFTVETRGAGTGGLGLAVEGPSEAKMSCMDNKDGSCSVEYVPYEAGTYSLNVTYGGHQVPGSPFKVPVHDVTDASKVKCSGPGLSPGVVRANLPQSFQVDTSKAGVAPLQVKVQGPKGLVEPVDVVDNADGTQTVNYVPSREGPYSISVLYGDEEVPRSPFKVKVLPTHDASKVKASGPGLNTTGVPASLPVEFTIDAKDAGEGLLAVQITDPEGKAKKTHIQDNQDGTYTVAYVPDVTGRYTILIKYGGDEIPFSPYRVRAVPTGDASKCTVTGAGIGPTIQIGEETVITVDTKAAGKGKVTCTVCTPDGSEVDVDVVENEDGTFDIFYTAPQPGKYVICVRFGGEHVPNSPFQVTALAGDQPTAQPALRPQQLAPPYTYAQGGQQPWAPERPLVGVNGLDVTSLRPFDLVIPFTIKKGEITGEVRMPSGKVAQPAITDNKDGTVTVRYAPSEAGLHEMDIRYDNMHIPGSPLQFYVDYVNCGHVTAYGPGLTHGVVNKPATFTVNTKDAGEGGLSLAIEGPSKAEISCTDNQDGTCSVSYLPVLPGDYSILVKYNEQHVPGSPFTARVTGDDSMRMSHLKVGSAADIPINISETDLSLLTATVVPPSGREEPCLLKRLRNGHVGISFVPKETGEHMVHVKKNGQHVASSPIPVVISQSEIGDASRVRVSGQGLHEGHTFEPAEFIIDTRDAGYGGLSLSIEGPSKVDINTEDLEDGTCRVTYCPTEPGNYIINIKFADQHVPGSPFSVKVTGEGRVKESITRRRRAPSVANVGSHCDLSLKIPEISIQDMTAQVTSPSGKSHEAEIVEGENHTYCIRFVPAEMGTHTVSVKYKGQHVPGSPFQFTVGPLGEGGAHKVRAGGPGLERAEAGVPAEFSIWTREAGAGGLAIAVEGPSKAEISFEDRKDGSCGVAYVVQEPGDYEVSVKFNEEHIPDSPFVVPVASPSGDARRLTVSSLQESGLKVNQPASFAVSLNGAKGAIDAKVHSPSGALEECYVTEIDQDKYAVRFIPRENGIYLIDVKFNGTHIPGSPFKIRVGEPGHGGDPGLVSAYGAGLEGGVTGSPAEFIVNTSNAGAGALSVTIDGPSKVKMDCQECPEGYRVTYTPMAPGSYLISIKYGGPYHIGGSPFKAKVTGPRLVSNHSLHETSSVFVDSLTKAASAPQHGAPGPGPADASKVVAKGLGLSKAYAGQKSSFTVDCSKAGNNMLLVGVHGPRTPCEEILVKHMGSRLYSVSYLLKDKGEYTLVVKWADEHIPGSPYRVTVP	66374	45207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_45623_45932_46137_46219_46439_46550_46728_47474_47608_48158_48275_48434_48573_48678_48946_49092_49216_49290_49444_49524_49729_49833_49996_50089_50264_50500_50630_50801_50943_51033_51137_51264_51361_51468_51717_53836_54027_54398_54556_54644_54769_55120_55292_55377_55539_55619_55783_55863_56038_56121_56720_56897_57161_57279_57398_57555_57726_57807_57899_57985_58147_58234_58359_59490_59635_59720_59835_59926_60122_60247_60385_60521_60646_60719_60858_61309_61511_61596_61760_61848_61927_62007_62127_62649_62798_62881_62980_63084_63334_66112
899483	contig_10793_pilon	+	2200	13	Intergenic	novelGene_83395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3401.0760633789	196	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	131	868	146975	163940	TRUE	50	TAAGTATGTATTAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130871	168194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
899484	contig_8057_pilon	-	2855	1	Intergenic	novelGene_176646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	342	1029	67	1095	259613	258585	NA	35	CCCATGAAACCATGACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTRAKCMDLQMPFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYVKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKCRYDAGISAAIWIIVGTACLPLPILRNADLANNTESCFADLGLQHISMASAIGMVTVAEIGGFVLPVVIITSCTWKTRKSLREFQVPSQNTEERKKALRMVLTCAVVFVVCFTPYHLNFPFFMMVKQHVFSSCSFIKSTLCFHIISLCLANLNCCLDPVVYYFMTSEFRDQFSEHGGLVLQSCVRCQESNWEINQRKEDLQNISLEFLDDSKTI	259679	256824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_256800_259700
899485	contig_17753_pilon	-	1236	2	Intergenic	novelGene_105071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTAGAACATGAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51448	50108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_50222_50325
899486	contig_2969_pilon	-	1693	15	Intergenic	novelGene_157059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_13	59.0108948778589	118	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1614	80	1693	956248	758023	FALSE	10	ATCTGGTTTTTGGTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVKVAVRVRPMNRREKELEAKFIIQMEKSKTTITNLKIPEGGTGDTGRERTKTFTYDFSFYSADTKSPDYITQEMVFKTLGTDVVKSAFEGYNACVFAYGQTGSGKSYTMMGNSGDSGLIPRICEGLFSQINETTRWDEASFRTEVSYLEIYNERVRDLLRRKSSKTFNLRVREHPKEGPYVEDLSKHLVQNYGDVEELMDAGNINRTTAATGMNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANPLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLKMLLAQGNQIALLDSPTALSMEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKEQTLALRKEGIGVVLDSELPHLIGIDDDLLSTGIILYHLKEGQTFVGREDASTEQDIVLHGLDLESEHCIFENIGGTVTLIPLSGSQCSVNGVQIMEATHLNQG	956327	758022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_758163_759831_759884_760751_760872_862784_862845_866552_866619_873646_873823_875530_875663_875845_876015_877462_877606_880937_881048_881786_881885_884195_884313_890627_890742_892781_892852_956201
899487	contig_10973_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_150360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	463	975	2730	2218	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3192	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3200
899488	contig_7898_pilon	+	711	5	Intergenic	novelGene_47611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	536.687525474554	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	278	379	598694	598961	TRUE	25	CAAGAGATCTCTTCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFPEQLGLGLEASVSLCVGDTRPRHQDNQPSPSTRWESVSGRPAGLAHPPSSPLPPQHFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKVSRIPSAKLLKQPS	563006	600140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_563183_596035_596137_598693_598752_598917_598998_599844
899489	contig_10749_pilon	-	1708	14	Intergenic	novelGene_133448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1209.87192828011	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	324	1331	155250	136250	FALSE	35	GAAACTGGATGCCACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157792	135872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
899490	contig_10890_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_166783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCCCCTGCGCGCGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125694	161109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_126759_127970_128135_130201_130278_156818_156927_160559_160681_160953
899491	contig_11752_pilon	+	4743	2	Intergenic	novelGene_37590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_1	0	545	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	3078	3725	87165	88933	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84087	89951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667
899492	contig_12528_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_81274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTAGTGGTACAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238482	239882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_238500_239900
899493	scaffold_4438_pilon	+	1813	5	Intergenic	novelGene_174535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	56.0195278452077	35	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	357	695	395703	414051	TRUE	30	AATCAGCGAGACATGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQVSRSSKASISIAANTSTQRDLRGSAY	395346	422518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_413970_414114_419006_419363_421818
899494	contig_14687_pilon	-	1993	6	Intergenic	novelGene_107918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	264	junction_3	784.289385367417	14	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	1113	1991	458232	457249	FALSE	40	TTCAGGAAATAATCAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENELKNKNTSKINGEEGKSQSNEKTGEQTLIDGPAPWDQIQEGEKHEEVEKLKSVDSQLQEKKIIHPSEQAALSDHNPNDLLLQECNMEKIHTVELVPKEKFVSGPPTPKCVIDITNDTNSQKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSESKHSIANTKYLETTKQDSDPSWVSDVVKVDLTQSNTNA	527957	457246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_457977_458081_458516_459962_460088_462780_462887_523429_523544_527473
899495	contig_3018_pilon	-	2722	12	Intergenic	novelGene_78834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	451.3082177825	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1356	1365	2720	577034	550964	FALSE	60	ACTTGAAAAAAGAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEGGKKCVVYSERWRSNPISQSNHVECYFILLFEIGYYLCSNFSFAFEDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFA	625130	550961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_577834_580093_580175_583417_583598_624826
899496	contig_854_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_36378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974703	976404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
899497	contig_5918_pilon	+	4878	21	Intergenic	novelGene_99533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	294.369066819189	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1191	3576	435	4010	723163	775314	FALSE	20	CTTTTTATTGTAGTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRASDKDIAVSKNTSVPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGALSPSLGNSSVLKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQAKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSVVSSPLSSPLHRSGIDITDFQAKREKVHSQYPPVQRLVTPKPVSVATNRTVYFKPSLTPSGESRKANQRVEKKHNTGYEKNRTPEQNREQRESGFSYPNFSMPAANGLSPGAGRGGGKMRRERTRFVASKPAEEEEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFSFSSSEITASSPSPVSPSQLLTNKVQTTSPSSTGSPMFRFSSPIVKSTEADVLPPSSIGFTFSVPVAKTTELSGSSSTSEPITSSSAQDTTSVNSTSCKKKLDEDCEGLFVPAKVLKEGSVLDVLKNPGFLSPKVDSLAAQPTTTSPAVYTRPAISSFSSSGVGLGEGLKAGSSWRCDTCLVQNRVTDNECIACQATKSPPRDSAKQMGVGTASQSGKPAPPAAGTGFGDKFKPAAGAWDCDTCLVQNKPEAVKCIACETPKPGTGVKRALTLPAASESAVTVTASSSSCTVTTGTLGFGDKFRRPLGSWDCPVCCVSDNAGDDKCVSCMSEKPGISVPTSSSSTPPVSLSSGGSLGLDKFKKPEGSWDCEVCLVQNKPESARCVACESAKPGTKSEFKGFGTSSSSSNPAASSFKFGIQPSSSGPSQTSTNTGNCKFGDKGGFTAGVASDSESANPMSGGFTFSKPTGDFKFGVSSDPKPEEDKKDSKNDNNFKFGLPSGLSNPAPLAPFQFGVSNLGQQEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINPAPAATNTTVTSETKSSFSFGTIETKSVSVSPFTCQTAEASKEEKPAARVGFTFGSVEQASLPSTSAFVLGRTEEKQPEPVTSTSLVFGRKADGEEPKCQPVFAFGSSEPTKDESASKSTFSFSMAKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSATADQGAAKAVFSFLNNSSSNSSPPATSTSGVLFGSSTPSSSAPAAAFVFGQASNPAGGPAFGNSAESSPSQSLLFSPENKPAAASVTAAAVAPFVFGPGAGSSTTATAGFTFGAPTTSSSAGSSFVFGTGPSSTPSASPAFGASQTHPPLF	698968	776182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_699091_712246_712476_723079_723329_723485_723626_723702_723832_730813_730931_731037_731083_731191_731246_733163_733311_737959_738013_738277_738405_744476_744615_745267_745367_746146_746235_750662_750789_753153_753772_760679_760875_764186_765072_767386_767744_768510_768583_775294
899498	contig_1301_pilon	-	3796	21	Intergenic	novelGene_47396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	559.475904306879	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1091	3276	89	3364	852486	769450	FALSE	15	TACTTTGTGTTTGTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPICPVVSFTYVPSRLGEDAKMATGNYFGFTHSGAAAAAAAAQYSQQPASGVAYSHPTTVASYTVHQAPVAAHTVTAAYAPAAATVAVARPAPVAVAAAATAAAYGGYPTAHTATDYGYTQRQQEAPPPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVAAAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSSTVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAAAAAAAAATAAWTGTTFTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHLEGQKHKKKEAALKASQNTSSSNNSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVVKLHTKLGKPIPSTEPNVVSQAAASTAVSASKPTASTSSIAASNCTVNTSSIATSSVKSLTTTGNSSLNITANSKVSALPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKTEDLKGTECVKSTPVTSAVQMPEVKPDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECSFNDPNAKEMHLKGRRHRLQYKKKVNPDLQVEVKPSIRARKIQEEKMRKQMQKEEYWRRREEEERWRMEMRRYEEDMYWRRMEEEQHHWDDRRRMPDGGYPHGPPGPLGLLGVRPGMPPQPQGPASLELSKAKKDSESLVFKPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKIVSITERALKLVSDSLSEHEKSKNKEGDDKKEGGKDRALKGVLRVGVLAKGLLLRGDRNVNLVLLCSEKPSKTLLSHIAENLPKQLAVISPEKYDIKCAVSEAAIILNSCVEPKMQVTITLTSPIIREENMREGDVTSGMVKDPPDVLDRQKCLDALAALRHAKWFQARANGLQSCVIIIRILRDLCQRVPTWSDFPSWAMELLVEKAISSASSPQSPGDALRRVFECISSGIILKGSPGLLDPCEKDPFDTLATMTDQQREDITSSAQFALRLLAFRQIHKVLGMDPLPQMSQRFNIHNNRKRRRDSDGVDGFEAEGKKDKKDYDNF	852574	769017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_769630_773755_773854_774332_774445_790077_790174_791035_791134_795799_795942_798096_798248_799191_799398_799683_799735_800425_800589_804161_804308_805024_805145_805936_806134_810303_810596_811766_811959_814796_815045_819983_820203_822469_822615_824145_824429_852066_852167_852449
899499	contig_17274_pilon	-	2073	9	Intergenic	novelGene_26469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTAACTGCTCTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56005	6982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_7084_26182_26474_27831_28000_30126_30210_42653_42711_47231_47294_51701_51784_54320_55370_55825
899500	contig_7272_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_25324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538693	536819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_536800_538700
899501	contig_7157_pilon	-	2037	5	Intergenic	novelGene_131314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	548.960551861425	8	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	105	440	1004754	997503	FALSE	30	GAACCATTGGACTCTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKKGEEALFTTRESVVDYCNRLLKKQFFHRALKVMKMKYDKDIKKEKEKGKAESGKEEDKKSKKENIKEEKMKKEKEKKKDGEKEESKKEAPGTPKKKETKKKFKLEPHDDQVFLDGNEVFVWIYDPVHFKTFVMGLILVFESFN	1010600	995905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_997523_1003386_1003448_1004298_1004389_1004589_1004795_1010536
899502	contig_16594_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_53813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	654	1043	115812	116201	NA	35	GCTTTGGTTTCCAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHNQPSRVCTHAIILVT	115158	117759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115200_117800
899503	contig_9739_pilon	-	3239	1	Intergenic	novelGene_165084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGATACTTTTCACCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18511	15272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_15300_18500
899504	contig_12864_pilon	-	3848	18	Intergenic	novelGene_76369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_17	111.656913964099	21	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	1260	3608	202672	183508	FALSE	30	AAGGCAAAGTTTAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAYLDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPSNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDEERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLVLTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADSLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFPHAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTETYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKINKPGNMIVAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLRCANPKKQPQEHKCISVCYHLFPPDT	213604	183267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_183745_184956_185105_185524_185706_187944_188120_191141_191256_191350_191452_194814_195003_196047_196181_198165_198471_199369_199491_200619_200954_202138_202331_202552_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
899505	contig_4151_pilon	+	2093	5	Intergenic	novelGene_65232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	12.3566783562574	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	512	1012	663144	663644	FALSE	25	TTACATTTTAAGCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528860	664725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_592891_593039_597782_597838_599620_599737_663078
899506	contig_4339_pilon	+	3153	1	Intergenic	novelGene_146096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTTTGCAATAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122789	1125942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1122800_1125900
899507	contig_9113_pilon	-	2250	6	Intergenic	novelGene_68587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	642.28199414276	261	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	349	1401	348512	347395	FALSE	20	TAATCTGTTTTCCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVSQHAAQIHRALLEFNYRGQQWGLQ	364481	346545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_347470_347534_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364434
899508	contig_7635_pilon	+	4005	1	Intergenic	novelGene_171375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157816	161821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_157800_161800
899509	contig_5686_pilon	+	3396	16	Intergenic	novelGene_45261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1692.32071297244	29	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	46	1938	93843	215344	TRUE	50	TTAAAAAAAAATTCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKLQVSTSGSQGAS	93797	220930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_215305_215475_219533_220386_220454
899510	contig_7996_pilon	+	4579	8	Intergenic	novelGene_165151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	905	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGCTCCCGCTGCGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213583	263532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_216686_218812_218995_222166_222331_223834_223931_226680_226847_227936_228114_232744_232928_263023
899511	contig_15991_pilon	-	2418	7	Intergenic	novelGene_70943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_6	147.423426451384	96	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1340	1834	128802	123001	FALSE	15	AATAGTGTTGTCGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPITVIKTRYESGRYGYQSISTALKTIYRSEGHRGLFSGLTATLLRDAPFSGIYLMFYNQTKNIVPQDQLDAVLIPFVNFSCGIFAGVLASLVTQPADVVKTHMQLAPVKCRWIGQTAALIFKDHGLRGFFQGWVPRALRRTLMAAMAWTVYEEMMAKMGLKS	136553	122416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_123124_124818_124986_127319_127489_128766_129215_130089_130175_130819_131646_136537
899512	contig_12528_pilon	+	2574	17	Intergenic	novelGene_81348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_9	117.878893758594	353	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2307	268	2574	982847	1053778	FALSE	25	TAAGTGAAGGCTGCCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKPPNRPGITFEIGARLEALDYLQKWYPSRIEKIDYEEGKMLVHFERWSHRYDEWIYWDSNRLRPLERPALRKEGLKDEEDFFDFKAGEEVLARWTDCRYYPAKIEAINKEGTFTVQFYDGVIRCLKRMHIKAMPEDAKGQDWIALVKAAAAAAAKNKTGSKPRTSANSNKDKDERKWFKVPSKKEETSTPSATPEVEKKEDLPTSSETFVGLHVEHVPKMVFPQPESTLSNKRKNNQGNSFQAKRARLNKITGLLASKAVGVDGAEKKEDSSETAPMLEQAISPKPQSQKNNEADISSSANTQKPALLSSTLSSGKARSKKCKHESGESSGCIKPPKSPLAPELTQVEDLTLVSQLSSSVINKTSPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEVPDVAHLSLEKLGPCLPLDLSRGLEVTAPVVPDPSYRNEFPRVEKEEAQMLTYPSSKAVADGRGAPTASGISKTEKKVKLEEKSSTTFGKRKEKDKERKEKRDKGPYKPKQKKKKKKKKKSKQHDYSDYEDSSLEFLERCSSPLTRSSGSSLALRSMFTEKNTTYQYPRAILSVDLSGENLSDVDFLDDSSTESLLLSGDEYNQDFDSTNFEESQDEDDAINEIVRCICEMDEENGFMIQCEECLCWQHSVCMGLLEDSIPEQYICYVCRDPPGQRWSAKYRCDKEWLNNGRMCGLSFLKENYSHLNAKKIISTHHLLADVYGVTEVLHGLQLKIGILK	980261	1053778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_980496_982813_982930_1001357_1001530_1001684_1001770_1005341_1005431_1010529_1010738_1011282_1011412_1016764_1016848_1020325_1020579_1022683_1022873_1023140_1023348_1037916_1037974_1039168_1039277_1046916_1047082_1050164_1050347_1052035_1052136_1053581
899513	contig_8964_pilon	-	5444	4	Intergenic	novelGene_168684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	130	447	618061	617218	TRUE	25	AATTTTCACCCCATTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRFDILNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSFKREERKKRPKCMSEQTLKLALELRVAKANGRNDEVKEMKRRFHRAAREDKVKYYNDICKDLELGNQKGRTHSAFLKLKELKKKIQASSGKNEEWQCRKHKKKMEGIHRVTVPKRIG	618190	347241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_348647_538301_541858_617181_617460_617985
899514	contig_11427_pilon	-	2072	2	Intergenic	novelGene_78992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	46	345	593699	593400	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAKRSLFCHSPVGYKSKFRVSAPGECFLRQLWRKVCAINLPLVWELLCSGTSGPKDALCFRHCFLGGMRFPCVSARFSLLYLKRDCIKTLILSASSV	593744	588954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_589744_592461
899515	contig_4732_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_75492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1401	1706	769510	769205	NA	20	CCTGACTATCCCATTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHRSSWVGGRKERERKATKTKNIKTKQKIQTKKQTNKKIMPKGLGGGGGVNPSGSELMSPQPSNHGPWASSRGLVDRRRVRGGKACISGYQVLCLLLGAP	770910	768352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_768400_770900
899516	contig_7201_pilon	-	1941	2	Intergenic	novelGene_152489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTTCAAAGACTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68513	66401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_67231_67401
899517	contig_15327_pilon	-	2114	18	Intergenic	novelGene_70790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_13	99.6044773246373	327	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	84	2045	1204638	1185925	FALSE	15	TTGGCCGGGCGAGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLQRLQENVEKTLSCLDHVISYYHVASDTERIIREGPTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNSPDSPELNKVKLLFERGKESLESEFRSLMTRHSKVVSPVLILDLISGEDELEVQEEVPLEHLPEGVLQDVIRISRWLVEYGRNQDFMNVYYQIRSSQLDRSIKGLKEHFRKSSSSSGVPYSPAIPNKRKDTPTKKPAKRPGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204721	1185855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192732_1197067_1197236_1199990_1200214_1202992_1203099_1203288_1203474_1204300_1204367_1204578
899518	contig_10734_pilon	-	3944	14	Intergenic	novelGene_50984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55.4462264150469	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	50	1528	306589	292792	TRUE	20	GACAGCTGCTTCCAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSHPGNSSEKGREIKKMSGEFSQILWIGGRNPGEDVEKFKAQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVKSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRISVKEKGVAASSTQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEALVKRVTILCIHGKMKYKRNKIFMEFRKLQNGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYVKFLAINQKCPLQEMRLQKNTADLLPELKAMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYVKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLKMPKMPELKGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKVREKQRQKVLEQKRKERTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKREKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKFKKGKITEEEFEKGLLTSGRRTIKTDFRISDLENDC	306638	288054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_288725_289708_289784_290303_290430_291246_292966_293236_293530_293959_294129_294544_294660_295378_295472_296402_296535_299615_299699_302298_302489_304461_304612_305497_305565_306576
899519	contig_18869_pilon	+	1772	6	Intergenic	novelGene_56456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	182.992240272641	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	90	1040	176729	188974	TRUE	35	CAGGATGTCATCATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGQFALSRRVAELAELPVDNLVIEEITQEMQTLKHIEQWSLKQARIDFWKKCHENFKKNSISSKAASSFFSSQALEACASPAEEQQSGIEERHLLLTLAGHWLAQNDLVPLEELEELEKQIWLCRITQHTLRGNQEDTDPRFSRQISTSGQLSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNGLPSKDSCENRLDGKEEESLNFLIGRLLDDGCVREASRVCRYFGFYNRDVVLVLHCGALASGEAGADDLHAEVQALLQGEPQGWAQAEAAAAEGSDADAGRRRELLQGLLRETGPALSPAHQADHTTNPLSEHWPEHNAHQPGPPQADGLYHGPTSVLPGFYCGPGL	176063	190159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_176141_176716_177409_187841_187931_188134_188291_188948_189101_189553
899520	contig_8274_pilon	-	3777	5	Intergenic	novelGene_178739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCATTTTATAAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226549	149612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8274_pilon_-_149839_167269_167677_222668_223084_223696_224539_224662
899521	contig_17829_pilon	-	1699	6	Intergenic	novelGene_157032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	166.004096335	4	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	272	685	29321	26860	FALSE	45	AATAGGCACGAAATAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKSDMYSLGVILLELFQPFGTEMERAEVLTGLRTGQIPKSLSKRCPVQAKYIQHLTRKNSSQRPSAVQLLQSELFQNSGNVNLTLQRRVIEQEKEIEELKRQLSLLSQDKGV	42899	25845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_26959_28032_28267_29240_29324_29537_29648_36209_36315_42845
899522	contig_2215_pilon	+	5187	1	Intergenic	novelGene_163853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	875	1213	178490	178828	NA	35	GCCCAGCTTACACATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLVSLCIFTGALWLSKIYLFLQSFPHLYPLLLYIRRGPFGLEDIFPTSVSLSQSKQLREKSHSTVEFLFIVAISLSAMVQGWKTPIARFPYIGSLYSNHALQIRGSWSSL	177615	182802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_177600_182800
899523	contig_14744_pilon	-	3131	5	Intergenic	novelGene_65995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_3	332.410138232876	488	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	144	1379	969897	962248	FALSE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPVRPSASSWPSIPPSSRHTAWGLELETILPEEIVSYSYSRRLCSLFYSHLGPSHRVPGILTFLVQSAFLN	970040	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
899524	contig_9809_pilon	-	4536	9	Intergenic	novelGene_176746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	4216	4536	108945	108233	FALSE	10	TGTTCCTAGTCGCCCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFCISKSSTLFSFLPCNWGGGPRAGSAADPRRLRKCGLSCCSFRSRESSDGPWQFSDCRRRSRSMARTCWTRRPVGCQLLLFRAHYFSPSVSEAPIPFASTVASRK	118207	108232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_108510_108901_109027_109122_109325_110410_110494_110650_110781_111744_111818_112240_112362_112466_112589_114804
899525	contig_16122_pilon	-	1078	5	Intergenic	novelGene_134535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	8.31790237980706	181	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	25	570	221023	219244	FALSE	5	TGTGTGCCGTTTCCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRQKILKEKAVPMIEGYMFEEHEMIRRAATECMCNLAMCKEVQDLFVAEGNDRLKLLVLYSGEDDELLQRAAAGGPGHAHLFAAVALQPHPTSDHPLAGDLAGTASEPQPGAAAPGRCGGAEHGRGLEGDRQHLNGE	221047	218735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219630_219716_219835_220669_220786_221002
899526	contig_14970_pilon	+	2552	2	Intergenic	novelGene_45011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	123	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTTTCCTTAAGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140119	150260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_140719_148307
899527	contig_6199_pilon	-	3724	2	Intergenic	novelGene_126345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3410	3712	85033	84731	FALSE	35	ATAAAGAGACAGTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNHCKQRKDWFKVRKIGVNIRVIRKETNNRTHQNKKEKRKDSVNTKSTTVKKMKRKYIKKNDLAHKIYWNNETVSNTDTKDIQMTTLNSYLSIIMLNVN	91742	84718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_86952_90251
899528	contig_13021_pilon	-	2311	6	Intergenic	novelGene_8274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	509.842877757452	487	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	112	972	270418	249850	FALSE	30	TACGGTTGCTAGCCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKARKAMRDNVPEDYGHTPMEVGEYERSSMVTA	270529	248510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249873_251082_251152_252257_252369_259754_260040_265837_266120_270327
899529	contig_4742_pilon	+	2488	4	Intergenic	novelGene_131011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_2	138.901243894918	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	877	2487	278140	284734	FALSE	50	AAAATATACACACTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGLELHRPNLLLGLIIRQKLKRQHSASASTGHAAEAPESVPMSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPKAEKIDKIEEVADGEAKEVKVKVDNHSEATGNSVAVEEETSVPGSSSISPGLLTNLSLRGKPPDISTEAFLTNLSIQSKQEETGDSKERTLKRQLLQDQENNSQDNWTSDTGSPGRSNVGKGSTDGNMSCNDSLVANTRSPQFINLKRDPRQAAGRSQQISTSESKDGENCRNGEKHAPPGLSQNKEHLTEQTSVDEKSSSVEKNSCVQQSDNSSIPQNSASE	277263	284735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_278281_280583_280674_283132_283329_283550
899530	contig_15897_pilon	+	4494	15	Intergenic	novelGene_49587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	281.224518120019	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	901	2706	1740	4445	878208	889144	FALSE	35	GTAGTTTTAGAAATGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRPSGAEDRTGAGAVVSENSPSVGALLVEMEAASVAGGILGARGLYNNSQRSSRGRGLREFNQPEDFPRAKPRRRIASETHSEGSEYEELPKRRRQRGSENGNEGSLLEREESTLKKGDFKDSWRSNKMYSDDHNGPDAKNRGPRAFGRALPPRLSNCGYGRRTFVSKESPHWQSKSPGNSWQEYSSSDTCGSRRSTDRDYIPDSYRHSDSFGGRGFEESRLEDKRSFFPDDHVADSENAENRPFRRRRPPRQDKPPRFRRLRQERESLSLWGPEEEPHLLAGQWPCRSKLCPGGKSSAVGRRSPELSYQNSSDHANEEWETASESSDFSERRERREGHVAEPDSQVDSGLSGASLGEKKELAKRSFSSQRPLVDRQSRKLEPGGFGEKSVRPGGGETSPRYESQQNGTPLKAKRSPEEALPGGLGGCSSGSSHSPYTLERAGHANSDIPEASSKKAEKESKLTAQRAGEQGETMKQFDLNYGNTIIENCGSSPGEESEVGSMVGEGFIEVLTKKQRRLLEEEKRKKEQAVQVPVKGRGLSSRIPPRFAKKQNNLCLEQGDVTVPGNSLGTEIWESSNQALPVQASTSDSWSKAVTAFSSTESGSAEGLKSSQGDSGVDLSAESRESSATSSQRSSPYGTLKPEEMNGPGLAEPKADSHKEQAQKQSEQKDSEQGSGQSKEHRPGPIGNERSLKNRKGSEGAERLQGAVVPPVNGVEIHVDSVLPVPPIEFGVSPKDSDFSLPPGSASGPAGNPVVKLQDALASNAGLTQSIPILRRDHHIQRAIGLSPMSFPTADLTLKMESARKAWENSPSLPEQSSPGGTGSGIQPPSSVGASNGVNYSAFGGVSMPPMPVASVAPSSIPGNHLPPLYLDGHVFASQPRLVPQTIPQQQSYQQVSF	868515	889193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_869008_871350_871547_876434_876652_877373_879458_880901_881108_881722_881869_882515_882658_884357_884441_885035_885225_885379_885578_886060_886148_887317_887423_887605_887796_888727_888826_889132
899531	contig_5549_pilon	+	4521	20	Intergenic	novelGene_81671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	471	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1924	2460	546291	551279	TRUE	0	TCTGCCTCTTCTTCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGRRWKTAVRRLSEVRRSDLSWMGSHRIVTLHLLVSFSGFWNIRWHCCRRNLNGYRAFSKHLLSRIRLSRVYPTAIIVRWVHRWVLLWLCAILGVYYTILEVRWIMIQVRRARFRSRWWRPDKAGHTLWWWSIVHTSADKVLVQMVEQLLEDPDNKHLPVVLDITENLVVPSEVVW	529748	617627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_530662_531621_531735_533275_533453_534946_535082_535202_535295_535677_535892_539397_539551_546164_546332_546787_547162_551157_551372_551697_551980_555271_555385_556807_556927_561726_561860_564547_564747_568134_568313_568756_568996_570130_570259_579060_579432_617420
899532	contig_1107_pilon	-	1878	7	Intergenic	novelGene_126547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	103.266107164398	75	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	68	793	209508	175303	TRUE	35	CAGTGTGTGTAATAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLQHHLRLARNPRPAWDGSCTMDSSSSPNSCLSVGSTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSDLKFAMKCYTPLVYKEIIPCKPSDIKYSVLNSEEVHYIIKQLSKESLQSVDVLREEACEILDEMGHKLRLGAIRFFAFTLSKVFKQIYSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYIDFLMLSFLLYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYVKTMLRGQEAALPRH	209575	174036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_175110_175290_175333_175674_175803_178789_178920_181370_181548_193461_193645_209430
899533	contig_10377_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_115412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTGTTGTTGCTTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254548	252867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_252900_254500
899534	contig_10500_pilon	-	3269	7	Intergenic	novelGene_41175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	420.852078790425	1	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	307	723	1325455	1318487	FALSE	30	ACCATAACCTGTTTATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPICGACRRPIEGRVVNAMGKQWHVEHFVCAKCEKPFLGHRHYERKGLAYCETHYNQLFGDVCFHCNRVIEGDVVSALNKAWCVNCFACSTCNTKLTLKNKFVEFDMKPVCKKCYEKFPLELKKRLKKLSETLGRK	1328674	1315940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1318602_1321532_1321609_1323130_1323180_1324555_1324649_1325371_1325519_1327651_1327802_1328581
899535	contig_3721_pilon	+	4201	17	Intergenic	novelGene_123782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	271.68202202897	257	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1390	2271	63865	101861	FALSE	20	CTCTTTGTGTTGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSDSSYKTNGNSKMSELEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTAGKFRSGDSVESGDQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKTSVPSGLMGQAKLLKTVIWSN	13552	103791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_13630_14268_14369_16664_17157_35282_35775_37958_38139_63816_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81608_81696_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450_101613_101796
899536	contig_10793_pilon	+	2189	15	Intergenic	novelGene_83407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3331.15755758706	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	184	1110	146975	163940	TRUE	30	TTAGTTCTCATAAGGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130902	167272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_140211_140296_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
899537	contig_8375_pilon	+	1811	4	Intergenic	novelGene_141304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	567.391105558297	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	167	664	175731	221250	FALSE	30	GATAATTTACATCTGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLTHSVFVRLEGGTLRLSKPNKNISRRASYNETKPEVTYVSQKIYDLSDSKIYLMPKSLARKRIWNKKYPICIELGRQDDFMSKAQTDKETSEEKPPAERELAGEDPKKPPQEGTRSGQRDQILYLFGRTGREKEEWFRRFILASKLKSEMKKPPGFSGNKPGVLPTHSRHNSPSGHLTHSRSSSKGSVEEIMSQPKQKELVGSVRQKMLLDYSLCLPV	174357	222397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_174515_175721_176056_180330_180486_221232
899538	contig_13481_pilon	-	2382	12	Intergenic	novelGene_119478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_9	22.2439517269246	237	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	140	1696	1332898	1306097	FALSE	30	AAAAATCATGTTTCCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVVVMDVSLSMTRPVSVEGSEEYQRKHLAAHGLTMLFEHMATNYKLEFTALVVFSSLWELMVPFTRDYNTLQEALSNMDDYDKTCLESALVGVCSIVQQEWGGAIPCQVVLVTDGCLGIGRGSLRHSLATHNQRSESNRFPLPFPFPSKLYIMCMANLEELQSTDSLDCLERLIDLNNGEGQIFTIDGPLCLKNVQSMFGKLIDLAYTPFHAVLKCGHLTADVQVFPRPEPFVVDEEIDPIPKVINTDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISDAKENPYGEDDNKSPFPLQPKNKRSYAQNVTVWIKPSGLQTDVQKILRNARKLPEKTQTFYKELNRLRKAALAFGFLDLLKGVADMLERECTLLPDTAHPDAAFQLTHAAQQLKLASTGTSDYAAYEQNITPLQTDFSGSSTERM	1338615	1305410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1325725_1325869_1326653_1326773_1327573_1327730_1331083_1331192_1332676_1332961_1338538
899539	contig_12078_pilon	-	4166	4	Intergenic	novelGene_74085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAGTGAGAGGTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359603	156406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_156582_169550_171023_357041_357490_357532
899540	contig_7629_pilon	+	2352	9	Intergenic	novelGene_153550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	63.1802975618191	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	176	958	225941	231652	FALSE	35	TCACATTAATACCCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPFWSMSTSSVRKRSDGEEKTLTGDVKTSPPRTAPKKQLPSIPKNALPITKPTSPAPAAQSTNGTHASYGPFYLEYSLLAEFTLVVKQKLPGVYVQPSYRSALMWFGVIFIRHGLYQDGVFKFTVYIPDNYPDGDCPRLVFDIPVFHPLVDPTSGELDVKRAFAKWRRNHNHIWQVLMYARRVFYKIDTASPLNPEAAVLYEKDVQLFKSKVVDSVKVCTARLFDQPKIEDPYAISFSPWNPSVHDEAREKMLTQKVSG	223184	233046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_223290_225870_225983_227159_227366_229608_229674_229760_229862_230315_230405_230480_230580_230674_230783_231579
899541	contig_10990_pilon	+	4530	17	Intergenic	novelGene_7479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	304.188360385058	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	3069	4511	738920	752144	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	714044	752163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733079_733919_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
899542	contig_7345_pilon	+	2961	20	Intergenic	novelGene_159189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	211.232552263457	170	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	939	2817	144	2960	294705	350341	FALSE	35	GTAAGTTGGTTTAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLLNDVVSGSQPAEGLVANVITAGDYDLNISATTPWFESYRDTFLQSMPASDHEFLNHYLACMLVTSSSEAEPVEQFSKLSQEQHRIQHNSEYSYPKWFIPNTLKYYVLLHDVSAGDEQRADSIYEEMKQKYGTQGCYLLKINSRTSNRSSDEQIPDPWSQYLQKNSIQNQESYEDVSCTITSNKNSDSNLLSLDGLDNEVKDGLPNNFRAHPLQLDQSSDRSNSIDGPDHVKSASSSHETKKASTGITHGACLTLTDHDRIRQFIQEFTFRGLLPHIEKTIRQLNDQLISRKGLSRSLFSATKKWFSGSKVPEKSINELKNTSGLLYPPEAPELQIRKMADLCFLVQHYDLAYSCYHTAKKDFLNEQAMLYAAGALEMAAVSAFLQPGAPRPYPAHYMDTAIQTYRDICKNMALAERCVLLSAEILKSQSKYSEAAALLIRLTSEDSDLRSALLLEQAAHCFINMKSPMVRKYAFHMILAGHRFSKAGQKKHALRCYCQAMQVYKGKGWSLAEDHINFTIGRQSYTLRQLDNAVSAFRHILINESKQSAAQQGAFLREYLYVYKNVSQLSPDGPLPQLPLPYINSSATRVFFGHDRRPADGEKQAATHVSLDQEYDSESSQQWRELEEQVVAVVNKGTIPSGFHPTQYCLNSYSDNSRFPLAVVEEPVTVEVAFRNPLKVPLLLTDLSLLWKFQPKDFSAKDNEEVKELVTGEPEMIGTEVISEFLVNSEESKVARLKLFPHHIGELHILGIVYNLGTVQGSMTVDGIGALPGCHTGKHSLSSMSVRGRQDLEIQGPRLNNTKEEKTSIKYGPDRRLDPIITEEMPLLEVFFIHFPTGLLCGEIRKAYVEFVNVSKCPLTGLKVVSKRPEFFTFGGNTAVLTPLSPSASENCSAYKTVVTDSTSVCTALTSSASSVDFGIGIGSQPEVIPVPLPDTVLLPGASVQLPMWLRGPDEEGVHEINFLFYYESVKRQYVSFCRCGEYQY	275930	350342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_276027_294657_294748_295535_295711_299853_300008_302251_302346_303007_303265_304318_304435_305150_305302_311018_311120_314496_314603_320043_320176_328870_329096_332776_332886_338556_338752_339369_339501_342993_343069_343571_343699_344974_345133_348296_348725_350301
899543	contig_3243_pilon	+	5841	2	Intergenic	novelGene_147527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	0	501	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTCCTCACTTATCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17491	26073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_+_17833_20573
899544	contig_6797_pilon	-	5373	3	Intergenic	novelGene_178236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	150	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCAGGCGCATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277174	158898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6797_pilon_-_160442_225402_227285_275226
899545	contig_21083_pilon	+	1723	8	Intergenic	novelGene_58019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	101.185019460715	196	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	615	1508	43603	50528	FALSE	45	TATACCATAAAAAGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQRQKRLKKDATKAEEDLTEQEQNQLNLLKKHAYVVGRVGRTFLYSKEQKDEATFEFDADSLAFDMENEPVVVDKSTKRVELTPQDVKDAHWFYDTPGITKENCILNLLTEKEVNVVLPTHSIVPRTFMLKPGMVLFLGAIGRIDFLQGSHSAWFTVVASNFLPVHTTSLDRADAVYQKHAGHTLLKVPMGGEERMAEFPPLVAEDITLEEGLGESEAVADIKFSSAGWVTVTPRFKDRLHLRGYTPQGTVLTVRPPLLPYVVNIKGKRIKKSVAYKTKRPPSLVYHLQKKKHLNV	40614	50743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_+_40863_41472_41786_43549_43715_44298_44502_47156_47289_48321_48439_49951_50073_50319
899546	contig_6101_pilon	+	2485	4	Intergenic	novelGene_114287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_3	72.7369690505912	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	999	1391	338371	356265	FALSE	80	ACAAAAAAGAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSTGNTALLLILCIQHSFPQPSDLYLDFILSVLALELICSLTCLLMYTVKIRKFNKAKPRPDVLEEEKIYAYPSSINSETGFRTISSLEEIVEKQGDIIVYLKRHNALLSKRLLALTSSDLGSQPGRV	337372	357359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_338387_342293_342429_345878_345982_356126
899547	contig_12837_pilon	+	4222	16	Intergenic	novelGene_57344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	50	junction_1	105.578701555864	421	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	853	2586	256709	352504	FALSE	45	TTAAGATAAATAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLFKLDEDLNIEKSAKVYFRTVELIEEPIEGSSGLSFYFKINGFPIFLKGSNWIPADSFQDRVTSDLLRLLLQSAVDANMNALRVWGGGIYEQDEFYELCDQLGIMIWQDFMFACALYPTDRSFMDSVSAEVAYQIRRLKSHPSIIIWSGNNENEAALMTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVTQAQCVKIETEFYRRSRSEIVNGEGHTMGALYWQLNDVWQAPSWSSLEYGGKWKMLHYFAQHFFAALLPVGFEDHDVFYVYGVSDLHSECRVTLTVRVHTWSSLEPLCSHVTGHFVINSGEAILIYKEPVPSLLRRCWNCTRQSCVVSFYLSADSKPLGPTNYHFLSSPKEAVGLQKAHITALISQQGDTFAFDLETSAVAPFVWLDVGSIPGRFSDNGFLMTEKTRTILFYPWEPTSKSKLEQSFHVTSLTNIY	213082	354140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_213330_232120_232216_234965_235072_237989_238161_255572_255749_256651_256763_282716_282869_285252_285371_286821_286909_289906_290075_302652_302872_310874_311040_329876_330022_338912_339056_339886_340145_352279
899548	contig_8797_pilon	+	7053	4	Intergenic	novelGene_174844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	410	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1801	2490	38897	39586	TRUE	20	TTTTTTTTAAATCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKAKWKPLELPLPRKIVNQKQYRIPGGIAEITATIKDLKDAGVVIPTTSPFNSPIWPVQKTDGSWRMTVDYRKLNQVVTPIAAAVPDVISLLEQINTSPGTWYAAIDLANAFFSIPVSKDHQKQFAFSWQGQQYTFTCLPQSYINSPALCHNLVCRDLDRLSLPQDITLVHYIDDIMLIGPSKEEVSMTLDLLVKHLRARGWEINPTKIQAPSTSVKFLGVQWCGAC	36209	105386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8797_pilon_+_37726_38612_42733_50868_51559_104659
899549	contig_7963_pilon	-	1473	5	Intergenic	novelGene_58438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	230.68430809225	385	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	391	873	119177	118203	FALSE	20	TTCTGAGTCATAGTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	120536	117602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488
899550	contig_6509_pilon	-	1579	2	Intergenic	novelGene_145640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAGAAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110457	107547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_108842_110172
899551	contig_2438_pilon	+	1178	4	Intergenic	novelGene_112059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_2	301.406701982554	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	199	531	311995	312871	FALSE	10	TTTGGATGGACTCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	310656	313518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_310768_311907_312083_312305_312409_312729
899552	contig_990_pilon	-	5290	25	Intergenic	novelGene_76142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	896	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2389	2757	1790918	1782933	TRUE	15	GCTGTCCAGTCGATCCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPTHSSHPPIGHDAGVVGLLVLVHLQVALADEAFLLLKGTDDADPQQGLAEVGVYWGAADRLKALQLPGGGHVEPLDEEVDEAQGQDDNGGNGRGQQDDDAGANDIEQGAHEHLDNLRDH	1805329	1715322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1715626_1726879_1727111_1727947_1728124_1731099_1731261_1735750_1735856_1738035_1738228_1750221_1750371_1752956_1753042_1756720_1756797_1759097_1759226_1761485_1761665_1763009_1763173_1765450_1765530_1777711_1777834_1780450_1780660_1782757_1783069_1787802_1788011_1790893_1791004_1791530_1791634_1795783_1795931_1797835_1797995_1798958_1799126_1800238_1800434_1803088_1803449_1804157
899553	contig_3382_pilon	+	6919	14	Intergenic	novelGene_124129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	514	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	5206	5532	789690	793871	TRUE	55	AGGTTAAAAAAAAAGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLANFSSLSPGRGFVVGMFILEPTRGPLFPLLITARASETNSSEGEGKEKSPSRESSRQMVSWAATEPELVEATAEEPELAGGAASGSCHGGRGLLVLFLDCSPSLWV	774098	822732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_777742_780615_780706_781138_781371_788449_789999_793853_793897_795751_795804_796544_796689_797291_797404_797900_798021_804748_804880_812049_812120_818855_819349_821838_821937_822590
899554	contig_12756_pilon	-	6890	16	Intergenic	novelGene_153209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_15	209.809119598426	981	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1647	4944	425	5368	173186	150438	FALSE	35	CAAAACCCAGTGATTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTILAEENLPFAKEIVSLIEAQTAKAPSSEKLPVMYLMDSIVKNVGREYLTAFTKNLVATFICVFEKVDENTRKSLFKLRSTWDEIFPLKKLYALDVRVNSLDPAWPIKPLPPNVNTSSIHVNPKFLNKSPEEPSTPGTVVSSPSISTPPIVPDIQKNLTQEQLIRQQLLAKQKQLLELQQKKLELELEQAKAQLAVSLSVQQETSSLGPGSASKLHVPQIPAMAVKAPHQVPVQSEKSRPCPSLQIQDLKGTNRDPRLNRMSQHSSHGKDQSHRKEFLMNTLNQSDVKTSKTIPSEKLNSSKQEKSKSGEKITKKELDQLDSKSKSKSKSPSPLKNKLSHTKDLKNQESENVRVSDMSKRDPRLKKHLQDKTDSKDDDVKEKRKATEKKDKDEHMKSSEHRLIGSRNKIINGIVQKQDTVTEESEKQGTKPGRSSTRKRSRSRSPKSRSPIIHSPKRRDRRSPKRRQRSMSPTSTPKAGKIRQSGVKQSHMEEFTPPSREERNAKRSTKQDVRDPRRIKKTEEERPQETTNQHSTKSGTEPKENVENWQSSKSTKRWKSGWEENKSLQQGDEHSKSPHLRHRESWSSTKGILSPRAPKQQHRLSVDANLQIPKELTLASKRELLQKTSERLASGEITQDEFLVVVHQIRQLFQYQEGKHRCNVRDSPTEENKGGLKKKPLLSDAELTYYEHKAKLKRTQVQHSFPRLDLLDPDIFDYPLTDALLSGIECEPSKSKHASRNSGAQFDRKEQFSERARRLSPISGSRTYAENLSPHEGRRRHDEQVSAKGVREEQRSPFNDRFPLKRPRYEDSDKPFVDSPASRFAGLDTNQRLTALAEDRPLFDGPSRPSVTRDGPTKMIFEGPNKLSPRIDGPPTPGSLRFDGSSGQIGGGGPLRFEGPQGQLGGGCPLRFDGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPGLRFEGAAGGLRFEGQGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGTLRFDSPRGQPVGGLRFEGGHGPSGTAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVGGLRFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVPGGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLHGQPGPRFERTGQPGPQRFDGPPGQQVQPRFDGVPQRFDGPQHQQASRFDIPLGLQGTRFDNHPSQRLESVSFNQTGPYNDPPGTTFNAPSQGLQFQRHEHIFDSPQGPNFNGPHGPGNQSFSNPLNRGSGHFFDEKNLQNSQFGNFGNLPAPLTVGSIQASQQVLTGVAQPVAFGQGQQFLPGHPQNPGAFVQNPSGALPKAYPDNHLSQVDVNELFSKLLKTGILKLSQPDSATAQVNEVAPQPPPEEEEDQNEDQDVPDLTNFTVEELKQRYDSVINRLYTGIQCYSCGMRFTTSQTDVYADHLDWHYRQNRTEKDVSRKVTHRRWYYSLTDWIEFEEIADLEERAKSQFFEKVHEEVVLKTQEAAKEKEFQSVPAGPAGAVESCEICQEQFEQYWDEEEEEWHLKNAIRVDGKIYHPSCYEDYQNTSSFDCTPSPSKTPVENPLNIMLNIVKNELQEPCESPKVKEEQIDTPPACTEESIATPTEIKTENDTVESV	173610	148915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_-_150654_151334_151371_151864_151958_152356_152513_152913_153098_155312_155419_155905_156026_158960_159061_161087_162653_163187_163672_163793_163975_164382_165498_166624_166820_167174_167364_169263_169390_173108
899555	contig_6740_pilon	+	3326	1	Intergenic	novelGene_142730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTTGTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751920	755246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_751900_755200
899556	contig_10236_pilon	+	3131	4	Intergenic	novelGene_169112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_3	5.43650214343336	1702	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1	429	77561	78888	FALSE	15	CCCTTATTGGGCATCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVAAGPGAPVSPDELLPKGDAEKTEEDLEEDDDEELDETLSERLWGLTEMFPERVRSAAGATFDLSLFVAQKMYRFSRAALWIGTTSFMILVLPVVFETEKLQMEQQQQLQQRQILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGKI	77560	81590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_77678_77901_78021_78467_78586_78813
899557	contig_7093_pilon	+	2489	1	Intergenic	novelGene_157969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTTTTTTATCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80180	82669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_80200_82700
899558	contig_20889_pilon	-	4017	1	Intergenic	novelGene_127639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	452	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	872	1240	24267	23899	NA	25	TGGGGCACCCAAGGACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLHSGCNNGVKRRNDCEDGAGLGSASFCGTRGHHELELTRWHLTTTTTWYMHTIRMIHQKDSSCLRMMNFMAGSSLPFSVYVFQYLVQWTYLNSTPVVRNLISPKERATAAGWHKPLVPDY	25138	21121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_21100_25100
899559	contig_9363_pilon	-	4770	7	Intergenic	novelGene_6715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	61.6128143237175	211	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1022	3069	54	3122	1313760	1309439	TRUE	20	TAGTGCTGAAATGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSNSSVSSAPEEEEEAVASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEASRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGPGAGDEVSCGTGGGSHRRSKKIKAPERPGTRVSERLRGARAETQGANHTPVTPTQHTRSTSTHPCSSPARERTPRLAPRARPTPAPATPVSVPVPVPVPISSPNPITILPVHILPPPPPLPPSQIPPSCSPACTPPPACTPPPAHTPTPAHTPPPAPTPLLTPSSSLLLGPSSVPISPSGTNLPLGLGPEAELCAQALASPESLELTGMASSEASPLTLVSPEELLPVAVEVLPMSEKNLSLTPSAPSPILEAGSILNGQEQEVPEPAQGTVLAVLPDGEGVPMCLNESNGVELPPSVASDELLQVPLEAPRNSEELIEAQTPISSPEKLQELVTAEVTAPSTSSSVTSSPESPSPARPPRRRTSADVEIRGQGAGRPGQPPGPKVLRKLPGRLVTVVEEKELVRRRRQQRGTASTPAPVVSETGASLGSPSTRSTSGRDSSPPTSGPCEASPPSTLPTQTQQPFIARRRIELGVTGGGSPENGERALLDITPPAVKRRRGRPPKKNRSPADSGQGVDEAPSSTSKGKTNGADPVPGAETLIVAEPVVGPQLIPGSHPLGPQSVHKHESIILSPVEKRRRGRPPKARDLPIPGTISSPGNGNLESRTQPLPLPPPLPSFPPLLACPTASVANTVTTVTISASPPKRKRGRPPKNPPSPRPSQLPVLDRDSSSVAESCGLGKQQQPQGQGDSEGSSSDEDGGRPLTRLARLRLEAEGTRGRKSEGSMVVAVIQDDLDLAESGPGGLELTPPVVSLAPKLRSTRLRPGSLVPPLETEKVPRKRAGAPIGGGPGQAKRGRPQPPSPLGPEGSIEESEAEASGEEEEGDGTPRRKPGPRRLGGTNQGDQRILRSSAPPHLAGSIISHRGRKAKT	1314244	1305479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1305961_1307239_1307411_1308442_1312133_1312239_1312324_1312473_1312669_1313664_1313785_1314215
899560	contig_7416_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_134332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGTCCTGCACCATCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866452	864335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_864300_866500
899561	contig_8412_pilon	-	4796	26	Intergenic	novelGene_118375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_6	276.067817754986	399	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1217	3654	206	3859	681980	634884	FALSE	40	AGAACAAAGTCAGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFGVIRSLMAFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIVILEYQPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVPGQFLAVDPKGRAVMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGVDVGFENPMFACLEMDYEEADNDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPGGSDGPSGVLICSENYITYKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFFFLAQTEQGDIFKITLETDEDMVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQIAHLGDDDEEPEFSSAMPLEEGDTFFFQPRPLKNLVLVDELDSLSPILFCQIADLANEDTPQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVRRHIEDEFDAYIIVSFVNATLVLSIGETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLLGDDALVQVYPDGIRHIRADKRVNEWKTPGKKTIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQLNEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQRSRFLAVGLVDNTVRIISLDPSDCLQPLSMQALPAQPESLCIVEMGGTEKQDELGERGSIGFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKLFRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYETLEFASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILALEKLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIETDHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAGEDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMNPIQGNTLDLVQLEQNEAAFSVAVCRFSNTGDDWYVLVGVAKDLILNPRSVAGGFVYTYKLVNNGEKLEFLHKTPVEEVPAAIAPFQGRVLIGVGKLLRVYDLGKKKLLRKCENKHIANYISGIQTIGHRVIVSDVQESFIWVRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTASLLDYDTVAGADKFGNICVVRLPPNTNDEVDEDPTGNKALWDRGLLNGASQKAEVIMNYHVGETVLSLQKTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGILVPFTSHEDHDFFQHVEMHLRSEHPPLCGRDHLSFRSYYFPVKNVIDGDLCEQFNSMEPNKQKNVSEELDRTPPEVSKKLEDIRTRYAF	684605	633946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_635025_635801_635907_636743_636888_637824_637924_638716_638930_639348_639475_640067_640225_640324_640531_641301_641477_644272_644428_645369_645493_648161_648306_649002_649159_649953_650110_650614_650767_656032_656106_659671_659768_662073_662240_668955_669060_670585_670724_672733_672847_675497_675640_676164_676338_677034_677362_681910_682062_684481
899562	contig_12503_pilon	-	2837	2	Intergenic	novelGene_143824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	417	767	120490	120140	TRUE	70	TGTTAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKLDFHRQKSETGSMPYTIHKNKLKWIKDLNAQTNHKILRRPSRDNAVGPSFQQWIITDSERQNKLMGPQKIKNFCSSKDFTKKVKRQATIWETIFRNHISDKNLINKTYIKL	120906	117728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_119795_120135
899563	contig_12919_pilon	-	2146	2	Intergenic	novelGene_75910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTATAGTAATTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743732	741526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_743266_743325
899564	contig_11720_pilon	+	916	6	Intergenic	novelGene_43863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2859.01874075705	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	135	632	87166	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	86376	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_86415_87069_87171_93153_93261_94959_95061_95383_95486_98299
899565	contig_12765_pilon	+	2643	9	Intergenic	novelGene_106544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	50.6246913570838	371	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	262	1956	10145	211118	FALSE	30	GAATTTTGTAAAGTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILFAWGTLLFYIGGHLVRDNDHPDHSSRELSKILAKLERLKQQNEDLRRMAESLRIPEGPIDQGLATGRVRALEEQLVKAKEQIENYKKQTGNGLGKDHEILRRRIENGAKELWFYLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFISDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQIAIYPHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWNGYSKGVNRKLGRTGLYPSYKVREKIETVKYPTYPEAEK	9883	211805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_10315_73779_73896_74010_74174_87110_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
899566	contig_11574_pilon	-	3648	11	Intergenic	novelGene_64065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	300.058144365388	75	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	247	2079	456525	449890	FALSE	15	CATAGTTGTCGCGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQEVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463701	448320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450853_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463503
899567	contig_3818_pilon	+	3988	3	Intergenic	novelGene_99252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	45	10	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	113	577	474920	476140	FALSE	35	AATAAATTTTATGATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPQTVLLLRVIAAFCFLGILCSLSAFLLDVFGPKHPALKITRRYAFAHILTVLQCATVIGFSYWASELILAQQQQHKKFHGSQVYVTFAVSFYLVAGAGGASILATAANLLRHYPTEEEEQALELLSEMEENEPYPVEYEVINQFQPPPAYTP	463861	479551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_463966_474911_475077_475832
899568	contig_11258_pilon	-	2576	3	Intergenic	novelGene_67850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	66	37	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	47	613	360471	354704	TRUE	60	ACAACAAAGAATATTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTETLSWGSGRQGECMRGREAKEVSHEEPQIWTLTPFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSTRAA	360517	351851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_355099_360299
899569	contig_7635_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_171354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTCTAGCAATAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236	1674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_200_1700
899570	contig_18850_pilon	-	2773	9	Intergenic	novelGene_142433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181967	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178390_178649_178946_179146_180513
899571	contig_7527_pilon	-	3139	1	Intergenic	novelGene_139583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCTTGTGAGTGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122650	119511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_119500_122600
899572	contig_3956_pilon	+	2306	10	Intergenic	novelGene_15258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_3	781.038197956199	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	123	1787	1285728	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1285065	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
899573	contig_3612_pilon	+	4094	5	Intergenic	novelGene_87824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	53.0471488394994	384	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	172	1356	955615	978135	FALSE	45	ATTGATAAATTAAGGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELDWWEENCVPRHDNVTFVFTPSQHWCKRTLTDDNNVLWGSWSILGPWNRFFFAGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEHYLEPRVKLCEALERYGLNTEDFFVLNHGESRYLNTDSENVK	932470	980873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_955598_955909_965350_965998_969734_969850_978006
899574	contig_9484_pilon	-	6326	8	Intergenic	novelGene_105681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1344	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCCCCACCCCTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219603	195196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_196759_197341_197387_198349_198439_201123_202616_202732_202834_206873_206943_211512_214466_219588
899575	contig_9406_pilon	-	3526	15	Intergenic	novelGene_136153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	649	junction_12	345.723435534172	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	274	2547	61918	34784	FALSE	20	CTTCAGAGGCAGGGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADNHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEILGRIQDKHKKLPEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQEDAARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKALLDACEGRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLWMEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	62365	33804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51387_57753_58129_58526_58732_60400_60532_61873_62156_62329
899576	contig_11338_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_6343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAATTAAAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296533	294519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_294500_296500
899577	contig_18544_pilon	+	1896	9	Intergenic	novelGene_152740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGCTCGTAGCATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37215	58058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_38279_38472_38554_40223_40322_47684_47856_49134_49289_53214_53277_54678_54803_54895_55015_58034
899578	contig_20165_pilon	-	5827	2	Intergenic	novelGene_54480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_1	0	29	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAATAATGAAGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71269	64574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_70120_70987
899579	contig_383_pilon	+	4514	6	Intergenic	novelGene_126135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	673.667870690001	737	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1916	2800	166109	254993	TRUE	35	TTAGTATATTAATTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMGRKIQHCENVNSTKAIYRYNAIPIQIPTAFLNEMEKLSTNFIWKGNKPRISKALLKKKNKVGGLTPPDLRTYYTATVVKTDWYWYNDRDIDQWNRIKNPDVNPSTYSQLIFDKGPTSIKWGKDSRFNKWCWQNWMSICKKKKQEPYLTPYTKINSKWIKDLNIKSKMIKIMEEKIGTMLGALIHGINIIQTITNNAQTLEDKLDNWELLKIKHLCPSKDFTKGVKREPTDWEKIFGQYESDKGLISIIYKKIQHLSNKKANNPIKKWAKEMNRHFTKGDIQMASRHMRKCL	156809	256775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_157284_159221_159374_164402_165118_165534_166742_254741_256266_256333
899580	contig_11566_pilon	-	3880	14	Intergenic	novelGene_166689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	324.752358997677	3	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	29	1309	224032	164404	TRUE	35	TACAAAATGTCACTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSANTSYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMSQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHREELGEFMELKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHPDRQDIQKSMTAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRSWEGDDIKTLGSVVYMSQVMIQCAGSEEKNERYLLLFPNILLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHKNSFEISGSMIERILVSCNNQQDLHEWVDHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPITPSSKHADSKPVPLTPAYHTLPHLSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKASDEEFAVRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSRVLLILYMH	224060	157400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_-_157964_158308_160291_164377_164433_177028_177119_183372_183467_186196_186422_189026_189167_189368_189448_191619_191707_194821_194969_195697_195758_197642_197782_203218_203342_223964
899581	contig_10246_pilon	+	3825	9	Intergenic	novelGene_46891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_1	201.917062181481	476	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	109	1311	144696	183855	FALSE	35	TCAATAAAACTCGGTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMRLLGLVVCLVLGTVHSEGPRRKRTSVDPEVNMNVSEIISYWGFPSEEHLVETEDGYILCLHRIPHGRQNHSDKGPKTVVYLQHGLLADSSNWITNLANSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHRTLSVSQDEFWAFSFDEMANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQVKSSELRRFLKTHQGSQPVIGILEGLWEVFGRVDWVGFVFLRSIPEQLKLHGWGCRLSLLSLSSSWLQIRVDIVIRYS	140691	186369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_140799_144694_144807_148218_148337_168075_168275_169672_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546
899582	contig_10011_pilon	-	2420	6	Intergenic	novelGene_68102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	1364	2125	326392	325558	TRUE	15	GAGCGGCCAGAGCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKDARCPGFWCPFFPKNGGAFGFEGSWSISGASALPILFSSEGVVDSGCSWVFSSPVKDTLVSTFLNVPPSWITDCSGFLEPFSGATVASISGMAIFPGVPTVSGLTIFISSRVRRISGFRGSPFSEEMASSRLLGRFLPSALLGSLLTKDPQNELLESPCSLLVEWAFLRSLELRMHPFSPASLAGDRNGPLLAGGVMLLTAGLPCPSGPWSLRLSWDFFWNPLSASGWRSWAYSPQRNTTLLNCQCHLLV	334218	322915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_323204_325550_325626_325698_326405_328219_328528_328964_329060_333270
899583	contig_12622_pilon	+	6308	22	Intergenic	novelGene_5760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	647	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2388	2687	80250	83313	TRUE	15	GCTGTGGAGGGGATGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQLSAALGNHLGIEKALLRLHHGPQHRSTPSSGIFHFHFKCLTALIQKLLALQSLLKLHPKLLGGVCPGSHDVGPRMHSLERKTALLAHLIHHRVKR	76733	194583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_78269_78578_79252_80070_80307_81625_81719_83163_83457_88913_89086_90302_90430_90531_90788_91168_91372_92347_92486_93418_94287_94457_94852_95807_95956_96242_96383_99903_100007_100175_100365_100739_100912_102622_102726_103190_103365_104264_104370_125265_125348_194479
899584	contig_13055_pilon	-	2678	8	Intergenic	novelGene_104961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_7	44.9189746734527	83	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	104	937	143110	119143	FALSE	35	AAAAAGTACCTCCCTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDGKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDAAIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVTGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVYTKEVLYLVMRIPRALNINMIYSWHSNSIAKSP	159235	117401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_119368_138770_138846_139427_139625_141019_141104_141629_141714_142549_142643_143034_143154_159175
899585	contig_10009_pilon	-	2962	7	Intergenic	novelGene_82726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73263	41553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10009_pilon_-_42023_55190_55301_60319_60407_63216_63355_68603_68814_70217_70384_71481
899586	contig_2054_pilon	+	2705	2	Intergenic	novelGene_51652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1206	junction_1	0	3	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAAAATTTAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10271	19424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_10443_16890
899587	contig_2799_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_85550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTGTTATTCAGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708790	710101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_708800_710100
899588	contig_13760_pilon	+	3321	6	Intergenic	novelGene_61319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_4	46.8811262663345	561	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	514	1419	202899	204617	FALSE	40	GGGTAAAAAGGTGTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLTLLPAPPPILPASASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDKYELFEKLDLPKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKSMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF	201152	206519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_201186_201650_201733_202500_203118_203240_203413_203569_203719_204251
899589	contig_10749_pilon	+	4215	6	Intergenic	novelGene_133493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1939	2274	207839	208611	TRUE	50	TAAACACAGGTAAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCRSATCMTLMPLLARRAIPSGQMASMATILVVIRAEGVAVPLPSEPAPLSRGKVPTLRATPGPPFLFWWVLICFDRWSLLMKRLGHSGQANFFSPTCVYVCASATHLNV	205900	243341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_208132_208568_208766_211206_211375_240885_241371_241890_242397_242713
899590	contig_4924_pilon	+	2115	9	Intergenic	novelGene_84650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	5	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTTTCATCTGAATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62869	155832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_64084_65479_65650_82345_82486_114578_114713_127723_127785_132966_133128_137219_137300_145996_146130_155810
899591	contig_10982_pilon	+	2617	7	Intergenic	novelGene_87876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	72	junction_2	217.560464137112	335	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	244	1056	145192	201769	FALSE	10	CTTTTTTTTTTGTCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	141984	203330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_142222_145185_145285_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
899592	contig_14450_pilon	+	2932	17	Intergenic	novelGene_48934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	81.8760257569333	439	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	83	2296	512549	556776	FALSE	50	TCACAAAATTATACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSAEWSRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRPSLPPSKQANKNLILKAISEAQESVTKTTNYSTVPQKQTLPVAPRTRTSQEELLAEVVQVQSRPPRISPPIKEEETKGDNIEKSQGPQQRQLLSRLQIDPVMAETLHISQDYYDMESMVHADTRSFILKKPKLSEEIVVAPNHESGMKTADTLRVLSGHLMQTPRDLVQPDKPASPKFIVTLDGVPSPPGYMSDQEEDMCFEGMKPVNQTAASNKGLKGLLHPQQLQLMSRQLEDPNGSFSNAEMSELSVAQKPEKLLERCKYWPGCKNGDECAYHHPVSPCKAFPNCKFAEKCLFVHPNCKYDAKCTKPDCPFTHMSRRIPVLPPKPAVTTPAPPSSTQLCRYFPACKKMECPFYHPKHCRFNTQCTRPDCAFYHPTITVPPRHALKWIRPQTSE	512466	557412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523323_523742_523844_525728_525885_544457_544533_549302_549466_550222_550456_553725_553847_554738_554876_555156_555249_556073_556181_556769
899594	contig_5686_pilon	+	1787	6	Intergenic	novelGene_45293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2724	junction_2	1222.19857633692	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	83	538	170242	176763	FALSE	55	ACTCAATACATAAAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVSDILLYFFASVF	93847	178012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667
899595	contig_7025_pilon	+	3429	20	Intergenic	novelGene_104376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTTTTCTGTATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48230	94920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_49327_54442_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60079_62976_63108_65716_65830_66741_66774_66974_67103_72956_73102_73190_73319_73866_74022_74668_74707_76456_76585_85337_85477_88023_88195_90765_90885_90971_91020_91826_91965_94786
899596	contig_11708_pilon	+	4517	1	Intergenic	novelGene_138990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	666	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATACTCAAGTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394803	399320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_394800_399300
899597	contig_8310_pilon	-	2913	14	Intergenic	novelGene_75579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2162	2572	308001	295473	TRUE	15	CCCCGAGGGTGACCTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVPVRPTPALQWTTMGPACVGLSVLTFFRNFSIPMGVKGTPKSGQLVKCSWETSLGALQPSGSYRELPDGVVHQDYAVLHTHADVPICPAALVRPVLMALFLSFLSFRLVSMTMVADFCSQIILQKSFTVSCLGP	326129	283429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_283526_290040_290132_294706_294784_295395_295476_296626_296727_302455_302565_303828_303995_307968_308108_308705_308853_309219_309312_316637_316755_317712_317884_320574_320710_324736
899598	contig_2069_pilon	+	2728	13	Intergenic	novelGene_23246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	307.01016767455	2691	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1169	1885	341330	343975	FALSE	15	GATGTGGTTTTTGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323991	344818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334826_335510_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
899599	contig_6710_pilon	-	553	2	Intergenic	novelGene_95285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
899600	scaffold_13505_pilon	-	1972	10	Intergenic	novelGene_111526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	424.028330057507	11	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	21	1007	603235	595273	TRUE	5	TCATTTTCTCTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603255	588570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_595062_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
899601	contig_11338_pilon	-	3262	5	Intergenic	novelGene_6307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	86.6804476222868	40	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	26	304	250534	233533	TRUE	40	TACATAATGGAATATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWVTYTKGMRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQGKKILVFLSPSLIFC	250559	229200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_229266_229427_230279_231490_233736_244695_244747_250509
899602	contig_14443_pilon	-	2422	4	Intergenic	novelGene_126663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	862.685857591794	17	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTCATCTTTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39494	27318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29310_29573_29709_37689_37863_39371
899603	contig_6215_pilon	+	2078	7	Intergenic	novelGene_21232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	239.785088962781	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	78	1220	571336	600051	FALSE	55	TGGAAGAATTAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPGAVVCCLLAVWYHRPGFGMPLAPAGSRLPGPCSSRTDSPPHVPVQELSTDMVINVIANMTTTVQSLFPNLQVFPALGNHDYWPQDQLPVVTSKVYNAVANLWKPWLNEEAISTLRKGGFYSQKVTTNSSLRIISLNTNLYYSSNIVTLNKTDPANQFEWLENTLNNSWQNKEKVYLIAHIPVGYLPFSRNTTAMREYYNEKLIDIFRKYSDVIAGQFYGHTHRDSIMVLSDKKGRPVNSLFVAPAVTPVRSVLQKETNNPGVRLFQYDPRDYQLLDMLQYYLNLTEANMKGESNWKLEYILTQAYDIKDLQPESLYGLAKQFAVLDSKQFIKYYNYFFVSYASSAICDEKCKAFQICAVMNLDHVSYADCLKQFYI	571258	600909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_571455_584025_584171_588153_588251_590620_590791_591255_591437_592971_593097_599745
899604	contig_9955_pilon	-	3577	3	Intergenic	novelGene_21275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_2	524	8	168	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	203	916	49317	47546	FALSE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49832	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794_49380_49692
899605	contig_19865_pilon	-	2317	6	Intergenic	novelGene_170150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCCGCGCCCCGCCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82716	43459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_43628_64495_64675_72649_72735_79191_79367_79925_80052_81132
899606	contig_2036_pilon	-	4797	2	Intergenic	novelGene_131842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	286	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAATGCTAGTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628762	622941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_626807_627830
899607	contig_762_pilon	-	2665	2	Intergenic	novelGene_135947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_1	0	14	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAGAGATTATTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259983	255261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_257668_259724
899608	contig_10258_pilon	+	2310	3	Intergenic	novelGene_155053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_2	47.5	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAGAAAAAAAGAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105510	109814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_106145_106931_107100_108306
899609	contig_10341_pilon	+	1614	8	Intergenic	novelGene_47262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.672187762047	45	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	113	874	507516	512557	FALSE	65	CCTAATGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESWTVNKENGRRIVAFELCSTALKKESKKVFQKYEIMSSEMLPAFIETSNVERKQNLSEDQEQSQKPKSGEGSEPISKRQMKKLIKQKQWEEQRELRKQKRKEKRKRKKLERQCQLESNSDGNDRKRIRRDVVHSTLRLIVDCSFDDLMVLKDIKKLHKQIQRCYAENRRALHPVQFYLTSHGGQLKKNMDENDKGWVNWKDIHIKPEHYSELIKKEDLIYLTSDSPNVLQELDESKAYVIGGLVDHNHHKGITYKQASDYGIEHAQLPLGNFVKMNSRKVLAVNHGKL	504198	513297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_504259_506607_506640_507495_507701_508603_508767_509339_509412_509660_509736_511731_511882_512440
899610	contig_16098_pilon	-	1953	8	Intergenic	novelGene_46024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_6	1366.02539791729	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	674	1342	350530	349343	TRUE	30	TGGTACCAGACTCTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354106	348292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350889_352152_352352_353990
899611	contig_10943_pilon	-	6125	1	Intergenic	novelGene_168269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1077	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56007	49882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_49900_56000
899612	contig_12437_pilon	+	3454	1	Intergenic	novelGene_169062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	431	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATAGTAACGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30639	34093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30600_34100
899613	contig_12427_pilon	+	3572	1	Intergenic	novelGene_40586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	694	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565131	568703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_565100_568700
899614	contig_13542_pilon	+	2233	12	Intergenic	novelGene_131576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	184.919325720146	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	101	901	735117	740910	TRUE	40	TTGAAAAAGAAGGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDQINSTFVRSNPSVLQGLLRIIPYLSFGEVEKMQILVERFKPYCNFDKYDEDHSGDDKVFLDCFCKIAAGIKNNSNGHQLKDLILQKGITQNALDYMKKHIPSAKNLDADIWKKFLSRPALPFILRLLRGLAMQHPATQVLIGTDSITNLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKRMAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVALEEMENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVR	735016	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_735164_735629_735804_736742_736843_738267_738487_739643_739758_740763_741111_741441_741504_742661_742857_745740_745966_749174_749266_749994_750158_753491
899615	contig_2596_pilon	+	4715	15	Intergenic	novelGene_53507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	99	junction_13	114.153696070388	517	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	582	1736	1027316	1034883	TRUE	25	TAATATTTTGGTTCAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPSTSNVRVALSNKPEEKACVNSDSPNNCVGKKVEPSTLGCRSQNLKESSVKVDKESCCTRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDTEAIGLWLPLIKNVVGTDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVRGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKKKNCQKGAAYKIFSWIRCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDIKQTSLAGEKPALGPGPQQNPSVLEQAAVGGDAASKPASSTRPACPASTSPLTWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPVLKNEIKCLPPLPPLSKSSAVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQVTWASAPPNDSDPLLSSCTPASTPSPIINDIVSCFCTLSLR	1022265	1049342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1022473_1025546_1025752_1027146_1027362_1030153_1030307_1030438_1030535_1030879_1031008_1032504_1032701_1033983_1034157_1034520_1036288_1038936_1039025_1039936_1040068_1045984_1046321_1047742_1047920_1047994_1048130_1048634
899616	contig_12586_pilon	-	3621	3	Intergenic	novelGene_121802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	5.5	395	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1041	3126	190	3315	55260	45220	FALSE	30	CCATATGGTATTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQQPPGSPLSREEGEAPPPAPAPESRRRSRRVRLRGSCRHRPSFLSRRELATSAPAGSAPASSGIMASAAKEFKMDNFSPKAGTSKLQQTVPADASPDSKCPICLDRFDNVSYLDRCLHKFCFRCVQEWSKNKAECPLCKQPFDSIFHSVRAEDDFKEYVLRPSYNFATPDVRRFRYRTTVTRDRNTSVYSPSGTVNRRTTTPPDSGVLFEGLGISARPRDGEIPQLTRQIAMRRPATADERSMRKIQEQDIINFRRTLYRAGARVRNIEDGGRYRDISAEFFRRNPACLHRLVPWLKRELTVLFGAHGSLVNIVQHIIMSNVTRYDLESQAFVSDLRPFLLNRTEHFIHEFISFARSPFNMAAFDQHANYDCPAPSYEEGSHSDSSVITISPDEAETQDLDINVATVSQAPWDDETPGPSYSSSEQVHAAMSSLLNTSDSSDEELVTGGTTSQIQGAQTNDDLNNDSDSSSDNCVIVGFVKPLAERTPELVELSSDSEELGSYEKMDTVKTQEQEQSYSSGDSDVSRCSSPHSVLGKDEHINKGHCDSGTRIKSKKEEKQSSSSSPRDLSSSVRDRVYSPHNHRHRKRGRSRSSDSRSQSRSGHDQKNRRKHHGKKRMKSKRSRSRESSRPRGRRDKKRSRTRDSSWSRRSQTLSLSSESTSRSRSCSSDHGKRRSRSRNRDRYYLRNNYGSRYKWEYTYYSRNKDRDGYESSYRRRTLSRAHYSRQSSSPEFRIQSFSERTNARKKNNHSERKYYYYERHRSRSLSSNRSRTASAGPDRVRSEKPGGKRKYKTRHLEGTNEVGQPSREFASKVKDSRYQKSSSKLDGNYKNESDSFSDSRSSDRETKHKRRKRRTRSLSVEIVYEGKATDTTRHHKKKKKKHKKKHKKHHGDNASRSPVVITIDSDTDKDSEVKEDTEYDNSGPPDPVQNEIFAPSLDPFETKDVVTIEDEFGVLDKDCDITTLANNLDNANRTVNNIPPQASSTEQTLDVREESTFASDLENQSRNVSLQTEPSRQLPSSRTSLMSVSLGRDHAMS	55449	44913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_48148_53644_53840_55257
899617	contig_11720_pilon	+	1231	11	Intergenic	novelGene_43812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2297.89230382975	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	135	1196	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67867	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67954_68015_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
899618	contig_11396_pilon	-	5405	14	Intergenic	novelGene_71414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_13	237.38199809116	410	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	213	1652	1689836	1658079	FALSE	15	GTTGCATTTGACATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEEEFFDAVTGFDSDHSGEFSEANQKVTGGLGSDTSKSQGIGKTEARPPQENGVQTHRTSLPAPMFTRSDFSVWSILKKCIGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHKASRQAHPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPVSAFYSEGLNQDFIFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLQQNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGDKCVLHFKSCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGVDPASYESFKKQERRGEHLKKTKPETSSEKADSDVADNVPETQETMQVIPGSRLLWRINMRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELQAGMEEILPPTDCRLRPDIRGMENGHMDLASREKERLEEKQREARRGRAREETSWRTRWFYQGNNPYTGTPDWLYAGGYFERNFSDCPDIY	1706355	1654325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1658182_1660807_1660899_1662172_1662297_1663036_1663166_1667761_1667886_1669438_1669529_1670179_1670288_1671109_1671293_1678224_1678323_1680165_1680301_1686029_1686106_1689328_1689471_1689799_1689971_1706277
899619	contig_2817_pilon	-	2279	14	Intergenic	novelGene_104337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	116	616	282606	282106	TRUE	25	TATTTCTTATTCTTCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSSLFNCLISLKDFSYSLSISANFFAFSFTSFDNKLFMFSNFSVGTERANFATNSFNWPSISVICLPFFSCSISHILKSFCNRLFSSISLPSSLLNSSTNISFCLIWFLNFPTSAEVPSYFAFMSFNCSFSSSVNLLFPVAASLVRCSLRARKCVCICFTLPSDSYILFCTSFNASSSCFICSSESSLTLSHSSAKALHSATL	282721	246392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_246725_248907_249042_253093_253181_261103_261169_261965_262031_265496_265568_265664_265772_266803_266986_268557_268595_271265_271337_272891_273011_275349_275508_280049_280100_281920
899620	contig_20241_pilon	+	5194	12	Intergenic	novelGene_159743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	43.9485048025546	529	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	262	1095	239418	253563	TRUE	35	TTCATGCCAAAGCTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFVVNKKMEFGVVYSCVEDKMYTGRRGHGAFCDGQKLQVSQQEDITKSLLVTELGSSRTPETVRTVLSNMEKLLCIPVHGIRGVGTAAVNMCLVAAGGADAYYEMGIHCWDMAGAGIIVTEAGGVLTDVTGGPFDLMSRRIIAASSRTLAERIAKEIQIVPFQRDDED	235262	257712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235754_235868_235947_236036_239404_239481_240085_240220_241925_242031_243723_243770_246679_246789_248322_248432_252525_252678_253447_256831_256880
899621	contig_2703_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_101670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTACTTATAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166391	164336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_165804_165838
899622	contig_5428_pilon	+	4830	18	Intergenic	novelGene_160416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	225.637075777448	3	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	359	1315	177032	225328	TRUE	25	AGCTAGCTACCGTTTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTAELFEEPFVADEYIERLVWRTPGGGSRGGAEAFDPKRLLEEFINHIQELQIMDERIQRKVEKLEQQCQKEAKEFAKKVQELQKSNQVAFQHFQELDEHISYVATKVCHLGDQLEGVNTPRQRAVEAQKLMKYFNEFLDGELKSDVFTNSEKIKEAADIIQKLHLIAQELPFDRFSEVKSKIASKYHDLECQLIQEFTSAQRRGEISRMREVAAVLLHFKGYSHCVDVYIKQCQEGAYLRNDIFEDAAILCQRVNKQVGDIFSNPETVLAKLIQNVFEIKLQNFVKDQLEECRKFDAEQYLKNLYDLYTRYIFNY	176673	245623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_177059_199551_199647_200448_200597_204094_204290_218513_218579_221479_221509_222581_222692_223937_223983_224084_224226_225226_226551_228104_228253_234515_234625_238132_238254_239776_239864_242911_243021_243192_243409_244056_244197_244260
899623	contig_14871_pilon	+	2787	12	Intergenic	novelGene_63708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	745.424234417019	13	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	790	2217	201945	233218	TRUE	5	TGTCTGTGTGGCCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	200606	234217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_201331_201879_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056_233435_233863
899624	contig_6902_pilon	+	1889	12	Intergenic	novelGene_135582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	636.50515309568	1	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1428	461	1888	462106	490166	FALSE	70	AAGAAAAAGAGAAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDGHQNKNSMKKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERK	434461	490167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461979_462147_463503_463599_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
899625	contig_17459_pilon	-	597	1	Intergenic	novelGene_175518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCTAAAAGAGCTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16717	16120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17459_pilon_-_16100_16700
899626	contig_17144_pilon	-	3021	3	Intergenic	novelGene_29175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_1	118	18	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1570	2013	166806	166363	FALSE	35	TCCTCCCAACAGCCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168869	165354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167331_167581_167676_167918
899627	contig_5779_pilon	-	3330	15	Intergenic	novelGene_106455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	266.393908124256	490	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1408	2478	129312	107541	FALSE	35	AATAGCCTATTTTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVRNWCIQENTGEVCKTDAEIGSLPAAQGEAEDYYRKPEKKCVEKFCSDSSSDCGSSSGSVRASRGSWGSWSSTSSLDGDKKPAVGPQHFLPTSDSVSQNDFPSESPISFSLSHNICNPIHVNALPQYAETACPGLPDGPAGDENKGLCPPGDLWPTQPVCLTSSLNCNLESSVPCVLQEPPPVHNSSFIDWSTTCEGQFPNVYCPLELNDYNAFPEENMNFPNGFPCPVEVQTDFIDNNPQSTWNTATSMPTAWGHASFINSTPYLASTRSLSPMSGLFGSIWAPQSDVYENCCSINPTTEHATHMENQAVMCKEYYPGFNPFRAYMNLDIWTTTANRNANFPLSRDSSYCGNV	166295	106688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113291_125880_125961_126872_126952_127357_127544_129215_129380_132098_132224_156804_156957_163902_163956_164145_164529_164893_165044_165624_165811_166004
899628	contig_16204_pilon	+	3490	2	Intergenic	novelGene_154533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	0	11	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	11	412	459331	459823	FALSE	70	TGGACCAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISMNGAVIGCDSGCHAILDTGTSLVTGPPEPIFNIQRIINARQSYGGEYIMDCEAINTLPDIIITINGVDYPLPASAYIRQVRGRALGADPQILELARIVGRRLGGRGPLEAKPCHCRHGWAHLAGLAPPTKQIP	459320	462901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_459469_459559
899629	contig_7057_pilon	+	7750	6	Intergenic	novelGene_123430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2789	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	5405	5809	1635668	1636072	TRUE	30	CCCAGAGAACGAAGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSPFPKLSLRLTLLGHVWQWRTRIKSARVSAKSLVLTQARHTSRETSLGVTSTTSRLLWKKCSSMLRKRHWKSLFLISAYFKSTLSSYPNDRPQATILKKAIAFGNGPEFSFGWTGDADSWAPLLWCRAMTYY	1630136	1655049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1630731_1630857_1637699_1643376_1643469_1643923_1644051_1654549_1654608_1655011
899630	contig_3394_pilon	-	4056	1	Intergenic	novelGene_152704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2702	3037	507658	507323	NA	55	AAAAAATACCTCAACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLQSFFLMNLNDYLFKLRKIKKIEKSSSGKIFSSYQQLLQLPQGNHHHIPTLLLLSVPLSFSAPLGRNTAIPRSTYGWLGLTSCMLGLLACHLSRKDLPVLRETGVRET	510359	506303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_506300_510400
899631	contig_755_pilon	-	2350	3	Intergenic	novelGene_119774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	211.5	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTGTTGAGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89049	83149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85621_87770
899632	contig_15118_pilon	-	4170	14	Intergenic	novelGene_74594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	646	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	763	1263	395308	394326	TRUE	10	CCTCCACCTTCTCCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELTLKARGRRAPAWVQFFLRVFTMISMRQRKRRVVMPIPRNAPLEKAVETSPLSGNNRTVTLWAPWSFRTSQWSPRPRLSPSESLRELLAQGPAELEVTMTEALLLFPSTSQFPTLQCREGVGQALAEQLQRRPSVFQEQEGLSTWGGSSTERSRETCPEPSGF	399368	378637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_379781_379883_380020_380149_380261_391806_392086_392167_392551_392641_392926_393223_393276_393416_393680_393942_393988_394114_394374_394461_394747_395047_395141_395233_395342_398639
899633	contig_7201_pilon	-	4100	18	Intergenic	novelGene_152493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	312.888673171957	8	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	62	1624	255800	70168	TRUE	60	GTAAAAATTTCAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALKLLSSGLRLCASARGSGGAWSKGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEVEEIVDIGSFAPEDIHIPKIYVHRLIKGEAYEKRIERLSIRKEEDGKAKSVKPGDSVRERIIKRAALEFEDGMYANLGIGIPLLASNFISPNMTVHLQSENGVLGLGPYPLKNEVDADLINAGKETVTVLPGASYFSSDESFAMIRGGHVDLTMLGAMQVSRYGDLANWMIPGKMVKGMGGAMDLVSSAKTKVVVTMEHSAKGNAHKIMEKCTLPLTGKQCVNRIITEKAVFDVDKKEGLTLIEIWEGLTVDDIKKSTGCDFAVSPKLMPMQQIAS	255861	66437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_68064_69317_70210_83641_83744_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161658_161708_163992_164088_169479_169595_171320_171429_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_238453_238545_239711_239821_255722
899634	SIRV6	+	1091	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	880	55	-318	-54	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	35	367	2002	10736	TRUE	20	TTAGTCGATTATTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1967	11770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899635	contig_10642_pilon	+	4560	17	Intergenic	novelGene_78705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	366	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3471	3845	860008	867795	TRUE	30	CAGGTGCCACGCCAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATSGIFGSGSTVTTGISLLSKNRFSGTGGISSGRTTGFSLLAFESTDFFSLVSLLSELPFGLNECLLLGSSEPLASFRLFLECLTFGLLLCFLLLLLSCSISLSEDDSEEEEELEEESESSE	848708	904291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_848819_851179_851285_851770_851826_852511_852610_855153_858044_859299_859448_859943_860031_866988_867146_867600_867824_868854_869000_869557_869591_878648_878737_880465_880506_881016_881130_883371_883448_903926_904008_904180
899636	contig_6794_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_149005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	151	534	20996	21379	NA	40	CAAAATAAAGTCTGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLNYVSLSAGDQGYRMAHRPTPGDLSSSAFALAMVSGDNFFVTRPGAVYPGPVPRQTVRPSVRNESRRLTGGGRGPTRLIKGREPEGRNRGRQARFLPYPARGVKLDLLRSVLQQRLIAFGGVIAA	20845	22771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_+_20800_22800
899637	contig_7894_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_170788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	288	665	231006	230629	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWCFLKKLEIEVSYDPAILLLGIYPIEIRAVTQIDICTLMFIAALFTIAKRWKQPRCASMEEWINKLWYIHIMEYYAIIKNNDETVEHLVTCRKLEGIMLSEFSQSQKDKYCIRPLL	231293	228515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_228500_231300
899638	contig_9982_pilon	+	3559	6	Intergenic	novelGene_55749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	66.0048483067721	83	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	1989	3266	327980	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	325991	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
899639	contig_16125_pilon	-	3533	18	Intergenic	novelGene_155220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1191.34679392316	281	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	44	1441	236934	151848	TRUE	35	AATTTATTATGGTCAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKT	236977	110360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_110914_117149_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_143589_143728_144626_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_155553_155618_179440_179598_235796
899640	contig_7378_pilon	+	1676	8	Intergenic	novelGene_120256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	325	675	416232	418934	TRUE	10	GGCACAGGGTGTTGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGQRKCLNQALTSQGKGSGSLMSSALKAESGRLERRWAGRGTGREKGGETGRSQLWRCCLLAPPWAWRPVSQLGTLGRLRGLPHVCPLLHGVLQGLGLLLVHLNIVHLLVGSDG	415907	426782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_416240_418591_418943_419911_420042_421678_421782_422143_422240_423544_423814_425112_425205_426479
899641	contig_7707_pilon	+	4545	2	Intergenic	novelGene_72232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	531	136	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	134	469	1049875	1050210	TRUE	5	GCTCTGCGTCTCTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIISSANRDSLTSLPIWMPFISFSCFIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVLKGNVFSLSPLRMMLAIGFAYMPFIMLRNFPSILLRGFIRNGCWILSNAFSMLIEMIM	1049741	1054866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1051152_1051731
899643	contig_6361_pilon	-	3038	19	Intergenic	novelGene_23872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	326.460219155961	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	872	2619	23	2641	98864	55091	FALSE	40	ATTAAAGCGTGTAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVRIKEEKQESEFLPSAGGTFNISVSGDIDGLITQALLMGNFESAVDLCLHDNRMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLNNWREALAAILTYAKPDEFSALCDLLGTRLESEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSNPLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQTMDTSTVGVLLAEKMSQYASLLAAQGSIAAALAFLPENTNQANIVQLRDRLCRAQGEPVPRHETPKIPYERHQLPKGRPGPTAGHTQMPRVPAQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNTAQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQQYSFGTGGSAMYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTENQPIQDQAPMLEGPQNGWNDPPALNRVPKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSNQASFSRPHLSGGQPFHGIQQPLGQPGIPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTIQHVQSLPTEKITKKPIPNEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTIINGLHNIARSIETRNYAEGLTIHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV	98886	54693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_55271_56667_56740_60093_60214_62559_62824_64372_64429_65598_65638_73524_73867_75463_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_87042_87504_87581_90692_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819
899644	contig_16369_pilon	+	5238	2	Intergenic	novelGene_98698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	432	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	349	696	11634	11981	TRUE	40	TGTGAAAAAAACGCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELHSPFLGNLRSLFSPEGWEQLRSHVTQSVKSVPRKLMLKICDNYKKFTKGGAMPQMYHLERPMSLQKQVGGKISEVERNTYSKDGKEEESSRDKRQRQEVRGKTTEGRVNMD	11285	16623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_+_14399_14498
899645	contig_12964_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_131728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTATAGCGCTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615940	614950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_615000_615900
899646	contig_4131_pilon	+	2166	9	Intergenic	novelGene_127837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	95.4135734578681	298	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1089	2036	91526	97745	FALSE	50	TATAAAGACTGTAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85375	97875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85845_87139_87694_90262_90438_91474_91571_93097_93329_94308_94332_94426_94540_97209
899647	contig_8045_pilon	-	4407	6	Intergenic	novelGene_35327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_5	168.363416453813	272	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	126	389	115779	102674	TRUE	20	TTTTAAATGTTTTGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQLPTKGLASKGAADVGRPGFVRTQATTRGCCGSTQGLFPMSRRRRPLPRRAAGGIEVCAGAVRPPARAGIRIGRRRGRGACASRSHSGGEMIRGQRKVQEVESIIKSMTAEYHLKKFKNKILDFHF	115904	80016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_83606_86593_86663_98059_98115_100942_101059_102484_102764_115605
899648	SIRV6	+	1350	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	381	79	165	56	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	159	650	1733	10736	TRUE	30	CGTTTGGTCGCAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1468	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899649	contig_854_pilon	+	4868	11	Intergenic	novelGene_36325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	159.818522080515	699	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	135	1589	651669	665708	TRUE	50	CACAATGAAACAATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRGAGAGPQGDGHGPSNKEDQRDCATASCLSQGPLPQLHPVDVMAALPVPWSLRLLVFLLPLAIPQLSTVVTDASTLTCFYNSRANISCVWSQDGTLQATACQVHAQPDKRQWSKTCELLPTMRQSWACNLILGAPNSQKLTAADVINISVTCLEGKRRRMVKTQEFKPFENLRLMAPDSLRVVHVEAHRCNVTWTLTQFSHYIENYLEFEAQTRPLDHSWEEVSLLSLKQNQQWIYLESLVPDTAYEFQVRARACKGSNMTWSPWSQPLAFRTKPAAPGKTPSFSWLGHMFVGLSGAFAFSILVYLRANCRYIGPWLKKVLKCHIPDPSEFFSQLSTEHGGDFQKWLSSPFPSSSFSPVGPAPEISPLEVLERDAKAMQLLLRPEDKVPAPSPSSHSHTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPCTEESDEGRPGAPAGSPLPALPPLPGEDDAYCTFPPWGRPAAFLPQSPHWPGSPKQCSPGQRGQGGEAAPLPSWGSFWRLRPQTPGASCPKSPQPSG	643819	669029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_643921_651635_651757_652192_652308_653460_653540_655839_655946_657358_657508_658859_659026_659221_659340_661801_661887_665159_668067_668108
899650	contig_9225_pilon	+	1034	1	Intergenic	novelGene_160164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGCGGCGCATTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45615	46649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_+_45600_46600
899651	contig_18592_pilon	-	2652	1	Intergenic	novelGene_114767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTGTATGTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3969	1317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_1300_4000
899652	contig_14326_pilon	-	2637	7	Intergenic	novelGene_120725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	44.2743969153982	469	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	32	1078	493216	443443	TRUE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSVGPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPGALSPAGAWRGPAEVGRGGKAGKAVGNKGQSLLRTKLLGPLLGVQVQTAHSFEQVLTIAGWTGAHLRACPKLALVSVPSHLLPLLQEPAGHQGRERALPLCHLPGPRRLPLLPLPH	493247	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443932_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
899653	contig_11924_pilon	+	2287	8	Intergenic	novelGene_128015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	198.182764546429	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	108	770	11090	64571	TRUE	15	ACCTCTTGTATTTCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAAAAAATTSIEVAEGAERRGESPTRKPNSEPGRMDLHQPGTGRYQVLHNEEDNSESSATEQPSTSNATPQIVQTAPSTPVLETNSSPPPYSSITVEVPTTSDTEAYSEFYPVPPPYSVATSLPTIQEEECPPRDDFSDADQLRVGNDGIFMLAFFMAFIFNWLGFCLSFCITNTIAGRYGAICGFGLSLIKWILIVRFSDYFTGYFNGQYWLWWIFLVLGLLLFFRGFVNYLKVRNMSESMAAAHRKRYFFLL	10982	72570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_11129_38813_38980_42072_42141_50560_50655_58636_58762_61408_61476_64467_64574_71055
899654	contig_9863_pilon	+	1427	7	Intergenic	novelGene_153987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	150.664822997569	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	344	904	15323	30596	FALSE	50	ACATGAATGCAAACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVSAKLFIVGSNSSSSTRNAVDMACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKPNSNQVNLASCCVMPPDLTAFAKQFDIQLLTHNDPKELLSEASFQEALQESIPDIQAHEWVPLWLLRYSVIVKSRGIIKSKGYILQAKRRGS	5738	31119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5944_13883_13950_15250_15336_18204_18265_20305_20509_21831_21947_30426
899655	contig_10011_pilon	+	3151	9	Intergenic	novelGene_68099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	77.6481446977325	606	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	499	2118	325794	333194	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKVSGLGLLGPCALPHQVPEEWSSPCFLEVGRTCGDAAHGPPAGYCDFLCS	322887	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323144_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994
899657	contig_5260_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_144413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTAATCCCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500719	497893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_497900_500700
899659	contig_6434_pilon	+	2784	1	Intergenic	novelGene_61884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGTGACATTTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886473	889257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_886500_889300
899660	contig_3397_pilon	+	3217	19	Intergenic	novelGene_154575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	289.838423485215	4	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	738	2870	172428	206594	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLPPRTSHPVVKFSCTDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQAKIESDRVIGSVGKKVVQETGIKVRSRSHGISMAYRKDFQQLLQGISEDVPHRLLDLNMKEYTGFQVALLNKDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	124831	206941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_124923_125314_125393_126209_126360_142138_142229_151575_151799_172322_172507_178078_178205_180374_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_190928_191145_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
899661	contig_7165_pilon	-	4740	29	Intergenic	novelGene_116839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_22	202.423943262951	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1162	3489	824	4312	324021	263040	FALSE	35	ACACAAATCCAGATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGKDSCRICSILLFKLCHIDSQIDGGIPSYCFALMVMFFLQQRKPPLLPCLLGSWIEGFDPKRMDDFQLKGIVEEKFVKWECNSSSATEKNSIAEENKAKADQPKDDTKKTETDNQSNAMKEKHGKSPLTLETPNQVSLGQLWLELLKFYTLDFALEEYVICVRIKDILTRENKNWPKRRIAIEDPFSVKRNVARSLNSQLVYEYVVERFRAAYRYFACPQRKGGSKSTVDSKKKEKGKINNKKPVKSDSMAASCCILLGESTEKINTERDQPDKCDEMECTSQRCITDKDLLVNELDLAEHGQKSSSLITSEGSQLEPKSIKKQGDLAPSETCLKKGLSQCNCNEYKSPDPGESASTDCRSNLETESSHQIVCTDMSATSCNCKATEDSSDLNDDDKLLAEELHYVFDKFILTSGKPPTIVCSICKKDGHSKNDCPEDFRKIDLKPLPPMTNRFREILDLVCKRCFDELSPPFSEQHNREQILIGLEKFIQKEYDEKARLCLFGSSKNGFGFRDSDLDICMTLEGHENAEKLNCKEIIENLAKILKRHPGLRNILPITTAKVPIVKFEHRRSGLEGDISLYNTLAQHNTRMLATYAAIDPRVQYLGYTMKVFAKRCDIGDASRGSLSSYAYILMVLYFLQQRKPPVIPVLQEIFDGKQIPQRMVDGWNAFFFDKTEELKKRLPSLGKNTETLGELWLGLLRFYTEEFDFKEYVISIRQKKLLTTFEKQWTSKCIAIEDPFDLNHNLGAGVSRKMTNFIMKAFINGRKLFGTPFYPLIGREAEYFFDSRVLTDGELAPNDRCCRVCGKIGHYMKDCPKRRSSLLFRLKKKDSEEEKEGNEDDKDSRDLLDPRDLHDTRDYRDPRDLRCFICGDAGHVRRECPEVKLARQRNSSVAAAQLVRNLVNAQQVAGSTQQQGDQPIRTRQSSECSDSPSYSPQPQPFPQNSSQSAAITQPPSQPGSQPKLGPPQQGAQPPHQVQMPMYNFPQSPPAQYSSMHNMGLLPMHPLQIPAPSWPIHGPVMHSAPGTAPSNIGLNDPSIIFAQPAARPVAIPSSSHDGHWPRTVPPNSLVNNGAVGNSEPGFPGLNPPIPWEHAPRPHFPLVPASWPYGLHQNFMHQGSARFQPNKPFYTQAGLPMHSNQPILLSQGYPYLSVSYIQQKK	368876	262611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_263129_264752_264912_268774_269223_276517_276619_277628_277853_278806_278923_284950_285034_285127_285176_285668_285847_285977_286056_290630_290745_293425_293516_293804_293909_294000_294059_296639_296744_301857_301945_305702_305854_309811_310510_313695_313871_317440_317654_317820_317941_323970_324032_325237_325308_328631_328684_332778_332868_334397_334576_346283_346401_359141_359306_368733
899662	contig_9653_pilon	+	1299	6	Intergenic	novelGene_48250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	615	977	839361	845824	TRUE	45	AAGTACTTTGCAAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMLVVLILSTSPWENSVLSTSTSISSRSESERSEEIVEPMLSIRIRSISCGPCSCSSRRFKNLCSRSKFSSWCWLFLSASSSFLMCALALLSKPSVVCLVQSGPNGIRTFKRSKHRRR	838746	929028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_839443_844948_845121_845715_845831_913559_913692_927808_927865_928900
899663	contig_14744_pilon	-	2537	6	Intergenic	novelGene_66006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_2	347.270845306657	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	68	577	969897	968300	TRUE	20	ATACCATTTATTGGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969964	960501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_967273_968630_969717
899665	contig_14184_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_66607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2	343	125990	125649	NA	10	TTTTGTTTGTTGTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWVCVLLSGGQLPRGLVCNLGREAEAPRGRGTRPRSLGESGQGSQGSGLCGRPRKPPPRFLCPTGGASFVCLRHRGPASRPGRLGPVGKPFQRLNGAEDVWAAAREGWGPGTW	125991	124971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_125000_126000
899666	contig_5331_pilon	-	2421	13	Intergenic	novelGene_112830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	131.718212484075	498	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	253	1500	797783	779458	FALSE	50	TCATTTTCAAAAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPTGAPPAEQPDVIPPQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSAQMGAVDLLGGGLDSLIGSTNFTPPAAAVPASLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLNTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPSENEAQFQIRDCPLNAEAVSSKLQSSNIFTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSLTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN	799413	778536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_779533_781125_781281_781384_781472_782417_782503_782799_782930_784285_784432_788985_789127_790517_790686_791484_791551_792042_792142_797687_797854_798194_798311_799347
899667	contig_2798_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_120055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAATTACATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174989	173027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_173000_175000
899668	contig_13244_pilon	+	1969	3	Intergenic	novelGene_87003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	212.5	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	406	930	471590	475178	FALSE	30	TTGCACACTAATTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLTSNRFGFFGFREKEAVRVCRTESELWEAGQKEYSKAWCLKVCFFLLAFDKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPESPFSREPHRISSTDLEPGRQHSLSVRQS	471184	476217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_471869_471962_472119_475088
899669	contig_10626_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_138186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1891	2235	10203	9859	NA	65	TGACCAAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAKPDTFDSEDNVACSFLNLQIMHVLQYSRCLHSIKHLTKPALVCLGMSVLTDCGVLNAIRHLVVADYRILRRVYDTVTGSVGQLQLYLKSESFMGIRRIVYQGFVSKKLINL	12093	9799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10626_pilon_-_9800_12100
899670	contig_16303_pilon	+	3834	7	Intergenic	novelGene_34079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1358	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2899	3204	37468	38653	TRUE	40	AACAAAGTTCAGGCAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLLRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	33088	48028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_35766_35982_36028_37168_37302_37424_37703_38582_38855_40432_40730_47896
899671	contig_15498_pilon	-	1499	11	Intergenic	novelGene_42658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	132.280913211241	20	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	13	603	697708	690589	TRUE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLTPSSRINPSPSIPMRWGRTPS	697720	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_690940_691301_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
899672	contig_6898_pilon	+	2900	16	Intergenic	novelGene_35686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2416.63856903206	7	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	254	1954	104574	125646	TRUE	40	TTAAAAGTTTAGGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_63950_64038_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125874_126875_127334_127423
899673	contig_5684_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_81067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAGGGGTAATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445637	443492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_443500_445600
899674	contig_10106_pilon	+	4901	12	Intergenic	novelGene_73876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	545.598587041625	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	273	1253	151101	172575	FALSE	25	TCTTTCAGATGTGAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	132478	176223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132647_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505
899675	contig_13863_pilon	-	2190	21	Intergenic	novelGene_41983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1243	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTTTAGAATCGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81653	48554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_48692_54756_54862_55284_55385_58893_59004_60734_60809_60881_60980_61928_61988_62760_62836_63953_64057_64640_64710_65651_65769_68684_68750_69377_69456_70273_70372_70467_70546_73188_73318_74716_74814_75878_76065_76171_76261_77544_77705_81490
899676	contig_7840_pilon	-	2558	12	Intergenic	novelGene_69033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	261.707141857408	47	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	150	1547	427684	365958	TRUE	5	CACTTTCTGTCCTGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRFLIGREGASAREEALAASGRRRLRRKKVEPQEALCSVKKYFYTIAPMTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEERGVKLGLGDFIFYSVLVGKASATASGDWNTTIACFVAILIGLCLTLLLLAIFKKALPALPISITFGLVFYFATDYLVQPFMDQLAFHQFYI	445704	364881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_365281_365345_366114_367533_367653_373196_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609_427738_445608
899677	contig_6163_pilon	-	2938	8	Intergenic	novelGene_103800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	300.156013854564	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	34	786	93933	77184	TRUE	20	CCACCCACTGCTTAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLPPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVQRMARSTSGMEKVVSK	93966	74074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_78301_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
899678	contig_1996_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_131885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGCCATACCCCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169207	169821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_169200_169800
899679	contig_8576_pilon	+	2543	1	Intergenic	novelGene_88760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAATAATAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729257	731800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_729300_731800
899680	contig_4857_pilon	-	3320	1	Intergenic	novelGene_48751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTATATATGGCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201942	1198622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1198600_1201900
899681	contig_34_pilon	-	4481	5	Intergenic	novelGene_40029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1582	2154	219099	218395	FALSE	55	TTGAAAAAGACTTTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQGCPLPPLLFHIVLEILVRAIRLEKEIKGIQIGREEVKVFLFADDTTLYTENPKESTRKLLERIADFSKVSGYKINIQKSVGFLYSNKENFEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTSDVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIDRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPLAFFTVVKTAW	384549	216067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_218419_218550_219662_327770_327776_382431_383093_384196
899682	contig_16846_pilon	+	2328	12	Intergenic	novelGene_82885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	113.043910140417	238	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	142	1206	348050	370491	TRUE	15	GTTGCTGCCTTATAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSRSENVEVLEEEPVMSKTHDHQLKSSSNLVEVCTKSSASLEMTKSIAKERIHLGSSPPKGGSCDLSHQEGLQSRSLHLSPQEQSVHQGRRQSWRRASMKGMNRRKSLPPFHQGITALSRSISVNLAESKRLGALLLSSFQFSIQKLEPFLRDTEGFSLESFRAKASSLSEELKHFADKLESDGTLQKCFGKSKEKELDLSLEASVAEMKEYIAKFSSERQTWDHLLLHYQKEAEEIPSRSAEGRIIEVEVEPTTYLGSSQSEVLNTKPDYQKILQNQEKVFDCMELVMDELQGSVKQLHAFMDESTECLQKVSVQLGKRSMQQIDPSPARKLLKLRLRNPPTTHCSGSCQ	345935	374826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_346062_348034_348084_348292_348617_350707_350782_352036_352110_353713_353802_356714_356775_357182_357258_368496_368642_369719_369808_370387_370558_373770
899683	contig_7629_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_153586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCCAGCATTATGCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349642	347748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_347700_349600
899684	contig_16635_pilon	+	4485	4	Intergenic	novelGene_153141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	730	junction_3	136.797498352695	1649	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	174	560	86080	87798	TRUE	45	GAACAAAGAAACCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEQNRGKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNRAEIKLKRAVEEVKKLLVPAAEGEDSLKKMQLMELAILNGTYRDANIKSPALAFSLAATAQAAPRIITGPAPVLPPAALRTPTPAGPTIMPLIRQIQTAVMPNGTPHPAAAIVPPGPEAGLIYTPYEYPYTLAPATSILEYPIEPSGVLGKSPSLRG	53052	95724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_+_53199_86052_86141_87472_90683_94683
899685	contig_8661_pilon	+	1234	11	Intergenic	novelGene_137933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	533	985	308439	312843	TRUE	40	AGCTGCTAAAAAACAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSLFHSGLISVHFWLEYLVQTFFTVTFSSVSSSSKSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSAASFTFFCGTLLPPAGADRFPDILKSFTSSSSSSSDSASSSTATKCCPLICTGPEPHFNRKTTGGVISKPPRDTVGCTDIFKVASVTLIGLPS	301096	316046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_+_301440_305326_305382_307624_307741_308420_308508_308833_308891_311746_311812_311905_312013_312318_312410_312779_312905_313808_313884_315933
899686	contig_14773_pilon	-	4888	1	Intergenic	novelGene_174759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	702	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCAGTCCATCAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17371	12483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_-_12500_17400
899687	contig_11493_pilon	-	3614	3	Intergenic	novelGene_143715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2685	3053	290157	289789	FALSE	15	ATCCCACCGGTGCGGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQSISEIFFFFIFWISNSCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNACNFLFVFSMNLSIFSSFLSAFSFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGRSSGVLFWMPSGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	294062	289227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_291434_291479_291784_292958
899688	contig_15668_pilon	-	3674	7	Intergenic	novelGene_169624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	150.241657191192	302	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	286	1914	81420	72021	FALSE	40	CATGGTTTCACAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQNTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELATIFESIQKDSSSTNLESMDTS	119352	70260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_72246_73013_73122_75051_75217_75976_76147_79706_79803_80555_81543_119189
899689	contig_9815_pilon	-	3592	4	Intergenic	novelGene_164237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2734	3099	2177	1812	FALSE	55	GGGAGGAGGAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFVIVCCLRGIQ	85903	1318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_2523_39125_39914_82661_84066_85707
899690	contig_10475_pilon	-	1943	5	Intergenic	novelGene_148733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	144.772882474585	44	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	179	658	266553	243953	TRUE	35	GGAGGAACCCCTGAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSFSHLPLHSNKEDVYDGVTSAENMRNGLVNSEVHNEDGRNGDVSQFPYVEFTGRDSVTCPTCQGTGRIPRGQENQLVALIPYSDQRLRPRRTKLYVMASVFVCLLLSGLAVFFLFPRSIDVKYIGVKSAYVSYDVQKRTIYLNITVSTNLHYRYLT	268754	210955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_210982_242693_244149_263189_263254_266333_266556_268578
899691	contig_7695_pilon	-	2750	13	Intergenic	novelGene_41634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	156.002848976834	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	355	1389	726563	716614	TRUE	0	CTGCCTTGGCCCTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHTPRQKRSTPLKERQLSKPLSERTNSSDSERSPDLGHSTQIPRKVVYDQLNQILVSDAALPENVILVNTADWQGQYVAELLQDQRKPVVCTCSTVEVQAVLSALLTRIQRYCNCNSTMPRPVKVAAVGGQSYLSSILRFFVKSLASKTSDWLSYMRFLIVPLGSHPVAKYLGSVDSRYSSTFLDAGWRDLFSRSEPPVAEQLDVVGRVMQYVNGASVTHQLPVAEAMLTCRHKFPDEDSYQKFIPFIGVVKVGLVEDSPSTTGDGDDSPVVSLTVPSTSPPSSSGMSRDATATPPSSPSMSSALAVMGSPNSPYGDVIGLQVDYWLGHPSERRRDGDKRDASSKNTLKSVFRSVQVSRLPHGGEAQLSGTMAMTVVTKEKNKKVPTIFLSKKPREKEVDSKSQVIEGISRLICSAKQQQTMLRVSIDGVEWSDIKFFQLAAQWPTHVKHFPVGLFSGSKAT	739792	715120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_716087_716218_716730_716884_717005_718112_718340_720165_720302_720516_720560_724655_724699_725249_725353_726130_726242_726427_726583_727247_727355_727942_728048_739669
899692	contig_12230_pilon	+	6995	7	Intergenic	novelGene_178740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2808	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	6159	6860	147608	148309	FALSE	5	CTTTCTTCTTTTTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHSSKSRGRQREASNKSKEGGKKKKATPAANKWHSQSQLMQAGVSRQKTVSVGRGGGRVWVKKVGEWESVYHKLPVLCSPSGRRKDGAWSEALERKEGEMARGEEEIKRSGKKQHQQPTNGTQRAACLGVWNPSSRGFPVKRLWPREAEEAEPGRRGVGVGKGISQITVCFVSCWTLREAAFSHPRLLVSNRTPRWRIQAALAGRGPLHESLLALRSLSVFSLHLVLG	112724	148444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12230_pilon_+_113975_117740_117858_118432_119102_139910_141644_141684_142026_142268_142671_145961
899693	contig_7426_pilon	-	3981	29	Intergenic	novelGene_27517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	538	43	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1286	1807	1013949	1012389	TRUE	25	GACCTGGAAGAACCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPWTRTLGSSLGKCFTRIVKVDPLRARWLERGSSSMVQLTAWPGSLVPFTAAEDSTGRNSREAGWPCSGGMAWTMTRCSWGPTMLQPRATVIAVCRLSPCDHDGADVGPPESLDNRCRLWLQQVPHDQQPQEAQVLLHGVPCQLLSCLQVWCNGQWLAGEGYDAVASSCVAL	1017580	994551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_994653_999840_999936_1000045_1000232_1000541_1000599_1000770_1000889_1001207_1001285_1002527_1002607_1002804_1002875_1003796_1003932_1004015_1004083_1004163_1004295_1008867_1009027_1009597_1009709_1009793_1009838_1009924_1010116_1011216_1011422_1011847_1012011_1012097_1012252_1012357_1012485_1012603_1012731_1013437_1013598_1013719_1013837_1013927_1014005_1014664_1014822_1014902_1015004_1016202_1016425_1016509_1016668_1016908_1017071_1017150
899694	contig_6102_pilon	-	2127	10	Intergenic	novelGene_32094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	144.118349856748	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1965	162	2126	814571	792042	FALSE	55	TGAGTAAAATTAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLNGDVNVNGLSTVSHTTTSGILNSAPHSSSTSHLHHPSVAYDCLWNYSQYPSANPGSNLKDSSLLSQFSGGQYPLNGILGGSRQPSSPSHNTNLRAGSQEFWANGTQSPMGLNFDSQELYDSFPDQNFEVMPNGPPSFFTSPQSSPMLGSSIQTFAPSQEVGSGIHPDETGEKELTSVVAENGTGLVGSLELEEEQPELKMCGYNGSVPSVESLHQEVSVLVPDPSVSCLDDPSHLPDQLEDTPILSEDSLEPFNSLAPEQVSGGLYGIDDTELMSGEDKLPLEDSPVISALDCTSLNNTTAFSLLADDSQTSASIFASPTSPPVLGESVLQDNSFDLNNGSDTEQEEMEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAK	814732	792040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_795644_796226_796446_797091_797278_798168_798763_814567
899695	contig_17743_pilon	+	1623	1	Intergenic	novelGene_176423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGGAGAGAGAGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42984	44607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_+_43000_44600
899696	contig_5423_pilon	+	3174	8	Intergenic	novelGene_85262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	511	junction_6	712.218207791828	633	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	278	1039	542216	553344	FALSE	20	TGCTGAGTCTTACAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKIDMVHRNISEGFFLDASRHILEAPQHGLERRHLEANQNELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	534827	555479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_548788_548903_551350_551465_553206
899697	contig_13571_pilon	-	3830	11	Intergenic	novelGene_128116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	62.939733078557	85	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	918	2483	247432	206603	FALSE	70	TCAGAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLQVLYLNTGQNLDNMLHGTGMKSDSNQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVVLISMAVCIMAMIIFFSCFCYKHYCKSISNRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI	293757	205255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_206729_206815_206947_208171_208348_214754_215053_223397_223591_227447_227593_229665_229766_229918_230016_240099_240203_247235_248103_293510
899698	contig_1143_pilon	+	6215	3	Intergenic	novelGene_86634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	107	212	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1216	3651	104	3754	1334675	1338509	FALSE	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDMKINADITGAKELLDDNNFISEKESGVHEPKDCQTSFQKNNALTLSEELSKDKSEKALSGGQSTLFIHAGAPAVSSENFTLPKGAAVNGPVSHSSLTKTSNMNKGSVSLTTGQPVDQPTTESCSALKVAADLQLSTPQNASQHQVLFLLSDVAHAKNPAHSIKKLPTSASVGCDIQNSVGNSIKSDSTLIDQVEVGEDSEDLLVKSDCVSTLTGISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTNEDTVDKAPVHSKVGQEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCISNKSKMLEVDFLEQNEELQAIDSQKYALSKVKPESTDEDLESVDAFRHLIYNPDKCGEDSSPVHTSTFLSNSLKKKCEESDSESPATFSTEEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLLKHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRYYCCEECNFMAVTENELECHRGVAHGAVVKCPIVSSDIAQRKMQKKTFMKDSVTGSSKKSTTYICKMCPFTTSARSILKKHMEYLHSSSCIDSFGSPLGLDKRKSDILEEPVDIVSTKPLSKQQPTTFPKNSALKQDVKRTFGSASQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSITQSGVNVCNQNNSPKTVMNKSSIDQKPKYFHQAAKEKSNVKANSNYLYRHKYENYRMIKKSGESYPVHFKKEETSSLNSLHLFSSSGNSHSDSFISDSHNSDTKRPESFKEHRRVAVKRVVKESKKESSVEGEDLDSYPDFLHKMTVVVLQKLNSAEKKDSYETEDESSWDNVELGDYTTQAIEEETYNDINQEHVNIFPLFKSKVEGQEPGENTALSYDQNDGFYFEYYEDTGTNNFLHDVHDPQHLENAETSLSKHSSVFHWSDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQIATSDKMQHFKRTGTGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRLGKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNNRRIIPRPFVAQKFASGDDYLSQNVIPLEAYRNGLKTEAVSVSASEEDGLSFLNECVETKPELSGGKKSLTLIELLKNKRMGEERNSALSPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDLTMHSGKRTFMTVLAYLSTV	1288514	1340970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1288587_1334643_1337679_1337862
899699	contig_8050_pilon	+	4116	12	Intergenic	novelGene_114825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	848	junction_8	220.800309917138	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1623	2153	321892	335684	FALSE	65	GTAAAAAAGGAAGACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQNNLHEKIGDEDGQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRVC	294515	337647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562
899700	contig_6710_pilon	-	1251	2	Intergenic	novelGene_93404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	277	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658195	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
899701	contig_5698_pilon	+	2085	6	Intergenic	novelGene_55039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1535	junction_1	325.96478337391	11	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	453	566	19257	19370	FALSE	5	CCTGTCTGAGTCTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	7893	20889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
899702	contig_2278_pilon	-	3021	1	Intergenic	novelGene_118140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCAAAGATTAACTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386683	1383662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1383700_1386700
899703	contig_8544_pilon	+	678	7	Intergenic	novelGene_55926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	427.791388672355	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	223	570	90532	118415	TRUE	35	GCTGAACTTGAAACACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQREWLRTCDGSYFRPRGLGNC	83417	120334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523_92618_118352_118455_120265
899704	contig_15407_pilon	+	1579	2	Intergenic	novelGene_123065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	330	704	449761	451267	FALSE	15	GTGGAGTTCATGCATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRALHRVLPALPRANVTVPRRNRRGHFIEKWQPMSSWTRQQPGPRVWANRRFRNVGCARRRPLTKSNWKRQSRQTRAAGTLRHVGQPSF	449431	452142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_451002
899705	contig_3155_pilon	+	1519	5	Intergenic	novelGene_26403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	40	546	258156	261211	TRUE	45	GAAGATTTGAATAAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258116	262517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261577_261909
899706	contig_5936_pilon	-	2246	4	Intergenic	novelGene_53600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_2	38.7240952838869	402	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTAAGATTGCTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560522	548465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_550095_551473_551513_555609_555898_560232
899707	contig_2799_pilon	-	636	7	Intergenic	novelGene_85548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	123	542	751411	718679	TRUE	35	GGTACAGTAATTAAATCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	755384	707635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302
899708	contig_1276_pilon	-	2510	3	Intergenic	novelGene_159758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGGGAGCAGAGCGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205659	87478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_87674_110518_111095_203920
899709	contig_17171_pilon	-	2486	4	Intergenic	novelGene_147353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	48.3321838943783	353	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	220	2043	77935	59401	FALSE	35	GATTAAGATTTTCTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLLLYFLVLFVLARFFEAIVWYETGIFATQLVDPVALSFKKLKTILECRGLGYSGLPEKKDVRELVEKSGDLMEGELYSALKEEEASESISSTNFSGEMHFYELVEDTKDGIWLVQVIANDRSPLVGKIHWEKMVKKVSRFGIRTGTFNCSSDPRYCRRRGWVRSTLIMSVPQTSTSKGKVMLKEYSGRKIEVEHIFKWITAHAASRIKTIYNAEHLKEEWNKSDQYWVKIYLFANLDQPPAFFSALSIKFTGRVEFIFVNMENWDNMSYMTDIGIYNMPSYILRTPEGIYRYGNHTGEFISLQAMDSFLRSLQPEVNDLFVLSLVLVNLMAWMDLFITQGATIKRFVVLISTLGTYNSLLIISWLPVLGFLQLPYLDSFYEYSLKLLRYSNTTTLASWVRADWMFYSSHPALFLSTYLGHGLLIDYFEKKRRRNNNNDEINANNLEWLSSLWDWYTSYLFHPIASFQNFPVESDWDEDPDLFLERLAFPDLWLHPLIPTDYIKNLPIWRFKCLGVQSEEEMSEGSQDIENDSDSESTDTFTSEKEAFEDKQSIIHNSQGRASHCDSEACSCANKYCQTSPYERKGRSYGSYNTNEAMEPDWLTWPADMLHCTECVVCLENFENGCLLMGLPCGHVFHQNCIAMWLAGGRHCCPVCRWPSYKKKQPYAQHQPLSNDVPS	81088	58957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_60977_67245_67362_77803_77944_80877
899710	contig_13780_pilon	-	2170	15	Intergenic	novelGene_149080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1628.76529077979	26	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	166	2037	702195	657588	FALSE	15	CGCCCGGGAGCGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNSVASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLAIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727564	657454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713222_727461
899711	contig_20527_pilon	+	2799	6	Intergenic	novelGene_138556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1158.2056121432	98	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	675	1301	13527	27453	FALSE	30	TGACCATGCTAGCTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12809	28951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_12893_12935_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
899712	contig_1037_pilon	-	3158	2	Intergenic	novelGene_84611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAAATACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500077	496865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_499849_499902
899713	contig_7744_pilon	+	3747	17	Intergenic	novelGene_62551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_1	176.188774826888	1037	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2735	3304	889342	890785	FALSE	0	GCGTCGTGTGTGTTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPENALEEITKNMDTSAVLAEILAGPGREPIQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAFGLPRPQQPQQEEVTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEDGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCDLMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS	879805	891228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_879908_882666_882894_883079_883203_883412_883515_884618_884709_884861_884903_885274_885371_886858_886943_887134_887194_887346_889155_889339_889446_889590_889642_889740_889877_890089_890144_890223_890288_890539_890596_890680
899714	contig_11572_pilon	-	6643	13	Intergenic	novelGene_100064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	24.3475985582882	807	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	150	1358	290529	289321	TRUE	25	TTGTCCCTGTAAAGTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNFEDELTCPICYSIFEDPRVLPCSHTFCRNCLENVLQASGNFYIWRPLRIPLKCPNCRSIIEIASTGIESLPVNFALKAIIEKYQQEDHPDIVTCPEHYRQPLNVYCLLDKKLVCGHCLTIGQHHGHPIDDLESAYLKEKDTPQKLLAQLTDTHWTDVTRLTEKLQEQKFHSEKMVQGDKEVVLQYFKELSDILEQKKNFFLTALCDVGNLINQEYTPQIETMKEIREQQLELMTLTTSLQEESPLKFLEKVDDVRQRVQTLKQRPLPEAQPVEIYPRVSQVLKEWCRTEIGQIKKVLIPEMKISSKKMPSSWPDRDEKEVEFFKILNIVIVTLISVILMSIFFFNQHVITFLNEVTLVCFSEVSLSVYQSFSNSLYDLKDSLCYTLYLLKEFMWKIVSH	304663	276329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_276350_276436_276511_277132_277286_279164_279291_280385_280577_282471_282617_283276_283451_283881_284065_284193_284424_284862_285052_285520_290533_303584_303663_304595
899715	contig_13144_pilon	-	3891	1	Intergenic	novelGene_178459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	1706	2296	102761	102171	NA	65	ATAGAAAGAGCAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	104466	100575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_-_100600_104500
899716	contig_13074_pilon	+	3727	22	Intergenic	novelGene_153447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1977	2297	629325	629645	TRUE	15	ACGGGAGGACGGGGGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWASKAEGKPVLRKISRTSNPDTNPSISLSVFRKISSYLAFSAGDTTHYRGKKIQFFCQNEANFEVSFFQNMTIFAANSEQFYSPIYSNSISLQSHPNQNTVVKRK	539173	715623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_539732_541037_541120_556624_556692_560582_560723_563081_563120_564215_564305_564556_564674_566188_566394_572615_572814_583611_583773_596953_597027_623119_623207_627541_627701_629322_630477_661300_661360_664964_665096_666202_666269_667204_667300_669882_669932_670716_670805_679254_679299_715556
899717	contig_12464_pilon	+	2838	1	Intergenic	novelGene_68705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	651	959	339501	339809	NA	50	GCTAAAACCAAAAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQIDICTPMFTAAIYTMTKRWKQPKCPTTDQWVNKLWYVHTMEYYAMINNDEFVKHLTSGIRKALCRVILEFRFWNLNLQGIMLSEISQSQKDKYCMKSLL	338850	341688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_338800_341700
899718	contig_10494_pilon	+	2373	5	Intergenic	novelGene_102155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.1893953674349	6	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	1	708	887650	892457	FALSE	20	ACAGGCCATGGTTGTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APALDPGLSVSPPGSTLPGHGLFPHPSDGRSVLAGKSKKEDGIKEEKRKRDSSTQPPKSSKPSAGSRSSQQPSTPQQAPSGQPPQAAFVAHKEIKLTLLNKATDKASRKRYELSDKDRQSSPPAKRANLSPDRGSRDRKSGGRLSSPKPERQRGQNPKAPATQPDRKRQLSPQSKGSSKVTSVPGKATDASATSAAPSTKSGKASTLSRREELLKQLKAVEDAIARKRAKIPGKV	887649	894122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_887726_889499_889727_890465_890563_891359_891457_892246
899719	contig_9653_pilon	-	3541	15	Intergenic	novelGene_48290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.35261842365	4	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	32	2152	1040020	1006903	TRUE	35	CTTAGAAGAAACTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1005351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006152_1006313_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
899720	contig_6740_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_142732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTTGTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753075	755246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_753100_755200
899721	contig_15304_pilon	-	1563	4	Intergenic	novelGene_30658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	374.130399133184	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	499	519	103265	103245	TRUE	15	AGCCCCTTGATTTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	105942	101889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102521_102831_103329_103548_103680_105638
899722	contig_2125_pilon	+	2695	12	Intergenic	novelGene_147737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1678.67453123534	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	254	1705	664253	682094	TRUE	15	TGTGTATGTACCTCTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENSKLPEGVTINYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVHFEISITSNKCPNKNSETIKIKPLGFTEEVEIILQFICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGEVCGGNGVCKCRVCECKPNYTGSACDCSLDTSSCMAKNGQICNGRGICECGTCKCTDPKFQGPTCEMCQTCLGVCAEHKAFNKGEKKDTCAHECSHFNLTKVENRDKLPQPGQVDPLSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEAIVHVVETPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK	651047	683121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_651177_664128_664268_665027_665124_669318_669409_671196_671338_671477_671678_673117_673357_673579_673803_674531_674747_676390_676558_682028_682131_682167
899723	contig_7119_pilon	+	2406	3	Intergenic	novelGene_40934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	302	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	163	1257	137044	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127506	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707
899724	contig_3956_pilon	+	2817	12	Intergenic	novelGene_14979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1046.11975674611	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	922	2298	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
899725	contig_10603_pilon	+	1305	2	Intergenic	novelGene_173380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	203	junction_1	0	114	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACAGCATTAACTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179793	181343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10603_pilon_+_180759_181003
899726	contig_7612_pilon	-	4943	8	Intergenic	novelGene_170352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1765	2313	35838	35290	FALSE	20	CAGTGGTTGAAGTGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIHSGEKPYECKQCGKSFCDISPLNRHIKTHSGERPYECKECGKAFNRSSHLTFHIRTHRGERPYECKECGKAFSWPSALTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHVRTHSGERPYECKECGKVFISSSSLTKHIRTHNGDGPYKCKECRKAFSWPSALTRHIRTHSGERPYEFKE	142770	32659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_36098_103398_103551_134839_135238_135320_135465_135705_136011_136403_136555_137569_137697_142542
899727	contig_15371_pilon	-	2034	8	Intergenic	novelGene_151469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	293	622	222500	220873	TRUE	25	CCACCCCAGCAGATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNAGDHLSPSYLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSGKHIEESLYNLFSERHTHLYSKASKQSEEEAQHLISHI	222792	204581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_205265_208940_209036_212974_213118_215188_215336_216233_216426_220720_220875_221999_222115_222287
899728	contig_16768_pilon	+	4730	24	Intergenic	novelGene_168316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_23	757.68472577141	761	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1052	3159	391	3549	24347	70488	FALSE	15	GTAGTCTTTCCATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAAEPPPPPPAESAPSKPAASAASGGSNYSNKGGPEGVVSLAAPSAVSAGPADAEMEEVFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQESINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDLPNAAQAQKEEQLKIDEAEPLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKLKL	23956	71669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_24524_28035_28111_32635_32803_44559_44661_46402_46504_47347_47528_48858_49015_49108_49241_50677_50747_52995_53106_54492_54720_56809_56932_57012_57166_59017_59151_61964_62114_62304_62425_63204_63316_63644_63759_64111_64235_64963_65097_68101_68221_68609_68823_69343_69452_70422
899729	contig_4496_pilon	+	4052	8	Intergenic	novelGene_66663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	148.322731410466	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	328	2712	911498	998163	FALSE	10	CGAATGTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	859263	999503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_859439_899756_899893_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
899730	contig_16211_pilon	-	2017	12	Intergenic	novelGene_150050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_10	294.091962903831	13	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	627	2015	91808	71552	FALSE	35	TAAAGTAAGCAATGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRDKRKDTREKIKEKERVKEKDREKEREKEREREKEREKEKERGKNKDKDRDKEREKDREKDKEKDREREREKEHEKERDKEKEKEQDKEKDREKDKSREIDEKRKKDKKSRTPPRSYNASRRSRSSSRERRRRRSRSSSRSPRTSKTIKRKSSRSPSPRSRNKKDKKREKERDHISERRERERSASTRKSSNDRDGKEKLEKNSTS	121401	71549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_71691_73420_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_92147_92272_97474_97609_121086
899731	contig_14397_pilon	-	3880	1	Intergenic	novelGene_134654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2865	3164	118665	118366	NA	30	ATAACTGACCGTTATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFNLYSWVTTTAINILNILNTLKMSLCHDFSPAPHPHSQPLAVRDLISVLIVVYLLKVISVEAYSMQSLCPASFTWHNVLFCFLILFYCVLVKVYTAV	121529	117649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_117600_121500
899732	contig_15744_pilon	+	2618	2	Intergenic	novelGene_83623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATCTGCCCAGAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192858	196768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_192986_194277
899733	contig_3975_pilon	+	4266	5	Intergenic	novelGene_54751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2886	3380	1866528	1867022	FALSE	55	AACTGGGAACAACACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESINSLEEENFLELPEAEYKILIYRTLLEIRKEILQNAETSREYTDTVVAELKKVIQEHNAKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAVEVRISDIEDKALDANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVRERGG	1813283	1867908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1814377_1814501_1814745_1817926_1818113_1865001_1865442_1865604
899734	contig_16121_pilon	+	2123	5	Intergenic	novelGene_6879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	501.659745245719	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	207	1613	57746	62826	FALSE	20	TTCTGTAGTTAAATGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	51446	63336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_51628_57720_58202_58867_59396_60693_60856_62565
899735	contig_1948_pilon	-	5137	6	Intergenic	novelGene_31191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_5	66.0908465674332	489	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	590	1471	568353	556776	FALSE	45	AACATTAAACATCTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPLGKVLLRNVIRHTDAHNKIQEESDMWKIRELEKQMEDAYRGSKRKMLPSSSSRMRSDGFDEESQRDYWKPRHEISGTLEDDFLKAKSWNKKLYDYEANMPDRWGHSGYKELYPEEFETDSSDQQDVINGKKTSPQVKSTTHESRRHKKSKKSHKKKQKKKSHKKQKKSKKEAIDVAAHSSTEISEETEASSTRKRKQPHKRKKKSRKKSLKKPALFLESESDTFQSDDSASSSSEDSQERDTKKTKRKKRERKVHIPVTNNEIQERTNKRTNWKVATDERSAESSEDD	569573	553109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_557284_557739_557794_558680_558831_563196_563298_568284_568362_568992
899737	contig_3022_pilon	+	3424	5	Intergenic	novelGene_178504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1308	2045	20505	21242	TRUE	35	TAACACTGTGCTTACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKPDTMSPIGVQTKTPDNCPVEEHTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKILEEFRKMMQEQNAKINSQLQIIQKQQLEIQKLNNNLSEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLSQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIAIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTHIEETPKENHQDISYSHSPKLKTNKES	49	102029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3022_pilon_+_505_760_1571_20462_21490_100836_101698_101758
899738	scaffold_13505_pilon	-	2074	10	Intergenic	novelGene_111538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	242.352869964948	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2	406	602237	600106	TRUE	20	AGAACCGTTTCCCCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPRTVLLFRASSNT	602238	588584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_595062_595299_596976_597232_597627_597907_599811_600147_601873
899739	contig_5947_pilon	+	6991	13	Intergenic	novelGene_101496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	257.449995144688	790	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1046	3141	425	3565	399990	418186	FALSE	55	AATAAAAACGATGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNPHQGRRNHEGQASDEARGQRHGQENDTRRRNGNQEVRNRRPPRPSENFQQWRAPFQKPAEQPQQVKRLGYKFLESLLQKDPSEVVITLATSLGLEELLSHSSMKSNFLELICQVLRKACSSKMDRQSILHVLGILKNSEFLRVCLPAYVVGMITEPVPDIRNQYPEHISNIISLLQDLVSVFPASSVQETSMLISLLPASLNALRASGVNIEEETEKNLEKVQTIIEHLQEKRREGTLRVDTFTLVRPEAEDHVESYQTMPIYPTYNEVHMDERPFLRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGIYKCQKTSIVRVGGRSNSEILKQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPVQDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAGQEEAAGEWQTQRSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRLWLQMYQADTRRKILNFERQYRTSAERMAELRLQEDLHILKDAQVVGMTTTGAAKYRQILQKVEPRIVIVEEAAEVLEAHTIATLSKACQHLILIGDHQQLRPSANVYDLAKNFNLEVSLFERLVKVNIPFVRLNYQHRMRPAIARLLTPHIYQDLENHPSVLKYEEINGGLFQPFLCRTQLP	397103	421612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_397220_399681_401644_405970_406103_407655_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728_413869_415242_415398_415803_415950_416710_416822_417146_417243_418141
899740	contig_18272_pilon	-	2496	1	Intergenic	novelGene_7015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1179	1655	181554	181078	NA	25	CCACCCAGCAGTGCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQTIHMIMGFIREVTGYNSGSGTLRIQFLNQDSLFSAMPAGRSLPGLCPAQASVTKLFSFASKYQEAPYSASKTSARRQSAVLLHGPGSPPLCHLLLVSSLCCHHFSAATSCRLQCYSSLSLCLGLLVPGASQHRDSRSKGCTPLLALLSWWW	182732	180236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_180200_182700
899741	contig_4876_pilon	-	2662	2	Intergenic	novelGene_137884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214460	211664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_214270_214403
899742	contig_7513_pilon	-	4562	31	Intergenic	novelGene_88974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	77.276875943296	332	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	596	3151	438047	274560	TRUE	15	GTCCTTGCGTAATAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVLKVFHYFESSSEPTTWASIIRHGDATDVRGIIQKIVDSHKVKHVACYGFRLSHLLSEEVHWLHLDMGVSNVREKYELAHPPEEWKYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLELADQVDQEIALKLGCLEIRRSYWEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESILKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFNQVQTIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGATQSFIIRPQKEGERALPSIPKLANSEKQGVRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGVYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSTDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKVQQEERMRMESRRQVTVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRAQEIPMWQPNMEDSAALDMRGIGQVLPAHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLPQQPWGQLQRGCQAPAPGDQSSAHGQPRPLQRQGIRECHWPGESCHRDVQ	511364	268686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279670_290337_290470_291263_291402_295215_295303_299245_299358_316288_316494_319421_319512_320507_320609_321989_322106_324214_324316_328391_328477_336651_336750_339336_339394_354241_354295_358902_358934_364345_364464_365744_365853_366898_366977_367510_367652_377803_377859_394585_394649_396680_396761_411206_411295_421998_422166_437948_438176_466543_466642_480277_480613_511330
899743	contig_7629_pilon	+	6606	31	Intergenic	novelGene_153552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	85.2553028653741	1162	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	158	1036	225941	231914	TRUE	10	TCCGGACTGCGCCGCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPFWSMSTSSVRKRSDGEEKTLTGDVKTSPPRTAPKKQLPSIPKNALPITKPTSPAPAAQSTNGTHASYGPFYLEYSLLAEFTLVVKQKLPGVYVQPSYRSALMWFGVIFIRHGLYQDGVFKFTVYIPDNYPDGDCPRLVFDIPVFHPLVDPTSGELDVKRAFAKWRRNHNHIWQVLMYARRVFYKIDTASPLNPEAAVLYEKDVQLFKSKVVDSVKVCTARLFDQPKIEDPYAISFSPWNPSVHDEAREKMLTQKKPEEQHNKSVHVAGLSWVKPGSVQPFSKEEKTVAT	223202	292207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_223290_225870_225983_227159_227366_229608_229674_229760_229862_230315_230405_230480_230580_230674_230783_231579_231641_231806_234140_243337_243503_244084_244291_244867_244968_245688_245762_253753_253936_254027_254304_254500_254773_257009_257120_257633_257800_258541_258684_260059_260162_260886_261005_262681_262844_275164_275352_275909_275975_276066_276227_277699_277829_282807_282873_285648_285851_289265_289399_291877
899744	contig_4732_pilon	-	296	4	Intergenic	novelGene_75398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	32	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCACGTGTTCCAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525125	524028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_524092_524184_524231_524534_524668_525071
899745	contig_10197_pilon	-	1921	1	Intergenic	novelGene_115212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGGCTGCTATCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910313	908392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_908400_910300
899746	contig_15135_pilon	+	2083	6	Intergenic	novelGene_119885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGTACAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112178	122822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_113528_113711_113932_119824_119981_120097_120179_120728_120819_122635
899747	contig_1085_pilon	+	3119	4	Intergenic	novelGene_171468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTTTTTCCAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24119	196087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1085_pilon_+_25030_25604_25882_156191_157566_195529
899748	contig_18364_pilon	+	2235	6	Intergenic	novelGene_102543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_4	944.168417179901	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	34	468	16504	29893	TRUE	40	ATCCCAGCCTCCATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQFRLCVRVGKMAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSRFAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQKKPGYHAPVALLNDIPQSTEQYDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGRRTRK	16470	32577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_29679_29873_31590_32506
899749	contig_6600_pilon	-	3391	3	Intergenic	novelGene_178741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	580	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	505	1158	81857	80891	TRUE	30	TTTCCAAAAGAGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRRRDEAKRSRKRKKGKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGFPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGAPAGAKRSGGGKAYTANYRLFCLPLDAP	82361	63993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6600_pilon_-_65944_80607_81250_81562
899750	contig_7051_pilon	+	2487	6	Intergenic	novelGene_64336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	364	junction_4	347.186059627975	17	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	205	729	331836	336141	TRUE	55	GAAAGAATGGAACAACAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQVKDILLL	321843	338759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_337814_338673
899751	contig_2537_pilon	+	3335	30	Intergenic	novelGene_33416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	199.40354580217	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	1187	2920	235526	297804	FALSE	10	GTCTCATCTATGTGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMLAVGEVEDSIFKKRKDDEDSYRRRQKEKRKRMKRDQPAFTPGGILTPQALGSRNSPGSQVASNARQAAYEMRMHNNSSPSVSPNTSFTSDGSPSPVGGIKRKAEDSDSEPEPEDNVRLWEAGWKQRYYKNKFDVDAADEKFRRKVVQSYVEGLCWVLRYYYQGCASWKWYYPFHYAPFASDFEGIASLPSDFEKGTKPFKPLEQLMGVFPAASGNFLPPSWRKLMSDPDSSIIDFYPEDFAIDLNGKKYAWQGVALLPFVDERRLRAALEEVYPDLTPEETRRNSLGGDVLFVGKHHPLHDFVLELYKTGSTEPMDVPPELCHGIQGKFSLDEEAVLPDQIVCSPVPLLRDLSQNTAISINFKDPQFAEDYIFKAVMLPGARKPAPVLKPGDWEKSSNGRQWKPQLGFSRDRRPVHLDQAAFRTLGHVMPRGSGTGVYSNAAPPPATYQGSLYRPLLRGQAQIPKLMSNMRPQDSWRGPPPLFQQQRFERGVGAEPLLPWNRMLQTQNAAFQPNQYQLLAGPGISQRRKEISFATTLRKIQLELGFCEAFPNPFMVLQFYAICGKEISFLSSSF	205823	298219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_205970_228454_228583_228665_228778_230755_230868_232305_232365_232440_232531_233323_233397_233548_233600_234125_234229_234953_235029_235110_235245_235342_235401_235480_235589_239846_239892_241320_241453_245173_245293_249123_249260_250522_250631_250723_250814_251426_251500_258097_258182_259021_259120_259201_259282_266057_266115_278243_278313_278407_278540_280631_280760_290367_290432_295098_295197_297646
899753	scaffold_12124_pilon	+	3249	11	Intergenic	novelGene_22024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	454.176133234674	1	200	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	259	1194	836073	852375	TRUE	30	TGTGACTTTTAAAAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829486	859592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
899754	contig_9705_pilon	-	5913	33	Intergenic	novelGene_41754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGATTCGGCATAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547940	462702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_462739_466104_466199_468452_468502_473559_473632_474498_474620_475167_475304_492026_492202_503876_503966_505982_506143_506708_506886_508328_508513_517189_517242_517907_518026_518130_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522997_524569_524650_528229_528347_529091_529272_530038_530206_532229_532354_534457_534737_535759_535903_536361_536520_537441_537566_537906_538042_538144_538331_538839_539017_539263_539367_540592_541028_541227_542815_547851
899755	contig_3153_pilon	+	10340	9	Intergenic	novelGene_104627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	351.288254144655	671	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	934	2805	233	3037	63009	111387	TRUE	40	AAACAGCTAACCTGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVKENSQNLIQRMGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILGRCKVLR	57728	167289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_62937_63010_66684_66946_67756_69752_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_116367_164965
899757	contig_5039_pilon	+	4495	9	Intergenic	novelGene_65008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_3	62.5238704416161	626	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	185	1183	1703196	1710859	TRUE	15	CATTTCCCAGGCAGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKKIKPLARATSRPGCEVDLGGFAGLFDLKAASFKDPLLASGTDGVGTKLKIAQLCNKHDTIGQDLVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYFSCGKLNLDTAEAVVAGIAEACGKAGCALLGGETAEMPDMYPPGEYDLAGFAVGAVERDQKLPHMDRIMEGDAVIGVASSGLHSNGFSLVRKIVEKSCLSYSSPAPEGCGDQTLGQLLLTPTRIYSQTLLPVLRSGHVKAFAHITGGGLLENIPRVLPQGLGVDLDAWAWGIPRIFSWLQQEGHLAEEEMARTFNCGIGAALVVPRDLTEQILRDIQQHKEEAWVIGSVVACPAGNHCLFVCF	1703011	1718557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1703245_1703623_1703734_1704337_1704537_1705711_1705964_1706189_1706343_1710623_1713145_1713409_1713552_1717572_1717689_1717788
899758	contig_15405_pilon	+	7550	9	Intergenic	novelGene_112105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_7	215.47415013175	793	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	2047	3072	118573	144629	FALSE	5	TCAGTGCCTTTGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKGSFETAKECGQMQNKWLMINIQNVQDFACQCLNRDVWSNEAVKNIIREHFIFWQVYHDSEEGQRYIQFYKLGDFPYVSILDPRTGQKLVEWHQLDVSSFLDQVTGFLGEHGQLDGLSSSPPKKCARSESLIDASEDSQLEAAIRASLQETHFDSTQTKQDSRSDEESESELFSGSEEFISVCGSDEEEEVENLAKSRKSPHKDLGHRKEENRRPLTEPPARTDTGIVTNHQGLPGVDSEILEISPEKSDGVVEGVDINGPKAQLMLRYPDGKREQITLPEQAKLLALVKHVQSKGYPNERFELLTNFPRRKLSHLDYDITLQEAGLCPQETVFVQERN	101668	149107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_103560_114075_114142_118483_118597_130539_130687_133280_133372_137791_137920_142530_142925_143069_143150_144467
899759	contig_3394_pilon	-	3220	14	Intergenic	novelGene_152684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	668	1003	530369	529448	TRUE	25	CCAATCCTGACGAAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVAAGGMGSCSILGGIAHEGRNRQASGIFRGSRHWLGNIFSGANMEDPTKGWKVGTLCTYEKSFISSGLGLPNPSSTSILNSVSCVGTMLTIGLSIMPNAVTVSELIPSL	534905	445627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_445677_504424_504572_507351_507546_507933_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518600_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176_530385_534253
899761	contig_18231_pilon	+	4761	6	Intergenic	novelGene_105904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACACCTGTGCCACTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486519	498764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_490711_492207_492336_495983_496157_497087_497166_497730_497896_498738
899762	contig_6479_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_160619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTGAACTTAAGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624225	621989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_622000_624200
899763	contig_16635_pilon	-	3040	4	Intergenic	novelGene_153138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1711	2022	89422	89111	TRUE	65	AAAAAAATTACAAAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNWEPVLQCPLLSLGSKGPCAPAHWDSRSQTRGDPHGHTPQATPRRATDAVGAAGRSSGGKKHAGVTGQSINRKETLIKVIGYMLLKKKMLQECATETSLS	91132	53052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_53199_86052_86141_87472_87770_88623
899764	contig_10734_pilon	+	5119	22	Intergenic	novelGene_51228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	455.486792000684	207	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1152	3459	204	3662	1243300	1333513	FALSE	30	GTGGTACTTAAATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGKRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198716	1334970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243358_1262350_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
899765	contig_20602_pilon	-	1850	12	Intergenic	novelGene_133706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	341.959931923789	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	328	1182	24969	16186	TRUE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVTLEECILPIMALKILYICGHKMPAGVDTDL	28921	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_16104_16282_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884
899766	contig_10947_pilon	+	4564	1	Intergenic	novelGene_167140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTGTTTTATTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92744	97308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10947_pilon_+_92700_97300
899767	contig_14450_pilon	-	3528	1	Intergenic	novelGene_48939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	436	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAGGAGAAATATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521338	517810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_517800_521300
899768	contig_4654_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_103051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCAAGGTGCGAGGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417374	419778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_417400_419800
899769	contig_678_pilon	-	2867	10	Intergenic	novelGene_167791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	362	junction_4	705.980641849808	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	968	2488	125444	31694	FALSE	50	AGTAGAGAATTCAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPPETTSKMASVRFMVTPTKIDDIPGLSDTSPDLSSRSSSRVRFSSRESVPETSRSEPMSDMSGATTSLGTVALDPASDRTSNPQDVTEDPSQNSITGEHSQLLDDGHRKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLSRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPAKVPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGKQMGCHLF	126411	31314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_31882_32698_32914_35731_35974_36684_36816_37326_37382_38796_38944_39925_40058_41346_41442_58505_58551_125173
899770	contig_11318_pilon	-	2140	2	Intergenic	novelGene_48161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAGATTCAATCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66019	58538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_58595_63935
899772	contig_13481_pilon	-	1547	8	Intergenic	novelGene_119397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	572.12796484988	1	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	89	331	556920	536905	TRUE	25	TCTGTCAGATGAGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPLPAYPPGPGAALALHVPCPSPPPPCTMSSLKSEGEHSTGTSTGSGGSLEEEVRTLFVSGLPVDIKPRELYLLFRPFKGYEGSLIKLTSRQPGRSRSGQECIERYSL	557008	526369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_527244_527460_527531_536157_536293_536767_536919_537232_537270_538013_538053_538608_538687_556845
899773	contig_5961_pilon	+	1462	8	Intergenic	novelGene_144103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	585.375023696217	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	197	637	144074	161248	TRUE	40	AAAAAAAATTTTCTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLSFLQMDIQLCQHHLLKRLSFPQLTDFGPLSNISFS	113699	176267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_161142_161249_170314_170478_172940_172984_175648
899774	contig_3018_pilon	+	2133	2	Intergenic	novelGene_78906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAGAAACTAATTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612171	615959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_613016_614670
899775	contig_252_pilon	+	2207	2	Intergenic	novelGene_99929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	294	848	380149	382465	FALSE	45	AAATAGTTACAGTAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLDGGDKLPCAKNRDLATPDHAAGDSDPHQYRSLRREADVTQVMADMAGVTLETAADSLDCGFALRFRVPINRNQAAAKVGQEKAPPPAGRPKAASASAAFDHSLKNGRLGGELRSPAGEKALEACGAVGLGSQMMAGGKAKEVTTKKCAISVAAEKKREAEGVAEGKKVVQTRVPGRKECH	379855	383824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_380670_382431
899776	contig_4654_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_103041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAATTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366286	368216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_366300_368200
899777	contig_7202_pilon	-	1077	3	Intergenic	novelGene_17538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	28	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	46	318	29911	28475	TRUE	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKVNE	29956	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
899778	contig_12841_pilon	-	5698	1	Intergenic	novelGene_55860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	105	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2238	2552	329041	328727	NA	45	TCAGATGCTATGAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDCRSVVPSLMHPAIPPHMIMVWQHPPPPCPLSQGPTDEWHPPFCAPTRAGDPQTGRVCFSNHPLAPGTHGTAVLTFPPSHLHQETGQITPLFCPTTEARSL	331278	325580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_325600_331300
899779	contig_5979_pilon	-	4970	4	Intergenic	novelGene_178442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	154	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1578	1901	426298	425975	TRUE	20	CTCTGGCCCACGGAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSRKT	519175	381275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5979_pilon_-_382466_382674_383795_425215_426550_517849
899780	contig_8674_pilon	+	4098	4	Intergenic	novelGene_102907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	298	651	173785	174138	TRUE	30	GATACAACTCTGTTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISVFWILLRVALWPKMWSVLENVPWALEKNVYFAAVGYSVLYMSMRLSWLIVSFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTITVELSISLSVLLELFMYFGALSLGV	173487	216194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_176314_214772_214934_214990_215449_215541
899781	contig_17274_pilon	-	4216	1	Intergenic	novelGene_26479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	522	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1680	2000	16164	15844	NA	20	GATCTCCACTCCGTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKFSARKSSMILSVFSIFSPYSGTLITHKFLLLIVFHIILRVPSFFFVLFSDFSSNKVVYKDLSSISPILSCIVSNLLLKSFIASTFLKSCCLSFGFLMAVFV	17843	13627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_13600_17800
899782	scaffold_13505_pilon	-	1454	12	Intergenic	novelGene_111429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	635.053872901822	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	153	998	512497	509110	TRUE	30	GAGGTTTATTTTTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKEPRFCAFVQDAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPAEREKVERAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVIFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPAFRPKSRPSPSSTREPLLSSSENSNGGREMPPADAGQGLPEKVMGSWVVVPYAQQRPRRSRRICSAWRRS	512848	507193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507544_508911_509005_509096_509220_509954_510023_510277_510365_510522_510611_511309_511478_511561_511638_511905_511984_512183_512285_512427_512543_512741
899783	contig_5423_pilon	-	4143	1	Intergenic	novelGene_85173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTCACCCCCACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115749	111606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_111600_115700
899784	contig_14643_pilon	-	6722	30	Intergenic	novelGene_99120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	235.521194494011	473	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1019	3060	8	3067	80489	45774	TRUE	35	CACAATTTTACTTGAACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLMGDEPDLDPDINKDFFESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQSNDDIASRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSINCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFIVRFPNQGRQVDDLDVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDSADDRKLIGQLNLKDKSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNPEVESCLPGVIMSLHPRYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAVCLDHAKLGESSLSPSLDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVSSMTSVNQVTHDQAVVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSIRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGALQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTSETGVEETILEGHLGVTKELLAFQTPEKKYHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCSSPATINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKI	80496	25991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_27249_28761_28858_29190_29452_29640_29798_34352_34442_34528_34750_35222_35409_40986_41117_41617_41844_42998_43123_43496_44251_45619_45775_48109_48266_52009_52201_53787_54009_56215_56439_57092_57240_57838_57986_58214_58324_64086_64254_65222_65349_66319_66446_68611_68891_69089_69221_75574_75696_76478_76629_76932_77174_78257_78470_78951_79048_80273
899785	contig_5057_pilon	-	2257	3	Intergenic	novelGene_151501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_2	24	338	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	198	410	365987	365024	FALSE	20	CATTGGCTTGCTAGATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRASGFVVSPVIAQKSTPILLRRRDFRPLWKGSKDNKCSPEDLATAYNNRGQIKYFRVDFYEAMDDYTSAIEVKPSFEVPYYNRGLTLYRLGYFDEALEDFKKVLDLNPGFQDAALGLKQTILDKEEKQMRNY	371464	363176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_365152_365902_366070_371349
899786	contig_9481_pilon	-	4321	13	Intergenic	novelGene_149661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	14	junction_2	100.044851053026	649	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	703	2634	379364	350479	FALSE	15	CAGGGTTGTATTCTGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQMEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEMLRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRQLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELELQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPAGTTKSLLEIQQEEVRQMQKQQQQQQHQQQQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSIGVSNRQNKKVEEEEKLLKLFQGVNKVQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRAKQKASQQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQPQPQQPQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY	380066	348791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_350547_354523_354672_356133_356385_358117_358273_359484_359691_359827_360044_367293_367417_370848_371086_372984_373144_374657_374820_376664_376766_378273_378375_379359
899787	contig_8653_pilon	-	5799	4	Intergenic	novelGene_178742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	567	146	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4760	5092	199374	199042	FALSE	60	ATGAAATAAAAAGGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKWTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKRGIDSSTIILGDFNTPLSVKDRITKKKLSKDTET	255540	198334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8653_pilon_-_199864_221735_223291_225020_225143_252947
899788	contig_10241_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_142840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	1913	2218	122586	122891	NA	40	ATAAATCATGTTCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQDRLISNKFFFFNSKSLDRLEETVVRIMDVKGNSGEGSEGSEESYRKRLYCLREYIWHQQQHVDRNVDIKRASGKALKENDEHAIRQWRMGNAFYAVANN	120673	122893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_120700_122900
899789	contig_7045_pilon	-	3910	1	Intergenic	novelGene_77471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	3330	3683	380901	380548	NA	30	CTAACTTGAATCGTCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFGPNPPEVKENEEHQSHKESRSPTDRKGHINQRLHQPETRRTKWCRATTNDRPDREHNRQSLMEQEKTGVQNSNSSKKTRLNSAAETGQPQKAWPPDCQPRTKNHSQGQFFRQD	384230	380320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_380300_384200
899790	contig_8140_pilon	+	2102	5	Intergenic	novelGene_86428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	411.122472628291	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	206	1228	181766	192093	FALSE	30	TTTAATCATGTATGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAFLDKPKMEKHNAQGQGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVIGLPSGLETWSFFAVYDGHAGSQVAKYCCEHLLDHITNNQDFKGSAGAPSVENVKNGIRTGFLEIDEHMRVMSEKKHGADRSGSTAVGVLISPHHTYFINCGDSRGLLCRNRKVHFFTQDHKPSNPLEKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDFDYKCVHGKGPTEQLVSPEPEVYDIERSEEDDQFIILACDGIWDVMGNEELCDFVRSRLEVTDDLEKVCNEVVDTCLYKGSRDNMSVILICFPNAPKVSPEAVKKEAELDKYLECRVEAVYNRLNPYKNDDTDSASTDDMW	171357	192967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_171543_181745_182600_184978_185097_191077_191119_192063
899791	contig_6270_pilon	+	3676	6	Intergenic	novelGene_99831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	24.6690088978054	260	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1702	2739	141603	159494	FALSE	10	TCTGCTGCATTTTTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAQDRSHGWERESQSASRASSSRQMLEVRPGLYLGGAAAVAELDQLREAGITAVLTVDSEEPSFKSGAGVEVLRRLFVPALDKPETDLLSHLDRCVAFIAQAHVEGRAVLVHCHSGVSRSVAVVTAFMMKTEQLTFETAYENLRTVNPEAKMNEGFEWQLKLYQVMEYEVDTSSAIYKQYRLQKVTEKYPELQNLPQELFAVDPTSISQGLKDEVLYKCRKCRRSLFRSSSILDHNEGSGPIAFAHKRMTPSFILTKGSQAQCTSYFIEPVQWMESILLGVMDGQLLCPKCSAKLGSFNWYGEQCSCGRWITPAFQIHKNRVDEMKILPVLGSQTTKIQTCDI	139901	160431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_141947_152077_152192_152276_152396_153281_153379_153688_153876_159317
899792	contig_13213_pilon	+	2267	2	Intergenic	novelGene_178743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	485	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCAAAATAAAACACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319	6359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13213_pilon_+_1744_5516
899793	contig_10286_pilon	-	2455	2	Intergenic	novelGene_98404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAAAGCTGGTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382517	380018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380640_380683
899794	SIRV7	-	915	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56080_70859_70988_78841_78964_114686_114961_147608
899795	contig_9415_pilon	+	2228	11	Intergenic	novelGene_109830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_7	265.3528971012	144	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	143	1261	1925966	2000181	FALSE	10	CTCAGTTCCTCTGTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTQGLGTQPPSAERPARSDPRQSLPNPSAPTSPGPGAAVLPAVLLVAMECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRGKDTFMF	1925823	2001148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077
899796	contig_7943_pilon	-	3382	4	Intergenic	novelGene_173129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_1	109.827136901587	821	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	121	465	243092	78011	FALSE	15	GCAGTGGCGTATTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGSPEEHAVYVWDHFIAQSAAENVFFVAHSYGGLAFVELMIQREADVKSKVTAVALTDSVHNVWHQEAGKTIREWMRENCCNWVSSSEPLDTSVESMLPDCPRVSAGTDRHELTSWKSFPSIFKFFTEASEAKTSSLKPALTRRSHRIKHEEL	296546	75093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_78154_236900_236986_242975_243093_296426
899797	contig_10864_pilon	-	5095	8	Intergenic	novelGene_107045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_4	14.9352343299259	90	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	1345	3945	705547	701651	FALSE	10	ACCTGGCTTTCTCCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRKWSSLALSFFGISQVDARYCQIAQNNPGPILRIVFDLDSNLRDKKTKDHFLIMTDQVKLALNKHLLSRLCQIAQSLLRKTFPGVCRRFIVGLKCEDENCEDFHRPLRRCEARCLVQSKIHLVAINGLLLEAKKVFPKTLAKELEEINCVLSTDMYGLCKSFLNVIFPKHFHQRVLSENPTVCKEILKPRSKSFRSYRFALKEYIHFLFENASAQNRRESTDLWLIAMQAFLASSNYPEEFEKLLRQEEDNYHRELKALEKEDRARGRGRGSRVKRVEGKFGMLTPNKGEASTEKTHLCFIRLLESCVDQFYMYRNPENYKRLFFRFMNVLVKRCKEPLIPSIANTVALLELQYIHCGAVLARLCKNTILCLPKSYISLLHYWEFLCSKKDKEPVDVFAIIQEFKPKDVTRAIQHFRFHLSYLAEVLCGHENVNFNVLLDAFDDIDCVVSGEAERTLVLCLVMLVNAKGILKPHCKRLLCSHFQEIEKQLQRMRENFPACVPERLLRVVRRVLVAVDVKSVAEALQDLLSDRDKEYLVDCRWCWDSVHAKGSVVRGLYHEEVKLNRLLCVGSLDGAAEPESEFDQDETGEPASEDRDHLLTAILSQRQRKASSRRKLRRVCLLVSLCISWRRWASAQAERGKEEAREPSAGNFKKADVDRTQCDLCGVKFIRGPENDFSPREVLEEVTFEAAALSGAEPERKEGLERNSESYEQHICLEGHQRQQAAYQKYSAFFREQVDPAVDEGKLVVQDMEQSVWIGSRLGWKEHSHVLQRKVQENIKKVLDTVEEVYRRKAWDSGQEVMTPLVNILILSVRDAQEWLRRTELSLKERGKQSFILGTGNALGLTVLDTAGPQVNLKWAAQ	731376	700500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_701848_703143_706196_709614_709761_716494_716628_716737_716842_721036_721126_728101_728259_731309
899798	contig_3193_pilon	+	5725	1	Intergenic	novelGene_126316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	776	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAGAGTAATGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105104	110829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_105100_110800
899799	contig_3153_pilon	-	1810	2	Intergenic	novelGene_104654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAACAAAGAAAACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124308	122434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_124159_124222
899800	contig_2969_pilon	-	1589	15	Intergenic	novelGene_157058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_11	71.4719868057352	106	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	621	1589	877516	758023	FALSE	10	ATCTGGTTTTTGGTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANPLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLKMLLAQGNQIALLDSPTALSMEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKEQTLALRKEGIGVVLDSELPHLIGIDDDLLSTGIILYHLKEGQTFVGREDASTEQDIVLHGLDLESEHCIFENIGGTVTLIPLSGSQCSVNGVQIMEATHLNQG	956294	758022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_758163_759831_759884_760751_760872_862784_862845_866552_866619_873646_873823_875530_875663_875845_876015_877462_877606_880937_881048_881786_881885_884266_884313_890627_890742_892781_892852_956201
899801	contig_7962_pilon	-	1614	11	Intergenic	novelGene_149298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAGCTGTTTAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235624	196274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_196336_196888_197344_198704_198840_204398_204525_210052_210168_211245_211428_212336_212503_225521_225640_230381_230481_231789_231830_235507
899802	contig_7898_pilon	-	2483	5	Intergenic	novelGene_47550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	376.760782858301	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	10	669	294434	292088	TRUE	10	CACCTGTGCTAGTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	294443	290167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_290617_290722_292355_293194_293344_293488_293571_294272
899803	contig_12677_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_110815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAAGTCGATTCGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2163	3512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_3500
899804	contig_3862_pilon	+	1590	7	Intergenic	novelGene_137396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	230.147356177636	783	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	956	1486	436118	448739	FALSE	15	TTTCAATTTTACTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYKTFVTYTVYVSMIALERPDLREKVIKGAEILEVLHSLPAVRQYLFSLYECRYSVFFQSLAVVEQEMKKDWLFAPHYRYYVREMRIHAYSQLLESYRSLTLGYMAEAFGVGVEFIDQELSRFIAAGRLHCKIDKVNEIVETNRPDSKNWQYQETIKKGDLLLNRVQKLSRVINM	429603	448843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_429813_431396_431603_435577_436196_436301_436411_442094_442264_448428_448507_448642
899805	contig_9272_pilon	+	5024	5	Intergenic	novelGene_125967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_1	381.957458364148	692	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	418	1917	637688	651627	FALSE	40	GGTACTACCTGTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALWSPTHVQVTVLQARGLRAKGPGGTSDAYAVIQVGKEKYATSVSERSLGAPVWREEATFELPPLLASGVAPAAAATLQLTVLHRSLLGLDKFLGRAEVDLQELHRDQGRRKTQWYTLKSKPGKKDKERGAIEVDIQFMRNNMTASMFDLSMKDKSRNPFGKLKDKIKRKNKDSASDSASAIVPSVTPSADSDDESSTKDKRKKSKIKTLFSKSNLQKTPVSQSMSVLPTSKSDRVLLRPGDLPSRWEDDDNEDDSSSASDIMTHKRTPSADPKQLNQINFSLSKKEGLSFLGGLRSKNDTLSRSNVCINGNHVYLEQPESKSETKDSTPSSSPSPQGFNRKRLFSSTENLAPKSWKEPGEAGGVASDRQLSESSTKDPLKSMSLPSYRPVVSGDTGGNTAPGNLEAAKDTKESKKQENKKPSLLSLVTGKKDVAKGSEGESPPTIPAKEKEGALPEIKPREDGSEPVKDLMKKSEKDTSAVVSGWGKSLNPFEEMQTTEPAVEPEPKSEPKPPVFSARAPQTKAVKPRLHPVKPMNTTATKVANSTLGTATIISENLINEAMMKKHSPSDPTSAYSQLTHDELVQLVLQQKETISKKEFHVRELEEYIDNLLVRVMEETPNILCVPAQVGTKAGKM	619415	654734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_619760_637614_638058_639481_640284_644165_644275_651408
899806	contig_5280_pilon	+	2040	9	Intergenic	novelGene_52624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	644.957508290275	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38851	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38946_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56282_62043_62065_78042
899807	contig_3018_pilon	+	1246	10	Intergenic	novelGene_78785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	537.863262259925	41	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	751	1245	478971	498520	FALSE	75	AAAACAAAAAGAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKIS	420957	498521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_421062_421110_421501_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505
899808	contig_12644_pilon	+	1285	9	Intergenic	novelGene_44639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4320.73175949399	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	748	1197	2679224	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675474	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679228_2679871_2679963_2680107_2680229_2680311
899809	contig_13798_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_178532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCTTTAATTATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107259	105313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_-_105300_107300
899810	contig_14970_pilon	+	2089	10	Intergenic	novelGene_44928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_6	5896.6282644312	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	180	1388	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135965	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_196136_196257_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
899812	SIRV5	+	697	4	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	6737	95	-456	-93	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAAAGAACACACTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7745	10896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_7763_7870_8382_8454_8586_10858
899813	contig_14537_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_158647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATTACTTTCTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45636	47563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_45600_47600
899814	contig_10867_pilon	-	1744	6	Intergenic	novelGene_159445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2670	junction_1	1564.30347439364	1153	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	33	515	88670	86811	FALSE	35	CTACAGAGGCTCACCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA	91449	85581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_91429
899815	contig_12102_pilon	-	5311	4	Intergenic	novelGene_151047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAAGGCGAATCCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48385	13170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_13180_40146_41260_42653_43442_44984
899816	contig_21007_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_161504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_0_1400
899817	contig_11548_pilon	-	2234	2	Intergenic	novelGene_66783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTCTTTCTGTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116777	114021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_114171_114692
899818	contig_11855_pilon	-	1810	1	Intergenic	novelGene_67045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTGGCAATTGGTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1985322	1983512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1983500_1985300
899819	contig_401_pilon	+	3880	23	Intergenic	novelGene_42901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	500.501285902527	7	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	727	2460	1948480	1973007	TRUE	15	TTTCTTTCCCACCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVCGGGVILPDPGHAGVLFPLCPASKCLSGGFPHLPPEPGACQYTLKALWAYRNPCHSGSCGHFLKGQ	1929643	1975740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940462_1940552_1940584_1948441_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968848_1972807_1973757_1975069
899820	contig_7744_pilon	-	3222	9	Intergenic	novelGene_62572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	559	858	889219	888920	TRUE	20	CTGAGCCACTGCTGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVIVTRLQIRRRFLAEPRQLTLVSHNAVGSKEFERGHLKQCWVEQKFSGCWPAGRLRLQALLNELLEREQGTRADIWQTLHHIHFYISHFTLSTRLCT	889777	882729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_882892_883077_883201_883410_883514_884617_884707_884859_884901_885240_885368_886855_886941_887132_887189_887341
899821	contig_14744_pilon	-	981	3	Intergenic	novelGene_65988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	604.5	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	68	538	969897	960939	FALSE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALA	969964	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_968343_968630_969717
899822	contig_8820_pilon	+	4139	26	Intergenic	novelGene_79266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	189.671488632319	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1215	3648	8	3655	86980	101011	TRUE	30	CCTGCCAACAGCACCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIVNEVEQYVKVWLQYQCLWDMQAENIYNRLGEDLNKWQALLVQIRKARGTFDNAETKKEFGPVVIDYGKVQSKVNLKYDSWHKEVLSKFGQMLGSNMTEFHSQISKSRQELEQHSVDTASTSDAVTFITYVQSLKRKIKQFEKQVELYRNGQRLLEKQRFQFPPSWLYIDNIEGEWGAFNDIMRRKDSAIQQQVANLQMKIVQEDRAVESRTIDLLTDWEKTKPVTGNLRPEEALQALTIYEGKFGRLKDDREKCAKAKEALELTDTGLLSGSEERVQVALEELQDLKGVWSELSKVWEQIDQMKEQPWVSVQPRKLRQSLDGLLNQLKNFPARLRQYASYEFVQRLLKGYMKINMLVIELKSEALKDRHWKQLMKRLHVNWVVSELTLGQIWDVDLQKNEAIVKDVLLVAQGEMALEEFLKQIREVWNTYELDLVNYQNKCRLIRGWDDLFNKVKEHINSVSAMKLSPYYKVFEEDALSWEDKLNRIMALFDVWIDVQRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVSKSPLVMDVLNIQGVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMFAGVSSIILNEDNSAVLGISSREGEEVMFKTPVSITEHPKINEWLTLVEKEMRVTLAKLLAESVTEVEIFGKATSIDPSTYITWIDKYQAQLVVLSAQIAWSENVESALSSVGGGGDAAPLHSVLSNVEVTLNVLADSVLMEQPPLRRRKLEHLITELVHQRDVTRSLIKSKIDNAKSFEWLSQMRFYFDPKQTDVLQQLSIQMANAKFNYGFEYLGVQDKLVQTPPDGPLLLDHDTSLGSQAGGGSPFGPAGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSAVSQQVQCIQEALREHSNPNYDKTSAPITCELLNKQVKVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTKPDRQLIAQVMLYSQGFRTAEVLANKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVLVSAGNVKRERIQKIKREKEERGEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPGVQYHRGGDDRPARRAQESVSGDVLDLRRWRGGWRDVGGKGPPALPDHPNQSRPHDGGALGQREEHGLASATQGSGETRGCGGRGPHH	86972	104116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_87016_87653_87831_87957_88069_88150_88271_88844_89085_91348_91505_91644_91759_92007_92119_92194_92405_92693_92841_93046_93214_93302_93477_94227_94394_94474_94664_94752_94948_96339_96626_96867_96969_97626_97787_98950_99195_99342_99527_99858_100073_100865_101105_101242_101400_102516_102577_103613_103687_104015
899823	contig_15327_pilon	-	1095	5	Intergenic	novelGene_70685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3091.92709931848	13	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	233	643	901528	900904	FALSE	55	ACAGTTTCCTAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	900451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_901792_901894_902035
899824	contig_7321_pilon	-	3619	15	Intergenic	novelGene_53113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_3	161.725280418773	422	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	31	1764	208319	117035	TRUE	15	TTTTTTTTCTCTTCACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIPRKRSRQTMGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEIRSRVDVIRHVVKNGLLWDDLYIGFQTRLQRDPDIYHHLFWNHFQIKLPLTPPNWRSFLMHCR	208349	112628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_119336_119453_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
899825	contig_14744_pilon	-	1682	9	Intergenic	novelGene_65992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	399.952477645782	715	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	70	369	969897	968463	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFI	969966	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_963912_963991_964176_964410_967273_967450_968343_968468_968514_968630_969717
899826	contig_12938_pilon	+	1410	7	Intergenic	novelGene_99739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	942.476348067508	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	119	601	78117	85512	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPD	76583	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_76685_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83456_85507
899827	contig_15087_pilon	-	2226	23	Intergenic	novelGene_37182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	973.893235998673	57	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	107	1696	149033	113497	TRUE	10	TGAGTGACGTGTGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQVAAEILEIADKPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRKVFQEFIKMTNYDVEHTIKKEMAGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFCRQTLQIHEGRWHG	181148	110641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118174_118903_118922_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149058_181066
899828	contig_10345_pilon	-	2222	9	Intergenic	novelGene_158380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTGGATGAGAGACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24391	11831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_12022_14180_14229_14650_14745_16895_16968_17163_17231_18808_18901_20418_21646_23044_23167_24081
899829	contig_10437_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_38493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATGTAAGGAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239674	1240475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1239700_1240500
899830	contig_9945_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_104817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAACAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104161	102021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_102000_104200
899831	contig_19558_pilon	+	1527	4	Intergenic	novelGene_164745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_3	115.597001114504	76	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	27	407	25184	30130	FALSE	10	CATGCTTCTGATTCGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWRVHVDQMHQHKSGIESALKETKGFLDKLHNEISRTLEKIGSREKYINNQLEHLVQEYRAAQAQLSEARERYQQGNGGVTERTRLLSEVTEELEKVKQEMEEKGSSMTDGGECTHLRRRSEQEKSNCLQKSVG	25157	31250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_25232_25976_26109_27488_27552_29992
899832	contig_8647_pilon	-	4316	11	Intergenic	novelGene_178116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	145.2804185016	442	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	169	2271	1026786	936002	FALSE	15	CATGTATCTGTGTCTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDRQPRVRSGNESHPAPAMEPAGRGAWAHSRPALDRLEKLLRCSRCTNILREPVCLGGCEHIFCSCCVSDCIGTECPVCYTPAWIQDVKINRQLDSMIQLCSKLRNLLHDSKLSDVKEDTRRTSIFNDAENKKNSIKMWFSPRSKKVRYVVSKVSVQTQPQMVKDENAQQASMYEFVSASPPVDLSEKAKKTSTKSRKKQKKKTLAEINQKWSLETEKDDDEPDSKEEFKEKLVSFCSQPSVIASPQLNGEIDLLASDPIAESECFGSLNEISLPLAEQIVSPEVESRDEVVIPEENPCENDLPSKKSLPLGCEGKRGRHNRLSSPISKSCRSNIQSTTRNLVRQTVVSKDSLPECSSPPSSKLKVGGKLRRKNSNTLDESISLSPGMSPSALNSPSYRGMLSSPSAMKLSPSSRMAVKRNHRGETLLHIASIKGDIPSVEYLLQNGSDPNVKDHAGWTPLHEACNHGHLKVVELLLQHKALVNTTGYQNDSPLHDAAKNGHVDIVKLLLSYGASRNAVCSVSTVTHVIVPGDTIQSTLKCMLGILNGCWILKFEWVKACLQRKVCEQEEKYEIPEGPQRSRLNREQLLPKLFDGCYFYFGGTFKHHPKDNLMKLVTAAGGQILSRKPKPDSDVTQTINTIAYHARPDSDQRFCTQYIIYEDFSNYRPEKVRQGKVWMAPSSWFIDCVISFELLPLDS	1026954	933956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_-_936335_937410_937509_954242_954336_954856_954864_962523_962534_977990_978164_980129_980211_991565_992525_1009758_1009908_1013404_1013462_1026643
899833	contig_16999_pilon	+	1765	2	Intergenic	novelGene_84941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	98	334	2625	2861	TRUE	45	GATGAAGGTTTACAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMMSEISQSQKDKYCMRPLL	2527	4741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_3095_3543
899834	contig_11986_pilon	-	3534	2	Intergenic	novelGene_69228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1704	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCCCTCCTTCCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818741	768375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_771615_818446
899835	contig_16322_pilon	+	1834	11	Intergenic	novelGene_87536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77576	96084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_77953_78550_78622_79821_79951_81564_81680_85983_86553_89498_89612_90089_90171_91475_91557_91946_92049_93066_93186_96006
899836	contig_8377_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_35038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTTGGCAGTAGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79862	78432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_78400_79900
899837	contig_14441_pilon	+	1293	5	Intergenic	novelGene_100344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	18	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	705	1253	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	6415	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6909_121628_121691_125517_125902_126159_126283_126514
899838	contig_16578_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_148649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGAAAAAAAGAAATCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176053	173595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_173600_176100
899839	contig_6825_pilon	-	2516	1	Intergenic	novelGene_155114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	514	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCGTGTATAATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24926	22410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_22400_24900
899840	contig_2365_pilon	+	3613	18	Intergenic	novelGene_103743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	309.76300797104	345	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1002	3009	71	3079	179760	319997	FALSE	60	CAAATAAAAACGATACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRELASVETNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQDYDLVSKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEEPSGNSGDLRKDVVMKENVSFKGDEDEKPTFVDLAKEETKDNDKLLQQQLDDQNRTISLVHGVNNDIVKALDRITLQNIPSQTSPAFTAGMKKDYSLPLTVLSCTKACPHMASCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVDVPDGPTLHDSDLYVEIVKSTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIVDRVVYDLDNPNYIIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVGYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRVGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVSFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICQFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCAGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESNCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYETSAQEELLSDSELSRTYLP	179689	320531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_179788_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137_212255_219467_220181_227531_227616_229217_229305_229386_229536_248941_249030_254096_254242_256889_257044_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_319819
899841	contig_15384_pilon	+	3604	5	Intergenic	novelGene_85115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	109.481733636255	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	239	1090	75617	79189	TRUE	75	TAATGAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVSVCFEGDSDGYINLVAYPYVESETVEQDDTPEREQPRRKHSRRSLHRSGSGSDHKEEKASLPLETSESSQEAKSPKMELHSHSDVPFQMLDGNSGLSSEKISHNPWSLRCHKQQLSRMRSESKDRKLYKFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMRHKHLDTGLPEVASPCGSSTSPEAGPSSPPKVDVRMIDFAHSTFKGFRDDPTVHDGPDRGYVFGLENLINIMEQMRDENQ	72008	81745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_72222_75591_75774_77964_78141_78670_81059_81100
899842	contig_11258_pilon	+	1787	8	Intergenic	novelGene_67784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	178.128708339487	23	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	28	933	279290	292582	TRUE	45	TCAGAAGAGCACAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279262	293481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285691_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450_292681_292725
899843	contig_12869_pilon	-	3306	1	Intergenic	novelGene_75350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAATGGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88746	85440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_85400_88700
899844	contig_5988_pilon	-	1946	14	Intergenic	novelGene_15875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	360.635090692868	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	61	1344	398182	393772	TRUE	20	GTATTAAGGCTGTGTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGELADKKDRDASPSKEERKRSRTPDRERERDRDRKSSPSKDRKRHRSRDRRRGGSRSRSRSRSKSIERERRHKERERDKERDRNKKDRDRDKDGHRRDKDRKRSSLSPGRGKDFKSRKDRDSRKDEDDEHGDKKPKAQPLSLEELLAKKKAEEEAEAKPKFLSKAEREAEALKRRQQEVEERQKMLEEERKKRKQFQDLGRKMLEDPQERERRERRERMERETNGNEDEEGRQKIREEKDKSKELHAIKERYLGGIKKRRRTRHLNDRKFVFEWDASEDTSIDYNPLYKERHQVQLLGRGFIAGIDLKQQKREQSRFYGDLMEKRRTLEEKEQEEARLRKLRKKEAKQRWDDRHWSQKKLDEMTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKNANPASGNSHWAAES	403612	387158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_387540_387877_387924_392536_392619_393678_393820_394138_394365_394464_394609_394837_394951_395088_395223_395505_395645_395796_395863_395972_396067_397411_397523_397973_398183_403552
899845	contig_4857_pilon	-	4927	3	Intergenic	novelGene_48793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19.5	220	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAGCAATCAGCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1246174	1237171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1238144_1241784_1244343_1244777
899846	contig_4232_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_63316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468087	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
899847	contig_9127_pilon	+	7895	1	Intergenic	novelGene_103028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3586	3921	251130	251465	NA	65	AAGGAAAAAAGAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHSMVAHLDAVTSLAVDPNGIYLMSGSKFKLPVLPSNFIKELLLSNKLCDVLFTGHDCSIRLWNLDSKTCVQEITAHRKKLDESIYDVAFHPSKAYIASAGADALAKVFV	247544	255439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_247500_255400
899848	contig_13244_pilon	+	2072	4	Intergenic	novelGene_86930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_1	533.689880819272	4	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	166	333	250894	252668	FALSE	25	AATAGTGTTCTTACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGKWRTGRRERRSRRIRNVLEPPEKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239749	254407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_247045_247121_250878_250935_252541
899849	contig_13592_pilon	-	2107	5	Intergenic	novelGene_33718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACTAAAAATCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261989	256870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_257884_258017_258094_259274_259449_259766_259894_261272
899850	contig_11816_pilon	+	2553	9	Intergenic	novelGene_98453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	709.940490463813	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	157	1290	420896	437224	TRUE	15	TGGTTGTTTTAAACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSGRGAGAIVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRTLKKKKVTYVEFVRWQLHHHLTC	400512	450646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433382_437152_437309_442782_442893_445555_445670_449691
899851	contig_1009_pilon	-	3469	10	Intergenic	novelGene_121765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	64.651391857684	3	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	86	847	356355	301449	TRUE	40	TGTTAACTGTAATTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIPFKIGQPKKQIIPKTVERDFEREYGRLQQLEDQTKRLQKDMKKSTDADLAMSKSAVKISLDLLSNPLCEQDQEFLKMVTALDTAMKRMDAFNQEKVNQIQKTVIEPLKKFGSVFPSLNMAVKRREQALQDYRRLQAKVEKYEEKEKTGPVLAKLHQAREELRPVRDDFEAKNKQLLDEMPRFYNSRLNYFQPSFESLIRAQVVYYSEMHKIFGDLTQQLDQPGHSDEQQERENEARLSELRALSIVADD	356440	297256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_299615_301184_301596_304758_304894_305141_305284_312521_312563_313138_313276_319034_319097_319491_319533_326889_326939_356347
899852	contig_6102_pilon	-	2207	21	Intergenic	novelGene_31995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_10	251.021791882697	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2202	6	2207	438578	422224	FALSE	45	AAAGTGACAGGCAAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPCKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAA	438583	422223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_422301_422537_422797_423161_423225_423318_423439_423672_423766_424435_424590_425298_425413_429166_429239_429548_429680_429962_430001_431438_431564_431940_432057_432161_432294_432427_432504_433389_433460_433715_433786_434353_434447_434547_434630_435076_435163_436270_436391_438467
899853	contig_5590_pilon	+	868	6	Intergenic	novelGene_163038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	445	junction_5	183.354738144396	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	363	866	360033	369179	FALSE	25	ATCCCAGCAGCCCCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSSTDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQPQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKKKEEVEETKKSKAKELPPKKTKKNNSSTTTSKKELAPMKSKPAAAYESEEEDRCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKKRKPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESTSESSSSDSEDSETELAPKLKKKGHPGREQKKHHHHHHQMQQTPAPVPQQPLP	358836	369181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_358983_359431_359629_360013_360310_361040_361152_368970_369024_369116
899854	contig_709_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_57545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTCCGTCCTGCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510798	1509583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1509600_1510800
899855	contig_6958_pilon	-	2264	6	Intergenic	novelGene_69938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	550.592916772455	13	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	190008	149618	TRUE	20	TGTAAACGGCATCCCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	190082	148590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149255_149327_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
899856	contig_13519_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_124639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGGACCAATGTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64850	62417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_62400_64800
899857	contig_18592_pilon	-	2633	1	Intergenic	novelGene_114782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAACGATAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13305	10672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_10700_13300
899858	contig_10225_pilon	+	1516	10	Intergenic	novelGene_86766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	476.793456330936	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	131	1258	20776	47494	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPAESEWPDPGGRQRPPHTLRGEAEAVGTVRPGLYLQELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	20645	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_47297
899859	contig_2703_pilon	-	304	1	Intergenic	novelGene_101666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCCCGCTTTCACGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5861	5557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_5600_5900
899860	contig_5003_pilon	+	2626	4	Intergenic	novelGene_120222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTTTCTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176543	351626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_178599_205733_206170_222979_223101_351612
899861	contig_5217_pilon	-	571	4	Intergenic	novelGene_135770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3686.19924704144	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATCTTGTGTTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559966	557641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559858
899862	contig_1867_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_54582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	201	611	472490	472900	NA	70	CTTCAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQYINRELPEIQARFRRGRGTRGIIADVRWFLAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVAHKLWITLRRMGILEHLIVLMRNLYIDQESVVPTEQGDTAWFKVRKGVCQGYVLSQYLFSLYAEQIIREAGLYEEEQGIRIGGRLINNLQYVDDTTLLAESEEDLKYLTDEEQRPQPSVWSTHQHKENKNSHNRTSKQRHDKQRKY	472289	475433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_472300_475400
899863	contig_8681_pilon	-	2457	1	Intergenic	novelGene_157205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187636	185179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_185200_187600
899864	contig_504_pilon	-	4844	9	Intergenic	novelGene_54421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	108	junction_4	103.548297909719	394	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	12	932	175503	157936	FALSE	20	TTGTTGATTTTTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKDMKLLKTILDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTTGEIVLYDGNSLRTVCTIAAHEGMLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYIYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSETTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSTSSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPCEH	175514	154023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_158049_158690_158810_159462_159571_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167643_167742_175457
899865	contig_10324_pilon	-	6874	3	Intergenic	novelGene_7808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	8	844	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6514	6867	158137	157784	FALSE	80	AAGAAAAAAAAGAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEHPTHSELKSLLKFTFQTKFSQVYKTITNVRSMLLSLLKYMRANGQFLPKSKTRRQKGQENWTNGHGETEVEKRGGCCHIAGITTNATKRFVYKFFHEKLTCTVNFHLKHNKII	166888	157776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_164091_166189_166324_166462
899866	contig_16148_pilon	-	3484	6	Intergenic	novelGene_50376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_5	506.553215368336	242	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1120	1605	111433	85700	FALSE	75	AAAAAAGAAAAGAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWGK	153079	83820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
899867	contig_7630_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_133637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	237	575	402036	402374	NA	60	GAAAAAAAAAAGCAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQVANRHMKCSRSSAIREMQIKSTMTCHLTPTGLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWHFLNKLEIEVSKHPAILLLGIYPREIKAVT	401799	404077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_401800_404100
899868	contig_3509_pilon	+	1637	5	Intergenic	novelGene_160692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	84.2982057934806	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	60	689	1889	6916	FALSE	5	CCTCTTTTTTTGCTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASWAAQDKPAECTSSEPGGMLKLCSPETAHRIWNEKSAKIYPIREKLNRTRLALIICNIDFENLPKRAGADADIRGMKTLLEGLGYSVDVKQNLTASDMTAELKTFADCPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPGSTFI	1829	7864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_1949_2619_2794_3215_3451_3849_3994_6899
899869	contig_16185_pilon	-	4034	5	Intergenic	novelGene_144733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	101.065572773324	367	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3026	3364	86152	82386	FALSE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	125640	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86931_122864_123786_124314
899870	contig_14925_pilon	-	1645	5	Intergenic	novelGene_55284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1031.13781207945	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	64	477	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129460	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113262_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129432
899871	contig_15952_pilon	-	2557	8	Intergenic	novelGene_154067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGTACCAGCCCGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314929	290928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_291014_299088_300791_304017_304156_304717_304855_306883_306988_307700_307806_310222_310396_314816
899872	contig_9389_pilon	+	3964	5	Intergenic	novelGene_84158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	334.398994466192	334	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	251	2107	1880835	1896858	FALSE	20	TTCATGCAATGGGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVAVDFTEEEWALLNFAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRQVDKGQMVSTEHLIMRFMKNNFQYTVLGETCEFPGTEEKCNNKGRHIRWHTDESLHESKERKEKKEGNQRVKLFSKMACLTRLRRTLARENSYQCCVRGRAFRYSSFKRHIRSHTGCDSYQCKECGMACSCSSCLSTHVKTLTVKNVSKCNECGVTCSCFSSFNTHKRTNSRERPHERKEFKKAFGQFSALIEHKKFQSGKQHYDHNEYVNTFSCSSSLTTHTRTHSEERSFECKDCGKAFSQFSNLLNHIRTHSGEWLYECKECRKTFSESSHLINHIKAHSGEWPYECKECGRAFTRSSDLTTHVRIHSGERPYECKECGKAFIRSSTLTRHIKTHSGERPYECKECGKSFIWSSDLTTHTRIHSGERPYECKKCGKAFSQSSSLTKHIRTHSGERPYECKECRKTFSQSSHLINHIRTHSGEWPYDCKECGKSFCDFSSFCRHVRTHSGERPYKCKECGKAFTQSSSLTQHKRTHSGERPYECKECGKAFSRVSNLTRHIRTHRGERPFECKECRKAFSLRSALTRHIKTHSGVRPYKCKECGKAFIRSSALNTHMTIHSGERLYECKE	1880584	1898715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1880838_1893240_1893368_1894353_1894505_1894859_1895358_1895780
899873	contig_9727_pilon	+	2240	4	Intergenic	novelGene_86342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	294.98512203537	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATACAAAACTTTTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426077	432818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_426135_428941_429016_429240_429299_430767
899874	contig_6513_pilon	-	2339	1	Intergenic	novelGene_117776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196024	193685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_193700_196000
899875	contig_12626_pilon	+	3978	8	Intergenic	novelGene_80459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	340.536911002467	253	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	2915	3928	180275	196455	FALSE	40	TACAAGAACTTAGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEQKSWEHQSESLKAQLVASQGKVQSLEDTLQNVNLQMSRIKSDLRVTQQERETLKQEVMSLHKQLQNAGDENWAPEIATHPSGFHNQQKRQSWDKLDHLMNEEQQLFWQENERLQTVVQNVRQLESNLLPTKHQKHLNPSGTVKPTEQEKLSLKRECEQFQKERSPNRKVGQMNSLERELETINLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTVMLSPSPRAWDLQLLQQQACSMVPREQFLQLQHQLLQAERINQCLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMMEVEQKLKLVKRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLYPSTPHSSFNSSFTFLYCH	176635	196505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_179511_180235_180350_181147_181295_183342_183490_184947_185095_187867_187970_191972_192174_196260
899876	contig_177_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_41854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAGGTAAAAAACAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426039	427589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_426000_427600
899877	contig_5222_pilon	+	1933	5	Intergenic	novelGene_59017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	371.322215198606	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	15	395	371486	373255	TRUE	5	GTGTTTCTTTCTCTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPGMKNRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTIMEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH	371471	374839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_371556_371926_372013_372146_372228_373111_374629_374674
899878	contig_454_pilon	+	4813	4	Intergenic	novelGene_178255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	4463	4813	325975	326325	FALSE	15	TTTTTTTATTGTACTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAVYKYTAIPIQIPTTFFKEMEKLIITFIWKEKKPRISKALLKRNKVGGLTLPELRTYYTAMTDKTDWYWYNDRHIDQWNRIQNPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWEKDSLF	285621	326325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_454_pilon_+_288647_311468_311928_324348_324470_325117
899879	contig_9036_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_155464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAGAATACCAGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179522	181578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_179500_181600
899880	contig_11378_pilon	-	4506	1	Intergenic	novelGene_112239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	647	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1179	1493	337069	336755	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASNCLVWNWGETGEQLTRSRAQVRRMSMGLPPRNNEQRTGKEYEYGLALKRQQAEGQVRSMVWACPQVTTSRGQVRSMVWACPQVTMSRGQVNESEYGQALK	338247	333741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_333700_338200
899881	contig_11855_pilon	+	2198	5	Intergenic	novelGene_66982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_1	137.689868908355	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	221	1084	1114075	1118117	FALSE	35	CCTGATTAAACTCTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQKEQQERLREAAALGDIREVQKLVESGVDVNSQNEVNGWTCLHWACKRNHGQVVSYLLKSGADKEILTTKGEMPVQLTSRREIRKIMGVEDDDDDDDSLPQLKKESELPFVPNYLANPAFPFIYTTTAENRAQLQNRGPSTPPASPPADGSPPLLPTGEPPLLGAFPRDHTSLALVQNGDVSAPSAILRTPESTKPGPVCQPPMSQSRSLFSSVPSKPPVSLEPQNGTYAGPAPAFQPFFFTGAFPFNMQELVLKVRIQNPSLRENDFIEIELDRQELTYQELLRVSCCELGISPDQVEKIRKLPNTLLRKDKDVARLQDFQELELVLMISENNFLFRNAASTLTERPCYNRRASKLTY	1108897	1119231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1109018_1113974_1114124_1114497_1114984_1116915_1117098_1117970
899882	contig_6919_pilon	+	3136	2	Intergenic	novelGene_163996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2307	2714	95234	95641	TRUE	45	GGGAGATAAGAACCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEKNFLEFLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHTIEEIKKIREDHNDKFNRLQESIQRQQSEIQKINNNISELDNSVESYRSRIEATEVRISEIEDKALDTNLYEEKSDKRIKKKKKKP	92927	96144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_95995_96075
899883	contig_10609_pilon	-	6227	26	Intergenic	novelGene_123926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.195959179422654	95	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	5510	6052	391053	386464	TRUE	60	TGAAACAAACAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGEPVVVWLVHVSTVVNQLINYSILAIVAGDMKGSISIDVDFINLHPQIQEVFDNIDLSIGDCSVQGRVTLLILTRHFCAMVNEQCYYVQLPIYAAQCRARRSFLSNALMFAPLANSKLTISTWPFRAAWCKAVRPPRSETLTLLSKGMITSAHLTALLAAATWRGGLPVLVPRIDIS	512153	361235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_361313_374910_374985_386439_386637_386994_387089_389601_389738_390913_391127_400430_400511_406868_406983_415516_415599_416760_416827_418779_418848_420312_420456_422067_422147_426655_426768_477869_477942_486434_486626_490589_490681_491948_492066_493321_493539_497626_497707_498778_498863_500773_500920_501394_501479_503650_503735_504831_504925_508720
899884	contig_10404_pilon	+	4875	3	Intergenic	novelGene_138644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	163	278	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGACAGGTAAGTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487272	492332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_487306_487387_489180_489282
899885	contig_6102_pilon	-	1493	6	Intergenic	novelGene_32044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	175.407411473974	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	170	418	555780	555368	TRUE	30	AAGTACAAACTGTTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRPGSAFASGRSYSPPDLSWSRGAARHASLGPSESGRGPRSLEPLLWWSDPVTLKMKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVTVPPNKVAHPGCE	556881	553679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_555040_555151_555529_555692_555806_556737
899886	contig_8058_pilon	-	2209	3	Intergenic	novelGene_149512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	5.5	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	79	1134	63142	61432	FALSE	60	CTATAAATGGATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKFFRYHNAVVYLDEYTEIFKMNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75121	60356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_63122_63189_75089
899887	contig_12576_pilon	+	2997	1	Intergenic	novelGene_178568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	430	1290	1706	2995	1706	2995	NA	60	ACTGCCAACAACAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHLYAAYKRCTLDLKTQIRLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVAILIPDKTDFKVKSTTKDKERHYIMIKGSIHQEDITIINIYAPNNRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQFDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNIKILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKKSNTWKLNNTLLKNSWVIEEIKDGIKKFIDSNENENTSYQNLWDTPKAVLRGQFIAINAHSQNQERLIIKALTLQLEQVEREQQKKPTGARRKEIIRIRAELNEIENRKTIERVNKSKSWFFEKINKIEKPLAKLTKEKLERKQISRIRNEMGDSTTDPTEIKRIITEYYEKLYSDKFENREEMDKFLETHYLPKLTQTEVEQLNKPITKKEIEKVIK	0	2997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12576_pilon_+_0_3000
899888	contig_960_pilon	-	2144	3	Intergenic	novelGene_108317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	788	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTAGAGGGTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056288	1051918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1052924_1053830_1054029_1055347
899889	contig_14829_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_163826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAGAAATAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203108	205314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_203100_205300
899890	contig_11720_pilon	-	6283	1	Intergenic	novelGene_43857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	320	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAGCACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86567	80284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_80300_86600
899891	contig_10139_pilon	+	512	2	Intergenic	novelGene_177805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGCCCCCTCGATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182993	183730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_183111_183335
899892	SIRV6	+	1205	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-3	-156	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	164	499	1673	2560	TRUE	45	ACGTTTACGAAGAAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1121	11534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2035_2476_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
899893	contig_5686_pilon	-	2497	4	Intergenic	novelGene_45407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTATGGGTTTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260391	173770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_173778_184292_186593_220990_221159_260369
899894	contig_8697_pilon	+	8510	3	Intergenic	novelGene_83211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_2	88.5	1134	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1038	3117	298	3414	27315	41135	FALSE	25	TTTTTAGGAGCTCCCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDAVHLKIIDRERKKLLEILQQDPDSVLDTLTSRRLISEKEYEILEKIPDPLKKSRKLLILVQEKGEVSCLHFLKCLVSTFPESAAIWDLSLRHDFLKHETTEPSPSTGVSKNSEDAFFSGKKQPENPEITASFKKKGQLDLQTSDSFGDKKISNRETALSSKEKNEKEYNTPKNTFSHSVEDVEYEVPSTITYLRDGERYEEPDDSLYLGKKEYLESVGYFEDAETTVEEKNYDDPEHIVYYGEEDSEYSEYMEFSDDEQSYEESETGMLSEEEEEKSMEERKKVFKDVLSCLNMDRSRKLLPDFVKQFSLDRGYAWTPETPGDLAWDFLMKVQALDVTARDLILGYKVPSEDRKGELLTEMKNLELRDVQTINPLDVLCATMLCSDSSLQCEVMSNMYQCQFALPLLLPDVENNKSIFMLGAMKNIVKKQSAQSSGGPAEDTEDFLAHIKMPVISFVRLGCCSFSKSKILNKLLRPAQMKSHKIFLHQDSPDLVLPRQISDGLVEITWCFPDGDDLKENLNFFQKPVAVANLHGDLEYLWIQFGFLMEVSSAVFIFTDYLGEKEWSLLRFLGEAAIKRCYFALSPQARENEEAQIFQRIMELKPSQLLYLEGEEAGDRRKDTECLQAALQEVMCSSLKCVSMEDMASLAGELGIQVDKECENTQGIQVSSSENMAGTAESVGQQRHSKPKTPAQMPTRDSGVICGVSQNPENIYSTPVFMSPPQNSWPLPSSIGGNFNQASSKPPWLMGSPFWPEQRCKWLHPLALHNTRAHSQGKSFGLQYFQPQRFYSGERFMKFSRTAQGFHWNGRFGRPPRPISQHAQAWPKRPKTIGAFEKSGAVVSQVGYFYPLGSQPAERLGRPQPGPACAQGIQLAAGTGKLMRTTSHIEDPYHQGFQPTGTMQKPIRPASQKAAQQKMQSRPSNPAFQTRPHPMSNSKLLPSSQSKSNQPKHSEPQPFQHVFSQPKPTQIKPTQPQPSQPKAPHSKPSQPKPSQPNASQSKPTQPKRSQPKSSWASPSQAKIYYPRAGSKRAGKH	27017	46231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_27604_29336_29898_38868
899895	contig_14575_pilon	-	2521	8	Intergenic	novelGene_101913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	36.4730820508182	173	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	166	1059	256411	188719	FALSE	55	ATACAGAAGTCAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSLDIKIKRANKVYHAGEMLSGVVVITSKDSVQHQGVSLTMEGTVNLQLSAKSVGVFEAFYNSVKPIQIITSTIEMVKPGKFPSGKTEIPFEFPLHVKGNKVLYETYHGVFVNIQYTLRCDMRRSLLAKDLTKTCEFIVHSAPQKGKLTPSPVDFTITPETLQNVKERALLPKFLIRGHLNSTNCVITQPLTGELVIEHSEVAIKSIELQLVRVETCGCAEGYARDATEIQNIQIADGDVCRGLSIPIHMVFPRLFTCPTLETTNFKVEFEINIVVLLHADHLITENFPLKLCRT	256576	187256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_188802_193138_193292_194103_194255_202541_202617_210819_210901_220297_220448_222993_223138_256354
899896	contig_9653_pilon	+	3253	4	Intergenic	novelGene_48177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_1	55.5517776493246	15	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162545	175737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_162604_163226_163321_171528_171609_172716
899897	contig_10044_pilon	+	3948	11	Intergenic	novelGene_156376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	33.1505656060345	141	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	1202	2803	74461	136529	FALSE	15	CTTGATAGTTTTTGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYNNLVSTGYQVSKPDVLSRLERGEQPWTILDKNHTRNFSEIWKVDDHLPGHWQNKSRVDSMKECCEHNALENIVHQHKNHFPLRENHGMVDLHDKAVTSNVTLINQTKSYEIKNSAELNRVEKTVLHANPEQFGTESKFLESWISNTTKSQYIKHQKTHKIEKPHVCSECGKGFIRKSFLTNHQIIHTGEKPHKCSLCGKAFSKKVKLAEHYQTTHKRQKHECPECGRAFLYNSQLSKHQKRHMAEKPYICSECGKGFIEKSALIIHQRIHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLVIHQRTHTGEKPYMCGECGKGFSHKSCLIGHQRFHTGRSPFVCSECGKPYSKKSGLISHQKIHTGEKPFQCSECGKAFNTKPKLIVHQRSHTGETPYGCNECGKTFAYTSSFYLHKRKHTSEKRVESIKMEDSSTPSHSSSHTKDFMQEKSPVNTVTMQIPSVTVQPSVNISGLPTNGNIVLVGQPVARCEPSGDNREFPQERNLMNAVNVVVPMSAVNGVVPSVMNYILFYATQNL	9313	137674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_9521_16094_16222_16476_16527_34701_34913_39399_39608_66145_66247_69509_69714_74367_74495_131718_131815_134802_135330_135584
899898	contig_8386_pilon	-	5170	4	Intergenic	novelGene_82217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	2285	2920	24427	23792	FALSE	30	TTATCTCTCCCCAGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYTDQEAVVQTEQGDTAWFKVRKGVHQGCILSPYLFNLYAEQLIREAGLYEEEWGIRIRGRLINKLQYADDTTLLAESEEDLKHLLVKIKDHSVQYGLHLNIKKTKILTTGPISSIIINGEKIEVVKDFILLGSTANSHRSSSQEVKTQCIGQIAAKDLFKVLKSKDVILKTKVRLTQAMVFSVTSYACESWTVNKED	154303	21541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_25320_97015_97118_146881_147156_153287
899899	contig_5238_pilon	+	5494	22	Intergenic	novelGene_176256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_4	208.169410340137	671	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1046	3141	222	3362	66240	119678	FALSE	30	TAATATGGCTAATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSVGNVADSTEPTKRMLSFQGLAELAHREYQAGDFEAAERHCMQLWRQEPDNTGVLLLLSSIHFQCRRLDRSAHFSTLAIKQNPLLAEAYSNLGNVYKERGQLQEAIEHYRHALRLKPDFIDGYINLAAALVAAGDMEGAVQAYVSALQYNPDLYCVRSDLGNLLKALGRLEEAKACYLKAIETQPNFAVAWSNLGCVFNAQGEIWLAIHHFEKAVTLDPNFLDAYINLGNVLKEARIFDRAVAAYLRALSLSPNHAVVHGNLACVYYEQGLIDLAIDTYRRAIELQPHFPDAYCNLANALKEKGSVAEAEDCYNTALRLCPTHADSLNNLANIKREQGNIEEAVRLYRKALEVFPEFAAAHSNLASVLQQQGKLQEALMHYKEAIRISPTFADAYSNMGNTLKEMQDVQGALQCYTRAIQINPAFADAHSNLASIHKDSGNIPEAIASYRTALKLKPDFPDAYCNLAHCLQIVCDWTDYDERMKKLVSIVADQLEKNRLPSVHPHHSMLYPLSHGFRKAIAERHGNLCLDKINVLHKPPYEHPKDLKLSDGRLRVGYVSSDFGNHPTSHLMQSIPGMHNPDKFEVFCYALSPDDGTNFRVKVMAEANHFIDLSQIPCNGKAADRIHQDGIHILVNMNGYTKGARNELFALRPAPIQAMWLGYPGTSGALFMDYIITDQETSPAEVAEQYSEKLAYMPHTFFIGDHANMFPHLKKKAVIDFKSNGHIYDNRIVLNGIDLKAFLDSLPDVKIVKMKCPDGGDNADSSNTALNMPVIPMNTIAEAVIEMINRGQIQITINGFSISNGLATTQINNKAATGEEVPRTIIVTTRSQYGLPEDAIVYCNFNQLYKIDPSTLQMWANILKRVPNSVLWLLRFPAVGEPNIQQYAQNMGLPQNRIIFSPVAPKEEHVRRGQLADVCLDTPLCNGHTTGMDVLWAGTPMVTMPGETLASRVAASQLTCLGCLELIAKNRQEYEDIAVKLGTDLEYLKKIRGKVWKQRISSPLFNTKQYTVELERLYLQMWEHYAAGNKPDHMIKPVEVTESA	66018	121810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_+_66277_69256_69438_70848_71093_99889_99959_103219_103337_105711_105792_106330_106527_106801_106943_107562_107664_107829_107984_108068_108171_108355_108536_109181_109341_109745_109836_111187_111314_111692_111864_111973_112091_112186_112358_113499_113653_115778_116032_116253_116378_119503
899900	contig_15384_pilon	+	3459	5	Intergenic	novelGene_85117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	109.481733636255	472	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	239	1090	75617	79189	TRUE	10	GGCGAGTCTGCAGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVSVCFEGDSDGYINLVAYPYVESETVEQDDTPEREQPRRKHSRRSLHRSGSGSDHKEEKASLPLETSESSQEAKSPKMELHSHSDVPFQMLDGNSGLSSEKISHNPWSLRCHKQQLSRMRSESKDRKLYKFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMRHKHLDTGLPEVASPCGSSTSPEAGPSSPPKVDVRMIDFAHSTFKGFRDDPTVHDGPDRGYVFGLENLINIMEQMRDENQ	72008	82074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_72222_75591_75774_77964_78141_78670_80889_81404
899901	contig_9127_pilon	-	2978	1	Intergenic	novelGene_103013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	866	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	56	171	135	305	183775	183605	NA	55	AAAGCACTATAAAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDPDVNSSTYSHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWKNWISIYKKMKQDPYLTPCTKTNLKWIKDLNSKPKTIQFIEEKIGPMLQSLIHGINRKQTITIKT	183909	180931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_180900_183900
899902	contig_7207_pilon	-	1680	8	Intergenic	novelGene_72079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_7	200.397360363894	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	780	1679	696514	671669	FALSE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDE	758074	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_757787
899903	contig_10734_pilon	+	2314	8	Intergenic	novelGene_51078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	232.479009366262	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	30	926	486356	495551	FALSE	35	TAACAAGAAGTGGACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGRNALEIVMKSIVNLDSPMVSPPPDYPGEFFKDVRQGLIGVGLINVEDRSGILTLDKDYNNIGKFLNRILGMEVHQQNALFQYFADTLTAVVQNAKKNGRYDMGILDLGSGDEKVRKSDVKKFLTPGYSTSGHVELYTISVERGMSWEEATKIWAELTGPDDGFYLSLQVASDDALMHWLDQYNSSADTCTHAYWRGNCKKASLGLVCEIGLRCRTYYVLCGSVLSVWTKVEGVLASVSGTNVKMQIVRLRTEDGQRIVGLIIPANCVSPLVNLLSTSDQSQQLAVQRKQLWQQHHPQSITNLSNA	486326	496939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_486429_487935_488011_489271_489419_489502_489598_489677_489771_492654_492732_494129_494324_495408
899904	contig_17144_pilon	-	1677	11	Intergenic	novelGene_29333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2169.32174884225	19	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	169	1593	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183276	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_172602_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
899905	contig_10904_pilon	-	1881	4	Intergenic	novelGene_22737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	407	junction_3	280.976076482599	14	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	501	1532	662171	652299	FALSE	15	TACTGTTGTTGAATTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662671	651949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_661936
899906	contig_9049_pilon	+	1645	7	Intergenic	novelGene_83145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_6	1606.75189953728	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	254	850	90226	113120	FALSE	30	TTGCAAACTTCGGATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMEFPDCRRSVGGEGCKTYPAVVQYNMFYR	89289	113915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_113028
899907	scaffold_880_pilon	-	3985	4	Intergenic	novelGene_121415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	837	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCGCCCGGCTGGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428439	352564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_352702_406893_407000_420188_420364_424872
899908	contig_20493_pilon	-	4520	8	Intergenic	novelGene_86418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_7	52.0211887756581	229	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	64	1077	54655	43349	FALSE	45	GCAAAATGCTGGATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGRGERRLCRRSRGGQKPCRMSLLKLSWLGFWPGTASPWLLLLLAVASWLLVCILVSTYTFYDNCRRLRCFPQPPLRSWFLGHLGLIRSSEEGLQYTQGLASTFGDVCCWWVGPLHAVVRIFHPTFIKPVLLAPAAIAPKDVVFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGEGPSPGLH	55265	39905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50419_50565_54457_54665_55211
899909	contig_8377_pilon	+	4199	19	Intergenic	novelGene_35070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2866.51674457234	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1932	2267	4198	131448	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	120149	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_122399_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
899910	contig_2341_pilon	-	1814	2	Intergenic	novelGene_84362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAACAACAGCAGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159895	157997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_158628_158711
899911	contig_6871_pilon	-	3465	8	Intergenic	novelGene_21607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	256	junction_6	100.854714661179	490	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	485	1039	454887	450393	FALSE	20	GTTAATTTTTTGAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKKDNEKERHKLFQGYETEEREETELSEKIKLECQPELSETSQALPPKPFSCGRSGKGHKRKSPFGSTERKTPVKKLAPEFSKVKTKTPKHSPIKEEPCGSLSETVCKRELRSQETPEKARSSVDTPPRLSTLQKGPSGHPKEKAFSSEIEDLPYLSTTEMYLCRWHQPPPSPLPLRESSPKKEETVARCLMPSSVAGETSVLAVPSWRDHSVEPLRDPNPSDLLENLDDSVFSKRHAKLELDEKRRKRWDIQRIREQRILQRLQLRMYKKKGIQESEPEVTSFFPEPDDVESLMITPFLPVVAFGRPLPKLTPQNFELPWLDERSRCRLEIQKKQTPHRTCRK	456435	447966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_450484_450890_450964_451137_451263_451644_451713_452356_452422_452863_452912_454802_455186_456249
899912	contig_8330_pilon	+	4472	3	Intergenic	novelGene_71905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	16.5	557	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	1183	3414	1212052	1219586	FALSE	5	CGGAGCCTGGCTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPQWGWTLTPTPLPPSRHPHQASSWSHLLLHGAHWTFPPQTLGFPHARDDLSLYGASPGLGGTPPSQDSVRAVPQPSAFQRACQPFPASQPRLEPMGLTGKPVQAAEERTWLPSCRKEQLQPRLDEHPRAPIVIRDSPVPCTPPVLPPCAQEHQSLPHNEGSSPPSSPPMPIIDNVFSLAPYRDYLDVQAPEATSEPDQVPATNESHDEDCKGTLPAQQAPLGTHCSLKEEVALDLSVKKPVTETSLVKVPSPVVHAKPTDLLDIGNTVTGMPGVGNTALDLPGAKSTVSDVLGGRNTVSDPPGLKNLVTEAPGLPGAPVTAEATPRTNFQSSVAFMFRKFKILRPAPLPAAVVPSVPTSAPAPAPPVLTPTSVPVGLQILTQPLPVACFNLALPSPPALAVASPAPSPAPAPAPAPAPAPGPAPAPAPSPVPASALTPAPGPAPGSTLAPAPLDSAEQRFAGLHASLCDAISGSVAHSPPEKLREWLEMDGPWGRAAWQDCQGVQGLLRKLLSQLQNFVCTHQCPFPHVVRAGAIFVPIHLVKERLFPRLPPASVDHVLQEHRVELRPTTLSEERALRDRALHGCTLRMLKLLALRQLPDIYPDLLDLQWRDCVRRQLGDFDTEAGAVPPSEPTMAREEPESLALAQKSPAPKARKPGKKPPTPGAEKAEAAAGGGSSGGASPTPAASASPPSPTLRTRFRNLLETAWLNGLALPTWGHKASGQDRPSPRPQLLGGQSNPL	1207589	1220644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1207737_1211016_1213913_1219215
899913	contig_4219_pilon	+	2024	2	Intergenic	novelGene_178745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCCCACAGATGAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517184	533008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4219_pilon_+_517889_531688
899914	contig_3956_pilon	-	1758	4	Intergenic	novelGene_14761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.2640830811685	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	8	400	840308	838325	TRUE	65	TCTTAATAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITAVTTAAASERMESDSDSDKSSDNSGLKRKASALKMSVSKRARKASSDLDQASMSPSEEENSESSSESEKTSDQDFTPREEGCGPGPTAWPCWRKEEKGRGCFVFSMPTSGEPLEASHQSLVTIHGC	840315	802414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_802700_837251_838487_838583_838701_840194
899915	contig_16187_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_101062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGGAGACCGTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40256	38034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_-_38000_40300
899916	contig_3584_pilon	+	2936	20	Intergenic	novelGene_108195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	92.9172031875661	4	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	336	2540	548868	562364	FALSE	35	TAAAATGTTATTGCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDSGYGTSRRSQWESPSPSPSCRDSERSHRPSTRDRDRSVRSKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREDGEEGIPFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAFTEDGKVDYRTEQKFADHMKKKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGSLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL	547761	562760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_547880_548039_548159_548320_548398_548846_549003_549589_549752_549880_549989_552777_552891_554444_554583_554968_555156_555304_555491_555880_555929_557526_557571_558259_558469_558570_558726_558981_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
899917	contig_4742_pilon	-	3593	1	Intergenic	novelGene_130994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1080	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208143	204550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_204600_208100
899918	contig_6233_pilon	+	3630	1	Intergenic	novelGene_74775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTAATTAGTACTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129335	132965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_129300_133000
899919	contig_1865_pilon	+	2215	1	Intergenic	novelGene_103241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	613	921	79740	80048	NA	45	AAGTAATTTGGTACCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVLKACEQPSKICLLIEPRLQQGRIKKTKDTREGLVQRTNGTKYHSLHQTESSTTRQCPATTTNCSDRNHNRGSQTELEKNVEQNSNSPKKVQAYWSDKI	79127	81342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_+_79100_81300
899920	contig_12080_pilon	+	5288	10	Intergenic	novelGene_128334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTCTCTCTTAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43905	61261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45892_46201_47139_54876_54963_56918_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881
899921	contig_10962_pilon	+	6392	41	Intergenic	novelGene_103889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	297.813925757343	531	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1987	5964	114	6077	311769	412410	FALSE	15	AATCCTGGGCTGTGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNRPSNNPGGSLRRSQRNSAGAQPQDDSTGGRSCSSSSAVIVPQPEDPDRANTSERQKTGQVPKKDSSRGVKRSASPDYNRTNSPSSAKKPKALQHTESPSETNKPHSKSKKRHLDQEQQLKSAQSPSTSKAHTRKSGATGSSRSQKRKRTESSCIKSGSVSESTGAEERSAKPTKLASKSAASAKAGCSTITDSSAASTSSSSSAVASASSTVPPGARVKQGKDQNKARRSRSASSPSPRRSSREKEQSKTGGSSKFDWAARFSPKVSLPKTKLSLPGSSKSETSKPGPSGLQAKLASLRKSTKKRSESPPAELPSLRRSTRQKTTGSCASTSRRGSGLGKRGAAEARRQEKMADPESNQETVNSSAARTDETPQGAAASSSVAGAVSMTTSGESESDDSEMGRLQALLEARGLPPHLFGPLGPRMSQLFHRTIGSGASSKAQQLLQGLQATDESQQLQAVIEMCQLLVMGNEETLGGFPVKSVVPALITLLQMEHNFDIMNHACRALTYMMEALPRSSAVVVDAIPVFLEKLQVIQCIDVAEQALTALEMLSRRHSKAILQAGGLADCLLYLEFFSINAQRNALAIAANCCQSITPDEFHFVADSLPLLTQRLTHQDKKSVESTCLCFARLVDNFQHEENLLQQVASKDLLTNVQQLLVVTPPILSSGMFIMVVRMFSLMCSNCPTLAVQLMKQNIAETLHFLLCGASNGSCQEQIDLVPRSPQELYELTSLICELMPCLPKEGIFAVDTMLKKGNAQNTDGAIWQWRDDRGLWHPYNRIDSRIIEQINEDTGTARAIQRKPNPLANTNTSGYSELKKDDARAQLMKEDPELAKSFIKTLFGVLYEVYSSSAGPAVRHKCLRAILRIIYFADAELLKDVLKNHAVSSHIASMLSSQDLKIVVGALQMAEILMQKLPDIFSVYFRREEGVMHQVKHLAESESLLTSPPKACTNGSGTLGSTTSVSSGTATAATNAAADLGSPSLQHSRDDSLDLSPQGRLSDVLKRKRLPKRGPRRPKYSPPRDDDKVDNQAKSPTTTQSPKSSFLASLNPKTWGRLSAQSNSNNIEPARTAGVSGLARAASKDTISNNREKIKGWIKEQAHKFVERYFSSENMDGSNPALNVLQRLCAATEQLNLQVDGGAECLVEIRSIVSESDVSSFEIQHSGFVKQLLLYLTSKSEKDAVSREIRLKRFLHVFFASPLPGEEPIGRVEPMGNAPLLALVHKMNNCLSQMEQFPVKVHDFPSGNGTGGSFSLNRGSQALKFFNTHQLKCQLQRHPDCANVKQWKGGPVKIDPLALVQAIERYLVVRGYGRVREDDEDSDDDGSDEEIDESLAAQFLNSGNVRHRLQFYIGEHLLPYNMTVYQAVRQFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHTIWYKPVREDEESNKDCVGGKRGRAQTAPTKTSPRNAKKHDELWHDGVCPSVSNPLEVYLIPTAPENITFEDPSLDVILLLRVLHAVSRYWYYLYDNAMCKEIIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDVDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDTSQTKESLQYSLETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS	274043	412725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_274108_311719_311867_331779_332580_349883_349990_353012_353150_359047_359132_360527_360624_363978_364128_367077_367114_367199_367296_368183_368277_368469_368632_370200_370270_370359_370526_373253_373372_373498_373656_375834_375908_377160_377390_377699_377819_380491_380703_383699_383801_384043_384219_385568_385711_386642_386835_388074_388227_390867_391041_391448_391523_391603_391804_392235_392364_393691_393844_394536_394680_396324_396482_397805_397905_401835_401951_402637_402793_403811_403977_407192_407325_408898_409013_410807_410903_411426_411531_412213
899922	contig_7056_pilon	-	4734	7	Intergenic	novelGene_43607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1296.30637668038	90	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1438	1956	725925	725118	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	730130	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_723276_723723_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728708_728906
899923	contig_15498_pilon	+	3428	20	Intergenic	novelGene_42703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	2412	3122	984557	993436	TRUE	40	GGTCCAGGATAAAAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAAAGTMTGVGGGEAGGVGGDGEKEGTVEGVMGAGVHSTFISSGGFSRISNSRVNGSTSCFTISTMLSVAGNFSPTPFISLIRSVLEISGISLGATLQGFLHISSSISSVGEGSDVSVQDVGLGIGNVSSFGEESSHLSSTAVVNIGWLLRAAEIGEAIVLRAIGETVVGDTGRGSSGVDSTAVSSDVWPACSFFSPLRTSLRTGEGDFNTGSGFGFSSCFWSLAAVTGVLAAR	892624	1022129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_892744_893711_893931_895504_895629_896633_896727_900271_900364_904152_904287_905643_905749_909052_909292_909684_909832_924897_925094_937391_937568_943064_943185_944807_944940_947590_947838_953500_953590_984377_985218_993386_993493_1011552_1011676_1014077_1014175_1022099
899925	contig_8864_pilon	+	6879	1	Intergenic	novelGene_135956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCCGCGATGTGTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25622	32501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_25600_32500
899926	contig_16211_pilon	-	8221	21	Intergenic	novelGene_150079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_6	838.341271499859	1412	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1160	3483	55	3537	242940	180100	TRUE	35	TTAAGTAAGTATTAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKSMLSRSFNSNITAVSSFHYGSSRDLHGSQGSLALSVADRRGSGGHIFRNPQTCSPGDPCQDDVFISGQQNYSSATLSLKDVPPDSLMKMPLSNGQMGQPLRPQANYSQIHHPPSSGICGKASL	242994	171671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_176085_178193_178269_178757_178851_179996_180208_182778_182899_185391_185536_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643_237708_242929
899927	contig_5539_pilon	+	3603	2	Intergenic	novelGene_104763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	129	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCATAGAAGTACAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151066	182773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_154314_182417
899928	contig_9121_pilon	-	5673	5	Intergenic	novelGene_134444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19466	136	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	5344	5673	107405	107076	FALSE	10	TGTACCCCCTGTTTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHSPSRRSKDSARSQVFERKDREVVRGKEEIKRSRKKSNTSSQQMALRDPASGGWWNPSSWCFPDKRTVSVGSRGGQVGVKNGGGWESVYRKFPVVSSPTGSSVKLLS	157294	107075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_108355_149757_151321_153969_155853_156136_156282_156491
899929	contig_7410_pilon	+	2375	7	Intergenic	novelGene_106090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_6	239.153890483373	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	106	786	405351	411936	FALSE	30	ATCCTAATACTCAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRSRSRSHSRSRGRRYSRSRSRSRGRRSRSASLRRSRSVSLRRSRSASLRRSRSGSVKGSRYFQSRSRSRSRSRSLSRPRSSRSPSGSPRRSASPERMD	405245	413525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411881
899930	contig_11338_pilon	-	3556	16	Intergenic	novelGene_6297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_15	115.389196490255	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	632	2203	227968	198987	FALSE	40	TCTTTGAAAAGGTAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGPSAVAFISYVSLGNIINATFFEEMNESDRVYLNSQVVSAAIGPKRNTSLPKTVTLSFQHTKMKPSGKKAFCVYWKSSQEGGRWSTDGCFLIHVNESHTICNSTHLSSFAVLMAFTSQEEDPVLTVITYVGLGLSLLCLLLAALTFLLCKAIQNMSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQVREPVAYSSVSPP	250559	197633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217_207416_212075_212244_213718_213904_223149_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_249573_249784_250509
899931	contig_183_pilon	+	3751	4	Intergenic	novelGene_178746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	281	592	134494	134805	TRUE	40	AAGGTGGCAATATTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKATVKYHFTLALLARIKNTRNNKSWRGCGEIGTLMHCWWEWKIIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPCDPAIPLLGLYPREISVVTRIDICTPMFMAALFTIAK	134213	192888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_183_pilon_+_135064_135123_136182_176154_177057_191947
899932	contig_4783_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_108383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGATTTACCTTTCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217951	215909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_215900_218000
899933	contig_8377_pilon	+	4993	14	Intergenic	novelGene_34887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3050.95665664232	276	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1218	3776	4993	154883	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	2519	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_3826_148594_151050_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
899934	contig_4114_pilon	-	3161	5	Intergenic	novelGene_15643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_3	93.515707236806	5	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2088	2552	573506	567115	FALSE	10	TAATTTTTGTGTGTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLQKCHGFVISCFLLWQMRNEFTITHVLIPKQSAGSDYCNTENEEELFLIQDQQGLITLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQMMLPESIAIVCSPKFQETGFFKLTDHGLEEISSCRQKGFHPHSKDPPLFCSCSHVTVVDRAVTITDLR	579856	566505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_567172_569005_569106_570031_570145_573311_575385_579647
899935	contig_6445_pilon	-	6832	1	Intergenic	novelGene_76979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1260	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	971	1282	400824	400513	NA	45	GATAGAGACTAGAAGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPCQERLMLGVPAQRGYFKCPGVSEARTHPCLGLSVSHTCRGQEPPGEWTVTVSGTYFSYLQVRRVSQTTGFRDGDHSSRFGNLKSLLQKQVFCFSCAIFTS	401794	394962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_395000_401800
899936	contig_4151_pilon	-	1822	2	Intergenic	novelGene_65239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGCGGCGCAGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664813	528938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_528997_663049
899937	contig_15022_pilon	+	3832	10	Intergenic	novelGene_171819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	175.691649077455	90	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	480	1007	111402	113989	TRUE	10	CCCCATGGTGCTGAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGRVVEDLISHYVVVFNVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKAAETEQHIKIPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAGGTPSALCGEGAADPARAGHRQLSGGEEAPVHGDHDALPGQPCR	110156	121832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_110502_110843_110950_111373_111522_111610_111698_111772_111842_112111_112234_113609_113724_113973_114120_118370_118454_119220
899938	contig_14970_pilon	+	4196	6	Intergenic	novelGene_45119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAAGCCTGCTTCTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266981	315716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_270381_280559_280695_285611_285807_290934_291166_311915_312049_315613
899939	contig_6740_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_142735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATCTGTTGCAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755246	753118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_753100_755200
899940	contig_16510_pilon	-	4013	4	Intergenic	novelGene_139083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	104.180399094818	18	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	459	824	345770	345405	TRUE	5	TTTTGCCTCCATCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIITVTRIDICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYSAIKNNDEAVKHLIMEGIMLSEFNQYQKDKYCIRPLL	346228	276990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16510_pilon_-_277225_277315_280027_344412_344513_345260
899941	contig_11309_pilon	-	1186	2	Intergenic	novelGene_149873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6668	junction_1	0	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATCTGTGTTAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57945	56223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928
899942	contig_6576_pilon	+	2589	8	Intergenic	novelGene_42332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	52	junction_1	434.844471375358	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	59	1375	665402	708104	FALSE	35	TAAAAGTTACATGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSGVRARSRRPRGGTRRRMEPEPELLLQEARENVEAAQSYRRELGQRLQGLREARRQIKESASQTRDVLKQHFNDLKGTLEKLLDERLVTLLQEVDTIEQETIKPLDDCQKLIEHGVNTAEDLVREGEIAILGGVGEQNEKLWSFTKKASHIQLDSLPEVPLLVDVPCLSAQLDDSILNIVKDHIFNHGTVASRPPVQIEELIEKPGGIIVRWCKVDDDFTAQDYRLQFRKCTSNHFEDVYVGSETEFIVLHIDPNVDYQFRVCARGDGRQEWSPWSIPQIGHSTLVPHEWTAGFEGYSLSSRRNIALRNDSESLGVLYSSAPTYFCGQTLTFRVETVGQPDRRDSIGVCAEKQNGYDSLQRDQAVCISTNGAVFVNGKEMTNQLPAVTSGSTVTFDIEAVTLGTTNNNEGGNFKLRVTISSNNREVVFDWLLDQSCGSLYFGCSFFYPGWKVLVF	665343	709318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_665519_684676_684885_688932_689021_689512_689691_692096_692320_693449_693583_706165_706279_707847
899943	contig_16103_pilon	-	3288	1	Intergenic	novelGene_118890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAATATAAATGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732187	728899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_728900_732200
899944	contig_10370_pilon	+	2683	4	Intergenic	novelGene_178747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_2	210.185632239694	186	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAGCATAGATTATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279	10632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10370_pilon_+_377_1376_1446_1535_3950_10529
899945	contig_6691_pilon	-	2198	3	Intergenic	novelGene_60181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	715	1131	468168	436626	TRUE	25	CTACCTCCCACTTAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKKKRKQKITNAGEATGRLELMHCWWECKMVQPLWKMIWCFLKKLEIEIPQDPAIPLLGMYPREIRAITQMDICTPMFLVTLFTIAKGWIQPKFPSTDEWINKLWYIHTVEYHAMIKNNDKSIEHLTTWMNLGGLC	468882	435148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_435901_436310_436963_468088
899946	contig_14158_pilon	-	2579	8	Intergenic	novelGene_136127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	118.528391501095	9	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	19	756	54234	31016	FALSE	15	AGCCCCAGCACTTTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLDEVMKKYGSLVPLSEKDVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD	54252	29192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_31127_31921_31973_33428_33513_38101_38240_51327_51406_53538_53587_53862_54002_54145
899947	contig_10930_pilon	-	5109	3	Intergenic	novelGene_36957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2581	2883	280415	280113	TRUE	40	TGAAATTGACTCAACGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKVFFYFCWSEFMGRA	284987	212727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_212800_277958_281834_283825
899948	contig_2646_pilon	-	2683	18	Intergenic	novelGene_69552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	83.6949064772894	21	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	110	475	877063	867353	TRUE	20	GAATTGTAAGGGCTGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGE	877172	846514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847437_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857025_857083_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863825_863997_864102_865297_865467_867268_867356_869452_869525_869942_870077_874678_874735_876962
899949	scaffold_12124_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_22410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTATAGGGGTGCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510595	1508779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1508800_1510600
899950	contig_9127_pilon	-	2710	2	Intergenic	novelGene_103011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTATATATATATACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175279	171857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_173932_174643
899951	contig_15977_pilon	-	3412	1	Intergenic	novelGene_137223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATTGACTGATTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91700	88288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_88300_91700
899952	contig_6102_pilon	+	3269	13	Intergenic	novelGene_31991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1510	2058	419257	420561	TRUE	25	TAAGACCCCACTGTTCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEEEEEAACQKANPKEHYPPRLGARCLALPLASLREEFVGWGTVRGHGVQRGVPLMGLPQAGGLQLAAAAVALQLALPAQSVQRGPSFQEVPRCQQEQGPEKPEPQPSHGLTVAQQPLWVGQAGSLWAGLEVAAAAVGASVGSAAAGPSSPRTSAAPCGRLVCRPGAAASDTPVLLAPGP	416996	424557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_418025_418172_418371_418973_419400_419717_420101_420538_420674_421184_421352_421432_421568_421801_421865_422132_422304_422541_422800_423163_423225_423318_423443_424437
899953	contig_5145_pilon	+	2047	2	Intergenic	novelGene_131345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTGGTAACAAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5376	7870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_7341_7787
899954	contig_6028_pilon	-	3120	11	Intergenic	novelGene_156573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	159.699749530173	233	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	322	1632	332055	309678	FALSE	25	ATGGTAACCGTAGATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	354040	308189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353771
899955	contig_4232_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_63362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11039	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCAGGAGGAAATCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
899956	contig_10000_pilon	-	1397	7	Intergenic	novelGene_139310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	314.32648454893	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	30	590	192623	159846	TRUE	45	AAAATTCCAGTAATTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	192652	158983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159036_159090_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_192582
899957	contig_753_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_112978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191097	1192923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1191100_1192900
899958	contig_5499_pilon	+	3128	12	Intergenic	novelGene_56994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	280.897087122168	85	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	130	594	803476	824189	TRUE	20	GTTTTAAGAGTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTGWMFEST	803346	840977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_824166_825218_827918_828026_831323_831427_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
899959	contig_610_pilon	+	3977	7	Intergenic	novelGene_76794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	114.017055254417	404	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	30	1034	296008	314475	FALSE	15	TAGTAGGGGATTCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAAGETDAPKFILYLLLVPILLIVFVLGFFTWSGQRDRGKEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTVEKPHSLPMSLDTPGLFTYENII	295978	317418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145_306407_306612_306733_309314_309419_313377_313441_314403
899960	contig_6602_pilon	-	5316	6	Intergenic	novelGene_166435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	130	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1254	1607	328126	327773	TRUE	35	ATGCCTTAGGAAATTAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLASRGYFRESQPPRHTYKHSHTQNQNSRVTRSPYWRAYSRGRSSRGACHLRNQGLRSRSGNLGPALSAPTLSTTGRGVPDSSWDPSYTGLAFLSPTSFGAVGDQRCRDRPRSGQ	329379	111774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_-_112929_113127_114205_130825_131271_192929_193147_270852_271044_327147
899961	contig_4496_pilon	+	2534	9	Intergenic	novelGene_66627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	166.064558229623	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	65	1543	617857	673470	FALSE	15	AATGATGTCTTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLQSVSKRAHLPPDHLVEVREMMSHAEGQQRDLIRRIECLPASGHLSSLDQDLLMLKATSMATMNCLNDCFHILQLQHASHQKGSLPPGTTIEWLEPKIPLSNHYKNGADQPFAAEQSKPLAAPEQQSVAESGLLAREPEEINADEEVEDTCDNKEDDLGAVEEQRSVILHLLSQLKLGMDLTRVVLPTFILEKRSLLEMYADFMSHPDLFIAITNGATAEDRMIRFVEYYLTSFHEGRKGAIAKKPYNPIIGETFHCSWRMPKSEVTSNVISSSSTQAITNQPPLSEEPLSQVGSDCYMVRFVAEQVSHHPPVSGFYAECAERKICVNAHVWTKSKFLGMSIGVTMVGEGILSLLEHGEEYTFSLPCAYARSILTVPWVELGGKVSVNCAKTGYSASITFHTKPFYGGKLHRVTAEVKHNSTNTVVCRVQGEWNSVLEFTYSNGDTKYVDLTKLTVTRKRVRPLEKQDPFESRRLWKNVTDSLKEFEIDKATEHKRTLEERQRTEERHRKLF	608917	674461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_608982_617856_618059_622314_622461_627391_627533_640710_641210_645178_645366_662079_662263_665409_665520_673459
899962	contig_2783_pilon	-	1873	4	Intergenic	novelGene_119649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.6690475583121	498	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	105	590	517573	511465	TRUE	20	TACCCAGTATAGTGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSWSSGRGSLAEREEEAASFRALPKPGPTFASEIMAAEDVVATGADPGELEGGGLLHEIFTSPLNLLLLGLCIFLLYKIVRGDQPAASGDSDDDEPPPLPRLKRRDFTPAELRRFDGVQDPRILMAINGKVFDVTKGRKFYGPDGPYGVFAGRDASRGLATFCLDKEALKDEYDDLSDLTPAQQETLSDWDSQFT	517677	508049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_509297_511428_511467_512463_512620_517245
899963	contig_12019_pilon	+	1335	4	Intergenic	novelGene_87644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	54.6829244117597	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	205	513	5225	6248	TRUE	10	CATCTCTTTCCTGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKGKESVGS	5020	8673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6434_7726_8013_8322
899964	contig_12424_pilon	-	1778	11	Intergenic	novelGene_174266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	119.892618621832	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1719	59	1777	164685	8630	FALSE	40	GGTAGGTAGACGTAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQMDKCFTINHERLAVRIHPEVPQKKVDGLDKASIANSDGPTSGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREEIVVKPEEGNGSVSEKTPPLEEKAEDKKAGSSHSKKTSGSKASTSPSISSTSSRPKASKETVSSKTGTVGTTKGKKKTGKQPSSRPSADAAASGTSSLKGDPSETRAESLKPEQTVPGTEEQTTGKSKSVVPPHPVAPLPLPPIPPLPPEDQCVTPSDTPIILVSNGADLPASALDPSRLLWTEEPTNKTTLHPGTGLSSRENAKCFTTKDELGKAAPQLLIPGLLGESSESFSAPEDEGQRDYQANDSDSDGPILYTDDDEEEDEDEDEDGSEESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFT	164743	8628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_-_8705_16015_16154_19617_19680_25046_25103_34032_34190_35725_35935_41888_42421_51666_51826_56992_57074_90195_90364_164603
899965	contig_7151_pilon	+	2401	5	Intergenic	novelGene_40730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	150.59112689664	52	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1898	2254	505515	507901	FALSE	45	AAATCATGATACCTACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502246	508048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503041_503267_504052_505593_506568_506685_507738
899966	contig_13244_pilon	-	3903	5	Intergenic	novelGene_86949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_4	108.335993557081	84	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	2022	3848	292294	278672	FALSE	20	CTACCAATTGTATTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEESYRAILRYLTNEREPYAPGTEGNVKRKIRKAAACYVVRHGTLYYQRRQRHRKTFAELEVVLQPERRRGLIEAAHLGPGGTHHTRHQTWHDLSKTYWWRGILKQVKDYIKQCSKCQEKLDRSRPISDASEMLEELGLDLESGEESNESEDDLSNFTSPPTTASKPVRKKPVSKHELVFVDTKGVVKRSSPKHCQAVLKQLNQQRLSNQFCDVTLLIEGEEYKAHKSVLSANSEYFRDLFLEKGAVSSHETVVDLSGFCKASFLPLLEFAYTSVLSFDFCSMADVAILARHLFMSEVLEICESVHKLMEEKQLTVYKKGEVQTVASTQDLPEQNGVRIAPPVASSEGTTATLSTELEDCEIVLVVNGELPEAEQNGELGRQNEPQVSSEAEAALSPVQCITDCHPEMESVDLATKNNQVKLETSSSREDSTVSNIPPKLSKDSVISSSPENSDMGNDISTEDVCAEDTPEHRQNLAQPLKDQENLVTLTAKADLGPDDDTYRSRLRQRSVSEGGYIRLHKGMEKKLQKRKAVPKSAVQQVAQKLVQRGKKMKQPKRDAKENTEEATHKCGECGMVFQRRYALIMHTLKHERARDYKCPVSVWKAN	294315	278616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_278873_279114_279963_283158_283391_284063_284300_291984
899967	contig_7571_pilon	+	3848	2	Intergenic	novelGene_106399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	597	1025	102152	102580	TRUE	50	AAGGATAAGGAAGGACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLCSIDYEKVFNCVDHNKLWLTLQRMGIPERLIVLMRNLYIDQEAVIRKNKGILSGLKSGKGVCEGCILLLYLFNLYAKQIIREAGLYVEEHSIRRGQDGRVVRSIWWTLLQQRSKTTSDSIIYVNLGALNIKGRVEELD	101555	105581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_105040_105217
899968	contig_15991_pilon	-	976	7	Intergenic	novelGene_70898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	25	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	77	907	105108	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106358	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102234_103603_103703_104975_105142_106315
899969	contig_7919_pilon	+	8230	18	Intergenic	novelGene_28121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	889	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAATAGAAAAACAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432227	1529046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1435380_1444056_1444148_1444241_1444366_1452107_1452194_1452282_1452421_1478688_1478842_1489699_1492558_1492822_1493023_1493668_1493801_1495705_1495782_1502043_1502217_1502999_1503208_1503297_1503397_1504118_1504370_1504454_1504524_1520460_1520527_1523746_1523966_1528911
899970	contig_17518_pilon	-	6538	9	Intergenic	novelGene_117356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	74.1880002089287	711	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	71	2437	125703	100488	FALSE	30	CAATCTGTGGTGGGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSCSRHEDRKPSEVFRTDLITAMKLHDSYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSEEKSLMFIRPKKYIVSSDSEPPELGYVDIQTLADSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEHTMERVLEEFEQRCYDNMSHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQACYGILKVPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSPEKMEPITKVSHIPSSRWALVCSLCNEKFGASIQCSVKNCRTAFHVTCAFDRGLEMKTILAENDEVKFKSYCPKHSSHGKPEEGLGKGAAQENGGPECSPRNPPEPFASLEQNREEAHRVSVRKQKLQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDEEDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIFNLYTKLLEQERISGVPSSSCSSSSLENMLLFNSPSVGPDAPKIEDLKWHSAFFRKQMGTSLVHSLKKPHKREPSQNSAGSEGKTLLKQPDLCGKREGMVGPESFLSLEKTFAEARIISAQQKNGVVMPDHGKRRDNRFHCYLIKGDLKDKPFKQSHKPLRSTDVSQRHLDNTRAAASPGVGQSVPSTRKETVPKCNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGERQQQGEAHEGACHQHSDYPYLGLGRVPAKERAKSKLKSDNENDGYVPDVEMSDSESEASEKKCIHTSSNINRRTDIIRRSILAS	128904	96386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17518_pilon_-_101399_104806_104925_111045_111568_115128_115246_116529_116698_119451_119664_123196_123385_125572_125731_128861
899971	contig_4350_pilon	+	2747	1	Intergenic	novelGene_136370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	1930	2574	59726	60370	NA	60	GGAAGAAAGGAAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNYQKRAGVAILISDKMDFKTESTVKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIYSSTITVGDFNTPLLVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQPDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNQKSKEKKSITWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLE	57796	60543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_57800_60500
899972	contig_15354_pilon	-	1431	3	Intergenic	novelGene_65732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGGGGGTTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579169	577314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_577485_577727_577900_578080
899973	contig_9809_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_176765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAAAAAAAGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114099	116064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_114100_116100
899974	contig_14326_pilon	-	2203	1	Intergenic	novelGene_120652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGAGGGGTCCCTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23595	21392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_21400_23600
899975	contig_3747_pilon	+	1931	4	Intergenic	novelGene_24804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4810.32271959654	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	524	850	203794	204120	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201173_203228_203386_203498_203651_203768
899976	contig_149_pilon	-	3491	7	Intergenic	novelGene_173780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	64.3428317685816	757	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	74	961	43979	33917	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLNYSYPGSDSSLLINGQSSLFPMEDGFLDDGRGDQPLHSGLGSPHCFTHQNGERVERYSRKVFVGGLPPDIDEDEITASFRRFGPLIVDWPHKAESKSYFPPKGYAFLLFQDESSVQALIDACIEEDGKLYLCVSSPTIKDKPVQIRPWNLSDSDFVMDGSQPLDPRKTIFVGGVPRPLRAVELAMIMDRLYGGVCYAGIDTDPELKYPKGAGRVAFSNQQSYIAAISARFVQLQHGEIDKRVEVKPYVLDDQLCDECQGARCGGKFAPFFCANVTCLQYYCEYCWAAIHSRAGREFHKPLVKEGGDRPRHISFRWN	55609	31386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_-_34145_36861_37044_38205_38321_39818_39938_40303_40394_43825_44000_55556
899977	contig_7057_pilon	-	6454	6	Intergenic	novelGene_123431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.2177249260106	58	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	63	509	1654583	1637503	TRUE	35	CATGTAGACACAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASGSAACTRVLESTPEARKMAAGLLRARREAFVAFGDLAVDFTQEEWWLLSPAQRTLYREVMLETCNHLVSLGIPFSKPKLITQLEHREEPRRGGEKTSAGPLSRRIKTRNSTLSLLRSGILQSASPQPTWLAQSSTSDILKFTSRKSFPSGETKSRRSETAAGTTF	1655049	1631493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1636113_1636176_1637693_1643372_1643470_1643924_1644052_1654550_1654609_1655012
899979	contig_10106_pilon	+	5104	12	Intergenic	novelGene_73861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	723.609433030173	489	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1423	1809	167085	172575	TRUE	40	CAGAATTTTCGTTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	130104	175920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_130554_132392_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505_175190_175239
899980	contig_20550_pilon	-	6504	18	Intergenic	novelGene_142611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGAAAATGGCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34031	3712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_3889_10674_10766_11578_11642_12451_12493_12952_12991_15548_15602_15689_15768_15897_15954_18903_19067_19167_19264_19383_19491_19756_19858_20007_20107_20466_20611_21234_21398_24121_24274_24355_24434_29226
899981	contig_17427_pilon	+	2641	1	Intergenic	novelGene_30272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAGATCTGAGCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46447	49088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_46400_49100
899982	contig_4797_pilon	-	2830	5	Intergenic	novelGene_6934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	816.332155130496	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTTGACTTCAATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671798	656185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_657746_657816_658729_659533_659644_665223_665308_671634
899983	contig_2770_pilon	-	1457	6	Intergenic	novelGene_107472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1801.97320734799	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	216	656	750561	744015	TRUE	35	GACCATTAACTTAAAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEGKTLHS	750776	742949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743746_744009_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
899984	contig_15236_pilon	+	2643	7	Intergenic	novelGene_141567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	381.577864487272	378	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	230	1510	419232	450343	TRUE	15	TTTGGAGAAGTGTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	419002	452544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_451215_452282
899985	contig_8628_pilon	-	2863	16	Intergenic	novelGene_164439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	493	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1092	1394	692317	689631	TRUE	35	TATATTCAGTCCACTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLVSFKSVLKSALAVMYLSLMYSSNSLCFFLSLEENLIHRGSSLMIFFTSFQVDVKVIAEVSSRSCLKCSLFFLVSASMCSLKSFSFSSLSNKDPDSQR	694556	652060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_652143_653086_653200_654182_654270_666373_666540_667579_667637_667780_667848_670361_670497_671315_671405_677680_677800_682461_682613_686716_686882_687298_687483_689576_689757_690448_690533_692224_692325_693472
899986	contig_20641_pilon	+	2325	7	Intergenic	novelGene_52793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1627.93168024815	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	86	538	14599	41471	TRUE	80	AAAAGGAAGAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSGPLRFAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVF	14513	86678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38649_41462_41619_45848_45965_54835_54968_85286
899987	contig_6205_pilon	+	2016	6	Intergenic	novelGene_160333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	80.2196983290264	229	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	110	646	27057	55482	FALSE	10	TTCTTTTCTCACTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARGLAAVERWNGGKSGLQARGPEPEHRQGQPSGPSMNDVLCKKRDDYLEWPEYFMAVAFLSAQRSKDPNSQVGACIVNTENKIVGIGYNGMPNGCSDDLLPWRRTAENKLDTKYPYVCHAELNAIMNKNSADVKGCTMYVALFPCNECAKLIIQAGIKEVIFMSDKYHDSEEATAARLMFDMAGVTFRKFTPKCSKIVIDFDSINSRPSQKLQ	24895	56852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6205_pilon_+_24998_27049_27165_27540_27677_52523_52641_54002_54100_55403
899988	contig_10023_pilon	+	2139	3	Intergenic	novelGene_123468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	236	junction_2	21	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1741	2055	67518	67832	FALSE	20	TCTTTATAGGTGTCAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCSIDSEEPWDKDRPTPALTPSSAQIRNFRAHMGTSDKLHIHVEFSTFAIPTLDCFPSLLYWDSPAREAPTCKLDKPDINGLKQSRSICPAPPSGGARGNEQS	65163	67916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_66642_67137_67223_67340
899989	contig_6445_pilon	-	2436	12	Intergenic	novelGene_76968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1011.76192770192	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2012	2347	55547	43105	FALSE	10	TTATTCTCTCTGGCTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96378	43015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_56845_64139_64205_64855_64941_68005_68099_73962_74051_80504_80562_85291_85477_88146_88216_96306
899990	contig_935_pilon	-	3652	9	Intergenic	novelGene_45547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	320.368440237174	23	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	41	832	370806	358287	TRUE	10	TATTTCTGACTTCTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKVGHHFIQA	377420	344398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_346783_352422_352741_358168_358314_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637_370822_377395
899991	contig_7919_pilon	+	2340	16	Intergenic	novelGene_28069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_1	153.157522396605	28	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	483	1946	1068397	1131662	FALSE	30	ACACAATCTGTACCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHFKSGLELTELQNMTVPEDDNISNDSNDFTEVENGQINSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLILLTSVTLLSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKLVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNELPSAIKCLMGKEEDFSAWYVDGRFLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFLIVVIYKKFQIPCIVPELNSTISANSTNADVCTPKYVTFNSKTVYALPTIAFAFVCHPSILPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFSMFVMYFLTAIFGYLTFYENVHSDLLHKYQSKDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTKFNLCRHILVTFILLVIINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITSQDGDKGTQRIWAALFLGLGVLFSLVSIPLVIYDWACSSSSGEGH	1066901	1132056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1067292_1068304_1068519_1079491_1079568_1079847_1079964_1113436_1113511_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449_1116533_1118753_1118813_1118934_1119052_1120392_1120473_1122282_1122384_1124642_1124762_1125500_1125643_1125751_1125850_1131560
899992	contig_18850_pilon	-	2803	11	Intergenic	novelGene_142413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTCAGCACGACTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181899	171837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_171939_175234_175507_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178390_178649_178946_179148_180513
899993	contig_8317_pilon	+	703	2	Intergenic	novelGene_19375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTCAGTTTGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16266	17068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
899994	contig_8820_pilon	-	4633	2	Intergenic	novelGene_79282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1305	junction_1	0	102	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2407	2754	168096	167520	FALSE	20	CACCCGGGGTGTACCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVCE	170502	165640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_167801_168029
899995	contig_14684_pilon	-	5696	3	Intergenic	novelGene_99677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3994	4332	367546	366355	FALSE	25	TTTTTTTTTTAATTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDLPVEEKVLDLTDREFKSLIFRIIQELTQKANKNEEKIDKFMENTDKKMEESKKIIQEQNAKINDNSIRTIKEGMNSVGIEPFNQEEGKAIPSKNRLVQV	406837	364990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_366466_367318_368560_403857
899996	contig_854_pilon	-	4290	23	Intergenic	novelGene_36588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2293	2610	1699021	1697806	TRUE	20	TTATCCTGCTGCCCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMS	1716404	1679329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704683_1704885_1704997_1705283_1705360_1715185
899997	contig_2214_pilon	+	1723	5	Intergenic	novelGene_144260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	288.885249709984	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	990	1721	294009	297196	FALSE	50	CACTGCAACAACGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKTDNEKIQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQK	293019	297198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_294221_294869_295034_295646_295781_295859_296009_297123
899998	contig_11117_pilon	+	6898	15	Intergenic	novelGene_148570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_14	142.624471237997	697	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1260	3783	76	3858	17375	136738	FALSE	75	AAAAAGAAATACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLEWSAVIVDEAHRIKNPNARVTEVMKALKCNVRIGLTGTILQNNMKELWCVMDWAVPGLLGSRIHFKKQFSDPVEHGQRHTATKRELATGRKAMRRLGKKMSGWFLRRTKTLIKDQLPKKEDRIVYCSLTDFQKAVYQTVLETEDITLILQSSEPCTCGSGRKGRNCCYKINSQGETVKTLYFSYLAVLQKVANHVALLQAASTSEQQKTLINNICDRVFSRFPDFVQKSKDAAFETISDPKYSGKMKVLQQLLNHCRKNRDKVLLFSFSTKLLDVLQQYCMAAGLDFRRLDGSTKSEERIKIVKEFNSAQDVNICLVSTMAGGLGLNFVGANVVVLFDPTWNPANDLQAIDRAYRIGQCRDVKVLRLISLGTVEEIMYLRQVYKQQLHCVVVGSENAKRYFEAVQGSKEHQGELFGIHNLFKLRSQGSCLTRDILEREGQVEAGIMTATTWWREGPPAHKQEMPREPDCQEYRGPEQPAEPLTEEACDLCSDFSDEESVGNSRIKTAKSKASHSSKASGVPGQLTLLQCGFSKLFETNYKAVEDSNEDDASDGESSDEQPTCHFTEAVDDRIVGCQKSQNSRGPLEHQKKAGIINPNEKFIFDKSEKTLKQNISSESSGEKKFKNPIEHQNVTESEDSDVIFPTQYATQRFPKCSIRFKPPLDGSEDSETDNAVKLKNDDDTKTDVRGNGPISKKLNPESITLKSVMKRKGTSDISDESDDIEITSRSRVRKQRATSSLRLKKEKESKSKLYSFPQTTKKTNQVYTTGKGCNSLAIDEFSSSDDDLSVSHISSSRQSRRPKITKDTISFSSKLPNRNKKNTTFISRKQMKFSNERIVSQEQIHESVDKFLDGVQEVAYVHSNQNVIGSSKAENHMSRWAARDVFELKQFSQLPANVAICSSKTYQEKIKKDTSTYTKKGQQPGKGDISFPFYISYPVSQKKKKVYRTDQTTFIIGETPKRIRRKQFEEMASYFNISSVKEFAEHITNGTSEERQKILRDFYGSQYPEIKDFFVDSASKLIKSAHEKGEKIRNKSEERESLMKEELSDSETLSFKDSTKKISQICSPKLYKEKSIKLQSYDFCGEAVFSNDTETEKLPVSSTQEIDDGLKSQLSKDTVASCSPNCKSEVCERKFENTMKDQQDLTKIDISRNGPLFKSETKKIDNPTLGNISMGELLGDTSILDDLFKSHGNSLTRLPKKVLSRPMEKSKQRPKDFWDILNEQNDDSLSKLTDLAVIETLCEKVPLATSSKRKEELETSLWKSNKKFLWKKRNSSDTDENTTST	17299	139778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_17464_17972_18181_23062_23204_25466_25581_26755_26876_30426_30499_31255_31402_52756_52853_56439_56540_62959_63113_66068_66150_67444_68607_73894_74050_126578_126761_135774
899999	SIRV4	-	547	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	3	67	3	-67	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	769	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTAATCGATTGCGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5155	3704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_-_4104_5007
900000	contig_14635_pilon	+	3053	2	Intergenic	novelGene_84363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGATTTTGGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500352	618322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_500362_615278
900001	contig_1406_pilon	+	2658	4	Intergenic	novelGene_25586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	812	junction_1	57.5905084772367	2886	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	52	447	2173822	2185260	FALSE	5	TTTTAGTTTGTGGGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAASGPGARSNVTAMAGIKALISLSFGGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2173770	2187471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2173838_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
900002	contig_9554_pilon	-	2849	14	Intergenic	novelGene_170683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	288.564781524175	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	1889	2782	92401	78255	FALSE	30	TAAAATTTTTTTAGTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFLSDFEMMLQRKKSLSGKRRRNRDGGTFISDADDVVSAMIVKMNEAAEEDRQLNNQKKPALKKLTLLPTVVMHLKKQDLKETFIDSGVMSAIKEWLSPLPDRSLPALKIREELLKILQELPSVSQETLKHSGIGRAVMYLYKHPKESRSNKDMAGKLINEWSRPIFGLTSNYKGMTREEREQRDLEQMPQRRRMSSTGGQTPRRDLEKVLTGEEKALRPGDPGFCARARVPMPSNKDYVVRPKWNVEMESSRFQGTSKKGISRLDKQMRKFTDIRKKSRSAHAVKISIEGNKMPL	125674	78187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_78387_82697_82810_85714_85772_86573_86686_88386_88505_89506_89637_91069_91153_92251_92403_95716_95815_101566_101625_102124_102315_104567_105715_122817_122934_125396
900003	contig_14142_pilon	-	2082	9	Intergenic	novelGene_120520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_8	214.05066573127	9	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	14	841	355495	350546	TRUE	5	CTGTTTGGGCTTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREVGPSTGGGPGNKLLGIAPD	355508	349029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_350223_350384_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
900004	contig_16091_pilon	+	3714	7	Intergenic	novelGene_112346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	775	junction_2	87.442203133778	102	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	111	992	14294	37985	FALSE	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	12748	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912
900005	contig_9235_pilon	+	2613	3	Intergenic	novelGene_156208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	240	1388	45805	46953	TRUE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43961	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_47275_47419
900007	contig_753_pilon	+	1558	4	Intergenic	novelGene_113015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCTTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363412	1370501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1363465_1364499_1364584_1366861_1367739_1369956
900008	contig_4103_pilon	+	2033	14	Intergenic	novelGene_51898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	57.1752211815552	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	399	1721	58124	65973	FALSE	20	CACTGAAGCCTGCCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53882	66285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_54615_54777_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
900009	contig_10748_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_150749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	934	1236	165035	165337	NA	40	GTAAGTATAAAGGTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHDDDSNQVIFSLEISSFLETVRRLKREKMIKFLRVLKHKKDTIGLKRQYSGPFVATRRIRSRDCCAVPSYERLSFSLCFSFPKLALTVARDFTPDLHA	164101	166227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_164100_166200
900010	contig_9366_pilon	+	6215	18	Intergenic	novelGene_166275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	246	junction_1	203.655197445012	1859	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1264	3795	483	4277	1043825	1091027	FALSE	20	AAAGGCTGCCTTCTCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQQSQVRPPFTPALPAAPPVANSGLPCGQEAAVTHGQSYPASNQSLIQLYSDIIPEEKGKKKRTRKKKKDDDAESTKAPSTPHSDVTAPPTPSISETTSTPTVNTPSELPQQAEQESVEPAGPTTPNAAASQLCTESENKLPISDCSQGTPNQQTHANPEMDKLSVETPAKIEEVKLEQAETEQCPGRDEPKLEEETSNKVEEKTVAHPVSSAQSPPRPVGGPAAKGDAGNELLKHLLKNKKSSSLINQKPEGSFCSEGDCAKDKKLVEKQNPAEGLQTLGAQMQGGFGCGNNQLPKIDGGSETKKQRTKRVQKTGEKAAPRSKKRKKDEEEKQTMYPNTDTFTHLKQQLSLLPLMEPIIGVNFAHFLPYGSGQFNSGNRLLGSFGSATLEGVSDYYSQLIYKQNNLSNPPTPPASLPPTPPPLACQKMANGFATTEELAGKAGVLVSHEVTKPLGPKPFQLPFRPQDDLLARAIAQGPKTVDVPASLPTPPHNNQEELRIQDHCGDRDTPDSFVPSSSPESVVGTAVSRYPDLSLVKEEPPEPVPSPIIPILPSNTGKSSESRRNDIKTEPGTLFFTSPFGTSPNGPRSSLISVAITLHPTAAENISSVVAAFSDLLHVRIPNSYEVSNAPDIPSVGLVSSHRINPGLEYRQHLLLRGPPPASANPPRLASSYQLKQPNAPFPPTNNGVTGYKDSNHGIAEGSALRPQWCCHCKVVILGSGVRKSFKDLTFVSKDSRESFSRVEKDIVFCSNNCFILYSSTAQAKNSESKESVPSLSQSPVKEVSSKAFHQYSNNISTLDVHCLPQLQGRASPPASPPITFPPAFEAAKVEAKPDELKVTVKLKPRLRTIHSGFDDCRPLTKKWRGMKWKKWSIHIVIPKGTFKPPCEDEIDEFLKKLGTSLKPDPVPKDYRKCCFCHEEGDGLTDGPARLLNLDLDLWVHLNCALWSTEVYETQAGALINVELALRRGLQMKCVFCHKMGATSGCHRFRCTNIYHFTCAIKAQCMFFKDKTMLCPMHKPKGIHEQELSYFAVFRRVYVQRDEVRQIASIVQRGERDHTFRVGSLIFHTIGQLLPQQMQAFHSPKALYPVGYEASRLYWSTRYANRRCRYLCSIEEKDGHPVFVIRIVEQGHEDMILSDTSPKGVWDKILEPVACVRKKSEMLQLFPAYLKGEDLFGLTVSAVARIAESLPGVEACENYTFRYGRNPLMELPLAVNPTGCARSEPKMSTHVKRFVLRPHTLNSTSTSKSFQSTVTGELNAPYSKQFVHSKSSQYRKMKTEWKSNVYLARSRIQGLGLYAARDIEKHTMVIEYIGTIIRNEVANRKEKLYESQNRGVYMFRMDNDHVIDATLTGGPARYINHSCAPNCVAEVVTFERGHKIIISSNRRIQKGEELCYDYKFDFEDDQHKIACHCGAVNCRKWMN	1043342	1092965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1044176_1052672_1052886_1053576_1053742_1056334_1056477_1056623_1056772_1058327_1058507_1058657_1058795_1059692_1059943_1061253_1061394_1062003_1062112_1066166_1067287_1068529_1068667_1070014_1070158_1070429_1070599_1087906_1088024_1088565_1088640_1088926_1089036_1090934
900011	contig_4093_pilon	+	4211	6	Intergenic	novelGene_27608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCTCGCTGCTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38364	72519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_+_41797_45447_45543_45618_45782_46295_46430_68954_69261_72438
900012	contig_14333_pilon	+	4435	22	Intergenic	novelGene_49158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	131	junction_1	138.089195270087	391	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	819	2460	79	2538	447369	575244	FALSE	45	GAATGTTTTAATAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGASSSFGTLCFQWLLLFGLLGPVLDGARPGFQQTSRLSSYEIITPWRLTRERREAPRPYSKQVSYVIQAEGKKRIIHLEMNKDLLPKDFVVYTYNKEGALISDHPNIQNHCHYWGYVEGVSNSSVALSDCFGLRGLLHLDNTSYGIEPLQNSSRFEHIVYRMDAVHKEPLKCGVSNKDVEKETTKDEEEESPSMTQLLRRRRAVLPQTRYVELFIVVDKEKYDTMGRNQTAVREEMIRLANYLDSMYIMLNIRIVLVGLEIWTNGNLISITGGAGDVLGNFVQWREKFLITRRRHDSAQLVLKKGFGGTAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFGQITVETFASIVAHELGHNLGMNHDDGRDCFCGAKSCIMNSGASGSRNFSSCSAEDFEKLILNKGGNCLLNIPKPDEAYSAPFCGNKLVDPGEECDCGTPKECELDPCCEASTCKLQSGAECAYGDCCKNCLFLPGGTLCRGKSNECDVPEYCNGSSQFCQPDVFIQNGYPCQKNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIFGSKAKAAPRDCFIDVNSKGDRFGNCGFSGNEYKKCATGNALCGKLQCENVQGMSVFGVVPAIIQTHHRGTTCWGVDFQLGSDVPDPGMVNEGTQCGVGKICRNFQCVNASVLNYDCDIQKKCHGHGVCNSNKNCHCENGWAPPNCETKGYGGSVDSGPTYNEKNTSLRDGLLVFFFLIVPLIAFAAFVFIKRDQLQKSCFRKKRSRTSKSDDKNQANVSRQPVGDPRFVPPVSPPGEAPVYANRFPVSTYAAKQPQQFPSRPPPPQPKVSSQGNLIPARRAPAPPLYSSVT	447290	577141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_447466_470473_470572_483946_484006_487545_487625_493959_494037_495606_495803_497018_497085_499000_499073_500333_500504_503128_503211_503708_503843_518615_518788_521811_521905_522850_523047_529895_530002_535296_535481_547632_547714_547963_548070_553234_553377_556863_556952_572653_572722_575150
900014	contig_4742_pilon	-	2468	4	Intergenic	novelGene_130980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	968	1393	247753	247328	TRUE	10	GCTGGAGCGGGGCCGCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLDLSATSTAFFNSKLHSVASPTEVDKPSRFFSVLFGFVQAVSPESAAADPISSTIWSPSLDNFTVPFDSCSVFPFALISSTIILSILSEMESFCSCSSLPENLNNGLLTVLILHSIRMSFFFSSILTQVSERSGQLNS	248720	190891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_191192_201373_201642_242101_242264_246982
900015	contig_15067_pilon	-	2017	3	Intergenic	novelGene_154331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	22.5	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	90	305	93847	92867	TRUE	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPSSEPGSVADRPLLFPTVTVRAHLTGWLMTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGYVIGWGLVLCLQDPVGGSTEPLWASALSSRGSWASPPWSP	93936	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92279_92840_92941_93705
900016	contig_5817_pilon	-	1909	6	Intergenic	novelGene_169578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTTGTTTATCCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201659	33192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_33407_132290_132457_152327_152476_155000_155536_170351_170524_200985
900017	contig_3077_pilon	+	5096	2	Intergenic	novelGene_26833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	0	470	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	144	515	542028	564266	FALSE	20	GCAGAATGGGGTGAGCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAEQPNELVSAEGRNRKAVLCQRCGSRVLQPGTAVFSRRQLFLPSMRKKPALADGSNPDGDLLQEHWLVDDMFVFENVGFTKDVGNIKFLVCADCEIGPIGWHCLDDKNSFYVALERVSHQ	541884	568847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_542154_564020
900018	contig_7327_pilon	-	3052	2	Intergenic	novelGene_172121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAATTAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151487	117994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_118572_149012
900019	contig_9177_pilon	+	3734	1	Intergenic	novelGene_32789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1461402	1465136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1461400_1465100
900021	contig_17144_pilon	-	1886	9	Intergenic	novelGene_29419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1977.34780940911	8	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	215	1597	174965	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176152	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_170887_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
900022	contig_17274_pilon	+	1766	14	Intergenic	novelGene_26512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	169.016332672494	1	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	749	1438	118629	124457	FALSE	15	TACTTCATCTCACTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87819	124785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100441_114494_114558_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
900024	contig_6445_pilon	-	1672	16	Intergenic	novelGene_76952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	698.671711177717	47	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	44	1072	88578	51379	TRUE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPATNAWAPLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGQRTPPQRRSAPLSHGELF	96334	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_51269_51438_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
900025	contig_16999_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_84946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1895	2236	12751	12410	NA	55	ACAACAACATATACTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKEYSLHYGLHLNITKAKILTTGPISNIMINREKIEVVKEFMLLGSTINTHGSSSQEIKRRIALDKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVCLNQAMVFSVSSYACKSWTMNKED	14645	12037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_12000_14600
900027	contig_10951_pilon	+	5235	8	Intergenic	novelGene_61613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	164	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2269	2757	165861	169701	TRUE	35	AACACCCAATGACAGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPDSPSWTTATKECRQGYRKATSQSSQQETEHLVTRDTCFPTPTLLHPHSASSASLRPLSLGQEALASPRSHRLHSGATWILPTRTDQLPDCHLLAAGVVFFCFFRFLPYLSPPPPPFSQIPGSVCHLCFFLKGCGTLLDCEAASWPVPPPDGTPGAFCLF	34086	241372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_35328_35403_35583_45126_45766_165651_165990_169341_169954_170117_170385_170739_170994_239667
900028	contig_9668_pilon	-	3484	2	Intergenic	novelGene_58160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1030	1455	598461	598036	TRUE	40	TCTTAAGGACTATCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCEKAASPNFQQETEQPVTSDIYMLSHPPPIFTSTRPPLLPVATVSWLGSTSFSSVAWIPTACTGQLPKCHLLAVDVAFFRFFRFLPYLSPPPPPFSQIPGSVCHLCFFLKGCEMPLECETASRPVLPCWWDPGAFTCLF	599490	451853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_453563_597715
900029	contig_4857_pilon	-	2862	1	Intergenic	novelGene_48752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGCCCCTCCAACGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202012	1199150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1199200_1202000
900030	contig_14953_pilon	+	2471	2	Intergenic	novelGene_137304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGCTTGTCCTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470096	472622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_470186_470240
900031	contig_16525_pilon	+	3599	29	Intergenic	novelGene_133880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	128.777349977964	432	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	61	1662	189487	211608	TRUE	25	CATTTGGTCAAAAGTCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVNSGWYRRRTWDRSCEEQKMSDSEDSNFSEEDSERSSDGEEAEVEEERRSAAGSEKEEEPEEEEEEEEEEEYDEEEEEEDDDRPPKKPRHGGFILDEADVDDEYEDEDQWEDGAEDILEKGEFSASNIDNVVLDEDRSGARRLQNLWRDQREEELGEYYMKKYAKSSVGETVYGGSDELSDDITQQQLLPGVKDPNLWTVKCKIGEERATAISLMRKFIAYQFTDTPLQIKSVVAPEHVKGYIYVEAYKQTHVKQAIEGVGNLRLGYWNQQMVPIKEMTDVLKVVKEVANLKPKSWVRLKRGIYKDDIAQVDYVEPSQNTISLKMIPRIDYDRIKARMSLKDWFAKRKKFKRPPQRLFDAEKIRSLGGDVASDGDFLIFEGNRYSRKGFLFKSFAMSAVITEGVKPTLSELEKFEDQPEGIDLEVVTESTGKEREHNFQPGDNVEVCEGELINLQGKILSVDGNKITIMPKHEDLKDMLEFPAQELRKYFKMGDHVKVIAGRFEGDTGLIVRVEENFVILFSDLTMHELKVLPRDLQLCSETASGVDVGGPT	189174	218188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_189226_189477_189559_193299_193466_195002_195075_196106_196183_196305_196375_196476_196543_196864_196896_197223_197293_203126_203379_204739_204830_204934_205006_209617_209724_209962_210057_210339_210477_211295_211452_211533_211682_212637_212785_212868_212995_213837_213923_214270_214391_214460_214564_214645_214774_214865_214972_215450_215610_215699_215869_215975_216180_217584_217681_217767
900032	contig_13004_pilon	+	1898	8	Intergenic	novelGene_112695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	307.950300787484	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	859	1473	943766	952167	FALSE	30	CTCAAAGGATGTGACCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837738	952592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_926989_927531_927669_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951
900034	contig_5602_pilon	-	9453	60	Intergenic	novelGene_133026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_21	134.53638567032	591	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2798	8397	103	8499	690083	529571	FALSE	45	AATGTCAAGTAATATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEDGGGGAGGGGGFSLVTRGRGPSSGRGREGSTMTSIHFVVHPLPGTEDQLNDRLREVSEKLNKYNLNSHPPLNVLEQATIKQCVVGPNHAAFLLEDGRVCRIGFSVQPDRLELGKPDNNDGSKLNSNSGAGRTSRPGRTSDSPWFLSGSETLGRLAGNTLGSRWSSGVGGSGGGSSGRSSAGARDSRRQTRVIRTGRDRGSGLLGSQPQPVIPASVIPEELISQAQVVLQGKSRSVIIRELQRTNLDVNLAVNNLLSRDDEDGDDGDDTASESYLPGEDLMSLLDADIHSAHPSVIIDADAMFSEDISYFGYPSFRRSSLSRLGSSRVLLLPLERDSELLRERESVLRLRERRWLDGASFDNERGSTSKEGEPNLDKKNTPVQSPVSLGEDLQWWPDKDGTKFICIGALYSELLAVSSKGELYQWKWSESEPYRNAQNPSLHHPRATFLGLTSEKIVLLSANSIRATVATENNKVATWVDETLSSVASKLEHTAQTYSELQGERIVSLHCCALYTCAQLENNLYWWGVVPFSQRKKMLEKARAKNKKPKSSAGISSMPNITVGTQVCLRNNPLYHAGAVAFSISAGIPKVGVLMESVWNMNDSCRFQLRSPESLKSMEKASKTTEAKPENKQEPVKTEMGPPPSPASTCSDASSIASSASMPYKRRRSTPAPKEEEKVNEEQWSLREVVFVEDVKNVPVGKVLKVDGAYVAVKFPGTSSNTNCQSSSGSDADPSSLLQDCRLLRIDELQVVKTGGTPKVPDCFQRTPKKLCIPEKTEILAVNVDSKGVHAVLKTGNWVRYCIFDLATGKAEQENNFPTSSIAFLGQNERNVAIFTAGQESPIILRDGNGTIYPMAKDCMGGIRDPDWLDLPPISSLGMGVHSLINLPANSTIKKKAAIIIMAVEKQTLMQHILRCDYEACRQYLMNLEQAVVLEQNLQMLQTFISHRCDGNRNILHACVSVCFPTSNKETKEEEEAERSERNTFAERLSAVEAIANAISVVSSNGPGNRAGSSSSRSLRLREMMRRSLRAAGLGRHEAGASSSDHQDPVSPPIAPPSWVPDPPAMDPDGDIDFILAPAVGSLTTAATGTSQGPSTSTIPGPSTEPSVVESKDRKANAHFILKLLCDSVVLQPYLRELLSAKDARGMTPFMSAVSGRAYPAAITILETAQKIAKAEASSSEKEEDVFMEMVCPSGTNPDDSPLYVLCCNDTCSFTWTGAEHINQDIFECRTCGLLESLCCCTECARVCHKGHDCKLKRTSPTAYCDCWEKCKCKTLIAGQKSARLDLLYRLLTATNLVTLPNSRGEHLLLFLVQTVARQTVEHCQYRPPRIREDRNRKTANPEDSDMPDHDLEPPRFAQLALERVLQDWNALKSMIMFGSQENKDPLSASSRIGHLLPEEQVYLNQQSGTIRLDCFTHCLIVKCTADILLLDTLLGTLVKELQNKYTPGRREEAIAVTMRFLRSVARVFVILSVEMASSKKKNNFIPQPIGKCKRVFQALLPYAVEELCNVAESLIVPVRMGIARPTAPFTLASTSIDAMQGSEELFSVEPLPPRPSSDQSSSSSQSQSSYIIRNPQQRRISQSQPVRGRDEEQDDIVSADVEEVEVVEGVAGEEDHHDEQEEHGEENAEAEGQHDEHDEDGSDMELDLLAAAETESDSESNHSNQDNASGRRSVVTAATAGSEAGASSVPAFFSEDDSQSNDSSDSDSSSSQSDDIEQETFMLDEPLERTTNSSHANGAAQAPRSMQWAVRNTQHQRAASTAPSSTSTPAASSAGLIYIDPSNLRRSGTISTSAAAAAAALEASNASSYLTSASSLARAYSIVIRQISDLMGLIPKYNHLVYSQIPAAVKLTYQDAVNLQNYVEEKLIPTWNWMVSIMDSTEAQLRYGSALASAGDPGHPNHPLHASQNSARRERMTAREEASLRTLEGRRRATLLSARQGMMSARGDFLNYALSLMRSHNDEHSDVLPVLDVCSLKHVAYVFQALIYWIKAMNQQTTLDTPQLERKRTRELLELGIDNEDSEHENDDDTNQSATLNDKDEDSLPAETGQNHPFFRRSDSMTFLGCIPPNPFEVPVAEAIPLADQPHLLQPNARKEDLFGRPSQGLYSSSASSGKCLMEVTVDRNCLEVLPTKMSYAANLKNVMNMQNRQKKEGEEQNVLPEEAESSKPGPSAHDLAAQLKSSLLAEIGLTESEGPPLTSFRPQCSFMGMVISHDMLLGRWRLSLELFGRVFMEDVGAEPGSILTELGGFEVKESKFRREMEKLRNQQSRDLSLEVDRDRDLLIQQTMRQLNNHFGRRCATTPMAVHRVKVTFKDEPGEGSGVARSFYTAIAQAFLSNEKLPNLDCIQNANKGTHTSLMQRLRNRGERDREREREREMRRSSGLRAGSRRDRDRDFRRQLSIDTRPFRPASEGNPSDDPDPLPAHRQALGERLYPRVQAMQPAFASKITGMLLELSPAQLLLLLASEDSLRARVDEAMELIIAHGRENGADSILDLGLLDSSEKVQENRKRHGSSRSVVDMDLDDTDDGDDNAPLFYQPGKRGFYTPRPGKNTEARLNCFRNIGRILGLCLLQNELCPITLNRHVIKVLLGRKVNWHDFAFFDPVMYESLRQLILASQSSDADAVFSAMDLAFAIDLCKEEGGGQVELIPNGVNIPVTPQNVYEYVRKYAEHRMLVVAEQPLHAMRKGLLDVLPKNSLEDLTAEDFRLLVNGCGEVNVQMLISFTSFNDESGENAEKLLQFKRWFWSIVEKMSMTERQDLVYFWTSSPSLPASEEGFQPMPSITIRPPDDQHLPTANTCISRLYVPLYSSKQILKQKLLLAIKTKNFGFV	690568	528616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_529784_532440_532527_533905_534051_535767_535882_536791_536948_538520_538606_538832_539009_541141_541203_544245_544377_545526_545672_546195_546308_548651_548896_551216_551316_551403_551525_553165_553387_554338_554453_554548_554722_555888_555963_556444_556676_557873_558086_558257_558527_559107_559366_559845_559978_561093_561206_561806_561931_564611_564852_564972_565134_569654_569785_569872_570000_570080_570200_570298_570446_571872_571965_572457_572607_573601_573700_576731_576856_577225_577322_577772_577925_581949_582077_583029_583241_586023_586222_586473_586629_586890_587003_587099_587244_588589_588703_591628_591739_594332_594518_597782_597901_598784_598940_600296_600408_600487_600605_610159_610372_612155_612306_612901_613062_613246_613437_620308_620429_622162_622240_622705_622788_623148_623194_690021_690125_690507
900035	SIRV5	+	2398	7	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	56	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8338	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11311_12159_12214_12407_12473_13030_13110
900037	contig_233_pilon	-	2600	15	Intergenic	novelGene_14649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1534.83122285581	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	126	1616	126907	92266	TRUE	20	TCCATGGGGTGTCCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	127032	78154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92352_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105611_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
900038	contig_11259_pilon	-	5330	6	Intergenic	novelGene_144534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	186.476379201228	689	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	409	714	153679	139954	FALSE	20	TCTGATGCCCTGCTAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLKPCMQEGSGMT	156323	135337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_139990_144321_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_156095
900039	contig_13633_pilon	+	1650	12	Intergenic	novelGene_15310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	456.773141153613	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	338	1348	23703	49142	FALSE	25	CTGATTCTGTGTGATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5032	49444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21641_21849_23672_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
900040	contig_11417_pilon	+	1926	5	Intergenic	novelGene_103321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2535	junction_3	1300.96935013858	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	698	1378	567459	570703	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQVEFRV	566761	571251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597
900041	contig_1836_pilon	+	3686	6	Intergenic	novelGene_71065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_5	73.9929726392987	145	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	2082	2957	938520	955496	FALSE	35	TTAAATGTATTCTTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVHQSCSLKLCLFYFLRTKKLIIDVIRNQPGNTLTEILETPATPQQDLDHTKDMLSRAIIDSRTPEEMKHSQFMIEDAQLPLEQKKRKIQRNLRTLEQTGHVSSKDKYQDIINEIAKDIRNQRIYRKLRKAELSKLQQTLKGLNEKAAFYAEQINYYDTYIKTCLDNLNRKNTRRSIKLDGKGEPKGPKRAKPVKYTAARLHEKGVLLGIDDLQTNQFKNVMFDIISTEDVGIFEVRAKFLGVEMEKVQLNIQDLLQLQYEGVAVMKMFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK	936438	956225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_938661_940486_940700_942383_942545_944469_944608_949744_949854_955382
900042	contig_5945_pilon	-	1308	6	Intergenic	novelGene_104568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	282.910869356411	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	125	565	235632	219523	TRUE	15	TATATGACTGTGCCTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLEKNQKNPLVMKKRKTVMMMLNPLLNLDLCLWKQCSLQCVNARLCIQILRMKIQMITMEKSMMWKHMGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	235756	215592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224530_225669_225778_226448_226536_235617
900043	contig_9366_pilon	-	3758	4	Intergenic	novelGene_166224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1650	2108	358820	358362	FALSE	35	TGAGACTAAAGGGGCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIPITFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLALPDPRTYYTAKVFKTAWYWYNNRHTDQRNGIENPDVNTSTYGHLIFDKSPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWMSLCKKRNRTHTSHHTQKLIQNGSNT	583605	356711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_358954_384423_385064_582642_583024_583110
900044	contig_16322_pilon	-	1441	6	Intergenic	novelGene_87512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	507.55074623135	8	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	293	706	37060	32956	TRUE	55	TATAAGTTAAATAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57626	31709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57371
900045	contig_12635_pilon	-	1218	10	Intergenic	novelGene_60811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	461.103935687143	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	188	1201	227344	180251	FALSE	10	CCTTTTGTTATTTGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGDRKRAREFIDSDFSESKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	262795	180233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_206834_206998_217982_218031_219680_219803_227341_227446_262709
900046	contig_5623_pilon	-	2342	13	Intergenic	novelGene_154834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	335.407919140592	12	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	200	1651	220970	207631	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	275938	206939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211572_218287_218450_220829_221000_239340_239459_275886
900047	contig_12410_pilon	+	3285	3	Intergenic	novelGene_167265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAATAGAAAATCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38211	138490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_38506_123668_123697_135527
900048	contig_10855_pilon	+	4458	5	Intergenic	novelGene_124382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	3798	4391	988307	1029919	FALSE	30	GCAGTTGTAATAGTATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETQKLALEHRVPKAKERNDEVKELNRRFKRVARENQIKYYNDMCKHLEVENQKGRTLLAFIKLKELKNKFKPRVSILKNSMGKILNDAGSIKRRWKEYIESLYQKKKLVDVQPFQEVAHNQEPMVLKEEVQAALKTLAKNKAPGIDRIPIEIFQQMDASLEVFIRLCQEIWKRVTWPTDWKTSIFMPIPKKGSN	796399	1029986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_798321_900862_902265_987832_988508_1009917_1010212_1029820
900049	contig_3627_pilon	+	2745	5	Intergenic	novelGene_78422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	27.0774352552083	152	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2472	273	2744	212743	219398	FALSE	30	TAAGTATTTGCTATTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYGRCGHGEEQRLELNPHPLKNVTRNEESMTGIEIEKWTQNKKSHLTDHVKGAFSATVTEAEKVKNSEDDRKKFPLTNLLEPQKLFAQTVRNGIKNVHYLPTETNVSFKKFNIEEFGKALENNSYKFLKDTANHNNAMSSIATSASCDHLKGGSNVFVFQKPGFNSKSVPDPTNFNLSSHTGTYNESDQSKTPENIPFKEPKDGSPLQPSLLSLMKGRGLTFEQLVAIEALTQLSEAPSENSSPSKSEKDEETEERTADLLNSCKALLYSVRKDFQDPNSQGEPQSLPHSPPLEKQRSCNMVVFNGQNTISKSHNSTATNQAPTKSQEYSKVANSISLFVPNSNSSKIDTSKNVAQGRITLDSYSKNLHQLPPSSNKLGYRNQLLDSSKKLDSKDDPSCQDTAHSQIEEDVATQLTQLASIIKFNYTKPEDRRGEGIPTSLSAQNAQQKYSQEKSIIQQKPPSSVHSNHGSSLTKQKNISQKKTKSTPPRDRRKKKPAVISCEENDPKKQEQLSHEYNKLHDIWMGSKFQNFGHFVPRRFPIFLGKISPLTKVRKPLTQTSSALQHKKFFPPLAQIKFERYCPELAQEKVVKVDSLDSFSLSQLKTESNGQAFTDKAYSSQVQPTGNVNQKAHPLPQPSSPPNQCANLMAGDDQTRIQQDVKEQLVHQRQPTLPGISHERPLSDPGQILRNVNVVCSGGITVVSTKSEEDVCSSSVGASELSPGDSVQKSFNDYAMSYFTNPTKNLVSTTKDSDLPTCSCVDRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVREIMETRYGQKGNAIRIEIVVYTGKEGKSSHGCPIAKW	171352	219399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_171526_172054_172109_212697_215030_218667_218759_219304
900050	contig_16594_pilon	-	3154	2	Intergenic	novelGene_53914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	643	junction_1	0	493	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACACAGTTTTATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335682	270614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_273670_335583
900051	contig_2455_pilon	+	1899	2	Intergenic	novelGene_119199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	803417	805967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_804066_804716
900052	contig_6661_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_174114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1469	1849	409185	409565	NA	40	CCCATACAATTCAGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIRKQRLILGKIFAKGHIRYSQFRSVPYTIPLYPPAFLINPSTSLFCMFFLERRHTSTKWAKDKQQTWQGSIAILALTVTRTLRKLPDAKSGWELLREFPWQHPDPVAKNSSFPMQNSSSSQLW	407716	409890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6661_pilon_+_407700_409900
900053	contig_11896_pilon	-	7697	3	Intergenic	novelGene_88001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	766	68	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	134	1516	141903	138166	FALSE	30	CATGAACACATGTGCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNKLWRSHSDSDLSDHHEPICKPGLELNKKEITTSADQIAEVKTMESHPPIPPVFVEHVVPQDTNQKGLCTKERMICLEFTSREFHAGQIEDELNLNDINGCSSGCCLNESKFPLDNCHASKALIQPGQAPEMANEFPDLTVEDLETDALKADMNVHLLPMEELTSRLKDLPMSPDPESPSPQPSCQAEVSDFSTDRIDFFSALEKFVELSQETRSQSFSHSRMEELSGGRSESCRLSVVEVAPSEVTADDQRSSSLSNTPHASEESSIDEEQSKAISELVSPDIFMQSHSENAISVKEIITEIESISQGVGQIQLKGDVLPNPCHTPKKNTIHELPIERAQALENKPGNLEQNKGSCAAQPELAKDSGKWDPEGCLTTCSFTADLEEEEPAEGEQELRSPEMHPGAKWCPGSVRRATLEFEERLRQEQEHHGAAPVCTSLSTRKNSKNDSLVADLAPKGKSDEATLEHSVVPKESEMSKDKGGLCFHARGLRLRQSLFPFPRG	142036	131984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_138233_138389_139013_141210
900054	contig_5718_pilon	+	2113	7	Intergenic	novelGene_110328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_5	85.5777748925243	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	411	1643	544517	713958	FALSE	40	AGCTAGTCAGGAAAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDSIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQRKPRILFSPFFHPGNSVHTQPEVVLHQNHEEDNCVQRTPRPSVENVHHNPPTIELLHRSRSPITTNHRPSPDPEQRPIRSPLDNMIRRLSPAERAQGPRLHQENNHQESYPLSVSPMENNHCPPSSESHQKPSSPRQESTRVIQLMPSPIMHPLILNPRHSMDFKQSRLSEDGLHREGKPINLSHREDLAYMNHIMVSVSPPEEHAMPIGRIADCRLLWDYVYQLLSDSRYENFIRWEDKESKIFRIVDPNGLARLWGNHKNRTNMTYEKMSRALRHYYKLNIIRKEPGQRLLFRFMKTPDEIMSGRTDRLEHLESQELDEQIYQEDEC	544106	714428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_544554_651532_651698_669623_669759_692101_692648_708547_708691_710010_710112_713852
900055	contig_7138_pilon	+	2238	2	Intergenic	novelGene_121006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAACAATATGGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717654	719993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_718435_718535
900056	contig_12479_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_56879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521807	518932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_518900_521800
900057	contig_3009_pilon	-	2592	2	Intergenic	novelGene_132506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAGGCTTTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54075	41865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_42459_52076
900058	contig_12919_pilon	+	2845	4	Intergenic	novelGene_75912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	148.867577247551	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	78	302	821938	840942	FALSE	20	TCACTTATGCTCCATGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGLRAGYRARPGRGFPVLCWPKRGIMAANENQKHSVLDLCDRLLTDERNQTSIIDKIAKPSPGADALNLDLVAYWTERMNFSMLKPSTPGVSVGAALDD	807077	843485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_807149_821931_822013_822806_822830_840815
900059	contig_10437_pilon	+	2235	10	Intergenic	novelGene_38196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	493.439803325768	2	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	94	945	229668	232058	TRUE	20	GTGACTTCCTCACAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARPRGPQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFW	225679	233541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232318_232510
900060	contig_9183_pilon	+	3938	2	Intergenic	novelGene_40278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	267	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	2868	3362	304769	305263	TRUE	35	CAATTCCAAATCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGYGEIGTLMHCCWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITPIDICTLMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMDYYATRKNNNESAKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKEKYCMRPLP	301901	425287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_305328_424775
900061	contig_10140_pilon	-	3149	9	Intergenic	novelGene_148407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_1	172.459234313504	200	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	210	1085	242182	225866	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSVIGSTSRDRNSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHQQDYNDGRKTFPRARRNQGTSFRSTVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGK	245553	223801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_226004_231195_231328_231634_231784_237110_237318_238205_238299_238478_238547_239767_239848_242173_242305_245466
900062	contig_11590_pilon	-	3945	1	Intergenic	novelGene_125578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAGCTGCAGAAGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434384	430439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_430400_434400
900063	contig_10953_pilon	+	2079	9	Intergenic	novelGene_42536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	123.913023932111	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	518	1123	184911	188559	FALSE	35	TTTTGTTTTTAAATAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGRSQAARGKEKEKDGTTDSGIKLEPVPGLPGALPPPPAAEEEASANYFNLPPSGPPAVVNIALPPPPGIAPPPPPGFGPHMFHPMGPPPPFMRAPGPIHYPSQDPQRMGAHAGKHSSP	179503	189515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_179609_180035_180102_181995_182129_183136_183238_184798_185000_185947_186113_187038_187128_187328_187461_188428
900064	contig_6102_pilon	-	4576	27	Intergenic	novelGene_32283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	302.094632788739	519	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1016	3051	65	3115	1580397	1467555	TRUE	15	GAGTCAGCGCTGCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSLWKQTATSFSCGVADLFLMCDAIPALDSWRLNIYSGVHRGYCILLKMSNSNATQETLEIMKESEKKLVEESVNKNKLISKASSKEEIEKEGEDISLRQESQRRTSNHGHARKRAKSNSKLKLVRSLAVCEESSTPFADGPLETQDIIQLHISCPSDKEEEKSTKDVSEKEDKEKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRDRMMLLKLEQEILDFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQIRVPLQDGRRSKSIEEREEEYQRVRERIFARETGQNGYLNDIRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCHQVTSSQSIRGLLPCTAQQQQQQQQLPALPPTPQQQQPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSAEAADPSSALFQPPLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSSYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHSVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLSNQRSSLGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGNDSQNVVQPPFQQPMLVPASQSVQGGLPAGGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQFQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVVVMQLNVPNGPQAPQNPSMVQWSHCKYYSVDHRGQKPGDLYNPESSPQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSNVCTGLSPLPVLTQFPRPGGTAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPSGGGGDNGGTAENGRHADLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRVAKKNYDLRILERASSQ	1626163	1454117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1454138_1457953_1458099_1462012_1462055_1466300_1467896_1468791_1468877_1469246_1469345_1470544_1470693_1471105_1471276_1476418_1476520_1477699_1477855_1478313_1478475_1478715_1478843_1479142_1479386_1487616_1487784_1489610_1489844_1494350_1494383_1497284_1497381_1500130_1500240_1500663_1500805_1501393_1501454_1502108_1502188_1503077_1503205_1503732_1503820_1505750_1505793_1510400_1510598_1580345_1580409_1626110
900065	contig_15491_pilon	-	2254	7	Intergenic	novelGene_75934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	446.810797641338	15	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	54	797	46982	32303	TRUE	10	TCTTTGGCCTCCTAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47035	30743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32063_32164_32436_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
900066	contig_6102_pilon	-	1895	15	Intergenic	novelGene_32341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	332.960928025852	1	62	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	452	1669	1690301	1685481	FALSE	25	AGCAAGGCTTTCTGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691585	1685254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1691159_1691386_1691492
900067	contig_11602_pilon	+	2730	2	Intergenic	novelGene_166578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_1	0	287	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAAGAGAAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44733	53273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_45021_50830
900068	contig_10904_pilon	+	2159	4	Intergenic	novelGene_22464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	120	1088	149100	150068	TRUE	15	TTTGGGAGGAGGGAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143926	151282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150326_150468
900070	contig_13707_pilon	-	3715	39	Intergenic	novelGene_43512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_33	248.638519890638	125	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	885	3191	156522	117289	TRUE	30	CAAACTTGACTTGTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVVEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLANEHDHLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALTNEQAAAAHELEKMQKSVHVKDDKIRLLEEQLQCKISKKMEEFKILNDQNKSLKLEVQRLQTLVSEQPSKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEDELKALRTENSSLTKEVRDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIEALKEEIGNIQLEKAQQLSIASQVQELQNLLKGKEEQMNTIKAVLEEKEQDLANRGKWLQDLQEENKSLKAHVQEAAQHKLNEACSASRFKELETVLKEKENEMKKVEAMLKERESDLSSKTKLLQEVQDENKLFKSQIEQLKHQNYQQVLSFPPHEELLKVISEREREIIDLQSELDSLKDAVEHQRKKNNERQQHLEAVELEAKEVLKKLFPKVSVSSDLSYSEWLRGFEKKAKECMAETSGSEEVKILEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKDDESQKTIKQMQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESSSEKETVSVSLNQTITQLQQLLQAVNQQLTKE	181991	108254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_108760_117269_117388_119119_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906_125000_125128_125219_126019_126101_127930_128021_133608_133700_135226_135265_136413_136483_138446_138538_140267_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_143308_143971_144010_145177_145247_145940_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152162_152693_152763_153125_153217_154405_154441_155990_156060_156456_156665_159262_159372_160632_160766_169938_170046_172845_172987_174886_175004_181856
900071	contig_4315_pilon	+	4311	3	Intergenic	novelGene_46710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1350	1940	1350	1940	TRUE	35	GAGACTATCAAGGCATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	0	280862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_2060_118682_118960_278887
900072	contig_10734_pilon	-	3842	7	Intergenic	novelGene_50983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	68.8371669634621	45	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	356	1033	294586	292792	TRUE	30	CTACTCACAAGACCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESYVKFLAINQKCPLQEMRLQKNTADLLPELKAMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYVKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLKMPKMPELKGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKVREKQRQKVLEQKRKERTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKREKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKFKKGKITEEEFEKGLLTSGRRTIKTDFRISDLENDC	294941	287771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_288725_289708_289783_290298_290430_291140_292966_293236_293530_293959_294129_294544
900073	contig_19096_pilon	-	2560	2	Intergenic	novelGene_173098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	248	junction_1	0	827	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	2157	2558	12826	12425	FALSE	10	ATTCCTCCATTTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRHLPSRSTLPPSIPCIVPQKTGLGGPELQKVSGWVWSMECAGRRLEEGRRVKRGYFFLYLPPFEAMGWLYPSNEGSYSFLQVFGNLSPLCLSQAWRMLTALHIATPTVHHHPCCFTPKCLHFCNKHFNKLT	15992	12422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_14884_15893
900074	contig_20527_pilon	-	2251	7	Intergenic	novelGene_138557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGATTCTGCTTAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37343	12814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308_27471_36171_36243_36519
900075	contig_3018_pilon	+	1733	2	Intergenic	novelGene_78927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGGTATTCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634105	638295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_634635_637091
900076	contig_10437_pilon	+	4238	6	Intergenic	novelGene_38259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_5	152.693680288347	82	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	60	476	397110	399014	TRUE	30	ATTAACATATATTTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLKVLLLPMVSFAVYPEEILDTQWELWKKTYRKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLEASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRVPPSDSRDNDTLYIPDWEGRAPDSIDYRKKGYVTPVRNQVPSIL	396544	408277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_396603_397108_397230_398632_398756_398840_401557_405379_405923_407600
900077	contig_12624_pilon	+	4512	11	Intergenic	novelGene_60965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	382.374959954231	431	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	627	1325	39740	55160	FALSE	45	GGGACCATAACAATGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6216	58347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6268_8278_8344_11632_11708_38761_38820_39362_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
900078	contig_2438_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_112011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2465.96110826996	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	147	488	310652	312871	FALSE	10	TTTGGATGGACTCTGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310661_311994_312083_312305_312409_312729
900079	contig_14744_pilon	+	3131	24	Intergenic	novelGene_66142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_10	256.420923446384	260	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	972	2919	9	2927	1626203	1689166	FALSE	15	CATGTGGGTTTTACCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRGHVQDPNDRRLRPIYDYLDNGNNKMAIQQADKLLKKHKDLHCAKVLKAIGLQRTGKQEEAFTLAQEVAALEPTDDNSLQALTILYREMHRPELVTKLYEAAVKKVPNSEEYHSHLFMAYARVGEYKKMQQAGMALYKIVPKNPYYFWSVMSLIMQSISAQDENLSKMMFLPLAERMVEKMVKEDKIEAEAEVELYYMILERLGKYQEALDVIRGKLGEKLTSEIQSRENKCMAMYKKLSRWPECNALSRRLLLKNSDDWQFYLTYFDSVFRLIEEAWTPPAEGEHSLEGEVHYSTEEAVKFIEDRITEESKSSRHLRGPHLAKLELIRRLRRQGCNDEYKLGDPEELMFQYFKKFGDKPCCFTDLKVFVDLLPATQCTKFINQLLGVVPLSTPTEDKLALPADIKALQQHLCVVQLTRLLGLYHTMDKSQKFNVVRELMLRYQHGLEFGKSCLKTELQFSDYYCLLAVHVLIDIWRETGDETAVWQALTLLEEGLTHSPSNAQFKLLLVRIYCTLGAFEPVVDLYSSLDAKHIQHDTIGYLLTRYAESLGQYAAASQSCNFALRFFHSNQKDTSEYIIQAYKYGAFEKIPEFIAFRNRLNNSLHFAQVRTERMLLDLLLEANISTSLAESIKSMNLRPEEDDIPWEDLRDNRDLNVFFSWDPKDRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLEDTTEIQERIENSLKSLLEQLKDVFSKCKGDLLEVKDGSLKTHPTLLENLVFFVETISIILWVSSYCESVLRPYKLNLQKKKKKKKETSIIMPPVFTSFQDYVTGLQTLISNVVDHIKGLETHLIAFKLEELILEDTSFSPEERKFSKTVQGKVQNSYLHSLLEIGELLKKRLETTKKIKI	1626194	1689370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626261_1636644_1636731_1637172_1637312_1639735_1639855_1643389_1643465_1644572_1644681_1645031_1645111_1647616_1647729_1648307_1648398_1649657_1649828_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324_1685472_1689043
900080	contig_3281_pilon	-	2432	2	Intergenic	novelGene_128518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAACAGTCTGGGTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14611	9983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_-_10613_12808
900081	contig_16103_pilon	+	2808	21	Intergenic	novelGene_118922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_18	360.352726505573	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	164	2449	777876	799882	FALSE	0	CTCTGGCGTTCTTTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSEPDPDSPHHAADIPESGAASWLQLHQPAILHRGPGPPQHLPVWACCVSCGSYLFQAAWCECQCERISHSFPAAEWIWVSWIQHWKKISTPLQAFLDG	776866	800241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797772_797917_798357_798464_799839
900082	contig_12414_pilon	+	4685	1	Intergenic	novelGene_59620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTTAGGAACCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539227	543912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_539200_543900
900083	contig_7045_pilon	-	4211	1	Intergenic	novelGene_77468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	3023	3376	380901	380548	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFGPNPPEVKENEEHQSHKESRSPTDRKGHINQRLHQPETRRTKWCRATTNDRPDREHNRQSLMEQEKTGVQNSNSSKKTRLNSAAETGQPQKAWPPDCQPRTKNHSQGQFFRQD	383923	379712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_379700_383900
900084	contig_16411_pilon	+	6062	1	Intergenic	novelGene_77375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1493	1855	331242	331604	NA	35	CCAAACTTCCCGCCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFRDWFLLVTCPKYVRRNLTIFVSKEHSGCTASKTDLFILLAVHGIFNILCQHRNSKASILLQSSLFIVQLSHAYEAIKNTMAWVRPTLVFKVTSLLFNTLKRAFAEDLPNAIRHLIS	329749	335811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_329700_335800
900086	contig_16492_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_100291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2034	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTCAAGAAAAAATAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129578	132186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_129600_132200
900087	contig_12078_pilon	-	3626	22	Intergenic	novelGene_74105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	238.848152409218	442	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	275	2845	786304	244384	FALSE	30	TGGGCTGTAAATCTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLKNSKHECTLSSQEYVHELRSGISDEKLLNCLESLRVSLTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDVLEKLLDKKQQEHIDKKNQYKLIQCLKAFMNNKFGLQRILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIVGEENILDKLLGAITTAAERNNRERFSPIVEGLENHEALQLQVACMQFINALVTSPYELDFRIHLRNEFLRSGLKRMLPDLKEKENDELDIQLKVFDENKEDDLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAENYLLSILQHFLLIRNDYYVRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDFTHLIDSCVNKAKVEESEQKAVEFSKKFDEEFTARQQAQAELQKREEKIKELETEIQQLRTQGHALSGSSGISVPPPPPLLSVGPPPPPPPPPLPLAGGNPPPPPPPPPLIGMNGIPPPPLSAGPPLPPPLGGVPPLPGAPLDLPFGMKQKKIYKPEVSMKRINWSKIEPRELSENCFWLKVKEDKFENPDLFAKLALNFATQIKVQKNVEASEDKKITPAKKRVKELRILDPKTAQNLSIFLGSYRMPYEDIKNIILEVNEGMLSEALIQNLVKHLPEQKVLNELAELKNEYDDLCEPEQFGVVMSSVKMLRPRLNSILFKLTFEEHVNNIKPSIIAVTLACEELKKSESFNKLLELILLVGNYMNSGSRNAQSLGFKINFLCKIRDTKSSDQKTTLLHFLAEICEEKYPDILKFPEELEHVESASKVSAQILKSNLTAMEQQIIHLERDIEKFPQTEDQHDKFVEKMTIFTKIARDQYDKLFTMHSNMIKLYENLGEYFIFDSNTVSIEEFFGDLSNFRTLFLEAVKEINKRREMEEKTRRAKLAKEKAEQEKLERQKKKKQLIDINKEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRIPRNPGKTHSSSHRIIYECSDNI	818540	243602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_244536_290430_290567_327724_327888_432936_433064_534549_534680_566421_566662_580910_581013_608420_608516_610329_610432_741435_741551_743143_743459_748638_748744_754024_754090_757619_757739_760281_760399_762347_762467_768122_768234_780880_780990_782815_782953_786292_786363_786443_786519_818399
900088	contig_6325_pilon	-	3833	2	Intergenic	novelGene_143369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	944	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTTTGACCTGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428983	424344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_425453_426258
900089	contig_17212_pilon	-	2516	2	Intergenic	novelGene_88620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1524	1871	138525	137638	FALSE	20	TCTGGACTCTTAATCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIHGINTIRTISNNAQAPEERLDKWECLKIKHLCSSKDFTERVKKQPTDWEKIFGYDKSDQCLISEIYKILQNLSNKKTNNQLKDGQSEFNQSQKDKYYIRPLL	140048	136992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_137690_138229
900090	contig_5988_pilon	+	2984	11	Intergenic	novelGene_16076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1714.38410223614	112	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	84	656	1218380	1222035	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGKYGLESRERVSPLAKILTRRMALMGLLYFSLASLKTAFRPLLQVS	1209860	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221876_1221955_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225520_1225623
900091	contig_20641_pilon	-	3137	6	Intergenic	novelGene_52840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	454	783	56705	56376	TRUE	30	TGCAAAGCGAAGAGGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTA	57158	14541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832
900092	contig_5423_pilon	-	4025	1	Intergenic	novelGene_85175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTTTCTTTGTACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115723	111698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_111700_115700
900093	contig_8254_pilon	+	2114	2	Intergenic	novelGene_48395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	486	junction_1	0	30	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1096	1524	107542	109211	FALSE	35	TTCATGAATACAGGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	106446	109801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_107756_108996
900094	contig_11026_pilon	-	7330	2	Intergenic	novelGene_167680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_1	0	535	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	32	541	262870	260959	FALSE	10	TGTCCTGCTGTTGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKFTRAYSLKMHRLKHEGKRCFRCQICSATFTSFGEYKHHMRVSRHIIRKPRIYECKTCGAMFTNSGNLIVHLRSLNHEASELANYFQSSDFLVPDYLNQEQEETLVQYDLGEHGFESNSSVQMPVISQVSSTQNCESTFPLGPLGRLAEKEDEMPEQPKSSACTEAARDDPPKSERLL	262901	254169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_261230_262631
900095	contig_13021_pilon	-	1937	10	Intergenic	novelGene_8232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_6	462.646973644292	1	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	877	1338	213104	206041	FALSE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISIETKQIKNLCHAWNQGSMFPQPKMVPTPRSYITLPPHSRRWHQESMKPVTITKLTITKLTTYILTSSEIERYKLHLRIFLQSEDQKTTTATGNIAASATSASCPETGDLTVECRALPLQTSACQPQLPPRFYSPNSSTHIQLVEDKPHP	231863	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_215421_215506_218018_218304_231351_231421_231599
900096	contig_12528_pilon	-	2508	9	Intergenic	novelGene_81309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	601.090051489791	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	521	967	966228	956077	TRUE	35	AAATTCAACTAGCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVSLGKKRGSAIPFLLSSVSVPLNPGYMEVSLVMLTLPQERTSGWRG	968131	932020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956213_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
900097	contig_7728_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_64720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	231	608	748528	748151	NA	45	GCGGACAAATTCACGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPSLHTVLLPELSSLDLQNILSTILVFHTALLQIEGLTSQQMKCSNGPMLMEFTVLTMSPYHPEAAVLIERWNGLLKTQLWHQLGDNTLHGWGNVLQEAVYALNQCPVCSAVFPIARIHGSWN	748758	746239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_746200_748800
900099	contig_6227_pilon	+	3987	1	Intergenic	novelGene_49614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	3321	3857	3325	3861	NA	35	TCTGAACTGAAATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYPRLLVSDRSPRWWIRAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	4	3991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_0_4000
900100	SIRV6	+	936	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	581	11	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	17	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	AAATTTACACATATGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
900101	contig_12624_pilon	+	2310	12	Intergenic	novelGene_60942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_5	306.646915162231	262	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	90	1052	11640	55160	FALSE	35	ACATGCCATTCCTGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6012	56418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
900102	contig_9109_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_175305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	105.5	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	95	1009	20698	17171	FALSE	10	CCTCAGTCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVTGADVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYREVMTETFRNLASVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19016_20664
900103	contig_1143_pilon	-	2222	10	Intergenic	novelGene_86609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_9	121.897143445804	179	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	184	870	249983	232022	TRUE	50	TATAGAGTAAGACAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKYVTFSLLPDMYFKCWL	295039	228463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_228967_229069_229195_231297_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_254862_254932_294929
900104	contig_6102_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_32166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_5	368.087272260262	40	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTGTCCTTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867401	839081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_847094_867237
900105	contig_14882_pilon	+	3695	4	Intergenic	novelGene_115003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	712	junction_3	30.4302481094059	537	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	185	871	254553	264587	FALSE	50	AAAACTGAGCCAAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKIWLPFPVLLLAAVPPLLLPGAASFTPSLDSDFTFTLPAGQKECFYQPMPLKASLEIEYQVLDGAGLDIDFHLASPDGKTLVLEQRKSDGVHTVETEVGDYMFCFDNTFSTISEKVIFFELILDNMGEQEQEQDWKKYITGTDMLDMKLEDILESINSIKSRLSKSGHIQTLLRAFEARDRNIQESNFDRVNFWSIVNLVVMVVVSAIQVYMLKSLFEDKRKSRT	254368	267411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_254742_257635_257734_261708_261890_264368
900106	contig_4211_pilon	+	1286	2	Intergenic	novelGene_80248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	557	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACCAGATAGCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144679	1147189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_+_1144746_1145969
900107	contig_9720_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_116801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAACAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452930	454643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_452900_454600
900108	contig_13740_pilon	-	1573	10	Intergenic	novelGene_34712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2028	junction_1	3014.66393106826	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	862	1347	160838	157474	TRUE	70	TTGTAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165409	157094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919_162031_165237
900109	contig_13780_pilon	-	2215	14	Intergenic	novelGene_149081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1673.92705191951	26	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	268	2082	702195	657588	FALSE	15	CGCCCGGGAGCGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTSHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSVASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	727630	657454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438
900110	contig_405_pilon	+	6378	6	Intergenic	novelGene_135329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	454	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAATTTCTTTGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602839	617147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_607885_608721_608879_611871_612059_613938_614048_615405_615478_616339
900111	contig_8357_pilon	+	5578	3	Intergenic	novelGene_39766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTTAAAAGCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883667	889632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_887177_887255_887408_887715
900112	contig_11677_pilon	+	3871	14	Intergenic	novelGene_85887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	220	junction_13	152.857128636999	501	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	199	2946	425868	443552	FALSE	20	CAAATTATGTTTTCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALLAPPKTDEAEKRSRKPEKEPRRSGRATNHDSCDSCKEGGDLLCCDHCPAAFHLQCCNPPLSEEMLPPGEWMCHRCTVRRKKREQKKELGHVNGLVDKSGKRTTSPSSDTDLLDRSASKTELKAIAHARILERRASRPGTPTSNASTETPTSEQNDVDEDIIDVDEEPVAAEPDYVQPQLRRPFELLIAAAMERNPTQFQLPNELTCTTALPGSSKRRRKEETTGKNVKKTQHELDHNGLVPLPVKVCFTCNRSCRVAPLIQCDYCPLLFHMDCLEPPLTAMPLGRWMCPNHIEHVVLNQKNMTLSNRCQVFDRFQDTISQHVVKVDFLNRIHKKHPPNRRVLQSVKRRSLKVPDAIKSQYQFPPPLIASAAIRDGELICNGIPEESQTHLLNSEHLATQAEQQEWLCSVVALQCSILKHLSAKQMPSHWDSEQTEKADIKPVIVTDSSITTSLQTADKAPTPSHYPLSCPSGINTQNSLSCSPPYQPPALEDISCSSCAEKSKKASCGTANGPVNTEVKVNGPHLYSSPTDSTDPRRLPGTNTPLPGLSHRQGWPRPLTPPAAGGLQNHTVGIIVKTENATGPSSCPQRSLVPVPSLPPSIPSSCTSIENTSTLQRKTVQSQIGPPLTDSRPLGSPPNATRVLTPPQATGDGILATGANQRFCSPAPSSDGKVSPGTLSIGSALTVPSFPANSTAMVDLTNSLRAFMDVNGEIEINMLDEKLIKFLALQRIHQLFPSRLQASPGSVGTHPLASGGHHTEVQRKEIQARAVFYPLLGLGGAVNMCYRTLYIGTGADMDVCLTNYGHCNYVSGKHACIFYDENTKHYELLNYSEHGTTVDNVLYSCDFSEKTPPTPPSSIVAKVQSVIRRHRHQKQNEEPPSEETAMMSSQAQGPHRKPCNCKASSSSLIGGSGAGWEGTALLHHGSYIKLGCLQFVFSITEFATKQPKGDAGLLQDGVLAEKLSLKPHQGPVLRSNSIP	406187	444477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_406364_425845_425919_428635_429030_430423_430545_431754_431888_433662_433828_436563_436723_437280_438077_439298_439425_440168_440313_441225_441325_442077_442161_442759_442899_443214
900113	contig_16578_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_148621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	8	355	90021	90368	NA	20	AGCTTGTAGTTGATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALMSFFWDLSYMGSIELLGWPAFHLFMILGKFSVSSSSMILSVFSFFSPCSETPVTPKFLLLIVSQIILMVPSFFFILFSDFFLKQSCIQVFVLNFTDPVLYHFKPAPQPFYDTVHF	90013	92560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_90000_92600
900114	contig_12837_pilon	-	6237	7	Intergenic	novelGene_57315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	5367	5759	159366	129550	FALSE	20	AGGCGCGAGGACGCGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCQKEYTALIWAVILSHNCGLPMKHIIPNWTCRTLCWRVTGQITKFLINPFQRHSLCFSSGSALSRCALKGPAKTLDYPDGGEGLSLRLTPALPDTGAFCKNGADQHSHGPRRDPDESKSLKTVAVRAG	171133	129071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_129800_153827_153894_153981_154012_159319_159398_161385_161488_163865_163967_166001
900115	contig_11855_pilon	-	2630	3	Intergenic	novelGene_66917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	703	1053	811504	811154	TRUE	25	CCCTTGAATGAGCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEGVQNKTPDDLPVEEKALDLIDREFKSLIFRIIQGFKQKADKNEEKIDKFIEKADKFMEIQTINERIQENNTGTKCQNKFTSKKHTKTTIRNPKDKQQDFRNGQCHRRAKEQV	812756	807791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_809038_810822_812041_812590
900116	contig_3386_pilon	+	3226	4	Intergenic	novelGene_34549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	292	junction_1	569.998830408157	1440	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	328	660	476337	486630	FALSE	30	TACCCCAGCAGTAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVKTTSSTYQMQKYLRTLKLLTYRKLMLLI	470046	489196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417
900117	contig_10263_pilon	+	3411	1	Intergenic	novelGene_135841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACAAAACAAGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877584	880995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_877600_881000
900118	contig_9468_pilon	-	2745	2	Intergenic	novelGene_59519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGATGGTAGCTATCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476040	472623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_474144_474815
900119	contig_20641_pilon	+	1793	3	Intergenic	novelGene_52882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	2	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGGAAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71276	86673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_71525_73084_73243_85286
900120	contig_7542_pilon	-	3739	5	Intergenic	novelGene_178752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3179	3541	890	528	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILFIFWISNCCFCIISRCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFCMNLSIFFSCLSAVCLSSWKIPSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWMPTGTILSCFCKCFDVVCCFRGIQ	53240	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7542_pilon_-_157_485_2380_18331_19195_25356_25737_52794
900121	contig_177_pilon	-	2465	2	Intergenic	novelGene_41845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3083	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATCCTGGCCTGTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420204	417658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_418392_418472
900122	contig_8377_pilon	-	6498	1	Intergenic	novelGene_35046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	443	742	89368	89069	NA	5	GTTCTTATTTCCCTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIIHSIHCLNLSPHNTSKVIRLSLAACQSCYQNISHLDQPIHTKEAESLIWYRVISKSYRDLFIHAFNYLFNKYMFKGSSVMSGTADTKVNKEKCLP	89810	83312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_83300_89800
900123	contig_9937_pilon	-	4210	22	Intergenic	novelGene_129191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_11	153.601259561162	440	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	114	3374	117901	14456	FALSE	20	CACAGTGATGTGGCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANLLKTVVTGCSCSLFNNLGSCKVLPGKKSFLRTFHTHQVLWCKAPVKPGIPYKQLTVGVPKEIFQNEKRVALSPAGVQALIKQGFNVVVESGAGEASKFSDDHYRAAGAQIQGTKEVLASDLVVKVRAPMVNPTLGVHEADLLKTSGTLISFIYPAQNPDLLSKLSERKTTVLAMDQIPRVTIAQGYDALSSMANIAGYKAVVLAANHFGRFFTGQITAAGKVPPAKILIVGGGVAGLASAGAAKSMGAVVRGFDTRAAALEQFRSLGAEPLEVDLKESGEGQGGYAKEMSKEFIEAEMKLFAEQCKEVDILISTALIPGKKAPVLFRKEMIESMKEGSVVVDLAAEAGGNFETTKPGELYVHKGITHIGYTDLPSRMATQASTLYSNNITKLLKAISPDKDHFYFEVKDDIDFGTMGHVIRGTVVMKDGKVIFPAPTPKNILQGSPVKQKTVAELEAEKAATITPFRKTMTSASAYTAGLTSILGLGIAAPNLAFSQMVTTFGLAGIVGYHTVWGVTPALHSPLMSVTNAISGLTAVGGLVLMGGHLYPSTTSQGLAALATFISSVNIAGGFLVTQRMLDMFKRPTDPPEYNYLYLLPAGTFVGGYLAALYSGYNIEQIMYLGSGLCCVGALAGLSTQGTARLGNALGMIGVAGGLAATLGGLKPCPELLAQMSGAMALGGTIGLTIAKRIQISDLPQLVAAFHSLVGLAAVLTCIAEYIVEYPHFATDAAANLTKIVAYLGTYIGGVTFSGSLIAYGKLQGILKSAPLLLPGRHLLNAGLLAASVGGVIPFMMDPSFTTGITCLGSVSALSAVMGVTLTAAIGGADMPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVAMNRSLANVILGGYGTTSTAGGKPMEISGTHTEISLDNAIDMIREANSIIITPGYGLCAAKAQYPIADLVKMLNEQGKKVRFGIHPVAGRMPGQLNVLLAEAGVPYDIVLEMDEINHDFPDTDLVLVIGANDTVNSAAQEDPNSIIAGMPVLEVWKSKQVIVMKRTLGVGYAAVDNPIFYKPNTAMLLGDAKKTCDALQAKVRESYQK	124501	13619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_14606_17373_17490_20228_20348_44130_44213_45066_45227_57847_58028_59866_60028_61162_61397_63472_63669_65136_65283_66162_66274_67431_67594_70399_70554_71082_71275_72463_72598_90931_91120_94459_94549_104847_104936_108259_108478_110958_111189_117750_117954_124440
900124	contig_9363_pilon	+	6904	10	Intergenic	novelGene_6609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	426	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGCAGAAAAAAAAGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768401	787928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_773741_773893_773970_774894_775043_776035_776192_776977_777664_780573_780688_780835_780908_781246_781354_786543_786648_787826
900125	contig_8330_pilon	-	4963	19	Intergenic	novelGene_71916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	278.778779724518	460	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1064	3195	298	3492	1323488	1283191	TRUE	25	GCTAATGTTGTGTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRLDDQESPVYAAQQRRIPGSTEAFPHQHRVLAPAPPVYEAVSDTMQSATGIQYSVTPSYQVSAVPQSSSSHGPTIAAVHSSHHHPTAVQPHGGQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFKSQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHGIQPQPQPAPQHSSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASPRSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTYQKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAEKVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHSGTGTTPPVKKKPKLLSLKDSSMADASKHGVGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELFNWFKNFLGYKESVHLETFPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTPLCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEAIQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIVLKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIESIYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLVYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQIMHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEATGASKKHNGVGGSPPKSKLLFSNTAAQKLKGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLMRICSQAERQIEEENRERVWEHDMPGVRRDKSDSPAIQLRLKEPMDVEVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYEDSLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLSENNNGATGGQLNTHTHTILTFFFVNNVQTVNFLLKEV	1345198	1281673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1282526_1282571_1283264_1290660_1290759_1295059_1295230_1297668_1298243_1299199_1299384_1300722_1300962_1303329_1303447_1303744_1303956_1304515_1304635_1306743_1306834_1308628_1308788_1308923_1309077_1309645_1309898_1311109_1311393_1312058_1312166_1318951_1319129_1323299_1323522_1344934
900126	contig_19730_pilon	-	4751	4	Intergenic	novelGene_142479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_2	34.3737626039914	831	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	99	407	97876	96045	FALSE	15	CTTAAACCTGTGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCSDGVSQEGSASSTKSTELLLGVKAIPDDTPMCRILLRKEVLRLVINLSSSVSTKCHETGLLTIKEKYPQTFDDICLYSEVSHLLSHCTFRLPCRRFIQELFQDVQFLQMHEEAEAVLATPPKQPIVDTSAES	98295	91700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_96120_96244_96384_97781_97906_98226
900127	contig_9389_pilon	-	888	1	Intergenic	novelGene_83977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCGCCCAGAAGCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372059	371171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_371200_372100
900128	scaffold_8345_pilon	-	2087	8	Intergenic	novelGene_107015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGAGAGAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620966	580075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_580125_583891_583931_598124_598200_599735_599967_602214_602322_602543_602744_612489_612537_619627
900129	contig_4151_pilon	+	4739	3	Intergenic	novelGene_65294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	141	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATAAAGTTCACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727852	778898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_731244_777415_778165_778299
900130	contig_13697_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_165912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTCATTCTGTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119975	119260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_119300_120000
900131	contig_18108_pilon	-	2966	8	Intergenic	novelGene_33478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	406	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2662	2964	244399	226794	FALSE	5	TCTCCCTCCTCTGTTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPPKSIHKVQGLYWGYLEGVPGQLLDAEVSLLVPEYRQRFKKNEQMCVCRELTHTSYFLTVTLIFSLSTFNDFERVGESTSLVVRCVPLLSHAVRAGGA	262116	226791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_226874_232749_232917_244343_244448_245847_245920_247182_247267_250795_251000_252191_252334_260005
900132	contig_11173_pilon	+	1674	9	Intergenic	novelGene_156908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	80.8724883690368	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	296	1363	434044	455686	FALSE	45	TCACATTAAACAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVLSWKLVPDNFPPGDQPPPPSYIYGSQHLLRLFVKLPEILGKMSFSEKNLKALLKHFDLFLRFLAEYHDDFFPESAYVAACEAHYSTKNPRAMY	433165	455997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936_450047_452961_453062_453732_453818_455586
900133	contig_6163_pilon	-	2914	7	Intergenic	novelGene_103805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_2	187.552363058664	81	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	38	952	93933	78086	TRUE	10	CTTTTCCCCAGCTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPLPPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVSWQPLSMAISMLIPPGLRVVLAGWWRPALARDSLVRVWACVLFLRMNSFPLDSEAVEHIIFHPVTQVWTS	93970	75166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
900134	contig_16211_pilon	-	4047	16	Intergenic	novelGene_150087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	884.289384509141	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1038	3117	55	3171	242940	175471	FALSE	40	TCGTAAGAATTAATGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKDDTKDTDSLSDEATHNSNQNNSNCSSPSRMSDSVSLNTDSSQDTSLCSPVKETHIGINSRIRQEDENFNSLLQNGDILSSSTEEKFKVHDKKDFNLPEYDLNIEEQLVLIEKGVDSAATSDESHKLDHINMNLDKLVTNDIFQPEMVERSKTQDIVLGMGFLNINAKGEAEHLENENKYPNLESINEVNGHSEGTPQSPRRTEPLDTDSSVDMGISKSTEDLSPQRSGPIGSVVKSHSITNMETGRLKICDILSDNGPQQPNATVKVTSAIDGKNIVRSKSATLLYDQPLQVFTGSSSSSDLVSGTKAIFKFDSNHNPEEPNIIRGPTTCGPQSMPQIYGPPQYNIQYSSCNSSAAAKDTLWHSRQNPQIDHVSFPSQRLPRSESIESHGYVKHSANMNFSNHNNVRANTSYHLHQRLGSARHGEMWAISPNDRLNPGVTRPTIQRQSSVSSTASVNLGDPGAARRAQIPEGDYLLYRELHSVGRTPPVLSGSQRPLSARTYSIDGPNTPRPQSARPSVTEIPERTMSVSDFSYSRTSPSKRPNARVGSEHSLLDPPGKSKVPHDWREQVLRHIEAKKLEKE	242994	174594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_175477_193013_194572_195233_195418_197077_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643_237708_242929
900135	contig_14353_pilon	-	2492	11	Intergenic	novelGene_82097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_9	448.69637841195	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	673	1119	83281	80452	FALSE	45	ACATTAATCAAAGTATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104398	79078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
900136	contig_9389_pilon	+	1546	6	Intergenic	novelGene_84058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	744	1181	752304	755643	TRUE	5	TGCTGCGGGGAGGGGCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPVGLWASPRPGWAADSTIWGSPTTPDTFSSSRRFKQAALGFRLRSRTCCSRFRMTDTAWCRMSSLVWGFSLLRCSWHMRPSSLNASLMSRTRSRSRALLATRRSFSRSAFCSGGRRSSSSSSGLVRVRGGLQLLFLLLGVVGH	751299	761889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_752038_752298_752443_755168_755405_755580_755715_761521_761659_761732
900137	contig_10980_pilon	-	3645	6	Intergenic	novelGene_162574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	306	782	545924	541817	TRUE	40	AAAAATTTATTTTTTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSEVPPVSVRPLSLVFLVEFEFSPLLFSCSIGGSLISTFMALWSEKMLCNISMFWILLRLGLWPNMWSILENVPCVLEKKVYLAALGWSVMYMSMRSSWLIVAFRSSMSLLSFFLDVLSFTKSGVLKSSTIIVKLSISLFNAVRVCFMHFGVLSLGA	546229	522129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_523758_527260_527323_527604_527848_539911_540723_541697_542187_545817
900138	contig_16776_pilon	-	4266	2	Intergenic	novelGene_130529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	388	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAACAAGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57882	53020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_56569_57164
900139	contig_5429_pilon	+	3918	3	Intergenic	novelGene_127825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2850	3206	605422	605778	FALSE	65	AAAAAAAAACTACAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVIHSRCSQAKYLSCFFNFKLFWEVLAPWAFSTDSQSQAPIVGSIFSVHQFFKCVFPWKQLTHWAHSATVLLPLKMFFVANRTHSICPRIPIKATPCTTQHGPWGLVSLLSHIFLL	599125	606490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_600766_602144_602269_604336
900140	contig_5815_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_141177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1676	1987	133997	134308	NA	30	GAAAGGCCTGAAGATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFWRLCSHAFIDFQPDSMMPRILNTAGAPGLTCLPDERYPSHCPPCICTVGTQDSPPMCPVPLRSKVFDNLPRLATPLLCRPPHPTYLCTKFSISPFSPGHS	132321	134732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_132300_134700
900141	contig_5039_pilon	+	2421	4	Intergenic	novelGene_64983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	512	1504	1679067	1680059	TRUE	15	CTCTGGGGTAAGGTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1678555	1689726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680625_1682882_1683015_1686177_1686283_1689611
900142	contig_7979_pilon	-	3528	7	Intergenic	novelGene_125540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_2	47.5374121672137	146	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	467	1240	1078483	1050436	FALSE	40	AAAGCCAAGACAACGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISKLEKNKAMKSEDKAEIMKTLEVLTKNITKLKDEVKAASPGRCLPKSIKTKTQMQKELLDTELDLYKKMQAGEEVTELRRKYTELQLEAAKRGILSSGRGRGIHSRGRGAAHGRGRGRGRGRGVPGHAVVDHRPRALEISAFTESDREDLLPHFAQYGEIEDCQIDDSSLHAVITFKTRAEAEAAAVHGARFKGQDLKLAWNKPVTSISAVETEEAEPDEEEVCFFFVCLFIFHLFLTLKCSWFLYNFTAVTLP	1081158	1048147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1050649_1061526_1061614_1065029_1065231_1077636_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080767
900144	contig_3948_pilon	-	5592	31	Intergenic	novelGene_53278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_18	311.68534703376	522	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	1803	3590	1458393	1414309	TRUE	20	GCTAATGTCTCTTGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLSSSKQDWLSWSLLLLSLICETRAFYVPGVAPINFHQNDPVEIKAVKLTSSRTQLPYEYYSLPFCQPRKITYKAENLGEVLRGDRIVNTPFQVLMNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGILMAGILPFGAMFIELFFIFSAIWENQFYYLFGFLFLVFIILVVSCSQISIVMVYFQLCAEDYRWWWRNFLVSGGICVLRPGLCHLLFC	1510948	1409183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1435012_1439634_1439773_1458390_1458578_1459907_1460034_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
900145	contig_13004_pilon	+	4204	17	Intergenic	novelGene_112644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	71.6780726146428	418	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	941	2826	1146	3971	633704	673741	FALSE	20	TTTAAGAGGTGTTTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTPDSALRQLLSQKPVEPPAPAIPPRYQQVPQQPHPGFTGGLSKPALQVGQHPTQGHLYYDYQQPLAQMQGVQGGQPLQTPQMLSQHMQQMQQHQYYPQQQQQAGQQRISMQEIQQQQQQQIHPSQPQQQLQLQLQQRQGAVQIPQYYQSQPMMQHLQEQQQQQQMHLQPPSYHRDPHQYTPEQAHAVQLIQLGSMPQYYYQEPQQPYGHPVYQQSHLPQHQQREDSQLKTYPSDRQAQALLSSHGDLGPADTGMGDPATSDVNRVSGAVPHRPLLSPSGIHLNSMGPQHQQLSPSAMWPQMHLPDGRTQPGSPESSGQAKGVFGEQFDAKNKLTCSICLKEFKSLPALNGHMRSHGGMRASPSLKQEIPKKHQPGVAKAEEPLKPVQEKKKFRHRPEPLFIPPPPSYNLNPASSYSGATLYQSQLRSPRVLGDHLLLDPTHELPPYTPPPMLSPVRQGSGLFSNVLISGHGPGAHPQLPLTPLTPTPRVLLCRSNSIDGSSVTVTPGPGEQTVDVEPRINIGLRFQAEIPELQDASALAKDTHKATLVWKPWPELENHDLQQRVENLLNLCCSSALPGGGTNSEFALHSLFEAKGDVMAALEMLLLRKPVRLKFHPLANYHYAGSDKWTSLERKLFNKALATYSKDFIFVQKMVKSKTVAQCVEYYYTWKKIMRLGRKHRTRLTDIMDDCVTSEEEEELEEEEEDLEEDRKSTKEEESEGPKSPELPPPFPALAPAEGPAMQALSQPSGSFICEMPNCGAVFSSRQALNGHARIHGGTNQVAKARGAVPSGKQKSGGAQSGYCSVKSSPSHSTTSGETDPTTVFPCKECGKVFFKIKSRNAHMKTHRQQEEQQRQKAQKAAFAAEMAATIERTTGPVGGPGLLPLDQLSLIKPMKDVDILDDDVVQQLGGVMEEAEVVDTDLLLDDQDSVLLQGDTEL	413978	673974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_414063_414332_414419_519757_519841_588921_589037_632926_634613_636087_636135_636998_637150_642214_642600_643681_643749_644821_644962_645107_645212_646733_646810_655219_655309_657212_657327_666516_666724_669361_669574_673416
900146	contig_8383_pilon	+	3897	9	Intergenic	novelGene_172757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAACAAATAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290412	320661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_+_292868_294745_294919_298575_298748_301345_301506_305648_305893_309915_310075_314750_314911_318246_318455_320495
900148	contig_9995_pilon	-	2285	2	Intergenic	novelGene_47733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGATGCCACTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513716	511361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_513573_513642
900149	contig_12624_pilon	+	3953	11	Intergenic	novelGene_60949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	329.53890513868	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1376	2074	39740	55160	FALSE	60	TTTAATGGACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6035	57039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6196_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
900150	contig_5780_pilon	-	2259	2	Intergenic	novelGene_29795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCTCTAAAGGAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113724	111291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_112516_112689
900151	contig_14415_pilon	-	2023	3	Intergenic	novelGene_77590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	33	junction_1	68	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	229	1416	19037	13005	FALSE	45	GGAAAACACTGAAGAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKGHYVQDICVYGLGDLPWIIQSPSLFAHKFESSTDPLAVTCLERRHRLKVLRQAAAPLDPHWHFHKNTHFNMRLNH	23887	12397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_13232_18076_19097_23718
900152	contig_15498_pilon	-	5231	8	Intergenic	novelGene_42627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	21.1727587783386	102	148	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	3186	3944	537695	534858	FALSE	45	GGACAGCACAAATTAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWNRTTHLWNDYSKIIHQRTNTVPFDLVPHEDGVDVAVRVLKPLDSVDLGLETVYEKFHPSIQSFTDVIGHYISGERPKGIQETEEMLKVGATLTGVGELVLDNNSVRLQPPKQGMQYYLSSQDFDSLLQRQESSVRLWKVLTLVFGFAACATLFFILRKQYLQRQERLRLKQMQEEFREHEAQLLSRVTPENRESLKSACVVCLSNFKSCVFLECGHVCSCTECYRALPEPKRCPICRQEVTRVVPLYNS	790965	533570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_535588_537666_537788_538368_540045_554027_554702_621974_621983_790021_790201_790244_790745_790909
900153	contig_19352_pilon	-	1648	3	Intergenic	novelGene_122422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTTGAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369033	365357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_365853_366768_366915_368026
900154	contig_8065_pilon	+	3507	21	Intergenic	novelGene_107326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_10	160.804415362266	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1045	3135	373	3507	125393	227183	FALSE	65	AAAAAGGTAAAAGAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMSEPGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGAKDKEDEVSRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKMLPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRR	125020	227183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139356_167447_167554_168762_168855_169620_169780_170920_171041_171704_171864_178285_178468_182274_182438_183789_183910_186853_187049_192927_193110_193450_193576_194049_194201_195650_195766_196153_196510_215370_215510_226319_226500_227129
900155	contig_4442_pilon	-	3091	2	Intergenic	novelGene_127926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1648	2133	124322	123837	FALSE	55	GTCAACACCACAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTNKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGLKTNTWIQICFRKTQKKEQRKMKRP	126233	122878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_125522_125785
900157	contig_14970_pilon	+	2215	11	Intergenic	novelGene_44947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_5	5995.70781142644	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	133	1524	136145	231550	FALSE	15	GCCACCTTAACTCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
900158	contig_10732_pilon	+	4544	1	Intergenic	novelGene_114673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACTATAACATTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48616	53160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_48600_53200
900159	contig_7066_pilon	+	3376	8	Intergenic	novelGene_42192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	53.3337585017067	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	2180	2803	998571	1003261	FALSE	40	GAGTAACAGAATAGCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993693	1003834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993862_994554_994788_996687_996939_997043_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
900160	contig_4232_pilon	-	248	2	Intergenic	novelGene_63424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTAAACAGAACCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468132	467756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467771_467898
900161	contig_4091_pilon	+	2351	6	Intergenic	novelGene_172985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	129.564501311123	169	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAAAACTTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10669	39050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_25756_25821_26470_27511_38665
900162	contig_7378_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_120254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCTTGGACTTTAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415305	416082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_415300_416100
900163	SIRV4	+	1445	3	NNC	SIRV4C	novel	1567	3	NA	NA	96	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	14	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATATTGTAACCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV4_+_1333_1688_1886_2389
900164	contig_987_pilon	+	3119	8	Intergenic	novelGene_72310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46.4564751313813	1011	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	611	2836	1169692	1236483	FALSE	60	AAAAAAAAATCAGACATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPKEKERKKDKKEKKKKKEKEKEKEKKEKEREKEKREREKKEKEKEKHKHEKIKVEPVVPAPSPVIPRLTLRVGAGQDKIVISKVVPAPEAKPAPLSRPKTPPPAPAAAPVPLHLTPSLVPLPLLAQSTASPALVPSPSPAVSGAGSSKAPVRSVVTETVSTYVIRDEWGNQIWICPGCNKPDDGSPMIGCDDCDDWYHWPCVGITTAPPEEMQWFCPKCANKKKDKKHKKRKHRAH	991264	1236766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_991623_995960_996039_1125079_1125099_1169536_1171360_1193952_1194036_1231518_1231772_1235359_1235467_1236368
900165	contig_5649_pilon	+	4843	18	Intergenic	novelGene_82295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	207	junction_7	247.642587636038	86	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	936	2811	15	2825	148738	173334	FALSE	80	AAGAAGAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAKTMMESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIMQFGVREVTAAQVARVLGMMARTHSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGKDKSDGAQAHTWNVEVLIDVLKELNPSLNFKEVTYELDHPGFQIRDSKGLHNVVYGIQRGLGMEVFPVDLIYRPWKHAEGQLSFIQHSLINPEIFCFADYPCHTVATDILKAPPEDDNREIATWKSLDLIESLLRLAEVGQYEQVKQLFSFPIKHCPDMLVLALLQINTSWHTLRHELISTLMPIFLGNHPNSAIILHYAWHGQGQSPSIRQLIMHAMAEWYMRGEQYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDLAALASRREYLKLDKWLTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPPETLATMLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSASSLDAISPVQIDPLGGMASLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSPAKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGGLGTGSLTGIGTGALGLPAVNSDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEIDDEANSYFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYRFFPQYPDKELHITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKMYYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHLASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRDPPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVSTMVTTSTTTTVAKTVTVTRPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIAFIFNNLSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYSNFLDTLKNPDFNKMVLNETYRNIKVGVSSCISFHY	148723	175352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_148797_149785_149913_150061_150173_152884_153056_153449_153578_154087_154329_156611_156732_157505_157629_157820_157973_164098_164250_165471_165674_166774_166922_168032_168158_168451_168739_169641_169721_171512_171744_172063_172205_173118
900166	contig_6929_pilon	+	3744	1	Intergenic	novelGene_139396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	406	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCCAGCAACAACAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112851	116595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_112900_116600
900167	SIRV5	+	1960	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	35	34	7	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
900168	contig_7919_pilon	-	4268	6	Intergenic	novelGene_28094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3820	4230	1340645	1296703	FALSE	20	GCACCTCCGCAGCGCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSFLLHFSLEKGFLRPRSRRLLRRRPHRRSLSTRHSAAKFPNMDSLVRLQVFRGLLGRRLCGPGREATAAATAKHGPDPGCVAPRALLHRCSPSPCLVWLPPSLSPRVSSLALPPLRSAQPRGHMSARYVDDGVR	1377796	1296664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1297070_1340601_1340684_1344108_1344267_1352983_1353062_1372224_1372326_1374352
900169	contig_15543_pilon	-	5689	3	Intergenic	novelGene_164348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	618	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGGTGGCTTAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60182	54200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_56444_56622_59838_59951
900170	contig_5686_pilon	+	1470	3	Intergenic	novelGene_45268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	531	845	95808	96200	FALSE	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQNARPTFLSLKRFFSCTSGYIAEDYHLWTDGSTLCKRIKCGPTLTGKLPVVIEFTPTHDDDPMCVRIELCSVGFSMAQLSLLAICTTQARPLKGRPQQSKA	93804	96825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94088_95560_96048_96125
900171	contig_5854_pilon	+	4204	4	Intergenic	novelGene_68858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1168	2013	176030	240267	TRUE	30	AAAATTAATTGTGCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSTL	174167	298212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_174479_175173_176849_240240_242165_297918
900172	contig_13571_pilon	+	5015	4	Intergenic	novelGene_128121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	593	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTTGTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229456	260239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_229478_236955_240203_247235_248499_259755
900173	contig_9415_pilon	+	2287	15	Intergenic	novelGene_109829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	286.910789306377	127	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	145	1227	1925966	2010403	TRUE	30	CTGCACATTCCAGAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTQGLGTQPPSAERPARSDPRQSLPNPSAPTSPGPGAAVLPAVLLVAMECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSFYRLRRT	1925821	2014194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077_2000122_2010379_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398
900174	contig_8954_pilon	+	3056	7	Intergenic	novelGene_130289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_5	104.558463178368	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1995	2738	163528	185921	FALSE	35	AACTTTTGCCACAATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPTKILITGKTRLRVNCVGVFDVLTFDNSQNNNPLALMAQYQQADLISLGKVVLALACNSLAGIQRENLQKAMELVTINYSSDLKNLILYLLTDQNRMRSVNDIMPMIGARFYTQLDAAQMRNDVIEEDLAKEVQNGRLFRLLAKLGTINERPEFQKDPTWSETGDRYLLKLFRDHLFHQVTEAGAPWIDLSHIISCLNKLDAGVPEKISLISRDEKSVLVVTYSDLKRCFENTFQELIAAANGQL	161533	186239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_163566_164944_165036_169411_169552_173747_173878_174335_174401_182928_183068_185780
900175	contig_7744_pilon	+	3209	13	Intergenic	novelGene_62460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124.620395824903	9	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	1230	2390	404093	407779	FALSE	15	GATTTTTAGATTTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLDFAYMPNNSLTPSLQEHLCQLYPRLKVLAFGAKPEATLHTYFPSFLSRATPSCTPEMRKELLSSLTECLTVDPLSASVWRQLYPKHLLHSSLLLDHLLKSQERIPKKVWKSLQETIQSFRLTNQDLLRKSTSNNQDVITCEAACKALLQQAWGPRLPWTRLLLLVLVFAVGFLCHDFRSHSSFQASLSGRLLQSSGFLPAGQQACAKLYSYSLQGYSWLEETLLTWSSHLFTMARPSLQLAWTHTNATVSFLSAHCASHLAWFGNGLTSLAQRIQTQLPDALSQLLHSLTELLLLLYQNVLLPLWHLLLEGLARAQEHCHKACRGEVTWDCMKTQLSEAAQWTWTYLQDITVAFLDWALAMISQQ	402110	408598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_402222_402441_402520_402945_403052_403158_404194_404555_404698_405079_405172_405460_405510_405712_405827_406034_406153_406684_406782_406986_407156_407298_407451_407652
900176	contig_11258_pilon	+	2107	5	Intergenic	novelGene_67788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	187.527831267788	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	152	463	288248	292582	FALSE	50	AGATCACAGCATACAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPSRNDPVGPGCVAAFSSAASLGPRLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279272	294226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
900177	contig_5944_pilon	-	4481	6	Intergenic	novelGene_178305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	840	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1812	2396	750409	749825	TRUE	35	AAGTCTATAGTCCAGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEETLRMKWDIIKSKKFECNWSSRTGGENGKHIGESLTENFPNIMRDEKPILQEVQQTPYKTDSKRKSPRHIIITFATTKDKERILRAAQENQKVTYKGETIRLSFDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEENYQLRIIYPAKLLLKYDGEIKTFPDKQKLREYLKNKPNLQELLKGVLWLGTNNIRQQPESST	752646	491927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_-_492547_576344_576971_580328_580747_626784_626929_749546_751871_752296
900178	contig_8386_pilon	-	3979	13	Intergenic	novelGene_82206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	200.573344855857	422	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	228	1376	45992	18699	FALSE	10	GCCTTTGGGATCTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTLYVGNLSRDVTEALILQLFSQIGPCKNCKMIMDTAGNDPYCFVEFYEHRHAAAALAAMNGRKIMGKEVKVNWATTPSSQKKDTSSSTVVSTQRSQDHFHVFVGDLSPEITTEDIKAAFAPFGRISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSTAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPAGYRVAGYETQ	46219	16095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_34662_35899_35933_36104_36160_36681_36781_38376_38474_45978
900179	contig_2342_pilon	+	2830	21	Intergenic	novelGene_132767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGCAAGTAATGTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460187	547520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_460574_480327_480522_481405_481531_487030_487113_487507_487616_488805_488899_507426_507525_510172_510236_511527_511609_513946_514114_519719_519877_520187_520295_522042_522176_522363_522558_525395_525548_526403_526522_528877_529005_529094_529216_540576_540674_547075_547177_547394
900181	contig_17074_pilon	+	5765	15	Intergenic	novelGene_145166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	513.577150772811	815	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	346	2085	610974	657627	FALSE	15	GACACGTGTGGATTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKHPQREKWSSKIDFVLSVAGGFIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGGGLPVFFLEVVIGQYTSQGGITCWEKICPLFTGIGYASIVIVSLLNVYYIIILAWAMYYLFHSFQTDLPWAHCNHSWNTPNCMEDTMRKNKSMWIAVGTTNTTNYTSPVIEFWERNVLSLSSGINHPGALKWDLALCLLLVWLICFFCIWKGVKSTGKVVYITATFPFIMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDISRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKHREIFIALVCCASYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLPNPKGLKESRVIR	563442	661307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_563736_578712_578754_610962_611203_612787_612923_616272_616517_625262_625396_635238_635374_636631_636736_636871_636997_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651728_657584
900182	contig_11978_pilon	-	1930	4	Intergenic	novelGene_63123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	403	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCCAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1953408	1906925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1908329_1922116_1922218_1952818_1953107_1953270
900183	contig_8447_pilon	+	3621	14	Intergenic	novelGene_69397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	600.643560184018	23	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	983	2032	48468	82902	FALSE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTHTHTHTACLHPGSLARRWLEHVCCLSLCY	22384	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44433_44490_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70912_82807
900184	contig_11448_pilon	-	3030	7	Intergenic	novelGene_66348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	146.206095024189	319	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	451	1458	186389	184876	TRUE	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERIHSINLHNFSNSVLETLNEQRNRGHFCDVTVRIHGSMLRAHRCVLAAGSPFFQDKLLLGYSDIEIPSVVSVQSVQKLIDFMYSGVLRVSQSEALQILTAASILQIKTVIDECTRIVSQNVGDVFPGIQDSGQDTPRGTPESGTGGAAVRRGGTGQPGRACSTRTGHGSPCGGRPAAAPARDRRVYSGEKQRGGDGQHGHHCQQQLRQERLAAAFGQHVHRAAIAKYPALLTPDRNPHQQPEDASDLDQQHTGHWHSRQHLPAGPLHYPARGQRPQAFPLQPAAAPDRPADPVCDSVPARLVDLYCTAASATAPGPIRRPQHSQWAGRKKAL	436787	164893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_166398_184807_185444_185949_186410_216681_216874_225366_225468_349238_349276_436687
900186	contig_20550_pilon	+	2434	20	Intergenic	novelGene_142604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	98	junction_19	241.482976006242	54	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	73	2001	3777	38142	FALSE	15	CCTGTGTCGGTAAGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ	3704	38575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37627_37774_38133
900187	contig_9177_pilon	-	2773	1	Intergenic	novelGene_32723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	131	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTCTTTTAAGAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615113	612340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_612300_615100
900188	contig_5445_pilon	-	704	4	Intergenic	novelGene_135411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1506	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGCATGCCGTTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53971	51606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_51818_52578_52635_53127_53240_53646
900189	contig_20641_pilon	+	1520	8	Intergenic	novelGene_52806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1226.78038884267	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	64	1095	14599	56734	FALSE	85	TAAAAATAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDSACRLWH	14535	57159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379_56498_56709
900191	contig_18272_pilon	+	3068	1	Intergenic	novelGene_7031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	420	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGAAAAGAGCAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223827	226895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_223800_226900
900193	contig_546_pilon	+	4796	8	Intergenic	novelGene_117214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1050.70625421811	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	28	1050	119834	146817	TRUE	55	CCCCCAAAAAAATCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPIHIN	119806	156560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140501_146798_146847_147557_147672_152818_154385_154523
900194	contig_5327_pilon	+	2244	5	Intergenic	novelGene_178586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGTTGTTAACCGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96804	184468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5327_pilon_+_97074_98066_98354_181948_182662_183372_184203_184323
900196	contig_15731_pilon	+	4556	18	Intergenic	novelGene_171972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	291.866111410043	335	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	818	2457	321	2777	21803	48097	TRUE	50	TATGATACTACACAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEKEAIGVFIRNSFKDINHLFQKELAAQLEKKWNDFCEKNLRASSDHCLALLQDIFSPLEEEVKQGVYSKPGGYRLFIQKTQELKKKYLQEPRKGIQAEEILQKYLMSKESVTDAILQTDLTLTEKEKETEVERVKAESAQATAKMLKEMQIKHQQLMEQKEKSHQEHVKQLTEKMEDKNQLLAQQESILALKLQEQEQLLKEGFKEERIKLQKEIQDLQMRSIETSTSVKLVIAEFAQDAKKMLEEMQIKYQQMMEQKEKCHQKHVNQFIEKMERDTEQLFTEQNRTPALNFQEIMTFRPIMMAPICLVENHKEQLTVNPSALKILDEITQPVVVVAIAGLYRTGKSYLMNLLAGQNRGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPDHTLILLDTEGLGDVKKGDTKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMGTINQQALEQLHYVTELTELIRTKSSSGTEEVDDSTEFVGFFPDFIWTVRDFSLELKIDKSPITEDGYLEDALKLIPAGRNPKIQNSNLPRECIRRFFPKRKCFVFDRPTSDNSFLYQIEEVPEHQLDCNFQMKLKKFRSYIFSHAKTKTVREGIIITGKRLATLVETYVNTINSGAVPCLENAVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKEMAQCLRLPTDTLQELLDVHAACERKAIALFMEHSFKDDKREFQKNLLDIIGEKMEDFVLQNEEASDKYCQAELKQLSEPLMENISRGIFSVPGGHALYLEAKKKVEQDYAQVPRKGVKANEVLQTFLQSQAAIEESILQSDKGLTDAEKAIAVEQAKKEAAEKEQELLKHKNQEQQQKMEAQQRTFQEHIAQLEMKIKKERENLLRELERILEHNLKIQEELLMQGFRKQYEKLKKETDRQQEEYEKTKNNERSWFSRLLEEAFRALSTVSLQDLELFAEIMKYLSLLNK	19871	70589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_19952_20592_20806_21775_21879_22171_22363_23510_23614_24625_24820_26463_26660_35458_35587_39240_39351_39554_39752_42058_42308_43233_43515_44873_45087_46142_46246_46579_46774_47875_49472_58806_59124_70501
900197	contig_10953_pilon	+	2220	11	Intergenic	novelGene_42537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	156.646895915623	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	8	1432	179555	188762	FALSE	25	CAAATGTCATCGGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSLGSNTYNRQNWEDADFPILCQTCLGENPYIRMTKEKYGKECKICARPFTVFRWCPGVRMRFKKTEVCQTCSKLKNVCQTCLLDLEYGLPIQVRDAGLSFKDDMPKSDVNKEYYTQNMEISNSDGTRPVGMLGKTTSTSDMLLKLARTTPYYKRNRPHICSFWVKGECKRGEECPYRHEKPTDPDDPLADQNIKDRYYGINDPVADKLLKRASTMPRLDPPEDKTITTLYVGGLGDTITETDLRNHFYQFGEIRTITVVQRQQCAFIQFATRQAAEVAAEKSFNKLIVNGRRLNVKWGREGRNHGLWNQARARSRTARSSSSCSRRRSLCQLLQLTSKWSSSRGQYCPASTPWHCPAPTPRFWTTHVPPNGTTPSFHEGSRTNPLSFSGPSEDGSPRWETQQSLAHCHHSWALWKKGRLKLPVNESRNKYIFSSFVVSMVAECVQMWAVRELQPCFPTCIQRTDGPQTSCH	179547	189550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_179609_180035_180090_181091_181122_181995_182129_183136_183232_183340_183514_184798_185000_185947_186113_187067_187128_187334_187461_188428
900198	contig_10058_pilon	-	3008	8	Intergenic	novelGene_67713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	448	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTCCAGCGGCCAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101647	72521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_72664_97064_97132_97293_97404_97628_97777_98057_98259_98434_98538_98695_98816_99530
900199	contig_6102_pilon	+	1666	8	Intergenic	novelGene_31829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	635.734381704838	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	103	915	370803	394507	FALSE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370700	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373431_393978_394036_394221_394272_394467
900200	contig_12179_pilon	+	5186	10	Intergenic	novelGene_128003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	162.670613188313	357	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	891	1643	521333	530744	FALSE	35	TTCAAGAAGTTTACAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIWGGENIEMSFRVWQCGGQLEIMPCSVVGHVFRSKSPHTFPKGTQVIARNQVRLAEVWMDEYKEIFYRRNTDAAKIVRQKSFGDLSKRFEIKHRLQCKNFTWYLNTIYPEVYVPDLNPVVSGYIKSFGQHLCLDVGENNQGGKPLIMYTCHGLGGNQYFEYSTQHEIRHNIQKELCLHAAQGPVQLRTCTYKGHKTVAAGEQIWEIQKDQLLYNSFLKMCLSANGEHPSLVPCNPSDSLQKWIFSQND	513545	534287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_513802_514346_514520_518688_518839_520568_520804_521256_521375_522882_523084_525287_525420_525624_525727_529373_529527_530621
900202	contig_15118_pilon	+	2336	12	Intergenic	novelGene_74606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	268.459517239926	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	53	865	392042	393566	TRUE	45	TGAGATGGTTGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGV	391989	399257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393462_393559_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394700_395049_395141_395233_395346_398644
900203	contig_5586_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_143509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTGACGTTCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236417	234038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_234000_236400
900204	contig_17769_pilon	+	3077	10	Intergenic	novelGene_124247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_7	159.218073916652	41	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	1929	2891	30137	40794	TRUE	20	CCCAGCTCCCAAATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYPSLLLSQINTEELEEEPVVNGDKSDCMPTDTVVSGNKGRAKHGNTETKKDGEGVEKAAASEQSNSSGKLRKKKKKQKNKKSTTGETLENGLEDIDRILERIEDRGGLARPGPPPLSSRKHVLHVEHRHLNPDTELKRYFGARAILGEQRSRQRQRVYPKSMWLTTPKSTWPRYSKPGLSMRLLETKKGLSSFMFEHSEEYQQVQHKFLAAVESMEPNNIVVLLQTSPYHVDSLLQLSDACRLQEDQEMARDLIERALYSMECAFHPLFSLTSGTCRLDYRRPENRSFYLALYKQMVFLEKRGCPRTALEYCKLILR	28208	42233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_30335_31842_31918_32653_32773_33781_33848_36592_36676_37784_37916_38560_38661_39508_39603_40697_40965_42217
900205	contig_7467_pilon	+	1083	2	Intergenic	novelGene_69479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	315	629	77771	78085	TRUE	30	ATAACCGAGACAGGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYLKQKTHMIISTDAEKVFDKDQHPFFIETLNKTGIEGKFLSIIKGIYTKPTANIIFNREAESIPHENENKRRIPLSPLLFNIVLEVLVRAVRQEKEIKGVMV	77456	127357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_78372_127189
900206	contig_13295_pilon	-	5486	2	Intergenic	novelGene_31223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAACACTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76827	71006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_75675_76009
900207	contig_10377_pilon	-	3697	7	Intergenic	novelGene_115364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1442	1858	312821	312405	TRUE	65	AAAAAAAAAAGATTACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIALYACESWTVNKEHRRRIDAFGLRCWRRIFNIPWTARRMNESVLEEVQPKYSLEARMARLHLTYFGQVISRDQSLEQDIVIGKVEGQRKRGRFSMRWTDTVAATMGSSITIVRTAEDRAVFCSFVHRLAMSWN	383206	197367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_198205_199280_199428_199483_200288_280719_280734_312367_313278_375966_376262_382516
900208	contig_3130_pilon	-	3350	9	Intergenic	novelGene_103586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_5	184.293880459987	312	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	131	1261	202529	185023	FALSE	35	TCACTAATTTATTGGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGGAGGCWRRNSAGRGLGELPRWWWRRLRRRQQERILGLSLTMPTVEELYRNYGILADATEQVGQHKDSYQVILDGVKGGTKEKRLAAQFIPKFFKHFPELADSAINAQLDLCEDEDVSIRRQAIKELPQFATGENLPRVADILTQLLQTDDSAEFNLVNNALLSIFKMDAKGTLGGLFSQILQGEDIVRERAIKFLSTKLKTLPDEVLTKEVEELILTESKKVLEDVTGEEFVLFMKILSGLKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFSKNVHSTRFVTYFCEQVLPNLSSLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDMEKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSFHQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIR	202659	182933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_185209_186380_186471_187649_187755_188282_188490_189699_189852_190418_190485_191011_191106_192189_192352_202460
900209	contig_5302_pilon	-	1524	3	Intergenic	novelGene_81435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	770	1144	176322	175948	FALSE	25	GTTTCCTTTTCAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	209566	175567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176778_177056_177244_209439
900210	contig_9471_pilon	+	2708	2	Intergenic	novelGene_21759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_1	0	182	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTTATTTGTTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384503	388091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_385716
900211	contig_16766_pilon	-	6263	6	Intergenic	novelGene_153351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1077	131	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATGTCTGAGCAGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181431	101492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_102794_103415_104113_128740_129137_176896_177276_177438_178663_179165
900212	contig_5549_pilon	+	3424	5	Intergenic	novelGene_81657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	74.0219562021972	191	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	317	1822	448082	458559	FALSE	45	TAAAGAGTATTTAAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGGNIQLEIPDFSNSVLSHLNQLRMQGRLCDIVVNVQGQAFQAHKVVLAASSPYFRDHMSLNEMSTVSISVIKNPTVFEQLLSFCYTGRICLQLADIISYLTAASFLQMQHIIDKCTQILEGIHFKINVTEVEAELSQTRTKHQERPPESHRVTPNLNRSLSPRHNTPKGNWRGQVSAVLDIRELSPPEESTSPQIIEQSSDVESREPILRINRAGQWYVETGVVDRGIRSEDEVRVLGAVHIKTENLEEWLGPENQPSGEDGSSAEEVTAMVIDTTGHGSVGQENYTLGFSGAKVATSSEIDRFSPSGSIVPLVERHRARSESPGRMDEPKQPSSQVEESAMMGVSGYVEYLREQEVSERWFRYNPRLTCIYCAKSFNQKGSLDRHMRLHMGITPFVCRMCGKKYTRKDQLEYHIRKHTGNKPFHCHVCGKSFPFQAILNQHFRKNHPGCVPLEGPHSISPETTVTSRGQAEEESPSQEETVAPGEIAQGSVSTTGPD	445965	460161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_446051_446567_446765_448047_448999_450983_451084_458070
900213	contig_8303_pilon	-	2130	7	Intergenic	novelGene_154914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	225.78529624402	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	214	861	51496	29167	TRUE	15	GCAAGTATTGTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGATRPNGPNTGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEFQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54793	27820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29083_29159_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36329_51333_51593_54676
900214	contig_10182_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_134629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	454	879	384202	383777	NA	60	CAGAGAATAGAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQKNHNLSICCLQETPLRLKDTNKLKLKGWKKIYQANNAQKTAGVAILISDKIDFKVKSTRKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIVNIYVPNDRAPKYIKQTLIALKREKDSSTTIVGDFNTPLPVKDRTSRKKLSEGGKSKC	384655	383244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_383200_384700
900215	contig_19016_pilon	+	3525	2	Intergenic	novelGene_173329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	707	1309	5438	6140	FALSE	5	TTTTTCTGCAGCTCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGMPITRKFLLLIMSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSVPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFNFWISNCCSCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVSSSTGELSGVLVWTPIGAILFVPF	4731	8356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_+_6025_6124
900217	contig_14514_pilon	-	1798	1	Intergenic	novelGene_137476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGAGGGCTGGCCGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74714	72916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_72900_74700
900218	contig_15304_pilon	-	2633	5	Intergenic	novelGene_30657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	359.476963796013	9	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1051	1350	106308	103245	TRUE	15	ACATATGTTGTCCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	112620	101866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102828_102922_103329_103548_103645_106188_107223_112484
900219	contig_19402_pilon	+	4016	18	Intergenic	novelGene_80764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1375.62131165506	33	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	10	2391	23458	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144511_145810
900220	contig_10958_pilon	+	5407	3	Intergenic	novelGene_5437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_2	5457.5	8	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2986	3324	892868	893206	FALSE	35	CTGCTTTATTATAAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTEVTEGPMMCNFVADCKDLGLALSEQGSSCRGLRRGGPWLAWVFRGALWCLGRDQTMRGQMWKQETSEEMLAVMRVGGAGGVGQRSSSTGGKMRLDSGHVLKVELGLLVD	888226	895289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_890136
900221	contig_7861_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_77402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCCTTGGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55140	52513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_52500_55100
900222	contig_10904_pilon	+	2374	4	Intergenic	novelGene_22648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	1463.71308663959	109	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGAATTGGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529595	535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531362_533736_533924_534013_534186_534946
900223	contig_9109_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_175306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	105.5	9	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	95	1009	20698	17171	FALSE	10	CCTCAGTCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVTGADVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYREVMTETFRNLASVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19016_20664
900224	contig_10225_pilon	+	2645	13	Intergenic	novelGene_86799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	1111	2529	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20684	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41528_42623_42726_45216_45259_46110_46617_46784
900225	contig_13428_pilon	-	6325	1	Intergenic	novelGene_143426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCGAGGTGACTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44134	37809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_37800_44100
900228	contig_20818_pilon	+	4068	4	Intergenic	novelGene_178753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4000	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATCACAAAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150622	172289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20818_pilon_+_150944_153536_154293_169011_171016_171302
900229	contig_14876_pilon	+	2026	3	Intergenic	novelGene_170236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	404	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	440	850	45475	51898	FALSE	30	CATTATAAGGTTTAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQYDSFTFTASKNGTYKFCFSNEFSTFTHKTVYFDFQVGEDPPLFPSENRVSALTQMESACVSIHEALKSVIDYQTHFRLREAQGRSRAEDLNTRVAYWSVGEALILLVVSIGQVFLLKSFFSDKRTTTTRVGS	38581	53074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_38966_45419_45649_51661
900230	contig_14744_pilon	-	2665	1	Intergenic	novelGene_65925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	464	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATAAAAAGACTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148894	146229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_146200_148900
900231	contig_14945_pilon	-	4042	14	Intergenic	novelGene_178652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_13	485.092402592799	50	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	187	1605	45302	17288	TRUE	60	CAAGAAAAAAAGGGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDMIIEKKIKKEAVLEEGTIAFKNWVKTGTEVYRQFWIFDVQNPEEVVVNSSNIKVKQRGPYTYRVRYLAKNNITHDPQSHTVSFLQPNAAVFEPSLSVGSENDSFTVINLAVAAAPHIYQNAFVQTILNSLIKKSKSSMFQTRTVKELLWGYKDPFLSLVPYPINTTVGVFFPYNNTADGVYKVFNGKDDISKVAIIDTYKGKKNLSYWPGYCDMINGTDAASFPPFVEKTRVLQFFSSDICRSVYAVFGSEINLKGIPVYRFVLPPKAFASPLQNPDNQCFCTETIVSKNCTSYGVLDIGKCKEGKPVYISLPHFLYASSDVMEPIEGLHPNEEEHRTYLDVEPTTGFTLQFAKRLQVNLLVKPARKIEALKGLKKNYIVPVLWLNETGTIGDEKAEKFRKQVTGKMRLLGLVEMVLLSVGVVMFVAFMISYCACRSKEVK	45661	12770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14945_pilon_-_15208_17287_17453_19060_19116_19860_19935_20276_20396_21362_21551_22695_22766_25622_25670_30038_30131_31394_31575_32034_32183_36257_36419_45182_45392_45564
900232	contig_11846_pilon	-	4383	2	Intergenic	novelGene_105953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	548	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	326	388	290180	290118	TRUE	60	AGAAAAAAAAAGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	290505	283910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_287770_289981
900233	contig_4426_pilon	-	1862	5	Intergenic	novelGene_15433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	549.994772702432	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1755	107	1861	890034	820724	FALSE	60	AATTAAAGTTGGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEK	890140	820722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991
900234	contig_8254_pilon	+	4776	14	Intergenic	novelGene_48383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_3	263.875508571123	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	410	2287	77558	109211	FALSE	35	CATAGTGCTATTACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDLIKNLAFPGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	72810	111700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_72865_74714_74964_77451_77595_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341_102546_104501_104664_107499_107756_108996
900235	contig_7870_pilon	-	4409	1	Intergenic	novelGene_109025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	411	806	561752	561357	NA	25	TTGTATTGCAGCCTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPRLVCFPRYHNLHFGISLPSGPFYFPSFFLPSLSPSSPPFLSSLPLSLPPPSSFLRYYPQWHWLHQLRTEFSSHLLPKEMVAAFSNWEGPVRLKVPLTAAVFICDVSELFACTLGLRVLVEKEESDSRH	562162	557753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_557800_562200
900236	contig_12005_pilon	-	3694	6	Intergenic	novelGene_160478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.8462610025861	185	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	64	654	216421	202795	TRUE	45	AAGACTAATAGGCACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKVNVAKLRYMSRDDFRVLTAVEMGMKNHEIVPCSLIASIASLKHGGCNKVLRELVKHKLIAWEHTKTVQGYRLTNAGYDYLALKTLSSRQVVESVGNQMGVGKESDIYIVANEEGHQFALKLHRLGRTSFRNLKNKRDYHKHRHNMSWLYLSRLSAMKEFAYMKALYERKFPVPKPIDYNRHAVVMELVNGYPL	216484	199431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12005_pilon_-_200029_200351_202888_205826_206003_208295_208413_209587_209727_216355
900237	contig_2798_pilon	+	3826	1	Intergenic	novelGene_120046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	961	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTTGCTTTACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163150	166976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_163200_167000
900238	contig_8140_pilon	+	1844	5	Intergenic	novelGene_86432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	342.16836133693	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	22	933	181766	189358	TRUE	50	ATTAAATTACTAATTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLEYPDIMGAFLDKPKMEKHNAQGQGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVIGLPSGLETWSFFAVYDGHAGSQVAKYCCEHLLDHITNNQDFKGSAGAPSVENVKNGIRTGFLEIDEHMRVMSEKKHGADRSGSTAVGVLISPHHTYFINCGDSRGLLCRNRKVHFFTQDHKPSNPLEKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDFDYKCVHGKGPTEQLVSPEPEVYDIERSEEDDQFIILACDGIWDVMGNEELCDFVRSRLEVTDDLEKVCNEVVDTCLYKGSRDNMSVILICFPNAPKVSPEAKS	181744	192816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_182600_184978_185048_189349_189459_191060_191119_192063
900239	contig_8161_pilon	-	2727	8	Intergenic	novelGene_156741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.2173739412987	22	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	102	1121	254273	230026	TRUE	30	TGTGGAGGCAATTAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254374	217043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_217246_226177_227339_229782_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
900240	contig_4857_pilon	-	2410	3	Intergenic	novelGene_48811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	322	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGGATTTACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252289	1249319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1251151_1251260_1251557_1252006
900241	contig_6102_pilon	-	1736	4	Intergenic	novelGene_31950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1240	1545	414771	414216	TRUE	30	ATTTTGAAATAATGGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDFSTHDGAVPFLVKHPKAFDIVFIGPLVLVLGHSLQHGQEVLKVQHLHVHLITLGVPQDLEHLCVGGVLAQGPHHVPTLAVQDLAITRSVKQLEGLLKL	416098	412714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_412880_414189_414363_414612_414784_414871
900242	contig_5083_pilon	+	3464	14	Intergenic	novelGene_151654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_13	117.567354483448	773	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	513	1961	461780	674122	FALSE	20	GCTGTAATTTTTGTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEGEQEEKSSENSSAERDLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPPYPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPTARTLHFQSGSTHYSAYKTIEHQIAIQYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPAHIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISPYYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNEHSECFLNPCLSLPPITGEKKSAFATYKVKAAASAHPLQMEAY	461267	675625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_461969_462228_462296_462501_462627_474735_474805_546411_546514_648611_648745_651100_651204_653251_653339_658044_658171_658766_658927_659475_659584_666163_666213_666789_666841_674042
900243	contig_13571_pilon	+	3819	1	Intergenic	novelGene_128130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACCAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310080	313899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_310100_313900
900244	contig_18592_pilon	-	3489	1	Intergenic	novelGene_114779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAACACAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12795	9306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_9300_12800
900245	contig_4754_pilon	-	3635	2	Intergenic	novelGene_35933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2851	3264	292777	292364	FALSE	70	AAAACTCCCAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIDHTLGHKATLNKIQNTDIIQSIFSDHNTIKAEINNRKSKAKNSITWKLNILLKNHRVIEELKDGIKKFLESNKNENISYQNLWDTAKAVIRGQFIAIDAHIKKERDKIKTLATRPEQIENNKRSLQPPEERK	296302	291992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_295329_296003
900246	contig_7272_pilon	+	3282	1	Intergenic	novelGene_25281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1597	1938	307261	307602	NA	70	AAAAAAAAAGCCCAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFRQSVDVTNMNCQKHKVLKAPHKTRLISSTVFPLNKAFPKPHEPLDAASGDSENSDLTLWLISELPEFRELWGEGCSKQRKCKHSIINKNKFAIIYINIDGFMNKHNITF	305664	308946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_305700_308900
900247	contig_11681_pilon	-	3635	2	Intergenic	novelGene_102978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	500	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTTGTGTTTACTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202727	182711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_185271_201651
900248	contig_6710_pilon	-	579	2	Intergenic	novelGene_92753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
900249	contig_5569_pilon	-	2292	3	Intergenic	novelGene_86735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.5	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1578	1967	423329	422940	FALSE	40	CAAAAACCACACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPSQSWAVRHESPGGLCVAVPTQRCSGPCWRQLECAASGAAEQSPGHPQLSSRNLSHDVTLPSWPAAFASPSLLIVAGRTKNVCSSLLVCVGDPVFPNEHHPLFPRPVLPRGVEGAGDESSVMSPN	425756	422614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_424669_424711_424835_425641
900250	contig_12279_pilon	-	2639	2	Intergenic	novelGene_50127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74007	71318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_71849_71898
900251	contig_4442_pilon	+	2780	1	Intergenic	novelGene_127940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTGGAGATCTCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197448	200228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_197400_200200
900252	contig_15029_pilon	-	5333	8	Intergenic	novelGene_128217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	79.0564252122934	175	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	129	2204	278776	262153	TRUE	15	ACATGCCGTTTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEASEQPSGHLVVHSDTHSDSILASFEDQRKKGFLCDITLIVENVHFRAHKALLAASSEYFSMMFAEEGEIGQSIYMLEGMVADTFSMLLEFIYTGYLHASEKTTEQILATARFLKVYDLVKAYTDFQNNDSSSKPATLNTAGAPVVVISNKKNDPPKRKRGRPRKVNSLQEGKSGLAAEEEIQLRVNNSVQNRQNFISKEGDSGILNQQILAKEMEESQPTCESGGVEVMPAEKDENCDPKTQDGQDNQSRYSKRRIRRSVKLRDYKLVGDEDDQGSAKNVCGNTGRRKHPGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQKRQLKSHYRVHTGHSLPECNHCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHVADTSSVSSNNNSEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMNGPSQGISIVTAESSQSMTTDQAANLTLLTQQPEQLQNLILSAQQEQTEHIQSLSMIESQMEPSQAEPVHVITLSKETLEHLHAHQEQRGELRLAASTSDPAQHLQLTQEPGPPPSTSAHAT	279551	258409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_258607_259220_262850_263645_263728_272616_272701_273397_273482_273986_274155_277815_278802_279448
900253	contig_20550_pilon	+	2471	20	Intergenic	novelGene_142605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	275.996768217459	240	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	73	2037	3777	38142	FALSE	20	CTGTGTCGGTAAGTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQVRLDRAAGSRQLMIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ	3704	38576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3930_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15553_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37627_37774_38133
900254	contig_12964_pilon	+	3135	1	Intergenic	novelGene_131673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201581	204716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_201600_204700
900255	contig_12677_pilon	-	284	1	Intergenic	novelGene_110863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3231	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3200
900256	contig_2988_pilon	+	5074	3	Intergenic	novelGene_136541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45972	51224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_46688_46741_47229_47352
900257	contig_5018_pilon	+	1653	7	Intergenic	novelGene_47182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_2	32.3041105055619	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	990	1550	1584525	1586783	FALSE	10	TAGCCTTTCTTCTGAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILDQMVLEQNTEGVKWTPSKMIARLGKEINNPESVYYWAQKNHIPVLSPALTDGSLGDMIFFHSYKNPGLVLDIVEDLRLINTQAIFAKRSGMIILGGGLIKHHIANANLMRNGADYVVYINTAQEFDGSDSGARPDEAVSWGKIRVDAQPVKVYADASLVFPLLVAETFAKKVDAFMPEKNED	1582967	1586886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1583310_1583877_1584567_1584644_1584732_1585207_1585314_1585397_1585502_1586484_1586611_1586687
900258	contig_10958_pilon	+	2067	4	Intergenic	novelGene_5411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	7	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGCTTGATTGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889160_895278_895855_900457
900259	contig_15543_pilon	+	6629	2	Intergenic	novelGene_164350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	5637	6200	60467	61030	FALSE	15	CGGAAGGATTTCTGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARVKHLCLSLKFTTVSLFCPSLHSWGPLGKARQTRVGHKQKINEKNEQTSAHHPSVLWTHPSPPVLLTGSRLRPCPRPGGMRLNTKQAYAQFTLNLGSNSASELPTFLRSDSRGSLASSVRTATAPCVAPSYGAGGGGTDAPFPSGLQVKSHFTGERIRGFSEFQPHPRNGWYMHISRGLPFLVI	54704	61459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_56440_56565
900260	scaffold_12124_pilon	+	2432	1	Intergenic	novelGene_21980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1473	1841	699431	699799	NA	65	TAATAACAAAAACTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRSQCDCLNHLVLLQQKYHKWMVLTKRSLFLHSPVGYKSKFRASAPGERFLHWLWRKVHVISLLLVWELLCAGTSGPKDTLCSQHCFLGGMRFPCVSAHFCLLYLKRDCIKTLILSTSSV	697958	700390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_698000_700400
900261	contig_17198_pilon	+	1857	9	Intergenic	novelGene_62390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	103.493659226061	28	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	404	1321	1060803	1083495	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPVQIISRRLISQPYCGLKSAASAQTKIHPTMARPSSNMADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRYRANQGGKQKVLRSWDMVV	1047913	1084031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1048196_1056768_1056843_1060755_1060918_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318
900262	contig_10734_pilon	-	2062	12	Intergenic	novelGene_51489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	562.242749255968	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	77	1576	2285163	2265543	FALSE	80	AAATAAAAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENQSRIIKRDIKRGLRTVKGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2285769	2265056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2285711
900263	contig_9668_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_58243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCTAGGTTGATTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589729	591980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_589700_592000
900264	contig_11720_pilon	+	1106	10	Intergenic	novelGene_43834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	10	1071	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68054	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
900265	contig_10159_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_30813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444166	445695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_444200_445700
900266	contig_16492_pilon	+	4911	23	Intergenic	novelGene_100299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_18	257.877128951684	573	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1364	4095	451	4545	159423	195042	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKAFREGSRKSLRMKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENLEKRKKRRDQPLEQSNSDIEVTTTTSETPVVDETKTEAPESEVGNPASNVAIPSTPQSVGVNTRRSSQAGDVAVEKPVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFENISSPESSPAHRPESLSPELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQLLQCDSPRTESQSLLQQSSSPFRGHPTQSPGYSYRTTALRPGNPPSHGSSESSLSSVSYSSPAHPVSTDSLAPFTGTPGYYSSQPHSGNSTSSSLPRRSCPSSAASPPPQGPSDSPTSDLVSQSSTGTLSSTSFPQNSRSSLPSDLRTISLSNAGQSAAYQASRVSAVSNSQHYPHRGSGGVHQYRLQPLQGSGVKTQTGLS	154530	195408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_154662_158439_158546_158871_159081_159418_159478_159993_160182_161131_161171_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337_170596_171328_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_187439_187497_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014_194104_194433
900267	contig_6163_pilon	-	1734	6	Intergenic	novelGene_103802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	340.581620173491	51	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	34	573	93933	76115	FALSE	25	ATAATCATCTGCAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLPPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYILGLCQQQGCHTGGLVYPRLPVYYDRFRGWQDPRLEWRKWYQSSCAGWKTHRPHHLFAVQPQVHDLCQCMFQHGLLVAYH	93966	74953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_77811_77887_86934_86975_89577_89676_93772
900268	contig_17144_pilon	+	1779	10	Intergenic	novelGene_29441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7010	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	894	1211	167621	168283	TRUE	40	TTACCCCATCTGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166074	181840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173137_181808
900269	contig_3077_pilon	+	3201	2	Intergenic	novelGene_26834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	385	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	85	321	542417	564061	FALSE	25	GGAAATTAGGTTCCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEDGGGRDGGPGPGSWTAEAFGSELFRMPVYLAFDSPPSVPGLTCQSTRCRRRRPGPSVRPRLATGPRSCRGARRSCTSLRFKAQLFRVRVEAFPSLHEKEASAG	542332	566941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_542613_564020
900270	contig_17618_pilon	-	2711	2	Intergenic	novelGene_173356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	0	11	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1408	1713	21279	20974	FALSE	5	TTATTTTTGGTTTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGTCLWPRQLQCITTPFGNTFTEVLQTLCDIYDESVLCFQTSIISIMAFGSGVRAEIAQERRKGKKKKKTTALTFFISFECNYCESLKAVFWLSPSHSK	31977	19975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_-_21377_30667
900271	contig_13760_pilon	-	2798	5	Intergenic	novelGene_61337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	35.4003884159482	155	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	426	1334	333942	324174	FALSE	10	TTTCTTGTTAACTCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPGRLLLIILCSLVFLAVYILICGWACLPLCLATCLEPHLPTSSRPTMLGPLHFSGYSSVPDGKPLVREPCRSCAVVSSSGQMLGSGLGTKIDGAECVLRMNQAPTMGFEADVGRRSTLRVISHTSVPLLLRNYSHYFQQARDTLYVVWGQGRHMDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRRQSGSFLSTGWFTMILALELCEEIVVYGMVSDSYCREESHPSVPYHYFEKGRLDECQMYLAHERAPRSAHRFITEKAIFSRWAKKRPIVFAHPSWWAQ	334367	322709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325726_327791_328205_330568_330755_333930
900272	contig_7151_pilon	+	1601	1	Intergenic	novelGene_40803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCAGCCTCTGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533900	535501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_533900_535500
900273	contig_13425_pilon	+	2686	3	Intergenic	novelGene_170843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	299.5	455	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	156	1910	59676	62332	FALSE	15	AGAAGTTGTGTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEVSEYLSQNPRVALWVEALRCDGETDKHWRYRREFLLRNAGDLAPTGGVASSNTDEAADAKSGTCSRQLQQLISFSMAWANHVFLGCRYPQKVMDKILSMAEGIKVTDAPIHTTRDELVAKVKKRGISSSNEGVEEPSKKRGIEGKNNSAVEQDHAKTSAKTEYPLAKQENSSTCMGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKLFLKKKVVVKICKRKYRGSEIEDLVLLDEESRPVNLPPALKHPQELP	59520	63108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60561_60980
900274	contig_233_pilon	-	3539	15	Intergenic	novelGene_14590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1528.09235483264	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	1261	2808	108727	91536	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNYEAVRGTPLWLALQGTRFGGLLD	126981	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91607_93800_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_109749_109814_109976_126903
900275	contig_12313_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_171856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACCTGTTGTTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99094	98339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_98300_99100
900276	contig_5718_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_110388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1896	2195	1225316	1225017	NA	25	CAAAGGTCCCTGAGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHSLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNREFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTIQPGSGQPRKTKWD	1227211	1224580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1224600_1227200
900277	contig_5145_pilon	+	3516	5	Intergenic	novelGene_131452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2828	3145	936106	937483	TRUE	10	CTTCCGGTCCAGGAGCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTKLIKKKKKKPTKRLTDSMTSKNTSFFRYLIPSDLQDTALVTVAGGPWGPRLQLVALLSDVLLQDLAVCGLRVAEVHELIQQLIDDDKVVTDALLLQLLKVF	933278	947088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_936297_937356_937494_939098_939164_941152_941307_946946
900278	contig_1008_pilon	+	2918	1	Intergenic	novelGene_121568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603364	606282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_603400_606300
900279	contig_7165_pilon	-	1556	8	Intergenic	novelGene_116915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	40.8686297538734	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	355	726	1231263	1227502	FALSE	25	CTCTGCATACAAACCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIGVKQWEQQDNVALKGGRGSASMVQKCKLCSRENSIEILSSTIKSYNAEDSEKFKTIVEFECRGLEPVDFQPQAGFAAEGVESGTVFSDINLQEKDWTDYDEKAQESVGIYEVTHQFVKC	1233108	1226671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1227580_1228037_1228104_1228838_1228917_1230701_1230734_1230938_1231021_1231227_1231421_1232685_1232770_1232995
900280	contig_12090_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_80485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	184	837	74669	75322	NA	40	CAGCAACTAACAACATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRPPKGVSSAEQRLQHLSSQPRPLGGRALAFLEGLCPGFFGPSRPPWPGCAQLFVGGAPQTMAGELDSSKPLSGLLSGLAQDAFHGHPGITEELLRSQLYPEVPPEEFRPFLAKMRGILKVPLFPAASAAEPSPILAALGLRPPQLRKLRSSRRCCLLRIAFLLIRELTPAPCRFPGADTLLRLPASVRADRRSRMGTLRFCPGHLFAAWCCVGSSFELPFGSVGAGLLKIKRDKSPASPGRGMGRFRVSSVYRIRGGLPTVNTCQEIHCMIKTYLPA	74485	76758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_74500_76800
900281	contig_6102_pilon	+	2606	23	Intergenic	novelGene_31744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	164.551286938322	418	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	501	1787	218430	227560	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQNLGKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFHIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKYPEKFNSSPPLPALCNLSPSHWAMWWG	216153	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_216300_216698_216776_217097_217221_217478_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_227023_227264_227330_227499_227657_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
900282	contig_7887_pilon	+	3063	4	Intergenic	novelGene_124858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2034	2366	135504	135836	TRUE	25	GATTTTATGTCTGATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSALHPFVETSQLVFRQFLEPCFSPVPSEQLGMLPSVPSVLDHMLPPEMVERRTVYFGTLTLYSFHLLVMLPASFNILPIESFSITTQDLNFFFSCFSLRNAKSVLLPF	123124	189265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_123407_133752_135933_153344_153768_189087
900283	contig_9843_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_114312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTTAGATTTATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27227	24337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_24300_27200
900284	contig_9481_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_149665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGCTGTCAGTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360528	361697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_360500_361700
900285	contig_5236_pilon	-	2730	14	Intergenic	novelGene_100942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	191.624077250873	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	369	1823	1010248	1006770	FALSE	15	TTTTAGGTCTTGGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011677	1005862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007078_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
900286	contig_4857_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_48915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATCTTCATCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770414	1771835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1770400_1771800
900287	contig_12837_pilon	-	6693	2	Intergenic	novelGene_57338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGAGCAGCACGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171856	163128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_163967_166001
900288	contig_17753_pilon	-	2767	2	Intergenic	novelGene_105046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGGGGCGGGGGGAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52845	45434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_45683_50326
900289	contig_20241_pilon	+	2664	10	Intergenic	novelGene_159746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	34.6092829907787	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	321	1154	239418	253563	FALSE	30	ATTGTGATTAAATGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFVVNKKMEFGVVYSCVEDKMYTGRRGHGAFCDGQKLQVSQQEDITKSLLVTELGSSRTPETVRTVLSNMEKLLCIPVHGIRGVGTAAVNMCLVAAGGADAYYEMGIHCWDMAGAGIIVTEAGGVLTDVTGGPFDLMSRRIIAASSRTLAERIAKEIQIVPFQRDDED	235283	255073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235754_236036_239404_239481_240085_240220_241925_242031_243723_243770_246679_246789_248322_248432_252525_252678_253447
900290	contig_9363_pilon	-	4141	5	Intergenic	novelGene_6490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	96.4789484810028	127	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	3091	4080	373380	372391	FALSE	30	ATTAGATCGTTTCCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	571079	372329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_377125_397284_397367_405212_405243_570673
900291	contig_10765_pilon	-	3361	10	Intergenic	novelGene_122925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	62.8892815064305	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	332	1501	243671	222119	TRUE	85	CGAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQEGVGREVMGQCVWLQGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLIMTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKAEAVQEEEDTTVHEDDLSSSINELPATFECSDSFSLGMTEAEEKGDRALDQFTLASFGEGDRGVSPPPSPFFSAILAAFQPTACDDAEEAWRSHINQLMCDSDGSCAVYTFHVFSSLFKNIQKRFCFLTCDAASYLGDNLRGIGSKFVSSSQMLTSCSECPTLFVDAETLLSCGLLDKLKFSVLELQEYLDTYNNRKEATLSWLANCKATFAGGSRDGVITCQPGDSEEKVIKVCENLSLLCSGIVCWF	244002	197894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_199334_202638_202842_203832_203944_222011_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236243_239034_239202_242487_242650_243413
900292	contig_13607_pilon	+	2685	11	Intergenic	novelGene_170167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_10	128.88913840972	353	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	30	2108	131615	478840	FALSE	10	TTGTCTGTCTTGTGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGGGGGGRMQGKKPGGSSGGGRSGELQGDEAQRNKKKKKKVSCFSNIKIFLVSECALMLAQGTVGAYLVSVLTTLERRFNLQSADVGVIASSFEIGNLALILFVSYFGARGHRPRLIGCGGIVMALGALLSALPEFLTHQYKYEAGEIRWGAEGRDVCAVNGSGGGEGPDPDLICRNRTATNMMYLLLIGAQVLLGIGATPVQPLGVSYIDDHVRRKDSSLYIGILFTMLVFGPACGFILGSFCTKIYVDAVFIDTSNLDITPDDPRWIGAWWGGFLLCGALLFFSSLLMFGFPQSLPPHTDPAMESEQAMLPEREYERPKPSNGVLRHPLEPDSSASCFQQLRVIPKVTKHLLSNPVFTCIILAACMEIAVVAGFAAFLGKYLEQQFNLTTSSANQLLGMTAIPCACLGIFLGGLLVKKLSLSALGAIRMAMLVNLVSTACYVSFLFLGCDTGPVAGVTVPYGNNSAASSALDPYSPCNNNCECQTDSFTPVCGADGITYLSACFAGCNSTNLTGCVCLTTVPPENATVVPGKCPSPGCQEAFLTFLCVMCVCSMIGAMAQTPSVIILIRTVSPELKSYALGVLFLLLRLLGFIPPPLIFGAGIDSTCLFWSTFCGEQGACVLYDNVVYRYLYVSIAIALKSFAFILYTTTWQCLRKNYKRYIKNHEGGLSTSTEYQDIETEKTCPKSHSPSEDSFMRS	131585	479417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_131795_210138_210605_398333_398433_411345_411610_431540_431706_437817_438017_440116_440256_450387_450564_456422_456488_468605_468849_478757
900293	contig_6847_pilon	+	1847	2	Intergenic	novelGene_143899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	239	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCTGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241186	243064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_241536_241566
900294	contig_3822_pilon	-	4758	1	Intergenic	novelGene_133326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302974	298216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_298200_303000
900295	contig_5727_pilon	-	2231	3	Intergenic	novelGene_7971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	294	junction_1	40.5	27	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1072	1584	200367	198938	FALSE	20	ATGGGTAACTTTGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKIKSKAIISSSDDSSDEDKLKIADEGHPRNSNSNSDSDEGERRKKHASSESDSDDNQIKSGSEAGSPRRPRRQRSDEDSDSDQPSRKRRASGSEQSDNESLQSGRSRSGASENDSRPASPSAESDRDSERGSDNEGSVQGSGNESEPEGSNNEASDRGSEHGSDDSD	201651	198290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_199365_200281_200395_200607
900296	contig_19016_pilon	-	3640	1	Intergenic	novelGene_173331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	332	999	2362	3360	6021	5023	NA	50	AGATGAAAATCATAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEEDTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQEQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	8382	4742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19016_pilon_-_4700_8400
900297	contig_12050_pilon	-	4570	5	Intergenic	novelGene_62740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	169.004992529807	25	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	233	646	697920	696482	TRUE	20	TAAATTGTGGTCATTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVGPLLCTAPVGPCSVGAGTVEPFCGVRWGTTEGWLPPWARKGNISHLHIVIKCLLPLRLYARCGENKTFLKMFTS	698152	685537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_687342_687460_693021_694177_695000_696775_697799
900298	contig_1452_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_115131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTATTCTGGGTAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696604	698441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_696600_698400
900299	contig_854_pilon	+	4537	28	Intergenic	novelGene_36550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2769.38600753137	16	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1162	3489	76	3564	1649769	1714980	FALSE	55	TGTTTTAAAAGTAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1649645	1715953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649712_1649759_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1714866
900300	contig_14744_pilon	-	1389	8	Intergenic	novelGene_66153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	284	634	1678700	1676121	TRUE	15	GCCTTCCCCAGTACAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERASLALRTARIKESSHSGRYRTQERILICFSINRFPVSRATSRCCRSKRTVSIREDTPFSVVFSEFFGSTGWLRLGSPLISLNVKERILNHMVSSSKESFLCSSETFTCLLDPS	1681772	1673750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1674249_1675318_1675470_1676014_1676147_1677967_1678206_1678613_1678736_1679038_1679108_1680471_1680572_1681693
900301	contig_14047_pilon	-	10016	6	Intergenic	novelGene_176580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1286	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTCCAGCGTCTTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113328	27087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_-_27122_27825_36163_47810_48716_67345_67523_83740_83978_113002
900302	contig_14441_pilon	+	1092	5	Intergenic	novelGene_100517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	409.281916898365	66	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	481	909	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111106	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113664_113711_116578_116963_117220_117344_117539
900303	contig_11338_pilon	+	1667	10	Intergenic	novelGene_6279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	83.0414146267384	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	40	1044	172347	189573	FALSE	15	ATCCATTTTACTTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAREEEEDDDYENMTPPYKDLPPKPGSMAPPRPPRAGELGLGDRRPNADFALLRLSNHSSLPRKEKEDPFNSLQAPEDGRAEPHPCVLHISSTRYWTGTFSVPATPRHLSASCPSTATPVPCLSQKPGGPGRCWEDRLIVCLCPLVVVSLLLGCISLAVTLIKYKAVVEELRMLTFQQMAWQANVTGMAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172307	190196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172384_176187_176351_176432_176475_176652_176695_177517_177685_177767_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
900304	contig_3077_pilon	-	2191	5	Intergenic	novelGene_26763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACAGCAGGGTCTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18083	12041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13162_13856_13985_15135_15262_16144_16326_17447
900305	contig_14744_pilon	-	1955	6	Intergenic	novelGene_66003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	415.554280449618	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	90	599	969897	968300	TRUE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969986	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967450_967948_968630_969717
900306	contig_2834_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_28011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAAAATCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283328	285089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_283300_285100
900307	contig_7840_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_68987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTCTCCCAGAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229665	231794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_229700_231800
900308	contig_21007_pilon	+	1322	2	Intergenic	novelGene_161528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	4364	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	15	CTACGTATCTGTCGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
900309	contig_9698_pilon	+	7455	24	Intergenic	novelGene_82487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_16	278.098811504656	117	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	711	2136	3480	5615	237185	254787	TRUE	10	TGTATATGTGTGTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTITDLLSEQKTSASQASPQSASSPRIESTTGITTATSPRTPSPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTLEQGSLDLDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQGTNICGKEDSGDHASNVQLEKCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCTAVEIRNIIEKVKCSLEITLQEKYQRELQTLKNEYEAKLDALIKESEENENKIKKLKGDLVCLEEVLQNKDNEFALVKHEKEVVICLQNEKDQKLLEMENIMRTQNCEIKELKESQEIVLGDLKKLHVENDEKMQLLRAELQYLEQSHLKELEDTLQVRHTQEFEKVMTEHRVSLEKLKEENQHRIDQIQESHATVVQEKDQQLQELKLKVSDLSDMRCKLEVELALKEAETDEIKLLLEESKAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELKTLMTIEKDQCISELISRHEEESNMLKAELNEVTSLHQQAFEIETKLKDQIVELQNKLESELSTLEKQKDEKMIQQEDRYEAIIHKLEKDKEKLVMSQDQDREQLIQKLNSEKEEAIKTALNEFKLGRDAAEKELLEKVRHLETQLAKSPATESAREESSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNVRTSLIAEQQIWFWTAVEER	133063	272665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_133377_177483_177599_189984_190106_191298_191426_191631_191803_206425_206629_208375_208803_214786_214958_233675_233861_234077_234265_234400_234483_235375_236665_237096_237224_237309_239208_254502_254669_254754_254940_257699_257809_257920_258162_262139_262195_264719_264768_266734_266794_268646_268784_270843_270915_271697
900310	contig_12644_pilon	-	2117	12	Intergenic	novelGene_44483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	511.568241895158	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	767	1885	1056052	1026128	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1123679	1025895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062644_1063291_1063383_1068651_1068750_1123231
900311	contig_4678_pilon	-	8333	10	Intergenic	novelGene_126018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	911	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCTCTCCAGCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337187	296864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_297474_309449_309607_311070_311277_315733_315847_319536_319807_322310_322430_323150_323289_326681_326791_329051_329256_330779
900312	contig_16970_pilon	+	6584	22	Intergenic	novelGene_157590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_8	101.893791131755	975	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1090	3273	87	3359	18974	181904	FALSE	15	CTTAAGTAGGGTTTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIEDSTGVRRVVVTPQSPECYPPSYPSAMSPTHHLPPYMPHHPHFIHNSHTAYYPPVTGPGDIPPQFFPQHHLPPTIYGEQEIIPLYGMSSYITREDQYSKPPHKKLKDRQIDRQNRLNSPPSIYKPNCTTVYNGYGKGHSGGSSGGGGGGSGGGPGIKKTERRARSSPKSNDSDLQEYELEVKRVQDILSGIEKPQVSNIQARAVVLSWAPPVGLSCGPHSGLSFPYSYEVGLSDKGRDGKYKIIYSGEELECNLKDLRPATDYHVRVYAMYNSVKGSYSEPVSFTTHSCAPECPFPPKLAHRSKSSLTLQWKAPIDNGSKITNYLLEWDEGKRNSGFRQCFFGSQKHCKLTKLCPAMGYTFRLAARNDIGTSGYSQEVVCYTLGNIPQMPSAPKLVRAGVTWVTLQWNKPEGCSPEEVVTYTLEIQEEENDNLFHPKYTGEDLTCTVKNLKRSTQYKFRLTASNMEGKSCPSEVLVCTTSPDRPGPPTRPLIKGPVTSHGFSVKWDPPKDNGGSEILKYLLEITDGNSEANQWEVAYSGSATEYTFTHLKPGTLYKLRACCISTGGHSQCSESLPVRTLSIAPGQCRPPRVLGRPKHKEVHLEWDVPASESGCEVSEYSVEMTEPEDVASEVYHGPDLECTVGHLLPGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCRAPCISCTPDGWVLVSWESPESSGADISEYRLEWGEDEDSLELVYHGTETCFEIRDLLPAAQYCCRLQAVNQAGAGPYSELVHCQTPASAPDPVSTLCVLEEETISAYPDSPSVCLLLNWEEPCNNGSEILAYNIDLGDTSITVGNTTTHVIKDLLPETTYRIRIQAINEIGAGPFSQFIKAKTRPLPPLPPRLECAAAGPQSLKLKWGDSNSRTHAADDTVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRLTEFTCYSFRIQAASDAGEGPFSETYTFSTTKSIPPTIKAPRVTQLEGNACEILWETVPPMKGDPVNYILQVLVGRESEYKQVYKGEEATFQISGLQTNTDYRFRVCACRRCLDTSQELSGAFSPSAAFVLQRSEVMLTGDMGSLDDPKMKSMMPTDEQFAALIVVGFATLSILFAFILQYFLMK	18887	185129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_19134_22382_22671_64802_64862_74719_74872_77041_77102_85736_85876_89378_89433_106962_107088_109330_109506_111312_111400_114425_114565_116586_116659_119119_119239_123253_123360_124332_124506_126914_127029_127368_127519_132526_132808_144813_145027_162197_162365_166330_166459_181592
900313	contig_5936_pilon	-	3507	1	Intergenic	novelGene_53597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCTCAGTTCTCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550583	547076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_547100_550600
900314	contig_5881_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_129061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATCAAAGAGATGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586827	588922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_586800_588900
900315	contig_3077_pilon	+	2270	9	Intergenic	novelGene_26791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_5	843.219833436097	3047	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	296	928	473998	477881	TRUE	20	TTTAACGTGTGGTCTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSNSTKL	467315	482393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_477865_477982_479457_479646_481023_481218_481533
900316	contig_18208_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_176196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3047	junction_1	0	23	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGAAATGCTTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155458	154380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154835_155353
900317	contig_8140_pilon	+	2141	6	Intergenic	novelGene_86431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_4	367.795595405927	182	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	28	1185	181766	191234	TRUE	40	AGAAATTTAATCATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FADLEYPDIMGAFLDKPKMEKHNAQGQGNGLRYGLSSMQGWRVEMEDAHTAVIGLPSGLETWSFFAVYDGHAGSQVAKYCCEHLLDHITNNQDFKGSAGAPSVENVKNGIRTGFLEIDEHMRVMSEKKHGADRSGSTAVGVLISPHHTYFINCGDSRGLLCRNRKVHFFTQDHKPSNPLEKERIQNAGGSVMIQRVNGSLAVSRALGDFDYKCVHGKGPTEQLVSPEPEVYDIERSEEDDQFIILACDGIWDVMGNEELCDFVRSRLEVTDDLEKVCNEVVDTCLYKGSRDNMSVILICFPNAPKVSPEAVKKEAELDKYLECRVEEIIKKQGEGVPDLVHVMRTLASENIPSLPPGGELASKRNVIEAVYNRLNPYKNDDTSCSLHPFSYTHP	181738	192962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_182600_184978_185097_189349_189459_191060_191119_191195_191292_192063
900318	contig_12528_pilon	+	4896	23	Intergenic	novelGene_81278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	266.9905591546	405	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	179	2536	284346	344698	FALSE	25	GTATACAGTTGCTTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLRMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCDSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPASPSTADKEENPAVLAENCFRELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVQCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKDSPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVDFEASDLQGSSACSTALSTSSKDSDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTTTHNLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTMVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDASFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLVIALQDSVIINEDNLPMFQRCGIMALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKYTLPKSLEKHDKNLYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVKDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILPNSVPSDDVVSNTEEITFEALKKAIDTNGIEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY	246447	347058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_246528_281542_281620_284324_284453_286846_286998_289038_289161_293929_294080_295481_295620_297531_297611_299724_299861_301889_302058_305296_305412_306949_307002_307896_308070_308532_308609_312425_312588_313171_313304_315483_315552_316469_316598_327245_327338_332992_333042_337048_337153_338090_338141_344592
900319	contig_3825_pilon	-	3926	5	Intergenic	novelGene_77988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.1989096480618	552	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	189	557	655715	650420	TRUE	25	AAGTGCCTGAAGTGTGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILKEMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDSREYPDAQGFAADIRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPVEVPAPPRACSPGGEQGCRELPQQ	655903	638411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_641482_648694_648918_650343_650537_652713_652843_655592
900320	contig_14687_pilon	+	1777	3	Intergenic	novelGene_107888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	3.5	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	299	973	404992	405666	FALSE	15	TACCTTTGTTGAATGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLLLIQERWKRAKREERLKAQQNTDKDIAAHLQTSHKPSAEDTEGQSPLLLQKYSPYTEKHLPENQRAFDRDPDTLLFLLQQKSEPTEPCIGSKAPKDDKTIIEEQATKIADLKRHVEFLVAENERLRKENKQLKAEKARLLKGPIEKELDVDADFVEKSELWSLPPHSETPTASSTWQKFATNTGKAKDIPIPNLPPLDFPSPELPLMELSEDLLKGLMNN	375528	406470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_375706_391200_391286_404955
900321	contig_6871_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_21608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTGTTAATTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448949	447973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_448651_448744
900322	contig_18162_pilon	-	2946	3	Intergenic	novelGene_122281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
900323	contig_4782_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_73679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGCATTTTACTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647688	649123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_647700_649100
900324	contig_20199_pilon	-	771	3	Intergenic	novelGene_82523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	50	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	28	363	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44014	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
900325	contig_6445_pilon	-	1568	15	Intergenic	novelGene_76885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	859.783420759115	9	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	186	1331	89674	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68081_77856_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_89993_90107_96306
900326	contig_610_pilon	+	1932	4	Intergenic	novelGene_76667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTTTTTTGAAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30503	70053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_32067_45051_45277_68886_68957_69979
900327	contig_5686_pilon	-	2948	18	Intergenic	novelGene_45209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	904	1575	208699	203000	TRUE	45	AATTTCTATTTCAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	241665	93555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171802_175534_175558_176665_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222909_224033_224201_241595
900328	contig_6445_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_77051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGTAACAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654787	651988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_652000_654800
900329	contig_5279_pilon	-	1285	8	Intergenic	novelGene_105558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	337.818995128142	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	81	638	353138	335367	TRUE	65	TAGAGAAGAAGAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAQKGTKEKEDIVQRSTDDFPKGKLKMVSLDITEVKSPKVKCSETRRKIQSGDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKGI	353218	292821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_292900_322494_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_339168_339283_339885_340245_353062
900330	contig_3721_pilon	+	5097	13	Intergenic	novelGene_123789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	249.935602817117	171	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	2580	4019	63865	102235	TRUE	5	TTGGTTTGTACTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTRRAAPLQQQHSEQSVPQPSPVMTRRGLRNSHSSEEDDPSSQTVLSQPVSKNTVRTPEVPVVSEDPVISLCRPPLRNSRSDSSYKTNGNSKMSELEAASVQQKANFSEEGETEEDDPDSSESDVTAGKFRSGDSVESGDQTIRSASQYAESLWQSSRSRDFTTAHNKQPSVLSSRYQKNPQEWVEQTPRIRSRMRNDNVHVQKSVLGNQSPSTSSQQVARQPKTTGFFQKWWWSLLLVAAVAIGIFWSIHTPEVETTAVKEFQNQMRQLKSKYQGQDEKLWQRSETFLEKHLNSSHPRPQPAILLLTAARDAEEALKCLSEQIADAYSSFRSVRAIRIDGTGKAAQNSDMVKLEVDQELSNGFRNGQNAAVVHRFESLPAGSTLIFYKYCDHENAAFKDVALVLTVLLEEETLGTSLGLKEIEEKVRDFLRVKFTSSDTPNSYNHMDPDKLSGLWSRISHLVLPVQPENALKRGFCL	46657	103781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_49191_63818_63977_69505_69581_72136_72197_73079_73125_80561_80604_81608_81696_88204_88262_90636_90682_91202_91272_95822_95886_101450_102399_102866
900331	contig_8310_pilon	+	2263	15	Intergenic	novelGene_75577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	412.234577563279	6	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	212	1432	283370	313849	TRUE	40	GAGAAAACAGTCGAGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCPTEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVAQLEEEIRMRSADDCKRFREEFNLLPSGHVHGTFEQANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSHVDGIPCSDYVNASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDVTVKHSN	283158	325155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_283526_290040_290132_294706_294784_295440_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311035_313829_314034_317695_317886_320576_320713_324834
900332	contig_10324_pilon	+	4306	22	Intergenic	novelGene_7693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	34.0202687350828	616	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1372	1797	11902	13152	TRUE	10	TGGTCCACTGCGCACGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKPRHSLYFIGYQDDFLLYLDPHYCQPSVDISQADFPLESFHCTSPRKMAFAKMDPSCTVGFYAGDRKEFETLCSELTRVLSSSSATERYPMFTLAEGHAQDHSLDDLCSQFSQPTLRLPRSGRLLKAKRPSSEDFVFL	9591	21904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_10930_11868_11948_12019_12097_12176_12297_12969_14108_14675_14774_14869_14889_16248_16321_16410_16500_16592_16669_17911_18082_18170_18270_18368_18507_19049_19172_19519_19594_19668_19769_20051_20100_20180_20238_20456_20567_20897_21001_21584_21660_21800
900333	contig_14441_pilon	+	768	3	Intergenic	novelGene_100721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	491.5	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	151	579	116728	117610	FALSE	10	CGAGTGTCTCATTTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	116577	117799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_116963_117220_117344_117539
900334	contig_6847_pilon	+	4458	11	Intergenic	novelGene_143859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	641.652553957358	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	512	1336	98739	110600	TRUE	25	TTCCAGCAGCATCATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74067	114723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77953_98703_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
900335	contig_401_pilon	+	2738	9	Intergenic	novelGene_42824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_7	1395.26815858995	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	59	1012	1711949	1714528	TRUE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYNNGGGGGGFGGGSGRYPVIQVFGVLARLAS	1711890	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1714325_1715234_1715419
900336	contig_5261_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_102478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1	414	662398	661985	NA	30	CAACGTGTATATAGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLHIAEKVVVFQTEQRDTVWFKIRKGACQGCILTLYLFNLCAEQTIQEAGLYEEERGIRTGGRLINNLRYADGTTLLTESEEDLNLLLMKIKDYSLHYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKI	662398	660131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_660100_662400
900337	contig_9098_pilon	-	2434	11	Intergenic	novelGene_75784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	453.762724339494	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	232	954	288130	264388	FALSE	35	CTAAACAGTGATAGATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295253	262907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267413_267490_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292840_292905_295200
900338	contig_20293_pilon	-	2038	16	Intergenic	novelGene_153505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_15	322.161960648505	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	211	1755	68656	19443	FALSE	45	GAAATGTACCTTATAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQTGALVHSYRGTGGIFEVCWNAAGDKVGASASDGSVCVLDLRK	119407	19159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_19470_20435_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147_116222_119316
900339	contig_14047_pilon	+	7571	2	Intergenic	novelGene_176582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAATCTTCTTACGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29608	48817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_35613_47250
900340	contig_9727_pilon	+	2485	6	Intergenic	novelGene_86340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	249.303028461349	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	117	584	425838	430935	FALSE	5	CACTTTTTGGGCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRLKSPFRKKKESVT	425245	432836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429427_430890
900341	contig_19032_pilon	+	2784	1	Intergenic	novelGene_172524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAAACACAGGATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144229	147013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_144200_147000
900342	contig_15047_pilon	+	1559	6	Intergenic	novelGene_52235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3077.58024428284	13	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	295	714	3242	4197	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAHGHMSPASMVHGTKCRVSEFSYLFPQTPKDRCDPPPHL	2551	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3545_4080_4434_4552_4676_20997_21062_21232
900343	contig_4301_pilon	-	4145	2	Intergenic	novelGene_65122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	401	junction_1	0	703	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	561	950	545856	545467	TRUE	75	AAAAAAAAAAAACCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFALNSPGIKVALPSGGLGREAADPALLASSTAWNGVDGDGTAVPSQPGCAKTFSASESSQRIFWPASHWSKSIWHHAAPSWKGLGRGGGGMALLSEVAAGVTAATGCGLRGCPLCCSLALLYIGPCL	546416	540987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_542416_543699
900344	SIRV7	-	2009	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33068	5	61	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114855	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
900345	contig_6898_pilon	+	2078	10	Intergenic	novelGene_35674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1546.80530987796	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	142	1329	59668	126957	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTITLFQGSDWALPPFDKPSTRVFLPVVLSLGTVNQEAA	59526	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122724_126840
900346	contig_8866_pilon	+	9122	1	Intergenic	novelGene_77825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTAAAGTCTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561532	570654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_561500_570700
900347	contig_6137_pilon	+	1105	5	Intergenic	novelGene_59160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	1113.9845151527	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	250	621	1268914	1313802	FALSE	20	TCTGCTTGCTCACAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNTLYNLFFLQDIFPTSKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKVCFLYLVSSFSSKCISFKSY	1239023	1314286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654
900348	contig_1090_pilon	+	4375	22	Intergenic	novelGene_131123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	235.132509560363	133	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	2125	4089	487967	513914	FALSE	20	ATCCCAGCCTTTGCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGMNATTIHFNLTFQSKNNDEFKIQITVEVDTREEPKLNSTTQKSYEHLVSPVTILPEAEILFEDVPLEKRFPKFKRRGNTTERLQEEVKIPLINISLLPKEAQLSLNNLDLQLEHGDITLKGYNLSKSALLRSFLMNSQDAKAKISEAVIIDERNDSLHVPLEKQVHKNVLANGLASERLQRSTFPAVTIKMKDHPQGQNPPQNLKSKAGFRSETQIQKIGGRGASNEKLSSLIVPLENHMTKEKKITGKEEEKNRVEGNVKNNIDVNEVLPGRKLQHYTEDYLGFLPWEKKKYFQDLLDEEESLKTQLAYFTDSKHTGRQLKDTFADSLRYVNKILNSKFGFTSRKVPAHMPHMIDRIVMQELQDMFPEEFDKTSFHKVRHSEDMQFAFSYFYYLMSAVQPLNISQIFDEVDTDQSGVLSDREIRTLATRIHDLPLSLQDLTGLEHMLINCSKMLPANITQLNSIPPTQEAYYDPNLPPVTKSLVTNCKPVTNKIHKAYKDKNKYRFEIMGEEEIAFKMIRTNVSHVVGQLDDIRKNPRKFVCLNDNIDHNHKDAQTVKAVLRDFYESMFPIPSQFELPREYRNRFLHMHELQEWRAYRDKLKFWTHCVLATLIMFTVFSFFAEQLIALKRKIFPRRRILKEASPDRIRV	406099	514200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_406379_406514_406670_440789_440876_457195_457316_458291_458334_460880_461087_465037_465103_465397_465533_481833_481996_482800_482981_483214_483386_485106_485226_486352_486566_487775_488876_491870_492071_492665_492886_493593_493708_497087_497174_497429_497529_500227_500396_503619_503711_513836
900349	contig_4531_pilon	-	3386	3	Intergenic	novelGene_47870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.5	690	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	257	772	199143	198628	TRUE	15	GCGTCTCTCTGATTGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLAHPGVCLAVGVACGMCLGWGLRVRFGMTPKSSMNETDRETGTEASILGESGEYKMILVVRNDLKMGKGKVAAQCSHAAVSAYKQIQRRNPELLKEWEYCGQPKVVVKAPDEETLAELLTHAKMLGLTVSLIQDAGRTQIAPGSRTVLGIGPGPADLIDKVTGHLKLY	211567	194653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_195050_196409_199165_211332
900350	contig_5302_pilon	+	2880	1	Intergenic	novelGene_81382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTTGTGGTTTGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102056	104936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_102100_104900
900351	contig_6494_pilon	-	829	7	Intergenic	novelGene_108560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1023.85688290242	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	399	752	3457	2635	TRUE	20	ACATGGCCTGACTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8313	2103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6483_6751_6883_8256
900352	contig_756_pilon	+	7104	9	Intergenic	novelGene_134772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_1	154.662485351167	781	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	250	1611	177389	204241	FALSE	20	TACTGCTGTGAACATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFLEDPSVLTKEKLKSELIANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLAASANSKGPPDFSSDEEREPTPVFGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRLEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYGVNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEDSTVELKLEKREPLKGRAKIPVTLKQRRVEHNQSYSQAGITDTEWTSGSSKSGPLQALTRESTRGSRRTPRKRVETSEHFRIDGAVISESTPIAETVMASSNETLVVNRVTGNFKHAAPILPITEFSDIPRRTPKKPLTRAEVGEKTEERRIERDILKEMFPYEASTPTGISASCRRPIKGAAGRPLELSDFRMEESFSSKYVPKYVPLADAKSEKTKKGRSIPMWIKILLFVVVAVFLFLVYQAMETNQGNPFSRFLPDSTESK	177139	209734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_177668_186009_186137_187913_188073_193805_193904_201392_201513_201611_201708_202141_202253_203248_203338_203958
900353	contig_16496_pilon	-	1530	2	Intergenic	novelGene_5136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	121	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	306	323	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3590	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
900354	contig_8954_pilon	-	1714	3	Intergenic	novelGene_130271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	229	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCAATTAAAAGATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160325	112662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_114353_145431_145439_160308
900355	contig_6710_pilon	+	561	2	Intergenic	novelGene_95668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGGTTCCTCTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653359	657832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657792
900357	contig_6208_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_52975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTGTGGACTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356747	354695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_354700_356700
900358	contig_4461_pilon	+	2645	3	Intergenic	novelGene_177926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_2	9.5	57	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	541	897	96251	99435	FALSE	40	ATCTATATAATGCAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQSRIGDSPIPGSGAYADDAAGAAAATGDGDTLMRFLPSYQAVEYMRRGEDPTIACQKVISRIQKYFPNFFGAIICANVTGSYGAACNKLPTFTKFSFMVYNSLKNQPTEEKVDCI	95710	101183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4461_pilon_+_96373_97609_97744_99334
900359	contig_12622_pilon	+	3589	4	Intergenic	novelGene_5844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	47.4201082523719	391	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1705	2298	465550	475513	FALSE	45	AAAAAAATAGCCTAGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	463845	476804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_465782_467745_467907_469399_469467_475379
900360	contig_9706_pilon	+	6228	14	Intergenic	novelGene_20900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	645.552907369348	358	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	294	1442	231608	365879	FALSE	45	AACTCATTTTTAAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFIVSSLCISSLLPTSLGLTSVS	91241	370665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684
900361	contig_10749_pilon	-	2369	14	Intergenic	novelGene_133435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1476.44770394525	172	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	767	1753	155250	137351	TRUE	25	AATTAAGATGTTTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRSVSF	156016	135749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_137271_137367_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
900362	contig_614_pilon	-	5152	35	Intergenic	novelGene_132636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	15	junction_7	132.116419380394	13	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1574	4725	41	4765	1069836	858400	FALSE	25	GTAACTCTTTTCCAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGKTIWLRNQLLEMLLSVMSSGHLHLSSEKKEEAFLSLGPDWFLLFMQGHLHPSTTVLGLKLLLYFLSSPVLRGRFKEGMAAGSWVANSAAGVDIIMNNLKSPPATPEQSACLLPGFRVLNDFLAHHVHIAEVYLIVSAFFLQTPLTELTDQPKDSLEAMLRWLLQKHHREEVLRAGLCLEGGLLLLEMLKATMNQPSADSEDDIWEQSFPASVLQFLGLVHSAYSQDPMWHALEFLQTLAAVTFPLGMQKGAMAESTWNAGSPGAAAEGHSPAEELQAPARKQLRMFTKLVLRGLLKSASSPKQWLPLEVLLEASPDSATGQQKRDFQSEVLLSTMEIFHIMSEGNAPVLGGGKEPQPNAEAAATPSLTNISYFTQKLVEKLHSGMFTADPRHILLFITEHIMVVIESIASQREAILSALYSSLNKVILYCLSKAQQSLSECLSLLSILSYLQEHWDIIFATYNSNAGFLLCLMHCLLQLNARSYPEGFGLEPKPRMTPYHQVFLSPNEEVRGKRGENVPSLSDVQHNIQRMVRTLWQQLVAQRRQALEDAFKIDLSVKPGESEVKIEEVTPLWEETMLKAWQHYLVSEKKMLASRSNVTHHSKVTSWSGSLSSAMRLMPSRLAKDPECKAEDFVPCIENYRRKGQELYASLYKDHVQRQRCGSIKAASAWARIKEQLFGELGLWGQTVGAAPCSQWELDRREGPARMRRRIRRLSPLEAQSQAAHEESQDRNDISQTNAGNKDELTPKEVEIERDEVAMDCTKLTFFPALHESLHSEDFLELCRERQVILQELHDQEKVSLKYSLVIVQGHLVSEGVLLFGQQHFYICENFTLSPVGDVYCTRHCLSNISDPFIFNMCSKDRSCDHYACQRHRYTDIREIRQTHFLLQDIALEIFFQNGCSTFLVFHNNDRSKAFKSFCSFQPGLKGKGITEDSLNLRKHPGSDRTMLQRWQKREISNFEYLMYLNTLAGRTYNDYMQYPVFPWVLADYTSETLNLANPKTFRDLSKPMGAQTKERRLKFVQRFKEVEKTEGDLTVQCHYYTHYSSAIIVASYLVRMPPFTQAFCSLQGGSFDVADRMFHSVKNAWESASRENMSDVRELTPEFFYLPEFLTNCNAVEFGCMQDGTVLGDVQLPPWADGDPRKFISLHRQALESDFVSANLHQWIDLIFGYKQQGPAAVEAVNTFHPYFYGDRMDLSSIRDPLIKSTILGFVSNFGQVPKQLFTKPHPTRTAAGKLSPGKDVNTPTGLLGHVQPFFYSLQSLRPSPVMVKGSESPKGAIGQIVPTEKTILAVERNKVLLPDLSNRTFSWGFDDFSCCLGTYGSDKVLMKFENLAAWGGCLCAVCPSATMVITSGASAAVCVWELCSARGQAGLCLRQALYGHTKAVTCLAASITFSLLVSGSQDRTCILWDLDHLTHVARLPAHREGISAIAISDVSGTIVSCAAAHLSLWTVNGQPLASVATAWGPEGAITCCCVMEGPAGDTSHGIITGSRDGIVRIWKTEDVKMSASQHTVAEEPSAQPPSPRGHRWEKNLALCRELDVSVALTGKPSKTSPAVTALSVSRNQTKLLVGDEKGRIFCWSADG	1069876	858012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_858467_859669_859782_863778_863864_864441_864625_866616_866797_871530_871687_872450_872615_874609_874758_877373_877587_886008_886101_887933_888088_898934_899045_901727_901846_904385_904506_906857_906901_943438_943502_945012_945099_948469_948591_966341_966491_982381_982549_983323_983373_985593_985801_993541_993620_1027597_1027735_1028986_1029173_1030633_1030756_1040528_1040768_1043109_1043268_1044339_1044455_1045124_1045314_1048805_1048971_1063954_1064081_1066593_1066764_1067682_1067889_1069789
900363	contig_5229_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_117673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	47	403	153496	153852	NA	10	CTGCTTGCCACTCCGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFTERSLFSHSLVGHKSKFRVSAPEEHSLCRLWRKVRVINLPLVWKLLCTGTSGPKEALYSWQCFLADMRFPTLRLLPFHLLRDKRWCWPLPRETPLHWIRNVTWVRVVLQYHPNPL	153449	155001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_153400_155000
900364	scaffold_12124_pilon	+	2796	6	Intergenic	novelGene_22269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3694.91859720887	114	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	825	1604	1508626	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491937_1508049
900366	contig_8775_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_166828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTTTCACCTAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160315	162087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_160300_162100
900367	contig_10148_pilon	-	4583	4	Intergenic	novelGene_172856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	515	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGAGGAGAAACCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339841	236939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10148_pilon_-_237058_285264_285898_327159_327284_336133
900368	contig_12624_pilon	+	2840	12	Intergenic	novelGene_60947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	268.712510358451	16	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	749	1369	39740	55078	FALSE	35	GTTTTCAATTTGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGKFWSVTDQSHHDSCLWDSNGPTPPSTAESLQRVY	6018	56549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39362_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50441_54975
900369	contig_12046_pilon	+	1769	2	Intergenic	novelGene_83487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTGTAGGGAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428489	430466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_428898_429105
900370	contig_4103_pilon	+	1946	2	Intergenic	novelGene_51939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	0	3146	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1120	1470	95174	95524	FALSE	30	GTACCAAGGACTTTTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISPPPGRGFILNKRMKVLTQNPYRPARPRKVTIVRTGREGGHCETTGFRAGGQGTQARNLPPADTGTAAAAAPNSGPLLQCQRRPACPARRGEGAQATAAGSKQDLSLQRCTEL	92170	96000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_92507_94390
900371	contig_8598_pilon	-	2896	1	Intergenic	novelGene_22866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCAATAACGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5949	3053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3100_5900
900372	contig_1093_pilon	-	2304	1	Intergenic	novelGene_139981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGATCTCCGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202422	200118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1093_pilon_-_200100_202400
900373	contig_7119_pilon	+	2317	12	Intergenic	novelGene_40857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	332.749800528965	110	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	767	1474	98364	112892	FALSE	10	GCACGTGTTTCTGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVRKNILDNKPTANKKCDLINVPKKTADMASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA	27547	113735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_27638_55126_55327_77981_78105_90791_90922_95067_95250_98276_98314_98359_98397_99516_99622_102234_102381_111479_111538_111632_111879_112772
900374	contig_6677_pilon	+	1480	8	Intergenic	novelGene_114213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	65.3121234487729	29	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	772	1479	596728	626427	FALSE	35	CCAGAAATGTCATTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNKGLRLGFWPCYHNQVNRTYCCGTYRAGPMRQISLVGAVDEEVGDYFPEFLDMLEESPFLKMTLPWGTLSSLRLQCRSQSDDGPIMWVRPGEQMIPTADMPKSPFKRRRSMNEIKNLQYLPRTSEPREVLFEDRTRAHADHVGQGFDWQSTAAVGVLKAVQFGEWSDQPRITKDVICFHAEDFTDVVQRLQLDLHEPPVSQCVQWVDEAKLNQMRREGIRYARIQLCDNDIYFI	584972	626428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_585003_594908_595583_596660_596779_615719_615858_616164_616308_624372_624541_625423_625533_626328
900375	contig_3449_pilon	+	4151	15	Intergenic	novelGene_73727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	405.390546137868	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	650	1996	512166	524912	TRUE	20	ATCACATTTTACTCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQDAGITSDTMMKNFFFVPSCIQLNQEDSFSTEA	493422	527127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493560_493640_493774_496888_497027_506311_506457_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524008_524356_524572_524800_526455_526514
900376	contig_1948_pilon	+	2129	4	Intergenic	novelGene_31137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCAGGGATCCCTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81404	149202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_81829_113604_115011_116335_116557_149124
900377	contig_5482_pilon	-	2977	1	Intergenic	novelGene_144499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTGTTTCTTCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590509	587532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_587500_590500
900378	contig_4732_pilon	+	2826	3	Intergenic	novelGene_75502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATATCCAAGTTCATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022829	1048509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1025123_1040789_1041309_1048495
900379	contig_3077_pilon	+	2237	5	Intergenic	novelGene_26796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	778.719461680521	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	230	850	473998	477634	FALSE	45	CACACAAAAGGTTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSK	467381	479021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443
900380	contig_6743_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_33546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	445	873	201474	201902	NA	20	TTTGAGAGCTTAGTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQEWKGVCCHSMGRATRVTQQCVYKFLYQKLTSSVNFHLKHNKNKMPCALTTQVQRRQKLWHTLPVGGHIELSCLTLNQALLFSCSGGICVISVRTSADSSENISLSNICYITNLLKFQVDRSSDSSNKGQCKYAHTCYH	201029	203684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_201000_203700
900381	contig_5686_pilon	-	3019	19	Intergenic	novelGene_45267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	896	1567	208699	203000	TRUE	45	GAAGCTGTGAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	241659	93802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93907_129745_129988_170205_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222914_224040_224201_241595
900382	contig_6217_pilon	-	3198	2	Intergenic	novelGene_109663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTGCTATAGCAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771952	760514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_762763_771002
900383	contig_6445_pilon	-	773	7	Intergenic	novelGene_76951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1048.60918469286	20	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	109	438	88578	49736	TRUE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLPPTPGHRKVGTVAAPILRTPWTCWGSLPQLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVSGTALSVSLSATASPSPRSGWKGRCRYLSSRVRCTSSAGSPRCHSTTRSW	96332	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_88146_88216_88473_88604_89656_89714_96306
900384	contig_1263_pilon	-	2508	6	Intergenic	novelGene_170406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1154	junction_3	525.581354311585	225	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	280	1650	65303	57943	FALSE	65	GGAAAAAGAAGAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVRTGEKNVSLPKRQIILFRFLLVESQSPAGAGSILSGGFFFKDIKDKIFLRASKGYDTFFKQ	76823	57084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
900385	scaffold_880_pilon	+	7551	2	Intergenic	novelGene_121438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_1	0	791	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCAGCCTTTCAGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417109	429169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_420365_424873
900386	contig_11259_pilon	-	3996	1	Intergenic	novelGene_144535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2496	2831	139186	138851	NA	65	AAGAAAAAGAAAGAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQADSNQKARVSISDKIDFKAKSIVKDKEGHYVMIKGMVHQEDITLVNMCPPNDRTPRYIKYDSQWFGSYNVVWQSYNNAIISIMGSVVSSQSVKREFPWECDLHPM	141681	137685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_137700_141700
900387	contig_14287_pilon	-	3179	2	Intergenic	novelGene_24061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTACAATAATAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31851	27920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_28701_29452
900388	contig_13165_pilon	+	3787	5	Intergenic	novelGene_178754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1758	2138	74123	249381	TRUE	45	AGAGTAACTCAGCACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQWEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDET	72034	261582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13165_pilon_+_72488_72818_74501_249378_249534_258307_259141_260918
900389	contig_6557_pilon	+	2083	3	Intergenic	novelGene_32962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGTTCAAAGGAGAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374542	386250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_374554_382923_384027_385281
900390	contig_14508_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_79049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53808	55831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_53800_55800
900391	contig_253_pilon	-	1916	1	Intergenic	novelGene_129635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTACTGACTGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237870	235954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_236000_237900
900392	contig_16125_pilon	-	3406	1	Intergenic	novelGene_155295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	436	1311	50	1360	236934	235624	NA	25	ATGCTTTTTCAGAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGEFLSCFPFSMFLSIEENVLTSRGKKLTRNDSITGTHAYVTNFVWRLFFFGVGGLRR	236983	233577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_233600_237000
900393	contig_3560_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_149497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	222	669	575	1243	197130	197798	NA	30	CTATGTATTCAACAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHYNESIERRPRVTFPETTLDETVNSIKYLLNKCRMERTRGCVNPRRQYPGSDVNSRVTRERKLHPEFLRKAGPEPRGDHEQPAGCRSRTRSSPHLFSNITCRPHPSPADRSCPNLRLLTSTSDELLFLGGPSLPAMGTLRPPGEIPWTAWFIEDTVFCPSALSSIYISDSQEVGRKRSIFSKEGEFPAMWLLPFGEGPPLAPDEPAPLSARGTDRGAVC	196555	199318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3560_pilon_+_196600_199300
900394	contig_8866_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_77877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCCCCAAGAATAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926648	928538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_926600_928500
900395	contig_1836_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_71075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATGGTTCGAATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976486	974580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_974600_976500
900396	contig_19342_pilon	+	1914	8	Intergenic	novelGene_41051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.91372543633873	21	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	660	1067	5070	6183	FALSE	30	GGCACCCTGAATTCAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3183	7030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4258_4294_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
900397	contig_16951_pilon	-	8207	3	Intergenic	novelGene_98659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	658	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2164	2469	103355	103050	TRUE	20	GGTCAGCAGTTTTGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRGKVAPCLPPHSPAYPLSGAKCLVWPNASLLHLSLVLLLLFKKPVAVKLTLTHGSLICVRVELRSIEFSMSDFSEVDCQAFLLRCLGWTQTARLLVSS	108112	95287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_97148_99171_104096_106689
900398	contig_7707_pilon	+	3889	2	Intergenic	novelGene_72202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	423	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGTAATATTGACACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688280	856687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_691689_856206
900399	contig_13984_pilon	-	2173	7	Intergenic	novelGene_130229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	1766	2173	6241	3675	FALSE	35	TTTGGATGCAAATTGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLPDLLHFLFFKRLSMLLLHLTLLRFSGFCFLLVQLCWSLNFWPLLCRRIRLRVFCSSRNCFMLLPLINISRHLLLLLLFGQFLFCAITLRRMCCCWGNSLLLCSFRFSKAWNPIQSVFQLFIFCNLSLHINCI	15788	3674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_-_3856_6014_6348_7979_8279_9099_9184_11083_11193_14290_14459_14789
900400	contig_6084_pilon	-	4087	3	Intergenic	novelGene_127041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCACTTGTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417878	326379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_330010_416640_416823_417603
900401	contig_5217_pilon	-	698	6	Intergenic	novelGene_135767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1794	junction_5	2348.02115833738	135	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	24	650	560372	557689	FALSE	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	560395	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
900402	contig_3424_pilon	-	4003	1	Intergenic	novelGene_55541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2749	3048	284903	284604	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVISRGSKPCLQPRKRRLVPLTLHLIPVSTNLITLGSPGGSVVRNLAANPKASSSNPPAAPWNPYRVVLLCPMGSLCVRIDSTATGFGLNHFRRLLPK	287651	283648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_283600_287700
900403	contig_10904_pilon	+	3873	7	Intergenic	novelGene_22667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3366	3728	542731	543093	FALSE	25	CCCCAGGAGACCACTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPISALSPLTLCPPEETLGPHLSRQSGCGAGQGFTSATRMYRDHWGPTTQRSVCMHHSLYRSLWMWFTWPRVKLGLCCQGAGRGGRGEVRATHRWSDRTCHSCPLSNTAGSAGSRQHQ	535196	543238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_537771_538076_538120_539111_539169_539553_539595_540490_540604_541596_541649_542245
900404	contig_6795_pilon	-	2140	13	Intergenic	novelGene_27668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	88.967066316075	258	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	659	1555	123001	46152	FALSE	30	TTAACATGCTGTGGATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHRPQNKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134362	45566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_122975_123159_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
900405	contig_14405_pilon	+	4260	4	Intergenic	novelGene_85645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	52.1301789327023	450	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	2747	3544	486491	491904	FALSE	20	TTAGGTTTATATTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNTEDSSHQSHYFPGIWAPSDAVLEQMDNGDWGYMMTDPVTLNVGGHLYTTSLTTLTRYPDSMLGAMFGGDFPTARDPQGNYFIDRDGPLFRYVLNFLRTSELTLPLDFKEFDLLRKEADFYQIEPLIQCLNDPKPLYPVDTFEEVVELSSTRKLSKYSNPVAVIITQLTITTKVHSLLEGISNYFTKWNKHMMDTRDCQVSFTFGPCDYHQEVSLRVHLMEYITKQGFTIRNTRVHHMSERANENTVEHNWTFCRLARKTDD	482795	492620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_485519_486467_486532_489320_489391_491217
900406	contig_5515_pilon	-	2041	6	Intergenic	novelGene_52315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	103.258123167139	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	508	1107	60874	59717	FALSE	30	AATGACTGCCCATTCGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLERPLPAQDLFDYITEQGPLGEGRSRCLFAQVVAAVRHCHACGVVHRDIKDENILMDLRRGCVKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFERDQEILEAELHFPDHVSPDCCALIRRCLAPKPSARPSLEEILLDPWMQTPAEDAPLSTPKGDPTPLAWSLLP	64026	58782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_-_59881_59978_60156_60615_60989_62830_62882_63556_63668_63795
900407	contig_15047_pilon	+	1664	6	Intergenic	novelGene_52225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	111	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	11	634	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2183	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
900408	contig_14223_pilon	-	3148	1	Intergenic	novelGene_156969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCTTTACAAATAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12278	9130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_-_9100_12300
900409	contig_4783_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_108345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAGAAATTCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54991	52140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_52100_55000
900410	contig_5419_pilon	-	3990	3	Intergenic	novelGene_15541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	3504	3962	427305	426847	FALSE	15	TACATGTGTGCACCCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNNKKRAGVAILISDKINFKAKFTTKDKEEHYIMIKGSIQRRGQHGGVVRCCLYLSYNKDLENTSDLIEYLRALDKARLRNPSERYGRGRPFGRGEEGQSREWQNCSSTAILVHGEADKQLCSARPWEAVSRSRETRQQRCCLDTPNQ	450295	426818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_430343_449701_449952_450079
900411	contig_1443_pilon	-	4255	13	Intergenic	novelGene_28357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_3	54.7334449856758	458	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	936	2811	127	2937	948786	939098	FALSE	30	CGCAGGACTGAGACTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEIDIWFPVVDQLEVPTAWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLSLCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNYQTGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDVPVEKPPEETAAQIPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVNSSDTAPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTADRSHSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEEGEQMTPELLMLQERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRNQEMVTGGILGLGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGVDEKEFTVQIKDEEGGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAEFNCLGVEPVQTANSRNGKKGHHAETVFNRVLPGPVAPESSKKRSRRMQPDLSKMMALMQGGGPGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMGGAASSPHVDSSTMLHHHHPHPHPHHHHHHHPGLRATGYPSSPATTTSGTALRLPPLQPEEDDEDEDEDDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDADD	950037	937779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_939665_942217_942335_942738_942919_943113_943231_944102_944406_944696_944849_945070_945788_945880_946090_946553_946762_946940_946996_947483_947560_948676_948807_949931
900412	contig_11986_pilon	-	1161	2	Intergenic	novelGene_69165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1534	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	229	654	509204	508779	TRUE	15	TTACATGTCTCATCTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLCSHTPVGYKSKFRAPAPGGRFLSLLALEEGPCHQSSLGLGASQRRNLRSKGHALLPALLSWWCEVPVSAHFSLLYLKRDWLKTLSNLVDIISITAANPSYYIIVIEFTTHREITSDDQMVDSHTLLGIMTQPG	509432	507214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545
900413	contig_4659_pilon	+	2476	3	Intergenic	novelGene_118226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	6	209	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAAGCCAATCTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790292	799338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_790385_791297_791478_797134
900414	contig_15114_pilon	+	4892	8	Intergenic	novelGene_121148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	468	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCAGCTTCGAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133292	204838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_137183_141881_142048_147671_147831_150654_150828_152061_152180_153335_153375_154909_155006_204587
900415	contig_10176_pilon	-	4428	1	Intergenic	novelGene_72717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	802	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGGAAAGGGCCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262939	258511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_258500_262900
900416	contig_8570_pilon	+	4927	2	Intergenic	novelGene_120133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACCAGAAGGAAGCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32438	112429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_35718_110781
900418	contig_16098_pilon	-	1561	10	Intergenic	novelGene_46045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1404.464161254	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	4	660	352350	350216	TRUE	30	ATAAAATGGCTTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVSGQEP	352353	348311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350073_350162_350422_350512_350643_350765_350889_352152
900419	contig_10904_pilon	+	2381	9	Intergenic	novelGene_22540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTGTAAAGAAGAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374361	396601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_375423_377963_378003_378679_378719_379274_379398_381162_381213_388756_389053_389358_389494_389762_389800_396000
900420	contig_10766_pilon	-	4008	19	Intergenic	novelGene_151185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2213	2560	142865	142518	TRUE	25	TCCCCTCCTCACAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIEYAMGCQKKEQICLGRSAARMLLRSKDERLRLTYFGHVIRRNQSLEKDIMLGKVEGRGKRGKPSMRWTDTVTTMGSSITTIVRMTKDQAVFRSVVHRVTMSQNQLDGT	189907	110691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_110898_112931_113143_114107_114377_114740_114860_135916_136029_136123_136253_138017_138086_139434_139570_142318_143962_147220_147332_153837_153932_155159_155252_155833_155877_156256_156416_161130_161286_172721_172872_174940_175019_188128_188277_189821
900421	contig_8383_pilon	-	3042	5	Intergenic	novelGene_172759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	35.3296971399416	245	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	2178	3041	318484	301443	FALSE	50	AAGAAAATGAAATCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTVFFSEDGLDRNELLPLSPLAPTMEEEPLVIFLTGDNDPEKVEERNKSEELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEVGVCQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMEDIHTSLKEGVPKCRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHSILVDLGRTFPTHPYFSVQLGAGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLSFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL	320661	301441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_-_301506_305648_305894_309916_310076_314751_314911_318246
900422	contig_8631_pilon	-	3440	1	Intergenic	novelGene_121973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793366	789926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_789900_793400
900423	contig_3122_pilon	-	3382	20	Intergenic	novelGene_64385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	128.248352383946	10	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	932	2799	519	3317	276393	250499	FALSE	5	CCTCTTTTCTCCTTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQLKIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEKKENKKMADEEQNIRLMQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKEHLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENSVTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRKKDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG	277499	250433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253146_255771_255847_256427_256546_257951_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277007
900424	contig_12148_pilon	-	2800	2	Intergenic	novelGene_140347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTACTTAGTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132251	128870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_130696_131276
900425	contig_12709_pilon	+	1687	2	Intergenic	novelGene_147411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAACCATGTTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45325	47439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_45608_46034
900426	contig_12950_pilon	-	5099	3	Intergenic	novelGene_114797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_2	56.5	558	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2208	173	2380	203624	191307	FALSE	45	TAAATTTAAACAGACTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIKTEESFSDTENDQGSRPEFSVDAVMKWTSSGTPDGHSLPDVTECSSTSELRNDISKRETALKIPNLKFSTKKECRFTFSLNESSRKLDHSVFTAYGEPNESIFSALRANDSFSKRMETHSNKNIIVYEEKHGYINLGMPLKCLPRDCQLKVTFVQSKYGQEENGQILRHCENPNIECILFHIVAVGKTIKKIVKVKELHVKGSTLCIYALKGETIKEALCKDGRFRSDLDKLQWKLMEGHQNIHEEESLVDEVSGKVLEIQIYRQKSVKVKTPKNPECKNENVTHKISPCGLIPSKKEVQDSERDRETEDVEHNRNFQSQSLRHDIKGKNRRTKSIISHHYKYRFYKKYRKLNSRVKRRPYLHRQHTINQDIQEDATYLWLKNFQKLDNTIMQQYPNFNKVPLLLGKCFREEQKRRKVTPFEQFKVYKKNFGKETANSNSVATYERLIPLSKSVGFITWDNNGNTGNGTGFHLKGGYVLTCLHVVHLIVGEGTHSTLWPDIVSKCAKVTFTYENFCPTYSSWFFFEPLLEVYDGNLDYVILKLKENGNAFPPGLYGQISPQPSSGLIYLIGHPEGQIKKIDDCAVIPLSQRLGKYPEYQDGLVETYVATNNACPMFTKRSFQSEVWSTNTLSYDTCFSSGSSGSPVFTASGKLVAMHAFGHFYKPVHKTYALIEYGYSLESIICDIQQKSESFYKFLNEEKNENHNEEKNEKQESSPQDHQNEPMEWMECS	204386	188587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12950_pilon_-_193440_203549_203702_204291
900427	contig_12622_pilon	-	1454	6	Intergenic	novelGene_5763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	302.345233135897	690	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	226	615	104350	102596	TRUE	25	ATCTGTGAATTACATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLGENSLDPLTTDSRKRKLPCDTPGQGLTCSGEKWRREQESKYIEELAELISANLSDIDNFNVKPDKCAILKETVRQIRQIKEQGKAISNDDDVQKADVSSTGQGVIDKDSLGPLLLQASIKVLDTQ	194603	87903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_88296_102148_102727_103191_103365_104264_104370_125265_125349_194480
900428	contig_8045_pilon	-	2055	2	Intergenic	novelGene_35401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119407	117233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_118040_118158
900430	contig_14326_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_120681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1611	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCAGTTGCTGAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120403	118245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_118200_120400
900431	contig_7919_pilon	-	8438	4	Intergenic	novelGene_28113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	798	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCTAGTATTTCCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417012	1406874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1412207_1413203_1413377_1413782_1413908_1414204
900432	contig_13275_pilon	-	7134	3	Intergenic	novelGene_178428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	136	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	5783	6415	1352	720	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNKKKKQERPPNKTGKKKTNDKEISSGIPLHVCGSRRGVSLARGSAWPERAPNSRKGKENRQTIQKEEKTRDPTSAVAQTGKQLHTQMELRRPSGKNKDGARSQALERKEGEAARGKQEIQSRKKKKKNNTSSQQMALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRPSVGEEGWRVGKRISPIAGALEPLRKKQRWRTEPGT	142006	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13275_pilon_-_2701_121380_121491_137682
900433	contig_11512_pilon	-	2677	12	Intergenic	novelGene_43376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1177.72653240214	13	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	134	1132	609650	556515	FALSE	15	GTAACTTTGCAGTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPAAAPTLAKVPAAALTPVRVLVSTSFPAPAPLGTVPGPSPWRCPARQPCGLRPWTWICSSPLPSSPFPPPACHAAHNLTLIQSLFSKSELW	622334	554969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556788_571078_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
900434	contig_20951_pilon	-	2381	15	Intergenic	novelGene_43112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_13	86.3418691443898	51	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	362	2380	237836	155040	FALSE	25	TAATGTTCAGAGGGGCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTPVPQQHEEEDLDDVILTETNKPQTSRPNLIKPAAQWQDLKRLGEERPKKSRAAFESDKNSYFSVCNNPLFNSAAQDDSEDDYSEFLDLGPPGISEFSKPSGQRGREPQPGPSHSQATNDIVNPGSEKKIILEDSNLLYSESDTLNQLSEDSEIELGESAAIVDDQAIEEDCWLDHPYFQPLNQETRERTSQVVPQEQRPEAELGPLLYQHEPPGPAFPRPVFPRPEPQQDGIPGPSSPQPAHPLGELEDQQLAIDDDEPGPAFPLQGSQEPNLENIWGQGATAVDQELIALLVKETEARFPDVANGYIEEIIRLKNYYDLNVLCNFLLENPDYPKREDRVIINPSSSLLASQDETKLPKIDFFDYFKLTPLDQRCFIQAADLLMADFKMLSSQDIKWALHELKGHYAITRKAFSDAIKKWQELSPETSGKRKKRKEMNQYSYIDFKFEQGNIKIEKRMFFLENKRRHCRSYDRRALLPAVQQEQEFYEQKIKEMAEHEDFLLALQMNEEQYQKDGQLIECRCCYGEFPFEELTQCADAHLFCKECLIRYAQEAVFGSGKSELSCMEGSCTCSFPTSELEKVLPQTILYKYYERKAEEEVAAAYADELVRCPSCSFPALLDSDVKRFSCPNPRCRKETCRKCQGLWKEHNGLTCEELAEKDDIKYRTSM	268896	155038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_155142_208039_208119_209206_209356_210309_210448_212025_212077_212792_212933_218280_218396_227946_228112_229223_229327_234046_234124_235970_236805_237770_237902_239596_239640_244509_244646_268779
900435	contig_3469_pilon	+	2449	2	Intergenic	novelGene_34140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	815	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	236	535	253975	254274	FALSE	40	AGCAGAAACACATTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATATDCSDQNHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPEGMAPRYPFSSVVKSSLRFTIQPGSGQPHKTKWD	236714	256188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_236747_253771
900436	contig_14744_pilon	-	2503	11	Intergenic	novelGene_66122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	93.367499698771	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	74	1030	1597397	1590956	TRUE	0	TTCCTTCTCCTGTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLWSALTSRSKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQYGQLSPQSGGRPR	1597470	1587228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1590998_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1597362
900437	contig_8885_pilon	-	1596	2	Intergenic	novelGene_115581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	411	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	322	621	245188	244889	FALSE	65	TGTAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQDLHQTTSSTARWCLATSTDCSDQDHNRGSWTELKKDIEQNSNTQEKDQIYWPERDWRNPKSMAPGHPFSSVVKSLPWFTVQPGTGQPHKTKWA	247542	243913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_245402_247434
900438	contig_15034_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_143627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	866	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTGATGGTTATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10398	8460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_8500_10400
900439	contig_2227_pilon	+	4108	2	Intergenic	novelGene_142340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239469	244304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_239543_240269
900440	contig_19342_pilon	+	1432	6	Intergenic	novelGene_41084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.78567765543682	56	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	20	553	3263	5306	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWGKRG	3243	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3765_4326_4365_5016_5522_5960_5994_6139
900441	contig_3602_pilon	-	3624	1	Intergenic	novelGene_60579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1396	1716	652211	651891	NA	40	GAAACTGAACAACACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVCILEFSRQETGQSSYICCPPRKEPNDVIRVGATLCDNSRCHPPPSRQGCVGPAGAEHLQPRPYSSPQLLLSPIGQGRDLPLCPMVSTTPGCPHPDWEELWWW	653606	649982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_650000_653600
900442	contig_12644_pilon	-	2442	2	Intergenic	novelGene_44510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTTTCCAAAAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114442	1110777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1112217_1113439
900443	contig_1863_pilon	+	5492	10	Intergenic	novelGene_156529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1054	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1830	2183	65545	65898	TRUE	30	AGAGCCAATGTCCTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILEDCIQVYQPQNMKKNPVLSFHLSSGTADPLCLNLLLYEETQKAEENMNSWKHKHNLFQCIISLFPLCSHVSLLTHSVCRPPCFLAGSRNSSTSSHTCSTSLNRVKFSGILDNS	63715	81239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_+_68233_70848_70887_71640_71738_71837_71923_73207_73344_74068_74170_77380_77561_79251_79430_79927_79993_81144
900444	contig_6109_pilon	-	3712	1	Intergenic	novelGene_160388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	407	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGACATATTTTCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626831	623119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_623100_626800
900445	contig_6417_pilon	+	2808	4	Intergenic	novelGene_178755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	2417	2806	550858	551247	FALSE	50	AGAAAATTATAGACCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITK	202946	551249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6417_pilon_+_203563_340232_340745_372527_373032_550073
900446	contig_4350_pilon	-	2034	4	Intergenic	novelGene_136384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	44.131117769161	166	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACATTTCTTTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270122	255986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_257466_258627_258878_265079_265231_269968
900447	contig_11105_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_159810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAAATCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204833	206296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_204800_206300
900448	contig_12837_pilon	+	4266	2	Intergenic	novelGene_57340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2650	3087	175966	176403	FALSE	20	GTACAGCCCCCGGACACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCICKKTETGPISHTIYKNKDLNIKPKTIKFIEEKMGSMLEALIHGIHRIQTITNNTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCTSKDFTKRVKREPTYWKKFLDITSQDRGLISKIYRKIQHLYNKKSDPIKKWAKEINRHFTKEDIHAANR	173206	177582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_174093_174202
900449	contig_7368_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_158810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2049	2396	390825	391172	NA	30	CAGATGGGCATCTGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDTRQTFGLRLNISAMRTPPPLLDSFGFQTSLSGAILGPCLCCQSLGERASSLVHVTTPGVFDNSLPPSISLSPVPSAVFQITSFLDLCCPCCCLWIPSSFCFLDPVSAEKWL	388776	391408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_388800_391400
900450	contig_8964_pilon	+	1951	2	Intergenic	novelGene_168695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTATAGTGCCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534393	537162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_534578_535395
900451	contig_5423_pilon	-	4223	18	Intergenic	novelGene_85234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	261.426073098116	54	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	3205	3915	502619	497362	FALSE	50	AAATGCAAAATATTGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534615	497053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502736_504059_504239_506641_506732_506931_508139_513907_514099_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
900452	contig_4486_pilon	-	1499	5	Intergenic	novelGene_38541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	211.137840047681	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	539	844	132305	130815	FALSE	45	TCAGTAATTTTTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMEHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	177681	130159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132279_132389_162084_162163_177304
900453	contig_12277_pilon	-	2626	2	Intergenic	novelGene_139692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGGTTCTTTGAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286614	244033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_244181_284135
900454	contig_6870_pilon	+	3824	22	Intergenic	novelGene_103990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	248.258368815786	191	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	897	2694	303	2996	1493590	1607140	FALSE	55	GGAAAAAGGAGCCAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGLDSLVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN	1481079	1607968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1488699_1488781_1493506_1493613_1502310_1502447_1504248_1504495_1521425_1521617_1523634_1523857_1524821_1524943_1525069_1525166_1530739_1530856_1532495_1532662_1533390_1533490_1539714_1539975_1547905_1548099_1561569_1561717_1564394_1564541_1567438_1567569_1593452_1593538_1594461_1594549_1601696_1601852_1607065
900455	contig_5461_pilon	+	2519	3	Intergenic	novelGene_156818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	38.5	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1173	1556	240040	264281	FALSE	65	TCTGTTAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGKFCFKHR	238867	265244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_240170_242392_242515_264149
900456	contig_6230_pilon	-	3034	13	Intergenic	novelGene_102106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.5196497645589	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	143	1387	181988	166056	FALSE	20	TAGAATGCTGTTTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRIKSAAASRVEGSSGAPTKGKRKPRQEEDEDYREFPQKKHKLYGRKQRPKTQPNPKSQTRRIRKEPPAYAAGSLEEQWYLEIVDKGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKMSHKRGRK	182130	164408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166083_166310_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179926_180772_180857_181156_181253_181942
900457	contig_11316_pilon	+	1103	1	Intergenic	novelGene_122679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139423	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
900458	contig_5253_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_61571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	443	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220642	222989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_220600_223000
900459	contig_6217_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_109598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATTCATAAATAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289996	287353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_287400_290000
900460	contig_1734_pilon	+	4661	7	Intergenic	novelGene_164385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	179.913636689014	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	2415	3134	654616	664551	FALSE	20	TTTTTATGCTATTGTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILGQIRHTVMMPEINTDGLDEQQVLLLAEMCILIDEDDNRIGAETKKNCHLNENIEKGLLHRAFSVFLFNTENKLLLQQRSDAKITFPGCFTNTCCSHPLSNPGEFDENDAIGVKRAAQRRLKAELGIPMEQVPPEEINYLTRIHYKAKSDDVWGEHEIDYILFVRKNVTLNPDPNEIKSYCYVSKEELENILKKAASGEIKITPWFKIIAETFLFKWWDNLNHLNQFVEHEKIHRM	615343	666078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_617407_646183_646265_654345_654621_658208_658382_658997_659091_659856_659988_664233
900461	contig_12677_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_110778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTGTCTGGTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	2926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2900
900462	contig_11422_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_99102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATGTTGATAATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821	1848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_800_1800
900463	contig_9335_pilon	+	5000	18	Intergenic	novelGene_147425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	120.143483998945	154	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	281	2332	34890	545617	FALSE	30	GGCATCCCGGCAGAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTCLCAQFEAVLQHGLKRSRGLALTAAAIKQAAGFASKTETEPVFWYYVKEVLSKHELQRFYALRHIASDVGRGRAWLRCALNEHSLERYLHMLLADRSRLSTFYEDWSFVMDEERSSMLPTMAAGLNSILFAINIDNKDLNGQSKFAPTVSDLLKESTQNVTSLLKESTQGVSSLLREITASSAVSILIKSDQETDPLPVLSKNVSADAKCKKERKKKKKVTNIISFDDEEDEQNSGDMFRKIPVAGESSEDNSDRSSVHIMTAFESPFGPNSNGSQSSNSWKIDSLSLNGELGYQKLDVKSIDDEDVDENEDDVYGNVPGRKCTGHSESPEKPLDGNTCLSPMHSWAPLQVLHGDADVLFPVRGVGSYSPAGVPVGSLENGTGPEEHSLAEPERRYKLEASPPGQGNPLSSLLPSASVPESMTINELRQAIMAMMNRKDELEEENRSLRNLLDGEMEHSAALRQEIDTLKRKVAEQEERHVVKIQALARENEVLKVQLKKYVGAVQMLKREGQTAEVVPNLWNVDGEVTVTEQKPGEVAEELANSYERKLIEVAEMHGELIEFNERLHRALVAKEALVSQMRQELIDLRGPVPGDLSQTSEDQSLSDFEISNRALINVWIPSVFLRGKATNAFHVYQVYIRIKDDEWNIYRRYTEFRSLHHKLQNKYPQVRAYNFPPKKAIGNKDAKFVEERRKQLQNYLRGVMNKVIQVVPEFAASPRKETLIQLIPFFIDITPPGEPLNKNSRPKVVSRFPKLSRGHPREMRNVEPQSGDL	19464	548285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_19593_34737_34919_38706_38778_41195_41445_44523_44900_50902_51022_59564_59641_61931_62015_109879_109944_112026_112156_184130_184214_265333_265441_332681_332799_369968_370025_374706_374789_458452_458594_501844_501985_545487
900464	contig_6674_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_147979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1059	1484	34175	34600	NA	90	ATGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLTRVWKKLIPTLMDDFEGFKTSVEEVTADVVKIARELELEVEPEDVTELLQSHDKTLTNEELLLIDEQKKWFLEMEYTGEDAVNIVEMTTKDLEYYIKLVDKAAAGFERTGSNFERGSTVGKMLSNSIACYREIFHER	33116	35663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_33100_35700
900465	contig_12948_pilon	-	4151	1	Intergenic	novelGene_126207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGGTTAGGCCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244993	240842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_240800_245000
900466	contig_10197_pilon	+	2867	7	Intergenic	novelGene_115210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACCAGATCCTCCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908364	952304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_910582_915128_915274_918066_918267_920433_920540_923906_923957_923996_924109_952267
900467	contig_11173_pilon	+	2143	8	Intergenic	novelGene_156904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_7	270.094012355335	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	1005	1982	433323	450103	FALSE	15	TCATTGCTTTCATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFSLAISSSSEDTSEETDEEISDESDTEEKSDVKEEPELHAKREMEERTISIEIPEVLKKKLEDDCYYINRRKRLVKLPCQTNIITILESYVKHFAINAAFSANERPRHHHVIPHTNMNVHYIPAEKNVDLCKEMVDGLRITFDYTLPLVLLYPYEQAQYKKVTSSKFFLPIKESTTSTNRSQEELSPSPPLLNPSTPQSTESQPTTGDAATPKRRKAEPEALQSLRRSTRHSSNCDRLSESSASPQPKRRPQDTSATMPKLFLHLEKKTPVHSGSSSPIPLTPSKEASAAFAGFEGRRNNEINEVTSSGLTFIPDGSLTVLQ	431570	450264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_+_431849_432247_432344_432692_433428_434010_434134_434780_434942_441129_441289_442832_443096_449936
900468	contig_14530_pilon	+	3272	2	Intergenic	novelGene_108451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_1	0	189	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	154	564	59966	73095	FALSE	20	TTATTACTTCCTGAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQRRWGGRKKGALAEVTLWRRRYGKQSGPCVRVPAALRVLSPHFSAVNGGGMEHEGSGSSGGSAGLLQQILSLKLVPRVGNGTLCPNSTSLCSFPEMWYGVFLWALVSSLFFHVPTGLLALFTLRHHKYGRFMSVSILLMGIVGPITAGILTSMLDIKIPVKTFNMTSKLISGSILVTCLSRMKEKE	59812	75803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_60099_72817
900469	contig_10973_pilon	-	1639	2	Intergenic	novelGene_150377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	640	1152	2730	2218	TRUE	45	AGACGACCCACCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3369	1537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1717_1909
900470	contig_12119_pilon	+	4338	7	Intergenic	novelGene_88657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_6	336.703958330691	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1363	4089	249	4337	319835	358365	FALSE	65	GAAAAAAAAATCAACATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKPKQNVSEATTIELTILAETASPSLSKEPQIVPDRTTPIMPLITALSVITTKFSSVENIVNFEQKGPVQSQTVTDKLATESATPSGSTKKPWDMDYLPSAAGPLEKPDMSEIKEDVPKSTTVISHHTTDSWDDVTEDTKTQESVTQIEQIEVGPFVTSVEISKHTPSKEFSATEIPFLSTRMTMESKTEKKTVSPISESVTTNLYGFTLGNDDGEDRTLTVRPGHSTFIFSQIPDVITVSKTSEDITHTQLEESESISASTLVTSVTMPDNDGSSMDDRQEKQTTGRTTEDSWDQHVSTTPFSPQHQTEVELFPFPGDKRLTEEIPTVIYSSLETEMAQGRERIVTQRPAMRTDTYTNDEIQAKITKDPFIGKTEEEFSGMEVSTASSEQIHPTESSVEITKSFESPALTTTKPSVQPTEERAREEEFATTPVGDQDTTKYDEGITTVHLTHSTLSVEVVTVSKWSWDEDNITSKPSESTDHEVSPKLPTVGGNGKDEEIPRFTEHGDEFTLIPDSTQKPLEEITEEYLTDRGKFTARFQPTTSISTAEKSTLRDSTTEEGVPSISRTESKVVYATTEGSALDEEVDVDISKPVSTVPQFTHTSDGEGLAFVNFSSTQQPTTYVDISHTIPLSIIPKKEWEVLVQFVPSEGELLGEPSQDIRVIDETHLEATISPEILRTTTEITQGTTQEEVPWKEQTAEQPVPAPSSTAEILKEATVSLDEQESDGSAYPIPEEKLVTGSERVPILETTPVGKIEHSVSYPPCPITEHKVKMDEMVTLTPSVGTKISLSPRPDQKYEAESSSSTEFESPLSPFSTHVTRLIEETTTEKREKTSLDYIDLGSGLFERPKVTEHSEFSTIKTTVPSDITTMFSSVDKFHTTSASVPSSTSTEKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSRFLPTTPDDIVAKETETEIDREYFTTASTSTQPTKPPTVESKEPFRPQAVSTPEPPLGTKFHSDINVYVIEVRENKTGKSLLSRHTIQGNQHFILKITL	306498	358366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_355321
900471	contig_8729_pilon	-	8570	14	Intergenic	novelGene_40082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157.820998145435	756	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	22	1977	223115	209748	TRUE	15	GCAGCACGGGCGCCGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSCSAGAMARTAAVAVAVLGPLLWGCGLALQGGMLYPRESPSRERKELGGLWSFRADFSDSRRQGFEEQWYQRPLRELGPTLDMPVPSSFNDVTQDRWLRGFIGWVWYEREAALPQRWTQDLRTRVVLRIGSAHYYAIVWVNGVHVAEHEGGHLPFEVDISKLVQVGPLESCRITIAINNTLTPNTLPPGTILYKTDTSKYPKGYFVQDTNFDFFNYAGLHRPVLLYTTPTTYIDDITVTTGVDQDNGLVNYQASVQGSARFELAVRLLDAEGQVVAHHTGAQGQLQVPSAHLWWPYLMHSYPAYLYSLEVRLTAQTAAGPVSDFYTLPVGIRTVAVTNSQFLINGKPFYFHGVNKHEDADIRGKGFDWPLLVKDFNLLRWLGANAFRTSHYPYAEEVMQLCDRYGIVVIDESPGVGIVLAESFGNVSLHHHLEVMEELVRRDKNHPAVVMWSVANEPASFLKPAGYYFKTLIAHTKALDPYRPVTYVTNSNYAVDLGAPYVDVICVNSYYSWYHDYGHLEVIPLQLTTQFEQWYSTYQKPIIQSEYGAETIAGFHQDPPLMFTEEYQRRLLEQYHLVLDQKRREYVVGELIWNFADFMTDQSPQRAMGNKKGIFTRQRQPKGAAFILRERYWRIANETKHLPSVVKAQCLGNSLFTL	223136	142075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_142245_199357_199473_203438_209918_212114_212251_213980_214158_216069_216155_217871_218019_218101_218281_218513_218667_219481_219670_220489_220633_220770_220953_221162_221349_222905
900472	contig_7279_pilon	+	1559	13	Intergenic	novelGene_145980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	274.304676510546	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	19	1308	64657	99452	FALSE	35	TATTTATTTAACAACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFEFLEMSSRKSKSNSLIHAECLSQVQRFLRERFCRQSSHSNLFGVQVQYKHLIELLKRTAIHGESNSVLIIGPRGSGKTMELMQIEEVNENILQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGNRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPVAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	64638	99703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_64714_67943_68021_68620_68712_75422_75478_76321_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
900473	contig_19701_pilon	+	3455	11	Intergenic	novelGene_147878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.522963465128	523	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2265	1191	3455	122829	129208	FALSE	45	GGATATGCAGACTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSEASPIRIAPVVPQSESKEEAVQMPSPVKKEEHESQVKVQPNFSKSTELLLSSASNTNELSSTFPIRCTKDEDLLEQKPVASAEQESEKENHLSTASNCNKSESQDALVTSPSKPKSPGVEKPVMKPIVEAGSQETTVKEPLSTFVDQSPEGLKRKSSLTQEEPPMSWEKRPRVADNHQHQQPFQGPPQPFLNRGDRVQVRRVPPLKIPVSRISLMPFPTSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQLVKAQRAAAAAAAAATAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGERKTARGGSPGSDRVSETRKGPTLELAGTGSRGGTRELLPCGPETQPQSETKNPGQAQPHSVSGAQLQQTPSVPPTSAISGACTSVPSPAHTNPPPPALEKLNNEKLNPTRTTATVASLSHPQRSVNCRQEKAPSAPAGPALISGASPVHFAVDSTVEPKAGSSKNTPNPSASVETSASVPVDMTPSALPSLLTTTTVEKLPVPQVSVTIAPTGSAPSLSTLPAVSSLKTPGTSSNMNGPISRPSSSIPANNPLVTQLLQGKDVPMEQILPKPLTKVEMKTVPLTKEEKGIGAATGTNITESAREEINEPQSHSAIQRLGKMLQSKQLPQVPRTLQLFSAKDLRDCSIDTHSYQEGLSKATQGQILQTLIKRVQRQNVLPVLQPNQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGFAGRRTSKPAMSGHYLLNISTYGRVSESFRRTHSINPEDRFCLSSPTETLKM	12841	129208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_12926_65685_65798_70260_70412_87853_87970_91634_91759_92848_92993_114769_114934_116714_116812_120499_120607_122737_123459_127573
900474	contig_5643_pilon	+	5383	12	Intergenic	novelGene_39032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	699.427617223925	52	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	3784	4662	636305	640732	FALSE	30	ACAGCCTGAACCTAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPGSRDTWSKPKLKCWVGGVVGGGACPRPRSSQFLCSCVQNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSK	631202	641453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_633266_633515_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636
900475	contig_5423_pilon	+	2933	2	Intergenic	novelGene_85184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAATGAGAGGGCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179120	182215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_179990_180151
900476	contig_15449_pilon	+	3878	18	Intergenic	novelGene_33562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_15	784.981369756666	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	391	2673	37166	51815	TRUE	25	CCAATATATTTGTCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	11183	55659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_14474_14552_15759_15842_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51161_51245_51330_51809_51932_54570
900477	contig_3382_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_124167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTTTGTGGCCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941480	940265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_940300_941500
900478	contig_7457_pilon	+	3082	15	Intergenic	novelGene_31656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	193.270153000447	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	104	2194	1023756	1040226	FALSE	10	TACTGGTGTCTCATGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPFSVHSELFTGQASRLSSFCSLSATSFQRKFVVVILQVLRLHPLDISLQFRWATIPVLGVYRVWWAALAPASFLGSVFWVHSLCLCPPGKSTTLFSRHSKAIVWGMQTRAVQGMLDFDYVCSRDEPSVAAMVYPFTGDHKQKFYWGHKEILIPVFKNMADAMKKHPEVDVLINFASLRSAYDSTIETMNYAQIRTIAIIAEGIPEALTRKLIKKADQKGVTIIGPATVGGIKPGCFKIGNTGGMLDNILASKLYRPGSVAYVSRSGGMSNELNNIISRTTDGVFEGVAIGGDRYPGSTFMDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTREEADEYIDIGALNGIFVLGRSMGFIGHYLDQKRLKQGLYRHPWDDISYVLPEHMSM	1023652	1041114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1024172_1024505_1024675_1026468_1026574_1027365_1027563_1029389_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037035_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
900479	contig_17427_pilon	-	2342	11	Intergenic	novelGene_30346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1175.82502524823	2	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	257	1249	184471	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188884	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184510_188038_188140_188767
900481	contig_5515_pilon	+	3371	3	Intergenic	novelGene_52311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGTCCTCAGAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39131	47565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5515_pilon_+_40678_45626_46509_46622
900482	contig_6743_pilon	-	5521	34	Intergenic	novelGene_33548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	98	junction_1	199.969409965491	504	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1173	3522	23	3544	275950	212774	TRUE	55	TCTCAAAAAATGAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVETLSPDWEFDRVDDGSQKIHAEVQLKNYGKFLEEYTSQLRRIEDALDDSIGDVWDFNLDPIALKLLPYEQSSLLELIKTENKVLNKVITVYAALCCEIKKLKYEAETKFYNGLLFYGEGATDSSMVEGDCQIQMGRFISFLQELSCFVTRCYEVVMNVVHQLAVLYISNKIAPKIIETTGVHFQTMYEHLGELLTVLLTLDEIIDNHITLKDHWTMYKRLLKSVHHNPSKFGIQEEKLKPFEKFLLKLEGQLLDGMIFQACIEQQFDSLNGGVSVSKNSTFAEEFAHSIRSIFANVEAKLGEPSEIDQRDKYVGICGLFVLHFHIFRTVDKKFYKSLLDICKKVPAITLTANIVWFPDNFLIQKIPAAAKLVDRKSLQAIKMHRDTFLQQKAQSLTKDVQSYYVFVSSWMMKMESILSKEQRMDKFAEDLTNRCNIFIQGFLYAYSISTIIKTTMNLYMSMQKPMTKTSVKALCRLVELLKAIEHMFYRRSMVVADSVSHITQHLQHQALNSISVAKKRVISDKKYSEQRLDVLSALVLAENTLNGPSTKQRRLIISLALSVGTQMKTFKDEELFPLQVVMKKLDLISELRERVQTQCDCCFLYWHRAVFPIYLDDVYENAVDAARLHYMFSALRDCVPAMMHARHLESYEILLDCYDKEIMEILNEHLLDKLCKEIEKDLRLSVHTHLKLDDRNPFKVGMKDLALFFSLNPIRFFNRFIDIRAYVTHYLDKTFYNLTTVALHDWATYSEMRNLATQRYGLVMTEAHLPSQTLEQGLDVLEIMRNIHIFVSRYLYNLNNQIFIERTSNNKHLNTINIRHIANSIRTHGTGIMNTTVNFTYQFLKKKFYIFSQFMYDEHIKSRLIKDIRFFREIKDQNDHKYPFERAEKFNRGIRKLGITPEGQSYLDQFRQLISQIGNAMGYVRMIRSGGLHCSSNAIRFVPDLEDIVNFEELVKEEGLAEETLKAARHLDSVLSDHTRNSAEGTEYFKMLVDVFAPEFRRPKNIHLRNFYIIVPPLTLNFVEHSISCKEKLNKKNKIGAAFTDDGFAMGVAYILKLLDQYQEFDSLHWFQSVREKYLKEIRAVAKQQNVQSASQDEKLLQTMNLTHKRLDVYLQEFELLYFSLSSARIFFRADKTAAEENQEKKEKEEETKTSNGDLSDSTVSAEPVVK	275972	203691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_205661_212765_212842_215590_215691_215968_216166_216797_216895_222714_222863_226922_227010_227486_227554_230855_230965_232788_232924_234993_235099_235388_235464_237197_237353_237493_237663_239024_239142_239726_239833_241010_241091_241220_241368_241934_242043_246874_247001_252127_252255_257711_257873_258656_258785_258886_259011_259517_259639_260285_260390_260874_260918_262502_262586_266344_266413_266859_266906_267658_267725_267829_267884_272048_272189_275889
900483	contig_15371_pilon	+	4199	6	Intergenic	novelGene_151435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	680	junction_1	307.827484153056	481	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	90	833	111161	162977	FALSE	50	CAAAAAATAGGAACTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEASLRALESLMTEFFHDCTTNERKREIEELLNNFAQQIGAWRFCLYFLSSTRNDYVMMYSLTVFENLINKMWLGVPSQDKMEIRSCLPKLLLAHHKTLPYFIRNKLCKVIVDIGRQDWPMFYHDFFTNILQLIQSPVTTPLGLIMLKTTSEELACPREDLSVARKEELRKLLLDQVQTVLGLLTGILETVWDKHSVTAATPPPSPTSGESGMIHLPHMAFLFLNAVGSQGSNSLSRADRDDDS	111071	166343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_111164_150998_151090_154077_154191_155017_155216_160082_160243_162798
900484	contig_14208_pilon	-	2101	3	Intergenic	novelGene_129089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	283	junction_2	7.5	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	429	899	214932	175588	FALSE	35	AAAAGTCTGTTCTCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTLSPTRSPTESSASDAFLKRKKKLKRVRGCVFRTRGGGEEEGATSPWETAPYRDPKAEAHEFVRGGFFLSFPSPPTPSLLIKETDLGPGCSRCWVTRASAAAAAAAAAAASAAASPLALSPPSRSLSPAAFPAFFLLPSTMEFSERKRSRKSQSFKLVNRDYHHEVYTISEFSSDVNGEAKETQPIFLGDESMEIKKQITGMRRLLNDSTGRIYQRVGKEGEKLKEEPQDSDLIWPQRLNSSAEAPQSLRPSSGGTWNELPSQSRQFSGQYGTRSRTFQSQSHTAGSSNGMPVIRH	215360	174385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_175914_212479_212564_214871
900485	contig_9415_pilon	+	3792	25	Intergenic	novelGene_109710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAACAACAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425263	469885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_425946_426279_426364_427731_427856_435523_435611_441090_441208_441719_441839_444542_444593_446109_446273_446893_446971_447787_447903_449028_449111_451091_451232_453010_453125_453247_453357_454140_454214_454332_454413_455170_455312_456369_456514_460019_460255_462549_462678_464335_464475_464747_464874_466631_466800_467517_467619_469491
900486	contig_6885_pilon	-	4105	3	Intergenic	novelGene_83694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	461	junction_1	68	806	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	8	532	314045	278027	FALSE	85	AAAAAGAAAAGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNSLQWVGSPCGLHGPYIFYKAFQFHLEGKPRILSLGDFFFVRCTPKDPICIAELQLLWEERTSRQLLSSSKLYFLPEDTPQGRNSDHGEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGLHAGSMKTEVLGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGKYNFCF	314052	274453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_278276_313336_313592_314024
900487	contig_11850_pilon	-	3922	8	Intergenic	novelGene_125195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1025.86391666254	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1905	2531	186097	181211	FALSE	30	ATTGCTATGCTTCAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	199695	179819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195775_197694_197738_197895
900488	contig_15666_pilon	+	3333	4	Intergenic	novelGene_70102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	49.0328687945364	255	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	447	1442	55151	58318	FALSE	30	ACAAGAGTCATTCTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSAPSTAFLMKEDFHMQVFNRTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANATIMAVIRFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSATKTISFVACATQLFFFLGFACTNCFLIAVMGYDRYVAICYPLRYTLPMSKRLGLGLVSLSGVTGLLIALVATNLICDMPFCGPNRVNQYFCDMAPVIKLACKDTHMKELALFTLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGKRKAFATCASHLTVVFVHYGCASILYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVCSLRNQEVKTALKRFLGMPVATKVI	20665	60209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_20864_50798_50929_55032_55184_57355
900489	contig_5023_pilon	+	3928	14	Intergenic	novelGene_7132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	209.326900992897	393	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	989	2338	359358	405576	FALSE	40	CCAACATCACAGCAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	323612	407166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
900491	contig_299_pilon	+	3185	12	Intergenic	novelGene_129420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	197.889233563452	111	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	153	1685	841615	863323	TRUE	70	GAACTGAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSSIYEIHTPVVDKKRKKKKKQYSVDKEIHQKCSSKSFKDFCLANEQSQITKSKKKRKDKYYFISSPVNKSEICDQTEKATLTLKKKKKKRRSALGVDKETDITYVLVDKENIENTPKNFKKDVDVIYVDNKEQKSAKEPEANELPSSPKSYKNESEELHDKVRRKKHKKRQRTEASCDTQESPQLSIALHQSETQEQESLLSVGLQGEIAELSVSAVKKKSKKKKKKISNNPEFEALAMPESLENLRPEGSQVISEIDTVEGSDALKEIRESNSTKTKSKKRKRRSVESAVESGANFSVLDESSENTRIDLEGGDSLASEGALIEEIVKPRTKRKKIQSCSEEKYVEEVQRLDYTNEESNLESGRHSETYLSDDSRDSDDSDVDLGSAVKQLQEFIPDIKERAATTIKRMYRDDFERFKEFKAQGVSIKFGKFSVKENKQLEKNVQEFLSLTGIETADKLLHTDRYPEEKSMITDLKRKYAFRLRISKFRSVHSLTICIYNLITLK	830681	883451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_830734_832793_832887_841607_842679_860693_860915_863075_863339_864117_864197_867487_867619_869261_869497_873329_873420_874619_874686_881780_881867_882653
900492	contig_8044_pilon	-	2054	5	Intergenic	novelGene_132397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	13.3111795119741	753	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	111	800	597547	569783	TRUE	15	GTTATTTTTCTGAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCSQLEERLQRLQSQVLSSLDTCKENTQGVQTEVSMVEGRVSQMEKTCSKLDSLSESLHKIKEGLNKHVSSLWSCVRQMNGTLRLHSRDISGLKSSVQQFYSHVFQISTDLQDLVKFQPLATEEPSEAPQLPPWGKGPQAPVRLPEAPTEPARPKLTLAPLPRPSGPPPPEDPGQRPVLPKRPLLPRPPRRNAASAGVARLDRAAVAAWVHGRHHGDGRGRASGQNGRVGQGPAPGGWMVKLVRPLSPTRKATQVHQDTPGHLP	597657	563545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_564662_567863_567993_569773_569807_571697_572105_597288
900493	contig_3077_pilon	+	1134	8	Intergenic	novelGene_26646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4085.95398897247	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	544	1095	13867	18049	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTTPLPQPTCQKIPSVALPQVARHLTRSWAHTNYTLCKAQFETFPQEHSHVSHPTSLS	9606	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9737_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16281_17876
900494	contig_12920_pilon	+	2497	3	Intergenic	novelGene_166348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGCTAAAGGCTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212186	248550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_212234_231288_233720_248531
900495	contig_13800_pilon	+	2038	14	Intergenic	novelGene_153720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	252.928691683888	1116	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	180	1715	109210	162575	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLTAHESTGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	99672	162898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_99821_109046_109072_109203_109241_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
900496	contig_14173_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_144574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTCTGTTCACCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2799	3801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14173_pilon_+_2800_3800
900497	contig_6163_pilon	+	5007	13	Intergenic	novelGene_103836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2999	3547	385306	399853	TRUE	40	TATAACGGCATCAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGIWRRCLLPWRPQNSHLLSIWTSTWCWSPYHRGHSLVHHTRWWDAREAGHTWRKVVGWRPPRVKWLHAAHANKAINWALQRWKAWRIATHHAFIFCLLGCLKVSPFCPHESAELPKRVVWVLSLNHSSHLAAEQDVATHVDFPFGPFLLCTALGRLWGRLWGCVGHEVQLAGQRGLKLR	381349	430241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_384188_385145_385360_385468_385541_388523_388681_395507_395713_399792_399997_400425_400615_410964_411126_413704_413852_417926_418188_418825_418983_420378_420572_430032
900499	contig_3081_pilon	-	3347	3	Intergenic	novelGene_133944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	19	230	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATGTAAAAATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269884	245831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_248673_252485_252591_269483
900500	contig_854_pilon	-	3227	19	Intergenic	novelGene_36607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	967	1554	1706853	1702673	TRUE	15	CTTCTCCACGAAGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1715969	1687021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695167_1697756_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709205_1715229
900501	contig_18162_pilon	-	1712	3	Intergenic	novelGene_122336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAAAATCAAGTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10048_10809_16363
900502	contig_5084_pilon	+	2353	2	Intergenic	novelGene_64652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	260	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGCTGTAGATTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457190	1462888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1457388_1460732
900503	contig_1107_pilon	-	1188	6	Intergenic	novelGene_126564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	384.457748003601	117	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	33	848	511637	496767	TRUE	15	CCCCGGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTGGRSGPRPGKGSAEEAAATPIAASASCQYRCIECNEEAKELYRDYNHGVLKITICKSCQKPVDKYIEYDPVIILINAILCKAQAYRHILFNTKINIHGKLCIFCLLCEAYLRWWQLQDSNQNTDPDDLIRYAKEWDFYRMFAIASLEQTAFFIGIFTFLWVERPMTVKKKLNFILLLKALLLSSYGKLLLIPAVIWEHDYTPLCLKLIKVFVLTSNFQAIRVTLNINRKLSLLAILSGLLLESTMVYFFQRMEWDIGSDCAIYKSQDF	511669	489810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_490147_496762_496910_497729_497955_501697_501852_504360_504481_511463
900504	contig_8291_pilon	+	1565	2	Intergenic	novelGene_99956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	147	467	553950	554270	FALSE	15	GATGGCTGCTCACAGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAGRRPPSSLPPSLSPSLCAGLPRPRLLFAPRPGARFCGSILLCHYEMSSLGASFVQIKFDDLQFFENCGGGSFGSVYRAKWISQDKEVAVKKLLKIEKEVRSFPAIRNSPDNTYISFSDLESQGHRTAGDLAKPLGPIHKAVSQLPFREPHK	540269	555368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_540382_553915
900505	contig_10235_pilon	+	2458	1	Intergenic	novelGene_46514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	641	1926	182	2107	297036	298961	NA	15	TTAATTTTTCTATTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCCCFFPWRDSSRPAASKNVFLRLRCVQIPAFCRDSAARRGFYPPFPGLNLSSGREQRSDMAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	296854	299312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_296900_299300
900506	contig_10159_pilon	-	2554	12	Intergenic	novelGene_30870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1586	1939	982685	976422	TRUE	0	GTGCCTCCGCGCCTTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGMLMLITPSSSRVSKCRTCKYSLSRIKPFRGVAQPSLKTWTHWRSTLVIDNEGRVSASARTWSSLFSGTKSSWMPLIVVCGTMFCSCRSSTTCWIQSLTEDTLVLSTHSGVSGFS	995934	958451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_958552_970012_970129_974246_974483_975157_975297_976397_976516_976640_976756_978441_978554_982652_982861_992071_992207_992584_993568_994445_994676_995872
900507	contig_610_pilon	-	2610	2	Intergenic	novelGene_76661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33157	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32219_32264
900508	contig_11677_pilon	+	5024	4	Intergenic	novelGene_85869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_2	29.3976567471325	325	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	20	2107	85519	108089	FALSE	15	GATCTGTTTTCTGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQPLSMEEKPGQPQPQHHHSHHHPHHHPQQQQQQQQPHHHHHYYFYNHSHNHHHHHHHQQPHQYLQHGVEGSPKAQPKPLKHEQKHALQQHQETPKKKTGYGELNGNAGEREISSKNLGSDEATNPFSRVLNGNQQVVDTNVKQTVKASTFGRAGIKTKNFIQKNSMDKKNGKSYENKSGENQTVDKTDTVAIPNGVVTNNSGYITNGYMGKGADNDGSGSESGYTTPKKRKARRNSAKGCENLNLVQDKIMQQETSVPTLKQGLETFKPDYSEQKGNRVDGSKPIWKYETGGTSRGKPSVGDMLRKSSDIKPGVSSKKFDDRPKGKHASAVASKEDSWTLFKPPPVFPVDNSSAKIVPKISYASKVKENLNKTVQNSSVSPSSSSSSSSSAGETQTQSSSRLSQVPMSALKSVTSANFSNGPVLAGTDGSVYSPGSQPLLTTAANTLTPISSGTDSVLQDMSLTSAAVEQIKSSLFIYPSNMQTVLLSTAQVDLPSQTDQQNLGDIFQNQWGLSFINEPSAGPETVIGKSSDHKVMEVTFQGEYPATLVSQGAEIIPSGTEHPVFPKAYELEKRTSLQVLGSIIKSGTTSESGALSLESSHIGDLQKADTSSQGALVFLSKDYEIENQNPLASPTNTLLGSAKEQKYQRGLERNDSWGSFDLRAAIVYHTKEMESIWNLQKQDPKRIITYNEAMDSPDQ	85499	111006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_85802_91024_92744_105969_106003_108036
900509	contig_10023_pilon	+	1733	6	Intergenic	novelGene_123467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	124.742294351194	328	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	23	439	64176	64802	TRUE	20	TAGGTGTCAGTTACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALAAPGRALLRGGVWALFRLRPGAGTPVPERDFSLSHSRGTVIVERWWKVPLAGEGRKPRLHRRHRVYKLVEDTKHRPKDSLELILTQSVEGEAAGAFPSQAVNVGHQLSPTLSRICLLRFLGIPGSVFEKRKP	64153	67922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_64305_64514_65277_65489_65541_66539_66642_67137_67223_67340
900510	scaffold_13505_pilon	-	1629	15	Intergenic	novelGene_111424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	538.406643983629	452	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	274	1059	512497	509193	TRUE	10	GAGGTCTGTGTGTGTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELIEVHSLFLDSLTKRRQDSGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKEPRFCAFVQDAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPAEREKVERAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVIFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPAFRPKSRPSPSSTREPLLSSSENSNGGREMPPADGRMERFLSDLLTFPRK	513509	507160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507544_508911_509005_509098_509205_509815_509854_509954_510023_510277_510365_510522_510611_511309_511478_511561_511638_511905_511984_512183_512285_512427_512543_512741_512868_513108_513192_513490
900511	contig_13021_pilon	+	2065	11	Intergenic	novelGene_8170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	2721.70047764261	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	169	1254	174676	180112	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRHSIHFLYT	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178246_180084_180211_180440
900512	contig_6137_pilon	-	2605	12	Intergenic	novelGene_59300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_2	233.562245052683	466	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	177	1280	1611099	1597068	FALSE	25	CCAGTTAGGGTGTAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LESEAKVDGETASDSESRVEPAPPPTSADDTPEVLNRALSNLSSRWKNWWVRGILTLAMIAFFFIIIYLGPMVLMMIVMCVQIKCFHEIITIGYNVYHSYDLPWFRTLSWYFLLCVNYFFYGETVTDYFFTLVQREEPLRILSKYHRFISFTLYLTGFCMFVLSLVKKHYRLQFYMFGWTHVTLLIVVTQSHLVIHNLFEGMIWFIVPISCVICNDIMAYMFGFFFGRTPLIKLSPKKTWEGFIGGFFATVVFGLLLSYVMSAYRCFVCPVEYNNDTNSFTVDCEPSDLFRLQEYSIPGVIQSVIGWKTVRMYPFQIHSIALSTFASLIGPFGGFFASGFKRAFKIKDFANTIPGHGGIMDRFDCQYLMATFVNVYIASFIRGPNPSKLIQQFLTLRPDQQLHIFNTLKSHLTDKGMLTAATEDE	1612577	1595742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1597201_1597459_1597564_1598011_1598132_1599583_1599737_1600637_1600707_1601231_1601320_1603538_1603622_1604888_1604948_1607359_1607500_1609787_1609886_1611042_1611140_1612441
900513	contig_1786_pilon	-	2932	22	Intergenic	novelGene_142592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	304.910157393342	579	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	99	1718	79935	49082	TRUE	45	TATAATGAAAATAGGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSVSRRVSRLVGLSGPESAVASEGPWTWTDGAMPLRLDIKRKLTARSDRVKSVDLHPIEPWMLASLYNGSVCVWNHETQNFEDKASKWEDKKTLVKTFEVCDLPVRAAKFVARKNWVVTGADDMQIRVFNYNTLERVHMFEAHSDYIRCIAVHPTQPFILTSSDDMLIKLWDWDKKWSCSQVFEGHTHYVMQIVINPKDNNQFASASLDRTIKVWQLGSSSPNFTLEGHEKGVNCIDYYSGGDKPYLISGADDRLVKIWDYQNKTCVQTLEGHAQNVSCASFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSSTYRLESTLNYGMERVWCVASLRGSNNVALGYDEGSIIMKLGREEPAMSMDANGKIIWAKHSEVQQANLKAMGDAEIKDGERLPLAVKDMGSCEIYPQTIQHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTAMALRNKSFGSAQEFAWAHDSSEYAIRESNSVVKIFKNFKEKKSFKPDFGAESIYGGFLLGVRSVNGLAFYDWDNTELIRRIEIQPKHIFWSDSGELVCIATEESFFILKYLSEKVLAAQETHEGVTEDGIEATPCLFQYWNTRQLS	80033	40720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1786_pilon_-_41111_41550_41620_41783_41853_42041_42223_42309_42403_43584_43800_44712_44824_48995_49129_50262_50396_52199_52307_52383_52473_54358_54470_55558_55759_56012_56156_56782_56883_57795_57943_60874_61024_61894_62022_62222_62310_62794_62834_68182_68321_79932
900514	contig_11816_pilon	+	3099	11	Intergenic	novelGene_98457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	580.395115417075	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	132	2252	420896	449750	TRUE	15	CTTGGTTGTTTTAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSSAATGGSTSDSAHGGINTGITGILPGSLFRFAVPPALGSHLTDNVMITVDIIPSGWNSSDGKSDKTKSAPSRDPERLQKIKESLLLEDSEEEEGDLCRICQMAAASSSNLLIEPCKCTGSLQYVHQECMKKWLQAKINSGSSLEAVTTCELCKEKLQLNLEDFDIHELHRAHANEQAEYEFISSGLYLVVLLHLCEQSFSDMMGSTNEPSTRVRFINLARTLQAHMEDLETSEDDSEEDGDHNRTFDIA	400537	450644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433939_437138_437309_442782_442893_445555_445670_447166_447216_449691_449866_449912
900515	contig_11677_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_85873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	470	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTTCTGAGGTGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112928	116511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_112900_116500
900516	contig_5961_pilon	+	3514	19	Intergenic	novelGene_144105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_5	540.514720965347	96	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	1050	3347	197721	214246	TRUE	25	GACTGCTGGTGAATCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	113708	267857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_204380_204468_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060_214260_267703
900517	contig_10779_pilon	+	4695	1	Intergenic	novelGene_165512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTCAGGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26423	31118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_26400_31100
900519	contig_13653_pilon	+	2988	1	Intergenic	novelGene_175687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	729	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1120	1428	179472	179780	NA	30	TAACAGGCTGGAGAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQCYEGLHQTESSTARWCPATTTDSSDQDHNRGFQTELEKDVEHNSNSQKKKKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGNGQPCKTKLD	178352	181340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_+_178400_181300
900520	contig_14744_pilon	-	2973	7	Intergenic	novelGene_65998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	444.899114656595	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	72	827	969897	964405	TRUE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQEVATIISTHSEDEKTMHPRLYVALPRISGRTRTPAHIV	969968	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_962609_964176_964410_965701_965811_967273_967450_968343_968630_969717
900521	contig_2078_pilon	-	2730	13	Intergenic	novelGene_100172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_6	60.4847891806049	7	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	73	1950	535379	505518	FALSE	40	TAACCTACTACATCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535451	504737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
900522	contig_10904_pilon	-	3165	7	Intergenic	novelGene_22521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	361.885225819826	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	247	900	354723	352112	TRUE	15	TGTTCTAAGACTCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362499	346722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_350113_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354852_362381
900523	contig_11417_pilon	-	2044	1	Intergenic	novelGene_103331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGATGAGAAGGCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582487	580443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_580400_582500
900524	contig_14816_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_172454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAACTGTTTCCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104100	102515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_-_102500_104100
900525	contig_3948_pilon	+	2444	3	Intergenic	novelGene_53373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	104.5	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	487	999	1813956	1860572	FALSE	30	ATAAACTGTGTTGACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813210	1862017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814331_1860434
900526	contig_18364_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_102563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114779	113338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_113300_114800
900527	contig_5686_pilon	+	3370	5	Intergenic	novelGene_45272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2724	junction_2	1259.79254244499	144	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	32	511	93843	175592	FALSE	25	TTTATTTGATGAGAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKVSFHSVLGSC	93811	178451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535
900528	contig_15821_pilon	+	5017	16	Intergenic	novelGene_25018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	193.282108156273	633	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	196	2208	172303	214569	FALSE	30	AGCTAATTTGTGTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIKAKPTSDKPGSPYRSVTHFDSLAVIDIPGADTLDKLFDYAVSKFGKKDSLGTREILNEENEMQPNGKVFKKLILGNYKWMSYLEVNCRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYSFPLVTLYATLGKDAVVHGLNESEASYLITSVELLESKLKTALLDINCVKHIIYVDNKTVNKAEYPEGFEIHSMRSVEELGSKPENASIPPNRPTPSDMAIVMYTSGSTGRPKGVMMHHSNLIAGMTGQCERIPGLGPKDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLSDQSSKIKKGSKGDCTVLKPTLMAAVPEIMDRIYKNVMSKVQEMNYIQKTLFKIGYDYKLEQIKKGYDAPLCNLILFKKVKALLGGNIRMMLSGGAPLSPQTQRFMNVCFCCPVGQGYGLTESCGAGTVTEVTDYTTGRVGAPLICCEIKLKDWQEGGYTVHDKPNPRGEIVIGGQNISMGYFKNEEKTAEDYCVDENGQRWFCTGDIGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDNICAFAKSDQSYVISFVVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANTMKLERFEIPIKVRLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELKNHYLKDIERMYGGK	114847	217378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_114978_152482_152536_172290_172531_172804_172983_174769_174880_175003_175143_177484_177636_178072_178197_188990_189063_199944_200085_200733_200907_207060_207136_209539_209732_211204_211320_212074_212233_214411
900529	contig_12250_pilon	-	3104	15	Intergenic	novelGene_80566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	368	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2618	2980	290829	290085	FALSE	30	GCCACCACGAATGCAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVWLRLWFWRRRVSGLPGAPTPSAHVRPRTVHHCACASSVSPKQSLCLVVQASGTAYFLAEIPQSSSQKAVDGVGVWVFGTLTSGQPGAGPPGGAGCSRCPEPVRVWGASSRGQGARWG	304460	289960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_290339_290720_291036_291166_291356_292367_292620_292984_293103_293241_293352_293766_293940_294374_294516_294661_294766_297453_297542_298027_298187_298307_298589_298732_298893_299251_299389_303961
900530	contig_8822_pilon	-	3799	7	Intergenic	novelGene_117922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	114.021440478924	414	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATATATACACTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104584	49484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_52744_57093_57174_60739_60836_61525_61653_77031_77173_103708_103778_104557
900531	contig_1725_pilon	+	2835	20	Intergenic	novelGene_24275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	652.740156502844	15	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	54	1634	201480	248410	TRUE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRIAALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAENWGRIRERFEPAEEAAQLPG	201426	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248347_248448_248575_248633_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
900532	contig_17796_pilon	+	4956	11	Intergenic	novelGene_33789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_10	341.111066956204	667	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	385	1485	53527	120497	FALSE	70	AAATTAAAAAATAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53142	123968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
900533	contig_2716_pilon	-	3745	6	Intergenic	novelGene_173555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2674	3024	822280	661444	FALSE	50	ACATAATCCATCACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVFGLGLCCIYINNRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAYIKKEERDKIKTLTIELKQTEKEQQKKPTTTRKRK	838233	660722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_661464_734707_735002_822243_822877_823072_823632_836419_837324_837619
900534	contig_5769_pilon	-	4680	6	Intergenic	novelGene_138767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTCATCTTTGAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258068	242210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_242241_243461_243605_248254_248323_250507_250614_251691_251822_253865
900535	contig_20614_pilon	-	4695	2	Intergenic	novelGene_107566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	122	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	3108	3845	237859	234198	FALSE	35	GAAGCTCCATAGACACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIERLRSRFETMEDRISEIEDKHLATTLSEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQREKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETVRLSLDYLAKTLQARRQLDDIYKTLKEKNCQPRMIYPAKLSFKYDGEIRSFPEIRGLCKNQTKLTRIVKGSPLIREQTTSDHRLSIGHRIVLARYQPRK	240966	233347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_234211_237134
900536	contig_3382_pilon	+	5397	5	Intergenic	novelGene_123995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	459	junction_4	78.715865618057	38	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	86	373	82719	91163	TRUE	10	GCTGTCCCGCACGCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVGVEEHYAFDIDLYHCPSCAVLHGSSLMKERRNWHRHDCTEIDDGSKPVQAGTRAFVTQLRARVFPSADEVVVKMHGGQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPPTYFFCYGCGTLRRW	82633	96487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_82720_86828_86947_88800_88963_91156_91299_91598
900537	contig_14744_pilon	-	7056	3	Intergenic	novelGene_65981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	607.5	816	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	68	577	969897	968300	TRUE	30	ATGATCCAGCAACCCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969964	960153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_966448_968114_968630_969717
900538	contig_12019_pilon	-	755	3	Intergenic	novelGene_87660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	949	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8659	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
900539	contig_3948_pilon	-	4153	1	Intergenic	novelGene_53247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	450	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	707	2124	86	2209	1206238	1204115	NA	55	GAAAAATAAACCTGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENGPVQSLVGDTVLQEGNDQVLDGNPTMKDPVNVTPSSTPRSPLADCLQDRPFDDELGLGKSYPPMRESDTRQEDLKTEALVSDSIAPWMPNMLNDKGAKQTGPDSGENVPSSEPQVGEEWETAAPHIPALLGSLTAEEGLDPPDNLPVLWAVPSRGMGSSGSICKQVPVEKLKINGDSEVLSPHSESTDTASDFEGSLTEDSSEADLGEATVNKALSVVDKDEKHGWNQSSSLSKMNGDLGLVTRTDGMAAPQSWVSRVCAGPQKIPNSLLLASTEYQPRPVCLDGPGSSMEATDPFVMQLLQGNLPLEKVLPPAHGGSKPESLQLLLKKELSPGGSLGMGSLPDPGADSLIVGKSSPSSLRALKEPLLHEIREASTGLTGLEATQAPGAPQKISKTVTSLDFLHPVTSPVASSGKLEEVDSKEAFSSFSFEDQKETRDLSQCSNSSAAPGRSPGTLTTSRAPSFSSPNAISFGSDQASQSLRDQNSVGGQGKKLFGSRNMASTPQCPRPVDPAPLPADAPSVAPNRKLGPSKSSVSGGVQTAREDWAPKPPPASAGSIKTEKTFAGGPLKMNAENRKAVGRSPLELMDHLQGMPFVMDLPFWKLPREPAKGLSQPLEPSSIPSQLNIKQAFYGKLSKLQLSSTSFNYSTSSSAFPKGLAGSVVQLSHKANFGASHSASLSLQMFTDSSTVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR	1206323	1202170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1202200_1206300
900540	contig_3747_pilon	+	2982	7	Intergenic	novelGene_24850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1729.50269024236	31	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	863	1603	202422	203804	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200989	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
900541	contig_20452_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_167301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGGGAAGAATACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45409	46481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_+_45400_46500
900542	contig_19032_pilon	-	4060	1	Intergenic	novelGene_172540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	160844	160512	NA	25	AGACTCTGTACTGCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVGGFLLLLIVVSVDCLCLAKSTSRRIG	160845	156785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_156800_160800
900543	contig_3068_pilon	-	2991	19	Intergenic	novelGene_137625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	322.691081300084	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	531	2480	246637	233625	FALSE	5	CTGTGTGCATTGTCGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFNRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	247167	233113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234622_234886_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466
900544	contig_2487_pilon	-	3554	3	Intergenic	novelGene_148441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	605	junction_1	307	397	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	172	1347	98899	86284	FALSE	50	TTCTACTTTAAAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIKPAEKLDHSRSNTPSPLNLSSTSSKNSHSSSYTPNSFSSEELQAEPLDLSLPKQMKEPKSIIAAKNKTKASSISLDHNSISSSSENSDEPLNLTFIKKEFSNSNNLDNKSTNPVFGMNPFSAKPLYTALPPQSAFPPATFMPPVQTSIPGLRPYPGLDQMSFLPHMAYTYPTGAATFAEMQQRRKYQRKQGFQGELLDGTQDYMSGLDDMTDSDSCLSRKKIKKTESGMYACDLCDKTFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHQCQICKKAFKHKHHLIEHSRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEEREAAEREAREKGHLEPTELLMNRAYLQSITPQGYSDSEERESMPRDGESEKEHEKEGEDGYEKLGRQDGDEEFEEEEEESENKSMDTDPETIRDEEETGDHSMDDSSEDGKMETKSDHEEDNMEDGM	99070	84076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_86862_96900_97082_98482
900545	contig_12540_pilon	-	3338	10	Intergenic	novelGene_148056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_9	50.3346823464058	184	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	96	1139	253748	211069	FALSE	25	CCACAGGAACTGTTACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAWGGAGTLATRAAVAALLLSALALYWLPLRAVLERAFSLHKAHSIKVMENTFQLVRNIIPPLTTKKYKGQDGRIGVVGGCQEYTGAPYFAAISALKVGADLSHVFCAKEAAPVIKSYSPELIVHPVLDSPHAVRDVEAWLPRLHALVVGPGLGRDDVLLENVKGILEASKARGIPVVIDADGLWLIAQQPSLIQGYRKAVLTPNYVEFCRLYEAVLRDPMDSRDPDGAVLRLSQALGNLTIIQKGERDVISDGDQVLVCSQEGSRRRCGGQGDLLSGSLGVLVHWALLAGSEKTDGVNPLLVAAFGACALTRQSSSQAFQKYGRSMTTTDMIAEVGAAFRKLFET	253843	208869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_211220_213070_213192_216266_216388_217740_217846_217933_217985_227296_227406_239511_239601_240308_240355_244251_244403_253648
900546	contig_7629_pilon	-	947	5	Intergenic	novelGene_153598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	159.522725653745	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	693	254	946	449167	397031	FALSE	75	AGAAACAAAAAAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDPMMDFFDDANLFEENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPQYDESTFGQDSSSHVLDHHLDQQFTSHLVTRPSDMAQAQLQSHAQSWHSSLSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVRVMSEKKQRKKMESESKQEKANRIISEAIAKAKERGERNIPRVMSPENFPSASVEGKEEKKGRRIKSKPKDKESKKTKACSKLKEKTKIGKLIITLG	540160	397029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_397053_413488_413821_447709_448003_449121_449330_540069
900547	contig_6446_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_149225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	997	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	246	611	415891	415526	NA	65	AAAACTTGTAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLCIKGHYQECEKKPTEWDKISANHISDKGLISRIHKELLQLNNKKINNPTKKWANDLNRCFSKEDIQMANKHMKRCSTSAVIKEMQIKTTMRYHFTFNMMAIIFSKRKITSVGRGVEK	416136	413307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_413300_416100
900548	contig_9807_pilon	+	2492	13	Intergenic	novelGene_32883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	575.538950318163	39	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	93	1505	109130	158783	FALSE	15	GTTGTGGATCACTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGAEWTITY	109037	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_158762
900550	contig_10003_pilon	+	2953	1	Intergenic	novelGene_88207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACACATCCTGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517306	520259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_517300_520300
900551	contig_17108_pilon	-	1944	4	Intergenic	novelGene_109511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	790	junction_3	152.283361606652	5	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1431	513	1943	48876	31551	FALSE	40	TGAAAATAATCAGCACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSNLLAREFLTDVNRLCNTMVQRAEAREEEEEETHMATLGQYLVHGRGFLLLTKLNSIIDQALTCREELLTLLLSLLPLVWKIPVQEEKATDFSLPFSANIILTKEKISSSRRFAQDKLYVEGSTPSGQVSAKVNVFQKSRRQRKTTHRYSIRDARKTQLSTSDSEANSDEKSIAMNKHRRPHLPQHFVTRSPKEDHLVAEVNYSATKDEQIPPDTMALENSREVIQRQQSNTDILSEPAALSIISNMNNSPFDLCHVLLSLLEKVCKFDMTLNHNSALAASVVPTLTEFLAGFGDCCNLSDSLENHVVSAGWTEEPVALIQRMLFRTVLHLMSVDISTAEMMPESLRKNLTELLRAALKIRTCLEKQPDPFAPRQKKTLQEVREDFVFSKYRHRTLLLPELLEGVLQILICCLQSAASNPFYFSQAMDLLQEFIQHHGFNLFETAILQMEWLVLRDGVPTEASEHLKALIKGV	53734	31549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_32699_34461_34553_48684_48884_53229
900552	contig_4884_pilon	+	3111	19	Intergenic	novelGene_63792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_9	104.932385637398	332	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	253	2412	218048	295554	FALSE	40	TAATACATTCTAAAGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPTKIYQPSYLSINNEVEEKTISIWHVLPDDKKGIHEWNFSASSVRGVSISKFEERCCFLYVLHNSDDFQIYFCTELHCKKFFEMVNTITEEKGRSAEEGDCESDSLEYDYEYDENGDRVVLGKGTYGIVYAGRDLSNQVRIAIKEIPERDSRYSQPLHEEIALHKHLKHKNIVQYLGSFSENGFIKIFMEQVPGGSLSALLRSKWGPLKDNEQTIGFYTKQILEGLRYLHDNQIVHRDIKGDNVLINTYSGVLKISDFGTSKRLAGINPCTETFTGTLQYMAPEIIDKGPRGYGKAADIWSLGCTIIEMATGKPPFYELGEPQAAMFKVGMFKVHPEIPESMSAEAKAFILKCFEPDPDKRACANDLLMNEFLKVSSKKKKTQPKLSEYLRSISLPVPVLVEDTSSSSEYGSVSPDNELKVDPFSFKTRPKSCGEKDVKGIRTLFLGIPDENFEDHSAPPSPEEKDSGFFLLRKDSERRATLHRILTEDQDKIVRNLMESLAQGAEEPKLKWEHITTLIASLREFVRSTDRKIIATTLSKLKLELDFDSHGISQVQVVLFGFQDAVNKVLRNHNIKPHWMFALDSIIRKAVQTAITILVPELRPHFSLASESDTADQEDLDVEDDHEEQPSNQTVRRPHAVIEDAVATSGVSTLSSTVSHDSQSAHRSLNVQLGRMKIETNRLLEELVRKEKELQALLHQAIEEKDQEIKHLKLKSQPIDIPGLPVCHLNSPGINTEDPELTDWLRENGADEDTISRFLAEDYTLVDVLYYVTRDDLKCLRLRGGMLCTLWKAIADFRDKQP	204453	296253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_204550_211962_212013_214470_214567_218037_218120_228963_229098_234593_234722_235441_235579_236659_236766_242369_242528_245882_246061_258177_258356_258452_258622_265734_265921_271590_271697_284653_284898_290877_290991_292122_292236_294757_294835_295493
900553	contig_2903_pilon	+	3314	22	Intergenic	novelGene_148970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_17	810.33766652356	294	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	34	2220	99513	207244	FALSE	35	ATTGGATTTAAACTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAQLADPWQKMAVESPSDSAENGQQIMDEPMGEEEINLQTEEGSIKEIAITHHVKEGHEKADPSQFELLKVLGQGSFGKVFLVKKISGSDARQLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILVEVNHPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALALDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKESIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRRGHTQSADWWSFGVLMFEMLTGTLPFQGKDRKETMTMILKAKLGMPQFLSPEAQSLLRMLFKRNPANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDPEFTAKTPKDSPGIPPSANAHQLFRGFSFVAITSDDESQAMQTVGVHSIVQQLHRNSIQFTDGYEVKEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKYVYVVTELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDAACDIWSLGVLLYTMLTGYTPFANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVSKMLHVDPHQRLTAAHVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQSPVLEPVGRSTLAQRRGIKKITSTAL	99479	208338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_99546_125366_125424_160631_160749_166402_166485_175924_176006_176815_176896_177503_177611_180986_181025_182098_182242_182839_182911_189793_189883_190034_190100_190177_190281_192371_192497_194614_194741_196916_197007_198877_199037_199422_199585_202184_202262_202802_202921_206115_206257_207121
900554	contig_8978_pilon	+	4414	29	Intergenic	novelGene_49352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	109.589930222272	161	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1349	4050	145	4194	200543	222003	FALSE	20	CTTCTTTGCAAAGGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAITETKVKKRHVIDPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGSCASTIGPLPHDVEVAIRQWDYNEKLAMFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVSSHSSHVMSAQSTSTLPTTPAPQPPTTSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDSERKEAEGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKSQPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAANPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQTAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPNTNIFGRF	200398	222223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_200642_201168_201274_201485_201678_201811_201972_202459_202642_202832_202944_203050_203306_203687_203835_203996_204097_204225_204363_204698_204831_205194_205322_205765_205996_206348_206430_206561_206733_206932_207078_207243_207295_207618_207738_207914_208059_208504_208669_208870_209003_209392_209621_209795_209941_210110_210208_218906_219010_220556_220750_221301_221476_221675_221758_221959
900555	contig_2854_pilon	+	2828	1	Intergenic	novelGene_120880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	487	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085639	1088467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1085600_1088500
900556	contig_16492_pilon	+	1945	4	Intergenic	novelGene_100308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	432.833557951424	58	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	186	344	165068	166139	TRUE	20	GTGGGTACCTTCTAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKK	164882	169279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_165074_165986_167407_168549_168800_169195
900557	contig_5797_pilon	-	5692	3	Intergenic	novelGene_56954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1820	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	3380	4690	376067	374757	FALSE	45	AAATAGGTCGAGAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIIINFIWKGKTPQISKALLMKKKNKVGGLTLPDLRIYYIATVVKTVWYWYNDRYNDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSITWGKDSLFNKWCWQNWISICKNMKQDPYLTSYTKTTSKWIKDLNTKPKTIKSIEEKIGPMLQVLIHGINRIETITINAQNPTNKLDNWDLLKIKHLCSSEDFTKRLKGEPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNKPIKKWAKEMNRHFTKEDIEAGNRHMRKCSLSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLTRIKNTGNNKCWRGCEEIGTLMQCWWECKMIQPFWKLIWRFLRKLETEILYDPAIPLLGIYTREITAITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYATRKNNDESVKPLITWMKLEGIMLSEIRQSQKDKYCMRPAL	473646	373754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_377173_456461_457266_472176
900558	contig_6434_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_61897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	977	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1776	2174	911122	910724	NA	25	CTAACAGATGTTTCCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIEGSLIFNLRYADDTTLLAESEEGLKHLLMKIKDYSLHHGLYLNIKKTKILTTRSISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINAHGSSSQVIRQHTAVGKSAVKDLFKVLKSKDVTLKTKMHVTQAMMFSITS	912897	910170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_910200_912900
900559	contig_6102_pilon	+	3384	28	Intergenic	novelGene_31896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	455.808857612092	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	68	2020	373473	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	373405	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394705_394749
900560	contig_12624_pilon	+	1921	10	Intergenic	novelGene_60937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	355.148795108004	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	134	934	11640	55160	FALSE	70	TACAAGAACAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	5968	56147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
900561	contig_19769_pilon	-	2559	4	Intergenic	novelGene_102244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_3	44.181444068749	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	364	2514	47410	39200	FALSE	20	CTTATTTTATATGGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLPETSHEAVPGWAGTQVSLGRWCVCFQEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLAGVLVFKPELISRLEQGQEPWVLDLQASEGRETSKTSQIDSTIRTDNEQAYEEMDILKSELNGMRIKIPPQDFSLSPGFADTSDSEVLLENNQSSSPRLTVMNSLFQKNRLNKGTVMLKKTFTQNSQECNEVRSTGSLDCKLSENQRDTAEETAERCDGCGRSFRSISDIAVCWEVNKQKKLNKCQECQKKLSHCFQGKHQSNCQEEKPYECEECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFKCTDCGKAFRLSSKLIQHQRVHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLIRHQRTHTGERPYTCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHTGEKSQMSRTADNPSLAPHQRIHTVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYACNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLECGKAFSMSTQLTIHQRIHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWYYEYGHALESSFVSRKKVNTIKKLHKCNECEKIFRWRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFNRSSRLTHHQKSHMG	48870	39154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_41020_44714_44832_47196_47758_48854
900562	contig_14513_pilon	-	1140	3	Intergenic	novelGene_70258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11579_11694_12166_18691
900563	contig_18592_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_114781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACGATAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	10668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_10700_12800
900564	contig_14925_pilon	-	897	6	Intergenic	novelGene_55304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112259_113039_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
900565	contig_17144_pilon	-	1805	9	Intergenic	novelGene_29363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1972.0344784955	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	390	1511	174965	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179757	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166593_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
900566	contig_6410_pilon	+	2926	7	Intergenic	novelGene_108616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	134.243145904073	482	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	134	439	300693	310310	TRUE	50	AAAATAAGTCCAAGTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSDCEGGRTPPQQKGHLPGRRSLCPPQRLPSSQGESSPFLFSIMNWHTIISVLMVVVLKVVGMTLFLMYFPQIFGKNDFNFVPTKGYATVCPTGWALHQGKCFLLTTSESSWNKSRSYCEGEGSTLAIVNTPEKLLVPRCTSLA	299798	315765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_299913_300673_300772_301579_301640_306809_306947_310280_310369_312966_313260_313629
900567	contig_14341_pilon	-	2687	4	Intergenic	novelGene_111771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGCGAAGTGCGTCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304295	299421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_299456_299910_300005_300968_301096_301863
900568	contig_5944_pilon	-	3573	4	Intergenic	novelGene_178303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1420	1725	308801	308496	TRUE	55	CGGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISLGYIPRSGIAGSCGISISSFLRKHHIVFQNGCIIMHSHQQCIRVLISLQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAA	388078	189404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_-_189679_195268_195512_307164_309732_387589
900569	contig_1725_pilon	+	2848	21	Intergenic	novelGene_24258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	623.064304466241	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	90	2183	201480	251153	TRUE	35	ATTTAACTACATTGGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTCSSSA	201390	255853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251083_251131_251165_252164_252265_252711_252779_255366
900570	contig_14792_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_170488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	18	317	42777	42478	NA	65	AAAAAAAAAAAACCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQIPYTKTKTNSKWIKDLNIKPKTIKIMEQKIGTMLGALIYGINRIPNITKNAHIADELDKWDLLKIKHLCSTKDFSKRIREPIDWEKKLATTYLTRV	42794	40977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_41000_42800
900572	contig_7391_pilon	-	3255	13	Intergenic	novelGene_112140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_12	79.5753922739659	429	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	915	2285	341704	316481	FALSE	20	TGAATTGAGGGATTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLPFDSLIVNLLGISLTVLFTLLLVFIIVPAIFGVSFGIRKLYMKTLLKIFAWATLRMERGAKEKNHQLYKPYTNGIIAKDPTSLEEEIKEIRRSGSTKALDNTPEFELSDIFYFCRKGMETIMDDEVTKRFSAEELESWNLLSRTNYNFQYISLRLTVLWGLGVLIRYCFLLPLRIALAFTGISLLVVGTTMVGYLPNGRFKEFLSKHVHLMCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKYDPQFGDAFWNSSKYGMVTYLLRMMTSWAIVCSVWYLPPMTRETDEDAVQFANRVKSAIARQGGLVDLLWDGGLKREKVKDTFKEEQQKLYSKMIVGNHEDRSRS	357886	315510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316590_322885_322966_323053_323183_326974_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206_330297_331310_331386_332334_332636_332814_332885_341539_342554_357821
900573	contig_4857_pilon	+	1555	3	Intergenic	novelGene_48835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	151	junction_1	54.5	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGATTCTGCTGAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1408309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1405453_1405556_1407013
900574	contig_12969_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_61706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	216	651	126	776	610586	611236	NA	40	AGAAAATAAATTTCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWQPGNQNELKSLERCLQSFSLGINFGLSKNLAPLTQRHNMFDLHHRSLQSRLNFVIQNRGDEGKDSDEFSGYEKLSVHMKHDKTFPGIKYHGYFKPTSIRSQLSGQPKTYTEEQPHKCSECGKVLYRKSLLFYHQRIHTGRNPVYAMNMEKPSLGRAGSRDISYLILERRSMDVMNVGNHFPRRHTLFYIIDFTQERSLMNAVNVEEPLLLSQH	610460	612178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_610500_612200
900575	contig_18491_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_176620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCTCAAGAAACAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10551	11910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_+_10600_11900
900576	contig_15031_pilon	-	2792	8	Intergenic	novelGene_138396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	238.500588284903	28	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	104	1216	129549	71286	FALSE	15	GGCAGGTTTCACTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNIGEQLNKAYEAFRQACMDRDSAVKELQQKTENYEQRIREQQEQLSLQQTIIDKLKSQLLLLNSSRDNSYGIVPLLEDSETRKNNLTLDQPHDKVKSGIPREKQSKVRRQEVSSPRKENSPKSLGTPLFHERDYIERTFWDLKEEFHRICMLAKAQKEHLSKLKVPDTANETQCSVPVQCTDKTDKQEALFQPQAKDDINRDAPCITSVTPRGLGRDEEDTSFESLSKFNVKFPPMDNDSTFLHSTPERPKALGPVTSETVCQDKFNMELRNNPGNFIKTEETFFENQGIDPIASAIHNLKTTDKTKPSNLVNTLDNAPCLPPGEHNALYVKTFPLQDLSDAPFPSFDSSGRAIRGPQQLVCAFMFQ	161630	69709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_71313_72495_73062_78711_78828_79524_79602_101742_101862_102970_103080_129450_129599_161576
900577	scaffold_4438_pilon	+	5676	1	Intergenic	novelGene_174549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	238	717	4866	5582	425376	426092	NA	50	ACTAAGCCAAACAGAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANSHQKRAEVAIPISDKIDFKTKSTIKDKECTPIMTKGMIQHEDITIINICPPNDGAPKYIKQTLTALEREIDSSTIIVGDFNTALSVKDRTSRKKLSKDTEYLKATISQLELIDIYRTLHPTAANYTFFYNAHGMFSRINHILGQNATLNKIQNTEIIQSIFSDHNVIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLKNHWVIDEIKKFLKSNESENTSHQNLWDTAKAVLRGQLQ	420510	426186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_420500_426200
900578	contig_12677_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_110705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1400
900579	scaffold_19766_pilon	+	4078	3	Intergenic	novelGene_34391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACAGAAATTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809201	813917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_811910_812264_813572_813854
900580	contig_3380_pilon	-	589	6	Intergenic	novelGene_60092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.2074368738204	1	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGTGGAACTCTCCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381538	369635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_369718_371066_371111_371942_371997_373064_373178_374795_374921_381367
900581	contig_10235_pilon	-	1763	7	Intergenic	novelGene_46327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.3109664583458	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	178	726	94532	92415	TRUE	30	CCTTACTCATGCAATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMLLLIFIMVHPGSCALWVIQPPEIRTQEGATTSLPCFFNASQGRPAIGSVTWYRDEVAHGKEVRNRTPEFWGRLVPLGSVRFLCDHQAELHIRDTRVNDAGVYLCRVEVLGLGIGTGNGSLLVVEKGSCQLETSTILYLLLRAAFYAFSFLSVAMGSTIYYQGKCPCCMGTPCHALDGL	94709	90010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_90033_90393_90490_90831_90898_91561_92462_92591_92706_92878_93224_94489
900582	scaffold_4438_pilon	+	1191	6	Intergenic	novelGene_174538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	63.8924095648302	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	310	1191	395703	419124	FALSE	40	GGAACAATGGAGGAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQTTTLIVKKRPDFSSSGQWEIVTKSNGKEQSEVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVFLSTRQGSWVLSHISGDGYPWDMLFHTHFRSMLRNVLPRMVVKWMMEQQMNQWFNHENYGLKPQNKYLMKEPVLNDDLPSRLLYGAIKVKSRVKELTEASAIFEG	395393	419124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_411934_412098_413970_414114_416923_417124_419006
900583	contig_6102_pilon	-	4145	24	Intergenic	novelGene_32053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_8	47.7281606149868	732	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	206	1795	591254	584381	TRUE	20	GCATTTCACCTTTGAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASGSQGRGARILIVNSGFSRPSEAGNEGAGRSRRQGRWSWCRTRSGNEEPLQEPPVGAGTATPTRRQMAQWEMLQNLDSPFQEQLHQLYSNSPLPVDIRQYLAAWIEDQNWREAALGNDDSKANMLFFHFLDQLSYKCGPCSEDPECLLLQHNLRKFARDIQAFSKGPAQLAEMIFNLLLEEERILIQAQRAQSDQKEPALDAPVESQQHEIESRILELRAMMEKLVKSISQLKDQQDVFCFRYKTQTPVRTPSLDHHQARQQQLLQETINELDKRRKEVLDAVKALLGRLTTLIELLLPQLEEWKVQQQKACIGAPLDRGLEQLEKWFTNGAKLLFHLRQQLKELKGLSRMVSYLDDPLTKGVDLREAQVTELLQRLLQSAFVVETQPCMPQTPHRPLIVKTGNKFSVRTRLLVRLQEGNESLTVEVSIDRNPPQIQGFRKFNLLTSNQKTLTPEKGQRQGLIWDFGFLTLVEQRSSGSGKGSNKGPLSVTEELHIISFTVKYTYQGLKQELKTDTLPVVVISNMNQLSIAWASVLWFNLLSKNPQNQQFFSSPPRSPLELAGPCSQLAVLFLHWPRPQTRAAEHAEGQVVWAEL	598653	579746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_581276_581579_581891_582702_582761_583000_583184_583385_583523_584131_584227_584343_584394_584525_584663_584773_584873_585040_585125_585204_585253_585404_585499_585727_585749_586157_586218_586434_586528_586633_586793_588943_589093_589255_589342_589720_589797_589888_589979_590356_590453_590810_590965_591123_591262_598455
900584	contig_7333_pilon	-	2255	3	Intergenic	novelGene_142810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	71	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	432	1820	406076	394458	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	406507	394022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_405092_405298_405761
900585	contig_15021_pilon	+	2178	14	Intergenic	novelGene_26975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	146.048180426588	14	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	199	1125	322371	332947	TRUE	50	CAAACAGTTTCACAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVAVLTQESFAEHRSGLVPQQIKVATLNSEEESDPPTYKDAFPPLPEKAACLENAQELAGAWSSKIRPIKASVITQVFHVPLEERKYKDMNQFGEGEQAKICLEIMQRTGAHLELSLAKDQGLSIMVSGKLDAVMKARKDIVARLQTQASATVAIPKEHHRFVIGKNGEKLQDLELKTATKIQIPRPDDPSNQIKITGTKEGIEKARHEVLLISAEQDKRAVERLEVEKAFHPFIAGPYNRLVGEIMQETGTRINIPPPSVSRTEIVFTGEKEQLAQAVARIKKIYEEKVRGLAGQSPAPGREGQE	318792	339816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_318892_321189_321252_322333_322447_324679_324838_326027_326244_332248_332456_332677_333315_333453_333562_334697_334803_335115_335195_336589_336730_338549_338655_338751_338866_339781
900586	contig_10235_pilon	+	2301	2	Intergenic	novelGene_46508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1180	1965	298176	298961	FALSE	50	AAGATCAAAAATGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKEEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGAGGFGAQAPRGASASGPTIEEVD	296449	299297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_297149_297695
900587	contig_7963_pilon	+	1089	5	Intergenic	novelGene_58392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1313.42957557686	28	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	67	756	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQAHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51383	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56956_57348_57564_57782_57934_63003
900588	contig_9436_pilon	-	3021	2	Intergenic	novelGene_60904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	44	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	343	366	418163	418140	TRUE	15	GACCATATCTGTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFKETEAVGVLEHGPYDPPPSPWDYLGPRSWEDGLRRLCLLQECAVRPQRGLHGEVLEVGDASGRKGEWRESPGDFRWGERCRGFREDSRELPAKRGFLGTSGDEGVRIGLGGMSGRLWT	418505	415385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162
900589	contig_12622_pilon	+	5115	22	Intergenic	novelGene_5796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	184.915461471334	109	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	3186	4823	446467	475513	FALSE	60	ACTTTAACTTATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	349680	475805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_403070_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449529_454887_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
900590	contig_7513_pilon	-	2280	11	Intergenic	novelGene_88973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	85.0520428913968	327	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	10	1206	316356	269761	FALSE	15	GTCCTTGCGTAATAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKVQQEERMRMESRRQVTVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRAQEIPMWQPNMEDSAALDMRGIGQVLPAHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLSRGSVDRDDGGLQGPTGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPCHLGSLASLSSPGDSYNEGVKLQPQEISPRPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPVLPASTHREIEMAQKLLNSDLGGLINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLAQTRPH	316365	268686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_269974_272301_272383_274516_274673_279629_279737_280088_280129_282426_282490_290337_290470_291263_291402_295215_295303_299245_299358_316288
900591	contig_10324_pilon	+	3726	27	Intergenic	novelGene_7692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	34.3791081461267	635	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	553	978	11902	13152	TRUE	15	CCACTGCGCACGCGCGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKPRHSLYFIGYQDDFLLYLDPHYCQPSVDISQADFPLESFHCTSPRKMAFAKMDPSCTVGFYAGDRKEFETLCSELTRVLSSSSATERYPMFTLAEGHAQDHSLDDLCSQFSQPTLRLPRSGRLLKAKRPSSEDFVFL	8006	21908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_8072_8632_8717_8796_8971_9591_9657_10798_10930_11868_11948_12019_12097_12176_12297_12969_14108_14675_14774_14869_14937_15977_16112_16196_16321_16410_16500_16592_16669_17911_18082_18170_18270_18368_18507_19049_19172_19519_19594_19668_19769_20050_20100_20180_20238_20456_20567_20897_21001_21584_21660_21800
900592	contig_3068_pilon	-	2839	23	Intergenic	novelGene_137628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	317.168636871422	5	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	29	2179	251978	234399	TRUE	10	CCTTCACTGTGTGCATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKWADTST	252006	233119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234420_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972
900593	contig_17833_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_174599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTTTTCAAGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13739	14227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_13700_14200
900594	contig_21007_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_161548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACAGAGGGGTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1855	620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_600_1900
900595	contig_3866_pilon	+	3374	5	Intergenic	novelGene_112418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	74.7278395245038	161	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCACCCATCCTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224223	243282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_224394_225367_225423_228056_228148_239657_240625_241191
900597	contig_6199_pilon	-	5994	1	Intergenic	novelGene_126378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATCTACTTCTGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284912	278918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_278900_284900
900598	contig_709_pilon	-	4492	25	Intergenic	novelGene_57552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	109.737154398843	470	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1235	3708	56	3763	1580832	1540432	FALSE	45	TCGAATAAACTTCACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAPPGPGSWSRLPWAEVMGDLKEAEAEAPPAGAAARGRLSLLPQGEPEESSAQGSAVFLGGNEVKSRAVVKYSSAPARTAFARLQEKTDLKLPPANWLRESAKLGPAGTTILGNSKRSKPFSSFGMAYDFIDSVGNDVDVVSDSENIKKLLKIPYSKSHVSMAVHRIGRTLLLDELDIQELFMRSSQTGDWTWLKEFYQRLIDQKWQRKKKSKEHWYQKAILSKFLYYSISGDGAAQPVPSAADQQGSSSPAQTTDSERASWPAPFEVPSSVSEDPSASNQESEPFEPSYIVGHVASAPKEQNLTTLFNDGENSQGLKNDFVRNILWTFEDIHMLVGSNMPIFGGGRYPAVSLRLRDNNKPINVLTGIDYWLDNLICNVPELVMCFHVNGIVQKYEMIKTEEIPNLENSNFSTKVIKDIAQNILSFLKSNCTKEGHTYWLFKASGSDIVKLYDLTTLCEETEDKYRNPFTMPVAVLLYKVACNMMMKKNQNKKHYGTIRTLLLNCVKLLDKGRHPQIIASANYMLSELFQLDEPKKEESSESPLNENSDESYSEEEEEEMVDSDENGPYSAGADPSEDSKAVAIIQSVGELSVPEKYKSIHQIRPSCAFPVCHDTEERCRLVLSYVLEGLKSVDNSIKKESDLPAADPNTPIPLKYEDESSRGGPEGLEKQMALFLDKMGSLQKGNYSSQSGMIPGSWQHKMKLQLILKSSKAYYVLSDAAMSLQKYGRALRYIKLALQSHDTYCCLCTNMLSEVLLFLSQYLTLCGDIQLMLAQNANNRAAHLEEFNYQTKEDQEILHSLHRESSCQGFAWATDLSTDLESQLSVSCKCYEAANEILQFSDLKSQNPEHYVQVLKRMGNIRNEIGVFYMNQAAALQSERVVSKSVSAAEQHLWKKSFSCFEKGIHNFESIDDATNTALLLCNTGRLMRICAQAHCGAGDEFKREFSPEEGLYYNKAVDYYLKALRSLGAREMHPTVWDSVNWELSTTYFTMATLQQDYAPLSRKAQEQIEKEVSEAMMKSLKYCDVDSVSARQPLCQYRAATIHHRLASMYHSCLRNQVGDEHLRKQHRVLADLHYSKAVKLFQLLKDAPCELLRVQLERVAFAEFQMTSQNSNVGKLKTLSGALDIMVRTKHAFQLIRKELVEEFDQPESDGPPPAAESSRGLDQEEVTKLLSIFESRLSFLLLQSVKLLSSTKKKTSSNTEEDVVLKANKQIYSQLLRATADRGTAVLERIDVVVHLLDQLACSGSAGQ	1580887	1539702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1540592_1548421_1548574_1549329_1549446_1550433_1550588_1552711_1552862_1553201_1553361_1554974_1555199_1556514_1556734_1558380_1558582_1558925_1559115_1561194_1561346_1561639_1561712_1564438_1564703_1566337_1566450_1566821_1566931_1567005_1567154_1569749_1569862_1570545_1570668_1570944_1571047_1575108_1575266_1575514_1575640_1576673_1576800_1577471_1577539_1578620_1578830_1580724
900599	contig_13021_pilon	-	3732	1	Intergenic	novelGene_8282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1853	2254	253082	252681	NA	35	GAAAATGTGCCTAACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKSNHIALGKSAAKDLFKMLKGKDVTLITKVRLTQAMVFSITSYVCESWKMNKEDGRRIDAFELWCWRRILSIPWTDKTTNKSILEVVHPEGSLEAKMARVHLMYFGHVIRRDQPLEKDIMLWKVEGQ	254934	251202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_251200_254900
900600	contig_15413_pilon	+	2671	5	Intergenic	novelGene_176957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1113	1574	103534	103995	TRUE	0	TTTTTCTTTTCTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTIPKHLQKQDRMVPVGVQNKTLDDTPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKQEKIDKLVENTDKKLEEFRTKCQNKFTTKIIQRQIEIQNINNKISEMDGVIKGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLRKTQKKEQRKMKTP	101642	220074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15413_pilon_+_102003_102781_104136_138725_138842_218968_219534_219798
900601	contig_10904_pilon	+	1866	6	Intergenic	novelGene_22734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATTATAATGATCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651617	662732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_652496_660333_660636_661464_661762_661935_662221_662407_662444_662664
900602	contig_12677_pilon	-	679	2	Intergenic	novelGene_110858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3787	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3378_3540
900603	contig_10068_pilon	-	2943	9	Intergenic	novelGene_148701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	137.035978396186	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	392	1309	57243	44668	FALSE	50	AAAAAAATCTCATGGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61146	43033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_54327_54436_56355_56498_57186_57276_58180_58370_59771_59887_61091
900604	contig_10734_pilon	-	2724	13	Intergenic	novelGene_51274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACGGGCGGTCCACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363089	1336650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1336826_1339436_1339503_1339939_1340076_1341847_1342034_1346894_1347011_1347327_1347504_1352397_1352590_1354483_1354613_1355744_1355811_1356734_1356873_1359064_1359203_1361512_1361685_1362055
900606	contig_3018_pilon	+	1991	2	Intergenic	novelGene_78898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	13	junction_1	0	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTTAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588241	592382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_589685_591834
900607	contig_1406_pilon	+	2783	3	Intergenic	novelGene_25505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	98	junction_2	13.5	204	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGCAAAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456102	1461705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1456276_1456887_1457041_1459248
900608	contig_3077_pilon	+	3321	12	Intergenic	novelGene_26827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	92.5783117239286	454	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	172	1605	492543	520670	TRUE	30	CTCAAATGCCTAGGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPDLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTTDEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGI	490520	522574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_490635_492485_492726_496881_497036_498360_498579_503787_503938_507593_507709_517678_517786_518599_518796_519232_519392_519712_519812_520617_520806_520993
900609	SIRV6	+	845	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	518	337	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	197	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	35	AATGGAAATTGGCGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
900610	contig_5686_pilon	+	2276	3	Intergenic	novelGene_45254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	649	990	94439	94780	TRUE	40	AAAAAGTTGGCATCAACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93790	96835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94809_94936_95485_96125
900611	contig_2924_pilon	+	3419	2	Intergenic	novelGene_140273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAATACCTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222793	226522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_222866_223175
900612	contig_15135_pilon	-	3961	36	Intergenic	novelGene_119868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	462.997521922226	1	59	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1227	3684	40	3723	122783	54147	TRUE	40	GTAAGAAATGCTTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGTLQGRRSTELTDLGLDSLDNSIACECAPEETESSESSLHPDFAKYLAETEETVKMTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNKQFCSKLGKYHMPFAWAVRSVFKDNQGNVDKDSRFSPLYRQEASKISTEDLLKLVSDYRRADRVSKTQTIPGSLDIAVDNVPSEHPNCVTSSFIPVKPFNVTAQPEPTVEVEEFVYDSSKYCRPYRVYKNQIYIYPRHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDEEGAKPMKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHVLFSFYHVTCDINAKANSKKKEAPETSVGYAWLPLKRHDQIASQEYNIPVATSLPPNYLSFQDSASGKHNTSDIKWVDGGKPLFKVSTFVVSTVNSQDPHVNEFFKQCQEREKDTSQSPTSNFILSCKNLLNVEKIHAIMSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEISTPVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRTYKERTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGFVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQELCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESIQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDIRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYKEPEKHSQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFAVNTSNQGSRDDLSTNGGFQTQTTVKHNSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRVSLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISEETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHTTTSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIPLRIILL	122822	53360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_53472_54019_54172_57109_57162_58967_59093_62133_62236_62839_62888_63101_63169_63261_63377_63466_63589_64779_64889_65955_66073_66198_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92251_94677_94797_95329_95423_95825_95913_96510_96633_96824_96949_98619_98713_100999_101066_101588_101777_103604_103685_105120_105244_110796_110880_113400_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
900613	contig_14326_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_120752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	181	363	551722	551540	NA	65	CGAAAAAAAAAAACCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSQPPGVKENEEHQRHKESISRRDRKGHINQRLHQPETRTRWCPATTNDHLDREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTKLNGLTETGGTLESIAPGFSISPELKQFLRPTLCTGIGLDYGT	551902	550436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_550400_551900
900614	contig_383_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_126120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	368.426660383899	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	367	975	141861	148666	TRUE	20	GTGTGTCTTACTAATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTFPYSDLGQIPSPPPIPTLNDSLIPTQFNPPVVVGLSEDDGDYIEIIPRQEFQSSEEDSVEIDYVPYNDPYQTDIRTDINSSRNPDNIAAWYLRSNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEPLMG	136434	154337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145266_148651_148832_150746_150864_153255_153328_154233
900615	contig_16110_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_126805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	500	850	126429	126079	NA	30	GACACATATTTTCAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKFALERRVAKAKGRNDEVKELNRDFKGRFKKTKYYNDTCKDLELENQKGRTCSAFLKLKELKKKIQASNCNTEGFYGQNTEQHREPQKKMRGIQSHRIKKNWSMFSHFRR	126928	124443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_124400_126900
900616	contig_16110_pilon	+	6126	15	Intergenic	novelGene_126769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	334.291674244794	475	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	115	1710	6170	70398	TRUE	45	ATATGAAAATAATTTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPTKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVESPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGGKKEEILSFRISINAELFL	6055	111853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_6193_7704_7769_9530_9615_14413_14538_32691_32771_53175_53331_54084_54158_55828_55977_56201_56270_56530_56572_57352_57574_58499_58679_68233_68360_70187_74642_111680
900617	contig_6361_pilon	+	3047	5	Intergenic	novelGene_23973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	405360	405704	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405180	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
900620	contig_8263_pilon	-	6835	3	Intergenic	novelGene_83084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	679	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2995	3378	138626	138243	TRUE	50	CTGAACAAAGAAAATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCYTYFYPNKKKSKLRGFWEGGIVNIVPILPHKYHKKYEGNGLALRDSELRSRGNRRRAANRQESTINKRITYGGKIASPTISAPPPQSHGPLAAVNWGSGPRKEPASLTTTAPACTKRRDLKLLL	141620	134470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_135251_135351_136042_136255
900621	contig_1301_pilon	+	1770	6	Intergenic	novelGene_47300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAAGAGTCATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268649	278466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_268821_269065_269264_270309_270402_274190_274260_276835_277906_278296
900622	contig_16125_pilon	+	3011	2	Intergenic	novelGene_155267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCGGGCAGAAGAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147606	151160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_148240_148782
900623	contig_10297_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_112555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCTGGAATGTTTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649166	648214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_648200_649200
900624	contig_11422_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_99016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1690	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_654_972
900625	contig_14679_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_174181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70044	71236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_70000_71200
900626	contig_602_pilon	+	3840	3	Intergenic	novelGene_134972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	813	1127	574616	574930	TRUE	45	CCTGGTTAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWLEITKLFERILTKALSHLLNHAAFSRCTLYEKKKTKITHTGTTSFPLLKQKVKRYTCRPQSEGIFNLAGLHHQTGTITSCHNSTVCNNNNCFIPGVGQSLT	573803	593656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_576109_589573_589917_592464
900627	contig_16228_pilon	+	4062	3	Intergenic	novelGene_147931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	164	694	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	63	518	47816	60229	TRUE	40	TAAAAAGTTACAGGGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYGE	47753	83435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60247_79908
900628	contig_16701_pilon	-	1426	2	Intergenic	novelGene_177600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	505	1071	99126	93634	FALSE	45	CAAGATACACCCTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIHRSTPITIARYGRSRNKTQDFEELSSIRSAEPSQSFSPNLGSPSPPETPNLSHCVSCIGKYLLLEPLEGDHVFRAVHLHSGEELVCKVFDVSCYQESLAPCFCLSAHSNINQITEIILGETKAYVFFERSYGDMHSFVRTCKKLREEEAARLFYQIASAVAHCHDGGLVLRDLKLRKFIFKDEER	99630	93278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16701_pilon_-_93931_98856
900629	contig_18804_pilon	-	7348	17	Intergenic	novelGene_163786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	21.1763429326218	716	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3589	4041	11234	4203	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLTQQIQAEDEQYSLVASLDNVRNLSTILKAIHFQDYATCFATKNGIKVTVEKAKCVQANAFIQAGIFQEFMVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFDFNST	26860	4	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_254_372_1569_2108_2855_3086_4215_7615_7750_9513_9623_11036_11296_11773_12257_14600_14713_17737_17781_20344_20419_20695_20747_20842_20917_21080_21129_21270_21374_24072_24203_24451
900630	contig_2114_pilon	+	2079	4	Intergenic	novelGene_104219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	77.6587978846498	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	120	740	136332	137672	TRUE	35	AAAAACTATGCATGGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEVGYTLNSFLWPELDTVVLNSGI	136212	139925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_138492_139405
900631	contig_7513_pilon	+	4878	23	Intergenic	novelGene_89001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_22	223.790343331867	520	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	354	1901	621818	662175	TRUE	15	CTGACATCCACGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAATADCTAPCKSRRRSFRKKREKPRPEHWKGVAGDPEDVSIPNDVDLLALPQLCFPGGVCVASEPEEDRVHFLVLTDVCGNRTYGVVAQYYRPLHDEYCFYNGKAHWESSLQTVSMAGCFVPFAVCVISRYPYYNALKDCLSCLLTHLKLCKDFEVDDHIKEFAAKLSLIPSPPPGPLHLIFNMKPLQIVFPSRVDPESPIIDLDLHLPLLCFSPETVLQVLTCMLTEQRMVFFSSDWALLTLVAECFLVYLHPLQWQHTFVPILSGQMLDFIMAPTSFLMGCHLDHFEEVSEEADGLILINIDNGSVTCSKPLEDSMDIPDVPLLAAQTFIQRVQSLQLHQELDLAHCSSSTDLNEGHGRRHAWQQKLNGQIQQVTLQLLVNIFREVKNHLNYEHRVFNSEEFLKTRVPEDQQFYKQVLDTYMFHSFLKARLSRRMDAFAQMELSTQSEEDRINGMLISPRRPTIEKMALRGSSPLHVAHRRIVVSMPNLQDIATPEVQPRNSSLRKVDAVSCKGCSKAQNVAPKSSYTFKIPEIHFPLVTQCVDAYYTDFIELLSKAMSFLGPDSSALLARYFYLRGLIQLVQGRLLNALLDFQNLYKTDIRIFPADLVKRTVALMSAPRACQDRADP	613384	692375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_613562_615394_615511_621757_621901_624879_624992_628220_628341_629352_629572_637331_637454_641686_641843_647441_647539_654249_654354_656305_656506_661840_662364_669619_669880_671630_671802_673125_673256_677527_677630_680394_680535_682651_682813_685351_685486_690075_690195_690278_690417_690611_690819_691148
900632	contig_4519_pilon	+	4206	6	Intergenic	novelGene_123672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	91.6069866331166	238	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	780	1157	69586	69963	TRUE	40	CCATAATTCAAAGGCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGPAPCGPSPGSGSSLGVSPQRVLPFSGLPEHASGRMTCLKLNPDRVIPLHTPPSHLTGPKLLSVVPKAPPCLAPPTSPAQAPWAPTSTPSVAPYTSIKLVCFLFRETHSAGREQAADPSAGG	68806	101122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_70919_77856_78014_78794_78937_79733_79866_79973_81239_100724
900633	contig_18850_pilon	-	2579	10	Intergenic	novelGene_142423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCGCCCGCCTCAGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181916	171934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_172057_175235_175507_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513
900634	contig_8122_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_40208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACAACAAAAAAATGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358388	359669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_358400_359700
900635	contig_3975_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_54864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAGTTTACTATCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2071604	2074095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2071600_2074100
900636	contig_11898_pilon	+	3661	2	Intergenic	novelGene_144291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	657	1049	240839	241231	TRUE	35	GACCCCAGTTTAAGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGVWGWLEAAQGQNCLLPQGGQRTFGICVNFIDKNSPNPGNTIGQRKVTQNRRMFQTFRKRERTRKKKACHTLAVCTDEYSSQSGHCTAAMYATNEVDRRESISTFSTSRESLSFNDLSSPLSDNQSSF	240182	246459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_242154_244769
900638	contig_1107_pilon	-	3722	18	Intergenic	novelGene_126587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	83.3080746033519	287	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	118	2334	885345	828870	FALSE	25	TGAGGTTCCAGAACCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSRMNLPKGPDTLCFDKDEFMKEDFDVDHFVSDCRKRVQLEELRDDLELYYKLLKTAMVELINKDYADFVNLSTNLVGMDKALNQLSVPLGQLREEVLSLRSSVSEGIRAVDERMSKQEDIRKKKMCVLRLIQVIRSVEKIEKILNSQSSKETSALEASSPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRIAGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSNVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVIIEQFVQSHPNGLRIMYDKLLDFVPHHCRLLREVTGGAISSEKSNTVPGYDFLVNSVWPEIVQGLEEKLPSLFNPGNPDAFHEKYTISMDFVRRFEVQCGSQASVKRLRAHPAYHSFNNKWNLPVYFQIRFREIAGSLEAALTDVLEDAPAGSSYCLLASHRTWSCLRKCWSDEMFLPLLVHRLWKLTLQILARYSMFVSELFLRPISNESAKDVKKPLVTGSKDPSVTQGTNDDQGNGPSETKPVVFISSTHLVYVVADLDKLQEQLPELLETIKPKLEMIGFKNFSSVSAALEDSQLSLSACMPSLSKKIIQDLSDSCFSYLKSALEVPRLYRRTNKEVPTKASSYVDSALKPFYQLQSEHKDKLKPAIIQQWLEGALSESTHKYYETVSDVLNSVKKMEESLKRLKQARKTTSPNPVGSSGGMSDDDKIRLQLALDVEHLGEQIQKMGLQASNIKSFPALIELVVAAKDQATAEQP	885462	827481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_828972_830568_830750_832067_832208_834151_834295_834587_834661_835598_835797_837627_837780_838993_839056_843882_844023_847728_847856_853032_853158_857752_857933_858472_858582_863302_863407_865151_865233_867475_867542_868869_869032_885273
900639	contig_11281_pilon	-	2066	20	Intergenic	novelGene_125447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	766.985158061732	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1263	804	2066	844638	802881	FALSE	35	ACGAAATACGGGAGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKK	900691	802880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849310_853765_853829_859558_859632_860043_860125_886942_887020_900630
900640	contig_3018_pilon	-	4520	1	Intergenic	novelGene_78932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTTTACTCACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651262	646742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_646700_651300
900641	contig_9633_pilon	-	1559	3	Intergenic	novelGene_139649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAATATGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193865	1173806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1174368_1192237_1193064_1193693
900642	contig_2854_pilon	-	5216	31	Intergenic	novelGene_120862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	54	junction_30	282.415314740543	342	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1092	3279	7	3285	1132514	919708	FALSE	55	TTTAATAAAAATGGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAAGLVAEVSWKVLERRARTKRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVSFIQNLVFCVERVYRVPDFGIWERGSKYNNGSTELHSSSIGLAKAALEAVNGFNLFGNQGCSWSVIFVDLDAHNRNRQTLCSLLPRESRSHNTDAALLPCISYPAFALDDEVLFGQTLDKVVRKLKGKYGFKRFLRDGYRTSLEDPNRRYYRPAEIKLFDGIECEFPIFFLYMMIDGVFRGNPKQVKEYQDLLTPVLHHTTDGYPVVPKYYYVPADFVELEKRKPGSQKRFPSNCGRDGKLFLWGQALYVIAKLLVDELISPKDIDPVQRYVPLQNQRNVSMRFSNQGPLENDLVVHVGLVAESQRLQVFLNTYGIQTQTPRQVEPIQIWPQQELVKAYFHLGVNEKLGLSGRPDRPIGCLGTSKIYRILGKTVVCYPIIFDLSDFYMSQDVLLLIDDIKNALQFIKQYWKMHGRPLFLVLIREDNIRGSRFNPILDMLAAFKKGMVGGVKVHCDRLQTLISGAVVEQLDFLRICDTEELPEFKSFEELELPKHSKVKRQSSASSAPELEQQPDVTITEWRNQPTHKILQKLNDCNCLASEAILLGILLKREGPSFITKEGTVSDHIERIYRKAGSKKLWSAVRHAASLLSKVVDSLAPSITNVLVQGKQVTLGAFGHEEEVISNPLSPRVIKNIIYYKCNTHDEREAVIQQELVIHIGWIISNNPELFSGMLKIRIGWIIHAMEYELQIRGGDKAAKDLYQLSPSEVKQLLLDVLQPQQSGRCWLNRRKIDGSLNRTPKGFYDRVWQILERTPNGIIVAGKHLPQQPTLSDMTMYEMNFSLLVEDILGNIDEPKYRQIIVELLMVVSVVLERNPELEFQDKVDLDKLVKEAFHEFQKDESRLKEVEKQDDMTSFYNTPPLGKRGTCSYLTKVVMNLLLEEVKPSNDDPCRVS	1132520	917776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_919843_920479_920621_923343_923452_927309_927440_932616_932752_952215_952419_956177_956269_958361_958420_960272_960355_962363_962527_962612_962675_970449_970541_970744_970828_971974_972080_972539_972624_984173_984268_984791_984848_1013998_1014094_1022720_1022880_1030218_1030297_1030833_1030892_1034447_1034646_1035630_1035727_1043761_1043826_1066039_1066156_1076127_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1132438
900643	contig_9484_pilon	+	4032	18	Intergenic	novelGene_105662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	609.740162482302	88	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	64	1074	126829	206935	TRUE	35	TGGGATTATAACCATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	126765	258106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513_212146_212355_213375_213461_214551_257896
900644	contig_6513_pilon	-	5324	1	Intergenic	novelGene_117750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	437	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78154	72830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_72800_78200
900646	contig_11338_pilon	+	2148	11	Intergenic	novelGene_6275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.4056891008432	277	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	613	1140	177794	189573	FALSE	10	GCTGTGGGGGAGGTTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFQQMAWQANVTGMAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172036	190581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176351_176432_176475_176652_176695_177543_177685_177767_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
900647	contig_9017_pilon	+	990	4	Intergenic	novelGene_130345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	194.417648947369	57	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	69	746	609506	610781	FALSE	15	CATTCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLLLLWAGSLAQYQRFQLQMKESVTVQEGLCVLVPCFVRYPRKGWTKTDPAQGYWFWNEADYVWDAPVATNNPARKVQEETKGRFHLIGDPQNYNCSLDIRDARMADTGSYFFRIVRGTYVLYNFRSNPLSLYVTALTRTPDIHIQGTLKSGHPTTISCKVPWACNRGTPPTFSWIGVAVTSPGAWIGVAVTSLGSKTPYSSELTLTPEPHHHGTNLTCRATFPGADVTTESTVLLNVSFSLEI	609369	611025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_609403_609470_609855_610072_610385_610764
900648	contig_10496_pilon	-	3670	11	Intergenic	novelGene_59426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	119.563539592971	99	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	44	1408	64679	44321	TRUE	55	AAGAATTAAAAGTATATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKLCLQKWKNQSSALYGMARGPE	64722	41518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_42367_42906_44387_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
900649	contig_21007_pilon	+	417	1	Intergenic	novelGene_161535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	393	25	417	589	981	NA	30	TACAATAATTGCTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQ	564	981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1000
900650	contig_13244_pilon	+	3330	4	Intergenic	novelGene_87001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	59.6452475521357	88	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1457	1957	471590	475123	FALSE	50	AACTCAATAATAATATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLTSNRFGFFGFREKEAVRVCRTESELWEAGQKEYSKAWCLKVCFFLLAFDKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	469847	476496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_470237_470522_471869_471962_472131_475069
900651	contig_6477_pilon	-	316	4	Intergenic	novelGene_154184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11933	junction_2	249.03859584856	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	117	198	314	770052	769583	FALSE	25	CAACAGTGGTGCTGTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDD	771303	769580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769666_770018_770106_770616_770699_771241
900652	contig_16205_pilon	-	4648	1	Intergenic	novelGene_156877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAAAAGAGTAAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100099	95451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_95500_100100
900653	contig_13542_pilon	-	4561	1	Intergenic	novelGene_131527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	227	373	499629	499483	NA	25	GAAGACAGTGGGCTGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPSQCAGALEDSGLCHSTVLAAACKESAVPAGSSGEPAAGIRGPLARGWGTEAQTARDPAGSQRPHAQEYLLPLMNMPPPAPSREGRADHLARCWLVQHPAETAHLVCLHTTAHRHRTPVLN	499855	495294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_495300_499900
900654	contig_233_pilon	-	2805	16	Intergenic	novelGene_14516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1552.18928398998	13	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	82	1173	126907	95903	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPYLDAPYGNSFKFILHVACS	126988	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_95799_95963_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107449_108724_108814_109914_109976_126898
900655	contig_9609_pilon	-	2747	4	Intergenic	novelGene_23001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCCTTGCTCTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319808	311094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_311599_313104_313264_314272_314431_317882
900656	contig_2219_pilon	+	4694	1	Intergenic	novelGene_67169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	392	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGGGACATTCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89477	94171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_89500_94200
900657	contig_1863_pilon	-	1426	5	Intergenic	novelGene_156520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	76.1031372546494	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTTAACCTTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62712	49131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_49540_51778_51906_55778_56446_56899_57021_62609
900658	contig_4857_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_48776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	800	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATATATGAAGAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216064	1217966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1216100_1218000
900659	contig_21315_pilon	-	3335	2	Intergenic	novelGene_151560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAAACTCCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52528	8167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_-_11108_52133
900660	contig_12019_pilon	+	2914	6	Intergenic	novelGene_87622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAACAAAACATTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1950	10532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2300_5118_6434_7726_8013_8322_8494_9216_9483_10005
900661	scaffold_12124_pilon	+	1681	3	Intergenic	novelGene_22379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2523	junction_1	1107	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	730	1509	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497064	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1508010
900662	contig_17753_pilon	+	6596	9	Intergenic	novelGene_105058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	276.314556936474	26	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	941	1963	131420	143267	TRUE	10	TTTTATCTTTTGGGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLRMNKAPTVGFEADVGSKTTHHLVYPESFRELGENVNMVLVPFKTIDLQWVVSATTKGTISHTYVPVPTKIKVKKEKILIYHPAFIKYVFDNWLQGHGRYPSTGILSVIFSLHVCDEVDLYGFGADSKGNWHHYWENNPSAGAFRKTGVHDGDFESNVTAILASIHKIRIFKGR	45480	148320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_130836_131726_137748_137946_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093_147777_148196
900663	contig_2278_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_118141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384870	1386710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1384900_1386700
900664	contig_2577_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_172052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGGTCCTCCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93898	91561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_91600_93900
900665	contig_9406_pilon	+	2293	11	Intergenic	novelGene_136156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1520	1885	63162	65335	TRUE	10	GTTGGCGTCCATGGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFVQGLQQLHELGLHGEALAVHLVCALPLLAEGLGLALQLLDLLLPHFHLVLQHLLLFQQDVDAGEVFAVIIRLNLTLQAMQPFVQVRTALGKKLRLVGIEEPLGLGLGGGFKDFPHFM	34219	79058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_34622_57777_58129_58526_58732_60400_60531_61872_62160_62332_62420_63104_63330_65137_65401_66992_67141_72060_72152_78954
900666	contig_15350_pilon	-	2216	5	Intergenic	novelGene_164252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_3	75.5	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1027	1665	232656	228098	FALSE	25	TTCCGTTTTTAGAATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQFAEHLLGAGFVSSRDPQDPESNVNSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRPNLGKKRKMVKVYTKSDGLVSIHPKSVNVEQTDFRYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDDDQETIAVDEWIIFQSPARIAHLVKELRRELDVLLQEKIESPCPVDWKDTACRDCAVLSAIIDLIKTQEKAMPRKFPPRCRDECFS	233682	227546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_228284_228673_228827_229742_229864_232380_232472_232568
900667	contig_5023_pilon	+	3033	16	Intergenic	novelGene_7258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1905.77804467245	2	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	702	1385	618569	631518	TRUE	25	GGAAGACTGTTACTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKRIVTMQWNWGRIKLSFPWLALLDKISMKETAL	580849	648225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607331_607935_608100_609594_609725_611692_611820_614402_614462_616535_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631419_631550_639072_639197_643413_643539_646857
900669	contig_9400_pilon	-	1945	7	Intergenic	novelGene_146583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	478.235791448342	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATTTGTAGTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158630	120044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130703_135459_135561_158539
900670	contig_826_pilon	+	4432	6	Intergenic	novelGene_154936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	613	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGTTTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98813	348016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_98821_133257_133431_228513_229676_296920_297315_344355_344530_345494
900671	contig_854_pilon	+	3030	16	Intergenic	novelGene_36660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3838.97445796255	56	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	114	2273	1700894	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1699278	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
900672	contig_2069_pilon	-	6094	6	Intergenic	novelGene_23199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	279.772050069338	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	76	615	109104	97205	TRUE	25	TGCCAGCTGAGCTAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPPIATVEEMTEAFYYKLRKLSACDDQPPPPRPPKRQGTTGQNRPNSREGTIESSQVLGLEQQPLLPEPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPVKEDHDYEEIHEHLRKSI	109179	91305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_95361_95780_97261_97870_98025_102635_102788_103522_103694_109097
900673	contig_7644_pilon	+	827	5	Intergenic	novelGene_64247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	123.574876087334	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAACAGAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162718	183359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_177755_177835_179596_179696_182891
900674	contig_7695_pilon	+	4527	3	Intergenic	novelGene_41529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATGGCTGGCGACCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355431	397120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_356272_376818_380088_396702
900675	contig_13481_pilon	+	4164	5	Intergenic	novelGene_119310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	135.916104638119	24	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	3108	4163	468683	469738	FALSE	80	AGAAAAAGAAAGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKD	248623	469739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_251968_252071_283655_284530_414927_415154_466806
900676	contig_9578_pilon	-	3609	13	Intergenic	novelGene_67965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	123.22968617811	179	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	89	1603	1276296	1058571	FALSE	15	AGTGGCTTTGGGCTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPREWSADLARFYTVTEPQRHRRGYTVYKVTARVVSRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEDFSSDSDLVSLTVDVDSLAELDDGMASNPNSPVRTFGLSLSSDSSALGAAASDSEQNKTEEERESRSLFPGSLKHKLGKRDYLEKAGELIKLALKKEEEEDYEAASDFYRKGVDLLLEGVQGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEEVGAITEETEACDWWSLGAVLFELLTGKTLVECHPAGINTHTILNMPGSISEEARSLIQQLLQFNPVERLGAGVAGVEDIKSHPFFTPVDWAALTR	1276384	1056564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1099512_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1182314_1182678_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583_1251620_1276191
900677	contig_9471_pilon	+	2992	4	Intergenic	novelGene_21768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.462986797652	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGAGCCTCTTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395687	401849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_395801_395887_397249_398155_399276_401451
900678	contig_9696_pilon	-	874	7	Intergenic	novelGene_68852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_6	67.4052833405678	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	301	789	691283	685465	FALSE	45	AGAACACAGCAAATGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLENYILELIPTLPQLDGLEKSFYSFYVCTAVRKFFFFLDPLRTGKIKIQDILACSFLDDLLELRDEELSKESQETNWFSAPSALRVYGQYLNLDKDHNGMLSKEELSRYGTATMTNVFLDRVFQECLTYDGEMDYKTYLDFVLALENRKEPAALQYIFKLLDIENKGYLNVFSLNYFFRAIQELMKIHGQDPVSFQDVKDEIFDMVKPKDPLKISLQDLINSNQGDTVTTILIDLNGFWTYENREALVANDSENSADLDDT	693691	685379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_685654_687067_687128_689734_689873_691181_691319_692108_692185_692269_692326_693558
900679	contig_15720_pilon	-	3846	1	Intergenic	novelGene_41967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	3025	3480	307437	306982	NA	35	GAAACTGGAGGACATTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	310461	306615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306600_310500
900680	contig_10140_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_148409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCAGGATATATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226316	223862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_223900_226300
900681	contig_3956_pilon	-	3938	1	Intergenic	novelGene_14734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAACAAGAGGACCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430474	426536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_426500_430500
900682	contig_14925_pilon	-	1080	3	Intergenic	novelGene_55292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	78	323	116065	112852	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEENKPWEEESTCPFT	129478	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112897_115864_116101_129436
900683	contig_6847_pilon	+	1994	7	Intergenic	novelGene_143897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1389	1697	233914	238427	TRUE	25	CTTGCCCATATTGGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNSRLPLLFLASITGRHHSKVFRRLSCRYSPSISPITGAPTPDGSGMVIITSFSSKLSSCSSYSMLTSQPFPLSEGQQLIVSGIKDSSVVCSLHFNTPTSL	230922	245074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_231956_231999_232278_233836_234044_237930_238042_238359_238508_239870_240039_245025
900684	contig_5799_pilon	+	7004	1	Intergenic	novelGene_50246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTTTCACCACCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169581	176585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_169600_176600
900685	contig_16098_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_46192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAAAAAATAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688785	686512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_686500_688800
900686	contig_10106_pilon	+	3675	7	Intergenic	novelGene_73870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	756.659691597807	10	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	465	956	151101	173151	TRUE	40	CAGAATTTTCGTTCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISECWGTATHFCPCLEGERGSASLGGVTHHLGYLYASRDSPCMLRRITECEILGN	132396	175920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159338_172990_175190_175239
900687	contig_17768_pilon	+	5645	20	Intergenic	novelGene_140388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	338.736645840773	386	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	90	710	21888	82858	TRUE	10	TTCAAGTCCTTCCCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVKSKKATDTYKIYVEKYALAKADFEQKMTETAQKFQDIEETHLIRMKEIIESLSNAIKEIHLQIGQVHEEFLNNMANTTVESLIQKYVESKGTGKERPGLIEFEECDPTSAVEGIKPRKRKTFALPGIIKKEKDAESVECPDADSLNIPDVDEEGYSIKPEANQNDTKENHFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELKVSIGNIMLSPAISVSADESEFI	21798	116796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_21906_39953_40053_40789_40887_58293_58339_60536_60610_66601_66627_78293_78352_78640_78821_80541_80567_82857_82901_84303_84396_92735_92840_97353_97484_101967_102080_104003_104160_104521_104655_108219_108420_109173_109239_112576_112742_113060
900688	contig_10864_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_107104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTTTAGGATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023178	1022341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1022300_1023200
900689	contig_10732_pilon	+	3318	1	Intergenic	novelGene_114692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1557	1919	90664	91026	NA	20	GGGACGGGAGGGGGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILIRENPKDSIRKLLELIEGFSEVAGYKINIQKSVGFLYNNKENFEMEIRKTIPFTVAPQKIKYLGKNLTRYIKDLYKENYKSLLQETKRDLHKWKDIQCLWIGSLNIVKMSTLPKVIY	89107	92425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_89100_92400
900690	contig_6027_pilon	+	4931	6	Intergenic	novelGene_74424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	104	junction_1	524.261156295219	646	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	130	819	205072	224015	FALSE	30	GCAGCCATCTAAGATACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLLGPEEGRAGAGPPGLSERQTRHPPTPQPLGARTDPLLEYRMSQGDSNPAAIPHAAEDIQGDDRWMSQHNRFVLDCKDKEPDVLFVGDSMVQLMQQYEIWRELFSPLHALNFGIGGDTTRHVLWRLKNGELENIKPKVIVVWVGTNNHENTAEEVAGGIEAIVQLINTRQPQAKIIVLGLLPRGEKPNPLRQKNAKVNQLLKVSLPKLANVQLLDTDGGFVHSDGAISCHDMFDFLHLTGGGYAKICKPLHELIMQLLEETPEEKQTTIA	198896	228127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_199019_205064_205153_217361_217452_218209_218327_219644_219768_223736
900691	contig_4924_pilon	-	2580	12	Intergenic	novelGene_84655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_5	1186.58826852799	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	22	768	252576	82377	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252597	62875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_77273_77353_82347_82480_114575_114711_127720_127785_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
900692	contig_11572_pilon	-	4440	19	Intergenic	novelGene_100028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.7809437223258	24	113	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	202	2001	233219	143399	TRUE	10	GCTACCCCCAGCCCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKQTQAESFVLTSSDGKFHLISKLGRVEKSVEAHCGAVLSGRWNYEGTALVTVGEDGQIKIWSKTGMLRSTLAQQGTPVYSVAWGPDSEKVLYTAGKQLIIKPLQPSAKVLQVWDSYGRPLYSSQPHEHPITSVAWAPDGELFAVGSFHTLRLCDKTGWSYALEKPNTGSVFNIAWSVDGTQIAGACGNGHVVFAHVVEQRWEWKNFQVTLTKRRTMQVRNVLNDAVDLLEFRDRVIKASLNYAHLVVSTSLQCYVFSTKNWNTPLIFDLKEGTVSLILQAERHFLLVDGGGIYLYSYEGRFISSPKFPGMRTDTLNAQTVSLSNDTIAIKDKADEKIIFLFEAATGKPLGDGKLLSHKNEILEIALDQKGLTNDRKIAFIDKNRDLYITSVKRFGKEEQIIKLGTMVHTLAWSDACNILCGLQDTRLTVWYYPNTVYVDRDILPKTLYERDASEFSKNPHIVSFVGNQVTIRRADGSLVHISISPYPAILHEYVSSSKWEDAVRLCRFVKEQTMWACLAAMSVANRDMTTAEIAYAAIGEIDKVHYINSIKNLPSKESKMAHILMFSGNIQEAEIVLLQAGLVYQAIQININLYNWERALELAVKYKTHVDTVLAYRQKFLETFGKQETNKRYLQYAEGVSIIQYFITMCMFYYEYTQYSTRQT	242687	105486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_105597_140846_141430_141534_141885_142002_143601_152951_153125_153686_153777_156397_156570_157847_157996_158411_158548_170052_170118_174872_175037_178262_178338_180854_180974_189891_190072_212134_212273_219367_219478_233191_233261_235371_235483_242638
900693	contig_9931_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_134833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322390	320037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_-_320000_322400
900694	contig_10642_pilon	+	2765	2	Intergenic	novelGene_78687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCTCTGCCTTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212714	215621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_213960_214101
900695	contig_11677_pilon	-	3073	1	Intergenic	novelGene_85910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	169	306	513132	512995	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIQLLGIYSRRIRAVTRTGICTPIFFAALFTIAKRWNQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATMKNNDGSVKHLITWMKLEDIMLSKVSQSQKDKYCMKPLL	513300	510227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_510200_513300
900696	contig_12677_pilon	-	1010	2	Intergenic	novelGene_110825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGAGGATCCTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3738	2175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2569_3121
900697	contig_9014_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_106823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	477	1577	2053	260510	260034	NA	10	CCCTGGTGCAGGCCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNPNPKSALPSPTPLYHFPLSCRHVWFPQMPLPTQAPSHPSTPPLHPGHPNTGGEEILLRFSYLQYCPQLQPPAGTARRADWPCYPAREVAHLAVQRHTALPQGVGHHEVLLGRGAHEGALWGEHVRGLAVDLAPHTALLHQHEILLGHEALWWGHD	262086	260032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_-_260000_262100
900698	contig_2069_pilon	-	4025	10	Intergenic	novelGene_23558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_3	184.165384610922	581	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	291	1310	2271776	2249764	FALSE	30	AAAAGCTTTGTATTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASALYACTKCTQRYPFEELSQGQQLCKECRIAHPIVKCTYCRSEFQQESKTNTICKKCAQNVKQFGTPKPCQYCNIIAAFIGTKCQRCTNSEKKYGPPQTCEQCKQQCAFDRKEEGRRKVDGKLLCWLCTLSYKRVLQKTKEQRKSLGSSHSNSSTSSLTEKDQHHSKHHHHHHHHHHRHSSSHHKISNLSPEQEQGLWKQSHKSSAAIQNETPKKKPKLESKPSNGDSSSINQSADSGGTDNFVLISQLKEEVMSLKRLLQQRDQTILEKDKKLTELKADFQYQESNLRTKMNSMEKAHKETVEQLQAKNRELLKQVAALSKGKKFDKSGSILTSP	2272066	2247048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2249854_2258729_2258832_2262203_2262340_2262984_2263066_2263256_2263305_2267609_2267810_2268667_2268824_2269898_2269954_2270811_2270877_2271689
900699	contig_8278_pilon	-	4915	5	Intergenic	novelGene_165297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	75	junction_3	49.9117972026654	347	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	30	494	229370	223037	TRUE	50	AATAGAAATACCACAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGGHWRRKMVGLRFRCGIGGLFKVPATQQRRSRAYSVSQDFAEVLRKPKRQLTKLVFPLQELERQLAPDTRPSLHLKLFEPSLEDIARADDLFTATDRHRIEYLSSAVRLEHAPDLLRPEVCFIGRSNVGKSSLIKALFSLAPEVEVRVSKTPLDENIFVSG	229399	213448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_217681_219892_220012_222966_223067_226857_226957_229034
900700	contig_2100_pilon	+	1193	6	Intergenic	novelGene_50660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATCACATTGAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1175768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562
900701	contig_11986_pilon	+	10465	2	Intergenic	novelGene_69237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1088	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTAACCACTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	778193	789999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_779644_780984
900702	contig_11316_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_122680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCAAGATTTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	139423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139400_140500
900703	contig_11318_pilon	-	2150	5	Intergenic	novelGene_48139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_2	397.226242209651	41	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	1839	2150	21085	14962	FALSE	70	AAAGAAGAAAAACGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQE	23045	14961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294
900704	contig_20409_pilon	+	2551	2	Intergenic	novelGene_178689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1976	2551	53003	53578	FALSE	30	CTGGCCATCCAAGAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEK	25576	53578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20409_pilon_+_26749_52199
900705	contig_12414_pilon	-	2785	2	Intergenic	novelGene_59573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTACCTGCTGCCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373931	370833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_371590_371902
900706	contig_4125_pilon	+	3440	2	Intergenic	novelGene_25147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGATATACCACTCGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858849	863308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_861966_862984
900707	contig_1452_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_115148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
900708	contig_20951_pilon	-	1630	10	Intergenic	novelGene_43117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	107.336553896933	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1320	309	1628	237836	212802	FALSE	25	GGCGGAGGTACGGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTPVPQQHEEEDLDDVILTEDDSEDDYSEFLDLGPPGISEFSKPSGQRGREPQPGPSHSQATNDIVNPGSEKKIILEDSNLLYSESDTLNQLSEDSEIELGESAAIVDDQAIEEDCWLDHPYFQPLNQETRERTSQVVPQEQRPEAELGPLLYQHEPPGPAFPRPVFPRPEPQQDGIPGPSSPQPAHPLGELEDQQLAIDDDEPGPAFPLQGSQEPNLENIWGQGATAVDQELIALLVKETEARFPDVANGYIEEIIRLKNYYDLNVLCNFLLENPDYPKREDRVIINPSSSLLASQDETKLPKIDFFDYFKLTPLDQRCFIQAADLLMADFKMLSSQDIKWALHELKGHYAITRKAFSDAIKKWQELSPETSGKRKKRKEMNQYSYIDFKFEQGNIKIEKRMFFLENKRRHCRSYDRRALLPAVQQEQEFYEQKIKE	268843	212799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_212933_218280_218396_227946_228112_229223_229327_234046_234124_235970_236634_237770_237902_239596_239640_244509_244646_268779
900709	contig_5125_pilon	+	2647	8	Intergenic	novelGene_43425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	422	1555	35654	58893	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25971	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26173_26324_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
900710	contig_19098_pilon	+	3156	1	Intergenic	novelGene_65832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCAGTAGAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390055	393211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_390100_393200
900711	contig_18231_pilon	-	3846	1	Intergenic	novelGene_105901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGAGGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490254	486408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_486400_490300
900712	contig_1090_pilon	-	1335	8	Intergenic	novelGene_131144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGCAATCTTTCAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503710	488520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_488876_491870_492069_492663_492889_493595_493705_497085_497171_497426_497526_500222_500394_503617
900713	contig_10642_pilon	-	3943	4	Intergenic	novelGene_78693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_3	503.428467830557	7	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	499	897	222398	222000	FALSE	35	CTAGTGATTCGAGAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVGR	241346	218953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_222703_225746_225809_237047_237098_241264
900714	contig_10548_pilon	+	2406	4	Intergenic	novelGene_178757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	273	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	2015	2404	816141	816530	FALSE	50	AGAAAATTATAGACCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITK	712638	816532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10548_pilon_+_712783_731877_732445_753386_753905_815355
900715	contig_4951_pilon	-	4536	1	Intergenic	novelGene_122118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGAGCATAAGTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17004	12468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4951_pilon_-_12500_17000
900716	contig_9484_pilon	+	1833	12	Intergenic	novelGene_105620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	519.102961171982	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	54	1691	95848	104965	FALSE	15	GTTTTCTGTAGTTAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQLAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95794	105107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103519_103641_104260_104412_104883
900717	contig_7333_pilon	-	2520	4	Intergenic	novelGene_142815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	66.788222514652	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	677	2092	405837	394458	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKWRRGGGSGGRFRKRAWKTWTFGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407640	394029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_405761_406195_407321
900718	contig_5684_pilon	-	2417	6	Intergenic	novelGene_81069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAGGGGTAATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466613	443492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_443947_446516_447056_459114_459216_461575_461696_465231_465528_465706
900719	contig_21315_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_151571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	576	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46634	48966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_46600_49000
900720	contig_10068_pilon	-	3072	9	Intergenic	novelGene_148703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	122.129477911764	257	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	96	1448	59848	44668	FALSE	70	ACTTAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEGSGRGGEFGMSSVSCGNGKLRQWLIDQIDSGKYPGLVWENEEKSIFRIPWKHAGKQDYNREEDAALFKAWALFKGKFREGIDKPDPPTWKTRLRCALNKSNDFEELVERSQLDISDPYKVYRIVPEGAKKGAKQLTLEDPQMAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENGCQVTGTFYACAPPESQAPGIPIEPSIRSAEALALSDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61148	43043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_54327_54436_56355_56498_57186_57276_58180_58368_59632_59887_61091
900721	contig_16385_pilon	+	1888	16	Intergenic	novelGene_86190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_8	143.183735885827	431	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	49	1707	3004	36650	FALSE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEFNDRILRPELSNDEMLSLHGELQKIYKTYCLDESIDKIRFDPFIVEEIQRIAEGPYIDVVKLQTMRCLFEAYEHVLSLLENVFTPMFCHSDEYFRQLLRGAESPTRNSKFNRSTQKRGESFGISRIGSKIKGVFKSTTMEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPDLIVKCIGKEAKYESIRLLFDGLQQPVLNKQLTYVFLDIVIQELFPELNKVQKEVTSVTSWM	2955	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_3113_3413_3539_4049_4109_8906_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_34231_34324_35622_35680_36611
900722	contig_11720_pilon	+	1658	11	Intergenic	novelGene_43809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2630.97510440521	4747	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	207	1100	68064	95960	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHERPG	67857	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_95945_96052_98299
900723	contig_15093_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_143294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55768	54049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_54000_55800
900725	contig_15047_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_52271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	978	1361	4954	4571	NA	35	ACCCAGACACTACTCTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMTEHLIMLMQNQYIDQEAVIPTEQRGAAWFKIRKGVCQGCILSPYLFNMYAEQIIQETGLYGEECGIRTEDAQTPTWGSKPSSWIRKLRPYSHLYLSSSSSRSQLQPPQLQQTAVQRQPGQQQFP	5931	4037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_4000_5900
900726	contig_5686_pilon	-	3825	5	Intergenic	novelGene_45343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTACCTTTTTGCTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163922	117895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_119698_119737_120292_122631_123286_123339_123585_163352
900727	contig_998_pilon	-	2419	2	Intergenic	novelGene_153779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTCCAACTAAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365991	300148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_302550_365973
900728	contig_15929_pilon	+	1665	6	Intergenic	novelGene_172469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	277.458753691427	237	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1091	1423	87373	92073	FALSE	15	TCCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKI	82762	92315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_83512_83865_84057_84400_84489_87310_87623_89766_89844_92067
900729	contig_3747_pilon	+	3318	2	Intergenic	novelGene_24918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1911	2237	203794	204120	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	201747	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202481_202616
900730	contig_12619_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_73588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATCTAGTACTTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1026919	1025419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_1025400_1026900
900731	contig_7457_pilon	+	3532	9	Intergenic	novelGene_31645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_3	68.0385919901345	112	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	129	998	1005828	1013285	TRUE	65	TAAAAAATAAGAAAACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYR	1001550	1016704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1014498_1015382
900732	contig_4782_pilon	-	5922	10	Intergenic	novelGene_73672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGCCCAACCCGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692300	588746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_588910_657910_658012_658644_658826_659619_659702_660215_660329_660708_660806_664146_664266_667194_667284_667789_667950_687483
900733	contig_7426_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_27564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	598	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACTTCAATTATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209401	1211242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_1209400_1211200
900734	contig_11338_pilon	+	2018	12	Intergenic	novelGene_6272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.9663152223981	308	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	594	1394	177438	189573	FALSE	10	TCCATTTTACTTCTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTHLCPPPLGERLKGSFLTLQSTGSSLSASCPSTATPVPCLSQKPGGPGRCWEDRLIVCLCPLVVVSLLLGCISLAVTLIKYKAVVEELRMLTFQQMAWQANVTGMAGLAGLKKDIDHIRADTNQSLVEFRGLLECTKVTCPKGWLPFEGKCYYFSSSTKSWDGARIFCQENYSHLVIISSSAEHNFIAKAHGSPRVYWLGLNDKDQEGDWKWLDGSPVTLSFWGPQEPNNNYEEDCASMNKDGTWNDLACDITTYWICERKCSC	172036	190197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_172160_172308_172384_176187_176221_176299_176351_176432_176475_176652_176695_177210_177685_177767_177831_179437_179534_179743_179896_183194_183305_189440
900735	contig_5623_pilon	+	2365	1	Intergenic	novelGene_154859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGAGAGAGTTGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247148	249513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_247100_249500
900736	contig_5424_pilon	-	3701	12	Intergenic	novelGene_172802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.785105139473	19	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	159	1490	126366	116731	TRUE	10	CGCCCCGCGGCAGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSISSSVDLVLVQSTRLKAWRLKSSLYPQNRIAELDVADENDINWDLLAEGWSSVRSPQWLRSKWWTIKRQIANHKDVSFPVLIKGLKQLHENQKNNPPLLENKSGSGIPNSNSNSSVQHVQIRVARLEENTALSPSPMTALQIPVQITHVSSTDSPAATVDSETITLNSGTLQTFEILPSFHLQPTGTPGTYLLQTGSSQGLPLTLTASPTVTLTAAAPASPEQIIVHALSPEHLLNTSDNVTVQCHTPRVIIQTVATEDITSSISQAELTVDSDIQSADFPEPPDALEADTFPDEIHQPKMTVEPSFNDAHISKFSDQNSTELMNSVMVRTEEEISDTDLKQEEESPSDLASTYGTEDLESPTIEEQVDQTTIDDETILIVPSPHGFIQASDVIDSVLPLTTLTDPILQHHREESNIIGSSLCSPVSEDSKDVEDLVNCH	126524	96051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_96447_112509_112562_113586_113694_115073_116841_117086_117229_117863_118245_118789_118946_120473_120560_123481_123692_124958_125111_126087_126161_126344
900737	contig_8044_pilon	-	1967	1	Intergenic	novelGene_132375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGTTGTATTTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376757	374790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_374800_376800
900738	contig_14814_pilon	-	4727	15	Intergenic	novelGene_137741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	66.5783641390247	164	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	2723	3304	397875	395214	TRUE	35	AGCAAAATTGTGCCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKKKKVVPSSLDLCNLYDPSNPKTTILKKRKKVKEMLHSVEHNGVLEAKAKQVPVLGNGGTFSPLKKKLRAENDFVKFDTSFLPKPSFFRKAKSTACASFLSPTVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNTTAEFKKTDKSILVSPTGPSRVAFNPEQRPLHGVLKTPTSSPSNTPLAPKKVLATPPKRRPTAMDFF	419219	392943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_394318_395164_395408_396348_396413_397413_397564_397701_398442_399029_399171_401489_401592_402158_402251_404264_404447_405639_406695_406814_406945_407717_407780_408364_408449_411513_411597_418994
900739	contig_7720_pilon	-	2223	4	Intergenic	novelGene_155797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCTTAGAACCCACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1153057	845027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_846634_940299_940520_996121_996383_1152921
900740	contig_17880_pilon	+	4458	2	Intergenic	novelGene_167315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	419	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATTCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6602	13380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_+_10439_12758
900741	contig_5423_pilon	-	1912	6	Intergenic	novelGene_85280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	448	junction_1	101.819448044075	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	491	1222	565372	558772	FALSE	5	GGGTCTTTTATGGTTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	567475	558081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011
900742	contig_11422_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_98966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1364	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGGATATGGCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_213_270
900743	contig_12810_pilon	-	5083	9	Intergenic	novelGene_145691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_8	234.737486354438	814	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	227	1471	313218	251502	FALSE	30	AACTATCTTCATGTGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVERLQEALKDFEKRGKKEVCPVLDQFLCHVAKTGETMIQWSQFKGYFIFKLEKVMDDFRTSAPEPRGPPNPNVEYIPFDEMKERILKIVTGFNGIPFTIQRLCELLTDPRRNYTGTDKFLRGVEKNVMVVSCVYPSSEKNNSNSLNRMNGVMFPGNSPSYTERSNINGPGTPRPLNRPKVSLSAPMTTNGLPDNTDIKEANLQQNEDKSHSDSLTSESEGSSVSPIKNKHPDEDAVEPEGHEVKRLRFDKEGEVRETASQTTSSEISSVMLEETEASSSSQDKDKESSGTRQHCTEEDEDEDEEEEEESFMTSREMVPERKNQEKEPDDALTVNEETSEENNQMEESDLSQAEKDLHSEGSENTGPVSSGSDCREAEALVESDSSKTGEILSESFMENDGATEVTDEPMEQD	313444	247889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_251819_252071_252362_253056_253201_253454_253530_254670_254709_256484_256579_270429_270601_312085_312168_313184
900744	contig_3627_pilon	+	2417	17	Intergenic	novelGene_78438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_13	310.201925163272	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	222	1898	294394	316047	TRUE	70	ATAAAAAAGAAGAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWMKKRRMMVKLKKFPRLPIGLNLILRQ	292732	323578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309391_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439
900746	contig_13633_pilon	+	4480	4	Intergenic	novelGene_15335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	468.104689145494	376	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	147	533	38237	38623	TRUE	60	ATGATAAACAGAGAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSQTILMIMGFIRGVTGYNSGSGTLKDTVFPSGRPLPSCARRHASPWHWASAQRHSVFSLWAGKPTTPSPAAGSLLPPLLSVFRVIACSLSPGSRSFSAQGSQVQRMCLTPGCSSLVVMGTSLSHL	38090	72815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_39433_49019_50887_71052_71920_72411
900747	contig_5039_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_64801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTTTATTTTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188977	186797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_186800_189000
900748	contig_987_pilon	+	2390	4	Intergenic	novelGene_72308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	76.7115810465843	25	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	837	2390	1169806	1171359	FALSE	25	GTAAGCAGTTTTCATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEKEKHKDKKKDREKGKKDKEKREKEKAKDKGREDKMKAPPAPLVLPPKEMALPLFSPAAAVRIPSMLPSLSPMLPEKLFEEKEKPKEKERKKDKKEKKKKKEKEKEKEKKEKEREKEKREREKKEKEKEKHKHEK	991252	1171359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_991623_995960_996204_1169536_1169657_1169702
900749	contig_6497_pilon	-	3184	4	Intergenic	novelGene_35637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	658	junction_3	51.7493961317424	11	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1785	1400	3184	756796	750879	FALSE	70	CAGAAACAAATGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMENELAGKQHEIEELNRELEEMRAAYGTEGLQQLQEFEAAIKQRDGIITQLTANLQQARKEKDETMREFLELTEQSQKLQIQFQHLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKIKLEMLEKEKNAVLDRMAESQEAELERLRTQLLFSHEEELSKLKEDLEIEHRINIEKLKDNLGIHYKQQIDGLQNEMSQKIETMQFEKDNLITKQNQLILEISKLKDLQQSLMNSKSEEMTLQINELQKEIEILRQEEKEKGTLEQEVQELQLKTELL	758195	750878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_752208_754320_754519_755398_755555_756694
900750	contig_6048_pilon	+	2980	1	Intergenic	novelGene_73161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1124	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTTTATTTTTTAAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177352	1180332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1177400_1180300
900751	contig_5264_pilon	-	3822	1	Intergenic	novelGene_165050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38118	34296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_-_34300_38100
900752	contig_5280_pilon	+	2097	10	Intergenic	novelGene_52606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	623.484255842881	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	18	1088	38343	78098	TRUE	30	TCACGTAGTATTTGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38325	79154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042_78595_78641
900753	contig_6217_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_109671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	187	564	788183	787806	NA	40	CCACAGAAGCAGCAGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRTLSDIVLEDEPLRLEGTQNTTGEELPPQSRVDLNDVDGVKLSRPSFAEVARLKIRRNSCKPPLIIGTWNVRSMNLGKLEIVKNEMECIKVNILGTSEPKWTGIGHFESDNCMVYYAGNDS	788369	785729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_785700_788400
900754	contig_1274_pilon	+	6440	1	Intergenic	novelGene_137772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAATAATGATTAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35792	42232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_35800_42200
900755	contig_10003_pilon	+	3374	15	Intergenic	novelGene_88153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATCCAGAGTGTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379119	602118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_380845_385998_386066_387776_387902_391285_391390_391980_392059_392162_392367_402819_402905_416836_416923_430739_430845_460909_461114_466537_466695_472051_472140_473195_473332_531525_531653_602035
900756	contig_10765_pilon	-	9596	55	Intergenic	novelGene_122924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	240.56472268907	471	95	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2794	8385	25	8409	416743	199075	FALSE	75	AAAAAGAAAAAAAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIVADLYAEVTGVLAQAKFPAVKKKFMAELKELRHKEQSPYVVQSIISLIMGMKFFRIKMYPVEDFEASLQFMQECAHYFLEVKDKDIKHALAGLFVEILVPVAAAVKNEVNVPCLRNFVESLYDTTLELSSRKKHSLALYPLVTCLLCVSQKQLFLSRWHVFLNNCLSNLKNKDPKMARVALESLYRLLWVYMIRIKCESNTATQSRLITIVTTLFPKGSRGVVPRDMPLNIFVKIIQFIAQERLDFAMKEIIFDFLCVGKPAKAFSLSPERMNIGLRAFLVIADSLQQKDGEPPMPVTGAVLPSGNTLRVKKTYLSKTLTEEEAKMIGMSLYYSQVRKAVDNILRHLDKEVGRCMMLTNVQMLNKEPEDMITGERKPKIDLFRTCVAAIPRLLPDGMSKLELIDLLARLSIHMDDELRHIAQNSLQGLLVDFSDWREDVLFGFTNFLLREVNDMHHTLLDSSLKLLLQLLTQWKLVIQTQGKVYEQANKIRSSELIPNGSSHRTQSERGPHCSVLHAVEGFALVLLCSFQVATRKLSVLILKEIRALFIALGQPEDDDRPMIDVMDQLSSSILESFIHVAVSDSATLPLTHSVDLQWLVEWNAVLVNSHYDVKSPSHVWIFAQSVKDPWVLCLFSFLRQENLPKHCPTALSYAWPYAFTRLQSVMPLVDPNSPINAKKTSSAASSADSYVTLWRNYLILGFGVAKPSVMSPGHLRASTPEIMATTPDGTVSYDNKAIGTPSVGVLLKQLVPLMRLESIEITESLVLGFGRTNSLVFRELVEELHPLMKEALERRPENKKRRERRDLLRLQLLRIFELLADAGVISDSTNGALERDTLALGALFLEYVDLTRMLLEAENDKEVEILKDIRAHFSAMVANLIQCVPVHHRRFLFPQQSLRHHLFILFSQWAGPFSIMFTPLDRYSDRNHQITRYQYCALKAMSAVLCCGPVFDNVGLSPDGYLYKWLDNILACQDLRVHQLGCEVVVLLLELNPDQVNLFNWAIDRCYTGSYQLASGCFKAIATVCGSRNYPFDIVTLLNLVLFKASDTNREIYEISMQLMQILEAKLFVYSKKVAEQRPGSILYGTHGPLPPLYRVSLALLSCELARMYPELTLPLFSEVSQRFPTTHPNGRQVMLTYLLPWLHNIELVDSRLLLPGSSPSSPEDDTKDREGEVTACHGLKGSGWGSPEATSLVLNNLMYMTAKYGDEVPGPEMENAWNALANNEKWSNNLRITLQFLISLCGVSSDTVLLPYIKKVAIYLCRNNTMQTMEELLFELQQTEPVNPIVQHCDNPPFYRFAASSKASAAASGTASSSNTVVAGQDSFPDADEGKILKESDERFSHVIRTHTRLESRYSNSSGGSYDEDKTDPVSPYASWLLTITETKQPQPLPMPCTGGCWAPLVDYLPETITPRGPLHRCNIAVIFMTEMVVDHSVREDWALHLPLLLHAVFLGLDHYRPEVFEHSKKLLLHLLIALSGNSSFHAIASVLLQTREMSEAKTLTVQPGYQPEYLYTGGFDFLREDQSSPLPDSGLSSSSTSSSISLGGSSGNLPQMTQEAEDVDAAAETDEKANKLIEFLTTRAFGPLWCHEDITPKNQNSKSAEQLTNFLRHVVSVFKDSKSGFHLEQHLSEVALQTALASSSRHYAGRAFQIFRALKQPLSAHALSDLLSRLVEVIGEHGDEIQGYVMEALLTLESAVDNLSDCLKNSDLLAVLSRSSSPDLSSSTKLTASRKSTGQLNVNPGTAGGSTATAERSRHQRSFSVPKKFGVIDRSSDPPRSATLDRIQACTQQGLSSKTRSSSSLKDSLTDPSHINHPTNLLATIFWVTVALMESDFEFEYVMALRLLSRLLAHMPLDKAETREKLEKLQAQLKWADFSGLQQLLLKGFTSLTTTDLTLQLFSLLTPVSRVPMVDSSQAIGFPLNVLCLLPQLIQHFENPNQFCKDVAERIAQVCLEEKNPKLSNLAHVMTLYKTHSYTRDCATWVNVVCRYLHEAYADITLNMVTYLAELLEKGLPSMQQSLLQVMHGLLSHMDLSVLPVKRFNVEVLKTIEKYVHSVHWREALNILKLVVSRSASLVLPSYQHSDLSKIEIHRVWTSASKELPGKTLDFHFDISETPIIGRRYDELQNSSGRDGKPRTMAVTRSTSSTSSGSNSNVLVPVSWKRPQYSQKRTKEKLVHVLSLCGQEVGLSKNPSVIFSSCGDSDLLEHQTSLVSSEDGAREQENMDDTNSEQQFRVFRDFDFLDVELEDGEGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLIMTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKAEAVQEEEDTTVHEDDLSSSINELPATFECSDSFSLGMTEAEEKGDRALDQFTLASFGEGDRGVSPPPSPFFSAILAAFQPTACDDAEEAWRSHINQLMCDSDGSCAVYTFHVFSSLFKNIQKRFCFLTCDAASYLGDNLRGIGSKFVSSSQMLTSCSECPTLFVDAETLLSCGLLDKLKFSVLELQEYLDTYNNRKEATLSWLANCKATFAGGSRDGVITCQPGDSEEKQLELCQRLYKLHFQLLLLFQSYCKLIGQVHEVSSMPQLLNMSRELSDLKKNLKEAAAALAGDPFDTGGAWSEPTFTSTEAAIQAMLECLKNNDLGRALRQIRECRSLWPNDIFGSNSDDEVQTLLNIYFRHQTLGQTGTYALVGSNQSLTEICTKLMELNTEIRDMIRRAQSYRVLTAFLPDSSVSGTSL	416767	197887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_199334_202638_202842_203832_203944_222178_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236243_239034_239202_242487_242650_243413_243615_252690_252862_255622_255698_259947_260110_262099_262280_265553_265695_268269_268441_269607_269706_271246_271855_273448_273544_275375_275564_285164_285287_286900_287100_290655_290842_291590_291695_292445_292597_299034_299118_309707_309799_316325_316495_319396_319544_320490_320748_328080_328253_328566_328667_340893_341049_343480_343592_345181_345343_347447_347621_348093_348186_350155_350214_354087_354213_354837_355031_355548_355809_360667_360755_363168_363352_365288_365548_380015_380124_384544_384678_386692_386865_395418_395506_398272_398382_399140_399245_406278_406381_409381_409481_409575_409669_411812_411982_416687
900757	contig_6873_pilon	-	3967	2	Intergenic	novelGene_129806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTGGCGCCAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155765	60980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_63048_153865
900758	contig_2987_pilon	-	4262	12	Intergenic	novelGene_125849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	55.8085570618191	354	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	778	3291	522271	507993	FALSE	10	CACCTGTTTCTGTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSHLYRDGEGRMDEDEDEHENFEITDWDLQNEFNPNRQRHWQTKEEATYGIWAERDSDEERPSFGGKRTRDYSAPVSFISAGLKKGAAEEAELEDSDDEEKPVKQDDFPKDFGPKKLKTGGNFKPSQKGFAGGTKSFMDFGSWERHTKGIGQKLLQKMGYVPGRGLGKNAQGIINPIEAKQRKGKGAVGAYGSERTTQSLQDFPVVDSEEEAEEEFQKELSQWRKDPSGSKKKPKYSYKTVEELKAKGRISKKLTAPQKELSQVKVIDMTGREQKVYYSYSQISHKHNVPDDGLPLQSQQLPLPGKEAKAPGFALPELEHNLQLLIDLTEQEIIQSDRQLQYERDMVVNLSHELEKMSEVLDHEERVISNLSKVLEMVEECERRMQPNCSNPLTLDECARVFETLQDKYYEEYRMSDRVDLAVAIVYPLMKEYFKEWDPLKDCTYGTEIISKWKSLLENDHLLSHGGQDLSADAFHRLIWEVWMPFVRNIVTQWQPRNCDPMVDFLDSWVRIIPMWISDNILDQLIFPKLQKEVENWNPLTDTVPIHSWIHPWLPLMQARLEPLYSPIRSKLSSALQKWHPSDSSAKLILQPWKDVFTPGSWEAFMVKNIVPKLGMCLGELVINPHQQHMDAFYWVIDWEGMISVSSLVGLLEKHFFPKWLQVLCSWLSNSPNYEEITKWYLGWKSMFSDQVLAHPSVKDKFNEALDIMNRAVSSNVGAYMQPGARENIAYLTHTERRKDFQYEAMQERREAENMAQRGIGVAASSVPMNFKDLIQTKAEEHNIVFMPVIGKRHEGKQLYTFGRIVIYIDRGVVFVQGEKTWVPTSLQSLIDMAK	523048	507021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_508349_510118_510285_510773_510917_511458_511703_512416_512586_513337_513445_513566_514095_515391_515545_517516_517645_519400_519558_519837_519992_522062
900759	contig_2114_pilon	+	2075	4	Intergenic	novelGene_104226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	77.6587978846498	274	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	108	728	136332	137672	TRUE	5	TGCATGGTTGTCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEVGYTLNSFLWPELDTVVLNSGI	136224	139933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_138492_139405
900760	contig_14744_pilon	+	4267	12	Intergenic	novelGene_65959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1772	2260	638744	639232	TRUE	15	AGGGTGGCGGCCGTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRMDRPRMYRWMVQNSHTREEKASTQLPCRPQEAQPRATASPLIRHSLRLAPPGGLWSCLRPEAEPVGGRRDTGRSTGADSPAAPRKEEDIQALQPQAARNFGFCLFSSFFLKEAAQKKRHRAASPRSRGAGAGDKRWDAYSRECPGPGAAATLPLAAGA	636972	661265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_639871_640222_640387_640950_641104_641739_641813_642088_642191_644162_644314_648657_648764_651531_651745_651963_652061_654505_654675_655847_655940_661216
900761	scaffold_13505_pilon	+	4033	2	Intergenic	novelGene_111602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAGAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653228	657952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_656166_656856
900762	contig_19378_pilon	+	5925	6	Intergenic	novelGene_73794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	34.626001790562	572	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4249	4593	38400	47270	TRUE	25	CACGTCTACTGGAGGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLSITTAYTGLELTFFSGVYGTCIGAVNKFGMEEKSLIGLSGIFIGIGEILGGSLFGLLSKNNRFGRNPVVLLGILVHFVAFYLIFLNMPADAPIAPVEGTDSSAYITSRST	34151	50583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_38434_40391_40518_46836_47012_47260_47354_47741_47878_49470
900763	scaffold_12124_pilon	+	2564	11	Intergenic	novelGene_22266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	10	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	35	358	1473608	1496374	TRUE	55	TAAATTTAAAATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGRSLRGAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1473573	1510580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508533_1509081
900764	contig_7467_pilon	-	2292	12	Intergenic	novelGene_69473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	248.521911500511	71	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	334	966	92058	75239	TRUE	45	AATTTAGGAGACTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRYVIWYVAGLFSQIKGMLMHITILLNFIKFY	133010	67562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_67697_68360_68512_70794_70966_72389_72482_73580_73695_74574_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_117970_118104_132844
900765	contig_7184_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_130025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTGAGTCTTTCAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58478	56466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7184_pilon_-_56500_58500
900766	contig_13097_pilon	+	2037	16	Intergenic	novelGene_107711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_9	528.436671281958	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	186	1817	184733	264394	FALSE	40	GAATATGAATGAGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184547	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
900767	contig_7748_pilon	-	3437	17	Intergenic	novelGene_101049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_16	260.388861848966	590	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	781	2346	323	2668	164891	150982	TRUE	10	TTGATTGTGTCACCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	191000	149907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_150665_150969_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878_164940_173287_173395_190833
900768	contig_1734_pilon	-	2840	17	Intergenic	novelGene_164394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	73.7139742518337	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	296	2059	840936	804665	FALSE	75	AAATGAAAAGAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKVKFTQQNYHDRLSQILADFPKLDDIHPFYADLMNILYDKDHYKLALGQINIAKNLVDNVAKDYVRLMKYGDSLYRCKQLKRAALGRMCTIIKRQKQSLEYLEQVRQHLSRLPTIDPNTRTLLLCGYPNVGKSSFINKVTRADVDVQPYAFTTKSLFVGHMDYKYLRWQVVDTPGILDHPLEDRNTIEMQAITALAHLRAAVLYVMDLSEQCGHGLMEQLELFQNIRPLFINKPLIVVANKCDVKKIAELSEDDQKIFIDLQTEGFPVVETSTLTEEGVIKVKTEACDRLLAHRVETKMKGNKVNEVLNRLHLAVPNKRDDKERPPFIPAGVVARKKRMEIEEPKKKRERDIELEMGDDYILNLQKYWDLMNSSEKYDKIPEIWEGHNVADYIDPDIMRKLQELEKEEELRTAAGEYDSDSESEDEEMMEIRQLAKQIREKKKLKILQSKEKNTQGPRMPRTAKRVQRKVLENEMRSLGVDMDDKDSAHYAVQARKSRSVTRKRKWEDSSPCSSLARSRSCSRTPRDVSGLRDVKMVKKAKTMMKKAQKKMNHLGRKGEADRHVFDMKPKHLLSGKRKSGKKDRR	843606	803883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_804818_813138_813283_815316_815383_816979_817178_818658_818760_819326_819379_819802_819881_822383_822495_824542_824633_827319_827386_827464_827657_834161_834255_835669_835771_838032_838170_838254_838359_840858_841030_843404
900769	contig_19727_pilon	-	3068	3	Intergenic	novelGene_168995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	837	1757	15805	14885	FALSE	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSVSNSSMILSVFSVFSPCSGTLITCRFLLLMVSHVVLRVSSFFFVLFLDFFSNRVVSKCLSSVSLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCKFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLDSLSVRSSAFSSTGRSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGILWLFSSFIDCRCFFFCPAFLFYLVMSEQAGCAFFVVCSSVGRMPFTYFSNGQGQSLMYGTAGQVQLKGSCWDGLFVACTRADSADWESMQGRFQ	58279	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_15806_56212_56768_57998
900770	contig_6375_pilon	-	1708	10	Intergenic	novelGene_72955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	213.225898873981	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	424	1287	206729	202748	FALSE	10	GCTTTCAGTGGCTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234041	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_229099_229237_233928
900772	contig_16846_pilon	+	3307	1	Intergenic	novelGene_82892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCCTTATAGATGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371522	374829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_371500_374800
900773	contig_5461_pilon	+	5221	16	Intergenic	novelGene_156807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	65.1587463217504	1809	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	188	2320	206753	334965	TRUE	25	TACTTCCACATTGCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFQYPDVYRDETAVQDYHGHQVCDPYAWLEDPDSEQTKAFVEAQNKITVPFLEQCPIRGLYKERMTELYDYPKYSCHFKKGKRYFYFYNTGLQNQRVLYVQDSLESEARVFLDPNILSDDGTVALRGYAFSEDGEYFAYGLSASGSDWVTIKFMKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGILKWVKLIDNFEGEYDYVTNEGTVFTFKTNRHSPNYRLINIDFTDPDESKWKVLVPEHEKDVLEWVACVRSNFLVLCYLHDVKNILQLHDLATGAFLKTFPLEVGSIVGYSGQKKDTEIFYQFTSFLSPGIIYHCDLTKEELEPRVFREVTVKGIDASDYQTVQIFYPSKDGTKIPMFIVHKKGIKLDGSHPAFLYGYGGFNISITPNYSVSRLIFVRHMGGVLAVANIRGGGEYGETWHKGGILANKQNCFDDFQSAAEYLIKEGYTSPKRLTINGGSNGGLLVAACANQRPDLFGCVIAQVGVMDMLKFHKYTIGHAWTTDYGCSDSKQHFEWLIKYSPLHNIKLPETDDVQYPSMLLLTADHDDRVVPLHSLKFIATLQYIVGRSRKQINPLLIHVDTKAGHGAGKPTAKVIEEVSDMFAFIARCLHIDWIE	206565	345115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_206798_213485_213561_233706_233841_235158_235290_239959_240170_242392_242515_264149_264256_277147_277340_281920_282119_287354_287459_323532_323670_325490_325586_328967_329100_330991_331149_334670_337344_344592
900775	contig_1244_pilon	-	4800	10	Intergenic	novelGene_37973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	291	junction_5	911.382588281245	407	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3587	4021	924306	923211	FALSE	30	TAAATGATGGGCTAAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	948530	922431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_927227_928758_928894_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
900776	contig_13863_pilon	+	775	2	Intergenic	novelGene_42009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1571	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAACTTGGTAGCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77092	81653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_77708_81493
900777	contig_4782_pilon	+	4013	1	Intergenic	novelGene_73687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGTGAATAGTTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689133	693146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_689100_693100
900778	contig_1275_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_108742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	590	931	379025	378684	NA	20	GGGTTGCCCAGCAATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSWKSFQMPNSKSLDCLEETVGRIMDIRDNSGEDSEGSEESCNTGDGADSRKQQQRNSSSRTRRPVQDVMGADPRSKRAESLCVGGFLAEWDSSGWALTDGARLADPQSKS	379614	376940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_376900_379600
900779	contig_12654_pilon	+	2934	15	Intergenic	novelGene_129271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_14	201.418084833411	5	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	499	2649	662573	683630	FALSE	45	AGAATAAAGGCCTTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGGDPFEEGMNDPDLASWSNEMVDDRLNNMDWSGQQKKANRSSEKNKKKFGVEGDKRVTNDISPESSPGVGRRRTKTPHTFPHSRYVTQMSVPEQAELEKLKQRINFSDLDQRSIGSDSQGRATAANNKRQLSENRKPFNFLPMQINTHKSRDAAASPPRRQAVGAAQCKELFASALSNDLLQNCQVSEEDGRGEPAIESSQIVSRLVQIRDYISKASSMREDLVEKNERSANVERLTHLIDHLKEQEKSYMKFLQKILARDPQQEPVEEIEDLKKQHDLLRRMLQQQEQLRALQGRQAALLALQHKAEQAVAVMDDAEKAAGTTADHPTAPGRQPARSPLHQRVPLRETTGSLSGISITSELNEELNDLIQRFHNQLRDSQPPAVPDNRRQAESLSLTREVSQSRNPSVSERSPDEKVQLFSKMRVLQEKKQKMDRLLGELHTLRDQHLNNSSFVPSAASPLRSVDQRSTSSAPSAPGGLAAVGNGEPTSLTSSVPYPTAALVSQNESENEGHLNPTEKLQKLNEVRKRLNELRELVHYYEQTSDMMTDAVNENTKDEETEESEYDSEHESPEPVTNIRNPQVAATWNEVNTNTNAQCISNNKDGRSVNSNCEINNRCAASMRAPNLPSSLDCRYNREGEHGIHVAPGEEDDEEEEDAEEEGASGASLSSHRSSLVEEAPEDAEFEQKISRLMAAKQKLRQLQDLVAMVQEVF	650834	683915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_651238_652960_653031_662547_662669_664432_664679_666373_666644_667358_667530_672271_672450_672567_672658_675037_675139_676079_676297_678631_678834_680073_680248_680750_680909_681009_681246_683618
900780	contig_10042_pilon	+	2163	7	Intergenic	novelGene_79103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	383.467802501795	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	10	1497	6321	53427	FALSE	75	AAAAAAAAAAACAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVCRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_26600_26809_42598_42736_45870_45997_46837_47035_49529_50060_53219
900781	contig_15236_pilon	+	2549	6	Intergenic	novelGene_141581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	416.962828079434	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	189	1199	425818	450343	TRUE	20	TCTCTCGACTCGTAGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	425629	452791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_426337_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209_451185_452282
900782	contig_1694_pilon	-	2277	3	Intergenic	novelGene_144918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	54.5	1	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTGTATTGGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434864	414165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_416167_419568_419737_434756
900784	contig_18511_pilon	-	4409	2	Intergenic	novelGene_126857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTGCAAGGCGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47175	35358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_39749_47156
900785	contig_4924_pilon	-	2613	13	Intergenic	novelGene_84665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	1117.17101483564	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	83	1369	252576	65524	TRUE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAQQHQRVLLRGIQPCHLLDNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	253899	62883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_253836
900786	contig_16113_pilon	-	5318	2	Intergenic	novelGene_140548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_1	0	458	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	85	1083	88169	87171	FALSE	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTTTEKDLNGSERCPRDTRITQLVFPALYTGVFFMGILLNALALWVFIHTPSSSSFIVYLKNTLMADLIMALMLPFKILSDSYPGLWQLRAFVCRFSAVVFYDTMYVSITLLGLIAFDRFFKIVRPTGKFFVQKPIFAKVVSALIWLLLFLISLPNTFLSNKKATPLSVKKCAALKSPLGLTWHQVANYISQFIFWTVFVLMLLFYAVITKKVYDSYRKSKSKDSRSNKKLKGKVFIVVAVFVVCFVPFHFAKLPYVHSQTNNKTDCKLQNQLFIAKETTLFLATTNICMVPLIYIFLCKKFTERLPCMRRRATVASQESHSNQTYNIILS	88953	82935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_-_88185_88884
900787	contig_7151_pilon	+	3509	1	Intergenic	novelGene_40691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2267	2578	13192	13503	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLQEKIHYLQLFEQQEPWQAHSPQANSAHAPQGTRPHPLWSFLLPPPMWVHGHRPEQKTPASSLCLQSCCPQPWEGHVHTWDSCPVHFRSSSQMGPFPSPK	10925	14434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_10900_14400
900788	contig_12010_pilon	+	4782	10	Intergenic	novelGene_160948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	193.226982242819	362	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	88	1452	200924	224676	FALSE	15	TGTTTCTGTGATATGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLRSPDRKRLEDGPPPDGSRTALLKTSTMTKREAEELIEIEIDGTEKPECTEESIVEQTYTPAECVSQAIDINEPIGNLKKLLEPRLQCSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVISYQGIEPKLNILEIVKPAETVEVVIDPDAHHAEAEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLSQEDFFQRVPRGEILWSHLELLRKYVLASQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQSAAPTTIKVLNSSTKAAKVQRAPRISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQAEKDN	194755	228006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_194818_200898_201001_205109_205255_209287_209373_211709_211956_216639_216835_219001_219056_220047_220189_220432_220626_224447
900789	contig_10176_pilon	-	2345	9	Intergenic	novelGene_72724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	249.664243284856	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	75	647	274981	268548	TRUE	35	AGGCAATTTTTAATACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWN	275055	260635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264248_264393_267068_267196_267804_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
900790	contig_15327_pilon	-	2183	19	Intergenic	novelGene_70791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_13	112.451251440868	335	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	84	2114	1204638	1185925	FALSE	15	TTGGCCGGGCGAGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLQRLQENVEKTLSCLDHVISYYHVASDTERIIREGPTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNSPDSPELNKVKLLFERGKESLESEFRSLMTRHSKVVSPVLILDLISGEDELEVQEEVPLEHLPEGVLQDVIRISRWLVEYGRNQDFMNVYYQIRSSQLDRSIKGLKEHFRKSSSSSGVPYSPAIPNKRKDTPTKKPAKRPGHEHDFRVKHLSEALNDKHGPLAGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204721	1185855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192732_1193632_1193702_1197067_1197236_1199990_1200214_1202992_1203099_1203288_1203474_1204300_1204367_1204578
900791	contig_10904_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_22505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAAATAAACTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332653	331359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_331400_332700
900792	contig_15135_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_119844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCTGAGCTCCATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15330	12824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_12800_15300
900793	contig_12677_pilon	+	1471	2	Intergenic	novelGene_110801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCATCCATTGAGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	3781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2683_2831
900794	contig_16882_pilon	+	3500	7	Intergenic	novelGene_148217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	83.3906469575575	20	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	49	495	202217	206820	TRUE	10	TTTCTTCAGATGTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRLFSLAHRVALATVRYSRCGCGGFGMFYAVRRGRKTGVFLTWNECRTQVDRFPAARFKKFATEDEAWAFVRNSVSPDVSEGQKNQRVQEPQLKANKRPRESPNDEEDENTEPCVKHLKQNTESVPSVSKDTFSYMGISFLDFLFLI	202168	214089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_202348_203443_203560_206620_208906_210165_210221_210653_210739_212311_212437_213434
900795	contig_7806_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_157541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCGCCCCCAAGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251728	249771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_249800_251700
900796	contig_17127_pilon	-	4182	17	Intergenic	novelGene_168293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	151.008678868964	9	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	452	2359	19506	8819	FALSE	25	CTTATGTTTGCAAAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSDRALPPVVFILIRLLTHLAMLLGAATSPQALRNIIKPPVGDPETFLHRHIQRDLEQLTKTLGKSADETANVVHLILCSLLRAQDSHSDQRLLNFDARLSTKERRNDWEKVVEKIILSELEHLDKTLLTVNTLISQDERISSDPVAKIIYGDPATFLCHLPQKSVVHCSKIWSCRKRITVEHLQHIVEQKNGRETVPILQKFLQKEAELRLVKFLPEILALQRNLVKRFQNASEVEFQSLRSFIDSHNSDGLKQWFRNRITIFLSTWNKLRRSLETNGEIKLPKDYCSTDLDLDADFEVILPRRRGRGLCSTALVSYLITLHNEMVYMVEKFSQKNNSYSVDTSEVTDLHVISYEVEQDLMPLLLSNCQYKVEQGGEALQEFDLEKIQRQITSRLLQGKPRLTLKGIPTLVYRHDWNYERLFMDIKNKMSQHALPYATLSALSGQLQSFSDACEALSVIEVTLGFLSTAGGDPDMPLNVYIQDTLRMDDQTSPVLKALNRCQLKHIIALWRFLSARKCEQLLRLGKDPFREISSEYKVDLSPEDAKLLSTFLNQTDLDTFLLELHEMMILKLKNPHQEVNFNPAWSLRDTLVSYMETKESDVPPEMESQFPEEILLSSCVPVWNTAARLKQG	23828	6995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_8961_10521_10701_10788_10879_11349_11545_12122_12201_13293_13496_13739_13921_14376_14461_14737_14871_16211_16464_17063_17156_18620_18802_19407_19568_20664_20762_22019_22055_23255_23338_23652
900797	scaffold_2602_pilon	+	5400	12	Intergenic	novelGene_127697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	484	junction_5	408.358232782188	904	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	402	755	47545	54259	TRUE	40	ATGTTAAAAAACCTGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRLETFFGLIIGTCIRIT	44030	70452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
900798	contig_5003_pilon	-	2733	10	Intergenic	novelGene_120218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	55.8171618371586	188	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1	810	187425	164493	FALSE	30	ACATCTCTACATTATAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWVPVESAVEELMPRLLPVEPCDLTECFDPSVPPRTPQEYLRRVQLEAAQCPDVVVAQIDPKKLKRRQTVNVSLSGCQPAPEGYSPTLQWQQQQVAQFSAIRQSVNKHRSHWKSQQLDSNVIMPKSEDEDGWKKFCLGERLCSEGIVGPATNESPGIDYVQIGFPPLLSIVSRMNQATVTSVLEYLSNWFGERDFTPELGRWLYALLACLEKPLLPEAHSLIRQLARRCSEVRLLVDSKDDERVPALNLLICLVSRYFDQRDLADEPS	187425	162569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_164533_165247_165307_167394_167506_170508_170578_173399_173445_175625_175740_182730_182791_183049_183140_186854_186940_187288
900799	contig_3424_pilon	-	1008	3	Intergenic	novelGene_55560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	32.5	130	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCATGGGGGTAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982261	980248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_980914_980996_981181_982102
900800	SIRV1	+	625	3	NIC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-64	-82	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACTTTGACTTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10647	11524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_+_10792_10882_11243_11403
900801	contig_18511_pilon	+	2825	8	Intergenic	novelGene_126876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	380.769896769314	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	532	1380	55332	61308	FALSE	20	CAATATTTGTCCTTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35411	62753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35581_51809_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
900802	contig_11338_pilon	-	3166	14	Intergenic	novelGene_6336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	147.760921561922	4	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	152	1816	319426	295354	FALSE	65	AAATTAGAAAAATTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEEDPVLTVITYMGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230_307429_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
900804	contig_4982_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_172230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTACTTCAGCTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33663	37049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_+_33700_37000
900805	contig_16103_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_118888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAACTGCACTATCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727518	728395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_727500_728400
900806	contig_253_pilon	-	2548	10	Intergenic	novelGene_129759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	214.554318426723	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	281	1066	726518	705354	TRUE	5	CTTGGTTCTGCCCACGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCGSPSVAPRKDRQVHLTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADVKILLEELANSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPARPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMECCICNEIVHPGCLQMDGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQVLRQETLDKN	728516	702433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_703410_703697_703914_704490_704650_705222_705387_709838_709929_711519_711652_712423_712694_714364_714449_726341_726739_728456
900807	contig_7962_pilon	+	973	2	Intergenic	novelGene_149296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGCACTTCAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193805	197221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_194449_196891
900808	contig_19342_pilon	-	4413	6	Intergenic	novelGene_41048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	512	817	5249	4291	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVSLLLSRGHHHGCPLLEGPVPRRPGLHKFHVLGLVLLVPLPGQGNIRWVEAESPAPHYGLTVRDGVMGHMCLWGTVPCSISFQFSRCLRSHSTHVPSK	6632	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_3359_3804_3891_4132_4365_5017_5292_5412_5541_6291
900809	contig_10658_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_130083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2312	2653	259613	259272	FALSE	30	ACAAAGGTGGAAGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRHHLISNVLSAREHHVYSHWPASAFSCSTFVYCACTLHGDIRLLLHWLVTYAHPLTGSEVTVGVPPASYLVSAESPSLFSKILARLFCNIVLDFALSTESKWKQKPVMLTL	426175	259234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_261391_425641
900810	contig_1428_pilon	-	3445	3	Intergenic	novelGene_158391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGGCACAGCAGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115588	45747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_45755_110208_112950_114891
900811	contig_567_pilon	+	3998	20	Intergenic	novelGene_34015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_9	178.760304702683	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	749	3538	640752	660604	FALSE	10	GTCTCCCAGCTCTCCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKMEVGQPEPVDTQPEDIPETKTEDCKVEPTETEERGTELKTEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHFCEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVLHHEVIWPTGFVCDGCLKKTGRTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGEVTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQEYGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNKSSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIPCDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESSNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTGQQPTTPQTPQPPPPLSPSLLLPAACLPTCPELRLLVLCPRARQQAR	636428	661064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_636487_638170_638309_638917_639356_640637_640818_641259_641405_643230_643350_644447_644688_645326_645416_647348_647430_649002_649060_649752_649831_651517_651586_652502_652654_652765_652913_653597_653712_654923_655090_656043_656209_657400_657563_659406_659689_659944
900812	contig_8447_pilon	+	4225	12	Intergenic	novelGene_69405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_1	452.77513438135	851	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	721	1956	48468	82214	FALSE	25	GCGAGAAACTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	40769	84483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073
900813	contig_6445_pilon	-	1677	14	Intergenic	novelGene_76920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_11	418.945774689491	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	211	1449	88578	43105	FALSE	20	GATACATTAGCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88788	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473
900814	contig_4924_pilon	+	4455	1	Intergenic	novelGene_84748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTAATCTTTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167817	172272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_167800_172300
900815	contig_17737_pilon	-	4027	8	Intergenic	novelGene_72903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	113.583736979034	146	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	25	708	87502	46223	FALSE	20	TGAGGTTTATTCTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFGLWAAYFELTWLIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGCTLRS	94195	42903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_46243_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_87457_87503_94171
900816	contig_7457_pilon	+	3705	9	Intergenic	novelGene_31540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	223.685011511724	436	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	144	902	762721	771926	FALSE	15	TTTTTGGTGAGAGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVIVHGSQDNNATATVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSSRGLTKEDYSNMSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRLGDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPSKAIDGYVKPQIKQVVPEFVNASADSVGGSATYMDQAPSPAVCAQAPYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLDDTMDVARRVEELLGRPMDSQWIPHAQS	760441	774729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_760522_762657_762769_762822_762865_764333_764429_764530_764662_765741_765898_770753_770806_771159_771268_771799
900818	contig_34_pilon	-	3189	3	Intergenic	novelGene_40043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	623	1018	348245	347850	TRUE	45	TAATGGAAATAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKGDPSKCGNYRTVSLISQASKILLKIIQKQLQQYVDRELPEIQKRFRRFRREHGTRSIIADVRWILAESREHQKDVYLCFIDYANALDCVDHNKLWITLQRMGIPEQLIVLMRNLYIDQEAVVQTE	377512	230093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_232074_347658_348506_377150
900819	contig_5451_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_167182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGACTAAATGAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625295	627259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_625300_627300
900820	contig_7272_pilon	-	3153	2	Intergenic	novelGene_25406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	88	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAAGTTTTCACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786265	781403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_783799_785507
900821	contig_2365_pilon	-	4616	26	Intergenic	novelGene_103730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	387	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGCAGCGGCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316011	116733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_116901_130178_130243_158561_158688_165787_165855_168857_168923_169336_169483_171534_171669_173637_173732_190641_190682_193762_193970_195602_195781_206221_206320_212135_212253_219465_220179_227529_227616_229217_229305_229386_229535_248940_249030_254096_254240_256887_257044_258064_258246_260405_260535_261544_261676_272886_273064_277038_277198_315097
900822	contig_5686_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_45484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	383	757	237430	237056	NA	45	TTGCCAGTGAAAAATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPSWTPVGDQQTGSVRKQLHGAAGERTTGNQRYTLSHPHPLHPHWASSTSCSHSLLAGGTGFSPVLPGFYPSTLAGSLRVLCLLLVFLFTTSFGFFHTSHHLPLLYLKYLALVPSLLLPGGM	237812	235188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_235200_237800
900823	contig_5718_pilon	+	2114	3	Intergenic	novelGene_110346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTTGCTATGATGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605783	639803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_606160_607742_609423_639745
900825	contig_16492_pilon	+	1739	12	Intergenic	novelGene_100288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	120.955630141015	9	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1449	289	1737	153548	168802	FALSE	35	CAACCTTGATCAAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIAVPLGVTTPDTSYSDMAAGSDPESVEASPAVNEKSVYSTHNYGTTQRHGCRGLPYATIIPRSDLNGLPSPVEERCGDSPNSEGETVPTWCPCGLSQDGFLLNCDKCRGMSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEV	113367	168804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_113481_149405_149465_153431_153619_158439_158546_158928_159081_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549
900826	contig_10324_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_7859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391235	545741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_391243_544054
900827	contig_6707_pilon	-	4335	20	Intergenic	novelGene_167037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_3	74.925817421924	435	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	53	2584	212721	126393	FALSE	0	GGCTGGCCGTCGTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDSERRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQSACDEAIYQLGLDLEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGKVKHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNTVNTMRLWSAKAPNDFKLHDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALAIPELMRILVDVEKVDWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLDIIYAINQRHLDHVAALFPGDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAINGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKFQNKTNGVTPRRWLLLCNPGLADIIVEKIGEGFLTDLSQLKQLLHLVSDEAFIRDVAKVKQENKLKFSAFLEKEYKVKINSSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHIITLYNRIRKDPTNSFVPRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIKLVTSISNVINHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPSADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVEEVEALDRSGYNAREYYDRLPELRQAVDQIGSGFFSPREPDCFRDVVNMLMNHDRFKVFADYEAYMECQAKVDQLYRDPKEWTKKVIWNIACSGKFSSDRTITEYARDIWGAEPLDLKIPLPNVPQD	212773	124641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_126546_127253_127321_128853_128989_130454_130663_132577_132720_134528_134588_144271_144420_145219_145322_147007_147123_147772_147937_148624_148772_151131_151225_151866_152011_154091_154175_154634_154747_156653_156786_158139_158244_159515_159595_162524_162627_212478
900828	contig_20398_pilon	+	4739	2	Intergenic	novelGene_155198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAGTGGCATGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52339	127131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_+_55307_125359
900829	contig_4402_pilon	+	2648	2	Intergenic	novelGene_140846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAACGCTTGAGGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592573	595655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_593745_594178
900830	contig_16098_pilon	-	2092	2	Intergenic	novelGene_46254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAGAAAATATAAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828780	826641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_827601_827647
900831	contig_10951_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_61616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTAAAAACTAAGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56097	54248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_54200_56100
900832	contig_13014_pilon	+	3793	2	Intergenic	novelGene_169350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_1	0	397	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGTGTTAAATGGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398765	402639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_401737_401817
900833	scaffold_4438_pilon	+	1528	6	Intergenic	novelGene_174534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	63.8924095648302	193	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	370	1137	395703	417127	TRUE	35	GAGTCAGCAGGCAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQTTTLIVKKRPDFSSSGQWEIVTKSNGKEQSEVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVFLSTRQGSWVLSHISGDGYPWDMLFHTHFRSMLRNVLPRMVVKWMMEQQMNQWFNHENYGLKPQNK	395333	419364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_411934_412098_413970_414114_416923_417161_419006
900834	contig_15384_pilon	+	4825	2	Intergenic	novelGene_85120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_1	0	590	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1156	1938	77877	79189	FALSE	10	CGAGTCTGCAGTCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFIENLGCAFLAGLTVSVVVILLDCGPEFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMRHKHLDTGLPEVASPCGSSTSPEAGPSSPPKVDVRMIDFAHSTFKGFRDDPTVHDGPDRGYVFGLENLINIMEQMRDENQ	76721	82076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_78141_78670
900836	contig_11258_pilon	+	1391	4	Intergenic	novelGene_67780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	206.747833523514	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	75	677	279290	292688	FALSE	55	AGAGAGAAGAAAAGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGPHHTPPCLLP	279215	293402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285643_285795_292654
900837	contig_13074_pilon	+	4765	5	Intergenic	novelGene_153457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1	441	639119	639559	TRUE	25	TGACACTATGGCCCTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGTFSRIQHILGHKASHNRIQSIDILQSIFSDHKVIKVEINNRKSKQKKSNTCNQNNTLLKNYWVIKETKDGIKKFTESNKNENTSNQNLWDTAKAVLKSVYSNKCTHPKRKKCQNQNINPTTGTSTAIETKEALGRQKKGNNKN	639118	724136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_642591_643003_643353_681544_681707_723127_723462_723688
900838	contig_14441_pilon	+	1346	5	Intergenic	novelGene_100482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	110	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	359	1306	92508	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWYHQPPGQSLILIATANQGSEATYESGFTKDKFAINHPDFTFSTLTVKNSSPEDSSVYLCSAGAQCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92149	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92708_121188_121239_125517_125902_126159_126283_126514
900839	contig_5967_pilon	-	2309	10	Intergenic	novelGene_44345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	453.474270031109	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	126	1190	488569	388566	TRUE	30	GAGACTGGGCAATGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517627	387319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388097_388223_388931_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
900840	contig_7962_pilon	+	3361	1	Intergenic	novelGene_149292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGAACACGACACCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159208	162569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_159200_162600
900841	contig_9552_pilon	+	2726	4	Intergenic	novelGene_167939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	56	junction_1	73.7804551053703	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	34	651	161438	168723	FALSE	25	TTCACATTCAGGATATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVREPDAGAANGTAARALETPAWEAPEDACPQPGSYEIRHYGPAKWVSTSVESMDWDSALQTGFTKLNSYFEGKNEKEMKIKMTAPVTSYVEPGSGPFSESTITISLYIPSQQQSDPPRPSESDVFIEDRAEMTVFVRSFDGFSSAQKNQEQLLTLANILREEGKVFDEKVYYTAGYNSPFKLLNRNNEVWLIQKNELSKENE	161404	170798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_161540_162108_162245_163331_163513_168524
900842	contig_294_pilon	+	4358	5	Intergenic	novelGene_166736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	63.8371952704691	454	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	24	443	100724	117463	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQRRRRMEAVVFVFSLLDCCALIFLSVYFIITLSDLECDYINARSCCSKLNKWVIPELIGHTIVTVLMLISLHWFIFLLNLPVATWNIYRFIMVPSGNMGVFDPTEIHNRGQLKSHMKEAMIKLGFHLLCFFMYLYSMILALIND	100700	121378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_100793_103747_103817_108090_108204_112255_112397_117435
900843	contig_299_pilon	+	4249	13	Intergenic	novelGene_129515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_6	112.988292166342	479	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	56	1345	1707341	1726377	FALSE	15	AAAGCCCCTCCCCGCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSVGGAPGKENREGRERMPKSPDALEVAQSEEEVDELSLIDHNEIMARLTLKQEGDDGPDVRGGSGDILLVHATETDRKDLVLYCEAFLTTYRTFITPEELIKKLQYRYEKFSPFADTFKNRVSKNTFFVLVRVVDELCLVELTEEILKLLMELVFRLVCNGELSLARVLRKNILDKVAQKKLLKCANSDQPLAARGVAARPGTLHDFHSHEIAEQLTLLDAELFYKIEIPEVLLWAKEQNEEKSPNLTQFTEHFNNMSYWVRSIIMLQEKAQDRERLLLKFIKIMKHLRKLNNFNSYLAILSALDSAPIRRLEWQKQTSEGLAEYCTLIDSSSSFRAYRAALSEVEPPCIPYLGLILQDLTFVHLGNPDYIDGKVNFSKRWQQFNILDSMRRFQQAHYDIRRNDDIVNFFNDFSDHLAEEALWELSLKIKPRNITRRKTDREEKT	1704861	1729281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1704916_1707339_1707452_1709357_1709434_1713522_1713608_1715662_1715756_1716566_1716753_1717716_1717802_1717953_1718049_1719611_1719691_1719777_1719880_1723628_1723727_1725025_1725155_1726226
900844	contig_1699_pilon	+	2653	1	Intergenic	novelGene_72819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGCTCTGTGTTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70695	73348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_70700_73300
900845	contig_7568_pilon	+	2438	2	Intergenic	novelGene_173999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1011	1412	26305	26706	FALSE	15	TTGATCTCTGATTTGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFHFFACGNPIFPALFIEETLFSPSNGLSTLVKNQLSTDVRVYFWTLSSISSVYGSTVIPAPGCFHYCSYTVCFKIRKCKRYSFVLLFQPCFSYLGPPAIPYEVEDWFFYFCKEGCWNSDQDCIQYIDCFG	22433	27732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_22504_25364
900846	contig_20727_pilon	-	2921	1	Intergenic	novelGene_152572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTAATTTTGAGATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25609	22688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20727_pilon_-_22700_25600
900847	contig_7806_pilon	-	2575	2	Intergenic	novelGene_157539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGAAACCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252052	243948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_244536_250064
900848	contig_3077_pilon	+	3060	7	Intergenic	novelGene_26814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	699.195827758973	10	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	1181	2332	473998	481662	FALSE	25	AGATTTAACGTGTGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWALLLLFLQFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	472817	482390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481509
900849	contig_4780_pilon	-	1758	13	Intergenic	novelGene_65395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	125.464691801673	8	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	643	1455	361784	312144	FALSE	30	ACATTTACAATCTATGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINANMMVLGHEPRQTTSNLGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428903	311840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_342280_342389_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_418007_418236_419799_419852_422134_422262_428740
900850	contig_1008_pilon	-	3684	2	Intergenic	novelGene_121541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	829	1656	304380	303553	TRUE	60	GCAAGAAAAACATAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDSEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLSIIKGIYTKPKANIILNGGSLKAPALRMETRQGYPLSPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKGIQIGKQEVKVSLFADDMISYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVEFLYTDKENFEEEITKSKPFTIAPKKIKYLGIHLTRDIKDLYKENYKTLLQKNKRDLHKWKNIPCSWTGKLNIVKMLILHKAIHRYNTILIQIPMAFFNEMEKQITNFIWKGRRSQISKALLKNKVGEPI	305208	301443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_301532_301612
900851	contig_18208_pilon	-	470	3	Intergenic	novelGene_176193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2379.5	393	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAATGCTTGTGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155514	154377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154568_154713_154835_155355
900852	contig_18163_pilon	-	4056	4	Intergenic	novelGene_35303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2828.66285646691	22	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	599	1174	10631	9401	FALSE	10	ATTTTCTGTTGTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11562	6518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10375_10683_10751_11226_11489
900853	contig_14575_pilon	+	2361	3	Intergenic	novelGene_101920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1912	2214	429675	429977	FALSE	80	GAAAAAAATAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWGRQGESVVSARQVPVGCACAARECNVQHTVQIRQEGGGRGDSELCWVCKRKESGEGNRSKKNRSADGACPWNGESRNQEMKKNKKEKKSKYKLKEKA	276958	430124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_277044_424322_424501_428026
900854	contig_19812_pilon	-	2443	20	Intergenic	novelGene_100980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	97.033135386222	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	201	2057	44592	15879	FALSE	40	AGGCAAAGCCAAAGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48257	15492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44639_46710_46843_48235
900855	contig_240_pilon	+	3877	3	Intergenic	novelGene_173803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3220	3669	710796	711429	FALSE	10	ACGCTTGATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARYSSERRGRWREGSKKSKEAETPQEEAKMAHGVRYSSEKRGRWQEARKKSKEVEKSNTSSQQMALRELPVRVCGIQAASVSWSRDCGRRKQRRPSQGEEGWGVGKRISQITCCFVSRWTLREATFSYPVCWSPIGVQDGGSALH	706443	711637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_707300_708432_710875_711058
900856	contig_1244_pilon	-	2407	2	Intergenic	novelGene_38038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	896	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	685	999	934642	933684	FALSE	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLISQGMFCGSFLWSTLMLVFAYRFRCWMLVTSLSMGEILNTGIPQDDVEISRPRESCLWGVELVVERKEPGMAHHSCQEETKKLGKYHRHHLRFSMREPDL	935326	932275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_933856_934499
900857	contig_10258_pilon	+	8114	14	Intergenic	novelGene_155046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_13	98.2798202935021	887	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	3777	5963	86761	108468	FALSE	30	GCTGAATGTGTGGAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSPTGSSLKSNHSDDCATVQALQETQTSSNTSPTALPISALKQPSVEGLCSKEQKRVWFADGILPNGEVADTTKLSSGSKRCPEDFSPLLPDMPLMVNTVDYGHSTTMEKPNEIGDITRNEIIQNPISQDPSVEKLPINTGTEGLPTSGSVILEDDVFAEIEQPSSPIGRVLVNNNLPVASISDYKLLCGIDKYVSNKISLLPNDEDSLPPLLVTSGETGSVPTVEEHPSHEQIILLLEGEGFRPVTFVLNANLLVTVKLVFYPSDKCWYFSTNGLHGLGQAEIVILLLCLPNEDTIPRDIFKLLITIYKDALKGKYIENLDNITFTESFLSSKDHGGFLFITPTFQKLDDLPLPSNPFLCGILIQKLEIPWAKVFPMRLMLRLGAEYKAYPAPLTSIRGRKPLFGEIGHTIMNLLVDLRNYQYTLHNIDQLLIHMEMGKSCIKIPRKKYSDVMKVINSSNEHVISIGASFSTEADSHLVCVQNDGVYQTQANCAAGHPRKVTGASFVVFNGALKTSSGFLAKSSIVEDGLMVQITPETMNGLRLALREQKDFKITCGKVDAVDLREYVDICWVDSEEKENKGVISSVDGRSLQGFLSEKVKLETDFETDEKIVKCTEVFYFLKDQDLSISATRYQFAKEIAMACCAALCPHLKTLKGNGMNKIGLRVSIDTDMVEFQAGSEGHLLPQHYLNDLDSALIPVIHGGTSNSTSLPLEIELVFFIIENLF	82984	110619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_86906_87990_88134_90338_90718_92673_92797_93515_93672_94249_94475_98058_98142_99631_99737_100091_100240_101521_101603_104821_104985_106038_106145_106931_107100_108306
900858	contig_14925_pilon	-	5434	4	Intergenic	novelGene_55346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	519	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3847	4260	116065	114666	TRUE	5	TTGTGTGCACTTGCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	119911	112103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
900859	contig_18419_pilon	+	2668	12	Intergenic	novelGene_141472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	195.259903083214	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	1461	2234	80714	82012	FALSE	25	ACTTGAAGGAGATTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKTVATPKSKVMAKAPSSLPAKQTPQGGGDSSSDSDSSSSEEEEEEKTSKPPVKRKLQKAAGTVTPSKPASKKKVKAESSSSSSSGDSSEEEEAKPKAKATPKPQTPKVNGTSALTAQNGKAGRDNSEEEDGVAVSKPGKKRKQNEAAKEAETPQVKKPKLQTPNTFPKRKKGEKRASSPFRRVKEEEIEVDARMADNSFDAKRGAAGDWGERANQVLKFTKGKSFRHEKTKKKRGSYRGGAISIQVNSVKFDSE	75420	82446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_+_75565_77415_77472_77585_77726_77833_77962_78482_78643_79208_79589_79940_80070_80281_80393_80501_81135_81324_81426_81576_81670_81853
900860	contig_5669_pilon	+	2438	5	Intergenic	novelGene_86101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	102.162554294614	359	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	318	662	380493	383947	FALSE	15	CCTCCTCCCTTGAGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSCSPSVAALDLSARTSASCRRSPSALPSCSCYSWLLVSWASSSQTRYQLGAKRPSQARGKVSEIINNAIVHYRDDLDLQNLIDFGQKEFSCCGGISYKDWSLNMYFNCSEDNPSRERCSVPYSCCLPTPNQAVINTMCGQGMQALGYSEASKVIYTNGCIDKLVNWIHSNLFLLGGMALGLAIPQVIYPVRLVGPTNSAKTPLFLRGHLGISWVSRR	377072	385723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_377143_377415_377522_379437_379534_380447_380577_383686
900861	contig_20596_pilon	+	2269	1	Intergenic	novelGene_157241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGATAGCCAGGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112868	115137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_112900_115100
900862	contig_9366_pilon	+	306	3	Intergenic	novelGene_166259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	434	junction_2	142	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	240	65	304	979223	996547	FALSE	30	GCAGTTACCTAGCAGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSVAVLQTPPDIQSEHSRDGEMDDSREGELMDCDGKSESSPEREAVDDEPKGAEGAEGTKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRSRTGQGKTKRSMIRKDSSGSIS	979158	996549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_979239_986838_986968_996452
900863	contig_8691_pilon	+	2457	2	Intergenic	novelGene_72684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	120	389	20105	20415	FALSE	45	AGAAAAACATCTGCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQHLIYKDCSDYHTIGKRSSETYRVTPDPKNSSFEVYCDMETMGGGWTVLQGRLDGSTNFNRTWQDYKVGFGNLRREFWLGNDKIHLLTKSKEMILRIDLEDFNGVKLYALYDHFYVANEFLKYLTFQ	19985	22483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_20361_20401
900864	contig_20293_pilon	+	4003	15	Intergenic	novelGene_153502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAAGGAAAGTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17107	116224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_19472_20436_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45338_45425_45495_48533_48674_49036_49172_49879_50102_52322_52469_68597_68701_116146
900865	contig_7138_pilon	+	1879	2	Intergenic	novelGene_120997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302815	305655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_304458_305418
900866	contig_7106_pilon	+	5016	9	Intergenic	novelGene_148320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	575	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	4421	4825	652504	669084	TRUE	25	GAGCGGAGAGGAAGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQAYFLCHLINHVSKCVWNYSYSTITNPYKIIFCNFISWHQIINFRINANLFATYKQSSIHIRIFSKKLLTYINGWIIMILYTKEYFIFGIIQLKECFQVVDQVRIYPFQWFQKRDTWELAIWLFIRCLLVEV	641006	688328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_644912_645360_645557_646062_646152_647173_647351_652450_652566_654695_654796_655851_655957_668946_669089_688141
900867	contig_3745_pilon	-	2885	1	Intergenic	novelGene_85089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404234	401349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_401300_404200
900868	SIRV7	-	1018	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	55	1389	50	-1387	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	33	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGACCTAAATCACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147868	2392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
900869	contig_2739_pilon	+	3273	1	Intergenic	novelGene_165840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGTAAAAGTACGTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239096	242369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_239100_242400
900871	contig_14326_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_120785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCCCACTCAGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884580	887031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_884600_887000
900872	contig_709_pilon	-	852	5	Intergenic	novelGene_57530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	349.522531462565	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	483	569	1482076	1481990	FALSE	25	TATGCAGTGTTATTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAVGNGAPRPPGSQLQRDEEEEDEVEDEKEDSDEEDSDEEDDEVVDEEVNVEFEAYSISDTDYDGINKLLQQLFLKAPVNTAELTDLLIQQSHIGSVIKQTDVSEGSDDDVDVDEDEIFGFISLLNLTERKKAVLKFSYSVQDESDTCLGGRWSFDDVPMKPLRTVMLIPADKMSEIMDKLKEHLSL	1498082	1481706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1482161_1487576_1487673_1489760_1489842_1490541_1490617_1497936
900873	contig_5415_pilon	+	4522	20	Intergenic	novelGene_146127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	69.596024658018	455	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	587	2773	142755	154721	FALSE	35	AATACTGATAAGTGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCCFGCMSVLANYFVFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSHFARVLEEEENKPNPVTQRVKMIMSLGLVLVHAHSRWIADPSPQNSTAENSKVSLELDENVSKRIEPNVSLWQFYLSKMVSMDIEQVITLSLALLLAVKYIFFEQAETESTLSLKNPITSPVVNQKKVPDNCCRRESPLVRNNQKFHATGEEAGINRERKAEVIKPLVTETDTSNRATFVVGNSSLLGTSPILETQEPEIELPREPRPNEECLQILESAEKGAKFLSDAEVIRLVNAKHIPAYKLETLMETHERGVSIRRQILSEKLPEPSSLQYLPYRDYNYSLVMGACCENVIGYMPIPVGVAGPLCLDGKEFHIPMATTEGCLVASTNRGCRAIGLGGGASSRVLADGMTRGPVVRLPRACDSAEVKAWLDTAEGFTVMKEAFDSTSRYARLQKIHTSLAGRNLYIRFQSRTGDAMGMNMISKGTEKALSKLHELFPDVQILAVSGNYCTDKKPAAINWIEGRGKSVVCEAVIPAKVVREVLKTTTEAMIEVNINKNLVGSAMAGSIGGYNAHAANIVTAIYIACGQDAAQNVGSSNCITLMEASGPTNEDLYISCTMPSIEIGTVGGGTNLLPQQACLQMLGVQGACRDNPGENARQLARIVCATVMAGELSLMAALAAGHLVKSHMIHNRSKINLQDLQGTCTKKTA	134771	156470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_134851_139717_139906_140372_140485_140773_140862_141682_141772_142724_142831_145035_145143_145266_145384_145901_146063_146185_146434_146560_146740_150093_150289_150754_150914_151065_151224_152065_152172_153045_153217_153529_153671_153759_153919_154360_154516_154666
900874	contig_4350_pilon	-	5673	4	Intergenic	novelGene_136379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.1441845795323	275	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	3947	5488	244764	243223	TRUE	45	AAACCTCACTAATCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLYGNDEINGNKFISNCMLPIFNRRHMVENLCESNEDNQCGQTFSQIPNLSMLKRTPVEAYPSECLEFGKSLMDHSSLKHHVISHSGCSASQCKECEEACSCPSYLSTLVRTLLTGEKPYECKECGKAFSQSSSLTTHIRIHSGERPYECRECGKAFSQSSNLIKHMRTHSGERPYECKECGRAFRHSSNLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSRSSDLITHIRIHSGGRSYECKECGQAFSRSSDLITHKRIHSGERSSECKECGQAFHKSSNLIIHTSSHTGERPYKCKECGKAFSQTSHLAAHIRTLSGERPYECKECGKAFHESSHLVIHMRIHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTSHIRSHSGERPYECKECGKAFSRSASLTTHIRSHSGEKPYKCKECGKAFHKSSNLIIHMSTHSGERPYKCKECGKAFSQSSNLTKHMRTHSGEKPYECKECGKAFHKSSNLTIHMRIHSGERPYECKQCRKAFNRSSHLTRHMRTHSGERS	270253	242851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_243028_243213_248176_258627_258878_269968
900875	contig_4232_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_63329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468067	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
900876	contig_5686_pilon	+	7405	2	Intergenic	novelGene_45360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	5604	5948	136974	137318	FALSE	15	ACCCCAGCCTTGTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPHSLFLTSAFQSYASVSGRGASITSGILAAEVCGKCFQLPSLSIRKAPCIGGLELMLTANQVYPVQLPWEVMGSVGSHRCMHGTQLSFSEGWWHVAEQKWMPEIFRKFKKCC	130020	138775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_134705_136054
900877	contig_408_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_84938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225330	223175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_223200_225300
900878	contig_4136_pilon	+	3776	22	Intergenic	novelGene_161251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_21	100.707249557213	332	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	972	2919	39	2957	156582	238026	FALSE	15	TTGATCATGCTGCTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIGPFEILVDPYMHEVTHFCLPQLLPLLKHTTSYLHEVFEFYEEILTCRYPYSCFKTVFIDEAYVEVAAYASMSIFSTNLLHSAMIIDETPLTRRCLAQSLAQQFFGCFISRMSWSDEWVLKGISGYIYGLWMKKTFGVNEYRHWIKEELDKIVAYELKTGGVLLHPIFGGGKEKDNPASHLHFSIKHPHTLSWEYYTMFQCKAHLVMRLIENRISMEFMLQVFNKLLSLASTASSQKFQSHMWSQMLVSTSGFLKSISNVSGKDIQPLIKQWVDQSGVVKFYGSFAFNRKRNVLELEIKQDYTSPGTQKYVGPLKVTVQELDGSFNHTLQIEENSLKHDIPCHSKSRRNKKKKIPLMNGEEVDMDLSAMDADSPLLWIRIDPDMSVLRKVEFEQADFMWQYQLRYERDVVAQQESILALEKFPTPASRLALTDILDQEQCFYRVRMSACFCLAKIANSMVSTWTGPPAMKSLFTRMFCCKTCPNIVKTNNFLSFQSYFLQKTMPVAMALLRDVHNLCPKEVLTFILDLIKYNDNRKNKFSDNYYRAEMIDALANSVTPAVSVNNEVRTLDNLNPDVRLILEEITRFLNMEKLLPSYRHTITVSCLRAIRVLQKNGHVPSDPALFKSYAEYGHFVDIRIAALEAVVDYTKVDRSYEELQWLLNMIQTDPVPYVRHKILNMLTKNPPFTKNMESPLCNEALVDQLWKLMNSGTSHDWRLRCGAVDLYFTLFGLSRPSCLPLPELGLVLNLKEKKAVLNPTIIPEAVAGNQEVASNPSSHPQLVGFQNTFSNSQDEEEIDMDTVHDSQAFISHHLNMLERPSTPGLSKYRPASSRSALVPQHSSGCDGTPTTKPPWSMELARKGTGKEQSPLEMSMHPAVAPPLSVFSKESTSSKHSDHHHHHHHEHKKKKKKHKHTHTHTHTHTHTDTQTHTHTHRHTHTHTHIHIHSKLLVICLTGTGSRIHGLLSMCCGAKLCLKQKHLPNLW	156543	238845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_156591_158779_158965_160081_160196_161368_161469_163776_163863_168190_168327_169366_169522_170189_170305_170868_170979_180099_180166_181557_181811_183196_183338_186001_186113_188673_188868_189729_189870_195449_195520_196514_196625_211649_211880_215622_215729_226529_226653_237274_237427_237813
900879	contig_13528_pilon	-	2552	6	Intergenic	novelGene_66851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1606	1911	27770	25343	TRUE	50	ACAAGGAAGGGGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSIALVTILTTISFFRNRTYKLSLSLMFFISFFYELCCLLKFGIHELLLQFLMFEHFINMLFPQGILFNELLQLLPQLNVFLAEFGIMYIMLFQLDLNFI	32368	12375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_12680_13898_13993_21896_22065_25267_25464_27585_29290_32282
900880	contig_4232_pilon	-	2979	3	Intergenic	novelGene_63451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	123	246	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	656	958	545715	545207	TRUE	25	CTTATTAGAATTGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPEAGMLVCGGAKLTQRFIFQVALLPFGLSSLGLKLVSSVRFSAPFLPFNSLKVIHSLKKLLLVSLGMELTFPLESVLLCSSWRSDGTRRIGAPGQCEA	546370	542772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544131_544543_545270_545475
900881	contig_16594_pilon	+	2944	2	Intergenic	novelGene_53888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAATAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214422	218233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_215525_216391
900882	contig_7279_pilon	+	2345	1	Intergenic	novelGene_145985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71839	74184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_71800_74200
900884	contig_15857_pilon	-	3525	3	Intergenic	novelGene_152066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	17	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1547	2263	50262	48131	FALSE	60	AATAGGGACAAAAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEKVNDGKPDPESCLDFSEHFNQLELLETHGHLIPTGTQSLWAGNSDDDEEQDEKTEEWYQLQEKKMEKDPSKLLLWAAEQNRLTTVQRLLSEKATHVNTRDEDEYTPLHRAAYSGHLDVVRELITQGADVHAVTVDGWTPLHSACKWNNTRVASFLLQHDADINAQTKGLLTPLHLAAGNRDSKDTLELLLMNRYIKPGLKNTVDETAFDIARRTSIYHYLFEIVEGCTNSSPQC	53127	46868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_48593_50007_50361_51679
900885	contig_21404_pilon	-	1400	8	Intergenic	novelGene_169131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	150.977224934689	458	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	125	871	6558	1868	TRUE	10	TTTGTACTTTTGGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLQSGNDFNAQDLPAVAPFLPASWAAQDKPAECTSSEPGGMLKLCSPETAHRIWNEKSAEIYPIREKLNRTRLALIICNIDFENLPKRAGADADIRGMKTLLEGLGYSVNVKQNLTASDMTAELKTFADRPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKMSLEFLC	10166	285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_388_1440_1892_2004_2115_4453_4598_4996_5232_5653_5828_6498_6615_10098
900886	contig_16492_pilon	+	1626	10	Intergenic	novelGene_100297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_2	125.246423767973	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1506	119	1624	153548	168802	FALSE	35	CAACCTTGATCAAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIAVPLGVTTPDTSYSDMAAGSDPESVEASPAVNEKSVYSTHNYGTTQRHGCRGLPYADHNYGAPPPPTPPASPPVQTIIPRSDLNGLPSPVEERCGDSPNSEGETVPTWCPCGLSQDGFLLNCDKCRGMSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEV	153429	168804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_153619_158439_158546_158871_159081_159418_159478_159993_160182_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549
900887	contig_10241_pilon	+	3674	2	Intergenic	novelGene_142838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	114	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	717	1325	118350	118958	TRUE	80	ACAATAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHLFTAWFTDYFKASVKTYCSEKKISFKILLLIDNAPGHPRALMEMHKEINAVFMPANTTSILQPMGQGVILTFKSYYLRNTFCKAIPAINSDSSDGSGQSKLKTFWKGFTILDAINNIRDSWEEVKISTLTGIWKKLIPTLMDDFERFKISVDKVTTDVVEIARELELEAEPEDVTELLQSHDKTLMDEELLLMDEQRK	117633	122426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_120856_121974
900888	contig_4857_pilon	+	3792	3	Intergenic	novelGene_48795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATACATAATACATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237173	1245289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1238717_1242189_1242271_1243121
900889	contig_17144_pilon	-	738	6	Intergenic	novelGene_29290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2433.29069369034	14	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	168	485	173640	166321	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGEERQGGLVGAWLVDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNGFLGLPHLAGPAP	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_173146_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174582_183168
900890	contig_4924_pilon	-	5865	13	Intergenic	novelGene_84645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1047.04723375893	3	124	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	41	1456	252525	65524	TRUE	35	AAAACCTGTAGTTTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252565	60833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_62869_63149_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
900891	contig_11163_pilon	-	1096	7	Intergenic	novelGene_153052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.3131380229295	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	36	758	117379	34004	TRUE	10	TCTTTGGCTATGTGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARDVLRAAAGMASGSTRLQRCMVLPAGRHTASLIFLHGSGDSGQGLRKWIKQVLTQDLAFQHIKIIYPTAPSRPYTAMNGGLSNVWFDRFKISNDCPEHLESIDVMCQMLTDLIDDEVKTGIKNNRILVGGFSMGGCMAMHLAYRNHQDVAGVFALSSFLNKTSAVYQALQKADGVLPELFQCHGTADELVPYSWAEETNSVLRSLGVSTQFHSFPGVHHDLSKTELQKLTSWILNKLPGDMERQDLNLD	117414	32980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_33210_33894_34021_73444_73677_74073_74190_83582_83753_110644_110745_117291
900892	contig_7357_pilon	+	2055	7	Intergenic	novelGene_36810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1408	1812	139801	166846	FALSE	15	CAGCCCCCACGCTGTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPSSSKSSCHLRASPGAAMGARAGE	135545	167089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_166771
900893	contig_8014_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_178141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGCACTTGACCTTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111997	110866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8014_pilon_-_110900_112000
900894	contig_13244_pilon	+	3922	4	Intergenic	novelGene_86940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257368	281452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_257435_274147_275489_278695_278871_279112
900895	contig_11548_pilon	+	4326	6	Intergenic	novelGene_66796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	900	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1086	1460	162652	163026	TRUE	35	CGCGCGCACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQPSGLTSASTLLGQVFQSSVAPPIKCPEAPYSARKPCAHRHSALSFCRSASLAHTNKRLEVSLCGSAPEPSCAGLLVLLLLGLCHCHFSVAAGSLLLVVLCLWGSAIHSQFQNYFHILGIC	161566	232000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_163561_225921_226519_229188_229582_230099_230761_231276_231750_231792
900896	contig_8775_pilon	+	4469	1	Intergenic	novelGene_166822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGATTTGAAGGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89479	93948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_89500_93900
900897	contig_11258_pilon	+	2664	5	Intergenic	novelGene_67812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGGCTTGGTGGGGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325992	360957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_327321_351853_352261_353000_353149_354744_355098_360529
900898	contig_13305_pilon	+	4995	1	Intergenic	novelGene_146774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	371	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	514	867	125137	125490	NA	20	AATCTTGTACTATGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVEGTWVPQGARTLGTPKGIQGLGFLGRKGLHAAFQVLSGSVGFESSLALGRGTHRSQIPDSQEDCGPWFLIPGGGRFGSTGREKEVRERELETSWSLLGNRGMYNICSSTGLLLS	124623	129618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_+_124600_129600
900899	contig_504_pilon	-	2646	12	Intergenic	novelGene_54424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	107	junction_11	97.41858223814	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	37	1341	187841	157936	FALSE	20	TTCTGAGTCCCCAGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGAAASPGRDPMAAEAADAPPGGIDPPLTCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHVKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEGSIYIHNIKDMKLLKTILDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTTGEIVLYDGNSLRTVCTIAAHEGMLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYIYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSETTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSTSSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPCEH	187877	156630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_158049_158690_158810_159462_159571_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167643_167742_175457_175555_181414_181585_183341_183425_187761
900900	contig_9731_pilon	+	2192	2	Intergenic	novelGene_154387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12406	28600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_+_13066_27067
900901	contig_5023_pilon	+	2724	13	Intergenic	novelGene_7255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2087.38693639254	84	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	738	1412	629246	646990	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580847	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_625796_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
900902	contig_10500_pilon	-	3556	8	Intergenic	novelGene_41257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	955.242783542594	28	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	433	1026	1635596	1629460	TRUE	70	GAAAAAAAAAAAAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640230	1626835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637052_1639929
900903	contig_7956_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_176871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	1532	2050	58462	58980	NA	65	CAACATCAAAACAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGISEQGEKTKNTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLSKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLGETIQARRQWDDIYKILREKNFQPRIIYPAKLSFRFDVEIRSFPDKQKLREYVEVKPNLQELLKGVL	56930	59130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7956_pilon_+_56900_59100
900904	contig_11855_pilon	-	1739	10	Intergenic	novelGene_66963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1844.02796502723	126	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	157	1191	1102035	1079293	TRUE	30	AACTAGTCCGTTGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102191	1077220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084555_1085877_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
900905	contig_14773_pilon	+	3314	2	Intergenic	novelGene_174760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCAGCCTCTGAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13999	17841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_+_17167_17694
900906	contig_16999_pilon	+	1956	4	Intergenic	novelGene_84960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	71.0226880807973	397	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTTCTTGGCATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50603	83195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50805_56118_56155_73925_74018_81568
900907	contig_5794_pilon	-	3540	6	Intergenic	novelGene_69795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3171	junction_5	4150.33379862391	22	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	764	1135	746429	745105	FALSE	15	TTGGGGTAGTGGATTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGKLFKVLFKC	747357	742699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_745278_746056_746135_746226_746323_746404_747019_747097_747245_747330
900908	contig_7357_pilon	+	2754	1	Intergenic	novelGene_36781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	127639	127953	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFPTVESGGGSPKWRQLPQPPEGHRGSETIKTDLLEVLLGNASPSSSSNREKSACASRERQLRHENKTKPLPSCQFQLIAPKEQGGNSGQNWSPKGTRWVWVF	127636	130390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_127600_130400
900909	contig_11105_pilon	+	3462	2	Intergenic	novelGene_159835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1820	2332	695736	696248	TRUE	70	AAAAAAAATCAAACACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGRGITENTEKIVEDLLTENFPDIMKDEKISIQDAHRTAHKVDPKRKSPRHIKIKLTKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRITSDYSAENMQARRQWDDIFKALKENNCQPRIIYPAKLSLKYDGEIRAFPDKHKFREFVKTKPKLQEILK	693916	697434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_696592_696647
900910	contig_13702_pilon	-	1647	2	Intergenic	novelGene_102649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTCAGCCCTGTACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273732	210123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_211748_273709
900911	contig_8588_pilon	+	3756	4	Intergenic	novelGene_146509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	292	junction_1	95.1816975870653	364	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	502	2247	396138	402935	FALSE	40	TGAGAAAAATGTCCCGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIEHEKIEAQDSGEEARNLSYNELYPSGTLKLQYNFDTIEQQFCDLPDNKDSTECDVAEVDGELFVAQSNFTLILEGEEGEFETGDSAASNVLVKAANTATEEKHVYSGENDNHGHVTNLPSIVTSDQESQKVETFPYVPEPIKVAIAENLLDVIKDTRSKEITSDTMEQPILENIPLISQKVMSSTTLAKSTFKTVEETSTMTMNVNQVDDMVSSRTRTRGQRVQSLNIKSQQEESVNIATPEILGLSVLKKTRKTKEMSDASENVYSDVKGISQNQQLPQNLVTPRRGRRKKDTDQDTLESINPMEQEFRVSAGRELRRLKSSQLLDPATEEASFNKEVKLTSVTRRTPKRTKKSIENQESVEIISDPKVNKGASPSRSIRKLRSSNLKASEDVECKQDGMSSDQQLPVQRSRRVKEREVSASDVMEHSKLDSSQLILQAEFDIPATPRKRGRPRKVDPYEDLGLKAVEGERSPKKRKVLSIQRRSTRNTPSKSENIDVGKLALEESILLPNEELATVVSSKKKLTKRTENQSQKRPLRSIAEEHFGNEMTHQEPNSQEEGLLATAALTKSSRGTRTRSSKAVLLPDLSEPKNEPLLFSTPVSKVPRKEKAKKIEASAQLKELVSDLSSPFVFSPPTLRTRRKNASSTSKLIDKLEDDSKSTETVEKQKVKRIRTAKTKQASKKTEKESSWSPPPVEIKLISPLASPIDGVKSKPRKPTEATGKVLGRSRKKPSSFPKQVLRRKML	395636	404444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_397474_400433_400568_401636_401720_402742
900912	contig_5643_pilon	+	3375	4	Intergenic	novelGene_38719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	465	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACCAAACTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31378	35360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_32076_32196_32687_33009_33120_33282
900913	contig_4769_pilon	-	4133	1	Intergenic	novelGene_118012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	502	852	1066730	1066380	NA	50	TGGAAAAAAAGGTGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADVTQILRVQSGKVREPGLFAAAEICFLLGGITEDELTKAETFYSVAIHRWRLKVRSPGGRRPPLRLWDLGCVRCGFGIWGVFRCVHISRGPCRKAASSKDGSPTRMEGMRVCFL	1067231	1063098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1063100_1067200
900915	contig_16685_pilon	+	1463	2	Intergenic	novelGene_115042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATAAATTTACTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435646	437205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_436888_436983
900916	contig_1230_pilon	-	2035	9	Intergenic	novelGene_28836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	182	508	408595	407721	TRUE	10	ACCGGTTTCCGCCCGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GICSEFGLINFFNGGSRRRTTRWRSSTTREAPRHSSRHSSSTLVQLGNNGVADFLQLFLLMFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408776	404453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_404519_405233_405445_405706_405912_406124_406278_406373_406930_407146_407348_407584_407787_408002_408234_408565
900917	contig_10930_pilon	+	1052	2	Intergenic	novelGene_37080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAAAGTTCATTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287887	289048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_288391_288499
900918	contig_16860_pilon	+	2895	13	Intergenic	novelGene_155341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	260	junction_12	172.948370587551	334	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	62	1315	102806	135257	FALSE	15	CTTCATAATTTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLLWSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSFEEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDGFNSLNTAHATENHGTGNHSAQ	102058	136837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_102085_102770_102896_105774_105887_107870_108017_108270_108411_108514_108593_108697_108793_111643_111770_120660_120739_127889_127972_128725_128824_133615_133646_135078
900919	contig_11855_pilon	+	2905	10	Intergenic	novelGene_67016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	277	junction_2	629.296981844045	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	129	1289	1592925	1608155	FALSE	10	CAGAGCCCCGCTGCCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSEADLVDVSAYSGLGEDSGGSALEEEDEEDGEPPYEPESGCMEIPGLSEEEDPAPSRKIHFSTAPIQVFSTYSNEDYDRRNEDVDPMAASAEYELEKRVERLELFPVELEKDSEGLGISIIGMGAGADMGLEKLGIFVKTVTEGGAAHRDGRIQVNDLLVEVDGTSLVGVTQSFAASVLRNTKGRVRFMIGRERPGEQSEVAQLIQQTLEQERWQREMMEQRYAQYAEDDEETGEYATDEDEELSPTFPGGEMAIEVFELAENEDALSPVDMEPEKLVHKFKELQIKHAVTEAEIQQLKRKLQSLEQEKGRWRVEKAQLEQSVEENKERMEKLEGYWGEAQSLCQAVDEHLRETQAQYQALERKYSKAKRLIKDYQQKEIEFLKKETAQRRVLEESELARKEEMDKLLDKISELEGNLQTLRNSNST	1592796	1609771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1593003_1597293_1597427_1599451_1599573_1601564_1601670_1602725_1602862_1604239_1604393_1604503_1604558_1607228_1607459_1607798_1607896_1608101
900921	contig_5424_pilon	-	7346	7	Intergenic	novelGene_172801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	160.285595803934	1007	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	4713	5135	118034	116731	TRUE	10	CGCCCCGCGGCAGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVEPSFNDAHISKFSDQNSTELMNSVMVRTEEEISDTDLKQEEESPSDLASTYGTEDLESPTIEEQVDQTTIDDETILIVPSPHGFIQASDVIDSVLPLTTLTDPILQHHREESNIIGSSLCSPVSEDSKDVEDLVNCH	123291	96051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_96447_112509_112562_113586_113694_115073_116841_117086_117229_117863_118245_118789
900922	contig_821_pilon	-	2133	3	Intergenic	novelGene_149400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	1	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263970	169504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_171366_190516_190730_263911
900923	contig_20357_pilon	+	2131	4	Intergenic	novelGene_178714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	161	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGAAAAAAAAATTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19838	30963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20357_pilon_+_19998_26404_26576_27763_27870_29268
900924	contig_7915_pilon	-	3108	7	Intergenic	novelGene_42955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTGTTGTGCGGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63317	35880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_35975_44609_44739_46248_46393_48107_48294_53929_54125_60117_60237_61076
900925	contig_19076_pilon	+	2296	4	Intergenic	novelGene_74211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	415.560665446896	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	907	1287	152334	155254	FALSE	15	ATTTTTTTAAGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQITWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGALTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSTGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGSGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME	102447	156263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_103079_146309_146503_152251_152398_154937
900926	contig_10793_pilon	+	1737	12	Intergenic	novelGene_83410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3542.38209763146	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	91	828	146975	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130911	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_165377_166401_166473_167141
900927	contig_6020_pilon	-	1540	7	Intergenic	novelGene_155561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.813191611037	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	331	744	349599	289990	TRUE	40	TTAGAAGCTGTCTTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVILIEFLPKTPIFRPD	349929	288496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_288894_289590_290041_293631_293692_293857_293915_318353_318426_318550_318606_349480
900928	contig_6954_pilon	+	1564	3	Intergenic	novelGene_64430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGATTAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226653	370022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_227891_255061_255375_370008
900930	contig_3975_pilon	-	4911	11	Intergenic	novelGene_54903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	41.7272093483377	384	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	116	1801	2134513	2123091	FALSE	10	ACCTCTGTCTGACTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNQDKKNGAAKQSGNTSNPKSNPGQPEAGPEDAHRRPSQPSSATEAEDSTSQALGKPEGAQAKTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNSQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRSYAVRNGEPEPGTPVVNGEKETSKGEPGTEEIRASDEGGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTLNTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARSKLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLRQENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREKDFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFKQEMEKMTKKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTLRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERNDLNKRVQDLSASGQGALTDSGPEQRPEVATATKEQGGEGLMAQAPSSPRATEATCCPGAQSTEASGQTGPWEASPTTA	2135221	2119980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2123418_2124167_2124264_2124625_2124719_2125191_2125267_2125501_2125622_2127497_2127693_2129086_2129258_2132021_2132114_2133357_2133697_2134335_2134520_2135112
900931	contig_18162_pilon	-	3573	3	Intergenic	novelGene_122273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16569	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
900932	contig_6137_pilon	+	3094	19	Intergenic	novelGene_59191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_7	1135.3333944999	3	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	690	1880	1331821	1353702	FALSE	30	TGAGATTTTGAGAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1294879	1354916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1294950_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
900933	scaffold_13505_pilon	-	2779	7	Intergenic	novelGene_111411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1457	1840	326921	326041	TRUE	5	CTCCCTGTGGTCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPHSGLDPASGPPGPPGVCAAPSLQVEEEEDDEDEDEEERPGDLLEMEAATAAAAAETRPTPGGALSRGSPAWFKKSGEVTRPGLPGAAPAAPSTRFPLPSRLVSGRVPPEARARAGVQARQADS	328377	320686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_320928_321061_321201_321291_321442_321516_321692_323802_323870_325873_326078_326574
900934	contig_12151_pilon	-	3393	10	Intergenic	novelGene_54975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	283.817799318289	8	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	391	1476	1000226	986256	TRUE	35	TACTAATTTTGGCCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSGNRGKGTKKSPALQSLGGLLFCCCYCCFLIFSNIVDFIDGFKELILFPKYFVSSLIMT	1000616	974608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_975170_976386_976557_980052_980231_983414_983728_985560_986624_987392_987496_988025_988176_989430_989518_994295_994464_1000016
900935	contig_6227_pilon	+	1268	5	Intergenic	novelGene_49790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	960	1259	1252987	1255106	FALSE	50	GCAACATAAAAAGTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAWAVGESASALSAGLPLRCSRPVNLLQSPLDSSGSQLSLHIHSDLSFPELSYMLAKHCQFLCSVLLADDQELLHSENRRAVELQFPPGSHHTLFLLV	1249665	1255115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1250467_1252828_1252990_1254301_1254367_1254483_1254581_1254971
900936	contig_16204_pilon	+	2343	13	Intergenic	novelGene_154516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	440.687428595623	21	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	913	1941	389626	396848	FALSE	15	ACTATAGCGTCCCGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNTTARATQRIEPSSCLPVHLLPPFPAQRPNPSRRLSVAVFSAIRRPSALAYWEYLSIATTRQLSGPRSRTAQPHTWITNTVSPPGIPTSRLIRLLKGPCTVLLPSLITLLTVTTICTGLRGCKRSGSRDRNSRARPISPENILHSPLGNDV	369282	397250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_384218_384412_387991_388298_388738_388802_389404_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394535_394691_394977_395098_395665_395758_396763
900937	contig_9498_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_178758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTACATTTTTAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15850	13865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9498_pilon_-_13900_15800
900938	contig_5586_pilon	-	3714	6	Intergenic	novelGene_143553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1152	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGTTTGGGATGGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387949	369147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_369241_373452_373558_380628_380719_383470_383572_384575_387246_387294
900939	contig_6885_pilon	-	6114	1	Intergenic	novelGene_83675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	5328	5630	210312	210010	NA	30	AACTTGCTCTTGAACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	215639	209525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_209500_215600
900940	contig_10890_pilon	-	5001	1	Intergenic	novelGene_166788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCAGGGAGTCTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142405	137404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_-_137400_142400
900941	contig_13348_pilon	-	5838	2	Intergenic	novelGene_162673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGACCAAATATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50344	26760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_29357_47102
900942	contig_13823_pilon	-	3814	9	Intergenic	novelGene_145252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	84	junction_5	58.6844048704594	380	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	1795	2658	238491	226238	FALSE	45	CAAAAGAAGATGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSLKLPEDFAVVFGEAEGELAVGGVFLRIFIAQPAWVLRKPREFLIALLEKLTELLEKNSPHGETLETLTTAAVCLFSAQPQLADHVPPLGQLPRIIQAMNHRNSAIPKSAIRVIHALSENELCVRAMASSETIGPLMSGMKKRADTVGLACEAINRMFQREQSELVAQALKADLVPYLLKLLEGIGLENLDSPAATKAQIVKALKAMARSLQYGEQVNEILSRSSVWSAFKDQKHDLFISESQTAGYLTGPGVAGYLTAGTSSSVMSNLPPPVDHEAGDLGYRT	247159	225081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_226345_232332_232433_234344_234489_236001_236143_236458_236639_238299_238875_239040_239211_245507_245621_246031
900943	contig_7840_pilon	+	3285	10	Intergenic	novelGene_68990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	457.521368319706	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	76	1317	238014	304152	FALSE	0	GGGCTGTTCTTTCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQESITGFGDMWTCPWEGRTLPPAMAGLQKGLSGVNLLVLPLQVCSRLVTDALPLRLTAG	230870	306120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_230931_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_303412_303496_304059
900944	contig_14288_pilon	+	4769	9	Intergenic	novelGene_153834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1422	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	13	420	435236	435643	TRUE	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKLDIHRQKNETGSIPHTKHKNSEWFKDLNENPETIRFMGENIWTKLGNIIYGINRLSNININAQTTEDKLNNWDLLKIKYLCSSKDFTERVKRESTDWGKIFGNNISDKGLISKIYRKLQHLNNKKTNTPI	435223	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_435732_435924_436018_447083_448234_457306_457336_506981_507854_514296_514546_524537_525078_563235_563912_660212
900945	contig_12250_pilon	-	2565	5	Intergenic	novelGene_80634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	369	junction_2	86.020346430365	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	641	1147	378386	377252	TRUE	20	TCAGTATCTGATTGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAFASLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRGEAVPTEPLPLTSGYPVDPTW	379622	375684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_377659_378286_378758_379009_379194_379537
900946	contig_12969_pilon	-	1894	3	Intergenic	novelGene_61661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	429	1634	270258	269053	FALSE	30	GAAAAGGTAATTGCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGLHEKAVKSNLSLINHNRSYEIKNFAEFNRDEKVYLHANHEKLHTEIKFCESEKSNSTKSQLIKHQKTHKIKKPYVCSDCGKAFIRKSWFINHQIIHTGEKPHRCSLCGKAFFKKYMLTEHQKSHTGEKPFECMECGKAFLYESLLNNHQKTHTGEKPHICTKCGKGFTQKGNLNIHQRIHTGEKPYVCGECGKAFSQKSSLIEHQRFHTEINPFLCNKCGKFYSQKSSLNRHQKIHTGEKHFKCDGCEKAFEEKPELIVHQRSHTGDTPYGCSECGKTFACPSSLLSHQRIHTNEKHVESIKGEDPSTSSHSKSHTGDLMQDKKPVNTLPVQMPSVAAQTSVNTSGFLTNGNIFLVGQPVARCEPSGDNGEIVQERNLMNAANVVVPLVINYVLFYVT	300711	268792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_270402_279378_279584_300631
900947	contig_3956_pilon	+	1360	6	Intergenic	novelGene_15019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1243.06453573417	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	81	839	1281682	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283918_1289586_1289677_1289758_1289892_1290297
900948	contig_9272_pilon	+	1246	4	Intergenic	novelGene_125964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	384.569889616959	70	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	464	1231	639844	651627	FALSE	25	CACTGAAATGGTTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPSYRPVVSGDTGGNTAPGNLEAAKDTKESKKQENKKPSLLSLVTGKKDVAKGSEGESPPTIPAKEKEGALPEIKPREDGSEPVKDLMKKSEKDTSAVVSGWGKSLNPFEEMQTTEPAVEPEPKSEPKPPVFSARAPQTKAVKPRLHPVKPMNTTATKVANSTLGTATIISENLINEAMMKKHSPSDPTSAYSQLTHDELVQLVLQQKETISKKEFHVRELEEYIDNLLVRVMEETPNILCVPAQVGTKAGKM	619314	651642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_619764_639829_640284_644165_644275_651408
900949	contig_8263_pilon	+	1992	8	Intergenic	novelGene_83089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_6	195.402044983346	39	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1395	1922	190666	192899	FALSE	80	AAAAAAAGGAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLFFTYFTNLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139578	192969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_190402_190697_192402
900950	contig_12464_pilon	-	2936	12	Intergenic	novelGene_68645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	605.618610039723	158	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	336	815	222560	128044	TRUE	20	CCACCTTGATCTCTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENDDKRKRG	234949	93016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_94160_94235_94384_95478_95560_95791_95944_96673_96912_98241_98524_127966_128068_182087_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_234642
900951	contig_6902_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_135550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	128	391	176665	176928	NA	5	TTGCCTGGTCCTGCACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFGESQSQILQTNYIDYLDELALEIGAKPDVLSLLLKDPKLAMKLYFGPCNSYQYRLVGPGKWEGARSAIFTQKQRILKPLKTRSLKTSFDFPVSFLLKILGLLAVVVCFFFSTSVVLVCLHKTFGFVS	176537	178034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_176500_178000
900952	contig_3426_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_57976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTCCCCATGTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576468	577416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_576500_577400
900953	contig_14047_pilon	+	7567	2	Intergenic	novelGene_176581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAGGGAATCTTCTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29608	48813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_35613_47250
900954	contig_14450_pilon	+	5032	4	Intergenic	novelGene_49003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1337	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	4219	4770	1309576	1310127	FALSE	30	CAAAGTGACCTGTCCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLERSKTLGEEVTADVVEIVRELEIEVEPEDVTELLYSYDKTLTDEELLLMDEQRKWFFEMESNPGEDAMNTVEMTTKDLEYYINLFDKSAAGFERTGSNFERSSTAGKTLSNSITCYREIFSERKGQPMWQTSLLSYFKKLPQSPQPSATTTLISQQPSPSRQDLLPAKRLRLTEGSDDG	1111907	1310389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1112176_1244326_1245976_1263322_1263667_1307618
900955	contig_7748_pilon	+	6989	16	Intergenic	novelGene_101052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAGTTCGAGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149944	177141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_150667_150969_151191_152257_152319_153771_153894_153980_154132_154779_154899_157062_157222_157502_157842_157918_158028_161605_161748_163126_163329_163412_163650_163771_164037_164222_164450_164880_164939_173286
900956	contig_13558_pilon	+	3658	2	Intergenic	novelGene_123017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACACAGATAGCCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36906	42765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_40402_42602
900957	contig_12503_pilon	+	3523	1	Intergenic	novelGene_143838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	762	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGCTGTTGGTAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173682	177205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_173700_177200
900958	contig_312_pilon	+	1510	6	Intergenic	novelGene_128314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	270.706483114092	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	237	569	433938	440781	FALSE	30	GTACCTAACTGTGTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRALDLFSDNAPPPELLEIISEDIAKKTCEDHQLCVVAVLPHILDTGKISRNSFSIGATGRNSYLEVLLKLADKYKKKMWGWLWAEAGAQYELENALGIGGFGYPAMAAINARKMKFALLKGSFSEQGINEFLRELSFGRGSTAPVGGGAFPKISTIEPWDGKDGELPVEDDIDLSDVELDDLEKDEL	430141	441722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_430198_433659_433775_433872_433946_435041_435201_439433_439531_440712
900959	contig_6375_pilon	+	2149	8	Intergenic	novelGene_73030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465048	469900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_465168_465387_465497_465629_465734_466162_466311_466665_466801_467355_467518_467614_467751_468664
900960	contig_11855_pilon	-	1753	8	Intergenic	novelGene_67148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.569844786113	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	263	559	2717169	2713545	TRUE	35	AATAACCCTGAATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQVCKHGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTARPELRPIKKTE	2719713	2709188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2711739_2711876_2713494_2713580_2716006_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2719571
900961	contig_10904_pilon	-	1738	7	Intergenic	novelGene_22697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	108.089083630124	48	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	30	503	662714	660537	TRUE	35	GACACAATGGACACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGETLTVSPSRPLSDLGRERDPAVSLRELV	662743	611687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_612262_613149_613435_613627_613801_660333_660626_661462_661763_662408_662445_662665
900962	contig_11364_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_65181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	1559	2545	203992	204978	NA	30	CTAACGAGGTACAGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKSTSKWIKGLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTTTINAENPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKYSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKVIWRFLRKLEIDIAFDPAIPLLGIYPREIRLVTRIDICTPMFMPALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNNESVEHLITWMKLEDIMLSEISESQKHKYCMRPLL	202433	205726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_202400_205700
900963	contig_5954_pilon	+	4358	2	Intergenic	novelGene_28504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_1	0	606	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1	387	430232	432421	FALSE	70	TTGGAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSAAISSLGLTVRPIPAHIEKSYRPANRRPPIPTPEPWPGPIEAPAPPPPARPRGAVSPPSLCVSRRRRRRPPRERTAPRQRSRAPLPRPGRFAKEKPSPLRKRSRRCRSQGRHGDRSERHAAGLPK	430231	436392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408
900964	contig_13021_pilon	-	1848	10	Intergenic	novelGene_8238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	556.604409914081	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	3	1046	236216	210494	TRUE	40	ACTTACTAGATGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSHLIKLFFWGTFSLLTLLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236218	205442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206217_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024_236058_236161
900965	contig_10861_pilon	+	3102	7	Intergenic	novelGene_39272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_3	235.611025963463	374	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	813	1316	1344622	1345502	FALSE	50	GAAATAATGATTAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRFKHRNRSFSRSKSNSRSRSKSQPKKEMKAKSRSRSASHTKTRGTSKTDSKTHYKSGSRYEKESRKKEPPRSKSQSRSQSRSRSKSRSRSWTSPKSSGH	1337608	1347288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339656_1340022_1340386_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1345204
900966	scaffold_13505_pilon	+	3880	2	Intergenic	novelGene_111656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	223	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACCCAGCAGAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836951	843334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_837479_839981
900967	contig_15666_pilon	+	1121	1	Intergenic	novelGene_70136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGAGCTGATGTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106762	107883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_106800_107900
900968	contig_3397_pilon	+	2877	17	Intergenic	novelGene_154574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_11	294.663977056918	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	78	2528	124812	206594	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRHRRRHLPSLSPPPRAPVSPASTMPILLFLIDTSASMNQRSHLGTTYLDTAKGAVETFMKLRARDPASRGDRYMLVTFEEPPYAIKAGWKENHATFMNELKNLQAEGLTTLGQSLRTAFDLLNLNRLVTGIDNYGQGRNPFFLEPAIIITITDGSKLTTTSGVQDELHLPLNSPLPGSELTKEPFRWDQRLFALVLRLPGTMSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLPPRTSHPVVKFSCTDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	124734	206943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_124923_125314_125393_126209_126360_142138_142229_172322_172507_178078_178205_180374_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
900969	contig_12689_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_145047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168597	166710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_166700_168600
900970	contig_16594_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_53916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACATATTGTATCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275634	275027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_275000_275600
900971	contig_20641_pilon	-	3690	9	Intergenic	novelGene_52776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	155.882918804467	9207	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	476	871	56705	54898	TRUE	20	ACACCAGCCCCACCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTALSVLAARHNLLRTQDRGLRIVG	57180	3713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_5228_12294_12417_14233_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41612_45842_45962_54832_54966_56377
900972	contig_4342_pilon	+	6073	6	Intergenic	novelGene_178759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_4	246.303390151252	422	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	53	781	18333	52077	TRUE	50	GTTGCAAAAAATACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGGYPSPCYQPDRRIQ	18280	87286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4342_pilon_+_18528_29090_29282_37922_38059_43362_43523_52030_52121_82037
900973	SIRV6	+	1316	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	108	170	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	114	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
900974	contig_17964_pilon	-	1238	1	Intergenic	novelGene_33868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTGGCTGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135433	134195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134200_135400
900975	contig_13992_pilon	-	4064	3	Intergenic	novelGene_147617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2783	3157	149564	149190	TRUE	45	GAATTAGTAAATACACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGLNIRAKTIKLSEENIEVNLHDLRFGKGFLDITPNAQTTKEKIDQLDFIKIKNFCVSKNTIKKVKRSGVQNSNSCKKTRLNGLTETRGTPEDIDPGLSVNPELKPFLKPTLQEKIRLDYEI	188172	89691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_90331_148921_152222_188047
900976	contig_18869_pilon	-	1581	2	Intergenic	novelGene_56414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCGGGGTGTCTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76310	73624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74027_75131
900977	contig_12057_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_131635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105850	103208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_-_103200_105800
900978	contig_1472_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_86121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	993	1337	265257	265601	NA	55	AAGATATAGAGAGACGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFIFWISNCCLCIISSCEFILPFCSCSIFLSSSNFLSVFSIILSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCYVIISCVRGIQ	264264	266283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_264300_266300
900979	contig_12179_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_128009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530171	532592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_530200_532600
900980	contig_7207_pilon	+	2855	1	Intergenic	novelGene_72048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAAAAAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601804	604659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_601800_604700
900981	contig_5551_pilon	+	3103	1	Intergenic	novelGene_134280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTCAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770742	773845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_770700_773800
900982	contig_13593_pilon	-	5154	2	Intergenic	novelGene_156117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	905	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCACCACACTCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50465	45247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_49383_49446
900983	contig_10404_pilon	+	3346	3	Intergenic	novelGene_138642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	326	junction_2	23	354	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	435	761	486429	487517	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQDAIEKAVSRGQCLYKISSYTSYPMHDFYRCHTCNTTDRNAICVNCIKKCHQGHDVEFIRHDRFFCDCGAGTLSNPCTLAGEPTHDTDTLYDSAPPIESNTLQHN	485994	490102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_486527_487206_487306_487387
900984	SIRV6	+	957	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	19	552	-18	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	572	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	239	730	1733	10736	TRUE	20	TTTTATTAGCCTGCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1106	11273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
900985	contig_15327_pilon	-	1296	2	Intergenic	novelGene_70676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901604_902027
900986	contig_10377_pilon	-	5784	9	Intergenic	novelGene_115391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	12	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2609	2953	259131	258787	TRUE	25	AGCTGTAGTTTAGGATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEENHSVGFTQLNILNSFSLSYSVKTVYFTQPYASLSLLIAVDSNAPQPHVCRGELGSVGFFNVNNRIFELRPSEQRKSNPCGFVQRSQELGMGRGGAGGKINGARCRLRGR	261739	209127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_209213_219551_219613_227485_227750_240232_240353_245158_245257_251691_251748_252535_252616_255019_255167_256866
900987	contig_4232_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_63307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCTTCTCCCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466780	467896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466800_467900
900988	contig_3584_pilon	+	3559	8	Intergenic	novelGene_108146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	100.848441550999	89	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1698	2354	353361	366078	FALSE	30	TGAAGGACAAGTTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPSDFSGSSVGTYQPFPNIHPPQIPATPPSYESVDDINADKNVSSAQIVGPGSKPEASAKPPSRPADNYDNFVLPELPSVPDTLPTASAGAKTSASEDIDFDDLSRRFEELKKKT	341051	367283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351654_352275_352364_352717_353469_354411_354619_355225_355319_356498_356548_365878
900989	contig_11396_pilon	+	2814	21	Intergenic	novelGene_71252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	22	516	121382	124511	TRUE	40	CAAAGGCCGGGAAGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQNRTSPSQALPAEPQEPPRGGCPLGAVWPLEGVLDAGGHQHEHLPDLLLPVGDVLGYGAPQLPMPWLCILTAFPHLFLLLLCAVLQLKLVEERPGIPQVRVDLHGAVEPLPGLGDLPFTPEQLGHGQEHVRVMLTLLQSVHTLGLPLGSGLEENCFRPEDA	121360	155242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_121630_122168_122296_124391_124514_125490_125576_126105_126146_127316_127443_127612_127735_128715_128855_130391_130515_133875_133998_137865_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144295_146253_146407_146608_146792_147260_147333_147885_148006_153256_153426_155157
900990	contig_3095_pilon	+	1301	5	Intergenic	novelGene_75174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1676.52631950709	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	35	739	220513	226800	TRUE	35	CCATAATGCAGTCTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220478	227540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220570_225499_225711_226126_226409_226645_226824_227001
900991	contig_5686_pilon	+	4912	2	Intergenic	novelGene_45323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTACAGCCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104094	114478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_104380_109851
900992	contig_8864_pilon	+	2261	8	Intergenic	novelGene_135971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_3	113.051730979897	356	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	106	1044	77479	88006	FALSE	55	GAAGTGAAAAAGAGATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YILGLFLFRIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSLILEQILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDANPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVVYLLRGRKTFLIPVLFNNYITAVLKLLEKLYKVNLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARSSIIQDAVTLCSYPFVFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTVS	77373	89223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_77512_77939_78130_79969_80134_80265_80380_83276_83301_83428_83519_84689_84861_87853
900993	contig_2703_pilon	+	3354	3	Intergenic	novelGene_101668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGCTTCACCTCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164081	170161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_167302_168026_168085_170085
900994	contig_8059_pilon	+	3341	17	Intergenic	novelGene_111088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_15	61.3835279207704	586	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	430	1341	266127	340344	TRUE	85	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKPSCIPNGKENFSGSTALWQNI	90280	343567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_340277_340374_341596
900995	contig_4103_pilon	-	5460	10	Intergenic	novelGene_51996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_9	220.428594860328	63	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	337	1737	240104	222223	TRUE	70	AATAGAGAAAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQNLLPPFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKDTVSLHQQCAHKEVCPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFTDNDVVDESPPLAKQIDFVPVQPLPSPQCNFSSDIGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHGQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVC	240611	215521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_216014_216555_216652_218862_219026_219250_222378_222871_222984_223150_223297_229274_230028_238934_239038_239972_240117_240287
900996	contig_8020_pilon	-	2616	8	Intergenic	novelGene_114390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	62.8941449531493	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1042	1467	149892	148058	FALSE	30	ATCCACTCAAGTTTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	151710	146908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149962_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127
900997	contig_10904_pilon	+	2105	2	Intergenic	novelGene_22790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGGCTGAATAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763193	765388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_765028_765117
900998	contig_8729_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_40135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	582	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	255	557	647147	646845	NA	60	GGAAAAAAAAAAGGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTKSNTARWCPATTTDCSDWDHNTGFWTELEKDVKQNFNSQKKTRFTGLTETGENSKSMAPRHPFSSVVKSLLRFIVQPGIGQPHKTRWDS	647401	645632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_645600_647400
900999	contig_12721_pilon	-	1315	2	Intergenic	novelGene_175072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	36	junction_1	0	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTGTCTAGTTAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742463	738672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12721_pilon_-_739746_742221
901000	contig_3386_pilon	-	5010	2	Intergenic	novelGene_34529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_1	0	206	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	2296	2829	407739	406345	FALSE	30	TAAATTGTTGTTTAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIVEEVLHLVAESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTSKFFLLIQFTAG	410034	404163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_406842_407702
901001	contig_11574_pilon	+	4256	31	Intergenic	novelGene_64105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	108.290088804716	366	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2769	66	2834	561358	622516	TRUE	25	ATGTTTGTTTTTTTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNGTTPDPERAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQMDGLIRETKATDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKTEPEKPEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAFEQLDIKAGNSDSEEEDVNERVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSFVDSEEEKEEEQSDEDFANHSDCDQNQHTARMSEEEEEDDGCDLFADSEKEEEDIEDVEQSTRPKRSRPTSFADELAARIKADTPGRIAESQTALSSGDAKPRKTLKEKERRAPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSRGGLFSGGKGLFDDEEDESDLFKEAPKDWEAPACVHEEPSSSKPGKKIPAGAVSVFLRDADVFGATSALSLKEPPKAEQPTPGKSPHLPAPTGLFDDDDEDDDFFAASHNEPSQTQTDKNKAKSTADIFDDEGGDLFKEKAAALPEAAVNHTNGNKARAEKKVTLPSSKHLKLVSETKTQKSLFSDEEDSEDLFSSQNASKSKGASLLPSKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGAKVAKKQTSSLLTPSQEKTKLTEPSKKKASALLFSSDDEDQWSITDSQTTSAFDSRSKGELRDSGTAPDPEAKNTVKKTSLFEEDDEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDADSGGFLLASPSTSVPPAAKKKETVAQEPPLLFSDEEEREAPLGAKPVVENGGSAMGSSDVGRADAVEESGKEGPLAASAQAAVKHSDLFSSSPPSEKGAKGRTQTVLSLFDEEGDKTKDQSNVRAPRKEVGKNPDSDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFSGTKKTGLLVPSVGSLFEDDEDDDLFSSAKSQPLIPEKKRVVKKRPPCLLCQEPETS	561292	630056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_561361_561453_561577_562397_562563_571391_571455_573476_573651_578178_578273_579881_579944_581148_581197_581474_581586_582130_582219_584172_584242_585288_585408_586814_586873_588396_588457_588833_589014_590766_590901_592591_592679_597647_597750_599243_599376_601306_601480_606615_606719_614601_614758_617412_617596_621505_621635_621759_621841_622444_622569_623807_623871_624221_624396_626077_626687_627460_627639_629710
901002	scaffold_12124_pilon	-	3807	2	Intergenic	novelGene_22162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3325	3630	982587	982282	FALSE	70	CTCCAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	987311	982104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_983902_985301
901003	contig_3285_pilon	-	4798	2	Intergenic	novelGene_153379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_1	0	456	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	69	584	73399	63562	FALSE	35	TGAAATTGACTCGACCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAALSGRGEAVVSVPGFVNPVMDPEGRVARRRSSLLPWLLLLWSRLALGTLSFGSSPHGVLHDLLSEQQLLEVEDLSLSLLQGGGLGPQSLPPDLPNLDPECRELLLDFANSSAELTGCIVRSARPVRLCQTCYPLFQQVANKMDNISRAVGNTSESHSCARSLLMTDRMQIVVILSEFFNSTWKEANCASK	73467	59347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_63685_73006
901004	contig_4486_pilon	-	4669	1	Intergenic	novelGene_38653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCATTTCTATATTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037931	1033262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_1033300_1037900
901005	contig_9883_pilon	+	2644	4	Intergenic	novelGene_87580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	106	junction_3	79.5361553005927	139	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATGAAAGTTCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65832	82438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_66004_67998_68098_71274_71493_80282
901006	contig_20165_pilon	-	3512	19	Intergenic	novelGene_54468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	192.592297898635	21	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	495	2405	102709	48430	TRUE	20	GGACCATGCAGCCTCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDVGSSVRSGPVTALGGLDSGPGSSSQEKAKAGECQPLESQLTDLRIPQELPICGDHAVMSPGIQAAAGNGDSLLDTGPTGEQSGNGKVPNRDSGIDSPSCSVAGESFPGEESSEAVQGPAMLGLHPGTDTQEAPQDTASDVDKGSSEAGQGPAMLGLHPETDSQDASQDTASDVDEGSSEGPDPGTILQTGGVEAGMAKSPKPQQLFNIAQELLHTEEAYVKRLHLLDQIFCTRLSEAGIPVEVTTGIFSNISSIYRFHRQFLLPELQARIVDEWDVNPRLGDILQKLAPFLKMYGEYVKNFDRAMELVGVWTQRSVLFKDIVHDIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRIPRYELLLKDYLKRLPADAPDQRDAEKSLELISTAANHSNAAIRKMEKMHKLLEVYERLGGEEDIVNPANELIKEGHIQKLSAKNGTTQDRYLFLFNSMVLYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDIVKPNAAHTFVITGRKRSLELQTRTEEEKNEWIQVIRTTIEKHKQNSETFKAFSGPLGWNEDSTPPLQTHLWWVPAPWSPLWRPMAAEVLEGSTAESLPLKRGVRRRGRAARAAGRPSTPSPRGGTAASSAAQSSVGSAPSSRLRTAGRAGSARSVS	128203	40728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_41403_42036_42411_48370_48506_49897_50021_58020_58084_70009_70120_70987_71019_72217_72298_75017_75111_75354_75502_77719_77779_78298_78438_89208_89366_92258_92396_92999_93090_102103_102759_103965_104149_118295_118455_128100
901007	contig_6113_pilon	-	2723	1	Intergenic	novelGene_178762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGATGAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6612	3889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6113_pilon_-_3900_6600
901008	contig_1867_pilon	-	2669	10	Intergenic	novelGene_54607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	194.55044729635	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	699	1595	547888	517583	FALSE	45	TTTGCAGATTATACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVDAGEVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	551130	516508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550885
901009	contig_3095_pilon	+	2145	5	Intergenic	novelGene_75183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1823.67655780843	400	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	28	666	220513	226800	TRUE	25	TGTGACTTCCCAGGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220485	245832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226255_226409_226645_226824_244376
901010	contig_6361_pilon	-	3836	17	Intergenic	novelGene_23880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	296.562170705824	2	116	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	6	1529	109578	85504	TRUE	20	CCCAGCAGTATTCGTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTSASLEIFELDLSDPSLDMKSCATFSSSHRYHKLIWGPHKMDSKGNVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDKHTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQPPEDISCIAWNRQVQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHNNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLPVIQMWDLRFATSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYELPTSTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLEKILCKIPKQNYQADHCSGDEELERDC	109583	73854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_75585_79194_79369_81578_81753_84156_84303_85420_85548_86862_86902_92924_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_103071_103215_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529
901011	contig_16228_pilon	+	2479	9	Intergenic	novelGene_147937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	256.570135391865	267	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	327	1223	59945	72224	TRUE	10	TCCCACTTGTGGTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKKVSVGNIWKKRRPSLLSTVRSRSQARP	47763	75087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71849_72142_72611_74146_74893_74963
901012	contig_4301_pilon	+	4083	4	Intergenic	novelGene_65108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	993	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGCTAGTAATTTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538010	546344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_539511_542201_542415_543698_545969_546244
901013	contig_5845_pilon	+	1928	8	Intergenic	novelGene_98892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	138.357419425935	297	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	103	849	135600	159569	TRUE	10	GGCTGTGTTCTTCTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGHLLGRPVGKSPELAAPAGLSGDRDCGGGPAGVMFRGLSSWFGLEQPAADGAPSEGDRQPEGNAPPKQRSEVVAESSEDEPQQTGDQELLLDQAKGLGNYLFNFATEATKKITESAAKTAQTIKKSVEEGKIDDLIDKTIIGDFQKEQKKFVQEQHTKKSEAAVPPWVDSNDEETIQQQILALSADKRNFLRDPPAGVQFSFDFDQLYPVALVMLQEDELLSRMRFALVPKLVKEEVFWRNYFYRVSLIKQSAQLTALAAQQQAAGKGGSNGREGDLPLTG	135497	162145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_135796_145353_145473_146405_146473_149064_149139_151638_151779_157490_157637_159564_159713_161209
901014	contig_12479_pilon	-	2490	1	Intergenic	novelGene_56889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1449	1769	579573	579253	NA	30	CAGCTGACTGGAAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGDWNVKVGNEEGLVVGKYGLGNRNDAGDHMIEFCKTNDFFIANTFFHQHKWQLYPGPHQIEYTGIKLTTSVKRDDGQAQHHQSEQSQGPTVEQTISCLYAGSS	581021	578531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_578500_581000
901015	scaffold_13505_pilon	-	1762	8	Intergenic	novelGene_111515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_5	444.526668697924	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1216	1533	594063	588797	FALSE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEQLLKPDTNIYCQLHPKAEVAPQLPPGTAPYGLRRGATSDPKSWGKGRS	602343	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_601873
901016	contig_15420_pilon	-	4453	16	Intergenic	novelGene_175290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	257.049065787492	59	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	948	2465	155560	135542	TRUE	35	AATAATATTCTGCCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLTNIGTSVQNVRREMDSDVETMQQTIEDLEVASDPLYIPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQFYFTQGGNLMTQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEEIAARVNQSALEAITPSPSFQQRHESLRPAGQSRPLAARTSSSGSLGSESTSLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQAKASGQGGRRTNPFGESGGGTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDSPDVVYETMRQILAARAIHNIFRMTESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPSVVLYATHQENKRLFGFVLRTSGGRSESNLSSICYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELSKQKQIEKDLEEQSRLIAASSRPNQAGNEGQFVVLSSSQSEESDLGEEGKKRESEA	156507	126873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_127775_134454_135689_140935_141026_141287_141339_141833_141981_142800_142838_142941_143117_143708_143762_145600_145784_146231_146324_148698_148756_150086_150130_152127_152317_152965_153125_154514_154598_155548
901017	contig_7378_pilon	-	2071	9	Intergenic	novelGene_120298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	20.7409618870485	224	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	13	840	740005	648505	FALSE	60	AATGAAAAAATTGAACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSKMKVSEENFFNVPAFLTVSGQLHLEVMSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMVEAEISFVESLQDLMQVMEGLFKTTLMMVLSNCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLIMSYTEAVEILKKASQNFTFTPEWGADLHTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLVLKPFYMRDNEDSPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGSLREERYHFLEQQLARLGLTEAYQWYLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFTHSCLL	740017	647273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_648650_652564_652592_654936_655035_670656_670795_672133_672201_695658_695697_695807_695907_700436_700570_739922
901018	contig_10414_pilon	+	3272	2	Intergenic	novelGene_146933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1886	2218	2136	2468	FALSE	20	ACCATTCCCAGCTTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSPSGRSKDGARSQALERKEGEVARGKQEIRRSREKKKATPAANKWHSESQPVQAGVSGQETVSVGSRGGRVWVMKGREWESIYHKLPALCSPSGRSKDGARSQALE	0	3522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_1658_1907
901019	contig_8724_pilon	+	3027	10	Intergenic	novelGene_169234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_5	15.8954920234218	348	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	80	1171	3519	42857	FALSE	45	GGCAAATATTAAATATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIFELWGHGKSPEELYSSLKNYPVEKMVPYLHSDSTYKVKIHTFNKTLTQEEKVRRIDALEFLPFEGKVNLKKPQHIFSILEDYGLDPNCIPESPHNIYFGRWIADGQRELIESYSVKKRHFIGNTSMDAGLSFIMANHGKVKENDIVFDPFVGTGGLLIASAHFGAYVYGTDIDYNTIHGLGKASRKNQKWRGPDENIRANLRQYGLEKYYLDVLVSDASKPSWRKGTYFDAIITDPPYGIRESTRRTGSQKEIPKGIEKCPESHVPVSLSYHLSDMFFDLLNFAAETLVLGGRLVYWLPVYTPEYTEEMVPWHPCLQLISNCEQKLSSHTSRRLITMEKVKKFENRDQYSHLLSDQILPYQGHNSFREKYFSGITKRVAKEEKTSQE	3439	44713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8724_pilon_+_3522_3608_3702_3933_4069_4787_4945_11159_11241_14918_15084_15779_15853_15966_16099_22387_22509_42725
901020	contig_12277_pilon	+	3076	3	Intergenic	novelGene_139719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	147.5	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	209	637	416333	421208	FALSE	30	AGGAGCATCAGCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPTPNGHCANGEAGRSKDFLSRQLSAVSCSSTHLHSRNLHHKWLHSYSGRPSVTSSPDQPSRSHLDDDGMPVYTDSIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLNSSLRFNGDFGDEVMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPASSSIDLELDKPIAATSN	416124	423647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_416501_418297_418387_421036
901021	contig_12624_pilon	+	2641	10	Intergenic	novelGene_60946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	347.957851853736	24	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1218	1916	39740	55160	FALSE	55	TTAACATTAAAAACAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6018	55885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
901022	contig_17144_pilon	+	2269	16	Intergenic	novelGene_29171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	163	480	167621	168283	TRUE	25	GGAGCCAGGGAGGGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	163895	183381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_163951_167262_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173754_174576_174760_174875_175003_175975_176276_179710_179736_183163
901023	contig_3627_pilon	-	610	2	Intergenic	novelGene_78412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	155	364	34162	21547	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVSALRIGGRPVGLPPVHPARPLLCSLVGGSADLLATLESGHCVGDDSRLMAASAAALAVRLSRSVANRGSYGAFCKRLTRTLLAFFDLAWRLRMNFPYFYLVASVILNVRLQPISFEI	34316	21300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_21568_33973
901024	contig_1225_pilon	+	5606	12	Intergenic	novelGene_44105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	740	109	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	523	879	23178	23534	TRUE	30	GTTGACAGAAAATTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRLFRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRDVTQIDICTPMFIAALFTTAKRWKQPRYSSTDECINKLWYIHTMEYYAMIKNNDESVKHLTTWMKLEDIIVSEISQSQKDKYCMRPLV	22655	338584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_23574_23982_24464_42762_43006_62117_62489_62614_62862_112399_112991_141704_141919_154133_154245_198129_198516_284450_284455_335459_335584_336668
901025	contig_7979_pilon	+	5177	20	Intergenic	novelGene_125536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAATCTACTATGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048090	1113579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1048889_1050534_1050648_1061525_1061614_1065029_1065230_1077635_1077742_1078315_1078484_1080366_1080441_1080766_1080892_1089705_1089845_1090384_1090543_1095870_1096035_1097021_1097132_1102864_1103012_1103398_1103539_1103981_1104222_1104716_1104977_1107317_1107536_1108699_1108789_1111104_1111242_1111876
901026	contig_9098_pilon	+	2359	6	Intergenic	novelGene_75775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTCCACTTCTGATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262871	288240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_264496_265551_265644_266728_266813_267336_267515_282568_282708_287998
901027	contig_16999_pilon	+	3402	3	Intergenic	novelGene_84974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACAATCCAGACACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60089	243536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_62409_242230_242507_242729
901029	contig_2733_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_128536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAGGTCTTTGTGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476955	475192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_475200_477000
901031	contig_6958_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_69968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAATCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276304	278987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_276300_279000
901032	contig_4364_pilon	+	1177	2	Intergenic	novelGene_639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	0	15	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	799	1176	1531622	1531999	FALSE	20	CCATTGGCAACGAGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVI	1530453	1532000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888
901033	contig_18162_pilon	-	2701	3	Intergenic	novelGene_122323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGGAGTTGTTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16567	8110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
901034	contig_6084_pilon	-	3114	9	Intergenic	novelGene_127056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	72.7611675277411	951	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTTTACAGAGGGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445417	429777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430710_431272_431397_433059_433099_433811_433891_435337_436474_436607_436733_437315_437459_438023_438240_445097
901036	contig_10460_pilon	+	5680	8	Intergenic	novelGene_157469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	418.917604289523	469	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	336	773	77203	80536	TRUE	5	CGGGCGCCGCCATCTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKTSKAEELLAEEKTKPIPVMPASPQKGHAVNLLDVPVPVARKLSAREQRDCEVIERLIKSYFLIVRKNIQDSVPKAVMHFLVNHVKDTLQSELVGQLYKSSLLDDLLTESEDMAQRRKEAADMLKALQGASQIIAEIRETHLW	76867	97726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_77314_77485_77596_79267_79428_80479_84179_86272_86443_86750_86907_95894_96063_96955
901037	contig_10324_pilon	+	2217	7	Intergenic	novelGene_7882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	209.013091030735	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	228	719	564200	568878	TRUE	30	ACTATTTATTTTTTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIFSANRLTGSDVNLVAGNLLSPEDIVLFHNLTQPRGVNWCEKTSLHNGGCQYLCLPAPRINPHSPKFTCACPDGMLLAKDMRSCLTEAEPAATTEGSSTARSTVRQTVSSVATEPKHTASPPAPSTSRQPTASPEFTTAEMATMSHQALGNIAGRGTEEKPGRVGALSIVLPIVLLVLLCFGAFLLWKNWRLKSINSINFDNPVYQKTTEDEVHICRSQDGYTYPARQMVSLEDDVA	563849	570447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_563961_564083_564237_565188_565372_567235_567314_567956_568115_568842_569141_569211
901038	contig_13542_pilon	+	2010	8	Intergenic	novelGene_131572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	170.996956650326	19	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1137	1517	723630	727397	FALSE	30	GAGCATGGGCTGGGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEMLEDMTTGTESETKAFMAVCIETAKRYNLDDYRTPVFIFERLCSIIYPEENEVTEFFVTLEKDPQQEDFLQGRMPGNPYSSNEPGIGPLMRDIKNKICQDCDLVALLEDDSGMEVTSIGQCC	720064	727890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_720594_720717_720851_721833_721944_722576_722719_723109_723192_723489_723664_725724_725847_727172
901039	contig_12074_pilon	+	1202	4	Intergenic	novelGene_53776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.440677103022	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	61	1146	46021	52741	FALSE	20	TTGTGATTATTGAACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTAAVLLWPLCKLRFYRPSAMAEAMDLGKDPNGPTHSSTLFVREDGSSISFYVRPSPAKRRLSTLILHGGGTLCRVQEPGAVLLAQPGEALAEAAGDFISTQYVLDCVERNERLELEDYRLGSAADQASETKPGAQAEGAAAAVEPDPEPLTGRIAFTEADDVAILTYVKENARSPSSVTGDAPVSPSSQKLKRKAEEDPEAADSGEPQNKRTPDLPEEEPEEEKIKENEEPVKKMLIEATREFEEVVGEENESPGFEIHITMCDDDPPTPEEDSETQPDEEEEEEKVSQPEVGAAIKIIRQLMEKFNLDLSTVTQAFLKNSGELEATSSFLESGQRADGYPIWSRQDDLDLQKDDEGARNALVKKFGAQNVARRIEFRKK	45960	52797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_46504_46617_46694_50487_50613_52339
901040	contig_5602_pilon	-	3189	2	Intergenic	novelGene_132990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAGGACTATTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26809	23434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_25068_25253
901041	contig_15498_pilon	+	1522	3	Intergenic	novelGene_42685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1029	1340	785456	786253	TRUE	60	CTGAACAAAAAATTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLPLPGNFTSFLTVAAGFFEELPLGFLMTNGVGLAFLAGVLALGGAFLGRSLAFPLWAAGTLTVGLDPLCFMDAVFPGDLAGVFFCNLSLRRRLFILRVFL	784427	795671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_785725_786210_786324_795559
901042	contig_18544_pilon	-	3512	3	Intergenic	novelGene_152730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_1	74.5	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	611	931	40293	38474	TRUE	30	ACCTTGTTTTTCCAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	40903	35698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38279_38472_38686_40184
901043	contig_11337_pilon	+	3321	2	Intergenic	novelGene_107175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCATTCTCTCAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116229	120006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_118700_119155
901044	scaffold_15027_pilon	+	2379	16	Intergenic	novelGene_163564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	156.792630212293	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1407	971	2377	82697	106778	FALSE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLYLEQSDFHEKFAGGDICVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHINKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSS	48905	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_66198_66324_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_104978_105638_105828_106597
901045	contig_6740_pilon	-	4488	6	Intergenic	novelGene_142661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTTAAAAAAAGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605511	364785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_365366_386537_386967_394559_394727_446607_446855_446975_447406_602876
901046	contig_34_pilon	-	2516	4	Intergenic	novelGene_39998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1426	junction_1	208.207161793782	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1731	2246	212564	212049	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	225643	211778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_213048_214057_214152_215288_215458_224659
901047	contig_6093_pilon	-	1491	2	Intergenic	novelGene_178763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGTAAGGAATAAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746106	683518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6093_pilon_-_684484_745580
901048	contig_7869_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_149996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1634	1936	94073	94375	NA	35	AAAATCACTGTGCACACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLLLMSILVVLLPRQILFILLAINGIFKILCQHHNSKASILLQSSGFIVQLSHAYEATENTIAWVRGSLVPEVTSSLFNTVKRAFAANLPRAMCLLIS	92439	94659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_92400_94700
901049	contig_5686_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_45344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAAAAAAAAACCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121321	119060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_119100_121300
901050	contig_13300_pilon	-	1968	2	Intergenic	novelGene_125765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTGGAATATGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46927	44874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45648_45732
901051	contig_10904_pilon	+	1874	2	Intergenic	novelGene_22601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	441	1432	1872	475592	658676	FALSE	35	GCCTGTAAACATATATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGIAFIVKKNISRFILKYSTVNDRIISIHLQGRLVNMTVIQIYTPTTYAKDEEIEDLYQLLQSEIDQICKQDALIITGDRNVKVGNQEEGLVVGKYGLGDRKDDRDCMIEFCKTNDFFIANTCFQQHKWQPYTWT	474160	658678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_475813_658456
901052	contig_2798_pilon	-	3038	1	Intergenic	novelGene_120056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCCCAGCACTTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183028	179990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_180000_183000
901053	contig_12464_pilon	-	2877	2	Intergenic	novelGene_68630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGAGGTCAGCAAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54472	45235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_45459_51818
901054	contig_3975_pilon	-	1803	2	Intergenic	novelGene_54753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	43	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAATAAAATAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1965138	1907087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1907458_1963705
901055	contig_8377_pilon	+	2512	6	Intergenic	novelGene_35146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3519.75999181762	4	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	703	1206	194431	197939	FALSE	15	GTGGATTCTGCTTCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	190895	199245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_191254_192216_192352_193993_194117_194344_194523_196081_196218_197663
901056	contig_3018_pilon	+	1980	16	Intergenic	novelGene_78870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAAATGGCGGCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562939	625105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_563044_566733_566846_567964_568081_569956_570088_570203_570434_572320_572360_576712_576887_577774_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_586973_587036_600008_600189_603361_603433_624764_624913_624977
901057	contig_7151_pilon	-	2288	13	Intergenic	novelGene_40663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	153.258201701863	7	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1470	41	1510	40830	5953	TRUE	25	ACCCAATGTTTTTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESQTQLLPLCNNSMFDLSDSAASEDSALNCSENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQGEWRFGTTAPGAQCVTTPGAWQRPRWCVSSWTVALPWKPCRRLHLAQEMGASGWTRCGAEAGSLPCGPVLRSPGGRTTVSTRRMLE	40870	1819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6214_13556_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_40775
901058	contig_15498_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_42684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGAGATTAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	786668	784422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_784400_786700
901059	contig_12102_pilon	-	4766	3	Intergenic	novelGene_151055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTATTTTTTCCCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47840	40137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_41260_42653_43442_44984
901060	contig_5023_pilon	+	3132	15	Intergenic	novelGene_7276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2265.78037644554	6	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	73	1329	607279	631419	TRUE	25	AAATATTGCTGTATTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYS	580856	648288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_631415_631550_639072_639190_643413_643539_646857
901061	contig_3233_pilon	-	5774	6	Intergenic	novelGene_56494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	80.1039324877375	660	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	141	620	140644	35438	FALSE	25	AGTTGTTAAGGCAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASPPAPGAGLAFPAPFSPRTAAPLPHSGAAGRAGGWSACCLPARKMVTSAGELALFALGVLLAVCQALENTTSSLSDPPVAAAVVSHFNDCPDSHSQFCFHGTCRFLVQEDKPACVCHSGYVGARCEHADLLAVVAASQKKQAITALVVVSIVALGILIITCVLIHCCQVRKHCEWCRALICWHEKPSALLKGRTACCHSETAV	140784	30283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_35446_37680_37791_38996_39147_45319_45438_104318_104373_140604
901062	contig_14441_pilon	+	793	5	Intergenic	novelGene_100474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	82	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	205	753	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVLYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	85673	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85683_121192_121239_125517_125902_126159_126283_126514
901063	contig_6654_pilon	+	2373	16	Intergenic	novelGene_85756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	136.951800117981	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2298	76	2373	600138	658901	FALSE	30	GGTTATGCCTATGAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRRAEKSCEQACESLKRQDYEMALKHCTEALLSLGQYSMADFTGPCPLETERIKIESLLYRIASFLQLKNYGQADEDCRHVLGEGLAKGDGAFRAVLCCMQLKGKLQLVSSILAKSLTGESLNGMVTKDLTRLKTLLTETETATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEATIEEKTKEYIFLRISRECCEELNLRPDCDTQVELQFQLNRLPLCEMHYALDRIKDNGVLFPDITMNPTIPWSPNRQWDEQLDPRLNAKQKEAVLAITTPLSIQLPPVLIIGPYGTGKTFTLAQAVKHILQQQETRILICTHSNSAADLYIKDYLHPYVEAGNPQARPLRYFLRLIMYLYHTLLFLRKGVCKDFSNFGNTKFLNFTMTFE	573082	658901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_578530_578577_600130_600348_602764_602802_616762_616888_618597_618655_623021_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951_650286_652729_652861_657968_658149_658678
901064	contig_17796_pilon	+	2885	1	Intergenic	novelGene_33837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTTATATCAGCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108985	111870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_109000_111900
901065	contig_34_pilon	-	1682	8	Intergenic	novelGene_40017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	62	1447	247052	212049	FALSE	35	GGCCACCCAAATGATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247113	211813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
901066	contig_1150_pilon	-	569	3	Intergenic	novelGene_61444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36526	40	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAAGTTTTAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309985	308948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309280_309319_309385_309812
901067	contig_20602_pilon	-	1765	12	Intergenic	novelGene_133712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	369.268273550869	5	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	12	644	29552	19774	TRUE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLAVRLMTLRAVLPVVVF	29563	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_16076_16282_17104_17275_19179_19325_19759_19825_23485_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
901068	contig_6102_pilon	-	4624	14	Intergenic	novelGene_32075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	126.626880495041	110	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	134	2764	789183	784393	TRUE	30	TTCAAAAGACTCTGCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSEEGLGRRRSSRITEETSGMEEEEEEEAIAAGRGRRGRRDGEVDVPASSIPELERQIEKLSKRQLFFRKKLLHSSQMLRAVSLGQDRYRRRYWVLPYLAGIFVEGTEGNLVPEDVKQETDSLKAAAHPAYNTALFVKKELADSSTSAGSPARARGRPRKTKPGSVRPRHLKSPVKSEDSEQSHAQPQPEAQLHPQFHPQPQAQSQLQSHPQSHSEFLEPEGSPLSLSQSQHDLSQSAFLSWLSQTQSCGSLLSSSVLTPDSSPGKLDPAPSQPLEEPEPDEAESSPDLQAPWLNFSAQMPCNAAPTPPPAVSEDQSTPSPQLPASSKPLIRPSAADSCSPVQLCSTPLPVVTPKRRAGDPGETPQSPTGLGQPKRRGRPPSKFFKQMEQRYLTQLTAQPVPPEMHSGWWWIRDPETLDATLKALHPRGIREKALHKHLSKHRNFLQEVCLRPPTDSIFEPSQLPTFQEGLTSWSLKEKTYETDLAVLQWVEELEQRVILSDLQIRGWTCPSPDSTREDLAYCEHLPDSQEDITWRGRGREGLAPQRKTTNPLDLAVMRLAALEQNVERRYLREPLWSPHEVVLEKALLSTPNGAPQCTTTEISYEITPRIRAWRQTLERCRSAAQVCLCLGQLERSIAWEKSVNKVTCLVCRKGDNDEFLLLCDGCDRGCHIYCHRPKMEAVPEGDWFCAVCLAQQVEGEFTQQPGFPKRGQKRKSGYVLNFPDGDGRQRRLLSRGRENLVVPQCSEEGLSPSKRRRLSMRNHHSDLTFCEIILMEMESHDAAWPFLEPVNPRLVSGYRRIIKNPMDFSTMRERLLRGGYTSSEEFAADALLVFDNCQTFNEDDSEVGKAGHIMRRFFESRWEEFYQGKQANL	789316	781751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_782030_782810_784559_784646_784791_784899_785127_785506_785654_785774_785908_786012_786303_786493_786646_786755_786912_787035_787259_787417_788071_788581_788727_788883_788944_789048
901069	contig_6445_pilon	+	3403	1	Intergenic	novelGene_76984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACAATCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406251	409654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_406300_409700
901070	contig_10225_pilon	-	3233	1	Intergenic	novelGene_86841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGCCTTGGGAATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27960	24727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_24700_28000
901071	contig_17976_pilon	+	2210	5	Intergenic	novelGene_32499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	953.143844076014	2554	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	187	1251	41843	47385	TRUE	55	GATTAAATAATAATTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEETHAHTSTKSSRHTCAEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41656	48865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_45713_45762_46443_47819_48339
901072	contig_14682_pilon	+	4667	4	Intergenic	novelGene_139099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88404	112563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_90001_90043_90215_101862_102632_110432
901073	contig_16544_pilon	+	2239	3	Intergenic	novelGene_178764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19080	76334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16544_pilon_+_20177_75072_76014_76132
901074	contig_7840_pilon	+	3331	10	Intergenic	novelGene_68976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_2	428.51322062092	391	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	222	2003	238014	304775	FALSE	30	GAAGATTTGCTCACGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	183030	306103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_304059
901075	contig_546_pilon	+	5855	1	Intergenic	novelGene_117201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	497	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1967	2371	101611	102015	NA	10	TTGTATGATTTCTTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYSIPCQKVDGSNPPRGTSEDRPGDPLPKGHGLKNPPLHIWGHHELELTWQLTTTSRHHEILPVQLDLHLKNLEFERTLDIINANTGILGGAILSITGNFTVWPHPLNPTCPTPITTPCLQLKITPHISVAT	99644	105499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_99600_105500
901076	contig_610_pilon	-	6198	2	Intergenic	novelGene_76769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	5351	6103	229060	227725	FALSE	55	AGAACAAAGAAAACTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAR	234410	227629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_227730_228312
901077	contig_753_pilon	-	3770	16	Intergenic	novelGene_113019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_12	1167.08454230569	12	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	1058	2197	1413335	1372748	FALSE	25	AAATATGCTTTCTTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMGMMSLRMFPQHLPRGNLRMQQEYHAFPLKKKKKSENQVAEHLMPLY	1502379	1371174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1373006_1375808_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413398_1415056_1415165_1416768_1416901_1427093_1427334_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
901078	contig_1863_pilon	-	4771	1	Intergenic	novelGene_156531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	424	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTATTCCTGGATCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70598	65827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_65800_70600
901079	contig_15775_pilon	+	4598	3	Intergenic	novelGene_148369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_2	11	84	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1927	2226	2644	2943	TRUE	35	CTAATCCCAAGAACCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPPPIVVSRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEGERTWLRLGWGWGSRKCVGPMAGAVIEDHLAPRLQRLAPGGPRAWGEAWSL	717	6255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_4641_4989_5140_5730
901080	contig_11309_pilon	-	1355	6	Intergenic	novelGene_149866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2779.67756403508	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	250	927	62950	56293	FALSE	25	TGTTAACACCTGGCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65785	55864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_63138_65723
901081	contig_2830_pilon	+	3223	3	Intergenic	novelGene_165845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	2290	3015	186960	187685	FALSE	40	ACCTCGCAAAGGCTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPVPHPRSRPDPEGAAHPNTAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPSANKRPPESRPPGRTGSNHLAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRSGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPVCWSLIGVQDGGSALR	125966	187893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_126499_126802_127798_186197
901082	contig_11855_pilon	+	2403	5	Intergenic	novelGene_67111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_4	141.729275380918	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	761	1510	2445507	2446256	FALSE	35	GGTGAAGGAGGAAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440128	2447149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2445497
901083	contig_9481_pilon	+	601	3	Intergenic	novelGene_149668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGGCTGGGGTGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370881	374895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_371085_372983_373143_374656
901084	contig_3900_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_84165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAGAATTATGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52294	53036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_52300_53000
901086	contig_3721_pilon	+	4117	1	Intergenic	novelGene_123828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	379	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3633	4019	265674	266060	NA	35	CTGTATACCAGCAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIMEGEEEKRTERIFKEIMACDKIQHPFMTKTFNRLGIEGKFLSRIKDIHEKPIAVIILIGEELRASSLRSGTRRGCLFLSLLFNIVLEVLARAVRQGKEIKGIQIGKEEVKLSGIRRWNNHGLIYI	262041	266158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_262000_266200
901087	contig_10958_pilon	+	1709	12	Intergenic	novelGene_5365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	191.637657404637	2	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	507	1634	807610	811107	FALSE	30	AACTTATCAAGCCTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	803712	811182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804897_804984_805189_805319_806603_806640_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809454_809546_809844_810038_810166_810331_810890
901088	contig_6076_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_81734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATGCTCATAACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52527	54454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_52500_54500
901089	contig_5084_pilon	-	653	3	Intergenic	novelGene_64591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACAGCCTTGGAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928346	915809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_916308_920283_920357_928264
901091	contig_3382_pilon	+	5945	13	Intergenic	novelGene_124153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_12	212.44587546008	40	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1011	3036	335	3370	931459	987641	FALSE	20	TCATCTCTTTTACTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGMIQTNTASKTQKDVARRPQFVSSRGVEELLKGAGCEPAPSPSVTSNVPPLDHPSLPLNGYKLSIIGDQLPEYTTISESFKASMKNFKIEKIKKIHNPKLLDAFQRKKSKMKNPNERILFSAANRSHVDSICAYNFDWTLHGTHDTRYGRGNYFTKEAIYSHKNCLCDDKNIVMFVARVLVGDFTEGNMTYTHPPRRFCDPETRYDSCVDTRLNPSVFIIFQKDQMYPEYVIEYTETDKACVIS	931124	990216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_978965_979048_981257_981389_981763_981898_987357
901092	contig_13074_pilon	+	2013	4	Intergenic	novelGene_153460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	192	491	659831	660130	TRUE	55	CCTAAGAAAGAAAAGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWKELEKDAEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPGSMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGSRQPHKTKWD	659639	667299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_661361_664964_665096_666202_666269_667204
901093	contig_19362_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_157794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCACAAGTTTGGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44619	46940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_44600_46900
901094	contig_6102_pilon	+	1630	2	Intergenic	novelGene_31980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3008	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	125	598	414607	415170	FALSE	10	CAGATTTGGTCCTGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEGEGPGGALMEEAAVWDRSRTSIWGFPYLWTWAPKGARRQGAGPSPAQARSGRSEYDRKGVMWCEGWGRNGK	414482	416202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_414788_414877
901096	contig_5961_pilon	+	1417	8	Intergenic	novelGene_144098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	531.779454055064	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	267	1013	144074	175856	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGWVITYLENGKLWTVVNVTT	113033	176260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113069_113347_113514_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650
901097	contig_3095_pilon	+	2210	6	Intergenic	novelGene_75189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2004.05375177414	531	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	15	728	220513	226800	TRUE	25	GACTTCCCAGGATATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEKMILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVTNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220498	245835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226222_226275_226409_226645_226824_244376
901098	contig_3068_pilon	-	3488	32	Intergenic	novelGene_137629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.570526796868	7	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1012	3039	373	3411	261337	233496	FALSE	35	TTATAAAGCTTGGATGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQCNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPFFNSVELWYTCTLPEVFSKRSCCWC	267463	233418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233575_233676_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972_252054_253023_253079_253805_253937_254871_254981_257505_257595_258489_258629_261251_261451_266438_266614_267379
901099	contig_14577_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_164630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTGTGTTGGTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47140	45508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_45500_47100
901100	contig_7410_pilon	+	2844	9	Intergenic	novelGene_106092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	215.452684770926	485	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	103	516	405351	407457	TRUE	55	GATTGAAAAAACAATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405248	413512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407879_408138_408214_408298_408410_410366_410421_411209_411246_411881
901101	contig_15498_pilon	-	930	7	Intergenic	novelGene_42668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	134.787487055241	113	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	19	678	697708	688241	FALSE	20	AAACTTCCATCTGGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697726	687988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688313_690965_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
901102	contig_7022_pilon	-	4145	25	Intergenic	novelGene_142124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.199826313471363	484	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3364	3705	108311	97895	TRUE	50	CTATGAGAGAGGAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLEVSDDVPESLSLLLELSIVFFLGFLSLILSALGSKGWFLLCSWLHFRFPPPELIVLVCPVEPEAVVDSTDVLIPDTDDVLFPFIDPFTPFSGPFRLLFPEVLEWNEEES	196318	34266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_34414_92798_92987_97789_97957_98514_98710_108226_108431_108717_109114_116634_117241_119392_119696_120713_120770_121539_121646_133778_133992_139936_140030_140128_140191_143550_143617_145330_145396_146696_146747_148268_148334_157310_157450_160294_160550_161500_161716_163101_163179_164011_164254_173414_173478_174475_174621_196291
901103	contig_13625_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_150145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAAAATTTGAGACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9370	11591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_+_9400_11600
901104	contig_16205_pilon	-	2031	2	Intergenic	novelGene_156878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	532	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATATTTCTGTGTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100560	95996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_97697_100229
901105	contig_11285_pilon	-	7004	8	Intergenic	novelGene_5716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_5	104.029823039514	650	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1498	4497	125	4621	910546	804977	FALSE	15	GCAGAGTCTGTTGTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRFSRFNEDRDFQGNHFDQYEEGHLEIEQASLDKPIESDNIGHRLLQKHGWKLGQGLGKSLQGRTDPIPIVVKYDVMGMGRMEMELDYAEDATERRRVLEVEKEDTEELRQKYKDYVDKEKAIAKALEDLRANFYCELCDKQYQKHQEFDNHINSYDHAHKQRLKDLKQREFARNVSSRSRKDEKKQEKALRRLHELAEQRKQAECAPGSGPMFRPTTVAVDEEGGDDEKDESSTNSGTSAAATSGLGSELSTDKGGPFTAVQITNTTGLAQAPGLASQGISFGIKNNLGTPLQKLGVSFSFAKKAPVKLESIASVFKDHAEEGTSEDGTKADDKGSDQGLQKVGDSDSSSNLDGKKEDEDPQDGGSLASTLSKLKRMKREEGAGATEPEYYHYIPPAHCKVKPHFPFLLFMRASEQMEGDNSAHPKNAPESKKSSSPKPKGSCKVAASQGAEKTVSEVSEQQKESSVTESSEPGSKTETKKASGGDVSEQSLESQKALEMQSCESITSKETSQATPAGKESQEGPKHPTGPFFSVLSKDESTALQWPSELLTFTKAEPSISYSCNPLYFDFKLSRNKDARAKGTEKPKDIGGPSKDRLQDLDPEEPNKSKEEGENVVHSSGGRVDAPASGSACSSLNKQDPGGSHGSETEDTGRSLPSKKERSGKSHRHKKKKHKKSSKHKRKHKVDPEEKSSKAESGEKSKKRKKRKRKKNKSSVPADSEWGPKPEPPGSGSPAPPRRQRQAQGDSQRRSLPAEEGSSGKKDESGGGSSSQDHGGRKHKGEPPASSCQRRAGTKRSSRSSHRSRPSSGDEDSDDASSRRQHQKSPSQYSEEEEEESGSEHSRSRSRSGRRHSSHRSSRRSYSSSSDASSEQSCYSRQRSYSDDSYSDYSDRSRRHSKRSHDSDDSDYASSKRRSKRHKYSSSDDDSSLSCSQSLSRSRSHSRERSRSRGRSHSSSCSRSRSKRRSRSTTAHSWQRSRSYSRDRSRSTRSPSQRSGSRKGSWGHESPEERRSGRRDFIRSKIYRSQSPHYFRSSRGEGPGKKEDSRGDDGKGTGPSSQNSSASAGRGSDGDCSPEDKNSVTAKLLLEKIQSRKVERKHSVSEEVLATPNKAGLKLKDPPQGYFGPKLPPSLGSKPVLPLIGKLPATRKPNTKKCEESGLERGDEQEQSETEEGPPGSSDAPFGHQFPSEQTAGPLSDLPPEEPKSEEATADHTVAPLGTPAHSDCYPGDPAISHNYLPDPSDGDTLESLDSSSQPGPVESSLLPIAPDLEHFPSYAPPSGEPSIESTDGAEDASLAPLESQPITFTPEEMEKYSKLQQAAQQHIQQQLLAKQVKAFPASAALAPATPALQPIHIQQPATASATSITTVQHAILQHHAAAAAAAIGIHPHPHPQPLAQVHHIPQPHLTPISLSHLTHSIIPGHPATFLASHPIHIIPASAIHPGPFTFHPVPHAALYPTLLAPRPAAAAATALHLHPLLHPIFSGQDLQHPPSHGT	910670	802593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_808851_811244_811376_824751_824896_845502_845590_846255_846324_868989_869063_877365_877441_910501
901106	contig_3866_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_112424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239699	242339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_239700_242300
901107	contig_4496_pilon	+	3325	1	Intergenic	novelGene_66700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	174	356	974647	974829	NA	75	TAAAAAAGGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAKENEECQRHKESISPRNKRGHINQRLHQPETRRARWCLATTNDCPDKEHNRESLMDRQKDGVQNSNSSKKTKINSLTETGGTPEDMAPGLSVNPELKTFPKPTLQTKNRLDYKT	974473	977798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_974500_977800
901108	contig_6375_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_73071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701670	704080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_701700_704100
901109	contig_5317_pilon	-	2173	13	Intergenic	novelGene_76588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	301.874237979254	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	248	1405	381997	373913	TRUE	15	CTAGATTTTTCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSVSQIVGFPLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKIKKQDRLFPPEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGKPLSNMKILTLGKLSRNKEEVKTMIEKLGGKLTGTATKASLCISTKKEVEKMTKKMAEVREASVRVVSEEFLQDVSGSTRSLQELLSVHVLSSWGAEVKVEPAEVVAPKAKSGAALPKKSKGAVKEEGVNKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	386736	355235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356322_370354_370488_373902_374100_375290_375424_375690_375760_376055_376299_377191_377333_379075_379221_381031_381209_381934_382052_384128_384229_386643
901110	contig_19957_pilon	-	3412	1	Intergenic	novelGene_57680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTGATTTTCTCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35635	32223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_32200_35600
901112	contig_8310_pilon	+	2013	9	Intergenic	novelGene_75586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	203.034941574104	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	47	925	308752	324814	TRUE	65	GCACAATACAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRSWTWPPWRSTCRRCTAPPAKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	308705	326126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_308821_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739_324848_325071
901113	contig_7321_pilon	+	1043	3	Intergenic	novelGene_53142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGATTGATGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174963	204009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_175902_186267_186353_203989
901114	contig_5590_pilon	-	4284	2	Intergenic	novelGene_163000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1475	1849	334619	334245	TRUE	80	AAAAAAATAATGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAETAAQSLVICSQQEAMLGGNLRRTSLLAQTGSRVTKTKLLPVLLNSQGLGKCGLGLVSRQARWWSTPLASALTRVHYEFTAAHILQTDKTTCLLLHGSCTIIGEIQDSPQGQRDEDGGPGL	336093	238888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_239182_332102
901115	contig_17144_pilon	-	2014	12	Intergenic	novelGene_29284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2133.25841638428	18	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	814	1719	172736	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183210	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166721_168260_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173440_174893_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
901116	contig_7151_pilon	+	3368	3	Intergenic	novelGene_40693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGGGGGCTCTTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15963	65216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_18886_40408_40716_65077
901117	contig_8263_pilon	+	1608	2	Intergenic	novelGene_83094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATCTTTACTACCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139783	142152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_141018_141778
901118	contig_4213_pilon	+	8536	1	Intergenic	novelGene_124799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	457	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	6104	6469	28237	28602	NA	25	GAGGCCTCACACTACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLKGWKKMFPANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEAHYIMIKGSIHQEDISVINIYISNDSAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNVPLSVKDRTSRKKLNKDIEELNATIN	22133	30669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_22100_30700
901119	contig_11224_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_124451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	327	644	17944	17627	NA	15	GAGCTTCTTGGATGGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCILLRVALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAAGWSVLYMSLSSSWLIVSFRSSVSLLSFFLDVLSFTDSGVLKSPTIIVDLSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	18270	16450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_16400_18300
901120	contig_4857_pilon	+	4778	2	Intergenic	novelGene_48792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3186	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCAACTAAAATAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237171	1245590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1238141_1241781
901121	contig_10904_pilon	-	1623	8	Intergenic	novelGene_22545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	283.807782033645	5	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	161	796	396033	375395	TRUE	5	TTTGTGTGTGGCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGEFREASLKC	396193	374473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375276_375369_375409_379283_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389453_389761_389798_395999
901122	contig_11335_pilon	+	3856	11	Intergenic	novelGene_104911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	110	junction_5	83.0836325638209	293	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	146	1276	317755	400727	FALSE	25	TTTTGTTTTTTAAACCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLSIKDDEYKPAKFNLFGKISGWFRSILSDKTSRNLFFFLCLNLSFAFVELLYGIWSNCLGLISDSFHMFFDSTAILAGLAASVISKWRDNDAFSYGYVRAEVLAGFVNGLFLIFTAFFIFSEGVERALAPPDVHHERLLLVSILGFVVNLIGIFVFKHGGHGHSHGSGHEHSHSLFNGALDQAYGHGDHCHSHELKHGAAHSCDHAHGHGHFHSHDGPSLKETSGPSRQILQGVFLHILADTLGSIGVIASAILMQNFGLMIADPICSILIAMLIVVSVIPLLRESVGILMQRTPPLLENTLPQCYQRVQQLQGVYNLQEQHFWTLCSDVYVGTLKLVVAPDADARWILSQTHSIFTQAGVRQLYVQIDFAAM	317609	403307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_317835_318071_318174_339139_339254_344708_344797_345473_345601_351119_351264_355242_355294_359407_359544_388471_388563_389804_389955_400679
901123	contig_5451_pilon	+	4813	1	Intergenic	novelGene_167161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	421	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	91883	92236	NA	15	GCTGAATGAGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFHIYCFLNLEQICSISYGTVLIRKKGCVCEFEKERLILSLCLSYEALEPAVEVTPPLWPRKADPGGTRQPRRPLEAQHHSWAASPWVGRGFERLLNGGDSAQPDSSDRIPTSQANQ	91880	96693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_91900_96700
901124	contig_3627_pilon	+	3439	8	Intergenic	novelGene_78569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_5	77.2480763910821	6	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	793	1224	1304132	1307800	FALSE	20	GTTACAGTCCTTGGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESFLCPLISQSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1301486	1310015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
901125	contig_9571_pilon	+	792	4	Intergenic	novelGene_136270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATGAAATAAGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406103	417060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_406208_413387_413494_414097_414198_416578
901126	contig_4654_pilon	-	4188	6	Intergenic	novelGene_103085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	937.421015339426	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2087	2443	496612	494476	TRUE	20	ACTAGATTTGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLIALTLFIFPVATVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSENQGDEADAGEGEN	500262	492661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493455_493523_494533_494873_494970_496408_497941_498805_499420_500118
901127	contig_7909_pilon	-	4430	19	Intergenic	novelGene_155905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	3597	4166	496311	451608	TRUE	25	AGTGCCTCTGAAGGGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTKVELGDVVTIITFCVVVFVVCVEGLVKVILTGDICGGKELAMLCMMLLILGLPLTGTVIVFETGTTAFGTSFRTTGEELEEFVRLRFLGFSSSSEQLTPSLLPVSAGTGRDALCWIAALATALAVTVKAVWGTSRGISGTNRRPSMDHSEELLGPDILCAIVVNRSSFTALRTSARWRSVEMLNF	550972	442997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_443073_444943_445040_451514_451617_453107_453186_458393_458568_462223_462484_496262_496540_511059_511321_516143_516297_517737_517902_524094_524232_526691_526845_528519_528719_536898_537063_538878_539035_542362_542516_544439_545005_545962_546462_550208
901128	contig_4426_pilon	-	2212	7	Intergenic	novelGene_15425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	773.183462489121	31	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	815	2212	843924	820601	FALSE	70	GAAGAAAAAAAAGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELLLGQSPSRNDAKIINSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFR	904632	820600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_843869_843950_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
901129	contig_5341_pilon	-	1548	4	Intergenic	novelGene_168018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	143	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	349	873	339444	338480	FALSE	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340896	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_339940_340672
901131	contig_10225_pilon	+	2709	10	Intergenic	novelGene_86847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	428.077038180377	1262	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	1007	2593	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	35496	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
901132	contig_12677_pilon	-	1456	2	Intergenic	novelGene_110798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2684_2832
901133	contig_5482_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_144456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCGTCAGAGAAGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303265	301815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_301800_303300
901134	contig_7357_pilon	-	1698	10	Intergenic	novelGene_36774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	2278.73547346433	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	219	1340	166824	110207	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSDLY	167042	107134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_107346_110059_110218_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
901135	contig_2323_pilon	-	4066	1	Intergenic	novelGene_151841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	192	701	57955	57446	NA	70	GTTAAAAAAGAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSFLTTCPKYVRCSLAILASKEHSGCTFSKTDLLVLLAVHGIFNVLRQHHNSKASVLLPSSLFIVQLSLAYDAIENTIAWVRRTLVFKVTSLLFNTFKRSFAADLPNALRLLISCLLLPWVLIVDPSKMKSLTTLIFSPFIMMLLIGLVVRIFVFFMLRCNPY	58146	54080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_54100_58100
901136	contig_5947_pilon	+	5432	15	Intergenic	novelGene_101495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	287.420343889629	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1074	3225	145	3369	399844	418186	FALSE	45	TTGTGCAGAAAAAGATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENYHQELEIRSITQQPVLLEEEPTNLEGILGPTTILLLTDKGKRGLRPWAETRIREGETMRGRPVMKLEAKPPRPSENFQQWRAPFQKPAEQPQQVKRLGYKFLESLLQKDPSEVVITLATSLGLEELLSHSSMKSNFLELICQVLRKACSSKMDRQSILHVLGILKNSEFLRVCLPAYVVGMITEPVPDIRNQYPEHISNIISLLQDLVSVFPASSVQETSMLISLLPASLNALRASGVNIEEETEKNLEKVQTIIEHLQEKRREGTLRVDTFTLVRPEAEDHVESYQTMPIYPTYNEVHMDERPFLRPNIISGKYDSTAVYLDTHFRLLREDFVRPLREGILELLQSFEDQGLRKRRFDDIRIYFDTRIITPMCSSSGIVYKVKFDTKPLKFVRWQNSKRLLYGSLVCMSKDNFETFLFATVSNREQEDLCQGIVQLCFNEQSQQLLAEVKPSDSFLMVETTAYFEAYRHVLEGLQEVQEEDVPFQRNIIECDSYVREPRYLLEGGRYDFTPLIENPSATEKSLRNTEGLRNAKVNILDPSQWPSKEALKLDDSQMEALQFALTRELAIIQGPPGTGKTYVGLKIVQALLTNEPVWQVSRQKFPILVVCYTNHALDQFLEGIYKCQKTSIVRVGGRSNSEILKQFTLRELRNKREFRRNLPMHLRRAYMSIITQMKESEQELHEGAQSLECTMHGVLREQSLEKYISAQHWKSLMNGPVQDTEWVCFQGWKHSMMLEWLGLGVGSFTQSVAAAGPENTAQAEGEEEEEGEEEASLIKIAEEADLIQADRVIDEEEVVRPRRQKKEENGADQALVKMLLAMRLDNHGQGTAAGQEEAAGEWQTQRSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRLWLQMYQADTRRKILNFERQYRTSAERMAELRLQEDLHILKDAQVVGMTTTGAAKYRQILQKVEPRIVIVEEAAEVLEAHTIATLSKACQHLILIGDHQQLRPSANVYDLAKNFNLEVSLFERLVKVNIPFVRLNYQHRMRPAIARLLTPHIYQDLENHPSVLKYEEINGGLFQPFLCRTQLP	394549	420249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_394570_397104_397220_399834_400059_400120_401644_405970_406103_407655_407805_408918_409069_410065_410181_411903_412152_413728_413869_415242_415398_415803_415950_416710_416822_417146_417243_418141
901137	contig_17214_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_153467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGTCCTATATTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24157	26321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_24200_26300
901138	contig_6589_pilon	+	2691	3	Intergenic	novelGene_25928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	13	186	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	295	2607	1208834	1211549	FALSE	15	GCAACCTCTCGGTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQVPPLATPWRDVHPFFLLSPLVGLVRQAWSHLRGPGPPESWLVEAVTEEAALDGEAKASLAFHHAAWGEHPQGEAEDSRTAEEDGEADRRACPDLKDSSSFLDASNDDDEEYGEEEATSVAREQGGEFTDGRPAPLPSSFLIRTLRDPPGEKESEKEKEAPEEGVANNTEMTKVFFYPLSPLECYPGVEEKEDEDREAVKKEAPRISIPPLSLGSKPSAWVCCPGEGEEEEKNEEEARPPEEERRAENKEATKIAISPSCSGSNPRAWEYCSGESEEEKDKNAKEATEKGEADPEPHSSSLIRRPLLRAWVYRPGGDTEEEDDEDSDSGAAAEGPSRIPSTGAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPPTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEEYEENENGDDSEATEGEAADSGQHPSLQTQSAVLRTWTYQPGEDTEEDGTTEEWGEAEPSPFRVAIYLPGEKPPPPWAPPRLPLRLQRRLNSLETPTRDLDPGTPLKATKVRFSEKVSVHYLAVWAGPARAARRGPWEQLARDRNRFARRIACVQEELNPCLTPAARARAWARLGNPPLSLSPIPVPTQTMPSSSGPSESPVPARHGSPAVATPSPSPACKSLSPCLNLGGRRG	1207797	1211633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1208083_1208824_1210772_1211174
901139	contig_13680_pilon	+	4830	37	Intergenic	novelGene_149579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_27	182.515389170203	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	951	2856	26	2881	275980	324258	TRUE	40	AATAAAAGACCTGACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFPEGPTHMLPLLMRALPGVDPNDFSKCMITFQFIATFSTLVPLVDCSSVLQERDDLTEVERELCSATAEFEDFVLQFMDRCFGLIESSTLEQTREETETEKMTHLESLVELGLSSTFSTILTQCSKEIFMVALQKVFNFSISHIFETRVAGRMVADMCRAAVKCCPEESLKLFVPHCCSVITQLTMNDDVLNEEELDKELLWNLQLLSEITRVDGKKLLPYREQLVKILQRTLHLTCKQGYTLSCNLLHHLLRSTTLIYPTEYCSVPGGFDKPLSEYFPIKDWGKPGDLWNLGIQWHVPSSEEVAFAFCLLDSFLQPELVRLEHCGDGGHEMSRDDVLQSLTIVHNCLIGSGNLLPPLKGEPVTHLVPTLVSLEETKLYTGLEYDLSRDNHRETIARVIRKLLNHILDNSEDDTKSLFLIIKIIGDLLQFQGSHKHEFDSRWKSFNLVKKSMENRLHGKKQHIRALLIDRVMLQHELRTLTVEGCEYKKIHQDMIRDLLRLSTSSYSQVRNKAQQTFFAALGAYNFCCRDIIPLVLEFLRPDRQDVTQQQFKGALYCLLGNHSGVCLANLHDWDCIVQTWPAIVSSGLSKAMSLEKPSIVRLFDDLAEKIHRQYETIGLDFTIPKSCVAIAELLQQSKNPSINQILLSPEEIEEGLKRQQERNADALRNYENLVNTLLDGVEQRNLPWKFEHIGIGLLSLLLRDDRVLPLRAIRFFVENLNHDAIVVRKMAISAVAGILKQLKRTHKKLTISPYEISGYPKPTQILAGDRPDNHWLHYDSKSVPRTKNEWESSCFVEKTHWGYYAWPRNLVVYAGVEEQPKLGRSREDMTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLINFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVLKPHLERLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGTCIATS	275954	341486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_276043_276841_276932_277671_277737_278468_278620_279860_279960_280179_280250_280792_280861_289104_289321_290755_290914_292043_292140_299752_299809_301745_301803_301992_302049_302141_302241_303358_303422_303563_303660_305400_305533_307759_307970_308732_308870_309953_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314501_315204_315275_315942_316069_316638_316792_323626_323730_324256_324349_325027_325160_325535_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_334385_334549_338835_338970_340110_340250_340775
901140	contig_7009_pilon	+	4350	2	Intergenic	novelGene_23627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432944	437373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_434071_434149
901141	contig_6101_pilon	+	3741	6	Intergenic	novelGene_114285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_1	139.897676892792	398	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	86	901	329183	356265	FALSE	20	ATTCAAGTCCTTTGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRPPPSAHGRGWRGPPGRGFGLRRREMAAAGRLEDGSLDLTQSIEDDPLLDAPLLPHHALHAHFRPRFHPVPTVVIAHLLLLIHVVFVILAFLTGVFCSYPNPHEDKCPGNYTNPLKVQTVIILGKVILWILHVLLERYIQYHHSKVRNRGYNTIYRSTRHLKRLALMVHSTGNTALLLILCIQHSFPQPSDLYLDFILSVLALELICSLTCLLMYTVKIRKFNKAKPRPDVLEEEKIYAYPSSINSETGFRTISSLEEIVEKQGDIIVYLKRHNALLSKRLLALTSSDLGSQPGRV	329097	359105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_329210_333376_333524_338121_338387_342293_342429_345878_345982_356126
901143	contig_10861_pilon	-	4515	1	Intergenic	novelGene_39185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4220	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	4131	4460	284913	284584	NA	10	GGAGGGATGGTGTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQGPCTSQPAKPPQPAMKWQGLSRREKDRGWEGIYRWLLGALFPAGSSVELLSCTPCSLIYDRSGRWQIHAALADRGPQHVSLFALHSLSVSYSILCLAEFFISSFDS	289043	284528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_284500_289000
901144	contig_6031_pilon	-	1359	4	Intergenic	novelGene_56769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	656.50302529556	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	96	527	257696	256126	TRUE	75	TCTAAAAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGMSASPAPPEGR	257791	254911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_256375_256704_256753_257561
901145	contig_7342_pilon	-	2773	8	Intergenic	novelGene_71217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	655.380120266717	226	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	99	752	716514	696372	TRUE	25	AAGACAGCCAGGGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVPSEAAPFCARSRDSTGPVLCEVGGGARAPGMAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPGTVK	716612	693319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_693417_694223_694352_694575_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
901146	contig_9389_pilon	+	3142	1	Intergenic	novelGene_83969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCGAGAAGGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252536	255678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_252500_255700
901147	contig_10857_pilon	+	2619	7	Intergenic	novelGene_160909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	229.875147272021	41	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	27	689	450654	469527	FALSE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWSRVRIAKCQMLLTGFFVLGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSFCDQQRSSEVLAL	450627	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_457543_457619_463693_463796_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484
901148	contig_9321_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_174715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGCCTTGGCAGCCGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16336	14173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_-_14200_16300
901149	contig_9548_pilon	-	1426	2	Intergenic	novelGene_141048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	140	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	673	1425	77262	76510	FALSE	55	GAAAATCAATTACATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLFIHSSVDGHLGCFHLFAIVNNVPIKRQGVTEWIKRQDPSICCLQETHLRNKDMNLLKVKGWEKIYQGNNYQRRAGVAILISDKIEFKTKSTIKEKEEHYIMIKGVIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSIIIVGDFNTPLSVKDRITKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHSAIKVEINNRKSKE	79565	76508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_77862_79492
901150	contig_5482_pilon	+	2168	16	Intergenic	novelGene_144485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	336.87059170482	7	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1686	481	2166	541045	571705	FALSE	65	AAATGCAGAAAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLTLNCLGKKEEAYELVRRGLRNDLKSHVCWHVYGLLQRSDKKYDEAIKCYRNALKWDKDNLQILRDLSLLQIQMRDLEGYRETRYQLLQLRPAQRASWIGYAIAYHLLEDYEMAAKILEEFRKTQQTSPDKVDYEYSELLLYQNQVLREAGLYREALEHLCTYEKQICDKLAVEETKGELLLQLCRLEDAADVYRGLQERNPENWAYYKGLEKALKPANMLERLKIYEEAWTKYPRGLVPRRLPLNFLSGDKFKECLDKFLRMNFSKGCPPVFNTLRSLYKDKEKVAIIEELVVGYETSLKSCRLFNPNDDGKEEPPTTLLWVQYYLAQHYDKIGQPSIALEYINTAIESTPTLIELFLVKAKIYKHAGNIKEAARWMDEAQALDTADRFINSKCAKYMLKANLIKEAEEMCSKFTREGTSAVENLNEMQCMWFQTECAQAYKAMNKFGEALKKCHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRSYVDLLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQRRAQKKAQIEEEK	504011	571707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_504338_510026_510085_539005_539091_541033_541139_543298_543457_544275_544411_551225_551380_557431_557552_559642_559739_559893_560001_561778_561852_564657_564828_565908_566062_566605_566735_567989_568204_571622
901151	contig_16970_pilon	+	4239	1	Intergenic	novelGene_157615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	375	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTCCAACTCTGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188210	192449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_188200_192400
901152	contig_7356_pilon	+	3080	5	Intergenic	novelGene_60378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCACTGACGCCACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428287	457913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_430732_433742_434072_435515_435620_437471_437532_457770
901153	contig_20314_pilon	+	2044	2	Intergenic	novelGene_125639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCATTATATGATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5752	7865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_6825_6893
901154	contig_9415_pilon	+	2182	14	Intergenic	novelGene_109844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	319.956838805213	2	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	602	1552	1983947	2013564	FALSE	30	CTGCACATTCCAGAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTGDFHCIMSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLEDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYLRNKVDTYVEFPLRGLDMKCYLLEPENSGPENCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAFATHEGRWFHFNDSTVTLTDEETVLKAKAYILFYVERQAKAGSDKL	1952294	2014194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983979_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000074_2000159_2010366_2010486_2010959_2011074_2011224_2011293_2013398
901155	contig_15327_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_70704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1335	1634	911741	912040	NA	30	GTTTATAGTTGAAATGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPESIAPRHPFSSVVKALLRFTVQLGIGQPHKTNWD	910406	912466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_910400_912500
901156	contig_16766_pilon	+	2849	2	Intergenic	novelGene_153370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	624	950	179206	179532	FALSE	55	AAAAAAAAAGTATGCGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILHANNNQKRVGVAILLSHKTDFKTRFTGRDKDGCYIVTKGSIHEEDLTIVTIYAPIRAPKYIKRTLIELKEEIDSTTIIAGRLQYSTFITEHLERRATRNRGSE	178079	181431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_178654_179156
901157	contig_8866_pilon	-	3314	2	Intergenic	novelGene_77849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	457	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACATTGTCTGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650458	645802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_647175_648516
901158	contig_12057_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_131616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4577	6690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_4600_6700
901159	contig_13740_pilon	-	3282	9	Intergenic	novelGene_34651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2960.97006908209	26	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	196	663	165243	160666	TRUE	40	AGTATAGGTTCTTAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQLWFWGFTWRWWKFWTRTRK	165438	155239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_161129_161270_161574_161722_161919_162031_165237
901160	contig_12427_pilon	-	1687	4	Intergenic	novelGene_40469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2184	junction_2	2141.08819684446	13106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTGGAGGAGGAAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325973	313536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315842_315958_316079_325856
901161	contig_7322_pilon	+	3744	11	Intergenic	novelGene_164913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	114.034906936429	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	188	1723	221528	236335	TRUE	75	TAGTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLSRRLGKRSLLGARVLGPTASDGPPGTVQPLEPQVELLERAAPQPFLAYKDSSCPEQPKEVLKAPGISGLQQVAFQPGQKVYVWYGGQEYTGLVEQHSWAEDKVTVWLLDQKLQICCKAEEVWLAELQGSISQVPPTEQGAQVPAYRPVSRNIDVPKRKSDAVEMDEMMAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSARKARGEAKKCRKVYGIEHRDQWCTACRWKKACQRFLD	214346	238423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_214521_221514_221780_222894_223128_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236223_237953_238019
901162	contig_6946_pilon	+	3307	6	Intergenic	novelGene_59744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	15.6384142418597	453	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	24	1472	1729	45946	FALSE	40	AATTTTATTGATATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHVDKLDMFRNMPDILHHLTTDRSTQIHACRHPKAEEYFQWNKLPCGITSKNRIPLHTISIKPSTIWFGERTRKTHVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYIRPMNAYANVIPVGTTMDKVTEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTAHLDSEEEDDDLFDDPPPVPLRHKVPNQETLHPEVFSMTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYLYEKLATGESVIVGRKKKPHS	1705	47781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_28232_28288_35894_35984_38551_38647_44954
901163	contig_3817_pilon	-	4999	1	Intergenic	novelGene_78407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1005	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1828	2205	1283607	1283230	NA	55	AAAAAAAAAAATTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECSLPGGQGAAGQGLDSAATCLHPVCNLHVSASGCPEGFATHQRADDNPQVGMGPCTENRGIRGNAKKKTRATKLDLKKFMQPGTFLEDSEETLRQRNGNQHCQVMTGGQHGFPSFRAQFPPPT	1285434	1280435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1280400_1285400
901164	contig_2940_pilon	-	581	4	Intergenic	novelGene_81939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	8304.15851647033	3340	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTATCTGGTATGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723513	717655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_721028_722105_722207_723468
901165	contig_5341_pilon	-	1492	4	Intergenic	novelGene_168023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.48249338897	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	298	822	339444	338480	FALSE	25	CAAAATCTCAGTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	337809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339511_339881_339910_340690
901167	contig_19032_pilon	-	2867	12	Intergenic	novelGene_172520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1436.33898713027	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	227	1198	160279	151651	TRUE	15	GTCCCCCATCTCAGCGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGSVHVNVLCGRVKGPN	160811	140078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_140207_146808_146874_147686_149038_149652_149755_151627_151699_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160591
901168	SIRV2	-	481	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-1	-320	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATCTACATACACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5908	3985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV2_-_4095_4338_4480_4687_4801_5790
901169	contig_6230_pilon	-	3218	13	Intergenic	novelGene_102104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.5196497645589	474	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	143	1567	181988	166056	FALSE	15	ATGCTGTTTGCAGTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRIKSAAASRVEGSSGAPTKGKRKPRQEEDEDYREFPQKKHKLYGRKQRPKTQPNPKSQTRRIRKEPPAYAAGSLEEQWYLEIVDKGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKLKYTRPGLPTFSQEVLHKWKLEVKKYHRIQCPNQGCEAVYSSVSGLKAHLGSCTLGNFVAGKYKCLLCQKEFVSESGVKYHINSVHAEDWFVVNPTTTKSFEKLMKIKQRQQEEEKRRQQHRSRRSLRRRQQPGAEHSEAELNLRVGKDPEQEPVPAHFQKVKPPKMSHKRGRK	182130	164404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_166134_166181_166365_169724_169824_170863_170927_171816_171919_174945_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179926_180772_180857_181156_181253_181942
901170	contig_6710_pilon	-	510	2	Intergenic	novelGene_97978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	35	CTTTAACTTTAATCATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
901171	contig_7744_pilon	+	1510	4	Intergenic	novelGene_62452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	168.738456395294	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	67644	69015	TRUE	60	AAAAATTTAAAACAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTSSRRHGQRRPRVLKEIRKLQKSTDLLLRKRPFGLLAREVCAIFTRGVDFNWQAQALLALQEAAEAFLVHLFEDAYLLSLHAGRVTLYPKDVQLARRIRGIQEGLG	67642	70248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_67755_68255_68334_68880_69392_69439
901172	contig_1258_pilon	-	3953	3	Intergenic	novelGene_178765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1198	1764	76220	75654	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSIKVIHHINKRKEKNHMIISVDAEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLRTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGTEEVKLSLFADDMILYIENPKDSMRNLLELIE	78438	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1258_pilon_-_1195_74658_76851_77871
901173	contig_19012_pilon	+	4049	3	Intergenic	novelGene_159488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	28.5	197	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAAAAAAGGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87852	101860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_91285_92941_93038_101339
901174	contig_11656_pilon	+	4098	21	Intergenic	novelGene_54012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	138.944233417584	569	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	152	2083	465719	528195	TRUE	45	AAGTCCTATTATAGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLRYKPQFPAPGWNVEKQKAVCEATFLTLLRFA	464953	537758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528687_531208_531337_535319_535411_536453
901175	contig_18869_pilon	-	1589	3	Intergenic	novelGene_56415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_2	1547	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	14	373	79419	74943	FALSE	20	TGATTTGCTTTTACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWDPNN	79432	73726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_74957_75486_75766_79352
901176	contig_4232_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_63357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10897	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTTCAGAAGATAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_468100
901177	contig_15350_pilon	-	2196	3	Intergenic	novelGene_164254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	231	junction_1	44.5	9	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1398	1751	229757	228098	FALSE	35	GTTGTAATAAAGCCCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDDDQETIAVDEWIIFQSPARIAHLVKELRRELDVLLQEKIESPCPVDWKDTACRDCAVLSAIIDLIKTQEKAMPRKFPPRCRDECFS	231154	227652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_-_228284_228673_228827_229742
901178	contig_10766_pilon	+	2529	2	Intergenic	novelGene_151217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	272	577	185470	185775	TRUE	65	AAGAAAAACAAAAATACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAVHRQGMVRNSSWIQKRMWNRAIIADVKWILAESREYPKDVYLCFIYSAKSFDCVDHNQIMNNISKNGNSRILNCAHEEPVLRPRGSHLNRTRGYFVV	185198	187787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_186144_186203
901179	contig_5006_pilon	-	1842	2	Intergenic	novelGene_178766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	376	1428	332200	331148	TRUE	35	GAATCACATGATCATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYTPNDRAPKYIKHTLTTLKREIDSNTIIVGHINTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDVYRTLHPTAAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDDNAIKVEIKNTKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEAIRDGIKKFLELNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQLIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREDQKKPTTTRRKEIVEIRADINEIEKRKTIERINKTKSWFFERINKIDKLLARLTKEIQERTQITQIRKEMGDVTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKLENLEEMDKFLETHALPKLQQRMLKI	332575	132223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5006_pilon_-_132593_331102
901180	contig_15047_pilon	-	5299	6	Intergenic	novelGene_52164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	338	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3139	3438	6719	6420	TRUE	15	GACTGAGTTCTGGCAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	9857	2168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2248_2551_2824_3289_3495_4155_4433_4551_5446_6285
901181	contig_19145_pilon	+	3754	3	Intergenic	novelGene_164144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1878	2195	169064	169381	FALSE	40	TGGGTTAACTGACAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGERQGRNKKKRRKSNTSTQQMALREPPIWLCGIQAAAVSQARHCGHGKQRRLSQGEEGWGVGKRISPITGCFVSHWKLREAAFSYPVCWSPIGVQDGRSALR	166576	170940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_+_166985_167361_168269_168501
901182	contig_13740_pilon	-	6956	6	Intergenic	novelGene_34656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	6	junction_5	3803.93267027691	451	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	4396	4830	160838	158260	FALSE	30	TTCAGGTGCTTAACATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNL	165415	156133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_164845_165026
901183	contig_9651_pilon	+	3884	1	Intergenic	novelGene_162847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	45	353	11443	11751	NA	20	CCCACGGCCTTATCACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLAGEREGLLFRCCFVLQEPCAWSRANQKIGSWNLRSCWLETLWGSSALSYRVTMSWNQGNGFGWGFFCFSSRCLFQNSSEQLVQDKSGFLTSLKQDFNP	11398	15282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9651_pilon_+_11400_15300
901184	contig_8978_pilon	+	5971	39	Intergenic	novelGene_49357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_33	111.54742913832	18	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1870	5613	130	5742	203039	222003	FALSE	25	AAAGGGAGTGTGTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAETAAAPPASGKALGLGGDYRGDLKDKLQSSVPWRELEVLIVMFSQYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVSSHSSHVMSAQSTSTLPTTPAPQPPTTSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDSERKEAEGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKSQPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNALLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGNTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQTAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPNTNIFGRF	202909	222232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_203306_203687_203835_203996_204097_204225_204363_204698_204831_205194_205322_205765_205996_206348_206430_206561_206733_206932_207078_207243_207295_207618_207738_207914_208059_208504_208669_208870_209003_209392_209621_209795_209941_210110_210232_210608_210711_210998_211113_211361_211538_211718_211899_213239_213312_213789_213924_214092_214255_214572_214685_214875_214966_215483_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218251_218449_218625_218704_218794_219010_220556_220675_221313_221476_221675_221758_221959
901185	contig_7340_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_159893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1207	1542	125883	125548	NA	75	AAAAAAAAAAATGGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIMKSEPSTEPTGARTALAAPLGILSPAPRGRCSSPHITERNSQKDLVGCPELQRGDVAEPGSRTRQSGSYVWARRNTVASWHSSRILNTRRTGGTDQPAPTGQKLPGCR	127089	125142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_125100_127100
901187	contig_12920_pilon	-	3695	3	Intergenic	novelGene_166323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	440	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAATAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93323	61107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_62034_62193_63804_92164
901188	contig_6361_pilon	+	3918	6	Intergenic	novelGene_23952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1198	1542	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	379470	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_380523_405214_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
901189	contig_11081_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_167083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47397	44345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_44300_47400
901190	contig_9027_pilon	+	3589	9	Intergenic	novelGene_156358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_7	139.326448942762	504	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	10	873	113839	204303	FALSE	30	TATTTAGGAACACATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNMEFNPSDHPRASTIFLSKSQTDVREKRKSLFINHHPPGQIARKYSSCSTIFLDDSTVSQPNLKYTIKCVALAIYYHIKNRDPDGRMLLDIFDENLHPLSKSEVPPDYDKHNPEQKQIYRFVRTLFSAAQLTAECAIVTLVYLERLLTYAEIDICPANWKRIVLGAILLASKVWDDQAVWNVDYCQILKDITVEDMNELERQFLELLQFNINVPSSVYAKYYFDLRSLAEANNLSFPLEPLSRERAHKLEAISRLCEDKYKDLRRPTRKRSASADNLTLARWSPAIIS	113829	207019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_113906_149601_149637_168996_169098_175045_175082_179381_179440_179535_179656_190798_190966_198745_198909_204186
901191	contig_10074_pilon	-	6740	40	Intergenic	novelGene_57102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATAAAAGAGGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299326	206509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_206637_206930_207575_210956_211172_214087_214206_214300_214426_217566_217653_220213_220317_221553_221639_226364_226517_227726_227839_229097_229202_229331_229491_232307_232435_232530_232680_240640_240741_240938_241149_246043_246172_248290_248415_248548_248633_249135_249224_254654_254855_256015_256099_260114_260156_260284_260407_261461_261619_262592_262697_264114_264171_264264_264386_281393_281580_282029_282189_284836_284903_286188_286337_286422_286477_286567_286647_287023_287119_291087_291263_293463_293613_294708_294790_297588_297641_297754
901192	contig_17274_pilon	+	1770	8	Intergenic	novelGene_26527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	490.429965459298	135	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	74	610	131715	170506	TRUE	30	ATGAATAGGGAGGGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVGNPTWNLGASQ	131641	172917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_170471_170674_171486_171637_172074
901193	contig_4103_pilon	-	4199	25	Intergenic	novelGene_51986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_13	278.984315444236	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1327	3981	219	4199	289125	202265	FALSE	45	CCCAGCACCAATCGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEIFLSSTAEGADLRTVDPETQARLEALLEAAGIGKLSTADGKAFADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLDEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTALTYACAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLAAGADQEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQEPDRSSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQNLLPPFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKDTVSLHQQCAHKEVCPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFTDNDVVDESPPLAKQIDFVPVQPLPSPQCNFSSDIGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHGQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREKRKEKRKKKKEEQKRKQEDEENKPKESLELPEDEDEEENDEDVEQEVPIEPPSATTTTTIGISATSATFTNVFGKKRANVVTT	300492	202264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_202387_203409_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_229274_230028_238934_238990_239972_240117_240287_240416_243058_243147_264115_264226_269082_269275_269525_269764_276615_276711_282406_282641_286814_286963_287688_287837_289084_289242_300390
901194	contig_17144_pilon	-	2021	13	Intergenic	novelGene_29381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2241.53478391481	64	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	322	1647	179764	166445	FALSE	25	AAATTCTTGAGTGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEESPSVPIPKPGG	183403	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166482_166765_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168013_173360_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
901195	contig_19744_pilon	-	3600	1	Intergenic	novelGene_120416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	524	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	487	981	278013	277519	NA	35	GGACTTTAGAATGACGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKWVKQDNETGIYYETWTVQASPEKGAETWFESYDCSKFVLRTYKKLAELGAEFKKIETNYTRIFLYSGEPTYLGNETSIFGPVGNKTLALAIKRFYYPFKPHLSTKEFLVSLLQIFDTVIIHRQFYLFYNFEYWFLPMKFPFIKITYEEIPLPNRNRTLSGL	278499	274899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_274900_278500
901196	contig_13800_pilon	+	2906	2	Intergenic	novelGene_153741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTTGTTTCATGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149861	152879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_152182_152293
901197	contig_854_pilon	+	1382	7	Intergenic	novelGene_36228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	116	694	543600	562402	TRUE	20	GGGTATCTGCCCAGCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543484	563581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562522_563012
901198	contig_15327_pilon	-	2581	17	Intergenic	novelGene_70778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_14	83.3943942960197	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	442	1413	1157860	1135719	TRUE	40	GATTAAACCAAATCTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169114	1129737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1166296_1166446_1167375_1167443_1168941
901199	contig_5669_pilon	-	2769	1	Intergenic	novelGene_86079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2278	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGTTTTACTCCGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192910	190141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_190100_192900
901200	contig_15293_pilon	+	2525	2	Intergenic	novelGene_146527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	205	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	725	1036	104685	104996	FALSE	55	ATACCTAGCAAAATCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKPGPRQCSCVLRPPAACRPCPALPPGVLLLWTQDCCCITHSYIRRPTPELVGGSEEWSLAEGAVKQVSFLPANMHVGLHISTVESQIYFCKPFLLFCFVLY	103354	106485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_+_103677_104282
901202	contig_15697_pilon	-	5153	1	Intergenic	novelGene_173294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	271	816	172	987	16656	15841	NA	70	TAAAATTTAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRTLSDIVPGDESPRLEGTQKTTGEGLPSQSRVDLNDMDRVKLSGPSFADVAGLKMRRSSCKRPLIIKTWNVRSMNLGKLETVKNEMECINVDILGISELKWTSIGHFESDNHTVYYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSILKYNAVSDRIISIYLQGRPVNMTIIQTYTPTTKAKEEEIEDFYQLLQSEIYRTCKQDALIITGEWNAKVGNKEGSIVGKYGLGDRNEARDHMIEFFKTNDFFIANSFFQQQTVTRHMDLTRWNTQESN	16827	11674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_11700_16800
901203	contig_13101_pilon	-	8037	22	Intergenic	novelGene_172778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.26490845034	448	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	608	2962	241813	231499	TRUE	30	TCTTCCTCAAACAAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVIPSENNGLSRGSPSKKNRLSLKFFQKKETKRALDFTESQENEEKVSEYSGSEIDQVVPAAQSSPINCEKRENLLPFVGLNNLGNTCYLNSILQVLYFCPGFKSGVKHLFNVISRKKEALKDEANQKDKGNCKEDSLASYELICSLQSLIISVEQLQASFLLNPEKYTDELATQPRRLLNTLRELNPMYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWLKSATKQPSILSKFCSLGKITTNQGSKGQLKENEYDLEEDAEKCENDNTLKVNGCGLDSPGNNVKPINVNEDKAINKGVEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERRENFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVGEDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLEFDCYGGGLSKINTPLLTPLKLSLEEWSTKPTNDSYGLFAVVMHSGITISSGHYTASVKVTDLNSLELDKGNFMVDQVCEIGKPEPLNEEEARGVVENYEDEEVSVRVSGNTQPNKVLNKKNVEAIGLLGGQKSKADYELYNKASNPDKVAGTAFAESRNSETNTTKGAHESDNNKESSDQTGINISGFENKISYVVQSLKEYEGKWLLFDDSEVKVTEEKDFLNSLSPSTSPTSTPYLLFYKKL	244720	183652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_183778_188856_189015_189680_189783_190859_191053_192478_192624_195022_195153_205036_205174_207157_207248_207370_207608_214755_214902_217218_217326_223850_224018_228160_232235_233532_233735_234695_234867_236439_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240024_241643_241883_244093_244190_244278
901204	contig_7748_pilon	-	3781	1	Intergenic	novelGene_101043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1930	2268	151320	150982	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLENSSLCQVCCSWIPPTVLTCMSVSPLPFPFPFCCYPWLFLDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL	153249	149468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_149500_153200
901205	contig_1107_pilon	+	2011	7	Intergenic	novelGene_126557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_6	56.9466124248551	108	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	37	615	209781	230663	TRUE	40	GTAATTTTTAAGAATAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEEGLTSSAPASSQTLLDALLQNLYDFGERKDETKQRIKKKRESKKRDLSTAAVLAEGPALPPDSLVRGQRKSASSFFKELREELHCAPAVTSTSFSSEPEVDSAVSHSLRNNRELVEVVEFHSRRQKRKLKPGQDEIPKTKTSVLEKDVVIQEFNLEKVCALKLLICSFFYNTKKVSMFLYLTDGKMVK	209744	234278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_209869_210850_211189_230510_231407_231544_231632_232190_232244_233289_233580_234055
901208	contig_15752_pilon	+	3641	23	Intergenic	novelGene_148754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_14	72.6124092939428	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	271	1851	190284	198057	TRUE	65	AAAAAACAAAAAACCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVCLAEGTCPTLAVAISPSAWYSWCSRRLVEERYSWTSRLSPADLIPLEIPANAGSSTQRDWQEQLVVGHNVSFDRAHIREQYLIQGSCMRFLDTMSMHMAISGLSGFQRSLWMAAKQGKHKAQHLTQKVQKSQNKARGPAISSWDWLDISSVNNLADVHSLYVGGSPLGKEPRELFVKGSMKDIRENFQDLMQYCAQDVWATYEVFQQQLPLFLERCPHPVTLAGMLEMGASYLPVNQNWERYLAEAHSTYEELQREMKNSLMDLANDACQLLSGDRYKEDPWLWDLEWDLQEFKQKKAKKVKKKEPATTSKLPTTGAGAPGDPKDQEDPGPPSEEEEFQRDAAARACLQQLKGTTELLPKRPQHLPGHPGWYRKLCPRLDDPEWTPGPSLISLQMRVTPKLMALTWDGFPLHYSERHGWGYLVPGRRDNLAKVPVGTDLASAGVACPYGAIESLYRKHCLEQGKQQPEPQEAGMAEEFLLTDNSTMWQMVEELGCLELEAEAKMENFQAAVLGQPSVLTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRIRAPGLG	185687	203947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_185753_188617_188814_190274_190440_190550_190698_190848_190929_192171_192355_192460_192616_192771_192899_193849_194087_196001_196123_196336_196424_196724_196833_197280_197442_198038_198142_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201812_202782_202944_203458
901209	contig_4232_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_63321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
901210	contig_5602_pilon	-	2331	10	Intergenic	novelGene_133012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.111547696167	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	226	1281	516168	488176	TRUE	85	AGAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSERPEAARPKQDERLSSDTNENEVKSSEEPLLKKSSRRFVIFPIQYPDIWKMYKKAQASFWTAEEVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516393	486688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_487403_487839_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_511996_512153_516120
901211	contig_5649_pilon	+	3846	2	Intergenic	novelGene_82394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	925	1332	1155482	1156183	FALSE	60	AATAAAGCAAATTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTALCSAIQFLRESGCVYGASVTFPCTSCAGFPSIVYRLTLHQRYHLSIVNNAARNMGVHMSIRVMILISLGYIPKSGIAGSYGMSISSFLRKRHIIFQNACIIMHSQQQCMSSDLLAASPTSVISSVFYSCQ	1154557	1158697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1155635_1155928
901212	contig_5815_pilon	+	411	4	Intergenic	novelGene_141236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	13509	junction_1	11895.13684943	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	1041346	1046025	FALSE	10	CTTCGTGCGATTCAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNVPYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN	1041344	1046057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_1041453_1044121_1044248_1045493_1045607_1045993
901213	contig_10057_pilon	-	1086	3	Intergenic	novelGene_162337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.5	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	127	366	50348	35371	FALSE	40	GTTTTAAACTTACTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQEERRRRSFQDYTGQKITLEAVLNTTCKKCGCKGHFAKDCFMQPGGTKYSLIPDEEEEKEEAKSVEFEKPDPTKNSRKRVKQARGQDVHQKIVRQQRRRKRRRNTRRSTRSESGKSVGGG	52233	34650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_35498_50235_50372_52130
901214	contig_11292_pilon	-	3615	11	Intergenic	novelGene_109385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	9	junction_8	27.4801746719339	388	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	92	1291	20569	13583	FALSE	80	TTAAAGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPALARSLRFVTLLYRHGDRSPVRTYPKDPYQEEDWPQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMSAEANLAGLFPPNGMQRFNPNISWQPIPVHTVPVAEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTPEYQNESTQNAQFLDMVANETGLTDLTLETIWNVYDTLFCEQTHGLVLPPWASLQTMQRLSQLKDFSFRFLFGIYQQTEKSRLQGGVLLAQIRENLTLMATTSQLPKLLVYSTHDTTLVALQMALDVYNGRQAPYASCHIFELHQEDNGNFSVEMYFRNESNKAPWPLILPGCPHRCPLQEFLRLTEPVVPKDWQQECQLTSSPADTEVIVALAVCGSILFLLIVLLLTVLFRMQAQPPGYHHIADEEDHA	20660	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_13717_15571_15748_15898_16006_16105_16189_16982_17116_17583_17674_17752_17852_17959_18113_19161_19249_19564_19661_20527
901215	contig_13720_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_178768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAAAAAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63158	60609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13720_pilon_-_60600_63200
901216	contig_11061_pilon	-	2214	2	Intergenic	novelGene_173346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199126	147581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_-_148635_197965
901217	contig_5419_pilon	-	2901	1	Intergenic	novelGene_15549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCCATCCATTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452593	449692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_449700_452600
901218	contig_15732_pilon	+	3342	2	Intergenic	novelGene_88883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTAGCGGTGTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197780	201366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_200622_200865
901219	contig_4180_pilon	+	4401	14	Intergenic	novelGene_8424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_13	66.2344768014345	678	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	238	1956	1072695	1155294	FALSE	15	ATGTGGTTGTTTCAGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKASLAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDITEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDSQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRSITIANQTNCPLYITKVMSKSAAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSIKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG	1072457	1157739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_1072734_1076123_1076213_1078057_1078243_1125305_1125471_1127668_1127731_1128287_1128369_1128940_1129010_1136507_1136629_1144951_1145109_1145581_1145724_1147773_1147945_1152735_1152916_1153722_1153889_1155202
901220	contig_13542_pilon	+	4218	25	Intergenic	novelGene_131571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	162.962653356187	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	706	2688	720724	738284	TRUE	40	TTGAAAAAGAAGGTGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGKSPSKSELRHLYLTEKYVWRWKQFLSRRGKRTSPLDLKLGHNNWLRQVLFTPATQAARQAACTIVEALATIPSRKQQVLDLLTSYLDELSIAGECAAEYLALYQKLITSAHWKVYLAARGVLPYVGNLITKEIARLLALEEATLSTDLQQGYALKSLTGLLSSFVEVESIKRHFKSRLVGTVLNGYLCLRKLVVQRTKLIDETQDMLLEMLEDMTTGTESETKAFMAVCIETAKRYNLDDYRTPVFIFERLCSIIYPEENEVTEFFVTLEKDPQQEDFLQGRMPGNPYSSNEPGIGPLMRDIKNKICQDCDLVALLEDDSGMELLVNNKIISLDLPVAEVYKKVWCTTNEGEPMRIVYRMRGLLGDATEEFIESLDSTTDEEEDEEEVYKMAGVMAQCGGLECMLNRLAGIKDFKQGRHLLTVLLKLFSYCVKVKVNRQQLVKLEMNTLNVMLGTLNLALLAEQESKDSGGAAVAEQVLSIMEIILDESNAEPLSEDKSNLLLTGDKDQLVMLLDQINSTFVRSNPSVLQGLLRIIPYLSFGEVEKMQILVERFKPYCNFDKYDEDHSGDDKVFLDCFCKIAAGIKNNSNGHQLKDLILQKGITQNALDYMKKHIPSAKNLDADIWKKFLSRPALPFILRLLRGLAMQHPASSDWN	719894	753887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_720594_720717_720877_721833_721944_722576_722719_723109_723192_723489_723664_725724_725847_727172_727371_728851_728933_731968_732057_732553_732682_733588_733697_734108_734229_734972_735164_735629_735804_736742_736838_738267_738487_739639_739758_740763_740907_741377_741504_742661_742801_745813_745966_749174_749266_749994_750158_753491
901221	contig_3018_pilon	+	3246	15	Intergenic	novelGene_78817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	167	346	541115	541294	TRUE	45	CCTGTCAGTTAAAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFSEALAVVFQLEVTVSDEAYREILTVVKEALVKDNHAVQVCEASRTLEDFLCGVMEDSATLLVQKAAFVKVARMNCEGVAEEDDSLKVLGCYLIAVFVGALFLREHHSQLLVQ	540948	566842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_541379_542306_542405_542584_542708_542814_542902_543787_544075_545131_545701_545831_545887_546200_546454_547002_547146_547311_547567_550198_550507_550842_551009_561477_561580_562782_563044_566733
901222	contig_8865_pilon	-	1663	2	Intergenic	novelGene_164474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	0	154	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGCCTTGCACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592629	579070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_-_580684_592579
901223	contig_1239_pilon	-	2788	1	Intergenic	novelGene_150403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAGGTAACCACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363726	360938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_360900_363700
901224	contig_6599_pilon	-	1123	2	Intergenic	novelGene_175972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
901225	contig_3627_pilon	+	2217	10	Intergenic	novelGene_78570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_4	35.2055691441771	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	25	1917	1313510	1343837	FALSE	30	TTTTAAAGTCATTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPPLSKAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKREYASDLSPPRKKPAKSHFRNKQHDSKGSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313485	1344137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323504_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
901227	contig_15105_pilon	-	1696	3	Intergenic	novelGene_151039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	973.5	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	38	517	839916	836135	TRUE	65	TAAAAAAAAAAAAGTTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGQSVNALFQYIPFCSDL	839953	833364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_833639_835229_836548_839849
901228	contig_10867_pilon	-	4667	2	Intergenic	novelGene_159444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6461	junction_1	0	11	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGTTATATGTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90537	85522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_88256_88603
901229	contig_854_pilon	+	1082	7	Intergenic	novelGene_36275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	58	636	543600	562402	TRUE	20	ACGTTATTCTTTCTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543542	563473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
901231	contig_5210_pilon	+	1842	12	Intergenic	novelGene_65438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.022556312081	421	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	571	1491	611037	622124	FALSE	70	GAAAATAAAAATGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSFEEKYGRAHPVFYQGTYSQALNDAKRELRFLLVYLHGDDHQDSDEFCRNTLCAPEVISLINTRMLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRNLQEEKEKKLECLPPEPSPDDPESVKIIFKLPNDSRVERRFHFSQSLTVIHDFLFSLKESPEKFQIEANFPRRVLPCVPSEEWPNPPTLQEAGLSHTEVLFVQDLTDE	565722	622475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565827_591290_591360_602445_602559_606728_606863_608380_608458_610963_611103_613063_613150_613245_613338_614670_614849_616480_616653_617262_617407_621941
901232	contig_12086_pilon	-	1958	4	Intergenic	novelGene_74705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_1	40.9416929574514	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	173	793	14945	11290	FALSE	60	GAAAAAAAAAATCGGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVVRRCPFLSRVPQTFLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEAGAKPAPRALSTSAVHCQQVKETPPANEKDKTAKAEVQQASDGSQKTPDGAQLPSEHLSPATSQGTASKCPFLAAQMSQRGSSVFRKASLELQEDVQEMHALRKEVVQTSVNPRVISVKTDGEEPSGLLKNFQDIMRKQRPERVSHLLQDNLPKCKPYCYLSDAGESL	16132	10124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_11484_12644_12873_14746_14967_15981
901233	contig_12479_pilon	-	2960	22	Intergenic	novelGene_56858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	112.467823566869	31	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	255	2276	593987	451002	FALSE	90	ATAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLLETPIRMSVLSEVTASSRHYVDRLFDPDPQKVLQGVIDMKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	594241	450317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773_537846_548942_549020_593942
901235	contig_12638_pilon	+	2608	10	Intergenic	novelGene_33213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	45.8324915747619	277	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	470	1252	474568	574233	FALSE	20	CTGCCCCTGGAATGGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGTSQISQSLACGGSEQIPGVDIQMSRKYHTTNKLLTVKDSPQPVEEKVGALTKIIEAMGFTGPLKYSKWKIKIAALRMYTSCVEKTDFEEFFLRCQIPDTFNSWFIITLLHVWMCLVRMKQEGRSGKYMCRIIVHFMWEDVEQRGKVMGVNPYILKKNMVLMTDSFYAAILGYDEGILSDDHGLAAALWRTFFNQKCEDPRQLELLVEYVRKQMQYLDSMNGEDLLLTGEVSWRPLVEKNPQSILKPHSPTYNDEGL	438136	575589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_438522_474483_474589_487758_487846_490168_490277_505351_505425_514586_514645_529209_529319_564798_564877_569794_569909_574098
901236	contig_11386_pilon	+	5022	1	Intergenic	novelGene_82808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	381	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	46	141	180	320	100822	100962	NA	20	GGGACTGGCACCACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSNSASVHGILTPLPGGKLGCGQCPHYSGASPPTLALSRVGDGHPSLLPLIDDHPHSKLMLASLPSPRRLSSFNLLTSSQSSKVGWGRHPAQLKYISQGTSGDRK	100642	105664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_100600_105700
901237	contig_8520_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_85444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.5	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATATTTATGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387892	215410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_321751_321844_387778
901238	contig_18162_pilon	+	2701	3	Intergenic	novelGene_122324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1624	2427	9935	10738	TRUE	40	AGAAGCCTTGAATCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	8110	16567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_9694_9894_10810_16364
901239	contig_8312_pilon	+	2376	5	Intergenic	novelGene_152881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	839	junction_3	351.023058359419	114	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	979	1470	263693	271808	FALSE	30	CCCAGGATTCTAAAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPRGIKEALSTPSRVTHRDQEWYDAEIARKLQEEELLATQVDMRAAQVAQDGEIARLLMAEEKKAYKKAREREKSSLDKRKHDTEWKPKTSKSANPKSKESDEPHRSKNNRPARPPPPAGTDAKDLDYPHFTNQRNSTRHFSKWESSHKGKKSIYSHISGSS	262714	272714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_263807_264911_264957_265066_265172_266972_267053_271660
901240	contig_11316_pilon	-	1638	2	Intergenic	novelGene_122613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCTAGGTGCATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137872_137961
901241	contig_5023_pilon	+	3164	1	Intergenic	novelGene_7170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGAGTATCTGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538657	541821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538700_541800
901242	contig_408_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_84939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223175	225745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_223200_225700
901243	contig_10197_pilon	-	4819	2	Intergenic	novelGene_115226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1049	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGGAAGTAACTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923586	918478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_919186_919474
901244	contig_821_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_149408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGTGGCAGAACTATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227359	228029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_227400_228000
901245	contig_15720_pilon	+	2003	2	Intergenic	novelGene_41959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	496	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	970	1548	307109	307687	FALSE	60	ACAAGAAAAAAGAAATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEMLLFIFWISNRCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSVFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSAFSSTGRSSAVLFWTPTGTIRSCFCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFIDCIFVCFVLLFCFIWLCLSRRAVCSLLFAHLWARYFSPPSPMGRVSHSGMVQQGRSN	305307	308142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305801_306632
901246	contig_11003_pilon	+	2958	1	Intergenic	novelGene_105446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTTCTGACACCACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388812	391770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_388800_391800
901247	contig_610_pilon	-	3403	9	Intergenic	novelGene_76670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	540.695255550666	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	448	1071	38502	32917	TRUE	35	AGATCCATGACTTATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	93785	30504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_30850_30929_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_93715
901248	contig_9471_pilon	+	4885	11	Intergenic	novelGene_21695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3288	3695	71195	74266	TRUE	10	CTTCTGGCTTTTGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDQVLQMITQRLNIPAAFLQVPKGYVAWDGGQAKQEISLNWNALPQVHLPGGRGYLLRIQSICFNGYRRLYLITLTGLDEKEFGFVSQTRALLGCEVRHDVPNGNEGPVCGVDSSKLPMGQDTAHEAVPVSVA	62997	105627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_64427_69336_71199_73862_74374_74922_75028_77001_77093_79127_79172_81091_81200_87353_87490_100470_100565_102735_103089_105475
901249	contig_2834_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_28024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2	334	771571	771239	NA	55	TATACACAATTAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSQIYLSQYPICLALLFEPVGGERSFHQWWHLSCFSLSSLLSPLLQNYSAVKLKHLLTSLLSSDATVTIWGEKEWWADEKARREQSAAWTALLTTLRSRAFWGPAPEPAL	771572	769367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_769400_771600
901250	contig_10930_pilon	-	720	4	Intergenic	novelGene_37058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	59	junction_1	2305.87814075246	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	20	409	280370	279421	TRUE	45	GTAAGAAATAAAGCTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRKTQGKKISWMQVGS	280389	278443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_278637_279302_279467_279700_279832_280157
901251	contig_6488_pilon	-	3063	3	Intergenic	novelGene_44729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	282	74	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	34	717	91238	53739	FALSE	35	TCCCCAGGTTTCAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQVKSGKINRGGECMCVCVCVCVCARAYACKLVNGGRKGEQFCGHPGILQ	91271	51392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_54122_90850_90987_91073
901252	contig_4857_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_48856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTAAAGGACATAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338354	1340190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1338400_1340200
901253	contig_2062_pilon	+	2862	2	Intergenic	novelGene_139042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTAACCACAAAGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205064	1208902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1207778_1208753
901254	contig_15866_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_63651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCACCCAGCATATGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524837	526504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_524800_526500
901255	contig_2799_pilon	+	4093	20	Intergenic	novelGene_85504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	706.309577194423	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1287	3861	232	4092	602301	761625	FALSE	15	GTGAGTCTCTCTTTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STFSPASRPGSESVTKDDALSPVPSQKEKGTATPELHQATDCRDDPGGDSSDPNKQPLEDSTASLDTSFSATDLQPRMGNTSSLGLGGQHEEPCPSAASEVLSIEGLDTESSLLSVSKASLATDSVLTGEGKQLVVPESSAAQGQDDKDKAVICHFIEEDSLSSGVLQEEQRTPPPGKEALGFCEEPSSAACAEGNTLQHSNSLDTSSAFLNVETENNKKVAPQGSLLTEGGAAQSLVPPGASLTVASRQEALGPEQSNSFVQDAGVKDAQTQGETAACEVNENVTLDVAMVSTQQDTVGARRKDISHNTQDIPASKVLLSPEKNMILGLPEALPDKSMTDLQVAVTPEVLPLDWEKGKLEGAGHSCTLGNSKEAQMDDEANQVPLQPVAKELTADRGLSTTENRAPPGMKEVRQAAAPRKERSVPTLSSTVSAKAVTLPEGADLIEEAASQIVAVVIERVKASGALITDREISHILPPSPSESGPVTEQLENVSPEKVNAFLPGQTPQVVSIHGEATVNVAGCCAGKEEPEKSILPVQGPEPATEMPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSFSLEGLTGGADVRNKPSSSLEANSANTKELRHPFSVEARGDSLVSLSEEDLESGQRERRMFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANRRSQQSVLLSKSVSIQNIAGVGNDESMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLMGDFEIDSKQLEAESWSRIVDSKFLKQQKKDVIKRQEVIYELMQTELHHIRTLKIMSDVYSRGMMTDLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVEKSEKNFLIRRIGDVLVNQFSGENADRLKKTYGKFCEQHNQSVNYFKDLYTKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRMLQCTK	602069	761626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_602847_602903_603763_607925_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191_699246_704625_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302_755439_756998_757112_757712_757866_758463_758715_761269_761396_761508
901256	contig_5019_pilon	+	3782	1	Intergenic	novelGene_109173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	713	1147	58807	59241	NA	25	GCATAATGACCTCCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIGGRLINNLQYADDTTLLAEIEENFKHLLMKIKDRSLQHGLQLNIKKTKILTTGPIGNIMINREKIEVVKDFVLLGSTVNTHGSSSQEVKRCIALAKSAAEDLFKVLKSKDVTLKTKMRLTEAMVFSVASYAYESWTMSKED	58094	61876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_58100_61900
901257	contig_5864_pilon	+	787	3	Intergenic	novelGene_162774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	91	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	107	385	79500	98258	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAGVFTVWKLLLSAWLVSRGSRLSAREREAPDGVMDFENLFSKPPNPALGKKPATDSDERIDDEIDDTEVEETHEEKIKLECEQSPPKWLSAWLLTERSAVRTHQPLRGRKMWPSAFTKITASETL	79393	98660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_79577_96694_96780_98141
901258	contig_2776_pilon	+	3116	1	Intergenic	novelGene_175039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGCGGCCCCGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11801	14917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2776_pilon_+_11800_14900
901259	contig_16635_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_153149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1005	1316	89422	89111	NA	30	TCCAGGTTCATTAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNWEPVLQCPLLSLGSKGPCAPAHWDSRSQTRGDPHGHTPQATPRRATDAVGAAGRSSGGKKHAGVTGQSINRKETLIKVIGYMLLKKKMLQECATETSLS	90426	88917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_88900_90400
901260	contig_6445_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_77101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143781	1141517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1141500_1143800
901261	contig_16185_pilon	-	1830	9	Intergenic	novelGene_144740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	86.3886566627818	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	147	1160	127403	82386	FALSE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134409	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_127364_127464_134323
901262	contig_9272_pilon	+	3261	18	Intergenic	novelGene_125891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	219.366262432092	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1042	3126	134	3259	251187	303160	FALSE	65	ACAAAGAGAAAGTAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIVEDGGQTQYEATLQQGFQYQPTTEDLPPLTNGYPSSISMYETQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVSFGKQVDSPSATADADISDVQSVDSSLSRRSFGMNKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLTLLPDGKFICMECQTGQHPCFSCKVSGTDVKRCSVGACGKFYHETCVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSVEKDIYKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSIFVSSYILICSNHSKRSSNSSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIDMPEGCWNCDDCKAGKKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAETCNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELK	237462	303162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_237519_251109_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_281875_282007_282540_282670_283486_283614_289341_289540_290013_290188_294983_295131_298470_298628_302280_302484_303122
901263	contig_12677_pilon	-	716	1	Intergenic	novelGene_110879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAACACCTAATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3674	2958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3000_3700
901264	contig_5297_pilon	-	1848	8	Intergenic	novelGene_175666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	649	1005	91341	90627	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSAAVLAAAAGRAAGSPSVGAGAARSLEVAGAAAPVALVVWTEETGAAAAGGGCDGASAVSLVSTGPGSGGRYLPKRRQGHLEQTAPTISCTWVWRSTLGSQTCTNVLRDTSPPPL	91989	72045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_72221_82408_82657_83142_83227_84767_84897_89131_89234_89732_89798_90586_90762_91119
901265	contig_11248_pilon	+	3166	1	Intergenic	novelGene_142535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAAGCAGCTTAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135157	138323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_135200_138300
901266	contig_12279_pilon	+	1813	2	Intergenic	novelGene_50125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTATAACACCCAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71309	73318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_72163_72358
901267	contig_6914_pilon	-	2318	7	Intergenic	novelGene_151712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGGAGATTTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20483	14282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_14346_15164_15330_16339_16482_17099_17210_17376_17593_18754_19433_19539
901268	contig_3975_pilon	-	2195	6	Intergenic	novelGene_54802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	625	junction_1	234.269929781865	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	639	1319	2018596	2016415	FALSE	10	TTTCTCTACTCTCCCGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKG	2019234	2015538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502
901269	contig_9098_pilon	-	4269	1	Intergenic	novelGene_75803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	341	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACATATGAAAAGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294564	290295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_290300_294600
901270	contig_5092_pilon	-	3502	7	Intergenic	novelGene_62276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	634.851535575226	179	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	235	414	253812	253633	TRUE	35	AGCAAACTAATGATTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGGTFPVRSSRARQRSRVGRGSAFVETGQVRLEGGRGAACAQAARGPWAFRALAEPHGLGAGASKGRPLLLLGHCPRMRSLNRADPSLVLVAFDKHGTSVKAVALFLITSHSSISKEESSQNAEHLTGLAVVNTVC	254046	232287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232437_232536_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_250924_251143
901271	contig_2069_pilon	+	2244	1	Intergenic	novelGene_23313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1435	1758	523820	524143	NA	25	CAGTCGGCAGTGGCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEDAPGCSPAVAGRGRQRAAVLPNRSPGAWPGQGFGLMALTKLPLPLLSRKGEASATFYHSALTLKGAVLAWLLEWTESTVERAGGRRRWGGALPVEGRIRSLAQ	522385	524629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_522400_524600
901272	contig_5502_pilon	-	5418	1	Intergenic	novelGene_154989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCTTTGAATCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409919	404501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_404500_409900
901273	contig_9227_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_154311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATGAGACCAGTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197854	196445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_196400_197900
901274	contig_9538_pilon	-	416	2	Intergenic	novelGene_176451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGGATTGGCTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28582	28027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28172_28310
901275	contig_10005_pilon	+	5463	23	Intergenic	novelGene_148900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	521	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGCCTCCCTAACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64131	180652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_66474_68559_68662_69411_69585_69678_69766_74176_74271_74498_74585_76137_76368_78256_78339_78957_79087_79733_79946_84145_84296_84714_84760_86921_86988_103100_103233_105085_105243_105922_105965_120369_120529_131707_131852_132123_132302_137513_137726_138167_138361_139667_139835_180371
901276	contig_3153_pilon	-	1805	14	Intergenic	novelGene_104670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.3558531617268	102	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	78	980	247624	204641	FALSE	30	AAATTTTTTTTTTCATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRKQTKKKTTAPRERLILAGVVQRLMMGTIHLFRKPQRSFFGKLLQEFRLVAADRRSWKILLFGAINLICTGFLLMWCSSTNSIALTAYTYLTIFDLFSLMTCLISYWVMMRKPSPVYSFGFERLEVLAVFASTVLAQLGALFILKESAERFLEQPEIHTGRLLVGTFVALSFNLFTMLSIRNKPFAYVSEAASTSWLQEHVADLSRSLCGIIPGLSSIFLPRMNPFVLIDLAGAFALCITYMLIEINNYFAVDTASAIAISLMTFGTMYPMSVYSGKVLLQTTPPHVIGQLDKLIREVSTLDGVLEVRNEHFWTLGFGSLHLGF	247701	203815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_204656_204932_205002_206345_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212283_214487_214583_217133_217170_217855_217937_221159_221226_224955_224999_229052_229138_233949_234037_247618
901277	contig_11572_pilon	+	3041	11	Intergenic	novelGene_100038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAGGAAAAATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140850	180975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_141390_142241_143600_152950_153125_153686_153773_156393_156572_157849_157995_158410_158548_170052_170118_174873_175037_178262_178338_180854
901278	contig_16148_pilon	-	2182	10	Intergenic	novelGene_50373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	420.583926828134	3	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	1279	2181	89222	74801	FALSE	40	CACAAGAGAATGGCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALILVLGVLMENFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEI	153087	74799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89050_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
901279	contig_16525_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_133790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	3	449	91483	91929	NA	20	CCCAGAGTCCAAGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSCIFNYLGSHTCRDLSPQFSWGLRYQEFRSPAQRSTEERQLLSEPGLCEVVGGTDFKHLGRERAQRYDPLRSGDSEDPGPLLSQTQALRPPAPSALGLGTFVSSAVCTSLFLLPAYIICCSGLQPAGEGKRRTEHNWGTLECSLGF	91480	93317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_91500_93300
901280	contig_6325_pilon	-	3747	4	Intergenic	novelGene_143350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1748	2059	388148	387837	TRUE	50	AAAAAATCCCCTTAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNQFSCNLREIVPTTTTLYTEQIIQEAGLYEKHGIRIEGRLINNLPYADDTTLLPENERGLEALTDEDQRLELSVWITPQHKENKNPHNWTNKQHHDNWRKD	389895	239372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_240363_305030_305267_353478_353864_387759
901281	contig_9839_pilon	-	5305	5	Intergenic	novelGene_88491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1366	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGACCCTTAGTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61483	45310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45422_49447_54121_57650_57848_59821_59926_61263
901282	contig_1154_pilon	+	5823	3	Intergenic	novelGene_87114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	450	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4477	4866	406216	406605	TRUE	45	CAGGAGAGGAAGGAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKKSRQYKEIKEYFKLRKIEVNIKVTTKETNSPTHQNKKQEKHKDSANTKSSTMKKMKRKTTQHRKLSGKKKLSTAHTHTKRHQNDSTKLTPISDHAEGKWTKCTNKETDSGGMKKKKKKKKKTLICL	401185	407609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_404308_404861_407385_407431
901283	contig_13004_pilon	+	1721	9	Intergenic	novelGene_112708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	289.609408298487	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	747	1361	943766	952167	TRUE	40	ATAAAAATTTATCCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAEGKSVQQTVELLTRKLEMLGAEKQGTFCVDCETYHTAASTLGSQGQAGKLMYVMHNSEYPLSCFALFENGPCLIADTNFDVLMVKLKGFFQSAKASKIETRGTRYQYCDFLVKVGTVTMGPSARGISVEVEYGPCVVASDCWSLLLEFLQNFLGSHTPGAPTVFGNRHDAVYGPADTMVQYMELFNKIRKQQQVPVAGIR	837850	964577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_926989_927531_927669_940213_940371_943755_943911_948443_948698_951951_952454_964503
901284	contig_10307_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_170300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650575	648223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_648200_650600
901285	contig_9319_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_154647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97187	95743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_-_95700_97200
901286	contig_5602_pilon	-	2574	9	Intergenic	novelGene_133010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_8	96.5362626166976	354	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	21	1082	516382	488176	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQGKFCHGKTGSGAGTRLSSDTNENEVKSSEEPLLKKSSRRFVIFPIQYPDIWKMYKKAQASFWTAEEVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516402	486683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_511996_512153_516328
901287	contig_1380_pilon	-	3301	1	Intergenic	novelGene_138865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAGAAGCATCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18541	15240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_15200_18500
901288	contig_16098_pilon	-	1043	5	Intergenic	novelGene_46198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	434.138514762282	74	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	67	531	708710	706282	TRUE	5	GCTCTGGCTCTGGGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHSDEKPYQCPVCQQRFKRKDRMSYHVRSHDGAVHKPYNCSHCGKSFSRPDHLNSHVRQVHSTERPFKCEKCEAAFATKDRLRAHTVRHEEKVPCHVCGKMLSSAYISDHMKVHSQGPHHVCELCNKGTGEVCPMAAAAAAAAAAAAVAAPPTAVGSLSGAEGVPVSSQPLPSQPW	708776	705353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_705403_705818_706431_707721_707894_708172_708237_708630
901289	contig_5033_pilon	-	3368	1	Intergenic	novelGene_28896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	908	1225	443573	443256	NA	30	AAGGAGGCACCATATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHRQGRGTLVLHCDHEVVEALVLAVWRGGPCGDLATDSVHAEGHVLVALGDVVGQDAVEPNVMVGGSHLHHSGAPTHVLGGEQESGHSEFKVFGAKSSTHTYSW	444480	441112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_441100_444500
901290	contig_821_pilon	-	4107	2	Intergenic	novelGene_149428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4183	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTTACTGGTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466146	461990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_464336_464384
901291	contig_3822_pilon	-	2498	12	Intergenic	novelGene_133309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_11	980.600869934196	58	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	777	1720	2496	292774	277222	FALSE	75	GAAAGAGAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASSILWCRGYLKQHGIQPRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKVTRDYDEEEQGYDS	297605	277219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277264_277370_277510_277901_277998_280890_280939_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119
901292	contig_10286_pilon	-	3033	7	Intergenic	novelGene_98396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.837685426218	24	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	105	1319	406140	382865	TRUE	10	GCTGGTACTTCTCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHIILRKKLSCFVLAFFLFAIVCVWKEMKKGSYYDSLKWETEGSPLVMGLGKMAMGSGPQSKVSTQHLRRSNQALNCTKASAKAKPQPSFQVWNKDSSSKNLPSRLQNIRKNYLNMNKYKVSYKGPGPGVKLSAEALRCHLRNHVNVSMVESIDFPFNTSEWEGYLPKENIRTKAGPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIDDHDAVLRFNAAPTANFQQDVGTKTTIRLINSQLVTIEGRFLKDSLYNEGILIVWDPSVYHSDIPEWYQHPDYSFFNNYKSYRKMHPNQPFYILRPQMPWELWDILQEISPEEIQPNPPSSGMLGIMIMMTLCDQVDIYEFLPSKRKTDICYYYQKFFDIACTMGAYHPLLFEKNMVKHLNQGADEDIYLHGKATLPGFRSTHC	410153	380010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380897_382036_383107_383409_383585_384953_385053_396479_396578_405539_406181_410089
901293	contig_12528_pilon	-	1752	10	Intergenic	novelGene_81325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	514.0441927488	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	501	1286	966228	933323	FALSE	30	GAAAAGGTTTATATTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968111	932856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947107_956098_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
901294	contig_7644_pilon	-	3976	1	Intergenic	novelGene_64257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACACCAGTTGCCATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184913	180937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_180900_184900
901295	contig_4857_pilon	-	4723	13	Intergenic	novelGene_48684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGTACCAAGCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1150503	1123488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1123660_1127712_1127839_1128627_1128775_1130169_1130268_1133429_1133521_1136156_1136236_1137331_1137424_1137632_1137784_1139970_1140131_1141537_1141631_1143087_1143159_1145849_1145950_1147159
901296	contig_3382_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_124052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224260	223406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_223400_224300
901297	contig_10500_pilon	-	2537	9	Intergenic	novelGene_41239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	895.865215517937	13	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	182	913	1640040	1630553	TRUE	20	TATCTTGTATTTCTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSWTTPFLHS	1640221	1626417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626842_1628378_1629573_1630546_1630581_1630638_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
901298	contig_9199_pilon	+	3191	9	Intergenic	novelGene_65620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_8	49.4619487586165	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	40	969	42527	56249	TRUE	25	GACACATCAGCTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSSFLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKG	42487	59152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54673_55404_55498_56069_56407_57087
901299	contig_12938_pilon	+	12220	1	Intergenic	novelGene_99736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	754	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	6333	6725	80440	80832	NA	20	TATTCTCATTCTTATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNMYCVHGALIAQWIGKNNVRRQLICPLEAWSLVVGKEYIFLMKQEKAYKGLSRQEQKPPAHVWTSLVVSRVKWEWEENLNLCCEHVSALPQFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	74107	86327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_74100_86300
901300	contig_756_pilon	+	5127	4	Intergenic	novelGene_134779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	261.407727506285	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	249	569	203300	204241	FALSE	50	TTAAATGTAAATGAACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEDSTVELKLEKREPLKGRAKIPVTLKQRRVEHNQVGEKTEERRIERDILKEMFPYEASTPTGISASCRRPIKGAAGRPLELSDFRMEESFSSKYVPKYVPLADAKSEKTKKGRSIPMWIKILLFVVVAVFLFLVYQAMETNQGNPFSRFLPDSTESK	187973	208799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_188073_193805_193904_203248_203338_203958
901301	contig_10414_pilon	-	2284	8	Intergenic	novelGene_146940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	70.6211507890909	288	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	421	1269	163508	157163	FALSE	15	CACTCACTGGCTCAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIVLSPTCAQSSLYLASHQKGSTEEEGLVNGSLTSWLQDLVTFEDVAVEFTQEEWALLDPSQRKLYRDVMLENSRNLASLDLESIPKVKELTSKQRVFRKKQTKHMKTERSHLGVKLNECNQCFKVFSAKSSLTQHKRIHTGEKPYDCNQCGKSFSSSSYLTVHKRIHNGEKPYECSDCGKAFSNSSSFKSHVRIHTGEKPYECDECFRVFRTRYSLKMHKRVHTGENHYECNQCGKTFSTCASLTVHNRIHTGEKPYECHDCGKTFRESSHLTQNVRTH	174581	156147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_157682_158168_158252_162099_162227_162818_162908_163477_163606_165110_165216_166211_166294_174445
901302	contig_753_pilon	+	1453	1	Intergenic	novelGene_113032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGTTGGTAAATGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424896	1426349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1424900_1426300
901303	contig_11088_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_85045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGGGACATGAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
901304	contig_10793_pilon	+	2969	15	Intergenic	novelGene_83413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3852.22479648489	2	84	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	156	959	152887	163940	TRUE	15	AGTGTTCACTTGTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130940	168639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_131002_151413_151488_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054_165377_166401_166473_167141_167802_167839
901305	contig_4402_pilon	+	2962	18	Intergenic	novelGene_140786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	247.69646007196	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	130	2250	197175	253248	FALSE	45	TTTATATGAAAACTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHQSHKRLTGCFQGQHGTDAERRHKKLPLTALAQSMQEASAQLEDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEREISDPLNVIAEVEIPNIQKQRKQLAKLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYDEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSEINKMTPSNIAIVLGPNLLWAKNEGSLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEIEFNVSETFVPLAIPNSNHSPHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESPPIPKDSVSAAVPTPGRNSSQVTPGPNQAQAATSSHQLSVGPAHNSAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSPGTSQHPPSLSPKPSTRSPSPPTQHTGQASGQPSAAPQLSAPRRYSSSLCPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPSSQGSPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNSGLPASQTQAVSNPETVQPHGGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPHPPGAHSAGDGSLTSTVPTASKIVTDTNSRASEPLRNIFPELHSDSASKDLPSRILLDIDNETESTAL	145644	253960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_145704_193471_193512_197144_197250_203276_203351_204868_204981_205222_205300_208980_209093_211528_211598_211755_211798_223678_223791_224379_224462_226245_226327_228336_228451_230977_231070_232549_232707_236194_236365_243517_244139_253117
901306	contig_10892_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_116743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	1243	1743	120512	120012	NA	50	CCAAGATCAGCAGACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETRVHGHTFWTEASRLLVFLVSSVFGSVSCVLLALRPHAHICPAGASVPKLSSSTGKCPEAPHSTRKPSAHRNSAPLLSGPASLAPSISAQRHPTPPGSLLLTGTQQSCSVGQLQHHLAPVSWFCCCWFSAAATSLPLHVLCCCWSSATAASFSFKITSTF	121754	119754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_119800_121800
901307	contig_5261_pilon	-	1354	3	Intergenic	novelGene_102499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAGTCAAATCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842925	839818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_840704_841858_841984_842581
901308	contig_7254_pilon	+	2145	5	Intergenic	novelGene_145853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	655.11239493693	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	5	499	228460	286535	FALSE	15	AGTCTTTTTTACTGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAGTSNYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSARDGRRDSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAEYTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQVIYRLRKSGREKLTVLLISLTSRINSRLIVMDSVTWSDKAEATVFLCSLF	228455	288181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_228491_230872_230988_242400_242489_243050_243169_286392
901309	contig_6100_pilon	+	5489	2	Intergenic	novelGene_168115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	4500	4862	455083	455445	TRUE	15	GAGCGCACTCTCACCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWLRDWEESCRKGPLDTVASKLGCKLGQQTSVFETVSKLRSTSSTLSNRESPGFMSSLKLQISMPVEHKSVATVSQTGCRLSDRSSVFMSTVLHTSIVFECSGEGIFIPNLSIESPL	450583	493156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_455890_492973
901310	contig_12626_pilon	-	7190	26	Intergenic	novelGene_80430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1094	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	5504	5917	164938	158023	TRUE	40	GCAAATCTATCTATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFSGLHSSEPSPWSGSMPPLLPSSSSDMEFFKGSLNTLPCARYSSSSDWSSSTWSCNILHCCSYSFLICASLSSCRKNSALLGSRSPNFSANTFSKFRCSLFVRFSYFANFSAFSRSSFSRRLFSFKERVRRSRM	196505	118538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_118671_132099_132272_147726_147767_149280_149472_155635_155782_156278_156448_156971_157109_157455_157599_157879_158055_160815_160927_161300_161392_162653_162793_164897_165021_166205_169837_171111_171242_171349_171419_173058_173275_176132_176247_179385_179509_180233_180348_181145_181293_183340_183521_184945_185093_187865_187968_191970_192171_196257
901311	contig_6418_pilon	+	6351	17	Intergenic	novelGene_81242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4.11504480534538	53	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	4587	5090	1496257	1505793	TRUE	5	CTCGCGCGCCTCAGTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDLERFLLENSFFSEGLSSSSGITCSSSSGLLSFSFPSTSGEHASFCDIISDSSFSPEISSSSERTKKASFGKLSLLSCLDGDPKEPSIFSSKSGFVSSIGRRDVLEKQVSSSSAGASFSKIGIISSVSMESVFSNIFSFLSSSITFSLMVSARSEEFSSSFFSP	1447182	1568469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1449165_1449537_1450369_1454062_1454175_1455957_1456143_1458960_1459119_1460540_1460618_1467819_1467885_1469633_1469699_1472221_1472860_1476860_1476950_1477830_1477905_1482694_1482760_1491131_1491269_1496148_1496297_1497627_1497712_1505413_1506967_1568381
901312	contig_5878_pilon	-	4058	17	Intergenic	novelGene_145714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_8	57.8759111699332	329	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	915	2744	247379	203001	FALSE	80	AAGAAAAAAATAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTFVTQQWKQSKEKSNCLHNKKLSEKKVKSPLHLFSTLRRSPSYPPPGCGKGKCKLKSEQDGISKTHKLLRRTCSSTVKTDDVCATKSHRTFGRSLSSDPRAEQAMTTIKSHKLLNRPCPATVKQEDCLTLKSHKLLTRSCSGDPRCEHNTSLKPHKLLSRSYSSNLRMEELYGLKNHKLLSKSYSSAPKSSKTELFKEPNSEGRRLSLTSGLIGILTPSSSSSSSSQPAPNGAKCIPVRDHGFLVQTIEFAEQRIPVLNEYCVVCDEPHVFQNGPMLRPTVCERELCVFAFQTLGVMNEAADEIATGAQVVDLLVSMCRSALESPRKVVIFEPYPSVVDPNDPQMLAFNPRKKNYDRVMKALDSITSIREMTQAPYLEIKKQMDKQDPLAHPLLQWVISSNRSHIVKLPVNRQLKFMHTPHQFLLLSSPPAKESNFRAAKKLFGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVVASNTRLQLHGAMYGSGIYLSPMSSISFGYSGMNKKQKVSAKDEPASSSKSSSASQSQKKGQQSQFLQSRNLKCIALCEVITSPDLHKHGEIWVVPNTDHVCTRFFFVYEDGQVGDANINTQEGGIHKEILRVIGNQTATG	250057	201686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203104_208192_208278_209329_209400_210462_210537_213578_213649_214925_214999_215168_215282_216486_216536_219428_219497_221820_221887_223064_223191_229679_229773_244459_244556_244657_244709_246120_246692_247257_247384_249147
901313	contig_20550_pilon	+	2261	21	Intergenic	novelGene_142617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	260.215891136571	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	228	1889	12976	38142	TRUE	20	CTGTGTCGGTAAGTTGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ	3816	38576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37627_37774_38133_38240_38301
901314	contig_7391_pilon	-	1165	2	Intergenic	novelGene_112153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCGTGGAGCACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411020	407273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_408198_410779
901315	contig_546_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_117219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTCCACCCCTAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129468	131913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_129500_131900
901316	contig_10734_pilon	-	2314	13	Intergenic	novelGene_51490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	587.282081333626	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	719	1828	2274500	2265543	FALSE	80	AAATAAAAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305172	2265056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277141_2280911_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
901317	contig_16724_pilon	-	4013	13	Intergenic	novelGene_105265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	155.944078295893	557	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	278	1762	391285	331871	FALSE	20	TAGTTTTAAGACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSSAIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKSLLGDSAPALHLNKGTPSQSPVVGRSQGQQQEKKQFDLLSDLGSDIFAAPAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSASADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQTTGGSAGSVNANFAHFDNFPKSSSADFGAFSTSQSHQTASAVSKVSTNKSGLQTADKYAALANLDNIFSTGQGGDQGSGFGTTGKAPAASVVSVPSQPSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVGASAQTQPASSSVPAPFGAAPSTNPFVAAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPAGFGTPAPYSLPTSFSGSFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGAGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSSNPFMTGAPTGQFPAGSSSTNPFL	426986	329619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_331931_332507_332600_334575_334735_342058_342155_342363_342444_346177_346359_350065_350276_352957_353078_361200_361355_362404_362568_367525_367642_391231_391326_426749
901318	contig_8812_pilon	-	3322	12	Intergenic	novelGene_57256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.3847308584607	283	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1580	2086	14642	11788	TRUE	55	TGTGAAAAGAAAGGACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPSDSPSSESVSLSSRDLGTEITSRLADSVTSLSWMVFSKFSCCLSLNNTTLSKLLNVSEGTTAVPPVPCRQTVPLISQARFSPPSISSSLERTEESRLLSDVPRSFWSSRPSGYVSSCDTTTVLVEDAGIRAFLFWSPGASLLISTVLCRGMGLFPSFSIESSLV	25785	1540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_-_1656_2154_2241_3617_3680_6499_6644_10647_10855_11165_12283_14630_14895_15235_15354_15516_15731_22658_22864_23482_23566_25078
901319	contig_11720_pilon	-	1106	10	Intergenic	novelGene_43835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
901320	contig_3789_pilon	-	3597	2	Intergenic	novelGene_79866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	516	959	518579	518136	TRUE	35	TATAAACTGTGTTATGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQYQHQHIMDDHIYDAISRKATKPIAESPKNGSEGVQQYYKDPKRLCEEDLEKLGSRVKVGSEQAKDCLPAKPLEATLDKSEGNSRDGQGSDENEESGVVDWVEVTVGEEDAISDRSDSWSQTAPEGPAELADSDSESVPAEAGQA	519094	500073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_502708_518131
901321	contig_9871_pilon	-	2776	5	Intergenic	novelGene_75660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGAGCTCAGAGACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421028	408525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_408944_413890_413997_416272_416505_418631_418745_419121
901323	contig_16870_pilon	-	2479	1	Intergenic	novelGene_155541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCAGAGGGTCAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388101	385622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_385600_388100
901324	contig_4364_pilon	+	543	1	Intergenic	novelGene_782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532771	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
901325	contig_6795_pilon	+	2046	12	Intergenic	novelGene_27658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	301	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	654	1196	46216	117662	TRUE	20	TAATATTTTACTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASERIILISTVLILGHWSFWISCGIVLVTTTSSMADSSISRGASEDNRPWVAITKILYAPLSFRVSAAARKLSTSSMMLTYHNDGDPSSDIANNCDWRLFFRNQQGDLQAWVDGSGVPDHGRGVPPIHQVGLSILCFPMNHSYPQAQALRKRLCPLGGGWRLGHNHCIPVIWDLFLNIL	45562	129331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_46313_70582_70722_71972_72054_74615_74764_110794_110854_117643_117756_119019_119194_122888_123155_124203_124272_127904_127957_128909_129061_129285
901326	contig_5600_pilon	-	1733	13	Intergenic	novelGene_174952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.6989446973461	250	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	458	1402	212951	197234	FALSE	15	AGCCCTCATTGGTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIAEALVSKGLATVIRYRQDDDQRSSHYDELLAAEARAIKNGKGLHSKKEVPIHRVADISGDTQKAKQFLPFLQRAGRSEAVVEYVFSGSRLKLYLPKETCLITFLLAGIECPRGARNLPGLVQEGEPFSEEATLFTKELVLQREVEVEVESMDKAGNFIGWLHIEGANLSVLLVEHALSKVHFTAERSSYYKSLLSAEEAAKQKKEKVWAHYEEQPVEEVVPVLEEKERSASYKPVFVTEITDDLHFYVQDVETGTQLEKLMENMRNDIASHPPVEGSYAPRRGEFCIAKFVDGEWYRARVEKVESPAKVHVFYIDYGNREVLPSSRLGVLPPAFSTRVLPAQATEYAFAFIQVPQDEDARTDAVDSVVRDIQNTQCLLNVEHLSAGCPHVTLQFADSKGDVGLGLVKEGLVMVEVRKEKQFQKVITEYLNAQESAKSARLNLWRYGDFRADDADEFGYSPCPPG	412072	196902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_197254_197444_197503_197588_197634_199824_200029_201571_201686_202859_202930_203791_203916_206927_207070_212783_212973_296652_296763_356450_356593_394481_394555_411961
901327	contig_20199_pilon	-	508	2	Intergenic	novelGene_82544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	699	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44139	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41051_44035
901328	contig_854_pilon	+	3661	18	Intergenic	novelGene_36532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3647.77063452133	6	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	82	2463	1649514	1715205	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEMPASPPGFLCCSPFSSTPSPPPRI	1612864	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679325_1702030_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709629_1715130
901329	contig_4350_pilon	-	2310	5	Intergenic	novelGene_136385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	35.5140817141595	22	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAATTACATTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270253	255993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_257466_258627_258878_265079_265231_269224_269377_269968
901330	contig_4924_pilon	+	3257	1	Intergenic	novelGene_84704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTCATTACTCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81019	84276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_81000_84300
901331	contig_8452_pilon	+	2407	1	Intergenic	novelGene_48048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424699	427106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424700_427100
901332	contig_3787_pilon	-	2873	2	Intergenic	novelGene_102428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	2059	2562	724413	723910	TRUE	50	GCAAACGGTCATTAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHINIDILGISELKWTGIGHFKSDNRMVYYARNDKLKMNGIAFIIKKNISTSILKYNTVSDRIISIYLQGRLLFQIYAPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWKANVENKEGLVVGKYGLGDRNDARDSMTEFCKTNDVFIANTFLQQHKWWLYT	726471	604456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_604699_723840
901333	contig_15518_pilon	+	2092	3	Intergenic	novelGene_127610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	32	junction_2	238	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	436	561	15096	38055	FALSE	70	GAAATGAAAAAAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRAPSFLL	11195	39586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_38035
901334	contig_5961_pilon	+	4431	19	Intergenic	novelGene_144099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_14	442.860667690928	2390	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	541	3801	144074	214246	FALSE	40	TTTTTTAAAAGAGAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSVKSSAAYILFYTALGPRVTDVAT	113355	214876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
901335	contig_20378_pilon	+	3145	1	Intergenic	novelGene_159564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	197	616	18525	18944	NA	30	AGCTTCAACCACATCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPPRNVEFAHPKKEASVITPWGAAFTNSISKTLEQMLSSLIINLEEGLPPSPFPSLPPLPQIKAEGSIEDMQDRMKLEVLRILKAGEGHMPPSLLSSECVGCGEDTQGTRVGVKLRDTAMGRKSVLLSSSTAPGSEV	18328	21473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_18300_21500
901336	contig_14034_pilon	+	2231	6	Intergenic	novelGene_72633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	4.81663783151692	290	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	238	783	152621	157240	FALSE	15	CTTCTTGTAACTTGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEPGVSAPSIPSLVDRYFTRWYKADVKGKPCEDHCILQHSNRICVITLAGSHPVLQSGKTIKSISYQISTNCSRLQNKVSGKFKRGAQFLTELAPLCKIYCSDGEEYTISSCVRGRLMEVNENILHKPSILQEKPSTEGYIAVVLPKFEESKNITEGLLTQEQYEEVVGKRINVTTATL	152383	158688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_152700_153843_153896_154464_154595_156785_156863_156941_157012_157102
901337	contig_15449_pilon	+	4456	1	Intergenic	novelGene_33586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAACAAAAATGGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27901	32357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27900_32400
901338	contig_5770_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_74159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1772	2299	236340	235813	NA	45	TCACACCACAATATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKQNSQTKLMIMGLIRLQFRFRNAQDTVVPSGQPLLSHAHRHTSFWFLASAQLVKVLQSSFSCPNKRPEAPHSASNPRPGTTQLQLHGSANVAPPSAWRHPTLPASLLPKGTQLSCSLVWEAHCTISCRHFSATASHLSSVLQLSLSLCLLVPGASQCRDPGSKGHTVLLALLS	238111	235645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_235600_238100
901339	contig_1645_pilon	+	7135	4	Intergenic	novelGene_178769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	159	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1008	1652	64700	65344	TRUE	40	GAGAGAGATAGACAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQNAKKSSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGVEDKHLDTTLFQENSEKRTKKSEETLRVTWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERIIEELMTENFPNIMKDEKLAIQEAQRIPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDSSEETMQARRQWDDVYKILKEKNCQPRITYP	63692	84020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1645_pilon_+_66201_68895_70301_80286_82350_82861
901340	contig_1699_pilon	+	2621	14	Intergenic	novelGene_72821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	129.169765821445	316	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	8	2446	81177	101858	FALSE	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVKTVVHGLVDFIQNYSRKGHETPQPQPNSKYKTSMCRDLRQQGGCPRGTNCTFAHSQEELEKYRLRNKKINATVRTFPLLNKVGVNNTVTTTAGNVISVIGSTETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDFSESVSGTKFEEDHLSHYSPWSCGTIGSCINAIDSEPKDVIANSNAVLMDLDSGDVKRRVHLFETQRRAKEEDPIIPFSDGPIISKWGAISRSSRTGYHTTDPVQATASQGSATKPISVSDYVPYVNAVDSRWSSYGNEVTSSAHYVERDRFIVADLSGHRKHSSTGDLLSIELQQAKSNSLLLQREANALAMQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVILEEQKTILPVTSCFSQPLPVSISNASCLPVTTSASVGNLILKTHVMSEDKNDFLKPVANGKMVNS	81169	102033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_81258_82789_82903_89240_89550_93132_93348_94520_94955_95512_95684_97598_97746_98067_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_101662
901341	contig_19362_pilon	+	6066	14	Intergenic	novelGene_157791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_10	452.114623890994	662	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	87	1454	32993	63943	FALSE	30	GATAGAACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSKDYCILYNPHWTALPSTVENATSISLMNLTTTPLCNVSDIPSAGIKDRAVVVQWGACHFLEKARIAQTGGAEALLIANNSVQYPPSGNKSEFHDVKILIAFISDKDLKDMKQTLGSNITVKMYSPSWPNFDYTMVVIFAIAVFTVALGGYWSGLIELENLKAVTNTEDREMKKKEEYLTFSPLTVVIFVVICCVMMVLLYFFYKWLVYVMIAVFCIASATSLYNCLAALIHKIPYGQCKIVCRGKSVEVRLIFLSGLCIAIAVVWAVFRNEDRWAWILQDILGIAFCLNLIKTLKLPNFKSCVILLGLLLLYDVFFVFITPFITKNGESIMVELAAGPFGNNEKLPVVIRVPKLIYFSVMSVCLMPVSILGFGDIIVPGLLVAYCRRFDIQAGSSVYYVSSTIAYAIGMILTFVVLVLMKKGQPALLYLVPCTLITASVVAWRRKEMKKFWKGSSYQMMNHLDYATNEENQVVPGEQAIQQ	32589	68555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_32661_32977_33161_33774_33865_34380_34515_39711_39861_42896_42994_43392_43495_44450_44533_45061_45137_50676_50734_51396_51500_54106_54182_55243_55405_63868
901342	contig_11656_pilon	+	2737	2	Intergenic	novelGene_54043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_1	0	26	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAGTGCAGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530777	537497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_531337_535319
901343	contig_9109_pilon	-	1559	3	Intergenic	novelGene_175307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	110	311	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	216	1127	19046	17171	FALSE	10	CCTCAGTCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954_19134_20664
901344	contig_19402_pilon	+	5061	15	Intergenic	novelGene_80783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_14	1585.9206509862	26	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	621	2213	29462	143862	FALSE	70	TTCAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQELYYPQLPALLPPKRKPAK	23467	146710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_143802
901345	contig_7229_pilon	-	812	4	Intergenic	novelGene_39816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1681.39016557398	83	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	37	399	877522	876021	FALSE	35	AGTTACGTCTACTTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEVTSGLNSQASVSCLVVN	878214	875607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_876071_876725_876867_877350_877535_878190
901346	contig_12120_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_21429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	83	679	114226	114822	NA	20	TGATTCCCAGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRPMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNNCWRGCGEIGTLTHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQHRCPSTDEWINKLWYIHTVEYYATRKKNNESVNHCITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	114143	116687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_114100_116700
901347	contig_7744_pilon	+	1817	4	Intergenic	novelGene_62448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	167.837884744641	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	372	470	68267	68912	FALSE	50	ACAAAGGTTAACAGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAAERSRSPAFRPRSPRSGTRRLAPGRARTPPALPWARAASPKPRGGAAQSRPPAPPRRGPSLGNRAATPFPPSRPPCSLSVRHFLPSTWPAETSGFEGDPKASEEHRPIAKEEALRPPGKRSMCYIHSWCGLQLASPGPVGPTRGGRSISCSSL	64265	70259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_64516_67644_67755_68255_68334_68880
901348	contig_10323_pilon	+	2116	3	Intergenic	novelGene_123594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTACCTACTTCTGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458026	460257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_458303_458347_459933_460002
901349	contig_13593_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_156126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70318	69765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_69800_70300
901350	contig_6870_pilon	-	2177	15	Intergenic	novelGene_103987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTCTAACCCACTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1561644	1481069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1481157_1488029_1488089_1493504_1493611_1502308_1502445_1504246_1504494_1521424_1521615_1523632_1523855_1524819_1524941_1525067_1525164_1530737_1530856_1532495_1532659_1533386_1533488_1539712_1539971_1547900_1548096_1561566
901351	contig_12429_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_136204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	624	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGGTTACTTAAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89982	92079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_90000_92100
901352	contig_563_pilon	-	2742	8	Intergenic	novelGene_169771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.0570885387885	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1	546	716155	713740	TRUE	45	ACTTGTAATACCTAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNWRLPGRGLGYWAKLPCVPGAVGGPGYGSGSAASWSPPSPPKRRLLPRAQLLPLLLLALAVGSALYTIWSGWHRGTEELPAPVIGSLSEAQLRRVIGQLDPQRLWSNYLRPLLVVRTPGSPGSLQVRKFLEATLRTLTAGWHVELDPFTASTPLGLLNFGNVVATLDRGGCPPSHSRLPL	716155	707088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_707922_708917_709785_710438_710556_711065_711167_711268_711423_713615_713899_715249_715394_715912
901353	contig_383_pilon	-	3472	1	Intergenic	novelGene_126136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	287	655	162850	162482	NA	35	TAATGGCAGAATTGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTHCEEWEFQNTLIVLMRNLYIDQEAVIRTEQGDTVWFKVRKGVRQGCILSPYLVNLYAEQIIQEAGLYEEEQGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAEGKEDLKHLLMKIKDYTAFSTDYTST	163136	159664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_159700_163100
901354	contig_11258_pilon	+	2901	1	Intergenic	novelGene_67837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	1287	1811	352833	353357	NA	25	GACTCAAACTCAGGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGLGCPTWPGAEGAERFPLQGCECHHQLGHIWTTRREDAQAEEAHPQVMGTGVPYHGLWLWLEFSWLLGLWVVLTVASAVDGTSRPSVVAVEVVGLVGVLDIGAGAENTRLTQDLSSDPPRPSPPSWLDFTHHAHFGRGRTEEPGAKVSPGPHGPREHFQTGLRKPTVLIPSC	351546	354447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_351500_354400
901355	contig_3942_pilon	+	544	5	Intergenic	novelGene_128641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCCAACACCTTCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176953	180046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
901356	contig_14196_pilon	-	3058	1	Intergenic	novelGene_169963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGTTCCGAATACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10245	7187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_7200_10200
901357	contig_11258_pilon	+	1284	4	Intergenic	novelGene_67791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	234.180841801089	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	5	460	279290	284112	TRUE	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPGEPLPHTSTRAA	279285	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284123_285643_285774_292719
901359	contig_6059_pilon	-	2527	15	Intergenic	novelGene_44824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	4674.64790772786	12	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	514	2073	580962	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHFLLLVTSSHVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584549	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580926_581108_584181
901360	contig_8992_pilon	-	2864	2	Intergenic	novelGene_174420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTAGGTAGACTACGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77277	73863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_73934_74483
901361	contig_7733_pilon	+	1637	10	Intergenic	novelGene_147129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_8	43.7137151119519	173	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	103	1092	88179	107305	FALSE	55	TAATATGACAGACCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIDSYYGTFARSCPRCAESSGLCLAFGPGRKSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGEVLLEALFLTVDPYMRVVAKRLKEGDTMMGQQVARVVESKNSALPTGTIVVAFSGWTTHSISDGKELEKLPTEWPDTLPLSLALGTVGMTGLTAYFGLLDICGVKGGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAKLKGCKVVGAAGSDDKVAYLKKVGFDVAFNYKTVESLEETLKKASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVICQMKKFGKIAICGAMSTYNSTGPPPPGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86698	107850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_91178_91225_92135_92193_93204_93373_96814_96933_97575_97732_100923_101033_106056_106176_107194
901362	contig_990_pilon	+	3459	1	Intergenic	novelGene_76012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	98	496	451818	452216	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQLQLNSQPRMVSEVKVRALIGNKWDPETWDGDIRTDNQEAGDTEPLNSVESFLPTEPALSLPLEEITPSLSAKPPTPVKPLALPPPSDEISPTPTEEPLSASSPGEAFKSLPGASPAAYTLQDIVECS	451720	455179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_451700_455200
901363	contig_12313_pilon	-	2041	11	Intergenic	novelGene_171847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	61.206290526383	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	302	811	84299	75327	TRUE	45	AAAAAGTGGGAAAAGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAVKNQPRAEPEGLQCQVRCLEPRHHND	115407	72308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191_75332_80410_80483_80881_81014_81623_81676_82660_82778_83613_83734_84287_84402_100064_100099_115242
901364	contig_8617_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_73495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63626	64137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_+_63600_64100
901366	contig_2054_pilon	-	2726	17	Intergenic	novelGene_51672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	72.9604987304774	1	16	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2346	379	2724	150933	56208	FALSE	35	TGCTCAGCATTTATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQLQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSREGSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDKEEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSLQTDMTRRQLEYEARQIRVAMEEQLGTCQDMEKRAQRRVARIQQIEKDILRIRQLLQSQATETERSSQSKHEAGSHEAERQNEGQGVAEISMATSGSGQGSAARMDHETASVLSSSSTHSAPRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLLHGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETCWEWQEAHEQGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGRKATRGISSQELGQGLSGGLQAIAELLQVDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDLQQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCTENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRDNNCLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAMGSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAEL	203994	56205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_56542_58136_58352_65648_65766_66046_66125_66710_66851_70670_70725_72068_72165_74194_74574_77018_77118_97314_97420_105084_105169_124994_125109_127144_127254_130938_131141_132268_132354_150798_150952_203634
901367	contig_16948_pilon	+	3667	12	Intergenic	novelGene_166417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_11	102.275353501634	309	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	394	2745	383206	410355	FALSE	0	CTTTGTTTGTGGCCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNVVQSNNGIKVLLSLLSIKMPITDADQIRALACKALVGLSRSSTVRQIISKLPLFSSCQIQQLMKEPVLQDKRSDHVKFCKYAAELIERVSGKPLLIGTDVSLARLQKADVVAQSRISFPEKELLLLIRNHLISKGLGETATVLTKEADLPMTAASHSSAFTPVTAAASPVSLPRTPRIANGIATRLSSHAAVAPSAPPAPAAHPQPRPPQSSLALPGPSYAGSSPLIGRISFMRERPSPCNGRKIRVLRQKSDHGAYSQSPAIKKQLDRHLPSPPTLDSIITEYLREQHARCKNPVATCPPFSLFTPHQCPEPKQRRQAPINFTSRLNRRASFPKYGGVDGGCFDRHLIFSRFRPISVFREANEDESGFTCCAFSARERFLMLGTCTGQLKLYNVFSGQEEASYNCHNSAITHLEPSRDGSLLLTSATWSQPLSALWGMKSVFDMKHSFTEDHYVEFSKHSQDRVIGTKGDIAHIYDIQTGNKLLTLFNPDLANNYKRNCATFNPTDDLVLNDGVLWDVRSAQAIHKFDKFNMNISGVFHPNGLEVIINTEIWDLRTFHLLHTVPALDQCRVVFNHTGTVMYGAMLQADDEDDLMEERMKSPFGSSFRTFNATDYKPIATIDVKRNIFDLCTDTKDCYLAVIENQGSMDSLNMDTVCRLYEVGRQRLAEDEDEEEDQEEEEQEEEDDDEDDDDTDDLDELDTDQLLEAELEEDDNNENAGEDGDNDFSPSDEELANLLEEGEDGEEEDSDADEEVELILGDTDSSDNSDLEDDIILSLNE	381878	411277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_382072_383005_384270_384847_385047_386717_386801_387339_387425_389838_390073_390728_390823_391220_391326_391539_391614_392145_392248_405439_405693_410296
901368	contig_6497_pilon	-	7788	31	Intergenic	novelGene_35619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	138.039849318956	11	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1662	4989	531	5519	726574	668749	TRUE	25	TCACTGTACATTTGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFPSVLSSLPLHKLVQSENENEGEVEEQPFKEKELDRKLEDAPPDILSSERYALQKANNRLLKTLLEVVKTTAAVEETIGRHVLGILDRSSKGQSSASLIWRSEAEAPIKSCIHEEHRGVTDESVPSYSGSDMPRDDSSMWSKVTEEGTELSQRLVRSGLTGTETDPENEELMLNISSRLQAAVEKLLEAISETSSQLEHAKVTQTELMRESFRQKQEVTESLRCQEELRERLHEESRAREQLAVELSKAEGVIDGYADERTFFERQIQEKSDIIDRLEQELLCEGNRLQELEAERQQIQEERELLSRQKEAMKAEAGPVEQQLLQETEKLMKEKLEVQCQAEKVRDDLQKQVKALEIDVEEQVSRFIELEQEKNAELMDLRQQNQALEKQLEKMRKFLDEQAIDREHERDVFQQEIQKLEQQLKVVPRFQPISEHQTKEVEQLTNHLKEKTDKCSELLLSKEQLQRDIQERNEEIEKLEFRVRELEQALLISADTFQKVEDRKQFGTVEAKAELSLEVQLQAERDAIDRKEKEITNLEEQLEQFREELENKNEEVQQLHMQLEIQKKESTTRLEELEQENKLFKDEMEKLGFAIKESDAISTQDQHLLFGKFAQIIQEKEIETDRLNEQITKLQQQLKITTDNKVIEEKNELIRNLETQIECLMSDQERVKKNREEEIEQLNEVIEKLQQELANIEQKTSVDAISLPEEADSLKHQLDMVVAEKLALEKHLETTNEEMTFTKNVLEETNFKMNQLTQELCSLKEECENMRKIQSVPEKNINMSVDDPSKDKTELDIVLTKDSVKPLENQTYLKSFEENSRVSISSLETKLFQLESTVSAKELELVQCYKQIKDMREQGLSETEMLKKKIVNLQKMLEEKIAAALVSQVQLKAVQEYAKFCQDIPAVSSKPEGTNTQNLNELREKEMESNISALTLRISELESQVVEMRSSLTLEKKQVQIAENNALEKEKKLLELQKLLADNEKKQEGNERKRSPQDLEVLETTTELFHTNEENIFFGELETLRAESAATKEELASYKEIAEKLQEELLVKETNIAFLQKDLSQVEDQLAEAKEKLSYFLEKEDKMEEQENRKVCSLEPLPIKVGKNSASQTDGTLEVNSSNQTPQVLVRNTGIQIDLQSECSSEEVAEIISQFTEKIEQMQELHAAEILDMESRHISETETLKREHYVAVQLLTEECSSLKAVIQCLRTKEGSSIPELTHSDSYQNREICSSDSGSDWGQGIYLTQSQGFDATSEGQEEGESSTDSFPKKIKGLLRAVHNEGMQVLSLTESPYSDGEDHSAQQISESWLEERRAYLSTISSLKDLITKMQVQRETEAYDGSQSHECFSDWRGELLIALQQVFLKERSVLLAAFQTELTVLGTRDAAGLLNCLEQRVQEQGLEYQAAMECLQKADRRSLLSEIQALHAQMNDRKMNLKREQENDPSSQELLEYNMQQKQSQMLEMQVELSSVRDRATELQEQLSSEKMVVAELQSELAQTKLALETTLKVQHKHLKELEAFRLEVKEKTDEVHLLNDTLASEQKKSRELQWALEKEKAKLERNEERDKEELEDLKFSLEGQKQKNIQLSLLLEQQKQLVNESQQKIESQRVIYDTQLSEEQSRNLELQVLLESEKVRIEEMRSTLDREQGTACTATEQR	727104	654590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_655142_656393_656534_657101_657253_658811_658898_660774_661008_664472_664674_665764_665951_667477_667584_667899_668109_668342_669013_669901_670053_670883_671104_673807_673953_678687_678877_679287_679480_680059_680179_680262_680327_680759_681249_681759_681901_682624_683699_684478_684659_685013_685167_688945_689051_689657_689835_697016_697137_698069_698303_700719_700933_702457_702621_717343_717577_724043_724250_726416
901369	contig_8552_pilon	+	5000	34	Intergenic	novelGene_80067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_33	293.119249450681	417	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	979	2940	339	3278	385286	517971	TRUE	40	TAACACAAATTTTGTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDSTQHVPSETSEDPEVEVTIEDDDYSPPTKRPKSSEPPQPPVTEPANAGKRKVREFNFEKWNARITDLRKQVEELFERKYAQAIKAKGPVTIPYPLFQSHVEDLYVEGLPEGIPFRRPSTYGIPRLERILLAKERIRFVIKKHELLNSTREDLQLDKPASGVKEEWYARITKLRKMVDQLFCKKFAEALGSTEAKAVPYQKFEAHPNDLYVEGLPENIPFRSPSWYGIPRLEKIIQVGNRIKFVIKRPELLTHSTTEVTQPRTNTPVKEDWNVRITKLRKQVEEIFNLKFAQALGLTEAVKVPYPVFESNPEFLYVEGLPEGIPFRSPTWFGIPRLERIVRGSNKIKFVVKKPELVISYLPPGMASKINTKALQSPKRPRSPGSNSKVPEIEVTVEGPNNNSPQTSAVRAPTQTNGSNVPFKPRGREFSFEAWNAKITDLKQKVENLFNEKCGEALGLKQAVKVPFALFESFPEDFYVEGLPEGVPFRRPSTFGIPRLEKILRNKAKIKFIIKKPEMFETAIKESAASSKSPPRKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	354726	520494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167_438225_440288_440352_467628_467740_469380_469447_481397_481582_485140_485200_486302_486375_491808_491993_493179_493239_499102_499175_500085_500270_500893_500953_501354_501430_509984_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512138_512711_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912_517986_518786
901370	contig_366_pilon	-	3528	9	Intergenic	novelGene_51577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	668.806025690558	2	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	581	949	769115	757099	FALSE	10	TTTGCTTTTACTATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	802276	754519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770487_776801_776990_780053_780185_802171
901371	contig_2940_pilon	-	4131	4	Intergenic	novelGene_81897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	173.569070465398	2	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2869	3261	453855	453111	FALSE	55	AAAATAAATTAAATTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF	457009	452240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_453255_453466_453602_453741_454692_454977
901372	contig_9995_pilon	+	2367	7	Intergenic	novelGene_47697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTCACTTGCCCAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295642	321413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_297006_297195_297672_299626_299707_300993_301089_301625_301790_321093_321154_321284
901373	contig_16622_pilon	-	2314	6	Intergenic	novelGene_48460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_1	1239.86973509317	442	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	727	1212	115540	112952	FALSE	25	GATTTCATGTCAATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121966	111849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
901374	contig_4974_pilon	-	4434	1	Intergenic	novelGene_161405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	343	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTCTATTCATCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80654	76220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_76200_80700
901375	contig_3986_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_52709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	581	1003	52653	53075	NA	65	AAAAAAGAATCAAAGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTETANKRGERISADTSLLSMSIHLEIGGAGHSLEIAPGCSLPSLRPCLGDTQRRECGGHSCLPLFVSLCLIRNEPTLLIGARSCLSASFRPIDLKNHLENGKGRQTSNSGCASRNILIQTSFLSCTSLTKKSNILVN	52072	54319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_52100_54300
901376	contig_8317_pilon	+	835	2	Intergenic	novelGene_19314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCAGTTTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16135	17069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
901377	contig_20223_pilon	+	3634	3	Intergenic	novelGene_177230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2663	2989	63393	63719	FALSE	50	ATAAAATCTCAAAGAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKIGKSFSRLTKEKKMMQIIKIRNESGGIVNKLIEMKRIIQEYYKQFYTNKLHNLDEMDKFLETHHLNRPTTSEKIERVIKNLPTTTTKVLDQTASLGNYTKHFKKS	58243	64364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_+_58812_60762_61602_62137
901379	contig_6108_pilon	+	5576	7	Intergenic	novelGene_171298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	4964	5575	1181219	1181830	FALSE	65	TAAATGAAATAAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIDHILGHRAILNKIQKAEIIQNIISDHNTIKAEINNRKSKEKKSFTLKLNNTLLTNHWVKEDFRDGIQKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLTGQFIAIDAHVKKEETDKIKTSTTKLKQIGREQQKKPTATGGKEIIKIRAEINEIENGKPIERINKTKNWFFERINYIDKPLARLIEEKQERMQITQIRNEMGNITTD	960046	1181831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6108_pilon_+_961688_961771_962500_1027036_1027162_1028906_1030459_1037340_1037526_1059469_1059481_1180497
901380	contig_7279_pilon	+	3339	9	Intergenic	novelGene_145986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	280.438913802988	262	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	1886	2545	84052	99452	FALSE	45	ATTTAAAAAAACCCATCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFGFPQYLKIFKEQLSLPAEFPDKLFAEKWNENIQCLSEDRSIRDILQKHFNVSKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTTADLMEASQLCSMDSKANVVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIHEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSIYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTPINAQKEYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL	74786	100246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7279_pilon_+_76408_79179_79229_81235_81388_83988_84163_88608_88696_95970_96080_96776_96873_96956_97025_99263
901381	SIRV6	+	1111	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	399	18	95	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	20	GAGACCTATTCGTGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
901382	contig_5423_pilon	+	2728	9	Intergenic	novelGene_85270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1689	2045	561527	567047	TRUE	20	CCTCTTCTTCATAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKGMIIAIQEKVIQNTTSSRKIFTFPSRVKNITDEMRNPSTSPTHSMQSMRIPNRHHVATKKIPPTLPAMAVRIRRTIILNRCQSCNQYIKEESHEDETYEEYNYLFSRICVQRNK	557463	573520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_558681_558745_559029_560555_560721_561503_561608_564346_564503_565318_565393_567001_567098_569080_569251_573057
901383	contig_2480_pilon	-	2077	2	Intergenic	novelGene_63553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACTAGCAGATACATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308824	306143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_307052_307655
901384	contig_4857_pilon	-	3116	4	Intergenic	novelGene_48808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2636.56548478424	191	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAGTGAAGTAATTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252713	1247832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1249555_1249909_1251155_1251443_1251565_1252685
901385	contig_16722_pilon	+	7155	24	Intergenic	novelGene_118278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	701	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	4543	4890	149218	149565	TRUE	35	CCATGGACAGAACCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLLPVEGVESFVTVVVVVTVDLAQFSVEETTVCLSPFATLITVFDSVATVDVIVVTSVMTVFLLASPLIFSSLLIGRPFSSIKSLLRLDSSPEVIGDGVTFLTSEVSVSISST	90878	165030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_91909_96291_96481_103887_103972_105710_105905_106668_106841_109686_109999_115772_115997_116286_116368_121587_122080_122766_122990_125205_125419_130772_130882_131815_131970_132711_132961_136189_136233_136609_136761_143790_143925_144487_144606_148847_151156_152222_152398_155147_155290_155908_156034_164406_164543_164933
901386	contig_15697_pilon	-	4345	1	Intergenic	novelGene_173292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1334	1759	14681	14256	NA	65	TTTAAAAATAAATAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANIAKNGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVWTEQGDTAWFKVRKRVRQDCILSPYLFNLYAEEIIREAGLYEQERGIRMGGRLINNLHYAEDTTWLAESEEDLKQLLMKIKGHSFSMDYSPNKENKNPHIWTNKQHHDKRRKD	16014	11669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_11700_16000
901387	contig_14353_pilon	-	1970	8	Intergenic	novelGene_82105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	444.633947128169	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	326	772	83281	80452	FALSE	35	TTAATGATCTAAGTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	88595	79253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_86256_86354_87365_87477_88547
901388	contig_5864_pilon	-	3921	1	Intergenic	novelGene_162784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	470	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAAAGTACAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122587	118666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_118700_122600
901389	contig_2010_pilon	-	3221	9	Intergenic	novelGene_176266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	47.3707122070167	354	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	396	2012	186491	149412	FALSE	15	TTTTTAGAGTTGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKILEGLVSSSHPLPLKRVIIRKVVESAEHWLDKAQCEAMFDLTTRLILEGQDPFQRQVGHQVLEAYARYHRPEFEAFFNKTFVLGLLQQGYHSLDRKDVAILDYIHNGLKLIISCPSVLDLFGLLQVEMLRMVCERPEPQLCARLSDLLTDFVQCIPKGKLSITFCQQLVRTIGHFQCVSTQEKELREYVSQVTKVSNLLQNIWKAEPSTLLPSLQEVFASISSTDASFEPSVALASLVQHIPLQMITVLIKSLTTDPNVKDASMTQALCRMIDWLSWPLAQHVDTWVIALLKGLAAVQKFTILIDVTLLKIELVFNRLWFPLVRPGALAVLSHMLLSFQHSPEAFHLIVPHVVNLVYSLKSDGLPSSTAFLVQLTELIHCMMYHYSGFPDLYEPILEAIKDFPKPSEDNIKLILSQSAWTSQSNSLASCLSRLSGKSETGKTGLINLGNTCYMNSVIQALFMATDFRRQVLSLNLNGCNSLMKKLQHLFAFLAHTQREAYAPRIFFEASRPPWFTPRSQQDCSEYLRFLLDRNKS	186886	148202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_-_149425_157367_157475_161142_161237_165254_165449_167411_167571_171573_171676_176916_177047_184143_184280_185809
901390	contig_12427_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_40531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTATGTTTCCAACAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504674	508515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_506130_507798
901391	contig_990_pilon	-	1923	1	Intergenic	novelGene_76143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	18	356	1723353	1723015	NA	20	TGTAAATTTCTGTGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGICPMTTFNLYMHSWIGEGARQGGNGSASSSAVCITPSAVSWPSAHVGCCWCPGARVPKGPERRLQAGKVEEVQPWVAESKYSGRDQVRLSWKRTLTSKQEAYNELPEVRRRQQGI	1723370	1721447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1721400_1723400
901392	contig_5686_pilon	-	2606	4	Intergenic	novelGene_45444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTGCACCTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241665	217452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_219668_222752_222914_224040_224201_241595
901393	contig_13992_pilon	+	3284	1	Intergenic	novelGene_147622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1295	1630	150227	150562	NA	20	TGACAGTAGGGGTCCACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTNDRRPDELWKDIVREESKRSLKRQERKKRPKWKSEETLKLAVECQVAKAKGRNDHVKELNRRFQRAAKEDKVKYYNDMCKDLEIENQNRRTCSAFLKLKELKKKIQA	148932	152216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_148900_152200
901394	contig_854_pilon	+	4468	26	Intergenic	novelGene_36508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3300.74499081647	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	1284	3857	1700894	1715383	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612773	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680835_1700821_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
901395	contig_6740_pilon	+	3194	1	Intergenic	novelGene_142734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTCAACAAACACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753075	756269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_753100_756300
901396	contig_8581_pilon	-	3401	18	Intergenic	novelGene_22839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	532.972346835508	4	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	57	2213	386058	312538	TRUE	30	TCAAAGACTCGAGTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAQVAEDEGWPRAPTVKMIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGISLPGADL	386114	306344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312567_314643_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
901398	contig_17274_pilon	+	4216	7	Intergenic	novelGene_26503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	108.503456166152	289	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	153	920	87834	114622	FALSE	30	ATTCTACTATATCCTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGGGHLSARMYTEEQNIGKRLVYETIFSHYKKHKVEISNAINKTFPFLEGLRDRGFITNKLLKDSEESCRNLVPVQRVVYNVLNELEKTFNQSLLKALFSKVNMKEYPDLIHIFRSFEEVIHNIQIDDRKDTWEMASTQFIHDQGQTLPEAGIPEHLDDGEKMNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRSSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGGFHGLL	87681	117918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_98273_98349_100306_100454_104417_104472_114494
901399	contig_19812_pilon	-	2428	21	Intergenic	novelGene_100990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	100.815970956987	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	438	2294	44592	15879	FALSE	10	AAGTGGTTTTTGTCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48265	15744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46216_46393_46710_46843_48235
901400	scaffold_13505_pilon	-	1784	9	Intergenic	novelGene_111540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	452.825021393474	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	17	982	603235	594258	TRUE	35	ATAAAGAGAACCGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603251	588590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589363_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602225_603171
901401	contig_8330_pilon	+	1477	10	Intergenic	novelGene_71785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	649.378240138544	111	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	281	1171	852673	857510	FALSE	5	CCCAGCCTTGGCGCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEPPISHLLRVLFLSFFEIFFCVFIFYYFSR	837470	857816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855703_857419
901402	contig_5375_pilon	+	2813	1	Intergenic	novelGene_169199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAAGTCGTTCTTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25836	28649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_25800_28600
901403	contig_12327_pilon	+	2510	15	Intergenic	novelGene_140687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1650	2075	1148758	1151877	TRUE	25	AGCGGAACTAGCTTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIHMFISKEFDSSLIHFPCVGKIGMFFFKAGILDPVLHIRVYEDKSFVDGAGPIHLFVPQLKVDVGVPGLLLGLPLHPALKHLPGTSNVSQHLLHVRVLVPNWLTRGRVVMARSQIFRAWLTWRFFISISAYFSQSVIFR	1139942	1155117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1140156_1141085_1141330_1141766_1141870_1143499_1143746_1144615_1144695_1145574_1145635_1146316_1146506_1147456_1147629_1147757_1148057_1148713_1148895_1151136_1151306_1151757_1151913_1152674_1152768_1153599_1153748_1154958
901404	contig_12120_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_21421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATACATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69370	71566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_69400_71600
901407	contig_15087_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_37234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162767	164977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_162800_165000
901408	contig_6557_pilon	-	3596	26	Intergenic	novelGene_32929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	468	806	310844	306801	TRUE	20	AAACCCACCGCTGCCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSMSFFSLINLEFWSSRSRISSSIFLILASAVTFSSCSFCRAPSSSSSCSSRYLNMCLHFFLFILKDLVPFFFFFNPRLQVVQNFFQFLLFGSQSRSHLFCLSEELCLRL	314176	186155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_186222_193236_193611_209515_209675_227266_227297_242943_243047_250645_250739_264786_264851_266753_266853_269259_269404_269646_269738_275647_275772_276508_276660_279736_279913_283892_284065_284280_284397_298122_298319_298412_298534_301501_301573_301657_301820_305588_305703_305807_305933_306761_306979_310160_310296_310818_310940_312456_312630_313977
901409	contig_13244_pilon	+	2489	5	Intergenic	novelGene_86932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	542.924200510532	3	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGTTCTTACTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239750	254409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_244930_245347_247045_247121_250878_250935_252541
901410	contig_14537_pilon	-	3559	1	Intergenic	novelGene_158663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	2110	2661	107875	107324	NA	65	CTAAAAAGAAACTCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFCNIMKDEKLAIQEAQRTSYRIDPKRKSLRHITITLAKTKDRQRILRAAQEKQKVTYRRETTGLSSDYLAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKVLFRYDGEIRTFPGKQKLRDYVKTKPNFQELLKGVLRSENKQHQLTG	109984	106425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_106400_110000
901412	contig_5690_pilon	-	3707	2	Intergenic	novelGene_119691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	279	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1583	1969	492188	491802	FALSE	55	AAAACTGCTCTAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDTESTKRRWKEYTESPYQKKLVDVQPFQEVAYDQEPMVLKDDVQAALKALAKNKAPVIDRVSIEMFQQMDAALEVLIRLCQEIWKTATWPTNWKRSIFMPIPKKGDSIKCGNYRTISLSHAK	540970	490063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_492451_539650
901413	contig_10444_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_139463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGACTAACTTGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798692	795914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_795900_798700
901414	contig_11702_pilon	+	4594	5	Intergenic	novelGene_141966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTTGAGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292657	515575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_292953_293035_293222_342344_342532_407887_407979_511740
901415	contig_3529_pilon	-	2774	3	Intergenic	novelGene_105332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTACAGAGTCCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592767	447180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_447270_589968_590642_590755
901416	contig_5479_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_133583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAAACCAGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194626	193568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_193600_194600
901417	contig_14618_pilon	+	3634	3	Intergenic	novelGene_136843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	251	478	1219514	1219741	TRUE	70	AAAAAAAGAAAGAAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRPSIAHSKFKLKLKKIKTSSQEPKYELEYIPPEFGDHLKNRFDILNTNERRPDELWDDIKDIIHKESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLELALELRVAKVNGRNDEVKELNRRFQKADREDKRKYYNDICKDLELENQNGRTRLAFLKLKELKKRFKP	1219263	1224066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1219840_1220935_1221146_1221218
901418	contig_14133_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_119959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4276	junction_2	86	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	668	979	208493	208182	TRUE	25	TTTCTCAAGTAGTATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209451	206562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_209131_209421
901419	contig_5217_pilon	-	352	4	Intergenic	novelGene_135777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3628.91967395257	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	2	352	559331	557648	FALSE	20	TATTCTATATCTTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEHKGV	559332	557647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557658_558322_558430_558674_558851_559273
901420	contig_3986_pilon	-	2432	2	Intergenic	novelGene_52717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	218	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAATAGAGTAATCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103483	83323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_84652_102379
901421	contig_8045_pilon	-	1397	6	Intergenic	novelGene_35399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	46.0408514256633	31	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300191	116397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_116840_232388_232502_235227_235597_235712_235932_286664_286746_300018
901422	contig_17875_pilon	+	2394	7	Intergenic	novelGene_143177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	88.3094307282951	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	66	884	39073	79204	TRUE	15	CACGTTATTGTTTGTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELATRSQIPKEVADIFNAPSDDEDFVGFRDDVPMETLSSEESCDSFDSLESGKKQDVRFHSKHFTEELRKIFIEDTDSETEDFEGFSQSDLNVKSDPEIMLVESDLSDDRKASLLSEEDEEEEKATPRRSRPRRSSIGLRVAFPFPTKKLANESDKKNSSSEPLHSSSCLQDNKKTVLGRQKSCRQWKQREDSASESEDDSRDEGQESSDALLKRTMNIKENKAMLAQLLAELNSMPDLFPVRTPNSALVSGTPCNSILPWDLQLQLLSEA	39007	81551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_+_39097_65210_65352_70946_71085_73534_73910_75808_75907_79161_79283_80119
901423	contig_17144_pilon	-	1493	8	Intergenic	novelGene_29402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2497.23903051154	94	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	328	1050	179764	173705	TRUE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLGGETGAPHTGDPGPQP	183409	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166405_173594_173751_174568_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
901424	contig_10793_pilon	-	3988	10	Intergenic	novelGene_83431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	584	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3136	3447	163322	162559	TRUE	50	AAAAAAAAAGGGGGGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNNIQTKALFTFRRGKKIKERVIGNGFSHSANCSTSLVFLLLLNGFQCDILSFFPIYLAPCTTHNFWSIKRKGIRIIWFRPHPICLCQHFICEILIGFKVKL	168751	152862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161473_162548_162689_163140_163398_163944_164068_164789_165375_166399
901425	contig_17144_pilon	-	2868	4	Intergenic	novelGene_29403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	936	junction_1	1201.06656305506	6	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	935	1363	169039	167578	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPR	169973	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167676_167918_168060_168162_168310_168996
901426	contig_14882_pilon	-	1311	10	Intergenic	novelGene_114993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	112.477926503902	104	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	951	361	1311	251664	228184	FALSE	65	GGAAAAGAAAAATTAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSSDYYNKDNEEESLLANVASIRHELKITEWSLQNLGEELSSVSTSETSDYACNSSRFERLILEDLAQPSHPGLLTYSPYKKVCKLSSGNTDSHKKPRDKVSFAFSTPMDQEIKSLREKLNKLRQQNACLVSQNHSLMTKVESIHFELTQSKAKVSMLESAQQQAANVPILEEQIINLEAEVSAQDKVLREAEDKLEQSQKMVIEKEQSLQKSQEECIKLKVDLLEQSKQGKRAERQRNEALYNAEELSKAFQQYKEKVAEKLEKVQAEEEILEKNLINCEKENKRLQEKCGIYKSEVEILKEKLRQLKEENNI	254062	228183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_228209_230014_230137_233727_233825_237873_238003_239933_240041_247287_247450_250927_251103_251530_251667_253004_253176_253875
901427	contig_15112_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_124752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	998	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAAGCTGCTGCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18057	20189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_18100_20200
901428	contig_12677_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_110738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1100
901429	contig_6320_pilon	-	2672	1	Intergenic	novelGene_158078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1031	1387	22152	21796	NA	35	CAGTCACTTAATAATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWCFLRKLEIETPYDPAIPLLGIYPREIRAVTQTDICTPTLTAALFTTAKRWKQSRCPSTDEWINKLWYLHTTEYYTTINNNDESAKHNITWMNLEGIMLSEISLSQKDRYCMRPIL	23182	20510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6320_pilon_-_20500_23200
901430	contig_3509_pilon	+	1812	3	Intergenic	novelGene_160693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	33	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1210	1602	3219	6916	FALSE	30	TCAGTGCAGAGCACATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAELKTFADCPEHETSDSTFLVFMSHGIRDGICGKKYSEGIPDVLEVNTIFQSLNTRNCPNLRDKPKVIIIQACRGVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPGSTFI	2009	7126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_3451_3849_3994_6899
901431	contig_6842_pilon	-	2561	3	Intergenic	novelGene_130777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	388	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2031	2348	1351895	1350902	FALSE	25	CAACGGTGTTTTTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDKKGKRGKRKQIKKKKKNKKSPQKTGEKKKEKKTTKKEMLSGISLHVCASQRVGSKPCSTACPERAPNSRKGKENKQTIQNKQINKSLGVPPARQHGGSALR	1354901	1350688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1350925_1351600_1352810_1353785
901434	contig_11548_pilon	-	4582	1	Intergenic	novelGene_66722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1540	2037	63817	63320	NA	30	CCTTAATATGGTCTACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKNKEKAQGFYRAKGVIYQPQGGGGRAQADFGDQEKKEDRSKMELRRRRTCPPPQTGREEAGREGGERRGGRPVPSADWGAGLIGRCNVGPSITLLLLSHWLLSYHWPNHLPLRLHARRGWGVNSLDSGCPPGPLPPWLRGGGGGGGGGLALVIECEGPMARS	65356	60774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_60800_65400
901435	contig_9098_pilon	+	3083	1	Intergenic	novelGene_75864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	485	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAACAAATTAGAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380801	383884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_380800_383900
901436	contig_10235_pilon	-	4243	10	Intergenic	novelGene_46356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	102.748884827687	130	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	3211	3870	140447	131467	TRUE	15	TCTTTGGTTTCTAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDSTSTTVEEPDSLEVLVKTLDSQTRTFIVGAQMNVKEFKEHIAASVSIPSEKQRLIYQGRVLQDDKKLQEYNVGGKVIHLVERAPPQTQLPSSGASSGTGSPSATHGGGPPPGTRGPGASVHDRNANSYVMVGTFNLPSDGSAVDVHINMEQAPIQSEPRVRLVMAQHMIRDIQTLQDGASAETEPWAAAVPPRMGPYYPTGHSEPTEGETTAPP	144289	130273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_130459_130749_130897_131425_131535_131619_131672_138227_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_141092
901437	contig_7241_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_171548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAAAAGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167172	168603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7241_pilon_+_167200_168600
901438	contig_5302_pilon	+	3468	4	Intergenic	novelGene_81522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTATGGCACTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1483065	1642758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1483280_1497991_1501063_1638682_1638847_1642739
901439	contig_11115_pilon	+	1696	19	Intergenic	novelGene_102876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	43	junction_3	109.712376492151	91	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1191	505	1695	286828	307992	FALSE	30	ATCCGGACCTGACCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEANKPSKPVSKPRASRRSKSEGETKSDVSPSPRITRKTTRQTTITSHFAKGPAKRKPDEEPEKAKSEDSVDEEDKDQDEKRRRVTSKEPVVRPLPAEEPERVKPGTHTEKEEERDEKEEKRLRSQTKELTPKQKPKEEPDREAVPGTHTEVDEEGDEKDEKRHRSQPKDLAAKRRPEEKEPEKVKPQISDEKDEDEKEEKRRKTSSKELIEKKVSRTKTIVSSKTHPPKCVQCGQYLDDPDLKYEQHPPDAVDEPQMLTNEKLSIFDANESGFESYEALPQHKLTYFSVYCKHGHLCPIDTGLIEKNVELSFSGSAKPIYDDDPSLEGGVNGKNLGPINEWWITGFDGGEKALIGFSTSFAEYILMDPSPEYAPIFGLMQEKIYISKIVVEFLQN	278071	307993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_278345_285869_285907_286400_286509_286741_286910_288130_288207_289275_289355_293202_293238_293630_293716_295231_295267_296296_296385_298117_298153_298855_298938_300321_300357_300616_300663_303906_303988_304062_304173_306938_307058_307305_307399_307882
901440	contig_10460_pilon	-	421	1	Intergenic	novelGene_157476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAAAAAAAAAAGTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111954	111533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_111500_112000
901441	contig_20641_pilon	-	2366	3	Intergenic	novelGene_52868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGAATTGCCAAGGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28998	16842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_16914_25949_26081_26834
901443	contig_12080_pilon	-	4363	12	Intergenic	novelGene_128329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	706.246579747441	27	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	233	1447	59953	46981	TRUE	40	GCCATATTTTCAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYQEIKTVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFIEQVENIKPEIVSVTAACEELRKSKNFSSLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFDISFLCKLRDTKSADQKMTLLHFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAATDEKDKFVEKMTIFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKVSVEEFFMDLHNFKNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMDSLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLALELTKDDAMTAVPAKIPKNSEGVSTILEETKELVGRAS	106895	43889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_45912_46086_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793
901444	contig_6048_pilon	+	4949	9	Intergenic	novelGene_73118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	374.17206519862	81	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	18	728	909094	1193897	TRUE	35	AGACTTCCAGAAGTGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRMHDIETENQKLRETLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQTLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAK	909076	1391958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1196450_1390289
901445	contig_8377_pilon	+	3965	2	Intergenic	novelGene_35066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTAGTGTTAAATATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117374	121453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_118622_118735
901446	contig_12915_pilon	-	8718	9	Intergenic	novelGene_148338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_8	125.596514183316	924	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2728	8187	429	8615	159330	50203	FALSE	30	TTGACATGAATTAACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEAEQERLSRSGGGCVAELQRLGERLQELERQLRESRVPAVEAATEYCQQLCQTLLEYAEKWKTSDDPLPLLEVYTVAIQSYVKARPYLTSECENVALVLERLALSCVELLLCLRVELSDKQWEQFQTLVQVAHEKLMENGSCELNFLATLAQETGVWKNPVLCTILSQEPLDKDKVNEFLAFEGPILLDMRIKHLIKTNQLSQATALAKLCSDHPEIGTKGSFKQTYLVCLCTSSPNEKLIEEISEVDCKDALEMICNLESEGDEKSALVLCTAFLSRQLQQGDMYCAWELTLFWSKLQQRVEPSIQVYLERCRQLSLLTKTVYHIFFLIKVINSETEGAGLATCIELCVKALRLESTENTEVKISICKTISCLLPDDLEVKRACQLSEFLIEPTVDAYYAVEMLYNQPDQKYDEENLPIPNSLRCELLLVLKTQWPFDPEFWDWKTLKRQCLALMGEEASIVSSIDELNDSEVYEKVVDYPEEIKETSVNGLSGGVGANSGHLKGICDDKQKKKEIKQLRERGFISARFRNWQAYMQYCVLCDKEFLGHRIVRHAQKHYKDGIYSCPICAKNFNSKETFVPHVTLHVKQSSKERLAAMKPLRRLGRPPKITTTNENQKTNNAVTKQEQRPIKKNSLYSTDFIVFNDNDGSDDENDDKDKSYEPEVIPVQKPVPVNEFNCPVTFCKKGFKYFKNLIAHVKGHKDNEDAKRFLEMQSKKVICQYCRRHFVSVTHLNDHLQMHCGSKPYICIQMKCKAGFNSYAELLTHRKEHQVFRAKCMFPKCGRIFSEAYLLYDHEAQHYNTYTCKFTGCGKVYRSQSELEKHLDDHSTPPEKVLPPKDQLNSSGDSVQPPKVNQNIEGNTEKEGSMLPSENNTENSLREDKSDTWDKSKAESAVNEQDQISASVLREADEALSNGLENPATTPLLQASEVAVSIKVSLNHGVEDNFGKQENSTVEGSGESLVTNLHTPVEDTCHDLCHPSFQERKEQDCFNEAQITQNSLVNSETLKIGDLTAQNLERQVNNLTTFSVQNQSGFQNSLPTPKLKCGGNVKTLSNLYNLPLKTLESITFVPPQLNLNSSLGTSSAPPKAPVQKFSCQVEGCTRTYNSSQSIGKHMKTAHPDQYAAFKMQRKSKRGQKSDNVNTPNNGKFVYFLPPQVSSSNNAFFVPQTKASGNPTCSAQLQHVSPSIFPAHLTNVSASLLSSMESVMNPNIPSQDKNEQGGMLCSQLENLSGTTLPAQMEDLTKTVLPLNIDSGSDPFLPLPAESSSMSLFPSPADSGTNSVFSQLENNTNHFSSQIEGNTNPSFLKGSNGENAVFPSQVNVANDPNNTSAQQSAPEKVKKDRGRGPNGKERKPKQNKRAKWPAIIRDGKFICSRCYRAFTNPRSLGGHLSKRSFCKPLDGAEIAQELLQNNGQPSLLASMILSTNAVNLQQPQQSTFSPEACFKDPSFLQLLAAENRSSTFLPNTFSRTGVTNFNTSVSEEGSEIIKQALETAGIPSTFEGTEMLSHVVPSGCVSEAAQVNAVVMPNPTVPPLLQTVCHPNTLLTSQNRTPNSKTPSIDECSSLPVFPANDLLLKTVENGLCSSSFPNSGGLSQNFTSTSSRVSVISGPQNARSSHLNKKGNSASKRRKKAVPPLIAPSASQNLVASDLTAMGLIAKSVEIPTANLHSNIIPNCEPQGLVENLTQKLNNVDNQLFMTDVKENFKTNLESRTVLAPLTLKTENGDSQMMSLNSCTTSVNSDLQISEDNVIQNFEKTLEIIKTAMNSQILEVKSGPQCVGETSQNAPISYNIQLPSVNTVQNNKLPDSSQFSSFIGVLPTKSNIPQSEILHKEDQIQELLEGLQKLKLENDLSSPASECVLINTSVTLTPTPVKSTPDASVVQPVSEMVNNIQFSDKVNKPFVCQNQGCNYSAMTKDALFKHYGKIHQYTPEMILEIKKNQLKFAPFKCVVPTCTKTFTRNSNLRAHCQLVHHFTTEEMVKLKIKRPYGRKSQNENLPTSRITQVKKQLAVTEEDKREFQPALELGAKKENALSSVAVVPENQLIEKKSPENTETSAQVITVTSEQYDINSLTNLQTKGRKIRRHKKEKEEKKRKKPVSQSLEFPTRYSSYRPYRCVHQGCFAAFTIQQNLILHYQAVHKSDLPAFSAEVEEESEAAKESEEIETKQTVKEFRCQVSDCSRIFQAITGLIQHYMKLHEMTPEEIESMTTAVDVGKFPCDQLECKSSFTTYLNYVVHLEADHGIGLRASKADEDGIYKCDCEGCDRIYATRSNLLRHIFNKHNDKHKAHLIRPRRLTPGQENISSRANQEKTKPKYRGTKHSRSGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNTKIVQIEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTSRFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKCHKLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETCSEQEVDKNDVKDSDICVSESNDNSGATSVPQKEAEKNEKDEMDELTELFITKLINEDSTSVEAQANTSSSVSNDIQENNSCQSEKQKASNLKRVNKEKNVSQNKKRKIEKTEAALAVDLNSMHKEEETAVAIQTTEDHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNSGTKRGSHSNSRKNIDKTAVTSGNHVCSCKESETFVQFANPSQLQCSNNVKIVLDKTLKDCTELALKQLQEMKPTVSLKKLEIHPKDPDVSAMKEISIGKATGRGQY	159977	50099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_57370_59805_59948_61840_61978_71774_71978_85008_85145_87417_87497_87695_87851_159162_159360_159578
901448	contig_10627_pilon	-	1739	2	Intergenic	novelGene_59994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	285435	285130	TRUE	40	TAAAAGGGATCATTTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGLLGAQHNCCFSQARLWTLELQSSQRLLGLFCPRAQSQGGGRRLKDWEPPVCQTRGLQRPELSLDWRGQEPCARRPWAPASELCPDTAVSTEALRSGAQD	285437	283065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_283237_283869
901449	contig_20199_pilon	-	940	3	Intergenic	novelGene_82533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1345	936	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44092	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42223_43867
901450	contig_11572_pilon	+	2919	8	Intergenic	novelGene_100053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_3	95.6332279373351	14	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	1453	2799	256017	270528	FALSE	40	ATTACAGCATTACTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPNSNFYVSRTAYRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHICQYYIYDLQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKVKNKAVKDAEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVHVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEYKSIPAKSESIITETTTRNNVLEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSGHNTAVSQLSKAKEALTAAAETLKERKAAIRDIEAKLPQTEQELKEVKKFVSEGRLDIVNQP	254564	270648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_256152_257659_257837_265156_265322_265592_265721_266166_266308_267008_267160_268763_268929_270243
901452	contig_14467_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_138243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCACCTTGTTTATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284750	286892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_284800_286900
901454	contig_13860_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_178770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAACATAACAGAGAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234779	232938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13860_pilon_-_232900_234800
901455	contig_5200_pilon	+	5070	5	Intergenic	novelGene_140144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	163	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1320	1700	2357	2737	TRUE	55	GAAGGGAAAGACAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	1037	75162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_2894_9951_9975_12599_12917_13777_14801_73311
901456	contig_8561_pilon	-	3682	2	Intergenic	novelGene_161644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2426	2761	200205	199870	TRUE	60	CAGTGAAAAAGATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISNHIKRQSMMPSASSQKKESRNFPEEEIFLKLPEAEYQRLIYRTLQKIRKEIKQNTEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDSRKS	202630	198869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_199312_199390
901457	contig_6981_pilon	-	4066	10	Intergenic	novelGene_177315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_9	44.9718704948156	70	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	274	1140	147403	135849	FALSE	35	AAGAACTAGATGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAWIIDTFGNEEQRHTFCPPLCTMEKFASYCLTEPESGSDAASILTSAKQQGDHYVLNGSKAFISGGGESDIYVVMCRTGGPGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAMKGLNGGRINVASCSLGAAHASVVLTRDHLNVRKQFGKPLASNQYLQFKLADMATRLVAARLMVRHAAVALQEEREDAVALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRMLISRSLIHE	148849	132922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6981_pilon_-_135902_138228_138332_138926_139080_139407_139506_139602_139739_146302_146441_146842_146920_147294_147405_148020_148192_148748
901458	contig_10749_pilon	-	1718	16	Intergenic	novelGene_133442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1370.26507735628	1659	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	232	1332	155250	136250	FALSE	20	TGCCACAGTGATTTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157952	135863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157429_157475_157839
901459	contig_15857_pilon	-	7900	20	Intergenic	novelGene_152068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1181	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	6502	6903	84972	77988	TRUE	10	CTATTTCTCTCGCGAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVFWIGYTIHKFLAKTKHTERFKASTIVHSQSYERLLWLSGISQTFPFSIFKHFFNLLQTEALYGLSYFRIIWVKKVWMTSQNNVFRKKLPYCVKRNFLHVHLSPLNTQQTNMLLYSFSWGKRSNHRTSRL	131895	53394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_53543_54607_54686_56445_56581_62287_62449_68575_68663_70077_70219_71477_71593_77855_78044_79043_79214_80716_80800_84879_85012_87925_88025_89277_89458_94927_94985_98578_98790_100759_100845_106560_106619_108630_108699_115719_115796_126267
901460	contig_6576_pilon	-	1760	9	Intergenic	novelGene_42281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	710.889924232296	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	381	1199	331080	323781	FALSE	30	ATTGTTAGCCTCAGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	338049	323219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331180_332079_332233_337921
901461	contig_20602_pilon	-	1838	12	Intergenic	novelGene_133720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	319.872366075146	3	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	452	1192	23530	16186	TRUE	30	GGAAATAAAGTTTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVTLEECILPIMALKILYICGHKMPAGVDTDL	29561	9697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_16104_16282_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
901462	contig_11631_pilon	-	3311	27	Intergenic	novelGene_104194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	42	junction_24	73.8538157082934	417	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1052	3156	155	3310	241681	135420	FALSE	25	TATTGGAATCTGACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENLDEFIEERKAKLAKDKAELESDPPYMEMKGKASEKLSENSRILISMAKENIPPNNQQTRGSLGIDYGLSLPLGEDYERKKHKLKEELRQDYRRYLTQKNFLSTVETDPSTLGVSLPIGERLSAKERLKLERNKEYNQFLRGKEESKETFRQVEKSTESKSERNKKSVCQVKPDLPSQVQASCKNSEGPRRDVLTPSEAYEELLNQRRLEEDRYRQLDDEIELRNRRIIKNTHEEGSISSKKHQRLANKANIPDRRFRRFNEDRVLDRQYYRPDHDPEVSEEMDERFRYESDFDRRPLRVYANDRIYGNRRGNMPPMEYDGDFTEQSNIRISSAGNKSSRDNVPNERSKSANTRDVYSPFVGMVFGGEDRELVQRRKEKYRLELLEQMAEQQRNKRREKDLELSVAASGAQDPEKSPDRLKQLSVTPRHFEETIPPERPRVAFQTPLPPAPSVPPIPSVHSISSQNEDLCNGLNSTLGEMVPPRIAPLPPPPLLPPLATSYRTPYDDAYYFYGARNPLDPSLAYYGSGMMGMQPAAYVNAPVTHQPAQSVVNMVGQNEMKTTGDRAVNSGLFFEDKPKPSKQSLQSYQEALQQQIREREERRKKEREEKEEYEAKLEAEMRSYNPWGKGGGGAPLRDAKGNLITDLNRMHRQNIDAYHNPDARTYEDKRAVVSLEQNLATSNAENLEDSANKNSGYMQTQSSPFARGNMFGEPPTELQIKQQELYKNFLRFQIEEKKQREEAERERLRIAEEREEKRLAEQRARIQQEYEEEQEKKREKEEEQRLKNEELIRLAEERRKEAERKKKDEEEKHNLQLQHYYERENMIGEETKHLRQPSPVVPALQNKISSKLRRPPSVDSIISSFIHESSMSRAQSPPVPARKNQLRAEEEKKNVIMELSEMRKQLRSEERRLQGQLLHMDSDDGIHIRKRERNPMDIFDMARHRLQAPVRRPSPKGLDPATFQNIHDFNELKDRDSETRVDLKCMYPDPPRDHHTLEIQQQALLREQQRRLNRIRMQEGAGVDLDAIPNIKIRDHRMPRNDPPDFLKNS	253152	135418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_135456_139511_139559_147474_147616_150473_150614_154174_154293_154915_154983_156901_157007_161948_162096_162516_162667_165441_165555_168680_168834_176482_176631_178697_178828_186069_186149_186503_186626_188740_188944_190902_190961_191898_191993_196675_196759_197826_197926_205542_205983_206681_206781_208084_208166_216406_216511_239674_239775_241582_241707_253023
901463	contig_6576_pilon	+	4099	1	Intergenic	novelGene_42371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	446	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCACAGAATATACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1238306	1242405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1238300_1242400
901464	contig_11338_pilon	+	3472	1	Intergenic	novelGene_6405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACACATTTTTGGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310605	314077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_310600_314100
901465	contig_6674_pilon	+	2478	7	Intergenic	novelGene_147982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.8894322178816	289	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	1923	2477	54692	80567	FALSE	15	AGGGACCACTCTTCTTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPSNLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGIRTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDPVIIDR	46953	80568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_47554_53369_54826_56743_56901_57437_57502_58127_58184_68844_68919_80497
901466	contig_5889_pilon	+	1579	13	Intergenic	novelGene_133677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_12	82.2794611201497	58	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	33	1403	20445	323066	FALSE	25	TCCATGAGTATATGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVKLFPQETLFLEAKE	20412	323242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_322982
901467	contig_12624_pilon	+	3108	8	Intergenic	novelGene_61080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	2760	3107	900316	903778	FALSE	35	TAAAGACAACTTCTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVKAFSASGMFSRIVCMQPMLKQILECGSWTAVKASRAPFQSFLSAASTPSFQRLMASARDMVRWKPGGREAASRQLRLGGREWVRRGVSPSRAAQLPQVLIFLAWCSECGPAS	874072	903779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_874139_875121_877461_878873_878933_882972_883041_884762_884813_888693_888805_900249_900335_903449
901468	contig_3601_pilon	-	3656	2	Intergenic	novelGene_132919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATGAAAAATATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326281	322544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_322973_323053
901469	contig_5643_pilon	+	4313	17	Intergenic	novelGene_39055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	777.224265314555	486	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	2623	4101	634785	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPALGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631216	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_631908_632432_633605_633646_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
901470	contig_5601_pilon	-	2392	2	Intergenic	novelGene_178771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1455	1793	18125	17787	TRUE	0	TCCTTTGCTCTTCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	19579	17097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5601_pilon_-_17440_17529
901471	contig_11574_pilon	-	5132	2	Intergenic	novelGene_64041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1884	2222	364756	364418	TRUE	80	TGAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIHGRNRIQIISNNAQTPEDKLGNWELLKIKQLCSSKDFTKRVKRQFTDWEKICGYNKSNQHLISKIYEILQNLNNKKTNNPIQKWAKDMNRHFDKRYSGG	366639	361047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_363448_363907
901472	contig_7356_pilon	-	6390	29	Intergenic	novelGene_60408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	365.060469900089	2319	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1545	4638	1353	5990	515889	463380	FALSE	40	AGAGGGGAAATTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSENKKQRSRPRKPRRTRNEENEQDKDLEGPVIDESVLSVKELLGLQQAEERLRRDCIDRLKRRPRNFPTAKYTCKLCDVLIESVASAHKHIKEKRHKKNIKEKQEEELLTTLPPPVPSQINAIGIAIDKVVQEFGLHNESLEQRRGIKHIMENVFQHKLPDCSLRLYGSSCSGFGFKNSDVNIDIQFPAIMSQPDVLLLVQECLKNSDSFTDVDADFHARVPVVVCREKQSGLLCKVSAGNENACLTTNHLTALGKLEPKLVPLVIAFRYWAKLCSIDRPEEGGLPPYVFALMAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLNKLGNFNLKDVEKDIVVWEYADAATGDADPAKEELPRAPRDMPVKRGQVPLIFDLKRQPSVPVGQLWVELLRFYALEFNLADLVISIRVKESVSRESKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNNQPVFEYILHCLRTTYKYFALPHKISKSNLLKPVSAVTGISEHSKEVTNHDPGVQAKGDKFKNSVLAQGPGAISPAANTPKVQPLALKQTADHFEGPPVEEMGNRHISVSLENLDCVKAEVSCDDHEDVTMHRLETGGEHEKLKIEREGQHHLTAHDQDINSSKHGELAICGSTPTETDRTLDLEGFRNLTVRGRDGYVTIVVKADIDEESIEGTDELEDSLNHFAPSVPSQTKEIIHSDEEEEEEEEEEPRLTINRTEDEDGIANEDELDNTYTGSGEEDALSEEDEELGDAAKDEDLKECGKQADGALLVELNKISLKEENECEEDSAEDQSALSYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFSSILDQVCIQCYKDFSPTILEDQAREHIRQNLESFIRQEFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDICMTINGHETAEGLDCVRTIEELARFLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFIHSRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKDEKKPEIFVDGWNTYFFDQIDELPTYWPEYGKNTESVGQLWLGLLRFYTEDFDFKEHVISIRRRSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGSPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDTPNQRYPESKEKRSKEDKEVHNKYTEREAAAKEDKPLQCTPQKTKPVRPAVDLGRDKLLRPPLEKWKRQDDRDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGLSKSDCVFGSPSSPSSLRPTGTFFQAVLLHEDKKKQKTAIFLSPQSGSLSSKYMTQGKASPKRTQQES	518400	462979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_463448_473372_473437_473787_473865_475963_476290_479029_479146_479855_479948_480030_480079_482346_482525_483357_483436_483606_483721_484518_484609_485070_485175_487277_487336_488978_489080_489683_489771_491151_491303_491811_492900_494323_494505_497361_497524_499875_499996_501191_501319_502268_502339_503462_503515_505423_505513_509940_510119_510847_510965_511283_511466_515369_515921_517079
901473	contig_2054_pilon	+	5383	2	Intergenic	novelGene_51666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAGACCGCCCCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28905	34795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_34170_34676
901474	contig_10496_pilon	-	2561	9	Intergenic	novelGene_59428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	108.182426946339	34	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	764	1798	55665	44321	FALSE	70	GGCAAAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKLCLQKWKNQSSALYGMARGPE	64723	43557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_44387_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_56288_64482_64573_64672
901475	contig_5039_pilon	-	2127	5	Intergenic	novelGene_64971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_1	600.32090376731	243	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	880	1590	1673164	1670208	FALSE	25	TTTAACTTGTTGTGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAKAGVPLPPNLKPAPPPSIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEGNKDDDDNVFSSSLPSEGRVKRQGRVRRQLKQPAASHLTVTRCNSLCGTKPQSEKHRIAENSVITSLPNIGPSMHLWEGSPRYNYLASRFASRLYSSRFWW	1675457	1669670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1670463_1670568_1670761_1670976_1671124_1673047_1673209_1674622
901476	contig_6497_pilon	-	5732	5	Intergenic	novelGene_35580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGCTAAAATTTTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396163	211669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_211987_212649_214146_265008_265422_265665_266340_393331
901478	contig_9415_pilon	+	4831	6	Intergenic	novelGene_109890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	136	326	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4127	4525	2071920	2073978	TRUE	40	ACGCATAAAACAGTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVDHYRGTEQALVQCAGHLNQGARQAIQILLHLLAFHLHQYPTCPSLLHTHCPACQLDLELVPCTFQNLMSWIWSSGLSTSPCRCHITGSMDCHSHIHRRTNHPHRSRCFDSPGGLRCARSLGGFSSCAD	2066613	2075210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2066725_2066865_2070822_2071860_2072067_2072758_2072808_2073775_2074049_2074974
901479	contig_10734_pilon	-	2418	14	Intergenic	novelGene_51485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	521.172846659028	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	185	1996	2305085	2265543	TRUE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305269	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265400_2265466_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
901480	contig_18869_pilon	-	6462	13	Intergenic	novelGene_56477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_8	307.835183174373	832	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	179	1579	264436	227662	FALSE	15	TTGATGTTGATCTTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLRTRKASQQSNQLQTQRTARAKRKYSEVDDSLPSGGEKPPKNETGLLSSIKKFIKGSTPKEERENPSKRSRIERDIDNNLITSTPRTGEKPNKQISRVRRKSQVNGEAGSYEMTNQHVKQNGKLEDNPCSGSPPRTTLLGTIFSPVFNFFSPANKNGTSGSDSPGQAVEAEEIVKQLDMEQVDEITTSTTTSTNGAAYSNQAVQVRPSINNGLEESEETVNRDIPPLTAPVTPDSGYSSAHAEATYEEDWEVFDPYYFIKHVPPLTEEQLNRKPALPLKTRSTPEFSLVLDLDETLVHCSLNELEDAALTFPVLFQDVIYQVYVRLRPFFREFLERMSQMYEIILFTASKKVYADKLLNILDPKKQLVRHRLFREHCVCVQGNYIKDLNILGRDLSKTIIIDNSPQAFAYQLSNGIPIESWFMDKNDNELLKLIPFLEKLVELNEDVRPHIRDRFRLHDLLPPD	328468	222778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_227728_228304_228401_229658_229786_232922_233003_233106_233170_242948_243036_245313_245426_245715_245795_249698_249915_254923_255074_256584_256724_264250_264461_328314
901481	contig_8412_pilon	+	2776	1	Intergenic	novelGene_118380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACAGAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659220	661996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_659200_662000
901482	contig_6445_pilon	-	1346	13	Intergenic	novelGene_76946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	820.723901334805	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	73	819	89674	67980	TRUE	45	AAAAAGATACATTAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGTSPPFRI	96339	42881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_67944_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
901483	contig_11088_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_85055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCGCACCCGCTCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
901484	contig_10263_pilon	-	5515	18	Intergenic	novelGene_135854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_8	423.813507657975	34	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1504	4515	54	4568	988314	900347	FALSE	25	AGTATGCAGTCTCTACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRKLTKSERQRFKEEAEMLKGLQHPNIVRFYDSWESTVKGKKCIVLVTELMTSGTLKTYLKRFKVMKIKVLRSWCRQILKGLQFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDLGLATLKRASFAKSVIGTPEFMAPEMYEEKYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRRVTSGVKPASFDKVAIPEVKEIIEGCIRQNKDERYSIKDLLNHAFFQEETGVRVELAEEDDGEKIAIKLWLRIEDIKKLKGKYKDNEAIEFSFDLERDVPEDVAQEMVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKRKQEESSLKQQVEQQSSASQVGIKQLPSTSSAGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQLQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQAHSTGTIPGHTASVVQAQSQPHGVYPPSSVAQGQSQGQPTSSSLTGIPSSQPLQHPQQPQGIQQTAPPQQIVQYSLPQTSASSEATTTQPVSQPQAPQVLPQVSAGKQLPVSQPVPTIQGEPQIPVATQPSVVPAHSATHFLPMGQPLPTSLLPQYPVSQIPISTPHASSAQTGFSSLPVTMAAGINQPLLPLASSATAAAIPGGSTVVPSQLPTLLQPVTQLPSQVHPQLLQPAVQSMGIPANLGQAAEVPLPSGDVLYQGFPSRLPPQYPGDSNIAPSSNAVSVCIPSTVLSPPMPTEALATPGYFPTVVQPYVESNILVPVGGIGGQVQMPQPAVSLAQQAPSASSQQAVLESTQGVSQVVPPEPIPTAQPQPIQPTTLVSSIDSAHSDVASGMSDGNENVPSSSGRHEGRTTKRHYRKSVRSRSRHEKTSRPKLRILNVSNKGDRVVECQLETHNRKMVTFRFDLDGDNPEEIAAIMVNNDFILAIERESFVDQVREIIEKADEMLSEDVTVEPEGDQGLESLQGKDDYGFSGSQKLEGQFKQPTPVSSMPQQIGIPTSSLTQVVHSAGRRFIVSPVPESRLRESKVFTNEISDTVAATTSHGPEMNLSHSASSLSLQQAFSELKHAQMTEGPSTAPPNFSHTGPVFPVVPPPMSSIAGVTTTGAATLSVSVPATSIPLTDISTSVIQSQVTVPTEKGVTGIVITSGGLPIPSVSEPPILTSVVSSITVPTVVSISTTSQSVLTPTCGSIVSSTSTLPSITVSTASASAVGSTVVPGAKPPTVLSQQAAGSTTGVATLTSVSTTTPFPSIVSQPFLQLSSSSSASTLAETVVVSAHSLDKTSHSSAAGLALSLSAPSSSSSPGAGVSSFVTQPGGVHPLVIPSAIASTPILPQAAGPMSTPLLPQVPSIPPLVQPVASVPAVQQTLIHSQPQPALLPNQPHAHCPEIDVDAQPKAGIDDIKTLEEKLRSLFSEHSSSGTQHASASLETSLVVETTVMPGISTTAVAPSKLMTSTTSSCLPPASLPLVTTGLSVVTSGQVSAPVSCTSGVKPGTAPSKPPLTKAPVRSSERFIFKGAMLLVGTNVY	988367	899399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_901819_902513_902637_902770_902829_903040_903215_903551_903669_904814_904978_905074_905173_905859_906142_906867_907327_908477_908628_914657_914742_923075_923264_924533_924871_926101_926322_927974_928064_965321_965480_967567_967789_988192
901485	contig_744_pilon	+	3234	3	Intergenic	novelGene_145072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGAAATTGGCTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62045	181273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_744_pilon_+_63068_178964_180469_180565
901486	contig_14405_pilon	-	2977	1	Intergenic	novelGene_85647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTATCACGAAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485982	483005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_483000_486000
901487	contig_15449_pilon	-	3282	1	Intergenic	novelGene_33633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCCCAGTAATGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74438	71156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_71200_74400
901488	contig_10437_pilon	-	3318	3	Intergenic	novelGene_38264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	3.5	97	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGATACAAGAGGACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408311	403978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_406582_406674_406844_407765
901489	contig_12622_pilon	+	3774	22	Intergenic	novelGene_5801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_14	176.414863550758	248	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	1623	3461	446467	475513	FALSE	75	GAAAAAAAAAAACAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	349682	475826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398346_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
901490	contig_8972_pilon	+	3926	4	Intergenic	novelGene_167631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	2.62466929133727	30	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	949	3480	384256	386787	FALSE	10	TTATGCTCTCTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQLSGAQKRKLTEDKKKRICESLKTIPKLTSSLKFNESEETSSIEHWSLMGANLCSNTSAEITNSSTIVTDFVPNAASIPCCSKKINSGVESETILESEMITSADPLNNRNTDPALWNNFSSNDINYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLGGKQTRFCSQNIFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVYCFVCKLFSPKSFNSRFATDGFSDWSNSNMIHKHENSSVHRDCMLSYLNRRHGFGLTHELESQVNEERQYWKAILQRVVAVITTIAERGLSFRGRNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKYGNTGKGNPSYISKTMCEELINLISDKVRSAIFSEISIARYFSLSVDSTPDVSHTDQLSIVLRYVSPTDGKPVERFITFTSLRSHTGEEIADQVLHYLCEVCKIDFSKCRGQSYDSAANMAGRYKGMQQKISERNEYAIFIPCASHSLNLIGRSAVDCCPEAVDFFSTVQLLYTFFATSTHRWAVLKTYLGSDRVLKCLSNTHWEAHAVATSAILESYTQILDALENIAEDQTQKGDTKREAENIANKMQTLEYVFMLVMWNDILQHFHWTSQALQDSEVNLKTCTDLYQSLTGYLHNLREYFEKFENTTKQILPNTDYQAVHSRRSIRKKQVDDGSAPEESLSARDQFRVTTYHTIIDTLESCMKRRAGVYEVLSDRFSFLNSVDIPDEECMKASRKLVQAYPDDLNTNLYGEVRQFHSYMRTKFTDSGKTNFTYVGMYESIIEDKIQCVFPNVEIALRIFLTLMITNCTTERSFSSLKRLRNPQHATVIQERPDSLSLLCMEVDIVRQLNYDEIIEEFVKSKE	378446	387233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_378476_380605_380649_383142_384014_384250
901491	contig_2894_pilon	-	3872	9	Intergenic	novelGene_86547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_8	67.0623543800842	384	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	91	1608	301130	292620	FALSE	15	CCAGCTTAGGCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQGQWLKTLRGITFHSSYRAPLQLLSPETMALGTPRRGLLMLLMALGLTHSDPVRPSRGPLVTCTCENPHCRGPTCQGAWCTVVLVQEEGRHPQVHRGCGNLHQELCRGRPTEFVNHYCCYSPLCNYNVSLVLKATRTPPEQPQVDGQLPLVLGPVLALLALVALGALGLWHVRRRQEKHRGLHSELGESSIILKASEQGDSMLRDLLDSDCTTGSGSGLPFLVQRTVARQVALVECVGKGRYGEVWRGLWHGESVAVKIFSSRDEQSWFRETEIYNTVLLRHDNILGFIASDMTSRNSSTQLWLITHYHEHGSLYDFLQRQTLEPQLALKLAVSAACGLAHLHVEIFGTQGKPAIAHRDLKSRNVLVKSNLQCCIADLGLAVMHSQGSDYLDIGNNPRVGTKRYMAPEVLDEQIRTDCFESYKWTDIWAFGLVLWEITRRTVVNGIVEDYRPPFYDAVPNDPSFEDMKKVVCIDQQTPTIPNRLAADPVLSGLAQMMRECWYPNPSARLTALRIKKTLQKLSHSPLEEPKVIH	301220	290355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_292758_294323_294455_297454_297653_298352_298629_298942_299090_299450_299551_299888_300101_300285_300538_301066
901492	contig_15977_pilon	-	3062	2	Intergenic	novelGene_137213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTGCGGTCGAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91650	77649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_80517_91455
901493	contig_15353_pilon	+	2556	2	Intergenic	novelGene_151995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0	27	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTACATCTGGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541427	544852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_543881_544749
901494	contig_7730_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_156260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAAATCGATTTCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37373	34559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_34600_37400
901495	contig_7357_pilon	-	2318	9	Intergenic	novelGene_36793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	1916.17842332075	6611	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	225	1436	166824	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167048	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139934_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
901496	contig_10013_pilon	+	2387	1	Intergenic	novelGene_125049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGAATTCCACTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220495	222882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_220500_222900
901497	contig_16635_pilon	-	1382	3	Intergenic	novelGene_153134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	259	594	88362	88027	TRUE	65	AAAAAAATTACAAAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRRNLKFSQQLNKSQKQRNLKLGGGGDGERSPSGAVVKALSCQQKGQQFEPPAAPREKDVQSASVKVTALEILWGSSTVLQGGCESESTQVAVRLVCFLVMGHGEVGKT	88620	53052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_53199_86052_86141_87472
901498	contig_8848_pilon	-	3951	3	Intergenic	novelGene_140462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	733	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCGGGGCCAAGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98479	93807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_94103_94681_94884_95025
901499	contig_9633_pilon	-	2922	2	Intergenic	novelGene_139650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAGAGAAAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195214	1173812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1174097_1192576
901500	contig_9183_pilon	-	3272	6	Intergenic	novelGene_40284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586.17314848089	17	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	222	1721	323783	312097	FALSE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTKADARSP	325979	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312125_315331_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325808
901501	contig_9653_pilon	+	5460	7	Intergenic	novelGene_48197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3963	4265	189280	189582	FALSE	75	CATTAAAAAAATAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSAVTHGVTLSRHGPPSVPAPACRERALGYRDSLPGGGHRCPAPDGSRWHEAAAGVSQEGWQPIWEWGGRTATAPSHRLASVKIYSLGNRMGQFFSAL	175860	190777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_175976_178100_178240_178909_179021_179274_179385_182571_182688_184268_184363_186002
901502	contig_4091_pilon	-	3223	4	Intergenic	novelGene_173016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	290	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	969	1271	56589	56287	TRUE	20	GCTAGTGGATTCGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	57557	10861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_55003
901503	contig_1639_pilon	+	2846	25	Intergenic	novelGene_74886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	217.235818965627	40	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	592	2160	289113	324232	TRUE	20	AAACGTGGTGGTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAAFRWLPHF	279917	331945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_280122_283497_283596_285554_285580_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_324206_324324_328942_329049_331456
901504	contig_7202_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_18570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	46	471	29911	28004	FALSE	25	CATTGAGACTCATTACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHVSIGNQGMHGRN	29956	27939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
901505	contig_10734_pilon	-	1470	2	Intergenic	novelGene_51051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATCTCTGAGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444817	415383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_416585_444548
901506	contig_18647_pilon	+	3197	1	Intergenic	novelGene_162843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACTTTAGATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77933	81130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_+_77900_81100
901507	contig_17074_pilon	-	2405	2	Intergenic	novelGene_145199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGAATCGCTGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660289	656883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_657528_658528
901508	contig_5936_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_53555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTTGGCTATATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117445	115852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_115900_117400
901509	contig_10867_pilon	-	404	5	Intergenic	novelGene_159463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3857	junction_4	1100.77359161637	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	79	402	88631	87116	FALSE	20	AGGTACCTGGGTTCAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRPFRKHGVVPLATYMRMYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKE	91456	87113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_91429
901510	contig_15596_pilon	-	4540	15	Intergenic	novelGene_139523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	958	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3226	3600	148592	142816	TRUE	55	CAAAAAAAAAACACCTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSCSMLKTRLLSGLEQINRAFRKEVHFFCNVLSPPWSPLHTLAILGIISLNMNSYSTDTSMKKKYTLSSSPSVSLGFLRITSVKTKLGSFSQGIAYSVLRGLWEEWREMMGSLPKKLYDVPE	158881	104156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_104361_125844_126162_128201_128348_136548_136612_138344_138443_141826_141924_142800_142918_144892_145045_148471_148650_148732_148889_150028_150250_151130_151248_154926_155098_155194_155242_156425
901511	contig_20058_pilon	-	2825	9	Intergenic	novelGene_109286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	652.655812335261	53	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1447	2676	40533	30516	FALSE	50	GAAAAATGGCAGGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPGNLIKHLVKGTRPLFLETRIPWHMGHSIEEIPIFGLKAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	59151	30366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40135_40247_40376_41605_45576_45681_49540_49751_59090
901512	contig_3584_pilon	+	2928	11	Intergenic	novelGene_108142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	132.934607984527	56	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	917	1564	351589	355314	TRUE	20	AATTTTTCTTTAATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVVMAEAPPGVETDLIDVGFTDDVKKGGPGRGGGGGGGFATPIGGPDGTVPMPMPMPMPSPGSPFSYPLPKGPVIGFQWIISGDLSALSQYSSTSDTSNSPIV	340782	367189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_341911_342080_350949_351051_351472_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353469_354411_354623_355225_355319_356498_356548_365878
901513	contig_13123_pilon	-	2812	2	Intergenic	novelGene_136908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAGTGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446215	442406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_443548_444544
901514	contig_10711_pilon	+	6929	4	Intergenic	novelGene_118415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	951	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2115	2420	209156	209461	TRUE	40	GAGAAATTATTCTTAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRVLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPVWMPFISFSCLIALPRISSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMSAIGFA	207041	308167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_210593_211740_212366_276260_276272_305425
901515	contig_8075_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_42514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTTGAGAATGTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788773	786846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_786800_788800
901516	contig_12869_pilon	+	2422	8	Intergenic	novelGene_75324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_7	320.804282632109	1278	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	68	745	67397	94497	TRUE	20	TAAACTCTGTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGKCDFLFTHHSNISSFQYFCP	67329	98481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94611_96917
901517	contig_14720_pilon	+	4034	1	Intergenic	novelGene_164996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230005	234039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_230000_234000
901518	contig_14868_pilon	+	1599	12	Intergenic	novelGene_150457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	85.6422503284583	211	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	107	1597	186170	252478	FALSE	45	TGACAAAAGATGACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSPGNSTLEEILGQYQRSLRERANRSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVR	186063	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
901519	contig_11961_pilon	-	2326	1	Intergenic	novelGene_153691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	32	352	110196	109876	NA	70	ACAACAACAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGKEVKRYEVMTDWYKYRKVRVNFKVTTKKVKKPTHQNKEQKHKVSVKTKPTKTKEMKKNTQTKETHHRRVRRTKKTSAPQKEKKKSTTECNTTPSNISKRNKSRHTNRHMHTHIN	110227	107901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_107900_110200
901520	contig_6740_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_142682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTAGATAGCATACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620635	618872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_618900_620600
901521	contig_18544_pilon	-	1684	8	Intergenic	novelGene_152744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	143.548612259515	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	345	1124	54710	38474	FALSE	85	CAAAAGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	58157	37913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895_55016_58025
901522	contig_8161_pilon	-	2400	7	Intergenic	novelGene_156744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.0765376089501	209	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	113	1132	254273	230026	TRUE	45	GCAAACAAGGAAGTATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254385	226178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227432_230010_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
901523	contig_10861_pilon	-	4256	6	Intergenic	novelGene_39210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_5	235.839267298726	372	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	190	939	533237	441659	FALSE	30	AAACGTGTTTTATTTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNGLKEEDKEPIIELFVKAGSDGESIGNCPFSQRLFMILWLKGVVFSVTTVDLKRKPADLQNLAPGTHPPFITFNNEVKTDVNKIEEFLEEVLCPPKYLKLSPKHPESNTAGMDIFAKFSAYIKNSRPEANEALERGLLKTLQKLDEYLNSPLPDEIDENSMEDIKFSTRKFLDGNEMTLADCNLLPKLHIVKVVAKKYRNFDIPKGMTGIWRYLTNAYSRDEFTNTCPSDKEVEIAYSDVAKRLTK	533426	438341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_441824_442798_442981_454502_454610_461401_461528_482633_482744_533177
901524	contig_15498_pilon	-	1558	7	Intergenic	novelGene_42712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_6	65.4590626948545	209	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1488	70	1557	1040372	984385	FALSE	15	TCCCAGGTAAGCTTTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTPYPSGQNAGPTTLVYPQAPQTMNSQPQTRSPFFQRPQIQPPRATIPNSSPSIRPGAQTPTAVYQANQHIMMVNHLPMPYPVPQGPQYCIPQYRHSGPPYVGPPQQYPVQPPGPGPFYPGPGPGDFPNAYGTPFYPSQPVYQSAPIIVPTQQQPPPAKREKKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGGGSRNPTPPIGRPISTPTPPQQLPSQVPEHSPVVYGTVESVHLAASTPVTAASDQKQEEKPKPDPVLKSPSPVLRLVLSGEKKEQAGQTSELTAVESTPELPLPVSPTTVSPIARNTIASPISAALSSQPIFTTAVDDRCELSSPKEDTFPIPSPTSCTETSDPSPTDEIDDDICKKPCSVAPNDIPLISSTDLINEINGVGEKLPATESIVEIVKQEVLPLTLELEILENPPEEMKVECTPAPITPSTVPSFSPSPPTPPASPPPTPVIVPAAATTISTSSAPTTVQGVLEEDESVRTCFNEDGKEIPNKTEAEADGQTEETMDSQSLNSRKSP	1040441	984383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_985218_993386_993496_1011552_1011676_1014077_1014176_1022100_1022216_1022805_1022986_1040342
901525	contig_10581_pilon	+	4875	12	Intergenic	novelGene_41374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	48.8233449106517	561	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	1375	2748	474919	485194	FALSE	5	TGTGGTTTGTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAAIASCKHTFPAWADTSVLSRQQVLLRYQQLIKENLKEIAKLITLEQGKTLADAEGDVFRGLQVVEHACSVTSLLLGETMPSITKDMDIYSYRLPLGVCAGIAPFNFPAMIPLWMFPMAMVCGNTFLMKPSERVPGATMLLAKLFQDSGAPDGTLNIIHGQHEAVNYICDHPDIKAISFVGSNQAGEYIFERGSRHGKRVQANMGAKNHGVVMPDANKENTLNQLVGAAFGAAGQRCMALSTAILVGEAKKWLPELVERAKNLRVNAGDQPGADLGPLITPQAKERVCNLIDSGTREGASILLDGRKIKVKGYENGNFVGPTIISNVKPNMTCYKEEIFGPVLVVLETDTLDEAIKIVNDNPYGNGTAIFTTNGATARKYSHLVDVGQVGVNVPIPVPLPMFSFTGSRASFRGDTNFYGKQGIQFYTQVKTITSQWKEEDATLSSPSVVMPTMGR	470416	487321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_471608_473582_473643_474623_474699_474870_475033_475281_475361_475781_476085_477421_477544_478888_479079_479280_479463_480930_481111_481387_481487_485089
901526	contig_6735_pilon	-	10042	20	Intergenic	novelGene_15815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_4	46.2474376021477	763	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3181	9546	130	9675	633176	573953	FALSE	35	AATCTGAAGTCCAGTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQLAKNSTEMEEFVRVKQQLKEKEELISTLQTQLSQTQAEQAAQLSSMQQVVREKDARFETQVRLHEDELLQLVTQADVETQMQQNLRVLQRKLEEREEALSGRAQVVDLLQQELNAAEQRNQVLLQQLQQMEAEQNTLRNTLETERQDSKILMEKMELEVAERKLSFHNLQEEMNHLLEQLEQADQAQAELESQYRSLEQKHKAEMEEKTLHILSLQKTEQELQSSCDTLKDQNSKLLQEKREQSVQSAQAIQQLEDQLHEKSKEISQFLTKSTLQKHETASQTSFPDVSHEGVQAVTEEKIASLQQRVVELENEKGALLLSSMELEVLKAENEKLSSQITLLEAQSRAGKADKEDSQISMVDNTRLNKSNSSTEESGQDVLENTFSQKHRELSVLLLEMKEAQEEIAFLKMQLQGKKTEGDPEDLGQKEVKQMESEGIPPVEMKVLLEDTGQDFPLMSDEESSLPAVKKEEQASNKHQNTTSEEMPFNDTKMELKSTKQDAIDKSPAVIPDISQCQQDELKRLKSQISELEISFHKAEETYEKNLDEKAKEISKLTQLIEEFKKNAENTSNAFTALSEERDQLLSQVKELSIVTELRAQVQQLEANLAEAEKQRRLDYESQTTHHNLLTEQIHSLIIEAKSKDVKIEVLQNELDDMQLQFSEQSTLIKSVQSQLQKKENEVLEGEERLRDMSDKMEELSRALSQKELEIAKLDQLLVEKKKDVETLQQTVKEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSKAEEAKKEHVEEDKEVVSGLKHNYNELSPAGLISKEELQHELDLLKKESEQRKRKLQAALINRKELLQKVSRLEEELAKVRDESRKEVPLNANEKREMEEDKENKEDSEKCVSSKCQEIEIYLKQTISEKEVELEHVRKDLEEKVAAEEQLQATVKQMNQNLQDKTNLIDLLQAQITENQAVIQKLITGNKDAGDGDSAAPVKETVVISPAGAGSGEQWKPKLEEKILDLEKEKEQLQKKLQEVLASRKVILKKAQEKEKHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSKEKENIGDRLRQLQIQVRGSLDRNPPPGIDQEESSSSIQGLEDPVFKAAEQQLDQPVSESPLGPDLPSQHEDANILQSNPYIDQIKAKLKEIESEKEELELKVSSTSSELTKKSDEVFQLQEQINKQVLEIQSLKTAASEAEAHAESLKLTLESNQLEIARLEHLRELQPALDELQRLISKKEEEVSYLSGQLSEKEKIFTKVKTEVIEREDLIKALHMQLEMQAKEHDEKIKQLQVELSEMKQKPEETEKEGKAKLQIQRKLQAALISRKEALKENKDLQEELSLARDSIERLTKSLADVESQVSAQNKEKDIFSQRLALLQEERDKLIAEVDKSLLENQSLNGSCESLKLALEGLTEDKEKLLKEIESLKCSQIAEKTEWQEKHKELQKEYEILLQSYENVSNEAERIQHVVDAVRQEKQELYGKLRSTEANKRETEKQLQEAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEVHPAGDTSKERMDALLSSNSNMKEELESVRMEYKTLSKDFEALMTEKDILSQEVQDLKHQIEDNIFKQASREAIEKQDNQGDIIEEATQSVSDEVKEQDSPSRSTRPEYSESILLENSGKIDPDISENVSSHGEINNYLQEIDQLKETIAELEKEKHKEKEFSQALENEKNTLLNQILSKDGELKILQEEVTQINLLNQQIQEELSRVTKLKETAEEEKDDLEERLMNQLAELNGSIGNYYQDVTDAQIKNEQLESEMQNLKKCVSELEEEKQQLVKEKTMVESEIRKEYLEKIQGAQKEPGSKSHAKELQELLKEKQQEVKQLQKDCIRYQEKISALERTVKALEFVQSESQKELETNKENLAQADELRKKAQAELASFRVLLDDTQSEAARVLADNLKLKKELQSNKELVKSQMKQKDDDLERRLEQAEDKHLKEKKNMQEKLDALRREKAHLEETFGEIQFTLDKKDMEVKQLQENLDSTVAQLAAFSKSMSSLQDDRDRVIDEAKKWERKFSDAIQTKEDEIRLKEENCSVLKDQLRQMSIHMEELKINISRLEHDKQTWESKAQTEVQLQQKVCDTLQGENKELLTQLEETRYLYHNSQNELAKLESELKILRDHSTDLNNSLEKCKENKENLEGIVKQQEADIQNCKFSYEQLEADLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSAKEEAVQVAISELHQQHDKEIKELENQLSQKEEENKKAVDKTSQLMETLNTIKKESTQQKAQLDSFVKSMSSLQDDRDRIVGDYQQLEERHLSVILEKDQLIQDAAAENNKLKEEIRCLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVISIKDCQQKQLLEAQLQQNKELKSEYAKLEEKLKESEEAKENLQRSSNTLQEEKQGLSKEIESLKISISQLKGQVTDLQEEGTLGVFQAQLKVKEEEVQKLSTTLSSSQKRIKELEEELVHVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIMRNETETAEERVAELARDLMEMEQKLLTVTKENKDLTAQIQSFGKSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDASLKEVAQLREKQGLLSREREVLVSKAASPKSSTEDNSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSFSKAMASLQNERDHLLNELARFRKSEEGKQRSAAQPATSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQYLQINQEIPELRPLKAQLQEYQDKTKTFQIMQEELRQEHLSWQHELHQLRMEKSSWEVHERRMKEQYLMALSDKDQQLNHLQNLMRELRASSSQTQNLKVQYQRQASPETPTSLDGSQNLVYETELLKTQLNDSLKEIHQKELRIQQLNSKGPLNLDVAPGAPQEKNGAHRKSSPEELREPQLSFSEAQQQLCNTKQEVSELRKLLEEERDQRVAAETALSVAEEQIRRLEHSEWDSVRTPIIGSCGTQEQAILIDLTSSGCRRTRSGAGWKRVLRSLCHSRTRVPLLAAIYFLMVHVLLILCFTGHL	645394	573585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_574088_574402_574509_577251_577387_577834_577933_584144_584283_584476_584643_588711_588891_596236_598131_598974_604182_605595_605670_608598_608714_615018_615135_616300_616704_618882_618997_620304_620428_622573_622700_629168_629301_632682_632836_633044_633198_645286
901527	contig_6847_pilon	-	1968	7	Intergenic	novelGene_143896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	312.004674110287	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	47	772	245032	232193	TRUE	25	CATTGGTTTTTAACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRTSEATKVHAPPVNMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGMIMLRISDDKFGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTTESLIGLKNPEKSFPVYSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQEDNLELNDVIITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNKSGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFISKKNYCNIQVTRVTQVDGNSPVRFSTETTFLVDKYEIL	245078	230917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_231977_232055_232283_233840_234046_237932_238042_238359_238508_239870_240037_245024
901529	contig_20527_pilon	+	1210	5	Intergenic	novelGene_138600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1051.74696933245	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	163	636	23541	28629	FALSE	25	GTGACCCTAACTGACCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEGTRKLVIGNPRLSKDSVDVL	13992	29203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_14051_23436_23740_24905_25023_25434_25530_28566
901530	contig_13565_pilon	+	4543	1	Intergenic	novelGene_162382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTAGTCCAAAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143989	148532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_144000_148500
901531	contig_5084_pilon	+	1435	13	Intergenic	novelGene_64508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTCAGAATCTGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349383	375955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_349479_349948_350031_350981_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383_353471_354824_354907_356009_356185_356695_356837_364477_364588_365262_365380_375773
901532	contig_678_pilon	-	3909	1	Intergenic	novelGene_167829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	13	375	160332	159970	NA	20	GCTGGTCAGAGCAGTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQVVQGVDALLVCHNGALSTEKEEVTGLCVRELNDDTRNDSKFAYTRTEMQTVAEKVDTVKSIHIHSVIILRRSDKRIEWKFLQSSCPWLQRRQRVSPHESCGLVSFPSSYNCLAFPC	160344	156435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_156400_160300
901533	contig_10163_pilon	-	1939	2	Intergenic	novelGene_82619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTGAACTGTAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119597	54250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_54537_117944
901534	contig_9833_pilon	-	4005	12	Intergenic	novelGene_68479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_11	81.6323141332144	435	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	164	1942	165894	127641	FALSE	20	GATTCTGCCCTGTGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVARGTRCCCFGGGGAEAVAAVAALPAPDHSASRLVSQPHLSPPGPAPASTCPMSVSLVVIRLELAEHSPIPAGFGFSAAAGEMSDEEIKMKTLASAVASLEGKSPGEKAAIIHQHLGHREMTDMIIETMKSDPDELKATMEEGKSSEASPTARRSRDQSKECVNAAPDSPSKQLPDQISFFSGNPSVEIVHGIMHLYKTNKMTSLKEDVRRSAMLCILTVPATMTSHDLMKFVAPFNEVIEQMKIIRDSTPNQYMVLIKFSAQADADSFYMACNGRQFNSIEDDVCQLVYVERAEVLKSEDGASLPVMDLTELPKCTVCLERMDESVNGILTTLCNHSFHSQCLQRWDDTTCPVCRYCQTPEPVEENKCFECGVQENLWICLICGHIGCGRYVSRHAYKHFEETQHTYAMQLTNHRVWDYAGDNYVHRLVASKTDGKIVQYECEGDTCQEEKIDALQLEYSYLLTSQLESQRIYWENKIVRIEKDTAEEINNMKTKFKETIEKCDNLEHRLNDLLKEKQSMERKCTQLNMKVAKLTTELKEEQEMNKCLRANQVLLQNKLKEEERVLKETCDQKDLQITEIQEQLRDVMFYLETQQKINHLPAETRQEIQEGQINIAMASATSTPSSGGSGKLPSRKGRSKRGK	166057	125577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_128005_130088_130193_139661_139752_142125_142236_142601_142741_143189_143266_146297_146447_156766_156881_162189_162380_163565_163765_164452_164615_165812
901535	contig_6210_pilon	+	1342	3	Intergenic	novelGene_171882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGAGCCCTGAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73568	80445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_73607_75273_75442_79309
901536	contig_6576_pilon	-	4101	17	Intergenic	novelGene_42346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_16	210.019009556278	587	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	138	2132	763122	723616	FALSE	35	ATAAAAGATGTATTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPSLLSSSLPFPSPPLSPPSPLGPPEPAGASAAGAAVLPVKKPKMEHVQADHELFLQAFEKPTQIYRFLRTRNLIAPIFLHRTLTYMSHRNSRTNIKRKTFKVDDMLSKVEKMKGEQESHSLSAHLQLTFTGFFHKNDKPSQNSENEQNSVTLEVLLVKVCHKKRKDVSCPIRQVPTGKKQVPLNPDLNQTKPGNFPSLAVSSNEFEPSNSHMVKSYSLLFRVTRPGRREFNGMINGETNENIDVNEELPARRKRNREDGEKTFVAQMTVFDKNRRLQLLDGEYEVAMQEMEECPISKKRATWETILDGKRLPPFETFSQGPTLQFTLRWTGETNDKSTAPIAKPLATRNSESLHQENKPGSVKPTQTIAVKESLTTDLQTRKEKDTSNENRQKLRIFYQFLYNNNTRQQTEARDDLHCPWCTLNCRKLYSLLKHLKLCHSRFIFNYVYHPKGARIDVSINECYDGSYAGNPQDIHRQPGFAFSRNGPVKRTPITHILVCRPKRTKASMSEFLESEDGEVEQQRTYSSGHNRLYFHSDTCLPLRPQEMEVDSEDEKDPEWLREKTITQIEEFSDVNEGEKEVMKLWNLHVMKHGFIADNQMNHACMLFVENYGQKIIKKNLCRNFMLHLVSMHDFNLISIMSIDKAVTKLREMQQKLEKGESASPANEEISEEQNGTANGFSEINSKEKALETDGVSGVLKQSKKQKL	763519	721646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_723962_725941_726022_726423_726623_727587_727746_728235_728380_728592_728685_730147_730326_733888_733995_738872_738967_740044_740277_741917_742004_745537_745588_756466_756536_760605_760671_760761_760809_763073_763161_763420
901537	contig_3956_pilon	+	1698	2	Intergenic	novelGene_14756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	0	199	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	23	1024	794009	796007	FALSE	25	TCCAAACAATCTGTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSGNRLQMLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793986	796681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795037
901538	contig_10074_pilon	+	10098	60	Intergenic	novelGene_57093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_46	249.139424305878	738	41	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1871	5616	204	5819	170583	291120	TRUE	80	ACCAAAAAAAAAAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDCFEYGTPETLPFLVAHAFITVVSNIRIWLHIPAVMQHIIPFRTYVIRYLCKLSDQELRQSAARNMADLMWSTVKEPLDTTLCFDKESLDLAFKYFMSPTLTMRLAGLSQITNQLHTFNDVCNNESLVSDTETSIAKELADWLISNNVVEHIFGPNLHIEIIKQCQVILNFLAAEGRLSTQHIDCIWAAAQLKHCSRYIHDLFPSLIKNLDPVPLRHLLNLVSALEPSVHTEQTLYLASMLIKALWNNALAAKAQLSKQSSFASLLNTNLPIGNKKEEEELRRAAPSPWSPAASPQSSDNSDAHQSGGSDIEMDEQLINRTTHVQQRLSDTEESMQGSSDETANSGEDGSSGPGSSSGHSDGSSNEVNSSRASQSAGSPGSEVQSEDIADIEALKEEDEDDDHGHNPPQSSCGTDLRKRKLESQTGICLGDSQGPSERSGTSNGTGTDLVFNTESMPSVDNRIRMLDTCSHPEDAEHDISGEMNAAHIAQGSQDSCIARTGDFLGETIGNELFNCRQFIGPQHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHDGRVVDDMLSADDVSCSSSQVSAKSEKNMADFDGEESGCEEELVQINSHAELTSHLQQHLPNLASIYHEHLSQGTAVHKHQFNSNAVTDINLDNVCKKGNTLLWDIVQDDDAVNLSEGLINEAEKLLCSLVCWFTDRQIRMRFIEGCLENLGNNRSVVISLRLLPKLFGTFQQFGSSYDTHWITMWAEKELSMMKLFFDNLVYYIQAAREGRQNRALYSHSAEVQVRLQFLTCVFSTLGSPDHFRLSLEQVDILWHCLVEDSECYDDALHWFLNQVRSKDQHAMGMETYKHLFLEKMPQLKPETISMTGLNLFQHLCNLARLATSAYDGGSNSELCGMDQFWGIALRAQSGDVSRAAIQYINSYYINGKTGLEKEQEFISKCMESLMIASSSLEQESHSSLTVIERGLLMLKTHLEAFRRRFAYHLRQWQIEGTGISSHLKALSDKQSLPLRVVCQPAGLPDKMTIEMYPSDQVADLRAEVTHWYENLQKEQISQQAQLQEFGQSSRKGDFPGGLMGPVRMISSGHELTTDYDEKALHELGFKDMQMVFVSLGAPRRERKGEGVQLPASCLPPPQKDNIPMLLLLQEPHLTTLFDLLEMLASFKPPSGKMAVEDSESLRCEELHLHAENLSRRVWELLMLLPTCPNMLMAFQSISDEQNNDGLNWKELLKIKSAHKLLYALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLEIFNSGILEPKEQESWTVWQLDCLACLLKLICQFAVDPSDLDLAYHDVFAWSGVAESHRKRAWPGKSRKAAGDHAKGLHIPRLTEVFLVLVQGTNLIQRLMSVAYTYDNLAPRVLKAQSDHRSRHEVSHYSMWLLVSWSHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLIPETAVRHESCNGLCKLSLSGLDGGDSINRSFLLLAASTLLKFLPDAQALKPIRIDDYEEEPMLKPGCKEYFWLLCKLVDNIHIKDAGQTTLLDLDALARHLADCIRSREILDHQDGSIEDDGLTGLLRLATSVIKHKPPFKFSREGQEFLRDIFNLLFLLPSLKDRQQPKCKSHSSRAAAYDLLVEMVKGSVENYRLVHNWVMAQHMQSHAPYKWDYWPHEDVRAECRFVGLTNLGATCYLASTIQQLYMIPEARQAVFTAKYSEDMKHKTTLLELQKMFTYLMESECKAYNPRPFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIEEMSPELKNTVKSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRGPVLRNCLVF	150855	312001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_150939_170277_170329_170513_170664_174140_174209_181391_181585_183237_183300_194635_194718_194801_194895_205009_205136_205306_205437_206104_206141_206507_206639_206932_207577_210958_211174_214089_214206_214300_214429_217569_217660_220222_220319_221555_221639_226364_226520_227729_227844_229102_229203_229332_229493_232309_232437_232532_232681_240641_240743_240940_241151_246045_246172_248293_248417_248550_248635_249137_249225_254655_254857_256017_256101_260116_260158_260286_260412_261466_261620_262593_262699_264116_264173_264266_264388_281395_281580_282029_282191_284838_284905_286190_286338_286423_286481_286570_286649_287025_287121_291086_291262_293461_293616_294713_294793_297590_297645_297758_297855_301177_301243_301337_301414_301495_301544_301662_301729_303593_303675_306785_306872_307261_307431_307536_307612_308912
901539	contig_5602_pilon	-	6372	9	Intergenic	novelGene_133017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_8	106.646612698201	198	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	4834	5727	512038	488176	FALSE	45	CCAAAGAAAGAAATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKAQASFWTAEEVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	521575	487530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_511996_512153_516856
901540	contig_7333_pilon	+	5317	23	Intergenic	novelGene_142783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	152.521919573592	850	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	595	1179	223622	237210	TRUE	10	GTGGGCTCTACGACGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTKSVDFVKDAHEEVERAVEECDPYSGLLNDSEEDNLGNDHRVDSDDRNDAEEDALGFPNNRDVYWSEEDQELIIPCLALVKASKASLKKIRISVAENGKKDQVAQLDDIVDITEEISPSVDDLALSIYPPMCHLTVRINSAKLVSVLKKALEITKASHATPQPEDSWIPLLISAVDHCMNRIKELTQSELEL	218369	270653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_218564_218733_218794_219139_219220_221849_221916_222679_222777_222951_223026_223598_223676_224012_224321_230329_230391_236788_236836_237095_239257_241124_241261_242377_242537_244717_245052_246497_246744_255404_255506_255779_255916_256540_256710_257851_257959_259204_259325_261998_262231_265608_265792_270484
901541	contig_1450_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_27439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	802	1140	423977	423639	NA	25	GAGCTTAATCTTGTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTSSTFSAFLPADLHKPRQDLSTGVQVGKEKVLNVKTGFPKNPSLATTLPRGWGQALGREERGRSVWETEIREGAVVTSGGSCWFWVSAPSPWAEAPGGPRVPSGAEEVM	424778	423364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_423400_424800
901542	contig_9785_pilon	+	4804	7	Intergenic	novelGene_157890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	97.4754954961616	423	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	136	1071	195113	236466	FALSE	10	TAGTGGTGATTTTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRDTLVHLFAGGCGGTVGAILTCPLEVVKTRLQSSSVTLYISEVQLNTMAGASVNRVLSPGPLHCLKVILEKEGPRSLFRGLGPNLVGVAPSRAIYFAAYSNCKETLNGVFDPDSTQVHMISAAMAGFTAITATNPIWLIKTRLQLDARNRGEKRMGAFECVRKVYQMDGLRGFYRGMSASYAGISETVIHFVIYENIKQKLLEYKTASAMEEDEESVKEASDFVGMMLAAATSKTCATSIAYPHEVIRTRLREEGTKYRSFFQTLSLVVQEEGYGSLYRGLTTHLVRQIPNTAIMMATYELVVYLLNG	194977	240199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_195154_214250_214416_218397_218476_223917_224019_232190_232258_235070_235361_236272
901543	contig_20951_pilon	-	1591	3	Intergenic	novelGene_43145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	148	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2	475	358332	357859	TRUE	40	AACTGAAGTGTACATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPRCSRFRSFCRSPPAVFPRFWPLVGENPGACGCGRRLTRAVARRAPGCADTSSGGPQARGPEPAVLWPEGLSRAVVAAAGKALGGRWGLLWPGRCALAPPTAPGPACLRRQWPWSEFIHGPAEAPGTVSSTGGRFGPGRSVPAEVHLSCRPRPSS	358333	348004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_348860_356651_356711_357656
901544	contig_9653_pilon	-	3623	15	Intergenic	novelGene_48291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.35261842365	5	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	32	2152	1040020	1006903	TRUE	40	TTTTAATCTCTTAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1005360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006764_1006834_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
901545	contig_14467_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_138266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1	384	318770	319153	NA	0	GGCCCTGGCTCCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	318769	319734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_318800_319700
901546	contig_6076_pilon	+	2253	2	Intergenic	novelGene_81724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTCAATACCCAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20632	23031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_20696_20841
901547	contig_13295_pilon	+	1796	2	Intergenic	novelGene_31250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACACAGTAGGTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120662	122664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_121640_121845
901548	contig_233_pilon	-	1749	11	Intergenic	novelGene_14511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1375.18304599788	8	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	105	1064	108727	91486	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNTTTSSR	109932	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91507_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
901549	contig_20875_pilon	-	6777	2	Intergenic	novelGene_153096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	392	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	5984	6340	24970	24614	FALSE	70	AAAAAAAGGGAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQSPRNNLGRAAGSLARVQGMSVLPGKWGVPPLQGKLSWCLGGSSCPVRLVLGVPAAWGRVHFLSSRSPCLLAPPSRLKCKTQSSHLRFPSHTSTGQEGAGCSLQPLPCGAFQQTL	34468	24176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_30931_34445
901550	contig_6871_pilon	+	2514	3	Intergenic	novelGene_21579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2094	2486	139644	183229	FALSE	40	CTCTATATATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLCLIGISLGLLILILFPFVRLEEVRCHPHTIITACIQYVWAFWQSSLAFALLWNLHSAHQHLTSSSWDLGQELALVLADLGFVSLGSLEPTDCCLTCGSWVFQPLQLCESSLMPDPWTWDLPTSTTA	137490	183257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_137699_137758_139752_182944
901551	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
901553	contig_9177_pilon	-	2565	2	Intergenic	novelGene_32814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	257	340	1647052	1644529	FALSE	85	AAAGAAAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHQHQSSLYRISTDQTFFPGSRPVGPNQAWAHLIILGHRLLPGPLCLLSVHSLSSLGIGSPLRPASKLLAANKDIVLRVLWVALPMWGRITGKVLQGQERVVCRQWFWSGHI	1647308	1642303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1644588_1647027
901554	contig_3382_pilon	-	2561	5	Intergenic	novelGene_124157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1648	2112	958223	951844	TRUE	35	AGCTCCCGGAGAATCGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSVIEILHNHVVVQGWPAAGHIGTGCAGPLARGVGGRKKFLMALKNPVSTFASASGRVPPAPGVLAVADVLDVAYHAVVEPVLPHGGQHLPVQQVVGAQAVGVTAVPAREVLADVEFLAGRLLAADLLPALALVALTYLRHKKRVALDKEHS	962267	931396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_931754_951751_951887_955421_955673_958052_958281_960677
901555	contig_15087_pilon	-	11787	2	Intergenic	novelGene_37246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	925	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	170	532	221084	220722	TRUE	60	AAATGATTGAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGRQINSPLAYRQRRGPWGPWSRLVPTQGGLPGGRGLSPGWRPPGAAPSRQPRALCAFHRQLSEDLLLTREALEKESQLRRQLQQEKEELLYRVLGADASPTFPLASVTPPKVSFLAT	221253	206436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_208191_211220
901556	contig_9609_pilon	-	6319	18	Intergenic	novelGene_23008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333328	314136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_314431_317882_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322755_323286_323360_323984_324070_324250_324332_324414_324486_325137_325224_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329944_330227_330303_331386_331487_331563_331692_332692
901557	contig_2069_pilon	+	2152	10	Intergenic	novelGene_23176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_3	189.857906581101	76	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	490	1014	76142	89492	FALSE	20	TCTATATCTGCTTTAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69914	90630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75454_75530_75847_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407
901558	contig_8581_pilon	-	2301	11	Intergenic	novelGene_22809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	523.810280540579	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	103	1707	329972	306934	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKWACGSEEKCPQAAKSPRPPACRPSSTSLFEQRPLVPPSEPCREVPAQEPATTAAGRKTKPNLWRIT	339356	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307135_312569_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264
901559	contig_6164_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_121267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCTGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315199	313209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_313200_315200
901560	contig_6740_pilon	-	2829	3	Intergenic	novelGene_142664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGAGAATAGTAGCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595981	386780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_386831_414647_414900_593454
901561	contig_6102_pilon	+	2444	19	Intergenic	novelGene_31994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	963	1265	429588	431551	TRUE	40	TTGATCTACAAAATTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWVCSVTLSSWRSGFLVCSPLFPVLFSSSSLPVVSMLSSSCSSRSVMVPPLTGADSESFFVLTVLGNVTSSTLGTGEGSSMSFVRSSCSSSLWPRFDLV	421822	435157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_421868_422132_422304_422541_422800_423163_423225_423318_423443_424437_424507_425292_425413_429166_429239_429545_429679_429961_430001_430140_430201_431438_431564_431940_432059_432163_432292_432425_432504_433389_433460_433715_433785_434352_434449_434549
901562	contig_1090_pilon	+	3470	14	Intergenic	novelGene_131121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_4	194.179749582517	17	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1845	1624	3468	483329	492825	FALSE	45	TGACAGAGAAATCCGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGKDVWPDDFYSHSKGQKVYLTWPVPNCAEGCPGSWIKDGYCDKACNNSACDWDGGDCSGNSGGSRYVAGGGGTGSVGVGQPWQFGGGISSISYCNQGCANSWLADKFCDQACNVLSCGFDAGDCGQDHFHELYKVTLLPNQTHYILPKGECLPYFSFAEIAKRGLEGAYSDNPVIRHASIANKWKTIHLIMNSGMNATTIHFNLTFQSKNNDEFKIQITVEVDTREEPKLNSTTQKSYEHLVSPVTILPEAEILFEDVPLEKRFPKFKRRGNTTERLQEEVKIPLINISLLPKEAQLSLNNLDLQLEHGDITLKGYNLSKSALLRSFLMNSQDAKAKISEAVIIDERNDSLHVPLEKQVHKNVLANGLASERLQRSTFPAVTIKMKDHPQGQNPPQNLKSKAGFRSETQIQKIGGRGASNEKLSSLIVPLENHMTKEKKITGKEEEKNRVEGNVKNNIDVNEVLPGRKLQHYTEDYLGFLPWEKKKYFQDLLDEEESLKTQLAYFTDSKHTGRQLKDTFADSLRYVNKILNSKFGFTSRKVPAHMPHMIDRIVMQELQDMFPEEFDKTSFHKVRHSEDMQFAFSYFYYLMSAVQPLNISQIFDEVDTDQSGVL	406099	492827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_406379_440789_440876_457195_457316_458291_458334_460880_461087_465037_465103_465397_465533_481833_481996_482800_483386_485106_485231_486361_486566_487775_488876_491870_492071_492665
901563	contig_6403_pilon	-	730	2	Intergenic	novelGene_139899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATATTTACCAAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119675	1116802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1117331_1119473
901564	contig_5959_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_150179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCCTTATCTCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170844	173074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_170800_173100
901565	contig_8447_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_69451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAAAATTCTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174866	173686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_173700_174900
901566	contig_7293_pilon	+	2354	3	Intergenic	novelGene_54245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	3039	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	403	729	335695	336451	FALSE	35	AATTTCACCACTTGAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335292	338076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
901567	contig_12479_pilon	-	2251	16	Intergenic	novelGene_56861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	98.5746417695748	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	185	1591	516614	451002	FALSE	30	CCTCAACTTACATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	518333	450341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518155
901568	contig_6795_pilon	+	2324	2	Intergenic	novelGene_27726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTGCATATCACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285004	445058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_286934_444663
901569	contig_15449_pilon	+	3353	13	Intergenic	novelGene_33585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	733.098939813417	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	240	1760	28094	54584	FALSE	40	GCACAAAAAATCCTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGAQWRRSQPPRAAEEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVEISE	27854	56177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_54570
901570	contig_15752_pilon	+	2893	17	Intergenic	novelGene_148757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_8	62.5204653993394	77	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	1178	2464	198226	203535	FALSE	25	TCATCTTCGCATCAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEVVAERAWIGGTESEMFNKLESIAMSDTPRTPVLGCRISRALEPSAIQGEFMTSRVNWVVQSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTRCMFAHKLGLSDLPQSVAFFSAVDIDRCLRKEVTMDCKTPSNPTGMEGRYGIPQGEALDIYQIIELTKGSLEKRSQPGP	192494	203964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_192616_192771_192899_193849_194087_196001_196123_196336_196424_196619_196833_197280_197442_198038_198142_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201812_202782_202944_203458
901571	contig_5686_pilon	+	1266	3	Intergenic	novelGene_45300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93920	96825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93938_94932_95482_96125
901572	contig_10023_pilon	-	3914	1	Intergenic	novelGene_123515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2579	2911	454539	454207	NA	25	CAATACCCCACCTGGTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFHVCTFERRTISTPVRVASWAHRREDCCKPQGGRSGRAVARWTWFFAPFLAVLQYISVYNHKYIQLKKKTSHANCRKNVLSLKLAVKNKDSCLSLCRPRCVSSFQILL	457117	453203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_453200_457100
901573	contig_7009_pilon	-	7182	1	Intergenic	novelGene_23648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	800	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACAAATTACTTGAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465304	458122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_458100_465300
901574	contig_8050_pilon	-	5049	3	Intergenic	novelGene_114840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	444	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAACATATGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351622	340022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_341572_341710_344232_350643
901575	contig_7056_pilon	-	3206	9	Intergenic	novelGene_43650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	899	junction_8	834.979191357485	24	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1450	2295	728682	725118	TRUE	80	AAAAAGGAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	730131	722479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561
901576	contig_15888_pilon	-	431	5	Intergenic	novelGene_84452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1061.08870976936	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	23	430	259726	251674	FALSE	10	CCTGACCTTGACCCCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEGHRWMRGDKVLKEDTLPDLTTEFEVDSDDKAGKYHCVFLPEVAGRASINVQGLPRVIAVKKSEQWGTARLGPLHLNHSAALTLTL	259748	251672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251740_254030_254066_254198_254282_254527_254685_259659
901577	contig_6137_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_59287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1353486	1352653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1352700_1353500
901578	contig_10095_pilon	-	1944	4	Intergenic	novelGene_57240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	68.3926571757199	12	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCGTAGTCAGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257036	238924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_240646_249005_249156_253394_253444_257012
901579	contig_12464_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_68646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCCAGGAAGTTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93017	95426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_93000_95400
901580	contig_9345_pilon	+	2767	2	Intergenic	novelGene_24732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	61	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTGCTTTTATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073583	1089702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1073945_1087296
901581	contig_19179_pilon	-	1050	1	Intergenic	novelGene_142364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATAATTTCTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18773	17723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_17700_18800
901582	contig_13101_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_172780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGCCTGGAGGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210472	212241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_210500_212200
901583	contig_9415_pilon	-	1612	15	Intergenic	novelGene_109734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	1092.82381134978	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	742	1431	553556	539729	FALSE	15	GGTTGGCACAGGGCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPYAETELKTPKLDWNIEVQNIAIELTRPQYLSMIDLLESVDYMVRNTPYRKYKPYLPLHTNGRQWWKYAIDSVLEVHVRRYTQMWSWSNIKKHRQLLRSYRSAYRNKLTQTKVSEEIQKQIQDLEKTLDVFNIILARQQAQVEVIRSGQKLRKKSADPGEKRGGWFSGFWGKKEAKKKDEESLIPEAIDDLMTPEEKAKLFTAIGYSESTRDLTLPKQNSIPEPECP	598827	539547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_539759_540958_541054_541866_541997_550108_550172_551526_551699_552261_552369_553463_553592_555373_555432_556367_556449_557255_557316_561643_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576060_598737
901584	contig_11338_pilon	-	3115	14	Intergenic	novelGene_6337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_10	162.485757227442	89	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	299	1765	319426	295354	FALSE	65	AAATTAGAAAAATTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
901586	contig_6885_pilon	+	390	3	Intergenic	novelGene_83640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	44	331	124540	144731	FALSE	25	AATATGTTTCCATTGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAAKSWYPSIFFFMSAAGRGSVTLFWFKVSCSFSCSDETSDASCWGFGAFSFSFLLFGFSCLMRLVPDTFVLLSFSCELFSCFRGLTGGRGLSSSPLINLSYGRINLS	124496	144790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_124615_128441_128646_144722
901587	contig_18055_pilon	+	2265	14	Intergenic	novelGene_117812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	366.04463465022	150	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	738	1268	77213	80793	TRUE	70	AAGAAGAAGAAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40661	85631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40863_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
901588	contig_9484_pilon	-	1340	11	Intergenic	novelGene_105617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAAAATGGCCGAGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105010	95791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_95905_97145_97225_98434_98609_100387_100562_100653_100822_101218_101268_102027_102078_103263_103371_103492_103641_104260_104410_104881
901589	contig_11328_pilon	+	3390	2	Intergenic	novelGene_88427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1966	2376	647025	647435	FALSE	65	AAAAAAAAAAGATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFFKNNESFQFLGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKVSLKRFEKKSSPALKLHLNPFMLTGISGDQVLFLPLEGFWEAATPLIVFAATRQGLYDNLKPKKQACAAN	644847	648449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_645017_645228
901590	contig_16205_pilon	-	2474	1	Intergenic	novelGene_156876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAAAAGAGTAAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97925	95451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_95500_97900
901591	contig_14790_pilon	-	2469	4	Intergenic	novelGene_127913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	122.967023583109	229	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	354	1613	178177	169763	FALSE	90	AAAAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHMHTKFCLICLLTFIFHHCNHCHEDHDHGPEEHHRHHCGMTESEPSKYSVLDAENQKKCYIEKLFYRYGENGRLSFFGLEKLLTNLGLGEIKVVEINHEDLGHDHVSHLDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNPENQTVTSISTKRNHKCDPEKETIEVSVKSDGKHTHDHNRRLRHHHRSHHHLDRNTTRHFHNDSITHGERGEPSHEPSTETNTTQEQREVKPQKQKRRRKGKKSNDNFEVITPGFPPNCDQGEHYEHNRVHKPDCVHNPVHSNAHLSEHNGHDPGHGHQDLDPDNEGELRHTRKREAPHVKKSAIYSAASHKDHNEDDHQHDECLNVTQLLKYYGHDASSPISPDLFTCLCPALLYQIDSRLCIEHFDRLLVEDLNKDKNLVPEDKSNIHASDPLFCEATSMT	197957	168906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_169798_174902_175111_177160_178189_197615
901592	contig_8729_pilon	-	2182	2	Intergenic	novelGene_40138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666033	646296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_646887_664441
901593	contig_15114_pilon	+	959	1	Intergenic	novelGene_121138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109217	110176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_109200_110200
901594	scaffold_9100_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_83268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	349.780105850775	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	112	1110	647136	654304	FALSE	35	ATGAACAGTGACAACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644843	654839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
901595	contig_5698_pilon	+	4130	1	Intergenic	novelGene_54997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	464	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	8213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4100_8200
901596	contig_5452_pilon	+	2180	1	Intergenic	novelGene_101029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTGGGGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530451	532631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_530500_532600
901598	contig_10500_pilon	+	4237	2	Intergenic	novelGene_41220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTCACTGCTCAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624354	1685943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1628497_1685848
901599	contig_990_pilon	-	4709	3	Intergenic	novelGene_76093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_2	168.5	427	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTTTTCCAAACGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350554	1338106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1340690_1342913_1343085_1348599
901600	contig_11115_pilon	+	1718	8	Intergenic	novelGene_102838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	586.314013519189	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	36	1406	165608	172933	TRUE	20	GAGTCTGTGGCTTAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLDKKSPSSMCPSGSHSSSSYTTMAFTTVRPSARRA	165572	173329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172788_172830_172964_173047
901601	contig_10734_pilon	-	2663	2	Intergenic	novelGene_51434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	0	14	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGTGTGTGTTTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2219833	2216269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2217020_2217920
901602	contig_17274_pilon	-	2212	11	Intergenic	novelGene_26571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	330.021878062652	70	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	709	1428	251759	232842	TRUE	75	AGAAAAAAGGAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	253300	231213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_252231_252363_252440_253139
901603	contig_854_pilon	+	979	7	Intergenic	novelGene_36249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	107	685	543600	562402	TRUE	25	ACCCATTTACTCTAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543493	563321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
901604	contig_11335_pilon	+	2835	2	Intergenic	novelGene_104912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATCATATAGTATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326703	330728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_327073_328262
901605	contig_5019_pilon	-	1184	9	Intergenic	novelGene_109238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	521.623367478874	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	29	994	527677	429664	FALSE	30	TATTCAGAGAGGGTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIEKEKGKNMSGHKCSYPWDLHDRYAQDKSVVNKMQQKYWETKQAFIKATGKKEDEHVVASDADLDAKLELFHSVQRTCLDLSKAIVLYQKRICFLSQEENELGKFLRSQGFQDKTRAGKMMQATGKALCFSSQQRLALRNPLCRFHQEVETFRHRAISDTWLTVNRMEQCRTEYRGALLWMKDVSQELDPDLYKQMEKFRKVQTQVRLAKKNFDKLKMDVCQKVDLLGASRCNLLSHMLATYQTTLLHFWEKTSHTMAAIHESFKGYQPYEFTTLKSLQDPMKKLVEKEERKKITQQESTEAAAEELNQLISLADENQSKESSSFKSKF	527705	429473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_429728_432232_432331_444197_444297_444642_444769_505172_505372_509192_509317_517865_517939_521461_521628_527660
901606	contig_14441_pilon	+	1229	6	Intergenic	novelGene_100480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	457.147416048697	172	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	641	1189	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92096	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92708_121189_121239_125517_125902_126159_126283_126514
901607	contig_9471_pilon	+	791	8	Intergenic	novelGene_21743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_2	188.498579001844	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATGATCAAAACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242820	278393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_242898_248960_249061_259416_259496_260221_260324_261048_261105_271741_271922_275967_276049_278277
901608	contig_18145_pilon	+	3095	17	Intergenic	novelGene_37328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	407.817930998319	3	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1499	2641	97254	100744	FALSE	40	CTAATCACAAACAGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86664	101198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96765_97173_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
901609	contig_6199_pilon	+	926	6	Intergenic	novelGene_126404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	198	junction_5	97.4383907913098	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	388	855	592950	603851	FALSE	15	GTATCCCCTCTGCTGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSGPNSNKSQFFITFRSCAYLDKKHTIFGRVVGGFDTLTAMENVESDPKTDRPKEEIHIESTTVFVDPYEEADAQIAEERKKTQLKEEALETTVKTNQPQLGSPGPQAYRQGVGKYISPAATKRAAEEEPSTSTATPTAKKRPSRGFGDFSSW	592562	603922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754
901610	contig_11677_pilon	+	4918	3	Intergenic	novelGene_85906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	8	591	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	108	1799	560544	568649	FALSE	20	AACCTCACCTTTTGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACLPGPGDLSFQLLSHTQMNTGLQKWDTTQKMRTAHYPTPAELDAYAKKVANNPLTIKIFPNSVKVPQRKHVRRTVNGLDTSAQRYSPYPTQAATKAGLLAIVKVPAKSILKDFDGTRARLLPEAIMNPPVAPYATVAPSTLAHPQAQALARQQALQRAQTLAHAPPQTLQHPQGIPPPQALPHPQSLQQPQGLGHPQPIAQTQGLVHPQALAHQGLQHPPNPLLHGGRKMPDSDAPPNVTVSTSTIPLSMAATLQHSQPPDLSSIVHQINQFCQTRAGISTTSVCEGQIANPSPISRSLLINASTRVSTHSVPTPMPSCVVNPMEHTHVATAALPAAGPVNLPTGISRAPTGYPSDLKSVAWNQHQLAHLQQMCSEAGGTPVAPGLTGKHATGRELAGLGFVGKAPAYPQELCLAQSFHLKPPLEKPTPSPPVNGLAAPLAYPNGHYFQPLWNNILPTPNSDSSGSQDLAMPFHGGQPTGAPLDCAAAAGAHYRAATGGGPVASQNSLMQTVDYLSGDFQQACFREQSLAMLSKAHRAPGSRAPDPTDSRSLHVQHPGYR	500945	571768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_501013_560503_560626_567039
901611	contig_5918_pilon	-	3255	3	Intergenic	novelGene_99556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCCGCCACTGTAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1717036	1687865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1688006_1695800_1695914_1714034
901612	contig_5424_pilon	+	6986	19	Intergenic	novelGene_172803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	103.944964070202	164	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCGAGAGCGACGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96051	168311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_96449_112511_113694_115073_118247_118791_118946_120473_120562_123481_123695_124961_125110_126343_126571_128699_129023_129701_129736_131068_131224_135061_135139_139133_139250_144247_144343_152897_153021_155822_155942_156656_156778_166294_166435_168210
901613	contig_6710_pilon	-	513	2	Intergenic	novelGene_97872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657827	653562	FALSE	35	TAATCATACTAATATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657829	653404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
901614	contig_20004_pilon	+	2198	9	Intergenic	novelGene_167521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_7	181.32735418298	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2064	135	2198	13715	27739	FALSE	50	ATAAAATCAGATGAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAYQNLRQRVDNFVVNHLATHTWSPHLNKNQLRNNIRQQVLKSGMLESGIDRIISQVVDPKINHTFRPQVEKAVHEFLATLNHKEEASASTAPDDEKPDSSIIIQGIPAPGPSANVANDAMSILETITSLNQEASAARASTETSNSKANERVYKKLPFQPSTDINTEKDRTSEDVADKEKSPPDSAGEGLEAAPKSEESNDFPGPVEEIKNHAKENNSLILVSKEVQQEGSDQKNKSTDKGEKKLDSNEKGERKKEKKEKTEKKFDHSKRSEEMQKIKDEKQVKEKEVESSKLPTEKNSNKAKTVEGTKEDCSLVDSDVDGLTDITVSSVHTSDLSSFEEDTEEEVVMSDSTEEGEITSDDEEKSKLNKTQTQTSDPSEGKAKGVRHAYVHKPYLYSKYYSDSDDELTVEQRRQSVAKEKEERLLRRQINREKLEEKRKQKAEKTKSSKAKSQGKGSVDLEESSAKSLEPKAPRIKEVLKERKVLEKKVALSKKRKKNSRNIEENSKKKQQPEEDSKETLKPSEHFEKEKVSSSKELKHVHAKSESSKPARRLSESMHSADENKSESKVEREHKRRTSTPVVVEGAQEETDVRDGKRQVERSEIGTEEPQKQKSTLKNERHLKKDDSETPHSKSLPKKEVKSSKEKPEKEKTLSEDKLSVKHKYKGDSVHKTGDEAELHSSEKGLKADENIQKQSQQTKLFSDDKADRKSKHRNERKLSVLGKDGKPVSEYI	7925	27739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_+_8053_13707_13899_14411_15027_15813_15964_18693_18861_21291_21404_22280_22420_23473_23547_27115
901615	contig_10263_pilon	-	3411	1	Intergenic	novelGene_135842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1002	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	12	320	880984	880676	NA	35	ATAACTGGACTCCTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGMARKFSAPGQLCISMTSNLGGSAPISAASATSLGHFTKSMCPPQQYGFPAAPFGTQWSGTGGPAPQPLGQFQPVGTASLQNFNISNLQKSISNPPGSNLRTT	880995	877584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_877600_881000
901616	contig_18162_pilon	-	5146	2	Intergenic	novelGene_122338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	131	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTCACTGGCAATGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	11245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_15477_15698
901617	contig_6794_pilon	-	3598	3	Intergenic	novelGene_148999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	280	junction_2	67	278	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1956	2477	18797	13983	FALSE	20	CCATGGCATTTGTATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPQHHGGNSSPTATPTSPSSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20752	12861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15948_18732
901618	contig_2834_pilon	-	2319	2	Intergenic	novelGene_27995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGAGCTGCGGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261971	259494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_259585_259742
901619	contig_8636_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_141916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	208	402	366810	367004	NA	25	ACAACGGGCTGGAAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNHIYRGSFTWLGIFYNRAANHTHARAHTFQLPPTTSGPGNGLLERGHRDRWLGLALSRPTSDSLGQVGMARWGHRIEMKGIQLDKVQLSAVTDISSRGRCRVASQCSLWPRPEREWGLGSDLLGVAGPQKAC	366602	367528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_366600_367500
901620	contig_7860_pilon	-	3872	2	Intergenic	novelGene_147755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	146	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	879	2994	3872	36873	35995	FALSE	55	ACAATTGAAAGAGTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQINNNQKRAGVAMLISDKIDFKAKSTTKDKKGHHIMIKGSIQQEDITIINIYTPNDRAPTYIKQTLTALKREIDTSTIIVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNATINQLDLIDIYRTLYPTAAKYTFFSNIHGTFSRIDHILGHKASLNRIQNIKILQSIFSDHKIIKVEINNRKRKEKKSSTWKLNNTFLKNYWVIEEIKDRIKKFTESNKNENTSYQNLWDTEKAVHRGQLIAINAHIQKEERAIIKILTLQLEQVEREQQKEPSGARNKEIVRIRAELNEIENRK	40392	35994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7860_pilon_-_39124_39649
901621	contig_11363_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_160502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACAAACCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216093	213916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_-_213900_216100
901622	contig_252_pilon	+	2157	2	Intergenic	novelGene_99931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	49	678	380149	382373	FALSE	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLDGGDKLPCAKNRDLATPDHAAGDSDPHQYRSLRREADVTQVMADMAGVTLETAADSLDCGFALRFRVPINRNQAAAKVGQEKAPPPAGRPKAASASAAFDHSLKNGRLGGELRSPAGEKALEACGAVGLGSQMMAGGKAKEVTTKKCAISVAAEKKREAEGVAEGKKVVQKERKAGGEMKEEKGARVPKVPSSSSHSEPQPTNHT	380100	383852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_380728_382322
901623	contig_12010_pilon	+	2679	10	Intergenic	novelGene_160949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	196.503573303357	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	109	1473	200924	224676	FALSE	40	AATTCACATATATATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTGSVSKTVRHRTALGETEAKQEEEVGGTALLKTSTMTKREAEELIEIEIDGTEKPECTEESIVEQTYTPAECVSQAIDINEPIGNLKKLLEPRLQCSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVISYQGIEPKLNILEIVKPAETVEVVIDPDAHHAEAEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLSQEDFFQRVPRGEILWSHLELLRKYVLASQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQSAAPTTIKVLNSSTKAAKVQRAPRISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQAEKDN	194771	225882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_+_194855_200898_201001_205109_205255_209287_209373_211709_211956_216639_216835_219001_219056_220047_220189_220432_220626_224447
901624	contig_12677_pilon	-	710	1	Intergenic	novelGene_110866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3657	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3700
901625	contig_20356_pilon	-	3592	4	Intergenic	novelGene_159531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	883	1188	101347	51795	TRUE	35	ACATTGTAACCAGTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLYEEERSIRIGGRITNNLLHADDTTLLAISEEDLKHLLMKIKHHSLQYGLHFNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTDVVKDFISLGSPINTHGSSSQEIK	132588	47210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_49361_51540_51806_101052_101904_132262
901626	contig_14219_pilon	-	8446	23	Intergenic	novelGene_54283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_22	231.961065591649	546	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1464	4395	237	4631	676735	582867	FALSE	10	CCTTCGGGTTTTACATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIVNGGSWTGEPPRRNSHTFNCRMLVKPLPDSEEEGHDNQEAHQKYETMQCFAVSQPKSIKEEGEDLQSCLICVARRVPLKERPVLPSSESFTTRQDLQGKITSLDTSTMRAAMKPGWEDLVRRCIQKFHTQHEGESVSYAKRHHHEVLRQGLAFSQIYRFSLSDGTLVAAQTKSKLIRSQTTNEPQLVISLHMLHREQNVCVMNPDLTGQAMGKPLNPISSSSPAHQAMCSGNPGQDMTLSSNINFPINGPKEQMGMPMGRFGGSGGMNHVSSMQATTPQGSNYALKMNSPSQSSPGMNPGQPNSMLSPRHRMSPGVAGSPRIPPSQFSPAGSLHSPVGVCSSTGNSHSYTNSSLNALQALSEGHGVSLGSSLASPDLKMGNLQNSPVNMNPPPLSKMGSLDSKDCFGLYGEPSEGTTGQAESNCHPGEPKETNDSSMPQPGSSERPDGQNRLHDSKGQTKLLQLLTTKSDQTEPSPLSSSLSDANKDSTSSLPGSGSTHGTSLKEKHKILHRLLQDSSSPVDLTKLIAEATGKELSQESSSTAPGSEVTVKQEPVSPKKKENALLRYLLDKDDTKDIGLPEVTPKLERLDSKTDPASNTKLIAMKTEKEEMSFEPSDQPGSELDNLEEILDDLQNSQLPQLFPDTRPGAPTGSVDKQAIINDLMQLTAENSTVTPVGAQKTALRISQSTFNNPRPGQLGRLLPNQNLPLDITLQSPTGAGPFPPIRNSSPYSVIPQPGMMGNQGMIGNQGNLGNSSTGMIGTNPSRPTMPSGEWAPQSSAARVTCAATTSAMNRPVQGGMIRNPTASIPMRASNQPGQRQMLQSQVMNIGPSELEMNMGGPQYSQQQAPPNQTAPWPESILPIDQASFASQNRQPFGSSPDDLLCPHPASESPSDEGALLDQLYLALRNFDGLEEIDRALGIPELVSQSQAVDPEQFSSQDSSIMMEQKAPVFPQQYASQAQMAPGSYTPMQDPNFHTMGQRPSYATLRMQPRPGLRPAGLVQTQPNQLRLQLQHRLQAQQNRQPLMNQISNVSNVNLTLRPGVPTQGPINAQMLAQRQREILNQHLRQRQMHQQQQVQQRTLMMRGQGLNLTPSMVASGGIPATLSNPRIPQANAQQFPFPPNYGISQQPDPGFTGATAPQSPLMSPRMAHTQSPMIQQSPANPAYQASSDMNGWAQGNMGGNSVFSQQSPPHFGQQANTSMYNNSMNINVSLATNTSGINNMNQMTGQISMTSVTSVPTSGLSSMGPEQVSDPALRGGNLFPNQLPGMDMIKQEGDTSRKYC	883665	579051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_582879_589018_589109_591142_591342_592609_592788_594649_594885_596943_597022_598033_598313_601123_601290_605267_605398_609037_609254_611519_611727_614151_614363_625515_626786_628523_628672_632777_632922_633201_633304_635724_635914_638846_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_883505
901627	contig_17976_pilon	-	1740	2	Intergenic	novelGene_32534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1066	1374	50211	49903	FALSE	20	CTCCAGGTTAGCAGGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEARMAGLRLTYFGHGIRRDQSLEKDIMLSKVQGQRKRGRPSMRWIDRVPATMGSSIPTIVRMAQDGAVFWSVMHRVAESEPTRWHLTTTRTAGEREMRS	51395	49536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_51163_51281
901628	contig_6871_pilon	+	2057	4	Intergenic	novelGene_21571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	526.72088328534	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	46	1317	125299	135017	TRUE	55	AGCTTTAAAAGAGAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKRQHRRVVRSVISGVGWPELETHLHCWPVVRLWESYLILLHFSFLIGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	125253	136010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_125444_129792_129843_133940_135323_135575
901629	contig_938_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_143919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAATACAACAGGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98900	97446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_97400_98900
901630	contig_11216_pilon	-	2911	1	Intergenic	novelGene_173596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2227	2526	133351	133052	NA	35	AAAAATTTTTCCATGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATLSAPVVPVPLGIYTKWKATSGQDHQRGTILRGLNPVGETGAQAWEEPVCVHGMRCMYVSVCTCACLFCFCRGDSWIRDIFVQEAVTLLSPSKDWL	135577	132666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_-_132700_135600
901631	contig_10437_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_38221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTCACTCATTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275447	272142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_272100_275400
901632	contig_546_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_117254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTGTTTCATGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729558	728119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_728100_729600
901633	contig_16125_pilon	-	5953	9	Intergenic	novelGene_155253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_8	600.063121679711	3	150	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	50	1957	236934	146011	FALSE	20	TTGTATGTTCATATTAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHSQSGSGGKSHTFIRNFSTNLRHFYVC	236983	142014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
901634	contig_10074_pilon	-	7855	2	Intergenic	novelGene_57170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2097	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	103	666	555336	554773	TRUE	35	CCAGAGACCAGGAAACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFERGDRDPPLSNLVSLYQSLPAWSPHSLLPCRPLPPRTALFVPKVGKIPPEHWLVFWTLILSLHLVLFPAGSLLDAHSLSSPTLPERPHEWGSYSRLLCFHERHYRSPHHPRCLLGTSKSVLFFLSLTLTVIKSLSLPPGSLLRLPFSIPGALSTGHRSPPPQEAFPCVPVKNTPLPSCRYIVSIP	555438	546738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_547308_548152
901635	contig_15047_pilon	+	1295	7	Intergenic	novelGene_52204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	113	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	700	825	4573	21020	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRLPLPAVFLHRRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRTQVGRGPGVRELEGLLGGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGKTLFFRW	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2768_3382_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
901636	contig_5765_pilon	+	2697	1	Intergenic	novelGene_141422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCAGCCTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925145	927842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_925100_927800
901637	contig_14687_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_107931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476828	479113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_476800_479100
901638	contig_3410_pilon	+	6265	1	Intergenic	novelGene_58935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	945	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	3730	4326	49607	50203	NA	35	CTAACAACCAGCCAGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLQFRQEKVIGQVLRESEAKPGPGLRPQTRSPALARSTPAASGISSERHLAALPQSGQPRRYPAHSLPVPKSPCTLAHTPRPTQFPEPRPYQPCPLQGQAQLSQTGGPLSGWQKKVNKTPWGFLPVSGQSSWVSPGPRHQKETERSLLGLSRTASAPKRDSPRGPARHSAVRFPSRTCPLVSATSRGGQQSCLSEV	45877	52142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_45900_52100
901639	contig_9578_pilon	-	2089	12	Intergenic	novelGene_67970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	129.162528148399	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	89	1240	1276296	1058571	FALSE	25	TTAAATCTCTGCTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPREWSADLARFYTVTEPQRHRRGYTVYKVTARVVSRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEEVGAITEETEACDWWSLGAVLFELLTGKTLVECHPAGINTHTILNMPGSISEEARSLIQQLLQFNPVERLGAGVAGVEDIKSHPFFTPVDWAALTR	1276384	1057721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1099512_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583_1251620_1276191
901640	contig_5260_pilon	-	5241	1	Intergenic	novelGene_144347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGGTCAGCAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76054	70813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_70800_76100
901641	contig_6489_pilon	-	2622	5	Intergenic	novelGene_128957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	306.889536315594	232	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	19	762	395604	389842	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAGTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRDGSMGLWEVTDDVLTKSDARHNVSRVPVYAHITHKALKDIPKEDTNPDNCKVRALAFNNKNKELGAVSLDGYFHLWKAENTLSKLLSTKLPYCRENVCLAYGSEWSVYAVGSQAHVSFLDPRQPSYNVKSVCSRERGSGIRSVSFYEHIITVGTGQGSLLFYDIRAQRFLEERLSACYGSKPRLAGENLKLTTGKGWLNHDETWRNYFSDIDYFPNAVYTHCYDSSGTKLFVAGGPLPSGLHGNYAGLWS	395622	387981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_392609_392773_393919_393986_395427
901642	contig_854_pilon	+	4574	27	Intergenic	novelGene_36556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3394.79360511089	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	975	2928	623	3550	1679334	1714980	FALSE	40	AATGATAGAATTCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1656036	1716004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1656194_1671958_1671991_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680882_1699034_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709640_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
901643	contig_9345_pilon	-	4310	15	Intergenic	novelGene_24559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	264.742395007459	198	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	790	2214	898530	881092	TRUE	20	AGGCAAGTGTGGGTGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRERKSRLSSTSSGAVLYGQPLLVSVPKHKLTLEFLYQAVCERISRYIKQPLPDEFGSSPLELGACNGSRGSCEGEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEEELGSDPSETIQKKVKGQPCPKRLFTFSVVNSYGTADINSLATDGKLLKLNSRSTLAIDWDSETRNLYYDEQESETCEKHVSMLQPQKKKKTSVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPVRALNMSEFVCDLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFSKTPSPITLPGSSDGGMRPSSSQQGLGDDEACSMDTN	900635	876741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_877288_878423_879776_880893_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053_890276_893010_893100_893734_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023
901644	contig_12312_pilon	+	2183	3	Intergenic	novelGene_64013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34.5	8	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACAGTCCGTTGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533383	536142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_533710_534152_535634_535766
901645	contig_11656_pilon	-	4351	2	Intergenic	novelGene_53948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	734	junction_1	0	513	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAATGAACTCTTCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124515	117341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_117528_120350
901646	contig_17274_pilon	-	2205	7	Intergenic	novelGene_26568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_4	281.563294640635	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	6	620	247033	232842	TRUE	40	TCAGACAAAGTAGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	247038	230412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874
901647	contig_1154_pilon	+	2825	2	Intergenic	novelGene_87218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAAAGGCAGTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1580430	1583837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1582259_1582840
901648	contig_19378_pilon	+	1890	5	Intergenic	novelGene_73798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	15.5161206491829	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	307	942	38400	49635	FALSE	25	CACGTCTACTGGAGGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLSITTAYTGLELTFFSGVYGTCIGAVNKFGMEEKSLIGLSGIFIGIGEILGGSLFGLLSKNNRFGRNPVVLLGILVHFVAFYLIFLNMPADAPIAPVEGTDSSAYITSSKEVAILCSFLLGLGDSCFNTQLLSILGFLYSEDSAPAFAIFKFVQSICAAVAFFYSNYLLLHWQLLVMVMFGFFGTISFFAVEWEAAAIVARGSDYRSI	38093	50583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_38434_40391_40518_46836_47012_47741_47878_49470
901649	SIRV6	+	1400	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	102	-11	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	40	AAGTCTAAAATTCTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
901650	contig_5023_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_7120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	527	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	150	455	137341	137646	NA	15	CCCTCTCATCTTTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIRVGCNTLAQVTSLIQCNGSFPSMWPAPPFILREIKGKGSEQSGGPHTTKKAVLGAELVLWTQCSCAEKLLVQGKIDEKDLPPEPTQRESLPLEMTP	137191	138654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_137200_138700
901651	contig_6102_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_32319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTCTTCGGGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1598314	1600688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1598300_1600700
901652	contig_16532_pilon	+	3316	2	Intergenic	novelGene_110063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	865	1224	583696	584055	FALSE	65	AAAAGAGGGGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKSLQVQYHPSQKKAFLEKEKLYFFFFESLTQSTENTMFQHNLIYFVFPLASILSNRHCCPGFLVREGEFEAEERQRCTKGQYSTAMGKLLKNKENPTSLSCDQKQNSTPSTSESAF	582232	586147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_582752_583350
901653	contig_17274_pilon	-	3530	5	Intergenic	novelGene_26490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAATATTTTACTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167868	34267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_34988_50171_50579_162790_163980_165066_165235_166822
901654	contig_5686_pilon	+	2612	5	Intergenic	novelGene_45384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACCAGATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162003	301145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_162934_164543_165651_178849_179004_281925_282072_300870
901655	contig_10976_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_155589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAGTATGTAAATTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124713	123142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_123100_124700
901656	contig_5236_pilon	+	3137	10	Intergenic	novelGene_100932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	31.1511646929677	149	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	173	1216	965121	1005141	TRUE	15	CTGCTGCAGTCCAGATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTGSQASDINELFGFFNDGAPPTKKPRKLLPSLKTKKPQELVLVIGTGISAAVAPQVPALKSWKGLIQALLDAAIDFDLLEDEESKKFQKCLHEDKNLVHVAHDLIQKLSPRTSNVRSTFFKDCLYEVFDDLESKMEDSGKQLLQSVLHLMENGALVLTTNFDNLLELYAADQGKQLESLDLTDEKKVLEWAQEKRKLSVLHIHGVYTNPSGIVLHPAGYQNVLRNTEVMREIQKLYENKSFLFLGCGWTVDDTTFQALFLEAVKHKSDLEHFMLVRRGDVDEFKKLREDMLDKGIKVISYGNEYADLPEYFKRLTCEISTRGRSAGTVRGQLNGSSSAHSDVRQ	928556	1009002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_928586_964696_964833_965113_965207_969356_969610_979903_980132_983078_983208_985897_986184_1004817_1004873_1005134_1006955_1008894
901657	contig_10937_pilon	+	9590	2	Intergenic	novelGene_67319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3247	3546	99908	100207	TRUE	25	CTGCTAGCTCAAGTCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNLQMPCQSASLGQTQTEPFGPSIWWAGLFKDKNQSPESAGKAKAIFGRKCVLWPSASQGDQGWRQEKRKRRDPHLFLQLLGTASPKQYSSSPSFVK	96661	106302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_106060_106110
901658	contig_6975_pilon	-	3326	3	Intergenic	novelGene_74280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1470	1832	366569	366207	FALSE	40	CATCATGTAAGGGAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEESLKLALELRTAKVNGRNDEAKEPNRRFQRAALEDKVKYYNEMCKNLKLENQKGRTRLAFLKLKELRKKFKPRFAILNDAMGKILNDVGSIKRRWKEYTVTVPKRTGQRSTISGGSI	432358	364712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_367072_368192_368201_431399
901659	contig_3588_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_72876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	589	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTTGTTGCTGTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101404	99426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_99400_101400
901660	contig_6870_pilon	+	2086	5	Intergenic	novelGene_103943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1430	1738	1204860	1209211	TRUE	10	GTCCCTCAGGTCCTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPHSSRTQSMGESMQILHRFSSRPGDAAPSVQPLTQVLQSFLVFVQPCHPLHQLPLLTAALVVDEVASQDLLQLPHSQRFNVLHVGQVRQRGPPAWDKAVL	1202308	1214223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1203467_1204588_1204953_1208995_1209221_1210173_1210260_1213970
901661	contig_7019_pilon	-	2862	4	Intergenic	novelGene_149472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2212	2619	1341816	1341409	TRUE	25	ACACACATCTGGCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWCHPYSSSGRKLTFTGNPDGRMEPSPLTTKTIPSLSPTPLKPPSILENQQTTIAPSFPYQGSLEQLRYTKNCLLGQNWAVVIGTLMSTLPLTRPPWACINGHPASLNRTPYLGITGGFSETHVGSLWRVCWGP	1525299	1302645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1302790_1331685_1331765_1341388_1343272_1524543
901662	contig_6677_pilon	+	3002	8	Intergenic	novelGene_114202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.1721804463509	1	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	766	2373	595001	626796	FALSE	35	AAGCCCAGTGGATATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGRRLKMYNKEVQTVCAGLTRISKEILTQGQINSTSGVNKESFRYLKDEQLCRLNLGMQEYRVPQGVQTPFMTHQEHSIRRSFLKTGTKFSNFIHEEHQSNGGALVLHAYMDELSFLSPMEMERFSEEFLALTFSENEKNAAYYALAIVHGAAAYLPDFLDYFAFNFPNTPVKMEILGKKDIETTTISNFHTQVNRTYCCGTYRAGPMRQISLVGAVDEEVGDYFPEFLDMLEESPFLKMTLPWGTLSSLRLQCRSQSDDGPIMWVRPGEQMIPTADMPKSPFKRRRSMNEIKNLQYLPRTSEPREVLFEDRTRAHADHVGQGFDWQSTAAVGVLKAVQFGEWSDQPRITKDVICFHAEDFTDVVQRLQLDLHEPPVSQCVQWVDEAKLNQMRREGIRYARIQLCDNDIYFIPRNVIHQFKTVSAVCSLAWHIRLKQYHPIVEAPQNTESTSNMDCGLTGKRELEVDSQCLRLKTESEETCTEMQLLTTSSCPSSSELNLPQDQMTQPIPALKVESRLESDQQHNLQEHSGTPV	584287	627425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_584594_584635_585003_594908_595583_615719_615858_616164_616308_624372_624541_625423_625533_626328
901664	contig_3449_pilon	+	3960	13	Intergenic	novelGene_73720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.162142965437	5	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	507	1850	512166	524912	TRUE	35	TGAACTGTAAAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQDAGITSDTMMKNFFFVPSCIQLNQEDSFSTEA	493420	527066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493736_496931_497027_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523894_524008_524356_524572_524800_526188_526231
901665	contig_6576_pilon	-	2455	11	Intergenic	novelGene_42320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	49.3311260767479	34	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	85	1227	579280	555376	FALSE	55	GGAGAAAAAATGTAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRAHRPWAAAGQGAAGLSPAEPAGPAMSDRERNKKRLLELLQTAGTGNAHCADCGAPDPDWASYKLGIFICLNCSGIHRNFPDISKVKSVRLDFWEDSTVEFMTRNGNLRVKAKYEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERQEFMADGKTIPPPGNREGFLWKRGRDNAQFLRRRFVLLSKEGLLKYYTKEEGKYPKAVISIKDLNATFQTEKIGNPHGLQITYRKEGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKLTFPELPESELVPLITRNYVKQGFMEKTGPKQREPFKKRWFALDSQERRLLYYKNPLDAFEQGQVFIGSKEQGYDVSDDLPKGIRGNHWKAGLTIVTPQRKFVFTCPTEKEQREWLRSLRDVLSCPMTPLNLLTTSTESGRSR	579364	554147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_555408_556703_556933_558141_558220_559839_559903_562690_562775_566866_567014_572548_572662_573866_573947_576496_576589_578222_578354_579186
901667	contig_5419_pilon	-	3670	3	Intergenic	novelGene_15468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	817	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	695	1387	64180	63304	TRUE	5	GTTTGGGTCCTGTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIYHSENPRTLKNYAISTLPVLCKWNNKVWMTVHLFNWFTEYFKPTVETYCLEKKIHFKILVLIDSVLGHPRALTEMYKEINVVFMPADTTSILQPMDQGIILTFKSYFLRNTLCKAVAAIDSDSSGGSGQSKLKTFWKRFTILDEINICDLWEAVKIATLTGIWKKLILTLMDNFEGFKTSVEEVTANVVEIARELELQVESEDVTELLKSHDKTLLDELLLMDEQRQ	64874	55102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_55877_61794_63934_64117
901668	contig_2834_pilon	+	1314	6	Intergenic	novelGene_27977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2682.28077575782	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	97	474	274763	285523	TRUE	25	TCAGTCATTGTCTAATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKVSWSNILSLRKVVPELLLTCCKLILRIVD	238712	291577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_238759_274712_274868_277842_277916_285323_285746_290617_290799_291140
901669	contig_2078_pilon	+	1993	7	Intergenic	novelGene_100127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	107.19919153924	131	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	40	1218	266417	311030	FALSE	20	TACTTATTCACGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLCFRQYGLLTHQMVLHPDPDAQIQPHSCQDPPDISKDIPCSTSSSESSSNFWHFPVDVLLQSLLNDLQQNFTCVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266377	311805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_280081_280216_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
901670	contig_9177_pilon	+	3525	22	Intergenic	novelGene_32645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50.3574074067125	303	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1178	2608	105101	109340	FALSE	20	CCCTGGGGGAAGTCAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57865	110257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_74357_74445_99894_100009_100303_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
901672	contig_9177_pilon	+	2685	22	Intergenic	novelGene_32651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	49.7829757166224	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1181	2611	105101	109340	FALSE	65	TATAAAACAAAAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57896	109414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_87402_87524_99894_100009_100303_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
901673	contig_3721_pilon	+	1947	2	Intergenic	novelGene_123820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	52	1119	197655	198722	TRUE	20	ATATGTGATGTTTTTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTWMQPDRLSPRVHHSQPQPLVGTAGNLLSHLLSLEHVGILNKDFESILPTRKNHNMASAPLTFTPQTYLTSPAAHPDALLKPSASQYKSKLDRIEALKATAASLSSRIESEAKKLAGANINYGSLWNTECDMQQAPQEDEPWTKAISPPVKEDTEDVFSARIQKMLGTCVSHATFDNDLPGVGNLSEFKKLPEMIRPHSAISSFRMRSPGPKPEGLLAQLCKRQTDSSSCDVQACSQDKAKMSHGSSTDSISEGPLLSEGSLSEEEGGRDGRPLLKVAEILKEKEFCAGERNTYEPIKEFQKEAEKFLPLFGHIGGTQSKGPWEELAKGSPHSVINIFTKSYQLYGKGEKNM	197603	397767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_199295_397511
901674	contig_11933_pilon	-	3183	11	Intergenic	novelGene_107255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	68.836109709948	441	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	3	1457	207924	116206	FALSE	20	TAAGGGCATCATTTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSHEGRSAVDQAGGAQIVVDHLRSLCGRTDPANEKLLTVFCGMLMNYSNENESSKEQFASTNIAEELVKLFKKQIEHDKREMIFEVLAPLAENDAIKLQLVEAGLVECLLEIVEQKVDSEKEDDIAELKTASDLMVLLLLGDESMQKLFEGGKGNVFQKVLSWLPSNNHQLQLAGALAIANFARNDGNCIHMVDSGIVEKLMDLLDRHVEDGNVTVQHAALSALRNLAIPVINKAKMLSAGVTDAVLKFLKSEMPPVQFKLLGTLRMLIDAQAEAAEQLGKNVKLVERLVEWCEAKDHAGVMGESNRLLSALIRHSKSKDVIKTIVQSGGIKHLVTMATSEHVIMQNEALVALALIAALELGTAEKDLESAKLVQILHRLLADERSAPEIKYNSMVLICAVMGSESLHKEVQDLAFLDVISKLRSHENKSVAQQASLTEQRLTVES	207926	114479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_116334_121189_121319_126412_126540_135963_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158485_176518_176666_207803
901676	contig_5302_pilon	+	3538	11	Intergenic	novelGene_81407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCACAGCTGGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174870	209272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_177325_178673_178745_179917_179966_180997_181107_181210_181373_181903_182019_182921_183026_185040_185121_185959_186077_203039_203191_209145
901677	contig_5341_pilon	-	1232	2	Intergenic	novelGene_168030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	231	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACAAAATCTCAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340893	337813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338803_340650
901679	contig_9858_pilon	-	1323	4	Intergenic	novelGene_140537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_3	513.831576383633	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	264	1049	263923	257701	FALSE	20	AAGCCTTAACTTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDSDTGMTLPAQKCVLDTFRSNGDSKILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRAKGSKCFLVTSNADVIEKEKINIYKEKLMNDSILSLQELDEAVFTKKLRIIQNQEKFIRDNEGKAKPEPDKKKKKLLCRKCKAFACYTVDVRVIEESQFAVVGDAFRECFVSKPHPKPKSYGSFEKRAKIYCARQDCSHDWGIYVKYKTFEIPVIKIESFVVEDVATGTQTLYARWKDFHFEKIPFDAAEMAK	264186	257426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_257998_260294_260439_262472_262625_263730
901680	contig_12277_pilon	+	4524	7	Intergenic	novelGene_139718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	170.612296026856	4	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	157	2085	414220	421208	FALSE	30	AGGAGCATCAGCTGCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNNAKERGEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCLSPSTPVDDSCAPYPAPGTSPDDSPLSRLPKTRSFDNLTTACDNTVPLASRRSSDPSLNEKWQEQRRSLELSSLAGPGEESLDADSLGKPAKVLGGAELSVAAGVAEGQMENILQEASKEESGVEEPAHRGDIEMQEVKEEALLEKESRSKMPEGSAVVVYKESELDDAALRSHPGTNLSVFSQGIPEQQGVHSVLPSPLQEPCRGEGSQEIPVEQPQIGDIPEDREETVLPVSVDAKVGCGTSQSRSLLPLQVPLEARGPNVDSSMDMLMEDKVKPEDEPQGHHRPCVVNSGRLSDKDMPAQAMEPRASERSLAERPQVGSEVYRTSPGHTRSPTRSPCALPLAECKEGIVCNGAPETENKASEQPTGLSTPQKYPTPNGHCANGEAGRSKDFLSRQLSAVSCSSTHLHSRNLHHKWLHSYSGRPSVTSSPDQPSRSHLDDDGMPVYTDSIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLNSSLRFNGDFGDEVTSIPDSESNLDQNCLSRCSTEIFSEVSWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRDTDRVDQTWNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPASSSIDLELDKPIAATSN	412866	423647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_412990_414186_414333_415083_416501_417717_417829_418297_418387_419178_419206_421036
901681	contig_16303_pilon	-	2462	8	Intergenic	novelGene_34030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	719.336400540705	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	49	882	40530	35759	TRUE	25	ATTGATGTTATTTTCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	40578	31510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_32258_32400_33092_35616_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433
901682	contig_16870_pilon	+	1740	5	Intergenic	novelGene_155509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	151	870	123181	124629	TRUE	50	AAAAAAAAAAGCCCCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTWASTGPSEASSRPPQLLPYQAVCPAPCHDLEPVLAPLASTPVAGSEAAPGSAPVATALEAAQVAAPVAVPGAGPLAVLVSAAGSVPVGTSVSVPASAAVPALRAVKVPVAAPVAAPASAEALSALDRSVFVPASAALAAPGRPFGASVAESVAAPGPGSAEPVVGIVVAHRLLETQAAGQASVSASVLSSQPVAEPSPAASLEAPSLQAPLSFSTSWLVAAMPHKAPALRLGCISP	122777	125711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_122853_123105_123229_123483_124080_124553_124661_124872
901683	contig_10307_pilon	+	1685	4	Intergenic	novelGene_170272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	155.64061166675	13	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	360	1178	389662	392058	FALSE	25	ATCTTAAGTTGTGAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWTMTQCNRISSTRRRTSISSSSRASCSRRRPARISGRNSSSPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387537	392565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387851_389615_389787_390250_390382_391495
901684	contig_3787_pilon	+	3856	13	Intergenic	novelGene_102419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	27.1334152332916	495	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	159	911	578147	598214	TRUE	5	CACCGGGGCTGGGCCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGGSLQDSKDALHLAQTNDMFFSTVGCHPTRCGEFEKNNPDLYLKELLNLAENNKGKVVAIGECGLDFDRLQFCPKETQLKYFEKQFELSEQTKLPMFLHCRNSHAEFLDIMKRNRDRCVGGVVHSFDGTKEAAAALIDLDFYIGFNGCSLKTEANLEVLKSIPSEKLMIETDAPWCGVKSTHAGSKYIKTSFPTKKKWENGHCLKDRNEPCHIIQILEIMSAVRDEDPLELANTLYNNTIKIFFPDM	565227	627732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_565266_573063_573131_575088_575139_578143_578208_579747_579892_579991_580035_586976_587063_587149_587191_589373_589451_592630_592702_594285_594413_598111_600964_627536
901685	contig_13992_pilon	+	4177	6	Intergenic	novelGene_147608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	491.535715894583	533	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	26	655	23047	34857	FALSE	35	ATACAGATTTTTATACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAGGGRVRMELNSLLILLEAAEYLERRDREAEHGYASVLPFDGDFARKKTKAAGLVRKAPNNRSSHNELEKHRRAKLRLYLEQLKQLVPLGPDSTRHTTLSLLKRAKMHIKKLEEQDRRALSIKEQLQHEHRFLKRRLEQLSVQSMERVRTDSTGSAISTDDSEQEVDIEGMEFGPGELDSVGSSSDADDHYSLQSGGSSDGSYESPCRRPGRPGLS	23021	38379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_23111_23189_23290_27566_27597_33048_33164_34085_34249_34699
901686	contig_5586_pilon	+	2756	4	Intergenic	novelGene_143522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	639	1088	272231	272680	TRUE	35	AGACTCATATGTAACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESVGVAEAAEASAECVWNAVLCEDAKGLTFPGMFSLEVLCWASSLCASESKHFPPSLLCALEHQSLWTISVVSFASGFWLGSASENTVRLEGGGRVTSGYSFPMVSLLSDIGLQITVTAPGRQPSPPTISVPGSGIQSLTFPFSPEG	268600	279328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_269230_272221_273853_274481_274562_278912
901687	contig_13823_pilon	-	3965	3	Intergenic	novelGene_145249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1777	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCCTGTATTTGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149180	141812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_143446_143521_145048_148374
901688	contig_9471_pilon	-	4928	2	Intergenic	novelGene_21825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417502	412449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_417026_417150
901689	contig_10434_pilon	+	5043	3	Intergenic	novelGene_82031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	18	405	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTACATGTAACTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130396	136812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_130722_131445_131609_132257
901690	contig_9119_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_169742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGAGCACAAGTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98576	96420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_96400_98600
901691	contig_13937_pilon	+	2752	3	Intergenic	novelGene_167369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	13	442	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	58	462	118155	118559	TRUE	30	CTCTGTGCTTAAAATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSWAHRALLCYLERSCAHCCSSSLTLQRLRDLLVLLKPRRQASSLLLQLRGWRKCLPAVSLSGTIASKACLSLPFPPVSPSFHQDEDCWVRGILSGLTKHYDFKLRSKRGIFLVSLYRRCLMYTLMIVALELL	118097	122527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_120466_120748_120938_122332
901692	scaffold_4438_pilon	+	3047	1	Intergenic	novelGene_174544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1360	1698	409617	409955	NA	35	GCAACCTTTATGTACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHFQHCICLLKHLSWYSVNSWSLVFFPVTSVQLESLFSVPSVLDHMPPPEMAEHQPVLFGTVTVYFFHLLLMLLESFNIFPVEFFNIATRGLNFFFSSFSLRNVKHVLPF	408257	411304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_408300_411300
901693	contig_14744_pilon	-	2688	5	Intergenic	novelGene_65991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	448.330793053522	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	69	539	969897	964405	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALV	969965	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_962609_964176_964410_968343_968630_969717
901694	contig_14643_pilon	-	5476	25	Intergenic	novelGene_99119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	215.061667512677	41	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1455	4368	84	4451	68872	27111	TRUE	35	TTTAAAGATCTAAGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVSSMTSVNQVTHDQAVVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSIRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGALQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTSETGVEETILEGHLGVTKELLAFQTPEKKYHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCSSPATINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLERDNVNPESQLIQQNEQSESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSLEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEIAMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ	69154	25852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_26440_26672_27249_28761_28858_29238_29452_29640_29798_34352_34442_34528_34750_35222_35409_40986_41117_41617_41844_42998_43123_43496_44251_45619_45762_48091_48266_52009_52201_53787_54009_56215_56439_57092_57240_57838_57986_58214_58324_64086_64254_65222_65349_66319_66446_68611_68891_69089
901695	contig_1717_pilon	+	5276	10	Intergenic	novelGene_146117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	58.4550053829524	594	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	79	1170	176846	210906	TRUE	40	TAAACACTGACTAACCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALDLGGTNFRVLWVRVTDNGLQKVEMKNQIYAIPEDMMRGSGTQLFDHIAECLANFMDQLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESYLVSWTKGFKCSGVEGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDVVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDDFCTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCAVVARRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDTLKVTVGVDGTLYKLHPHFAKIMHETVKDLAPRCDVSFLESEDGSGKGAALITAVACRIREAGQR	176767	264677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_176903_186960_187081_187737_187834_189467_189568_204006_204191_204754_204911_206532_206767_210761_214800_262730_262809_264542
901696	contig_854_pilon	+	5353	30	Intergenic	novelGene_36570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3090.34127041943	15	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	933	2802	1538	4339	1700894	1714980	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1677577	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681892_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1698987_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
901697	contig_3424_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_55540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1106	1405	284903	284604	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVISRGSKPCLQPRKRRLVPLTLHLIPVSTNLITLGSPGGSVVRNLAANPKASSSNPPAAPWNPYRVVLLCPMGSLCVRIDSTATGFGLNHFRRLLPK	286008	283646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_283600_286000
901698	contig_6286_pilon	+	3893	1	Intergenic	novelGene_165650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2882	3229	125258	125605	NA	20	TTCAGTGGCTTCACATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSRATIINRPISDEECTVSDAGKNMHSSPKVVSLRVWIVGNVEDTHYSLANQKKERQDKNISRNSDVIMKQDKMEHDFELLVECKKRLDLALVVGTFSLKCHRHQGIECVGRK	122376	126269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_122400_126300
901699	contig_12750_pilon	+	5778	3	Intergenic	novelGene_172620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	7	596	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	59	565	14869	31732	FALSE	30	ATACCCTTATAAGTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGRTLQARALLQQCLHAQLQVRPAEGDVAAQWVEVQRGLVIYVCFFKGADKELLPKMVNTLLNVKLSETENGKHTSVLDLPGDILIIPQATLGGKVKGRNMQYHSNSGKEEGLELYSQFVTLCEKELAANSKCAEAGVVVKHGTYGNRQVLKLDTNGPYTHLIEF	14810	36945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_14980_27181_27252_31406
901700	contig_7744_pilon	-	1714	11	Intergenic	novelGene_62509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	314.297772820617	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	723	1676	822865	820619	FALSE	15	CTCAGCAACTTTGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDYTTPPNEELSRDLVNKLKPYISFLTQCRPLSASMYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	824669	820580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822329_822501_822579_822778_822868_823128_823501_823760_823968_824167_824255_824615
901701	contig_17144_pilon	-	3051	18	Intergenic	novelGene_29326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	2021.44209033241	1181	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	185	1621	179764	170834	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRDEETETQMFTYPRSPSLPTTGQTPCRGPRSSQHLGGLGLPQLPASGLRD	183266	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
901702	contig_1143_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_86630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1287248	1285158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1285200_1287200
901703	contig_13283_pilon	-	4064	3	Intergenic	novelGene_154011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	3436	3969	54827	52925	TRUE	60	GAAAAGAAACAGAAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAQDGLRHGLPGSVDLDVRARGWRRLVLCIPAPLPEPGWHCGLQLRKPARSPPFPSSSWQGLRGMSREWGGRGATSPQGLPLQGRLGEEEPIAPDDGSLGELLSSDVVLLSCLHVSFRDPILSYSGQFVGAFLWAGFRVLLRVLCCIRMTAGITVFIGPIGFTICSCVGLPSLLLC	58262	26897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_26965_52896_53455_54823
901704	contig_14970_pilon	+	1805	6	Intergenic	novelGene_45040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4847.65229776229	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCACCAGATAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182401	232830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_182409_192102_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
901705	contig_1076_pilon	+	4883	2	Intergenic	novelGene_101147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_1	0	561	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	706	1311	1009522	1010127	FALSE	5	TTTATTGCCCGTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRLSIGESITNRRDSTTTFSSTVSLAKLLQERGISAKVYHSPVSENPILQPPPKTLTIPSTPPNSPSHSLCPSPLPFEPRAHVSENFLASRPAETFLQEMYGLRPSRNPPDVGQLKMNLVDRLKRLGIARVVKTPDTQENGRSQEADIGLQKPDSAVYLNSSGSLLGGLRRNQSLPVMLASFGTPVCTSSPKMGILKED	1006811	1013699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_1007444_1009448
901706	contig_9484_pilon	+	2846	8	Intergenic	novelGene_105639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	608	junction_6	391.892634192956	24	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1235	1921	101609	103702	TRUE	5	TGGTGGTGGTTTTCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYCELCFIWSSSYCMLRSGNTT	97147	105099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_97228_98440_98611_100389_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_104412_104883
901707	contig_5794_pilon	+	1129	9	Intergenic	novelGene_69800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	333	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTGTGTGGTCGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743231	747139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_743602_743693_743763_743854_743975_745131_745211_746082_746134_746225_746321_746402_746495_746807_747018_747096
901708	contig_11751_pilon	+	2554	3	Intergenic	novelGene_150302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTGATGTCACTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159565	163702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_159992_160550_162621_163644
901709	contig_20951_pilon	-	1968	10	Intergenic	novelGene_43119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	117.357005187874	14	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	671	1966	237836	218345	FALSE	80	AAAAAGAAAAAAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVTPVPQQHEEEDLDDVILTETNKPQTSRPNLIKPAAQWQDLKRLGEERPKKSRAAFESDKNSYFSVCNNPLFNSAAQDDSEDDYSEFLDLGPPGISEFSKPSGQRGREPQPGPSHSQATNDIVNPGSEKKIILEDSNLLYSESDTLNQLSEDSEIELGESAAIVDDQAIEEDCWLDHPYFQPLNQETRERTSQVVPQEQRPEAELGPLLYQHEPPGPAFPRPVFPRPEPQQDGIPGPSSPQPAHPLGELEDQQLAIDDDEPGPAFPLQGSQEPNLENIWGQGATAVDQELIALLVKETEARFPDVANGYIEEIIRLKNYYDLNVLCNFLLENPDYPKREDRVIINPSSSLLASQDETKLPKIDFFDYFKLTPLDQRCFIQAADLLMADFKMLSSQDIKWALHELKGHYAITRKAFSDAIKKWQELSPETS	268888	218342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_218396_227946_228112_229223_229327_234046_234124_235970_236805_237770_237902_239596_239640_244509_244646_247820_248138_268779
901710	contig_2834_pilon	+	1416	6	Intergenic	novelGene_27998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2294.97532884343	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	53	436	274763	285707	TRUE	25	AAGAAATTTTTTTCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPRTNRSLSPRRLLKSWPVT	274710	291559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285583_285646_285746_290617
901711	contig_9706_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_20874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2949	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2900_4000
901712	contig_14970_pilon	+	2790	1	Intergenic	novelGene_45139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	1303	1866	285542	286105	NA	40	AACCACTGATGTTTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELTWRGNRVEGCFSASPHPLHSPHSHNLTSVQDNTIHLGYKDGGHRFIKGCAIHVNRCSHREDKPGHALINPQIFFQATKSDWQSSSTKRQREQERNKGYVHFREAGQSTNWNATKVCVLLFQLSDMQRICFCSQIKSQQIGGSNSIFLKMLTGSKIFLLVQVFGSYLKLQVFFLLWSPFPSWTKY	284239	287029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_284200_287000
901713	contig_10013_pilon	+	1805	3	Intergenic	novelGene_125059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGCTCTGCCTGAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278018	279916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_278249_278288_278633_278685
901714	contig_7056_pilon	+	5485	10	Intergenic	novelGene_43639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACACACCTTTGAAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721909	730140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725318_725471_725606_725661_725733_725812_728706_728906
901715	contig_1225_pilon	+	2751	4	Intergenic	novelGene_44170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	103	420	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250711	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275027_275082
901716	contig_7031_pilon	+	2947	2	Intergenic	novelGene_132786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGACGTAACCCTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210969	214892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_212931_213906
901718	contig_14768_pilon	-	4305	16	Intergenic	novelGene_115070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGTAAAGTAGGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33176	7602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_7788_7879_8060_8153_8303_8398_8531_9586_9707_9813_9923_14131_14272_16349_16499_16588_16741_17765_17877_27602_27760_28224_28378_28503_28657_30044_30116_30404_30516_30943
901719	contig_16578_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_148682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGCTCAAAATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298076	299348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_298100_299300
901720	contig_20794_pilon	-	1430	9	Intergenic	novelGene_161385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	45.0039928784102	185	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	334	1155	23881	276	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLETKITKWNLQLRKNKHEAVVIKESSRQKAIALKKASKAYKQRLEHFTGNIENLTSQIRDQEAKLSETISASNAWKNHYEKIIIEKTELEVQIETLKKQITNLLEDLKKMEDHGKTSCEEIVRKLHSIEYENETLNLENTKVKTMLAALKEKTASVENELIELQEVENQQKTLIEVYKTQVQKLQEAAEIVKSRCENLLHENNQITKNKNKKLEKFDGNHSLLTKLSLEEENYLIQLKCENLKQKLEQMDAENKELEKKLASQEECLKHSNLKFKEKSSEYIALARQLEAALEEGRQKVSEEIEKMSTRERALQIKILDLETELRKKNEEQNQLVCKFSSKAQHQEVCLKEIQHSLEKSENENESIKNYLQFLKTSYVTMFG	30443	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20794_pilon_-_405_2779_2906_5415_5579_5660_5747_9366_9472_10708_10820_23779_23916_25076_25187_30254
901721	contig_10861_pilon	-	3902	1	Intergenic	novelGene_39427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGTGATCCTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239770	2235868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2235900_2239800
901722	contig_10352_pilon	+	5525	11	Intergenic	novelGene_49597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	369	junction_10	102.053368391249	787	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	2464	3738	15350	34079	FALSE	15	GCTTCCTTAGAGGGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWIRGRRSFIFKGEDNWAELMEVNHDDKVVMTEHFDLSQEMERLTLDLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNNVSVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPEEYFSEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQKFKATLWMCEEFPLSLEEQVIPIIDLMARTSAHFARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEETVSQNVDGTQASSASHVTNFEVDQSVFEIPESYHIQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQEVSGPASNGGISQTHAYDAQYERAIQESLLTSSEGLCPGTPSETSRFDSDLQLAMELSAKELEERELRLQEEEAELQQVLQLSLTEK	12886	35866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_+_15396_16073_16264_21362_21430_22736_22819_23721_23784_24830_24962_25654_25813_26501_26616_29272_29434_32946_33015_33883
901723	contig_10217_pilon	-	1389	10	Intergenic	novelGene_87413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	515.98384987646	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	134	613	130155	113137	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTFCGSILSWMDLQLRALE	130288	109070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114031_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
901724	contig_8204_pilon	+	3667	7	Intergenic	novelGene_176993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_5	49.4390758633515	104	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	3	1832	18967	63532	FALSE	40	ATCAGAGGTTAAAGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEAIFSEEKNTTEPAYKVKNAPSIPNTPEPTITQEPLVGSQKRKARKTKITHLVRTADGRVSPAGGTLDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	65367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_45005_45066_55658_55857_57899_58087_63444
901725	contig_1301_pilon	-	4450	20	Intergenic	novelGene_47284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	776.946658917666	75	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	244	1974	305285	259065	TRUE	55	ATGAATAAAACTATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	322913	242507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_244650_247691_247743_249993_250042_254403_254509_258934_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_322794
901726	contig_12969_pilon	+	2287	5	Intergenic	novelGene_61703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	31.8933770554327	189	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	513	1316	608602	611236	FALSE	15	TTCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYNSLVSVGCQGTKRDSVFELEQGETPWIVEGAVHSQTSPEEIWAIDSMQWQPGNQNELKSLERCLQSFSLGINFGLSKNLAPLTQRHNMFDLHHRSLQSRLNFVIQNRGDEGKDSDEFSGYEKLSVHMKHDKTFPGIKYHGYFKPTSIRSQLSGQPKTYTEEQPHKCSECGKVLYRKSLLFYHQRIHTGRNPVYAMNMEKPSLGRAGSRDISYLILERRSMDVMNVGNHFPRRHTLFYIIDFTQERSLMNAVNVEEPLLLSQH	599218	612207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_599389_605232_605433_608459_608636_608880_608977_610562
901727	contig_8122_pilon	+	3234	6	Intergenic	novelGene_40255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2109	junction_5	448.44772270578	139	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2038	2559	742073	748168	FALSE	20	GAGTAATGTGCTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRVEVKVKIPEELKPWLVDDWDLITRQKQLFYLPAKKNVDSILEDYANYKKSRGNTDNKEYAVNEVVAGIKEYFNVMLGTQLLYKFERPQYAEILADHPDAPMSQVYGAPHLLRLFVRIGAMLAYTPLDEKSLALLLNYLHDFLKYLAKNSATLFSASDYEVAPPEYHRKAV	735568	748843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_737594_742060_742163_744037_744127_744610_744784_745062_745148_748083
901728	contig_12277_pilon	+	4812	5	Intergenic	novelGene_139714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCAGTTCTGTCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394870	474445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_397494_398009_398267_470412_470655_472645_473415_473524
901729	contig_5586_pilon	+	3250	3	Intergenic	novelGene_143573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1271	junction_2	17	20	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1907	2368	392865	417177	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGKHGTQQKRASDWMLIQLHWGKPHPGCLLSPILSILQSKSMKNMGKYLAREKQN	390958	418059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_392877_392973_393128_416881
901730	contig_10161_pilon	+	3153	3	Intergenic	novelGene_178772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGAGAGCCACCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64560	68404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10161_pilon_+_66814_66893_67676_68286
901731	contig_14985_pilon	-	2397	4	Intergenic	novelGene_169091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	401	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAAAAAACACAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95558	7857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_9539_10106_10189_39938_40194_95179
901732	contig_2917_pilon	+	6796	4	Intergenic	novelGene_147567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	381	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCGACTCGACAGCAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47433	123344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_47445_69048_69384_114081_115225_118037
901733	contig_16775_pilon	+	2168	15	Intergenic	novelGene_107768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	230.919026801118	384	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	124	1056	130489	165213	TRUE	40	TAATAGTACATTTGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAIAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLVRTILFRNHPRSAGCLLT	130365	174736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160259_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
901734	contig_10599_pilon	-	1964	4	Intergenic	novelGene_49884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACACCACGATCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165612	158604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_158680_161350_161482_163804_164059_164108
901735	contig_4754_pilon	+	1297	5	Intergenic	novelGene_35894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	86.5722241830485	60	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCTAATGACAGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114718	126044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114787_119671_119871_121506_121634_121913_122010_125237
901736	contig_8954_pilon	+	2236	19	Intergenic	novelGene_130257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	396.419706035577	47	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	38	1549	49668	164974	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAATACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGSPVETKYPLMQRMTNSSSSPSLLNDSAKPYAGHDALTSPASSLFNDFGALNISQRRKPRKYRLEERLVPMGSKARKAKNPIGCLADRCKSGVPINMVWWNRVTENNLQTPNPTASEFIPKGGSTSRLSNVSQSNMSAFSQVFSHPSMGSPATAGLAPGLSLSAGSSPLHSPKITPHTSPAPRRRSHTPNPASYMVPSSASTPVNNPVSQTPSSGQVIQKETVGGTTYFYTDTTPAPVTGMVFPNYHIYPPTAPHVAYMQPKANAPSFFMADELRQELINRHLITMAQIDQADMPAVPTEVDSYHSLFPLEPLPPPNRIQKSSNFGYITSCYKAVNSKDDLPYCLRRIHGFRLVNTKCMVLVDMWKKIQHSNIVTLREVFTTKAFAEPSLVFAYDFHAGGETMMSRHFNDPNADAYFTKRKWVLAQKYRQEALTRVDRIQMTTFNGQHDGPLPRQHAGLLPESLIWAYIVQLSSALRTIHTAGLACRVMDPTKILITGKTRSLKVASKLCWSF	49630	185932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_49674_51999_52067_53962_54034_66240_66394_102198_102347_144169_144418_147202_147308_148186_148245_159262_159425_159661_159779_159873_159976_162335_162405_163399_163566_164934_165036_169411_169552_173747_173878_174335_174401_182928_183068_185780
901737	contig_3584_pilon	-	4955	5	Intergenic	novelGene_108111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	244.00665974518	386	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	343	642	254310	188073	TRUE	10	TCTGCTTCCTTGCTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKPLSQHLIQGPSHKSLKF	277362	182528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_186831_188061_188126_223281_223328_254109_254314_277023
901738	contig_5928_pilon	-	2834	3	Intergenic	novelGene_40395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_2	12.5	49	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAGACTGAAGTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363314	359148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_359500_359761_359834_360903
901739	contig_18162_pilon	-	3609	3	Intergenic	novelGene_122287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2404	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCGATCAGTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16364
901740	contig_5686_pilon	+	5127	2	Intergenic	novelGene_45225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	516	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93785	100408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94065_95560
901741	contig_6802_pilon	-	3554	4	Intergenic	novelGene_178773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	499	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1954	2346	177260	176868	FALSE	70	TAAATAAAAGGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLKVKGCKKIYQANSYQKRAGVAILTSDTINFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDKAPKNIKLTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTINQLDRIDI	312051	175659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6802_pilon_-_177953_215832_216085_290057_290071_311055
901742	contig_9436_pilon	+	2353	1	Intergenic	novelGene_60915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTGTGAGCCAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437502	439855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_437500_439900
901743	contig_11338_pilon	-	2414	2	Intergenic	novelGene_6287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTCTGGGCCTCAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193948	191150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_192299_192682
901744	contig_13800_pilon	+	4446	3	Intergenic	novelGene_153736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTTGTTTCATGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144733	152879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_146655_150242_152182_152293
901745	contig_8598_pilon	-	4241	3	Intergenic	novelGene_22871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCAATAACGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18720	3053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_5964_15952_16486_17922
901746	contig_4429_pilon	+	2830	10	Intergenic	novelGene_50799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	695	junction_2	263.609981264409	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	75	1985	165292	198515	FALSE	20	TACCTAGTTTTGTTAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSNNNDFRALLQSLYATFKEFKMHEQIENEYIIGLLQQRSQTIYNVHSDNKLSEMLSLFEKGLKNVKNEYEQLNYAKQLKERLEAFTRDFLPHMKEEEEVFQPMLMEYFTYEELKDIKKKVIAQHCSHKDTAELLRGLSLWNQAEERQKFFKYSVDEKSDKETEVSEHSTSISHLPPEVMLSIFSYLNPQELCRCSQVSTKWSQLAKTGSLWKHLYPVHWARGDWYSGPATELDTEPDEEWVKNRKDESRAFQEWDEDADIDESEESAEESIAISIAQMEKRLLHGLIHNVLPYVGPSVKTLVLAYSSAVSSKMVRQILELCPNLEHLDLTQTDISDSAFDSWSWLGCCQSLRHLDLSGCEKITDVALEKISRALGILASHQSGLLKTSKIKITSTTWKNKDITMQSTKQYACLHNLTSKGTEEETDNEHPWTKPVSSENFSSPYVWMLDAEDLADIEDAVEWRHRNVESLCVMEAASNFSCSTSGCYSKDIVGLRTSVCWQQHCASPALAYCGHSFCCTGTALRTMSALPESSALCRKASRTRLPVGKDLIYSGSEKSDQETGRVLLFLSLSGCYQITDHGLRVLTLGGGLPYLEHLNLSGCLTVTGAGLQDLVSACPSLNDEYFYYCDNINGPHAETASGCQNLQCGFRACCRSGE	165217	199360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_165427_166681_166778_168311_168499_172184_172368_174813_174940_182071_182221_182828_182912_183987_184714_191596_191746_198438
901747	contig_854_pilon	+	846	7	Intergenic	novelGene_36245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	108	686	543600	562402	TRUE	20	TGTGAATTTGCAGGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543492	563187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
901748	contig_614_pilon	-	3018	1	Intergenic	novelGene_132602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGCTTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205346	202328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_202300_205300
901749	contig_7840_pilon	+	3254	2	Intergenic	novelGene_68984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACCCATGATTTCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214722	349152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_217236_348411
901750	scaffold_13505_pilon	-	3256	1	Intergenic	novelGene_111623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	725	1042	686074	685757	NA	10	GTCATACTTTGGCTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPETMVPSPQPQQLGPSRCLYVFRKLLWLCFGQVALTSLILCAFSLPKLTFVYYLVTPTDFCVLILYLVTLLNPYISSNNFLVESLGFSMYRINSSAIKDSFTS	686798	683542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_683500_686800
901751	contig_19237_pilon	-	2302	3	Intergenic	novelGene_162963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	82	103	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCTCTGTAAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71770	65842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_67816_68341_68467_71566
901752	scaffold_4438_pilon	-	2874	5	Intergenic	novelGene_174529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1862	2263	113617	113000	FALSE	45	AAAGTAATAATGCACGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQHINRKFPEVQVRFRRGCGTRDIIAGIRWILAESKECQKDVYPCFIDYAKAFACVNHNKLWITLRRMGIPEHLPYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSLRYGLYLNIKKKRKNPHNWTNNQHHDKGRKD	411304	112388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_113180_113395_114155_162801_163302_305544_305615_410550
901753	contig_401_pilon	-	2926	1	Intergenic	novelGene_42914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2112	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	993	1328	1936096	1935761	NA	40	GAAAAGAAAATGTCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWDIPVNWPNNLFSASVLPPSSLHRAWGLKSLQAAIQGTKNWFLLTWSNRGRRRLKKRRKIWNVWLIASMNNCLLCHETRRTGWCPATITEYFHQRFHRLILIKRGKMH	1937088	1934162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1934200_1937100
901754	contig_6871_pilon	+	2158	5	Intergenic	novelGene_21528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	246.820152135112	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	739	1356	63442	69012	FALSE	60	AGCTAATAAAACTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYMRYSRKVWDQVKASNPDLKLWEIGKIIGGMWRDLTDEEKQEYLNEYEAEKIEYNESMKAYHNSPAYLAYINAKSRAEAALEEESRQRQSRMEKGEPYMSIQPAEDPDDYDDGFSMKHTATARFQRNHRLISEILSESVVPDVRSVVTTARMQVLKRQVQSLMVHQRKLEAELLQIEERHQEKKRKFLESTDSFNNELKRVSK	62703	69814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_63469_64401_64534_64815_64988_68046_68220_68898
901755	contig_7079_pilon	+	1773	12	Intergenic	novelGene_129238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	491.983050840219	1134	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	22	1431	342490	348663	TRUE	20	CTCTAAATCTGAGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGPVGGRPGGRGGPVQQNIPSTLLRDHENQRLFEMLGRKCWTLATAVVQLYLALPPGAEHWTKEHCGAVCFVKDNPQKSYFIRLYGLQAGRMLWEQELYSQLVYSTPTPFFHTFAGDDCQAGLNFADEGEAQSFQALVQEKIQKRNQRQSGDRRQLLPTPAPANEERRGGLPPLPPHPGGDLGGPPAGPLALGLVTVDIQNPDITSSRYRGLPAPGPGPADKKRSGKKKISKADIGAPCGFKHVSHVGWDPQNGFDVNNLDPDLRSLFSRAGISEAQLTDAETSKLIYDFIEDQGGLEAVRQEMRRQEPLPPPPPPSRGGNQPPRPPTMGGNKGRSGPLPPVPLGGTPPPANTTGTPTPRQRGPSTTTPSSHRTFRTTASPTPRSWGSAPATTPATTTTTAQLWRWTSCSSTPSCSGVWGGPGLWWGSGGTFGSNPAGNSAEQDSGGAQRAQRCSHHHRAPRGWWGP	342468	349819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_342619_342946_343088_344715_344803_344900_345004_345095_345138_345231_345286_346268_346444_347296_347340_347541_347696_347909_348318_348589_348706_349519
901757	contig_9121_pilon	-	3434	2	Intergenic	novelGene_134427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTGTGTAAATCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130548	40614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_40958_127457
901758	contig_4742_pilon	+	2466	4	Intergenic	novelGene_130990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	518	junction_1	231.482660737737	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	813	2439	26	2464	201400	254545	FALSE	65	TGAAAAAAACAAATATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERHTEVFMDIVDTFNHLIPTEHLDDALFLGSNLENEVCEDFSTSQNVLEDSLKNMLSDKDPMLGSASNQFCLPVLDSNDPNFQMPCSTVVGLDDIMDEGVVKESGNDTIDEEELILPNRNLRDKVEDNSVRSPRKSPRLMAQEQVRSLRQSTIAKRSNSSPLSSTKKTSGKTVSAPKAGVRQPEKCQIKEEVCASLKPEYHTESRRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWTPSKQCGFCKKPHGNRFMVGCGRCDDWFHGDCVGLSLSQAQQMGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGLLKHTPT	201374	254547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_201644_242103_242266_246984_248768_254295
901759	contig_12758_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_177793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACAATCGGGCAGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116640	117928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12758_pilon_+_116600_117900
901760	contig_11816_pilon	+	7513	3	Intergenic	novelGene_98497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	557106	557441	TRUE	25	TGGTAGCTATCAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPVLGLPAQVPGGCGRHLQCCRRHCRTVGPWHEWLERAGSSTGTVGGTSRPWAPSTSGWRGWEALLALHLTTSLLLLSHFHCHIPNIVFHQKGCDSIPICSTASSHSPSI	557104	648237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_562074_644817_646525_647400
901761	contig_10753_pilon	+	4106	11	Intergenic	novelGene_105122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	45.536359099076	300	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	527	1378	78634	100792	FALSE	65	TAAATAAATAAACTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNPFAYEEYRKDKIRQKIEETRAQRVQLKKLPKVNKELALKLIEEEEEKQKSTWKKKVKSLPNILTDDRFKVMFENPDFQVDEESEEFRLLNPLVSKMSEKRKKKLRLLNQPELHEQEEEEPEGKPSDAESSESSDDEKDWVEEVRKQRRLLHQEERMKRQERIKEDQQTVLKPQFYEIKAGEEFRSFKDSTTKQKLMNKTLEDRLKLEAKNGTLNVSDTAVGSKQLTFTLKRVSFSFSFSFLMLFFNSQKKNQLPVVFCVCPPWKPLPKLLPYGGGLCSLS	5778	103520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_5867_10042_10122_12297_12448_19661_19729_33694_33748_78358_78439_78624_78724_79749_79840_90187_90362_90629_90875_100539
901762	contig_9843_pilon	+	3041	4	Intergenic	novelGene_114300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACTAAAAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491	294471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_710_2437_4354_114990_115354_293927
901763	contig_5696_pilon	+	3093	6	Intergenic	novelGene_117549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	707.465052140387	5040	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	47	985	689252	700600	TRUE	50	TATATATATATATATATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSGKKSDIFQRLCWPISSLDFLPLLFKFHPFSSSFYSTIICLFSFLFF	684372	704419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_702406_704116
901764	contig_610_pilon	+	3921	3	Intergenic	novelGene_76850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	590	junction_1	4	103	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	2309	2932	373231	375649	FALSE	40	ATTACTCTTTCAGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERKERKSEMQPPKDQGKPLLRFPRPHLRKESEQVWILAAKQKMGVDMFLIYPEPTVSHSLYTMLPQGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	370922	376638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_373717_374082_374155_375583
901765	contig_4385_pilon	-	2358	17	Intergenic	novelGene_141497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	50.3076472815018	13	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	42	1463	319648	313191	TRUE	35	ATAATGTCAAACTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSRHPASGSPSRTMRGPGLGLGLWLPGALWLQVITSGPSLPHVDRFQVVWPWRLPTPRARRALSSRWSLYPESVSYVLGAGGHNFTLHLRKNRNLLGSGYTETYTAANGSEVVEQPRGQDHCLYQGHVEGHQGSAASISTCEGLRGFFRAGSAVHLIEPLDSAEEGRHALYQAQHLQQKRGTCGVSNASLEHILGPRIAAAFRPRDRPLSQEPRHVELYVVTDSTEFQQFGSQEALRRRVLEVVNHVDKLYQELGLRVALVGLEMWSRDKISVSPQADHTLENFLAWRKKDLVGRHAHDNAQLITGVDFSGTTVGLAKVASMCSQASAAVNQDHSQNPVGVASTMAHEMGHNLGMDHDENVHGCYCPVPRDSGGCVMAASIGLKFPRMFSQCSRADLETFVENPQTDCLLGTLDPHRLVSDPVCGNKFLERGEQCDCGSVQECQDPCCNASSCRLTEGGCVCSGCLLSQVPGEAGWRVVPCPQGCV	319689	301310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_301843_312409_312557_312898_312972_313047_313238_313369_313461_313803_313982_314118_314268_314497_314580_314764_314932_315348_315418_315502_315566_315774_315956_316303_316381_316458_316538_316781_316859_318105_318210_319590
901766	contig_16722_pilon	+	1796	5	Intergenic	novelGene_118292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	867	1214	149218	149565	FALSE	25	TCACGTTTCAATGGCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLLPVEGVESFVTVVVVVTVDLAQFSVEETTVCLSPFATLITVFDSVATVDVIVVTSVMTVFLLASPLIFSSLLIGRPFSSIKSLLRLDSSPEVIGDGVTFLTSEVSVSISST	136137	150147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_136233_136609_136760_143791_143925_144487_144606_148847
901767	contig_13780_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_149092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	429	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCCTCAGGCTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689703	692808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_689700_692800
901768	contig_11117_pilon	+	2737	1	Intergenic	novelGene_148594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1870	2187	84833	85150	NA	45	GGATCAACAAAATTGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTVHHEDITIMNIYIPNNRCPKYLIETLTPLKRKIDSSTVIVGDFNTPLVVKDRTCRKKLNKDTEDLKTTVSQLEIIDI	82963	85700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_83000_85700
901769	contig_11258_pilon	-	2844	2	Intergenic	novelGene_67859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	75	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	360	815	360591	354704	FALSE	80	TACAAATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSTRAA	360950	352674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_355099_360530
901770	contig_13968_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_106874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	3	608	52054	51449	NA	40	AATGGGGGACATTACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTIRVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYTTLHPTAAKYTFFYNAHGTFSTRDHILGHRAIRNKIQNVEIIQSIFSDHNAVKVEINNRKSKEKKSIPWKLNNTLLTHHWVIEEIRDVIKKFLESNKNENTSYQNLSDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIENSKKSPQPPEERK	52056	51282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_51300_52100
901771	contig_13216_pilon	+	4940	1	Intergenic	novelGene_47497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	275	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGATTCCTTAATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236157	241097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_236200_241100
901772	contig_15371_pilon	-	3007	19	Intergenic	novelGene_151436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCATGGTCCCGGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222397	111092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_111163_150997_151088_154075_154189_155015_155213_160079_160241_162796_162876_177202_177690_180946_181081_186470_186584_195431_195543_196973_197064_198096_198175_205109_205265_208940_209036_212974_213118_215188_215336_216233_216426_220720_220875_221999
901773	contig_17976_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_32533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	696	1004	50211	49903	NA	40	ACCAGGAGACCAAAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEARMAGLRLTYFGHGIRRDQSLEKDIMLSKVQGQRKRGRPSMRWIDRVPATMGSSIPTIVRMAQDGAVFWSVMHRVAESEPTRWHLTTTRTAGEREMRS	50906	49518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_49500_50900
901774	contig_13952_pilon	+	1567	1	Intergenic	novelGene_133270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGTATGTCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206317	207884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_206300_207900
901775	contig_8476_pilon	-	2307	3	Intergenic	novelGene_121339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	375	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGAGATAGACTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198110	137158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_137348_149171_149176_195996
901776	scaffold_12124_pilon	+	2226	10	Intergenic	novelGene_22224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3072.0886127266	66	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1407	2057	1508755	1509405	FALSE	45	AAACTTGACTGGAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1509574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497238_1506629_1506687_1508010
901777	contig_5023_pilon	+	1328	9	Intergenic	novelGene_7272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	2570.92359073058	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	74	1123	607279	647385	FALSE	15	AATCCTACTCTGCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPQKVTPLWPTSAGHPCLWAFGASDKPVSLFESQEIWMVYKSSLITRNFPQNWGPKCHQFLCFPPGRSSLFLTVGFGLVLELTHL	580855	647590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618582_647131
901778	contig_9345_pilon	-	3843	1	Intergenic	novelGene_24532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAATTTATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712364	708521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_708500_712400
901779	contig_16098_pilon	-	2634	7	Intergenic	novelGene_46037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1170.38569141402	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1815	2525	350530	348413	FALSE	15	GCTTTATTTTCTGGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349435_350286_350643_350765_352352_353990
901780	contig_15326_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_157713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGACCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145094	147610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_145100_147600
901781	contig_9133_pilon	-	5916	15	Intergenic	novelGene_109309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_13	140.300915673332	461	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	107	1759	913329	860888	FALSE	65	TTGTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFSANPFEQDVEKATNEYNTAEDWGLIMDICDKVGSTPNGAKDCLKAIMKRVNHKVPHVALQALTLLGACVANCGKIFHLEVCSRDFATEVRGVIKNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSAAARNGASTNKSKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPSAEIQLNNKAARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGVGLFPSNFVTTNLNIESEAGVTLSFQGNACNDSSHLCCSLVPLESAVDQLNVTDDDVEEIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEAVELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPVSAGIPVQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRSLPPNVNSSVTTQPAQTPYLSTGQDTISSPAYMNQNSNLQSATGTAAYTQQMGMSVDMSSYQNTASNLPQVAGFPVAVPAHSATQQQTSYHQQPLL	913435	856730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_861117_862770_862941_865212_865367_871598_871654_872621_872710_872856_872940_873208_873284_874994_875090_883416_883604_884199_884270_886991_887139_888376_888476_888590_888667_889903_889989_913289
901782	contig_11719_pilon	-	1784	6	Intergenic	novelGene_154781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	36.4527090899977	3	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGCCTTTTTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170258	160790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_162127_163481_163533_164244_164329_166324_166462_169847_169956_170190
901783	contig_13041_pilon	-	2089	4	Intergenic	novelGene_127729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1164	1535	288728	288357	TRUE	10	ATGGAGTGCTCCCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFRSKTGQKFLRAMIKVHCTQDGAVISLLHSNRIGMLYDTVKLRDAFRSVPKSVVMSVMQILLNIVRPGGPTSYAAAWTTVEMQRTAEIRVTAHSPLWLLGAINAPTRRSRNQSIANAIRSC	289891	268533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_-_268633_274925_275164_284998_285094_288234
901784	contig_16496_pilon	-	1300	3	Intergenic	novelGene_5140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	15	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	309	326	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3593	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_262_494_1354_3413
901785	contig_14220_pilon	-	1020	6	Intergenic	novelGene_159854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_5	366.139645490624	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	807	213	1019	319674	292083	FALSE	45	AACACCAACCACCACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIKDHRPALLPTQPPVVTHSPRLIPPPQPQPPPPPPPPPQQQPIRSLFQQQQLQPLLPLQHPHHPSPPQGMHMPPQIETPRIMMTPPPVTPQQPKNIHINPHFKGTVVTPVQVPLLPLPSQPRPAVGPQRFPGPPEFPQHAPGPVPNNFSQPPRLPIQDQWRAPPPPQDRDPFFIGVSGEPRFPSHLFLEQRSPPPPPPPPTLLNSSHPVPTQSPLPFTQPGPAFSQQGQQPGFPRERPVRPSLQPPGPVGILHFSQPGSANTRPFIPPRQPFLPGPGQPFLPTHGQPNLQGPLHPPLPPPHQPQPQPQQQQPQHQQQQPQHQPQHHQHQPQHQPPLQP	325969	292081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_292227_293528_293873_294242_294376_313693_313753_319547_319834_325916
901786	contig_5423_pilon	+	3147	7	Intergenic	novelGene_85251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	618	junction_5	724.331185761504	512	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	389	1036	542216	553344	FALSE	40	GTACAGTCTACAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	534716	555455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_551350_551465_553206
901787	contig_17144_pilon	-	1788	11	Intergenic	novelGene_29339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	739	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	317	1579	179764	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLWRLLGLPGTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183398	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166374_172650_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
901788	contig_12257_pilon	-	2509	5	Intergenic	novelGene_152093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	31.7125763696361	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	115	534	148314	118587	TRUE	15	TTTTGTCATTCACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAKAKARGGGRGGRRNTTSPVPSSGGAAPRCSPPPAAMSERLRPRKRRRNGNEEDNHLPPQTKRSSRNPVFQDSWDTETVPVTRNSKENRLRGSRVLYVSSSSESGGSSSSSSNNSPDRASGPESGLNQTITGSSPNTPQPAPEQSALCQGLYFHINQTLKEAHFHSLQHRGRPPT	148428	116423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_117384_117571_118821_121675_121739_138594_138695_148291
901789	contig_13780_pilon	+	2541	3	Intergenic	novelGene_149052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.5	284	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	287	1429	605685	607162	FALSE	30	ATCAGTGCATGAAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRFEEVGCCEDLEAVGEGQRALLGRNHLRLSCTRLSVGRVEAQRPGDGSPGLGAFGPRWGLGDRAEAGAVEAAETTGGARWRGRDSAGETGPNQSMAMGNQHPSISRLQEIQKEVKSIEQQVTSFSGLSDDKNYKKLERILTKQLFEIDSVDTEGRGDIQQARKRAAQETERLLKELEQNANHPRRLEIQNIFKEAQALVKEKIVPFYSGGNHVTDEFEEGIQDVILRLTHVKTGGKISLRKARYHTLTKICAVQEIIEDCMKRQPSLPLSEDAHPSVAKINSVMCEVNKARGTLIALLMGVNSNDTCRHLSCVLSGMMADLDALDVCGRTEIRNYRREVVEDINKLLKYLDLEEEAGSTHAFDLGQNHSILKIEKVLRRMRGASHEAAAGPGRRGPAGRGTLQGCQEAGGEAGPEHPRLSRPEIRRMGVLRYQASQVQYCLFCTLYRLYVFLESCQFIELKCDLYTCLLQPQYL	603977	608274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_604236_605656_606547_606881
901790	contig_12424_pilon	-	1359	7	Intergenic	novelGene_174268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	27.0662766802775	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	294	1358	51784	25054	FALSE	35	TAAAACGTGAGTATCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDGLDKASIANSDGPTSGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREEIVVKPEEGNGSVSEKTPPLEEKAEDKKAGSSHSKKTSGSKASTSPSISSTSSRPKASKETVSSKTGTVGTTKGKKKTGKQPSSRPSADAAASGTSSLKGDPSETRAESLKPEQTVPGTEEQTTGKSKSVVPPHPVAPLPLPPIPPLPPEDQCVTPSDTPIILVSNGADLPASALDPSRLLWTEEPTNKTTLHPGTGLSSRENAKCFTTKDELGKAAPQLLIPGLLGESSESFSAPEDEGQRDYQANDSDSDGPILYTDDDEEEDEDEDEDGSEESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNI	90366	25052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_-_25103_34032_34190_35725_35935_41888_42421_51666_51826_56992_57074_90195
901791	contig_6677_pilon	-	1556	7	Intergenic	novelGene_114209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGCTCCTTGTGGCCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626522	584870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_584998_594905_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624540_625422_625530_626325
901792	contig_3601_pilon	-	3375	6	Intergenic	novelGene_132833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	424	1170	376851	376105	TRUE	20	TGAACCCACCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESREYQKGVYLCFIDDAKAFNYVDYNKLWITLQRKGIQEHLIVLTRNLYTGQEAVIQTEQGDTVWFKVRKGVRQDCILSPYLFNLHAEQIIRETGLYEEERGIRIGRRLFNNLQYADDTTLLAESEEDLEHLLMKIRDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLESTISACGSSNQDIKRCIALGKSAAKDLFKVFKSKDVTLRTKVRLTQAMVFSVASYACESWTVNKED	432427	79288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_81131_195909_195915_271017_271350_376078_377159_391578_391613_432345
901793	contig_3449_pilon	+	4340	14	Intergenic	novelGene_73723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	387.704960111003	54	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	775	2121	512166	524912	FALSE	10	CATTTTACTCTGGTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQDAGITSDTMMKNFFFVPSCIQLNQEDSFSTEA	493420	527131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_498816_498859_506311_506457_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524008_524356_524572_524800
901794	contig_12437_pilon	+	2080	2	Intergenic	novelGene_169067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30710	33055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30775_31039
901795	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	148	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
901796	contig_18272_pilon	-	4489	3	Intergenic	novelGene_7021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3767	4078	195358	195047	FALSE	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALGVGKWTTEQGQQQEAWAGCFRHSFTVLQQSSPAPGSCPSRFRARRKEGRHNVRRCSLGLCLGSFPVLEMATQPKCKSGPPSMAMSGTFPLGAVVKSSVC	199557	194635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_196993_197242_198974_199156
901797	contig_5961_pilon	-	4203	2	Intergenic	novelGene_144141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	269	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187010	182702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_186410_186514
901798	contig_13952_pilon	+	3089	4	Intergenic	novelGene_133254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	416	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1986	2444	214644	219907	FALSE	30	CAGAACCTGCTTTGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFKLYHYDEVLLMCCKFYHCDEVILMRFTKLGSVLMQSLLQYKREKRAETQRNLIPPRKQCREQSASFGPEVPAQRSSQTKERLMHYKELSLSVGSGGRSLSSIFPSQGASQHRDPRPKGGTILLALISWWYEVPMSLCSLFSFISQKILI	115875	220552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_115885_205107_206679_214238_214913_219717
901799	contig_14684_pilon	-	3382	1	Intergenic	novelGene_99667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	316	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2508	2861	317659	317306	NA	15	CCCTAACACTCTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHPPPFFTPTWVFSASCRQSLLARKHRLHPAVAWIPTTRTGRLQSAICYLLVLFFLLFRLLPYLSQPPPPFSQRPGSVCHLCFFLKGCEMPLECETASRPMPPHWWDPRAFVRLF	320166	316784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_316800_320200
901800	contig_8538_pilon	-	4350	18	Intergenic	novelGene_4628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.11764705882353	231	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3658	4050	817400	813633	TRUE	15	AGCCCAGGCCCTCCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAQRQHLSIAGRHGECGHGPAQRGDGAADPGPLQLLHPLCFLGRLQSPQRDEQLLSSDEGLYGGRGREGEVDDLLDVESFHLKDQVFNGPPGDFRRRELLKVTENRRGCTPVAVAGLCPPSPARPLIS	829565	811017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_811058_812144_812229_813456_813696_814481_814585_817021_817129_817280_817470_818258_818382_818643_818764_820352_820527_821378_821494_821652_821793_822015_822111_822201_822274_823540_823642_823872_826268_827242_827405_828348_828421_829546
901801	contig_5217_pilon	-	932	6	Intergenic	novelGene_135760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3100.49122559636	32	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTGTTTATGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560412	557638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559058_559374_559858_559966_560368
901802	contig_6102_pilon	-	3845	21	Intergenic	novelGene_32247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_14	183.655186422818	403	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	1273	2457	1308338	1303765	TRUE	40	TGAGACCTCACACAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGPGTGAESSGEIINNTVPLENSIPGNCCCALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSTSFTLGPNKLPIQLQVLSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSETERVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKRELELAVLPPSCRLPPPCSELSPLCLPIMSSPASLPVFLVRLLLVAHPPCPPSPPPLLPKSKHSMALLASQQLNRWARMAGVMSQRPSR	1315143	1300802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1301782_1301869_1301999_1302084_1302151_1303242_1303336_1303530_1303642_1303754_1304181_1304506_1304644_1304739_1304835_1306035_1306243_1306604_1306698_1307617_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507_1311645_1314868
901803	contig_12528_pilon	+	1980	14	Intergenic	novelGene_81347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	134.055009463019	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1701	279	1979	982847	1039236	FALSE	80	AGAAGAAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKPPNRPGITFEIGARLEALDYLQKWYPSRIEKIDYEEGKMLVHFERWSHRYDEWIYWDSNRLRPLERPALRKEGLKDEEDFFDFKAGEEVLARWTDCRYYPAKIEAINKEGTFTVQFYDGVIRCLKRMHIKAMPEDAKGQVKSQHPLSWCCPIDPAGSCNQSMGSEDWIALVKAAAAAAAKNKTGSKPRTSANSNKDKDERKWFKVPSKKEETSTPSATPEVEKKEDLPTSSETFVGLHVEHVPKMVFPQPESTLSNKRKNNQGNSFQAKRARLNKITGLLASKAVGVDGAEKKEDSSETAPMLEQAISPKPQSQKNNEADISSSANTQKPALLSSTLSSGKARSKKCKHESGESSGCIKPPKSPLAPELTQVEDLTLVSQLSSSVINKTSPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEVPDVAHLSLEKLGPCLPLDLSRGLEVTAPVVPDPSYRNEFPRVEKEEAQMLTYPSSKAVADGRGAPTASGISKTEKKVKLEEKSSTTFGKRKEKDKERKEKRDKGPYKPKQ	980250	1039237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_980496_982813_982930_1001357_1001530_1001684_1001770_1005341_1005431_1005657_1005736_1010529_1010738_1011282_1011412_1016764_1016848_1020325_1020579_1022683_1022873_1023140_1023348_1037916_1037974_1039168
901804	contig_13292_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_142946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACTGAAAAAAGTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273212	271127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_271100_273200
901805	contig_6084_pilon	-	2768	9	Intergenic	novelGene_127064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	64.7239329769136	915	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1914	2318	435364	430603	FALSE	15	TTTTATTTTCTATTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQVFDILSTYFETRNWPEALKKGVSSGKGYVLQNSVE	445417	430152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430710_431272_431397_433030_433099_433811_433891_435337_436474_436607_436733_437315_437459_438023_438240_445097
901806	contig_4900_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_159050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCATCTAGTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560639	558337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_558300_560600
901807	contig_2069_pilon	-	2792	8	Intergenic	novelGene_23366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	29.9223484836252	601	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	21	932	1006801	973930	FALSE	10	GAGTTGATTTGCTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCGGRLMLAGHGGVFALTLLLILTTTVLFFVFDCPFLASRLTLAIPIIAAILLFFVMSCLLQTSFTDPGILPRATVCEAAALEKQIDNTGSSTYRPPPRTREVMINGQMVKLKYCFTCKMFRPPRTSHCSVCDNCVERFDHHCPWVGNCVGRRNYRFFYAFILSLSFLTTFIFACVVTHLTLRSQGSNFLSTLKETPASVLELVICFFSIWSILGLSGFHTYLVASNLTTNEDIKGSWSSKRGGEASVNPYSHKSVITNCCAVLCGPLPPSLIDRRGFVQSDTVLPSPIRSDEPACGAKPDASMVGGRP	1006821	972069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_974048_974876_974990_976427_976531_977102_977152_977252_977391_978942_979093_993421_993583_1006721
901808	contig_14353_pilon	-	4696	4	Intergenic	novelGene_82145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	242.231753125436	13	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3307	3723	405561	402843	FALSE	65	GACTTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHYWLLHLMILEYISAPTPIFAGGANDRWVRSVSFSHDGLHIASLADDKMVRFWRIDEDYPVQIASLSNGLCCAFSTDGSVLAAGTHDGSVYFWATPRQIPSLQHLCRMSVRRVMPTQEVQKLPVPSKVLEFLSYRI	408867	401869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_403003_403494_403603_404590_404691_405512
901809	contig_9177_pilon	+	2660	21	Intergenic	novelGene_32643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_20	45.5247185603601	308	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1141	2571	105101	109340	FALSE	15	GTCATGGTGTCATAGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57815	109429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_99894_100009_100303_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101464_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
901810	contig_10377_pilon	+	4875	3	Intergenic	novelGene_115340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTAGATGTTTCCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32810	234602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_33512_64574_65146_230999
901811	contig_19402_pilon	+	3623	13	Intergenic	novelGene_80812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1388.5646065872	225	21	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	535	1230	97756	143056	TRUE	70	TCAAAAAAAAAAAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	72683	146711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_72691_79130_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_145885_146406
901812	contig_13144_pilon	-	3084	2	Intergenic	novelGene_178461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1872	2819	102761	101713	FALSE	60	TACTCATAAAAAAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	104632	101447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_-_102098_102198
901813	contig_15146_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_116965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	392	835	605891	606334	NA	15	TTTCCCAAATGGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPFLCAQCGRRFTHRCKLREHERVHSGERPFQCAECDKTFRLKGILKAHQRTHSEERPFSCGQCGKGFTRQSKLTEHLRVHSGEKPFLCPECDRSFRLKGQLQSHQRLHTGERPFPCPECGKCYRVKADMRAHQRLHGGSMPFSCECGKGFAKQSKLVEHIRIHTGEKPFQCRTCDKRFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECNKNFRERAHMLRHQRIHRPERPFSCGDCGKGFIYKSKLAEHTRVHTKSTSVQSEPEIKKRLSQLFAMIEADWS	605499	608090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_605500_608100
901814	contig_13004_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_112677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAAGTTTTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673068	673914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_673100_673900
901815	contig_10106_pilon	+	4432	11	Intergenic	novelGene_73863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_5	606.391795788828	9	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	687	1073	167085	172575	FALSE	75	AGAAAAATAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	131570	175934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_131648_132756_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505
901816	contig_3745_pilon	-	4952	1	Intergenic	novelGene_85102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2810	3166	468967	468611	NA	25	TTCCTAAGTCTGTCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNTPSSWLPVNRYSISHQRKATSILKPPTLLQITEAKYQGSAAQMLGASFLLTEWRLYPRCGRLRILGLHHLCPTLLIRKRFHNGRGKPQSPEVIVPTQKAAYRDITLREACHRPYP	471776	466824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_466800_471800
901817	contig_4232_pilon	-	2460	6	Intergenic	novelGene_63474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	264.805135901855	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	444	1244	614173	608965	FALSE	10	GATCTCTGCTGGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKCKLRWHPSCLQFTPVMMAAVKTYRWQCIECKCCNICGTSENDDQLLFCDDCDRGYHMYCLTPSMSEPPEGSWSCHLCLDLLKEKASIYQNQNSS	614616	607748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611924_612075_613618_613698_613873
901818	contig_6743_pilon	-	5451	25	Intergenic	novelGene_33553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	373	junction_22	168.752525701263	398	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	985	2958	337	3294	260386	212774	FALSE	30	ATTTCAAAAATTTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEHLGELLTVLLTLDEIIDNHITLKDHWTMYKRLLKSVHHNPSKFGIQEEKLKPFEKFLLKLEGQLLDGMIFQACIEQQFDSLNGGVSVSKNSTFAEEFAHSIRSIFANVEAKLGEPSEIDQRDKYVGICGLFVLHFHIFRTVDKKFYKSLLDICKKVPAITLTANIVWFPDNFLIQKIPAAAKLVDRKSLQAIKMHRDTFLQQKAQSLTKDVQSYYVFVSSWMMKMESILSKEQRMDKFAEDLTNRCNIFIQGFLYAYSISTIIKTTMNLYMSMQKPMTKTSVKALCRLVELLKAIEHMFYRRSMVVADSVSHITQHLQHQALNSISVAKKRVISDKKYSEQRLDVLSALVLAENTLNGPSTKQRRLIISLALSVGTQMKTFKDEELFPLQVVMKKLDLISELRERVQTQCDCCFLYWHRAVFPIYLDDVYENAVDAARLHYMFSALRDCVPAMMHARHLESYEILLDCYDKEIMEILNEHLLDKLCKEIEKDLRLSVHTHLKLDDRNPFKVGMKDLALFFSLNPIRFFNRFIDIRAYVTHYLDKTFYNLTTVALHDWATYSEMRNLATQRYGLVMTEAHLPSQTLEQGLDVLEIMRNIHIFVSRYLYNLNNQIFIERTSNNKHLNTINIRHIANSIRTHGTGIMNTTVNFTYQFLKKKFYIFSQFMYDEHIKSRLIKDIRFFREIKDQNDHKYPFERAEKFNRGIRKLGITPEGQSYLDQFRQLISQIGNAMGYVRMIRSGGLHCSSNAIRFVPDLEDIVNFEELVKEEGLAEETLKAARHLDSVLSDHTRNSAEGTEYFKMLVDVFAPEFRRPKNIHLRNFYIIVPPLTLNFVEHSISCKEKLNKKNKIGAAFTDDGFAMGVAYILKLLDQYQEFDSLHWFQSVREKYLKEIRAVAKQQNVQSASQDEKLLQTMNLTHKRLDVYLQEFELLYFSLSSARIFFRADKTAAEENQEKKEKEEETKTSNGDLSDSTVSAEPVVK	260722	210616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_212842_215590_215691_215968_216166_216797_216895_222714_222863_226922_227010_227486_227554_230855_230965_232788_232924_234993_235099_235388_235464_237197_237353_237493_237663_239024_239142_239726_239833_241010_241091_241220_241368_241934_242043_246874_247001_252127_252255_257711_257873_258656_258785_258886_259011_259517_259639_260285
901819	contig_16937_pilon	-	4298	2	Intergenic	novelGene_178774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	603	1079	173739	173263	TRUE	35	AGTAATCCTCTTGATAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEGKIDKFMENTDKKLEEFRTIMQEQNAKINSQLEITQRQQLEIQKINKKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRFMWDKSKAKICK	174341	167348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16937_pilon_-_169351_172045
901820	contig_9049_pilon	+	2284	9	Intergenic	novelGene_83148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1711.72920153131	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	200	556	90226	107948	TRUE	60	TCAAAAAGAAACACAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSGSQSVFAGSIASSSPGTCYKCKFSDST	89343	114128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558_111685_112569_112809_113028
901822	contig_6063_pilon	-	2708	13	Intergenic	novelGene_27573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	452.681700781269	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1261	1839	45585	26004	TRUE	35	GCTTTAGTAACAAATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELCHSLLRLRRK	49376	16717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26042_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191
901823	contig_7151_pilon	+	2208	5	Intergenic	novelGene_40751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	167.664844257823	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1702	2058	505515	507901	FALSE	35	TCATGATACCTACTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502541	508051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503293_503387_504052_505593_506568_506685_507738
901824	contig_15273_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_140444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168257	165465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_165500_168300
901825	contig_13093_pilon	-	5240	6	Intergenic	novelGene_105211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	91.36082311363	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	47	1357	80341	44030	TRUE	25	ACCATGCACTTGTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEKVLTSKNREDTETMKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLAEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSVNHSILY	80387	40046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_40133_40232_44053_59701_60773_77589_77717_80070_80127_80307
901826	contig_17737_pilon	-	1815	8	Intergenic	novelGene_72910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	128.451690275737	18	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	145	1032	93998	53442	TRUE	45	AAAAATCATGTTTAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGQPWALSPLLSQAQRLLRGPAGSAAASGRRRRWARSGRWIYCLATTMAAERALKPEKWELIKASMENTENSVDSKSIKNLETKIFHGSKSVDSEISLDSSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHPSTAMASRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEILELMRNVSEEDHSKRSSFICVLLSHGDEGVIFGTNGPVDLKKLTVFFRGDNCRSLTGKPKLFIIQACRGTDLDCGIETDSGFDEDMTCQKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYAHKLELMRILTRVNWKVATEFESYSPDSTFHAKKQIPCIVSMLTKELYFNQ	94142	52564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_52796_52889_53672_55308_55430_55942_56119_56431_56561_66613_66739_68816_68885_93959
901827	contig_1435_pilon	-	8369	1	Intergenic	novelGene_115492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	922	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATTAACAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503233	494864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_494900_503200
901828	contig_6745_pilon	-	4139	9	Intergenic	novelGene_170739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_8	324.831783389495	406	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	713	1033	15890	4613	FALSE	35	GATGACAAAGATACCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAVELSRQSSSDRSLERSCSPNLSREVLCETFRSLRNLVGQLNLRDDVVKITIDWNKLQSLSAFQPALLLSALEQHVLYLQPFLAKLRPLIKEENTTAVEEIGKTETGNENQVNAKFPVGNLQEEEKHKDCDLGDVKKIQIRFDPEVVQIKAGKAEIDRRISAFIERKQAEINENNVREFCNVIDCNQENSCARTDAVFTPYPGFKSHVKVSRVVNTYGPQTRPEGVQGSGHNPNSMLRDCGNQAVEERLQNIEAHLRLQTGGPVPRDIYQRIKKLEDKILELEGISPEYFQAVNFSGKRRKVQPPQQNYSLAELDEKISALKQALLRKSREAESMATHHLP	27416	1506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6745_pilon_-_4721_6220_6260_12030_12129_15814_15968_16374_16441_21044_21142_21229_21455_23419_23540_27289
901829	contig_17769_pilon	+	2349	9	Intergenic	novelGene_124271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_5	107.145636868703	14	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1748	2269	115427	116765	FALSE	25	TATAGCATGTCTGATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	110387	116845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_114508_114697_114814_115333_115535_116111_116307_116546
901830	contig_10569_pilon	-	2436	2	Intergenic	novelGene_44051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1172	2221	2469	1420	FALSE	55	ATAAAGATAAGGGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTLDNSPVEENTLEVPDRELKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQKLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	3735	1204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_2708_2802
901831	contig_10937_pilon	-	5481	2	Intergenic	novelGene_67322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	0	56	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	155	571	125114	117282	FALSE	30	AATCCCAGCAAGATTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEPGIVSPFKRVFLKGEKSRDKKAHEKVTERRPLHTVVLSLPDRVEPDILLNDYIEKEVKVSCHRQQEVTAKLKKKGNAFYPPGALKFMQHFHVNTFVDSPTCRLAYGNRSNTWKKQNSDPCLLVPFIIAYHVLFS	125268	112371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_117687_125102
901832	contig_14158_pilon	-	2259	8	Intergenic	novelGene_136128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_3	118.528391501095	327	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	19	756	54234	31016	FALSE	65	AAAAGAAATAAGGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLDEVMKKYGSLVPLSEKDVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYGELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQGIHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRVRKRIYKELCECRLMD	54252	29512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_31127_31921_31973_33428_33513_38101_38240_51327_51406_53538_53587_53862_54002_54145
901833	contig_6102_pilon	+	1186	5	Intergenic	novelGene_31940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	629.080032666751	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	332	394	394006	394068	TRUE	20	CAAACCAGCTGTGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSSAPELRQRLTHGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVRGLEWAGKR	393383	395257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393428_393560_393640_393723_393856_393929_394071_394467
901834	contig_11825_pilon	+	2019	15	Intergenic	novelGene_155390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	379.484538955308	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1161	857	2017	30413	65127	FALSE	70	GGAAAAAAAAATACAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQLDSINGTLPSYQKIQEEEPQKKLPVTFEDKWKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQRNREQEEIVRLNSKKKSLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLRKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLICLVPEKQLLNERIKNMQLDNTPDSGISLLHKKSLEKEELCQRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRESYNTQQLALEQLHKIKCDKLKEMERKRSEMIQKKKLDDDAARKAKQGKENLWRESLRKEEEEKQKQL	10455	65129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_10550_17654_17719_18535_18700_20048_20256_20396_20494_21350_21515_30346_30493_30928_31015_31713_31977_33054_33205_34376_34518_35530_35619_46093_46234_57030_57168_65051
901835	contig_9373_pilon	+	4149	5	Intergenic	novelGene_162712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAATAACATAATTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161581	172564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_164910_166746_166946_167449_167568_168151_168475_172383
901836	contig_4105_pilon	-	2060	14	Intergenic	novelGene_21501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	753.913175984527	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	608	1591	109032	100151	FALSE	25	GGTTAAACAGTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAARERETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	121873	99681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104237_105870_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847
901837	contig_2646_pilon	-	2836	18	Intergenic	novelGene_69551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_2	79.7850052254403	14	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	95	1816	877063	847898	TRUE	30	AAGCTATTTTTCCTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGSKSPDGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCSRRPGGRRHGRGNPEGPLTWKPREQAITEMISEEGGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRRLLERLKEGGHGNPAPPAASNPHSSQRSQMDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQDSGAAP	877157	846460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847437_847853_847919_852063_852160_853820_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863816_863997_864102_865297_865467_867268_867360_869457_869525_869942_870077_874678_874735_876962
901838	contig_5502_pilon	-	1584	6	Intergenic	novelGene_154978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCGCTGTCCAGGACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399286	362779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_362870_363179_363342_377697_377826_381989_382117_395613_395840_398435
901839	contig_14868_pilon	+	1742	12	Intergenic	novelGene_150454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	85.6422503284583	272	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	250	1740	186170	252478	FALSE	45	TGACAAAAGATGACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRALSISRLEPLSLRTTTPDVHHKDQWVARAPTSSALVSRIPSDSSCRKLASAPQVLGLLFSEGSPLDKSARNSYLWAPGPCMAKSPGNSTLEEILGQYQRSLRERANRSIHQLKCALREGDVTVGEDALDPSFSTSAGNEDTGAAWHELQHSHAVNQLRALLHQQAAKESEISPLRRRKTSPLSSSADEENNVPTLHNLVPIINDQSQYIHHLEAEVKFCKEELSGMKNRIQVVVLENDRLQQELKSQRGEETMKEQTLLDTCGNMQNSSITTGEDSGVDEAAKRPLSHGNTDLIKAASAAEAEKWKLELEQLKFTYKDKSEILESQLKFLRKDLAEYQKKCEDLQERLKHKESLLTANISNRVGGLCLKCAQHEAVLSQTHNNVHVQTIERLTKERDDLMSALVSIRSSLTDVQQREASAYEQVKQAVQMTEEANFEKTKALIQCEQLKNELKRQSERLEKELASQQEKRAFEKEVMKKERTKEREDMEAKMMILSQNIAQLEAQVEKVTREKISAINQLEEVQNQLASREMDVTKVCGEMRYQLNKTKMEKDEAEKEHREYRTKTKRELEIKDQVR	185920	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_186237_202442_202596_203297_203384_206553_206668_209000_209127_214769_214911_218411_218477_221695_221885_230102_230242_239753_239907_248549_248685_252355
901840	contig_12528_pilon	-	4243	5	Intergenic	novelGene_81312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	577	junction_4	74.7228211458855	905	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3134	3637	947253	933323	FALSE	15	TCGGTGCCTATGACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHTYRNKHIHTHTLICTRIHTVTHTDRSLAFPGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	950386	932716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964
901841	contig_10857_pilon	+	2706	8	Intergenic	novelGene_160910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	218.553313908548	544	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	27	776	450654	469527	FALSE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWSRVRIAKCQMLLTGFFVLGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSFCDQQRSSEVLAL	450627	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_457543_457619_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484
901842	contig_776_pilon	-	2042	7	Intergenic	novelGene_139930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	113.433779017638	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	123	608	911734	833183	FALSE	45	AATTTAATTTCTAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSGGLATTLQTECILEQTYGQWWQTLHRTMLRGVLGKTFRLIGYTIQYGCIVHCTFEYVGGVVMCSGPSMEPTIQNSDIVFAENLSRHFYGIQRGDVVIAKSPSDPKSNICKRVIGLEGDKILSSSSSDFFKSHSYVPMGHVWLEGDNLQNSTDSRFGL	932096	831748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_833196_834739_834799_857382_857510_861796_861886_863749_863884_911670_911784_932023
901843	contig_3277_pilon	+	1923	2	Intergenic	novelGene_74733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCCAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221137	227088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_222589_226616
901844	contig_3584_pilon	-	3994	26	Intergenic	novelGene_108194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	646	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	785	1159	559613	558696	TRUE	25	CAAAATACCTTGCGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVAGHPCPDIHILPNSLELGCLMEIGSTDTLPDNVPVGATRSQAHALLHHDVLELSPHLPDLPHGFGMDEMIITPNSGVIIILPLQVDIQVGQMVTLRDSKLLPDLITLLLPSHLGPVEDGRD	562770	542223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_542346_544575_544921_545965_546154_547082_547188_547729_547878_548037_548157_548318_548397_548845_549001_549587_549748_549876_549987_552775_552888_554441_554581_554966_555154_555302_555489_555878_556025_556400_556509_556600_556718_556934_557021_558369_558467_558568_558732_558984_559136_559229_559365_559560_559687_560166_560263_561491_561614_562277
901845	contig_2444_pilon	-	5423	2	Intergenic	novelGene_83797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4727	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAATGGTGAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282271	276423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_277387_277811
901846	contig_18919_pilon	-	4978	2	Intergenic	novelGene_156039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	554	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAACACACTGGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167472	155672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_-_160318_167139
901847	contig_7272_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_25331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACAATGTCGTAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575513	573804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_573800_575500
901848	contig_17144_pilon	-	1013	5	Intergenic	novelGene_29517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1597.62433006011	60	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	245	733	167257	166363	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183189	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_179700_179786_181794_181850_183158
901849	contig_10861_pilon	+	4547	5	Intergenic	novelGene_39207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1308	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1308	1724	416270	416686	TRUE	50	AATAAATTGATTAATCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASTSSQNKESRNLTDEENFLELLEVEVKRLIYRTLQDIRKEIIQNSEQAKEHTDKAIEEFKKVIQDHNDKFNRQQESIERQQTEIQRINNKISELDNSIESHRRIEAMEDRISETEDKALDANLFEEKLDKRFFKK	414962	754187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_417783_518110_518429_521764_522167_599617_599791_753353
901850	contig_4783_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_108347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCTCAGCAATGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58321	56568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_56600_58300
901851	contig_1535_pilon	-	2037	6	Intergenic	novelGene_127250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	380.900721973587	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGCTTTGCTGGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136101	127064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129782_129831_132498_132753_135888
901852	contig_4803_pilon	-	4092	26	Intergenic	novelGene_150710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	485.385019958383	5	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	1987	3465	47200	15989	TRUE	20	GTAAGCACCGAGCCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPPMSEDLLLEALSEDFSGPRPADTSSLKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	93202	14410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47392_50092_51434_55797_55882_57974_58089_58514_58572_59981_60024_66818_66879_93105
901853	contig_9505_pilon	+	3209	13	Intergenic	novelGene_121870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	154.728503263692	3	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	162	1058	652560	675915	FALSE	40	AAATTAAATTTTTAGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECNTDKDQSPKDVFDELFKLAPEKVSAVKQAIVTFVNQKLDRLGLSVQSLDTQFADGVILLLLIGQLGGFFLHLKEFYLTPSSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLNYPINPEGTS	650632	678066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017_659074_663426_663450_666184_666244_666444_666514_669223_669326_675220_675294_675904
901854	contig_13481_pilon	+	1628	4	Intergenic	novelGene_119445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	122.518025884629	40	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	414	803	1091943	1093268	FALSE	35	AAATTTATGTACAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066915	1094093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071054_1071222_1091839_1092052_1092987
901855	contig_9653_pilon	-	4005	15	Intergenic	novelGene_48271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1083.32325060719	13	119	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	717	2111	1018271	1006903	FALSE	15	TGGATTTGATGTGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1075359	1005008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021044_1025286_1025426_1039825_1040050_1075283
901856	contig_10973_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_150378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	854	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1038	1550	2730	2218	NA	45	AGACGACCCACCAACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3767	1537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3800
901857	contig_7342_pilon	-	4317	3	Intergenic	novelGene_71179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	348	junction_1	84.5	308	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCAATGTCCCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483083	477802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_481479_482357_482474_482558
901858	contig_6361_pilon	-	5938	11	Intergenic	novelGene_23903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4796.70876747797	81	113	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	25	GATGTCATGGATTGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	143875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_144433_254253_255619_267872_268214_280072_280282_283223_283385_380077_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
901859	contig_2161_pilon	+	1847	6	Intergenic	novelGene_114927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	13.0537350976646	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1162	1527	839930	859116	FALSE	40	TTCCCAAAATATCAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHFVIAGAVTGSLFRINLGLRGLVAGGIIGALLGTPVGSLLMILQKYCGESVQERKQKDRQALHAMKLDEWKARLQMTELLPEEIESSLQKNRSEDDAKKIEALLNLPRNPSSTDKQDKD	833872	859436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_834902_839290_839380_839886_839955_847906_847986_850901_851013_858965
901860	contig_16724_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_105278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415456	416180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_415500_416200
901861	contig_9233_pilon	-	2440	2	Intergenic	novelGene_78255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAGCTGCCGGGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679052	676377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_676714_676948
901862	contig_7158_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_163732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTCCCCTCCGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154587	1156314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1154600_1156300
901863	contig_16999_pilon	+	2332	9	Intergenic	novelGene_84997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	108.78641631656	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1646	2020	183925	189898	FALSE	0	TTGGTTTTTTTTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQRKAQPAQPSDEPAEKADEPMEH	172975	190210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_173128_174439_174485_174760_174863_175244_175349_182566_183806_183921_184052_185263_185344_188357_188469_189841
901864	contig_14840_pilon	+	2435	8	Intergenic	novelGene_66232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10784	22957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_+_11297_12866_12934_13215_13341_13763_13863_15810_15877_18220_18384_19224_19609_21938
901865	contig_16846_pilon	+	2706	2	Intergenic	novelGene_82919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476826	479990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_477182_477639
901866	contig_7956_pilon	+	4503	2	Intergenic	novelGene_176872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1226	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1234	1752	58462	58980	TRUE	20	AATTCCCTCATCTTGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGISEQGEKTKNTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLSKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLGETIQARRQWDDIYKILREKNFQPRIIYPAKLSFRFDVEIRSFPDKQKLREYVEVKPNLQELLKGVL	57228	64429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7956_pilon_+_59729_62426
901868	contig_7909_pilon	+	1812	2	Intergenic	novelGene_155896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTTGGTGTGCTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394699	396625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_395926_396039
901869	contig_8866_pilon	-	2300	9	Intergenic	novelGene_77852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	192.675731476489	205	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	228	1358	686785	657073	FALSE	25	CTTGGTGCAGAAGCTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSAKPSQPPTPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLDEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSALSSPSALNSPGLGIEGLNRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVNPVLPLTSAAVTNLSVTGTTDTPSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPPRDQPGDGDIRVANSYPPRSCTVASKCQSCCHGCCCRTKPRPDGTLSVCSWRCLTQSQPRDPGRCSQPSSDEQQYTGNYSSSCFWWLSSNNVTGCNWEPGICQCRRSPQHRDCPSVPEPSEPLSAHQQPS	695620	656130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_657224_660814_660904_661651_661987_676950_677057_684092_684273_685274_685421_686661_686804_690845_691020_695585
901870	contig_1009_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_121729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137271	134624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_134600_137300
901871	contig_15666_pilon	-	1353	5	Intergenic	novelGene_70177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	713.692992469451	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	260	691	108757	107816	FALSE	25	GAAAGTGATGTTGCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110741	107153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108778_110189_110246_110558
901872	contig_14005_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_154723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	908	1255	1683	2030	NA	40	ATCCCAAATGATGCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPHTFSSGRVGWMDEVMSLFVSFEYSSEWIELEAPEISRFSGLTGVSGGRILTFHRGDPGSIPGRCTSCVVTTVCRWRLVCCCDAEQVSVALSRLRQTRKKCLCSIVHGVTMS	775	2583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_+_800_2600
901873	contig_12958_pilon	+	1694	3	Intergenic	novelGene_136195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTGGTGATACCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50394	61919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_+_51113_52404_52685_61223
901874	contig_5023_pilon	+	2901	14	Intergenic	novelGene_7288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2023.4196287678	82	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	67	1578	607279	646990	FALSE	20	GTAGATGTTTCCTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580862	648313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611777_618605_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
901876	contig_6513_pilon	+	3924	9	Intergenic	novelGene_117746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	384.56385604344	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	2128	3924	159747	171458	FALSE	65	ACTGATAAAATAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNAASFPLRSPQPVCSPAGSDGTPKGSRPPLILQSQPLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKDQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRIRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSIATKQPQTSVVQNQQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGEGRPETPKQKSEGRPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSK	48593	171458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_48855_136290_136434_148509_148676_151555_151684_152058_152159_152690_152843_158569_159826_163882_164510_170367
901877	contig_11656_pilon	+	2449	1	Intergenic	novelGene_53950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATACTGTAACCATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122019	124468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_122000_124500
901878	contig_9439_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_176914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGAATGTCTGCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172378	169957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_170000_172400
901879	contig_11160_pilon	+	1984	3	Intergenic	novelGene_168812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	72	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	298	1230	318478	320379	FALSE	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLKEPSGGGGTALLNKENKFRDRSFSENGERSQHLLHLQQQQQQKGSGGGSQINSTRYKTELCRPFEESGTCKYGEKCQFAHGFHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNADERRPAPSGGRLRGPAQLQPARCAAPGLRKAWRPPRSPRRRLAHPSLPAPPRRPRLLSAFNCRAACRSPRCSTRPLAPRTRCRTATAT	318180	321133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319737_320198
901880	contig_4232_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_63401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATAAGCTAGGACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
901881	contig_9468_pilon	-	2728	6	Intergenic	novelGene_59507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	68	junction_1	161.919239128647	145	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	491	811	361919	357007	FALSE	20	GAGCCTGTTTCATTTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCDVCSLSNRMSKSFDTVIMNPPFGTKNNKGTDMTFLKTALEMARTAVYSLHKSSTREHIQKKAAEWKIKMEIIAELRYDLPASYKFHKKKSVDIEVDLIRFSF	369774	355089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_357046_357467_357518_359009_359062_360992_361076_361822_362005_369369
901882	contig_8177_pilon	-	4990	11	Intergenic	novelGene_86498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	183.51773756234	717	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	1253	3766	56173	39318	TRUE	40	AGAGAGAAAGTGGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIKLELLFDPDEENAEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKIMLDWASGKIYKDKFDYLFYIHCREVSLMTKRSLGDLIISCCPDPNPPISKIVKKPSKILFLMDGFDELQGAFDENTGALCTDWQKADRGDILLSSLIRKRLLPEASLLITTRPVALEKLQHLLHHPRHVEILGFSEARRKEYFFKYFSDEHQAREAFRLIQENEILFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMDSGKSLAQTSKTTTAVYIFFLSSLLQTRGGTQEHHFSASLRGLCSLAADGIWNQKILFEEYDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKYYSFIHLTFQEFFAAMYYLLEEEEERETRSMSCSYSKPPNRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERSSYLEKKLSCKISQQIRQELLKWIEAKAKAKKLQTQPSQLELFYCLYEMQEDDFVQRAMDHFPKIEINLSIRMDYVVSSFCIQNCCCVESLSLGFLNNLPKEEEEEEEEGRRLHAVNCVSPCSHAACSYSLVNCYLIPSICRGLFSVLSTNTRLTELDLSDNTLGDPGMKVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLTRHCCLDISSVLSSNQKLVELDLSDNALGDSGVRHLCVGLRHLFCNLRKLWLVSCCLTSDCCQDLASVLTTNQSLTRLYMGENALGDAGVGILCEKAKHPQCKLQKLGLVNSGLTSVCCPALSLALSTNQNLTHLYLRGNALADKGIKMLCEGLMNPNCKLQMLELDNCNLTSHCCWDLSTLLTSNQSLRELSLGNNDLGDLGVVLLCEVLKQQNCFLNTLRLCEMYFNYETKCALETLQEEKPELTIVFEPSW	64069	37967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_38110_38235_39418_40643_40815_41311_41483_45742_45914_46558_46730_50693_50865_54614_56998_59940_60262_60804_60867_64024
901883	contig_17976_pilon	-	1984	4	Intergenic	novelGene_32487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTCCTCCCCTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48866	41620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_46874_47609
901884	contig_12967_pilon	+	5743	19	Intergenic	novelGene_169801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_14	88.4667231851113	359	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	89	2353	199421	226703	FALSE	45	TTCAATAAAGAGTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLTLFVGRLPPSARSEQLEELFSQVGPVKQCFVVTEKGSKACRGFGYVTFSMLEDVQRALKEITTFEGCKINVTVAKRKLKHKSKEKGKNENLESPKKVLKPKKAKMADKKARLIIRNLSFKCSEDDLRTVFAQFGAVLEVNIPRKPDGKMRGFAFVQFKNLLEAGKALKGMNMKEIKGRTVAVDWAVAKDKYKDTQSASVSGEGKNPEPKQQGSGKENGQEKEDDDDDDDEEDDAEEDEEDEEEDEGESKMTKPVQIQKRAVKRVAAAESSEEDHSNEDSDLEQRDGIDDGEELAQSDMDTEEREDEDAQISKKKKRKLPSDVNEGKTVFIRNLSFDSEEEDLGELLQQFGDLRYVRIVLHPDTEHSKGCAFAQFLTQEAAQKCLAAASPETEGGGLKLDGRQLRVDLAVTRDEAAKLQTKKVKKPTGTRNLYLAREGLIRAGTKAAEGVSAADMAKRERFELLKHQKLKDQNIFVSQTRLCLHNLPKAVDDKQLRKLLLSATRGEKGVRIKECRVMRDLKGAHGKGKGQSLGYAFAEFQAHEHALTALRYINNNPDVFGPQKRPIVEFSLEDRRKLKMKELRIQRSLQKVRSKSANREPQGEQPKPGKDQQQKPAQNHTHGQSKASLEPKGKTGSTSWMGFLTKAEVEQVELPDGKKRRKVLVLPSHRGPKIRLRDKGKAKPLPPSKPKPQINQRKQEKQLLSSKQAPKKKAKGNKTEIRFNQLVEQYKQKLLGPSKGAPLAKRSKWFDS	199332	230093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_199539_203665_203825_204148_204244_204685_204762_205336_205430_206211_206284_207096_207272_207449_207593_208984_209058_211660_211771_215058_215133_216536_216673_217583_217649_220107_220267_222096_222247_222560_222636_223766_224024_224607_224708_226568
901885	SIRV4	-	782	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	157	36	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGTTAACGAACCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2771	1626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1894_2256
901886	contig_6199_pilon	+	1842	21	Intergenic	novelGene_126400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	197.881094347085	413	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	442	1299	583471	592948	TRUE	15	TCCCCTCTGCTGAGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCLFMRFYTDCCFQAISKYHCPVLFTVFTNNTHIVAIKTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559454	603925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559590_564006_564057_565838_565885_568957_569021_570040_570093_574879_574932_583427_583523_585652_585745_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754
901887	SIRV6	+	772	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-16	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	24	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1637_1736_1847_2029_2477_2621_2740_2829_3106_3165_10724
901888	contig_5551_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_134247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGGAATGAGTTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481385	479963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_480000_481400
901889	contig_7396_pilon	-	2394	16	Intergenic	novelGene_79586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3482.49151167507	15	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	420	1658	254680	246442	FALSE	30	TTATAATAAGCCTGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257459	245705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257142_257294_257381
901890	contig_18967_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_165327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	35	310	108372	108647	NA	55	AACTTTTCAAAAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFLECDNGVVIMQILHCRKMSLFSKDTCQNIFSEVSSYFQLTFKSLCIRSPWVVQTVKCPTTNPPRGTLEERPGNLLPKRHSLENPMEHLVPKLIRGHLVAK	108337	109863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_108300_109900
901891	contig_15182_pilon	+	3189	7	Intergenic	novelGene_136434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTTCCAAATCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246380	367722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_248851_306829_306998_309312_309492_329678_329734_332398_332525_359304_359433_367659
901892	contig_563_pilon	-	3731	1	Intergenic	novelGene_169769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	565	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCCTCTGTGGGTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709882	706151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_706200_709900
901893	contig_11357_pilon	+	4221	5	Intergenic	novelGene_178775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1512	1910	334670	335068	TRUE	40	CACTGCAAATATACCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKKNKKGPQRNRKKKKKRHQRKKKCPRGSLCMSVQAEGESPCHAAQPGQKGLPTQEKKKKTNKQFKMNKSPVIPPPRQPKPGSSSTLEQSSTAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRW	333096	540942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11357_pilon_+_334217_334278_335654_437357_438384_534173_534704_540772
901894	contig_9839_pilon	+	3187	7	Intergenic	novelGene_88598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_5	151.416001649613	481	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	276	1031	538788	549059	FALSE	15	CCATTGTTTGTCTGATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENSLEQLCYVAAFTVSSYSTTVFRTSKPFNSLLGETFELDRSEENGYRSLCEQVSHHPPAAAHHAESKNGWTLRQEIKITSKFRGKYLSIMPLGTIHCIFHATGHHYTWKKVTTTVHNIIVGKLWIDQSGEIDIVNHKTGDKCNLKFVPYSYFSRDVARKVTGEVADPSGRVHFALLGTWDEKMECFKVQLASGDNGGDARQRGHEAEESRVMLWKRNPLPKNAENMYYFSELALTLNAWEGGTAPTDSRLRPDQRLMENGRWDEANAEKQRLEEKQRLARRKREAEAMKATEDGTPYDPYKALWFEQKKDPVTKELTHIYRGGYWECKEKQDWSTCPDIF	538244	551215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_538409_538676_538798_544665_544770_546481_546578_547653_547836_548602_548824_548916
901895	contig_4742_pilon	+	1819	2	Intergenic	novelGene_131005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1725	93	1817	247260	254527	FALSE	55	AAAACACACACCAACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSSRHIGHIEVVPEESVSSSHSSVSSCLEMKDEAELDSKHKCNNQGEANVPSHELSCPLLSETCVSIEEKKNDILMECKIKTVSSPLFKFSGKEEHEQNDSISDKMDRIIVEEMRAKGKTEQESKGTVKLSSEGDQIVEEIGSAAALSGDTACTNPNKTEKNLEGLSTSVGEATECNLELKNAVEVADKSKNSILGNKIEPLGYCKDAESNDQQLQSTEFNKPNLEIIDTAAFEPESNILESAICDAPDQNAKEHVESIKTEPHDTANLQDDRNSQSSSVSCSETKNMKSKHTKPTVHSKQNMTTDTPKKIVGAKHEVMHNKNKVNVKSVKRNANESESQQNFHRPVKVRKKQVDKDLKIQSSNSGVKSVKSQAHLVFKKTSQDQNLVQTSKSLTHSLSDKTHGHPACSKEPHHPSQAGYLLHSSQKQCHKPQQQAPTMKTNSHVKEELEHAGVEHFKEEDKLKLKKPEKNLQPRQRRSSKSFSLDEPPLFIPDNIATVKREGSDHGSLFENKYVWTPSKQCGFCKKPHGNRWRCDDWFHGDCVGLSLSQAQQMGEEDKEYVCVKCCAEEDKKTEILDPDILENQAKVEIHSEDKTMECEKLGL	247167	254529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_248770_254312
901896	contig_7078_pilon	+	5329	9	Intergenic	novelGene_130113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	91.6501500271549	638	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1091	3276	121	3396	182358	249554	FALSE	15	CCTGCTGTCATTCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNSILWKKKVSQMQQTVKVVCQKDDLPADQTVLPGSSDREGNAQSCWEDDGKERQEILGPEAQADEARCTVKDDECDSDAENEQNRDPNVEEFLQQQDTAVIYPEAPEEDQRQGTPEAGGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLMPVNGRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFSGGGPLQATSSPQGVVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQASLASKEQETISASSIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENLVPTNGCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVDDSTCLLCDGRPGDPNALPELKHHDLKQPARPPQLPAAEAEKPESSVSSGTGDGSLSPSQPPLKNLLSLLKAYYALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSELSSPEPGQVNIPAENSDQPPSTNADEPQDSTINPQSPLKMSKSPVLPVGSTVSGSRGRTPSPSPLNLSSSRNAQGYVYTADSAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSSITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTTVSPAVQEPPLKGIQPSGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTENGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEGRDGAEPEEAGPEGLPSERAAARASPSQADSDERESLTREEDEDSEKEEDEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEAANEGEGAEPEGPVKDDGAVHQASRVEHKVNANSEQVSEEKTNEA	29759	251487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_182312_182515_219236_219297_227970_228133_231995_232199_236108_236215_242646_244458_246397_246579_248958
901897	contig_2027_pilon	+	4427	2	Intergenic	novelGene_39929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_1	0	517	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTTAGGGTTCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169641	174155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_170054_170140
901898	contig_14945_pilon	-	5209	16	Intergenic	novelGene_178651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.737917114543	1022	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	369	1787	45302	17288	TRUE	20	GATTCTATTTTTTTAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDMIIEKKIKKEAVLEEGTIAFKNWVKTGTEVYRQFWIFDVQNPEEVVVNSSNIKVKQRGPYTYRVRYLAKNNITHDPQSHTVSFLQPNAAVFEPSLSVGSENDSFTVINLAVAAAPHIYQNAFVQTILNSLIKKSKSSMFQTRTVKELLWGYKDPFLSLVPYPINTTVGVFFPYNNTADGVYKVFNGKDDISKVAIIDTYKGKKNLSYWPGYCDMINGTDAASFPPFVEKTRVLQFFSSDICRSVYAVFGSEINLKGIPVYRFVLPPKAFASPLQNPDNQCFCTETIVSKNCTSYGVLDIGKCKEGKPVYISLPHFLYASSDVMEPIEGLHPNEEEHRTYLDVEPTTGFTLQFAKRLQVNLLVKPARKIEALKGLKKNYIVPVLWLNETGTIGDEKAEKFRKQVTGKMRLLGLVEMVLLSVGVVMFVAFMISYCACRSKEVK	52419	11732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14945_pilon_-_12262_12314_15208_17287_17453_19060_19116_19860_19935_20276_20396_21362_21551_22695_22766_25622_25670_30038_30131_31394_31575_32034_32183_36257_36419_45182_45392_45899_45986_52226
901899	contig_15327_pilon	+	5142	1	Intergenic	novelGene_70559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	606	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCTAAATGGCAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576641	581783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_576600_581800
901900	contig_10068_pilon	-	2522	7	Intergenic	novelGene_148705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	117.056966188832	5	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	94	696	59848	47711	TRUE	80	AGAAACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEGSGRGGEFGMSSVSCGNGKLRQWLIDQIDSGKYPGLVWENEEKSIFRIPWKHAGKQDYNREEDAALFKAWALFKGKFREGIDKPDPPTWKTRLRCALNKSNDFEELVERSQLDISDPYKVYRIVPEGAKKGAKQLTLEDPQMAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPPSQGSR	61146	43047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47732_56407_56498_57186_57276_58180_58368_59632_59887_61091
901901	contig_14666_pilon	+	1660	5	Intergenic	novelGene_39583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	86	1369	477340	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484812_484883
901902	contig_10627_pilon	-	2645	4	Intergenic	novelGene_59973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAAGATATGATATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239525	232775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_232906_234196_235665_235982_236481_238976
901903	contig_5967_pilon	-	2152	11	Intergenic	novelGene_44337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_1	408.891966171995	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	109	1254	488569	388566	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAACCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517610	379696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_380550_388520_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
901904	contig_7887_pilon	+	5110	3	Intergenic	novelGene_124842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_2	34.5	342	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1669	5007	103	5109	20087	84152	FALSE	35	CCCAGCGACCATCAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRNTAMLGLGSDSEGFSRKSPSAISTGTLVSKREVELENNTEEEEDLRKWNRERNLEAGKDDGLTDAQQQFSVKETNFSEGNLKLKIGLQAKRTKKPPKNLENYVCRPAIKTTIKHPRKALKSGKMTDEKNEHCASKRDPSKLYKKAGDVAAIQCQSEESIHLHSQGENNPLSKKLSPVHSEMADYINATPSTLVGGRDPDLKDRALLNGGTSVTEKLAQLIATCPPSKSSKTKPKKLGTGTTAGLVSKDLIRKAGIGSVAGIIHKDLIKKPAISTAVGLVTKDPGKKPVFNATVGLVSKDSVKKLGSGTTAVFINKDLGKKTGTITTVGLVSKDSGKKLGIGIVPGLVNKESGKKLGLGTVVGLVNKDLGKKLGSAVGLVAKDCAKKIVASSTMGLVNKDIGKKLVTCPMAGLVSKEAINLKAEALLPTQEPLKASCSTNISSHENQELSESLKDNATSKTFEKNVIRQSKESILEKFSVRKEIINLEKEVFNEGTCIQQDSFSSSERGSYEISKHEKQPPVYCTSPDFHMGGASDASTAKSPFSAVGESNLPSPSPTVSVNPLSRNPPETSSQLANPLLLSPTTELMEEISGCVGKNQFTSESAHLNIGHRSVGHSMNIDCKGIDKELSDSKTTHIDIPRISSSLGKKPSLTSESSIHTITPSVVNFTSLFSNKPFLKLGAVTASDKHCQVAESLSTNLQSKPLKKRKGRKPRWTKVVARSTCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSNSEPAKFMKNIGASSFVDHDFLKRRLPKLSKSTAPSLALLTDSEKPSHKSFATHKLSSSMRVSSDLLSDIYKPKRGRPKSKEMPQLEGPPKRTLKIPASKVFSLQSKEEQEPPILQPEIEIPSFKQSLSVSPFPKKRGRPKRQMRSPVKMKPPVLSVAPFVATESPSKLESESDNHRSSSDFFESEDQLQDPDDLEDSHRPGLCSMSDLEMEPDKKITKRNNGQLMKTIIRKINKMKTLKRKKLLNQILSSSVESSNKGKVQSKLHNTVSSLAATFGSKLGQQINVSKKGTIYIGKRRGRKPKTVLNGILSGSPTSLAVLEQTAQQATGSALGQILPPLLPSAAGSSELLPSPICSQSSGTSGGQSPVSSDAGFIEPSSVPYLHLHSRQGSMIQTLAMKKASKGRRRLSPPTLLPNSPSHLSELTSLKEATPSPISESHSDETIPSDSGIGTDNNSTSDRAEKFCGQKKRRHSFEHVSLIPPETATVLSSLKEKHKHKCKRRSHDYLSYDKMKRQKRKRKKKYPQLRNRQDPDFLAELEELISRLSEIRITHRSHHFIPRDLLPTIFRINFNSFYTHPSFPLDPLHYIRKPDLKKKRGRPPKMREAMAEMPFMHSLSFPLSSTGFYPSYGMPYSPSPLTAAPIGLGYYGRYPPTLYPPPPSPSFTTPLPPPSYMHAGHLLLNPTKYHKKKHKLLRQEAFLTTSRTPLLSMSTYPSVPPEMAYGWMVEHKHRHRHKHREHRSSEQPQVSMDTGSSRSVLESLKRYRFGKDTVGERYKHKEKHRCHMSCPHLSPSKSLINREEPWVHREPSESSSLALGLQTPLQIDCSESSPSLSLGGFTPNSEPAGSDEHTNLFTSAIGNCRVSNPNSSGRKKLTDSPGLFSAQDTSLNRPHRKEPLPSNERAVQTLTGSQPTPEKP	19984	84153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_20507_62747_67309_84126
901905	contig_13283_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_154018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGAACGGTTGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58262	55866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_55900_58300
901906	contig_9871_pilon	+	2269	7	Intergenic	novelGene_75697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	54.389541478323	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1105	1506	562018	562419	FALSE	65	AAAAAAAAAAAGAGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGAPGCSPIPAAPPPLSSPLSPPPGFIHQSSSCAVVHSCTGQCLPQLLSSCRRHWRVCRPGLGAYGLLAPGGYTWSESGLTNRAAAAMLPGTCTPSPHPVPRSSQSPSLAAGTAPAQPTATHLARRPPVSS	552186	563182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_552296_552830_552940_555670_555839_556798_556924_557753_557870_560958_561088_561669
901907	contig_3161_pilon	+	2088	3	Intergenic	novelGene_84500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCCTATAGGGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320893	407489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_320901_386068_386169_405508
901908	contig_17796_pilon	+	6981	2	Intergenic	novelGene_33775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	728	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2026	2328	22093	22395	TRUE	55	TGCAACAATAAAGAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTMFKESKKHTEIKLVEIRKQMKEQNERLNKEIENLKQNQRELLKLKNKATQLEKAKETLNNRVEQTADRLHEVENKITEFISSQEKQEKRPKKSKQT	20067	85876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_25949_84776
901909	contig_7549_pilon	+	1671	4	Intergenic	novelGene_164526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	92.782900723499	198	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	130	996	692328	702012	TRUE	30	GCCAAGGAAACCCTATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLENDGAPSESIFDLDYASWKIRLTLGIAGFFFYLGVFVVCHQLSSSLTGTYRALAAKEKVFWNLAATRAVFGVQSTVAGLWALLVDPVLHADKAVNQQNWCWFNVATATGFFFFENVAVHLSNLFFRTFDLFLAVHHLFAFLGFLGSAINLKAGHYLAMTTLLLEMSTPFTCVSWMLLKAGWSDSLFWKLNQWLMIHMFHCRMILTYHMWWVCFWHWDGLINSLYLPHFILFLVGLALLTLIINPYWTHKKTQQLLNPVDWNFAQPEAKSCQPERTNGQIPQKKKQ	692198	765651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_+_692871_701688_702110_764176_764352_765248
901910	contig_13592_pilon	+	2130	6	Intergenic	novelGene_33698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	767	junction_3	226.76454749365	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	517	1086	256608	259489	FALSE	70	AGAAAAAATAAAATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKVRRILYKQNYTP	249301	260533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276
901911	contig_5958_pilon	+	5092	8	Intergenic	novelGene_140086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	51.5985286928349	580	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	199	624	154917	182843	FALSE	65	TAGAAAACAAAAATTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFKRHLNDDDVTGSVKSERRNLLEDDSDEEEDFFLRGPSGPRFGPRNDKIKHVQNQVDEVIDVMQENITKVIERGERLDELQDKSESLSDNATAFSNRSKQLRRQMWWRGCKVKAIMALVAVILLLVIIILIVVKYHA	151787	187311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_151932_154862_154983_160822_160870_167909_167961_176696_176798_177740_177821_181665_181718_182814
901912	contig_3612_pilon	-	2339	2	Intergenic	novelGene_87827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTCAAAAAAATGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938508	935379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_935555_936344
901913	contig_12010_pilon	-	2525	6	Intergenic	novelGene_160955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAACAAAAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225851	211416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_211951_216635_216835_219001_219056_220047_220187_220430_220623_224444
901914	contig_5686_pilon	-	3358	2	Intergenic	novelGene_45462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTAGAAGACCCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225943	221458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222914_224040
901915	contig_7345_pilon	+	1764	11	Intergenic	novelGene_159192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_8	121.527322030891	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1686	79	1764	320101	350342	FALSE	35	GTAAGTTGGTTTAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIRLTSEDSDLRSALLLEQAAHCFINMKSPMVRKYAFHMILAGHRFSKAGQKKHALRCYCQAMQVYKGKGWSLAEDHINFTIGRQSYTLRQLDNAVSAFRHILINESKQSAAQQGAFLREYLYVYKNVSQLSPDGPLPQLPLPYINSSATRVFFGHDRRPADGEKQAATHVSLDQEYDSESSQQWRELEEQVVAVVNKGTIPSGFHPTQYCLNSYSDNSRFPLAVVEEPVTVEVAFRNPLKVPLLLTDLSLLWKFQPKDFSAKDNEEVKELVTGEPEMIGTEVISEFLVNSEESKVARLKLFPHHIGELHILGIVYNLGTVQGSMTVDGIGALPGCHTGKHSLSSMSVRGRQDLEIQGPRLNNTKEEKTSIKYGPDRRLDPIITEEMPLLEVFFIHFPTGLLCGEIRKAYVEFVNVSKCPLTGLKVVSKRPEFFTFGGNTAVLTPLSPSASENCSAYKTVVTDSTSVCTALTSSASSVDFGIGIGSQPEVIPVPLPDTVLLPGASVQLPMWLRGPDEEGVHEINFLFYYESVKRQPRIRHRILRHTAVICTSRSLNVRATVCRSNSLEDEEGRGGNMLVFVDVENINT	314581	350342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_314603_320043_320176_328870_329096_332776_332886_338556_338752_339369_339501_342993_343069_343571_343699_344974_345133_348296_348740_350194
901916	contig_3103_pilon	-	495	1	Intergenic	novelGene_146196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCCATCCTGCCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73206	72711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_72700_73200
901917	contig_13481_pilon	+	2188	4	Intergenic	novelGene_119318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_1	91.6854526204797	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1962	227	2188	414928	470269	FALSE	20	ACCCAGTCCAGCCCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGTCSEKDPGVLQPVPLGGRGGQYDGSAGVDTGAVEPLGSIAIEPGAALNPLGAKPEPEDGENECRPLKKVKSEKMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNSPAYSDISDAGEDGEGKVDGVKSKDPEQLVKEGAKKTLFAPQPQSKDSPYYQGFETYYSPSY	284303	470269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_284530_414927_415154_466806_466895_468621
901918	contig_11293_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_134688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	464	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1662	2006	281386	281730	NA	40	CAGTCTGAGAAAATAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQTLKLALECGAAKANGRNEVKELNGRFQRVAEEDKVKYHNEMCKDLELENQKGRTCSVFLKLKKLKKFKHRTAILKDSMGKILNNAGSIKSRYKKYTQSLYQKELVNVQTF	279724	282384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_279700_282400
901919	contig_12417_pilon	-	1274	2	Intergenic	novelGene_178776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	780	1082	2193	1891	FALSE	15	CCCAGGGATCCCACGGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQAGCVFFVVCSSVGTILFASFSNWLGSVTQIWYGRAGLAEEELLGPVVCGTYYSHQGGSVISAGQVPVGRACAAWWCDVKRMVQVGRMQRGDCYVWS	3342	1698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12417_pilon_-_2911_3280
901920	contig_4924_pilon	-	3097	1	Intergenic	novelGene_84777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2426	2770	366260	365916	NA	10	TTTTTTATTTTTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAALEVLTPLCQEIWKTATWPTDWKRSLFMPIPKKGDPTECGNYQTISLISHTSKILLKIIQKQLQQYTDRELPENQARFRRGHGTRDIIADARWILAESREYQKDVYL	368685	365588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_365600_368700
901921	contig_16098_pilon	+	3509	2	Intergenic	novelGene_46196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGAGGCGGCGGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700007	704197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_703420_704100
901922	contig_4103_pilon	+	2304	13	Intergenic	novelGene_51894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	50.9418922782506	28	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	663	1985	58124	65973	FALSE	15	GCCTGCCAGTGTCACCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53859	66292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54777_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
901923	contig_12540_pilon	-	3487	9	Intergenic	novelGene_148059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	97.0048323538575	11	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1951	2331	216375	211069	FALSE	30	TTTTAGTAAATGAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRDPDGAVLRLSQALGNLTIIQKGERDVISDGDQVLVCSQEGSRRRCGGQGDLLSGSLGVLVHWALLAGSEKTDGVNPLLVAAFGACALTRQSSSQAFQKYGRSMTTTDMIAEVGAAFRKLFET	253854	209912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_211220_213070_213192_216266_217846_217933_217985_227296_227406_239511_239601_240308_240355_244251_244403_253820
901924	contig_10475_pilon	+	3813	1	Intergenic	novelGene_148734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	341	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTATCACCCTCCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220940	224753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_220900_224800
901925	scaffold_12124_pilon	+	3116	4	Intergenic	novelGene_22083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	206.576862208719	72	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	259	609	867290	872529	FALSE	20	AGACTGGTGGAGGCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPGEEKCDFGLFVCNSVF	859932	875036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_869990_870110_872361
901926	contig_15596_pilon	-	3511	19	Intergenic	novelGene_139516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2171	2545	148592	142816	TRUE	15	CACAGTGCCCGGCGCGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSCSMLKTRLLSGLEQINRAFRKEVHFFCNVLSPPWSPLHTLAILGIISLNMNSYSTDTSMKKKYTLSSSPSVSLGFLRITSVKTKLGSFSQGIAYSVLRGLWEEWREMMGSLPKKLYDVPE	180708	33716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_33873_55184_55259_125844_126162_128201_128348_136548_136612_138344_138443_141826_141924_142800_142918_144892_145045_148471_148650_148732_148889_150028_150250_151130_151248_154926_155098_155194_155242_159167_159365_172116_172329_178771_178876_179820
901927	contig_7457_pilon	-	1288	4	Intergenic	novelGene_31702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	139	480	1176842	1174926	FALSE	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176980	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
901928	contig_6360_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_165885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAACAAAACACAAGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87288	88712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_+_87300_88700
901929	contig_6230_pilon	+	3984	5	Intergenic	novelGene_102084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	33.6191909480285	41	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	569	1339	106543	117900	FALSE	25	TATCCACCCTACTCGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRYWGEIPISSNQTNRSSFDLLPREFRLVEVHDPPLHQPSANKPRPPTMLDIPSEPCSLTIHTIQLIQHNRHLRNLIATAQAQNQQQTEGVKTEESEPLPSCPGSPPLPDDLLPLDCKNPNAPFQIRHSDPDSDFYRGKGEPVTELSWHSCRQLLYQAVATILAHAGFESANESVLETLTDVAHEYCLKFTKLLRFAADREARLGQTPFPDIMEQVFHEVGIGSVLSLQKFWQHRIKDYHSYMLQVWACGFNLPC	102888	120545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_103152_105598_105698_106336_106956_112590_112916_117867
901931	contig_6374_pilon	+	10592	1	Intergenic	novelGene_158434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	637	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAAAAGCTCTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61204	71796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_61200_71800
901932	contig_2367_pilon	-	2233	2	Intergenic	novelGene_65336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	259	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATTTCACAAGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280906	277683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_279571_280560
901933	contig_13145_pilon	+	3837	2	Intergenic	novelGene_116638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	459	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	3487	3837	119463	119813	FALSE	20	CGGCTCAGGGTCCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRVRSCSDQNLLLHTLHTFFLLSALLAVLLGESVFGFLSSSLFSEAFFSAALSPSEMPSTSSCGFSPKASPAPGSTAAEPAGASSGSGAGLAAGVGPSAPPCLPSSCSSRLWAFLW	114155	119813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_117633_119453
901934	contig_8552_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_80093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTTGGTGGCTCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528379	530318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_528400_530300
901935	contig_14744_pilon	-	2854	6	Intergenic	novelGene_65987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_4	297.542870860654	27	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	59	1294	969897	962248	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPRSQLHHHWLSCPHPSVMEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPVRPSASSWPSIPPSSRHTAWGLELETILPEEIVSYSYSRRLCSLFYSHLGPSHRVPGILTFLVQSAFLN	969955	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
901936	contig_7234_pilon	+	3602	2	Intergenic	novelGene_145966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	158	307	574633	574782	TRUE	55	TAACCAATGTCATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKKIKYLGINLTRDVKDLYNGNYKIPLQETKRDLHKWKNIPCSWTGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPTQIPMAFLNAMEKQITNFIWKRSRLRICKALLKK	574475	578295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_575426_575643
901937	contig_16703_pilon	+	2145	16	Intergenic	novelGene_72745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1273.30700496341	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	207	1949	6490	40668	FALSE	30	TTAGTAACCAAATTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIINYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	40864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29717_32924_33016_38544_38758_40600
901938	contig_13905_pilon	+	5853	12	Intergenic	novelGene_130405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_11	34.5366017364785	495	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	127	2052	34088	116231	FALSE	15	CAATTCTGGTACTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGAAGLREEKRYGLSCGRLGQDNITVLHVKLTETAIRALETYQSHKNLIPFRPSIQFQGLQGLVKIPKINPSNEVHNFNFYLSNVGKDNPQGSFDCIQQTFSSSGASQLNCLGFIHDKITVCATNDSYQMTRERMTQAEEESRNRSTKVIKPGGPYVGKRVQIRKAPQAIADAVPERKRSTPMNPANTIRKTHTSSSVSQRPYRDRVIHLLALKAYKKPELLARLQKDGVNQKDKNSLGAILQQVANLNPKDLSYTLKDYVFKELQRDWPGYNEIDRQSLESVLSRKLNPSQNAAGTSRSESLICSSKDAASSPSQKRLLDSDFIDPLLNKKARISHLTSRVPPTLNGHLNPTSEKSAGLPLPPAAAAIPTSPPLPSTHLPISNPPQTVNSNSNSPSTPEGRGTQDLPVDSFSQNGSIYEDQQDKYTSRTSLETLPPGSVLLKCPKPAEENHSTSHKKSKKKSKKHKEKDQIKKQDIETIEEKEEDLKSKEEIAKLNNSSPNSNEEVKEGCTASTEPSSTIELPDYLIKYIAIVSYEQRQNYKDDFNAEYDEYRALHARMETVARRFIKLDAQRKRLSPGSKEYQSVHEEVLQEYQKIKQSSPNYHEEKYRCEYLHNKLAHIKRLIGEFDQQQAESWH	33961	120032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_34235_52110_52159_87813_87936_93189_93354_100544_100805_104200_104326_104496_104588_106447_107016_109770_109838_113532_113705_115978_116024_116114
901940	contig_6364_pilon	-	6058	15	Intergenic	novelGene_51710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1180.73305663067	18	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	396	1754	472628	436151	TRUE	25	TAAATGCGTAGTGCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521239	431225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_432745_433365_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472641_486627_486732_490716_490802_521045
901941	contig_8145_pilon	-	2058	4	Intergenic	novelGene_118648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	136.787751238511	4	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAATGTCCCACAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735821	729471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_731203_733967_734089_734339_734407_735682
901943	contig_20878_pilon	+	4030	6	Intergenic	novelGene_173444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	560.971086598944	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	102	533	29569	34366	TRUE	35	AAACACAAGCCGCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APDVLFYPLRPELVESTYLLYQATKNPFYLHVGMDILQSLEKYTKVKCGYATLHHVIDKSKEDRMESFFLSETCKYLYLLFDEENPVHKSGTRYMFTTEGHIVSVDKLLRESPWKEFFSEEGEQDQEGKPMHRPRSHEVKVINSSSNCNRVPDERRYSLPLKSIYMRQIDQMVGLI	27210	37934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_27279_29535_29610_30551_30649_31645_31850_34276_37097_37167
901944	contig_4364_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532814	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
901945	contig_3601_pilon	+	2972	2	Intergenic	novelGene_132920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1	405	329230	329634	TRUE	10	CCATCTTGGCCCCACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLHSNSRFPQHFFFWLLFYCSLSLLSRTQLAPHITTSSLPLPPAYLHHVLNIALPNSTGRTYRNLPCSEPWLTLSAPVCDTNNASQPLSFSCTCPAAPQLSNKPCSLDKKVKNIVPADEQTTKNAQPACSHITK	329229	543911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_330303_542012
901946	contig_20842_pilon	-	1568	16	Intergenic	novelGene_160964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	97.6666894197926	1	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	377	1546	235273	40806	FALSE	40	GTGAGTTAATGGAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPWKILMAAPLFFLLALHTSASPAYNDQPTTSHSGSRVCVGCVVVVSVIEQLAQVRNSTAQAAMERLCSYLPEKLFLKSTCYLVIHIFGSDIIKLLSADMNADVVCHTLEFCKQDAGRPLCHLYPPPKVAWELTLKKARHIVGKSQTLKYPRSNSSICSLPFLAKICQEIKSAIKKSVPFKDSDSDKYSVFPTLRGYHWRGRDCNDHSKTAYPGRRPDNWDAHQDSNCNGIWGIDPKDGIPYEKKFCEGSQPRGIILLGDSAGAHFHIAPEWITALQISLNSFLNLPTAVSNELDWPQFSGITGFLDSTSGIKEDSIYLRLRKRNHCNHRDYQNISKNGASSQNLEKFIERVDCRPVAVRMSCKSGPNNPVCLGTNCWTTQPLSYMP	235649	40783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_40859_41170_41230_41604_41642_59928_60012_89827_89920_124655_124751_127280_127330_130216_130266_131009_131081_132234_132296_141520_141592_147843_147904_173524_173625_187148_187216_207155_207252_235146
901947	contig_16431_pilon	-	4474	2	Intergenic	novelGene_87616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2895	3338	223047	222604	FALSE	40	AAAGGGGGGGTTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVIYRYNAISIQIPTAVFNETEKQISYFIWKGNRPPISKALFKKNNKVGGLILPDFRTYYTATVVQIAWYWYNNRCIDQWNRIENPIENPEVNASTYEQLIFDKGPKSVNWGNDSLFNKWCWHNGISSCKKLKQDPYLTHKK	248288	221467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_224507_246853
901948	contig_546_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_117188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	499	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGACAGAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66395	64237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_64200_66400
901949	contig_10734_pilon	+	705	4	Intergenic	novelGene_51131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_3	86.1097490931711	151	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	34	405	813511	853530	FALSE	15	TCCATTTGTGGTATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQNGGGGRGAGMAGAGGEARFAGLSLRQLNELLEDEGQLAEMVQKMEETQSVQLNKEMTLASNRSLAEGNLLYQPRLDALKASLTQRYQELQVLFEAYQIKKTKLDKQSNNASVETLLALLQAEGAKIEEDTER	813477	853830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_813622_843568_843741_845218_845302_853524
901950	contig_10225_pilon	+	1931	13	Intergenic	novelGene_86771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	39	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	126	1127	20776	42680	TRUE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20650	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46336_47260
901951	contig_10734_pilon	-	2480	3	Intergenic	novelGene_51470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	86.5	65	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	953	1984	2269689	2265543	FALSE	65	AAAGAAAAAAATCACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRVLPVSVKPLSLVFLLEFEFCTPVFFCSVRNSLLYSKRAIFFVIYIYFTTMKFFLKRSLKTYLIKKKKQQQFHECGASAGFPQATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2270641	2265046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290
901952	contig_6557_pilon	+	2559	5	Intergenic	novelGene_33030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	81.3956387038028	220	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	134	556	637549	639195	FALSE	10	GTTGTGACCCTGTGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSGLVPSRFLTLLAHLVVVITLFWSRDSNIQACLPLTFTPEEYEKQDIQLVAALSVTLGLFAVELAGFFSGVSMFNSTQSLISIGAHCSASVALSFFIFESWECTTYWYIFVFCSALPAVTEMALFVTVFGLKKKPL	637415	641198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_637636_637821_637890_637991_638093_638843_638941_639125
901953	contig_9982_pilon	+	3036	18	Intergenic	novelGene_55736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	116.553001145936	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	533	2743	315214	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	307574	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307846_311157_311260_313037_313152_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
901954	contig_19816_pilon	+	4660	1	Intergenic	novelGene_156515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129405	134065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_129400_134100
901955	contig_6417_pilon	-	4784	8	Intergenic	novelGene_178756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	115	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCCCATAAAACAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551434	421856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6417_pilon_-_422298_423158_424134_473043_473268_478669_478970_544225_545119_545823_546057_549586_550064_550193
901956	scaffold_880_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_121494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCTCTTTTTGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535111	539100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_535100_539100
901957	contig_12619_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_73586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGACCCTATAGGGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017590	1015312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_1015300_1017600
901958	contig_1263_pilon	-	1581	7	Intergenic	novelGene_170390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	919.510558213807	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	260	1327	65303	52077	FALSE	55	AAAAAAAGTTGAGAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQSSDKAQKAEGE	76803	51822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_52113_58281_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_76564
901959	contig_4429_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_50813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCCTAGCAAGTCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180760	181865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_180800_181900
901960	contig_6898_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_35791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCACTACATGGACTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127680	125650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_125600_127700
901961	contig_14536_pilon	+	2560	1	Intergenic	novelGene_69301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	449	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTAAAGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116944	119504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_116900_119500
901962	contig_12540_pilon	-	2847	3	Intergenic	novelGene_148109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGTCGGTTCTGTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066512	1061800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1061843_1062848_1062909_1063767
901963	contig_3915_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_178777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	261	786	196	981	98595	97810	NA	80	AATAAAAGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAECIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGNSIIPCLHITG	98790	96838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3915_pilon_-_96800_98800
901964	contig_7119_pilon	+	2356	4	Intergenic	novelGene_40885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	246	1097	137033	139689	FALSE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALHHRSPVHGDHSHRGTVHTVHRACSHGSPDHRAGCHGSPLQGTHCHSSSVHGASHHRSPVHGDQKPCPWGPQPQRHCPYCS	127412	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139252_139445
901965	contig_15596_pilon	-	3320	15	Intergenic	novelGene_139532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1990	2364	148592	142816	TRUE	15	TGGCGTTGAGACACTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSCSMLKTRLLSGLEQINRAFRKEVHFFCNVLSPPWSPLHTLAILGIISLNMNSYSTDTSMKKKYTLSSSPSVSLGFLRITSVKTKLGSFSQGIAYSVLRGLWEEWREMMGSLPKKLYDVPE	157645	115987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_116207_125843_126162_128201_128348_136548_136612_138344_138443_141826_141924_142800_142918_144892_145045_148471_148650_148732_148889_150028_150250_151130_151248_154926_155098_155194_155242_156425
901966	contig_11656_pilon	-	5107	9	Intergenic	novelGene_53953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	435	junction_8	386.129815444236	187	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	402	2048	224380	139088	FALSE	35	GCCCCAGTTAATTGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLANPLYTEWILEAIKKVKKQKQRPSEERICNAVSSSHGLDRKTVLEQLELSVKDGTILKVSNKGLNSYKDPDNPGRIALPKPRNHGKLDNKQNVDWNKLIKRAVEGLAESGGSTLKSIERFLKGQKDVSALFGGSAASGFHQQFRLAIKRAIGHGRLLKDGPLYRLNTKATNMDGKESCESLSCLPPVSLLPHEKDKPVAEPIPICSFCLGTKEQNRDKKPEELISCADCGNSGHPSCLKFSPELTVRVKALRWQCIECKTCSSCRDQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLTRMPKGMWICQICRPRKKGRKLLQKKAAQIKRRYANPIGRPKNRLKKQNTVSKGPFSKVRTGPGRGRKRKITLSSQSASSSEEGYLERIDGLDFCRDSSVPLKFNKKTKGLIDGLTKFFTPSPDGRKARGEVVDYSEQYRIRKKGNRKSSTSDWPTDNQDGWDGKQESEERLFGSQEIMTEKDMELFRDIQEQALQKVGVTGPPDPQVRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRYVLRVPLPPVFRFIEL	227391	136028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_139256_157925_158045_160484_160802_162123_162260_164495_164578_165175_165292_169387_169497_223780_224705_227314
901967	contig_7963_pilon	+	2934	4	Intergenic	novelGene_58594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	70.0015872835911	24	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1877	2260	268630	269915	FALSE	30	TACATAGTGGCAGAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	266561	270589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_268345_268536_268697_269102_269240_269735
901968	contig_10050_pilon	+	4532	2	Intergenic	novelGene_119640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	0	764	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	14	1213	299529	300728	TRUE	25	GTTTAAAATGATTTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNSKFAKSRGRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTQQDDLGDGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLPSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPMQTLQDSKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQSNSRVLGQNVMMGPNSVMPTYGSQVPHNKMMTPNSHTHPGHAQQTSAVNGRALPHAVSTMPHTSGLNRLTPGKTPLQVPLPPPMQMNALGGYSSVSSCHGYGRMGVLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDSVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG	299515	304515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_300747_301214
901969	contig_19380_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_178737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1	492	70136	69645	NA	80	AACAACAACAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRPMRKFSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGHNKCWRGCGEMGTFVHSCWECKMIQPFWKMIWRFLKKLEIDIPFDPTIPLLGIYTREIRVVPRIDIRTPMFMAALFTIPKRWKQPRRPLTDEWINKLWYIHTMGVLGNEKEQ	70136	67457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19380_pilon_-_67500_70100
901970	contig_14970_pilon	+	760	1	Intergenic	novelGene_45116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	283	615	264734	265066	NA	35	CCCTTACACAGAATGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKMYMFASVVSRDYRYFTIWAVNFYYAFRVVGVSNYPQTHHTITQSLEKSVHVLLRTTPENKSRMRQLVLLMHGKGSVTMRPGGLYTCPVLKSEITQGLALPNKLSRL	264451	265211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_264500_265200
901971	contig_5889_pilon	+	1572	13	Intergenic	novelGene_133675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_12	82.2794611201497	338	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	33	1403	20445	323066	FALSE	25	TTTCCCATCCATGAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELMMRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSLEQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASSKLQIVFDFVASKGFPWDEFKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVKLFPQETLFLEAKE	20412	323235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896_197034_201118_201208_255473_255555_256680_256759_273382_273599_322982
901972	contig_4091_pilon	+	2076	5	Intergenic	novelGene_173023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	149.626200914145	25	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTTTGTTATACCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11155	39059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21118_21311_21414_21461_26751_27502_38106
901973	contig_7342_pilon	-	2521	9	Intergenic	novelGene_71215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	633	junction_4	436.677208444636	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	126	779	716514	696372	TRUE	5	GTAGGTGGCCGTTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KARRAGAAGAVPSEAAPFCARSRDSTGPVLCEVGGGARAPGMAETLSGLGDSGAVGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDSSGNKSVLMERLKKAIEDEGGNPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPGTVK	716639	691266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_691417_693321_693417_694223_694274_694924_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239_712325_716325
901974	contig_521_pilon	-	2923	19	Intergenic	novelGene_174730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	127.331697197167	287	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	251	2191	34292	14411	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILEERVKLGNLAEFLTTSFYTYLTFLDPDCDEKLFDDASEGSFSPDSDSDIGGYLEDTCNQVTESQDELDQYINHLLQSTSSKCYLPPLCKKTEDRHVFSAIHSTRDILSVMAKAKGLEIPFVPMALPTKVMSTHRKSLNLVDSPQPLLKKAPEGDFQWPRDDHGDVDCEKLVEQLKDCSNLQDQADILYILYVIKGPSWDTSLSGQHGVTVHNLLSELYAKAGLNQEWGLIRYISGLLRKKVEVLAEACADLLSHQKQLTVGLPPEPREKTISAPLPPEELTKLIYEASGQDISIAVLTQEIVVYLAMYVRAQPSLLAEMLRLRIGLIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQMTRRFSADEQFFSVGQAVSSSAHSSKSVRSSTPSSPTGTSSSDSGGHHIGWGERQGQWLRRRRLDGAINRVPVGFYQKVWKILQKCHGLSIDGYVLPSSATREMTPHEIKFAVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTLLSDTEMSSLGGIIHVDQIVRTANQLFLQDQMAIGTLDTLEKDQATGVCHFFYDSAPSGAYGTMTYLTKAVASHLQELLPNSGCQMQ	35933	13678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_14582_15140_15342_16164_16219_18320_18492_20380_20435_22208_22239_23050_23170_26338_26441_27053_27184_27277_27357_27553_27634_28396_28554_28921_29056_30079_30169_31238_31419_32213_32382_34270_34350_34603_34749_35885
901975	contig_7728_pilon	+	5131	5	Intergenic	novelGene_64737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_2	199.805374051851	465	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	270	2027	867342	914498	FALSE	15	ACTCATATCTGTGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATSVDQRPKGQGNKVSVQNGSIHQKDAVNDDDFEPYLSSQTNQNNSYPPMSDPYMPSYYAPSIGFPYSLGEAAWSTAGDQPMPYLTTYGQMSNGEHHYIPDGVFSQPGALGNTPPFLGQHGFNFFPGNADFSTWGTSGSQGQSTQSSAYSSSYGYPPSSLGRAITDGQAGFGSDTLSKVPGISSIEQGMTGLKIGGDLTAAVTKTVGTALSGTGMTSIATNSVPPVSSAAPKPTSWAAIARKPAKPQPKLKPKGNVGIGGSAVPPPPIKHNMNIGTWDEKGSVVKAPPTQPVLPPQTIIQQPQPLIQPPPLVQSQLPQQQPQPPQPQQQQGPQPQAQPHQVQPQQQQLQNRWVAPRNRGAGFNQSNGAGNENFGLGVVPVSASPSSVEVHPVLEKLKAINNYNPKDFDWNLKNGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYSIWCSTEHGNKRLDAAYRSLNGKGPLYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSVVDYNAYAGVWSQDKWKGKFEVKWIFVKDVPNNQLRHIRLENNDNKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIATFKHTTSIFDDFAHYEKRQEEEEAMRRERNRNKQ	867072	917602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_867366_867829_867855_873709_873796_883757_885357_914474
901976	contig_6410_pilon	-	3120	1	Intergenic	novelGene_108643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCATCCTAGCAACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405176	402056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_402100_405200
901977	contig_5210_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_65430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCCAAGTCAGAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468613	465936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_465900_468600
901978	SIRV6	+	1409	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	111	8	24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	35	CGGTCTTCAAAGTCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
901979	contig_3130_pilon	-	6473	25	Intergenic	novelGene_103553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	78	junction_4	150.651432673794	446	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	956	2871	25	2895	167769	70771	TRUE	35	TTATGAGCAAAATCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRPGRGSKMAAAVGVRGRCELPPCSGPGWLLSLSALLSVAARGAFATTHWVVTEDGKIQQQVDSPMNLKHPHDLVILMRQETTVNYLRELEKQLVAQKIHIEENEDRDTGLEQRHNKEDPDCIKAKVPLGDLDLYDGTYITLESKDISPEDYIDTESPVPPDPEQPDCTKILELPYSIHAFQHLRGVQERVNLSTPLLPKEDPVFTYLSKRLGRSIDDIGHLIHEGLRKNASSWVLYNMASFYWRIKNEPYQVVECAMRALHFSSRHNKDIALVNLANVLHRAHFSADAAVVVHAALDDSDFFTSYYTLGNIYAMLGEYNHSVLCYDHALQAKPGFEQAIKRKHAVLCQQKLEQKLEAQHRSLQRTLNELKEYQKQHDHYLRQQEILEKHKLIQEEQILRNIIHETQMAKEAQLGNHQICRLVNQQHSLHCQWDQPVRYHRGDIFENVDYVQFGEDSSTSSMVSVKFDVQANQSDISDSVKSSPVAHSILWIWGRDSDAYRDKQHVLWPKRADCAESYPRVPVGGELPTYFLPPENKGLRIHELNSDDYSSEEEAQTPDCSINDFRKSQTLSYLVKELEVRMDLKAKMPDDHARKILLSRINNYTIPEEEIGSFLFHAINKPNAPVWLILNEAGLYWRAVGNSTFAIACLQRALNLAPLQYQDIPLVNLANLLIHYGLHLDATKLLLQALVINSSEPLTFLSLGNAYLALKNISGALEAFRQALKLTTKCPECESSLKLIRCMQFYPFLYNITSSVCSGNCHEKTLDNSHDKQKYFDNSLSLDAAEEEPSERGTEEDPVLSVENSGRDSDALRLESTVVEESNGSDEMENSDETKMSEEILALVDEFQQAWPLEGFGGALEMKGRRLDLQGIRVLKKGPQDGVARSSCYGDCRSEDDEATEWITFQVKRVKKPKGDHKKTPGKKTESNQVENTHRYQSNLEITGPKVASPGPQGLLDWKTREVP	167793	31231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_-_32389_34072_34217_35870_35991_62840_62925_63990_64151_68857_70806_73827_73982_74793_75054_86945_87117_102962_103150_115882_116108_116475_116554_117895_118062_118217_118334_119670_119818_124093_124207_126473_126635_128372_128513_128962_129108_129921_130032_133509_133642_133929_134042_134805_134976_143287_143378_167610
901980	contig_3285_pilon	-	3720	5	Intergenic	novelGene_153375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_4	143.192833270384	351	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	73463	73119	TRUE	15	TAAAGTGTGTGGTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGAVWEGRGGGERPGVCEPGDGPRRKSRAAAFVAAAVAVAPVVKVGSGHALLRQQPPRGSPRPPVGAAVAGGGGLVPVSAAGRRAGAAVAAPGPAESGPRVSGAAAGFREQQR	73465	43045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_45929_50738_50907_55756_55852_63569_63685_73006
901981	contig_2069_pilon	-	2503	1	Intergenic	novelGene_23214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAATAAAATTATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106840	104337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_104300_106800
901982	contig_5317_pilon	-	3361	1	Intergenic	novelGene_76537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATGCATCAAGTTTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37723	34362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_34400_37700
901983	contig_10456_pilon	+	5836	3	Intergenic	novelGene_163467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_2	12	400	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	659	1630	58869	64040	FALSE	75	AAAATGTGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALCDTITNRLVQPEDRQDAIRAILVYSQSVEELLKRKKVHREIIFKYLATQGVVIPPATEKHNLIQHAKDYWNKQSQLKLKEAPKPVTKREDIQLFQKQEKEDKKTEKVDFRRLGEEFCHWFFGLLNSQNPFLGPPQDEWGPQHFWHDVKLKFYYNTLEQNVIDYHGAEIVSLRLLSLVKEEFLFLSPNLDSHGLKCASSPHGLVMVGVAGTVHRGNTCLGIFEQIFGLIRCPFVENTWKIKFINLRIVGESALAPGALQKPTITFEPSDLEAFYNVISLCGTNEVRLNGKQTMECGTGDQALCAGNEALLNKRELSLPLKH	58210	68246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_58924_61587_61830_63365
901984	contig_14508_pilon	-	2709	14	Intergenic	novelGene_79044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1237.47056865366	22	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	144	971	117502	43875	FALSE	35	AAGAATTCTTTATATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNKEAKHGGHKNGKKGGLSGSSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEILGKLGVYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHGEDLYQEEDEPTRDQQLEDEDFLTGSDADDKIENLETETFHEETEDSYQVEETAPQDYNQDMEEIIYEQENPGSSEPVVDDERLHHDADDITYQVYDEQVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPDT	117645	42136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_43883_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387_63421_64057_64106_64597_64655_65526_65560_69277_69404_74524_74600_77847_77941_109280_109350_111889_112040_117486
901985	contig_12157_pilon	+	3310	2	Intergenic	novelGene_135904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1498	1926	141660	142088	FALSE	70	TAAAAATAAAATAATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVNFKVTTKEVNKPTHQNKEEKHKVSVKKKPAKTKETNKQKNPLTKRTQHRRVRGTKKTSKRQHHKQKALQNAIPLLEIYPREIRAITQIDICTCIFIAALFTTAKGWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDEL	139804	143472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_140091_140448
901986	contig_13550_pilon	+	3786	2	Intergenic	novelGene_141253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	573	1928	50620	51975	TRUE	25	AACTCCTGGGACTGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSLSPEQRQHKTQLLGLLKASKLKVPEKALTQLLLLIESACPWYPLRGNLDVEAWERIGNIIRDMNIPASVLIAWHHCRLALQSPQAVPSAPSPSKENVYDPPFSTPPKADFSQHESLMERCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFKELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWNLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDSLNHNIPISLDMLLGSGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASDAATKAWGKVPDSKTPTGSFATIRQTANEPYIDFINRLQTAISRQVDNQQAAEVLCLQLAYENANADCRAVLTPLKAQNPNLAEMIRACQNVGTETHKAQVLAAALRPSTATCFGCGKPGHFKKDCHSSKNKNAKNPLPKLRWTLHDHNDSVLLCTSRPYIFAITANPPDIIKINTSFQLTIQWRYMDYTMFI	50047	53943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13550_pilon_+_53270_53379
901987	contig_4732_pilon	-	2469	1	Intergenic	novelGene_75463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGCTCTTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698654	696185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_696200_698700
901988	contig_11702_pilon	-	2926	23	Intergenic	novelGene_142004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.63638519924	144	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	48	2249	527480	508213	TRUE	15	CGACGCCAGCCAGCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHGKLRRERAPQAEYETQVKEIRWQLSEQLRCLELQGDLRRELLQELAEFMRRRAEVELEYSRGLDKLAERFSSRGGRLGSGSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQQTRQQSRESAALSEVLTGSLVQRLTHLSEYVGRIVRKSKDLEQQLQEELLKVVSELQTARKTYQVYRTESVNAETKLREAERQEEKRAGRSAAAAAATATTTTEAGPSRKSSIKKGRLVEKRQAKFLEHDLKCTKARNEYLLSLASVNAAIRNYYLQDVPDLMDCCDTGFHLALGQVFRSYTAAESRTQASQMQGLGSLEEALEALDPPGDKAKVLELHAAAFCPPLRFDYQPHEGDEVAEIQVEMELRDEIMPRAQNIQSRLGRQTIETEEVNKTLKATLQALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAGRRRGQQQETETFYITKLQEYLSGRSVLAKLQAKHKQLQEAIQRGDKEEREMSWTQYSQRKVQRSRQPRPSSQYSQKLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGGCPAGQHGGGE	527527	506006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506183_506305_506403_507258_507359_507568_507653_507909_508098_508180_508249_508330_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277_509339_509956_510060_510269_510298_510545_510631_510707_510900_511114_511217_516746_516969_517068_517198_518380_518570_518801_518865_519090_519254_519327_519536_527413
901989	contig_4339_pilon	+	2997	14	Intergenic	novelGene_146083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	91.1892498595138	29	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	919	2010	1045769	1064677	TRUE	20	TTTGTGAGTCTTTCTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVKVTIKTICALICGCPIVKPEYFTEFLQAVQSNKQPPQIESFYPPIDEPAIGNKNIDLSGRQERKQIFKGKTFVFLNAKQHKKLSSAVAFGGGETKLVTEENEEEDGFYLAPGTCVVDVGITNSQTLIPDSQKNCINSIMDLLKRQGLRPIPESEIGLAVIFMTTENYCDPRGQPSTGLRPTTPGPSLSQGLSFSEKLMSGVPVNTTVYVPNTESEQADTCMGFSERPKEMKSSRMEQKFRMLSQETSTVKEPPKTSCNNIISHTLVKMKVPDYQLSPAKFTGVSKGRDRASQQQQTNSIKNYFQPSTKKRGRDEENQEMSSSKSARIEMSCSLLEQTQPATLPTWKNEEQHPSQNEPKS	1044850	1076465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1045796_1048186_1048291_1049800_1049919_1050550_1050745_1052479_1052578_1060595_1060726_1062166_1062437_1064441_1064584_1064668_1064884_1068673_1068746_1069966_1070123_1072078_1072193_1074868_1074919_1076076
901990	contig_10023_pilon	+	4528	3	Intergenic	novelGene_123514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100	616	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	880	2505	451514	453139	FALSE	25	CTACTTTGTGTTGAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPRSFPPSKAVTVKSAEANPAEPEALPAPMAQALPSPASTATPPPTPTHPQPLALPPLPAEEAEGMNVDDQDEGSPLTQEAEPASGGGSSSGVGKKEQLSVKKLRVVLFALCCNTEQAAEHFRNPQRRIRRWLRRFQASQGENLEGKYLSLEAEEKLAEWVLTQREQQLPVNEETLFQKATKIGRSLEGGFKISYEWAVRFMLRHHLTPHARRAVAHTLPKDVAENAGLFIEFVQRQIHNQDLPLSMIVAIDEISLFLDTEVLSSDDRKENALQTVGTGEPWCDVVLAILADGTVLPTLVFYRGQMDQPADVPDSILLEAKESGYSDDEIMELWSARVWQKHTACQRSKGMLVMDCHRTHLSEEVLALLSASSTLPAVVPAGCSSKIQPLDVCIKRTVKNFLHKKWKEQAREMADTACDSDVLLQLVLAWLGEVLGVIGDCPELVQRSFLVASVLPGPDGNLNSPTRNADMQEELIASLEEQLKLSGDQSEEASASTPRPRSSPEETFEPESLHQLFEGESETESFYGFEEADLDLTEI	450021	455162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_450713_450906_451020_451438
901991	contig_17440_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_7551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_900_3000
901992	contig_10434_pilon	+	4456	7	Intergenic	novelGene_82027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_2	15.723301886761	405	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	270	1118	126767	132340	FALSE	15	TGCATCCTTGTTTTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRTSSETEDVPAVGRVSTFYLLFSSTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVSNITNQFCNASVIDPACVRCRPLTPEGRQRPQGKDFMKFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILGNNTSVGATYFMTYHTVLQTSADFIDAMKKARLVASNITKTMGINGSNYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTFVLLGCELWSAVIMCITVAMILVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSTKGSRVGRAEEALSHMGSSVFSGITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGVTHGLVFLPVLLSYVGPSINKAKSSATQERYRGTERERLLNF	125465	135678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_125661_126692_126823_128279_128481_129476_129709_130607_130722_131445_131609_132257
901993	contig_4797_pilon	-	5929	1	Intergenic	novelGene_6897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	733	1131	293587	293189	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWRFSFGVYPIWGSLSFLDSQHFIFHDNREVFCISSSMILSVFSVFSPCSGTLITCRFLLLIVSHIILRVSSFFFIHFSDFSSNRVASMCLSSIPLILSSIISTLLLSPSMSLSIFEILFLSFGFLTVVFV	294319	288390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_288400_294300
901994	contig_9696_pilon	-	2965	3	Intergenic	novelGene_68849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTGGATGACTCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684714	669758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_669848_676019_676117_681935
901996	contig_15118_pilon	+	3176	9	Intergenic	novelGene_74567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.4161072783587	236	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	581	943	237605	239130	TRUE	55	TTGGACAAAATGAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRRTRTWLPALRTQTCCPCCCCCPCCGGSLQEYPGYKLQIPELVTVQEGLCVIVFCEFFYPRHVSFTTDQLCIYWYWTGDNTYSNRLVATNCQNLVVKTETQGRFHLLGDPKTNNCSLSIRDARKSDTGIYEFRVWGQYVQYSYRTQLNLQVTDLTEKADIHILEPLQSGSPTNLTCSLPGSCDGGRPLTFSWMGDALNMLDPSTLQSSVLTLTPRPQDHGTYLTCQVKRRWPQVTTERTIRLNVSYAPQNLTIKIFFQNGTVLKVMGNTISVPILEGQSLRLVCVADSNPPCRAELVPGIPSPECLSHLQHE	236734	254127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_236818_236895_237274_237485_237765_238195_238244_238975_239235_239320_239606_239792_239893_240762_240845_252465
901997	contig_3382_pilon	-	4771	3	Intergenic	novelGene_124097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5210	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3292	3777	637651	637166	TRUE	30	CTCTCACGTAATTTAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQEGRTCSAFLKLKELKKEFKPRVAILKDSTGKILNNAGSIKRRRKEYIESLYQKELVDVQPFQEVVCDQELMVLKEEVQAALKTLVINKLRELAEYQMRCFNKLMQRWKCSLVYAKKFGRQLPGQPTGRDSYLCPFQRKVIHQSAEVIKPYH	752362	635696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_635910_636384_637970_749389
901998	contig_18162_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_122295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
901999	contig_10982_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_87859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTATGTTTTGTTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80058	77711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_77700_80100
902000	contig_6497_pilon	+	3664	4	Intergenic	novelGene_35654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	2178	3050	1040168	1041040	FALSE	15	CCGACTCTGTGGTCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKKEVQAAVKTLVKNKASGTDGIPIEMFQQTDAALQVLTCLCQEIWKTAAWPTDWKRSIFMPIPKKGDPTECRNYRTISLISHTSKILLKIIQKRLQQYINRELPEIQDKFRRGGGIWDIIADVRWILAENREYQKDVYLCFIDYGKAFDCVNHNKLWIMFRRMGIPEHLIVLMRNPYIDQKAVFRAEQGDTARFKVRKGVHQGCMLSLCLINLYAEQIIQVAGLYEEECGIRIGGRLTNSLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKSSQLDQ	835214	1041654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_835241_880431_882443_896455_896545_1040116
902001	contig_2036_pilon	-	1909	3	Intergenic	novelGene_131812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	381.5	26	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	112	699	661441	500993	FALSE	10	TTTATCATCTCTGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFLACSRPSSCLLSSHFRFLGLELAAYLLILGFINLHSLQERILLPDPLILGLPATAAT	661552	499782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_501171_647832_647936_661134
902002	contig_4678_pilon	-	2537	4	Intergenic	novelGene_126069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGCCATCTTGCCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793847	714745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_714919_715086_716181_737065_738310_793821
902003	contig_3727_pilon	+	1317	6	Intergenic	novelGene_146745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_5	220.732054763236	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	20	430	300452	307411	FALSE	20	CCTGGACTGCCTCTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVPHEESTDSEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKKGVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP	300432	308298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_+_300503_301347_301414_301685_301734_302573_302663_303623_303706_307336
902004	contig_501_pilon	-	5614	1	Intergenic	novelGene_134891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	321	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729530	723916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_723900_729500
902005	contig_8992_pilon	-	3397	1	Intergenic	novelGene_174424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAATGGCGGCGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77282	73885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_73900_77300
902006	scaffold_19766_pilon	-	1647	6	Intergenic	novelGene_34395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.077652474175	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGGAATTTATATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830502	825025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826291_827332_827413_827987_828085_828182_828315_830336
902007	contig_5033_pilon	-	3497	3	Intergenic	novelGene_28967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	1178.5	304	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	468	701	464569	462819	FALSE	30	CCTGAAATCAGCCGAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESESKALCSCPSWFSVLCPHPGPRPHLNSDLITPSPWSPHYSSFAAAPFASSFT	477167	460022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_463031_464547_464983_477113
902008	contig_5539_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_104750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	23	373	44983	44633	TRUE	60	AAAAAAAAACTTCAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDRIPTEMFQQTDAMLEALTHLCQEIWETSICPNNWKRSMFVPIPKKGEPTECRTYRTISLSHASKILLKISQKQLQQCISRELPEIQAGFRKGRGMRDITDDVRWILDESREIPQRCLPLFH	45005	42046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_43007_44272
902009	contig_5020_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_27924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAAAGATGCCCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137753	135744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_135700_137800
902010	contig_2209_pilon	-	2357	6	Intergenic	novelGene_141016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_5	46.1952378498044	100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	18	677	248781	184465	FALSE	25	CAGACCTAGCATCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAACAMCAHNPGTEFDLSWISNIQVNQPAVLRRAEQIQARRTVKKEWQAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVVINRTLVLTGQWEALYDEIRQFRKACGEAHLKTILATGELGCLTDVYKASMIAMMAGKCFIFR	248798	182784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_184617_202235_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248750
902011	contig_4678_pilon	+	6891	4	Intergenic	novelGene_126021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	106.904942199445	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	1089	2120	331385	332416	FALSE	0	TGGCCCTTGCCCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSRLDKSIGAASPRHQPLEKAPVPTGLRLPPPERLLITSGPKPQASDRPPDKSHASLSQRLPPPEKVLSAVVQTLVAKEKALRPVDQNTQSKNRAALVMDLIDLTPRQKERAPSPHEGTPQADEKMPVLESSSWPPSKGLGQMPRAGERGSVSDPVILPPGKAAAPSEHPWQAVKSLTQTRLLSQPPAKAFLYEPATQASGRPPAEAEQTLGLPSQAPGLVKQMAGGQQLPGLAAKGTTLSGQSFRPLGNAPASLPTEKKTLATTEQSPWVLGKASLGPGLWPMVAGQTLTPPCWSSGSTQTLAQTCWSLGRGQDPKPEQNTVPALNQAPSSHKCAESEQK	311070	337187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_311279_315735_315849_319538_319789_330867
902012	contig_12790_pilon	-	6167	7	Intergenic	novelGene_35285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	276.057964927658	619	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	272	910	460293	455080	TRUE	65	AAAAAAAAACTTAGATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIILWMTISVGYFGLSLDTPNLHGDIYVNCFLSGVVEVPAYTVAWVLLQYLPRRYSMATALFLGGSVLLFLQLVPPDLYYLTTVLVMVGKFGITAAFSMIYVYTAELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTILTAILTLFLPESFNIPLPDTIDQMLRVKGIKYRQSPTHTRVLKDEEESPTILKSTAF	462319	449754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_453387_453454_455168_455548_455685_456711_456895_458373_458589_460276_460378_462132
902013	contig_1301_pilon	-	5934	7	Intergenic	novelGene_47306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	940.910669983548	387	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	166	591	284738	278293	TRUE	45	AGGTAAGAAGACCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSR	284903	268651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_273893_276899_278465_279344_279450_283355_283451_284684
902014	contig_1244_pilon	-	2743	1	Intergenic	novelGene_38037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935014	932271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_932300_935000
902015	contig_12915_pilon	-	4754	1	Intergenic	novelGene_148337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1520	4563	89	4651	54765	50203	NA	30	TTGACATGAATTAACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCSAQLQHVSPSIFPAHLTNVSASLLSSMESVMNPNIPSQDKNEQGGMLCSQLENLSGTTLPAQMEDLTKTVLPLNIDSGSDPFLPLPAESSSMSLFPSPADSGTNSVFSQLENNTNHFSSQIEGNTNPSFLKGSNGENAVFPSQVNVANDPNNTSAQQSAPEKVKKDRGRGPNGKERKPKQNKRAKWPAIIRDGKFICSRCYRAFTNPRSLGGHLSKRSFCKPLDGAEIAQELLQNNGQPSLLASMILSTNAVNLQQPQQSTFSPEACFKDPSFLQLLAAENRSSTFLPNTFSRTGVTNFNTSVSEEGSEIIKQALETAGIPSTFEGTEMLSHVVPSGCVSEAAQVNAVVMPNPTVPPLLQTVCHPNTLLTSQNRTPNSKTPSIDECSSLPVFPANDLLLKTVENGLCSSSFPNSGGLSQNFTSTSSRVSVISGPQNARSSHLNKKGNSASKRRKKAVPPLIAPSASQNLVASDLTAMGLIAKSVEIPTANLHSNIIPNCEPQGLVENLTQKLNNVDNQLFMTDVKENFKTNLESRTVLAPLTLKTENGDSQMMSLNSCTTSVNSDLQISEDNVIQNFEKTLEIIKTAMNSQILEVKSGPQCVGETSQNAPISYNIQLPSVNTVQNNKLPDSSQFSSFIGVLPTKSNIPQSEILHKEDQIQELLEGLQKLKLENDLSSPASECVLINTSVTLTPTPVKSTPDASVVQPVSEMVNNIQFSDKVNKPFVCQNQGCNYSAMTKDALFKHYGKIHQYTPEMILEIKKNQLKFAPFKCVVPTCTKTFTRNSNLRAHCQLVHHFTTEEMVKLKIKRPYGRKSQNENLPTSRITQVKKQLAVTEEDKREFQPALELGAKKENALSSVAVVPENQLIEKKSPENTETSAQVITVTSEQYDINSLTNLQTKGRKIRRHKKEKEEKKRKKPVSQSLEFPTRYSSYRPYRCVHQGCFAAFTIQQNLILHYQAVHKSDLPAFSAEVEEESEAAKESEEIETKQTVKEFRCQVSDCSRIFQAITGLIQHYMKLHEMTPEEIESMTTAVDVGKFPCDQLECKSSFTTYLNYVVHLEADHGIGLRASKADEDGIYKCDCEGCDRIYATRSNLLRHIFNKHNDKHKAHLIRPRRLTPGQENISSRANQEKTKPKYRGTKHSRSGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNTKIVQIEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTSRFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKCHKLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETCSEQEVDKNDVKDSDICVSESNDNSGATSVPQKEAEKNEKDEMDELTELFITKLINEDSTSVEAQANTSSSVSNDIQENNSCQSEKQKASNLKRVNKEKNVSQNKKRKIEKTEAALAVDLNSMHKEEETAVAIQTTEDHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNSGTKRGSHSNSRKNIDKTAVTSGNHVCSCKESETFVQFANPSQLQCSNNVKIVLDKTLKDCTELALKQLQEMKPTVSLKKLEIHPKDPDVSAMKEISIGKATGRGQY	54853	50099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_50100_54900
902016	contig_7840_pilon	+	2935	3	Intergenic	novelGene_69003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCGGTGAAGGACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277661	281149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_279668_280100_281013_281132
902017	contig_7056_pilon	-	1910	12	Intergenic	novelGene_43625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1188.96739697705	5	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	65	706	730480	726835	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRWGWMVGWICHFSYGKQLNPYSLCLKEIYFIVPIN	730732	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725506_726830_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730700
902018	contig_11493_pilon	+	3490	1	Intergenic	novelGene_143693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCACCAGCTTCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199579	203069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_199600_203100
902019	contig_5696_pilon	+	3930	1	Intergenic	novelGene_117567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1644	2201	701184	701741	NA	25	TCTTAAAGGCCTGTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKFLNIIKGIYAKPTANIIFNGDRLKTSPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGVQIDNEEVKLYLFADDMILYIENTKDSTRKLLELIEKFSRVAEYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKAIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIHAHG	699540	703470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_699500_703500
902020	contig_15629_pilon	+	3584	11	Intergenic	novelGene_122455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	56.3936166600441	181	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	304	1917	121130	160967	FALSE	40	CTTTACTTTTGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTELPLAFLILMFSNTSENCMSRLHITAVEGEPFYLKYCRSSSEHKNEKNTRWCYQPNGSLEQIELNPSNSPRIAFHEYALEFWPVELSDSGSYFLKMGNDTHEWKLNVIRRNKHNCFTEKQVNTRTVEVKKHLMIKCETPYYRKLINKTSLYKNCEQIEIRGNTFEKNAEFEDQGYYTCVFSLHYNGKLFNVTKTFNVTIAGDYNSITPVLLGPKFNQIEVELGKSEQLNCSALLNKDDTVYWNFRKENETDHNLHEEQEIKIKTSEGKWHASRILRIENINENNLNFLYNCTLASKGGTDVRVFILVRKENVDIPGHIFTRGMITAVFILVAVVGIVTVCAIYRVDLALFYRHLIGRDETLTDGKTYDAFVSYLRECRPESYEEHAFAVEVLPSVLEKHFGYKLCIFERDVLPGGAVVDEVHSLIEKSRRLIIVLSQSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVSDFMFLPQSLELLKSHQVLKWKADKSLSYNSRFWKNLRYLMPAKKIKPGRDESEVLPVLSWT	115161	162634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_115437_121101_121188_124615_124860_126730_126897_132731_132880_137886_137950_143382_143504_147329_147470_154570_154730_158393_158553_160611
902021	contig_12010_pilon	-	2821	10	Intergenic	novelGene_160951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTCCAACCCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225949	195206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_195364_200897_200999_205107_205253_209285_209370_211706_211951_216635_216835_219001_219056_220047_220187_220430_220621_224441
902022	contig_11253_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_126822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGTCTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105173	107640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_105200_107600
902023	contig_11512_pilon	-	2141	10	Intergenic	novelGene_43293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	453.035441341084	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	520	1350	396169	367967	TRUE	25	GTACGGAACCCTTGGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	419195	366016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366360_367518_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314_409576_418977
902024	contig_10734_pilon	+	4017	9	Intergenic	novelGene_51174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_8	427.977200765415	88	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2504	3010	1134427	1141057	TRUE	35	TCAAAACTGGTGTTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGVSSFIYSFNSTKENHARSKSSFSLAANQKVDSSNPPAAPWKPYGAVLLCPIESL	1123670	1143371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1141417_1142723
902025	contig_5236_pilon	-	2119	2	Intergenic	novelGene_100945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	248	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008123	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035
902026	contig_20527_pilon	-	2758	6	Intergenic	novelGene_138574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAAGGGTTCTTGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29204	12898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308_27633_27880
902027	contig_10531_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_114536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486970	488850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_+_487000_488800
902029	contig_3956_pilon	+	3109	15	Intergenic	novelGene_14836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1120.62277692507	8	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	84	2597	1281682	1290491	FALSE	10	GTGGTGACTGTGTGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289164_1289491_1289677_1289758_1289892_1290297
902030	scaffold_15027_pilon	-	2482	17	Intergenic	novelGene_163561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	717	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	436	795	104914	102821	TRUE	15	TCCCAAAGGCGTGGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCILIRLSLVVCCSVRIHGVVSSPCRRRDCTDSKKRLYKLFLSASLAAAWHLALSTHCRFLSSCIDLPAIMICFRTGLRKDTMVCCLLESPWSLPELALALSLIFSSFSVFSDTLYNV	106780	48898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_49071_55947_56003_56115_56224_66196_66324_76385_76482_76888_76970_77393_77528_81941_82058_82608_82707_83484_83574_88155_88402_90038_90243_91101_91216_102773_103043_104776_104975_105635_105825_106594
902031	contig_233_pilon	-	2626	15	Intergenic	novelGene_14605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1481.72426619139	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	752	2188	104176	78579	FALSE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	109971	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104299_105499_105645_107314_107472_108401_108583_108724_108814_109914
902032	contig_3269_pilon	+	2081	14	Intergenic	novelGene_117005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	523	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGCTATCAGCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45428	80278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_45893_46045_46111_46698_46760_50721_50863_52713_52811_53477_53671_53949_54157_55783_55935_56458_56573_61063_61186_65583_65694_72224_72281_72365_72585_80197
902034	contig_5039_pilon	+	2272	2	Intergenic	novelGene_64982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	676	1668	1679067	1680059	TRUE	10	GTACTTCCTCTATCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1678391	1682921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1680625_1682882
902036	contig_12008_pilon	+	2086	9	Intergenic	novelGene_24997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	590.136213089826	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	40	483	23677	34072	TRUE	30	TGGTGAGTAAAGAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	40464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30121_30168_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39215_39300
902037	contig_5495_pilon	-	4949	16	Intergenic	novelGene_157667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_13	66.2921480183656	504	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1340	1780	530334	521128	FALSE	40	GCATACAGTAGATTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRRLPGRFNGGPSPTQSPEKILKLPKEEEDSANQKPSEFKKDTCYSPKPSVYLSTPASASSKPNMAAFLSPVEIKAKVETVDGKKNPLDELRAQVVELLSIVEALKKDHGKELEKLRKDLEEEKAMRSNLEVEIEKLKKAVLSS	602027	517958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_-_521170_522816_522881_528004_528190_529273_529379_530289_530403_537458_537602_538381_538548_555157_555221_556357_556395_558189_558295_559524_559620_560035_560115_562310_562499_588346_588468_590797_590899_601854
902038	contig_960_pilon	-	2255	4	Intergenic	novelGene_108200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTAAGATGAGGGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272779	70645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_70653_138761_139156_270129_271552_272347
902039	contig_5954_pilon	-	3845	16	Intergenic	novelGene_28739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	169.618866875121	405	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	1427	3505	1265881	1249935	FALSE	90	GAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1267307	1249594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1254060_1254319_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369_1258490_1260597_1260835_1261563_1261621_1261767_1261839_1261931_1261998_1262315_1262365_1265268_1265323_1265746
902041	contig_13958_pilon	+	4260	10	Intergenic	novelGene_129527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	317.566363240392	307	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	145	888	114673	134685	TRUE	15	CTATATCCTTATTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGIWSRRRWVGSVWFSSEASCLLRFFWKPTFALGCGEQRPRSLCESAMADTAPNGPQGAGAVQFMMTNKLDTAMWLSRLFTVYCSALFVLPLLGLHEAASFYQRALLANALTSALRLHQRLPHFQLSRAFLAQALLEDSCHYLLYSLIFVNSYPVTMSIFPILLFSLLHAATYTKKLLDAKGSNSLPLLRSVLDKLNANQQNILKFIACNEIFLMPATVFMLFSGQGSLLQPFIYYRFLTLRYSSRRNPYCRTLFNELRIVVEQIIMKPACPLFVRRLCLQSIAFISRLAPTVA	114354	146940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_114472_114645_114718_117494_117590_118080_118269_121700_121769_124361_124496_126638_126723_134555_137201_140713_140870_146239
902043	contig_7396_pilon	-	2524	16	Intergenic	novelGene_79559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3278.53734054278	26	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	60	1445	255163	246385	TRUE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257046	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246172_246279_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
902044	contig_5814_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_143056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTTGGAAACCCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355091	353275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_-_353300_355100
902045	contig_6364_pilon	-	3935	2	Intergenic	novelGene_51755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	51	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	307	657	698021	697671	TRUE	65	TCAATTAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLSEKMLCNILMLWILSKLALWPNILDNVPCALEKKVYFSAVGWSVRYMSMRSSWLIVAFRSFVSLLSFFLDVLSFTESGVLKCPTIIVELFPVLLEFVLCILEPCHWMCKYLL	698327	633299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_633486_694578
902046	contig_935_pilon	+	5187	8	Intergenic	novelGene_45555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2377	2742	351010	351375	TRUE	70	TTAAAAATAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLAPTHLEQRRTTHKESISPRDTKGHINQRIHQPETRRTRWCPATTNDHSDREHNRESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLIKTRGTPEDMAPGLSVSPKLKPFPRPTLQTKIRPDYGI	348633	370822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_352753_358182_358306_359242_359404_361934_362048_362131_362248_362607_362749_368062_368292_370637
902047	contig_6513_pilon	-	3672	2	Intergenic	novelGene_117749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCGAGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77740	72822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_73625_74870
902048	contig_10734_pilon	+	1439	8	Intergenic	novelGene_51430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	49.6838987592396	61	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	467	1303	2148129	2156004	FALSE	30	ATTTTGTTGCTAGAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2146555	2156140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2146845_2147951_2148138_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
902049	contig_15236_pilon	+	3257	2	Intergenic	novelGene_141545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1404	1811	122756	123163	FALSE	40	ATAAAATTTGTATGGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	119631	124609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_120420_122140
902050	contig_5832_pilon	-	2864	2	Intergenic	novelGene_134139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250996	248041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_249423_249513
902051	contig_2730_pilon	+	4728	3	Intergenic	novelGene_135351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGCATTGGCATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231150	336658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_231158_248988_250314_333262
902053	contig_2069_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_23302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	410	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463073	465229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_463100_465200
902054	contig_8978_pilon	+	5040	35	Intergenic	novelGene_49355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	112.681752451939	360	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1599	4800	13	4812	200543	222003	FALSE	25	CAAAGGGAGTGTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFNPAKISSNFSSIIAEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKSQPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNALLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGNTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQAKIQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQTAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPNTNIFGRF	200530	222231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_200642_201168_201274_201485_201519_206348_206430_206561_206733_206932_207078_207243_207295_207618_207738_207914_208059_208504_208669_208870_209003_209392_209621_209795_209941_210110_210232_210608_210711_210998_211113_211361_211538_211718_211899_213239_213312_213789_213924_214092_214255_214572_214685_214875_214966_215483_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218251_218458_218625_218704_218794_219010_220556_220750_221307_221476_221675_221758_221959
902055	contig_6847_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_143845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	240	572	64375	64707	NA	25	CCCATAGGGGTTTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTESSTTRWYPATTTNCSDRDHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKKTRLNGLTETGETPRVWPLDTLFSSVMKSLLRFTHFSQRLDRPIKQNKTKGAHQPRSKD	64135	66223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_64100_66200
902056	contig_14575_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_101915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGGGGAATTTTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218509	220389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_218500_220400
902057	contig_1699_pilon	+	3346	13	Intergenic	novelGene_72823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_6	152.803795764372	286	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	884	3181	82820	101858	FALSE	60	AGCATTCTGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRDLRQQGGCPRGTNCTFAHSQEELEKYRLRNKKINATVRTFPLLNKVGVNNTVTTTAGNVISVIGSTETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDFSESVSGTKFEEDHLSHYSPWSCGTIGSCINAIDSEPKDDLDSGDVKRRVHLFETQRRAKEEDPIIPFSDGPIISKWGAISRSSRTGYHTTDPVQATASQGSATKPISVSDYVPYVNAVDSRWSSYGNEVTSSAHYVERDRFIVADLSGHRKHSSTGDLLSIELQQAKSNSLLLQREANALAMQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVILEEQKTILPVTSCFSQPLPVSISNASCLPVTTSASVGNLILKTHVMSEDKNDFLKPVANGKMVNS	81936	102023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_82903_89240_89550_93132_93348_94520_94955_95512_95684_97598_97716_98067_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_101662
902058	contig_14333_pilon	+	2322	2	Intergenic	novelGene_49103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	204	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTACCTTTTCCTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340682	369351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_340773_367119
902059	contig_20378_pilon	-	3664	20	Intergenic	novelGene_159568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_19	156.55813218566	567	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	1197	2756	106416	69827	FALSE	45	ACTCCTGTCAATAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMKRLLMVLAGASEFDPQYNKDATSRPTDNILIPQLIREIGSINLKKNEPPLTCPYSLKARVLLLSHLARMKIPETLEEDQQFILKKCPALLQEMVNVICQLIIMARSREEREFRAPTLTSLENCMKLSQMTVQGLQQFKSPLLQLPHIEEDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHNLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGGDANKNRTKGGWQQKSKGPKKTAKSKKKKPLKKKPTPVPLPQSKQQKQKQANGVIGSEAVVKEDEEEVSDKGSDSEEEETNRDSQSEKEDGSDRDSDREQDEKQNKDDEAEWQELQQSIQRKERALLETKSKITHPVYSLYFPEEKQEWWWLYIADRKEQTLISMPYHVCTLKDTEEVELKFPAPGKPGNYQYTVFLRSDSYMGLDQIKPLKLEVHEAKPVPENHPQWDTAIEGDEDQEDSEGFEDSFEEEEEEEEDDD	145565	68918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_69971_71103_71209_74371_74471_78344_78447_80157_80317_87955_88127_88323_88384_91611_91695_94354_94503_97707_97863_98618_98712_103185_103319_103416_103512_106403_106513_107631_107683_109115_109794_122404_122518_123909_124025_124765_124866_145522
902060	contig_8576_pilon	-	4686	3	Intergenic	novelGene_88719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	944	1744	627439	626639	TRUE	35	ACTGTTTAATGAGAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKGQNQNINYRTQTNEIEQQKKPTATGRKEIVKIRAEINEIENIKTIERINKTKSWFFERINKINKPLARLTKEKQERMQITQIRNAMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLQQSDGENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFSEELVPVLLKLFQSTEKEATLPNSFYEASVSLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDVRILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGM	631231	523195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_525063_625563_628263_631111
902061	scaffold_19766_pilon	-	2225	4	Intergenic	novelGene_34404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	45.0653845971483	36	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	892	1413	827532	825937	FALSE	25	CGACCCACTGACACTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLASSDAPLDLYLVANASLCAHLTPPCSASDPKFPISQGQSQTMAVLRGLVQKGVKVDLGIPLELWDEPSVEVTFLKKQCETMLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	830564	825124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_826190_826309_827289_828310_830450
902062	contig_5423_pilon	+	2938	9	Intergenic	novelGene_85264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	813.771581895067	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	249	1010	542216	553344	TRUE	35	TGAAAACAATGCTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKIDMVHRNISEGFFLDASRHILEAPQHGLERRHLEANQNELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	534848	555470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541159_542201_542351_544406_544525_545686_545830_548788_548903_551350_551465_553206_554547_554744
902063	contig_8330_pilon	+	2175	3	Intergenic	novelGene_71907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	106	1326	1213063	1219586	TRUE	5	CCGGAGCCTGGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGLKNLVTEAPGLPGAPVTAEATPRTNFQSSVAFMFRKFKILRPAPLPAAVVPSVPTSAPAPAPPVLTPTSVPVGLQILTQPLPVACFNLALPSPPALAVASPAPSPAPAPAPAPAPAPGPAPAPAPSPVPASALTPAPGPAPGSTLAPAPLDSAEQRFAGLHASLCDAISGSVAHSPPEKLREWLEMDGPWGRAAWQDCQGVQGLLRKLLSQLQNFVCTHQCPFPHVVRAGAIFVPIHLVKERLFPRLPPASVDHVLQEHRVELRPTTLSEERALRDRALHGCTLRMLKLLALRQLPDIYPDLLDLQWRDCVRRQLGDFDTEAGAVPPSEPTMAREEPESLALAQKSPAPKARKPGKKPPTPGAEKAEAAAGGGSSGGASPTPAASASPPSPTLRTRFRNLLETAWLNGLALPTWGHKASGQDRPSPRPQLLGGQSNPL	1212957	1220643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1213913_1219215_1219905_1220112
902064	contig_19352_pilon	-	6598	19	Intergenic	novelGene_122383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_18	182.590785807303	1183	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	212	1663	177600	136984	TRUE	25	CATTTGCTATTTCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHCLLDQFDRDLPVYLKKDPAYFYGYVYFRQVRDKTLKRGYFQKSLVLISKLPYTHFFHTVLKQIAPEYFEKNESYLEAACNDVDRWPAPVPGKTLHLPIMGVVMKVRIPTCHDKPGTTQIGQLTQQADTHISVILPTVHEVDLFRCFCPVFLHSQMLWELVLLGEPLVVMAPSPSESSETVLALVSCISPLKYCSDFRPYFTIHDSEFKEYTTRTQAPPSVILGVTNPFFAKTLQHWPHIIRIGDLKPAGEIPKQVKVKKLKNLKTLDSKPGVYTSYKPYLNRDEEIVKQLQKGVQQKRPSEAQSVILRRYFLELTQSFIIPLERYVASLMPLQKSISPWKSPPQLRQFLPEEFMKTLEKTGPQLTSRIKGDWIGLYRHFLKSPNFDGWFRTRRKEMTQKLEALHLEALCKEDLLLWIQKHTEVETVDLVLKLKNKLVQADRERLPVKPDTVEELRTHIDAIILALPEDLQGILLKTGMT	179304	130763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_132708_133992_137116_137622_137698_140867_140971_141090_141201_141307_141362_142687_142778_144174_144240_144327_144394_154861_154957_165913_166010_166451_166575_170333_170390_171179_171243_172277_172358_173906_174013_175018_175100_177543_177657_179149
902065	contig_6412_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_149983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCCAGCTTGAAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620286	623199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_620300_623200
902066	contig_4732_pilon	+	1595	2	Intergenic	novelGene_75468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCTCCAGTTGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696251	697954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_696313_696420
902067	contig_12479_pilon	-	2370	17	Intergenic	novelGene_56857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_16	106.447096602021	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	277	1683	516614	451002	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	518718	450314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_518529
902068	contig_15752_pilon	-	3802	1	Intergenic	novelGene_148770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	907	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGGCTGGGTCTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325503	321701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_321700_325500
902069	contig_4782_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_73664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTAGCTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547502	545575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_545600_547500
902070	contig_8801_pilon	-	1976	1	Intergenic	novelGene_66284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCTATAGGACAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449134	447158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_447200_449100
902071	contig_9668_pilon	-	3527	1	Intergenic	novelGene_58253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1224	1580	614402	614046	NA	15	TATCCCTTACCTGTGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQEAHCTVSCRRLSAARSLSCHDFSPSSGFQLALSLGLLPPGESKRRDPRSKRCAFHSWLFFFGGGRILLSLWNWLSFRTKLTNPLGRPQLPYHTVLPSHLDGSYKTMARKATHKSN	615625	612098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_612100_615600
902072	contig_211_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_129864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGTTCCCACCTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114515	111827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_111800_114500
902073	contig_10569_pilon	+	5770	3	Intergenic	novelGene_44057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	175	junction_2	88.5	9	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	26	331	58718	81578	FALSE	20	TCCAAAATCTGTGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATEETERRMDFYADPGVSFYVLCPDNGCGDNFHVWSESEDCLPFLQLAQDYISSCGKKTLQEVLEKVFKSFRPLLGLPDADDDAFEEYSADVEEEEPEADHPQMGVSQQ	58692	87017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_58790_68808_68932_81467
902074	contig_9668_pilon	-	2269	3	Intergenic	novelGene_58112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTCAGCCCGGATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333894	214055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_214243_282639_282809_331981
902075	contig_16110_pilon	-	4604	4	Intergenic	novelGene_126787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACACATTAACAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74075	57162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_57572_58497_58679_68233_68360_70187
902076	contig_5317_pilon	+	3485	24	Intergenic	novelGene_76584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1139	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	2658	3431	381972	401557	FALSE	35	GACGCTGAGACCTGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSFRSFIEHTFFSSSLMFQIRSFWALRAFSSLLSLSFSFLGFFLVTSSVPSTSSPFLFPSLLTLGSCFFRNSLSSGVRRGKPTIWLTLYSGRKPSFSLFWTKQFGWYQRSITPICGFSGSSIFLDRRIWPFSIFSIHPLHVLLLDLAYSAAKSLSVFSTLPSLPSWPLPATPPASAVFLTFCWSSQRSSENPSTSTSGCRRVWPTFQKQGKWYQCGTLPSKMGDCTMMAIRRESLGMFSLHFLQEARPLLAYSAR	355232	401611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355614_355656_355763_356222_356341_356923_356986_357962_358095_361104_361257_361766_361864_364144_364275_364799_364923_366580_366666_370358_370487_373901_374098_375288_375427_375693_375762_376057_376299_377191_377330_379072_379220_381030_381209_381934_382051_384127_384229_386643_386858_388795_388912_394981_395149_401460
902077	contig_7078_pilon	+	3197	1	Intergenic	novelGene_130132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	547	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCAATCAACTGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113986	117183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_114000_117200
902078	contig_17074_pilon	+	3643	1	Intergenic	novelGene_145153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTGATGTGGGTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272592	276235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_272600_276200
902080	contig_3382_pilon	-	3074	14	Intergenic	novelGene_124171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	17	352	987659	981864	TRUE	20	TTGTTTTTTGACAGTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQSSYLTNHTGFVCFSVLNHILWIHLIFLKDDENRRIQPGIHAAVIPSLRVTKSARRVCVCHISFSEIPNQDAGYKHNYVFVITQAIFVGIDGFFGEVISSSVSGVMSAV	987675	945151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_945242_951750_951887_955421_955683_958022_959114_959551_959694_962563_962617_965242_965416_967479_967600_971867_971973_972810_973047_978963_979046_981255_981387_981761_981896_987355
902081	contig_15731_pilon	-	4798	23	Intergenic	novelGene_171967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGGATCTTTGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48217	11638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_-_11689_15121_15368_15885_16013_17410_17523_17793_17995_18352_18592_19670_19951_20591_20804_21773_21877_22169_22357_23504_23610_24621_24817_26460_26659_33744_34469_35456_35585_39238_39351_39554_39747_42053_42308_43233_43513_44871_45085_46140_46242_46575_46772_47873
902082	contig_4924_pilon	+	2143	8	Intergenic	novelGene_84709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATAGTAGGGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81215	252653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_82483_114578_114713_127723_127785_132966_133128_145996_146130_155810_155860_197778_197860_252396
902083	contig_4114_pilon	-	3386	1	Intergenic	novelGene_15591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCATTTTCTTGACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230694	227308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_227300_230700
902084	contig_11422_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_99110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAAACCATACCTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063	1538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_1100_1500
902085	contig_3627_pilon	-	4271	1	Intergenic	novelGene_78516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACACAAGGCAAAGTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627383	623112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_623100_627400
902086	contig_7963_pilon	+	1622	8	Intergenic	novelGene_58557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	228.764918103939	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	224	1051	247659	251126	TRUE	10	CAGTGGTTTCTAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKSSGADVHP	246705	253518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251099_251227_253047
902087	contig_11294_pilon	+	5249	19	Intergenic	novelGene_50051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	151.406940819749	240	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	28	1701	251378	348804	FALSE	25	GCTTTCTGAAATTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGGSNHLAVVLGDIILAVIDSIFVWFIFISLAQTVKTLRLRKNTVKFSLYRHFTNTLIFAVLASVVFMVWTTKTFRIAKCQSDWMERWVDDAFWSFLFSLILVVIMFLWRPSANNQRYAFMPLIDDSDDEIEEFMVTSENLTEGIKFRVSKTISNGAAKPATSDNFDEDLKWVEENIPSSFTDVALPVLVDSDEEIMTRSEMAEKMFSSEKIM	251350	352352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693_323788_325734_325806_332506_332617_333604_333664_334971_335076_337381_337456_338120_338195_340644_340698_347019_347051_348744
902088	contig_9011_pilon	+	5063	26	Intergenic	novelGene_159287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	216.560938306057	4	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1050	3153	314	3466	317573	787824	FALSE	25	CATCAAGCCATGCCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTGDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLIKNTKGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPAPRLKSKKWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTKKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRRDFLRLQLANKERSEALRRQQLEQQQRENEEHKRQLLAERQKRIEEQKEQRRRLEEQQRREKELRKQQEREQRRHYEEQMRREEERRRAEHEQEYKRKQLEEQRQAERLQRQLKQERDYLVSLQHQRQEQRPVEKKPLYHYKEGMSPSEKPAWAKEVEERSRLNRQSSPAMPHKVANRISDPSLPPRSESFSISGVQPARTPPMLRPVDPQIPHLVAVKSQGPALTASQSVHEQPTKGLSGFQEALNVTSHRIEMPRQNSDPTSENPPLPTRIEKFDRSSWLRQEEDIPPKVPQRTTSISPALARKNSPGNGSALGPRLGSQPIRASNPDLRRTEPVLESPLQRTSSGSSSSSSTPSSQPSSQGGSQPGSQAGSSERTRVRANSKSEGSPVLPHEPSKVKPEESRDITRPSRPASYKKAIDEDLTALAKELRELRIEETNRPLKKVTDYSSSSEESESSEEEEEDGESETHDGTVAVSDIPRLIPTGAPGSNEQYNVGMVGTHGLETSHADTFSTSISREGTLMIRETSGEKKRSGHSDSNGFAGHINLPDLVQQSHSPAGTPTEGLGRVSTHTQEMDSGTEYGMGSSTKASFTPFVDPRVYQTSPTDEDEEDEESAAAALFTSELLRQEQAKLNEARKISVVNVNPTNIRPHSDTPLPQLLSSRSGQKMGWQMGSGRKSSGKQAYTFFFYLNAQSLYG	317259	789421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_317630_421427_421494_598551_598609_625098_625225_645919_646031_649708_649800_652879_653011_665507_665563_667558_667638_675963_676140_680784_680852_684813_685019_704497_704609_706563_706753_716217_716383_719256_719497_722081_722189_731969_732134_733842_733941_735022_735047_739981_740167_757471_757602_763089_763255_764414_764527_765328_765440_787693
902089	contig_18272_pilon	+	2669	4	Intergenic	novelGene_7057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.12825877028341	85	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAGTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476534	481159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_477403_477464_478146_479999_481048_481087
902090	contig_10063_pilon	-	3186	1	Intergenic	novelGene_127746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTGGTGGCTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434103	430917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_430900_434100
902091	contig_2027_pilon	-	4148	19	Intergenic	novelGene_39928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3299	3754	164705	163485	TRUE	25	ACTTCCCACTGTTTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVAQKLGCKVANLGLEHMGHNGAVVARPCLLHQVCISLCNLTLHAQGVAEVELFQVAIVEEVLGELWHIAEALQSRVHEARVAQICETTDAWLALEVLIFLRHALHDILLCTGPSAIFVSGLHDDHLASLEAGVKYCNVCVAQSLKRAV	172104	162194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_162264_162424_162556_162886_163005_163408_163553_163691_163758_163880_163975_164372_164551_164655_164815_165548_165634_165744_165839_166559_166769_167451_167503_167698_167946_168037_168105_168341_168464_169414_169554_169649_169770_169962_170052_170138
902093	contig_12677_pilon	-	976	2	Intergenic	novelGene_110728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1743	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_116_873
902094	contig_15264_pilon	+	1749	1	Intergenic	novelGene_158861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGAATTACTGTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10543	12292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_10500_12300
902095	contig_10324_pilon	-	4094	5	Intergenic	novelGene_7895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_4	137.266847781975	255	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	201	860	761911	755303	FALSE	5	GCGCGTCTGTTCTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGEPPTGQRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFKVKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDVANQESFAAVQDWATQIKTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPTEDGRRLADDLGFEFFEASAKENVNVKQVFERLVDVICEKMNESLEPSSSQGSNGKGPALGDAPPPQSSGCSC	763781	752068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_755491_760887_761013_761092_761212_761683_761971_763640
902096	contig_6593_pilon	+	3596	1	Intergenic	novelGene_49841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTGTAATATATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185697	1189293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1185700_1189300
902097	contig_10331_pilon	-	2849	5	Intergenic	novelGene_54120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	81.4984662432367	338	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	447	1184	397775	397038	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYICPTEEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSTEYSENKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENVDIKKYCVHYLENVGSFEYTRNTLKELESKAYKQIDACGGNPELIALVEHLSKMFKENE	409095	395372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_397797_398048_398120_398576_398647_401970_402064_408904
902098	contig_3449_pilon	-	3112	5	Intergenic	novelGene_73714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGCAGAACATTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530869	334345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_-_336551_363142_363422_428858_429254_475386_475598_530847
902099	contig_7695_pilon	+	2665	1	Intergenic	novelGene_41539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACTCAGTTTTATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372532	375197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_372500_375200
902100	contig_15929_pilon	+	1156	7	Intergenic	novelGene_172464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	276.673493891667	170	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	559	897	87373	92051	FALSE	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKIVS	82259	92310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_83350_83512_83865_84057_84400_84489_87307_87623_89766_89844_92039
902101	contig_14954_pilon	-	2595	3	Intergenic	novelGene_165165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	375	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1177	1482	123859	123554	TRUE	50	TCTATGAACAATAATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISLGYIPRSGIAGSYGIPISSFVRKCYIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPFQHLLFPVFLICANTAGVRWYLIVVLICISLMASDRKYFLMCLLAA	125035	40706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_40753_118794_119126_122817
902102	contig_18364_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_102560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCCGTAGGGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102486	101651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_101700_102500
902103	contig_13707_pilon	+	2558	32	Intergenic	novelGene_43521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAAAAAGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124962	181991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_+_124999_125127_125219_126019_126104_127933_128020_133607_133700_135226_135263_136411_136482_138445_138538_140267_140305_140788_140858_140952_141045_141609_141648_143000_143069_143215_143307_143970_144008_145175_145246_145939_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152164_152695_152762_153124_153216_154404_154441_155990_156057_156452_156626_159285_159370_160630_160765_169937_170046_172845_172986_174885_175004_181856
902104	contig_13097_pilon	-	4619	2	Intergenic	novelGene_107679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3971	4369	78959	78561	FALSE	45	ATTCGTAGAATCAAACGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNISSNNMQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKGKDRNYIMIKVSIHQEDITIINIYVPNDRTPKYIKQTLTALKREIDSFTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKFSKDTEELNATVSQLDLIDIHRTLYPTAAK	110530	78310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_80135_107735
902105	contig_12948_pilon	-	5541	4	Intergenic	novelGene_126172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGATAACATGTAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172437	165358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_165512_166101_166420_167286_171925_172005
902106	contig_5744_pilon	-	2443	5	Intergenic	novelGene_149341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	135.987821145866	430	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	812	1216	648812	642056	FALSE	35	TCCCAATAAAGAGCTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFQADAPNPGLIPDADAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYTETELRENPPVKPDFSKLQRNILASNPRVTRFHINWEDNTEKLEDAESSNPNLQSLLSTDALPSASKGWSTSENSLNVMLESHMDCM	655838	640828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642269_644567_644745_648797_648914_654236_654451_655342
902107	contig_19640_pilon	+	2915	3	Intergenic	novelGene_134870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	339	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGCCACTGAGCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94866	98864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_96381_96470_96610_97602
902108	contig_17194_pilon	+	5434	10	Intergenic	novelGene_155357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.7168048226829	402	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	763	1716	259448	294708	FALSE	20	CTTTTACTGTGTACTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPPQATLHRNVSPGAPQRPPSTGNAGGMLNTSDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLIGTTGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLNTQRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFSSPGMLSLGQVSAWQQHHLGQAALSSLVAGGQLSQGSNLSINTNQNINIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQPPPQPPLQPQPQPRQEMGRSPVDSLSSSSSSYDGSDREDPRGDFHSPVVLGRPPNTEDRESPSVKRMRMDAWVT	75833	298426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_190807_190996_232839_233044_256436_256548_259298_259530_260448_260509_272282_272471_288401_288529_292599_292727_294338
902109	contig_2278_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_118092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1628	2101	662078	661605	NA	10	ACGCGGGCGGCGCGAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSETILRRKQEFFCFPAYPDEAQIYHIPGTLLDILPFDRYPDVLGKKDNNKQKEQKFSRSRKKSSRFGGVRDVLSKNEVILEPKCRLAEVQATRGTVPGAGSGRRSEDSQDRSSSPVVVNSSSPRTGRARWTPPSDTRTWRGWEGVTSAFLLSLPGR	663705	661515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_661500_663700
902110	contig_3612_pilon	-	1513	12	Intergenic	novelGene_87812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_7	174.064821211729	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	21	689	881794	873082	TRUE	40	TATTTGGAAATTTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARTVLLPAARRWLRGFTERILVGGAAGRSLYFGGSRLRSTQAAAQVVLNVPETRVTCLENGLRVASEDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLNAYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSFP	881814	868740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_868909_868997_869074_869260_869350_869424_869511_871145_871307_872192_872337_872981_873095_874616_874816_878786_878917_879316_879404_880323_880465_881695
902111	contig_10140_pilon	-	2571	2	Intergenic	novelGene_148408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_1	0	169	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATAGTAGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231576	223813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_226004_231195
902113	contig_6612_pilon	-	5579	13	Intergenic	novelGene_148154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_10	130.457608057177	733	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	24	2534	72745	16917	FALSE	20	TTATTGAGTTTTGAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEEEGERGVASTSVQNQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIERKRKPNRNTDNSKGIKPGQKQIQLPKTSAASTPPTDSDPQTTQEPLPTPSSSSLNKEMKYAIPETYDTERIKLPQEQYQLPQTLVTIPPPPHSLHQTPQMLLLTPSSSFFTQNMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVIKTKEHNK	72768	13871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_50106_50275_60837_61006_61951_62141_64167_64576_67224_67264_67488_67657_71390_71525_72480
902114	contig_10345_pilon	+	1550	4	Intergenic	novelGene_158388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3170	junction_2	131.631640910873	13	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	953	1252	20456	24141	FALSE	20	CAACTGGTATGTCACTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	19503	24439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_20517_21588_21648_23046_23170_24084
902115	contig_15236_pilon	-	3611	2	Intergenic	novelGene_141602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1208	1531	594693	594370	TRUE	45	TACCAAGTAATAATAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYHPTPCLPLLDLSHFLAGQSAAFRWANSQLPRELIHHSPAGRDQGMGGTSSVLCEFTPPTPAGFFSAISLLLVLLFLASFGFFPASHLLPLLSLERLTPCVFASS	595900	532387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_534351_594252
902116	contig_10135_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_106604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCCCCCTGAGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81300	83823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_81300_83800
902118	contig_9833_pilon	-	3938	4	Intergenic	novelGene_68506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	401	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	35	CTGGACAGAGCTAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	213059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
902119	contig_13067_pilon	-	3055	4	Intergenic	novelGene_141345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	656	1000	158941	44011	FALSE	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRAPGGFELPTFWLAAVALNPYATRVLQQILDQWNGIENPDVNPSTYEQLIFDKGPKSIKWEKTVSLINDVGKIGLPPAGKRSRDTSLTPYTKTNSKSIRDLNVETKTVEFF	159596	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_44148_100865_100993_148937_149009_158931
902120	contig_6137_pilon	-	5469	4	Intergenic	novelGene_59175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	668	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2776	3126	1311572	1311222	TRUE	30	CAATCATTAATGGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKVTEKQKKKIPTALLPPQACRASKGRCEKLHEKRGTENVDAEYTEIPKKHNSKTQECCPKATGFSNYIIYLLSSCEALSISAKCELIVFQCTSATYNIWSLKVKSYLILLIAL	1314347	1251618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1252938_1268440_1268456_1310048_1310271_1310434
902121	contig_17976_pilon	+	1798	4	Intergenic	novelGene_32521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	9	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	176	637	41843	48588	FALSE	75	TAAAAAAAAAAGAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRLQYGWSWKTLC	41667	49749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46794_48551
902122	contig_17993_pilon	-	418	2	Intergenic	novelGene_61925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTACAGACTCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55205	41882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_42218_55122
902123	SIRV6	+	1025	6	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	1389	56	4	-55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2476	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
902124	contig_16322_pilon	-	2608	14	Intergenic	novelGene_87532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_13	153.527246391692	527	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	583	2289	103834	77890	FALSE	10	TCATTTTTGGCTTTAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	106707	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_106148
902125	contig_11720_pilon	+	2102	10	Intergenic	novelGene_43817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2412.10024257843	234	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1192	1818	87050	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVPLRYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67872	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67882_67971_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
902126	contig_18850_pilon	-	2822	10	Intergenic	novelGene_142411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCATCCACTCTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182424	163395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_163405_175385_175508_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513
902127	contig_2444_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_83788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTTTTCCAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256300	258700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_256300_258700
902128	contig_18162_pilon	+	3218	2	Intergenic	novelGene_122306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	1792	2898	9632	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKNIGSPFLLRPPGSAELSPSPARPRPAAPARPRDAAAGGRLPRGLRAAALHGVPAHQPQAPRAAPVRMWWLQEAPVASESVLLLSAIDKGCLSLWWHEMRTSCCRPRKKLKSSLLMVNRWCFVSVDVSQDYNQVENVIKQAQEILGPVDMLVNCAGMSLSGKFEELEVSTFERLMSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7840	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_10810_16364
902129	contig_3077_pilon	+	3592	10	Intergenic	novelGene_26888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCGATCGAGGGCTCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497324	1523346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1498430_1499810_1499954_1501400_1501629_1502948_1503058_1503238_1503347_1504899_1505016_1508718_1509798_1517370_1517519_1517849_1517991_1522931
902130	contig_16125_pilon	-	2639	16	Intergenic	novelGene_155240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	900.885998460528	4	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	862	2298	236037	117592	FALSE	40	CTGTCCAAAGAAATATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	236981	117250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_155570_155618_179440_179598_235796_236752_236834
902131	contig_1339_pilon	+	1494	2	Intergenic	novelGene_163157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	210	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	42	668	667070	676121	FALSE	5	TCTCGCCGTCCTCGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQKKLVYLFFRLGMSEPSPELVPAATSGPESLLCRAAPQVMLLPPRPPTLRSSPEAMDPPPTLQSSPEAMDPPPSQVDPLPPQVDPPPAASSPPHYYLLIDTHGVPYKYTAQRKEGRRPPAEEPAPGDGEEEGRSCPCHECGRVCSSPMQLQGHLLTHSMVRPFTCDTCDRAFKRSSDLARHRRMAHNTVRRTGTDRPYVCPYCPRRFQDTATLAEHVPTH	667028	676947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_667137_675561
902133	contig_6270_pilon	-	4998	2	Intergenic	novelGene_99871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1064	1381	1051977	1051660	TRUE	20	TATGTATGATTTCTGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTGPAITFCTPACTGLSNRGNPDFTVQLIELSPTLLPQPALLPIQLFSFLMSIFLPNIALEAVSSWFCLIPPLHQPPLLHGWFSTVMYVESEKDILLCVTLVLH	1053040	1047359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_1048767_1049449
902134	contig_8289_pilon	+	3165	15	Intergenic	novelGene_171176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_14	364.936365713816	76	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	176	1636	197934	236995	FALSE	5	CTGCTCCCATGGCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTAKPTGYNPSIVIVGTLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQGSEPKYTRQLTLSRQKQKVCMDETLWLQENIRDKLRPIPITASVEIQESSSRRRVNSLPEVLPILNSNEPKTVHTDVHFLKEGCGNDNICNSNLKLEYKFCTREGNQDKFSYLPISQKGIPELVLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTNDGDDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRSFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSSVTFYLILSTTEVTFDTTDLDINLKLETTSNQDNLASITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGGTVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLKNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVESKGLEKIACEPPSEINFLKLKESHNSRKKREIAEKQTDDSRKFSLFAERKYQTLNCSVNVNCVNIRCPLRGLDSKASVILHSRLWNSTFLEEYSKMNYLDVLMRASIDVTATAENIKLPNAGTQVRVTVFPSKTAAQYSGVPWWIILVAILAGILMLGLLVFLLWKDRTRYVMDM	192597	238524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_192636_197796_197958_198161_198306_199808_199925_200043_200237_200327_200412_200507_200588_200739_200818_200905_201009_203309_203484_204936_205036_205134_205246_205336_205436_212521_212648_236965
902135	contig_3382_pilon	-	6191	13	Intergenic	novelGene_124154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	64	753	990400	989711	TRUE	55	GGACGGAAAAGAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQMSSGMTSRTSYMKKAEGHYKEERKKRPKWMSEETPKLALERRVAKANGRNDEVKEMNRRFKGQLEKTTSLLKCYNEMCKDLEIQNQKRRTHLAFLKMKELKKKFKPQVAILTDSMILNKTGSIKRRWQENTEFLYQKELVNIQPLQEIVYDQEPRGLKEEIHAALKALGKNKAPELTEYQLRCFNKRMQHRKCSLIYAKKFGRHLPGQLTGRDPYLCPFQRKVI	990463	931124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_931754_951751_951887_955421_955681_958018_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965416_967479_967600_971867_971973_978964_979046_981255_981390_981765_981896_987355
902136	contig_16722_pilon	+	5698	18	Intergenic	novelGene_118274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTCTCCAGAAGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89820	149489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_91909_96291_96481_103887_103972_105710_105905_109688_109999_115772_115997_116286_116368_121587_122080_122766_122990_125205_125419_130772_130882_131815_131970_132711_132961_136189_136233_136609_136761_143790_143925_144487_144606_148847
902137	contig_5084_pilon	+	2060	12	Intergenic	novelGene_64506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCAGAATCTGACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349225	375956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_350027_350978_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383_353471_354824_354907_356009_356185_356695_356837_364477_364588_365262_365378_375774
902138	contig_4924_pilon	-	1981	11	Intergenic	novelGene_84688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1120.21505078266	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	24	1310	252576	65524	FALSE	35	TTAGTTTTTAGAAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252599	64852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
902139	contig_8600_pilon	+	3645	7	Intergenic	novelGene_125736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	160.97066675502	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	81	1097	102400	119760	FALSE	35	CTTCAGTATTTGAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRALSGRLTPSLKLPDPGASITSVTMGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSVMKSFSFSDHSCNPSLLSIITHITVPTQAPGNSSTLAPTSAPPLKSGPFLDTESFIGLVVFVLCLLYSSIRTSSNSQVSKLTLSGSDSVILSDTATSGANDEADGKPRRAVDNEKEGVQYSYSFFHLMLCLASLYIMMTLTRWYSPDAEFQSLISKWPAVWVKISSSWVCILLYAWTLVAPLVLTNRDFS	102319	122308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109433_116379_116587_118721_118950_119621
902140	contig_11316_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_122669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139375	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140035_140432
902141	contig_9471_pilon	-	2940	11	Intergenic	novelGene_21857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1030.13283124071	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	802	1269	437668	434615	FALSE	25	ACTTAGGTTTACAGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGDPFKDIILYVKEEMKKNNIPEPVVIGIVWSSVMSTVEWNKKEELVAEQAIKHLKQYSPLLAAFTTQGQSELTLLLKIQEYCYDNIHFMKAFQKIVVLFYKAEVLSEEPILKWYKDAHVAKGKSVFLEQMKKFVEWLKNAEEESESEAEEGD	446559	432943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437832_438947_439105_439752_439819_440615_440711_442732_442914_445217_445292_446494
902142	contig_12638_pilon	-	2318	14	Intergenic	novelGene_33131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGACATTTTTAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199758	177418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191804_195500_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
902143	contig_10599_pilon	+	2119	5	Intergenic	novelGene_49861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	748.492818936829	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGATATGAAGCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123153	165607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_150971_151011_154179_154252_163810
902145	contig_5777_pilon	-	3883	3	Intergenic	novelGene_173316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	424.5	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	710	1042	43469	43137	TRUE	30	TGAAAGTGAGTGGTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPEYIRQSLTILASKEHSGYTSSKTNLFVLLAVHGIYNVLCQHRNSKASILLQPSLFIVQFSHAYEAIENTMAWVRRTLVLKGTSLLFNTFKRSFAAYLPSAVCRLIF	78031	39571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_40165_40888_43649_77501
902146	contig_3386_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_34580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482366	484973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_482400_485000
902147	scaffold_13505_pilon	+	3392	5	Intergenic	novelGene_111565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.9226580145875	17	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAACCAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608577	620865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_610099_612696_614334_620104
902148	contig_10197_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_115208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908347	910355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_908300_910400
902149	contig_12837_pilon	+	5822	1	Intergenic	novelGene_57411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTAAGTTCCTGGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498861	504683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_498900_504700
902151	contig_3745_pilon	-	5110	1	Intergenic	novelGene_85101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3920	4234	466005	465691	NA	50	ATGTTAGACTAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGLIHQEDITTINIYAPSNKAPKYMKLFKNNRIKTEIDNLTMIVGDFNIPLSIMNGTTRWKINKETDALNNTINQPDIYRTLHATTAEYTHFSQLYKEYSSG	469924	464814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_464800_469900
902152	contig_7457_pilon	+	1969	3	Intergenic	novelGene_31301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATGAAGCTGATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166221	168705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_167224_167654_167785_167868
902155	contig_1239_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_150404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTTGCTAGAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426690	424508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_-_424500_426700
902157	contig_8538_pilon	-	4920	22	Intergenic	novelGene_4627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.98976975388345	245	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3650	4042	817400	813633	TRUE	25	CGATGATCACGACCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAQRQHLSIAGRHGECGHGPAQRGDGAADPGPLQLLHPLCFLGRLQSPQRDEQLLSSDEGLYGGRGREGEVDDLLDVESFHLKDQVFNGPPGDFRRRELLKVTENRRGVQPVAVAGLCPPSPARPLIS	828176	803893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_803969_806564_806667_806925_807040_808914_809020_809280_809361_810913_811058_812144_812229_813458_813686_814471_814585_817021_817129_817280_817470_818258_818382_818643_818764_820352_820527_821378_821494_821652_821793_822015_822109_822200_822274_823540_823642_823872_826268_827242_827405_828092
902158	contig_9011_pilon	-	6926	1	Intergenic	novelGene_159361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	663	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789208	782282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_782300_789200
902159	contig_12278_pilon	-	2274	2	Intergenic	novelGene_152603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	73	639	234501	226604	FALSE	15	GTCCATTTCGACTCATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQTWKPYRAVPLCPIGLLQVRIDLMATVLVLVPNSKSLDCLEELLVELWMPKAILVKARNEKSYREILYRLREYIWHQQQNVARNVDVKFASGEAFKGNNEYVIRQWRKGEAFYAVAKNLSELCSNVWQKVELVSDKSGYLAEEISKQDLKGATWFLLAAYSKMQEERDGLKNELGKIKTELKILLYKLRTCVLECSPRTWLHNLLLKTLSL	234573	224968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12278_pilon_-_227150_234480
902160	contig_8304_pilon	-	3015	1	Intergenic	novelGene_153163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	955	1338	29900	29517	NA	35	CACTTACATGAAATGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIALFSSSCTILSFLCSLGSCPVLHPLLPVKTIYWSVPQLYSPEYPPELSMPTGHFPFQHLTGSAYSTFPNEFQTRNCYMKQKLTEMKGGTDNLTILIGYFNTPQLGRSTRSRKLTRKTTRKYET	30854	27839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_27800_30900
902161	contig_6270_pilon	+	7454	1	Intergenic	novelGene_99883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1639	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	309	620	1075150	1075461	NA	20	AGATGAGGTTTCTCCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEKAFDKVQHPFLIKKVLRKIGIEGNFLDIIKSINTKPIANIILNGERLKASPLITGTRQGCPLSPLLFNTVLEFLARAIRQAIKGIQISKKEVKLSQFTDDMISYTENPKESTRKLLELTEDFSKVSGYKTNIQKSVGFLYTNKENFEKEIIKSIPFTMAPKKIKYLVIYLTRDVKDLYKENYKTLLQEPKQTYISGKAYHTCG	1074841	1082295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1074800_1082300
902162	contig_12528_pilon	+	2984	23	Intergenic	novelGene_81276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	261.572805629003	220	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	170	2635	246294	344698	FALSE	25	GACTACTGTGTTTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTRVYCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKADMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLRMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCDSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPASPSTADKEENPAVLAENCFRELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVQCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKDSPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVDFEASDLQGSSACSTALSTSSKDSDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTTTHNLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTMVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDASFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLVIALQDSVIINEDNLPMFQRCGIMALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKYTLPKSLEKHDKNLYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVKDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILPNSVPSDDVVSNTEEITFEALKKAIDTNGIEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY	246124	345047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_246304_281542_281620_284324_284453_286846_286998_289038_289161_293929_294080_295481_295620_297531_297611_299724_299861_301889_302058_305296_305412_306949_307002_307896_308070_308532_308609_312425_312588_313171_313304_315483_315552_316469_316598_327245_327338_332992_333042_337048_337153_338090_338141_344592
902163	contig_3601_pilon	-	3179	1	Intergenic	novelGene_132875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1838	2191	152004	151651	NA	35	TAGTTGGTAATAAATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSENHSAMSCKTFASGCASGDAPGCDSEASTGDDSHKGSSEAAGLISSDGGRETNGFTGKGGLADKDGVISSDGSERAGSVGRRHSTEFRDSVSPSQGSGSHFFLINALTLTSDTI	153841	150662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_150700_153800
902164	contig_7009_pilon	-	5613	8	Intergenic	novelGene_23625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5030	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3984	4385	537017	536616	TRUE	45	GAACATACTCTTCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	541000	431204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_431277_444938_444992_453478_453601_506371_506631_512644_512815_517990_518116_522864_523001_536324
902165	contig_3161_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_84521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405034	406466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_405000_406500
902166	contig_10299_pilon	+	2968	21	Intergenic	novelGene_79741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	104.653045822852	339	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	49	2430	445836	517350	FALSE	15	GGAAATGTCTCTCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFWFILVLLGSGLIRVNANNATTVSPSVEVTRSIKASTTEPVKEETKTSNPDFSVTSVSVAPTFSPNLTLGPTYVTTVNSSDSDNGTTRTAGTDSRVATISPNGTWLPDNQFTDVRTEPWEGNSSTAATTPETFPSSDETPIIAVMVALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTCNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK	436657	517888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_436700_445829_445909_446647_446990_461790_461876_463092_463167_463367_463505_488618_488710_489793_489871_493160_493198_497085_497184_498369_498490_499230_499398_499838_499975_500712_500863_502292_502387_502702_502780_503290_503426_511683_511810_511888_512041_516300_516437_517275
902167	contig_12312_pilon	+	1907	1	Intergenic	novelGene_63921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGTTTGGAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44487	46394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_44500_46400
902168	contig_12019_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_87774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	657	1169	702425	701913	NA	50	AAAAAGTTCACAAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGSNKCWRGCGEIRTLKHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKPEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTNEWINKLWYTHTMEYYATRKNNDESVKHFITWMKLEDIIFSEISQSQKDKYCMRLLL	703081	700734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_700700_703100
902169	contig_5210_pilon	+	1260	10	Intergenic	novelGene_65442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	73.5503522832328	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	493	1215	613292	622124	FALSE	75	TGGAAAAAACAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFWACSTNKPEGYRVSQALRENTYPFLAMIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRNLQEEKEKKLECLPPEPSPDDPESVKIIFKLPNDSRVERRFHFSQSLTVIHDFLFSLKESPEKFQIEANFPRRVLPCVPSEEWPNPPTLQEAGLSHTEVLFVQDLTDE	565746	622169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_565827_591290_591360_606728_606863_608380_608458_613063_613150_613245_613338_614670_614849_616480_616653_617262_617407_621941
902170	contig_13101_pilon	+	4727	7	Intergenic	novelGene_172783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1265	1768	236472	236975	TRUE	20	GGCACAGTACGGGGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTLFPGESSPQPLTFKVLSFSHFSASSSRSYSFSLSCPLDPWFVVIFPRLQNLERMLGCLVADFNQFILTLDFFCDGPAHSFSQVYLGIILAGISNISPVAFLFDLVCLWFSSKYSLNTLVFFFMLPNSVSLFLFAFPFGSFSLYSSECLILSISMLLVPLISSF	232673	244675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_233735_234695_234865_236437_237126_238254_238404_238996_239092_239899_241885_244095
902171	contig_7254_pilon	+	2086	5	Intergenic	novelGene_145854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	655.11239493693	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	188	343	242444	286438	FALSE	15	AGTCTTTTTTACTGGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGTSNYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSARDGRRDSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAEYTNNHRFYTLIWTKEKWEGEVDCPVN	228461	288181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_228491_230872_230988_242400_242489_243050_243091_286367
902172	contig_7119_pilon	+	2832	4	Intergenic	novelGene_40911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	2	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	197	1450	137033	140225	FALSE	30	TCTTAAAGGGCTAGATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127461	141607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139462_139789
902173	contig_4364_pilon	+	1940	6	Intergenic	novelGene_386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	25	AGTGCTGCAGTGAACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
902174	contig_7051_pilon	+	3094	12	Intergenic	novelGene_64352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_5	439.039334445198	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	841	2529	338727	347955	FALSE	20	TGTTAACTTCTTGCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQDKRKEKQKREEKDFKFSSQDDRLKRKRESERTFSRSGSISVKIIRHDSRQDSKKSTTKDSKKHSGSDSSGRSSSESPGSSKEKKAKKPKHSRSRSMEKSQRSGKKASRKHKSKSRSR	321875	348520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337699_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
902175	contig_13331_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_178779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	525	827	3615	3917	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMTNVINVHKCLKAQDSWMGNASHYMLMSNMVLGTLICKLRTIVVSHNEMYFASEAFSLVQEIVLDYKNNLTYDFNILFGGSWELDFIGITKIQNDNTN	3090	4980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13331_pilon_+_3100_5000
902176	contig_4315_pilon	+	4053	14	Intergenic	novelGene_46759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	74	junction_1	307.929312567773	599	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	423	2228	265874	293317	FALSE	15	CCCCCGACTATACTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKGSSTDGKTDLANGSLSSSPEEMSGAEEGRETSSGIEVEASDLSSSLTGDDGGPTRTSTESRGTDTESSGEDKDSDSMEDTSRYSINDENRVHDHSEEEEEEEEEEEEEEEEEQPRRRVQRKRANREQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELGSSARFVYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVLDFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKLALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEKKVGLYTIYVNPANTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENENNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLVYSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGSDCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTELTGLKDVIKKNKRERDEDSLHHTDLFDSHMLWFLMHHLRQRRHHRRWREPGVGATDADSDESPSSSDTSDEEEGPDRVQCMPS	250370	295142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_250697_251445_251519_265850_265923_268802_269489_270465_270607_271713_271809_277695_277807_285725_285799_286277_286336_286848_286957_288344_288476_291955_292076_292480_292598_293200
902177	contig_13292_pilon	+	2729	21	Intergenic	novelGene_142923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_20	183.600626360587	275	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	177	2462	148568	553721	FALSE	20	TCCCAGCATTCATTTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLSETRHPLQPEEQEVGIDPLSSYSSKSGGDANKNGRTSSTSDSDGTFNSYRKEWEELFVNNNYLATIRLKGINGQLRSSRFRSICWKLFLCVLPQDKSQWISKIEELRAWYSNVKEIHITNPRKVVGQQDLMINNPLSQDEGSLWNKFFQDKELRSMIEQDVKRTFPEMQFFQQENVRKILTDVLFCYARENEQLLYKQGMHELLAPIVFILHCDHQAFLHASESAQPSDEMKTLLNPEYLEHDAYAMFSQLMETAEPWFSTFEHDGQKGKEALMTPIPFARPQDLGPTIAIVTKVNQIQDNLLKKHDIELYMHLNRLEIAPQIYGLRWVRLLFGREFPLQDLLVVWDALFADGVSLSLVDYIFIAMLLYIRDALISSNYQTCLGLLMHYPPIGDVHSLILKALFLRDPKRNPRPVTYQFHQNLDYYKARGADLMNKSRTNAKGAPLNINKVSNSLINFGRKLISPAVAPGSAGGPVPGGSGGSSSTAGIPTRTSAEAPKPHLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRLMKSESMPVQLNKGQSSKNISSSPSIESLPGGREFTGSPPSSATKKDSLFSNISRSRSHSKTMGRKESEEELEAQISFLQGQLNDLDAMCKYCAKVMNTHLVNIQDMIVQENLEKEDQILVSLAGLKQIKDILKGSLRFNQSQLEAEENEQINITDDHYCSSGRGQGQGRLPAGAAKQASSETPGRTDGGSSDDFILVSKEDDSGSARGGLLGPGPASSHPQNYSQEK	66992	553988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_67134_148532_148665_241658_241726_262862_262972_264453_264544_264639_264715_265803_265872_288559_288663_295514_295604_297098_297150_297247_297318_302678_302852_373571_373715_389668_389776_426697_426784_445078_445390_471397_471562_516722_516823_548771_548852_549664_549815_553568
902178	contig_1301_pilon	-	1939	15	Intergenic	novelGene_47324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	576.777129524791	7	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	83	1207	322831	279423	TRUE	65	ATGAAGAAAAAGAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRLFKFANK	322913	269185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_274190_274328_277726_277906_278296_278465_279344_279448_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
902179	contig_14687_pilon	-	2594	2	Intergenic	novelGene_107910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCTATAGGGCAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442306	437011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_439105_441805
902180	contig_9038_pilon	-	3372	1	Intergenic	novelGene_143328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATGGTTTGAATTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405771	402399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_402400_405800
902181	contig_5424_pilon	+	4870	22	Intergenic	novelGene_172804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	117.074718859019	96	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	320	676	96371	115196	TRUE	25	GTGAGCGAGAGCGACGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFSTRTYGTSGLDNRPLFGETSAKDRIIHLVVGSLTSLLILVTLISAFVFPQLPPKPLNIFFAVCISLSSITACILIYWYRQGDLEPKFRNLIYYILFSIIMLCICANLYFHDVGK	96051	168311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_96449_112511_112563_113588_113694_115073_116843_117088_117236_117868_118245_118789_118946_120473_120562_123481_123695_124961_125110_126343_126571_128699_128812_129701_129736_131068_131224_135061_135139_139133_139250_144247_144343_152897_153021_155822_155942_156656_156778_166294_166435_168210
902182	contig_15449_pilon	+	2989	18	Intergenic	novelGene_33560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	839.01762872712	12	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	357	1820	44312	51815	TRUE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTKIQVKMQMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	11178	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_12845_12884_14474_14552_15759_15842_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51179_51221_51330_51809_51932_54570
902183	contig_9839_pilon	-	6716	3	Intergenic	novelGene_88512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	428	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCTCTGGGTTCTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55967	45364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_45423_48718_48857_49447
902184	contig_18055_pilon	-	2642	22	Intergenic	novelGene_117818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	134	511	92357	91068	TRUE	10	AGACTGCTCCGCCGGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLNIRFLSDSRVMSSNAGSFTNLSRISSQTASNSIGGAACFNILLKADSFRFIFRASSFSLSRSRASAFSSNLLLKASLIFPASNVVDLLVELITATKSSKVVFTSTTNPLSFRMSFIIFFSS	94913	40687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_40859_41917_42054_59718_59800_63065_63116_73607_73717_75197_75318_75559_75625_77928_78311_80663_80771_81057_81158_81240_81304_82068_82234_83358_83469_84603_84757_85571_85699_90723_90843_90994_91103_91209_91329_91839_91981_92274_92365_94704_94798_94880
902185	contig_15697_pilon	-	3487	2	Intergenic	novelGene_173293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	443	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	476	901	14681	14256	FALSE	65	TTTAAAAATAAATAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANIAKNGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVWTEQGDTAWFKVRKRVRQDCILSPYLFNLYAEEIIREAGLYEQERGIRMGGRLINNLHYAEDTTWLAESEEDLKQLLMKIKGHSFSMDYSPNKENKNPHIWTNKQHHDKRRKD	42961	11669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_15038_42842
902186	contig_19737_pilon	-	3795	1	Intergenic	novelGene_158960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	416	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21289	17494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_17500_21300
902187	contig_7322_pilon	+	2091	2	Intergenic	novelGene_164922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAATATCACACAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284667	294278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_286152_293671
902188	contig_12677_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_110848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
902189	contig_11816_pilon	-	2386	12	Intergenic	novelGene_98500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_11	181.575838491708	169	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	71	2053	599730	559655	FALSE	80	ATGTAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRWATPRCAVGFLVLLLRCFARAEPSGTTGNDPFTIVNADTGKCIKPLNDWIVAKDCQETEDMLWKWVSRHRLFHLQSQMCLGLDIAKPVDSLRMFSCDSSAMLWWKCEHKFLYGAAQYRLTLKDGHAIASTNSSDVWIKGGTEESLCEQPYHEMYTRDGNAYGRPCEFPFLINGTWHHECVVDENHSGPWCATTLNYEYDQKWGICLKPENGCGNNWEKNEQIGSCYQFNTQTALSWKEAYISCQNQGAALLSINSAAELTYLKEKEGIARIFWIGLNQLYSARGWEWSDHKPLNFLNWDPDMPRAPTIGTSSCARMDAESGLWQSFSCEAQLPYVCKKPLNNTVELTDVWTYSDTHCDSKWLPNNGFCYLLANESGSWDEAHAKCKALSSDLISIHSLADVEVVVSKLHNGDAKEEIWTGLKNINIPTLFQWSDGTEVTLTYWDENEPNVPYNKTPNCVCYLGKLGQWKVQSCEEKLKYACKKKGEKINDAGSDKMCPPNEGWKRHGDTCYKIYADNVPFGTNCNLTITSRFEQEYLNDMIKKYDKFQRKYFWTGLRDVDSRGEYSWASVGGIKRAVTFSNWNYHEPAFPGGCVAMSTGKSLGKWEVKDCRNFRALSICKKMSEPPEPEEAAPKPSDPCPEGWYSFPSGLSCYKVK	599800	559321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_559864_563103_563274_563411_563501_564055_564167_565625_565784_566698_566891_569925_570067_571234_571346_577146_577312_586398_586570_592877_593250_599636
902190	contig_7045_pilon	-	2128	2	Intergenic	novelGene_77461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	909	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTCAATAGCAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553401	372781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_373085_551576
902191	contig_16846_pilon	-	6097	3	Intergenic	novelGene_82929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	16.5	424	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	63	776	514386	495280	FALSE	80	AACAAAGCAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSDLGEDEGLLSLAGKRKRRGNLPKESVKILRDWLYLHRYNAYPSEQEKLSLSGQTNLSVLQICNWFINARRRLLPDMLRKDGKDPNQFTISRRGGKASDVALPRGSSPSVLAVSVPAPTNVLSLSVCSMPHHPGQGEKSAASLPQGELEPTKSLVTPGSTLTVLTRAEAGSPTGGLFNTPPPTPPEQDKEDFSSFQLLVEVALQRAAEMELQKQQDLSPPLLHTPIPLVSENPK	518241	489958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_495802_514194_514427_518219
902192	SIRV6	+	1285	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	20	6	20	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	36	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACGCTAGAAGACCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3125	11818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
902193	contig_7356_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_60431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	1237	1872	515934	515299	NA	45	TTTTAAAGCAATATATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFRCRVRKLQSKTMGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSGNVFQFVKLQPRSQHVFSSFSFK	517170	515067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515100_517200
902194	contig_1406_pilon	-	3487	3	Intergenic	novelGene_25445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	14.5	494	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	465	1583	586902	585784	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPPPVAELGHHLTELDVSHNRLTALGAEVVGALRELRKLNLSHNQLSSLPAQLGALAHLEELDVSFNRLAHLPDSFSFLHRLRTLDVDHNQLTAFPQQLLQLVALEELDVSSNRLRGLPEDISALRALKILWLSGAELGFLPSSFCELASLESLMLDNNGLQALPAQFSCLQRLKMLNLSSNLFEEFPAALLPLAGLEELYLSRNQLTSVPSLISGLGRLLTLWLDNNRIRYLPDSIVELTGLEELVLQGNQIAVLPDNFGQLSRVGLWKIKDNPLIQPPYEVCMKGIPYIAAYQKELAHSQPAVQPRLKLLLMGHKAAGKTLLRHCLTEDRVEGNQGGGDKEKSSPPSPPPVSKGIEVTSWPADASRGLRFIVYDLAGDESYEVIQPFFLSPGALYVLVVNLATYEPCRFPTAVGSFLHRVGARVPHAVVCIVGTHADLCGEWELEEKCLDIHRQIALQEKHDAEGLSHLAQVVDEALARDFELRSASPHAAYYGVSDKNLRRRKAHFQYLLHHRLQILSPRAAC	587366	484185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_484848_498646_498774_584668
902196	contig_5899_pilon	+	1463	2	Intergenic	novelGene_146952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	58	330	12751	43251	FALSE	60	AAAAAAAAAACTCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQRHPREGKLAQADATDCMQWDPLQLHAAKHDKVIFADEESLVCDQHNLLLFIVPVVYLSQEPEALNGLSRSLCYVAFQIFHGSLNGPWLSGKKKILSVEKSEPSLCL	12693	44384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_12871_43098
902197	contig_8530_pilon	+	4793	3	Intergenic	novelGene_178781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	4167	4691	66565	67089	FALSE	30	CTGGTCATCCAAGAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITKHLQKQYRMVPVGVQNKTPNDSPLEENALELPDREFKSQILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEELRKIMQEQNAKINSQLEIIERQELEIQKINHKISEMDGVIQRLRIRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRRKKNKETLRVMWDTIKTKNL	980	67191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8530_pilon_+_2347_5444_6323_64642
902198	contig_6397_pilon	-	3731	2	Intergenic	novelGene_146229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAATGCTGCCAGGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265295	261513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_264236_264286
902199	contig_12429_pilon	+	2274	3	Intergenic	novelGene_136218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.5	746	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGAGTGCTGTTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327890	374871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_328041_334090_334150_372806
902200	contig_8303_pilon	-	2210	6	Intergenic	novelGene_154917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	247.211164796414	1208	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	259	864	51496	29167	FALSE	15	GCAAGTATTGTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGATRPNGPNTGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEFQESTIGVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54838	27820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36287_51333_51593_54676
902201	contig_6031_pilon	-	1439	6	Intergenic	novelGene_56764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	840.742386227791	5	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	1	939	257696	254965	FALSE	20	AGAGTTGCCCTGATGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNACLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257696	254464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255862_256163_256375_256704_256814_257469
902202	contig_1699_pilon	+	4006	6	Intergenic	novelGene_72827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	363	junction_4	48.9955099983662	182	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1419	1766	99093	99796	FALSE	85	GAAAAAAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVIL	97078	102036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643
902203	contig_6109_pilon	-	3424	1	Intergenic	novelGene_160389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	528	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTACCTTTTAATTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626831	623407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_623400_626800
902204	contig_5280_pilon	+	3992	8	Intergenic	novelGene_52575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	544.460601824205	865	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	120	1451	38385	62372	FALSE	0	TTTTTCCCTCCCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGKSGSQTVKRECHHCGMYNPYSWKRILSFNCLRSTVKMQCLWLPKRKRVNAFQHVLWMPLGTRYVPKYSQPCSCSKVIFGQLQIIWPISQILLRAHCLKASF	38265	64913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043
902205	contig_11590_pilon	-	3131	5	Intergenic	novelGene_125583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	559	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAGCAAAATAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740211	602516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_603303_687807_688323_690719_691249_691435_691811_739285
902206	contig_10973_pilon	+	1872	2	Intergenic	novelGene_150343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGGCCTAGGTGCATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239	3260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1512_1660
902207	contig_13004_pilon	+	3173	4	Intergenic	novelGene_112621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATATATATACACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189887	378066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_192538_370538_370837_377773_377801_377868
902208	contig_17108_pilon	+	4893	1	Intergenic	novelGene_109501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	455	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1673	2101	16877	17305	NA	40	ATTATCACTTTCTAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSVPWIHSTLNHKDTLKPSARCGQQFCPSSGKRTGAMCQEESSWWGKFSLSVFFLLRETRALRNNATALLFRIPGHFWDETPLLTFGVCSKGKDRYCEGLTEISVSTIFTIPRRRISYRKRKMKCYSHVINYIIILKFRL	15204	20097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_15200_20100
902209	contig_7357_pilon	-	2274	8	Intergenic	novelGene_36799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_7	2194.59058521964	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	280	1392	166808	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSCFCCCSNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167087	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_166772
902210	contig_9705_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_41770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATTTAGCAGACATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556407	558582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_556400_558600
902211	contig_6102_pilon	+	1856	13	Intergenic	novelGene_31927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	382.846538736113	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1	483	380019	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	380018	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393114_393279_393435_393540_393636_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
902212	contig_7119_pilon	-	5219	1	Intergenic	novelGene_40933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	84	353	132642	132373	NA	5	TGCTCTGGTAGCCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSKIYKILEHLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFPKEDIWVANIHMTKYLGSLAVREMRIKTTMRYHLTLTLLALKKKEQKIANVGEAVGRLERLCTVGGNAKWYNHYGKRYGTFLKN	132725	127506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127500_132700
902213	contig_5836_pilon	-	4161	4	Intergenic	novelGene_106267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	167	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	3742	4161	693	1	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRRRKQTIQNKQTNKSPGIPPAWQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHRARYSSERRGGGERQGRNKQKKSNTSSQQMALREPLVQVCGIQAAAVSRPRDCGCGKQRRPSRGEEGWGVGKHISQITGCFVSRWKLREAA	16553	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_266_538_1352_4039_4159_13589
902214	contig_8843_pilon	+	6509	11	Intergenic	novelGene_156647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	285	junction_7	333.637842577847	462	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	13	1665	49851	117048	FALSE	45	ACAAAAACCCTTATACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYDPPDPRRIYTIMSAEEVANGKKSHWAELEISGRVRSLSTSLWSLTHLTALHLNDNYLSRIPPDIAKLHNLVYLDLSSNKLRSLPAELGNMVSLRELLLNNNLLRVLPYELGRLFQLQTLGLKGNPLSQDILNLYQDPDGTRKLLNFMLDNLAVHPEQLPPRPWITLKERDQILPSASFTVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWEYRKKGIMEEIVNCDADIISLQEVETEQYFTLFLPALKERGYDGFFSPKSRAKIMSEQERKHVDGCAIFFKTEKFTLVQKHTVEFNQVAMANSDGSEAMLNRVMTKDNIGVAVVLEVHKELFGAGMKPIHAADKQLLIVANAHMHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKGVIDYIFYSKTHMNVLGVLGPLDPQWLVENNITGCPHPHIPSDHFSLLTQLELHPPLLPLVNGVHLPNRR	49838	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_49963_53127_53315_54647_54734_66012_66103_83970_84040_87806_87965_89797_89953_107316_107469_110287_110516_112586_112790_116835
902215	contig_401_pilon	+	3673	30	Intergenic	novelGene_42910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	356.050598282681	2	103	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1940	3322	1952148	1972939	FALSE	35	CCATAATGAGCTTATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1929691	1973290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1946477_1946691_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952097_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1972807
902216	contig_16211_pilon	-	2000	11	Intergenic	novelGene_150057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_9	306.471466861109	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	584	1171	91808	85565	TRUE	20	TAGGTCTCCATCCCCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPGWLHSTSLCNDFLGCF	121358	73441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85615_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_92147_92272_97474_97609_121086
902217	contig_4924_pilon	-	4285	11	Intergenic	novelGene_84647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1298.08878355835	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	509	1132	114708	69062	TRUE	35	AAAACCTGTAGTTTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINIAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGMCLPQLQGRAWCGQPSGQQSPLESLETRTFCRCSCLLEMLSLLKSSLTNRPI	252614	60833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_62869_63149_64084_65479_65652_69049_69153_74571_74840_82347_82480_114575_114728_145988_146130_155810_155860_197778_197862_252398
902218	contig_14925_pilon	-	7474	1	Intergenic	novelGene_55235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	792	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60454	52980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_53000_60500
902219	contig_12157_pilon	+	3607	1	Intergenic	novelGene_135876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	411	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAGCTTAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16607	20214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_16600_20200
902220	contig_9177_pilon	-	3273	1	Intergenic	novelGene_32689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTGAAGTCGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413960	410687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_410700_414000
902221	contig_12570_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_79340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCGCCCAGCAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135654	134264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_134300_135700
902222	contig_3575_pilon	-	3042	5	Intergenic	novelGene_141107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_4	122.603782568076	146	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	1301	2233	404352	397675	FALSE	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCYVALNVLKSGYLSLSDINLLVFDECHLAILDHPYREIMKLCENCPSCPRILGLTASILNGKCDPEELEEKIQKLEKILKSNAETATDLVVLDRYTSQPCEIVVDCGPFTDRSGLYERLLMELEEALNFINDCNISVHSKERDSTLISKQILSDCRAVLVVLGPWCADKVAGMMVRELQKYIKHEQEELHRKFLLFTDTFLRKIHALCEEHFSPASLDLKFVTPKVIKLLEILRKYKPYERQQFESVEWYNNRNQDNYVSWSDSEDDDEDEEIEEKEKPETNFPSPFTNILCGIIFVERRYTAVVLNR	406632	396865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_398152_400062_400232_403636_403798_404226_404362_405341
902223	contig_12503_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_143825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	30	329	120439	120140	NA	20	GCCCAGGAGTGGACAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRQKSETGSMPYTIHKNKLKWIKDLNAQTNHKILRRPSRDNAVGPSFQQWIITDSERQNKLMGPQKIKNFCSSKDFTKKVKRQATIWETIFRNHISDKNLINKTYIKL	120468	118397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_118400_120500
902224	contig_5686_pilon	+	3144	4	Intergenic	novelGene_45387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163012	301135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_165603_178849_178968_268157_268329_300870
902225	contig_709_pilon	+	2446	4	Intergenic	novelGene_57541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_3	54.1848687365763	93	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	106	543	1506140	1508895	FALSE	40	ATCTTTAATGCATATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLLLKDPKEDDCGQDPYIRELGSYGLEATLIPVLSFEFLSLPSFSEKLSHPEGYGGLIFTSPRAVEAVELCLEKDNKTEECQDYMLTFDGSEHLVEPRQSYFLGNRRYDSILNSQANVSPPVLNVRLLGVYISTQNRSGASLL	1506034	1510798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1506203_1506403_1506488_1508381_1508479_1508701
902226	contig_8674_pilon	+	1722	3	Intergenic	novelGene_102935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	943	junction_2	593	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	22	1203	455575	460416	FALSE	30	CATATGAAGCCTTAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQGNIFDMERKKKKYDKREQNKNAGSSFKLCNSLSNLNERTSIKEKTVSIEVKSTNLEINIHRSLMKSSNINSSDSKDISCKINRVMAPKEYLQRQKHKEAIGNKASKKSCVIEKIKNVPCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQVSGIKSTKEAWLKCVNTEKRMQEANQKIDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGNSPLK	455553	460935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456506_457759_457844_460249
902227	contig_10003_pilon	-	2772	3	Intergenic	novelGene_88257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_2	7.5	187	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967378	747812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_750355_806943_807043_967247
902228	contig_19402_pilon	+	4102	1	Intergenic	novelGene_80802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	617	940	51611	51934	NA	85	AAAGCACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQPLWKMIWCFLQKLKIEIPYDPSTPFLGIYPRDLTEVTRIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPKYPPIEEWINKLWYIHTVEYYTAIGNNDEFSKHNIDESGGHYAK	50994	55096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_51000_55100
902229	contig_5777_pilon	+	1854	8	Intergenic	novelGene_173311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCCCGGGTCGCTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18972	65181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_18981_43195_44439_46524_46683_47289_47416_53621_53664_56490_56571_57809_57942_65116
902231	contig_1639_pilon	+	2725	25	Intergenic	novelGene_74881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	246.236787575609	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	132	2204	283593	324232	TRUE	15	TTTCTTTTGTCAGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRSGTPKPSTPTPTPSSTPHPPDAQSSTPITPCATLIPHDSGFTPQPTLLTQFAQQQRSLSQAMPVTTIPLSTMVTSITTGTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAAFRWLPHF	279697	331676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314717_315025_315536_315689_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
902232	contig_11855_pilon	-	2583	4	Intergenic	novelGene_66983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTTAAATTATTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119259	1113497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1114122_1114495_1114982_1116913_1117096_1117968
902233	contig_15596_pilon	+	4495	15	Intergenic	novelGene_139530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	312.361904181149	55	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	384	2969	126064	157355	FALSE	20	TCTGGGCGAGACTTCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVPARGLLTALAVVFGMAVAFAPVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLSLTAFKFLGKNEDGKGRCPFDPAQSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRHSSQSPLRTEYAIPWLNEPSFVFTDVIRRNPNDTEGEDDKVYFFFMEVSVEYEFMFKLMIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSNLVFNMLQDVFILRGPWLKEPVFYGVFTPQLNNVGLSAVCVYNLSSVEEVFSRGKYMQSATVEQSHTKWVRYNGAVPRPRPGACINSEARAANFTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSITPTDNRPRLIQKDVNYTQIVVDRVQALDETICDVMFISTDRGALHKAVSLENGVHVIEETQLFQDFSPVQTLLLSSKKGKRFVYAGSNSGMVQAPVAFCGKHSTCVDCVLARDPYCAWSPHTTACVTLHQEHGSGRGLIQDMSGDVSACPDKVQGSSQQHFFKHGGTAELKCSQKSNWARVVWKFQNGVLKADSPKYSLVGRKNLLIFNLSTGDSGVYQCLSEETVKNKTVSQELAKHVLEVKVVSSPPVAPTLLAVQTEGSRIATRVFAGATLGASPPKPAVRVTTPGAVMTPPSHLTPTSTPCQPKIVINTIPQIHSEKTMYLKSSDNRLLMFLFLFFFLLFLCLFSYNCYRGYLPSQCLKFRSAMLLGKKKSKSDFSDCEQTAKETLVEQGSSSQQNGEQPKPALDTGYETEQDTITSKLPTDREDSQRIDDLPIKDKPFDVKCELKYADSDADGD	105664	158881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_105831_125846_126164_128203_128350_136550_136614_138346_138446_141831_141926_142805_142920_144894_145047_148473_148650_148732_148890_150029_150253_151133_151250_154928_155102_155198_155243_156426
902234	contig_11631_pilon	-	2047	15	Intergenic	novelGene_104196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	63.2994180583883	187	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1932	115	2046	241681	161982	FALSE	50	AAAGAGAAAATATGATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENLDEFIEERKAKLAKDKAELESDPPYMEMKGKASEKLSENSRILISMAKENIPPNNQQTRGSLGIDYGLSLPLGEDYERKKHKLKEELRQDYRRYLTQKNFLSTVETDPSTLGVSLPIGERLSAKERLKLERNKEYNQFLRGKEESKETFRQVEKSTESKSERNKKSVCQVKPDLPSQVQASCKNSEGPRRDVLTPSEAYEELLNQRRLEEDRYRQLDDEIELRNRRIIKNTHEEGSISSKKHQRLANKANIPDRRFRRFNEDRVLDRQYYRPDHDPEVSEEMDERFRYESDFDRRPLRVYANDRIAPLPPPPLLPPLATSYRTPYDDAYYFYGARNPLDPSLAYYGSGMMGMQPAAYVNAPVTHQPAQSVVNMVGQNEMKTTGDRAVNSGLFFEDKPKPSKQSLQSYQEALQQQIREREERRKKEREEKEEYEAKLEAEMRSYNPWGKGGGGAPLRDAKGNLITDLNRMHRQNIDAYHNPDARTYEDKRAVVSLEQNLATSNAENLEDSANKNSGYMQTQSSPFARGNMFGEPPTELQIKQQELYKNFLRFQIEEKKQREEAERERLRIAEEREEKRLAEQRARIQQEYEEEQEKKREKEEEQRLKNEELIRLAEERRKEAERKKKDEEEKHNLQLQHYY	253112	161980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_162096_162516_162667_165441_165555_168680_168834_176482_176631_178697_178828_186069_186149_186503_186626_205542_205983_206681_206781_208084_208166_216406_216511_239674_239775_241582_241707_253023
902235	contig_12638_pilon	-	5569	15	Intergenic	novelGene_33333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_2	204.071566078258	777	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	1396	2997	1391053	1332741	FALSE	10	CGATTGCCTTATTCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFLGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECGLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYTRTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETGGFGQE	1392448	1330168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1332841_1351883_1351957_1357893_1357991_1359275_1359381_1359790_1359912_1369746_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373068_1373158_1374643_1374716_1375548_1375622_1378299_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900
902236	contig_5669_pilon	+	2032	8	Intergenic	novelGene_86073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	246.530703473425	23	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	121	987	186087	188167	TRUE	50	TACAGCAAACCAAGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHGEAPRRLLLASCCPGACF	185966	280173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187250_187512_187718_188312_194163_194997_260597_260629_280136
902237	contig_19007_pilon	+	2680	20	Intergenic	novelGene_168434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_19	153.448720083586	463	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	131	2332	3958	33635	FALSE	20	GTACCCAAAGTTGTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACDPNNKRLRQIKDQILTDCRYNPKILFQLLLDTAQFEFILKEMFKQMLSEKQTKWEHFKKEGSERMTELADVFSGVKPLTRVEKNENLQAWFREIAKQILSLNYDDSTAAGRKTVQLIQALEEVQEFHQLESNLQVCQFLADTRKFLHQMIRTINIKEEVLIAMQIVGDLSFAWQLIDSFTSIMQESIRVNPSMVTKLRATFLKLASALDLPLLRINQANSPDLLSVSQYYSGELVSYVRKVLQIIPESMFTSLLKIIKLQTHDIAEVPTRLDKDKLRDYAQLVPRYEVAKLTHAISIFTEGILMMKTTLVGIIKVDPKQLLEDGIRKELVKRVAFALHRGLIFNPRAKPSELMPKLKELGATMDGFHRSFEYIQDYVNIYGLKIWQEEVSRIINYNVEQECNNFLRTKIQDWQSMYQSTHIPIPKFTPVDESVTFIGRLCREILRITDPKMTCHIDQLNTWYDMKTHQEVTSSRLFSEIQTTLGTFGLNGLDRLLCFMIVKELQNFLSMFQKIILRDRAVQDTLKTLMNAVSPLKSIVANSNKIYFSAIAKTQKIWTAYLEAIMKVGQMQILRQQIANELNYSCRFDSKHLAAALENLNKALLADIEAHYQDPSLPYPKEDNTLLYEITAYLEAAGIHNPLNKIYITTKRLPYFPLVNFLFLIAQLPKLQYNKNLGMVCRKPADPVDWPPLVLGLLTLLKQFHSRYTEQFLALIGQFIRSTVEQCTSQKIPEMPADVVGALLFLEDYVRYTKLPRRVAEAHVPNFIFDEFRTVL	3099	33983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_3230_3957_4088_7103_7217_9157_9325_9438_9515_11438_11550_12627_12769_13834_13916_15012_15115_15842_16023_17200_17326_19056_19220_19752_19856_19943_20024_24081_24186_25166_25297_27121_27219_29232_29387_33039_33128_33578
902238	contig_6842_pilon	+	3773	1	Intergenic	novelGene_130785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAGGCAATGTGACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1384850	1388623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1384800_1388600
902240	contig_11364_pilon	+	3419	4	Intergenic	novelGene_65173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	368	1018	128950	129600	TRUE	55	GGAAAGAAAAGAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQIKTPDDSPVEENALEVPDREFKSLMLGIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQYAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	128250	132186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_128568_128899_129778_129831_130812_130942
902241	contig_12677_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_110839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3486	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3500
902242	contig_16492_pilon	+	1840	12	Intergenic	novelGene_100302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	285.252823918921	3	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1011	828	1838	161165	170388	FALSE	55	GAAAAGAAAGAAACGACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMIADGMIHLCIYAVSAITKDAEVTIAFDYEYSNCNYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRRTREDRKVEAIMHAFENL	158156	170390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_158546_158928_159081_159418_159478_159993_160182_161125_161171_164830_165074_165986_166136_166513_166632_167388_167499_168549_168800_169195_169280_170337
902243	contig_11281_pilon	+	2957	12	Intergenic	novelGene_125422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	255.282407223875	416	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	440	1672	126667	237909	FALSE	25	CACTGTTAGTTTTTATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDASLIEANGELKVFIDQNLSPGKGVVSLVAVHPSTVNTLGKQLLPKTFGQSNVNIAQQVVIGTPQRPAAPNTILVGSPHTPNTHFVSQNQASDSSPWSAGKRNRKGEKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVAEFSAADNHILPNESAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEVERQRRLERIKQKQSQLQELILQQIAFKNLVQRNRQAEQQANRPPPSNSVIHLPFIIVNTSKKTVIDCSISNDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMACGLESGSCSAEDLKMARSLVPKALEPYVTEMAQGSISGVFVTSSGSTSNGTRLSASDLTNGADGMLATSSNGSQYSGSRVETPVSYVGEDDDDDDDFNENDDED	124059	239194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_124435_126602_126679_178695_178763_215057_215165_223446_223569_224868_225035_227028_227173_228437_228507_230872_231025_231738_231906_233428_233508_237761
902244	contig_10500_pilon	-	1932	7	Intergenic	novelGene_41286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1657	junction_6	296.400301769227	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	122	1030	1640040	1629460	FALSE	25	GAGCAGAATGCATTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640161	1628557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
902245	contig_2114_pilon	-	1527	5	Intergenic	novelGene_104229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACGTAGATGCGGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139933	136393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_136523_136910_137097_137427_137993_138372_138491_139404
902246	contig_11386_pilon	+	2682	4	Intergenic	novelGene_82779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	515.69844763087	59	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	231	953	17940	21088	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRYGLQASVPLAGPRALCSPSAC	17709	23420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_22453_23055
902247	contig_10766_pilon	+	3099	1	Intergenic	novelGene_151236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	935	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATGAATATAGATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218595	221694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_218600_221700
902248	contig_7426_pilon	+	4091	30	Intergenic	novelGene_27518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	187.902016108265	71	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1172	3519	289	3807	996222	1017294	FALSE	10	GCTCTGCCATGCATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSNPLVGNSPARYGTLMIETSVDPLSSSVSSMRLSGYCGGSPWRVIGYHIVVWMMAGIPLLLFRWKPMWGVQLRLRPCSLARAETLVIEIRDKEDSSWQRYIVQVQTEAISEGSLDLPPQAQMEDGRSQAAVGAVPEGSWKDTAQLHRKEEAKRVLRYYLFQGQRYVWIETQQAFCQVSMLDRGHTCDDIHRSQSGLSLQDQTVRKTIYGPNEITVPVKSYLQLLVDEALNPFYGFQAFSIMLWLADRYYWYALCIFLISAISICLSLYKTRKQSQKLRDMVKLSMQVCVYRPGGEEEWVDSRELVPGDCLVLPQEGGLMPCDAALVAGECIVNESCLTGESIPVLKTVLPEGPVPYCPETHRRHTLFCGTLVLQAQAYVGPHVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFIAALSVLAVLGTIYSIFILHRNQVPLKEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQNRLQKQGIFCIHPPRIILGGKLRLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLQGQTFLPLDPEPRHLPMGPLLRALATCHTLSQLRDTPVGDPMDLKMVESTGWVLEGAPAADSTFGTQVLAVMRPPLGEPQLQEEPPVPVSILCRFPFSSTLQRMAVVVTWPRATQPEAYVKGSPELVSGLCRPETVPTNFAQTLQSYTAAGYRVIALASKPLPIAPNLEAAQQLTRDTMEQDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQALRRTHIRAVMVTGDNLQTAITVARGCSMVGPQEHLVIVHAIPPEQGQPASLEFLPVESSAAVNGTKDPGQAVSCTMELDPRSSHLALSGSTFTILVKHFPKLLPKVLVQGTIFARMTPEQKTKLVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSSFTSSAASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDMQFLTIDLVITSTVAVLMSRTGPALVLGRARPPGALLSVPVLCSLLLQVALVAGVQLGGYFLTMAQPWFVPLNRTVPAPDNLPNYENTVIFSLSSFQYLILASAMSKGAPFRQPLYTNVPFLVALVLLSSFLAGLILVPSPLYRILALRNISDICFRLLLLGLVAFNFVAAFMLESMLDQYLPACLRRLRPKQASKKRFKQLERELTEQPWPPLPADPVR	994556	1017578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_994655_996031_996226_999842_999938_1000047_1000234_1000543_1000603_1000773_1000889_1001207_1001288_1002530_1002609_1002806_1002877_1003798_1003934_1004017_1004085_1004165_1004298_1008870_1009027_1009598_1009710_1009794_1009842_1009928_1010118_1011218_1011426_1011922_1012013_1012100_1012261_1012365_1012487_1012605_1012731_1013438_1013600_1013721_1013839_1013929_1014010_1014671_1014825_1014907_1015005_1016203_1016428_1016512_1016665_1016906_1017077_1017156
902249	contig_9807_pilon	+	2064	14	Intergenic	novelGene_32848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	567.778876034505	5	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	135	1844	109130	158783	FALSE	35	TAAACCACGTGTGGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQVSSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108995	159003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139483_140755_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
902250	contig_11338_pilon	+	4350	4	Intergenic	novelGene_6313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGGAGGCTCTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239006	250564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_243038_244695_244745_249568_249784_250509
902251	contig_16121_pilon	+	1033	2	Intergenic	novelGene_6846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCCATTTTCCAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32440	45627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_32456_44609
902252	contig_5153_pilon	+	2572	11	Intergenic	novelGene_74403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_10	223.812086358177	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	988	1869	1011783	1022174	FALSE	35	AGGTCTGGAATATTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	1010795	1022877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
902253	contig_14603_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_165990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAATTATTTTGGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14888	13749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14603_pilon_-_13700_14900
902254	scaffold_4438_pilon	-	2085	2	Intergenic	novelGene_174531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACAGCTCTCCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408118	394294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_395772_407510
902255	contig_854_pilon	+	2424	15	Intergenic	novelGene_36525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	2376.79880000691	35	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	156	1820	1649514	1715801	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFSQYSRGPNLFNG	1612790	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687013_1715762
902257	contig_9481_pilon	+	2946	1	Intergenic	novelGene_149640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	353	694	128043	128384	NA	45	AAAAAAGAGTTGGCCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQHWRGGVKPEGWQVETECWPATVPPPPWYRTSLLPAQTPRFSSSQELSRRLQVVCPALLGPGTGGQGALSCTQPAGRGSLVTLFQPAPLPELGSLAFLMPGSGKVSRNDLA	127690	130636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_127700_130600
902258	contig_11816_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_98498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562021	559319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_559300_562000
902259	contig_9921_pilon	+	3937	4	Intergenic	novelGene_23750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	258.801081914276	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	124	651	321085	323234	TRUE	45	TTTAAAAAAACATCTTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVGCAESGVTIVTDMKVFPCFNWKSTSLTFQV	299192	326583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_321520_323141_324416_324478
902260	contig_10196_pilon	+	2635	2	Intergenic	novelGene_132351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	56	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATGGATTTCGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477303	2481206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2479266_2480533
902261	contig_1452_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_115129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTTTATGTTTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698703	696480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_696500_698700
902262	contig_5590_pilon	+	2589	11	Intergenic	novelGene_163004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	78.9711972810341	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	26	1183	246764	259038	FALSE	20	GTTTTAATGAGGTACTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGVLDLPTPRPRWRGFERSGPDGPGRKRRLLQAYEEPDAKQPRVDSEGDYSDNDDGPGDFRSGDEEFRGEDEFGELGRQRGEKDDEDEEVKKRREKQRRRDRMRDRAADRIQFACSVCKFRSFEDEEIQKHLQSKFHKESTKPKSDPFKGIGQEHFFKRIEAAHCLACDMLIPAQHQLLQRHLHSPDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYLRGEDPFTSEAVDPEAEGEDNLGGEDKEETAEEVAAEVLAEVITAAVRAVDGDRAPAPESSEVPAAVEGLADTSEASGDPLPEQLSASGTSCGTTEKGNTDAEAGNGAAEGTSRAAEALEAEASAAEAYSTGTGLVPGRDTMEGEVEQTDAESKDVLPME	245215	260444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_245238_246760_246800_251581_251712_251914_251962_253027_253062_254826_254915_255250_255333_255816_255854_256233_256365_256696_256793_258561
902263	contig_15327_pilon	-	2659	3	Intergenic	novelGene_70466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14	204	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1392	1853	352751	352290	FALSE	15	TCCAGCCAGTGTGGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNNLPHVTQQIVIFSNINSGLCPLPVPLLRFCTTSLAIRGHSWQGPGRERTSQRILFTRAGHVVEEGWSQVMKIKSIFPGLIGFSCGAWLSLNQQARSCTEEPLPGWEKGGGREAYSRPGFPASIVHWVYNLLQEVCLCAIETDSVFPFPSG	355176	351483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_353360_354306_354985_355071
902264	contig_1275_pilon	+	1090	8	Intergenic	novelGene_108757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGGATAAACCTGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400557	457697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477_444696_448396_448509_456887_456973_457653
902265	SIRV5	+	1954	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	41	34	13	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
902267	contig_15893_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_128496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	909	25	933	22021	22929	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLQLPRNMIENSMFEEEPDVVDLAKEPCLHPLEPDEVEYEPRGSRLLVRGLGEHEMDEDEEDYESSAKLLGMSFMNRSSGLRNSAASYRQSPDGSCSVPSARTMVVCAFVVVVAVSVIMVIYLLPKCTFTKEGCHKKNQSMGLIQPFATNGKLFPWAQIRLPTAIKPLRYELNLHPNLTSMTFRGSVTISVQVLQATWNIILHSTGHNISRVTVMSAVSSQEKQVEILEYPFHEQIAIVAPEALLEGHNYTVKIEYSANISTSYYGFYGISYTDENNEKKYVAFLNDSGSMLCDNFWSMDPFAHIGDSN	21996	24450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_+_22000_24400
902268	contig_9471_pilon	-	5393	2	Intergenic	novelGene_21709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1853	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAATATAAAACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98253	87375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_91037_96521
902269	contig_1813_pilon	+	2482	3	Intergenic	novelGene_105460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_2	71.5	477	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	276	416	15280	15420	FALSE	40	AAATTGAATTATACTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEDISDSQVSKLKEKLLLISALTNKPESNRPPETANKEQVQSFTSEPSALPKFSQSLGDQIEKAAQLRPISLPGISSINALQDLFQKTGQDMDGKLTYQEIWNTLGSAMPEPKSLRVFDSDGDGRYSFLELRAALGV	8752	17486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_8867_9914_10041_15244
902270	contig_8263_pilon	+	1911	4	Intergenic	novelGene_83093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	158	junction_1	138.622589148458	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	503	895	140133	188105	FALSE	65	ACAATCTCAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGEDFRPGKSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSGR	139630	189121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959
902271	contig_17880_pilon	-	4751	9	Intergenic	novelGene_167316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_7	111.295777098684	821	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	1426	2928	22723	9863	FALSE	15	CAATTCACCTTTTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLEALQVLAHLARGYFSMAQVYLMELGEVICKCMGEADPSVQLHGAKLLEELGTGLIQQYKPDSAIAPDQRVPVLLVVTFWTMMLNGPLPRALQNSEHPTLQASACDALSSILPEAFSVLPPSSLENDRQILCITLLLGLNDNKNRLVKAATSRALGVYVLFPCLRQDVIFVADTANAILMSLQDKSLNVRAKAAWSLGNLTDTLIINMETPDPSFQEEFSGLLLLEMLRSAIEASKDKDKVKSNAVRALGNLLHFLQPSHIENPRFTAIIEEAILALISTVVVEAAMKVRWNACYALGNVFKNPALPLGTASWTSQAYNALTSVVTSCKNFKVRITSATALSIPGKRGQYGSTEQYTRIWNALVTAFQKSEDTTDFLEFKYCASLRTQICHALIHLLSLASASDLPCIKEALEQDGNMVRSYILQFLKSGAEGDDIGTPHSSQERDQMVKAALEHIGSVQALAGDTAKRAIMGYLEDILTVHLDSAGSQVALLGLTQR	24148	8039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_10435_12754_12960_14022_14120_15179_15305_16659_16798_17566_17702_21255_21343_21743_21867_22702
902272	contig_3103_pilon	-	4987	1	Intergenic	novelGene_146188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2123	2470	65155	64808	NA	30	TCTGGGTAAGTAACTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLPKLIYRFNTIPIKIPAAFFAETGKVILKFILEIQGTQNRQNNLEENKVRGLTFPNLKTYYEVTVLKTLCYWDKGSHIYQWNRIYSPEINPYIYGQLIFNKGTRQFSSVFNY	67277	62290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_62300_67300
902273	contig_5145_pilon	-	2217	12	Intergenic	novelGene_131434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	94.5500872990843	869	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	701	1375	925621	916397	FALSE	5	TTCCGTCCTGCCTGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947093	915554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
902274	contig_10042_pilon	+	2044	4	Intergenic	novelGene_79089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	126.291549818488	136	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	10	603	6321	42785	FALSE	35	GAACCCAGAATCTTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVCISLVVLLWKNIIGFL	6311	44226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598
902275	contig_12512_pilon	-	6044	1	Intergenic	novelGene_24183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAATTGTAAGTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592640	586596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_586600_592600
902276	contig_8050_pilon	+	5922	30	Intergenic	novelGene_114833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_11	353.764672514964	313	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1335	4008	1006	5013	344102	409965	FALSE	20	TCTCTTTAAGTATGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDELKSVMLERACDQNNSIMVECLLLLGADANQAKESTSLICQVCEKESSPKLVELLLNSGPREQDVRKALTISIGKGDSQIISLLLQRLALDLANNSICLGGFCMGKIEPSWLGPLFPDKTSNLRKQTNIGSTLARMVLRYQMKSAGEEGAASGSDGNFSEDVLVKFDEWTFIPDSSMDCVFGQSDDLDSEGSEGSFLVKKKSNSISVGEFYRDPALQHCSPNLQRHSNSLGPIFDQEDLLKRRRKILSSDDSLRSSKLQSHMRNSDSTSSLASEREYITSLDLSSNELRDIDALSQKCCISGHLEHLEKLELHQNALSSFPQQLCETLKCLTHLDLHSNKFTAFPSYLLKMNCIANLDVSRNDIGPSVILDPVVRCPTLKQFNMSYNQLSSMPENLAVVVEKLEQLILEGNKISGICSPLSLKELKVLNLSKNHISSLSENFLEACPKVESFSARINFLAAMPFLPSSITSLKLSQNKFTCIPEAILNLPHLRSLDMSSNNIQYLPGPAHWKSLNLRELLFSSNQISILDLSEKAHAWSRVEKLHLSRNKLKEIPPEIGCLENLTSLDVSYNLELRSFPNEMGKLSKIWDLPLDELRLNFDFKHIGCKAKDIIRFLQQRLKKAVPYNRMKLMIVGNTGSGKTTLLQQLMKTKKSDLGMQSATVGIDVKDWPIQIRGKRKKDLVLNVWDFAGREEFYSTHPHFMTQRALYLAVYDLSKGQAEVDAMKPWLFNIKARASSSPVILVGTHLDVSDEKQRKACISKITKELLNKRGFPAIRDYHFVNATEESDALAKLRKTIINESLNFKIRDQPVVGQLIPDCYVELEKIILLERKNVPVEFPVVDRKRLLQLVTENQLQLDENELPHAVHFLNESGVLLHFQDPALQLSDLYFVEPRWLCKVMAQILTVKVEGYPKHPKGIISRRDVEKFLSKKRRFPKNYMSQYFKLLEKFQIALPIGEEYLLVPSSLSDHRPVIELPHCENSEIIIRLYEMPYFPMGFWSRLINRLLEISPYMLSGRERALRPNRMYWRQGIYLNWSPEAYCLVGSEVLDYHPESFLKITVPSCRKGCILLGQVVDHIDSLMEEWFPGLLEIDICGEGETLLKKWALYSFNDGEEHQKILLDDLMKKAEEGDLLINPDQPRLTIPISQIAPDLILADLPRNIMLNSDELEFEQAPEFLLGDGSFGSVYRAAYGGEEVAVKIFNKHTSLRLLRQELVVLCHLHHPSLIFLLAAGIRPRMLVMELAPKGSLDRLLQQDKASLTRTLQHRIALHVADGLRYLHSSMIIYRDLKPHNVLLFTLYPNAAIIAKIADYGIAQYCCRMGIKTSEGTPGR	323425	410874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_341428_341574_341712_341853_343856_344234_350645_350905_353778_353968_359355_359475_360574_360645_361144_361363_364869_365121_365392_365542_368098_368193_370881_371069_372248_372431_374721_374952_375388_375517_376837_377057_380923_381126_382195_382285_387024_387213_388117_388273_389342_389490_389633_389826_390691_390839_394914_395016_403317_403509_409796
902277	contig_3960_pilon	+	4103	1	Intergenic	novelGene_138056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTATGACTCGGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735147	739250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_735100_739200
902278	contig_8050_pilon	+	2850	2	Intergenic	novelGene_114814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1042	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	331	699	294062	294675	FALSE	30	GTTAAGGTAAATGGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVRSCSHSAHSPFLFGSECFPVSIIYPEFLVISVNEPLTVILR	293731	296826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460
902279	contig_10475_pilon	-	4040	2	Intergenic	novelGene_148727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	77	1003	84427	83449	FALSE	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKILRNFHKTSAEDFLYKPNCIRQMATCSDDDAVPVHPFSREAKRIVALPAADRHRLGLAMLYSPEMRRKRTIRTLCMTVLAAVFPTFKGPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHAPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKQRQHQLCETIEQGNTLGEGSLKQHSKVLLSAKSHVKSGQRYTPQASLVR	84503	80411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_83599_83650
902280	contig_7025_pilon	-	2601	18	Intergenic	novelGene_104384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	650.542749181105	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	94	2451	95047	49239	FALSE	25	ATGACCACGGGAAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95140	49088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_94786
902281	contig_6842_pilon	-	2737	3	Intergenic	novelGene_130646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_2	58.5	37	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	861	1286	202004	189633	FALSE	25	GATATATTTTTGTTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNSLLLQLLRACADDHDYSHLLIVFQLKHVSWWTRTLNTSLVPPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVRKTSDSTKMRIYLGQLQRGLFVIRRRSAA	202864	188181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_189732_192865_192951_201762
902282	contig_12279_pilon	-	1743	2	Intergenic	novelGene_50128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGAATGTTTTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73328	71349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_72340_72575
902283	contig_12528_pilon	-	2336	2	Intergenic	novelGene_81308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAATAAAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934660	931393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_931460_932390
902284	contig_6446_pilon	-	3537	3	Intergenic	novelGene_149196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCATTCTTTTCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321101	249273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_251767_300989_301248_320315
902285	contig_742_pilon	+	2514	2	Intergenic	novelGene_178782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	297	641	297	641	TRUE	60	AAAGAAAAGAATCACACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLRINLTRDVKDLYKQNYKTLLHETQRDLHKWKSIPCSWTGRLNIVKMSILPKAIYKYNAISIQIPTIFFKEMEKLIINLIWKGKKLRISKALLKKKNKFVGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRSIDQWNRIENPDVKPSPDLRQGPKVHQMGKRQSF	0	187331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_742_pilon_+_1530_186346
902286	contig_11304_pilon	+	3847	2	Intergenic	novelGene_156732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	0	89	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGCGCCTTTCCCGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533785	538014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_534960_535341
902287	contig_14882_pilon	+	3829	3	Intergenic	novelGene_114977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2995	3420	50536	50961	FALSE	85	AGAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYYEDLTIINIYAHNDRAPKYIKQILTALKRETDSSTIIVRNFNTPISVKDRISRKKLNKDTEEPKGTISQLELTDIYRTLYPMAAKYTFFSNAHGTFSRAEHILGHRATLNKIQNSEIIQSIFSDHNTIKVEINNRKSK	15944	51370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_16448_47979_50177_50241
902288	contig_6929_pilon	+	1836	10	Intergenic	novelGene_139357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_8	21.5549828102603	95	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	234	1442	18834	71684	FALSE	40	AAATCTCTTACAATCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSSSGEKLKYQQQDELQQLRQNLHRLQNLCNSAEKELRYERGKNLDLKQHNSLLQEESIKIKIELKQAQQKLLDSAKMCSSLTAEWTHCQQKIKELELEILKQAQSIKSQNNLQEKLAQEKSKVADAEEKILDLKQKLEHAQKVCLTDTCILGKKQLEEKIKEAMENEAKVKQQYQEEQQKRKLLDQNINELQRQVRILQDKENRLEVTSSQQQFRIQQQETLLKQLENEKRKSDEHLKSNRELSEKLSGLQQEKEALCEEYGQFLKQLDVHVRNYNEKHQHQKTKLRRVKDRLVHEVHLRDERIKQLENDIGALQQQMEKEKAFQDQITTQNDILLLEKRKLLEQLTEQEELIHGNKSIISSVQSRVLFLDKENKQLQENSLRLTQQVGLLERIIRSMQIRRGEETTISEIPEFEVLNKIVPLPNSSFSGTGLVESVGSLQEIEEHKSQEAMAKPKSAESLSCSQSSEVGYINVASLK	7222	72078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_7405_18782_18993_24316_24472_41490_41654_51251_51365_59700_59843_64035_64173_66596_66712_71104_71173_71527
902289	contig_6412_pilon	+	3953	2	Intergenic	novelGene_149945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	302	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1035	1418	228962	229345	FALSE	30	AAGGAAGGGGAGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPTALHPAIQSLREFGCVSGASMTFPCTSCAGFPSIVYCLTLHQNYHLSVVYLVPPPLLPPLVTNKDCFFLCVNFYMSFYSRALIQYFSFCDLLISLSIMSSSFIYVTRCFTDSSLFCIIA	139298	231880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_140156_228784
902291	contig_15857_pilon	-	2730	20	Intergenic	novelGene_152072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1364	1765	84972	77988	TRUE	40	TCGTGAGAAGAAATGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVFWIGYTIHKFLAKTKHTERFKASTIVHSQSYERLLWLSGISQTFPFSIFKHFFNLLQTEALYGLSYFRIIWVKKVWMTSQNNVFRKKLPYCVKRNFLHVHLSPLNTQQTNMLLYSFSWGKRSNHRTSRL	126757	53476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_53593_54607_54686_56445_56581_62287_62449_68575_68663_70077_70219_71477_71593_77855_78044_79043_79214_80716_80800_84879_85012_87925_88025_89277_89458_94927_94985_98578_98790_100759_100845_106560_106619_108630_108699_115719_115796_126267
902292	contig_10988_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_104724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATTATGTTGAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67872	67371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_67400_67900
902293	contig_1867_pilon	-	4816	23	Intergenic	novelGene_54541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTAGCTCAGTGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508790	356846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_356861_361974_362095_370856_370898_373802_373869_379091_379204_385204_385348_387661_387747_389352_389458_390642_390719_408285_408378_417203_417319_418593_418684_418866_418950_419933_420131_492601_492721_495537_495682_497563_497709_498415_498522_499632_499738_499850_500014_503059_503215_503735_503788_506302
902294	contig_10095_pilon	+	3651	2	Intergenic	novelGene_57229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2350	2661	185598	185909	TRUE	60	GAAAGAAAAGAAACAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWERLWGDWNSYALLVGMQNGTTISEMIWCFLKKLQIEIPYDPAITLLGIYPREIRALTRIDICTTIFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINYGTYTQQNTTQ	183248	186999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_186633_186732
902295	contig_16255_pilon	-	3013	5	Intergenic	novelGene_176095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	34.97409755805	222	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	59	319	33474	30015	TRUE	5	GGTGTGTTCTGCTGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRCCISKQLWRLQCSFWMEEGYDVKGVPTLLLDAYSFNDILAITGFNTCLGIAFSTGSTIFNVLRGILEVVIGVAAGSLLGVFIQYFPSSDQVREITCGKVML	33532	8860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_8922_11294_11404_24186_25063_28366_30158_33356
902296	contig_6412_pilon	-	2560	8	Intergenic	novelGene_149952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.7671336210123	65	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	263	568	242228	223664	TRUE	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHQRLQKYSTKSHYAELQTHRIEPADWPDIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGKTELEQCQVDAIVDTLDDFMSHFPWAEEKQDVKDKIFNKLLTHDAPILLQDLDTYLGGKEWFVGNSVTWADFYWDICSTTLLVLKPDLLDIHPRLVTLKNKVQAIPAITDWIQRRPQTKL	263716	220512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_221335_222493_223829_225668_225768_242186_242297_245458_245552_251634_251672_251747_251777_263681
902297	contig_5018_pilon	+	1252	9	Intergenic	novelGene_47184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	54.4895345456355	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	110	1144	1583103	1586783	FALSE	5	TTTCTTCTGAGTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPSEGEAPAAALAAVLKHSSALPPESAQVRGYDFNRGVDYRALLESFGTTGFQATNFGRAVQQVNAMIEKKLEPLSQEEDQHADLTQSRRPLTGCTIFLGYTSNLISSGIRETIRYLVQHNMVDVLVTTAGGVEEDFIKCLAPTYLGEFSLRGKELRENGINRIGNLLVPNDNYCKFEDWLMPILDQMVLEQNTEGVKWTPSKMIARLGKEINNPESVYYWAQKNPGLVLDIVEDLRLINTQAIFAKRSGMIILGGGLIKHHIANANLMRNGADYVVYINTAQEFDGSDSGARPDEAVSWGKIRVDAQPVKVYADASLVFPLLVAETFAKKVDAFMPEKNED	1582993	1586891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1583310_1583877_1584043_1584265_1584388_1584469_1584567_1584644_1584732_1585282_1585314_1585397_1585502_1586484_1586611_1586687
902298	contig_678_pilon	-	2328	12	Intergenic	novelGene_167787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_11	751.732478351351	94	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	177	1607	125258	31428	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGATTSLGTVALDPASDRTSNPQDVTEDPSQNSITGEHSQLLDDGHRKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLSRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPAKVPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVCILFTGAV	125649	30706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_31553_31722_31882_32698_32914_35731_35974_36684_36816_37326_37382_38796_38944_39925_40058_41346_41442_58505_58551_125173_125366_125580
902299	contig_7396_pilon	-	1954	14	Intergenic	novelGene_79596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2991.02238363545	3	63	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	296	1228	251531	247733	TRUE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYLNQIIPMQGVVAHMVILVDLLLLHK	255162	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247810_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251580_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255114
902300	contig_8375_pilon	+	2003	4	Intergenic	novelGene_141312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	131.90232076132	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	41	646	211491	221189	FALSE	25	ATTATCTGACCATTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVILPLFSCRPRAYCLADSDEESSSAGSSDEDDAPEPSGGDKQLLPGSEGYVGGHRTSKIMRFVDKITKSKYFQKATETEFIKKKIEEVSNTPLLLTVEVQECKGTLAVNIPPPPTDRIWYGFRKPPYVELKARPKLGEREVTLVHVTDWIEKKLEQEFQKVFVMPNMDDVYIPIMHSAMDPRSTSCLLKDPVVEAADQL	211450	222546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_211643_213043_213254_215395_215517_221066
902301	contig_3818_pilon	+	5807	38	Intergenic	novelGene_99242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	300.176609811889	33	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1379	4140	179	4318	432159	451629	TRUE	0	CCGTTTTCTTCTGTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDRECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEPEKERIMGKMEADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERCRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKAKPFGPEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKGGERTYTQLVRLVILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDMLNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPALYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKESIEEPSAKINVLLQAFVSQLKLEGFALMADMVYVTQSAGRLMRAIFEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPFERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKVELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEHLITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVSALRNSAFESLYQDQFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGKTICAEFAILRMLLQNSEGRCVYITPMEALAEQVYMDWYEKFQDRLNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIILSTPEKWDILSRRWKQRKNVQNINLFVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDVAHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSLCWISSKSSCMSRCRWSPTWTTARTTTSTPRPSPRPSRTSRTLWTTSPGPSCTAA	431853	455906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_431939_432065_432166_432340_432478_433015_433100_433189_433364_433760_433899_434113_434270_434796_434968_437161_437356_437543_437668_438704_438855_439107_439219_439731_439864_440027_440217_440562_440761_441159_441313_441423_441505_441777_441862_442575_442683_443096_443216_443440_443596_443701_443892_444526_444701_446045_446207_446495_446724_446985_447178_447263_447443_447733_447886_449717_449758_451469_451660_451750_451916_452136_452259_452460_452605_452699_452877_453179_453341_453429_453512_454984_455078_455391
902302	contig_5794_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_69735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	7	306	393950	394249	NA	25	TACTGGTTTTAGTGGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYSPKGDWRNLESMAPSHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPHKNKWD	393943	395929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_393900_395900
902303	contig_8120_pilon	-	2752	10	Intergenic	novelGene_159715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	10.257186580306	149	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	1408	2700	57119	37997	FALSE	15	AATGCTTCAGGCTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITGVFRMRVWAPVGVLTSLAYCLHQRKAALAEPQEADRRNPVDRNLLELKMVQVVFRHGARSPLQPLPLEQSQQVEWNPQLLEVPSQTQFDYTVTDLAGGLKPHSPFDSEYHETTLKGGMFAGQLTKVGMQQMFALGERLRKSYVEDIPFLSPTFNPLEVSVRSTNINRNLESTRCLLAGLFQRQKEGPIIIHTDEASSEVLYPNSQNCWSMRQRTRGRRQTASLQPGISEDLKKVKEVMGIGSSDGVDFLILLDNVAAEQVHSLPSCPALKRFAWMIEQRAVDTALYILQREDRESIQLAVGPFLHILENNLLKAVDPATPPSKIRKLYLYAAHDVTLMPLLMALGIFDHKWPPFAVDLTMELYQHQESKEWFVRLCYHGEEQVPEGCPEGLCPLDKFLNTMSAYTLSPEKYHRLCSQAQVIELGSGE	58526	37944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_38141_38786_38953_40447_40544_42609_42711_43772_43906_44654_44743_48107_48188_48681_48813_48930_49069_56903
902305	contig_11631_pilon	-	6671	38	Intergenic	novelGene_104168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTGAGGGAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106719	12721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_12749_13290_13447_14550_14696_24284_24470_30904_31182_34366_34476_35855_36029_37005_37145_46105_46339_48965_49066_49178_49319_49425_49535_50251_50456_54297_54408_54747_54958_55245_55330_58894_59069_59901_60052_67278_67408_68312_68472_68721_68871_73825_73918_79190_79234_79421_79591_80186_80339_80463_80639_81512_81672_82818_82950_86021_86152_87078_87215_87294_87436_88997_89070_92604_92737_99300_99440_100935_101106_102542_102684_103717_103835_105309
902306	contig_9119_pilon	-	1218	2	Intergenic	novelGene_169748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	0	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCATGGTCTATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252699	250418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_251598_252660
902307	contig_1452_pilon	-	4661	3	Intergenic	novelGene_115123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1801	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2064	2363	711116	710817	TRUE	20	GCTCTGCATCCCCTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYYYDETVCDLLMCCKFYHCDEVILMRLTRLDSVLMQSLLQYKREKRAETQGYLIPPGKQCWEQSASFGSEVPAQRSSQTKGRLITRTFLQSQWR	713179	650045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_650379_708694_710127_710283
902308	contig_7678_pilon	-	3022	21	Intergenic	novelGene_175948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	114.408686296103	24	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	164	2020	79518	58711	TRUE	30	CAATTTATATCCTGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKKIAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKERSAEELKEMQDKVVKLQEELSENDKKIKELNHEIEELEKRKDKEIGGILRSLEDTLAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLESEENKRKELEKNMVEDSKTLAAKEKEVKKITDGLNALQQASNKDAEALAVAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAETEAKQAQMKLKHAQQELKAKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKKLKEKLEAEMKKLNYEENREESLLERRRQLSRDISRLKETYEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDTEVTGKKLLEKGELKRRYTIIPLNKISAKCIAPETLRVAQNLVGPNNVHVALSLVEYKPELQKAMEFVFGTTFVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAASILTKFQELKDVQGELRIKERELQALEEELAGLKNVAEKYRQLKQQWEMKTEEADLLQTKLQQSSYHKQQEELDALKKTIEESEETLKNTNEIKKKSRRKV	85404	43616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_-_43670_47220_47382_47653_47771_50528_50730_55436_55633_56635_56780_58580_58776_60285_60411_63122_63259_65390_65596_67310_67431_67793_67933_68874_68993_69500_69661_71310_71545_75582_75733_75964_76199_77782_77828_78015_78127_79503_79543_85265
902309	contig_3382_pilon	-	6211	12	Intergenic	novelGene_124152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	538	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGACGGAAAAGAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985022	931124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_931754_951751_951887_955421_955681_958018_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965416_967479_967600_971867_971973_978964_979046_981255_981387_981761
902310	contig_16103_pilon	+	1826	12	Intergenic	novelGene_118917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	320.909451454858	168	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	424	1275	794268	806541	FALSE	10	CCTTCAGCCTCTGCCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGVSVTSSNTGVPDISGSVYSKTQQSFEKQGFHSGTPAASFNLPSALGSGGPINPATAAAYPPAPFMHILTPHQQPHSQILHHHLQQDGQTGSGQRSQTSSIPQKPQTNKSAYNSYSWGAN	771067	807092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776836_794237_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_803231_803300_804931_805130_806445
902312	contig_15596_pilon	+	2154	15	Intergenic	novelGene_139528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_1	294.304472356401	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1671	482	2152	126064	156440	FALSE	25	TTCCCAGCAACATTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVPARGLLTALAVVFGMAVAFAPVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLSLTAFKFLGKNEDGKGRCPFDPAQSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRHSSQSPLRTEYAIPWLNEPSFVFTDVIRRNPNDTEGEDDKVYFFFMEVSVEYEFMFKLMIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSNLVFNMLQDVFILRGPWLKEPVFYGVFTPQLNNVGLSAVCVYNLSSVEEVFSRGKYMQSATVEQSHTKWVRYNGAVPRPRPGACINSEARAANFTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSITPTDNRPRLIQKDVNYTQIVVDRVQALDETICDVMFISTDRGALHKAVSLENGVHVIEETQLFQDFSPVQTLLLSSKKGKRFVYAGSNSGMVQAPVAFCGKHSTCVDCVLARDPYCAWSPHTTACVTLHQEHGSGRGLIQDMSGDVSACPDKVQG	104349	156442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_104614_125846_126164_128203_128350_136550_136614_138346_138446_141831_141926_142805_142920_144894_145047_148473_148650_148732_148890_150029_150253_151133_151250_154928_155102_155198_155243_156426
902313	contig_19179_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_142369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATTAATACGCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25168	23133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_-_23100_25200
902315	contig_15839_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_136423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAAGCTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143841	141955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_142000_143800
902316	contig_10500_pilon	-	1513	2	Intergenic	novelGene_41296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATAAAAATCATAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640218	1638624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1640061_1640141
902317	contig_9633_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_139645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAGTAATATGTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1142787	1141301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1141300_1142800
902318	contig_10042_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_79137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTATCGTGTACTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85432	82977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_83000_85400
902319	contig_854_pilon	+	581	2	Intergenic	novelGene_36336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCCGAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936169	976420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_936206_975875
902320	contig_9809_pilon	+	5056	6	Intergenic	novelGene_176761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	391	junction_4	54.7452281025479	1125	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1437	1778	112291	114954	FALSE	20	ATTGGTTTCTACCCAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVILYFLLEN	109188	118232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_109325_110410_110496_110652_111819_112241_112362_112466_112590_114806
902321	contig_935_pilon	-	2305	10	Intergenic	novelGene_45553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	283.87321113483	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	650	1444	361950	345477	FALSE	45	ACTGTCTAAAATTAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	377415	344615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362061_362642_362749_368062_368292_370637_370822_377395
902322	contig_19956_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_178659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18915	20814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19956_pilon_+_18900_20800
902323	contig_6031_pilon	+	3385	2	Intergenic	novelGene_56775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAACTGGTAGATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432751	437027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_433764_434654
902324	contig_6902_pilon	+	2662	2	Intergenic	novelGene_135597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	812	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAGGAGCTCCCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476951	505087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_478123_503596
902325	contig_12414_pilon	-	5785	11	Intergenic	novelGene_59654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	514	junction_10	366.616639011379	110	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1281	4503	5783	787209	759122	FALSE	5	GTATCTGTTTTTGTTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEK	791711	759119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129
902326	contig_7368_pilon	+	3209	12	Intergenic	novelGene_158797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	28.3093886829671	169	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	225	1559	27266	50892	FALSE	5	CCTGTCCTTTCCTTTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVSYVQRVALEFSGSLFPHAICLGDIDNDTLNELVVGDTSGKLSVYKNDDSRPWLTCSCQGMLTCVGVGDVCNKGKNLVVAVSAEGWFHLFDLTPAKALDASGHHETLMGEEQRPVFKQHIPANTKVMLINDIDGDGCCELVIGYTDRVVRAFRWEDLSEGTEHLTGQLVFLKKWMLEGQLDSLSVTPGPLGVPELMVSQPGCAYAILLCTWNKDTGSPPASEGATEGNREPPATRDVVLHQTSGRIHNKNVSTHLIGSIKQGHSPESGGSGLFALCTLDGTLKLMEEADKLLWSVQVDHQLFALEKLDVTGNGHEEVVACAWDGQTYIIDHNRTVVRFQVDENIRAFCAGLYACKEGRNSPCLVYVTFNQKIYVYWEVQLERMESTNLLKLLETEPEYRGLLQELGMDPDDLPAACALLHQTLYHPDQPQQCAPSSLQDPT	27041	52542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_27362_36284_36381_36970_37013_37932_38105_38887_39028_39474_39624_39986_40085_40279_40334_40447_40540_49050_49169_50518_50693_50788
902327	contig_10627_pilon	-	4712	21	Intergenic	novelGene_60052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	191.401906991545	528	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	3	1790	1309781	1195998	TRUE	50	TATTAAAAATAAGTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELHSLDPRRQELLEARFTGVGVSKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQRNRKRKAEPYETSQGKGTPRGHKISDYFEFAGGSGPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAAKEASEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISTQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMGQAPPATNEQKQRKSKTNGAENETLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNKWYSVWRDKNHRFWSFQDHGR	1309783	1184043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1186689_1190759_1190868_1192352_1192465_1195940_1196065_1197344_1197519_1200974_1201065_1205309_1205402_1208025_1208108_1209964_1210063_1211767_1211835_1215549_1215703_1219545_1219683_1222442_1222554_1228834_1228928_1230067_1230164_1243530_1243699_1261928_1262025_1262746_1262791_1263818_1263889_1265398_1265471_1309703
902328	contig_6898_pilon	+	2992	6	Intergenic	novelGene_35756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3511	junction_5	1472.93576234675	52	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	56	937	119670	125646	FALSE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119614	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
902329	contig_12402_pilon	-	2120	2	Intergenic	novelGene_133383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCTCAATGAGATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642751	640519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_640825_640936
902330	contig_5686_pilon	-	2259	5	Intergenic	novelGene_45442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTACATTTATTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241665	213740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_215473_219531_219668_222752_222914_224040_224201_241595
902331	contig_4103_pilon	+	1398	6	Intergenic	novelGene_51985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	104	523	202368	218877	TRUE	35	CGACCTTATGTGTAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVTTLALFFPNTFVNVADVAEIPIVVVVVALGGSMGTSCSTSSSFSSSSSSSGSSKLSLGLFSSSSCFLFCSSFFFFLFSFLFSLLAARACFLLSSLDFSRSSSFKRILAFLFASAACWSLAFTIVSTHWWHFFNSSYICNCCYVSHAFNIRRELTDFLHQILNNFYMTLAKC	202264	219977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_202387_203409_203582_215896_216019_216559_216654_218864_219025_219249
902332	contig_7840_pilon	-	2212	2	Intergenic	novelGene_69004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGATTGTTCTAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287873	277686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_279794_287768
902333	contig_12464_pilon	-	2668	5	Intergenic	novelGene_68683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	175.643104049092	183	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	157	1032	242417	183872	FALSE	45	ACATTTCACAATGCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKSDEASGRTQTLGRTQKPRTAKTQTNTAKFTWSCLTF	242573	182235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_183899_192378_192464_222492_222589_234642_234945_242051
902334	contig_4315_pilon	+	2020	9	Intergenic	novelGene_46747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	202.867567639581	5	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	310	1137	222198	225248	FALSE	30	GTAGATTTCTACAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDTVGTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLDLPPELDVPTGAGGGAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVTQFAPYKQLFLQTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKEAGMKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVGKFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSMEIERKKLPKETLEQQKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQTRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFHGQICRVTTVSTDLRKCL	218740	226131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_218799_218980_219091_221890_221969_222134_222204_222737_222875_223148_223336_223422_223534_223829_223992_225023
902335	contig_8898_pilon	-	6234	5	Intergenic	novelGene_137262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42.1485468314152	781	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	180	527	402771	375511	TRUE	10	ATTCTCTCTCTTATTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWVLVDHQYNIYLYKEGVLRTASEPYHVDNFQDKTCHLTNHCIQKEYSKNYGKYEEGNEMFFEEFNQYLTSALNITLESGILLQIKHIIRSCLMSVEPAISTKHLPYQSFQLFGFDFMVDEELKVWLIEVNGAPACAQKLYAELCQGIVDLAVSSVFPPPDVAQQTQQAAFIKL	402950	353007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_353033_354183_354192_369836_375623_378532_378677_402679
902336	contig_14786_pilon	+	2520	1	Intergenic	novelGene_174705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGAATCCAACTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24111	26631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14786_pilon_+_24100_26600
902337	contig_8598_pilon	+	2894	1	Intergenic	novelGene_22865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	453	782	3506	3835	NA	90	AAATAAAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVCEFCVANVMIIKPSRKVESAVGGTVGVRIGKMVERGGLSGLHLMRVSLALLILVLLPPCGVGGGQHCPHAIFRTSIATTREMQVKMTMRYYFTPTKVAIINTIYF	3053	5947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_3100_5900
902338	contig_5331_pilon	+	2648	9	Intergenic	novelGene_112819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	479.029748554304	77	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1540	2088	724669	730693	TRUE	5	GTGTGCCGAGTTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSQHTALSLPTQHMGSSQQPLHLQDRRMVASLLRLVNLSLAQEVTTSPAWGMDRVTTVIPKYLGATPCSQSPHLHPILLPAIPLHSQLAMIRAVTLSRTPMGSQAAMDSRVAMGNRAAMGSSRPLVIPPKLDPTARLQVNIANRAAATGSRVHSDRTTPVAWVFMVRSLEDFPDQERTGA	723129	741611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_724748_727440_727609_729398_729611_730603_730785_734135_734169_734490_734610_737891_737930_741171_741240_741400
902339	contig_17144_pilon	-	1382	7	Intergenic	novelGene_29196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1488.2144129422	17	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	215	1087	169017	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLKRRSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170877	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168218_168996_169099_170744
902340	contig_7078_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_130225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968555	966303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_967742_968356
902341	contig_7730_pilon	+	4135	2	Intergenic	novelGene_156309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1108	1410	471855	472157	TRUE	20	TGTTTTACTCCAAGAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIWYPESLLKSSISSSSFLVDSLGFSLYKIISSANRDTLTSSLPISMPFISFSSLIALARTSSTMLNKSGDRGTLDILNLTGPAKTLLTCLSLLTSQSK	470747	477097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_474014_476228
902342	contig_7426_pilon	+	4232	16	Intergenic	novelGene_27489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	57	junction_5	56.4747337802982	515	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	80	2077	881984	929690	FALSE	15	GCAAGTGGCTTTTGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTGGTCGRWLGADRERNRARTGTAGKMLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAEAQTFSLKHSERVRVEVVRDGHAEEVAANGKQRWPLLPTTTLRLTMSQASIEASSDKVTVNYYEQEGNTPIDQAGLFLTAIEISLDVDADRDSVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRDTPWLPKEDSSDEKVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRQKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLRFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAEEIPLTPIFTDTVTFRVAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYMNRGDRWIQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGSLKDFPVKQLLGPDFGYVTREPLFEPVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKVYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVCDFLQAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMTFVPIPGTKQFRMLMASTSACYRLFREKQKEGHGEAIMFKGLGGMSSKRITISKILSNESLMQENQYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEGHQARAFFPNMVNMIVLNKDLGIPKPFGPQVEDVCCLETHVRSLLEPLGLCCTFIDDISAYHRFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP	881904	931845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_882076_894003_894188_896536_896610_903430_903493_906113_906232_906717_906844_913446_913626_916107_916212_917181_917294_918331_918440_921076_921229_921896_922042_923041_923136_925202_925289_927695_927825_929456
902343	contig_13097_pilon	+	3097	15	Intergenic	novelGene_107717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	551.730196004962	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	113	1675	184733	264394	FALSE	65	AAATATAAAAATTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184620	265816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
902344	contig_6286_pilon	+	2987	2	Intergenic	novelGene_165664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	50	junction_1	0	348	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACTTTCTCTCCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366775	370761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_367150_368148
902345	contig_14563_pilon	-	7410	29	Intergenic	novelGene_135032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	546.558663318934	505	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	659	2422	158505	108853	TRUE	20	GTGCAGTGCGATTGATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRNKDKSQEEDSSLHSNVSSHSASEEASGSESGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESSESLSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKREPSEDERDQGTSAESEPEQKKVKARRPIPRRTVPKPCVKKQPKPQRGKRRKQDSSDDEDEDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGLDEQQDNSETIEKVLDLRLGKKGATGASTTVYAVEANGDPSGDFDTEKDEGEVQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLEKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERIIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQSCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPTYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKSNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEVWAPEINVVVYIGDLMSRNTVYGNMNGFIPKPKG	159503	61773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_62227_62649_65406_66607_66650_75198_75375_76341_76513_80680_80774_81216_81314_82383_82533_83281_83518_89281_89354_91431_91585_91924_92088_96551_96741_107765_107957_108805_108896_110640_110860_113623_113749_115997_116177_116346_116392_118159_118261_119825_120052_120931_121066_122811_122953_125258_125367_131682_131745_133439_133527_136796_137029_158443_158575_158914
902346	contig_3942_pilon	+	478	4	Intergenic	novelGene_128780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	10680	junction_1	1821.81173560827	15	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	277	384	795165	795407	FALSE	25	CTGAAGCAGTAACTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK	793523	795501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_793624_793794_793882_795075_795179_795313
902347	contig_15731_pilon	+	3996	21	Intergenic	novelGene_171970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_5	256.071567144812	376	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1280	3843	24	3866	15182	48097	FALSE	40	GCAGGAACTGCCATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKVNTLNMTSDHMPGPVCLIENIDGKLMVNQEALTILSALTQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKQGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPEKPNHTLVLLDTQGLGGVEKEDNENDSWIFALAILLSSTFIYNSMGAINQQAMDQLHYVTELTNQIRAKSSPDSNEVEDSADFVRFFPDFVWALRDWILKLEADGQSITADKYLENSLKLKPGTSQEEKIFNLPRVCIQKFFPKKKCFVFHPPTKWKKLVHLETLQDDELDSEFVQQVAEFSSYIFSHSKIKILSGGIKVNGPRLKSLVLTYVNAISNGSLPCIENAVLALAQIENSATVQKAIAHYDQQMGQKVQLPTETFQELLDLHRASEKEAIGVFIRNSFKDINHLFQKELAAQLEKKWNDFCEKNLRASSDHCLALLQDIFSPLEEEVKQGVYSKPGGYRLFIQKTQELKKKYLQEPRKGIQAEEILQKYLMSKESVTDAILQTDLTLTEKEKETEVERVKAESAQATAKMLKEMQIKHQQLMEQKEKSHQEHVKQLTEKMEDKNQLLAQQESILALKLQEQEQLLKEGFKEERIKLQKEIQDLQMRSIETSTSVKLVIAEFAQDAKKMLEEMQIKYQQMMEQKEKCHQKHVNQFIEKMERDTEQLFTEQNRTPALNFQEIMTFRPIMMAPICLVENHKEQLTVNPSALKILDEITQPVVVVAIAGLYRTGKSYLMNLLAGQNRGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPDHTLILLDTEGLGDVKKGDTKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMGTINQQALEQLHYVTELTELIRTKSSSGTEEVDDSTEFVGFFPDFIWTVRDFSLELKIDKSPITEDGYLEDALKLIPAGRNPKIQNSNLPRECIRRFFPKRKCFVFDRPTSDNSFLYQIEEVPEHQLDCNFQMKLKKFRSYIFSHAKTKTVREGIIITGKRLATLVETYVNTINSGAVPCLENAVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKEMAQCLRLPTDTLQELLDVHAACERKAIALFMEHSFKDDKREFQKNLLDIIGEKMEDFVLQNEEASDKYCQAELKQLSEPLMENISRGIFSVPGGHALYLEAKKKVEQDYAQVPRKGVKANEVLQTFLQSQAAIEESILQSDKGLTDAEKAIAVEQAKKEAAEKEQELLKHKNQEQQQKMEAQQRTFQEHIAQLEMKIKKERENLLRELERILEHNLKIQEELLMQGFRKQYEKLKKETDRQQEEYEKTKNNERSWFSRLLEEAFRALSTVSLQDLELFAEIMKYLSLLNK	15158	48227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_15369_15886_16015_17412_17523_17793_17991_18348_18592_19670_19952_20592_20806_21775_21879_22171_22363_23510_23614_24625_24820_26463_26660_35458_35587_39240_39351_39554_39752_42058_42308_43233_43515_44873_45087_46142_46246_46579_46774_47875
902348	contig_9133_pilon	-	6581	13	Intergenic	novelGene_109312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_11	134.506092385769	397	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	2934	3764	872991	860888	FALSE	40	AGATCTGTTTATAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKIPNTEELIVYFVSIAAVDQLNVTDDDVEEIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEAVELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPVSAGIPVQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRSLPPNVNSSVTTQPAQTPYLSTGQDTISSPAYMNQNSNLQSATGTAAYTQQMGMSVDMSSYQNTASNLPQVAGFPVAVPAHSATQQQTSYHQQPLL	913460	858070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_861117_862770_862941_865212_865367_871598_871654_872621_872710_872856_875090_883416_883604_884199_884270_886991_887139_888376_888476_888590_888667_889903_889989_913289
902350	contig_13780_pilon	+	4843	6	Intergenic	novelGene_149066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	257	129	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCCACCCCTTGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654482	813457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_655099_679734_682625_782363_783034_804177_804395_812931_813299_813374
902351	contig_10940_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_49186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCAGCAGTTTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176866	179288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_176900_179300
902352	contig_10225_pilon	+	2292	13	Intergenic	novelGene_86794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	160	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1122	1847	42707	47307	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRHRV	20682	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46766_47297
902353	contig_9373_pilon	+	2752	4	Intergenic	novelGene_162713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162904	168581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_164910_166746_166946_167449_167568_168151
902354	contig_9363_pilon	-	900	4	Intergenic	novelGene_6522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	9.53356643071673	212	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	466	840	567801	557841	FALSE	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACKLLRPRTPLTKDAAHFLNKLSVNTRILPLVKDQAMDAVLLTARWKFPWAVACTTFYLTRDKRKEKQAESGDLIPARKQWWEQSASFGPEVPVLRCCQTKGRLMTRTFLQSRQREKAFPWS	571076	557780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_558069_558644_558723_567732_567830_570639
902356	contig_16703_pilon	-	896	5	Intergenic	novelGene_72757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTCCTGCTGTACTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20490	9948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_10034_11219_11291_15394_15478_16919_17017_19930
902357	contig_6445_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_77035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCAGTGTTTTGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549652	550566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_549700_550600
902358	contig_15219_pilon	+	3452	8	Intergenic	novelGene_40830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	220.031166623536	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	94	1182	19617	24591	FALSE	35	ACTATTCCTTAAAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLNGFHDAFIEEGTFLFTSESVGEGHPDKICDQISDAVLDAHLQQDPDAKVACETVAKTGMILLAGEITSRAAVDYQKVVRETIKHIGYDDSSKGFDYKTCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDRNQEDIGAGDQGLMFGYATDETEECMPLTIVLAHKLNAKLAELRRSGTLPWLRPDSKTQVTVQYMQDRGAVLPIRVHTIVISVQHDEEVCLDEMRDALKEKVIKAVVPAKYLDEDTIYHLQPSGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGWGAHGGGAFSGKDYTKVDRSAAYAARWVAKSLVKGGLCRRVLVQVSYAIGVSHPLSISIFHYGTSQKSERELLEIVKKNFDLRPGVIVR	19523	26861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_19708_22617_22696_22781_22905_23151_23265_23346_23491_23690_23910_24130_24314_24453
902359	contig_13004_pilon	+	506	3	Intergenic	novelGene_112676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGCACAAATATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669527	673959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_669574_673416_673590_673672
902360	contig_15720_pilon	-	3742	9	Intergenic	novelGene_41972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.157347717276	11	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	50	1180	327739	309905	TRUE	50	ACATAAGGTCTCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGPQSPRSAHTRPPLLLLLLFGLMRERAAESPWGLPVVADGPASFAKEVMAELASQELGKKPWPGGTHSLHYHYLALSEPGQGLPQFLAVGYVDDQPFIRYDSRVGRAQPQALWMAAVDAQYWERETQKLRVWEKVQQVEMWTVMGYHNHSSGKHSAQRMFGCEIQEDGRSSSFWQFGFNGQDHLSLDLDTLSWVSAHPVALRTKRWWETERCYAEYDKAYLQGLCLTSLRRYLELGGQSLIRTEPPKVQVTRHTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPGQ	327788	306713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306981_307502_307599_307705_309909_310615_310728_310843_311120_314402_314679_316351_316613_321157_321266_327645
902361	contig_6589_pilon	+	3216	2	Intergenic	novelGene_25943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1051	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCACAAACAAAAGGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1238250	1241531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1239509_1239573
902362	scaffold_12124_pilon	+	2109	10	Intergenic	novelGene_22271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	17078	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	194	571	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473574	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
902363	contig_6283_pilon	-	2948	15	Intergenic	novelGene_100212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	163.883607278745	2	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	89	2050	641399	611758	FALSE	20	CTTGTCATGAATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEYLSLVARLIIHFRDIHNKKSQASVSDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQVSQSSLPMLSSPSPGQQVPTPQSMPPPPQPSPQPGQPSSQPNSNVSSGPAPSPSSFLPSPSPQPSQSPVTARTPQNFSVPSPGPLNTPVNPSSVMSPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	643997	610859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526_615664_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_642229_642260_643944
902364	contig_9112_pilon	+	3553	2	Intergenic	novelGene_60213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1280	junction_1	0	163	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	221	904	108641	112135	FALSE	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGQ	108420	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553
902365	contig_14553_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_124989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGAGAAAGATGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7611	5744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_5700_7600
902366	contig_1719_pilon	-	2345	14	Intergenic	novelGene_87276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	487.866178663805	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2211	133	2343	382036	359750	FALSE	35	TTATGAGGTGAACATACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQS	382168	359747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
902367	contig_11056_pilon	+	2110	7	Intergenic	novelGene_130392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACATCAGATGCAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644734	684568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_645851_647122_647205_655568_655761_667860_668062_670513_670713_679002_679132_684377
902368	contig_11825_pilon	+	1879	2	Intergenic	novelGene_155396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	490	987	14653	15150	TRUE	75	AGCAAACAAACAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPSCLHGFCGIIQAKSYCFSSVCDFCFFSSCSQDSLSLVSASVIMICLGDFLLGSILYGVRWASWMVSFSSFMILGKFSVSSSSVILSVFSVFSPCSGTPITCRFLLLIVSHIILRVSSFFFILFSDFSSNRVVSKCLSLISLILSSIIFKPAPQPFYDTVHF	14163	16266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_15283_15506
902369	contig_2100_pilon	-	2021	10	Intergenic	novelGene_50730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_7	842.096516564388	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	213	1391	1180240	1172150	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPWSSGTMIRPGIWGKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQVKNYMEEKVPLLLLSDLHFLGRPKTFRWWEVLLKLDEAHQKWALCLFILSSFRVPCSCHGLHA	1185493	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
902370	contig_6497_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_35661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCACATTGTTTTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880587	882455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_880600_882500
902371	contig_10861_pilon	+	2910	5	Intergenic	novelGene_39273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	322.458815199709	336	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	202	531	1339531	1344777	TRUE	50	AAATAATGATTAACTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRK	1337613	1347289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1345072_1345204
902372	contig_10011_pilon	+	3000	1	Intergenic	novelGene_68075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATCACAGTCTGGGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281756	284756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_281800_284800
902373	contig_10042_pilon	+	1548	4	Intergenic	novelGene_79085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	126.291549818488	196	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	10	603	6321	42785	FALSE	55	TATTTCAAAATGAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVCISLVVLLWKNIIGFL	6311	43730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598
902374	contig_16622_pilon	-	2355	13	Intergenic	novelGene_48465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1026.23375613075	58	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	309	1526	128619	112684	FALSE	25	CCCAGGATTTCATGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	132422	111854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128337_128679_132173
902375	contig_6589_pilon	-	3808	6	Intergenic	novelGene_26312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	16.9941166289984	766	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACTATTTTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2377528	2318352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2319193_2335239_2335264_2367447_2369902_2371466_2371574_2376326_2376474_2377292
902376	contig_13894_pilon	+	2953	4	Intergenic	novelGene_62076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1956	2411	700437	700892	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWGAYAAALRACSKAARPYSVYRRRAGGAVTWSCLSQAALSPPPPPLPRPIGLPASLARTVPGVRVRGQPAGGAESRGRLRPACKALGSRPEPSAALARRKEVQDGQLPVILSQPEDPAGCALLLCRCPAGRKVCFPCCGLEAPPLQRGA	415928	701434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_416617_502988_502992_665601_665610_699180
902377	contig_6079_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_160113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCATGCTTCCTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486055	487604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_486100_487600
902378	contig_10437_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_38343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACCGCATCTATGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500009	497815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_497800_5e+05
902379	contig_5999_pilon	+	5427	1	Intergenic	novelGene_45594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	417	770	4925	5278	NA	40	AAGTAACCCAGCTGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYRYNAIPIQIPTAFFNEMEKHITNFIWKGKRPQISKLYSRRTKGEASHYLILELIIPPQCSKQPGTGTIDQWNRIENPDRNSSTYEQLVFDKGPKSVNWGKESPFNKWW	4508	9935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_4500_9900
902380	contig_11318_pilon	-	4114	4	Intergenic	novelGene_48163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAGATTCAATCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74292	58538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_58595_63935_66802_69201_69452_73350
902381	contig_1435_pilon	-	5301	14	Intergenic	novelGene_115519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_7	210.371972619704	820	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	89	1765	625057	581903	FALSE	25	GGCAGGCTGTAATTTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLLLINFSPSRHLRVPPPVPESPGALSAMRRLLLAPGGPWRGSFRRLPACSGCNPALLLLLLLFQGSCLGVSGAAASSRRPNVVLLLTDDQDEVLGGMTPLKKTKALIGEMGMTFSSAYVPTALCCPSRASILTGKYPHNHHVVNNTLEGNCSSNSWQKIQEPNTFPAILSSVCGYQTFFAGKYLNEYGAPGAGGLEHVPLGWSYWYALEKNSKYYNYTLSINGKARKHGENYSVDYLTDVLANVSLDFLDYKSNSEPFFMMISTPAPHSPWTAAPQYQKSFQNVFAPRNKNFNIHGMNKHWLIRQAKTPMSNSSIQFLDNAFRGRWQTLLSVDDLVEKLIKRLEFNGELNNTYIFYTSDNGYHTGQFSLPIDKRQLYEFDIKVPLLVRGPGIKPNQTSKMLVANIDLGPTILDIAGYDLNRTQMDGMSFLPILRGASNVTWRSDILVEYQGEGHNVSDPTCPSVGPGVSQCFPDCVCEDSYNNTYACVRTTSALWNLQYCEFDDQEVFVEVYNLTADPDQITNIAKTIDPELLGKMNYRLMMLQSCSGPTCRTPGVFDPGYRFDPRLMFSSHGSVRTRRFSKHPL	625145	578366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_581982_589380_589542_591272_591384_592364_592473_595983_596086_605935_606040_607861_607981_609036_609120_611601_611770_613315_613415_613833_613900_615712_615920_618516_618577_624847
902382	contig_4180_pilon	+	3004	2	Intergenic	novelGene_8330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	469	junction_1	0	62	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACTACTGAATAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818059	822602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_820097_821635
902383	contig_16098_pilon	-	1714	11	Intergenic	novelGene_45990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1404.8586441347	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	105	1562	352350	348441	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354093	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348618_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
902384	contig_9696_pilon	+	1808	4	Intergenic	novelGene_68804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369185	373288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_370238_371009_371178_372581_372804_372922
902385	contig_15236_pilon	+	4119	6	Intergenic	novelGene_141547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	332	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1884	2291	122756	123163	TRUE	40	GCAGAAGAGAAGAGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	120872	332995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_123896_137919_138338_195609_195885_209173_209177_269871_270060_332783
902386	contig_8312_pilon	+	1649	2	Intergenic	novelGene_152901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTGGTCTCTGTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278507	280274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_279852_279969
902388	contig_5684_pilon	+	2146	4	Intergenic	novelGene_81049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	189.060836769544	150	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	936	1499	443906	447039	FALSE	15	TTTTGAATTTCTCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403586	447686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_442295_443891_443949_446518
902389	contig_17311_pilon	-	3159	4	Intergenic	novelGene_57845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	15542	junction_1	2091.86461214763	12	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	38	484	126865	121474	FALSE	10	TATATGTGTCTGGTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKVWVIRENTETSTSVGLIF	126902	118798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_121642_123344_123555_123642_123709_126862
902390	contig_4486_pilon	-	2156	8	Intergenic	novelGene_38538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	252.325025249869	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	371	1468	177451	130815	FALSE	30	TAAACTGTCTTATGGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMEHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	178013	130126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132279_132604_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304_177724_177915
902391	contig_1090_pilon	-	1878	9	Intergenic	novelGene_131143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	126	479	514075	500372	TRUE	25	CCTTTCAAAGTGATATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKCFFKKTSIVLDIFPSSGQAGQVSRHEDIFVAPKVLKCSVNTEVDDIQMKIFYTLIRSGLASLSILLLGNIFRLSAINCSAKKENTVNIINVASTQWVQNFNLSRYALLSCSSCI	514200	488340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_488876_491870_492069_492663_492889_493595_493705_497085_497171_497426_497532_500229_500394_503617_503709_513834
902392	contig_12677_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_110830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAAGGGCCATGGACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2232	2890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2900
902393	scaffold_12124_pilon	-	4318	2	Intergenic	novelGene_22158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	526	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3823	4128	982587	982282	FALSE	65	AAAAAAAAAGAGTAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	987390	982091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_984120_985100
902394	contig_11100_pilon	-	2957	2	Intergenic	novelGene_175535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	1637	2818	193642	192461	FALSE	10	CCCAGCAGCCCTGGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAEPSWRKVQHVKNSSGKRQNKPQVPRISSQLKSSLVATSQQAEDEPPESTYPQGKLGRSPLSPRCQGASGNKLFLDFESMRIFKEDADEDSGSDLSDSERIPIHTSPLTPPDLQLRAEEINPACFHRSPDQDHSKPGYCYPDFLPPPFNSWNLQDMAVLLNSEGKLDAVPRAGGLLRRYINRLVQLEWLQIQTVQTEKGKGAKTRPPAAPGTSWALKSPRRRKLIAAALPKPLPQQEGASKPGPSQKKDLRQEDTCRYVAFQTSPRPADARGSSRSCSKKQVLEVRREGKKRKIGKGTELQRLGLVCGDELQRRGLACGDGSSRIHTSGDLGIPKPSGMILDLAVPCKAPGTQAHAHLKKKGNASNGSRANTSSEKKLETNGVKQSTDKFE	230439	192321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11100_pilon_-_195254_230414
902395	contig_8697_pilon	+	2497	3	Intergenic	novelGene_83212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1980	516	2495	29813	40763	FALSE	40	AGCCCAGCAGAAGATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSDDEQSYEESETGMLSEEEEEKSMEERKKVFKDVLSCLNMDRSRKLLPDFVKQFSLDRGYAWTPETPGDLAWDFLMKVQALDVTARDLILGYKVPSEDRKGELLTEMKNLELRDVQTINPLDVLCATMLCSDSSLQCEVMSNMYQCQFALPLLLPDVENNKSIFMLGAMKNIVKKQSAQSSGGPAEDTEDFLAHIKMPVISFVRLGCCSFSKSKILNKLLRPAQMKSHKIFLHQDSPDLVLPRQISDGLVEITWCFPDGDDLKENLNFFQKPVAVANLHGDLEYLWIQFGFLMEVSSAVFIFTDYLGEKEWSLLRFLGEAAIKRCYFALSPQARENEEAQIFQRIMELKPSQLLYLEGEEAGDRRKDTECLQAALQEVMCSSLKCVSMEDMASLAGELGIQVDKECENTQGIQVSSSENMAGTAESVGQQRHSKPKTPAQMPTRDSGVICGVSQNPENIYSTPVFMSPPQNSWPLPSSIGGNFNQASSKPPWLMGSPFWPEQRCKWLHPLALHNTRAHSQGKSFGLQYFQPQRFYSGERFMKFSRTAQGFHWNGRFGRPPRPISQHAQAWPKRPKTIGAFEKSGAVVSQVGYFYPLGSQPAERLGRPQPGPACAQGIQLAAGTGKLMRTTSHIEDPYHQGFQPTGTMQKPIRPASQK	27568	40765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_27608_29336_29898_38868
902396	contig_383_pilon	-	5209	3	Intergenic	novelGene_126157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	584	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1636	2226	507232	506642	TRUE	50	TACACAGACTACAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQETISKHLQKQDRMVPVGVQNKIPDDTPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKVDKHEEKIDKVIENTDKKLEELWKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQNINNKISEMDGVIEGLRSRLETVKDRISGTADKHLDTTLFEENSEKRTKKNEQTLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLKNC	509128	440294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_442121_505484_508426_508686
902397	contig_10377_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_115371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208766	210609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_208800_210600
902398	contig_8177_pilon	-	6646	8	Intergenic	novelGene_86499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	179.839611082447	160	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	3918	6431	56173	39318	FALSE	30	TCATTAATATCATATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIKLELLFDPDEENAEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKIMLDWASGKIYKDKFDYLFYIHCREVSLMTKRSLGDLIISCCPDPNPPISKIVKKPSKILFLMDGFDELQGAFDENTGALCTDWQKADRGDILLSSLIRKRLLPEASLLITTRPVALEKLQHLLHHPRHVEILGFSEARRKEYFFKYFSDEHQAREAFRLIQENEILFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMDSGKSLAQTSKTTTAVYIFFLSSLLQTRGGTQEHHFSASLRGLCSLAADGIWNQKILFEEYDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKYYSFIHLTFQEFFAAMYYLLEEEEERETRSMSCSYSKPPNRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERSSYLEKKLSCKISQQIRQELLKWIEAKAKAKKLQTQPSQLELFYCLYEMQEDDFVQRAMDHFPKIEINLSIRMDYVVSSFCIQNCCCVESLSLGFLNNLPKEEEEEEEEGRRLHAVNCVSPCSHAACSYSLVNCYLIPSICRGLFSVLSTNTRLTELDLSDNTLGDPGMKVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLTRHCCLDISSVLSSNQKLVELDLSDNALGDSGVRHLCVGLRHLFCNLRKLWLVSCCLTSDCCQDLASVLTTNQSLTRLYMGENALGDAGVGILCEKAKHPQCKLQKLGLVNSGLTSVCCPALSLALSTNQNLTHLYLRGNALADKGIKMLCEGLMNPNCKLQMLELDNCNLTSHCCWDLSTLLTSNQSLRELSLGNNDLGDLGVVLLCEVLKQQNCFLNTLRLCEMYFNYETKCALETLQEEKPELTIVFEPSW	60309	39102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_39418_40643_40815_41311_41483_45742_45914_46558_46730_50693_50865_54614_57155_57373
902399	contig_10106_pilon	+	4700	11	Intergenic	novelGene_73873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	700	junction_4	429.23034608471	1	204	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	384	1364	151101	172575	FALSE	55	TAAAAAAAACAGAATTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	132477	175911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505
902400	contig_14621_pilon	-	1950	16	Intergenic	novelGene_105867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_12	111.360475733339	1	45	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	633	1874	431679	396356	FALSE	60	ACTTTATTTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	460582	396279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397
902401	contig_12464_pilon	-	4584	11	Intergenic	novelGene_68648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	597.399330431496	139	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	150	1325	242417	128044	TRUE	35	AAATAAAGGTGCCTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLRGNLKQVRIEKNPARLRALESASGENDPAAATALALAMVGEQAPPGAAPEDHPEEMGFTIDIKSFLKPGEKTYTQRCRLFVGNLPTDITEEDFKRLFERYGEPSEVFINRDRGFGFIRLESRTLAEIAKAELDGTILKSRPLRIRFATHGAALTVKNLSPVVSNELLEQAFSQFGPVEKAVVVVDDRGRATGKGFVEFAAKPPARKALERCGDGAFLLTTTPRPVIVEPMEQFDDEDGLPEKLMQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENDDKRKRG	242566	93040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_94384_95478_96912_98241_98524_101765_101890_127966_128068_182087_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_234642_234945_242051
902402	contig_20356_pilon	+	2439	21	Intergenic	novelGene_159535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	759.427817504732	12	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	49	2208	68419	153150	TRUE	45	TCAAGTCATAATAAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSVNSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITCQKTGYSAVLEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLKLGKEVLATLEGHWDSEVFINDKKTDNSEVFWNPTPDIKQWRLIRHTVKFEEQEDFESEKLWQRVTKAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWACKLFELDPLTGEWHYKFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQTKVRHRTPMVSVPKMKHKPT	68370	159930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_68510_102905_102977_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_134526_134624_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153100_153143_153177_156694_156798_159828
902403	contig_16204_pilon	+	1840	8	Intergenic	novelGene_154506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	121.487044744764	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	44	727	277830	287228	TRUE	45	AGATTAAAGCAAATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRVPKGLPHSLLGMMYYSCTGGEPTLSDCSWRFNNSNLCSQSLAARVICSGVRNLSSLEVPASFQPVTVESSVTVRMEDKESLQLILLIPCIILGILLLGSFISIVFLLLKVKGKYALPIMANHQHLPTTTPVGINSYQEASITIPKEEVPKLPIQVRAPPPEDSDSGSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDDEAQQSRFQMPPLGGRSPYPGSSAPPRTQQWLQHIFRGGLL	277786	289346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_277942_280214_280272_283083_283225_283554_283654_284821_284945_286670_286744_287149_287291_288295
902404	contig_3382_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_124165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGGCACTGAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936215	934532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_934500_936200
902405	contig_21232_pilon	+	2556	12	Intergenic	novelGene_165974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	787.271792987058	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	34	1473	4297	19577	TRUE	25	AGTGACTGATGACTGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSDFRVTSVSTMEIGLTRSSNDSGSIKILTTRDGAGEPRNETTTNHSIITGGLSPGTKYHFEIFPQGPNGTQGPPQTVEGQTEPNPVSGLHVTFMGTTKVTLTWCSDNGTAKCRMLLESIGSQKDSTQDSVFNISDLEPGNRYQFPPPPVVSNETQKDPEDGVEANNTERSPAEKLPSNHTAPVYLGTAASSCHQGSRGTEVQLVGLKPGTQYKATVYSQAADGTEGQPQVIEFRTNRSQVLDIQVVNISATNMSLTWRISGNASSYQILVVRETTFFNLTANEMHVVIPGLTSSTLYNITVYPLHDDGSEGTPGFLQAYTPPGPVSDFRVTSVNTTEIGLAWSSNDSDSFKILTTRDGAGEPRNETTTNHSIIIGGLNPGTKYHFEIFPQGPNGTQGPPQTVEGQTESSVVFGIRVVRVTTTEMELKWQSTDTTFQYIYRLDIQPEVSCNKTVGPLKEITLSSHSRNGQCPREIQLHCRLHTAQQCVQH	4263	28205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_4511_11043_11287_13447_13667_14912_15168_18091_18350_18626_18853_19552_19823_22219_22508_25330_25463_27267_27477_27592_27718_28121
902407	contig_8954_pilon	-	2097	17	Intergenic	novelGene_130255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGAGACTAGTATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185940	49597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_49671_51996_52066_53961_54032_66238_66392_102196_102344_144166_144417_148185_148243_159257_159424_159660_159779_159873_159975_163398_163569_164946_165033_169408_169552_173747_173876_174333_174401_182928_183066_185778
902408	contig_7962_pilon	+	5570	12	Intergenic	novelGene_149297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	142.798071612324	711	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	914	2341	196933	235545	TRUE	5	CCTTGGGCTTTGTATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSAKAEEYGKISFEETQPLVNSETESSFSINENTTASGSGPSENAPICERVGTPKKRRMEFEDDLIKESSSCGEDKKRTLDAEIFPEKKGSGDDGSTSKKRKIEADDVPTNGSSTRDGSQQKRKIELEDVSEKRKRLEEGHSSAVAAHYNELQEVGLEKRSQSRIFYLRNFNNWMKSVLIGEFLEKVRQKKKHGITVLDLGCGKGGDLLKWKKGRINKLVCTDIADVSVKQCQQRYEDMKHRCRDNEYIFNAEFITADCSKELLIGKLHDPEMCFDICSCQFACHYSFESYEQADIMLRNACERLSPGGYFIGTTPNSFELIKRLEASETESFGNEIYTVKFQKKGNYPLFGCKYDFNLEGVVDVPEFLVYFPLLNEMAKKYNMKLVYKKTFLEFYEEKIKNNENKTLLKRMQALEPYPANENSKLASEKVDDYEHVAKYMKNSHIRLPLGTLSKSEWEATSIYLVFAFEKQQ	193821	238852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_194694_196891_197344_198704_198841_204399_204526_210053_210170_211247_211430_212338_212504_225523_225642_230383_230486_231795_231830_235507_237392_237469
902409	contig_15236_pilon	-	2483	1	Intergenic	novelGene_141616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	627	935	609202	608894	NA	55	AATTTATAGTTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTVTLGIKNITRTHEMGKIYITIPQIVLKIQHNPCQNPSQLFIQVDKLILKFTWKCKRPKIAKTILKKKDKVGGFILCDFKTSYEANQNLWYWHKDRHIDQ	609828	607345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_607300_609800
902410	contig_5779_pilon	+	4299	22	Intergenic	novelGene_106454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	48	401	106725	107078	TRUE	35	TCCTCACAACTTCCATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQICNSTIIWTCIVTDRYRLTCISYLALSTKYLSTCIRSKPAHSKRETTYQNVPVLSSPQWLEDVGEGVLTITVTGRALPGALLPSTPTPGPERVFSSPQHSQSRQSLSAKLGFLSQ	106677	193887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_107817_108774_108917_125881_125961_126872_126948_127353_127544_129215_129379_132097_132224_156802_156956_163901_164529_164893_165044_165624_165809_166002_166195_168165_168308_171096_171225_177329_177402_178737_178848_181057_181108_183534_183659_184755_184824_186319_186496_192964_193120_193833
902411	contig_11855_pilon	+	2436	5	Intergenic	novelGene_67098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	160.228547706081	84	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	781	1530	2445507	2446256	FALSE	20	GAGGTGACTGAGATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440080	2447162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440407_2441574_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2445497
902413	contig_8138_pilon	+	1850	5	Intergenic	novelGene_52466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280155	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288518_288616_304995_305080_306364_306518_306597
902414	scaffold_13505_pilon	+	5418	3	Intergenic	novelGene_111589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	4874	5350	729950	766822	FALSE	20	CAGTAAGACCCCTCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKNSQTILMITGFIREVTSYNSGSGYSSCIRTASFQLCLQASALLSLCPAQASVIKLFSSTNKCPEAPQSTSKPLPKGAQLSSFMGRQVQLHRQVLRSTLLRPQASCPKALSSLAPWARKLTTPSPAGFLLVSWFCCLCYCCFSLSPALHLSVSWA	643108	766890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_647791_729758_730093_766488
902415	contig_13004_pilon	+	3319	9	Intergenic	novelGene_112689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	332	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCTCTGGCGTAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817285	836490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_819681_819971_820114_827777_827922_829552_829701_830675_830801_831944_832006_832341_832447_834849_835005_836446
902416	contig_15236_pilon	+	2408	5	Intergenic	novelGene_141529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	138.131051903618	11	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	37	1275	55447	122228	FALSE	25	CGCAGCATCAGGATTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQGGAWTMGEVVEKSLEGPLAPSTDEAAQKTGDLVEILNEDKVKFDDTGLSLILQNGLETLRMENALTDVILCVDIQEFSCHRVVLAAASNYFRAMFCNDLKEKREKRIVIKGVDAEIMHTLLDYTYTSKALITKQNVQRVLEAANLFQFLRMVDACASFLTDALNPENCVGILRLADTHSLGSLKKQVQSYIIQNFVQILNSDEFLELPVDTLYHILKSDDLYVTEEAQVFETVMSWVRHKQSERLCLLPYVLENVRLPLLDPWYFVETVEADPLIRQCPEVFPLLQEARMYHLSGNEIISERTKPRMHEFQSEVFMIIGGCTRDERFVAEVTCLDPLRRSRLEVAKLPLTEHELDSENKKWVEFACVTLKNEVYISDTHTHTHTQPLNSKQTTLSGKCKYLLLIAVKT	55410	123361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_55734_82174_82341_100925_101376_109866_110105_122130
902417	contig_7467_pilon	+	2723	4	Intergenic	novelGene_69472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAAGACTTGTTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67533	74629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_67699_68362_68509_70793_70968_72391
902418	contig_6028_pilon	-	5273	1	Intergenic	novelGene_156602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	390	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTCAATTTATAAATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389246	383973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_384000_389200
902419	contig_7744_pilon	-	3904	16	Intergenic	novelGene_62563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1140	1439	889219	888920	TRUE	20	CTCACAGCTGCGCTCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVIVTRLQIRRRFLAEPRQLTLVSHNAVGSKEFERGHLKQCWVEQKFSGCWPAGRLRLQALLNELLEREQGTRADIWQTLHHIHFYISHFTLSTRLCT	891228	879833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_879907_882666_882892_883077_883223_883433_883513_884618_884707_884859_884901_885272_885368_886855_886941_887132_887189_887341_889454_889594_889639_889737_889875_890087_890144_890223_890288_890539_890594_890678
902420	contig_10958_pilon	-	8633	37	Intergenic	novelGene_5329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	185.397687334917	1297	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1791	5376	1980	7355	550561	503411	TRUE	5	TTGTGCGTCACGGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQLNYKDGTPYNNEKHTPRATLITFLCDRDAGIGVPEYQEEDNSTYNFRWYTSYACPEEPLECAVTDPYTLEQYDLSSLAKPGGSRGGNWYAMDNAGQRSTWRKYYLNVCRPLNPVPGCDRFAAVCEMKYKHEQGSSSETVSIRNLGVAWAGPTIEYRGSLLLQYVNGSACRTSDGRLTTYTTRIHLICSPGSLNTHPIFSLSWECVVTFLWNTEAACPIRVTTDTDQACSIKDPNSGFVFNLNPLNSSQGYVVSGIGKTFVLNICGAMPVCGTVDGKPAFGCEAETQTEDLKNLKPERPVGGEKSLQLSTEGFITLTYKGLVSAPGGAADAFIIRFVCNDDVYPGAPKFLHQDIDSGLGIRDTFFEFETALACVPSPVDCQVTDPAGNEYDLSGLSKVRKPWTAIDTSVEGKKRTFYLSVCNPLPFIPGCHGSAVGSCLVSEDNSWNLGVVQISPQAAANGSLSIVYVNGDKCGNQRFSTRITFECSQTSGSPVFQLLDDCEYVFVWRTVEACPIVRVEGDDCKVKDPRHGNVYDLKPLGLNDTVVSAGEYTYHFRVCGKLSSAVCPTQDRSMVVSSCQEKQGREGFQKVAGLLNQKVTYENGLLKINYTGGETCHKVYQRSTTIFFYCDRNTQKPVFLKETSDCSYLFEWRTQHACPPFEMTECSFKDDAGNSFDLSSLSKYSDNWEAVTRTGATERYLINVCKSLAPQGGTDPCPLEAAVCLLDGSKTVNLGRVRDGPQWSDGSVVLTYVDGDLCPDQIRKKSATIRLTCSESQVNSRPMFISAVEDCEYTFSWPTATACPVRSNVHDNCQVTNPTTGHLFDLSSLSGRVGYTAAYSEKGLVYMSICGENENCSPGVGACFGQTRISVGRANKRLTYVDQVLQLVYEDGSPCPSKLGLSYKSVISFVCRPEVGPTNRPMLISLDKQTCTLFFSWHTPLACEQVVECSVKNGSSIIDLSPLIHRTGGYEAYDESEDTTSDTYPDFYINICQPLNPMHGVACPAGAAVCKVPVHGTPIDIGRITGPPILNPTANEVYLNFESSTPCSADRHFNYTSLITFHCRRGVSMGTPKLLRTSDCDFVFEWETPLVCPDEVKTNGCSLTDEQLYYSFNLSSLSTSTFKVTRDSHTYSVGVCTAAAGLDQGGCKDGGVCLLSSSRGASFGRLASMRLDYRHQDEAVILSYANGDTCPPETEDGDPCVFPFIFNGKSYEECVVEGRPRPWCATTANYDRDHQRGFCKFSNSHRTSAIIFRCDEEADIGWPQIFSEVRGCEVTFEWKTKVVCPPKKMECKFIQKHKTYDLRLLSSLTGSWFLVHDGASYYINLCQKVYKGPSGCSERASICKKSTSGKVQVLGLVHTQKLDVVDDRVVVTYSKGHRCGQNKTASTVIELMCAKTVGRPVFDRFDIDSCTYYFSWDTRAACAVRPQEVEMVNGTITNPINGKSFSLGDIYFKLFRASGDMRTNGDQYLYEIQLSSITSSSHPSCSGANICQLKPNDQQFSRKVGTSDKTKYYIQDGDLDVVFSSSSKCGKDKTKSVSSTIFFHCDPSVEGGIPEFSHETADCQYLFSWYTSAVCPLGVGFDGESAGEDRPEHQGLSGRSQAVGAVLSLLLVALTGCLLTLLLYKKEQRETVMNKLTNCCRRSSNVSYKYSKVNKEEEADENETEWLMEEIQMPAPRPGKEGQENGHITTKSVKADALTSLHGDDQDSEDEVLTIPDVKVHSARGPGVDSSHKTRSPPRMADPEQDGDRMGLIRGEKARKGRRRPGQQKPGNSAHPVSFHDDSDEDLLHV	555292	502047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_502862_502946_503828_505435_505506_505677_505831_508306_508494_509650_509839_510494_510642_511942_512058_514494_514632_515433_515669_517329_517477_517792_518001_519512_519675_522633_522784_524657_524877_525909_526167_526484_526605_527678_527806_529222_529414_530441_530579_531544_531643_532480_532612_533324_533541_534020_534109_535237_535414_535517_535662_536005_536177_538266_538463_541034_541137_542754_542857_547663_547844_548552_548722_549207_549324_550441_550620_551157_551306_551883_553619_555254
902421	contig_9579_pilon	+	7005	27	Intergenic	novelGene_150582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	170.928983661699	734	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1242	3729	9	3737	756011	806209	TRUE	30	TTATACTCATTACTATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAPGLLIWLLLFGPPWRALGQADSSPGRRFSEHKLCADEECSMLMYRGEALEDFTGPDCRFVNFKKGDPVYVYYKLAGRSPEVWAGSVGRIFGYFPKDLIQVVHEYTKEELQFPTDETDFVCFDGGRDDFDNYNVEELLGSWELYDSATGDSERTIEKTSQHMKEPLEVSEESDPEPEPKEANLEEGESLFSEDLKDLEERFEVRKNHPHANSQTDNAQGEQSSFDPFEEMLQEKLKVPESENNKTSSGSQISNEQERIDAYTLLKKEMTMDLKTKFGSTADVLVSDDETTRLVTSLEDDFDEELDAEYYIVGKEEEESKEDFDELPLLTFTDGEDMKTPTKSEVENYSTDKEQKSNEEDMIEVAQPPGIKDDNKNTLTTLGDTVFSVVTGSEEKTGMMDLESSNSEEEKEDDVLVPDSRWGEAQSAIDSVDPENAEDGLLIVEVPKTKDDKDPEMDTELHIKGKGRKVQESRRGLVQDETETKKQEEMTVDDTTQSRNRHSSLAAEEGKEMLKSASDNKEKDQKEAAIRISKETLREEKPGERILDGDAESESVHKAAGNQMNKEKIKQESMDIAPLVGDNQHNTSRDGVEEGDVLVSGPEPHTLSMEHQGEEFKEELVLKTQNQPRFFSPDEIGLPTELEEEVPVQGRNLSWQQERDVAAAVNKHVTEKRRLSEGAIKEDTSDKGSFHHKAMQGTQEVENTGPTDSAEVPGFHTEKPKAEDDDYLPEELLEDENAVSAKQSKEKNTGIQDRRLDINLQAPERAILETTNPDPATGENKVETGMNLETERKSATVAKGEGTLDRGPASMEVEKEESSLVDKKTRRPSEVSDFPDTQKIQTPELGKVFQNKDSDYLEEDNPGEQPKTSGFAEKPEVEELSKEDHEALQKSMDPESQWSASEELEDDLFHWASHTTVKPEHTDSEKDLPIIRSFFKEQQSLQRFQKYFDVHELEAMFQEMSLKLKSAQQESLPYNVDKVLDKVFRASESHILSVAEKMLDTRVTENKNLGMKENNIFEEAAVLDDIQDLIYFVRYRHSTAEETVLAAVAQPPEEGRDGPMEEIQPPREDNFPPGSTEDLKMQVAEEPGHLGQPMTGDPAASEVTSDLAASEVTGDPAASEVTGDPAASEVSQTPNTEKDSDPGIITAEGTPVDGKKQLETNAEQPASATPLENALRLIYSFMFHLTKTLVATLPDDVRPGPDFYGLPWKPVLITAFLGIVSFAIFFWRTILAVSRLREILF	756002	824518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_756144_759195_759330_762654_762742_765404_768238_770494_770738_772977_773115_797303_797459_806202_806292_806563_806642_806730_806842_807900_807973_808157_808263_808895_809019_809115_809228_810379_810436_810525_810617_810789_810929_816661_816764_817425_817487_817586_817623_817696_817765_817889_817991_818155_818297_818993_819063_819173_819251_821249_821401_823025
902422	contig_3270_pilon	+	3838	6	Intergenic	novelGene_104468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTCGAGTCCCTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121452	139605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_121502_127794_127939_130712_130840_132594_135896_138789_138935_139533
902423	contig_6102_pilon	+	2742	18	Intergenic	novelGene_31854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	495.521290643469	7	81	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	59	1474	370803	393349	TRUE	10	AGCTGTGGCTCTTTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSWCHSTREWRLIATATAIAPHL	370744	395263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375499_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
902424	contig_12479_pilon	-	3055	23	Intergenic	novelGene_56859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	125.345407073335	30	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	480	2375	537841	451002	FALSE	75	CTTTATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	594240	450321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773_537846_548942_549016_593516_593621_593942
902427	contig_1443_pilon	+	5902	5	Intergenic	novelGene_28151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	624	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	3530	4963	324365	328618	FALSE	30	GGTATCTGGTGGAAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTTPPFSTPPKADFSQHESLMEKCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFKELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWKLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDNLNHNIPISLDMLLCSGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASNAATKAWGKVPDSKTPTGSFATIRQTANEPYIDFINRLQTAISRQVDNQQAAEVLCLQLAYENANADCRAVLTPLKAQNPNLAEMIRACQNVSTETHKAQVLAAALRPSTATCFGYGKPGHFKKDCHSSKKKNAKNPLPKVRWTLHDHNDSVLICTSRPYIFAITANPPDIIKINTSFQLTLSSGATWITPCLSRQNVSTLNISSVFVLRQRSHLWLPVNLTRPWQDRSPLAQVVNALQKMRTKRFLGILIASIITATAIAATAATAAVALSQSIQTAQQFNTYMQNVTSEMQTMVRIDQKILKRLGALEASVLWLGE	176656	329557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_177575_177934_178002_318843_320421_323397_325234_328053
902428	contig_3575_pilon	-	2821	5	Intergenic	novelGene_141117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	16	junction_1	32.457664734235	419	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	156	596	709385	697889	FALSE	25	TATTATTCTTATGACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLINPLQPIPRHRLQGNWLQEEGGPEDFSQLLRDFERWLQVENSKLVRIIAMRTATAKDVRARDMKLQELEARVPEGQHLFENLLHLGPARGTSDELEDLRYRWMLYKSKLKDSSHLLTQSSPGELTGFQKTRRWRGLRTLFRKVCCMALPVQLLLLLFLLLLFLLPVGDQDRSCTLANNFARSFKLMLHYDGPPPT	710562	695663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_698090_706814_706854_708345_708496_709334_709494_710515
902430	contig_11978_pilon	+	3403	3	Intergenic	novelGene_62852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5.5	22	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	714	1400	569925	570611	TRUE	50	TAATAATAATAAGCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLYTENPKESTRNLLELIERFSRVAGYKIKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYKYNAIPIQLPTTFLKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKEKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYDHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNK	564856	572814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_564923_569277_571668_571867
902431	contig_4732_pilon	+	1800	16	Intergenic	novelGene_75433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	612.013057231806	15	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	396	1541	653092	675284	FALSE	0	GCTGCTTGGCTGGTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILEDKDGKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIAMGNIGPAGMEGPFGGGMENMGRFGSGMNMGRINEILSNALKRGAIMAKQGGGGGGGSVPGIERMGPGIDRIGGAGMERMGAGLGHGMDRGAGIERMGLAMGGGGGASFDRAIEMERGNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAERACRMMNGMKLSGREIDVRIDRNA	634963	675543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_635101_644311_644482_651997_652058_653063_653158_654506_654546_654662_654699_655351_655506_656584_656635_657712_657774_660227_660330_662167_662246_670261_670316_672214_672328_672840_673018_673616_673669_675120
902432	contig_9705_pilon	+	5290	35	Intergenic	novelGene_41755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	272.456829696822	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1102	3309	868	4176	506088	541303	TRUE	65	TAAATTAGGAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEREKEKEKEEEKVEKLGLLEALLKIGDWQHAQNIMDQMPPYYAASHKLIALAICKLIHITIEPLYRRVGVPKGAKGSPVTALQNKRAPKQAENFEDLRRDVFHMFCYLGPHLSHDPILFAKVVRIGKSFMKEFQSDGSKQEDKEKTEVILSCLLSITDQVLLPSLSLMDCNACMSEELWGMFKTFPYQHRYRLYGQWKNETYNSHPLLVKVKAQTIDRAKYIMKRLTKENVKPSGRQIGKLSHSNPTILFDYILSQIQKYDNLITPVVDSLKYLTSLNYDVLAYCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETDKSRERSQCGVKAVNKASSATPKGNSSNGNSGSNSSSKTVKENDKEKAKEKEKEKKEKTPATTPEARVLGKDGKEKPKEERANKDEKARETKERTPKSDKEKEKFKKEEKAKDEKFKTAVPNVESKSTQEKEREKEPSRERDIAKEMKSKENVKGGEKTAVSGSLKSPVPRSDIAEPEREQKRRKIDTHPSPSHSSTVKVSIA	462702	548642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_462741_466106_466199_468452_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505989_506139_506722_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539266_539370_540595_541030_541229_542015_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483
902433	contig_9471_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_21710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	263	757	96554	97048	NA	55	AGTGTTAAAAAAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWKYKMIQPFWKTIWLFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDKWINKLWYIHTREYYATRKNSNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSEKDKYCMRPLL	96291	98539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_96300_98500
902434	contig_5039_pilon	+	2229	2	Intergenic	novelGene_64784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137943	140450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_138171_138448
902435	contig_14443_pilon	-	2532	5	Intergenic	novelGene_126664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	837.931679792571	30	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	97	450	39405	29618	TRUE	10	TGTCTTCATCTTTTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWMFKEDHSLEHRCVESAKIRAKYPDRVPVIVEKVSGSQIVDIDKRKYLVPSDITVAQFMWIIRKRIQLPSEKAIFLFVDKTVPQSSLTMGQLYEKEKDEDGFLYVAYSGENTFGF	39501	27318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_29292_29508_29709_37689_37863_38988_39045_39371
902436	contig_8045_pilon	+	4101	1	Intergenic	novelGene_35395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGGAAGAAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116162	120263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116200_120300
902438	contig_1301_pilon	+	8045	1	Intergenic	novelGene_47379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	5142	5441	693850	694149	NA	35	AGGTTTTTGGAGATCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRRFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRLTIQPGSGQPRKTKWD	688708	696753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_688700_696800
902439	contig_10857_pilon	+	3828	11	Intergenic	novelGene_160914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.003559268354	7	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	396	839	451750	463722	TRUE	15	GCCATCCATTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVHTYFGAHFTAVSRASLERNPYKAMHHWAFSVGVSLAGLLTLGAVLCAAATVREAAGLMAGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQGIRLLTQLSREPRSGRRHSWGAAVPRVPKGSISAPVLLPPPTTHFRPRRACGRRRAGHL	451233	471453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_451599_451719_451841_454214_454313_457543_457619_458753_458905_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_470398_470501
902440	contig_14441_pilon	+	786	4	Intergenic	novelGene_100740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	138	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	198	746	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121190	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
902441	contig_6735_pilon	-	8677	13	Intergenic	novelGene_15818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_12	36.012343562852	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2854	8562	116	8677	633176	588795	FALSE	60	GATAAAACAAAAACATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQLAKNSTEMEEFVRVKQQLKEKEELISTLQTQLSQTQAEQAAQNLRVLQRKLEEREEALSGRAQVVDLLQQELNAAEQRNQVLLQQLQQMEAEQNTLRNTLETERQDSKILMEKMELEVAERKLSFHNLQEEMNHLLEQLEQADQAQAELESQYRSLEQKHKAEMEEKTLHILSLQKTEQELQSSCDTLKDQNSKLLQEKREQSVQSAQAIQQLEDQLHEKSKEISQFLTKSTLQKHETASQTSFPDVSHEGVQAVTEEKIASLQQRVVELENEKGALLLSSMELEVLKAENEKLSSQITLLEAQSRAGKADKEDSQISMVDNTRLNKSNSSTEESGQDVLENTFSQKHRELSVLLLEMKEAQEEIAFLKMQLQGKKTEGDPEDLGQKEVKQMESEGIPPVEMKVLLEDTGQDFPLMSDEESSLPAVKKEEQASNKHQNTTSEEMPFNDTKMELKSTKQDAIDKSPAVIPDISQCQQDELKRLKSQISELEISFHKAEETYEKNLDEKAKEISKLTQLIEEFKKNAENTSNAFTALSEERDQLLSQVKELSIVTELRAQVQQLEANLAEAEKQRRLDYESQTTHHNLLTEQIHSLIIEAKSKDVKIEVLQNELDDMQLQFSEQSTLIKSVQSQLQKKENEVLEGEERLRDMSDKMEELSRALSQKELEIAKLDQLLVEKKKDVETLQQTVKEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSKAEEAKKEHVEEDKEVVSGLKHNYNELSPAGLISKEELQHELDLLKKESEQRKRKLQAALINRKELLQKVSRLEEELAKVRDESRKEVPLNANEKREMEEDKENKEDSEKCVSSKCQEIEIYLKQTISEKEVELEHVRKDLEEKVAAEEQLQATVKQMNQNLQDKTNLIDLLQAQITENQAVIQKLITGNKDAGDGDSAAPVKETVVISPAGAGSGEQWKPKLEEKILDLEKEKEQLQKKLQEVLASRKVILKKAQEKEKHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSKEKENIGDRLRQLQIQVRGSLDRNPPPGIDQEESSSSIQGLEDPVFKAAEQQLDQPVSESPLGPDLPSQHEDANILQSNPYIDQIKAKLKEIESEKEELELKVSSTSSELTKKSDEVFQLQEQINKQVLEIQSLKTAASEAEAHAESLKLTLESNQLEIARLEHLRELQPALDELQRLISKKEEEVSYLSGQLSEKEKIFTKVKTEVIEREDLIKALHMQLEMQAKEHDEKIKQLQVELSEMKQKPEETEKEGKAKLQIQRKLQAALISRKEALKENKDLQEELSLARDSIERLTKSLADVESQVSAQNKEKDIFSQRLALLQEERDKLIAEVDKSLLENQSLNGSCESLKLALEGLTEDKEKLLKEIESLKCSQIAEKTEWQEKHKELQKEYEILLQSYENVSNEAERIQHVVDAVRQEKQELYGKLRSTEANKRETEKQLQEAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEVHPAGDTSKERMDALLSSNSNMKEELESVRMEYKTLSKDFEALMTEKDILSQEVQDLKHQIEDNIFKQASREAIEKQDNQGDIIEEATQSVSDEVKEQDSPSRSTRPEYSESILLENSGKIDPDISENVSSHGEINNYLQEIDQLKETIAELEKEKHKEKEFSQALENEKNTLLNQILSKDGELKILQEEVTQINLLNQQIQEELSRVTKLKETAEEEKDDLEERLMNQLAELNGSIGNYYQDVTDAQIKNEQLESEMQNLKKCVSELEEEKQQLVKEKTMVESEIRKEYLEKIQGAQKEPGSKSHAKELQELLKEKQQEVKQLQKDCIRYQEKISALERTVKALEFVQSESQKELETNKENLAQADELRKKAQAELASFRVLLDDTQSEAARVLADNLKLKKELQSNKELVKSQMKQKDDDLERRLEQAEDKHLKEKKNMQEKLDALRREKAHLEETFGEIQFTLDKKDMEVKQLQENLDSTVAQLAAFSKSMSSLQDDRDRVIDEAKKWERKFSDAIQTKEDEIRLKEENCSVLKDQLRQMSIHMEELKINISRLEHDKQTWESKAQTEVQLQQKVCDTLQGENKELLTQLEETRYLYHNSQNELAKLESELKILRDHSTDLNNSLEKCKENKENLEGIVKQQEADIQNCKFSYEQLEADLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSAKEEAVQVAISELHQQHDKEIKELENQLSQKEEENKKAVDKTSQLMETLNTIKKESTQQKAQLDSFVKSMSSLQDDRDRIVGDYQQLEERHLSVILEKDQLIQDAAAENNKLKEEIRCLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVISIKDCQQKQLLEAQLQQNKELKSEYAKLEEKLKESEEAKENLQRSSNTLQEEKQGLSKEIESLKISISQLKGQVTDLQEEGTLGVFQAQLKVKEEEVQKLSTTLSSSQKRIKELEEELVHVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIMRNETETAEERVAELARDLMEMEQKLLTVTKENKDLTAQIQSFGKSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDASLKEVAQLREKQGLLSREREVLVSKAASPKSSTEDNSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSFSKAMASLQNERDHLLNELARFRKSEEGKQRSAAQPATSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQYLQINQEIPELRPLKAQLQEYQ	645380	588794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_588891_596236_598131_598974_604182_605595_605670_608598_608714_615018_615135_616300_616704_618882_618997_622573_622700_629168_629301_632682_632836_633044_633198_645286
902442	contig_7996_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_165152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAAGAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216997	214168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_-_214200_217000
902443	contig_8616_pilon	-	18507	8	Intergenic	novelGene_72605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2345	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	6003	6728	475107	474382	TRUE	10	AGTGGCCAGGCCCCCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSGPFRSPSTLGRGTSISPFTFGPFRLKSTSGMAILGALRCRSGILNLGPFSFASGPSIFTSGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFRCQSGPWTSTSGTSTSTLAASISTSGAFKSPSTLGRETSTSPFTLGPFRCKSKSGMEILGALMFISGILNLGPFSFASGPSTFTSGTSMSTLGPETSMSALGRFTSTFGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFKCQSGP	481109	447690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_447825_459761_459866_460229_460394_460853_461040_462005_468111_468311_468735_468950_473503_474270
902444	contig_5684_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_81062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	796	1116	441249	441569	NA	70	AAAAAAAAAAAACAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHQQILKKKTKAVAVESVPTHSDPIGQSRTAPYGFQGCSLYKSRLPHLVSRGAASGFEPPTFELAAECLTTALPGLLKKSLKLGKLTVSSLSLLGSPFRLYWPH	440453	442598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_440500_442600
902445	contig_6795_pilon	-	2246	13	Intergenic	novelGene_27660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	92.5007507477041	114	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	806	1657	119175	46152	FALSE	30	CATGCTGTGGATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134327	45562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_122838_123159_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
902446	contig_6576_pilon	+	3274	2	Intergenic	novelGene_42339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677209	680655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_678056_678227
902447	contig_7657_pilon	-	4995	7	Intergenic	novelGene_30015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	86	junction_2	575.067145837964	335	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	226	1002	174162	144429	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEADNLDSIKEEWVCETGSDNPPVSDNRQRNCEYFVDSLFEEAQKIGAKRLSPTEKKKQVDVSIKLWKNGFTVNDDFRSYSDGASQQFLNSIKKGELPLELQGIFDKEEVDVKVEDKKNEVFMSTKPVFQPFSGQGHRLGSATPKIVSKVKSIEVENKNNLSAVPLNNLEPITNIQIWLANGKRIVQKFNVSHRVSHIKDFIQKYQGSQRSPPFSLATALPFLRLLDETLTLEEADLQNAVIIQRLQRTAEPFRGLS	204369	140435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_144622_148740_148900_154455_154594_159603_159711_167271_167411_174121_174177_204158
902448	contig_7909_pilon	+	3238	5	Intergenic	novelGene_155921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	171.32188272372	321	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	248	835	542509	545022	TRUE	5	TTCCTCCCCTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVTEY	539009	551172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_539038_540065_540115_542338_542518_544443_546467_550213
902449	contig_15373_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_178783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29628	31688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15373_pilon_+_29600_31700
902450	contig_16411_pilon	+	6153	32	Intergenic	novelGene_77301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1194.48354123485	27	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1001	3006	857	3862	124585	241370	TRUE	20	TCAGCATCTTCGTCTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTPSEKHMLLKVMGFGLYLMDGNVSNIYKLDAKKRINLSKIDKFFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHYEENKSKWTCTQSSISPQYNICEQMVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKPLNIAYSHIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	89549	243788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_89629_99637_99778_101239_101330_111959_112038_113690_113793_120329_120510_122766_122864_124494_124624_127063_127169_129442_129535_131612_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136_167337_169242_169331_184039_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_242383_242509
902451	SIRV7	-	2119	4	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	32993	6	-9	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	46	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAATTAGTGTTAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114925	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_114680
902452	contig_8978_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_49428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489644	487858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_487900_489600
902453	contig_11590_pilon	+	3500	14	Intergenic	novelGene_125606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860601	893097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_860678_861524_861649_862060_862210_865287_865503_866857_867033_869799_869999_873983_874172_874791_874988_875274_875413_878196_878336_879305_879513_880035_880101_881602_881727_891592
902454	contig_9468_pilon	-	1062	7	Intergenic	novelGene_59510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	144.791133092542	199	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	370	999	369478	357007	FALSE	20	TTACTGGTCTCCCGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLRFKELESRLQQVDGFEKPKLLLEQYPTRPHIAACMLYTIHNTYDDIENKVVADLGCGCGVLSIGTAMLGAGLCVGFDIDEDALEIFNRNVEEFELTNVDMVQCDVCSLSNRMSKSFDTVIMNPPFGTKNNKGTDMTFLKTALEMARTAVYSLHKSSTREHIQKKAAEWKIKMEIIAELRYDLPASYKFHKKKSVDIEVDLIRFSF	369847	356943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_357046_357467_357518_359009_359062_360992_361076_361822_362005_362379_362495_369369
902455	contig_17976_pilon	+	1805	6	Intergenic	novelGene_32517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1199.10359852683	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	180	668	41843	47060	TRUE	75	TAAAAAAAAAAGAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGVR	41663	49749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46595_46678_46931_47049_47133_48684
902456	contig_5954_pilon	-	3139	17	Intergenic	novelGene_28741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	174.598009277741	334	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	565	2805	1265881	1249935	FALSE	85	CAAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKGSGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1266445	1249600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1254060_1254319_1254916_1255079_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369_1258490_1260597_1260835_1261563_1261621_1261767_1261839_1261931_1261998_1262315_1262365_1265268_1265323_1265746
902457	contig_20614_pilon	+	3271	6	Intergenic	novelGene_107522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5.6	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	124	1374	58672	64723	TRUE	35	ATTGGTGGAACAGAATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRSSPWPLAQLFEGEELPPHFGIRTSHDGCHLKPSGSPGVMAQKHPGGRGLCGAHHSGGASLRTFGPSVEPDILSFSGPRDSAGTTLNGTRCLTEQSDPKYTQPPNPAHWSDPSHGPPRGPGPPRDGEDPDQSEISSEEESGMDQELSRENEAGYQEDGNPSFLSIPPTCNCQRTPGIPEGLYSEGGDSSSSNFCHHCTSPALGEEEELEEEYDEEEPLKFSSDFSRVPSGKKPPPRRQRHRFPTKEDTRETGRRDPRSPGRHRLGRKRSQADRRRGLGLWGAEELCQLGQAGFWWLIELLVLVGEYVETCGHLIYACRQLKGSDLDLFRVWVGVWAGRLGGWAQVMFQFLSQGFCYGIGLLTRFLRLVGALLLLALALLLGCLQLGWQFLVGLADLQDFLSRIFQVPPGQMSNGNFFAAPQSSPGTTTASKPNSTVPKGEAKPKRRKKVRRPFQR	58136	68950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_58204_58615_59735_64535_66206_67449_67601_67866_68042_68861
902458	contig_12391_pilon	+	2221	14	Intergenic	novelGene_103595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_9	296.813750299517	469	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	22	987	56804	103666	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSQLPAD	56782	108078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_103647_103817_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
902459	contig_14618_pilon	+	2508	6	Intergenic	novelGene_136840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	36.4889024225175	239	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	56	514	1228613	1244156	FALSE	20	AGAGGATGCCGGCTTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVEDSFDPNINPTIGASFMTKTVQYQNELHKFLIWDTAGQERFRALAPMYYRGSAAAIIVYDITKEETFSTLKNWVKELRQHGPPNIVVAIAGNKCDLIDVREVMERDAKDYADSIHAVFVETSAKNAININELFIEISRRIPSTDASPPPGSKGFKLRRQASEPKRSCC	1188861	1246150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1188907_1228602_1228685_1238008_1238081_1238168_1238276_1239062_1239173_1244058
902460	contig_11851_pilon	-	4761	1	Intergenic	novelGene_146556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3432	3827	40024	39629	NA	15	ACCTGTGTTGTTCAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLQALISGAKELWNTRPSRADMAARPVGPRGQRTTKQKLKRQGTQEVELPQFQKVGPRPLGSQRVEPKPPRFQRVGSSPTWFRSVGLPFTSASGMGPDPPLKAEGVGLPCPRGRRTGSARAKGFATQMD	43455	38694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_38700_43500
902461	contig_5686_pilon	+	3564	22	Intergenic	novelGene_45279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1344.64679292832	78	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	24	1109	93843	208354	TRUE	70	TTTAAAAAAAAAAAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGCV	93819	258282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_202911_208341_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_257383
902462	contig_8263_pilon	+	1326	6	Intergenic	novelGene_83111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	393	junction_3	45.0484183962101	6	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	69	1040	180047	192899	FALSE	45	GCTGTTTTTAAAACAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	179978	193185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
902463	contig_8896_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_171569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTCCCCTAAGCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17333	15901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8896_pilon_-_15900_17300
902464	contig_7870_pilon	-	3693	1	Intergenic	novelGene_109099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGTCTCAACAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850702	847009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_847000_850700
902465	contig_6361_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_23878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	400	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2608	3018	73819	73409	NA	30	AAAAGTGTGATTCTCCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRPQQPVAPPASNTYPNTPYISSASSYSGQSQLYAAQHQVSPPPSSPAAAFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPDASELPASQRTGLRLKGIWFGSFLYIFMNGWMGGWRRIISVCKLNSVRY	76426	73374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_73400_76400
902466	contig_7272_pilon	+	3292	14	Intergenic	novelGene_25346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTAGAACTTTCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592735	609911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_593431_595296_595454_597554_597698_598020_598326_598893_599066_599907_600052_601012_601175_603503_603668_603885_603964_604438_604610_604708_604812_604920_605071_606906_607027_609183
902467	contig_12837_pilon	+	4937	1	Intergenic	novelGene_57410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	408	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTTTGACTAGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498861	503798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_498900_503800
902468	contig_6102_pilon	-	1196	6	Intergenic	novelGene_32164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	607.090306297177	34	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTGTCCTTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846795	839081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846162_846761
902470	contig_12327_pilon	+	1892	4	Intergenic	novelGene_140682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAGATGCATTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139403	1144291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1140156_1141085_1141330_1141766_1141871_1143499
902471	contig_11026_pilon	+	593	2	Intergenic	novelGene_167659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	513	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTGTGTAAATCAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123822	125364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_123967_124915
902472	contig_10549_pilon	+	3756	1	Intergenic	novelGene_110606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAGAAAGAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158708	162464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_158700_162500
902473	contig_2798_pilon	-	4617	1	Intergenic	novelGene_120042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152844	148227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_148200_152800
902474	contig_11277_pilon	+	3024	8	Intergenic	novelGene_80304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	122.779543599618	76	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	135	1139	250372	267180	TRUE	25	GGAAAATATGTGGGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGKPLHFDTQFSVHNVLKPSEMLSYPNGGNSLRVILKDCLKAMCHFDWILLFCVMTIFTNDKPLLLVFPNTSKTG	248203	270871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248302_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_267610_269415
902475	contig_2917_pilon	-	2184	7	Intergenic	novelGene_147574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	258.472059525891	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	405	1016	109433	93080	TRUE	45	TGGGTATCAAACTAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124084	76795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93051_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_123985
902476	contig_13004_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_112590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	963	1301	53407	53745	NA	30	TTCACCACTGATTTTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFPNLLQINLPLKSAEVSRRNTEELYSSSHELQNGCSLQNHGSSVWATASVTSHSHFYFYPHILYFQCSSFLWRSHGGAVVKRSAANQKVSSLNPPATPWKPYGVVLLCL	52444	54127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_52400_54100
902477	contig_12886_pilon	-	3794	1	Intergenic	novelGene_135487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	372	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCATGCAAAGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363195	359401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_359400_363200
902478	contig_5316_pilon	+	2095	9	Intergenic	novelGene_61212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	284.745472966648	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	350	1507	453918	550408	FALSE	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396010	550996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453972_474052_474257_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
902479	contig_16185_pilon	-	2654	11	Intergenic	novelGene_144744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	87.8393989050472	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	94	1068	127403	87630	TRUE	25	TGAACGTTGGTATCAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLEVRR	134356	81719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87051_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127364_127464_134323
902480	contig_19812_pilon	-	2076	19	Intergenic	novelGene_100994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	102.588173457438	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	79	1956	46806	15879	FALSE	25	AGTGTCACCTTACTAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48277	15758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38602_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
902481	contig_5258_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_100241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACCACATAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185987	187977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_186000_188000
902482	contig_7629_pilon	-	4181	1	Intergenic	novelGene_153576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1995	2330	323598	323263	NA	0	TGCTTCCTTCTTTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEFSSIYAKYFSWPRLRKITEKNNYHLLHDTIQHHFPVILSKCDKYLVIKITSDIQSTVLGSEGALVGTVVKHSAANQKVTSLNPLAAPQEKDVAVCFCKDPSFGNPMG	325592	321411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_321400_325600
902483	contig_16098_pilon	-	1791	8	Intergenic	novelGene_45936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1816.34487195509	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	201	1382	350803	348441	FALSE	50	CCTAGTCAACAAAAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPVAPRTAQSCVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354105	348031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350331_350765_350889_353990
902484	contig_7229_pilon	-	631	3	Intergenic	novelGene_39811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1980.5	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCTACTTAAAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877534	875602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876816_877346
902485	contig_14441_pilon	+	1930	10	Intergenic	novelGene_100362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	387.086968248292	3	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1080	1691	31079	126274	TRUE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIQSTELGDSAVYFCASSLSTQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGQPPVHRLPPAQFPTRGGSCRPLSSTRSCWGKRPCTLCWSVPSC	23052	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23405_23565_23796_25816_25950_26652_26785_26886_27118_31077_31145_121201_121239_125517_125896_126143_126283_126514
902486	contig_12464_pilon	-	1984	5	Intergenic	novelGene_68681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	91	junction_4	634.428877022476	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	591	1040	222518	182052	FALSE	40	TGAAAAAATATTTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKTQQYHKEREQPPRFAQPGTFEFEYASRWKALDEMEKQQREQVDRNIREAKEKLEAEMEAARHEHQLMLMRQDLMRRQEELRRLEELRNQELQKRKQIQLRHEEEHRRREEEMIRHREQEELRRQQEGFKPNYMENVSKILVHYSDA	242571	181107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_182194_192378_192464_218694_218892_222492_222589_242051
902488	contig_7176_pilon	+	1839	1	Intergenic	novelGene_107879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCGTTGTCCTTGAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722809	724648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_+_722800_724600
902489	contig_177_pilon	+	4758	12	Intergenic	novelGene_41787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	141.814452165409	490	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	384	1649	380699	393448	TRUE	65	TTACAGCCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESAGLKVTRDLKAAVSAILQGYGDGQQSVTDASAELHRLCGCLELLLQFDQKEKKSFLRPRKDYWDFLSTALWQQRGDMEPSRFVRSQEKLKTPLGKGRAFIRFCLAHGQLAESLQLCLLNPELTRSRCSNSRKTQGRRPRRDKVSPKKISAACGGPKGVHQEEPHPNQASCLGDVPRGDCFAGLSGSQPHKHLPPFLEKKREDPRSPKAPRSRWEPEEELQQDQSEGAPRPGICLQNSTPSIQGQREGSKGAPKEVIGTEAEGRGGLPGAETQRSVEETHEGEAEWGHVQRLLTSSPRRTIEEVTWGRRQESEVPSIPGGALGPSGPGKRGRLHHREATKTNRSNQRGWERGASRSIPAGCGQEPQTSTPEGQGAGPAPEAAADGTGPGAEGLAEATQQVSGRERPAAGRASAETTGG	378661	402899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_378744_379288_379464_380572_380742_380856_380964_382177_382304_382848_382956_383964_384035_385201_385848_386533_386641_393388_393536_399296_399408_399988
902490	contig_8254_pilon	-	3193	15	Intergenic	novelGene_48382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAAATCACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110076	72810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_72863_74712_74962_77449_77593_82134_82243_86617_86828_87385_87463_93957_94110_94953_95092_95725_95840_97732_97844_100693_100895_102339_102544_104499_104661_107563_107755_108994
902491	contig_16411_pilon	+	8043	4	Intergenic	novelGene_77276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	731	junction_3	16.1314048434171	424	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18717	36908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_20515_21951_22081_26146_26188_30832
902492	contig_5083_pilon	-	2178	12	Intergenic	novelGene_151659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGATCAATGTGCAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674763	461517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_461967_462226_462294_462499_462627_648611_648742_651097_651204_653251_653337_658042_658171_658766_658926_659474_659580_666159_666212_666788_666844_674048
902493	contig_1699_pilon	-	5641	2	Intergenic	novelGene_72830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	778	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGAAGTTTGGCTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106919	100077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_100459_101659
902494	contig_50_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_122204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	668	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAGAAGGTTCTATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2146	867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_900_2100
902495	contig_11656_pilon	-	1237	2	Intergenic	novelGene_53955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	418	junction_1	0	99	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141112	138174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_139256_140956
902496	contig_14445_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_137382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGTTCTACTCTGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363184	361388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_361400_363200
902498	contig_10892_pilon	+	3363	1	Intergenic	novelGene_116763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCGGGTTGCAGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203491	206854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_203500_206900
902499	contig_11855_pilon	+	3796	1	Intergenic	novelGene_66929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATGAAACATGTATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911737	915533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_911700_915500
902500	contig_15327_pilon	+	495	3	Intergenic	novelGene_70444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	41	379	239417	242874	FALSE	15	ATCCACGTGTGTTATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPQWGDSHHSAPSMALDREVWAEQQAHSVSNLRSEETTRPRPEPPTPSHVGAIHSHHRSWPAQPGWGQSVWIAGAQLSIYPADIKERSEQRHMGTSYHQESSVGSRARPLDLRFLRREAPRPKED	239376	242990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_239453_241057_241230_242743
902501	contig_4654_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_103090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCACCCCCAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492732	493514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_492700_493500
902502	contig_13139_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_178784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	685	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	492	911	63762	63343	NA	75	TAAATAAAAGGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKKIIDLYLS	64253	63194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13139_pilon_-_63200_64300
902503	contig_5669_pilon	+	2152	2	Intergenic	novelGene_86102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_1	0	352	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	620	964	380493	383947	FALSE	30	GCTAAGCTGGACTCCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFNCSEDNPSRERCSVPYSCCLPTPNQAVINTMCGQGMQALGYSEASKVIYTNGCIDKLVNWIHSNLFLLGGMALGLAIPQVIYPVRLVGPTNSAKTPLFLRGHLGISWVSRR	379873	385135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_380577_383686
902504	contig_4364_pilon	+	3852	4	Intergenic	novelGene_101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	3.09120616516523	988	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGAAATTCGGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981273	989410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_981338_981481_981669_985621_986570_986757
902505	contig_990_pilon	-	3005	4	Intergenic	novelGene_76059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACTAAAAAAACAAGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091682	1056565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1056624_1064801_1065075_1088595_1090938_1091350
902507	contig_7066_pilon	-	5178	3	Intergenic	novelGene_42141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	21.5	169	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGCTGAATCATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757854	746973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749996_752252_754283_757728
902508	contig_14536_pilon	+	7868	4	Intergenic	novelGene_69309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	412	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	5325	5681	351188	351544	FALSE	80	ATAATCCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKTKNKVGGLTLPDLRTYYRATVVKTARYWYKDRYVDQWNRIESPDVKSIHLQSPDLRQGPKVHQMGKRQSF	204934	353731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_209253_324938_325687_336446_336610_351092
902509	contig_4659_pilon	-	2197	10	Intergenic	novelGene_118232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_9	212.268697645225	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	70	1095	860030	819799	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAATCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQSSCKDLKRLFSGTQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884154	817409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_818087_819373_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_852958_853001_853789_853937_859916_860039_884093
902510	contig_4402_pilon	-	3602	12	Intergenic	novelGene_140796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	756	1076	253205	244003	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLGRSLLAESECSSGKMLRSGSEALELVSLNIPISVLTEYGRSYTLVPGTFPTCEGIREGIRYYFGSCGHCAGEAAIPSRVGARRMRGWGHAGSVPRLWYRSRSR	253960	215915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_217145_223676_223788_224376_224460_226243_226324_228333_228451_230975_231068_232547_232709_236196_236363_243515_244138_245103_245155_246895_246942_253116
902511	contig_14288_pilon	+	4464	5	Intergenic	novelGene_153827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	1430	2254	388961	389785	TRUE	75	AAAAAAGAAAAAAATAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKQKPGEYVWKWLLRVWDNGARNIKMDRSEFIDMGPLSTDCSFSVSAKEVRKGSNSLFGWVAEAWIMRWPTLNQVEVPDLPWYTVEEGIHGLRETGMLEWIYQVTPTDPHMECPEDTPFTTTVRNEFVKGAPVSLKTAVTPILCKSDLTAGTTLTELRHLTTMGLIGPGGSRGQVAALNQQRQGGRDHSNGQRSQSSNQNSLTHMDLWHWLLSHGVPRSETDRKSTKYLFDLYKWMNSRSGEQQSNSNHQNRESRSLNQFPDLSEFKDPQLLE	387531	660864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_390053_400663_401270_525068_525078_563235_563912_660212
902512	contig_8386_pilon	-	4204	1	Intergenic	novelGene_82235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	800	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGGCCTTTCTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69150	64946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_64900_69200
902513	contig_18039_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_171244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGATCTGAGTCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111947	109220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_-_109200_111900
902514	contig_2799_pilon	-	4889	2	Intergenic	novelGene_85592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	4519	4887	781803	780338	FALSE	5	CCCTCGGGTACTCTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGS	786321	780335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781547
902515	contig_12123_pilon	+	1651	7	Intergenic	novelGene_144584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1489.25279549474	14	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	9	1055	61563	131965	FALSE	70	CTACGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTPRLHGGRAPLPQDRGFLVVQSDPRELRLWARGDAWGASRTDEKPLRRRRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVVVALARDSLALARPRSSDVYVSYDYGKSFKKISEKLNFGVGNNSESVIAQFYHSPADNKRYIFVDAYAQYLWITFDFCNTLQGFPIPFRAADLLLHSKASDLLLGFDRSHPNKQLWTSDDFGQTWFMIQEHVKSFSWGIDPYDEPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSLENQEVILEEVKDFQLRDKYMFATKVVVSSSPGQSAAAFCPALGLLWPEPHASSPVCHKASY	61554	132561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_61848_82114_82232_91500_91627_98944_99107_100690_100759_109332_109521_131864
902516	contig_13295_pilon	-	5123	5	Intergenic	novelGene_31225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_4	209.047243464247	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	241	558	85663	80202	FALSE	40	CTGAGACCACTATTATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCVSSRVGQAGGGRGE	134794	75636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_80316_83126_83228_85560_85677_101889_102009_134686
902517	contig_1244_pilon	+	3214	2	Intergenic	novelGene_38087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTCAGTTGGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565876	1569154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1566837_1566900
902518	contig_1090_pilon	-	2976	3	Intergenic	novelGene_131113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	441	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGCCAGTGAAAACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344697	337642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_338147_340828_341459_342855
902519	contig_5686_pilon	+	3563	6	Intergenic	novelGene_45227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2724	junction_2	1222.19857633692	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	58	600	93843	176763	FALSE	45	TCCATAAAGATTATAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVSDILLYFFASVF	93785	179726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667
902520	contig_7398_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_166163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	906	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	163	759	140709	141305	NA	20	CTGTGAACGGGGCACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDFTKKVKRKPTDWEKTLGHYKSDKGLISKTYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVANGHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKKTENNKCWRGYQEIGTLMHCWWECNMIQSFWKTIWLFLRKLEIEIPYDPAIPFLGIYPREIRAVTQTDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRRPSTDEWINKRRYIHIIVYYATRKNNDESVKHLKTWMKLEDIMLSEVSQSQKDKYCMKLLL	140546	142365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_140500_142400
902521	contig_14744_pilon	-	1811	13	Intergenic	novelGene_66036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	103	junction_12	456.964622992488	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	524	1702	1345024	1304013	TRUE	25	GGAAGGTTTGCATTATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKLAETTDKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEFETKCNNSKPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIVDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKRKGHEYTNIKYSLADQASGDQSPLPPCTPTPSCTEMREDNARVYENVGLMQQQKSFR	1346916	1303213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1303291_1303980_1304083_1306173_1306287_1313632_1313785_1314309_1314378_1315775_1315931_1319642_1319775_1325293_1325453_1325580_1325661_1328045_1328143_1344215_1344330_1344985_1345103_1346471
902523	contig_9921_pilon	+	3202	4	Intergenic	novelGene_23746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	258.801081914276	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	128	592	321085	323595	TRUE	10	TCAAGTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSSDWIIFLILVDLTVLAHCVLLKESNVSLV	299188	326290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_321460_323505_324741_324825
902524	contig_13740_pilon	-	5518	15	Intergenic	novelGene_34642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	4261.63118921114	6136	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	2654	3679	165243	157474	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	178058	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_155952_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237_166215_170858_171002_173066_173230_176356_176452_176777
902525	contig_9363_pilon	+	4180	25	Intergenic	novelGene_6772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1244	1804	1508295	1517957	TRUE	65	AAAAAAAAAAACAGAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHFLLIYNINFCDDLGQGGTAAIEVEVLAAVEGDGDGAAEPEHRGGLNLSHELDSCNYLDGRLLFEDNWAAELSSREAGLSVAGQPLQCLIMAGDRRLHLHHPRVCDGSLAVTLWHPNQGLQGRHVVVMDRRLNHHLVDVLDILNLGTFRLEIDVECGVLLVLDEDIDGVQDWDAGGGRVVLQEA	1505348	1539561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1505429_1505622_1506718_1508226_1508338_1509046_1509147_1509561_1509659_1509767_1509824_1510100_1510214_1516336_1516415_1517883_1517973_1518084_1518160_1518573_1518687_1519972_1520113_1520467_1520541_1520636_1520694_1526261_1526349_1528119_1528274_1528377_1528539_1529874_1530004_1530147_1530346_1530798_1530939_1532248_1532394_1535522_1535663_1535774_1535849_1538730_1538885_1539040
902526	contig_3960_pilon	+	2699	2	Intergenic	novelGene_138055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734210	737228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_735601_735919
902527	contig_5793_pilon	+	1106	2	Intergenic	novelGene_178785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGTCTATGAGGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121863	155599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5793_pilon_+_122298_154927
902528	contig_13565_pilon	-	5329	1	Intergenic	novelGene_162371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTCTTTATCACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94610	89281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_89300_94600
902529	contig_8992_pilon	+	1329	8	Intergenic	novelGene_174419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	88.9147723086208	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	195	995	74535	108008	FALSE	25	AGGTGATATGTGCTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLCNRARLVSYLPGFCSLVTRVVNPKAFSTAGSSGSDESHVATAPPDICSRTVWPDETMGPFGPQDQRFQLPGNIGFDCHLNGTTSQKKSQGSDTPVEQEINSAETYFESAKVECAIQTCPELLRRDFESLFPEVTTSRLMIMTVTQKTKNDMTVWSEEVENEREVLLEKFINGAKEICYALRAEGYWADFIDPSSGLAFFGPYTNNTLFETDERYRHLGFSVDDLGCCKVIRHSLWGTHVVVGSIFTNATPDSHIMKKLSGD	73853	108342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_74000_74486_74544_90496_90642_96567_96696_100352_100459_102457_102589_106813_106901_107813
902530	contig_15821_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_25021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCAGATAGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125350	122924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_122900_125400
902531	contig_9995_pilon	-	5547	1	Intergenic	novelGene_47804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAGAAGAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834367	828820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_828800_834400
902532	contig_6102_pilon	-	3239	2	Intergenic	novelGene_32175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1486	junction_1	0	120	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGTGGGGCTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846838	842511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_845001_846088
902534	contig_10341_pilon	+	3180	9	Intergenic	novelGene_47225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	205.541814480655	618	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	192	1181	87490	120280	FALSE	40	CTGAAACAACTGCGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGSTAGNSAHCRKPSGRGVQNKTNCTKDSTSSSGESGKGYSRDQVDGVLSINKCKNYYEVLGVTKDAGDEDLKKAYRKLALKFHPDKNHAPGATDAFKKIGNAYAVLSNPEKRKQYDLTGNEEQGCNHQNNGRFNFHRGCEADITPEDLFNIFFGGGFPPGSVHSFSNGRAGYNHQHQHRHSGHEREEERGDGGFSVFIQLMPIIVLILVSLLSQLMVSNPPYSLYPRSGSGQTIKMKTENLGVIYYVNKDFKNEYKGILLQKVEKNVEEDYVTNIRNNCWKERQQKTDMQYAAKVYRDDRLRRKAEALSMDNCKELERLTSIYRGE	67392	122279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_67507_69566_69627_87472_87645_94305_94452_105635_105822_111077_111173_111962_112073_113062_113236_120155
902535	contig_9924_pilon	+	1381	1	Intergenic	novelGene_175927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	246	741	100	840	129709	130449	NA	30	ATGTTTCTGTCTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDGEKKSKKIKEKISKKKNELSDNAEKLPGKGDSYDSSEDKKSRNGASDREKKRCNLPEKSSRRRQDCSSSDTEKYYLKEDGCDSSDKRLKRTELRERRNLNSKRSTKEIQSGSSSSDAEESCSEDNKKQKKQRPTAKKKTNNVKEKKRNSLRTSTKRKQAEITSSSSDIGDDDQNSVGDGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGMQK	129609	130990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_129600_131000
902536	contig_383_pilon	-	5304	2	Intergenic	novelGene_126101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	284	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGATAAGGAAGGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125915	119315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_123867_125162
902537	contig_5255_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_171554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATACTACCTAGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31990	34053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_+_32000_34100
902538	contig_5041_pilon	-	7503	1	Intergenic	novelGene_27089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	266	568	549770	549468	NA	35	CCAGCATCAACAATTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNIHKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLLLRFTVQPGIGQPHKTKRNE	550035	542532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_542500_550000
902539	contig_10324_pilon	+	1949	10	Intergenic	novelGene_7798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	92.4471153460316	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	74	1318	132046	138898	TRUE	25	AATGAGCTTTCTGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAENVKQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGSPMHNEVPPPPNLRGRGRGGNIRGRGRGRGFGGANHGGYMNAGAGYGSYGYGGNLATAGYSQFYSNGGHSGNAGGGGGGGGGGSSGYSSYYQGDDYNSPVPPKHAGKKQPHGGQQKPSYGSGYQSHQGQQQSYNQSQYSNYGPPPGQTERLQSWTRQLLLLLKLLQLPRGRGWIRLQLREQIQLQW	131609	140160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_131657_132019_132220_132653_132822_133225_133364_133457_133635_133727_133882_134042_134097_137596_137964_138885_139015_139645
902540	contig_9839_pilon	-	6151	1	Intergenic	novelGene_88518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	531	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAAAAAGGGGAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52843	46692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_46700_52800
902541	contig_8571_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_169160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTAAGTCTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362862	365050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_362900_365000
902542	contig_4305_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_136721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAGAGAACAGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822308	824651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_822300_824700
902543	contig_15407_pilon	+	2424	3	Intergenic	novelGene_123055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	202	223	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATTGTGTAGTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449424	472469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463783_470538
902545	contig_19352_pilon	-	893	3	Intergenic	novelGene_122386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_1	140	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGATGAAATTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144359	142914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_143711_144174_144240_144327
902546	contig_7569_pilon	-	3438	1	Intergenic	novelGene_114592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	85	303	101242	101024	NA	35	TGAATCCAGCCATTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEPLRLEGTQNTTGEELSPQSRDDLNDMDGVKLSGPSFTDVTRLNMRRNRCKHPLIIGTWNVRSMNLGKLEVIKNEMEHMKIDILGITELKWTGTGNFE	101326	97888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_97900_101300
902547	contig_10904_pilon	+	4256	3	Intergenic	novelGene_22710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1640	1996	639547	729981	FALSE	65	CAGAAAAAAATGAAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDCIKRNNLRVTGVPEQGGIKENTKRIVEDLLAENVPEIMKDEKISIQESHQTPHRVDPKRKSPRHIVIKFAKTIDKERILRLARDKQRVIYRGESIRLNSDYLAETMQARRKWNGI	637732	732241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_639358_639532_639604_729681
902549	contig_13547_pilon	+	3065	1	Intergenic	novelGene_104860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	164	526	48166	48528	NA	25	TAGTCAAATCCCAGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKYPLIIRTQTVRSMNLGKLEIVKNEMEHININNSGISELKWTRIGNSESDNPMVYYAGNDNLKRNGTALIVKKNISRSILKYNAVSDRIISIHLQGRPVNMTTIQIYVPPLMSS	48002	51067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_48000_51100
902550	contig_1734_pilon	-	3072	5	Intergenic	novelGene_164388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2639	3007	654408	654040	FALSE	55	TTTTAATCGAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLSQAGRIRWSACPPYPAEVRFLNWGGDCGREQEIDWIGGRQQPTSASQSSSLAWLGLANPLAARVQGVPETLRRVRVDVGASLETSCFKESLVVVNQNHSTRQQDDFLKICSSRHKRKL	666078	653974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_654803_658207_658380_658995_659083_659847_659986_664231
902551	contig_2854_pilon	-	2671	16	Intergenic	novelGene_120832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	137.706773818703	6	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	389	2470	340469	257841	FALSE	15	TCCGTGACTTGAGTGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWRRVGCAEQWVRLAPTAPCAASCHHVVVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGCREHILEDAKPESVDDTTDLALPPEMPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	356589	257639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368_274512_300455_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773_348009_356279_356338_356503
902552	contig_17964_pilon	-	2174	11	Intergenic	novelGene_33893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	236.570158726751	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	251	1258	369511	346143	TRUE	75	TAGTAAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSELYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRANSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPADQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFAR	370885	340342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340914_344422_344616_345990_346147_347653_347776_348928_349055_351505_351644_355598_355734_357565_357696_359050_359316_369423_369661_370784
902553	contig_14450_pilon	-	8314	3	Intergenic	novelGene_48956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1457	1984	1043352	1042825	TRUE	25	TAATGCCTCCCCAGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1044808	1035619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039919_1040409_1042053_1042436
902554	contig_19179_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_142366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACTGTTGCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21067	22458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_21100_22500
902555	contig_19132_pilon	+	3344	1	Intergenic	novelGene_169995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1950	2327	342786	343163	NA	50	CCTTATAACAACAACAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWIPSRVHAKKFGRRLPGQLTERESICAIPKTGDPTECGNYQTISLISHASKVFLKIIQKQLQHYIDRELLEIQAGFRRGCGTRDITADVRWILAESREYQKNVYLCFTDYAKVFDSVDHNKL	340836	344180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_340800_344200
902556	contig_9335_pilon	-	2883	3	Intergenic	novelGene_147458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	3.5	185	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	126	509	737423	642197	FALSE	50	AAATAAAGAAGGACCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGGIFHRARGRTLDAFSAEKEREWKGPFYFIQGADPQFGLMKAWSVGDCDGGGDEWGQEIRLTEQAVQAINKLNPKPKFFVLCGDLVHAMPGIKAVFSGHYHRNAGGIYQDLDMVVSSAIGCQLGKDTHGLRVVVVTTEKIVHRYYSLDELSERGIEDDLMGLMKKK	758592	639822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_737269_737489_758532
902557	contig_5832_pilon	+	1194	2	Intergenic	novelGene_134108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAATTGTCAAGTTGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5403	21117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
902558	contig_6117_pilon	+	5728	1	Intergenic	novelGene_167310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	360	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGGTCCTTGATTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146198	151926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_+_146200_151900
902559	contig_11316_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_122602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	707	1219	137674	138186	NA	30	CAACGACCCCCTCCATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136967	138994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_139000
902560	contig_3817_pilon	+	3096	1	Intergenic	novelGene_78296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	2386	2967	116887	117468	NA	30	TCCCAGCCAACGAATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRVRCVSLILEERILVCSCLLLSTQLAVTVLIVKADSRIRLLWCLLFLLAVEKHSPTAKHFFQLQTLQSENSNLRKQATTTIYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSARGSRPMSMYETGSGQKPYLPMGEVNHPEESRTRLQPFPAHVSNTTGACAVHSLPSLTAASPLLNLQIPTPPLGQTGLRELSLCLLY	114501	117597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_114500_117600
902561	contig_7843_pilon	-	2394	8	Intergenic	novelGene_152024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_6	50.6528803298913	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	398	1276	213416	201305	FALSE	75	ACGAAACAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSGVCTSSVQLPGKVAVVTGANTGIGKETAKELAQRGARVYLACRDVQKGELVAKEIQTKTGNQQVLVRKLDLADTKSIRAFAKGFLEEEKQLHILINNAGLMMCPYSKTADGFEMHMGVNHLGHFLLTHLLLEKLKESAPSRVVNVSSLAHYLGRIHFHDLQSEKFYEAGLAYCNSKLANILFTQELARRLKGSGVTTYSVHPGTVKSELPRYSTFMTWMWWLFFFFLKTPQQGAQTSLYCALTEGLEILSGKHFSDCQVARVSAQARNETVARRLWDISCDLLGIPLD	214902	200186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_201408_207185_207376_208283_208494_209063_209169_211506_211663_213301_213594_213688_213800_214793
902562	contig_13558_pilon	+	3229	1	Intergenic	novelGene_123009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATAAGCTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36705	39934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36700_39900
902563	contig_12079_pilon	-	2920	10	Intergenic	novelGene_67530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	394.575940522868	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	171	2159	871668	861365	FALSE	40	AAGTACAAACGTTAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862496_862540_862630_864518_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
902564	contig_12871_pilon	-	3150	2	Intergenic	novelGene_140369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	419	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	291	665	16487	16113	FALSE	30	TCAGAGGCAGCTCCCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLQKTAWHFLKNLEIEAPYDPAIPLLGIYPRDLKIMTPTDICSPMFIAALFTTANTWKPPKCPSMDERISRLWYIHTVKYYTTIKNNESVKHIITVMGQEGIMQSEISQAYKNKYCTIPLL	17170	13627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_16642_17034
902566	contig_14472_pilon	+	2725	1	Intergenic	novelGene_111179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTCCTAAAACCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369664	372389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_369700_372400
902568	contig_9698_pilon	+	5746	10	Intergenic	novelGene_82498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_9	207.272767145132	29	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	711	2136	2313	4448	237185	254787	FALSE	30	CATCCCATTCAGAACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQTITDLLSEQKTSASQASPQSASSPRIESTTGITTATSPRTPSPLTVQDPLCPAVCPLEELSPDSIDAHTFDFETIPHPNIEQTLEQGSLDLDSLAESPESDFMSAVNEFVIEENLSSPNPISDPQSPEMMVESLYSSVINAIDSRRMQGTNICGKEDSGDHASNVQLEKCRVVAQDSHFSIQTIKEDLCHFRTFVQKEQCDFSNSLKCTAVEIRNIIEKVKCSLEITLQEKYQRELQTLKNEYEAKLDALIKESEENENKIKKLKGDLVCLEEVLQNKDNEFALVKHEKEVVICLQNEKDQKLLEMENIMRTQNCEIKELKESQEIVLGDLKKLHVENDEKMQLLRAELQYLEQSHLKELEDTLQVRHTQEFEKVMTEHRVSLEKLKEENQHRIDQIQESHATVVQEKDQQLQELKLKVSDLSDMRCKLEVELALKEAETDEIKLLLEESKAQQKETLKSLLEQETENLRTEISKLNQKIQDNNENYQVGLAELKTLMTIEKDQCISELISRHEEESNMLKAELNEVTSLHQQAFEIETKLKDQIVELQNKLESELSTLEKQKDEKMIQQEDRYEAIIHKLEKDKEKLVMSQDQDREQLIQKLNSEKEEAIKTALNEFKLGRDAAEKELLEKVRHLETQLAKSPATESAREESSSLVAELQEKLQEEKAKFLEQLEEQEKRKNEEMQNVRTSLIAEQQIWFWTAVEER	208492	256085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_208803_214786_214958_233675_233861_234077_234265_234400_234483_235375_236665_237096_237224_237309_239208_254502_254669_254754
902569	contig_10236_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_169116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTTTATGCAACACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82087	84962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_83650_84298_84494_84649
902570	contig_10734_pilon	+	2961	1	Intergenic	novelGene_51321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCAGTGATCTATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1511054	1514015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1511100_1514000
902571	contig_2114_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_104243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	297.112503944213	1	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	463	1539	158824	165991	FALSE	30	ACCTTTGGGAATATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRPTGPRSCSSEASHHQQQAAQNSLLPLLSSAVEPPDQKPLLPIPITQKPQAAPETLKDAIGIKKEKPKTSFVCTYCSKAFRDSYHLRRHESCHTGIKLVSQRKKTPTTVVPLISTIAGDSSRTSLVSTIAGILSTVTTSSSGTNPSSSASTTAMPVTQSVKKPSKPVKKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPFECPVCNQRFKRKDRMTYHVRSHEGGITKPYTCSVCGKGFSRPDHLSCHVKHVHSTERPFKCQTCTAAFATKDRLRTHMVRHEGKVSCNICGKLLSAAYITSHLKTHGQSQSINCNTCKQGINKTCMSEETSNQKQQQQQQQQQQQHVTSWPGKQVETLRLWEEAVKARKKEAANLCQTSTAATTPVTLTTPFNITSSVSSGTMSNPVTVAAAMSMRSPVNVSSAVNITSPMNIGHPVTITSPLSMTSPLTLTTPVNLPTPVTAPVNIAHPVTITSPMNLPTPMTLAAPLNIAMRPVESMPFLPQALPTSPPW	153620	166519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_153653_158393_159084_159855_159920_161009_161194_162413_162555_165563
902572	contig_1372_pilon	+	1848	13	Intergenic	novelGene_140514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	38.3141256225719	3	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	507	1670	457535	484809	TRUE	40	TACATTACTTGAAGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQGMKFDPEITVLQTMLAECQEKLKKLSWLESRVECLEEKMKGKVMVNEKTWTNLLSRVTLLETEMLLLKKNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451608	487438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_454521_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_470835_471043_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766_484853_487303
902573	contig_11656_pilon	+	3771	22	Intergenic	novelGene_54006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_5	141.80355931043	226	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	946	2157	520424	528195	TRUE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLRYKPQFPAPGWNVEKQKAVCEATFLTLLRFA	464944	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_507865_507931_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528687_531208_531337_535319_535411_536453
902574	contig_7943_pilon	-	1364	4	Intergenic	novelGene_173131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_1	109.827136901587	126	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	121	465	243092	78011	FALSE	25	TATTGGGTGGAATTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGSPEEHAVYVWDHFIAQSAAENVFFVAHSYGGLAFVELMIQREADVKSKVTAVALTDSVHNVWHQEAGKTIREWMRENCCNWVSSSEPLDTSVESMLPDCPRVSAGTDRHELTSWKSFPSIFKFFTEASEAKTSSLKPALTRRSHRIKHEEL	296546	77111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_78154_236900_236986_242975_243093_296426
902575	contig_10236_pilon	+	3436	2	Intergenic	novelGene_169115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCAACAGACATAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81437	85030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_+_84493_84649
902577	contig_5684_pilon	+	1658	4	Intergenic	novelGene_81050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	200.446168999726	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	597	995	446641	447039	FALSE	65	TCATGAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403592	447702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441837_443891_443954_446563
902578	contig_5039_pilon	-	5454	1	Intergenic	novelGene_65044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	1162	1713	1806385	1805834	NA	35	GTCCTAGAATGATTCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRYRGLIKYWFHSPPKIPLQIGEVGVHTPRRATCGCITAKITPTSAAVNRAVDTEIRVKNSTVALSPSAAIMKHRKAGSLKEQEFIVSQFQRLGVQTRVSAVSIPPECCERGNVHTSAQLPVALTVLGVTLLLVDVAPVTSSSFIFDPISMSVLPFYKTPLRRGLGLGPTLLWYRAWWRSV	1807546	1802092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1802100_1807500
902579	contig_7707_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_72107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGATCAGGGTCACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3578	5886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_3600_5900
902580	contig_8383_pilon	+	900	5	Intergenic	novelGene_172760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAACAAATAAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305685	320661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_+_305893_309915_310075_314750_314911_318246_318455_320495
902581	contig_8242_pilon	+	2515	9	Intergenic	novelGene_80189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_5	471.256498628931	91	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1423	1884	33759	37065	FALSE	10	TACGGGCTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKADFKAGKALVISGREVFEFRPELVDDDDEEADDTRYTQGTGGDEVDDSVSINDIDLSLYIPRDVDETGITVASLERFSTYTSEKDENKLSEASGGRAENGERSDLEEDNEGEEQENGAIDAVPVDENLFTGEDLDELEEELNTLDLGE	3421	37696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_3607_20830_20933_28995_29854_30702_30760_31973_32157_33721_33804_33959_34062_35060_35185_36874
902582	contig_13944_pilon	-	2257	2	Intergenic	novelGene_175284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	270	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTGTGATTTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64315	59477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13944_pilon_-_61592_64172
902583	contig_3601_pilon	-	3105	1	Intergenic	novelGene_132876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1826	2179	152004	151651	NA	35	CACAACTGCCAAACCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSENHSAMSCKTFASGCASGDAPGCDSEASTGDDSHKGSSEAAGLISSDGGRETNGFTGKGGLADKDGVISSDGSERAGSVGRRHSTEFRDSVSPSQGSGSHFFLINALTLTSDTI	153829	150724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_150700_153800
902584	contig_6871_pilon	-	3324	8	Intergenic	novelGene_21585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_7	602.272702488885	1083	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	930	1967	291919	284992	FALSE	20	CTACACGGGCCTCAGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKKKKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLWDKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKGACLDILILRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQPDRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRPSRPHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGSMPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGGRGRDRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNRSSPATHSP	299856	283634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_285216_286071_286231_287596_287802_289144_289322_289596_289758_291807_291950_293236_293386_299106
902585	contig_7426_pilon	-	2896	4	Intergenic	novelGene_27557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.9140854951858	91	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	29	454	1185828	1161950	TRUE	10	AGCGCCTTGTCCGTCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLRAGRRRQTAGKSKSPPRVPIVIQDDSLPTGPPPQIRILKRPTSNGVVSSPNSTSRPALPVKSLAQREAEYAEARKRILGSASPEEEQEKPILDRPSSDFLPFRPTRISQPEDSRQPNNVIRQPLGPDGSQGFKQRR	1185856	1158904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_1159146_1159748_1162080_1163424_1163677_1185784
902586	contig_2444_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_83799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAGTAAACTCTATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279703	277897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_277900_279700
902587	scaffold_13505_pilon	-	1179	11	Intergenic	novelGene_111426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	396.836754850152	7	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1	1050	512497	507292	FALSE	15	GAGAGGTCTGTGTGTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPAEREKVERAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVIFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPAFRPKSRPSPSSTREPLLSSSENSNGGREMPPADGRMERFLSDLLTFCRPGPEGQLATTALQKVLSLKQLLLPAEEDSGAGPPRESDGVLGGGPLRPAETQEVQENLLSLEEILKQLEVWRSCLLLGGLRASFQGAPQ	512497	507162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507346_509089_509263_509766_509854_509954_510023_510277_510365_510522_510611_511309_511478_511561_511638_511905_511984_512183_512285_512427
902588	contig_7342_pilon	+	2510	11	Intergenic	novelGene_71237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_5	228.920968895381	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	123	788	717166	727771	TRUE	60	GAAGAAAAAGACCAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTTVTVCEFSFTLLFFLSCVCIKLCYGLVYGFSGGQSRSFKDQRLETHSYHQICASGVLVS	717043	738101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034
902589	contig_6658_pilon	+	2527	21	Intergenic	novelGene_168405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	283.232108878919	407	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2262	265	2526	156287	198543	FALSE	65	AGAAAAATATGGAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRKEENFVSHVNAKRPRQEEVEDFDRDGDEFNGTSTLTAAEVGIIESIQLKNFMCHSMLGPFKFGSNVNFVVGNNGSGKSAVLTALIVGLGGKAVATNRGSSLKGFVKDGQNSADISITLRNRGDDAYRANVYGDSIIVQQHISMDGSRSYKLKSATGSVVSTKKEELIAILDHFNIQVDNPVSVLTQEMSKQFLQSKNEGDKYKFFMKATQLEQMKEDYSYIMETKERTKEQINQGEERLTELKRQCLEKEERFQSIAGLSTMKTKLEHLKHEMAWAVVNEIEKQLNAIRDNIEIGEERAARLDRKMEEQQVRLNEAEKKYKDIQDKLEKISQETNARAPECLALKADVTAKKRAYNEAEVLYNRSLNEYKALKKDDEQLCKRIEELKKSTDQSLEPERIERQKKISWLKEKVKALQDQESSVNQEIEQFQQAIEKDREEHSRIKREELDVKHILTFNQKQLKELKDSKTDQLKRFGPNVPALLEAIDDADRRGLFTYKPVGPLGACIHLRDPELALAIECCLKGLLQAYCCHNHADERVLQALMKRFYSPGTSRPQIIVSEFHNEIYDVRRRSAHHPEFPTVLTALEIDNAVVANSLIDMRSIETVLLIKNNSVARAVMQSQKPPKNCREAFTADGDQVFPGRYYSSENKRPKFLSRDVDSEISHLENDIENKKAQILNLQQHLSALEKDIKRNEELLKRCQLHYKDLKLKIRKSISEIRELENIEEHQSVDIATLEDEAQENKSKMKLV	145613	198544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6658_pilon_+_145783_155155_155246_156281_156404_159899_160018_162208_162315_169698_169836_170463_170526_174496_174578_175311_175414_178970_179091_179191_179291_184609_184757_185035_185125_185300_185466_185833_186013_187054_187260_192054_192170_193411_193573_195605_195742_196628_196710_198501
902590	contig_8065_pilon	+	5869	1	Intergenic	novelGene_107346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	406	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGATTTTTCTCAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260265	266134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_260300_266100
902591	contig_12701_pilon	-	1017	6	Intergenic	novelGene_169541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.2709518512617	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	187	948	40561	70	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKRRAEGRRLPPACSDAQRDP	52391	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_128_29682_29809_30464_30610_33152_33253_40228_40576_52219
902592	contig_6513_pilon	+	6006	36	Intergenic	novelGene_117780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_35	301.215477825481	50	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1543	4632	80	4711	203531	262042	FALSE	20	ATTCCTTGTATGCTTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGHSHEGRRSSGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFKRFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQCVVHLPSSEKDSNSEEDSNKKVDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHSKEVETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVVAVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQLLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVTQNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGALCRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQEVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQQLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIRGNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTEVNMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVSGSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSESEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKITEDVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAITSLLGGGSPKNNAAAETEDDESDGEDRGGGTSGVRRRRSQRISQRITH	203451	263337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_203568_203803_203876_203965_204056_205629_205734_207920_208008_210569_210802_211565_211718_212250_212332_213108_213210_215594_215734_217492_217576_218551_218685_219547_219692_222542_222633_223706_223922_224032_224136_224940_225040_225147_225295_227702_227838_228598_228698_229501_229556_237118_237228_239085_239223_246518_246660_246868_246963_247402_247558_248063_248155_250105_250280_250714_250906_252976_253085_253506_253708_256838_256986_258594_258870_260341_260517_261288_261519_262035
902593	contig_9579_pilon	+	6874	2	Intergenic	novelGene_150593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	279	junction_1	0	152	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	5506	5952	821256	823327	FALSE	35	AAATGTATGGAGTCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKGPPPFPGMPLMSSPVGGPLPPPIRYGPPPQLCRPFGPRPLPPPFGPGLHPPLGLREYAPGIPPGKRDLPLDPREFIPGPTPFRPLGPREYFIPGTRLPPPPHGPQDYPPSPAARDLLPSGSRHEPPSAPQSGSQDSSQALKQSP	815750	824249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_+_821401_823025
902594	contig_13365_pilon	+	2025	1	Intergenic	novelGene_168083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCACTGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44431	46456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_44400_46500
902595	contig_2798_pilon	-	3501	5	Intergenic	novelGene_120015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	39	junction_2	709.482337694181	1235	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	552	1484	116665	115733	FALSE	0	GTTTGCCTGTTCTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193430	113715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452_120595_151071_151194_170381_170519_193294
902597	contig_9706_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_20768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGTAAAAGGAACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160	928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_900
902598	contig_11258_pilon	-	2249	5	Intergenic	novelGene_67815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	140.542475785792	210	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	53	757	360591	352035	TRUE	60	TTTATACACAAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVSTTHSPSSQENSNQSQSPWSLLSSIHFLLLVFLKVPLFLSMLSAVLWVNRPQRDPREGPYENQ	360643	326009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327326_351858_352171_353000_353152_354741_355099_360530
902599	contig_7378_pilon	+	6433	3	Intergenic	novelGene_120295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	449	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2808	3107	610128	610427	FALSE	35	AAGCCCGCACCAAGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLTALARTSSTMLNRSRDKGHPCLDPVLKGNVFSLSPLRMMLAVGFAQMPFIMPYSHFKQRLSFGKISTVLI	607139	613753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_607390_607524_608993_609038
902600	contig_20550_pilon	+	1607	17	Intergenic	novelGene_142616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	317.838304016366	2	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	211	987	11625	20036	TRUE	25	AAACCTCCTGTGTCGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDGSWTSPSSTTHWEGMPSPFKDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKLKMMEQHLIE	3815	38569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_11580_11644_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19857_20004_20111_20470_20537_37663_37774_38133_38251_38316
902601	contig_16594_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_53869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1020	junction_2	1608	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1804	2364	272836	149135	FALSE	50	AAAATTCAAAGCAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVGNN	274639	149056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_149351_165477_165649_272662
902602	contig_14744_pilon	-	2655	10	Intergenic	novelGene_66124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	88.2871297752431	34	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	435	1805	1597041	1588348	TRUE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNCQLP	1597475	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588364_1588690_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969
902603	contig_10990_pilon	+	2297	3	Intergenic	novelGene_7467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	35	50	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708598	716575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557
902604	contig_19342_pilon	-	1497	2	Intergenic	novelGene_41050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAAAGAATTTACTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3084	116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_1275_2745
902605	contig_7078_pilon	-	1885	2	Intergenic	novelGene_130210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAATAATTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953867	951432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951554_952103
902606	contig_1759_pilon	-	2824	19	Intergenic	novelGene_171322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	982.352066895231	329	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2487	337	2823	97828	11650	FALSE	25	GTATGTATCCAAATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNNKKLSENTQNASLCSGTVVHGRRFHHANAQISVVKTAAQSSLDRKERKEYPPHVPKIEINPVGLSRPHSVECIMKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPIILSSDDDDDSDRTNRRESVSPQPADSACSSPAPSTGRVEAALNENTCRVEHELRSIPADSELNTVTLPRKARMKDQFGNSIISTPLKRRKVVSQESSVDPMSLSCQSSFDSVILNCRSIRVGTLFRLLIEPVIFCLDFIKIQLEEPESDPVAITLNTSDLTKCEWCNVRKLPVVFLQTIPAVYQKLSVQLQMNKEDKVWKECKGINKLTNLEEEYIILIFQTGLDHQANMVFESIITEIGIKNNISNFFAKIPFEEANSRLVACTRTYEESIKGSCVQKENKIKNVSFESKIQLRNKQEFQFFDDEEETGESHTIFIGPVEKLIVYPPPPAKGGISVTNEDLHCLNEGEFLNDVIIDFYLKYLVLEKLKKEEADRIHIFSSFFYKRLNQREGRNLHETTNLSIQQKRHGRVKTWTRHVDIFEKDFIFVPLNEAAHWFLAVVCFPGLEKPKYEPNPQYHENTVIQKCSTLEDSCISSPSANEMDSCSQNSSAKPVIKKIINRKHCIAVIDSNAIQEESDPRYRRNICSVKCSLKKINHTASENEESNKGESACQKVVDRTKSENGLQNEYLSSIHHT	125757	11648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_12080_15718_15812_16816_16940_28010_28128_28214_28325_29890_30118_38870_39066_39454_39489_43310_43482_45375_45606_50292_50681_56768_56915_64867_64939_92396_92418_96839_96945_97802_97949_107687_107748_109685_109780_125695
902607	contig_8674_pilon	-	6493	7	Intergenic	novelGene_102923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1523	2110	455951	455364	TRUE	30	GAGTTAGTCAATTTAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLVGLMYSESHGTFLIFSITQLFFDALLPIASLCFCLCKYSFGAITLLILHEISFESEELIFEDFIKLLWILISRFVDFTSIDTVFSLILVLSFKFDKELHNLNELPAFLFCSRLSYFFFFLSISNIFPWSNFLFSRSLYLEPPALNFNFIFSGDIDCIKEPFFLYRSLFVKITVFAFSGREFCAVCFFCRLS	476864	427649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_427727_430044_430135_445721_445788_451213_456504_457757_457842_460247_460393_476123
902608	contig_12250_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_80739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATATCAAAGTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427056	429288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_427100_429300
902609	contig_12179_pilon	+	4161	13	Intergenic	novelGene_127992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	166.568054160054	316	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	446	2347	509827	530744	FALSE	30	GGAGCAAATATTGCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHLRRLVKLQLKRHYHKKFWKLGAVIFFFIIFLILMQREVSVQYSKEESRMERNMKSKNKMFDLMLEAVNNIKDAMPKMQIGAPVRQNIDVGERPCLQGYYTAAELKPVLDRPPQDPNAPGASGKAFKTNNLSAEEQKEKERGEAKHCFNAFASDRISLHRDLGPDTRPPECIEQKFKRCPPLPTTSVIIVFHNEAWSTLLRTVHSVLYSSPAILLKEIILVDDASVDEYLHGKLEEYIRQFSIVKIVRQKERKGLITARLLGASVATAETLTFLDAHCECFYGWLEPLLARIAENYTAVVSPDIASIDLNTFEFNKPSPYGSNHNRGNFDWSLSFGWESLPDHEKQRRKDETYPIKTPTFAGGLFSISKEYFEYIGTYDEEMEIWGGENIEMSFRVWQCGGQLEIMPCSVVGHVFRSKSPHTFPKGTQVIARNQVRLAEVWMDEYKEIFYRRNTDAAKIVRQKSFGDLSKRFEIKHRLQCKNFTWYLNTIYPEVYVPDLNPVVSGYIKSFGQHLCLDVGENNQGGKPLIMYTCHGLGGNQYFEYSTQHEIRHNIQKELCLHAAQGPVQLRTCTYKGHKTVAAGEQIWEIQKDQLLYNSFLKMCLSANGEHPSLVPCNPSDSLQKWIFSQND	485138	532558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_485337_485381_485465_485697_485753_509717_510342_514346_514520_518688_518839_520568_520804_521256_521375_522882_523084_525287_525420_525624_525727_529373_529527_530621
902610	contig_5057_pilon	-	2441	3	Intergenic	novelGene_151502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	35	512	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGGCTTGCTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371469	363178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_365152_365902_366070_371168
902611	contig_1239_pilon	+	12026	1	Intergenic	novelGene_150418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	816	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAACAAAGCAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667988	680014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_668000_680000
902612	contig_7870_pilon	+	2335	2	Intergenic	novelGene_109033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATTCCCCACCAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590786	597515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_591393_595786
902613	contig_12570_pilon	+	3175	3	Intergenic	novelGene_79331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	69	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2868	3173	44383	44688	FALSE	55	ACTATTAAACAAGTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDITSGKTINKETEDPKDTINQLILTDIYRTLHPTTANYTFFSSAHGSFSRIDHMLGHKANLNILKKTEIIQTIFSNHNGVKLKINDRKKTEKYTDIWKLNN	36670	44690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_37144_41720_42183_42450
902614	contig_7088_pilon	+	5212	5	Intergenic	novelGene_159780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCAATGCAGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475801	718542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_476120_476464_476467_670525_670534_670930_671099_713826
902615	contig_383_pilon	+	847	1	Intergenic	novelGene_126092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAACCAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82921	83768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_82900_83800
902616	contig_10861_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_39313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTACCATTGTCCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1463779	1465362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1463800_1465400
902617	contig_960_pilon	+	4947	1	Intergenic	novelGene_108302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	653	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3641	4036	1043247	1043642	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWMIWLAQNYSACGIQYSKVLLRTLSRMHYFISDLQLLQCYSCCHRDYSLENPIGWFYSVTWGHYESRLTRQPPTTTTFFVLLILLLLRIYTAKQPIQQFLHVQLGDIDYTLQVVQPFSPSSSESTTFLP	1039606	1044553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1039600_1044600
902618	contig_7457_pilon	-	2135	7	Intergenic	novelGene_31423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	167.56134863254	12	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATATTGCCGAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473214	468261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472326_472768_473151
902619	contig_10904_pilon	-	2043	11	Intergenic	novelGene_22551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_5	225.084784025931	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	149	757	396033	380540	TRUE	30	ATACAGTATGAATTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIDGTEGTWSPPIAGIELGEK	396181	374489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_380384_380599_381161_381213_388756_389054_389359_389492_389761_389798_395999
902620	contig_6199_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_126361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAATGATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138776	140648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_138800_140600
902621	contig_636_pilon	+	5221	6	Intergenic	novelGene_178786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	338	162	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	3401	4561	394789	575991	FALSE	55	ACATTCAAAAAAGTCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHNQVGFTPGMRGWFNNRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKQKANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARARRQEKEINGIQIGNEEVKLSLFADGMILYIENPKDSMRNLLELIERFRRGAGYKINIQKSVGFLYTSEENDEKQSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIRKFLESNENENTSYQNFWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTSTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSLLFDRQKGSTTTGQTDKRKTGEDANNPNKK	372458	576651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_636_pilon_+_374921_392116_392242_393975_395494_480776_481121_575374_575407_575911
902622	contig_10044_pilon	+	2090	4	Intergenic	novelGene_156390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	75.5351279574977	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	237	1451	148993	156192	FALSE	25	CTTGGAGAGAGCATTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAQDSLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLFWDVMLENYNNLVSLEIWEVDHLLGHSQNESRVDSMEQCYEHNTLENIVHRHKNHSPLRENHDMFDLDEKAVKSNLALINQNRSIEIKNSAELNRSEKTFLHVDQEQFRTESKFRESQIPNTTKSQHIKHQKTQKIEKLPVCSECGKAFIKKSWLVRHQIIHPGKGPFVCSECGKSLTQKSSLVRHQKSHRREKLFQCNECSKAFSTKHKLIIHQRTHKERRHGCNECGKTFLYMSCLFRHKIKHTRKKHVDTGKVKNPSPASHSSSHTADLMRDKNPVSTVTMQIPSVAAQTSVNTSGLLTNRNVVLVGQPVARREPSGDNREFVQQRVLMNTVNVVVPMNAVNVVVPMNAVNVVVPSVSNCILFYVPQNP	142838	156831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_142891_148808_149008_151765_151893_155119
902623	contig_2940_pilon	-	662	1	Intergenic	novelGene_81971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGGACTCAGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073840	1073178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1073200_1073800
902624	contig_6189_pilon	-	3359	2	Intergenic	novelGene_164926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25301	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_2859_24798
902625	contig_12586_pilon	+	2658	1	Intergenic	novelGene_121796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACATGGTATTACAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34797	37455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_34800_37500
902626	contig_2342_pilon	+	2837	21	Intergenic	novelGene_132768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCAAGGGAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460288	547627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_460574_480327_480522_481405_481531_487030_487113_487507_487614_488802_488899_507426_507525_510172_510236_511527_511609_513946_514114_519719_519877_520187_520295_522042_522176_522363_522558_525395_525548_526403_526522_528877_529005_529094_529216_540576_540674_547075_547177_547394
902627	contig_5153_pilon	+	3794	1	Intergenic	novelGene_74375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	476	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961270	965064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_961300_965100
902628	contig_15049_pilon	-	3611	11	Intergenic	novelGene_160723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	74	junction_1	160.112335564753	288	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	106	1965	290360	228680	FALSE	20	CACGCCAAAGGCTTTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLKRHLQSHDKLRPFSCPVGACGKKFTTIYNLKAHMKGHEQENLFKCEVCAERFPTHAKLSSHQRSHFEPERPYKCDFPGCEKTFITVSALFSHNRAHFREQELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFVCDSDSCGWTFTSMSKLLRHKRKHDDDRRFTCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFECPVEGCCARFSARSSLYIHSKKHLQDVDTSKSRCPVSTCNRQFTSKHSMKTHVVKQHNLRQDLLSQLEAASSLTPSSELTSSGQSELNNIDLVSLFSNASGDNNSSTVASDMALVNSGILTIDVNSVSSSLGGNLPVNNNSLGQMDPLVLVANSDIPSSLDSPLMLGSTAPVLQQSNLNPDDVQTVSAEALGCLVSLPVKNLSQDPQALTSSSNSALNRSTPTPSNSPGGNSHVPELLAPIKVERNLPPGPDVGPQERDKVVTQFGLSNPAENCSAQKDIDLSAVPGNLYLLCDLGQPRFSEYKWCVVNGFQESGGSARTDYRAIQLAKKKKQKGTGNNAGSSGPAQRKIKGEKISPHFHASQGSWLCGDVVVPSGGLTGPEPAAGVRCVQVQLLQDDPSGEGVLPLALSLQPPLLRPVLTVDLPVYVLQEVFPAPEDAAGPEAVQFSRSTINLQDLQ	290465	227033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15049_pilon_-_228767_230118_230221_232553_232721_264488_264574_265241_265305_266440_267130_269965_270137_283350_283482_287497_287577_287676_287830_290227
902629	contig_8304_pilon	+	2327	2	Intergenic	novelGene_153176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACTGATATTTACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151106	153480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_151725_151771
902630	contig_11898_pilon	+	3152	7	Intergenic	novelGene_144303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	59.0639954249249	475	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	125	1999	346596	381031	FALSE	10	TTATGTGTTCGTGACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEETMECLQEFPEHHKMILDRLNEQREQDRFTDITLIVDGHHFKAHKAVLAACSKFFYKFFQEFTQEPLVEIEGVSKMAFRHLIEFTYTAKLMIQGEEEANDVWKAAEFLQMLEAIKALEVRNKENAAPLEENNAGKNEAKKRKIAETSNVITESLPSAESEPVEIEVEIAEGTIEVEEEGLETLEEVASSKQSIKYIQSTGSSDDSALALLADITSKYRQGDRKGQIKEEDGCAADPTSKQVEGIEIVELQLSHVKDLFHCEKCNRSFKLFYHFKEHMKSHSTESFKCEICNKRYLRESAWKQHLNCYHLEEGGVSKKQRTGKKIHICQYCEKQFDHFGHFKEHLRKHTGEKPFECPNCHERFARNSTLKCHLTACQTGVGAKKGRKKLYECQVCNSVFNSWDQFKDHLVIHTGDKPNHCTLCDLWFMQGNELRRHLSDTHNISERLITEEVLSVETRVQTEPVTSMTIIEQVGKVHVLPLLQVQVDSAQVTVEQVHPDLLQDSQVHESHMSELPEQVQVSYLEVGRIQTEEGTEVHVEELHVERVNQMPMEVQTELLEADLDQVTPEIMNQEERKPCQADTAEDTREDHEDAEGIQTKPTVDSQAEKAGNEDRTAMPVLE	345463	382184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_+_345573_346580_346720_347820_347923_355150_355296_370825_371512_378807_378939_380344
902631	contig_11396_pilon	-	3321	2	Intergenic	novelGene_71339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2660	2968	486664	486231	FALSE	55	GGAAGAAGTAGAAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMYQANNTQKRAEVAILISDKYIKQTVTALKREIDSSTIVVGDFNTPLFVKDRTSRKKLNKDTEELNATVNQLDLIDIYRTLYPTAAKYTFFFNAHGTFS	489323	485877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_486471_486595
902632	contig_19647_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_144019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTCCCATGGGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97533	134195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_98754_134177
902633	contig_3745_pilon	-	1749	2	Intergenic	novelGene_85090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403537	401354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_402275_402708
902634	contig_753_pilon	-	1869	3	Intergenic	novelGene_112902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278598	275223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_275414_276271_276469_277116
902635	contig_10456_pilon	-	10769	6	Intergenic	novelGene_163460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCACCTATAATGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52800	28873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_33682_36291_36497_37104_37244_42729_42872_46718_49063_49669
902636	contig_7342_pilon	+	2472	10	Intergenic	novelGene_71236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	289.566896682478	18	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	31	864	716998	727771	TRUE	55	AGTAAAGTGACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTTVTVCEFSFTLLFFLSCVCIKLCYGLVYGFSGGQSRSFKDQRLETHSYHQICASGVLVS	716967	734868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_728977_729447_729488_730009_730111_734516_734667_734756
902637	contig_4686_pilon	-	3223	21	Intergenic	novelGene_118529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	245.642199143388	21	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2694	529	3222	537789	460693	FALSE	25	TAACCTGGCCAAGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHLQQLIEGAHREIEDKPVATSNIQELQAQISRHEELAQKIKGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMMTAGRCHTLLSPVTEESGEEGTNSEISSPPACRSPSPVANADASVNQDIAYYQALSAERLQTEAARIHPSAPSSQEFYEPGLESSTTAKLDDLQRSWETLKNVISEKQRTLYEALERQQKYQDSLQSISTKMEAIEMKLNESLELGKSPESQMAEHQALMDEILMLQDEINVLQSSLAEELVSESPESDPAEQLALQSTLTVLAERMSTIKMKASGKQQLLEEKLNDQLEEQRQEQALQRYRCEADELNHWLLSTKATLDITLGTPEEPMDMEAQLVDCQNMLVEIEQKVVALSELSVHNENLLLEGKAHTKDEAEQLAVKLRTLKGSLLELQRALHDKQLNIQGTSQEKEESDADLTASQSPGVQEWLTQARTTRTYQRQSSLQQQKELEQELAEQKSLLRSVASRGEEILSQHSAAETSGAGEKPDVLSQELGMEGEESSTEDQMRMKWESLHQEFSTKQKLLQNVLEQEQEQVLYSRPNRLLSGVPLYQGDGQAQAKSAVTSLLDGLNQAFEEVASQGGGTKRQNMHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQ	540761	460691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_460849_473608_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454_487587_491549_491707_495378_495486_496544_496677_506904_507097_509797_509972_511588_511784_521407_521570_521780_521949_530671_530813_531879_532075_537681_537823_539161_539349_539905_540029_540576
902638	contig_20641_pilon	+	2390	8	Intergenic	novelGene_52818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	1515.93466823849	25	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	64	981	14599	71492	TRUE	65	TGATCTGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGFQPQMNPG	14535	86663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_71463_71525_85286
902639	contig_12157_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_135881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	366	1101	314	1414	23277	22177	NA	35	GGAATTCAATAGCTTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPFYVLCVCSLQTPRPLNIIKQNNGEQIIRRRTRKRLNPEALQAEQLNKQPRGSSEEQVNGSPLERRSEDHLTEGHQREIPLPSLSKYEAQGSLTKSHSAQQPVLVSQTLDIHKRMQPLHIQIKSPQESTGDPGNSSSVSEGKGSSERGSPIEKYMRPAKHPNYSPPGSPIEKYQYPLFGLPFVHNDFQSEADWLRFWSKYKLSVPGNPHYLSHVPGLPNPCQNYVPYPTFNLPPHFSAVGSDNDIPLDLAIKHSRPGPTANGASREKTKAPSNGKNEGPLNVVKTEKVDRSTQDELSTKCVHCGIVFLDDVMYALHMSCHGENGPFQCSICQHLCTDKYDFTTHIQRGLHRNNAQAEKNGKPKE	23590	22130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_22100_23600
902640	contig_15002_pilon	+	6958	1	Intergenic	novelGene_162430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	226	681	610	1290	22993	23673	NA	10	CTACGGGCTTGCTGTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYKCSDCGKVFSRKDTFIQHQRIHTGERPYECSECGKAFSRKDNLVQHKRIHTGEMPYKCSECGRYFSHHSNLTVHQRVHTGARPYECNECGKVFKHKSSLVQHESTHTGESPYGCSECGKSFSHKYILIKHQKIHTEIRPYECIECGKLFSQSSDLMAHQRVHTGERPFVCSECGKDFIRSSHLVRHKRVHTGERPYECSECGKTYSLSSHLIRHQKVHTVGGL	22383	29341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15002_pilon_+_22400_29300
902641	contig_7056_pilon	-	2341	9	Intergenic	novelGene_43652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	873	junction_7	837.151419995212	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1001	1432	725838	725118	TRUE	85	AGAAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	729608	722481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906
902642	contig_10196_pilon	-	3465	1	Intergenic	novelGene_132130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	666	42	707	1034115	1033450	NA	25	TTTCTTGTTCTTAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPRQLSRFWEWGKNIVCVGRNYAEHAREMRSAVLSEPVLFLKPSSAYAPEGSPILMPAYSRDLQHELELGVVIGQRARAVPQAAAMDYVAGYALCLDMTARDVQNECKKQGLPWTLAKGFTASCPVSAFVPKEKIPDPHKLRLWLKVNGELRQEGETSSMIFSIPYIISYVSKIITLEEGDIILTGTPKGVGPVKENDEIQAGIDGVVSMRFKVERPEC	1034156	1030691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1030700_1034200
902643	contig_6005_pilon	-	2055	5	Intergenic	novelGene_158887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	118.383645407632	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	476	802	326574	311978	FALSE	70	CAACAAAGAACAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFAERIIYDVIVEPPSVGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSNAPNIPKLNRFLLLFIGFVCVLLSFFMARVFMRMKLPGYLMG	327341	310724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_326558_326883_327174
902644	contig_12327_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_140678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATGGTATCTTTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1137765	1135060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1135100_1137800
902645	contig_18272_pilon	-	3777	1	Intergenic	novelGene_7006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	513	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165922	162145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_162100_165900
902646	contig_10023_pilon	+	4504	18	Intergenic	novelGene_123501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	102.660457578237	33	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	2657	4282	451514	453139	FALSE	35	AATTAAAATCACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPRSFPPSKAVTVKSAEANPAEPEALPAPMAQALPSPASTATPPPTPTHPQPLALPPLPAEEAEGMNVDDQDEGSPLTQEAEPASGGGSSSGVGKKEQLSVKKLRVVLFALCCNTEQAAEHFRNPQRRIRRWLRRFQASQGENLEGKYLSLEAEEKLAEWVLTQREQQLPVNEETLFQKATKIGRSLEGGFKISYEWAVRFMLRHHLTPHARRAVAHTLPKDVAENAGLFIEFVQRQIHNQDLPLSMIVAIDEISLFLDTEVLSSDDRKENALQTVGTGEPWCDVVLAILADGTVLPTLVFYRGQMDQPADVPDSILLEAKESGYSDDEIMELWSARVWQKHTACQRSKGMLVMDCHRTHLSEEVLALLSASSTLPAVVPAGCSSKIQPLDVCIKRTVKNFLHKKWKEQAREMADTACDSDVLLQLVLAWLGEVLGVIGDCPELVQRSFLVASVLPGPDGNLNSPTRNADMQEELIASLEEQLKLSGDQSEEASASTPRPRSSPEETFEPESLHQLFEGESETESFYGFEEADLDLTEI	397316	453361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_397349_423620_423746_425961_426121_436811_436988_437926_438036_439258_439550_439629_439849_440703_440811_441467_441806_442308_442464_448191_448293_448769_448917_449327_449463_449574_449748_449894_450036_450655_450713_450906_451024_451439
902647	contig_6327_pilon	+	3372	14	Intergenic	novelGene_147475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	188	junction_11	147.826221341061	356	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	374	2521	17019	67487	FALSE	50	AAAAAGAGTGATTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEVPSQPPSPSSSPPTSPEPELVQLRRKVEKLERELRSCKRQVQEIERLLHHTERLYQSAESNNQELRTQVEELSKILHCERNEDNKKSDVEVQTENHTPWSISDYYCQTYYKDISFPNKATELSVQQSQDTEASTFNSKEQSQIEDDAYTGADITENVECRQEDTFPSNSQESASVLTTEDTSLEGSSLAESLRAAAEAAVSQTGFSYDENSGLYFDHSTGFYYDSENQLYYDPSTGIYYYCDVESGRYQFHSRVDLQTYQTCSMRQSKDKKLKKKRKDPESATSEEKDLNLEDKKVSSVEHMSCSEGEDFANVKKKAKRDIHYKNSSPKFTVPVSGNSIESPFNENTYNSTSFKVEKIIETDSEPEEGEITDSQTEDSYDEDITSEDGITAENTEDEDEEKIWPPCIRVIVIRSPVLQIGSLFIITAVNPATIGREKDMEHTLRIPEVGVSKFHAEIHFDHDLQSYVLVDQGSQNGTIVNGKQILQPKTKCDPYVLEHGDEVKIGETVLSFHIHPGSDTCDGCEPGQVRAHLRLDKKDESFAGPALSKEEKELERRKELKKIRVKYGLQNTDYEDEKALKNPKYKDRAGKRREQIGSEGTFQRDDAPASVHSEITDSNKGRKMLEKMGWKKGEGLGKDGGGMKTPIQLQLRRTHAGLGTGKPSSVEDVHLLQNKSKKNWDKARERFAENFPETKPQKDASGSMPWVKGSTE	16645	68338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_+_17235_20376_20480_21489_21693_24031_24197_33670_33857_44196_44528_45811_45924_49725_49778_56660_56763_57608_57775_59500_59584_63384_63513_65391_65492_67286
902648	contig_17274_pilon	-	1513	8	Intergenic	novelGene_26572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_7	304.787714680904	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	141	746	247024	232842	TRUE	70	AAAGAAAGCAGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	259035	231230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_258905
902649	contig_7182_pilon	-	1289	5	Intergenic	novelGene_117142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2783.18211540316	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	399	824	888888	887056	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	891349	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888912_889168_889469_891274
902650	contig_10225_pilon	-	2999	11	Intergenic	novelGene_86795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1174	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCTCGGCTCAGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47936	20682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39911_40139_40305_40967_41051_41435_41524_42607_42723_45213_45256_46107
902651	contig_16594_pilon	-	2269	2	Intergenic	novelGene_53912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCCAGATGGGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271810	269503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_271150_271187
902652	contig_19402_pilon	-	3458	5	Intergenic	novelGene_80858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	517.357709906792	6	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	1764	2900	171006	167101	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	176699	166542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174055_174166_175052
902653	contig_6137_pilon	-	7802	3	Intergenic	novelGene_59234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCAATCTTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1327527	1315555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816
902654	contig_5023_pilon	+	3453	14	Intergenic	novelGene_7126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	206.185129658537	329	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	931	2280	359358	405576	FALSE	30	AAACACTCTGATTCTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	320101	406749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_320270_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
902655	contig_13868_pilon	-	4490	7	Intergenic	novelGene_172651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.750084860799	658	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	136	885	98723	74161	TRUE	75	AAAAAAGAAAGAAGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKAKSPAGRGARGPWLWDARRRPGPLPSVLCAASVRRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKMKDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEAAIKFSGFDEKMFLKRGGKYVWSKADLKLDW	98858	69327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_71803_73030_74326_76205_76239_80320_80471_82044_82275_84692_84855_98713
902656	contig_6795_pilon	-	1915	11	Intergenic	novelGene_27663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	85.5041519459728	174	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	475	1326	119175	46152	FALSE	30	CATGCTGTGGATATAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134369	45562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
902657	contig_9177_pilon	-	3446	25	Intergenic	novelGene_32571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1137.95136878003	2	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	252	2252	24978	16653	TRUE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIPGTLNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	25636	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2067_14881_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24808_24958_25075_25327_25431_25584
902658	contig_9375_pilon	-	4967	5	Intergenic	novelGene_136035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.6746966179872	10	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	756	1667	154166	97001	TRUE	20	TATTTTTATTTTTTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFYDLLFPGHRQKLDDSKPSLFSDRLSDLGRIPHPSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY	154921	92853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_94777_95623_97480_99183_99250_132432_132595_153961
902659	contig_6593_pilon	+	1154	3	Intergenic	novelGene_49857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	473	junction_2	179.5	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGTTAATTAGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266183	1278028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1266489_1273656_1273793_1277315
902660	contig_2311_pilon	-	7080	4	Intergenic	novelGene_169824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	195.991496414173	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	60	509	534687	508516	TRUE	65	AAAGAGAGAGAGAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSGLHREEGLEPWPTVRTMILRLFLALNFFPSIQATAENKIFVKQAPMLVAYNNAVNLSCEYTNNLFSKEFQAALYKGVDSDVEVCVVNGNYSLQPQFHSNTGFNCDGKLGNETVTFYLWNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYILNEKNNGTIIHVKETHICPAPPVY	534746	495252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_501763_508454_508551_512659_513017_534629
902661	contig_15857_pilon	-	2586	3	Intergenic	novelGene_152065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25.5	8	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	633	1349	50262	48131	TRUE	45	TGACAAATTTTGAACAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEKVNDGKPDPESCLDFSEHFNQLELLETHGHLIPTGTQSLWAGNSDDDEEQDEKTEEWYQLQEKKMEKDPSKLLLWAAEQNRLTTVQRLLSEKATHVNTRDEDEYTPLHRAAYSGHLDVVRELITQGADVHAVTVDGWTPLHSACKWNNTRVASFLLQHDADINAQTKGLLTPLHLAAGNRDSKDTLELLLMNRYIKPGLKNTVDETAFDIARRTSIYHYLFEIVEGCTNSSPQC	50894	46828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_47430_47494_48593_50007
902662	contig_2693_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_167601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCATTGCTGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302476	300079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2693_pilon_-_300100_302500
902663	contig_13148_pilon	+	2732	2	Intergenic	novelGene_162925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76564	79390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_76843_76936
902664	contig_10341_pilon	-	6254	1	Intergenic	novelGene_47228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTGTTGTAGAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78047	71793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_71800_78000
902665	contig_6847_pilon	+	3641	10	Intergenic	novelGene_143879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	695.217969194812	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	18	842	98739	110600	TRUE	40	TTTACCTTAAGAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	98721	114624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110653_111608_113451_113719
902666	contig_2834_pilon	-	5000	2	Intergenic	novelGene_28009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	221	601	365034	364654	TRUE	30	GTTATTTTAAGCTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHWKCSLVYAKKFGRQLPGQPTGRDPYLCPFQRKGDPTEFGNYQTILLISYTSKILLKIIQKRLQQYIDKELPEIQAGFRQGHGTRVIITDVRWIFAESREYQKDVYLCFIDRAKAFDCADHNKL	365254	276795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_281043_364501
902667	contig_9363_pilon	-	1808	9	Intergenic	novelGene_6587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1111.83820203301	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	176	793	786587	777382	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	787941	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754092_774883_775045_776037_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
902668	contig_11708_pilon	+	3919	1	Intergenic	novelGene_138969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTGATCAGGAGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267669	271588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_267700_271600
902669	contig_8050_pilon	-	8619	9	Intergenic	novelGene_114871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	591	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	2087	2704	438618	434548	TRUE	60	AACATTTCATAATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLENEKIFVPHPPHIMFFSVEFMDSLKHISGVLTFPIFSIFKGATPLHLTALSSKIAKFPSAVPTKRKFFCLLCLENELQYKQVTESVIFSSVCLLFPSSVLMTRRLPDCVPDTIQLSFSTGRYTKAKHNILLSVTSSEVCASVFKSRKESCPLSLCPQPSQMLAFLLLGFVATMHSTAKFLGNKIYLIRQTNSAEFKMSKT	448469	427244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_427844_429231_434745_436251_436446_437188_437261_438463_438650_442581_442739_443737_443945_445953_446026_446850
902670	contig_12503_pilon	-	3733	2	Intergenic	novelGene_143830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	331	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	593	991	151992	151594	TRUE	60	GAAAAAAAAAACATATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVETLTAAFVVKVTSTCESSMNASCITDSDKSFAYDFTTLSSESNDQRCGNAGVGGYENWHTSMMPSKTSSSARSAANLATVFVNICFFTYCKSFKAFDKASLTKKLARPLMARSFRENARCLLSSLNAI	152584	148271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_149836_150415
902671	scaffold_12124_pilon	+	2060	11	Intergenic	novelGene_22228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509206
902672	contig_9471_pilon	+	2092	8	Intergenic	novelGene_21804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_7	353.857690754521	50	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1092	1868	413930	417296	FALSE	25	TTTATATGAATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	411948	417520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
902673	contig_12540_pilon	-	2870	10	Intergenic	novelGene_148057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	94.34818624072	192	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	152	1048	244355	211069	FALSE	30	GTAAACAATGTTTGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTFQLVRNIIPPLTTKKYKGQDGRIGVVGGCQEYTGAPYFAAISALKVGADLSHVFCAKEAAPVIKSYSPELIVHPVLDSPHAVRDVEAWLPRLHALVVGPGLGRDDVLLENVKGILEASKARGIPVVIDADGLWLIAQQPSLIQGYRKAVLTPNYVEFCRLYEAVLRDPMDSRDPDGAVLRLSQALGNLTIIQKGERDVISDGDQVLVCSQEGSRRRCGGQGDLLSGSLGVLVHWALLAGSEKTDGVNPLLVAAFGACALTRQSSSQAFQKYGRSMTTTDMIAEVGAAFRKLFET	253924	209246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_211220_213070_213192_216266_216388_217740_217846_217933_217985_227296_227406_239511_239601_240308_240355_244251_244403_253820
902674	contig_5794_pilon	-	4316	7	Intergenic	novelGene_69790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1683.55011805411	5	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	33	527	749501	746800	TRUE	45	TATTAAAATTGAGCTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVGRGESGLKMEGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCVVMRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVGK	749533	741662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743754_743852_743980_745136_747019_747097_747245_747330_747454_749495
902675	contig_1699_pilon	-	2829	3	Intergenic	novelGene_72799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2068	2373	59090	58785	TRUE	30	ACTTAGATGTCCCCTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPPVSFRPLSLVFLLEFEFCTPPFSCYIRDSLLCSLSGQSLVVAGHHLVLQVSGLCFMWPFLSLGLILSLCLWCSSLSFTPGGWDQLMHLRWPLANF	72336	3303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_3660_58684_59439_70617
902676	contig_12638_pilon	+	2554	11	Intergenic	novelGene_33381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	109.991136006498	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	93	1439	1515842	1539055	FALSE	30	AGTTTACAAGGGCTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPNSPPQEQMALTLRLVCHCPLRSTP	1515749	1540170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1538900_1538975
902677	contig_8299_pilon	-	4501	3	Intergenic	novelGene_178787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3624	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3008	3352	32392	32048	FALSE	30	CACGACCAAGTGGGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANNTQKTAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIIIKGSIHQEDITIINIYAPNNRAQKYIKQTPTALKREVDSSTVAIVDFNKPLSVKDRNKLKKRHRRAKCYDQPT	267930	30898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8299_pilon_-_33808_121474_122934_267797
902678	contig_5640_pilon	-	1682	2	Intergenic	novelGene_27230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	322	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23383	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782
902679	contig_10734_pilon	+	1276	7	Intergenic	novelGene_51429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_6	41.0829107483337	241	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	180	1139	2146713	2156004	FALSE	30	TTTTGTTGCTAGAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2146533	2156141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2146845_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
902680	contig_6199_pilon	-	3564	1	Intergenic	novelGene_126344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	645	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	924	1655	87359	86628	NA	35	ATAAAGAGACAGTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSVNRIQTKTNNTQTPEDKLDCWDLLKMRQLCSSKDFSKRVKREPTDWEKIFGHYRADRGLISKIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRQFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLARIQNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCRWECKMIQPFWKVIWYFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYTGEIRAVTRIDVCTPIFIATLFTIAKRWKQPRCPSTDELMNKLLYIHKLE	88282	84718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_84700_88300
902682	contig_854_pilon	-	2007	5	Intergenic	novelGene_36367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1451.15410966582	13	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	221	622	993124	976077	FALSE	10	CTTGTGTGTATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSRRCVISPWGLGMLPSGAGSPRQGHQPRLSHPELTQQEAGG	1001725	974691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976181_991210_991309_991918_992043_993048_993301_1001681
902683	contig_6164_pilon	-	2276	3	Intergenic	novelGene_121284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	238.5	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	330	857	569414	567664	FALSE	20	GAACTGACCTTGTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EESRGARAGAVAAAVVSKAAFGCLAPCFLGPIVTSRPCCGVGSCRLADALPEHSPAKTSAVSNTKPGQPPQGWPASNPWNNPSAPPSVPSGLPPSATPSTVPFGPAPTGMYPSVPPTAPPPGPPAPFPPSGPSCPPPGGPYPAPTVPGPGPTGPYPTPNMPFPELPRPYGAPTDPAAAGPLGPWGSMSSGPWAPGMGGQYPTPNMPYPSPGPYSAPPPPQAPGAAPPVPWGTVPPGTWGPPAPYPAPAGSYPTPGLYPTPSNPFQVPSGPSGAPPMPGGPHSYH	580099	566244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_567676_568898_569607_579962
902684	contig_9668_pilon	-	3192	4	Intergenic	novelGene_58211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591667	533614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_534127_534191_536081_590509_590609_590975
902685	contig_10857_pilon	+	3071	7	Intergenic	novelGene_160915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	228.542057884806	484	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	320	1144	451613	469527	FALSE	15	CCATCCATTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPWTLPSGASVSPSLQGLYPALPPRPLSLPHSLHPSCWACLWPPWLFIPTSGPTLLPSAVRPWRGTPTRPCTTGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSFCDQQRSSEVLAL	451293	471454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_451841_457543_457619_463693_463796_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484
902686	contig_610_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_76854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCTCAGGTGTAGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377407	379542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_377400_379500
902687	contig_2817_pilon	+	7892	10	Intergenic	novelGene_104339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_9	45.4796114949149	499	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1137	3414	935	4348	271285	293395	FALSE	80	AGAGATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEEVNRKSNQREHQSFQDLEIENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEKEKLKSLLAAKEKQHEESLRTVEALRNRLKFSESDHLASGSHFSNRKEEMLLKQGQMYMTDSQCTSTGMPVHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRSFCDSTKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAATGNSRLTEELKEQLKDMKAKYEGTSAEVGKLRNQIKQNEMLVEEFKREEGKLIEENKRLQKDFSMCEMEQEKKGRQITEMEGQLKELVAKLALSVPTEKFENMKSLLSNEVNEKAKKLAEMEREYEKSFSEIRQLKRELENFKAKLAQHVRPEEHEQLKNRLEQKSGELGKKITELTSKNQALQKEIEKVYLDNKLLNQQVHDLTVEMKSHYVPLKVSEEMKKSHDVIVEGLNKKLLDVTQKYSDKKLEMGKLLMENDSLSKNVSRLESVFIPPEKHEKETVALKSSITELKKQLSELTKKCGEDQEKIHALMSENTNLKKTISNQYVPLKTHEEVKTALSSTLDKTNRELLEMRKKIEDKNQDSLKIKHENDILKRNLENTHNQMKAEYISLKEHEEKMSTVSKSMKKVEDNSAEILANYRKGQEEIVRLHAEIGAQKKELDTIQECIKLKYTPITSFEECERKFKAAEKELKEQLSEQTQKCSVREEEAKKCKQEIEKLRKEIVSLQKNLKEKNVLIENSHEMERALSRKTEDLNKQLKDLLQKYTEVKNEKEKLAEENAKRTPEILAAQTLLQKQPVPLEQVEALKKSLNDTIENLREELKNKQRCYEKEQQTVTKLHQMLENQKNSSVPLVEHLQIKEAFEKEVGIIKASLKEKEEESQNKTEEVSKLQSEVHNTKQALKKLETREVVDLSKFKAMKSDLETQISNLNEKLANLNRKYEDACEEVLHAKKKELSAKDEKELLHSSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELERRIQESAEQIEAKDNKITELLTDVERLKQALNGISQLTYTCASPSTRQSQLVETLQRQVESLQQQLADTDRQHQEVIAIYRTHLLSAAQGHMDEDVQAALLQIIQMRQGLVC	270350	296939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_271339_272893_273002_274655_274689_275372_275472_278941_278979_280049_280103_281923_284663_287013_287167_289783_289850_293323
902688	contig_9199_pilon	-	2942	23	Intergenic	novelGene_65644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	111.139440373846	403	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	894	2685	114	2798	148779	142511	FALSE	25	CCAATTTAAGGCAGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHCYDPALDGIMEYDFKFNPSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGVCTVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMEIMTQKLQRQRLRSRPQGLTDAERRELEQEAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISHPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGSAGGYGGAGGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAAPMGCYPGGGGGAQMAASAPVADAGEEAAEPSAPRREPSAPEMLAQAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARSLLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQMNVIEQIAHVIYHAPYLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVSFLLQVGADPALLDRHGDSAVHLALRAGAPDLLRALLQSGGPAVPQLLHTTDFEGLYPVHLAVRARSPECLDLLVGDGAEVEAAERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLGANVNARTFAGNTPLHLAAGLGSPTLTRLLLKAGADIHAENEEPVCPLPSPPTSGSDSDSEGPERDTRSSFRGHTPLDLTRSTKVRTLLLNAAQDTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDAALQNLEQLLDGPGAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRKTASPSGSLLRSYELAGGDLAGLLDALSDMGLEEGVRLLRGPEPQDKLPSTAEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH	150143	142366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_142636_142731_142844_142972_143146_143348_143419_143555_143708_143838_143942_144071_144242_144399_144608_144700_144816_145226_145369_145459_145658_145782_145912_146143_146283_146366_146453_146594_146700_146985_147145_147228_147336_147574_147727_147805_147905_148159_148201_148316_148396_148758_148851_150101
902689	contig_14651_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_157214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	246	557	86685	86374	NA	25	TTAATTGTAAGCCTTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWESKMVQPLWKLIWHFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIRAVTRIDICTPMFIAALFMIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTVEYYAMIKNNDEPET	86930	84587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_84600_86900
902690	contig_6241_pilon	-	2737	10	Intergenic	novelGene_156407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	136.098094615702	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	542	1351	195215	193200	TRUE	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPVFEAVGRIYELRLMMDFDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMKKREEILEEIAKVTEGVLDVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLHAGLLRLPLQCTHWAQQGVLRESRQHKRPRARRSWQQSPRAEGFLPRGIFCWPWYL	365488	181408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193303_194092_194162_194577_195247_219950_220075_286433_286494_293626_293710_365087_365246_365403
902691	contig_10286_pilon	-	1913	5	Intergenic	novelGene_98397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	251.332822170126	14	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTACTTCTCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424835	380010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380650_381133_382113_410164_410233_415379_415572_424800
902692	contig_6513_pilon	-	4123	16	Intergenic	novelGene_117784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3667	3999	246655	237172	TRUE	15	AGATTTTCCTTGTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYLMISFIRSSSIVARKVSLGCSISGTTSSRIFATLQITMKSFCVLHLVVRYGCIVMACLTMSWGLILLNKNRVVMQATNLPEFTPLLSESGTSDSSYLRMCSTRLSTS	263338	228680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_228700_229502_229555_237118_237225_239079_239223_246518_246660_246868_246962_247401_247556_248061_248151_250101_250280_250714_250903_252973_253085_253506_253707_256836_256984_258592_258868_260339_260515_261286
902693	contig_7272_pilon	-	3088	10	Intergenic	novelGene_25357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	293	junction_8	735.852642253265	6	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	2360	3088	605006	601048	FALSE	35	AGAGAGAGGATGGAGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLE	618661	601047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_611629_611658_616565
902694	contig_3866_pilon	-	2473	1	Intergenic	novelGene_112436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254625	252152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_252200_254600
902695	scaffold_21177_pilon	-	6262	8	Intergenic	novelGene_145481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_7	199.474922980206	672	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	84	2489	221483	179494	FALSE	30	CTCAGCCAGTCAGATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGGTVDIVESEPENDHGVELLDQNSSIRVPREKMVYMTVNDSQQEDEDLNVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGNNSDGIENRNGTASALLHIDESAGLGRLAKQKPKKRRRPDSRQYQTAIIIGPDGHPLTVYPCMICGKKFKSRGFLKRHMKNHPEHLTKKKYRCTDCDYTTNKKISLHNHLESHKLTSKAEKAIECDECGKHFSHTGALFTHKMVHKEKGANKMHKCKFCEYETAEQGLLNRHLLAVHSKNFPHICVECGKGFRHPSELKKHMRIHTGEKPYQCQYCEYRSADSSNLKTHVKTKHSKEMPFKCDICLLTFSDTKEVQQHALIHQESKTHQCLHCDHKSSNSSDLKRHIISVHTKDYPHKCDMCDKGFHRPSELKKHVAAHKGKKMHQCRHCDFKIADPFVLSRHILSVHTKDLPFRCKRCRKGFRQQNELKKHMKTHSGRKVYQCEYCEYSTTDASGFKRHVISIHTKDYPHRCEYCKKGFRRPSEKNQHIMRHHKEVGLP	254661	175720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_180678_181500_181642_182184_182341_182719_182864_183067_183218_217716_218287_221422_221512_254606
902696	contig_11258_pilon	-	859	4	Intergenic	novelGene_67858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	149.019760061842	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	87	743	360591	352035	FALSE	20	TTTTGAAACTTTTTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPATTEGLLVPSTALATVSTTHSPSSQENSNQSQSPWSLLSSIHFLLLVFLKVPLFLSMLSAVLWVNRPQRDPREGPYENQ	360677	351918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353000_353104_354741_355099_360530
902697	contig_4392_pilon	+	1699	2	Intergenic	novelGene_117302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	440	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTCAGTCTGGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245116	246975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_246017_246176
902698	contig_4429_pilon	+	3453	1	Intergenic	novelGene_50807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2584	2934	179032	179382	NA	20	GGGCTGCGGGGAGATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPRTSKALLKQENKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWHNWLSICKRMKQDPYLTP	176448	179901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_176400_179900
902699	contig_7963_pilon	-	3807	13	Intergenic	novelGene_58456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_12	547.82130982648	3	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	1406	2842	125592	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	129559	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126910_129471
902700	contig_6871_pilon	+	2124	2	Intergenic	novelGene_21574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1133	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	6	1115	129810	135017	FALSE	60	AAAAAGAAAAAACTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	129804	136026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_129843_133940
902701	contig_11337_pilon	+	1363	2	Intergenic	novelGene_107183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	498	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	170552	170851	TRUE	35	CTATATCATCAGTTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRSLPILWCLLHQLGWAGKNTGDTRTCHPSLILRWDCPPFFHLASPSLSTSLFPHSSKWVVVEASGSFLIASIFLSEIRNKAHREQSLVLVNLGICEAE	170550	173040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_171383_172509
902702	contig_5671_pilon	+	1496	7	Intergenic	novelGene_79418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1908.71629345193	12	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	124	546	370430	531238	TRUE	50	CTAAACAGCTGCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368801	534253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205_531869_533933
902703	contig_4091_pilon	+	3648	5	Intergenic	novelGene_173017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.870384374269	78	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	2377	2886	56711	57220	TRUE	60	AGCAATGAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELLDREFKSLILRIIQELKQKADRNEEKIDKFMEKAEKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNTKINPQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKQLEYNSVPGKLRKKKNEETLRVMWETIKSKNFQVIRVPE	10861	58051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_55004_57571_57639
902704	contig_854_pilon	+	2786	15	Intergenic	novelGene_36534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2764.97816078027	3	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	82	1917	1649514	1715538	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATPATSTPSSSPVCCWQSHVVTSHTCCLIRPPLQGLWVVWQE	1612864	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679325_1702030_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705426_1715414
902705	contig_5236_pilon	-	2268	17	Intergenic	novelGene_100891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	303	740	83405	77054	TRUE	5	TCGGCTCCGTCTGCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCGVCFFQDVKLKVFIPNLSISDTVKAWWTLGFCVDLSKAVVAHLVHEAVEQHWRALAVHTELPSRRVVVVLLDVFARVCAASNSDHPQKLVDIVRRIPSEASENDQNVADIKLPHDLIGFFFCGCHCLPYSRNMGIIPCVIVH	84327	60660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_60685_62749_62879_64042_64108_66493_66610_67070_67203_69752_69805_70439_70603_71864_72045_72868_73034_74061_74152_75043_75201_75463_75651_76985_77102_77238_77344_81584_81775_83310_83425_84044
902706	contig_5023_pilon	+	2348	13	Intergenic	novelGene_7323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2158.03187566562	2	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	27	926	607279	629214	TRUE	20	TAGGGGACCGCTTGTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKVGGFR	607252	647706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618677_629205_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
902707	contig_1982_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_151337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1017	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGATAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398035	399933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_398000_399900
902710	contig_10765_pilon	-	9644	57	Intergenic	novelGene_122929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	236.402685246671	5	122	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2794	8385	139	8523	416743	199075	FALSE	25	CATTTAAAGTTTTTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIVADLYAEVTGVLAQAKFPAVKKKFMAELKELRHKEQSPYVVQSIISLIMGMKFFRIKMYPVEDFEASLQFMQECAHYFLEVKDKDIKHALAGLFVEILVPVAAAVKNEVNVPCLRNFVESLYDTTLELSSRKKHSLALYPLVTCLLCVSQKQLFLSRWHVFLNNCLSNLKNKDPKMARVALESLYRLLWVYMIRIKCESNTATQSRLITIVTTLFPKGSRGVVPRDMPLNIFVKIIQFIAQERLDFAMKEIIFDFLCVGKPAKAFSLSPERMNIGLRAFLVIADSLQQKDGEPPMPVTGAVLPSGNTLRVKKTYLSKTLTEEEAKMIGMSLYYSQVRKAVDNILRHLDKEVGRCMMLTNVQMLNKEPEDMITGERKPKIDLFRTCVAAIPRLLPDGMSKLELIDLLARLSIHMDDELRHIAQNSLQGLLVDFSDWREDVLFGFTNFLLREVNDMHHTLLDSSLKLLLQLLTQWKLVIQTQGKVYEQANKIRSSELIPNGSSHRTQSERGPHCSVLHAVEGFALVLLCSFQVATRKLSVLILKEIRALFIALGQPEDDDRPMIDVMDQLSSSILESFIHVAVSDSATLPLTHSVDLQWLVEWNAVLVNSHYDVKSPSHVWIFAQSVKDPWVLCLFSFLRQENLPKHCPTALSYAWPYAFTRLQSVMPLVDPNSPINAKKTSSAASSADSYVTLWRNYLILGFGVAKPSVMSPGHLRASTPEIMATTPDGTVSYDNKAIGTPSVGVLLKQLVPLMRLESIEITESLVLGFGRTNSLVFRELVEELHPLMKEALERRPENKKRRERRDLLRLQLLRIFELLADAGVISDSTNGALERDTLALGALFLEYVDLTRMLLEAENDKEVEILKDIRAHFSAMVANLIQCVPVHHRRFLFPQQSLRHHLFILFSQWAGPFSIMFTPLDRYSDRNHQITRYQYCALKAMSAVLCCGPVFDNVGLSPDGYLYKWLDNILACQDLRVHQLGCEVVVLLLELNPDQVNLFNWAIDRCYTGSYQLASGCFKAIATVCGSRNYPFDIVTLLNLVLFKASDTNREIYEISMQLMQILEAKLFVYSKKVAEQRPGSILYGTHGPLPPLYRVSLALLSCELARMYPELTLPLFSEVSQRFPTTHPNGRQVMLTYLLPWLHNIELVDSRLLLPGSSPSSPEDDTKDREGEVTACHGLKGSGWGSPEATSLVLNNLMYMTAKYGDEVPGPEMENAWNALANNEKWSNNLRITLQFLISLCGVSSDTVLLPYIKKVAIYLCRNNTMQTMEELLFELQQTEPVNPIVQHCDNPPFYRFAASSKASAAASGTASSSNTVVAGQDSFPDADEGKILKESDERFSHVIRTHTRLESRYSNSSGGSYDEDKTDPVSPYASWLLTITETKQPQPLPMPCTGGCWAPLVDYLPETITPRGPLHRCNIAVIFMTEMVVDHSVREDWALHLPLLLHAVFLGLDHYRPEVFEHSKKLLLHLLIALSGNSSFHAIASVLLQTREMSEAKTLTVQPGYQPEYLYTGGFDFLREDQSSPLPDSGLSSSSTSSSISLGGSSGNLPQMTQEAEDVDAAAETDEKANKLIEFLTTRAFGPLWCHEDITPKNQNSKSAEQLTNFLRHVVSVFKDSKSGFHLEQHLSEVALQTALASSSRHYAGRAFQIFRALKQPLSAHALSDLLSRLVEVIGEHGDEIQGYVMEALLTLESAVDNLSDCLKNSDLLAVLSRSSSPDLSSSTKLTASRKSTGQLNVNPGTAGGSTATAERSRHQRSFSVPKKFGVIDRSSDPPRSATLDRIQACTQQGLSSKTRSSSSLKDSLTDPSHINHPTNLLATIFWVTVALMESDFEFEYVMALRLLSRLLAHMPLDKAETREKLEKLQAQLKWADFSGLQQLLLKGFTSLTTTDLTLQLFSLLTPVSRVPMVDSSQAIGFPLNVLCLLPQLIQHFENPNQFCKDVAERIAQVCLEEKNPKLSNLAHVMTLYKTHSYTRDCATWVNVVCRYLHEAYADITLNMVTYLAELLEKGLPSMQQSLLQVMHGLLSHMDLSVLPVKRFNVEVLKTIEKYVHSVHWREALNILKLVVSRSASLVLPSYQHSDLSKIEIHRVWTSASKELPGKTLDFHFDISETPIIGRRYDELQNSSGRDGKPRTMAVTRSTSSTSSGSNSNVLVPVSWKRPQYSQKRTKEKLVHVLSLCGQEVGLSKNPSVIFSSCGDSDLLEHQTSLVSSEDGAREQENMDDTNSEQQFRVFRDFDFLDVELEDGEGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLIMTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKAEAVQEEEDTTVHEDDLSSSINELPATFECSDSFSLGMTEAEEKGDRALDQFTLASFGEGDRGVSPPPSPFFSAILAAFQPTACDDAEEAWRSHINQLMCDSDGSCAVYTFHVFSSLFKNIQKRFCFLTCDAASYLGDNLRGIGSKFVSSSQMLTSCSECPTLFVDAETLLSCGLLDKLKFSVLELQEYLDTYNNRKEATLSWLANCKATFAGGSRDGVITCQPGDSEEKQLELCQRLYKLHFQLLLLFQSYCKLIGQVHEVSSMPQLLNMSRELSDLKKNLKEAAAALAGDPFDTGGAWSEPTFTSTEAAIQAMLECLKNNDLGRALRQIRECRSLWPNDIFGSNSDDEVQTLLNIYFRHQTLGQTGTYALVGSNQSLTEICTKLMELNTEIRDMIRRAQSYRVLTAFLPDSSVSGTSL	417393	197953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_199334_202638_202842_203832_203944_222178_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236243_239034_239202_242487_242650_243413_243615_252690_252862_255622_255698_259947_260110_262099_262280_265553_265695_268269_268441_269607_269706_271246_271855_273448_273544_275375_275564_285164_285287_286900_287100_290655_290842_291590_291695_292445_292597_299034_299118_309707_309799_316325_316495_319396_319544_320490_320748_328080_328253_328566_328667_340893_341049_343480_343592_345181_345343_347447_347621_348093_348186_350155_350214_354087_354213_354837_355031_355548_355809_360667_360755_363168_363352_365288_365548_380015_380124_384544_384678_386692_386865_395418_395506_398272_398382_399140_399245_406278_406381_409381_409481_409575_409669_411812_411982_416687_416769_416856_416937_417360
902711	contig_10902_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_65682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_1	295.140022113337	202	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	468	1433	189165	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	160603	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
902712	contig_10259_pilon	+	3015	3	Intergenic	novelGene_177187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	7	381	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	72	446	30789	61659	FALSE	20	AGCTCTGGATCCGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVDLSSDFIRVAVLEENGERVLMEGKLTHKINTESSLWSLEPGKCVLVNLNKVGEYWWSAILEGEEQIDIDKINKERSMATVDEEEHAVLDRLTFDYHQKLQGKPQSHELKVHEMLKKGWDAEGSPFRGQRFDPAMFNISPGAVQF	30717	64228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_+_30864_52711_52901_61548
902714	contig_4392_pilon	-	3889	2	Intergenic	novelGene_117286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2064	2429	40693	40328	FALSE	35	TGCTAACATACCTAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIILSLAALYLRINLEMFFLMVNAMSFLFVTPSIADHLLSDSKCPIPVHFSSLMPMIAIFIYSISFLTTSNFPRFVLHTVHVPIINGCLQLFFLIFSCATSTNEGPESLTPFTSLRLTLL	198279	38867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_41516_197038
902715	contig_14508_pilon	-	630	11	Intergenic	novelGene_79040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_1	1110.00639637797	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	276	353	628	64631	37044	FALSE	50	TGAGATTATCAAATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHGEDLYQEEDEPTRDQQLEDEDFLTGSDADDKIENLETETFHEETEDSYQVEETAPQDYNQDMEEIIYEQENPGSSEPVVDDERLHHDADDITYQVYDEQVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPETSRKTNDPEQKEK	77942	37041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_37085_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387_63421_64057_64106_64597_64655_65526_65560_69277_69404_74524_74600_77847
902716	contig_15105_pilon	-	3184	1	Intergenic	novelGene_151038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	353	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1	414	836548	836135	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGTTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGQSVNALFQYIPFCSDL	836548	833364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_833400_836500
902717	contig_14970_pilon	+	4155	1	Intergenic	novelGene_45089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	553	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAGGAAGACCCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222602	226757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_222600_226800
902718	contig_5988_pilon	+	2804	10	Intergenic	novelGene_16071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1986.5809514196	11	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	354	701	1221749	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209835	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
902719	contig_960_pilon	-	3515	25	Intergenic	novelGene_108224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_24	344.95494874935	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1021	3066	347	3412	487192	419919	FALSE	20	ACAGCCGTGTGCACACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPADLTALAKELRAVEDVRPPHKVTDYSSSSEESGTTDEEDDDVEQEGADDSTSGPEDTRAASSLNLSNGETESVKTMIVHDDVESEPAMTPSKEGTLIVRQSTVDQKRASHHESNGFVGRIHLLPDLLQQSHSSSTSSTSSSPSSSQPTPTMSPQTPQDKLTTNETQSASSTLQKHKSSSSFTPFIDPRLLQISPSSGTTVTSVVGFSCDGMRPEAIRQDPTRKGSVVNVNPTNTRPQSDTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLVGTESGLMLLDRSGQGKVYPLINRRRFQQMDVLEGLNVLVTISGKKDKLRVYYLSWLRNKILHNDPEVEKKQGWTTVGDLEGCVHYKVVKYERIKFLVIALKSSVEVYAWAPKPYHKFMAFKSFGELLHKPLLVDLTVEEGQRLKVIYGSCAGFHAVDVDSGSVYDIYLPTHIQCSIKPHAIIILPNTDGMELLVCYEDEGVYVNTYGRITKDVVLQWGEMPTSVAYIRSNQTMGWGEKAIEIRSVETGHLDGVFMHKRAQRLKFLCERNDKVFFASVRSGGSSQVYFMTLGRTSLLSW	490030	419815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_420003_421405_421546_422303_422464_422993_423144_425000_425102_427874_428010_430724_430869_436239_436411_436729_436848_438781_438974_440053_440175_440650_440827_442977_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758
902720	contig_9468_pilon	-	2361	13	Intergenic	novelGene_59460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGTCAGGAAGGGAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206748	150881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_150988_172514_172567_172893_172971_173052_173128_173540_173650_175886_175932_177205_177311_189779_189927_192805_192870_200358_200571_201334_201503_203172_203264_205638
902721	contig_14499_pilon	+	3091	1	Intergenic	novelGene_174025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1602	1949	106257	106604	NA	50	AAAAAAAGTTGAGTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKNHTIISINAEKAFDKVQHPFLTKILNKIGTEGKFLNIIKGIYIKSTANTIINAMRLKAFPPRTGTRQACPLSPLLFNIVLEVLPRTIRQEKEIKDIQIVKEDENYPYSQMI	104655	107746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14499_pilon_+_104700_107700
902722	contig_5765_pilon	-	5046	14	Intergenic	novelGene_141353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.7181768751193	485	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	243	1523	587164	386026	TRUE	25	TTTTTCAATCCCAGTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGKENKQTKAPGSHQCGSPDRKAVPHSNGALQPPRKKQRWRTEPAPKDNEERVFRERLRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMATYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQESPDEVGSQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELENNIRKALSFDNRGEDHRAAASTDGQLGSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKVLGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDLKLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPRDLTRVGVWPFGGLVGPGGANV	653739	350312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_353565_380033_380181_385901_386091_392572_392713_463984_464140_556479_556654_559952_560153_563192_563290_568125_568269_580592_580723_583210_583297_584771_584807_587108_587269_653601
902723	contig_4857_pilon	-	6170	1	Intergenic	novelGene_48713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	813	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGCTCCCAAGCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183544	1177374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1177400_1183500
902724	contig_610_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_76729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1256.39590363335	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	59	727	252557	220501	TRUE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVGKNYL	252615	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220498_220785_234998_235302_252475
902725	contig_5317_pilon	-	953	3	Intergenic	novelGene_76544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	588	899	43257	35312	FALSE	25	TACCAGCATCACCCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTQVGVFKKANQIGLTCLLQSTNSCALETQICFEVLSNFSHQTLEGKFANQKFSGLLITSDFPECHSTRPVTMRFLHPSSRGRTLASGFCSQLLPGCFTTS	43844	35257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682_36837_43195
902726	contig_6028_pilon	-	4017	9	Intergenic	novelGene_156553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	167	junction_8	160.974959232795	558	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	184	1164	247497	198358	FALSE	40	CTACAGCTAACATCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLWVLLSLIFTLIAGSDNAQVNAVNHKGLELTKNITKKDAGCRKGLYLASPNHEQHLCCQPCPAGTRKTADCSVNEGNPNCTHCKEGQEYTEMENYLDYCRRCRFCDEGHGLEVEKHCTRTQNTKCRCKEDFFCSSSSCDHCAPCITCEHGIIEKCTQTSNTKCKEKDSKSNLLWLLCLLLLPVAAIICGLWIYRKHNRETTGYFKPTEMKPMICRDVDLSKYITYIAEQMTINQVKEFVRRNGINEAKVDEIKNNHPQDTAEQKVQLLRNWYQFHGKKGAYDTLIKSVQKRIAENIQDMIQKDITSDDENTNFRNENERQSFA	247680	195504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_198684_200594_200620_201553_201610_203548_203615_203762_203825_205382_205492_206259_206398_227058_227228_247467
902728	contig_6470_pilon	-	5367	2	Intergenic	novelGene_145600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	301	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGTTCTTTAACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029226	988473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_-_988655_1024040
902729	contig_6137_pilon	+	1266	6	Intergenic	novelGene_59170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_2	1088.15355534042	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	363	734	1268914	1313802	FALSE	70	GAAAAGAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNNTLYNLFFLQDIFPTSKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKVCFLYLVSSFSSKCISFKSY	1239051	1314334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239268_1240381_1240523_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654
902730	contig_5003_pilon	-	3084	9	Intergenic	novelGene_120219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_2	52.5588955363409	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	32	811	187425	165238	FALSE	20	AGTCCAAGTTGTTTTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVALAGLEVMAWVPVESAVEELMPRLLPVEPCDLTECFDPSVPPRTPQEYLRRVQLEAAQCPDVVVAQIDPKKLKRRQTVNVSLSGCQPAPEGYSPTLQWQQQQVAQFSAIRQSVNKHRSHWKSQQLDSNVIMPKSEDEDGWKKFCLGERLCSEGIVGPATNESPGIDYVQIGFPPLLSIVSRMNQATVTSVLEYLSNWFGERDFTPELGRWLYALLACLEKPLLPEAHSLIRQLARRCSEVRLLVDSKDDERVPALNLLICLVSRYS	187456	162964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_165307_167394_167506_170508_170578_173399_173445_175625_175740_182730_182791_183049_183140_186854_186940_187288
902732	contig_17059_pilon	+	4290	5	Intergenic	novelGene_166086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	130.315722382221	395	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	187	1026	421631	428213	FALSE	40	TCTGGACAATCTACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLGLRDDIPFNFQKLEKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDLAQRRLYRDVMMETFRNLASVVSLHLNDGENLSSEHIMVRLMKNNTWSSMLGEISDSLGNKDHHKNQWRHVRSHTVQNHCESNEGNQCEKPFSQIPPKVNPFEFCECGKAFMDHSSHKHDARSHTGCNTRPCKECGEASSCSSHLTTPIRTLNGKKPHKCKVCGKYFICISTLRNPVTTLTGEKWYECNQCRKDFCSFSSFWIHMRGHKHECKECCKTYSPSSLILQKKIHNWRKAL	421444	431477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_421694_425605_425733_426717_426869_427547_428029_428195
902733	contig_9098_pilon	+	5000	1	Intergenic	novelGene_75828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCCCCCTAAATGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330026	335026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_330000_335000
902734	contig_10500_pilon	-	3386	8	Intergenic	novelGene_41260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1020.80174572815	70	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	332	859	1635596	1629460	TRUE	80	AAAGAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMAMGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640228	1626838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629567_1630606_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637022_1639998
902735	contig_8122_pilon	+	3900	1	Intergenic	novelGene_40253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTACAGTCGTGTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735042	738942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_735000_738900
902736	contig_4315_pilon	+	3714	14	Intergenic	novelGene_46763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	313.197255272231	611	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	404	1885	269040	293317	FALSE	20	CGACTATACTCTGTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQEEEEQPRRRVQRKRANREQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELGSSARFVYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVLDFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKLALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEKKVGLYTIYVNPANTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENENNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLVYSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGSDCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTELTGLKDVIKKNKRERDEDSLHHTDLFDSHMLWFLMHHLRQRRHHRRWREPGVGATDADSDESPSSSDTSDEEEGPDRVQCMPS	255226	295146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_255321_265850_265923_268802_269050_269087_269489_270465_270607_271713_271809_277695_277807_285725_285799_286277_286336_286848_286957_288344_288476_291955_292076_292480_292598_293200
902737	contig_9345_pilon	-	1917	6	Intergenic	novelGene_24640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2071.87995791262	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	283	843	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001357	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949484_949595_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
902738	contig_10748_pilon	+	6817	4	Intergenic	novelGene_150742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	132	junction_3	99.4730560950496	961	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	781	918	167584	167721	FALSE	20	TGTTGGAATCTGACTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPHLQLLDVSSNALTALGPELLALRNLRTLLAKNNRLGGPGALPKGLTQSPLCRSLQVLNLSGNCFQEVPASLLELRALQTLSLGGNQLQSIPAEIENLQSLECLYLGGNFIKEIPPELGNLPSLNYLVLCDNKIQSVPPQLSQLHSLRSLSLHNNLLTYLPREILNLIQLEELSLRGNPLVVRFVRDLTYHPPTLLELAARTIKTRNISYTPCDLPGNLVRYLGLASNCPNPKCGGVYFDCCVRQIKFVDFCGKYRLPLMHYLCSPECSSPCSSASHSSTSQSESDSEDEASVAAHRMQKVLLG	145426	173620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_145729_157209_157339_158829_159108_167512
902740	contig_11816_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_98475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAAAAAATACGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453952	456624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_454000_456600
902741	contig_8269_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_106252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAGAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349425	347406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_347400_349400
902743	contig_3132_pilon	-	2296	11	Intergenic	novelGene_127419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	118.632246880854	439	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	409	1500	229216	210841	TRUE	35	AGGTTCCATAGTTGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKEGDLVEVDEETAAILKNSRFAQDFLINPVGERLPSTGNCSALESKAIITDPFKLAEESHDTKSRCPPGIAGGCCDTRKSC	229624	209906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210572_210709_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
902744	contig_13295_pilon	-	2580	9	Intergenic	novelGene_31215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.460361238224	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	58	864	60363	55632	TRUE	50	ATTGTGAAATAAAACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGSVSWEESTNDISHYLGMLDPWYERNVLGLMHLPPEVLCQQSLKPESRPLAGCPAQLPILADMLLYYCRFAARPVLLQVYQTELTFSTGEKTTEIFIQSLELGHSAATRAIKASGPGSKRLGIDDDREAVPLTLQIVYSKGAISGRSRWSNMEKVCTSVNLSKACRKLEELDSNMEALTLTLTEVVKRQNPKSKKGFNQISISQIKVDKVQIIGSNSCPFAVCLDQDERKVLQSVVRCEISPCYKPEKSSLRPPRQRPPYPLAQAAPDLCSLLCLPIMTFSGPLP	60420	53645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_53807_54076_55780_55912_56026_56646_56730_56802_56897_59115_59193_59375_59470_59647_59777_60294
902745	contig_12178_pilon	+	2419	2	Intergenic	novelGene_156546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238407	250661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_238417_248251
902746	contig_6576_pilon	+	2964	2	Intergenic	novelGene_42361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	107	junction_1	0	260	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTCTGATTTGGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813571	819197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_814254_816915
902747	contig_10000_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_139344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325514	326072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_325500_326100
902748	contig_1719_pilon	-	4276	20	Intergenic	novelGene_87274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	621.414279181925	582	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2202	2073	4274	364776	353055	FALSE	20	TAGGTTTGGCATTCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMDLWEQQEEERITTMQLEREKALEHKNRMSRMLEDRDLFVMRLKAARQSVYEEKLKQFEERLAEERHNRLEERKRQRKEERRITYYREKEEEEQRRAEEQMLKEREERERAERAKREEELREYQEHVKKLEEVERKKRQRELEIEERERRREEERRLGDDPLSRKDSRWGDSESTWRRGPEVESEWRRGPPEKDWRREGRDEERSLRRDEDRPRRLGDDEESQSSVRPEDDRFPRRGTDEDRGLRRGPDEDRFSRRGVDDDRPSWRNTDDDRPPRRIGDEDRASWRHADDDRPLRRGLDDDRGTWRAADEDRGPRRGMDEDRGPRRGGVDDERTSWRSGDDDRGPRRSMDEDRGPRRSMDEDRGPRRSVDDDRGPRRSVDEDRGPRRSVDDDRGPRRGFDDDRGPWRNTDDDRVPRRGTDDDRGPRRSIDDDRLSRRADDDRIPRRGDDSRPGPWRPFGKPGGWRDREKARENSWGPRQESRLSEDSEWDREKERDRDNPDRDENDRDPERERDRDRERDEDRFRR	382171	353052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_353249_355121_355409_355468_355988_356639_356723_358421_358607_359047_359202_359740_359864_361990_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
902749	contig_240_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_173800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCAAGCTGGCCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642063	643611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_642100_643600
902750	contig_348_pilon	-	5823	6	Intergenic	novelGene_67574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2306	2779	330188	329715	TRUE	40	AAGGGCTTAAATGCAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRIRSAFLKLKELKRKFKPEVAILKDSTRKILKDTGSIKVRWKGCSELLYQKELVGIQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKTLAKNKAPGIDGIRTEMFQQTMQCWKHSLVYAKKFRRQLPGQLTGIDPYLCLFPRKVTPQNVEII	332493	6361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_6679_114053_114703_115637_116535_146403_146525_197144_197699_329208
902751	contig_408_pilon	-	6101	1	Intergenic	novelGene_84936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	951	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229268	223167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_223200_229300
902752	contig_5696_pilon	-	3913	8	Intergenic	novelGene_117574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738231	713363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_714071_714622_716735_730426_730595_731912_732064_732416_732504_733582_733650_734430_734592_737771
902753	contig_10235_pilon	+	2711	5	Intergenic	novelGene_46380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_1	149.564367414167	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1320	1883	156557	158044	FALSE	25	TCTCTCCTGCCAAGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVCSLPSGGKEAVQSEDLSGPEKGPLDRGRGLGDTMIWVGLRSESALGGLHHLFRSIYQSPPFYSPQLEKYQQGDFGYCPRVYCENQPMLPIGLSDIPGEAMVKLYCPKCMDVYTPKSSRHHHTDGAYFGTGFPHMLFMVHPEYRPKRPANQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQAASNFKSPVKTIR	153850	158872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_153946_154761_155636_156206_156840_156980_157171_157953
902754	contig_15135_pilon	-	3810	6	Intergenic	novelGene_119860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	598	junction_4	87.2316456339097	223	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	37	804	51840	44418	FALSE	35	TTGCCATTTATAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQVSSLEATLSSWMLYFILCVPMDWGMCVGLDVSEYI	51876	41411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_44640_44777_44901_46298_46406_49385_49485_49803_49862_51681
902755	contig_602_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_134967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCTGGACAGAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559989	562315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_560000_562300
902756	contig_18869_pilon	+	2612	11	Intergenic	novelGene_56457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_8	124.879181611668	77	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1115	2185	182555	189734	FALSE	30	GGATGTCATCATTACTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWSLKQARIDFWKKCHENFKKNSISSKAASSFFSSQALEACASPAEEQQSGIEERHLLLTLAGHWLAQNDLVPLEELEELEKQIWLCRITQHTLRGNQEDTDPRFSRQISTSGQLSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNGLPSKDSCENRLDGKEEESLNFLIGRLLDDGCVREASRVCRYFGFYNRDVVLVLHCGALASGEAGADDLHAEVQALLQRAELLEEEEESAVAARKVRSTSSLDTQSLKTAPPSDQVVADLKTLTSKCLHGKNSCRQVLCLCELAQDLGCPYTDVAAWGGEAVLRAILASQQPDRCKRAQAFISTQGLKPDAVAELVAEEVTRELLTPSEGAGHKPTFSPAEESQTFLQLTMLCPDLTLVGRKLLDKISSVPHGELACTTELLILAHHCFTLTCHMEGIIRVLQAARLLTDNHLAPNEEYGLVVRLLTGIGRYNEMTYIFDLLHKKHYFEVLMRKKLDPSGTLKTALLNYIKRCHPGDSEKHNMIALCFSMCREIGENHEAAACIQLKLIESQPWEESLKDGHRLKQLLLKALTLMLDAAESYSKDFCVRQALRCHRLTKLITLQIHFLNTGQNTMLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	176751	190161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_177471_180985_181126_181983_182183_182498_182637_184431_184566_185235_185344_186722_186892_187841_187931_188134_188291_188948_189101_189553
902757	contig_9239_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_137181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCGCGCGCGCGCACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186408	188018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_186400_188000
902758	contig_12644_pilon	+	3858	1	Intergenic	novelGene_44475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTAACCCACAGGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024731	1028589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1024700_1028600
902759	contig_8020_pilon	-	2781	10	Intergenic	novelGene_114382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_9	56.55108037304	70	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	993	1601	150417	148058	FALSE	5	ACCCTGTCTCTCTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLKKNGGIVMVSLSVGVLQCNLLANVSTVADHFDHIRTVIGSKFIGIGSDYDGAGQFPQGLEDVSTYPVLIEELLRRGWSEGELQSVLRENLLRVFRQVEQVREENKWQSPLEDEFPDEQLGSSCRSVLPRLHQRQDLVPDQKPIVTPTH	153703	146877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149914_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151231_151580_151708_153168
902760	contig_8377_pilon	+	2003	20	Intergenic	novelGene_34970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3239.27628454959	10	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1827	177	2003	131448	180503	FALSE	30	ACAAACGTGAGTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNI	68100	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164482_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
902761	contig_4105_pilon	-	3803	1	Intergenic	novelGene_21513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTGCTATGTGGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120996	117193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_117200_121000
902762	contig_11754_pilon	+	3042	1	Intergenic	novelGene_176978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1908	2957	49660	50709	NA	45	CAGAGCAGTTAATCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSDKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTLRVIRIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKHEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	47752	50794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_+_47800_50800
902763	contig_1435_pilon	-	3135	1	Intergenic	novelGene_115506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGTTATGGGGCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548808	545673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_545700_548800
902764	contig_17976_pilon	+	2273	2	Intergenic	novelGene_32457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	0	143	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	351	743	8904	9296	FALSE	10	TGAGTGGCTGTGGGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQDLREMRQVLRESEMPQEFLESELPQELRATPRQLFESESPQDIGETLQELRAMRQELRAMRQVFRQSEMPQELAEMPQELPESEPQQELHEMPQELHESESQQESSSKSSSHAGSPGSRKAGKCCLL	5882	10826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_6167_8837
902765	contig_9091_pilon	+	4004	14	Intergenic	novelGene_32414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	646.383210207281	736	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	5	652	2310	13675	TRUE	50	TACAATACAAATAACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMVNVKANPKVIDTGGGFLLEEEEEEEHKIGQVVHQPGPVMEFDYTICEECGKEFMDSYLMNHFDLATCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCELEKREPALKFIVKKNPHNSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSLWKRETVAHQHEYGPEEKIEDDMYRKTCTVCAHELTYEKM	2305	38061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_2419_3892_3999_5988_6155_7078_7197_13526_16081_18727_18790_24580_24692_25320_25450_28658_28781_31154_31250_32009_32105_33092_33198_34423_34547_37956
902766	contig_2867_pilon	-	5442	8	Intergenic	novelGene_135226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	532	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	4870	5247	1204344	1193348	TRUE	0	CGCTTCCGGGCCTGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAQAQASRSSPEPVVTGLGTCGLRTSGLSSVGLSLSGLSTTVGRRPMVDLDGSCLTTLISSGLKPTGPGTRSRGLMASRFCSAVWRLVFRNEASMSWPVSCKQEMNKGRACLPRVSRSVISCLA	1223476	1192496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1192664_1193319_1193708_1204326_1204516_1204995_1205085_1208271_1208422_1216964_1217144_1217750_1217861_1219306
902767	contig_21315_pilon	-	2846	1	Intergenic	novelGene_151566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	335	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34605	31759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_-_31800_34600
902768	contig_8065_pilon	+	3466	22	Intergenic	novelGene_107329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_11	137.889008571413	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1093	3279	187	3465	125393	227192	FALSE	70	AAGAACTAATAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPIVERKILDLYALSKIVSSKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMGIQMPNLDLKEKVEPEVLSTDIQASPEPGTRMNILPKRTRRLKSQSEPGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGAKDKEDEVSRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKMLPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGIYGSGKNRRKKV	125206	227193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_125558_128249_128328_129484_129608_139184_139356_143032_143168_167447_167554_168762_168855_169620_169780_170920_171041_171704_171864_178285_178468_182274_182438_183789_183910_186853_187049_192927_193110_193450_193576_194049_194201_195650_195766_196153_196510_215370_215510_226319_226500_227129
902769	contig_9484_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_105650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_8	498.670677345725	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	81	944	126829	201271	FALSE	70	TAAATAAATAAAAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRQSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSEPVWWVQEPPSCLDSEPRHVHSTADKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDVSQRHPEYCGSACWIH	126748	201738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198282_198435_201121
902770	contig_10159_pilon	+	2919	11	Intergenic	novelGene_30869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	129.076566424739	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	724	1377	978504	992845	TRUE	90	AAAAACAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLGLLHFLCLSPGPNSNRLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNAEAEDDGSVCTKLQMAGATSCGWSWTKGKGRFSPFTPYVLKERKKNNNRIMDGFYFYFGLFCIFHNEYILITFHKQKRNLRLSEVHH	957493	996462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_992585_993570_994447_994678_995874
902771	contig_3588_pilon	-	2676	1	Intergenic	novelGene_72862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACGCTTATTGGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87131	84455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_84500_87100
902772	contig_18162_pilon	-	2880	3	Intergenic	novelGene_122319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
902773	contig_6412_pilon	-	2113	7	Intergenic	novelGene_149953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	35.9787746070127	207	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	38	637	251767	223664	TRUE	65	GGAAAAAAAAAAGCATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDCRNTAQNHTMPNYKLTYFNMRGRAEIIRYIFAYLDIKYEDYRIEPADWPDIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGKTELEQCQVDAIVDTLDDFMSHFPWAEEKQDVKDKIFNKLLTHDAPILLQDLDTYLGGKEWFVGNSVTWADFYWDICSTTLLVLKPDLLDIHPRLVTLKNKVQAIPAITDWIQRRPQTKL	263709	221027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_221335_222494_223829_225668_225768_242186_242297_245458_245552_251634_251777_263681
902774	contig_2596_pilon	-	4384	4	Intergenic	novelGene_53439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	35	junction_3	88.2886679528516	419	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	37	537	23699	21835	FALSE	15	CGCTCTTTTTCCAAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VETAAPLRTRLQMEAAPDPGPGLCCKPGGRLDMSHGFVHHIRRNQIARDDYDKKVKQAAKEKVRRRHTPAPTRPRKPDLQVYLPRRRDGSTHPSNPEYEESGDSNSSGGSELEPSGHQLFCLEYEADSGEVTSVIVYQDDDPGRVSEEVSAHTPLDPPMREALKLRVQEEIAKRRNRH	23735	17987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_21958_22327_22480_23390_23510_23592
902775	contig_12151_pilon	+	4199	10	Intergenic	novelGene_54981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGCGCGCGCTTCCGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984202	1023819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_986624_987392_987501_988024_988174_989428_989520_994297_994463_1000015_1000225_1001749_1001917_1011463_1011661_1016306_1016742_1023562
902776	contig_10599_pilon	+	2761	19	Intergenic	novelGene_49899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	265.109248386862	414	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	297	2165	302336	350466	FALSE	30	GAGTCAGATTGAATATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLSFPVSYSYLLIQMEESPQRKKRKSEAIGTSDQIDLLALGTAVGSILLYSTVKGELHSKLISGGHDNKVNCIQWHQDNGCLYSCSDDKHIVEWNAQTCKVKCKWKGDSSSVSSLCISPDGKMLLSAGRTIKLWVLETKEVYRHFTGHATPVSSLMFTTIRPPNESQPFDGITGLYFLSGAVHDRLLNIWQVRSEKKEKNAVMSFTVTDEPVCIDLTLSENKEEPVRLVVVCRDGQVHLFEHILNGFCKKPLSSNCTIQIATSGKGKKSTPKPIPILAAGFCSDKMSLLLVYGSWFQPTIERVAINSKEPHVCLVRDISSCWAPKVETAITKVRTPVMNSEAKVLVPGIPGHCAVVKPVTPQAEELESKRKLGENEVSIEERLGAMDIDSKKGKDDLPQTNSFPVLLTQGLESNDFEMLNKVLQTRNVNLIKKTVLRMPLHAVIPLLQELTKRLQGHPNSAVLMVQWLKCVLTVHASYLSTLPDLVSQLRTLYQLLDSRVRTFQKLSHLHGKLILLITQVTASEKTKGMTCPGQKAKLVYEEESSEEESDDEIADKDSDDNWDEDEEEKESDKDEDVDEEHEEEDAEEKDEENGEDRDVTSEKELNGDSDLDSENESEEE	295747	351062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_295980_302271_302390_302883_303022_307357_307480_315223_315345_316318_316459_323323_323427_326889_326955_329050_329223_330609_330697_331544_331677_332440_332573_339955_340043_341748_341781_342815_342880_345408_345523_346239_346310_350123_350174_350280
902777	contig_4857_pilon	+	2002	5	Intergenic	novelGene_48701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	329	junction_2	27.6676706645138	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	167	532	1157643	1160595	FALSE	75	CTTAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLLGPNASPEGLIPWTRFCKENINDKNFSFWLWIESILELIKKHLLSLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGTFLLRFSESCREGAITFTWVERSQNGGEPYFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEGMWGELRNHCLDE	1152876	1162065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1152891_1155450_1155501_1156468_1156564_1157635_1157782_1160368
902778	contig_16411_pilon	+	1857	5	Intergenic	novelGene_77344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	600.305963655201	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	12	698	231797	241641	FALSE	85	AGAAAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRMLSHDISMVGFHSANEKKTGQCVLFFFLFYPLLH	231785	242800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241324_241534
902779	contig_6375_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_72987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	506	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	663	968	295199	294894	NA	15	GCTCTTTCTATGAGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTRLAFLKLKELKKKFKPQVATLKDSKGEKKMMQEASKEDGRKTESLYQKELVDVQLFQEATYDQEPMVLKEEVQAALKALAKKQGSRN	295861	292966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_293000_295900
902780	contig_7467_pilon	-	2970	1	Intergenic	novelGene_69486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119762	116792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_116800_119800
902781	contig_6344_pilon	-	2985	1	Intergenic	novelGene_157091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCCCCATCTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769104	766119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_766100_769100
902782	contig_4402_pilon	-	2766	4	Intergenic	novelGene_140865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	282.40672009631	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	618	974	624811	617078	FALSE	5	TAGCCTCGTGTGTTCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAVCKNTISQFFYTLFLPL	625809	615285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_617169_619559_619660_624645_625269_625649
902783	contig_1406_pilon	-	1401	7	Intergenic	novelGene_25522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	67.8642435716744	105	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAATGCTCAGTTCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058894	1737707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1738155_1750141_1750260_1751245_1751389_1829371_1829712_1977741_1977871_2012379_2012515_2058805
902784	contig_20641_pilon	+	2132	2	Intergenic	novelGene_52883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	111	junction_1	0	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	63	392	72555	72884	TRUE	75	TGAAAAAAAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFEAETARLLVSLVLHLLLLMASRPLGSSPHLPCWGKCSKAQQLHWYKCPEVPHSARKPPAHRHSAPLLHGSASLAPPISARRHPTLPESVLHAGPQLSRSVGRLQCCLSLVSWFYCCWFSAAAASLLL	72492	86668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_73243_85286
902785	contig_15991_pilon	-	2211	2	Intergenic	novelGene_70936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTATTAGTGGTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118295	115008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_116071_117146
902786	contig_7066_pilon	-	4774	3	Intergenic	novelGene_42135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1654	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3070	3408	728217	727879	FALSE	30	GCAAAGTGCCTAGAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILRKFSVSNSSVILSVSSVFSPCSGTLITCRFLLLIVSHIILRVSSFFSFFFSDFSSNRVVSKCLSSILLILSSTISNLLLSPSMTLSISEILLSFGFLFVVFV	898519	726512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_730376_896994_897483_898096
902787	contig_11281_pilon	+	940	1	Intergenic	novelGene_125474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACCAATTGATGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862987	863927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_863000_863900
902788	contig_21232_pilon	-	2482	2	Intergenic	novelGene_165982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	220	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1894	2211	17931	17614	TRUE	0	CTTCTTGTGTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVLLHTYLPQFKLKKKPLANQKQKKTFFKKKEKNLFLQKTRVTKCHKIFTLGLISNSRHLISLFLLCVATYNTSPSETVILPIKRATWPQDGRDCVLQSHHRK	19824	17095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_17254_17500
902789	contig_8376_pilon	-	4717	12	Intergenic	novelGene_153770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_11	112.037995326113	529	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1058	1795	142041	128830	FALSE	40	TTTAATAAAGCAATGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELQAANENKQQELETVRKKLEEAASRAAEEEKKRVQTQVELQARFSTELEREKHIRQQMEEQVAQKSSELEQYLQRVRELEDMYVKLQEALEDERQARQDEETVRRLQARLLEEESSKRAELEKWHVEQQQAILTTEAEKQELENERVVKERALQEAMAQLEQLELERKQALEQYEGVKKKLEMATSKTKSWKDKVAQHEGLIRLIEPGSKNPHLITNWGPAAFTEAELEEREKSWKEKKTTE	215468	125907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_128937_129307_129405_131134_131334_138811_138979_140818_140927_141981_142165_143935_144045_145374_145522_149675_149904_171807_171982_193128_193270_215333
902790	contig_12951_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_68215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAAAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791613	789131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_789100_791600
902791	contig_1239_pilon	+	11907	1	Intergenic	novelGene_150417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	814	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGGGTGCCTGGGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667988	679895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1239_pilon_+_668000_679900
902792	contig_7342_pilon	-	2745	20	Intergenic	novelGene_71207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	605.619245368004	428	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	173	2269	700720	681080	TRUE	20	CCCTTTACTTAAAGTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPDEIEITSEGSKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETSLENLQDIDMMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLPESLSDSRELVEGEMKELPEQLPEHAEIEDKDTINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPVEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSGEDDSDTKRLSKEEKGRSSCGRNFWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGRMISVEKAKNEPAGKKTSDKRESEGKKDKSSNSDRSAHLKRDDKADRKDDAKKGEDGSGEKGKDPDGQKSGPSERSRTTKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSGSKERASKSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPRKSRDSESRRVRERSEREQRMQAQWEREERERLEIAREKLAFQRQRLERERWERERLERERMHVEHERRKEQERIHREREELRRQQELRYEQERRPGGRRPYDVDGRRDDAYWPEAKRAALDDRYHSDFSRQERFHDFDHRDRGRYPDHSVDRREGSRSMMGEREGQHYPERHGGPERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGRGLPPPSQGQT	712304	679922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_680237_680588_680656_680984_681092_681569_681690_686249_686293_686521_686660_687098_687390_688385_688493_690313_690403_690585_690726_691085_691169_691266_691417_693321_693417_694223_694274_694924_695445_696385_696414_698784_698848_700552_700763_700853_700919_712239
902794	contig_5280_pilon	-	5335	4	Intergenic	novelGene_52642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	286	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATTGTGTGTATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287933	172533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_173275_207069_207349_283254_285652_286015
902795	contig_15105_pilon	-	1971	5	Intergenic	novelGene_151035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	839.069834697923	77	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	40	504	839916	835244	TRUE	65	TAAGGAACAAAGAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGAAHLVSCIYLS	839955	831496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_831513_832201_833639_835229_835282_836187_836548_839849
902796	contig_13481_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_119458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGATTGCTCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079900	1081783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1079900_1081800
902797	contig_15118_pilon	+	2435	11	Intergenic	novelGene_74614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	258.021627000529	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	38	1810	392042	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	392004	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394637_395081_395141_395233_395346_398644
902798	contig_13823_pilon	+	5896	1	Intergenic	novelGene_145261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2199	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1362	1667	243497	243802	NA	25	TTGTATCATCTACGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESFTSSLPIWMPLISFSCLIALARTSRTMLNRSGDKGHPCLIPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	242135	248031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_242100_248000
902799	SIRV3	+	1558	3	NIC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	2695	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	56	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6698	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_+_7989_8124_8208_8755
902800	contig_9133_pilon	-	4717	14	Intergenic	novelGene_109311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_12	137.265259549858	355	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	286	1863	913329	860888	FALSE	20	TTGTCTAACTTCAGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFSANPFEQDVEKATNEYNTAEDWGLIMDICDKVGSTPNGAKDCLKAIMKRVNHKVPHVALQALTLLGACVANCGKIFHLEVCSRDFATEVRGVIKNKAHPKVCEKLKSLMVEWSEEFQKDPQFSLISATIKSMKEEGITFPPAGSQTVSAAARNGASTNKSKEDEDIAKAIELSLQEQKQQHTETKSLYPSAEIQLNNKAARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGVGLFPSNFVTTNLNIESEAAAVDQLNVTDDDVEEIKKSEPEPVYIDEDKMDRALQVLQSIDPTDSKPDSQDLLDLEDICQQMGPMIDEKLEEIDRKHSELSELNVKVLEAVELYNKLVNEAPVYSVYSKLHPPAHYPPVSAGIPVQTYPVQSHGGNYMGQSIHQVTVAQSYSLGPDQIGPLRSLPPNVNSSVTTQPAQTPYLSTGQDTISSPAYMNQNSNLQSATGTAAYTQQMGMSVDMSSYQNTASNLPQVAGFPVAVPAHSATQQQTSYHQQPLL	913614	858033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_861117_862770_862941_865212_865367_871598_871654_872621_872710_872856_872940_874994_875090_883416_883604_884199_884270_886991_887139_888376_888476_888590_888667_889903_889989_913289
902801	contig_16411_pilon	+	6706	1	Intergenic	novelGene_77299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACATCAGTACAAAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87197	93903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_87200_93900
902802	contig_10641_pilon	+	942	10	Intergenic	novelGene_171399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_1	543.606270914692	55	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	168	374	202225	230185	TRUE	50	TAAGTACATTTCATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLRRRTFHPRWGEGRSRPNVTAASRPASGLDACRRLRGGVGKILQFPSVPRCQAMRGGGGGADGKNELGLAQMEHAPKSRQRSRPFSFSGGRAQELCPSRISKLKKMLCISWMYHLKLKLVI	202057	244621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_+_202345_229607_229652_230142_230186_234450_234547_234803_234906_235935_236046_236596_236657_243798_243859_244087_244169_244562
902804	contig_2100_pilon	-	1455	11	Intergenic	novelGene_50731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	876.208200144235	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	83	772	1182812	1173272	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGGKLGPSSPPVQGSRWWEMISQ	1185493	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173337_1175604_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
902805	contig_5485_pilon	-	3139	7	Intergenic	novelGene_37737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_6	57.3577951691544	19	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1378	1938	356011	352675	FALSE	35	AATGGGATGAATTTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIGYSRTVEAFLREAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEIAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTILANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPELITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL	357618	351473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_352833_354028_354096_354566_354705_355166_355263_355909_357086_357193_357315_357436
902806	contig_16622_pilon	-	4193	4	Intergenic	novelGene_48490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	831	junction_3	1218.53965421273	113	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	724	1080	115540	115058	FALSE	60	TAAACTGTTTAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQVPGTWGGERRQALASNETADELGAPKAAENI	121963	111944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_115292_115417_115559_118811_118884_121330
902807	contig_4131_pilon	+	1705	2	Intergenic	novelGene_127871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	188	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	17	328	214010	214321	TRUE	15	CACTCATCTCTCAGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVAIIMSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG	213993	235400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_214495_234196
902808	contig_2888_pilon	+	3898	10	Intergenic	novelGene_151489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_8	57.5199374988929	250	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	250	1518	63491	84985	FALSE	30	CCAGCCGGAAGTAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQAASHYRQNRSSLYRREESLGKEPEYVPWTATSGPSGIRTAIVRQHGIVLKMIYPQADSTLRNILTEQLVALVDCFLDGYVSQLKSLDKSSDQERYNNLEMEYLQKRTDLLSPLLTLGQHQWAASLAEKYCDFDILVQMCEQTDNQTRLQRYMTQFADQNFSDFLFRWYLEKGKRGKLLSQPISQHGQLASFLQAHEHLSWLHEINSEELEKAHATLLGLANMETRYFAKKKTLLGLSKLAALASDFSEDILQEKIEEMAEQERFLLHQETLPEQLLTEKQLNLSAMPVLTAPQLISLYICEENRRANEYDFKKALDLLEYINEEEDVNINDLKLEILCKALQRDNWSSSDGKDDPIELSKDSIFVKILQKLLKDGIQLSEYLPEVKDLLQADHLGNLKANPYFEFVLKANYEYYVQGQM	63241	87365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_63588_64154_64407_65343_65478_68033_68193_68820_68957_74130_74250_76573_76655_79515_79581_80892_80982_84848
902809	contig_11026_pilon	-	3011	5	Intergenic	novelGene_167681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	71.61878245265	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	547	657	264204	261219	FALSE	70	AAAAAGAAAGGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDRRIQPEKVKQAENTRTLELPGPSETDRRVADYVTCESTKTTLPLGTEEDVRVKVETLSDEEAHEEVSQPVSASQSSLSDQQTVPGSEQVQEDLLISPQSSSIGSVDEGVTEGLPTLQSTSSTNAHADDDDRLENVQYPYQLYIAPSTSSTERPSPNGPDRPFQCPTCGVRFTRIQNLKQHMLIHSGIKPFQCDRCGKKFTRAYSLKMHRLKHEVIS	281402	258864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_261230_262848_262933_264188_264353_266727_266813_281089
902810	contig_6914_pilon	+	2481	7	Intergenic	novelGene_151709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_4	72.472216898769	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	6	749	13603	17589	TRUE	20	TGTGGATTATTATTTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEEEPRRKIPLVPENLLKKRKAYQALKATQAKQALLEKKKQRKGKGLRFKRLESFLLDSRRQQRDRVRIRRLKVKPHGLEVPDGHSLAFAVRIQRINGVSGLVRKTIARLRLRKIFSGVFVKVTPVTLKVLRTVEPYVTWGFPNLKSVRELILKRGQAKVKNKTIPLTDNTVIEEHLGKFGVICLEDLIHEIAFPGKYFQVISQFLCPFYLSVARHATKNKVGFLKEMGLPGYRGESINQLIRQLN	13597	20483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_13617_14238_14348_15166_15331_16344_16483_17103_17214_17380_17596_18757
902812	contig_2917_pilon	+	2597	1	Intergenic	novelGene_147602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2177	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTTCAATGCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113998	116595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_114000_116600
902813	contig_15687_pilon	+	2482	24	Intergenic	novelGene_129131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	169.987011624368	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1566	917	2482	136562	164843	FALSE	30	GTATAGGGTTTAATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLQIVDRAIQVVRSALANQIDWTEIGLIVKEAQAQGDPVANAIKELKLQTNHVTMLLRNPYLLSEEEDDDIDGNIGVEKNETEPPKGKKKKQKNKQLQKPQKNKPLPVDVDLSLSAYANAKKYYDHKRYAAKKTQKTVEAAEKAFKSAEKKTKQTLKEVQTVTSIQKARKVYWFEKFLWFISSENYLIIGGRDQQQNEIIVKRYLTAGDIYVHADLHGATSCVIKNPTGEPIPPRTLTEAGTMALCYSAAWDARVITSAWWVYHHQVSKTAPTGEYLTTGSFMIRGKKNFLPPSYLMMGFSFLFKVDESCVWRHRSERKVRVQDEDMETLASCTSELISEEMEQLDGGDSSSEEGKDELHETPVEIELMTQIDQEGITVQSGGDELNEDLIQEESSEDEGESEEVVKDEELVGEMKDEEEEILNYPDTTIDLSHLQSQRSLQKLASKEESSNLSDSKLQSRRHLSAKERREMKKKKLPNDSGDLEEIEGKDKEKESALHSETHQNTSKNFPAGQPVKRGQK	112960	164843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_113043_113906_113976_114118_114222_122655_122782_125895_126045_129924_129993_131794_131882_133301_133388_134918_134954_136364_136443_136528_136738_136974_137167_137404_137469_140141_140231_151593_151698_152081_152145_157778_157892_159247_159306_159998_160058_160145_160267_161641_161922_162636_162680_162851_162902_164689
902814	contig_5428_pilon	-	3425	8	Intergenic	novelGene_160413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	87.199045117408	158	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	853	2325	176356	158372	FALSE	50	AATTCAGGTCAAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRAVWLISHEPGTPLCGTVRFSRRYPTVEKRAKVFNGASYVPVPEDVPLLKALLFELRLSDDDKDFVESRDSCSRINKTSVYGLPVGGEELWPVVAFLKNGMIYACVPLVEQTLSPRPPLISISGISQGFELLFGMQDFLYSSQKNDAELNTKLSQLPDLLLQTCPFGTLLDTNLQNSLDNTNFASVTQPQKQPAWKAGTYKGKPQVSISVTEKVKSMQYDKRDVADMWQVIGAVTCKCDLEGIMPNVTISLSLPTNGSPLQDILVHPCVTSLDSAILTSNSIDAMADSAFSGPYKFPFTPPLESFNLCYYTSQVPVPPILGFYQMQEEEVQLRITVNLKLHESVKNNFEFCEAHIPFYNRGPITHVEYKVSFGQLDVFREKSLLIWTIGQKFPKSMEIILSGTVTFEAKNHEKQPFDQICIGGTAYVKLHFKILDYTLTGCYADQHSVQVFASGKPKISTHRKLISSDYYIWNSKAPAPIAYRSLLL	177208	157271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_158455_162056_162154_165148_165268_165364_165451_166173_166314_167474_167703_169920_170567_176282
902815	contig_15471_pilon	+	2339	1	Intergenic	novelGene_175216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAACTAACTTGAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245152	247491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_245200_247500
902816	contig_8729_pilon	+	5667	9	Intergenic	novelGene_40128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_3	38.3957598570467	352	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	79	1554	566600	613153	FALSE	40	GAAAATCCAAGCACTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKSERRGIHVDQSELLCKKGCGYYGNSAWQGFCSKCWREEYHKARQKQIQEDWELAERLQREEEEAFASSQSSQGAQSLTFSKFEEKKTNEKTRKVTTVKKFFSASSRVGSKKEIPEAKAPSPSINRQTSIETDRVSKEFIEFLKTYHKTGQEIYKQTKLFLEAMHYKRELSIEEQSEFTQDFYQNVAERMQTRGKVPPERVEKIMDQIEKYIMTRLYKHVFCPETTDDEKKDLAIQKRIRALHWVTPQMLCVPVNEEIPEVSDMVVKAITDIIEMDSKRVPRDKLACITKCSKHIFNAIRITKNEPASADDFLPTLIYIVLKGNPPRLQSNIQYITRFCNPSRLMTGEDGYYFTNLCCAVAFIEKLDAQSLNLSQEDFDRYMSGQTSPRKQESEAWSPDACLGVKQMYKNLDLLSQLNERQERIMSEAKKLEKDLIDWTDGITKEVQDIVEKYPLEIKPPNQPLAAIDSENVENDKLPPPLQPQVYAG	530342	617266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_530414_566592_566779_576736_576904_594814_594982_600880_600963_601811_601945_603062_603155_609482_609740_612754
902817	contig_9668_pilon	-	8819	3	Intergenic	novelGene_58210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2020	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	1332	1997	541610	540945	TRUE	25	CATCCCCAGACATTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRSETVEERISEIEDKNLDTTLFEENSEKRKNKNEETVGIMWDTIKSKNFRAIRVPEQEEKTENTEKIIEELLTEPLPNIMKDEKLAVQEVQQTPYRINPKRKSARHIIITLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRTFPDKQKSRKYVKTKPNLQELLKEVL	598070	530024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_536626_540723_542237_597365
902818	contig_12765_pilon	+	2148	8	Intergenic	novelGene_106547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	84.1863821456624	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	8	580	10145	191784	TRUE	30	GAGGAATTTTGTAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIMLILFAWGTLLFYIGGHLVRDNDHPDHSSRELSKILAKLERLKQQNEDLRRMAESLRIPEGPIDQGLATGRVRALEEQLVKAKEQIENYKKQTGNGLGKDHEILRRRIENGAKELWFYLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQVK	10137	211802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_10315_73779_73896_74010_74174_87110_87226_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
902819	contig_19647_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_144018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	897	1217	98428	98748	NA	20	TTTGTAGAGAACTGTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNILKHNSENIPSPLSSLKIGLTEMLELRNWALGLDMRWLRANSASSGREAGEHHLGQVRRGFADDDRDGASGSELLDVYLGCLDMTYLAAISSTILFFFFLFLF	97531	99005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_97500_99000
902820	contig_7333_pilon	-	1935	4	Intergenic	novelGene_142819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.0420741312351	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	173	859	406076	395132	FALSE	40	AGCTCTTTAAACAATAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKVSRLDLRMKRIQIGIFLRKYNCIGHCSQDLKGKFLDIIIRVKAVRVNVDQADSGKRPQGTEEEN	407207	394055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_405120_405298_405761_406195_407153
902821	contig_12464_pilon	-	5537	7	Intergenic	novelGene_68693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	130.330882329895	68	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	1846	3036	357758	344383	TRUE	15	CCTTCAAGTCTTCTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQVILFNEL	377862	336461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_343318_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_376096
902822	contig_6110_pilon	+	2566	5	Intergenic	novelGene_163281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	424	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651431	753738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_+_651522_689959_690157_700645_701144_722620_722823_752159
902823	contig_1301_pilon	-	1565	13	Intergenic	novelGene_47318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	600.190311253208	2	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	96	797	322831	292242	TRUE	70	AAAGAGAAAGAGGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCRFLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETVMSILLAHKQLL	322926	269177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279423_283344_283451_284684_284864_292182_292280_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
902824	contig_9668_pilon	+	5921	4	Intergenic	novelGene_58254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	658	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1831	2331	631002	631502	TRUE	60	AACATTTTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCIGQICCKRPFKVLKSKDVTLKTKAGLTQAMVFSITSYACESWTINKEDRRRIDTFELCCWRRILTAKRTNKSVLEEVQPECSLEARMARLCLTCFGHVIRRDQSFAKDIMLGRGSSKKRKTLNEMDCHSGCNHGLKHNDCEDGEAQGSVLFCCIFGLYESKPT	613733	646278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_615319_630756_634598_644767_645019_646034
902825	contig_14546_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_157454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATATCGGTTGCATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536324	534628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_534600_536300
902826	contig_9646_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_117442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGAATTTCTAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198689	195418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_195400_198700
902827	contig_177_pilon	+	2020	2	Intergenic	novelGene_41844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	26	1102	417672	418748	TRUE	15	ACTAGTTTGTGGTATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	417646	420147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_419180_419660
902828	contig_15104_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_163359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTTCATGGAGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635988	633328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_633300_636000
902829	contig_11309_pilon	-	1031	8	Intergenic	novelGene_149871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2302	junction_7	1690.83161521791	11736	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	67	960	65730	56293	FALSE	20	CATCTGTGTTAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65796	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
902831	contig_12312_pilon	-	5062	22	Intergenic	novelGene_63941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	754.066340152824	24	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1066	3201	94	3294	326065	215838	TRUE	40	TTAAATGATGGAGATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326158	213831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214297_214534_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
902832	contig_2087_pilon	-	535	2	Intergenic	novelGene_65565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGGGTCCTGCAGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70417	69151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_-_69262_69992
902833	contig_11316_pilon	-	2753	2	Intergenic	novelGene_122645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2551	junction_1	0	270	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGATGGAAGTCATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	137672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138589_138689
902834	contig_4364_pilon	+	660	3	Intergenic	novelGene_430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	14526.5	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	285	659	1531103	1531759	FALSE	15	ATGCCCTGCCCCACGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEG	1530448	1531760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531337_1531618
902835	contig_10734_pilon	+	1670	9	Intergenic	novelGene_51182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	366.300423150179	25	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	219	1196	1129441	1142903	FALSE	30	CTGGTGTTAATGTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123690	1143377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
902836	contig_13044_pilon	+	1611	5	Intergenic	novelGene_99988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	784	1125	80390	91663	TRUE	5	GCCAGCCTCCGGCTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALILQPPLPITLDITVDGTDTFFDLLTTSFHPSSLFCPRLGLATVNFPFGEERGDGPDFVQVDRELLVTSLIVSDNFTEVLPETDFLSSFGNVTRTDGCFLLVTVVVTTAGE	77924	93243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_78632_80313_80463_90731_90890_91552_92006_93099
902837	contig_3382_pilon	-	5551	2	Intergenic	novelGene_124095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	429	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCCACTTCCCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588344	582754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_582927_582965
902838	contig_12427_pilon	+	3645	3	Intergenic	novelGene_40408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	355	1416	39918	40979	TRUE	45	CAGAAAAGTATGAACCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILASRVQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINIIHHINKRKEKNHMIISIAAEKAFDKVQHLFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIIRNGERLKTFPLKTGTRQECPLSLLLFNIVLEVLARAIGQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFVDDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSAGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSITPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNNVKMSILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKEMEELIINFLWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTCYTATVVKTAW	39563	68058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_41697_41800_43295_68040
902839	contig_4426_pilon	-	2918	1	Intergenic	novelGene_15340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1197	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTTTATCTTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9343	6425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_6400_9300
902841	contig_11656_pilon	+	3856	23	Intergenic	novelGene_53998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_5	138.766942975659	504	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	959	2509	520424	536519	FALSE	40	CATTAATATTCCAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQAEEEEQNSLEQAS	464931	537866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_507865_507931_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
902842	contig_5023_pilon	+	2237	13	Intergenic	novelGene_7200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2134.23610455826	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	100	1011	607279	630202	TRUE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKHSFVFVFVQ	580829	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_630172_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
902843	contig_10241_pilon	-	4132	2	Intergenic	novelGene_142836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1174	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTGTATGTGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122431	117180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_120953_122071
902844	contig_10855_pilon	-	2089	9	Intergenic	novelGene_124316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_8	48.0973946799616	104	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	50	1309	401138	320307	FALSE	20	CCCAGCACCCCCCTGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKAEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLAITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAAQCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSSSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTDFQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGMRRTLPSTSSSGSKRHKSGSMEEDVDTSPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEMDKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIAVHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPSWYLG	401187	319526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_320325_329068_329254_331357_331484_344244_344370_344949_345074_346212_346288_349770_349843_380500_381033_401135
902845	contig_19957_pilon	+	1869	3	Intergenic	novelGene_57699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCTCACTTACATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130525	372924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_132260_249791_249896_372893
902846	SIRV6	+	1043	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	8	486	8	20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	18	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	35	CATAAATTTGTGAACGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
902847	contig_8972_pilon	+	1955	3	Intergenic	novelGene_167632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	3	24	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1035	921	1955	384256	385290	FALSE	20	GTTCGATCAGCTATCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQQLSGAQKRKLTEDKKKRICESLKTIPKLTSSLKFNESEETSSIEHWSLMGANLCSNTSAEITNSSTIVTDFVPNAASIPCCSKKINSGVESETILESEMITSADPLNNRNTDPALWNNFSSNDINYWIERGPSDCQHHSGPFENSCRKFLGGKQTRFCSQNIFLGCKANGENYKREWLLYSPSVGSVYCFVCKLFSPKSFNSRFATDGFSDWSNSNMIHKHENSSVHRDCMLSYLNRRHGFGLTHELESQVNEERQYWKAILQRVVAVITTIAERGLSFRGRNEVFGSPQNGNFLGLLELVAQFDPFLAGHISKYGNTGKGNPSYISKTMCEELINLISDK	380604	385290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_380649_383142_384014_384250
902848	contig_7353_pilon	-	1137	3	Intergenic	novelGene_178788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGTAGCCCAGACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41301	13613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7353_pilon_-_14059_40377_40881_41112
902849	contig_14525_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_149775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTACCTTTAGAGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170604	172845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_170600_172800
902850	contig_5999_pilon	+	4527	1	Intergenic	novelGene_45603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATCAATTGATCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64335	68862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_64300_68900
902852	scaffold_8345_pilon	+	1636	5	Intergenic	novelGene_106993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACCTCGCGGAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131243	150853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_132502_133284_133356_138101_138240_147411_147512_150784
902853	contig_6735_pilon	-	3958	6	Intergenic	novelGene_15654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1120	junction_1	394.379309802124	4	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	1974	2828	545229	542771	FALSE	40	GAAGTGGAAAAGGCAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFHQYFSTYRPPSSPLPSSLLLDISLIPIAPSSLSLSPPSPKTTLILFAVSEASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGVA	548445	541640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545945_546577_546634_547243
902854	contig_10627_pilon	+	4011	2	Intergenic	novelGene_59974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0	172	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGCTTAGTGTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233007	239514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_236483_238978
902855	contig_11285_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_5723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840393	842512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_840400_842500
902856	contig_8377_pilon	+	4083	28	Intergenic	novelGene_34920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3451.22961964532	17	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	392	3283	128927	197939	FALSE	45	ACAAATATTATTTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68073	198739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68334_128714_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142374_169263_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185748_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
902857	contig_2069_pilon	-	2540	2	Intergenic	novelGene_23550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAGAACAAAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539198	1536387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1538681_1538951
902858	contig_6738_pilon	-	4089	3	Intergenic	novelGene_166130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCGCCACCACCACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40655	32690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_32748_36530_38970_39062
902859	contig_12312_pilon	-	4377	17	Intergenic	novelGene_63946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	11	junction_3	800.465089416772	2653	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	98	2053	326065	218747	TRUE	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENQAGTDSMRQGHRQGLR	326162	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218796_229509_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
902860	contig_5590_pilon	+	2725	1	Intergenic	novelGene_163006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTATTCTGTCAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259405	262130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_259400_262100
902861	contig_5686_pilon	+	2067	2	Intergenic	novelGene_45386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTCACATATTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163012	166435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_164429_165784
902862	contig_5820_pilon	-	3289	2	Intergenic	novelGene_178789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2278	2589	25597	16127	FALSE	55	CTGAGGAAAAATCAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSFFMTLGKFSVSSSSVILSVFFVFPHFSDSHLSTPIASSLSTLFCLCVCFWFLFLSPLSHSHLSSTHHNLLPPFRLPAPCTEHDTPKQHRHSLLEPALH	27874	15426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5820_pilon_-_16363_25521
902863	contig_9924_pilon	+	1683	13	Intergenic	novelGene_175911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	716.424275869792	4	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	863	1681	127463	171886	FALSE	30	AACCAATTTGTTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKITNGDEALSKSVPLTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKSQLNSDSDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTMSDGESGEEKKMKPKEHKEAKGRNRRKVSSDDSEDSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSGEEEKEEEEEEEEEEDDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAEREREREKLRE	15627	171888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99269_116829_116931_119585_119700_123901_124012_126980_127053_127360_127479_136325_136399_147476_147611_148061_148239_166286_166381_170996_171100_171664
902864	contig_2100_pilon	-	1125	8	Intergenic	novelGene_50684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	849.207505710531	150	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	94	792	1182812	1170252	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILESSETPSPTKLWAV	1185504	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170295_1175573_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
902865	contig_19098_pilon	-	2846	1	Intergenic	novelGene_65823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTATGGATTACACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368175	365329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_365300_368200
902866	contig_8866_pilon	-	3239	1	Intergenic	novelGene_77843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	3	617	639725	639111	NA	5	GGCTCCCCACTTCCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPWSNSFPTKFSHFLLVSLVQCLQCLGPANFLSEQQEGRSPASSTELESVEGPRPAPEDLLPVTHGPAEAWTCHGEGVVPPWPQPPPSLPARHRWESNALSGSRWARLGPASLKLFSPCCKARTKNQTKPIAVQLILTHSPTQVKFWWHFWNHHELRRVQHPAALGSVQPALSCPGEPEGQNEDLLGSAGSAVLRLDNYLHRFA	639727	636488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_636500_639700
902867	contig_15114_pilon	-	2110	4	Intergenic	novelGene_121087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACCCGTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31488	27086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_27223_27445_28314_29195_29346_30532
902868	contig_4091_pilon	+	2358	7	Intergenic	novelGene_173024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	125.197177816967	76	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1589	1888	62116	62415	FALSE	35	TAGGACAGGCAAGTCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDAEQNSNTHKKNQVYWSERDWGDPETMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKQD	11163	62885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21118_21311_21414_21461_25756_25821_26325_26378_26470_27502_62039
902869	contig_11316_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_122649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	185	385	137986	138186	NA	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137801	138863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137800_138900
902870	contig_12630_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_173069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCTAGGCATTTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70925	73057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_70900_73100
902871	contig_11258_pilon	+	2574	4	Intergenic	novelGene_67817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1346	1657	330208	330519	TRUE	20	AGGACTACAGGGCTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVGCHHLSLNVIPSTPIQTSPWPEPSLEVQCRSSVASATQAGIQSLGRPTWPGTEGAERFQLQGCECHPHLGHVWMTIDHRGGSPDREGPPPGHGNWGTLP	326455	360950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_326467_328873_330663_354744_355098_360529
902872	contig_12172_pilon	-	5219	7	Intergenic	novelGene_178790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	578	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCATTGTATTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110036	44120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12172_pilon_-_44701_45562_46687_51352_51489_53222_53595_79797_80190_107340_109532_109612
902873	contig_5502_pilon	-	3076	3	Intergenic	novelGene_154956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCCTCTTAGCTCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434048	266445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_267245_348294_348494_431970
902874	contig_6496_pilon	+	4907	2	Intergenic	novelGene_103537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_1	0	172	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	1134	3584	1231831	1234281	FALSE	20	ACATCCATTGTCATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETGHYRDDNRDKDAEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAITKLVPSTKKRALQDLASPCSPEPTGVATDVVLSESGKDQKSANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPAANIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKVPTVASEVDKKIKEESEDSAEKFEPTTLYQYLREEDLDDSPKGGVDILKSLENTVTTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGSVKPLPPAVQSVQMQPSYASGVKSLSSEHSALLHSPGSLTSPPHRSNVSAMEELVEKVTGKISVKKEEKPTAEKEKGSPAKSVSPVAKENKDFPKAEEVSSKQPPKKSPDAEAGKAKREGPGDAHTPNGTEPLKAKVTNGCSALGIITDHSPEPPFINPLSALQSIMNAHLGKVSKPASPSLDPLTMLYKISNSVLDRPTHPGVPGKQTDTIDRYYYESSDQPIDLTKSKSKPLVSGTADAVSSPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETPEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLSQIQEQQNVSKVLASKPLGPLGAADEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELEKQ	1145933	1235604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_1146315_1231078
902875	contig_12257_pilon	-	2522	4	Intergenic	novelGene_152099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	32.6904675198546	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	170	589	148314	118587	FALSE	30	AAGTACCATCACAGCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGTEPTEGYSLPAASTRLAAKAKARGGGRGGRRNTTSPVPSSGGAAPRCSPPPAAMSERLRPRKRRRNGNEEDNHLPPQTKRSSRNPVFQDSWDTETVPVTRNSKENRLRGSRVLYVSSSSESGGSSSSSSNNSPDRASGPESGLNQTITGSSPNTPQPAPEQSALCQGLYFHINQTLKEAHFHSLQHRGRPPT	148483	116653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_-_118821_121675_121739_138594_138695_148291
902876	contig_15518_pilon	+	1033	4	Intergenic	novelGene_127583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	293.647180586953	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	516	989	15096	16176	FALSE	10	CACTCATGCTTGTTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGEASIPLHLALF	11046	16220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11270_11338_11422_14886_15202_15808
902877	contig_11677_pilon	+	2357	7	Intergenic	novelGene_85894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	175.800707873685	436	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	901	1428	442156	443552	FALSE	5	TTATGTTTTCTGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRQQTTHLIFPPPPQNTKHYELLNYSEHGTTVDNVLYSCDFSEKTPPTPPSSIVAKVQSVIRRHRHQKQNEEPPSEETAMMSSQAQGPHRKPCNCKASSSSLIGGSGAGWEGTALLHHGSYIKLGCLQFVFSITEFATKQPKGDAGLLQDGVLAEKLSLKPHQGPVLRSNSIP	437623	444481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_438077_439298_439425_440168_440313_441225_441325_442077_442161_442713_442899_443214
902878	contig_5988_pilon	+	2856	9	Intergenic	novelGene_16074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	339	junction_7	1651.89424884736	2	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	87	611	1218380	1223396	TRUE	0	CTTTTTTCTTGTTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQALC	1209857	1226934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1223384_1223461_1224753
902879	contig_11538_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_152291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	147	467	184100	183780	TRUE	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRATWCYSQKCHAVPPQQRSKKLSQTESHLNPETLKSNEEIKNSVKHQMERGTDQEQRARRDTFRGPYQLLQHKSAILDSYQRSAYRRYEKAALQSLQQETEQPVTRDIRFPTPHPSLPLLGLLCFLQPQSLGQEALALPQCRLNSTCPHWLAP	184246	181433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_182696_182761
902880	contig_11304_pilon	+	2840	15	Intergenic	novelGene_156684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	169.056882710633	43	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2325	515	2839	447600	503868	FALSE	35	AGAAGGTAATACTTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSSTGKLKHEWFLQKDSEGDTPSLINWPSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILDSPSKTMSIKERLALLKKSGEEDWRNRLNKKQEYGKASAASSLHIQEPEQSFK	273686	503869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_273886_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_479856_479938_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491075_491299_503744
902881	contig_9833_pilon	-	3906	4	Intergenic	novelGene_68496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	641	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1487	1798	215579	215268	TRUE	60	TCAAAGACAAAAAAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	217694	212429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_213517_214246_215729_216089_216930_217197
902882	contig_14441_pilon	+	1212	6	Intergenic	novelGene_100498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	139	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	624	1172	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	95900	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_96004_96118_96448_121196_121239_125517_125902_126159_126283_126514
902883	contig_13888_pilon	+	4510	4	Intergenic	novelGene_151818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACACTGCCCGGCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361666	468604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_364841_367683_368474_447965_448073_468165
902884	contig_8978_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_49493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1769370	1768089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1768100_1769400
902885	contig_12765_pilon	+	1990	4	Intergenic	novelGene_106567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	388	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1476	1874	164193	164591	FALSE	25	AATAACATTGGCTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMGVPMSIHVTALISLGYIPRSGIAGSYGISISSFFFPLLSFIDLPNLCLKSGLWQWFQFWVSRVSGDHSFGGSSVSVRPFFHEFEFCSTFFSCSVQDSVVIPVRAVIGGSQAPSSSNGLRLVESLAHVVL	161882	164707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_162139_162617_163188_163364_163467_163645
902886	contig_11493_pilon	-	1932	2	Intergenic	novelGene_143718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGATGTGACAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326125	298658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_298753_324287
902887	contig_8140_pilon	-	1998	2	Intergenic	novelGene_86443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	508	837	636523	636194	FALSE	40	ATCCCTGAGAAATAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQNKTPDNLPVEEKALDLTDREFKSLTFRIIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDQKMEEFKKIIQEQNAKISSQLEIIQKQLEIQNINNKISEMDSVIEGLSSRF	637816	635032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_636950_637735
902888	contig_21007_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_161536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	25	447	589	1011	NA	30	TAAGCAAGAGTATTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	564	1394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1400
902889	contig_6102_pilon	-	3780	12	Intergenic	novelGene_32251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_6	158.827990538546	100	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	24	977	1311623	1308361	TRUE	20	GTTATGTCCCAGCGACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLKPQIMSLWGLVSKMPPEKLQRLYIDFPQHLRHLLGDWLENQPWEFLVGSDAFCCNMASALLSATVQRLQTTAGEQGEGSTILQHISTLESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKAVMEQFHHLPRPFHWKQEELKFNTALQRLQHRVRKICLLREALQQGPEAGQVSLHSLIETPVNGSGSKEALPKLLQESVGELEVVQTLVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRALLVSRLDEVLRTLVTSSFLVEKQPPPGFEDSDKVPGRGPVSAGLAVPGTPSQAPACQGGHGD	1311646	1303791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1306243_1306604_1306698_1307617_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507
902890	contig_14970_pilon	+	2039	9	Intergenic	novelGene_44965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4589.65932831621	63	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	133	666	136145	191948	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITMGWNRLDGNGFSYVIILSLSCTKKTSALKF	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191853_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
902891	contig_6958_pilon	+	5769	12	Intergenic	novelGene_69997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	248.782988177672	465	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	304	1254	737362	769290	FALSE	10	ATTTCCTTTTTATGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMAEGGITSEDYRTFLQQPSGNMDDSGFFSIQVISNALKVWGLDLILFNSPEYQRLRIDPINERSFICNYKEHWFTVRKLGKQWFNLNSLLTGPELISDTYLALFLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFEKQQQQQQQQQQQRQQQVDLPGPVSQPCERPTTSSGALGSDLGDAMSEEDMLQVAMSMSLETIRNNLETEGEK	728843	773805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_728985_735676_735728_737250_737416_737703_737749_739220_739307_739744_739812_743783_743872_750150_750284_750917_751082_752856_752954_758481_758604_769195
902892	contig_8484_pilon	-	3309	3	Intergenic	novelGene_178375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	8.5	60	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	33	410	46931	44496	FALSE	75	GGTAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSWGCCPENWMISNTSCYFISSEAKTWTESKKNCTGMQALLLVINAKEEQLLIIQKLNRNSAYYVGLSDPEGMHQWQRVDQSPYNRSVTFWHPYEPSNYKEHCVFINFRQGNWGWNDASCDVPQKSICKMMKIYL	46963	41596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_-_44638_45969_46086_46811
902893	contig_2704_pilon	+	3623	5	Intergenic	novelGene_75309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	105.366918432685	429	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	96	551	217418	321113	TRUE	35	TTTGTAGGGGATTAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGDFLSYLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMAYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNLLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDAWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDVFKIMLKCWDYKPENRPKFTDLQKELTAIKKKMS	217322	324767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_217453_315106_315262_319931_320055_320970_321604_322185
902894	contig_11227_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_163177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGGCCAAAATCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125871	127986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_125900_128000
902895	contig_7356_pilon	-	2620	2	Intergenic	novelGene_60428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	155	745	515889	515299	FALSE	40	CTAAATGAAGAGCTATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDAAKPYFVKRAKDRGTIDDDDFRRGHPQQDYLIVDDYAKGHSSKMEKGLPKKKVTPGNYGNTPRKGPYAVSNNLYAFKNPIYSQPAWINDSHKDQSKKRLSDELSGNSDNWREFKPGPRIPVISRPRKDSYQESEDGYRWQDGRGCRTVRRLFHKELTSLETMSEMEAGSSGNVFQFVKLQPRSQHVFSSFSFK	517091	513423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515921_516968
902896	contig_12528_pilon	-	1542	10	Intergenic	novelGene_81322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_9	480.57599185833	40	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	196	1071	966228	933323	FALSE	30	GGTTTATATTCTTCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968150	932851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_968000
902897	contig_17964_pilon	-	1772	1	Intergenic	novelGene_33940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAAAGTACAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701529	699757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_699800_701500
902898	contig_13428_pilon	+	2998	2	Intergenic	novelGene_143428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	704	junction_1	0	112	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCACCCCTAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40733	44134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_41310
902899	contig_2251_pilon	+	2957	11	Intergenic	novelGene_128470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCGAGTGCGGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65993	145197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_+_66350_70001_70071_76934_78871_79960_80015_81835_81917_85625_85719_89943_90059_93874_93968_109196_109290_137992_138040_145177
902900	contig_7322_pilon	+	5058	9	Intergenic	novelGene_164915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_3	103.26535902712	1162	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	77	1612	221528	236335	FALSE	60	ATAAAGAATAAAATGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPCFQIPPDSGKGFCSLCLPRKGSSMASVLSRRLGKRSLLGARVLGPTASDGPPGTVQPLEPQVELLERAAPQPFLAYKDSSCPEQPKEVLKAPGISGLQQVAFQPGQKVYVWYGGQEYTGLVEQHSWAEDKVTVWLLDQKLQICCKAEEVWLAELQGSISQVPPTEQGAQVPAYRPVSRNIDVPKRKSDAVEMDEMMAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSARKARGEAKKCRKVYGIEHRDQWCTACRWKKACQRFLD	221451	239781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_221780_222894_223128_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236223
902901	contig_5482_pilon	-	3597	3	Intergenic	novelGene_144450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_2	88.5	308	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	132	488	302713	291277	FALSE	35	ACCAAAGACCCAGCAGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSRSPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEPMKKKKGRVLQISEKASEIFF	302844	288167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_291462_293196_293311_302655
902902	contig_19865_pilon	+	2019	4	Intergenic	novelGene_170164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	96.5965262775473	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	28	432	79219	81192	FALSE	10	TTTGAACGTTGCCCGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFENKHQEDFPMRSPGDGNHSCLVLKRSCWFTNWMATTLSLVYQYLSHCGFRSSLSWQPPLDRREETTGGSVFAKISVSFCLKFSRF	79191	82779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_79369_79682_79754_79927_80052_81132
902903	contig_6743_pilon	+	4707	9	Intergenic	novelGene_33550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	394	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAGCAGAGATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210611	232694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_211902_211957_212842_215590_215690_215967_216159_216792_216898_222717_222862_226921_227010_227486_227549_230850
902904	contig_8263_pilon	+	1757	6	Intergenic	novelGene_83087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	229.529605933527	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1269	1694	192474	192899	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139444	192962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_187936_188098_188945_189005_189258_189386_192402
902905	contig_7119_pilon	+	2147	4	Intergenic	novelGene_40939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	148	996	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127510	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_138789_139094
902906	contig_15543_pilon	-	5765	1	Intergenic	novelGene_164349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	673	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGGACCGCCTGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60469	54704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_54700_60500
902907	contig_10225_pilon	+	1233	2	Intergenic	novelGene_86870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	175	1128	46299	47636	FALSE	20	CTTGATTCTGATCCTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	46124	47741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_46827_47210
902909	contig_8682_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_165288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACATAAAAAAACATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220705	223458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_220700_223500
902910	scaffold_4438_pilon	+	1584	4	Intergenic	novelGene_174537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	17.6635217326557	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	250	558	395636	419036	TRUE	30	AATCAGCGAGACATGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKVVVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFEKTEDIGGLWRFKASIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVSYERASTE	395386	422518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_413970_414114_419006_419363_421818
902911	contig_10940_pilon	-	4298	23	Intergenic	novelGene_49193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_18	82.3436158689923	425	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	1801	3636	421751	400258	FALSE	25	TGTGAAGCTGACAAGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQALIASARRLPAVNMFEQGHGKLDLLRAYQILNSYKPQASLSPSYIDLTECPYMWPYCSQPIYYGGMPTIVNVTILNGMGVTGRIVDKPDWQPYLPQNGDNIEVAFSFSSVLWPWSGYLAISISVTKKAASWEGIAQGHVMITVSSPAEMESKNSAEQTSTVKLPIKVKIIPTPPRSKRILWDQYHNLRYPPGYFPRDNLRMKNDPLDWNGDHIHTNFRDMYQHLRSMGYFVEVLGSPFTCFDANQYGTLLMVDNEEEYFPEEIAKLRRDVDSGLSLIVFSDWYNTSVMRKVKFYDENTRQWWMPDTGGANVPALNELLSVWNMAFSDGLYEGDFTLANHDMYYASGCSIAKFPEEGIVITQTFKDQGLEVLKQETAIIENVPILGLYQIPAEGGGRIVLYGDSNCLDDSHRQKDCFWLLDALLQYTSYGVTPPSLSHSGNRQRPPSGVGSITPERMEGNHLHRYSKVLEAHLGDPKPRALPACPHLSWAKPQPLNETAPSNLWKHQKLLSIDLDKVALPNFRSNRPQVRPLSPGESGAWDIPGGIMPGRYNQEVGQTIPVFAFLGAMVVLAFFVVQINKAKSRPKRRKPRVKRPQLMQQVHPAKTPSV	458418	399595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_400455_401669_401801_405355_405483_406695_406828_408819_408961_411133_411212_411884_412010_412777_412935_413529_413646_414423_414597_415145_415335_418409_418555_421626_421789_423983_424137_426124_426228_428768_428837_429970_430088_431881_431992_432323_432435_434200_434405_443614_443873_444579_445066_458265
902912	contig_11986_pilon	+	3936	9	Intergenic	novelGene_69218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1088	1723	742973	744492	TRUE	10	GGGGGATTATTCTGCCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWSLIPDQRDNSRQRCRANILRILCAERHPRPFEAAKRTAICLDTYHALSAQEIWNDLFVYVVQQAARTLVVISCINKELPSGVVVNEWTNLRPEHGEHAGGAQDEEAAQRLGVVGLHHLDDAQQGFDAGSPQVAHVQSFQVHQAGPRAAGLRSRASLRIQHEWHTVLCISPFLFEIITQSFTSSSKNTLVLGNCSFMNYVYSKRVIYS	741885	758681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_743255_744138_745359_747986_748076_751503_751695_753184_753293_755576_755811_756608_756741_757968_758101_758220
902913	contig_12948_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_126180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGAGTCCGCCCACTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173387	170935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_170900_173400
902914	contig_15371_pilon	+	2471	11	Intergenic	novelGene_151458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	690.95400715243	142	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	511	2004	180787	216652	FALSE	70	AATAGTATAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCLSCSYIEKFTDFLRLFVSVHLRRIESYSQFPVVEFLTLLFKYTFHQPTHEGYFSCLDIWTLFLDYLTSKIKSRLGDKEAVLNRYEDALVLLLTEVLNRIQFRYNQAQLEELDDETLDDDQQTEWQRYLRQSLEVVAKVMELLPTHAFSTLFPVLQDNLEVYLGLQQFIVTSGSGHRLNITAENDCRRLHCSLRDLSSLLQAVGRLAEYFIGDVFAARFSNALTVVERLVKVTLYGSQIKLYNIETAVPSVLKPDLIDVHAQSLAALQAYSHWLAQYYSEVHRQSTQQFVSLISTTMDAITPLISTKVQDKLLLSACHLLVSLATTVRPVFLISIPAVQKVFNRITDASAQRLVDKAQVLVCRALSNILLLPWPNLPENEQQWPMRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDSKYHDGKSREIDGHGFPYLADETGTRGSRGEFSCHSHSAVKRKSQTWDSRILLLHRIQLISWTIFPERRTTLLLF	180276	217119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_180810_180956_181084_186475_186586_195433_195543_196973_197067_198099_198170_205106_205267_208942_209036_212974_213120_215190_215338_216235
902915	contig_7165_pilon	-	1401	8	Intergenic	novelGene_116916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_7	28.9080173894329	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	94	576	1233001	1227502	FALSE	30	CTTCACTCTGCATACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPSPWLRRRRPPFTTGRKVAAAASTELSGATMGKIALQLKATLENVTSLRPVGEDFRWYLKMKCGNCGEISEKWQYIRLMDNVALKGGRGSASMVQKCKLCSRENSIEILSSTIKSYNAEDSEKFKTIVEFECRGLEPVDFQPQAGFAAEGVESGTVFSDINLQEKDWTDYDEKAQESVGIYEVTHQFVKC	1233094	1226676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1227580_1228037_1228104_1228838_1228917_1230701_1230734_1230938_1231021_1231363_1231421_1232685_1232770_1232995
902916	contig_17074_pilon	-	3691	17	Intergenic	novelGene_145142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	144.802653959622	226	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	21	2054	281636	239208	TRUE	30	TAACTTTCGTAATATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RISPGDMGRRRATGGEPRRRELRGQKVKDQNPARREEEEADVLEDEKPPKKTLLSKISQGKKRRGCSDPRGPADDGPTKKKVAKVTAKSRHLKVVKDEAVSDGEDFRNFPAAHKKAHHPKREATIDKDSSEGEDEDESEGDWEEVEELSEPVPGDVGENAVFSKSVLPMNPVEIEIETPEQAKTRERSEKVKMEFETYLRRMMKRFTKEVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNRICSQPDLRAIALSIIPTRFTKVPQRDVDVCYLSNLVKWFIGTFTVNADLSYNEQDGLQTTLERRFAIYSARDDEELVHIFLLILRALDLLTRLVMSLQPIPLKLSAAKGKKPSKQRSIEGPGSSSETPSHVPENHTKPKASKGTKQEETFSKDTGNPGAKGKRGKAATGRKKQRAPSSSEETGKGEEQQENQRKRRGRERHMTSRVSYKEESGSDKANSDSDFELSSGEAHSPSDEDSDPDFLRQKRAPAPKRTKAGSKSDSQTSRQSCPNPAASSSSSSNKRGKKIPSGVEEVEGGKAAGVDQWLEVFCDKEEKWVCVDCVHSVVGEPLTCYRYATKPVTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPAWMTMTRKCRVDAKWWAETLRPYQSPFVDREKKEELEFQTKHLDQPLPTAIGTYKNHPLYALKRHLLKYQAIYPETAAILGYCRGEAVYSS	281656	226654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_227622_231625_231716_232839_232934_233439_233610_233689_233825_237417_237500_239108_239212_246242_246404_247627_248498_249342_249433_257668_257790_258271_258430_260179_260265_261810_261935_264317_264437_267691_267891_281533
902917	contig_13004_pilon	-	3741	4	Intergenic	novelGene_112746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTGTCTACATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981002	949986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_950236_955077_955236_976473_979003_980197
902918	contig_3975_pilon	-	2320	6	Intergenic	novelGene_54939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAATGCCTAGTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2355428	2343609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2344935_2347067_2347163_2351503_2351633_2352981_2353058_2354277_2354530_2354985
902919	contig_4780_pilon	-	1341	11	Intergenic	novelGene_65396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	102.254633146865	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	253	1077	419847	312144	FALSE	35	AGCGCAAATATATTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRLLRLGGGMPGLGQGPPTDAPAVDTAEQVYISSLALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVRVIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAKMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALSERAVAVVVDPIQSVKGKALIHGLNRHYYSITINYRKNELEQKMLLNLHKKSWMEGLTLQDYSEHCKHNESVVKEMLELAKNYNKAVEEEDKMTPEQLAIKNVGKQDPKRHLEEHVDVLMTSNIVQCLAAMLDTVVFK	428861	311879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4780_pilon_-_312243_314879_314943_329020_329147_332797_332873_357470_357622_358602_358674_361664_361785_362008_362081_419799_419852_422134_422262_428740
902920	contig_10311_pilon	-	3490	8	Intergenic	novelGene_50414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_7	958.497250696024	186	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	232	807	70321	68584	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVSFFSPCCTAGDVVKCRYC	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70493_71497
902921	contig_11815_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_50960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	978	1343	501134	500769	NA	0	CCCTTGTTGTTCGCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFWGIQ	502111	500661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_500700_502100
902922	contig_3077_pilon	+	2635	5	Intergenic	novelGene_26759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_4	2811.39387137413	2	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	213	1010	11934	16408	FALSE	15	CACTTCCCTTTCCTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSQTWGHQVSQQLRPTTTLPSSVPRRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	11721	18033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144
902923	contig_5084_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_64592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTTACAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916624	915819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_915800_916600
902924	contig_10732_pilon	+	4325	1	Intergenic	novelGene_114683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	395	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATAGAGAAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65430	69755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_65400_69800
902925	contig_12951_pilon	-	2393	2	Intergenic	novelGene_68149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195066	192300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_193222_193594
902926	contig_6361_pilon	+	5131	5	Intergenic	novelGene_24016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3830	4297	426566	427033	TRUE	40	GACAGATACCCAATATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTPLTLTTSDPLAKFFLPVPVTLCFVGLEVLLAKGGMSPPGNTSLIPFNWKLRMPPGHFGVIMPLDQQAKKGVTILGCVIHPDYQEETGLVLHNGGKEEYVWNAGDPLGHLLVLPCPVTKANGKLEQPNSDVTTNGPNPSGMKVWVTQPGKEP	414648	427932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_415503_419464_419589_420868_422161_425006_427416_427480
902927	contig_8674_pilon	+	2836	5	Intergenic	novelGene_102936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_4	853.853141646735	83	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	42	857	455950	476156	TRUE	25	TCATTGACTTAATGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDSEYIRPTKHSMRVESCGKSNERHGSIVQTSKESLNILTSHGKTLKIHHSEEAKVHKSSKNAKGTVGGKQPDKIWMDKTKTGRHLTNINNEGELSQLTQQAKDQRKQYLNRVAFKCTESESICLSKLDNSPRKPNNDTERSQENKPKSFIPVKDATEKPTVLEFKLCPEVLLENRNFGEEWKKLKPAPGKEQAPVQVSGIKSTKEAWLKCVNTEKRMQEANQKIDKNVLPKSKLPKRSVSADGLETQQNTVKDSKAMFQTYKKMYMEKRSRSLGEWRPVVVP	455908	478309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_456506_457759_457844_460249_460397_476127_476227_476400
902928	contig_7412_pilon	-	4430	12	Intergenic	novelGene_76294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_11	63.3360445990634	414	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	1119	3266	311237	288581	FALSE	15	ACCAGCTCCCCCTGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIYNAIVFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHMEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIVVRPPFLRPDMSDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTGLRTHLSLAATEDNSLLGKDSPPMPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRGDSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLEPESFRSPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSLANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPEPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPRLVPTGPSHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLRQSPPLPGHEEEPGLGDSGIQSTPGSGHAPRTSSSSDDSKRSPLGKTPLGRPAAPRFGKPDGLRSRGLGSPEPGPPVPYLGRSMSYSSQKAPPGVSETEEVALQPLLTPKDEVQLKTAYSKSNGQPKSIGSASPGPGQPPLSSPTRGGVKKVSGVGGTTYEISV	315627	287416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_288747_289375_290236_290687_290801_291236_291361_291824_291958_292383_292476_293121_293225_293377_293551_294321_294480_303688_303811_311133_312333_315604
902929	contig_9609_pilon	+	2923	15	Intergenic	novelGene_23094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGATCCGCCTCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476625	487413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_477134_477276_477373_477447_477576_477648_477787_478080_478187_478264_478444_478527_478580_478748_478906_478987_479117_479224_479307_479391_479511_482482_482654_482770_482861_483224_484135_487355
902930	scaffold_9100_pilon	+	1031	6	Intergenic	novelGene_83245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	581.96687190939	78	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	172	801	647136	654618	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPPGSPLTSASRCHLRPIPPSGPSPGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPIRRMCVLCVV	644768	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_654580
902931	contig_18822_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_111719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCATGATTCCCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133485	132211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_132200_133500
902932	contig_12593_pilon	-	3808	5	Intergenic	novelGene_178791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2776	3144	1264	850	FALSE	30	GAGTGAGACTTCCGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKISIQDAHRIPHKVNPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILSADRDKQKVIYKGESIRISSDYSAENMQPRKQWDDIYKTLKEKYDGEIRPFPDKQKFREFAKTKPKLQEILKGFLWLENQ	59712	185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12593_pilon_-_964_1009_1309_1414_2820_52667_53701_59419
902934	contig_16098_pilon	-	722	5	Intergenic	novelGene_45983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1334.57041309179	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	137	598	349429	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349677	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604
902935	contig_5669_pilon	+	3879	8	Intergenic	novelGene_86067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	243.866306631736	3	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	837	2015	186087	189257	TRUE	20	GACTGATTACTCTGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	185250	192910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_189011_190096_191884
902936	contig_12427_pilon	+	3912	2	Intergenic	novelGene_40582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGATCAAAGATTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556152	569904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_557904_567743
902937	contig_1262_pilon	+	3417	13	Intergenic	novelGene_133541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.097190093262	201	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	1181	2431	165952	293265	FALSE	75	TGATTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNKKKDKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTNEYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDLFDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDFGLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGSLPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRATPIEVLCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYDYLRKLFTDLFDRKGYLFDYEYDWIGKQLPTPVGAVQQDPALSSNREAHQHRDKMQQSKNQVVSSTNGELNTDDPTAGRSNAPITAPTEVEVMDETKCCCFFKRRKRKTVQRHK	125362	294251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_125667_126095_126721_165700_166130_171951_171993_195456_195527_221439_221589_223101_223337_260782_260869_260990_261076_262795_262945_264398_264495_278065_278173_293210
902938	contig_7457_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_31460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGTACCCAAAGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484237	486572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_484200_486600
902939	contig_1699_pilon	+	2057	7	Intergenic	novelGene_72828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_6	112.915036888607	15	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1350	1889	99093	101858	FALSE	70	ATTCTGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVILEEQKTILPVTSCFSQPLPVSISNASCLPVTTSASVGNLILKTHVMSEDKNDFLKPVANGKMVNS	97147	102026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_101662
902940	contig_12842_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_168343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTCATTGTAGAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153469	155309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_153500_155300
902941	contig_3900_pilon	-	3381	3	Intergenic	novelGene_84192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	581	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1163	1501	423367	423029	TRUE	65	CAGAAGAAAGGAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVHMSIRVTTLTSLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKCPNIFENGCITLHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVILIRASNAGVRWYLIVVLICISLMANEHEHFLMCLLAI	424529	268912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_269183_343337_343584_421664
902942	contig_1154_pilon	-	2743	19	Intergenic	novelGene_87238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	20	junction_2	30.3897013907225	688	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	390	1703	1870016	1856525	TRUE	15	CACCTGCCTGTGCTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTWLRPPDLERRSQVWEHFQSLLSTYSRLREQEQCFAVEAVERLIHPRLCELCIEALERHVIQAVNSSPERAGEEALHAFLLVHSKLLALYSSHSASSLRPADLLALILLVQDLYPSESTVGADDAQPSPQRPWSSQNIPVQQPWGPGSVRQARRSSTETETDSFCFPEEYFTPAPSPSEQSSGSIVWLDEGTPPTDTYQIQVAEDTLQMLVPHSPTASSPRRIFLDASIKESYCPLVPHTFYCLPLWPGINMVLLTKSPSAPLALVLYQLLDGFSLLEKKLKEGHEAGGTLRSHPLVADLRQRMDKFVKNRGGQEIQSTWLELKTKAFSRSEPGSSWELLQACGKVKQQLCAIYRLSLLSTAPSRGRPPPAPAPPGPSPKAHARKAGRLEGLFVSEEPAEHHHGVIPRRLPRFGAFHLRGPHDWADGGSFPQHP	1880493	1850285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1851074_1851623_1851707_1853356_1853471_1856469_1856612_1857691_1857761_1857838_1857975_1858388_1858451_1859840_1860021_1860112_1860281_1861540_1861597_1864160_1864231_1864370_1864470_1865167_1865271_1865768_1865930_1868432_1868542_1870002_1870141_1875484_1875602_1878694_1878812_1880462
902943	contig_10126_pilon	+	3671	6	Intergenic	novelGene_105750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1035.51977286771	3	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	373	783	165618	166639	TRUE	25	AACAATGACCCCTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	161945	186770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162305_165604_165724_166334_166667_169472_169588_181512_181563_184074
902944	contig_4426_pilon	-	2258	7	Intergenic	novelGene_15417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	806.66095039297	12	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	127	1749	904506	820377	FALSE	60	CAGATGGAAAAGAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNEIQTQIPAYLLIIPEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIF	904632	819867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_820383_821017_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890167_904482
902945	contig_9235_pilon	+	2688	3	Intergenic	novelGene_156198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6.5	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	409	1320	45805	46953	FALSE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43687	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_43935_45643_46423_46659
902946	contig_19209_pilon	-	2487	4	Intergenic	novelGene_169567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	154	junction_3	121.420298504364	562	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	50	832	191489	186440	FALSE	10	TGTGAATGCCTCTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEDKDGIKYQVSLTESMKMESGSPLRPGLAAMGTQPATHHPIPTYPSYVPAAAHDYGSGLFHPGGFLGGPASSFTPKQRSKARSCSEGRECVNCGATATPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTCCANCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNVNRPLTMKKEGIQTRNRKMSNKSKKSKKGTECFEELSKCMQEKSSPFSAAALAGHMAPVGHLPPFSHSGHILPTPTPIHPSSSLSFGHPHPSSMVTAMG	191538	184784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19209_pilon_-_186740_187270_187397_189397_189544_191278
902947	contig_8674_pilon	+	4958	2	Intergenic	novelGene_102919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1477	junction_1	0	147	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCAGCACCATTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427065	434341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_427728_430045
902948	contig_3975_pilon	-	4008	11	Intergenic	novelGene_54734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	192	junction_10	339.098584485397	89	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	108	1241	1731202	1720421	TRUE	35	TATGATGTGACACAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLVRYQHHALLE	1731309	1717010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
902949	contig_19311_pilon	-	2865	9	Intergenic	novelGene_144074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_7	26.8188366638078	264	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	392	1504	164618	95818	FALSE	75	TTAAAAAGAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPKKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEEFRRKLLKAGGDPNRSVHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKADSSLLTITSGQQDKKAPSKRPPVSDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKVESETSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENMSSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEAEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS	202994	94456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19311_pilon_-_95950_105459_105532_106862_106935_113333_113434_116025_116156_117990_118067_164087_164781_193126_193271_202909
902950	contig_5020_pilon	-	3578	2	Intergenic	novelGene_27786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGAACATTGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33898	30043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_32514_32790
902951	contig_12142_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_147825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGATATTTTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142801	141453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_141500_142800
902952	contig_11594_pilon	-	3269	2	Intergenic	novelGene_80892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGCCCATAGAAGCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103618	100220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_103343_103471
902953	contig_7297_pilon	+	4395	5	Intergenic	novelGene_169695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3926	4264	151318	151656	FALSE	35	CTCCAGAACATTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPAWVCGIQAASVSRSRGQEIVTVGSRGGRVRVKKCGGWESVYHKLPVVLSPAGRSVRLLSRTPCLLVSDRSPRWWIHAALAGRGPLHESLLGLRSLSVFSLHLVLG	126652	151787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_+_127081_143439_144697_148035_148798_149564_151013_151287
902954	contig_11364_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_65175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	587	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	45	458	133835	134248	NA	25	CAGCAATGCTGAGGGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNTGNNKCWRGCGEMGTLTHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDLAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWIDKLWYIHTMEYHATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	133790	136473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_133800_136500
902955	contig_15112_pilon	+	2290	2	Intergenic	novelGene_124769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATGTTCAAAAAGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71979	75867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_74207_75804
902956	contig_7151_pilon	+	4265	6	Intergenic	novelGene_40744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_2	113.325019302888	14	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502283	509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503041_503212_503293_503387_504052_504143_505033_506685_507738
902957	contig_5684_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_81078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGACAAAAGAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455887	453807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_453800_455900
902958	contig_12410_pilon	+	5352	7	Intergenic	novelGene_167266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	3960	4622	64136	105562	TRUE	20	TGTCACTGTTCATGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGILLCICGNCVRRSQAMQYCPASMSSQFEKRKRKTKKQFRTNKKSPGIPPARQPRPGSSRTPERSPTAPQERAKTAHGATHPSKRRGRQREASEKPREAEKATPAANKRHPESRPPGRAESKQPAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRGGGLESAHRKVPAVLSPSGCSVRLLSHTPVCWFSDRSPRWWIHAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	39886	119934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_40782_41268_41351_41457_44247_44756_44928_64113_64297_105060_105690_119331
902959	contig_1532_pilon	-	1893	8	Intergenic	novelGene_37433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1353.65077038476	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	588	1352	27321	13113	FALSE	50	AAACCAGTGAACCCAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	34930	12571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27458_28815_28964_29438_29505_32049_32227_34870
902960	contig_9653_pilon	+	6853	2	Intergenic	novelGene_48205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCGTGTGTTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190717	199387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_192229_194045
902961	contig_11629_pilon	+	1725	8	Intergenic	novelGene_161183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_5	197.3658159513	378	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	301	1665	164886	423756	FALSE	55	TGATAAGCAAAGAAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDFLPPPPPPLDDPSALPPGSGNFPPPPPLEEGAFRVQQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPPQGSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31461	423816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
902962	contig_10990_pilon	-	1789	6	Intergenic	novelGene_7503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1224	1553	751051	749304	TRUE	5	CCGCCTTGCCCCTGGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWVLQEATSP	753006	744362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_744391_744703_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
902963	contig_3147_pilon	-	2154	3	Intergenic	novelGene_142283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_1	113	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1731	2144	213403	212990	FALSE	5	CGTTCACGCTCTTCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLTPTKMRSTSTSGQVGCSGRAVVTAVGQSALRIHARSRLTVSVVHGEALVAQCLSTQLLIRRLAVRTHQLLHRRKMWQSASIKITDLETLWGSSTLSYRVTMSRNQLKGKLGFVLFCGTWILWGKNAKTILLTF	221346	212979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_214655_219342_219429_220953
902964	contig_6227_pilon	-	4729	10	Intergenic	novelGene_49785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	68.6521020152414	66	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	1719	3380	1254536	1243877	FALSE	10	TCCCCAGTTCTTTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVVVDTAQIENKEAYAPQISLEGSRIVVQVPSTWCLKEDPATMSLLQRSLDPEKTLGLVDVLYTAVLDLNRWRAGREQALPCIQIQLQREICDFGNQADLPSGNGNKSSGLQKTFAKLTSRFTKKASCTSSSSSTNYSIPNTPSKNIFIAGCSEEKPKMSSNIDTRLQSILNIGNFPRTTDPSQSAQNAGNQMANGFLMERHENFLHGDDSKDEKGMNLPTDQEMQEVIDFLSGFNMGQSHQGSPLMTRRNSAATAMVTEQKAGAVQPQQPPLPVPPPRPPQAGTHTPLTPQLGLAPQQQSPKQQQPQVQYYQHLLQPIGPQQPPPQPRAPGKWVHGSSQQPAQAQPVGAGLSPLGQWPGVSDLSSDLYSLGLVSSYMDNVMSEVLGQKPQGPRNNTWPNRDQSDGVFGMLGETLPFDPAGMCGPLGVLT	1308730	1242527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1244943_1246112_1246239_1250370_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1292061_1308695
902965	contig_12301_pilon	-	4875	6	Intergenic	novelGene_110033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	161	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	3998	4585	214621	214034	FALSE	45	CCCGATCCAAATACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKKIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFNKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLRTGTRQGCPLSPLLFNVVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEIKLSLFVDDMILYIENPKDSRRKLLELIERFSRVAE	312465	213743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_215508_216638_217650_271342_271599_300963_301114_310616_311141_311295
902966	contig_12948_pilon	-	5655	3	Intergenic	novelGene_126165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTGGAAATTTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172547	40637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_41426_109233_109997_168443
902967	contig_6137_pilon	-	3559	1	Intergenic	novelGene_59206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAATAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309608	1306049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1306000_1309600
902968	contig_6919_pilon	+	3141	2	Intergenic	novelGene_163997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2307	2714	95234	95641	TRUE	45	ATAAGAACCACATGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEKNFLEFLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHTIEEIKKIREDHNDKFNRLQESIQRQQSEIQKINNNISELDNSVESYRSRIEATEVRISEIEDKALDTNLYEEKSDKRIKKKKKKP	92927	96149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_95995_96075
902969	contig_10861_pilon	+	2603	7	Intergenic	novelGene_39274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	321.527819774415	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	188	865	1339531	1345502	TRUE	50	AAATAATGATTAACTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCMFHLISTLDVQEDLLMFTFEDVRDAEDALHNLDRKWICGRQIEIQFAQGDRKTPNQMKAKEGRNVYSSSRYDDYDRYRRSRSRSYERRRSRSRSFDYNYRRSYSPRNSRPTGRPRRSRSHSDNDRFKHRNRSFSRSKSNSRSRSKSQPKKEMKAKSRSRSASHTKTRGTSKTDSKTHYKSGSRYEKESRKKEPPRSKSQSRSQSRSRSKSRSRSWTSPKSSGH	1337627	1347289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339587_1343172_1343280_1344610_1344774_1345017_1345072_1345204_1345691_1345739
902970	contig_10377_pilon	-	4620	4	Intergenic	novelGene_115404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	503	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATGGTCATGAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282964	231015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_234605_267573_267930_280182_280636_282742
902971	contig_12528_pilon	+	3430	15	Intergenic	novelGene_81355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	232.516238186515	291	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	847	3417	1010506	1061722	FALSE	40	TTAATGAAAAGAAGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVFPLEDWIALVKAAAAAAAKNKTGSKPRTSANSNKDKDERKWFKVPSKKEETSTPSATPEVEKKEDLPTSSETFGLHVEHVPKMVFPQPESTLSNKRKNNQGNSFQAKRARLNKITGLLASKAVGVDGAEKKEDSSETAPMLEQAISPKPQSQKNNEADISSSANTQKPALLSSTLSSGKARSKKCKHESGESSGCIKPPKSPLAPELTQVEDLTLVSQLSSSVINKTSPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEVPDVAHLSLEKLGPCLPLDLSRGLEVTAPVVPDPSYRNEFPRVEKEEAQMLTYPSSKAVADGRGAPTASGISKTEKKVKLEEKSSTTFGKRKEKDKERKEKRDKGPYKPKQKKKKKKKKKSKQHDYSDYEDSSLEFLERCSSPLTRSSGSSLALRSMFTEKNTTYQYPRAILSVDLSGENLSDVDFLDDSSTESLLLSGDEYNQDFDSTNFEESQDEDDAINEIVRCICEMDEENGFMIQCEECLCWQHSVCMGLLEDSIPEQYICYVCRDPPGQRWSAKYRCDKEWLNNGRMCGLSFLKENYSHLNAKKIISTHHLLADVYGVTEVLHGLQLKIGILKNKHHPDLHLWACSGKRKDQDQVIAGVEKKMTVQGMVNLEEKTYHVQNHKEPPCLPPKMEGTYITSEHSYQKPQSFGQDCKSLADPGSSDDDDVSSFEDEQEFHMREKNRLQFSVKEDGMPEKNPAEGNTVFVYNDKKGTEDPGDSHLQWQLNLLTHIENVQKEVTSRMDLIEKEVDVLESWLDFTGELEPPDPLARLPQLKRHIKQLLIDMGKVQQIATLCSV	1009659	1061735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1010738_1011285_1011412_1016764_1016848_1020325_1020579_1022683_1022873_1023140_1023348_1037916_1037974_1039168_1039277_1046916_1047082_1050164_1050347_1052035_1052136_1053581_1053778_1058457_1058825_1060064_1060228_1061579
902973	contig_10042_pilon	+	2909	2	Intergenic	novelGene_79141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1258	1584	94573	94899	FALSE	10	TGCTCTGTAGGGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRGRGRESGPILLQGENSPGWSSEGQLRRGQESRQVEPRERDGRKIMLGLTWDCEVAWNLRQETHLVSLPYGLGDSSLWADLFNKKMGMKIQYFSSFEWKGAWHCG	87599	96224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_87607_93322
902974	contig_11386_pilon	+	5017	3	Intergenic	novelGene_82783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	384	612	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	107	736	17940	20925	FALSE	5	CTTTCACTGTTGCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYRFFRYYCLEQESHPDLGGDNHASFDHRHHDPENPPS	17833	25206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_20050_20816
902975	contig_9706_pilon	-	3672	2	Intergenic	novelGene_20978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	637	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1021	1389	404839	404471	TRUE	35	AGCCAGGCAATGAGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSDASICPSPPAVKENEEHQRYKESISPRDRKGHINQRLHHPETRRTRWCLATTSDHPDREHNRESLIEQEKGRVQDSNSSKKTRLNGLTETGGTPESTAPGLCHPRTKTISEANSSDKD	405859	359790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_361788_404184
902976	contig_8050_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_114837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAGAAGAGAGCGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334331	336599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_334300_336600
902977	contig_10674_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_6455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTTAGGACTTATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311906	308578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_308600_311900
902978	contig_7321_pilon	-	2254	11	Intergenic	novelGene_53117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	150.653542938757	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	40	1242	208319	117035	TRUE	85	AAAAAAAAAAAATTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYIKETNIKNDPNELNNLIKKNCDVVTWTPRPGATLDLGRMLKDPTDSKGITEPPEGTKIYKDSWDFGPYLKILNAAIGDEIFLHSSWIKEYFTWAGFKDYNLVVRMIETDEDFNPYPGGYDYLVDFLDLSFPKKRPSREHPYEEIRSRVDVIRHVVKNGLLWDDLYIGFQTRLQRDPDIYHHLFWNHFQIKLPLTPPNWRSFLMHCR	208358	113471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_114463_117013_117111_119336_119453_126174_126292_128642_128818_142773_142915_169480_169617_173563_173702_203985_204078_207655_207860_208311
902979	contig_16103_pilon	+	3949	6	Intergenic	novelGene_118795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAACAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588870	611114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_589420_589795_589876_590287_590371_590564_590606_590749_593240_610408
902980	contig_5799_pilon	-	3194	2	Intergenic	novelGene_50248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1932	2252	170855	170535	FALSE	70	TAAGATATACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQESSKENGRKTQSLYQKELVDVQPFQEVAYDQGLMILKEEVQAALKALAKNKSPRIDRIPIEMFWQMDAVLEALTHLCQEIWKTASYLANQLKETHIFAHSRER	306742	169592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_171384_305339
902981	contig_14525_pilon	-	1509	16	Intergenic	novelGene_149759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	280.088287668172	4	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	5	772	157408	145193	TRUE	25	GTAATGTTTTTCATTGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASGATGGASVPALWSEINRYGQNGDFTRALKTVNKILQINKDDVTALHCKVVCLIQNGSFKEALNVINTHTKVLANNSLSFEKAYCEYRLNRIENALKTIEGANQQTDKLKELYGQVLYRLERYDECLAVYRDLVRNSQDDYDEERKTNLSAVVAAQSNWEKVVPENLGLQEGTHELCYNAACALIGQGQLNQAMKFLQKAEDLCRRSLSEDSDGTEEDPQAELAIIHGQMAYILQLQGHTEEALQLYNQMWDC	157412	134605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137069_138539_138605_140186_140233_141309_141353_142242_142375_145157_145208_145317_145429_146713_146746_148423_148536_148614_148759_153473_153598_155326_155448_157299
902982	contig_5769_pilon	+	4099	1	Intergenic	novelGene_138776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGCAGAAATTAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299427	303526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_299400_303500
902983	contig_17144_pilon	-	1448	8	Intergenic	novelGene_29129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	1015	1446	12299	11868	FALSE	20	GTCATCTCGCAGCTTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFS	22379	11865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_12356_13328_13501_14252_14365_15440_15526_17462_17651_19969_20171_20622_20765_22321
902984	contig_6210_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_171886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78513	80077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_78500_80100
902985	contig_3975_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_54811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAACATTAATTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2037357	2034333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2034300_2037400
902986	contig_9345_pilon	-	2516	4	Intergenic	novelGene_24441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	120	497	555456	555079	TRUE	30	ACTCTATGTATCTTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGNNREKKTKQRNKNQKTRKKKCPQGCPCVSAQSKRVASKPHEGAPRPRIEKEIKQIKTEHIRANKQKSPRGPTSVMARAGKQFHSQAVFCSLSGRSKDGMQSQVFERKEGEVVRDKEEI	555575	361792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_362391_362498_362769_549449_550093_554570
902987	contig_5419_pilon	+	2005	7	Intergenic	novelGene_15553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	42.971566826863	20	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1186	1932	607255	608001	FALSE	25	CCTCTTGAATCTGAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLGLDLGPNTYYNLGPELELALSLLEEPHVGGEGEGGGSSLPKMGKMLALQSVPWPQGVLYFNLLHVAKDWNNNSKKNLGLFLEILVKGHRDTEVNFQPEDTCARLRHLLHASLLVVTLNPEQCHPSPRKRRSAIPVPKASCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPRGFMANYCHGECPFSLTTSLNSSNYAFMQALMSAAHPDVPHAVCIPTRLSPISMLYHDNDDNVILRHYEDMVVDECGCG	539319	608074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539733_540053_540147_541812_541927_550898_551051_586830_586980_588112_588276_607153
902988	contig_9594_pilon	-	3449	2	Intergenic	novelGene_73913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1996	2865	113553	112684	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHDDITIINIYAPNDRAPKYIKPTLTTLKIEIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILAHRAILKKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKIKEKQSATWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLDSNENENTSYQNLWDRAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQPK	115816	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_114919_115186
902989	SIRV6	+	1317	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	200	11	-65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	12	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	50	CAGTTAAATAAAACTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
902990	contig_6612_pilon	-	3721	10	Intergenic	novelGene_148163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_6	245.487270545745	256	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	1189	2400	50271	19223	FALSE	40	AGCCCAGCAAAGGAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYAIPETYDTERIKLPQEQYQLPQTLVTIPPPPHSLHQTPQMLLLTPSSSFFTQNMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVGTAWGISFFQCGGLLHLCFKKTRLLLLHREFCR	72768	17901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_50106_50275_60837_61004_61951_62141_64167_64576_71390_71525_72480
902991	contig_7286_pilon	+	856	6	Intergenic	novelGene_108704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	228	326	288412	288510	TRUE	30	TGAAGGAGAGTTTTAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCIIFNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286885	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290857_291315_291499_292022
902992	contig_14682_pilon	+	1172	11	Intergenic	novelGene_139129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	345.025854103718	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	390	998	158662	174580	FALSE	30	TGAGTGTAAAGAGATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYSNELEAIIEEDDGDGGWVDTYHNTGIAGITEAVKEITLESKDSMKLHDCSVLCEEEEEDEGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIAEACKSKTDAGGEDAILQTRTYDLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENHPHLPPPPMCSVHPCRPVDILKFVQAVIPTIEYDYTRHFTM	142410	174754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_142607_146013_146056_151306_151361_157167_157239_158635_158744_162323_162374_165799_165879_169207_169243_169509_169666_170436_170580_174516
902993	contig_6509_pilon	+	1796	11	Intergenic	novelGene_145633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1161	1730	78970	226645	FALSE	45	TATTCTGAAACAGAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGAHRPGSATTWTELEASGTSCPSTGDRLAADKLQHPAHSASWGVCAAVTPGQMPPGPWQHSISAGPRHLCFPVSESFCSPLAPTVKGSLRLVVRSLTSFPPSLLSSFGVLVRETLSLSFFPVCFSTMSLLRENSSGCGVLEHPPLGIVLLPHVIFIYTAIASSSTVSIHKSIKPTRPSQDLRFHS	73430	226711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_73889_74356_74507_76422_76563_77878_78084_78289_78463_78935_79031_79828_79993_91924_92064_110629_110775_224542_224589_226630
902994	contig_8312_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_152882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTGAGTTCATGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263245	264952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_263200_265000
902995	contig_14807_pilon	-	979	7	Intergenic	novelGene_124699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7482.56383757154	45	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	585	887	37635	37247	FALSE	10	ATCTGTGTCTGTGGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37686_38132_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
902996	contig_5423_pilon	+	2210	6	Intergenic	novelGene_85266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	996.156935427345	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACAGTCTACAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534912	555454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535034_541109_541167_542213_542351_544406_544489_553460_554552_554732
902997	contig_3233_pilon	+	2904	3	Intergenic	novelGene_56615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_2	9	14	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	695	2422	1016087	1020091	FALSE	25	ATTATGTATAAGTTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKGISEKSKMDEKEENEFNTKETTVDLQIGTEKTEKNKAGMVAEKLEKIVAVMKEKPAENTVSKAYPNKGVGQANKLDETSKTSMPTTSHVSSSKSAIKAAIVSSPKAKTTASKTENQKSFLKSVLRDQINAEKKLSAKELGLLKPTSAGSGLGEGSSKLKLTQSGVTRGGSGRISAPQGKDSKLDYRDITKQSQETETRSSIMKRDDTNTKTLVGQNTKNSKSTTGRSSKSKEEPLFPFNLDEFVTVDEVIEEVNPSQAKQNPPKGKRKEALKNTPSSELNLKKKGKSSAPHVVEGELSFVTLDEIGEEEDAAAHLAQALVTVDEVIDEEELNMEEMVKNSNSLLTLDELIDQDDCISHSEPKDVTVLSVAEEQDLLKQERLVTVDEIGEVEELPLNESTDITFATLNTKGDEGNTVTDSIGFISSQMPEDPSALVTVDEIQDENSDLHLVTLDEVTEEDEDSLADFNNLKEELNFVTVDEVGEEEDGENDLNVELAQSKNDHPTGKKGDRKKRAVDTKKTKLALSQVGQVNENVKEEDLKAMIERHLAGRYLAVIIFLFFEGNTFKVNYKI	1015392	1020573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_1016729_1017345_1017412_1019071
902998	contig_10013_pilon	-	674	1	Intergenic	novelGene_125048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	331	672	220665	220324	NA	25	ACTCCACAGCGACTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSSYDHISVWVFATGQIPLQLKVYSIKTIYPYSVKTMLKLCIYTQLKLCIYRSSWVVETVNELGLLTHRLEVSVQPRGISEERPGDLLLKTSLKPSGAQLYSDTHGAAMQRN	220995	220321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_220300_221000
902999	contig_12624_pilon	-	3558	1	Intergenic	novelGene_61026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	359	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864212	860654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_860700_864200
903000	contig_13244_pilon	+	3194	3	Intergenic	novelGene_86981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1890	2366	379558	380034	FALSE	50	CCCGTAACAAAAGAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVNGLNAPIKREWQIGLKKHDLSICCLQETHLRLKDKLKLKGWKKIHQANNTQKRAGVAILISDKIDVKVKSTTKDKEGHYVMIKGSIHKEDITIINIYASNDQAPKYIKQTLTALKRERDSSTIVVGDFNTPLSVEGQNIQKEAQQRHGRAKYYS	366551	380862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_367339_369798_370113_378769
903001	contig_16103_pilon	-	1584	3	Intergenic	novelGene_118848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2514.5	47	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743702	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723587_737556_737630_743496
903003	contig_14415_pilon	-	3097	2	Intergenic	novelGene_77592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	0	52	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	171	1202	19037	18006	FALSE	30	CCGAGAGTCAGCCCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKGKNNPETWVSLQVRSNNGNFTLN	23829	16110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_19097_23718
903004	contig_9614_pilon	-	3613	19	Intergenic	novelGene_104416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	371.358188708675	1649	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1041	3126	49	3174	155634	107861	TRUE	15	TTTTTGTCTTAATTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGSFSSSSTTACLHRPASRCRYRQEVRKFKMAAAEIPSLREQPEIEDADNSEKSINEENGEVSEDQSQNKHSRHKKKKHKHRSKHKKHKHSLEDDKDKKHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPVINESRSRDRGKKSRSPVDLRGKSKDRRSRSKERKSKRSETDKEKKPIKSPSKDASSGKENRSPSRRPGRSPKRRSVSPKQRDKSRRSRSPLLNDRRSKQSKSPSRTLSPGRRAKSRSLERKRREPDRRRLSSPRTRPRDDILSRRERSKDASPINRWSPTRRRASRSPIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRDRGRRSRSRLRRRSRSRGGRRRRSRSKVKEDKFKGSLSEGMKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDKVTEREKVTVMSTINPTKDLLADLIGCQRLPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQEKI	155682	105299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_105397_106167_106255_106770_106817_107325_107461_107786_108065_109251_109339_110641_110794_111390_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136482_140312_140490_145263_146464_155497
903005	contig_15449_pilon	+	3896	15	Intergenic	novelGene_33575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	666.34426047606	54	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	301	2727	37166	51815	TRUE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTKIQVKMQMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	27790	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_27912_36986_38069_43216_43279_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51179_51221_51330_51809_51932_54570
903006	contig_11505_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_140917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTTATACCTCAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41748	43813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_41700_43800
903007	contig_12622_pilon	+	2280	7	Intergenic	novelGene_5853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	90.8706345428611	14	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	590	2218	1107540	1111730	FALSE	35	ACTTACAGATGTGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISHGLVSFKDLIVDFTQEEWQQLDPAQRLLYRDVMLENYSNLVSVGCHVSKPDVIFKLEQGEEPWMEEEFSSQNYSEVDGALKKNEDVQNKHLMQIVFFSNNTLIAERADIFGNTFNLGMNIVPSIKIPYKDDSCGNSSKTNSEVIVKKSYFKRIPNEYSGCGKLLFHTKHEITHSGMKKYKYNQIRKARIQSEDLILHQNIQTLKQAYDYNKCGKTFKRTVLITQKKVNSERKPNECNECKKTFSKKSNLIVHQRIHTGEKPYVCNDCRKTFRVKTHLTRHQRIHTGERPYECSECGKTFTDKSALIVHQKIHRGEKSHECDECGKTFFRKSSLTEHFRSHTGEKPYECEECGNAFSKKSYLAVHQRTHRGEKPNECNECGKTFFCHSALTAHQRIHTGERPYECNECRKTFFCQSALNVHQRTHTGEKPYECSQCGKFLCTKSALIVHQITHRREKSYECNECGKSFCHKSTLRVHRRIHTGEKPYECNECGKTYRQLWTFTEHQKIHTGEKPYECNICEKTFRHKSNFLLHQKTHKE	1098279	1111792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098707_1099890_1100008_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986_1109080_1109919_1111093_1111509
903008	contig_11338_pilon	-	3576	1	Intergenic	novelGene_6320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	567	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	690	1001	249898	249587	NA	20	CCCATCCCAGCAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERDSPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAATSCHLISRSWDLSCQLICQTWDSSICTACEREPCSPTCRSWACQLLQLCDLGEAFTLIHRLAMF	250587	247011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_247000_250600
903009	contig_10159_pilon	+	2684	9	Intergenic	novelGene_30882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	106.143770424835	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1560	2240	993261	996016	FALSE	85	CAAAAAACAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPLWLFFFPFPDAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	975101	996460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_992585_993570_994447_994678_995874
903010	contig_10674_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_6423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACAGTGCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130503	132030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_130500_132000
903011	contig_6576_pilon	+	3306	19	Intergenic	novelGene_42358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_2	49.5388611640609	356	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	69	1865	788282	817073	FALSE	20	ACTTTACTAATCCCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIIQERIEDRLPELEQLERIGLFSHAEIKAIIKKASDLEYRIQRRALFKEDFINYVQYEINLLELIQRRRTRIGYSFKKDEIENSIVRRVQGVFRRASAKWKDDVQLWLSYVVFCKKWATKVQLSKVFSAMLAIHSNKPALWIMAAKWEMEDRLSSESARQLFLRALRFHPECPKLYQEYFRMELMHAEKLRKEKQEFEKAKMEVENLDYPEEILNGELARIIYKNSVSIIKGAEFHVSLLSIAQLFDFAKQLQKEIYDDLQALHTDDPLTWDYVARRELEIESQPGEEQPATKQPKAVEVGRKEERCCAVYEEAVKTLPTEAMWKCYINFCLERLTKKTNSEFLREKRLERTMFAFRKAHELKLLPEFQYKQWIELLLHHDLFKEALEVAGAGTELFRDSVTMWQMKLQVLIKSESTDIAMLFEEAFAHLKPQVCLPLWISWVEWSEGTKSQEDTEAIFKKAVLAVTGADSVILKDKYLDWAYRSVGYKKARAVFRSLQESRPFSVDFFRKMIQFEKEQESCKMANLREYYERALREFGSVDSDLWMDYIKEELNHPLGRPENCGQIYWRAMKMLQGESAEVFVAKHAMHQAGQL	788213	818514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_788374_789599_789685_793050_793093_793335_793429_794418_794467_794961_795026_797138_797258_800150_800229_800980_801063_801544_801627_802364_802550_803058_803139_803527_803606_808760_808941_810787_810869_811050_811161_811971_812039_814180_814254_816915
903013	contig_5020_pilon	+	902	4	Intergenic	novelGene_27917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_1	527.11942564175	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	291	593	124540	125772	FALSE	5	ACCTTGGTGTCTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	124167	126081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_124363_124444_124547_124909_125091_125657
903015	contig_16724_pilon	-	3818	14	Intergenic	novelGene_105266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	151.418343647325	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	114	1805	422369	331871	FALSE	5	GGTCCAGGTGTGTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSGRWRWRRLSRLGRLVWPVSPRSAESAPRCAEPRKAMAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPHNRKCFDCDQRGPTYVNMTIGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSSAIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKSLLGDSAPALHLNKGTPSQSPVVGRSQGQQQEKKQFDLLSDLGSDIFAAPAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSASADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQTTGGSAGSVNANFAHFDNFPKSSSADFGAFSTSQSHQTASAVSKVSTNKSGLQTADKYAALANLDNIFSTGQGGDQGSGFGTTGKAPAASVVSVPSQPSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVGASAQTQPASSSVPAPFGAAPSTNPFVAAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPAGFGTPAPYSLPTSFSGSFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGAGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSSNPFMTGAPTGQFPAGSSSTNPFL	422628	329857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_331931_332507_332600_334575_334735_342058_342155_342363_342444_346177_346359_350065_350276_352957_353078_361200_361355_362404_362568_367525_367642_391231_391326_422202_422370_422515
903016	contig_2438_pilon	+	1389	6	Intergenic	novelGene_112032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	2767.43086634517	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	405	737	311995	312871	FALSE	10	ATGGACTCTGGCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305089	313523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311739_311801_311907_312083_312305_312409_312729
903017	contig_14790_pilon	-	2499	5	Intergenic	novelGene_127910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_4	80.0780868902348	153	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	63	1661	178177	163426	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHMHTKFCLICLLTFIFHHCNHCHEDHDHGPEEHHRHHCGMTESEPSKYSVLDAENQKKCYIEKLFYRYGENGRLSFFGLEKLLTNLGLGEIKVVEINHEDLGHDHVSHLDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNPENQTVTSISTKRNHKCDPEKETIEVSVKSDGKHTHDHNRRLRHHHRSHHHLDRNTTRHFHNDSITHGERGEPSHEPSTETNTTQEQREVKPQKQKRRRKGKKSNDNFEVITPGFPPNCDQGEHYEHNRVHKPDCVHNPVHSNAHLSEHNGHDPGHGHQDLDPDNEGELRHTRKREAPHVKKSAIYSAASHKDHNEDDHQHDECLNVTQLLKYYGHDASSPISPDLFTCLCPALLYQIDSRLCIEHFDRLLVEDLNKDKNLVPEDKSNIHASAWICGIISITVISLLSLLGVILVPIINQGCFKFLLTFLVALAVGTMSGDALLHLLPHSQGGHDHSHQHAHGHGHSHGHESKKFLEEYDAVLKGLVALGGIYLLFIIEHCIRMFKHYKQQRVSVF	197666	162587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_163630_165586_165757_174902_175111_177160_178189_197615
903018	contig_2341_pilon	+	1945	6	Intergenic	novelGene_84361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	44.728514395182	23	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	33	455	147339	157640	TRUE	75	ACAATTAAAACAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYTNVQDTPAMPWWKDKFWIFLAGAIIVTSVSLGLILYCVCRRLFRQGKKLKTAKPLKQNEDEEMTYENVLNQSPGKLPPLPPRDLPSLEDASPADTQSEPPAAYSSIHKVKKAKRVSIPSYIEPEDDYDDVEIPTTTGKHHIKTKVSHF	129610	160996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129631_147326_147451_149686_149748_155756_155831_157464_158592_160457
903019	contig_10324_pilon	+	3086	16	Intergenic	novelGene_7744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	1155.47005153747	27	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	572	2143	69577	79380	TRUE	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	69005	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80072_80514
903020	contig_10642_pilon	-	5177	8	Intergenic	novelGene_78668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.162780042629	1057	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	255	2552	222596	171910	TRUE	30	TATTGGTGTTCAGCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARATDSVLNGHRSKGLCDSAKKEDLPELAGQALSAGPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNGSGGVDKASPSESNAGGGSPSSGSGGNPSNTSGTTRRCAGPVGSVQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLRGGTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQAPAVGRIKFFSDHVSAPTAELERIKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRGPKEGLLCASSQASCCHVI	241350	169187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170808_170904_173129_177948_178084_181157_181371_185224_185367_222007_222703_225746_225809_241264
903021	contig_11396_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_71317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAATTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448094	445789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_445800_448100
903022	contig_6823_pilon	-	4688	3	Intergenic	novelGene_131201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGACCTGTGGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148933	50053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_54181_59661_59816_148526
903023	contig_15500_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_128998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCAGCAAGTTTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256308	258682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_256300_258700
903024	contig_4418_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_98392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATGTGGAGAAATTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906659	907370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_906700_907400
903025	contig_15787_pilon	-	8262	3	Intergenic	novelGene_143980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	536	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCACAGGGTTGCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78878	68103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_68242_68537_74579_76795
903026	contig_13863_pilon	+	4076	11	Intergenic	novelGene_42047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGCAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277318	315243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_277658_278181_278398_279422_279530_282936_283036_301674_301766_302368_302535_307709_307849_310942_311065_311950_312131_312273_312393_312745
903027	contig_20356_pilon	+	2519	20	Intergenic	novelGene_159537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	109	junction_11	675.353831546052	185	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	48	1478	68419	141166	TRUE	35	ACTGAAATGATCAGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVNSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQETHYLQY	68371	159986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_68510_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153177_156694_156798_159828
903028	contig_7593_pilon	-	6259	1	Intergenic	novelGene_127297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCCTCAATTTACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187709	181450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_181400_187700
903029	contig_15991_pilon	-	2107	5	Intergenic	novelGene_70909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_4	2754.30853391555	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	75	614	105108	101983	TRUE	20	AAAGGTTGTGTTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKVTAAPAGGCELWD	106356	100378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_101049_101159_102271_103583_103703_104975_105142_106315
903030	contig_10404_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_138727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	360	674	1547306	1547620	NA	25	GAATTTGCTCTGCAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNLYCLNYLPHMAVTITFFTNHYRNFYIDKNWCGYTAILLIIHLPTPYTPDSKCSPYLQLLLSLLLSHQHILPSSSSETSLRHGFTLPFAKKSREFSSFSSY	1546946	1548369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1546900_1548400
903031	contig_20953_pilon	-	5179	2	Intergenic	novelGene_178148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	756	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	338	610	8270	7998	TRUE	30	AACTTTTTTAATTTTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITAIAVDRYLAVRHPLHARRFRSPRQAAAVCTLLWVLVGSTLAARWTLSVQEGGFCFSNHSRHHINTVVFSLLGFYAPLAVLVFCSLQVVAGLARRPAVHSAQVEATQKATRMVWANLAVFVACFLPLHVVLTLFYATNLHSCAWQQVVTQSLYFTSRLSDANCCLDAICYYYMAKEFQEARAAAPGAKAHKSQDTLHVTLA	8607	3359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20953_pilon_-_7181_7249
903032	contig_5686_pilon	+	1661	3	Intergenic	novelGene_45326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCAGTAATTCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108305	223214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_108480_221569_222283_222440
903033	contig_10074_pilon	+	4684	31	Intergenic	novelGene_57115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_18	221.006234200657	516	34	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	1707	4070	320785	343546	FALSE	10	TGGTGACTTTTCATTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKGRDDVYDRTLLDYFFSYHQFIHLLCRVAINCEKFTETLVKLSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAVSKTCIKLLWEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKDDEGATPVKRRRVSSDEEQGGDVCVGDVKTEAREALTPASASDNETRDSSIIDPGTEQDLPSPENSSMKEYRMEAPSSFSEEVAGARPQHLGEQSSSGRFEDCKEFKDLHCSKDSSLAEEESEFPSTSISAVLSDLADLRSCDGQALPSQDPEALSLSCGHSRGLFSHMQQQEILDTLCRTIESTIHVVTRISGKGNLATS	293585	344160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_293616_294713_294793_297590_297645_297758_297855_301177_301243_301337_301414_301495_301544_301662_301729_303593_303675_306785_306872_307261_307431_307536_307612_308912_309065_312508_312558_312638_312744_312821_312867_314083_314189_315818_315967_320607_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329877_330002_338513_338594_341265_341407_341507_341652_342585_342746_342941
903034	contig_9127_pilon	-	2319	13	Intergenic	novelGene_102994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	434	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCAGTGAAAGAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42632	18622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_18856_26168_26394_27354_27645_27742_28012_28827_28905_28989_29089_33028_33140_33710_33888_38559_38701_38907_39081_41395_41617_42229_42495_42594
903035	contig_5549_pilon	-	3424	15	Intergenic	novelGene_81670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	164.551276047862	11	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	1093	2664	547157	530509	FALSE	20	TGAGACCCCTTCTTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYTPPPQCVSRFVRPPPSAPEPGPPYLDHYPPYLQDRVVNSQYGTQPQQYPPMYPPHYDGRRIYPAQSYTREEMFRESPIPIEIPPAAVPSYVPESRERYQQMEGYYPVAPHPTQIRPSYLREPPYSRLPPPPQPHPSLDELHRRRKEIMAQLEERKVISPPPFAPSPTLPPTFHQEEFLDEDLKIAGKYKGNDYSQYSPWSCDTIGSYIGTKDAKPKDVVAAGSVEMMNVDSKGMRDQRLDLQRRAAETSDDDLIPFGDRPTVSRFGAISRTSKTIYQGAGPMQAVAPQGAPTKSINISDYSPYGTHGGWGSSPYSPHQNIPSQGHFNERERMSMSEATSHGKPLPSAEREQLRLELQQLNHQINQQTQLRGLEAVSNRLVLQREANTLAGQPQPPPPPPPPKWPGMISSEQLSLELHQVEREIGKRTRELSMENQCSLDMKSKLNTSKQAENGQPESQNKVPAEDLTLTFSDVPNGSALTQENISLLSNKTSSLNLSEDPEGGGDNNDSQRSGVTPSSAP	564670	529748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_530660_531619_531736_533276_533454_534949_535083_535203_535295_535677_535892_539397_539551_546164_546333_546788_547300_551191_551372_551697_551980_555271_555385_556807_556927_561726_561860_564547
903036	contig_15371_pilon	-	4020	4	Intergenic	novelGene_151459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTCTAAAAATGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200118	180429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_181081_186470_186584_195431_195543_196973
903037	contig_9297_pilon	+	3257	7	Intergenic	novelGene_69893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	321.148157224806	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	74	604	939250	970594	FALSE	30	TGAGAACTGCCTACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLPSLLQPSPPPQPYPLRLVISKMAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAAVIPEEQAGFLELRSQMSLFISTT	939176	973247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939325_955845_955942_964903_964970_966037_966180_968984_969069_969424_969471_970572
903038	scaffold_12124_pilon	-	4139	2	Intergenic	novelGene_22161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3653	3958	982587	982282	FALSE	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVGVFSPRKLPARGVPAPPGSSWAGSISATYALFAALRMGTLHVKDKETEAQGGQGSLRGQLLSGGSGSIRDSPISTMCYYPTRKKCPGQANPERQKVD	987330	982100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_984120_985210
903039	contig_11816_pilon	-	2905	2	Intergenic	novelGene_98555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTGTACTAAATATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1185099	1156545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1158595_1184243
903040	contig_7657_pilon	+	6040	3	Intergenic	novelGene_30029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	417	181	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2840	3229	194006	194395	TRUE	35	GCATTAGGGTCACATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVTEGLKSRSETMEDRISEIEDKYLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWNTITSKNMPVIGVPEQGEKTENTERITEELQTENFPNIMKDEKLTIQEAQQIPQRIDLKRKSPRHIIITLAKTKDKES	190808	197325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_193350_193707_196324_196442
903041	contig_12622_pilon	+	3575	20	Intergenic	novelGene_5819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.924694964153	4	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	1554	2693	446467	469448	TRUE	20	CGCGCAGCTCAGTTGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPARSQPLQKQPAPRKRRRHQLRRARTVALPSTFLAPGRRPPPFS	388911	476243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_389057_398268_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467788_467824_467907_469399_469467_475379
903042	contig_8263_pilon	+	3924	3	Intergenic	novelGene_83107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAACGGATGTGGCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158104	162846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_161064_161567_162409_162722
903043	contig_1443_pilon	-	866	7	Intergenic	novelGene_28261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	35.8375966456085	162	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	123	569	560906	557964	FALSE	65	ATATATATATTAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELQEVQITEEKPLLPGQMPEAAKTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPKRPAILTYHDVGLNYKTCFQSLFQFGDMQEIIQNFVRVHVDAPGMEEGAPVFPSGYQYPSLDQLADMIPCILQYLNFSTIIGVGVGAGAYVLSRYAVRNKNS	562631	557666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_558046_558985_559049_559231_559353_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
903044	contig_8617_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_73376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGATGCAAACCAGACGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61777	60677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60700_61800
903045	contig_3523_pilon	+	2400	14	Intergenic	novelGene_171480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	145.345008850091	433	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2310	91	2400	6020	52044	FALSE	25	GTTAGTGGGTAATGATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHSKLLETERQLGEAHGRLKEQRQLSSEKLMDKEQQVADLQLKLSRLEEQLKEKVTNSTELQHQLDKTKQQHQEQQALQQSTTAKLREAQNDLEQVLRQIGDKDQKIQNLEALLQKSKENISLLEKEREDLYAKIQAGEGETAVLNQLQEKNHTLQEQVTQLTEKLKNQSESHKQAQENLHDQVQEQKAHLRAAQDRVLSLETSVNELNSQLNESKEKVSQLDIQIKAKTELLLSAEAAKTAQRADLQNHLDTAQNALQDKQQELNKITTQLDQVTTKLQDRQEHCSQLESHLKEYKEKHLSLEQKTEELEGQIKKLEADTVEVKASKEQALQDLQQQRQLSRDLELRATELNKQLEMEKEIVSSTKLDLQKKSEALENIKQTLTKQEKEKVILKQKIENLNQESKMQHQELNNRIQAAATELQKVKMEKETLITELSATKEKLSKVSDSLKNSRSELEKENQKGKAAILELEKTCKELKHQLQVQTESTLQEQNELKKSLEQEKETCHQLKLEINSMQGQVAQAQNTLKQKEKEEQQLQGNINELKQLTEQKKKQIEALQGEIKIAVSQKTELENKLQQQLTQAAQELTAEKEKMSVLQNTYGKSQETLKQLQSDFYGKESELLATRQDLKSVEEKLSLAQEDLISNRSQIENQKKLIQELKTAKATLEQDSAKKEQQLKEQCKALQDIQKEKSLIEKELVNEKSKLVEIEEIKCRQEKEIAKLSEELKSHKQESIKEVTSLKDAKQLLIQQKLELQGKVDSLKTTLEQEKKNQQVLKEQAKKEEDELKKEFTEKEAKL	5929	52044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_6080_7065_7186_9978_10183_20956_21158_24489_24604_27065_27222_28474_28615_31727_32059_33370_33473_35396_35592_41063_41247_45797_45984_50754_50887_51858
903046	contig_6862_pilon	-	3145	14	Intergenic	novelGene_63747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1101	1496	110578	85758	TRUE	20	CACTGGCGCCGGAGACGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLPLLFLYLFSLHIHEKSFISQVLLLTHFLVFFLIYTRLKCQWSLEFRVQSWLIRIGNLLHRIYFLLLSLFFVLLYWISDAGVGLEFRRQMPITRQSKVFSPSLICHIRIWLLEAYFLVPDGGLILTPV	149620	48983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_49074_49378_49561_55244_55398_55962_56140_82880_83002_83260_83945_84168_84327_85673_85795_86044_86221_109121_109217_110490_110596_144167_144343_144847_144997_148861
903047	contig_5797_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_56955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	782	1099	377992	378309	NA	0	TGTTTTTTTTTTTTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILQNVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVVFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVFKSPTIIVELSISVFSAVRVLCILEPRHWVRRCLLWLCLHDGSSH	377210	378614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_377200_378600
903048	contig_401_pilon	+	2732	9	Intergenic	novelGene_42822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1179.87212628106	45	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	59	895	1711949	1714182	TRUE	40	TGAATGGAATGACAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGEYGFVAYLWGFYICVCKEHVGNLLSLE	1711890	1716436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1715234_1715419_1715486_1715716
903049	contig_12765_pilon	+	1844	9	Intergenic	novelGene_106545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	50.6246913570838	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1584	259	1842	10145	211007	FALSE	50	TAAAGGTGTCAACAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILFAWGTLLFYIGGHLVRDNDHPDHSSRELSKILAKLERLKQQNEDLRRMAESLRIPEGPIDQGLATGRVRALEEQLVKAKEQIENYKKQTGNGLGKDHEILRRRIENGAKELWFYLQSELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKYPNYEFISDNSISWSAGLHNRYTENSLRGVILDIHFLSQADFLVCTFSSQVCRVAYEIMQTLHPDASANFHSLDDIYYFGGQNAHNQIAIYPHQPRTADEIPMEPGDIIGVAGNHWNGY	9886	211009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_10315_73779_73896_74010_74174_87110_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_206153_206305_210800
903050	contig_12312_pilon	-	4028	15	Intergenic	novelGene_63965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	832.630307874892	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	65	2053	326065	215838	FALSE	45	AACAATAAAGTGCATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326129	213862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218804_235099_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
903051	contig_10904_pilon	-	5235	1	Intergenic	novelGene_22686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	453	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGCAAACATAGCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573932	568697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_568700_573900
903052	contig_6208_pilon	+	3506	11	Intergenic	novelGene_53025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	909	1265	490324	493139	TRUE	20	GGCACAGCTCCAAGCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMPFTFPFMRLWLRVLLLLFSMPGVFNIYRTLLFIRSTGSIWRGKSVTKEVSVNISIQILKRSIIIYLILLHGFQIVFNITNEVDEELPVVYEDAIQEKLTDELIKFLPVMETIQLF	489415	532556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_490439_492897_494298_496608_496730_503056_503295_505002_505086_507315_507506_508313_508385_510807_510925_513675_513748_531834_531972_532502
903053	contig_8050_pilon	-	3649	3	Intergenic	novelGene_114832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATTAGGAGAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336559	321857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_321941_323426_326228_335794
903054	contig_6375_pilon	-	4121	6	Intergenic	novelGene_72945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	613	1260	285587	284940	TRUE	40	AGACACTTGCATTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPVFQIPPRSPMTHRLFIHRPINKTIIQIYGQTTNAKNEEMEDFYQLLQSKICQTCNQDALIITGDWNVKVGNKEEGSVVGKYGLGDRNNTGDHMIEFCKTNNLFIANTFFQQHKGQVYMQTLPDGIHRNQIDYICGKRQWRNSISSVRTRPGADCRTDHQLLIGKFKFKLKKFKISPREANYDLEHFPPEFRDHLKNRFDELWDDKDIIHVMD	286199	52138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_52641_52880_53298_83170_83579_112965_113269_125244_126002_284465
903055	contig_9415_pilon	-	3322	8	Intergenic	novelGene_109737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_6	1507.09282245992	133	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1554	1868	560813	560499	FALSE	55	ACTACGAAAGAAGAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCIFTQITCAFCVCLLALPSPPPQVTLTSAALPLPHVAVKKKIRIVHLTKIAHGVGGEGVASKQRQKLCSISIKIQYIELKNKAETSYEEKELEKQRKESQGG	598807	559044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_580082_580126_583012_583057_597719_597918_598737
903056	contig_5428_pilon	-	4917	1	Intergenic	novelGene_160399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATGTATTTTATCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28183	23266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_23300_28200
903057	contig_5236_pilon	+	1946	15	Intergenic	novelGene_100897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	196.115750910278	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	836	1714	75075	84085	FALSE	30	TTTGTAAAAATGTGCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	67069	84317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_67219_68413_68453_69712_69812_70513_70606_71870_72052_72875_73032_73930_73960_74060_74121_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
903058	contig_5429_pilon	-	3944	4	Intergenic	novelGene_127823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	535	junction_2	63.5522532164587	521	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2102	2443	604403	600615	FALSE	10	CTCACTTGTTCATTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEMSISREDKITTPKTEVSEPVVTQPSPSVSQPSTSQSEEKAPELPKPKKNRCFMCRKKVGLTGFDCRCGNLFCGLHRYSDKHNCPYDYKAEAAAKIRKENPVVVAEKIQRI	607152	599113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_600764_602142_602269_604336_604441_605088
903059	contig_7275_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_111239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	460	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGGTCAGTCCGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392840	390161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_390200_392800
903060	contig_15003_pilon	+	2522	3	Intergenic	novelGene_137330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAACCAGAGAGATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146861	254201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_147399_229631_230697_253281
903061	contig_5988_pilon	-	2709	3	Intergenic	novelGene_15859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_2	29.5	58	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1337	2218	271663	270782	FALSE	80	TAAAAAAACAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQSSSDTTIAGLMSMSAASTTNAVPSIPATEESSSNLSSVEMLQNEHWLSSQPPFKLEHAQGHRTSENVALTGVDHSLQHDGSNAFVSQKQSSKSVPSAKVSLKEYRAKHAEELAAQKRQLENMEANVKSQYAYAAQNLLSHRDSHSSVILKMPIEGSENPERPFLEKADKTALKMRIPVAGGDKIASSKPEEIKMRIKVHAAAEKHNSIDDSGTKSREHKEKHKTHPSNHHHHHNHHSHKHSHSQLPTGTGNKRPGDPKHSSQTSTLPHKTYSLSSSFASASSTRKRGPP	274320	270290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_272788_272950_273115_274272
903062	contig_16211_pilon	+	2685	13	Intergenic	novelGene_150094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAGAAAATAAATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195819	242994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_197192_201423_201603_204232_204404_205330_205454_211934_212035_221218_221291_222658_222772_223583_223715_224188_224261_225372_225521_226177_226253_237643_237708_242929
903063	contig_15375_pilon	-	2958	1	Intergenic	novelGene_178792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12498	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGATTCTAGAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22535	19577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15375_pilon_-_19600_22500
903064	contig_7887_pilon	-	3329	2	Intergenic	novelGene_124845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	2018	2668	63538	62888	TRUE	45	TGCAGGATAGACCATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLTNPIVELATIFFAQSLATRPTAEPNFFPKSLLTNPTTVPSPNFLPDSLFTKPGTIPIPSFFPESLLTSPTVVIVPVFLPKSLLMNTAVVPLPSFFTESLLTNPTVALNTGFFPGSLVTNPTAVLIAGFLIKSLCIIPATEPMPAFLIKSLLTNPAVVPVPNFFGFVLEDLEGGQVAMSCANFSVTLVPPLSNARSFKSGSRPPTRVDGVALM	65555	19985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_20506_62746
903065	contig_4426_pilon	+	3579	1	Intergenic	novelGene_15362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	468	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGATGTTACTGAGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86087	89666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_86100_89700
903066	contig_11850_pilon	-	1168	8	Intergenic	novelGene_125198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	949.446433777201	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	344	970	186097	181211	TRUE	15	TTGTTTTATTTCTTAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	198230	179834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_180003_181180_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195749_197922
903067	contig_10627_pilon	+	4805	20	Intergenic	novelGene_59955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	111.23756116461	57	63	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	365	2464	174446	179152	FALSE	25	TAACACATGTATGGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFLSKTSEISLDDEELAQHPATTEDVRACCQDIKVLGRKELRSLLNWRTKLRRHVAKKLKEQAKALDISLSSGEEEEEGNEEESTAGTRRQPSKEEEEEEQLNQTLAEMKAQEVAELKRKKKKLLREQRKQRERVELKMDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTSLDSDLDLEEGAGGGGHQGLKDQQRVQFAEVEDDKEEEEEENPLLVPLEEKAVLQEEQANLWFSKDGFAGIEDDADEALEIGQAQLLYESRRKGQEQPQPQPPSSLKTERKSPQCQDEAPKGTETPKGTEAAPDPEGKDKDDSSDSDSSSSEDEEREPHRGKKRSRGPKSDDDGFEVVPIEDPVKHRILDPEGLALGAVIASSKKAKRDLIDNSFSRYTFNEDEGELPEWFVQEEKQYRIRQLPIDKKEVEHYRKRWREINARPIKKVAEAKARKKRRMLKKLEQTKKKAEAVVNTVDISEREKMAQLRSLYKKAGLGKEKRQVTYVVAKKGVGRKVRRPAGVRGHFKVVDSRMKKDQRAQQRKEQKKRHRRK	172569	181493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172594_172707_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174431_174627_174709_174826_174941_175047_175129_175231_175460_175542_175633_175784_175918_176055_177073_177256_177416_177538_177622_177895_178138_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178879_178959
903068	contig_11678_pilon	-	1217	7	Intergenic	novelGene_160844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	57.6784670007409	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	213	404	252770	251474	TRUE	20	GGCGGAAGATCTCGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVNRTCSRGSGRGGLVGRVPLTGERSCRRYQPGPQRATVTGPTKIGQFQKIVGGLIELVDQLAKEAENEKMKAIGARNLLKSIAKQREAQQQQLQALIAEKKMQLERYRVEYEALCKVEAEQNEFIDQFIFQK	257596	235584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_235775_248119_248264_249696_249866_251163_251556_252073_252178_252764_252851_257464
903070	contig_5041_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_27059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGGCAAAAAAATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524514	526496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_524500_526500
903071	contig_15327_pilon	-	2165	13	Intergenic	novelGene_70776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.1669816408259	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	24	1274	1169101	1135719	TRUE	45	ATTAAAAGGCAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169124	1129719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1135083_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
903072	contig_9653_pilon	-	2127	14	Intergenic	novelGene_48304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_7	825.367294964874	9	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2094	33	2126	1040020	1006930	FALSE	65	AAAAAAAGGAGAAAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKN	1040052	1006928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
903073	contig_19865_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_170153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	116.148567773857	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	115	1362	43592	81643	FALSE	20	CTAGTCTGTACAGTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHWWFGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPLWGPSTQDWNWSWLLGDCHLMPCLHSKPICDSPLCATEVEGTGRRGVGGVTGSVLEGECGHRSRRN	43477	82017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191_79369_79927_80052_81132_81367_81437
903074	contig_7179_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_78203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	17	430	1439301	1438888	NA	70	ATACATGAGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSTLVMAAYGQTAGSGVLKTCDLDRILEALKLLLSPGGERMDLGAGLDPDLSGPPLFRGFPASYSALPQALPRTLRPRGRSAALLGGFGHYLFYHLENRGSRRGWDPLNTGNSHHLLSVCLMPGTVLDALGRLFPSVPAAIF	1439317	1438275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1438300_1439300
903077	contig_8487_pilon	+	4117	3	Intergenic	novelGene_111906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCGACCCCGGAACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36135	54977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_39271_43298_44234_54930
903078	contig_15087_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_37241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	458	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTACTTGCTTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175432	177171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_175400_177200
903079	contig_5988_pilon	+	3268	10	Intergenic	novelGene_16090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	1649.67242539575	1709	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	395	1108	1218380	1224777	FALSE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210202	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
903081	contig_15135_pilon	-	1047	1	Intergenic	novelGene_119867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	239	556	51924	51607	NA	80	TAAAATTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQALSFPKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEVISKGSFSVGIVLLIRMIGFSFRA	52162	51115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_51100_52200
903082	contig_13465_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_178794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACAGTCCGCCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193466	192447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13465_pilon_-_192400_193500
903083	contig_2798_pilon	-	3274	5	Intergenic	novelGene_120020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	803.435863961773	6	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	434	1177	116665	115840	FALSE	60	TTACAGAATAAAGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIGSSLLASFPVSSLGSTICKLWHARNPVAVMYFITKSS	193434	113742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_115954_116035_116680_120452_120595_170381_170519_193294
903084	contig_15264_pilon	+	5214	7	Intergenic	novelGene_158868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	878	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	4589	4954	99820	107597	TRUE	65	AAAGGAAAAGAAAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNIHEYCSRVIWSSRCKFLNPGIAFAHFTAAITCRPPNMLSVVRIRQVVSGTVLSYPAYNTSGSMTSNSDTRVGVSCGNVAGTIVLLTGFSDVSCETPVVVCWIPFIFFLVFRASRFIPA	75188	115329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_79404_79962_80123_93994_94128_99739_99883_100918_101201_107576_107691_115162
903085	contig_9423_pilon	-	2463	9	Intergenic	novelGene_99171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	159.333769176531	59	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	142	1722	61283	33642	FALSE	20	ATTTTAGGCCTCCAGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKKYGQLEEYLSLADYFQDEKFD	74947	32900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_33708_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_73820_73917_74910
903086	contig_756_pilon	+	3368	7	Intergenic	novelGene_134774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	241.403362307432	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	237	1382	177389	204241	FALSE	30	GTTTTGTCATTGCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFLEDPSVLTKEKLKSELIANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLAASANSKGPPDFSSDEEREPTPVFGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRLEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYGVNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEDSTVELKLEKREPLKGRAKIPVTLKQRRVEHNQVVNRVTGNFKHAAPILPITEFSDIPRRTPKKPLTRAEVGEKTEERRIERDILKEMFPYEASTPTGISASCRRPIKGAAGRPLELSDFRMEESFSSKYVPKYVPLADAKSEKTKKGRSIPMWIKILLFVVVAVFLFLVYQAMETNQGNPFSRFLPDSTESK	177152	206227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_177668_186009_186137_187913_188073_193805_193904_202141_202253_203248_203338_203958
903087	contig_17212_pilon	-	6108	3	Intergenic	novelGene_88609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	335	junction_1	235	463	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1244	3735	98	3832	95064	86023	TRUE	25	CACTTGGTGAAAGGACTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGKKKSQENKSKGNKTEDIKLKTSEPDSTPANMRDSAEGPKEEEEKPSASAAEQTDVLQEVVSQDVLPELAVPSAVCEPQTEPDEKVEATNCEVNDLEDEEEEEDDDEDDELEEEGEEEADMPNESSVKEPEIRCDEKLEDLLEEPKHISRESLEDSPEVTPVIRIPKTKGEPNGDVFETFMFPCQHCERKFTTKQGLERHMHIHISTVNHAFKCKYCGKAFGTQINRRRHERRHETGLKRKPSLTLQPSEDLTDGKVSGDNVTPQDESNPPNLGQNSLILNSEKASQEAVNSTVVEENGEVKELHPCKYCKKVFGTHTNMRRHQRRVHERHLIPKGVRRKGGLLEEPQPPAEQAQPTQNVYVPSTEPEEEGEADDVYIMDISSNISENLNYYIDGKIQTNSSTSNCDVIEMESNSADLYGINCLLTPVTVEITQNIQTTPVPVTDDLPKEPSSSTNRESKKRRTTSPPLLPKIKAETDSDPVAPSCSVSLPLSISATEAVSFHKEKSVYLSSKLKQLLQTQEKLTSPAGISATEMPKLGPPPVSAPASMLPVSSSRFKRRTSSPPSSPQHSPALRDFGKQSDGKAVWTEPVLSSKKPKMESHSNSPAWSLSGRDERETVSPPCFDEYKISKEWAASSTFSNVCNQQPLDLSSGVKQKAEGVGKTPVQWESVLDLSVHKKPCSDSEGKEFKENHLVPPACSAVKKKKPTTCMLQKVLLNEYNGIDLPVENAADVTRSPSPCKSLEPQPDPDLGPHSSLSAPTVESPPDVSPSSPALQTSSLSSGQLPPLLIPTNPSSPPRCPPVLTVATPPPPLLPTIPLPLPAPSSDASPHPCPSPLSNAAAQSPLPVLSPTVSPSPSPIHSVEPLTSAASPGPPTLSSSSSSSSSSSSFSSSSSSSSPSPPPLSAVSSVVSSGDNLEVSLPMISFKQEELENEDLKPREEPQSSVEQDVVQETFNKNFVCNVCESPFLSIKDLTKHLSIHAEEWPFKCEFCVQLFKDKTDLSEHRFMLHGVGNIFVCSVCKKEFAFLCNLQQHQRDLHPDKVCTHHEFETGTLRPQNFTDPSKAHAEHMQSLPEDPSETSKEEEELNDSSEELYTTIKIMASGVKTKDPDVRLGLNQHYPSFKPPPFQYHHRNPMGIGVTATNFTTHNIPQTFTTAIRCTKCGKGVDNMPELHKHILACASASDKKRYTPKKNPVPLKQTVQPKNGVVVLDNSGKNAFRRMGQPKRLNFSVELSKMSSNKLKLNALKRKNQLVQKAILQKNKAAKQKADLKKCF	95161	80421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_82016_85340_89739_95045
903088	contig_11779_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_146439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACTCGACGGCAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6094	4299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_4300_6100
903089	contig_9698_pilon	-	2192	9	Intergenic	novelGene_82503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	864	1178	257749	254588	TRUE	20	CTTTTTTAAGTCTCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFLIFSLVKTVLKLVCFRNVQYYPWPEFQQPSSCAHSCQPCSPLICLHVAVSNLHSKCKSNDVTPFISLQLLSRTISLFSNQRCSNILHFFILSLFLLFKLF	269047	238278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_239205_254499_254667_254753_254937_257696_257807_257918_258162_262139_262194_264718_264768_266734_266794_268646
903090	contig_19865_pilon	-	2340	6	Intergenic	novelGene_170155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1805	2137	72676	64577	TRUE	10	AGCCTCGTCCCCGCAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEHKISNSSDLSCRNPQTQAATDTGETKKSGMKTRSQKWLPLSIRSQTRTSNISRSKWMPTAINMALNSTHVSPSARYWGFRAQTPVPTEAPTMTINFHSHIGAKTAQ	82018	43504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_43628_64496_64675_67503_67711_72648_72735_79191_80052_81132
903091	contig_16205_pilon	-	6182	1	Intergenic	novelGene_156880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	467	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAACATCTGGGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103917	97735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_97700_103900
903092	contig_5791_pilon	-	2399	6	Intergenic	novelGene_35870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	357.285879933702	11	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	172	1509	1088908	1083684	FALSE	60	ACCCAGAAAGATAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESGMYIYLYSPCFHKDLISLCVSY	1090691	1082793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1089007_1090618
903093	contig_11493_pilon	+	4178	2	Intergenic	novelGene_143698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	754	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTGCAATGAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210897	220758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_210905_216587
903094	contig_18039_pilon	+	4294	6	Intergenic	novelGene_171250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	97.5655676968058	204	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	558	2744	213615	215801	FALSE	30	TTACTTCCCTAATAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKELSAKEIIDKGELFQRVILKRNESHGIEDFHFRQVRENVHEFQSQWGKDERNNKGVTTAHNKILTGRRDQHVNTDAGNKYVTCKNTTELSFQSHVAEMQKFHIGEKMYECHQVETSVSSGSSIPSFQRIPPSVQSNISNECGDVFMPPSWFQQHQKTHSREKPYKCNECGKSFSQRSVFTNHQRINCVQRPYKGNESVKTIYCGSSVTKHHTIHTGEKPCKCNACGKVFSLQLGLRTHQRFHTGKKLYKCNECGKEFMRCSYLCNHRSIHSGEKPYQCNECGKAFIYRPQLVQHQQIHSGGKPYQCNKCCKTFRRRSFLINHQKIHFGQTSYKCNKCGKAFSGRSSLVEHQRIHSGEKPYKCNECGKTFNWSSNLTKHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFSRRSGLTRHHTTHSREQLYQCNECGKAFIRKLSLVEHQRIHSGEKPYECNECGKAFIYRSKLVQHQQIHSGEKPYQCNKCCKAFSRRSVLINHQRIHFGQRPYKCSECGKTFNWGSNLSKHQKIHTGEKPYKCNICGKVFSRRSGLTRHQTIHSREKPFRCNECGKAFTRKSRLIEHQRIHSGEKPYKCNECDKTFTRKSRLLEHQRIHSGEKPYKCNKCGKSFIQRSTLVKHQAIHITEKPYKCNECGKAFKWNASLTRHQRIHAVEKPYKCDSCDKGFGHPESLRSHQRYHTGERSCKCIECGKTFSSQSAFQNHKIIHSGESPYK	196176	217351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_196217_197219_197413_198369_198453_201831_201959_202444_202542_213597
903095	contig_9468_pilon	+	2754	21	Intergenic	novelGene_59513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	2	7	junction_19	158.96914795016	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2637	116	2752	439957	539411	FALSE	55	AGAGAAGAAAACACTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLREGYNEPAADVPSEKDLNKVLQLLEPQISFLEDLTKMGGAMRSVLTQVLTNQQNYKDLTSGLGENTYAKKSHEKYLIALKSSGLTYPEDKLIYGMQEPSAGTSTLAVQGFAGATGTLGQVDSSDEEDQDGSQGLGKRKRVKLSSGTKDQSIMDVLKHKSFLEELLFWTIKYEFPQKMVTFLLNMLPDQEYKVAFTKTFVQHYAFIMKTLKKSHESDTMSNRIVHISVQLFSNEELARQVTEECQLLDIMVTVLLYMMESCLIKSELQDEENSLHVVVNCGEALLKNNTYWPLVSDFINILSHQSVAKRFLEDHGLLVTWMNFVSFFQGMNLNKRELNEHVEFESQTYYAAFAAELEACAQPMWGLLSHCKVRETQEYTRNVVRYCLEALQDWFDAINFVDEPAPNQVSFHLPLHRYYAMFLSKAVKCQELDLDSVLPDQEMLMKLMIHPLQIQASLAEIHSNMWVRNGLQIKGQAMTYVQSHFCNSMIDPDIYLLQVCASRLDPDYVISSVFERFKVVDLLTMASQHQNIVLDAEHERSMLEGALTFLVILLSLRLHLGMSDDEILRAEMVAQLCMNDRTHSSLLDLIPENPNPKSGIIPGSYSFESVLSTVADFKAPVFEPGGSMQQGMYTPKGEVWDQEFDPVMVILRTVYRRDVQSAMDRYTAFLKQSGKFSGNPWPPYKKRTPLHPSYKGLMRLLHCKTLHIVLFTLLYKAPVGGPERCHDSWFPGSNLVSNMRHFINYVRVRVPETAPEVKRDSPASTSSDSLGSLQNSGTAQVFSLVAERRRKFQEIINRSSSEANQVVRPKTSSKWCAPGSAPQLTTAILEIKESILSLLIKLHHKLSGKQNSYYPPWLDDIEILIQPEIPKYSHGDGITAVERILLKAALQSRMNKRLIEEICRKVTPPVPPKKITA	437387	539413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_437417_439870_440030_444711_444856_445432_445483_466031_466099_469950_470082_471219_471449_478818_478999_479583_479718_487495_487583_496649_496716_496850_496941_498092_498222_498304_498358_498457_498592_499547_499634_501080_501223_504231_504329_532181_532324_536801_536976_538982
903096	contig_11574_pilon	-	3487	4	Intergenic	novelGene_64042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716952	361047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_363380_534824_535303_601726_601743_716291
903097	contig_20718_pilon	-	7035	15	Intergenic	novelGene_169147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	421	junction_7	375.5030163742	836	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1192	3579	5	3583	116501	60216	FALSE	10	CAGCTTGTTGACTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNLGNSHPPTKGSTFQTRIPFNRPRGHNFSLKTSAVVLENAAGATKVIAQAQQAQVEAPQAGAWRNRLNLLEGSQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSVLPAMLQTNMGNPVTVVTTTTGSKQNCTTGEGDYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIRPILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGEQLLNVGTKSTRFFCRETDISHSGWRLKTLEEHESETGMKSKEARKYIFNSLDDIVHVNTVMDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVKSCFHIMDICKSHPNSFDTNNHNKTSLLRPIASCSAANLTGNFTKIGTLRSQALTTSAHSVVHHGIPLQVGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPAVQPLQIRPGVLSQTWSGRTQQMLVPAWQQITPLAPATTALTSEGVAGSQRLGDWGKMISHSNHYSSVMPQPLLTNQITLSAPQPISVGIAHVVWPQPVTTKKNKLCQNRSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEISCIETQDNHNSGGEARNCCETSVRQDSDSSGSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEDTSQRHSLRECQGNLDCEACQSTLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQFSPSPCKRPNSMSDEEQESGCDTVDGSPASESSGHDSPFAESSFVANSHQNTDLVTSADTKTKPAVCTVVVPPMGLENGLNAEHMANTDSACRPLIKGRSIPGRLNQPSAVGGRQQKLTSAFQQQHLNFSQVQHFGSGHQEWNGNFGHRRQQAYIPTSVTSNPFTLSHGSPSHTAVHAHLAGNTHLGGQATLLPYPSSAALSSAAPVAHLLASPCTSRPMLQHPTYNLSHPSGIVHQVPVGINPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAASPAYTGFPLSPTKLSQYPYM	116505	56763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_-_60693_61545_61674_61963_62197_64365_64507_64823_65121_65642_65805_65903_66029_66285_66408_71174_71299_71734_71895_73008_73194_73915_74003_74635_74756_79808_79933_115407
903098	contig_9708_pilon	+	4693	2	Intergenic	novelGene_67238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	4121	4480	30992	31351	FALSE	20	CAGGATGGTTCCAGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLFFIFVFPYFSVSHLSTPRASSLSTPFCCVYVLGSYSSFLSLLFPIPILAPHITIYLVLPAYMPCALNITLQSSTAWPTGTCPELIPGLHCQPWYMPQTTHPSNSPSAGPALLYHT	2116	31564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_2967_27721
903100	contig_6823_pilon	-	3107	7	Intergenic	novelGene_131254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_6	117.810110865843	325	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	163	1173	486599	477436	FALSE	10	TGAATTCTGTGTGTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAVQANGTQPLSKTWELSLYELQRTPQEAITDGLEIVVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCADCIITALRSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDALISKIYPSRDEYEAHQERVLARINKHNNQQALSHSIEEGLKIQAMNRLQRGKKQQIENGSGAEDNGDSSHCSNASTHSNQEAGPSNKRTKTSDDSGLELDNNNATVAIDPVMDGASEIELVFRPHPTLMEKDDSAQTRYIKTSGNATVDHLSKYLAVRLALEELRSKGESNQMNLDTASEKQYTIYIATASGQFTVLNGSFSLELVSEKYWKVNKPMELYYAPTKEHK	521303	475501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_477538_477844_478017_478869_479143_481757_481974_482602_482764_486512_486602_521143
903101	contig_3424_pilon	-	4532	1	Intergenic	novelGene_55500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGATCTCATTGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167730	163198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_163200_167700
903102	contig_3721_pilon	+	3427	1	Intergenic	novelGene_123829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2905	3291	265674	266060	NA	50	AAACAATTCAATTTACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIMEGEEEKRTERIFKEIMACDKIQHPFMTKTFNRLGIEGKFLSRIKDIHEKPIAVIILIGEELRASSLRSGTRRGCLFLSLLFNIVLEVLARAVRQGKEIKGIQIGKEEVKLSGIRRWNNHGLIYI	262769	266196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_262800_266200
903103	contig_4091_pilon	-	3672	2	Intergenic	novelGene_173038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGCCACCATGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34946	24650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_27442_34065
903104	contig_10011_pilon	-	2504	7	Intergenic	novelGene_68111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1806	2414	331536	328311	FALSE	35	TGGGGACAAGGCAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDTRSTPGALSVPVQGDFDVLHKPPCWLALLGLQLTDELIKKSNVLGHAAAVLFPDLANGLTQLLQPGHKELLLFLQKLAQLLHLMPNLLLLGFSLFLEVGCLLIPLVFLLLPRFSQLLQMLQLPVNLLLEFQGDFLDGAHLVASVLLTQAADEADKLPVVLTEEQAGLLHVTLTRGRRLGAEAVQQLLLWERGLAPGATG	334220	328220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_328528_328964_329060_330804_331037_331471_332228_332412_332446_332993_333043_333188
903105	contig_19628_pilon	+	3205	2	Intergenic	novelGene_166575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGACGGAGAGTGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23315	27319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_25980_26778
903106	contig_7720_pilon	-	3644	1	Intergenic	novelGene_155792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	657	974	841487	841170	NA	45	AAAAGAAGAATTGATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTMLAIMRMMQDWASFRSVVHTVTMSQNQLNPQTVPGSPMRTVLPPINQKPELPARVQKEELCSERFNSNPALEPQPGCVAHLPEPTLSSAEGGAWHSINHFA	842143	838499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_838500_842100
903107	contig_3469_pilon	+	6577	7	Intergenic	novelGene_34150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	4009	4632	579798	580421	FALSE	20	GCCTCCACCAGACTGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKSINIIHHINKRKEKKHTIISTDIEKACDKVQHPFLTKTLSKIGIEGKFLKIIKGIYAKPMANIILNGERLKILPLRTGTRQRCPLSPLLLNTVLEFLARAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFVDDVIVYIDNPKDSIRKLLKLIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKQNYEKEIRETIPFIIAPKNIKYLGINLTGM	328831	582366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_328908_358051_358550_363551_364598_476175_476233_519808_520147_555820_557314_579297
903108	contig_8330_pilon	-	999	3	Intergenic	novelGene_71892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	35	358	1208440	1204013	TRUE	10	CCAGGTCTTTCTCCTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHICTLPPRTALFPRAGPGHTCARGQARAPSPANRRPQASGRSRSRGRLGSRVRAATASGRSRQPGLRPEESQMKRSFAPGWNIPKVSPKFDLDDSEDEILDLELI	1208474	1070172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1070342_1203540_1204123_1208226
903109	contig_6102_pilon	+	2975	3	Intergenic	novelGene_31823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	4.5	233	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	555	1469	364422	365336	FALSE	40	AGAAACGACACATTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRKSLSAVTSSRGTAREEPSASSVTCSGISSSMLGVEEELVGGGSTGPVPPGRRHDLYDIYDLPDRGFEDHEPGPKRRRGGCCPPDGPHFESYDYNLAPSRGVECRLLEEENAMLRKRVEELKKQVSNLLATNEVLLEQNAQFRNQAKVMTLSSTAPATEQTLAPTVGTVATFNHGIAQTHTTLSSQALQPRPVSQQELVAPAGAPAAPPTNAAPPAAPPPPPPHLNPEITPLSAALAQTIAQGMAPPPVSMAPVAVSVAPVAPVAVSMAQPLAGITMSHTTTPMVTYPIASQSMRITAMPH	361721	366842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_361765_362534_362599_363974
903110	contig_8866_pilon	+	4776	14	Intergenic	novelGene_77814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4258	4572	710884	715114	TRUE	60	AAAATAAATCAGAGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWDRGICVMGVAAEAEMVAPAALCCWLAECCCTAAASSWAWAWACCSSNCCWAGVKVSPVICPPASISCVWGMAACTEGCWEGWLGCCESPDSSLDLDCTFKD	550086	769799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_551330_554615_555448_679889_680170_683064_684273_685274_685423_686663_686798_690843_691022_695556_695652_708098_708224_710869_711060_713011_713132_715095_715148_726513_726616_769730
903111	contig_10058_pilon	+	2046	9	Intergenic	novelGene_67735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	157.659789975123	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	116	889	82771	99369	TRUE	5	GCCACCCCTTCCTGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSLESVSGRHKPLSAVLLTIKVGGLNPVCPEVPRKISLMILLKGPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	82655	100652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_82787_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532
903112	contig_10734_pilon	+	5495	25	Intergenic	novelGene_51243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_18	463.245008068085	4	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1181	3546	264	3809	1243300	1321486	TRUE	25	TTCCCAGCAGTCAACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKKTQGIRDSVLHLKSLAGIMAGRREICAQ	1221292	1334469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1221446_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1310195_1310254_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333251
903113	contig_9363_pilon	-	1906	16	Intergenic	novelGene_6758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	447.000502112569	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	10	1614	1548937	1505779	TRUE	10	CAGTTGTTGTGATGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTLLHHFLRAAPPTSS	1548946	1505322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505456_1505619_1505824_1530261_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
903114	contig_10404_pilon	+	4188	17	Intergenic	novelGene_138640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	129.134559181499	432	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	555	1355	479955	487517	TRUE	20	TTCTTCCGTTACCTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIAGFEVKAYANPTVVRCEIHHGQTGGIYVHEKGRGQFIENKIYANNFAGVWITSNSDPTIRGNSIFNGNQGGVYIFGDGRGLIEGNDIYGNALAGIQIRTNSCPIVRHNKIHDGQHGGIYVHEKGQGVIEENEVYSNTLAGVWVTTGSTPVLRRNRIHSGKQVGVYFYDNGHGVLEDNDIYNHMYSGVQIRTGSNPKIRRNKIWGGQNGGILVYNSGLGCIEDNEIFDNAMAGVWIKTDSNPTLRRNKIHDGRDGGICIFNGGRGLLEENDIFRNAQAGVLISTNSHPVLRKNRIFDGFAAGIEITNHATATLEGNQIFNNRFGGLFLASGVNVTMKDNKIMNNQDAIEKAVSRGQCLYKISSYTSYPMHDFYRCHTCNTTDRNAICVNCIKKCHQGHDVEFIRHDRFFCDCGAGTLSNPCTLAGEPTHDTDTLYDSAPPIESNTLQHN	476083	493460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_476271_477218_477305_478481_478577_479680_479804_479891_479978_481803_481881_481980_482125_484851_484963_485950_486059_486417_486527_487206_487306_487387_489180_489282_489441_490009_490096_490366_490489_491923_492188_492919
903115	contig_6445_pilon	+	3157	2	Intergenic	novelGene_76985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	355	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACAATCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406254	409654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_407310_407552
903117	contig_5033_pilon	+	4871	1	Intergenic	novelGene_29091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	415	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2765	3073	706318	706626	NA	45	GCAACGAGCAAGATCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLGFSTGSWDGEGGKAGGCASFSSETSSGFSSALARLPGAFPSIAPTTWSQGAAEASPPQAASLLSTRGSFSKECSFVLPQVGEDLFSSASVNSAEHSRPG	703553	708424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_703600_708400
903118	contig_3386_pilon	+	4335	2	Intergenic	novelGene_34524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACAGATTATCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404159	408657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404940_405102
903119	contig_8412_pilon	-	1239	3	Intergenic	novelGene_118376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_2	55	143	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTACACACCCAGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646398	641421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_641477_644272_644428_645369
903120	contig_10176_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_72721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATACATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260311	262467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_260300_262500
903121	contig_8377_pilon	+	2454	21	Intergenic	novelGene_34977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3902.02690245723	16	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	370	1959	128927	176581	TRUE	50	TCAGAAATTGAACATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDITLALNL	68104	180487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176555_176703_177253_177345_177430_177512_179567_179666_180383
903122	contig_6673_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_164026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	622	960	120504	120166	NA	15	GTGTGTGTGTTAGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSAFVKIPTQHHQILLEMLKRARRESERRYSSFHDIQISTDVNSLFSSFLDHEKNSHRHCVSSSLAVTQHNCFLKSSTEFLSFCSKALFCINFSLSQLKTIYSFNAYLLNT	121125	118735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_118700_121100
903123	contig_19402_pilon	+	5179	18	Intergenic	novelGene_80765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	1565.74409165535	9	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	10	2325	23458	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_146044_146114
903125	contig_16860_pilon	+	2686	11	Intergenic	novelGene_155342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_10	211.056864375457	308	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	39	1262	102806	135257	FALSE	5	TGGGCCGCTGCTCCTATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLLWSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSAIRGFSPPHRICSFEEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDGFNSLNTAHATENHGTGNHSAQ	102767	136681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_102896_105774_105887_107870_108017_108270_108411_108514_108593_108697_108793_111643_111770_120660_120739_127889_127972_128725_128824_135078
903126	contig_7426_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_27493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACAAAATGTGGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908001	909900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_908000_909900
903127	contig_13481_pilon	+	3837	1	Intergenic	novelGene_119496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGACAGCTCAACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1379252	1383089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1379300_1383100
903128	contig_14704_pilon	+	3660	1	Intergenic	novelGene_82695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	3068	3409	78317	78658	NA	30	CAGTTAATATGTTTGCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRSSEVKVYIYIVFNSYISGINFILPPAPKIKVCDQSDYYKHEENKTRTGPDKEIHEERQHTSTRTCLSSFTHTQILPGNHSPSGLYDLCCWSTVQHLFPIIFIPPTPWLC	75249	78909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_75200_78900
903129	contig_11258_pilon	+	2523	7	Intergenic	novelGene_67779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	214.617812763889	8	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	78	533	279290	284112	TRUE	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFLGRAETWCPAGAQAILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPGEPLPHTSTRAA	279212	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284296_285129_285795_288238_288270_291348_291387_291794_291915_292450
903130	contig_9739_pilon	-	3336	1	Intergenic	novelGene_165099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2003	2347	218006	217662	NA	50	GGATGGAAAAATTAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSITSHQKNANQNYNEIPSNPGITGMNQKKKTKRNKCWRGCREIGTFMWECKMVQPFWKMIQCFLRKLGIETRYPAIPLLGIYSRDIRTMTQIDMHTHVHCRIVHNSKKMETT	220008	216672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_-_216700_220000
903131	contig_13021_pilon	-	5259	33	Intergenic	novelGene_8116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	172.448812038348	142	40	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	820	2463	2629	5091	173629	147970	FALSE	15	GTTACTGCTTTTGAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSEAEWITIANNLLLKCHIHLRIHALEDCDANVFIALYQSILGERVPDLIVIPRSQEDDAHNVQAVIDSLALDYLQVSLSHITGENIVRGDKESIKNLLEIFDGLLEYLTEHSSETSHEKSETEQHFKESHQGVPLEEPESTKESWKRVSFGRCSLSSEALGPSWDEDEAESTGELIRLGDTAHTFSLRSNGAQDSNEVQSKKATTSPSSKSHEEVLNPQSSILSSSRTAFVEDMEIPSVSMTSSARKLGEPIRSAIRLHPPHHPSEPRAPCPIGKEYCLSAGISTGEPATFSAEPDDSVFSTSKLPKNSKQEICSAQVQGPRTRRLPKGSRHENRSAVSSWGSPFPQRLRRTLTEQELHAVSEKLSQRLSELDWMLKSALGDRIKEKTEHEEEDAGAGNEEVENGEVESGSAETLSQYSDSIMDYGPKKLRPGLAVSRKPPYRSHSLSPSPVNRRKPCHRERTKQRKPKETDIRRFRAQAISEAFERELRRNKVQENIGPLGINDEQEETEKTYREAVHKGTPKPCQPWKIYSRKTTTPSPRGGFPKPNKEVPMKVNEQSLLPLMLEQFPFLSVSDQTLSKMWKQQIAQVKQLKKDAYGENRSKKKLQDEIEEALRRHDLLTALVKKEYEHNRRLQDFKDRINRQRLTQSKIKENRQQIVRARKYYDDYRVQLRAKMMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	181149	147801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_150265_151766_151842_151957_152128_152919_153050_154324_154418_155195_155336_157302_157478_158091_158222_158404_158518_160045_160225_160916_161046_163208_163325_164974_165072_166458_166570_169579_169688_171694_171824_173610_173969_174538_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
903132	contig_7254_pilon	+	3461	9	Intergenic	novelGene_145851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	167	junction_7	685.502917572201	389	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	21	773	228460	286342	FALSE	25	CAGATATTCAGGTGCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGTSNYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSARDGRRDRYSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAEYTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQDYTHEYHKTKANFMAIRERENLMGSVRKDIESYKSGSGVNNRRTELFLKEHDHLRNSDRLIEETISIAMATKENMTSQRGMLKSIQSKMNTLANRFPAVNSLIQRINLRKRRDSLILGGVIGICTILLLLYAFH	228439	289030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_228491_230872_230994_242400_242489_243050_243159_247420_247513_250252_250328_274073_274104_283445_283529_286217
903133	contig_9578_pilon	-	2098	10	Intergenic	novelGene_67968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	102.606042707045	58	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	276	1247	1182606	1058571	FALSE	30	AAATCTCTGCTTTATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNPNSPVRTFGLSLSSDSSALGAAASDSEQNKTEEERESRSLFPGSLKHKLGKRDYLEKAGELIKLALKKEEEEDYEAASDFYRKGVDLLLEGVQGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEEVGAITEETEACDWWSLGAVLFELLTGKTLVECHPAGINTHTILNMPGSISEEARSLIQQLLQFNPVERLGAGVAGVEDIKSHPFFTPVDWAALTR	1204430	1057719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1099512_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1182314_1182678_1198800_1198895_1204320
903134	contig_17859_pilon	-	9015	33	Intergenic	novelGene_155721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_7	93.1432867951309	646	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1267	3804	990	4793	235369	206195	FALSE	10	TTGTCTGTGGAGGTGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIACVSPSDRDFMETLNTLKYANRARNIKNKVVVNQDKTSQQISALRAEIARLQMELMEYKAGKRVIGEDGAEGYSDLFRENAMLQKENGALRLRVKAMQEAIDAINNRVTHLMSQEANLLLAKAGDGNEAIGALIQNYIREIEELRTKLLESEAMNESLRRNLSRVSARSPYSLGSSPAAPSFGGSPASSMEDATEVIRKAKQDLERLKKKESRQRRKSPEKDAFKKRAKLQQENSEETDENEAEEEEEERDESGCEEEEGREDEDEDSGSEESLVDSDSDPEEKEVNFQADLADLTCEIEIKQKLIDELENSQRRLQTLKHQYEEKLILLQNKIRDTQLERDRVLQNLSTMECYTEEKANKIKADYEKRLREMNRDLQKLQAAQKEHARLLKNQSRYERELKKLQAEVAEMKKAKVALMKQMREEQQRRRLVETKRNREIAQLKKEQRRQEFQIRALESQKRQQEIVLRRKTQEVSALRRLAKPMSERVAGRAGLKPPMLDSGVEVSASTTSSEAESGARSVSSIVRQWNRKINHFLGDHPASTVNGTRPARKKFQKKGASQSFSKAARLKWQSLERRIIDIVMQRMTIVNLEADMERLIKKREELFLLQEALRRKRERLQAESPEEEKGLQELAEEIDVLAANIDYINDSITDCQATIVQLEETKEELDSTDTSVVISSCSLAEARLLLDNFLKASIDKGLQVAQKEAQIRLLEGRLKQTDMTGSSQNHQLLDALREKAEAHPELQALIYNVQQENGYASTDEEISEFSEGSFSQSFTMKGSTSHDDFKFKGEPKLSAQMKAVSAECLGPPLDISTKNITKSLASLVEIKEDAVGFSIRDSYYRDKVSRTISLPTRGSTFPRQSRGTETSPLTRRKSYDRGQPIRSTDVGFTPPSSPPTRPRNDRNVFSRLTSNQSQGSALDKGIITPVGGAKGARTAPLQCVSMAEGHTKPILCLDATDELLFTGSKDRSCKMWNLVTGQEIVALKGHPNNVVSIKYCSHSGLVFSVSTSYIKVWDIRDSAKCIRTLTSSGQVISGDACAATTTRAITSAQGEHQINQIALSPSGTMLYAASGNAVRVWELSRFQPIGKLTGHIGPVMCLTVSQTSSHHDLVVTGSKDHYVKMFELGEGVTGTVGPTHNFEPPHYDGIECLAIQGDILFSGSRDNGIKKWDLEQQELIQQIPNAHKDWVCALAFVPGRPMLLSACRAGVIKVWNVENFTPIGEIKGHDSPINAICTNTKHIFTASSDLTVKFWSVRRLPSGPP	240774	201972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_206250_207351_207552_208424_208596_209876_209995_210286_210452_212722_212904_213787_213925_217560_217675_219177_219253_219331_219538_220298_220357_220539_220592_220739_220906_221708_221811_221897_222093_222315_222464_222659_222893_223401_223471_223971_224080_228021_228222_229909_230102_231198_231317_231728_231811_232206_232426_232523_232588_233778_233969_235183_235380_235904_236021_236386_236555_236887_237024_237122_237273_240044_240228_240548
903135	contig_6544_pilon	+	2105	13	Intergenic	novelGene_142061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	65.8772005746719	294	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	110	1291	11054	24564	FALSE	5	CTCCTGGTCTGGACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEEDAPAPSTSADKVESLDVDSEAKKLLGLGQKHLVMGDIPAAVNAFQEAASLLGKKYGETANECGEAFFFYGKSLLELARMENGVLGNALEGVHVEEEEGGKTEDESLVENNDNIDETEGSEEEDKENDKAEEMPNDSVLENKSLQENEEEEIGNLELAWDMLDLAKIIFKRQETKEAQLYAAQAHLKLGEVSVESENYVQAVEEFQACLNLQEQYLEAHDRLLAETHYQLGLAYGYNSQYDEAVAQFSKSIEVIEKRMAVLNEEKKEAEGSPTEYEKEIEELKELLPEIREKIEDAKESQRSGNVAELALKATLVESSTSGFTSSGGGSSVSMIASRKPTDGASSSNCVTDISHLVRKKRKPEEESPRKDDAKKARQEPEVNGSSGDAVPSGNEVSENMQEAENKAESRAAVEGTVEAGATVESTAC	5993	25378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_6045_10995_11107_12992_13074_14290_14401_20544_20625_21128_21215_21320_21395_21749_21939_22068_22236_22921_22979_23075_23154_23866_23993_24483
903136	contig_10765_pilon	-	2268	10	Intergenic	novelGene_122930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	53.0152552002781	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	16	1698	243671	199075	FALSE	35	ATGCACACTGTAATTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVQEGVGREVMGQCVWLQGESMDNFNWGVRRRSLDSLDKCDLQLLEEHQLSGRTPSLSKMDREDSDESSEEEDLTTSQLLEHSDLIMTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKAEAVQEEEDTTVHEDDLSSSINELPATFECSDSFSLGMTEAEEKGDRALDQFTLASFGEGDRGVSPPPSPFFSAILAAFQPTACDDAEEAWRSHINQLMCDSDGSCAVYTFHVFSSLFKNIQKRFCFLTCDAASYLGDNLRGIGSKFVSSSQMLTSCSECPTLFVDAETLLSCGLLDKLKFSVLELQEYLDTYNNRKEATLSWLANCKATFAGGSRDGVITCQPGDSEEKQLELCQRLYKLHFQLLLLFQSYCKLIGQVHEVSSMPQLLNMSRELSDLKKNLKEAAAALAGDPFDTGGAWSEPTFTSTEAAIQAMLECLKNNDLGRALRQIRECRSLWPNDIFGSNSDDEVQTLLNIYFRHQTLGQTGTYALVGSNQSLTEICTKLMELNTEIRDMIRRAQSYRVLTAFLPDSSVSGTSL	243686	198504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_199334_202638_202842_203832_203944_222178_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236243_239034_239202_242487_242650_243413
903137	contig_16846_pilon	+	2816	3	Intergenic	novelGene_82934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	6	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2369	2698	576790	577119	FALSE	35	AAAGGCATTAGCGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQALGCTGSLMYAKETDVFIYKEVTEHTLQAMVPQQGREAKVHTQVGVVTEAKSAHSSSLTAHPTNPYRSWRQCELPPLSGYTDWASWREPTLQQALTGEGEENQHA	518579	577237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_518861_520467_520574_574808
903138	contig_2710_pilon	-	5854	14	Intergenic	novelGene_161774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_4	185.54601974655	925	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	317	1720	1106645	944051	FALSE	25	TGACTGGTTTTAAATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAPTTPPSVDKVDGFSRKSVRKARQKRSQSSSQFRSQGKPIELTPLPLLKDVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFMDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGCLTEQTYPEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQEFQPSIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFVYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKVLIPLHTVRSLSLFHAQLAYCIVQFLEKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLKAFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIPT	1109135	939916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_944151_948310_948413_950426_950555_956497_956618_958356_958408_958511_958566_960067_960177_961169_961230_961353_961485_985987_986081_992008_992111_1019489_1019687_1106488_1106653_1108826
903139	contig_5423_pilon	-	3160	22	Intergenic	novelGene_85181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_7	437.971312700158	247	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	942	2826	335	3160	411648	178174	FALSE	15	GTGCCTGACGTGCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKMSSFLYIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVHPEAGDLTNPPKKFRDCLFKVCPMNRYSAQKQYWKAKQAKQGNHTEAALLKKLQHAAELEQKQNESENKKLLGEIVKYSNVIQLLHIKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVSLDAAGNEGSWFYIHPFWKLRSEGDNIVVGDKVVLMPVNAGQPLHASNIELLDNPGCKEVNAVNCNTSWKITLFMKYSSYREDVLKGGDVVRLFHAEQEKFLTCDEYEKKQHIFLRTTLRQSATSATSSKALWEIEVVHHDPCRGGAGQWNSLFRFKHLATGNYLAAELNPDYRDAQNEGKNAREGDLPTSKKKRQAGEKIMYTLVSVPHGNDIASLFELDATTLQRADCLVPRNSYVRLRHLCTNTWVTSTSIPIDTDEERPVMLKIGTCQTKEDKEAFAIVSVPLSEVRDLDFANDANKVLATTVKKLENGTITQNERRFVTKLLEDLIFFAADVPNNGQEVLDVLITKPNRERQKLMREQNILAQVFGILKAPFKEKAGEGSMLRLEDLGDQRYAPYKYLLRLCYRVLRHSQQDYRKNQEYIAKNFCVMQSQIGYDILAEDTITALLHNNRKLLEKHITAKEIETFVSLLRRNREPRFLDYLSDLCVSNTTAIPVTQELICKFMLSPGNADILIQTKVVSMQVDNPMESSILSEDIDDEEVWLYWIDSNKEPHGKAIRHLAQEAKEGTKADSEVLTYYRYQLNLFARMCLDRQYLAINQISTQLSVDLILRCVSDESLPFDLRASFCRLMLHMHVDRDPQESVVPVRYARLWTEIPTKITIHEYDSITDSSRNDMKRKFALTMEFVEEYLKEVVNQPFPFGDKEKNKLTFEVVHLARNLIYFGFYSFSELLRLTRTLLAILDIVQVPMSSYFERLSKFQDGGNNVMRTIHGVGEMMTQMVLSRGSIFPMS	411982	178173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_178260_204308_204460_205821_205967_206438_206691_207998_208185_208303_208424_214142_214316_220441_220604_223567_223710_244252_244414_245160_245261_250720_250873_263864_263910_276688_276785_281423_281571_281872_281957_282264_282364_286309_286469_289019_289107_289956_290073_345663_345735_411556
903140	contig_5003_pilon	-	1099	4	Intergenic	novelGene_120223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_3	48.187135212627	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	19	612	187425	182509	FALSE	30	TATACCTGTTTGAAATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGLEVMAWVPVESAVEELMPRLLPVEPCDLTECFDPSVPPRTPQEYLRRVQLEAAQCPDVVVAQIDPKKLKRRQTVNVSLSGCQPAPEGYSPTLQWQQQQVAQFSAIRQSVNKHRSHWKSQQLDSNVIMVREFSQFKLYNVQLAFPIRGFNQPQMENIRVGGGAQGRGGNAEGRTRQDRVWSKERYVAVKKEAPGGLEAVPP	187443	182021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_182791_183049_183140_186854_186940_187288
903141	contig_7630_pilon	+	2348	1	Intergenic	novelGene_133657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	83	382	532258	532557	NA	55	ATCTTAAAACCAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAKFIRWGKKSLFNKWCWENWISTYRKMKQDPYFTPFTKTNSKWVKDLNMQTKTIKFLKEKTGATLSGLAFNNELSNIITKAQTAKDKINKWDHIKVKNLCSSKDFTKKVKRTSYQQGGYLQKPFI	532175	534523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_532200_534500
903142	contig_6137_pilon	+	6861	17	Intergenic	novelGene_59237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_13	1279.55497482279	97	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	4286	5140	1328176	1345285	TRUE	20	TATTAGTATTCTTTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQR	1315555	1354719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1345282_1345366_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
903143	contig_15185_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_99390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGTTCCACTTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105807	103515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_103500_105800
903144	contig_3153_pilon	-	3011	2	Intergenic	novelGene_104644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	248	709	103739	103278	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRELPEIQIGFRRECGTKDIIADVRWILAESREYQKDVCLCFIDYAKAFDCVDHNKFYITLRRMGIPEHLILLMQNLCIEQEVVVLTEQGDTAWFKIRKDVHQGCDLSPYLFNLYAELDYMEKNEASGLEEDLLTTYNMQIIQPCLLKVKRI	104172	100975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_103808_103993
903145	contig_12948_pilon	-	5844	3	Intergenic	novelGene_126167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	832	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCACGAAACAAACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172547	56842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_57015_70527_72078_168425
903146	contig_7138_pilon	+	2689	1	Intergenic	novelGene_120999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303496	306185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_303500_306200
903147	contig_11572_pilon	+	1191	3	Intergenic	novelGene_100063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_2	61.5	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	739	1071	268881	270528	FALSE	40	ATTACAGCATTACTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSGHNTAVSQLSKAKEALTAAAETLKERKAAIRDIEAKLPQTEQELKEVKKFVSEGRLDIVNQP	266538	270648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_267160_268763_268929_270243
903148	contig_16322_pilon	-	2031	14	Intergenic	novelGene_87533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	159.759730838635	6	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	15	1712	108570	77890	FALSE	10	TCATTTTTGGCTTTAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVIATFFHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108584	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89882_90079_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
903149	contig_15720_pilon	-	5258	1	Intergenic	novelGene_41938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1683	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAAAAAAGAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304959	299701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_299700_305000
903150	contig_6710_pilon	+	3647	2	Intergenic	novelGene_89073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCACAGTGATGGCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653351	657176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_654573_654750
903151	contig_5649_pilon	-	3570	7	Intergenic	novelGene_82356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	80.2234725972116	183	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	590	934	971685	970776	FALSE	5	TGTCCTTTTGTGATTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYGGLTSLFNLVVLTWALQVLRRLRAREKALGARACRDAVTVLGLTVLLGTTWVLAFFSFGIFLLPQLFLFTIFNSLYGFFLFLWFCSQRCCTEAEAEAGTEMEAFSSSQMMQ	995773	968139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_970883_971447_971726_974496_974572_980982_981081_990838_991020_994065_994247_995759
903152	contig_1008_pilon	-	5754	5	Intergenic	novelGene_121546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_4	39.162322454114	372	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	213	1355	573637	520962	FALSE	75	ACAAGGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANKTGYVPSNYVERKNSLKKGSLVKNLKDTLGLGKTKRKTSARDASPTPSMDAEYPANGSSTDRIYDLNIPAYVKFAYLAEREDELSLVKGSRVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVMEEVDEASADSPSFRSLRKGASMSNGQGARALHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNSRGQIGLVPKNYVVVLSDGPALQPSHAPQISYTGPSATGRFAGREWYYGSVTRHQAECALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVEHYKKAPIFTSEHGDKLYLVKALQ	701063	516562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_521157_534949_535672_573411_573654_608217_608393_701042
903153	contig_17074_pilon	+	4190	1	Intergenic	novelGene_145201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCGACACGTGTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657113	661303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_657100_661300
903154	contig_17144_pilon	-	2389	14	Intergenic	novelGene_29280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1738.19866971086	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	220	2094	174597	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183208	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174730_181812_181850_183158
903155	contig_7342_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_71176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1014	1442	476814	476386	NA	20	TTTTTGCAGCGGGGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSGYILGSLELSLFSRHTHGDRVSSHQTRGQSVGTTRLTGTDLPILRLQTNADLLTLLKLGLHPNWERCPRGLNLPAASELKEIQACPEGTDKPGLSQWGSKKTGQTIELFKVPSGVPKLKLDLWVRPRCARSQSLRRWF	477827	475734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_475700_477800
903156	contig_11708_pilon	+	3421	1	Intergenic	novelGene_138975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAGAATATTACTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296403	299824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_296400_299800
903157	contig_2438_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_112063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	715	1107	311851	312243	NA	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGGTGTGCGGCPRGDQRQRGVYVFVLWGELAMLGVGVEKGMGGRVIRRSGLLTE	311136	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_311100_313500
903158	contig_16098_pilon	-	716	5	Intergenic	novelGene_46199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	433.858487873638	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	30	608	708827	705466	FALSE	0	CCTGGCTCTGGCTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIRKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPYQCPVCQQRFKRKDRMSYHVRSHDGAVHKPYNCSHCGKSFSRPDHLNSHVRQVHSTERPFKCEKCEAAFATKDRLRAHTVRHEEKVPCHVCGKMLSSAYISDHMKVHSQGPHHVCELCNKGTGEVCPMAAAAAAAAAAAAVAAPPTAVGSLSGAEGVPVSSQPLPSQP	708856	705357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_705467_706285_706431_707721_707894_708172_708237_708630
903159	contig_6784_pilon	+	2276	4	Intergenic	novelGene_178795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1337	2014	26133	54623	TRUE	50	GAATTAGAGCAGAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQQRTQPACSDIAKFKKRMKQTNIQLVNEKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDLKTKSTIKDKEGHYILIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLKTLKRETDNSTIIVGEFNTPLSVKDRTIKKKLSKDIEDLKGTVSQLDLIEIYRTLHPTAAKYKFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSMLSNHNAIKVEINNRKSKGKKINYMETE	24637	64336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6784_pilon_+_25744_25902_26225_54037_54844_64294
903160	contig_610_pilon	-	3833	2	Intergenic	novelGene_76701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	0	361	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACATGCTTCTGTAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221332	204468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_207487_220517
903162	contig_2730_pilon	+	2256	3	Intergenic	novelGene_135352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	565.5	147	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCATTGTTATATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291553	312104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309919_310612
903163	contig_15629_pilon	+	3349	11	Intergenic	novelGene_122457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_9	65.0633537407964	2	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	113	1360	121130	160638	FALSE	25	TGTTGAACTTTACTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTELPLAFLILMFSNTSENCMSRLHITAVEGEPFYLKYCRSSSEHKNEKNTRWCYQPNGSLEQIELNPSNSPRIAFHEYALEFWPVELSDSGSYFLKMGNDTHEWKLNVIRRNKHNCFTEKQVNTRTVEVKKHLMIKCETPYYRKLINKTSLYKNCEQIEIRGNTFEKNAEFEDQGYYTCVFSLHYNGKLFNVTKTFNVTIAGDYNSITPVLLGPKFNQIEVELGKSEQLNCSALLNKDDTVYWNFRKENETDHNLHEEQEIKIKTSEGKWHASRILRIENINENNLNFLYNCTLASKGGTDVRVFILVRKENVDIPGHIFTRGMITAVFILVAVVGIVTVCAIYRVDLALFYRHLIGRDETLTENVDQKVTRSTPSLWRFCPVCWRNILGINYAYLKGMYCLEELLLMKSIH	115352	162627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_115437_121101_121188_124615_124860_126730_126897_132731_132880_137886_137950_143382_143504_147329_147470_154570_154730_158430_158553_160611
903164	contig_11855_pilon	-	1932	10	Intergenic	novelGene_66976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1788.05076984843	21	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	97	813	1102035	1084568	TRUE	20	TGTTCTGTAACTCGAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKILIVMSV	1102131	1078730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079454_1082885_1083047_1084332_1084592_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
903165	contig_8729_pilon	-	6706	10	Intergenic	novelGene_40111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	179	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	411	830	904654	820356	TRUE	30	CACAAAACCTGTTGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSILSSLLVFYLQLFAHIIIILCLNEPPSEIFSSFTSSFLPFALATQRSRASFRVSSDIHFGPFFLSCLFNDLLLSSYMMSLMSLHNSSGLWSLVFNTSNLFLRYSLNSGGIYSRLYFGSQGLVLIFFSFNLNLHMSN	905064	307324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_308910_479737_480239_480429_482325_546763_547282_665070_665324_730452_730582_766975_767247_782569_782864_819925_820762_904640
903166	contig_12689_pilon	+	1958	6	Intergenic	novelGene_145043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATAGTCAATAAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88538	168617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_88613_88758_88795_90614_91620_106201_106363_106579_106981_168336
903167	contig_12677_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_110749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492	15	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_500
903168	contig_5551_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_134243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1855	2196	453199	453540	NA	50	AAAGTCAATGATTCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQHGLHFNIKKIKILITGPISNIMINGEKIEVVKNFVLLGSTINAHKSNSQEIKRCIAMGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVHLMQAMVFSVTSYACESWIVNKND	451344	454257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_451300_454300
903169	contig_2414_pilon	+	2719	2	Intergenic	novelGene_158529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	146	664	1155127	1155645	TRUE	20	TGCCGGCAGATCATCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALECWVANAKRRNDEVKELNRRFQRAAREDKVKYYNDMCKDLEVEKQKERIHMAFLSLKKLKKKFKLQVAIVKDSMGKILNDAGSIERRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEEAYDQEPMVLKEEVQAALKALSKNKDPVTDGISTEKFQQTDAALEMLTRLCPEN	1154981	1160138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_1156106_1158543
903170	contig_6163_pilon	+	5121	14	Intergenic	novelGene_103837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	2999	3547	385306	399853	TRUE	20	TTTGTTTGGAAAGCTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGIWRRCLLPWRPQNSHLLSIWTSTWCWSPYHRGHSLVHHTRWWDAREAGHTWRKVVGWRPPRVKWLHAAHANKAINWALQRWKAWRIATHHAFIFCLLGCLKVSPFCPHESAELPKRVVWVLSLNHSSHLAAEQDVATHVDFPFGPFLLCTALGRLWGRLWGCVGHEVQLAGQRGLKLR	381349	435089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_384188_385145_385360_385468_385541_388523_388681_395507_395713_399792_399997_400425_400615_410964_411124_413703_413852_417926_418188_418825_418982_420376_420567_430028_430240_434972
903171	contig_10766_pilon	+	3130	2	Intergenic	novelGene_151219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1171	junction_1	0	15	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	220	723	191087	194104	FALSE	20	TGTATGCTCAAATTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSNRVFSVYFCSENEGDVGTLKNNKVTLAIPLKYEVMLSVHGFVNPTSFVYGSHEENEPQTCMEEKINFTFHVRKVDCVEICNRMKECYHVLFQGSSASPLSHDAGTAEGGKGAATHSTHALSSRALISFLPLSCPWSSSPHLLTGQVVKNKQEQVIMLVTSKAIR	190867	196511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_191215_193728
903172	contig_16703_pilon	-	3898	2	Intergenic	novelGene_72765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1695	2045	20572	20222	FALSE	55	TAAATGAGAACATAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAGPHLGGLSHRRQPGGSHISRKGLGKVRARHFRTQLQYSLSLLLPSHQAHGLAQFLSTGTCHPLHHQGLLNRKHHGVLPVRCQARVPKVMLGLGCQFPLQGHPEPTERVACCLG	22310	18368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_20741_20784
903173	contig_15897_pilon	-	6060	26	Intergenic	novelGene_49564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1358	1885	880989	879018	TRUE	5	CTCCCGGGCTCACTCGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACPLQGVGRVAAPTAAATKTSRQSLFWGSFGFQRRPILLALIAGRGLTTTWPNGLLPKPSRLQLSALSVNQGSLARKASLGQLLLLTQTGPRQAAVHLGVRLSHVAFSPLPPLTEVTALRGCFPFFIGVIRGVLVREFRGPATHSTALAPRTEFGPAWPLTCQQVGLLLRPPQA	888826	806615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_806749_842297_842468_843310_843489_846503_846607_849568_849643_853910_854056_855943_856186_856652_856774_857228_857371_860534_860627_862641_862833_866902_867222_868799_869005_871347_871541_876428_876648_877369_879456_880899_881108_881722_881867_882513_882656_884355_884436_885030_885222_885376_885578_886060_886148_887317_887420_887602_887790_888721
903174	contig_13612_pilon	+	1730	9	Intergenic	novelGene_157287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	99.1878741328798	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	199	1209	51083	57016	FALSE	20	GTGGTTGTAAGATGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	49360	57537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56881
903175	contig_1337_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_84264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAGGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609329	607853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_607900_609300
903176	contig_12050_pilon	+	4098	4	Intergenic	novelGene_62757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	3136	3663	937629	938156	FALSE	15	GGTTGTGTCCATTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETENPQQANTTAVLWQPRLTDGCVGNGEKHLHNLTVSPATFLVASKGRIVTSLWRKLRHPLTQRSQSTAPGVRYSDICESWNLCKAETCQRRKTQIFSTKMSARKVVRLHPVKGGKLARPEKRGGPVEFRLSQVHCHHRVPPDAARGHGFPSTGLLPKTHLSLTLRRCQSSPK	761584	938591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_761809_807779_808171_861237_861590_935460
903177	contig_11088_pilon	+	856	4	Intergenic	novelGene_85033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	57.9271573232759	4	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGAGGGTAGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13625	17535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_16250_16348_17119
903178	contig_1154_pilon	+	6063	2	Intergenic	novelGene_87130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	355	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATAGAAAGTATTTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471559	477864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_474055_474296
903179	contig_10339_pilon	-	4601	7	Intergenic	novelGene_125271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.8221299129512	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	237	1001	357260	332025	TRUE	15	CTTCGTCCTCAGAGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAQCGKCIGPALLRFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSEDGVALCMFMQNTLTRFMRLPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSGRELRLEEALLTERDLVGTVWGGPANLEAVARKGKSSK	366800	292296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_292503_308600_308709_328738_332434_346586_346668_348532_348588_357040_357263_366566
903180	contig_3095_pilon	+	1248	5	Intergenic	novelGene_75000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	28407	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
903181	contig_5041_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_27090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	266	568	549770	549468	NA	15	TCCTAGCATGTTTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNIHKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLLLRFTVQPGIGQPHKTKRNE	550035	547729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_547700_550000
903182	contig_17144_pilon	+	1382	9	Intergenic	novelGene_29234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	134	652	166201	173661	TRUE	15	CTGGTCAGGCTCCAGGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGDGDQEYRRLRGASGIPETGVVFSLLTRPSLVDSPGPSGGRPSQMGLQETRYPWIRPLSSSRGIGFQNSCTFTVLGSSCLCRHHVSSLTIGAPFCGFQLQAGTPVTPVAWQGPAGAAHLQGVGCGWEKATELVVEGPGGQGGHLGPAGFSKLWLVAQLTLLFHVQAWLP	166067	179732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166345_172680_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699
903183	contig_8656_pilon	+	3329	2	Intergenic	novelGene_162364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	0	12	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGCATGTCCAAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643283	648922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_644760_647069
903184	contig_753_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_113018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAGATAGTTTTTATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369531	1371354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1369500_1371400
903185	contig_14923_pilon	-	3202	1	Intergenic	novelGene_157751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	327	984	2206	3189	355598	354615	NA	50	AACTGAAGATATGATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSIVQGCKRTYLSQRDLQAHINHRHMRAGKPVTRASLENVHPPIAPPPTEIPDRFIMPPDKHHMSHIPPKQHIMMPPPPLQHVPHEHYNQPHEDIRAPPAELSMAPPPPRSVSQETFRISTRKHSNLITVPIQDDSNSGAREPPPPAPAPAHHHPEYQGQPVVSHPHHIMPPQQHYAPPPPPPPPISHPMPHPPQAAGTPHLVYSQAPPPPMTSAPPPITPPPGHIIAQMPPYMNHPPPGPPPPQHGGPPVSAPPPHHYNPNSLPQFTEDQGTLSPPFTQPGGMSPGIWPAPRGPPPPPRMQGPPSQTPLPGPHHPDQTRYRPYYQ	357803	354601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_-_354600_357800
903186	contig_3789_pilon	-	4059	3	Intergenic	novelGene_79821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTGAACCACTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312483	160671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_161710_212432_213125_310154
903187	contig_8866_pilon	-	10219	55	Intergenic	novelGene_77889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	130.242851144884	663	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1392	4179	105	4283	1205994	1096371	TRUE	25	TCATCATATGATATCGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSLVQFCYFQDLPAARDFLFPHLREETPSGAARRDPSKSADWEDDGWGAWEETEPQEPEEEGTTCKTQKTSWLQDCVLSLSPTNDLMVIAREQKAVFLVPKWKHNDKGKEEMQFAVGWSGSLNVEEGECVTSALCIPLASQKRSSTGRPDWTCIVVGFTSGYVRFYTENGVLLLAQLLNEDPVLQLKCRTYEIPRHPGVTEQNEELSILYPAAIVTIDGFSLFQSLRACRNQVAKAAALGNENIQPPPLAYKKWGLQDIDTIIDHASIGIMTLSPFDQMKTASNIGGFNATIKNSPPAMSQYITVGSNPFTGFFYALEGSAQPLLSHVALAVASKLTSALFNAASGWLGWKSKHEEEAVQKQKPKVEPATPLAVRFGLPDSRRHGESICLSPCNTLAAATDDFGRVILLDVARGIAIRMWKGYRDAQIGWLQIVEDLHERVPEKVDSSPFGNTQGPSRVAQFLVIYAPRRGVLEVWSTQQGPRVGAFNVGKHCRLLYPGYKIMGLNNVTSQSWQPQTYQICLVDQVSGSMKTVTAPFHLALSDKKSERAKDMHLVKKLAALLKSKSPSLDLMEMEIKELILDIKYPATKKQALESILASERLSFSCLRNITQTLMDTLQNQELESVDEGLLHFCASKLKLLHLYESVSKLNSLDFHSDTPFSDNDLAVLLRLDEKELLKLQSLLERYKQESTRTAVRFSDDKDGVLPVKTFLEYLDCEKDVINVKKISEEAYVALGALFFWKCLHGESSTEDMCRTLESAGLSPQLLLSLLLSVWLSKEKDILDKPQSVCCLHTMLSLLSKMKVAIDETWDSQSVSPWWQQMRTACIQSENSGAALLSAHVGHSVAAQLSNTVTEKKFSQTVLGADSEGLTDSWEALSLDTEYWKLLLKQLEDCLILQTLLHSRANARPSKASSLQAEPLPRLSVRKLLEGGKGGIADSVAKWVFKQDFSPEVLKLANKERGVENPDEPKEGINRGFLEELEVDMDLGATPDVLPLACQQFPCSLELDVLLAHCCWEYVVQWNKDPEEARFFVRSIEHLKHILNAHVQNGVALMMWNTFLVKRFSAATYLMDKVGKSPKDRLCRRDVGMSDTAVTSFLGSCLDLLQTLMEADVSRDEMQAPVLDTEDAWLSVEGPISLVELALEQKHIHYPLVEHHSVLCSILYAVMRFALKAVKPLSLFDSKGKNAFFKDLTSIQLLPSGEMDPNFISVRQQFLLKVVTAAVQAQHSVAEDRDASEEAVTTPFWKDQDWPVLAVDLAHHLQVSEDTVRRHYVGELYNYGVDHLGEEAILQVQDKEVLASQLLMLIGQRLAYALFHTQTREGMELLARLPPTLCTWLKAMDPHGLQNTAVPIATTAKLVNKVIELLPENHGQYSLALHLIEAVEAVSIPS	1206098	1043074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1043196_1044077_1044232_1044327_1044375_1044456_1044568_1044646_1044739_1045101_1045216_1048076_1048247_1048986_1049079_1050936_1051088_1053170_1053332_1068884_1068988_1069976_1070077_1078296_1078402_1079354_1079458_1080843_1080968_1081521_1081654_1082451_1082558_1083470_1083618_1084068_1084259_1091616_1091763_1092903_1096524_1096722_1096882_1097927_1098150_1098414_1098505_1103848_1104068_1104287_1104363_1105952_1105989_1111887_1111959_1113972_1114040_1116435_1116543_1116645_1116820_1119164_1119394_1120841_1121003_1121629_1121736_1125894_1125993_1126369_1126584_1128528_1128657_1131752_1131844_1134395_1134461_1134807_1134891_1135103_1135248_1135976_1136194_1138572_1138713_1140273_1140364_1140481_1140562_1141430_1141580_1150008_1150108_1152315_1152416_1155258_1155361_1155645_1155722_1155801_1155850_1158006_1158089_1158981_1159106_1182622_1182688_1205879
903188	contig_15327_pilon	-	1420	15	Intergenic	novelGene_70789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	116.489642177723	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	80	1351	1204638	1185925	FALSE	15	TTGGCCGGGCGAGTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204717	1185855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192640_1203389_1203474_1204300_1204367_1204578
903189	contig_11548_pilon	+	2243	11	Intergenic	novelGene_66742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1200.52406889658	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	574	1410	102092	119638	FALSE	25	CTGGAAACCATTACGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63650	120471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63819_84717_84810_86979_87080_96086_96198_101989_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
903190	contig_14445_pilon	+	1173	2	Intergenic	novelGene_137387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGGGGCTTGGATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397247	432403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_397401_431383
903191	contig_8581_pilon	-	2014	9	Intergenic	novelGene_22843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	599.543784889811	1	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	49	1152	326214	307216	FALSE	35	TGTACCAACTCAAAGACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTSSPESCTKP	326262	306353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_309084_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006
903192	contig_11258_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_67800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGGGCTGGTCCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286809	284502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_284500_286800
903193	contig_15570_pilon	-	3039	1	Intergenic	novelGene_137835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACCACAGCTTGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473315	470276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_470300_473300
903195	contig_6410_pilon	-	4035	3	Intergenic	novelGene_108612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	992	1366	22354	20281	FALSE	20	TGACCTGGAGCCCAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRQMRKCSRSLAIRAMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLKKARNRNTIDPAILFLGIYPRELRVVTRIHMHTHVHCSTVHNSKKMETI	24396	17611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_20440_22138_22958_24008
903196	contig_20602_pilon	-	1486	11	Intergenic	novelGene_133729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	299.942344459731	98	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	21	1298	29552	16186	FALSE	45	ATTAAAATGAGTGATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVTLEECILPIMALKILYICGHKMPAGVDTDL	29572	15997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_16282_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
903197	contig_9982_pilon	+	4102	4	Intergenic	novelGene_55741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	185	junction_1	62.9144039328215	19	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2292	2600	311646	311954	TRUE	80	AAAAAATTAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKAFLILLCSYSPAMFYQLKGLATTRLSVEAFIGLRCYPGFCRASRLRQTRKRGLAICFRKSASEDPADRNGLIRCVWGCQESGADLAAANSSGVKKCPFP	309354	317292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_313217_315168_315273_316048_316153_317260
903198	contig_16917_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_161933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139659	137602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_137600_139700
903199	SIRV6	+	1467	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	5	56	5	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	253	744	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1092	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
903200	contig_15787_pilon	-	6938	1	Intergenic	novelGene_143981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	536	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGGTTCAAGCACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75103	68165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_68200_75100
903201	contig_15897_pilon	-	3665	4	Intergenic	novelGene_49556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.49443825784929	272	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	968	1348	682399	682019	TRUE	10	AGGCCTGGCGAGGGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDNFYPSVTWAVPVSESNVAKLTNIYRDQSFTTWLVATNTSTNDMIILQTLHWRMQLSIEVNPNRPLGQRARLREPIAQDQPKILSKNEPIPPSALVKPNANDAQVLMWRPKYGPPLVVIPPKHR	699665	679295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_680598_681003_682548_690252_690393_698986
903202	contig_18194_pilon	+	4453	1	Intergenic	novelGene_55965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	194	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2074	2565	11324	11815	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNEKTLRTEWDTVKSKNLQVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTENFLNIMKDEKLTIQKAQRNPYRIDPKRKSPRRIIITLAKTKDKQRILRAAQKNQKVTYRGETIRLNSDYTAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIHPAKFSFKYDGEIRTFPDEQK	9250	13703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_+_9200_13700
903203	contig_6589_pilon	-	2454	16	Intergenic	novelGene_26259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_14	54.2841904548031	374	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	829	2394	2233261	2227865	FALSE	5	GCTTGGCCAGCGTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWKILYPEIPRKLRELETKGYKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2234089	2227804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2230878_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110
903204	contig_14219_pilon	-	4819	23	Intergenic	novelGene_54284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_17	216.934617106569	28	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1464	4395	155	4549	676735	582867	FALSE	45	AGTAAATGTTGACAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIVNGGSWTGEPPRRNSHTFNCRMLVKPLPDSEEEGHDNQEAHQKYETMQCFAVSQPKSIKEEGEDLQSCLICVARRVPLKERPVLPSSESFTTRQDLQGKITSLDTSTMRAAMKPGWEDLVRRCIQKFHTQHEGESVSYAKRHHHEVLRQGLAFSQIYRFSLSDGTLVAAQTKSKLIRSQTTNEPQLVISLHMLHREQNVCVMNPDLTGQAMGKPLNPISSSSPAHQAMCSGNPGQDMTLSSNINFPINGPKEQMGMPMGRFGGSGGMNHVSSMQATTPQGSNYALKMNSPSQSSPGMNPGQPNSMLSPRHRMSPGVAGSPRIPPSQFSPAGSLHSPVGVCSSTGNSHSYTNSSLNALQALSEGHGVSLGSSLASPDLKMGNLQNSPVNMNPPPLSKMGSLDSKDCFGLYGEPSEGTTGQAESNCHPGEPKETNDSSMPQPGSSERPDGQNRLHDSKGQTKLLQLLTTKSDQTEPSPLSSSLSDANKDSTSSLPGSGSTHGTSLKEKHKILHRLLQDSSSPVDLTKLIAEATGKELSQESSSTAPGSEVTVKQEPVSPKKKENALLRYLLDKDDTKDIGLPEVTPKLERLDSKTDPASNTKLIAMKTEKEEMSFEPSDQPGSELDNLEEILDDLQNSQLPQLFPDTRPGAPTGSVDKQAIINDLMQLTAENSTVTPVGAQKTALRISQSTFNNPRPGQLGRLLPNQNLPLDITLQSPTGAGPFPPIRNSSPYSVIPQPGMMGNQGMIGNQGNLGNSSTGMIGTNPSRPTMPSGEWAPQSSAARVTCAATTSAMNRPVQGGMIRNPTASIPMRASNQPGQRQMLQSQVMNIGPSELEMNMGGPQYSQQQAPPNQTAPWPESILPIDQASFASQNRQPFGSSPDDLLCPHPASESPSDEGALLDQLYLALRNFDGLEEIDRALGIPELVSQSQAVDPEQFSSQDSSIMMEQKAPVFPQQYASQAQMAPGSYTPMQDPNFHTMGQRPSYATLRMQPRPGLRPAGLVQTQPNQLRLQLQHRLQAQQNRQPLMNQISNVSNVNLTLRPGVPTQGPINAQMLAQRQREILNQHLRQRQMHQQQQVQQRTLMMRGQGLNLTPSMVASGGIPATLSNPRIPQANAQQFPFPPNYGISQQPDPGFTGATAPQSPLMSPRMAHTQSPMIQQSPANPAYQASSDMNGWAQGNMGGNSVFSQQSPPHFGQQANTSMYNNSMNINVSLATNTSGINNMNQMTGQISMTSVTSVPTSGLSSMGPEQVSDPALRGGNLFPNQLPGMDMIKQEGDTSRKYC	883258	582596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_582879_589018_589109_591142_591342_592609_592788_594649_594885_596943_597022_598033_598313_601123_601290_605267_605398_609037_609254_611519_611727_614151_614363_625515_626786_628523_628672_632777_632922_633201_633304_635724_635914_638846_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_883180
903205	contig_12402_pilon	-	3097	3	Intergenic	novelGene_133367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2437	2757	641082	577325	TRUE	20	TGGATCGGAGCTGACTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIEDHSLQHRLHLNINKTKILTTKPISNIMINGKKIEVIKAIILLGSTINTHGSSNQEIKLHIALGKSAAKDLFKVLKSKYVTLRTKVLLTQAMVFSITSYACES	643518	570161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_570338_577160_577483_640919
903206	contig_3832_pilon	-	3856	7	Intergenic	novelGene_161425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	349	junction_1	154.864098127645	342	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	1319	2680	75013	63968	FALSE	15	CCCCCTTTGATCAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGGNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSSSEKLQNINLAMSPLPASETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQPASPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFDVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPQSASTISVFQQTQMQEPAVIANTSTATTDELKTVTKDGMEDIKILIASPSPTHVLKETTSATTSPYSDTQSRTASPSRAGKGVIEQTEKSHPRSPNLLSVTLSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLSQAVGIGTLLQQPDDRATTTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPVQGSRNLLQGEELLRALDQVN	76331	62791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_64120_64556_64684_65240_65350_68428_68854_68979_69103_73716_74004_74874
903207	contig_11850_pilon	-	3140	3	Intergenic	novelGene_125231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1367	junction_2	527	59	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	247	1056	286754	285063	FALSE	20	TAATGTAATTTTTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLTSRSLSHWRSRAPRQLAPLLPSLAPSSSRQGARRVQRHVTAQQPSGLAGGTAIKGGRRRRPDLFRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEVGCVVILTHIF	287000	282978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_285261_285361_285531_286311
903208	contig_11702_pilon	-	1520	13	Intergenic	novelGene_141999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	201.534254050163	21	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	271	1032	510277	508213	TRUE	5	GCCAGCTCTCTGTTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAGRRRGQQQETETFYITKLQEYLSGRSVLAKLQAKHKQLQEAIQRGDKEEREMSWTQYSQRKVQRSRQPRPSSQYSQKLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSVFPPLAELPGPVYEKCMAPPLRQLLGGCPAGQHGGGE	510872	505998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506183_507568_507653_507909_508098_508180_508249_508330_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277_509339_509956_510060_510269_510298_510545_510631_510707
903209	contig_2100_pilon	-	1713	12	Intergenic	novelGene_50685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	837.172543606511	276	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	789	1364	1174340	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185511	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174370_1175570_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
903210	contig_14970_pilon	+	2429	12	Intergenic	novelGene_44933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_6	6377.93420660653	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	173	1729	136145	231550	FALSE	10	ACTCTTTGTGCTGTGATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTVTTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135972	232250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_196136_196257_207681_207823_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
903211	contig_14970_pilon	+	2460	4	Intergenic	novelGene_45120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAATGTTTATTGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267021	315789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_268978_280561_280695_285611_285812_315618
903212	contig_2257_pilon	+	8101	6	Intergenic	novelGene_122490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	191.345760339758	346	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	122	931	288451	331989	FALSE	45	GGAAAGTCATCTACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPGGCLVTGRCGAGYHSAVGGGWRGLWAGAPATASVCPVMAAAAAVVTPSGLEDGVSRSRGEGAGEVVVERGPGAAYHMFVVMEDLVEKLKLLRYEEELLRKNNLKPPSRHYFALPTNPGEQFYMFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLDMNESAKQEDILESTTDAAEWSLEVERVLPQLKVTIRTDNKVQKREHILFK	288329	339159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_288663_291408_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_331833
903213	contig_5744_pilon	-	2107	3	Intergenic	novelGene_149339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	103.5	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAACAATTCACTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655747	640743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642269_644567_644745_655342
903214	contig_2770_pilon	-	1340	5	Intergenic	novelGene_107443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1975.11687945296	34	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750772	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743851_744644_744680_746600_746745_747765_747797_750558
903215	contig_12638_pilon	+	1902	18	Intergenic	novelGene_33121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	636.495563280786	8	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	677	1762	182987	199604	FALSE	40	AATGTTAACAGGAATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQVDVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170909	199744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178127_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191794_195520_195554_198068_198151_198736_198847_199345_199415_199503
903216	contig_5423_pilon	-	3872	16	Intergenic	novelGene_85196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	480.428900971714	241	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	335	2293	411648	214070	FALSE	75	ATAAAGAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKMSSFLYIGDIVSLYAEGSVNGFISTLGLVDDRCVVHPEAGDLTNPPKKFRDCLFKVCPMNRYSAQKQYWKAKQAKQGNHTEAALLKKLQHAAELEQKQNESENKKLLGEIVKYSNVIQLLHIKSNKYLTVNKRLPALLEKNAMRVSLDAAGNEGSWFYIHPFWKLRSEGDNIVVGDKVVLMPVNAGQPLHASNIELLDNPGCKEVNAVNCNTSWKITLFMKYSSYREDVLKGGDVVRLFHAEQEKFLTCDEYEKKQHIFLRTTLRQSATSATSSKALWEIEVVHHDPCRGGAGQWNSLFRFKHLATGNYLAAELNPDYRDAQNEGKNAREGDLPTSKKKRQAGEKIMYTLVSVPHGNDIASLFELDATTLQRADCLVPRNSYVRLRHLCTNTWVTSTSIPIDTDEERPVMLKIGTCQTKEDKEAFAIVSVPLSEVRDLDFANDANKVLATTVKKLENGTITQNERRFVTKLLEDLIFFAADVPNNGQEVLDVLITKPNRERQKLMREQNILAQVFGILKAPFKEKAGEGSMLRLEDLGDQRYAPYKYLLRLCYRVLRHSQQDYRKNQEYIAKNFCVMQSQIGYDILAEDTITALLHNNRKLLEKHITAKEIETFVSLLRRNREPRFEVVHVVFFSSGDCGFLIYFQNF	411982	212490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_214316_220441_220604_223567_223710_244252_244414_245160_245261_250720_250873_263864_263910_276688_276785_281423_281571_281872_281957_282264_282364_286309_286469_289019_289107_289956_290073_345663_345735_411556
903217	contig_15866_pilon	-	5678	1	Intergenic	novelGene_63677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	625	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627082	621404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_621400_627100
903218	contig_4857_pilon	-	7261	8	Intergenic	novelGene_48896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	86.8839244425032	395	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	249	1712	1501060	1460499	FALSE	30	TTCTATAACTTACTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALPRTLGELQLYRILQKANLLSYFDAFIQQGGDDVQQLCEAGEEEFLEIMALVGMASKPLHVRRLQKALRDWVTNPGLFNQPLTTLPVSSIPIYKLPEGSPTWLGISCSSYERNSNAREPHLKIPKCAATTCVQSLGQGKSDVVGSLALQSVGDSRLWQGHHATESEHSLSPADLGSPASPKESSEALDAAAALSVAECVERMAPTLPKSDLNEVKELLKTNKKLAKMIGHIFEMSDDDPRKEEEIRKYSAIYGRFDSKRKDGKHLTLHELTVNEAAAQLCVKDNALLTRRDELFALARQISREVTYKYTYRTTKSKCGERDELSPKRIKVEDGFPDFQDSVQTLFQQAKAKSEELAAFSSQQPEKVMAKQMELLCTQAGYERLQHAERRLSAGFYRQSSEEHSPNGLTADNSDGQGERPLNLRMPNVQNRQPHHFVVDGELTRLYSSEAKSHPSESLGILKDYPHSAFTLEKKVIKTEPEDSR	1515867	1454949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1460588_1463568_1463686_1465934_1466098_1471403_1471494_1485560_1485613_1487708_1487843_1500241_1501080_1515638
903219	contig_854_pilon	+	1798	15	Intergenic	novelGene_36448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	491.268874591966	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	428	1672	1455725	1465350	FALSE	10	TCTCTTTCCTTTATTGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQFNLQTLPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFLNIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDDEEEEEEEEEEEEET	1451230	1465476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453657_1453779_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456387_1456461_1457303_1457417_1458336_1458470_1459021_1459170_1460135_1460207_1460534_1460621_1460745_1460876_1464205_1464349_1464541_1464823_1465336
903220	contig_5419_pilon	+	5309	12	Intergenic	novelGene_15479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	4270	4671	127355	134449	FALSE	5	TCCCCGCGCTGCCACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLGSVSKVPPAKGGNHLVLECGVGGIPPLQRQMMGLILSGSSGTWLSLPSWGGKLGPQRTRRGGRRKRGRRRRRRSYLGKVAHPPHLACYTTEKGRSLSQPGVVSSPLGESPSPPKLDLSAVEDSFSLLEI	113400	135087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_115260_115384_116123_117462_117560_118159_118373_119397_119500_120388_120832_123513_123714_124194_124337_124519_124588_125326_125403_127023_127371_134063
903221	contig_7129_pilon	-	1576	9	Intergenic	novelGene_169310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_8	57.8705451849211	590	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGCTTGGTGTAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964562	945515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_946167_946321_946376_947142_947257_948254_948330_960097_960153_961269_961682_961779_961890_961981_962032_964507
903222	contig_5917_pilon	+	1965	4	Intergenic	novelGene_122135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	7.31816613336672	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGTAATTGGTGAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12754	17326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_13074_13313_13431_15160_15211_15847
903223	contig_9406_pilon	-	3011	14	Intergenic	novelGene_136142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	542.907011990671	2	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	97	1911	62401	34784	FALSE	10	GCACGGTGGGTGACTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQTVQLLIKKNQTLQKEIQGHQPRIDDIFERSQSIITDSSSPSAEAIRQRLADLKQLWGLLIEETEKRHRRLEESHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLWMEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	63182	33683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51248_60449_60532_61873_62156_62329_62420_63104
903224	scaffold_17907_pilon	-	2094	10	Intergenic	novelGene_150754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACAACAACATCCGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59334	19215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_-_19297_33764_33864_34288_34364_41626_41766_46175_46388_53574_53679_55152_55355_56657_56785_57274_57379_58383
903225	contig_6316_pilon	+	4809	1	Intergenic	novelGene_134713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGGAAAAAATGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137236	142045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_137200_142000
903226	contig_1454_pilon	-	4926	5	Intergenic	novelGene_177037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	497	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1226	1534	147875	147514	TRUE	55	CGACACACACACACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRGEAGKQLCCVCTREAVSTRDLAAELLLGHSEPVKSSSQEARISTQVHPFTGILKKSPFGKNLSPFYLLPPCSAPGVCWARSRSQRCPDPFFWPWRGNK	174439	110609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1454_pilon_-_111700_119311_119629_145528_147635_147687_148232_173570
903227	contig_11512_pilon	+	2046	4	Intergenic	novelGene_43342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1270	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTACAAGGCAAGGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554958	567800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556869_561326_561378_566278_566315_567751
903228	contig_1435_pilon	+	4814	11	Intergenic	novelGene_115518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	797	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTCTAAGGTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578366	615822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_581978_589376_589540_591270_591386_592364_592473_595983_596086_605935_606039_607860_607979_609034_609120_611601_611770_613314_613418_615684
903229	contig_8317_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_19560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTTTTCTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
903230	contig_11258_pilon	+	3426	6	Intergenic	novelGene_67790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	384	junction_3	42.4330060212566	43	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2074	2532	285721	292582	FALSE	40	TGATGTCAGAAGAGCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279280	293476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
903231	contig_13428_pilon	-	4409	6	Intergenic	novelGene_143430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTAAACGGAATAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53168	40733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_40906_41308_41376_44988_45076_46683_46791_47239_47294_49246
903232	contig_4402_pilon	-	1241	4	Intergenic	novelGene_140868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	282.40672009631	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	550	906	624811	617078	FALSE	40	TTGTTTCTTGCAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAVCKNTISQFFYTLFLPL	625844	616742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_617169_619559_619660_624645_625201_625684
903233	contig_16516_pilon	+	2583	9	Intergenic	novelGene_173249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	7.88986691902975	126	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	8	826	13019	28564	FALSE	40	TAAACTCACAGATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTRIQCGPDEYPHNNLCCKNCASGEYLSKHCTRNHHAGKCEACEHETYMAHSSGLNDCLPCTQCREDQEVVTNCTRTRNRQCQCRTGFYCEQADCEMCRACLRCPEGTVIRHPCNATADTVCVNKKGNANLYLLFMIIPVLLFTVYIYCCKRKGTPPFSTVISFFEERWRKPGGPIPDSSPCGQALTHGDVEAGHPAPDMQPMVLLKESSVSAPENRTPSSFSKDLEEVLWRRTEAGDPGQLPETCPDAVNRPEGQTTNRSYSEFGKEVL	13011	30321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_+_13095_15312_15442_19586_19696_21278_21350_23420_23502_23898_23938_24044_24071_25749_25994_28520
903234	contig_1535_pilon	-	2293	7	Intergenic	novelGene_127248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	360.742598291666	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	218	826	134839	129614	TRUE	0	TTGCTTTGCTGGGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVLTTDAQKLLHQLNALLEQESRCQPKVCGLRLIESAHDNGLRMSARLRDFEVKDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQPFCVGIIYHCIGNPSTEV	136105	127063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_128293_129140_129336_129570_129670_129792_129831_132498_132753_134578_134840_135888
903235	contig_6164_pilon	-	3006	1	Intergenic	novelGene_121297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	912	1247	614083	613748	NA	60	AAAAAAAAAAAGAGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLQISFFTNINSDYTHRPCQMGYTGIKSTTSVERDDGESSIPSVRRPEADCGTDRQLLTCKFKLKLKKIRTSPQEPKYDLEYIPPEFREHLKYRFDALNTNDRRTDKL	614994	611988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_612000_615000
903237	contig_1406_pilon	-	1098	1	Intergenic	novelGene_25438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAAAACTATCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479489	478391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_478400_479500
903238	contig_1301_pilon	-	2112	1	Intergenic	novelGene_47413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	561	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTTAAACCTTAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829052	826940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_826900_829100
903239	contig_7322_pilon	+	2160	10	Intergenic	novelGene_164905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	109.380071311003	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	184	1719	221528	236335	FALSE	50	AAAAAAAAAAGTTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASARGWRARGKTRRWVFEPREREVEGGGGRAGSRGIAVKVPSQLPSWKGPAKEAQHRKGSSMASVLSRRLGKRSLLGARVLGPTASDGPPGTVQPLEPQVELLERAAPQPFLAYKDSSCPEQPKEVLKAPGISGLQQVAFQPGQKVYVWYGGQEYTGLVEQHSWAEDKVTVWLLDQKLQICCKAEEVWLAELQGSISQVPPTEQGAQVPAYRPVSRNIDVPKRKSDAVEMDEMMAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSARKARGEAKKCRKVYGIEHRDQWCTACRWKKACQRFLD	165103	236776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_165274_221514_221780_222894_223128_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236223
903240	contig_10436_pilon	+	2596	19	Intergenic	novelGene_108468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	45.0943113217205	262	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	335	2074	81942	86641	FALSE	60	AAACATTCCAAAAAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKGQLTTDQVFPYPSVLNEEQTQFLKELVGPMSRFFEEVNDPAKNDALEQVEETTLKGLKELGAFGLQVPSELGGVGLCNTQYARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGETLAAFCLTEPASGSDAASIRSSAVPSPCGSYYTLNGSKIWISNGGLADIFTVFAKTPVKDASTGTTKEKITAFVVERSFGGVTHGPPEKKMGIKASNTAEVYFDGVRVPSENVLGEVGGGFKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMKAIIAKAVNHATNRTQFGEKIHNFGVIQEKLARMAVLQYVTESMAYMVSANMDQGSKDFQIEAAISKIFSSEAAWKVTDECIQVMGGMGFMKEAGVERVLRDLRIFRIFEGTSDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGNALKNPFGNAGLLLGEAGKQLRRRAGLGSGLSLSGVVHPELSRSGELAVQALEQFATVVETKLIKHKKGIVNEQFLLQRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDSWCIEAAARIRESMAALQSDPQQQELFRNFKSISQALVEQGGVATRNPLGF	81255	87163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10436_pilon_+_81500_81760_81827_81917_81991_82082_82148_82412_82548_82990_83136_83371_83502_83596_83723_84078_84278_84655_84761_85178_85266_85350_85414_85517_85620_85699_85798_85885_85959_86041_86115_86195_86269_86355_86432_86500
903241	contig_16776_pilon	+	3111	4	Intergenic	novelGene_130522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTCTCTCCATGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36157	57981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_36646_39318_41567_42702_42804_57707
903243	contig_16790_pilon	+	2390	1	Intergenic	novelGene_171676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	374	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25321	27711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_+_25300_27700
903244	contig_1406_pilon	+	2009	2	Intergenic	novelGene_25507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAGTCTAGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456149	1460407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1456290_1458538
903245	scaffold_12124_pilon	-	3275	9	Intergenic	novelGene_22330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	512	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1949	2284	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510352	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
903246	contig_15327_pilon	-	2833	19	Intergenic	novelGene_70773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	93.2781086619768	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	730	1647	1156728	1135719	TRUE	45	ATTAAAAGGCAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169114	1129719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1156720_1156845_1157798_1157913_1167375_1167443_1167551_1167640_1168525_1168734_1168978
903247	contig_13021_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_8094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCGGAACGGAGCCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47448	45236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_45200_47400
903248	contig_14415_pilon	+	914	3	Intergenic	novelGene_77605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_2	124.5	756	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTATTGGTTTTGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33331	38344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_36199_37805
903250	contig_2027_pilon	-	2197	11	Intergenic	novelGene_39885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	794	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1608	2186	99498	98920	FALSE	80	AATTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPRTLCLLAPTMGLGGNAEGLTCSSWVPFGSSDAGTLGALEVAMGIEGGLCALAAAIALILLVVAVVDCWLLGGGPGTLPTLGGLGGAGGREFIRTRRGAGETGNLIRRISPTGKVRVCLPDRKTCSPQTAQQQQNRAVAKARHTAPRADTGACVVCVEYQTKQDISLLLLFSLPPIFFQPPIHFFLLKL	103798	98908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_99674_99768_99890_99990_100076_100185_100354_102033_102188_102287_102356_102438_102626_102712_102788_103045_103157_103233_103362_103463
903251	contig_14986_pilon	+	2106	2	Intergenic	novelGene_59733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	732	1694	151004	152053	FALSE	40	GATGCAAATTATTTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150272	152465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151559_151645
903252	contig_19737_pilon	-	3761	2	Intergenic	novelGene_158961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	316	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21295	17494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_21043_21082
903253	contig_754_pilon	+	3995	4	Intergenic	novelGene_161112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	896	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1377	2069	320174	320866	TRUE	30	CTGGGAGAAATGTTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLRSRFETVEDRISGAEDKHLDTTLFQENSEKRTEKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEEGEKTENTERIIEKLLTENFPSITKDEKLAIQEVQRTPYRRDPKRKSPRHTIFTLAKTKDKQRILRATHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDEIYKILIEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKRVLRSEDKQLQHTGRT	318409	351750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_754_pilon_+_318655_319042_321573_324270_324967_351226
903254	contig_15236_pilon	+	5932	6	Intergenic	novelGene_141564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	414.94076685715	207	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	249	1448	419232	440439	TRUE	70	CCAAAAAAAAAAATTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWQFPAVVVLFVSLAVVLHYSSQLREKAFPEGSDDLQPTAPATAQARPSPPQPTSQAPHKTLTASLTDGRTASQTAATTSKSDSPTTHTMIKTPATTASVTTESLPPTSPITHTLVTTQATSSISQSAPPVTEATIGPSAAPHSRSPPVTPPAHTTLTRPSTLSHTAEKTNQPSNQTSHPATLPTAPGNSTTSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGIYQVLNGSRLCIKAELGIELIVQDEESVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNGELWVHHVTNIISEAQE	418983	445152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419281_425596_426337_428009_428139_437907_437966_440215_443280_443508
903255	contig_18511_pilon	+	2365	4	Intergenic	novelGene_126898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	504.857075484405	17	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58964	63412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_59255_59753_59948_61191_62500_62839
903256	contig_15543_pilon	+	4309	2	Intergenic	novelGene_164351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	506	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCACGTGTAAAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56073	60469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_56451_56537
903257	contig_19604_pilon	-	4533	10	Intergenic	novelGene_77233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	40.7730848041259	34	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	3728	4243	257693	255934	FALSE	10	ACGTGTTATCTCGGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGLTVGDVDIFEINEAFASQAVYCVEKLRIPPERVNPLGGAVALGHPLGCTGTRQVVTLLNELKRRGKRAYGVVSMCIGTGMGAAAVFEYPGK	267724	255643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257036_257273_257454_257635_257827_258469_259674_259778_261962_263725_263769_264035_264116_267640
903258	contig_4857_pilon	+	2513	4	Intergenic	novelGene_48789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAATACATAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234259	1245285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1234350_1238542_1238717_1242189_1242267_1243113
903259	contig_7234_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_145916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	145	705	273422	273982	NA	80	AAAACACAAAAAGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRDWSLLITCPKYMAPSPLLRSILAVLLPRQFCSFFWQSMVFSISSKASSRLQFSSFIVQLSHAYEAVEQYHGLGQVHLILKVTSLLLNISEWSQAAGLPNAIHRLIFCCCCALGESLRSPGGTVVKVKLTANPKVGSSKPPAALLEKDMAICFRKDLQPWKPYRVTMSWNQLHGSGFWFWFR	273277	275044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_273300_275000
903261	contig_12638_pilon	-	2658	1	Intergenic	novelGene_33073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1927	2232	129775	129470	NA	20	CAGTTATTTCATTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQVLPWLCSGIAWAVHAVKIQSLVGEMEKLVWGSLLYEVACLSAPRTQRGYISIRITTSPFDCICSFTDYLSDPRYWSFVWATFQVNASFNTFFFSLKTK	131701	129043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_129000_131700
903262	contig_9363_pilon	-	1118	6	Intergenic	novelGene_6555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	522.262922291062	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	50	613	757196	753891	FALSE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVLLWVKIKRSTTDPLLSENFLHGRVHSPAGACAAGTELPWRSHWWSQVLVSQHEPVPAHRTLQLMGSINMSNEQ	758109	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754113_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070
903263	contig_7057_pilon	-	717	7	Intergenic	novelGene_123236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_2	24.5334239128763	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	207	575	538082	537131	FALSE	25	AAGTACGTATTTGCTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539464	536988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420
903264	contig_3975_pilon	+	2797	1	Intergenic	novelGene_54924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	87	326	2244373	2244612	NA	90	GAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCETYPLSAKKLSGPHKPQTLKTAFKAQMKSQAIHSLMKSNGTLPVCHLFEESLDGRPLIIQMKLFMMWSLPSSPDHFPILSIYNLLSSHAEQLVVQSLAYSHTSIL	2244286	2247083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2244300_2247100
903265	contig_6227_pilon	-	4006	15	Intergenic	novelGene_49628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	264.166198845055	110	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	184	2262	398743	343524	TRUE	55	TACTCAATGTCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLWSQEKVTSPYWEERIFYLLLQECSVTDKQTQKLLKVPKGSIGQYIQDRSLGHSRIPSAKGKKNQIGLKILEQPHAVLFVDEKDVVEINEKFTELLLAITNCEERFSLFKNRNRLSKGLQIDVGCPVKVQLRSGEEKFPGVVRFRGPLLAERTVSGIFFGVELLEEGRGQGFTDGIYQGKQLFQCEEDCGVFVALDKLEIIEVDDTGLESDYAGPVDTMQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPDSVTQERRPPKLAFMSRGVGDKGSSSHNKPKPTGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKISPQAVPDMWRTCNVRMQRVL	406533	340081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354500_355219_355314_356184_356565_359403_359521_361757_361857_392432_392539_395032_395336_398239_398898_406504
903266	contig_11538_pilon	-	5927	18	Intergenic	novelGene_152282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_10	234.845616667248	582	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	73	2739	296872	118846	FALSE	60	GAAAAGAAAGAATAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYSFYQQLHEQKRSEKFFKVLYDRMKAAQKEIRSTVTVNTIDLGSKKRDDDNELMTSGPRMRVRDSSLYLKEGMKGQLTEASSATSKAYCVYRREMDPEIDIMCTGPDAGNAEEKSAEEVTMSPAIAIMQPILRFLQLLCENHNRELQNFLRNQNNKTNYNLVCETLQFLDCICGSTTGGLGLLGLYINEKNVALVNQTLESLTEYCQGPCHENQTCIATHESNGIDIIIALILNDINPLGKYRMDLVLKLKNNASKLLLAIMESRHDSENAERILFNMRPRELVDVMKNAYNQGLECDHGDDEGGDDGISPKDVGHNIYILAHQLARHNKLLQQMLKPGSDPDEGDEALKYYANHTAQIEIVRHDRTMEQIVFPVPNICEYLTRESKCRVFNTTERDEQGSKVNDFFQQTDDLYNEMKWQKKIRNNPALFWFSRHISLWGSISFNLAVFINLAVALFYPFGDDGDEGTLSPLFSVLLWITVAICTSLLFFFPKPVGIRPFLVSVMLRSIYTIGLGPTLILLGAANLCNKIVFLVSFVGNRGTFTRGYRAVILDMAFLYHVAYVLVCMLGLFVHEFFYSFLLFDLVYREETLLNVIKSVTRNGRSIILTAVLALILVYLFSIIGFLFLKDDFTMEVDRLKNRTPVTGSNGVPTMTLTSMMGTCEKENCSPTIPASNTGDEEYEDGIERMCDTLLMCIVTVLNQGLRNGGGVGDVLRRPSKDEPLFAARVVYDLLFFFIVIIIVLNLIFGVIIDTFADLRSEKQKKEEILKTTCFICGLERDKFDNKTVSFEEHIKSEHSMWHYLYFIVLVKVKDPTEYTGPESYVAQMIVEKNLDWFPRMRAMSLVSNEGDSEQNEIRNLQEKLESTMSLVKQLSGQLAELKEQMTEQRKNKQRLGFLGSNTPHVNHHMPPH	296944	115657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_118933_119683_119846_172061_172223_190829_190996_192713_192845_210651_210745_213828_214025_217492_217658_226872_227049_234663_234790_237544_237738_252861_252970_284064_284188_285673_285770_290036_290148_292981_293183_295778_296036_296757
903267	contig_8254_pilon	-	3822	1	Intergenic	novelGene_48396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGGATAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110280	106458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_106500_110300
903268	contig_9694_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_177822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38009	39321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9694_pilon_+_38000_39300
903269	contig_9668_pilon	+	1075	2	Intergenic	novelGene_58150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	654	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	27	338	355578	359314	FALSE	20	GAATTATGGTTCTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	355551	360051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_355714_359138
903270	contig_20739_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_83178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1648	1989	123594	123253	NA	30	CATTAAAACTCCACTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKTLDISLLGEDKKKPHRPAVNSTCTSETPCGGCMDLTQQAFQATGKPNSPRCSDPARPGASSSAKAQVTLERHPAARGEACRQVLPGCRFAAPHCHPARSPLRMHKAQPKN	125241	122566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_122600_125200
903271	contig_9609_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_22930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47767	49846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_48998_49105
903272	contig_7207_pilon	+	5360	1	Intergenic	novelGene_72050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	794	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	912	1229	626466	626783	NA	45	AAAAAAAATCTGTTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQVNGKTRTKKQVLTPSLVCFSAYHATSFYSMMCYNYLMNKCTVTNADRANVFLRLAEDYCKGLLERKRFFPTHQKYQAPSTKCFFTGSALSDVVVVLVNFMSA	625554	630914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_625600_630900
903273	contig_19744_pilon	-	4948	27	Intergenic	novelGene_120391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	987	1298	219232	215609	TRUE	20	GTCCACCGGCATACCGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGTHLSPGYIRTGTTNELSGIIIVPLSSLSITASFATKICLSAFVADIICISIHGVASWVIIKPHTRSCDRFTLMQTFIFQSHQGLSSDILIEFFDWIKQVF	225793	179349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_179494_180251_180496_183375_183545_186058_186218_187301_187501_188366_188519_192998_193159_194330_194486_194664_194893_196382_196446_197837_198081_198377_198477_200500_200580_202343_202610_203112_203398_205234_205334_206948_207067_208657_208761_209568_209697_210063_210196_211796_211902_212698_212888_213862_213971_215585_215796_218457_218566_219215_219382_224956
903275	contig_11026_pilon	+	3442	16	Intergenic	novelGene_167643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	299.2210331288	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	701	2106	48	2153	43170	125017	FALSE	20	CAGAGACTCCTTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTRTAATAAMGRLLVLLLLGLTAPAAALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKGCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQPVSVDNWCRRDKRQCKSHLVIPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVREACLTQGMTLHSYGMLLPCGVDRFHGTEYVCCPQTKITDSTVSKEEEEEEEDDGDDDYDIYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKEDDYNEESPTEPSSDGIISEKEITQDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEATLNDRRRVALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTVRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESDEILPFHPFHPFPSLPESEGLSPILSVRIGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSKSEVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	43122	126306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_43275_88933_89108_89926_90051_102873_102987_103750_103936_104325_104535_108820_108952_110007_110083_111253_111413_112211_112341_115713_115814_117394_117548_122129_122246_123351_123427_123810_123967_124915
903276	contig_818_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_167991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAAATCTTGACTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673013	670080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_-_670100_673000
903277	contig_16360_pilon	-	3973	2	Intergenic	novelGene_170083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	0	229	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	274	1230	150792	149836	FALSE	25	TTTGCATTCTAAAGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESSSFLKGMMLGSIFCALITMLGHIRIGHGNRMHHHEHHHLQAPNKEDILKISEDERMELSKSFRVYCIILVKPKDVSLWAAVKETWTKHCDKAEFFSSENVKVFESINMETDDMWIMMRKAYEYAFAKYKDQYNWFFLARPTTFAIIENLKYFLLKKDPSQPFYLGHTIKSGDLEYVSVEGGIVLSIESMKRLNSLLSIPEKCPEQGGMIWKISEDKQLAVCLKYAGVFAENAEDSEGKDVFNTKSIGLFIKEAMTNQPQQVVEGCCSDMAVTFNGLTPNQMHVMMYGVYRLRAFGHIFNDALVFLPPNGSDND	153060	147092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_150798_152792
903278	contig_17427_pilon	+	3079	12	Intergenic	novelGene_30401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	109.393595231558	121	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	753	1274	356572	362118	TRUE	15	ATACCCTTCTCCGTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGVLRL	331904	368803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351805_352477_352700_355635_355829_356562_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361857_362103_362182_364741_364852_365169_365769_367770
903279	contig_7051_pilon	+	5199	10	Intergenic	novelGene_64349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_3	440.542370546709	2	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1332	3867	5198	338727	347598	FALSE	70	AGGATAAAAGAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKERERE	321871	347599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_331924_334316_336118_337699_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
903280	contig_4531_pilon	+	2572	10	Intergenic	novelGene_47858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	327	junction_8	139.889197775672	79	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	478	1515	160360	171440	FALSE	50	GAATTTAAAAAAAGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQFSTDELVAEVEKRNRYSTILIFITGIS	156521	172497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_156603_157336_157538_159683_159837_160317_160441_160733_160872_161120_161286_161407_161589_163103_163268_170545_170672_171257
903281	contig_8263_pilon	-	1549	1	Intergenic	novelGene_83101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150338	148789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_148800_150300
903282	contig_12570_pilon	+	1996	2	Intergenic	novelGene_79394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGCTGGTGGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292674	294812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_294372_294513
903283	contig_7411_pilon	-	1815	2	Intergenic	novelGene_137021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATGGCCATGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345351	342809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_344395_345121
903284	contig_2799_pilon	+	2981	2	Intergenic	novelGene_85543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1051	junction_1	0	137	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTTGAATGGTTAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704202	709958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_704819_707593
903285	contig_6217_pilon	+	4316	1	Intergenic	novelGene_109670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCTCTCCAACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785155	789471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_785200_789500
903286	contig_9900_pilon	+	5125	15	Intergenic	novelGene_159502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_2	32.9945109844356	389	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1111	3336	74	3409	33664	126399	FALSE	50	AAAAGGAAAAAGGGGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCQQKGPPRRRSISGTSTSEKPNSMDTTNTSPFKVPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRNTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSAVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFYSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTSRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPNKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWSGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSVTYSEKDEKESSLPNGRSISLMDLQDTHAAQVEHASVMLDVPMRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVRRPLHPALNQPGSLQPLSFQNPVYHLNNPIPTMPKASVDSSLENLSTASSRSQSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSDDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKMDQAGLGARAKAPPSLPHSASLRSTGSTSLASAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSRESPVPKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYEEDVEETEQNQDEAKHAEKYEQEISKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC	33590	128115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_+_33700_57154_57265_88427_88582_90533_90633_91219_91775_94389_94535_102404_102550_103176_103414_105730_105933_108026_108227_109003_109866_117145_117281_118913_119117_120840_120929_126234
903287	contig_6163_pilon	-	1540	8	Intergenic	novelGene_103817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_3	191.483467608426	52	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	35	949	93933	78086	TRUE	80	CAAGCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLPPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVSWQPLSMAISMLIPPGLRVVLAGWWRPALARDSLVRVWACVLFLRMNSFPLDSEAVEHIIFHPVTQVWTS	93967	75963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_77811_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
903288	contig_2100_pilon	-	2704	4	Intergenic	novelGene_50598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAGGGGAAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698351	695213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_697347_697433_697621_697889_698047_698124
903289	contig_6165_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_167402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1488	1787	379241	378942	NA	45	AAAAAAAAGATGTGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKTDQIYWPKGDWRNPESMVPRHPFSSVVKSLPRFTIQPGSGQPHKTKCD	380728	378497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_378500_380700
903290	contig_14744_pilon	+	3064	14	Intergenic	novelGene_66148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	335.624226333224	10	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	811	2163	1653040	1679073	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQYFKKFGDKPCCFTDLKVFVDLLPATQCTKFINQLLGVVPLSTPTEDKLALPADIKALQQHLCVVQLTRLLGLYHTMDKSQKFNVVRELMLRYQHGLEFGKSCLKTELQFSDYYCLLAVHVLIDIWRETGDETAVWQALTLLEEGLTHSPSNAQFKLLLVRIYCTLGAFEPVVDLYSSLDAKHIQHDTIGYLLTRYAESLGQYAAASQSCNFALRFFHSNQKDTSEYIIQAYKYGAFEKIPEFIAFRNRLNNSLHFAQVRTERMLLDLLLEANISTSLAESIKSMNLRPEEDDIPWEDLRDNRDLNVFFSWDPKDRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLERIQQRSRSE	1650229	1685980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1651023_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679041_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324
903291	contig_10444_pilon	+	2671	1	Intergenic	novelGene_139468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAGGACAAAATGAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861964	864635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_862000_864600
903292	contig_6291_pilon	-	3677	3	Intergenic	novelGene_164799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386818	382934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_382942_383025_383566_383688
903293	contig_6654_pilon	+	2080	15	Intergenic	novelGene_85749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	126.155576935135	362	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	571	2079	613804	650207	FALSE	50	CAAAAGAATATATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWKNLCKIKFSKYLIQNQRSVKVLGEGLAKGDGAFRAVLCCMQLKGKLQLVSSILAKSLTGESLNGMVTKDLTRLKTLLTETETATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEATIEEK	573059	650208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_613656_613874_616762_616888_618597_618655_623021_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951
903294	contig_8801_pilon	+	5240	1	Intergenic	novelGene_66279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	576	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCAGCTCACTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438766	444006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_438800_444000
903296	contig_4857_pilon	-	4585	3	Intergenic	novelGene_48791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAGTAACAACAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320586	1237069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1241627_1268273_1268281_1320565
903298	contig_6361_pilon	+	3748	6	Intergenic	novelGene_23953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	881	1225	405360	405704	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	379787	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_380581_405272_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
903299	contig_4131_pilon	-	2785	2	Intergenic	novelGene_127860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2	628	163381	162755	TRUE	20	CATATTTTATCTCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPLLPPPPVEKTPVKKKAAKKPAGARRKASGPPVSELITKAVAASKERSGVSLAALKKALAAAGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTKGTGASGSFKLNKKAASGEVKPKVKKAGAAKAKKPAGAAKKPKKATGAATPKKSAKKTPKKAKKPAAAAVAKKVAKSPKKAKAAKHKKAAKSAAKAVKPKAAKPKVAKPKKAAPKKK	163382	160522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_161007_161081
903300	contig_16098_pilon	-	964	7	Intergenic	novelGene_46017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1361.28632999168	94	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	846	118	963	352350	348292	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSWIDWRRQSRPSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFS	354106	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348449_350022_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
903301	contig_19362_pilon	-	3392	8	Intergenic	novelGene_157783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1431	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2828	3154	30657	30331	TRUE	60	AATACATACACATAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYYNLHQTEPRTTRWSRATTTDCSDRDHNRVSWTEWEKNVEQNSNSQKKKKDQTCWSDRHWRNPESMAPGHTFNSVPKSLPRFTLQPKIRQVYWANNNTCEECAS	43563	7256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_7265_30100_32661_32977_33161_33774_33862_34377_34515_39711_39860_42895_42994_43392
903302	contig_1301_pilon	-	1657	13	Intergenic	novelGene_47329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	550.963619236536	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1242	415	1656	296953	269193	FALSE	70	AAGAAAATGAAGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTRE	322919	269191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_309751_309912_322794
903303	scaffold_9100_pilon	+	3347	4	Intergenic	novelGene_83326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	969	1574	868423	869028	FALSE	60	AAAAAAAGACAGCAACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLLGRLMIFLEEIVSETTVHLGFMGAPELLTVCPGLKLLTGLLIVLPAETEPLPDCPGPLTDRPGGPEPLAGRRRSCRLLTGRPGPLELPRGLPEPPEPLMGRPGPLELLAGRPGPLVPLTVRLEGFESPAGLLAPLVDRSGPKLELPSWRLDTEPELMVGRAVPVLGRPRAELELLPGCLTPGLFTLLFGVTMSPSLE	862200	870801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_862875_863858_863931_866854_867031_868376
903304	contig_935_pilon	-	2640	10	Intergenic	novelGene_45543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	357	junction_5	250.797591891879	384	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	16	1560	370806	345477	FALSE	5	TTTCTGACTTCTGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	370821	344396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637
903305	contig_10331_pilon	+	1465	14	Intergenic	novelGene_54140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	352.507971289282	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	178	795	410802	534709	TRUE	65	TGAAAGAAAAGAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIPEEESSSSSSDEDEDDRKLIDELLGKVVCVDYVSLDKKKALWFPALVSNFSIKEFN	409620	545932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528671_534706_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_545719
903306	contig_3584_pilon	-	2530	7	Intergenic	novelGene_108113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	209.558000457047	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	319	903	254310	188073	TRUE	35	ATACAGGCACCATGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPALSQHLIQGPSHKSLKF	277338	185214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_186831_188061_188126_216596_216661_218252_218395_223202_223328_254109_254314_277023
903307	contig_11978_pilon	+	2561	1	Intergenic	novelGene_62822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424395	426956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_424400_427000
903308	contig_17198_pilon	+	2614	9	Intergenic	novelGene_62395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_8	68.1761276034361	328	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1342	2157	1063432	1096458	FALSE	15	GATGTCTTGTCAGAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFRKVFAKAKHIAILTGAGVSAESGVPTFRGAGGYWRKWKAQDLATPQAFARDPSRVWEFYHYRREIMHSKDPNPGHLAIAECEARLCEQGRRVVVITQNIDELHRKAGTKNLLEIHGSLFKTQCTACGNVAENYKSPICPALSGKGAAEPGTEDARIPVEKLPRCEEAGCGGLLRPHVVWFGENLDPAVLEEVDRELALCDLCLVVGTSSVVYPAAMFAPQVSARGVPVAEFNMETTPATDRFRFHFQGPCGTTLPEALARHETETVS	1059663	1096915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1060918_1063068_1063154_1063429_1063564_1066040_1066267_1078370_1078459_1079807_1079862_1081254_1081379_1083318_1083435_1096382
903309	contig_14467_pilon	-	3473	7	Intergenic	novelGene_138261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.68532681717842	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	91	693	347832	321141	TRUE	20	TGGCTTATCCCATCCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPIRRKAPGWHDPPEKHRNLSSGDLPFALLMVPNYLPSVSSAIGGEVPQRYVWRFCIGLHSAPRFLVAFAYWNHYLSCACSCPGYRPLCRLNFSLNVIENLALLVLTYVSSSEDFTIHENAFIVFIASSLSYMLLTCILWRLTKKHKVSQEERKSYCWKQRLFIINFIAFFSALAVYFRHNMYCEAGVYTIFAILEYTVVLTNMAFHMTAWWDFGNKELLITSQPEEKRF	351751	313288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_313438_318509_321272_321478_321588_322016_322124_322254_322508_347829_347889_351717
903310	contig_610_pilon	-	4996	9	Intergenic	novelGene_76845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	78.2719617743161	158	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	2	1021	390350	359507	TRUE	50	CATACACAAAAATTCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSADHVIHPSGESLWLRPPNLELNKAYSVQWKVQFSSSAICEILTWRGNCSWTPTPCVLEHFNNTLKFICKELAILIEGAQQQDSGFYFLEVTDKSGKIQKTKFQVSVLEPIEKPDLQGRLKELDDGTCQLNLSCSVSRDENVSYAWYKGKKLIQPWGNLTHLVEHIDVNGLHIYTCNVSNSVSWANHTLILPGDCLRTQQNVIFPRLLVIIFAILLVILCLGTLISFCVWRRKRKQSSESTEEECRTVYERINHLPLRRNQEQEQEQEQEQNSSREDRTIYSRIQSQKSASLLPKNENTVYSTVQSFQKSGSKKNHGPSSRCTVYEEVWEFSAQTNIS	390351	351456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_352348_356422_359543_380222_380277_381346_381413_384549_384628_387146_387218_387817_387929_389658_389935_390022
903311	contig_14740_pilon	-	5041	1	Intergenic	novelGene_174685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTATTACTGGAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310209	305168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_-_305200_310200
903312	contig_10857_pilon	+	1442	2	Intergenic	novelGene_160922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469135	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_470361_471240
903313	contig_9863_pilon	+	4294	6	Intergenic	novelGene_154002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1294	1749	301817	302272	TRUE	60	GAAATAAAAGAATCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDGFPVEEKALKLPDREFKSLIFRAIQELKQKAEKYEEKIDKLMEKVDKFMENTDKKMKEFRKIMKEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGQGSRLKWWKTGSVKLKTNTWIQFCLRKTQKKEQRKMKRP	250524	305003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_250533_264080_264914_301241_301545_301667_302582_302636_303616_303746
903314	contig_3956_pilon	+	1284	6	Intergenic	novelGene_15121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1243.06453573417	65	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	75	473	1281682	1289798	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGPASWSLSTLWRSSVQSKWSVVSMVS	1281607	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283896_1289637_1289677_1289758_1289892_1290297
903315	contig_160_pilon	+	4121	3	Intergenic	novelGene_156322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1337	1702	92221	92586	TRUE	55	GCAAGAAAATTCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVVYSRSSLSRTRRHKLHEEVAQMPMFSTPVTSPSISQSVPMASWGVPYDQLTEEKTNAWFTDGSARYADTTRKWTAAALQPLSGTPLKDSGEGESSQWAELRAVHLVVHFAWKEKWPDV	90721	95387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_90818_90980_92915_93296
903316	contig_9843_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_114323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCGAGTCAATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63005	65916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_63000_65900
903317	contig_5467_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_111974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAATTTGAGATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162121	164672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_162100_164700
903318	contig_4924_pilon	-	2559	13	Intergenic	novelGene_84656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1146.86290411423	1	61	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	148	1143	155859	69091	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMADALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEDLPPSTGVWRPGHSADVHAFWKCYLC	252462	62880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69171_74641_74822_82359_82480_114575_114705_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
903319	contig_9481_pilon	+	3909	28	Intergenic	novelGene_149663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	422	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	636	950	359668	367369	TRUE	40	TCAACAACACAAGATGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVCRLECVLFRALFGCCCCWCCCCCCCFCICLTSSCCISRRDFVVPAGLLTLPQPESFCCCCCCCCWSAFISSLCWRLCSSRSCRSLSSSSFWISANDSVAWD	354625	481943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_354674_356135_356385_358117_358273_359484_359691_359827_360044_367293_367417_370848_371085_372983_373143_374656_374822_376666_376768_378275_378375_379359_379459_380945_381037_384123_384290_389193_389356_390358_390556_393934_394126_394208_394373_394466_394686_398659_398839_425711_425750_426402_426515_429920_430034_434999_435098_444008_444136_454513_454597_477026_477093_481896
903320	contig_16322_pilon	-	2941	2	Intergenic	novelGene_87564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	0	290	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATTTGGCTCTATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173100	169128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_170846_171876
903321	contig_17106_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_127665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAGAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48206	46959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_47000_48200
903322	contig_4732_pilon	-	4443	1	Intergenic	novelGene_75446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	757	1134	652346	651969	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNSHTANSSVNKRQCCYWSPVIQIGHPNRIPKSSLASHLEKPDSRLQIPSHPTQMFGKIKSAITGALTAFLISFDSTPPYSYICHVVNPQKKFSQRLTLDFPSASIKSSTYVTSPTTNQFPDDT	653102	648659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_648700_653100
903323	contig_3382_pilon	+	3211	12	Intergenic	novelGene_123998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_8	219.983057198834	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	782	2437	98994	123359	FALSE	35	AAAACACTTTCCCAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQAYLVRGVKALHSALRLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEESGKPVKSQGTPTVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMRKLRDHTVRTPSNLDILELHTREVLKRLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPDWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFTDPSLYTADSESEEDKRRTKKTKMKIEESSGLDGVESEEPQTPLNRFLTSVKSELRNRSSEYSDISDSEDSGPDCTALKTNFTTEESDSSGDEKKREVTSSFAEEANVPRASLQKTQSPSGSGIPTKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCSQRPVRSADGAATERDAVRDAGSCHSSDREARPLCRIDKPVGCGYQVKTDDPDLRTSSWIKQFDTTSRFNPQDLSRGQKGIKKEGSSEVLQRAQSRNHMDSSGAGLPSGKCMQNSGVVPGPCQVSSGSLSPERPGGETSFSVPLHPTKRPASNPPPISNQATKGKRPKKRNGHSQTASREDPQAE	98212	124133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_99091_105991_106084_108767_108858_116177_116388_117742_117868_118059_118215_119463_119562_120174_120324_120458_120671_121875_121962_122482_122757_123291
903324	contig_11386_pilon	+	2621	4	Intergenic	novelGene_82781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	515.69844763087	357	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	108	830	17940	21088	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRYGLQASVPLAGPRALCSPSAC	17832	23427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_22508_23055
903326	SIRV5	+	2022	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	5	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5464	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGGTTTACCGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
903327	contig_5566_pilon	+	4087	3	Intergenic	novelGene_153661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	536	junction_2	3.5	57	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176731	182558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_179774_180773_180832_181571
903329	contig_7056_pilon	+	1595	10	Intergenic	novelGene_43670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	773.173035749357	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	197	988	798314	810882	FALSE	50	AAAAAACAAAACCTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKWLLCVLLVFGTTTVQAHDGHDDDTIDVEDDLDDVIEEVEDSKSKPDTSSPPSPKVTYKAPVPTGEVYFADSFDRGTLSGWILSKAKKDDTDDEIAKYDGKWEVDEMKETKLPGDKGLVLMSRAKHHAISAKLNKPFLFDTKPLIVQYEVNFQNGIECGGAYVKLLSKTPELDLDQFHDKTPYTIMFGPDKCGEDYKLHFIFRHKNPKTGVYEEKHEEKQKSDTEEDGGTASQDEEDRKPKAEEDEILNRSPRNRKPRKE	781862	811489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_781929_797522_797650_798310_798488_798975_799050_799734_799794_800455_800598_801054_801137_801618_801746_808732_808813_810828
903330	contig_5935_pilon	-	3235	4	Intergenic	novelGene_102738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2523	2933	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1382353	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237_1216207_1286929_1287021_1380834
903331	contig_8954_pilon	-	1744	6	Intergenic	novelGene_130291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185908	163888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_165032_169407_169552_173747_173876_174333_174401_182928_183079_185796
903332	contig_8818_pilon	-	4575	5	Intergenic	novelGene_178230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2679	3065	56752	56366	TRUE	50	CAACACCAGCAGCCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWDPTSTVTQTGKQLHTRMELHSPSGKSKDGARSQILERKEGEAARGKQEIQRREKKKKSNTSSQQMALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRMSVGEEGWRVGKCISQIAGALEPLRKKQRWRTEPGT	240501	233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_1186_44673_45140_56273_57390_237722_238463_239200
903333	contig_15327_pilon	-	6029	14	Intergenic	novelGene_70745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_6	90.903681388274	493	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	661	1986	94	2079	1064459	1042391	FALSE	20	CACAAGTGTACGTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPDLRREREAASFNPELLTNILDGSAENTRRRREIENLILKDPDFQHEDPNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVQKMREFSIADPEEIMWFKNFVHRGQPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQKRFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLFTQGKGYGLHAFIVPIREIGTHNPLPGITVGDIGPKFGYDEMDNGYLKMDNYRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPVSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARSLSKACTIAIRYSAVRHQSEIKPDEPEPQILDFQTQQYKLFPLLANAYAFQFVGAYMKETYYRINEDIDRGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTTNAGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVTFTPTCTFEGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVYGMVSYLNDLPSQRVQPQQVAVWPTVVDINNPDSLTEAYKLRAARLVEVAAKNLQAEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFSEKLHKIQDKSIQTVLRNLCLLYSLYGISQKAGDFLQGSIMTEPQITHVNQRIKELLTVIRPDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKKSPLNKTEVHESYYKHLKPLQSKL	1064552	1038440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1042442_1043091_1043299_1043418_1043563_1043657_1043764_1043877_1044058_1044474_1044666_1045131_1045295_1046422_1046593_1047041_1047158_1047299_1047420_1049071_1049180_1051354_1051516_1063935_1064096_1064350
903335	contig_13592_pilon	+	2782	9	Intergenic	novelGene_33716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	478.571833688528	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	426	1091	256608	260292	FALSE	70	GTACCAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPNGYLMFEDENFIESSVAKLNALRKSGQFCDVRLQVCGHEMLAHRAVLACCSPYLFEIFNNDSDPHGVSHVKFDDLNPEAVEVLLNYAYTAQLKADKELVKDVYSAAKKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVASCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEEFLKLPRLKLEVMLEDNVYLPSNGKLYTKVINWVQRSIWENGDSLEELMEEVY	249338	261983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249464_249517_249572_255367_255596_256589_256719_257714_257885_258019_258096_259276_259451_259768_259895_260283
903337	contig_11681_pilon	+	2000	2	Intergenic	novelGene_102986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	808	1134	206566	206892	TRUE	75	AAAAAATGACAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQRKNQRREHCLHLRTLQAGHRPKEIHLLSSKKRKRPSLEQLGGSAELLEGTQEARPSRFQRVGSSPTWFQSVRLSLRVCQGDGARPRGRRTMPVGPRGLGCRSDGL	205758	231945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_207512_231698
903338	contig_12951_pilon	+	4103	2	Intergenic	novelGene_68222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1332	1676	796605	796949	FALSE	70	GCAAGGAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	799376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795580_795634
903339	contig_9839_pilon	+	1190	9	Intergenic	novelGene_88497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1686.29560260798	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	125	457	49467	54114	TRUE	15	TGACCTGCTCCTGGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGYPDHVRVDGVELGTHFDVFFLLSSIHSGVFHPVEVCLPILRSLLLVCHLWISRHHHREKIN	45316	79009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52068_52202_54061_54122_57651_57850_59824_59927_76159_76347_77384_77514_78899
903340	contig_6914_pilon	+	2118	14	Intergenic	novelGene_151750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	19.3485623214058	117	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	237	1331	163057	169723	TRUE	30	ACCTTCACAGAAGGGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLDDLFPNEEEEDPSNGLSRGQGTQPGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEAVERYYRRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAEILYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSQHRDGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRKQGTDPISQTKVAELLGEGDGRRTSQESPGSVKFEGGEDVSVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGNEPRPSSSNMKRAASLNYLNQPNAAPLQGSRGLSASTMDLSSSS	162229	170626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_162284_162874_163086_163550_163639_165457_165560_165775_165950_166274_166375_166573_166627_166835_166907_167096_167206_167762_167901_168470_168587_168934_168999_169672_169744_169859
903341	contig_8866_pilon	-	3989	2	Intergenic	novelGene_77760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACCAACAAAATAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339607	335415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_339226_339428
903342	contig_16951_pilon	-	10223	2	Intergenic	novelGene_98656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	9387	9761	93365	92991	FALSE	50	CAAAAATCTTATGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKEEVQAAPNALAKNKAPGINRIPTEMFQQMDAMLDMLTHLCQEIRKTANWPVDWKRSIFVRILKKGDPIECKNYQTISYTSTILLQIIQKGLQQYIDKELPEIQARFRRGREMRDIIADVR	104775	92528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_97148_99171
903343	contig_9471_pilon	+	6052	1	Intergenic	novelGene_21689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1687	1995	53820	54128	NA	40	GCATAAATTTGAATAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFATELISLSFPETLTSSEQEEQEKWSLAGWVCTHAGPQSQGVSTRVLVRLDGLMPYTDSCTTSFWQNESFILSVLELSILIFYHIFNLSQVCLSQACSC	52133	58185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_52100_58200
903344	contig_8823_pilon	+	3803	1	Intergenic	novelGene_53077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	406	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGAAAAAAGACGGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75348	79151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_75300_79200
903345	contig_8075_pilon	+	2565	10	Intergenic	novelGene_42502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	343.554297827222	8	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	109	660	719960	783013	TRUE	30	AAAAGTCTTATCGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRSLAPGFDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGADEEELGSQIEEDTYISRNKEHRHEIQK	719851	796413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781927_781965_782964_783123_785929_786066_793313_793386_794825
903346	contig_2892_pilon	-	2531	8	Intergenic	novelGene_118978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	78.6238785974992	252	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	21	563	187823	24381	TRUE	15	GCACATTTGAGTCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAGAAMEVYIPSFRYEESDLERGYTVFKIEVLMNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASVFTASSPGVDPIPRNHFLCSSIRSNSSFVKVLS	187843	10684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_24333_24482_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_187763
903347	contig_14005_pilon	-	1299	1	Intergenic	novelGene_154717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_-_0_1300
903348	contig_9127_pilon	+	6304	16	Intergenic	novelGene_103005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_7	1861.39262799538	441	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	189	2330	136718	251465	FALSE	65	AAGGAAAAAAGAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWDCNGGGRQLLALTHGKHTATTPSLPLSWPASAPPPARGYPPRPFPQLSAFRPAPRSGPHTMDELAGGGGGSPGMAAPPRQQQGPGGNMNLSPGGNGAAGGGGPPAAEGAGPAAGPELSRPQQYTIPGILHYIQHEWARFEMERAHWEVERAELQARIAFLQGERKGQENLKKDLVRRIKMLEYALKQERAKYHKLKYGTELNQGDLKMPTFESEETKDTEAPTAPQNSQLTWKQGRQLLRQYLQEVGYTDTILDVRSQRVRSLLGLSNSEPNGSVETKNLEQILNGGESPKPKGQEIKRPSGDVLETFNFLENADDSDEEEENDMIEGIPEGKDKHRMNKHKIGNEGLAADLTDDPDTEEALKEFDFLVTAEDGEGAGEARSSGDGTEWAEPITFPSGGGKSFIMGSDDVLLSVLGLGDLADLTVTNDADYSYDLPANKDAFRKTWNPKYTLRSHFDGVRALAFHPVEPVLVTASEDHTLKLWNLQKTVPAKKSASLDVEPIYTFRAHIGPVLSLAISSNGEQCFSGGIDATIQWWNMPSPNVDPYDTYEPNVLGGTLVAHSDAVWGLAYSGIKNQLLSCSADGTIRLWNPQEKLPCICTYNGDKEHGIPTSVDFIGCDPAHMVTSFNTGSTIIYDLETSQSLVILSSQVDSGLQSSNHINRVVSHPTLPVTITAHEDRHIKFFDNKTGKMIHSMVAHLDAVTSLAVDPNGIYLMSGSHDCSIRLWNLDSKTCVQEITAHRKKLDESIYDVAFHPSKAYIASAGADALAKVFV	136529	255439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_137000_197536_197641_198070_198145_201762_201845_207044_207219_215045_215176_216756_216899_235060_235195_236659_236836_237035_237084_237360_237483_241423_241592_242594_242736_245261_245370_251124_251212_251295
903349	scaffold_13609_pilon	+	7715	43	Intergenic	novelGene_124417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	144.58351320344	3	113	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2196	6591	37	6627	654730	704230	TRUE	20	AACTCATCATGTGTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLRLTRDHKYAMMFAELKSTRMILNLTQSSGFNGFTPLVTLLLRHIIEDPCTLRHTMEKVVRSAATSGAGSTTSGVVSGSLGSREINYILRVLGPAACRNPDIFTEVANCCIRIALPAPRGSGTASDDEFENLRIKGPNAVQLVKTTPLKPSPLPVIPDTIKEVIYDMLNALAAYHAPEEADKSDPKPGVMTQEVGQLLQDMGDDVYQQYRSLTRQGSDFDTQSGFSINSQVFAADGASAETSTSGTSQGEASTPEESRDGKKDKEGDRASEEGKQKGKGSKPLMPTSTILRLLAELVRSYVGIATLIANYSYTVGQSELIKEDCSVLAFVLDHLLPHTQNAEDKDTPALARLFLASLAAAGSGTDAQVALVNEVKAALGRALAMAESTEKHARLQAVMCIISTIMESCPSTSSFYSSATAKTQHNGMNNIIRLFLKKGLVNDLARVPHSLDLSSPNMANTVNAALKPLETLSRIVNQPSSLFGSKSASSKSKSEQDAQGASQDSNSNQQDPGEPGEAEVQEEDHDVTQTEVADGDIMDGEAETDSVVIAGQPEVLSSQEMQVENELEDLIDELLERDGGSGNSTIIVSRSGEDESQEDVLMDDKEDDEGEEGDEDDDDDGSEMELDEDYPDMNASPLVRFERFDREDDLIIEFDNMFSSATDIPPSPGNIPTTHPLMVRHADHSSLTLGSGSSTTRLTQGIGRSQRTLRQLTANTGHTIHVHYPGNRQPNPPLILQRLLGPSAAADILQLSSSLPLQSRGRARLLVGNDDVHIIARSDDELLDDFFHDQSTATSQAGTLSSIPTALTRWTEECKVLDAESMHDCVSVVKVPIVNHLEFLRDEELEERREKRRKQLAEEETKMSDKGKEDKENRDQSAQCTASKTNDSTEQNLSDGTPMPDSYPTTPSSTDAATSESKETLVTLQPSQQQPTLPPPPALGEIPQELQSPAGEGESSTQLLMPVEPEELGPTRPSGEAETTQMELSPAPTISRDLTSPYDFLLASLSPERAEDSDALTAVSSQLEGSPMDTSSLASCTLEEAVGDTSAAGSSEQPTAGSTTPGDAPPVVAEVQGRGDGSGEPAQPPEDSSPPASSESSSTRDSAVAISGADSRGILEEPLPSTSSEEEDPLAGISLPEGVDPSFLAALPDDIRREVLQNQLGIRPPTRTAPSTTSSAPTVVGNPGVTEVSPEFLAALPPAIQEEVLAQQRAEQQRRELAQSASSDSPMDPVTFIQTLPSDLRRSVLEDMEDSVLAVMPPDIAAEAQALRREQEARQRQLMHERLFGHSSTSALSAILRSPAFTSRLSGNRGVQYTRLAVQRGGTFQMGGSSSHNRPSGSNVDTLLRLRGRLLLDHEALSCLLVLLFVDEPKLNTSRLHRVLRNLCYHAQTRHWVIRSLLSILQRSSESELCIETPKLTTTEEKGKKSSKSCGSSSHENRPLDLLHKMESKSSNQLSWLSVSMDAALGCRTNIFQIQRSGGRKHTEKHASSGSTVHIHPQAAPVVCRHVLDTLIQLAKVFPSHFTQQRTKETNCESDRERGSKQACSPCSSQSPSSGICTDFWDLLVKLDNMNVSRKGKNSVKSVPVSAGGEGETSPYSLEASPLGQLMNMLSHPVIRRSSLLTEKLLRLLSLISIALPENKVSEAQANSGSSASSTTTATSTTTTTTTTAAATTPTPPATTTPVTSAPALVAATAISTIAVAASTTVTTPTTATTTVSTSTTTKGSKSPAKVGDGGSSSTDFKMVSSGLTENQLQLSVEVLTSHSCSEEGLEDAANVLLQLSRGDPGTRDTVLKLLLNGARHLGYTLCKQIGTLLAELREYNLEQQRRAQCETLSPDGLPEEQPQTTKLKGKMQSRFDMAENVVIVASQKRPLGGRELQLPSMSMLTSKTSTQKFFLRVLQVIIQLRDDTRRANKKAKQTGRLGSSGLGSASSIQAAVRQLEAEADAIIQMVREGQRARRQQQAATSESSQSEASVRREESPMDVDQPSPSAQDTQSIGSDGTPQGEKEKEERPPELPLLSEQLSLDELWDMLGECLKELEESHDQHAVLVLQPAVEAFFLVHATERESKPPVRDTRESQLAHIKDEPPPLSPAPLTPATPSSLDPFFSREPSSMHISSSLPPDTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEESIVYSV	654693	707706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_654874_657577_657774_659374_659543_660457_660604_661021_661089_662471_662687_674314_674527_674974_675158_678258_678432_678779_678929_679662_679739_680558_680608_681532_681706_683077_683307_684170_684350_684626_684717_684867_685023_686252_686299_688094_688383_689346_689639_689829_689961_690482_690698_690773_691063_691223_691327_692359_692907_693558_694163_694886_695009_695120_695278_696489_696623_696862_697066_697633_697762_699036_699134_700772_700929_701683_701930_702286_702405_703031_703121_703164_703173_704215_704504_704633_704740_705380_705499_705813_705996_706311_706503_707488
903350	contig_15327_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_70404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGGCTGTTCAATGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201	2578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_200_2600
903351	contig_3825_pilon	+	1135	7	Intergenic	novelGene_77950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1241.4496119009	15702	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	12984	14024	TRUE	25	GAGCCCAGGAGTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGLPRCTRQCACTPTDKG	12982	15854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_13971_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
903353	contig_5947_pilon	+	4662	3	Intergenic	novelGene_101593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1919	2407	889314	889802	TRUE	15	GCCGTATGTGTGTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLKVVRTETEYLKISILGISELRWTGIGHFESDSHMVYYAGNGKLKRHGVTFVIKKNISRCILKYNAASDRIISICLQGKPVNMTIIQIYVPATKAKDEEIEDFCQLLQSEIDQTCNQDALITTGDWNVKVGNKEEGSVVGRYGLVDRNRARECVIEF	883715	892113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_884767_888446_890701_890756
903355	contig_18108_pilon	+	4736	1	Intergenic	novelGene_33480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	920	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGGTGGGGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234780	239516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_234800_239500
903356	contig_8710_pilon	+	6300	17	Intergenic	novelGene_73515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.3315932010349	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	128	1675	368593	438250	TRUE	20	TATGCATGGAGTTGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTTIHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKNKSGLISGLDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTLAGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNATGRLTLADIERIAPLAEGALPYNLAELQRQQSHGLGRPVWLQIAESAYRFTLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRGSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFTKRDGSIPLFAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVLRDLGLFGLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVYAHCKLLLADENGHVGGLNLLAAGALAGNYSFFFFFLILTKRTLPYS	348362	444584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_348413_353291_353336_368559_368703_378227_378344_386208_386349_398322_398470_401126_401266_401941_402036_403627_403713_416879_416962_418229_418389_421453_421507_421746_421828_436144_436286_438049_441680_441813_441905_443479
903357	contig_11292_pilon	-	2741	1	Intergenic	novelGene_109457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATCAATCTTCCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405907	403166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_403200_405900
903358	contig_17144_pilon	+	2700	5	Intergenic	novelGene_29139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	21	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTAAAAAGCATATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59886	65524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_59919_61123_61279_61743_61942_62045_62223_63386
903359	contig_15112_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_124753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	701	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATCATACAAAAACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20225	18057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_18100_20200
903360	contig_16126_pilon	+	9603	11	Intergenic	novelGene_141868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	212.724352155554	477	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	925	2778	3587	6364	25806	45044	TRUE	20	GAACTGTCTCGTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPYDSRLDDKKFLYSAPKNKSHIDDCLHTYIFRPEMYQLPICKLKELFEENKKLQQFSPLSDYEGQEEEMNGTKMKFRKRNNSRSEIITSGKQKSSHSLDYDKDRVKELINLIQCRKKNVSGDSDTEDMRSKTVLKRKLEDLPENMRKLAKTSGLSENCHLYEESPQPVGSLISALGHDADLRRQQQDPSNSGVADIHSLFNWLSETLANARHSDASLTDTVNKALGLSTDDAYEELRQKHEYELNSTQDKKEYEQPTCAKIENVHFKGTQSPLLEVDTSSLKYPVGASTSEGGTDLKLHLKEDPNLISVNNFEDCSLCPTVPIEHGFRRQQSKSNDVEETEIHWKLIPITGMKSPEEQLVCVPPQEAFPHDPRVISRQRSSDYQFPSSPFTDTLKGTTEDDVLTGQVVAEEQCVPAAEPPALSETTERTVLGEYNLFSRKIEEILKQKNVSYVTRIPTPIFSTQEKMKRLSEFIYSKTSKAGVQEFVDGLHEKLNTIIIKASAKGGNLPPVNPNDSGAKMASTAVGRHAVPVSSGDFSGNCLPESLCSDAFKDTNSHEPHSSSAVGLTDVEMSQPHHAAELMVTSDHTVPGDAAREPVEKETKSPSDVNMSAQPALSNFISQLEPEVFNSLVKIMKDVQKNTVKFYIHEEEENMLCKEIKEYLIKLGNTECHPEQFLERRSKLDKLLIIIQNEDIAGFIHKVPGLVTLKKLSCVSFAGVDSLDDVKNHTYNELFVSGGFIVSDESILNPEVITIENLKNFLTFLEELSTPEGKWQWKVHCKFQKKLKELGRLNAKALSLLTLLNVYQKKHLVEILSYHNCDSQTRNAPELDCLIRLQAQNIQQRHIVFLTEKNIKMLSSYTDNGIVVATAEDFMQNFKSLVGFHNSDTDETLPLLGANENLESQSDAVLTLTPLELGVGISQH	22219	48320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_26299_30660_31080_32275_32421_37088_38018_40710_40834_41652_41813_42295_42405_43854_44034_44234_44400_44988_47595_47631
903361	contig_15264_pilon	+	1805	1	Intergenic	novelGene_158862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAGAGTGATTTAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10543	12348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_10500_12300
903362	contig_10263_pilon	-	2937	3	Intergenic	novelGene_135857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	80.5	4	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	802	1353	926104	923052	FALSE	75	ATGAAAAAACATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESGYVCEGDHKTMAKAIKDRVSLIKRKREQRQLVREEQEKRKQEESSLKQQVEQQSSASQVGIKQLPSTSSAGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQLQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQAHSTGTIPGHTASVVQAQSQPHGVYPPSSVVSKCIKE	926905	921467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_923264_924533_924871_926101
903363	contig_5084_pilon	+	5515	6	Intergenic	novelGene_64642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	660	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	5206	5514	1340920	1344218	FALSE	15	TCTGCTCACCACCGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILTRGCDAQYSQVSQLLPKLSKFLELVALINLLGLGGQVLLKKLNHGLTKLLLLLAQPVDRIVHGQHRVGPLGDEAGERRQLWPPQPPPPNTPALTPSGSRH	1333797	1344219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1334962_1335202_1335338_1335727_1335823_1337108_1340982_1341203_1341295_1344062
903364	contig_2799_pilon	+	767	7	Intergenic	novelGene_85545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	421.829217680436	16	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	353	766	721200	755382	FALSE	20	GGTCCCAGCAAAGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLADENTAAPMFANR	704713	755383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_704819_707593_707703_721061_721224_729189_729365_748947_749016_751384_751452_755302
903365	contig_14744_pilon	-	3882	5	Intergenic	novelGene_65982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	461.036061496278	37	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	158	667	969897	968300	TRUE	30	ATGATCCAGCAACCCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	970054	960153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_964410_967273_967450_967948_968630_969717
903366	contig_11512_pilon	-	2892	17	Intergenic	novelGene_43351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1181.68058124594	4	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	489	1400	586598	556654	TRUE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622304	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555270_555365_556120_556226_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586805_592797_592923_609596_609669_622219
903367	contig_14956_pilon	+	3959	1	Intergenic	novelGene_102957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1462	2511	1462	2511	NA	50	GATCAGAGCAGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTLDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	0	3959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14956_pilon_+_0_4000
903368	contig_10299_pilon	+	2083	7	Intergenic	novelGene_79673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	78.3446800292712	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	185	631	184255	185123	TRUE	20	ACTTGATACATTCGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELGYNCQTGGVIAEILRGIRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPELVKIVNDNATYCRLAQFIGNRKELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRSSMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALIGEAVRHGELRNVAM	183907	187681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_183964_184126_184326_184665_184854_184935_185864_186084_186207_186389_186532_187233
903369	contig_5643_pilon	+	722	8	Intergenic	novelGene_38800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2041.02718237256	12	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	68	670	233973	238136	FALSE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNFPQRPLCQAHFLVRPPAPATALEEERGPLSCWGVLAPTPSNTLRIFHPLHSFHPYPLKKG	233607	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236737_237780_237823_237993
903370	contig_19777_pilon	-	1974	7	Intergenic	novelGene_29706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	46	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGTAAAAAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19478	10426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_10583_12884_12976_13206_13283_13382_13517_15437_15559_16872_17031_18240
903371	contig_3822_pilon	-	2737	14	Intergenic	novelGene_133298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_13	1099.42692441571	7	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	72	1571	306185	277069	FALSE	25	TGTTCATGTTTCTGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEGVIPDETKALSLLAPANAVAGLLPGGGLLPTPNPLTQIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRCTRPNGRLLSGGKMRRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDSEKEKKEEKKPTEAGSPKTKECSVEKGTGDSLRESKVNGDDHHEEDMDMSD	320793	275902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_282994_283043_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_299561_299696_305985_306208_320744
903372	contig_13592_pilon	+	3178	4	Intergenic	novelGene_33727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1447	junction_2	334.032267237097	28	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2093	2569	267144	267783	TRUE	30	ACATGCTGTACATACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLPGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRKLIFFSLKVGFEKKTSGSTVCAIHT	265051	269461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_267282_267365_267493_267571_268000_269068
903373	contig_11933_pilon	-	2306	13	Intergenic	novelGene_107257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_12	69.3398935197721	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	188	1771	207924	116206	FALSE	10	TTTACCCTATGGTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSHEGRSAVDQAGGAQIVVDHLRSLCGRTDPANEKLLTVFCGMLMNYSNENDSLQAQLINMGVIPTLVKLLGIHCQNAALTEMCLVAFGNLAELESSKEQFASTNIAEELVKLFKKQIEHDKREMIFEVLAPLAENDAIKLQLVEAGLVECLLEIVEQKVDSEKEDDIAELKTASDLMVLLLLGDESMQKLFEGGKGNVFQKVLSWLPSNNHQLQLAGALAIANFARNDGNCIHMVDSGIVEKLMDLLDRHVEDGNVTVQHAALSALRNLAIPVINKAKMLSAGVTDAVLKFLKSEMPPVQFKLLGTLRMLIDAQAEAAEQLGKNVKLVERLVEWCEAKDHAGVMGESNRLLSALIRHSKSKDVIKTIVQSGGIKHLVTMATSEHVIMQNEALVALALIAALELGTAEKDLESAKLVQILHRLLADERSAPEIKYNSMVLICAVMGSESLHKEVQDLAFLDVISKLRSHENKSVAQQASLTEQRLTVES	214376	115670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_116334_121189_121319_126412_126540_135963_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158485_162881_163011_176518_176666_207803_207930_214194
903374	contig_4486_pilon	-	2568	9	Intergenic	novelGene_38536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_8	197.69005886741	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	656	1876	177451	130815	FALSE	15	CTGTCTTATGGGATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMEHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	178298	130122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132279_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304_177724_177915
903375	contig_12410_pilon	-	3298	1	Intergenic	novelGene_167269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	787	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGAATAGCAGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64233	60935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_60900_64200
903376	contig_17964_pilon	-	2396	4	Intergenic	novelGene_33865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5735.30704399415	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	TRUE	0	CTCTCTGGCTGGTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134313_134413_135640_136905_136999_139520
903377	contig_17440_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_7555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2352	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGTCAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2859	1409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1400_2900
903378	contig_16205_pilon	-	636	4	Intergenic	novelGene_156874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	318	junction_1	714.270256975607	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	89	634	103379	87239	FALSE	50	AAGTACAGGGATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKSKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLIYIDDEDPSSSIESSDPSLSSTTTSSRNQASRSRVS	103467	87236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_87429_88544_88738_89468_89553_103300
903379	contig_6557_pilon	+	3387	1	Intergenic	novelGene_32966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTACAATCTTTTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382145	385532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_382100_385500
903380	contig_2219_pilon	-	3901	1	Intergenic	novelGene_67202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATACACAAATAAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229586	225685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_225700_229600
903381	contig_13699_pilon	+	11676	29	Intergenic	novelGene_158313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_17	351.304004854102	870	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3854	11562	115	11676	31433	111105	FALSE	40	TTTCAGCAAAGACAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGIIDTATGRRLTINEAVSNDLVAAKIALVILESLWSFMGLLWPESGEILPITDALEQGIVSTELAHKILSGRQHIMALFLPATAEVWSWKKAIENGILDKDLANNLKSICIPDVMPHMQLADASEQSKLSINPGAAALPCSKGQTEGIASHREKLLFQLMTHSYINVRDGQRLLLLDKELIETLTPRDGSQTSPPEVFGIGHQRLETPEELQESVNVKSTEAFFDGLTLRPQEFQVSFQNKEYTEGTETIVETEGSYVENPGKDLFVGEQKVRNPNVNTLKVINKVKSELQRQLLGTQTEHRTEVSMRKNVSSGLTVPHQEAEGLCLVVDKDHFPVETPAEEWQAFRKTSFTCQKEQANTLETERIPGETGRTLIKPQDKKSQFQVEKTLDLESEVKSENDVSIQSLDKKKVVNKMLLDRDDYKQSQEGENIAGGSSRMMLEKRDEEDNGSETSLSCSRPSELLEETTLNILSAQLLDGGIFHEQTGQKLLLNEAIAQGIVPSHIAVKLMGKFQMFRGFFDSQTCESLTTEEVIDEGLMDEKLLHNVLMSDKAISGVLDPRTHTLCTVKDAVATGLLDKQTATRILEGQVVTGGIIDMKRGKKVSVTLASNLGLVDSADQAELVSLEKASKGRDCEKTIRERLITLQMETTGIMDPDTKAPLTVVHAIDRGLLERQEAIQLLTKQVVDGGIIHHVSGMRLSVDNAFKHGLIDEDLSRQLKKVENLNLHQFFHPETKETISFPEAMKLDLITPDLKREIQEIQSLTGSFVDLISGQRLTLAEAKKEGPLTNKALLSSGMMHGIVDPENYRIVPYSELVKKCKIDIESGQRYLEVIPFSDIKDGVSGKAVTLSEATQLGKVDFASTWRVLEAQANTGGIIDTATGKRLTLASALEQKLVDENMVRIIASHQVSNGGIIDIFNDQRVNLKEAIEKKLISHELAAVIQVDTLEPSDHKAQIEKHDEIEVCELKNEFLRKEMLIACNQAAEMSCDKEETERLFQIESPSAEETTKLRLPDGEQAKKTRKISLRESQYKDHDKRRASPDAKGSVSILISGNLTGKFLDQIAVEHPHSEVCNFKLKELVQVNMGNNTNGEQEKIVTQVEIISPVKQSTSGLESKEIRENQREMISEVQESNCGTSGKLLSEQATREPMNIKVKSKREKREMILDASVKTCKPAILSEEEWNQETGITDEHDSSIKSQPTEITIPERGKEAEREQGFSIICKAKDSSYQMVSKGISIGNQDASTFFNSKQANEGEVNNLSICLTLKPEENLIQEITDGPQSEPSPSMTPRLEGLHYQESVGQALDADTSQISKAYKSLQGTTRQETNYYRDSCVTFKSKETKDVISRSNECKEKSYQEVTFDLTKALKLEDITVSRVDPKEVSYLEFSDRKDLNHQDSRSDREVCGISKSNIVTTQETTGEKFLEMANSKVTDSEAGSLEGIVTQEGPTVLVSLLPEKLLQDLSWKEITGQQDAITSPTIPETSAEKTVPLISCSTKKMDEMTPQEELRESPSSEQTPFMTVPGGKENEGVNLEPFKATKNVYNRQLCLEHDEKLVSYLSLLRDIEMRMKQIQPLELNLTELEDLLCQAKVLDRELKDLSTMVSQELECVNQIIISQPQEVPAQLLKALEKDAKNLQKSLSSVSDMWSSRLHCLQNVVEVKKTKMLNQQVQLEGKLEDLKAWVVNTNLTLNSKEYNNETDADSLNHCLQQYEDLEQPMAERKSQLDALAFDIQFFISEHAQDLSPKQNRQMLRLLNELQRSFQDLAEQTAAQMDVLQGHLQQLEQAAQVKTLQKQQNTCHQKLEDLCNWVGQAEKTLVSHQGRAIQQDLSALQKDQSDLKDLQDDIQNHATSFASVVKDIEGFLEENQTKLSTHELTALREKLLQAKEQYEALQGRTRVAQKELEEAVTSALQQETEKCKAAKELAENRSKIDTLLDWVTSLGSSGRQLQASLPRMEQISGAGLEKEALDTTDGHTGVNQAPEKLDEQCEKMKAHHQELLSKQQNFILATQSAQAFLDQHGHNLTPEERQTLQEKLGELKEQYATCLAQSEAELKRVQTLRDELQKFLQDHREFENWLERSEKELENMHKGDSSPEALPSLLKRQGSFSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLDTENSFKKGGEPSATENLVKEKLRDATERYTALHSKCTRLGSHLNVLLGQYRQFQSSVDSLQAWMRTCRANVEKLLSDSVASDPGILQQQLATTKQLQEELAEHQVPVEKLQKVAHDLMEVEGEPSPDHRHVQETTDCILSCFQSLSCSLAERSALLQKAIAHSQSVQESLESLLQSIREVEKNLGGEQMASLSSGVIQEGLATNMKLKQDIARQKSSLEATREMVTRFMETADSTTAAVLQGKMAEVSQRFEELCLQQQEKESSLKKLLPQAEMFEHLSEKLQQFMENKIRILASGNQPDQDIAHFFQQIQELNLEIQDQQENLDTLEHLVTELSSCGFALDISQHQDRVQNLKKDFTELQNTVKEREKDASSCQEQLDEFRKLVRTFQKWLKEAEGSIPPTETFRSTKELEKEIEHLKGLLDDWASKGTLVEEISCKGTSLENLIMEITAPDSQGKPGSILPSVGSSIGSVNGYHTCKDLTEIQCDMSDVNLKYEKLGGVLRERQESLQAVLSRMQEVQKEASSVLQWLESKEEVLKAMDASSSPTKTETVRAQAESNKAFLEELEQNSPTIQKVKDALAGLLMTYPNSQEAENWKKIQEDLNSRWKRATEVTMARQRQLEESASHLASFQTAESQLRPWLMEKELMMGVLGPLSIDPNMLNAQKQQVQFMLKEFEARRQQHEQLNEAAQGILTGPGDVSPSFSQVQQELQSINQKWVELTDKLNSRSSHIDQAIVKSTQYQELLQDLSEKVKAVGQRLSGQSAISTQPEAVKQQLEDTSEIRSDLEQLDNEIKEAQTLCDELSVLIGEQYLKDELKKRLETVALPLQGLEDLAADRMNRLQAALASTQQFQQMFDELRTWLDDKQSQQAKNCPISAKLEQLQSQLQENEEFQKSVNQHSGSYEVIVAEGESLLLSVPPGEEKRTLQNQLVDLKSHWEELSKKTADRQSRLKDCLQKAQKYQWHVEDLVPWIDDCKAKMSDLRVTLDPVQLESSLLRSKAMLSEVEKRRSLLEILNSAADILINSSETDEDDIRDEKAGINQNMDTITEELQAKTGSLEEMTQRLKEFQESFKNIEKKVEGAKHQLEIFDALGSQVCSNKNLEKLRAQQEVLQALEPQVDYLKNFTQGLVEDAPDGSDASQLLHQAEVAQQEFLEVKERVNSGCVMMENKLEGIGQFHCRVREMFSQLADLDDELDGMGAIGRDTDSLQSQIEDVRLFLNKIQVLKLDIEASEAECRQMLEEEGTLDLLGLKRELEALNKQCGKLTERGKARQEQLELTLGRVEDFYRKLKVLNDMTTAAEEGEALQWVVGTEVDVINQQLADFKTFQKEQVDPLQMKLQQVNGLGQGLIQSAGKNCDVQGLEHDMEEINARWNTLNKKVAQRIAQLQEALLHCGKFQDALEPLLSWLADTEELIANQKPPSAEYKVVKAQIQEQKLLQRLLDDRKATVDMLQAEGGRIAQSAELADREKITGQLKSLESRWTELLSKAAARQKQLEDILVLAKQFHETAEPISDFLSVTEKKLANSEPVGTQTAKIQQQIVRHKALKEEIESHATDVHQAVKIGQSLSSLTCSAEQGVLSEKLDSLQARYSEIQDRCCRKAALLEQALSNARLFGEDEVEVLNWLAEVEDKLSSVFVKDYRQDVLQKQHADHMALNEEIVNRKKNVDQAIKNGQALLKQTTGEEVLLIQEKLDGIKTRYTDITVTSSKALRTLEQARQLATKFQSTYEELTGWLREVEEELATTGGQSPTGEQIPQ	31318	111105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_35948_36489_36640_38903_39120_39207_39358_41505_41740_44567_44718_45400_45635_46778_47004_50324_50844_51604_51782_52041_52166_53003_53213_53587_53906_56103_56271_58071_58229_60106_60225_64366_64430_65340_65583_66406_66537_67776_67977_70769_71266_72689_74162_104575_104738_104916_105088_106270_106438_108464_108625_108983_109311_110257_110343_110881
903382	contig_16548_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_167091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACGATTAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19948	21331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_+_19900_21300
903383	contig_8377_pilon	-	4894	27	Intergenic	novelGene_35078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.20274170204252	13	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCAGAGATGTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199233	128831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_128932_131428_131569_135046_135194_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176704_177252_177343_177428_177526_180381_180501_182889_183046_183256_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660
903384	contig_9484_pilon	+	1686	12	Intergenic	novelGene_105611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	533.911637224397	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	64	1551	95848	104965	FALSE	5	GGTGGTGGTTTTCTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCPSQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95784	105100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101713_101985_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
903386	contig_7207_pilon	+	4243	4	Intergenic	novelGene_72022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	6	992	3307	4293	TRUE	60	AACCCCTAAAAGACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMVNRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	3301	63793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_5534_45541_46277_61399_62113_63230
903387	contig_14333_pilon	+	2157	2	Intergenic	novelGene_49110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	0	5	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTTGTTTTCCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353885	369100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_354062_367119
903388	contig_4364_pilon	+	1954	6	Intergenic	novelGene_395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
903390	contig_3018_pilon	-	2794	1	Intergenic	novelGene_78928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCAGAACTGCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641362	638568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_638600_641400
903391	contig_1143_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_86631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTAAAATTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285571	1287689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1285600_1287700
903392	scaffold_13505_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_111679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAATAAAAGACGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949907	948652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_948700_949900
903393	contig_9871_pilon	+	2242	7	Intergenic	novelGene_75698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	56.3079331296518	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1077	1478	562018	562419	FALSE	60	AAAAAAAAAAGAGGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGAPGCSPIPAAPPPLSSPLSPPPGFIHQSSSCAVVHSCTGQCLPQLLSSCRRHWRVCRPGLGAYGLLAPGGYTWSESGLTNRAAAAMLPGTCTPSPHPVPRSSQSPSLAAGTAPAQPTATHLARRPPVSS	552186	563183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_552296_552830_552940_555670_555839_557753_557870_558461_558559_560958_561088_561669
903394	contig_4659_pilon	-	3604	9	Intergenic	novelGene_118235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_6	171.156361260691	218	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	193	1218	860030	819799	FALSE	75	AATAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQSSCKDLKRLFSGTQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884161	817412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_852958_853001_853789_853937_859916_860039_883977
903395	contig_14868_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_150462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTTGGCATATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206465	205021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_205000_206500
903396	contig_4783_pilon	-	3694	4	Intergenic	novelGene_108412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTACTAGTACCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469643	386149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_386339_386446_387502_465983_467709_468918
903397	contig_5482_pilon	+	5070	10	Intergenic	novelGene_144495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_8	370.837424030704	32	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	1820	2833	568038	587931	FALSE	10	TCTTTTATTTTCTTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKITLRSYVDLLKLEDVLRQHPFYFKAARIAIEIYLKLHDNPLTDENKEHEADTANMSDKELKKLRNKQRRAQKKAQIEEEKKNAEKEKQQRNQKKKKDDDDEEIGGPKEELIPEKLAKVETPLEEAIKFLTPLKNLVKNKIETHLFAFEIYFRKEKFLLMLQSVKRAFAIDSSHPWLHECMIRLFSTAVCESKDLPDTVRTVLKQEMNRLFGATNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKMVYYLDPSSQKRAIELATTLDESLNNRNLQTCMEVLEALCDGSLGDCKEAAEVYRANCHKLFPYALAFMPPGYEEDMKITVNGDSSAETEELANEI	561787	590168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_561852_564657_564828_565908_566062_566605_568204_571622_571817_579686_579796_581713_581813_585112_585260_586235_586334_587730
903398	contig_2867_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_135173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGACAATCTTGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739466	741492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_739500_741500
903399	contig_14077_pilon	+	4107	1	Intergenic	novelGene_174863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCAGAACATTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36315	40422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_+_36300_40400
903400	contig_5316_pilon	+	2250	11	Intergenic	novelGene_61235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	325.17689032279	46	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	294	791	453918	521456	TRUE	30	AAAATGTGGAGTTTGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSPPFSAEE	450438	551011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_450590_453775_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521387_521430_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
903401	contig_12677_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_110829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATAGTTACTCCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2230	2512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2500
903402	contig_3975_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_54910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCACCATCTAGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2144145	2146190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2144100_2146200
903403	contig_8375_pilon	-	2460	14	Intergenic	novelGene_141257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCAAGGTCGGGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64750	5933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_6047_18691_18796_24651_24972_28748_29049_31082_31356_35204_35456_37049_37325_40522_40811_41396_41517_43344_43430_45559_45615_46932_46996_51080_51140_64596
903404	contig_3004_pilon	+	3839	1	Intergenic	novelGene_127551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811788	815627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_811800_815600
903405	contig_5605_pilon	+	5174	5	Intergenic	novelGene_143950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	5.58457697592217	146	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	106	555	460762	484951	FALSE	10	GGGGAGTTTTTTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYQTSTGQYIAIAQGGTIQISNPGSDGVQGLQALTMTNSGAPPPGATIVQYAAQSADGTQQFFVPGSQVVVQDEETELAPSHMAATTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKAE	450943	489570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_450972_460684_460874_469106_469143_472975_473133_484806
903406	contig_8898_pilon	+	6351	8	Intergenic	novelGene_137243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	443	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5869	6219	321757	323554	TRUE	40	AAAATCTTCATCAAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERICNARSKLLFHPANHDTIQQDRVTFTVQSMWSSINWSDPCKLQSKAGIDVVYTNCVTTSHTAVKWFIRPQGSPSGVCTGQRKPQDSGSSLRTVVVLILAKSAPLCTQRKWER	301993	324474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_307072_307575_307836_308485_308677_309914_310077_310677_310851_321752_321888_323334_323614_324401
903407	contig_610_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_76852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	76	333	377424	377167	NA	10	AGGGGTCTCAGGTTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIHTLPDASPLGTVCLARLASSWREMWTNHIPEQMSRVKTGEIYSKESSELGDLSKVLGAELEIKGFEEQRKQEMMGVRTVQMTPVTLTMTADGLSCVLGCVGLELARFI	377499	374822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_374800_377500
903408	contig_14682_pilon	+	6097	6	Intergenic	novelGene_139094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	130	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3395	3715	91757	103750	TRUE	80	GAAAAAAGAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLDVCGSRRGVSLPCSSAWPDRAPKSRKGKENKKQFKTNKQNPRDSTSVAAQTGKQLHIRMELCSPSGRSNDGTWSQVLERKEGEVGRGKEEIKRSKKKQH	63718	112563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_64611_64798_65676_90131_91958_92229_92332_103732_104199_110629
903409	contig_1380_pilon	-	2298	16	Intergenic	novelGene_138867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGACCTATCTGATGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107989	21511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_21567_26776_26914_29226_29354_30860_30928_34166_34274_36621_36751_41651_41722_43954_44040_47071_47162_47266_47304_50527_50582_51341_51415_64117_64227_76947_77089_85291_85368_107048
903410	contig_13901_pilon	-	3296	1	Intergenic	novelGene_146653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAATGTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232392	229096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_229100_232400
903411	contig_9471_pilon	-	4110	10	Intergenic	novelGene_21714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_9	144.85838124625	137	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	161	1693	153444	126302	FALSE	20	AAATTATGCTGTGTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSIALWLSVEWTGDLLLHFLGMTLHGVSAVVIHQVEEALDEDEKETLLFLCRDVAADVALPHVRDLLDILSERGKLSAMGLAELLYRMRRFDLLKRILKMDKAAVEDLLLRHPHLVSDYRVLLTEISEDLDKSDVSSLIFLLRDYTGRGKIAKDKSFLDLVVELEKQNLVAPDQLDLLEKCLKNIHRIDLKTKIQKYKQSAQGAAGTNYVNALQASFPNLSLKEASYNLGLQNGRRKEQRMVVEQLGIQREPVKTSIQESGTFLPQHIPEERYRMQSKPLGICLIIDCIGNDKDLLQDTFTSLGFEVQYFRYLSVDGIIQILHQVACMPQHQNYDSFVCVLVSRGGSQSVFGVDQTRSGCPLDQIRRMFMGDLCPSLLGKPKLFFIQIYVVSEDQQEVSSLLEVDGAGMNIVESKVRQPGPCMVHREADFLWSLCRADVALLEQSPCSPSVYLQCLSQKLQQERKRPLLDLHIELHSKVYDWNSRVSAKEKYSVWLQHTLRKKLILSCK	167022	123884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_128295_128807_140993_141076_141797_141848_144789_144848_147757_147847_148762_148899_150603_150710_153082_153495_166912
903413	contig_6292_pilon	-	4790	4	Intergenic	novelGene_178627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	2665	3408	12290	11547	FALSE	25	TAGTGGTTTATTTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFPSFMILGKFSVSNSSVILSVFSVFSPCSGTPITCRFLLLIVSHIILRVSSCFFILFSNFSSDRVVAKCLSSISLILSSFVSKLLLSPSMTPSISEILFFTFWISNCCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSFFFFFLVCIFHEFTWLFHEFVYFSSFLSVFCFNSLIILNIRDLNSLSVRSSAFSSTEGHLVFYFGCLLEPSCRGFVNVLILSAVFGAFSGYFSHLLIVDSFVLSCFFVLFGYV	235784	10164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6292_pilon_-_12361_93953_95067_95321_95720_234701
903414	contig_7412_pilon	-	1976	7	Intergenic	novelGene_76304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1266.8272376295	5	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	267	1682	375758	364445	FALSE	10	CGAGGTCTACTGGTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	377148	364150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373516_375282_375801_376924
903415	SIRV6	-	1102	6	Genic_Genomic	SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9291	-112	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	24	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTTTGACCATACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11838	2470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
903416	contig_11248_pilon	-	4124	6	Intergenic	novelGene_142562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	922	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1919	2248	485371	485042	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKTIIQEQNAKINSQLGVIRKQKLEIQKINNKISEMGSVIEGVRSRFETMEDRISEIEEKHLDTTLSEEKSEKRMKKNEDALRIMWDTIKSKNLQVIGVSEQGEKT	558538	381704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_383282_484159_484270_484852_485517_550616_551963_552226_552571_558455
903417	contig_5125_pilon	+	2630	8	Intergenic	novelGene_43427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	3	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	403	1536	35654	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25971	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26021_26191_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
903418	contig_13292_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_142937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAACAGTGGAAAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192487	192958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_192500_193000
903419	contig_9653_pilon	-	4071	14	Intergenic	novelGene_48280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	974.340262303453	6	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	642	1766	1018271	1007791	TRUE	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEGIQCNFP	1040051	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007260_1007734_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021122_1021159_1025286_1025426_1039825
903420	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_93031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657821	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657822	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
903421	contig_8484_pilon	-	1763	3	Intergenic	novelGene_178378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	8.5	7	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	35	412	46931	44496	FALSE	35	AAACTGAGCCGTGATCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKSWGCCPENWMISNTSCYFISSEAKTWTESKKNCTGMQALLLVINAKEEQLLIIQKLNRNSAYYVGLSDPEGMHQWQRVDQSPYNRSVTFWHPYEPSNYKEHCVFINFRQGNWGWNDASCDVPQKSICKMMKIYL	46965	43144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_-_44638_45969_46086_46811
903422	contig_10749_pilon	-	1113	4	Intergenic	novelGene_133482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	763	junction_3	475.975489565027	13	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	67	513	168321	164528	FALSE	10	GTCTCTGTTCACCTGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGKKNESSPGGGVKVWGGNTGTMWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNPLAPGMVGPGMVMDKKMRKKMKKAHKKTHKHHKHGKHSSSSSSSSSSDSD	169054	163927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168302_168346_169012
903423	contig_13172_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_146312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGATGGTTCGCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8105	5828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_5800_8100
903424	contig_4103_pilon	-	4670	27	Intergenic	novelGene_51987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_16	286.240797893484	9	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1548	4644	27	4670	352666	202265	FALSE	45	CCCAGCACCAATCGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWLRVRTMLTDGGGGGTSFEEDLDSVTPRSAPAGASEPPPPGGVGLGLRTVRLFGEAGPAPGVGGGSSGAGGGDAALDFKLAAAVLRAGGEGGASGSDEDEVSEVESFILDQEDLDNPVLKTSEIFLSSTAEGADLRTVDPETQARLEALLEAAGIGKLSTADGKAFADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLDEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTALTYACAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLAAGADQEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLDKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQNLLPPFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKDTVSLHQQCAHKEVCPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFTDNDVVDESPPLAKQIDFVPVQPLPSPQCNFSSDIGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHGQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREKRKEKRKKKKEEQKRKQEDEENKPKESLELPEDEDEEENDEDVEQEVPIEPPSATTTTTIGISATSATFTNVFGKKRANVVTT	352692	202264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_202387_203409_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_229274_230028_238934_239038_239972_240117_240287_240416_243058_243147_253240_253298_264115_264226_269082_269275_269525_269764_276615_276711_282406_282641_286814_286963_287688_287837_289084_289242_300390_300542_352375
903425	contig_14790_pilon	-	2182	3	Intergenic	novelGene_127914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	105	144	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	61	1293	178177	174895	FALSE	60	CCCTAAAGAAAAATAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHMHTKFCLICLLTFIFHHCNHCHEDHDHGPEEHHRHHCGMTESEPSKYSVLDAENQKKCYIEKLFYRYGENGRLSFFGLEKLLTNLGLGEIKVVEINHEDLGHDHVSHLDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNPENQTVTSISTKRNHKCDPEKETIEVSVKSDGKHTHDHNRRLRHHHRSHHHLDRNTTRHFHNDSITHGERGEPSHEPSTETNTTQEQREVKPQKQKRRRKGKKSNDNFEVITPGFPPNCDQGEHYEHNRVHKPDCVHNPVHSNAHLSEHNGHDPGHGHQDLDPDNEGELRHTRKREAPHVKKSAIYSAASHKDHNEDDHQHDECLNVTQLLKYYGHDASSPISPDLFTCLCPALLYQIDSRLCIEHFDRLLVEDLNKDKNLVPEDKSNIHASGK	197664	174005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_175111_177160_178189_197615
903426	contig_8161_pilon	-	2717	7	Intergenic	novelGene_156749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.0765376089501	212	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	113	1132	254273	230026	TRUE	65	ATTTAAAAAACAAGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254385	226191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227449_229697_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
903427	contig_8964_pilon	-	1353	5	Intergenic	novelGene_168706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	71.8274842939665	684	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549666	542825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543520_547370_547457_547844_548009_548900_549078_549434
903428	contig_7816_pilon	+	5186	10	Intergenic	novelGene_66457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	209.563096364853	47	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	21	1418	94386	144716	TRUE	30	CATGTGATGGACCGTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPGFKMESLSRAGQEMSLAALKRHDPYITSIADLTGQVALYTFCPKANQWEKTDIEGTLFVYRRSASPYHGFTIVNRLNMHNLVEPVNKDLEFQLHEPFLLYRNASLSIYSIWFYDKNDCHRIAKLMANVVEEETRRSQQAARDKQSPNQANGCNDHRPIDILEMLSRAKDEYERNQMGDSNISSPGLQPSTQLSNLGSTETLEEMLSGSQDKSAPSGHKHLTVEELFGTSLPKEQPMVVGLDSEEVEKLPGDASQKEPSPFLPFSFEHSGGAPQSESLGVQSAALYSVQPEVTTPVLITPASITQSNEKHAPSYTIPLSPVLSPTLPAEAPTAQVPPSLPRNSTMMQAVKTTPRQRSPLLNQPVPELSHTCLVASQSPFRAPLSVTSTAGTSLASVDLLQKLRLTPQHDQIQTQSLAKGSVAPSFPPAAGQLATPESFIEPPTKTAVARAAASASLSNMVLSPLQVPAG	94365	150883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_94521_97123_97165_99408_99537_127279_127347_131043_131183_136343_136458_143942_146095_146636_146703_148224_148444_148778
903429	contig_16724_pilon	-	1704	8	Intergenic	novelGene_105318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	827.953883168055	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	403	1137	570116	541872	FALSE	30	TTTCAGCAGTTTATCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTSSDTPLGRVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575958	541304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_570078_570256_571072_571184_575806
903430	contig_15897_pilon	-	4064	26	Intergenic	novelGene_49565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	70	393	888762	887324	TRUE	0	CGCTCGCTCCCTCCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLLVTLLLRYCLRNQPGLTCKYMAIQIQRREVVAWNGRRCYRGHRHGWHGDSTKSAIVDPVGGSHGGWRLDARTSASWRALLRQTGRVFPSLACRLHLQSEVSGGEGHWGEANGPLDVMIPPEDGNRLC	888831	806629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_806749_842297_842468_843310_843487_846502_846607_849568_849642_849853_849950_853909_854050_855937_856186_856652_856774_857228_857371_860534_860627_862641_862833_866902_867224_868799_869005_871347_871541_876428_876650_880899_881108_881722_881867_882513_882656_884355_884436_885030_885222_885376_885578_886060_886148_887317_887420_887602_887790_888721
903431	contig_17274_pilon	+	980	7	Intergenic	novelGene_26535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_1	359.028047496138	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	51	839	131715	172211	FALSE	20	GGTTGGTGGTTCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVDTTPPENRRSEHCCETEQINAERKDPTSDENDAPGSQQANQRCAQESEPAGSSEQISLQANNGDARQEVSSPLPSNEESNYYLHYQFSNSIFVLL	131664	172352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_168583_171486_171637_172074
903432	contig_4783_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_108337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	2095	2688	28922	28329	NA	50	GAAAATGACAGACCAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQSLRLISSRGVALVIKEIKDGIKKFIESNENENTLYQNLWDTAKAVLRGQLIAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEQVEREQQKKPSGARRKEIIRITAELNEIDNRKTTERVNKSKCGFFEKINKIDKPLAKLTKEKQERKQITRIRNEMGDITTDPTEIKRIRTEYYEKLYSNKFENLEEMEKFLETHYLPKLT	31016	28076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_28100_31000
903433	contig_8161_pilon	-	2026	6	Intergenic	novelGene_156750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.1409396253439	13	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	79	1050	254276	227195	FALSE	35	TGTTCATGGAAGACACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDSRKDLQGPVSWLKESGKKGILGRLMMLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQSSPGLGASLCRDPGSKGHTLLPVLLSWWYEVPNSPLVSLSFYLLRDKRWCRPYPKETPFTLNQGCDLSKVVTVSP	254354	226218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227422_230027_230067_231373_231479_232136_232413_236172_236434_254212
903434	contig_3975_pilon	-	2246	14	Intergenic	novelGene_54835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_13	208.346405901496	168	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	256	1785	2066301	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079237	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
903435	contig_11708_pilon	+	6002	14	Intergenic	novelGene_138959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCACCAGGAAAACACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243890	279652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_243932_244261_244394_244650_244825_247671_247823_248229_248356_249277_249413_250376_250540_250737_250953_252345_252444_253646_253769_255578_255803_255956_256156_266615_266680_275494
903436	contig_14142_pilon	+	2947	2	Intergenic	novelGene_120440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAACAAAAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78681	256961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_81271_256603
903437	contig_10371_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_175493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGACATGTTAGCGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858819	860179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_858800_860200
903438	contig_5602_pilon	-	4095	4	Intergenic	novelGene_133048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	79.4578854208665	412	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	104	1546	873136	867894	FALSE	5	CCCTGCTGTGCTCTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFGASFQQAAEERMEMISERSKENMYSWNKTAEKSDFEAVEALMSMSCSWKSDFKKYTENRPVTPVSDMSEEENLLPGTPDFHTIPVFCLTPPYSPSDFEPSQVSNLLAPAPSTGHFKSFSDISKPHIAPPFKEEEKSPIPAPKLPKAQATSVIRHTADAQLCNHRSCPVKAASILNYQDNSYRRRTHLNVEAARKNVPCAAVPPNRSKCERNTVADVDEKARAALYDFSVPSSETVICRSQPAPVSPQQKSVLVSPPAVSTGGMPPMPVICQMVPLPANNPVVTTVVPSTPPSQPPAVCPPVVFMGAQVPKGAVMFVVPQPVVQNTKPPVVSPNGTRLSPIAPAPGFSPSTAKVTPQMDSLRIRSHICSHPGCGKTYFKSSHLKAHMRTHTGEKPFSCSWKGCERRFARSDELSRHRRTHTGEKKFACPMCDRRFMRSDHLTKHARRHLSAKKLPNWQMEVSKLNDIALPPTSVPTQ	873239	865344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_868154_868623_869537_869652_869887_873100
903439	contig_16496_pilon	-	1422	2	Intergenic	novelGene_5125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	6	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3482	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
903440	contig_5423_pilon	+	2066	1	Intergenic	novelGene_85204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATACCAGAGAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297311	299377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_297300_299400
903441	scaffold_2602_pilon	+	5852	5	Intergenic	novelGene_127704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACACTAGTTTTGCTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59422	128764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_59895_60160_63928_109649_109813_114505_114515_127323
903442	contig_4213_pilon	-	3633	3	Intergenic	novelGene_124800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCTGTCTGGGCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46208	24236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_24355_40540_40630_42782
903443	contig_6418_pilon	+	2748	1	Intergenic	novelGene_81227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	523	906	1399390	1399773	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVTAILFETEAARLLVSLVSSASASVSCGLLALRPHARICPAGASVPKLCSSTGKCPEAAHSTRKPPAHRHSAFSLHGSAPVLSRTGLLVLLLLVLCCCWSSVTAARLPIHSFKTTSPL	1398867	1401615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1398900_1401600
903444	contig_11281_pilon	-	2116	18	Intergenic	novelGene_125445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	569.294761921763	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	236	1954	849228	798705	FALSE	15	CTGTTGAGACTTATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYQKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNKKRLTVYHPSAYLNGHWLCCKASSDSAPGCTPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMNKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFIIDDPQETYKTLKQIIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQSYIRQQSEISTHSI	860112	798542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_798781_802863_803048_808733_808838_810970_811180_822044_822128_824252_824360_830358_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847400_849225_849331_853751_853812_860039
903445	contig_15172_pilon	+	1290	5	Intergenic	novelGene_158753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	217.215906415713	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	12	1202	243174	268787	FALSE	55	CTTAAGGAAAACAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEQPPWWAPTFSSPSSVLLQHSWRPPGQQGPWRGLQMPYTSALSAPGPGHGHPATPAPARLCSRFWISDKPSPPPPPSFLLSNQREAQIKESPCKASRREEAWVGLLPVALTKLTGTAIVPAEEMVSLVSASHSDPENAAAPSHTHPRARTLPVDTKTALFPLHPPLSPNRTVFLTEICTPPDSPFHEVIQSSIPVAKSGDWVHQLLRPGRAQNGCTVQAETHTFHMARPLQSCLAALSGPRQVLCHQLPRDCVTWTRWPVGCRQGTFPQFRLFFFPLLPSCCQSKPLAS	243162	268875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_267920
903446	contig_11338_pilon	+	2936	2	Intergenic	novelGene_6308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTCCCTCACCCCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229266	233415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_230285_231497
903447	contig_6272_pilon	-	5254	3	Intergenic	novelGene_160459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4002	4301	185988	185689	TRUE	50	ACCTAAACGCAAGAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQPEFSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNCNSQKKDQIYWPKGDWKNPESMTPRYPFSSAVKSLPRLTVQPGIGQPHKTKWD	192486	184603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_185120_185251_186778_189274
903448	contig_7357_pilon	-	1958	10	Intergenic	novelGene_36777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2080.08627551365	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	220	1470	166824	136424	TRUE	55	AAAAGAAAGGTGCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167043	116531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_116961_136364_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
903449	contig_3095_pilon	+	1467	5	Intergenic	novelGene_74963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	5909	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	123	887	147241	151151	TRUE	20	GGTCCAGTCCTCATTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147118	152417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
903450	contig_11088_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_85018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	1813	2187	376	2	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFFLITAKGLTRVLILATWELLFTGSECPSRISAARSLSMWKLLPERKHSTAVCLLHCRPAWLQCCSFAAVALALFASSKPSPSPPHRHSVGFHNFALFRAPRYSYRIKSLVFPGLCCKRDIG	2188	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_0_2200
903451	contig_10494_pilon	+	3178	17	Intergenic	novelGene_102151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	44.1487188375835	314	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1700	2383	889190	892457	FALSE	10	AGCAGTTGTTCTGGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYADLASPVSSASSRSPTPAQTKKEKGKSKKEDGIKEEKRKRDSSTQPPKSSKPSAGSRSSQQPSTPQQAPSGQPPQAAFVAHKEIKLTLLNKATDKASRKRYELSDKDRQSSPPAKRANLSPDRGSRDRKSGGRLSSPKPERQRGQNPKAPATQPDRKRQLSPQSKGSSKVTSVPGKATDASATSAAPSTKSGKASTLSRREELLKQLKAVEDAIARKRAKIPGKV	845422	893252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_845536_851254_851340_859993_860143_860458_860552_861772_861931_866518_866641_868062_868327_878082_878275_880261_880388_885873_885979_887089_887234_887602_887669_889107_889269_889526_889727_890465_890563_891359_891457_892246
903452	contig_17796_pilon	+	4394	9	Intergenic	novelGene_33791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	408	junction_7	231.587692624198	82	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	164	1165	53527	97088	TRUE	10	TCCTCCTCTCTGCTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSGLVTSCFCFSRIL	53363	110907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_99648_110237
903453	contig_17796_pilon	+	4966	13	Intergenic	novelGene_33790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	156	junction_12	319.774519084238	819	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	290	1495	53527	120497	FALSE	70	AAATTAAAAAATAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53237	123968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
903454	contig_3747_pilon	+	2452	6	Intergenic	novelGene_24799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4134.29420336773	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	330	656	201313	202209	TRUE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQG	200983	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202210_203070_203128_203228_203386_203498_203651_203768
903455	contig_14635_pilon	+	3313	4	Intergenic	novelGene_84368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAAAGTGTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581926	588626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_582407_583390_583724_584689_584850_586286
903457	contig_15516_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_177470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	27	353	38404	38730	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAVLFTTAKRWKQPKCVLTDEWINKLWYTHIMEYYATIKNNDDSVKHLTTWMNLEGIMLSEISQSQKDKYCMGPLLLKTQEKVYTQKKTIFDGYKEGKRWRREITN	38377	40723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_+_38400_40700
903459	contig_11088_pilon	-	2452	2	Intergenic	novelGene_85020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACCTCAACCTTTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9062	5995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_6287_6901
903460	contig_3627_pilon	-	1984	9	Intergenic	novelGene_78461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	642	980	316019	315532	TRUE	35	CAGTAATTTCCCAGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGNFFSFTIILLFFIIHSTTLTDHKDTHQPIKARSVKHKRVINYNTKDIRDAQTLPVSTNHTVCDLVPIFKPPKVKTDLVRPFKCTSDVATEPEISNLSDLWVSNFKYP	323672	312692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_312785_313377_313492_314035_314205_314655_314699_314945_315817_315965_316054_318593_318774_320223_320416_323437
903461	contig_2703_pilon	-	2550	2	Intergenic	novelGene_101774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTCAGAAGGTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681534	596246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_598708_681445
903462	contig_7129_pilon	-	2399	9	Intergenic	novelGene_169311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_8	56.6798851004481	302	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	69	740	964522	948105	TRUE	25	ACTTAACAGCGCTTGGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDDVIWDTLGNKQFCSFKIRTKTQSFCRNEYSLTGLCNRSSCPLANSQYATIKEEKGQCYLYMKVIERAAFPRRLWERVRLSKNYEKALEQIDENLIYWPRFIRHKCKQRFTKITQYLIRIRKLTLKRQRKLVPLSKKVERREKRREEKALIAAQLDNAIEKELLERLKQDTVRKLGALGYSFYFLGVSIMLGNIWKSIFFLKMLGRSPLWFYPWNKISII	964590	945523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_946167_946321_946376_947142_948330_960097_960153_961269_961422_961616_961682_961779_961890_961981_962032_964507
903463	contig_5039_pilon	+	3395	4	Intergenic	novelGene_64972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACGCTAAAGCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1669674	1674925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1670761_1670976_1672821_1673047_1673211_1674623
903464	contig_14665_pilon	+	5589	12	Intergenic	novelGene_171040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	716	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTGCCACCTCTACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32104	66298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_32753_33681_33887_34688_34804_38438_38535_40416_40543_41340_41588_43686_43861_44989_45102_50142_50320_52452_52581_53747_53968_62957
903465	contig_3122_pilon	+	3111	10	Intergenic	novelGene_64379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1703	2011	253084	256464	TRUE	35	TTCCCCAAGAATTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKFASSFSRNCCIKRIFCSCMSSKACPVTSISDRRASSSCLAMASFFCRYSICSSTARIFLKASSSAIFLFSFFSLSSRSLSLCLRSSNSALDFFSAAIS	249591	260396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_+_250675_250927_251036_251700_252120_252991_253205_255695_255847_256427_256545_257950_258329_258447_258569_258895_259033_260012
903466	contig_13021_pilon	-	2353	12	Intergenic	novelGene_8247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_8	500.326686664253	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	98	1822	270418	210494	TRUE	60	CAGATATTAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTDGDGCALCLQLLPVGLLLVLKVIALIPACWILPKYKAKCPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	270515	205756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_252257_252369_259754_260040_265837_266120_270327
903467	contig_5602_pilon	-	2536	8	Intergenic	novelGene_133011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	137.148214181087	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	631	1047	504410	488176	FALSE	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516239	486686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_507500_507635_508421_508539_511996_512178_516130
903468	contig_14711_pilon	-	7210	12	Intergenic	novelGene_68915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	129.102048174981	5	157	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	554	991	97079	94482	TRUE	15	CTCCAGCCAATCTGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGQGHRKDSDKSRSRKDDDSLAEASHSKKTVKKVVVVEQNGSFQVKIPKNFICQHCFGAFRSSYHLKRHILIHTGEKPFECDICDMRFIQKYHLERHKRVHSGEKPYQCERCHQCFSRTDRLLRHKRMCQGCQSKTSDGQFSL	100785	85450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_85600_85918_86005_86147_86240_87715_89248_89524_89678_90274_94572_95550_95670_95985_96110_96595_96686_97064_97183_99505_99821_100650
903469	contig_8681_pilon	+	2040	6	Intergenic	novelGene_157194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_4	69.0871912875317	218	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	128	679	54812	104297	FALSE	25	ATAAATCCTTTTTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GISQSRISHWLLQQGSDLSEQKKRAFYRWYQLEKTSPGATLSMRPAPIPIEDPEWRQTPPPVSATSGTFRLRRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEIANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIEAAILESHGIDVQSPGGHSNSDDVDGNDYSEQDDSTSHSDHQDPISLAVEMAAVNHTILALARQGANEIKTEALDDD	40536	105658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_40650_54797_54952_99493_99577_101047_101144_102008_102104_104159
903470	contig_19098_pilon	+	3946	1	Intergenic	novelGene_65840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	817	1116	405510	405809	NA	10	CCTAGTGGTCTTTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFIFDGYWVSLVRKNKFTLCSNTSSPIRKSTLALANPCPCSQDKEGETFCCRNEGRGTSDIVLLVLSAVKLVLIHSDPMYHQMKHCLVLHHPRNYCYA	404693	408639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_404700_408600
903471	contig_17769_pilon	-	3496	13	Intergenic	novelGene_124264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	452	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	425	1090	116181	111910	TRUE	85	AAAAAAAAAAACAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPACIGTLRDFPQVILGTCGDPAKEQLLSNPAPQHHAHAVKELLPCVQVLLPGQVLGIAKPLSPGDDRHLEQRVCVFQEPAHHSMPSLMVGHSCLLAGLKDLSLLLQASKDPLDGLLKVLLPHRGAQVAGGNQGCLVANVGDVSTCEPWGEGGQLPRQSVLTEAFIQFQWTQVDLEDGGPAFDVWGYQCISAGQSGPAASGLGQGCPGGWCPQAPRRWW	116845	103212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_104848_106406_106478_106926_107053_108443_108719_110390_110526_110819_110974_111899_112013_112760_112881_113493_113606_114695_114812_115331_115532_116166_116305_116544
903472	contig_15498_pilon	-	1514	11	Intergenic	novelGene_42669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.451534983443	14	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	31	1263	697708	688241	FALSE	20	CAAACTTCCATCTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGLFGRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697738	687989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688752_689498_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
903473	contig_8801_pilon	-	2554	4	Intergenic	novelGene_66254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	578	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTAAAACATACATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512058	346303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_346498_470442_470568_492090_492195_509927
903475	contig_2214_pilon	+	1702	13	Intergenic	novelGene_144258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	299	junction_10	200.25405738711	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	379	1701	287118	295786	FALSE	10	TTACGTCTTTATCTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQFTRTKEELEAEKRDLIRTNERLSQELEYLTEDVKRLNEKLKDSNTTKGELQLKLDELQASDVSVKYREKRLEQEKELLHNQNTWLNTELKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVSRMEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHMKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKAIQDHLLEVEESKDQMEKEMLEKIEKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSVKLEQAMKEIQRLREDTDKANKHCSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKITELQFKLESSLTELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVVIPLQASNLDDISVLSTPKRSSTSQTTSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQVK	284753	295787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_284854_286124_286229_286560_286726_287108_287202_287621_287703_287780_287869_288604_288746_289158_289251_289492_289691_292870_292979_293993_294221_294869_295034_295646
903476	contig_5125_pilon	+	2505	8	Intergenic	novelGene_43414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	1143	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	350	1408	35729	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25946	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26018_26341_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
903477	contig_13850_pilon	+	3363	1	Intergenic	novelGene_141168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	690	1067	48577	48954	NA	15	ACATGTCTTGTTCTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFLSVSRSPPNSKCCRQVSPWDMTTAAWNDGGVGPTGVPPHGCPGLPVGLGVPLLLEEGCTSPALVSRTPRTACVAARPSAPSALSAAAAASFSTCQGLMQRAGLAPLQSMATANRHQGFCSAE	47887	51250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13850_pilon_+_47900_51200
903478	contig_11656_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_53995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAAGCACCTAGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464588	462485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_462500_464600
903479	contig_1435_pilon	-	2502	9	Intergenic	novelGene_115523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	192.357577183744	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	14	862	611604	581903	FALSE	20	TACCAGGTTTTGGACTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIHGMNKHWLIRQAKTPMSNSSIQFLDNAFRGRWQTLLSVDDLVEKLIKRLEFNGELNNTYIFYTSDNGYHTDKRQLYEFDIKVPLLVRGPGIKPNQTSKMLVANIDLGPTILDIAGYDLNRTQMDGMSFLPILRGASNVTWRSDILVEYQGEGHNVSDPTCPSVGPGVSQCFPDCVCEDSYNNTYACVRTTSALWNLQYCEFDDQEVFVEVYNLTADPDQITNIAKTIDPELLGKMNYRLMMLQSCSGPTCRTPGVFDPGYRFDPRLMFSSHGSVRTRRFSKHPL	611617	580262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_581982_589380_589542_591272_591384_592364_592473_595983_596086_605935_606019_607861_607981_609036_609120_611601
903480	contig_5878_pilon	-	3969	26	Intergenic	novelGene_145715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	141	junction_21	134.470814677386	357	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	91	2655	389003	203001	FALSE	80	AAGAAAAAAATAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRQERIQKDIDVVIQKSRAEKDCLFADFRFADSTFTFTYVGGPKSVSYSVHVSEDYPDNTYVSSSENDEDVLVTTEPIPVIFHRIATELRKTNDISCCLSIKSKLQKENGEESRQNSTVEEDSEGDNDSEEFYYGGQVNYDGELHKHPQLEADLSAVRELYGPHAVSLREYGAIDDVDIDLHIDVSFLDEEIALAWEVIRTEPIIVRLHCSLTQYLNGPVPTVDVFQISTKERFGLGHQLKKIMQTFVTQQWKQSKEKSNCLHNKKLSEKKVKSPLHLFSTLRRSPSYPPPGCGKGKCKLKSEQDGISKTHKLLRRTCSSTVKTDDVCATKSHRTFGRSLSSDPRAEQAMTTIKSHKLLNRPCPATVKQEDCLTLKSHKLLTRSCSGDPRCEHNTSLKPHKLLSRSYSSNLRMEELYGLKNHKLLSKSYSSAPKSSKTELFKEPNSEGRRLSLTSGLIGILTPSSSSSSSSQPAPNGAKCIPVRDHGFLVQTIEFAEQRIPVLNEYCVVCDEPHVFQNGPMLRPTVCERELCVFAFQTLGVMNEAADEIATGAQVVDLLVSMCRSALESPRKVVIFEPYPSVVDPNDPQMLAFNPRKKNYDRVMKALDSITSIREMTQAPYLEIKKQMDKQDPLAHPLLQWVISSNRSHIVKLPVNRQLKFMHTPHQFLLLSSPPAKESNFRAAKKLFGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVVASNTRLQLHGAMYGSGIYLSPMSSISFGYSGMNKKQKVSAKDEPASSSKSSSASQSQKKGQQSQFLQSRNLKCIALCEVITSPDLHKHGEIWVVPNTDHVCTRFFFVYEDGQVGDANINTQEGGIHKEILRVIGNQTATG	389093	201686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203104_208192_208278_209329_209400_210462_210537_213578_213649_214925_214999_215168_215282_216486_216536_219428_219497_221820_221887_223064_223191_229679_229773_244459_244556_244657_244709_246120_246692_247257_247384_249147_249215_259787_259879_260322_260384_273638_273734_275282_275361_276632_276704_277247_277338_288356_288395_387913_387969_388918
903481	contig_18081_pilon	+	4192	2	Intergenic	novelGene_23791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2193	junction_1	0	58	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGGGCCCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105460	113336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_108517_112200
903482	contig_5551_pilon	+	4458	1	Intergenic	novelGene_134291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCCAAGGGAAGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815654	820112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_815700_820100
903483	contig_6412_pilon	-	2519	6	Intergenic	novelGene_149951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.6435917521163	152	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	10	609	251767	223664	TRUE	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNYKLTYFNMRGRAEIIRYIFAYLDIKYEDYRIEPADWPDIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGKTELEQCQVDAIVDTLDDFMSHFPWAEEKQDVKDKIFNKLLTHDAPILLQDLDTYLGGKEWFVGNSVTWADFYWDICSTTLLVLKPDLLDIHPRLVTLKNKVQAIPAITDWIQRRPQTKL	251776	220512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_221294_222534_223829_225668_225768_242186_242297_245458_245552_251634
903484	contig_12464_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_68663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGACCTGAAGGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126870	127960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_126900_128000
903485	contig_13780_pilon	-	3048	14	Intergenic	novelGene_149030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_2	301.897176743082	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	998	2707	513453	474967	FALSE	40	AATTAAGAATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSACWTLEDSVDTCLSVQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDRDADAAKEPLDDLFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEGAAMRSRKQGLDTAHKQRVAEVLNDPESSEKRRSRESLSTDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGLKRASSLNVLNVGKAAGDRFQERDNCLADSRALSASHSDLAC	514450	474625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_475033_475983_476048_483206_483338_490695_490858_493706_493816_496478_496547_496635_496686_501149_501250_501416_501591_503670_503773_504390_504479_509132_509359_509841_509921_513162
903486	contig_7593_pilon	-	4747	2	Intergenic	novelGene_127288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAAAATGGCCGCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187709	165990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_166195_183166
903487	contig_10437_pilon	+	1657	12	Intergenic	novelGene_38191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	17	junction_11	576.425075589703	44	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	152	1453	229668	233347	FALSE	30	CACAGTGACGCGAACACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWSRATLRPGSGHQGLPRGPAGYISPLTERPEWLEEPPFCLPSPGAFSPRMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKNDCANGLPSCYFFASYPCSHRFKIQLPFSGTFFFFSSARLAGFGVEWQLVLIFIY	225114	233551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225265_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510_232646_233182
903488	contig_165_pilon	+	2330	13	Intergenic	novelGene_117057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_1	281.137965340072	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	359	1573	45144	71673	FALSE	25	TAATCATGCTACCTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVPGLLQQEEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVHTKTTLSTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFDGPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRLSSHPVLNKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFSGVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCAKADKMTRSHKNVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVENRVSSDEDLKLTELLRYYMLNIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSRDVKLAEAHQQECCQKFEQLSESAKEELISFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHAKNNVSLLQSCIDLFKNN	44785	72430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_45195_55359_55465_56647_56759_58873_58996_60303_60428_61102_61199_61951_62058_62145_62222_63546_63587_63670_63758_64905_65066_69629_69716_71622
903489	contig_20324_pilon	+	3769	3	Intergenic	novelGene_100870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	3	121	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	47	808	7068	9398	FALSE	45	AGGTTATTGAGGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRSPVVLLNRNIAPMASTMPLAMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQACISEVGKDGGSVCPVCRHKFLLRNIRPNRQLANMVNNLREMSQSAKEGAKGGQCGVHGEKLHLFCEEDGKILCWVCAQSRKHRNHSMVPIEEAVQEYQEKLQVELEKLRRRRELAEKLEVDVTEKRTAWKKKVETQKSRIHAEFVQQKNFLAEEEQRQLEKLEKEEKDQLRILGETEAQLAQQRQALQELISELEWRSRGSALELLQVRPGRGCL	7021	12359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20324_pilon_+_7476_7941_8038_9140
903490	contig_7695_pilon	+	2278	2	Intergenic	novelGene_41530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCTGAATGTTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355484	378020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_356276_376533
903491	contig_12079_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_67465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAATGAAGTAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590434	589043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_589000_590400
903492	contig_10774_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_158674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18214	21125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_18200_21100
903493	contig_19061_pilon	-	5560	7	Intergenic	novelGene_173507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	313.828730715055	82	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	193	678	78343	42284	TRUE	15	TATTCTGGTTTTCATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGCGEAVRDSGGGDGRPRGSAQHRSRPPRRGPSPRPTAELPRASVHSSPRPRSLLPLRPVLEIMNPVYSPGSSGVPYANAKGIGYPAGFPMGYAAAPAYSPNMYPGANPTFQTGYTPGTPYKVSCSPTSGTVPPYSSSPNPYQTAVYPVRSAYPQQSPYAQQGTYYTQPLYAAPPSCHPPHHGGAAQRHAGDSVPCTHPPLPEAMELPWVWWLGPLWPCQQGPY	93413	36880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_41649_42169_42296_43730_43911_44036_44180_65871_65953_78273_78355_93232
903494	contig_8576_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_88736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATCACTAAGGAGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632613	631448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_631400_632600
903495	contig_2093_pilon	+	1556	1	Intergenic	novelGene_152952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAACAAAGACATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987426	988982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_987400_989000
903496	contig_8443_pilon	+	951	2	Intergenic	novelGene_150618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATCTTCCAACATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810512	811757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_811350_811643
903497	contig_3081_pilon	+	3950	4	Intergenic	novelGene_133976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATAAACTAAGCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202929	1213341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_1205520_1210431_1210584_1211662_1211763_1212233
903498	contig_6873_pilon	+	2677	3	Intergenic	novelGene_129840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAATAATAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725263	766435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_727371_764706_765024_766182
903500	contig_383_pilon	-	1564	2	Intergenic	novelGene_126113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1789	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGCCATTCTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142032	135408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_136795_141854
903501	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
903502	contig_12624_pilon	-	3982	14	Intergenic	novelGene_61058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	583	junction_7	823.868253671838	458	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	174	890	903621	877414	TRUE	45	ACAAACAAGGCACCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVVFSEAGPHSEHQARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWKQKLYEPVVIPMGRLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAEPPPRPKTPEIFR	903794	862032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_871232_871259_874056_874133_875116_875186_875385_877462_878874_878935_882974_883083_884679_884815_888695_888805_900249_900333_903447
903503	contig_17108_pilon	-	3725	1	Intergenic	novelGene_109544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACCCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361888	358163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_358200_361900
903504	contig_10434_pilon	-	1940	5	Intergenic	novelGene_82057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	436	junction_4	96.3145887184283	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	152	448	170660	167742	TRUE	45	AACTACAATATAATGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEDSKVVPTECAIKVFKTTLNEFKNRDKYIKDDFRFKDRFSKLNPRKIIRMWAEKEMHNLIRMQRAGIPCPTVVMLKKHILVMSFIGHDQVPAPKLKEVKLSSEEMKEAYYQTLHMMQQLYNECTLVHADLSEYNMLWHAGKVRSICC	170811	163298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_164521_165465_165574_167579_167844_169239_169400_170625
903505	contig_8594_pilon	-	3443	1	Intergenic	novelGene_140044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGGGGCTGCAGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427761	424318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_424300_427800
903506	contig_10749_pilon	-	1441	15	Intergenic	novelGene_133456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1149.76671325011	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	138	1238	155250	136250	FALSE	20	TTAGTTTTATAAGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	157606	136046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_157542
903507	contig_10766_pilon	+	5070	1	Intergenic	novelGene_151216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	3560	4006	188645	189091	NA	75	CACTGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLSRQVFWNPTETKRVSFLLPRVRRERNNQPVIQAGSLGDIAFLTVTSSSGAAMTACWLGSLDKQYWSSILGLPELLLLILSLHTQTCSQSTSNMPEPAILHKFQKIGVKPGYRPVSFFLQESEAFGALFLPPYFNHEHLNSSMRY	185085	190155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_185100_190200
903508	contig_14525_pilon	-	1707	11	Intergenic	novelGene_149753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	309.563386077876	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	817	1299	134712	127683	FALSE	35	AGACTGAAAGTGGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVDVEALENSPGATYVRKKGGKVAGDNQTKEQGQGDLKKKKKKKKGKLPKNYDPKVTPDPERWLPMRERSYYRGRKKGKKKDQIGKGTQGATAGASSELDASKTVSSPPTSPRPGSAATVSASTSNIIPPRHQKPAGAPATKKKQQQKKKKGGKGGW	142002	127274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_127861_128434_128595_132105_132144_134605_134744_135621_135700_135835_136036_136968_137069_138539_138605_140186_140260_141223_141349_141858
903509	contig_14405_pilon	+	2642	5	Intergenic	novelGene_85646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	49.2290564605904	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	998	1930	483909	491904	FALSE	40	AAAATTAGGTTTATATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNGAELEYTGPHWSAGRFHRNFYLRRGSELQTQIFSDIHGLEFFMSLNTEDSSHQSHYFPGIWAPSDAVLEQMDNGDWGYMMTDPVTLNVGGHLYTTSLTTLTRYPDSMLGAMFGGDFPTARDPQGNYFIDRDGPLFRYVLNFLRTSELTLPLDFKEFDLLRKEADFYQIEPLIQCLNDPKPLYPVDTFEEVVELSSTRKLSKYSNPVAVIITQLTITTKVHSLLEGISNYFTKWNKHMMDTRDCQVSFTFGPCDYHQEVSLRVHLMEYITKQGFTIRNTRVHHMSERANENTVEHNWTFCRLARKTDD	482911	492616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_483950_485447_485519_486467_486532_489320_489391_491217
903510	contig_2069_pilon	+	1549	4	Intergenic	novelGene_23193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_3	56.7470018787092	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	36	395	81637	89492	FALSE	25	CTGTGTTTCTAAATGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	81601	90646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_81709_87422_87531_87707_87803_89407
903511	contig_4202_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_147080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293551	291999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_292000_293600
903512	contig_13021_pilon	-	2074	10	Intergenic	novelGene_8242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_7	418.081272741657	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1019	1480	213104	206041	FALSE	50	AAACACTTACTAGATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISIETKQIKNLCHAWNQGSMFPQPKMVPTPRSYITLPPHSRRWHQESMKPVTITKLTITKLTTYILTSSEIERYKLHLRIFLQSEDQKTTTATGNIAASATSASCPETGDLTVECRALPLQTSACQPQLPPRFYSPNSSTHIQLVEDKPHP	236232	205446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231351_231421_231599_231882_236024
903513	contig_17796_pilon	+	2012	10	Intergenic	novelGene_33815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	467.072918409011	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	79	990	53527	110256	TRUE	60	ACCTGAAGTACAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLIYFLLNLFFFFSRIFSFH	53448	111350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72423_72473_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96882_110199_110487_110558
903514	contig_18869_pilon	+	4287	25	Intergenic	novelGene_56435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_14	131.532077836549	234	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1424	4272	16	4287	116141	168196	FALSE	40	CCCCAGCAGCTCCAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAEVPGSVATAGGSCNTEAMDRVLSVLLVPIPAEATGRLGPRAQLHREQEVLGSLTAAGSLQVLSLAPGGGGNCSLEGPFRQFVWENSPNRSTPTDKPKLLILSKKYELFIYEFNLKDGRCDSTILFSCNGETLQKLIEDQSMSISLSSLRILSFHNNTSLLFINKHIVLHVLFPEGDAEIRVLNSFTLDLAAPAVGGIVDTQLCRGILFVLNSLGWIYIFDVVDGTHVARVDLALHQEDVWDEQQPEPAEVSSFTSLKVSQDLDVVVVVSSSSSALALNLNLYFRQHPGHLLRERRLEDLPIQGPKGIDEDDPVNSDYNMKLTKFSFQVDRSWKAQLSSLNETIKIPKPEVSHCTPWFQDYLHLESFESGNHGTNVLSWAFMPQDTCGQYSFPRKDGHAKTSDPERSWKIVHVSDEEEAAELECVSVTGFTALFTQATERKGCTIILWDLETQGMQCFSLGKIRIPIESDGDQQLCLVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDSLCHLNAWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVDFFLKSKENLLNPSSNSSALDQFDHFPSDLYLRNVEELTPALDLLCSAIRESDSETQSKHFSEQLLNLTLSFLNKQIKELFVHTEELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKQTDALDEYDVNENVPKVKESDIWEKLSFEEVIANAILNNKIPEAQTFLRINSHSAQRLEELIKIGLDLVFDSLKKNNIKEASELLKNMGFDVKDQLLKICFFTTDKNIRDFLVEILKEKNYISENEKRTIDFVHQVEKFYSGQFQENPQIQSFPRYWIKEQDFSKHKSVLDSVLKYHKDEFNKQDHRIVLNWAQWWDRLTQESVLLPRISTEDYRSYSAEALWRHLTARHDWLSISLWIREFQTQDSYASLQQNRWPPLTVDVIDQNTCCNSYMRNKILDKLARNGVFLASELGDFDLFLLRLSRIGGVMQNTLPVQNYRTKEGWDFHSHFILYCLEHNLQHLLYVYLDFYKLSPSNCPFLEKKELHEAHPWFEFLVQCRQVSSNLTDPKMIFQASLANAQILIPSNQASISSMLLEGHTLLALATTMYAPGGVSQVVQNEENENCLKKVDPQLLKMALTPYPKLKAALFPQNTAPNILPHDITLYHLIQSLLPFDPSRLFGWQSANTLAIGDASSELPHFSRPDLVNKYAIVERLNFAYYLHHGRPSFAFGTFLVQELIKSKTPKQLIQRVGDEAYVLGLSSFHMPSVGAACVCFLELLGLDSLKLRVDMKVANVILSYKCRNEDAQHSFVRESLAEKLSKLANGEKAAVEELLVLLEEGTRNSIQQQEIKRLSSDSSSQWALVVQFCRLHNMKMSTSYLIECAKANDWLQFIIHSQLHDYRPEEVKSLLHYFSPVLQDHLKLAFENLPSTFNCRMNSDLICSRS	116125	168196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116392_118630_118816_119693_119919_121690_121893_127625_127764_128533_128983_130281_130428_132150_132284_136509_136666_137079_137256_138333_138511_139404_139477_141302_141431_141771_141945_142672_142887_151307_151512_153836_153944_159332_159479_160586_160749_161734_161802_164828_164995_165460_165667_165885_165995_167554_167715_168076
903515	contig_16776_pilon	-	3474	1	Intergenic	novelGene_130530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACCAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58040	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_54600_58000
903516	contig_4496_pilon	-	3151	10	Intergenic	novelGene_66665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.628539361054709	220	118	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCTTCCTCCTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998432	859270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_859438_878529_878625_891911_891993_899754_899891_911479_911829_941357_941486_951023_951146_952442_952526_996159_996280_996562
903517	contig_7870_pilon	-	1530	7	Intergenic	novelGene_109071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_5	1086.66044221121	81	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	415	717	748907	705680	FALSE	70	AGTAAAGAATGAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWATSWIVLSSRKIEFYKESKQQALSNMKTGNKPESVDLCGAHIEWAKEKSSRKNVFQVRILHIFNLFLLSLNLNSLG	854069	704866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_705833_738946_739035_748845_748908_762132_762202_801903_802026_823988_824168_854025
903518	contig_11338_pilon	-	1937	4	Intergenic	novelGene_6312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	213.131154195929	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1	462	245042	233533	FALSE	55	TAAAACAAAGATGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSNLLSCPRVQSPVWPCIEACYNFLSRTWLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQGKKILVFLSPSLIFC	245042	232057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_233736_242914_243038_244695_244747_244957
903519	contig_1008_pilon	-	2028	5	Intergenic	novelGene_121548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	74.3370701601832	4	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	87	443	535615	535090	TRUE	30	ACGAGACTACGCGTAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKNLKDTLGLGKTKRKTSARDASPTPSMDAEYPANGSSTDRIYDLNIPAYVKFAYLAEREDELSLVKGSRVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVMALHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNSR	573441	519711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_521157_534949_535094_535175_535312_535398_535672_573411
903520	scaffold_880_pilon	-	3327	8	Intergenic	novelGene_121459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	506	865	492392	490395	TRUE	25	CCTTCTCTGCAAGGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATDSNANWEKLAVWPAMTMGCTNSWKSLSSTRCRKSTSGSRREELRQMMLSFSSCSSMPSLIFWSSKRSGKVTWLSREWQRVKNFSRWLSWGGRGRRRGSHPICVSQWIHKQSQIAL	492897	455195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_455210_456015_456178_479494_479614_482288_482360_484796_484938_485540_485641_488539_490712_492349
903521	contig_3081_pilon	+	1564	2	Intergenic	novelGene_133942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATCGGATGGCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236989	239362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_237023_237831
903522	contig_16122_pilon	-	2471	10	Intergenic	novelGene_134538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	24.1727323166894	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	797	1966	223388	219244	FALSE	15	GAATGTGTGCCGTTTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQFAEGSTLKLAKQCRKWLCNDQIDAGTRRWAVEGLAYLTFDADVKEEFVEDEAALKALFQLSRSEERSVLFAVASALVNCTNSYDYEEPDPKMVELAKYAKQHVPEQHPKDKPSFVRARVKKLLAAGVVSAMTCMVKTESPVLTNSCRELLSRVFLALVEEVADRGTVVAQGGGKALLPLALEGTDVGQIKAAQALAKLTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRQKILKEKAVPMIEGYMFEEHEMIRRAATECMCNLAMCKEVQDLFVAEGNDRLKLLVLYSGEDDELLQRAAAGGPGHAHLFAAVALQPHPTSDHPLAGDLAGTASEPQPGAAAPGRCGGAEHGRGLEGDRQHLNGE	224184	218738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219630_219716_219835_220669_220786_221002_221117_221575_221643_221827_221956_222156_222298_222932_223075_223335
903523	contig_5791_pilon	+	1821	4	Intergenic	novelGene_35822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	12.8149218578274	97	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	261	371	958489	960870	FALSE	15	GTCTCACCCTCTTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVSWGTADIRIGFARGAHGDYNPFDGPGNTLAHAFAPGPDLGGDAHFDEDESWTDGGKIGINFLYAAAHELGHSLGLGHSSDPNAVMYPTYANADPKNFKLSQDDIKGIQKLYGKRSNSANN	952872	962320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_952924_956557_956687_958408_958571_960841
903524	contig_5434_pilon	-	2363	2	Intergenic	novelGene_74691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	177	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACGAGAAACAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390410	387893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_388211_388364
903525	scaffold_13505_pilon	-	2522	10	Intergenic	novelGene_111521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_6	241.027891424301	52	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	2	637	603276	600106	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPQREHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPRTVLLFRASSNT	603277	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_599811_600147_601873_602237_602570_602698_603171
903526	contig_17108_pilon	-	1388	4	Intergenic	novelGene_109503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_2	34.3737626039914	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	88	945	27917	22388	FALSE	15	GCTTCATGCTTTCATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHEERHEKKQEGINVNESQDLSRTQSEIAMEEDLLSLTVKSDPTPSELGSLRKSADGLGKLESQKISPTNVEQISATKAAPEEAKVFMSQENETSLQSIRLLEALLAICLHSARTSQQKMELELPNQSLSVENILLEMRDHLSQSKVVETELAKPLFDALLRVALGNHSVDFEHNDATTEKSHQPEELSSQPHDFSEEAEDSQCYSFKLLGEEEGYEADSESNPEDSESQDNGIDLKSEAEGFSASSCPNDFLENLTQGEIIYPEICMLELNLLSSGNAKLDVLTHVFESFLKVIRQKEKNIFLLMQQVKDACN	28004	21944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_22636_24144_24299_25751_25914_27623
903527	contig_8616_pilon	-	4373	4	Intergenic	novelGene_72463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.7621978545932	4888	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	844	1359	301626	294382	TRUE	25	CTCAAACATGGCAGTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRLQEAQLYKEEGNQRYREGKYRDAVSRYHRALLQLRGLDPDLPSPIPNLGPQGPALTPEQENVLHTTQRDCYNNLAACLLQMEPVNYERVKEYSQKVLERQPDNAKALYRAGVAFFHLQDYDRARHYLLAAVNRQPKDANVQRYLQMTQSELKSYHRKEKQLYLGMFG	302469	291271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_293031_293126_294477_297044_297228_301388
903528	scaffold_13505_pilon	-	2535	8	Intergenic	novelGene_111508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_4	442.335591502882	1039	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	34	1011	603235	594258	TRUE	30	CCAAACCCAGTATCTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603268	588083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
903529	contig_16846_pilon	-	3492	1	Intergenic	novelGene_82853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89022	85530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_85500_89000
903530	contig_753_pilon	-	4702	14	Intergenic	novelGene_113021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	371	junction_1	1166.7992683167	126	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	70	1788	1502312	1375722	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTDVELKRLKDAFKRTCGLSCYMGQHCFIREVLGDGVPPKVAEVIYCSFGGTPKGLHFNNLIVGLVLLTRGRDEEKAKYIFSLFSSESGSYVVREEMERMLHVVDGKVPETLRKCFSEGEKVNYEKFRNWLLLNKDAFTFSRWLLSGGVYVTLTDDSDTPTFYQTLAGVTHLEESDIIDLEKRYWLLKAQSRTGRFDLETFGPLVSPPIRPSLSEGLFNAFDENRDNHIDFKEISCGLSACCRGPLAERQKFCFKVFDVDRDGVLSRVELKDMVVALLEVWKDNRTDDIPELHTDLSDIVEGILNTHDTTKMGHLTLEDYQIWSVKNVLANEFLNLLFQVCHIVLGLRPATPEEEGQIIRGWLERESRYGLQPGHNWFIISMQWWQQWKEYVKYDTNPIVIEPSSSVLSGGKYSFGTAVHALEQSEDRLGGGSLSHLNTTEEKFSDNISTASEASETAGSSFLYSATQGSDTGFARQHNTSDNNNQCLLGSNGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPLKATTLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVSIANNASSYSSLTYRTVIDGVFCYFSI	1502381	1372807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1375950_1376467_1376644_1378153_1378353_1393775_1393879_1398454_1398517_1409148_1409233_1411938_1412002_1413281_1413398_1415056_1415165_1416768_1416901_1435781_1435942_1442711_1442831_1445130_1445237_1502249
903531	contig_3382_pilon	+	2898	12	Intergenic	novelGene_124160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	313.815548287696	5	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	47	877	931459	958158	TRUE	20	CAAAGGTCAGTGGCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSAKLRPPSGNGVAMADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRREPFPHIVEMWDTEAEAKVETGFFRAIRNFFRPPTPLAKGPAHPVPM	931412	981383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958018_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_972811_973049_978965_979048_981257
903533	contig_2799_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_85570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTATCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744417	746855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_744400_746900
903534	contig_7151_pilon	+	2249	5	Intergenic	novelGene_40739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	121.12054945384	79	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1743	2099	505515	507901	FALSE	35	TCATGATACCTACTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502269	508051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_505593_506568_506685_507738
903536	contig_7051_pilon	-	1666	6	Intergenic	novelGene_64303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGCAGAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207365	197585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_197651_199210_199322_199977_200045_201831_201912_203046_203166_206141
903537	SIRV6	+	1091	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4373	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	218	709	1733	10736	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1127	11331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
903538	contig_7260_pilon	+	10333	3	Intergenic	novelGene_169136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	235.5	884	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	359	2164	299184	309320	FALSE	35	AGGGAATTTAGGTGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTRKPSAAAPAAYPTGRGGDIAVRQLQASPGLGAGAPRSGVGTGPPSPIALPPLRASNAAAAVHTIGGSKHTMNDHLHVSSHSHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLESIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKAAPMTPEQAMKQYMQKLTTFEHHEIFSYPEIYFLGPNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGSRYGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDTSKRAKNFVSSKGYPRYCSVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPTARMTPGQALRHPWLRRRLPKPPTGEKTAVKRITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS	298825	317489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_299233_299890_300040_307712
903539	contig_5765_pilon	+	758	1	Intergenic	novelGene_141409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACAACCTACTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846621	847379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_846600_847400
903540	contig_16548_pilon	-	3759	1	Intergenic	novelGene_167089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAGGAGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14685	10926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16548_pilon_-_10900_14700
903541	contig_5419_pilon	+	3992	3	Intergenic	novelGene_15462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	300	1325	1591	61985	TRUE	25	CAGGGATTTCCCATATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIHLQKKMKQDPYLTPYTKTTSKRIKDLNIKPRTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCSSTDKWISKLWYVHTMEFYAMIKNNDESAKHLVTWMKLEDIMRSGISKSQKVKYCMRPLL	1291	65290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_2430_61798_63850_64487
903542	contig_15114_pilon	+	780	1	Intergenic	novelGene_121155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAAAAAAACCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145508	146288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_145500_146300
903543	contig_15182_pilon	-	3262	7	Intergenic	novelGene_136435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.822773750312	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	145	561	367709	309376	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAMRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPRVHMQHHRLFIFRHHPLSSSLGLTSHTQPSAITLRRR	387522	246380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_248851_306829_306996_309310_309486_332396_332526_359304_359433_367659_367778_387446
903544	contig_6871_pilon	-	1959	4	Intergenic	novelGene_21604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_2	33.6749164809655	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTAGACTGTAAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427355	423347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_425044_425522_425587_425736_425860_427279
903545	contig_2706_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_178669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	805	1854	34272	33223	NA	65	CACAAAAAAAGCACTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLLQENKEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKYCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	35076	32819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2706_pilon_-_32800_35100
903546	contig_10437_pilon	+	3953	1	Intergenic	novelGene_38382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	521	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3117	3476	645352	645711	NA	25	TCTCTGCTGAGAAAAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTKRKTLLGRVEADSNLRRLIEKTSFQKKGRELDFNMFLKTKRNRNTNNPDRPRSPPFTPLQSLLAVGRAQRGEKEPSWSQQLLSWGGAGDRNPSRDDLVSQAPNNTPTLHMCYCLY	642235	646188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_642200_646200
903547	contig_9375_pilon	-	5112	2	Intergenic	novelGene_136034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	0	364	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	171	743	132526	97001	FALSE	10	TTGGTTTTGTTATGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY	132696	92631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_97480_132432
903548	contig_5020_pilon	-	2280	12	Intergenic	novelGene_27942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_11	14.0606713687094	121	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	5	1183	198340	164537	FALSE	15	CTTTGTTTTTTCTCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAPLRIQSDWVQTLRKDEGEAWLSCHPPGKPTLYGSLTCQGISLDGIPEVTASEDFIVNEINKKSIHISCLKENSSSKFLAPYTSFSRIHTKSITCLDISSGGGLGVSSSTDGSMKIWQASNGELRRVLEGHVFDVNCCRFFPSGLVVLSGGMDAQLKIWSAEDASCVVTFKGHKGGVLDTAIVDRGRNVVSGSRDGTARLWDCGRSACLAVITDCGSSINGVAVGAADNSINLGSPEQTPSEREVGTEAKMLLLAREDKKLQCLGLQSRQPVFLFVGSDAFNCCTFLSGFSLLAGTQDGNIYQLDVRSPRAPVQVIHRSGAPVLSLLNFRDGFIASQGDGSCFIIQQDLDYVIELTGPDCDPVYKVATWEKQIYTACRDGLVRRYQLSDL	198344	163439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_164615_166911_166995_171486_171570_173613_173730_175103_175196_178068_178264_184684_184836_185496_185596_187799_187890_190949_191054_196551_196593_198293
903549	contig_9297_pilon	+	2712	2	Intergenic	novelGene_69851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	283	528	730517	732287	FALSE	75	GGAAAAAAAAAAAAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIEDFSKVAGYKVNIQKSVGFLYTNKENPEEEITKSIPFTVAPKKIKYLGINLTKDVKELHSENYKTLLQETKSDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPLAFFNEMEKQIANFIWKGKRPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTKRPSKMHQLVPTTWSKEE	730234	734471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_730705_732229
903551	contig_7909_pilon	-	2790	3	Intergenic	novelGene_155913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATTTTGATTGCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551172	511090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_511190_544734_546459_550205
903552	contig_11171_pilon	+	3033	9	Intergenic	novelGene_48575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	148.202564080383	5	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	2	895	70574	93759	TRUE	35	TTCGGAAGGAGAGGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADISLDELIRKRGVAAKGRLNVRPGTGDVRSRVGIQQSLLSPPARTATFQQRFDARQKIGLSDARLKLGVKDAREKLLQKDARFRIKGKVQDAREMLNSRKQQSTVPQKPRQVADAREKISLKRNSPAAFMSPPIGTVTPALKLTKTIQNLYDLDEDDDVTAPIPSKQMKFTASGSFLHHMAGLSSSKLSVSKALPLTKVVQNDAYTAPALPSSIRTKALTNMSRTLVNKEESPKELPPAEPVLSPLEGTKMTVNNLHPRVTEEDIVVRAFLCVWSPQAGSAGPSWGSRSGLCEEG	70572	107783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_70633_85884_86276_88360_88457_90410_90591_91202_91285_93673_93804_104185_104253_105710_106194_106239
903553	contig_14687_pilon	+	2830	1	Intergenic	novelGene_107926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCCCACTGTTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465323	468153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_465300_468200
903554	contig_9036_pilon	+	4377	1	Intergenic	novelGene_155433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	426	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	3511	3879	7262	7630	NA	10	CTGTTGCCATCTTTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKEIREKKTEQNQKPKRKKKCPQGCPHASVQSKGVASKPRGTAQLEGAPKPRKEKENKQSRANKQKNPGGPTSVAAWARKQFHRQSVFRNLSGKSKDGTQSQVFERKRWGVVRGKEEI	3751	8128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_3800_8100
903555	contig_13740_pilon	+	2055	7	Intergenic	novelGene_34707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAGTTGTGTTACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157084	162216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_161719_161916
903556	contig_14664_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_169540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGATACCACACTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201228	199586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_-_199600_201200
903557	contig_14219_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_54294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GATTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622825	625094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_622927_622967
903558	contig_2358_pilon	-	3263	1	Intergenic	novelGene_156102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAAGCAGGTGATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62688	59425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_59400_62700
903559	contig_14744_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_65931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	697	1149	163279	163731	NA	20	CGCCAAGGCCACCTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLGGFRGAFRSSLWSSRRQSRGQGVTPHHQAGLPGWGHEDQVPGGDLSVSLPIREFEIINFFLGMALKDKVLKITPVQKQAHAGQWTRFKAFVAIGGYSGHVIVGIKCSKEVATPSVGPSFWPSSPLSTCGKATGGTRLTSPILFPAR	162582	163878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_162600_163900
903560	contig_2799_pilon	-	3133	1	Intergenic	novelGene_85522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCAGACATAGTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632340	629207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_629200_632300
903561	contig_12886_pilon	+	3188	1	Intergenic	novelGene_135458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	776	1129	250207	250560	NA	10	GCCAGGCCTTTCTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLPPWDGVSHDHSKAVTRPILLPGEREGRLQDSSPPSYAGSCPRPEPSLFASWIPKGSGTILISQLPVSELGVAGKGAQGERGYRDAKGLGFYPGPCWAPPTITGTAQAAGTVQS	249431	252619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_249400_252600
903562	contig_6677_pilon	-	1569	7	Intergenic	novelGene_114208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	1246	1569	594991	584762	FALSE	15	CCCGGCGGGTGCCAGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLFLFLLYFLQDKIISSLGFTIFIWCFCLGGLDHWHPPTPLAVFLLVLVLEIARKTGSRVTIRAAVVMVPVPLLVALMFGPGRAHRQGREGEEGRGAWGRELGSDSR	626430	584761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_585000_594905_595578_615715_615858_616164_616307_624371_624542_625427_625532_626329
903563	contig_401_pilon	+	4086	17	Intergenic	novelGene_42920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	471.039409179317	11	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	1136	2779	1947000	1972939	FALSE	20	CATCACTTCTGTGTACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1944912	1974246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1945310_1945464_1945598_1946394_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807
903564	contig_12951_pilon	-	6449	2	Intergenic	novelGene_68224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2454	2762	799273	798965	TRUE	35	TCAGAAGTTCTTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKKVYLAAVRWSIWYMSMRSSWLIVALSSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTTIVEPSISCFSAVRVYVFWRPVIGCINIYYSYVLLVY	801726	795218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_798548_798606
903565	contig_12931_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_166771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	18	431	124720	124307	NA	60	TGAAATAGAGAACAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFPDIMKDEKISIQDAHQTPYKVDPKRKSRRHIIIKLTKTKDKDRILRAARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIFKALKENNCQPRVIYPAKPSLKYIGEIRAFPDKQKFREFAKIKPKLQEILKGVLRLDNQ	124737	122803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_122800_124700
903566	contig_4900_pilon	-	1527	7	Intergenic	novelGene_159074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	75	GCAGTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1179998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1180775_1181553_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
903568	contig_12622_pilon	-	2930	6	Intergenic	novelGene_5855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2422	2787	1108535	1098530	FALSE	10	TTCCACTTCCGCACCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPIHGICSFFRCSWERAKNGEARAGIKLLPLALLRVQVAPRSRLGLSPYEMLCGRPFSGVWHPSGTFGTRFQPFGCINLSPSQSTFFRQRRATGRVCLGACRSEAQTCPRCLSPRPTAAG	1112133	1098386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1098702_1099886_1100004_1107490_1107555_1108522_1108648_1108984_1109078_1109917
903569	contig_15105_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_150957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	360	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441154	439397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_439400_441200
903570	contig_13592_pilon	+	4703	4	Intergenic	novelGene_33703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1087	junction_1	138.862842002059	43	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGTGGGTACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249302	261976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_249572_255367_255596_256589_258096_259276
903573	contig_15062_pilon	-	3578	18	Intergenic	novelGene_162302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_17	51.7049119898239	253	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	81	1865	352573	250293	FALSE	40	ACTGTACAGTAAATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLPCAGRPAAARRGAGRPGPGDPPAMATKARVMYDFAAEPGNNELTVNEGEIITITNPDVGGGWLEGRNSKGERGLVPTDYVEILPTDGKAPFSCGNSVADQAFLDSLSGSTAQANSSAANSNSQVSGGNDPWSPWSAPKPGNWEGTDGWGTKPEGTAAQRSTSNNWDAAFGHPQAYQGPATGDDDDWDEDWDEPKSSLPYFKDSESAEAGGAPRGNSRPGSSSMKLPLNKFPGFTKPGLEQYLLAKQLAKPKEKIPIIVGDYGPMWFYPTSTFDCVVADPKKGTKMYGLKSYIEYQLTPTNTNRSVNHRYKHFDWLYERLLVKFGSAIPIPSLPDKQVTGRFEEEFIKMRMERLQGWMTRMCRHPVISESEVFQQFLNFRDEKEWKTGKRKAEKDELVGVMIFSTMEPEAPDLDLLEIEQKCDAVGKFTKAMDDGVKELLTVGQEHWKRCTGPLPKEYQKIGKALQSLATVFSSSGYQGETDLNDALTEAGKTYEEIANLVAEQPKKDLHFLMECNHEYKGFLGCFPDIIGAHKGAIEKVKESDKLVATSKITPQDKQTMVKRVGTMSYALQAEMNHFHSNRIYDYNSVIRLYLEQQVQFYETIAEKLRQALSRFPVM	352653	248579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_250341_252345_252438_254467_254583_256646_256737_258252_258330_262395_262474_266256_266361_267583_267688_271013_271145_276827_276946_277065_277192_279787_279873_283143_283295_285163_285330_298871_298998_300161_300237_307664_307752_352561
903574	contig_9535_pilon	-	4134	4	Intergenic	novelGene_124490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	246	junction_3	29.6348143611905	337	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	3	539	595846	586593	FALSE	30	AAAACCAATCTTGTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPLGGMFSGQPPGPQPPPPGLPGQASLLQAAPGAPRTSNITLVDELESSFEACFASLVSQDYVNGTDQEEIRTGVDQCIQKFLDIARQTECFFLQKRLQLSVQKPEQVIKEDVSELRNELQRKDALVQKHLTKLRHWQQVLDDINVQHKKPADLPQGSLAYLEQASANIPAPLKQN	595848	582997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_586791_588070_588184_589060_589128_595687
903575	contig_3449_pilon	+	2872	4	Intergenic	novelGene_73733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	355.612460724062	224	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTGTCAGCTTTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493433	527176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_512069_512272_524984
903576	contig_5758_pilon	+	4295	3	Intergenic	novelGene_119085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2189	2530	164174	164515	TRUE	60	ACACAATTTAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGRGLSQVTQLRKLASPRSAGRRAGLLLTGCADQRIPGLADKLTVQVPRMGDEMTGSSPRIQREQKARTSAYIQIQATPPRRLPFIGLATHSIFNHGSDYIKTPRIMAQPS	161985	288134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_165179_168474_169302_287859
903577	contig_11574_pilon	-	2343	11	Intergenic	novelGene_64080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	295.29891635426	47	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	75	1745	456525	449890	FALSE	20	CATATTAGTTCTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463701	449291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451661_452822_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
903578	contig_4068_pilon	+	2483	2	Intergenic	novelGene_161703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	609	1097	70472	70960	FALSE	20	CCTGGAGAACGTTCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAKLDIHLQKNETGPIPHVIYKNEFKMDQRTKYKAKNYKVHRRKIGPTLQAPIDGINSIQTITINTQTPEDKLDYWDILKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGQISIIYKKIQHLYNKKTNKPIKKWAKEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCS	35120	72346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_35267_70009
903579	contig_10130_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_172722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1450	1899	42821	43270	NA	60	TCATTCACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRLLTYFGHVIMRDQCLEKNIMLGKVVGQQKRGRPSTRWTDTVAATMGSSLTTIVRMVQDLAMFHPVVYRVAELEPTRGHKQQQQHNQSLQKQTATSISCGATGGIELLTFRLAAVRFKHCATRAPQQNLGSDYMGAHCAILSTLLCV	41371	43467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_+_41400_43500
903580	contig_5062_pilon	-	2214	9	Intergenic	novelGene_157851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAATAACTTAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744080	676062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_676236_706255_706293_716399_716498_723731_723898_733902_734080_739284_739423_739579_739691_741720_741861_742906
903581	contig_1337_pilon	+	3075	1	Intergenic	novelGene_84223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	436	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	2567	2971	85632	86036	NA	25	CACACTGCAATGTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTVTIRVQEHSGYSSSIRAPSSQPCLQACLSLVLSLCPEALSFLCLWAGKPTTPSPTARSLLSDLCCRFSLLSRLQLAVSLVQELLSTGILDPKDMLAADCSSLVVVGSFLSHPWGGPFQAQQNGKTD	83065	86140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_83100_86100
903582	contig_4429_pilon	-	2618	4	Intergenic	novelGene_50798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1479	1871	165366	164974	FALSE	30	CCCTACAATGTGACAGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIINGLATLLKQTNNVFVFNLLVHFELLKSSIQRLKKSTKIVVVGKVGFRKLSKNLKRHSKYMQTSTSKNILNEFYLFFQRAKYLPHTWLNQLQIKKIHKLTRYHGIIKSTLGPKDVSLHSKELDDIEK	173319	164226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_165425_166679_166776_168309_168497_172182
903583	contig_15897_pilon	+	2124	5	Intergenic	novelGene_49513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	37.9695601765414	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	968	1285	158355	159682	TRUE	25	ATCTCTGACCCCCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLNSSFLNDGLTFIPGSRKGVFRIKKFMTTREERSGHSDVLWVIPALSQPSGTLRDGKDGYVGARDVGEGGDMRAGSQSCCFFLHHPGQAEVQAVFSDEMLTM	156328	161655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_156994_158052_158655_159664_159923_160322_160452_161185
903584	contig_14727_pilon	-	2870	7	Intergenic	novelGene_56660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	174	323	344244	344095	TRUE	30	GGAAGGGTAAGGAGTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSADVRVDSACCSGWSAGEWGSFSKEVSEAKGNLGKELVQASDSLLPLAGSSPSLFMSGRSVDWEEGEFSLFLIFPCSTGNFSSWLASWKLSVSSDKDNVAAMTG	344417	333658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_335014_336191_336761_338200_338269_340708_340864_340947_341009_341740_342055_344069
903585	contig_3975_pilon	-	1861	10	Intergenic	novelGene_54904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	41.7721627432302	147	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1509	352	1860	2134513	2123268	FALSE	35	GCCCTGAACAAAGGCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNQDKKNGAAKQSGNTSNPKSNPGQPEAGPEDAHRRPSQPSSATEAEDSTSQALGKPEGAQAKTAQSGALRDVSEELSRQLEDILSTYCVDNSQGGPGEDGAQGEPAEPEDAEKSRSYAVRNGEPEPGTPVVNGEKETSKGEPGTEEIRASDEGGDRDHRRPQEKKKAKGLGKEITLLMQTLNTLSTPEEKLAALCKKYAELLEEHRNSQKQMKLLQKKQSQLVQEKDHLRGEHSKAVLARSKLESLCRELQRHNRSLKEEGVQRAREEEEKRKEVTSHFQVTLNDIQLQMEQHNERNSKLRQENMELAERLKKLIEQYELREEHIDKVFKHKDLQQQLVDAKLQQAQEMLKEAEERHQREKDFLLKEAVESQRMCELMKQQETHLKQQLALYTEKFEEFQNTLSKSSEVFTTFKQEMEKMTKKIKKLEKETTMYRSRWESSNKALLEMAEEKTLRDKELEGLQVKIQRLEKLCRALQTERNDLNKRVQDLSASGQGALTDS	2134864	2123266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2123418_2124167_2124264_2124625_2124719_2125191_2125267_2125501_2125622_2127497_2127693_2129086_2129258_2132021_2132114_2133357_2133697_2134335
903586	contig_10437_pilon	+	2936	8	Intergenic	novelGene_38277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	959.911879459011	48	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	98	1012	431167	451175	FALSE	60	AAAAAAGAATCGTTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431069	453099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441814_443802_443977_445309_445476_446951_447055_451075
903587	contig_5686_pilon	+	1644	2	Intergenic	novelGene_45378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150204	163941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_151245_163337
903588	contig_17274_pilon	-	2503	2	Intergenic	novelGene_26548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGCTCCACTTCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175376	168078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_168421_173215
903589	contig_16098_pilon	-	1302	7	Intergenic	novelGene_46009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	953.033300689027	8	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	303	644	350768	350056	TRUE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVREGSSP	352334	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349177_349955_350076_350232_350422_350512_350643_350765_350889_352152
903590	contig_15687_pilon	+	2626	27	Intergenic	novelGene_129133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_10	167.30608752546	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	862	2586	41	2626	113917	183202	FALSE	60	GAAGAAAAAGGAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVLAELNASLLGMRVNNVYDVDNKTYLIRLQKPDFKATLLLESGIRIHTTEFEWPKNMMPSSFAMKCRKHLKSRRLVSAKQLGVDRIVDFQFGSDEAAYHLIIELYDRGNIVLTDYEYLILNILRFRTDEADDVKFAVRERYPIDHARAAEPLLTLERLTEIIASAPKGELLKRVLNPLLPYGPALIEHCLIENGFSSNVKVGEKFESKDIEKVLVCLQKAEDYMKTTLNFSGKGYIIQKRERKPSLATDKPTEDILTYEEFHPFLFSQHLQCPYIEFESFDKEKQALKKLDNVRKDHENRLEALQQAQEIDKLKGELIEMNLQIVDRAIQVVRSALANQIDWTEIGLIVKEAQAQGDPVANAIKELKLQTNHVTMLLRNPYLLSEEEDDDIDGNIGVEKNETEPPKGKKKKQKNKQLQKPQKNKPLPVDVDLSLSAYANAKKYYDHKRYAAKKTQKTVEAAEKAFKSAEKKTKQTLKEVQTVTSIQKARKVYWFEKFLWFISSENYLIIGGRDQQQNEIIVKRYLTAGDIYVHADLHGATSCVIKNPTGEPIPPRTLTEAGTMALCYSAAWDARVITSAWWVYHHQVSKTAPTGEYLTTGSFMIRGKKNFLPPSYLMMGFSFLFKVDESCVWRHRSERKVRVQDEDMETLASCTSELISEEMEQLDGGDSSSEEGKDELHETPVEIELMTQIDQEGITVQSGGDELNEDLIQEESSEDEGESEEVVKDEELVGEMKDEEEEILNYPDTTIDLSHLQSQRSLQKLASKEESSNLSDSKLQSRRHLSAKERREMKKKKLPNDSGDLEEIEGKDKEKESALHSETHQNTSKNFPAGQPVKRGQKSKMKKMKEKYKDQDEEERELIMKLLGSAGSNK	113012	183202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_113043_113906_113976_114118_114222_122655_122782_125895_126045_129924_129993_131794_131882_133301_133376_134251_134323_134398_134475_136364_136443_136528_136738_136974_137167_137404_137469_140141_140231_151593_151698_152081_152145_157778_157892_159247_159306_159998_160058_160145_160267_161641_161922_162636_162680_162851_162902_164689_164844_182977_183056_183184
903591	contig_10163_pilon	+	2287	1	Intergenic	novelGene_82669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAATAAGATTTTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400964	403251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_401000_403300
903592	contig_15327_pilon	-	756	4	Intergenic	novelGene_70694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	59	535	901528	900794	FALSE	25	CTGGTTATGACTTGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQSVCHPRQESHHHAQRHPVGSPDTGGESLSGRQFLWCFVVNSVKYFGLICEFFCKKLFIICCVCT	902086	900572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900989_901126_901281_901400_901536_902035
903593	contig_12570_pilon	+	2253	2	Intergenic	novelGene_79332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6386	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	129	386	39601	39858	TRUE	35	AATTATTTTAATGCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQAHDILYVQTIEGETNSLCKLSANALKKKIDHKLHQTEPKKMKQDPHLTLYTKNTSKRIKDLNIKPKTIKFIEEKLGPTLQALIHGINRIQPITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFIKRVK	39472	135211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_40532_134017
903594	contig_4402_pilon	-	4864	2	Intergenic	novelGene_140869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	435	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCAGAGAGGCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625829	620424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_625226_625766
903595	contig_10482_pilon	-	12747	1	Intergenic	novelGene_152812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	583	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATCAGATCCAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93026	80279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_80300_93000
903596	contig_14326_pilon	-	6331	2	Intergenic	novelGene_120641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	702	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	179	547	114591	114223	TRUE	10	CATCTATTTTGTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFYCARTPLTSQLHPVQCLPLPQVQKQEETGFLSSTCRETRGGDDLHLSHPIMSHHPCIHLSYCGGLHIAVMLEAMPLVFQIQAGSPMVDRFQQSFQTKTRKKGLEICFHELVKTLWITTE	114769	11265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_11662_108834
903597	contig_9482_pilon	-	2969	4	Intergenic	novelGene_44218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	33.5095342982992	551	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	1447	2229	209792	203095	FALSE	5	CTTTTTGCGTCTGCTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLNDPPNWNIRPNSRAEGGDGSRWNYALLVPMLGLAAFRWIWSRESQKEIEKEREVFHQRTAAFQRDLEAKYHAIISENRRAVAQLSLELEKEQNRTASYREALISQGRKLVEEKKLLEQERARVMQEKRQLQPLRSAYQSCLEREEDWQRRARLLLKEFEDALTERQNIYCSLVLPRSKRLEIEKSLLVRASVDPVAADLEMVTGLTDIFRHDTYCGDVWNTNKRQNGRLMWLYLKYWELIVELKKFKRVEKAILEK	211955	202354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_203757_209671_209803_210412_211652_211758
903598	contig_2161_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_114920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTATTACTAATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807706	808495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_807700_808500
903599	contig_9345_pilon	+	5247	3	Intergenic	novelGene_24727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	52	258	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	194	2875	1087419	1105467	FALSE	40	CTAAATAAAAGCAGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSLLLLPPLWGRTFLLLLLVALAQSRWPSEPSETVRDWENQLEASMHSVLSDLREAVPTVVGIPDGTAVVGRSFRVTIPTDLIASNGEVIKVSAAGKETLPSWLHWDPKSHALEGLPLDTDKGVHYISVSAARLGANGSHIPQSSSVFSIEVYPEDHSEPQSVRAASPEPGEVVSSTCAADEPLTVLTVILDADLTKMTPKQRIDLLHSMQSFSGVELHNMKLVPVVNNRLFDMSAFMAGPGNAKKVVENGALLSWRLGCSLNQNSVPDIRGVEAPAREGTMSAQLGYPVVGWHIANKKPPLPKRLRRQIHATPTPVTAIGPPTTAIQEPPSRIVPTPTSPAIAPPTDTMAPPVRDPVPGKPTVTIRTRGAIVQTPTLGPIQPTRVSEASITVSGQIRPTMTIPGYVEPTAVATPPTTTTKKPRVSTPKPAMPSTDSSTTTTRRPTKKPRTSRPVSRVTTKTSITRLETASPPTRIRTTTSGVPRGGEPNQAPELKNHIDRVDAWVGTYFEVKIPPDTFYDKEDTTTDKLKLTLKLREQQLVGERSWVQFNSNSQLMYGLPDSSHVGKHEYFMHATDKGGLSAVDAFEIHVHKRPQGDRAPARFSAKFVGDPAPVVNDIHKRIALVKKLAFAFGDRNCSTITLQNITRGSIVVEWTNNTLPLEPCPKEQITGLSRRIAEDDGKPRLAFSNALEPDYKALSVAVMGSGSCRHLQFIPVASPRKVPSEAPPTEVPDRDPEKSSEDDVYLHTVIPAVVVAAILLIAGIIAMICYRKKRKGKLTLEDQATFIKKGVPIIFADELDDSKPPPSSSMPLILQEEKAPLPPPEYPNQSVPETTPLNQDTVGEYTPLRDEDPNAPPYQPPPPFTAPMEGKGSRPKNMTPYRSPPPYVPP	1041987	1107839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1042059_1087296_1087698_1103064
903600	contig_7457_pilon	+	2491	10	Intergenic	novelGene_31635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_8	78.8680723709295	359	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	176	1261	1005828	1015465	FALSE	70	TAATAAAATTAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVAATFKVISCSV	1001503	1016695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382
903601	contig_18039_pilon	+	1942	2	Intergenic	novelGene_171245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1113	1514	121902	122932	FALSE	20	GCTTGTACCAGTTCTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDANLLKIKGWKKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKI	120789	123360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_122082_122710
903602	contig_8671_pilon	+	4449	20	Intergenic	novelGene_126243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	174	junction_1	198.213433189965	233	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1272	3819	21	3839	399201	500867	FALSE	20	GGGTGAATTTTGTTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTAAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQLQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLNPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEAKKEIPASQLPHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNFEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEANLDESIDIQQQDMDIDEGQDVVEEEIFEQEAKKVAVRSRSRTRSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGAKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSTEPVKETVQTTQSPPPPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPAVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPLPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVGPPPAIPPVVPTSLVQPPLSMTPETVKDVGFGSLVLPGGSVASSLATSTLPAGNVFNPPAKQAEPEEKGPHFTDHQISSGENPRAVIPNDVSCTPAILGGPPSNVTNNSGILGVQRSNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIGPQPPNILNNSGILALQPPSVSSSSGLLGVLPPNMPNSAGLVGIQPPNVPNTSGLMGTQPPAGPQNLPPLSISSQRMPAMPMLDIRPGLMPQAPGPRFPLMQPGIPPHRGLPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSHPERPFLAPGRQGVDSVPNPEKRLPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISMPPPVDVRDVVGRPVDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDMRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKHWGHRGDFDEREHRVLPVFGGPKGLHEERGRFRPGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREINGNRLGRDRIPNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPLQVQNDPELYEKLASSSEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT	399180	501477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_399231_435069_435154_438528_438574_450379_450542_454995_455150_455972_456104_463334_463512_464633_464714_467543_467662_472928_473061_473293_473407_474556_474751_481125_481227_485437_485552_487336_487494_489948_490086_491869_492015_494362_494432_498384_498604_499410
903603	contig_3382_pilon	-	4030	3	Intergenic	novelGene_124169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGCAGAGCCGAGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952039	944731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_945867_948547_949345_949941
903604	contig_3825_pilon	+	3315	5	Intergenic	novelGene_77933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1356	junction_1	788.778604869579	17	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	20	370	12232	13848	TRUE	25	CTAGAAACTTCAGGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVSKQAF	12212	17306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13621_14198_14390_14912_15231
903605	contig_11933_pilon	+	2324	14	Intergenic	novelGene_107258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	672	1106	121198	137878	TRUE	50	CTGAAAGAGAGGCATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQIRTMELYLISGALLSSASSLCKICTSLALSRSFSAVPNSKAAISAKATRASFCIITCSLVAMVTRCLMPPLCTMVLITSFDLLCRIRADSSLFDSPITPAWSLASHHSTKRSTNLTFFPSCSAASACASINILNVPRSLN	115670	214379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_116337_121192_121318_126411_126539_135962_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158481_162874_163013_176519_176668_192747_192819_207803_207930_214256
903607	contig_6028_pilon	-	1659	11	Intergenic	novelGene_156578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	184.336675677956	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	259	1365	332055	309678	FALSE	25	ATTTATAGACGTCTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARDLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	353977	309383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319475_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353771
903609	contig_13607_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_170215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAACAGCTCTTAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401357	403987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_401400_404000
903610	contig_14405_pilon	-	1622	9	Intergenic	novelGene_85640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_4	86.639969846486	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	496	1245	437598	434961	FALSE	20	CTAATTGTATTTTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNFSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGCQSVPIVFRGPNGASAGVAAQHSQCFAAWYGHCPGLKVVSPWNSEDAKGLIKSAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPEAAQSKDFLIPIGKAKIERQGTHVTVVAHSRPVGHCLEAAAVLSKEGIECEVINMRTIRPMDIETIEASVIKTNHLVTVEGGWPQFGIGAEICARIMEGPAFNYLDAPAVRVTGADVPMPYAKILEDNSIPQVKDIIFAIKKTLNI	439483	434583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_435107_435411_435554_436262_436355_436694_436806_437339_437798_437895_437959_438043_438152_439270_439325_439412
903611	contig_2027_pilon	-	4618	21	Intergenic	novelGene_39922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.217944947177034	265	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	4125	4550	162954	155294	FALSE	35	ATAGGAAGAGGCCCCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEKQQLYWINLNLLDAGQLHNLAFNGWLAMLQTIPADQVMPRSCWEQHIVLTFHQSLLEVPVYLIFKELSIVDTAGEGAGVLVSSLHVHFPLFIPVLLHKEPAFTGLQWTLSPTLAILNLAPLAFQTRHRLALWLSVLSG	172104	155225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_155410_162152_162264_162424_162556_162886_163005_163408_163553_163691_163758_163880_163975_164372_164551_164655_164815_165186_165412_165548_165634_165744_165839_166559_166769_167451_167503_167698_167960_168032_168105_168341_168464_169414_169554_169649_169770_169962_170052_170138
903612	contig_5894_pilon	+	3528	1	Intergenic	novelGene_83051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	527	1003	517972	518448	NA	60	AAAAAAAAAAACATTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGSKEDGRNTESLYQKELVNVQTFQEVTYDQEPTVLKEEVQAALKALAKSKPSVTDRIPIEMFQQTDAALEVLTLLCQEIWKTATWLADWKRSIFVPIPKKGDPTDCGNYRTISLISHTSKILMKSIQKQLQQYMDRPARNSSWIQKRTCNEGYHC	517445	520973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_517400_521000
903613	contig_12375_pilon	-	1180	2	Intergenic	novelGene_178796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGAACTTTGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1945	470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12375_pilon_-_1184_1478
903614	contig_3018_pilon	-	2005	14	Intergenic	novelGene_78865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	439.849369052203	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	980	2005	580152	562938	FALSE	75	AGGAAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625113	562937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_582859_582946_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
903615	contig_19825_pilon	-	2857	10	Intergenic	novelGene_59685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	224.741552526672	1	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	78	896	46721	17388	FALSE	30	GATAACCAAATGTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSATAAVALVLIYGVSSASAQRKKEMVLSEKVSQLMEWTNKRPVIRMNGDKFRRLVKAPPRNYSVIVMFTALQLHRQCIVCKQADEEFQILANSWRYSSAFTNFPAKGKPKRGDTYELQVRGFSAEQIARWIADRTDVNIRVIRPPNYAGPLMLGLLLAVIGGLVYLRRSNMEFLFNKTGWAFAALCFVLAMTSGQMWNHIRGPPYAHKNPHTGHVNYIHGSSQAQFVAETHIVLLFNGGVTLGMVLLCEAATSDMDIGKRKIMCVAGIGLVVLFFSWMLSIFRSKYHGYPYSFLMS	70092	15426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_17404_19816_19908_23163_23239_36715_36780_37429_37520_38098_38240_38733_38842_42367_42432_46551_46722_70015
903616	contig_2940_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_82006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	164	463	1196884	1197183	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRRFWTDLEKDVEQNSNTHKKDQIYWLKGDWRNLESTASRRPFSSVVKSLPRFTVQPGSGQPHKTKWD	1196720	1199307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1196700_1199300
903617	contig_4091_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_173029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	164	397	13416	13649	NA	75	AAAAACCTACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	13252	13963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_13300_14000
903618	contig_5779_pilon	-	5520	4	Intergenic	novelGene_106481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	169	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1808	2188	296437	280011	TRUE	40	CAGGCAGATACCTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVIREVTGYSSGSRTLRVQFFHQDSFSLALLTGTPLPGPQSLSRGTQLSLSVDGEVHCIVSCCRVTAACFSFLGGGGGLLLSALKIGSFKAKLTSPLGLPYHTVLPNHLGGSYKTMASECDYDMP	343766	150848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_153652_279481_280036_296081_296462_341983
903619	contig_4388_pilon	+	6658	8	Intergenic	novelGene_161999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	878	126	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	5736	6044	1972282	1972590	TRUE	35	TACCAAAACCTTTGGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNDKINLQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDIIEGLRSRFEMVEDRITGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGKKT	1683337	1974351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1686168_1740954_1741227_1802356_1803036_1842765_1842789_1900552_1901435_1904063_1904266_1971434_1973124_1974270
903620	contig_3269_pilon	+	2748	2	Intergenic	novelGene_117023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATTAATCGTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126358	129154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_128908_128955
903621	contig_21404_pilon	-	1561	4	Intergenic	novelGene_169132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	425	junction_1	50.2195181179589	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1028	1465	4682	1446	TRUE	50	AAAAATGAAAATTTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTVEQKFRGVNMPLAVANKKKLNLVFPVNQGVVWLKDSVENSISSSSLAPEDFEDDALKKFHVEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTLGSLFIIKLIEKFQDYAWSCDLETIFRKVRLSFESPDGKAQMPTVERMTLTRYFYLFPGY	5709	296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21404_pilon_-_388_1440_1545_2004_2115_4453
903622	contig_11896_pilon	-	5931	1	Intergenic	novelGene_88022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	552	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155610	149679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_149700_155600
903623	contig_12503_pilon	-	3060	1	Intergenic	novelGene_143829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	101	427	151231	150905	NA	60	GAAAAAAAAAACATATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLAETFSRSTASKGTKSRGSNGAKQATVFPGCLHWAWRIWSVTRVTVWRLWFPRSWFSNISWESWTIKLELLRIHSSGYRTRFFMFVPFLLRWHPYGRIFYKQTRSF	151331	148271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_148300_151300
903624	contig_13481_pilon	-	4143	1	Intergenic	novelGene_119325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	304	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316908	312765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_312800_316900
903625	contig_2798_pilon	+	2891	1	Intergenic	novelGene_120057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAATGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180084	182975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_180100_183000
903626	contig_8354_pilon	-	3772	1	Intergenic	novelGene_24159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570218	566446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_566400_570200
903627	contig_6552_pilon	+	2854	1	Intergenic	novelGene_163605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCCCTCTCTCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143170	146024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_143200_146000
903629	contig_13021_pilon	+	3896	10	Intergenic	novelGene_8161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4139	junction_1	2054.09241620746	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	169	1020	174676	177567	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRVIAFEHCIFKFGS	174507	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177792_178170_178282_178522_178585_178670
903630	contig_10642_pilon	-	4622	2	Intergenic	novelGene_78692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1025	1621	222596	222000	TRUE	25	AGAGAGAAGGGCGGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVGR	223620	218942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_220018_220073
903631	contig_821_pilon	-	4558	7	Intergenic	novelGene_149378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_6	486.3155411413	423	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	150	2171	95995	39265	FALSE	10	GCTGTTGTTATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRVKLLIGPVQEIPAGQDQPPSGLMHQAFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQVPTGHGTQEQDVYQVPPSVQRSIGGTNGPHLSKKVITPVRMGHGYVYEYPSRFPKDTYDIPPSHATQGVYDIPPSSMKGPVFSVPVGEIKPQGIYDIPPSTGMYAIPPSSCRDEVGLRGKEYDIPPPMRQAGRLQVTPEGVYDIPPASTKPVGKDVSMKYNCDVPGAAELMSHRHQNMSLNHAPSLLGLPVGTQNDAYDIPRGVQFLEPPAETSEKANPEEKDGVYDVPLHNPADTKGSQDVVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTTSKESSLSASPSQDKKLLLDPDTAIERLHRLQQTLEMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTVVDKVELFLREYLLFAKGALANASCLPELILHNKIKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECNWSLNILAISKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPDDAKQLTTTINTNAEALFKAGPGSSHLKNGPESILNSTEYPHAGSHKAQAHNKTLHPSLGKDQPPDCSSSDGSEKSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIIKQNKMQLEHHQLSQFQLLEQEITKPVEQ	96144	36877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_39319_42364_42455_44311_45527_46810_46913_47427_47530_68762_69210_95983
903632	contig_17274_pilon	-	1597	9	Intergenic	novelGene_26575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_8	326.075887447999	372	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	232	837	247024	232842	TRUE	50	CCTTTAAAAAGAAAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	259035	231237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_251831_258905
903633	contig_5210_pilon	-	1589	11	Intergenic	novelGene_65445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTCCTCAGGAGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622475	565785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_565823_591286_591358_606804_606863_608379_608456_610961_611101_613061_613146_613241_613337_614669_614847_616478_616651_617260_617407_621941
903634	contig_13878_pilon	-	1818	7	Intergenic	novelGene_165733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	232.976155193807	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	445	861	57125	43119	FALSE	15	GCATATCCTTAGTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDRVIDFDENTALDDAEEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLSLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVIQEALEEHDKNGDGFVSLEEFLGDYRRDPSKDPEWILVEKDRFVNDYDKDNDGRLDPQELLSWVVPNNEGIAQ	60578	42161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_43122_45960_46088_46983_47085_52427_52542_57053_57241_59806_59913_60355
903635	contig_7644_pilon	+	1395	4	Intergenic	novelGene_64252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_3	35.6121078036982	20	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	1042	1395	175979	179696	FALSE	20	TGAGTGGCTGCATGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIHLFDIDVPGKITFQESKTLSPGDSFSTFDTPYCRVGLGICYDIRFAELAQIYAQRGCQLLVYPGAFNLTTGPAHWELLQRGRAVDNQVYVATASLARDDKASYVAWGHSTVVNPW	174937	179696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_176079_176578_176654_177755_177835_179596
903636	contig_6098_pilon	+	2854	2	Intergenic	novelGene_145465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAACAACAAAGATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21778	27201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_21837_24405
903637	contig_3081_pilon	+	2766	2	Intergenic	novelGene_133930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGTAAGAGGAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194929	198276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_197613_198193
903638	contig_12626_pilon	+	4105	1	Intergenic	novelGene_80420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1740	2075	107206	107541	NA	75	ATAAAAAAGGAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPLLQQTLLQDNLLGRVRSGESTESVGSGCGFFWGTGGVADHTCCNLFITSWLCVPLSVSLIKTKT	105466	109571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_105500_109600
903639	contig_19012_pilon	+	4402	24	Intergenic	novelGene_159470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	79	junction_3	217.370912087036	423	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	987	2964	239	3202	12581	115367	FALSE	35	ATATTTTGTTAGCATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQQTFLNQLREITGINDTQILQQALKDSNGNLELAVAFLTAKNAKTPQQEETIYYQTALPGNDRYISVGSQADARKKQYMPTRTRCATVEQSKCGSKDKRDLDVIDLTGDDKDDLQRAIALSLAESNRAFRETGITDEEQAISRVLEASIAENKACLKRTPTEVWRDSRNPYDRKRQDKAPVGLKNVGNTCWFSAVIQSLFNLLEFRRLVLNYKPPSNVQDLPRNQKEHRNLPFMRELRYLFALLVGTKRKYVDPSRAVEILKDAFKSNDSQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQMKAEEETDEEKPKNPMVELFYGRFLAVGVLEGKKFENTEMFGQYPLQVNGFKDLHECLEAAMIEGEIESLHSENSGKSGQEHWFTELPPVLTFELSRFEFNQALGRPEKIHNKLEFPQVLYLDRYMHRNREITRIKREEIKRLKDYLTVLQQRLERYLSYGSGPKRFPLVDVLQYALEFASSKPVCTSPVDDIDASSPPSGSIPSQTLPSTAEPQGAPSSELPGTSPAITAISSRSIIHKPFTQSRIPPDLPMHPAPRHITEEELSVLEGCLHRWRTEIENDTRDLQESIARIHRTVDLMYSDKSMIQVPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIFDHRENRWMKYNDIAVTKSSWEELVRDSFGGYRNASAYCLMYINDKAQFLIQEECNKETGQALVGIETLPPDLRDFVEEDNQRFEKELEEWDAQLAQKALQEKLLASQKLRESESSVTTAQAGEPEYLEQPSRSDFSKHLKEETIRIITKASHEHEDKSPETVLQSAIKLEYSRLVKLAQEDTPPETDYRLHHVVIYFIQNRAPKKIIEKTLLEQFGDRNLSFDERCHNIMKVAQAKLEMIKPEEVNLEEYEEWHQDYRKFRETTMYLIIGLEHFQRESYIDSLLFLICAYQNNKELLSKGLYRGHDEELISHYRRECLLKLNEQAAELFESGEDREVNNGLIIMNEFIVPFLPLLLVDEMEEKDILAVEDMRNRWCSYLGQEMESNLQEKLTDFLPKLLDCCTEIKGFHEPPKLPAYSTHELCERFARIMLSLSRTPADGR	5306	116567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_5386_8432_8578_12566_12651_21348_21473_36887_37051_41930_42018_50664_50803_55916_55994_58185_58260_63391_63541_69245_69374_69765_69862_71237_71400_71998_72223_75379_75451_76138_76368_77785_77987_85960_86101_101339_101519_103389_103469_105769_105850_109643_109768_114682_114879_115194
903640	contig_9345_pilon	-	3251	15	Intergenic	novelGene_24409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.7549967555743	7	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	814	1386	205737	196247	TRUE	30	CAAGAGTTTAAGGTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAKSLAKFISDQNIKDLKVWTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDHYPLEFALRDQDKYRYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKMAEQLPYLKCPLHTVLKLTPMAYGCKVESIFLNVEAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ	221145	194202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_195125_195303_196307_198455_198521_199399_199463_199555_199686_201653_201759_204464_204612_205734_205867_207634_207757_208548_208606_209024_209095_211740_211808_214946_215044_215211_215329_220991
903641	contig_15273_pilon	-	3698	1	Intergenic	novelGene_140435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1075	1377	120217	119915	NA	20	GATTTGTTCTGTAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPIASSLSTLFCLYVFGFYFTLLFPIPILAPHITIYPLLPAYVHRALHITLPSSTGTAYCNLPCTHSWSAPSAVVRAKNNSSRQLPFSWTYPAVPYLSD	121291	117593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_117600_121300
903642	contig_9653_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_48341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTTTTTTTTTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094950	1092482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1092500_1095000
903643	contig_5541_pilon	+	2518	2	Intergenic	novelGene_178797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	766	1581	126430	134687	FALSE	40	ATGAAATTAGGACATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKIPEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAHKQTKKRMKQTNLQSINEENNY	125664	135624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5541_pilon_+_127178_134619
903644	contig_7151_pilon	+	4542	5	Intergenic	novelGene_40747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	188.636389649505	4	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502502	509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503293_503387_504052_504143_505440_508007_508218
903645	contig_5686_pilon	-	621	3	Intergenic	novelGene_45468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTTCTGTGTCTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241665	222522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222914_224040_224201_241595
903646	scaffold_13505_pilon	-	2179	17	Intergenic	novelGene_111425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_16	528.308444471598	539	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	50	1708	515685	508930	TRUE	15	AGAGGTCTGTGTGTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGAKGRGGGRSRSDVDMDPSSATAVLGPARRATPEPGDEGEPGRSGLELEAEEPPGWRDLVPPGTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFYQPMADSGFFPLEELQNIFPNLDELIEVHSLFLDSLTKRRQDSGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKEPRFCAFVQDAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPAEREKVERAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVIFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPAFRPKSRPSPSSTREPLLSSSENSNGGREMPPADGRMERFLSDLLTFCRPGPEGQLATTALQKVLSLKQLLLPAEEDSGAGPPRESDGVLGGGPLRPAETQEVQENLLSLEEILKQLEEMEGEFCRLRLLLCQLGGKEPSCT	515734	507161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_507615_508911_509005_509098_509263_509766_509854_509954_510023_510277_510365_510522_510611_511309_511478_511561_511638_511905_511984_512183_512285_512427_512543_512741_512868_513108_513192_513490_513638_515174_515321_515635
903647	contig_3077_pilon	-	2535	7	Intergenic	novelGene_26745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGGGTAGGGGGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18083	11193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16561_16706
903648	contig_15172_pilon	+	1942	9	Intergenic	novelGene_158751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_6	198.405164688322	20	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	17	664	243174	267542	FALSE	20	GCAATAGTCTGCTCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENTGKLRLGEAQLTGHPGPAQTLGMPPWCHTNRPAAPHSLLHTCQRHQSKNGQKIGR	243157	268820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_259199_259309_260340_260392_267534
903649	contig_6079_pilon	+	2785	2	Intergenic	novelGene_160097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTCTACCCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426388	433181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_426770_430777
903650	contig_177_pilon	+	3632	13	Intergenic	novelGene_41784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	31	junction_5	136.20225972999	135	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	688	2097	380699	393448	TRUE	35	TTTGGAATATATGTGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESAGLKVTRDLKAAVSAILQGYGDGQQSVTDASAELHRLCGCLELLLQFDQKEKKSFLRPRKDYWDFLSTALWQQRGDMEPSRFVRSQEKLKTPLGKGRAFIRFCLAHGQLAESLQLCLLNPELTREWYGPRSPLVCRELQEDILDSLYSLNGVAFDLDLQRPDLDGAWPMFSESRCSNSRKTQGRRPRRDKVSPKKISAACGGPKGVHQEEPHPNQASCLGDVPRGDCFAGLSGSQPHKHLPPFLEKKREDPRSPKAPRSRWEPEEELQQDQSEGAPRPGICLQNSTPSIQGQREGSKGAPKEVIGTEAEGRGGLPGAETQRSVEETHEGEAEWGHVQRLLTSSPRRTIEEVTWGRRQESEVPSIPGGALGPSGPGKRGRLHHREATKTNRSNQRGWERGASRSIPAGCGQEPQTSTPEGQGAGPAPEAAADGTGPGAEGLAEATQQVSGRERPAAGRASAETTGG	377715	401325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_378102_379288_379464_380572_380742_380856_380964_382177_382304_382848_382956_383290_383435_383964_384035_385201_385848_386533_386641_393388_393536_399296_399408_399988
903651	contig_7078_pilon	+	1770	9	Intergenic	novelGene_130118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	393.166611470252	9	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1368	402	1769	182358	243326	FALSE	65	ATTTAAAAAAAGAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNSILWKKKVSQMQQTVKVVCQKDDLPADQTVLPGSSDREGNAQSCWEDDGKERQEILGPEAQADEARCTVKDDECDSDAENEQNRDPNVEEFLQQQDTAVIYPEAPEEDQRQGTPEAGGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLMPVNGRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFSGGGPLQATSSPQGVVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQASLASKEQETISASSIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQ	29776	243327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_90824_90980_106254_106398_182312_182515_219236_219297_227970_228133_231995_232199_236108_236215_242646
903652	contig_7657_pilon	+	3840	3	Intergenic	novelGene_30028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	157	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2346	2669	353124	353802	FALSE	45	CGACGTCAGCACCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAPVPLLSPLPLTHLSSTHHNLLPPSCLPAPCTEHHPPQAAVGVENKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLIFRAVQDLKQKADKNEEEIDKFMENTGKKNWKNSGK	190782	354973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_193032_353027_353253_353607
903653	contig_7151_pilon	-	2889	6	Intergenic	novelGene_40692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_4	114.137811438629	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	171	1661	65162	13305	FALSE	30	TCACAGTCTAGGAGGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIRMTMSGHYFLQGLVFLLFSVQVDAQENRQLRLVDGGRRCTGRVEIFYQGKWGTICDDHWDLNDAHVVCRQLGCGQAINAVSQALFGNGSGVIWLDDVNCTGQESHVWKCPSQDWGKNDCNHHEDAGVSCSGFVRLGSSDGLCSGQVEVYTGTEWTPASDRNFTFPTAHVICAELGCGKALSVLQDVPFRETDGQIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	65332	12076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_13676_13782_13876_18160_18479_18570_18880_40400_40716_65077
903654	contig_5586_pilon	-	3401	1	Intergenic	novelGene_143545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGTTTCCTGCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348007	344606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_344600_348000
903655	contig_7151_pilon	-	2295	5	Intergenic	novelGene_40742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATATTAACTTGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508047	502274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502453_503036_503212_503293_503385_504050_505590_507735
903656	contig_15613_pilon	-	4226	15	Intergenic	novelGene_147187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_4	68.2047113699723	10	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	851	2556	537	3092	111581	43757	FALSE	45	AGAAGTCCACATAAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHVIARDYGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVIFNCSCRDVIGWTSGLMSIKVFYERGECILLSAVDNCAEDVREIVQRLGIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHDDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPAAVQPLSRASPVPGTPDRLQCQQLLQQAQAAIPRSTSFDRKLPDGTRSSPSNQSSSSDPGPGAGGGHWRQQVAYDGCQSPLLLDHQGSGPLECEGAREREDIMEGSRHPETKWHGPPSKVLSSYKERALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSNTSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTTPCMPTSILGPLHLTGSRSMIHSRAEQWADSGDISGPDGEQVKMYAVHNYASAISVSNTAEGSMGDLSEVSSHSSGSHHSGSPSAHCSKNSGSLDTSKVYIVSHSSSQQAPGSVSKPYHRQGAVSKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECQGMYSEMDTMSTASQHQTVAGDAVSETPHVLSKEDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSPRRSLYRTLSDESICSNRRGSSFGSSRSSILDQALPNDILFSTTPPYHSTLPPRTQPVPSMGSLRNEFWFSDGSLSDKSKCTDPGLMPLPDTATGLDWSHLVDAARAFEDQRVASFCTLTDMQHMQDLEGAQELPLCVDPGNGKDFLDTTGERSPSTLTGKVNQLELILRQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFNSVDKKS	117885	42622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_43904_48094_48177_49092_49217_58852_58985_68951_69172_71501_71656_76775_77001_84127_84517_86299_86404_86790_86892_88386_88474_90800_91062_107156_107432_111326_111904_117671
903657	contig_13992_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_147621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1560	1934	149564	149190	NA	85	AAAAAAAAAAAGTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGLNIRAKTIKLSEENIEVNLHDLRFGKGFLDITPNAQTTKEKIDQLDFIKIKNFCVSKNTIKKVKRSGVQNSNSCKKTRLNGLTETRGTPEDIDPGLSVNPELKPFLKPTLQEKIRLDYEI	151123	148932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_148900_151100
903658	contig_177_pilon	+	3374	12	Intergenic	novelGene_41785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_6	139.437180381444	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1707	2114	386594	400091	FALSE	20	GTGTATACGCATACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDRELKALQKQLSRCQEESAQLQAELARKQQEAERRDAMYQEELGGQRDLVQAMKRRVLELIQEKDNLWQKVQHLSSVAPECCVSCSKIFGRLSRRYPCRLCGGLVCHACSTDYNKRERCCPLCSRREDSQVT	377898	401351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_378102_379288_379464_380572_380742_380856_380964_382177_382304_382805_382956_383964_384035_385201_385848_386533_386641_393388_393536_399296_399408_399988
903659	contig_5023_pilon	+	7757	6	Intergenic	novelGene_7240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2945	junction_1	1708.16376264104	520	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	85	702	607279	614529	FALSE	70	AACAAAAAAAAAAGTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQVCVSTITDRALCLE	580844	621584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402
903660	contig_18162_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_122296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
903661	contig_3009_pilon	-	2078	2	Intergenic	novelGene_132512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAATTCACAGCAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64916	62795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_64668_64710
903662	contig_11304_pilon	-	2353	12	Intergenic	novelGene_156705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	326	349	490107	490084	TRUE	75	CAAAAGAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDALYHWCFDLSGSKHGTWILIELLLCLFSRVWLLTGHRGCGWSSGLPSHCVRLLTSGLPELRSQRKLASPDILHLYLLFKGPPVFQVLVPGCRAFSSGKFLQLITKMGYGRTR	491267	375206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_375275_433617_433674_441233_441320_447545_447606_447719_447873_457802_458481_484413_484450_485227_485290_485601_485743_488982_489224_489660_490239_491073
903663	contig_10930_pilon	+	2886	8	Intergenic	novelGene_37006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1863	2435	276899	280292	TRUE	25	ACTAAGGTGCGCCTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALLSCLCNRFLQNIYILVHQEQGIFLRNGCFCFVWQYDSMFIHCS	267438	281752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268581_272839_273013_273952_274324_276722_277013_278443_278637_279700_279834_280159_280338_281346
903664	contig_5423_pilon	+	2412	1	Intergenic	novelGene_85248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	214	513	526433	526732	NA	65	AAAAAAAAACCTGAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSIARWCPATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNIHKKAQIYWPERDWRNPESMAPIHPFSLVVKSLPKFTVQPGTGQPHKTKWG	526219	528631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_526200_528600
903665	contig_3866_pilon	-	2385	3	Intergenic	novelGene_112392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	389	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTGAAAAAAAGAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166907	160653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_161691_164547_164695_165706
903666	contig_1535_pilon	+	4237	3	Intergenic	novelGene_127225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTCCAGAGATGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40618	51246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_40712_41661_41852_47292
903667	contig_8964_pilon	-	4019	5	Intergenic	novelGene_168683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1535	2059	237612	237088	FALSE	50	GGAAATAATAAATATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKKDRMAPVGVQNKTPYDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKKRQTKMRKQIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQIAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVLEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRAKKNEETQRVTWDTIKSKKL	439083	235127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_238085_239207_239531_404605_404677_438341_438530_438603
903668	contig_9468_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_59465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165252	167268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_165300_167300
903669	contig_7378_pilon	+	2887	1	Intergenic	novelGene_120270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511688	514575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_511700_514600
903670	contig_16103_pilon	-	1861	8	Intergenic	novelGene_118882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3585.2446761351	14	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	71	391	743628	737441	TRUE	10	CTCATCTCGTCACCCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERCVEGPQSVDFKRGSQGL	743698	722723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737326_737630_743496
903671	contig_7695_pilon	-	2923	1	Intergenic	novelGene_41535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	297	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTACCTCTTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368570	365647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_365600_368600
903672	contig_7457_pilon	-	1811	8	Intergenic	novelGene_31265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	562.055847323203	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	156	1295	41481	28421	FALSE	10	TCGTACGGGATTGGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQDKPPDWFTSYLETFREQVVKETVEKLEQKLHEKLVLQSPTLGSCPSEVSMPISDETLFLPENQFNWHIVCSSCQKRIIGVRYQCSLCPSYNICEDCEAGPYAHDSNHVLLKLRRPVVGSSEPFLHSKLSTPRLPAALEQVRLQKQVDKNFLKAEKQRLRAEKKQRKAEVKELKKQLKLHRKIHLWNSIHGLQSPKSPLGRPESLLQSNTLMLPLQPCAPVMPTLSAAFVDENLPDGTHLQPGTKFIKHWRMKNTGNVKWSADTKLRFMWGNLTLASTEKKDVFVPCLKAGHVGVVSVEFVAPTLEGTYTSHWRLSHKGQQFGPRVWCSIIVDPFPSTDSPGNNEKGIISSSKADDLTCQQEEAFLLAKEDTQLDEVTQQTERTGTCIPQKIKKITSERELYIPSVDLLTAQVFCKTWAGGKLTEKVLV	42109	27904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_28475_37389_37540_38379_38671_38759_38920_40148_40359_40778_40947_41374_41590_42062
903673	contig_5253_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_61544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTAAGTTGAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66246	63949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_63900_66200
903675	contig_302_pilon	+	5104	2	Intergenic	novelGene_145002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	717	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1900	2199	4663	4962	TRUE	10	TCTCTGGTACTTTTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQSLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSHTQIKVQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKRD	2763	8470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_6992_7594
903676	contig_3161_pilon	-	2405	2	Intergenic	novelGene_84502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTCTGTGTGTCTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348279	345836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_346224_346261
903677	contig_17796_pilon	+	2252	13	Intergenic	novelGene_33764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_10	257.944263467043	203	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	387	1631	12080	39611	TRUE	45	ATGTAACAAACACATCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEVKSCDDILDQLPNGRVLSPPSLQVGAKVSFICDEGFQLKGSSISHCVLVGKKGLWNGSVPVCERIFCPNPPAILNGKHTGNGLGNIPYGKEVSYMCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKWHLQVGRWDQCFYHPRLLPGRYSSNTYSPLL	8152	42651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_13832_13907_14011_15233_15320_16867_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904_34981_39517_39779_40843_40949_42302
903678	contig_15518_pilon	-	3334	1	Intergenic	novelGene_127622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2874	3182	21681	21373	NA	55	CATCCATAAAGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDRPSRQKINKLTKDLNATINQLDLIDIYRTLHLTAAKYTSFSNTHGTFYRIDHVLGHKARLNRIQNKELLQNIFSDHKAIKVEISNKKSMGKKIKYMETK	24554	21220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_21200_24600
903679	contig_6062_pilon	+	4833	1	Intergenic	novelGene_5286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2278	2664	747351	747737	NA	75	AATCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYLISSPLSPWAAQMVKCSLLTERLLVQVHPEHHQDRPSNLLPKVTALKTLWNAVLLCTREVAMIQNCQIIYQVVFFSKINLFLFNNNSNCIIIISGVCVSQDNAFNLIYPCIYISPVYCLILVSST	745073	749906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_745100_749900
903680	contig_2890_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_60286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCTATAAGACAGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319846	317250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_317200_319800
903681	contig_6958_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_69966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAATCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276301	278985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_276300_279000
903683	contig_10197_pilon	+	4924	2	Intergenic	novelGene_115225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1095	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATACCACAGCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918372	923586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_919188_919477
903684	contig_10982_pilon	-	2319	6	Intergenic	novelGene_87860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1053	1415	83377	79887	FALSE	25	ACCATTAAGTCTGGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTTNHQQSIYFSNHKHQTTLKATNPSNPDRMNGTSPTGEPAEFTGITSNVFFVTPASPKYIMPPVLELTQISPISSVLQSWGGPSGLTMHIIPPGITCPTSWTVSAEFLSSVLTRITP	90428	78982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_79966_80615_80752_82559_82638_83307_83442_85245_85360_89554
903686	contig_10002_pilon	-	2690	11	Intergenic	novelGene_157650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	75	junction_4	76.7742795472546	404	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	36	1520	437655	270182	FALSE	40	TAATAATGGAATTGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELIPEFYYLPEMFVNFNNYNLGVMDDGTVVSDVELPPWAKTSEEFVHINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQQGPEAVRSLNVFYYLTYEGAVNLNSIIDPVLREAVEAQIRSFGQTPSQLLIEPHPPRGSAMQVSPLMFTDQAQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTQPGLATAAVITVTANRLFAVNKWHSLPAHQGAVQDQPYQLPVEIDPLLASNTGMHRRQITDLLDQSIQVHSQCFVITSDNRYILVCGFWDKSFRVYSTDTGKLIQVVFGHWDVVTCLTRSESYIGGNCYILSGSRDATLLLWYWNGKSSGIGDNPGSETTIPRAVLTGHDCEITCAAVCAELGLVLSGSKEGPCLIHSMNGDLLRTLEGPENCLKPKLIQASREGHCVIFYENGLFCTFSVNGRLQATMETDDNIKAMQLSRDGQYLLTGGDNGVVMVWQVSDLKKLFAYPGCDAGIRAMALSYDQRCIISGMASGSIVLFYNDFNRWHHEYQTRY	437690	269011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_270273_275372_275525_279922_280120_283264_283367_298835_299004_306621_306778_313090_313154_318414_318593_323255_323346_353841_354010_437535
903687	contig_10324_pilon	-	3529	25	Intergenic	novelGene_7691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	99.6840756116821	593	35	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	4	1041	21894	18148	TRUE	10	CCGGGGGCAGTCCCGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMPEPRGSSPLRVNAAFAARYSRYREREELQRLKDRYGDRDSGGDSSSESDSSDELVEFDPQQERDFYRTLSLLKKKDPCIYQKDATFYQKTASSSESEEESAAAEKQKKVRPMYLKDYERKVILEKEGKYVDEENSDGEASDQRRQQTLSQSYVEEQKQLKESFRTFMEDSEDEDSTRDSGSGLLQKRAKTREEKAQEEADYVEWLKGQKEIENPETLQELTHLKDYWNNPELDAGERFLRDYILNKRYEEEGDEEEEERSSLRTPGPLVQLAVDDSSDEGELFLKKQEDFEHKYNFRFEEPDSATVKTYPRSIASSVRRKDERRKEKREEIRQRKSRVSMEVPG	21897	8006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_8071_8631_8722_8801_8961_9585_9654_10795_10928_11866_11947_12018_12095_12174_12296_12966_14109_14676_14776_14871_14886_16278_16321_16410_16500_16592_16669_17911_18268_18367_18507_19049_19166_19516_19595_19669_19767_20049_20100_20180_20236_20455_20565_20895_21002_21585_21660_21800
903688	contig_20375_pilon	+	3854	12	Intergenic	novelGene_105825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	148.730606764142	204	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	60	1586	31789	53862	TRUE	30	AGAGTTGATCACTAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCKVQRARAAFRSGRSRPLQFRLQQLEALRRMVQERERDILEAIGADLCKSEFNAYGQEVISILGEIDHVLEKLPKWVTPKPAEKNLLTMLDEAYIHSEPLGVVLIIGAWNYPFVLTIQPLIGAIAAGNAVIIKPSEVSENTAKIVSKLLPQYLDQDLYVVINGGVKETTELLRQRFDHILYTGNTAVGKIVMEAAAKHLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDIACRRITWGKYMNCGQTCIAPDYILCEPSLQSQIVQKIKETVKEFYGENVKESPDYERIINLHHFKRIINLLEGQKIAYGGETDEATCYIAPTVLTDVDPEAKVMQEEIFGPILPIVPVKNADEAIKFINDHEKPLAFYIFSRNNKLIKRMIDETSSGGVTGNDVIMHFTLSSLPFGGVGSSGIGAYHGKHSFDTFSHQRSCLLKSLKREGINKLRYPPNSQSKVDWAKFLILKRFNKGKLCLLMLTVLGIVAAVLIKKYQAVLRRKALLIFLVVHRLHWSSKQW	31729	60634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20375_pilon_+_31942_33506_33739_34676_34763_36921_37131_38335_38454_40445_40588_44736_44904_46452_46553_52600_52837_53778_53899_55893_57789_60297
903689	contig_151_pilon	-	4917	9	Intergenic	novelGene_132569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_8	142.575363843127	486	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	8	1660	253657	216804	FALSE	25	ATTACAATGTGTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNGRLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEDEVLSCLYSRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDSFLDDHHFTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRNDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ	253664	213546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_217049_219634_219762_219870_220358_223422_223648_226819_226908_228049_228195_231678_231773_233386_233529_253557
903690	contig_12479_pilon	-	2439	17	Intergenic	novelGene_56860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_14	112.052565092237	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	478	1773	516412	451002	FALSE	25	CTTACATAGATTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDKAKTALQQYLA	518738	450335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451036_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516566_516621_518254_518336_518437
903691	contig_11293_pilon	-	3478	1	Intergenic	novelGene_134689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTTTAAAAAAATCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283202	279724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_279700_283200
903692	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_93388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657833	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657833	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
903693	contig_15236_pilon	-	3951	3	Intergenic	novelGene_141638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1172	junction_1	83	349	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	128	766	675954	667044	FALSE	20	GTTTAAGTGTCAGTGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKMALNYKSKSQKRSAVEKSMNTFLIIYLIILISEAIISTILKYTWQAEEKWDEPWYNQKTEHQRNSSKILKFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFFIGWDLDLYHEESDQKAQVNTSDLNEELGQVKLMLLFFLFVTFIKIIHFQRLVKQKLLRDFHQRTALLCFTSDFCFPFLNLKPSLFLLNTLFLDSVVPWFFNFKS	676081	663858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_667470_668586_668738_675892
903694	contig_11572_pilon	+	4207	6	Intergenic	novelGene_100065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_5	348.795412813873	21	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	2579	3190	284025	285673	FALSE	35	GCTACTGGAAATAAATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDRFRQACEDLRKQRLNEFMAGFYVITNKLKENYQMLTLGGDAELELVDSLDPFSEGVMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC	280355	286690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_282619_283278_283453_283883_284067_284195_284429_284867_285052_285520
903696	contig_5346_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_161867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	708	1202	626238	625744	NA	10	TGTAGATTTGTTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGMPITRKFLLLIVSHITLRVSSFFLVLFSDFSSNRVVSKCLSSVPLILSSMVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFSSCIIFLNSSNFFVCIFHEFVYFFLMFVSFLPQFLENSEY	626945	625574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_625600_626900
903697	contig_14450_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_48977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGCACCGCTAAGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040760	1039074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039100_1040800
903698	SIRV6	+	1099	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	593	224	377	-89	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	53	544	1733	10736	TRUE	30	AGAAAACCATTTTGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1680	11601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
903699	contig_18804_pilon	-	3725	14	Intergenic	novelGene_163789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	23.0163307086499	348	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2710	3348	11234	6040	FALSE	55	AATACAAAGAGAAGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLTQQIQAEDEQYSLVASLDNVRNLSTILKAIHFQDYATCFATKNGIKVTVEKAKCVQANAFIQAGIFQEFMVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFDFCSTNVINKIILQSEGLREAFSELDMTSEVLQITMSPDKPYFSQDPSDISSDIPGSMFSSESGLNF	24909	5662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_6113_7490_7750_9513_9623_11036_11296_11773_13330_14601_14713_17737_17781_20344_20419_20695_20747_20842_20917_21080_21129_21270_21374_24072_24203_24451
903700	contig_14144_pilon	+	2463	2	Intergenic	novelGene_175658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	2116	2463	31689	32036	FALSE	35	TGAGCATAAGAGCGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCHNQQVNSASTPSPEPPTPDDPILDYAGGNSASMTKLALFTRHTPSSVPAERGPQACGGASLNSESNGDSGNYDALAGDTLLGDCELSRQMGAQLKLLPMNDQIRELQTIIRDK	27747	32036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14144_pilon_+_29675_31500
903701	contig_17144_pilon	-	2086	12	Intergenic	novelGene_29430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1818.15618163744	429	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	317	2008	179764	166152	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183398	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166526_170903_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
903702	contig_7707_pilon	+	9624	11	Intergenic	novelGene_72132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_6	166.232517877821	492	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	278	1138	85324	103442	FALSE	25	ATGGCACTATTGTCCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGHSLEGCFQVTKLLSRRPRNWSQCVELARLKFEKYFNHKALQLLHCFPLDTRLKDGSLFWQSPKRPPSPIKFDLNEPLHLSFIQNAAKLYAMVYCIPFTEKDLSADALLDILSDVKIQEFKPSNKVVQTDETARKPDHVPISGEDERNAIFQLEKAISSNEATKSDLQMAVLSFEKDDDRNGHIDFITAVSNLRAKMYGIEPANRFKTKRIAGKIIPAIATSTAAVSGLVALEMLKVAGGCPFEAYKNCFLNLAIPIIVFTETSEVRKTEIRNGISFTIWDRWTVHGKEDFTLLDFINAVKEKYGIEPAMVVQGVKMLYVPIMPGHAKRLKLTMHKLVKPSTEKKYVDLTVSFAPDTDGDEDLPGPPVRYYFSHDTD	81312	111928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_81434_84082_84135_84227_84292_85283_85354_87190_87263_93662_93781_95112_95307_96440_96569_97486_97575_97780_97876_103306
903703	contig_12079_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_67479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCATGCCATTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609189	607653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_607700_609200
903704	contig_5988_pilon	+	4058	1	Intergenic	novelGene_16150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATTATTAAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1927643	1931701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1927600_1931700
903705	contig_299_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_129447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	108	419	934067	933756	NA	15	ACTAGGGGTGTGTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFNSWILLNIRDLNSLSVTSSASSSTGRSSGVLFWMPTRTTLSCFYKCFDVVCCLWGIQWLFSSFTDCRFVCFVLLFCFIWLCLSRQAVCSLLSARLWARYFSPPSPMGRVSHSGMVNRAGPAEGELLGWVVCGTYQG	934174	931953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_932000_934200
903706	contig_16594_pilon	+	4349	4	Intergenic	novelGene_53861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3374	3760	135147	149173	TRUE	60	ATAGTCACAACAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKVNKRIACSEIELFTLLSGLLGKKERADASTHHGSCGSCSLCCCSLVDLVLGSLDLGLQMCGRMEVFALFSRASPFDVIHADSDCVVIGVNHGAVSRMSKPTIVLSSVAIATLVLSTYLKSVRAH	131773	272903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_135507_149146_149351_165477_165648_272661
903707	contig_2204_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_71677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAACAGCTTACTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18431	20444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_18400_20400
903708	contig_12932_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_158344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	590	1192	4482	3880	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKAPDKERTIEEEENVGGLTLPDLRIYYTSKVFKTTWYWYNDRCINQWNNIENPDVNPSFRSSTKTQSSSNGEKTVFLTNGAGKTECPSAKKKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLSRKPVTIKIMEEKIGSTLEALIHSINRIQTITNNTQTPEGKLDNWDLLKIKHLCPSKDFTNRVKREPTDWEKFLAMTNLTKV	5071	2531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12932_pilon_-_2500_5100
903709	contig_7629_pilon	+	5585	4	Intergenic	novelGene_153556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90.5096679918781	29	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACGCATAATATGCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230262	245722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_230580_230674_234145_243342_243503_244084
903711	contig_8322_pilon	+	2991	11	Intergenic	novelGene_143240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_6	375.307127563546	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	192	1655	290111	300333	TRUE	15	CTGATTATCCTTGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLAFAAN	289919	305366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472_295648_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
903712	contig_7733_pilon	+	1552	7	Intergenic	novelGene_147157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	56.4783636055043	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	26	898	236172	240982	FALSE	25	ACCATGATGTATTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQKSCAFAMGHLVRTSRDSSTEKLLQKLSGWYMEKEEPIYKTSCALTIHAIGRYSPDVLKNHAKEVLPLAFLGMHEIADEEKSEKEECNLWTEVWQENVPGSFGGIRLYLQELITITQKALQSQSWKMKAQGAIAMASIAKQTSSLVPPYLGMILTALLQGLAGRTWAGKEELLKAIACVVTTCSAELGKSAPNQPSTNEILQAVLKECCKENIKYKIVAIRCAADVLKATKEDRFQEFSDIVIPLIKKNSPESTGARTIKNEDENEKEKELQMESLLGAFESLGKAWPRNVETQRKH	236146	241636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_236190_236267_236335_237020_237213_238078_238288_239109_239154_239249_239443_240832
903713	contig_18804_pilon	-	3897	12	Intergenic	novelGene_163794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	22.928202706249	770	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	3549	3896	9601	7490	FALSE	40	ACTTGGAAAGCAGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFDFCSTNVINKIILQSEGLREAFSELDMTSEVLQITMSPDKPYFR	26860	7488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_7750_9513_9623_11773_12257_14600_14713_17737_17781_20344_20419_20695_20747_20842_20917_21080_21129_21270_21374_24072_24203_24451
903714	contig_4232_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_63305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGCTGTCGGAGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467359	466773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466800_467400
903716	contig_8696_pilon	-	3853	4	Intergenic	novelGene_153342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	189	590	1390987	1390586	TRUE	40	AAAAGTTTGCGTAAGCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSPISYRSTDPPSWTPIRSANRSYKKAASQSFQQETKQPVTSNIRFPTPPTLLHPHSASSASCSHSLLAGKYQLHPSFTWITPARTGRLPKCHLLAAGVAFFHSLNFFLTSYHLPLLSLKYLAPCTIFASS	1391175	1205779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8696_pilon_-_1207766_1221240_1221251_1272552_1273531_1390296
903717	contig_6552_pilon	-	2015	2	Intergenic	novelGene_163580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGACACCACAAGCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115243	25805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_25971_113393
903718	contig_3410_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_58923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTTACACGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15495	13699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_13700_15500
903719	contig_5316_pilon	+	2332	1	Intergenic	novelGene_61262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCAGGGCCCCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549406	551738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_549400_551700
903720	contig_3018_pilon	+	3136	2	Intergenic	novelGene_78883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTATCAATTTCTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568110	571362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_570088_570203
903721	contig_8656_pilon	-	2856	1	Intergenic	novelGene_162359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCAGAGATGGCGGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624127	621271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_-_621300_624100
903722	contig_6898_pilon	+	2657	4	Intergenic	novelGene_35767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3511	junction_3	1742.17992437317	16	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	131	604	124380	125646	FALSE	20	TACTTTACTGTGACTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	123023	127699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_123145_124370_124464_124782_125008_125481
903723	contig_2487_pilon	-	7446	11	Intergenic	novelGene_148442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	337.920774738695	514	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1209	3630	2369	5998	221813	86284	FALSE	40	CTAAGAATGTAGTTAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGPRCKRRKQANPRRKNVVNYDNVVDTGSETDEEDKLHIAEEDGIANPLGQETSPASMPNHESSPHVSQALLPRDEEEDEIREGGVEHTWHNSEILQASVDGPEEMKEDYDTMGPEATIQTTVNNGTVKNANCTSDFEEYFAKRKLEERDGHAVSIEEYLQRSDTAIIYPEAPEELSRLGTPEANGQEENDLPPGTPDAFAQLLTCPYCDRGYKRLTSLKEHIKYRHEKNEENFSCPLCSYTFAYRTQLERHMLTHKPGTDQHQMLTQGAGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCIGLISVNGRMRNNIKTGSSPNSVSSSPTNSAITQLRNKLENGKPLSMSEQTGLLKIKTEPLDFNDYKVLMATHGFSGTSPFMNGGLGATSPLGVHPSAQSPMQHLGVGMEAPLLGFPTMNSNLSEVQKVLQIVDNTVSRQKMDCKAEEISKLKGYHMKDPCSQPEEQVVTSPNIPPVGLPVVSHNGATKSIIDYTLEKVNEAKACLQSLTTDSRRQISNIKKEKLRTLIDLVTDDKMIENHNIATPFSCQFCKESFPGPIPLHQHERYLCKMNEEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVDNKALLLSSVLSEKGMTSPINPYKDHMSVLKAYYAMNMEPNSDELLKISIAVGLPQEFVKEWFEQRKVYQYSNSRSPSLERNSKLLAPNNNPPTKDSLLPRSPVKPMDSITSPSIAELHNSVTNCDPPLRLTKPSHFTNIKPAEKLDHSRSNTPSPLNLSSTSSKNSHSSSYTPNSFSSEELQAEPLDLSLPKQMKEPKSIIAAKNKTKASSISLDHNSISSSSENSDEPLNLTFIKKEFSNSNNLDNKSTNPVFGMNPFSAKPLYTALPPQSAFPPATFMPPVQTSIPGLRPYPGLDQMSFLPHMAYTYPTGAATFAEMQQRRKYQRKQGFQGELLDGTQDYMSGLDDMTDSDSCLSRKKIKKTESGMYACDLCDKTFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHQCQICKKAFKHKHHLIEHSRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEEREAAEREAREKGHLEPTELLMNRAYLQSITPQGYSDSEERESMPRDGESEKEHEKEGEDGYEKLGRQDGDEEFEEEEEESENKSMDTDPETIRDEEETGDHSMDDSSEDGKMETKSDHEEDNMEDGM	226790	84835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_86862_96900_97082_98482_100453_101385_101495_104103_104319_105009_105199_128409_128482_133370_133629_221755_221898_224402_224572_224675
903724	contig_11816_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_98545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTAGAACTTTATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082968	1085709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1083000_1085700
903725	contig_12638_pilon	-	3672	14	Intergenic	novelGene_33126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2994	3386	172943	172551	FALSE	55	AAAGAAAATTCAAATCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPKNPRKSINNPPVQPKHFLFPYLFTWNYIHVKLRHKNLNIKIEQLFKSLSITKLHKNYQEFIQIGTTWSCYTLQNKCIIFKRFSAMFVLKFNYISYRSITANLQSLQFVTPVIMHAYCYFHHQLVKE	200478	172264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_173560_178085_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191861_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
903726	contig_7816_pilon	+	3653	8	Intergenic	novelGene_66553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_5	42.2948831758304	242	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	16	1038	328886	351499	FALSE	10	TGTTTTTGTATGGATCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	328870	354114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331
903727	contig_8964_pilon	-	2802	2	Intergenic	novelGene_168705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_1	0	144	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549476	542823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_543520_547370
903728	contig_10323_pilon	-	2932	3	Intergenic	novelGene_123579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2611.5	15	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	260	1678	460768	459350	TRUE	15	GAGCCTGTGATTCCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	463339	458014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_458528_458608_460999_463310
903729	contig_1261_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_168145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3	329	27363	27037	NA	40	TAAGTGTAATTAAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHLCCGDQSLGSTEIPLSGLLKKGSAEINHRPVTVEGAFTLDPPNRAKQKLAPIPVELAPTVGVSVALQREGIDAQASSDPPSPPLPPRSCSSVAEDYAQKLNLRGVT	27365	25089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_-_25100_27400
903730	contig_6576_pilon	-	3676	2	Intergenic	novelGene_42388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAATCGGCAGTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291958	1286457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1286583_1288407
903731	contig_1090_pilon	+	1666	1	Intergenic	novelGene_131149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACACAGTCGAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517999	519665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_518000_519700
903732	contig_17427_pilon	-	2507	13	Intergenic	novelGene_30355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1130.69111117444	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	43	1335	188879	178125	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVK	204703	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178736_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
903733	contig_5033_pilon	+	2637	2	Intergenic	novelGene_28943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1245	1628	452335	452718	TRUE	30	TTTTTAAATTTTAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALCPECRNAYPPIYCTLSCCTFWALSASAPVASRAWQFLHRGPCWEKPPLQVCSWAGPRPPFHALFSVSAQLSCFLPLPTLARLTLRPKGRCMALWSAAGRRARPAQVCRPQEQMAGALLTSCGR	451090	457099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_453121_456492
903734	contig_5280_pilon	+	2773	8	Intergenic	novelGene_52601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	520.806713333326	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	22	1344	38343	62372	FALSE	20	GTGAATTTGTAAGGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGKSGSQTVKRECHHCGMYNPYSWKRILSFNCLRSTVKMQCLWLPKRKRVNAFQHVLWMPLGTRYVPKYSQPCSCSKVIFGQLQIIWPISQILLRAHCLKASF	38321	63801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043
903735	SIRV6	+	1036	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	42	450	-1	44	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	10	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	216	707	1733	10736	TRUE	20	TAATTGGCATCGCGCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
903736	contig_14300_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_133156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATAGTGCCTGGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617419	615965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_616000_617400
903737	contig_7051_pilon	-	2589	1	Intergenic	novelGene_64311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTGTCTTATTTCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214492	211903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_211900_214500
903738	contig_5317_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_76596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAATAAAAACCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388990	390659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_389000_390700
903739	contig_610_pilon	-	2174	5	Intergenic	novelGene_76813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_4	77.1184154401528	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	81	992	334463	331286	FALSE	45	ATAAATGAATGGATGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTHTQEYILQVYEQLARPHVTLSSRMGENGHCTFILTCVAESRGGPVTYSWTPLEPWTVVSHGGSVLSVSLRPRDHALMFTCTVQNPVSNSSSYPVSVPHFCAGSGTTVGETVIGTLGESATLHLEFPAGQEVENITWSSRGLLAVLRPGPAGKPVLVVETQGPYSRRLSISHPGYSLQISSLRLQDSGLYRAQITLRTSPMNITKDFTLRVYEKLQEPNITVSSRIMNAGTCFIMLVCSLDQAGEDVQYSWDPHGQGAVMSHGGTTLSISWRSVDSDSYRCTVRNPVSQRSRSFPARPLCSASFLPCSLRKEFLLFGILGALGIKSI	338498	330103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_331366_333249_333517_333619_333950_334228_334502_338456
903740	contig_11551_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_168476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	73	489	492734	493150	NA	40	CCTGCAAAAATCTCAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTMDYSSVKKEAWRRQSWIKPACVTWRAHGLTTSPSSCAGSELPSEASSRAPFLLLQALCSQSLSLLCPLGLEVTKAQGFWEGAGSPTLHPDPLRQRLQAQCSSVWDVDKLTYISSKHLLQCLFLSFLPTSQQFFL	492661	494779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_492700_494800
903741	contig_4732_pilon	-	4722	7	Intergenic	novelGene_75496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	462	773	1069869	1041436	TRUE	50	CATAGGAAGAAAGAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIGIKSTTLVEKYNRKAQYHQSEQGRGRLWNRSSVAHKPLQVEDEVIRISQQEPKYDVEYIPPEFRDHLMNRFNTLNTNDLKTEIERPDEWSQIVVEYKYV	1070330	842737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_842775_906572_906906_974093_974408_998141_998702_1023061_1025664_1041332_1041501_1069622
903742	contig_15486_pilon	+	2808	6	Intergenic	novelGene_157310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_4	58.5948803224309	378	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	9	536	34567	104521	FALSE	25	ATATAATTTGGTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLKQLDQRLFENYIELKADPIVGSLEPGIYAGCFDWKDCLPPTGVRNYLKEALVNIIAVHAEVFTVSKELVPRVLSRVVEAVSEELSRLMQCVSSFSKNGALQARLEVCALRDTVIIYLTPESKSSFKQALEVLPQLSSGADKKLLEELLNKFKSNMHLQLTCFQAASTMMKT	34558	106793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_34703_78816_78873_80703_80827_99883_99946_102096_102157_104430
903743	contig_7933_pilon	-	6243	5	Intergenic	novelGene_164659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	45.293487390573	273	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	92	625	100219	69516	FALSE	40	CAGAGAAGTAGAGAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFSFEEVTQKDHALPKPSWSKDLRLLFDQFMKKCEDGSWERLPSCSRHSVQRFQNFTKAFFSGSIPVKEEQISQAKFFPRSFEDGLGFEYAMFWSKDEKRIVCLFQGGLYLQGIPGFLHGGALVTLIDTTLGTHAMLAGGAVMTANLSINFKRPMPLCSVGVINTQLDKIEGRKLFVSCNIQSVDEKTVYTEGTGLFIKLEPGKTLV	100310	63897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_69557_73582_73708_83107_83219_83805_83966_100122
903744	contig_6375_pilon	-	2003	9	Intergenic	novelGene_72954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	193.615558194583	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	50	1582	229189	202748	FALSE	10	GCTTTCAGTGGCTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGDARELVKAFLSSSAMVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	229238	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206774_207612_207739_228690
903745	contig_8168_pilon	-	1268	1	Intergenic	novelGene_168241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAGAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157667	156399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8168_pilon_-_156400_157700
903746	contig_9982_pilon	+	1444	5	Intergenic	novelGene_55732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	54.63744137494	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	189	536	311199	315276	TRUE	80	AAAAAATTAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVW	307542	317292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313217_315168_316153_317260
903747	contig_7410_pilon	-	1289	2	Intergenic	novelGene_106040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGTGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32539	30256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_30607_31600
903748	contig_4496_pilon	-	3104	2	Intergenic	novelGene_66636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTGAGAATAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643203	632382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_633493_641209
903749	contig_16156_pilon	-	4000	1	Intergenic	novelGene_137065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGTGTTTCTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30339	26339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_26300_30300
903750	contig_18869_pilon	+	2677	16	Intergenic	novelGene_56432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	156.41653791506	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	258	2489	118812	151360	TRUE	35	GAATTACATGAAGCTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISLSSLRILSFHNNTSLLFINKHIVLHVLFPEGDAEIRVLNSFTLDLAAPAVGGIVDTQLCRGILFVLNSLGWIYIFDVVDGTHVARVDLALHQEDVWDEQQPEPAEVSSFTSLKVSQDLDVVVVVSSSSSALALNLNLYFRQHPGHLLRERRLEDLPIQGPKGIDEDDPVNSDYNMKLTKFSFQVDRSWKAQLSSLNETIKIPKPEVSHCTPWFQDYLHLESFESGNHGTNVLSWAFMPQDTCGQYSFPRKDGHAKTSDPERSWKIVHVSDEEEAAELECVSVTGFTALFTQATERKGCTIILWDLETQGMQCFSLGKIRIPIESDGDQQLCLVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDSLCHLNAWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVDFFLKSKENLLNPSSNSSALDQFDHFPSDLYLRNVEELTPALDLLCSAIRESDSETQSKHFSEQLLNLTLSFLNKQIKELFVHTEELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKQTDALDEYDVNENVPKVKESDIWEKLSFEEVIANAILNNKIPEAQTFLRINSHSAQRLEELIKIGLDLVFDSLKKNNIKEASELLKNMGFDVKDQLLKICFFTTDKNIRDFLVEILKEKNYISENEKRTIDFVHQVEKFYSGQFQENPQIQSFPRYWIKEQDFSKHKSVLDSVLKYHKDEFNKQDHRIVLNWAQWWDRLTQESVLLPRISTEGMEFFLHRNWETLTSSS	115880	153873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_115957_118630_118816_119693_119919_121690_121893_127625_127764_128533_128983_130281_130428_132150_132284_136509_136666_137079_137256_138333_138511_139404_139477_141302_141431_141771_141945_151307_151512_153836
903751	contig_2703_pilon	-	1733	9	Intergenic	novelGene_101672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	499.915430347974	3	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	840	1274	170182	167024	FALSE	50	CTAATAAATTTTTATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGEAVEAKPARPVTVYSISLQKFQPPFFTLDVECGGGFYIRSLVSDIGKELSSCANVLELTRTKQGPFTLEDHALPEEKWTIDDIAQALELCSSLLPEETGLKKPKPEESKEEKEEPKEQAVSCECVSLNEVKGEDDVIQTC	191185	166564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_167305_168027_168085_170085_170226_172070_172146_180899_180982_185332_185389_188914_189014_190619_190903_190984
903752	contig_11077_pilon	-	1833	2	Intergenic	novelGene_178798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATTTACAATCAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259715	123471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11077_pilon_-_124199_258609
903753	contig_8089_pilon	+	2594	1	Intergenic	novelGene_177427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCCCAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8089_pilon_+_0_2600
903754	contig_5744_pilon	-	2520	5	Intergenic	novelGene_149338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_4	144.335330047775	516	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	798	1202	648812	642056	FALSE	20	CAATTCACTGCTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVFQADAPNPGLIPDADAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYTETELRENPPVKPDFSKLQRNILASNPRVTRFHINWEDNTEKLEDAESSNPNLQSLLSTDALPSASKGWSTSENSLNVMLESHMDCM	655899	640737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642269_644567_644745_648797_648914_654236_654376_655342
903755	contig_15449_pilon	+	5736	12	Intergenic	novelGene_33591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	608.542684079849	93	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	2584	3936	44662	51340	TRUE	15	TTAAACTTTCTGGTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGKI	28085	55779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_36986_38069_43216_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51932_54570
903756	contig_11338_pilon	-	1645	10	Intergenic	novelGene_6359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	244.727966889315	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	300	1106	319426	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323315	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
903757	contig_15327_pilon	+	1717	3	Intergenic	novelGene_70515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	1	170	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	12	350	465424	466294	TRUE	0	TTTTTGCTGTGGCTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAKMAAPSVKAVRGWSGLALGVRGVVLRLPGLTQVRWSRYGPEYQDPRIDGEYYRKPMAKLTEEEKYERELRKTQLIKAAPATKTSSVFEDPVVRLDRNKRFCSPGGDYPPESLR	465412	468564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_465507_466038_466946_467848
903758	contig_6227_pilon	-	3408	5	Intergenic	novelGene_49648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	69.1411599555576	272	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAAATTCCTCTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446093	426431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_429452_431540_431625_443269_443354_443545_443630_445957
903759	contig_12624_pilon	+	2417	11	Intergenic	novelGene_60940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_4	303.386222495353	50	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1298	1996	39740	55160	FALSE	30	CTAGGAAAACTCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6012	55581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
903760	contig_5005_pilon	-	2717	10	Intergenic	novelGene_84334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_6	126.144537909671	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	298	1614	667337	616685	FALSE	30	GTATGGGCATCATTTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAAAETEFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKTENAKVRKVKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRQLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVTENSEGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKKKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRENAKLNIELEAAPH	667634	615581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_616796_627291_627427_631840_631982_635774_635895_637691_637918_642393_642531_653670_653800_655985_656090_658274_658432_667280
903761	contig_1596_pilon	+	8266	8	Intergenic	novelGene_131596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1321.44333582485	1043	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	222	659	129031	160660	TRUE	10	TTTTTTGCATGTGGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSTSGPTRREDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKENKKLHLLHRF	120773	174471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_120805_127019_127064_128884_129124_154562_154705_159579_159747_160624_162294_168444_171748_171800
903762	contig_6364_pilon	+	2546	10	Intergenic	novelGene_51843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	291.788905601462	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	566	1735	1772471	1785208	TRUE	15	TAGTTGGATGCTTGGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLAKDMKNKLGIFRRRNESPGGPASGQGRQSDEVIQAHLRGSPQVG	1707964	1787387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1708251_1714424_1714537_1719467_1719512_1727359_1727483_1772470_1773440_1781110_1781176_1784680_1784784_1785175_1785238_1785826_1785994_1786772
903763	contig_7009_pilon	+	3983	3	Intergenic	novelGene_23596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGGACAGGGAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415571	422210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_415783_415969_416094_418562
903764	contig_7412_pilon	+	2147	3	Intergenic	novelGene_76300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1280	1918	327355	328629	TRUE	35	CTTGCGCAATGAAAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQGMVARALDPATGVNDTATHRGPPVHFTPLVEHICQTRCNLIIKFDVGAGSGGAKMIDQRGLDREAFFNICWPLNVEGPHGTRDGHRALAHIQLHVSRAAAQTHCIVEQQAAHCGLAHISGAHYHHPGASFFFLLCLPPHLLQGCVRVEVKQHRGILGDISHLSAAAQLQRTAMPSENSHLGTSVKGEFLVSGQLCTKYFCHASQELQLN	326075	329577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_+_327481_328116_328744_329462
903765	contig_14575_pilon	-	10245	43	Intergenic	novelGene_101868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	4466	4813	111516	109704	TRUE	55	TTATCCACCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSETGLNESHVLEDKAVSDQPRGFALTELPGQPSWHRLAAGRLQTPRQEPFLGKHWHPGELLSAVHQGAKTQVGTPWPGSFLLQISDSLRPRALDQVMLLRQSTLLHSAFNCV	117762	17090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_17272_19960_20119_20521_20561_20879_21036_21521_21609_22648_22704_26341_26426_27682_27778_28956_29020_30471_30761_33860_33916_39339_39503_40650_40700_41531_41650_42755_42849_44947_45004_47300_47374_59250_59374_59880_59983_61541_61637_62293_62355_63864_64003_65123_65448_68965_69218_70557_70631_72113_72162_73354_73410_74802_74884_76190_76364_80556_81603_83151_83219_85344_85494_91826_91969_96889_96956_98189_98288_105305_105406_107164_107254_107679_107769_108446_108642_109651_109821_111285_111563_113156_113276_113462
903766	contig_15092_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_57764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAGCAGGTACTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270759	268583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_270159_270342
903767	contig_1244_pilon	+	2259	1	Intergenic	novelGene_37932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTTTATGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711864	714123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_711900_714100
903768	contig_12464_pilon	-	5196	2	Intergenic	novelGene_68635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	330	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAAGGGTTACAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66791	61495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_66031_66130
903770	contig_11629_pilon	+	1637	9	Intergenic	novelGene_161178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	260.068710872723	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	876	1583	251968	423756	FALSE	65	AGAAAATGATAAGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL	31460	423810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_31576_67007_67134_164825_165187_165269_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412468_420326_420448_423627
903771	contig_4884_pilon	+	2673	13	Intergenic	novelGene_63820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	643.830399510099	17	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	280	1593	576025	585192	TRUE	25	GCTTGTAGAGACCACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEGVEGIIKEVEVDIIEVAIDLSGIEDTLGVLDEVGHVLEVQKEDLFLLRDPEADLAGHIDPLGLQDLPLLGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKNVFVFYTANGG	563325	593614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_575041_575156_575923_576247_578052_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_585152_585316_586137_586319_587339_587487_592827_593041_593198
903772	contig_4350_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_136380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTACCTTTTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248802	246645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_246600_248800
903773	contig_9008_pilon	-	4699	14	Intergenic	novelGene_58614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	22	junction_13	47.0392005728472	291	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	52	1536	108627	66778	FALSE	35	TCATCAAGACTTCTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQYERRGGGACGGNVLSMSDKDDTETPVITEVTPILKDGNCEPAKSSESVNQSTKPESKSGPVASTRKRPEARSSNDCETAEVLPVQASQAAGKEPVSKEVPQTGWGYWGSWGKSLLSSASATVATVGQGISNVIEKAETSFGIPSPSEISAQVHYASGEKNAEEAGSFGLFSTISTAVQSTGKSVISGGLDALEFIGKKTMDVIAEGDPGFKKTKGLMNRNSTLSQVLREAKEKEELWTCNEVTVETDKKTHYGLLFDEFQGLSHLEALEMLSRESEIKVKSILNSLSGEELETLKLELEQLKEVFSLAEFTEEEEEEKKGDEDFTKEITELFSQLHVSSKPEKLARARSTAYEWIATSLTKPLAEKEDGEKCLEVESTEQANKNSVEDIHSFAIRSLAELTACSIELFHKTAALVLHGQKQEVTAIERSRTLSQVTVVLCKELSALSKEFTTCLTTAGVKENADVLNPLITAVFLEASNSASYIQDAFQLLLPVLEISLIESKTESLQA	112560	63614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_-_66880_77229_77284_79700_79774_80835_80976_81679_81803_86239_86320_95629_95754_96410_96570_97081_97217_98372_98444_107435_107529_107964_108065_108396_108642_112523
903774	contig_14575_pilon	-	4774	2	Intergenic	novelGene_101924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGAGGATATGGAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445082	386253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_386955_441009
903775	contig_2715_pilon	+	3389	1	Intergenic	novelGene_173179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACTCCTAAGAATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145251	148640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_145300_148600
903776	contig_14536_pilon	-	4031	3	Intergenic	novelGene_69269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	3	36	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2186	2560	23184	17390	FALSE	35	CTTTTGAATATATGCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLIRNFYGKLRSVAITLDSETARLQRALNGEESGFEDYAVKILHDLHSEVWTLKEDVTILLHKASLESQENTDFIKATKVLMKRNSVDIMKIREFFQKYGYNPRAKENSGLNHFHFIAFVFVF	25369	15918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_17600_17711_17774_23081
903777	contig_8576_pilon	+	2084	2	Intergenic	novelGene_88813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1532	1996	934478	940439	FALSE	40	GCAGAAGGACGGGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWSTFSCRRWGTSCLWPQRRPRWQAPSLGSIQQAQWVSAVGSWAMRTGLESRGRLLRVASPHRCGLLRAMSSLAMSMKTSSMFLDSLADVSSTARSPYFSASVQASSNRTCRWSRRSALFPINITTRLAAPYFSSSWIQCGMDSNVDRRVRS	932946	940527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_934844_940340
903778	contig_9400_pilon	-	2915	8	Intergenic	novelGene_146577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	436.405447131122	84	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	178	465	132513	121571	FALSE	25	TCCCCTTCAAAACATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVSEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTAFGMTSFAIAILILQVLGFVLAVVGLSLCIPECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRKAVEEPLNAFKESKGMMNDE	158630	119120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123473_124088_124114_125262_125295_130570_130664_131168_131262_132506_132600_158539
903779	contig_15491_pilon	-	2084	4	Intergenic	novelGene_75949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	498.48058025252	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	54	431	46982	32412	FALSE	25	TTGCTTATCAAAGAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELVSNKKYS	47035	30758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_38887_39040_45107_45207_46879
903780	contig_938_pilon	+	4682	13	Intergenic	novelGene_143907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_12	182.922778941157	82	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	2100	4403	82318	127395	FALSE	55	TTAAAAATAGAAAAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKNHFLQSFKLGDDKGIAHPISFPSLAKKLLIDLCKDVPFQVKCVACRQTLRSHMELTAHFRVRCRNAGPVAVAEKSIAQVAEKFVLRGYCPNCNQVFVDEASTRNHKQNSGHKVQIITSMEESVLLYCHSNQGNKPPSDLHLLLDKSKFSSLKRTMSIKESSTQDYNTIPKKKMNLENESCGAVVCVQRDKSTIKTWFCECHQRFPSEDAVEKHVFSANTMCYKCMVCGKVCEDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELIRKETIMAHVTEFHNGHRYFYETEEVEGETLPLSSTTLGTNSTKKPSSTITIIDHSPASNPPRGKWQCRICEDMFDSQECVKQHCMSLASHQFHRYSCARCKKTFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLVFNVEEAFLIHYKERHSIDYVFVSEKIETSIKTEDDFPVLETSNLLTCGCRESYICKINRKEDYSRCLQIMLDKGKLWYRCNLCSVTAQNLADMKTHIHQVHREEKKDEEEQHYVIKCGTCTKAFHDPESAQQHFHRKHCFLQKPSVANFGSEKGSLYKFTASASPTERKLKQAVSYPKNSDVEKGAENDLSCQNIDEEAVELPDLDYLRTMTHIVFVDFDNWSNFFGHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIFNYLNRIGCFFLHPRCSKRKDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHILNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKDVELEEAIRRSLEDM	24218	127674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_24344_24837_24922_32069_32151_64172_64299_68841_68954_74981_76442_82206_82361_82853_83002_91965_93570_95206_95351_96634_96766_97701_97889_127348
903782	contig_10331_pilon	+	9894	7	Intergenic	novelGene_54074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	305.195429192509	1387	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	8346	8936	103733	109782	TRUE	35	AAGCTCAGTAATATGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESQIHLYGHTEEITSLFVCKPYSIMISVSRDGTCIIWDLNRLCYVQSLAGHKSPVTAVSASETTGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEGVSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSHKPIVSLTFSCDGHHLYTANSEGTVIAWCRKDQQRLKQPMFYSFLSSYAAG	87913	110877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_96244_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643_110229_110365
903783	contig_17171_pilon	-	2938	2	Intergenic	novelGene_147363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTACATATTGGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238674	235438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_237926_238223
903784	contig_13481_pilon	+	4453	3	Intergenic	novelGene_119424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATTGGTCTGTAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766156	800610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_767640_797205_797724_798158
903785	contig_6509_pilon	+	3282	1	Intergenic	novelGene_145652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	457	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAAACAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181251	184533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_181300_184500
903786	contig_5696_pilon	-	5115	7	Intergenic	novelGene_117573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTAAAAAATACTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738251	711447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_712992_714012_714071_714622_716735_730426_730595_731912_732504_734429_734592_737771
903787	contig_5967_pilon	-	2159	9	Intergenic	novelGene_44359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	424.175965844365	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	121	1140	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517622	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430797_482468_482550_488455_488583_517515
903788	contig_6674_pilon	-	1666	10	Intergenic	novelGene_148027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAATAAATCCTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486330	324470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_324554_342130_342275_371979_372110_394452_394579_449884_449975_469261_469327_470320_470501_471157_471339_475651_475845_485856
903789	contig_11574_pilon	+	4138	29	Intergenic	novelGene_64104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_25	112.920280711298	355	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	902	2709	71	2779	561358	622516	TRUE	25	ATGTTTGTTTTTTTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMNGTTPDPERAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQMDGLIRETKATDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKTEPEKPEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAFEQLDIKAGNSDSEEEDVNERVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSFVDSEEEKEEEQSDEDFANHSDCDQNQHTARMSEEEEEDDGCDLFADSEKEEEDIEDVEQSTRPKRSRPTSFADELAARIKADTPGRIAESQTALSSGDAKPRKTLKEKERRAPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSRGGLFSGGKGLFDDEEDESDLFKEAPKDWEAPACVHEGDADVFGATSALSLKEPPKAEQPTPGKSPHLPAPTGLFDDDDEDDDFFAASHNEPSQTQTDKNKAKSTADIFDDEGGDLFKEKAAALPEAAVNHTNGNKARAEKKVTLPSSKHLKLVSETKTQKSLFSDEEDSEDLFSSQNASKSKGASLLPSKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGAKVAKKQTSSLLTPSQEKTKLTEPSKKKASALLFSSDDEDQWSITDSQTTSAFDSRSKGELRDSGTAPDPEAKNTVKKTSLFEEDDEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDADSGGFLLASPSTSVPPAAKKKETVAQEPPLLFSDEEEREAPLGAKPVVENGGSAMGSSDVGRADAVEESGKEGPLAASAQAAVKHSDLFSSSPPSEKGAKGRTQTVLSLFDEEGDKTKDQSNVRAPRKEVGKNPDSDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFSGTKKTGLLVPSVGSLFEDDEDDDLFSSAKSQPLIPEKKRVVKKRPPCLLCQEPETS	561287	630056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_561361_561453_561577_562397_562563_571391_571455_573476_573651_578178_578273_579881_579944_581148_581197_581474_581586_582130_582219_584172_584242_585288_585408_586814_586873_588833_589014_590766_590901_592591_592679_597647_597750_599243_599376_601306_601480_606615_606719_614601_614758_617412_617596_621505_621635_621759_621841_622444_622569_624221_624396_626077_626687_627460_627639_629710
903790	contig_6446_pilon	+	4853	3	Intergenic	novelGene_149206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTAGGGGTGAAAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280266	308641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_280938_281002_283549_307005
903791	contig_6439_pilon	-	1825	7	Intergenic	novelGene_154240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	447.805544355533	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	5	469	403758	358939	TRUE	25	ATAACATTTTACTGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSSGQQQPPPPRRVTNVGSLLLTPQENESLFTFLGKKCVTMSSAVVQLYAADRNCMWSKKCSGVACLVKDNPQRSYFLRIFDIKASVRTSVREQQKCILVWMGNYCGNKSSIITLYIIVLEDIFIPLLEILVKLLLILPTKKKQKNSEKQLQTY	403762	348001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_349313_355055_355080_358917_359015_360536_360624_362311_362362_362716_362852_403641
903792	contig_15732_pilon	-	2512	10	Intergenic	novelGene_88851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	679	1014	343864	339863	TRUE	30	AGGGAAGGGCAGGAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFVWLDGSSYRPWWGERGSAAQEWLLRTILWIVSGNEHIQVIILVVRTLTVNLRWAVLRFTLIFFLCFIHLSSFCTQPASLPTSVMKCCILCGWENIQPLHSHVLAHYFC	349540	21128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_21484_53524_53924_97592_97748_110634_110756_126335_126489_153773_153880_184975_185175_339852_339916_343581_343875_348872
903793	contig_1725_pilon	+	2734	19	Intergenic	novelGene_24263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	505.67423515418	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	85	2010	201480	251163	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKWGPDYRNHGWGQCGNGRGSRGRELVHLRHEGR	201395	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_251064_251188_252129_252265_252711_252779_255366
903794	contig_13481_pilon	-	4004	3	Intergenic	novelGene_119428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_1	4	347	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2303	2776	896751	894741	FALSE	10	TAGTTTGAGCCTTTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGSLRPGVCPPASADETFEHHLQRLRKLIKKRSELYEAEERALRVMLEGEQEEERRRELEKKQRREKEKILLQKREIESKLFGDPDEFPLAHLLEPFRQYYLQAEHSLPALIQIRHDWDQYLVPSDHPKGNSVPQGWVLPPLPSNDIWATAIKLH	899053	893512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_894865_895947_896036_896489
903795	contig_11396_pilon	+	2487	2	Intergenic	novelGene_71346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTGTGGTACATAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488106	490646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_488215_488267
903796	contig_18511_pilon	+	2192	9	Intergenic	novelGene_126887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	279.886137563117	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	434	2116	47986	61308	FALSE	45	AGACAATTCACACTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLHFVNFYLNIQHHLLLKLHSKIPHFSFAGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	47552	61384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
903797	contig_18850_pilon	-	7878	12	Intergenic	novelGene_142438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	79	624	189818	186855	TRUE	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGFRGGEAEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEDEEEEEEDEELELELLERLFLLAGVGSWGRPSRTASFGAGAGLGTLFRATSGCGGRLEPSESLELEPEEEEDEEEEEDDEDELEDDEDEDELRRSFVGCREASAGACWAPAEAGSSPPSGWNTPGAGPESMLLWSPAEDVVLATVPEEKA	190198	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513_184082_184228_187171_187886_188087_189788_189842_190143
903798	contig_7753_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_41508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATTTTTAGATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1236843	1234933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1234900_1236800
903799	contig_19727_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_168989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56180	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032
903800	contig_18162_pilon	-	3610	3	Intergenic	novelGene_122288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2153	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAACCGATCAGTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
903801	contig_13481_pilon	-	10637	1	Intergenic	novelGene_119526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	479	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGGCTACTACTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459518	1448881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1448900_1459500
903802	scaffold_880_pilon	+	7188	2	Intergenic	novelGene_121480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCCCTGGTGGCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492886	500200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_497171_497296
903803	contig_6697_pilon	+	2919	1	Intergenic	novelGene_178521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168756	171675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6697_pilon_+_168800_171700
903804	contig_8864_pilon	+	4563	2	Intergenic	novelGene_135967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	280	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2470	2835	59209	59574	TRUE	45	AGGATTTCAGAGCATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEEYFLELPEAEHKRLIYRTLQEIRKEIKQNTEQAIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKMSDNSIESHRSRIEAMEVRISEMEDKALDTNLFEEK	56739	62034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_61221_61952
903805	scaffold_9100_pilon	+	1552	8	Intergenic	novelGene_83261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	510.694405207463	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	113	1006	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652022_653382_653449_654139
903806	contig_9982_pilon	+	2578	16	Intergenic	novelGene_55729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	120.396825354972	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	150	2546	307671	338345	FALSE	15	GGTTCTGGTTTTTATAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAASYNAASRKFLRSRVHGGFGLCGCLIVTGRKTELPAKPTGPLGDAVMGAVAVEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	307521	338377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
903807	contig_4924_pilon	-	2086	13	Intergenic	novelGene_84675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	1095.52940969195	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	110	880	155859	77324	TRUE	35	AAAGATTTAGAGATCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGHENSKTLS	252424	64819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_77273_77353_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
903808	contig_3956_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_14803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTCCCCCCAACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225290	1226110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1225300_1226100
903809	contig_19865_pilon	+	4166	5	Intergenic	novelGene_170160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_1	64.4995155020563	534	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1911	2762	67491	81377	FALSE	15	TGAACGTTGCCCGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHWWFGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPD	65580	82781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_67713_72650_72735_79191_79369_79927_80052_81132
903810	contig_9112_pilon	+	2173	4	Intergenic	novelGene_60202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	397.158518590359	245	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108365	114781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_110461_110528_111553_112128_113625
903811	contig_5033_pilon	-	1735	7	Intergenic	novelGene_28914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1034.21442274908	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	142	591	464569	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	464710	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450144_450243_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547
903812	contig_2768_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_57503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1378	1683	747501	747196	NA	30	GAGGCCTCATCTTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKYYSLHQTESSTTRWCLATTTNCSDKDHKTGSWTELEKNVEQNFNSQKKKKDQTYWSDRDWRNLKSMAPGHPFSSVMKSLLRFTLQPKIRQAHKTKQD	748878	746990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_747000_748900
903813	contig_10013_pilon	-	4025	19	Intergenic	novelGene_125040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2873	3208	210268	205187	TRUE	20	GGTCCTAGAAGCAGGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWILTLLLLPGDPAAERAQAALHPGPSVTSLCPASAILALRQELEPGDVGLGCPRAGRQASPLPSHVIGLHVVLFHPLQHWGVQTLNSWTGHLQSLRELQGADLVRGHRN	268104	161568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_161797_188437_188575_203145_203409_204112_204264_205148_205264_206158_206219_207531_207610_209961_210063_210248_210392_249258_249402_250647_250760_250919_251061_256718_256969_257945_258073_260051_260171_261229_261478_263046_263121_264684_266192_268076
903814	contig_6842_pilon	+	4063	2	Intergenic	novelGene_130741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	0	151	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1515	1817	1254703	1267295	FALSE	25	AACCACCCAGATGGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGHEWIRNMNVHSLPHGHHQPFYNVLVEDGSCRYAAQENLEYNVEPQEISHPDVGRYFSEFTGTHYIPNAELEVRYPEDLEFVYETVQNIYSAKKENIE	1253188	1269541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1254818_1267107
903816	scaffold_19766_pilon	-	3487	1	Intergenic	novelGene_34346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCCCAGTGATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602652	599165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_599200_602700
903817	contig_10377_pilon	-	6042	6	Intergenic	novelGene_115406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	123	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATGAAATGGTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302284	231020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_234605_267573_267967_269074_269311_280182_280747_282853_282981_301146
903819	contig_10023_pilon	-	2448	6	Intergenic	novelGene_123475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_3	113.795254734106	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1385	1780	144386	132633	FALSE	25	AGTCCGAGGAGCAAGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMYLNMLRTCEGYNEIIFPHCACDSRRKGHVITAISITHFKLHACTEEGQLENQVIAFEWDEMQRWDTDEEGMAFCFEYARGEKKPRWVKIFTPYFNYMHECFERVFCELKWRKENIFQMARSQQRDVAT	151773	131964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_132681_136935_136996_137390_137520_137859_138010_144377_144468_150470
903820	contig_15516_pilon	+	2672	3	Intergenic	novelGene_177466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	426	752	38404	38730	FALSE	35	AATTCATTTATTTTAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAVLFTTAKRWKQPKCVLTDEWINKLWYTHIMEYYATIKNNDDSVKHLTTWMNLEGIMLSEISQSQKDKYCMGPLLLKTQEKVYTQKKTIFDGYKEGKRWRREITN	33974	40650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15516_pilon_+_34028_35933_36230_38327
903822	contig_854_pilon	+	1272	7	Intergenic	novelGene_36215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	25	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	120	977	543600	563502	FALSE	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSILMFSPSQGKEGEPQDPIRHPHVTAVIASCLVWQHLPIYSSPTQRLNLLWKLGARWLQATTCIPSGTGLSPPPEAVCFNVAGPASLNVILSTDLK	543480	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562396_563216
903823	contig_5889_pilon	-	4540	3	Intergenic	novelGene_133695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1854	2192	379126	378788	TRUE	0	TCGCCTCCTCCCTTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVTEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEENLRIKWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLNNC	380979	279725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_281745_282292_282396_378561
903824	contig_5686_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_45390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATATGTTTTACTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163805	166359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_163800_166400
903825	contig_19185_pilon	+	9389	1	Intergenic	novelGene_163667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	825	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGTGCAGTGGTTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168473	177862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_168500_177900
903826	contig_6102_pilon	-	2504	11	Intergenic	novelGene_32404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_10	80.415483583698	239	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	240	1841	1824110	1817503	FALSE	15	CCTACAATGTTGTTGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLGRRALCALVLLLACTSLGLLYASTRSSPGLQAPSALWAPPQGPPRPQLPALTPEPRYAHIPVKIKEQVVGLLAQNNCSCESSGRGLSLLFQRQVQAFDFTKAFDPQELRAASAAREQEFQAFLSRSRSPTDQLLIAPANSPLQYPLQGVEVQPLRSILVPGLSLQAASGRELYQVNLTASLGTWDVAGEVTGVTLTGEGQPDLTLTSPGLDQLNRQLQLVTYNSRSYQANTADTVRFSTEGHEAAFTIRIRHPPNPRLYPPGALPQGAQYDISALVTIATKTFLRYDRLRVLIASIRRFYPTVTVVIADDSEKPELVSGPHIEHYVMPFGKGWFAGRNLAVSQVTTKYVLWVDDDFVFTARTRLERLVDVLERTPLDLVGGAVREISGFATTFRQLLTVEPGAPGRGNCLRQRRGFHHELVGFPGCVVTDGVVNFFLARTDKVREVGFDPRLSRVAHLEFFLDGLGSLQVGSCSDVVVDHASKVKLPWVSRDAMSEAYARYRYPGSLDESQVAKHRLLFFKHRLQCVTTE	1824949	1816839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1817721_1818314_1818556_1818782_1818924_1819405_1819597_1819737_1819837_1821722_1821904_1822045_1822087_1822948_1823056_1823180_1823346_1823892_1824112_1824711
903827	contig_7171_pilon	-	6406	8	Intergenic	novelGene_101361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_7	16.8595639907793	572	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	113	466	1360418	1359920	TRUE	15	CCAGGCCTTTCTTCTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILCPNGGAGGGFSRTPGAGDAAVLAPTQPGLTFSLRPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLQVTSGPEHILHVQINWPEKRNAMNRAFWSEMVECFNKISEDASCRAVVVSGEGRTFTSGTKCSFHSHPHQSLPLLEIEQLLTTFIFFIKGLI	1360965	1350864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1360113_1360257_1360465_1360899
903828	contig_10134_pilon	-	2600	4	Intergenic	novelGene_16219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	489.258849917119	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39628	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32517_32684_33627_34922_35178_38558
903829	contig_6550_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_110656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCTGAAGAGCTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18974	20241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6550_pilon_+_19000_20200
903831	contig_9423_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_99193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAAGGGTGTCTGGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141374	143500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_141400_143500
903832	contig_14405_pilon	-	4217	2	Intergenic	novelGene_85631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445991	385720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_387725_443778
903833	contig_34_pilon	-	4222	2	Intergenic	novelGene_40032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGTAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239348	216290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_216916_235751
903834	contig_1535_pilon	-	1927	7	Intergenic	novelGene_127221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_6	617.737471207092	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	307	1278	54886	40062	FALSE	55	AATATATATATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEMPEDMEQEEVNVPSRRVLITGATGLLGRAVYKEFKQNNWHAVGCGFRRARPKFEQVNLLDSDAVHHIIHDFQPHVIVHCAAERRPDIVENQPDAASQLNVEASRNLAKEAAAIGAFLIYISSDYVFDGTNPPYREEDIPNPLNLYGKTKLEGEKAVLENNLGAAVLRIPVLYGEVERLEESAVTIMFDKVQFSNKSANMDHWQQRFPTHVKDVATVCRQLSEKRMLDPSIKGTFHWSGSEQMTKYEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPRNAQLDCSRLETLGIGQRTSFRIGIKESLWPFLIDKRWRQTVFH	55192	39412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40233_40592_40707_41658_41853_44504_44658_45799_45915_47293_47489_54856
903835	contig_10437_pilon	+	5765	22	Intergenic	novelGene_38232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	158.929639732454	343	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2295	146	2440	349799	392342	FALSE	30	TACCCAGCAGCAGGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGTYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGDSSVGPVSMNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPTCTDMSNICQPTEFISRHNIEGTFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTTVKNSSQEPRSALSGTIQRPQLGPTANLSLEMGSGQLAPRQQQQTELEVVPGRDGLAGYNHPQVSVQPVTAPGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYSNISADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPSTPRPAENFRNSGLAPSVTIVQSSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPPWTPSTRPGFSAQQVASQATAKTRSPQFAVGNFQAPSSFSPMSLPGAPTTSPGAAYPSLTNHGSSFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWSQWQGQQPHQRSSSGEHHVQQPTAQQAGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPSFSE	318785	395667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_321315_321425_349796_349909_355625_355671_360481_360527_366332_366547_369227_369442_371770_371874_373765_373832_374209_374296_375720_375798_376665_376801_379153_379229_380474_380627_387220_387332_387492_387563_387716_387841_388029_388133_388508_388657_389963_390124_390570_390738_392252
903836	contig_14445_pilon	-	3424	1	Intergenic	novelGene_137377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTTTGCACATTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346484	343060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_343100_346500
903837	contig_7992_pilon	+	3131	11	Intergenic	novelGene_115536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	83.3324066615143	3	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	427	1395	606395	645332	FALSE	40	TTTTATATAGGAATAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGELPPNINIKEPRWDQSTFVGRASHFFTVTDPRNILLSKKQLENARKTIHDYRQGIVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRSTPAVLFWQWINQSFNAIVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVISRVLMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPVQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEADLQAKIRETHPELRRVYFNKGL	582544	647068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_582962_606385_606559_609963_610135_611209_611309_614478_614555_615800_615887_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235
903838	contig_6230_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_102089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCCACCTGCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117092	119987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_117100_120000
903839	contig_7963_pilon	+	2377	10	Intergenic	novelGene_58547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	165.454107620195	27	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	880	1725	247452	252056	TRUE	10	CAGTGGTTTCTAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSFHICTPSGLQHRGRRGWGPVIRGSATGSGLGPSIDPETTRTHPG	246089	253518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250432_251647_251683_251956_252094_252903
903840	contig_7887_pilon	+	2512	2	Intergenic	novelGene_124843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	0	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2409	102	2510	20087	64736	FALSE	35	TACCCACAAACTATCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRNTAMLGLGSDSEGFSRKSPSAISTGTLVSKREVELENNTEEEEDLRKWNRERNLEAGKDDGLTDAQQQFSVKETNFSEGNLKLKIGLQAKRTKKPPKNLENYVCRPAIKTTIKHPRKALKSGKMTDEKNEHCASKRDPSKLYKKAGDVAAIQCQSEESIHLHSQGENNPLSKKLSPVHSEMADYINATPSTLVGGRDPDLKDRALLNGGTSVTEKLAQLIATCPPSKSSKTKPKKLGTGTTAGLVSKDLIRKAGIGSVAGIIHKDLIKKPAISTAVGLVTKDPGKKPVFNATVGLVSKDSVKKLGSGTTAVFINKDLGKKTGTITTVGLVSKDSGKKLGIGIVPGLVNKESGKKLGLGTVVGLVNKDLGKKLGSAVGLVAKDCAKKIVASSTMGLVNKDIGKKLVTCPMAGLVSKEAINLKAEALLPTQEPLKASCSTNISSHENQELSESLKDNATSKTFEKNVIRQSKESILEKFSVRKEIINLEKEVFNEGTCIQQDSFSSSERGSYEISKHEKQPPVYCTSPDFHMGGASDASTAKSPFSAVGESNLPSPSPTVSVNPLSRNPPETSSQLANPLLLSPTTELMEEISGCVGKNQFTSESAHLNIGHRSVGHSMNIDCKGIDKELSDSKTTHIDIPRISSSLGKKPSLTSESSIHTITPSVVNFTSLFSNKPFLKLGAVTASDKHCQVAESLSTNLQSKPLKKRKGRKPRWTKVVARSTCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSNSEPAKFMKNIGASSFVDHDFLKRRLPKLSKSTAPSLALLTDSEKPSHKSF	19985	64738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_20507_62747
903841	contig_14333_pilon	-	1808	4	Intergenic	novelGene_49145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	177.60067567439	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	68	580	446908	441008	FALSE	55	CTTTAAAAAAAAAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGGCPVSYLLLCGQAALLLGNLLLLHCVSRSHSQNTTYEPEFTSSGTAHPEVSAGTQSWKYVDPQSPVILCSYLPDEFIECEDPVDHVGNATASQELGYGCLKFGGQAYSDVEHTSVQCRALEGIECADPRTFLRENKPCIKKKITSLESYMGTFGRYSETQICFAKN	446975	439779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_441090_443131_443248_445731_445820_446681
903843	contig_1154_pilon	-	2741	16	Intergenic	novelGene_87056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_15	192.430997733964	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	275	2296	190299	106481	FALSE	20	ATAATTTTTCAGCTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWQCSLHVTDSGCDSVTDTETEDEKALPYSKQQHLPLENSPGNLMVVQPDRIRCGAETMVYIIVKCKLDERVTTEAEFSPENSPSRRVEAKLENEYTISVKAPNLSPGNVSLKVYSGDLVVCETTISYYTDMEEIGNLLSSAANPVEFMCQAFKIVPYSTETLDKLLTESLKNNIPANGLHLFGINQLEEENMMTNQRDEELPTLLHFSAKYGLKNLTALLLTCPGALQAYSVANKYGHYPNTIAEKHGFRDLRQFIDEYVETVDMLKSHIKEELMQGEEADAVYESMAYLSTDLLMKCSLNPGCDEELYESMAAFAPDASEDLYVEMLQASTSNPISGDSFSRTTKDSMIRKFLEGNSVGMANSERKLHRLSREEDVYHIVDDDDTLSVDMASRPPVPVPRPEASPPGAHQLPDNEPYISKVFAEKSQERPGNIYVSSESIRKEPPVRPWRDRPQSSVYDPFAGMKTPGQRQLITLQEQVKLGIVNVEEAVLHFKEWQLNQKKRSESFRFQQENLKRLRDSITRRQREKQKSGKQTDLEITVPIRHSQHLPGKVEYAVYESGPRKSVFPPRTELRRGDWKTDSTSSTASSASNRSSTRSLLSVSSGMEGDNEDNEVPEVTRSRSPGPHQVDGTPTVPLERPPRVPPRAASQRPPTRETFHPPPPVPPRGR	190573	106035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_106539_118505_118625_119813_119885_124948_125105_133770_133844_137278_137485_140501_140568_141386_141585_143945_144042_161832_162023_164788_164986_166867_167001_167130_167274_169518_169664_172218_172356_190265
903844	scaffold_13505_pilon	+	8697	6	Intergenic	novelGene_111600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4771	5283	659510	660022	TRUE	0	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	652843	663815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_655835_656194_660929_661255_661942_661993
903845	contig_4626_pilon	+	1744	6	Intergenic	novelGene_158820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	19.2603219080056	209	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	5	484	45244	85382	FALSE	15	CACAGTTTCGGTTTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASLDRVKVLVLGDSGVGKSSLVHLLCQNQVLGNPSWTVGCSVDVRVHDYREGTPEEKTYYIELWDVGGSVGSASSVKSTRAVFYKIPLLVIGTKLDQIHETKRHEVLTRIAFLAEDFNAEEINLVIEKRYFLREGNQIPGFPDRKRFGGGTFKSLHYD	45239	86642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_45290_50119_50212_66617_66736_77328_77448_84375_84415_85316
903846	contig_10500_pilon	-	3512	3	Intergenic	novelGene_41292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1657	junction_2	47	103	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	190	495	1640040	1636930	TRUE	85	CAAAAAAATAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGEY	1640229	1632066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1633231_1635076_1637067_1639871
903847	contig_4782_pilon	-	6536	3	Intergenic	novelGene_73600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	290	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACTTGCACTTTATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83474	69933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_76219_77894_78063_83391
903848	contig_13937_pilon	+	6089	8	Intergenic	novelGene_167361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	81.2657520052549	529	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	57	965	99797	116008	TRUE	30	CTCTGTGCTTAAAATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDNEDNSNDGTQPPKRRRMGSGDSSRSCETSSQDLGFSYYPAENLIEYKWPPDETGEYYMLQEQVSEYLGVTSFKRKYPGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYKEYSQQQNTQKVEASKVPEYIKKAARKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQGKYRVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSDGDSDDAEDGRGDEKRKSKGASDSSSGNASDGESPPHPHGPEDSPQGRPKSKDKAATPRKDGPKRSVLSKSVPGYKVEEKSP	99740	122527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_99850_109489_109621_111226_111361_111463_111608_112212_112323_115425_115580_115825_120938_122332
903849	contig_15859_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_50189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATGGAAAAATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328519	325985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_326000_328500
903850	contig_3382_pilon	+	2481	6	Intergenic	novelGene_124161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_3	208.758233370567	25	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	43	2052	931459	962620	FALSE	70	AAACAACCAACCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSAKLRPPSGNGVAMADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCV	931416	963049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492
903851	contig_12951_pilon	+	1639	9	Intergenic	novelGene_68192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.571035500638	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	147	1331	755258	836145	FALSE	65	AAAAAATAGAATTACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEFEQIDKAASDFPCKVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRVCFH	755111	836453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755298_813298_813374_816856_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833506_833656_835934
903852	contig_15327_pilon	+	2237	9	Intergenic	novelGene_70412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	201.315323249374	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1	378	25258	30624	TRUE	25	TGAAAAGTACGCCCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGAAATQDGEAPGRSPPCSQSYDLTGKVGDASGRLRRRQKLFPAPIQRRGLPVRDLHSHRRHRLQEQGGDRGWCEGEAAAQSFHPASSCPFLHPFLDLGHRGAGALPQCHACLLPRCPGPAPAV	25257	34372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_25346_28757_28869_29900_29943_30392_30511_30605_30659_31691_31758_32351_32409_32488_32566_32747
903853	contig_6102_pilon	-	2327	12	Intergenic	novelGene_32095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	200.886876599948	15	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	1130	2326	796401	792042	FALSE	55	TGAGTAAAATTAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEDKLPLEDSPVISALDCTSLNNTTAFSLLADDSQTSASIFASPTSPPVLGESVLQEELVRLGVYRKKESRGPTDPDNSFDLNNGSDTEQEEMEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAK	814732	792040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_795644_795969_796030_796226_796448_797091_797278_798168_798763_800356_800495_814567
903854	contig_2798_pilon	-	3243	5	Intergenic	novelGene_120021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	732.861173756667	2	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	548	1480	116665	115733	FALSE	20	ATTAATGTTCTTTTATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193422	113969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120448_120595_151071_151194_170381_170519_193294
903855	contig_9682_pilon	-	2114	2	Intergenic	novelGene_125304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	0	164	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTAATAGTGGGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210271	201370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_203307_210093
903856	contig_12180_pilon	+	1873	13	Intergenic	novelGene_160354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_5	43.5229026554475	27	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1692	180	1871	130429	167517	FALSE	30	GTATTATGTGAAAACGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDIEDRLSPSPWQEKRGEIIASEDAVTPSAVTPSAASASSRPFIPVTDDPGAASIIAETMTKTKEDVESQNKASGPEPQYLDEFTSLLVADDTRVLVDLLKLSVCSRAGDRGKDVLSAVLSGMGTAYPQVADMLLELCVTELEDVATDSQSGRLSSQPVVVESSHPYTDDTSTSGTVKIPGAEGLRVEFDRQCSTERRHDPLTIMDGVNRIVSVRSGREWSDWSSELRIPGDELKWKFISDGSVNGWGWRFTVYPIMPAAGPKDLLSDRCILSCPSMDLVTCLLDFRLSLASHRSIVPRLAASLAACAQLSALAASHRMWALQRLRKLLTTEFGQSININRLLGDHDGETRALSFTGSALAALVKGLPEALQRQFEYEDPIVRGGKQLLHSPFFKVLVALACDLELDTLPCCAETHKWAWFRRYCMASRVAVALDKRTPLPRLFLEEVAKKIRELMADSENLDVLHESHDIFKREQDEQLVQWMNRRPDDWTLSAGGSGTIYGWGHNHRGQLGGIEGAKVKVPTPCEALAALRPVQLIGGEQTLFAVTADGKLYATGYGAGGRLGIGGTESVSTPTLLESIQHVFIKKVAVNSGGKHCLALSSEGEVYSWGEAEDGKLGHGNR	129705	167519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_+_129762_130305_130447_140607_140800_143824_143979_157495_157604_159047_159180_159604_159764_159847_159967_160750_160877_161346_161503_161893_162010_162108_162308_167304
903857	contig_12603_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_105822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAACACTCAAAAATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784706	783156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_783200_784700
903859	contig_8120_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_159719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTGGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57597	56221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8120_pilon_-_56200_57600
903860	contig_12619_pilon	-	3814	2	Intergenic	novelGene_73578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	906	1496	899662	899072	TRUE	50	GCACTGCAAAATGACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGPAILDSYQRPTNGLREGSFTELPAGDRKTGNQRYMLSHPIPFFTPTRPPLLPAATLYWLGSTGFTPVSLGFHPHAMAGSLSAICWLLCVTFFRFFRFLPYLSPPPPPFSQIPGSMCHLCFFLKGCETPFKCETASWPVLPCWWDPGAFFVCLFVLNCLFSFSCLELEAHSSQAVLCSLGPTPSDCMDAQSDP	900567	896129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_896777_897400
903861	contig_10011_pilon	+	3782	1	Intergenic	novelGene_68051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGAAGGTGTGAAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196652	200434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_196700_200400
903862	contig_16804_pilon	-	4657	8	Intergenic	novelGene_167283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.2617446653013	231	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	324	2645	20463	2250	TRUE	30	TTGAGTAAGGATATTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKTSLSANQQLIDLLENKSLESKLILNHSDEEEEEEGNEEENLDIPADIKKPEVLHLTESTTTIPREKNRGFHVDEAKKGSLEAVSLSTGPQRAFPPAACQCHCRHMERWKASIENDDFEVEKPKGYNPDLYTSRANNITVESEPAAIPSEPFKVKHELLKEPWKESAEGKRGFPIYPLERSELKSEDMNFENKDDYDRNGHCHSQDYPGRYSEEESKSSTSGIAGDVTDDLQEVRAPTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTLPTPVLASSAGSRNSLSEPEASEHGFSNGAALVAQIQKESFLAPVFTKDEQHHRHPYEFEVERDAKARSLEQFSATHGHPPIVLNGWHGESAIDLSCTSEGSPGATSPFPVSASTPKIGTISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFLKEQTLQAGILEVHEDPGQATLSTTHPEGPVPATSAPETVTAASSQAEKAIPSKSLLDWLRQQSDYSLEVPGFGTNFSDKPKQRRPRCKEPGKLDINFLNGEERVPAVPKEPGPRGFLPENKFNHSLTEPVLRDAGPRRRGRRPRSELLKAPAIVTDSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQNMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPTGEDVKSTLSMLPMMLPGMATVPQMFGVGGLLNTPMTTTCTSPAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSRDVKTDTLAEDKPGPSPFSDQSEPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPTLQQARHSEFVGLESQKRKKKKTKGDNPHPHPEPAPRSEREPSSNQNCTEASAPLPPDREHVAQAGDGGPKDSNNNTN	20786	44	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_1784_1976_3147_10676_10797_12070_12263_14536_14990_15984_16192_16602_16755_20162
903863	contig_12677_pilon	-	660	1	Intergenic	novelGene_110685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_700
903864	contig_12852_pilon	-	3504	2	Intergenic	novelGene_141438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	308	730	326430	326008	FALSE	35	ATCCCTGAAAGCATCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYTGLSCLVILGDDLSQVNKEACLARLRALQLEDGSFYAVPEGSENDIRFVYCASCICYTLNNWSGMDMKKAIDYIRRSISYDNGLAQGAEPESHGGSTFCGIASLGLMGKLEEVFSEKEKQDKEMMYNEATEWLSWKT	326805	323233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_326473_326540
903865	contig_3223_pilon	-	5712	5	Intergenic	novelGene_151825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	418	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	808	1293	761474	580575	TRUE	40	AGGGAATCAGAGTAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEETLRIMWYPIKSKNLEVIRGPEQGERTENTERIIEDLVTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIHKILKGKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDK	762281	542098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_-_543115_543192_544605_575072_576534_580044_580892_761305
903866	contig_13901_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_146656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239278	240725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_239300_240700
903867	contig_10600_pilon	-	2967	22	Intergenic	novelGene_169861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_21	137.944745584843	297	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	223	2553	135833	86861	FALSE	25	TTATGCAATTTTCCATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA	163051	86446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_86942_87520_87635_88303_88410_88764_88848_88926_88975_92370_92464_101648_101781_102118_102196_102860_102979_103522_103655_103965_104015_108114_108222_108297_108406_111698_111830_114484_114648_121481_121646_122574_122666_122989_123041_124151_124320_125029_125205_135693_135991_162986
903868	contig_9888_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_162256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	145	450	32105	31800	NA	55	TTCAAATTCATCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLKTEGSVVGKYGLGDRNDVGDRMIEFCMTYDLFIANSFFLQHNGNYTCGPCWMEYTVIKWSTFVGRDNGEAQYHKSEQGQELTVEQAISCSYGSSSWS	32249	29966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_30000_32200
903870	contig_8386_pilon	-	4496	7	Intergenic	novelGene_82212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	87.1902453769278	34	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	860	1477	31400	19750	FALSE	50	TTAAGTGAAATACTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFK	35410	16730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573
903871	scaffold_4805_pilon	-	2066	11	Intergenic	novelGene_161015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_4	75.8340293008357	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	59	1501	533627	385501	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGAGGVRPGRGALVAEVMASWAALSPSIVEYFEGEDFYRCGYCKNESGSLSRGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRVVRSSPPSSQFKATFQESYQIYKRYQMIVHKDPPDKPTVSQVSGPRAVLTCKRNFPLQLLSSSQDSFAAHLWREIAFTKQLHEKASQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKGQYRPSDLLCPETYVWVPIEQCLPLLENSKYCRFNQDPEAVDEGRSKDPDRLQVFYKKAIMPYGVYKKRQRDPSEEATVLQYARLVGQRCAESMLLFRS	533685	384935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_385680_406635_406757_469654_469755_495372_495406_512413_512605_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_533521
903872	contig_8571_pilon	-	1142	5	Intergenic	novelGene_169165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	59.3085154088348	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	41	667	393626	379028	FALSE	70	AACTTAAAAAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVPSSATQFGAHEQTHAMYACPKLPYNKETSPSFYFAISTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPTAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQYKPTTNSSCKAALEEPKGQIPSSLLLLLPTGSTEN	393666	378552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_379136_382304_382533_383145_383292_389502_389557_393535
903873	contig_5999_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_45640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCACGTCTTGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217815	218808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_217800_218800
903874	contig_11525_pilon	+	950	2	Intergenic	novelGene_171080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGGAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59906	60908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_60746_60797
903875	contig_13292_pilon	+	2058	2	Intergenic	novelGene_142971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCATGCTTGGGAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490122	492354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_491558_491731
903876	contig_12411_pilon	-	2787	4	Intergenic	novelGene_145675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2453	2752	263056	261934	FALSE	25	TTAGGGGACCTCTGCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLHVCARRRGRFQATQHHLARIGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEEKPQDPISATAQTGKQLHTRKELHSPSGRSKDGARSQLHEAAFLYPLFAGLR	266864	261898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_261982_262804_264284_264426_264865_266077
903877	contig_8487_pilon	-	4232	5	Intergenic	novelGene_111905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	73.7156699759284	323	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	1	1479	54973	39000	TRUE	20	TGTCTGTGCTAAATCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATEEGWCLCKLLRFFYSLFFPGLIVSGTLCVCLVIFLWGIRLLLQRKKKSATTSKNGKNQMVIAFFHPYCNAGGGGERVLWCALRALQKKYPEAVYVVYTGDVNVSGDQILEGAFRRFNVRLIHPVKFVFLRKRYLVEDSLYPHFTLLGQSLGSMFLGWEALMQCVPDVYIDSMGYAFTLPLFKYVGGCRVGSYVHYPTISTDMFSVVKNQNAGFNNAGFITRNPFLSKVKLIYYYWFGFMYGLAGSCSDVVMVNSSWTLAHILSLWKAGNCTSIVYPPCDVQTFLDLPLHEKKKTPGHLLVSIGQFRPEKNHPLQIRAFAKLLNKKGAESLPSLKLVLIGGCRNKDDELRVNQLRKLSEDLGVQDHVEFKINIPFEELKKYLSEATIGLHTMWNEHFGIGIVECMAAGTIILAHKSGGPKLDIVVPYEGDVTGFLAESEEGYADMMAQILSMSAEKRLQIRKSARASVLRFSDQEFEVTFLLSVEKLFK	54973	36135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_37002_37112_39272_43299_44232_48572_48804_54929
903878	contig_4961_pilon	+	5155	4	Intergenic	novelGene_178799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	330	665	316209	316544	TRUE	20	TGCTCGCAGCTGAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNISWFRILLRLALWPNMWSILENVPSMLENKVYLAAVRWRVRYMSMRSSWLIVAFRSSMSLLSFFLDVLSFTKSGMWKSLTTIVELSTSLFSAARVCFMYFGAPSLGV	315879	382648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4961_pilon_+_317158_349599_349610_378612_378947_379115
903879	contig_990_pilon	-	962	1	Intergenic	novelGene_76004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATATGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216325	215363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_215400_216300
903880	contig_11846_pilon	+	6404	1	Intergenic	novelGene_105974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTCATGCAAACCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310859	317263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_310900_317300
903881	contig_6497_pilon	+	1110	1	Intergenic	novelGene_35578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAGCTTTGAAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206203	207313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_206200_207300
903882	contig_1406_pilon	+	1304	8	Intergenic	novelGene_25609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	512.075289426092	690	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGACGTGTTCACCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2214516	2232121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2214579_2218160_2218226_2219053_2219192_2225347_2225454_2226996_2227086_2228828_2228877_2229815_2230056_2231565
903883	contig_567_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_34014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATGAAAATAGTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634560	636699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_634600_636700
903884	contig_5023_pilon	+	4546	1	Intergenic	novelGene_7306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAGAAGATACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590793	595339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_590800_595300
903885	contig_8647_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_178119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAACTGCCCCCATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971104	972342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_971100_972300
903886	contig_5936_pilon	+	1675	2	Intergenic	novelGene_53551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATCATTAAGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98575	100673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_99078_99500
903888	contig_3380_pilon	-	5060	2	Intergenic	novelGene_60099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATTACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393538	388346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_392144_392275
903889	contig_14773_pilon	-	6381	1	Intergenic	novelGene_174758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTGAAAAGATTCACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12200	5819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_-_5800_12200
903890	contig_14549_pilon	-	3275	2	Intergenic	novelGene_176217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2078	2437	2823	2464	FALSE	30	TGATGCTACTTACCAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLFVNLFPFQGKENGSGCLMGSTSSPGDSEIAEASRTQCRAGREEVNGREVFPKWVVFFLIPTKGHTHVLIFSHLGAAFHWFRVSKQNLCCWISLDVETASRASEWSCMPASLRNLN	4981	1625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14549_pilon_-_4462_4542
903891	contig_4924_pilon	-	1280	8	Intergenic	novelGene_84723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	515	junction_3	1209.84127817138	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	22	1215	252576	114265	FALSE	65	CAAGGAAAAGATGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPGKKCCSSLSDDAGRAVHILTAVESILTHSNPIRQSRVSEAVNLYGSRLPHLSPVEWLVDSNYQPFSQQPSTLTTAPLRLHEQCICLDKGRCVQDRDRKLFLGI	252597	114199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
903892	contig_20004_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_167527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGTATTAAAAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28682	26970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_-_27000_28700
903893	contig_13901_pilon	-	5274	1	Intergenic	novelGene_146654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	378	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238163	232889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_232900_238200
903894	contig_6958_pilon	+	9513	21	Intergenic	novelGene_70016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	94.1973858448312	620	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1980	5943	393	6335	783058	851948	FALSE	65	AAAAGAAAAAAAACTTAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWLGGLGSGLGQSLGQVGGSLASLTGQISNFTKDMLMDGTEEVEELPNTRRKEIEAIHAILRSENERLKKVCTDLEEKHEASELQIKQQSTSYRNQLQQKEVEISHLKARQIALQEQLLKLQSATQSVPSGAVQGPSTTALPSFGYGVSHHASAFRDDDMDFGDIISSQQEINRLSNEVSRLESEVGHWRHIAQKTTAQGADSSDQSEICKLQSTIKELKQNRSQDIDVHQHEMSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSDAENEIMKLKSLNQDSSLTEDNLKLEKHVQALEKENSLLSQEKEELHISLLKLNSEYEVIKSTATRDMTLDSELNDLRLNLEAKEQELNQSITENKILVAELEELDKQNQEATKHMILMKDQLSKQQNEGDNMISKLKQDIHDEKKRVHQLEDDKMNITKELGVQREKLIQSELALNDLHLTKQKLEDKIEDLVDQLNKLQKNNLNIQKENFELKEHIRQNEEELSSVRNELTQSLGQDSNSNLKDDLLKEREAEVRNLKQDLSEMEQINETLEKVAFDLKMENEKLVLACEDVRHQLEESLADKSQISLEKDTIVEALKLEKGQLEAELCQAEKRLLEKANKYEQTIEELTNARNLNSSALQLEHEHLIKLSQEKDFEISELKKNIEQVNADHQVSKEVLSSSLEEQKQLTQLIKEKEMFIEKLQGRSSELQDELDKYTQALRKSEISRQTIEEKDRSLASMKEENNHLKEELERLREQQSRATPVAEPKSLDVITELESEVSRLNIIKGDLEEEIKHYQKITEDQNQSEMQLLQSVQEQKKEMDEFKYQHEQMNVTHTQLFLEKDEEIKSLQKTVEQIKTQLHEERQDIQTENSDIFQETKVQSLNIENGSEKHDLSKAETERLVKGIKERELEIKLLNEKNISLTKQIDQLSKDEVGKLTQIIQQKDLEIQALHARISSASYTQDVVYLQQQLQTYAMEREQVLAVLSEKTRENSHLKTEYHKMMDIVAAKEAALIKLQDENKKLSARFESSSQDMFRETVQNLSRIIREKDIEIDALSQKCQTLLTVLQTSSTENAVGSVNSNQFEELLQERDKLKQQVKKMEEWKQQVMTTVQNMQHESAQLQEELHQLQAQVSVDSDNNSKLQVDYTGLIQSYEQNETKLKNFGQELAQVQHSIGQLCNTKDLLLGKLDVISPQLSSGSSLSSPSAEPLRASKSDQLSESSKLLQQEIEELRKSLQEKDATIRTLQENNHRLSDSIAATSELGRREHEQTDSEIKQIKEKQDVLQKLLKEKDLLIKAKSDQLLSLNENFTNKANENELLRQAVTNLKERILILEMDICKLKEENEKIIDASRGKETEYQALQETNMKFSMMLREKEFENHTMKEKALAFEQLLKEKEQGNTGELNQLLNAVKSMQEKTVLFQQERDQVMLALKQKQMENSALQNEVQHLRDKELRLNQELERLRNHLLESEDSYTREALAAEDREAKLRKKVTALEEKLVSSSNAMENASHQASVQVESLQEQLNVVSRQRDETALQLSVSQEQVKQYALSLANLQMVLEHFQQEEKAMYSAELEKQKQLVAEWKKKAENVEGKLISLQERLDEANAALDSASRLTEQLDLKEEQIEELKKHNELQKEMLDDIQKKLMNLVNSTEGRVDKVLMRNLFVGHFHTPKSQRHEVLRLMGSILGIKREEMEQLLNEDQGGVTRWMTGWLGGGSKSVPNTPLRPNQPSVFNSSFSELFVKFLETESHPSVPPPKLSVHDMKPLDSPGMRKLATNEPESFKEATGSRTSRRTDVNPFLAPRSAAVPLVNPAGLGTGGSGHLLLKPISDVLPTFTPLPVSPDNSAGVVLKDLLKQ	782665	855126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_786736_786796_792713_792825_797530_797810_799938_800008_801481_801648_802350_802717_805686_805728_806275_806363_808034_808248_808852_811883_814160_814302_814837_815032_817770_817935_820207_820312_832175_832276_846518_846601_847331_847447_847888_848006_849084_849230_851727
903895	contig_16622_pilon	-	2263	5	Intergenic	novelGene_48474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	831	junction_4	1195.96893249783	10	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	189	617	115540	113571	FALSE	55	AAAACAAAAAACTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAVWWWCFWRTDQRQGKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQGILLGGLRST	121428	111924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
903896	contig_15002_pilon	+	2427	3	Intergenic	novelGene_162426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	1.5	114	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	695	1375	22993	23673	FALSE	35	TTCAATGATAATTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYKCSDCGKVFSRKDTFIQHQRIHTGERPYECSECGKAFSRKDNLVQHKRIHTGEMPYKCSECGRYFSHHSNLTVHQRVHTGARPYECNECGKVFKHKSSLVQHESTHTGESPYGCSECGKSFSHKYILIKHQKIHTEIRPYECIECGKLFSQSSDLMAHQRVHTGERPFVCSECGKDFIRSSHLVRHKRVHTGERPYECSECGKTYSLSSHLIRHQKVHTVGGL	16514	24725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15002_pilon_+_16623_16786_16895_22514
903897	contig_9706_pilon	+	3140	17	Intergenic	novelGene_20896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	676.212845559739	53	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	317	1759	231608	555646	FALSE	15	TTCCTTTGCATTTTGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVK	91218	557027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357503_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500
903898	scaffold_17542_pilon	-	4730	5	Intergenic	novelGene_139229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3180	3587	399406	398999	TRUE	45	TAATAACACATGTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKGLELENQKRRTHSTFLKLRELKEKFKSQVAVLKDFMGKILNDAGSIKRRWKEYTEPLYQKELVKVQPFQKVAYDQELMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDGIPIEMFQQTDAALEVLTRLCQEIWNCSLCCG	451164	349099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_349482_365764_365986_366051_366496_398902_399777_448355
903899	scaffold_4438_pilon	+	3171	1	Intergenic	novelGene_174543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1468	1806	409617	409955	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHFQHCICLLKHLSWYSVNSWSLVFFPVTSVQLESLFSVPSVLDHMPPPEMAEHQPVLFGTVTVYFFHLLLMLLESFNIFPVEFFNIATRGLNFFFSSFSLRNVKHVLPF	408149	411320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_408100_411300
903900	contig_1349_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_171638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGGGCGCCGGCGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25810	26971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_+_25800_27000
903901	contig_5640_pilon	+	4458	3	Intergenic	novelGene_27290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_1	98.5	437	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	1016	2146	1252924	1269139	FALSE	40	TTTAAAAATTTAGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFVFHFFQRFGPHGIPVTVFPKREYKDKPEAMQPQSNTFQEGTEVDREANGAVPHDPPPVPPPEPSLAESLWTSKPPPLFHEGAPYPPPLFIRDTYNQSIPQPPPRKIKRPKRKMYREEPTSIMNAIKLRPRQVLCDKCKNSVVAEKKEIRKGSSASDSSKYEDKKRRNESVTTVNKKLKTDHKVDGKNQNESQKRNAVVKVSNIAHSRGRVVKVSAQANTSKAQLSTKKVLQSKNMDHAKAREVLKIAKEKAQKKQSETSTSKNAHSKVHFTRRYQNPSSGSLPPRVRLKPQRYRNEENDSSLKTGLEKMRSGKMAPKPQSRCTSTRSAGLNKRQLLHQTVTSPAAPLQCLTDHCGFRLGALKLTVKRAAQRH	1251908	1271451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1253921_1266328_1266449_1269125
903902	contig_15087_pilon	+	2670	19	Intergenic	novelGene_37128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1613	2323	52951	72512	TRUE	20	GAGCCGCCCGGGGCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVPLLVHFKQLSALLLQHLHLLLGCTQDAHLWQLACYHSSLLLAGRHLLPCAFHLWGVWLPGGTLFVAAAHQQLLELHIFLPKPLSGLIPLFQALVQLGLQDLILLPKLLTQGLQDGGALLVLVHLGGQPVELEGHAAQMGEELAVVWLLGTHAQSGLQPLQVQHQVAVSRGRGPSSIVFLVLPPLSGGEFCSSAGTTSNSEEVPYWMEVLGPALACHWGVHRQREVLGHLCPFL	33324	89721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_33551_33636_34121_38965_39059_40458_40648_41127_41194_41710_41831_42908_43046_49136_49266_52531_52669_52919_52986_54480_54568_58874_58999_60951_61054_66539_66724_69119_69207_71087_71173_72505_72645_87530_87715_89690
903903	contig_10907_pilon	-	2950	7	Intergenic	novelGene_144901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	173.034357538868	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	136	492	41010	28415	TRUE	40	AAACCAAACTCATTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDK	41145	13938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_16878_28331_28417_30338_30495_36029_36127_36951_37051_41007
903904	contig_14450_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_49041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCTGTGGAGGAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293129	1294865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1293100_1294900
903905	contig_14536_pilon	-	4560	6	Intergenic	novelGene_69315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_5	42.178667593939	189	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	12	623	370282	235516	FALSE	35	AATTTTTATTGGCAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATAGRGVLLATWGGRLRRVLAASRRALPGPAPLAAAVAGVALTGAGVSWYKGRVNLAASEGNLTVLAQRNVDSDEMVGKLSLRKQRFMQFSSLEHEGEYYMTPRDFLFSVMFEQMERKTSVKKLTKKDIEDALAGIQKAGWGPTFFRDLGDKGLISYTEYLFLLTILTKPHTGFHVAFKMLDSDGNEKVEKKEFFKVSPL	370293	231578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_235614_236607_236656_256980_257057_257152_257185_292478_292624_370069
903906	contig_4857_pilon	+	2413	1	Intergenic	novelGene_48877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACATTTGCTTTTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1377713	1380126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1377700_1380100
903907	contig_10475_pilon	+	1518	2	Intergenic	novelGene_148735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221290	222999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_221762_221952
903908	contig_11338_pilon	-	2604	14	Intergenic	novelGene_6342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_10	162.485757227442	323	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	299	1765	319426	295354	FALSE	65	ATTAAAAAACAAAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
903909	contig_11677_pilon	-	2035	10	Intergenic	novelGene_85904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	41.7632953621499	150	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	224	1540	488590	484850	FALSE	10	TTCTGGTTCTCACTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGRRGSGLVRAVLGVWQLGPEASRGWVCRLPSFLGYHPRCVSCIAGAAFAGPRLSSASRHYGPGSALDRFLGLAQPDSFLTPCVPAVSMHRDEQDLLLVHCPDMPENPRVLRVVLLGAPNAGKSTLSNQLLGRKVFPVSKKVHTTRCQALGVITEKEAQVILLDTPGLISPIKQKRHHLELSLLEDPWKSMESADLVVVLVDVSDKWTRNQLSPQVLQCLTQYSQVPSVLVMNKVDCLKQKSVLLNLTAALTEGVVNGKKLKMKQAFRSHTPSTHRPSPEAKGSDTQPVGGSQRTGWPHFQEIFMLSALSQEDVKTLKQYLLAQARPGPWEFHSGVLTTQTPEEICANIIREKLLQYLPQEVPYNVQQRTEVWEEGPSGQLVIVQKLLVSKESHVGILIGQKGQLIAQIAQEAGRDLMDIFLCDVQLHLSVKLLK	488813	484354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_484973_485082_485164_485284_485435_485755_486008_486098_486212_486360_486423_486590_486638_487052_487131_487242_487371_488307
903910	contig_383_pilon	-	3293	7	Intergenic	novelGene_126144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_6	47.4391423006595	325	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	356	1561	385190	350004	FALSE	25	TTACTGTACTGAGTATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLESLETKATLTSTPIRGAGDGMETEEPHKSIEATSGVQSIKRHILQSPQKKAVASESLGVLHLGKILTEKAVEVEAVRILVPKAAITHDIPNKNAKVKSLGHHKGESLGHSEGVVEPRKELSEVKHVLEKLKNSERRLLQDKEGLSNQLRVQTEVNRELKKLLVASVGDDLQYHFERLAHEKNQLILENEALGQNTARLSEQLERMSIQCDVWRSKFLASRVMADELTNSRAVLQRQSRDAQSAIQDLLSEREQFRQEMLATQKLLEKLLVCLQWGREQSYYPNAQPHSTAELALTNHKLAKAVNSHLLGNVGANDQKKIPSTGEFCSTPAEKMAETILRILDPVACTENSPESPFSESSPTTLLATKKNIGRFHPYTRYENITFNCCNHCQGELIAL	386861	348271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_350190_353503_353724_359666_359796_361353_361554_363254_363695_385159_385241_386556
903911	contig_8594_pilon	-	2957	5	Intergenic	novelGene_140030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	64.9942305131771	328	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	34	1131	327303	323698	FALSE	20	GCACACAGTTGTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWSRDSDCAENMYIDMMLWRHARRLLEEVRLKDLGCFAAQLGFELISWLCKERTRAARVDNFVTALKRLHKDFLWPLPVIPTSSISSPFRNGKYRPGEQLLKSQSAGPFLNLEMEAGISDVQRSQSWLGSLGPTHQEIDSASSHGAQTQDAFLSPLFNKGDECSIGSATDLTESSSMLDGDWTMVDENFSTLSLTQSELEHISLELASKGPHKSQVQLRYLLHIFMEAGCLDWCIVIGLILREPSIINQTLVVIQSSEVDGEMLQNIKTGLHAVDRWASSDCPGYKPFLNIIKPQLQKLSEMTEEQVQPEAFQPVSVGKTPEQMSPRAEESRGASGHSIVPLAEVGGSTASRKEEATARAQEEEPFQDGTYDCSVS	327336	321871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_323984_324995_325185_325331_325510_325986_326176_327047
903912	contig_16411_pilon	+	4294	1	Intergenic	novelGene_77270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18705	22999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18700_23000
903914	contig_9471_pilon	-	1357	8	Intergenic	novelGene_21704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_5	73.9047925871316	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	138	590	103082	81188	TRUE	15	TACGTATCCTTTCGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQGQGLDTSLEENCSMDFRRKLLKINEYLGAKDVEALKFLCRDLLSHKKLEKSGSALEIFEQLLAEEHLSEEDPFFLAELLYIIRQKSLLRHLQYFKEQVQNLLPVRRRVSLFRNLLYELSEDIDSERLRSMIFLLPNVFPKTEMSPR	105606	73942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_74371_74919_75029_77002_77095_79129_79170_81089_81200_100470_100565_102735_103090_105476
903916	contig_8681_pilon	-	5029	1	Intergenic	novelGene_157200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	668	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3	308	126113	125808	NA	15	TGAAGTTAGTCTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFCLPFIALTEYLEYIYLYLFFQNLKSFASHNRSLPQPGHRCLTCLCSQWPLWPLGAAGLLQGGSSWQPQKAEPGRGFKPSFIVPLGALVAQRLKLSAAN	126115	121086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_121100_126100
903917	contig_1263_pilon	-	5286	3	Intergenic	novelGene_170404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2353	junction_1	98.5	38	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2255	2617	60116	59754	FALSE	65	GGAAAAAGAAGAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKVII	76708	57084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_60189_63285_65324_76564
903919	contig_10609_pilon	-	5360	10	Intergenic	novelGene_123922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	388	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	4639	4998	391053	387006	TRUE	60	TGAAACAAACAACATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGEPVVVWLVHVSTVVNQLINYSILAIVAGDMKGSISIDVDFINLHPQIQEVFDNIDLSIGDCSVQGRVTLLILTRHFCAMVNEQCYYVQVAHICCPVQSTPVLLVKCIDVCPFGQQ	421352	361235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_361313_374910_374985_386436_386637_386994_387084_389595_389738_390913_391127_400430_400511_406868_406983_415516_418853_420317
903920	contig_15047_pilon	+	1583	6	Intergenic	novelGene_52188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	64.6826097185325	3	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	20	937	2194	4510	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWGKRGWGRSLFSESMSLSGDFQQGWG	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4158_4687_21013_21062_21232
903921	contig_5083_pilon	+	2365	14	Intergenic	novelGene_151662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	130.032449295637	10	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	59	1564	461780	674122	FALSE	25	GATGAATGCAGTGCCGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEGEQEEKSSENSSAERDLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPPYPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPTARTLHFQSGSTHYSAYKTIEHQIAIQYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPAHIVNGTVLPRVFNGCNLLEVDHQAFLLWHLRSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISPYYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYMQILQRSVGHCSGLTDRLYGANRAGEKKSAFATYKVKAAASAHPLQMEAY	461721	674923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_461969_462228_462296_462501_462627_474735_474805_546411_546514_556889_556974_648611_648745_651100_651204_653251_653339_658044_658171_658766_658927_659475_659584_668797_668871_674042
903922	contig_9363_pilon	+	3618	1	Intergenic	novelGene_6634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACAAAGTAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875729	879347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_875700_879300
903923	contig_12019_pilon	-	2958	1	Intergenic	novelGene_87720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1368	1670	402625	402323	NA	10	TCTGAGCGCCCAGGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPISAQEQPPRTNTPQPGVSIHNSCWEKEVLLRPGIFTLGPDEPCQYNMRSAQVPTGGTAHPCYLSWKVPDNELTWLCHSAARKLAPFFPLHARRKNTI	403992	401034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_401000_404000
903925	contig_10225_pilon	+	1989	12	Intergenic	novelGene_86832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	563.123813874059	4	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	901	1731	42629	47494	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFCRAALS	21337	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21494_34904_35026_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46780_47471
903926	contig_12142_pilon	+	3749	5	Intergenic	novelGene_147818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	40.8128349909682	237	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	582	995	135751	136164	FALSE	35	CACAGACCAGGTAACCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPILTQPAPFSNPDSDHPFPNPGPQSLTPQALAPLSLLSRQLPVSHPETPTSRSLFPPHSAI	121423	138918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_121502_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
903927	contig_3068_pilon	+	6761	1	Intergenic	novelGene_137658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	813	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGCATGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422343	429104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_422300_429100
903928	contig_19778_pilon	+	3218	3	Intergenic	novelGene_143754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	777	junction_2	120	14	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCAACTTCAGGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12877	18202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_+_13704_14323_14434_15920
903929	contig_1624_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_138381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCTGAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209128	210764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_209100_210800
903930	contig_5770_pilon	+	1739	3	Intergenic	novelGene_74161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAAAAGCAGTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253594	256960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_255057_255962_256152_256872
903931	contig_15092_pilon	-	6400	17	Intergenic	novelGene_57761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	102	junction_16	144.920614044379	546	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1093	3282	247	3528	293639	257861	FALSE	50	AAAATAGTAATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSAWTDTIPYGEPGISSSVSGGWDTSAWGLKSSTEPQSPPIASPKAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPTDVQTIQKSPVVSKPPTKSQRPEDEVKSTLQESLHTGQSRTTESTETKVKDSSPCAPGKTLAVDTLSPKTEGKHEEIVNQESDMKVPAEHLKVSESVISVKTTTESGSNISMQSLTAETKDVALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSTFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETTDSKSSLHLMQTSFQLLSASACPEYNRLDDFQKLNESCGSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELSGKGYSLVPIIVNSSTPKTKVIESVDAESEEVVNETVIPNEETEMEESGRSATPVNCEQPDILVSSTPIKEGHAVFDKEAEHSKAAESQPEALSEKEDVSKTVDFLNEKLEKREAQLLSLSKEKALLEEAYDNLKDEMFRVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEMKSIKEELATRLNSSETAELLKEKDEQIRGLMEEGEKLSKQQLYSSNIIKKLRAKDKENENITVKLNKKVKELEEELQHLKQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSVVERQEKDLGRLQVDMDELEEKNRSIQAALDSAYKELTDLHKANAAKDSEAQEFALSREMKAKEELSAALEKAQEEARQQQETLAIQVGDLRLALQRAEQAAARKEDYLRHEISELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTTRPLLRQIENLQVTLGSQTSSWEKLEKNLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSLESQNSLLRQENSRFQAQLESEKNKLRKLEDENNRCQVELENLKDEYVRTLEETRKEKTLLNNQLEMEKMKVEQERKKAIFTQEAMKEKERKPFSVSSTPTVSRSSSISGIDMAGLQTSFLSQDEPHDHSFGPMSASANGSNLYDAVRMGAGSSIIENLQSQLKLREGEITHLQLEIGNLEKTRSIMAEELVKLTHQNDELEEKVKEIPKLRTQLRDLDQRYNTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQRLS	293885	254988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_258005_259014_259141_261446_261600_261880_261983_262982_263076_263311_263382_264202_264396_267752_267910_268574_268668_276591_276749_277039_277207_277456_277600_283860_283967_287003_287131_287845_287950_289745_290951_293497
903932	contig_5341_pilon	-	937	2	Intergenic	novelGene_168024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAATCTCAGTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340893	337809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338540_340686
903933	contig_9482_pilon	+	2863	14	Intergenic	novelGene_44224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	127.507140999699	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2112	2627	230471	235868	FALSE	10	CGTGCTTTCTCTTATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDKLRFADGSIRTSELRLNMQKSMQSHAAVFRVGSVLQEGCEKITQLYRDLQHLKTFDRGMVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKVRIDEYDYSKPIQGQQKKPFTEHWRKHTLSYVDVKTGKVTLEYRPVIDRTLNEADCATVPPAIRSY	212053	236104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_212154_216625_216713_218607_218770_219276_219421_219700_219866_220906_221056_221736_221862_223619_223789_226155_227119_230423_230543_232975_233088_233345_233477_234032_234147_235781
903934	contig_6100_pilon	+	3770	2	Intergenic	novelGene_168114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTACTAGCATTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450583	454407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_454091_454144
903935	contig_7083_pilon	+	2091	8	Intergenic	novelGene_125160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	658.718855515951	304	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	255	704	161470	182245	FALSE	10	ATTGTTGAGTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYIERPQLIRAKVPIVKFRDKVNCVEFDLNVNNIVGIRNTFLLRTYAYLENRVRPLVLVIKKWASHHEINDASRGTLSSYSLVLMVLHYLQTLPEPILPSLQKTYPESFSPAIQLQLVHQAPCNIPPYLSKNESNLGDLLLGFLKYYATEFDWDSQMISVHEAKAIPRPDGIEWRNKYICIEEPFDGKNTARAVHEKQKFDMIKDQFLKSWQRLQNKRDLNSILPLRAAILKR	156657	183632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_156728_159880_159958_161362_161492_169672_169717_174263_174401_178715_178808_180833_180914_182170
903936	SIRV6	+	926	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	594	8	-39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	11	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	40	ATGCGGTAAACGTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
903938	contig_3815_pilon	+	7820	7	Intergenic	novelGene_177127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	123	junction_1	116.498092497498	698	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	596	1354	35209	41400	FALSE	40	TCCTTTAAAATAAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLEFFGIKLIDKTGNVARAVNWQERFQHLNESQHNYLRITRILKSLGELGYESFKSPLVKFILHEALVENTIPNIKQSALEYFVYTIRDRRERRKLLRFAQKHYTPSENFIWGPPRKEQSEGSKAPKMPTSPVSGHNSQTSMHKKSKESKNSSSAVHLNSKTMEEKKVAPNEPGEETDRPRAEPSDGAAKPRNSEDCDGENSNSQPDKTINNPIEKKESASPSDKDEEVEKPNKNSENPGNTSSHDDILLQ	27115	47866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3815_pilon_+_27348_31029_31117_31275_31355_34808_34888_34984_35052_35157_35304_40736
903939	contig_6576_pilon	-	1840	4	Intergenic	novelGene_42322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCGCCTCTATTGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606625	599319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_599378_600398_600863_604573_604724_605457
903940	contig_10263_pilon	+	3411	1	Intergenic	novelGene_135843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2202	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACAAAACAAGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877584	880995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_877600_881000
903941	contig_16148_pilon	-	2958	13	Intergenic	novelGene_50364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	453.068634425293	9	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1120	1932	111433	77572	TRUE	25	ATCCAACATTGACTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKEKT	153079	58795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77385_77581_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
903942	contig_16205_pilon	-	2044	1	Intergenic	novelGene_156881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAAAGACTTTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100389	98345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_98300_100400
903943	contig_10386_pilon	+	4229	4	Intergenic	novelGene_173537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	12.9185482500507	277	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	149	1597	88066	128634	FALSE	35	TCTTTCTTTTTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSPLDDRVVVALSRPVRPQDLNLCLDSSYIGSATPGSDSHPPVIATTVVSLKAANLTYMPSSSGSARSLNCGCSSASCCTVATYDKDSQTQTQAIAAGTATTAIGTSTTCPTNQMVNNNENTGPLTPSGGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPSDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECPEVGGGAPAASGLLPQSIPATPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGMETVV	85706	131266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_85812_88022_88877_123875_124248_128368
903944	contig_7321_pilon	-	1536	10	Intergenic	novelGene_53135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	172.478948438124	42	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	72	1286	208319	166071	FALSE	40	AGAATATCAGATGTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELVVEMDGKNGFSLLELSPPNPWDSDPRTPEDLAFGEVQITYLTHACMDLKLGDTRMVFDPWLIGPAFARGWWLLHEPPSDWLERLCQADLIYISHMHSDHLSYPTLKKLAKRRPDIPIYVGNTERPVFWNLNQSGVQLTNINVVPFGVWQQVDKNLRFMILMDGVHPEMDTCIIVEYKGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKEKRANRHGDFIPPRKQCWKQIMSFGPEVPALRGS	208390	165820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_166177_169480_169617_173563_173702_174645_174728_175746_175895_183961_184153_186238_186349_203985_204078_207655_207860_208311
903945	contig_2219_pilon	-	3246	2	Intergenic	novelGene_67201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATACACAAATAAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229051	225685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_228592_228711
903946	contig_14142_pilon	+	1215	6	Intergenic	novelGene_120511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	618	1088	346657	347301	TRUE	15	TGCCAGTACTAGTCGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLTTSLDLGFVGVQYRDAPHLSSILGWVEDVNLNLGLEPDTGLGTIMPHVVSYSFLGAWGRPWRGWRWSRLRGSGDSWAGSSAVTCWMNCGISMTGGGGRIVSDSCGSVAGGVCGSSSVTGGFVALRSSVAGCSRACCAFCSCRGHREGWQQSG	345401	347516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_345718_346103_346277_346387_346458_346598_346723_346896_347337_347424
903947	contig_10475_pilon	-	1804	2	Intergenic	novelGene_148718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	57	647	25759	24959	FALSE	30	TATGCGTGCAGTTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVVKVKPVIDGQTVTWQMQLYGTPLLSIPEVPDDPEHRLGLYHATLNILVALFKDSRDNSHMRTAENRFKAFKAAVNTDMEHTPYPAINVSAYVIYLSLQPWCHRVLRRILSTKFTGPAEQMMVQVHMVARWSQMTTLNAIKRFLNECDSSLILIPEVKEEIPKFHEAYERLREKTGEWFPYAKAIKHPEAQKVKTAAFPNLASAALYHAVFV	25815	23801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_24970_25179
903948	contig_17158_pilon	+	6588	17	Intergenic	novelGene_141154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	125	junction_1	1058.36695956258	509	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	939	2820	17	2836	165610	210068	FALSE	25	GTACAAGTCTTTGGACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQPPGGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDNAYDPDVNAKQIWIDKTVINGHICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGLYGNGFKSGSMRLGKDAIVFTKNGESMSVGFLSQSYLEAIKAEHVVVPIVAFNNHRQMINLAESKASLAAILEHSLFSTEQKLLAELDAVMGKKGTRIIIWNLRSYKNGATEFDFDKDKYDIRIPEDLDETTGKKGYRKQERMDQIAPESDYSLRAYCSILYLKPRMQIILRGQKVKTQLVSKSLAYIERDVYRPKFLTRTVRITFGFNCRNKDHYGIMMYHRNRLIKAYEKVGCQLRANNMGVGVVGIIECNFLKPTHNKQDFDYTNEYRLTITALGDKLNDYWNEMKVKKNAEYPLNLPVEDIQKRPDQTWVQCDSCLKWRKLPDGIDQLPEKWYCSNNPDPQFRNCDVPEEPEDEDLVHPTYEKTYKKRDKEKFRIRQPEMLPRISAELLFRTTPVSSQSFCPVKESVPRGHLSEAANTYTTRLINNNRVSPQSEPESNSLKRRLSVRSSILNAKNRRLTSQTFENSAYKDDDDEDVIILEENSTPKPAVDHDIEMKSEQVHVEQSGVQMEIVGDNEPCGQASSTSTSSSRCDQGTTAATQTEVPNLVVKKEETIEDEIDARNDAAALASCVDAEAKTHETQETFDKCAGDAGCQLNEVRNELLLVTQERENFKRQCHTLTDQVKVLQQRILELNDKYVKKETCHQSTETDAVFLLESVNGKSESPDYMTSQYQQALEEIERLKKQCSALQHVKAECSQCCNSESKSEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSVERDQYKREVELLEMEKSQIRSQCEELKTEIEKLKSTSQQIGTVSTSSNIEESINYADGESLKLRSLRINVGQLLAMIVPDLDLQQVNYDVDVVDEILGQVVEQMSEISST	165593	213820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_165649_179698_179772_182053_182187_183117_183332_183877_184027_185769_185921_187921_188051_188245_188366_190786_190885_196197_196303_197534_197658_197752_197828_198978_199025_200428_200596_204568_205458_207378_207534_209914
903949	contig_17274_pilon	+	2422	7	Intergenic	novelGene_26497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	159.738762428605	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1548	2165	74947	80052	FALSE	10	CTTCATCTCATTCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHRRKKRRLEPHNNALVDSYQENSDDCEVCRDGGQLFCCDTCSRSFHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKESSGSKQCQEESEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFVNIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHRVGGFVQDMRLIFQNHRASYKLKDFGQIGLRLEAEFERNFKEVFTIQETNENSSLV	73399	80309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_74968_76380_76423_77051_77168_77893_78003_78281_78360_78575_78720_79944
903950	contig_7378_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_120307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAAGGACTATGCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730886	729260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_729300_730900
903951	contig_7870_pilon	-	3001	1	Intergenic	novelGene_109056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1753	2061	662315	662007	NA	80	TAAAAACAGAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHCCFSRNSWVMQLVKCSATSQKVDGSHTPKVTSEGRLGEQLLKGHSLENSMEQFYSHTRVTMNQNQLHSKASNNNNCFNNDDVNDDKVIEIPFEACICHS	664067	661066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_661100_664100
903952	contig_11448_pilon	-	4431	1	Intergenic	novelGene_66340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	426	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTGGTGAAGACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150689	146258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_146300_150700
903953	contig_7630_pilon	+	2308	2	Intergenic	novelGene_133656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	63	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	1898	2308	530601	531011	FALSE	60	ACGAGAAAAGAAAACTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQITKIRNERGDFTTDPIEIKRIMTEYCEQLYGNRLDNLDEMDKSLEVHNLCLLTQEEIESLSRSITSEEIKSVIKNLLTKQSPRPDSFTGDFYQTFREVLTPRLFNLFQKTEKEEILPNSFYEANITLTPKPDKDT	528091	531011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_528334_528945
903954	contig_8377_pilon	-	3094	16	Intergenic	novelGene_35131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.81582827759238	30	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGACTTTCGAGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199250	177308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182894_183046_183256_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660_197928_198036
903955	contig_10139_pilon	+	766	2	Intergenic	novelGene_177812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGCATGCTAACTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183395	184370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10139_pilon_+_184107_184315
903956	contig_19269_pilon	-	3463	3	Intergenic	novelGene_175625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	69	374	14403	14098	TRUE	35	TGTGAGATGAGACAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYGIISSANRESLTSSLPIWMPFISFFCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	14471	794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_-_903_7477_7584_11222
903957	contig_1812_pilon	-	3855	2	Intergenic	novelGene_174515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1689	2327	14659	14021	FALSE	10	GTGTCTATGGGGCTTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRGKRKQNKFKKKNKKVPPKKQKKRKKNQRKKKCSHGSLYTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPQDPTSAVAQTGKQLHTRMELHSPSGKSKDGAWSQTLERKAGEVARGKQEIQRSREKKKKATPAANKWHSESQLVQAGVSRQETVSVGSRGGRVWVKKRREWESVYHKLPTLWSPSGRSKDGARSQVLE	61910	12492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_-_15288_60850
903958	contig_4105_pilon	-	2138	14	Intergenic	novelGene_21502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	747.668114518371	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	20	1669	137447	100151	FALSE	25	GGTTAAACAGTCTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137466	99681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
903959	contig_4402_pilon	+	2518	2	Intergenic	novelGene_140835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGGGTTCAGAAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592184	595136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_593745_594178
903960	contig_5331_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_112760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	40	387	70486	70139	NA	30	TTATGAGACCCCAACCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVYRANYFLIKQYTYCFVALVANPRHVNTLPFSILGSSFPFSSFLVPSFLLVLALGWCAHVVSYTWFSYMYYCLLYGPVLIFGSRVNFRSDFSTELKRYPGAILSGFLQSLSDQ	70525	68644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_68600_70500
903961	contig_11525_pilon	+	1547	2	Intergenic	novelGene_171086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAGACCTAAAGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60816	62415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_61190_61241
903962	contig_17274_pilon	+	4614	8	Intergenic	novelGene_26518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	198.145689546137	358	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	77	484	118629	122898	TRUE	35	TATTCCCCAGACTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLVSQLQAPSLLLSLHT	118552	175398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_123572_124349_126154_152428_153229_174545
903963	contig_12512_pilon	-	3039	7	Intergenic	novelGene_24185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	448.711767173539	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	235	666	599702	592270	TRUE	20	CGTAGTGTGAAATGGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQTHPKQAQKKRLSVAGSVPQAQYP	599936	586660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_588388_590668_590862_591103_591267_591594_591852_592236_592340_595423_595506_599422
903964	contig_2078_pilon	+	2476	1	Intergenic	novelGene_100147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1045	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2092	2460	301115	301483	NA	80	GAAAGAAAAAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDWVDVVYLLIGFSGMGAFIASQQIGEDIKQGVLHAYFPQSSSWSSGGRRGEGPGVVAGLSTKDALAAVTYRESMGRGVSYGTSWGWEKEKKRERKKFKKGNLQVVAEWAWGPVGSEGGCV	299023	301499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_299000_301500
903965	contig_8289_pilon	+	4261	1	Intergenic	novelGene_171182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATAGATTCCTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220847	225108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_220800_225100
903967	contig_16846_pilon	-	3372	2	Intergenic	novelGene_82928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	362	685	492969	492646	FALSE	80	AACAAAGCAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCDPGPRPGERVVAEFMLSLTSSTLPLVASWEFCTPYALVTIEKPVPPTSLLLPSPSSVYRALRPKLGQPVFPGINSQGLGLLSGEDVNLGSSHFTSPLPPNEQRV	493664	489958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_493245_493578
903968	contig_7151_pilon	-	2182	4	Intergenic	novelGene_40785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1137.98486613643	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	297	629	551063	536318	TRUE	35	TAAAAAGTCCATTTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGTDSREHTRIFLFLISIQIHNII	551359	528599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_535501_536494_549638_549729_550996
903969	contig_6227_pilon	+	2298	2	Intergenic	novelGene_49695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942412	944878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_942810_942977
903970	contig_13977_pilon	-	3432	18	Intergenic	novelGene_80953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	74.1547992786398	5	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	534	2351	172728	155523	FALSE	15	TGAATGTTTCTTGTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKLQELIQKGTKLVLEQVVTSIASVADTAEEKFVPYYDLFMPSLKHIVENAVQKELRLLRGKTIECISLIGLAVGKEKFMQDASDVMQLLLKTQTDFSDMEDDDPQISYMISAWARMCKILGKEFQQYLPVVMGPLMKTASIKPEVALLDTQDMENMSDDDGWEFVNLGDQQSFGIKTAGLEEKSTACQMLVCYAKELKEGFVEYTEQVVKLMVPLLKFYFHDGVRVAAAESMPLLLECARVRGPEYLTQMWHFMCDALIKAIGTEPDSDVLSEIMHSFAKCIEVMGDGCLNNEHFEELGGILKAKLEEHFKNQELRQVKRQDEDYDEQVEESLQDEDDNDVYILTKVSDILHSIFSSYKEKVLPWFEQLLPLIVNLICPHRPWPDRQWGLCIFDDVIEHCSPASFKYAEYFLRPMLQYVCDNSPEVRQAAAYGLGVMAQYGGDNYRPFCTEALPLLVRVIQAADSRTKENVNATENCISAVGKMMKFKPDCVNVDEVLPHWLSWLPLHEDKEEAVQTFGYLCDLIESNHPVVLGPNNTNLPKIFKIIADGEMHEAIKHEDPCARRLANVVRQVQTSGGLWTECIGQLSPEQQGAIQGLLSSA	203043	154441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_-_155610_156535_156678_158052_158282_159330_159551_160091_160215_161212_161269_161359_161472_162555_162729_163633_163731_166254_166377_166462_166596_169176_169261_170053_170273_172707_172828_190736_190797_192585_192779_195786_195868_202943
903971	contig_13592_pilon	-	2886	14	Intergenic	novelGene_33746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_5	115.048896216826	382	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2319	566	2884	387919	326683	FALSE	50	GTACTAAATTTCTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKESCGKKEKSRRKGTTSSPNFEEEDKKEKKTSSSANSAYSIRSVSSEKRKLKSDHTDILYCNTKRRQELKRFSVATDTSRKRPKISSSSQEPVELQEASFSNDNQIISQSPSSNGTKTNISIRADFKPKDIKLINVPSKLDHELKNLSSPKTAKDVQPKAEGQACEKKWAHLLAQSQKMKELKKEKSSKLRDSSEKCVLEKCKRNEFSQDYNSNKIIKEPLEPRKRKISFKIPIKSRDTLQKLVEENVFRLDSNKSKTKQEEKECLESSHVSLNLTRHKIVHLCSDSTCKTVHEWKEKHHHEHQESNDSSSSKNLTQNFEAPCSSVSPESVQDTDEEMQIVEELHAARVGKSVDLPVVPPSGELMSMEIDLVEDDVHSSAANTASDKKLLIVIDTNILMNHLKFIRILKTTEIPGFDRLVLIIPWIVVQELDRMKAGKLLKHAQHKAVPAVHFINDSLKNQDRKLWGQSIQLASQKLYGLSDENNDDRVLKCCLQYQELFPCSLVILCTDDRNLRNKGLISGVKSLSKEELSAELLNLSLNTDECHQPCISKHQLKAEATSLKESFEEKSANSGLSILLESIISELEKSLGTALSLILETEMKIAFGNLWMEMLYLKPPWTLIHLVQCFKKHWLAVFGLVMEKNLLLTIESLYENLCKANNAVDFTTAKFLLQDSKSLLHAFSTRSDYDGILPQAFAQVNKLLQTFTEVKAKLKPNPSENTVGKKQEDTSLMTSSNQEITLFSGSQLPQPNRHQEIWSILENVWITIYQN	388484	326680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_326869_332877_333027_337466_337606_339905_340070_341523_341670_348351_348446_351343_351533_351918_352021_353143_353274_354500_354561_359369_360109_381314_381374_383032_383114_387838
903972	contig_5549_pilon	-	2164	10	Intergenic	novelGene_81673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	116.20904960405	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	534	1856	546935	530509	FALSE	75	AAAAAAAAAAAGAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRESPIPIEIPPAAVPSYVPESRERYQQMEGYYPVAPHPTQIRPSYLREPPYSRLPPPPQPHPSLDELHRRRKEIMAQLEERKVISPPPFAPSPTLPPTFHQEEFLDEDLKIAGKYKGNDYSQYSPWSCDTIGSYIGTKDAKPKDVVAAGSVEMMNVDSKGMRDQRLDLQRRAAETSDDDLIPFGDRPTVSRFGAISRTSKTIYQGAGPMQAVAPQGAPTKSINISDYSPYGTHGGWGSSPYSPHQNIPSQGHFNERERMSMSEATSHGKPLPSAEREQLRLELQQLNHQINQQTQLRGLEREANTLAGQPQPPPPPPPPKWPGMISSEQLSLELHQVEREIGKRTRELSMENQCSLDMKSKLNTSKQAENGQPESQNKVPAEDLTLTFSDVPNGSALTQENISLLSNKTSSLNLSEDPEGGGDNNDSQRSGVTPSSAP	551367	530200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_530660_531619_531736_533276_533427_534949_535083_535203_535295_535677_535892_539397_539551_546164_546333_546788_547201_551099
903974	contig_12427_pilon	+	2081	2	Intergenic	novelGene_40576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCCATTTAACAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538877	542517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_539899_541457
903975	contig_15570_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_137872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGGAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898681	897201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_897200_898700
903976	contig_7051_pilon	+	1916	9	Intergenic	novelGene_64283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	120.531570034576	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	134	577	184159	203048	TRUE	25	TATATTGACTAGTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAAAERSRADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMI	184025	207363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_203042_203168_206143
903977	contig_10197_pilon	+	1941	2	Intergenic	novelGene_115211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908366	910358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_910005_910055
903978	contig_14287_pilon	-	1478	2	Intergenic	novelGene_24054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	94	906	22710	21898	FALSE	65	TAAAAATTTTAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAAEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERIRELHALADKVDKTHRDCTISCVVANSVSAFSGVLTILGLALAPVTAGVSLSLSATGMGLGTAAAITSVSTSIVEHSNRLSAKSKASKLLSTGHCEGVVKAVLRNTANLVDTTVRCIRNSSNIKKSMHVIKLAKDNPHLVADARCLMTTGKISIQSGKQVQKAFGGTILAMSKGARVMGMATAGFSLLVDVFNLVQESKHLHEGAKAESAEELREKARELERKLEELTKIHKNLQ	25873	21325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_-_22754_25823
903979	contig_12677_pilon	-	821	1	Intergenic	novelGene_110849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
903980	contig_5033_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_29092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGAAATGTGTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706502	708436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_706500_708400
903981	contig_9014_pilon	+	1793	2	Intergenic	novelGene_106826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCAAAATCCAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260744	262573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_262365_262400
903982	contig_6344_pilon	-	2850	4	Intergenic	novelGene_157103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_3	45.8281815286426	198	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	580	1278	993996	991066	FALSE	5	TTTGTGTGTGTGTATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSNSAVILPSTPQACEIPPSPHTNSSRKQPMSATLRERLRKTRSSFNSCYSVAKRLKVENEESDQIFSEKPVSSTEENRLEFQESFKHIDSDFEESTYLKNTFKNISVCESKSLDIGSCNALQNDFVNENLPIQGLKEEKAKLVKQVQEKEDFLRRLKLVKMYRSKNDLSQLQLLIKKWRNCSQLLLYELQSAMSEENKKLSLTELIDHYGLDDKLLHYNRSEEEFIGV	994956	989493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_991258_992459_992871_993900_994023_994403
903983	contig_3588_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_72877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTGTCCTGTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99426	101489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_99400_101500
903984	contig_2703_pilon	+	7946	2	Intergenic	novelGene_101765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	564	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	7187	7609	593333	593755	FALSE	25	ACAGGTCCCCAGACTTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQEELWAVADLFPVLHTPQVIPAVLLTRRECCGYDGTPGFCSQAPVLLSSLFPVFPSQSTMKSSHSGPSSCSHTLRPCHTSFLMSLQPSEVPTFPPLCPPTHLVNLLFYAQLRSNVFSVAFLKNELLLQLSFVAFFMYH	586104	594092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_586978_587019
903985	contig_14970_pilon	-	1291	8	Intergenic	novelGene_45113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	132.829490209771	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	170	1027	312002	264487	FALSE	35	TCAGTTTGAATCGAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEQAKLMVEFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPPGYCLPNLWEDHCNQGLGVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315736	264222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291011_291104_291170_311919_312047_315611
903986	scaffold_13505_pilon	-	2190	11	Intergenic	novelGene_111527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	415.746364987116	16	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	2	1141	603261	595273	TRUE	5	TCATTTTCTCTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603262	588570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589363_589810_589843_590205_590259_594013_594275_595062_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
903987	contig_10404_pilon	+	1022	4	Intergenic	novelGene_138681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1384	junction_2	1950.43180404295	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	69	410	1098040	1099868	FALSE	20	CCAACTGTTGCTCGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1097971	1100480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098110_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
903988	contig_17829_pilon	-	3320	16	Intergenic	novelGene_157025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	146.809718116116	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	204	1352	44445	26860	TRUE	40	AAACCGTGAAATGCCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSHIQKIRPREVAFEAQTSRYLNEFEEIAILGKGGYGRVYKVRNKLDGQYYAIKKILIKGATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPHIVGYHTAWIEHVHVAQPQDRAPIQLSSLEVLSDQEDNRDQYGVKNDDSSSSSIVFAELTSDKDKAFGESGFENQNNRLVNYTTNLVTRDASELESLIELQENGLSIMEHQLPLRQYSDLEENFTSTEESSDEHLNLFGQTEVQYHLMLHIQMQLCELSLWDWITDRNRRGRECVDESSCPYVMVSVATKIFQELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACTDILQKNTDWTNRNGKGMPTHTSRVGTCLYASPEQLEGSEYDTKSDMYSLGVILLELFQPFGTEMERAKYIQHLTRKNSSQRPSAVQLLQSELFQNSGNVNLTLQRRVIEQEKEIEELKRQLSLLSQDKGV	45874	17354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_17418_22112_22316_24358_24593_25391_26959_28032_28128_28196_28267_29240_29324_29537_29653_36213_36315_39444_39557_41389_41700_42845_42904_43465_43566_44439_44521_45061_45162_45846
903989	contig_10976_pilon	+	3281	1	Intergenic	novelGene_155593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	492	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTAGAGACCATTCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136944	140225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_136900_140200
903990	contig_8377_pilon	+	2428	21	Intergenic	novelGene_34897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3613.73045861199	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1980	448	2427	128927	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68026	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
903991	SIRV7	-	1755	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	10	697	5	-695	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75	57	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACGTATAGCAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147913	1700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
903992	contig_9752_pilon	+	2579	1	Intergenic	novelGene_122042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	318	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1280	1711	205164	205595	NA	55	GTTAAACCAAAAGATAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCALRPRSCFPRRLWDPWGHFFSFFLFIYLFIFLFSFSSFLSFSSLQSNGSLPQHFFLGGGLLFLSPFSLLYHTHLAPHITASRLPSAYLHHALNITSLRSTGTAHQNLPCTDSWPALLTPVRATNSPSQPLPFSWTCPAAP	203884	206463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_203900_206500
903993	contig_7396_pilon	-	2744	16	Intergenic	novelGene_79571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3549.19769087168	4	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	176	901	255163	248983	TRUE	15	GCTAGATATGGTGCGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESRPSKDVHSLMIPTFTMKLTIMVVLQ	257444	245201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248606_248753_249064_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
903994	contig_7078_pilon	+	7034	2	Intergenic	novelGene_130220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	325	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	4684	5094	974624	975034	FALSE	65	AGCAAGATGAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKSSTAMLPKLCNIEYYLKIVSQSSGAALTGIPQVDGFTKRNLFSHSPAGCKSKFRASAPGERFLHQLWRKVHVNSLPLVWELLCAGTSGLKDALCSQHCFLGGMRFPCVSARFSLLYLKKDCIKTLILSTLSV	964540	976974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_966206_971605
903995	contig_10855_pilon	+	5373	3	Intergenic	novelGene_124337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	416	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	304	507	541529	541732	TRUE	30	ACTGTTTGCTGAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTPCSSWARFWGTGVGNSTGAQRCDFDHDTSLPGLSPHPTITPSARPTEPPRGDLRPPEKALQFPRRPPCPSPHPRGHLVKSLPETVVPSGHGEETAGPTMPARCPVLSHERHRCPMGIQESHERHRCSMGIQVSYERQRCPMGAQVSHEVQVSHEVQVSHGGTGVP	541225	647641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_545633_643036_643518_647156
903996	contig_14184_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_66606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	126301	126005	NA	75	TTCAAAAAAAAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCYRRAPSSNCAGGRGAGLSQLQVRRGLAGREQQVRARADSGFRRLAACGGLSARGSEPPRCGADQLRARPRAFPPGPSGPRGRRLRRLRGWTQPGA	126301	124805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_124800_126300
903997	contig_8843_pilon	-	3478	2	Intergenic	novelGene_156651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2712	3029	76237	75920	FALSE	20	TCCTCAATTCTGCAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKLAGQTAGCWPMGLWKLVNTRICRAEGGLPAQRATETGKFQSEQVRLQAAGSRPKNQISDDDEPDAGPRARKSFATASIYFGSRSYAQGHSLLIRYLRKGVT	96888	75470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_78428_96367
903998	contig_20293_pilon	-	2494	1	Intergenic	novelGene_153541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTATCTGTTGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	141176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_141200_143700
903999	contig_8167_pilon	-	2790	9	Intergenic	novelGene_155653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	14.2516446419352	106	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	426	929	148855	143912	TRUE	20	ACTCACGTCACAGCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKGNDLVLK	180366	136361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_144152_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_168994_169037_180258
904000	contig_9471_pilon	+	1789	10	Intergenic	novelGene_21744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_6	184.184958032495	29	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	32	1618	259445	303272	FALSE	10	TTCTCCTATATCTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSERGVVEEWLSEFKALPDTQVTNYAATLHRKKTLVPALYKVIQDSNNELLEPVCHQLFELYRSSEVRLKRFTLQFLPELIWVYLRLTVSRDRQSNGCTEALLLGIYNLEIADKDGNNKVLSFTIPSLSKPSIYHEPSTIGSMALTEGALCQHDLIKVVYSDLHPQRETFTAQNRFEVLSFLMLCYNSAIVYMPASSYQSLCRMGSRVCVSGFPRQHEKQWKELCGRIVLDPEFMVQLLTGVYYAMYNGQWDLGQEVLDDIIYRAQLELFSQPLLVANAMKNSLPFDAPDSSQEGQKVLKVEVTPTVPRISRTAITTASIRRHRWRREGAEGVNGGEESVNLNDADEGFSSGASLSSQPIGTKPSSSSQRGSLRKVATGRSAKDKETASAIKSSESPRDSVVRKQYVHQPADLSVDSVELTPMKKHLSLPAGQVVPKTSSLIRTASASSSKSFDYVNGSQASTSIGVGTEGVTNLAANNANRYSTVSLQEDRLGQAGEGKELLSPGAPLTKQSRSPSFNMQLISQV	259413	303443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_259496_260221_260324_271741_271922_275967_276049_278277_278394_289122_289219_293218_293336_293894_293983_297483_297644_302676
904001	contig_5419_pilon	-	5483	5	Intergenic	novelGene_15478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	94.4325155865288	444	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	1930	2850	120809	116032	FALSE	30	AGAAGAATGTTTATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSNNYYIYQQQQPPPQQQPQQQQQQQQQQQQQQQQQPPQPTPQQSQPQQQQPSAQGPSTVRGAPPLHTPSPDGCTPPGGKQAGAEGYGPPPVMAMHPPPLQHGGYHPHQHHPHSHPAQQPPPPQQQAQGQAPINSAGFAFPPDWCSNIDSLKESFKMVNRLNWSSIEQSQFSELMESLRQAEQKNWSLDQHHIANLCDSLNHFLTQTGHVPPQGGSHRPPASARIADSCALTSGKQESAMNQVNSYGHPQAPHLYPGPSPMYPIPTQESAGYNRPAHHMVPRPPVPPPGANEEIPDDFDWDLIT	122738	113398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_116121_117460_117560_118162_118373_119397_119500_120388
904002	contig_7066_pilon	-	1756	3	Intergenic	novelGene_42200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_2	1	54	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGGAAAATGCAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030681	1028463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1028795_1029107_1029158_1029306
904003	contig_211_pilon	-	6579	3	Intergenic	novelGene_129877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	19	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	5396	5875	278434	277385	FALSE	30	GGAGGGGCAGATGCAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTDGSRRWTALQRNQPDRQVVILPASGIFLGQSGLDFVPQESCSGSTAGSQEKEGEAGHVDGQRTVALQEDLLAPLEVQEDGLQLGKCADGQKGMEDLVTMAHDVTAAREVLLRHRAGEEVGADQEEDDLEGVVPGRLLLAASQVAQGHAVCHGADV	284148	276680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_277790_278359_280949_281267
904004	contig_8978_pilon	-	5629	4	Intergenic	novelGene_49429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	369	120	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1254	2048	536135	492810	TRUE	80	AAAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAPTRRCRQKHHGVPPQQRFEKLSQTEKTAILKS	537692	488702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_492076_492601_492908_535438_537092_537395
904005	contig_13901_pilon	+	2469	14	Intergenic	novelGene_146624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	135.802196912975	36	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	593	2173	64511	153162	FALSE	60	CCTTTGAAAATATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFPNILPPAGDGGLTSSQSEFQKMLIDERLRCEHHKTNYQTLKAEHTRLQDEYIKSQNELKRLLNEKQTHQEKFQLLLEELREELVEKTKDLEEMKLQVLTPQKLELLRAQIQQELETPMRERFRNLDEEVEKYRAEYNKLRYEHTFLKSEFEHQKEEFGRILEEGKIKYESEAEKQSAKLQSERLEKELQSSNEQNTLLISKLHKAEREVNILTSKVKELKHSNKLEITDIKLEAARAKSELERERNKIQSELDGLQSDNEILKSAVEHHKVLLVEKDRELIRKVQAVKEEGYQKLVALQDEKLELENRLADLEKMKVEHDVWRQSEKDQCEEKLRASQMAEESARRELQSIRLKLQQQLVNIENAEKEKNENSDLKQQISSLQIQVTSLAQSENDLLNSNQMLKEMVERLKQECRNLRSQAGKAQLEVEKTLEEKQVQWLEEKHKLHERITDREEKYSQAKEKLQRAAIAQKKRKSLHENKLKRLQEKVDVLEAKREELETENQVLNRRNSIKGNSLYCGKD	2236	153458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2704_64385_64660_65112_65264_90152_90246_93293_93426_107190_107323_119255_119371_120602_120748_120858_121009_135113_135190_138181_138340_140174_140305_150067_150172_153116
904006	contig_10930_pilon	-	2545	7	Intergenic	novelGene_37001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	98	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	25	1587	280370	268388	FALSE	30	GACTACTTTGTTAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
904007	contig_16970_pilon	-	2899	1	Intergenic	novelGene_157610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163403	160504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_160500_163400
904008	contig_9683_pilon	-	4074	8	Intergenic	novelGene_151295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	152.340247539539	250	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	21	1070	927038	918040	FALSE	55	CACAGGATGAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAEVAASGSGEPREEAEASGPAWDESQLRSYSFPTRPIPRLSQSDPRAEELIENEEPVVLTDTNLVYPALKWDLEYLQENIGNGDFSVYSASTHKFLYYDEKKMTNFQNFKPRSNREEMKFHEFVEKLQDIQQRGGEERLYLQQTLNDTVGRKIVMDFLGFNWNWINKQQGKRGWGQLTSNLLLIGMEGNVTPAHYDEQQNFFAQIKGYKRCILFPPDQFECLYPYPVHHPCDRQSQVDFDNPDYERFPNFQNVVGYETVVGPGDVLYIPMYWWHHIESLLNGGITITVNFWYKGAPTPKRIEYPLKAHQKVAIMRNIEKMLGEALGNPQEVGPLLNTMIKGRYN	927058	915035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_918085_918872_918984_919215_919280_919671_919779_920597_920744_922806_922956_926325_926577_926861
904009	contig_2636_pilon	-	1294	4	Intergenic	novelGene_52049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	350.122835587741	144	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	123	392	85555	46943	FALSE	50	CTTACCAATAACAACAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQGDL	85677	46040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_46955_62471_62624_81113_81216_85551
904010	contig_1090_pilon	-	4415	1	Intergenic	novelGene_131147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2563	2865	509511	509209	NA	35	CTCAGGGGGGAGAAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKISIQDAHQTPHQVDPKRKSPRHTIIKFNINKEKQRTLRVTRDKRKVIYKGESITISSHYSAETLQARRLWDDTFKALKENNCQPKVIYPAKLSQI	512073	507658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_507700_512100
904011	contig_8357_pilon	-	1260	6	Intergenic	novelGene_39742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	260.996551701359	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	81	533	779990	762968	FALSE	25	AAACTTTATCTTGATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIEKLCKTEQDLALGTDAEGQKVKDSMRVLLPVLLNKNHDNYDKIRAILLYIFSINGTTEENLDRLVQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQVRNLDAIDNRLDSREWPYCSQCPAVWNGSGAVSARQKPRAHYLEDRKNGSKLIIFVIGGITYSEMRCAYEVSQAYKSCEVLRIF	783818	762240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_762986_763778_763918_773765_773852_779490_779610_779899_780039_783786
904012	contig_253_pilon	+	4277	12	Intergenic	novelGene_129615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	222.683557862157	254	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	269	1447	133058	160694	FALSE	15	GTGGCTCGTTTAACGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWLGDSKNMVVNGRRNGGKLSDDHLQTPSKLPHTGKDTLKAGRNAVERRSSRCNGNSGFEGQSRYVPSSGMSAKELCENDDLATSLVLDPYLGFQTHKMNTSAFPARSSRHFSKSDSLPHNNPVRFRPTKGRQEELKEVIERFKKDEHLEKAFKCLTSGEWARQYFLNKSKMQEKLFKEHVFIYLRMFATDSGFEILPCNRYSSEQNGAKIVATKEWKRNDKIELLVGCIAELSEIEENMLLRHGENDFSVMYSTRKNCAQLWLGPAAFINHDCRPNCKFVSTGRDTACVKALRDIEPGEEISCYYGDGFFGENNEFCECYTCERRGTGAFKSRAGLPAPAPVINSKYGLRETDKRLNRLKKLGDSSKNSDSQSVSSNTDADTTQEKNNAK	113271	163524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_113358_130785_130892_132981_133218_140013_140162_146394_146464_153736_153903_154301_154412_155795_155963_156277_156298_156381_156519_159992_160190_160689
904013	contig_1594_pilon	+	3426	1	Intergenic	novelGene_138815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	438	2987	3424	502870	503307	NA	40	GTCATGAGAAACGAGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWALWEEHGPFCAPLSSLPLPQGQADRKGSREPSPHQPSAPEVRGEAQHGQRALQWARSASERMALPPPLPQEGAAFSGLLWSVLGQLLHVPTHSSGPRREDPQELDIKHLSQPRKKDVLMEGDQFPEQWQCQHGGYYLAQKWWDG	499883	503309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_499900_503300
904014	contig_10811_pilon	-	6080	30	Intergenic	novelGene_165798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	120	524	456234	455830	TRUE	20	CTCCTCGCAGAAGCTCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGGCTLGIRGPATAGWAGMDITGLGMPGICCCGGRGPCCHWPGCMLDRTGPLTWLGRGTFKPTGAIWLTGVTMPVRPGGMPLLMLTRYRCCCCWASRSICRAASTAAGGGWAGGGGAGTWVVGFPVDTVVGG	456353	345605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_346173_387512_387691_400477_400718_402038_402155_410314_410557_412066_412171_412492_412640_413665_413783_414264_414438_414781_414825_416903_417030_417600_417789_418752_419164_420549_420730_421664_421857_426226_426346_429579_429818_430257_430347_435624_435708_437098_437156_441489_441567_441887_441957_444878_445029_445366_445515_446049_446165_447215_447381_447781_447950_452522_452685_453262_453545_455219
904015	contig_5794_pilon	-	2393	6	Intergenic	novelGene_69758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCGACACGGCCCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734495	695386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_695549_730264_730525_731314_731407_731976_732168_732761_733441_733486
904016	contig_8461_pilon	-	3858	12	Intergenic	novelGene_163921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	87.7081938745022	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	27	1544	498141	368901	TRUE	75	TTTAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSQDISVKMASDFLMKLSAANQKEPMNLNFKVKEEPKEEEAVSATLPPSSYVFSPESQVSAPSIPEDTLQPQEGKGNVLRRDMSVKAASELLMKLSAESYKETPMVKIKEEPMEVDIQDPHVSISPSQNVGYSTLIGREKTEPLQKMPEGRVPPERNLFSQDISVKMASELLFQLSEKVSKEHNHTKENTIRTTTSPFFSEDTFRQSPFTSNSKDLLPVQSVLHGRISAPETEKIVLEAGNGLPSWKFSDQLFPCDVCGKVFGRQQTLSRHLSLHTEERKYKCHLCPYAAKCRANLNQHLTVHSVKLVSTDTEDIVSAVTSEGSDGKKHPYYYSCHVCGFETELNVQFVSHMSLHVDKEQWMFSICCTACDFVTMEEAEIKAHIGTKHTGEDRKTPSESNSPSSSSLSALSDSANSKDDSDGSQKNKGGNNLLVISVVPGSQSSLNSEEKPEKGFECVFCNFVCKTKNMFERHLQIHLITRMFECDVCHKFMKTPEQLLEHKKCHTVPTGGLK	498167	363165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_365451_366880_366909_368899_369083_369436_369629_380064_380232_381945_382118_385818_385957_425752_425857_447170_447229_449561_449802_480082_480317_498110
904017	contig_7411_pilon	-	2070	11	Intergenic	novelGene_137054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	82.9325629653395	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1561	2022	991943	990105	FALSE	20	CACCTTTTCTAGCAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWQPCTTATTCCPTVPTAWRHPPPGIDVATYYSTLPAGVTVSSSTGVTTAPPPPGTTPPPPPSTAETSSGVTSTTTTTSALAPVAAIIPPPPDIQPVIDKLAEYVARNGVKFESSVRAKNDQRFEFLQPWHQYNAYYEFKKQFFLQKEGGDSAQSLQAAAAPEEAPAESAAEKPSEAVDDGASEDVAEGGGRAASGKKEAASGKAVPDGKLVKASFAPISFAIKAKENDLLPLEKNRVKLDDDSDDDEESKEGQESASCATNPNPAVVPPCVVVEEKKPQLTQEELEAKQAKQKLEDRLAAAAREKLAQASKESKEKQLQAERKRKAALFLQTLKNPLAEAEAGKIEESNFTVEEAGTTSPCAPLVAGRGLPALEGKPPDRPSSRSKDAPREEEREKKKKKHKKRSRTRSRSPKYHSSSKSRSRSHSKAKHALPSAYRTVRRSRSRSRSPRRRAHSPERRREDRSVPTAYRVSNSPGASRKRTRSRSPHEKKKKRRSRSRTKSKARSQSGSPSKQSAHRMSAHSASISPVESRGSSQERSRGSFSGKRWSDLVSNCFLCAKQNNSGPDGQSESNACSLQKPADQCLLSPRASCHTAQRQSRHRRGHGLPLQPEASEVTEPAEPRCVLLSRSSQKPPDVPPGLPQTGGGFCKLIFDDIFSLRFLTSSLLPVYL	1030936	990056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_990428_990900_990975_991878_992044_1000030_1000157_1006139_1006409_1020080_1020272_1021423_1021655_1027731_1027910_1028558_1028653_1029523_1029656_1030697
904018	contig_8702_pilon	+	3010	5	Intergenic	novelGene_157730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	49.6789693934969	226	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	42	734	49189	50693	FALSE	30	CTAACATACTGTGCATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGLDLKGSESPEMGPEVTPAPRDELVEAACALTCDWAERILKRSFSSIVEVARFLLQQHLISARSAHAHVLKAVGLAEEDEHAPRERSSKSKNGVENLEAGAQKKPEKPTQPPKELEPRAGAGASVRGERKKNVVETPAPAASNPQVNALVARLPLLLPRTPRSHLQPIRVSPPILAPRLPSGPLKVATLPLPSRGGGPPAAVPIINMILPTVPAACPGSGRWCYFQRSKGLQFPAYQRSGR	48844	52969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_48880_49182_49385_49628_49730_49893_50205_50608
904019	contig_4402_pilon	+	4059	10	Intergenic	novelGene_140798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_8	313.624332956201	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	130	1428	224421	245151	TRUE	35	TGGTTTATATGAAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYDEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSEINKMTPSNIAIVLGPNLLWAKNEGSLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEIEFNVSETFVPLAIPNSNHSPHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESPPIPKDSVSAAVPTPGRNSSQVTPGPNQAQAATSSHQLSVGPAHNSAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSPGTSQHPPSLSPKPSTRSPSPPTQHTGQASGQPSAAPQLSAPRRYSSSLCPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPSSQGSPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNSGLPASQTQAVSNPETVQPHGGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPHPPGAHSAGDGSLTSTVPTASKIVTGGEGSRD	223702	253957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_223791_224379_224462_226245_226327_228336_228451_230977_231070_232549_232707_236194_236365_243517_244139_245128_246943_253117
904020	contig_19730_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_142480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95165	92634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_92600_95200
904021	contig_6743_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_33545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTATCTTTTAAGATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202592	200973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_201000_202600
904022	contig_10050_pilon	+	3955	5	Intergenic	novelGene_119617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.0229564948946	19	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	199	1599	194332	300728	TRUE	45	GTACATAAATTATGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGERASCPRRPSDRASVRGPCQQAPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRGRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTQQDDLGDGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLPSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPMQTLQDSKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQSNSRVLGQNVMMGPNSVMPTYGSQVPHNKMMTPNSHTHPGHAQQTSAVNGRALPHAVSTMPHTSGLNRLTPGKTPLQVPLPPPMQMNALGGYSSVSSCHGYGRMGVLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDSVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG	193402	304502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_193478_194208_194395_299390_300747_301214_303269_304218
904023	contig_10734_pilon	+	3638	17	Intergenic	novelGene_51231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	503.129514731297	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1095	3288	246	3533	1243306	1297561	FALSE	30	ATTACTTATTTAGTAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNEVIRFEWLFVQRTAYRLHGSI	1198759	1297666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1240226_1240306_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381
904024	scaffold_19766_pilon	-	3856	20	Intergenic	novelGene_34250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.6242796014296	438	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1243	2226	157793	155425	TRUE	15	CACTTCCCCAGTGATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGWFDNLLLDIDKADAIVKMLDAAVIKMEGGTENDLRILEQEEEEEQAGKPGEPSKKEEGRAGPGLGDGERKANDKDDKKEDGKQAENDSCNDDKTKKSEGDGDKEEKKEDSEKEAKKSSKKRNRKHSGDDSFDEGSVSESESESESGQAEEEKEEAEEVLKEKEKPKEEEREKPKEAPGLECKPRPLHKTCSLFMRNIAPNISRAEIISLCKRYPGFMRVALSEPQPERRFFRRGWVTFDRSVNIKEICWNLQNIRLRECELSPGVNRDLTRRVRNINGITQHKQIVRNDIKLAAKLIHTLDDRTQLWASEPGTPPLPTVSDSP	166595	152682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_153647_154068_154263_154454_154609_154706_155632_155935_156015_156138_156201_156535_156694_156873_156992_157076_157176_157390_157576_157717_157888_158831_159167_159685_159875_160118_160266_160520_160650_165948_166089_166387
904025	SIRV6	+	799	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-11	513	-5	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
904026	contig_1734_pilon	-	3590	1	Intergenic	novelGene_164376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1802	2128	558049	557723	NA	20	TTTTTGCTGTATAGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFVETSQLIFHQFLEPCFLSVPSVQLGILPSVPSVLDHMLPPEMVECQPVLFGIVTLYSFHLLLILPASNINIFPIESFSIATGSFNFFFSSFSLRNAEHVLRLVF	559850	556260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_556300_559800
904027	contig_9437_pilon	+	1727	2	Intergenic	novelGene_141732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGATACCCTTCTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247835	268832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_249221_268490
904028	contig_16098_pilon	-	1671	11	Intergenic	novelGene_45962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1309.29292368056	28	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	101	1099	352350	349467	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKVVPSGRGWGRGGQERLGKDHGWRHLLVLILPLDLLPAGRQLYPVL	354089	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348434_348485_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
904030	contig_20794_pilon	-	819	5	Intergenic	novelGene_161386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	7.75806032459145	122	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	208	612	5565	276	FALSE	40	TATAATATTAAAAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVQKLQEAAEIVKSRCENLLHENNQITKNKNKKLEKFDGNHSLLTKLSLEEENYLIQLKCENLKQKLEQMDAENKELEKKLASQEECLKHSNLKFKEKSSEYIALARQLEAALEEGRQKVSEEIEKMSTRERALQIKILDLETELRKKNEEQNQLVCKFSSKAQHQEVCLKEIQHSLEKSENENESIKNYLQFLKTSYVTMFG	9474	68	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20794_pilon_-_405_2779_2906_5415_5579_5660_5747_9366
904031	contig_9801_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_167566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGAAGTGATGCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100718	101980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_100700_102000
904032	contig_12050_pilon	+	2828	2	Intergenic	novelGene_62711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1470	1862	677686	678078	FALSE	35	GCATGAGACTAAACGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQIAKINSQLEIIQKHTIRNPKDNKISEMDSVTEGLRSRFKTVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGVQEQREKTENTERIIEELTENFPNIIKMKS	643429	679044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_644068_676854
904033	contig_16776_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_130531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAAGGTGACTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56952	54918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_54900_57000
904034	contig_10581_pilon	+	3799	12	Intergenic	novelGene_41396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACACAGCGTCTTCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607624	649696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_609886_612474_612596_614122_614268_615223_615345_618989_619082_619574_619751_620292_620396_627358_627549_628814_629036_632023_632160_633201_633383_649644
904035	contig_6137_pilon	-	3508	20	Intergenic	novelGene_59163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	20	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3061	3462	1300361	1239072	FALSE	30	AGCAAGTGAGCTTTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERCLVKRTSCRAYCLIPFYLESSNKEPTTDCDPRSTCSEFLSLRNTQFPRLLQSTTTGNINQIFSSLQSWRLACPKVCGSGIGCRRLLTHVLQGLMNPEPTGQMAVCWLTGLWSWQIPKLAGQLTSYWLKS	1354909	1239025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1239268_1240379_1240521_1268906_1268969_1300358_1300429_1313652_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1323947_1328110_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
904036	contig_1594_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_138814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTGTGTGTGTCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499770	502128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_499800_502100
904037	contig_3111_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_129975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	336	746	67124	67534	NA	25	ACAGGGTCGCTATGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVSCWSLGSAASGFLPCLPPLLAVLHCLWCLLSAGSTWFSAQGPQVQRMRYALVSLFLVVVRSPLLASGMAHFKPTGRAKLTNLIRVPYTLFAWFCSHKSAIYIISKLFNPLGRQQAPYLHSATNHLVGVTRPW	66788	69126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_66800_69100
904038	contig_6412_pilon	+	3945	3	Intergenic	novelGene_149956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1365	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1027	1410	228962	229345	FALSE	30	AAGGAAGGGGAGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPTALHPAIQSLREFGCVSGASMTFPCTSCAGFPSIVYCLTLHQNYHLSVVYLVPPPLLPPLVTNKDCFFLCVNFYMSFYSRALIQYFSFCDLLISLSIMSSSFIYVTRCFTDSSLFCIIA	225231	231880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_225239_227288_227892_228545
904039	contig_7051_pilon	+	2899	11	Intergenic	novelGene_64331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_5	422.266373276395	70	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	208	1362	331836	343526	TRUE	40	AGAGAGGAGTCGAAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKGILWVSWFWFCGVFWFW	321840	347537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_344223_345366_345538_346867
904040	contig_5947_pilon	-	4192	2	Intergenic	novelGene_101477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTGTGTGTGTGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335925	320136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_323847_335443
904041	contig_9656_pilon	-	4452	6	Intergenic	novelGene_121918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	769	junction_1	129.402627484916	90	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	3811	4383	438091	430496	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVSHSTHRTFGKQQWQQLYDTLNAWKQNLNKVKNSLLSLSDT	441901	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_430617_431077_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026
904042	contig_5023_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_7308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGTTTCTGTTGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593698	595289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_593700_595300
904043	contig_13244_pilon	-	5057	11	Intergenic	novelGene_86943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_5	140.352591711019	374	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1054	3165	224	3388	292294	266457	FALSE	35	TTTAAAAGCATAAGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRQRIPRAGEVQFPLVTNSSALPSPCGCRRKELTKAQPFLPIVSPLLLCIPPELVRCLPPLPLTGALREPPSAMSSEESYRAILRYLTNEREPYAPGTEGNVKRKIRKAAACYVVRHGTLYYQRRQRHRKTFAELEVVLQPERRRGLIEAAHLGPGGTHHTRHQTWHDLSKTYWWRGILKQVKDYIKQCSKCQEKLDRSRPISDASEMLEELGLDLESGEESNESEDDLSNFTSPPTTASKPVRKKPVSKHELVFVDTKGVVKRSSPKHCQAVLKQLNQQRLSNQFCDVTLLIEGEEYKAHKSVLSANSEYFRDLFLEKGAVSSHETVVDLSGFCKASFLPLLEFAYTSVLSFDFCSMADVAILARHLFMSEVLEICESVHKLMEEKQLTVYKKGEVQTVASTQDLPEQNGVRIAPPVASSEGTTATLSTELEDCEIVLVVNGELPEAEQNGELGRQNEPQVSSEAEAALSPVQCITDCHPEMESVDLATKNNQVKLETSSSREDSTVSNIPPKLSKDSVISSSPENSDMGNDISTEDVCAEDTPEHRQNLAQPLKDQENLVTLTAKADLGPDDDTYRSRLRQRSVSEGGYIRLHKGMEKKLQKRKAVPKSAVQQVAQKLVQRGKKMKQPKRDAKENTEEATHKCGECGMVFQRRYALIMHTLKHERARDYKCPLCKKQFQYSASLRAHLIRHARKDAPTSSSSTSTSNEASGTSSEKGRTKREFICSICGRTLPKLYSLRIHMLKHTGVKPHACQVCGKTFIYKHGLKLHQSLHQSQKQFQCELCVKSFVTKRSLQEHMSIHTGESKYLCSVCGKSFHRGSGLSKHLKKHQPKPEVRGYHCTQCEKSFFEARDLRQHMNKHLGVKPFQCQFCDKCYSWKKDWYSHVKSHSVTEPYRCNICGKEFYEKALFRRHVKKATHGKKGRAKQNLEWVCEQCGRKFTQLREYRRHMNNHEGVKPFECLTCGVAWADARSLKRHVRTHTGERPYVCPVCSEAYIDARTLRKHMTKFHRDYVPCKIMLEKDTLQFHNQGTQVEHAVSILTADMQEQVSSGPQELETVVVTGETMEALEAVAATEECPSMSTLSDQSIMQVVNYVLAQQQGQKLSEVAEAIQTVEVEVAHISEAE	292517	264787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_266975_267523_267700_267831_267991_271079_271198_271898_272044_275242_275489_278695_278873_279114_279963_283158_283391_284063_284300_291984
904044	contig_8322_pilon	+	3350	5	Intergenic	novelGene_143242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	476	junction_4	388.522441436785	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1252	1974	294578	295697	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGRCTRNNLFSSNIVSL	290103	297073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_290226_291573_291673_292427_292713_293832_295076_295472
904045	contig_5602_pilon	-	1965	2	Intergenic	novelGene_133049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	0	354	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	78	599	868885	867894	FALSE	25	TATAATTGGTTGATTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVVTTVVPSTPPSQPPAVCPPVVFMGAQVPKGAVMFVVPQPVVQNTKPPVVSPNGTRLSPIAPAPGFSPSTAKVTPQMDSLRIRSHICSHPGCGKTYFKSSHLKAHMRTHTGEKPFSCSWKGCERRFARSDELSRHRRTHTGEKKFACPMCDRRFMRSDHLTKHARRHLSAKKLPNWQMEVSKLNDIALPPTSVPTQ	868962	866527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_868154_868623
904046	contig_6164_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_121254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCGCATTCAGTCTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17896	17306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_17300_17900
904047	contig_6361_pilon	+	4031	7	Intergenic	novelGene_23938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4803	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	418	747	326956	380251	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKASGIDRIPVEMFQQTDVTLKTRLCQEIWKTAILPTDWKRYLFVPIPKKADPRECRNDWTISLISHVNKILLKIILRWLQQYIDRNCQGYHC	326538	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_327271_380236_380564_405255_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
904048	contig_2770_pilon	+	1491	6	Intergenic	novelGene_107476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGAAGCGCGAGCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742982	750774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744574_744674_746594_746718_747758_747797_750560
904049	contig_8317_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_19886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16406	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
904050	contig_7165_pilon	+	3853	2	Intergenic	novelGene_116843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	229	615	274540	274926	TRUE	35	CTGTAGCATCTCAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSFLNDIKYNNKSTSNRIQNRSLGPHKNYLVHQRTLSKEEKDNLQTGKKIFRNHISNNGLISRVYIKLLPLNNKKQNSPIKKWAKAMNRYYTKEDTQADNKHIKRGSASGEVTSKVHHSARDWTAP	274311	279174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_276619_277628
904051	contig_9875_pilon	+	5049	3	Intergenic	novelGene_154405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	65	1302	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	133	2091	63136	133391	TRUE	85	AATGAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTWSKTIPGKVEFFSSEGSDTSIPIPVVPLQGVDDSYPPQKKSFMMLKYMHDHYLDKYEWFMRADDDVYIKGDRLENFLRSLNSSEPLFLGQTGLGTTEEMGKLALEPGENFCMGGPGVIMSREVLRRMVPHIGKCLREMYTTHEDVEVGRCVRRFAGVQCVWSYEMQQLFYENYEQNKKGYIRDLHNSKIHRAITLHPNKNPPYQYRLHSYMLSRKIAELRHRTIQLHREIVLMSKYSNTEIHKEDLQLGIPPSFMRFQPRQREEILEWEFLTGKYLYSAVDGQPPRRGMDSAQREALDDIVMQVMEMINANAKTRGRIIDFKEIQYGYRRVNPMYGAEYILDLLLLYKKHKGKKMTVPVRRHAYLQQTFSKIQFVEHEELDAKELANKINQESGSLSFFSNSLKKLVPFQLPGSKNEHKEPKEKKINILIPLSGRFDMFSRFMGNFEKTCLIPNQNVKLVVLLFNSDSNPDKAKQVELMRDYRVKYPKADMQILPVSGEFSRALALEVGSSQFNNESLLFFCDVDLVFTTEFLQRCRANTVLGQQIYFPIIFSQYDPKIVYSGKAPNDNHFAFTQKTGFWRNYGFGITCIYKGDLVRVGGFDVSIQGWGLEDVDLFNKVVQAGLKTFRSQEVGVVHIHHPVFCDPNLDPKQYKMCLGSKASTYGSTQQLAEMWLEKNDPSYSKSSNNNGSVRTA	63003	136756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9875_pilon_+_63502_131798_135724_136130
904052	SIRV6	+	1058	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	444	-11	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	15	GCATCGCGCGCCTAATCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
904053	contig_6227_pilon	-	1753	7	Intergenic	novelGene_49629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_3	62.6781904298102	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	564	1457	350023	341366	FALSE	40	GCATAAAATTTTAATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQKVQDCYFYQIFMEKNEKVGVPTIQQLLEWSFINSNLKFAEAPSCLIIQMPRFGKDFKLFKKIFPSLELNITDLLEDTPRQCRICGGLAMYECRECYDDPDISAGKIKQFCKTCNTQIHLHPKRLNHKYNPVSLPKDLPDWDWRHGCIPCQKMELFAVLCIETSHYVAFVKYGKDDSAWLFFDSMADRDGGQNGFNIPQVTPCPEVGEYLKMSLEELHSLDSRRIQGCARRLLCDAYMCMYQSPTMSLYK	350586	341069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_344676_344786_345745_345879_349057_349125_349959
904054	contig_7408_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_168758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATTGATTTTTTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91418	90705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_90700_91400
904055	contig_6975_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_74311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTTCCTTTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539397	536196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_536200_539400
904056	contig_12938_pilon	+	1055	3	Intergenic	novelGene_99744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAATGTCATCTCAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78105	86305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_78186_79040_79179_85468
904057	contig_3601_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_132949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACAATTTGGTTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453414	450865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_450900_453400
904058	contig_4103_pilon	+	1309	9	Intergenic	novelGene_51899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	60.6051513899602	3	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	185	568	58124	63452	TRUE	35	ATGCCGAAACCACTGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVRLQGERVRALKQQKAKAEKIEEEVAKLLKLKAQLGPDEGKQKFVLKTPKGTRDYSPRQMAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCVNPSAGRGRTPGHGQCGCWWTL	53935	66275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_58096_58217_60671_60768_61422_61553_63387_63556_65063_65181_65381_65529_65901
904059	contig_16768_pilon	+	2414	17	Intergenic	novelGene_168317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	905.368172261291	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1995	418	2412	28049	63713	FALSE	50	GGAAAAAGAAATTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHQESRKKSKNQILLTKKKCYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQESINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFEL	24119	63715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_24524_28035_28111_44559_44661_46402_46504_47347_47528_48858_49015_49108_49241_50677_50747_52995_53106_54492_54720_56809_56932_57012_57166_59017_59151_61964_62114_62304_62425_63204_63316_63644
904060	contig_6058_pilon	-	1705	9	Intergenic	novelGene_172406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	418.317761994396	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	300	893	398054	390909	TRUE	15	CTGTATTCTCCCTTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANI	401591	385239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_390912_391087_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302
904061	contig_2332_pilon	+	638	6	Intergenic	novelGene_58664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3074.96178838047	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	25	399	331257	333888	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENGMNLMFAFYLYYSLFYDLTNTFSILVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLVLLVPYLKPRKMS	330769	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331494_332053_332150_333846_333928_334162_334280_334756
904062	contig_14744_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_65904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACAAATCTCCTACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18041	16345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_16300_18000
904063	contig_12873_pilon	+	3642	3	Intergenic	novelGene_27215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2101	junction_1	679.5	278	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	55	438	16357	17076	TRUE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLQLLLVAVLLPGGDNEEAFQEPVSYHVIQIASYYNHSWEQNLGSGWLDELRTHGWESNSGTIIFLRPWSKGNLSKKEIKELEIGFRLYFAGLTREVHNYVSQFQVECESSSLNVKTGLGKGYVS	16302	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_19703_19851
904064	contig_10068_pilon	-	2967	8	Intergenic	novelGene_148704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	144.03046729843	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	99	1343	59848	44668	FALSE	70	ACTTAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEGSGRGGEFGMSSVSCGNGKLRQWLIDQIDSGKYPGLVWENEEKSIFRIPWKHAGKQDYNREEDAALFKAWALFKGKFREGIDKPDPPTWKTRLRCALNKSNDFEELVERSQLDISDPYKVYRIVPEGAKKGAKQLTLEDPQMAMSHPYTMAGPYPSLPSQVHNYMMPPHDRSWREYVPDQPHPEIPYQCPVTFGPRSHHWQGPTCENDCRLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDSGQRKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCSDRPNKLERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKLITAQVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQE	61151	43043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_44812_47648_47762_51231_51586_56355_56498_57186_57276_58180_58368_59632_59887_61091
904065	contig_14635_pilon	-	1752	1	Intergenic	novelGene_84370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACCTCATAAAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587462	585710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_585700_587500
904066	contig_4228_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_151170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	969	1346	427598	427221	NA	70	ATGATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLQYLALCFIQYSLTSTPNIQLSEEKTQIHTHTHTQSPSQAITIINQAIQVLVTLYPWYTIHDTVSYSTGFRGIGRSYRGGSPRLGLGKRSSNAYVAAFAADGDLIVQALPESVGNFSQFLKC	428566	427122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_-_427100_428600
904067	contig_8310_pilon	-	1906	13	Intergenic	novelGene_75583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1263	1568	302500	294655	FALSE	25	GGACCTCAGGGAGAAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPGPASTDGTFLFPFFQVSQHDNGCRFLFPDHSPKVIHRFLFRALSSYEFILFFVTIYVRSINIVGTGNSIHVAQNHPGMIIWGENSPSVRLSEPHLP	320713	294316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_294784_295440_295476_296626_296728_302459_302578_303836_303995_307968_308108_308705_308855_309223_309319_310953_311031_313065_313199_316630_316755_317712_317884_320574
904068	contig_6544_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_142093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGGATCCTTGGCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93868	96091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_93900_96100
904069	contig_3832_pilon	-	3192	14	Intergenic	novelGene_161442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_8	57.6602988127151	278	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	1	2034	518009	253357	FALSE	20	TTTTTTTGTCTGAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFNGYMRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGYQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTKQKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTAGTSDTFEGWVDLEPEGKVFVVITLAGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQGAMRRRVHQINGHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNINKVDSKITEQRFGINIPHKFNIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVELAKTLAGMGLQPGNISPTSKFVSRSTLRRQGKESTKEGNGVGVNSSNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARIKETGELYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHEKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLPQGGEHAILRHPFFKEIDWAELNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQL	518009	252198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_253504_255215_255360_275631_275821_276732_276872_325845_326001_366640_366815_366991_367136_370100_370229_372528_372659_374095_374182_378036_378072_380931_381083_447700_447765_517661
904070	contig_12951_pilon	+	2213	2	Intergenic	novelGene_68154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACTGGTAAGCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197935	200195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_199698_199744
904072	contig_11678_pilon	+	3669	3	Intergenic	novelGene_160823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2241	2552	16286	16597	TRUE	40	TTGGGTGATATCACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEYTVSSQSDERETPWGCGPHLYISRCSGFLLSLDPAAASCHLISCSWDLSCQLICQTWDSLICTACEWEPCSPTFRSWACQPLQLPDLGDASTLIHRLGTF	0	150173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_2172_16216_16700_149158
904073	contig_13301_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_153107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTATAATAACAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42702	43691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_42700_43700
904074	contig_13608_pilon	+	4225	1	Intergenic	novelGene_52388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	379	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTCATTTCCTAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434932	439157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13608_pilon_+_434900_439200
904076	contig_9997_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_169476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120950	122721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_+_121000_122700
904077	contig_602_pilon	+	2593	2	Intergenic	novelGene_134971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	813	1127	574616	574930	TRUE	75	ACAAAAAAAGACAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYWLEITKLFERILTKALSHLLNHAAFSRCTLYEKKKTKITHTGTTSFPLLKQKVKRYTCRPQSEGIFNLAGLHHQTGTITSCHNSTVCNNNNCFIPGVGQSLT	573803	577677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_576109_577389
904078	contig_13481_pilon	+	2096	5	Intergenic	novelGene_119449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_3	96.5255795113399	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	497	886	1091943	1093268	FALSE	15	TGCCCGTCTCTTAATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066922	1094478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071054_1071222_1083899_1083990_1091839_1092052_1092987
904079	contig_1150_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_61457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	729	2190	379	2568	334522	332333	NA	15	TACTCTTCTGTCTCATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDCKKIFDIENGTFERLTHLKVLSLSFNDLSHVPPKLPRSLTELYLSNTNIQNIGQEDFKELKNLTILDLSGNCPRCFNAPFPCKPCYGNSSIQIHPLAFQTLTQLRYLNLSSTSLQKIPATWFYNMSQLKVLYLEFNYLVHEIASGAFLRYLPSLEILDLSFNYARTEYPQYINISENFSKLMSLQVLHLRGYVFQELRKEDFLPLLGLPNLKAINLGINFIKQIDFTIFQHFHKLSIIYLSENRISPLVNDIRQDYTNSSSSQSHILKPRSTHTEFDPHSNFYHDTRPLVKPQCSIYGKALDLSLNSIFFIGQKQFEAFGDIACLNLSANGNGQVLHGTEFSAVPHVKYLDLTNNRLDFDDDKALTELVELEVLDLSYNAHYFRIAGVTHRLGFIKNLTQLKVLNLSHNSIYTLTEYNLTSMSLEELVFSGNRLDLLWNDEDDRYWHFFTFLRNLTRLDLSFNNLRRIPNEAFSNLPQSLTELYINNNMLHFFNWTLLQQFPHLRLLDLSRNKLSTLTNSLSTFTSSLQTLLLRQNRISHLPSGFFSEARGLVHLDLSSNLIKMINKSTLQTKTATNLAVLELGGNPFDCTCDIGDFRRWMDENLNVSIPRLTDVICASPGDQRGKCIVSLELTTCVSDAIAAIFFFFTFFVTTMVMLTAVAHHLFYWDVWFIYHMCLAKIKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVLNELRYHLEESEDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTIFVLTKKYAKNWNFKTAFYLALQRLMEENMDVIIFILLEPVLQHSQYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQSLKNVVLTENDSRYNNLYVDSIK	334900	332279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_332300_334900
904081	contig_8330_pilon	+	2488	12	Intergenic	novelGene_71786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_6	545.634576350409	171	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	277	861	852673	855118	TRUE	5	GCCCAGCCTTGGCGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSECHTRPSP	837474	857815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
904082	contig_14415_pilon	+	1689	2	Intergenic	novelGene_77627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_1	0	55	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTATAGGGGTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36101	39397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_36199_37805
904083	contig_15025_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_155982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	513	1109	105067	104471	NA	50	GAGAATAACAGCACAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFHPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLS	105579	103527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_103500_105600
904084	contig_2377_pilon	+	2419	3	Intergenic	novelGene_67905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	435	2014	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	54	959	253864	270942	FALSE	40	GTCACATTTTTAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSSLERISHTSLLSLSHSAPWHCGRCPHRAAPCSVRSLRVVPRAWVAQLGCSCGICWRALGSRHFLSEVTWQWCALFSHFCNFQLAQRLRLGSGPRLRNSNPAVSCGHRPGYRHRREHLISYHLQLRVMEPNDPSRVDSEFRYTLFPIFYSIIFVLGVIANGYVLWVFAHLYPSKKLNEIKIFMVNLTVADLLFLVTLPLWIIYYYNQGNWTLPSFLCNLAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQATTRKRGIILSLIIWVTILAAASYYLTMDSTNTVSNKTGNLHAA	253810	272402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_254208_269329_269871_270921
904085	contig_5686_pilon	+	2746	1	Intergenic	novelGene_45453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	708	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCAGTAATTCCACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220468	223214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_220500_223200
904086	contig_7171_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_101254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	5	322	812459	812776	NA	5	GTGGGCTGGGGGCTGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMESWDLDKVFVGHLALREHSNIPCFTLTPYPPRPRLLSSSLKSVSASLLLKMAAGWGGSCLSPVILEGGACVIWLPLLTTSSRFHWRKKPGPVQFKTLNKKKSVC	812454	814206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_812500_814200
904087	contig_12873_pilon	+	4369	2	Intergenic	novelGene_27132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	307	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2975	3274	19035	19334	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15933	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16403_16529
904089	contig_4486_pilon	+	2245	13	Intergenic	novelGene_38579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1311.55860418901	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	141	1232	343083	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPLLLRRGASTAAPWQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311767	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377413_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
904091	contig_9389_pilon	-	2235	4	Intergenic	novelGene_83891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	949	1413	101250	98625	FALSE	80	GTCAAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILLLPLVLVKFTAESWRLSEAWLLIRMLIGSWAVMARKFCCRARCMSRCCSSATSAIFFSGGSPDSSFSRSCSRAAACAATAAWAAAACTAAAWAATTGWPARETGRRPGTVMGMAESSSFLILGAGVMELPLVLAVRPSEGTGSLGEDSML	103150	97802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_98724_100096_100394_101181_101281_102232
904092	contig_4888_pilon	-	1669	4	Intergenic	novelGene_178802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	108	479	515326	478188	TRUE	70	TTAAAATTAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPNPLYLPISPPDRSCPFSLLYLLELRGTLLTSITLCPTVQSNPCLKSWPQKLFQFWADRESKGHAFWGSSSLIQTIKSSLLTRIWVLHPTFLLLHQGLSVVFPVRAIIGGSWTWRRM	515433	385435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4888_pilon_-_386007_449559_449676_477684_478206_514972
904093	contig_4103_pilon	-	6085	9	Intergenic	novelGene_51978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	154.493881351334	362	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	997	2994	63	3056	202183	185498	FALSE	35	ACCTCAGCTAACCAGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNKTKETPPTAHLILPEQHMSLAQQKADKNKINGEPRGGGAGGNSDSDNLDSTDCNSESSSGGKSQELNFTMDVNSSSDRRYPSVLLHSQEEKTSTTTSKTQARLEGEVNPNSLSTSYKSVSLPLSSPNIKLNLTSPKRGQKREEGWKEVVRRSKKLSVPASVVSRIMGRGGCNITAIQDVTGAHIDVDKQKDKNGERMITIRGGTESTRYAVQLINALIQDPAKELEDLIPKNHIRTPASTKSIHANFSSGVGTTAASSKNAFPLGAPTLVTSQATTLSTFQPTNKLNKNVPTNVRSSFPVSLPLAYSHPHFALLAAQTMQQIRHPRLPMAQFGGTFSPSPNTWGPFPVRPVNPGNTSNSPKHNNTSRLPNQNGAVLSSESPGLTTASCPITVSSVVAASQQLCVTSTRTPSSVRKQLFACVPKTSPPATVISSVTSTCSSLPSVSSAPITGGQVPTTFLPASTPQAQLSSQKMESFPAMPAPKEKVSTQDQPMANLCTPSSTANNCSSSASNTPGAPETHSSSSPTPPSSNTQEEAQPSIVSDLSPMSMPFASNSEPAPLTLASPRLVAADNQDTNNLPQLAVPAPRVSHRMQPRGSFYSVVPNATIHQDPQSIFVTNSVPLTPPQGPPAAVQLSSAMNIMNGSQMHINPANKSLPPTFGPATLFNHFSSLFDSSQVPANQGWGDGPLSSRVAADASFTVQSAFLGNSVLGHLENVHPDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSMDPSGSSPSSSSTPLTSFSSIPGTRVFLQGPAPVGTPSFNRQHFSPHPWTSASNSCDSPIPSVSSGSSSPLSATSAPPTLGQPKGGSASQDRKIPPPIGTERLARIRQGGSVAQAPVGTSFVAPVGHSGIWSFGVNAVSEGLSGWSQSVMGNHPMHQQLTDPSTFSQHQPLERDGSGMVAPSNIFHQPMASGFVDFSKGLPISMYGGTIIPSHPQLADVPGGPLFNGLHNPDPAWNPMIKVIQNSTECTDAQQIWPGTWAPHIGNMHLKYVN	202245	182468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_185558_185838_186004_186703_186880_187407_187660_188676_188854_195525_197139_200563_200714_201329_201477_201929
904094	contig_10205_pilon	+	7852	44	Intergenic	novelGene_143102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	84	junction_3	116.403486925966	294	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2296	6891	265	7155	133965	207510	FALSE	25	CTTCAAGGTCATGGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRGPGPGLLLLAVLCLGTAVSSTGASKSKRQAQQIIQPQSPVAVSPSKPGCYDNGKHYQINQQWERTYLGNALVCTCYGGSRGFNCESKPEPEETCFDKYTGNTYRVGDTYERPKDSMIWDCTCIGAGRGRISCTIANRCHEGGQSYKIGDTWRRPHETGSYMLECVCLGNGKGEWTCKPIAEKCFDHAAGTSYVVGETWEKPYQGWMMVDCTCLGEGSGRITCTSRNRCNDQDTRTSYRIGDTWSKKDNRGNLLQCICTGNGRGEWKCERHASVQTTSTGSGSFADVRTAIYQPQPHPQPASYGHCVTDSGMVFSVGMQWLKTQGNKQMLCTCLGNGVSCQETAVTQTYGGNSNGDPCVLPFTYNGRTFYSCTTEGRQDGHLWCSTTSNYEQDQKYSFCTDHSVLVQTRGGNSNGALCHFPFLYNHRNYTDCTSEGRRDNMKWCGTTQNYDADQKFGFCPMAAHEEICTTNEGVMYRIGDQWDKQHDMGHMMRCTCVGNGRGEWTCVAYSQLRDQCIVDDITYNVNDTFHKRHEEGHMLNCTCFGQGRGRWKCDPVDQCQDSETRTFYQIGDSWEKHVHGVRYQCYCYGRGIGEWHCQPLQTYPGSTGPVQVIITEGPSQPNSHPIQWNAPEPSHISKYILRWKPKNPPGRWKEATIPGHLNSYTIKGLTPGVIYEGQLISVQQYGQREVTRFDFTTTSTSTPVTSNTVTGETTPFSPVVATSESVTEITASSFVVSWVSASDTVSGFRVEYELSEEGDEPQYLDLPSTATSVNIPDLLPGRKYIVNVYQISEEGEQSLILSTSQTTAPDAPPDPTVDQVDDTSIVVRWSRPQAPITGYRIVYSPSVEGSSTELNLPETANSVTLSDLQPGVQYNITIYAVEENQESTPVFIQQETTGVPRSGKVPPPRDLQFVEVTDVKITIMWTPPESAVTGYRVDVIPINLPGEHGQRLPISRNTFAEVTGLSPGVTYNFKVFAVNNGRESKPLTAEQTTKLDAPTNLRFINETDVTVLVTWTPPRAWIAGYQLTVGLTRGGQPKQYNVGPSATQYPLRNLQPASEYTVTLMAIKGNQQSPKVTGIFTTLQPLGSIPPYNTEVTETTIVITWTPAPRIGFKLGVRPSQGGEAPREVTSDSGSIVVSGLTPGVEYVYTISVLRDGQERDTPIVKKVTTPLSPPTNLHLETNPDTGVLTVSWERSTTPDISGYRITTTPTNGQQGYSLEEVVHADQSSCTFENLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIPAVPPPTDLRFTNVGPDTMRVTWAPPPSIELTSFLVRYSPVKNEEDVAELSISPSDNAVVLTNLLPGTEYLISVSSVYEQHESIPLRGRQKTGLDSPTGFDSSDITTNSFTVHWMAPRATITGYKIRHHPERASGRPREDRVPPSRNSITLTNLNPGTEYVVSIIAVNGREESPPLVGQQSTVSDVPRDLEVIAATPTSLLISWDAPAVTVRYYRITYGETGGSSPVQEFTVPGSKSTATISGLKPGADYTITVYAVTGRGDSPASSKPISIDYRTEIDKPSQMQVTDVQDNSISVRWLPSSSPVTGYRVTTTPKNGPGPSKTITAGPDQTEMTIEGLQPTVEYVVSVYAQNRNGESQPLVQTAVTTIPAPTNLKFTQVTPTSLTAQWVVPNVQLTGYRVRVTPKEKTGPMKEINLAPDSTSVVVSGLMVATKYEVSVYALKDSLTSRPAQGVVTTLENVSPPRRARVTDATETTITISWRTKTETITGFQVNAIPANGQTPIQRTIKPDVRSYTITGLQPGTDYKIHLYTLNDNARSSPVIIDASTAIDAPSNLHFLATTPNSLLVSWQPPRARITGYIIKYEKPGSPSREVVPRPRPGVTEATITGLEPGTEYTIYVIALKNNQKSEPLIGRKKTDELPQLVTLPHPNRHGPEILDVPSTVQKTPFITNPGYDNGNGIQLPGTSGQQPSVGQQMIFEEHGFRRTTPPTTATPVRHRPRPYPPNVDEEIQSGHVPRGDVDHPLFPHILGLNPNASTGQEALSQTTISWTPFQESSEYIISCHPVGIDEEPLQFRVPGTSASATLTGLTRGATYNIIVEAIKDQKRHKVREEVVTVGNSVNEGLNQPKDNSCFDPYTVSHYAIGEEWERLSDSGFKLSCQCLGFGSGHFRCDSSKWCHDNGVNYKIGEKWDRQGENGQMMSCTCLGNGKGEFKCDPHEATCYDDGKTYHVGEQWQKEYLGAICSCTCFGGQRGWRCDNCRRPGAEAGPDGSTGHSYNQYSQRYHQRINSNVNCPIECFMPLDVQADRDDSRE	133700	208207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_134113_135096_135226_136324_136463_138084_138217_139393_139532_141933_142093_144405_144598_145622_145803_146421_146599_147888_148042_149315_149445_150979_151124_155725_155848_158629_158811_159005_159183_160219_160349_160451_160542_161654_161850_162994_163268_165210_165478_169683_169779_171433_171603_172036_172124_175867_176060_178755_178939_181724_181815_183098_183369_184453_184571_185654_185820_186360_186517_187216_187331_190082_190271_191895_191984_192872_193050_194185_194276_194534_194715_195878_195969_196933_197401_198353_198493_200746_200912_203224_203351_203881_203989_206780_206892_207438
904095	SIRV6	+	1387	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	29	112	-8	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	229	720	1733	10736	TRUE	35	GCGGTCTTCAAAGTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1116	11713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
904096	SIRV7	+	1587	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	903	50	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGTTAATATGCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001	3897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1733_2020_2679_3001_3111_3808
904097	contig_2917_pilon	-	2242	2	Intergenic	novelGene_147601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	0	85	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCTTGTGAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124090	110978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_113116_123985
904098	contig_6270_pilon	-	4205	17	Intergenic	novelGene_99833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.21030729568982	262	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATTTACAAAGTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454038	166983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_167909_169119_169390_181104_181181_183180_183268_187324_187433_194218_194348_194944_195156_208924_209143_237851_238036_238953_239046_285756_285888_290589_290705_291890_291987_302376_302447_304625_304745_391262_391348_452749
904099	contig_6364_pilon	-	2488	11	Intergenic	novelGene_51845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1741	2196	1772732	1714508	TRUE	10	CACCAGCCCCTCCTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPCLVGVLGLEEVPCRKVSLCWSVILGQERFPGRKRSPCWVEGLVLEEAPGQERGPCWLRDLRHLAPSLHPRASPFSHLPLSQTSGSVGDAANCCCLAMFSDRHQHTLFFCSCECASKVNKHSAFSARYSTQNFRSSEEPSCSFTLWR	1787716	1708043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1708251_1714422_1714535_1719465_1719510_1727357_1727477_1772466_1773438_1781108_1781176_1784680_1784784_1785175_1785238_1785826_1785992_1786770_1786992_1787299
904100	contig_2027_pilon	+	3970	20	Intergenic	novelGene_39923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	172.447848313082	1	98	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	1413	2474	166680	170260	FALSE	40	AAAAGCTATCATTTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFGHPLLLSVPRDRLTWDALYHILLYRLSRYVARPSSDDEDDGDEKGDTENKGNIAKSGQTAGGSLQDPGPEQAGPSSGVVGRNRAPADNSPGPSNWPQRSRRKQLFTLQTVNSNGTSDRMTFSEDGHGVSFSSQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGFVKHECVSYVLKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPNCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDILVEFPIRDLDLSEFIIKPRSESDPDLYKYDLIAVSNHYGGLRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVTEDEVESKAAYVLFYQRQDVARRLRSQPDLSGPPRTPCLWFPTQL	155997	171756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_156094_162155_162266_162426_162558_162888_163007_163410_163557_163695_163758_163880_163981_164378_164553_164657_164817_165188_165296_165745_165855_166579_166769_167451_167505_167700_167962_168038_168110_168346_168460_169410_169561_169655_169772_169964_170054_170140
904101	contig_18898_pilon	+	2979	17	Intergenic	novelGene_77635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	389.595543480672	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	12	1886	39761	70148	FALSE	25	GTTGTATCTTGAAACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQEVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVLELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMSLRLNEQYEHASVHLWDLLEGKEKSVCGTTYKALKEIVERVFQSNYFDSTHNHQNGLCEEEEAASAPTVEDQVAEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFMAETQFSSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQTQAASPSVPEPHSLTPVAQADPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQNMDMPQLVCPPVHSEPRLGQPNQVPVQAEATQVPLVSSTSEGYTSSQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDPTTAASSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSQDQPHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGSRGLMNGYRGPANGFRGWISAEFQARLWAEWTTGSPTRSWRAPKTQQRDAANEHSASELI	39749	71241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_+_39818_53324_53388_53471_53559_56519_56759_56851_56935_59827_59966_61120_61174_61250_61338_62145_62302_62388_62498_63949_64012_64580_64692_64910_65061_66092_66244_67304_67500_68476_68541_70078
904102	contig_7378_pilon	-	2377	3	Intergenic	novelGene_120246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	116	junction_2	20	33	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAGCAATGAATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300426	296990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_297210_297956_298030_298341
904103	contig_12019_pilon	-	2831	3	Intergenic	novelGene_87764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	677	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGGTTCCCAATAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857655	667859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_669745_700729_701584_857563
904104	contig_11056_pilon	-	1987	6	Intergenic	novelGene_130391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	215.590723362579	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	211	855	679018	645867	FALSE	20	TGCCAGTGTCCTTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPKTLIPHPISTPSKSAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPTSPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPSSAMQAPTVCIYLNKNGNTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTVFSFLKQGHGGEVISAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHSHDRYLPGDTFVLGNSLSRSLEPHSDPMDSALNPNNLVVSTSQNLRAPAYRPLLPSCGLPQSTASAVRRLCSRGDRRQGPASVAQ	684474	644734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645905_655567_655766_667867_668060_670511_670713_679002_679130_684375
904105	contig_7271_pilon	-	4874	4	Intergenic	novelGene_159952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_3	140.528368033726	757	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	8	454	556626	479323	FALSE	30	TGAGAAGCCAGAAGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMHMLNGALLALLFPVVNTRLLPFELEIYYIQHVMLYVVPIYLLWKGGAYTPEPLSSFRWALLSTGLMFFYHFSVLQILGLVTEVNLNNMLCPAISDPFYGPWYRIWASGHQTLMTMTHGKLVILFSYMAGPLCKYLLDLLRLPIKKID	556633	474902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_-_479530_481255_481357_515238_515318_556566
904106	contig_6589_pilon	+	2407	3	Intergenic	novelGene_25797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3763	junction_2	485	34	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	505	807	669284	669586	TRUE	20	CTAACCACGGGCCCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQESILSPAPGEHRSLTLQSPPPSDTEVQIQPHPPSDPRVPSSSPLLPQTRKSPPPAPSSSDPGVLSLSPLLPQTQEFEPPTLPPSDPGVQVSSLLHQ	668779	672836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_669748_670000_671188_672584
904107	contig_14666_pilon	-	3008	6	Intergenic	novelGene_39506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1085.02173250124	56	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	264	782	458202	323157	FALSE	30	TCAAAAATTTTGACTCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWVSSSY	475160	320930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_323170_450760_450929_451950_452102_453686_453867_458195_458360_475054
904108	contig_15456_pilon	+	4444	2	Intergenic	novelGene_139485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	263	574	61992	62857	FALSE	30	GTATTATAGGTCACTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALFGFSSLDHYHFFSSLQGGTSVNLKTFVQTILKVPLSGTSVAHLTGPTGVKVETTHGRVTVSPACRVSVPFACRITGIFSVQVSWRNRTIEGNKVRIIVL	61729	66727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_62090_62643
904109	contig_11846_pilon	+	4005	4	Intergenic	novelGene_105916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	315	junction_2	95.9664293154411	160	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	3647	4003	177196	181653	FALSE	30	TGCCAAGTCAACCCCGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVVDSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLPSATSLSPTQVVSQLPTGPDSRETLFLAEQPPPPPPPLLAPSLTNGTAVP	148496	181655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_148677_173729_177257_180800_180977_181533
904110	contig_5210_pilon	+	1039	4	Intergenic	novelGene_65453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	55.6496980125579	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	376	1011	614712	622124	FALSE	45	CCAATCCCTAAAAGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMLKDRRMTVVGRLEGLIQPDDLINQLTFIMDANQTYLVSERLEREERNQTQVLRQQQDEAYLASLRADQEKERKKREERERKRRKEEEVQQQKLAEERRRRNLQEEKEKKLECLPPEPSPDDPESVKIIFKLPNDSRVERRFHFSQSLTVIHDFLFSLKESPEKFQIEANFPRRVLPCVPSEEWPNPPTLQEAGLSHTEVLFVQDLTDE	614336	622152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_614849_616480_616653_617262_617407_621941
904111	contig_14023_pilon	+	2277	2	Intergenic	novelGene_165375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	172	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	531	1746	2276	230217	254541	FALSE	25	AGTTAGTAGTCGCACAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQNSQIILMIIGVSREVTVTIQVQEHSGYSSSIRTASFQSCYQACLSLALGLCLKALSFLSPWDRRPTTLSPVVGSLLLPLLTVFRITAHLLSLHLLLPKASQHRDPRSKGCAGSWLFFLGSGGLFSVSHLLGGSFQTQQDSKTDHPLGGPQLPYHTVIWVGFTRPWLERPHKSH	228471	254542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_230660_254453
904112	scaffold_4805_pilon	-	1990	11	Intergenic	novelGene_161016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	74.2350321613724	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	59	1057	533627	469737	TRUE	75	AGAAAATACAAACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGAGGVRPGRGALVAEVMASWAALSPSIVEYFEGEDFYRCGYCKNESGSLSRGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRVVRSSPPSSQFKATFQESYQIYKRYQMIVHKDPPDKPTVSQFTRFLCSSPLERNCFH	533685	384949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_385680_406635_406757_469654_469755_495372_495406_512475_512605_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_533521
904113	contig_854_pilon	+	3161	15	Intergenic	novelGene_36486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2811.01897422792	14	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	176	1228	1649514	1679435	TRUE	25	TTTCCACTGAGCGTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGTGLVLLWVRGRR	1612770	1716367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679496_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165
904114	contig_12948_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_126213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTTATTGCATACCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266405	265394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_265400_266400
904115	contig_9653_pilon	+	6188	2	Intergenic	novelGene_48325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	249	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATCCCCACAAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029347	1035712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1034805_1034981
904116	contig_3394_pilon	+	3784	1	Intergenic	novelGene_152686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	389	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449302	453086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_449300_453100
904117	contig_6434_pilon	-	2753	2	Intergenic	novelGene_61886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTAGTTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893224	888669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_889511_891312
904118	contig_13481_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_119326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315580	312766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_312800_315600
904119	contig_8671_pilon	-	3012	1	Intergenic	novelGene_126250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	76	312	442912	442676	NA	20	GTGCTAATCGCCAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAIPFLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	442987	439975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_440000_443000
904120	contig_6576_pilon	-	3251	2	Intergenic	novelGene_42277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1069	junction_1	0	36	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2094	2570	326684	323781	FALSE	55	AAAAAAAAATTCTTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	328777	323099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_326528
904121	scaffold_2602_pilon	+	3745	11	Intergenic	novelGene_127698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	365	junction_7	400.979001943992	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	330	683	47545	54259	TRUE	75	AAGATAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRLETFFGLIIGTCIRIT	44558	68845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_56771_57959_57997_58068_58133_58241_58305_65344_65480_68593
904122	contig_3382_pilon	-	3103	16	Intergenic	novelGene_124197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	48	junction_12	112.76808059021	126	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	208	1437	1443363	1395030	TRUE	40	GAAAACAAACGTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQNQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPATNNTIQFYCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQPQMPKQSPVVEQNPQPPGGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQRQQVQRRPAPVGLPNPRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLAPHPQQLRYPPSQSLPRPVVKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQAAPSAATSTSSTPSSPTITSAAGYDGKAFGSSMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNLMRKDPNIDHGQPRPPSNRTVQSPNSSVPSPGLAGPVTMTGVHPPNALT	1446913	1378832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1379613_1380458_1380609_1382391_1382467_1391045_1391179_1392175_1392505_1393799_1393972_1395002_1395077_1397716_1397853_1400313_1400488_1401191_1401366_1406979_1407249_1417133_1417252_1436149_1436297_1439432_1439548_1443313_1443431_1446773
904123	contig_302_pilon	-	1467	14	Intergenic	novelGene_145004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_2	254.467514579624	243	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1398	69	1466	58213	12537	FALSE	5	TGGTTTTTATTCTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQDLPEQPVKKVKMQESGEQTLSQVSNPEVSDQKPETSSLASNLTMSEEIMTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQSQPYAVYPQATQTYGLPPFASSTNASLISTSSTIANIPTAAVASISNQDYPTYTILGQSQYQACYPSSSFGVTGQTNSDTESTTLAATTYQTEKPAVMVPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDADDQSRKNMTGKNRGKRKADTSSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIG	58281	12535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_12661_13696_13812_16105_16267_18649_18709_20798_20889_22294_22379_23217_23358_25365_25544_28178_28265_43989_44127_46988_47056_51719_51800_54397_54442_58180
904124	contig_990_pilon	+	4817	27	Intergenic	novelGene_76161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_19	157.871736568331	657	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	1663	3465	1895705	1919720	TRUE	20	GCTCATCTCAGATGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFSVTGRVLNGPEGEGVPEAVVTLNNQIKVKTKADGSFRLENITTGTYTIHAQKEHLYFETITIKIAPNTPQLADIIATGFSVCGQISIKRFPDTVKQMSKYRVVLSSQDKDKSLVTVETDAHGSFCFKAKPGTYNVQVIVPEVETRAGLTLKPQMFPLTVTDRPVMDVGFVQFLASVSGKVSCLDTCGDLLVTLQSLSRQGEKRSLQLSGKVNSMTFMFDSVLPGKYKISIMHEDWCWKNKSLEVEVLEEDVSAIEFRQTGYMLRCSLSHAITLEFYQDGNGPENVGIYNLSKGVNRFCLSKPGVYKVTPRSCHRFEQAFYTYDTSSPSILTLTAIRHHVLGTITTDKMMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLHDERIPV	1883526	1933041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1883629_1884968_1885076_1887670_1887744_1890852_1892128_1892648_1892739_1895689_1895796_1895977_1896129_1901768_1901944_1903810_1903953_1905047_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911080_1911145_1911719_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919696_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769_1929890_1930456_1930550_1932419
904125	contig_4496_pilon	+	4076	13	Intergenic	novelGene_66646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	119.564574603015	426	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	17	964	689129	747754	TRUE	20	TTTTTATGATTCTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRIAAMEGARSEPERQLQPAPLEPLGGLDAEQDAAVGEEAEGDLEEGSEDRKMTENNFSLKKIEISVSEAEKRSGRNAVNMQETYTAYLVETRSVEHIDGQSVLTDSLWRRYSEFELLRSYLLVYYPHVVVPPLPEKRAEFVWHKLSADNMDPDFVERRRIGLENFLLRVASHPILCRDKIFYLFLTQESNWKETVNETGFQLKADSRLKALNATFRVKNPDKRFTELKHYSDELQSVISHLLRVRARVADRLYGVYKVHGNYGRVFSEWSAIEKEMGDGLQSAGHHMDVYASSIDDILEDEEHYADQLKEYLFYAEALR	689112	758134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_689270_705632_705755_707657_707794_707868_708019_709514_709563_717024_717081_725591_725665_735034_735097_743050_743117_747660_749453_752295_752442_753351_753467_756981
904126	contig_11855_pilon	-	1684	9	Intergenic	novelGene_66964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2029.27873578274	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAACTAGTCCGTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102197	1077222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084575_1085889_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1101936
904127	contig_2710_pilon	-	5284	13	Intergenic	novelGene_161777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	213.728588921141	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	139	543	1019615	961218	TRUE	15	GATTTTGCTCTAGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSSQFRSQGKPIELTPLPLLKDVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFMDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGCLTEQTYPEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQEFQPSIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYVCL	1106555	940021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_944151_948310_948413_950426_950555_956497_956618_958356_958408_958511_958566_960067_960177_961169_961230_961412_961485_985987_986081_992008_992111_1019489_1019687_1106488
904128	contig_9008_pilon	-	2789	14	Intergenic	novelGene_58615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_13	48.7282040488102	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	69	1553	108627	66778	FALSE	25	AATCCTTTCACTTACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YERRGGGACGGEAGGLLGNVLSMSDKDDTETPVITEVTPILKDGNCEPAKSSESVNQSTKPESKSGPVASTRKRPEARSSNDCETAEVLPVQASQAAGKEPVSKEVPQTGWGYWGSWGKSLLSSASATVATVGQGISNVIEKAETSFGIPSPSEISAQVHYASGEKNAEEAGSFGLFSTISTAVQSTGKSVISGGLDALEFIGKKTMDVIAEGDPGFKKTKGLMNRNSTLSQVLREAKEKEELWTCNEVTVETDKKTHYGLLFDEFQGLSHLEALEMLSRESEIKVKSILNSLSGEELETLKLELEQLKEVFSLAEFTEEEEEEKKGDEDFTKEITELFSQLHVSSKPEKLARARSTAYEWIATSLTKPLAEKEDGEKCLEVESTEQANKNSVEDIHSFAIRSLAELTACSIELFHKTAALVLHGQKQEVTAIERSRTLSQVTVVLCKELSALSKEFTTCLTTAGVKENADVLNPLITAVFLEASNSASYIQDAFQLLLPVLEISLIESKTESLQA	112556	65541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_-_66880_77229_77284_79700_79774_80835_80976_81679_81803_86239_86320_95629_95754_96410_96570_97081_97217_98372_98444_107435_107529_107964_108065_108396_108642_112502
904129	contig_8744_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_173637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	528	827	7213	6914	NA	20	TGGGGTTGTTAACCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTESSKTRWCPATTTDCSGQDHNRGFWTELEEDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVRSSPRFTVQPGSGQPHKTKWD	7740	6585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8744_pilon_-_6600_7700
904130	contig_835_pilon	-	3057	1	Intergenic	novelGene_152170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1049	1402	347934	347581	NA	35	CGACAGACTCGTAGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKDWSLLITCSKYMTRSLATLASKEHSGCTTSKTDLFVLLAVHGIFNILRQHYNSTLLWSSLLTAQLSHASEVTENTMAWVRCTVVLKVTSLFFNTLERSFAADLPSAICRLVS	348982	345925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_345900_349000
904131	contig_14666_pilon	+	1186	6	Intergenic	novelGene_39612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1732.84568268499	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	69	1073	477340	485115	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDRES	477271	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483930_484280_484930_485104
904132	contig_11448_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_66341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146264	148602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_146300_148600
904133	contig_4908_pilon	-	2705	2	Intergenic	novelGene_117380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAAAAGCCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226427	222393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_-_224828_226156
904135	contig_2332_pilon	+	2793	4	Intergenic	novelGene_58668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6257	junction_3	538.296283554781	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	485	841	331257	332173	TRUE	10	CATTTGCGTCTTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENGMNLMFAFYLYYSLFYDLTNTFSILVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLVSRLVNK	330772	334837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331494_332053_333928_334162_334280_334756
904136	contig_18251_pilon	+	2459	1	Intergenic	novelGene_50168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52863	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_52900_55300
904137	contig_7411_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_136968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	362	1089	1207	2295	87309	86221	NA	55	ATTAATAGGAAAGAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERILSHCPEDSSFKGGWKCVADTEMLQRSQGCIRQVTVSHQEALAQHMSINTVEKPYGCHECGKTFSRRFSLVLHQRTHTGEKPYVCKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHMGKKQYICRKCGKAFNSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRSSHLTRHQSIHTTKTPYECNECSKAFRCHSFLVKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLTQHMKIHTGEKPYACAQCDKAFSRSFSLILHQITHTGEKPYVCNVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLENPYEYENSFNYHTFLTEHQRIHIVEES	88515	85845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_85800_88500
904138	contig_4812_pilon	-	1336	3	Intergenic	novelGene_103718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_2	70.5	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAACAAGAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947348	944163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944451_944834_944939_946403
904139	contig_13878_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_165743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTATTCTTGGTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323009	320816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_-_320800_323000
904140	contig_4232_pilon	-	766	2	Intergenic	novelGene_63387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGAAGCGTAGAAGATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468088	467249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467676_467748
904141	scaffold_15027_pilon	+	2874	14	Intergenic	novelGene_163563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	158.972886676392	486	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	979	1917	88327	105053	TRUE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLCTPANFLTIEMMESVQYLVAVYF	48902	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82650_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_105828_106597
904142	contig_4385_pilon	-	3557	23	Intergenic	novelGene_141498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.6200749359201	480	98	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	194	1339	316493	313191	TRUE	40	TATATAATGTCAAACTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRWWSSHEGRYEARVASGHVEGHQGSAASISTCEGLRGFFRAGSAVHLIEPLDSAEEGRHALYQAQHLQQKRGTCGVSNASLEHILGPRIAAAFRPRDRPLSQEPRHVELYVVTDSTEFQQFGSQEALRRRVLEVVNHVDKVLYQELGLRVALVGLEMWSRDKISVSPQADHTLENFLAWRKKDLVGRHAHDNAQLITGVDFSGTTVGLAKVASMCSQASAAVNQDHSQNPVGVASTMAHEMGHNLGMDHDENVHGCYCPVPRDSGGCVMAASIGLKFPRMFSQCSRADLETFVENPQTDCLLGTLDPHRLVSDPVCGNKFLERGEQCDCGSVQECQDPCCNASSCRLTEGGCVCSGCLLSQVPGEAGWRVVPCPQGCV	318177	301313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_302426_302905_303041_305403_305458_305721_305789_306246_306440_307550_307666_310599_310685_312013_312092_312393_312557_312898_312972_313047_313238_313369_313461_313803_313982_314118_314268_314497_314580_314764_314932_315345_315418_315502_315566_315774_315956_316303_316363_316436_316538_316781_316859_318105
904143	contig_1301_pilon	-	1314	10	Intergenic	novelGene_47330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_3	340.745297876128	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	250	1314	296953	269193	FALSE	70	CAAGAAAATGAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTRE	297886	269192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691
904144	contig_11364_pilon	+	6690	2	Intergenic	novelGene_65159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1697	174	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	369	668	74020	74319	TRUE	30	CTAAATTGGCAAATGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEYSTARWCLATTSDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNTRKKDQIYWPEKDWRNPESMAPGHPFSSVMKSFLRFTIQPGIGQPRKTERD	73651	80644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_79867_80169
904145	contig_17407_pilon	-	2425	2	Intergenic	novelGene_178803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1756	2370	1441	827	FALSE	35	AGCCAGATACCAGTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETWRVMCDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTEKITEELLTENFPNIVKDEKLAVQEAQQTPYRIDPKRKSSRHIIITLDKTKDKQRILRTAHEKQEITYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYQTLKEKNCQPRKIYPAKLSFKYDDEIRTFPDKQKLREYVNLQELLKGVL	3450	771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17407_pilon_-_2309_2562
904146	contig_8156_pilon	+	2817	1	Intergenic	novelGene_98918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGACTGCCAGAAGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172206	175023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_172200_175000
904147	contig_3627_pilon	+	2348	9	Intergenic	novelGene_78459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_5	332.593971683192	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	231	1019	312574	315236	TRUE	70	GATAAAAAAGAAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQALNANPFFYFRFSQAQEHRHKCTPHTT	309436	323577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_316050_318589_318776_320225_320418_323439
904148	contig_817_pilon	+	3417	1	Intergenic	novelGene_132449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2407	2733	551593	551919	NA	40	GCCCCAGCAAATAACGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYLCASMWWLVYVLVVNCHDLVRKGMFSTRSLVLRFGSLGCPMGCLPHGVKLLNLRLAGRIKWLGALTSTLLLPLTCKVFNLEKGHYLNVGSAVFRLFKYYAEMSL	549186	552603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_549200_552600
904149	contig_504_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_54397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAAAATCTTTTAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15499	13933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_13900_15500
904150	contig_2854_pilon	-	2016	11	Intergenic	novelGene_120834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	100.225196432833	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	115	1818	333259	257841	FALSE	10	TCTTCCGTGACTTGAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLEYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGCREHILEDAKPESVDDTTDLALPPEMPILIDFHALKDILGPPMYDMEVSERLSQPGVAIGLAWTPLGGEIMFVEASRMDGEGQLTLTGQLGDVMKESAHLAISWLRSNAKKYHLTNASGSFDLLDNTDIHLHFPAGAVTKDGPSAGVTIVTCLASLFSGRLVRSDVAMTGEITLRGLVLPVGGIKDKVLAAHRAGLKQIIIPQRNEKDLEEIPANVRQDLSFVTASCLEEVLNAAFDGGFAVKTRPGLLNSKL	333373	257642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_258063_262649_262841_264212_264421_274368_274512_300455_300590_303945_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215
904151	contig_17796_pilon	+	4552	6	Intergenic	novelGene_33757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_3	162.139446156696	54	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	387	671	12080	13839	TRUE	40	CAAGGACATGTCATACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRLIGSSSAACLLLSGNNVIWDKEAPICESISCEPPATIAHGYFNSSNRKLFHYGTVVTYYCHTGPSGEKLFDLVGETSIYCTSKHDQLGVWSGPPPRCISNKCTAPEVENGIQESGNRSFFSLNEIVMFRCQPGFVMSGSRIVQCQANNRWVPELPSCFRVCQPPPEILHGKYSPSNKDNFFPGEDVFYSCEPGYHLRGAASLRCKPQGDWSPAAPRCEGA	8152	32111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_8243_11783_12180_13654_17090_18022_18200_20417_20604_31843
904152	contig_10766_pilon	+	5893	22	Intergenic	novelGene_151187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	967	junction_5	646.234338968209	502	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2715	730	3444	114181	194104	FALSE	85	AAAAAAGCAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEARRGVGPRAAAVPEVVMLLLCLGVRIGRPYNVDTESALLYRGPAGTLFGYSVVLHRHGTNRWLVVGAPTDNWLANPSVINPGAIYRCRIGKNPNRTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGVCYGMPSDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTEDLIVMGAPGSFYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKDNRVKFGSYLGYSVGAGHFQSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDAKELNILYEMKGKKLGSYFGASICAVDLNADGLSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGVGAVMIEMGTELIGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLRGAIYIYNGRVDGISPAFSQRIEGLQISESLSMFGQSISGQIDADDNGYVDVAVGAFQSDSAVLLRTRPVVIVKASLNHSESVNRTKFDCIENGLPSVCIDLKLCFSYNGKQVPDHIVLFYNVSLDVNRKAETPSRFYFSSDGTSEVITRSIQLSSGGVYCTAHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGHHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIIKTTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLVVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPTGLYFIKILDLEEKQINCDVTDNSGVVKLDCSVGYIYVDRLSRLDISFLLDASSLSRAEEDLNITVHAACENEGDVGTLKNNKVTLAIPLKYEVMLSVHGFVNPTSFVYGSHEENEPQTCMEEKINFTFHVRKVDCVEICNRMKECYHVLFQGSSASPLSHDAGTAEGGKGAATHSTHALSSRALISFLPLSCPWSSSPHLLTGQVVKNKQEQVIMLVTSKAIR	113451	196553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_114378_114741_114864_135922_136030_136124_136255_138019_138088_139436_139567_142316_142403_143671_143735_143824_143963_147221_147334_153839_153935_155162_155254_155835_155882_156261_156417_161131_161287_172722_172873_174941_175019_188128_188280_189827_189924_190640_190721_191124_191215_193728
904153	contig_20614_pilon	-	3832	1	Intergenic	novelGene_107572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	440	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	241	723	3108	3830	237859	237137	NA	15	GCTGTCTTAGTTATCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIERLRSRFETMEDRISEIEDKHLATTLSEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQREKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETVRLSLDYLAKTLQARRQLDDIYKTLKEKNCQPRMIYPAKLSFKYDGEIRSFPEIRGLCKNQTKLTRIVKGSPLIREQTTSDHRLSIGHRIVLARY	240966	237134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_237100_241000
904154	contig_11160_pilon	+	2201	3	Intergenic	novelGene_168825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	760.5	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	294	809	318478	321967	FALSE	20	CATCCCAGCTAGCATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLKEPSGGGGTALLNKENKFRDRSFSENGERSQHLLHLQQQQQQKGSGGGSQINSTRYKTELTCLKSSSTK	318184	323359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319470_321936
904155	contig_7057_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_123378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	502	1047	1160538	1159993	NA	60	AAAAAAAAAAGTCCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDTYLTPCTKTNSKWIKDLNIKLKTVKIMKDKIGTMLGALIHGLSRIQTISNTAQTPEEKLDNWELLKIKHSCSSKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYNKSDQHLISKIYKILQNLNNKKITNLIKNGQRTQKKKDQIYWPDRDWRKPESMALGHPFSSVVKSPPRFTVQPGIEQPHKTKQD	1161039	1159576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1159600_1161000
904156	contig_6654_pilon	+	1730	12	Intergenic	novelGene_85758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_7	114.540548235473	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	969	760	1728	627190	650195	FALSE	70	TGAAGAAAAAACAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEAT	574446	650197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_616762_616888_618597_618655_623021_623074_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951
904157	contig_12873_pilon	+	3517	2	Intergenic	novelGene_27143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2397	junction_1	0	438	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1691	2422	17632	19334	FALSE	30	GCCAAATTTGTAGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15941	20429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_18014_18984
904159	contig_14575_pilon	+	3703	4	Intergenic	novelGene_101910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_2	12.328828005938	212	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAGCAGCTTACTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111120	117763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_111566_113159_113278_113464_114813_115971
904160	contig_11309_pilon	-	2614	7	Intergenic	novelGene_149859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4230	junction_6	1053.49545165922	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	145	888	64259	56293	FALSE	25	CTTCACGAATTTCACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	64494	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427
904161	contig_401_pilon	-	4049	19	Intergenic	novelGene_42743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_13	72.552088567839	292	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1006	3021	54	3074	949257	905195	TRUE	20	ACTCATAACTGGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVGTGCPVTCNGRWAAAMSERKPNGGSGGASTSSSGTNLLFSSSATEFSFNVPFIPVTQVAASPASLLLPGEDSTDVGEEDSFLGQTSAHTSTPQTFSYFSQVPSSGDPFGNIGQSPLTTATASVGQSPFSKPPAALPFTTGSQDVLNAFSPSVSKAQYGAPPMPQMGVNAYLPSQQSGLPPAHFGSPPPGAPQQGYNPYRHTPGSSRANPYITPPQLQQCQTPGHPTQLPPPGPPVQMYQMPPGALPPSPPSVQSALPPPAQQQVLARPAGPSVQAPPPFLLQNQYEPVQPHWFYCKEVECKQLWMPFSVYDSFNLEEIYNSVQPDPESVVLGTDGGRYDVHLYDRVRKPVYWEEEPAEVRRCTWFYKGDADSRFIPYTEEFSEKLEAEYKKAVTTNQWHRRLEFPSGETIVMHNPKVIVQFQPSSVPDEWGTTQDGQTRPRVVKRGIDDSLDEIPHGEMPQVDHLVFMVHGIGPVCDLRFRSIIECVDDFRVVSLKLLQTHFKKSLDDQKVSRVEFLPVHWHSSLGGDATGVDRNIKKITLPSIGRFRHFTNETLLDILFYNSPTYCQRIVEKVGMEINRLYALFMGRNPDFKGGVSVAGHSLGSLILFDILSNQKDLSLSKSPGPLTIANGVVKQSHFPEKQMTEEPKLTLDESCDLDVENEEVLTLQETLEALSLSEYVSTFEKEKIDMESLLMCTIDDLKEMEIPLGPRKKIANFVKHKAAILEQKKTSSEKKAVLAASTKGREESAPKARETASLPSESNGSKRKLPVGPYVSSVHVDYESFEVGTGQVSVVYNSLDFAPEIFFALGSPIGMFLTVRGVDKIDENYRLPTCKGFFNIYHPLDPVAYRLEPMIIPDLDLKAVLIPHHKGRKRLHLELKESLSRMGSDLKQGFISSLKSAWQTLNEFARAHTSSTQLQEELEKVANQIKEEEEKQVVEAEKIVESPDFSKDEDYLGKVGMLNGGRRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTALLLLKEIYRTMNISPEQPQH	949310	896263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_897219_905174_905277_906024_906188_906895_907082_918591_918695_919074_919231_920654_920853_924790_924887_926174_926328_926757_926877_927265_927475_928712_928855_929787_929878_933258_933380_934910_935001_939513_939708_940531_940755_942397_942931_949094
904162	contig_1884_pilon	+	4117	2	Intergenic	novelGene_178804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	3286	3810	190651	191175	FALSE	55	ATGAAAACACATCATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSYLSIITLNVNRLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCVQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINNYAPNDRSPKYIKQTLTKLKKEIHSSTIIVGDFNTPLSVNDRTTKKKLNKDTEDIGHNQPT	176748	191482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1884_pilon_+_178754_189370
904163	contig_14142_pilon	+	2139	13	Intergenic	novelGene_120434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	710	1114	53653	54549	TRUE	0	CGGCCCCGGTCGTGGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVVGGDASVTAEELPPILAYTAVFHVVIFLLLLPFFLSLLFIFFFLLLGLPLYPFLLTVRAAPFSLRSPVKFRIKADEVVGTRAGVAQNNFPTLLAHLTVILVIRLVAINLLLPGHCRTAQDLLFLPSWPASL	51157	62529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_51258_51633_51768_52479_52690_53189_53395_53592_53826_54145_54341_54512_54664_54809_54939_55181_55470_56769_56893_57142_57313_57825_57940_62442
904164	contig_7843_pilon	+	2349	1	Intergenic	novelGene_152029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAATGTGTTACCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259879	262228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_259900_262200
904166	contig_6137_pilon	-	3316	4	Intergenic	novelGene_59249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACTCATTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332658	1318957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1321503_1323816_1323939_1331695_1331859_1332172
904167	contig_10774_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_158675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGACCAGACTTAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22662	23896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_22700_23900
904168	contig_11281_pilon	-	7074	10	Intergenic	novelGene_125458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_8	411.219054897887	603	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	3589	4773	849449	830355	FALSE	30	AAAAAATTTTGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQDPLEEKEKKKKNGSQSLFHPRLSFFKPHLCYSLLFFRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEG	853037	828053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225
904169	contig_14744_pilon	-	3855	4	Intergenic	novelGene_65984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_2	301.13894910268	115	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1	483	969870	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969870	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_964410_967273_968630_969717
904170	contig_9235_pilon	+	2777	3	Intergenic	novelGene_156221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	183	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	498	1409	46042	46953	FALSE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45026	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_45726_45845
904171	contig_7078_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_130212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	137	412	954493	954218	NA	35	AGTTGTGTCCCCTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRTYRLGKNFGHYKSDKGLISKIYRKIQHLYNRKTNNSIKKQAKEMNRPFTKEDIGGANRHIRKCLRSLAIRKMQIKTTMRYHLTLALLARIKTLEITNVGEASGRSELLCTAGGNAKCYNYFGKMIQCFLRKLEI	954629	952880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_952900_954600
904172	contig_18734_pilon	-	4000	1	Intergenic	novelGene_172360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	984	1292	18270	17962	NA	15	GCCCCGGGGATGCCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALISLGYIPRSGIAGLYGISVSSFLRKRRIIFQNGCIILYSHRQCIRVPISPQPLQHLLFSVVFIRASSARVGWYLTVVLICISLMASDLEHFLICLLAA	19253	15253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18734_pilon_-_15300_19300
904173	contig_7078_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_130219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGGCCTTGGAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964254	966185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_964300_966200
904174	contig_5947_pilon	-	3862	1	Intergenic	novelGene_101552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	125	340	616086	615871	NA	35	TAAAGTTGTTTTTAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNLQVFWHQLSNSKKKHQYCKKFQGERNSFKNLVQKENGSMSNFMSLLLSYVKFKAHASMYYPYLCEMMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWTPEEPSQLPGTLSAVW	616210	612348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_612300_616200
904175	contig_14970_pilon	-	2776	4	Intergenic	novelGene_45080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTGGTTAAGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226148	213103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_213891_216611_216671_221175_221249_224291
904176	contig_3747_pilon	-	2265	2	Intergenic	novelGene_24952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATAGTATAGTTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	202840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_203127_203227
904177	contig_19744_pilon	-	5083	28	Intergenic	novelGene_120389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	458	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	718	1029	219232	215609	TRUE	20	TCCTCACACTTTTCATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGTHLSPGYIRTGTTNELSGIIIVPLSSLSITASFATKICLSAFVADIICISIHGVASWVIIKPHTRSCDRFTLMQTFIFQSHQGLSSDILIEFFDWIKQVF	225524	177770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_178147_179321_179494_180251_180496_183375_183545_186058_186218_187301_187501_188366_188519_192998_193159_194330_194486_194664_194893_196382_196446_197837_198081_198377_198477_200500_200580_202343_202610_203112_203398_205234_205334_206948_207067_208657_208761_209568_209697_210063_210196_211796_211902_212698_212888_213862_213971_215585_215796_218457_218566_219215_219382_224956
904178	contig_6286_pilon	-	1807	4	Intergenic	novelGene_165663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.35702260395516	39	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1499	1807	368170	365256	FALSE	20	TTCTCACCCCCGCACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAVRNAVTDQWPWGGHQGVGDEPRHLVLAWALWPIWYALGLFSASRLVARSQGSRGWAKPCRRGLVWGRTLFLGVRSPHCNGASSSSAVPSPGRCPGTLCP	371576	365255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_365428_367034_367147_368145_369597_371504
904179	contig_18081_pilon	+	3486	1	Intergenic	novelGene_23768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	529	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	590	916	52798	53124	NA	50	GACAGTACCCGACAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYNAEQYCWLDGEITSSCCLGNFLLSVVDQTRCNVWILDGDLYHKGLLKFSLEAVSLKDTLVMLVVDMSKPWTALDSLQKWASVIREHIDKLKIPPEEMKEMEQKRE	52208	55694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_52200_55700
904180	contig_5023_pilon	+	2058	8	Intergenic	novelGene_7370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1213.19468632976	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	138	812	629246	647055	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	625742	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646989_647053
904181	contig_3095_pilon	+	1241	5	Intergenic	novelGene_74966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	79	822	147241	151132	TRUE	15	ATGGGTCTTAGGTGGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWVRSASPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147162	152237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150998_151163_151848
904182	contig_10861_pilon	+	2028	9	Intergenic	novelGene_39301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.511546529846	298	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	28	798	1437804	1445658	TRUE	25	GAATTTAATCCCTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRVELPHRVSKAESLRKLTATYSPVECLLGSNYQSFSSG	1437776	1455136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1445010_1445543_1445682_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
904183	contig_19604_pilon	+	2161	4	Intergenic	novelGene_77250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.545092761196	4	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	44	403	273206	273988	TRUE	20	GGGAACAGCAGGTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	273162	275814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484_273577_273833_275016_275083
904184	contig_11386_pilon	-	3678	9	Intergenic	novelGene_82825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	97.1336064397899	342	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	177	1133	222850	205805	FALSE	45	TACTAAAAAGTGACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEAAAVVAAAAAGASDWVSGSGTGANQRGQRTGGARHGVQLEVLWHLQSKAHCGRDSNMEQYTANSNSSTEQIVVQAGQIQQQVQGQPLMVQVSGGQLITSTGQPIMVQAVPGGQGQTIMQVPVSGTQGLQQIQLVPPGQIQIQGGQAVQVQGQQGQTQQIIIQQPQTAVTAGQTQTQQQIAVQGQQVAQTAEGQTIVYQPVNADGTILQQVTVPVSGMITIPAASLAGAQIVQTGANTNTTSSGQGTVTVTLPVAGNVVNSGGMVMMVPGAGSVPAIQRIPLPGAEMLEEEPLYVNAKQYHRILKRRQARAKLEAEGKIPKERRKYLHESRHRHAMARKRGEGGRFFSPKEKDSPHMQDPNQADEEGMTQIIRVS	230152	203259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_205859_208633_208736_209555_209730_211238_211406_212975_213082_213501_213634_217969_218117_222775_222913_230038
904185	SIRV6	+	732	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	490	-439	490	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
904186	contig_14811_pilon	-	1720	4	Intergenic	novelGene_74483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	115	junction_2	370.874042709321	315	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	263	865	375703	357434	FALSE	30	CAACCCCAAAGTGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	386729	356578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102_375519_375695_375765_386528
904187	contig_9682_pilon	+	3658	11	Intergenic	novelGene_125288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	162.264752796163	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	10767	27135	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEEQYKLLSDHIEQMAIE	2375	30213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_27085_28054_28351
904188	contig_2069_pilon	+	2719	14	Intergenic	novelGene_23251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	315.795323572932	2847	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1160	1876	341330	343975	FALSE	15	GATGTGGTTTTTGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323994	344818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332216_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
904189	contig_10734_pilon	+	1762	1	Intergenic	novelGene_51531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTGAGTGAAGATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2290234	2291996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2290200_2292000
904190	contig_11986_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_69219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	809	1147	742973	743311	NA	25	TCACCTTTCTACAACAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWSLIPDQRDNSRQRCRANILRILCAERHPRPFEAAKRTAICLDTYHALSAQEIWNDLFVYVVQQAARTLVVISCINKELPSGVVVNEWTNLESQERHWSCLLCLLGFRD	742164	744917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_742200_744900
904191	contig_20561_pilon	+	1912	1	Intergenic	novelGene_166374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTAGCCGGGCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95734	97646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_95700_97600
904192	contig_13612_pilon	+	1991	9	Intergenic	novelGene_157294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	115.308011430256	264	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	154	1194	51083	56402	TRUE	20	GTGGTTGTAAGATGGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEVRAAAA	50039	57537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56544_56881
904194	contig_8576_pilon	+	2540	10	Intergenic	novelGene_88798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	553.813602372531	3	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	191	1273	902723	915733	TRUE	70	AAACAGCAACAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLGLSPPPSPSPQECGVFSV	893620	917056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913461_914198_914268_914930_914977_915338_915456_915676_916559_916614
904195	contig_3747_pilon	+	2965	7	Intergenic	novelGene_24887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4165.42130722292	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	900	1565	202676	203804	FALSE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201097	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202137_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
904196	contig_7644_pilon	-	2033	7	Intergenic	novelGene_64253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	626	967	178075	176026	FALSE	55	TATTTTCACCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEVQKLQPKIHEVSVVASEEEVLKSRSPLSRFILSNCIWVQGHPASLKQLPVGWSSGQIKSTRIYQQLAASLRIDLRKLCKADVVADAQAYSAVRVSNVEKLSPGLNVLDS	183350	174959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_176083_176583_176652_177753_177834_177938_178086_179594_179695_182476_182531_182889
904197	contig_3155_pilon	+	1892	4	Intergenic	novelGene_26410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	1050.07756327278	2	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	250	576	259780	261211	FALSE	40	ATAAAGTGATGAAGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258141	262527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258224_259209_259329_259731_259978_261082
904198	contig_16103_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_118873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATACTGAAAATTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723336	722335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722300_723300
904199	contig_12102_pilon	-	3659	2	Intergenic	novelGene_151061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_1	0	477	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2497	2817	95241	88479	FALSE	45	AAACTAAGAAATGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVVIYDLRDMPANHQTFLRQRTFSVPVKQEMKRSVNKENIQHAEERLLRYLIHLRFQSSKSGKIYLHRDVRLLFSRKSMEVDSGAAYELKSYTESPTNPQFSPRC	97737	87636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_88633_95074
904200	contig_12951_pilon	-	5529	2	Intergenic	novelGene_68223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	110	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1534	1842	799273	798965	TRUE	35	TCAGAAGTTCTTACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKKVYLAAVRWSIWYMSMRSSWLIVALSSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTTIVEPSISCFSAVRVYVFWRPVIGCINIYYSYVLLVY	800806	795218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_798573_798631
904201	contig_5083_pilon	-	3160	3	Intergenic	novelGene_151678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	148	645	864782	707064	TRUE	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YADDITLLAETEENLKHLLTKIKDYNLQYGLHLNITKIKILTTGPISNIMTNGEKIEVVKDFILLGSTINSCGSSSQEIKRHIALGKSAAKNFFKVIKSQPITLGTKVRLTQAVVFSITSCAYESWTMNKENQRRIDAFELWCWRRILNIPWTARKTNKSILVEVQPECSLEARMARLHLTYFGLIIRRDRSLEKDIILGRGSTKKRKTLNKMK	864929	586513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_588900_706934_707327_864547
904202	contig_6515_pilon	+	2812	2	Intergenic	novelGene_177997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCGATACCTAGTAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544247	576834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_+_545100_574874
904203	contig_7919_pilon	+	5988	2	Intergenic	novelGene_28111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	667	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2760	2475	5234	1408497	1411256	FALSE	25	GCTCCTTTGATGAACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYALAHTQGEEKKQTSGTSNTRGSRRKPAAATPTRRSTRNTRAETVSQSQKSPVSNNSGCDAPDSNNPSVSVSSSAESEKQTRQAPKRKSLRRGRKPPLLKKKFRSSVPPPEKSSSSDSVDEETAESDLPPVLEKEHQSDIESSNTCTVQTNAENKSANGLISCNEHVEAREEHTENHDTKETVKPSYSECYTHNPPVLVGENQKPNPLPSSREEEEVEKVENTGIEDNVLCIESDISKNISEKRGDLLENQDQISGSLESEVKTDTCTDHPPVDFLKCSGSEIEVHQPISSPVDELPENAESVVNEEKIVESSIIEIIDHKDSTVKIEQPLESPKLDSSEGQNIQTVDKKSIESSEVQLPQHVETGDAEIIAKCDSSRNENFSSTQDSENNLLKNDLDSTKLDKCLEEKTESLGEHLTSRDLPNTYTEDIQKHFSEDNNEMIPMECDSFCSDQNESEIEPSVNADSKQLNENSGEHSSENIMLPSDPAVEKVETVSQPSESPIDTVDKAKKPRTRRSRFHSPSTTWSPNRDTAREKKRSQSPSPKKETGKDNRKSRSPSPKKESARGRRKSRSQSPKKDYARERRRSQSRSPKRDSSREGKRSESLSPRRDTSRENRRSQSRVKDSSPREKSRSRSRERESDRDGQRRDRDRERRTRRWSRSRSRSRSPSRSRTKSKSSSFGRNDRDSYSPRWKERWTNDGWRCPRGNDRYRKSDPEKQNENTRKEKNDTNPEADDPNPDKCRNDCPSWVTEKINSGPDPRTRNPEKLKDTHWEENRNENSGNSWNKNFGSGWMSNRGRGNRGRGTYRGGFAYTDQNENRWQNRKPLSGNSNSSGNESFKFVEQQPYKRKSEQEFPFDTPADRSGWTSASSWAVRKTLPADVQNYYSRRGRNSSGPQSGWMRQEEETAEQGNIFSIY	1405591	1412010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1406446_1406876
904204	contig_12675_pilon	+	577	5	Intergenic	novelGene_137924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	26.280934153869	14	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	272	577	5537	38865	FALSE	65	ACAGAAGAAACAGAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEKEDSDLENAGADEYTASFEDDFEDYEDDFEICDGDDDDSSNEHESKEKIEELPPARKKEIQEIQKAINAENERIGELSLKQFQKQGRMEYEGESRTDANNSPPRAPVCGIFMDFVTASHRQKGRDQALKQKTRSMKLLRLIDLDFSFTFSLLDLPPVNEYDMYIRNFGKKNTKQAYVQYNEDNVERDIQ	4289	38865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12675_pilon_+_4369_5344_5565_19116_19220_36065_36196_38820
904205	contig_854_pilon	+	3336	19	Intergenic	novelGene_36568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3631.94697514252	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	924	2471	1700894	1715538	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKEAQAWERVTSGLSSPFLPKSIRVGTFPHPATSTPSSSPVCCWQSHVVTSHTCCLIRPPLQGLWVVWQE	1677572	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685182_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709203_1715226_1715284_1715390
904206	contig_14563_pilon	-	4793	3	Intergenic	novelGene_135038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75999	70862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_73426_73585_74920_75103
904207	contig_2703_pilon	-	3312	1	Intergenic	novelGene_101788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	892	1206	610845	610531	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRLQRGNLSNSCMDIPKISRNTSGDRWRCKRRKEQGSVLTVTWMAPKVALQFTNSHFQEQGRMAREALISSPEACDKALGIGAPYLVRPGEASSHQIAELAE	611736	608424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_608400_611700
904208	contig_12970_pilon	+	3290	3	Intergenic	novelGene_50514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1784	2395	156983	157594	TRUE	40	AATGAGAAACGGATTTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEELQPECSLEGRMARLHLTYFRHVVRRDQSLEKDIMLGKVQGQQKRGRPSTRWTDTVAATMGSSITMIVSMVQDRAVFRSVVHRVTISWNRLDSTLLQQQQQHAKPTVNIILTGQRLIVFPLRTGMRQGCPLSSLLLNIVPEVLARAIRQEREIKDIQVGKEEVKLSLVTDDMILYTENPRDSTRKLLDLKEEFSKV	88134	207648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_88550_155614_157627_206785
904210	contig_2799_pilon	-	559	6	Intergenic	novelGene_85555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	122	430	751411	721184	TRUE	45	TCGTGTATCTAGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLSLLFLLLDILFLM	755383	718659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_718698_721092_721225_729191_729365_748947_749014_751382_751452_755302
904211	contig_10904_pilon	-	1744	11	Intergenic	novelGene_22547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	186.40034871212	23	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	13	939	419191	375280	FALSE	0	TTTTGTGTGTGGCTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLTMALVLLLLLLTLWPECHTDITSHGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	419203	374474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389492_389761_389798_417965_417999_419154
904212	contig_14876_pilon	+	1943	4	Intergenic	novelGene_170238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	330.325428765163	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	263	793	38853	51867	FALSE	30	GATAATCTTCATTGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSGSAQRWAASAGRWGCRLLALLLLVPGPSGASEITFELPDNAKQCFYEDITLGTKCTLEFQVITGGHYDVDCRLEDPDGNVLYKEMKKQYDSFTFTASKNGTYKFCFSNEFSTFTHKTVYFDFQVGEDPPLFPSENRVSALTQMESACVSIHEALKSVIDYQTHFRLRKLFLR	38590	53017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14876_pilon_+_39045_45402_45649_51661_51736_51848
904214	contig_14970_pilon	+	2051	9	Intergenic	novelGene_44927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	5333.97421605129	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	378	1100	177395	224731	FALSE	45	GCTATATTAATGACAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRLLVNPMETLI	135962	225682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_224697
904215	contig_8377_pilon	-	3125	1	Intergenic	novelGene_35047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAGTAAACAGCAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88429	85304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_85300_88400
904216	contig_10494_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_102226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTCATACCAGCGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245631	1242757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1242800_1245600
904217	contig_6489_pilon	-	2622	5	Intergenic	novelGene_128958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	306.889536315594	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	19	762	395604	389842	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAGTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRDGSMGLWEVTDDVLTKSDARHNVSRVPVYAHITHKALKDIPKEDTNPDNCKVRALAFNNKNKELGAVSLDGYFHLWKAENTLSKLLSTKLPYCRENVCLAYGSEWSVYAVGSQAHVSFLDPRQPSYNVKSVCSRERGSGIRSVSFYEHIITVGTGQGSLLFYDIRAQRFLEERLSACYGSKPRLAGENLKLTTGKGWLNHDETWRNYFSDIDYFPNAVYTHCYDSSGTKLFVAGGPLPSGLHGNYAGLWS	395622	387981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_392609_392773_393919_393986_395427
904218	contig_3469_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_34143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	218	517	253975	254274	NA	40	AGCAGAAACACATTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATATDCSDQNHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPEGMAPRYPFSSVVKSSLRFTIQPGSGQPHKTKWD	253757	256188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_253800_256200
904219	contig_5686_pilon	-	1739	4	Intergenic	novelGene_45328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCTACTCTGACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241655	108305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_108478_221566_222914_224040_224201_241595
904220	contig_6842_pilon	-	2966	3	Intergenic	novelGene_130645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_2	58.5	35	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	738	1163	202004	189633	FALSE	15	GTTTTGCCATCAAGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNSLLLQLLRACADDHDYSHLLIVFQLKHVSWWTRTLNTSLVPPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVRKTSDSTKMRIYLGQLQRGLFVIRRRSAA	202741	187829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_189732_192865_192951_201762
904221	contig_10263_pilon	+	3411	1	Intergenic	novelGene_135844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACAAAACAAGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877584	880995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_877600_881000
904222	contig_5451_pilon	-	3523	2	Intergenic	novelGene_167160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2679	2978	92753	92454	TRUE	80	ATAGAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRTPLMEGAQGPGATPCLENTICTQQEAKGLFHMQREKGTVSSPGYTTCVRLMKSGAKRRKRESTLSLRSSLLQMLTHTPATGAHADPRRPSFQTSL	95431	91871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_92299_92335
904223	SIRV6	+	1441	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	81	6	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	25	TGCGTTTGGTCGCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
904224	contig_10734_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_51266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308474	1306419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1306400_1308500
904225	contig_3747_pilon	-	3551	7	Intergenic	novelGene_24979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2724	3197	263941	260768	TRUE	15	TAGCTCTCATCGCTACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRENRYYLLLPLHAAMAICYSRIVLSVYMPSPTSPGLHGQMESQQRTSGQQRTHQRHLQSGHVLCLRPPLVLLLGRPGTKHQSTLMGCPIKSWPLSPSMAAWASLHVSYSTRVYSMDVFGNFLMNSNDKENPAFNRCWWGSGEDGGGLNTRKKKKQL	266664	260013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_260093_260360_260421_260552_260897_261271_261408_261518_261640_262926_262998_263924
904226	contig_16411_pilon	+	3249	9	Intergenic	novelGene_77275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	357.419549514293	142	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	2	667	18707	41282	TRUE	10	CTGTGCCACCAGGCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKRTLKGSIELSRIKCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKYHPNFWIDGRWRCCAQLEKLAAGCAEYDPTKNASKKPLPPTPEDNRRSLQEPEETLVIALYDYQTNDPQELTLRRNEEYYLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSPNNLETYEWYNKSINRDKAEKLLLDTVSLLNFSFDLK	18705	106290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18812_20432_20515_21951_22081_26146_26188_30832_30985_35170_35237_41191_43408_59108_59418_106142
904227	contig_10286_pilon	+	3439	2	Intergenic	novelGene_98417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGAAGGAATACACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417031	518372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_419532_517433
904228	contig_16622_pilon	+	2477	6	Intergenic	novelGene_48467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCCACATTCTTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111857	121845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_112706_112976_113741_115155_115292_115417_115561_118813_118889_121334
904229	contig_10437_pilon	+	2526	21	Intergenic	novelGene_38231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_20	139.912651322173	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	31	2352	318795	392342	FALSE	30	GATAGATGCAGTGGATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGTYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGDSSVGPVSMNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPTCTDMSNICQPTEFISRHNIEGTFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTTVKNSSQEPRSALSGTIQRPQLGPTANLSLEMGSGQLAPRQQQQTELEVVPGRDGLAGYNHPQVSVQPVTAPGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYSNISADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPSTPRPAENFRNSGLAPSVTIVQSSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPPWTPSTRPGFSAQQVASQATAKTRSPQFAVGNFQAPSSFSPMSLPGAPTTSPGAAYPSLTNHGSSFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWSQWQGQQPHQRSSSGEHHVQQPTAQQAGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPSFSE	318764	392516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_349796_349909_355625_355671_360481_360527_366332_366547_369227_369442_371770_371874_373765_373832_374209_374296_375720_375798_376665_376801_379153_379229_380474_380627_387220_387332_387492_387563_387716_387841_388029_388133_388508_388657_389963_390124_390570_390738_392252
904230	contig_3956_pilon	+	2705	8	Intergenic	novelGene_14861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1066.68576938677	17	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	220	1650	1286091	1289956	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281701_1285973_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
904231	contig_1893_pilon	+	4343	5	Intergenic	novelGene_172346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2500	2880	259565	306114	FALSE	20	AATATTTGTCCTTTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFREPASVGGWNPSGTGEFILAFCTCIIFLNSSIFFFVCIFHEFVCLFQEFVYFFSFLSAFCFNSWILLNIRNLNSLSVRSSAFSSTGRSCGVYFGRLLEPSYPVFVNVLILSALFGAFSGYFPY	94590	307577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_+_95637_95711_96792_181430_181558_259318_259617_305785
904232	contig_13244_pilon	+	1700	3	Intergenic	novelGene_86973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGTAACGAAAAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296068	299278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_296919_297253_297391_298565
904233	contig_1230_pilon	+	2114	9	Intergenic	novelGene_28841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	797.671141511337	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	73	1902	405241	408779	FALSE	25	ACCATATAGTTGTTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITKQQLKMKNFKARSMMRTNRRFLTSVMRLSTGLIRIRRPRRKNLNISRKSWRKSATPLLPSCTRVLEECLEECLGASLVVELLHLVVRLLDPPLKKLIKPNSEQIP	404453	408991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407780_408131_408237_408568
904234	contig_14483_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_133757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACTACCATATGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74353	76915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_74400_76900
904235	contig_6291_pilon	+	1944	1	Intergenic	novelGene_164803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTTCTCTGGCTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384871	386815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_384900_386800
904236	contig_2444_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_83786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTTTTCCAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256192	258700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_256200_258700
904237	contig_9668_pilon	-	4939	14	Intergenic	novelGene_58086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	177.391987304284	311	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	1472	3016	184257	121609	FALSE	40	ATGAGAAATGATATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLSFHAGSWESWCCCCLIPPDIPWNPGRRWQLEMADTRSVHETRFEAAVKVIQSLPKNGSFQPTNEMMLKFYSFYKQATEGPCKNSRPGFWDPIGRYKWDAWSSLGDMTKEEAMVAYVEEMKKILETMPMTEKVEELLHVISPFYEIVEDKKSGRSSDFTSDLGNVLTTPNAKTMNGKAESSDSGAESEEEEAREEVKGAEQSDNDKKMMKKSADHNNLEIIVTNGYDKDSFVQDIQNDFHASSSLNGESTEEVKPVEQNFEQTGKTTVCIHEDVSGIQHLTSDSDGEVYCDSMEQFGQEESLDSFSSNSGPFQYYLNGDPNQRLENSGFPEDVQVSPANGSIGDMQGVAVEGKGEVKRGGEDGRSNSGTPPNEKRGGENLEFCNVRRGRGHRMQPLGEGAKGRQVGSGGDGERWGSDRGSRGSLNEQIAIVLMRLQEDMQNVLQRLHKLETLTASQAKSSTLQTSSQPSSLRPSWWPFEMSPAVLTFAIMWPFIAQWLVHIYYQRRRRKLN	190947	119685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_121622_123176_123287_123619_123665_129339_129540_134528_134797_145066_145150_145973_146178_147289_147422_164932_165048_174462_174536_176722_176844_183890_184057_184242_184683_189901
904238	contig_13680_pilon	+	2939	19	Intergenic	novelGene_149582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	300	junction_7	211.533327788867	14	33	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	292	2217	311046	340245	TRUE	15	GACCTGACTGGTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQQSKNPSINQILLSPEEIEEGLKRQQERNADALRNYENLVNTLLDGVEQRNLPWKFEHIGIGLLSLLLRDDRVLPLRAIRFFVENLNHDAIVVRKMAISAVAGILKQLKRTHKKLTISPYEISGYPKPTQILAGDRPDNHWLHYDSKSVPRTKNEWESSCFVEKTHWGYYAWPRNLVVYAGVEEQPKLGRSREDMTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLINFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVLKPHLERLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGTCIATSCESRDPRKLHWLFELLLESPLSGEGGSFVDACRLYVLQGGLAQQEWRVPELLHRLLKYLEPKLTQVYKNVRERIGSVLTYIFMIDVSLPNTAPTTSPRVPEFTARILEKLKPLMDVDEEIQNHVMEENGIGEEDERTQGIKLLKTILKWLMASAGRAFSTAVAEQLQLLPLFFKIAPVENDNSYDELKRDAKLCLSLMSQGLLYPLQVPLVLQVLKQTARSSSWHARYTVLTYLQTVVFYNLFIFLNNEDAVKDIRWLVISLLEDEQLEVREMAATTLSGLLQCNFLTMDGPMQIHFEQLCKTKLPKKRKRDPGSVGDTIPSAELVKRHAGVLGLGACVLSSPYDVPTWMPQLLMNLSAHLNDPQPIEMTVKKTLSNFRRTHHDNWQEHKQQFTDDQLLVLTDLLVSPCYYA	308762	341493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_308870_309953_310008_310273_310404_311045_311128_314346_314501_315204_315275_315942_316069_316638_316792_323626_323732_324256_324349_325027_325160_325535_325745_326144_326231_331226_331356_332521_332678_334385_334549_338835_338970_340110_340250_340775
904239	contig_12789_pilon	-	4831	2	Intergenic	novelGene_176628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	4248	4568	286963	286643	FALSE	35	GATACACAGAGTCGCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSVRTRPGANCGTDHQLPKCKFKLKLKKIRTSVQEPNYNLENISPEFRDHLKNRFDTLNTNDRGPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETETCF	307237	286379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_-_287285_303311
904240	contig_13697_pilon	-	1057	4	Intergenic	novelGene_165935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	63.8766171789194	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	281	760	318850	318371	FALSE	25	GGGGAACACCTGTGCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTATITGPEDSGLTSCLPAAQSTPRALECRVTSLSTAEGPGSWGLAKDNLQLPPQAPHAGPGSTPNGAADAGPPVLPTLPTHQGSATSHASGSHAQGPPAGCDTLIHFTVMEGHHVLPELQDYSGPSSLQCHTASLARGHQLRAANSHEPKELPPARL	320395	318073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_318885_319173_319222_319979_320061_320278
904241	contig_9098_pilon	-	4654	3	Intergenic	novelGene_75766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_2	4	127	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	1147	3348	29183	24722	FALSE	30	ATCTGGACAATGGCCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQVVQTIGSDGKNLLQLLPIPNSSGNLIPLVQSSVMSDALKGNTGSPVHVTFQTQISSSSTSASVQLPVFQPASSTNYFLTRTVDASEKVRVTSVGTKNFTSSVSKVQSHGVKIDGLTMQTFAVPPSTQNDSSYILVNTQSLPMTVKSPVLPSGHHLQIPAHAEVKSVPASSLPPSVQQKILAAAATSTSGTVEASQIPTVIYVSPVKTVKNVVTKNFQNIYPKPVTEIANPVILSTTQIPMNVATETKSGQHSQAAPVKWIFQETLQPCTPSLVPVKSSNNVASKILKTFVDRKNLGDNTVNMPPLSTISPSGTQSKSIPIKDNALVMFNGKVYLLAKKGSDVLPSQIDQQNSISPDILPRKDTSQIVSSSPVTDISREVVNIVLAKSKSSQMETKSLSNIQVASMASLRAEKNKKVEQPSLSTLNPHNMNQTINCLKPYKTLFTKPVFPDGFSTGQNTPRKGNIIQSIEKINSSIDATTVPSQQGVFRDQEPKIQNEMASTLKKDKKERNDMKDTQEGSNKALCLKNDAEFKKIFGLTRDLRVCLTRIPDHLDSGKSFDAFTSLVKGDTYKKSELMVEKEERKQGFDKKRKAKTIKKMYYTKKRKTESTCNTAINGETNVTSSQLLSNILPTSEVSQYNSLTSHKKTREGKRTEVDHCIHDNQEKGTLNSNATFEQSHSFNKNYYTEDVFPMTPPELEETIRDEKIRRLKQVLREKEAALEEIRKKMHQK	30329	23415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_25163_25987_26261_27695
904242	contig_10331_pilon	+	3244	12	Intergenic	novelGene_54096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTACTTACTTAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304596	326049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311290_312016_312168_312477_312542_312622_312689_318101_318200_318790_320200_321427_321525_325324
904243	contig_9516_pilon	-	4507	8	Intergenic	novelGene_106161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_2	86.0166096917168	550	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	203	2191	836578	825196	FALSE	40	ACACCTATAAAAACCTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITLQPSDLIFEFASNGMDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPELLHLYSGLELDDVHNGILTDGTLCMTENQILEGRFLLADDNEATSPSMSTTEVLLNVESPNDVLDEKQIFSTSEMLPDSDAAPAVSLPNYLFPASEPEALNREGDTGGQEGHSLEEKSLREENAKKTGKSKKRIRKTKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLVVIEDEDERSEAAAMSPQASTSSTPSTTTTRRASSRVSSRAATQGKGGPSWEKPKVQHVGLQPSASLELGLSLDEEIPTTSTVLVSPPESQAKLTQAVSPSSVPSNIHLGVAPVGSGSALTLQTIPLTTVLTNGPPASTTASTQLVLQSVPPTSTFKDTFTLQASFPLNTSFQESQVAAPGPPLILSGLPQLLAGANRPTNPAPPPVTGAGPAGPSSQPPGTVIAAFIRTSGATAAPGVKEGPLRPSSYVQGMLTGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSQNQSLMGNQTFSPPSRPTVGLTPVAELELSSGSGSLFMAEPSVTTSGSLLARSPTPAPFSPFNPTSLIKMEPHDI	836780	822879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_826001_827058_827437_828112_828306_828395_828480_829748_829941_830933_831027_831466_831639_836506
904244	contig_3081_pilon	-	1572	8	Intergenic	novelGene_133972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	81	junction_1	309.833332418497	6	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	156	1121	1216116	1195826	FALSE	20	AAAGACTGTTTTTTCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALVEDDICILNHEKAHRRETVTPVSVYSGDESVASHFALVTAYEDIKKRLKDSEKENSLLKKRIRFLEEKLIGAQLDEETSSVGREQVNKAYHAYREVCIDRDNLKSKLDKMNKDSCESLKVLNEQLQSKEVELLQLRTEVETQQVMRNLNPPSANWEVEKLSCDLKIHGLEQELELMKKECSDLKIELQKSKQMDLSQEDNLKSRDLQRLSISSDNMQHAYWELKREMSNLHLVTQVQAQLLRKLKTPTAIKKACAPVGCVEDLGRDSTKLHLTNFTATYKRHPPLSPNGKASSHATSPFARRYKDFIRESNSPIMDR	1227172	1195374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1196023_1198423_1198543_1205462_1205522_1210434_1210584_1211662_1211763_1212233_1212360_1215900_1216122_1227022
904245	contig_5845_pilon	+	1948	10	Intergenic	novelGene_98891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	130.929158114014	28	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	107	802	135600	157633	TRUE	10	GGCTGTGTTCTTCTGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGHLLGRPVGKSPELAAPAGLSGDRDCGGGPAGVMFRGLSSWFGLEQPAADGAPSEGDRQPEGNAPPKQRSEVVAESSEDEPQQTGDQELLLDQAKGLGNYLFNFATEATKKITESAAKTAQTIKKSVEEGKIDDLIDKTIIGDFQKEQKKFVQEQHTKKSEAAVPPWVDSNDEETIQQQILALSADKRNFLRDPPAGVQFSFDFDQLYPVALVMLQEDELLSRMRFALVPKLVKEEVFWRNYFYRVSLMPQEREGATAEKAICR	135493	162145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_135796_145353_145473_146405_146473_149064_149139_151638_151779_157490_157542_157584_157637_159049_159109_159564_159713_161209
904246	contig_2444_pilon	+	3234	2	Intergenic	novelGene_83795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACGGCATCCCGAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276380	279731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_279555_279671
904247	contig_7151_pilon	+	4129	5	Intergenic	novelGene_40734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_1	106.066901057776	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502249	509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505033_506685_507738
904248	contig_2940_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_81988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAAAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128598	1127326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1127300_1128600
904249	contig_1143_pilon	-	1298	9	Intergenic	novelGene_86611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_8	142.132365684245	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	293	979	249983	232022	FALSE	70	AGTAAAAAAAAAAGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKYVTFSLLPDMYFKCWL	295036	231702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_254862_254932_255613_255726_294929
904250	contig_2033_pilon	-	4791	9	Intergenic	novelGene_71532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.127368405307	480	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	2233	3114	132405	125838	TRUE	5	ATGTTTGTTTTCTTGGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKEILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEQGDVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGTPFWMAPEVIQQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPNSDMHPMRVLFLIPKNNPPTLVGDFSKSFKEFIDACLNKDPSFRPTAKELLKHKFIVKNSKKTSYLTELIDRFKRWKAEGHSDDESDSEGSDSESTSRENNTHPEWSFTTVRKKPDPKKLQNGAEQDFVQTLSCLSMIITPAFAELKQQDENNASRNQAIEELEKSIAVAEAACPGITDKMVKKLIEKFQKCSADESP	134637	124087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_124789_124861_125863_126936_127074_127154_127218_128180_128275_129861_130011_131069_131256_132093_132252_132335
904251	contig_20425_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_178805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	904	1548	906	1550	NA	40	CCAAACAACAGCGCCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFKELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGPNYEMTPWDWKLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDNLNHNIPISLDMLLGSGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASNAATKAWGKVPDSKTPTGSFATIRQTAKEPYIDFINRLQTAISRQVDHQQAAEVLCLQLAYENANADCLMPTAEPF	2	1902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20425_pilon_+_0_1900
904252	contig_12923_pilon	-	2323	13	Intergenic	novelGene_30139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_12	179.69596236112	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	91	1014	171200	165557	TRUE	15	GTATCTCACCTGTCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENNRWEESGQQLYNVEATSYALLALLSLKDFDTVPPVVRWLNEQRYYGGGYGSTQATFMVFQALAQYQRDVPDHKDLNLDVSIHLPSRSSLVRHRIHWESASLLRSEETKENENFTLTAKGKGQGTLSVVTVYHAKVKRKTSCKKFSLRVQLQPVAATVKKPQDAKSSMFLSICVRYLGQQDATMSILDISMMTGFSPDTADLDLLSKGIDRYISKYEMDKAVSDKNTLIIYLDKISHTREECLTFKVHQYFKVGLIQPGAVKVYSYYNLGERPTLGLGTEGPRGLRVGCEGPTTMRVPRLCPLRV	171290	162566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_162741_162825_162962_163047_163132_164477_164562_164725_165773_167571_167662_167778_167867_168872_168925_169045_169137_169274_169335_169487_169647_170317_170482_171196
904253	contig_1275_pilon	-	2689	20	Intergenic	novelGene_108762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	582.502885991448	4	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1875	814	2688	485958	400578	FALSE	15	TGAATTCTGTTCTCGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAE	525140	400576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456934_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486069_495661_495855_505868_506003_513627_513806_524942
904254	contig_7333_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_142793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAATAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230355	232338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_230400_232300
904256	contig_10074_pilon	+	1865	2	Intergenic	novelGene_57172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	65	364	551756	552055	TRUE	35	GAAGAGGCACGAGGGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDIEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRFTIQPGSGQPCKTKWD	551691	553926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_553480_553849
904257	contig_12866_pilon	-	5943	2	Intergenic	novelGene_174638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGATCACCTTTCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647793	569297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_570753_643305
904258	contig_12938_pilon	+	1195	5	Intergenic	novelGene_99704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	892.668471494317	85	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51945	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_83391_83470_84550_84635_85468
904259	contig_4857_pilon	+	1743	3	Intergenic	novelGene_48866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	857	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCACTTACAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355349	1357725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1356253_1356425_1356973_1357432
904260	contig_10299_pilon	-	3489	3	Intergenic	novelGene_79767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	32	571	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	452	1798	592066	584510	FALSE	30	AACAAACCCGTTGCCGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLTRGQLQHLGTRGSNSSWRPGASLGNMGPIHILEAFEQWSVLCAVCGAMHLGYLQICMPSLLLSSNTQARRESLFSLLCQQELNFAGERLSLDNY	592517	582818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_584887_591057_591641_591679
904261	contig_8020_pilon	-	1385	1	Intergenic	novelGene_114422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAATAAAAACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238556	237171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_237200_238600
904262	contig_6084_pilon	+	1456	3	Intergenic	novelGene_127053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_2	53	109	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	539	1030	413016	418368	FALSE	25	TATCATGGTTTATTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVAVAVESLAGVKARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAGERPLRLNPGVRSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGGGGGGVYWVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVIAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLAFEGATKRNRPNVQASSSRL	412477	418794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_413337_414082_414233_418347
904263	contig_5988_pilon	-	2228	10	Intergenic	novelGene_15850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	179.009000394456	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	26	1393	259970	243148	TRUE	35	AAAATCTATTGTATATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGSGGSGMNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTHICQDTNQVLFKCCQGSEEVPCNKAVPVSLSEDPCCPLHFQLPPQMYKPEQVLSVPDDLEAGPMDLYLSAAELQPTESLPLEFSDDLDVVGDGMQCPPSPLLFDPSLTLEDHSIKEIAEGPVDILASEEQP	260586	241683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243013_243289_249401_249656_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260569
904264	contig_11026_pilon	+	842	6	Intergenic	novelGene_167655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	266.935947373148	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	115	495	122243	125017	FALSE	30	GCATTGTGTAAATCAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPFPSLPESEGSGAEEQDRGLIGAEEKAINSKSEVDENMGSREWMWVNVTELSLVIDETLDVKEMIFNAERVGGLQEEPESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATIIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI	117516	125364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_117548_122159_122246_123216_123262_123351_123427_123810_123967_124915
904266	contig_6576_pilon	+	4273	2	Intergenic	novelGene_42308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513613	693952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_514255_690320
904267	contig_7182_pilon	-	3147	2	Intergenic	novelGene_117110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTGCTCAGCAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163276	154655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_157240_162713
904268	contig_5451_pilon	-	3061	2	Intergenic	novelGene_167159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2222	2521	92753	92454	TRUE	45	AAAGCAAATGTGGGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRTPLMEGAQGPGATPCLENTICTQQEAKGLFHMQREKGTVSSPGYTTCVRLMKSGAKRRKRESTLSLRSSLLQMLTHTPATGAHADPRRPSFQTSL	94974	91856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_92105_92161
904269	SIRV3	+	498	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5811	-1	3752	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	194	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7755	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
904270	contig_6137_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_59289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGTCCTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355265	1353403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1353400_1355300
904271	contig_9937_pilon	-	1704	8	Intergenic	novelGene_129190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	82.485867682573	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	151	828	59935	14496	FALSE	20	CACAGTGATGTGGCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYIGGVTFSGSLIAYGKLQGILKSAPLLLPGRHLLNAGLLAASVGGVIPFMMDPSFTTGITCLGSVSALSAVMGVTLTAAIGGADMPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVAMNRSLANVILGGYGTTSTAGGKPMEISGTHTEISLDNAIDMIREANSIIITPGYGLCAAKAQYPIADLVKMLNEQGKKVRFGIHPVAGRMPGQLNVLLAEAGVPYDIVLEMDEINHDFPDTDLVLVIGANDTVNSAAQEDM	61220	13619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_14504_17429_17490_20228_20348_44130_44213_45066_45227_57847_58028_59866_60028_61162
904272	contig_11815_pilon	-	6773	15	Intergenic	novelGene_50880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	603	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	5604	5915	59831	59520	TRUE	40	TGCAGAGGAAAGAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQARGSSSVSAGRSNRQSPGCWQRGGRGTNSLCWVCGSSGGSRHCGGGGRGGGDGPCSADGGSGILCLPFTCFVRRGQGSFWGKLGCILRNRVCFRIRLASS	82963	36038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_36473_54708_54883_55433_55516_58825_58990_59515_59901_63644_64238_65470_65659_66418_66572_71282_71340_73042_73103_74398_74537_75145_75224_78099_78369_78579_80566_80951
904273	contig_5586_pilon	+	2131	6	Intergenic	novelGene_143521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAACAGTATCTTGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268593	279183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_269230_272221_272504_272891_272979_273077_273853_274481_274562_278912
904274	contig_5317_pilon	-	3444	24	Intergenic	novelGene_76585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	275.606312190905	2	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	32	1960	401580	373913	TRUE	10	GATTTTTCTTTTTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESSDKLYRAEYAKSGRASCKKCKENIPKDSLRMAIMVQSPIFDGRVPHWYHFPCFWKVGHTLLHPDVDVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVAGKGQDGSDGKVEKTLSDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQMRLSKKMLDPEKPQMGVIDRWYHPNCFVQNREKLGFRPEYSVSQIVGFPLLTPEDKEFLKKQLPRVKSEGKRKGDEVDGTDEVTKKKPKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKDELKKVCSMNDLKELLIFNEQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSGQLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKIKKQDRLFPPEATTPVAAAPPPRTAAAPAAENSAPAGKPLSNMKILTLGKLSRNKEEVKTMIEKLGGKLTGTATKASLCISTKKEVEKMTKKMAEVREASVRVVSEEFLQDVSGSTRSLQELLSVHVLSSWGAEVKVEPAEVVAPKAKSGAALPKKSKGAVKEEGVNKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGGKVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKESRYWIFRSWGRVGTVIGSNKLEQMPSKEDAVEHFMKLYEEKTGNAWNSKNFTKYPKKILSPGD	401611	355232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355456_355530_355767_356227_356343_356925_356988_357964_358093_361103_361257_361766_361866_364146_364276_364800_364924_366581_366666_370365_370488_373902_374100_375290_375424_375690_375760_376055_376299_377191_377333_379075_379221_381031_381209_381934_382052_384128_384229_386643_386859_388796_388913_394982_395149_401460
904275	SIRV6	+	881	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-16	223	-10	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	41	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
904276	contig_6445_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_76976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCCAGCATAGCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96339	94259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_94300_96300
904277	contig_19558_pilon	+	1650	4	Intergenic	novelGene_164744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_3	156.342217231587	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	27	341	25184	28706	FALSE	65	AAAACAAGAAATGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWRVHVDQMHQHKSGIESALKETKGFLDKLHNEISRTLEKIGSREKYINNQLEHLVQEYRAAQAQLSEARERYQQGNGGVTERTRLLSERLIIEYLLMKIEDYTFSMDYIST	25157	30015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_25232_25976_26109_27488_27552_28634
904278	contig_19032_pilon	+	3264	2	Intergenic	novelGene_172516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1400	1762	17090	17452	FALSE	30	TTCCCAGCAAAGTGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDQRRIDAFELWCWQRIVNIPWTARIINKSVLEEVQPKCSLEAKMAILHLTYFEHGIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRKKRTPSRRWIDTVAATVDSNIVMIVRLVQRCRPGSISLCCT	15162	18954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_15754_16281
904279	contig_20378_pilon	-	1637	2	Intergenic	novelGene_159565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	0	120	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAGTTTAATTTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21407	19094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_20545_21220
904280	contig_15538_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_152642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTGCATTTTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211154	209398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_-_209400_211200
904281	contig_5454_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_145501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACAAAAAGAGAAGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195432	193632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_193600_195400
904282	contig_7733_pilon	+	1981	4	Intergenic	novelGene_147136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	60.184900284226	38	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	104	439	88179	107305	FALSE	25	AAGCCCAAAGTTGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPHSCLHLGRGLVKEFAGLQNWESVEGGERSFRMVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86854	108847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86948_88168_88285_106056_106176_107194
904283	contig_5039_pilon	+	1887	7	Intergenic	novelGene_65021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	435.831007004626	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTGTAAGACTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1756803	1788300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1756871_1773327_1773468_1775230_1775298_1776931_1777000_1781414_1781508_1784537_1784596_1786906
904284	contig_11849_pilon	+	2261	2	Intergenic	novelGene_171744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTTTATCTCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92110	94428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_92462_92518
904285	contig_11656_pilon	-	3857	12	Intergenic	novelGene_53945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	573.195883325375	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1151	3453	405	3857	162257	113507	FALSE	35	AGTTACACTCAAGCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWICQICRPRKKGRKLLQKKAAQIKRRYANPIGRPKNRLKKQNTVSKGPFSKVRTGPGRGRKRKITLSSQSASSSEEGYLERIDGLDFCRDSSVPLKFNKKTKGLIDGLTKFFTPSPDGRKARGEVVDYSEQYRIRKKGNRKSSTSDWPTDNQDGWDGKQESEERLFGSQEIMTEKDMELFRDIQEQALQKVGVTGPPDPQVRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRLPKLYLCEFCLKYMKSRTILQQHMKKCGWFHPPANEIYRKSNISVFEVDGNVSTIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTQNDVKGCHLVGYFSKEKHCQQKYNVSCIMILPQYQRKGYGRFLIDFSYLLSKREGQAGSPEKPLSDLGRLSYMAYWKSVILECLYHQNEKQISIKKLSKLTGICPQDITSTLHHLRMLDFRSDQIIRREKLIQDHMAKLQLNLRPVDVDPECLRWTPVIVSNSVVSEEEEEEAEEGENEESQCQERELETNVGKPVSRENKEQDSYSLLESEKKPEVIAPASSTRLNKQVLPRDGLPANSQPSRRGRWGRKNKKTQERFGDKDSKLLLEETSSAPQEQDGECEEKSETSQEQYTESEEPLAASQEQPSHDGKPDVPKRRLSEGVELWRGQLKKSPEALKCRLPEGNDRLPRRYSDGDRPLLRGFSESSEEEEEPESPRSNSPPILTKPTLKRKKPILHRRRRVRKRKHHNSSVVTETISETTEVLDEPFEDSDSERLMPRLEPTFEIDEEEEEEDENELFPRGYFRRLSSQDVLRCRSSSKRKSKDEEDDEDSDDVDDTPILKPVSLLRKCDVKDSSLEPDTSTPMKKKKGWPKGKSRKPIHWKKRPGRKPGFKLNREIIPVSTQECIVEPIVPIPKPGRKPKIQENEETVEPKEDLPLTEERKEEEMHVEAEEVEEGEEEDTTSSEVRAASPVDSSNSPETETKEPEVEEEEEKPRILEEQRQSEEEQQELEEQEQEEEDEVAVETNQNEDHDADDEDDGHLESTKKKELEEQSVREDVKEELGSQESFLDTNMQNSRENVKDKDETEPDSEEEQTSHETSVVSEHMPGSEDDPEEDSNTKEELIELKEEEEIPHSELDLETVQAVQSLTQEESNEHEGAYQDCEETLAACQTLQ	162661	113506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_114523_117214_117528_120350_120957_122563_122766_123444_123677_129280_129375_130456_130619_132521_132664_139139_139256_157925_158045_160484_160802_162123
904286	contig_19185_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_163636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80067	79096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_79100_80100
904287	contig_11855_pilon	+	2771	8	Intergenic	novelGene_67005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	204.990492562012	333	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	220	1074	1375584	1387339	FALSE	0	TCTCTTTGTTCCTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKASSKGGSLRDKLDGNELDLSLNNLNEVPVKELAALPKATILDLSCNKLATLPSEFCGLTHLVKLDLSKNKLQQLPADFGRLVNLQHLDLLNNRLVTLPVSFAQLKSLKWLDLKDNPLDPALAKVAGDCLDEKQCKQCANKVLQHMKAVQADQERERQRRLEVERELEKKREAKQRAKEAQERELREQEKKPKKETNQAPKSKSGSRPRKPPPRKHTRSWAVLKLLLLLLLFCVAGGLVACRVTELQQQPLCTSVNAIYDNALQGLRSHEILRWVLQTDSQQ	1375364	1389036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1375689_1377515_1377576_1379236_1379396_1379626_1379732_1382983_1383057_1385406_1385466_1385534_1385581_1387091
904288	contig_15286_pilon	+	3529	8	Intergenic	novelGene_124434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	72.5885806502395	237	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	115	981	8542	23487	FALSE	35	GGAAAAAACTCTGGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAFKLVKTWLGPEAISLLKFTSKNEIQEYVSVEYLPPHMGGTDPFKYSYPPLVDDDFQTPLCENGPITSEDETSSKEDIESDGKETLETISNEEQTAPVKKINPAEPNSKAEENEKVDSKMKAFKKPLSVFKGPLLHISPAEELYFGTAESGEKKTLIVLTNVTKNIVAFKVRTTAPEKYRVKPSNSSCEPGASVDIVVSPHGGLTVSAQDRFLIMAAEMEQSSGTGPAELTQFWKEVPKNKVMEHRLRCHIIESSKPTTLTLKDSAFNMLDKTSEDICLQLNRLLESNRKLQDQVQRCIWFQQLLLSLTMLSLAFVISFFYLLYS	8427	26035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_8554_10756_10934_11419_11533_15377_15475_16537_16635_17061_17192_22665_22769_23349
904289	contig_17144_pilon	-	2756	14	Intergenic	novelGene_29183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1869.594421733	347	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	333	2459	174965	166363	FALSE	10	CTTGAGTGTGCCTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176270	166065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
904290	contig_13565_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_162383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGAATGGCTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146571	147262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_146600_147300
904291	scaffold_13609_pilon	-	1313	8	Intergenic	novelGene_124428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTAGCCCGCGCGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813172	798881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_799042_807199_807393_807482_807539_809665_809879_810538_810796_810885_811027_812723_812809_812964
904292	contig_4402_pilon	-	2240	2	Intergenic	novelGene_140870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAGTACTTACAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625849	623124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_625266_625750
904294	contig_12119_pilon	-	3772	1	Intergenic	novelGene_88672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAGCTAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341515	337743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_337700_341500
904295	contig_3382_pilon	+	3487	1	Intergenic	novelGene_124048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216228	219715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_216200_219700
904296	contig_8865_pilon	+	1781	1	Intergenic	novelGene_164448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	39	425	368033	368419	NA	30	AGCTCAATGTCATCAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGVRNSYALLVGMQNDIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAVPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRGPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPVL	367994	369775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_368000_369800
904297	contig_5686_pilon	+	2465	2	Intergenic	novelGene_45430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	454	759	192073	192378	TRUE	20	TGTGCTTTCCTTCAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRGNAPMEILLSLNKGKGKPPHAAKKSFTFAITTLLSVTHSSKTTTPNIHVDINREYFIIFSDLVTPTSSYHTLPHFPFIPIPNTDKRVGGEGDDEKDN	191619	194391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_192395_192701
904298	contig_14687_pilon	+	5129	17	Intergenic	novelGene_107896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1264	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2189	2494	430511	431327	TRUE	10	GGTATGATCTTGGTGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPASVEPTRSLPAVVVNKSRKVEPCSLFWDTGGDVLQFGESGLSCSCSSLICFSRVHSLFSFFPLWLFALQDLLTNAAVTGILEALTCCLCLYHFLGCCCH	415339	452327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_416249_416565_416696_421405_421585_422832_422974_425039_425166_425357_425488_425837_425929_426487_426657_429457_429737_430476_430693_431203_431414_431600_431731_433569_433662_442446_442598_443640_443856_445842_446047_450570
904299	contig_7025_pilon	-	1991	14	Intergenic	novelGene_104377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	791.548740308532	97	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1062	1787	63028	49239	FALSE	10	TATTTTGTCTTTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	88118	49034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65846_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_85312_85478_88024
904300	contig_11579_pilon	+	1158	1	Intergenic	novelGene_171937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACCATCCCAGGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45499	46657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_45500_46700
904301	contig_6958_pilon	+	2698	1	Intergenic	novelGene_69967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAGCAGAGGACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276301	278999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_276300_279000
904302	contig_2890_pilon	-	2978	2	Intergenic	novelGene_60266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	329	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2050	2379	344754	344425	TRUE	15	GGGTTCTGTACACCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGLWLGRTRRPCPPVNHPAFLAWLWPRPVQVGLLSPLLQHNFAFSLYKQQQPKQLSKNQKFHFPISFFLSLTKSCAFMSLEPLQRIPLLARTIKNGIGEVSDLLQLH	346803	159419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_159798_344203
904303	contig_8544_pilon	+	947	8	Intergenic	novelGene_55910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	408.205080511135	53	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATATACTTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18507	92618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_27777_27950_83412_83520_83788_83836_90458_90625_91487_91586_92523
904304	contig_5686_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_45452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	489	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCTGTCCAATCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222715	220468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_220500_222700
904305	contig_253_pilon	+	3459	10	Intergenic	novelGene_129614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	185.327338032526	364	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	521	1702	133058	160197	FALSE	35	ATGAGTCAGAATCGACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWLGDSKNMVVNGRRNGGKLSDDHLQTPSKLPHTGKDTLKAGRNAVERRSSRCNGNSGFEGQSRYVPSSGMSAKELCENDDLATSLVLDPYLGFQTHKMNTSAFPARSSRHFSKSDSLPHNNPVRFRPTKGRQEELKEVIERFKKDEHLEKAFKCLTSGEWARQYFLNKSKMQEKLFKEHVFIYLRMFATDSGFEILPCNRYSSEQNGAKIVATKEWKRNDKIELLVGCIAELSEIEENMLLRHGENDFSVMYSTRKNCAQLWLGPAAFINHDCRPNCKFVSTGRDTACVKALRDIEPGEEISCYYGDGFFGENNEFCECYTCERRGTGAFKSRAGLPAPAPVINSKYGLRETDKRLNRLKKLGDSSKNSDSQSVSSNTDADTTQEKNNASK	112913	161954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_113358_132981_133218_140013_140162_146394_146464_153736_153903_154301_154412_155795_155963_156277_156298_156381_156519_159992
904306	contig_11846_pilon	-	3422	12	Intergenic	novelGene_105965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	162.024587461745	9	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	1213	2913	308692	290118	FALSE	35	GACGGAGCCTCACTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	336738	289608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308802_335635
904307	contig_10734_pilon	-	4305	1	Intergenic	novelGene_51220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	377	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTAGTCTGCTTCCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179346	1175041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1175000_1179300
904308	contig_1244_pilon	-	3056	6	Intergenic	novelGene_37929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.903428106267	456	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	99	851	349752	345560	TRUE	10	TATGTGTCTTTGTTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDIKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSPDEPLRSRKVFVGRCTEDMTADELRQFFCQYGEVVDVFIPKPFRAFAFVTFADDQVFFSFNNFVRAN	350840	343285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_343745_343813_345770_347073_347215_347810_347975_349514_349764_350753
904309	contig_7051_pilon	+	3901	8	Intergenic	novelGene_64341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	484.651779052523	20	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	152	1150	334385	343526	TRUE	75	AGAAAAGAGAAACAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEEVEASKGLEKVLQERWQQPCSATGVGQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKGILWVSWFWFCGVFWFW	321854	347607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_345538_346867
904310	contig_7368_pilon	+	2652	11	Intergenic	novelGene_158795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	317.066065670863	282	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	565	1944	8755	17381	FALSE	35	CATAAAACCTGGGTGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEEMKAAESGAQSAPLPLEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTERPMIGDRVFVHYTGWLLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAVATMRVGEVCHITCKPEYAYGLAGSPPKIPSNATLVFEIELFEFKGEDLTEDEDGGIIRRIRTRGEGYARPNDGAIVEVALEGYYKDRMFDQRELQFEIGEGENLDLPCGLEKTIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPHAELTYEIHLKSFEKAKESWEMNPEEKLEQSTIVKERGTGYFKEGKYKQALLQYKKIVSWLEYESSFSGEEAQKARALRLASHLNLAMCYLKLQSFSAVIENCNKALELDSNNEKGLFRRGEAHLAVNDFELARADFQKVLQLYPSNKAAKAQLAICQQRIRKQLAREKKLYANMFERLAEEDSKAKAEVAAGDRSSDVEMKDEQKNNVAGSQAQVETEA	4455	18089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_+_4811_8545_8860_11774_11920_12353_12497_13373_13495_13780_13938_14798_14890_14986_15071_15300_15487_15963_16204_17273
904311	contig_20527_pilon	+	2251	7	Intergenic	novelGene_138558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_5	1140.26528346112	197	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	713	1339	13527	27453	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12814	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36519
904312	contig_9471_pilon	+	4076	4	Intergenic	novelGene_21739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1452	1856	229401	229805	TRUE	40	TCATTCAACAAATATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTVSKHLQKQDRMVPVGVQNKTPVDIPVKEKALDLTDREFKSLIFRIIQEFKQKADKNEEKIDKFMEKADRFMENTAKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKIKQQDFRNGQCHRRAEKQV	227900	430056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_228072_228120_230141_427890_429274_429554
904313	contig_10500_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_41189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	951	1256	1372507	1372812	NA	35	ATGAAGTGAATCATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPFETEAAWLLVSLVSSASASYGLSALWPHARICPAGASVPKLSSSTGISARRHPTPPGSLLHTGTQLSHSMGWLQRCLSTVSWFCCCWFSAAAASLLL	1371556	1374079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1371600_1374100
904314	contig_7963_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_58532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTGAAAAAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239132	237397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_237400_239100
904315	contig_546_pilon	-	1463	1	Intergenic	novelGene_117212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117956	116493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_116500_118000
904316	contig_4315_pilon	-	1516	2	Intergenic	novelGene_46780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCCTGTGTCTCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333729	327067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328389_333534
904317	contig_9471_pilon	+	2890	8	Intergenic	novelGene_21803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_7	339.238402716366	129	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1893	2669	413930	417296	FALSE	40	AAATTTATATGAATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	411948	417517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152
904318	contig_9839_pilon	-	1048	2	Intergenic	novelGene_88535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	661	975	67288	66974	TRUE	30	AGTCATTTTGTAGATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSICKSSMILSVFSVFSSWSGILITCKFLLLILSHIFLSISSFVSFFSLIFPQQGSIQGFVFNLIDPVFLHFKFAPKTLYTKKPNPLLLSRF	67948	63688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_63738_66949
904319	contig_13004_pilon	+	1715	2	Intergenic	novelGene_112706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	0	110	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	837838	861395	FALSE	80	CAACAAAAAAGAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEQKRKGARDSVCVHIPCSVGLTCLGDEAITALREQALWPRARKVQREAVKACVVVIWELVPVIGEVSAQCGPGCGGAGVEQALELRFHFSLSHQAWNLIFLS	837837	862798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_861162
904320	scaffold_17306_pilon	-	3556	2	Intergenic	novelGene_175320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCCGGTTGTGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32067	24404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17306_pilon_-_24597_28703
904321	contig_12080_pilon	+	2676	17	Intergenic	novelGene_128352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	271	720	107843	108292	TRUE	5	CCCCGCGCCTACGCCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	62622	164276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109686_110390_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118140_118502_118606_120731_120885_164134
904322	contig_16303_pilon	+	2583	9	Intergenic	novelGene_34022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	8	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1845	2150	37468	38653	TRUE	25	TCAGGGGATCTGTGAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLLRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	21423	47976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_21544_31737_33097_35621_35766_35982_36028_37168_37302_37424_37703_38582_38710_40436_40736_47898
904323	contig_13740_pilon	+	1147	1	Intergenic	novelGene_34748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTGGCGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341381	342528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_341400_342500
904324	contig_3942_pilon	+	785	6	Intergenic	novelGene_128683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	449.491001022267	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	60	611	426591	429999	FALSE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426531	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
904325	contig_6164_pilon	-	2159	4	Intergenic	novelGene_121285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	287	junction_3	82.4028046987615	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	127	864	570209	567664	FALSE	15	GCAGTATGACTGTGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEFSLADALPEHSPAKTSAVSNTKPGQPPQGWPASNPWNNPSAPPSVPSGLPPSATPSTVPFGPAPTGMYPSVPPTAPPPGPPAPFPPSGPSCPPPGGPYPAPTVPGPGPTGPYPTPNMPFPELPRPYGAPTDPAAAGPLGPWGSMSSGPWAPGMGGQYPTPNMPYPSPGPYSAPPPPQAPGAAPPVPWGTVPPGTWGPPAPYPAPAGSYPTPGLYPTPSNPFQVPSGPSGAPPMPGGPHSYH	580084	566368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_567676_568898_569607_570191_570214_579962
904326	contig_8330_pilon	-	4037	5	Intergenic	novelGene_71895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2733	3095	1088935	1088573	TRUE	15	AACATTCTCTCCTTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASWNSTDRKQAKGATYVVLQEKKRTIPGAAQRSAELLEGAQEARPSCFQRVWPWCPGSQRVGPQSPRFPRVGSLSTQFQSVGLALRCARWIGLPPKTEGVWLPCPRGRVGGVTTKRD	1105011	1086662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1086793_1087625_1087749_1087883_1091161_1094731_1095039_1104811
904327	contig_10370_pilon	-	2077	2	Intergenic	novelGene_178750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCCCCTTCTGGTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20354	17957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10370_pilon_-_18901_19220
904328	contig_20199_pilon	-	1352	3	Intergenic	novelGene_82586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGTGGCTGCTGGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44146	40649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41578_42091_42174_43804
904329	contig_5317_pilon	-	3832	3	Intergenic	novelGene_76592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_2	57.5	14	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAGGTAAAAATAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360143	355267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_355767_356227_356343_356925
904330	contig_10811_pilon	+	2527	9	Intergenic	novelGene_165797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_8	226.433627140493	227	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	105	2012	345710	414565	FALSE	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSINPGIGNVGASSPVQQGLGGQAQGQPNSASMASLGAMGKSPLNQGDSSAPSLPKQAASTSGPTPPASQALNPQAQKQVGLVTSSPATSQTGPGICMNANFNQTHQGLLNSNSGHGLMNQAQQGQAQVMNGSLGTAGRGRGAGMPYPAPAMQGASGSVLAETLTQVSPQMASHAGLSTAQAGGMSKMGMTGSTSPFGQPFSQTGGQQMGTTGVNPQLPSKQSMVNSLPPFPTDIKNASVTNVPNMSQMQTSVGIVPTQAMATGPTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRPCSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNASDKRNQQPILGSPASGIQNTIGSVGAGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPYMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPQTHQQMRTINPLGANPMNIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGTLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRLHKQGILGNQPPLPAPGTQTPGIPPGQPVRPPSKGLMPPTNPRQFACFSFCVLGVSPRIQNSNLRKPLLWNCML	345605	415080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_346175_387514_387692_400478_400720_402040_402155_410314_410558_412067_412171_412492_412640_413665_413784_414265
904331	contig_3233_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_56600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCAAAAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931150	928968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_929000_931200
904332	contig_14445_pilon	-	1766	2	Intergenic	novelGene_137383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	599	925	366611	366285	TRUE	60	ACAGAACATAGCAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTSGKGRGGLAISNEAGARDLSHAGLLQGEGGRPRRRWRQGNGASLSVYQLFRLARGVPGRRQYQKVGSLSPPRGTLEESPGGFLLENHPLKTVWSTALLIYMGLP	367209	364148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_364423_365717
904333	contig_12622_pilon	+	3771	22	Intergenic	novelGene_5809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	183.897745914356	1	54	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	1627	3465	446467	475513	FALSE	85	AAAAAAGGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	349718	475819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405843_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
904334	contig_13780_pilon	+	2587	1	Intergenic	novelGene_149136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	812	1258	911658	912104	NA	50	CACTAGCAAACCAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYWFCFSREPSLRQTFHPITAQYTFSSSAHGSFSRIGLIAGHKASLKKVKKTGIPPSIFSNHNRVELEINNRRKTGKYTNMWKLNNILLNNKWVKEKIKSKIRKYLESNENESTTYQNLWNAAKAVLRGNFIAVNTYIKKEDLKAIT	910846	913433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_910800_913400
904335	contig_19237_pilon	-	2114	4	Intergenic	novelGene_162965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	130.248480477381	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGACATGCCTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71664	65850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_67163_67236_67816_68341_68467_71566
904336	contig_11855_pilon	+	2585	5	Intergenic	novelGene_67101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	68.3410564741284	19	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	931	1680	2445507	2446256	FALSE	25	AGAGGTGACTGAGATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440084	2447161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443327_2443442_2443588_2443832_2445373
904337	contig_5084_pilon	-	4009	17	Intergenic	novelGene_64477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	77.7764976953193	53	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1206	3618	391	4008	110012	64707	FALSE	50	AGGCACTAGAGGCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLDTGKMPVVYLEPCAVTKSTVKVSELPDNMLSTSQKDTSSVLAELDYLPTYVENSNGTGFCLGKESDNGFRKYSPDFRVIQKYPLFKEPQWKYPDISDSISTEGTYDNSSKGSSGDSFSGKEDLSRKRTTMLKIATAPKSVNASQNTSSNIPGKRGRPRKLKLSKAGRPPKNTGKSLTSTKNTPVGPGSTFPDVKPDLEDVDGVLFVSFESKEALDIHAVDRPTEEPSSLQASTTNDSGCRTRISQLEKELIEDLKSLRHKQVIHPGLQEVGLKLNSVDPTVSIDLKYLGVQLPLAPATSFPFWNLTGTNPASPDAGFPFVSRTGKTNDFTKIKGWRGKFHSASAARSEGGNSEGSLKNRSAFCSDKLDEYLENEGKLMETSMDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQASLKTKPIHTIIRKRAPPCNNDFCRLGCVCSSLALEKRQPAHCRRPDCMFGCTCLKRKVVLVKGGSKTKHFQRKAVHRDAVVYDALGEEPREEGEEGGREEEELLKEKKKRKKLEYTICETEPEQPIRHYPLWVKVEGEVDPEPVYIPTPSVIEPMKPLLLHQPEVLSTTVKGKLLPGIKAARPYTPKPNPVIREEDKDPVYLYFESMMTCARVRVYERKKEDRRQPSPSPSPSPLFQQQSSCHSSPENRSAKEPDSEQQPLKQVTCDPENDSDKSQEKSWKSSCNEGESSSTSYVHQRSPGGPTKLIEIISDCNWEEDRNKILSILSQHINSNMPQSLKVGSFIIELASQRKSRGEKNPPVYSSRVKISMPSCQDQDDMAEKSESETPDGPLSLGKMDDLTSMQTDALDSVRERLHGGKGLPFYAGLSPAGKLVAYKRKPSSSTSGLIQNHCVDYLEDDEEQVDIETVEDFSEEIIVHMKTAAARLLSSKQPCHTHVSADEKAAERSRKAPPIPLKLKPDYWNEKLQKEAEAFAYYRRTHTANERRRRGEMRDLFEKLKITLGLLHSSKVSKSLILTRAFSEIQGLTDQADKLIGQKNLLTRKRNILIRKVSSLSGKTEEVVLKKLEYIYAKQ	138903	64705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_64760_65538_65651_66438_66646_68942_68995_71746_71875_84603_85122_86662_86736_87211_87395_88475_88703_93274_93624_94782_95442_96630_96736_97148_97281_107959_108056_108174_108254_109367_110320_138820
904338	contig_7707_pilon	+	1478	2	Intergenic	novelGene_72118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTATTGACTATGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24845	115211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_26246_115133
904339	contig_8140_pilon	-	3855	2	Intergenic	novelGene_86465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	21	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2876	3202	900357	900031	FALSE	85	AATAATAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRFRFTYFGHVSRRDQSLENNIMLSKVEGQRKRGRPSTRWTDTVAGTMGSNVAMTVRMVQDQLVLLYTGLLRVGTNSMAPNSNNLATLAHWPGSPEAHFSLPCPIRL	961799	899377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_903147_961713
904340	contig_9332_pilon	-	3865	3	Intergenic	novelGene_60725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1909	2919	283884	282874	TRUE	25	TCTAATTCCTTTACAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQPLEIQKINNKISEMDNVIEGLKSRFEMVENRFSGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEENLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDENLAIQEAQRTPYKRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSLDYSAETLQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKFREYVKAKSNLQELLKGVL	285792	234854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_235095_235869_236235_282532
904341	contig_5894_pilon	-	5788	5	Intergenic	novelGene_83008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAGAAGATAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668811	244169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_244420_357293_360066_436850_438172_518141_518377_667601
904342	contig_13740_pilon	-	1810	8	Intergenic	novelGene_34706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	2467.0244491397	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	168	656	165243	161045	TRUE	50	AAAAAAATGCCTTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165410	157083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_161270_161574_161722_161919_162031_165237
904343	contig_18511_pilon	-	3618	1	Intergenic	novelGene_126885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1543	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	2697	3299	43854	43252	NA	45	TTTCAAGGTAACCACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSVLEGLENRFEMMEDRISEIEDKHLYTTQKKSEKRRKKMKKLRLMRNTIKSKNLQVIGVPEQGEKTKNTDSITEELPTEKFPNIMKDEKLTIQDAQRIPYRINPKRKSPRHIIITLSTTKDKEIILRAAREKQKVTYRGETIRLRSDYTAETMQARRQWDDIYKTLKEKKMPAKENIILQNSLSNMMVKLGHLQINRN	46550	42932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_42900_46600
904344	contig_6076_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_81721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTCTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18976	20553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_19000_20600
904345	contig_6630_pilon	-	3823	14	Intergenic	novelGene_30696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	593.284778502168	1799	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	771	2084	374404	357618	FALSE	20	AGATGTTGCTTGGATGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVVEGTPLTDGRRLKYRINGFHAFILTSVIVGASLFWGVELYYVYNHFLQFALGAVVFSVALSVYLYARALKAPRNELSPASSGNAVYDFFIGRELNPRIGAFDLKYFCELRPGLIGWVLINLVMLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQAFYLVRHPNEISWPVASVIIALKLFGYIIFRCANSQKNAFRKNPTDPRLAHLKTIHTSTGKNLLVSGWWGFVRHPNYLGDLIMALAWSLPCGFNHILPYFYVTYFTMLLIHREARDEHHCRKKYGLAWEKYCQRVPYRIFPYIY	384203	355878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358778_358860_360550_360720_364054_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372710_374298_374492_374845_374930_378018_378225_379782_380096_384123
904346	contig_11337_pilon	-	2763	2	Intergenic	novelGene_107203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	54	623	360301	359175	FALSE	30	TACCATAAAAGGTTCGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNVFSLRETRSAQQRGKMVDIETNQLQDGSLIDLCGATLLWRTAEGLSHTPTVKHLEALRQEINAARPQCPVGFNTLAFPSMKRKDVVDEKQPWVYLNCGHVHGYHNWGNKEERDGKDRECPMCRSVGPYVPLWLGCEAGFYVDAGPPTHAFSPCGHVCSEKTTAYWSQIPLPHGTHTFHAACPFCAHQLAGEQGYIRLIFQGPLD	360354	357034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_359742_360298
904347	contig_8538_pilon	-	3644	10	Intergenic	novelGene_4629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	232	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1357	1743	825244	824858	TRUE	5	TCCTCGTCGCTGGAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWNKQNEFGGCLGCGQPPLKQEGLSSREGYAMRRDGLLGEGDVRSPLSKGQAGKRDLAKDFESDLGGKKAQQHEAPSEALRQCCEAAAGFLPDRWTSRAQGDSKVPTWVLSESVGRNHLGGRNTVIS	827575	818281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_818382_818643_818764_820352_820527_821378_821494_821652_821793_822015_822109_822200_822274_823540_823642_823872_826268_827242
904348	contig_7119_pilon	+	2271	3	Intergenic	novelGene_40948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	82	1167	138713	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127525	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_140123_140169
904349	contig_8375_pilon	+	6080	2	Intergenic	novelGene_141287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	304	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3051	3365	112469	112783	TRUE	45	CATTATGCAGAGAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGLERAESWLVLGGLERALELGSGGLGSSPGDFTCYPQVFGHIILPLWPLRALFQNEDLDLISASGAVVKSTAANQNVGSSNPPGTPWKPYGAVLLYPVGSL	109418	280771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_115135_280407
904350	contig_6047_pilon	+	2565	4	Intergenic	novelGene_24223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	32.3419232575925	488	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	209	694	150917	165033	FALSE	30	CCCCAACAAGGCTAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEENAGSYSLPQAQAFYTFPFQQMLAEAPNMETMNEQQVPAEVSVPAPAQELVQEAPKGRKRKPRTTEPKKPMEPKKPATPKKPGKSTKSKEKQEKITDTFKVKRKVDRFNGVSEAELLTKTLPDILTFNLDIVIIGINPGLMAAYKGHHYPGPGNHFCK	150708	166904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_150940_159859_160003_163929_164172_164955
904351	scaffold_13505_pilon	+	3234	14	Intergenic	novelGene_111405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_13	76.9430743237527	441	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	33	1472	287876	326615	FALSE	60	CGATAAATTAAAACTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSPSPGRASSMVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKTSPFSLSPTGPSTKIKAEDPSGDSTPAAPPPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAGDIQQLLQLQQLVLVPGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLFQLPQQTQGALLTSQPRAGLPTQAVTRPTLPDPHLSHPHPPKCLEPPSHPEEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHLVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTVTTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGSGAAPPLNSIPSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLSGLNPSTGPGLWWNPAAYQP	287843	328377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_287904_296703_296770_296900_296936_297084_297142_300649_300767_317941_318048_318134_318227_320763_320926_321060_321203_321293_321443_321517_321695_323805_323873_325876_326079_326575
904352	contig_14357_pilon	+	2418	1	Intergenic	novelGene_121660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATCTACTTAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475289	477707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_475300_477700
904353	contig_9839_pilon	-	3216	1	Intergenic	novelGene_88517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	370	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	2859	3215	46924	46568	NA	30	ATGCTATCAGTGGTAACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKEKRRGIDALELRCWQRILNIPWTAKRTNKPVLEEAQPECPLEAKMLVLHFMYFGYVISRDQSLEKGIMLGKVEGQQKRGRPSMRWTDTVAPTVGSNTAMIMRMAQDRAVFRSVVHR	49782	46566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_46600_49800
904354	contig_1443_pilon	+	2880	8	Intergenic	novelGene_28368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	868	1266	978594	980076	TRUE	15	GTCTCAACCGGGCTTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSSSRGDCAGMTSTSELSDEVLRFLFLPTTGVIVFSLLLPLVLEVPEVLLFFGFSSLSLSPLLFFLRFFSPSSSGRTLGNSSSFRTRGMFCSPRARALAMASATIRFAFSCFFWCSSLRFSSIPVLPPV	969218	1000680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_969830_970196_970265_970345_970530_978589_978705_979788_980174_980884_981257_982132_983189_1000591
904355	contig_3463_pilon	-	2745	16	Intergenic	novelGene_61999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	187.20106837302	2	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	342	1700	532098	508757	FALSE	15	TCTCCTCACTGCAGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNNTPQLNRSLSQGTQLPSHVTPTTGVPTMSLHTPPSPSRGILPMNPRNMMNHSQVGQGIGIPSRTNSMSSSGLGSPSRSSPSIICMPKQQPSRQPFTVNSMSGFGMNRNQAFGMNNSLSSNIFNGTDGSENVTGLDLSDFPALADRNRREGSGNPTPLINPLAGRAPYVGMVTKPANEQSQDFSIHNEDFPALPGSSYKDPTSSNDDSKSSLNTSGKTTSSTDGPKFPGDKSSTTQNNNQQKKGIQVLPDGRVTNIPQGMVTDQFGMIGLLTFIRAAETDPGMVHLALGSDLTTLGLNLNSPENLYPKFASPWASSPCRPQDIDFHVPSEYLTNIHIRDKLAAIKLGRYGEDLLFYLYYMNGGDVLQLLAAVELFNRDWRYHKEERVWITRAPGMEPTMKTNTYERGTYYFFDCLNWRKVAKEFHLEYDKLEERPHLPSTFNYNPAQQAF	597462	507711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_508844_515599_515745_517455_517557_519603_519654_519741_519804_522651_522809_522899_523021_524024_524150_525994_526121_528709_528790_531072_531256_531976_532125_542246_542307_551883_552007_565091_565150_597388
904356	contig_3130_pilon	+	3180	2	Intergenic	novelGene_103568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAACAGGTTTATAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95426	98659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_98451_98503
904357	contig_9538_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_176462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCGGTCAAGCGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29516	29157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_29200_29500
904358	contig_12468_pilon	+	4634	2	Intergenic	novelGene_164871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	996	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	4011	4385	4303	4677	FALSE	45	GTCACAAATATTTACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEEERNAEEERNNEEEERVKSNKFTVKGFAGVFSKLNQGLQLLENADCFAKVNRQIREAVTWYCKICEGKKRTRQTTLTNSLIRNAIPIPRDNPDDPESSTSGVITATDKMLMLSNSSSLLE	255	4926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_+_1325_1361
904359	contig_10642_pilon	-	3120	3	Intergenic	novelGene_78670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	588	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCCAGGAAATCAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179668	176135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_178252_178477_179166_179352
904360	contig_11851_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_146554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	478	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTTGGCAGTTTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36392	34387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_34400_36400
904361	contig_7979_pilon	+	4181	20	Intergenic	novelGene_125539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	448	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAGAAAAAAGCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048112	1111995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1048889_1050534_1050648_1061525_1061614_1065029_1065230_1077635_1077742_1078315_1078484_1080366_1080443_1080770_1080892_1088412_1088487_1089707_1090543_1095870_1096035_1097021_1097132_1102864_1103012_1103398_1103539_1103981_1104222_1104716_1104977_1107317_1107536_1108699_1108789_1111104_1111242_1111876
904363	scaffold_12124_pilon	-	3236	10	Intergenic	novelGene_22334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1910	2245	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1552889	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1510266_1552841
904364	contig_6494_pilon	-	912	7	Intergenic	novelGene_108548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1002.9692030278	172	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	481	834	3457	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8305	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5711_6363_6490_6751_6883_8256
904365	contig_13265_pilon	+	3118	14	Intergenic	novelGene_145999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_9	181.92748409038	15	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	574	2148	45049	113433	FALSE	70	ACTTTTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSSWIEASSCAALEMPIHSDILQVILDYLYTDEAVVIKESQNVDFICSVLVVADQFLITRLKEICEVALTEKLTLKNAAMLLEFAAMYNAEQLKLSCLQFIGLNMAALLEARSLDVLSDDVLKDLSVFYRKMIPAMDRRVITPYQDGPDISYLEVEDGDIFLKEEINMEQNYLETMFKKVKTKAKKKPRKRSDSSGGYNLSDVIQSPPSTGLVTSGKTYSVESLSELLTSDSEGSYAGVGSPRDLQSPDFTTGFHPDKIEGKVKPYVNGTPPTYSREDLKSWEKSPVLKTSAPQPIPSNTIDNTSSSSWVVGSFSKMISHGIKLSQKQRKMIAVTTKENNSGMNSMETVLTTPSKSPKPVNAWAFSLHSVSSKSFWDFSLDEKKSVTGHSSGDHVKKICFKGIESSQDPKVIRYPTQGTPGEGNHISDLPLQDSANPWLSSSLTGPSVAPVTFASIVEEELQQEAALIRSREKPLALIQIEEHAIQDLLVFYEALSNPDEFVIVERTPQGPLAVPMWNKHGC	44475	114403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_45073_47162_47260_62547_62650_64862_64981_66860_66922_67476_67599_69565_69679_74623_74773_76338_76503_79357_79502_97722_97873_111915_111985_112372_112503_113301
904366	contig_10437_pilon	+	2138	8	Intergenic	novelGene_38272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	122	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	124	1146	431167	451175	FALSE	50	ATGATGTTAGAGTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431043	452167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
904367	contig_11448_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_66393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACCAATTCTCTATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428916	426624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_426600_428900
904368	contig_5935_pilon	-	1662	2	Intergenic	novelGene_102736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	950	1360	1215294	1214687	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEDQMSCGMTSRTSSMKKPLPMPALSKEKAMFSSSLKIVKPNGKKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPIPQLKSFQKIQVRLVHELEKKFRGNHVVFTAQGRILPKPT	1216243	1214384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1215041_1215237
904369	contig_14970_pilon	-	1807	6	Intergenic	novelGene_45132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	105.85537303321	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	222	914	291083	270167	TRUE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERVPHRSRLCRHPQHLPRSSSSVPLPRPPLTLSRPSQLTLVPSGTLPLGIACLICGKIIAIKDLEVVARQLGMYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLQSIFKSWISLNHSQVHLSLCHHILTGFVHSIILRKILQSKREGKSILRWRDAPAVKSNSDLCFSLAASSS	315750	268160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_270086_270381_280559_280695_285611_285807_290934_291170_315615
904370	contig_16643_pilon	+	3392	1	Intergenic	novelGene_158114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATTTGCAAAGAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190756	194148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_190800_194100
904371	contig_6842_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_130775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	331	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	888	1277	1351716	1351327	NA	55	GTAAAACAACAGAGACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHRLSRTGSQLKKRKRKQTNNSKQTNKQKPRGPTSAAAQTGKQLHTQTEFCSPSGRSKDGAWSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSRKKSNTSSQQMALREPASAGWWNPSNQCFPDQRLCPREAEEAKCG	1352603	1350514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1350500_1352600
904372	contig_4364_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	657	1430	1216402	1217175	NA	0	CTGCCCGGTGTCCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQLPELSSSLLPVSSTGLASALLLGFLHGLCQRAAGPTLGAMTPLPTCSRSVSGLGWCFPRSRASSISLPCPKGLGGLHQCQQGLRPQRWACRPSPCTGRQLSAPGPSSASLWNLCLPGTGCSAFRGTSLIAGPTTPCWPLGRQPILQPWLRQLHVGCVGAAHGTARDAAALSLATGAWSFLVSLASVSRAPENRGEGCQGGEKQGRWAGTALGGQCLVGECGHTCVRSWQACARVLPASLGWPTHSSVTPSPSVA	1215745	1218764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1215700_1218800
904373	contig_6446_pilon	-	1972	1	Intergenic	novelGene_149178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTTCACAGGAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154318	152346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_152300_154300
904374	contig_299_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_129437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTTCTGCTACAACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884547	883136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_883100_884500
904375	contig_12079_pilon	-	1701	2	Intergenic	novelGene_67567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGAAAGAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872428	870545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_871422_871603
904376	contig_3095_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_75083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
904377	contig_12964_pilon	-	1993	3	Intergenic	novelGene_131680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCATCTGGGATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424605	278029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_278037_281022_281033_422629
904378	contig_2332_pilon	+	3673	17	Intergenic	novelGene_58692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_3	38.3876200747064	333	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	813	2442	11	2452	513748	542564	FALSE	30	CTTTCATGTAGATTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSKKKENAIELKGETKTPKKTRSSPTKKESTSPEDSEKKRTNYQAYRSYLNREGPKALGSKEIPKGAENCLEGLIFVITGVLESIERDEAKSLIERYGGKVTGNVSKKTNYLVMGRDSGQSKSDKAAALGTKIIDEDGLLNLIRTMPGKKSKYEIAVEAEMKKEKSKLERTPQKTDQGKRKISPNKKDSESKKSKLTPKRGGSLKSVKKEPSVFQKGLDFEEQVAEETSVDSGARNLTDDSSGHKVESLLWVDKYKPTSLKTIIGQQGDQSCANKLLRWLQNWHKSPSEDKKHAKFGKFAGKDDGSSFKAALLSGPPGVGKTTTASLVCQELGYSYVELNASDTRSKNSLKEIVSESLNNTSIKGFYSGGAVHSASTRHALIMDEVDGMAGNEDRGGIQELIGLIKHTKIPIICMCNDRNHPKIRSLVHYCFDLRFQRPRVEQIKGAMMSIAFKEGLKIPPPAMNEIILGANQDIRQVLHNLSMWCAQSKALTYDQAKADSSRAKKDIKLGPFDVARKVFAAGEETAHMSLMDKLDLFFHDYSIAPLFVQENYVHVKPIAAGGDMKKHLMLLSRAADSICDGDLVDSQIRSKQNWSLLPTQAIYASVLPGELMRGYMTQFPTFPSWLGKYSSTGKHDRVVQDLALHMSLRTYSSKRTVNMDYLSHIRDALVQPLASQGAEGVQAVVAFMDTYYLMKEDFDNIMELSSWGGKPSPFSKLDPKVKAAFTRAYNKEAHLTPYSLQAIKISRRSTGPVLDSEYNEELNEEDSQFDEKDQDSVETDAMIKKKTKSSKPSKSEKDKESKKGKGKSLKK	513737	543785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_513838_516407_516516_520450_520631_521828_521934_524087_524488_526120_526231_527899_528015_529287_529380_529567_529706_529852_529949_530062_530162_530818_530974_531094_531213_535481_535628_539618_539833_541129_541322_542480
904379	contig_15407_pilon	+	2951	3	Intergenic	novelGene_123048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	2021	2524	335162	336179	FALSE	60	GAATCCACAAACAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTHLQSINDNYAGYNQKQKSSSDQSSRTGGENRKHRIIEELLTEDFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDDIYKTLKEKKCQPRKIYPAKLSFKYDGEIRSLPDKQKLRD	333033	336606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_334996_335103_335191_335704
904380	contig_7009_pilon	-	8229	1	Intergenic	novelGene_23650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1702	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3579	3941	469978	469616	NA	10	TTTTTTTTTTATTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKYNSHTLSPEMQRRHQLVSGRHPLHRKAGSQLCTAKLGPMPGSQSTQAITDETRGVCAQAACRQLSSSLFTPTKAFPPPPLLQCFIRWHQHLLGSHQVALSSILFGKQYQHCDCVHP	473556	465327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_465300_473600
904381	contig_10042_pilon	+	451	2	Intergenic	novelGene_79252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCACCATCTACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1203520	1211203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1203728_1210959
904382	contig_17989_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_150841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	2148	2453	271767	271462	NA	30	GAGTGGGCAAAGCCATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLKSSRTQDSACSRYFTPELGLPPRPPGWQLEAAETRPAVEAGAQVCLLCILTQCQRFSAALQGTPLSATLSLVMSQCCRKIKDTVQKLASDHKDIHSSVS	273914	271460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_271500_273900
904383	contig_5302_pilon	-	2833	10	Intergenic	novelGene_81440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	685.861178049578	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	328	1179	209238	177300	TRUE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209565	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176921_176997_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
904384	contig_5669_pilon	+	3830	6	Intergenic	novelGene_86064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	196.546788322781	14	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGAAAGCCAAAGAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184615	192261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187306_189293_190117_190940
904385	contig_9647_pilon	+	3679	1	Intergenic	novelGene_127381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	652	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAAGAAACTCCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45195	48874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_45200_48900
904386	scaffold_2602_pilon	-	2229	13	Intergenic	novelGene_127694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCTCCACATCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69585	37918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_38155_44016_44104_44559_44614_45177_45273_47170_47283_47479_47593_52861_52945_54033_54206_56685_56788_58074_58132_58240_58305_65419_65480_68591
904387	contig_11396_pilon	-	1444	5	Intergenic	novelGene_71334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	122.45688016604	97	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	496037	492463	TRUE	30	CTCTTTGTTAAAACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSRRASAGDETHQFPSPAGPPTPRHHTWTPPGLGKTLLRGLQTTACLSPGGETRPQAGLSLLEGFQSPQWIQHSTAGQTLPSTPSSLAGNTPSPVSLLDSEVPRAWGGRGQASVYL	496037	477757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_477984_478315_478373_491301_491528_491878_492642_495865
904388	contig_6654_pilon	+	1928	14	Intergenic	novelGene_85752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	104.606956674092	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1362	565	1926	616912	650195	FALSE	70	TGAAGAAAAAACAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENGFILDSLDILWEKIISNGMVTKDLTRLKTLLTETETATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEAT	573067	650197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_616762_616972_618597_618655_623021_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951
904389	contig_20165_pilon	-	4137	1	Intergenic	novelGene_54477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1919	2218	64567	64268	NA	30	CCCAGTGCCCATCAACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRTEINEIENRKTVERINKSRNWFLKKINEIYKPIARLTKKQREKMQITKTRNVSRDITTDPTEVKRIITENYELYFNKIDNFDEMNKFLETHNLPN	66485	62348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_62300_66500
904391	contig_6102_pilon	+	2875	1	Intergenic	novelGene_31758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTGGGTGTTCCGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292774	295649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_292800_295600
904392	contig_15857_pilon	+	2658	19	Intergenic	novelGene_152070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	110.065412649608	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	188	2020	54668	108636	TRUE	30	TCAATGACTATGCTAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPADALDDENTFKILVATDIHLGFMEKDAVRGNDTFVTLDEILRLAQENEVDFILLGGDLFHENKPSRKTLHTCLELLRKYCMGDRPVQFEIISDQSVNFGFSKFPWVNYQDGNLNISIPVFSIHGNHDDPTGADALCALDILSCAGLVNHFGRSMSVEKIDISPVLLQKGSTKIALYGLGSIPDERLYRTFVNKKVTMLRPKEDENSWFNLFVIHQNRSKHGNTNFIPEQFLDDFIDLVIWGHEHECKIAPTKNEQQLFYVSQPGSSVVTSLSPGEAVKKHVGLLRIKGRKMNMQKIPLHTVRQFFTEDVVLARHPDLFNPDNPKVTQAIQSFCLEKIEEMLENAERERLGNSRQPEKPLIRLRVDYSGGFEPFSVLRFSQKFVDRVANPKDIIHFFRHREQKEKTGEEINVGKLITRPSSEGTTLRVEDLVKQYFQTAEKNVQLSLLTERGMGEAVQEFVDKEEKDAIEELVKYQLEKTQRFLKERHIDAVEDKIDEEVRHFRESRQRNTNEEDDEVREAMNRARAHRSQLEDFASAFSADDFMSVDLTEEMADDSDDSISAAASKGRGRGRGGRGQNSTSRGGSQRPLNLQNNSPPEVLLLRITQR	53415	126767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_53545_54609_54688_56447_56581_62287_62449_68575_68664_70078_70221_71479_71595_77857_78044_79043_79216_80718_80800_84879_85007_87922_88027_89279_89454_94923_94987_98580_98785_106561_106621_108632_108701_115721_115798_126269
904393	contig_3386_pilon	-	6545	2	Intergenic	novelGene_34575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	209	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3676	3984	475077	474769	FALSE	80	AATTAAAAAAAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSIGPNSPGAKENEEHQRHKESISPTDRKGLINQRLHQPQTRTRWCPATTNDHPDREHNRESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGIPEDTAPRLC	484970	472207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_477755_483972
904394	contig_7594_pilon	+	3745	12	Intergenic	novelGene_55407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCGAGCTGCTGTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448490	519128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_450841_453157_453329_453415_453474_453915_454117_469853_469973_472007_472122_477175_477242_481293_481446_483903_483959_484574_484640_500700_500887_518920
904395	contig_9482_pilon	+	3226	14	Intergenic	novelGene_44247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	108.46115657325	9	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	96	1334	420637	436249	TRUE	5	CCCCCCGGCCTTGTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEETDREAVATAVQRVAGMLQRPDQLDKVEQYRRREARKKASVEARLKAAIQSQLDGVRTGLSQLHNALNDVKNIQQSLADVSQDWRQSINTIESLRDVKDAVVQHSQLAAAVENLKNIFSVPEIVRETEDLIEQGELLQAHRKLMDLECSRDDLMYEQYRMDSRNTHDMTLIQGYFGSMQRLSEELAKQLWMVLQRSLVTVRRDPTLLVSVIRIIEREEKIDRRMLDRSKQTGFMPPGRPKKWKEKMFAILDRTVTTRIEGTQADTRESDKMWLVRHLEIIRKYVLDDLIVAKNLMVQCFPPRYDIFRNLLNMYHQALSTRMQDLASEDLEANEIVSLLTWVLNTYTSVEMMGNLDQAARYLHVDAHLKHHCLAAESTRNRPEGLGQGDGAGGRPGRLLPDHASRHRVPDV	418918	458097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_418967_420589_420781_422386_422607_424070_424753_433283_433308_433366_433402_434900_435027_436241_436343_436918_437030_437123_437275_451041_451165_454613_454776_455372_455501_456973
904396	contig_13937_pilon	+	1294	9	Intergenic	novelGene_167367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_6	103.408096273938	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	31	1185	109560	122418	FALSE	30	CTCTGTGCTTAAAATCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPPDETGEYYMLQEQVSEYLGVTSFKRKYPGLTALRSDEVIDLMIKEYPAKHAEYSVILQEKERQRITDHYKEYSQMQQQNTQKVEASKVPEYIKKAARKAAEFNSNLNRERMEERRAYFDLQTHVIQVPQGKYRVLPTERTKVSSYPVALIPGQFQEYYKRYSPDELRYLPLNTALYEPPLDPELPALDSDGDSDDAEDGRGDEKRKSKGASDSSSGNASDGESPPHPHGPEDSPQGRPKSKDKAATPRKDGPKRSVLSKSVPGYKPKVIPNALCGICLKGKESNKKGKAESLIHCSQCGNSGHPSCLDMTMELLSMIKTYPWQCMECKTCIMCGQPHHEEEMMFCDVCDRGYHTFCVGLGAIPSGRWICDCCQRAPPTPRKVGRRGKNSKEG	109529	122527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_109621_111226_111361_111457_111608_112212_112323_115425_115580_115825_115988_120356_120466_120748_120938_122332
904397	contig_2323_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_151860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACACCACTGTTACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154867	156175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_154900_156200
904398	contig_21386_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_177033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAACCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78223	76292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_76300_78200
904399	contig_7022_pilon	+	3788	24	Intergenic	novelGene_142136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_9	150.78008874079	494	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1099	3297	490	3786	108247	196385	FALSE	45	AAATTGTTTAAATACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKYLSRNGIMDISRDNFSFSAKIRVGDFYEARDGPQGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQERERRRQHMMLMKAMEARKKAEEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYWILPQCGGIFVEGMESGEGLEEIAKEREKLKKAESIQIKEEMFETSGDI	92879	196387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_120709_120771_121540_121650_121894_121997_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_148267_148334_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477_174623_196293
904400	contig_19812_pilon	-	2186	19	Intergenic	novelGene_100991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	84.2211961239165	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	79	2052	46806	15879	FALSE	10	AAGTGGTTTTTGTCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48277	15744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
904401	contig_13021_pilon	+	2327	13	Intergenic	novelGene_8147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1981.6200215284	2544	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	170	1156	174676	177795	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEK	174506	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177796_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
904402	contig_10857_pilon	+	1246	2	Intergenic	novelGene_160923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGAAATGGCAATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470424	501283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_471504_501116
904403	contig_3018_pilon	-	1607	11	Intergenic	novelGene_78876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	381.474573202461	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	543	1607	583440	562944	FALSE	65	ACCAGAAGGAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYE	625120	562943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_624785
904404	contig_5201_pilon	+	3010	25	Intergenic	novelGene_82171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	86	junction_5	200.14813524404	180	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2904	105	3008	250608	326698	FALSE	20	GGGTCACGAAGCTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHNRSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPILDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKDCRHTVWKGSAFAALHRGRPPEMPVNYGSPPNLVEIHRGKQLTGCSTFNTAFPGTMYQHLKMHRRILGHLSAVYCVAFDRTGHRIFTGSDDCLVKIWSTHNGRLLSTLRGHSAEISDMAVNYENTMIAAGSCDKIIRVWCLRTCAPVAVLQGHTGSITSLQFSPMAKGSQRYMVSTGADGTVCFWQWDLESLKFSPRPLKFTEKPRPGVQMLCSSFSVGGMFLATGSTDHVIRMYFLGFEAPEKIAELESHTDKVDSIQFCNNGDRFLSGSRDGTARIWRFEQLEWKSILLDMSTRMSGDLSSEEERFMKPKVTMIAWNQNDSIVVTAVNDHVLKAWDSYTGQLLHNLLGHADEVFVLETHPFDSRIMLSAGHDGSIFIWDITKGTKMKHYFNVIEGQGFGAVFDCKFSQDGQHFACTDSHGHLMIFGFGCNKPYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDSNNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPTNYQRLVPGRENSSDEHLVPQLGYVATSDGEVIEQVISLQTNDNGEQSPESNILDGMIRQLQQQQDQRMGPDQDPIPGGLANGEETPRRGFRRLSLDIQSPPNIGLRRSGQVEGVRQMHQNAPRSQIATERDLQAWKRRVVVPEVPLGIFRKLEDFRIEKGEEEKNLYIMGRKRKTLQLSQKSDLVVLRSQSRQRTCRRKYPNYGRRNLGRVESSSGNESSSSVRRETSCDQSEGSCSSEEEWKSDRKSESDSESSSDSSSTYSDWTADAGINLQPPLRTSSRRRITRFCSSSEDEMSTENLSPPKRIRKRKKERKPKKENLRRMTPAELANMEHLYEFHPPVWITDTTLRRSPFVPQMGDEVIYFR	250503	326700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_250657_250797_250857_251002_251033_251196_251257_268758_268910_270971_271071_271521_271683_272651_272874_287290_287392_288467_288539_289353_289455_291973_292015_292847_292947_298284_298436_298891_299027_305214_305344_305530_305757_310069_310256_312331_312516_313074_313169_318139_318272_323248_323341_324869_325060_326454_326581_326683
904405	contig_1706_pilon	-	511	1	Intergenic	novelGene_155029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCGTACGGTTTAGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14129	13618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_-_13600_14100
904406	contig_17964_pilon	-	2466	3	Intergenic	novelGene_33880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10345	junction_1	1529.5	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	FALSE	55	GAAGAAATTTCAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520
904407	contig_5780_pilon	+	2255	6	Intergenic	novelGene_29774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	281	763	107519	110295	TRUE	30	AGCTGATCACCTATTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73990	113453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110359_112024
904408	contig_3627_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_78524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_1	0	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	630860	634316	FALSE	10	TGCTGTTGTCTATCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	630858	634503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_631000_634066
904409	contig_14687_pilon	-	949	5	Intergenic	novelGene_107919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_3	952.244978983875	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	465	947	458476	457792	FALSE	65	GAAAAATAAAAACACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHGHYTRAQANSPRPAMNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENE	527784	457789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_457977_458081_458275_458371_458516_523429_523544_527473
904410	contig_10737_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_133894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTAGTCAATCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275408	278014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_275400_278000
904411	contig_4982_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_172238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTGAATCATGCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168666	167005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_167000_168700
904412	contig_7359_pilon	-	1767	2	Intergenic	novelGene_139854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	565	1002	49019	40694	FALSE	55	AGACTAACTTAAAATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWDKGFWERKDMPLPLYKGSVPTFKETDDCGKRRSSRGNKRVSFSTQGPARSTPTGLPRALPLIPTPGHLTLPGHHLHQDLNPHRAPTSHQGWLLIIQYIYLYMHIYIFFCGAWKGRQDNLCSSQNSFLTMKKAISSHALLIMR	49583	39928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_40856_48743
904413	contig_10263_pilon	+	2607	11	Intergenic	novelGene_135853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGGCCACTGTCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899264	923234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_899344_900410_901819_902513_902627_902762_902829_903048_903213_903545_903667_904812_904978_905074_905175_908479_908628_914657_914741_923074
904414	contig_16125_pilon	-	3538	1	Intergenic	novelGene_155236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	802	1110	119071	118763	NA	40	CACTACCAATTACCTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEIQMNMIFFFTYKCITYNFSPLIALILLCKITLLLFSSIYSFNVKKIFSLKIIFYIYSDGEIYDDIADGKSHMTATTENRSSEVTNLFSQILKIPCWID	119872	116334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_116300_119900
904415	contig_10159_pilon	+	3070	12	Intergenic	novelGene_30864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_4	100.771814897252	464	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	875	1528	978504	992845	TRUE	90	AAAAACAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWTDTQGLKRGHCWVSCTSSASLQGQTQTESQKKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGKRGGFRGCTVWLTGLSGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRQGLNKNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLFADAGLICITSFISPFTKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAGEIKGFTGIDSDYEKPETPECVLKTSVSSVSDCIQQVVELLQEQNIVPHTTIKGIHELFVPENKLDQVRAEAETLPSLSITKVDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNAEAEDDGSVCTKLQMAGATSCGWSWTKGKGRFSPFTPYVLKERKKNNNRIMDGFYFYFGLFCIFHNEYILITFHKQKRNLRLSEVHH	957460	996462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_957549_970012_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978443_978556_982654_982861_992071_992208_992585_993570_994447_994678_995874
904417	contig_6291_pilon	+	4720	6	Intergenic	novelGene_164778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	417.972726382954	978	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	289	1158	355015	381395	TRUE	40	AGTTTAAAGATGGATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEDVSSLTGDALTDLLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQFRQDQRDGGKSEDELDQASTPTDVRDIDL	354726	386737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961_360122_370429_370579_381245_383705_385484
904418	contig_9995_pilon	+	2688	1	Intergenic	novelGene_47815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGGCCTGAAATCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878837	881525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_878800_881500
904419	contig_5916_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_158061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGTGTTGATAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504047	505204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_504000_505200
904420	contig_11281_pilon	+	3306	1	Intergenic	novelGene_125457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAGATAACTAAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828053	831359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_828100_831400
904421	contig_7840_pilon	-	4370	1	Intergenic	novelGene_69025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1578	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	110	478	363588	363220	NA	60	ACACACAAAAGGAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCIALGKSAAKDLFKVLRSKDVTLTEVCLTQAIMFSVALYACESWTMNKEDRRRTDAFELWCWQRILNISWIARRTNKSVLEEVHPECSLEARMTRLSLIYFGHAIRRDQSLEKDIMLDEV	363697	359327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_359300_363700
904422	contig_8386_pilon	+	4024	7	Intergenic	novelGene_82207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTAGCTTGTAGTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16175	32157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_18829_19753_19900_20735_20858_21223_21318_21438_21528_21914_22023_31345
904423	contig_8027_pilon	-	7540	2	Intergenic	novelGene_158836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	433	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTAATTTTTCTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252148	242315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_246046_248338
904424	contig_9199_pilon	-	1020	7	Intergenic	novelGene_65643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.6040267767869	24	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	290	823	144110	142560	FALSE	20	TTTAAGGCAGTCCCCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQVGADPALLDRHGDSAVHLALRAGAPDLLRALLQSGGPAVPQLLHTTDFEGLYPVHLAVRARSPECLDLLVGDGAEVEAAERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLGANVNARTFAGNTPLHLAAGLGSPTLTRLLLKAGADIHAENEEPVCPLPSPPTSGSDSDSEGPERDTRSSFRGHTPLDLTRSTKVRTLLLNAAQDTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDAALQNLEQLLDGPGAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRKTASPREAGPTP	144557	142362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_142582_142997_143146_143348_143419_143555_143708_143838_143942_144071_144242_144399
904425	scaffold_15027_pilon	+	4518	18	Intergenic	novelGene_163566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	148.550458613648	22	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	783	2672	76925	106784	FALSE	35	TTTCCCCAGCATCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLYLEQSDFHEKFAGGDICVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHINKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSSR	48916	108630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_66198_66324_67318_67525_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_104978_105638_105828_106597
904426	contig_7123_pilon	+	4136	2	Intergenic	novelGene_170574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3485	3811	436468	436794	FALSE	15	GATGGCTGTGTCCCGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPAQSGAETVALVASQDPGKAQETLTDQPYSTDDASNRGRTSLRLQSCTLTSLGRSSPVHPTSRPSTISVIDTPHRQGKSHLVISWKLQRPSTPPNNDSLNKNTYM	431546	437119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_432416_433852
904427	contig_6410_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_108642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCATCCTAGCAACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404770	402056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_402100_404800
904428	contig_11386_pilon	-	3222	2	Intergenic	novelGene_82820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2055	2354	149132	148833	TRUE	35	ATACCTGTTTCAAAGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECPEDTPFTTVVRNKFVKGAPAALKTAVIAILCKSDLTVGNGLTELRHLSTMGLMGPVVVGAKWLYSIDKNKVGVVMVTGQRSQSSNQSSLTHTDLWL	151186	147885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_148031_148109
904429	contig_15092_pilon	+	2736	2	Intergenic	novelGene_57816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	530	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1203	1679	326864	327340	TRUE	10	ATTTCCTGGCCACCCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWCVQGSEQTLNRVAAKVKLVRVGQACSRGNYLLTVPLILGLRLISLNTNKFLLKKKKKDGFCNSLHRIALLFCFYFSFLSLHKEVGISPGGPVIGGIFLRKPQKLRYGARSDRSVKCTENTNAFQRSVLPRSETSSGSLAASLESLSHCEGQGPTP	325661	338134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_328267_338003
904430	contig_5649_pilon	+	4632	4	Intergenic	novelGene_82436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	337	840	1483471	1483974	TRUE	5	TTCCTGGGTCTTCCGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLCDSGGFLPLHGPPLAPYDMGAELAALYLLCPPLPSSWPQVLSSGTSSSSGTSSSMHTQWMNACQVARPWAWSLLSCRMTLSAGSGASFLEPRSMLGRKNFSLAFSHSGCLLSSLTRQFHRFPVLSWRLAWSMRSWLCVDRVGKKAGRQVSWVRTGQTGELGNR	1467735	1672077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1468006_1483404_1485828_1486864_1486887_1670160
904431	contig_9177_pilon	+	4102	4	Intergenic	novelGene_32800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	59.1100668245266	101	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3293	3805	1566737	1569099	FALSE	55	GGAAAAAAAAAAGCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNQTFPTSPFIYYYDDKYEIREREQRIKRKVKELQKNGDFPRQFKRPHMEAVDKKPHRDMRKSHGSWRNNRWPQEKKEAQKEMMSRNSRDGEKHRKADKYHEVDEDFPRGPKLHQKPDRSSRHSSHYHRPRGEKLPKEAKRGKHKKKERGLEDDDNDNLFLIKQRKKKI	1532780	1569396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1535959_1558471_1558568_1566718_1566837_1568686
904432	contig_13863_pilon	+	2019	18	Intergenic	novelGene_41996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	499.770244790398	2	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1067	1909	70318	81541	FALSE	30	TAGTAAACTTGGTAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	55132	81651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65796_68692_68740_70282_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
904433	contig_16211_pilon	+	2605	9	Intergenic	novelGene_150059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAACTCTTCTGCTCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79627	121388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_80000_80383_80504_85310_86404_87605_87790_87917_88078_91745_91860_92145_92272_97474_97609_121086
904434	contig_9809_pilon	+	2388	9	Intergenic	novelGene_176747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	143.590509348633	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	155	883	108394	111861	TRUE	70	GTAAAGTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRCSPCSGTSSRTIRTSGASWGRRLSLPGARRPSYRAEKRRELTTLKYRNSFPKKQISFLRFRGSQMRLQFLTLTRTVKALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKWYEDFVFQQLHHLV	108239	116059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111871_112241_112362_112466_112590_114806
904435	SIRV6	+	734	6	NNC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	-2	143	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	99	308	2569	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2470	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10827_11041_11109_11205
904436	contig_3307_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_86899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAGTTGTGGCTATTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186114	183224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_-_183200_186100
904437	contig_15248_pilon	+	4215	3	Intergenic	novelGene_149150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	3322	3840	164430	164948	FALSE	70	GAAAAAATCCACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTIKSKNFRVLGVPEQGEKTEITERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTLYRIDPKRKSARHIIITLAKTKHKQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSSDYWAESMQARRQWDDIYKTLKEKICQPRITYPAKLSFKYDGEIRSFPDNQKLKDYVKTKPNLQDLLKGVL	83893	165323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_84017_144043_145391_162578
904438	contig_3382_pilon	+	5794	4	Intergenic	novelGene_124219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	143	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2497	2805	1828042	1828350	TRUE	25	TCCTAGTGCTGCTATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKKVYFAAVGWSVRYMSTGSSWLMVAFRSSMSLLSLFLDVLSFTKSGVLKSPTTIVELSISLLSAVRVYVFWSPVIGYVSIYYSSVLLVY	1824519	1903141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1824827_1825804_1827691_1827738_1828773_1900574
904439	contig_3482_pilon	-	694	3	Intergenic	novelGene_178806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTACCTGCACCGTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99843	61086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3482_pilon_-_61604_79633_79642_99674
904441	contig_11681_pilon	-	2330	3	Intergenic	novelGene_102979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185733	182807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_184150_184245_184332_184831
904442	contig_2069_pilon	-	2796	1	Intergenic	novelGene_23298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1003	1350	458468	458121	NA	60	AAAAAAAAAACCAGTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTQNNKCWTGCGETRTLIHCWWECRMVEPLWKLIWRFLKKQEIEVPYDPEIPLLGTYPREIRAVTRIDICTPMFTAALFTTAKRWKQPRCPSMDK	459470	456674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_456700_459500
904443	contig_8616_pilon	+	2919	2	Intergenic	novelGene_72619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	219	2189	478331	480301	TRUE	10	CCTGATGCTTTGTGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLDTTDINIEGPDAKVKAPSFGISAPQVSIPDVNVNLKGPKVKGDVPSVGLEGPDVDLQGPEAKIKFPKFSMPKIGVPGMKMEDGRAEVHAQLPGLEGGLSAPDVKLEGPDVSLKGPKVDLPSVNLSMPKVSGPDLDLNLKGPSLKGDLDASIPSMKVHAPGLNLKGVGGKVQMEGDGVKVPGIDATSLNVHAPDVTLKGPSLQGDLNVSGDINCPEVSVGAPDLSLEASEGGIKLPKMKLPQFGISTPGSDVDINIKGPQVTGELKGPGMDMNLGGVNLKGPQISAPHISAPDGDFSLEGPKVKGEMKGPSVGGGLAGINVQGLEGSLQMPGIKSSGCDVELPGVNVKLPTGQISGPEIKGDLKGTGLGFDGAAPDIGVKGPSFNMAAPESDFSVGLKGPKIKGAVDVSGGVSAPGISLGEGHISVKGSGAEWKGPQVSSALNLDATKFAGGLHLSGPKVEGDVKGGQIGLQGPGLSVCGPQGHLGSGSGKVTFPKMKIPKFTFSGRELVGREVGVDVNFPKAEASVQAAAAEGEWEESEVKLKKSKIKMPKFNFSKPKGKGGVTGSPEASISGSKGDLKSSKASLGSLEGEAEGETSSPKGKFSFFKTKKPQQRSNSFSDEREFSAPSIPTGTLEFEGGEVSLEGGKARGKHGKLKFGTFGGLGSKSKGHYEVTGSDEEAGKLQGSGVSLASKKSQLSSSSSSDSGTKVGIQLPEVEVAVSTKKE	478112	481104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_480655_480727
904444	contig_5413_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_168093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACACACACACACAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385113	383907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_-_383900_385100
904445	contig_12871_pilon	-	1717	3	Intergenic	novelGene_140370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17170	14941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_15152_15270_16642_17034
904446	contig_678_pilon	-	3804	24	Intergenic	novelGene_167781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_23	575.044622251474	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1094	3285	92	3376	99253	17430	FALSE	60	GGAAAAAAAAAAAACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHFTVTKVEDPGKGAAASTSQERAPTSAGEKARKKDSGEPDPSQNSITGEHSQLLDDGHRKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLSRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPAKVPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVYLSNVVLLGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILVASLDLVAPILTMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMGIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLKEGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNVSFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENCILSESGVASRESFLSLVSLLCR	99344	17001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_17635_19596_19782_19988_20097_20705_20838_21641_21812_22620_22817_23880_24050_25338_25444_26391_26512_28135_28235_29697_29817_30102_30278_31117_31176_31453_31553_31722_31882_32698_32914_35731_35974_36684_36816_37326_37382_38796_38944_39925_40058_41346_41442_58505_58551_99129
904447	contig_7119_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_41027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCACATAGCAATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230327	228329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_228300_230300
904448	contig_4857_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_48760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTATTAAAAGCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209586	1211276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1209600_1211300
904449	contig_8676_pilon	-	3807	1	Intergenic	novelGene_142207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATTATGCTTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332762	328955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_329000_332800
904450	contig_854_pilon	+	1410	7	Intergenic	novelGene_36254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	101	415	543600	557091	TRUE	55	GAAAACAAATAAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKVSWTEWGH	543499	563553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557212_557533_557752_562271_562405_563029
904451	contig_16930_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_139155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTCCCTCTCCGATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106632	105131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_105100_106600
904452	contig_4686_pilon	-	6620	24	Intergenic	novelGene_118555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	209.872109765607	15	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1229	3687	2934	6620	582937	566143	FALSE	30	GTTGGTAAAATGGGACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGHNLLKSAREKAERTLKFLEDGEAEALRKEIHDHMEQLKELTSNVRKEHMALEKGLHLAKEFSDKHKAQTQWIAEYQQILHIPEEPKMELYEKKAQLSKYKSLQQMVLSHEPSVKLVREKGEALLELVQDVTLKDKIDKLQADYQDLCHAGKEHVFSLEAKVKDHEDYNSELQEVEKWLLQMSGRLVAPDLMETSSLETITQQLAHHKARMEEIAGFEDRLNNLKIKGDHLISQCADHLQAKLKQNVHAHLQGTRDSYSAICSTAQRVYQSLEHELKKHVSRQDTLQQCQAWLSAVQPDLKPSPHPPLSRAEAVKQVKHFRALQEQARTYLDLLCSMCDLSNSSVKTTAKDIQQTEQMIEQRLAQAQTLTQGWEEIKHMEAELWIYLQDADQQLQNMKRRHAELELNIAQNMVSQIKDFVKKVQSKQASVTAIIEKVNKLTKKQESPEHKEISHLNDRWSDLCLQSNNLCAQREEDLQRTRDYHDCMKVIEVFLEKFTTDWDNLARSDAESTAVHLEALKQLALMLQERKYAIEELKDQKQKMIEHLNLDDRELVKEQTGHFEQRWFQLEDLVKRKIQVSVTNLEELSVVQSRFKELMEWAEEQQPSIAEALKQSPPPDVARKLLMDHLAICSELETKRMLLKSLMKDADRVMVDLGLNERQQIQKALSDAQRHVSCLSDLVGQRRKYLNKALSEKTQFLMAVFQATSQIQQHERKIMFREHICLLPDDVSKQVKTCKSAQASLKTYQNEVTGLWAQGRDIMKGATEQEKSEVLGKLQDLQSVYDTVLQKCSHRLQELEKNLVSRKHFKEDFDKACHWLKQADIVTFPEINLMNESAELHAQLAKYQHILEQSPEYENLLLNLQRTGQAILPSLNEVDHSYLSEKLNSLPQQFNVIVALAKDKFYKVQEAILARKEYASLIELTTQSLSDLEDQFLKMSKVPTNLVVEEAVSLQDGCRALLGQVVSLGEAVDELNQRKESFQSTGQPWQPNKMLNLVTSYRRLKRQAEQRVSLLEDTTSAYQEHEKMCQQLERQLEAVKKEQSKVNEETLPAEEKLKMYHSLAGSLQDSGILLKRVTMHLEDLSPHLDPLAYEKAKHKLQSWQEELKVLTSAIGETVTECESRMVQSIDFQTEMSRSLDWLRRVKAELSGPVCLDLNLQDIQEEIRKTQIHQEEVQSSLRIMNALSHKEKEKYTKAKELISANLEHTLAELSELDGGVQEALCTRQ	623216	566142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_568304_571254_571521_572589_572767_574131_574258_575093_575241_577183_577361_580234_580403_580638_580792_582625_582955_588133_588452_591982_592148_592935_593080_595239_595394_597469_597643_599582_599748_601996_602141_604946_605130_607760_607939_608383_608521_612694_613052_617806_617972_619268_619579_622430_622604_623066
904453	contig_5961_pilon	+	4218	19	Intergenic	novelGene_144110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	516.214856215683	174	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	170	2530	144074	209789	TRUE	20	TTCTGAAGCCCAGCTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISYENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINR	113726	214584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197745_197889_201775_202352_204380_204468_206906_206988_207371_207635_209572_210441_210996_211234_211817_211961_213793_213927_214060
904454	contig_7733_pilon	+	6018	50	Intergenic	novelGene_147146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_1	133.057843953552	400	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1840	5523	368	5890	155571	247041	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHIDCRDQLERVFLRLGHAETDEQLQNIISKFLPPVLLKLSSTQEGVRKKVMELLVHLNKRIKSRPKIQLPVETLLVQYQDPAAVSFVTNFTIIYVKMGYPRLPVEKQCELAPTLLTAMEGKPQPQQDSLMHLLIPTLFHMKYPVESSKSASPFNLAEKPKTVQLLLDFMLDVLLMPYGYVLNESQSRQNSSSAQGSSSNSGGGSGIPQPPPGMSFYAAKRVIGDNPWTPEQLEQCKLGIVKFIEAEQVPELEAVLHLVIASSDTRHSVATAADLELKSKQSLIDWNNPAIINKMYKVYLGDIPLKTKEGAVLKPELKRDPVSTRVKLKIVPHLLRSRQAAETFPANIQVVYDGLFGANTNSKLRTLSLQFVHHICITCPEIKIKPLGPMLLNGLTKLINEYKEDPKLLSMAYSAVGKLSSRMPHLFTKDIALVQQLFEALCKEEPETRLAIQEALSMMVGAYSTLEGAQRTLMEALVASYLIKPEVQVRQVAVKFASTVFPSDHIPSRYLLLLAAGDPREEVHGEAQRVLRCFPGRNKKEGAFKQMPSFPEMVYYIQEKASHRMKTPAKYMTGTTVLPFNPAAFGEIVLYLRMCLAHSAGVVPTSQSLADMQDHAPAIGRYIRTLMSGSQATSSSSSSKSGETNPVQIYIGLLQQLLAGVGGLPVMYCLLEAVSVYPEKLATKFVDKTEWIKSLMNSSKEEMRELAALFYSVVVSTVSGNELKSMIEQLIKTTKDNHSPEVQHGSLLALGFTVGRYLAKKKMRMAEQQDLETSASFLPEQEELIQSATETIGSFLDSTSPILAIAACTALGEIGRNGPLPIPSEGSGFTKLRLVESLLNRIPSSKETNKMKERAIQTLGYFPVGDGEFPHQKLLLQGLMDSVEAKQIELQFTIGEAITSAAIGTSSVAARDAWLVTEEEYTAPTGGKVNDVVPWVLDVILNKHIISPNPHVRQAACIWLLSLVRKLSTHKEVKSHLKEIQSAFVSVLSENDELSQDVASKGLGLVYELGNEQDQQELVSILVETLMTGKRVKHDVSGETVVFQGGTLGKTPDGQGISTYKELCSLASDLSQPDLVYKFMNLANHHAMWNSRKGAAFGFNIIATRAGEQLAPFLPQLVPRLYRYQFDPNLGIRQAMTSIWNALVTDKSTVDKYLKEILEDLVKNLTSNLWRVRESSCLALNDLLRGRPLDDIIDKLPEIWETLFRVQDDIKESVRKAAELALKTLSKVCVKMCDPAKGATGQRTIAVLLPCLLDKGMMSPVTEVRALSINTLVKISKSAGAMLKPHAPKLIPALLESLSVLEPQVLNYLSLRATDQEKAAMDSARLSAAKSSPMMETINMCLQYLDVSVLGELVPRLCELIRSGVGLGTKGGCASVIVSLTTQCPQDLTPYSGKLMSALLSGLTDKNNVIQKSCAFAMGHLVRTSRDSSTEKLLQKLSGWYMEKEEPIYKTSCALTIHAIGRYSPDVLKNHAKEVLPLAFLGMHEIADEEKSEKEECNLWTEVWQENVPGSFGGIRLYLQELITITQKALQSQSWKMKAQGAIAMASIAKQTSSLVPPYLGMILTALLQGLAGRTWAGKEELLKAIACVVTTCSAELGKSAPNQPSTNEILQAVLKECCKENIKYKIVAIRCAADVLKATKEDRFQEFSDIVIPLIKKNSPESTGARTIKNEDENEKEKELQMESLLGAFESLGKAWPRNVETQRCYRQELCKLMCERLKLSTWKVQLGVLQSMSAFFQGLMLLEEEHAEPEALAEILLETCKSITYSLENKTYSSVRTEALSVIELLLKKLEESKQWESLTSECRALLIESLATMESDSRPELQEKASLLKKTLENLE	144844	247169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_145131_155489_155593_163689_163821_165473_165591_167059_167179_168318_168469_171838_172008_174580_174721_178919_179002_181569_181690_191109_191196_191466_191546_194504_194555_196475_196543_196626_196750_200079_200184_203287_203412_204392_204474_205772_205999_206551_206644_208772_208908_209630_209794_210229_210403_211522_211625_215799_215924_218117_218264_218743_218799_219598_219714_220489_220559_222173_222292_222584_222753_226881_226962_227527_227634_228395_228444_230043_230166_231738_231890_232765_232832_234201_234292_235414_235482_236097_236190_236267_236335_237020_237213_238078_238288_239109_239154_239249_239443_240832_240972_243089_243196_243380_243470_245412_245485_246901
904455	contig_8628_pilon	-	4358	9	Intergenic	novelGene_164445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATAAAAATATCACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694545	669101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_671405_677680_677798_682461_682613_686716_686882_687298_687483_689576_689757_690448_690534_692224_692325_693472
904456	contig_116_pilon	-	2450	19	Intergenic	novelGene_154902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	167.554966105653	3	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	111	2183	327496	262769	FALSE	20	TACTTTTACACACTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRRSSPSAAPLQCARLPRLSEPPSLAPSQAVAQTCSMAGIAAKLVKDREAAEGLGLHERAVKYLNQDYAALRDECLEAGTLFQDPSFPALPSSLGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICTDPQFIVGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEVLARVVPLDQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKAPPNLFKIIQKALEKGSLLGCSIDITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGKWNDNCPNWDTVDPEVRERLTRRHEDGEFWMSFGDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVGRLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCVRVFSEKKADYQVVDDEIEANLQEFDVSEDDIDDGFRKLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRKYPVCRCLLLLLSDGSGKLGLKEFYILWTKIQNYQKIYREIDVDKSGTMNSYEMRKALEEAGFRLPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIQLDLISWLCFSVL	327606	262501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_262793_264796_264856_265118_265236_266738_266818_267677_267747_271055_271152_272359_272426_273507_273545_275945_276158_278958_279138_281073_281235_281943_282019_283324_283411_285621_285706_286887_287057_288523_288658_289399_289519_321165_321236_327259
904457	contig_14300_pilon	+	3769	6	Intergenic	novelGene_133082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	41.775590959315	293	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	267	1085	130254	140824	FALSE	25	TTCCACAATTTCTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYLKFSLSVVAAILFQFFFKQKARSDHIPIPDVKLERTVPRLHCPSLEYFKKHFLVPERPVILEGVANHWPCMKKWSLEYIQEIAGCRTVPVEVGSKYTDEDWSQTLMTVNEFISRYVVDEPKDVGYLAQHQLFEQIPELKQDISIPDYCCLGNGEEDEITINAWFGPQGTVSPLHQDPQQNFLAQVIGSKYIRLYSPQESEALYPHDSHLLHNTSQVDVENPDLEKFPKFAEAPFLSCILSPGEVLFIPVKYWHYVRALDLSFSVSFWWS	129987	143508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_130487_131727_131861_134772_134818_139428_139579_140462_140556_140659
904458	contig_6062_pilon	+	3453	10	Intergenic	novelGene_5260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	210.960648135448	9	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	766	2202	662655	735463	FALSE	25	AAGACCGCAGTTGTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANSSPPSAQKSVLPATLPAVLPTPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSTQSLTNSRGSVHTISFLLQIGLTRESVTIEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSAEEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGLSVPRPLQTECAVPSNEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDSSDINSDSSRGLDDIEEPSPPEDKMFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLSRRDSERIRLVPGVLKACKRPSKAQQFTWSKRGRRRVRNRRKKWNV	652587	736714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_652698_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_729318_729397_732300_732485_734987_735112_735322
904459	contig_3386_pilon	-	4238	5	Intergenic	novelGene_34506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_4	688.651036447343	141	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1304	1816	406857	406345	TRUE	15	ACAGTCTTGTGGTTTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVTESPSCLFSPPSESALASQLALSASCDQRAPFSLAGVVSHDPGMASRQVAPPFGSRACCFLSAFSPTLTKSAAATSTAHTFLANQLSCLFTKCLHNNYSSSLRLTKKAGKIHNTPLRQPTKSNATSGKTFSANSSWPSVRQPHLTISSLLKPKTSKFFLLIQFTAG	412211	403522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404940_405102_405190_405426_407838_409398_409607_412096
904460	contig_4426_pilon	-	4474	6	Intergenic	novelGene_15412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1462	4386	87	4472	904546	818261	FALSE	25	TGTCCCAGCAGATGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYIKSEKGKNKEKDREVDKRERSRDKESANVTNSKHLQEEKKSSVADGSKAQHEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNSLLKLKSEADKPKPKSLPAPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENT	904632	818258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
904461	contig_6047_pilon	-	2470	18	Intergenic	novelGene_24212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1944	2273	109264	107166	TRUE	15	CTTTTGATCGTAGGAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPRFLTNSSLVIPIPVSVTCSRFFSLSHLILTVSSSFPERAFSSVSDISLILSKASEAFEISSLRKIYLFLYNELMISFIILLTSAWKANFSDFSLSSLIWDAFNPSN	123880	105207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_105281_106260_106368_107148_107290_107806_107925_109176_109511_114652_114763_115032_115161_115888_116002_117938_118077_118158_118239_118356_118423_119278_119557_119764_120014_120542_120670_122416_122494_122579_122738_122978_123028_123756
904462	contig_9468_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_59466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGGCCTACAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168882	170895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_168900_170900
904463	contig_10225_pilon	+	2194	13	Intergenic	novelGene_86767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	543.127338250944	68	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	1149	2078	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20645	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35647_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46602_47258
904464	contig_5684_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_80997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGCACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297712	295853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_295900_297700
904465	contig_10466_pilon	+	5605	23	Intergenic	novelGene_173615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_21	129.04429376019	454	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1761	5286	138	5423	50216	115485	FALSE	25	TATGTATGTTTGTATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVDSAMELLFLDTFKHPSAEQSSHIDVVRFPCVVYINEVRVIPPGVRAHSSLPDSRAYGETSPHTFQLDLFFNNVSKPSAPVFDRLGSLEYDENTSIIFRPNSKVNTDGLVLRGWYNCLTLAIYGSVDRVISHDRDSPPPPPPPPPPPQPQPNLKRNPKHADGEKEDQFNGSPPRPQPRGPRTPPGPPPPDDDEDDPIPVSVSGDKEEDAPHREDYFEPISPDRNSVPQEGQYSDEGEVEEEQQEEGDDDEDDVDVEEEEDEDEDDRHTVDSIPEEEEEDEEEEGEEDEEGEGDDGYEQISSDEDGIADLERETFKYPNFDVEYTAEDLASVPPMTYDPYDRELVPLLYFSCPYKTTFEIEVSRMKDQGPDKENSGAIEASVKLTELLDLYREDRGAKWVTALEEIPSLIIKGLSYLQLKNTKQDSLVQLIDWTMQALNLQVALRQPIALNVRQLKAGTKLVSSLAECGTQGVMGLLQAGVISGLFELLFADHVSSSLKLNAFKALDSVISMTEGMEAFLRGRQNEKSGYQKLLELILLDQTVRVVTAGSAILQKCHFYEILSEIKRLGDHLAEKTSSVPNHSEPDHDTDAGLERTNPEYENEVEASMDMDLLESSNISEGEIEKLINLLEEVFHLMETAPHTMVQPPVKSFPTMARITGPPERDDPYPVLFRYLHSHHFLELVTLLLSIPVTSAHPGVLQATKDVLKFLAQSQKGLLFFMSEYEATNLLIRALCHLYDQDEDEGLQSDGVIDDAFALWLQDSTQTLQCITELFSHFQRCTASEETDHSDLLGTLHNLYLITFNPVGRSAVGHVFSLEKNLQSLITLMEYYSKEALGDSKSKKSVAYNYACILILVVVQSSSDVQMLEQHAASLLKLCKADENNAKLQELGKWLEPLKNLRFEINCIPTLIEYVKQNIDNLMTPEGVGLTTALRVLCNVACPPPPVEGQQKDLKWNLAVIQLFSAEGMDTFIRVLQKLNSILTQPWRLHVNMGTTLHRVTTISMARCTLTLLKTMLTELLRGGSFEFKDMRVPSALVTLHMLLCSIPLSGRLDSDEQKIQNDIIDILLTFTQGVNEKLTISEETLANNTWSLMLKEVLSSILKVPEGFFSGLILLSELLPLPLPMQTTQVIEPHDISVALNTRKLWSMHLHVQAKLLQEIVRSFSGATCQPIQHMLRRICVQLCDLASPTALLIMRTVLDLIVEDLQSTSEDKEKQYSSQTARLLALLDALASHKACKLATLHLINGTIKGDERYAEIFQDLLALVRSPGDSVTRQQCVEYITSILQSLCDQDIALILPSSSESSVSEVEQLSNSLPNKELMASICDCLLAMLANPDSSYNCLLTCVRTMMFLAEHDYGLFHLKSSLRKNSNALHSLLKRVVSTFSKDTGELASSFLEFMRQILNSDTMEHSKDDDNLDSLLDNIVGLKQMLESSGDPLPLSDQDVEPVLSAPESLQNLFNNRTAYVLADVMDDQLKSMWFTPFQAEEIDTDLDLVKVDLIDLSEKCCSDFDLHSELERSFLSEPSSPGRTKTTKGFKLGKHKHETFITSSGKSEYIEPAKRAHVVPPPRGRGRGGFGQGTRPHDIFRQRKQNTSRPPSMHVDDFVAAESKEVVPQDGIPPPKRPLKVSQKISSRGGFSGNRGGRGAFHSQNRFFTPPASKGNYSRREGTRGSSWSAQNTPRGTYNDSRGGQSNFNRGPLPPLRPLSSTGYRPSPRDRASRGRGGLGPSWASANSGSGGSRGKFVSGGSGRGRHVRSFTR	50078	115667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_50279_59272_59389_63282_63370_64890_64940_66402_66572_68814_68938_70440_70714_74613_75755_78890_79383_80439_80595_88556_88640_90875_90970_91099_91645_92151_92388_92890_93144_96276_96495_101068_101202_109226_109388_110046_110144_111109_111277_111744_112077_114517_114662_115330
904466	contig_15664_pilon	+	3172	10	Intergenic	novelGene_171498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_9	78.9136111497336	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	180	1541	22071	78854	FALSE	15	TGCTGAGACCCCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMMEKGPELLGKNRSANGSAKSPAGGGGSGASSTNGGLHYSEPESGCSSDDEHDVGMRVGAEYQARIPEFDPGATKYTDKDNGGMLVWSPYHSIPDAKLDEYIAIAKEKHGYNVEQALGMLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKSFHRIQQMLPDKTIASLVKYYYSWKKTRSRTSLMDRQARKLANRHNQGDSDDDVEETHPMDGNDSDYDPKKEAKKEGNTEQPVQTSKIGLGRREYQSLQHRHHSQRSKCRPPKGMYLTQEDVVAVSCSPNAANTILRQLDMELISLKRQVQNAKQVNSALKQKMEGGIEEFKPPEAHAPQAPRTLGPSPPAPSSTPTPTAPIATLNQPPPLLRPALPAAPALHRQPPPLQQQARFIQPRPTLNQPPPPLIRPANSMPPRLNPRPVLSTVGGQQPPSLIGIQTDSQSSLH	21891	80485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_22237_22618_22676_30013_30092_33059_33113_35501_35664_37092_37218_37969_38049_53258_53478_59964_60043_78509
904467	contig_10217_pilon	-	1648	10	Intergenic	novelGene_87408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	20	CATTCTGTTTGGTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	108884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
904468	contig_12490_pilon	-	2557	4	Intergenic	novelGene_169049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGAGACGCCCAAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268887	253766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_-_254207_263243_263407_264564_264658_267026
904469	contig_5649_pilon	+	4487	21	Intergenic	novelGene_82298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	266.974081138975	10	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	951	2856	1369	4224	156651	203268	FALSE	25	AACCTTTGTCTGGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEWYMRGEQYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDLAALASRREYLKLDKWLTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPPETLATMLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSASSLDAISPVQIDPLGGMASLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSPAKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGGLGTGSLTGIGTGALGLPAVNSDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEIDDEANSYFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYRFFPQYPDKELHITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKMYYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHLASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRDPPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVSTMVTTSTTTTVAKTVTVTRPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIAFIFNNLSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYSNFLDTLKNPDFNKMVLNETYRNIKVLLTSDKAAANFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKNKPILHTDLDVKSLLLEAYVKGQQELLYVVPFVAKVLESSIRSVVFRPPNPWTMAIMNVLAELHQEHDLKLNLKFEIEVLCKNLALDINELKPGNLLKDKDRLKNLDEQLSAPKKDVKQPEELPPITATTTSTTPATSTTCTATVPPQPHTITHSAHMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIEKLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS	155282	203531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_156732_157505_157629_157820_157973_164098_164250_165471_165674_166774_166922_168032_168158_168451_168739_169641_169721_171512_171744_172063_172205_173118_173299_175074_175192_175541_175653_175976_176055_176225_176404_177179_177241_199918_199984_201362_201496_202873_203009_203189
904470	contig_16869_pilon	-	2265	8	Intergenic	novelGene_137587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	81.0588095905985	47	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	110	1138	83930	46172	FALSE	35	TACCCAGATTATTACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVSLVVVVVGGWTAVYLTDLVLKSSVYFKHSYEDWLENNGLSISPFHIRWQTAVFNRTFYSWGRRKARLLYQWFNFGMVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRDWRYLRNKSKLLELN	84039	45044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_46219_51938_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_83855
904471	contig_6938_pilon	-	2789	2	Intergenic	novelGene_69060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	0	2	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTTGACCAAAGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139917	136015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_138137_139249
904472	contig_6028_pilon	+	3966	7	Intergenic	novelGene_156554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	854	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTGTGTGTTCCTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195504	247680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_198686_201530_201611_203750_203823_205380_205491_206258_206401_227061_227233_247470
904473	contig_1263_pilon	-	1888	2	Intergenic	novelGene_170396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54696	51834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53529_54502
904474	contig_14142_pilon	+	3080	11	Intergenic	novelGene_120621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	248.069849034501	953	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	110	934	617485	619267	TRUE	40	GGCATCAAGAAGAGAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQEAAEKAKSRRAPSEVWQSVIEPGAHGPSVPSGTMPALLERPKLSNAMARALHRHIMMERERKRQEEEEVDKMMEQKMKEEQERRKKKEMEERMSLEETKEQILKLQEKLLALQEEKHQLFLQLKKVLHEEEKRRRKEQSDLTTLTSAAYQQSLTVHTGTHLLSMQGSPGGHNRPGTLMAADRAKQMFGPQVLTTRHYVGSAAAFAGTPEHGQFQSSPGGAYGTAQPPPHYGPTQPAYSPSQQLRAPSAFPAVQYLSQPQPQPYAVHGHFQPAQTGDNTPRRAPVPRVFPLSVLFSVHPIFCSFHKLL	617180	622950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_617221_617415_617579_617952_618063_618141_618255_618381_618462_618547_618631_618834_618989_619076_619348_619435_621210_621425_621533_622765
904475	contig_16411_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_77369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	618	885	1502	309333	308716	NA	60	AATGCAATAGAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNFNTPLSVKDRTSREKLNKDMEDLNATINQLDLIDIHRTLQRTAAKYTFFSNAHGTFSKTDKILGHKASLNRIQIIEISHSIFSDHNAIKVEINNKKSKERKSNAWKLNNTLLKNYWIIEEIKDGINNFTESKENENISYQNLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAKIKTLTLQLEQIQRKQQKKPSGTRRKQIIEIRAEL	310217	308715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_308700_310200
904476	contig_19402_pilon	+	5076	19	Intergenic	novelGene_80786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	1527.51465309898	10	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	482	1234	29462	81256	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEWPLL	23606	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81241_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144111_144356
904477	contig_13888_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_151803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	480	679	1158	346160	346639	NA	55	GGAAATAATAAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIYGTLHPTAAKYTFFSNAHGTYSRIDHILSHKASLNRIQSTEILQSFCSDHKAIKVEINNNKSKENKSNTWKLNNTLLKNYWVIEVIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAKIKTLTLQLEQVEREQQKKPLGTKR	345481	346641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_345500_346600
904478	contig_20748_pilon	-	2881	3	Intergenic	novelGene_138179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186694	173301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_-_174136_174690_175838_185794
904479	contig_16594_pilon	-	4127	1	Intergenic	novelGene_53894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGAAGTAGATCGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234462	230335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_230300_234500
904480	contig_12437_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_169064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACTTGCCAAAGAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30655	33033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30700_33000
904481	contig_3529_pilon	-	3085	3	Intergenic	novelGene_105353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	480	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1195	1533	530598	530260	FALSE	80	ATGTAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKVYSLQYGLHLNIKKTEILTTGPINNIMINGENIEVVKDFILFGSTTNVHGSSSQEIKRLIALGKSAAKGLFKVLKSKDITLRTKVCLTQAMVFSVNSYAYESWAVNKED	676058	528707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_531067_556419_556753_675665
904482	contig_9833_pilon	+	2240	10	Intergenic	novelGene_68570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	70.0729778318449	171	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	488	1633	310835	329211	FALSE	35	CTTAAATCTAGTGGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNRARLLIVMEMMEGGELFHRISQHRHFTEKQASQVTKQIALALQHCHLLNIAHRDLKPENLLFKDNSLDAPVKLCDFGFAKIDQGDLMTPQFTPYYVAPQVLEAQRRHQKEKSGIIPTSPTPYTYNKSCDLWSLGVIIYVMLCGYPPFYSKHHSRTIPKDMRRKIMTGSFEFPEEEWSQISEMAKDVVRKLLKVKPEERLTIEGVLDHPWLNSTEALDNVLPSAQLMMDKAVVAGIQQAHAEQLANMRIQDLKVSLKPLHSVNNPILRKRKLLGTKPKDGVYIHDRENGAEDSNVALEKLRDVIAQCILPQAGENEDEKLNEVMQEAWKYNRECKLLRETLQSFSWNGRGFTDKVDRLKLAEIVKQVIEEQTMSHESQ	310347	329818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_310958_312370_312461_313108_313205_318932_319014_321424_321613_324259_324381_325691_325823_326085_326202_327254_327360_329116
904483	contig_16068_pilon	-	3293	1	Intergenic	novelGene_177504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394729	391436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16068_pilon_-_391400_394700
904484	contig_18162_pilon	-	3170	3	Intergenic	novelGene_122307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTTAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8904_8948_10809_16363
904485	contig_18799_pilon	+	4525	9	Intergenic	novelGene_171412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	78.561977921893	740	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2517	36	2552	6492	74299	FALSE	25	ACAATCACTCAGTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQAIHSRVKPIQLKGEHHSNIFCLAFNSGNTKVFSGGNDEQVILHDVESSETLDVFAHEDAVYGLSVSPVNDNIFASSSDDGRVLIWDIRESPHGEPFCLANYPSAFHSVMFNPVEPRLLATANSKEGVGLWDIRKPQSSLLRYGGNLSLQSAMSVRFNSNGTQLLALRRRLPPVLYDIHSRLPVFQFDNQGYFNSCTMKSCCFAGDRDQYILSGSDDFNLYMWRIPADPEAGGIGRVVNGAFMVLKGHRSIVNQVRFNPHTYMICSSGVEKIIKIWSPYKQPGCTGDLDGRIEDDSRCLYTRMMAFFDSLVRREIEGWSSDSDSDLSESTILQLHAGVSERSGYTDSESSASLPRSPPPTVDESADNAFHLGPLRVTTTNTVASTPPPPTCEDAASRQQRLSALRRYQDKRLLALSNESDSEENACEVELDTDLFPRPRSPSPEDESSSSSSSSSSEDEEELNERRASTRQRNAMRRRQKTPREERPSAPTKSTSTYIGEDNYDYPQIKVDDLSSSPASSPERSTSTLEIQPSRASPTSDIESVERKIYKAYKWLRYSYISYSNNKDGETSLVTGEADDGRAGTSRKDNPIPSSSKEVCLNTAVAQRNQDLPPEGRSKDAFKEGTSTRNPSNGPGHEHSSHTWAEVPEGTSQDTNNSGSVEHSFETKKLNGKALSKALSSRSEESPSPPVPKASGSTPSSGSGNCPRTQSDDNEERSLETICANHNNGRLHPRPLHPHNNGQNFGELEMMAYSSPGHSDTDHDNLSLAGTLLHRDCCGSEMASETPSAGMREDPTDPPATDSSSRGIHGHSGLKRHRVELEDGDPENSSSEKKLKT	6456	76272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_6604_8199_8237_9345_9486_11210_11341_35285_35500_53687_53755_65757_65886_72526_72606_72689
904486	contig_16951_pilon	-	3024	1	Intergenic	novelGene_98632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	439	771	78578	78246	NA	20	GAGCATGGATCCATCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYSATKNVLWREQMDLGKALRAPETLLQVVSRPPSENVFLFFAPSPELQTSVSHGGLRTCHLAPTTLPPSHPSLLQPRDTSTGCWTPKHSQGQGTIRHTYFTENLK	79016	75992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_76000_79000
904487	contig_6710_pilon	-	4050	1	Intergenic	novelGene_98144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGCTACCCACCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657502	653452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653500_657500
904488	contig_10940_pilon	+	3154	14	Intergenic	novelGene_49291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	102.90588565177	427	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	772	2355	1031846	1057832	FALSE	25	GTTGGTTTAAAGCGTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSAAPRTCNSPENSLDFVSDSLPDRPFPRALDSHARTAGQPELCHLTNFEQACLSAEAGGDGLLRTAVAQPYVGTDTTENLGVANGQILESSDEGPAANGVELHMESTDSEPAQPQSVSPPADLVASAAGSALTSQPAKSWASLFHDSKPSSSSPMAYVETKYSPPATSPLVSEKQVEVKEGLVPVSEDPVAIKIAELLETVTLIHKPVSLQPRGLINKGNWCYINATLQALVACPPMYHLMKFIPVYSKAQRPCTSTPMIDSFVRLMNEFTNMPVPPKPRQALGDKIMRDIRPGAAFEPTYIYRLLTVIKSSLSEKGRQEDAEEYLGFILNGLHEEMLNLKKLLSPNNEKLTVSNGPKSHLVNEEEQEEQGEGSEDEWEQVGPRNKTSVTRQADFVQTPITGIFGGHIRSVVYQQSSKESATLQPFFTLQLDIQSDKIRTVQDALESLVARESVQGYTTKTKQEVEISRRVTLEKLPPVLVLHLKRFVYEKTGGCQKLIKNIEYPVDLEISKALYHKPDARFAE	996279	1058631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_996395_1016193_1016263_1025108_1025170_1028702_1028783_1031399_1032441_1041374_1041467_1041956_1042067_1042451_1042508_1042721_1042826_1043938_1044039_1046223_1046402_1049234_1049401_1052683_1052829_1057794
904489	contig_1275_pilon	+	806	5	Intergenic	novelGene_108751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	186	407	400596	400817	TRUE	15	CGGAGGCTCTTCAGTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNQILIPRLSLLSGSLQVSFFGVTFNFSCTVSQHPHFSIYRVGFGSCWEIENRIHFSIVLLMIHVHWLCCFNTDVICLGFHTFIFSMFCTWACWGGRCTLCGFRVGLELSHRFRVSSRSTVFSAIFTGLDSFNW	400410	444505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_400855_411392_411524_440363_440502_442108_442174_444477
904490	contig_7207_pilon	-	3736	3	Intergenic	novelGene_72053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0.5	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2288	2806	639651	628468	FALSE	20	GAGAACCTTAGTCCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKEEIPEEELAEDVEEIDHAERELRRGQILWFRGLNRIQTQIRVVNAFRSSLYEGLEKPESRSSIHNFMSHPEFRIEDSEPHIPLIDDTDAEDDAPTKRNPSPPPSPNKNNNAVDSGIHLTIEMNKSATSSSPGSPLHSLETSL	641938	627537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_628780_637109_637293_639627
904491	contig_14142_pilon	-	3056	13	Intergenic	novelGene_120454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	192.887488794202	830	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	209	1825	102717	98719	FALSE	55	AAAGCAAAAAAAATCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLDLQSEEIQGREKARPELSGASKAKPPTAPASSLVPAPSAQPTPPSAPVPGKKAQEEAPGPPGVSRADMLKLRSLSEGPPKELKIRLIKVESGDKETFIASEVEERRLRMADLTISHCAADVVRASKNAKVKGKFRESYLSPAQSVKPKINTEEKLPREKLNPPTPSIYLESKRDAFSPVLLQFCTDPRNPITVIRGLAGSLRLNLGLFSTKTLVEASGEHTVEVRTQVQQPSDENWDLTGTRQIWPCESSRSHTTIAKYAQYQASSFQESLQEEKESEDEESEEPDSTTGTPPSSAPDPKNHHIIKFGTNIDLSDAKRWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIKFCLLQSMKHCQVQRESLVRAGKKIAYQGRVKDEPAYYCNECDVEVFNILFVTSENGSRNTYLVHCEGCARRRSAGLQGVVVLEQYRTEELAQAYDAFTLAPASTSR	102925	97487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98743_98845_99017_99096_99224_99625_99768_99925_100114_100195_100260_100481_100631_100742_100815_100894_100960_101080_101287_102074_102181_102304_102432_102541
904492	contig_5686_pilon	+	4341	1	Intergenic	novelGene_45491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAGCCAAAGATTAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244517	248858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_244500_248900
904493	contig_16303_pilon	-	2985	8	Intergenic	novelGene_34038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	242	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	75	1166	45428	35759	TRUE	20	ATGTATTGTGATATGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45502	31605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33121_35454_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
904494	contig_15067_pilon	-	1890	4	Intergenic	novelGene_154336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.0511725842044	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	196	501	93847	92165	TRUE	80	TAAACAAACAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	94042	90713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_91803_91864_92279_92840_92941_93755
904495	contig_12740_pilon	-	3479	13	Intergenic	novelGene_159202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	79	junction_3	64.4663456558709	368	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	92	1492	89237	29777	FALSE	40	TTTAAAAAGATCACTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFLSAELTRGYFLEHNEAKYTERRERVYTCMRIPRELEKLMFFGIFLCLDAFLYVFTLLPLRVCLALFRLFTLPCYGLRDRRLLQPAQVCDILKGVILVICYFMMHYVDYSMMYHLIRGQSVIKLYIIYNMLEVADRLFSSFGQDILDALYWTATEPKERKRAHIGVIPHFFMAVLYVFLHAILIMVQATTLNVAFNSHNKSLLTIMMSNNFVEIKGSVFKKFEKNNLFQMSNSDIKERFTNYVLLLIVCLRNMEQFSWNPDHLWVLFPDVCMVIASEIAVDIVKHAFITKFNDITADVYSEYRASLAFDLVSSRQKNAYTDYSDSVARRMGFIPLPLAVLLIRVVTSSIKVQGILSYACVILFYFGLISLKVLNSIVLLGKSCQYVKEAKMEEKLFSPPPTSTPGKPPNKSQNKSKSPQGLATEETLSASVTSQPTHPKENVIPLLVTSNSDQFLTTPDGDEKDITQENSELKHRSSKKDLLEIDRFTICGNRID	89328	27789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_30007_31699_31861_41486_41564_44468_44538_44926_44987_46839_46950_47705_47787_57904_57975_58175_58274_60054_60191_63887_64051_74787_74907_89210
904496	contig_9900_pilon	-	1745	1	Intergenic	novelGene_159521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGAAGTCATACCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388077	386332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_386300_388100
904497	contig_6445_pilon	-	1155	12	Intergenic	novelGene_76912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	651.24525346853	21	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	49	837	88578	44555	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGICLQGSGVHPRPGVPAVTLQRGAGEHERPGRL	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49812_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
904498	contig_4426_pilon	-	5569	5	Intergenic	novelGene_15400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	77.8086595437809	164	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	207	2888	819391	799730	FALSE	50	AAAAAATGAGTGAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENTFVPADVPKTDAIVSVYSESTIEEASPTFEKANTLPVLPSEKDFNGSDASSQLNTHHAFSKPVCKSSSGLEVENSTTDTQVISHEKGNKLESFVLTHLNDKCDSDLCEMSAGVPKENLSEQGNPKHCPESEKCLLSIEDEESEQSILSNLENHSQQSVPPEIHKYSQFIKVEIEENAEDDKTENHVPQRVTRNRANTMASQSRQFLAACTLLSEKDNESSSPRGRIRLTEEDDPQVHHPRKRKVSRVPQPVQVNPFLLQAKEKTQQSLAAVVDSLKLDEIQPYSSERANPYFEYLHIRKKIEEKRKLLCSVIPQAPQYYDEYVTFNGSYLLDGNPLSKICIPTITPPPSLSDPLKELFRQQEVVRMKLRLQHSIEREKLIVSNEQEVLRVHYRAARTLANQTLPFSACTVLLDAEVYNVPLDSQSDDSKTSVRDRFNARQFMSWLQDVDDKFDKLKTCLLMRQQHEAAALNAVQRLEWQLKLQELDPATYKSISIYEIQEFYVPLVDVNDDFELTPI	819597	797048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_799916_800548_800645_802509_802654_806901_807001_817234
904499	contig_17769_pilon	+	2562	9	Intergenic	novelGene_124270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_2	85.7175594612912	33	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	1311	2525	114214	116765	FALSE	40	AAGGCCATAGCCACTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPQQTLSRLLLSWWLRAEGLGAPRCCDLPVGQVVRKTLSLPSPIFAPPFSSLPPPHSPSCPYPSSPSHPCPPLPCSLHPHPPWFLVSSSEVAVTHQVPSEVHITYSRLAKIGALESTALWDVRGMSMGCGGKCGRLGASSVLKPQPLLPHLWITWDLFPGLEKKTQVLQPSEKTTVAYHEAGHAVVGWFLEHTDPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPREQYLYTREQLFDRMCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	108649	116802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_108716_110387_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_114814_115333_115535_116111_116307_116546
904501	contig_7051_pilon	+	4408	4	Intergenic	novelGene_64361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1215	junction_1	29.8030572630095	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	3492	4406	345357	347601	FALSE	75	TAAAAGAAAAGAGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQ	337494	347603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_338865_342961_343100_343373_345538_346867
904502	contig_5050_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_110252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATGTAAATCCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267408	265613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_265600_267400
904503	contig_3009_pilon	-	2162	2	Intergenic	novelGene_132505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	78	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGCTCAGACTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21832	19429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_19443_19683
904504	contig_3789_pilon	-	2913	1	Intergenic	novelGene_79906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	420	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGGTTAGGCTAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675609	672696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_672700_675600
904505	contig_3627_pilon	+	2088	14	Intergenic	novelGene_78562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	117.680140145291	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	29	1354	1299272	1307800	FALSE	20	TACAGATGGTGTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299243	1308534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301484_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
904506	contig_10737_pilon	+	2963	1	Intergenic	novelGene_133891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTAGTTATTTGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268249	271212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_268200_271200
904507	contig_12479_pilon	+	3693	7	Intergenic	novelGene_56894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	108.85681216881	283	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	10	1620	605769	619471	FALSE	35	TTTCTAAAAATGACATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLMLAVAVQVVFKISSSRAWPGSVYVVTGGTSHLGPVGCGWLWPAAATASWTRSMRRWRWRSGAARGRWTCCCAAATSRRCATRPTCAAWPYRPSIATCRPSTGLAGVVKYRGLRIGGISGIFKSHDYRKGHFECPPYNSSTIRSIYHVRNIEVYKLKQLKQPMDVFLSHDWPRSIYHYGNKKQLLKAKSFFRQEVENNTLGSPAASELLEHLKPTYWFSAHLHVKFAALMQHQAKDKGQPAKATRFLALDKCLPHRDFLQVIEIEHDPSAPDYLEYDIEWLTILRATNDLINVTGRLWNMPENNGLYTRWDYSATEEAMKGVLEKLNHDLKVPCNFSVTAACYDPSKPQNQMQLLHRISPQTTEFCAQLGITDINVRLQKAKEEPYLCNENEEQDDVESNDSGELSEYNTDTSALSSVNPDEIVLDEEEEDADSMLSAHSDTNTSSVGPSDQASDFSASFSDVRILPGSMIVSPDDTLGSPIATEGKAGDTMESRDGKDLIEAPLKRLSDEHEPEQRKKIKRRNQAIYTAVDDDDVA	605759	621544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_606073_608824_608906_610976_611063_614920_615146_617880_617962_618083_618230_618783
904508	contig_11056_pilon	-	2234	6	Intergenic	novelGene_130395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	243.617240769203	4	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	347	574	679018	668161	TRUE	20	ATGCCAGTGTCCTTTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIPKNPYPASDVNTEKPSIHSSTKTILEHQPGQKGRKPGKKRGRTPKTLIPHPISTPSKSAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPTSPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPSSAMQAPTVCIYLNKNGNTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTVFSFLKQGHGGEVISGTD	684610	644735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645905_655567_655766_667867_668172_670511_670713_679002_679130_684375
904509	contig_2726_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_165902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGAGTCCCATCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187232	189256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_187200_189300
904510	contig_3612_pilon	+	5147	19	Intergenic	novelGene_87804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	116.666455026263	511	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	286	1929	835560	868523	TRUE	65	AAGAAAAAAAAAATTTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKTLDPKDWKNQDHYAVLGLGHVRYKATQRQIKAAHKAMVLKHHPDKRKAAGEPIKEGDNDYFTCITKAYEMLSDPVKRRAFNSVDPTFDNSVPSKSEAKENFFEVFSPVFERNSRWSNKKNVPKLGDMNSSFEDVDAFYSFWYNFDSWREFSYLDEEEKEKAECRDERRWIEKQNRATRAQRKKEEMNRIRTLVDNAYSCDPRIKKFKEEEKAKKEAEKKAKAEAKRKEQEAKEKQRQAELEAARLAKEKEEEEVRQQALLAKKEKDIQKKAIKRERQKLRNSCKTWNHFSDNEAERVKMMEEVEKLCDRLELASLQCLNETLTSSTKEVGKAALEKQIEEINEQIRKEKEEAEARMRQASKNAEKSTGGGGNGSKNWSEDDLQLLIKAVNLFPAGTNSRWEVIANYMNIHSSSGVKRTAKDVIGKAKSLQKLDPHQKDDINKKAFDKFKKEHGVVPQAENATPSERFEGPCTDFTPWTTEEQKLLEQALKTYPVNTPERWEKIADTVPGRTKKDCMKRYKELVEMVKAKKAAQEQVMNASRAKK	832873	872018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_833090_835490_835593_840192_840269_845722_845822_852537_852680_854519_854601_857019_857086_857575_857668_857754_857877_858279_858430_861852_861942_862013_862084_863593_863779_864627_864729_864862_864971_867953_868109_868448_868914_869003_869073_869259
904511	contig_15384_pilon	-	3056	21	Intergenic	novelGene_85128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	36.2702012677073	166	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	82	1902	96998	85128	TRUE	10	GGTCCACACCTGCCTGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLSLPFPHPLVEGGPWNEGLLLGRPPEEPEQPLTENSLLEVLDGAVMMYNLSVHQQLGKMVGVSDDVNEYAMALRDTEDKLRRCPKGRKDILAELTKSQKVFSEKLDHLSRRLAWVHATLYSQEKMLDIYWLLRVCLRTIEHGDRIGPLFAFMPEFYLSVAINSYSALKNYFGPVHSMEELPGYEETLTHLAATLAKHFADTRIIGTDIRDSLMQALASYVCYPHSLRAVERIPEEQRIAMVRNLLAPYEQRPWAQTNWILVRLWRGCGFGYRYTRLPHLLQTKPEDAHLPSLQKPCPSTLLQQHMADLLRQGPDVAPSFLNSVLNQLNWAFSEFIGMIQEIQQAAERLERNFVDSRQLKVCATCFDLSVSLLRVLEMTITLVPEIFLDWARPTSEMLLRRLAQLLNQVLNRVTAERNLFDRVVTLRLPGLESVDHYPILVAVTGILVQLLVHGPASGIERATSVLLADPCFQLRSICYLLGQLEPPAPGTALPAPDRKRFSLQSYTDYISAEELAQVDRMLAHLTSASAQAAAASLPTSEEDLCPICYAHPISAVFQPCGHKSCKACIDQHLMNNKDCFFCKATIVSVEDCEKSTSATSSAA	97079	82972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_83039_83128_83177_83315_83462_84060_84189_84279_84470_84551_85243_85328_85415_85529_85625_85813_85957_89584_89670_89897_89974_90062_90252_90358_90499_91737_91823_91910_91999_92096_92185_92335_92411_93217_93396_95525_95634_96428_96513_96812
904512	contig_1443_pilon	+	4612	5	Intergenic	novelGene_28359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938443	946214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_939664_942216_944405_944695_944849_945070_945788_945880
904513	contig_2940_pilon	-	5215	10	Intergenic	novelGene_81872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	311	643	371731	371399	TRUE	55	CTTTAAAGAATAGACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVNNLTTHQQYPYSTLGSLSPASLSPSAFWPLSLDHCTSLVAFGFTGLWKWVSFRGSGYPTHYLSVTFLYCGGLHVSVMLEAMPPLFPIPAGSSIVDGFQQSFQTKTD	372041	316079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_316282_317939_318050_333002_333529_334888_334950_350542_350594_353925_354065_365349_365387_366071_366183_367603_367692_368151
904514	contig_8045_pilon	+	2257	9	Intergenic	novelGene_35445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	108.247329643738	49	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	175	1719	452026	462377	FALSE	25	TACCAATTCTTTTCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	434963	462915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452532_457233_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
904515	contig_7321_pilon	-	1550	1	Intergenic	novelGene_53149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGTTACACACATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529868	528318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_528300_529900
904516	contig_12279_pilon	+	1839	3	Intergenic	novelGene_50124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAAATATATAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71309	73305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_71751_71856_72192_72242
904517	contig_3986_pilon	-	7483	9	Intergenic	novelGene_52669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	125.788450880834	632	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	5685	6566	55958	34990	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILNDGL	61642	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35005_41425_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923
904518	contig_16411_pilon	-	4558	1	Intergenic	novelGene_77300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	444	4115	4558	89911	89468	NA	50	CTACACAAGATGGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRNLEWSLLLHHGHCVGSTFAETVHSATGHGVPCGARHLHTSEPASSQCGSPAGTKSLCVSHKTSTECTKMGHAAYSEQFRSENFITGTIHLPSGQTVGIHTSQQTPEVTFRVLPIPICKLNPQVRSRPDTDSSKPHSGKWRGEME	94025	89467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_89500_94000
904519	contig_8576_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_88827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGCTCCGCAGTTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1027035	1028608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_1027000_1028600
904520	contig_12464_pilon	+	2573	2	Intergenic	novelGene_68720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	377865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375686_375816
904521	contig_19816_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_156514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	8.5	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACATGTTCTCAAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127659	133595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_127791_128448_128579_131718
904522	contig_2365_pilon	+	3888	25	Intergenic	novelGene_103732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_19	307.049251840084	351	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	878	2637	202	2838	130213	258133	TRUE	25	CGATGAAATTGGCACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFQDYDLVSKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEEPSGNSGDLRKDVVMKENVSFKGDEDEKPTFVDLAKEETKDNDKLLQQQLDDQNRTISLVHGVNNDIVKALDRITLQNIPSQTSPAFTAGMKKDYSLPLTVLSCTKACPHMASCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVDVPDGPTLHDSDLYVEIVKSTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIVDRVVYDLDNPNYIIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVGYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRVGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVSFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQEIALTFSYLLGYILEKLTQVGL	116733	320157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137_212255_219467_220181_227531_227616_229217_229305_229386_229536_248941_249030_254096_254242_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_319819
904523	contig_6227_pilon	-	1294	3	Intergenic	novelGene_49652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	16	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	53	514	467737	428750	FALSE	25	GATTCAACAGTTTCTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGPGRGVGSLRLRGCEMCTQEGFQAQRSQLVGLLVSGSLEGFEGVLDWLLSWEVLSWEDYESLSLLGQPLSHLARRLLDTVWNKGAWGCEQLMAAVQEAQADSQPLELCGLWDPHSPCPARELQSHRPAIVRRLYSHVEGVLDLTQERGFISQYECDGIRLPIFTRLPW	474609	427969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_428766_467291_467746_474565
904524	contig_7887_pilon	+	3035	2	Intergenic	novelGene_124844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_1	0	279	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	978	2934	102	3035	20087	65261	FALSE	50	AAAACCATTATCCGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRNTAMLGLGSDSEGFSRKSPSAISTGTLVSKREVELENNTEEEEDLRKWNRERNLEAGKDDGLTDAQQQFSVKETNFSEGNLKLKIGLQAKRTKKPPKNLENYVCRPAIKTTIKHPRKALKSGKMTDEKNEHCASKRDPSKLYKKAGDVAAIQCQSEESIHLHSQGENNPLSKKLSPVHSEMADYINATPSTLVGGRDPDLKDRALLNGGTSVTEKLAQLIATCPPSKSSKTKPKKLGTGTTAGLVSKDLIRKAGIGSVAGIIHKDLIKKPAISTAVGLVTKDPGKKPVFNATVGLVSKDSVKKLGSGTTAVFINKDLGKKTGTITTVGLVSKDSGKKLGIGIVPGLVNKESGKKLGLGTVVGLVNKDLGKKLGSAVGLVAKDCAKKIVASSTMGLVNKDIGKKLVTCPMAGLVSKEAINLKAEALLPTQEPLKASCSTNISSHENQELSESLKDNATSKTFEKNVIRQSKESILEKFSVRKEIINLEKEVFNEGTCIQQDSFSSSERGSYEISKHEKQPPVYCTSPDFHMGGASDASTAKSPFSAVGESNLPSPSPTVSVNPLSRNPPETSSQLANPLLLSPTTELMEEISGCVGKNQFTSESAHLNIGHRSVGHSMNIDCKGIDKELSDSKTTHIDIPRISSSLGKKPSLTSESSIHTITPSVVNFTSLFSNKPFLKLGAVTASDKHCQVAESLSTNLQSKPLKKRKGRKPRWTKVVARSTCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSNSEPAKFMKNIGASSFVDHDFLKRRLPKLSKSTAPSLALLTDSEKPSHKSFATHKLSSSMRVSSDLLSDIYKPKRGRPKSKEMPQLEGPPKRTLKIPASKVFSLQSKEEQEPPILQPEIEIPSFKQSLSVSPFPKKRGRPKRQMRSPVKMKPPVLSVAPFVATESPSKLESESDNHRSSSDFFESEDQLQDPDDLEDSHRPGLCSMSDLEMEPDKKITKRNNGQLM	19985	65261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_20507_62747
904525	contig_14142_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_120441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTCAAAAGAGACAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81617	78797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_78800_81600
904526	contig_6842_pilon	+	3980	1	Intergenic	novelGene_130804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGATACCACTTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677713	1681693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1677700_1681700
904527	contig_5095_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_74955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGGGAGCTATTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264321	263060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_263100_264300
904528	contig_10857_pilon	+	3119	8	Intergenic	novelGene_160913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	123.870735784016	64	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	8	748	450654	468931	TRUE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWSRVRIAKCQMLLTGFFVLGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCRCSRPSALRDA	450646	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_450720_457543_457619_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_470317_470471
904529	contig_1008_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_121550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	70.2440191206499	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	217	924	535615	520962	FALSE	25	AGAAGGGGTCTTGAGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANKTGYVPSNYVERKNSLKKGSLVKNLKDTLGLGKTKRKTSARDASPTPSMDAEYPANGSSTDRIYDLNIPAYVKFAYLAEREDELSLVKGSRVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSLNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNSRGQIGLVPKNYVVVLSDGPALQPSHAPQISYTGPSATGRFAGREWYYGSVTRHQAECALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVEHYKKAPIFTSEHGDKLYLVKALQ	573571	519782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_521157_534949_535259_535411_535672_573411
904530	contig_6710_pilon	-	566	2	Intergenic	novelGene_93381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3	359	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657832	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
904531	contig_4110_pilon	+	4245	5	Intergenic	novelGene_177875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1229	1753	399340	399864	TRUE	30	AATCAGTTGGTGACATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTITKHLQKQDRRVPVGAKNKTPDDSPLQENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEENIDKFMENTDKKLQEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFPMLEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEEILRALWDTIKTKNL	397440	405799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4110_pilon_+_397756_398426_399910_403002_403405_403646_403893_404000
904532	contig_10904_pilon	-	1712	9	Intergenic	novelGene_22548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	219.74470272341	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	353	910	388922	375280	FALSE	0	TTCTTTTGTGTGTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGEFREASANISLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	396143	374477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379273_379395_381161_381213_388756_388991_389348_389453_389761_389798_395999
904533	contig_11081_pilon	+	4018	13	Intergenic	novelGene_167075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	65	junction_8	36.7229681383312	344	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	115	1707	28022	55557	FALSE	35	TTTTTTTAAACCACATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAEKWSESRFLYVTFNKSIAKQAELVFPSNVICKTFHSMAYGHVGRKYQSKKKLNLFKLTPFMVNSVLAEGKGGFIRAKLVCKTLENFFASADEELTIDHVPIWCKNSQGQRVMVEQSEKLNGVLEASRLWDNMRKLGECKEEAYQMTHDGYLKLWQLSKPLLASFDAIFVDEAQDCTPAIMNIVLSQPCGKIFVGDPHQQIYTFRGAVNALFTVPHTHVFYLTQSFRFGVEIAYVGATILDVCKRVRRKTLVGGNHQSGIRGDTKGQVALLSRTNANVFDEAVRVTEGEVPSKIHLIGGIKSFGLDRIIDIWILLQPEEERKKQNLIIKDKFIRRWVHKEGFSGLKRYVTAAEDKELEAKIAVVEKYNIRIPELVERIGKCHIEDLDFAEYILGTVHKAKGLEFDTVHVLDDFVKVPCARHNLAQLPHFRVESFSEDEWNLLYVAVTRAKKRLIMTKSLENILTLAGEYFLQAELTSNVLKTGVVRCCVGQCNNAIPVDTALTMKKLPITYSNRKENKGGYLCHSCAEQRIGPLTFLTASPERVHSMDRTIENIVLPRHEALLFLVF	27907	57868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_28048_28770_28994_29968_30057_30140_30228_30935_31073_39030_39131_39224_39347_41149_41226_41852_42051_42593_42720_44461_44569_54697_54830_55386
904534	contig_10078_pilon	-	3499	2	Intergenic	novelGene_160002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1835	2149	169606	169292	FALSE	15	GCCTTTGCTTTGATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRISGSGDKHLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNL	171699	167941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_171012_171270
904535	contig_5083_pilon	+	1564	9	Intergenic	novelGene_151657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	134.970309235031	37	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1074	489	1562	461780	658168	FALSE	15	GTAAGTTTTGCTCTTATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEGEQEEKSSENSSAERDLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPPYPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPTARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPAHIVQCPLPCCTQGHDCQHFYPPSDFTVSTQVFRDMKRNHSLQKVGEPWCMESNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISPYYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHS	461291	658170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_461969_462228_462296_462501_462627_546411_546514_600069_600214_648611_648745_651100_651204_653251_653339_658044
904536	contig_4538_pilon	-	4090	1	Intergenic	novelGene_153070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAGCAACTAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54347	50257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_50300_54300
904537	contig_11590_pilon	-	3767	2	Intergenic	novelGene_125584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	435	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACAATAAAATAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746790	620705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_620950_743267
904538	contig_13051_pilon	-	2383	2	Intergenic	novelGene_140130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394351	391554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_392077_392490
904539	contig_18511_pilon	+	2848	7	Intergenic	novelGene_126888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	414	junction_1	294.761297022221	6	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1251	2003	55332	59968	FALSE	20	TTCTTACCTTCCTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTVFNCAI	47918	60813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_48211_49187_49298_51672_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
904541	contig_5918_pilon	-	2291	2	Intergenic	novelGene_99542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	586	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACACACGGATTTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894562	727430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_729108_893948
904542	contig_17127_pilon	-	4006	14	Intergenic	novelGene_168291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	154.128241386514	840	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	905	1831	13780	8819	TRUE	25	TCTTTCCAATCCTGCCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAATSPQALRNIIKPPVGDPETFLHRHIQRDLEQLTKTLGKSADETANVVHLILCSLLRAQDSHSDQRLLNFDARLSTKERRNDWEKVVEKIILSELEHLDKTLLTVNTLISQDERISSDPVAKIIYGDPATFLCHLPQKSVVHCSKIWSCRKRITVEHLQHIVEQKNGRETVPILQKFLQKEAELRLVKFLPEILALQRNLVKRFQNASEVEFQSLRSFIDSHNSDGLKQWFRNRITIFLSTWNKLRRSLETNGEIKLPKDYCSTDLDLDADFEVILPRRRGRGLCSTALVSYLITLHNEMVYMVEKFSQKNNSYSVDTSEVTDLHVISYEVEQDLMPLLLSNCQYKVEQGGEALQEFDLEKIQRQITSRLLQGKPRLTLKGIPTLVYRHDWNYERLFMDIKNKMSQHALPYATLSALSGQLQSFSDACEALSVIEVTLGFLSTAGGDPDMPLNVYIQDTLRMDDQTSPVLKALNRCQLKHIIALWRFLSARKCEQLLRLGKDPFREISSEYKVDLSPEDAKLLSTFLNQTDLDTFLLELHEMMILKLKNPHQEVNFNPAWSLRDTLVSYMETKESDVPPEMESQFPEEILLSSCVPVWNTAARLKQG	19429	6607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_8409_8444_8961_10521_10701_10788_10879_11349_11545_12122_12201_13293_13496_13739_13921_14376_14461_14737_14871_16211_16464_17063_17156_18620_18802_19407
904543	contig_9189_pilon	-	2681	2	Intergenic	novelGene_165135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCCTGGCAATCTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576081	515858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_515991_573532
904544	contig_11258_pilon	-	3005	1	Intergenic	novelGene_67811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2320	2622	326543	326241	NA	50	ATAACCAAGGCAAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKCSQSLAIREMQIKTTVKYNFAPTLPAIKIIFKKSENNKCWWGCVEIGTLVHCWLEYKMVKPLRKTVWHFLKKLEIEIAYDPAIPLQGIYLKDIRAVT	328862	325857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_325900_328900
904545	contig_504_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_54398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTTTCTCTTCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15224	13947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_13900_15200
904546	contig_16148_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_50369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72294	69737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_69700_72300
904549	contig_4125_pilon	-	932	4	Intergenic	novelGene_25080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	50.9378706530482	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	245	871	527566	526557	FALSE	10	CCACCTGTCCCCAGGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVRLTSQLVRAASRAGRSLPWPVSGVPGAHAWKPCYSTQPVGPSKAASLPGREAQLELEEMLVPRKMSISPLESWLTARCLLPSLGAGIPGTVTPSQLYECPPSHVGEGAEQGDEGVLDVPQVQCKNVLKIRRRKMNHHKYRKLVKRTRFLRRKVREGRLKRKQPAIPLLPSQMKFERDLRRIWLRAGLKEAPEGWQTPKIYLKGK	528497	526495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_526686_526769_527216_527514_527676_528362
904550	contig_10241_pilon	-	1707	5	Intergenic	novelGene_142831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTCTAAGTAAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122447	92706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_92783_105208_105321_116152_116189_120079_121172_122056
904551	contig_4091_pilon	-	2739	9	Intergenic	novelGene_173005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATTCTGAAAACAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228787	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21459_25752_25819_26749_27505_38109_38618_62554_62817_108214_108378_228550
904552	contig_5623_pilon	+	3934	1	Intergenic	novelGene_154868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGCATTCCATAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262957	266891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_263000_266900
904553	contig_3817_pilon	+	2077	15	Intergenic	novelGene_78287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	545.03100922829	1	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	308	1327	85013	115746	FALSE	30	AACTTGTTGATCATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAVWLATQNHSTLVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSDAKRRQQGSPLSSSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLETTASKANRQKSLDSDLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKLLGKDAN	77949	116496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82189_84237_84351_84989_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89654_94141_94181_95299_95352_99010_99084_99336_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113197_115722
904554	contig_13366_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_99785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105969	103623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_-_103600_106000
904555	contig_21025_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_76488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	247	744	407	1150	23690	22947	NA	30	CCAGATGACTTTCCAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHRAAILDSYQRPANRGYKKAASWSFQQETEQPVNSDIRFPTPHPSSSPLGLLCFPRPQSLGQEAPAAWIPPARTGRLPECHLLAAGVAFFHFFRFLPYLSPPPPPFAQIPGSVHHFCFFLRSCGAPFECGTASQSVLPCWWDPGAFFVCLFVFFFFSRVGSLFWPGGAVRLGTYALSLCRRAEGSLRAFLLLCFFFPVFLGGFLFFFFKFVLFSFPSFSLFVFLHYSVSHLSIPSFSSCPLDTGH	24096	22209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21025_pilon_-_22200_24100
904556	contig_18364_pilon	+	3378	2	Intergenic	novelGene_102573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	179	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTAAATGCTATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129151	133509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_132313_133292
904557	contig_9527_pilon	+	3022	1	Intergenic	novelGene_134090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	330	993	1959	2951	624444	625436	NA	20	CTCTTTTAATGAGGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQPSPVPGLAHFPRFPSPVPGLAQFPRFPCFDLGPACFRAARLGITMKAKLARLEAQEQAFLAHLKGQDPGAPQPQSDSKPPPKKKKKKQKEEAAAPVAERNGEEEHREQTDHSNRKSKKKKRRHQEEKVPEEREGTIENEEEEAAGTGGLGELKSREQTDQPLRKRKKKRWQQEEGGILAKGEGGKEAAGGVRTEEVENRAYTDPCSQSKKRRQREEEDSLKIEDEEGEAASGDGRTGEAASKACNDLGIRRSKKKRKRHREEEAVLDRKGEEDETGGGGGTREAESRTRTGPGSRDKKRKQQHPEEGRAVVSTGQRAKKKKEKKRD	622485	625507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_622500_625500
904558	contig_20241_pilon	+	4342	1	Intergenic	novelGene_159749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3877	4272	257007	257402	NA	40	CTCACAACTGGACCAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGSWLKAENTREMFTCVLLTMQRHWTVDHKLWITLRRMRIPEHLIVLMRNLYTDQEAVVQTEQGGTAWFKIRKGVCEACILSPSLVCRLSRSFEKLNYMKNMTSGLEEDSLKICDRQMTQPCLLKVKRT	253130	257472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_253100_257500
904559	contig_20641_pilon	+	2392	10	Intergenic	novelGene_52862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1626.75467278631	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	27	884	14659	71492	TRUE	80	GAAAAAAAAAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGFQPQMNPG	14632	86669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_71463_71525_83676_83717_83757_83811_85286
904560	contig_12644_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_44512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1117913	1120267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1117900_1120300
904561	contig_17796_pilon	+	1562	1	Intergenic	novelGene_33841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	575	913	121461	121799	NA	15	TGGCTATAGATGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSFLVTCPKYKRRSFTILTSKDHSGCTSPKTDLFVLLAVHGVFNILRQHHNSGASVVLRSSLFIVQLSQAFETTENTMAWVRHTVVLKVTSMLFNTFKEVFCSIFA	120886	122448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_120900_122400
904562	contig_6102_pilon	+	2075	19	Intergenic	novelGene_31747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	193.005469122279	1	38	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	103	603	218427	220098	TRUE	25	ACTAGGCTATCTGTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLDP	217527	229247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219870_220090_220190_220361_220446_220705_220788_221434_221521_221611_221702_226861_227023_227264_227330_227565_227657_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
904563	contig_10000_pilon	-	4055	16	Intergenic	novelGene_139300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	339	junction_12	169.741319529322	3	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	621	1866	1268	3133	262978	159846	FALSE	20	GCTCAGCAAATGTGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATGHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPGNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	272085	158923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_182891_182946_192582_192801_225789_226009_234052_234131_236640_236869_244288_244453_255345_255513_260138_260186_262201_262289_262894_263003_270842
904564	contig_854_pilon	+	1609	2	Intergenic	novelGene_36353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974686	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975857_975979
904565	contig_5590_pilon	+	829	6	Intergenic	novelGene_163039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	445	junction_5	183.354738144396	269	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	501	329	829	360033	369176	FALSE	15	CCGCCATCCCAGCAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPSSSDSSSDSSSDSDSSTDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQPQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKKKEEVEETKKSKAKELPPKKTKKNNSSTTTSKKELAPMKSKPAAAYESEEEDRCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKKRKPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESTSESSSSDSEDSETELAPKLKKKGHPGREQKKHHHHHHQMQQTPAPVPQQPL	358870	369176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_358983_359431_359629_360013_360310_361040_361152_368970_369024_369116
904566	contig_13571_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_128100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTGAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15969	17499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_16000_17500
904567	contig_20199_pilon	-	1220	3	Intergenic	novelGene_82550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1299	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	160	387	43987	41931	TRUE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQR	44146	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41472_41922_42078_43906
904568	contig_709_pilon	-	2775	10	Intergenic	novelGene_57553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_4	90.4777443475589	7	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	417	2099	1559073	1540432	FALSE	20	ATGTCTATGTATTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGSWQHKMKLQLILKSSKAYYVLSDAAMSLQKYGRALRYIKLALQSHDTYCCLCTNMLSEVLLFLSQYLTLCGDIQLMLAQNANNRAAHLEEFNYQTKEDQEILHSLHRESSCQGFAWATDLSTDLESQLSVSCKCYEAANEILQFSDLKSQNPEHYVQVLKRMGNIRNEIGVFYMNQAAALQSERVVSKSVSAAEQHLWKKSFSCFEKGIHNFESIDDATNTALLLCNTGRLMRICAQAHCGAGDEFKREFSPEEGLYYNKAVDYYLKALRSLGAREMHPTVWDSVNWELSTTYFTMATLQQDYAPLSRKAQEQIEKEVSEAMMKSLKYCDVDSVSARQPLCQYRAATIHHRLASMYHSCLRNQVGDEHLRKQHRVLADLHYSKAVKLFQLLKDAPCELLRVQLERVAFAEFQMTSQNSNVGKLKTLSGALDIMVRTKHAFQLIRKELVEEFDQPESDGPPPAAESSRGLDQEEVTKLLSIFESRLSFLLLQSVKLLSSTKKKTSSNTEEDVVLKANKQIYSQLLRATADRGTAVLERIDVVVHLLDQLACSGSAGQ	1559489	1539755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1540592_1548421_1548574_1549329_1549446_1550433_1550588_1552711_1552862_1553201_1553361_1554974_1555199_1556514_1556734_1558380_1558582_1558925
904569	contig_5779_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_106457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAATTATGGTAGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109447	106754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_106800_109400
904570	contig_2689_pilon	-	2320	9	Intergenic	novelGene_100826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	236.398994022817	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	14	613	189399	156418	TRUE	45	ATATGAAATTCTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTPAMLNPANVPTHLMVLCCVLRYMVQWPGMRILRRQELDAFLAQALSPKLYEPDQLQELKIENLDPRGIQLSALFMSGVDMALFANDACGQPIPWEHCCPWMYFDGKLFQSKLLKASREKTPLIDLCDGQNKLPRLKRCVRASWRGSTSPGRTTRFLSHHLLLCPSTQLPCILGTLGQSHHLRAGAEVLQESVALEALTGKL	189412	143061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_143500_143562_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135_157316_158472_158683_164367_164483_189343
904571	contig_7396_pilon	-	2564	1	Intergenic	novelGene_79522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1836	2174	195124	194786	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNTLFCSALKFYVEFISLVLIFLVLIFFPFVGEMLSYGDKQEVEIRGCSVWCVELIRDCLLELIEKKGEKISGEINSILLDYYLWDYARDHRADMNGIPFHHTRCIYY	196959	194395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_194400_197000
904572	contig_5033_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_29067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATACAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539020	540717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_539000_540700
904573	contig_8866_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_77821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAGTGGAGGGCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561580	558720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_558700_561600
904574	contig_8671_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_126247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATAGCCTTGGAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467511	429485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_429835_466020_466437_466835
904575	contig_7412_pilon	-	3220	8	Intergenic	novelGene_76307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1453.41434742682	5282	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	1402	2928	377290	364445	FALSE	15	GACGAGGTCTACTGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLTPLTLLLLLLARDGASSDLDDTSHRPMKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	382060	364152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_377239_377831_381199
904576	contig_11307_pilon	+	2919	6	Intergenic	novelGene_105242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	87.5958903145576	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCCTAATAAAAGCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75366	88503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_76960_78550_78663_78881_79041_79683_79834_87512_87600_87685
904577	contig_5222_pilon	+	3414	21	Intergenic	novelGene_58976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	52.4199151086684	340	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	421	1665	37965	50644	TRUE	40	TTAAACTTCAGACCCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTVNYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTASYLRPREVQVREFEVLRKLNHQNIIKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVVAGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLMGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFTPFGGPRRNKEIMYRITTEKPAGAIAGTQRRENGPLEWSYTLPITCQLSMGLQSQLVPILANILEAEQAKCWGFDQFFAETSNILQRVVVHVFSLSQAVLHHVYIHAHNTIAIFLEAVYEQTNVAPQHQEYLFEGHLCVLEPSLSAQHITHTTASSGDAPGHVQADAGGHADSPPLPQQQPGQREVHQHGCEA	35332	76141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_35552_36304_36392_37536_37620_37933_38052_38958_39100_40249_40380_40976_41159_41864_42026_42908_43020_43573_43754_44369_44509_45683_45771_50617_50694_51007_51121_53998_54076_68292_68333_69123_69226_70544_70642_71736_71856_72116_72189_75061
904578	contig_2854_pilon	+	2794	2	Intergenic	novelGene_120821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	171	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	142	990	246682	247530	FALSE	30	CAAACCTGTTGTCACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAQRVPSLSARGRGGGAARGGGGWRRRRSAFERGLGSEARSPPTEMSRQTATALPTGTSKCTPSQRVPALTGTTASNNDLASLFECPVCFDYVLPPILQCQSGHLVCSNCRPKLTCCPTCRGPLGSIRNLAMEKVANSVLFPCKYASSGCEITLPHTEKADHEELCEFRPYSCPCPGASCKWQGSLDAVMPHLMHQHKSITTLQGEDIVFLATDINLPGAVDWVMMQSCFGFHFMLVLEKQEKYDGHQQFFAIVQLIGTRKQAENFAYRLELNGHRRRLTWEATPRSIHEGIATAIMNSDCLVFDTSIAQLFAENGNLGINVTISMC	205525	249334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_205665_246679
904579	contig_8045_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_35329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTCCTGCCTAAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82563	84964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_82600_85000
904580	contig_7009_pilon	+	5968	1	Intergenic	novelGene_23660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCCCAATTAAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504087	510055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_504100_510100
904581	contig_1301_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_47416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTCTGCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839192	841404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_839200_841400
904582	contig_4071_pilon	-	1155	4	Intergenic	novelGene_151865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	8.83176086632785	41	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	144	752	64136	59459	TRUE	40	GCAGAACATTAAAAGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRGWRHQLFVPLEIVLSWLPGVAVHAGETYQGISCFKHWYSFDTTVMAATWTVQAHVDQEEVLEVKIEKEEEEEYKYTTRKDQSLQKNNSYSREVFRQYFRQFCYQETSGPREALRQLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREQHPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTEEQEMFLQEMAPLRTEQEASMSLQSVKAKLKCESPEPEAQQEQGKEERCILRRRGRQG	65180	36216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_36599_59437_59651_63719_64205_65105
904583	contig_9423_pilon	-	1821	9	Intergenic	novelGene_99172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	168.360290745769	1	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	171	1037	61283	51308	TRUE	30	CTTGTATCAGATGTACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIVIPILTLKEL	74568	33456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_33708_39165_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51340_59757_59852_60542_61292_73820_73917_74502
904584	contig_6084_pilon	-	2750	9	Intergenic	novelGene_127063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.3239241192014	93	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1914	2228	435364	430664	FALSE	15	ATTCTGATCTTTCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDGFSSYMLDITEEDCFSLFPLETLVYLTPDSEHALEDVDVNKIYILGGLVDESIQKKVTFQKAREHSVQTARLPIQEYMIRRQNGKNYYSEILAINQDSKLA	445417	430141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_430681_431272_431397_433030_433099_433811_433891_435337_436474_436607_436733_437315_437459_438023_438240_445097
904585	contig_9112_pilon	+	4473	1	Intergenic	novelGene_60224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAGAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110296	114769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_110300_114800
904586	contig_7151_pilon	+	1097	7	Intergenic	novelGene_40752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	169.530397143272	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATACCTACTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502545	508053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503041_503212_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440_505593_507738
904587	contig_9995_pilon	+	3641	1	Intergenic	novelGene_47763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686360	690001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_686400_690000
904588	contig_5482_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_144512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725925	728493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_725900_728500
904589	contig_3956_pilon	+	2657	13	Intergenic	novelGene_14939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1147.57603233947	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	98	2209	1284120	1290491	FALSE	10	TGTGTGGTGTCATCGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281669_1284089_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
904590	contig_8885_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_115568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.9804661001858	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGCTCATTAGAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58249	45848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_46355_46751_47248_49094_49264_56139_56437_58183
904591	contig_9180_pilon	+	3097	4	Intergenic	novelGene_109111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383030	397655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_384978_387023_387177_396171_396216_396702
904592	contig_15787_pilon	+	4253	2	Intergenic	novelGene_143970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACCTTTCTGTTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57331	61620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_61396_61431
904593	contig_6589_pilon	+	3608	14	Intergenic	novelGene_25733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	48.8033125270147	179	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	67	1515	460735	507033	FALSE	10	CACTTGGCTCTCGGACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457290	509126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884
904594	contig_17470_pilon	+	5661	33	Intergenic	novelGene_110470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	250.240126865677	551	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	801	2406	2822	5227	71596	89852	FALSE	10	GGCTTTACTTTTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSLIERGACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEALLASEDYGKDLASVNNLLKKHQLLEADISAHEDRLKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVKDKRDTINGRFQKIKSMAASRRAKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIGKEEIQQRLAQFVEHWKELKQLAAARGQRLDESLEYQQFVANVEEEEAWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHEENISSKMKGLNGKVSDLEKAAAQRKAKLDENSAFLQFNWKADVVESWIGEKENSLKTDDYGRDLSSVQTLLTKQETFDAGLQAFQQEGIANITALKDQLLAAKHIQSKAIEARHASLMKRWSQLLANSATRKKKLLEAQSHFRKVEDLFLTFAKKASAFNSWFENAEEDLTDPVRCNSLEEIKALREAHDAFRSSLSSAQADFNQLAELDRQIKSFRVASNPYTWFTMEALEETWRNLQKIIKERELELQKEQRRQEENDKLRQEFAQHANAFHQWIQETRTYLLDGSCMVEESGTLESQLEATKRKHQEIRAMRSQLKKIEDLGAAMEEALILDNKYTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMRMQHNLEQQIQARNTTGVTEEALKEFSMMFKHFDKDKSGRLNHQEFKSCLRSLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNRDGHVSLQEYMAFMISRETENVKSSEFSLRT	58888	90286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_60284_60863_60969_61418_61443_61955_61992_64182_64231_65164_65257_65607_65753_65836_66019_67629_67730_67882_68081_68185_68333_69020_69125_69295_69459_71513_71653_71908_72047_73069_73175_76238_76448_77264_77386_77636_77759_78136_78270_79627_79727_81385_81546_82226_82304_82984_83195_83604_83902_84382_84496_84990_85009_87600_87656_88113_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88911_89834
904595	contig_15744_pilon	+	3960	2	Intergenic	novelGene_83619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAATTAAAAAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190523	195846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_192990_194352
904596	contig_12142_pilon	+	3360	19	Intergenic	novelGene_147802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	54.9749943155977	257	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	14	2218	87452	136164	FALSE	20	CCAACATCTTATTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPARRCCLGWDFSTQQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIRDKVWSQACLGACAPQLAEKLGPPMRSSSVAGTISSYYVQRYGFHPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIVVSLGTSDTLFLWLQEPMPSLEGHIFCNPVDPQHYMALLCFKNGSLMRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPILTQPAPFSNPDSDHPFPNPGPQSLTPQALAPLSLLSRQLPVSHPETPTSRSLFPPHSAI	87438	137306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88923_89007_94352_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100329_100403_102360_102480_104919_105002_106950_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
904597	contig_12250_pilon	+	3129	9	Intergenic	novelGene_80572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	68.509009444014	184	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	240	1598	311980	314215	FALSE	20	AGCCCCAGCCCCTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQLQDMLSWMQPGVSITSSFALSQYGVDMGWTLPECSITDSVTMTQPMEPNPPQQPRLALGSSLPNTKHSPHFPQEPASRTHPEPLTGHHFNLAPIGRRRIQSRWASTRGGHKERPTVMLFPFRNLGSSAQVISKPENRRQHWTHTADPACAVGTRTASAGKPKCPSQHLGGRALKENPVGSSASEQKENCLDCALDPLKLSLSPPRTRKPASSPSLCSPIITIGDLVLDSDDEENGQREGKESLGNYQKTKFDTLIPTFCEYLPPSGPSAIPVPSHDHTDSSRP	311740	315746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_312793_312871_312969_313132_313596_313684_313753_313856_313949_314083
904598	contig_10404_pilon	+	1116	6	Intergenic	novelGene_138654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2900.39200109227	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	69	491	1085448	1099854	FALSE	20	CCCAACTGTTGCTCGGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQSLYK	1085379	1100479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098846_1099839
904599	contig_2069_pilon	-	3379	9	Intergenic	novelGene_23307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCATTCCAGCTCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532215	504405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_504453_510937_511071_511588_511742_514126_514247_515264_515396_518069_518225_520107_520547_523271_525372_532114
904601	contig_10868_pilon	+	6213	14	Intergenic	novelGene_173897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	97.5601164993203	283	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1742	5229	100	5328	496329	521986	FALSE	15	GTACCTCGTGTCCTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSATPLYGNVHSWMNSERVRMCGINEDRKIPVNDGDASKTRLELREENPLNHTVVDATTAHRIDGLAALSMDRAGLIREGLRVPGNIVYSSLCGLGSEKGREAATSTLGGLGFSSERNPEMQFKQNTPETVEPPAVSGKPPNGFSAIYKTPPGIQKSAVPTAETLGLDRPASDKQSPLNINGASYLRLPWVNPYMEGATPAIYPFLDSPNKYSLNMYKALLPQQSYSLAQPLYSPVCTNGERFLYLPPPHYVSPHIPSSLASPMRLSTPSASPAIPPLVHCADKSLPWKMGVSPGNPVESHAYPHIQNSKQPRVPSAKAVASGLPGDTALLLPPSPRPSPRVHLPTQPAADTYSEFHKHYARISTSPSVTLSKPYMTVSNEFPTARLSNGKYPKAPEGGEGAQPVPGHARKTAVQDRKDGGSPPLLEKQTVTKDVTDKPLDLSSKVVDVDASKAEHMKKMAPTVLVHSRGGSGLVLSGSELPKETLSPPGNGCAIYRSEIISTAPSSWVVPGPSPNEENNGKSMPLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVVSNVSGSVSSAGRPASASPAPNANADGTKTSRSSMDTTPSVIQHVGQPPTTPAKHSGSTSSKGAKASNPEPSFKANENGLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAISPLSLHGKGPVYPHPVLLPNGSLFPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEISKEEKPERRSRSHERARYEDPTLRTRFSEMLEASNTKLHPEVPTDKNPKPNPSWNQGKTVVKSDKLVYVDLLREEQDTKTDTNVSKPGFAAESVGQSTEPTKPPADPGLQQHRDFIALREELGHISDFNEAYAFKQAPGQSVFSLSKENVPAGTNKENLGLPVATSFLEPTLGGDGPAITFGKTQEEPKPFCVGSAPPSSVDGTPPTYTKDGSDDAESNDGKVLKPKPSKLAKRIANSAGYVGDRFKCVTTELYADSSQLSREQRALQRAMMRFSELEMKEREGGHPAAKDSEVCKFSPADWERLKGNQDKKPKSVALEEAIADQNDSERCEYSAGNKLDPFEAQEDKDLPVEKFFVERQPLSEPPTDPVAVDMPHSPTLRLDRKRKVSGDSIQTETAVEDMPEDPLLKAKRRRVSKDDWPEREMTNNSSNHLEDPHYNELTNLKVCIELTGLHPKKQRHLLHLRERWEHQVSPAESKPGRQNRKEVTQAVQPEVTAQGNNITEEKPGRKRSEAKGNRSWSEESLKPNDNEQGLPMFSGSPPMKSLSSTNANGKKQTQPSCTPASRPPAKQQKIKESQKTDVLCTDEDEDCQAASLLQKYADTSEKPSGKRLCKTKHLIPQEPRRGLSLTGDYYVENADGKVTVRRFRKRPEPTSDYDLSPAKQEQKPFDRLQQFLPASQSSQLPCATSPQETTQSRPMPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLGYEEVVLYCLENKICDVNHRDNAGYCALHEACARGWLNIVRHLLEYGADVNCSAQDGTRPLHDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSGRTIMKMTHSELMERFLTDYLNDLQGRSDDDSNGSWDFYGSSVCEPNDESGYDVLAHPPGPEDLDDDDDAYSDVFEFEFSESPLLPCYNIQVSVSQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCNFPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSKDLEAFNPESKELLDLVEFTSELQTLLGSSVEWLHPSDMTSDDYW	476234	522871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_476294_496288_496415_497661_497741_498737_501588_502787_502975_509497_509759_510186_510532_511217_511544_511889_512145_517263_517431_519392_519539_520048_520127_520317_520475_521694
904602	contig_17796_pilon	+	3170	12	Intergenic	novelGene_33797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_11	345.925492383825	18	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	145	1290	53527	120497	FALSE	30	AAAGCCATCCACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53382	122377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
904603	contig_8552_pilon	-	3757	2	Intergenic	novelGene_80108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	813	1115	564526	564224	FALSE	30	AGTGGCATGACACAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILSKAIYRYNAIPIQIPMTFFNEMEKQITNFIWKGKRPQISKALLKKNNKVGGLTLPDFKTYYTAVVVKRAWYWYNNRYIDQWNRTENPDKNSSTFKQ	565380	561581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_565163_565204
904604	contig_12677_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_110761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACTATTAACAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673	192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_200_1700
904605	contig_15118_pilon	+	3542	14	Intergenic	novelGene_74597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	247.153068063608	13	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1938	2702	393544	395136	TRUE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEIKDSFQQLSPRGHFWELASQPSFSSASY	379438	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_379782_379884_380022_380151_380317_391630_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393266_393415_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394700_395049_395141_395233_395346_398644
904606	contig_9484_pilon	+	3958	16	Intergenic	novelGene_105661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	561.976685953746	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	70	945	126829	206895	TRUE	35	GGGAGTGAAGCCAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEKGYGTWTYRGKERTSPSSSKCTRRP	126759	214546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202577_202788_202823_204859_204895_206885_206944_211513_213165_213232
904607	contig_6316_pilon	+	1783	12	Intergenic	novelGene_134709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_2	134.650020791582	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	532	1437	147168	157164	FALSE	20	GGTTACTTTGTTCTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136302	157510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
904608	contig_9185_pilon	-	2237	2	Intergenic	novelGene_166905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCACAGATGTTAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512469	383144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_385127_512214
904609	contig_14300_pilon	+	1909	1	Intergenic	novelGene_133143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGTCAGTGGTGGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457286	459195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_457300_459200
904610	contig_16411_pilon	-	5750	5	Intergenic	novelGene_77307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	67	513	134302	131443	TRUE	45	CAAAAAAACCAACTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSVPSARRAPTTSMTWALHLDKSCRPRRARSKSSRYSSSDFWLSSPEPVTTFTVAVASEFRDEADVVIPDLHHLLADVVLWADAALGARPPGQKIMGRSRPCLKCLGGTGSFHAVAAPGTSNTQPPWPAPLGGTQEASQHLSEGAC	134368	119881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_120512_122764_122862_124492_124622_127061_131730_134142
904611	contig_17796_pilon	+	4406	14	Intergenic	novelGene_33788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	209	junction_13	326.433207644771	581	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	385	1569	53527	117926	TRUE	25	TATAGAAGTTTCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGTYISDESHREVKFISL	53142	123227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_117874_117961_120424
904612	contig_14546_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_157451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536324	534248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_534200_536300
904613	contig_5033_pilon	+	2124	2	Intergenic	novelGene_28903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGCTGGCAATCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444572	447294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_445011_445608
904614	contig_614_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_132605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1662	2258	214272	213676	NA	35	AGAGACTAGCTTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYFAKEDIQTANRHMRKCSRSLAIRDMQIKTTTRYHLTPTRLALVQKTQNNKYWRGCGETGTLIHCWWECKIVQPLWKSIWHFLIKLEIEVPHHPPIPLLGIYPRVIRAITQIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWINRLWCIHTMEYYTMIKNNNESVKHLLTWRNLEGIMLSEFSQSQNDKYCIRLLL	215933	212732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_212700_215900
904615	contig_17753_pilon	-	2750	2	Intergenic	novelGene_105077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCTGGGAGGGACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67066	63122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_64579_65772
904617	contig_11316_pilon	+	1414	3	Intergenic	novelGene_122616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.5	68	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137261	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137346_137408_137766_137896
904618	contig_13888_pilon	+	3182	5	Intergenic	novelGene_151797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2878	3180	430143	430488	FALSE	60	AAAAAATAAACATAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNELNAPIKRKRICCLQETHLRLKDTNKLKLKGWKKIYQANNTGKRARVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYRMIKGSIHQEGITVI	338484	430490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_339351_342666_343762_428726_429458_429957_430221_430263
904620	contig_12464_pilon	+	2119	5	Intergenic	novelGene_68662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAATGGCGCTACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126766	242577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_128067_182086_182194_192378_192464_222492_222597_242054
904621	contig_10600_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_169855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGAGAGCTGTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72840	71623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_71600_72800
904622	contig_935_pilon	-	4275	4	Intergenic	novelGene_45580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	175.583471760743	90	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	67	2505	630665	623188	FALSE	30	CAGCCCCAAGCAACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTIDIKSLSVEKYDVSSQGTVPTFPWFSLQMPLTPNAVVPMSLFPLKDKLRFPKGSQEHIFKSSVYMQ	633021	621417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623566_623677_623744_628670_630678_632967
904623	contig_211_pilon	+	6181	2	Intergenic	novelGene_129878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	378	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	285	386	277682	277783	TRUE	55	GGTGGAAAAAGGTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAHRVALCHLAGCQEQAAWYHTLQIVFFLVSAYFFSCPVPEKYFPGCCDIVGHGHQIFHAFLSICTLSQLEAILLDFQGRQEIFLQRHSPLSIYMACLSFFFLTACSAATAAFLRHKVKARLTKKDS	277397	284148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_277793_278362
904624	contig_91_pilon	+	3095	6	Intergenic	novelGene_127150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	19.0326036053925	226	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	406	717	1369162	1383349	FALSE	15	CTTGCCTAAGTTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPVKKEHIFVAVKTCKKFHGDRIPIVKQTWEAEAGLIEYYSDYTESSIPTVDLGIPNTDRGHCGKTFAILERFLNHSHDKIPWLVIVDDDTLISISRLQHLLSCYDSGEAVFLGERYGYGLGTGGYSYITGGGGMVFSREAIRRLLASQCQCYSNDAPDDMVLGMCFSGLGIPVTHSSLFHQARPVDYPKDYLAHQVPISFHKHWNIDPVKVYFTWLAPSEKDRARQETQARFKEEL	1342619	1385727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1342690_1354247_1354362_1356554_1356655_1365459_1365580_1369160_1369306_1383181
904625	contig_12841_pilon	+	3560	1	Intergenic	novelGene_55896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3593	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1190	1564	901048	901422	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFERFHQKNKKRTYRLGKNFWTAQVRQRSNLHNLQENPTPLQQKTNNPIKKWAKEMNRHFNKEDIQAANRHMRKCSRSLAVREMQIKTTMRYHLIPALLARIKNTGNSKCWRGCGEMGTLMHC	899858	903418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_899900_903400
904626	contig_7635_pilon	+	3647	15	Intergenic	novelGene_171358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	134.404354885714	319	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	842	2074	141050	158234	FALSE	60	AAGCATTAAACATAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAAAAYGRSPVVGFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDALIGPGIPRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDNYIRSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAHCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY	35182	159807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_35249_53885_53961_78276_78497_137016_137137_138098_138153_138638_138792_140309_140443_141029_141224_141955_142033_151766_152017_153317_153566_155131_155280_155774_155926_156288_156366_158126
904627	contig_4884_pilon	-	3287	1	Intergenic	novelGene_63790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATTTAATTTCCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199560	196273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_196300_199600
904628	contig_5389_pilon	+	4552	4	Intergenic	novelGene_143020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	125.966485842686	300	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	66	1256	410753	425370	FALSE	30	TTTAAATGGGTGAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQFLQRAEVRGSVLFVSQDRGMKEVKSEQERGSRRRHRDGDMVAAATVVVKQERLSPETVPPSHRRPDSSGHSPSSPAGEPGRPGHRGNRSRGSSRSPARKKSKSSGRRSKSPRSKRSRSPHHSAVKVKQEREDHPRKGREDRQHREPSEQEHRRARNSDRERHRVHSHQRRTSNERPGSGQAQGRDRDIQNLQAQEAEREFYNARRREHRQKNEVSGNDNDSQELVPRPGGNNKEKEVPVKEKPSFELSGALLEDTNTFRGVVIKYSEPPEARIPKKRWRLYPFKNDEVLPVMYIHRQSAYLLGRHRRIADIPIDHPSCSKQHAVFQYRLVEYTRADGTVGRRVKPYIIDLGSGNGTFLNNKRIEPQRYYELKEKDVLKFGFSSREYVLLHESSDTSEVDRKEDEDDEEEEEVSDS	410687	428666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_410977_413027_413131_423555_424155_425105
904629	contig_3077_pilon	+	1694	9	Intergenic	novelGene_26678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3606.00975586243	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	515	1198	13867	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAGRGHLLCCRRNVAEGGSDRSLGWPRWIGASGSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9634	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9732_11272_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
904630	contig_4783_pilon	-	1964	2	Intergenic	novelGene_108437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	177	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACTCAGTCCGGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469565	466333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_467691_468958
904631	contig_13740_pilon	-	3086	13	Intergenic	novelGene_34754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_7	293.977925758607	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1747	2169	744004	687607	TRUE	60	GTAGTAAAATAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDIIPEDDDERGELYDDVDHPLPISSPHKGGQPTDDEIYEELPEEEEDNASVKMEEQKRKMSHDSVSHIPGDKSTDYANFYQGLWDCTGALSDELTFKRGDVIYILSKEYNRYGWWVGEMKGAIGLVPKSYVMEMYDI	873877	686309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_745417_757233_757318_757593_757675_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
904632	contig_6470_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_145597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAGTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964654	966203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_964700_966200
904633	contig_14868_pilon	-	4218	8	Intergenic	novelGene_150424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_6	112.157687827342	320	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	71	2182	89992	50257	FALSE	25	TACAATGATTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSSGSPSKDVTKASSSGVREKVEKKTKSRSTDVGSRADGRKFMQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVASGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSSHGSPSVNSRWRRFPTDYASTSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSTGSTMSTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREELVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKPPEGNNCRSGDPRPQPAETPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSRKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWEEIESKLRTESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAVLPSPPKQKSSPVNNHSSPGQTPTLCQPEARVLHPAAVSVSAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE	90062	48220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_50547_52398_52451_53514_53609_59857_59947_66902_67074_69348_69497_81295_81531_88959
904634	contig_9297_pilon	-	1652	3	Intergenic	novelGene_69902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCAGGCATTAGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971973	969025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_969063_969256_969469_970570
904635	contig_9481_pilon	+	3836	2	Intergenic	novelGene_149632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2609	3070	111300	111761	TRUE	15	CCCAGGGGGTGCCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPGIPLCSCADWGSSSQAVQYSPARRGSQTKKRKREQTNKQIKTEQIKTNKKALGIPTAWQYGLRSSSSVKRHFTAFQEEAKMAHRATYLRERRRRWREVWKKPKEAEKSNTSYQQMTLREPASVGRWNPSGTGLKPVPPGQETVARGSRGG	108691	113355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_111942_112769
904636	contig_13800_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_153737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	371	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTATTACTTGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148331	146464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_146500_148300
904637	contig_9415_pilon	-	4213	20	Intergenic	novelGene_109732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	317	junction_5	1130.89205590333	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	29	2107	598837	532726	FALSE	55	CCAGCTATAAATAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLESVVADLLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGNVALDNLQIKENALSELDVPFKVKAGQIGKLTLKIPWKNLYGEAVVATLAGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELSRIEEALQKAAEKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVKITDIHIKYEDDVSDPTRPLSFGVTLGELSLLTANEHWTPCILNEAEKIIFKLIRLDSLSAYWNVHCGISYQGSREQILAQLKSEIITSSNRSPHHQYIFQPISASAKLYMNPYAETELKTPKLDWNIEVQNIAIELTRPQYLSMIDLLESVDYMVRNTPYRKYKPYLPLHTNGRQWWKYAIDSVLEVHVRRYTQMWSWSNIKKHRQLLRSYRSAYRNKLTQTKVSEEIQKQIQDLEKTLDVFNIILARQQAQVEVIRSGQKLRKKSADPGEKRGGWFSGFWGKKEAKKKDEESLIPEAIDDLMTPEEKAKLFTAIGYSESTRDLTLPKQYVAHIVTLKLVSTSVTIREKENIPEILKIQIIGLGMQVSQRPGAQALKVEAKLKHWYITGLRQQNIVPSLVASIGDTASSLLKIEFETNPENSPADQTLVVQSQPVEIVYDAKTINAVVEFFQSNKGLNLEQITSATLMKLEEIKDRTATGLTHIIESRKVLDLRINLKPSYLIVPQTGFYHENSNLLVLDFGTFRVGICFSVCPSLFS	598865	530619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_532905_533629_533745_534850_535044_537182_537326_540958_541054_541866_541997_550108_550172_551526_551699_552261_552369_553463_553592_555373_555432_556367_556449_557255_557316_561643_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_580082_580126_583012_583057_598737
904638	contig_2069_pilon	-	2990	2	Intergenic	novelGene_23197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACAAATGTTTACTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107925	91143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_91970_105761
904639	contig_1735_pilon	-	4035	2	Intergenic	novelGene_106906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTGGTTTCTCTCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196096	191937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_194936_195059
904641	contig_4659_pilon	+	2629	4	Intergenic	novelGene_118224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	14.6590889515307	256	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	167	823	791331	797532	FALSE	35	TGAAAAGCCAATCTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVPYEETAVMGLQKFHKPLATFFFANHTIQIRQDWRQLGVAAVVWDAAIVLSAYLEMGAVELRGCSAVELGAGTGLVGIVAALLGAHVTITDQKVALEFLKSNVQANLPPHIQPKAVVKELTWGQNLRSFLPAEFDLILGADIIYLEETFTDLLQTLEYLCSDHSVILLACRIRYERDNNFLAMLERQFTVSKVHYDPGKDVHIYKAQRKNQREDL	790251	799338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_790385_791297_791478_793137_793250_797134
904642	contig_6017_pilon	+	3816	1	Intergenic	novelGene_152558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	448	1347	494	1840	468946	470292	NA	50	ATTCTATTAAACCAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFRIYKRKVLILTLVVAACGFVLWSSNGRQRKNEALTPPLLQDAELARGTGGRGGEHSAVSVGIRRVSNDSAAPLVPAAPQPEADNLTLRYRSLVYQLNFDQTLRNVDKSGSWAPPELVLVVQVHNRPEYLRLLLDSLRKAQGIDKVLVIFSHDFWSTEINQIIAGVDFCPVLQVFFPFSIQLYPNEFPGSDPRDCPRDLEKNAALKMGCINAEYPDSFGHYREAKFSQTKHHWWWKLHFVWERVKILRDYAGLILFLEEDHYLAPDFYHVFKKMWKLKQQECPECDVLSLGTYTASRSFYGIADKVDVKTWKSTEHNMGLALTRDAYHKLIECTDTFCTYDDYNWDWTLQYLTVSCLPKFWKVLVPQVPRVFHAGDCGMHHKKTCRPSTQSAQIESLLNNNKQYMFPETLIISEKSTVAALSPPRKNGGWGDIRDHELCKSYRRLQ	468452	472268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_468500_472300
904643	SIRV6	+	1061	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	398	351	182	143	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	142	633	1733	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1485	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
904644	contig_1406_pilon	+	8823	25	Intergenic	novelGene_25478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_22	71.819362523858	411	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	976	2931	133	3063	1338625	1426352	FALSE	15	ACTTTGTGTGATTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEYKKDELLEAARSGNEDKLMALLTPLNVNCHASDGRKSTPLHLAAGYNRVRIVQLLLQHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRVEVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKTLALEIINFKQPQSHETALHCAVASLHPKRKQVTELLLRKGANVNEKNKDFLTPLHVAAERAHNDVMEVLHKHGAKMNALDSLGQTALHRAALAGHLQTCRLLLSYGSDPTVISLQGFTAAQMGSEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLCSPQNVNCRDLEGRHSTPLHFAAGYNRVSVVEYLLHHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVRHGASVNVADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLKHGADPTKKNRDGNTPLDLVKEGDTDIQDLLRGDAALLDAAKKGCLARVQKLCSPENINCRDTQGRNSTPLHLAAGYNNLEVAEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVDIAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAAQKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATVVSASLISPASTPSCLSAASSIDNLTGPLAELAVGGASNTGDGAAGAERKEGEVVGLDMNISQFLKSLGLEHLRDIFETEQITLDVLADMGHEELKEIGINAYGHRHKLIKGVERLLGGQQGTNPYLTFHCVNQGTILLDLAPEDKEYQSVEEEMQSTIREHRDGGNAGGIFNRYNVIRIQKVVNKKLRERFCHRQKEVSEENHNHHNERMLFHGSPFINAIIHKGFDERHAYIGGMFGAGIYFAENSSKSNQYVYGIGGGTGCPTHKDRSCYICHRQMLFCRVTLGKSFLQFSTMKMAHAPPGHHSVIGRPSVNGLAYAEYVIYRGEQAYPEYLITYQIMKPEAPSQTATAAEQKT	1297444	1432112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1297518_1337826_1337864_1338602_1338679_1357846_1357942_1359408_1359476_1359778_1359966_1365110_1365233_1366710_1366803_1366897_1366977_1377635_1377808_1383262_1383343_1387627_1387774_1388381_1388548_1390165_1390386_1390703_1390814_1397260_1397450_1399354_1399593_1400210_1400294_1404712_1404834_1406006_1406105_1408141_1408217_1409127_1409234_1410013_1410201_1412887_1413045_1426265
904645	contig_13823_pilon	-	3536	1	Intergenic	novelGene_145271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCTTTTGTTGATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290670	287134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_287100_290700
904646	contig_5961_pilon	+	2921	18	Intergenic	novelGene_144120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	523.971795907542	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	579	1949	172953	207567	TRUE	45	ACTTGAAGAAATACAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKI	113771	213894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170370_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_206988_207561_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793
904647	contig_4105_pilon	-	1947	15	Intergenic	novelGene_21505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	752.642718176752	17	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	14	1795	137447	100151	FALSE	10	TTGCATGCTGCTGCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137460	99998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102126_102724_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
904648	contig_3584_pilon	+	3280	22	Intergenic	novelGene_108196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	90.7497368548748	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	209	2224	548868	559045	TRUE	25	ATGTTATTGCACTTCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREDGEEGIPFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAFTEDGKVDYRTEQKFADHMKKKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGSLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIVIKSGRSLLSLRVTI	548048	562764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_548159_548320_548398_548846_549003_549589_549752_549880_549989_552777_552891_554444_554583_554968_555156_555304_555491_555880_556022_556399_556511_556602_556720_556936_557045_557457_557571_558259_558469_558570_558710_558996_559138_559231_559367_559562_559689_560168_560265_561493_561616_562279
904649	contig_16532_pilon	-	2809	1	Intergenic	novelGene_110043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTGATGAAGAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186762	183953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_184000_186800
904650	contig_15732_pilon	+	2686	17	Intergenic	novelGene_88836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	272.504121241771	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	662	2338	85890	393829	TRUE	25	CTGGCACTCTTTGAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWRARGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQAGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQINSP	11092	398732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_85812_85909_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348875_349182_368548_368618_380802_380982_393814_393845_395326_395383_398197_398263_398520
904651	contig_15486_pilon	+	3905	2	Intergenic	novelGene_157315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	858	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	352	672	71675	71995	TRUE	10	CTGTCTGTAGCGCCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPWALGKNVYFAAVGWRVLYMSVRSDWLIVPFTSSVSLLSFFLNVLSFTENGVLKSPTIIVELSISLLSAVKVCFVYLELCHWVRRCLLWSCLHTGLSL	71323	75433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_75014_75218
904652	contig_12793_pilon	-	4331	4	Intergenic	novelGene_164106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATATTGCACTGGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149091	44252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_45811_45992_46389_67350_67440_146803
904653	contig_9833_pilon	-	3166	5	Intergenic	novelGene_68487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1207	1728	215789	215268	TRUE	30	AAAAGGGATGGGGAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	217689	197433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_197453_213605_214577_214819_216837_217104_217165_217590
904654	contig_8377_pilon	+	1786	17	Intergenic	novelGene_35082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3603.08661460473	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1380	407	1786	140932	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEDVIFISGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	131430	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140936_142251_142363_143432_143589_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
904655	contig_14275_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_162870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCCCAGAGAAAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348723	347396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_-_347400_348700
904656	contig_6270_pilon	+	2176	7	Intergenic	novelGene_99805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_5	380.021380977439	36	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	68	1000	27433	45668	FALSE	85	ATAAAATAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27365	46844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578
904657	contig_5602_pilon	-	1997	10	Intergenic	novelGene_133016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	116.173667359063	39	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	440	1294	508819	488176	FALSE	20	CTACATCATGTTGTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516385	487472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_508816_509046_511996_512153_516328
904658	contig_12677_pilon	+	733	2	Intergenic	novelGene_110875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3372_3452
904659	contig_16121_pilon	+	3670	3	Intergenic	novelGene_6882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	922	junction_2	172.5	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	439	1434	57746	59407	TRUE	5	CTCCTTGATTTTTCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQVNL	57307	63353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_58202_58867_60856_62565
904660	contig_5961_pilon	+	4183	19	Intergenic	novelGene_144118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	479.009023987783	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	1483	3174	197721	211220	TRUE	40	GGGAAATGACAGGGCAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYVSPKDFKITIGKINDQFAGYNQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRHKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTLHVFVSAIGVHK	113767	214780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197889_201775_202352_206906_206988_207371_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211138_211181_211234_211817_211961_213793_213927_214060
904661	contig_13067_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_141338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44110	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44100
904662	contig_3397_pilon	+	3086	17	Intergenic	novelGene_154576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	311.580841987677	7	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	659	2575	172428	206594	FALSE	15	ATGCTCTATTTTACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLPPRTSHPVVKFSCTDCEPMVIDKLPFDKYELEPSPLTQFILERKSPQTCWQVYVSNSAKYSELGHPFGYLKASTALNCVNLFVMPYNYPVLLPLLDDLFKVHKAKPTLKWRQSFESYLKTMPPYYLGPLKKAVRMMGAPNLIADSMEYGLSYSVISYLKKLSQQDLKPQTFRNAYDIPRRNLLDHLTRMRSNLLKSTRRFLKGQDEDQVHSVPIAQMGNYQEYLKQVPSPLRELDPDQPRRLHTFGNPFKLDKKGMMIDEADEFVAGPQNKHKRPGEPNMQGIPKRRRCMSPLLRGRQQNPVVNNHIGGKGPPVPMTQAQSDLIKPLPLHKISETTNDSAIDDVVENHVADQLPSDITPNAMDTEFSASSSPASLLERPTNHTEALGHDHLGTNDLTVGGFLENHEEPRDKEQCAEENIPASSLNKGKKLMHCRSHEEVNTELKAQIMKEIRKPGRKYERIFTLLKHVQGSLQTRLIFLQNVIKEASRFKKRMLIEQLENFLDEIHRRANQINHINSN	125302	207105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_125393_126209_126360_142138_142229_151575_151799_172322_172507_178078_178205_180374_180530_184563_184717_184849_184983_185905_186001_189048_189160_193146_193274_194048_194192_195499_195732_203393_203769_204799_204894_206500
904663	contig_5331_pilon	+	647	1	Intergenic	novelGene_112842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTAAACCCTAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791984	792631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_792000_792600
904664	contig_2069_pilon	-	2315	8	Intergenic	novelGene_23219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	111.348506033617	320	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	112	552	218699	190760	TRUE	20	TTTTGTAGTAAGTTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYRNPGPSGPQLRDFNSIIQTCSGNIQRISQATAQIKNLMSQLGTKQDSSKLQENLQQLQHSTNQLAKETNELLKELGSLPLPLSTSEQRQQKLQKERLMNDFSAALNNFQAVQRRVSEKEKESIARARAGSRLSVRLEPDAKPGG	218810	182952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_184493_186018_186102_186863_186937_190692_190792_196222_196365_201208_201309_202852_202923_218602
904665	contig_8820_pilon	-	3290	18	Intergenic	novelGene_79268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1197	1535	103655	102607	TRUE	15	ACCCTCATCTCCTTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSGWLALYCATLRQAWCSMEKSEPRQRSRVRSMMCSSLNACSKALVTRPLDVKYGCMMVAASLWICSIGDAASSPSSSLPLRLRCASSSPSSRGDAAQPGQEVVEDHVRA	109358	94557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_94660_94748_94948_96338_96624_96866_96966_97623_97787_98950_99195_99342_99498_100843_101105_101242_101400_102516_102744_103453_103685_104013_104157_104408_104645_104737_104938_105020_105150_105611_105773_106759_106925_109225
904666	contig_10904_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_22736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	405.922637333766	666	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	59	1189	662714	652299	FALSE	15	CTGTTGTTGAATTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662772	651947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662665
904667	contig_9098_pilon	-	1818	8	Intergenic	novelGene_75837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	144.378894947019	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	502	1371	345261	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	347422	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957
904669	contig_4426_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_15439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAAACACAAATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821492	905069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_821944_868806_868955_881692_881834_887174_887380_889993_890139_895571_895641_904482
904670	contig_14744_pilon	-	2740	6	Intergenic	novelGene_66135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	17.7155299102228	8	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1148	1960	1591737	1588029	FALSE	25	AGTTCAGCTGAGCCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1592884	1587248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677
904671	contig_8377_pilon	+	5005	29	Intergenic	novelGene_34974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	3524.7834647272	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	903	2712	156	2867	68257	192233	TRUE	20	GATTCTGCTTCAGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSGPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQLLET	68101	199248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189212_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
904672	contig_7333_pilon	-	2584	6	Intergenic	novelGene_142820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	54.4058820349418	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	173	2221	406076	394458	FALSE	35	CAGGGAGAAATTGTGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEHLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGFPFPKSGVVSRPEQGEPWILDPLVSKERELPRGSHTGEGRMPADLLPSRSERRSWVEQDHWGFEDENVAGVHWGYEETKTLLAILSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATPQDSDSSSAPVLFRSPGGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407207	394094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_402472_403175_405092_405298_405761_405797_405838_406195_407153
904673	contig_15182_pilon	-	2339	11	Intergenic	novelGene_136439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_10	76.5412307191359	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	121	1626	658646	248833	FALSE	80	ACATTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAMRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPRASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRYHPQETLKEFVQLVCPDAGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSAEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQQTQSWYLG	658766	248119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_248851_282913_283006_306829_306996_309310_309490_332396_332526_359304_359433_367659_367778_387446_387522_450766_450833_647577_648110_658643
904674	contig_11448_pilon	+	2053	2	Intergenic	novelGene_66421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTACGGTTCACTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556814	712842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_558581_712555
904675	contig_5083_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_151677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	313	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588811	586513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_586500_588800
904677	contig_9561_pilon	+	3092	1	Intergenic	novelGene_100854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	411	725	131745	132059	NA	35	AGAAAGCTACACTGATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPQRLARPLWAGLLRMLMSCSRAFYSAPGIRCSAFWALPGHRETWSTDRRIERRPSSARSLILQPALGATYSGPSGTGRGSSVQGSSPRPALGQRFDFPWPR	131334	134426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_131300_134400
904678	contig_10434_pilon	+	3445	17	Intergenic	novelGene_82022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	33.9313990832975	40	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	372	2315	118516	132340	FALSE	25	CAGACTCGGCTATGTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYHTHFLYCVRAPTSLNDTSLLHDPCLGTFGGPVFPWLVLGGYDEQNYNNATALVITFPVSNYYNDTEKLQRAQAWEREFINFVKSYENPNLTISFTAERSIEDEVTRESNSDVFTIVISYAVMFLYISIALGHIKSCNRLLVDSKISLGIAGILIVLSSVACSLGIFSYIGIPLTLIVIEVIPFLVLAVGVDNIFILVQTYQRDERRQGETLDQQVGRVLGEVAPSMFLSSFSETVVFFLGGLSVMPAVHTFSLFAGMAIFIDFLLQITCFVSLLGLDIKRQEKNRLDILCCVRGADDGTSVQASESCLFQFFKNSYSPLLLKDWMRPIVVAIFVGVLSFSIAVLNKVDIGLNQSLSMPDDSYVLDYFKSLNRYLHAGPPVYFVLEEGHDYTSLRGQNMVCGGTGCNNDSLVQQLFNAAELDSYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVSNITNQFCNASVIDPACVRCRPLTPEGRQRPQGKDFMKFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILGNNTSVGATYFMTYHTVLQTSADFIDAMKKARLVASNITKTMGINGSNYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTFVLLGCELWSAVIMCITVAMILVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSTKGSRVGRAEEALSHMGSSVFSGITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGVTHGLVFLPVLLSYVGPSINKAKSSATQERYRGTERERLLNF	110365	133470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_110400_113090_113192_117117_117221_118382_118573_119146_119330_120099_120215_122944_123073_123175_123317_124484_124575_125013_125205_125544_125661_126692_126823_128279_128481_129476_129709_130607_130722_131445_131609_132257
904679	contig_8773_pilon	-	2767	1	Intergenic	novelGene_74516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1437	1838	29392	28991	NA	40	CAGCACAATTGGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIAFDPAVPLLGIYPREIRFVTQIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	30828	28061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_28100_30800
904680	contig_9548_pilon	-	5001	3	Intergenic	novelGene_141075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	153	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGCTGGTTTCCTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392885	218878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_219645_288322_289865_390192
904681	contig_18850_pilon	-	3046	7	Intergenic	novelGene_142434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182303	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_177108_177565_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513
904682	scaffold_12124_pilon	-	3211	3	Intergenic	novelGene_22108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1996	junction_1	249.5	7	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	102	884	899419	895096	FALSE	55	GAAAAATCAGTCACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGVVSYPFDTVRRRMMMQSGRKGGTCAAGGDRGEREG	899520	892768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_895281_895908_896396_899308
904683	scaffold_12124_pilon	+	4824	12	Intergenic	novelGene_22094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	202.033791462126	129	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	934	1299	879089	894124	TRUE	20	TTAATCGTTGCGTGAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRSRMTPVTHHSGIQLS	860128	897933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860365_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_894078_894711_894994
904684	contig_9836_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_176155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACCAAGGTAGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22936	24176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_22900_24200
904685	contig_13379_pilon	+	2920	9	Intergenic	novelGene_175872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	25.9563937210083	208	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	17	1768	154277	192750	FALSE	45	TTCATACCTGAAACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACSVGLLTRVPLCAQGRGQVHRPICRLLSCPGTVAADLKREEQPSGNVGTGSEDSVLQKRFSEVQKERREEAQRTVLISCPNKISEKKFLKYLSQHGPINNHFFYESFGLHAVVEFRQKGSVASLQDAACTPSLGTEAAVPFRSRFFSVKLKNPSTSEKSSVQRSSQSPPSSKKLFELLCYAESIDDQLNTLLKASQVTEENAKLRQLTCSLIEDIAAAYFPYCTVRPFGSSVNSFGKLGCDLDMFLDLDETERLNAQKTSENFRMEFQVKNVPSERIATQKILSVIGECLDHFGPGCVGVQKILNARCPLVRFSHQASGFQCDLTTNNRIALKSSELLYIYGALDSRVRALVFSIRCWARAHSLTSSIPGAWITNFSLTMMVIFFLQRRSPPILPTLDSLKTLAAAEDKCVIEGHNCTFTSDLNRIKPSGNTETLELLLKEFFEYFGNFAFNKNSINIRQGREQNKPDSSPLHIQNPFETSLNVSKNVNQSQMQKFVDLARESAWILQQEDKDRPSPSSNQPWGLAALLLPSVSNSRSLAKKKGKKPASERIKNLLDSIKSNNTENSINTSGKRTISTQA	154260	193902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_154434_168316_168490_168954_169183_172628_172854_176087_176300_178947_179175_189771_189865_189945_190020_192387
904687	contig_8898_pilon	+	2866	2	Intergenic	novelGene_137245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	419	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGCAATTAAACAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302199	305222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_303816_303972
904689	contig_19769_pilon	+	3381	2	Intergenic	novelGene_102241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	0	25	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	296	970	32424	33098	FALSE	10	CTGCCTGCAGTTGATGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVVGAATPYLNLPSDGHSGRVSFLGAQLPPDVAAMPQLLGELDRSTFRKLLKLVVSSLQGEDCREAVQHLGASVGLPEERLGTLLAGVHTLLRQALRLPPASLKPEAFKNQLEELCIPQDLAGDLASVVFGSQRPLLDSVASQQGAWLPRVANFWWRVDVAISTSSLARSLRPSILMQLELSDGSAHRFEVSTAKFQELRYGVALVLKEMADLEKRCDRKLQD	30973	35509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_31210_32364
904690	contig_3018_pilon	-	6568	3	Intergenic	novelGene_78810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	894	467	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2295	2603	562844	561331	TRUE	15	TGTCTTAGTTCAGTTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMVSWEISSCLMLLLGLSDSCSSRSNCCCHYVDFYCSLSEVSTFESLMCH	565138	526466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_526545_557443_561574_562778
904691	contig_1450_pilon	-	2975	22	Intergenic	novelGene_27348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	41	979	355898	349016	TRUE	40	CCACCTCAATACACACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVLVPGQDLEGSHDLVCRICVSRLTRHKVDEGLECHYPQAVGIHDAHDAGKLCLSLGVVANIITQADEAGFELLGTQRAGVIPVKVVKGGPELVHLLLADALGVPGQDLVLHLIDGPGDGGEELFPAHADVLHSVVGVLVVEDERLLDELVVTLQLVDLWLVVDNALLVLPQVAELVLQGPVHLNGDSSDLLHLRLDPGPYDVGLGPKLLA	355938	243338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_243480_244445_244529_308886_309013_315774_315877_322453_322541_324995_325084_325652_325733_329046_329127_331945_332038_339442_339534_340844_341074_342471_342611_345690_345846_346444_346546_347006_347150_348035_348220_348940_349077_350343_350524_351264_351413_352391_352470_354166_354328_355587
904692	contig_18804_pilon	+	2124	12	Intergenic	novelGene_163795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	84.8442423181765	211	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	550	1800	43147	59010	FALSE	15	TAAATGCCCCTTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAKEELESVLEDEAEDFPTFGDSQSDYDTIVHPFYAYWQSFCTQKNFAWKEEYDTRQASNRWEKRAMEKENKKIRDKARKEKNELVRQLVAFVRKRDKRVQAHRKLVEEQNAEKARKVEEMRRQQKLKQAKLAEQYKEQSWMTVANLEKELREMEAQYGKEFGDGSDEDEVEEQDPRVRQDGKDSDEAEDAELYDGLYCPACDKSFKTEKAMRNHEKSKKHREMVALLKQQLEEEEENFSGPQTDENTLNAISEEEVEDSPKQKLSKKQKKKRQKPAQSYDDNFNENETGGGVTVNSEDRNLNQNSAKELGDSPQENIIVTETSEQCDDPKSETKSVPKPKGKKAKDMKKPVKVSVEPQTMGDVLISCTTCHDEFPSRNKLFEHLKATGHARALSSSSLNSVASSRSKKEKRRNR	29347	59334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_29646_40614_40709_42543_42668_43113_43237_43677_43983_45095_45248_46995_47084_50054_50214_50781_50825_54393_54567_58228_58305_58845
904693	contig_14519_pilon	-	1420	4	Intergenic	novelGene_66818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_1	50.1087705785014	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	7	318	277984	270622	FALSE	35	TAAAACATTGGTTACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAMITVHTPRRGLIDVKPLGVIWGKFSEFYSKKNTIMFDDIGRNFLMNPQNGLKIRPFMKAHLNRDKDKELLKLTQYLKEIAKLDDFLELNHKYWERYLSKKQGQ	277990	269519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275483_277945
904694	contig_8012_pilon	+	3892	1	Intergenic	novelGene_177967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	618	1857	67	1923	213107	214963	NA	25	CTGACTATGCTATCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLAVRDPAMDRSLRSVFVGNIPYEATEEQLKDIFSEVGSVVSFRLVYDRETGKPKGYGFCEYQDQETALSAMRNLNGREFSGRALRVDNAASEKNKEELKSLGPAAPIIDSPYGDPIDPEDAPESITRAVASLPPEQMFELMKQMKLCVQNSHQEARNMLLQNPQLAYALLQAQVVMRIMDPEIALKILHRKIHVTPLIPGKSQSVSVSGPGPGPGPGLCPGPNVLLNQQNPPAPQPQHLARRPVKDIPPLMQTPIQGGIPAPGPIPASIPGPGSLTPGGGMQPQVGMPGVGPVPLERGQVQMTDPRAPIPRGPMTAAGLPPRGLLGDAPNDPRGGTLLSVTGEVEPRGYMGPPHQGPPMHHASGHESRGPSSHDMRGAPIADPRLLIGEPRGPMMDQRGLPMDGRGSRDSRGVDTRAMETEVLEARVMERRGMETCAMEARGMEARGMDARGMEIRGPGPTSRGPMTSGLQGPGPINMGAGGPQGPRQVPSISGVGNPGAGMQGSGIQGAGMQGAGMQGGGIQGTGMQGAGMQGAGVQGAGMQGGGMQGAGKQGGGQPSSFSPGQSQVTPQDQEKAALIMQVLQLTADQIAMLPPEQRQSILILKEQIQKSTGAS	213040	216932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8012_pilon_+_213000_216900
904695	contig_3386_pilon	-	2348	5	Intergenic	novelGene_34583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACAAAAAACGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509216	503851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_504898_505994_506119_506536_506632_507642_507738_508228
904696	contig_20602_pilon	-	1346	10	Intergenic	novelGene_133731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_9	216.29854767981	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	6	1298	29552	16994	FALSE	45	ACCAAGCTTAAAGTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVNAFYNFRFKKTNRDVKTSFEFHSFTVNMGIRKKNR	29557	16945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
904697	contig_16411_pilon	+	2661	1	Intergenic	novelGene_77281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	213	644	29736	30167	NA	75	TTATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQLVEMDTNPFPSIFFRCPGMQLFPLLALRTKAAGPLTHVCRYARHHHFKSSTNIWTSHSSLGSARMTYYISMTRLFFFSFIIFMLPNAAMYSDKSHFGQQSQSLPIVTLLKNMPTRSKYAHPEILLQFALQSLLHVLNILS	29523	32184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_29500_32200
904698	contig_12312_pilon	+	3445	20	Intergenic	novelGene_64000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	70.2573031268585	29	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	89	1576	477005	533697	TRUE	25	AAACAGTCCGTTGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSCSLGRAAVTVHRRRRGLHRRVRLPASMATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKVRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476916	536142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_526427_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152_535634_535766
904699	contig_8710_pilon	-	1561	10	Intergenic	novelGene_73505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_8	60.5146650933311	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	224	1228	302946	272139	FALSE	30	AAATCTTAGGTTTTAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRVEYASKVDENFDCVEADDVEGKIRQIIPPGFCTNTNDFLSLLEKEVDFKPFGTLLHTYSVPSPTGGENFTFQIYKAEMTCRGFREYHERLQTFLMWFIETASFIDVDDERWHYFLVFEKYNKDGATLFATVGYMTVYNYYVYPDKTRPRVSQMLILTPFQGQGHGAQLLETVHRYYIDCPSVLDITAEDPSKSYVKLRDFVLVKLCQDLPCFSREKLMQGFNEDMAIEAQKKFKINKQHARRVYEILRLLVTDMSDAEQYRSYRLDIKRRLISPYKKKQRDLAKMRKCLRPEELTNQMNQIEISMQHEQLEESFQELVEDYRRVIERLAQE	320502	271805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_272307_278084_278202_280875_281028_285950_286058_286370_286476_286975_287098_287395_287576_302892_303014_318175_318281_320451
904700	contig_16205_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_156891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115525	113429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_113400_115500
904702	contig_10855_pilon	+	3584	7	Intergenic	novelGene_124386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	32.2748612183951	83	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2549	3088	901784	902323	FALSE	30	GCAACATTTATGGTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNIVKNENSKTIVLMRNLYIDQEEVVQTKQGDTVWFKVRKGVHQVCILSPYLFSLYAEQIFQEAGLYEEDRGIRIGRGLINNLWYADETTLLAESSEDLKHSLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGSISNIMINGEKIEVVKDFILLGYTIYAHGSSSQEIKTMHCIGHICCKRPI	819253	902819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_819352_826613_826680_832510_832638_833903_834085_834439_834649_840704_842196_901407
904703	contig_5423_pilon	-	5083	11	Intergenic	novelGene_85268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	240.588216669063	253	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	136	1089	573204	549436	TRUE	45	AAATGAGTAGTAACATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTGLFLLSVIKTCHNREKK	574276	543784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_544523_545684_548892_549386_549489_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172
904704	contig_10019_pilon	+	3357	1	Intergenic	novelGene_86705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGATGACTGGCTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441513	444870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_441500_444900
904705	contig_6740_pilon	-	2145	3	Intergenic	novelGene_142695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTACAAAGGCTGTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733714	634422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_635294_732092_732864_733211
904706	contig_10627_pilon	-	3511	19	Intergenic	novelGene_59960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	152.777090907547	87	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	795	2388	136	2523	203559	180958	TRUE	10	CCTGTGGATTGTTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGERGARRDGARAARTLGGGILPASAVVAAAAIVPGFCEITIDTMNWNKGGPGMKRGFGFGGFAISAGKKEEPKLPQQSHSAFGATGSSSGFGKSAPPQLPSFYKIGSKRANFDEENAYFEDEEEDSSNVDLPYIPAENSPTRQQFHSKPADSDSDDDPLEAFMAEVEDQAARDMKRLEDKDKERKNVKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPSKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENTDRGNNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTGSAQQGHNSPDSPPRQCCQEHTRLWQYWEHQQCSSDLPFCWSPRSQQHSSRE	218214	179631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_180149_180486_181231_182484_182587_183788_183900_185313_185541_186296_186574_187310_187409_187937_187986_188571_188672_189224_189354_190018_190196_191051_191172_192804_192910_196550_196701_197548_197586_199009_199072_200796_200948_203338_203575_218094
904707	contig_3797_pilon	-	3107	1	Intergenic	novelGene_120094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTATTGGAAGATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366766	363659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_363700_366800
904708	contig_17074_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_145164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1170	1553	555180	555563	NA	20	GGGAGTGTTGCCCAGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHIGSNRLKGLLGAAVCHGDSHSPVLSLHFPMEVASEGIWCHPELKNSGIPGVEMGHLRAWAHCSGSDDQPQGPVRPSLGSDHKWEQNSQGVLLLGFVYCLGAGNILNCCVWGGRGKITKYKKAAS	554010	556143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_554000_556100
904709	contig_4751_pilon	+	2994	15	Intergenic	novelGene_173718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	106.100669370256	243	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	594	2225	160725	224948	TRUE	35	TTATTGTATTATTGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKRENLSPTSSQVIENSQDSPVNSLCLSPLNVSHDTSCSDESFAGVLHSSFDICGNSRRRNQEVKLGGLINDIGGGICMSSPVSKTSSTHSSASCSHLNKLTPQRPMNKLSEEKLNWQGDIVGETVTPDKKQSEGMSEEMLDEKCSLSPVLSTTEGHSLVHSRPSSSFAKRRRTSGYLHSPPKEKLKKKKYSTKSSLPKWQLFKSENRPQLMTKSVTETPDCGESSYDDYFSPDNLKERNSRSLLSDFQLSSNLVQFNSRSLSKNERGSILKMSDFSFMGKKSIPVDITDLTAKTSSSLQTPTNDEGNTTLSFMTSKEACTAEETPRDCIQADPQKREGPSPEEYNFSYIFDKLVHPKESLEQGHHGNLTPLKGNTNKMKKLIEIKSIQKEEGTTSKMLNSSESETQNNYKLHVVDDCKVEKSTEEMKNSSRGYSESVENGQTSRDVLPGSYEGFKELLKPHEEPNKRSEVKKPTRTLVMTSMPSEKQNVVIQVVNKLKGFSFSREVCETTTHVVTGKPLRTLNVLLGIARGCWILSYEWV	109811	398333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_109933_112256_112349_117475_117595_153643_153732_158296_158412_160666_160759_163417_163508_172925_174117_184098_184209_217923_217962_220285_220449_224942_225078_239280_239359_373781_374020_398009
904710	contig_6102_pilon	-	2099	15	Intergenic	novelGene_32331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_12	304.767090729686	61	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	44	1786	1691438	1685481	FALSE	20	GCCCCAGCCCATACTTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRRREEEEVSGGEKMGRGTGRLTTSFFPFPGRQSPSPSCQSPPCTVTWWNFAAVPGPHPQALHAPPLQRLDSWEQHLDPSSGRCFYINSLTGCKSWKPPRRTCSRETNPGSMEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQGSRCLCGQTCRLDTSEPPPALQPPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRVIAHSDKNRMTPHNLGIVFGPTLFRPEQETSDPAAHALYPGQLVQLMLTEFTSLFP	1691481	1685167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1685653_1687190_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1690853_1690968_1691159
904711	contig_6304_pilon	-	5043	6	Intergenic	novelGene_122240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	312	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGGGTGAACGGCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159459	70255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_-_70360_73343_73423_99473_99559_128695_128849_132144_135692_158384
904712	contig_4232_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_63425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCTTATCTGCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467779	468063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467800_468100
904713	contig_11285_pilon	-	3851	7	Intergenic	novelGene_5493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	270	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3059	3370	117899	115238	TRUE	25	TTTCATTTGGTGCAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTMVSISSLHPRCTDMISILHSIGSRGNSAILRPRRVSRPSSSRAPSVYNCSMAVIKVSIGGASMKSKDSRSLMPMALRESTVLAKLVLWISGTLVVSISSR	122458	112049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_112447_115153_115315_116756_116896_117803_117932_118109_118307_118807_118989_119810
904714	contig_2342_pilon	+	1507	11	Intergenic	novelGene_132771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCCAAGGGAGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519752	547627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_519877_520187_520295_522042_522176_522363_522558_525395_525548_526403_526522_528877_529005_529094_529216_540576_540674_547075_547177_547394
904715	contig_10005_pilon	-	5511	24	Intergenic	novelGene_148901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	165.302472372317	30	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	494	3079	138325	68657	TRUE	20	TCTTTAATGTTCTGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSSPSLSNCNSVLANKIFGIPLDELQQGGHPDNEVPFIVRHVVDYIEEHGGLEQQGLFQVNGNAETVEWLRQRYDNGEEVDLVKEADVPSAISLLRFFLQELPEPVIPGSLHIHLMQLSQDYNNEDEFGRKLRFLLQQLPPVNYSLLKFLCRFLANVASHHEEIWSANSLAAVFGPDVFHIYTDVEDLKEQEVVSRIMAGLLENYYEFFENEEEDFSSNDLSSITEQVNELSEEEEEDEKLEHIEELPEEGAEKSNDMPEVVQLRMTENILEPNGVTASTSAHMSPISILPASADILERTIRAAVEQHLFDLQSSLDHDLKNLQQQSLVCNNEAGSINCDGEGSNNQVDIADGIINASESNREYSEPVASTNLDNEVMQQDFVFEDEENNQVVLSEVYEENSASKSVGILLEPCSDQGDSEDGCLERKEYLSFDSDTLSHLILESSSKIRDLNANTESEVPGGQSVGVQGEAACVQIPHLDLKNVSDGDKWEDPFPAFKSWQEDSESGEAQLSPQAGRMNHHPLEEDCPPVLSHRSLDFGQSQRFLHDPEMLDSSSKALCFARIRRSSFSSKDEKREDRTPYQLVKKLQKKIRQFEEQFERERNSKPSYSDIAANPKVLKWMTELTKLRKQIKDAKHKSSDGEFVPQTRPRSNTLPKSFGSSLDHDDEESEDESRVIQKEKKPSKEATLELILKRLKEKRVERCLPEDIKKMTKDHLVEEKTSLQKSLLYYESQHGRPVTREERHIVKPLYDRYRLVKQMLTRASITPVLGSPSTKRRGQMLQPIIEGETAHFFEEIKEEEEDGVSLSSELSDILKTAVQAQSFSSSLENSESDVEENQEKLALDLRLSSTRAASMYA	180662	64138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_66475_68560_68663_69408_69586_69679_69764_74176_74273_74500_74585_76137_76368_78256_78339_78957_79088_79734_79946_84145_84294_84711_84761_86922_86988_87768_87811_103100_103234_105086_105243_105922_105965_120369_120531_131709_131852_132123_132302_137513_137727_138168_138361_139667_139835_180371
904716	contig_9471_pilon	-	3858	4	Intergenic	novelGene_21685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2342	2671	52162	51833	TRUE	50	AACAACAACAACATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVALELRVAKAKRRNDEVKGLNRRFQRVASEDKVKYYNDMCKDLEIENQKGRTCLAFLKLKELNKKIPPRVAVLKDSMGENIKQRRKHQKKMEERHSHYTIKN	59911	50021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_50278_50596_50814_51118_52534_57941
904717	contig_6163_pilon	-	1197	3	Intergenic	novelGene_103816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	273	junction_2	142.5	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	102	347	78436	77771	TRUE	80	CAAGCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEWELALAEGITNVPWAWGCYFYFLQGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGEVPLSSLALVFL	78537	75963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77882_78301
904718	contig_1261_pilon	+	1535	7	Intergenic	novelGene_168141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	212	352	14766	16833	TRUE	20	AGGTTGACTGTGGAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLVILSLDLVSSIPLQELAYEPVLSALADFQKCLLAFLSTFLVQVLLCILRFHEALSGFLKYKVLEEEKMASVVEQINPEMTQRQKSHAFLLVHNLLESLCKKDLLFCYLTLVLL	13983	26597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_+_14070_14640_14793_14901_14998_16815_17000_17757_17907_24309_24484_25903
904719	contig_6137_pilon	-	1724	2	Intergenic	novelGene_59179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	38	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1262552	1258269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1258699_1261257
904720	contig_521_pilon	-	3180	10	Intergenic	novelGene_174727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	74.4401325451086	262	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	1522	2448	27162	14411	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVRAQPSLLAEMLRLRIGLIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQRSSTPSSPTGTSSSDSGGHHIGWGERQGQWLRRRRLDGAINRVPVGFYQKVWKILQKCHGLSIDGYVLPSSATREMTPHEIKFAVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTLLSDTEMSSLGGIIHVDQIVRTANQLFLQDQMAIGTLDTLEKDQATGVCHFFYDSAPSGAYGTMTYLTKAVASHLQELLPNSGCQMQ	30169	13678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_14582_15140_15342_16164_16219_18320_18492_23050_23170_26338_26441_27053_27184_27277_28554_28921_29056_30079
904721	contig_10861_pilon	+	1716	8	Intergenic	novelGene_39296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	171.165631682846	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	35	1378	1437804	1454668	FALSE	40	TCAAAAAGCATGTTGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGASPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437769	1455006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442938_1443023_1444871_1445010_1447273_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
904722	contig_10003_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_88150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGCTGCTTTCCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375009	376086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_375000_376100
904723	contig_15732_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_88886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTGGTTTTTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211570	209174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_209200_211600
904724	scaffold_12124_pilon	-	3173	3	Intergenic	novelGene_22149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGAAAAGTTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979136	971615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_973450_974300_974313_977809
904725	contig_9727_pilon	-	1394	1	Intergenic	novelGene_86346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATCTCTTACCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436781	435387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_435400_436800
904726	contig_3077_pilon	-	1840	9	Intergenic	novelGene_26652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACAGGGCCTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	9613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9799_11191_11476_12010_12069_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
904727	contig_4402_pilon	+	1519	6	Intergenic	novelGene_140818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	954	1277	411648	432816	TRUE	25	CACGAGCAAGTGGGGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVAKSWWYFTRISRQGLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLIVGCGSLGIIISAGCCGSAVIRVGRLRLAYTGLYLFWHTINSKE	410694	462680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_411950_432794_432885_432964_432987_440953_441042_462246_462294_462663
904728	contig_6418_pilon	+	6098	15	Intergenic	novelGene_81247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	826	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	4334	4837	1496257	1505793	TRUE	5	CTCGCGCGCCTCAGTCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDLERFLLENSFFSEGLSSSSGITCSSSSGLLSFSFPSTSGEHASFCDIISDSSFSPEISSSSERTKKASFGKLSLLSCLDGDPKEPSIFSSKSGFVSSIGRRDVLEKQVSSSSAGASFSKIGIISSVSMESVFSNIFSFLSSSITFSLMVSARSEEFSSSFFSP	1447744	1568469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1450369_1454062_1454175_1455957_1456143_1458960_1459119_1460540_1460618_1467819_1467885_1472220_1472860_1476860_1476950_1477830_1477905_1482694_1482760_1491131_1491269_1496148_1496297_1497627_1497712_1505413_1506967_1568381
904729	contig_8616_pilon	-	13502	7	Intergenic	novelGene_72603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	200	925	475107	474382	TRUE	10	AGTGGCCAGGCCCCCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSGPFRSPSTLGRGTSISPFTFGPFRLKSTSGMAILGALRCRSGILNLGPFSFASGPSIFTSGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFRCQSGPWTSTSGTSTSTLAASISTSGAFKSPSTLGRETSTSPFTLGPFRCKSKSGMEILGALMFISGILNLGPFSFASGPSTFTSGTSMSTLGPETSMSALGRFTSTFGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFKCQSGP	475306	447690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_447825_459761_459866_460229_460394_460853_461040_462005_468150_468320_468735_468950
904730	contig_9481_pilon	-	3304	2	Intergenic	novelGene_149650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2567	2968	150064	149663	FALSE	55	GATTGCAAATGAGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFRTDETAAKPRCRPHVHFQMALLACSLSSLNAGGGGQEASSASVQDWLTSGLISNSEKGQLQDLDTSCPGSSSYVSNSCLFLVTRKMDFSAHVLMKPLISFRYRNCVYTYRILPNEDKFSVQVSPLDIDI	163770	149326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_150779_161918
904731	contig_9909_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_42460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	840	1289	248275	248724	NA	45	TTAAAAAGAAACTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGAQAMIEHNSMMLESDLGTMVINSEDEEEEDGTMKRNVTSSQVQRPSFMDYFDKQDFKNKSHENCNQNMHEPFRMSKNVFPDNWKVLQDGDYDFLKNLSLEELQMLLKALDPMMEREIEELGQRYTAKRQPILDAMDVKKRRQQNF	247435	249765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9909_pilon_+_247400_249800
904732	contig_8801_pilon	+	2706	1	Intergenic	novelGene_66258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAGAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363744	366450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_363700_366400
904733	contig_10861_pilon	+	1092	4	Intergenic	novelGene_39230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.674506688621	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	46	348	603123	605721	TRUE	30	CTGCAAGGTTCATAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGNDEFLVVELLEVMVGAVALEDLLKETTYEFFEGGWMFSWVVSLAVTGNEMKRMMSYSQTRMLMSAFFCLTGDLLLLCLGGGGIRLGGVLLLGDGRLLGLGRLLGEYDLDRDL	603077	606969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605072_605190_605701_605897_606400
904734	contig_11338_pilon	-	1597	3	Intergenic	novelGene_6335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_2	53	205	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTAGAAAAATTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299034	294003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907
904735	contig_9098_pilon	-	2606	14	Intergenic	novelGene_75819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_13	155.418122815225	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	633	1502	345261	335775	TRUE	65	AATGACATACTGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355859	312789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_313368_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355700
904736	contig_2504_pilon	+	3414	6	Intergenic	novelGene_166838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGCAAAAAGCCAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255785	406016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_255874_288172_288867_318773_318990_378167_378176_400375_402559_405791
904737	contig_12790_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_35282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	988	1344	437006	437362	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFETEAAWLLVSLVSAACFLVPWPLGSLGLKPTSVLLGQVFQSSVAPPVSAQRYLTLPGSLLHTGTQLSCSMGWLQTSRWSPGSAAASSLLLLVLYYCHFIHSQFQNCFHSVGIC	436018	438546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_436000_438500
904738	contig_8636_pilon	-	3135	18	Intergenic	novelGene_141929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	364	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	2329	2937	445607	436573	TRUE	35	GTGCACTGACAAAGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHNGTRATFHCQDACHLQDDIFGRGPARQRACQLHTNHLGTLQLPGDPSHDVHCISTPDPNADAPQASPIGGVGVGADQKNPRVCIVFQNDLVNDPRSRPPEAHAILGTCSCQEIIYFLVYVLGTTKVFLTPDLGLDQVVTVDGGWHSHLGQPAADELQHGHLGRGILHGHTVRPQPQVRLAPLNLLVGWVIQVAIHNLL	457479	392433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_392467_429628_429771_436549_436808_440074_440167_445100_445261_445485_445636_446891_446997_448260_448354_449632_449740_450876_451038_451238_451312_451843_451955_452833_452959_453193_453351_454290_454484_455492_455627_456085_456207_456559
904739	contig_4469_pilon	-	4568	7	Intergenic	novelGene_21966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1366	1665	892563	892264	TRUE	65	CAAACAACACTCAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYRGLHQTESRTAMWCPATTTDCSDQDHNREFWTELEKDAEQNSSSQKKDQIYWLKGDWRNPESMAPRHPFSSPVKLPPRFTVQPGSGQPHKTKWD	915780	858425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_859182_859229_859520_859632_861054_884322_884382_891886_892777_913673_913788_914742
904740	contig_9863_pilon	+	1356	4	Intergenic	novelGene_153985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	89.6747208278652	3	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	5445	18293	FALSE	45	ATATCCCTTTCTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTDSRAAGALLARASTLHLQTGNLLNWGRLRKKCPSTHSEELRDCIQKTLNEWSAQISPELVREFPDVLECTVSHAIEKINPDEREEMKVSAKLFIVGSNSSSSTRNAVDMGKPTFNVLS	5443	19282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5571_13883_13950_15250_15336_18204
904741	contig_13571_pilon	-	2282	2	Intergenic	novelGene_128120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACACAGTGGCTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271028	219500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_221225_270470
904742	contig_10481_pilon	-	4870	1	Intergenic	novelGene_170532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATACATTGATAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80506	75636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_-_75600_80500
904743	contig_10446_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_162511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075629	1074778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1074800_1075600
904744	contig_16322_pilon	+	1282	1	Intergenic	novelGene_87544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAATACTCCATCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84816	86098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_84800_86100
904745	contig_15498_pilon	-	903	8	Intergenic	novelGene_42659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	151.989392755561	2	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	13	492	697708	688532	TRUE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEDLLEEERWQVQRPVQVARCVWCVPV	697720	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688138_688180_688391_688482_688590_688714_688735_691544_691595_692421_692509_697262_697374_697554
904746	contig_16211_pilon	-	2294	9	Intergenic	novelGene_150054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	322.151749956445	73	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	857	1444	91808	85565	TRUE	40	GTAAGTCGAAAGCATAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPGWLHSTSLCNDFLGCF	92950	73420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_73517_79619_80001_80384_80505_85311_85615_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_92147
904747	contig_5605_pilon	+	974	3	Intergenic	novelGene_143952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	1.5	36	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	54	380	465493	485358	FALSE	10	TGCACTTTGTAGTGTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTGDETATTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAAKECRRRKKEYVKCLESRVAVLEVQNKKLIEELETLKDICSPKTD	465439	485952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_465518_472975_473133_485213
904748	contig_2854_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_120907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGAAGAGAAAATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317666	1319074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1317700_1319100
904749	contig_3241_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_146404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATAAACCTTCACCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840120	838861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_838900_840100
904750	contig_3601_pilon	-	3608	3	Intergenic	novelGene_132855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1796	2101	130167	129862	FALSE	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	161687	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_131098_160555_160998_161264
904751	contig_11656_pilon	-	1799	2	Intergenic	novelGene_53943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2365	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1647	151	1797	114439	112793	FALSE	25	ACCCCTACCCCAGCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRSSSKRKSKDEEDDEDSDDVDDTPILKPVSLLRKCDVKDSSLEPDTSTPMKKKKGWPKGKSRKPIHWKKRPGRKPGFKLNREIIPVSTQECIVEPIVPIPKPGRKPKIQENEETVEPKEDLPLTEERKEEEMHVEAEEVEEGEEEDTTSSEVRAASPVDSSNSPETETKEPEVEEEEEKPRILEEQRQSEEEQQELEEQEQEEEDEVAVETNQNEDHDADDEDDGHLESTKKKELEEQSVREDVKEELGSQESFLDTNMQNSRENVKDKDETEPDSEEEQTSHETSVVSEHMPGSEDDPEEDSNTKEELIELKEEEEIPHSELDLETVQAVQSLTQEESNEHEGAYQDCEETLAACQTLQSYTQADEDPQISMVEDCHASEHNSPISSVQSHPSQSVRSVSSPNVPALESGYTQISPEQGSLSAPSMQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNNSSQSSCSYGGLSSSSSLTQNSCVVTQQMANIGNSCSMMQQNNVQPAANCNIKSPQSCVVERPPSNQQQPPPPPPQQQQQQQQQQQQQPAPQPPPPQQQQQQPQQQQPQPQQPQP	117281	112790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_114523_117214
904752	contig_1263_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_170376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTTTGAAGGGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42510	42975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_+_42500_43000
904754	contig_7457_pilon	-	4353	5	Intergenic	novelGene_31476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	176.84792195556	284	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	126	626	549396	537177	FALSE	15	GGATTCTGGTTATCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEVRLLFLLVFEQLIFHPHKGAIFLFQ	551389	533449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_537384_537938_538037_539131_539211_549279_549443_551310
904755	contig_7898_pilon	-	2834	10	Intergenic	novelGene_47644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	106.383072077711	227	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	62	1105	806466	776864	FALSE	15	TTTCTAGCCTTTGTCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSTFLISILLIVYGSFRSLNMDFENQDKEKDNNSSSGSFNGNSTNNSIQTIDSTQALFLPIGASVSLLVMFFFFDSVQVVFTICTAVLATIAFAFLLLPMCQYLTRPCSPQNKISFGCCGRFTAAELLSFSLSVMLVLIWVLTGHWLLMDALAMGLCVAMIAFVRLPSLKVSCLLLSGLLIYDVFWVFFSAYIFNSNVMVKVATQPADNPLDVLSRKLHLGPNVGRDVPRLSLPGKLVFPSSTGSHFSMLGIGDIVMPGLLLCFVLRYDNYKKQASGDSCGASGPANISGRMQKVSYFHCTLIGYFVGLLTATVASRIHRAAQPALLYLVPFTLLPLLTMAYLKGDLRRMWSEPFHSKSSSSRFLEV	824925	775134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_776936_777652_777763_778758_778959_779697_779862_780332_780440_795944_796058_797012_797092_797868_797989_806387_806477_824874
904756	contig_3825_pilon	-	3744	12	Intergenic	novelGene_77989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	84.3643220975266	544	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	216	1547	662379	650420	TRUE	25	ACAGAAGGTTATGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTATVASVGIPAAPGPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGTQSTGTQQVAAVSSVSPATPFQNAPPAVSQTPVIAVTPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPTTPIIPVVPPTPPVVKKKGVKRKADTTTPTTSAITAGRGESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILKEMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDSREYPDAQGFAADIRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPVEVPAPPRACSPGGEQGCRELPQQ	674719	640182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_641641_643236_643366_645233_645526_648675_648918_650343_650537_652713_652843_655592_655965_657774_657990_659296_659445_661244_661383_662166_662492_674616
904757	contig_6202_pilon	+	3519	9	Intergenic	novelGene_139819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	41	junction_1	51.6718915368888	208	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	1226	2599	437158	493636	FALSE	25	CCCATGTCCCTGCAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETMSKRLKLHLGGEAEMEERAFTNPFLDYEAAASAVLAAGAAEETGGARPSPTADEIGLPFHNDGKIIHSFTRRIQTKIKDLLQQMEEGLKTADPHDCSAYTGWTGIALLYLQLYRVTCDQTYLLRSLDYVKRTLRNLNGRRVTFLCGDAGPLAVGAVVYHKLKSDCESQECIAKLLQLQRSIVYGDSDLPDELLYGRAGYLYALLYLNTEIGPGTVCESAIKEVVSAIIESGKTLSREERKAERCPLLYQWHRKQYVGAAHGMAGIYYMLMQPAAKVDQETLTEMVKPSIDYVRHKKFRSGNYPSSLSNETDRLVHWCHGAPGVIHMLMQAYKVFKEEKYLKDAMECSDVIWQRGLLRKGYGICHGTAGNGYSFLSLYHLTWDKKYLYRACKFAEWCLDYGAHGCRIPDRPYSLFEGMAGAIHFLSDILGPETSRFPAFELGSSQGDIKVQKDN	435932	494556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_+_437362_469864_469983_476609_476818_477822_477971_479078_479226_486493_486677_489888_490066_490365_490439_493520
904758	contig_19402_pilon	-	4423	18	Intergenic	novelGene_80763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	20	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146715	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144221_144356_145617_146267
904759	contig_935_pilon	+	2698	4	Intergenic	novelGene_45581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1451	1912	629499	629960	TRUE	15	AACCTACCCCGTGTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVCLHKNCEVSVPGQDRDVNASDLHSELPVTVPQGHGEHTLMVLPMDGQLLMVASYSGAVIHKGPLFLPHLVQSWVRRSVKHQMNLFSILEAMPHPLEVFDGRFTHQIFIPATDAQHKILLALAFRDIHQRLLLGHLGEEALEDGVWGVIG	623009	632960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_623566_623677_623743_628669_630676_632889
904760	SIRV3	+	287	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5591	1117	3532	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	566	2	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTAACAGGTTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7535	7822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7500_7800
904761	contig_9888_pilon	-	3222	2	Intergenic	novelGene_162258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGCACCATTTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40565	37210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_40334_40466
904762	contig_6898_pilon	+	2970	13	Intergenic	novelGene_35719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1697.37304180771	3	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	107	1729	59668	125646	TRUE	45	AAAAGTTTAGGAATACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59561	127686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124800_125008_125481_126617_127415
904763	contig_9578_pilon	-	2112	13	Intergenic	novelGene_67971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_4	126.736247336304	1	97	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	55	1296	1276296	1058571	FALSE	45	GAGATCATGATATGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPREWSADLARFYTVTEPQRHRRGYTVYKVTARVVSRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEGHIQLTYFSRWSEVEDSCDSTAMERMYCAPEVGAITEETEACDWWSLGAVLFELLTGKTLVECHPAGINTHTILNMPGSISEEARSLIQQLLQFNPVERLGAGVAGVEDIKSHPFFTPVDWAALTR	1276350	1057754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1088497_1088588_1099512_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583_1251620_1276191
904764	contig_18108_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_33485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATGGCTTAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247804	245123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_245100_247800
904765	contig_9272_pilon	+	5616	2	Intergenic	novelGene_125968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	4432	5007	637700	638275	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASMFDLSMKDKSRNPFGKLKDKIKRKNKDSASDSASAIVPSVTPSADSDDESSTKDKRKKSKIKTLFSKSNLQKTPVSQSMSVLPTSKSDRVLLRPGDLPSRWEDDDNEDDSSSASDSEFLSSLTWFFFLNLAYFALREKKQTLRVCMCVRVRTHKHTKTHFEKKILIQLLVTKMMRIRMKTMGYLNLG	619888	638884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_620823_634202
904766	contig_10734_pilon	-	970	6	Intergenic	novelGene_51120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	187.469890915848	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	133	819	739047	737389	FALSE	10	GTAGACTCCCTGTTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVGSRKRSRSRSRSRGRGAEKRRKSSKDAPRSCSASRSQGRKASTASGAEGRSKHKARRRPRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRRKHKDNKRKKKKKRKKKLKKKDREKAKAQQAEALPGPSLDQWHRAAAEEEDGPVLTDEQKSRIQAMKPMTKEEWDARQSVIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHREINKQATRGDGLAFQMRAGLLP	739499	737237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_737446_737526_737597_738019_738138_738215_738501_738890_739053_739372
904767	contig_19012_pilon	-	3275	17	Intergenic	novelGene_159469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1612	2004	75395	71247	TRUE	65	AGAGGAAGGGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCKSLVSFSISVLQRCRQPSSTESSSSVMCLGAGCMGRSGGIRDCVNGLCIIDLDEMAVIAGDVPGSSEEGAPCGSAVLGNVCDGMEPLGGELASISSTGEVQTGLLEANSNAYCRTSTKGNRLGPEP	87086	5305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_5378_8424_8578_21348_21471_36885_37046_41925_42016_50662_50801_55914_55994_58185_58258_63389_63539_69243_69366_69757_69861_71235_71398_71996_72221_75377_75451_76138_76366_77783_77985_85958
904768	contig_366_pilon	-	2987	1	Intergenic	novelGene_51600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10823	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTTACAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767061	764074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_764100_767100
904769	contig_5423_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_85292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGAAAACAAACAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582145	584320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_582100_584300
904770	contig_709_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_57610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	1091	1678	2396693	2396106	NA	10	CCTGACTGTGGCGGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLLMGSAITVPSQPWAIIKVTQLCRKNPHKVRQKTNRNSSEKRSPWFCKGESLGKLKQRLSQDDQTFQKGARPVNVPGSTPVPAQAPLEHGGRGSSWTRGEARGAQQLSCTEPGQTQPCASCWPRSGLFQERKSLRKRTAAAKSVAKRQKTRKRPEFGILCSSQKRIIIIISPLGFARASSSINISPLLDQLK	2397783	2395324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2395300_2397800
904771	contig_10011_pilon	+	2272	6	Intergenic	novelGene_68073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGGAGGGGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277684	283837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_277793_277973_278085_279706_279830_280155_280255_280937_281131_282199
904772	contig_9121_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_134455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCTAGTATAAGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158533	156833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_156800_158500
904773	contig_1637_pilon	+	1672	1	Intergenic	novelGene_142394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAGACCAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724446	726118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_724400_726100
904774	contig_3424_pilon	-	1533	2	Intergenic	novelGene_55455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1229	1531	37615	37313	FALSE	30	GTAAAACTCAGCGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPKDAIPSLSECQCQICVEILIEPVTLPCNHTLCNPCFQSTVEKASLCCPFCRRRVSSWTRYHARRNSLVNKELWEIIQKYYPEECKLRACGQESQEIG	41061	37310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_38235_40452
904775	contig_10042_pilon	+	3397	2	Intergenic	novelGene_79160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	363	1259	709724	734806	FALSE	10	TCTTGATGGATTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIYGINRIQTVSNNAQTREDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLAPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLKIDISFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAERWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMKYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSELSQSQKDKYCMRSLL	709361	736944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_709815_734000
904776	contig_6445_pilon	-	3049	1	Intergenic	novelGene_77058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1698	2024	665317	664991	NA	80	AAAAAAAAAAAAGGAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSITSYKTITLYLFLIILVLFLLPAAHFHLDVAPAPETQLTVFLPNQSPLSISCFSGQLRSSRNATLVIIFDRLPFVPDFQSAVSMTSLSPAASRVYFLIKTPKAVG	667014	663965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_664000_667000
904777	contig_4336_pilon	+	3942	1	Intergenic	novelGene_152372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397541	401483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_397500_401500
904778	contig_7909_pilon	-	4402	2	Intergenic	novelGene_155910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1913	2494	483704	483123	FALSE	40	CAGCACAATTAGAAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMAPIGVQIKTQDNSPVEENALEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGGENRKRREDH	486209	481214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_485156_485748
904779	contig_4888_pilon	+	3492	6	Intergenic	novelGene_178800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2481	2888	779964	780371	FALSE	50	GGAAATAGCAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAANSHLSIITLNVNGLNAPIKKQTVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQTNNYQKRAGVAILISDKIDFKMKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYTPNDRAPKYIKQTNNTEKRN	245477	780975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4888_pilon_+_246459_328368_328422_481453_481877_593116_593673_595525_595724_779694
904780	contig_12125_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_76252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	406	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634963	632105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_632100_635000
904781	contig_6206_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_168147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTATTCCTTTCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2023	4062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_+_2000_4100
904782	contig_15325_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_157163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTTACAACAACGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75428	77493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_75400_77500
904783	contig_10581_pilon	+	2254	1	Intergenic	novelGene_41398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATTAACCCAATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608503	610757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_608500_610800
904784	contig_10331_pilon	-	2620	2	Intergenic	novelGene_54182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATACAAAAGTACAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600733	594326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_595067_598853
904785	contig_5999_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_45604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAGAGCTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64867	67106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_64900_67100
904786	contig_854_pilon	+	3469	15	Intergenic	novelGene_36621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3742.16113485024	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	167	2146	1702628	1715076	FALSE	10	GTGCTACATGCGTGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGGAALQGAAGQAHGHAEEHQPQLRPLHHPQQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDLL	1692683	1716399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692779_1702556_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713140_1715067
904788	contig_13244_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_86956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAATCTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291801	293974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_291800_294000
904789	contig_4783_pilon	-	1284	2	Intergenic	novelGene_108335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAACTTGAAATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26420	25067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_26029_26097
904790	contig_4131_pilon	+	3388	8	Intergenic	novelGene_127836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	106.933509762862	27	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	2380	3261	91522	97745	FALSE	55	GAATATAAAGACTGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYESEGIDDKANKRMEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85375	97872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_87694_90262_90438_91474_91571_93167_93329_94308_94332_94426_94540_97209
904791	contig_2323_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_151859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	82	366	154150	154434	NA	30	TAAACTTCTCTTTGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDYNLQYGLHLNIKKTKILTTGPISHVMINGEKIEVVRGFVLLGSIINTCGSSSQEIKQHIALGKSSAKDLFKGLKSKDATLRTKVHLTQAIVFSFTTCACESWTVNKEGQRRIDTFELRC	154068	155430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_154100_155400
904792	scaffold_13505_pilon	-	2902	10	Intergenic	novelGene_111531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_9	413.351821569788	390	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	3	1151	603270	595273	TRUE	5	CCTCATTTTCTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQREHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603272	588572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
904793	contig_9335_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_147455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTCAGTTTATGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548774	551135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_548800_551100
904794	contig_14472_pilon	+	4275	22	Intergenic	novelGene_111172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_14	113.43662759764	284	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	268	2715	348317	383754	FALSE	50	AAAAAAATCTCCTTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRNHCPHLDSVGEITKEDLIQKSHGACQDCKVRGPNLWACLENRCSYVGCGESQVDHSTIHSQETKHYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGAQPSLPHVRQLHPTQENSVQDFKIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEVEEEDELKARGLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELWHKSRPGFVVPTNLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEELKEQVMEIEEDTHAVTTEESMEEDQSQSDIDFQSCESCGSSDKAENENGSRGFSEDNNETTMLIQENENNSEMSKDWQKEKMCNKINKINSEGELDRDSVSETVNLNNQETVKVQIHSRASEYITDVHLNDLSTSQILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLASTHKKAQSASSPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIIKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYVKRFVVSCVPSWFWGPIVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQKFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGGVPPRKASYIEDLVLMLPQNIWDNLYSRYGGGPAVNHLYICHTCQIEAEKTEKRRKTELEIFIRVKKVMIFKLLSRIK	317689	385314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_317800_346890_346997_348265_348398_348572_348627_349053_349117_350953_351107_356818_356922_359568_359639_362186_362301_364657_364737_368352_368765_369622_369764_375655_375772_377265_377439_377535_377631_378279_378314_379351_379398_379974_380156_380607_380735_381414_381585_382668_382751_383600
904795	contig_10082_pilon	+	2830	1	Intergenic	novelGene_63839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	92	589	45082	45579	NA	25	AATGTATTCTCTCATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNICKHSSIIGTWNVRNINLGKLEVIKNEMKCININILGITELKWTGIDHLESDNHMVYYAGNYKLKRNGITFIVKKNISRSILKYNAVSGRMISICLQGRPTNMTIIQIYTPTTNAKDEETEDFYQLLKVETDQTCNQDALIITGDWNVKLGNKEEGSVVRKYDLGDKYNAQITTEFCKTNHFFIANIFFSTT	44990	47820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_45000_47800
904797	contig_3956_pilon	+	2293	11	Intergenic	novelGene_14907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	83	1588	1281682	1290310	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKLHG	1281599	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287424_1290297
904798	contig_7333_pilon	-	3404	6	Intergenic	novelGene_142816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	63.4570721039034	75	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	1057	2976	403052	394458	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPADLLPSRSERRSWVEQDHWGFEDENVAGVHWGYEETKTLLAILSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATPQDSDSSSAPVLFRSPGGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407651	394029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_402472_403141_405092_405298_405761_406195_407321
904799	contig_5936_pilon	+	2611	5	Intergenic	novelGene_53549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCTAGAGCACAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98133	165842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_99706_115786_115931_127576_128085_136060_136143_165537
904800	contig_17127_pilon	-	4017	17	Intergenic	novelGene_168304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.371210799764	434	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	169	2442	93830	69582	TRUE	35	ATATGCAAGATGCTATACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAETPASGANDAPAESAPDVKRAGKDGEKKSQKEKPPPASVPASRDHGQEADTKDKMALPGGKAGESKKAQPEDRKKPEESGRARAKAVKNAKEQRNQDACACEVESTLSPGEGIMVYFHAIVSKDFSFNPNQHRVLIRGGEEFGKPPWNRNVCEMSYTKDLGEYGSLLEGFAFISKQNLDKPIPYKYVIAYTKDSEEYEFIYKRQQKEGEYVNRCLCIRSSLLGSGDWHQYDDIICMKPPGKIQRFWDHVTDGTRKSLVRGKQIAARVMLDSIFSILQTWNAINLKKFFTQFKQFYSVVREPTVYEGGPQTWSSFLKYGETEVKKDLWHYLKEKMDLFLQRNSEEHPPEHWPVRSGLRMGLIVLFAMEEFALPMSDADLSSLCYLLCVSASSPDPLHRDLQPVFETSRSWRRYLVNLCGRCMYPSKDCWVLTLPVLHHCMGLAPQGKDIPPEDTWAALEGLSFSQFREERSDQNQLLQLMESNQHLLNVDGCLFRSWFSLLPLRDLADYMRTLVPYLAASPAHFLDCFLGVYYRLRGLYKISHRNLENIEKALKMLLHLLEADLNTVPVEPFLQSYLTVCLNLHETICKITKNPKFSEMPALSAEIVCRIVSLQPVVDWAEMHGSEIGKKDSVKMVFQGALTATRSWLQRIFANKMFQSSHPSGVSFRYPEEVEVWRRLVEIHFPVEHGWKKALLGDLEGRLKQERPLLQIAAYCSTGWDASGLDDSVAKSFEKCVIEAVSSACQSQTSILDGLSPYDLRKFGKLVSAVITKSWPVNDGEAVDDVDEVLKHLLTGPDVKQLFKLYGVWDGQE	94839	66780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_66994_67932_68604_68890_69786_72709_72833_73558_73649_76030_76202_81044_81199_83646_83703_84601_84825_85441_85634_87090_87351_88022_88310_91964_92168_92523_92683_93678_93852_94437_94561_94815
904801	contig_14925_pilon	-	4526	1	Intergenic	novelGene_55363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGCTATATCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120866	116340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_116300_120900
904802	contig_6707_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_167040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	1809	2147	142062	142400	NA	20	CAATACGTCGTTTGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPTYVRGSLPILSSEEHSGSTSSKTGMFVLLAVHGIFNILRQHHNSKASILLRSSLSILQFSHAYKMTENIMTWVRRTLVLKVTSLLFNTLERSFAADLTN	140253	142401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_+_140300_142400
904804	contig_7045_pilon	-	3197	2	Intergenic	novelGene_77469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383627	379716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_380558_381271
904805	contig_8550_pilon	+	1710	12	Intergenic	novelGene_72368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	26.872825685636	84	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1176	534	1709	164974	184011	FALSE	50	TATTTTATAAGTATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPNINWKDIMKVDPDDLPRQEEVADNLLIFLSKVEINEIKSESQESLIHLFRVTQSLMKMKAQEVELALEEVEKAGEEQAKFENQLKSKLMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRDEIRQLEKQLEQKDRELEDMEKELEKEKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENEQLRQDIIDYQKQIDSQKETLLSRRGEDSDYRSQLSKKNYELVQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDDYNRMKAIVHQTDNVMDQLKKENEHYRLQVQELTELLKVKNEEDDPVMVAVSAKVEEWKLILSSKDDEIIEYQKMLHNLREKLKNAQLDADKSNVMALQQGIKERDSHIKMLTEQIEQYTKEMEKNTFIIEDLKTELQRNKGNS	163677	184012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_+_164183_164945_165076_165234_165313_166346_166417_166722_166770_169394_169539_177885_177940_178681_178835_179229_179413_179982_180073_182584_182708_183879
904806	contig_10748_pilon	+	2761	1	Intergenic	novelGene_150750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAATGACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166207	168968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_166200_169000
904807	contig_8576_pilon	+	2735	9	Intergenic	novelGene_88778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	605.034244898584	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	38	1072	893619	914861	TRUE	40	AAAAAACAAGGTGGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAPGTTATPSAAGAAAAAVAAASPTPIPTVTSPTPGAGGGGGGRDGSSGGWTKQVTCRYFMHGVCKEGDNCRYSHDLSDSPYGVVCKYFQRGYCIYGDRCRYEHSKPLKQEEAAATDPTTKPSLAASSSLSSGVGPLVGMSASEPEARNADLATVGAAAEDWVNAIEFVPGQPYCGRAAPSCTEVPPQGSVTKEESEKEQPAVETKQQLCPYAAVGECRYGENCVYLHGDSCDMCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQRREAETDSEIQGGNEQQGVQVF	893581	917069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910091_910555_910783_913245_913439_914262_914310_914837_914977_915338_915512_915694
904808	contig_6017_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_152560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	240	723	234	956	469570	470292	NA	40	ATATGAAGATTTCTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRLLLDSLRKAQGIDKVLVIFSHDFWSTEINQIIAGVDFCPVLQVFFPFSIQLYPNEFPGSDPRDCPRDLEKNAALKMGCINAEYPDSFGHYREAKFSQTKHHWWWKLHFVWERVKILRDYAGLILFLEEDHYLAPDFYHVFKKMWKLKQQECPECDVLSLGTYTASRSFYGIADKVDVKTWKSTEHNMGLALTRDAYHKLIECTDTFCTYDDYNWDWTLQYLTVSCLPKFWKVLVPQVPRVFHAGDCGMHHKKTCRPSTQSAQIESLLNNNKQYMFPETLIISEKSTVAALSPPRKNGGWGDIRDHELCKSYRRLQ	469336	470994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_469300_471000
904809	contig_13295_pilon	-	4069	3	Intergenic	novelGene_31236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	77	304	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGCAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134795	94988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_98830_101889_102009_134686
904810	contig_6079_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_160094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	1103	1621	422555	423073	NA	55	AATAGAAAGGCAAAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYCIQYNVICEKEKKIEVKLSLKSLGGDSDSKGKKRICFFLPKVRTHIPECRASLTKYSHRMLLPSSKSTCTNFLPDLTAMTTNIPGRHLSPYATLCKKYGSQMCLAFVASSYYANPKPNPLPSSRSQLTVTPKHRLIFIMFITMISYSKAGRIIQFHLQLCFSLLFFKCN	421452	424007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_421500_424000
904811	contig_935_pilon	-	2668	4	Intergenic	novelGene_45586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	183.577413280247	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	68	2506	630665	623188	FALSE	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTIDIKSLSVEKYDVSSQGTVPTFPWFSLQMPLTPNAVVPMSLFPLKDKLRFPKGSQEHIFKSSVYMQ	632752	623025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623566_623677_623744_628670_630678_632697
904812	contig_6612_pilon	-	2633	13	Intergenic	novelGene_148162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_10	130.457608057177	48	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	22	2532	72745	16917	FALSE	60	GGAAAAAGAAACCACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEEEGERGVASTSVQNQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIERKRKPNRNTDNSKGIKPGQKQIQLPKTSAASTPPTDSDPQTTQEPLPTPSSSSLNKEMKYAIPETYDTERIKLPQEQYQLPQTLVTIPPPPHSLHQTPQMLLLTPSSSFFTQNMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVIKTKEHNK	72766	16815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_50106_50275_60837_61006_61951_62141_64167_64576_67224_67264_67488_67657_71390_71525_72480
904813	contig_12119_pilon	+	5963	9	Intergenic	novelGene_88656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	436.808524985491	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1917	5751	213	5963	319835	380331	FALSE	35	CCAAGTCATGGGGCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINIKSILWMCSIFVATRALHKVKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYCFKPKQNVSEATTIELTILAETASPSLSKEPQIVPDRTTPIMPLITALSVITTKFSSVENIVNFEQKGPVQSQTVTDKLATESATPSGSTKKPWDMDYLPSAAGPLEKPDMSEIKEDVPKSTTVISHHTTDSWDDVTEDTKTQESVTQIEQIEVGPFVTSVEISKHTPSKEFSATEIPFLSTRMTMESKTEKKTVSPISESVTTNLYGFTLGNDDGEDRTLTVRPGHSTFIFSQIPDVITVSKTSEDITHTQLEESESISASTLVTSVTMPDNDGSSMDDRQEKQTTGRTTEDSWDQHVSTTPFSPQHQTEVELFPFPGDKRLTEEIPTVIYSSLETEMAQGRERIVTQRPAMRTDTYTNDEIQAKITKDPFIGKTEEEFSGMEVSTASSEQIHPTESSVEITKSFESPALTTTKPSVQPTEERAREEEFATTPVGDQDTTKYDEGITTVHLTHSTLSVEVVTVSKWSWDEDNITSKPSESTDHEVSPKLPTVGGNGKDEEIPRFTEHGDEFTLIPDSTQKPLEEITEEYLTDRGKFTARFQPTTSISTAEKSTLRDSTTEEGVPSISRTESKVVYATTEGSALDEEVDVDISKPVSTVPQFTHTSDGEGLAFVNFSSTQQPTTYVDISHTIPLSIIPKKEWEVLVQFVPSEGELLGEPSQDIRVIDETHLEATISPEILRTTTEITQGTTQEEVPWKEQTAEQPVPAPSSTAEILKEATVSLDEQESDGSAYPIPEEKLVTGSERVPILETTPVGKIEHSVSYPPCPITEHKVKMDEMVTLTPSVGTKISLSPRPDQKYEAESSSSTEFESPLSPFSTHVTRLIEETTTEKREKTSLDYIDLGSGLFERPKVTEHSEFSTIKTTVPSDITTMFSSVDKFHTTSASVPSSTSTEKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSRFLPTTPDDIVAKETETEIDREYFTTASTSTQPTKPPTVESKEPFRPQAVSTPEPPLGTKFHSDINVYVIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSESKEEEPCSEETDPEHDLIAEILPELIEIDIYHSEEDEEEDEDCANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDQEAAEARRGQFESVAPSQKISDSSESDSHQFVIAETELSTVVQLNESKESESLEITWKPETYSETPEHFSSGEHGVFPTVQFHEGEATEGPDSVTERGLELDNLVPNDTESVPLFPEESSGNDAIDQESQKIVFSRPTEVTFSEEAEKSTSITYTPSIVPSSVSANVSEEESVTPTGHPQPEDAFSTIESWVEVTPRHVGELLGTPSSIPMPEGSGEGEEDKNKMFTVVADLSQRNTTNTQGTLDTSKIMITESLFDVPVTTSYSVSEQPSAEIVPIKLISETDTSEGVFSTSLEEKKRKDEEEETPGTASTIEKDSPTQRSDQLILPSELESSNETTFSDSASTTGKSITSLTTSTQSEREMTSFTLFTETNVLGNLGAQVTEHSTSHQAEVQKGLTTVPGSPVSLFTEQSSGDAAVHPETTTVSSFSLNLESDIQTKKEAASTLSSLVENTFPFDPTEFILSTAVDRQVAEIMSQTSKENLISEISGE	306486	380331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_306601_306648_306741_319828_319905_325358_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348977_355321_358301_378604
904814	contig_2100_pilon	-	1736	12	Intergenic	novelGene_50675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	354	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	83	1387	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
904815	contig_2733_pilon	+	5552	2	Intergenic	novelGene_128544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	315	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGAGAAACTTGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506108	511709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_510707_510755
904816	contig_9243_pilon	-	2018	10	Intergenic	novelGene_60313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	239.582713364737	4	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	635	748	20169	20056	FALSE	25	TTCATTAGCTTGAATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLEDQLSDEEKVRIAAKFIIHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNLDQFTPLRKEATDPRPYEAENAIESWRTSVETALRAYVKEHYPNGVCTVYGKKIDGQQTIIACIESHQFQAKNFWNGRWRSEWKFTVTPSTTQVVGILKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDTLTVSNEVQTAKEFIKIVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	64612	18785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_20197_21196_21260_25151_25224_27305_27385_32837_32918_34503_34630_41497_41535_45071_45124_47702_47767_64578
904817	contig_1143_pilon	-	2367	1	Intergenic	novelGene_86578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGTCTTAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109463	107096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_107100_109500
904818	contig_5480_pilon	+	2506	1	Intergenic	novelGene_107223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAAAAAAAAGTCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63960	66466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5480_pilon_+_64000_66500
904819	contig_14077_pilon	+	4283	2	Intergenic	novelGene_174860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	0	126	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTCCCAGTATACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30045	36360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_+_30181_32212
904820	contig_3525_pilon	-	3022	7	Intergenic	novelGene_135133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_6	53.9258750508511	236	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	157	1200	609659	591940	FALSE	25	ATTCTCTGGTTTCCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGWSRNQREAPDKGRGPGNAPATPDWSAASFFCPGLCSVRCTPRKRVLARFMARFWVCAAGAGFFLTFLVLHSCFCGSPILRNFVFQISWTTENILYRLDVGWPKYSEHFTGTTFCVAVDSFNGLVYVAQRGDNMPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVWVADRGNKRIQVFDKDTGEWLGAWDNCFTEEGPSSVRFTPDGKYLIVAQLNLSRLLLLEAPPVGSIGSCSVVSTIQLADQVLPHLLDVDRKIGAIYVAEIGAKQVQKYVPLKSYFLSLGS	609815	590117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_592193_592762_592876_602693_602786_605990_606192_608457_608606_608885_609039_609575
904821	contig_15185_pilon	+	4187	1	Intergenic	novelGene_99388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGAATGAAGTGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85897	90084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_85900_90100
904822	contig_6020_pilon	-	6105	1	Intergenic	novelGene_155555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTACTCCCAGCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286613	280508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_280500_286600
904823	contig_16369_pilon	-	5294	1	Intergenic	novelGene_98696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	153	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2545	2871	13476	13150	NA	0	CTTCCCTGCTGGGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFTYPWQNQLILVLLFLSAPGDSEKDPRHCQHAGLVQHGDEAHREAGFPGQVLHDRRHAAHLCGHGPRGALPDMSQPSSAAEQCSHRVRVCVCVRVQERERAQEVAF	16020	10726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_10700_16000
904824	contig_5586_pilon	+	3463	4	Intergenic	novelGene_143562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	631.940046382742	8	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	191	325	384614	384748	TRUE	25	CCCTCGAGAATCCCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSGNFNSD	380667	387952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_380719_383470_383575_384578_387232_387297
904825	contig_5588_pilon	-	4279	9	Intergenic	novelGene_172844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.4865239101725	330	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	3340	4170	1061505	1058578	FALSE	15	GCCAGGCAATCTGGGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLFLGVAVHISAAITAYSRATVLCFMQTRGPIGFCCNFPRLFIIPYTELGLYACNAVGVNLWKEACISRTNAVALNVPIDLMATLSPDQSFLSVRKGPLRREVARNIRRHDGFICVGDTVLLTLLPGLVDDAHPDQRRQDDAAHHSDGEDAHAGPILPAAGAGQDAQLAVSSLSAQGIGHLTGISARVLCHHILNNKQLVARGEVVPLSEAQRLVPLEPGDTGRRAAGGFALECHRFSYRHHAVFQGHHQGWSFWTVRVALAEMEPAVFWAVQL	1077398	1058468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1058639_1059150_1059571_1060033_1060162_1060683_1060829_1061428_1061715_1061813_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328
904826	contig_5602_pilon	-	2395	3	Intergenic	novelGene_133050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87.5	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATAATTGGTTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873238	866530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_868744_869842_869887_873100
904827	contig_1154_pilon	-	5558	31	Intergenic	novelGene_87175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_14	39.358466546461	322	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1006	3021	49	3069	957975	925315	FALSE	30	ACTGATGAGCACAGCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQQEGPADQVAADVKSGSYTVLQVVEALGSSLENPEPRTRARGIQLLSQVLLHCHSLLLEKEVVHLILFYENRLKDHHLVIPSVLQGLRALSMCVALPPGLAVSVLKAIFQEVHVQSLPQVDRHTVYSIITNFMQTREEELKGLGADFTFGFIQVMDGEKDPRNLLVAFCIVHDLISRDYSLGPFVEELFEVTSCYFPIDFTPPPNDPHGIQREDLILSLRAVLASTPRFAEFLLPLLIEKVDSEMLSAKLDSLQTLNACCAVYGQKELKDFLPSLWASIRREVFQTASERVEAEGLAALQSLTACLSRSVLRADAEDLLDSFLSNILQDCRHHLCEPDMKLVWPSAKLLQAAAGASARACDHITSNVLPLLLEQFHKHSQSNHRRTILEMMLGFLKLQQKWGYEDKDERPLSGFKDQLCSLVFMTLTDPSTQLQLIGIRTLTVLGAQPDLLSSGDLELAVGHLYRLSFLEEESQSCSVAAMEASGTLATLYPVAFSSHLVPKLAEELHVGESDLARGDGPTKCSRHLRCLQALSAVSTHPSIVKETLPLLLQHLWQMDKGNMVTGSSEVIAVCQSLQQVAEKCQQDPESCWYFHQTAIPCLLALAVQASMPEKELSVLRKVLLEDEVLVAMVSVIGTATTHLSPDLAAQSVAHIVPLFLDGNISFLPENSFPCRFQPFQDGSSGQRRLVALLMAFVCSLPRNVEIPQLNQLMQELLELSCCHSCPFSSTAAAKCFAGLLNKHPAGQQLDEFLQLAMDKVETGLGPGLCRTQAFTLLLWVTKALVLRYHPRSSCLTDRLMGLLSDPELGPAAADGFSLLMSDCSDVLTRAGHAEVRIMFRQRFFTDNVPALVQGFHAASQDVKPNYLKGLSHVLNRLPKPVLLPELPTLLSLLLEALSCPDCVVQLSTLSCLQPLLLEAPQVMSLHVDTLVTKFLNLSSSPSMVVRIAALQCMHALTRLPTPVLLPYKPQVIRALAKPLDDKKRLVRKEAVSARGEWFLLGSPSS	958023	922825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_925343_925422_925524_925868_925929_926010_926176_926307_926391_926695_926883_927030_927088_927219_927321_927790_927918_928143_928213_928356_928460_928967_929068_930514_930671_931639_931790_931894_931996_932340_932423_932611_932738_933028_933108_936787_936943_937190_937330_937854_937933_938334_938410_938848_938936_942551_942614_942701_942831_943238_943309_943887_943963_944347_944434_945256_945358_947891_947941_957935
904828	contig_16663_pilon	-	2011	1	Intergenic	novelGene_178807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATTTGGTTTTACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4561	2550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16663_pilon_-_2600_4600
904829	contig_7056_pilon	-	1876	12	Intergenic	novelGene_43631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1035.67338257382	26	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	188	874	728928	724719	TRUE	15	ACTGCAATTTGTCTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENSS	730436	721898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724731_725486_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383
904830	contig_4654_pilon	-	2144	3	Intergenic	novelGene_103102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	1145.5	131	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1378	1845	496612	494706	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLIALTLFIFPVATVSNSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLNEESYKDSTLIMQLLRDNLTVSIANLRDYFWMVCILFPVHLFNNLLLSQVLEGICSLLSVFMSQNQLDGSGFKCN	498854	494406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494970_496408_497941_498805
904831	contig_3584_pilon	+	7062	1	Intergenic	novelGene_108134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	442	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	486	1461	49	1509	302952	304412	NA	15	ACTACTAGCTTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STSLQFIGSPYSLPYAMPPNFLPSPLLSPSANLATTHLPHFVPYASLLAEGATPPPQASSPAHSFNKAPSAASPPGQLPHHSSTQPLDLATGRMPIYYQMSRLPAGYTLHETPPAGASPVLTPQEGQSALEAAAANGGQRQREQNLARRESEALDSTNSKGEGQGLVPVVECVVDGQLFSGSQTPRVEVMVPAHRGTPDTDLEVQRVVGALASQDYRAVAAQRKDEPSPLNLSHHTPDHQGEGRGSAKNPAEMVEKNQARGFYVQSHQELVKHRPLPKAMVVANGNLVSTGTDPGLLPMASEILVASSVDMQARATFPDKEPTPPPITSSHLPSHFMKGAIIQLATGELKRVEDLQTQDFVRSAEVSGGLKIDSSTVVDIQESQWPGFVMLHFVVGEQQSKVSIEVPPEHPFFVYGQGWSSCSPGRTAQLFSLPCHRLQVGDVCISISLQSLNSNSVSQASCAPPGQLGPPPEKGLRGQCWDPESYVTVRGRASRQERVPVW	302903	309965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_302900_310000
904832	contig_233_pilon	+	2043	11	Intergenic	novelGene_14613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	336	845	78477	91651	TRUE	5	CTCGGGGGCGTCCAGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78141	105500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101767_104153_104305_105455
904833	contig_7151_pilon	-	4039	7	Intergenic	novelGene_40729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATTTCCTTTCTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509826	502238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502453_503036_503212_503293_503385_504050_504140_505030_505169_505440_506683_507736
904834	contig_2892_pilon	-	4422	2	Intergenic	novelGene_119031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	622	954	313122	312790	TRUE	65	CAATTAAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGCPLSPLLFNIVLDVRTRAIRQDNEINGIQIGKEVKLSLSEDNMIPYIENLKESIRKLLELRQEFGKVAGYKVNKQKSVWFLYTSNEKSEREIRETIPFTIASKRIK	313743	305547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_308098_311871
904835	contig_15498_pilon	+	4663	2	Intergenic	novelGene_42697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	355	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGCGGAGGAGAAGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832259	837320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_832752_833149
904836	contig_1150_pilon	+	397	3	Intergenic	novelGene_61453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAATGCCGGGCGGGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309149	311049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309387_309813_309927_311002
904837	contig_15002_pilon	+	3194	2	Intergenic	novelGene_162427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	0	196	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	566	1246	22993	23673	FALSE	20	GTTAGGTGCCATTAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYKCSDCGKVFSRKDTFIQHQRIHTGERPYECSECGKAFSRKDNLVQHKRIHTGEMPYKCSECGRYFSHHSNLTVHQRVHTGARPYECNECGKVFKHKSSLVQHESTHTGESPYGCSECGKSFSHKYILIKHQKIHTEIRPYECIECGKLFSQSSDLMAHQRVHTGERPFVCSECGKDFIRSSHLVRHKRVHTGERPYECSECGKTYSLSSHLIRHQKVHTVGGL	16535	25621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15002_pilon_+_16623_22514
904838	contig_10531_pilon	-	2462	5	Intergenic	novelGene_114523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	317	682	482939	482574	TRUE	5	TCTCTCGGCCCCGGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGKNTEVAKDIILLGSTINAHGSSGQEIKWHIALGKSDAKDLFKELKSKDITLRTELLLTQAMVFSITSYACVSWVMNKEEGTRIDAFELQCWQRILNILRIARGTNKSVLEEVQPNAP	485830	429102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10531_pilon_-_429315_466103_466437_467899_468095_481533_483188_485762
904839	contig_12391_pilon	+	2240	14	Intergenic	novelGene_103598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_9	296.417165654546	735	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	10	996	56804	103666	TRUE	60	AAAAAAAAAACCTGAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQNSDFLCQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSQLPAD	56794	108088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96528_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101934_102041_102095_103647_103817_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
904840	contig_5033_pilon	+	3317	1	Intergenic	novelGene_28961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATAGGGTTTCCAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457105	460422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_457100_460400
904841	contig_5686_pilon	+	2760	1	Intergenic	novelGene_45437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAACATGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209607	212367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_209600_212400
904842	contig_10163_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_82630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98596	100477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_98600_100500
904843	contig_15087_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_37222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCGGTGGTGGTAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129000	131808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_129000_131800
904844	contig_5499_pilon	+	3708	1	Intergenic	novelGene_57030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	2497	3093	1398640	1399236	NA	60	AAAAAAAAGACCAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDLPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNEAVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1396143	1399851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_1396100_1399900
904845	contig_8636_pilon	+	2696	17	Intergenic	novelGene_141932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	157.692132314044	2	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	69	1577	429698	453202	TRUE	10	ACTGCTACTGTGTGCGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKALGVRQYHVASVLCQRAKVAMSHFEPNEYIRYDLLEKNINIVRKRLNRPLTLSEKIVYGHLDDPANQEIERGKTYLRLRPDRVAMQDATAQMAMLQFISSGLPKVAVPSTIHCDHLIEAQVGGEKDLRRAKDINQEVYNFLATAGAKYGVGFWRPGSGIIHQIILENYAYPGVLLIGTDSHTPNGGGLGGICIGVGGADAVDVMAGIPWELKCPKVIGVKLTGSLSGWTSPKDVILKVAGILTVKGGTGAIVEYHGSGVDSISCMATICNMGAEIGATTSVFPYNHRMKKYLSKTGRADIANIAEEFKDHLVPDPGCHYDQLIEINLSELKPHINGPFTPDLAHPVAEVGNVAEKEGWPLDIRVGLIGSCTNSSYEDMGRSAAVAKQALAHGLKCKSQFTITPGSEQIRATIERDGYAQILRDVGGIVLANACGPCIGQWDRKDIKKGEKNTIVTSYNRNFTGRNDANPETHAFVTSPEIVTALAIAGTLKFNPETDFLTGKDGTKFKLEAPEADELPPRGV	429629	457083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_429772_436550_436810_440076_440170_445103_445263_445487_445633_446894_447000_448263_448356_449634_449741_450879_451038_451238_451313_451844_451957_452835_452960_453194_453353_454293_454486_455494_455628_456086_456209_456561
904846	contig_2854_pilon	-	1691	6	Intergenic	novelGene_120875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_5	298.764388774834	91	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	21	644	1132514	1076098	FALSE	5	TTCTTTTTTGCTTTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGLSAMAGAAGLVAEVSWKVLERRARTKRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVPFPQILQY	1132534	1075050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1132438
904847	contig_7993_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_170967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTATGTGATTATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33957	34703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_34000_34700
904848	contig_13329_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_177850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCATTGTCTTAAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22812	21423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13329_pilon_-_21400_22800
904849	contig_4686_pilon	-	3329	19	Intergenic	novelGene_118482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	187.461543381339	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1015	3048	115	3162	430270	332701	FALSE	50	AGGAATACAAGAGGATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWEKCEKGIADSLEKLRSFKKKLSQPLPDHHEELHSEQMRCKELENVVGGWTEDLTQLTLLRDTLSAYISTGDISILNERMELLQRQWEELCHQLSLRRQQVSEKLNEWAVFSEKNKEICEWLTQMESKVSQNGEILIEEMIEKLKKDYQEEIAVAQENKIQLQQMGERLAKASNESKASEIEYKLGKVNDRWQHLLDLIAARVKKLKETLVAVQQLDKNMSSLKTWLAHIEAELAKPIVYDSCDSEEIQRKLSEQQELQRDIEKHSTGVASVLNLCEVLLHDCDACATDAECDSIQQATRNLDRRWRNICAMSMERRLKIEETWRLWQKFLDDYSRFEDWLKISERTAAFPSSSGVLYTVAKEELKKFEAFQRQVHESLTQLELINKQYRRLARENRTDSACSLKQMVHDGNQRWDNLQKRVTSILRRLKHFIGQREEFETARDSILVWLTEMDLQLTNIEHFSECDVQAKIKQLKAFQREISLNHNKIEQIIAQGEQLIEKSEPLDAAVIEEELDELRRYCQEVFGRVERYHKKLIRLPLPDDEQDLSDRELELDDSAALSDLHWHDTSADSVLSPQPSSNPSLSLAQPLRSERSGRDTPASVDSIPLEWDHDYDLSRDLESAVSRTLHSEDEESQEDKDFYLRGAVGLSGSHGALESRIRQLDKALDDSHFRIQQTENIIRSKTPTGPELDASYKGYMKLLGECSGSIDLVRRLEHQLKEEEESFPGFVNLDSTETQTAGVIDRWELIQAQALSKELRMKQNLQKWQQFNSDLNNIWAWLGETEKELERLQRLELSTDIQTIELQIKKLKELQKAVDHRKAIILSINLCSPEFTQADCEESRDLQDRLSLMNGRWDRVCSLLEEWRGLLQDALMQCQDFHEMSHGLLLMLENIDRRKNEIVPIDSNLDTEILQDHHKQLMQIRHDLLESQLKVASLQDMSCQLLVNAEGADCLEAKEKVHVIGNRLKLLLKEVSRHIKDLEKLLDMSSSQQDLSSWSSADELDTSGSMSPTSGRSTPNQQRTSHGKQELTRAHSLCFRALKRQWESIQQA	430384	332533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_332788_364486_364580_366026_366240_367770_367900_369729_369931_373540_373753_375405_375533_377529_377673_381283_381618_382962_383155_384985_385124_385364_385548_388362_388514_389373_389562_398467_398631_413088_413256_417837_417997_425619_425776_430258
904850	contig_9345_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_24459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	141	779	488215	488853	NA	50	GGCTAACAAACCCAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPCLTPYTKTNSKWIKGLNVKTKTIKLLEENKEAMLSGLAFNNELFNITKAQTVKDKIDKWDIIKIKNFCSSKDFSKNVKRQATNWENIFRNHISNKNPITKIYKQLQQFNNKKTTQSKWAKDLNRHFTKEDIQMATKHMKRCSTSLAIRDANQSHNEIPFHSPTRKAKMKKKITDVGEDVGTLELLPIAGKNAKWHIVPQKTKNRATI	488074	489610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_488100_489600
904851	contig_13453_pilon	-	4070	2	Intergenic	novelGene_146711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3486	3821	86897	86562	FALSE	20	ATCGGGATTGCATTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISVSFLKDPSNLAYLLPSGVCVLLVMVCILLMPCIKASSVNPVFSSMNFTLFGFIFRSLIQIELVFVYGVRYESCFRFLQMDIQFCQHHLLKRLSFPHLVDFGPLLKIR	90424	86312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_89838_89879
904852	contig_19865_pilon	+	1540	8	Intergenic	novelGene_170154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	137.496716101787	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	453	1166	79219	81643	FALSE	20	CTAGTCTGTACAGTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLMATTFGQKGGNHWWFGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPLWGPSTQDWNWSWLLGDCHLMPCLHSKPICDSPLCATEVEGTGRRGVGGVTGSVLEGECGHRSRRN	43493	82017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67674_67703_72650_72735_79191_79369_79927_80052_81132_81367_81437
904853	contig_14814_pilon	+	423	2	Intergenic	novelGene_137743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	115	324	398186	398395	TRUE	35	CTGCGAGACACCAGAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGPLGVTSSEGGTGNPGTPSWTLRLLFLGRFLLLQGGMAGGCSKPPSSTMLEVASSAPVSATLGTFWSFLCPSSGSLPFWSGDVVLSPEPKFSSWRWFFFFFLLFF	398071	399158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_398426_399089
904854	contig_3155_pilon	+	1996	4	Intergenic	novelGene_26365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1054.77401476441	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	344	670	259780	261211	FALSE	30	GAAGTTGCATTACACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTPNRKRTKKITVRDAEPNRSRSHHEQQRQGQGTAEATGGSNTGPYRVSGPRAHHRQGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258078	262537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258255_259209_259329_259731_259978_261082
904857	contig_10339_pilon	-	4458	8	Intergenic	novelGene_125262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.1045241245046	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	220	1041	357260	332025	TRUE	15	CGGAGGTCATGTGACCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKCIGPALLRFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSGVMMLQLLEKVVELENWTEGNGLMYVHAKHLNKIHEVILPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSGRELRLEEALLTERDLVGTVWGGPANLEAVARKGKSSK	366783	292259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_292333_308600_308654_328733_332434_346586_346668_348527_348579_354184_354246_357040_357263_366566
904858	contig_4891_pilon	-	1476	13	Intergenic	novelGene_124517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	352.495971214172	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	217	1143	68026	32303	TRUE	70	AGTCATAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPLKTSTLSALRPWISWTSYCDMTTSRDSPQERPWSTPISTPL	92825	30067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_30326_32227_32315_33408_33522_34409_34489_35734_35837_37388_37500_56597_56682_58132_58193_59630_59682_60192_60295_65786_65899_67925_68137_92719
904859	SIRV7	-	707	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	152	-11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATTAACATGAAAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147766	56048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
904860	contig_3130_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_103578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCATGTAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152841	153939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_152800_153900
904861	contig_854_pilon	+	4310	25	Intergenic	novelGene_36583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3133.68783898815	14	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	1394	3553	1700894	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1679250	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693208_1699021_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
904862	contig_9538_pilon	+	333	1	Intergenic	novelGene_176447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAGGTCAGAAGGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26228	26561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_26200_26600
904864	contig_12479_pilon	+	4601	12	Intergenic	novelGene_56876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	74	412	504682	505020	TRUE	35	GAATCGTCCGCTCAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLSKVAGNFACTAVSEVTANVLWTLFSLCPQFLPLPLLSLIKIHSKSRSIIRANLNSLSLTWSGHTVAKLSGPSSFLGLLLPLHVTTSGDVFTLTYRIHSTSTTSLHSS	504608	594189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_507966_512516_512716_514756_514823_516362_516454_516544_516623_518255_518338_531547_531638_535587_535686_535789_535932_537771_537846_548942_549019_593941
904865	contig_3956_pilon	-	2438	11	Intergenic	novelGene_15243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	CAGCCGTGGAGGCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
904866	contig_4232_pilon	+	630	1	Intergenic	novelGene_63311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTCTATCACTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466908	467538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466900_467500
904867	contig_9272_pilon	-	1098	3	Intergenic	novelGene_125904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283614	281139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_282001_282536_282669_283509
904868	contig_15236_pilon	+	2392	9	Intergenic	novelGene_141598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	26.4902694399283	122	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	962	2158	492870	511415	FALSE	20	GAAGCTAACGTGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYILHRKRQAQKCTKPCNCCEVDFHRKHILFCYQIAAGEKIPLSQEEITLQGHAFEARIYAEDPNNNFMPVAGQIVHLSTPQTDLCTRIETGVREGDEVLVHYDPMVAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLHTNIDFLLSLSGHPDFEAGNVHTDFIPQHHTELFPAQRATAKELLCQAALGLILKERAATDAFRLKAQDRFSPFASSSGRRLNICYTRNMTLRDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIDDKTFRVLGDLHSEGDCTYLKCSVDGVASKAKLIILENTTYLFPQEGSVQIDFPVPKYMSSVSAEGTQGGTVAPMTGIIEKVFVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKAPKDGTIKNVFHQEGSQANRHAPLVEFEEEESDKRESE	491908	511649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_493156_495822_495933_497260_497478_499243_499331_503696_503747_505706_505845_507515_507624_509859_509932_511286
904869	contig_2504_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_166849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGAAGAAAGGAAATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390530	388605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_388600_390500
904870	contig_1008_pilon	-	2064	4	Intergenic	novelGene_121547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	91.277355108239	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	97	1098	573637	520677	FALSE	30	CGAGACTACGCGTAGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANKTGYVPSNYVERKNSLKKGSLVKNLKDTLGLGKTKRKTSARDASPTPSMDAEYPANGSSTDRIYDLNIPAYVKFAYLAEREDELSLVKGSRVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVMEEVDEASADSPSFRSLRKGASMSNGQGARALHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNSRGQIGLVPKNYVVVLSDGPALQPSHAPQISYTGPSATGRFAGRELCLVVRPLVGSFASLSFYSVLFVFAFALGLNLKQPSRVLTSMPKSSPPH	608297	519710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_520828_535046_535672_573411_573654_608217
904871	contig_6102_pilon	+	4370	8	Intergenic	novelGene_32215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894898	904376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_900644_902907_902949
904872	contig_8484_pilon	-	2777	3	Intergenic	novelGene_178376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	8.5	239	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	33	410	46931	44496	FALSE	35	ATTAGGTGTGCACATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSWGCCPENWMISNTSCYFISSEAKTWTESKKNCTGMQALLLVINAKEEQLLIIQKLNRNSAYYVGLSDPEGMHQWQRVDQSPYNRSVTFWHPYEPSNYKEHCVFINFRQGNWGWNDASCDVPQKSICKMMKIYL	46963	42128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_-_44638_45969_46086_46811
904873	contig_15047_pilon	-	4460	4	Intergenic	novelGene_52215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	277	579	9980	9678	TRUE	25	GATTCAGGGGAGACTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSRRSWGELVQGTEKAEVSTSSLLNAFSIAAKKNYHKLADFKQHPFIIPEFCNFQFQHGSHWAKIKVSADLCSLLETLWKNPLPRSFTLLSKFSSLQL	10256	2179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2223_3215_4433_4551_4659_7163
904874	contig_3469_pilon	+	3584	1	Intergenic	novelGene_34236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAGAAGACCTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636853	640437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_636900_640400
904875	contig_12464_pilon	-	6567	1	Intergenic	novelGene_68713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGGAATCCTCACAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367699	361132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_361100_367700
904876	contig_6163_pilon	+	742	3	Intergenic	novelGene_103787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	4.5	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	157	642	12879	16461	FALSE	60	TAAAAACATAGTTCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYIERHGCYKRACLLPGKAFGCVGGYIASTSSLVDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAGALESVRILKSTEGRALRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVCDELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLATWNRVALELKPHSSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGMSKLVSAQA	12722	16561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_13041_13678_13842_16300
904877	contig_12970_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_50554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACCTGTCCTCTGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592167	594826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_592200_594800
904878	contig_4180_pilon	+	2421	11	Intergenic	novelGene_8298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	179.447178857735	954	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	841	1707	811833	821915	FALSE	15	TGGAGAATCTGGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733029	822629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_791893_791965_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
904879	scaffold_9100_pilon	-	1911	3	Intergenic	novelGene_83317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	32	144	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATAGCTAAGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844445	838185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_839161_841667_841753_843594
904880	contig_5686_pilon	+	3684	1	Intergenic	novelGene_45429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1356	1661	192073	192378	NA	55	TTCAGAAGTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRGNAPMEILLSLNKGKGKPPHAAKKSFTFAITTLLSVTHSSKTTTPNIHVDINREYFIIFSDLVTPTSSYHTLPHFPFIPIPNTDKRVGGEGDDEKDN	190717	194401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_190700_194400
904881	contig_16303_pilon	-	3534	8	Intergenic	novelGene_34083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	95	1186	45428	35759	TRUE	35	ACACCCTGCAACCACATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45522	33091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_33863_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
904883	contig_12626_pilon	+	5195	14	Intergenic	novelGene_80445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_10	450.630419687718	80	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1423	4272	22	4293	155680	173300	FALSE	30	ATGTACTTACATTCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLDPDGTMSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTLSAKTSTTGFRVFSCLDDGMGYASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNVNLTELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQVSKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLTLSLKENSRLENELLENAEKLAKYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLAQMRNEYEQQCRMLQDQVDELQSELEEYRAQGKVFRLPLKNSMSEELDGNSGGIEPDQGLGSEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDLSCLKLELEDKVRHYEKQLDETKVTYEKEQEGMKQKYEDEIHTLEKQISGLKNEIAELQEQAVVLKETQHKTTCRHQEEKKQLQMKFDEEQTHLQEKLRLQHEVDLKARLEQIEESFNRERDGLIHKGAWAEEKVRDLTQELEQFHQEQLKSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGREEMETECNRRTSQIEAQFRADCQKVTERYEDALQSLEGRYRQELKDLLEQQREEKSQWEFEKDELTQECAEAQEQLKETLQREKATSLVLTQEREMLEKTYQEHLNSMVVEKEQLLKDLEDLKNVSESQQSLLSNQILELQSNHERELKDCEQVLCQAGASEQLASQRLEKLEMEHEQERHEMMSKLLAMESIHKETCEKADRERAEMSTEISRLQNKLKEMQQAVSSLSRLESGCQAMGVGEAEGNGTMSLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHERAVKENVKMATEISRLQQRLQKLEPGSVMSSCLDEPSTEFLGNSLEQTEPFLLQNRMKRIEDITKKRVLSDLQDDETRDLGSTDTSSVRRQEAKIDSEASIESFSELENSEETRAETWDLKIQISQLQEQLTILRADCDRASEKKQDLLFDVSVLRKKLKTLERIPEASPKYKLLYEDASRENDCLQEELRLMETHYDEALENNKELTSEVFRLQEELKKVEEVTETFLSLEKSYDEVRGENEELHVLVLRLQGKIEKLQGRSVLQCDCLSLWEAHLDNLQAEPDEKVLELNQTLEECAPKVTNAHHIIEEHKQENQYLEQENTRVLEKLKAHEVAWLQGTIQTHQEKPRIQNQAILEENTALLGLQDKHFQRQATIAELELEKKKLQELTRKLRERVTALVKQKDVPSQGEKEEELKSMMLDLQSTCSEMQQKVELLRYESEKLQEENSILRDEITSLNEEDSISNLKLGKLNGSQEEMWKKIETVKKEKDVVQKMVENLKKQISELKAKNQQLDLENTELSQKNSQNQEELQKLNQRLAETLCQKEKEPGHSTFEEWEQEKSNLTEELENCKLQVWSIATL	155658	174202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_155785_156281_156450_156973_157111_157459_157601_157881_158057_160817_160929_161302_161393_162654_162794_164898_165021_166205_166712_167699_169842_171116_171243_171350_171421_173060
904884	contig_10299_pilon	+	1938	17	Intergenic	novelGene_79743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	70.1157246539605	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	1008	1769	502326	517350	FALSE	20	TGATAGTCCTTTTTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK	446784	517519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_446990_461790_461876_463092_463167_463367_463505_488618_488710_489793_489871_493160_493198_497085_497184_498369_498483_500805_500863_502292_502387_502702_502780_503290_503426_511683_511810_511888_512041_516300_516437_517275
904885	contig_3475_pilon	-	3094	4	Intergenic	novelGene_177122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCACTTAAAGCACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419262	250546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3475_pilon_-_251529_304793_305915_349046_349549_418773
904887	contig_5033_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_28964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCAATCTCCACCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458756	460264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_458800_460300
904889	contig_19362_pilon	+	2904	16	Intergenic	novelGene_157784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_1	457.748227740971	311	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	51	1673	17137	63943	FALSE	40	ATTCCCAAATGACAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPPLAELRRGAPTGPMGSQPPLLPAVAALLWGFLLPPTAAQEAILHASGNGRTSPSKDYCILYNPHWTALPSTVENATSISLMNLTTTPLCNVSDIPSAGIKDRAVVVQWGACHFLEKARIAQTGGAEALLIANNSVQYPPSGNKSEFHDVKILIAFISDKDLKDMKQTLGSNITVKMYSPSWPNFDYTMVVIFAIAVFTVALGGYWSGLIELENLKAVTNTEDREMKKKEEYLTFSPLTVVIFVVICCVMMVLLYFFYKWLVYVMIAVFCIASATSLYNCLAALIHKIPYGQCKIVCRGKSVEVRLIFLSGLCIAIAVVWAVFRNEDRWAWILQDILGIAFCLNLIKTLKLPNFKSCVILLGLLLLYDVFFVFITPFITKNGESIMVELAAGPFGNNEKNDGNLVEATAQPSAPHEKLPVVIRVPKLIYFSVMSVCLMPVSILGFGDIIVPGLLVAYCRRFDIQAGSSVYYVSSTIAYAIGMILTFVVLVLMKKGQPALLYLVPCTLITASVVAWRRKEMKKFWKGSSYQMMNHLDYATNEENQVVPGEQAIQQ	17086	65174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_17203_32540_32661_32977_33161_33774_33865_34380_34515_39711_39861_42896_42994_43392_43495_44450_44533_45061_45137_50676_50734_50928_50983_51396_51500_54106_54182_55243_55405_63868
904890	contig_6364_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_51760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTCATCAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642602	645040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_642600_645000
904891	contig_6898_pilon	+	1978	10	Intergenic	novelGene_35690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1546.80530987796	34	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	134	1234	59668	126957	FALSE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIVLSLGTVNQEAA	59534	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122713_126916
904892	contig_8377_pilon	+	3734	18	Intergenic	novelGene_34902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2002	junction_4	3078.5396101866	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	1669	3273	136354	177627	FALSE	80	ATTTAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDVSENASFLSLMIFILLLSMHSIHFHICLWKMFEILLEIL	68043	178088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720_124739_131430_131572_135049_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430
904893	contig_16125_pilon	+	5060	1	Intergenic	novelGene_155283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	141	374	171287	171520	NA	60	TAGATCTACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFIGLCNLWLKDEFGSGFSSELEGCLWAIVLGVPPVSVRPVSPVIFMNLNSVLYFPSTLSRTLYCDDRTVGGGSRVPSSISGLSLAEAVVHVVHKSFGLIFSLHLWFSSFSFAPNVMGQKVVF	171146	176206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_171100_176200
904894	contig_18869_pilon	+	2350	6	Intergenic	novelGene_56461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	177.874562543383	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1407	1925	187901	189734	FALSE	35	CAGGATGTCATCATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDAAESYSKDFCVRQALRCHRLTKLITLQIHFLNTGQNTMLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	184449	190159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_184566_185235_185348_186722_187931_188134_188291_188948_189101_189553
904895	contig_13481_pilon	-	3391	1	Intergenic	novelGene_119522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	619	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGGCAAGTTTTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441119	1437728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1437700_1441100
904896	contig_2636_pilon	-	1614	4	Intergenic	novelGene_52070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	371	junction_1	177.69074258385	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	116	394	85555	62451	TRUE	40	TCAAGAAGTCATGGATCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMIFFQSYSQLLKGKKDPKEVFHEKLLCEKTKLNMEGKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85670	59553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59968_61644_62624_81113_81216_85551
904897	contig_5317_pilon	+	3614	2	Intergenic	novelGene_76614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	27	junction_1	0	238	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	791	1180	761570	761959	TRUE	20	GCAGTCTCTGAAGTGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRIVFIVLCIHRHYPFPSYSTTIGGLLSFIPRFPEPLDLEQSLCLATSKRGSKLLKACIPFFFHNGCCPKSVPHFPAPQHALKLPASHMPTSIHYLFTHTSCRCLFNDCNLLLSFANLEHMCWPQLCL	760779	766245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_762578_764429
904898	contig_2892_pilon	-	2563	8	Intergenic	novelGene_118979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	70.2433089267554	50	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	146	607	100546	24381	TRUE	45	ACAAGGAGTAAAGCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRKHFVEKRYSEFHALHKKLKKCIKTPEIPSKHVRNWVPKVLEQRRQGLETYLQAVILENEELPKLFLDFLNVRHLPSLPKAESCGSFDETESEESSKLSHQPVLLFLRDPYVLPAASVFTASSPGVDPIPRNHFLCSSIRSNSSFVKVLS	130455	10696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_12606_24333_24482_28142_28208_28732_28766_30146_30242_90011_90117_100483_100568_130331
904899	contig_16870_pilon	+	2534	5	Intergenic	novelGene_155533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_4	22.466641938661	236	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATAAATAAACCCCACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296291	315250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_296314_300446_300518_310906_310989_312531_312581_312940
904900	contig_8322_pilon	+	2864	2	Intergenic	novelGene_143236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	275	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTAAGTGTTATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286496	294214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_289345_294198
904901	contig_6576_pilon	-	2822	3	Intergenic	novelGene_42276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_2	17	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1572	2141	326684	323781	FALSE	55	AAAAAAAAATTCTTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	328255	323099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_325444_325538_326528
904902	contig_18039_pilon	+	4422	7	Intergenic	novelGene_171251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	84.7506145503775	449	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	659	2845	213615	215801	FALSE	15	TGAGTATGGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKELSAKEIIDKGELFQRVILKRNESHGIEDFHFRQVRENVHEFQSQWGKDERNNKGVTTAHNKILTGRRDQHVNTDAGNKYVTCKNTTELSFQSHVAEMQKFHIGEKMYECHQVETSVSSGSSIPSFQRIPPSVQSNISNECGDVFMPPSWFQQHQKTHSREKPYKCNECGKSFSQRSVFTNHQRINCVQRPYKGNESVKTIYCGSSVTKHHTIHTGEKPCKCNACGKVFSLQLGLRTHQRFHTGKKLYKCNECGKEFMRCSYLCNHRSIHSGEKPYQCNECGKAFIYRPQLVQHQQIHSGGKPYQCNKCCKTFRRRSFLINHQKIHFGQTSYKCNKCGKAFSGRSSLVEHQRIHSGEKPYKCNECGKTFNWSSNLTKHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFSRRSGLTRHHTTHSREQLYQCNECGKAFIRKLSLVEHQRIHSGEKPYECNECGKAFIYRSKLVQHQQIHSGEKPYQCNKCCKAFSRRSVLINHQRIHFGQRPYKCSECGKTFNWGSNLSKHQKIHTGEKPYKCNICGKVFSRRSGLTRHQTIHSREKPFRCNECGKAFTRKSRLIEHQRIHSGEKPYKCNECDKTFTRKSRLLEHQRIHSGEKPYKCNKCGKSFIQRSTLVKHQAIHITEKPYKCNECGKAFKWNASLTRHQRIHAVEKPYKCDSCDKGFGHPESLRSHQRYHTGERSCKCIECGKTFSSQSAFQNHKIIHSGESPYK	196176	217378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_196217_197219_197413_198369_198453_201831_201959_202444_202542_204698_204800_213597
904903	scaffold_13553_pilon	+	4272	2	Intergenic	novelGene_73755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1843	2148	50254	50559	TRUE	45	AAAAAAGAAGTCTTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCEFAIPLKPRKAGRLEPRSARPRGMQCTQVVSAARCHRKCFALTRTDLSERLQTHFSGPVCVGMCVWAGGLSFGFPCSQPQENKKEPHRQMEEGAKRGR	48411	219834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_52295_219445
904904	contig_19380_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_178738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	222	713	70136	69645	NA	40	GTGTCCATCAAGTGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRPMRKFSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGHNKCWRGCGEMGTFVHSCWECKMIQPFWKMIWRFLKKLEIDIPFDPTIPLLGIYTREIRVVPRIDIRTPMFMAALFTIPKRWKQPRRPLTDEWINKLWYIHTMGVLGNEKEQ	70357	67581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19380_pilon_-_67600_70400
904905	contig_6445_pilon	-	2762	1	Intergenic	novelGene_77098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACATACAAGACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144267	1141505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1141500_1144300
904906	contig_9571_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_136323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAGAGAAAAATGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710136	709028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_709000_710100
904907	contig_21232_pilon	-	3473	10	Intergenic	novelGene_165971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	201	686	26194	19749	TRUE	80	ACTAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIIFHFKRKSSICEDGCDSVCVRQRERESWSRLIFCQLKDPVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAASVQNDAELDAPSVTFPTCAKISTV	26394	3276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_4508_4781_5043_11043_11285_13445_13665_14910_15167_18091_18347_18617_18744_19550_19820_22216_22506_26068
904908	contig_9027_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_156369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202757	205433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_202800_205400
904909	contig_1154_pilon	-	4051	14	Intergenic	novelGene_87174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	53.397138854716	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	231	1562	930665	925315	FALSE	30	ACTGATGAGCACAGCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGSSEVIAVCQSLQQVAEKCQQDPESCWYFHQTAIPCLLALAVQASMPEKELSVLRKVLLEDEVLVAMVSVIGTATTHLSPDLAAQSVAHIVPLFLDGNISFLPENSFPCRFQPFQDGSSGQRRLVALLMAFVCSLPRNVEIPQLNQLMQELLELSCCHSCPFSSTAAAKCFAGLLNKHPAGQQLDEFLQLAMDKVETGLGPGLCRTQAFTLLLWVTKALVLRYHPRSSCLTDRLMGLLSDPELGPAAADGFSLLMSDCSDVLTRAGHAEVRIMFRQRFFTDNVPALVQGFHAASQDVKPNYLKGLSHVLNRLPKPVLLPELPTLLSLLLEALSCPDCVVQLSTLSCLQPLLLEAPQVMSLHVDTLVTKFLNLSSSPSMVVRIAALQCMHALTRLPTPVLLPYKPQVIRALAKPLDDKKRLVRKEAVSARGEWFLLGSPSS	931791	922825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_925343_925422_925524_925868_925929_926010_926176_926307_926391_926695_926883_927030_927088_927219_927321_927790_927918_928143_928213_928356_928460_928967_929068_930514_930744_931639
904910	contig_15047_pilon	-	3461	2	Intergenic	novelGene_52267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	255	554	6719	6420	TRUE	10	TTCCCACTTGCGCTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	6973	3394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_4434_4551
904912	contig_2367_pilon	-	4500	1	Intergenic	novelGene_65337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	2471	3100	280243	279614	NA	80	AAAAAAAAACAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSHPFPLGHTTSPLVESYWPATTWVPLPPYAGSCCTLFLFPFPLFFLPPTQHHTPPLTLPLGLCCTTLAREPLACCQPGSPRCHPPAPTMPFFYFFLPPPPNLVCHLYPFPPNYAAPPRVESHWPATCLGLPYPHIPASSCYTIVFPFPPFSFPHSPVCHLTPFPLGHVALPQLQSHQPTAFYLPPGPVQPHSPLPTGTQVCSAPPAR	282713	278213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_278200_282700
904913	contig_9706_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_20875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGCTTAATCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_3800
904914	contig_17144_pilon	-	2091	12	Intergenic	novelGene_29394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2038.17668477174	186	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	147	1427	179764	166736	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQRLGAHYHGRGDLPAAQPSGPQHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	183228	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167277_172670_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
904915	contig_9752_pilon	+	3482	1	Intergenic	novelGene_122047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243602	247084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_243600_247100
904916	contig_6929_pilon	+	2531	5	Intergenic	novelGene_139433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	51.9879793798528	64	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	18	608	194296	202816	FALSE	20	CTTGGCATGACTCATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPATTARTEGVTENQAVQSATGSLVELTPTPGGLALVSPYHTHRAGDPLDLVALAEQVQKADEFIRANATNKLTVIAEQIQHLQEQARKILEDARRDADLHHVACNIVKKPGNIYYLYKRESGQQYFSIISPKEWGTSCPHDFLGAYKLQHDLSWTPCEDIEKQDAKISIVDKLLHQPVALPTCTEPNFQGLTH	194278	204739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_194366_194493_194610_201374_201462_201960_202093_202630
904917	contig_9133_pilon	-	5705	5	Intergenic	novelGene_109292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_1	63.4527383175856	484	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	400	1710	59469	48142	FALSE	55	ATAATGCAAGTAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVMYGGGPISSVLVNKYGSRPIMIAGGCLSGCGLIAASFCNSVQELYLCIGVIGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKKRPLANGLAMAGSPVFLSTLAPLNQAFFGIFGWRGSFLILGGLLLNCCVAGSLMRPIGPKPTNERKEKSKESLQEAGKSDEKKDAGDANTDLIGGNPKEEKLSVFQTINRFLDFSLFTHRGFLLYLSGNVLMFFGLFTPLVFLSNYGKSKHYSSEKSAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTRWIRPRVQYFFAASIIANGVCHMLAPLATSYIGFCVYAVFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPMLGRLNDVYGDYKYTYWACGVILIFSGIYLFIGMGINYRLVAKEQKEQKQKMESKEEEASVAIAEKPKEVTKAAESLEQKGTEGSPKEEESPV	94563	44146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_48417_51474_52342_56310_56455_59444_59708_94402
904918	contig_6079_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_160111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTTCCCAGCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485207	487854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_485200_487900
904919	contig_859_pilon	+	3264	2	Intergenic	novelGene_132818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	361	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCAGACTACCCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79503	93846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_82470_93548
904920	contig_10627_pilon	-	1347	1	Intergenic	novelGene_60036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGATCTTTTGCAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646038	644691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_644700_646000
904921	contig_6743_pilon	-	6615	34	Intergenic	novelGene_33551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.132528353872	521	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2673	24	2696	275950	231904	TRUE	30	AAAAATTTCCTTTCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVETLSPDWEFDRVDDGSQKIHAEVQLKNYGKFLEEYTSQLRRIEDALDDSIGDVWDFNLDPIALKLLPYEQSSLLELIKTENKVLNKVITVYAALCCEIKKLKYEAETKFYNGLLFYGEGATDSSMVEGDCQIQMGRFISFLQELSCFVTRCYEVVMNVVHQLAVLYISNKIAPKIIETTGVHFQTMYEHLGELLTVLLTLDEIIDNHITLKDHWTMYKRLLKSVHHNPSKFGIQEEKLKPFEKFLLKLEGQLLDGMIFQACIEQQFDSLNGGVSVSKNSTFAEEFAHSIRSIFANVEAKLGEPSEIDQRDKYVGICGLFVLHFHIFRTVDKKFYKSLLDICKKVPAITLTANIVWFPDNFLIQKIPAAAKLVDRKSLQAIKMHRDTFLQQKAQSLTKDVQSYYVFVSSWMMKMESILSKEQRMDKFAEDLTNRCNIFIQGFLYAYSISTIIKTTMNLYMSMQKPMTKTSVKALCRLVELLKAIEHMFYRRSMVVADSVSHITQHLQHQALNSISVAKKRVISDKKYSEQRLDVLSALVLAENTLNGPSTKQRRLIISLALSVGTQMKTFKDEELFPLQVVMKKLDLISELRERVQTQCDCCFLYWHRAVFPIYLDDVYENAVDAARLHYMFSALRDCVPAMMHARHLESYEILLDCYDKEIMEILNEHLLDKLCKEIEKDLRLSVHTHLKLDDRNPFKVGMKDLALFFSLNPIRFFNRFIDIRAYVTHYLDKTFYNLTTVALHDWATYSEMRNLATQRYGLVMTEAHLPSQTLEQGLDVLEIMRNIHIFVSRYLYNLNNQIFIERTSNNKHLNTINIRHIANSIRTHGTGIMNTTVNFTYQFLKKKFYIFSQFMYDEHIKSRLIKDIRFFREIKDQNDHKVWSPWVL	275973	210611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_211904_211958_212842_215590_215691_215968_216166_216797_216895_222714_222863_226922_227010_227486_227554_230855_231928_232788_232924_234993_235099_235388_235464_237197_237353_237493_237663_239024_239142_239726_239833_241010_241091_241220_241368_241934_242043_246874_247001_252127_252255_257711_257873_258656_258785_258886_259011_259517_259639_260285_260390_260874_260918_262502_262586_266344_266413_266859_266906_267658_267725_267829_267884_272048_272189_275889
904922	contig_2703_pilon	+	586	2	Intergenic	novelGene_101640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGGACGGTGGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	3219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1458_2743
904924	contig_15371_pilon	+	2669	2	Intergenic	novelGene_151452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1385	junction_1	0	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	775	1074	160122	162977	FALSE	15	CTGGGGACGAGGTTGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKTTSEELACPREDLSVARKEELRKLLLDQVQTVLGLLTGILETVWDKHSVTAATPPPSPTSGESGMIHLPHMAFLFLNAVGSQGSNSLSRADRDDDS	159347	164572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_160243_162798
904925	contig_9516_pilon	-	2289	4	Intergenic	novelGene_106163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	112.676528168026	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	12	1211	828129	825196	TRUE	20	TTTCCTGGTGGTTGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLVVIEDEDERSEAAAMSPQASTSSTPSTTTTRRASSRVSSRAATQGKGGPSWEKPKVQHVGLQPSASLELGLSLDEEIPTTSTVLVSPPESQAKLTQAVSPSSVPSNIHLGVAPVGSGSALTLQTIPLTTVLTNGPPASTTASTQLVLQSVPPTSTFKDTFTLQASFPLNTSFQESQVAAPGPPLILSGLPQLLAGANRPTNPAPPPVTGAGPAGPSSQPPGTVIAAFIRTSGATAAPGVKEGPLRPSSYVQGMLTGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSQNQSLMGNQTFSPPSRPTVGLTPVAELELSSGSGSLFMAEPSVTTSGSLLARSPTPAPFSPFNPTSLIKMEPHDI	828140	823404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_823762_824474_826001_827058_827437_828112
904926	contig_14353_pilon	-	2537	5	Intergenic	novelGene_82151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	113.201148404069	1	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	598	726	407973	407845	FALSE	30	TTGGTAGTTTCTTGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVASASCPRNQTVPHRWPAFPPRVNEKEIVRSRTIGELLAPAAPFDKKCGCENWTVAFAPDGSYFAWSQGHRTVKLVPWSQCLKNFDGQKNKPREHTIDCGDIVWSLAFGSSIPEKESRCVNIEWHRFKFGQDQLLLATGLNNGRIKIWDVYTGKLLLNLVDHTEVVRDLTFAPDGSLILVSASRDKTLRVWDLKDDGNMMKVLRGHQNWVYSCAFSPDSSMLCSVGASKAVCIKVLVRSL	420349	406033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_407979_409840_409973_414146_414350_415277_415447_420261
904927	contig_6364_pilon	-	2997	1	Intergenic	novelGene_51722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAGAAAAAAAAAAAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438211	435214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_435200_438200
904928	contig_6356_pilon	-	6101	7	Intergenic	novelGene_126423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1019	172	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	3523	4518	75308	74313	TRUE	50	CACACACACACACAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWEKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTISKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLQEIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPSKKWAKEMNRHFTKEDVQMANRHMRKCSRSLTIREMQIKTTTRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCW	121091	23862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_23937_35169_35813_40573_40983_73855_75548_78648_79716_118593_120416_120697
904929	contig_17144_pilon	-	1083	5	Intergenic	novelGene_29550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2199.41816169641	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	52	819	173640	166363	FALSE	15	CTCTTAAACTGTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173691	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166739_172641_172740_173128_173209_173305_173460_173580
904930	contig_13014_pilon	-	3383	6	Intergenic	novelGene_169351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	48.0899157828333	200	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	356	760	416867	407330	FALSE	30	ATCCAGATTTGTTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSNEISFIRAGEGALKQALANGTLCILEPVMSVEIVAPNEFQGVVIAGVNRRHGVITGQDGIEDFFTLYADVPLSEMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYCRYQPCSPSTQEDLINKYLEATGQLPVKKGKAKS	425603	404706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_407462_407615_407670_408424_408586_416809_416962_418526_418681_425496
904931	contig_10904_pilon	-	3335	3	Intergenic	novelGene_22776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1846	2181	713233	712898	FALSE	30	ACCTTTTCTGGTGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFMVFGFIFRSLIHFELVFVYGVRYGSCFIFLQMDIQFCQHHLLKKIAFSPCNELWAFVEDQVTVGGWIYTSVFNSVPLVNVSVVVSVLDCFDYHSCTVHSSKYFLLLLK	839918	711743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_713728_735736_736581_839411
904932	contig_10341_pilon	+	3106	9	Intergenic	novelGene_47251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1462	1779	168247	168564	TRUE	30	AGAGAGAAGCCTGCTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRDILKIVPSFVFIFLHNCLWILSSQGLIIRSEGPTRFLSLLKRENKYCKHFPVLGNCFCFFKKNKKAKNNSSPPKKSLMFTVSMCFLKKLSKPQVCNRFSPC	166785	221203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_169009_170368_170459_172785_172871_174151_174215_175666_175715_182571_182697_197815_197956_201135_201259_220994
904933	contig_6028_pilon	-	2620	13	Intergenic	novelGene_156575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	186.486576073334	236	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	934	2244	332055	309678	FALSE	55	AAACAAAGAAATTCTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	354016	309301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_335867_336332_344627_344800_353771
904934	contig_12623_pilon	-	2809	8	Intergenic	novelGene_138162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	134.140346850085	336	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	5	1117	214398	51811	FALSE	0	CCTTGTTTCCCTGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDCSNDTTTLDASKPATEEVKSNSEESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	214402	50118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_147430_147540_177617_177720_214320
904935	contig_12884_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_104987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	693	1001	887327	887019	NA	10	GTGTTTGTTCAGATCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSPTREEPLKLQPTARPFLTVSSSQNICLEVSSEPVGPPWPYRSPGTPSSACTISQNTGGHFWGKHASPPPPAVPAWKASSIHLSGHQRAQETIWGLGRG	888019	886230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_886200_888000
904936	contig_13021_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_8221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	530	916	180464	180850	NA	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	179934	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_179900_181200
904937	contig_15666_pilon	+	3399	2	Intergenic	novelGene_70220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCACCTGCCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128653	132348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_131713_132008
904938	contig_7293_pilon	+	970	3	Intergenic	novelGene_54240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	646	junction_1	44	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	71	427	329270	330139	FALSE	20	TCTTGTAAGCAGTGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRHNTTSCTSVSPFGVLQVWLLLSLLLTALVPGTSQETNCVEAELYTELRCMCVKTTSGVHPSYINTLKVIRAGAHCNKVEVIATLKDGKKICLDPEAPIIKKIVQKILQSDGSAA	329199	330682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_329388_329744_329881_330036
904939	contig_12050_pilon	-	3006	3	Intergenic	novelGene_62709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2343	2672	643528	643199	FALSE	45	ATACAAGTGCTATAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRDSASASGWNPSSQCFPAKRLAAGSRGGRVGVKNGRGWESVYHKLPVVLSPAGSSVKLLSRTPYLLVSDRSPRWWIRAALDDTGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	678153	642864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_644381_673526_673717_676853
904941	contig_7452_pilon	+	3437	1	Intergenic	novelGene_109151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2725	3042	137315	137632	NA	55	GGAAATAATAAAGATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHQKDITLRNIYAPKDRAPKYIKQTLTALKREIDCPTIIVGDFNIPLSVKNRISRKKLNKDTEDLKATINQLDLIDTCRTLHLTAAKYTFFSTHMEHSPE	134590	138027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_134600_138000
904942	contig_3155_pilon	+	1823	5	Intergenic	novelGene_26376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	24	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	69	590	258156	261298	FALSE	35	AGTGATGAAGTTGCATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTSVPGKTSHTFSTSHNVTALVILT	258087	262531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261149_261220
904943	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
904944	contig_14326_pilon	-	2509	8	Intergenic	novelGene_120717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	56.5216230972804	38	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	241	1368	447468	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQSEARRGPELRAAAKWLQFPQLALRRRLGQLSCMSRPALKLRSWPLTVLYYLLPFGALRPLSRVGWRPVSRVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	451604	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_445734_445901_447415_447627_451522
904945	contig_2770_pilon	-	1565	6	Intergenic	novelGene_107449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1801.97320734799	46	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	216	653	750561	743847	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEGNSYR	750776	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744032_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
904946	contig_7045_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_77467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382510	379705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_380516_381122
904947	contig_935_pilon	+	2680	4	Intergenic	novelGene_45583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1447	1908	629499	629960	TRUE	35	CCTGTAAGTACAATAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNVCLHKNCEVSVPGQDRDVNASDLHSELPVTVPQGHGEHTLMVLPMDGQLLMVASYSGAVIHKGPLFLPHLVQSWVRRSVKHQMNLFSILEAMPHPLEVFDGRFTHQIFIPATDAQHKILLALAFRDIHQRLLLGHLGEEALEDGVWGVIG	623013	632580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_623566_623677_623743_628669_630676_632523
904948	contig_17427_pilon	+	2274	11	Intergenic	novelGene_30402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	141.227476080259	54	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	9	1412	331916	367940	FALSE	20	AATACCCTTCTCCGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAASRTVSVGSGLRGLRRTLPLVVILGATGTGKSTLALQLGQRLGGEIVSADSMQVYEGLDIITNKVSAQEQRICQHHMISFVDPLVTNYTVVDFRNKATTLIEDIFARDKIPIVVGGTNYYIESLLWKVLVNTKPREMNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPSVPPVYGLEVSDVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGRKPAATPIKMPCNETENKRSYHVCDLCDRIIIGDREWAAHTKSKSHLYQLKKRRRLDSDAVTTLGSQSISPERDKELKEKGSSGRNDQELKSSI	331907	368802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351803_355729_355829_356562_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365288_367770
904949	contig_4803_pilon	-	3886	17	Intergenic	novelGene_150705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_16	389.042253489258	13	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	254	1501	45557	15989	TRUE	25	TATTTTCATGTTTCAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEESKAPAPTPERNTVLRTSLCSIQSAPPKPATSKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPPMSEDLLLEALSEDFSGPRPADTSSLKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	45992	12652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_37478_37575_39339_39436_41849_41934_45461_45564_45745
904951	contig_6084_pilon	-	2422	2	Intergenic	novelGene_127051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1652	1951	423954	423655	TRUE	30	AACTGTTTGTAGATATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQALHRAESSTARWCQATTTDCSDQDHNRWFWTELEKDVEQNSNSQKKEQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRVTVQPGSGQPHKTKWD	425605	380383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_380421_423220
904952	contig_11493_pilon	+	2959	4	Intergenic	novelGene_143711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270216	294911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_270784_291319_291718_292852_294295_294359
904953	contig_13699_pilon	+	4512	8	Intergenic	novelGene_158321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	219.658083095951	4	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2049	2462	4510	72698	108549	FALSE	45	GAAAAAACTTGCTAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRLQAALASTQQFQQMFDELRTWLDDKQSQQAKNCPISAKLEQLQSQLQENEEFQKSVNQHSGSYEVIVAEGESLLLSVPPGEEKRTLQNQLVDLKSHWEELSKKTADRQSRLKDCLQKAQKYQWHVEDLVPWIDDCKAKMSDLRVTLDPVQLESSLLRSKAMLSEVEKRRSLLEILNSAADILINSSETDEDDIRDEKAGINQNMDTITEELQAKTGSLEEMTQRLKEFQESFKNIEKKVEGAKHQLEIFDALGSQVCSNKNLEKLRAQQEVLQALEPQVDYLKNFTQGLVEDAPDGSDASQLLHQAEVAQQEFLEVKERVNSGCVMMENKLEGIGQFHCRVREMFSQLADLDDELDGMGAIGRDTDSLQSQIEDVRLFLNKIQVLKLDIEASEAECRQMLEEEGTLDLLGLKRELEALNKQCGKLTERGKARQEQLELTLGRVEDFYRKLKVLNDMTTAAEEGEALQWVVGTEVDVINQQLADFKTFQKEQVDPLQMKLQQVNGLGQGLIQSAGKNCDVQGLEHDMEEINARWNTLNKKVAQRIAQLQEALLHCGKFQDALEPLLSWLADTEELIANQKPPSAEYKVVKAQIQEQKLLQRLLDDRKATVDMLQAEGGRIAQSAELADREKITGQLKSLESRWTELLSKAAARQKQLEDILVLAKQFHETAEPISDFLSVT	63594	108551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_65583_66406_66452_70845_71266_72689_74162_104575_104738_104916_105088_106270_106438_108464
904954	contig_5918_pilon	+	1878	5	Intergenic	novelGene_99478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1209	junction_2	235.781148525492	45	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	28	663	158624	166269	FALSE	25	ATTCAGCAAATTTTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKVERLTMQVSSLQREPFTIAQGKGQKLCEIERIHFFLSKKKTDELRNLHKLLYNRPGTVSSLKKNVGQFSGFPFEKGSVQYKKKEEMLKKFRNAMLKSICEVLDLERSGVNSELVKRILNFLMHPKPSGKPLPKSKKTSSKGSKKERNSSGMARKAKRTKCPEILSDESSSDEDEKKTQEESSDEDKESEEEVKCFVPFFSSFLSHEKSQIFLLCNR	158596	167484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_158670_158903_159014_160171_160267_161124_161246_166005
904955	contig_5419_pilon	-	2375	11	Intergenic	novelGene_15464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	66.4857879550209	27	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	9	836	79704	70320	TRUE	55	GTAAAAATTAATATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAESEYESVLCVKPDVSVYRIPPRASNRGYRASDWKLDQPDWTGRLRITSKGKIAYIKLEDKVSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSRYFVIRIQDGTGRSAFIGIGFTDRGDAFDFNVSLQDHFKWVKQESEISKESQEMDTRPKLDLGFKEGQTIKLSIGSITTKKGGASKPRTAGPGGLSLLPPPPGGKITIPPPSSSVAISNHVTPPPIPKSNHGGSDADILLDLDSPAPVITPAPAPVSASNDLWGDFSTASSSVSNQAPQPSNWVQF	79712	18005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_18108_21616_21734_25954_27202_70246_70369_70693_70797_72459_72644_72723_72833_73654_73737_74407_74513_74670_74772_79609
904956	contig_8386_pilon	+	4650	9	Intergenic	novelGene_82204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	434	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGGAAGAAGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16095	35745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_18829_19753_19900_20485_20595_20735_20858_21223_21318_21438_21528_21914_22023_31345_31423_34573
904957	contig_14727_pilon	+	5515	11	Intergenic	novelGene_56649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	174.953250898633	21	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1202	3609	205	3813	315073	342062	FALSE	55	TGGACATATAAAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSMLHHRELENLKGRDSSHECRVCGVTEVGLSAYAKHISGQLHKDNVDAQEREDDGEGEEEEEDYFDKELVQLIKQRKEQSRQDEASSSSQEINPDDRRPQWRREDRFPYQDREGYSQPAWHHRAPPQRDWKWEKDGFSNTRKNSFPHPSRNSGGQRGCSGWHKGVGGGSSAWFHNHSNSGGGWHSNSGTVDWNHNGTGRNSSWHSEGTGGFSSWHMNSSNGNWKSSVRGTNSWNYNGPGDKFQPGRNRNSNCQMEDMTLVWNKKSNKSNKYNQERYNCQRQENDKVGTVATYPSPEGFANDNFSSEGLFDFNFEQLESPTTKQTDTIAPKIGGRNGSVAKEKLRRWTPYPSQKTLDSQSAVKDVAGNKSEKTDKPFFDFNLITTGTKEAQTDVTSNSPVLKTQKETRLESFHHKATSDCTVSYEVVRDCPITEKPEQEHISSKMPSLKSIRLPVPGTKSIPQKQDSKNPSRNIKSNSFFPGEHSHPLNKPIVEDNHSSPYVPKLRSVLKGNNKSTFGAQREPSENVSDTLQKAKEVLPCHESAQKPSLPTSKRTRSYAKASRNVEESEKGSLKIEFQVHTLEDESGGEISDTEKHGTTIGTLGSATTEVLSCSTRPADEKVGDDQILKTCRKLSTSPCNSIVHKKESELQMTSAGSPHPSLLLDLKTSLEDTQVDDPVKSHVSYETEGFESTSLDAELQKSDIGQPSGPLLPELSKLGTGAHLPEPNLNSARRIRNISGHRKSETEKESGLKPTLRQILNASRRNVNWEQVIQQVTKKKQELGKGLPRFGIEMVPLVQNEQEGLDLDGEADLSNLEGFQWEGISISSSPGLARKRSLSESSVIMDRAPSVYSFFSEEGTGKENEPQLVVSPGNSLRATQSQKVTAGFKQEMIPVAASLRTGEMAENVAIRRRHSTQLPSDCTIPLVHSAKDLSSQESSAPASETPNGQESNGEGNSASSNLSSALANSSLVDAATDSSCTSGAEQTDGQSIRKKRRATGDGSSPELPSLERKNKRRKIKGKKERSQVDQLLNISLREEELSKSLQCMDSNLLQARAALQTAYVEVQRLLMLKQQITMEMSALRTHRIQILQGLQETYEPSERPDQVPCNLSRERRNSRSQTSADATLLPTPFFPVFLDPSQVSPSSTSSIFQVSGIVPAPDSSVQIKQEPMSPQRDENVNVVPQGSAGSVSKELSQTNSM	284645	343764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_284749_306245_306332_315057_315120_328614_328816_332847_334759_334812_335023_336126_336761_338200_338271_340710_340866_340949_341011_341742
904958	contig_15236_pilon	-	1943	1	Intergenic	novelGene_141544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAGGAACGGAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114028	112085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_112100_114000
904960	contig_2496_pilon	+	1705	2	Intergenic	novelGene_168514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATCTAATAATCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95160	124163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_+_96845_124142
904961	contig_16541_pilon	-	1468	5	Intergenic	novelGene_126729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	199.254861923116	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	35	334	353170	290932	FALSE	30	AGAGGCTTAATGTTTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLAGLVGDGSIMASMQKRLQKELLALQNDPPPGMTLNEKSVQNSITQWIVDMEGAPGTLYEGEKFQLLFKFSSRYPFDSPQRRPPDNSFYVRTCNKNPKKTKWWYHDDTC	353204	289797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_290946_301648_301725_316655_316759_319826_319919_353155
904962	contig_21232_pilon	-	2814	13	Intergenic	novelGene_165975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	520	912	25361	19749	TRUE	25	TGGACCAGGGGATGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGASTEGGGSVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAASVQNDAELDAPSVTFPTCAKISTV	28205	4263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_4508_4781_5043_11043_11285_13445_13665_14910_15168_18091_18347_18623_18853_19552_19820_22216_22505_25327_25462_27266_27475_27590_27714_28117
904963	contig_6102_pilon	+	3549	21	Intergenic	novelGene_32347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_19	76.3630146078584	277	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	958	2877	604	3480	1699043	1714849	FALSE	35	TATACAAAGCTGAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVFSGVLPLHDGRNSQLSGSGARNFIQYSISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1698439	1714918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
904964	contig_12677_pilon	-	1480	2	Intergenic	novelGene_110717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_272_357
904965	contig_3862_pilon	-	3610	1	Intergenic	novelGene_137423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1320	1694	601146	600772	NA	30	GAATGTGGAGATCTAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFHGYFFNGKILQMLSFKKSLNACSYFFHTVCYLVLCETPRYWLPRCWELLTLPCTVSVLAAKQLSSLLCFHSLHTSIKMVAHPFVYRTENQLVKYVCIAWVLLNLTNWTNDSVKYLYIAPYF	602465	598855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_598900_602500
904966	contig_6760_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_150790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTCCTTGGGAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159583	162095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_159600_162100
904967	contig_9706_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_21040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644661	642151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_642200_644700
904968	contig_14505_pilon	-	1239	9	Intergenic	novelGene_171959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_8	81.0831941588391	156	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	209	1237	46523	12354	FALSE	40	GTAGATAATTATGTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEALLEGMQNRGHGGGFLTSCEAELQELMKQIDIMVAHKKSEWEGQTHALETRLDIREQELKTLRSQLDMKHKEVGVLRQQVEEHEKVKQEMAMEYKQELMKLHEELGRLKRSYEKLQKKHIRDSRGNTKSHREDRCEIERLTGKIEEFRQKSLDWEKQRLIYQQQVSSLEAQRKALAEQSEIIQAQLANRKQKLESVEMSSQSEIQHLSSKLERANDTICANELEIERLTMKVNDLVGTNMTVLQEQRQKDEELKESEKLLEILREEKRELKAALQSQENFIREARLQKETLQAKLRSLEEPQSERRCNSQGREDLENVLSQLDFTHTSEELLQAEVTRLEG	48961	12351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14505_pilon_-_12490_13313_13418_13664_13899_30912_31027_36707_36831_37699_37796_45097_45276_46479_46549_48778
904969	contig_1596_pilon	+	1208	3	Intergenic	novelGene_131586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	33	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCAGCAGCTGTACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83506	164665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_84341_97991_98198_164497
904970	contig_3627_pilon	+	1398	3	Intergenic	novelGene_78489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	65525	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	246	719	621315	634316	FALSE	20	GATTTAAGCTGTCTGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLKCNKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621069	634995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
904971	contig_2689_pilon	+	3233	2	Intergenic	novelGene_100846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	131	460	306865	307194	TRUE	55	AATACGTTATTAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNGESLRAFPLKSGTRQGCPLSPLQFNSVLKVLVRAIKQEKEIKGIQIGKEEVKLPLFADDMILYTENPKESTRELLELTEEFSKVPGYKGNKHQTGYYTSAMRNLNV	306734	351162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_309201_350395
904972	contig_12644_pilon	-	2122	12	Intergenic	novelGene_44485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	522.158473142379	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	7	1653	1123673	1026372	FALSE	60	CTTGTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQALQHLPPCRCCRSSFR	1123679	1025902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231
904973	contig_5779_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_106522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTTTAATTGTTAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313924	310938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_310900_313900
904974	contig_12951_pilon	+	3393	3	Intergenic	novelGene_68177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2674	3126	343227	343679	FALSE	55	AAAAAAAAGCAGCTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSTEPHVSAPQCTTPDRKSATRAPATVDEKKMGWGWGDGHRTPCPPITLLALITPLLGLPQEMQGPICLVSLEGINWACSGQPFSTRRWPLLSAGPHHSSTCGSLFCSSVARARMEISDSFWGLVPGSTLPPDRSHTPQPSFSQQSTQ	337000	343946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_337834_340191_340419_341613
904975	contig_5961_pilon	-	5345	1	Intergenic	novelGene_144158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACCACAATATGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223715	218370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_218400_223700
904976	contig_17976_pilon	-	2010	4	Intergenic	novelGene_32514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	1113	1739	48761	46460	TRUE	20	ACTGGGACAGTCACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLINVIFPSPLTPLSPAFSAFQVTPAAFHLTPSGLHLTAAAFHLTPSGLHPTAAAFHLTPSGLHPTAAAFHLIPSGLHPTAAAFHLTPSGLHPTAAACHLTPAGLHPAAAACHLTPAGLHLTSAAFHLTPDGLHLTAAAHHLTPAALHLTSAAFHLTPDGLHLISAAFHLTPDGLHLAAAAFQLTAPVFQLTPSVFRVQVSPAAFR	49873	41662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_47027_48701
904977	contig_1867_pilon	-	3721	5	Intergenic	novelGene_54530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	9	136	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	738	1400	303104	299073	TRUE	30	TCAGGTGACTTAGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERDALRASESGIKCRIHDLKASTCALKESLISRSNRAEIAENQTQSLIVRVAELQCQLSCKPREVSEVKVRALIGKRWDPETWDGDIWADNQEAGDTEPVNSIESLLPAEPVPSEEITSCLSAKPPCPEKPLAPPLPSEEIIPSPAASKEHLPESLPGVSPEADALQGNAECSQNNSTLPILASRPTLSPRYGTIPQGDQPATWWQGDYMGPLPSWKG	303883	294895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_295525_295788_295880_297471_299178_302546_303343_303384
904978	contig_6058_pilon	-	2250	3	Intergenic	novelGene_172420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	152	junction_2	79	26	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	109	330	401483	398024	TRUE	40	GAATTTACAGCATTAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNGGRERVGRYSPGGLWLSGQLSRHQRTERDEAPGDMVFETPGLLTTKFFEALSAPEATKRARPGNPQPLQTPAPRLRTASLPRPRPSECGGGRQRGLKKWPKELLKRN	401591	393861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_395744_397985_398065_401302
904979	contig_5711_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_80289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACAGGCTTTAGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219087	217103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_217100_219100
904980	contig_5999_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_45596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6792	7753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_6800_7800
904981	contig_15837_pilon	-	2196	8	Intergenic	novelGene_147521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	57.3158096934548	221	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	706	1374	24793	7311	FALSE	25	TTTTAATTGAAACTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTIQCRALVCLQSLVSLLDVDHLGGAPALQTLAQHLSQLLFSQPDFAKHTDFLEAISGALRALLQTMASKNISQCMTPDQLMTLCKAGIYNSNTGVRVNVVSILGITGSVLAKEDGTLETLKTIGCCLLEVATKDPSLVVAGEALDALFDVFADGKEAEKASVQIRLLSALKEFQPVFKMKMRKEGRSKYSQEQLCVLDNVKMNLRRFITYQETVEKRLTS	36440	6488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_7434_9637_9815_12045_12190_17614_17704_24657_24795_26598_27133_27230_27322_36361
904982	contig_8464_pilon	-	1345	2	Intergenic	novelGene_125397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTCCCTGTTGACATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882968	873886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_874208_881944
904983	contig_16846_pilon	+	2333	9	Intergenic	novelGene_82861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_4	435.264574712898	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	202	1302	179165	207005	FALSE	20	AATGTGGTTCCCAGACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPEQVAICLQLLDFIAPRAELSVRLRSRPVGRQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVWTYKGRPKEKSFLYEIVANKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARVCEVDNKKHICTREKVSYVSGNNKEGV	178963	208036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206637_206739_206857
904984	scaffold_19766_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_34403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	121	483	826299	825937	NA	65	TAAAAAAAAAAATGGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEFEDVVGDWYFHHQEQPLQHFLCKGHVLPVAETGKCVGWAPFLPGHNLPYLQDQYLNCLFSPNLACLEEAWTGKEKITDGQEKTEGEEEHEGEEEHEKEEEEITETPGHPKHDPEDL	826419	825052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_825100_826400
904985	contig_2100_pilon	-	1240	11	Intergenic	novelGene_50713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	970.704491593606	2	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	83	1048	1182812	1170114	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQENVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTTRTAGPSVVNSPLNPGDVLTASLELL	1185493	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170195_1173275_1173374_1174204_1174403_1175562_1175651_1175728_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
904986	contig_10437_pilon	-	3680	1	Intergenic	novelGene_38465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	540	3140	3679	1109022	1108483	NA	50	AAACCAACAGCCAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAQALGPANRFINPKCAKYILKTNLIKEAEEMRSKFTREATSVVDLNEMQTMWFQTEGAWACKAMNKFGEALKKYHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRYYVDLLKLEDVLRQHPFYFTAARTAIEIYLKLHDNPPTDENKEHEADTANLSDKELKKLCNKQKRAQKKAQVNLC	1112161	1108481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1108500_1112200
904987	contig_2114_pilon	-	4944	3	Intergenic	novelGene_104233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATCCTCCTTTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145215	138462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_138491_139404_139768_140662
904988	contig_5758_pilon	-	1833	8	Intergenic	novelGene_119054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_7	273.652468414571	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	861	972	1832	91284	45474	FALSE	70	AAAAGGATCAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSFPHCVSSCNSFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRGHGADVKCVDWHPTKGLVVSGSKDSQQPIKFWDPKTGQSLATLHAHKNTVMEVKLNLNGNWLLTASRDHLCKLFDIRNLKEELQVFRGHKKEATAVAWHPVHEGLFASGGSDGSLLFWHVGVEKEVGGMEMAHEGMIWSLAWHPLGHILCSGSNDHTSKFWTRNRPGDKMRDRYNLNLLPGMSEDGVEYDDLEPNSLAVIPGMGIPEQLKLAMEQEQMGKDESNEIEMTIPGLDWGMEEVM	92255	45472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_45542_45763_45851_46830_46926_47492_47604_48269_48349_48445_48601_49701_49829_91145
904990	contig_11839_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_155351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTGAATTGTAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17381	19341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11839_pilon_+_17400_19300
904991	contig_3975_pilon	-	2564	12	Intergenic	novelGene_54738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	413.722009115355	56	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1121	1642	1721714	1719543	FALSE	20	GAACCCCATGCTGATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS	1731310	1718620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722355_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
904992	contig_9468_pilon	+	2854	2	Intergenic	novelGene_59532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	20	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	517	843	591674	592000	TRUE	75	TACTAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDIPTANGHVRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTSVRLALIQKTQNNKCWGGCGETGTLIHCWWEYKMVQPFWKLIWCFLKKLEIELPYHPAIPLLGIYPRK	591157	612448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_592212_610648
904993	contig_16578_pilon	-	2878	1	Intergenic	novelGene_148647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCTTGCCTAGAACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174657	171779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_171800_174700
904994	contig_8322_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_143218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGCACAATAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87598	86661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_86700_87600
904995	contig_6673_pilon	+	2092	2	Intergenic	novelGene_164015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGCAAAAAAAAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62012	102531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_62513_100939
904996	contig_6589_pilon	-	1801	14	Intergenic	novelGene_26269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	64.1822479097263	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	174	755	2233261	2230875	TRUE	15	TCTTCAAGCTTGGCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELEAEGRLWLESPLGGALPIFLPTNGQALILGRGPLTRVTDRKCSRNQVELIADPETRTVTVKQLGVNPSTAGTQELKPGLEGSLGVGDTLYLVNGLHPLTLRWEETCTAGSQPDTPPGTLLVAPDLKEDAEPQKKRMRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKVAGFDLDGTLITTRSGKVFPTSPSDWK	2233434	2227811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228987_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230523_2230632_2230737_2230959_2231914_2232215_2232513_2232561_2233110
904997	contig_5039_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_64796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGCACTGGAAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174005	171270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_171300_174000
904998	contig_12677_pilon	-	520	1	Intergenic	novelGene_110888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTCCAATACTAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3737	3217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3200_3700
904999	contig_8954_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_130272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	189	512	115033	114710	NA	10	TTGGTAGGCAGTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSCIIFLNSSIILTVLSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGTFSTFSSIGKSSGVLFWMPTGTILFCFGKCFDIVCCLRGIQ	115221	112974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_113000_115200
905000	contig_10766_pilon	+	2854	1	Intergenic	novelGene_151220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2040	2354	193790	194104	NA	80	CAAAAAAAAAAAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKINFTFHVRKVDCVEICNRMKECYHVLFQGSSASPLSHDAGTAEGGKGAATHSTHALSSRALISFLPLSCPWSSSPHLLTGQVVKNKQEQVIMLVTSKAIR	191750	194604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_191800_194600
905001	contig_11986_pilon	+	9433	1	Intergenic	novelGene_69131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	798	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	2812	3315	150363	150866	NA	60	AAAAAAACCACCATCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKHGLLLLLYLYRSRISLLSKQILSVFQDPSQVMPCLTTPTHRPPPSSECLGTYCSCIFQNPFHAEDGVTGKNNVWRSHKFGKYWANKAKCISLATGLLQVSNMLTCIFKRGDLVHSYILIYYLKFLLTFLCVYVVSFTTFIMVSIFSFFLVTCLAPVSLTRRIF	147551	156984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_147600_157000
905002	contig_8581_pilon	-	2161	10	Intergenic	novelGene_22832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	585.363092975022	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	78	1475	326214	307094	TRUE	35	AAGACTCGAGTCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	326291	306341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306642_306707_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006
905003	contig_678_pilon	+	8211	5	Intergenic	novelGene_167769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	84.870489570875	184	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	5049	5555	17233	19701	TRUE	20	GATTGAACTATCTCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVTLQIHHLKSLFRVQRKHITPPTPQEINFTRCQEALLRLYQSPLLRWRETREEPMTFIVTSLSHLHNRLTRLRKLSLLATPLSERIQFSSPSGFRGGPGIFNKTSFASWDLLTITSLSLTAVCIRLTLDWSGRMLSRSWNPSIDLALCPRDAMYLSFVQVMCTFS	11360	22564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_13297_13547_14627_15199_17634_19595_19781_19987
905004	contig_7593_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_127300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTCCAACCCCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185687	183217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_183200_185700
905005	contig_12622_pilon	+	2574	6	Intergenic	novelGene_5860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	102.29486790646	129	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	2177	2572	1107540	1110080	FALSE	35	AGATGACTCATGTGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISHGLVSFKDLIVDFTQEEWQQLDPAQRLLYRDVMLENYSNLVSVGCHVSKPDVIFKLEQGEEPWMEEEFSSQNYSEVDGALKKNEDVQNKHLMQIVFFSNNTLIAERADIFGNTFNLGMNIVPSIKIPY	1100804	1110082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1102875_1103000_1103062_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986_1109080_1109919
905006	contig_5023_pilon	+	2386	16	Intergenic	novelGene_7333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2052.73192491264	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	15	1115	607309	629249	TRUE	15	AATCCTACTCTGCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTNQRTRTSTGGLLKVRRGRSGHLGTG	607294	647590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625720_625801_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
905007	contig_5324_pilon	-	2440	3	Intergenic	novelGene_102065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	99	641	444540	443941	TRUE	20	TGGCATATGAGTGTGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444638	442016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442425_442549_444131_444187
905008	contig_15327_pilon	+	6338	1	Intergenic	novelGene_70549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	403	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTTAGGCAGTGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549410	555748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_549400_555700
905009	contig_4964_pilon	+	3257	3	Intergenic	novelGene_157255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATGTTTCTCAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122851	129771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_125965_126977_127048_129697
905011	contig_5033_pilon	-	4395	5	Intergenic	novelGene_28944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1237.11728930607	203	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	487	711	464569	456452	TRUE	65	GGAAAGAAAAAAAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPALWALGEVLAQAGDRALSLQAGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRREYPCSAWVGGGRE	465055	451090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451512_452806_455578_455959_456604_462979_463031_464547
905012	contig_11417_pilon	-	1569	7	Intergenic	novelGene_103299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTGAATCACATTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537821	517482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_517511_521567_521647_527037_527106_528492_528609_529167_529346_530871_530957_536806
905013	contig_16103_pilon	+	1505	2	Intergenic	novelGene_118693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	30	386	197793	198149	TRUE	5	GGGGCCCGTCCCGGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVAPTSSWGMGSQSKLSHTVSSLVANFLGPALPATPSLWGESEPALPQGPSGPAPLNTPRAKFTSSPMRWDSISVPLLGAPTPMTAHSGTISFSKLVPEPSQLGTILAFPESVFIQREHLFLSHLVS	197763	199922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_199195_199848
905014	contig_8702_pilon	-	3722	10	Intergenic	novelGene_157728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1953	2435	50726	50244	TRUE	35	GGAAGAAACCCGGGCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTLGATRRILSSASLVCRELEPLTPLEIAPSSRPWASTVPFLASPISPGLSDPPAELLSLPEPQVSSVNLEGWAESRAAADFSGVEFLSLLPPDFFRGRPRFLLASAPVSSISCFAALAGGSCPLASLTATSAVLLTPLSWGPGSPPMPTSLLSVHWG	52678	46658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_-_46711_47116_47253_47469_47503_47906_47991_48252_48374_48554_48673_48794_48880_49182_49382_49620_49728_49891
905015	contig_854_pilon	+	5934	14	Intergenic	novelGene_36366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1983	2531	976970	977518	TRUE	15	AGTAAGGTGGTGTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSGVSTHLLGPAHLPRGQRQVVLLLHCFEELNGWHLGHDWAWGLLGLGHLVQAPHLRRRVRGRGLAPGREQARPESREEAVITHLLQDKEPLGVGGPRGLMCPGLPWAQDRAAEFSRSRAAERGLGRLACGWRELHIVLKPWLQGGWGSRGSTGQSRTGAGVLVRGVTQRGSQGARQGLWG	974691	994392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975017_975312_978083_978784_978892_979721_979779_980007_980100_980727_980893_981768_981907_984025_984183_984331_984468_985010_985183_985262_985419_991117_991309_991918_992043_993048
905016	contig_2550_pilon	-	4860	25	Intergenic	novelGene_135694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_12	116.803543218232	303	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1069	3210	52	3261	1801470	1648845	FALSE	30	CAGCATTGGTTTGTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKASVGKISVSSDSVSTLNSEDFVLVSRQGDETPSTNNGSDDEKTGLKIVGNGSEQQLQKELADVLMDPPMDEQPGDKELVERSHLDGEGDAPLSNQLSASSTVNPVPLVGLQKPEMSLPVKPGQGDSEMSSPFTPVADEDSVVFSKLTYLGCASVNAPRSEVEALRMMSILRSQCQISLDVTLSVPNVSEGTVRLLDPQTNTEIANYPIYKILFCVRGHDGTPESDCFAFTESHYNAELFRIHVFRCEIQEAVSRILYSFATAFRRSAKQTPLSATAAPQTPDSDIFTFSVSLEIKEDDGKGYFSAVPKDKDRQCFKLRQGIDKKIVIYVQQTTNKELAIERCFGLLLSPGKDVRNSDMHLLDLESMGKSSDGKSYVITGSWNPKSPHFQVVNEETPKDKVLFMTTAVDLVITEVQEPVRFLLETKVRVCSPNERLFWPFSKRSTTENFFLKLKQIKQKERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSIRLPQSGSQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLSVRPKQLSSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDHLVEKYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKKLMELACSMKIGQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQLKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIRQKVDDCERCREFFNKEGRVKGISSAKEVLDEDTDEEKEILKNQLREMELELAQTKLQLVEAECKIQDLEHHLGLALNEVQAAKKTWFNRTLSSIKTATGVQGKETC	1801521	1647245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1648968_1650350_1650549_1652243_1652316_1653044_1653129_1654039_1654145_1659994_1660106_1660529_1660623_1671583_1671713_1671975_1672018_1673856_1674001_1674585_1674712_1677962_1678038_1682020_1682135_1743881_1744033_1748640_1748735_1752722_1752898_1769461_1769632_1770656_1770760_1771467_1771535_1772085_1772197_1776275_1776434_1777053_1777229_1777997_1778203_1779819_1780055_1801320
905017	contig_5084_pilon	-	3955	4	Intergenic	novelGene_64571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2403	2729	647643	647317	TRUE	20	AGGTCTTTTGTAGCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDIQAANRYMRNRSQSLAIREMQIKTTMTYYLTPTRLALIQKTQNNKCWSSCGETGTLTHCWWECKMAQPLWKSIWCFLKKLEIEVPYNQEFHSLEYILEK	768344	646046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_646800_646843_647656_765166_766334_767121
905018	contig_6241_pilon	-	2798	4	Intergenic	novelGene_156406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_3	142.452331208256	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	187	1965	195215	182242	FALSE	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPVFEAVGRIYELRLMMDFDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMKKREEILEEIAKVTEGVLDVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLMPGRIQLWGHQIAVDWAEPEIDVDEDVMETVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYQKAAKGGGGAEAATQQPSYVYSCDPYTLAYYGYPYNALIGPNREYFVKAGSIRGRGRGAAGNRAPGPRGSYLGGYSAGRGIYSRYHEGKGKQQEKGYELVPNLELSAVNPVAIKPGAVAIPAIGAQYPMFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	195401	181408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193303_194092
905019	contig_16496_pilon	-	1027	2	Intergenic	novelGene_5225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	35	TCCTTAAGATAAATGTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
905020	contig_10549_pilon	-	3268	1	Intergenic	novelGene_110591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	901	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCATTTATGTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118255	114987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_115000_118300
905021	contig_11816_pilon	-	3558	21	Intergenic	novelGene_98493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_20	148.079125807792	202	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	994	2985	95	3079	599730	526076	FALSE	40	CCCTCAAGGAAATCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRWATPRCAVGFLVLLLRCFARAEPSGTTGNDPFTIVNADTGKCIKPLNDWIVAKDCQETEDMLWKWVSRHRLFHLQSQMCLGLDIAKPVDSLRMFSCDSSAMLWWKCEHKFLYGAAQYRLTLKDGHAIASTNSSDVWIKGGTEESLCEQPYHEMYTRDGNAYGRPCEFPFLINGTWHHECVVDENHSGPWCATTLNYEYDQKWGICLKPENGCGNNWEKNEQIGSCYQFNTQTALSWKEAYISCQNQGAALLSINSAAELTYLKEKEGIARIFWIGLNQLYSARGWEWSDHKPLNFLNWDPDMPRAPTIGTSSCARMDAESGLWQSFSCEAQLPYVCKKPLNNTVELTDVWTYSDTHCDSKWLPNNGFCYLLANESGSWDEAHAKCKALSSDLISIHSLADVEVVVSKLHNGDAKEEIWTGLKNINIPTLFQWSDGTEVTLTYWDENEPNVPYNKTPNCVCYLGKLGQWKVQSCEEKLKYACKKKGEKINDAGSDKMCPPNEGWKRHGDTCYKIYADNVPFGTNCNLTITSRFEQEYLNDMIKKYDKFQRKYFWTGLRDVDSRGEYSWASVGGIKRAVTFSNWNYHEPAFPGGCVAMSTGKSLGKWEVKDCRNFRALSICKKMSEPPEPEEAAPKPSDPCPEGWYSFPSGLSCYKLFHIERVVRKRNWEEAERFCQSLGAHLPSFSHMNEIKEFLQFLMDQFSGQRWLWIGLNKRSPDLQGSWQWSDRTPVSAVFMANEFQQDYDIRDCAAVKVVRRPWRRGWHFYDDREFTYLSPFACDAQLEWVCQIPKGRTPKTPDWYNPERAGIHGPPVVIEGSEYWFVADPHLSYEEAVLYCASNHSFLATLTSFAGLKAIRNKIANISDDEQKWWVRITEQLPDHHFIYSRHPWHHFPLTFGEECLYMSAKTWLRDLNKPADCNTKLPFICEKYNVSSLEKYSPESAAKVQCSGKWIPFQNKVKSKLLRCANDDYFYESCKTNDKMVPHQITSLR	599824	525596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_526318_526859_526940_527231_527300_528276_528453_528799_528836_530424_530540_536028_536098_537161_537244_557845_557989_559663_559864_563103_563274_563411_563501_564055_564167_565625_565784_566698_566891_569925_570067_571234_571346_577146_577312_586398_586570_592877_593250_599636
905022	contig_7022_pilon	+	4076	24	Intergenic	novelGene_142125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_16	159.244637091313	10	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1357	4071	4	4074	34270	196316	FALSE	65	AGAAAAACTAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGHLFRAAGDQPFNLSTVSSAFPMVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSESDSNSESDTEGSEEEDDDDDKDQDESDSDTEGEKTSMKLNKTASSVKSPSMSLSAHSTPRNLHIAKAPGSAPAALCSESQSPAFLGTPSSTLTSSPHSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYWILPQCGGIFVEGMESGEGLEEIAKE	34266	196318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_119394_119692_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477_174623_196293
905023	contig_8140_pilon	-	970	1	Intergenic	novelGene_86445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTTGAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739745	738775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_738800_739700
905024	scaffold_2602_pilon	+	4084	14	Intergenic	novelGene_127693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_8	429.456282088005	30	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	2688	3317	55532	68818	FALSE	10	TACTTTTTTGTTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYTGRKCTTQTTRKRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	37506	69585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_55579_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
905025	contig_5523_pilon	-	4568	4	Intergenic	novelGene_169100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_3	115.511423196534	414	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	167	1540	410975	406061	FALSE	35	AGTCTACCAAAACAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMMKLLIILIFSGLITGFRGNSSYSLPPKLLLVSFDGFRADYLQNYEFPHLQNFIKEGVLVEHVKNVFITKTFPNHYSIVTGLYEESHGIVANSMYDVITKKHFSDLNDKDPFWWNEAVPIWVTNQLQGNRSSAAAMWPGTDVLIHNTTPSYFMNYNSSVSFDERLNNITMWLSNSNPPVTFATLYWEEPDAGGHKYGPEDKENMRTVLKEVDDHIGDLVHKLKVLGLWENLNVIITSDHGMTQCSKERLINLDTCISHTSYTLIDVSPVAAILPKINRTEVYNKLKICNPHMNVYLKEDIPARFHYQHNDRIQPIILVADEGWTIVQNKTLRKLGDHGYDNSLPSMHPFLAAHGPAFHKGYKHSTINSVDIYPMMCHILGLKPRPNNGTFSNTRCLLVDQWCINLPETIGIVIGVLLVLTTLTCLIIIMKNRLSVPHSFSRLQLQDDDDDDPLIG	420671	403032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_406429_409315_409487_410140_411000_420529
905026	contig_6980_pilon	+	1958	1	Intergenic	novelGene_36063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGTGAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357316	359274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_357300_359300
905027	contig_9199_pilon	+	3009	10	Intergenic	novelGene_65621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	96.4343312670004	2	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	28	708	42527	55426	TRUE	15	CATCAGCTGGACCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLGRRDSCTMESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKEVKPATYP	42499	59156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_51095_51172_51972_52099_53099_53225_54455_54677_55406_55498_56069_56407_57087_57129_57304
905028	contig_14970_pilon	+	2315	12	Intergenic	novelGene_44966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_7	6313.05797992156	57	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	133	1614	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATQQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_210859_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
905029	contig_610_pilon	+	1695	6	Intergenic	novelGene_76834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	212.843228691918	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	7	657	350011	375609	FALSE	40	TCAGTAGAAAAGTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIMANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMGRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGQDASSSEERQFIHSVLLCTETPTGGTTTATE	350004	376647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_366326_366597_368139_368245_369603_369658_374082_374155_375583
905030	contig_18735_pilon	-	2394	1	Intergenic	novelGene_132688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTGATGAAGAAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96345	93951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_94000_96300
905031	contig_10196_pilon	+	1702	3	Intergenic	novelGene_132330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACACTTGTGATATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2397509	2400456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2397808_2398946_2399226_2399331
905032	contig_9366_pilon	-	3515	1	Intergenic	novelGene_166252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCAAGGCCATCACAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938051	934536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_934500_938100
905033	contig_8801_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_66263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381345	378907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_378900_381300
905034	contig_9609_pilon	-	5710	22	Intergenic	novelGene_22975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5964	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTCTCCCACACCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331952	309905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_310031_311499_311590_313098_313264_314272_314431_317882_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330305_331386_331487_331563
905035	contig_14970_pilon	+	2694	2	Intergenic	novelGene_45088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	11954	junction_1	0	34	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1687	1995	224271	231550	FALSE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFGSLNPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	222584	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_224375_231345
905037	contig_6137_pilon	-	6458	11	Intergenic	novelGene_59238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4837	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCAATCTTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354916	1315555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816_1323939_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336781_1346639_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
905038	contig_5499_pilon	+	2540	12	Intergenic	novelGene_56990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	249.812028506989	102	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	1	1401	803317	840037	TRUE	30	GAATTTGTAATGATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRAAGRMGGRGISSGGGKELPGPQLTAERAAAPKEPSSRRGIPGLLSVGINMAAALRAAAALLRDRLVPGSSRVQQQWRCQSGAAAAATATETARQVKSTKPQVHPEKRKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803316	841279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_809513_809641_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
905039	contig_10013_pilon	-	2779	18	Intergenic	novelGene_125038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1567	1902	210268	205187	TRUE	15	GAGGTGGGGTTGGGCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWILTLLLLPGDPAAERAQAALHPGPSVTSLCPASAILALRQELEPGDVGLGCPRAGRQASPLPSHVIGLHVVLFHPLQHWGVQTLNSWTGHLQSLRELQGADLVRGHRN	264913	161508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_161797_188437_188575_203145_203409_204112_204264_205148_205264_206158_206219_207531_207610_209961_210063_210248_210392_249258_249402_250647_250760_250919_251061_256718_256969_257945_258073_260051_260171_261229_261478_263046_263121_264684
905040	contig_6898_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_35798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126628	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_126600_127700
905041	contig_3745_pilon	-	12188	1	Intergenic	novelGene_85105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	960	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	8987	9304	476007	475690	NA	20	TCCTTATGTGTTGTAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYITHLHFPLWSVFPACSGDAARFKSYLLTINVTLISGISLNNLGFRQFLASEFRSIVADRYPSELSLDTGMTSVKVLSAISTEHLEVTWVSSHRFLSSTPFAF	484993	472805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_472800_485000
905042	contig_11855_pilon	+	4551	1	Intergenic	novelGene_67124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTCTTTGCTTCCTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2648122	2652673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2648100_2652700
905043	contig_10801_pilon	+	6488	5	Intergenic	novelGene_74039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1861	2259	264743	265141	TRUE	50	TTTACCACAATATAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRLCTFIFSSLKNTEFYLKTFSSCNISPSLSPCGTVVKHLPANRKVSSLNPPVTPRVKDVAVCFRKDLQPLRKAPAVESAPIVSILPTSLCSPIALASETNRMYLSGGQLGLACPASGRYRGLLTEVSAC	262882	391510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_268372_268613_269207_269348_269582_324645_324727_391418
905044	contig_10500_pilon	-	6756	23	Intergenic	novelGene_41206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	39	junction_22	95.1236255208526	536	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1686	5061	60	5120	1566202	1503587	FALSE	30	TATTATATTTTTATGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRRRRLRRSGLRSAAAAMEEPVQDGVACPATPGTGKSKLETLPKEDLIKFAKKQMLLIQKAKSRCTELEKEIEELKSKPVAGGSDDVIKALTEHLDAILLEKAETEQQYLALKKENVKMKQEVEDFVTKVEDLHKEFEQSHRNYVKEIESLKNELIAVHSQHSEDKESLQKELEEAVKKQLELSEQLKFRNDSENNVRKLQDEIQKIRPAYEEQILYLQKQLEATTNEKKQEINNLHKVIEANSQDHQRDINSLQEELLHLKAMHEEEVKDLMCRIETSAKEHEAEVNMLNQLKENLVKQCEAKEKNIQEKYQCELENLRKASSANQEKQICSVLLQEDVVVEQAANEKVRHLEDTLKELESQHSILKDEVTYMNNLKLKLEMDAQHIKDEFFHEREDLEFKINELLLAKEEQGWLIEKLKSELEDANKKFCCIVEQHNKEIQSLKEQHQKEIAELNETFLSGSEKEKLTLMFEIQGLKELCENLQQEKQDAILNYESLREIMEILQTELGESAGKISQEFESLKQQQASDVHELQQKLRTAFNEKDALLETVNCLQGEKKKLLSQQELVPELENTIKSLQEKNEQYLISLSQRDTMLQELEAKISSLTEENDGFINKMKNSHEEMDTLHKKCEREEGLITELTERVEQTTQYNSELKQKVNELTEELEKTLKRKDQNDQELEKLMVQVKILCQDQEALSSKVKLLYEENNTLSLEKSQLSSDLEALLSQKEGDVRLKEQITELEKKFQLTVEERDTCSRLFENEQLQKLFVKTQLYGFLEQMGLKVSEDNEEQDVVNILQVVGESLAKMNEEKHNLVSQYDERVLELEKEIKCVQEEHIVQCEELRSLLEDYEQEKVLLKKELEETLSEKEALQLDLLEMKNANEKTRLENQNLLIQIEEVSQKLLESENEIHNEKLFIKEHENLKSLLEQKESELQDVRAELALLKDSLEKSSSVKNDQTSSVKELEEKIENLEKESREKEEKINKVKLVAVKAKKEFDSSRKEAQTLREELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEYDKQSEQLDVEKERASNFEHHIEDLTKQLRNSVAEREKLNSDNEDLVARIETLQSNVKLLEVQILEVQRAKAIADKELEAEKLQKEQKMKEHASTVSELEELQLQLQKEKKQLQKTMQELELVRKDAQQSTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNSKIEDLEQEIKIQKQKQETLQEEMTSLQSSVQQYEEKNTKIKQLLVKTKKELADSKQAESDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIELAEITSEKHRIHEHLKTSAEQHQRTLSAYQQKITALQEECHTTKAEQAAVTSEFESYKVRVHNVLRQQKNKSMSQAETDGAKQEREHLEMLIDQLKIKLQDTQSNLQMTISELQTLQSEHDTLLERHNKMLQETVSKEAELREKLCSVQSENMAMKSEHVQTVSQLTSQNEVLRNSFHDQVRHLQEEHRKTMETLQQQLSKVEAQLFQLKSEPATRSPASSHQPLKNLRERRNTDLPPLDMHTITREEGEGMETTDAESVSSTSTHTLSLEQLLNSPETHLEPPLWHAEFTKEELVQKLHSTTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKSVANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVIDTMLQLSPEEKGKLTVIAQGEEENASRSSGWASYLHSWSGLR	1566261	1501950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1503658_1510812_1511015_1512614_1512755_1513972_1514168_1515956_1516175_1517876_1518054_1519358_1519481_1520929_1521068_1521676_1521755_1521854_1521956_1530274_1530438_1531122_1531228_1531531_1531697_1532119_1532240_1539838_1539938_1540042_1540144_1547441_1547515_1548285_1550758_1551641_1551747_1562740_1562809_1563933_1564019_1565751_1565809_1566196
905045	contig_9436_pilon	+	3831	4	Intergenic	novelGene_60878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	7	342	88499	88834	TRUE	25	GTTCTCTAAGGCAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEMPRWQNSQALRVVPLTTKAWKNKRIDYIWQSRSPDPQRQSWGVGLSSRGRERQFRRSVGCEAASTLHAGSAGVHRLRRAVVLGRCFSTSGETQWWRVCTSLQSQGEVVLDL	88492	313865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_89273_196633_197061_197188_197860_311912
905046	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
905047	contig_18108_pilon	+	3518	3	Intergenic	novelGene_33487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	463	junction_1	44.5	75	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	798	1193	247233	252349	FALSE	45	GACTAACTTGAAATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTISFDIPPQEILTKDSVTVSVDGVVYYRVQNATLAVANITNADSATRLLAQTTLRNVLGTKNLSQILSDREEIAHNMQCTLDDATDDWGIKVERVEIKDVKLPVQLQRAMAAEAEAAREARAKVIFFLF	246435	254674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_247269_250797_251002_252193
905048	contig_6102_pilon	+	4361	8	Intergenic	novelGene_32216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894898	904376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_900644_902942_902993
905049	contig_3956_pilon	+	2822	15	Intergenic	novelGene_15205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1271.67809148674	9	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	1050	2654	1286460	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1282849	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286228_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290307_1290434
905050	contig_854_pilon	+	1807	11	Intergenic	novelGene_36404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAGCGGTGATGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979751	993353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_979779_980007_980100_980727_981034_981766_981907_984025_984179_984327_984468_985010_985183_985262_985419_991117_991309_991918_992045_993049
905051	contig_17074_pilon	+	2933	11	Intergenic	novelGene_145124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	212.95858752349	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	48	1013	208015	223655	FALSE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207967	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212435_214167_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
905052	contig_8954_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_130317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGGAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648357	646028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_646000_648400
905053	contig_12644_pilon	-	2180	15	Intergenic	novelGene_44491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	520.993776648169	275	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	4	1683	1151228	1028440	TRUE	40	ACAAAACTATATTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGCGIVQKIPGPLTDGHGA	1151231	1025965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1028436_1028496_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
905054	contig_8177_pilon	-	3157	7	Intergenic	novelGene_86502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	205.755248346724	40	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	1457	2683	55495	46555	FALSE	80	TTAAAAAAAAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGKSLAQTSKTTTAVYIFFLSSLLQTRGGTQEHHFSASLRGLCSLAADGIWNQKILFEEYDLRNHGLQKADVSAFLRMNLFQKEVDCEKYYSFIHLTFQEFFAAMYYLLEEEEERETRSMSCSYSKPPNRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERSSYLEKKLSCKISQQIRQELLKWIEAKAKAKKLQTQPSQLELFYCLYEMQEDDFVQRAMDHFPKIEINLSIRMDYVVSSFCIQNCCCVESLSLGFLNNLPKEEEEEEEEGRRLHAVNCVSPCSHAACSYSLVNCYLIPSICRGLFSVLSTNTRLTELDLSDNTLGDPGMKVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLTRHCCLDISSVLSSNQKLVELDLSDNALGDSGVRHLCVGLRHLFCNLRKLW	64046	46080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_-_46730_50693_50865_54614_55531_55981_56998_59940_60262_60804_60867_64024
905055	contig_10793_pilon	+	1855	12	Intergenic	novelGene_83425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2731.7433086094	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	22	795	146975	163944	TRUE	40	ATGTCAAATACAATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSLNFVLLFFLNK	146953	167257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162660_163910_164068_164789_164820_165325_165377_166401
905056	contig_11525_pilon	-	4591	1	Intergenic	novelGene_171094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGTAACATTCAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262431	257840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_257800_262400
905057	contig_15327_pilon	-	1975	12	Intergenic	novelGene_70768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	78.1646915701998	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	24	1394	1169101	1130292	FALSE	30	CAAAGATGGTGGAGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRFETFCLDPSLVTKQASLVHFPPGFQPIPCKPLFFDLALNHVAFPPLEDKLEQKTKSGLTGYIKGIFGFRS	1169124	1129710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130509_1135815_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
905058	contig_16303_pilon	+	3844	7	Intergenic	novelGene_34084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2888	3193	37468	38653	TRUE	35	AAACAGAACGGTGGGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLLRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	33099	45522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_35766_35982_36028_37168_37302_37424_37703_38582_38855_40432_40730_45369
905059	contig_7088_pilon	-	2074	11	Intergenic	novelGene_159798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	140.741465105348	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	219	728	742677	721448	TRUE	40	AACATGTTTTGTTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMILIPGQTLPLQLFRPQEVSMVRNLIQKDRTFAVLAYSNVQEREAQFGTTAEIYAYREEQDFGIEIVKVKAIGRQRFKVLELRTQSDGIQQAKVQILPECVLPSTMSAVQLESLNKCQIFPSKPVSLEDQYSCKWWQKYQKRKFHCANLTSWPHWLYSLYDAVRNLNG	749079	716409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_717375_718590_718723_720117_720183_720632_720749_721379_721465_722781_722849_734068_734229_741620_741771_742561_742701_743346_743460_748997
905060	contig_15323_pilon	-	2764	2	Intergenic	novelGene_148516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAACAACGACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83780	80875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_82543_82683
905061	contig_9036_pilon	+	4078	17	Intergenic	novelGene_155448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_14	353.324296636603	395	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	86	2062	94373	235959	FALSE	15	GTTTATATGTTTCCTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGIQKLASQYLKRDWPGIKADDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRISICENYKNFISEPARTVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLAKGKKKYFETEQMAHAVREKADIEAKSKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNSKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLVNIMKALDGNVYDHLKDYLIAFSQTELETCQAVQNTFQSLLETSSKVIRDYNLQLFLQENAVFHKPQPFQFQPCDSDTSRQLESETGTTEEHSLNKEARKWATRVAREHKNIVYQQRVLDELECHGVAASEQSRAELEQKIDEARENIRKAEIIKLKAEARLDLLKQIGVSVDTWLKSAMNQVMEELENERWARLPAVTNNGTLHSLNADAEGEEGEEFEDNMDVFDDSSSSPSGTLRNYPLTCKVVYSYTASQPDELTIEEHEVLEVIEDGDMEDWVKARNKVGQVGYVPEKYLQFPTSNSLLSMLQSLAALDSRSHTSSNSTEAELVSGSLNGDASVCFVKALYDYEGQTDDELSFPEGAIIRILNKENQDDDGFWEGEFNGRIGVFPSVLVEELSASENGDTPWTRDTQISPSPKPHSSLPPLSLYDQPPSSPYPSPDKRSSQYFPRSPSANENSFHSESPGFSQAPRHTPETSYGKLRPVRAAPPPPTQNHRRPAEKIEDVEITLV	82984	237975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_83066_94368_94514_101675_101810_110016_110072_110908_111038_144325_144449_150080_150177_169590_169708_184315_184421_209722_209885_223493_223629_231205_231290_231407_231586_231887_232109_233098_233229_233359_233443_235875
905062	contig_5434_pilon	-	3775	10	Intergenic	novelGene_74655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_2	113.926877133244	385	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	79	630	282075	275963	TRUE	30	AAGGTATAATCTCAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAPTPQATSFPAEGRCGYYVEKKKRFCRMVVAAGKRFCGEHAGAAEEENARKRILCPLDPKHTVYEDQLAKHLKKCNSREKPKPDFFIQDINAGLKDETEIPEQLVPISFLSEEQLENLIKKLRKASVGLNSTLKDQIMSHPVLHDALNDPKNGDSATKHLKQQVCLGHSNSTKWPFIHL	282153	256512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_258804_259095_259330_262817_262893_273748_273822_275490_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
905063	contig_10766_pilon	+	4237	4	Intergenic	novelGene_151180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2024	2329	185470	185775	TRUE	80	AGAAAGAAAAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAAVHRQGMVRNSSWIQKRMWNRAIIADVKWILAESREYPKDVYLCFIYSAKSFDCVDHNQIMNNISKNGNSRILNCAHEEPVLRPRGSHLNRTRGYFVV	30615	187779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_32312_180048_180133_185226_185926_186021
905064	contig_6898_pilon	+	2194	13	Intergenic	novelGene_35668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1695.2179042989	5	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	185	1825	59668	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59483	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124782_125008_125481_125760_127448
905065	contig_5702_pilon	+	4323	4	Intergenic	novelGene_178808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2841	3890	74812	75861	FALSE	45	ACAAACTTATATCTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGIQTKTTDNSPVEENTLEVPDKELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQNLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSTDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLPSEDKQLQPSGRT	16959	76294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5702_pilon_+_17409_58871_59378_72317_73380_73988
905066	contig_6208_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_53026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTTTATTTACAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491140	489668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_489700_491100
905067	contig_7333_pilon	-	3624	6	Intergenic	novelGene_142813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	50.1382089827708	76	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	853	2562	635	3196	406076	394458	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGFPFPKSGVVSRPEQGEPWILDPLVSKERELPRGSHTGEGRMPADLLPSRSERRSWVEQDHWGFEDENVAGVHWGYEETKTLLAILSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATPQDSDSSSAPVLFRSPGGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407207	394029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_402472_403175_405092_405298_405761_406195_406691
905068	contig_6958_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_69969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276331	278978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_276300_279000
905069	scaffold_12124_pilon	-	4074	1	Intergenic	novelGene_22185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2226	2609	1231935	1231552	NA	45	AAAGATGTGTAAATTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQVQQTPYRIDPKRKSPRHIIITFAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGEAIRLSSDYLAETMQARRQWDDVYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRTFPDKQKLREYVKTKPNLQELL	1234160	1230086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1230100_1234200
905070	contig_16205_pilon	-	4801	2	Intergenic	novelGene_156885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	891	junction_1	0	15	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	105825	103176	FALSE	30	GTGATGGACAACTTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGGCLIRLRSSLDMQSKYHCYSRVFLHEEAVKTNVRKKVKHF	105895	98774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_103466_105785
905071	contig_6488_pilon	-	2892	1	Intergenic	novelGene_44735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTACACCGAGTTAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64799	61907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_61900_64800
905072	contig_15384_pilon	+	2353	2	Intergenic	novelGene_85155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	122398	123329	FALSE	65	ATTAACTAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRRWSVKAAGRSGVQSGQECHYCPACSYAYPHPCSPAHQRSGRLRCLSGCPQRTGPAGYGEQSQRLLSGCQPTSTPEAAGCSRSRRSLLQRWEGWGPHPRVEA	122396	125366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_122566_123182
905073	contig_11702_pilon	-	2126	17	Intergenic	novelGene_142005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	194.523616818113	7	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	605	2035	517074	506100	FALSE	15	TCCGACGCCAGCCAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERFSSRGGRLGSGSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQQTRQQSRESAALSEVLTGSLVQRLTHLSEYVGRIVRKSKDLEQQLQEELLKVVSELQTARKTYQVYRTESVNAETKLREAERQEEKRAGRSAAAAAATATTTTEAGPSRKSSIKKGRLVEKRQAKFLEHDLKCTKARNEYLLSLASVNAAIRNYYLQDVPDLMDCCDTGFHLALGQVFRSYTAAESRTQASQMQGLGSLEEALEALDPPGDKAKVLELHAAAFCPPLRFDYQPHEGDEVAEIQVEMELRDEIMPRAQNIQSRLGRQTIETEEVNKTLKATLQALLELVASDDGDVLESLQASPSTESLKSTCSDPGARQAGRRRGQQQETETFYITKLQEYLSGRSVLAKLQAKHKQLQEAIQRGDKEEREMSWTQYSQRKVQRSRQPRPSSQYSQKLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQPRVSEIRDAFERGEDALVEGCGVQDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGDLLASSEPEDAMERLESVSRLLARLPGPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNRLVQTLIMKPTSGLPPKHPVPRVPGPASPWPCPASSGHLPLTLCRGGQTGFLDLTPLPAPALA	519393	506008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_-_506256_508408_508566_508678_508785_508880_509016_509116_509195_509277_509339_509956_510060_510269_510298_510545_510631_510707_510900_511114_511217_516746_516969_517068_517198_518380_518570_518801_518865_519090_519254_519327
905074	contig_12402_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_133365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTATATGTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554991	556817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_555000_556800
905075	contig_10403_pilon	+	6546	20	Intergenic	novelGene_175798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTCGACCCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68613	106907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_71478_72488_72630_73323_73407_73614_73728_75434_75632_78425_78538_78630_78704_79186_79385_81793_81912_83421_84711_86339_86499_87385_87608_93366_93436_96011_96164_96315_96439_98355_98453_99047_99145_99952_100069_101988_102134_106729
905076	contig_20819_pilon	+	1781	7	Intergenic	novelGene_55623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	480.839341383608	31	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	31	582	29817	41333	TRUE	15	CAACCGGGCCTCTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFA	29786	43614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40205_41332_41400_41530_41569_42519
905077	contig_12644_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_44455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAACTTGCCCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374330	375920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_374300_375900
905078	contig_10331_pilon	+	6685	17	Intergenic	novelGene_54064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	535.911242068125	18	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	26	1645	60926	92767	TRUE	35	AAGCTCAGTAATATGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLLGKCGMYFVEDNASDAVESSSLQGELEPASFSWTYEEIKEVHKRWWQLRDNAVEIFLTNGRTLLLAFDNTKVRDDVYHSILTNNLPNLLEYGNITALTNLWYTGQITNFEYLTHLNKHAGRSFNDLMQYPVFPFILADYISETLDLNDPSIYRNLSKPIAVQYKEKEDRYVDTYKYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGVRSMNSTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPINFIQSSQQYQVNFFYEILYNH	59517	110877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_59532_60914_60971_64318_64472_67058_67304_70621_70689_71998_72156_75274_75416_79165_79384_83233_83465_88910_89101_92594_96244_103717_103858_104125_104224_107726_107884_108299_108372_109643_110229_110365
905079	contig_15371_pilon	+	3134	1	Intergenic	novelGene_151437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2615	2962	116095	116442	NA	30	TCCCGGCATAGGAGACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLHESESTCRHLTVTYAYICAAHKHAIFLILKNLEPLLSWQLLCHFFFPLYNETPGRSSLYLVSNSSPSILSSAYFVTVHTTSVAQSSGSQSSSFLISIGQVEQTSVKSSLGL	113480	116614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_113500_116600
905080	contig_14196_pilon	+	2260	1	Intergenic	novelGene_169962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7187	9447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_+_7200_9400
905081	contig_21232_pilon	+	3468	6	Intergenic	novelGene_165969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	930.165447648965	30	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	2369	3316	11079	18357	FALSE	80	AGCAAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTKVTLTWCSDNGTAKCRMLLESIGSQKDSTQDSVFNISDLEPGNRYQFPPPPVVSNETQKDPEDGVEANNTERSPAEKLPSNHTAPVYLGTAASSCHQGSRGTEVQLVGLKPGTQYKATVYSQAADGTEGQPQVIEFRTNRSQVLDIQVVNISATNMSLTWRISGNASSYQILVVRETTFFNLTANEMHVVIPGLTSSTLYNITVYPLHDDGSEGTPGFLQAYTPPGPVSDFRVTSVNTTEIGLAWSSNDSDSFKILTTRDGAGEPRNETTTNHSIIIGGLNPGTKYHFEIFPQGPNGTQGPPQTVEGQTGK	33	18509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_2114_4253_4515_11051_11287_13447_13667_14912_15168_18091
905082	contig_6079_pilon	+	3368	1	Intergenic	novelGene_160109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481960	485328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_482000_485300
905083	contig_9972_pilon	-	4079	3	Intergenic	novelGene_162787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1392	1928	190175	189396	FALSE	30	TGTTCTAATCTAATATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSHNKESRNSPEEKNFLELSEAEYKTLIHRTLQKIRKKIKQNAEHATQEMKKIREEHNDKFNRLQESIQRHQSEIQKINNQISELDNSIESQRNKSEATEVRISENEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEETLIIMWDSIERNNLRVIGVIRTVGGDNRKYRENWQEGNGMTYIKP	316453	187244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_189434_189676_191345_316231
905084	contig_7599_pilon	+	3735	4	Intergenic	novelGene_73762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	4.49691252107735	342	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	292	2313	19763	26604	FALSE	20	TTTTATATTGCCTTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFQDFDIQGSRRCSLDWLTIETYKNIESYRACGSTIPPPYISSQDHVWIRFHSDDSISRKGFRLAYFSGKSEEPNCACDQFRCGNGKCIPEAWRCNNMDECGDSSDEEICSKEANPPTAAAFQPCAYNQLQCLSRFTKVYTCLPESLKCDGNIDCLDLGDEIDCDVPTCGQSLKYFYGTFNSPNYPDFYPPGSNCTWLIDTGDHRKVILRFTDFKLDGTGFGDYVKIYDGLEENPHKLLRVLTAFDSHAPLTVVSSSGQIRVHFCADKVNAARGFNATYQVDGFCLPWEIPCGGNWGCYSEQQRCDGYWHCPNGRDEVNCTMCQKEEFPCSRNGVCYPRSDRCNYQNHCPNGSDEKNCFFCQPGNFHCKNNRCVFESWVCDSQDDCGDGSDEENCPVIVPTRVITAAVIGSLICGLLLVIALGCTCKLYSLRMFERRSFETQLSRVEAELLRREAPPSYGQLIAQGLIPPVEDFPVCSPNQASVLENLRLAVRSQLGFTSIRLPTAGRSSNIWSRIFNFARSRHSGSLALVSAEGDEVVPSQSTSREPERNNTHRSLFSVEPDDTDTENERRDTGGASGGVAAPLPQKVPPTTGVEATVGAYGSSSTQSTRGGNTDHGRDVTSMEPTSVSPARHQLTSALSRMTQRLRWVRFTLGRSSSVNQNQSPLRQLDNGVNGREEDDDVEMLIPVSDAASDFDVNDCSRPLLDLASDQGQVFRQPFSATNPGVRPSNPGDGPCERCGIVHTAQIPDACLEATLKNETSDDEALLLC	18283	28026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_+_18489_19676_20782_22338_22472_25734
905085	contig_3424_pilon	+	3412	15	Intergenic	novelGene_55527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	393	junction_1	596.673568158315	107	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	264	1838	276289	329904	FALSE	65	ATAAAAGAAAAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRNKIISIFSGTEKGSRKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPVLNTKGSETSTVVTEEDDDDEEAAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSNVDSGAKPSDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLTPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR	249095	331478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_249338_276267_276476_309784_309886_310236_310385_312001_312034_313038_313147_314560_314694_315892_315957_317097_317147_317632_317746_318973_319092_321267_321368_323488_323686_329184_329323_329817
905086	contig_10106_pilon	+	4324	1	Intergenic	novelGene_73889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTCTCACCTCATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155199	159523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_155200_159500
905087	contig_3068_pilon	-	3840	26	Intergenic	novelGene_137627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	312	junction_17	263.433938588026	29	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	753	3329	253924	233625	FALSE	5	CTGTGTGCATTGTCGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQNLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVMCDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSELPTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFFKSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLNSQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLECLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLITVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREVMKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLDHFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN	255611	233113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_233732_234350_234442_234585_234658_234820_234941_235404_235505_236332_236434_238194_238273_238365_238475_238963_239032_239631_239786_240838_240940_241208_241277_241367_241461_242304_242411_242606_242709_243213_243349_244214_244346_244950_245096_246466_246624_248414_248525_250503_250587_251780_251872_251972_252054_253023_253079_253805_253937_254871
905088	contig_7179_pilon	-	4266	3	Intergenic	novelGene_78115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTATCAAGGCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745275	718249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_718258_729488_729883_741411
905089	contig_5020_pilon	-	2297	11	Intergenic	novelGene_27941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_10	14.9482440440341	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	328	1161	185532	164537	FALSE	20	TATATGTATTCTGTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIWQASNGELRRVLEGHVFDVNCCRFFPSGLVVLSGGMDAQLKIWSAEDASCVVTFKGHKGGVLDTAIVDRGRNVVSGSRDGTARLWDCGRSACLAVITDCGSSINGVAVGAADNSINLGSPEQTPSEREVGTEAKMLLLAREDKKLQCLGLQSRQPVFLFVGSDAFNCCTFLSGFSLLAGTQDGNIYQLDVRSPRAPVQVIHRSGAPVLSLLNFRDGFIASQGDGSCFIIQQDLDYVIELTGPDCDPVYKVATWEKQIYTACRDGLVRRYQLSDL	198363	163400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_164615_166911_166995_171486_171570_173613_173730_175103_175196_178068_178264_184684_184836_185496_185596_187799_187890_190949_191054_198293
905090	contig_4125_pilon	-	2623	6	Intergenic	novelGene_25246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	96.8949947107692	103	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	141	863	2989818	2985225	FALSE	10	TGTCCAGTGAGTCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEELEAARRLLLRVLHVSENPAPLVVNVHPEVRDVRPFIVGAIVRGMYLEPGNALKRFLTAQTKLHEDLCEKRTAATIATHDLKAIRGPLLYGARPPQDLKIVPLGRREIKAKDLVRQLQLEAEEQRKQKKRQNVSGLHRYLHLLDGKDNYPCLVDADGDVISFPPITNSDKTKIKKTTTDLFLEVTSATSLQMCKDIMDALILKMAEINKYTLDNKEEGSLSDTEADTVSGQFLDPKTNESAEKGGNSPLVVEQVRVVDMEGSLKVVYPSKTDLDIAASHITVIR	2989958	2983464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2985474_2985667_2985758_2986075_2986179_2986975_2987092_2987887_2988005_2989770
905091	contig_19342_pilon	+	899	3	Intergenic	novelGene_41075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.5	191	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	26	319	3263	6197	FALSE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHLKVRS	3237	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3834_6178
905092	contig_8447_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_69379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAAAAAAAAATACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5773	7579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5800_7600
905093	contig_12327_pilon	-	3416	14	Intergenic	novelGene_140684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	227.908940603699	46	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	2407	3231	1144678	1139988	FALSE	15	CTGGATTTCTTTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLESWRNFEDEFGTVSDKERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155117	1139802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1147756_1148059_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1152768_1153599_1153753_1154963
905094	contig_12886_pilon	-	412	3	Intergenic	novelGene_135492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	78	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	98	382	483387	457150	FALSE	25	TTTGCTAAAGCCATCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYAGGSQTLLHYCPLANSPADIAGTRGPAATTMFHRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKYKREKRAEIHGNLVPPRKQCREQSASFGPEVPAQRSSQTKGRLMTWTFLQRRWRKRSPVADALNLDL	483484	457119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_457355_479086_479123_483343
905095	contig_7457_pilon	-	2005	3	Intergenic	novelGene_31268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	159.5	34	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAACAACGTGTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53090	47887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_49135_49252_49925_53004
905096	contig_6137_pilon	+	2661	2	Intergenic	novelGene_59176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	710	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTAGAGGATTGACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256822	1262432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1258344_1261292
905097	contig_8268_pilon	-	2500	2	Intergenic	novelGene_147005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	1146	1661	280031	279516	TRUE	45	CAGTTTATAAAAACAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKITTECLKDNRQYQNIKKQEGMAPVAIQNKTPDDFLVEEKAIELPDRKFKSLIFRVVQELKQKAYKNEEKIDKFTEKVDKFMENTDKKMEEFRKIIQEQNAKINSQEETMQKQLEIQNINNKISEMGNVIEGLRSRFKTIEDRISEIEDKDLDTTLSEVKSEKGKNEEK	281176	277591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_277817_278901
905098	contig_5286_pilon	-	7465	1	Intergenic	novelGene_157348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	6673	7254	528335	527754	NA	80	AATAGTAAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKIKNTIEALFSTTSVVTNISYAELMPLTVHFLNRVEKKRKGSLMAWQSSGAGLPCAFLSLQGLLSEILRKEEDPKTASQSLLVNLRAMQNFLQLPEAERDRIYQDERERSLNAASAMGPTPLISTPPSRPPQVKSPFPPCCLYLSVVFFLPFFLCLRKDMTLNRWMDSWIYRFLKNNPTLLLEENLIPGH	535007	527542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_527500_535000
905099	contig_6059_pilon	-	2475	13	Intergenic	novelGene_44835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3907.47845927808	15	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	577	2022	584299	569146	TRUE	25	GCACATGATGTTATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	567792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571633_575794_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
905100	contig_6544_pilon	+	4793	3	Intergenic	novelGene_142091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1910	2662	92138	92890	TRUE	30	AAGGAAAAGGTCTCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIHNEEVKLSLFADDMILYIQNPKDSTRNLLELIERFSRVTGYKINIQKSVGFLYTNKKNDENEIRKTKPFIIAPKNIKYFGTNLTRDAKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGSLNIVKMTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFLWKGKRPRISKTLLKKKNKIGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYCYNNTHIDQRNNTESPKVNPSTYGHLIFDKGPKPIKWGKDSLFNKWCW	90228	101747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_93291_93336_93768_100447
905101	contig_4103_pilon	-	2784	12	Intergenic	novelGene_51888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_6	27.0065801593024	229	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	168	1385	53593	48971	TRUE	30	TGTAGTAGTTTGAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLGLLPRKAWVALLSQILRPPHAACPRAVRFHSQVAEAVLTSQLKPNQEKSNFIIKTPKGTRDLSPQQMVVREKILDTVVSCFKRHGAKGLDTPAFELKETLTEKYGEESVLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKCYHVGKVWRRESPTIAQGRYREFCQCDFDIAGEFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGGVSLVEQLFQDPRLSQNKQVLEGLGDLKLLFEYLTLFGIAEKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPNQAGKDSLSMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRMKVGPRYG	53760	46917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_49235_49326_49455_49761_49856_50128_50228_50474_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53485
905102	contig_11338_pilon	-	2138	4	Intergenic	novelGene_6311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_3	155.169441435985	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	72	473	250534	233533	FALSE	65	ACTTAAAAAGAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGSSLLPGLCFLLSLPGAVAQKAKASCPRCPENAFCVNGTYCTCDSGYASGSGQKFFTFPLEICNDINECEPPFSVYCGLNAECQNVEGSFHCHCVSGYSLLSGDTEFKNSNENTCQGKKILVFLSPSLIFC	250605	231867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_233736_242914_243038_244695_244747_250509
905103	contig_5092_pilon	-	2698	8	Intergenic	novelGene_62268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	669.710263274122	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATTGTTGCTTCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258989	232277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232437_232536_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250821_252780_258476_258650_258929
905104	contig_11720_pilon	-	3318	3	Intergenic	novelGene_43985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1228	1713	265777	265292	TRUE	0	GGGCTGCTTCTGTGCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRTPPQSGILKPEWPGSAQPGPAAWTSQLQGWRLWNMASWGQRPKRPQAAKEEGHGSVLGMGKTEKNTLGRAELIGGTQNSRELGTEVLKSAQLTCCVTSDKSLYISGPQFPHQANRATALCQRGLQDKMDSGRFKGWGRSCSCIAGAPWGSTVQLRAD	267004	262306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_262356_262914_263051_263871
905105	contig_6767_pilon	+	4785	3	Intergenic	novelGene_174620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2673	3107	186273	186707	FALSE	60	GGAAAAAAAATCAATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGGIQNKTPDDFPVEEEALELPDGEFKSLILRILQELKQKADKKEEKIEKFMENTDKKLEEFGKIMQEQNAKINSPPEIIQKQQLEIQNINSRISEMDGVIEGMRSRFETLEDRISGIEDKHLDTTPFEENSEKRTKKNEGP	85607	188385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_87532_119077_119820_186266
905106	contig_11281_pilon	-	5655	3	Intergenic	novelGene_125510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3166	3471	966613	966308	TRUE	25	CACCCAGTCATTCCAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVQSFPRIYHKVSVFSSPFILIRKWNTVSILSDNWDNNIAYFSPQNDICVKRQLHGSMKSCPKIPLIQPSHFSFNLRGCSCRERRGKLCSRRFIKPPV	972057	963057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_963892_964957_967706_969984
905107	contig_9527_pilon	-	3500	5	Intergenic	novelGene_134080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	16.9170771707172	320	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	2620	3234	490725	489658	FALSE	25	CTCATTTGTTCTTAAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLGLGLLVKSIEGDQRLVERAQRLDQELLLALEKEKKRTPQVVHAGPRHPPHHVVRWVDPTALCEELLLPLEPAPQGGARLLLTGLHACGDLSVALLRHFSCCPDVAALASVGCCYMKLSDPGGYPLSQWVAGLPGCELPYRLREGACHALEEYAKRLHKAGPGLRTHCYRAALETVIRCAQPELRRPGVQGIPRVHELKIEE	494271	489391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_490147_490599_490744_490976_491040_491533_491687_491886
905108	contig_5832_pilon	+	7527	30	Intergenic	novelGene_134137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_11	61.8463440591596	306	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1584	4755	201	4955	226160	269157	FALSE	55	ATAAAAAGAGTACAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKQAPKTDIVAGSTIDQAVNATFAALVYCTPDLHEKLQKYVNSGGKIALSEEFAQVYSLADGIRIWMLEMKQKSLMGLGNEAEEKHDSEANEANPESLSKDCIQKSLLLLKFLPMGVSSKEGCEKLVTTAETEPLQPLDKRQRTSSVVEEHFQASASPTEAAPPAVVDKRLGLDVQQKLLPSSGPSTTEVSSATAEEPSSPSTPTRRPPFTRGRLRLLSFRSMEEARPVPTIKEKYPVLKDVMDFIKDQSLSHDSVVKVLSLKKAQAQSILEVLRIIQYCAESLGQPHCFHPPFILFLLELLTCQKEFTNYFGHLEGCGAELHKEIRETYYQLVLFLVKAIKGFSSLNDRSLLPALSCVQTALLHLLDMGWEPSDLAFFVDIQLPDLLMKMSQENISVHDSVISQWSEEDELADAKQNSEWMDECQDGMFEAWYEKIAQEDPEKQRKMHMFIARYCDLLNVDISCDGCDEIAPWHRYRCLQCSDMDLCKTCFLGGVTPEGHGDDHEMVNMEFACDHCQGLIIGRRMNCNVCDDFDLCYGCYAAKKYSYGHLPTHSITAHPMVTIRISDRQRLIQPYIHNYSWLLFAALALYSAHLASAEDVDGEKLDPHASSSATTLRSQCVQLVGDCLMKAHQGKGLKALALLGMLPDGESTPQNQSLPVLLPTHTSGEQLEKKAVQAAEEPSEAGAFVNCNGKGAAHKETRPLGFKETDKVDEGVSLTKDPSCQTQTVDSTADASTPPGLTDAEDSEASSRKPVEEKAVTPSPEQVFAECSQKRILGLLAAMLPPLKSQGPTVPLIDLEHVLPLMFQVVISNAGHLNETYHLTLGLLGQLIIRLLPAEVDAAVIKVLSAKHNLFASGDSSIVPDGWKTTHLLFSLGAVCLDSRVGLDWACSMAEILRSLNSAPLWRDVIATFTDHCIKQLPFQLEHTNIFTLLVLVGFPQVLCVGTRCVYMDNANEPHNVIILKHFTEKNRAVIVDVKTRKRKTVKDYQLVQKGGEQECSDSQAQLRQYSQHFAFIASHLLQTSMDSHCPEAVEATWVLSLALKGLYKTLKAHGFEETHATFLQTDLLKLLVKKCSKGTGFSKTWLLRDLEILSIMLYSSKKEINTLTEPGDLELDEQEDKEEEVERLVSSPSETEQKKLDPLEGLDEPTRICFLMAHDALNAPLHVLRAIYELQMKRTDSFFLEVQKRFDGDELTTDERIRTLAQRWQPSKSLRLEEQSVKAVDTDMIILPCLSRPARCDQATAESNPVTQKLISSTESELQQSYAKQRRSKSAALLHKELNCKSKRAVRDYLFRVNDATAVLYARHVLASLLTEWPGHMPVSEDILELSGPAHMTYILDMFMQLEEKQQWEKILQKVLRGCQENMLGTMALAACQFMEEPGMEVQVRESKHPYNNNTNFEDKVHIPGAIYLSIKFDSQCNTEEGCDELAMSSSSDFQQDRHNFSGSQQKWKDFELPGDTLYYRFTSDMSNTEWGYKFTVTAGHLGRFQTGFEILKQMLSEDRVVPHLPLAKIWEWLVGVACRQTGHQRLKAIHLLLKIVRCCTHRDLCDLALLKPLWKLFTHMEYSLFEDVTQPGILLPLHRALTELFFVTENRAQELGLLQDYLLALTTDDHLLRCAAQALQNIAAISLAINYPNKATVLWNVEC	224192	271729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_224316_226082_226163_228425_228520_229186_229656_230339_230505_231108_231229_231960_232123_233704_233835_235497_235637_237542_237709_238009_238273_239193_239364_243638_243790_245196_245337_246804_247086_247767_247943_248489_248623_250921_251122_253270_253391_254717_254910_255752_255854_257370_257507_257597_257958_259490_259635_261151_261321_261494_261594_262052_262219_266355_266510_267125_267198_269076
905109	contig_11512_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_43339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556464	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555000_556500
905110	contig_16768_pilon	+	991	1	Intergenic	novelGene_168312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCGGATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15995	16986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_+_16000_17000
905111	contig_12570_pilon	-	2741	2	Intergenic	novelGene_79395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295558	292674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_294367_294509
905112	contig_6576_pilon	-	2411	11	Intergenic	novelGene_42319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	49.3311260767479	34	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	41	1183	579280	555376	FALSE	55	GGAGAAAAAATGTAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGLSPAEPAGPAMSDRERNKKRLLELLQTAGTGNAHCADCGAPDPDWASYKLGIFICLNCSGIHRNFPDISKVKSVRLDFWEDSTVEFMTRNGNLRVKAKYEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERQEFMADGKTIPPPGNREGFLWKRGRDNAQFLRRRFVLLSKEGLLKYYTKEEGKYPKAVISIKDLNATFQTEKIGNPHGLQITYRKEGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKLTFPELPESELVPLITRNYVKQGFMEKTGPKQREPFKKRWFALDSQERRLLYYKNPLDAFEQGQVFIGSKEQGYDVSDDLPKGIRGNHWKAGLTIVTPQRKFVFTCPTEKEQREWLRSLRDVLSCPMTPLNLLTTSTESGRSR	579320	554147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_555408_556703_556933_558141_558220_559839_559903_562690_562775_566866_567014_572548_572662_573866_573947_576496_576589_578222_578354_579186
905113	contig_2799_pilon	-	937	9	Intergenic	novelGene_85539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	122	541	751411	718679	TRUE	45	GGATGACATCAAAGGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	755383	702700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_702762_704619_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302
905114	contig_13519_pilon	+	3554	2	Intergenic	novelGene_124643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1817	2233	113840	114256	FALSE	30	AGGAGCAACTGGCATTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEETKRSRKKQQQQPTNGTQGASQCRQVAFKQHRGEASASRPRDCGRRKQRRLSRGEKGLGVGKRISLVTVCSVFCRELHEVAFPYSLFSDLQQESKMVDPCYVDRGPLHVSLLTLCSLSVSYSIWCLAEFFISSFDA	111036	115577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_111543_112529
905115	contig_5918_pilon	+	3195	1	Intergenic	novelGene_99626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1484	1945	2229256	2229717	NA	45	AAAAACAGTTCCCACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKADGDIFLPWSNWWIRTADLSVNSRALNHCATRLPAFELKGTSGVSACPVDVSVSCLNTAVGKHPAAPGAPGHEDTSRSCPVNWLKGRRQEVASVSRSSCLLELKEGVSPAREEPSCSSQECCTTGLHHAVGHTWLSSCPQNFIPHGLLILR	2227772	2230967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2227800_2231000
905116	contig_8161_pilon	-	1630	6	Intergenic	novelGene_156753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_4	8.77724330299668	56	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	108	1127	254273	230026	FALSE	10	CACCTCCTTTCCAGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254380	229522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
905118	contig_6445_pilon	+	1689	3	Intergenic	novelGene_76992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATAAAATAATTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439043	624903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_439845_505613_506153_624554
905119	contig_8020_pilon	+	2178	2	Intergenic	novelGene_114451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	211	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1455	1757	375728	376030	FALSE	30	TAAACTATTCCTGTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCLLTRQNAWIMKLEEPSFLQHFFRLRGHFRLRQRAPTVRRKNSFPWHSLYCGGMVLLDILFSYTLTRNPEDVTRAADAVTEPSWLLQGHQSESRELS	374166	376451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_374874_374980
905120	contig_9011_pilon	-	2387	2	Intergenic	novelGene_159268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACGCACATAAACAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117286	99282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_99923_115539
905121	contig_9668_pilon	+	1170	4	Intergenic	novelGene_58089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTGCTTGTGGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136742	597369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_136915_272157_272382_464331_464341_596604
905122	contig_6902_pilon	-	2405	8	Intergenic	novelGene_135612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCAGCCCCTAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541495	530912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_530964_534149_534380_534615_534731_535818_536033_536457_536561_536924_537048_537938_538180_540167
905123	contig_15407_pilon	+	4306	10	Intergenic	novelGene_123068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	600.545019950756	135	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	323	1069	449761	468108	TRUE	60	AAAAAAAAGTTTGAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDVSNYLASIKFKY	449438	529471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_469549_486109_486522_486736_486958_528307
905124	contig_513_pilon	-	4439	20	Intergenic	novelGene_80128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	535.96740401982	721	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	300	1694	368838	313101	TRUE	25	AAATAAGTCCTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCLEPQTKADCTNNINDFLKGCAALQVEVFDPDDLYLGVSFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCGRSSSLSAANSSQTNPQGAVSSTAPGLQRQSKAVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGLETAPLTKNYYAVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEFTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLNLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDDLDQFMESQGASSPGILILTTSLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIIAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKTLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSSVLIMLSASPRMSGFIYQGKISIAGMVVTRLDEIEGNDYTFEITGNLTERLVVHCNNSQDLQEWLEQLCRLTRGPASCSSLSKTSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKEVILLHLTGV	415209	302424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_304851_306469_306525_308605_308706_311806_311885_313014_313116_315688_315830_316906_317050_318376_318456_319441_319529_322046_322194_324191_324252_327391_327531_336630_336754_338178_338275_345090_345186_356920_356992_368639_368842_370350_370476_373327_373413_415123
905125	contig_3627_pilon	+	4602	15	Intergenic	novelGene_78485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	125.217769489471	2678	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	74	2224	490450	510062	FALSE	60	TATAAAAATAATAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLLSDATLESEKTMGKLEISRKQNEKKAKKEKPKSNKTEEPAEEKEETISPKAKKIKKKAEPSEVEIDSPKSKKVKKMEEPPQDGTTSLKTKNVKKKKEPVENQVVSPKIKKAVKNEEPSEEETGAPEPKKMKKEMGMNGEIGEKKPKLKNGLPHSGPASNCNEAISEESNSEVEQEIPVEEKEGAFSNFPISEVTVKLLKARGVNFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLQGELQDKKRGRPPQVLVLAPTRELANQVSKDFRDITKKLAVACFYGGTPYGGQFDNMRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVYNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTHRAAVIGDVIRVYSGYHGRTIVFCETKKEAQELSQNASIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGDFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVVQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQYKEEYQLAQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIVKASSKDAIRYLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATAVDQRSLINLDVGFVTMILKCSIEMSNISYAWKELKEQLGEDIDSKIKGMVFLKGKLGVCFDVPTAAATEITDSKTKARSGVLIKHSVSNWK	490376	512440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_490537_492642_493093_494368_494445_495121_495301_496705_496824_498238_498425_499634_499781_500502_500653_501121_501284_502582_502703_504261_504336_505813_505974_506852_506988_509130_509161_509984
905126	contig_3018_pilon	-	3032	15	Intergenic	novelGene_78833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	488.896863210578	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1356	1675	3030	577034	550964	FALSE	60	ACTTGAAAAAAGAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEGGKKCVVYSERWRSNPISQSNHVECYFILLFEIGYYLCSNFSFAFEDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKKGKKDKDIAKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPENKQRKLSPLRLSVSNNQEPDFIDDIEEKTISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFA	625099	550961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772_624903_624965
905127	contig_12540_pilon	-	2144	6	Intergenic	novelGene_148096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	454	636	984745	984563	TRUE	25	TCAGGCAGCTCACGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLYFTCQGNWGRGLSLGERTPLPESPKLPLLTARDVKPQASPGEAPRQATPVVLQGPGARGSCVQSTADTESLATLVPPGPDSGGGEVWWCHRQRPLLPGVLDRAETPEPTDGSNTPRRREVPVEPGTSARSSALPDAPSVHILQRPDDPMTPIRPQRWPAIPERGFVSAPVYSTGDSRPGSRRMHRVNIQVFTYTYIYKNKTKNDLVSR	985198	980210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_980252_980488_980604_980822_980954_981204_981329_982389_983225_984300
905128	contig_6735_pilon	-	3327	10	Intergenic	novelGene_15729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	810.667687012028	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2506	2847	543144	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	568283	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543273_544851_546634_547243_547355_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
905129	contig_2911_pilon	-	3797	5	Intergenic	novelGene_178809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGTAGTGTCTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349839	43204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2911_pilon_-_43598_201151_202290_285703_286849_343203_343951_349465
905130	contig_14684_pilon	+	4145	2	Intergenic	novelGene_99641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	416	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTTTAGTTAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4739	58742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_4783_54640
905131	contig_21027_pilon	-	3220	2	Intergenic	novelGene_127575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	285	635	13307	12957	FALSE	50	AACAAGGAAGGAATAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWRMRLPKYEGAELSFQWTRKVELKCRAERPPSRIWRVWPKPRVWRAGPLPKWSHRTEDYFQDLRANTMYSADLAWCQLSLLSLQFLPFVMEISSLCLFHHCTLEADNLYSRFHR	13760	10371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_-_13308_13476
905132	contig_3004_pilon	+	2056	2	Intergenic	novelGene_127509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306616	309078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_308352_308757
905133	contig_6375_pilon	+	4631	7	Intergenic	novelGene_73029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	649	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	506	856	466250	467634	FALSE	10	CACCGGCCCCCGCCCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPDFCWLMERRVKVSPKVTFLLHAPQVGARPPLLKPGELQVVLLQAPSLLPLLLSAHSPGPLQEPYLSDCSAYLQPLFMGPIITITLGLILRDAGVISMKIHNSLLPRQGFDVW	464954	471409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_465168_465387_465497_465637_465734_466162_466311_466666_466801_467355_467506_467628
905134	contig_504_pilon	-	2437	12	Intergenic	novelGene_54425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	112.479052227882	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	101	1231	183350	157936	FALSE	55	TACTAATTATAAATTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIVERLFSSSLVVVVSHVKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEGSIYIHNIKDMKLLKTILDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTTGEIVLYDGNSLRTVCTIAAHEGMLAAIAFNSSGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEHLSDSRPEEPSTWSSYMGKVFMAATNYLPAQVSDMMNQDRAFATGRLSFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYIYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGSETTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSTSSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPCEH	187787	156729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_158049_158690_158810_159462_159571_160595_160761_164723_164832_166136_166208_166920_167014_167643_167742_175457_175555_181414_181565_183341_183425_187761
905135	contig_9839_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_88538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTCACTCTCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70782	68189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_68200_70800
905136	contig_19061_pilon	+	5211	4	Intergenic	novelGene_173504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1391	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGAAATAAAGAAGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36880	44178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_41647_42167_42295_43729_43906_44036
905137	contig_3818_pilon	-	3678	3	Intergenic	novelGene_99230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	11	238	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	940	1851	407161	406250	FALSE	60	TCAAGAAAGAAAATGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPALGRRCGCVLVELECMCKCEKLPGDVLCLVHQNKNQPAVPRRSNSSLKASLCTGSHLDVHKTVQWFRNMMGNAWALVAHKYDFKLSLPPSTTSCKLRLDYRSGRFLSISLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQLTSVNWPESFAACEHLFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLWELQDLSPGASCPVLTSYHFKTALMHLLLRLPLTDWEPGLLSQRLQDLLWFLGRGLQQRSLHHFLIGNTLLPLTIPIPKTFRDAEPVNLFQHLVLNPTAHSQAVEEFHNLLTRVKTLPCGPLAGTH	409115	404422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_407910_408738_408841_409026
905138	contig_3386_pilon	-	2269	8	Intergenic	novelGene_34477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_2	54.4995787289466	137	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	44	1111	119519	82975	FALSE	25	AGTACAATCTTGTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VREAGGARGGAGPCMDFVLEDMDLAANELSIYDKLSETVDLVRQTGHQCGMSEKAIEKFIRQLLEKNEPQRGAPQYPFLIALYKVLVTLGLILLTAYFVIQPFSPLPPEPVLSGAHTWLSLIHHIRLMSLPITKKYMPENKGVPPHRDDEDRPFPEFDPWSTNDCEQNESDPIPANCTDCTQNLPLKVMLLEDTPERFEQLHPLVIKTEQPLLSEELQHFLCRYPEVAEGFTEGFFTKWWRCFPDRWFPFPYPWRRPLNRSQILHELFPVFTYLPFPKDASLKKCFLLHPEPVVGSKTHRMHELFTIVSGEAMLQLIPPFQCRRHCQSMAMQLEPGDIGYAGATHWKVYIIARGTQPLVICDGTTLSEP	119562	81816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_83070_86144_86269_89774_89905_95083_95224_95349_95505_100748_100963_101427_101636_119517
905139	contig_5419_pilon	+	3658	9	Intergenic	novelGene_15502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	528.45693710557	3	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	FALSE	40	TACATATGACATCACAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
905140	contig_5461_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_156832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATAAAGCTGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800138	798090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_798100_800100
905142	contig_17144_pilon	-	1952	13	Intergenic	novelGene_29437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1867.91108817667	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	220	1875	174965	166152	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLRKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	176157	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_167624_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
905143	contig_3153_pilon	+	3303	9	Intergenic	novelGene_104624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_8	345.696760181521	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	935	2808	233	3040	63009	145130	FALSE	35	CACCACGACCAAATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFVKENSQNLIQRMGMTVIKQIVDDLFVLNVLNYEEVNIICCEKVEQDAARGTIHMILKKGSEACNLFLKSLEKWNYPLFKDLNRQSFFDQMSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILERETTGSI	57728	145393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_62937_63010_66684_66946_67756_69752_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_145104
905144	contig_14945_pilon	-	3602	16	Intergenic	novelGene_178653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_15	544.72523552909	17	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	520	1938	45302	17288	TRUE	70	AAGAAATAAAAAGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDMIIEKKIKKEAVLEEGTIAFKNWVKTGTEVYRQFWIFDVQNPEEVVVNSSNIKVKQRGPYTYRVRYLAKNNITHDPQSHTVSFLQPNAAVFEPSLSVGSENDSFTVINLAVAAAPHIYQNAFVQTILNSLIKKSKSSMFQTRTVKELLWGYKDPFLSLVPYPINTTVGVFFPYNNTADGVYKVFNGKDDISKVAIIDTYKGKKNLSYWPGYCDMINGTDAASFPPFVEKTRVLQFFSSDICRSVYAVFGSEINLKGIPVYRFVLPPKAFASPLQNPDNQCFCTETIVSKNCTSYGVLDIGKCKEGKPVYISLPHFLYASSDVMEPIEGLHPNEEEHRTYLDVEPTTGFTLQFAKRLQVNLLVKPARKIEALKGLKKNYIVPVLWLNETGTIGDEKAEKFRKQVTGKMRLLGLVEMVLLSVGVVMFVAFMISYCACRSKEVK	52314	13543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14945_pilon_-_15208_17287_17453_19060_19116_19860_19935_20276_20396_21362_21551_22695_22766_25622_25670_30038_30131_31394_31575_32034_32183_36257_36419_45182_45392_45899_45986_48333_48590_52226
905145	contig_4429_pilon	-	5376	1	Intergenic	novelGene_50792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	386	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAGAAAAAGGATGCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160454	155078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_155100_160500
905146	contig_12644_pilon	-	2130	14	Intergenic	novelGene_44480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	485.040594897195	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	8	1717	1151228	1026304	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQLGFFRIPPRRCFSIS	1151235	1025890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026352_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
905147	contig_521_pilon	-	2382	13	Intergenic	novelGene_174728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	71.9924282284062	262	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	133	1650	31269	14411	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDQYINHLLQSTSSKCYLPPLCKKTEDRHVFSAIHSTRDILSVMAKAKGLEIPFVPMALPTKVMSTHRKSLNLVDSPQPLLKKAPEGDFQWPRDDHGDVDCEKLVEQLKDCSNLQDQADILYILYVIKGPSWDTSLSGQHGVTVHNLLSELYAKAGLNQEWGLIRYISGLLRKKVEVLAEACADLLSHQKQLTVGLPPEPREKTISAPLPPEELTKLIYEASGQDISIAVLTQEIVVYLAMYVRAQPSLLAEMLRLRIGLIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQRSSTPSSPTGTSSSDSGGHHIGWGERQGQWLRRRRLDGAINRVPVGFYQKVWKILQKCHGLSIDGYVLPSSATREMTPHEIKFAVHVESVLNRVPQPEYRQLLVEAILVLTLLSDTEMSSLGGIIHVDQIVRTANQLFLQDQMAIGTLDTLEKDQATGVCHFFYDSAPSGAYGTMTYLTKAVASHLQELLPNSGCQMQ	31401	13678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_14582_15140_15342_16164_16219_18320_18492_23050_23170_26338_26441_27053_27184_27277_27357_27553_27634_28396_28554_28921_29056_30079_30169_31238
905148	contig_12079_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_67377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGGGAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371380	369441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_369400_371400
905149	contig_5389_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_142992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGCAGGATAATAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11239	13581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_11200_13600
905150	contig_2704_pilon	-	1993	5	Intergenic	novelGene_75304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_2	83.5624766267731	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	919	1347	202263	193570	FALSE	20	ATTCTGTGTTTCCACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLRVKLMHFVNSLHNYIMTRILHSTGLEFQHQVEEAKDLDQLIKIHYRYLSTIHDRCLLREKVSFVKEAIMKVLNLALMFADGWQAGLGAWKMESIEKMESDFKNCHMFLVTILNKAVCRGSFPHLESLALSLMAGMERS	203181	192923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_193617_194798_194900_200083_200173_200816_200943_202197
905151	contig_13868_pilon	-	3159	7	Intergenic	novelGene_172652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.750084860799	11	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	31	780	98723	74161	TRUE	20	TCTTCTCTCTAAGTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKLGPRRRAMRQGMEKINFSGGEPFIHDRGEYLGKLVKFCKVELQLPSVSIVSNGSLIREKWFKNYGEYLDILAISCDSFDEQVNILIGRGQGKKNHVENLQKLRTWCRDYRVAFKINSVVNRFNVEEDMNEQIRALNPVRWKVFQCLIIEGENSGKDALREAERFVVSDEEFEGFLDRHKEISCLVPESNQKMKDSYLILDEYMRFLNCRNGRKDPSKSILDVGVEAAIKFSGFDEKMFLKRGGKYVWSKADLKLDW	98753	70628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_71839_72991_74326_76205_76239_80320_80471_82044_82275_84692_84855_98713
905152	contig_11186_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_98861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACATGATGGCCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51163	52316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_51200_52300
905153	contig_6163_pilon	-	644	6	Intergenic	novelGene_103812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	352.057722539927	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93939	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_77811_77887_86934_86975_89577_89676_93830
905154	contig_10976_pilon	-	3563	1	Intergenic	novelGene_155585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCAAAAAAATGCATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107429	103866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_103900_107400
905155	contig_6589_pilon	-	3389	10	Intergenic	novelGene_25748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_3	14.1141728961781	184	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	60	1652	521829	519242	TRUE	45	TTCAATAGTTAATTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTDRSRRQRVPGPAPLTAEMQPLLPLLLPLLWWIECVGGQGSQAGAGAPTNPRSPPESRDLDDKYQLQVQKSVTVQEGLCVLIPCTFSYPPGGWNHPDPVFGYWFREQANPMLDAPVATNNPRRKVNSQTRDRFQLLGDPGDRSCSLVIRDAQRRDMAVYFFRVERGNYVKFSFMKYTLSLEVTGLTKKPDVYIPETLEPGHPATLLCVFPGNFEGCPAPTFSWTGAVVSQQAAGPQASLFSVLTLTPRPQDHNTQLTCRVDFSRNGMSIARTVRLSVANAPKDVVISISRAKGSAPEPQGNISHLEVQKGQFLKLLCAADGQPRATLSWVLDDRVLSWSPSSGSKNLRLELLRVGPQDTGHYTCRAENRLGSQQRSLDLSVQYPPENLRVMVSQANRTVLDNLRNDMSLPVLEGQSLSLACVADSSPPCHPKLGKGETTREPLAALGPWGPRAASGSEARRREGHLPSSEPAGLPAGLSAPLCALRPAAVQPLLLLGGPGSALQLLRPSLARPLPALAGWGPPGGGKQQQLLGHGHLPAPRGPGPTAP	521888	514008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_515474_517764_517847_518836_518934_519148_519435_519518_519778_519904_519953_520201_520466_520600_520649_520954_521240_521333
905156	contig_9706_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_20764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGGTCGGGCTAGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_200_1700
905157	contig_6898_pilon	-	2461	6	Intergenic	novelGene_35765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3296	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2092	2418	124838	122725	FALSE	10	CTCCCGTTCAATCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127706	122681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126199_126501
905158	contig_11752_pilon	+	2235	2	Intergenic	novelGene_37665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACGCAGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87655	89943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_89204_89256
905159	contig_7758_pilon	+	4680	10	Intergenic	novelGene_163544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_1	249.852845580042	281	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	3142	4416	184560	193745	FALSE	70	CAAAGAGAAAAAGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNLQTLPPKPPKPTTVVNNGMNNNMSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFSDPLTFNSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYNTQFQEKSREYDRLYEDYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFKREGNEKEIQRIMHNYEKLKSRISEIVDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQLRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNENTEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR	181418	194009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_184576_188333_188437_189040_189140_189241_189423_189675_189802_190755_190899_191131_191309_191409_191479_192171_192343_193555
905160	contig_7345_pilon	-	2161	4	Intergenic	novelGene_159188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATCTTCAAATTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297499	275886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_276026_294656_294748_295532_297022_297057
905161	contig_4088_pilon	-	4496	4	Intergenic	novelGene_178057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	2175	2741	111019	91798	TRUE	20	ACTGCTTCTTGGTCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARVCRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPGREAVARPNVAPQPCRKEQRWLLESGTRAKGGGRQRVASENPKEVEKEKRGKKKKQHLQPTNGTQRAACTGARNPGSRQPWVKSLRPREAEEQRNKGPGFSSAWQPRPGSSRTPERSPTAPQERAKTVLGARHPSKRRRDERL	113193	72487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_-_72832_72893_74000_91492_91816_110470
905162	contig_13481_pilon	-	3373	1	Intergenic	novelGene_119408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGAAAATGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639915	636542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_636500_639900
905163	contig_3787_pilon	+	2664	1	Intergenic	novelGene_102426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAGGAACCAAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597993	600657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_598000_600700
905164	contig_10953_pilon	-	4346	8	Intergenic	novelGene_42521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACGACACTCCCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149095	126963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_127113_131417_131489_133873_134054_140561_140605_143065_143175_144722_144798_145018_146740_147097
905166	contig_14618_pilon	+	2368	8	Intergenic	novelGene_136786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	41.0286112216281	45	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	189	929	298711	307723	FALSE	15	GCCGTGGTAGATGTGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFGTTSGFGTGGTSMFGSTTTDNHNPMKDIEVTSSPDDSIGCLSFSPPTLPGNFLIAGSWANDVRCWEVQDSGQTIPKAQQMHTGPVLDVCWSDDGSKVFTASCDKTAKMWDLNSNQAIQIAQHDAPVKTIHWIKAPNYSCVMTGSWDKTLKFWDTRSSNPMMVLQLPERCYCADVIYPMAVVATAERGLIVYQLENQPSEFRRIESPLKHQVSQTSSQEACSWHLLDARQRLHVEHNCTFKNQ	295936	309162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_296118_298703_298801_299303_299409_301268_301362_305016_305104_306087_306175_306283_306356_307516
905167	SIRV5	+	1993	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	34	2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
905168	contig_11574_pilon	-	2500	11	Intergenic	novelGene_64073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_3	289.94139062921	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	74	802	456525	451671	TRUE	20	TTAGAAGGGCGCTGTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQFFLH	463700	449200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451686_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
905169	contig_14326_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_120651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAAGTTTTCTCCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21387	23361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_21400_23400
905170	contig_10734_pilon	-	4135	4	Intergenic	novelGene_50985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_3	20.2374789822141	278	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	356	1033	294586	292792	FALSE	25	AAAAGGTTATGTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESYVKFLAINQKCPLQEMRLQKNTADLLPELKAMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYVKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLKMPKMPELKGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKVREKQRQKVLEQKRKERTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKREKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKFKKGKITEEEFEKGLLTSGRRTIKTDFRISDLENDC	294941	289689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_292966_293236_293530_293959_294129_294544
905172	contig_3837_pilon	-	2263	5	Intergenic	novelGene_104022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	591	1001	99957	90889	TRUE	45	GCAAAAGAAGTCCACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYFTKKDIQMANRHMRKCLRSLAVREMQIKTTMRYHLTPALPARIKNTGNNKCWRGFGEIRTLNALLVGMQNDTTILENDMALPQKARNRHTIRSSNPTPRNISWRNKSCHSYRYMHTYVHGSIVHNSKTMETT	151338	82861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_-_83147_83668_84518_90760_91267_99924_99978_150768
905173	contig_4213_pilon	+	1658	2	Intergenic	novelGene_124784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAATAGAGAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11448	29101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_12415_28409
905174	contig_15531_pilon	-	2175	2	Intergenic	novelGene_176723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	172	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	280	1437	288275	286785	FALSE	70	ATAAATTAAAAATAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRKDIEKDNAGQVTLVPEEPEDMWHTYNLVQVGDSLRASTIRKVQTESSTGSVGSNRVRTTLTVCVEAIDFDSQACQLRVKGTNIQENEYVKMGAYHTIELEPNRQFTLAKKQWDSVVLERIEQACDPAWSADVAAVVMQEGLAHICLVTPSMTLTRAKVEVNIPRKRKGNCSQHDRALERFYEQVVQAIQRHIHFDVVKCILVASPGFVREQFCDYMFQQAVKTDNKVLLENRSKFLQVHASSGHKYSLKEALCDPAVASRLSDTKAAGEVKALDDFYKMLQHEPDRAFYGLKQVEKANEAMAIDTLLISDELFRHQDVATRSRYVRLVDSVKENAGTVRIFSSLHVSGEQLSQLTGVAAILRFPVPELSDQEDDSSSEED	288554	286046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15531_pilon_-_287217_287549
905175	contig_8167_pilon	-	5283	3	Intergenic	novelGene_155644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1422	1775	53180	52827	TRUE	50	TTAGAGAAAAAAACTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAFQIQISTIFFKEMEKTIINFTWKGKRPWISKALLKKKKAGGHMLPDLRIYYTAMVVKSAWCWYNDRYIDQWNRIKNPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKKTVF	69837	49067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_49860_50110_53950_69185
905176	contig_14683_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_166044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATAGATGAATAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144542	145608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_144500_145600
905177	contig_14536_pilon	-	1534	5	Intergenic	novelGene_69290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	336	junction_4	85.3126602562597	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	156	599	137680	83268	FALSE	65	AAATTTAAAAAAGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGVSPAFASVSPSVEEEDLGEDSPRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDM	137835	82332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
905178	contig_6612_pilon	+	3056	14	Intergenic	novelGene_148158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAGAGAAAAAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16647	72766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_16945_19325_19517_21399_21824_36293_36454_40685_40915_46707_46877_50106_50274_60836_61006_61951_62141_64167_64578_67226_67295_67493_67657_71390_71525_72480
905179	contig_7416_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_134311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	175	771	5920	6516	NA	35	TGGGGAGGAACACCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLDIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGKTGTLMHCWWECKMIQPFWKMTWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNKESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLV	5745	7835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_5700_7800
905180	contig_3004_pilon	-	1831	3	Intergenic	novelGene_127478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	112	junction_1	123.5	54	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	761	1147	260777	257499	FALSE	45	TAAAGTATTAAAGACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTLEKHYGDKPVGMGGTFLVQKGKVKTHIMPAEFSSCPLNSEEEVNKWLQFYEMKAPLVCLPVFVSRDPGFDLRLEHTHFFSHHGEGGHYHYDTTPETVEYLGYFLPAEFLFRIDQPEETHSFGRN	261537	256814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_257673_258591_258709_260681
905181	contig_12078_pilon	-	3353	22	Intergenic	novelGene_74107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	258.942827193769	19	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	275	1495	786304	741528	TRUE	60	GGGGAAGAAAAACCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLKNSKHECTLSSQEYVHELRSGISDEKLLNCLESLRVSLTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDVLEKLLDKKQQEHIDKKNQYKLIQCLKAFMNNKFGLQRILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIVGEENILDKLLGAITTAAERNNRERFSPIVEGLENHEALQLQVACMQFINALVTSPYELDFRIHLRNEFLRSGLKRMLPDLKEKENDELDIQLKVFDENKEDDLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAENYLLSILQHFLLIRNDYYVRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDFTHLIDSCVNKAKVEESEQKAVEFSKKFDEEFTARQQAQAELQKREEKIKELETEIQQLRTQGHALSGSSGISVPPPPPLLSVGPPPPPPPPPLPLAGGNPPPPPPPPPLIGMNGIPPPPLSAGPPLPPPLGGVPPLPGAPLDLPFGMKQKKIYKPEVSMKRINWSKRII	818540	243864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_244536_290430_290567_327724_327888_432936_433064_534549_534680_566421_566662_580910_581013_608420_608516_610329_610432_741435_741540_743143_743459_748638_748744_754024_754090_757619_757739_760281_760399_762347_762467_768122_768234_780880_780990_782815_782953_786292_786363_786443_786519_818399
905182	contig_16594_pilon	+	3128	1	Intergenic	novelGene_53892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAGTTGATTTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228699	231827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_228700_231800
905183	contig_10345_pilon	+	1302	12	Intergenic	novelGene_158366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	1182.97860511731	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	67	717	11670	20459	TRUE	35	TTTAAAGGACAACTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARCFRNTPSTVSMT	4372	24430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
905184	contig_7457_pilon	-	2948	4	Intergenic	novelGene_31478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	205.004606994304	208	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	143	463	539147	537177	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVRSGGGCGVSLPRLPWRQWGRQRELNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEVRLLFLLVFEQLIFHPHKGAIFLFQ	551389	534691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_537384_537938_538037_539131_539211_551310
905185	contig_1263_pilon	-	5554	8	Intergenic	novelGene_170397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	949.469690868303	9	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	407	1411	65303	59754	TRUE	65	TTTCACCGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIILLKGLEAINDYQFNTVKSLLAHDLQLTKKMQDEYNRIKIADLMEEKFRGAACVDKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKVII	76822	51842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53520_54792_55637_58131_60189_63285_63454_63985_64123_65038_65324_75483_75612_76564
905186	contig_6958_pilon	-	2060	11	Intergenic	novelGene_69994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTCCGGATCCGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770224	728665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_728730_737250_737413_737700_737747_739218_739303_739740_739809_743780_743870_750148_750282_750915_751080_752854_752954_758481_758602_769193
905187	contig_10446_pilon	+	3793	12	Intergenic	novelGene_162486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_11	129.799018193386	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	50	1441	771039	816659	TRUE	30	TTTTTTTTTAACATGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNRESPSYPSPKPPTSMFASTFFMQDGTHNSSDLWSSSNGMSQPGFGGILGTSSSHMSQSSSYGSLHSHDRLSYPPHSVSPTDISTSLPPMSSFHRGSTSSSPYVAASHTPPINGSDGILGPRGNAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTSSSFPSNPSTPVGSPSPLTGTTQWPRPGGQAPSSPSYENSLHSLQSRMEDRLDRLDDAIHVLRNHAVGPSTSLPAGHSDIHSLLGPSHNAPVGSLNSNYGGSSLVSSSRSASMVGTHREDSVSLNGNHSVLSSTVTASSTDLNHKSQENYRGGLQSQSGTVVPAEIKTENKEKDENLHELPSSDDMKSDDESSQKDIKVSSRGRTSSTNEDEDLNPEQKIEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLKSEKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSAVSAEPPTTLPGSHPGLTETTNPMGHM	770989	822729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_771067_772451_772592_772858_773004_773315_773381_783896_783976_789576_789651_791478_791686_799865_799981_800945_801109_809341_809575_816516_816671_820388
905188	contig_18778_pilon	+	4272	2	Intergenic	novelGene_151772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2978	3292	42422	42736	FALSE	30	AGGAAGTGGTAATTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICSTCLSISPLSVQAGPFGHWGFRAWNACLPAHLDMEWGGKSLFASCFGFLTLIQCIALVRASASCGLVKFHFPSVNPFIFYFGVTARLFSPGIGEATGMAL	37688	43716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18778_pilon_+_38705_40460
905189	contig_14173_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_144575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAGAAATGCCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2802	4222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14173_pilon_+_2800_4200
905190	contig_14160_pilon	-	2901	5	Intergenic	novelGene_171539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	63.1124987621311	75	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	95	1723	27093	4034	TRUE	30	ATGGTTATTATTTAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIISELEHLDFVNTDVGRCRAWLRLALNDGLMECYLKLLLQEQARLCEYYQPTALLRDVEEGEFLLSFLQGLTSLSFQLSYKSAILNEWTLTPLALSGLCPLSELDPLTTSGAELQRKESLDSISHSSGSEDIEVQHSGHKIRRNRKLTASSLSLDTASSSQLSCSLNSDSGLHQENGSKSPDCSEEPMSYESDLGTANADDSDRSLQEVLSEFSKAQVNSVPTNGLSQETETSTLQSSLSCRGLDTSAYLHLDVPAEPLPAQASSRTPDGDHKQEPLFQMPGTLDLLQLSAAQTAPSGDTSAQKPSGPVREKTRAVRQGSGPEKPLEGDRVGLNLVVSSPTSPKSKSWISEDDFYRPPQERPPESLSDHSISSAKWTPESRPGLHRHFSLGPRKSHSMGALDRACVPSPGSRKTKAAPMQEHKNFCVVHRRQMGLSNPFRGLMKLGTLERRGAMGIWKELFCELSPLEFRLYLSNEERTCVENCSLLRCESVGPAHSDGRFDLVFSGKKLTLRASSQDEAEDWLDRVQEALHKCRPQQEDEWVNIQYPDQPEDLPEAPQGGLPLPLRPTLRA	27187	464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_-_1140_3530_4453_7428_7700_14681_15088_26560
905191	contig_19865_pilon	+	1703	5	Intergenic	novelGene_170162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	132.248582223024	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	257	1063	67491	81377	FALSE	20	CTAGTCTGTACAGTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLFRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEILLVHKLDGHNTFSCIPIFVPLWLSLITLGIRKDFCQFLLEIFPFLREYGNISYDLHHEDNEETEETPVPEPPKIAPIFRKKARVVITQSPGKYVLPPPKLNIEMPD	67234	82017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_67713_72650_72735_79191_79369_79927_80013_81138
905192	contig_6028_pilon	+	2472	12	Intergenic	novelGene_156582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1965	2369	336188	354032	FALSE	30	GCGCTAGAGTAAAACGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKVCSSTTTPATPATRCYSRNSVQLPCISSCHELQVSPSICVTQVLLGRASPSPLWIDGACLVPLARALCVALLLLFLLSAVASQRWGQTAPALANPRAGRQTPETEAAFAAAAAGKEIVTALVPTSPSPGR	309396	354135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_309733_310934_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326712_332028_332108_335867_336332_353771
905193	contig_1248_pilon	-	2233	3	Intergenic	novelGene_178283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	1607	2233	2088	1462	FALSE	30	CTGGCCATCCAAGAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNYPVEENTLEVPDRELKSLILGVFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETMEDRISGTEDKHLHTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEK	99751	1461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1248_pilon_-_2827_98628_99057_99311
905194	contig_13481_pilon	+	1482	4	Intergenic	novelGene_119350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	188.936203224498	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1425	57	1481	414928	469732	FALSE	65	AGGACAAGAAAAAGAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPA	393378	469733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_393435_414927_415154_466806_466895_468621
905196	contig_15407_pilon	+	1268	9	Intergenic	novelGene_123077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_1	632.084732749495	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	259	1263	449761	470398	FALSE	70	AAAAATGAAGAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIRRVVEVFKPGKFVTTLFVNQSSKCRTVLSSPQKIEGFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449502	470403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468308_470257
905197	contig_5779_pilon	+	2179	2	Intergenic	novelGene_106422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	0	100	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCAATTAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62234	112901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_62643_111130
905198	contig_5125_pilon	+	2226	5	Intergenic	novelGene_43417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	997.064786009415	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	689	1132	58450	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25950	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26083_26202_26502_35610_35768_49981_50079_58446
905199	contig_9706_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_20753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2667	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGTAAAAGGAACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138	928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_100_900
905200	contig_2577_pilon	+	3334	2	Intergenic	novelGene_172064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1057	1668	150498	151109	TRUE	30	AATGGGGATTTTACTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEHCLIIVPEDEPLRLEGAQKMIGEELPPQGRVDLNDVNGVKLLGPSFAVVAQLRMRRNSCKHPLLIAIWNVQSVNLGKLEVVKNEMELIKIIILGISELKWTDIGHFELDNHMVCYARNDNLKKNGIAFIKKNISRSILKNYIVSDRIISIPLQGRPVNATIIQIYVPTTNAKEEEIEDFYQLLQSESNMQSGCLVITGD	149441	162716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_152690_162630
905201	contig_10042_pilon	-	3189	14	Intergenic	novelGene_79180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	191.995346343997	133	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	382	2637	944185	801835	FALSE	45	GAAATTAGATAATGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFFDSRREQGGSGLGSGSSGGGGSTSGLGSGYIGRVFGIGRQQVTVDEVLAEGGFAIVFLVRTSNGVKCALKRMFVNNEHDLQVCKREIQIMRDLSGHKNIVGYIDSSINNVSSGDVWEVLILMDFCRGGQVVNLMNQRLQTGFTENEVLQIFCDTCEAVARLHQCKTPIIHRDLKVENILLHDRGHYVLCDFGSATNKFQNPQTEGVNAVEDEIKKYTTLSYRAPEMVNLYSGKIITTKADIWALGCLLYKLCYFTLPFGESQVAICDGNFTIPDNSRYSQDMHCLIRYMLEPDPDKRPDIYQVSYFSFKLVKKECPIPNVQNSPIPAKLPEPVKASEAAAKKTQPKARLTDPIPTTETSIAPRQRPKAGQTQPNPGILPIQPALTPRKRAMVQPPPQAAGPSGQPVLLASVPQPKTQPQPSQPLPQSQPKQPQAPPTPQQTPSTQAQGLPTQAQATPQHQQQLFLKQQQQQPQQQQQPPQQPAGSFYQQQQQQQPQQAQAQQFQAVHPASQQPAIAQFPVVAQGGSQQQLIQNFYQQQQQQQQQQLATALHQQQLMTQQAALQQKTAVTAVQQPQAQPVAPQPVPAQEPAIQAPIRQQPKVQTTPPPAIQGQKIGSLTPPSSPKTQRAGHRRILSDVTHSAVFGVPASKSTQLLQAAAAEASLNKSKYVALPLCLSYLCGQGLPFAIIVVILCICMIMYVCIVCHVYVCLIRNCEFSCSARTVLILNNLLLCSLFSFSWSFRAQSVF	944848	801282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_802309_807096_807361_810795_811104_812063_812219_817366_817447_819357_819462_824641_824775_825254_825337_827005_827128_849627_849771_851270_851380_864221_864341_944022_944415_944696
905203	contig_5640_pilon	-	2469	2	Intergenic	novelGene_27262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	202	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGCTGATATGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873058	860304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_862662_872946
905204	contig_20878_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_173447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCTTCTCCTTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36312	38253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20878_pilon_+_37778_38130
905205	contig_8045_pilon	-	2870	4	Intergenic	novelGene_35455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_3	129.416639836872	262	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	102	473	481505	478660	FALSE	15	TCCTCTTTGTTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWRRAALVGTRLARNGSSLAGGLGGTAGAAASGMGSNTSSSWGKSAIAPMNQIQETISDNCVVIFSKTSCSYCTMAKKLFQDININYKVVELDMLEYGNQFQDALFKMTGERTVPRIFVNGTFIGGAMDTHRLHKEGKLLPLVHQCYLKKSKRKEF	485419	476262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_478792_480120_480298_481442_481507_485319
905206	contig_10734_pilon	+	5144	7	Intergenic	novelGene_51196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_2	361.766806412946	8	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	4408	4812	1131100	1134382	TRUE	60	GCTGAACAAGAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKINPLRNTSLRNIMTKNILLIREESDLIHLKMVRTGTNAKKGSHQEAEVTPDLDPVKGAIVVEAGSGRSLGPEAERERNHDPEAGRGNGGSDLVPAQDQDTGIGVEAEVGQGVEVEIERRELRNQEDLAEV	1124235	1140841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1129449_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662
905207	contig_1982_pilon	+	4454	13	Intergenic	novelGene_151312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTCTGTTTGACTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115850	173241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_117110_119054_119222_138854_138963_139306_139560_145408_145562_146250_146391_150726_150908_152112_153598_154939_155134_166323_166464_170061_170185_170730_170914_173173
905208	contig_5947_pilon	+	4505	1	Intergenic	novelGene_101522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTCTAACAAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489955	494460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_490000_494500
905209	contig_14536_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_69303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	529	834	123854	124159	NA	45	CATAGACAAAGTCATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSWTPTGDWRTGYEKAASRSFQQEAEQLVTSDTSFPTPHSSSSPLGLLCFLWPQSLGREALASSWCRLDSTCQGGFFPLLLISSIPLITSSSSFLSNT	123325	125394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_123300_125400
905210	contig_10958_pilon	+	2232	6	Intergenic	novelGene_5413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	8	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	888255	894000	TRUE	25	GATGAGGTTTGAATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888221	901619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894176_895279_895452_895566_895855_900457
905211	contig_18272_pilon	+	2193	3	Intergenic	novelGene_7073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3965.5	6	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	865	1167	518896	538154	FALSE	60	ATTTAAAAAAAAATGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASTQRTIRLPCPTTSPRAPSRTMCVTVLTSTRTSLSFLLLLWLATQAVDQSSCGSFFWNYSLINPASLLSAGQETAGNSSFLTQMRGGQEMGKEEKQA	518031	539180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_519040_537077_537197_538114
905212	contig_19469_pilon	-	3779	14	Intergenic	novelGene_134994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_9	32.2427919562822	250	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	32	1666	157463	134615	FALSE	15	GGTATTTGTCGCAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASLIDRTIKMRKETEARKVVLAWGLLNVSMAGMIYTEMTGKLISSYYNVTYWPLWYIELALASLFSLNALFDFWRYFKYTVAPTSLVVSPGQQTLLGLKTAVVQTTPPHDLAATQIPSSPPSPSIQGQSVLSYSPSRSPSTSPKFTTSCMAGYSPQLQGLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPDVTNENVFCIYQSAINAPHYELIYQSHVYSLPKGRNNMFHTLLMFLYIIKTKESGMLGRVNLGLSGVNILWIFGE	157494	132501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_139384_139459_141415_141514_141610_141726_142377_142476_144912_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488_155731_156187_156320_157184_157244_157377
905213	contig_5640_pilon	-	4688	6	Intergenic	novelGene_27261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	801	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	4330	4662	184134	183660	FALSE	25	CCTTAGTTGATAGGGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAGGIEAAGASQTRDCARGKQRRASGGEEGWGVESVYHKLLDLHSPSRRSIDVTWSQLFERKEGEVVRGRMGLKKGGVVGKRVSQITGCFVSRWKLCEAAFSYLSAGLR	333264	183633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_183785_183926_185915_189013_189421_189654_189862_312677_312697_331348
905214	contig_5461_pilon	+	5131	17	Intergenic	novelGene_156809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	70.280214810073	25	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	206	2230	213499	334965	TRUE	25	TACTTCCACATTGCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKYVTLTLGLKTRTVNRQRLSWRRRTRSLCHFLSSALLEVYTKKGKRYFYFYNTGLQNQRVLYVQDSLESEARVFLDPNILSDDGTVALRGYAFSEDGEYFAYGLSASGSDWVTIKFMKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGILKWVKLIDNFEGEYDYVTNEGTVFTFKTNRHSPNYRLINIDFTDPDESKWKVLVPEHEKDVLEWVACVRSNFLVLCYLHDVKNILQLHDLATGAFLKTFPLEVGSIVGYSGQKKDTEIFYQFTSFLSPGIIYHCDLTKEELEPRVFREVTVKGIDASDYQTVQIFYPSKDGTKIPMFIVHKKGIKLDGSHPAFLYGYGGFNISITPNYSVSRLIFVRHMGGVLAVANIRGGGEYGETWHKGGILANKQNCFDDFQSAAEYLIKEGYTSPKRLTINGGSNGGLLVAACANQRPDLFGCVIAQVGVMDMLKFHKYTIGHAWTTDYGCSDSKQHFEWLIKYSPLHNIKLPETDDVQYPSMLLLTADHDDRVVPLHSLKFIATLQYIVGRSRKQINPLLIHVDTKAGHGAGKPTAKVIEEVSDMFAFIARCLHIDWIE	206605	345115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_206798_213485_213561_233706_233780_233829_233841_235158_235290_239959_240170_242392_242515_264149_264256_277147_277340_281920_282119_287354_287459_323532_323670_325490_325586_328967_329100_330991_331149_334670_337344_344592
905215	contig_10777_pilon	+	2275	12	Intergenic	novelGene_101162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	254.713321271303	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	258	1145	8328	53404	FALSE	50	CTCATGAGGAATAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSDAAKPFSMVIFHCRHMFHKECLPVPSMNSPAQFCNICSAKSRGPGSAILEMKK	6467	54534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560_50606_52656_52737_53323
905216	contig_16148_pilon	-	2859	10	Intergenic	novelGene_50371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	533.553079729551	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	1148	2302	111433	74633	FALSE	20	TAGTGTGTATCAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLVIIFTFLSAIFYFQDFDIL	153107	74075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_74885_75358_75527_77699_77841_78492_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
905217	contig_8365_pilon	-	3997	5	Intergenic	novelGene_150925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2531	2872	194143	193802	TRUE	35	GAGCTATGTGAGATCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRISKIQDQHLDTALFEENSEKRTKKNEQNLRIMWDTIKSKNVQVIGVPERGENRKHRIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKKKSPRHIRIQLTKTKDKES	198054	191821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_192833_193103_193206_193789_194505_194674_195836_197046
905218	contig_9014_pilon	+	4561	26	Intergenic	novelGene_106772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_1	48.8122935334942	311	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	124	2964	106878	116265	TRUE	5	TGGTGTGCTGTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATIRRQTPRRPAFWVLMTVLLANMLALSDTLAVMSVDLGSESMKVAIVKPGVPMEIVLNKESRRKTPVTVTLKENERFFGDSAASMAIKNPKATLRYFQQLLGKQADNPHVALYRARFPEHKLGIDPQRQTAHFQISPQLQFSPEEVLSMVLNYSRSLAEDFAEQPIKDAVITVPAFFNQAERRAVLQAARMAGLKVLQLINDNTATALSYGVFRRKDINTTAQNIMFYDMGAGSTVCSIVTYQTVKTKEAGMQPQLQIRGIGFDRTLGGLEMELRLREHLAGLFNERQKGKSSKDVRENPRAMAKLLREANRLKTVLSANADHMAQIEGLMDDVDFKAKVTRAEFEELCVDLFERVPGPVQQALQSAEMSLDEIEQVILVGGATRVPKVQEVLLKAVGKEELGKNINADEAAAMGAVYQAAALSKAFKVKPFIVRDAVVYPILVEFTRETEEEPGVRSLKHNKRVLFSRMGPYPQRKVITFNRYSHDFNFHINYGDLGFLGPEDLRVFGSQNLTTVKLKGVGESFKKYPDYESKGIKAHFNLDESGVLNLDRVESVFETLVEDSPEEESTLTKLGNTISSLFGGGATPDAKENGTDTVQEEEEGPAEGSKEEPGEQAELKEEAEAPSQDTSQPPPPEPKEDAAADGEKAAGKENGEKSEAQKPNEKGEAGPAGVSPAPEEEKKQKPARKQRTVEEIGVELDVLDLPDLPEEELSRSMQKLRDLTLRDLQKQEREKAANSLEAFIFETQDKLYQPEYQEVSTEEQREEISGKLSAASTWLEDEGFGATTVMLKEKLTELRKLCQGLFFRVEERKKWPERLSALDSLLNHSSMFLKGARLIPEMDQIFTEVEMATLEKVINETWAWKNTTVAEQAKLPATEKPVLLSKDIEAKMMALDREVQYLLNKAKFAKPRPRPKDKNGTRAEPPLNASDQGGEGHPSARPA	105904	118238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_106021_106870_106969_107204_107299_107488_107568_107701_107857_107981_108059_108364_108547_108799_108916_110812_111006_111218_111354_111513_111597_111734_111868_112047_112236_112493_112633_113181_113243_113394_113475_113903_114090_114237_114411_114542_114631_114727_114851_115027_115162_115340_115426_115925_116162_116255_116307_116571_116623_116733
905219	contig_5286_pilon	+	3008	11	Intergenic	novelGene_157331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486973	567635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_487669_489780_489984_519309_519462_527925_528143_536996_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559631_560395_560573_564245_564478_567121
905220	contig_10044_pilon	+	1343	2	Intergenic	novelGene_156392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	0	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	107	1120	155179	156192	FALSE	15	GTCTGAGTTGATGTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPWTILDESHNQNFSEIWEVDHLLGHSQNESRVDSMEQCYEHNTLENIVHRHKNHSPLRENHDMFDLDEKAVKSNLALINQNRSIEIKNSAELNRSEKTFLHVDQEQFRTESKFRESQIPNTTKSQHIKHQKTQKIEKLPVCSECGKAFIKKSWLVRHQIIHPGKGPFVCSECGKSLTQKSSLVRHQKSHRREKLFQCNECSKAFSTKHKLIIHQRTHKERRHGCNECGKTFLYMSCLFRHKIKHTRKKHVDTGKVKNPSPASHSSSHTADLMRDKNPVSTVTMQIPSVAAQTSVNTSGLLTNRNVVLVGQPVARREPSGDNREFVQQRVLMNTVNVVVPMNAVNVVVPMNAVNVVVPSVSNCILFYVPQNP	152199	156415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_152247_155119
905221	contig_1275_pilon	-	2808	1	Intergenic	novelGene_108810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643739	640931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_640900_643700
905222	contig_5020_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_27926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAGAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137019	136350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_136400_137000
905224	contig_7056_pilon	-	3133	13	Intergenic	novelGene_43614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_3	999.532901326081	46	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	1557	2390	726042	723226	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYANQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	731069	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724534_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
905225	contig_20670_pilon	+	2200	8	Intergenic	novelGene_144825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	66.7520541608562	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	88	756	21913	26681	TRUE	10	TGCTAATTTGTCCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAGGGDCAASAPDADRPHQRPFLIGVSGGTASGKSTVCEKIMELLGQNEVDHRQRKLVILSQDRFYKVLTAEQKAKALKGQYNFDHPDAFDNDLMHRTLKNIVEGKTVEVPTYDFVTHSRLPETTVVYPADVVLFEGILVFYSQEIRDMFHLRLFVDTDSDVRLSRRVLRDVHRGRDLEQILTQYTTFVKPAFEEFCLPTKKYADVIIPRGVDNMGIAIC	21825	28355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_22021_22403_22564_23577_23675_23884_24028_24115_24211_26468_26518_26664_26744_26973
905226	contig_5988_pilon	-	2399	10	Intergenic	novelGene_16139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_9	60.4129820076921	146	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	85	1263	1622355	1590132	FALSE	45	ATTTTAAGGTTACAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAAGALSLLWGWLWSERFWLPQNVSWADLEGPGDGYGYPRARHILSVFPLAAGIFSVRLLFERFIAKPCALHVGIQDSGLYQAEPNAILEKVFMSITKYPDEKRLEGLSKQLDWDVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDTRQCWHSYPYQLLTSGLYYYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLATIGLITFSYINNMVRVGTLVMCLHDASDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFVVTRLGIYPFWILNTTLFESWEMIGPYPSWWLFNGLLLILQVLHVIWSYLIARIAFKALIRGKVSKDDRSDVESSSEEEDVTTSTKSSCGSSSRNGANRVNGHMGGSYWAEE	1622439	1588995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1590282_1592449_1592607_1593386_1593494_1593600_1593730_1594950_1595044_1595762_1595814_1598961_1599020_1599715_1599847_1600464_1600571_1622158
905227	contig_11816_pilon	+	3483	11	Intergenic	novelGene_98450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	580.395115417075	3	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	164	1600	420896	433818	TRUE	20	TGTTACAGTTTGAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCAGSGRGAGAIVLRCGLFCFSERPRRRRKTAVCSLRAGRGLFSASLRGEETLRMESKPSRIPRRISVQPSSSLSGRMMSGSRGSSLNDTYHSRDSSFRLDSEYQSTSASASPFHSTWYSESEITQGARSRSQNQQQDHDSKRPKLSCTNCTSTSAGRNVGNGLNAVSDSSWRHSQVPRSSSVVLGSFGTDLIRERRDLERRADSSISNLMDYSRRSGDFTTSSYVQDRVPSSYSQGARPKENSLSTLQLNTSSTNHQLPSEHQSIPCPRDSSRNSLRSNFSQRELESPQSSTQPGFSYISNRDDTATISNSERVASSQRSFQESSDNEGRRTTRRLLSRIASSMSSTFFSRRSSQDSLNTRSLSSESSYISPGVLAPSQSRSNATSACEVPDNRASETSQGFRFLRRRWGLSSLGQNHNSEPDSENFNQESEARNTGPWLSSSLRNRCTPLFSRRRREGRDESSRISASDIPSRSHHIFRREVNEVVHLEAQNDSLGAAANRPQASAASSRNSSWIFIPICSPPSTWKSFD	400505	451011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_400657_420883_421049_429948_430139_430906_431075_432830_433692_433753_433939_437138_437309_442782_442893_445555_445670_447166_447216_449691
905228	contig_10000_pilon	-	3888	24	Intergenic	novelGene_139304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	339	junction_12	172.227264461288	2	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1001	3006	3	3008	287111	159846	FALSE	15	AAGAGTGTGGTGTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQEMEEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRVLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATGHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPGNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	287113	158965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_182891_182946_192582_192801_225789_226009_234052_234131_236640_236869_244288_244453_255345_255513_260138_260186_262201_262289_262894_263003_270842_270957_273197_273441_280591_280703_281388_281456_283019_283184_284782_284931_285837_285939_286746_286805_287001
905229	contig_9848_pilon	-	4590	2	Intergenic	novelGene_79922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2475	3044	61870	61301	FALSE	30	GGAACTCAGAGAGGGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGKRPRISKALLKKNKVESLTLSDFRIYYTVTIVKTAWYWYNNRYVDQWNKTENPDINSSSYEQLIFDISPKSVNRRKDSVFNKRCWHNWMSICKKLKQDPYLIPCTKTNSKWIKDLNIKSKMIKIMEEKIGTMLGALIHSINTIRTVSNNAQAPQERLDNWKLQKTNTYAHQKTSPKE	65358	59754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_62180_63193
905230	contig_11422_pilon	-	1332	2	Intergenic	novelGene_99029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGTTAGTAAAACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2149	743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1842_1915
905231	scaffold_12124_pilon	+	1818	10	Intergenic	novelGene_22360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3082.6448881071	11	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	99	476	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1486529	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508472_1508667
905232	contig_19362_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_157804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGGTAGAAAGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83171	84258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_83200_84300
905233	contig_16999_pilon	+	2363	9	Intergenic	novelGene_84998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_1	109.849826467774	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	50	601	173125	184059	TRUE	5	TATTGGTTTTTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTADARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECK	173075	190208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_173128_174439_174485_174760_174863_175244_175349_182566_182656_183734_183806_183921_185344_188357_188469_189841
905234	contig_14326_pilon	-	2197	2	Intergenic	novelGene_120740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	1786	2196	470061	469651	FALSE	55	GAAAGGAAATAGTAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEISNRKSKEKNSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIQKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIQTLTTELKQIEREQQKKPTTTG	480089	469649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_471830_480072
905235	contig_12414_pilon	-	4715	6	Intergenic	novelGene_59658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_2	399.508898524176	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	4237	4647	787209	767686	TRUE	50	ATTGAGAGAAGAAAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASWEDEKVTEASSNSFVAIKIDTKSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATD	791445	766884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_766903_767635_767691_781929_782108_782791_782911_783428_783458_787129
905236	contig_7078_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_130197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAACACTGTCCCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951255	953063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951300_953100
905237	contig_8676_pilon	+	5041	11	Intergenic	novelGene_142197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	195.765267603832	217	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	67	1038	220514	240573	TRUE	70	TAAAATATGAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNLSEAKLDEYIAIAKEKHGYNMEQALGMLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKTFHRIQQMLPDKSIASLVKFYYSWKKTRTKTSVMDRHARKQKREREESEDELEETNGNNPIDIEVDQNKESKKEVPPTETVPQVKKEKHSTQAKNRAKRKPPKGMFLSQEDVEAVSANATAATTVLRQLDMELVSIKRQIQNIKQTNSALKEKLDGGIEPYRLPEVVQKFNARWTTEEQLLAVQAIRKYGRDFQAISDVIGNKSVVQVKNFFVNYRRRFNIDEVLQEWEAEHGKEETNGPSNQKPVKSPDNSIKMPEEEDEAASVLDVRYASAS	201863	244701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_201886_220469_220523_221920_222083_222563_222683_225222_225302_229948_230144_236092_236171_236403_236462_237128_237359_240531_242116_242240
905238	contig_6445_pilon	-	1921	2	Intergenic	novelGene_76980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATGTTTGTAATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400183	397087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_397609_398783
905239	contig_10159_pilon	+	2684	6	Intergenic	novelGene_30858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAAAGCACAAACAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791412	896634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_792227_841053_841686_843654_844129_852950_853145_858697_858980_896346
905240	contig_17274_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_26543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATTTTTTGCATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147185	149585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_147200_149600
905241	contig_8167_pilon	+	2152	9	Intergenic	novelGene_155656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	652	969	137013	137330	TRUE	15	AACCCTTCCGCGCAGGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPACSTHFMLLRVKTWEEAWLRSLVILSQSGLARVCGCACLSFPPEDKSPQVPQMQLSLAEQPCPAGAASDPSSGQDYKSLDFRSFRALEAMRLKKSLGARVRR	136361	180487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_137452_139852_140013_143295_143387_143934_144143_144928_145048_148701_148884_157061_157233_166302_166379_180432
905242	contig_12379_pilon	-	3653	5	Intergenic	novelGene_148922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2821	3237	38203	37787	TRUE	20	TCCAAGCCACGTGGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSQIILNIRDLNSLLVRSSAFSSAGRSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCRLQGIQWLFSSFIDCRFVCFICFFVWLCLSRWAVHSFVVCSSMGTILFTSFFSGHDQSLRYVTAG	46574	37284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_37494_37579_40362_40428_40672_40799_41047_46402
905243	contig_6375_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_72971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTCCATGAACAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221993	223566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_222000_223600
905244	contig_8138_pilon	+	3640	12	Intergenic	novelGene_52491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGGAGGGCAGAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319046	409837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_320534_322037_322145_323764_323888_330160_330292_341008_341136_347713_347803_351791_351877_351977_352125_360254_360349_362854_362925_373949_374019_408726
905245	contig_1725_pilon	+	2477	18	Intergenic	novelGene_24266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	528.575103593054	39	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	77	2158	201480	255543	FALSE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGVNKARGN	201403	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251062_255512
905246	contig_7078_pilon	+	2835	1	Intergenic	novelGene_130177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1512	1811	769824	770123	NA	50	AAAAAAAAAAGTCCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTRDCSNQDQNRGFWTKLEKDAEQNSNIHTKDQIYRPERDWRNPESMDPRYPFSSVVKSLLRFTIQSRTGQTHKTKWD	768312	771147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_768300_771100
905247	contig_6589_pilon	-	2057	11	Intergenic	novelGene_26272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	49.3762088459614	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	906	1490	2231995	2228878	TRUE	15	TTCTTCAAGCTTGGCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSSPGWENLEKLLTFTSPGVKARGKLVIFTNQMGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGGKMP	2232900	2227812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2231914
905248	contig_6137_pilon	-	1973	4	Intergenic	novelGene_59277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTATGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1349055	1341504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1341640_1345125_1345188_1346607_1346749_1347420
905249	contig_8687_pilon	+	4887	8	Intergenic	novelGene_169671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	13.2434042112306	389	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	99	1367	304034	339853	FALSE	45	CGAGTAATAAAATAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEEDYSSALSCIAEALKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGRISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELQQQSCLLISHAIEALILDPESASVQEYGSAGAARADSEYERRMMSVYSRVLEEVESLNRKYTPVSYMHTACLCNAIIALLKVPLSFQRYFFQKLQSTSIKLALSPSPRNPAEPVAVQNNQQLALKVEGVVQHGSKPGLFRKIQSVCLNVSSTLQSKSGQDYKIPIDSMTNEMEQRVEPHNDYFSTQFLLNFAILGTHSIAVESSVKDANGIVWKTGPRTTIFVKSLEDPYSQQIRLQQQQAQQPLQQQQQRNAYTRF	303935	343373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_304229_317426_317622_318320_318425_319477_319547_322802_322936_328570_328670_329958_330145_339565
905250	contig_7657_pilon	-	2808	3	Intergenic	novelGene_30046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCCACTCCAATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310671	286507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_286606_292928_293669_308701
905251	scaffold_12124_pilon	+	4673	11	Intergenic	novelGene_22099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	203.889308204231	172	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	546	881	867290	877161	TRUE	35	AATGTAAGAACTCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPDGKPGGQLRKI	862910	892089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_863427_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879174_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026
905252	contig_9098_pilon	-	2419	9	Intergenic	novelGene_75777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	477.05293207358	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	546	911	267418	264388	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295261	262879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_287999_288160_289194_289280_292840_292905_294101_294181_295200
905253	contig_990_pilon	+	3592	27	Intergenic	novelGene_76162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_25	169.988391528474	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	1546	2937	1911790	1930511	TRUE	20	TTTTAGCTCATCTCAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWVKLYKSENLDNPIQTVSLGQSLFFHFPPLLRDSENYVVLLDSTLPKSQGNCLNKTLPRDHTLPCL	1885020	1933036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1885076_1887670_1887744_1890852_1891006_1891989_1892128_1892648_1892739_1895689_1895796_1895977_1896129_1901768_1901944_1903810_1903953_1905047_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911080_1911145_1911748_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919670_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1927820_1927923_1929769_1929811_1930456_1930550_1932419
905254	contig_6576_pilon	+	3477	2	Intergenic	novelGene_42427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	1275	2645	1301228	1303449	FALSE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPADGDFREVCYVN	1299953	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302564_1303414
905255	contig_4232_pilon	-	2865	2	Intergenic	novelGene_63454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	0	7	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTATTAGAATTGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546357	542774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_545270_545987
905256	contig_3986_pilon	-	3021	14	Intergenic	novelGene_52675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_13	106.337188382692	14	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	310	1812	60653	35282	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	153862	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_108396_108527_153684
905257	contig_8843_pilon	+	1875	11	Intergenic	novelGene_156646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	285	junction_7	333.637842577847	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	13	1665	49851	117048	FALSE	35	TTAATTTAACATGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYDPPDPRRIYTIMSAEEVANGKKSHWAELEISGRVRSLSTSLWSLTHLTALHLNDNYLSRIPPDIAKLHNLVYLDLSSNKLRSLPAELGNMVSLRELLLNNNLLRVLPYELGRLFQLQTLGLKGNPLSQDILNLYQDPDGTRKLLNFMLDNLAVHPEQLPPRPWITLKERDQILPSASFTVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWEYRKKGIMEEIVNCDADIISLQEVETEQYFTLFLPALKERGYDGFFSPKSRAKIMSEQERKHVDGCAIFFKTEKFTLVQKHTVEFNQVAMANSDGSEAMLNRVMTKDNIGVAVVLEVHKELFGAGMKPIHAADKQLLIVANAHMHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKGVIDYIFYSKTHMNVLGVLGPLDPQWLVENNITGCPHPHIPSDHFSLLTQLELHPPLLPLVNGVHLPNRR	49838	117258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_49963_53127_53315_54647_54734_66012_66103_83970_84040_87806_87965_89797_89953_107316_107469_110287_110516_112586_112790_116835
905258	contig_3861_pilon	+	3514	8	Intergenic	novelGene_57896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	780.862474499596	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	2481	3512	150245	176462	FALSE	50	AGAAAAGATCGATGAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPENTFGSRNYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGNVHRPGIVIDYQNKPTNVAVAAARGIKRKMIQPFNKPGGTFIKKPKLTKPVEKTNLSKSPTKTDSKMEEKEKRRIEARREKQRRRREKNNEKYGDGYRTAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLESSSHQATLDHIQKQTKFDKVVMDFLHECMVNKFKRTSIRKQQTNSLTEAGKIIDKDAMEGVTADDHMMKVETIHCNACSVYIPALHSLIQQHLKSPDHIKAKQAYKEQIKRESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQLIEGDEEE	147764	176464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_150425_152749_152949_157484_157597_165474_165623_166767_166868_170343_170475_171793_171890_176396
905259	contig_7396_pilon	-	3118	15	Intergenic	novelGene_79618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_14	3091.08590736891	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1386	2267	251531	247859	TRUE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQGGSGYGKFSSL	257465	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247895_248193_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257294_257381
905260	contig_610_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_76806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314254	315814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_314300_315800
905261	contig_13901_pilon	+	1471	9	Intergenic	novelGene_146626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	157.602149414277	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	513	1469	64511	135135	FALSE	55	GAATATTGAAAATGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFPNILPPAGDGGLTSSQSEFQKMLIDERLRCEHHKTNYQTLKAEHTRLQDEYIKSQNELKRLLNEKQTHQEKFQLLLEELREELVEKTKDLEEMKLQVLTPQKLELLRAQIQQELETPMRERFRNLDEEVEKYRAEYNKLRYEHTFLKSEFEHQKEEFGRILEEGKIKYESEVKELKHSNKLEITDIKLEAARAKSELERERNKIQSELDGLQSDNEILKSAVEHHKVLLVEKDRELIRKVQAVKEEGYQKLVALQDEKLELENRLADLEKMKVEHDVWRQSEKDQCEEKLRASQMAEESARRELQSIRLKLQQQL	2316	135137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2704_64385_64660_65112_65264_90152_90246_93293_93426_119255_119371_120602_120748_120858_121009_135113
905262	contig_12079_pilon	-	2258	10	Intergenic	novelGene_67425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1313.0219126922	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	369	1064	600738	580918	FALSE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRQVGCDGFWESLSDT	638737	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580964_585351_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
905263	contig_11964_pilon	-	2951	1	Intergenic	novelGene_164730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCCAGAAAACAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272847	269896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_269900_272800
905264	contig_8278_pilon	+	3777	6	Intergenic	novelGene_165298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGATTGCCGCTCCCGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214750	229433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_217683_219894_220019_222974_223067_224070_224201_226856_226954_229031
905265	contig_6361_pilon	-	3946	10	Intergenic	novelGene_23904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_2	96.4627478791428	213	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	320	1366	170482	156301	FALSE	35	AACTTTTAGAAAAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLNSTTQTPNKIAISPLKSPNKAVKSAVQTITVGGVSTSQFKTIIPLATAPNVQQIQVPGSKFHYVRLVTATTASSSTQPVSQNPSTNTQPLQQAKPVVVNATPVRMSVPIVPAQTVKQVVPKPINPTSQIVTTSQPQQRLIMPATPLPQIQPNLTNLPPGTVLAPAPGTGNVGYAVLPAQYVTQLQQSSYVSIASNSNFTGTSSIQTQARLPFNGIIPSESASRPRKPCNCTKSLCLKLYCDCFANGEFCNNCNCTNCYNNLEHENERQKAIKACLDRNPEAFKPKIGKGKEGESDRRHSKGCNCKRSGCLKNYCECYEAKIMCSSICKCIGCKNFEESPERKTLMHLADAAEVRVQQQTAAKTKLSSQISDLLTRPTPALNSGGGKLPFTFVTKEVAEATCNCLLAQAEQADKKGKSKAAAERMILEEFGRCLMSVINSAGKAKSDPCAMNC	219820	153720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_156503_158628_158832_166504_166643_166803_166907_167814_167887_168646_168739_170093_170292_170443_170518_175490_175708_219753
905266	contig_7515_pilon	+	3023	4	Intergenic	novelGene_178810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1531	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAACTACCTGATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143160	360989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7515_pilon_+_143476_241506_241749_241810_242220_358932
905267	contig_6544_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_142105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAGAAAGGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122844	123569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_122800_123600
905268	contig_4604_pilon	+	2160	9	Intergenic	novelGene_19174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1186.1092316372	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	319	1035	373631	379856	TRUE	25	GTTTTACTGATTTTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	372062	381068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_379872_379958
905270	contig_9177_pilon	-	1837	12	Intergenic	novelGene_32578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	814.656901872558	17	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	86	1399	9011	2152	FALSE	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRDEH	9190	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2163_4339_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147
905271	contig_15371_pilon	+	3342	1	Intergenic	novelGene_151454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGGAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161523	164865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_161500_164900
905272	contig_10904_pilon	-	1884	7	Intergenic	novelGene_22720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	375.691251783518	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	280	1230	662171	651376	FALSE	50	TGACTAAGACAAGAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662760	650721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
905273	contig_12793_pilon	+	2913	9	Intergenic	novelGene_164110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2179	2664	178859	238235	TRUE	30	ATACATGGAGCTGCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLHSAWMRMKMPAVQPKPPESPTRKEGAASPQLLQDLPGHFHCSILHPLQWMPDGLQLIQVYLTTHIHFLQVLSCKIKGLDLWMADLKSVLFLAFTCSFHSEVRQVDKSISFLCHLIAVPVQGRLLQHHPELFPFVAEESSLFLFLIQPSLAVSMSQIFT	132556	239127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_+_134225_149114_149307_178540_178907_190429_190520_191880_191940_207040_207115_208603_208677_238093_238264_238906
905274	contig_12948_pilon	-	3428	8	Intergenic	novelGene_126205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1118	junction_5	146.63796874463	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1668	1760	3427	249445	235780	FALSE	30	TCTCTAAGCATAGACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPICLLGMLDEESLTVCEDGCRNKLHHHCMSIWAEECRRNREPLICPLCRSKWRSHDFYSHELSSPVDSPSSLRAAQQQTTQQQPLAGSQRRNQESNFNLTHYGTQQIPPAYKDLAEPWIQVFGMELVGCLFSRNWNVREMALRRLSHDVSGALLLANGESTGNSGGSSGSSPSVGATSGSSQTSISGDVVEACCNVLSMVCADPVYKVYVAALKTLRAMLVYTPCHSLAERIKLQRLLRPVVDTILVKCADANSRTSQLSISTLLELCKGQAGELAVGREILKAGSIGIGGVDYVLNCILGNQTESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTD	251204	235778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_236399_236877_237068_237339_237432_240648_240771_245391_245671_248451_248636_248748_248831_249345
905275	contig_5031_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_133215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATCATCCCCATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100906	97966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_98000_100900
905276	contig_11258_pilon	-	2268	3	Intergenic	novelGene_67838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17.5	6	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	43	903	360471	353202	FALSE	15	CAACACCTGTTTGTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TETLSWGSGRQGECMRGREAKEVSHEEPQIWTLTPFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSTRAAAGLSGDFNLWHGRYMVWTRLWPLCGCARRGQDGGGREVRVLSGAPPASAGWNQDCGLPESCLEMLPWPMWPWGDFGPRLLCPAPSKVSMMCEIKPRRW	360513	351836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_353506_354713_355099_360299
905277	contig_12866_pilon	+	5968	1	Intergenic	novelGene_174646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTCAATTTTTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653187	659155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_653200_659200
905278	contig_4301_pilon	+	7647	8	Intergenic	novelGene_65096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	177.890358344225	584	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	218	1624	459349	530958	TRUE	20	ATCCACGGATTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSTAVPLGFHYETKYVVLSYLGLLSQEKLQEQHLSSPQGPQLDTASQSLDQEVQLKVKTEIEEELKSLDKEISEAFTSTGFDRHTSPVFSPANPESSIEDCLAHLGEKVSQELKEPLHKALQMLLSQPVTYQAYRECTLETAVHASGWNKILVPLVLLRQMLLELTRRGQESLSALLQFGVTYLEDHAAEYIIQQGGWGTVFNLESEEEEYPGIIAEDSNDIYILPSDNSGQISPPESPTVTTSWQSESLPVSLSASQSWHTESLPVSLGPESWQQIAMEPEEVKSLDSSGAGEKSENNSSNSDIVHVEKEEIPESMEEAAVASAGLPTRELQEAFSETPAPLLPHITASSQLETREPDTEMIAVEKTSPATSLFVELDEEEVKAATAEAVKLEEEVVPALEPTKTLLSEGERSVRKESLTEESSLAREEKAIPLSEGKSILLFGGAAAVAILAVAVGVALALRKK	450268	537078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_450436_459298_459470_492399_492508_494596_494754_499139_499210_507918_508063_530151_532354_532450
905279	contig_16103_pilon	-	2404	1	Intergenic	novelGene_118690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	634	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180712	178308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_178300_180700
905280	contig_18869_pilon	+	1535	3	Intergenic	novelGene_56466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_1	235	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	187780	188974	FALSE	25	ACTAAGGTACTCCTAGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNWEEPVRSPGLSRSPFLPRRGEPQGWAQAEAAAAEGSDADAGRRRELLQGLLRETGPALSPAHQADHTTNPLSEHWPEHNAHQPGPPQADGLYHGPTSVLPGFYCGPGL	187777	190174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_187931_188134_188291_188948
905281	contig_5613_pilon	-	3566	7	Intergenic	novelGene_176651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2654	3007	81300	80947	TRUE	30	CACAGTTTCCAGTCTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVFSMSGVNISFKVCKKNNSMYFIFAANNLVMFITRSCRGALVKRLVVKQKVGCSKPRATLWEKNVSVSFPKRFTVLETLWGNSTLFFQGCYESESTQRPWVWFFLVCSLQHPLNE	127540	24861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5613_pilon_-_24883_30535_30717_69595_69717_80710_82486_111264_111462_114600_114810_126478
905282	contig_16103_pilon	-	2674	15	Intergenic	novelGene_118925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.257539376818856	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAGACTGAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797875	781700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_782376_784334_784418_785514_785688_788394_788594_789048_789327_789467_789641_790825_791015_791766_791823_792254_792430_792774_792849_793922_794114_794201_794297_795266_795321_795891_795972_797696
905283	contig_11631_pilon	-	2198	17	Intergenic	novelGene_104197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_6	77.7929945432106	27	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	96	1199	241681	191895	TRUE	60	AGAAAGACGAAAAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENLDEFIEERKAKLAKDKAELESDPPYMEMKGKASEKLSENSRILISMAKENIPPNNQQTRGSLGIDYGLSLPLGEDYERKKHKLKEELRQDYRRYLTQKNFLSTVETDPSTLGVSLPIGERLSAKERLKLERNKEYNQFLRGKEESKETFRQVEKSTESKSERNKKSVCQVKPDLPSQVQASCKNSEGPRRDVLTPSEAYEELLNQRRLEEDRYRQLDDEIELRNRRIIKNTHEEGSISSKKHQRLANKANIPDRRFRRFNEDRVLDRQYYRPDHDPEVSEEMDERFRYESDFDRRPLRVYANDSSRDNVPNERSKSANTRDVYSPFVGMVFGGEDRELVQRRKEKYRLELLEQMAEQQRNKRR	253093	162057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_162096_162516_162667_165441_165555_168680_168834_176482_176631_178697_178828_188740_188944_190902_190961_191888_191993_196675_196759_205542_205983_206681_206781_208084_208166_216406_216511_239674_239775_241582_241707_253023
905284	SIRV6	+	939	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	577	12	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	351	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
905285	contig_11846_pilon	-	2307	1	Intergenic	novelGene_105975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCTGACTGTGATGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313332	311025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_311000_313300
905286	contig_383_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_126112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCCAGGGCCCCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135555	135244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_135200_135600
905287	contig_17797_pilon	+	4463	2	Intergenic	novelGene_177282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	70	junction_1	0	603	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	41	838	29497	55246	FALSE	25	TCTATTAGGGAGGCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFISKRRKGLIWWMNHMASHPVLAQCDVFQHFLTCPSSTDEKAWKQGKRKAEKDEMVGANFFLTLSTPPAAALDLQEVESKIDGFKSFTKKMDDSALQLNHTANEFARKQVTGFKKEYQKVGQSFRGLSQAFELDQQAFSVGLNQAIAFTGDAYDAIGELFADQPRQDLDPVMDLLALYQGHLANFPDIIHVQKGALTKVKESRRHVEEGKMEVQKADGIQDRCNTISFATLAEIHHFHQIRVRDFKSQMQHFLQQQIIFFQKVTQKLEEALHKYDSV	29456	58871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17797_pilon_+_30041_54992
905288	contig_15123_pilon	+	3480	10	Intergenic	novelGene_110903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.5733639143669	249	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	275	1099	173864	210300	FALSE	15	CCCAGCTCCATTTCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLILIATLVVAQLLLVQWKQRHPRSYNMVTLFQMWVVPLYFTVKLHWWRFLVIWSLFSAITAFVTFRATRKPLVQTTPRLVYKWFLLIYKISYATGIVGYMAVMFTLFGLNLLFKIKPEDAMDFGISLLFYGLYYGVLERDFAEMCADYMASTIGFYSKSGMPTKHLSDSVCAVCGQQIFVDVSEEGIIENTYRLSCNHVFHEFCIRGWCIVGKKQTCPYCKEKVDLKRMFSNPWERPHVMYGQLLDWLRYLVAWQPVIIGLVQGINYILGLE	143387	212681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_143458_160328_160437_170796_170835_173805_173948_188328_188484_191684_191793_194840_194962_207393_207528_208391_208494_210179
905289	contig_6862_pilon	-	2399	13	Intergenic	novelGene_63746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	193	588	110578	85758	TRUE	5	TTCGGCTACGCCGCGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLPLLFLYLFSLHIHEKSFISQVLLLTHFLVFFLIYTRLKCQWSLEFRVQSWLIRIGNLLHRIYFLLLSLFFVLLYWISDAGVGLEFRRQMPITRQSKVFSPSLICHIRIWLLEAYFLVPDGGLILTPV	113781	48934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_49074_49378_49561_55247_55398_55962_56140_75087_75208_82884_83002_83260_83945_84168_84327_85673_85795_86044_86221_109121_109217_110490_110596_113606
905290	contig_14333_pilon	+	1599	2	Intergenic	novelGene_49077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_1	0	60	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	418	1236	262547	263365	FALSE	20	AGGTGTCACTTGTAGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGNFETPEAETPPIRSPLKGSCDSSLGLTGPGAKTQESQEDDEQLVAEVVEKYSSETCPRPSENEVPQQAIASHSVKDFKEEPEHDTSKISIVRPFSIETKNSTDVPAALGTKTAHGFVTAVLEEALLSRAPEAIQDKAMTEGNMGVTLEASTETDVKTLNSCSESVPSRSKLRKPKPVSQRKKTISGEFSETETMVEGTPLPKAPYQVSLDELDENTYSSLIGGARIQKPPTEVKETSSTPSSDTNDSGVELLEESRSSPLKLEFDFTEDVENVEAKKALPRKLGRKLGNKLTPKAQKDGISKPVGGKGVEQPADIKAEDTPVLHTSSKLDPSQWDNPNFNPFGVHSTLQNSPSLSSKSSYHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTCNDFRSTTGNHVNEILESPKKAKSRLIT	228236	263728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_228346_262238
905291	contig_19402_pilon	+	2624	13	Intergenic	novelGene_80799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1149.84697955375	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	408	1460	57720	145553	FALSE	55	AAAAAAAAAGGACTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLSCQK	36984	146717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138599_145534
905292	contig_233_pilon	-	2500	15	Intergenic	novelGene_14537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1418.46127647431	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	126	2057	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127032	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105498_108414_108583_108724_108814_109914_109976_126898
905293	contig_20550_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_142632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1790	2182	27861	27469	NA	25	CAAAACTTGCTTGACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESTTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELDKDAEQNSNTQKKTIYWPDRDWRNPEIMAPRHPFSSVVKSLPRFIVQLGTGQSHKMGLMRHSSPGTRTRRQKGTGKLVIGNSRFTKDSVDM	29650	27103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_27100_29600
905294	scaffold_12124_pilon	-	2959	7	Intergenic	novelGene_22366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2192	2527	1508404	1508069	TRUE	40	AGAGAAGGAAAGGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510595	1490361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497122_1506628_1506684_1508007
905295	contig_4486_pilon	+	3085	2	Intergenic	novelGene_38610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	2458	3042	366694	367517	FALSE	20	TTTTCATAGGATTATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKIMVPTALRPATQSLKEFVCVYGASMTFTCTTCASFPCIVYCLLLHPRHRCMYPSLPMHSSVDGHLGCFHRFAIANNAAMNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRRIIFQNGCIILHSHQQCIRILVSPQPLQHLLFLVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDQEHFLMCLLAI	364236	367560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_366853_367091
905296	contig_14441_pilon	+	784	5	Intergenic	novelGene_100473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	60	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	201	749	125667	126705	FALSE	0	GCCTGGCCGTGTGTCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTDPQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	85673	126740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85683_121648_121691_125517_125902_126159_126283_126514
905297	contig_9924_pilon	+	3290	10	Intergenic	novelGene_175914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	250.714977614023	3	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	925	2775	515	3289	114555	129828	FALSE	80	AAAGTAAAAAAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSSEEEKHNKKGMANQREKSLKTAREKSSDNVERKQEREKFFSAEGTVDKDKTIMELRDGLSKKQQPSVSSDGTDKPSSRRGEGFNSPEDKKVAETKEKSKHLKTKMCMKVQGGLSGVAEKFPKKEQTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDGEK	15631	129829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_51314_51455_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_123901_124012_126980_127049_127352_128405_128485
905298	contig_5586_pilon	-	4082	5	Intergenic	novelGene_143551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	500	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAATTCCTGCCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388109	368994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_369241_373452_373553_380617_380719_383470_383572_384575
905299	contig_1107_pilon	-	2668	15	Intergenic	novelGene_126589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_13	99.9483540103976	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	200	2083	869021	828870	FALSE	35	TTTGCAAATTTAGCACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIILCLTVGNGSSWKNLEMILNSTINFLRQPWLNSSTRIMQILSTFPQTCPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRIAGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSNVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVIIEQFVQSHPNGLRIMYDKLLDFVPHHCRLLREVTGGAISSEKSNTVPGYDFLVNSVWPEIVQGLEEKLPSLFNPGNPDAFHEKYTISMDFVRRFEVQCGSQASVKRLRAHPAYHSFNNKWNLPVYFQIRFREIAGSLEAALTDVLEDAPAGSSYCLLASHRTWSCLRKCWSDEMFLPLLVHRLWKLTLQILARYSMFVSELFLRPISNESAKDVKKPLVTGSKDPSVTQGTNDDQGNGPSETKPVVFISSTHLVYVVADLDKLQEQLPELLETIKPKLEMIGFKNFSSVSAALEDSQLSLSACMPSLSKKIIQDLSDSCFSYLKSALEVPRLYRRTNKEVPTKASSYVDSALKPFYQLQSEHKDKLKPAIIQQWLEGALSESTHKYYETVSDVLNSVKKMEESLKRLKQARKTTSPNPVGSSGGMSDDDKIRLQLALDVEHLGEQIQKMGLQASNIKSFPALIELVVAAKDQATAEQP	885462	828284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_828972_830568_830750_832067_832208_834151_834295_834587_834661_835598_835797_837627_837780_838993_839056_843882_844023_847728_847856_853032_853158_857752_857933_858472_858582_868869_869032_885273
905300	contig_2069_pilon	+	1966	10	Intergenic	novelGene_23269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	220.875083404932	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	618	1124	342065	343975	FALSE	10	TGATGTGGTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324085	344817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332216_332333_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335643_342007_342077_342574_342729_343519_343652_343766
905301	contig_5696_pilon	-	4141	13	Intergenic	novelGene_117548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAAGCACAAATGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738163	684369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_684413_689245_689821_692392_692487_705014_705133_707515_707618_712911_712992_714012_714071_714622_716738_730430_730595_731912_732064_732416_732504_734429_734592_737771
905302	contig_11338_pilon	+	3513	4	Intergenic	novelGene_6310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGGGACAAGACAACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231860	245016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_235140_242913_243038_244695_244746_244956
905303	contig_20004_pilon	+	2624	8	Intergenic	novelGene_167523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.797848737368	32	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	969	1742	13715	15160	TRUE	35	TGTGTCTTAATCAGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESGIDRIISQVVDPKINHTFRPQVEKAVHEFLATLNHKEEASASTAPDDEKPDSSIIIQGIPAPGPSANVANDAMSILETITSLNQEASAARASTETSNSKANERVYKKLPFQPSTDINTEKDRTSEDVADKEKSPPDSAGEGLEAAPKSEESNDFPGPVEEIKNHAKENNSLILVSKEVQQEGSDQKNKSTDKGEKKLDSNEKGERKKEKKEKTEKKFDHSFTEQRVSIWGYPIFACLQILVNLFDNCFKTLKT	12746	23547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20004_pilon_+_13899_14411_14900_15058_15419_15723_15964_18693_18753_21291_21404_22280_22420_23473
905305	contig_5280_pilon	+	2799	1	Intergenic	novelGene_52657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	119	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCGCAGCCACTAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305216	308015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_305200_308000
905306	contig_10766_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_151210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGAAAAACAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168696	172167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_168700_172200
905308	contig_12079_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_67462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	512	1231	581102	598095	TRUE	25	CCAGGAGCACCGCAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWVLLLSSLAWDNSLVKVCSLPLHALILLGLGDPLLLIAVVHDALTGELGAVACVLGALLLQVVLDVVIHRLIHGGRGRRGRCHHQVQLLPGLHQVVLRLFGPVLPFLHLVLLAPPRLFQQGNLGCVLSELRGHLLFLPLNSFSPLLLSFQLLPLQLFLVLLLAGLGLHLLHLNGVGLATTHVQLMVPHTQLQDPLVDPQTRGVEYEVRCLLVNGLDDKLLVIATGLFLSYFLSQNS	580590	600698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582169_583661_583756_585317_585378_585891_586056_591616_591664_598051_598244_599418_599548_600608
905309	contig_5279_pilon	+	4197	1	Intergenic	novelGene_105553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTAGGGGGTAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277820	282017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_277800_282000
905310	contig_4857_pilon	+	2264	4	Intergenic	novelGene_48810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAACTTTCAAATATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249318	1252511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1249554_1249908_1251152_1251276_1251568_1252016
905311	contig_9705_pilon	+	4382	28	Intergenic	novelGene_41752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_2	218.213101064062	54	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	933	2802	583	3384	492133	538335	TRUE	65	AAGAAGGAAGAAAAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMCEPQTLCHILGFKFKFYQEPSGETPSSLYRVAAVLLQFNLIDLDDLYVHLLPADNCIMDEHRREIVEAKQIVRKLTMVVLSSEKMDEREKEKEKEEEKVEKPPDNQKLGLLEALLKIGDWQHAQNIMDQMPPYYAASHKLIALAICKLIHITIEPLYRRVGVPKGAKGSPVTALQNKRAPKQAENFEDLRRDVFHMFCYLGPHLSHDPILFAKVVRIGKSFMKEFQSDGSKQEDKEKTEVILSCLLSITDQVLLPSLSLMDCNACMSEELWGMFKTFPYQHRYRLYGQWKNETYNSHPLLVKVKAQTIDRAKYIMKRLTKENVKPSGRQIGKLSHSNPTILFDYILSQIQKYDNLITPVVDSLKYLTSLNYDVLAYCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMG	462681	540806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_462741_466106_466199_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_539020_539266_539370_540595
905312	contig_8570_pilon	-	3654	2	Intergenic	novelGene_120145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAACTTTCCCAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295889	290284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_290628_292578
905313	contig_6915_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_162423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCACTCGTTTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269646	270903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_269600_270900
905314	scaffold_12124_pilon	+	4387	12	Intergenic	novelGene_22095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	194.821257346445	215	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	923	1399	879089	889101	FALSE	35	AATGTAAGAACTCATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRFSVVQKIFPPVPGIRDPIKDFFHNNRLVDWEAGAEGWQECSVEEVQAVGET	860139	892089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860365_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026
905315	contig_9527_pilon	-	3273	2	Intergenic	novelGene_134026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	687	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCCCCAAACATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59055	55723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_58080_58138
905316	contig_7694_pilon	-	2928	2	Intergenic	novelGene_159918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1935	2240	3673	3368	FALSE	10	GGTCCGTTGTAATGTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESIGFSMYSIISSANRESLTSSLPVWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	6396	2679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7694_pilon_-_5468_6256
905317	contig_9924_pilon	+	1692	10	Intergenic	novelGene_175916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	442.125617588933	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	210	1412	15841	171041	TRUE	25	GTAACCAATTTGTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETGSPPRSAINQNTDKISGAGTNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKVCKESRIGRKSAEL	15631	171886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99252_114522_114579_115839_115893_116800_116926_123901_124012_126980_127049_127352_127966_170996_171100_171664
905318	contig_383_pilon	+	3265	2	Intergenic	novelGene_126124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTCATCTTCTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138709	142032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_140779_140836
905319	contig_7963_pilon	+	859	5	Intergenic	novelGene_58388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1291.70882458083	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	67	792	51450	63115	FALSE	20	AGGTTCCTGGCACTTACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTKRHLNSSCPTNSSLSFLSHFLCSPPQ	51383	63182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57818_63034
905320	contig_15067_pilon	-	1586	3	Intergenic	novelGene_154327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAGGCGAGCATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94091	90308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_91592_91634_91821_93974
905321	contig_5586_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_143572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCACAAAACAAAAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393380	390946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_390900_393400
905322	contig_15123_pilon	-	3092	3	Intergenic	novelGene_110891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGTATTGAGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74084	16964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_17538_24433_24438_71569
905323	scaffold_12124_pilon	-	3214	9	Intergenic	novelGene_22328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1888	2223	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510291	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
905324	contig_1008_pilon	-	2543	4	Intergenic	novelGene_121549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_1	33.0790299468141	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	161	1303	573637	520962	FALSE	40	AAGTATTATGACGAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANKTGYVPSNYVERKNSLKKGSLVKNLKDTLGLGKTKRKTSARDASPTPSMDAEYPANGSSTDRIYDLNIPAYVKFAYLAEREDELSLVKGSRVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVMEEVDEASADSPSFRSLRKGASMSNGQGARALHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNSRGQIGLVPKNYVVVLSDGPALQPSHAPQISYTGPSATGRFAGREWYYGSVTRHQAECALNERGVEGDFLIRDSESSPSDFSVSLKASGKNKHFKVQLVDNVYCIGQRRFHTMDELVEHYKKAPIFTSEHGDKLYLVKALQ	608361	519721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_521157_534949_535672_573411_573654_608217
905325	contig_4857_pilon	+	3275	4	Intergenic	novelGene_48652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2506	2838	447861	448193	FALSE	15	TGCCGAACACGCTGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRQAWPNAGFLPQAGLEPGRGPWGHVGGEGRRTRKGGEGKGAGPGSRCLHLPLRPGRTGLGRGTHLPISRTIKTTFKFFSPGLISFIKRSGSLTPFILRQVRLQQRRRG	441392	448630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_441767_442782_442850_443245_445067_447617
905326	SIRV6	+	1189	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-436	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	26	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1849	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2026_2470_2627_2743_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
905327	contig_12626_pilon	+	3257	1	Intergenic	novelGene_80443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	501	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	940	1251	150603	150914	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPTALCPAIQSLREFGCVHRVFNGWFFRSRSPGLSSKVPLGGLKPPTFRSAAEYNNHLHNQGILFSLCSKEASHESSAFEELMLCCRKEKMTIVDTL	149663	152920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_149700_152900
905328	contig_10225_pilon	+	2757	11	Intergenic	novelGene_86835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	577.188877231708	2	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	977	2641	42629	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21388	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21601_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
905329	contig_1948_pilon	-	4584	5	Intergenic	novelGene_31192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_4	68.9981883820148	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	91	918	568353	556776	FALSE	45	AACATTAAACATCTGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVPLGKVLLRNVIRHTDAHNKIQEESDMWKIRELEKQMEDAYRGSKRKMLPSSSSRMRSDGFDEESQRDYWKPRHEISGTLEDDFLKAKSWNKKLYDYEANMPDSSDQQDVINGKKTSPQVKSTTHESRRHKKSKKSHKKKQKKKSHKKQKKSKKEAIDVAAHSSTEISEETEASSTRKRKQPHKRKKKSRKKSLKKPALFLESESDTFQSDDSASSSSEDSQERDTKKTKRKKRERKVHIPVTNNEIQERTNKRTNWKVATDERSAESSEDD	569635	553109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_557284_558680_558831_563196_563298_568284_568362_569553
905330	contig_3004_pilon	+	3394	11	Intergenic	novelGene_127547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_4	60.4115882923136	106	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	134	1645	802247	855040	FALSE	20	GCTCAAGTATTTTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGAPAPGGSCRALVPHGPLRLGVASQAKAGERVPRRQRPGDPGEMEAASPTAAESAGREELDMDVMTPLINEPNFDGTSDEEREQELLPVQKHYQLDDQEGISFIQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCQRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWGCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESNVFVSNSTNASNLCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVFIRDLKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVIRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTALYVTLATLGYMCFREEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIPVVTSKFHAKWKQICEFGIRSFLVTITCAVAILIPRLDIVISFVGAVSSSTLALILPPLVEILTFSKEHYSIWMILKNISIAFTGIVGFLLGTYVTVEEIIYPAPSVMADTPQSLSLNLNTTCLTSGLK	802113	856789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989_814114_815278_815370_817376_817466_818526_818623_820752_820838_827930_828159_833489_833589_837198_837369_850865_851036_854732
905332	contig_7078_pilon	+	3024	4	Intergenic	novelGene_130209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	236.059785271067	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTAATATTTTGTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951295	984765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325_967140_983915
905333	contig_4364_pilon	+	747	2	Intergenic	novelGene_105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATACTTTTGTCGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981369	986069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_981669_985621
905334	contig_12179_pilon	-	2641	1	Intergenic	novelGene_127994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	977	1417	490662	490222	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLFETPEVMAIPFETEAAQLLAFFASSASASCGLLALRPHTRICPAGASVPKLSSSTNKCLEAPHSTRKPCATHRHSALLLRGQAPVPSCTGLLVLLLLVLCHSRSSATAGSLPLLLLCCCRFSASATALSIQFQNHFHILGIF	491638	488997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_489000_491600
905335	contig_1856_pilon	-	2948	2	Intergenic	novelGene_84880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256694	252758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_254877_255864
905336	contig_12410_pilon	+	2934	3	Intergenic	novelGene_167262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1	180	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAGAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32900	44868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_32944_37492_38210_42694
905337	contig_4857_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_48772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAGAAATGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209983	1211818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1210000_1211800
905338	contig_10904_pilon	+	2264	2	Intergenic	novelGene_22677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	79	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGCAATAACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541492	548566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_541868_546677
905341	contig_13021_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_8264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1426	1800	227291	226917	NA	75	TGAAAAAGATAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKKSRNFPEEENFLELSEAEYESLIYKTLHEIRKEINQNAEHAIEKIKKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKISNKTSEADISTESHRSRIEAMEVRISEIEDKALHTNLFEEKSDKRI	228716	226094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_226100_228700
905342	contig_13004_pilon	+	2426	13	Intergenic	novelGene_112666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	72.2672509201475	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	33	2303	634295	673741	FALSE	55	CAGGTTTAGAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVQLIQLGSMPQYYYQEPQQPYGHPVYQQSHLPQHQQREDSQLKTYPSDRQAQALLSSHGDLGPADTGMGDPATSDVNRVSGAVPHRPLLSPSGIHLNSMGPQHQQLSPSAMWPQMHLPDGRTQPGSPESSGQAKGVFGEQFDAKNKLTCSICLKEFKSLPALNGHMRSHGGMRASPSLKQEIPKKHQPGVAKAEEPLKPVQEKKKFRHRPEPLFIPPPPSYNLNPASSYSGATLYQSQLRSPRVLGDHLLLDPTHELPPYTPPPMLSPVRQGSGLFSNVLISGHGPGAHPQLPLTPLTPTPRVLLCRSNSIDGSSVTVTPGPGEQTVDVEPRINIGLRFQAEIPELQDASALAKDTHKATLVWKPWPELENHDLQQRVENLLNLCCSSALPGGGTNSEFALHSLFEAKGDVMAALEMLLLRKPVRLKFHPLANYHYAGSDKWTSLERKLFNKALATYSKDFIFVQKMVKSKTVAQCVEYYYTWKKIMRLGRKHRTRLTDIMDDCVTSEEEEELEEEEEDLEEDRKSTKEEESEGPKSPELPPPFPALAPAEGPAMQALSQPSGSFICEMPNCGADCRCHVTPFLPQVFSSRQALNGHARIHGGTNQVAKARGAVPSGKQKSGGAQSGYCSVKSSPSHSTTSGETDPTTVFPCKECGKVFFKIKSRNAHMKTHRQQEEQQRQKAQKAAFAAEMAATIERTTGPVGGPGLLPLDQLSLIKPMKDVDILDDDVVQQLGGVMEEAEVVDTDLLLDDQDSVLLQGDTEL	634262	673864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_634613_636087_636135_636998_637150_642214_642600_643681_643749_644821_644962_645107_645212_646733_646810_655219_655309_657212_657327_666516_666724_669325_669574_673416
905343	contig_16072_pilon	+	4505	1	Intergenic	novelGene_175854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	608	1827	520	2346	28117	29943	NA	10	TTTGCTTGCATTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRVEGLLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWKQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWTQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS	27597	32102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_+_27600_32100
905344	contig_5686_pilon	-	3491	2	Intergenic	novelGene_45320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACAAAAAACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111631	102603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_104355_109891
905345	contig_935_pilon	+	3758	2	Intergenic	novelGene_45559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3833	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAATAAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364718	370822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_368292_370637
905346	contig_12425_pilon	+	2671	1	Intergenic	novelGene_46663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCTCACAAACATTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202488	205159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_202500_205200
905347	contig_14618_pilon	+	2514	4	Intergenic	novelGene_136847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_3	15.7480157480236	194	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	495	863	1238027	1244156	FALSE	30	AAGCACTTGAAATTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYRGSAAAIIVYDITKEETFSTLKNWVKELRQHGPPNIVVAIAGNKCDLIDVREVMERDAKDYADSIHAVFVETSAKNAININELFIEISRRIPSTDASPPPGSKGFKLRRQASEPKRSCC	1237532	1245807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1238081_1238168_1238276_1239062_1239173_1244058
905348	contig_20889_pilon	+	3315	2	Intergenic	novelGene_127651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACCCTGATCTCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46587	51197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_48469_49763
905349	contig_9239_pilon	-	4982	1	Intergenic	novelGene_137196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3358	3714	230817	230461	NA	35	GAGAGGTAGGCAAGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPTTLFFWLLFLSRLSLLSHTQPSSTHHNLTLLLPPACLHHVLNIALLSSTGMAYRNLPCTDPQLALSTPVCATNNPSQPIHSGWTCPLEKEGKNTMSTDKQTTKNAQPAYTEITK	234174	229192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_229200_234200
905350	contig_610_pilon	-	3727	4	Intergenic	novelGene_76702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	1239.21543279968	387	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	58	717	252557	207479	FALSE	35	AAACATGCTTCTGTAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVVK	252614	204468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_207487_220517_220785_234998_235302_252475
905352	contig_10196_pilon	+	1821	2	Intergenic	novelGene_132328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACACTTGTGATATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2397496	2400456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2397808_2398946
905353	contig_14577_pilon	-	1724	2	Intergenic	novelGene_164656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	46	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	245	439	127106	103082	FALSE	55	AAATATATATAATTGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVPGFTPTPWCARPPAGLQAGRFRLPCRCSSRPQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDACEREPCSPTCQSLVCQPLQLHESGEALQCCLPALGFIDLHSL	127350	101796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_103213_127042
905354	contig_9972_pilon	+	2070	3	Intergenic	novelGene_162788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACACAAATGCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187404	248553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_189439_245521_245540_248535
905355	contig_12948_pilon	+	3616	1	Intergenic	novelGene_126227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGCTCCTAACCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369397	373013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_369400_373000
905356	contig_3575_pilon	-	4760	1	Intergenic	novelGene_141097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	793	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3827	4147	360255	359935	NA	0	CTTTGTGTCCTTTTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLPSSRLSVITWNSAGTARGQSRIEIQASHRSVLRPRQFNFPACSVRVSDLFIQNLGHQTETLISSFKTASEIMLEPPLNQFASSAEEKFNVFNTYMVIFITFK	364081	359321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_-_359300_364100
905357	contig_8210_pilon	+	3146	3	Intergenic	novelGene_30240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2126	2449	219715	220038	FALSE	60	AAGAAACCCAGCAACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKALDINLFEEKSDKRILKNEEILRIMCNSIKRNNLSNWSTRTGGITENTERIVEDLLAENFPDIVKDEKLSIQEVHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKEF	30695	220735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_32178_32277_32651_219444
905358	contig_4339_pilon	+	1806	10	Intergenic	novelGene_146085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_2	56.7831047729368	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	119	1498	1050728	1076107	FALSE	5	GTCTCAGCTGCTTGGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENEEEDGFYLAPGTCVVDVGITNSQTLIPDSQKNCINSIMDLLKRQGLRPIPESEIGLAVIFMTTENYCDPRGQPSTGLRPTTPGPSLSQGLSFSEKLMSGVPVNTTVYVPNTESEQADTCMGFSERPKEMKSSRMEQKFRMLSQETSTVKEPPKTSCNNIISHTLVKMKVPDYQLSPAKFTGVSKGRDRASQQQQTNSIKNYFQPSTKKRGRDEENQEMSSSKSARIEMSCSLLEQTQPATLPTWKNEEQHPSQNEPVDKKSDNLFADTNLKSNVKNLTNKSLPTEKLISKRRKDIDDLAIEDEVLEQLLKNTKPELEIEMRVKKEEDVNIRKKPRLIIESNSIFNDEAIPKSNEVSQENEIGKKCETKEESLWSTKEELSNNHELQDDGEMLPKKVILTEFRSLVVSNSTSRNPSIVNNDYGQLKNFKKFKKVTFPGAGKLPHIIGGSDLIAHHARKNTELEEWLRQEMEVQNQHAKEESLADDLFRYNPNVKRRR	1050609	1076415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1050745_1052479_1052578_1060595_1060726_1062166_1062437_1064441_1064884_1068673_1068746_1069966_1070123_1072078_1072193_1074868_1074919_1076076
905359	contig_6102_pilon	+	5391	35	Intergenic	novelGene_32261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	134.576999736699	282	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1053	3162	1417	4578	1417801	1428375	FALSE	15	AATGCCATTTGTGTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCGVDEFRCKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVPGRWQCDYDNDCGDNSDEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAGRWKCDGDHDCADGSDEKDCTPRCDMDQFQCKSGHCIPLRWRCDADADCMDGSDEEACSTGVRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGEDDCGDNSDENPEECAQFLCPPNRPFRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGDGTDEEDCEPPTAQTPHCKDKKEFLCQNQRCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEGCSIDPKLTSCAANASICGDEARCVRTEKAAYCACRPGFHTVPGQPGCQDINECLRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCARNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLFPGHPNSAYEQAFQGDESVRIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDRGVTHLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMIDEPHAIVVDPLRGTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGLAVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGTDPIVAADSKRGLSHPFSIDVFEDYIYGVTYINNRVFKIHKFGHSPLVNLTGGLSHASDVVLYHQHKQPEVTNPCDRKKCEWLCLLSPSGPVCTCPNGKRLDNGTCVAVPSPTPSPDAPRPGTCNLQCFNGGSCFLNARRQPKCRCQPRYTGDKCELDQCWEYCRNGGTCAASPSGMPTCRCPTGFTGPKCTQQVCAGYCANNSTCSVNQGNQPQCRCLPGFLGDRCQYRQCSGYCENFGTCQMAADGSRQCRCTAYFEGPRCEVNKCSRCLEGTCVVNKQSGDVTCNCSDGRVAPSCLTCVGHCSNGGSCTMNSKMMPECQCPPHMTGPRCEEQVVSQQQPGHMASILIPLLLLLLLLLVAGVVFWYKRRIRGAKGFQHQRMTNGAMNVEIGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFALDPDKPTNFTNPVYATLYMGGHGSRHSLASTDEKRELLGRGPEDEIGDPLA	1396051	1429188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1396060_1410824_1410835_1413353_1413440_1413653_1413774_1414266_1414455_1414557_1414764_1415123_1415313_1415915_1416065_1416474_1416570_1416718_1416836_1417011_1417132_1417482_1417606_1417795_1417922_1418451_1418569_1419249_1419357_1419459_1419593_1420637_1420758_1420890_1421014_1421387_1421529_1421636_1421772_1421850_1421971_1422803_1423073_1423756_1423936_1424423_1424531_1424793_1424911_1425412_1425590_1425741_1425883_1426020_1426195_1426422_1426585_1427024_1427200_1427320_1427423_1427571_1427637_1427750_1427842_1427940_1428086_1428234
905360	contig_3818_pilon	-	2404	2	Intergenic	novelGene_99232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	212	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	933	1844	407161	406250	FALSE	15	TTCCGTTTTCTTAATTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPALGRRCGCVLVELECMCKCEKLPGDVLCLVHQNKNQPAVPRRSNSSLKASLCTGSHLDVHKTVQWFRNMMGNAWALVAHKYDFKLSLPPSTTSCKLRLDYRSGRFLSISLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQLTSVNWPESFAACEHLFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLWELQDLSPGASCPVLTSYHFKTALMHLLLRLPLTDWEPGLLSQRLQDLLWFLGRGLQQRSLHHFLIGNTLLPLTIPIPKTFRDAEPVNLFQHLVLNPTAHSQAVEEFHNLLTRVKTLPCGPLAGTH	409210	405689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_407910_409026
905361	contig_20550_pilon	-	4821	20	Intergenic	novelGene_142606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAAATGGCGGCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40506	3708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_3929_10675_10766_12451_12491_12953_12991_15548_15602_15689_15768_15897_15954_18903_19067_19167_19264_19383_19491_19756_19858_20007_20107_20466_20611_21234_21398_24121_24274_24355_24434_29226_29355_30888_30966_37486_37545_37624
905362	contig_15236_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_141611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	408	719	593334	593023	NA	35	GAACACTCCACCCAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKIHKFMEKADKFMENTDQKMEEFRKRQEQNVKINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEKDSVIEGLRNRFETMEDRISEIEDNHLNTTLRKNQKKEQRKMKKP	593741	591518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_591500_593700
905363	contig_610_pilon	+	2673	9	Intergenic	novelGene_76831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_7	170.811848242445	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	11	1639	350011	375609	FALSE	30	TCTTTCAGTAGAAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMAAPPSPSSVSAELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVAYTCTAKNPVSQSTSSPIHAQQFCADLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGQDASSSEERQFIHSVLLCTETPTGGTTTATE	350000	376643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360719_361083_363029_363303_363794_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369658_374082_374155_375583
905364	contig_2358_pilon	+	6875	5	Intergenic	novelGene_156098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	303	130	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	6382	6756	459536	459910	FALSE	55	TATCAAGCAAACAACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLKQKRGLKNVDINFSYGEEVKAIEIKDWFKLRKIGLNIKLTTKETKNPTHQIKKQEKYKDSPNTKSTMKKMKRKYIKKNDSAQKIKWNKKAINNTQKRHQHNSTKLISINNYTECKWTKHR	49904	460029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_53389_121344_121790_167326_168421_348908_350253_459521
905365	contig_5918_pilon	+	3243	1	Intergenic	novelGene_99562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTCAGCTGAAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714074	1717317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1714100_1717300
905366	contig_11176_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_123442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTGCCTCACAGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63092	61152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_61200_63100
905367	contig_610_pilon	+	2533	9	Intergenic	novelGene_76827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	177.584442941942	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	812	1504	363971	375609	FALSE	40	ATTACTCTTTCAGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGQDASSSEERQFIHSVLLCTETPTGGTTTATE	349996	376638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360719_361083_363029_363303_363933_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369658_374082_374155_375583
905368	contig_612_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_155632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263099	264898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_263100_264900
905369	contig_13224_pilon	+	3982	3	Intergenic	novelGene_104064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	562	900	14799	15137	TRUE	40	AAGTCTCGTAGTATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKKCPQRCPCASAESKGLASKPHGTAWLEGAPKPRKEKENKQTNQNRTNQSKQTNKQKSPGVPTSMAARAGKQFHSRAVFHSLSGRSKDGTRSQEFERKEGEVVIGKEEI	12828	127819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_12906_14314_15504_125103
905370	contig_1107_pilon	-	2532	18	Intergenic	novelGene_126590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	92.1897396508191	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	88	2211	885345	828870	FALSE	35	ACAAAGTTGTCTCCCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSRMNLPKGPDTLCFDKDEFMKEDFDVDHFVSDCRKRVQLEELRDDLELYYKLLKTAMVELINKDYADFVNLSTNLVGMDKALNQLSVPLGQLREEVLSLRSSVSEGIRAVDERMSQSSKETSALEASSPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRIAGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSNVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVIIEQFVQSHPNGLRIMYDKLLDFVPHHCRLLREVTGGAISSEKSNTVPGYDFLVNSVWPEIVQGLEEKLPSLFNPGNPDAFHEKYTISMDFVRRFEVQCGSQASVKRLRAHPAYHSFNNKWNLPVYFQIRFREIAGSLEAALTDVLEDAPAGSSYCLLASHRTWSCLRKCWSDEMFLPLLVHRLWKLTLQILARYSMFVSELFLRPISNESAKDVKKPLVTGSKDPSVTQGTNDDQGNGPSETKPVVFISSTHLVYVVADLDKLQEQLPELLETIKPKLEMIGFKNFSSVSAALEDSQLSLSACMPSLSKKIIQDLSDSCFSYLKSALEVPRLYRRTNKEVPTKASSYVDSALKPFYQLQSEHKDKLKPAIIQQWLEGALSESTHKYYETVSDVLNSVKKMEESLKRLKQARKTTSPNPVGSSGGMSDDDKIRLQLALDVEHLGEQIQKMGLQASNIKSFPALIELVVAAKDQATAEQP	885432	828548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_828972_830568_830750_832067_832208_834151_834295_834587_834661_835598_835797_837627_837780_838993_839056_843882_844023_847728_847856_853032_853158_857752_857933_858472_858582_863302_863341_865178_865233_867475_867542_868869_869032_885273
905371	contig_610_pilon	+	3763	7	Intergenic	novelGene_76692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCAGGGCAGAGGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112561	161823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_115307_118409_118500_124894_124969_130538_130635_148642_148928_151219_151556_161686
905372	contig_5062_pilon	-	2712	13	Intergenic	novelGene_157837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCTCGCCAAAACTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744905	622708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_622737_662399_662567_676051_676236_706255_706293_716399_716498_723731_723898_733902_734080_739284_739423_739579_739691_741720_741861_742906_743063_743419_743525_743700
905373	contig_5686_pilon	+	3928	7	Intergenic	novelGene_45477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	226792	227210	TRUE	45	GATACTGATAATCAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGILSEISEQEVQDSSFTELPAGDRTTGNPRYRLSHTPTLLHPHLASSTSCSHSLLAGKHKLPPSVTWIPPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLTSHHLRLLSVKLPC	226791	380788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_227116_227198_228782_270213_271313_271717_272232_272354_272621_286788_286871_380728
905374	scaffold_19766_pilon	-	3096	4	Intergenic	novelGene_34302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619770	544418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_544776_545716_545863_555603_555662_617235
905375	contig_10074_pilon	+	4136	32	Intergenic	novelGene_57092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_24	309.500480365563	55	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1311	3933	204	4136	170583	254757	FALSE	35	GGGGTAGCAGAAAGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDCFEYGTPETLPFLVAHAFITVVSNIRIWLHIPAVMQHIIPFRTYVIRYLCKLSDQELRQSAARNMADLMWSTVKEPLDTTLCFDKESLDLAFKYFMSPTLTMRLAGLSQITNQLHTFNDVCNNESLVSDTETSIAKELADWLISNNVVEHIFGPNLHIEIIKQCQVILNFLAAEGRLSTQHIDCIWAAAQLKHCSRYIHDLFPSLIKNLDPVPLRHLLNLVSALEPSVHTEQTLYLASMLIKALWNNALAAKAQLSKQSSFASLLNTNLPIGNKKEEEELRRAAPSPWSPAASPQSSDNSDAHQSGGSDIEMDEQLINRTTHVQQRLSDTEESMQGSSDETANSGEDGSSGPGSSSGHSDGSSNEVNSSRASQSAGSPGSEVQSEDIADIEALKEEDEDDDHGHNPPQSSCGTDLRKRKLESQTGICLGDSQGPSERSGTSNGTGTDLVFNTESMPSVDNRIRMLDTCSHPEDAEHDISGEMNAAHIAQGSQDSCIARTGDFLGETIGNELFNCRQFIGPQHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHDGRVVDDMLSADDVSCSSSQVSAKSEKNMADFDGEESGCEEELVQINSHAELTSHLQQHLPNLASIYHEHLSQGTAVHKHQFNSNAVTDINLDNVCKKGNTLLWDIVQDDDAVNLSEGLINEAEKLLCSLVCWFTDRQIRMRFIEGCLENLGNNRSVVISLRLLPKLFGTFQQFGSSYDTHWITMWAEKELSMMKLFFDNLVYYIQAAREGRQNRALYSHSAEVQVRLQFLTCVFSTLGSPDHFRLSLEQVDILWHCLVEDSECYDDALHWFLNQVRSKDQHAMGMETYKHLFLEKMPQLKPETISMTGLNLFQHLCNLARLATSAYDGGSNSELCGMDQFWGIALRAQSGDVSRAAIQYINSYYINGKTGLEKEQEFISKCMESLMIASSSLEQESHSSLTVIERGLLMLKTHLEAFRRRFAYHLRQWQIEGTGISSHLKALSDKQSLPLRVVCQPAGLPDKKEQISQQAQLQEFGQSSRKGDFPGGLMGPVRMISSGHELTTDYDEKALHELGFKDMQMVFVSLGAPRRERKGEGVQLPASCLPPPQKDNIPMLLLLQEPHLTTLFDLLEMLASFKPPSGKMAVEDSESLRCEELHLHAENLSRRVWELLMLLPTCPNMLMAFQSISDEQNNDGLNWKELLKIKSAHKLLYALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLEIFNSGILEPKEQESWTVWQLDCLACLLKLICQFAVDPSDLDLAYHDVFAWS	150855	254757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_150939_170277_170329_170513_170664_174140_174209_181391_181585_183237_183300_194635_194718_194801_194895_205009_205136_205306_205437_206104_206141_206507_206639_206932_207577_210958_211174_214089_214206_214300_214429_217569_217660_220222_220319_221555_221639_226364_226520_227729_227844_229102_229203_229332_229493_232309_232437_232610_232681_240641_240743_240940_241151_246045_246172_248293_248417_248550_248635_249137_249225_254655
905377	contig_10734_pilon	+	1950	12	Intergenic	novelGene_51175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	438.415837169452	319	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	863	1471	1134427	1142903	TRUE	25	AAAGCTCCTATTTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123670	1175419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723_1143366_1175402
905378	contig_5686_pilon	-	5383	2	Intergenic	novelGene_45406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3878	4192	174091	173777	FALSE	20	AGGCGAGAGTTTCTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGVWVEKLLTLKAEETKGTLSSSTITTSSIGRNFREHWSPWVVQRVNGSAANQKVGGSNPPAAPWEKDVAVLFHKGYSLGNPMGQFYSVLQGHYESELTLQQ	178021	172585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_176624_176676
905379	contig_17768_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_140408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGAAATGAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113797	115931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_113800_115900
905380	contig_18208_pilon	-	2249	2	Intergenic	novelGene_176174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177560	142705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_144936_177541
905381	contig_938_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_143913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1872	2177	73311	73616	NA	75	TAAAAAAGAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLLPVLKPYSVTLSIALIGFNQTRSFSLLKFCEELPSWLPRSTHGAHCPPFWPLPKLSLNSPHCRGQELKMCSQITCNSWRESHTVKESPRLEEQWLHP	71439	74202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_71400_74200
905382	contig_12864_pilon	+	1209	6	Intergenic	novelGene_76437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTGCACTGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242238	249614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242888_243778_243824_244597_244767_245704_245913_246327_246350_249498
905383	contig_2419_pilon	+	2111	3	Intergenic	novelGene_137120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCTAGCGACCCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61242	131842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_61452_78376_78653_130216
905384	contig_10003_pilon	-	6350	2	Intergenic	novelGene_88212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	465	junction_1	0	417	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGAAAAAAAAACACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548601	525376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_531657_548531
905385	contig_2596_pilon	-	3594	2	Intergenic	novelGene_53440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGGAGTAAAAATATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22382	18418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_21958_22327
905386	contig_11427_pilon	-	2104	11	Intergenic	novelGene_78995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	87.96567512388	40	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	319	855	655701	597239	TRUE	30	ACTTAAAATTTTTTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPAAGVGRLEEEALRRKERLKALREKTGRKDKEDGEPNTKQLREEEEEGEKHSPSNPCWLGTYPRELRLRNYVPEDEDLKKRRVPQAKPVAVEEKVKEQLEAAKPEPVIEEVDLANLAPRKPDWDLKRDVAKKLEKLEKRTQRAIAELIRERLKGQDDSLASAVDATAEQEACDSD	656486	591366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_592615_597237_597322_597416_597494_598601_598637_598879_598942_601035_601116_604026_604063_623519_623588_655605_655781_655862_655953_656337
905387	contig_5539_pilon	-	3268	1	Intergenic	novelGene_104781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTCACGTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285702	282434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_282400_285700
905388	contig_5495_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_157673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	58	498	579063	579503	NA	80	AAAAAAACAAAAAAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLNEIIKILSKVYSNRDKMRKNHICPLSSTFLKNTKPHGTRLPPLTALTRITTEGSELEKDVEHNFNSQKEDQIYWPKEDWRNPESMAPKHPFSSVVKFLQGSLFSLGVDSPVKPNDTNEVQESSDKGHKAEGDTEAGDREPKVE	579005	581049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5495_pilon_+_579000_581000
905389	contig_17074_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_145177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCCAAGATAATTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582293	584529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_582300_584500
905390	contig_9423_pilon	+	3058	9	Intergenic	novelGene_99168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	511	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGCCCTCACCTTTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32605	74899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_33708_39165_39350_44030_44203_48935_49064_59654_59849_60542_61291_62243_62375_73820_73919_74598
905391	contig_299_pilon	+	1886	2	Intergenic	novelGene_129435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1300	1716	879546	879962	TRUE	55	CAAAAAAAAAGAAGCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTESSTARWCPATTTDSSARDHNRGSWTELEKDVEQNSNSQKKKKTRFTGLTDGRNPKGTAPRHPFSSVVKLFQRFIVQPGIGQPHKSKTGLMRHSSPGTRTRRQEGTRKLVIGNPRLRRDSIDMLWGC	878246	880258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_880035_880160
905392	contig_16098_pilon	+	3397	1	Intergenic	novelGene_46165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACCAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462865	466262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_462900_466300
905393	contig_6497_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_35550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCCGCTGGCACTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103161	101532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_101500_103200
905394	contig_6434_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_61900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	479	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2093	2491	911122	910724	NA	40	TTAGAAGCAAGGATGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIEGSLIFNLRYADDTTLLAESEEGLKHLLMKIKDYSLHHGLYLNIKKTKILTTRSISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINAHGSSSQVIRQHTAVGKSAVKDLFKVLKSKDVTLKTKMHVTQAMMFSITS	913214	910576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_910600_913200
905395	contig_5261_pilon	+	2542	27	Intergenic	novelGene_102491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	45.6331039653758	67	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	564	2417	810272	842810	FALSE	10	TCCTGCTTCATCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKIARVTGIAGTCLALCLSSDLKSLSVVTEVSTDGASEVSYFQLETNLLYSFLPEVTRMARKFTHISALLQYINLSLTCMCEAWEEILMQMDSRLTTFVQEKNTTTSVQDEFMHLLLWGKASAELQTLLMNQLTVKGLKKLGQSIESSYSSIQKLVISHLQSGSESLLYHLSELKGMALWKQKYEPLGLDAAGIEDAITAVGSFILKANELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVADFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVEKVGQYLKDEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDHCLQKPADVIGKSMNQAICIPLYKDVRSEDSTRRLLKFPFLWNNKTSNLHYLIFTILEDSVYKMCILRRHTDISQSVSNGLIAVKFGSFTYATTEKVRRSTYSCLDAQFYDDETVTVVLKDTVGREGRDRLLVQLPLSSVYNSEDSADYQFSGTYSTRLDEQCSAIPTRTLHFEKHWRLLESMKAQYVAGNGFRKVSCVLSSNLRHVRVFEMDIDDEWELDESSDEDEEASNKPVKIKEEVLSESEAENQPASAAIAPPEIVIKVEKLDPELDS	793344	842935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_793464_793596_793736_799125_799232_808682_808770_809007_809062_810213_810299_810897_811003_812382_812467_814199_814287_814829_814895_816117_816161_816240_816318_818001_818103_818185_818238_825709_825766_828096_828144_829243_829301_829622_829680_835108_835203_836966_837065_838349_838412_838491_838531_838610_838713_839556_839632_840531_840706_841860_841985_842582
905397	contig_11816_pilon	-	3111	18	Intergenic	novelGene_98593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_17	103.288355728348	133	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	10	2310	1504486	1395481	FALSE	5	TACCTGTTGTCTTGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQAMKSPDHNGEDNFARDFMRLRRLSTKYRTEKIYPTVTGEKEENVKKNRYKDILPFDHSRVKLTLKTPSQDSDYINANFIKGVYGPKAYVATQGPLANTVIDFWRMIWEYNVVIIVMACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPFKISCEAEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLFEKQLQLYEIHGAQKIADGVNEINIENMVSSIDPEKQDSPPPKPPRTRSCLVEGDAKEEILQPPEPHPVPPILTPSPPSAFPTVTTVWQDNDRYHPKPVLHMVSSEQHSTDLNRNYNKSPELPGKNESTIEQTERKLERNLSFEIKKVPLQEGPKSFDGNTLLNRGHAIKIKSASPCIIDKISKPQELSAGDLKVDDISQNSCVDCSITQSDKGPATPSEETQKNSGTPPRPDCLPLDEKGHAMWSFHGPENALLMPDSSEDKSSDIHCQTVKTLSLTPSPTTQVEPHDLVDHHNSSPLFRTPLSFTNPLHSDDSDSDEGNSDGAVTKNKTNISIASATVSAATGAESISTRKVLPMSIARHDIAGTIHSGAEKDVDVSEDSPPPLPERTPESFVLASEHNTSVRAEWSELQSQKQSEQKKSEGLITSGNEKCDHPAGGVHTVTYIDCPPTFSDKKEQISLSLTEATDIGFGNRCGKPKGPRDPPSEWT	1504495	1394679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1395543_1396108_1396217_1398887_1398919_1400399_1400468_1401435_1401514_1405081_1406059_1406277_1406364_1415484_1415584_1415675_1415754_1418076_1418144_1427539_1427683_1428832_1428893_1434444_1434517_1436863_1436903_1438840_1438937_1442048_1442126_1454938_1455048_1504435
905398	contig_57_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_44912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTTTTAATTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146688	148349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_146700_148300
905399	contig_4782_pilon	+	6726	1	Intergenic	novelGene_73686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAAGTTTTGTGTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685609	692335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_685600_692300
905400	contig_12528_pilon	+	5747	19	Intergenic	novelGene_81277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	241.880646008688	412	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	200	2275	284346	327364	FALSE	30	CGTATTAATCAGAACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLPCPGLSGPEPASHGAIGASRAAPLSFRAAARVYCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKADMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLRMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCDSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPASPSTADKEENPAVLAENCFRELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVQCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKDSPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVDFEASDLQGSSACSTALSTSSKDSDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTTTHNLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTMVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDASFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLVIALQDSVIINEDNLPMFQRCGIMALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKYTLPKSLEKHDKNLYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVKDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILPNSVPSDDVVSCGKFME	246174	330836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_246276_281542_281620_284324_284453_286846_286998_289038_289161_293929_294080_295481_295620_297531_297611_299724_299861_301889_302058_305296_305412_306949_307002_307896_308070_308532_308609_312425_312588_313171_313304_315483_315552_316469_316598_327245
905401	contig_2009_pilon	+	2768	1	Intergenic	novelGene_165446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAGAAATTTATCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28508	31276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_28500_31300
905402	contig_3627_pilon	+	3719	14	Intergenic	novelGene_78443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	292.80722498927	18	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	212	1285	294394	312669	TRUE	75	CGAAAAATAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLD	292742	319517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312668_312787_313379_313494_314037_314205_314941_316050_318589
905403	contig_5236_pilon	-	1347	7	Intergenic	novelGene_100946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.837899465485	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	158	619	1007775	1006770	TRUE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1009541	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006503_1006676_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007813_1009005_1009053_1009468
905404	contig_6489_pilon	+	1361	3	Intergenic	novelGene_128929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGCAGACATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182156	233252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_182212_231700_231759_232004
905405	contig_3181_pilon	+	2498	8	Intergenic	novelGene_136933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAGAAAACGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309500	321109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_309542_309872_311518_313189_313334_315992_316100_316238_316362_317406_317595_319464_319572_320966
905406	contig_2636_pilon	-	3068	1	Intergenic	novelGene_52076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	481	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62625	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59600_62600
905407	contig_2703_pilon	+	1062	2	Intergenic	novelGene_101641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCATGGAAGTCGGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	3230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1759_2579
905408	contig_16103_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_118711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCAAGTCTACACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199563	198316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198300_199600
905409	contig_5894_pilon	+	2284	1	Intergenic	novelGene_83013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1408	1707	264880	265179	NA	50	AATAAATAAAGTGGTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTKSSTARWCLAVTTDCSDWDHNRGSWTELEKDVEQKSNTQKKDQIYWPDRDWRNPKGMAPGHPFSAEVKSLPRFTVQPGIRQPYKTKWD	263472	265756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_263500_265800
905410	contig_7165_pilon	+	3620	2	Intergenic	novelGene_116863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2896	3195	409087	409386	FALSE	50	AAAAAAAGTGGTATATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHSYQGLHQTKSSTARWCPAITTHCSDKDRNRGFWTDLEKDVKQNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHLFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	404934	409811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_405199_406455
905411	contig_4496_pilon	-	2975	1	Intergenic	novelGene_66680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGCTGTACTTAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907986	905011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_905000_908000
905412	contig_7321_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_53125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACAAGGCATCTAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121641	123441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_121600_123400
905413	contig_17753_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_105073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATATATATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53590	55779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_53600_55800
905414	contig_13244_pilon	+	2126	4	Intergenic	novelGene_86931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	256.750202856135	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTGTTCTTACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239749	254407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245183_245345_250910_250935_252541
905415	contig_10674_pilon	-	3799	6	Intergenic	novelGene_6416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	630.913940248589	217	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	237	560	355630	353777	TRUE	35	AACCAGGAGATCAGTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPFRKDLEKYKDLDEDELLGNLSETELKQLETVLDDLDPENALLPAGFRQKNQTSKSTTGPFDREHLLSYLEKEALEHKDREDYVPYTGEKKGKNRILKSLFDSS	395372	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_62056_93058_93577_205846_205985_351217_353975_355504_355707_395212
905416	contig_10904_pilon	-	2418	9	Intergenic	novelGene_22694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	13.8423038183678	48	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	613924	613343	TRUE	35	ACTTTGTGAAAGCAGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNHARQCHHPDLHCPSVSWRSQGLRRLKRKLSLRGEECSQPQSDPSDTSVCGCEDKLRTGNSRPGLCQGQRNQVQTGILSKPYSWATPGPIITKGSSVTIWCQRSL	613926	606823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_607415_608143_608202_608666_608778_609721_609772_610367_610668_611472_612262_613149_613435_613627_613801_613865
905418	contig_3529_pilon	+	2900	9	Intergenic	novelGene_105393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	109.980680121556	321	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1415	1963	806633	809557	FALSE	10	GATGTGTGTTCTCTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGWPDLRFGKLNKGVPRTLSEFIGEASLSGLCESWPRPLFFSFTGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEVFRSRAHRDFVRDATWSLLNHSLLTTVGWDHQVIHHTVPLEPVPTPGPNSVAE	790289	810494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_791387_791493_792027_792170_792674_792725_806012_806844_807636_807746_808481_808551_809397
905419	contig_18538_pilon	+	1557	13	Intergenic	novelGene_163886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	69.3967558479661	292	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	235	1557	17589	53992	FALSE	20	TATGTAAGTTGATGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYALDENYFRGYEWWLMKEAKKRNPNITLVGLPWSFPGWLGKGFNWPYVNIQLTAYYVVAWIVGAKHYHNLDIDYIGIWNERTFDISYIKMLRKMLNHQGLEQVKIIASDNLWEPISASMLLDSQLLKVIDVIGAHYPGTYSVRDAKLTEKKLWSSEDFSTLNNDVGAGCWGRILNQNYINGHMTATIAWNLVASYYEQLPYGGCGLMTAQEPWSGHYEVEPPIWISAHTTQFTQPGWYYLKTVGHLEKGGSYVALTDGLGNLTIIIETMSHKYSMCIRPFLPYFNVSRQVATFTLKGSFSQIPELQVWYTKLGKPSKKFLFKQLDPIWILDLNGHFTLELEEDELFTLTTLTTGQKGSYPLPPESQPFPPVYKDDFNIYDPPFSEAPNFADQTGVFEYFVNRDDPGEHHFTLRQVLNQRPITWAADASNTISIIGDYEW	9300	53992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_+_9446_14567_14637_17568_17683_20198_20339_22202_22242_22738_22870_36096_36253_39289_39415_41766_41895_48482_48573_49392_49480_51530_51682_53810
905420	contig_7045_pilon	+	5622	7	Intergenic	novelGene_77421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4417	4866	199064	204268	FALSE	55	GAACACCAAAGACACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLKILLDHLVAYPQEPLAGPSVTEAASPHLDVVKTGHFIHLRVTNDVPLVIQHIEIDDWTLNLGAAELRITVNPHHGGSVGVPEGGQGRVGVLRQGEGVLLYILHPTSETIMECYNKIMNFTYKRNEINITSKLGTHIKIAAHTINV	167332	205024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_171003_174127_174229_183821_183954_187614_187686_198621_199072_201081_201196_203940
905421	contig_14814_pilon	-	4630	14	Intergenic	novelGene_137742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_9	120.795195640973	367	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	3693	4274	397875	395214	FALSE	30	TTCAAGTATGGAATGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKKKKVVPSSLDLCNLYDPSNPKTTILKKRKKVKEMLHSVEHNGVLEAKAKQVPVLGNGGTFSPLKKKLRAENDFVKFDTSFLPKPSFFRKAKSTACASFLSPTVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNTTAEFKKTDKSILVSPTGPSRVAFNPEQRPLHGVLKTPTSSPSNTPLAPKKVLATPPKRRPTAMDFF	409687	394857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_395408_396348_396413_397413_397564_397701_398442_399029_399159_399888_399909_401493_401592_402158_404447_405639_405705_406496_406695_406814_406945_407717_407780_408364_408451_409637
905422	contig_4857_pilon	-	1938	2	Intergenic	novelGene_48740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGCAATGAAGAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196291	1193575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193928_1194705
905423	contig_2219_pilon	-	1749	2	Intergenic	novelGene_67173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106193	98832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_100143_105754
905424	contig_10500_pilon	-	3560	7	Intergenic	novelGene_41251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_4	861.100345810844	21	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	450	905	1635143	1629460	FALSE	30	TTTTCACAGCCTGAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640215	1626804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1636940_1637067_1639871_1640061_1640141
905425	contig_12635_pilon	-	2294	2	Intergenic	novelGene_60798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTATGTTGGGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187765	169168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_169539_185841
905426	contig_1596_pilon	+	3355	8	Intergenic	novelGene_131595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1321.44333582485	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	222	659	129031	160660	TRUE	10	TGACTGCTCCATCTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSTSGPTRREDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKENKKLHLLHRF	120773	169551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_120805_127019_127064_128884_129124_154562_154705_159579_159747_160624_162294_168444_169134_169177
905427	scaffold_15027_pilon	+	1517	12	Intergenic	novelGene_163559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_3	142.020368693955	5	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1122	396	1517	76925	102851	FALSE	60	GAAAACGAAGAAAAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKT	48875	102851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775
905428	contig_14744_pilon	-	2494	13	Intergenic	novelGene_66128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	82.1389405553514	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	512	1708	1594088	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604757	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1593188_1593928_1594203_1594246_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
905430	contig_17470_pilon	+	2624	13	Intergenic	novelGene_110460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	39.4978902390157	155	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	58	1446	2683	17391	TRUE	30	AGAGGCAGCAGCCATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLRQWQEEQERKVRALSEMASEQLKRFDERKELKQHKEFQDLRDVMEKSTREALGHQEKLKAEHRHRAKILNLKLREAEQQRLKQVEQERLRKEEGQIRLRSLYALQEEMLHLNQQLDSSSHHKDLLKIDLSAFWTRGNQLCSLISGIIRTASENDFPTAEDQAMAEQALQEMQDLLTNLQQEITRACEDKRRQDEEEAVQVKQQESQAQQRPEVQKESPAPSQGPGGKQNEDLQLKVQDSTMQWYQQLQDASSQCVLAFEGLTSSKDSQTKKIKMDLQKAATIPVSQISTIAGSKLKEIFDKIHSLLSGKPVQSAGRSVSVTLNPQGLDFVQYKLAEKFVKQGEEEVASHHEAAFPIAVVASGIWELHPRVGDLILAHLHKKCPYSVPFYPPFKEGMALEDYQRMLGYQVKDSKMEQQDNFLKRMSGMIRLYAAIIQLRWPYGNRQEVDSPSWLKPWLALVGTDLKHGAPVRCDSHPTL	2625	21227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_2775_3005_3067_3328_3584_9646_9882_11195_11309_11471_11542_14794_14938_15040_15232_16244_16379_17296_17402_18894_18978_19691_19756_20206
905431	contig_21232_pilon	-	5751	2	Intergenic	novelGene_165970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	308	784	22559	22083	TRUE	80	ACTAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCPPCHLTTLLLEYPPVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAASARQAQHHMRFWNFCLCKHQSTGSSKSWPIGDEEAGIRCGRGVRD	22866	3276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_4137_17975
905432	contig_19061_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_173511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	593	910	48352	48669	NA	45	TGTTGATATAAATCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRSLFSHSPVGYKSKFRASAPGECFLHQLRRKVHVINLPLVWEILCAGTSGPKDALCSQHCFLGGMRFLCASAHFSLLYLKRDCIKTLSNLVNLISIPSSQ	47759	50714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_47800_50700
905433	contig_11922_pilon	-	2639	1	Intergenic	novelGene_176477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAATTTAAAAAATAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27951	25312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11922_pilon_-_25300_28000
905434	contig_6677_pilon	+	4131	21	Intergenic	novelGene_114187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_20	50.8006889717059	235	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2436	77	2512	527055	581680	FALSE	25	CTAACTTTATTGGAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQREILQKFLHEAQDKKIKKEEFANEFLKLKRQSTKYKTDKIYPTAVAEMPKNIKKNRYKDILPYDHSLVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLPTTLLDFWRMIWEYNVLIIVMACMEFEMGKKKCERYWAEPGQKQLQVGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKAKFNSETRTIHQFHYKNWPDHDVPSSTDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAVDYTWMLLKDGIIPQNFNIFSLIQEMRTQRPSFVQTQEQYELVYSAVLELFKRQMDIFRDKHSGTEIQVKYSVPEQNSTLEADPYPLSLPKSSIKEATMVNQQNQQRTKVEKAEASSFDFKTSEISENEGFVLHPAKATTSFDFLELNCGYNKNGDRTMKWETKALPMAGEPLQKHQSLDLSSILLQACPNSKPINTAGRHFNSKRPIIRTKSTGFELIQQRETKELDIKENFSYLESHPYNSCPVELQSQKLMHASSAELKNSLPSDPKHQACDASNVKQHDPSDFSVYSYMSLVEDPYFSPLPSASAGSKMSLDSPEKQDGAVFPSSLLPKSSTTLFSYYNSHDSLVPNPPTNFPPPLNQETVVMATSPKTDDEIPPPLPERTPESFIVVEEAGEIRPSAPKPLSSIVKVKMGTSLEWSGTSESKKFDDSVRLRPSKSVKLRSPNSELHRDRSSSPPPPLPERTQESFFLADEDCMQAQSVETYSTSYPDTMENSTSSKQILNTPGKSFTRSRSLKILRNMKKSICNSSPPSKPAESVQSNNSSSFLNFGFANRFSKPKGPRKPPPTWNI	526978	583299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_527142_540550_540660_540919_540997_541119_541216_543701_543741_545172_545245_545351_545412_546027_546171_546674_546742_547569_547648_550229_550317_560631_560709_560853_561681_563312_563397_563535_563667_564822_564851_565735_565820_566091_566208_568994_569026_573813_573892_581615
905435	contig_10627_pilon	-	4640	1	Intergenic	novelGene_60022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCCCAGCTGTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402246	397606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_397600_402200
905436	contig_4426_pilon	-	1610	2	Intergenic	novelGene_15409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1422	187	1608	819682	818261	FALSE	25	TGTCCCAGCAGATGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNTPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENT	819922	818258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_819733_819786
905437	contig_14353_pilon	-	2248	7	Intergenic	novelGene_82072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	221.363200796037	103	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	52	729	104372	80586	FALSE	10	GTATGGATGGTTGCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTEMLWSATHRSTIPGGLRSAACLGKCPSAAARTSRCGYCVKATASR	104423	79066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82477_86256_86357_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
905438	contig_1275_pilon	-	4987	26	Intergenic	novelGene_108739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	316	junction_12	209.993462755392	92	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1570	4713	261	4973	444565	355148	FALSE	30	CAAGATAGGGGATTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETAKPSVGSISLGLPRQQESVKSATVPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTTGAIQEGSITRGTPTSKISVDSIPSLRGSITQGTPALSQAGIPTEALVKGSISRMPIEESSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTTHDISLKRSYESLEGNIKPGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATSESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQNTRPIIEGSISQGTPIKFDSNSGQPAIKHNVKSLITGPSKLPRGMPPLESVPENIKVMERGKYEDVKAGEPVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYEDTSARRTPVSYPNTMSRGSPMMSRASDVTVSSSKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSHSPFDPHHRGSTGGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLYAMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQQLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASLSPGHTTHLAAAASAEREREREREKERERIAAVSSDLYLRSGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPSAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKESKHEAARLEDNLRSRSATAGEQQQLEQKTLEVEKRSVQCLYTSSGFPSGKPQPHSAVVYSEAGKDKGPPPKSKYEEELRTRGKTTITAANFIDVIITRQIASDKDARERGSQSSDSSSSLSSHRYETPSDAIEVISPANSPAPPQEKLQAYQAEVVKTNQAEGDPTRQYEGPLHHYRPQQESPSPQQQLPSSSQAEGIGQVPRTHRLITLADHICQIITQDLVRNQGSSQPPQQPPTSTFQNSPSALVSTPVRTKTSNHYSPDSQSQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGRYGLYFEPYVNFQTIK	448526	355133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_355421_355599_355758_356168_356298_359071_359566_359775_359942_363603_363718_364063_364214_364696_364907_367964_368193_369970_370332_370639_370897_371287_371372_372977_373119_375532_375702_380116_380218_380553_380656_380752_380874_388392_388554_395563_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396
905439	contig_11752_pilon	+	2086	9	Intergenic	novelGene_37560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1058.22374760728	109	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	271	1299	87165	105616	TRUE	35	CATTTAACCACACAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKDKKSRQSMNDPY	83931	106459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96572_100956_100976_105597_106029_106084
905440	contig_5669_pilon	+	4863	15	Intergenic	novelGene_86084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	607	915	191570	191977	TRUE	30	TCTCATCCGAAACTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLKNAILGKQIHCICGALVRFKSPSSLCPCILPSQSLTFTIISLQTKNLLLSIPTHGDPTGQSRTAPQGSQGAAGGFKLPSWNPLHNSFLFNQHLRITRHF	190963	226138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_191814_191912_194419_196364_196458_201969_202085_205123_205291_207172_207333_208494_208586_209480_209599_212408_212550_213404_213466_215462_215540_216828_216920_219863_220057_221963_222103_226077
905441	contig_6673_pilon	-	5375	2	Intergenic	novelGene_164017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	155	junction_1	0	252	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAGCATTTCTTTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102531	91112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_93340_99383
905442	scaffold_880_pilon	-	3459	1	Intergenic	novelGene_121385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	664	975	268671	268360	NA	35	TATCCGGCATTAGGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTNGPFLCERKERDSGYRVGDGCVSAEIEGRWGDGKGQLGDRAPPQLLSVPCELGNTLRVTLLLSLSVSQGDSETPLEITNSLSIESILTPNNPIGQSRTAP	269334	265875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_265900_269300
905443	contig_6217_pilon	+	2507	1	Intergenic	novelGene_109597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAAAGGCTTCAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286600	289107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_286600_289100
905444	contig_5574_pilon	-	4212	1	Intergenic	novelGene_155861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGTTCATAGTAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197970	193758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_193800_198000
905445	contig_4091_pilon	-	2234	3	Intergenic	novelGene_173036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	269	634	222721	222356	TRUE	40	AAACCCAAATGAGGGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEIMLFIFWISNCCLCIISCCEFILAFCSCIIFLNFSNFLSIFSMNLSIFSSCLSDFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGVSCGVLFWTPTGTILSCFCKCLDIVCCFQGIQ	222989	20663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_20974_22033_22820_221851
905446	contig_14970_pilon	+	2464	14	Intergenic	novelGene_44955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_13	6637.62717102569	74	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	133	1803	136145	231550	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTALTSTTGTTPETITKREEVKDWFSQWFQPSHSKNHLHTTTKMAGTDSNTMSAGWDPNEENEDETGKPPSYSGSGIDDDEDFISRTNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_196136_196257_198393_198523_199729_199856_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231706_231743
905447	contig_16255_pilon	-	1939	2	Intergenic	novelGene_176098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	162	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	59	319	33474	30015	FALSE	50	TCAGACTTTTTAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRCCISKQLWRLQCSFWMEEGYDVKGVPTLLLDAYSFNDILAITGFNTCLGIAFSTGSTIFNVLRGILEVVIGVAAGSLLGVFIQYFPSSDQVREITCGKVML	33532	28394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_30158_33356
905448	contig_14666_pilon	+	1459	2	Intergenic	novelGene_39561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	120	1178	477340	484940	FALSE	45	CTCCCTTTATTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	485221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477352_483893
905449	contig_7342_pilon	+	1932	4	Intergenic	novelGene_71172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCAGAAGCGAAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472471	482766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_473484_480882_481478_482356_482472_482556
905450	contig_756_pilon	-	2798	8	Intergenic	novelGene_134773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACACACTACAGACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205553	177152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_-_177666_186007_186136_187912_188071_193803_193902_201390_201511_201609_201710_203251_203336_203956
905452	contig_5794_pilon	-	2503	2	Intergenic	novelGene_69781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAGGGAATTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741793	739206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_740913_740996
905453	contig_7272_pilon	+	2384	7	Intergenic	novelGene_25369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACCTTCTTGAGCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604498	616589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_604610_604708_604812_604920_605071_606906_607027_609183_609235_609832_611657_616564
905454	contig_10437_pilon	+	2097	10	Intergenic	novelGene_38198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	563.914449338585	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	81	701	229668	231447	TRUE	30	ATTAAACATTCGGAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPQPGPEERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKVG	225692	233342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231751_231947_232055_232163_232318_232510
905455	contig_10667_pilon	-	5405	12	Intergenic	novelGene_137306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_11	121.863085346827	288	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	210	1613	99329	44225	FALSE	20	TACCCAATTGGTTTCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSILPFTPPVVKRLLGWKKSAGGSGGAGGGEQNGQEEKWCEKAVKSLVKKLKKTGRLDELEKAITTQNCNTKCVTIPSTCSEIWGLSTPNTIDQWDTTGLYSFSEQTRSLDGRLQVSHRKGLPHVIYCRLWRWPDLHSHHELKAIENCEYAFNLKKDEVCVNPYHYQRVETPVLPPVLVPRHTEILTELPPLDDYTHSIPENTNFPAGIEPQSNYIPETPPPGYISEDGETSDQQLNQSMDTGSPAELSPTTLSPVNHSLDLQPVTYSEPAFWCSIAYYELNQRVGETFHASQPSLTVDGFTDPSNSERFCLGLLSNVNRNATVEMTRRHIGRGVRLYYIGGEVFAECLSDSAIFVQSPNCNQRYGWHPATVCKIPPGCNLKIFNNQEFAALLAQSVNQGFEAVYQLTRMCTIRMSFVKGWGAEYRRQTVTSTPCWIELHLNGPLQWLDKVLTQMGSPSVRCSSMS	130851	40432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_44349_48258_48404_48582_48721_51600_51814_52670_52725_61282_61358_65888_66024_67021_67216_68255_68346_99093_99383_130367_130454_130781
905456	contig_9752_pilon	+	1917	1	Intergenic	novelGene_122033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATCCACAATCAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186967	188884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_187000_188900
905457	contig_16724_pilon	-	2372	15	Intergenic	novelGene_105268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	200.13659876011	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	80	1750	422246	331871	FALSE	30	GAAAATATGCTATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGGGGGCPVSVGWCGLSARGPTYVNMTIGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEELVPPDNMSIVCDFVSPSLLLRSILAVLLLRQPKVCKQIWLGLFDDRSSAIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKSLLGDSAPALHLNKGTPSQSPVVGRSQGQQQEKKQFDLLSDLGSDIFAAPAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSASADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQTTGGSAGSVNANFAHFDNFPKSSSADFGAFSTSQSHQTASAVSKVSTNKSGLQTADKYAALANLDNIFSTGQGGDQGSGFGTTGKAPAASVVSVPSQPSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVGASAQTQPASSSVPAPFGAAPSTNPFVAAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPAGFGTPAPYSLPTSFSGSFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGAGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSSNPFMTGAPTGQFPAGSSSTNPFL	422620	331248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_331931_332507_332600_334575_334735_342058_342155_342363_342444_346177_346359_350065_350276_352957_353078_361200_361355_362404_362568_367525_367648_376069_376166_391231_391326_422202_422268_422562
905458	contig_9389_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_83973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACCCTTGGCCGTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341533	342617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_341500_342600
905459	contig_4469_pilon	-	1976	5	Intergenic	novelGene_21973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACACTAAAATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934742	925361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_926243_926658_926753_931156_931225_931508_931577_933877
905460	contig_20602_pilon	-	1747	12	Intergenic	novelGene_133713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	297.226657536657	133	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	12	1397	29552	10026	FALSE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29563	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17242_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
905461	contig_6919_pilon	-	2270	1	Intergenic	novelGene_163994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1038	1391	84430	84077	NA	10	TTCATTCTCCCTTGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGSGSWGHTAMSCKASATGDAPGNTSGDISDKDSSGTAGLISSDEGGRDNGFTGEGGLVDKDGVISSEGIRTLVHLARVIQQNLGAQYSQLPDYLPICSHPKFQDTISSQSILLF	85467	83197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_83200_85500
905462	contig_6189_pilon	+	748	1	Intergenic	novelGene_164939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACTAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47968	48716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_48000_48700
905463	contig_9609_pilon	+	3382	2	Intergenic	novelGene_22948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCTAGGCTACATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179609	183086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_180081_180175
905464	contig_20641_pilon	+	1576	6	Intergenic	novelGene_52852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1431.55375728612	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	45	875	14599	56473	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQVSHRRKVCPRFWAGGRGLFPLHSH	14554	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_56399
905465	contig_9370_pilon	+	2127	4	Intergenic	novelGene_177240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	34.5864456430872	209	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	15	818	59855	75603	FALSE	20	GAATACATTGTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPVRDELSALAAIFCGQDEWEVLNRSEADGTVFRIHTKAEGLTDVDIPLELVFHLPVTYPLCLPGISVNSECLTRAQCAMVKEKLLEQAKNLLSEPMVHELVLWVQQNLRHILNQPETGGGSEECTFPPSITVDDGLWITLLHLDHMRAKTKYIKTVEKWASDLRLTGRLMFMGKIILILLQGDRNNIKEYLILQKTSKVDVDSSGKKCKEKMISVLFETKVQTEHKRFPAFEVKEYSSLDELQKEFEMAGLKNLFSEFVLGLVK	59840	76912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_+_59940_72911_73400_75275_75392_75488
905466	contig_19941_pilon	-	2606	10	Intergenic	novelGene_139754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	65.9777366116409	103	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	484	1485	38965	17219	FALSE	30	CATAGACATATGCCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQEKYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAMKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTSATLDEATSGVTPGTLPSTPVISFPGIPDTLPPGSAPLEAPMTPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPPSPRLVSENEMAVTPGHLNSTGVLLEVGGVLPVIHGGEMQQTPNTVAASPAASGKLPLFLYLLYFRDVELSIACFGFPKICY	40353	16097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_17453_17844_18064_18602_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_39944
905467	contig_8254_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_48399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCCATCATATCATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115569	117765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_115600_117800
905468	contig_563_pilon	-	4112	3	Intergenic	novelGene_169764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	619	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1862	2260	683174	682776	TRUE	35	TTCTGTATGGGGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPRAIYRYNAIPIQIPPAFFNKMEKQITNFIWKGKRPQISQALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTASYWYNNRYIDQWNRIENPDINSATYGQLILTKAQSPLIGEKTVSLTNGAGINGYPSGKN	723222	680869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_680982_681035_685014_723200
905469	contig_1037_pilon	-	3016	1	Intergenic	novelGene_84617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATAAAAAACCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570112	567096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_567100_570100
905470	contig_8594_pilon	-	3264	1	Intergenic	novelGene_140018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	940	1281	164374	164033	NA	25	GGTTACCTGAGCTGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANRQIRKCSRSLVIREMQIKTTMRCHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRTIT	165313	162049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_162000_165300
905471	contig_5253_pilon	-	3895	5	Intergenic	novelGene_61608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2706	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	2064	2681	441665	398719	FALSE	45	CCAGCTAGTAAATAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISVTALISLGYIPRSGIAFCRPSAAAQRHLAFSLGGLGSPLYSLSCHCFSATTSLSPLPAIFRVIVHSVSWVQELLSTGIPGPKDMLSTPAVLPWWWWDSLFLTSGVAYFKPSRMAKLINSFGGPQLPLSAQSYPMTWMGVTRPWRERPHCFVTLVANPMTCQHSPLLNFGFPLTSFPVPSCLLVLAPGLVCPFSLILFYGPV	524904	397504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_398882_423684_424073_441598_442500_491472_492047_524249
905472	contig_5686_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_45471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATCGGAACTCTTACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228648	226556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_226600_228600
905473	contig_12638_pilon	-	5270	25	Intergenic	novelGene_33334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	246.134109785702	631	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	128	2698	1434492	1332741	FALSE	10	CGATTGCCTTATTCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFLGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECGLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYTRTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETGGFGQE	1463523	1330168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1332841_1351883_1351957_1357893_1357991_1359275_1359381_1359790_1359912_1369746_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373068_1373158_1374643_1374716_1375548_1375622_1378299_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405590_1411285_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1458588_1458666_1463494
905474	contig_9653_pilon	-	3815	14	Intergenic	novelGene_48295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	973.747996025313	2	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	32	1273	1040020	1016036	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLVSEKLNINLDFMSIQMLSWDRFDGFKCGFSLS	1040051	1005464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007322_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016097_1016557_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
905475	contig_12414_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_59584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	NA	30	AAGCCTCACTAGCAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	371875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_371900_374600
905476	scaffold_15568_pilon	-	2862	6	Intergenic	novelGene_122567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	20.2188031297602	199	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	102	413	31653	19540	TRUE	25	TATGTAGGTAGGTAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDTTGEKAASLPEEQIPGPAQGNTGTEQAPGTTMMPVPATEAHLPLPSLLLPLLLGLTGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSLHPVGPIQWFRGAGPDRQLVYNFKGGLDHLGLFPPSDKCFRLHKR	31754	10381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_12022_12424_12537_13096_13342_16719_17035_19402_19776_31577
905477	contig_3181_pilon	-	3681	3	Intergenic	novelGene_136928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2856	3203	274136	273299	FALSE	60	GCAATAAGGCAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITKYYEKLYPNKFEKLEEMDKFLETRYLRNLTKSDVENLNRPITREATEKVIKKKNPNQKKPWPRWLHWRILPNIKRRAHTSTTQTISEHRKGSNTSKFIL	278129	272820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_273642_274131_274604_275741
905478	contig_14822_pilon	+	2053	8	Intergenic	novelGene_145437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTTTTTCCCTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356833	360402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_357704_357783_357940_358135_358400_358550_358706_358830_358926_359067_359110_359188_359332_360074
905479	contig_8964_pilon	-	2994	1	Intergenic	novelGene_168702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGATTGTTACTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545355	542361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_542400_545400
905480	contig_19812_pilon	-	2282	21	Intergenic	novelGene_100983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	97.6547361882669	512	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	59	2146	46806	15879	FALSE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACAHMKSSSQPPRQDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48257	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_34397_34434_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
905481	contig_8866_pilon	+	2578	6	Intergenic	novelGene_77780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	691	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGCCCAGCTTGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341085	418260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_342356_348800_349550_352281_352490_356565_356636_363336_363438_418080
905482	contig_5019_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_109170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATTTAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4547	6767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_4500_6800
905483	contig_1244_pilon	-	3022	1	Intergenic	novelGene_37893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	673	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACCCAGCTAAGAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96666	93644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_93600_96700
905484	contig_6175_pilon	-	5258	19	Intergenic	novelGene_16299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	2483	3376	1505229	1490025	TRUE	10	GAGTAGCCGGCGGGCGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLEGQLDKGIWARPALLDQAFPKSIERERVKIYVISQKVCAVQGSLYHLLTLLRDLPLQPGGVRDIQVGVPFTMPVFCIAQLETVSGHDILPQVAYDGGVRPGVLCIHAHFAVFEDNKRERLVKPPVKTLAMQQRLGIGVHGHVRVILPVPLLSFIQRHEEGCLFHGIKRLLIFPTCKVRLAAPGPGHPLSRSECRQLRFSRLGLRWIVQNPLYLLLDLPGLQQPAVMVEPDLEVAPSVVHNNVLAVFYVLDGICLLPRDPGSVEHPLPLGRAEWNGGSQKTKLGLSSSRSSWRL	1522833	1444479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1444539_1466791_1466945_1471079_1471222_1478853_1479025_1481903_1482006_1484446_1484586_1488389_1488467_1488985_1490062_1491421_1491509_1493858_1494056_1495307_1495497_1498490_1498597_1502629_1502747_1505068_1505234_1514156_1514294_1516651_1516803_1517889_1518004_1518665_1518761_1520852
905485	contig_13224_pilon	+	3046	11	Intergenic	novelGene_104130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	64.7169993123909	36	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	131	1393	393528	413551	FALSE	25	GAAATTTTATGCTCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDSWALAVDEQEAAAESLSNLHLKEEKIKLDANGAVVKTNTNTEKTDEEEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	393397	415204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405040_405134_409126_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882_413075_413489
905486	contig_14441_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_100589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.986403956887	17703	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	610	1038	116728	117610	FALSE	15	TGCCTACGAGTGTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111199	117793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111405_112108_112154_112454_112665_116578_116963_117220_117344_117539
905487	contig_13456_pilon	+	808	4	Intergenic	novelGene_153279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	646	junction_3	374.602307639567	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	51	587	305013	319411	FALSE	35	AAACTGTAGGCAGTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDPQAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSMILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMSLGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITVSVERCHH	250268	319632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_250299_304992_305208_307142_307306_319232
905488	contig_10958_pilon	+	2053	5	Intergenic	novelGene_5429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4731.09678087439	4	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAACATCAAAACCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888222	901654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889060_893841_893859_895279_895855_900457
905489	contig_9484_pilon	+	1851	12	Intergenic	novelGene_105618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	543	junction_10	427.41040335088	2	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	57	1718	95848	104965	FALSE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95791	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
905490	contig_3747_pilon	+	2747	7	Intergenic	novelGene_24817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4163.6890160316	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	680	1345	202676	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202648_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
905491	contig_19769_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_102245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	677	2034	364	2397	47410	39200	FALSE	20	CTTATTTTATATGGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLPETSHEAVPGWAGTQVSLGRWCVCFQEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLDSTIRTDNEQAYEEMDILKSELNGMRIKIPPQDFSLSPGFADTSDSEVLLENNQSSSPRLTVMNSLFQKNRLNKGTVMLKKTFTQNSQECNEVRSTGSLDCKLSENQRDTAEETAERCDGCGRSFRSISDIAVCWEVNKQKKLNKCQECQKKLSHCFQGKHQSNCQEEKPYECEECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFKCTDCGKAFRLSSKLIQHQRVHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLIRHQRTHTGERPYTCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHTGEKSQMSRTADNPSLAPHQRIHTVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYACNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLECGKAFSMSTQLTIHQRIHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWYYEYGHALESSFVSRKKVNTIKKLHKCNECEKIFRWRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFNRSSRLTHHQKSHMG	48870	39154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_41020_47196_47758_48854
905492	contig_12157_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_135875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATATTAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16607	19063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_16600_19100
905493	contig_7887_pilon	+	5073	20	Intergenic	novelGene_124868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	54.2317791758317	300	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	159	1301	185807	203804	TRUE	10	CTGTGGAGTGGTGAGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYKKPDVPLYKKIRSNVYVDVKPLSGYEATTCNCKKPDDETGKGCVDDCLNRMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRHEWVQCLERFRAEEKGWGIRTKEPLKAGQFIIEYLGEVVSEQEFRNRMIEQYHNHSDHYCLNLDSGMVIDSYRMGNEARFINHSCDPNCEMQKWSVNGVYRIGLYALKDMPAGTELTYDYNFHSFNVEKQQLCKCGFEKCRGIIGGKSQRMNGLSSSKSSQPVVTHKRPGRSKEKRKSKHKLKKRRGHLSEEPSENINTPTRLTPQLQMKPMSNRERNFVLKHHVFLVRNWEKIRQKQEEVKHTSDNIHSASLYTRWNGICRDDGNIKSDVFLTQFSALQTARSVRTRRLAAAEENVEVARAARLAQIFKEICDGIVSYKDSSRQALAAPLLNLPPKKKNADYYEKISDPPGPRHH	177617	216594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_177666_177778_177888_185805_186013_186125_186273_193137_193247_196303_196469_196618_196714_200511_200670_201803_201957_203613_203669_203749_203884_204915_205165_206026_206114_207988_208080_208460_208600_208720_208894_210981_211149_212364_212406_213350_213653_214150
905494	contig_13607_pilon	+	1568	9	Intergenic	novelGene_170178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_1	121.755903347641	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	69	1541	398348	468985	FALSE	25	AGTAATCTGAGGGTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSYIDDHVRRKDSSLYIGILFTMLVFGPACGFILGSFCTKIYVDAVFIDTSNLDITPDDPRWIGAWWGGFLLCGALLFFSSLLMFGFPQSLPPHTDPAMESEQAMLPEREYERPKPSNGVLRHPLEPDSSASCFQQLRVIPKVTKHLLSNPVFTCIILAACMEIAVVAGFAAFLGKYLEQQFNLTTSSANQLLGMTAIPCACLGIFLGGLLVKKLSLSALGAIRMAMLVNLVSTACYVSFLFLGCDTGPVAGVTVPYGNNSAASSALDPYSPCNNNCECQTDSFTPVCGADGITYLSACFAGCNSTNLTGCVCLTTVPPENATVVPGKCPSPGCQEAFLTFLCVMCVCSMIGAMAQTPSVIILIRTVSPELKSYALGVLFLLLRLLGFIPPPLIFGAGIDSTCLFWSTFCGEQGACVLYDNVVYRYLYVSIAIALKSFAFILYTTTWQCLRKNYKRYIKNHEGGLSTSEFFASTLTLDNLGRDPVPTNQTHRTKFIYNLEDHEWCENMESVL	210550	469012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_210605_398333_398433_411345_411610_431540_431706_437817_438017_440116_440256_450387_450564_456422_456488_468605
905495	scaffold_9100_pilon	+	7457	37	Intergenic	novelGene_83234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.2675246355448	763	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	4665	6314	589899	614785	FALSE	35	ATCTTTCTAACTGTAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSISNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTADIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSTSNSSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQNSEPSSVDGNSRDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSIKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDIINSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFPVNTPFLEEKVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRMMKKT	532595	615928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_533450_533795_534065_536519_536629_538582_538699_539477_539595_540336_540492_540701_540825_543207_543785_544088_544176_545387_545534_546556_546660_547358_547545_548115_548275_548760_548941_553196_553286_559118_559198_559510_559719_565384_565518_566836_567031_567885_567950_568119_568232_570762_570930_580775_581208_589893_590053_593147_593341_594141_594308_595020_595115_596712_596863_596993_597074_601279_601411_601516_601605_604259_604349_604701_604820_609202_609294_609782_609899_612962_613056_614698
905497	contig_8278_pilon	-	2341	4	Intergenic	novelGene_165299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_3	79.8429013055568	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	38	403	229370	223037	TRUE	25	ATATTTGATAGAGCTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVWLRGGHWRRKMVGLRFRCGIGGLFKVPATQQRRSRAYSVSQDFAEVLRKPKRQLTKLVFPLQELERQLAPDTRPSLHLKLFEPSLEDIARADDLFTATDRHRIEYLSSAVRLEHAPDLLRPELDENIFVSG	229407	215931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_217681_219892_220012_222966_223067_229034
905498	contig_9471_pilon	-	2968	12	Intergenic	novelGene_21860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1089.07116388232	16	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	124	834	445281	437746	TRUE	25	TTACACTTAGGTTTACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMVFLPISKVLNTSQSISPRQA	446607	432947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437136_437687_437805_437958_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
905499	contig_6576_pilon	-	4030	3	Intergenic	novelGene_42431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	142	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGACATAGGCAGCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305686	1301491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1302545_1302668_1303537_1303577
905500	contig_5623_pilon	-	1876	5	Intergenic	novelGene_154879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	37.9958879354069	233	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1083	1613	344683	339867	FALSE	0	TTTGGTTTTTGTCCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPIWMVKTRMQLERRVRGSKQMNTLQCARYVYQTEGIRGFYRGLTASYAGISETIICFAIYENLKKYLKEAPLASSTNGTEKNSTNFFGLMAAAAISKGCASCIAYPHEVIRTRLREEGTKYKSFIQTARLVFREEGYLAFYRGLFAQLIRQIPNTAIVLSTYELIVYLLEDHAQ	350016	339603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_340070_341498_341780_344636_344704_346714_346816_349055
905502	contig_5039_pilon	+	2796	10	Intergenic	novelGene_64994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	137.357603033509	117	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	77	1150	1688604	1698825	FALSE	20	TGAGATTTCTGGTAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVLVIGSGGREHTLAWKLAQSPHVKQVLVAPGNAGTACSEKISNAAVSVSNHAALAQFCKDEKIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLTSAGVRCFGPTAEAAQLESSKRFAKEFMDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGE	1687284	1700471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1687322_1688564_1688749_1691365_1691462_1692008_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648
905503	contig_6544_pilon	+	1336	12	Intergenic	novelGene_142060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	67.1880302208561	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	110	1234	11054	24564	FALSE	25	AGCAAAGGTTGAGGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEEDAPAPSTSADKVESLDVDSEAKKLLGLGQKHLVMGDIPAAVNAFQEAASLLGKKYGETANECGEAFFFYGKSLLELARMENGVLGNALEGVHVEEEEGGKTEDESLVENNDNIDETEGSEEEDKENDKAEEMPNDSVLENKSLQENEEEEIGNLELAWDMLDLAKIIFKRQETKEAQLYAAQAHLKLGEVSVESENYVQAVEEFQACLNLQEQYLEAHDRLLAETHYQLGLAYGYNSQYDEAVAQFSKSIEVIEKRMAVLNEEKKEAEGSPTEYEKEIEELKELLPEIREKIEDAKESQRSGNVAELALKATLIASRKPTDGASSSNCVTDISHLVRKKRKPEEESPRKDDAKKARQEPEVNGSSGDAVPSGNEVSENMQEAENKAESRAAVEGTVEAGATVESTAC	5993	24666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_6045_10995_11107_12992_13074_14290_14401_20544_20625_21128_21215_21320_21395_21749_21939_22068_22236_23075_23154_23866_23993_24483
905504	contig_9609_pilon	+	1762	9	Intergenic	novelGene_23070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	846.653965619957	20	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	31	942	449884	454609	TRUE	65	GTAGAAAGAAAAAAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	449853	456259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455906_456086
905505	contig_21007_pilon	+	849	2	Intergenic	novelGene_161518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	CTAGTAAGCAAGAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
905506	contig_6634_pilon	-	2594	2	Intergenic	novelGene_171152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGAAGCAGCTCCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427277	423017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_423775_425440
905507	contig_6360_pilon	+	4329	2	Intergenic	novelGene_165876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	646	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTCCCAGTATCGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395	64359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_+_4389_64023
905508	contig_8322_pilon	+	3982	13	Intergenic	novelGene_143238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	359.720522304006	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	10	1833	287401	304580	FALSE	15	CATTTGTAGTGTTGTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQLMTLISAAREYEIEFIYAISPGLDITFSNPKEVSILKRKLDQVSQFGCRSFALLFDDIDHNMCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSKPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGCRSHSSAQFLIGDQEPWAFRGGLAGEFQRLLPIDGANDLFFQPPPLTPTSKVYTIRPYFPKDEASVYKICREMYDDGVGLPFQSQPDLIGDKLVGGLLSLSLDYCFVLEDEDGICGYALGTVDVTPFIKKCKISWIPFMQEKYTKPNGDKELSEAEKIMLSFHEEQEVLPETFLANFPSLIKMDIHKKVTDPSVAKSMMACLLSSLKANGSRGGFL	287391	306729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_287524_290053_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294917_295076_295472_295648_299239_299326_300316_300422_301317_301404_301681_301875_303494_303655_304557
905509	contig_3382_pilon	-	4438	3	Intergenic	novelGene_124096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	3772	4395	637166	633315	FALSE	20	TTTCATTTCACTTGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHTSKILKIIQKWLQHTPTRNGQKLKLDSEEDVERGMSLLMSDGSWPKAENTRKMFTCVLLTMNAKAFNCVDHNKLWITLQRMGIPEHLLVLTRNLYLDQEAVVRTEQGDAAWFKVRKGVHQGCILSPYLFSLYAEQITQEAGLYEQENGIRVGGRLINNLRYADDTTLLAESEENLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKQKSLQLDQ	752357	633271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_633889_637116_637970_749389
905511	contig_1274_pilon	-	6213	2	Intergenic	novelGene_137804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	57	junction_1	0	321	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	239	2383	440243	438099	FALSE	40	TCTAGCAAAGTAATGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPSHSSYVLQQLNNQREWGFLCDCCIAIDDIYFQAHKAVLAACSSYFRMFFMNHQHSTAQLNLSNMKISAECFDLILQFMYLGKIMTAPSSFEQFKVAMNYLQLYNVPDCLEDIQDADCSSSKCSSSASSKQNSKMIFGVRMYEDTVTRNGNEANRWCAEPSSTVNTPHNREPDEESLQLGNFPEPLFDVCKKSSVSKLSTPKERVSRRFGRSFTCDSCGFGFSCEKLLDEHVLTCTNRHSYQNTRSYHRIVDIRDGKDSNIKAEFGEKDSSKTFSAQTDKYRGDTSQAAADDSASTTGSRKSSTVESEIASEEKSRAAERKRIIIKMEPEDIPTDELKDFNIIKVTDKDCNESTDNDELEDEPEEPFYRYYVEEDVSIKKSGRKTLKPRMSINADERGGLENMRPPNNSSPVQEDTENASCELCGLTITEEDLSSHYLAKHIENICACGKCGQILVKGRQLQEHAQRCGEPQDLTMNGLGNTEEKMDMEENPDEQSEIRDMFVEMLDDFRDNHFQINSIQKKQLFKHSACPFRCPNCGQRFETENLVVEHMSTCLDQDMFKSAIMEENERDHRRKHFCNLCGKGFYQRCHLREHYTVHTKEKQFVCQTCGKQFLRERQLRLHNDMHKGMARYVCSICDQGNFRKHDHVRHMISHLSAGETICQVCFQIFPNNEQLEQHMDVHLYTCGICGAKFNLRKDMRSHYNAKHLKRP	455202	434268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_440262_454982
905512	contig_6434_pilon	+	3337	14	Intergenic	novelGene_61903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1409.59237886568	7	152	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	53	1174	913560	925567	TRUE	25	GACTTTACATGCATATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRFVFSKPMAQPTLAGWDLGPSLPRTDLSTLSTEISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGGPLWKS	913507	933829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924377_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932366
905513	contig_16098_pilon	-	1765	9	Intergenic	novelGene_45769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	341.120740171277	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTCTTGGCTTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36343	31089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_32173_34565_34661_34734_34799_34981_35073_35215_35749_35907_36011_36295
905514	contig_9098_pilon	-	2749	3	Intergenic	novelGene_75814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATCTGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313560	302672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_303079_309867_310015_311364
905515	contig_3817_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_78306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTCAGCATTATAATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130910	129169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_129200_130900
905516	contig_2596_pilon	-	650	6	Intergenic	novelGene_53523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	296.408906748768	5	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	19	399	1120571	1055847	TRUE	0	GTGGCTCTCCTGCTGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQIQIAMGLFGKTQEKPPKELVNEWSLKIRKEMRVVDRQIRDIQREEEKVKRSVKDAAKKGQKDVCVVLAKEMIRSRKAVSKLYASKAHMNSVLMGMKNQLGEDPRNPGHHAGAVQRDDEGWDHRRDVRGHF	1120589	1054867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1055042_1055769_1055885_1059028_1059086_1083437_1083618_1103052_1103114_1120526
905517	contig_5997_pilon	+	4295	2	Intergenic	novelGene_168607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	373	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCAGCATTTTGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137604	142677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_138628_139405
905518	contig_12620_pilon	-	1289	2	Intergenic	novelGene_98804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATTCGAAGAGCGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218970	217113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_217203_217770
905519	contig_9981_pilon	-	3575	13	Intergenic	novelGene_121053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	83.8455507996035	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	552	2372	285125	258123	FALSE	45	AAAAGACTTTTAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKWVESIAKIMKRKKQAQANGISHNITFESPPPPIEWHISRSGQSETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAVNSVSVYRLDHTFEALQERKRRILDEAVELSQDHFKKYLAKLKSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNPMGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNAGRHGSTSGTLRGHPTPLEREPCKISFSRIAETELESTMSAPTSPNTPCTPPVSASSELSVFLDVDLNSSCGSNSIFAPVLLPHSKSFFSSCGSLHKLSEEPLVPPPLPPRKKFDHDASNSKGNMKSDDDPPAIPPRQPPPPKVKPRVPVPIGAFDGPLHSPPPPPPRDPLPDTPPPVPLRPPEHFINCPFNLQPPPMGHLHRDVRDASTCPNSPNTPPSTPSPRVPRRCYVLSSSQNNLPHPPAPPVPPRQNSSPHLPKLPPKTYKRELLHPSLYRLPLLENAETPQ	296096	256919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_258624_259678_259789_264582_264625_265150_265413_269463_269581_273396_273570_274630_274749_278229_278393_278554_278675_284910_285134_286455_286560_294257_294381_295780
905520	contig_14925_pilon	+	5541	1	Intergenic	novelGene_55241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGGCATTACTATTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69927	75468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_69900_75500
905521	contig_15666_pilon	-	1980	7	Intergenic	novelGene_70144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	672.222102846638	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	229	1107	110110	107816	TRUE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTASWAPSDFCGPGPRETSANPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110651	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107224_107398_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_110043_110246_110558
905522	contig_12923_pilon	+	3904	3	Intergenic	novelGene_30178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAGGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321732	327606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_321973_323765_327107_327283
905523	contig_17753_pilon	-	1312	5	Intergenic	novelGene_105062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTGCAAAGTGTCGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145100	45501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_45683_75017_75171_96132_96229_130834_131193_144576
905524	contig_7345_pilon	+	2303	14	Intergenic	novelGene_159191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_12	171.792877906531	75	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1917	387	2303	305188	348740	FALSE	25	TGAGTATTCTTTAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPLQLDQSSDRSNSIDGPDHVKSASSSHETKKASTGITHGACLTLTDHDRIRQFIQEFTFRGLLPHIEKTIRQLNDQLISRKGLSRSLFSATKKWFSGSKVPEKSINELKNTSGLLYPPEAPELQIRKMADLCFLVQHYDLAYSCYHTAKKDFLNEQAMLYAAGALEMAAVSAFLQPGAPRPYPAHYMDTAIQTYRDICKNMALAERCVLLSAEILKSQSKYSEAAALLIRLTSEDSDLRSALLLEQAAHCFINMKSPMVRKYAFHMILAGHRFSKAGQKKHALRCYCQAMQVYKGKGWSLAEDHINFTIGRQSYTLRQLDNAVSAFRHILINESKQSAAQQGAFLREYLYVYKNVSQLSPDGPLPQLPLPYINSSATRVFFGHDRRPADGEKQAATHVSLDQEYDSESSQQWRELEEQVVAVVNKGTIPSGFHPTQYCLNSYSDNSRFPLAVVEEPVTVEVAFRNPLKVPLLLTDLSLLWKFQPKDFSAKDNEEVKELVTGEPEMIGTEVISEFLVNSEESKVARLKLFPHHIGELHILGIVYNLGTVQGSMTVDGIGALPGCHTGKHSLSSMSVRGRQDLEIQGPRLNNTKEEKTSIKYGPDRRLDPIITEEMPLLEVFFIHFPTGLLCGEIRKAYVEFVNVSKCPLTGLKVVSKRPEFFTFGGNTAVLTPLSPSASENCSAYKTVVTDSTSVCTALTSSASSVDFGIGIGSQPEVIPVPLPDTVLLPGASVQLPMWLRGPDEEGVHEINFLFYYESVKRQPRIR	303031	348740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_303265_304318_304435_305150_305302_311018_311120_314496_314603_320043_320176_328870_329096_332776_332886_338556_338752_339369_339501_342993_343069_343571_343699_344974_345133_348296
905525	contig_11338_pilon	+	2912	15	Intergenic	novelGene_6339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	464	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294405	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_295361_298712_298821_298901_299076_300260_300352_300823_300893_306727_306961_307227_307428_314757_314941_315144_315340_315548_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
905526	SIRV5	+	2764	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-38	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	62	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGTCGTGACCGACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8460_8586_10858_10992_11133_12480_12537
905527	contig_1301_pilon	-	4328	14	Intergenic	novelGene_47304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	730.747708185083	69	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	83	1291	322831	279341	TRUE	45	GTAAGAAGACCAAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKR	322913	268649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_274190_274263_276836_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
905528	contig_5532_pilon	-	3264	9	Intergenic	novelGene_175860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_8	35.9722114972099	265	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	370	1548	42273	21368	FALSE	25	AAACACTGTTGAGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRESFNPESYELDKSFRLTKFTELKGTGCKVPQDVLQKLLESLQENHFQEDEQFLGAVMPRLGIGMDTCVIPLRHGGLSLVQTTDYIYPIVDDPYMMGRIACANVLSDLYAMGVTECDNMLMLLGISNKMTDRERDKVMPLIIQGFKDAAEEAGTSVTGGQTVLNPWIVLGGVATTVCQPNEFIMPDNAVPGDVLVLTKPLGTQVAVAVHQWLDIPEKWNKIKLVVTQEDVELAYQEAMMNMARLNRTAAGLMHTFNAHAATDITGFGILGHAQNLAKQQRNEVSFVIHNLPVLAKMAAVSKACGNMFGLMHGTCPETSGGLLICLPREQAARFCAEIKSPKYGEGHQAWIIGIVEKGNRTARIIDKPRIIEVAPQVATQNVNPTPGATS	42834	19651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_-_21583_23301_23515_29293_29394_31725_31817_32957_33113_34163_34272_36309_36414_42080_42352_42543
905529	contig_18364_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_102551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19002	21440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_19000_21400
905530	contig_9363_pilon	-	2461	12	Intergenic	novelGene_6575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	943	junction_5	488.623923731713	2	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1116	1826	756838	754431	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCCLLSLPLLYPISLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	759860	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532
905531	contig_7119_pilon	+	2338	2	Intergenic	novelGene_40972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_1	0	2	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	33	1187	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137000	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707
905532	contig_6137_pilon	+	3754	14	Intergenic	novelGene_59252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_2	669.265339513826	50	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	2377	3711	1328176	1348329	FALSE	15	TTCTGTAGTTCACCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRYLFFMKNFHGMIGTK	1319320	1348372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
905533	contig_9668_pilon	-	1516	1	Intergenic	novelGene_58229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAGAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563925	562409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_562400_563900
905534	contig_7396_pilon	-	1907	14	Intergenic	novelGene_79595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2936.70765015607	2	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	149	1456	254680	246385	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	255143	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254735_255049
905535	contig_299_pilon	+	1593	2	Intergenic	novelGene_129520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCCGCCTGGTGACCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1727597	1729288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1729065_1729162
905536	contig_12920_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_166346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGGTCCTAGCAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212054	212906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_212100_212900
905537	contig_14970_pilon	-	1803	7	Intergenic	novelGene_45136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.853564145892	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	389	1081	291083	270167	TRUE	20	CTTGCTGTAGATCATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLQSIFKSWISLNHSQVHLSLCHHILTGFVHSIILRKILQSKREGKSILRWRDAPAVKSNSDLCFSLAASSS	315786	268331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_270086_270381_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312047_315611
905538	contig_12654_pilon	-	299	3	Intergenic	novelGene_129312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAACGCATTGCCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788141	781939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_782051_782811_782900_788041
905539	contig_17989_pilon	-	3308	1	Intergenic	novelGene_150842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGTCTTTTGGTAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275222	271914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_271900_275200
905540	contig_6233_pilon	+	1146	8	Intergenic	novelGene_74769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	342.76165336923	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	207	395	123409	125895	TRUE	10	TTCTTTCAATTTGGTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDVEADEEDSRKKDASDDLDDLNFFNQKKKKKKTKKIFDIDEAEEGIKDLKIESDVQEPTEPEDDLDIMLGNKKKKKKNVKFPDEDEILEKDEGNFGKMKTAKKMMVSHSVTRWGLLGQAQKETTRMRSY	118113	131703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_118156_119651_119756_123348_123496_125135_125231_125888_126031_127998_128056_130494_130581_131230
905541	contig_10734_pilon	-	1946	9	Intergenic	novelGene_51477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_2	512.921960438428	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1524	422	1945	2274500	2265053	FALSE	70	AAAGGAAAGAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTNLTLGWWTSSYLGKAYSISRVKKSQDPRRTSQTCPSCTYLCTSHPQLLDNCRKCSCFQMNRQLVGRVTVGPVTARAGASAESASHPNSPSRLPDAWKSCAVGKSPVPASPPQICSRSSSCPDKTCSSSCSTKSPCWCWIQSPPTASCGTVPTGATRPGASAPRTWLTLPSCPAAAAGGSGESSPKAKASTVASRVLTSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKLPTTKSPGPDGFTGEFYKAFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIKHHDQAGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHIN	2281040	2265051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267167_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839
905542	contig_15182_pilon	-	3137	11	Intergenic	novelGene_136437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_7	89.2269578098458	366	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	190	1719	653509	248833	FALSE	40	AAAAAAAGTTTGCACCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAMRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPRASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRYHPQETLKEFVQLVCPDAGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSAEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQQTQSWYLG	653698	247414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_248851_282913_283006_306829_306996_309310_309490_332396_332526_359304_359433_367659_367778_387446_387522_450766_450833_647577_648110_653482
905543	contig_6327_pilon	-	3112	1	Intergenic	novelGene_147485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAGAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49709	46597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_46600_49700
905544	contig_16036_pilon	+	2588	2	Intergenic	novelGene_114800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATAAGTGTTCATATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9858	12499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_+_12231_12283
905545	contig_9571_pilon	-	3366	1	Intergenic	novelGene_136295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525195	521829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_521800_525200
905546	contig_11364_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_65182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	1559	2545	203992	204978	NA	30	CTAACGAGGTACAGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKSTSKWIKGLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTTTINAENPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKYSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKVIWRFLRKLEIDIAFDPAIPLLGIYPREIRLVTRIDICTPMFMPALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNNESVEHLITWMKLEDIMLSEISESQKHKYCMRPLL	202433	205726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_202400_205700
905547	contig_9389_pilon	+	343	2	Intergenic	novelGene_84136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAACAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673610	1674006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1673683_1673735
905548	contig_3529_pilon	+	1995	9	Intergenic	novelGene_105397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	101.944838025277	487	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	85	930	790486	809429	FALSE	10	GATGTGTGTTCTCTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEAVMPLSTFLPHWLGIPSKVKPLSLVMRMGLSPLWTRRMQVMPLAQLCTPSVSPGWCSPHTVFPSWPLSVKTAHLPCWTQAFPRCLEAEPTETL	790401	810494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
905549	contig_3866_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_112374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTGAGAATTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90147	87826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_87800_90100
905550	contig_14326_pilon	-	2530	8	Intergenic	novelGene_120734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.1451612403736	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	9	1055	493216	443443	TRUE	50	AAAAAAAACCTTATGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSVGPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPGALSPAGAWRGPAEVGRGGKAGKAVGNKGQSLLRTKLLGPLLGVQVQTAHSFEQVLTIAGWTGAHLRACPKLALVSVPSHLLPLLQEPAGHQGRERALPLCHLPGPRRLPLLPLPH	493224	440937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_441970_442040_442291_442976_443138_443410_443932_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
905551	contig_14807_pilon	-	513	3	Intergenic	novelGene_124659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	2034	1186	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	75	416	38324	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38398	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298
905552	contig_4924_pilon	-	2615	14	Intergenic	novelGene_84666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1093.36591210421	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	20	1378	252576	65524	TRUE	60	CCCTAATATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDNNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252595	62890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65636_69075_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252454_252519
905553	contig_7840_pilon	+	2683	2	Intergenic	novelGene_68979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184706	187642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_185318_185570
905554	contig_12128_pilon	-	3702	2	Intergenic	novelGene_131995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497760	491488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_494985_497554
905555	contig_1719_pilon	-	2099	3	Intergenic	novelGene_87310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	234	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCTGACCAGAATAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562552	425656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_425790_508779_509266_561072
905556	contig_4857_pilon	+	2788	2	Intergenic	novelGene_48871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	572	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGCTCATAAACACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361245	1364512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1361544_1362022
905559	contig_2215_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_163860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTTGTTAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218750	221359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_218800_221400
905560	contig_9471_pilon	-	2214	11	Intergenic	novelGene_21701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_9	175.615061996402	188	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	686	1876	100512	71045	FALSE	20	CTGACTGTGTCTAGTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFLLPNVFPKTEMTSLSFLAHLEKQDLIGEDNLTTLEDLCKIVAPNLLKKIEKYKTEKISQVVTPPVEKETEALHQEEEKLLSLLGNMQVHGTSQKEPWQNEHERRSNGDRATNGAPIPSSMEMLRASADIRNAATSTKEAAVYRMNRKHRGHCVIVNNHTFTSMKARPGTHKDAESLKCVFQWLGFAVRIYDDVTKGGLEEALQEYKSHSGHADGDCFVCCILTHGKFGAVYSADGALIPIRDIMSHFTAQQCPGLAHKPKLFFIQACQGDEIQPSVTIEADALNPEKVPSAPREVNLRESIPVEADFLLGLATVPGYVSFRHLEKGSWYIQSLCNHLKDLVPRHEDILSILTAVNNDVSRQAGKDGTKKQMPQPAFTLRKKLIFPVPQEALSL	105626	70706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_71199_73862_74371_74919_75029_77002_77095_79129_79170_81089_81200_87353_87490_100470_100565_102085_102215_102735_103090_105476
905561	contig_5623_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_154858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACGGGGGATAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247148	249492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_247100_249500
905562	contig_6210_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_171888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1728	2039	107308	107619	NA	60	CAGGAAAACTCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKNN	105580	107747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_105600_107700
905563	contig_5779_pilon	-	3328	2	Intergenic	novelGene_106459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	0	59	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2782	3192	108909	107541	FALSE	15	TCTAGGCACTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFPNGFPCPVEVQTDFIDNNPQSTWNTATSMPTAWGHASFINSTPYLASTRSLSPMSGLFGSIWAPQSDVYENCCSINPTTEHATHMENQAVMCKEYYPGFNPFRAYMNLDIWTTTANRNANFPLSRDSSYCGNV	111690	107404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774
905564	contig_10205_pilon	+	5204	28	Intergenic	novelGene_143104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_14	129.406887997431	262	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1461	4386	122	4507	163057	207510	FALSE	25	CTTCAAGGTCATGGATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQESTPVFIQQETTGVPRSGKVPPPRDLQFVEVTDVKITIMWTPPESAVTGYRVDVIPINLPGEHGQRLPISRNTFAEVTGLSPGVTYNFKVFAVNNGRESKPLTAEQTTKLDAPTNLRFINETDVTVLVTWTPPRAWIAGYQLTVGLTRGGQPKQYNVGPSATQYPLRNLQPASEYTVTLMAIKGNQQSPKVTGIFTTLQPLGSIPPYNTEVTETTIVITWTPAPRIGFKLGVRPSQGGEAPREVTSDSGSIVVSGLTPGVEYVYTISVLRDGQERDTPIVKKVTTPLSPPTNLHLETNPDTGVLTVSWERSTTPDISGYRITTTPTNGQQGYSLEEVVHADQSSCTFENLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIPAVPPPTDLRFTNVGPDTMRVTWAPPPSIELTSFLVRYSPVKNEEDVAELSISPSDNAVVLTNLLPGTEYLISVSSVYEQHESIPLRGRQKTGLDSPTGFDSSDITTNSFTVHWMAPRATITGYKIRHHPERASGRPREDRVPPSRNSITLTNLNPGTEYVVSIIAVNGREESPPLVGQQSTVSDVPRDLEVIAATPTSLLISWDAPAVTVRYYRITYGETGGSSPVQEFTVPGSKSTATISGLKPGADYTITVYAVTGRGDSPASSKPISIDYRTEIDKPSQMQVTDVQDNSISVRWLPSSSPVTGYRVTTTPKNGPGPSKTITAGPDQTEMTIEGLQPTVEYVVSVYAQNRNGESQPLVQTAVTNIDRPKGLAFTDVDVDSIKIAWESPQGQVSRYRVTYSSPEDGIHELFPAPDGEEDTAELQGLRPGSEYTVSVVALHDDMESQPLIGTQSTAIPAPTNLKFTQVTPTSLTAQWVVPNVQLTGYRVRVTPKEKTGPMKEINLAPDSTSVVVSGLMVATKYEVSVYALKDSLTSRPAQGVVTTLENVSPPRRARVTDATETTITISWRTKTETITGFQVNAIPANGQTPIQRTIKPDVRSYTITGLQPGTDYKIHLYTLNDNARSSPVIIDASTAIDAPSNLHFLATTPNSLLVSWQPPRARITGYIIKYEKPGSPSREVVPRPRPGVTEATITGLEPGTEYTIYVIALKNNQKSEPLIGRKKTDELPQLVTLPHPNRHGPEILDVPSTVQKTPFITNPGYDNGNGIQLPGTSGQQPSVGQQMIFEEHGFRRTTPPTTATPVRHRPRPYPPNVDEEIQSGHVPRGDVDHPLFPHILGLNPNASTGQEALSQTTISWTPFQESSEYIISCHPVGIDEEPLQFRVPGTSASATLTGLTRGATYNIIVEAIKDQKRHKVREEVVTVGNSVNEGLNQPKDNSCFDPYTVSHYAIGEEWERLSDSGFKLSCQCLGFGSGHFRCDSSKWCHDNGVNYKIGEKWDRQGENGQMMSCTCLGNGKGEFKCDPHEATCYDDGKTYHVGEQWQKEYLGAICSCTCFGGQRGWRCDNCRRPGAEAGPDGSTGHSYNQYSQRYHQRINSNVNCPIECFMPLDVQADRDDSRE	161790	208207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_161850_162994_163268_165210_165478_169683_169779_171433_171603_172036_172124_175867_176060_178755_178939_181724_181815_183098_183369_184453_184571_185654_185820_186360_186517_187216_187331_188661_188932_190082_190271_191895_191984_192872_193050_194185_194276_194534_194715_195878_195969_196933_197401_198353_198493_200746_200912_203224_203351_203881_203989_206780_206892_207438
905565	contig_5954_pilon	+	2751	14	Intergenic	novelGene_28510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_13	660.49207942431	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	383	1864	438796	443539	FALSE	5	CTGGGTCTGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMGKSVPGKYACGLWGLSPASRKRYDATAAYGHDAAAAAASQWAAAAPSLWSSSPMATAAAAASATSSAQQQYGFQHPLAMAAKYDDYHHERWHRVHPAMATAAGGCRSFSRSPSDARQPHYGAPAPRGPAASAARCPSPSAASATWFRRHDDPSPRRRWPEP	430538	444426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_430606_432408_432538_435590_435668_438686_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441487_441740_441801_441925_442106_442858_443064_443503
905566	contig_13901_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_146672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCACACACATCTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280739	278277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_278300_280700
905567	contig_709_pilon	-	2242	5	Intergenic	novelGene_57584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	169.237074838819	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	419	739	2213607	2212176	FALSE	15	TGTCCATGATGTCTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRHRAPSVGRGGGAGAGGGAAAARFYTRWKDWESWYSQSFGLHFSLREEQWQEDWAFILSLASQPGASLEQTHIFVLAHILRRPIIVYGVKYYKSFRGETLGYTRFQGVYLPLLWEQSFCWKSPIALGYTRGHFSALVAMENDGYGNRGAGANLNTDDDVTITFLPLVDSERKLLHVHFLSAQELGTEEQREKLLKEWLDCCVTEGGVLVAMQRSSRRRNHPPGHTDGREMARPLPTDPALHIPV	2265165	2210672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2212362_2213472_2213703_2213866_2213997_2215315_2215437_2265093
905568	contig_12528_pilon	+	3327	1	Intergenic	novelGene_81302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTTAGTCCAAAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926295	929622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_926300_929600
905569	contig_5686_pilon	+	1208	1	Intergenic	novelGene_45333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTCACATGAGGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110886	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_110900_112100
905570	contig_2646_pilon	+	4232	25	Intergenic	novelGene_69687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_24	37.2196931147418	560	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1188	3567	145	3711	2336145	2392453	FALSE	15	TTTTGTATAACTCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAESNLQYSLLLVLGLFLTEIIRSWSLALTWALNYRTGVRLRGAILTMAFKKILKLKNIKEKSLGELINICSNDGQRMFEAAAVCSLLAGGPVVAILGMIYNVIILGPTGFLGSAVFILFYPAMMFASRFTAYFRRKCVAATDDRVQKMNEVLTYIKFIKMYAWVKAFSQSVQKIREEERRILEKAGYFQSITVGVAPIVVVIASVVTFSVHMTLGFDLTAAQAFTVVTVFNSMTFALKVTPFSVKSLSEASVAIDRFKSLFLMEEVHMIKRKPAGPHIKIEMKNATLAWDSSHSSILNSPKLPPRTKKDKRAARGKRDKERQPRRVEHQAALAEQKGHLLLDSDERPSPEEEEGRHIHLGHLRLQRTLYNIDLDVEEGKLVGICGSVGSGKTSLISAILGQMTLLEGSIAVSGTFAYVAQQAWILNATLRDNILFGKEFDEERYNAVLNSCCLRPDLAILPNSDLTEIGERGTTLSGGQRQRISLARALYSDRNIYILDDPLSALDAHVGNHIFNSAIRKHLKSKTVLFVTHQLQYLVDCDEVIFMKDGCITERGSHEELMNLNGDYATIFNNLLLGETPPVEINSKKETSGSQKKPQDKGPKTGSVKKEKAVKPEEGQLVQVEEKGQGSVPWSVYGVYIQAAGGPLAFLVIMILFMLNVGSTAFSTWWLSYWIKQGSGNTTVTRGNRTVVSDSMKDNPFMQYYASIYALSMAVILFLKAVRGVVFVKGTLRASSRLHDELFRRILRSPMKFFDTTPTGRILNRFSKDMDEVDVRLPFQAEMFIQNVILVFFCLGMIAGIFPWFLVAVGPLVILFTVLHVVSRVLIRELKRLDNITQSPFLSHITSSIQGLATIHAYNKGQEFLHRYQELLDNNQAPFFLFTCAMRWLAVRLDLISIALITTTGLMIVLMHGRIPPAYAGLAISYAVQLTGLFQFTVRLASETEARFTSVERINHYIKTLSLEAPARIKNKAPSPDWPQQGEVTFENAEMRYRENLPLVLKKVSFTIKPKEKIGIVGRTGSGKSSLGMALFRLVELSGGCIKIDGVRISDIGLADLRSKLSIIPQEPVLFGGTVRSNLDPFNQYTEDQIWDALERTHMKECIAQLPLKLESEVMENGENFSVGERQLLCVARALLRHCKILILDEATAAMDTETDLLIQETNTPSGAGARADKDRAEHHEFSGPLLSVLCHFTVRQRAVGKAPDPSLLSPLGMSSTKMFLGDGAPSLPSFCCRF	2336000	2392974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2336202_2336353_2336528_2337666_2337815_2341167_2341317_2342053_2342162_2347129_2347487_2349544_2349617_2351723_2351849_2351969_2352043_2353625_2353830_2354713_2354858_2357521_2357625_2360466_2360652_2361053_2361201_2361415_2361546_2367733_2367888_2367976_2368106_2369902_2370090_2372472_2372563_2374633_2374824_2378534_2378695_2387446_2387526_2389129_2389244_2389979_2390047_2392232
905571	contig_16541_pilon	+	2836	1	Intergenic	novelGene_126739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	245	738	48	785	322833	323570	NA	85	CAAAAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGKDSLFNKWCWQNWMYICEKVKTGPIPHTVHKNEFKMDQRPKYKTKNCKDHRRKNRVNSRGPNTWVNRIQIITKNTQTPEDKLDNQDLLKIKHLCSSEDFTKRVKRELTDWEKIFGYDKSDIGLISVIHRKIQHLYDKKTNNLIKKWAKDMNRHFTKEDIQVANRYMRECSQSLAIREMQIKITMRYHLNPTLLAQIKKKTENNKCWRGCRETGTLLHYWWEHKMVQPFWKAVWHFLKKLEIEMSMIQESHSSEYTPEK	322785	325621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_322800_325600
905572	scaffold_15568_pilon	-	2324	5	Intergenic	novelGene_122568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_4	38.5681215513538	238	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	256	765	13415	11943	FALSE	25	GGTATGTAGGTAGGTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVSVSAHPVPSLQVAILICHVQRFYPKGAQITWLKRNHSFKTCEALAPTTNTDGTFSQDDHLLVKTSEQEDKRPFTCQVWHSAQPPVEASMQLSELKDKEQTSLGPRASSSLYEMLLLLCWKLLPLTMLSALYVVKRTLSSRKTGLGWGTTMTPIAVTPASPASAAF	31754	10383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_12022_12424_12537_13096_13418_16719_16796_31577
905574	contig_11338_pilon	+	2626	1	Intergenic	novelGene_6397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	119	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGGTCAGACTTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310367	312993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_310400_313000
905575	contig_16496_pilon	-	2042	2	Intergenic	novelGene_5181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1676_3228
905576	contig_11720_pilon	-	3610	6	Intergenic	novelGene_43856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACATCCCACAAGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98631	80272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_82282_86224_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
905577	contig_19812_pilon	-	2105	19	Intergenic	novelGene_100985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	99.3753484348267	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	62	1969	46806	15879	FALSE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48260	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_46710_46843_48235
905578	contig_14687_pilon	-	1741	5	Intergenic	novelGene_107887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	873	1205	405569	405237	TRUE	5	ACTTCCTCCTCCGGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAFPVFVANFCQVEEAVGVSECGGKLHNSDFSTKSASTSSSFSIGPFRSLAFSAFSCLFSFLNLSFSATRNSTCLFRSAILVACSSIIVLSSLGALLPMHGSVGSLFC	406441	375523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_375705_391199_391283_403748_403791_404953_405169_405221
905579	contig_3018_pilon	+	3374	3	Intergenic	novelGene_78885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAAAGGATGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568308	573685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_570088_570203_570434_572320
905580	contig_10042_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_79120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41800	43739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_41800_43700
905581	contig_5434_pilon	+	2825	3	Intergenic	novelGene_74656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAGGAAAAAATTTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256518	259852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_257645_257861_258802_259093
905582	contig_11427_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_78962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATAAATGAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67967	69157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_68000_69200
905583	contig_7909_pilon	-	3804	1	Intergenic	novelGene_155948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3387	3704	1067079	1066762	NA	50	TCTTCTGGCAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFHAIFTTEKRVFEEPAKELQVTQGCGCLPSEVLVNFTQQMTAGGGGCSPHWTNSYTFSSRVCSLCALPDRTAGPGSSNVSSTVMKDVSLFLHIDTLCRSIFE	1070465	1066661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1066700_1070500
905584	contig_16121_pilon	-	3202	2	Intergenic	novelGene_6848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTCAGCTCTCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60833	33596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_33706_57740
905585	contig_9752_pilon	+	5673	6	Intergenic	novelGene_122019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	545.736200008759	456	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	10	621	124393	192723	FALSE	60	AGGAAGAAGCAAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTMAAAVAAAAASSEAPAATATAKPEAGDEDSRDVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPNKMRDCFCTVNLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGIETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITDNGTVCQQLVVHIKACHGLPLINGQSCDPYATVSLVGPSR	124383	197775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_124523_153344_153463_158602_158707_165525_165621_177497_177575_192635
905586	contig_5649_pilon	-	1435	6	Intergenic	novelGene_82296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTTAAAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157927	152339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_153052_153445_153577_154086_154327_156609_156730_157503_157628_157819
905587	contig_11316_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_122593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	884	1396	137674	138186	NA	25	CCGTTGTTTTTCAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136790	139346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_136800_139300
905588	contig_1172_pilon	+	3544	1	Intergenic	novelGene_162030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	606	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1481	1792	607214	607525	NA	35	GTTAATTAAGGCTTAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIITARETGRCLCCLGAWPPRRKREGRGEVDTGWAEPLPLPPAPTLCTLLPADVCPWPWARSGHTEVAAPAGAPPVYTVHRLSHIPSSSVVRSSPVKSGLCL	605733	609277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_605700_609300
905589	contig_4924_pilon	-	8491	1	Intergenic	novelGene_84773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	538	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAATGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251760	243269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_243300_251800
905590	contig_8491_pilon	+	2902	7	Intergenic	novelGene_154215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	32	junction_1	106.544200530421	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	135	755	264406	294819	FALSE	50	GTGAATATATACATACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAPSRLLYLLSRGSSGRPVPGTTKAGKTEPEPQGLLAAGRGESSMETGERARLIIILVLQLVLRVRRNRQQRCRRVLCRSPLFPRTRCHLNLRKIALEGANVIYKRDVGKVLMKLRKPRITATIWSSGKIICTGATSEEEAKFGARRLARSLQKLGFQVIFTDFKVVNVLAVCNMPFEIRLPEFTKNNRPHASYEPELHPAVCYRIKSLRATLQIFSTGSITVTGPNVKAVATAVEQIYPFVFESRKEIL	264271	296966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8491_pilon_+_264528_288127_288201_290189_290273_290436_290501_291970_292075_292172_292268_294739
905591	contig_5532_pilon	+	3551	1	Intergenic	novelGene_175864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCTCACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40440	43991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_+_40400_44000
905592	contig_13244_pilon	-	2774	2	Intergenic	novelGene_86982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCTACCTGTGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377526	374577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_376605_376779
905593	contig_14970_pilon	-	1529	6	Intergenic	novelGene_45112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	137.833232567476	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	222	1004	291083	264487	FALSE	25	GCAAGCCCCTGTCTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERVPHRSRLCRHPQHLPRSSSSVPLPRPPLTLSRPSQLTLVPSGTLPLGIACLICGKIIAIKDLEVVARQLGMYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315750	263961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_315615
905594	contig_3081_pilon	+	4761	25	Intergenic	novelGene_133911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	119.900646080643	916	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	882	2649	646	3294	201705	252540	FALSE	5	TTCTGTGGCTGATTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLLCMNNDFPPRAHCLVRWYGLREFVVIAPAANSDAVLSESKCSLLLSSVSIALGNTGCQVPLFVQIHHKWRRMYVGECQGPGVRTDFEMVHLRKVPNQYTHLSGLLDIFKSKIGCPLTPLPPVSIAIRFTYVLQDWQQYFWPQQPPDIDALVGGEVGGLEFGKLPFGACEDPISELHLATTWPHLTEGIIVDNDVYSDLDPIQAPHWSVRVRKADNPQCLLGDFVSEFFKICRRKESTDEILGRSTFEEEGREITDITHALSKLTEPAPVPIHKLSVSNMVHTAKKKIQKHRGGEESPLNNDVLNTVLLFLFPDAASEKPLDAAASTDNNNPPSESEEYNLYNQFKSAPSDSLTYKLALCLCMINFYHGGLKGVAHLWQEFVLEMRFRWENNFLIPGLASGPPDLRCCLLHQKLQMLNCCIERKKARDDGKKTSTSDNMTNTYPGNAGKARDQLGSDNPKDTDKEKGEVGKSWDSWSDSEEEFFECLSDTEELKGNGQESGKKGGPKEMVNLKPEGRLLQHGKLTLLHNGEPLYIPVTQEPAPMTEDLLEEQSEVLAKLGTSAEGAHLRARMQSACLLSDMESFKAANPGCFLEDFVRWYSPRDYIEEEVIDEKGNVVLKGELSARMKIPSNMWVEAWETAKPIPARRQRRLFDDTREAEKVLHYLAVQKPADLARHLLPCVIHAAVLKVKEEESLENISSVKKIIKQIISHSSKVLHFPNPEDKKLEEIILQITIVEATIARARSLKAKFGTEKCEQEEEREDLERFVSCLLEQPEVLVVGAGQGHAGRIVHKLFVNAQRAATMAPPEEDLKRMGSPEERRQNSSSDFPPPAGRELILRTTVPRPAPYSKALPQRMYSVLTKEDFRLAGAFSSDTSFF	158601	254007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_158642_158754_158811_163708_163785_193875_194009_195392_195716_201687_201767_207583_207704_208765_208932_214282_214383_216969_217052_217354_217424_218870_218945_221102_221196_221656_221827_223756_223847_224713_224887_225584_225640_225871_226244_236013_236152_239888_240117_246409_246507_246603_246708_246840_246957_248590_248694_252303
905595	contig_6873_pilon	+	1616	4	Intergenic	novelGene_129839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGCCGGGGCCGCTGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696786	800251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_697648_699960_700091_785971_786518_800172
905596	contig_7543_pilon	-	3666	1	Intergenic	novelGene_176508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	358	1407	263358	262309	NA	50	TGATAAAAACTCTCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDFPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	263715	260049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7543_pilon_-_260000_263700
905597	contig_14970_pilon	-	2069	4	Intergenic	novelGene_45140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	88.2433503947402	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	354	701	291083	285608	FALSE	30	AAGCTATTTTTACCATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVR	315751	284239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_285807_290934_291170_311919_312047_315611
905598	contig_804_pilon	+	4447	4	Intergenic	novelGene_138785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGATTTTCAGCATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101905	151701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_+_102749_120349_120484_126009_127868_150089
905599	contig_12915_pilon	-	4106	2	Intergenic	novelGene_148342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3270	3704	68772	68338	FALSE	30	GATAACACAAGCTTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEDRRNTQSLYQKELVDVQPFQEVAYDQELMVLKEEVKAALKALAKNKPPGTDGIPIEMFQQTVAALEALTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPTKNDPTECRNYQAVSLVSHMSKILLKIIQKGLQQYIDRELQEI	72106	67935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_69718_69782
905600	contig_6217_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_109647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCAGCTCTCTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720044	717821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_717800_720000
905601	contig_10861_pilon	+	4807	5	Intergenic	novelGene_39307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_2	117.000801279307	181	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	3580	4356	1447236	1454668	FALSE	65	ACAGAATATAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFVLIISCLLRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1443656	1455119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
905602	contig_405_pilon	+	5243	15	Intergenic	novelGene_135331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	424	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTGAATTACCTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604606	632026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_607880_608717_608879_611871_612059_613938_614048_615405_615479_616338_616435_619250_619374_620528_620612_621436_621689_623544_623737_624542_624652_626649_626870_627541_627708_628808_628955_631973
905603	contig_9400_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_146596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTGTAATTCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138939	140986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_+_140458_140724
905604	contig_3077_pilon	+	1601	9	Intergenic	novelGene_26668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3604.78046965068	2	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	57	806	9676	16169	TRUE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVVIPPRTTLWGTC	9619	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15266_16134_16328_17449
905605	contig_15449_pilon	+	419	3	Intergenic	novelGene_33559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	27	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTGATTAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11178	16044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_14474_14552_15759
905606	contig_20719_pilon	-	3250	1	Intergenic	novelGene_140581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	242	553	201405	201094	NA	45	ACAGGCTGACTAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRTENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKFLDSTSQTKV	201646	198396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_198400_201600
905607	contig_2093_pilon	-	5332	32	Intergenic	novelGene_152950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	122.625017435859	368	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1149	3450	216	3665	1066232	968082	FALSE	65	GATGTGAAAGAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNEEYFRGQEFKDHVRPLKGNNDILSITQPDIIYRIHKEYLQAGADIIETNTFSSTSVAQADYGLEHLAYRMNKCSAALAKKAAEEVTFHTGVKRFVAGALGPTNKTLSVSPSVERPDYRNITFDELVEAYQEQAKGLLDGGVDILLIETIFDTANAKAALFALQTLFEEKYAPRPIFISGTIVDKSGRTLSGQTSEAFVISVSHADPLCIGLNCALGATEMRPFIETIGKCTTAYVLCYPNAGLPNTFGDYDESPHMMAVNIKDFAVDGLVNIVGGCCGTTPDHIREIAEAVKNCKPRVPPATVFEGHMLLSGLEPFRIGAYTNFVNIGERCNVAGSRKFAKLIMAGNYEEALSVAKVQVEMGAQVLDINMDEGMLDGPSAMTRFCNFIASEPDIAKVPLCIDSSNFAVIEAGLKCCQGKCIVNSISLKEGEDDFLEKASKIKKYGAAVVVMAFDEEGQATEIDTKIKVCTRAYHLLVKKLGFNPYDIIFDPNILTIGTGMEEHNLYAVNFIYATKVIKETLPGAKISGGLSNLSFSFRGMEAIREAMHGVFLYHAIKFGMDMGIVNAGNLPVYDDIHKELLQLCEDLIWNKDPEATEKLLRYAQTHGKGGKKVIQTDEWRNGPIEERLEYALVKGIEKHIIEDTEEARLNQDKYPRPLNIIEGPLMNGMKVVGDLFGAGKMFLPQVIKSARVMKKAVGHLIPFMEKEREETRGLTGAVEEEDPYHGTIVLATVKGDVHDIGKNIVGVVLGCNNFRVIDLGVMTPCDKILKAALDHKADIIGLSGLITPSLDEMIFVAKEMERLAIKIPLLIGGATTSRTHTAVKIAPRYSAPVIHVLDASKSVVVCSQLLDENLKDEYFEEIMEEYEDIRQDHYESLKERRYLTLSQARKNGLHIDWLSEPHPAKPTFLGTRVFEDYDLQKLVDYIDWKPFFDVWQLRGKYPNRGFPKIFNDKTVGEEAKKVYGDAQNMLKALISQKKLQARGVVGFWPAQSVQDDIHVYAADAVPQAAEPIATFYGLRQQAEKDSASTDPHYCLSDFIAPLESGIRDYLGLFAVACFGVEKLSRAYEEECDDYSSIMVKALGDRLAEAFAEELHERVRKELWAYCGSEHLDMAGLRSLRYEGIRPAPGYPSQPDHTEKLTMWRLADIEPSTGIRLTESLAMAPASAVSGLYFSNLKSKYFAVGKISKDQVEDYALRKNMSVAEVEKWLGPILGYDTD	1078108	966414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_968169_968594_968708_970417_970611_971417_971619_973447_973645_976320_976477_979213_979290_980309_980409_984811_984894_990363_990485_991071_991140_999935_1000037_1001320_1001429_1002328_1002482_1003557_1003648_1010248_1010390_1010903_1011021_1012293_1012474_1027537_1027724_1030598_1030740_1038075_1038189_1041042_1041123_1042685_1042754_1043869_1043932_1045034_1045136_1056275_1056371_1057706_1057767_1061741_1061849_1063801_1063895_1066171_1066242_1067631_1067722_1077992
905608	contig_12793_pilon	-	2786	10	Intergenic	novelGene_164111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_9	116.224877811174	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	32	1324	256471	134019	FALSE	40	AAATAAAGTCTTCACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDGNALQVPLRQKQRKKTQGFFTMSRRRVSCKDLGHADCQGWLYKKKEKGTFLSNKWKKFWVVLKESSLYWYSNQMAEKADGFVNLSDFTVERASECKKKHAFKISHPEIKTFYFAAENLQEMNVWLNKLGLAVIHQASTAKDEECYSESDQEDPEGAVETPPPPSSSETLAASAARQASSSSSKLSEASCSFSSLENARKMSSNVSSSSSKEMQSWLDIVNSSSAAEDAGQSITFAVRGHSPLPSEANSRKVQEDATSESGFLNSLSSDDTSSLSSNLDHLTVPDKPTGSKTPEREEIKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIRTLNSTLKCKEHDLAVINQLLDDPKLTARKYREWKVLNTLLIQDIHQQQRAMPAPESNPQELEKQPPSAYVESSI	256502	132556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_134223_149112_149307_178540_178908_190430_190520_191880_191940_207042_207115_208603_208678_238094_238265_238907_238948_256447
905609	contig_10958_pilon	+	1829	2	Intergenic	novelGene_5470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895279	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
905610	contig_17144_pilon	-	3222	14	Intergenic	novelGene_29172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1973.50656290932	47	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	255	1889	174965	166631	FALSE	40	TACACCGAGGCCCAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWHQ	176192	165297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166640_167269_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
905611	contig_7119_pilon	+	3470	5	Intergenic	novelGene_41024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_4	69.3433486356118	282	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1711	2583	225143	228989	FALSE	25	TGTAAGTCAAATCCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTPPAKQKAKAASLKRDMAKVPHDSSKDSITVFVSNLPYSMEEPDVKLRPLFETCGDVAEIRPIFSNRGDFRGYCYVEFKDEKSALQALELDRKNVEGRPMFVSPCVDKSKNPDFKVFRYSTALEKHKLFISGLPFSCTKEELEEICKAHGTVKDLRLVTNRAGKPKGLAYVEYENESQASQAVMKMDGMTIKENVIRVAISNPPQRKVPEKPEARKAPGGPMVPRQIYGARGKGRTQLSLLPRALQRPSTAAPQTENGPAPRPAVATSAATEAPKMSNADFAKLLLRK	221889	229876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_223495_225037_225494_226228_226382_227308_227500_228811
905612	contig_6031_pilon	-	2685	2	Intergenic	novelGene_56757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2508	junction_1	0	281	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	107	475	257696	256672	FALSE	10	GTTGCCCTGATGACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQVRRPPALCPF	257802	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_256814_257469
905613	contig_5039_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_64783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAACTGCAGCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139826	137872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_137900_139800
905614	contig_11816_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_98600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTAATTTTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431626	1433800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1431600_1433800
905615	contig_17796_pilon	+	2318	11	Intergenic	novelGene_33785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_10	355.489310669111	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	386	1552	53527	110627	FALSE	55	AAAAAAAAAAACTGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGERRIKINSPRLIPTRQRPDKPPLSAIIIVTSCPSHSTFSWVQ	53141	111393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_110496
905616	contig_3382_pilon	+	1558	6	Intergenic	novelGene_124178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	256.708706513823	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	491	535	958824	962601	TRUE	45	TCAAAAAACAAAGCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTHGEDRGGLL	958333	978310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_958837_962569_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_977701
905617	contig_4402_pilon	-	1484	4	Intergenic	novelGene_140867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	282.40672009631	37	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	761	1117	624811	617078	FALSE	20	TGTATATTTTGCCATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAVCKNTISQFFYTLFLPL	625841	616710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_617169_619559_619660_624645_625165_625434
905618	contig_12078_pilon	-	3352	22	Intergenic	novelGene_74106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	258.942827193769	19	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	274	1494	786304	741528	TRUE	60	GGGGAAGAAAAACCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLKNSKHECTLSSQEYVHELRSGISDEKLLNCLESLRVSLTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDVLEKLLDKKQQEHIDKKNQYKLIQCLKAFMNNKFGLQRILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIVGEENILDKLLGAITTAAERNNRERFSPIVEGLENHEALQLQVACMQFINALVTSPYELDFRIHLRNEFLRSGLKRMLPDLKEKENDELDIQLKVFDENKEDDLTELSHRLNDIRAEMDDMNEVYHLLYNMLKDTAAENYLLSILQHFLLIRNDYYVRPQYYKIIEECVSQIVLHCSGMDPDFKYRQRLDIDFTHLIDSCVNKAKVEESEQKAVEFSKKFDEEFTARQQAQAELQKREEKIKELETEIQQLRTQGHALSGSSGISVPPPPPLLSVGPPPPPPPPPLPLAGGNPPPPPPPPPLIGMNGIPPPPLSAGPPLPPPLGGVPPLPGAPLDLPFGMKQKKIYKPEVSMKRINWSKRII	818539	243864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_244536_290430_290567_327724_327888_432936_433064_534549_534680_566421_566662_580910_581013_608420_608516_610329_610432_741435_741540_743143_743459_748638_748744_754024_754090_757619_757739_760281_760399_762347_762467_768122_768234_780880_780990_782815_782953_786292_786363_786443_786519_818399
905619	contig_8775_pilon	-	2858	4	Intergenic	novelGene_166830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1814	2200	161488	161102	FALSE	50	TCATAATGAAATGTACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGTWNCTKYESRRIGSLQKWSGTYKDRFLGISELKWTGIRHFELNSHMVYYVRNDRLKRNGITFVLKKEHFKIYPEDQLIRLLFVFTHQLLLPKMKKLKIFTNFCSLKLIKHAINIH	192852	160443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_162548_163239_163517_164644_164863_192593
905620	contig_177_pilon	+	3066	4	Intergenic	novelGene_41789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	131.940222154664	9	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	58	930	385142	393448	TRUE	25	ATCTCTGTGTATACGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQVTELVLRGVMGLGASLQISAACGGPKGVHQEEPHPNQASCLGDVPRGDCFAGLSGSQPHKHLPPFLEKKREDPRSPKAPRSRWEPEEELQQDQSEGAPRPGICLQNSTPSIQGQREGSKGAPKEVIGTEAEGRGGLPGAETQRSVEETHEGEAEWGHVQRLLTSSPRRTIEEVTWGRRQESEVPSIPGGALGPSGPGKRGRLHHREATKTNRSNQRGWERGASRSIPAGCGQEPQTSTPEGQGAGPAPEAAADGTGPGAEGLAEATQQVSGRERPAAGRASAETTGG	385084	401345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_385848_386533_386641_393388_393536_399296
905621	contig_11720_pilon	+	1460	9	Intergenic	novelGene_43803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2779.87682955558	23	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	225	497	68064	86252	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESV	67839	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86247_86419_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
905622	contig_1836_pilon	-	5620	36	Intergenic	novelGene_71037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	14	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCTCCGTTCGTATCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956271	623591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_623741_675424_675527_790990_791154_812783_812858_818777_818855_833372_833446_833755_833869_834579_834762_838180_838268_842084_842247_845694_845856_852944_853072_859240_859404_872897_872987_877329_877501_879518_879661_884151_884323_893135_893220_894949_895022_895653_895725_897903_898112_909608_909759_913369_913536_916908_917131_918516_918661_919026_919110_919945_920182_922381_922517_926526_926628_927403_927548_938572_938658_940483_940698_942381_942545_944469_944608_949744_949852_955380
905623	contig_8552_pilon	+	4378	33	Intergenic	novelGene_80063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	94	junction_10	299.954163164974	415	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	958	2877	356	3232	385286	517971	TRUE	25	CTCATTCATTTCTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDDDYSPPTKRPKSSEPPQPPVTEPANAGKRKVREFNFEKWNARITDLRKQVEELFERKYAQAIKAKGPVTIPYPLFQSHVEDLYVEGLPEGIPFRRPSTYGIPRLERILLAKERIRFVIKKHELLNSTREDLQLDKPASGVKEEWYARITKLRKMVDQLFCKKFAEALGSTEAKAVPYQKFEAHPNDLYVEGLPENIPFRSPSWYGIPRLEKIIQVGNRIKFVIKRPELLTHSTTEVTQPRTNTPVKEDWNVRITKLRKQVEEIFNLKFAQALGLTEAVKVPYPVFESNPEFLYVEGLPEGIPFRSPTWFGIPRLERIVRGSNKIKFVVKKPELVISYLPPGMASKINTKALQSPKRPRSPGSNSKVPEIEVTVEGPNNNSPQTSAVRAPTQTNGSNVPFKPRGREFSFEAWNAKITDLKQKVENLFNEKCGEALGLKQAVKVPFALFESFPEDFYVEGLPEGVPFRRPSTFGIPRLEKILRNKAKIKFIIKKPEMFETAIKESAASSKSPPRKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	354709	519918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167_438225_467628_467740_469380_469447_481397_481582_485140_485200_486302_486375_491808_491993_493179_493239_499102_499175_500085_500270_500893_500953_501354_501430_509984_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512138_512711_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912_517986_518786
905624	contig_6138_pilon	-	4556	1	Intergenic	novelGene_159689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCAGCTTTGGCAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576039	571483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_571500_576000
905625	contig_5236_pilon	-	2091	9	Intergenic	novelGene_100950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	241.410956669328	8	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	59	1189	1011714	1006770	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGCSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011772	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007363_1009468_1009625_1009810_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
905627	contig_14924_pilon	-	2902	2	Intergenic	novelGene_104142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1047	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTATCTATTGCCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161301	6266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_-_8507_160639
905628	contig_10205_pilon	+	2367	13	Intergenic	novelGene_143105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_11	165.429806363102	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	14	1882	190214	207510	FALSE	25	ATTGCCTAGAATTATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTGPMKEINLAPDSTSVVVSGLMVATKYEVSVYALKDSLTSRPAQGVVTTLENVSPPRRARVTDATETTITISWRTKTETITGFQVNAIPANGQTPIQRTIKPDVRSYTITGLQPGTDYKIHLYTLNDNARSSPVIIDASTAIDAPSNLHFLATTPNSLLVSWQPPRARITGYIIKYEKPGSPSREVVPRPRPGVTEATITGLEPGTEYTIYVIALKNNQKSEPLIGRKKTDELPQLVTLPHPNRHGPEILDVPSTVQKTPFITNPGYDNGNGIQLPGTSGQQPSVGQQMIFEEHGFRRTTPPTTATPVRHRPRPYPPNVDEEIQSGHVPRGDVDHPLFPHILGLNPNASTGQEALSQTTISWTPFQESSEYIISCHPVGIDEEPLQFRVPGTSASATLTGLTRGATYNIIVEAIKDQKRHKVREEVVTVGNSVNEGLNQPKDNSCFDPYTVSHYAIGEEWERLSDSGFKLSCQCLGFGSGHFRCDSSKWCHDNGVNYKIGEKWDRQGENGQMMSCTCLGNGKGEFKCDPHEATCYDDGKTYHVGEQWQKEYLGAICSCTCFGGQRGWRCDNCRRPGAEAGPDGSTGHSYNQYSQRYHQRINSNVNCPIECFMPLDVQADRDDSRE	190200	207995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_+_190271_191895_191984_192872_193050_194185_194276_194534_194715_195878_195969_196933_197401_198353_198493_200746_200912_203224_203351_203881_203989_206780_206892_207438
905629	contig_9705_pilon	-	4773	4	Intergenic	novelGene_41737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.6333225737023	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	281	832	311917	294890	FALSE	25	ATGATATGACTTTGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSFERSKTFAPADINKDEEFVEEFNRLKTFANFPSSSPVSASTLARAGFLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYFENNAAQPTNPGAQNGQYKVEKYPGNRNHFVLERPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPEMCSEEARLKSFHNWPEYAHLTPIT	341146	290948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_294898_311373_311949_340660_340787_341023
905630	contig_10323_pilon	-	2722	2	Intergenic	novelGene_123584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	54	1529	460768	459210	FALSE	25	AAGAGCCTGTGATTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDFKMSGSTCLLSLLAICIKSSKSV	460821	458016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_459281_459363
905631	contig_11720_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_44031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	378	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGAAGTACAGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419382	422115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_419400_422100
905632	contig_6870_pilon	+	3592	21	Intergenic	novelGene_103992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	229.223531732674	8	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	45	2021	1488054	1561651	TRUE	55	GGAAAAAGGAGCCAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNCLQPLLLHLLLLWSAVV	1481136	1607968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1493506_1493613_1502310_1502447_1504248_1504495_1521425_1521617_1523634_1523857_1524821_1524943_1525069_1525166_1530739_1530856_1532495_1532662_1533390_1533490_1539714_1539975_1547905_1548033_1561597_1561717_1564394_1564541_1567438_1567569_1593452_1593538_1594461_1594549_1601696_1601852_1607065
905633	contig_848_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_83329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACTCTAAGGACACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498555	496815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_496800_498600
905634	contig_6915_pilon	-	3397	2	Intergenic	novelGene_162409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAGAGTTCCGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183981	178145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_180044_182482
905635	contig_12644_pilon	+	1333	8	Intergenic	novelGene_44497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCAGCGCAAGCGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042906	1151235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1043300_1055955_1056062_1062523_1062658_1063290_1063381_1068354_1068404_1068663_1068754_1123235_1123682_1151210
905636	contig_10345_pilon	+	2436	12	Intergenic	novelGene_158347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	670.221549653422	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	73	882	11670	20524	TRUE	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIGM	4366	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_21648_23046_23170_24084
905637	contig_5479_pilon	+	4355	1	Intergenic	novelGene_133563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATAGGGTAGTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80569	84924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_80600_84900
905638	contig_1244_pilon	-	2666	26	Intergenic	novelGene_37913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGTCTTGGCCGCACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294940	260550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_260597_262584_262723_266551_266690_273685_273779_274110_274278_274466_274583_278843_278916_279127_279240_279445_279593_280415_280608_281617_281774_281915_282066_282242_282295_282949_283060_284463_284515_284677_284757_284856_284969_287074_287169_287420_287498_289999_290085_291702_291778_292444_292503_292551_292619_293411_293470_294001_294078_294795
905639	contig_610_pilon	-	691	3	Intergenic	novelGene_76822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	94.5	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	49	480	343470	335536	FALSE	10	TCCACTTGTGGTACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQSSAVLRQVSLLVDGMGLSPQWSLLLLGLFMGPGASREDSARMVVTGTLGGSVTLPLKWPSGQQVGSVSWTTRSAPVAIASVTLAEAGGPDIFHQAETRYWGRVSVTGQDRSLQISNLSSEDAGSYRAYVNLRRSPVTHTQEYILQVYDIKRDASRDA	343518	335324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_335568_338456_338808_343421
905640	contig_13004_pilon	-	5439	19	Intergenic	novelGene_112603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	108.098206378377	968	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	673	2109	180969	155490	FALSE	10	CTTTCTCTCCCCCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLQLHEGFRPDFHPKNPYSESIKEMLTTFGTATYKVGLKVHPNEEDPRVPIMCWGSCAYTIQSIERILSDEDKPLFGPLPCRLDDCLRSLTRFAAAHWTVASLSVVQGHFCKLFASLVPNENHGDLPCILDIDMFHLLVSLVLAFPALQCQDFSGISLGTGDLHIFHLVTMAHIVQILLTSCTEENGMDQENPTGDEELAVLDLYKTLRQYTGSALKEIPSAWHLWRSVRAGIMPFLKCSALFFHYLNGVPSPSEVQVIGTSHFEHLCSYLSLPKNLICLFQENSEIMNSLIESWCHNNEVKRYLEGERDAVSYPRESNKLIDLPEDYSSLINQASNFSCPKSGGDKSRAPTLCLVCGTLLCSQSYCCQTELEGEDVGACTAHTYSCGSGVGIFLRVRECQVLFLAGKTKGCFYAPPYLDDYGETDQGLRRGNPLHLCAERLKKIQKLWQQHSVTEEIGHAQEANQTLVGIDWQHL	194150	152159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_155632_156913_157016_159230_159402_160412_160491_163609_163667_164374_164484_166783_166915_168886_168978_169605_169742_170998_171067_171517_171615_177777_177834_178102_178252_180919_180999_181673_181778_184510_184679_185557_185642_193357_193558_194063
905641	contig_15371_pilon	-	3245	11	Intergenic	novelGene_151468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	626	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1165	1554	225596	222129	TRUE	75	GAAAAAAAAAAAAAACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLEKELKQLSLHIRGGTLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSTDKRKSLNNQGNTSSGASMKTNAVVSEEEEQTTPWGCSQVHYFSPESENYSQ	231344	204433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_205265_208940_209036_212974_213118_215188_215336_216233_216426_220720_220875_221999_222460_225537_225700_226860_226960_227138_227371_230614
905642	contig_11396_pilon	-	2997	21	Intergenic	novelGene_71253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_3	373.652174488521	331	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2436	15	2450	155228	124543	TRUE	10	GTCAGGGTGGTGACTGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITAAMNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREHWIQDAEECDKAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHSALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENNEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVLGNLAAAQELCEEALKHYEDFPKLWMMKGQIEEQEELVEKAREAYSQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKVGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSG	155242	121360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121631_122169_122297_124392_124548_125485_125578_126107_126242_127268_127446_127615_127736_128716_128856_130392_130515_133875_133999_137866_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144292_146250_146407_146608_146786_147254_147334_147886_148006_153256_153426_155157
905643	contig_19459_pilon	-	899	6	Intergenic	novelGene_59877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4721.72720940124	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	264	569	11335	7003	FALSE	10	TTCCTGTCTTCTTGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15557	6672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7084_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
905644	contig_7695_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_41671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTCACTGGTCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979563	996658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_979677_983512_983666_984015_984090_984182_984247_985916_986124_986757_986866_988045_988173_995503
905645	contig_14666_pilon	+	937	2	Intergenic	novelGene_39624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	84	641	484383	484940	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477321	485236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477389_484366
905646	contig_7045_pilon	-	10641	31	Intergenic	novelGene_77433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_22	43.7906763287955	579	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	826	2481	7141	9621	279183	230622	FALSE	85	AAAAGTAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPVLETSHVFCCPNRVRGSLSWSPGPGGLLAFGTSCSVVLYDPQKRVVITNLNGHTARVNCIQWICKQDGSPSTELVSGGSDNHVIHWEIENNQLLKAVHLQGHEGPVYSVCAVYQRRASDVTLHTLIVSAASDSTVRIWSKKGSEVTCLQTLDFGNGFGLALSLSFLPNTDVPILACGDDDCKIHLFVQKNDQFQKVLFLCGHEDWIRGVEWAIFGRDLFLASCSQDCLIRIWRLYIKSTSLEIQDDDNIRLKENTFTIENESIKIEFAVTLETVLAGHENWVNAVHWQPSFYKDGVLQQPMKLLSASMDKTMILWAPDEESGVWLEQVRVGEVGGNTLGFYDCQFGDNGSMIIAHAFHGALHLWKQNAANPKEWTPEIVISGHFDGVQDLMWDPEGEFIITVGTDQTTRLFAPWKRKDQSQVTWHEIARPQIHGYDLKCLAMIHRFQFVSGADEKVLRVFSAPQNFVENFCTITGQSLNHILCNQESDLPEGATVPALGLSNKAVFQGDITPQPSDEEELLTSTGFEYHQMAFQPSVLTEPPTEDHLLQNTLWPEVQKLYGHGYEIFCVACNNSKTLLASACKAAKKEHAAIILWNTTSWKQVQNLVFHSLTVTQMAFSPNDKFLLAVSRDRTWSLWKRQDTVSPELEPVFSLFAFTNKVTAVHSRIIWSCDWSPDGKYFFTGSRDRKVVVWGECDSSDDSMEHSIGPCSSVLDVGGAVTAVSVCPVLNLSQRYVVAVGLECGRICLYSWKKTDQIPEINDWTRCVETSQSQSHTLAIKKLCWKNYNGRTEQNEAESTEWLHFASCGEDHTVKIYRVNRCAL	307689	229601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_230779_233777_233892_234417_234552_235994_236117_237758_237952_241137_241211_242171_242230_242377_242474_243839_243910_246433_246623_251145_251296_254076_254209_254418_254520_255616_255713_256874_257016_257483_257551_258389_258455_260770_260849_261668_261826_272262_272334_275191_275271_279045_280014_281960_282717_284218_284403_285202_285375_286356_286574_294714_294822_299726_300107_301304_301386_302480_302678_303473
905647	contig_17440_pilon	+	1294	1	Intergenic	novelGene_7543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACCCTTAAAATTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677	1971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_700_2000
905648	contig_8452_pilon	+	2947	1	Intergenic	novelGene_48053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1311	2396	432928	434013	NA	50	GAGAATATAATTAGCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	431617	434564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_431600_434600
905649	contig_7457_pilon	+	3725	12	Intergenic	novelGene_31565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	53.4117020638303	111	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1206	1787	863440	865732	TRUE	15	CCCGCTTTATGGCTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTVDIRAQLLIGAGNSSQGIHMTQRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFS	859215	868012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_859661_859839_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862177_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_865537_866881_867222
905650	contig_15123_pilon	-	1796	5	Intergenic	novelGene_110932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.3277944909683	69	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	1254	1796	320397	318650	FALSE	5	TTTTCCCTTTGTCTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDSEDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDRGNQLTVPETLISDTSAAASRTWSPWPLLGHQAAIESPGPEPTSPSWPVPLPLAARSGLFPTPFNKDTGLIDY	321787	318649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318863_319141_319292_319627_319688_320277_320408_320544
905651	contig_5003_pilon	-	2334	13	Intergenic	novelGene_120185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	71.6288175247924	37	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	34	807	187425	153293	TRUE	30	AGACACCAGTCCCAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCVALAGLEVMAWVPVESAVEELMPRLLPVEPCDLTECFDPSVPPRTPQEYLRRVQLEAAQCPDVVVAQIDPKKLKRRQTVNVSLSGCQPAPEGYSPTLQWQQQQVAQFSAIRQSVNKHRSHWKSQQLDSNVIMPKSEDEDGWKKFCLGERLCSEGIVGPATNESPGIDYVQIGFPPLLSIVSRMNQATVTSVLEYLSNWFGERDFTPELGRWLYALLACLEKPLLPEAHSLIRQLARRCSEVRLLVDSKDDERVPALNLLICLVSS	187458	17383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_17642_17848_17863_147302_148505_153239_153297_165247_165307_167394_167506_170508_170578_173399_173445_175625_175740_182730_182791_183049_183140_186854_186940_187288
905652	contig_10976_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_155578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	438	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCAGCTGGGCTCGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95355	93308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_93300_95400
905653	contig_5586_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_143548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344871	346481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_344900_346500
905654	contig_14176_pilon	-	1396	1	Intergenic	novelGene_74872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTACTGATGTATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506896	505500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_505500_506900
905655	contig_6365_pilon	-	3563	6	Intergenic	novelGene_133993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	111.372528030929	657	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	259	759	12349	11849	TRUE	30	TGGAAGGGAGTGGGAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNEYKKIVLLKGLEEINDYHFNIVKSLLAYDLQLTKKMQEECDRIKIADLMEKKFRGAACVDKLIELFKDIKDLKKDITKKLRRAKLKGNRGTPSLQPTTSLNRALLWSYLIYPFPTLRLSSHNNGETSNVNQFTIYVFPFSVMSIDVFWKVYFGFIKEQKAEKK	17699	1407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_2527_2636_3345_10080_10134_10366_10535_11092_12368_17459
905656	contig_13519_pilon	+	1769	13	Intergenic	novelGene_124619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	359.871736409886	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	166	1719	67598	120612	FALSE	25	ATCCAAGACTTGTACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	56988	120662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
905657	contig_7630_pilon	-	3163	1	Intergenic	novelGene_133643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	562	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTTCTTCCCACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429379	426216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_426200_429400
905658	contig_19342_pilon	+	1367	6	Intergenic	novelGene_41103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.09838667696593	9	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	485	907	4349	5544	TRUE	25	GAACCTTCCAGAATCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGGV	3618	6767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4137_4365_5016_5293_5413_5545_6139_6186_6353
905659	contig_9112_pilon	+	1472	5	Intergenic	novelGene_60217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	467.214618778137	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	211	993	108641	114303	FALSE	90	AACAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108430	114782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_111824_111892_112128_113625_113750_114251
905660	contig_5696_pilon	+	4374	15	Intergenic	novelGene_117547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	765	junction_9	388.581046362064	96	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1401	4206	67	4272	689252	738140	FALSE	45	TTAATAAAATGTGTAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFADTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELDNLPNLQELDISRHFTECLKAQAPTVKSLSQCVSRLPSLIRLHMLSWLLDAEDITLLNAMKERHPQSKYLTFHWKWVLPFSPIIQK	684352	738242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_734430_734596_737775
905661	contig_10973_pilon	+	1618	2	Intergenic	novelGene_150361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATAGTTTTAGCGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	3206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_2168_2221
905662	contig_14505_pilon	+	1727	9	Intergenic	novelGene_171960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGCCGAAATAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12351	61807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14505_pilon_+_12485_13308_13418_13664_13898_30911_31026_36706_36833_37700_37794_45095_45278_46480_46549_61138
905663	contig_9871_pilon	+	2648	7	Intergenic	novelGene_75652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	170.823170429411	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	173	982	391952	419187	FALSE	55	AAGAATTTTAAAGATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATWNEKAVTRRAKVAPAERMSKFLRHFTVVGDDYHTWNINYKKWENEEEEEEEQPPTPASGEEGRADDPTAGPAPAPSPRLEFRATLRKLFSCHRFQVIIICLVILDALLVLAELILDLKIIQPDRNNYAARVFHYMSIAILTFFMMEISFKIFVFRLEFFHHKFEILDAIVVVLSFILDIVLLFREHEFEALGLLILLRLWRVARIVNGIIISVKTRSERQLLRLKQMNIQLAAKIQHLEFSCSEKEQEVERLNKLLRQHGLLGEIN	384837	420853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_384991_391932_391973_408671_408945_413892_413998_416273_416506_418632_418746_419121
905664	scaffold_12124_pilon	-	1396	5	Intergenic	novelGene_22113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	998.020885302507	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	104	955	899419	894491	FALSE	5	CAGTGTGCTTCTCTGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVRIPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGAEREFRGLGDCLVKITKSDGVRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKILKDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDELKKVI	899522	894049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_894649_895139_895185_895229_895281_895908_896396_899308
905665	contig_12864_pilon	+	1883	2	Intergenic	novelGene_76404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1745	junction_1	0	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGTTTCTGGGTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227214	229317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_228946_229165
905666	contig_18804_pilon	-	1554	4	Intergenic	novelGene_163791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.6734686795809	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	1206	1553	9601	7490	FALSE	40	ACTTGGAAAGCAGTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFDFCSTNVINKIILQSEGLREAFSELDMTSEVLQITMSPDKPYFR	12780	7488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_7750_9513_9623_11036_11214_11773
905667	contig_854_pilon	+	5026	27	Intergenic	novelGene_36614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_25	3522.55413424666	104	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1288	3867	1	3867	1692680	1714452	TRUE	30	ACCCCCTTGTCATAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRSLFFFFF	1692679	1715990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714427_1714484_1714862
905668	contig_13607_pilon	+	5332	1	Intergenic	novelGene_170182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219797	225129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_219800_225100
905669	contig_6735_pilon	-	8265	13	Intergenic	novelGene_15819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_12	43.0970319937077	637	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2723	8169	97	8265	634126	596648	FALSE	50	AAAAGGAAATATGATGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRLSGLANVVLHELSGDGTDQDMGPPLDPEIPQESDMEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQLAKNSTEMEEFVRVKQQLKEKEELISTLQTQLSQTQAEQAAQNLRVLQRKLEEREEALSGRAQVVDLLQQELNAAEQRNQVLLQQLQQMEAEQNTLRNTLETERQDSKILMEKMELEVAERKLSFHNLQEEMNHLLEQLEQADQAQAELESQYRSLEQKHKAEMEEKTLHILSLQKTEQELQSSCDTLKDQNSKLLQEKREQSVQSAQAIQQLEDQLHEKSKEISQFLTKSTLQKHETASQTSFPDVSHEGVQAVTEEKIASLQQRVVELENEKGALLLSSMELEVLKAENEKLSSQITLLEAQSRAGKADKEDSQISMVDNTRLNKSNSSTEESGQDVLENTFSQKHRELSVLLLEMKEAQEEIAFLKMQLQGKKTEGDPEDLGQKEVKQMESEGIPPVEMKVLLEDTGQDFPLMSDEESSLPAVKKEEQASNKHQNTTSEEMPFNDTKMELKSTKQDAIDKSPAVIPDISQCQQDELKRLKSQISELEISFHKAEETYEKNLDEKAKEISKLTQLIEEFKKNAENTSNAFTALSEERDQLLSQVKELSIVTELRAQVQQLEANLAEAEKQRRLDYESQTTHHNLLTEQIHSLIIEAKSKDVKIEVLQNELDDMQLQFSEQSTLIKSVQSQLQKKENEVLEGEERLRDMSDKMEELSRALSQKELEIAKLDQLLVEKKKDVETLQQTVKEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSKAEEAKKEHVEEDKEVVSGLKHNYNELSPAGLISKEELQHELDLLKKESEQRKRKLQAALINRKELLQKVSRLEEELAKVRDESRKEVPLNANEKREMEEDKENKEDSEKCVSSKCQEIEIYLKQTISEKEVELEHVRKDLEEKVAAEEQLQATVKQMNQNLQDKTNLIDLLQAQITENQAVIQKLITGNKDAGDGDSAAPVKETVVISPAGAGSGEQWKPKLEEKILDLEKEKEQLQKKLQEVLASRKVILKKAQEKEKHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSKEKENIGDRLRQLQIQVRGSLDRNPPPGIDQEESSSSIQGLEDPVFKAAEQQLDQPVSESPLGPDLPSQHEDANILQSNPYIDQIKAKLKEIESEKEELELKVSSTSSELTKKSDEVFQLQEQINKQVLEIQSLKTAASEAEAHAESLKLTLESNQLEIARLEHLRELQPALDELQRLISKKEEEVSYLSGQLSEKEKIFTKVKTEVIEREDLIKALHMQLEMQAKEHDEKIKQLQVELSEMKQKPEETEKEGKAKLQIQRKLQAALISRKEALKENKDLQEELSLARDSIERLTKSLADVESQVSAQNKEKDIFSQRLALLQEERDKLIAEVDKSLLENQSLNGSCESLKLALEGLTEDKEKLLKEIESLKCSQIAEKTEWQEKHKELQKEYEILLQSYENVSNEAERIQHVVDAVRQEKQELYGKLRSTEANKRETEKQLQEAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEVHPAGDTSKERMDALLSSNSNMKEELESVRMEYKTLSKDFEALMTEKDILSQEVQDLKHQIEDNIFKQASREAIEKQDNQGDIIEEATQSVSDEVKEQDSPSRSTRPEYSESILLENSGKIDPDISENVSSHGEINNYLQEIDQLKETIAELEKEKHKEKEFSQALENEKNTLLNQILSKDGELKILQEEVTQINLLNQQIQEELSRVTKLKETAEEEKDDLEERLMNQLAELNGSIGNYYQDVTDAQIKNEQLESEMQNLKKCVSELEEEKQQLVKEKTMVESEIRKEYLEKIQGAQKEPGSKSHAKELQELLKEKQQEVKQLQKDCIRYQEKISALERTVKALEFVQSESQKELETNKENLAQADELRKKAQAELASFRVLLDDTQSEAARVLADNLKLKKELQSNKELVKSQMKQKDDDLERRLEQAEDKHLKEKKNMQEKLDALRREKAHLEETFGEIQFTLDKKDMEVKQLQENLDSTVAQLAAFSKSMSSLQDDRDRVIDEAKKWERKFSDAIQTKEDEIRLKEENCSVLKDQLRQMSIHMEELKINISRLEHDKQTWESKAQTEVQLQQKVCDTLQGENKELLTQLEETRYLYHNSQNELAKLESELKILRDHSTDLNNSLEKCKENKENLEGIVKQQEADIQNCKFSYEQLEADLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSAKEEAVQVAISELHQQHDKEIKELENQLSQKEEENKKAVDKTSQLMETLNTIKKESTQQKAQLDSFVKSMSSLQDDRDRIVGDYQQLEERHLSVILEKDQLIQDAAAENNKLKEEIRCLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVISIKDCQQKQLLEAQLQQNKELKSEYAKLEEKLKESEEAKENLQRSSNTLQEEKQGLSKEIESLKISISQLKGQVTDLQEEGTLGVFQAQLKVKEEEVQKLSTTLSSSQKRIKELEEELVHVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIMRNETETAEERVAELARDLMEMEQKLLTVTKENKDLTAQIQSFGKSMSSLQNSRDHANEELDEL	645380	596647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_598131_598974_604182_605595_605670_608598_608714_615018_615135_616300_616704_618882_618997_622573_622700_629168_629301_632682_632836_633044_633198_634033_634129_645286
905670	contig_11855_pilon	-	2907	10	Intergenic	novelGene_67012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_9	36.9557626773109	290	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	53	2059	1416353	1410010	FALSE	15	TCTAAGCTGAGCCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQQEIANVVCLHQAGNLMPKAVPRHCQLAGKMSPGIQWDEIRAQQPVDGPPVRIAYMLVVHGRAIRQLKRLLKAVYHEQHFFYIHVDKRSNYLHREVVELAQQYDNVRVTPWRMVTIWGGASLLRMYLRSMRDLLEVPGWAWDFFINLSATDYPTRTNEELVAFLSKNRDKNFLKSHGRDNSRFIKKQGLDRLFHECDSHMWRLGERQIPAGIVVDGGSDWFVLTRSFVEYVVYTDDPLVAQLRQFYMYTLLPAESFFHTVLENSPACESLIDNNLRVTNWNRKLGCKCQYKHIVDWCGCSPNDFKPSDFLRLQQVSRPTFFARKFESTVNQEVLEILDFHLYGSYPPGTPALKAYWENTYDVADGPSGLSDILLTAYTAFARLSLRHAATAAPPPATALCRFEPRGLPSSVHLYFYDDHFQGYLVTQAVQPSAQGPAETLEMWVMPQGLLKLVGRSDQASRLQSLEVGTDWDPKERLFRNFGGLMGPLDEPVAMQRWARGPNLTATVVWIDPTYVVATSYDITVDAETEVTQYKPPLSRPLRPGAWTVRLLQFWEPLGETRFLVLPLTFNRKLPLRKDDASWLHAGPPHNEYMEQSFQGLSSILNLPQPEPAEEAARRHAELTGPALEAWTDGELSGFWSVAGLCATGPSTCPTLEPCRLTSWSSLSPDPKSELGPIKADGRLR	1416405	1409161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1410333_1411893_1412228_1412845_1413042_1413315_1413579_1413910_1414088_1414178_1414396_1414606_1414688_1415376_1415580_1415862_1416039_1416316
905671	contig_13612_pilon	+	1876	9	Intergenic	novelGene_157297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	130.827116359721	2	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	149	961	51083	55134	TRUE	40	GAAAGAGACATCAGCACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLAAHWKLRPQL	50044	57486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53707_55102_55301_56237_56382_56881
905672	contig_10299_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_79747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1921	2238	469520	469837	NA	30	TCCTACTAAAGGTATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKAERAIIKTLTLQLEQVEREQQKKPMGTRRKEITKIRAEISEIENRKTFERVNKTKSWFFEKINKIDKPLAKLTKEKQERKQITHTEMRWVILKQTQLKLKES	467599	470081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_467600_470100
905673	SIRV3	+	1544	3	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	2709	-17	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	46	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTGGCATTTGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6712	8920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_8002_8117_8208_8755
905674	contig_4486_pilon	+	2666	14	Intergenic	novelGene_38574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1562.43411979457	2	74	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	614	1183	375590	391240	TRUE	35	AATAGAGTGTGAGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEGKVFFSE	311765	413475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_332818_332987_342989_343093_360535_360643_375403_375593_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391284_399319_399433_407559_407696_411177_411318_412424
905675	contig_10003_pilon	-	3186	6	Intergenic	novelGene_88213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_5	113.244867433363	16	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	366	692	626149	531504	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQESGTETKSNGSALQNGSSSGNHLLECGGLREGRSNGETPAVDVGAADLAHIQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPILFFK	967529	529009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_531657_625975_626164_750293_750355_806943_807043_967247_967378_967468
905676	contig_1521_pilon	-	1141	4	Intergenic	novelGene_145440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_2	99.3523471735262	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	21	1139	191760	160443	FALSE	25	TAAGGTTTCTGACACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVSPEMIRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRTSKSNQSKKKGPRTPSPPPPIQEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKPRDGKDRGRDFERQREKREKPRSASPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQRTITPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREETKGKRDREKDTREERDYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDTRDARDRRELRDSRDMRDSRDMRDYSRDSKDSRDPRDSRSTRDAHDYRDRESRDAHRKEETYQEESRSYGRNHLREESSRAEVRSDSRNESRSEIRNDRMGRSRGRGPELPEK	191780	160440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669_163981_179059_179258_191614
905677	contig_11281_pilon	+	3674	4	Intergenic	novelGene_125466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAACCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843006	850903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_844697_846305_846455_847246_847401_849222
905678	contig_9272_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_125898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGGACATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256436	258207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_256400_258200
905679	contig_6199_pilon	+	4980	3	Intergenic	novelGene_126351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	304	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	577	930	94497	94850	TRUE	35	AACAAAGCCTCTGATGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKWAHIGLCRGKRHSKSIDPLCLCLGKGAVPILSSWLSGASRLFFPVKLSPRQGQENGSGRRTGPTSGLGDSAIAEVCPGPSAEWGRAGKWERGSSQRGCFLIHAVGQTQVLIFC	93365	101360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_93818_94372_97273_99732
905680	contig_6795_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_27704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAAGAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125764	123742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_123700_125800
905681	contig_12528_pilon	-	1400	8	Intergenic	novelGene_81329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	549.673520912038	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	507	983	966228	933323	FALSE	40	TATCAACTTGAAAGTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968117	932905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956217_964909_964971_966191_966274_967656
905682	contig_15182_pilon	-	3020	10	Intergenic	novelGene_136438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_6	88.9824507597418	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	167	1663	653509	248774	FALSE	50	AAAAAAAAAGTTTGCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAMRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPRASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRYHPQETLKEFVQLVCPDAGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSAEGGAASPTSPILVPGIKVAASHHPPDRPPDPFSTL	653675	247416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_248851_306829_306996_309310_309490_332396_332526_359304_359433_367659_367778_387446_387522_450766_450833_647577_648110_653482
905683	contig_4782_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_73676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCTAAAGGACAATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606214	604487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_604500_606200
905684	contig_16930_pilon	-	6651	2	Intergenic	novelGene_139146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	538	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67517	57534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_60950_64281
905685	contig_10674_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_6425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	26.5	223	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAGGTATAATAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198414	188193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_190182_196461_196578_198366
905686	contig_12391_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_103615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCCTAAGACAAAAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108072	106563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_106600_108100
905687	contig_6088_pilon	+	4927	40	Intergenic	novelGene_161267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.071935623166	311	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1428	4284	642	4925	169138	249457	FALSE	30	CTCAGAGAGTGGAGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKRILGHLSSVYCVAFDRSGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHSAEISDMAVNYENTLIAAGSCDKVVRVWCLRTCAPVAVLQGHSASITSIQFCPSTKGTTRYLTSTGADGTICFWQWHVKTMKFRDRPVKFTERSRPGVQISCSSFSSGGMFITTGSTDHVIRIYYLGSEIPEKIAELESHTDKVVAVQFCNNGDSLRFVSGSRDGTARIWQYQQQEWKSIVLDMATKITGSNLPSGEDKVSKLKVTMVAWDRYDTTVITAVNNFLLKVWNSITGQLLHTLSGHDDEVFVLEAHPFDQRIILSAGHDGNIFIWDLDRGTKIRNYFNMIEGQGHGAVFDCKFSPDGNHFACTDSHGHLLLFGFGCSKYYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPTKFQRLVPGRENCKDEQLIPQLGYVANGDGEVVEQVIGQQTSDQDESILDGIIRELQREQDLRLINEGDVPHFPVNRSYSVNGALRSPNMDIHSSPNIGLRRSGQIEGVRQMHNNAPRSQMATERDLVAWSRRVVVNELNHGVSRVQEECRTAKGDIEIGLYTVEKKKKPSYTTQRNDYQPSYGRSLRRTQRRRQHTYQTRSNIEHNSQASCQNSGVQEDSDSSSEEDETVGTSDASVEDPVIEWHSESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQATRKICSSSEEENLKPLEERQKKPKQTRKKKGRLVSMTGELNEEWFAPQWILDTIPRRSPFVPQMGDELIYFRQGHEAYVRAVRKSKIYSVNLQKQPWNKMDLREQEFVKIVGIKYEVGPPTLCCLKLAFLDPISGKMTGESFSIKYHDMPDVIDFLVLHQFYNEAKERNWQIGDRFRSIIDDAWWFGTVESQQPFQPEYPDSSFQCYSVHWDNNEREKMSPWDMEPIPEGTAFPDEVGAGVPVSQEELTALLYKPQEGEWGAHSRDEECERVIQGINHLLSLDFASPFAVPVDLSAYPLYCTVVAYPTDLNTIRRRLENRFYRRISALMWEVRYIEHNARTFNEPDSPIVKAAKIVTDVLLRFIGDQSCADILDTYNKIKAEELNSTDVEEDTETVDLDSDGPGTSSGRRVKCRGRRQSLKSNPDAWKKQCEELLSLIYEREDSEPFRQPADHLSYPGHQEQEGESSESFVPERQQDPFISEDYQDVIDTPVDFSTVKENLGTGNYASPLEFYKDVRQIFSNCKAYTSNKKSRIYSMTLRLSALFESHIKNIISEYKSAIQSQKRRRPRYRKRLRSSSSSLSSSRAPSPKGKQKQMKLQPKNDQNTSMSYARTSSPFSSPVSDTAEGLSLYLLDDEVDGPFSSSSLIACSRSGNSHDPGKAKSFRNRVLPVKQDHPVDGPLTNGDGSRTGIKRKLLIASEEDESMGGEEKEKKETKEKSHSS	113469	249459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_113682_114081_114118_114521_114582_125989_126141_127919_128019_169054_169216_170536_170759_175407_175509_176007_176079_176691_176793_178989_179031_179694_179800_181039_181194_194332_194468_195521_195651_196588_196815_199130_199299_205700_205885_208469_208564_210876_211027_216373_216451_217022_217192_218167_218282_226529_226638_228405_228531_229226_229310_230709_230822_231710_231773_231880_232037_232912_233034_234063_234190_234277_234357_238363_238421_239502_239644_240557_240633_242007_242161_243899_244064_244602_244701_245252_245412_249311
905688	contig_12810_pilon	+	3397	1	Intergenic	novelGene_145695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATAACATGATCCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264181	267578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_264200_267600
905689	contig_11677_pilon	+	2628	1	Intergenic	novelGene_85908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAAGTTGTGCTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510212	512840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_510200_512800
905691	contig_7909_pilon	-	2751	4	Intergenic	novelGene_155935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005625	941979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_943694_943964_944022_944636_945238_1005246
905692	contig_14575_pilon	+	9056	46	Intergenic	novelGene_101885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_41	108.208153317781	397	169	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	3035	5326	72160	108581	TRUE	35	TATGTAGTAGCATTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTPKAKHKGKKKKPKDLKPMLVGSGTPSVIPSVKSETVTSGSKNKGSSHSSGPFAVPEHLRKDIEEFEAYYKKRQQRNNEYDSQNKKMGEANPKQKCSTLYDYFSQYLEDNGPLDIRHRVFNEYRFYPEETRQIVQKAGGLRQFLLRCPRFVVIDNCIALRKVSTRIKRKRKKKVIKEEVDEISSIDDEMYLPFFLSLHPDTREFTPESGSSSAPASEDVMPKPVSADSPNSACKDVKPELASGDFSRPVAADGEPKCVSSDSPQPVSEDANHTPVSSQSPKPASEDVKPTYWAQPCLVTGYYPYLPYQGFDITQSPPAYINMLSSMPQYAGIYTPLATISEYQLQGAIPVVPSFVAHDRPDPNAAAAFEGHHVNAENTSGNRIASETQILQGSLETSVKSHCGLGDADTALKESSRNDSHGGRSAKKGEGSRVRMRAVAAHPPTQMAAVQVSWDVAHQEVNTEPYERFEAEPGDISRMEKEYRKLQEKLENAYEKYEQTRFKGLAEIRDLEEKLKRNSERCQVSKTELEWFIQDLEKETKKWQQEKKETQEKVKALKKKVRRLSIASETCTQKNDEKDEEHGLHLDESLEIRNPFANEKAKLEERIKKSKENYEEVHERAVAAEVSVLTCWKDIHVWKLEVTKTQGEAYVECLKSRRSDHEPYLVDAVLYEWESYFASVEEELETIDSQLEDKVDEVKSGTWVSEITKVLSLPVFDKTYWPDRDWRNPESTAPGHLFSSVMKSLPRFTLQPKIRRAHRTK	19964	117727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_24256_24378_26341_26428_27684_27857_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867_64005_68967_69220_70559_70634_72115_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556_81605_83153_83220_85345_85496_91828_91969_96889_96959_98192_98290_105307_105409_107167_107256_107681_107772_108449_108645_109654_109822_111287_111566_113159_113278_113464_114813_115971
905693	contig_6795_pilon	+	2859	2	Intergenic	novelGene_27657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATACTAAGTGAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45299	50161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_46986_48988
905694	contig_9888_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_162266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	422	733	61758	61447	NA	20	GTTTTGATGTGTATATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMIKKKKNKTKLKSTSIAKDVEKMETSSVAGGNVKWHSHCGNQLEVPQKVEHRITIWPSNPNSQHILRSEGRNTDRGWYTNVHCSTFHNSQNVETTQLSINR	62179	61077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_61100_62200
905695	contig_4797_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_6905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCAAAGAATTCTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359018	357112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_357100_359000
905696	contig_12464_pilon	+	2671	6	Intergenic	novelGene_68656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGATATTCTCCTACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120150	490965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_121762_215529_215917_338809_339096_340396_340494_399838_400109_490945
905697	contig_11386_pilon	-	3521	5	Intergenic	novelGene_82785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGCTTATGGAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32456	17833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_18035_19623_19979_20815_21019_27697_28779_30775
905698	contig_13992_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_147611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	131	580	37406	36957	NA	25	CCACTGCTGACAGGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTPPPPNTPLSSEGGKVKAQGQLHSHFCWWWGGGIPDYSPPIPMVNNTHFLAQMGTKDGTAPGQAARTVCRGAAAGPQAGLARGGSRPSPGVRGGREVALRIQNTDQPRGPGALSPEQVLKHGGSVAMLGPADGRGPFLSTPAPQELRGDANSSHHSHPAGRKDSLPDPRHPPIGLGPSGDRPASACHLEPH	37536	35487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_35500_37500
905699	contig_15092_pilon	+	2232	4	Intergenic	novelGene_57781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTAAAAAAAAAAAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308990	318493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_310143_312712_312799_316608_316689_317579
905700	contig_10734_pilon	+	2021	8	Intergenic	novelGene_51204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_7	421.485129376725	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	38	1138	1129441	1142903	FALSE	50	TAAAACAAGCAAACTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1129403	1143786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
905701	contig_16121_pilon	+	3345	5	Intergenic	novelGene_6876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	457.437700676278	13	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	783	2189	57746	62826	FALSE	30	AGAACAGAATGTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVFACGNDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQIANKDNPLSTSSAWHSDSYLALGILGFFLFVLLGITSLPSVSNTVNWREFRFVQSKLGYLTLILCTAHTLAYGGKRFLSPSTLRWCLPSAYVLALIIPCTMLVIKFILIMPCIDKTLTRIRQGWERNSKISSALNGKTDI	50847	63982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_51628_57743_58202_58867_59396_60693_60856_62565
905702	contig_5769_pilon	+	2508	7	Intergenic	novelGene_138766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_1	43.1602311805157	162	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	104	700	241835	253984	FALSE	5	CCCTGGATTTTCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFIFDWIYSGFSSVLQFLGLYKKTGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKDDRLGQHVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLGGHVQARRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHERLLESKEELDSLMTDETTANVPILILGNKIDRPEAISEERLREMFGLYGQTTGKGNVSLKELNARPLEVFMCSVLKRQGYGEGFRWMAQYIN	233509	255792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_233595_241816_241893_242120_242241_248258_248325_250509_250614_251691_251824_253867
905703	contig_6740_pilon	-	2935	1	Intergenic	novelGene_142725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	509	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTTCCAATTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733631	730696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_730700_733600
905704	contig_11026_pilon	+	2975	6	Intergenic	novelGene_167676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	136.542447612455	656	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	213	824	205524	222883	FALSE	45	TAAAGACCAAAAATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGPPSSLPPGWSLQRTATSTTRASGTQTLPCGPPTWACMTRASAVTLGFNDFTYDYDLALLELEQPAEYSSVVRPICLPDATHVFPAGKAIWVTGWGHTQEGGSSALILQKGEIRVINQTTCESLLPQQLSARMMCVGYLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCARRNKPGVYTRLSMFRGWIKEQTGV	204501	225034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_204606_205415_205603_220656_220727_220767_220932_221998_222136_222721
905705	contig_854_pilon	+	1444	7	Intergenic	novelGene_36242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	110	688	543600	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543490	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
905706	contig_11512_pilon	-	1882	17	Intergenic	novelGene_43374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1100.38610943784	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	138	1292	609650	556654	TRUE	5	CTTTGCAGTGGCCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622338	554965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555376_556473_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
905707	contig_12638_pilon	-	2083	18	Intergenic	novelGene_33344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	274.022212622226	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	67	1491	1434492	1378296	TRUE	55	CTTGTAACAGAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSAL	1463539	1369781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373068_1373158_1374643_1374733_1378281_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1463494
905708	contig_9484_pilon	-	4122	7	Intergenic	novelGene_105655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	317	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCAGTCTGCGGGCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197301	126759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_126861_168512_168613_175465_175546_182686_182722_187809_187915_193423_193489_193665
905709	contig_4364_pilon	+	1949	6	Intergenic	novelGene_557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	1347	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	76	1203	1530895	1532568	FALSE	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530449	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
905710	contig_14727_pilon	+	3137	21	Intergenic	novelGene_56674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.0254675701435	81	43	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1596	1898	372989	376244	TRUE	45	GAAGGAAAAGGTTATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPMVKRLAPSFRSFLRFFCIRATRKLQTTWESSGSSSSSSSFRRYCGLVQKVSGKLRQPPAEQPLTQRPSFTDTVQVWSLSDSRASAVRLQISSFVKW	362355	414850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_363158_363557_363619_363865_363981_364211_364294_364382_364452_364905_364971_365053_365111_365487_365569_370715_370752_371626_371837_372971_373152_376104_376271_377290_377369_378998_379081_380186_380279_384135_384278_385119_385289_386012_386150_388022_388145_390305_390374_414527
905711	contig_15596_pilon	-	4904	1	Intergenic	novelGene_139536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	384	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	355	771	137118	136702	NA	25	CTTTTGACTGGAACATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATTSWTQQVLLGSEEAPKIGGGGALIRCFPERPPAEGPSISQGRGMFSRDGTVPNPLHYPQILRLLGHGGHEPAFKCARRHWKSPSVIKVSGHRINSILLIFKKHYQTSAVCLALPFDRPESNDLTEPTRILKQNV	137472	132568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_132600_137500
905712	contig_6233_pilon	-	2041	11	Intergenic	novelGene_74765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	277.730246822344	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	504	1343	149777	143464	TRUE	30	TACTATTAAACATCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250356	117806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118501_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_148115_148189_149521_149787_176316_176404_199837_199941_200462_200546_250135
905713	contig_854_pilon	+	4889	27	Intergenic	novelGene_36549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	2660.33986155793	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1015	3048	92	3139	1649736	1713159	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLERKCTAAVGAPEQGAQGQAAGDGGHCQVQVQGLHCCPGGQDRTAGGAAGQRDQRAPGGLQTGASGREEAEGRHAAGG	1649644	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695203_1698965_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702677_1712329_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
905714	contig_9706_pilon	+	1004	2	Intergenic	novelGene_20871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2922	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3465_3530
905715	contig_18055_pilon	-	1785	15	Intergenic	novelGene_117801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGAGGAGGGGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85591	40469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_40736_41920_42054_59718_59798_61359_61402_73600_73717_75197_75318_75559_75625_77928_78010_78045_78311_80663_80771_81238_81304_82068_82234_83358_83471_84609_84754_85566
905716	contig_6496_pilon	-	1792	4	Intergenic	novelGene_103479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.3041913500602	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	68	487	285171	247658	FALSE	50	TTTTAATAAACAAAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSDKAVKYYTLDEIKKHNHAKSTWVILHHKVYDVTKFLDEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDAREMSKAYIIGELHPDDRSKLAKPSLVDQLGDPSHLGTDCSPDVPPLHSGRLIPSQKLMKEKTASDTG	285238	246352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247790_263148_263179_264936_265066_285042
905717	contig_10868_pilon	+	4636	12	Intergenic	novelGene_173902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_11	82.5382455802828	260	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1202	3609	156	3764	500145	521986	FALSE	40	GGAGAAAATTGAAGTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVLSGSELPKETLSPPGNGCAIYRSEIISTAPSSWVVPGPSPNEENNGKSMPLKNKALDWAIPQQRSSSCPRMGGTDAVVSNVSGSVSSAGRPASASPAPNANADGTKTSRSSMDTTPSVIQHVGQPPTTPAKHSGSTSSKGAKASNPEPSFKANENGLPPSSIFLSPNEAFRSPPIPYPRSYLPYPAPEGIAISPLSLHGKGPVYPHPVLLPNGSLFPGHLAPKPGLPYGLPTGRPEFVTYQDALGLGMVHPMLIPHTPIEISKEEKPERRSRSHERARYEDPTLRTRFSEMLEASNTKLHPEVPTDKNPKPNPSWNQGKTVVKSDKLVYVDLLREEQDTKTDTNVSKPGFAAESVGQSTEPTKPPADPGLQQHRDFIALREELGHISDFNEAYAFKQAPGQSVFSLSKENVPAGTNKENLGLPVATSFLEPTLGGDGPAITFGKTQEEPKPFCVGSAPPSSVDGTPPTYTKDGSDDAESNDGKVLKPKPSKLAKRIANSAGYVGDRFKCVTTELYADSSQLSREQRALQMEGLQEDSILCLPAAYCERAMMRFSELEMKEREGGHPAAKDSEVCKFSPADWERLKGNQDKKPKSVALEEAIADQNDSERCEYSAGNKLDPFEAQEDKDLPVEKFFVERQPLSEPPTDPVAVDMPHSPTLRLDRKRKVSGDSIQTETAVEDMPEDPLLKAKRRRVSKGLHPKKQRHLLHLRERWEHQVSPAESKPGRQNRKEVTQAVQPEVTAQGNNITEEKPGRKRSEAKGNRSWSEESLKPNDNEQGLPMFSGSPPMKSLSSTNANGKKQTQPSCTPASRPPAKQQKIKESQKTDVLCTDEDEDCQAASLLQKYADTSEKPSGKRLCKTKHLIPQEPRRGLSLTGDYYVENADGKVTVRRFRKRPEPTSDYDLSPAKQEQKPFDRLQQFLPASQSSQLPCATSPQETTQSRPMPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLGYEEVVLYCLENKICDVNHRDNAGYCALHEACARGWLNIVRHLLEYGADVNCSAQDGTRPLHDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSGRTIMKMTHSELMERFLTDYLNDLQGRSDDDSNGSWDFYGSSVCEPNDESGYDVLAHPPGPEDLDDDDDAYSDVFEFEFSESPLLPCYNIQVSVSQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCNFPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSKDLEAFNPESKELLDLVEFTSELQTLLGSSVEWLHPSDMTSDDYW	499989	522858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_501588_502266_502321_502787_502975_509497_509759_510288_510532_511217_511544_511889_512145_517263_517431_519392_519539_520048_520127_520317_520475_521694
905719	contig_18859_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_150529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATTAGATGATGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36942	39296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_36900_39300
905720	contig_14744_pilon	-	1746	8	Intergenic	novelGene_66133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	97.0886403325984	22	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	67	579	1601809	1588860	TRUE	20	CAGCTGAGCCTCATGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEFLDDQDTRLCDNCKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWETCLPAT	1604751	1587244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1594082_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
905721	contig_7031_pilon	+	3167	1	Intergenic	novelGene_132804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1636	2001	350604	350969	NA	20	ACTAAGTTCTGGTCAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWQSTSEKLAGENLMNSSGTLSDTALEDEPLRLEGTQNTAGKELPPQSRVNLNDVEGHHELKNVDGQQKKKKDPQTRWIDTVAATMSSSIGTIVRMVQDPAVFHSVVHRVAVSQNQLNST	348968	352135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_349000_352100
905722	contig_5018_pilon	+	1632	6	Intergenic	novelGene_47037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	448	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAGAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392264	1396117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1392458_1392537_1392704_1394289_1394419_1394549_1394632_1394888_1395525_1395691
905723	contig_1146_pilon	-	2536	17	Intergenic	novelGene_84792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	71.7046622873994	43	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	16	1290	248184	172525	TRUE	40	AATCGCAGTGAAATAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFPWHSRNRNYKAEFASCRLEAVPLEFGDYHPLKPITVTESKTKKVSRKGSTSSTSSSSSSSVMDPLSSVLDGTDPLSMFAATADPTATAAAMDSSRKKRDRDDNSTVGLDFEPWSSKRGEILTRYTTTEKLSINLFMGSEKGRAGTATSAMSEKVRTRLEELDDFEEGSQKELLNLTQQDYVNRIEELNQSLKDAWASDQKVKALKIVIQCSKLLSDTSVIQFYPSKFVLITDILDTFGKLVYERIFSMCVDNRSVLPDHFSPENVNDTAKETCLNWFFKIASIRELIPRFYVEASILKCNKFLSKTGISECLPRLTCMIRGIGDPLVSVYARAYLCRVGMEVAPHLKESLNKNFFDFLLTFKQIHGDTVQNQLVLQGVELPSYLPLYSPAMDWIFQCISYHAPEALLTEMMERCKKLGNK	248199	169987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_171122_171644_171757_172524_172576_187636_187760_188221_188300_192746_192841_194256_194305_194998_195096_202551_202612_204205_204291_213188_213318_216576_216654_220315_220341_224136_224260_229522_229691_232543_232644_248167
905724	contig_9183_pilon	-	7180	6	Intergenic	novelGene_40280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	567.146682966585	73	120	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2157	2465	320566	318047	TRUE	30	AGGCCTGGAGACAGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVSGPATGAGQSQGLWPEEGTLARKRPCAEEQKMQDTKPHENCDTKPLGKLSGPIFFKKNVLLSPP	411098	310539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_318347_320557_322571_392366_392452_411031
905725	contig_13172_pilon	-	1735	13	Intergenic	novelGene_146315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.605005452845	1	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	780	1733	33401	13185	FALSE	40	GTAAGGGAAATTGCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTRPAGQNLQGIEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFDPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGHLLIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPSRYQRLVPGRENCREEQLIPQMGVTSSGLNQVLSQQANQEMSPLDSMIQRLQQEQDLRRSGEAGIISSTSEVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQMHSNAPRSEIATERDLVAWSRRVVVPELSAGVA	58791	13182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_13361_14071_14186_18768_18995_20711_20841_31868_32004_32449_32604_33381_33481_34200_34242_34337_34439_35842_35919_41247_41349_41643_41866_58632
905726	contig_12915_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_148330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAACTCTGCTCCATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35678	38046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_35700_38000
905727	contig_4742_pilon	-	2654	2	Intergenic	novelGene_131013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	15	365	284846	284496	TRUE	45	AAAAAGTTAACTTTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQNEMLLLLILFATGAQFRYFALKHPPVQVLLVLFEKCVYFLLKLSFVEYLNYHSAEHMNFSLQKMTFHLHWFALLSAPCSVTGQEERVFLHSGNSLHLCFLTYLSADFVLLLAWDPFSG	284860	279747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_280672_283130
905728	contig_2854_pilon	+	1703	3	Intergenic	novelGene_120820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATATCTGGCAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200671	248644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_200867_204781_204915_247269
905729	contig_9668_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_58205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1253	1612	523778	524137	NA	20	TGTGATTTATGGAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQTTLTVMGFIRQVTGYRSDQEGLGREFFNQDNLFSAMPTGRLLSDPWPFGLASALVERVLQSSLVLPVSAWGHPTPPGSLLPEGTQLSCSIGWKPSSANKCLQATHSARKPPA	522525	524616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_522500_524600
905730	contig_14882_pilon	-	1960	8	Intergenic	novelGene_114995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	91.8134755126625	6	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	1124	1960	251664	230104	FALSE	50	CTAATTAACTGTGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNSSDYYNKDNEEESLLANVASIRHELKITEWSLQNLGEELSSVSTSETSDYACNSSRFERLILEDLAQPSHPGLLTYSPYKKVCKLSSGNTDSHKKPRDKVSFAFSTPMDQEIKSLREKLNKLRQQNACLVSQNHSLMTKVESIHFELTQSKAKVSMLESAQQQAANVPILEEQIINLEAEVSAQDKVLREAEDKLEQSQKMVIEKEQSLQKSQEECIKLKVDLLEQSKQGKRAERQRNEALYNAEELSKAFQQYKEKVAEKLEKVQAEEEILEKN	254125	230103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_230137_233727_233825_237873_238003_239933_240041_247287_247450_250927_251103_251530_251667_253004
905731	contig_14537_pilon	-	3801	1	Intergenic	novelGene_158650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCCACAACAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56607	52806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_52800_56600
905732	contig_6612_pilon	-	2777	7	Intergenic	novelGene_148171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_4	132.332598654552	13	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	24	1469	72745	60763	FALSE	15	GTCCTATTGTGATTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEEEGERGVASTSVQNQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIERKRKPNRNTDNSKGIKPGQKQIQLPKTSAASTPPTDSDPQTTQEPLPTPSSSSLNKVPAPWPSPVPRASTQHHYRDHQNT	72768	59454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_61006_61951_62141_64167_64576_67224_67264_67488_67657_71390_71525_72480
905733	contig_5602_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_133041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1364	1669	643862	644167	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTKRIEIQLMASKSTEKTKERQGTDCSDQDHNRGFWTKLEKDIEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	642498	644440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_642500_644400
905734	contig_14882_pilon	-	1905	14	Intergenic	novelGene_114991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_13	106.527436252621	9	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1659	246	1904	247425	209118	FALSE	50	AACAAGAAAAGACTATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQEIKSLREKLNKLRQQNACLVSQNHSLMTKVESIHFELTQSKAKVSMLESAQQQAANVPILEEQIINLEAEVSAQDKVLREAEDKLEQSQKMVIEKEQSLQKSQEECIKLKVDLLEQSKQGKRAERQRNEALYNAEELSKAFQQYKEKVAEKLEKVQAEEEILEKNLINCEKENKRLQEKCGIYKSEVEILKEKLRQLKEENNIGKEKLRTMAVKSSEVMAQLTESRQTVLKLESELVDQEEILREKFSVMNENKELKLRIATQNERLDLCQQEIESSRVELRSLEKIISQLPLKRAMFGFKSSLSKHQMSSLSNKEDSYISCCEANKMVISELRIKLAIKEAEIQKLQANLTANQLSQSLISCNDSQESGKLNSLETEPVKLGSNQVESIKDQNKHYEREKQRLAAGIEELRTKLMQIEAENSDLKVDMAHRTSQFQLIQEELLEKASNSSKLESEMTKKCSQLLTLEKQLEEKIVAYSSVAAKNAELEQELMEKNEKIRSLETNINTEHEKICLAFEKAKKIHLEQHKEMEKQIERLEAQLEKKDQQFK	254857	209116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_209157_214506_214639_215122_215234_216555_216762_222564_222726_223723_223849_227916_228209_230014_230137_233727_233825_237873_238003_239933_240041_247287_247450_253004_253176_254807
905736	contig_4402_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_140864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAGATAGAGGCGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617834	615005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_615000_617800
905737	contig_14441_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_100780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1769	2164	125667	126062	NA	35	GCCGGAAAGCACCCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGESRTGGTGRPGLARAVAWASVACRQPGFVLLGKGSLSAIPPSLSDCGLSSGK	123898	126535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_123900_126500
905738	contig_3747_pilon	+	2607	9	Intergenic	novelGene_24895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3826.39692628718	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	100	1275	201313	203804	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201213	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204807_204876
905740	contig_3095_pilon	-	2788	3	Intergenic	novelGene_75212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1432	junction_1	1115.5	123	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	37	774	255481	248388	FALSE	15	TCTGTACTCTGAACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	255517	246373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_248759_253535_253806_255384
905741	contig_13937_pilon	+	3939	2	Intergenic	novelGene_167370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	3512	3937	123685	125352	FALSE	10	ACTGGGGTGGTTGCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGDGHGVRATSGRLQLIVVEAGVQGAVGHVQVGVAAQAAHPEHDLALVVQAQVAVVAGADLALHHVQQEPLLRDLVVFSAQRGGHGLGRQEQQQRPPPARRHGGWWMRGHTASSWAGGCHSARAPIRGGSSRTASRVHGGT	120173	125354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_+_124041_125282
905742	contig_6576_pilon	+	3168	2	Intergenic	novelGene_42394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8439	junction_1	0	2	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	122	1468	1301228	1302574	FALSE	35	GAGAACAGAGAAGTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295655	1304274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211
905743	contig_7816_pilon	+	1925	9	Intergenic	novelGene_66551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_6	41.3158565202272	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	316	1338	328886	351499	FALSE	50	GGCCCAGAAAAAAAGACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	328399	352086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_328670_328840_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331
905744	contig_12603_pilon	-	1824	4	Intergenic	novelGene_105813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	140	junction_3	44.3245605355165	109	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	125	541	626384	623750	FALSE	60	CCATAAAAAAAAATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIPITPPKDVPVDLHLKTFVGYRSSTQFHVFELTRQLPRFSMYALTSPDSASEPLSYVNFVIAERAQRVVIWLNQNFLLPEDTNIQNAPFQVCFTSLRNGGQLYIKIKPSGEITVNTDDIDLAGDIIQSMASFFAIEDLQVEADFPAYFEELRKVLIKVRARSGCICENVVLLCLKCFF	627168	622466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12603_pilon_-_623954_625011_625144_626303_626434_627093
905745	contig_4232_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_63338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCCTACCTCTGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466964	468103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
905746	contig_383_pilon	-	3260	7	Intergenic	novelGene_126145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	59.6648044402132	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	324	1529	385190	350004	FALSE	30	ATTACTGTACTGAGTATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLESLETKATLTSTPIRGAGDGMETEEPHKSIEATSGVQSIKRHILQSPQKKAVASESLGVLHLGKILTEKAVEVEAVRILVPKAAITHDIPNKNAKVKSLGHHKGESLGHSEGVVEPRKELSEVKHVLEKLKNSERRLLQDKEGLSNQLRVQTEVNRELKKLLVASVGDDLQYHFERLAHEKNQLILENEALGQNTARLSEQLERMSIQCDVWRSKFLASRVMADELTNSRAVLQRQSRDAQSAIQDLLSEREQFRQEMLATQKLLEKLLVCLQWGREQSYYPNAQPHSTAELALTNHKLAKAVNSHLLGNVGANDQKKIPSTGEFCSTPAEKMAETILRILDPVACTENSPESPFSESSPTTLLATKKNIGRFHPYTRYENITFNCCNHCQGELIAL	386316	348272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_350190_353503_353724_359666_359796_361353_361554_363254_363695_385159_385241_386043
905747	contig_10861_pilon	-	2986	6	Intergenic	novelGene_39233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	359.006629465251	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	2005	2985	609120	603079	FALSE	35	CCCAGCAGTCAAACCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRFVCFKVTCFSSCHVFLQNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPT	611124	603077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606511_607921_608038_608886
905748	contig_17753_pilon	+	2891	11	Intergenic	novelGene_105066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	226.479690038643	9	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1035	2057	131420	143267	TRUE	15	ATTTTATCTTTTGGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLRMNKAPTVGFEADVGSKTTHHLVYPESFRELGENVNMVLVPFKTIDLQWVVSATTKGTISHTYVPVPTKIKVKKEKILIYHPAFIKYVFDNWLQGHGRYPSTGILSVIFSLHVCDEVDLYGFGADSKGNWHHYWENNPSAGAFRKTGVHDGDFESNVTAILASIHKIRIFKGR	45658	148319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_54271_54448_75018_75173_96134_96231_130836_131726_137748_137946_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093_143979_148196
905750	contig_5551_pilon	+	2458	3	Intergenic	novelGene_134292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACAAACAGCCCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820163	830584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_820171_826530_827062_828664
905751	contig_3942_pilon	+	1740	5	Intergenic	novelGene_128688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	566.582021864443	92	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	58	441	426591	429812	TRUE	25	CCACCCAGTGGGCCAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQARQRPADRRSAATPQIRALGRRQWEAHE	426533	431195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_429533_429607_429798_429853_429936
905752	contig_678_pilon	+	2725	3	Intergenic	novelGene_167776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	803	1309	17233	19701	TRUE	30	GAGCATATATGTGTGATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVTLQIHHLKSLFRVQRKHITPPTPQEINFTRCQEALLRLYQSPLLRWRETREEPMTFIVTSLSHLHNRLTRLRKLSLLATPLSERIQFSSPSGFRGGPGIFNKTSFASWDLLTITSLSLTAVCIRLTLDWSGRMLSRSWNPSIDLALCPRDAMYLSFVQVMCTFS	16430	21324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_17634_19595_19781_19987
905753	contig_9014_pilon	+	1492	6	Intergenic	novelGene_106803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2096.98654263684	5878	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	51	428	150693	152329	TRUE	30	GAAGATCTGTGTACAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150642	153629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151763_152234_152334_152425_152713_152856
905754	contig_5196_pilon	+	4349	11	Intergenic	novelGene_38692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	91.5155178098228	304	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	338	1333	302305	336267	FALSE	70	AATTTAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYLVAIFLSAIFLYYVLHCILWGTNVYWVPPVEMKRRNKIQPCLSKPAFASLLRYHQFHPFLCASDFKKIASLYGNDKFDLPYGTKTSAEYFRVALSKLQSCDLFDEFDNVPCKRCVVVGNGGVLKNKTLGEIIDSYDVIIRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKINSHGFWKKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKNAYHNVTAEQLFLKDIIDKNYVISLTQE	246935	339283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_247090_281606_281779_302293_302394_304819_304898_309130_309235_310808_310873_328015_328112_331045_331233_331341_331480_334900_335054_336180
905755	contig_15498_pilon	+	5587	1	Intergenic	novelGene_42695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830092	835679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_830100_835700
905756	contig_8581_pilon	-	4144	2	Intergenic	novelGene_22862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2750	3292	426068	425231	FALSE	30	AGTCTATAATCTGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQHSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLLESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKKKSNTCSLQTAPKEPPARSRGIQAAGSPGSRACGPGKQRSKRTKAPGSNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGT	428817	424378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_425363_425657
905758	contig_16122_pilon	-	3040	19	Intergenic	novelGene_134537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_12	20.4450483002609	55	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	217	2532	231210	219244	FALSE	5	TGTGTGCCGTTTCCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRKLRHPKVRYMSSTDAKVEQMFQILLDPEEKGTEKKQKASQNLVVLAREDAGAEKIFRNNGVQLLQRLLDTGETDLILAALRTLVGICSEHQSRTVATLSMLGTRRMVSILGVENQAVSLAACHLLQIMFDALMEGVRKGFRGKEGAIVVDPARELKVLISNLLELLTEVGVSGQGRDNALTLLIKVAPRKSPKDPNNSLTLWVIDQGLKKILEVGGSVQDSPGELAVTANSRMSASILLSKLFDDLKCDAERENFYRLCENYIKSWFEGHGLAGKLRAIQTVSCLLQGPSEAGNRALELSGVMESVIALCASEQEEEQLVAVEALIHAAGKAKRASFITANGVSLLKDLYKRSEKDSIRIRALVGLCKLGSAGGTDFSMKQFAEGSTLKLAKQCRKWLCNDQIDAGTRRWAVEGLAYLTFDADVKEEFVEDEAALKALFQLSRSEERSVLFAVASALVNCTNSYDYEEPDPKMVELAKYAKQHVPEQHPKDKPSFVRARVKKLLAAGVVSAMTCMVKTESPVLTNSCRELLSRVFLALVEEVADRGTVVAQGGGKALLPLALEGTDVGQIKAAQALAKLTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRQKILKEKAVPMIEGYMFEEHEMIRRAATECMCNLAMCKEVQDLFVAEGNDRLKLLVLYSGEDDELLQRAAAGGPGHAHLFAAVALQPHPTSDHPLAGDLAGTASEPQPGAAAPGRCGGAEHGRGLEGDRQHLNGE	231864	218735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219630_219716_219835_220669_220786_221002_221117_221575_221643_221827_221956_222156_222298_222932_223075_223335_223431_224213_224515_225137_225310_226075_226247_226546_226716_228333_228502_228973_229067_231180_231218_231454_231617_231817
905759	contig_5794_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_69764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGGAAGCTCTGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699671	702437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_699700_702400
905760	contig_5959_pilon	-	3086	5	Intergenic	novelGene_150185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	162.70890418167	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	143	1180	216308	211902	FALSE	40	ATACAAAATGTAGGGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDPEVFRQRFRQFGYQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVREHHPENGEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEEIVSQEEAQELPNSELDAVENQLKWASWELHSLRHCDDDARTENGALAPKQEIPSAVESHDVVPGTLNIGVPQIFKYGEACFPKGRFERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSIQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHNAEKLLNVVKV	218281	209995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_212059_212130_212444_215174_215323_215888_216392_218222
905761	contig_9098_pilon	-	3217	1	Intergenic	novelGene_75783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGGTTGCATCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266112	262895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_262900_266100
905762	contig_15112_pilon	-	3176	2	Intergenic	novelGene_124747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1862	2206	28664	12832	FALSE	55	ACAAAAAAAAAGCTTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPYDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFMAALFTIAKRWKQLRCPSTDEWINKLWYIHTMEFYARVKNNDESVKHLAAWMNLEGIMLSEISQS	30525	11861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_13008_28495
905763	contig_12540_pilon	-	2109	9	Intergenic	novelGene_148060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	102.794622305839	1	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	579	959	216375	211069	FALSE	40	CTGAAATTTTAGTAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRDPDGAVLRLSQALGNLTIIQKGERDVISDGDQVLVCSQEGSRRRCGGQGDLLSGSLGVLVHWALLAGSEKTDGVNPLLVAAFGACALTRQSSSQAFQKYGRSMTTTDMIAEVGAAFRKLFET	253924	209918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_211220_213070_213192_216266_216388_217740_217846_217933_217985_227296_227406_240308_240355_244251_244403_253820
905764	contig_2215_pilon	-	6564	3	Intergenic	novelGene_163836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	327	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	740	1039	215132	214833	TRUE	25	TGCTTCTCTACGAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPRPFPLCRFIIKWESQSGATLCSLCQHPCAWLAGCCLFVPGFSGIHLKVGSWCQLAISPVKYCDSPVNSTVCSVGNPGRAKPTNNYLIYNCLLLCA	215871	105622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_105714_147820_147966_209543
905765	contig_6599_pilon	-	292	2	Intergenic	novelGene_175995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGAAGAGAGAGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262718	262329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_262454_262550
905766	contig_5894_pilon	+	1737	2	Intergenic	novelGene_83016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGAAAACTCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270672	273024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_271468_272082
905767	contig_12078_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_74126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTACATATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558852	561275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_558900_561300
905768	contig_5236_pilon	-	2729	15	Intergenic	novelGene_100959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	184.658938233132	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	114	2030	1011714	1006770	TRUE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011827	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006351_1006553_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
905769	contig_10904_pilon	-	4818	2	Intergenic	novelGene_22558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3445	3798	405168	404815	FALSE	20	GTCATGGTTTGAATTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLEDSYLANQWKRSISVPIPKKGNPTECRNDQTISLISQTGKILLKIIQKRLQQYIDRELQKFKLDSEEDIEQRISLLMSDGSWLKAENTRKVFTCVLLTMQKHLTVWIIINYG	409751	403794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_406221_407359
905770	contig_4071_pilon	-	1992	4	Intergenic	novelGene_151869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	6.84754619472471	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	225	1658	64136	57018	FALSE	55	GAAGTTAAAAGGGAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPGGKSVPSTLPIASGLCGSLLEGSGLRRGWRHQLFVPLEIVLSWLPGVAVHAGETYQGISCFKHWYSFDTTVMAATWTVQAHVDQEEVLEVKIEKEEEEEYKYTTRKDQSLQKNNSYSREVFRQYFRQFCYQETSGPREALRQLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREQHPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTEEQEMFLQEMAPLRTEQEASMSLQSVKAKLKCESPEPEAQQEQVSDVETENEYRNLILKQEVSEEMELYGDISSRFESEMAAEYEETHEPKGKIENPSGYPWEDKQPTCDENGVSWSENSDLTEQQRICPGEKAYECDSCGKAFSQYAHLIEHQKIHTGDRPYKCEVCGKTFRGRTVLVRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGQCSALNQHQRLHTGEKHYRCNECGKAFSQKAGLFHHLKIHTRDKPYQCTHCNKGFSRRSILIQHQRIHTGEKPYQCDDCGKAFRRRSYLSKHQRMHSRGGPYKYKEYGESFRQNSALIQHQTMHKGEKSVPM	65261	56683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_-_57890_59505_59651_63719_64205_65105
905771	contig_7840_pilon	-	2318	1	Intergenic	novelGene_69022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAATTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350757	348439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_348400_350800
905772	contig_2054_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_51684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATAAAAAAAGATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120828	122962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_120800_123000
905773	contig_3270_pilon	+	2477	7	Intergenic	novelGene_104487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	52.8193987933306	246	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1770	2411	323665	338530	FALSE	35	CAACTGTCGAGTTTCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVLPECLTDGSDVVSDLEQEEMKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDVRTKQLENTEPQGTPAGEVEEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	321895	338596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_323672_324439_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337788_338428
905774	contig_11055_pilon	-	4904	16	Intergenic	novelGene_142169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	93	junction_4	94.3346289663675	568	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	342	2768	176488	132739	FALSE	55	AGACAACATGATAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDLHRASEREAIQVFIRSSFEDVDLSFRKELEIQLEKKWDDLCKRNLQVSSDRCSALLQDIFSPLEEEVKQRIYSKPGGYHLFIQKTQELKKKYLHEPKKGIQAEEILQKYLMSKDPVTDAILHTDLTLTEKEKEIELERVKAESAQVAAKMLEEMQINHQQMTEQREKSHQEHMKQLTEKIERDRVQLLADQERILALKLQEQEQCLKAEFREERIKLQEEIQDLQMRNRETSLLLEHVKAESVQTPEEMMEEIKYQQMMGQKEKSDQEYVKQLIEEMEKDRDQLLTEQDKTLALNSQETMAFKPIMEAPICLIENQNEQLMVNPKALKILDKISQPVVVVAIVGPYRTGKSYLMNRLAGQNHGFCLGSTVRSVTKGIWMWCIPHPSKPNHTLVLLDVEGLGNVKKSDPKNDSWIFILAMLLSSTFVYNSMKTIDHQALEQLYYVTELTELIRAKSSSRADEVEDSTEFVSFFPDFVWTVRDFTLELKIDGNPITEDEYLEDALKLIPGVNPKIQNSNLSRECIKNFFPKRKCFVFDQPTRDNNLLHQIEGVLEEKLDCNFQVKLKNFCSYIFSHAKIKTLREGIVINGNRLGTLVETYVDTINSGAVPCLEDTVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKQMAQCMRFPTDTLQELLDVHAACEREAIALFMEHSFKDDKREFQKNLMETIEKKKEDFMIQNEEASEKYCQVELKKISEPLMASISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKFEQNYARVPRKGVKANEVLQSFLQCQAPIEEAILQSDRALSDSEKAKAAMQAKKEAAEKKQELLKIKNQEQQKKMKAQERSFKENMEQLKQKIEREIENSLRDKEKMLEHKQKVQKELLNEGFEKKSEMLNKEINQLREKIETTKKNKNSWFSKALDTAGPILLKALPLLIIAAIKLY	188633	130602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_132937_133843_134038_134375_134479_139218_139432_151331_151613_152535_152782_159355_159553_159753_159864_162131_162260_167701_167898_173506_173695_174693_174797_175941_176136_176412_176516_177128_177342_188532
905775	contig_8606_pilon	-	3158	1	Intergenic	novelGene_159410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTTCCCTAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139437	136279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_136300_139400
905776	contig_10973_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_150374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	91	603	2730	2218	NA	40	GACGACCCACCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2820	1536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2800
905777	contig_4232_pilon	-	3147	2	Intergenic	novelGene_63456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	246	junction_1	0	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	422	724	545715	545207	FALSE	35	TGAGTTCTAAACTTATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPEAGMLVCGGAKLTQRFIFQVALLPFGLSSLGLKLVSSVRFSAPFLPFNSLKVIHSLKKLLLVSLGMELTFPLESVLLCSSWRSDGTRRIGAPGQCEA	546136	542783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_545270_545475
905778	contig_15044_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_174967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	716	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109695	112276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_+_109700_112300
905779	contig_14450_pilon	-	1597	1	Intergenic	novelGene_49045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTCCCAGCAAATATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321890	1320293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1320300_1321900
905780	contig_2757_pilon	+	2112	3	Intergenic	novelGene_164588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCAGATGCTCTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230917	380362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_231478_254328_255169_379650
905781	contig_6871_pilon	+	2232	3	Intergenic	novelGene_21558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	833	junction_1	150	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	72	1208	121971	135017	FALSE	40	TTGTAAAGGATAAACGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121899	136041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940
905782	contig_16622_pilon	-	2253	6	Intergenic	novelGene_48488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1198.78828823108	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	727	1071	115540	113120	FALSE	75	TTTAAGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	121966	111937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113158_113602_113739_115153_115292_115507_115559_118811_118884_121330
905783	contig_8801_pilon	-	2114	5	Intergenic	novelGene_66250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	47.6077724746706	38	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	106	561	199038	193594	TRUE	15	TTTCCTAGCAATTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	204529	190579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_191576_193036_193615_194487_194715_198830_199065_204450
905784	contig_3509_pilon	+	2661	6	Intergenic	novelGene_160703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	68.7301971479786	35	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	424	732	37204	38968	TRUE	30	TAAGATATGCTTCCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILSGLLDNVEKKYLNLSGTEKEKFYGAKPADKLRVLEASVRKKRDEAGRILVETLFSKEKESTSAEVLPEIKAGPDESAEFTDPLKLCPREEFQRLCKEKAGEIYPIKERKNRTRLALIICNIEFKKLSRRNGAEVDIEGMKRLLEGLGYSVDVKKQLTATEMQSVLQEFAARPEHKSSDSTFLVFMSHGFLEGICGTMHSEEQPDMLSYDTIFQIFNNNNCQSLKDKPKIIIVQACRGGEL	23927	43027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_24130_36139_36250_37092_37267_38722_39933_40576_40687_42172
905785	contig_4519_pilon	+	3051	3	Intergenic	novelGene_123750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTTGTTTTTAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273787	1426507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1276255_1370535_1370764_1426151
905786	contig_20141_pilon	+	2216	10	Intergenic	novelGene_173467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_9	19.3333333333333	58	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	405	1421	15621	39691	FALSE	45	AAAACCCACCAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLSEDPLGKILASIYLPKSLRERLHLNNLQTILFNFFGQTSLFKIKNFTKALTTYVVSASISDTSIQNLADPVVITLHHIEGSPNYGQVHCAFWDFGKNNGLGGWNSSGCKVNETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDTVNERILVLITYAGCGISSIFLGIAIVTYIVFHKLRKDYPSKILINLCTALLMLNMMFLVNSWSASFQKVGLCITAAVALHYFLLVSLTWMGLEAVHMYFALVKVFNIYIPNYILKFCLVGWGIPAVMVAIILSVKKDLYGTLSSGTPFCWIKDDSIFYISVVAYFCLIFITNLFMFCAVIVQLNSVKAHSQKTRRKMILHDLKGITSLTFLLGLTWGFAFFAWGPVRILFLYLFAIFNTLQGFLIFVFHCAMKENVREQWQIHLCCKWFRLDNSSDGFDEDPLSCEVVANCGRSILPVEIKMNSIHEQRFLQYFPAEIPSPLPDWGKF	6934	40486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20141_pilon_+_7072_12034_12155_13309_13356_15519_15624_18320_18443_22450_22720_26749_26829_29201_29483_35827_35930_39530
905787	contig_7963_pilon	+	2501	11	Intergenic	novelGene_58592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_8	150.529731282561	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	177	2288	260459	269915	FALSE	50	CATAATATATATTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDLRPWVCLLLLDSAFLWVLRGTLGALLPGGLPGLWLEGALRLGGLLKLGRLLGFGGTLLPLLCLVMPTFLSLRALVPGALHAPPVRVASAPWSWLLASYGAAALSWALWAILSSGGAPASAQERKQGQENKALMWRLLKLSRPDLPFLIAAFFFLVMAVWSETLIPYYSGRVIDILGGDFDPEAFTSAIFFMCFFSFGSSLSAGCRGGSFLFTMSRINLRIRELLFSSLLRQDLGFFQEIKTGELNSRLSSDTTLMSRWLPLNANVLLRSLVKVVGLYSFMLSLSPRLTLLSLLNVPLSLAADKVYNSRHQALLQEIQDAVARAGQIVREAVGGLRTVRSFGAEEHEVLRYREALERCRQLWWQRDLERALYLVFRRLLHLAVQVLMLNCGLQQILAGDLTQGGLLSFLLYQEDVGNYVFSLVYMWGDMLSNVGAAKKVFCYLDRQPDLPPSGTRAPSTLKGHVEFKDVSFAYPSHPDQPVLKGLTFTLSPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLENLYQPTGGQLLLDGEPISQYEHRYLHRKVVLVGQEPVLFSGSVRDNIAYGLENCTDEEVMAAAKDARADKFIAEMEHGMHTDVGERGSQLAAGQKQCLAIARALVRDPQVLILDEATSALDVECEKALQDWRARGGRTVLKIAHRLKTVQNADQILVLKQGQLLDGAELMKQQDVYARLAQRQLED	260282	270128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_260952_261040_261156_263629_263761_264024_264231_265076_265275_265464_265594_267797_267987_268170_268345_268536_268697_269102_269240_269735
905788	contig_9809_pilon	+	2879	11	Intergenic	novelGene_176749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	162.059371836374	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	118	1458	108357	116809	FALSE	15	CCATTGGTTTCTACCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVEEEKKKINFFLFKYFFC	108239	118230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_114925_116752
905789	contig_4232_pilon	-	1129	1	Intergenic	novelGene_63323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTCATAATTGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468042	466913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468000
905790	contig_12250_pilon	-	2509	2	Intergenic	novelGene_80535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	66	junction_1	0	287	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	391	1443	234210	233158	FALSE	35	AAGTGAGAGGGATGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMNTTSPAAAISPSVFIRPLAIILLSVALAVGLPGNGFVVWSILAKMRKRSVTALLVLNLALADLAVLLTAPFFLSFLARGTWVFQLIGCRLCFYICGVSMYASILLITAMSLDRSLAVACPFLSQKLRTKAMAGRVLAGIWVASVLLATPVLVYRTVALEKNNRSLVCLEKYPTESHRAFHLLFETITGFLLPFLAVVASYSDLGRRLQARHFRRSRRTSRLVVVIILAFAAFWLPYHVVNVAEAGRALAGLVPGSGPAGMRLILVRKVLIALAFLSSSVNPVLYACAGGSLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEVSSARRGGTLGQTMRGAPTFPKPGPAENLTASCNPLD	235191	232091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_234220_234810
905791	contig_14546_pilon	+	4200	11	Intergenic	novelGene_157435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	209.349492476098	751	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	97	984	514567	529108	TRUE	20	CTTGACCTGTTAGTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKEIHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSVANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEPEERQQTPEVVPDDAGTFYDQTVSNDLEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKSEPVLEETAPEDGQKSSSPAPADIAQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQFVRLVSKVMLNLEEL	498480	536757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_498559_514548_514662_517685_517768_518157_518332_523716_523808_525315_525410_526579_526782_528373_528476_529060_529190_529581_529692_533732
905792	contig_3584_pilon	+	3992	23	Intergenic	novelGene_108114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	1338	2021	188096	197911	TRUE	20	CGTAGCAAGGTTCGAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVLNAGTMLLLGDRSCSWNVFGTAAWKTKSVMSSSVLLEACIVITVTLGLVFDRSKVNSIFKPFLLYAVMEGMPEVMSLKRGCDESPSNKKGGWDICGTEAGAGAAAGAPVRLMSPSKSRSSPPAEAGLLVGAVGITGVMSFPPNKSNKSLAWLVGCGPEGGGLVSSGAGSVSPFVCTISVGPFVVTFSMTGILSSRADLIWSYFLKSALYSTALCWSSTSMLLP	185527	277343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_186831_188061_188161_191148_191309_191438_191545_196409_196539_196717_196859_197828_197936_199888_200012_201128_201224_201404_201527_204448_204502_205234_205378_207411_207527_208799_208854_210911_211011_211206_211288_211992_212091_215286_215362_216561_216662_218254_218395_223202_223328_254109_254314_277023
905793	contig_3964_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_174201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1616	1957	47951	48292	NA	50	AAAAAAAAAACCCTGGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMKTHPSRTFGTQQTSVQRSVYSNKCKHPKGCKGQNQNINPTTQRSRNRAAKGALRNQKKEIIRLRAELNEIENRKTTERVNKTKSHFFEKINKIDKPLAKLTKEKPKKQIT	46335	48520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_46300_48500
905794	contig_9313_pilon	+	2205	2	Intergenic	novelGene_86487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTCCAGAAAAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462544	464799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_462677_462726
905795	contig_5765_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_141368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGTCATCAAATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478019	477153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_477200_478000
905796	contig_5643_pilon	+	1142	9	Intergenic	novelGene_38783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2471.80495475978	21	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	70	663	233973	237527	TRUE	15	CCCAGCCACCTCTTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAVSLGWALVGWRFVSGKAVRLELE	233605	238187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_237158_237281_237376_237635_237720_237819_237913
905797	contig_7657_pilon	-	1412	3	Intergenic	novelGene_30022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	700	142	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCAGCCCTTGAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204374	166269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_167411_174121_174177_204158
905799	contig_5951_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_153246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198108	199100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_198100_199100
905800	contig_5640_pilon	+	3721	1	Intergenic	novelGene_27299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCTATGAGTTGCAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304662	1308383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1304700_1308400
905801	contig_9713_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_170250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	296	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAGCACAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120914	281908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_+_121694_280477
905802	contig_2036_pilon	+	4171	3	Intergenic	novelGene_131802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2039	2743	506727	507431	FALSE	60	CAGAAGAAAGGAAACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRCETVEDRISGTKDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENLPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRTAREKQEVTYTGETIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNSQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	313854	508859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_314661_379642_380605_506456
905803	contig_15407_pilon	-	3252	9	Intergenic	novelGene_123064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGAGAGCGCTGCGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472311	449426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468070_468151_468305_470254
905804	contig_6599_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_175982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGATTAGAGGTCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261459	261061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261100_261500
905805	contig_6479_pilon	-	2103	4	Intergenic	novelGene_160615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.152011122766	238	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	70	1089	670011	611527	FALSE	25	GATAATTTCTGAGGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMEEAVGKVEELIESEVPPKTSVQETAKEEDGSVELEPQVQKDGVADSTVLSSMPCLLMELRRDSSESQLASTESDKPTTGRVYESDSSNHCMLSPSSSGHLADSDTLSSAEENEPSQAETAVEGDPSGVSGATVGRKSRRSRSESETSTMAAKKNRQSSDKQNGRVAKVKGHRSQKHKERIRLLRQKREAAARKKYNLLQDSSTSDSDLTCDSSTSSSDDDEEVSGSSKTITAEIPGHLDPGFLTSDKTSAGNAPLNEEINIASSDSEVEIVGVQEHARCVHPRGGVIQSVSSWKHGSGTQYVSTRQTQSWTAVTPQQSWASPAEVVDLTLDEDSRL	670080	610512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_611532_614517_614691_626170_626298_669296
905806	contig_7452_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_109147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	594	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAATCAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122923	124971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_122900_125000
905807	contig_6137_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_59308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGCTCACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645904	1644224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1644200_1645900
905808	contig_6278_pilon	-	3072	1	Intergenic	novelGene_119814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	447	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATGCGGAAATCAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467503	464431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_464400_467500
905809	contig_8693_pilon	+	2650	2	Intergenic	novelGene_150874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGCTCAGCATCCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1134623	1195857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1136684_1195267
905810	contig_10734_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_50972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAACTAGAACTGTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230871	229370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_229400_230900
905811	contig_3612_pilon	+	1134	5	Intergenic	novelGene_87830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	113.318136235997	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	29	946	955645	978135	FALSE	30	TAAGGTGAGTGGATCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGDTGYCTAFEEIGKRFGPFDLAAIPIGAYEPRWFMKYQHVDPEEAVRIHIDVQTKKSVAIHWGTFALANEHYLEPRVKLCEALERYGLNTEDFFVLNHGESRYLNTDSENVK	955616	978323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_955909_965350_965667_965903_965998_969734_969850_978006
905812	contig_7962_pilon	-	5177	3	Intergenic	novelGene_149288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	50	322	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	374	529	131654	131499	FALSE	45	ACAGGAATCAAATCGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAWLRSWVVVGYHPWRPGSRYLTRFARSRPGGAKVSAEEGHSCGIRGAVARPARRCRRPWRGVNVIPFLELIGLPDSIVSILKNSQSGNALTAYALFKIATPARYTVTLGGTSFTVKYLRSRGYMSTPPPVKEYLQDRMEETKELLTEKMEETKDRLTEKLQETKEKVSFKKKVE	193640	126850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_131733_141384_141497_193457
905813	contig_19185_pilon	-	4678	1	Intergenic	novelGene_163649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1511	1942	127843	127412	NA	15	TTTCTTGCATCATTTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLVACIYTLGLHSDVNHGGAESRMDTDCLKSYPLGVHCQQNQASSEGGVLGSLWWIHELPSSSLLCSPVFSIYSCGWVIVKRVDRDSRCYFGSIPGPSSGKTGRELANHCEMTFISDHTKLRKLCLPPAEHLAELLFGKLF	129353	124675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_124700_129400
905814	contig_5041_pilon	-	2614	17	Intergenic	novelGene_27068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	605.759308507719	3	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	169	1743	605390	532806	TRUE	35	TAATAGTCTCACGAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKESRKSSRKKNGRSEFPESTAGLTISQHMLRAKWSCSCSAK	616679	525068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532929_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_572946_576493_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559
905815	contig_3627_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_78582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	258	590	1316994	1316662	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIELPYDLATSILRIYSKEEKTGTQTETCTPMFTAALFTIAKKWKQSDCPPTEEWINKMWYTHTLQYYSAIERNKVLIHVTIWMNLENTMLSKISQQQKDKYCMISLI	1317251	1315876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_1315900_1317300
905816	contig_4091_pilon	-	3262	1	Intergenic	novelGene_172994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1088	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	2178	2624	11776	11330	NA	15	CCTCTGGCACCTGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASQRGSLFATQHRLAKKGSQLKKRKRKQTINSKETNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTQTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVIGKEEIKTSRKKSNTSSQQIALREPASVGWWNPSSWCFSDKRLCPWEAEEAEWG	13953	10691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_10700_14000
905817	contig_10904_pilon	+	2911	2	Intergenic	novelGene_22758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGACACACCACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653155	659317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_655389_658639
905818	contig_6593_pilon	-	1812	2	Intergenic	novelGene_49846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	165	761	1202286	1201690	TRUE	85	AAAGAGAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYDKSDLRLISKIYKILQNLNSKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIHKTQNNKCWRGCGETGTLLHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAVPLLGIYPRETRAITQIDICTPMFIAALFTIAKGWKQPKCPSMDEWINKLWYIHTMEYYAMIKNNDEAVKHRITWWKLEFIMLSEFSQAQKDKYYIRRLL	1202450	1196376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1197085_1201346
905819	contig_5961_pilon	+	3319	15	Intergenic	novelGene_144129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	534.584942945917	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	943	1800	197721	207020	TRUE	45	ACTTGAAGAAATACAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKVKIKISTEIR	144036	213894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775_202352_206906_207635_209572_209786_210229_210441_210996_211234_211817_211961_213793
905820	contig_3948_pilon	-	3848	19	Intergenic	novelGene_53275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_15	122.734645515749	514	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	350	1846	1430935	1414309	TRUE	20	GCTAATGTCTCTTGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGILMAGILPFGAMFIELFFIFSAIWENQFYYLFGFLFLVFIILVVSCSQISIVMVYFQLCAEDYRWWWRNFLVSGGICVLRPGLCHLLFC	1458411	1409183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1432988_1433053_1434911_1435012_1439634_1439749_1458390
905821	contig_5023_pilon	+	1749	11	Intergenic	novelGene_7283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2412.18156240363	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	70	1362	607279	647201	FALSE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGNWKPMDLLQASPLSPSPLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580859	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616546_618524_618668_622527_622624_625648_625852_647053
905822	contig_12951_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_68137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113523	111843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_111800_113500
905823	contig_16846_pilon	+	2035	8	Intergenic	novelGene_82912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	25.5718276106136	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	3	692	456417	477663	FALSE	10	GTATGTATGTGTCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASDDRKRVSLGDVLLSVLLTNDGKSAQQRKNPAKPKFKPLSPRPRTCTHASREKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYSIPSINVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVGAWHHL	456414	479006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459710_464053_464156_464527_464615_465206_465311_475327_475478_476253_476322_477639
905824	contig_9833_pilon	+	4744	3	Intergenic	novelGene_68499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4023	4535	216973	217485	FALSE	25	CTCTCCACTATATACTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAAVSQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKRISPITSCFVSHWKLCEAAFSYPVCWSPIGVRDGGSALR	212433	217694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_213504_213741_214305_214583
905825	contig_11337_pilon	+	2490	2	Intergenic	novelGene_107196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAGAGTAGAACTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225325	228822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_227299_228305
905826	contig_15498_pilon	+	2671	2	Intergenic	novelGene_42709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1335	2024	984557	985246	FALSE	55	GTCTTCAAAAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAAAGTMTGVGGGEAGGVGGDGEKEGTVEGVMGAGVHSTFISSGGFSRISNSRVNGSTSCFTISTMLSVAGNFSPTPFISLIRSVLEISGISLGATLQGFLHISSSISSVGEGSDVSVQDVGLGIGNVSSFGEESSHLSSTAVVNIGWLLRAAEIGEAIVLRAIGETVVGDTGRGSSGVDSTAVSSDVWPACSFFSPLRTSLRTGEGDFNTGSGFGFSSREEKIKEF	952434	985893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_953590_984377
905827	contig_383_pilon	-	4761	1	Intergenic	novelGene_126099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102289	97528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_97500_102300
905828	contig_4857_pilon	+	3507	1	Intergenic	novelGene_48755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204585	1208092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1204600_1208100
905829	contig_4315_pilon	+	3695	1	Intergenic	novelGene_46819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1943	2365	350069	350491	NA	20	GTTTTCATTTTCAAGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIRACLEGEGRPVGWPGEGEGGGLSRAESDTTRSGFCWCWSIWSLSSSRRIPSWNISASSSLEWGDIHWDPRTAAHQTGLGGHSSEQRLPQEYPSGAHLVPSFILCRELKQDERGLHWESEGLSPSPCSATSGPWDLE	348126	351821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_348100_351800
905830	contig_5485_pilon	-	719	9	Intergenic	novelGene_37780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	169.383994226137	3	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	31	381	653565	647955	TRUE	10	AGTTGACTTTCTGTGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKEVECGVIMGKQKKTRKYATMKRMLSLRDQRLKEKDRLKPKKKEKKDPSALKEREVPQHPSCLFFQYNTQLGPPYHILVDTNFINFSIKAKLDLVQSMMDCLYAKYLPLLDISYKWGHTICGPL	653595	638688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_638758_639418_639496_641107_641196_645870_645944_647923_648014_650867_651017_651981_652054_653192_653261_653562
905831	contig_9696_pilon	-	5113	3	Intergenic	novelGene_68772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	626	937	144915	144604	TRUE	40	TTAGCACAGGTGACCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVCKLLRPQALCIELGGRTEALNKLLGHLTGMSLNLQTREPNSMRHLVVQSSLSSYFFVVVVNTSFTQLLPIQLFTGIQLTEAVTVISCATLPLINVIFHHH	145540	140035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_143796_144022_144381_144545
905832	contig_15304_pilon	-	497	2	Intergenic	novelGene_30654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	288	341	102033	101980	FALSE	25	AATTATGCGGTTTATCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKQMPSRVTPQRSQSAKPTS	107225	101823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102037_106941
905833	contig_5189_pilon	+	2890	13	Intergenic	novelGene_34862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	971	1294	199225	205736	TRUE	15	ACCTTATTTCTTTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSILRHDSKHWIVTTNARSNFFIILFGVAYLVELGIDPPNQTAYRCMWCVMTCTSIGFGFNLPPLNSSLNFSLASTVLFKSLCKRRPKSLNMVEPPERTIFYIRQF	198194	253014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_199058_199117_199332_200439_200512_204911_205046_205725_205790_218496_218670_220257_220402_228135_228244_230387_230485_235736_235848_244163_244286_247691_247748_252282
905834	contig_17144_pilon	-	1240	5	Intergenic	novelGene_29239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2926.38192782487	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	16	945	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179779	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167283_174945_175001_175973_176271_179700
905835	contig_7321_pilon	+	4323	1	Intergenic	novelGene_53134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGGGTTGCTATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165530	169853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_165500_169900
905836	contig_12464_pilon	-	3015	4	Intergenic	novelGene_68655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCACCTAAAACATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281105	117912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_120017_210317_210896_272259_272341_280853
905837	contig_7078_pilon	+	2563	2	Intergenic	novelGene_130218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	113	436	960948	961271	TRUE	5	GTCTTCTGTGCCTTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGLVLLSIVPCCPEVLYFKHFLCLSSWTQAIWFSAITMTVPSQPPVLIFIAGSNSVCWNTQGLCSGFSFLVSLNIILFNPLPSNTMTLKYLVMAYLWISRLENSGIYLTFPYGCLNSFQMKNGKNRNTYFLLESVHSSQSSSSH	960835	963681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_961364_961646
905838	contig_5253_pilon	+	4352	1	Intergenic	novelGene_61590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATCCAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338816	343168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_338800_343200
905839	contig_15866_pilon	-	2447	23	Intergenic	novelGene_63600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAGAAAACAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411486	279817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_279891_298025_298171_320833_320912_321399_321450_325883_326014_327159_327248_336076_336153_337477_337565_345219_345320_351322_351394_368539_368628_371353_371403_374371_374534_376728_376863_378938_379033_381903_382089_382343_382429_386494_386613_386774_386841_388053_388168_389788_390016_402956_403129_411431
905840	contig_10021_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_168666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078386	1080868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10021_pilon_+_1078400_1080900
905841	contig_3745_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_85099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	268	807	1015	1821	456820	456014	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVIIDWFKPRWIKVNFKVTTKKVNKPTYQNKEEKHKVSVKTKSTKTKEMKKKNPKTKGIQHKRVRGTKKTLAPQKKKHYKMTAINSNLSIITLNVNGLNAPTKRWRVTEWIKIQDPSICCLQETYLRNKDVNLLKIKGWKKIHQANSYQKRAGVATLISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNYRAPKYIKQTLTALKREINSSTITVGDFNTPLSVKDRTSRKKLSEDTEDLKGTISQRDLTDT	457834	455573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_455600_457800
905842	contig_5502_pilon	+	8354	3	Intergenic	novelGene_154984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	323	1298	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	7358	7669	395703	398610	FALSE	25	TATCTTGGTTGTCTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	384020	399295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_391296_395620_395841_398436
905843	contig_9091_pilon	-	3544	10	Intergenic	novelGene_32413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	190.064771285871	2155	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	104	526	28734	16041	TRUE	65	ACAAAAAGGAAAAATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDCAAVANWIFSSELSRDFTRLFVWEILHSTIRKMSKHVLKIQKELEEAKEKLARQHKRRSDDDDRSSDRKDGALEEQIERLQEKVESAQSEQKNLFLVIFQRFIMILTEHLVRCETDGTNVLTPWYKNCIERLQQIFLQHHQIIQQYMVTLENLLFTAELDPPLQELFMQRLK	31213	2305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_2417_3890_3993_5981_6153_7076_7195_13524_16076_18717_18788_24577_24692_25320_25450_28659_28775_31150
905844	contig_14219_pilon	-	3783	18	Intergenic	novelGene_54288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_17	268.034122188649	26	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1178	3534	250	3783	676735	598103	FALSE	15	GCTGGCCTCGTGCAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIVNGGSWTGEPPRRNSHTFNCRMLVKPLPDSEEEGHDNQEAHQKYETMQCFAVSQPKSIKEEGEDLQSCLICVARRVPLKERPVLPSSESFTTRQDLQGKITSLDTSTMRAAMKPGWEDLVRRCIQKFHTQHEGESVSYAKRHHHEVLRQGLAFSQIYRFSLSDGTLVAAQTKSKLIRSQTTNEPQLVISLHMLHREQNVCVMNPDLTGQAMGKPLNPISSSSPAHQAMCSGNPGQDMTLSSNINFPINGPKEQMGMPMGRFGGSGGMNHVSSMQATTPQGSNYALKMNSPSQSSPGMNPGQPNSMLSPRHRMSPGVAGSPRIPPSQFSPAGSLHSPVGVCSSTGNSHSYTNSSLNALQALSEGHGVSLGSSLASPDLKMGNLQNSPVNMNPPPLSKMGSLDSKDCFGLYGEPSEGTTGQAESNCHPGEPKETNDSSMPQPGSSERPDGQNRLHDSKGQTKLLQLLTTKSDQTEPSPLSSSLSDANKDSTSSLPGSGSTHGTSLKEKHKILHRLLQDSSSPVDLTKLIAEATGKELSQESSSTAPGSEVTVKQEPVSPKKKENALLRYLLDKDDTKDIGLPEVTPKLERLDSKTDPASNTKLIAMKTEKEEMSFEPSDQPGSELDNLEEILDDLQNSQLPQLFPDTRPGAPTGSVDKQAIINDLMQLTAENSTVTPVGAQKTALRISQSTFNNPRPGQLGRLLPNQNLPLDITLQSPTGAGPFPPIRNSSPYSVIPQPGMMGNQGMIGNQGNLGNSSTGMIGTNPSRPTMPSGEWAPQSSAARVTCAATTSAMNRPVQGGMIRNPTASIPMRASNQPGQRQMLQSQVMNIGPSELEMNMGGPQYSQQQAPPNQTAPWPESILPIDQASFASQNRQPFGSSPDDLLCPHPASESPSDEGALLDQLYLALRNFDGLEEIDRALGIPELVSQSQAVDPEQFSSQDSSIMMEQKAPVFPQQYASQAQMAPGSYTPMQDPNFHTMGQRPSYATLRMQPRPGLRP	883265	598102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_598313_601123_601290_605267_605398_609037_609254_611519_611727_614151_614363_625515_626786_628523_628672_632777_632922_633201_633304_635724_635914_638846_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_845300_845389_883180
905845	contig_10500_pilon	+	1932	7	Intergenic	novelGene_41287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGGGGCCGACCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628557	1640161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637066_1639870
905847	contig_593_pilon	-	5478	7	Intergenic	novelGene_102040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2567	2941	810557	810183	FALSE	80	AAGTAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIIIECPEDSRQYQNILKKTDKIVPIGIQNITLGDLPAEENALELPDREFKSLIFRANQDLKEKADKNEEKMTKSWKRQTKPWKRQKKSGRIQENNTGTKCPNKFTTRYHSKTTVKNPKYKQ	1042518	807645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_810990_811399_811677_826439_826829_883899_884483_998660_998769_1041689_1042103_1042154
905848	contig_17274_pilon	-	1521	9	Intergenic	novelGene_26577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_8	326.931543866602	386	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	141	830	247024	232842	TRUE	70	AAAACAAAAACCAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	259035	231306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_258905
905849	contig_18108_pilon	-	4740	1	Intergenic	novelGene_33481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATAGTGACCCTATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239520	234780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_234800_239500
905850	scaffold_6394_pilon	+	3476	22	Intergenic	novelGene_111069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_14	120.197984823189	303	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	940	2823	72	2894	536459	618488	FALSE	10	ATTTACTCCGGGTTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALPAARAPPPGPSSRGRHPGPKMPAVSKGDGMRGLAVFISDIRNCKSKEAEIKRINKELANIRSKFKGDKALDGYSKKKYVCKLLFIFLLGHDIDFGHMEAVNLLSSNRYTEKQIGYLFISVLVNSNSELIRLINNAIKNDLASRNPTFMGLALHCIANVGSREMAEAFAGEIPKILVAGDTMDSVKQSAALCLLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNPEEFKTSVSLAVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEPAVRGRLTECLETILNKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAQQIVAEMLSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIVINRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLIAGDPRSSPLIQFSLLHSKFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKATIQDVLRSDSQLKNADVELQQRAVEYLRLSTIASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEETKRERSADVNGGAEPAPASASAASTPSPSADLLGLGAVPPAPTGPPPSSGGGGGLLVDVFSDSASAVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFRQNLGRMFIFYGNKTSTQFLNFTPTLICSDGLQSNLNLQTKPVDPTVDGGAQVQQVVNIECLSDFSEAPVLNIQFRYGGTFQNVSVKLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEITKAKIIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTKTTQIGCLLRLEPNLQAQMYRLTVRTSKDTVSQRLCGLLSEQF	536387	619070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_536526_576725_576795_578671_578815_580656_580851_585085_585216_587984_588087_593943_594053_596872_597021_599989_600159_600370_600509_602743_602927_603578_603677_604476_604709_604799_604974_610091_610262_613032_613116_614045_614136_616275_616400_617159_617277_617400_617471_617597_617733_618410
905851	contig_2646_pilon	+	3735	2	Intergenic	novelGene_69572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1397	1765	1111236	1111604	TRUE	50	TGCAAAACTGAAAACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHGEVVNVKCKFFLSGRGNKVDQTGDKPLCHSCQVSHKSALQLVQSMQFILSPLKHEVWPLLFRGDEAVGFCILNLLIDTHAARIVYIDITCKQGKSASSTTFHQSQNKQSQDSKHSIPVL	1109839	1121867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1113454_1121746
905852	contig_9919_pilon	+	4189	1	Intergenic	novelGene_137960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGATTAGTATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545440	549629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_545400_549600
905853	contig_2798_pilon	-	4101	2	Intergenic	novelGene_120048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCCAGCTTCCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169936	163458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_164529_166905
905854	contig_16594_pilon	-	4102	10	Intergenic	novelGene_53790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3127.83091330433	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	228	896	165546	121101	TRUE	35	TCTGAGATTGAAGAGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRKGKPKVAAAAALRAALPGALRTVSERSLERRRGESEKQGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306171	115109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115308_115504_115817_115872_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_165477_165649_306046
905856	contig_7119_pilon	+	4578	13	Intergenic	novelGene_41015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	81.3966625032419	128	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	16	1590	198227	218460	TRUE	40	TTAGCCCCAGCAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAASSASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKYANMWLEYYNLER	198211	222435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217142_217268_217328_218346_221177_222163
905857	contig_12468_pilon	-	3199	1	Intergenic	novelGene_164879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGCAATTCAGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67372	64173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_64200_67400
905858	contig_9668_pilon	+	3171	9	Intergenic	novelGene_58102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	463.173006958523	3	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	882	1424	339365	359314	FALSE	35	ACCATTTGAATTTTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	213988	361061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_281470_281586_282642_282811_331983_332161_337928_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
905861	contig_6375_pilon	+	2822	1	Intergenic	novelGene_72989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTAAGCATGTCTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293497	296319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_293500_296300
905863	contig_7593_pilon	+	3371	1	Intergenic	novelGene_127347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCATCACGTAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630438	633809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_630400_633800
905864	contig_12080_pilon	-	4526	1	Intergenic	novelGene_128358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	433	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCACCAGTAGGCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83311	78785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_78800_83300
905865	contig_15491_pilon	-	2573	5	Intergenic	novelGene_75970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	236.844358176419	288	121	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	99	560	86030	80831	TRUE	25	ACTTCTGTTTGTTAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQAEEVSQESQKELQEKIKTLIETLDEKSKKLMELQHENLKLQEALKRAANFSGPCPQDWLWHGENCYLFSSSPYNWEKSQETCLSLDAQLLKINSTGDLEFIQKASAHSSFPFWMGLSLRKPNNSWIWEDGSPWMSHLFRLQGASKIYSSGTCAYIQRGIVYADNCILVAFSICQKKANLLTAQ	86128	78775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_80408_80449_80973_81236_81353_81674_81815_85966
905866	contig_15353_pilon	+	3164	1	Intergenic	novelGene_151996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTTGTACATCTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541685	544849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_541700_544800
905867	contig_15327_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_70678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3046	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901426	900443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901256_901390
905868	contig_5236_pilon	+	1271	7	Intergenic	novelGene_100931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	28.7078192987362	31	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	207	839	979976	1005141	FALSE	30	TAGTGTACAGTATTTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSGKQLLQSVLHLMENGALVLTTNFDNLLELYAADQGKQLESLDLTDEKKVLEWAQEKRKLSVLHIHGVYTNPSGIVLHPAGYQNVLRNTEVMREIQKLYENKSFLFLGCGWTVDDTTFQALFLEAVKHKSDLEHFMLVRRGDVDEFKKLREDMLDKGIKVISYGNEYADLPEYFKRLTCEISTRGRSAGTVRGQLNGSSSAHSDVRQ	928544	1005573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_928586_965113_965207_979903_980132_983078_983208_985897_986184_1004817_1004873_1005134
905870	contig_5050_pilon	-	4287	1	Intergenic	novelGene_110253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATGTAAATCCTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269900	265613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_265600_269900
905871	contig_20756_pilon	+	2767	13	Intergenic	novelGene_176924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	26.0676204002846	208	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	338	1885	6331	16694	FALSE	5	TTGCTCCCAGTTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKRYNIMAFNAADKVSFATWTQARLERDLSNKKIYQDEELPESGAGSEFNRRLREEARRKKYGIVLKEFRPEDQPWLLRVNGKAGRKFKGVKKGGVTENASYYIFTQCPDGAFEAFPVHNWYNFTPLARHRTLTAEEAEEEWERRNKVLNHFSIMQQRRLKDQDQDDEEEEKEKRGRKKASELRIHDLEDDLEMSSDDSEASGEEGGRAPKAKNKAPAGKAGRRKKKKGPDDEALEDSDDGDFEGQEVDYMSDGSSSSQDEMESKPTVTKQEEGPKGVDEQSESSEESEEEKPPEEDKEEEEEKAAPTPQEKQRRKDSSDESDSSEESDIDSEASSALFMAKKKTPPKRERKPSGGSSRGNSRPGTPSAEGSTSCTLRAAASKLEQGKRTSDMPTAKRLRMDAGPQGLSGKSTPQPQSGKSTPSSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTKKTGLSSEQTVNVLAQILKRLNPERKMINDKMHFSLKE	5993	17576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20756_pilon_+_6343_6422_6470_7907_7981_10992_11187_13262_13434_14687_14873_14957_15109_15187_15250_15433_15554_15635_15710_15786_15923_16284_16403_16489
905872	contig_17144_pilon	-	1898	12	Intergenic	novelGene_29426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2041.93817748265	2	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	157	1233	179764	170838	TRUE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERDSMPWPEILTASGWAGTPPAPSLRPT	183238	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166427_168192_168310_168996_169099_170744_170918_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
905873	contig_5686_pilon	-	2519	2	Intergenic	novelGene_45310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATGAAAGGGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100402	96426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_98347_99803
905874	scaffold_9100_pilon	+	1579	8	Intergenic	novelGene_83262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_5	491.398504063574	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	98	1033	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_652013_652069_653324_653449_654139
905875	contig_15118_pilon	+	3548	2	Intergenic	novelGene_74555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1404	1886	143898	144380	TRUE	30	AAACTATCCTCTCCACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALAKNKAPGVDRIPTEIFQQVDAALEALTCPCQEIWRTATWPTDWKRSIFGLMPRKGDPTECRNYRTISLISHPSNILLKIIQKQLQQYVNKELPEIQARFRKGCGTRDIIAYVRWILAGNREYQKDVYLCFVDYAKTFDCVDITNYG	142494	256264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_144736_254957
905876	contig_6102_pilon	-	2070	3	Intergenic	novelGene_32346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	906	junction_1	6.5	8	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTAAGAGGGAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688804	1686251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1687297_1687629_1688077_1688226
905877	contig_15666_pilon	-	2708	5	Intergenic	novelGene_70131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	713.474728003732	3	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	676	1566	110619	107816	FALSE	35	CTAATTCCTTTAATTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	111294	106673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_109098_109378_109948_110246_110558
905878	contig_2480_pilon	+	2630	14	Intergenic	novelGene_63536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	70.7518373274299	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	188	1876	254349	279119	FALSE	20	TTACTCGTGTCACCCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFPGFFELFLRVLWWVGILALYLRHREKLDCAGGALLSSYLIVLIVLLAVVICAVSAIVYVSMKGTICNPGPRKSMSKLLYIRLALFLPEVVWASLGAAWIQGVECDRTVVNGIIATVVVSWIIIASTVITIIIVFDPLGGKMAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251520	279873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
905879	contig_6361_pilon	-	3435	6	Intergenic	novelGene_23927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4521.2031584524	12	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	5	TCTATTCCTGGTGCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	255661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_256544_409059_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
905880	contig_3780_pilon	-	3071	3	Intergenic	novelGene_169784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_1	179	247	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	207	890	17102	15808	FALSE	30	AGCTTTCCTTTTTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISDLYKSLEQKESKIQQLAETVKKFEKEFKQFSQLFGKNGNLLSNIQALASHIDKSAWLEAQVRQLLQMANQQQTKLDLRPLVEAIDTIKQKITTLETNDQILVVLEGQTNKHDAHINIHKAQLNKNEERFKLLEGACYNGKLIWKVTDYKMKKREAVDGHTVSIFSQPFYTSRCGYRLCARAYLNGDGSGKGTHLSLYFVVMRGEFDSLLQWPFRQRVTLMLLDQSGKKNHIMETFKADPNSSSFRRPDGEMNIASGCPRFVAHSTLENAKNTYIKDDTLFLKVAVDVTDLEDL	19019	13626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3780_pilon_-_16386_16996_17166_18876
905881	contig_7119_pilon	+	2584	2	Intergenic	novelGene_40888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	571	1149	139647	140225	FALSE	30	CTAAAGGTTGGCGATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127412	141660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_139265
905882	contig_2087_pilon	+	3342	3	Intergenic	novelGene_65547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCGACAACTAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4609	9602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_5644_5752_7492_9033
905883	contig_11081_pilon	+	3437	12	Intergenic	novelGene_167077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.5635869900408	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	140	1582	28817	55557	FALSE	40	TAAGAGAGTGAAGGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSVLAEGKGGFIRAKLVCKTLENFFASADEELTIDHVPIWCKNSQGQRVMVEQSEKLNGVLEASRLWDNMRKLGECKEEAYQMTHDGYLKLWQLSKPLLASFDAIFVDEAQDCTPAIMNIVLSQPCGKIFVGDPHQQIYTFRGAVNALFTVPHTHVFYLTQSLCSLRKGGIRGDTKGQVALLSRTNANVFDEAVRVTEGEVPSKIHLIGGIKSFGLDRIIDIWILLQPEEERKKQNLIIKDKFIRRWVHKEGFSGLKRYVTAAEDKELEAKIAVVEKYNIRIPELVERIGKCHIEDLDFAEYILGTVHKAKGLEFDTVHVLDDFVKVPCARHNLAQLPHFRVESFSEDEWNLLYVAVTRAKKRLIMTKSLENILTLAGEYFLQAELTSNVLKTGVVRCCVGQCNNAIPVDTALTMKKLPITYSNRKENKGGYLCHSCAEQRIGPLTFLTASPERVHSMDRTIENIVLPRHEALLFLVF	27950	57412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_28044_28770_28994_29968_30057_30140_30228_30935_31073_39202_39347_41149_41226_41852_42051_42593_42720_44461_44569_54697_54830_55386
905884	contig_348_pilon	-	3714	1	Intergenic	novelGene_67617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	2245	2718	330188	329715	NA	30	ATCAGCATGCTCCTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRIRSAFLKLKELKRKFKPEVAILKDSTRKILKDTGSIKVRWKGCSELLYQKELVGIQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKTLAKNKAPGIDGIRTEMFQQTMQCWKHSLVYAKKFRRQLPGQLTGIDPYLCLFPRKVTPQNVEII	332432	328718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_328700_332400
905885	contig_678_pilon	-	4184	3	Intergenic	novelGene_167808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTGTTTTTTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118461	96865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_97316_110285_113503_117944
905886	contig_14744_pilon	-	1684	7	Intergenic	novelGene_65999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	383.434225853086	1059	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	72	1244	969897	960939	FALSE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPNCAPFSMAEFLEADRQDFLPRHLWVDSNLQPFSYREPYAPPKDSLSAA	969968	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961278_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
905887	contig_6138_pilon	-	2858	18	Intergenic	novelGene_159683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_15	109.314916022709	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	697	2595	599150	569009	FALSE	25	TGAATCAGTGATTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLLLERPTDDSVEVAIGFLKECGLKLTEVSPRGINAIFERLRNILHESEIDKRVQYMIEVMFAVRKDGFKDHPVILEGLDLVEEDDQFTHMLPLEDDYNPEDVLNVFKMDPNFMENEEKYKVIKKEILDEGDSDSNTDQDAGSSDEEEEEEDEEGEEDEEGQKVTIHDKTEINLVSFRRTIYLAIQSSLDFEECAHKLLKMEFPESQTKELCNMILDCCAQQRTYEKFFGLLAGRFCMLKKEYMESFESIFKEQYDTIHRLETNKLRNVAKMFAHLLYTDSLPWSVLECIKLSEETTTSSSRIFVKIFFQELCEYMGLPKLNARLKDETLQPFFEGLLPRDNPRNTRFAINFFTSIGLGGLTDELREHLKNTPKVIMAQKPDVERNKSSPSSSSSASSSSESDSSDSDSDSRDNSSESSSEESGSSSTGSRSSASAKNIRKKAQGKTRSKEVDKLIRKQQTNDRKQEERRPEQRHQETRTERERRSEKHRDQNSRDPNRREATTKYSSDRGVPSERDSYSRVANDRDQEMYIDLENKHSDPKKKREERRNSFSENEKHRHRTKDSENFRRKGRSKSREKNSKHSGSRSDDNRYQNGAERRWEKSSSYSEQSREPEKNQDRRREKSPTKQK	615014	568745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_569596_575307_575529_575621_575724_577345_577474_579122_579276_579911_579990_583601_583663_591382_591465_592701_592807_598577_598641_598732_598940_599038_599175_600629_600684_601111_601281_606576_606706_608113_608265_613332_613444_614956
905888	contig_7153_pilon	+	5301	9	Intergenic	novelGene_178811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	4442	4891	394437	395044	FALSE	25	TTCCAACTGCATTTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRISEIEDKAPDTNLFEEKSDKRIVENLLAENVLDIVKDDKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPKHIIIKFAKTKHKERILRVSRDKQKVICKEESIRISSDYSGETVQARRQWDDIYKALKNMMATLRHFQINRSLGNLQKPNQNYKKY	0	395454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7153_pilon_+_995_5040_5414_132198_133427_278746_279035_279155_279460_283964_283988_393205_394509_394615_394906_394956
905889	contig_8978_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_49311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136207	133667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_133700_136200
905890	contig_6361_pilon	-	7146	2	Intergenic	novelGene_24020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11607	junction_1	0	331	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3059	3388	420979	419370	FALSE	15	CCAGGGATCAGTGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPVSHFQYCIIQICNHTQNNCYKYSCHLMVSFI	424037	415611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_419591_420870
905891	contig_401_pilon	-	2587	9	Intergenic	novelGene_42742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	59.1173356554573	218	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	90	1085	926186	905195	TRUE	15	TAACTGGTTTTGTTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEEVLTLQETLEALSLSEYVSTFEKEKIDMESLLMCTIDDLKEMEIPLGPRKKIANFVKHKAAILEQKKTSSEKKAVLAASTKGREESAPKARETASLPSESNGSKRKLPVGPYVSSVHVDYESFEVGTGQVSVVYNSLDFAPEIFFALGSPIGMFLTVRGVDKIDENYRLPTCKGFFNIYHPLDPVAYRLEPMIIPDLDLKAVLIPHHKGRKRLHLELKESLSRMGSDLKQGFISSLKSAWQTLNEFARAHTSSTQLQEELEKVANQIKEEEEKQVVEAEKIVESPDFSKDEDYLGKVGMLNGGRRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTALLLLKEIYRTMNISPEQPQH	926275	896258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_897741_905174_905277_906024_906188_906895_907082_918591_918695_919074_919231_920654_920853_924790_924887_926174
905892	contig_1107_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_126588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAATATGACAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827564	829697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_827600_829700
905893	contig_6163_pilon	-	2681	2	Intergenic	novelGene_103804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_1	0	63	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	369	719	78436	78086	TRUE	10	CTTTTCCCCAGCTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVSWQPLSMAISMLIPPGLRVVLAGWWRPALARDSLVRVWACVLFLRMNSFPLDSEAVEHIIFHPVTQVWTS	78804	75166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094
905894	contig_4852_pilon	+	3140	4	Intergenic	novelGene_153969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAGATTCCCAATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83223	90226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_+_84724_86842_86945_87165_87245_88767
905895	contig_16492_pilon	+	3195	6	Intergenic	novelGene_100316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_3	117.794736724524	13	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	23	1396	177832	193608	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFENISSPESSPAHRPESLSPELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSGEPMAFCCQSGSGNMCQAPHS	177809	195407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_177932_184045_184294_187439_187497_189449_189921_191928_192228_193409
905896	contig_7078_pilon	-	1345	3	Intergenic	novelGene_130144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTCAGATGTTGTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243601	231914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_232197_236106_236214_242645
905897	contig_3081_pilon	+	2844	2	Intergenic	novelGene_133987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	985	1662	2971957	2972634	TRUE	45	ATCAATTACATGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEPNAKINSQLEIIHRQQLEIQKINNKISEIDGVIEGVRSRFETVEDRISGIEEKHLDTPVFEENTEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRATREKQEVQYRGETIRQSSDYSAETMQARRQWDDIHKISKEKQIASQE	2970972	2973953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2972721_2972857
905898	contig_15518_pilon	+	2517	1	Intergenic	novelGene_127630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTAATCTGGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38145	40662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_38100_40700
905899	contig_11386_pilon	+	4380	6	Intergenic	novelGene_82801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	30.5286750449475	248	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	323	769	90888	93371	TRUE	35	GCATTGCTAGAAACAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWEATYLLAPVLLVLRVSDSREQETAPVLLQKLEVTSSRSQVQKSRYSIQDERSSGYFIINMTGLRTADSGFYYCGNYNSFSSVVHILRSFHLIVSQASTPSTTRSTVSTTVQASATNLATDRYCHHLCLFSPPFPPTLSPVPNTPT	90565	100046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_90946_91207_91256_91357_91547_93219_96764_98903_98963_99886
905900	contig_8156_pilon	-	970	2	Intergenic	novelGene_98927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315996	306525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_307367_315867
905901	contig_10494_pilon	+	2752	2	Intergenic	novelGene_102237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1162	1533	1284115	1284486	FALSE	15	GCCATGGACATCGGCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSRADHLLTEVTTGEAPLVIARVRRHCPQVPPAYPHCTQRQVPKKVQGQNPALKVRRGGGARSAPHGHGSQHQCPEHHRARSSRRPLPGIPLPLMGLPSSWFGLPALCSGLRLLNGTEDVT	1282595	1285705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1282808_1283165
905902	contig_11056_pilon	+	3007	3	Intergenic	novelGene_130354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	8.5	193	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	348	1460	112932	114044	FALSE	25	TGCTGGACTAAACTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETGEEEKVSAEALGFSDLSDSEFLDLEDAQGLDASLSKPGPSCELSGNDGKPRSLQKWKRGLDVSSPMERFHFKYLCVTDLSTQNWCEQQMVYGKEFPGFLTPEKAALLDTGASIHLARELEVHDLVTIPITTKEDAWAIKFLNILSMIPTLQSEGHIREFPVFGEVEGVLLVGVIDELHYTAKGELELAELKTRRHPMLPVEAQKRKDYFQVNLYKYIFDAMVQGKVTPASLIHHTKLCPEKPLGPSVLRHAQQGGFCVKSLGDLMELVFLALTLSDLPVIDILKIEYIHQDTATVLGTEIVAFEEKEMKGKVQHYMAYWMGHREPQGVDVEEAWKCRTCNYVDICEWRKGGWVPTSTLEPKTKKKK	102408	115591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_102669_103501_103559_112901
905903	contig_11836_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_178812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	624	1673	131520	132569	FALSE	55	TCAGCAAAAACAAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMNPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	129980	132868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11836_pilon_+_130292_131207
905904	contig_610_pilon	-	4991	2	Intergenic	novelGene_76803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3740	4246	306758	306252	TRUE	85	AACAAAAACAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHFGEVQTFSSVSLPTPSKESKYKDNEQDGHQQEVQDKLGGVCFTSGTFKERMAGAQEREEGQLGKMTRMLEQLPPSSQPGNFRVASSFCIKSVPMGTRGRKRLATRGSWREGRAAPSQRFQEEMGFEKFLLMGFLAMQMKVIFFSPSVQEMGRMEPSWDSLAVFQL	310497	304223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_304861_306143
905905	contig_13699_pilon	+	1372	11	Intergenic	novelGene_158307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	267.958224355962	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	381	1268	16972	31214	FALSE	30	GGAGGCATCATAGACACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGYEIKLSQEEGVPADLSALESHRSTLRHWLSHVKEKNSVFSVLDEEIAKAKVVAEQLSRLTPERNLDLERCQEKGSQLQERWHRVIAQIETRQSELESIQEVLGEYRACHGTLIKWIEETTAQQEMMKPGQAEDSRVLSEQLSQQTDLFAEIERNQTKLDQCQKFSQQYSTIVKDYELQLMTYKAFVESQRKSPGKRRRMLSSSDAITQEFMDLRTRYTALVTLTTQHVKYISDALRRLEEEEKVVEEEKQEHVEKVKELLGWVSTLARNTQGKTTSSQTKGSTDIEKAILEQQILSEELTAKKEQVSEAIKTSQIFLAKHGHKLSEKEKEQISQQLNALNKAYHDLCDSSSNQLQQLQSQLAQQTEQKGCRAVAGVIDLGTVEIFPIFRAMQKGLIDQDTGLVLLESQIIMSGLFLLVA	14835	31318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_14922_15605_15800_16871_17035_19204_19289_22109_22218_22414_22514_23788_23942_24250_24340_26798_26935_30502_30640_31195
905906	contig_6266_pilon	-	5469	19	Intergenic	novelGene_170994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	112.870200224707	530	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	208	2514	791310	733642	FALSE	55	AACATGAAAGTTAATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVHIDTESISALIKQVNRSIDGTADDEDEGVPTDQAIRAGLELLKVLSFTHPISFHSAETFESLLACLKMDDEKVAEAALQIFKNTGSKIEEDFPHIRSALLPVLHHKSKKGPPRQAKYAIHCIHAIFSSKETQFAQIFEPLHKSLDPSNLEHLITPLVTIGHIALLAPDQFAAPLKSLVATFIVKDLLMNDRLPGKKTTKLWVPDEEVSPETMVKIQAIKMMVRWLLGMKNNHSKSGTSTLRLLTTILHSDGDLTEQGKISKPDMSRLRLAAASAIVKLAQEPCYHEIITLEQYQLCALAINDECYQVRQVFAQKLHKGLSRLRLPLEYMAICALCAKDPVKERRAHARQCLVKNINVRREYLKQHAAVSEKLLSLLPEYVVPYTIHLLAHDPDYVKVQDIEQLKDVKECLWFVLEILMAKNENNSHAFIRKMVENIKQTKDAQGPDDAKMNEKLYTVCDVAMNIIMSKSTTYSLESPKDPVLPARFFTQPDKNFSNTKNYLPPEMKSFFTPGKPKTTNVLGAVNKPLSSAGKQSQTKSSRMETVSNASSSSNPSSPGRIKGRLDSSEMDHSENEDYTMSSPLPGKKSDKREDSDLVRSELEKPRSRKKTPVTDSEEKLGVDDLSKLVQEQKPKGGQRGRKRGHTASESDEPQWPEEKRLKEDLLENEDEQNSPPKKGKRGRPPKPLGGGIPKEEPTIKTSKKGSKKKSGPPAAEEEEEDDRQSGNTEQKSKSKQHRLPRRAQQRAESPETSAVESTQSTPQKGRGRPSKTPSPSQPKKNVRVGRSKQAATKENDSSEEVDVFQGSPPANDDITQEETEEEEVSPVRRRSSKRDRR	797928	730686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_733678_735548_735682_738940_739049_739141_739582_744973_745080_748919_749066_749655_749719_751254_751375_751627_751761_753529_753645_756070_756276_762129_762254_765031_765169_766795_766865_772662_772822_775103_775228_791221_791383_794002_794109_797899
905907	scaffold_880_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_121387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	665	976	268671	268360	TRUE	5	GGGTTGTTGTTCTTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTNGPFLCERKERDSGYRVGDGCVSAEIEGRWGDGKGQLGDRAPPQLLSVPCELGNTLRVTLLLSLSVSQGDSETPLEITNSLSIESILTPNNPIGQSRTAP	269335	266403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_266642_266826
905908	contig_10990_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_7399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTTTGAAGAGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119452	121630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_119500_121600
905909	contig_4486_pilon	-	3765	1	Intergenic	novelGene_38550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTCTTTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138708	134943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_134900_138700
905910	contig_10734_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_51039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCCACAAGGGGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386678	387854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_386700_387900
905911	contig_5586_pilon	+	3472	1	Intergenic	novelGene_143539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	996	1310	328064	328378	NA	40	CAGAACAACTTCCACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRHIQIGKEEAKLSLVDDDMILYIENPRDSTRMLLEIIEGFSKVAACKINTEKSIGFLCTNREDSEKEIKKSVPFTIAPKRINKIPKNKPNQGCKRLIQGKL	327068	330540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_327100_330500
905912	contig_11846_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_106013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465173	462386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_462400_465200
905913	contig_1847_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_171733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGTACACATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139245	138449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_138400_139200
905914	contig_12677_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_110697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTTGGAGTAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1100
905915	contig_1406_pilon	-	2026	3	Intergenic	novelGene_25518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	227	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1663644	1653850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1655663_1658488_1658614_1663555
905916	contig_10323_pilon	+	2855	2	Intergenic	novelGene_123636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCATAGGGTTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506555	510187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_508154_508930
905917	contig_18637_pilon	-	1665	2	Intergenic	novelGene_81851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCCTTTGACACAACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216511	154383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_154695_215157
905918	contig_10777_pilon	+	1288	12	Intergenic	novelGene_101161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	254.713321271303	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	258	1145	8328	53404	FALSE	55	ATTGAGTTGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSDAAKPFSMVIFHCRHMFHKECLPVPSMNSPAQFCNICSAKSRGPGSAILEMKK	6467	53547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560_50606_52656_52737_53323
905919	contig_9345_pilon	+	2094	3	Intergenic	novelGene_24520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	1679	2092	675802	679558	FALSE	65	GATACTAAAAGAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVWQGCLPHWSPHKIQPSGAGGCQCPKALKYVSEELRSPPGGFPPSSLGRPQQWLSVEPPEHLLGVKEHEGGQQGGGGVSPKLLALPQHLLSHMAGQNIAKWSDPGLNILQNFMQPLRESNVVKIRENIIDPSIFK	672624	679560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_673591_675089_676106_679448
905920	contig_17144_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_29464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1818.15618163744	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	328	1905	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166521_170801_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
905921	contig_15108_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_131185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCCCCTTTGATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122506	120903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_120900_122500
905922	contig_5894_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_83023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCAGTTACCAAGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297025	299598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_297000_299600
905923	contig_6199_pilon	-	3965	1	Intergenic	novelGene_126339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1242	1559	82811	82494	NA	40	AAGGTCATTTCCAGATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFITTSFIIVLEVLARAVTLEKEIKGIQIDREKFKVSLFADDMILYTENPKESSRKLLEVIQDFSKVSGYKINIQKSIGPATWFSRQKHHAIPLQQRYEKLSQT	84052	80087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_80100_84100
905924	contig_5033_pilon	-	1866	4	Intergenic	novelGene_28962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	1242.2031503207	100	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	144	749	477189	458223	FALSE	45	TAAAAATGTTAGGCAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESEIQNAALICGNLL	477332	457105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_458261_462973_463031_464547_464983_477113
905925	contig_4315_pilon	+	1720	3	Intergenic	novelGene_46817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGTGCCACTTCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342134	345845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_343698_344460_344567_345794
905926	contig_10904_pilon	-	1634	8	Intergenic	novelGene_22543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	231.687245207492	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	116	820	396033	375288	FALSE	5	TTTGTGTGTGGCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTLEQGRYCISWSREDILSNTNGKTEGISVEQAEGAAMISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGAAPDKMTKSSLLRLVCMRL	396148	374473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375322_379166_379195_379301_379395_381161_381213_388756_389054_389359_389492_389761_389798_395999
905927	SIRV6	+	1017	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	500	11	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	CTATGGGGAAAGAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
905928	contig_10904_pilon	-	1226	4	Intergenic	novelGene_22749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_3	413.991143222493	867	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	34	879	662714	652299	FALSE	15	TCTACTGTTGTTGAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662747	651951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_662665
905929	contig_12638_pilon	-	1997	13	Intergenic	novelGene_33065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	93.7717382204729	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	1598	1996	77507	40692	FALSE	85	AGAAAAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTEPASTLAELQDISTVTVTNTFKKTGDFVTSKAPAVDLDHKFRCKVVDCLKFFRKAKLLHYHMKYFHGMEKSPEPEESPGNRHVQTRGSSSSDKASQDSLARKRVSASSPTAKDKEKNKEKKFKEFVKVKP	137308	40690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_40754_51872_52152_77449_77630_78343_78533_79439_79554_79728_79862_83545_83934_87172_87253_96222_96308_97539_97712_100655_100742_128452_128568_137195
905930	contig_20199_pilon	-	500	3	Intergenic	novelGene_82526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	216	56	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44026	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_42110_42171_43906
905931	contig_2476_pilon	-	5269	16	Intergenic	novelGene_157622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_3	63.9397633193409	416	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	442	1806	147115	111465	FALSE	25	TAAAACTTTTCTGTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEINWTGLTNLLDIPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVTEVQIAQLRFPIPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLLKGKSDPYGVIRVGNQIFQSKVIKENLSPKWNEVYEALVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLTEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLKLEWLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKHQDLEIEVKDEQHQCSLGNLKIPLSQLLTSHDMTMNQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLYLEKQERSPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKIPVKSQISVSPATEGSKTTPSTPVIDGSSKTDMEEKDQPSNASPQWPRDLSRSSSSLQASNFTYSPSHISVKEPTPSIASDVSLPVATQELRQRLQQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHSCRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELAKGWTQWYDLTEDGTRLRTVT	158672	108001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_111511_111628_111679_112563_112670_113958_114091_117479_117579_119129_119519_121505_121656_134494_134582_135386_135462_144886_144983_145472_145563_147070_147120_148861_148945_151287_151465_154347_154469_158616
905932	contig_16622_pilon	+	2046	3	Intergenic	novelGene_48498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1017	1319	115175	115477	TRUE	25	ATTTAAGTTGAGGCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELALQLSMLGPQGPPVLLQSLVLGPPLFTLLLCQGQGPLREIREERRCLGDSREMCSWLHCSPELPPGVLSPKDSAESPYLCALQLLLCTHFLLQHFLQ	114158	121903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_115561_118813_118889_121334
905933	contig_7189_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_117648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402553	405152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_402600_405200
905934	contig_10129_pilon	+	2698	6	Intergenic	novelGene_128162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	239.721171363732	79	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	34	918	586326	596842	FALSE	25	TTTGACTTGGTAATGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSAAAWARSGMYFCWGAGSRVRLRREAEGGAELQQAASGERHALLLLSDGTVHSCGDNSWGQLGRRDKPHGKRPERIQALETLKVDLLSCGKEHCLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGTGGFEELKFTPKKVNTLADIKIIQVSCGHYHSLALSQDGKVFSWGKNSDGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSVSGTSFGWGSNNAGQLALSGNNVSVQSYKPRSIGALKELGVIYISCGYEHTAVLTQDGKVFTFGDNSSGQLGHSPTAKKKGPQLVEGIDGLVSQIDCGR	586292	598622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_586519_588123_588284_589293_589371_592929_593158_595360_595456_596710
905935	contig_13787_pilon	-	1464	6	Intergenic	novelGene_40608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	929.61613583242	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	267	407	175026	131430	TRUE	5	CTTCTCCCCTCGAGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGLLLILLLQVAAGIIGVVFKPEYKRILNETLHEEAKLLNETNDAAVKFQKAIAEFEEEFKCCGLINGAADWGNNFEKYYKSCECPIMSNLSCTTYEGKSVYKQTCVSLIKDYFGKYIIIVIGIAFGLAFIET	179836	130312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_130878_130937_131436_171775_171860_174975_175111_179556_179665_179762
905936	contig_9683_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_151271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTTCCAAGGAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126758	128684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_126800_128700
905937	contig_11163_pilon	+	1938	6	Intergenic	novelGene_153051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1257	1556	73484	74180	TRUE	15	GAGAACGTCGCGGGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVFVAQFCSGHGEHLGNYETVCSLLATLTLNLSLQPKNKELTHLQSHDTGIIQEAHHQLSEEPGKQQTFYSENWKEQILLPHLDDSYTLNAWPCTLP	32803	117394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_34021_73444_73676_74072_74189_83581_83752_110643_110748_117294
905938	contig_12479_pilon	+	3818	8	Intergenic	novelGene_56895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	108.342992766642	307	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	117	1745	605876	619471	FALSE	35	TTTCTAAAAATGACATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAVAGCCHGELDKIYETLALAERRGPGPVDLLLCCGDFQAVRNEADLRCMAVPPKYRHMQTFYRYYSGEKKAPVLTIFIGGNHEASNHLQELPYGGWVAPNIYYLGLAGVVKYRGLRIGGISGIFKSHDYRKGHFECPPYNSSTIRSIYHVRNIEVYKLKQLKQPMDVFLSHDWPRSIYHYGNKKQLLKAKSFFRQEVENNTLGSPAASELLEHLKPTYWFSAHLHVKFAALMQHQAKDKGQPAKATRFLALDKCLPHRDFLQVIEIEHDPSAPDYLEYDIEWLTILRATNDLINVTGRLWNMPENNGLYTRWDYSATEEAMKGVLEKLNHDLKVPCNFSVTAACYDPSKPQNQMQLLHRISPQTTEFCAQLGITDINVRLQKAKEEPYLCNENEEQDDVESNDSGELSEYNTDTSALSSVNPDEIVLDEEEEDADSMLSAHSDTNTSSVGPSDQASDFSASFSDVRILPGSMIVSPDDTLGSPIATEGKAGDTMESRDGKDLIEAPLKRLSDEHEPEQRKKIKRRNQAIYTAVDDDDVA	605759	621544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_606073_606829_606955_608824_608906_610976_611063_614920_615146_617880_617962_618083_618230_618783
905939	contig_8045_pilon	+	2987	2	Intergenic	novelGene_35397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATTGAACACTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116385	119408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117589_117624
905940	contig_2798_pilon	-	6067	5	Intergenic	novelGene_119988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	146	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	3136	3567	138503	138072	TRUE	50	CCAGATAAACAGAATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMAPLNITLSDPLTKFLLPVPLTLCSASLEVLVPKGGMHPFGDASLIPLKWRLRMPPGHFGLLMPQDQQAKKGVTILAAVIDPDYQEEIRLIFHNGCKEWYVWNAGDPLGHVSVLPCPVNKVNGKLQQPNCDLTTNGLDPQE	141638	8568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_9317_9408_9742_9908_10383_49756_50057_137426
905941	contig_8145_pilon	-	2183	6	Intergenic	novelGene_118646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	140.5546157193	14	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	97	516	735820	731044	TRUE	30	TTCCATTTTATTATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEEINEDYPVEIHEYLSTLENSIGAVDEMLKTMMSVSRNELLQKLDPLEQAKVDLVSAYTLNSMFWVYLATQGVNPKEHPVKQELERIRVYMNRVKEITDKKKAGKLDRGAASRFVKNALWEPKPKNASKGANKGKK	737364	729332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_730332_730375_731203_733967_734024_734339_734407_735682_735830_737277
905942	contig_10864_pilon	-	2105	13	Intergenic	novelGene_107077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	651.795783244688	350	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	464	952	919572	897050	TRUE	20	CACTTGGCTACCGATACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMDELKEGLRQRDELIEKHGLVIIPNGTPNGDVSQEPVVGAITVVSQEAAQVLESAGEGPLDVRLRKLAGEKEELLSQVQAFFPLADQKTEAAAGGGAAERPQE	976551	893901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_894805_895375_895481_896060_896141_896984_897106_901977_902053_903662_903796_911644_911738_919440_919612_924360_924390_927814_927932_929301_929347_958175_958263_976405
905943	contig_15293_pilon	-	2186	2	Intergenic	novelGene_146528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCAGAGCTGCCCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106485	103608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15293_pilon_-_103675_104365
905945	contig_10386_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_173542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122312	121154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_-_121200_122300
905946	contig_6048_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_73296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1451	1885	2000525	2000959	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHASPPPLETLWGTNPRNIPNSAGQLYTALSSTSPVCPCPGRSSIHTQGVPGVPLPKGHQHNLPLVMLSGTDLLTVGSSCGDEYVHPMVSHSQLQDLRGKKGYSSCLETSGQPGGRKSCSVIRYSVLVGKRQIGLLNSESAP	1999074	2001230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1999100_2001200
905947	contig_9682_pilon	-	4095	2	Intergenic	novelGene_125297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2737	3105	27128	26760	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAICSMWSLSSLYCSGRENSIISQKIARQTGLSHSSDKRPLQIRGLVRSGECRYLTHTASPGNPGHPCLPSIVGRAEPQHDGLMQRPHLPTRWVSAMNLSPLDSWESGTHVRIQVMLQMMLY	30210	25769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_28006_28351
905948	contig_9955_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_21358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162439	160731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_160700_162400
905949	contig_20890_pilon	+	1989	1	Intergenic	novelGene_147046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACCAATCCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25464	27453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20890_pilon_+_25500_27500
905950	contig_14635_pilon	-	2676	11	Intergenic	novelGene_84369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_3	96.7148385719585	129	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	36	2144	629511	583285	FALSE	20	CTGAGTATCTTATGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNLDNEQPDYDMDSEDETLLNRLNRKMEIKPLQFEIMIDRLEKASSNQLVTLQEAKLLLNEDDYLIKAVYDYWVRKRKNCRGPSLIPQIKQEKRDGSTNNDPYVAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRREFSRAITILEMIKRREKTKRELLHLTLEVVEKRYHLGDYGGEILNEVKINRSEKELYTTPATLHNGNHHKVQECKTKHPHHLSLKEEASDVVRQKKKYPKKPKAEVLITSQQPTPETLPVINKSDIKQYDFHSSDEDEFLQVPSPVSEPEEENDPDGPCAFRRRAGCQYYAPRLDQTNHSFENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPSRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEMLNGFSSSSQTVDFSCNFSRTNASNKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDSEECTSRKPGQTVNNKRISAASVALLNTSKNGISVTGGITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQLQQKQQSQHSSQQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRGEVAKEQNTGHNNINGVVQPSGTSKTLYSTNMALSSSPGISAVQLVRTVGHTTTNHLIPALCTSSPQTLPMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNVHINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAISSIARCVCGCVFQVSFCPFVVAILWKEKDIFCCCLLLKQ	629546	582752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_583725_584690_584851_586287_586425_595441_595786_595893_596040_597684_597775_603225_603418_605472_605606_606337_606487_612736_612944_629400
905951	contig_19777_pilon	-	3066	3	Intergenic	novelGene_29712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24996	21827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_22714_22751_23984_24048
905952	contig_1462_pilon	+	1365	3	Intergenic	novelGene_178280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAATCCAAAAGAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187722	219892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1462_pilon_+_188516_201446_201538_219411
905953	contig_1443_pilon	+	4837	1	Intergenic	novelGene_28342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1300	1656	803572	803928	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRYSTLASRSKYYRLLKFVTLLLSTSLSIPVLFLSIDKTFPSYHPWEHAKPKPKPLPSLSIVTHSDPIRHSRTAPQGFQRAIGGFKLPTFFDSSWALNHCTQGLDFPLSSCASSQH	802272	807109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_802300_807100
905954	contig_3009_pilon	+	3401	2	Intergenic	novelGene_132510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGAAGTTTAGAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50540	54094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_52277_52429
905955	contig_14556_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_138534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGATGAAAAAAGGACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176518	174250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_174200_176500
905956	contig_7457_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_31511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670924	670137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_670100_670900
905957	contig_5791_pilon	-	3726	3	Intergenic	novelGene_35850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_1	42.5	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	2385	3242	1060017	1059160	TRUE	30	CGGTTCAAACCCAGCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDSKILSNWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNPTEKHKKLYPSCSFIQNLVSVTSLGSTSKNTSPMRNSFAHSLSPTLEHSGSFSGSYCNLSPNPVNSRAVEDISPLRTNPYSYAMSTEEARFLTYQMWPLTFLSPSDLARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRFSISNLSMQTRAARLRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGKKETNM	1062401	1056312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1056541_1057135_1057215_1058982
905958	contig_17144_pilon	-	1482	11	Intergenic	novelGene_29318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	157	1398	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTLCPVSVDWASQATCTL	183238	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166201_172623_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
905959	contig_1639_pilon	+	2005	20	Intergenic	novelGene_74894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_18	233.490982226645	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	104	1942	283593	315717	FALSE	30	TCAGTATTTTATGAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGQNTGNNNP	283489	315780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536
905960	contig_302_pilon	-	2753	2	Intergenic	novelGene_145011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_1	0	109	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGAAGTCAGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58281	51789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_54442_58180
905961	contig_12864_pilon	-	9474	27	Intergenic	novelGene_76345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_26	235.672238174448	699	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2831	8493	980	9472	110334	82676	FALSE	5	TGCCCCTTCTGATGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSASSSSSSSSSASSGPALLRVGPGFDAALQVSAAIGTNLRRFRAVFGESGGGGGSGEDEQFLGFGSDEEVRVRSPTRSPSVKTSPRKPRGRPRSGSDRNSAILSDPSVFSPLNKSETKSGDKIKKKDSKSIEKKRGRPPTFPGVKIKITHGKDISELPKGNKEDSLKKIKRTPSATFQQATKIKKLRAGKLSPLKSKFKTGKLQIGRKGVQIVRRRGRPPSTERIKTPSGLLINSELEKPQKVRKDKEGTPPLTKEDKTVVRQSPRRIKPVRIIPSSKRTDATIAKQLLQRAKKGAQKKIEKEAAQLQGRKVKTQVKNIRQFIMPVVSAISSRIIKTPRRFIEDEDYDPPIKIARLESTPNSRFSATSCGSSEKSSAASQHSSQMSSDSSRSSSPSVDTSTDSQASEEIQVLPEERSDTPEVHTPLPISQSPENDSNDRRSRRYSVSERSFGSRTTKKLTTLQSAPQQQTSSSPPPPLLTPPPPLQPASSISDHTPWLMPPTIPLASPFLPASAAPMQEKRKSILREPTFRWTSLKHSRSEPQYFSSAKYAKEGLIRKPIFDNFRPPPLTPEDVGFASGFSTSGTAASARLFSPLHSGTRFDMHKRSPLLRAPRFTPSEAHSRIFESVTLPGNRSSAGTSSSGVSNRKRKRKVFSPIRSEPRSPSHSMRTRSGRLSTSELSPLTPPSSVSSALSISVSPLATSALNPTFTFPSHSLTQSGESAEKNQRPRKQTSAPAEPFSSSSPTPLFPWFTPGSQTERGRNKDKAPEELSKDRDADKSVEKDKSRERDREREKENKRESRKEKRKKGSEIQSSSALYPVGRVSKEKVLVGEDVATSSSAKKTTGRKKSSSLDSGTDIASVTLGDTTAVKTKILIKKGRGNMEKNNLDLGPTAPSLEKEKTLCLSTPSSSTVKHSTSSIGSMLAQADKLPMTDKRVASLLKKAKAQLCKIEKSKSLKQTDQPKAQGQESDSSETSVRGPRIKHVCRRAAVALGRKRAVFPDDMPTLSALPWEEREKILSSMGNDDKSSIAGSEDAEPLAPPIKPIKPVTRNKAPQEPPVKKGRRSRRCGQCPGCQVPEDCGVCTNCLDKPKFGGRNIKKQCCKMRKCQNLQWMPSKAYLQKQAKAVKKKEKKSKTSEKKESKESSIVKNLVDSGQKPTPSAREDPAPKKSSSEPPLRKPTEEKSEEGNTSAPGPESKQVTTPASRKSSKQVSQPAPVIPPQPPSTGPLKKDVPKTTPSEPKKKQPPPPESGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQKPKEKEKPPPVNKQENAGTLNILSTLSNGTSSKQKIPADGVHRIRVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSIPITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWDAQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTEQHPAEWRLALEKELQISLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNPETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQEDQQPLDLEGVKRKMDHGNYISVLEFSDDIVKIIQAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSSNSGMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREENSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTSLHPPTPPILNTDRSREDSPELNPPPGIEDNRQCALCLTYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIVECRPPVVEPDINSTVEHDENRTIAHSPTSFTEISSKESQNTAEIVSPPSPDRPPHSQTSSSCFYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGSPTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPQRSKLRIMSPMRTGNSYSRNSVSSVSTTGTATDLETSAKAVDHVLGSLNSSTNLGQNPPTSSNLQRTVVTVGTKTSHLDGSSSSEMKHTSASDLGSKSSSLKGEKTKMLSSKSSEGSGNNVAYPGIPKLAPQVHNTTSGEINISKIGTFVEPSSVPYSKEALSFPSLHLRGQRSDRDQHTDTTQSANPSPEADTDVKTLKLSGVSNRSSIINEYVGSSSRDRRQKGKKSCKETFKEKHSTKSFLEPGQVTTGEEGNVKPEFVDEVLAPELIGQQPCNNVSSDKIGDKVLSIPGVPKTSSMQVEGSAKELQTPRKRTVKVTLTPLKMESENQSKNTLKESSPASPLQGESASPAEPVSASESPGDGPVAQPSPNDTSSQDSQNNSYQNLPVQDRNLMLPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSSSTGKKRGKRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSSGEERLASNNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATTRKSSQIPKRNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVIKSSAGHKNEPKMDNCHSVSRVKTQGQDSLEAQLSSLESSRRVHTSTPSDKNLLDTYNTELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESSSSELLNLGEGLGLDSNRGKDMGLFEVFSQQLPTTEPVDSSVSSSISAEEQFELPLELPSDLSVLTTRSPTVPSQNPNRLAVISDSGEKRVTITEKSVPSSEGDPALLSPGVDPTPEGHMTPDHFIQGHMDADHISSPPCSVEQGHGNNQDLTRNSSTPGLQVPVSPTVPIQNQKYVPNSTDSPGPSQISNAAVQTTPPHLKPATEKLIVVNQNMQPLYVLQTLPNGVTQKIQLTSSVSSAPSVMETNTSVLGPMGSGLTLTTGLNPSLPTSQSLFPPASKGLLPMPHHQHLHSFPAATQSSFPPNISSPPSGLLIGVQPPPDPQLLVSEASQRTDLSTTVATPSSGLKKRPISRLQTRKNKKLAPSSTPSN	138755	82673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_85900_86305_86492_87059_87221_87917_87997_88117_88236_88497_88657_89649_89788_90597_90705_91060_91255_91867_91942_92230_92342_93079_93254_94371_94557_94969_95084_95993_96115_96357_96454_97637_97785_100792_100907_101971_102104_102644_102719_103063_103442_103881_103947_105653_105889_106730_106909_108405_111063_113716_113787_138574
905962	contig_16303_pilon	-	3378	7	Intergenic	novelGene_34113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	84	junction_5	628.735437207097	26	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	95	1186	45428	35759	FALSE	10	TTGGCTGGGCCATGATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45522	33566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
905963	contig_8865_pilon	+	3058	3	Intergenic	novelGene_164471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2546	2890	526642	598832	FALSE	40	ATATACAGAGTCACTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLQKIRTSPQEPKYHLEYIPPEFRSHLKNRFDISNTNDQKPDELWNNIKDVIHEESKRSLKRQKRKKRPKWMSEETLKLALECRLPKAKRRNYEVKQLNRRFQGGSRRQNKVL	457812	599000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_459934_526217_526839_598684
905964	contig_4364_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	920	1402	1214325	1214807	NA	90	GACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTMRRLPQVKREPGENGTSLTDEELVTMSVRELNQHLRGLSKEEIIQLKQRRRTLKNRGYAASCRVKRVTQKEELEKQKAELQQEVEKLASENASMKLELDALRSKYEALQNFARTVARSPVAPARGPLTAGLGPLVPGKVAATSVITIVKSKADARS	1213405	1215810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1213400_1215800
905965	contig_17875_pilon	-	2687	10	Intergenic	novelGene_143182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.12160822022031	20	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	149	1642	123572	81212	FALSE	10	GGGTTCCTCTTTCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAESAPTPNEHIIPQGLLENSIKITNEPPTGMLASLHAALYNFDQDTLEMCSKEQEFKTILFSLCYFHACVAGRLRFGPQGWSHSYPFNPGDLTICANVLYNYLEANTNVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRKLCRVYLEEFMNPSLVEDELMLAPGFAAPPNLDYSGYHQYIEEMLPPESPALYGLHPNAEIEFLTVTSNTLFRTLLEMQPRNALSSEELGQSTEDKVKNVLDDILEKLPEEFSMAEIMQKNSNRSPYVLVCFQECERMNILLREIRESLQQLDLGLKGELTLSPNMEAQQSALSYDTVPDTWVKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLVLPAVVWLSGFFNPQSFLTAIMQTTARKNEWPLDKTCLTVDVTKKTKEDYGHPPREGAYLHGLLMEGARWDVQSGTIAEARLKELTSVMPVIFAKAIPVDRQETKHTYECPVYKTKTRGPNYVWTFRLKKKEKTAKWVLAGVALLLEA	124543	80166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17875_pilon_-_81460_82378_82520_83109_83223_101703_101820_101900_102084_107128_107372_114738_114859_117505_117698_123434_123663_124485
905966	contig_11316_pilon	+	2754	2	Intergenic	novelGene_122646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2	514	137674	138186	TRUE	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137672	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138599_138698
905967	contig_14357_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_121684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATAGGGTTTCCAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565769	567989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_565800_568000
905968	contig_7357_pilon	-	2300	7	Intergenic	novelGene_36865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	233.799356048918	97	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	42	554	249442	234918	TRUE	35	CCCAGCTAGTTACTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGRHRFVFSAVDMADETPKKGNFSALVGHTNGLTKPASLAAAAAVTTKPGGGSGSKKLVIKNFRDRPKLPDNYTQDTWHKLHEAVKAIQSSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKVSPTLYKQLRQVCEDHVQAQILQFREYTLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMVSLSTFSLVLMACMAQSLLEF	249483	227100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_227239_228379_228470_229094_229258_233562_235052_240163_240270_247801_247918_249285
905969	contig_12250_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_80528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAAAAAAAAGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123771	125024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_123800_125000
905970	contig_7323_pilon	+	3296	1	Intergenic	novelGene_173205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAGAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6988	10284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_+_7000_10300
905971	contig_12860_pilon	+	1021	5	Intergenic	novelGene_178813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	48.5611727617857	216	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	894	128	1021	11959	58904	FALSE	10	GTATTATTTTTTGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGKRRTKDDTWKADDLRKRLWVTQADSPKEEKKHREKKLQKESEIDLLEYRVRKYKDQDPDAKYKERISARDAHMSKETPRGERDREKQRERKKDTKDWEREKYKEKHREQDTDKSHSRGKDREKEKERKARKEELRQTTAYHNLLGHEARDKQLLEKAERKIRSVSKVRIEEKEKKDDDSERGDEERERRYRERKLQYGDSKDNPLKYWLYKEEGERRHRKQKEQDQEKKHREKSSTREKIPKEKNSSFSDKEGKERHKEKRHKEGVHLDEERQQSNMDKKERSSKEEHKKRDFK	11831	58904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12860_pilon_+_11974_21528_21583_22626_23060_36063_36156_58604
905972	contig_10861_pilon	-	4767	12	Intergenic	novelGene_39351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	156.07017917093	785	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	326	1567	1523683	1521248	TRUE	10	CCACATGCTGTTGTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRRRRRWRWTTKKTGKPLVADPTALTTDRKNTENSQSLRDLTKSLTVMRGKTRERDATGSHQLTLQTTNLLIMDHEPIVLHQKPGKGHSNAFQDRLGVSQERHLGEPQSKGVVSQSKEHKSSHKEKRLLDAKGDEKSSAVSREKSHKAVSKEENRRPLSGDSTKEKPPPSGAKKEREREGSSIKKKSLPPLEVASDNHLKKPKHKDSEKTKSDKNKQGLDSLDIGKGAGDLVPKVKEKVSNSLKSQEGKLKTSSLDRKSAGSLPKAEEADMDDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGEKGLKKSDSKSTSKNLDSVRKLPKMNESKSEKLQPSGADSAKLKKVPTDILPVLPDLPLPMIQANYRPLPSFELLSSLQTKRKDSTLFTPGRGRSWIHWTQNEF	1535570	1515231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1517764_1518732_1518915_1519500_1519613_1519942_1520124_1520947_1521046_1521152_1521313_1522064_1522180_1522550_1523388_1523458_1523743_1524776_1524884_1530182_1530240_1535468
905973	contig_13592_pilon	+	1714	4	Intergenic	novelGene_33733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1447	junction_1	361.564194392457	1	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	219	845	267426	269322	FALSE	40	AGAACAGTTAAGTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGVCALNAKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKAWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYIIGGAESWNCLNTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSRAISCVEMYDPTRNEWKMMGNMTSPRSNAGIATVGNTIYAVGGFDGNEFLNTVEVYNLESNEWSPYMKIFQF	267207	270191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_267493_267571_267704_267825_268000_269068
905974	contig_3525_pilon	-	2882	7	Intergenic	novelGene_135135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_6	53.9258750508511	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	30	1073	609659	591940	FALSE	30	TTGGAAAGACAGTATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRVLARFMARFWVCAAGAGFFLTFLVLHSCFCGSPILRNFVFQISWTTENILYRLDVGWPKYSEHFTGTTFCVAVDSFNGLVYVAQRGDNMPKVLVFTEDGYFLRAWNYTVDTPHGIFAASTPYERSVWITDIGNGSYGHTVKKYNSFGDLVQVLGTPGKKGTDLNPLQFDNPAELYVEDTGDIYIVDGDGGLNNRLFKLSQDFTMLWLHGENGTGPTQFNIPHSVTVDSAGRVWVADRGNKRIQVFDKDTGEWLGAWDNCFTEEGPSSVRFTPDGKYLIVAQLNLSRLLLLEAPPVGSIGSCSVVSTIQLADQVLPHLLDVDRKIGAIYVAEIGAKQVQKYVPLKSYFLSLGS	609688	590130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_592193_592762_592876_602693_602786_605990_606192_608457_608606_608885_609039_609575
905975	contig_7035_pilon	+	2754	5	Intergenic	novelGene_83530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	2183	2752	484211	484780	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTKIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKHITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHI	427864	484782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_428157_429108_429535_436161_436851_437021_437218_483631
905976	contig_11281_pilon	-	3624	1	Intergenic	novelGene_125481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879065	875441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_875400_879100
905977	contig_10078_pilon	+	4577	17	Intergenic	novelGene_160009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_13	101.623212622658	467	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	972	2919	80	2998	219088	287116	FALSE	15	ATTACTGGCTCTTCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIDPSSVASPKDPEDIPTFDEWKKKVMEVEKEKSQSMHPSSNGGQHATKKVQKNRNNYASVECGAKILAANPEAKSTSAILIENMDLYMLNPCSTKIWFVIELCEPIQVKQLDIANYELFSSTPKDFLVSISDRYPINKWIKLGTFHGRDERNVQSFPLDEQMYAKYVKVEFISHFGSEHFCPLSLIRVFGTSMVEEYEEIADSQYQSERQELFDEDYDYPLDYNTGEDKSSKNLLGSATNAILNMVNIAANILGAKTEDLTEGNKSISENATATAAPKMPESAPVSTPVPSPEFVTTEVHIHEIEPSTPDTAKESPIVQLVQEEEEETSPSTVTLLGTGEQEDESSPWFESETQIFCSELTAICCISSFSEYIYKWCSIRVALYRQRSRTAVRKGKDYLLSPQPPLMLPTESVDSSVLQPPSGELDSKSMERDTETVVLDDLSSMHQSDLINHTLHAMELEPSHPQTLSQSLLLDITPEITTLSKIEVTESVKHETGHTPSQVIPQESSVEVDNKTEKSESSSSIEKPSVIYATSKVNELTDNIVKEDINSMQIITKLSETIVPPINTATVPDSEDGEAKMTITDTPKQILTPVVDSSSLPEVKEEDQSPEDALLAIPGSSGLQRTATDFYAELQNSTDLGYANGNLVHGSNQKESVFMRLNNRIKALEVNMSLSGRYLEELSQRYRKQMEEMQKAFNKTIVKLQNTSRIAEEQDQRQTEAIQMLQAQLANMTQLVSNLSTTVAGLKREVSDRQSYLVISLVLCVVLGLMLCVQRCRNTSQCDGDYISKPPKNNQYPSPKRCFSSYDDMNLKRRTSFPLIRSKSLQLTGKEVDPNDLYIVEPLKFSPEKKKKRCKYKTEKIETIKPADPLHPIANGDIKGRKPFTNQRDFSNLGEVYHSSYKGPPSEGSSETSSQSEESYFCGISACTSLCNGQSQKTKTEKRALKRRRSKVQDQGKLIKTLIQTKSGSLPSLHDIIKGNKEITVGTFGVTAVSGHI	219008	288695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_219110_220543_220669_221142_221211_235856_235965_237385_237492_240018_240075_240553_240646_241714_241781_252260_252330_253034_253126_255848_257025_258270_258359_274075_274181_275905_276061_276552_276645_285545_285602_286672
905978	contig_4924_pilon	-	1585	12	Intergenic	novelGene_84693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	515	junction_7	1012.69060648493	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	189	1394	155859	65524	FALSE	10	GGGCTCCCTTGTTTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252503	65332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
905979	SIRV6	+	1125	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	3	400	3	94	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	290	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	255	746	1733	10736	TRUE	25	AGAGACCTATTCGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1090	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
905980	contig_5454_pilon	-	3790	1	Intergenic	novelGene_145499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120924	117134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_117100_120900
905981	contig_11378_pilon	-	3226	1	Intergenic	novelGene_112261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATATGTGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387281	384055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_384100_387300
905982	contig_14682_pilon	-	2737	6	Intergenic	novelGene_139105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	98.4918270720977	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	652	1647	122475	94370	FALSE	70	GAAAACTAAAAAAAACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	141979	93279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96558_119740_119809_122397_122532_124154_124254_141483
905983	contig_20527_pilon	+	4902	5	Intergenic	novelGene_138607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	1143.70939818645	28	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	2662	3408	23541	27453	FALSE	35	ATAATGACCATGCTAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	20879	28947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_23740_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
905984	contig_10126_pilon	-	3812	9	Intergenic	novelGene_105719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1131	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1804	2454	184883	184233	TRUE	15	CGCCGCGAGCTGGCGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAGPLAATSPRLRIWVPGFLSSFSMVGAVQSKGKWFAKSPGMVVLAGEEVESSPSSPWQIKLCSVKEAVKGLQDHDKDPGVGAAEARELLGPWLLWSVPRWAAWLVWQHQPPCVGTCRAVVGLKCWRARVVGRQELPSLLGPRAWPSWCSGGWAAAPQHCGSMWDRKLMGNGPKTTKAVHFLWIRTLAYSEQEGSGLGAESLGTWLRWTMSRLA	186778	139718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_139792_162013_162303_165403_165721_166329_166664_169468_169582_172547_172573_181520_181567_184071_186124_186215
905985	contig_2365_pilon	+	4467	25	Intergenic	novelGene_103731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	318.745838752794	390	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	202	1515	130213	219475	TRUE	45	AATTTTTTCTAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLKVISEKSLTNSSRIVGLLAQLEKINTESTESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRKEMTAKGSTGMEVLLSTLENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRASFLVAKGGSQILLQLLMNASKESPTNEELMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSGLMKVALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVHVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDLEAENETENEDDIDQNFKNEDIETDINKLKPQQELGRALEELKMYEHLFPELVDDFFEGL	116733	316014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_130179_130245_158563_158689_165788_165857_168859_168924_169337_169485_171536_171669_173639_173734_190643_190682_193762_193972_195604_195783_206223_206322_212137_212250_219458_220181_227531_227616_229217_229305_229386_229536_248941_249030_254096_254242_258064_258246_260405_260536_261545_261678_272888_273066_277040_277202_315101
905986	contig_10940_pilon	+	1179	3	Intergenic	novelGene_49208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGACCAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819578	839031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_819804_834339_834964_838701
905987	contig_12931_pilon	-	2497	4	Intergenic	novelGene_166761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_2	26.106618998935	342	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	39	389	98906	71935	FALSE	50	TATGATAATTAAAGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESEKKGLIERIYMVQDIVSTVQNILEEIASFGERIKNTFNWTVPFLSFLACLILVIATITLYFIPLRYIILIWGINKFTKKLRNPYTIDNNELLDFLSRVPSDVQKVQYAELKPCSNQSPLRKKRSIP	98944	69826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_72004_74174_74273_80522_80633_98832
905988	contig_9272_pilon	-	2449	11	Intergenic	novelGene_125905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310522	281139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_282003_282536_282668_283484_283611_289338_289538_290011_290186_294981_295128_298467_298625_302277_302482_303120_303236_303826_304095_310456
905989	contig_5686_pilon	+	3100	14	Intergenic	novelGene_45396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1786.46654322413	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	276	2114	170242	211355	TRUE	30	GCATTTGCATCTCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	169966	212393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283_211712_211763
905990	contig_11720_pilon	-	1599	9	Intergenic	novelGene_43769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6625	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCTCTAGCCGGCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98764	67762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_86225_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
905991	contig_10437_pilon	+	1170	2	Intergenic	novelGene_38364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGATTTTGGTGAGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559418	560849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_559471_559731
905992	contig_19865_pilon	+	2578	9	Intergenic	novelGene_170152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	110.523753103123	5	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	122	1060	43592	81192	TRUE	15	TGAACGTTGCCCGTGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFENKHQEDFPMRSPGDGNHSCLVLKRSCWFTNWMATTLSLVYQYLSHCGFRSSLSWQPPLDRREETTGGSVFAKISVSFCLKFSRF	43470	82781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191_79369_79682_79754_79927_80052_81132_81367_81437
905993	contig_7088_pilon	-	4875	7	Intergenic	novelGene_159779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	435	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1746	2195	346623	346174	TRUE	50	CCAAAAGAGACCTTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQITYIRNEMDDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSTKFENLEEMDKFLETPYLPKLTQTEVEQLNKPITKEEIEKVIKKLPTEKSPGPDGFTGEFYETFRKELPSLLLRVFLSIEKDGILPNSFYEASITLIPKPGKDATKKENYRPISS	440502	258216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_259270_293904_294830_344980_345233_345723_346808_346855_347110_438682_439584_440096
905994	contig_10017_pilon	-	2564	14	Intergenic	novelGene_156991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_13	379.711101641839	8	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	20	1147	337686	307398	FALSE	35	CCTTGCATATAGAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDKNIQMADNSSSDGVPSDSLEAAKNASNKEKLTDQVMQNPQVLAALQERLENVSHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVKCAHIEAKFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEEEDKLAGDVKNKVVIAEKEAATAEEPNPKGIPEFWFTIFRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYKMKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPNDSFFNFFSPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNFEEGEEGEEEDLEGDEEGEEDEDAEINPKV	337705	305980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_307404_309261_309319_309601_309632_312468_312589_313000_313024_316229_316376_317605_317746_323654_323727_325798_325931_327519_327607_327845_327988_330763_330864_334941_335001_337672
905995	contig_6137_pilon	-	2832	2	Intergenic	novelGene_59250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGAACTGGCACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324453	1319307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1321503_1323816
905996	contig_2890_pilon	-	2592	2	Intergenic	novelGene_60285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAGGAAAATTTACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320331	313581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_313589_317746
905997	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
905998	contig_11281_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_125459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGCACGTTCAGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829020	830313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_829000_830300
905999	contig_3103_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_146189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTAATCTCAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65029	62944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_62900_65000
906000	contig_10500_pilon	-	3477	9	Intergenic	novelGene_41275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	797.536519540015	41	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	288	1196	1640040	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1703929	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627490_1627822_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871_1640106_1703707
906001	contig_8447_pilon	+	3907	13	Intergenic	novelGene_69406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	542.541242671928	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	721	1956	48468	82214	TRUE	25	AGAAACTTTTTTGCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	40769	84486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_83804_84124
906002	contig_14711_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_68880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	978	1373	60530	60925	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFMFFYARVWSRYKSPSICLVLCPVCCCHVRECLHSSRRCVSDLESWASQPGPRSWERLQPVIKSLFEAPLSLARNFLNFSNLGFKRKKNLESTSLLLSRSPCPGPACPAKGLQLWAEAVSPWWVSAQG	59552	61483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_59600_61500
906003	contig_17144_pilon	-	2928	16	Intergenic	novelGene_29373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2084.19427117531	9	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1071	2081	172736	166916	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEVRSLQGEGSGTPPLA	183409	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166934_167218_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173399_174678_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
906004	contig_2069_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_23291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGGTTTTTGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343854	344818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_343900_344800
906005	contig_9833_pilon	-	4456	2	Intergenic	novelGene_68480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_1	0	536	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1956	2414	130183	127641	FALSE	60	AAAATAACCAAACTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKFKETIEKCDNLEHRLNDLLKEKQSMERKCTQLNMKVAKLTTELKEEQEMNKCLRANQVLLQNKLKEEERVLKETCDQKDLQITEIQEQLRDVMFYLETQQKINHLPAETRQEIQEGQINIAMASATSTPSSGGSGKLPSRKGRSKRGK	132138	125598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_128005_130088
906006	contig_7035_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_83553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	396	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGCTGGAGGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811952	810349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_810300_812000
906007	contig_7839_pilon	+	1430	9	Intergenic	novelGene_45730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	703.372489776932	11	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	82	1008	952473	956139	TRUE	25	TGATGAGGATGCATCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEPLQAHERNLG	950917	956952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954483_956104_956153_956428_956763_956877
906008	contig_10437_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_38287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	975	1310	432090	432425	NA	80	AAAAAAAAACAAACAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKVDEIAMQAMRFQTVCFLPVQILFFQQCCNQYYSLISCQMPFLVLEIQQETKQSSCSYGTSILLRETARK	431115	433379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431100_433400
906009	contig_12786_pilon	-	5830	6	Intergenic	novelGene_103374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1719	162	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACTATGTTGTCTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596867	487357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_487677_487882_490369_516330_516956_534325_535191_595205_596640_596766
906010	contig_6842_pilon	-	1836	15	Intergenic	novelGene_130659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	364	759	373297	363465	TRUE	45	CAGATAAAAACAGCGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELEFIVLSSSCIMTSSELLSSMTSCMLFTLLLWLLVLTDMLGMEWLLPRLSISLLRLVPCSLSSSSSCDSFKGPFRVSWKRIFFIFRYCRLSSSRTASFVLCIRSIRTRSGRSRRTKSCRNSSADVGLS	393042	249462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_249599_329516_329614_334910_335138_339848_339902_340280_340383_342591_342639_343775_343873_346261_346345_347567_347659_362300_362395_363414_363498_371854_372024_373103_373309_383701_383838_392826
906011	contig_14744_pilon	-	2080	5	Intergenic	novelGene_66011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	515.935255143511	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1	483	969870	968300	TRUE	30	GCAAATACCATTTATTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969870	960505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_964176_964410_965701_966437_968108_968630_969717
906012	contig_6710_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_92958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
906013	contig_3386_pilon	+	5116	4	Intergenic	novelGene_34528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGGACTACCGCCGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404161	412207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404932_405135_405188_405424_409609_412097
906014	contig_3155_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_26453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTCTGACTCATAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372971	374945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_373000_374900
906015	contig_18843_pilon	+	3575	2	Intergenic	novelGene_165625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	940	1470	55582	56112	TRUE	50	AATCAAAACCAAAAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRETCRNPISATAAWIHHLGVLSEIGEQGVQKSSFTELPAGDRTTGNQGYTLSHLLYFFAPTQPPLLPAATVSWPESTSFTPGLLRFHPPALASSRSAVCWLLVLLLSTSLDFFLTSHYLPLLSLKYLAPCAIFASSWGAARRCSTVELLPGPSSHAGGTPGAFCSNFFCFDWFV	54642	59353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_57879_59014
906016	contig_15857_pilon	+	3084	1	Intergenic	novelGene_152078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	569	1063	129388	129882	NA	40	CCTATATGACAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRNWSLLKTCPKCMRQSLTILASKEYSGCTSSKTDLFIVLAVHGMFSILCQHHNSNVSIHLSSLFIVQLLHAYEAVANTMAWVSLTLVLKVISLLFNTSKRSSAADLPNAMRLLISQLLLPWALIVDLSKMKSLTTSVFSPSIMMMLLIGPVLKSFLYVEM	128819	131903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_128800_131900
906017	contig_15105_pilon	-	5148	2	Intergenic	novelGene_150949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	479	142	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	4084	4740	385510	384854	FALSE	30	GGTGTTTAGAAACTCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVQTDQEDTAWFKVRKGVCQGCILSPYLFNLYAEQIIREAGIYEEERSIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYDTIHFNIKKTKNFTTGPTSNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINTHGNSSQEIKSHTVPGKFAAKDLCKVLKSKDVTLKTKVRLTQAIVFSITSYACER	483671	384445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_387757_481834
906018	contig_11986_pilon	-	3916	1	Intergenic	novelGene_69233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTGGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779077	775161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_775200_779100
906019	contig_7179_pilon	-	5266	24	Intergenic	novelGene_78069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_13	128.257125958631	351	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2613	74	2686	547098	414067	FALSE	30	TGCTCAAGTGGAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSFVEVAVDGLPSETKKTGKRIGSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENTQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGSVPNGSAVTDGSQPPSRESSGTAVPPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGGSARTTTGSNEQSPGTRNRHRQPIKNPSHNGLPNGTVNDEATAATDPEEPSVVGVTSSPAAVSNVTLNPNAASLPAPATPAEGEEPGTSGTQQLSTTAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGTMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGQVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKNTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCVDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLYAIEETEGFGQE	570903	411486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_414167_414702_414776_414985_415083_416809_416915_417289_417411_418627_418769_419104_419239_420731_420892_423002_423092_423303_423376_423673_423750_424227_424357_424852_424935_428464_428520_434575_434751_451375_451466_468437_468649_480130_480259_501923_502021_503927_504066_540603_540726_541039_541188_547028_547114_570845
906020	contig_8238_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_165238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATTAAAAAAAAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338137	337266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_-_337300_338100
906021	contig_10904_pilon	-	3494	1	Intergenic	novelGene_22735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1420	1740	653700	653380	NA	20	TCCTGTTATTATTTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIVINGEKIEVVKNFILLRSTIKAHGSSGQEIKRPIVLSKSAAKHLFKVLKNKYVTLTTKVLLTLGMVFSIASYACESWTMNKEDRRRIDAFELWCWRRISNIS	655119	651625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651600_655100
906022	contig_7962_pilon	-	6040	6	Intergenic	novelGene_149282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.9389265388762	293	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	194	1015	147459	131499	TRUE	30	TTATGGGAAAGGCTATACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWNVLRTVSGLVHRTCLEPPKAGVFGHFQSIKGLLLLYNAESKVVLVQGPQKQWLHLSSAQCVAKESKSFIAQPPLLGAFHCKQWEQNILSKRIVSSSATSQGTPTGKKEEPDPLQDKSISLYQRFKKTFRQYGKVLIPVHLISSGVWFGTFYYAAIKGVNVIPFLELIGLPDSIVSILKNSQSGNALTAYALFKIATPARYTVTLGGTSFTVKYLRSRGYMSTPPPVKEYLQDRMEETKELLTEKMEETKDRLTEKLQETKEKVSFKKKVE	193609	49077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_49276_75395_75551_126826_131733_141384_141497_146983_147501_193457
906023	contig_21232_pilon	-	2025	10	Intergenic	novelGene_165979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	520	912	25361	19749	TRUE	5	TGGGTAGCTTCTCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGASTEGGGSVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAASVQNDAELDAPSVTFPTCAKISTV	28205	13489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_13665_14910_15168_18091_18347_18623_18853_19551_19820_22216_22505_25327_25462_27266_27475_27590_27714_28117
906024	contig_12864_pilon	-	3165	3	Intergenic	novelGene_76391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	551.5	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGTCCTTTATCAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218969	215157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_215890_215942_217908_218501
906025	contig_16715_pilon	-	5985	3	Intergenic	novelGene_178098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	42.5	339	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	290	1588	78856	76485	FALSE	15	TCTACTGATTTGTGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGEGYFAMAEDELASGSYIPLGGDFSSRDFGGGGGFDGPCLDYCESPTAHCNVLNWEQVQRLDSILSETIPIHGRGNFPTLELQPSLIVKVVRRRLAEKRIGVRDVRLNGSAASHVLHQDSGLGYKDLDLIFCADLRGEEEFQTVKDVVLDCLLDFLPEGVNKEKITPLTLKEAYVQKMVKVCNDSDRWSLISLSNNSGKNVELKFVDSLRRQFEFSVDSFQIKLDSLLLFYECSENPMTETFHPTIIGESVYGDFHEAFDHLCNKIIATRNPEEIRGGGLLKYCNLLVRGFRPASDEIKTLQRYMCSRFFIDFSDIGEQQRKLESYLQNHFVGLEDRKYDYLMTLHGVVNESTVCLMGHERRQTLNLITMLAIRVLADQNVIPNVANVTCYYQPAPYVADANFSNYYIAQVQPVFTCQQQTYSTWLPCN	79387	72087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16715_pilon_-_77262_78334_78894_79135
906026	contig_10711_pilon	-	5505	4	Intergenic	novelGene_118423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.450793488832	571	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAAATTGGTTTTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897407	706221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_706886_708383_712173_712745_713762_897371
906027	contig_12079_pilon	-	6081	5	Intergenic	novelGene_67469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1277	junction_4	657.032343191718	89	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	140	412	638707	600804	TRUE	15	CCTCGTAGCCTTTAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQELRKESPPPVQIPRQVLPGRCA	638846	593822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_598152_599463_600885_601782_601879_609189_609274_638695
906028	contig_17274_pilon	-	1323	7	Intergenic	novelGene_26574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	369.20485129833	10	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	114	557	247024	232847	TRUE	55	CTTTAAAAAGAAAGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRSGAQHSEMDLVRRELL	259008	231236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237157_243029_243105_246141_246311_246874_247035_258905
906029	contig_5832_pilon	+	1198	2	Intergenic	novelGene_134109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCAAGTTGTTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5403	21121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
906030	contig_5222_pilon	+	3210	23	Intergenic	novelGene_58977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_13	50.3062521786752	320	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	300	2462	37965	75095	FALSE	10	TGCGTGGCTCTCACAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSTVNYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTASYLRPREVQVREFEVLRKLNHQNIIKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVVAGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLMGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFTPFGGPRRNKEIMYRITTEKPAGAIAGTQRRENGPLEWSYTLPITCQLSMGLQSQLVPILANILEAEQAKCWGFDQFFAETSNILQRVVVHVFSLSQAVLHHVYIHAHNTIAIFLEAVYEQTNVAPQHQEYLFEGHLCVLEPSLSAQHITHTTASSPLTLFSMASETPKGLAFRDPALDIPKFVPKVDLQSDYNTAKGVLGAGCQARRLAQALLDGQELMLRGLQWMAEMLQATCRRTLEVTRTALLFLSSSLGSERFTNTAARPEIQELNRATELRSKLRTLAEVLSRCSQNITETRMSLRNLSSELAKNRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMYLIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLLQVFQEECVQKYQAALVTHGKRMRMVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKILDRLSYQLLQDGRVEAQASSSPIAPYPSPASGSQDLVLHMQELHEEMKQLTFDLQDNNRIIERLSRVPSAPDV	35453	75843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_35552_36304_36392_37536_37620_37933_38052_38958_39100_40249_40380_40976_41159_41864_42026_42908_43020_43573_43754_44369_44567_45282_45348_45430_45523_45683_45771_50617_50694_51007_51121_53998_54076_68292_68333_69123_69226_70544_70642_71736_71856_72116_72189_75061
906031	contig_14816_pilon	+	3295	3	Intergenic	novelGene_172456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAAATATTTTAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153741	157609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14816_pilon_+_153994_154523_155093_155135
906032	contig_6163_pilon	+	3008	2	Intergenic	novelGene_103844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGACCCAAGCCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435211	443745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_438034_443559
906033	contig_12852_pilon	+	4431	4	Intergenic	novelGene_141448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	218	junction_1	102.966013810383	165	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	350	709	536180	539112	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQVCVITVLCYL	533636	542834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_533917_536110_536210_537625_537824_538980
906034	contig_14546_pilon	-	2029	2	Intergenic	novelGene_157452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536325	534248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_535254_535301
906035	contig_10801_pilon	-	2310	9	Intergenic	novelGene_74068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	53.1975974551483	139	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTAAATAGTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439918	379143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_380330_381499_381657_382268_382525_384170_384407_388367_388484_400613_400713_409912_410060_411357_411422_439869
906036	contig_3832_pilon	-	2609	3	Intergenic	novelGene_161455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTATTTATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486904	328063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_328940_466861_466947_485256
906037	contig_15720_pilon	+	3272	1	Intergenic	novelGene_41957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	350	100	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2905	3204	308157	308456	NA	30	TGGAGGGAGGGAAGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGISLCVCAEKGTSFQATRYCLARRGSQTAKRKRKQTNQNRTNQSKQTNKQKSRGSSTSMVARARKQFHTRAVFHSLSGRSKDGAQTRYLRGRRGRW	305252	308524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305300_308500
906038	contig_6434_pilon	+	4226	1	Intergenic	novelGene_61835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1806	2213	704999	705406	NA	35	TTTAAGAAGCACTGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLQNQLSNCPHSSHPYNRAGGGGEVTFWGYFPQRWGTFNLEIIIFLRTGEPLSQQVLLMPMACEAKRRSREKERGEREKLHLVGEGCEFPWTPWFEVNPWKEARDLVPSCQCFTGELLSTTHEYPRKCLSTKR	703193	707419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_703200_707400
906039	contig_11846_pilon	-	3232	2	Intergenic	novelGene_105927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	522	926	177251	176847	FALSE	60	AAAAAACATAAGTAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFRLDSTGRMFFSTSSMGPGLCAIFSLRSSASLARFSFSCLAWREGSAEVSAREEMCEWTWLCPGDSEQLSSPPKKSQTPQNGKHIPGEGWPGLKFCKNKTGSTVAVCSHTRQWSPAQASTEDFQRLCCRAE	181316	174540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_177256_180799
906040	contig_20199_pilon	-	772	4	Intergenic	novelGene_82556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	79	junction_3	1217.16911999388	195	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	44182	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44183	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906_43951_44118
906041	contig_13800_pilon	-	4078	9	Intergenic	novelGene_153694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.72753437013566	34	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	2060	3505	93910	21082	FALSE	50	ACAACCACCGGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISPPGSRKQPPSVGLSTGPQVRKSISFIRNVKGTQTKGYAGANQSRMSKTMMILPEMKIEKMNISSPRTVTQVIDINGVDVTPRPLYHPDPYTVTAKPNKILTSQEGSLGSEFISSYSLYQNTINPSLLGQFTRSALGSSTVSKSSVSTTESIAEDLEEPSYKRERLASYTDLRVVRTILEKIVTKEDLEKNIEIILTETETLRFFDLPTVMVSLESEEAERVNQRNRNYEILCKNRAGNDLYVERMMQTINGAPKTKEVQCDKVIMEDKGIMSTAWDLYDSYNAMELSSSSVKRSTIESCKANVPSKERDQRVPGSTTEKNSEASSLMDIENVILAKIHEDEEDRSDAILKSDKFHQDLFFMERVLMENIFQSKLAAYRQLRVLKEIPQVDDFNKQKFIPSQSSRLEVRIQGVSSRERLSLSVSSVGRSLSSVFPWCRRFSAQGFQVQRKCSATNTTFLVYAVPRLSACFSLLYIKTD	95969	20508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_21363_35983_36179_45663_45817_53683_53824_56438_56596_57877_57991_69616_69802_80033_80206_93860
906043	contig_4136_pilon	+	3007	10	Intergenic	novelGene_161235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAACAAAAGCACGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13539	41493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_15217_18212_18361_26919_27091_27204_27364_30391_30514_34391_34504_36207_36313_36406_36646_37670_37823_41371
906044	contig_14925_pilon	-	1490	4	Intergenic	novelGene_55294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	954.787701824628	4	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	79	345	116065	113240	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAINHSSHQEGEHDVSHTAGTKNGACQECCHQFSLDCQVIFLLRLTGMRMLHPLK	129479	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114787_115957_116101_129436
906045	contig_10793_pilon	+	1927	14	Intergenic	novelGene_83390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3139.17381623266	14	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	252	1055	152887	163940	TRUE	30	AAGTTAGCTTCATACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130871	167065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152868_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
906046	contig_266_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_166304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTTATTTCCAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670712	668707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_668700_670700
906047	contig_17074_pilon	+	2466	8	Intergenic	novelGene_145110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.615424750556	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	98	703	208015	223810	FALSE	25	TACAACCTTGCCATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQTDSATCTRQDLVFIS	207917	225573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216329_223761
906048	contig_15752_pilon	+	2443	14	Intergenic	novelGene_148755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	81.9235464052997	245	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	657	1400	190284	201011	TRUE	20	TCTTCGCATCAAAGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLDTMSMHMAISGLSGFQRSLWMAAKQGKHKAQHLTQKVQKSQNKARGPAISSWDWLDISSVNNLADVHSLYVGGSPLGKEPRELFVKGSMKDIRENFQDLMQYCAQDVWATYEVFQQQLPLFLERCPHPVTLAGMLEMGASYLPVNQNWERYLLWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLCMLSPRASAGIGCRMRASGW	188166	203967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_188814_190274_190440_190550_190698_190848_190929_192171_192257_199241_199291_199401_199565_199619_199649_200976_201100_201239_201409_201602_201650_201742_201812_202782_202944_203458
906049	contig_9177_pilon	-	4953	34	Intergenic	novelGene_32594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1629.90204091951	36	24	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1195	3588	930	4517	23335	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQAVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKCAQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	26436	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_18254_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24096_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312
906050	contig_13191_pilon	-	7199	8	Intergenic	novelGene_177765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	470	172	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	4007	4543	139944	132807	TRUE	55	GAAGGAAACGAAAAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLMRYSSPRTRTRRQEVDPPSWTPIGDQQTGVRESSLTEHPVGDKIAGNLRCALSHPPPLFSRARAPLLPVATVSWLGGASCLDSARPGGRLSGCHWLAAGVALFFLFLLLLVSHLPLAASPSFCSGAWLRAPSLLLPAGLGGSIWVCGCFTVWAAALVGSRGFCSFVPLLPVATVS	277875	56577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13191_pilon_-_58108_87919_87934_130805_131647_132535_133292_139892_140508_230066_230324_251694_253252_276246
906051	contig_7870_pilon	+	7668	1	Intergenic	novelGene_109053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	568	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	5235	5561	653895	654221	NA	25	GGGTATATAATGGTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFPQEQRQQQSSSAEMAPLIIPYIYQYLCQDFRYFALQVKVREDEVNRILNSPLRYLQRKKKSPKVSRGMRRKYSCGLKCTQHKKIPLRFLKGRLNSLCVIHKGPR	648660	656328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_648700_656300
906052	contig_17130_pilon	-	2329	3	Intergenic	novelGene_176545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1559	1915	22641	22285	TRUE	45	AGAGACAAACTTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVAFECSVAKVKGRNDEVKELNRRFQRVAEKDKVKYYNDTCKDLELENQKGRTHSTFLKLKEPKKKFKPRAAILKDSMGKIPNKRRKHQKKTEGIQSHCTKKNWSTFSHFRR	24294	8748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_-_9068_22189_24129_24223
906053	contig_6227_pilon	-	3417	7	Intergenic	novelGene_49649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	65.5423951008472	270	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	346	537	438998	429379	FALSE	45	ATATAAAGTCAGGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIEHGLHCEQLQKLALFNNKLTDGCARSVAELLACKQNFLALRLGNNRITAAGAEVLAQGLRDNVSLQFLGFWGNRVGDKGAQALAEALSNHRSLKWLSLVGNDIGSLGAQALALMLERNVVLEELWLSNNCISCVGAEALLQALERNDTILEVWLRGNTFSPEEIETLSHKDTRLLL	443589	426498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_429452_431540_431625_438963_439048_439707_439792_442026_442111_443269_443354_443545
906054	contig_8377_pilon	+	1981	19	Intergenic	novelGene_34971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	3234.50714470316	18	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1905	76	1980	68257	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68100	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177445_179584_179666_180383
906055	contig_20748_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_138180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176140	175158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_-_175200_176100
906056	contig_10044_pilon	+	1625	5	Intergenic	novelGene_156386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	67.7177044797001	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	253	762	148993	152801	FALSE	20	TCATGAGTATTGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAQDSLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLFWDVMLENYNNLVSLGYRVSKPDALSRLEQGEQPWTILDESHNQNFSGLSYPSLGSVICCNVSQNSRTVLIVNWFIREGTGYNSHQDKLGSKRNNSGYSSSVRSGSFCSLLLGLAWGLLPLGPAQGLLSQVLQLLVP	142822	153664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_142891_148808_149008_151765_151893_152150_152247_152529
906057	contig_15327_pilon	+	4175	6	Intergenic	novelGene_70795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	323	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGCTCCAGACGAGGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227658	1240937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1231360_1237046_1237157_1238883_1238931_1239957_1240023_1240294_1240486_1240876
906059	contig_15518_pilon	+	4252	2	Intergenic	novelGene_127577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGCCAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	8017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_2127_4133
906060	contig_14744_pilon	-	1680	6	Intergenic	novelGene_66064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGCCCCACCATTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386569	1382076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1383209_1383301_1383401_1384428_1384572_1385181_1385231_1385818_1386004_1386497
906061	contig_6278_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_119806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	2141	2569	336577	337005	NA	50	AATTTGAAAACCTAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHPTRTSFDAPKAVLKGPFIAINAHIQKEEKAIIKTLTPQLEQAEREQQKKPSGARRKEIKRIRAELNEIENRKTIERVNKTKSWFFEKINKIDKPLAKLTKEKQEKKQITRVRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSN	334436	337006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_334400_337000
906063	contig_5229_pilon	+	2815	9	Intergenic	novelGene_117707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	512	1090	652965	655253	TRUE	5	TTCTCCTAGCCCGCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARGLQETYRSRFRFAALRTARITLECRPARGGIQDGNKLLGGQSAHQGGHKVLCPPTVELDVAQLIHAGIHPGILHSFLAELNPNNPLHLLGQGQANGASATAHVQHCALCIQLGPVLDDRVEHLSRWGIHLEEGVRRDLEGQPQQILMDVPIPSHMLQWQALLAGSLSVSGGSRCVSITSPSRARPAPT	652352	657555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_652850_652950_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654025_655071_655382_655477_656306_656545_657085_657325
906064	contig_10460_pilon	+	6170	21	Intergenic	novelGene_157459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	264.556095185879	461	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	67	2166	30480	80536	TRUE	40	CTGATACAATTCAAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSVVPIHYRCSPGEALVFLGVMEALIPVINKLQDVFNTVGADIIQLPQIVVVGTQSSGKSSVLESLVGRDLLPRGTGIVTRRPLILQLVHVSPEDKRKTTGEENGVEAEEWGKFLHTKNKLYTDFDEIRQEIENETERISGNNKGVSPEPIHLKIFSPHVVNLTLVDLPGMTKVPVGDQPKDIELQIRELILRFISNPNSIILAVTAANTDMATSEALKISREVDPDGRRTLAVITKLDLMDAGTDAMDVLMGRVIPVKLGIIGIVNRSQLDINNKKSVTDSIRDEYAFLQKKYPSLANRNGTKYLARTLNRLLMHHIRDCLPELKTRINVLAAQYQSLLNSYGEPVDDKSATLLQLITKFATEYCNTIEGTAKYIETSELCGGARICYIFHETFGRTLESVDPLGGLNTIDILTAIRNATGPRPALFVPEVSFELLVKRQIKRLEEPSLRCVELVHEEMQRIIQHCSNYSTQELLRFPKLHDAIVEVVTCLLRKRLPVTNEMVHNLVAIELAYINTKHPDFADACGLMNNNIEEQRRNRLARELPSAVSRDKVASGGGGVGDAVQEPATGNWRGMLKTSKAEELLAEEKTKPIPVMPASPQKGHAVNLLDVPVPVARKLSAREQRDCEVIERLIKSYFLIVRKNIQDSVPKAVMHFLVNHVKDTLQSELVGQLYKSSLLDDLLTESEDMAQRRKEAADMLKALQGASQIIAEIRETHLW	30413	95931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_30582_47224_47373_55459_55507_55832_55905_58690_58778_60462_60626_62599_62721_64852_64985_65911_66119_69295_69417_69641_69798_70043_70134_71490_71584_74363_74421_77136_77314_77485_77596_79267_79428_80479_84174_86268_86443_86750_86907_95894
906065	contig_2332_pilon	+	2621	5	Intergenic	novelGene_58688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	34.8667104843574	41	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	101	721	426955	504379	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIRKFFGVIPSGKKLVNETVKKNEKTKSTEETLKAKKGIKEIKVNSSCRDDDFKQKQPNKKKRIIYDSDSESEETVQVKNAKKQPEKMPLSSKPGKILRKDPVTYISETDEEDDLMYKKTAFKSKDNGGSANSYLGESNMKKNEENTKTKNKPLSPVKLTPTSVLDYFGTGSIQRSDKKMVASKRKKVSVLGAVRMFRLLPIHCY	426854	506279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_426958_462517_462647_469677_469754_471303_471427_504089
906066	contig_6509_pilon	-	3386	1	Intergenic	novelGene_145636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	877	1245	91164	90796	NA	25	TTTTAACCAAGTGTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHRLCLEWLTVARAGSQGGQHSPSLCSSSAWPCAHRPSQPDGHNPQQRPGMSPTLGLCCLVASSSNTRTATQDPRLEARPRRAVRVSVEKSADHTRGESGEIQVMGMKQQRLGQAQEIPQ	92040	88654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_88700_92000
906067	contig_17470_pilon	+	5769	2	Intergenic	novelGene_110500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTCGCTCCAGCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246371	302595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_247086_297540
906068	contig_11708_pilon	+	5689	5	Intergenic	novelGene_138958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	187	564	240988	241365	TRUE	70	AACAAAAAAGGGAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLPDTVLEDEPPQVGSHSQNTNGEELPSESSVNLNDVDGVKLSGPSFADVAQLKMRRNSCKHPLIIRMWNVRSTNLGKLEAAKNEMEGLKRDDPGISGLKWTGIGHFESIGQSYGRLCWE	240801	250009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_243303_243387_243932_244261_244394_244650_244825_247671
906069	contig_4674_pilon	-	5798	5	Intergenic	novelGene_174133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	4289	4984	57745	57050	TRUE	25	AACAGTAGGTGTATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFTGLTMFPIILKWLLDKMMEWPSTDTVTGPARWQYLAWLRQCSPGGCICSKPASNIWCYLSYSQDSWVQESKGGNGNGTTHYYPSDQLARFLLPVPVTLCSAGLEVLVPKGGMLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHSGLLMPLDQQAKKGATILAGVIDPDYQEEIGLILHNGGEEEYVWNAGDPLGRLLVIPYPVIKVNGKLQQLNSDMTTNDPDPSGMKVWVTPPGKEP	211547	56124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_56363_56473_58904_207295_210041_211107_211363_211417
906070	contig_7870_pilon	-	1213	7	Intergenic	novelGene_108964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	602.12420276514	58	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	180	614	600052	364867	FALSE	35	AATTTATATAGTTACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQASQIE	848813	364267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364884_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496576_600045_600086_848667
906071	contig_19132_pilon	-	1042	3	Intergenic	novelGene_169985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_1	7	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	261	389	281753	281625	FALSE	20	GCAGATTAATTTGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLTITCDVYIETPDRGGVFIAGRVNKGGILIRSARGVFFWIFANGTYRVTGDIAGWFIYHLGHVDVTAKKWYTLSLTIKGSFCSGMLNGKPLWTDVRVNFPKNGWAAIGTYSFEFAQFDNFQVEAQS	293781	280971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_281772_292123_292201_293616
906072	contig_7457_pilon	-	4127	1	Intergenic	novelGene_31525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGAGGGGGGACCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709387	705260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_705300_709400
906073	contig_4315_pilon	-	2333	5	Intergenic	novelGene_46868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	53.5116809678037	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAGAAAGAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881061	850660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_852309_854920_854981_855434_855507_870361_870405_880551
906074	contig_9239_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_137161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTGCCTTATTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97701	96322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_96300_97700
906075	contig_6885_pilon	-	2258	2	Intergenic	novelGene_83697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	169	309	278167	278027	FALSE	20	ATCTAAGGGTTTTGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIKLRLLRAASSVPGSRAFEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGLHAGSMKTEVLGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGKYNFCF	312198	276077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_278276_312138
906076	contig_2069_pilon	+	3474	11	Intergenic	novelGene_23260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_1	272.293591551472	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	159	1001	333898	341321	TRUE	10	TGATGTGGTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324028	344817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574
906077	contig_8386_pilon	+	2786	2	Intergenic	novelGene_82202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	578	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1430	1789	13492	13851	FALSE	30	TCTACCTTTCATGATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKDKKGKRGKTKQIKKKKKKKDPQKTEKNHQLKKKCSQESLCTSVHAEGGSLLATQLCLARKGSQLRKRKRKQFKTNKRTKAPGFHQRGSPDRVAVPQSNGAPQPLRKKQRWCTEPGI	11806	14848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_12499_12754
906078	contig_17144_pilon	-	2156	12	Intergenic	novelGene_29371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2172.71999618409	116	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	174	1862	179764	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183255	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168020_173370_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
906079	contig_12886_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_135471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTTTTAAGACCCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291873	294489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_291900_294500
906080	contig_10341_pilon	+	553	3	Intergenic	novelGene_47261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	24.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	123	551	500824	507698	FALSE	30	GTATGTGTTTCAAAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGEGNWDSEELENKLGFCHVVAVARDGGRVPLPVLNLPYLISPTRGAIALRPEVQGKLRGNCCSSTALKKESKKVFQKYEIMSSEMLPAFIETSNVERKQNLSEDQEQSQKPKSGEGSEPISKRQMKKLIKQKQWEEQRELR	500701	507700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_+_501018_506607_506640_507495
906081	contig_7963_pilon	+	2323	9	Intergenic	novelGene_58554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	151.899586487258	15	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	573	1916	247365	253116	FALSE	5	GTTTCTAGTGTGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	246309	253523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251275_252903
906082	contig_3469_pilon	-	4760	2	Intergenic	novelGene_34152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	203	613	533515	533105	TRUE	25	GAGTCTATGGGTGGTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533717	353145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_355410_531221
906083	contig_610_pilon	-	3435	7	Intergenic	novelGene_76662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	479.099502539226	61	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	37	1020	68933	32917	FALSE	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	68969	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887
906084	contig_10324_pilon	-	1807	5	Intergenic	novelGene_7832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6734624840973	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGGATCCTCAAGGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271426	267636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_268125_268218_269064_269624_269829_269968_270067_271254
906085	contig_2550_pilon	+	2883	16	Intergenic	novelGene_135685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	44	junction_15	48.6974331972436	214	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	38	2014	1565635	1628072	FALSE	20	ATCAACCACCCTCTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEGETEVKKDEAVENYSKDQGGRTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNTVKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASLIIRNTKEPPLTLKVILTSPLIRDGLEKKDGENVAMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKGWPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTTQQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFEDGSGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTMSVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNEGKNETVSSNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAVSAAVQAVRGRGRGALTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMKFPTYPVPHYSFF	1565597	1628941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1565817_1575188_1575355_1578979_1579125_1590506_1590599_1591101_1591198_1592322_1592435_1593099_1593198_1593515_1593628_1602259_1602353_1603740_1603941_1614495_1614655_1618513_1618649_1618838_1618980_1622320_1622445_1625354_1625400_1627995
906086	contig_15112_pilon	-	2844	1	Intergenic	novelGene_124749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	380	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAACTTGACCTCATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19262	16418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_16400_19300
906087	contig_3584_pilon	-	3175	1	Intergenic	novelGene_108110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTTCCTTGCTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185703	182528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_182500_185700
906088	contig_5302_pilon	-	2102	11	Intergenic	novelGene_81445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	666.989212806324	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	86	994	209238	177220	TRUE	20	TACTGGGTTTCCTTTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209566	175573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176639_177176_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209510
906089	contig_9423_pilon	-	1976	9	Intergenic	novelGene_99177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_8	194.106768300335	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	301	1824	61283	39157	FALSE	20	TGTTGTCCTACCCGGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMVHVGRRETRNSSKTQVPKQKSRVDWRRTKRNSISQLSDSDEEFYSSEEFDSDKEFDSDESVDGNESVDNNEELDSNTGLDSNKKPENEGELKLIEVENEGNNSKHLVNAGNSSTYEEEKNKSKHSLDLTDYESHPSQEDDDLNKYTGQIIEEDLEEEHIKRGKRKSIASVICDSDESDDSDVIVRKAGVKRPRRVIEDECSSLEMEQKKSEKTLAARKQEKLQKLKELSKQRSRQRRDSERDFEDSEKESCPSNDEDDEDEEESCEDEDGDDSVIGDFIVEDEEGDEENESQREEKLTTSQLKLVKQNSLYSFSDPYTHFERVVKALLINALDESFLGTLYDGTRQKSYAQDMLTSLHYLDDRFVQPRLESLVSRSRWKEQYKERVENYSNVNICQKNPENRSCHACGLHRYCTYLVHLSGKLYNTRTMETDDFMSHDKQVFTVGRICAHRTRIYHKLKHFKFKLYQECCSIAKIEEMEDEQVKETVERIFSQSKESGWIKKVK	74951	39004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_39352_44032_44204_48936_49062_51256_51350_59652_59852_60542_61292_62246_62292_73820_74027_74910
906090	contig_7657_pilon	-	5387	4	Intergenic	novelGene_30059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	642	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3471	3785	412931	412617	TRUE	35	TCATCATTGGTCACAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRDLNINTVIQGLYQMALVILHIENELYEAFDKFLSILSIWQVLVLKQNYNDLLYMKIILLWELKHKQLLNCHQQKKEWPVSIYFLVIIDSNIEKCMSFFCAV	416401	405378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_405835_408348_408477_408816_408953_411734
906091	scaffold_880_pilon	-	3898	6	Intergenic	novelGene_121416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	696	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCGCCCGGCTGGAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428440	352564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_352702_406893_407000_420188_420364_424872_426803_426843_427006_427052
906092	contig_12479_pilon	+	3102	8	Intergenic	novelGene_56893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	110.012244216501	285	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	117	1670	605876	619471	FALSE	35	TAATCACTGACTTAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAVAGCCHGELDKIYETLALAERRGPGPVDLLLCCGDFQAVRNEADLRCMAVPPKYRHMQTFYRYYSGEKKAPVLTIFIGGNHEASKYRGLRIGGISGIFKSHDYRKGHFECPPYNSSTIRSIYHVRNIEVYKLKQLKQPMDVFLSHDWPRSIYHYGNKKQLLKAKSFFRQEVENNTLGSPAASELLEHLKPTYWFSAHLHVKFAALMQHQAKDKGQPAKATRFLALDKCLPHRDFLQVIEIEHDPSAPDYLEYDIEWLTILRATNDLINVTGRLWNMPENNGLYTRWDYSATEEAMKGVLEKLNHDLKVPCNFSVTAACYDPSKPQNQMQLLHRISPQTTEFCAQLGITDINVRLQKAKEEPYLCNENEEQDDVESNDSGELSEYNTDTSALSSVNPDEIVLDEEEEDADSMLSAHSDTNTSSVGPSDQASDFSASFSDVRILPGSMIVSPDDTLGSPIATEGKAGDTMESRDGKDLIEAPLKRLSDEHEPEQRKKIKRRNQAIYTAVDDDDVA	605759	620903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_606073_606829_606896_608840_608906_610976_611063_614920_615146_617880_617962_618083_618230_618783
906093	contig_7587_pilon	-	925	3	Intergenic	novelGene_163704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAATGAATAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47379	26893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_26990_43396_43651_46804
906094	contig_3382_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_123985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTTGTGATCCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46153	47607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_46200_47600
906095	contig_13481_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_119467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTCAAATATGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253101	1254750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1253100_1254800
906096	scaffold_4805_pilon	-	2043	11	Intergenic	novelGene_161013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	80.4637185320191	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	26	1630	533627	385338	FALSE	40	AAAAGATCTTGTATCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGALVAEVMASWAALSPSIVEYFEGEDFYRCGYCKNESGSLSRGMWAHSLTAQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKKMLKFLAKGDVSRGSCEDEPMDSTVEDAVAGDFALINKLDIHCDLKTLRDDLKESLESEEKKGGNPKKEESTELIQSQHIEEKLGSGEPSQSVKVQTVPKPGKGADLTKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQQSPAGELQGLQAQGELPSLIPPKSKSNQTKSLEDFIFEPLPEDASHKLEVRVVRSSPPSSQFKATFQESYQIYKRYQMIVHKDPPDKPTVSQFTRFLCSSPLEAENPPDGPDCGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPHCVSSVYLYYDPDYSFLSLGVYSALREIAFTKQLHEKASQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKWMKAGVRILTGCRCSTRKPLCLTACTRSGRETPARKPLCCSTRAWWGSAAPRACCSSGAERRSRACAPPRPPVWTSGSWRALFTSGTLHSPAPRRSHFHRSTAFLKDFVAMYL	533652	384924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_385680_469654_469755_474528_474711_495372_495406_512475_512605_515129_515360_521929_522182_524314_524419_526885_526949_529420_529485_533521
906097	contig_1442_pilon	-	2897	6	Intergenic	novelGene_172149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_5	4.04969134626332	179	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	50	919	369310	304636	FALSE	35	ACAATGGAGTATTACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTAHAGNRPLPRSVVVMESPWDELTLAFSRTSMFPFFDIAHYLVSLMAMKRQPGAVTVAWKNPFSSWFTAMLHCFGGGILSCILLAEPPVRFLANNTNILLASSIWYIIFFCPCDLVCQAYSFLPVQLLAAGMKEVTRTWKIVGGVTHANSYYKNGWIVMIAIGWARGAGGTIITNFEQLIKGTWKPEADEWLKMSYPSKVTLLGSVMFTFQHTKHLAISKHNLMFFYTVFLVATKITMMLTETSTVSFAPFEDALGRMLFGCHQRFSPRVKKNETKSNGTGSSTSKPTADASDKLKKKHSKKTE	369359	302657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_304846_333688_333807_340251_340340_342041_342227_349654_349812_369198
906098	contig_17274_pilon	+	1932	1	Intergenic	novelGene_26540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	150	347	141107	141304	NA	60	GTACTGAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEESLGWAVCGTYHSHQHGSVISVGQVPVGCACAVWWCDVKHTVQVGRMEGRDLDVWRYNGYGRGERGTGAKSIQTKKIASRACLWSGEIRDHGMEKNKKGKKKKRKEGINKI	140957	142889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_141000_142900
906099	contig_6230_pilon	+	6280	11	Intergenic	novelGene_102107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAATATGACACAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164417	182130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_166369_169729_169823_170862_170926_171815_175141_177889_178058_178660_178762_179187_179273_179799_179925_180771_180856_181155_181252_181941
906100	contig_15361_pilon	-	4631	2	Intergenic	novelGene_167876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1022	junction_1	0	237	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	10	453	514053	508426	FALSE	85	ACCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAQMLLDQYRKKSKLFRTKVVLAPLGDDFRYSERTEWDQQFKNYQLLFDYMNSQPQLNVKIQFGTLSDYFDALDKADKNSGKSSQSVFPVLSGDFFTYADRDDHYWSGYFTSRPFYKRMDRVMESHLRYICLCVATFVYSLLLCYCSLFV	514062	504247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_508699_513882
906101	contig_4783_pilon	-	6019	2	Intergenic	novelGene_108355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	3593	4090	147198	146701	TRUE	60	CAGAGAATAGAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEEDFLKLLEAEYKRLIYRTLQDIKKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNGKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRTEAMKVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEDTLRIMWDCIKRNNVRVIGVPERRGNRKYRENC	150790	115620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_117459_146609
906102	contig_614_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_132609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAATGAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247550	249503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_247600_249500
906103	contig_10642_pilon	-	3352	7	Intergenic	novelGene_78707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	47.1439874804365	160	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2517	834	3350	867018	855792	FALSE	30	TTCCCCAGCAAAGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVTVEPEPKIPDVAPIVSDQKPSVSKSGRKIKGRGTIRYHTPPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLSQRSRSWSYNGYHSDLSTARHSDGHHKKRRKERKVKHKKKAKKQKHCRRHKQTKKRTVIVPSDVESSKSSTRQTKFSCDRERRSRSSSLSSRHSSRRDWSKSDKDNQSSSTHSSRDSYRSKSHSRSYSRGSSRSRTASRSSSHSRSRSKSRSSSKSGHQRTASKSPRTASQLSENKPVKTEPLRVTVPQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSRWKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTDLLPTQSAYSLANVKETGSSSSYHKREKHPESDRSAYSKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSHSLVSSHSRSRSPSSRSHSRNKYSDHSEYSRSSSYSSVSSDDRRLTKRRFRSSGKKNSTSGKRHSSSSEKTLGNKYVKGRDKSSYQRKYSEGRSSLDYSSDSEQSSVQVVQSAREKEKQVQIEVTNNKQEKKRDEEKSKPERECPRSKKRTLKENFSDHLRNGNKPKRKNYAGSKWDSESNSERDVTKNSKNDSRPSSDKEEGEATSDSESEFGEIHIKTKPTTKSLANTSLPDSNSVWKPSQPRSSTSDSGGSCSNSENNRGKLQKHKHGSKENLKREHTKKMKEKLKGKKDKKHKAPKRKQAFHWQPPLEFGEEEEEEINEKQVTRESKEKKQVSENGETIKDDTQKTEKSCEDGSVSGKHNAVNISSDLEQHTKDERKLSISPTVLNTEENVASSPPNIQHIEESVPSGVEDVLQTDDNMEICTPDR	869895	855789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_858046_859301_859448_859943_860032_866989_867146_867600_867824_868854_869001_869558
906104	contig_6277_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_80381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	601	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12768	9834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_9800_12800
906105	contig_10003_pilon	-	3078	1	Intergenic	novelGene_88294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTTTAGCATTTCTCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907168	904090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_904100_907200
906106	contig_14970_pilon	-	2582	14	Intergenic	novelGene_44967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	967	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2014	2328	188827	177322	TRUE	10	GCCGCCTCGGAAGTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232251	136012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192205_196136_196264_207685_207822_210761_210859_212611_212701_213683_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
906107	contig_10404_pilon	+	6935	10	Intergenic	novelGene_138641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	570	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	4138	4458	493338	493658	TRUE	25	CACCACATCCACCGCGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGCIPTVQFCSQIRKTAFRIFCLESNDLLKEFRLKVINNFFRYLYNFTHYFESFQSRKKINNLFFAICSFFIHYSPAIWVVLALQGRSNIMYFAQQPLKVWKLL	485950	509164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_488840_488979_489180_489282_489441_490009_490096_490366_490489_491923_492188_492919_495460_496844_497015_499234_499440_508863
906109	contig_10134_pilon	-	2931	4	Intergenic	novelGene_16203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	693.05892005418	38	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39724	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32279_32318_33731_34922_35178_38558
906110	contig_10962_pilon	-	2295	1	Intergenic	novelGene_103912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCTGAGAGTGAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383540	381245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_381200_383500
906111	contig_14684_pilon	+	2813	1	Intergenic	novelGene_99653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCTGAAAAGAAAAAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250528	253341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_250500_253300
906113	contig_14514_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_137460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	326	694	27905	27537	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLGAWGMDRVRPSLAFTGNPSSHQLALSCRPSCAQRLRKHHSFRGVGPGASPRTGLGQGLWTCSEYAGRCSELCLHPGGCGYGGALVSELHGAAFSGQAQPQRGSQHKKPINLPGRHVTV	28230	27274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_-_27300_28200
906114	contig_16632_pilon	-	4281	13	Intergenic	novelGene_154131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_3	252.157468437659	220	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	807	2424	274	2697	228974	86012	FALSE	15	TTGGCTTATATGCAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGRFLAPEAGSRESPGTARSFPEGPDYSSSAWLPGNESLWQATTVPSNHRNNHTRRHSIASDSGDTGIGTSCSDSVEDHSTSSGTLSFKPSRSLVTLPTAHVMPSNSSSSISRHRESLTSDGSKWSTSLMQTMGNRSRGEQDSTLDMKDFRPLRKWSSLSKLTAPDNCSQSSIVYTEEPRNDLEKTGRSKALKSQLRTVGPGCFHDSMEMLKLEDKEINKKRSSTLDCKYKFESCSKEDVRAFPSTLRRQALDMTYSALPESKPIMTSSEAFEPPKYLILGQQEVGGVPIQPSVRTQMWLTEQLRTNPFECRATEDSYSLAPWQPQQIEAFRQGSETPVQVLTGSSRQSYSPSDYQDFSKWESVLKLKEGLLRQKEIVIDRQKQQITHLHEKIRDNELRAQHAMLGRYVNCEDSYVASLQPQYENTTLQAPFSEQSVSNSQQEELEQKLTSAEKEVLQLNEFLKQRITQSSEEKKKLEEKLKTRDRYISSLKKKCQKESEQNKEKQRRIETLEKYLADLPTLDDVQSQSLQLQVLEEKNKNLQETLIDTEKKLEEIKKQCEEKEAQLICQKKKEKELVTTVQSLQQKVERCLEDGIRLPMLDAKQLQNENDNLREQNENASKVIDSQQVEIDRMILEIQSMQGRLSKEKLITQKMVEELEKKERNIQRLTEALLGNQRQTEETCSSLDQGQEAGQSRQQTVLSKWPLFDLTVIDQLFKEMSYCLFDLKALCSILNQRAQGKEPNLSLLLGIRSMNCSAEETENDHSPETLTKKLSDVCQLRRDIDELRTTISDRYAQDMGDNCITQ	229247	84427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_86176_89580_89813_93377_93486_102379_102431_102968_103087_108532_108688_109943_110097_118937_119118_131606_131725_141912_142035_173316_174105_207309_207472_228901
906115	contig_3335_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_165008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577605	575812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_-_575800_577600
906116	contig_3382_pilon	-	1909	4	Intergenic	novelGene_124137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	353.613725223819	563	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAGAAGAAACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824547	819318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_819347_821837_821939_822592_824111_824285
906117	contig_10003_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_88222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTAAGTCACCCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589914	588141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_588100_589900
906118	contig_9738_pilon	-	3061	1	Intergenic	novelGene_169264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACACTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185871	182810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_182800_185900
906119	contig_6137_pilon	-	4498	8	Intergenic	novelGene_59256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGTAAGGCAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340509	1319334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1321503_1323816_1323947_1328109_1328336_1331694_1331859_1332172_1332317_1336675_1336789_1337697_1337774_1339032
906120	contig_6364_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_51831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAATCACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600882	1598405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1598400_1600900
906121	contig_3956_pilon	+	2997	14	Intergenic	novelGene_14862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	1151.33016460483	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2394	84	2477	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKECPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289758_1289892_1290297
906122	SIRV1	-	1427	6	FSM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	77	57	-69	-51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	65	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGATCGTCGAGTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10709	1057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444
906123	contig_3382_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_124187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	585	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	355	666	976076	976387	NA	5	GTGTGGGTTTTCCTGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDPYLTPYTKTNSKWIKNLNVKPKTIKFMEENIGTKLRTLIYGINRLSNITKNVQTREDNLHIWELLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWENIFAMAHLTRV	975721	978324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_975700_978300
906124	contig_12638_pilon	-	1988	11	Intergenic	novelGene_33398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1450	1821	1529501	1521279	TRUE	15	GGCGCTTCGGCACGGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTFRIPLAIILYRLWTPVVVSSEMPRMPEQELRVLGVNKVGEVTAIVQNHVEGPILEVQSLLDAPQVLLVCFALPGIHWNASLGNGSCGMVLGGEDVAAGPLHLAPRAMRVSMRTAVSTVM	1539680	1515835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1515869_1521144_1521332_1522652_1522730_1524396_1524543_1529405_1529525_1529953_1530162_1530252_1530341_1530440_1530556_1534858_1535058_1538797_1538881_1538947
906125	contig_4604_pilon	+	4272	6	Intergenic	novelGene_19115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	23.1222836242444	159	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	56	580	5641	33368	FALSE	35	TCCAACCTAATTCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSAVIAFGLWFRFGGTMKDLSSEDKSPEYFYVGLYVLVGAGALMMAVGFFGCCGAMRESQCVLGSFFTCLLVIFAAEVTTGVFAFIGKGVAIRHVQTMYEEAYNDYLKDRGKGNGTLVTFHSTFQCCGKESSEQVQPTCPKELLGHKNCIDEIETIISVKLQLIGIVGIGIAGLTVRKFQNLLLLPSKKP	5585	37060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_5690_21252_21351_22724_22800_24239_24339_26061_26134_33236
906126	contig_15977_pilon	+	1323	2	Intergenic	novelGene_137220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTGATCAAGAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79438	91691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_+_80528_91457
906127	contig_16703_pilon	+	1773	2	Intergenic	novelGene_72777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_1	0	320	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	506	901	29627	33056	FALSE	55	AAAAAAGAAAGTTAGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWECVSANCILCRLSFSVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGKLLWLLSSILGK	29121	33928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_29789_32822
906128	contig_9620_pilon	-	3423	4	Intergenic	novelGene_178708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1926	2432	20662	19570	FALSE	40	AGGGACACAGCAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKVNKKISEMDSVIEGLRSRFETMENRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFRVTGIPEQGEKTENTDRIIEELLTESFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSLRHIIITLAKTKDKQRILSAARKT	25830	18578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9620_pilon_-_19581_20166_20930_23363_23987_24795
906129	contig_7527_pilon	-	2031	3	Intergenic	novelGene_139571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTCTCAAGCATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96216	88334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_90036_94413_94588_96060
906130	contig_10904_pilon	-	2557	4	Intergenic	novelGene_22753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_3	350.565574781983	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	352	1029	662171	661320	TRUE	15	TCTCTACTGTTGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGEGALWGSISFLRLQNDRSKPCVQQSPSGDGVIGDSGLLGAESQRGV	662743	651953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_661763_661936_662445_662665
906131	contig_12570_pilon	+	3415	1	Intergenic	novelGene_79396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGACCATCGACTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292679	296094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_292700_296100
906132	contig_9705_pilon	+	4895	19	Intergenic	novelGene_41762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	354.685171648963	91	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	510	2183	522907	538335	TRUE	25	CAATATCCTTTTCGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMG	522397	550770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_539020_539266_539567_540536_541031_541229_541987_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695
906133	contig_14986_pilon	+	2193	2	Intergenic	novelGene_59724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1194	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1284	1724	151613	152053	FALSE	15	GCATAATGTGTCTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150252	152522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_151362_151438
906134	contig_13021_pilon	-	1667	10	Intergenic	novelGene_8246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	508.839371681122	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	772	1170	212088	206041	FALSE	40	GTAACTAATGTTACTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPQPKMVPTPRSYITLPPHSRRWHQESMKPVTITKLTITKLTTYILTSSEIERYKLHLRIFLQSEDQKTTTATGNIAASATSASCPETGDLTVECRALPLQTSACQPQLPPRFYSPNSSTHIQLVEDKPHP	231659	205543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_212786_212907_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231351_231421_231599
906135	contig_6710_pilon	-	934	2	Intergenic	novelGene_93397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	153	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657878	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
906136	contig_2438_pilon	-	2490	10	Intergenic	novelGene_112079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1735	2106	353088	348994	TRUE	15	CTGCAGCTGCCAGAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGIEDDLAHVLELLFLLHPQLVGSLQEVLGPLLGYLLQVAELLVVLAHHFFLFHDFLARCHCIHDGFLLHLEGLIFGLEFFPGQDVGCPFDPLKLLGADDEGFPRGVLCGNNELPDHVPSD	365469	320589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_320732_346406_346536_348880_349026_351267_351412_351705_351876_353062_353243_355299_355429_359140_359289_363558_363671_364278
906137	contig_17976_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_32535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCTCCCCAGAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49610	50917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_49600_50900
906138	contig_15354_pilon	+	4198	27	Intergenic	novelGene_65767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	117	junction_26	65.9203953318702	249	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1140	3423	136	3558	663143	690420	FALSE	55	TAAAGTAGAATCTAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLEELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYHNGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGIKGLWPLRSDPNRETDDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVSQEPKALVSEWKEPQGKNISVASCNSSQVVVAVGRALYYLQIHPQELRQISHTEMEHEVACLDITPLGDSNGLSPLCAIGLWTDISARILKLPSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFESSHYLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRTFRSLSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGTIDEIQKLHIRTVPLYESPRKICYQEVSQCFGVLSSRIEVQDTSGGTTALRPSASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHNLLIIDQHTFEVLHAHQFLQNEYALSLVSCKLGKDPNTYFIVGTAMVYPEEAEPKQGRIVVFQYSDGKLQTVAEKEVKGAVYSMVEFNGKLLASINSTVRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEILDDDNFLGAENAFNLFVCQKDSAATTDEERQHLQEVGLFHLGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGSVLFGTVNGMIGLVTSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDGDLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGMKREATADDLIKVVEELTRIH	663007	691060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_663204_664557_664707_665958_666076_666467_666690_669379_669495_670617_670716_671430_671590_672205_672290_672860_672978_673521_673625_676259_676336_676430_676540_677979_678159_678242_678407_678484_678593_678748_678957_679786_679883_679990_680103_681077_681202_681563_681729_682455_682551_687126_687298_687694_687805_688070_688241_688446_688550_689596_689721_690336
906139	contig_7408_pilon	-	7065	1	Intergenic	novelGene_168749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	522	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	5512	5811	29463	29164	NA	60	TCACAGTGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFHNICRIFKTRKKPRTNTINTLLNGKTLKAFFLRLGTRQAYELSSFFPNILLEFLANALRQEKEAARKIGKEYIKLLLFANYMVVSIKIPKEYTDIS	34974	27909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_27900_35000
906140	contig_14684_pilon	+	4795	13	Intergenic	novelGene_99680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	162	junction_3	97.4153478667504	438	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	914	2745	183	2927	390200	477254	FALSE	15	AGTTGATTCTGCCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PETVCNVAISFDRCKITSVTCSCGNKDIFYCAHVVALSLYRIRKPDQVKLHLPISETLFQMNRDQLQKFVQYLITVHHTEVLPTAQKLADEILSQNSEINQVHGAPDPTAGASIDDENCWHLDEEQVQEQVKLFLSQGGYHGSGKQLNLLFAKVREMLKMRDSNGARMLTLITEQFMADPRLSLWRQQGTAMTDKYRQLWDELGALWMCIVLNPHCKLEQKASWLKQLKKWNSVDVCPWEDGNHSSELPNLTNALPQGANANQDSSNRPHRTVFSRAIEACDLHWQDSHLQHIISSDLYTNYCYHDDTENSLFDSGGWPLWHEHVPTACARVDALRSHGYPREALRLAIAIVNTLRRQQQKQLEIFRTQKKELPHKSITSITNMEGWVGHPLDPVGTLFSSLMEACRTDDESFSGFSDFTENMGHCKSLEYQHLPAHKFLEEGESYLTLAVEVALIGLGQQRIMPDGLYTQEKVCRNEEQLISKLQEIELDDTLVKIFHKQAVFLLEAGPYSGLGEIIHRESVPMHTFAKYLFTSLLPHDAELAYKIALRAMRLLVLESTAPTGDLTRPHHIASVVPNRYPRWFTLSHIESQQCELASTMLTAAKGDVRRLETVLESIQKNIHSSSHIFKLAQDAFKIATLMDSLPDITLLKVSLELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCATEVGVYALDSIMQSWFTLFTPTEATSIVATTVMSNSTIVRLHLDCHQQEKLASSARTLALQCAMKDPQNCALSALTLCEKDHIAFETAYQIVLDAATTGMSYTQLFTIARYMEHRGYPMRAYKLATLAMTHLNLSYNQDTHPAINDVLWACALSHSLGKNELAAIIPLVVKSVKCATVLSDILRRCTLTTPGMVGLHGRRNSGKLMSLDKAPLRQLLDATIGAYINTTHSRLTHISPRHYSEFIEFLSKARETFLMAHDGHIQFTQFIDNLKQIYKGKKKLMMLVRERFG	390017	479122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_390330_416369_416519_419802_419954_457151_457332_460150_460328_460601_460749_463242_463390_464905_465167_468455_468592_472035_472194_472791_472956_474700_474783_476391
906141	contig_3382_pilon	-	2357	1	Intergenic	novelGene_124148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1475	1861	894231	893845	NA	15	TTTTGCTCTAGTTATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFLDINLSIYICIRFTGFGSLKDSEQTARRTNKSVLEEIQLECSLEARMVRLRLTYFGHVIRRDQSLEEDIMLGKVEGQRRRGRPSTRRIDTVAATVGSSITTIVRMVQDWAEFHSVVHRVAMSWN	895705	893348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_893300_895700
906142	contig_5502_pilon	-	5250	7	Intergenic	novelGene_155003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	201.665082638407	283	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	4056	4814	457252	449795	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALQREPDNPYDKNAIKVNNVNGNQVGHVKKDLAAVLAYIMDNKLAQVEGVVPFGANNAFTMPLHMAFWGREENRKVVLDQLKKHGFKLIPPPKTLGFSLESNWGSGRAGPSYSMPVHAAVQMTTEQLKTEFDKLFEDLKEDDKTHEMEPAEAIETLLLPHQKQALAWMVSRENSEDLPPFWEQRNDLYYNTITNFSEKDRPENVHGGILADDMGLGKTLTAIAVILTNFHDGTPLPVERIKKNQLKKVKY	462456	449358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_449903_452469_452662_452815_452891_454154_454253_455347_455482_457100_461094_462242
906144	contig_8873_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_162906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTGCATATTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396033	395069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8873_pilon_-_395100_396000
906145	contig_13074_pilon	+	2541	4	Intergenic	novelGene_153419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1380.10080147148	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	287	751	403694	451174	FALSE	30	CACCTGAAGTTGTGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403315	452964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403418_403509_403817_449108_449279_451002
906146	contig_8676_pilon	+	2177	5	Intergenic	novelGene_142211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	16.7630546142402	233	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	254	1369	411846	426463	FALSE	35	GAGGAAAATTGCTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEHVRANVRATTHVSFPLQLSAHLSECVNAPSTCSFKRYGCVFQGTNQQIKAHEASSAVQHVNLLKEWSNSLEKKVSLLQNESVEKNKSIQSLHNQICSFEIEIERQKEMLRNNESKILHLQRVIDSQAEKLKELDKEIRPFRQNWEEADSMKSSVESLQNRVTELESVDKSAGQAARNTGLLESQLSRHDQMLSVHDIRLADMDLRFQVLETASYNGVLIWKIRDYKRRKQEAVMGKTLSLYSQPFYTGYFGYKMCARVYLNGDGMGKGTHLSLFFVIMRGEYDALLPWPFKQKVTLMLMDQGPSRRHLGDAFKPDPNSSSFKKPTGEMNIASGCPVFVAQTVLENGTYIKDDTIFIKVIVDTSDLPDP	411592	427271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_411981_413569_413663_418978_419120_424540_424716_425891
906147	contig_9516_pilon	-	3748	1	Intergenic	novelGene_106143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACGGAGGAGGAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575520	571772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_571800_575500
906148	contig_678_pilon	+	1446	8	Intergenic	novelGene_167789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAGGATCACTCCAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30708	38872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_31176_31453_31550_31719_31887_32701_32918_35737_35971_36681_36816_37326_37384_38796
906149	contig_11258_pilon	-	3421	3	Intergenic	novelGene_67840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_2	12.5	187	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1270	1641	353988	353617	FALSE	15	CAACACCTGTTTGTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSQCPPTLSSTWEYPCRIKVLILQEIHSAATLSRAISLSGAAMQSSLRHCSVAQWGRESGTGTITVQCVLRQTDIQSIADSSSQGVRTQRVTLCHGVREGSLGELTSLLCLDAGEGGAES	360599	351836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_355099_358490_358581_360530
906150	contig_5229_pilon	-	2534	10	Intergenic	novelGene_117713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	41.7452592118754	22	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1244	2050	655675	652839	FALSE	20	AAGGATTGTTTCTGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGCFLIPSRQTPRTSHWFRATLGSHRSTPYSAYNPETYAGYWKQLTVRTSRRGQAMAIAYFHPQKLSQEELAGLKTSLAKHFMEGPGKKTPSQEGLPLEHVAGDRYIHEDLLGLTFQISPNAFFQVNTPAAEVLYTVIQDWAQLNAESTVLDVCCGTGTIGLALAQKVKRVVGIELCQEAVEDARVNARMNELSNVEFHCGRAEDLVPTLVSRLAAQQLVAILDPPSRRSAFQGDPGCPQSCKPEAAPICLLQPPGSHGQLCGPL	657607	652354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652848_652949_653047_653192_653311_653638_653715_653903_654027_655073_655186_655308_655380_655474_656307_656546_657083_657531
906151	contig_6283_pilon	+	2665	16	Intergenic	novelGene_100215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	2311	2664	629565	643975	FALSE	35	ACAAGAGAGAGGTATTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALCCAWNCCCCCSAACCCWNCCCCCCSATCWSCSWVCGVAVDTTAIPCGAIPEVPGGGCPMAPRLPIPPRVCPGPRPAMLIPVAPAAGAPVRFCRAFIGSKRTTLLTNVSKVDNEPG	610862	643976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_+_611268_611617_611895_612525_612625_613035_613202_613268_613431_613720_613786_614871_614938_615007_615143_615323_615452_615526_615662_620763_620886_626387_626506_628013_628330_629448_629674_641212_641407_643924
906152	contig_18393_pilon	+	3483	1	Intergenic	novelGene_167466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	377	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	2185	2694	103483	103992	NA	5	CTCTTGATGTGGTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METMSLTKPWPQAGQDYPQQRLPRGQGESQGLSTITRCSPLLCVLNLCTANQAPFLWPVYLTAVKHLKPFPEAPACLWEPPASRGGLCFAARKPEGCVSLSQGFWDASLLGASQGSLIRNAGLNLTDQTECPFHLSLLTLVLSKQLFEHFSPVFHKADFLSLSFSAIRE	101298	104781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18393_pilon_+_101300_104800
906153	contig_6677_pilon	+	2652	5	Intergenic	novelGene_114194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_4	64.865244931319	7	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGTCTATATTATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563720	581943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_565820_566091_566208_568994_569026_573813_573892_581615
906154	contig_15120_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_108025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAACCTCATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252970	255540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_253000_255500
906155	contig_7151_pilon	-	5084	1	Intergenic	novelGene_40701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	860	1195	50418	50083	NA	40	GTCCCAGCTACAAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFPGFQYIAFVQHQKKGEIATLLSKLFGLILWLPSLHNFNIEQITEEKTCHVIVALKSPILSLQPHVTTKVILVSLSQQQSSASPKPKFSTISPCTELGNSLREKESVDP	51277	46193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_46200_51300
906156	scaffold_13505_pilon	+	9264	7	Intergenic	novelGene_111593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4785	5297	659510	660022	TRUE	15	GAGTGATCTTGGTGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	650940	664572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_650948_652843_653142_653684_653874_654866_656035_656387_660857_661182_663631_663887
906157	contig_6677_pilon	+	2345	8	Intergenic	novelGene_114159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391603	403609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_392196_393287_393417_395897_396142_397786_397998_398501_398683_399092_399236_401865_401997_402895
906158	contig_4103_pilon	+	3668	8	Intergenic	novelGene_51972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCATTTCAAATACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176265	197299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_177160_177306_177477_182404_182515_185837_186003_186702_186880_187407_187609_188676_188853_195524
906159	contig_5981_pilon	+	5374	1	Intergenic	novelGene_35503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGCCCAGCCAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27815	33189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_27800_33200
906160	contig_14575_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_101933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442408	440122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_440100_442400
906161	contig_13244_pilon	+	5552	9	Intergenic	novelGene_86993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_2	119.776875898481	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	2801	4117	467911	470779	TRUE	30	AGTTCACTATTATATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVHHSESKHDSNADLLQSIINIKNECSPVSLNTVQVSWMSPVVVPQSSPREQFQDFHGGQVFSPPQKYQPFQVSGSPPVMDQASLYQYSPQNQNVQQQQHHYIHDPNLEYTPYSRLQSPNYEPNLFDGQELQFCPNQSFVSLLSNHGESENVAVPIQTPPSIQQHSNAHLQTFSMMPNSACEALAEHKAGSPPLNTSLPFQNITENPVNTTQLGKSFFQWQVEQEESKLANISQDQFLSKDADGDTFLHIAVAQGRRALSYVLARKMNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKVHSQNRFGMGWGGGSYSKKRLYLAPNYR	464889	475247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_467553_467672_467777_467877_468654_469348_469455_469834_469982_470172_470237_470522_471869_471962_472131_475069
906162	contig_4654_pilon	-	3917	6	Intergenic	novelGene_103087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	878.86303824885	139	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	188	619	500418	497809	TRUE	20	ACTAGATTTGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLELLDKYLIPNATQPESKVFYLKMKGDYFRYLSEVASGDNKQSK	515977	492661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493455_493523_494533_494873_494970_496408_497941_500118_500422_515793
906163	contig_6397_pilon	-	3639	13	Intergenic	novelGene_146257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	106.484838513909	44	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	167	916	554772	474030	TRUE	35	CCAGCAAGGTTCAGACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTYIDSAYPSTGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYG	601729	458326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_459936_463248_464182_467269_467338_473916_474035_475530_475669_516792_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601649
906164	contig_11978_pilon	+	4577	5	Intergenic	novelGene_62879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1057	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2357	2701	651768	652112	TRUE	0	CTCGGCTTCCCTCCCCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGCGPHAPSRAGRRAETDPDSSCGRTWNTQAGNPQRPPPLPDPGSQSQSCSPQHLPRKRRKRPRKKLRKRRRKRKKRKSCLQSCSGRKGYGSNPRRGLSQSQTPLRAGRPAQG	649411	662479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_652521_653702_653863_654629_654815_659842_660865_662378
906165	contig_12864_pilon	-	7218	20	Intergenic	novelGene_76366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	151.310086849065	674	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1048	3147	113	3259	208748	181861	FALSE	50	AACACAACTGGTAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQCDEPPASPDDSDNSVSESLDEFDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMAVDLDDQDWLDMNNIEQALFSRLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSTDRDAGEKHSFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDVLLEAIQGAHFEDVTEFLEEVIEALTTDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAYLDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPSNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDEERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLVLTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADSLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFPHAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTETYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKINKPGNMIVAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE	213587	177901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_181988_183586_183745_184956_185105_185524_185706_187944_188120_191141_191256_191350_191452_194814_195003_196047_196181_198165_198471_199369_199491_200619_200900_202138_202331_202552_202756_203081_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
906166	contig_17796_pilon	+	3046	1	Intergenic	novelGene_33780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	955	1284	33220	33549	NA	80	GAAAACCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKLSEKLDYMKKELSIRIGGRLINNPRYADDTTLLAESEEDLKYLLMKIKDYSLQYGLHLNIKEIKILTTGPISHIMTKREKIEVIKDFIFLGSPINAHESSSQEIK	32265	35311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_32300_35300
906167	contig_13593_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_156119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTGTCCAGGCCAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50458	48102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_48100_50500
906168	contig_19990_pilon	+	3813	1	Intergenic	novelGene_30748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	306	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCCCAGGCAAATACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18132	21945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_18100_21900
906169	contig_5649_pilon	-	4805	1	Intergenic	novelGene_82412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTAAAAAAAGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298850	1294045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1294000_1298800
906170	contig_9982_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_55786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1333	1632	677151	677450	NA	15	GTCTTTCTTATGGGGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPDRAAFCSVVRGVALSRRLTRWPLTTATTTAAKAEGDGEVSLWGAWRRLLPGSLSQFFLSPLEFVIKLSPLENVELCYFQTENFLKLKVVISAKDSF	675818	677919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_675800_677900
906171	contig_15897_pilon	-	1110	2	Intergenic	novelGene_49519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTCATGGAAGTGAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161661	159817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_160448_161181
906172	contig_12140_pilon	+	2418	2	Intergenic	novelGene_86517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8040	12979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_+_8126_10646
906173	contig_5684_pilon	-	5866	12	Intergenic	novelGene_80999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_11	122.806842892231	640	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	474	1958	315453	299846	FALSE	15	TACTCTATTGGCATTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKSRKPVVMKIKPGISEFATFPEKVSDYISPLLNFAAEHVPRAKHKETPLYILCTAGMRILPESQQKAILEDLLTDIPVHFDFLFSDSHAEVISGKQEGVYAWIGINFVLGRFEHIEDDDEAVVEVNVPGSESSEAIIRKRTAGILDMGGVSTQIAYEVPKTVSFASSQQEEIAKNLLAEFNLGCDVHQTEHVYRVYVATFLGFGGNAARQRYEDRIFANTAQKNRLLGKQTGLTPDTPYLDPCLPRDIKDEIQQNGQTMYLRGTGDFDLCRETIQPFMNKTNETQTSLSGIYQPPIHFQNSEFYGFSEFYYCTEDVLRMGGDYDAAKFTKAAKDYCATKWSILRERFDRGLYASHADLHRLKYQCFKSAWMFEVFHRGFSFPVNYKNLKTALQVYDKEVQWTLGAILYRTRFLPLRDIQQEIFRSSHTHWRGFSFVYNHYLFSGCFLVVLLSILLYLLRLRRIHRRTLRNGSAATLWMEEGLAAQKVAGTL	326579	295937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_300075_301353_301516_302452_302539_304368_304694_308102_308270_309973_310129_310411_310472_312163_312268_312910_313062_315407_315614_316151_316350_326464
906174	contig_12528_pilon	-	1971	10	Intergenic	novelGene_81311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_7	522.108356380617	120	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	925	1326	959940	933323	FALSE	55	AAAAAGTATATATATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968105	932677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956217_959917_960131_963878_964021_964909_964971_966191_966274_967656
906175	contig_4469_pilon	+	2735	2	Intergenic	novelGene_21934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACCCTCCAAATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626929	660269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_629495_660099
906176	contig_5947_pilon	-	2131	5	Intergenic	novelGene_101528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	319	621	518436	518134	FALSE	15	ATGGTATGTCCAGTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTHCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPENMAPRHRFSSMVKSLLRFTIQPASGQPHKTKWDW	769699	516623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_518560_655804_655850_669613_669621_709504_709579_769630
906177	contig_14101_pilon	-	2834	2	Intergenic	novelGene_122751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTCATGTCTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78516	75637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14101_pilon_-_76241_76285
906178	contig_4093_pilon	-	2627	6	Intergenic	novelGene_27627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	113	850	69245	41737	FALSE	40	CCAAAGCTCACCCTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72536	39959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
906179	contig_3747_pilon	+	2661	7	Intergenic	novelGene_24908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1549.56054702257	7	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	618	1283	202676	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201384	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
906181	contig_3986_pilon	-	2647	3	Intergenic	novelGene_52720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	302	805	201743	140748	TRUE	20	AGGCATTGGTGATTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILDRYLFISHDITEVFCQQIQQFSVFCVIFPCSGIPITRKFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSFPMIQSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFIIWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFFVCIFHEFVYFFLMFVSFLPQFLENSEY	202044	93336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_94848_140416_141146_201637
906182	contig_10023_pilon	+	2536	6	Intergenic	novelGene_123513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	137.639238591326	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	424	1830	451514	452957	FALSE	65	AATGGAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPPRSFPPSKAVTVKSAEANPAEPEALPAPMAQALPSPASTATPPPTPTHPQPLALPPLPAEEAEGMNVDDQDEGSPLTQEAEPASGGGSSSGVGKKEQLSVKKLRVVLFALCCNTEQAAEHFRNPQRRIRRWLRRFQASQGENLEGKYLSLEAEEKLAEWVLTQREQQLPVNEETLFQKATKIGRSLEGGFKISYEWAVRFMLRHHLTPHARRAVAHTLPKDVAENAGLFIEFVQRQIHNQDLPLSMIVAIDEISLFLDTEVLSSDDRKENALQTVGTGEPWCDVVLAILADGTVLPTLVFYRGQMDQPADVPDSILLEAKESGYSDDEIMELWSARVWQKHTACQRSKGMLVMDCHRTHLSEEVLALLSASSTLPAVVPAGCSSKIQPLDVCIKRTVKNFLHKKWKEQAREMADTACDSDVLLQLVLAWLGEVLGVIGDLSCPAPTGTLTHLPGTLTCRRSSLPP	449713	453663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_449748_449894_450036_450655_450713_450906_451024_451439_452841_452877
906183	contig_14243_pilon	+	3319	7	Intergenic	novelGene_57435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.6766812457914	157	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	139	1104	672680	700060	FALSE	10	CACCAGGTTCTGTGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFGFGQSVEVEILLSDAESRKRAEHKTEDGKKEKYFLFYDGETVSGKVSLVLKNPNKRLEHQGIKIEFIGQIELYYDRGNHHEFVSLVKDLARPGEITQSQAFDFEFTHVEKPYESYTGQNVKLRYFLRATISRRLNDVVKEMDIVVHTLSTYPELNSSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIKHMEIDIIKRETTGTGPNVYHENDTIAKYEIMDGAPVRGESIPIRLFLAGYELTPTMRDINKKFSVRYYLNLVLIDEEERRYFKQQEVVLWRKGDIMRKSMSHQAAMASQRFRGHSLPG	672135	702275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_672260_672665_672903_690570_690728_695190_695356_697328_697505_699384_699528_699958
906184	contig_7078_pilon	+	4053	5	Intergenic	novelGene_130188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2068	2391	960948	961271	TRUE	25	GGAATACCCAGGTTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPSQPPVLIFIAGSNSVCWNTQGLCSGFSFLVSLNIILFNPLPSNTMTLKYLVMAYLWISRLENSGIYLTFPYGCLNSFQMKNGKNRNTYFLLESVHSSQSSSSH	781177	963257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_781604_920165_921695_960835_961364_961646_962634_962674
906185	scaffold_19766_pilon	-	1522	5	Intergenic	novelGene_34401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	86.5462304205099	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATGGTTGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830595	825044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_826098_827289_827413_827987_828081_828201_828310_830450
906187	contig_6829_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_123777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCACTAACACCTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88649	90606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_88600_90600
906188	contig_9839_pilon	+	1247	6	Intergenic	novelGene_88523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	1295.34295072772	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	18	698	49467	76201	FALSE	25	TTCAGTATCCATACTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSNVMISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGANTSSVCKRSTRL	49449	76750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_76159
906189	contig_14405_pilon	-	1823	5	Intergenic	novelGene_85648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTTAATACTAGATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500634	484154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_485511_486460_486531_489319_489390_496808_496964_500462
906190	contig_1337_pilon	-	2601	6	Intergenic	novelGene_84260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_5	74.0010810731843	38	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	20	649	655231	565225	TRUE	10	CTCTCCCCTCCTCCCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPQTQGAAAGGEQGRDGSHSGVGDVGFEDSKDYILEPLSLPESPGGITTLERSPTVPCIFCEEHFPVAEQDKLLKHMIIEHKIVIADVKLVADFQRYVLYWRKRFTEQPITDFCSVIRINSTAPPEEQDNYFLLCDVLPEDRLLREELQKQRLKEILEQQQQERNDTNFYGICMFCNVECFGNRFAFYVSLNITVFHLKAHQNIHNC	655250	562416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_563661_564516_565390_583671_583755_584028_584118_593253_593456_655140
906191	contig_13481_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_119477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	33.5410196624968	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	448	1281	1331108	1306097	FALSE	15	CCTTGGGTTCTATACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCDSVPDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISDAKENPYGEDDNKSPFPLQPKNKRSYAQNVTVWIKPSGLQTDVQKILRNARKLPEKTQTFYKELNRLRKAALAFGFLDLLKGVADMLERECTLLPDTAHPDAAFQLTHAAQQLKLASTGTSDYAAYEQNITPLQTDFSGSSTERM	1338618	1305397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1331083_1331192_1332676_1332961_1338538
906192	contig_15613_pilon	+	2394	2	Intergenic	novelGene_147221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	383	817	238689	239123	TRUE	55	ATGAAGGAAAAGGAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIITTLIQHYTGSPSQNNKTRKRNERYPNQKGRSKIIFADDMILYIEDHKDFTRKLLELIEESSSVAAYKMNTQKSVGFLYTNEDYSKKEIKKTIPFTIAPKSIKYLGISLTRDIKDLHDENYKTLLQEAKTKVHCCPVDFDS	238306	241082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_240441_240822
906193	contig_16870_pilon	+	2125	3	Intergenic	novelGene_155508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	330	1394	123091	124629	TRUE	40	AAAAGTTGAGTATTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPTLSISPALFSHSPTSRLLADSSWLSSMLTWASTGPSEASSRPEMTDVLCSPESISHPRSRETRAQKLPSLPTARSFKPPMWTARSWFQAQTSVSGCPRVRKYQGGTKGPGRPAPSWGLGGEPELTYLPQLLPYQAVCPAPCHDLEPVLAPLASTPVAGSEAAPGSAPVATALEAAQVAAPVAVPGAGPLAVLVSAAGSVPVGTSVSVPASAAVPALRAVKVPVAAPVAAPASAEALSALDRSVFVPASAALAAPGRPFGASVAESVAAPGPGSAEPVVGIVVAHRLLETQAAGQASVSASVLSSQPVAEPSPAASLEAPSLQAPLSFSTSWLVAAMPHKAPALRLGCISP	122761	125572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_124080_124553_124661_124872
906194	contig_8978_pilon	+	5804	39	Intergenic	novelGene_49356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_33	112.661226422661	40	51	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1805	5418	155	5572	203162	222003	FALSE	15	GGGAGTGTGTGAGTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVSSHSSHVMSAQSTSTLPTTPAPQPPTTSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDSERKEAEGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKSQPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNALLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGNTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQAKIQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPNTNIFGRF	202900	222235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_202944_203050_203306_203687_203835_203996_204097_204225_204363_204698_204831_205194_205322_205765_205996_206348_206430_206561_206733_206932_207078_207243_207295_207618_207738_207914_208059_208504_208669_208870_209003_209392_209621_209795_209941_210110_210232_210608_210711_210998_211113_211361_211538_211718_211899_213239_213312_213789_213924_214092_214255_214572_214685_214875_214966_215483_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218248_218458_218625_218704_218794_219010_220556_220750_221672_221758_221959
906195	contig_5261_pilon	+	2645	29	Intergenic	novelGene_102492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	38.6332177045102	88	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	98	2524	793607	842810	FALSE	10	TTTATCCTGCTTCATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGLGASQRVGRESHAAGDLWAAEVQSRRAALMLRFPTCFPSFRVVGEKQLPQEIIFLVWSPKRDLIALANTAGEVLLHRLASFHRVWSFPPNENTGREVTCLAWRPDGKLLAFALADTKKIVLCDVEKPESLHSFSVEAPVSCMHWMEVTVESSVLTSFYNAEDESNLLLPKLPTLPKNYSSTSKIFSEENSDEIIKLLGDVRLNILVLGGSSGFIELYAYGMFKIARVTGIAGTCLALCLSSDLKSLSVVTEVSTDGASEVSYFQLETNLLYSFLPEVTRMARKFTHISALLQYINLSLTCMCEAWEEILMQMDSRLTTFVQEKNTTTSVQDEFMHLLLWGKASAELQTLLMNQLTVKGLKKLGQSIESSYSSIQKLVISHLQSGSESLLYHLSELKGMALWKQKYEPLGLDAAGIEDAITAVGSFILKANELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVADFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVEKVGQYLKDEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDHCLQKPADVIGKSMNQAICIPLYKDVRSEDSTRRLLKFPFLWNNKTSNLHYLIFTILEDSVYKMCILRRHTDISQSVSNGLIAVKFGSFTYATTEKVRRSTYSCLDAQFYDDETVTVVLKDTVGREGRDRLLVQLPLSSVYNSEDSADYQFSGTYSTRLDEQCSAIPTRTLHFEKHWRLLESMKAQYVAGNGFRKVSCVLSSNLRHVRVFEMDIDDEWELDESSDEDEEASNKPVKIKEEVLSESEAENQPASAAIAPPEIVIKVEKLDPELDS	793376	842931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_793464_793596_793736_799125_799232_806791_806925_808682_808758_808902_808930_809016_809062_810213_810299_810897_811003_812382_812467_814199_814287_814829_814895_816117_816161_816240_816318_818001_818103_818185_818238_825709_825766_828096_828144_829243_829301_829622_829680_835108_835203_836966_837065_838349_838412_838491_838531_838610_838713_839556_839632_840531_840706_841860_841985_842582
906196	contig_5261_pilon	+	2821	3	Intergenic	novelGene_102497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_2	3	276	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	83	385	829244	835297	FALSE	25	ATTGAAAGTGTTGGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQKDITFVADFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVEKVGQYLKDEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKGICVPSRRWPCLNLLETRSAVDQHTVLLNTC	829161	837733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_829301_829622_829680_835108
906197	contig_4654_pilon	-	3338	1	Intergenic	novelGene_103100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497742	494404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494400_497700
906198	contig_3942_pilon	+	561	6	Intergenic	novelGene_128634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1096.96873246233	10669	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176950	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974_180015_180073
906199	contig_6710_pilon	-	554	2	Intergenic	novelGene_95409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2100	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657502	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657503	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
906200	contig_709_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_57613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGAGAACTTGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2399959	2397790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2397800_2400000
906201	contig_8843_pilon	+	6397	12	Intergenic	novelGene_156648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	363.843213895107	443	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	13	1665	49851	117048	TRUE	45	ACAAAAACCCTTATACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYDPPDPRRIYTIMSAEEVANGKKSHWAELEISGRVRSLSTSLWSLTHLTALHLNDNYLSRIPPDIAKLHNLVYLDLSSNKLRSLPAELGNMVSLRELLLNNNLLRVLPYELGRLFQLQTLGLKGNPLSQDILNLYQDPDGTRKLLNFMLDNLAVHPEQLPPRPWITLKERDQILPSASFTVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWEYRKKGIMEEIVNCDADIISLQEVETEQYFTLFLPALKERGYDGFFSPKSRAKIMSEQERKHVDGCAIFFKTEKFTLVQKHTVEFNQVAMANSDGSEAMLNRVMTKDNIGVAVVLEVHKELFGAGMKPIHAADKQLLIVANAHMHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKGVIDYIFYSKTHMNVLGVLGPLDPQWLVENNITGCPHPHIPSDHFSLLTQLELHPPLLPLVNGVHLPNRR	49838	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_49963_53127_53315_54647_54734_66012_66103_83970_84040_87806_87965_89797_89953_107316_107469_110287_110516_112586_112790_116835_117126_117237
906202	contig_12079_pilon	-	2295	4	Intergenic	novelGene_67521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	357.22666318304	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	373	1530	862522	861365	FALSE	35	ACAAACGTTAACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863533_871637_871725_872314
906203	contig_15449_pilon	-	2392	1	Intergenic	novelGene_33608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51161	48769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_48800_51200
906204	contig_7919_pilon	-	3361	4	Intergenic	novelGene_28117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTGGATATGGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417012	1412002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1412207_1413203_1413423_1413780_1413903_1414196
906205	contig_4884_pilon	+	4451	4	Intergenic	novelGene_63827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	909	junction_3	141.805030470243	218	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	655	921	578494	578896	TRUE	70	TAACGAAAAATTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIIYNECNPELPSSSLLIIHRFTDEESRVFLLDRGNTRDKEAPKEKGSEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKDSGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKGMFTMVN	577839	585822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_578568_578703_581363_582400_582486_584843
906206	contig_1264_pilon	-	3389	2	Intergenic	novelGene_161312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAGAAATATACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139903	135075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1264_pilon_-_135295_136733
906207	contig_4305_pilon	+	1727	5	Intergenic	novelGene_136665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCTTCTGTCCGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511089	514692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_512380_512649_512709_513072_513297_513933_514043_514647
906208	contig_7622_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_132413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAGAATGGCTTGGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269649	268042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_268000_269600
906209	contig_1694_pilon	-	6449	1	Intergenic	novelGene_144958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTGGCCAAATCAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1537429	1530980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1531000_1537400
906210	contig_2310_pilon	-	3347	9	Intergenic	novelGene_71633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_8	134.733069437314	183	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	93	1316	495462	468648	FALSE	45	AATATAGATTGTACTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPRIACTRRRRRHGLLRLSHPREPPAAGTMTVRGAALAPDPALPTTAAASPSISAIPEGSPTAMEQPVFLMTTAAQAISGFFVWTALLITCHQIYMHLRCYSCPNEQRYIVRILFIVPIYAFDSWLSLLFFTNDQYYVYFGTVRDCYEALVIYNFLSLCYEYLGGESSIMSEIRGKPIESSCMYGTCCLWGKTYSIGFLRFCKQATLQFCVVKPLMAVSTVVLQAFGKYRDGDFDVTSGYLYVTIIYNISVSLALYALFLFYFATRELLSPYSPVLKFFMVKSVIFLSFWQGMLLAILEKCGAIPKIHSARVSVGEGTVAAGYQDFIICVEMFFAALALRHAFTYKVYADKRLDAQGRCAPMKSISSSLKETMNPHDIVQDAIHNFSPAYQQYTQQSTLEPGPTWRGGAHGLSRSHSLTGARDNEKTLLLSSDDEF	523252	466616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_468890_472011_472207_472686_472857_474008_474101_477143_477220_477728_477820_493510_493677_495270_495500_523197
906211	contig_12638_pilon	-	3103	24	Intergenic	novelGene_33335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	255.419163259734	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	84	2654	1434492	1332741	FALSE	20	CCAGCTTTTGGGGACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSGSQLGSMGSLSMKSQLQITVISAKLKEKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNTNSPKWKQPLTVIVTPMSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFLGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECGLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYTRTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETGGFGQE	1463556	1332291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1332841_1351883_1351957_1357893_1357991_1359275_1359381_1359790_1359912_1369746_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373068_1373158_1374643_1374716_1375548_1375622_1378299_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405590_1411285_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1434422_1434514_1463494
906212	contig_15123_pilon	+	2256	8	Intergenic	novelGene_110890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_7	187.243811374259	131	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	110	1354	14949	34913	FALSE	25	GATGCATTTGCTGGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTDPNASAAQQAVLQQHINNLTYSPFGDSPLFRNPMSDPKKKEERLKPTNPAAQKALTTPTHYKLTPRPATRVRPKALQSTGTAKSHLFDGLDDDEPSLANGAFMPKKSIKKLVLKNLNNSSLFSPVNRDAEDLASPSDYPENGERFSFLSKRVDENHQQDGDDDSLVSRFYTNPIAKPIPQTPESAGNKHNSSSSVDDTIVALNMRVALRNGLEGSSEETSFHDESLQDDREEVENNTYHMHPAGIVLTKVGYYTIPSMDDLAKITNEKGECIVSDFTIGRKGYGSIYFEGDVNLTNLNLDDIVHIRRKEVIVYLDDSQKPPVGEGLNRKAEVTLDGVWPTDKTSRCLIKSPDRLADINYEGRLEEVSRKQGARFKEYRPETGSWVFKVSHFSKYGLQDSDEEEEERPSKTSTKKLKTAPVPPAGQTTPFQMALNGKPAPPPQVEKGQ	14839	35815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_14976_24515_24704_26366_26484_28526_28826_31148_31263_32027_32167_33789_33968_34730
906213	contig_13418_pilon	-	5541	3	Intergenic	novelGene_177918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3145	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	4656	5240	276350	275766	TRUE	30	TTCCCAAATACTTTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKRQENKQIIQNKQTNKSPGIPPAQQPKPGGSSTLEQSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASEKSKEAGQKGKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGAQSEVLKRKEGEVGRGKEEIKSS	287158	255624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13418_pilon_-_255637_275476_277039_283191
906214	contig_13888_pilon	+	3359	5	Intergenic	novelGene_151790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	697.150450046473	29	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	106	597	337589	338879	TRUE	55	AAAATAGGGAAACAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVSICPIISLNYHFKGKEKTGILC	337483	429306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_339363_342670_343726_427759_427981_428303
906215	contig_8161_pilon	-	2265	5	Intergenic	novelGene_156747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.017356926904	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	40	612	235566	230026	TRUE	60	AACAAGCAAACAAGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEEQDGIFYLPTPNQ	236191	226183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227471_229659_230067_232136_232413_235310_235587_236172
906216	contig_9696_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_68820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	908	1243	398890	399225	NA	30	CAGACTCATATAATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIICYIHTVECLCIVNKTQVNIFLVFSAFSQDPSDISNDIPRSTLSSESCLNFSQFPVNVLLQPFLNYLSAKFYLHVILMILLDNFCILLDHISLEWAQIWISSSWLAR	397982	399984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_398000_4e+05
906217	contig_9127_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_103000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62221	61521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_61500_62200
906218	contig_5093_pilon	+	2838	1	Intergenic	novelGene_135094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGGTAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607721	610559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_607700_610600
906219	contig_7151_pilon	+	1297	6	Intergenic	novelGene_40750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	150.118086851652	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	815	1171	505515	507901	FALSE	30	ATAGGTACTTTTGAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502537	508027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503293_503387_504052_504143_505033_505593_506568_506685_507738
906220	contig_5569_pilon	-	2945	7	Intergenic	novelGene_86736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	30.5963868600344	233	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	226	801	428310	424759	FALSE	40	CAAAAACCACACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFFVSLLPDGILPCGVCFLKGQTPVPAGEEEGELGEYRQKLLRFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLEERALLLGRMGKHEQALFIYVHVLKDTRMAEEYCHKHYDQNKNGNKDVYLSLLRMYLSPPSVHCLGPIKLELLELLEPQANLQAALQVLELHHSKLDTTKALNLLPANTQINDIRIFLEKVLEENAQKKRFNQVLKNLLHAEFLRVQEERILHQQVKCIITEEKVCMVCKKKIGNSAFARYPNGVVVHYFCSKEVNPADT	429391	422614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_424835_425641_425734_426658_426794_426923_427083_427983_428030_428242_428346_429201
906221	contig_10627_pilon	+	4834	21	Intergenic	novelGene_59951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	111.214702265483	903	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	62	1465	172734	177436	TRUE	25	TAACACATGTATGGTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKGKVGKSRRDKFYHLAKETGYRSRSAFKLIQLNRRFQFLQKARALLDLCAAPGGWLQVAAKFMPVSSLIVGVDLVPIKPLPNVVTLQEDITTERCRQALRKELKTWKVDVVLNDGAPNVGASWVHDAYSQAHLTLMALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFLSKTSEISLDDEELAQHPATTEDVRACCQDIKVLGRKELRSLLNWRTKLRRHVAKKLKEQAKALDISLSSGEEEEEGNEEESTAGTRRQPSKEEEEEEQLNQTLAEMKAQEVAELKRKKKKLLREQRKQRERVELKMDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTLLK	172558	181493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172594_172707_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174348_174431_174627_174709_174826_174941_175047_175129_175231_175460_175542_175633_175784_175918_176055_177073_177181_177423_177538_177622_177895_178138_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178879_178959
906222	contig_2854_pilon	+	3414	2	Intergenic	novelGene_120911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1534	junction_1	0	152	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	86	301	1329764	1329979	TRUE	35	ATTGAAACAAAGTCTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSLILKFQKLLLGLNANLIAIWEDNQGEMVDVYMNMSSWGPACYSPLQNAGVIVFITISDGMYSAVCWASSCQLVRQSVISVQLCAGTSGGSLKSAMVE	1329678	1336284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1331713_1334904
906223	contig_11855_pilon	-	2396	7	Intergenic	novelGene_67013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_2	57.1246201057147	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	75	995	1415504	1412173	TRUE	30	AGCTCAGTGTGAAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNYLHREVVELAQQYDNVRVTPWRMVTIWGGASLLRMYLRSMRDLLEVPGWAWDFFINLSATDYPTRTNEELVAFLSKNRDKNFLKSHGRDNSRFIKKQGLDRLFHECDSHMWRLGERQIPAGIVVDGGSDWFVLTRSFVEYVVYTDDPLVAQLRQFYMYTLLPAESFFHTVLENSPACESLIDNNLRVTNWNRKLGCKCQYKHIVDWCGCSPNDFKPSDFLRLQQVSRPTFFARKFESTVNQEVLEILDFHLYGSYPPGTPALKAYWENTYDVADGPSGLSDILLTAYTAFARLSLRHAATAAPPPATALCRLAPTGTPKNACSETLGG	1415578	1409210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1410333_1411893_1412228_1413315_1413579_1413910_1414088_1414178_1414396_1414606_1414688_1415376
906224	contig_6208_pilon	+	3400	1	Intergenic	novelGene_52998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1053	1358	413902	414207	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYEIISSANRETLTFSLPIWMPFISFSSLTALASTSSTVLNNSGDRGHPCLIPVLMGNAFKVSPFRMMLAVGFV	412849	416249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_412800_416200
906225	contig_5286_pilon	-	4090	2	Intergenic	novelGene_157321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTGGGTTCCTTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603909	283132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_285186_601872
906226	contig_8050_pilon	+	1695	12	Intergenic	novelGene_114830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	553.409492252981	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	816	1442	321926	336334	FALSE	45	ACTAATGTTTTATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMASQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRFLLSTAYLSFMDLWVKDSVHEGIQGTTSKSSLILCAHFHSFLQR	305552	336587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320810_320926_321619_321763_321858_321943_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_336199
906227	contig_14208_pilon	-	4238	2	Intergenic	novelGene_129077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1613	2047	112249	111815	FALSE	75	AAAAAGAAGAAAAATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKEISQNPSVRRNFRGHLVQSLLFIQFFYFTGKKKKAGGPDTLNDFPKVCLEWLSFCLKAWLEPRSHEAQPRHHIAFLYLNQCQLLSACFLKILRGDLSHRIHNWKFVVSLPTLNPFSWSTFSNFAQGCEVINGHRNRTRLH	113910	109623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_113195_113243
906228	contig_5623_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_154861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2012	2413	247926	247525	NA	15	AGGCTCAGCTCTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWRWVSPSAENAPSKHHRLPASLLTPELIWPEGLRLSPGQVCQLLTASEPSLPPLATHSSSSTLPFMFRAPRLPYIINSLVFSGLCCKRGHWKCLTTPPSWPRLLCSINFSILLDHLCLEWAQIWVSSSQ	249937	247148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_247100_249900
906229	contig_16622_pilon	-	1194	5	Intergenic	novelGene_48461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1286.29552883465	167	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCATGTCAATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121967	111849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115297_121470
906230	contig_16411_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_77278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTGCACTTGGGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19372	20943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_19400_20900
906231	contig_7909_pilon	+	2181	10	Intergenic	novelGene_155914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_8	112.213861074664	115	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	227	2017	516234	545022	FALSE	70	TAATATAGGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGTTTKITTIPMTSKPNVIVVQKTTGKGTTIQGLPGKNVVTTLLNAGGEKTIQTVPTGTKPAIITATRPITKMIVTQPKGIGSTVQPAAKIIPTKIVYGQQGKTQVLIKPKPVTFQATVVSEQTRQLVTETLQQASRVAEAGNSSIQEGKEEPQSYTDSSSSSTESSQSSQDSQPVVHVIASRRQDWSEHEIAMETSPTIIYQDVSSESQSATSTIKALLELQQTTVKEKLESKPRQPTIDLSQMAVPIQMTQEKRHSPESPSIAVVESELVAEYITTVSHRSQPQQPSQPQRTLLQHVAQSQTATQTSVVVKSIPASSTGAITHIMQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVTEY	511182	545186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_511317_516141_516292_517733_517905_524099_524237_526672_526847_528521_528721_536900_537066_538881_539038_542365_542518_544443
906232	contig_15087_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_37236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGAAAGCCTTCCTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164899	165301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_164900_165300
906233	contig_8818_pilon	-	5775	7	Intergenic	novelGene_178228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204593	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_2179_40640_41006_43575_43894_44689_47033_193789_194005_204124_204231_204341
906234	contig_11579_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_171936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCACTATAGACACTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42448	43988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_42400_44000
906235	contig_9375_pilon	-	4175	2	Intergenic	novelGene_136080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	378	686	626743	626435	TRUE	45	CACATTTGAAATACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSCIIFLNFSTFSVFSRNLPAFSMNLSLFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSAFSSTGKSSGVLFWTPSGMILSCFYKCFDIVCCL	627120	622861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_625953_626036
906236	contig_15327_pilon	-	633	3	Intergenic	novelGene_70679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	43	junction_1	3024.5	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901283	900444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900773_900884_901033_901126
906237	contig_2219_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_67209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATATTTGAGTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368351	366221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_366200_368400
906238	contig_2854_pilon	-	1800	7	Intergenic	novelGene_120876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_6	321.961005230275	128	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	155	754	1130219	1076098	FALSE	10	ATTCTTTTTTGCTTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPDAVIFPPAFLRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVPFPQILQY	1132534	1075051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1130167_1130278_1132438
906239	contig_10323_pilon	-	1030	6	Intergenic	novelGene_123613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1007	junction_5	1492.14980481184	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	49	1029	473591	460538	FALSE	35	CAGACGTTGAAAGGGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHI	474244	460536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208
906240	contig_8866_pilon	-	2575	14	Intergenic	novelGene_77853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	155.378712759175	220	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	11	2023	769789	657073	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKMNNPSESSKPSMESGDSNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGHLHQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLDEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSALSSPSALNSPGLGIEGLNRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVNPVLPLTSAAVTNLSVTGTTDTPSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPPRDQPGDGDIRVANSYPPRSCTVASKCQSCCHGCCCRTKPRPDGTLSVCSWRCLTQSQPRDPGRCSQPSSDEQQYTGNYSSSCFWWLSSNNVTGCNWEPGICQCRRSPQHRDCPSVPEPSEPLSAHQQPS	769799	656520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_657224_660814_660904_661651_661987_676950_677057_684092_684273_685274_685421_686661_686804_690845_691020_695554_695650_708097_708225_710870_711060_713011_713132_726515_726617_769731
906241	contig_7428_pilon	-	2653	1	Intergenic	novelGene_77701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAAGTGTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277437	274784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_274800_277400
906242	contig_6102_pilon	+	10147	64	Intergenic	novelGene_32260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	26	junction_57	119.971935493775	295	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1925	5778	113	5890	1394094	1416791	TRUE	60	AAAAAAGAAAAATGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGGWPNGLTVDYLEKRILWIDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEFLSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEANGGRGPCSHLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYIISFTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVETVVSADLPNAHGLAVDWVSRNLFWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQGLEQPHSLVVHPLRGKLYWTDGDNISMANMDGSNRTLLFSGQKGPVGLAIDFPENRLYWISSGNHTINHCNLDGSGLVVIDAMQSQLGKATALAIMGDKLWWADQVSEKMGTCNKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESTQLDHEGTNPCSINNGDCSQLCLPTSETTRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEGIRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAENDTIYWVDMGLSTISRAKRDQTWREDVVTNGIGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGSFRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGQYPRIERSLLDGTERVVLVNVSISWPNGISVDYEDGKLYWCDARTDKIERIDLETGENREVVLSSNNMDMFSVSVFEEFIYWSDRTHANGSIKRGSKDNATDSVPLRTGIGVQLKDIKVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGGGQRACACAHGMLAEDRASCREYAGYLLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFFSDIHFGNIQQINDDGSGRTTIVENVGSVEGLAYHRSWDTLYWTSYTTSTITRHTVDQTRPGAFERETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKYVGSDMKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGHVNCSCRGGRILQEDFTCRAVNSSCRAQDEFECANGECISFSLTCDGVSHCKDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNLLWCNGVDDCGDSSDEIPCNKTACSVGEFRCRDGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRLGVKGVLFQPCERTSLCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNYFACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGEDETHCNKFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPSSFSCPGTHVCVPERWLCDGDKDCADGADESIAAGCLYNSTCDGREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCADGSDESPECEYPTCGPNEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSSEHKCNASSQFLCSSGRCVAEALLCDGQDDCGDGSDERGCHINECLSRKLSGCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFRLKDDGRTCADVDECSTTFPCSQRCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGHPHSCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNYTLLKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTGLSNPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDHSLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYVTERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHKTTGANKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVNNGGCSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGGDGRTCVSNCTASQFVCKNDKCIPFWWKCDTEDDCGDHSDEPPRLSRVQVPPRTVPVLHRHLHKPCLHL	1393321	1429178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1393391_1394050_1394296_1394533_1394666_1394962_1395191_1395491_1395667_1395751_1395847_1396088_1396239_1396403_1396545_1396919_1397055_1398915_1399048_1399290_1399426_1399604_1399735_1399984_1400112_1400531_1400684_1400776_1400902_1401207_1401586_1403150_1403341_1406847_1407053_1407422_1407616_1408583_1408710_1408891_1409021_1409304_1409425_1409658_1409773_1410078_1410229_1410307_1410431_1410748_1410866_1411020_1411150_1411436_1411560_1411653_1411795_1411889_1412081_1413089_1413274_1413353_1413440_1413653_1413774_1414266_1414455_1414557_1414764_1415123_1415313_1415915_1416065_1416474_1416570_1416718_1416836_1417011_1417132_1417482_1417606_1417795_1417922_1418451_1418569_1419249_1419357_1419459_1419593_1420637_1420758_1420890_1421014_1421387_1421529_1421636_1421772_1421850_1421971_1422803_1423073_1423756_1423936_1424423_1424531_1424793_1424911_1425412_1425590_1425741_1425883_1426020_1426195_1426422_1426585_1427024_1427200_1427320_1427423_1427571_1427637_1427750_1427842_1427940_1428086_1428234
906243	contig_11338_pilon	+	3918	17	Intergenic	novelGene_6149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	503.592061934807	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	447	2141	6086	11749	TRUE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	744	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_13195_13275
906244	contig_7870_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_109010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAATACTATAATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517535	515374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_515400_517500
906245	contig_16870_pilon	-	814	7	Intergenic	novelGene_155517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	122.698025882879	17	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTAATGTGATTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212865	201328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_-_201366_202226_202563_203003_203068_203179_203224_203510_203628_207462_207586_212772
906246	SIRV6	+	1390	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	5	NA	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	186	518	1673	2560	TRUE	5	GGGGTTTGCCGATGCGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1099	11700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
906247	contig_10324_pilon	-	2278	2	Intergenic	novelGene_7913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACGCCCCCATCCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883741	875197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_875351_881616
906248	contig_19692_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_174883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCCTTTGCCGTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55343	56631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_+_55300_56600
906249	contig_5686_pilon	+	1959	3	Intergenic	novelGene_45385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162349	301135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_162925_164534_165654_300870
906250	contig_12644_pilon	+	3184	1	Intergenic	novelGene_44450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340090	343274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_340100_343300
906251	contig_19701_pilon	-	3471	5	Intergenic	novelGene_147890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1461	1928	172299	150094	TRUE	45	TTGTGCAGCAAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILKDSGSIKRRWKKYTESLYQKELVNIQPFQEVVYDQELMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDGILTEMFQQMDAALEVLTRLCQEIQKTAKEIWKTATWPTDWKRSIFVPISKKGDPTECGNYQTISLISHVSKILLNIIKKGCSSTSTRDW	182393	85570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_86572_149551_150282_172019_172486_180586_181549_182081
906252	contig_7408_pilon	-	2435	8	Intergenic	novelGene_168740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	214.273523462753	4	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	531	1610	38514	12597	FALSE	65	TAATAAAAAGACAAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48287	11771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48135
906253	contig_8452_pilon	-	2358	3	Intergenic	novelGene_48074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAATAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019656	950875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_952959_959895_960038_1019523
906254	contig_7078_pilon	+	4202	3	Intergenic	novelGene_130205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	137.5	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGAATTCTCCAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951295	969167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325
906255	contig_4470_pilon	-	6013	2	Intergenic	novelGene_171773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	240	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	5597	6013	232973	232557	FALSE	40	ACAAGGCTAGCAGTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTMLGTLIHGINTIQTISNDAQAPEERLDKWELLKVKHLCSSKDFTKRVKRQPTGWETNFRLQQIRSAFKIYKVVQNLNSKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTP	246679	232556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_-_233797_241906
906256	contig_17042_pilon	-	2172	7	Intergenic	novelGene_140186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	13.832329280831	213	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	164	607	86257	50490	FALSE	35	ATTTTACACTACATATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDREARASVRVVNQLLTEMDGLETRQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPAADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASLCALRQEMARQKNGNEKGELKISLKHFEEAFKKVKPSISKKDQVMYEALQQSLR	89918	48924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17042_pilon_-_50532_56301_56373_59271_59361_62001_62079_74993_75101_86199_86296_89793
906257	contig_5539_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_104790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305280	303383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_303400_305300
906258	contig_5059_pilon	+	2940	2	Intergenic	novelGene_140755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATCCACAAACAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444575	447565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_446805_446854
906259	contig_13528_pilon	+	3523	2	Intergenic	novelGene_66858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1235	junction_1	0	213	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2029	2448	25280	27821	FALSE	15	CCCAGCTATGTTTTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQVQLEQHDVHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKEADEKHQREREFVSSVSEKRNCCQNCNQSYRKHLNFVFNGAPGALGVLL	23251	28896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_25466_27587
906260	contig_7230_pilon	+	4743	7	Intergenic	novelGene_52566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	27.4575429830614	158	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	55	591	221725	295915	TRUE	15	AGATCCAGCTCTTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDSEQTLQNHQQPNGGEPFLIGVSGGTASGKSSVCAKIVQLLGQNEVDYRQKQVVILSQDSFYRVLTPEQKAKALKGQFNFDHPDAFDNELIFKTLKEITEGKTVQIPVYDFVTHSRKEETVTVYPADVVLFEGILAFYSQEVRDLFQMKLFVDTDADTRLSRRVLRDISERGEGP	221670	304812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_221824_277410_277571_278641_278739_284541_284685_295877_295977_298862_298912_300770
906261	scaffold_4805_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_161017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAAAAAATTGGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384959	387137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_385000_387100
906262	scaffold_12124_pilon	+	4872	1	Intergenic	novelGene_22109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	310	933	105	1037	893154	894086	NA	25	GTGCTTAGAGAGTTAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPNTQCSVTNVEHVKRKPRDRGRLFCLRVAGTLGQVYAASAVGFLQVSTGQRWVSGCKPAGTLLGDPLVMRDPLRVVLRGYYWLEWWKSTAEEDIPDGRLGRTCVKAQAPGIHLGSPTEPGAASRTSQAEDWHQPGLCPSPAWAPDPACPLCPQGCSEDPISTTQWRACLRGETAPDACWCCGGALEAAELPSAWLPTSTADEQGTHLCERPPHCTIYLGSSADPGAARKEPSGTQAPAFTCVWVSISPAGWPPSPSSPLRTPYHNPQWRPCLGREDPLAGPLCPRQNPRERREAHCSKSCFYCRAAE	893049	897921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_893000_897900
906263	contig_3721_pilon	+	2653	2	Intergenic	novelGene_123788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTCCCCTGCTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46649	58954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_49191_58842
906264	contig_9609_pilon	-	1690	1	Intergenic	novelGene_22923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	1369	1689	18723	18403	NA	15	TGGTAGCCGGGCACCGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQSALNPLCFPSHPQTEAACLVLRGTLLTSITLCPAVQSGPCLKSWPQKLFQFWGNRESRGHAFWGTSSLRPLSLVLLLEFEFCTPPFSCSIQESLLCFLSGLLL	20091	18401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_18400_20100
906268	contig_10225_pilon	-	1509	2	Intergenic	novelGene_86839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAACCAGAAGATAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25848	24184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_25222_25376
906269	contig_6102_pilon	+	3941	32	Intergenic	novelGene_31860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	518.03961696482	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	58	2058	370803	379784	TRUE	5	CAGCTGTGGCTCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPGPDSQRPLLGGTGEGQVRSLCQTKAGRTKLPEPCCSGRSQSPLE	370745	395262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379410_379644_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394847_394929
906270	contig_12654_pilon	+	4517	12	Intergenic	novelGene_129255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	64.4712761975863	380	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	295	1485	55203	84535	FALSE	10	TTACTGTGTCATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWLFPLTKSASSSAAGSPGGLTSLQQQKQRLIESLRSSHSSIAEIQKDVEYRLPFTVNNLTININILLPPQFPQEKPVISVYPPIRHHLMDKQGVYVTCPLVNNFTMHSDLGKIVQSLLDEFWKNPPVLAPTSTAFPYLYSNPGRLPPYTSQGFPFLPPYPPQEANRPITSVSVADTVSSATSYTTAKPAAPSFGILASLPLPVPTTDASTPINQNGFGYKMPDVPDAFPELSELSVSQLTDMNEQEEILLEQFLTLPQLQQVITDKDDLVKSIEELARKNLLLEPSLEVKRQTVLDKYELLTQMKSTFEKKMQRQHELSESCSASALQARLKVAAHEAEEESDNIAEDFLEGKTEIDDFLSSFMEKRTICHCRRAKEEKLQQAIATHSQFQAPL	54908	89064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_55328_66352_66428_68316_68432_69086_69188_73389_73613_75245_75317_79173_79302_79386_79446_79525_79595_83260_83405_84454_84536_86032
906271	contig_8167_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_155640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACTAATAAACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47612	50021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_47600_50000
906272	contig_4782_pilon	+	4153	1	Intergenic	novelGene_73601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTCTCCCAGCTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73283	77436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_73300_77400
906273	contig_5779_pilon	+	591	2	Intergenic	novelGene_106473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACCAAACTTACAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135835	137713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_136355_137641
906274	contig_2438_pilon	+	1335	5	Intergenic	novelGene_112015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	6095	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
906275	contig_7253_pilon	-	2726	1	Intergenic	novelGene_140189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATTTGCTGGTGTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	143985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_144000_146700
906276	contig_15500_pilon	-	867	2	Intergenic	novelGene_128975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161759	159780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_160168_161279
906278	contig_17059_pilon	+	4688	5	Intergenic	novelGene_166083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	113.639781766774	430	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	418	2298	421631	429087	FALSE	40	TCTGGACAATCTACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLGLRDDIPFNFQKLEKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDLAQRRLYRDVMMETFRNLASVVSLHLNDGENLSSEHIMVRLMKNNTWSSMLGEISDSLGNKDHHKNQWRHVRSHTVQNHCESNEGNQCEKPFSQIPPKVNPFEFCECGKAFMDHSSHKHDARSHTGCNTRPCKECGEASSCSSHLTTPIRTLNGKKPHKCKVCGKYFICISTLRNPVTTLTGEKWYECNQCRKDFCSFSSFWIHMRGHKHECKECCKTYSPSSLILQKKIHNKDNPYKCKVCGKAFSCSSSLSTHMRTHTGERPYDCKECGKAFSQSSHLTEHMRTHSGERPYECMECGKAFMCSSHLTKHLKTHNGQRPYECKECGKAFSEASSLTRHIRTHSGVRPYKCKECGKAFSRSSSLTKHIRTHSGERPYVCKQCGKVFSCSSDLTTHMRTHSGEKPYKCKECGKTFSVSSTLTTHMRIHSGERPYECKECGKAFSQSSHLTTHRRTHSGERPYECKQCGKAFSCSSALTAHIKTHSGERPYECKECGKAFSCSSVLTNHIRIHSGERPYECKQCGKAFSQASALITHRRIHSGERPYECKECGKSFSRSSSLTRHIKTHSGGVMNVRNVGKSLVRP	419430	431477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_419664_421446_421694_425605_425733_426717_426869_427547
906279	contig_5696_pilon	+	1549	2	Intergenic	novelGene_117493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAATGTGGGGATATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233241	237093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_233787_236089
906280	contig_17144_pilon	-	1327	10	Intergenic	novelGene_29266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1628.41864517409	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	115	1032	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183196	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168254_176130_176271_179700_179786_181794_181850_183158
906281	contig_7816_pilon	+	1986	9	Intergenic	novelGene_66552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.9348542257657	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	372	1394	328886	351499	FALSE	55	AGAAAAAAAGACGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	328399	352091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_328726_328840_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331
906282	contig_8620_pilon	+	784	4	Intergenic	novelGene_173877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	169.580528232328	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACATCTTATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82121	117870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_82467_95446_95548_103846_103922_117607
906283	contig_3747_pilon	+	2431	6	Intergenic	novelGene_24781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4134.29420336773	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	332	685	201313	203229	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGLPFWAATSFELNTPY	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202187_203078_203128_203228_203386_203498_203651_203768
906284	contig_16125_pilon	-	4937	4	Intergenic	novelGene_155270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_3	561.986358078794	11	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	60	1478	236934	153413	FALSE	30	TTAACCCAGCATATCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEVSFFFLFPALTRIFNKLP	236993	149953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_153490_155570_155618_179440_179598_235796
906285	contig_10000_pilon	-	3978	1	Intergenic	novelGene_139330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCTACTCATAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252891	248913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_248900_252900
906286	contig_6630_pilon	-	1884	4	Intergenic	novelGene_30708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_3	618.657327515717	116	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	18	671	380081	372498	FALSE	40	GAAGAAGAGATGGAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRKFADGEVVRGRWPGSSLYYEVEILSHDSNSQLYTVKYKDGTELELKENDIKTPFGNSIGRYNGEPERIERNDIPPRSIQEKPHLSQESSYVSTQYSLRPRREEIKFKEMDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVSFC	380098	371284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_372710_374298_374492_374845_374930_379916
906287	contig_6418_pilon	-	2662	14	Intergenic	novelGene_81251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	530.815360314264	44	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	489	2273	1476927	1449950	FALSE	25	ATACAATTCTGCTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESKRNVSESALPSFQTPVNTVSSTSLITPPTVVSSQPKLQTPATSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNSPAGAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSLPTVGPSGLYSPSNNRGPIQMKIPISAFSTSSPAEQSSTATPRVEADRQAFRLWHHWVGLNRQPLENQTNKTTDNSVNKKAADSTSQTGRATASDSGGVIDLTMDDEESATSQDPKKPNHTPVSTIGSSQPVTRPLQPIQPAPPLQQSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNSGLTLGSAGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGIVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQSTDVISSSQSS	1497719	1449560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1450370_1454063_1454177_1455959_1456143_1458960_1459117_1460538_1460618_1467819_1467885_1469633_1469697_1472220_1472860_1476860_1476950_1477830_1477855_1482694_1482761_1491132_1491271_1496150_1496297_1497627
906288	contig_6684_pilon	-	3449	1	Intergenic	novelGene_168584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGAGCATCCAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25162	21713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_21700_25200
906289	contig_13481_pilon	+	2147	4	Intergenic	novelGene_119450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	24.4585817704589	43	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	372	761	1091943	1093268	FALSE	30	ATGGAGTCCAATTTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFNAIVQGMNTRPKEELQSYPKPPVSLLLSLKLREEPVGIKVFASVAIILIESTRWQQNPPVSALLPGSAELPSCQRGSKRLPVIPGGQAGCRGLPAPRSLLYGVPLWAALACPPQFLCLQQWNRLNN	1066922	1094654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071089_1071222_1091839_1092052_1092987
906290	contig_7979_pilon	-	3182	20	Intergenic	novelGene_125541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_15	154.642846495721	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	577	2736	1104746	1048799	FALSE	45	AGTCATAATATTACATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFQHQEKDIKKEEITKEEEREKKFSRRLNHSPPQSSSRYRENRSRDERKKDDRSRKRDYDRNPPRRDSYRDRYNRRRGRSRSYSRSRSRSWSKERLRDRDRDRSRTRSRSRTRSRERDLVKPKYDLDRTDPLENNYTPVSSVPSISSSHYPVPTLSSTITVIAPTHHGNNTTESWSEFHEDQVDHNSYVRPPMPKKRCRDYDEKGFCMRGDMCPFDHGSDPVVVEDVNLPGMLPFPAQPPVVEGPPPPGLPPPPPILTPPPVNLRPPVPPPGPLPPSLPPVTGPPPPLPPLQPSGMDAPPNSATSSVPTVVTTGIHHQPPPAPPSLFTADTYDTDGYNPEAPSITNTSRPMYRHRVHAQRPNLIGLTSGDMDLPPREKPPNKSSMRIVVDSESRKRTIGSGEPGIPTKKTWFDKPNFNRTNSPGFQKKVQFGNENTKLELRKVPPELNNISKLNEHFSRFGTLVNLQVAYNGDPEGALIQFATYEEAKKAISSTEAVLNNRFIKVYWHREGTTQQLQTASPKVMQPLVQQPILPVVKQSVKERLGPVPSSHTEPAEAQSASSDLPQNVTKLSVKDRLGFVSKPSVSATEKVLSTSTGLTKTVYNPAALKAAQKALLVSTSAVDNNEAQKKKQEALKLQQDVRKRKQEILEKHIETQKMLISKLEKNKAMKSEDKAEIMKTLEVLTKNITKLKDEVKAASPGRCLPKSIKTKTQMQKELLDTELDLYKKMQAGEEVTELRRKYTELQLEAAKRGILSSGRGRGIHSRGRGAAHGRGRGRGRGRGVPGHAVVDHRPRALEISAFTESDREDLLPHFAQYGEIEDCQIDDSSLHAVITFKTRAEAEAAAVHGARFKGQDLKLAWNKPVTSISAVETEEAEPDEEEFQEESLVDDSLLQDDDEEEEDNESRSWRR	1111143	1048352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1048889_1050534_1050649_1061526_1061614_1065029_1065231_1077636_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080767_1080894_1088414_1088487_1089707_1089840_1090379_1090545_1095872_1096033_1097020_1097133_1102867_1103009_1103395_1103537_1103979_1104220_1104715_1104977_1107317_1107536_1108699_1108789_1111104
906291	contig_14732_pilon	+	3964	1	Intergenic	novelGene_169704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2270	2593	42856	43179	NA	25	TTTCCTGTTGAAATTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIGVSEWAEEVKIFVSHVNAHQRVTSAEDDFNNQVDRMTCSVETSHPLSPATPVIAQWVLEQSGHGGRDGSYAWAQQHGLPLTKADLAIAAAECPFCQQQRPTLNP	40586	44550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_+_40600_44600
906292	contig_5236_pilon	+	2079	17	Intergenic	novelGene_100881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	130.808543298976	13	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	827	1837	73022	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60626	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70505_72973_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
906293	contig_12250_pilon	+	2015	2	Intergenic	novelGene_80526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGCAAAATGAGACTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70032	72121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_70287_70360
906294	contig_11417_pilon	-	1927	5	Intergenic	novelGene_103303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537824	526342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_527106_528492_529346_530871_530957_536806_536969_537760
906295	contig_16715_pilon	+	2833	2	Intergenic	novelGene_178097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGGGTGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72085	75187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16715_pilon_+_73065_73333
906296	contig_14441_pilon	+	2060	2	Intergenic	novelGene_100702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	983	junction_1	0	36	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1213	1608	116728	117123	TRUE	30	ATAAACACAGCCTGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGESRTGGTGRPGLARAVAWASVACRQPGFVLLGKGSLSAIPPSLSDCGLSSGK	115515	117771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_117344_117539
906297	contig_7151_pilon	-	3441	5	Intergenic	novelGene_40709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436232	59033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_59236_59353_61639_83571_83583_258178_258602_435712
906298	contig_5903_pilon	-	2359	3	Intergenic	novelGene_173228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCCCACAAACAAAAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518113	469662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_-_470560_516543_516635_516742
906299	contig_13097_pilon	+	3001	11	Intergenic	novelGene_107700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	263	junction_8	255.662355461261	33	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	220	1197	184733	225365	FALSE	30	ACATTTGATTTTTGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQV	184513	227169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_215273_215382_225265
906300	contig_20550_pilon	+	2445	21	Intergenic	novelGene_142613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_20	238.84888528105	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	62	2050	3777	38142	FALSE	10	TGCCTGTTTTGTGCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADYSTVPPPSSGSAGGGSGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQKRPLEDGDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQQGQTQDYSKAWEEYYKKQGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ	3715	38537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_3891_10676_10768_12453_12493_12952_12993_15550_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37487_37548_37627_37774_38133
906301	contig_3789_pilon	-	3932	1	Intergenic	novelGene_79905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACCCCAGCCTCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670401	666469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_666500_670400
906302	contig_6552_pilon	-	3775	1	Intergenic	novelGene_163590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	333	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATATGGTTCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104509	100734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_100700_104500
906303	contig_6189_pilon	+	3615	1	Intergenic	novelGene_164928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGACAGGGGCAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9901	13516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_9900_13500
906304	contig_18487_pilon	+	2492	15	Intergenic	novelGene_172670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_10	32.4314819335806	243	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	284	2179	196613	210098	TRUE	20	CCACGAAACTGTCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAAASSYPMASLYVGDLHSDVTEAMLYEKFSPAGPVLSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPIRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYAFVHFETQEAADKAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGAKAKEFTNVYIKNFGEEVDDESLKELFSQFGKTLSVKVMRDPSGKSKGFGFVSYEKHEDANKAVEEMNGKEISGKVIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKNLDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGSKPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRTLPASAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRPPYYTPNQLAQMRPNPRWQQGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGNAPASRGLPTTTQRVGVPPAVQNLAPRAAVAAAAPRAVAPYKYASSVRSPHPVMQPLQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKVGAVAAATS	196329	211434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_196806_199297_199492_200490_200607_201851_201992_202356_202452_203123_203262_204011_204108_206117_206391_206751_206840_207019_207140_207774_207903_209065_209160_209271_209403_210008_210112_211134
906305	contig_8822_pilon	-	3888	7	Intergenic	novelGene_117923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	113.346690389363	11	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTACATATATACACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104337	49487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_52744_57093_57174_61525_61653_62413_62498_77031_77173_103708_103778_104206
906306	contig_16205_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_156883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1005	1343	99369	99707	NA	35	CTTCATCAGCCTGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAITLLGIYPREIRAITQTDTCTSMFPAALFTTAKRWKQPRCPSVDERINKLWYIHTMEYYPTIKNNNEAMKHLVTWRNLEGIMLSRFH	98364	100204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_98400_100200
906307	contig_10216_pilon	-	2684	2	Intergenic	novelGene_178814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1461	1832	244044	243673	FALSE	5	GCCCTGGCCTGGATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYKANNTQKRAGVVILISEKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKVSIHQEDITIINIYALNGRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLLVKDRTFKKKLSKDMEELNATVKQLDVMDIY	284941	242820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10216_pilon_-_244872_284308
906308	contig_1274_pilon	-	3148	1	Intergenic	novelGene_137805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTTAACAGCTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445893	442745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_442700_445900
906309	contig_2504_pilon	-	3697	2	Intergenic	novelGene_166840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTAAGAAGTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371644	367890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_368482_368538
906310	contig_6497_pilon	+	10087	36	Intergenic	novelGene_35621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2859	28	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	383	961	668772	671069	TRUE	10	CCAGGCAGGTGTGCCTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFPVPYPRYFSFPQFELSPTQEVPEALSFDFVLLITGCRISLFAILFSAVTHLPVVSVVPKVDLAEYSFVSDPQVKILDPSSSSLSRSSLRSNLAFSFSRAHWSSLDFFCSLANVSLSKCTSSVFSLTSNLNASNSFRCLCCTLRVVSSASLVCASSLCSSATTIFSELSCSCSSVALSLTLLSSTCISSI	668389	790293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_669016_669903_670051_670881_671104_673807_673955_678689_678876_679286_679477_680056_680179_680262_680324_680756_681243_681753_681901_682624_683695_684473_684658_685012_685167_688945_689049_689655_689837_697016_697136_698068_698303_700719_700931_702455_702621_717343_717573_724040_724252_726418_726523_728258_728482_729767_730123_738387_738483_742431_742529_743590_743789_744888_745107_749822_752207_754319_754519_755398_755551_756688_756862_757224_757282_764429_764473_767272_767531_789957
906311	contig_8452_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_47988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCAGTTTCATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110410	111953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_110400_112000
906312	contig_19330_pilon	-	3141	1	Intergenic	novelGene_163701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTAACCAAAAACAGAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84024	80883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_80900_84000
906313	contig_19701_pilon	+	10185	1	Intergenic	novelGene_147897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	538	134	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	279	840	39	878	129206	130045	NA	10	GCAACTGTGCTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFCLSSPTETLKMGYADCKKATGDSSSGKEDDTEEESSGDEQESFTVKKEPQASQSSDKCEANSGVHSREALFTSDCLANKNVKAETPVNEQTTLSKDNYLFTRGQTFDEKTLARDFIQAAQKQMAHAVRGKMMCSSSELFNSTALPVPADSPTHKPLLLPTLQTPKLYGSPTQIGSSYRGMINVSTSSDMDHSSAVPGMPDCSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFPEENSIEDTPSKCYCRLKAMIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR	129167	139352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_129200_139400
906314	contig_12644_pilon	+	5711	3	Intergenic	novelGene_44473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	203	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4364	4732	1175781	1176149	FALSE	30	TGGACTCATCAGCATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAMLEVLTLLCQEIWKTPTWPNNWQRSIFVPIPKKGDPTERRNYQTTSLISYTSKFCCRSFKNGCRSTSTGNCQKFKQGSEEDMERGMTLLMSDGSWLSREYQKVVYLCFIDYAKAFDCET	1012977	1177128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1013443_1017034_1020921_1175768
906315	contig_3270_pilon	-	8228	18	Intergenic	novelGene_104467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	286.494479013454	113	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	914	2745	481	3225	209754	132578	TRUE	40	ACCCAGAACAGCAACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMHQINPKLESQRVNKKVNNDASLRIHNLSILVRQIKLYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDVEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKAMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLAKTVEELRSTVDSVEGNASKILKIEKENQRLNKKVEILENEVIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKTEFEKRQIRKELEHYKEKGERSEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREVNIFS	210586	119076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_119134_121338_121504_127796_133667_135020_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492_209594_209691_210059_210410
906316	contig_15185_pilon	+	1831	2	Intergenic	novelGene_99389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88305	90182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_88322_88367
906317	scaffold_13505_pilon	+	1776	13	Intergenic	novelGene_111404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	77.0573379590376	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	33	1277	287876	326065	TRUE	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSPSPGRASSMVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKTSPFSLSPTGPSTKIKAEDPSGDSTPAAPPPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAGDIQQLLQLQQLVLVPGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLFQLPQQTQGALLTSQPRAGLPTQAVTRPTLPDPHLSHPHPPKCLEPPSHPEEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSPNQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHLVTPLSIPSPLSLPHPRPPPTAQIPALKAATQLSACRA	287843	327061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_287904_296703_296770_296900_296936_297084_297142_300649_300767_317941_318048_318134_318227_320763_320926_321060_321203_321293_321443_321517_321701_325957_326079_326575
906318	contig_3956_pilon	+	1198	5	Intergenic	novelGene_15276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1178.75220042212	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	209	481	1289515	1290298	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKA	1287973	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1288067_1289134_1289229_1289493_1289677_1289758_1289869_1290297
906320	contig_12677_pilon	-	1515	2	Intergenic	novelGene_110754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTAGGCCCCACATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1720	27	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_372_549
906321	contig_12050_pilon	+	1693	2	Intergenic	novelGene_62599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298599	301275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_299183_300165
906322	contig_8269_pilon	+	1840	8	Intergenic	novelGene_106247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	444.287184196007	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	890	1750	344617	378608	FALSE	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGDGPQPPSALKRCRLPSRC	343727	378698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_378549
906323	contig_2854_pilon	+	2399	1	Intergenic	novelGene_120828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	282	849	471	1319	246682	247530	NA	20	AAGATGTTTTTGTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQTATALPTGTSKCTPSQRVPALTGTTASNNDLASLFECPVCFDYVLPPILQCQSGHLVCSNCRPKLTCCPTCRGPLGSIRNLAMEKVANSVLFPCKYASSGCEITLPHTEKADHEELCEFRPYSCPCPGASCKWQGSLDAVMPHLMHQHKSITTLQGEDIVFLATDINLPGAVDWVMMQSCFGFHFMLVLEKQEKYDGHQQFFAIVQLIGTRKQAENFAYRLELNGHRRRLTWEATPRSIHEGIATAIMNSDCLVFDTSIAQLFAENGNLGINVTISMC	246211	248610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_246200_248600
906324	contig_14687_pilon	+	3903	1	Intergenic	novelGene_107936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCAGCCAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505528	509431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_505500_509400
906325	contig_7321_pilon	+	3227	2	Intergenic	novelGene_53108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	139	450	11803	12114	TRUE	50	TCTGGAAAACAGCAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIENPDVNPSTFSNLVFTRAQSPSNGEQTVFLTNGAGKTGCPSAKQMKQDPHLTPYTKTNSKWIKHLNIKPKTIKFIEENIGSMLEALIHSINRIKTITNNTRTPEDKLDNWDLLKIKHLSSSEDFTKRVKREPTDWEKFLDITSQTNV	11664	15379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_12654_13141
906326	contig_6497_pilon	+	1475	3	Intergenic	novelGene_35570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATTTGTGCCTCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174101	181198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_174192_176997_177043_179858
906327	contig_3745_pilon	-	3269	1	Intergenic	novelGene_85091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2750	3076	408830	408504	NA	60	AGAGAAACAATAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQIAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKTSEMDSVTGGVKSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRMKKNEKTLRVMWDSIKSKNLSDQSSRTGGENRKHREDH	411579	408310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_408300_411600
906328	contig_5586_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_143546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCCCATGATTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346481	344818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_344800_346500
906329	contig_1443_pilon	+	3230	16	Intergenic	novelGene_28364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1282	1680	978594	980076	TRUE	15	GTCTCAACCGGGCTTGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSSSRGDCAGMTSTSELSDEVLRFLFLPTTGVIVFSLLLPLVLEVPEVLLFFGFSSLSLSPLLFFLRFFSPSSSGRTLGNSSSFRTRGMFCSPRARALAMASATIRFAFSCFFWCSSLRFSSIPVLPPV	955558	1000680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_955648_956643_956817_957755_958000_958101_958225_959765_959904_962343_962427_969182_969302_969773_969830_970196_970265_970345_970530_978589_978705_979788_980174_980884_981257_982132_983020_983082_983186_1000589
906330	contig_2924_pilon	-	3716	11	Intergenic	novelGene_140290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_8	59.9470599779505	408	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	117	1280	470300	449565	FALSE	20	TCTTGGATTATAATTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAVSRVLSGAAQKPASRVLVASRNFANDATFEIKKCDLHRLEEGPPVTTVLTREDGLKYYRMMQTVRRMELKADQLYKQKIIRGFCHLCDGQEACCVGLEAGINPTDHLITAYRAHGFTFTRGLSVREILTELTGRRGGCAKGKGGSMHMYAKNFYGGNGIVGAQVPLGAGIALACKYNGKDEVCLTLYGDGAANQGQIFEAYNMAALWKLPCIFICENNRYGMGTSVERAAASTDYYKRGDFIPGLRVDGMDVLCVREATRFAAAYCRSGKGPILMELQTYRYHGHSMSDPGVSYRTREEIQEVRSKSDPIMLLKDRMVNSNLASVEELKEIDVEVRKEIEDAAQFATADPEPPLEELGHHIYCSEPPFEVRGANQWIKFKSVS	470416	447128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_449730_450389_450499_451744_451813_453869_453942_454122_454279_455079_455173_455758_455851_456507_456635_458092_458267_458792_458853_470252
906332	contig_12279_pilon	-	2982	2	Intergenic	novelGene_50126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAGCTTCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77612	71309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_71709_75029
906333	contig_8473_pilon	+	2824	3	Intergenic	novelGene_178815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2209	2796	47322	47909	FALSE	55	ACCCCAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVGVQNKTPDDSSVEENALELPEREFKSLILRILQELRQKSDKREEKLDKFMENTDKKLEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEIDRVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAI	482	47937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8473_pilon_+_969_1097_1328_45829
906334	contig_4857_pilon	-	1525	2	Intergenic	novelGene_48786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8183	junction_1	0	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATCTGGTAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239780	1234062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1234361_1238553
906335	contig_5954_pilon	-	1832	11	Intergenic	novelGene_28738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_3	241.502877829644	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	104	1492	1258441	1249935	FALSE	90	GAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFARRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1260652	1249594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1252993_1253021_1254060_1254319_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369_1258490_1260597
906336	contig_7022_pilon	+	3769	23	Intergenic	novelGene_142123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	153.843647150589	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1255	3765	4	3768	34270	174570	FALSE	5	TTCTTCCTCAGTGTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGHLFRAAGDQPFNLSTVSSAFPMVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQERERRRQHMMLMKAMEARKKAEEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYW	34266	174571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_148267_148334_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477
906337	contig_11427_pilon	-	2941	1	Intergenic	novelGene_79031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	161	607	839212	838766	NA	25	GAGGTCTTTTACAGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKIEVVKDFILFGSRVNIHGSSSQEMKWHIALGRSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSVTSYACKSWVMNKEDRRIDTFELWCWRRILNRSWQKNEQICLGRGITRVLLRSKDGDTMSHVLWTRYQEGSVPGEGHRAW	839372	836431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_836400_839400
906338	contig_6823_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_131214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATTTGGTTTTACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207923	210062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_207900_210100
906339	contig_18055_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_117797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	29	448	39456	39037	NA	70	AAAAAAACAAAAGTATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFVESGSVLALRRHRLGTPAPLSRPVYSAFSQGDSWGEGEVDEEERCDQVARDLRAEFSVRGSSEPRKDSLLPLDRDGSPVLPNKRNGIFLATAASRAPARRWPVQVLSVLCSLIFAALLAFLLAIVYLIVKGTEAGL	39484	35880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_35900_39500
906340	contig_3394_pilon	-	2933	12	Intergenic	novelGene_152699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	21	335	530348	529448	TRUE	40	AAAAGTGGCTCTATGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVAAGGMGSCSILGGIAHEGRNRQASGIFRGSRHWLGNIFSGANMEDPTKGWKVGTLCTYEKSFISSGLGLPNPSSTSILNSVSCVGTMLTIGLSIMPNAVTVSELIPSL	530368	503995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_504572_507351_507546_507933_508123_511664_511833_513965_514068_517866_518601_519402_519629_520627_520733_521049_521177_524129_524231_529371_529591_530176
906341	contig_17960_pilon	+	3972	4	Intergenic	novelGene_178816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2350	2724	27614	27988	TRUE	40	AAATCCATATATATTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWFFLRKVEIEIQYDPTIPLLGIYSREVRAITRIDICTPKFIAALFTIAKGWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEDITLTEISQSQKDKYCMRPL	3202	29290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17960_pilon_+_3914_4293_5343_27024_28021_28074
906342	contig_15273_pilon	+	3938	2	Intergenic	novelGene_140413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3414	3764	31172	31522	FALSE	50	TTGTTAAAAGAGAAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTKDTREVLVQRPKGRHEPQPSPPEPRRTRWCPATITNLSDRDHNRGSQTEQEKNVEKNSNSQKKKKTRLTGLTETGPQTSFNSELRLLPKFTLQLKIRQVYKTNSNTREERAS	9972	31696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_10137_27922
906343	contig_11364_pilon	+	3572	1	Intergenic	novelGene_65158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1123	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	685	984	74020	74319	NA	55	AGGCATCAATAACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEYSTARWCLATTSDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNTRKKDQIYWPEKDWRNPESMAPGHPFSSVMKSFLRFTIQPGIGQPRKTERD	73335	76907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_73300_76900
906344	contig_16846_pilon	-	4765	9	Intergenic	novelGene_82904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.579068175359	932	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGCTCACATCTGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481694	456065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_456438_459575_459707_464052_464156_464527_464622_465212_465309_475325_475475_476250_476385_476828_478282_479461
906345	contig_9633_pilon	+	2776	2	Intergenic	novelGene_139651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	312	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGGCTAAATAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178613	1292099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1180739_1291448
906346	contig_9683_pilon	+	3433	8	Intergenic	novelGene_151296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCCCGGCTCAGCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915545	932205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_918087_918874_918983_919214_919283_919674_919776_920594_920743_922805_922955_926324_926576_932138
906347	contig_2917_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_147606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTGAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249719	247515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_247500_249700
906348	contig_19707_pilon	-	3508	3	Intergenic	novelGene_178574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2056	3105	143312	142263	FALSE	65	CACAAAAAAAAGCACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMEDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	146450	141859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19707_pilon_-_144146_144758_145723_146192
906349	contig_16054_pilon	+	1622	5	Intergenic	novelGene_178817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATTTTATAGCACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21073	45828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16054_pilon_+_21688_39808_40056_44274_44583_45325_45555_45604
906350	contig_12157_pilon	-	3069	1	Intergenic	novelGene_135884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAGAATTAAATGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67368	64299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_64300_67400
906351	contig_14666_pilon	-	4819	1	Intergenic	novelGene_39474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1816	2118	20692	20390	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPLNFQMRQEGSREMKARLEIHSEQQVGLRPKSSGKRPKLFPWFHAAMRRNAGLTNRGGTSAQERTQHLDSAESLKSNPCVFFTISVTNINTTKNTVK	22507	17688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_17700_22500
906352	contig_7022_pilon	-	3559	5	Intergenic	novelGene_142149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1433	1753	186178	185858	TRUE	55	ACAACCAAAGAATTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVMTLISLGYIPRSGIAGSNCMTISSFLRKHHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQHLLFPVFLICASNAGVRCYLTVVLICMSLMASDREHFLMCLLAI	293491	178009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_178346_184387_187047_250410_250689_250813_251083_293474
906354	contig_5643_pilon	+	837	9	Intergenic	novelGene_38789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1982.54485683805	159	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	768	69	836	233973	238192	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGPCPNSIQHTENLPSSTQLPSVPPEEGVRGLESPTLSCTINKVYCTQ	233606	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237238_238052
906355	contig_10482_pilon	-	3196	1	Intergenic	novelGene_152818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACACTGAAAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97715	94519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_94500_97700
906356	contig_9177_pilon	-	1525	13	Intergenic	novelGene_32569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1205.87571913527	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	20	1306	25367	1932	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSPEY	25386	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1945_20423_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327
906357	contig_11328_pilon	-	1478	7	Intergenic	novelGene_88457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTGCAACCAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857455	830713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_830900_833262_833350_836361_836680_837924_838109_839248_839384_848756_849058_857188
906358	contig_15105_pilon	+	1792	6	Intergenic	novelGene_151012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	441	797	828792	829148	TRUE	25	GAAATGAGAGTTGGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVLLPHCNIRGNNFRPDLILPLKSVLAPSLPPISLPPSSSLSFPSFRPSTQLSPIVPLLPQPIKTILPLRIEARVVTLNLLQDNGYHMPHMLKNIGYVIKIEVFEDVRLRFFPSKL	828351	839950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_829397_831005_831087_831363_831513_832201_832309_836187_836497_839849
906359	contig_6583_pilon	+	2930	6	Intergenic	novelGene_174583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	564	1136	2926	26748	TRUE	60	AAAAACAAACAAGCACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTRVLVVLVMEEFKRSRQLPSKEPVSVLCCEAHSRSSGFTSSLSLAVEFPGFVAEVVLPAVTSDACLPTGVVSHGNLLGFSDVLCLQETSLSFSDVSSPSEVSTMFLQFVSYSFSFTSEMGSEITLQKEMALAAEGFRECPMWCGTFFTFFKASSACSCSIAATISLYAFLASSVSSTNLLNKLSAPK	2362	32516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_+_3263_10844_11065_26732_28077_29945_30108_31401_31530_32340
906360	contig_4857_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_48855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTTAATTGAGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337798	1339926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1337800_1339900
906361	contig_854_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_36285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCTCAAGGCGCGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563800	543568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562362_563302
906362	contig_9516_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_106159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATACATACGTGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798860	796638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_796600_798900
906363	contig_12122_pilon	-	3400	1	Intergenic	novelGene_174998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	65	301	142822	142586	NA	55	CTTAAAAAAAAAACCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNKENLKEEITKSIPFTTAPKMIKYRGINLTRDIKDLYKENYKILLQETKRDLRKWKNIPCSWIGKLNIVKMSILPKAIYRYHAIPIQIPLALFNEMEK	142886	139486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12122_pilon_-_139500_142900
906364	contig_5640_pilon	-	1878	3	Intergenic	novelGene_27263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	1	208	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATATTCTCCTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873051	860958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_862662_863728_863799_872946
906365	contig_16411_pilon	+	2935	5	Intergenic	novelGene_77345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	600.305963655201	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	123	698	238160	241550	FALSE	20	ATCAGCATCTTCGTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPTHSSVQLDSQWDGLEPNKSLPKPIPTTPKGGPVHALP	231809	243787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241342_241437
906366	contig_6898_pilon	+	1775	8	Intergenic	novelGene_35676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1082	junction_2	1232.78574532542	64	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	138	1109	59668	119789	FALSE	55	TCAGAAAAAAAAATTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERWVL	59530	120455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612
906367	contig_10424_pilon	+	2128	21	Intergenic	novelGene_56808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	616	933	310888	312522	TRUE	35	AGCAGCACAGGAGAGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNDSVMQSTISSAASALLRQKTIASPISFFLGVNPRKISSNLSLCSSLSAPFLLGSSTKASVSCSSDIPCRYGFNGGGLQKDPFLNIRKSSVLHLVGESPCRIE	303381	347222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_303428_304146_304243_305645_305802_307378_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312428_312505_312572_313426_313533_316593_316641_317571_317781_317959_318127_319579_319667_319761_319792_319876_319972_320538_320607_323693_323822_329370_329460_341003_341049_347147
906368	contig_6228_pilon	-	3032	3	Intergenic	novelGene_164488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	60	196	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	82	1626	174788	168240	FALSE	10	GTATTTGATTTTGTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLANHGLILLQQLNAQREFGFLCDCTVAIGDVYFKAHKSVLASFSNYFKMLFVHQTSECVRLKPTDIQPDIFSYLLHLMYTGKMAPQLIDPVRLEQGIKFLHAYPLIQEASLASQGAFSHPDQVFPLASSLYGIQIADHQLRQATKIAPAPEKLGREPRPPTSRVSHEQVPEASQLSQLPSNLTQVNRTNMTPSDPLQTSLSPELVSTPVPPPPPGEETNMEASSSDEQPTSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGVPFTSSQPGESRVPLSLCSNAADLGKDAMEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTGKPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNMLVQTNKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSILLGTGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD	188655	166833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_169612_174615_174801_188586
906369	contig_7056_pilon	+	2152	7	Intergenic	novelGene_43603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1377	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATCAGAAAGTATCACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721891	726582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723720_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725318_725471_725733_725812
906370	contig_12886_pilon	+	3903	2	Intergenic	novelGene_135537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	155	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1846	2337	881241	881732	FALSE	30	GCTTCTTAAAAAAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSASSSTGRPCGVLFWTPTGTILSCVCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFTDCRFACFILLFYLVMSEQVGCAFFVVCLSVGTILFTSFSNRQGQSLRYGTAGQVQLKGSFWNRLFVARTRADSADWQSVQGRFQ	879329	883298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_880955_881020
906371	contig_11335_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_104913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACGAGGGGAGGGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330393	328818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_328800_330400
906372	contig_12125_pilon	+	534	2	Intergenic	novelGene_76261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	65	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686305	698780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_686598_698538
906373	contig_14598_pilon	+	6192	3	Intergenic	novelGene_178818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1114	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3464	3763	7316	7615	FALSE	60	AAAAAAAGAATGACCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKHYPKPQCSVKTATVPPPSVARVRAPSVQKKKKKKRHMRTTSWSQQSTCKVQILRAPRKLKLCMQKLLVDWAWVNRVRGDVRSFGSLWYTEHSSPTP	3306	10044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14598_pilon_+_3434_3590_4686_5074
906374	contig_10437_pilon	-	4074	2	Intergenic	novelGene_38110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_1	0	1027	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	138	692	80783	80229	FALSE	75	ATATTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRGGARPKGPHLGASPFCQLSREHPRQDWPQRRAGDGLATTEGNMEPFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTQSRPQAQRVIKDLVKVAVKVAVLHRSGCFGPGELDLAARFRQKLRQGAMTALSFSEVDFTFEAAVLANLLTECRDMLLELVENHLTPKSHGRIRHVFDHFADRSLLTALYGPDFSQHLGKICDGLRKLLDEGKL	82883	76846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_80788_82750
906375	contig_13800_pilon	+	2179	16	Intergenic	novelGene_153697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	318.80837853203	151	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	267	1856	98375	162575	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94179	162898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94286_95566_95668_95759_95802_98357_98435_109046_109072_114289_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
906376	contig_14219_pilon	-	2216	6	Intergenic	novelGene_54302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_5	130.496896514821	113	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	184	807	676735	638764	FALSE	50	ATAAGCTTTTAAAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGMGENTSDPSRAETRKRKECPDQLGPSPKRSTEKRNREQENKYIEELAELIFANFNDIDNFNFKPDKCAILKETVKQIRQIKEQEKAAAANIDEVQKSDVSSTGQSVIDKDALGPMMLEALDGFFFVVNLEGNVVFVSENVTQYLRYNQEELMNKSVYSILHVGDHNEFVKNLLPKPIGKCLSSGSASPCPLPHPYVHIVLVGGG	883287	637354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_639025_643496_643601_673944_674118_676649_676755_767883_767941_883180
906377	contig_3975_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_54913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2225223	2227129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2225200_2227100
906378	contig_11117_pilon	+	1041	1	Intergenic	novelGene_148588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	466	843	79100	79477	NA	65	AAGGAAAGAAAAGAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITIDPTEIKRIITEFYEKLYSNKFENLEEMDKFLETDYLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTPNHKKPWPRWLHWRILQNIYRRACTSTTQAISEHRSGSNTSRFVLCSQHNADTKTR	78634	79675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_78600_79700
906379	contig_17976_pilon	-	2787	4	Intergenic	novelGene_32464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3617	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2225	2578	47536	41782	FALSE	30	CCCCAAAGCAAGGCTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRARGAADSLHIAANTFSSMGSTFNRMASKYCNQFGSGCSTSWIVFCISTDSFGISRSSESCCISVGDRAESSSDLEGSLPIVSECSSEFSFWGDSMVAQRFRSQCLVRRDRCEEK	49760	41572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_46519_47393
906380	contig_5302_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_81406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	4	378	176322	175948	NA	65	AGCCTTTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	176325	174461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_174500_176300
906381	contig_16125_pilon	-	1457	2	Intergenic	novelGene_155212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	319	624	49639	49334	FALSE	70	AAAAGAAAAAAAAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGMSLSAQSKRVTSKLCGTAQLEGAPMLRKEKTNQNRTNQSKQTNKKAPGVLPAWRDGPGSSFTVKQCFAAFQEQGKMVHGARYLRERRGGVVSGKEEI	66405	48500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_49937_66384
906382	contig_5423_pilon	+	5438	25	Intergenic	novelGene_85242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.16418656973	54	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2859	3506	542216	553344	TRUE	35	TAGTACAGTCTACAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKELQAHVDQITEMAAVMRKAIEIDEQQGCKEQERIFQLEQENKGLREILQITRESFLNLRKDDVSESTSLSALVTNSDLSLRKS	497067	555453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_497401_498240_498369_499851_499995_501581_501628_501682_501813_502180_502334_502608_502781_504058_504237_506639_506732_506931_507020_515747_515834_517365_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520742_530048_530126_532558_532794_534813_535231_541109_541167_542201_542351_544406_544525_545686_545830_551350_551465_553206_554555_554731
906383	contig_16594_pilon	-	1534	4	Intergenic	novelGene_53870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_3	1787.12531426559	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	896	1456	272836	149135	FALSE	50	AAAATTCAAAGCAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVGNN	289428	149056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_149351_165477_165649_272662_273670_289366
906384	contig_6137_pilon	-	2363	2	Intergenic	novelGene_59240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCCAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1317978	1315569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1317557_1317602
906385	contig_13295_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_31256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTATTGAGTATTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174538	172121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_172100_174500
906386	contig_16041_pilon	+	3977	1	Intergenic	novelGene_178360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTATGTTAATGAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1189	5166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_+_1200_5200
906387	contig_12079_pilon	-	3198	1	Intergenic	novelGene_67500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCTTAGTCCTCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853596	850398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_850400_853600
906388	contig_610_pilon	+	423	5	Intergenic	novelGene_76857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATGGCTGGATCAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381381	389790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_381413_384549_384627_387145_387216_387815_387929_389658
906389	contig_6375_pilon	+	3145	7	Intergenic	novelGene_73028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1873	2181	468620	468928	FALSE	95	AACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPDLYQQFGVDLQTTEIFLLNDLGSELCIEKKRGKKRETHPTERGEEVRWGSHNMGSKDTERETQRQTETKTEAANGKNEAESMQVRGKKKLKSQQGKVI	464954	469892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_465168_465387_465497_465629_465737_466167_466312_466668_466801_467355_467518_467614
906390	contig_10775_pilon	-	5482	3	Intergenic	novelGene_157934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	114	junction_2	6.5	113	110	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	117	818	26002	7114	FALSE	45	TCAAAACATTCCTAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAGPGAEQGAESGGARAGAGAVGLKTLALDDSWCHSEMSSLSGKVQTVLGLVEPSKLGRTLTHEHLAMNFDCCYCPPPPCHEATSKETIMMKNLFWIQQNPYSHKENLQLNQETEAIKEELLYFKANGGGALVENTTSGISRDMQTLKWLAEETSVHIISGAGFYVDATHSSETRAMSIEQLTDVLINEILYGADGTNIKCGVIGEIGCSWPLTASERKVLQATAQAQAQLGCPVIIHPGRNRSAPFQIIQVLQEAGADISKTVMSHLDR	79527	2449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_7384_25570_26042_79450
906391	contig_4426_pilon	+	4621	1	Intergenic	novelGene_15453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1893	2213	892901	893221	NA	35	TGGATCTGAATCTACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSHKALCKEWHTLDEHNQINHIYCVCIPAVCTQAVPGLQTSDLQTTHTCPFVLCKFALTLKQSPATNSSSQSPSLAAHTASKSLKRLRAFFLFIFFFFILLCFK	891008	895629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_891000_895600
906393	contig_13295_pilon	-	2658	2	Intergenic	novelGene_31254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTTTTCCCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134789	131206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_131250_132174
906394	contig_3571_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_88714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	848	1201	83516	83163	NA	55	GAATGACTAAATAAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTGHKRSLNRIQSIEILQSIFSNHKAIKVEIGNRKSKGKKSSTWKLNNILLKNYWVIKEIKDGIKKSTESNWNEDTSYLSLWDTAKAMLSGQFIIINAHIQTEERAKIKTLTLQL	84363	82837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_82800_84400
906395	contig_1399_pilon	-	3235	8	Intergenic	novelGene_166660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	23	junction_5	21.8856023868829	177	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	3	2027	96384	74308	FALSE	35	ATGACATGGCCTCAAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEPPNGEAAEIKIIREAYQKAFLFVNKGLNTDELGQKEEAKTYYRQGIGHLLRGISLASTEPEHTGPEWESARQMQQKMKETLQNVRTRLEILEKGLATSLQNDLQEVPKLYPEFPPKEMPEKPPSFGSLLWHAEVNGDTPATSGASASAPGPLPSAPQGRPTEAPPAYTPQAAEGHYTVSYGTDSGEYSSVGENFYRNHSQPPPLETLGLDADELILIPNGVQIFFVNPAGEVSAPSYPGYLRIVRFLDNSLDTVLNRPPGFLQVCDWLYPLVPDRSPVLKCTVGAYMFPDTMLQASGCFVGVVLSSELPEDDRELFEDLLRQMSDLRLQANWSRAEGETEFQIPGRIRHSSDQMGKASGPDKRLLGSPSDPGTKDVRYKGKRGKKVKDTSSEEMNLSHIVPYEPVSEEKAKELPEWSEKVAQNILSGASWVSWGLVKGAEFTGKAIQKGASKLRERIQPEEKPVEVSPAVTKGLHIAKQATGGAAKVSQFLVDGVCTVANCVGKELAPHVKKHGSKLVPESLKKDRDGRSTLDGAMVIAASSVQGFSTVWQGLECAAKCIVNNVSAETVQTVRYKYGHKAGEATHYAVDSAVNVGVTAYNIDHIGLKAMVKKTAKQTGHTILEDYKIVDNSQGKDREGGASVKVTGQKEEQLEVEEQKEELEKKAKKKEK	96386	73099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055_82215_83948_84144_87124_87249_88846_89015_92501_92700_95583
906396	contig_4131_pilon	-	2266	5	Intergenic	novelGene_127842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCCCAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97875	86548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_87692_91472_91569_93095_93335_94417_94538_97207
906397	contig_3627_pilon	+	1958	14	Intergenic	novelGene_78561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	122.152199175101	2	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	29	994	1299272	1304178	TRUE	30	TTTGAGATTGGAGCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDV	1299243	1308379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303660_1304170_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
906398	contig_5602_pilon	+	1555	2	Intergenic	novelGene_132993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	403	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTAGAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52511	54123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_53988_54044
906399	contig_15047_pilon	+	1496	7	Intergenic	novelGene_52184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2827.28625285017	5	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	20	385	2194	3255	TRUE	35	GACCGGAGAACCTTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGELPLPAVFLHRRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLLQPERRRVSHFPEDVWL	2174	21644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
906400	contig_9903_pilon	-	2492	1	Intergenic	novelGene_172022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173818	171326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_171300_173800
906401	contig_6239_pilon	+	4706	3	Intergenic	novelGene_178345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	312	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2066	2590	145782	146306	TRUE	25	GGGTGGGGGGCAAATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKYLQKQERMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILTILQDLRHKADKHEEKKDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQQEIIQRQQIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRPEKNEDTLRIMWDTIKSKNL	0	151110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_1360_145075_147522_150209
906402	contig_7753_pilon	+	2479	9	Intergenic	novelGene_41503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATATCTAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224045	1234912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1224401_1225505_1225710_1226867_1226903_1229534_1230230_1231007_1231117_1232452_1232669_1233234_1233336_1233553_1233626_1234220
906404	contig_709_pilon	-	2911	6	Intergenic	novelGene_57538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	17	586	1542216	1510572	TRUE	10	CTCTGGGTTCAGCTGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLIVLMKNLYVDQEAVVQTEQEDTAWFKVRKGVHQGCILLPHLFILYADQIILEAGLYEEECSIRIGGRLLNNLCDTGDTTLLAESEEDLKPLPMKIKDYGLQYGLHLNIKKTKILTTGPVSNIIINGEKIEVVKDFILLGSTINAYGSSSQEIKRCIALGKRAAKDLLKVLTSKDVTLRTKVCLTCMRKLDNE	1542232	1498430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1498611_1506108_1506202_1506402_1506486_1508379_1508477_1508699_1510724_1541798
906405	contig_3111_pilon	-	2652	3	Intergenic	novelGene_129946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	405	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1032	1364	14132	13800	TRUE	15	GGGGATTGCATTGTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRWLCHLGSVDGWEVSIVLLPCFHPGAHRFDGSGRQSEHTGPDPARGSRCSSGMAIILLSRFLWLFLCCLGFFFLETLTASWLRAMAANQKVGSWNPPGAPMGQFYSVL	15163	4830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_5666_6746_6826_13425
906406	contig_3270_pilon	+	1283	10	Intergenic	novelGene_104481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_9	79.9519917678998	123	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	243	1214	300302	338530	FALSE	25	CTGTCGAGTTTCAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEEEEEVEWVVESIAGFLRGPDWSIPILDFVEQKCEVFDDEEESKLTYTEIHQEYKELVEKLLESYLKEIGINEDQFQEACMSPLAKSRTSQAILQPVLAAEDFSIFKEMMVQKNIEMQLQAIRIIQERNGVLPECLTDGSDVVSDLEQEEMKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	300059	338599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_300417_307276_307342_308024_308127_320732_320848_324439_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337728_338428
906407	contig_15104_pilon	+	7102	5	Intergenic	novelGene_163347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	972	1700	329060	329788	TRUE	75	AAAAGAAATGGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMEDVIGGLRGRFEMVEDTISGIEDKHLDTTLFHENTEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIHEAQQTPYRSDLKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARWQWDDIYKILKDKNCQPRIIYPANLMVKLGHFQTNRN	328088	636446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_330591_482903_483218_483308_484924_633699_635341_635416
906408	contig_10674_pilon	+	4749	10	Intergenic	novelGene_6413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	42.7580040878927	555	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	45	950	5738	41305	FALSE	25	AATCTGCATTTCTCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQVAERVEALGQFVMKTRRTLKGHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAIACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALWDVESGQLLQSFHGHVADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHESDINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFAGYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHILRVWA	5693	45104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_5831_19915_19958_22823_22901_26995_27129_28782_28927_29834_29927_33911_33961_35891_35989_39644_39812_41293
906409	SIRV5	+	2819	4	ISM	SIRV5A	SIRV510	2474	18	7249	-1717	-38	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	82	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCGGATTCAAGGTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133
906410	contig_13823_pilon	-	2200	2	Intergenic	novelGene_145263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAGAGAACAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247339	244728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_245621_246031
906411	contig_10734_pilon	+	2102	3	Intergenic	novelGene_51369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	891	1340	1799944	1800476	FALSE	30	TTTTAGTGGAAGACAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDSRPLCPGTTHSAGPGPRICPQDSRVPSPWLPPAMLGPSLHAQLMLDIKTMAGTQADVDLAGNSGAVTGPGPRAYQENAGHSPGYGAGTTLPLLLAQTADSALAFSLDTIISELGTRAQGGEETILQKAESILLEPQSDPCCRTPYT	1798428	1801238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1798522_1799146_1800135_1800217
906412	contig_12644_pilon	-	2097	14	Intergenic	novelGene_44486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	484.478808593659	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	16	1872	1151228	1026128	FALSE	60	CTTGTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1151243	1025902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026323_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
906413	contig_3747_pilon	+	2881	8	Intergenic	novelGene_24818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4081.07126792434	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	565	1479	202144	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201537_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
906414	contig_9375_pilon	-	4493	4	Intergenic	novelGene_136033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	59.3314606446042	394	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	148	786	132526	97001	TRUE	15	GTTATGTGTGTACATTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY	132673	92623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_94777_95446_97480_99183_99250_132432
906415	contig_14682_pilon	-	2577	5	Intergenic	novelGene_139110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	96.3080993478742	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	402	1580	141614	94370	FALSE	30	GTAATCATTTTTCACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPSLTCPHIGGMHHPYRIIGLLWRSYLTCLAFRALSISKKEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	142015	93372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96558_119740_119809_122397_122532_141487
906416	contig_19990_pilon	-	3351	5	Intergenic	novelGene_30755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGTGAGGTTCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154084	44840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_46839_51429_52130_126610_126922_145810_146002_153933
906417	contig_854_pilon	+	1320	6	Intergenic	novelGene_36253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	2946.89500321949	42	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	102	584	543600	563064	FALSE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIGCTPALPARWF	543498	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_563029
906418	contig_5253_pilon	+	2855	2	Intergenic	novelGene_61570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	122	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGAACGTTCACTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218573	398956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_220554_398081
906419	contig_11285_pilon	+	2014	8	Intergenic	novelGene_5717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	313	456	807786	807929	TRUE	15	TCCTCTCAGGACGACGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRSFLLGRLLPVSSVSDPWLPPGSCLFRLLQADPEAGASTLPPEECTTFSPSSLLLFGSSGSRSWRRSFEGPPISFGFSVPLALASLFLESLKSKYKGLQLYEMEGSALVKVNSSDGHWRAVLSSLLKTEKKGPVGCLGPSWLSFPAGVA	807473	910560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_808851_811244_811376_824751_824898_845504_845590_846255_846326_868990_869062_877364_877438_910499
906420	contig_7035_pilon	-	3449	14	Intergenic	novelGene_83556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	86.3335351409916	185	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	514	1494	951280	946793	TRUE	5	CTCCTGTGCACTGTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNKKLKYYTGNYDQYVKTRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMKNYIARFGHGSAKLARQAQSKEKTLQKMMASGLTERVVSDKTLSFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVALVGPNGAGKSTLLKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYPEIKEKEEMRKIIGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHLLFLDEPTNHLDIETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSKLVDEEPQLTKRTHNV	959431	941384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_941654_945106_946931_947076_947281_947994_948124_948581_948645_949522_949634_950033_950124_950435_950556_950732_950829_951250_951354_952255_952306_954345_954470_958559_958762_959367
906421	contig_4402_pilon	+	2873	7	Intergenic	novelGene_140808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAGCACCTAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356574	369672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_358615_359161_359304_360068_360142_362622_362843_364393_364501_368721_368864_369523
906422	contig_16951_pilon	-	3820	4	Intergenic	novelGene_98636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTTGCCATTAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109943	83224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_83358_91172_91462_103951_104096_106689
906423	contig_13004_pilon	-	2120	18	Intergenic	novelGene_112606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	117.557877963496	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	49	2010	194170	155490	FALSE	10	GCTTTCCTTCCCAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERKRKAEIARLRREKIMAQMSEMQRHFIDENRELFQQTLDLDASPSAVFDNSPVASDMTLTALGPAQTRVPEQRQFITCILCQEEQEVKVESKAMVLAAFIQRSTVLSKNRSKFIQDPEKYDPLFMHPDLSCGTHTGSCGHIMHAHCWQRYFDSVQAKEQRRQQRLRLHTSYDVENGEFLCPLCECLSNTVIPLLLPPRNIFNSRLNFSEQPNLTQWIRTISQQIKALQFLRKEGSTPDTASSKNSENMDKLQLHEGFRPDFHPKNPYSESIKEMLTTFGTATYKVGLKVHPNEEDPRVPIMCWGSCAYTIQSIERILSDEDKPLFGPLPCRLDDCLRSLTRFAAAHWTVASLSVVQGHFCKLFASLVPNENHGDLPCILDIDMFHLLVSLVLAFPALQCQDFSGISLGTGDLHIFHLVTMAHIVQILLTSCTEENGMDQENPTGDEELAVLDLYKTLRQYTGSALKEIPSAWHLWRSVRAGIMPFLKCSALFFHYLNGVPSPSEVQVIGTSHFEHLCSYLSLPKNLICLFQENSEIMNSLIESWCHNNEVKRYLEGERDAVSYPRESNKLIDLPEDYSSLINQASNFSVRECQVLFLAGKTKGCFYAPPYLDDYGETDQGLRRGNPLHLCAERLKKIQKLWQQHSVTEEIGHAQEANQTLVGIDWQHL	194218	155379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_155632_156913_157016_160412_160491_163609_163667_164374_164484_166783_166915_168886_168978_169605_169742_170998_171067_171517_171615_177777_177834_178102_178252_180919_180999_181673_181778_184510_184673_185547_185642_193357_193558_194063
906424	contig_14450_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_48921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	339	1020	207	1226	17441	18460	NA	30	AATCCACCCAGTACCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTCIEGQHDLDHYLFPIVYIFVVIISIPTNIGSLCVSFLQAKKDNELGIYLFSLSLSDLLYSLTLPLWINYTWNNDNWTFSAALCKVTAFLMYMNFYSSTAFLTCITLDRYLAVVYPLKFSYLRTRRFAFMVSLSIWVLETIFNAVMLWEDEIAVEYCDAEKSNFTLCYDKYPLEKWQIRLNLFRTCTGYAIPLVIIMFCNQKVCRAVRHNRATEDGEKKRIIKLLASITLTFVLCFTPFHVMLLVRSVLEHDASFNGLFDGQSWKQTYKIYRITVALTSFNCIADPILYCFVTETGRSDIWNVLKFWTGKLNKSARQRKSVLSMSTKDTVDLEVLE	17234	19586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_17200_19600
906425	contig_10609_pilon	-	4126	1	Intergenic	novelGene_123976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGCATAGCACCTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647605	643479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_643500_647600
906426	contig_7106_pilon	+	2609	2	Intergenic	novelGene_148313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTTCATCTCACATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488919	491581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_490427_490479
906427	contig_15982_pilon	+	5403	23	Intergenic	novelGene_145968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_9	43.0671203994896	175	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1028	3087	192	3278	7582	59974	FALSE	25	GTCACTAATCAGTGTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQTPRRRSRGHARSAPRPNPALRPGVPRSAASPEPRDAHLWLFPSPADLRSAFFRRSKKMRQICCTRERLAVLTCGEAGVEIHELRAGSHGARKPKYIKLEGKMKIHSMDQGAEHMLILSSDGKPFEYNYSIQHARFQCVLQATIIIQIACGDYHSLALSKGGELFAWGQNLHGQLGVGRIVDSTPTPQIVAHLSGVPLAQISAGEAHSMALSMSGNIYSWGKNDFGQLGLGHTNNKDCPSLIEELDNQDVEFLTCGGSHTALLTKDGLVFTFGAGKYGQLGHNSAQNEPRPRLVTELIGNRVTQIACGRYHTLAYVSDLGKVFSFGSGKEGQLGNGGTHNQLIPLPMKLPSKEELKFENHTSEKKLIMIAGGNQSILLWMEKENSYVNLRRKIPTLNEGTIKRWLADVGTKQWQSTKREIREIFSSPACLTGSFLKKRIAAETMSIPLDLNKARNTFQELTQKHWIANMITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEVFLLLPECPVMQDSNNWESLVVPFAEIVCKISDQSSGVLEKYWASLEESTFSKLVQMLKTAIISQMNHRTGSAENHYHMKPLLEMLKKLHRVNQATCQLPENTFIINELSNWIDFSAEVYRRFFWKMNLETSVDITCSVIISHFPFVFNSLSKIKLFRADSEFKMKVKEQRAFMRLPETVALGGSSQPTFNLTVRRNHLVEDVFNQLNQSENKDFEKQLWVSFSGEVNYGFGGVRSEFFHCIFEEMTRPEYGMFMYPGEAPYMWFPVRPKFEEKRYFFFGILCGLSLYNFNVADIPFPLALFKKLLDQTPSLEDLKELSPVLGKCLQILLDDEGDDFEEVFSICFNVHWDKNDAELIPNGSYIMVDQTNKREYVSKYVDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCDKEIIEIFHPKELKDVIIGNTDYDWETFEKNACYEDDYSDSHPTIVMFWKALHKLTLEEKKNFLLFLTGTDRLQMKGLKNMKITFCCPENLNEKDPIRAQTCFSILYLPKYSTMERVEEALHVAITSNRGFG	7390	62099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_7871_10496_10618_11536_11614_13833_14056_15115_15208_15453_15585_18149_18296_20696_20774_21741_21846_22662_22723_24352_24447_28085_28276_30021_30177_41427_41542_42693_42805_43695_43858_46725_46870_47676_47844_50281_50349_53196_53268_58142_58327_58407_58511_59768
906428	SIRV6	+	1400	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	392	18	176	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	148	639	1733	10736	TRUE	30	TTTTTAAGATAGTTACGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1479	11807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
906429	contig_12638_pilon	+	5824	1	Intergenic	novelGene_33185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	2298	2693	250319	250714	NA	20	GCTACCAGGGCCCCCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALQTPFYWILSLCIGVGQVCENFLKIHSLILRTFEKMSKNVKLLLVKSWKEFLAVIIFKNYFPSLKNCHTFCFLGSSTVVQTLETKHNKMAHCQYSHNIASKYCLGILQQRILFIKMKSLILFNKLVTK	248021	253845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_248000_253800
906430	contig_2312_pilon	+	4982	3	Intergenic	novelGene_160728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1071	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	19	342	4077	4400	TRUE	50	TTAAAAAAAACCAGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLNIVKMSILHKAIYRYNAIPIQIPAAFFNEMEKQITNFIRKGKRPRINKALLKKKNKVRGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRVENPDISSSTYEQLIIDKGP	4058	103128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_6406_19729_20813_101576
906431	contig_18538_pilon	+	1488	12	Intergenic	novelGene_163887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.081559601743	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1323	166	1488	17589	53992	FALSE	20	TATGTAAGTTGATGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYALDENYFRGYEWWLMKEAKKRNPNITLVGLPWSFPGWLGKGFNWPYVNIQLTAYYVVAWIVGAKHYHNLDIDYIGIWNERTFDISYIKMLRKMLNHQGLEQVKIIASDNLWEPISASMLLDSQLLKVIDVIGAHYPGTYSVRDAKLTEKKLWSSEDFSTLNNDVGAGCWGRILNQNYINGHMTATIAWNLVASYYEQLPYGGCGLMTAQEPWSGHYEVEPPIWISAHTTQFTQPGWYYLKTVGHLEKGGSYVALTDGLGNLTIIIETMSHKYSMCIRPFLPYFNVSRQVATFTLKGSFSQIPELQVWYTKLGKPSKKFLFKQLDPIWILDLNGHFTLELEEDELFTLTTLTTGQKGSYPLPPESQPFPPVYKDDFNIYDPPFSEAPNFADQTGVFEYFVNRDDPGEHHFTLRQVLNQRPITWAADASNTISIIGDYEW	9300	53992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_+_9446_17568_17683_20198_20339_22202_22242_22738_22870_36096_36253_39289_39415_41766_41895_48482_48573_49392_49480_51530_51682_53810
906432	contig_10793_pilon	-	1369	12	Intergenic	novelGene_83423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGAGAAATGTCAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167284	146951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_146992_151413_151496_152862_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161399_161472_162548_162689_163140_163316_163973_164068_166314_166481_167141
906433	contig_9471_pilon	-	2730	9	Intergenic	novelGene_21700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_3	174.474881788182	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	134	877	103082	75012	TRUE	20	ACTGACTTTTTTTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQGQGLDTSLEENCSMDFRRKLLKINEYLGAKDVEALKFLCRDLLSHKKLEKSGSALEIFEQLLAEEHLSEEDPFFLAELLYIIRQKSLLRHLQYFKEQVQNLLPVRRRVSLFRNLLYELSEDIDSERLRSMIFLLPNVFPKTEMTSLSFLAHLEKQDLIGEDNLTTLEDLCKIVAPNLLKKIEKYKTEKISQVVTPPVEKETEALHQEEEKLLSLLGNMQVHGTSQKEPWQNEHERRSNGGSCV	105602	69945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_71199_73862_74371_74919_75029_79129_79170_81089_81200_87353_87490_100470_100565_102735_103090_105476
906434	contig_2403_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_71007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	228.136411434524	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	16	795	135879	161174	TRUE	25	TGGGCGAGAGGATGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDPAAMLGPETNFLSAHSARDEAARLEERRGVIEFHVVGNSLNQKPNKKILMWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYITRLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPSQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHDILNFLTYADEYAIGYFKKQGFSKEIKIPKTKYVGYIKDYEGATLMGCELNPRIPYTEFSVIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKDGVRQIPIESIPGISMYRPSFKSKYCGNAMSCV	135863	163580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_135894_138651_138861_139830_139958_148218_148330_151046_151191_161000_161739_162825
906435	contig_3111_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_129978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101238	103094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_101200_103100
906436	contig_10904_pilon	-	3191	1	Intergenic	novelGene_22687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	256	510	576957	576703	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGKSLKAFPLRTRTRQGCPLSPFLFNIVLEVLARAIRQEKEIKDIQIRKEEVKVSLFSDDMIIYTENPKEYTRKLLELIEGFSKVSGYKINIQKSVGFHCTNKENFEKEITKSISFTIASKKRKYLGVIRVVKDLYKENCKMLL	577212	574021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_574000_577200
906437	contig_2867_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_135231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTACACAATGGTTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210624	1212021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1210600_1212000
906438	contig_18843_pilon	+	2057	2	Intergenic	novelGene_165623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	0	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	109	321	42483	42695	TRUE	65	CTTAAAAAAAAAAACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDNRCSSIVLFPVCRIRRGRELSLLFFLCPFQSKLMGFLLWWLARSVSHRLNLFNKRLCSHILGENSRTRVLSLYKRIFHIFEVLFSFCNSSFLSPFLCSCIAML	42374	46109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_44351_46028
906439	contig_13901_pilon	+	3455	1	Intergenic	novelGene_146649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212587	216042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_212600_216000
906441	contig_6445_pilon	-	762	2	Intergenic	novelGene_76943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2033	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATACATTAGCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45003	42879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512
906442	contig_15517_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_176406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	214	522	12780	12472	NA	55	AAATAGACAAATTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIRISEIEGKALDTNLFEEKSDERIRKNEETLRIMWDSIKRNNLRVIGVTKWGITENTETIIEDLLAENFPVIVKDEKISSRMHVEPHIRYIPKESQKSIL	12993	10240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_-_10200_13000
906443	contig_10861_pilon	+	3809	7	Intergenic	novelGene_39295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	171.076980723104	203	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	2688	3464	1447236	1454668	FALSE	20	GCATGTTGTAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNFVLIISCLLRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISELVQAVSLGGNYLLNIGPTKDGVIVPIFQERLLAVGKWLSISGEAIYASEPWRVQSDKNTTSVWYTSKGPDVYAILLRWPEDGVLYLTSPKTTLTTKIVMLGLEGDLKWSPNPVQGLLISLPQLPLSALPVKFAWTLKLTGVK	1437764	1455013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1437953_1442887_1443023_1444871_1447380_1451750_1451952_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
906444	contig_4857_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_48892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATACAGGCATACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433340	1434552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1433300_1434600
906445	contig_8291_pilon	-	1882	3	Intergenic	novelGene_99957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCTTCCGCCCGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654037	540269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_540380_553913_555365_653716
906446	contig_11285_pilon	+	4175	23	Intergenic	novelGene_5490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_11	285.77549993594	346	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1214	3645	22	3666	92463	120031	FALSE	0	TGGCTTTCTGTGGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVAVALAGTVTGAEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKTSLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVFCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQDKQRDAEHRDRTKKKKRSRDRDRDRERDRDRDHKRRHRSRSRSHSRTRERNKGKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPAIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSIIEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR	92441	120540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_92611_98337_98424_99167_99241_99631_99718_100679_100790_101183_101526_101929_102075_102167_102372_103066_103155_105226_105325_105416_105565_107236_107419_108625_108821_109167_109354_109473_109685_110050_110233_112310_112452_115160_115317_116758_116897_117804_117934_118111_118309_118809_118990_119811
906447	contig_7943_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_173145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAGAGAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186145	183548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_183500_186100
906449	contig_1535_pilon	-	3085	4	Intergenic	novelGene_127242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	422.109253893139	36	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1	636	136154	129144	FALSE	35	GAAATACTTTGGCACCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPALQHTAQESRRGLACSELVLTEGRSVSAALRRPPSRTASPSPGCSPPARESSRLVGLSDLISWGEVRAGPGRVVTIITAEEPQSRSRRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136154	126694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_129336_129570_129670_129751_129831_135888
906450	contig_13004_pilon	+	5010	2	Intergenic	novelGene_112645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	449	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTACCTAGCAATTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414004	422646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_418754_422385
906451	scaffold_16735_pilon	-	4555	14	Intergenic	novelGene_160361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	69.5110565467719	1851	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	357	2099	398709	365642	FALSE	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILEINNRAASTLTSSTLKDFLTQPSLGLLVRTCPEPAGGAELLESPPHRLDGPPDPSENPLAFLTSNPGPSLCSEQGGSAETAPEETEGPDLESSDETDRSSKSTEQVATFCRSLHEMHSPDQSSSPQDSSGPQLAAMRQLTDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKARTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLKELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPSSLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGAHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSSPESRKEFLRAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARPAMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSAGSPEREPPQPPRGGDTDRWVEEQFDLAQYEEQDDIKETDILSDDDEFCESAKGASVDRELREQLQAASISQRDRGRKALDSHASRMTQLKKQAALSGINGGLASSGEEVIWVRREDFAPARKVNTEI	430560	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_366112_369584_369758_372785_372874_376138_376242_376749_376809_382011_382121_385895_386015_386104_386285_390415_390525_396416_396543_396836_396906_398571_398752_410583_410688_430350
906452	contig_7308_pilon	-	3724	12	Intergenic	novelGene_159603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	328.041974738116	280	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2376	1348	3723	524476	496563	FALSE	20	CCTCCCAGAGGCCACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGLDWSEESGEELEDSEQASPYQVAWSIRETLRYERHASDDDDTESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASREPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPATCSGTVKGEPCRNQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDSSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPTSVSLPVEASQIRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQAVTSLECLSTIGVLTQSDGVPVQELSDRGIGVFSTGTGASGIQSLSREVNTDLGELLNGHIVHDNFSSLELDENLLRSATLSNPPTPLAGQIQGQFSAPANVGLTSATLISQSALGERAFPGQFHGLHDGSH	563931	496561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_497021_499098_499257_500223_500442_502542_502677_503758_503869_506830_507056_511182_511292_518702_519449_524258_524506_524610_524704_544136_544843_563412
906453	contig_4832_pilon	+	5082	23	Intergenic	novelGene_163408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.6211690477528	253	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	3034	4638	497716	509953	FALSE	70	AGAGAGGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQTSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGMYVINLHKALASLATATLESVVQERFGSRCARIFRLVLQKKHLEQKQVEDFAMIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQEIPKTPDHAPSRTFYLYTVNILSAARMLLHRCYKSIANLIERRQFETKESKRLLEKSQRVEAIIASMQATGAEEEQLQEIEEMITAPERQQLETLKRNVNKLDASEIQVDETIFLLESYIESTMKRP	397488	510397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_399203_400158_400272_402840_402935_403868_403939_405142_405220_422458_422673_441984_442041_447617_447676_495654_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502388_502517_502611_503917_503999_504248_504301_504658_504720_505180_505332_506088_506191_506558_506609_507026_507177_509871
906454	contig_3386_pilon	-	2068	3	Intergenic	novelGene_34579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	516	1055	482995	480371	FALSE	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNITTDSTEIKRIITEYYEKLYSSKFENLEEMDKFLETHYVPKLQQSDVENLNRPKTRKEIEKVIKKLPAKKSPGPYAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFVAALLTIAKNWKQPRCPSTEEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSKISQSQKDKYCMRPLL	525121	479357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_480676_482760_483040_524650
906455	contig_1867_pilon	+	2661	2	Intergenic	novelGene_54536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	663	962	333551	333850	TRUE	35	CTATTGTAGTAATCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSALLGQVFQSLVAPPIKCLKAPHSTRKPPAHRHPAISLHGSAAAPSRAGLLVLLLLVLCRCPFCAAAGSLLLLILCRCHTSIHSEFQNHFHILGIC	332888	335603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_335013_335066
906456	contig_10734_pilon	-	7106	1	Intergenic	novelGene_51138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859590	852484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_852500_859600
906457	contig_19890_pilon	+	2874	7	Intergenic	novelGene_138539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2321	2698	33708	35390	TRUE	20	GCAGGCAGTGCGGCCGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSRSCPSSTRAWVPVAYTVAPSRTTTGVFVMQRITLGAGWNAISFFSTELMVTPAAQETTMCLALTSAPISSRMKGMMCGFTARNRTSLCRTVSLLLWVRCTPIFLSADTVGRYISGELAIIL	30424	35813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_+_32406_33001_33165_33320_33417_33627_33848_33958_34139_35332_35402_35648
906458	contig_8671_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_126245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCAAAGCAGATTACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417427	420064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_417400_420100
906459	contig_14790_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_127923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	53	331	286158	285880	NA	30	AGCTAAATCTCATACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYRTNSFSLNSQYTHCFMTLVNNPTTCLHCPFSTLEDLFCFFGENIHSQIYTISKIFTCTIQCHRLHSSSCAAILNNLFQIIPSPLSSAHSPLGFPSNLLSCYCQFDLT	286210	284861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_284900_286200
906460	contig_16635_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_153151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94656	92440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16635_pilon_-_92400_94700
906461	contig_6881_pilon	+	2082	2	Intergenic	novelGene_164838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCTCCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81577	91962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_+_83094_91396
906462	contig_3975_pilon	-	2007	13	Intergenic	novelGene_54846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	214.714927287322	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	97	1548	2066301	2056837	FALSE	20	AACGTTGTACATCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079237	2056377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064252_2064633_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
906463	contig_14640_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_168052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAGAAAAAAAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444218	446117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_444200_446100
906464	contig_11932_pilon	+	7130	1	Intergenic	novelGene_85392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	641	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	878	1195	113097	113414	NA	40	TAACTGAACAGAATCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFRRGHSRSCTGFPRIPLCWEWISTRAFDFRQGRLHSQDSAARIPGLRVGVFYKGGKALPPPLLLGPKTSTGPRVSVPSRPHLSSQTPEALPVISHMPSPLVIH	112219	119349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_112200_119300
906465	contig_3004_pilon	-	3018	1	Intergenic	novelGene_127468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTTTTACCCCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228565	225547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_225500_228600
906466	contig_12837_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_57267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACAACTAGCTTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31697	29154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_29200_31700
906467	contig_7679_pilon	-	2948	21	Intergenic	novelGene_173742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_13	53.5998833953956	185	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	269	2419	151083	87422	FALSE	45	TGTAGAAAGCAAACACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRPTAHSDHAERDQEIQCLKMGMETLLVANEDKDRRIEELMGLLNRYRRVNEIVMATQGPSERTLSINEEELDGSFRKWNAVNKGPEELFKPEMPPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRSEFVEKGVDRNQLSPVVQHKDSPFLAEHKCPTLPGKLSGAMPNGEAAKSTPTASQPDPTGSGLLRLRETESSWDDTAMANNLSSTSSGTESGPQSPLTPEGKQSPKGIKKFWGKIRRTQSGNFNTDAPGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDASAPFAQWNTERVCAWLEDFGLGQYVIFARQWVTTGHTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFYALIGPEAEQEKREKMALPAYTALTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPSDGAGDGHSVYSGYRCLGPLDAPELDGLDQVGQIS	155387	86892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7679_pilon_-_87617_88872_89062_89755_89882_91148_91272_91801_91891_92129_92242_92526_92678_101890_102020_102791_102934_104587_104727_109816_109859_110800_110859_112630_112699_115222_115327_116440_116517_118886_118949_121594_121704_126255_126349_137177_137310_151071_151186_155221
906468	contig_9730_pilon	-	2745	14	Intergenic	novelGene_150628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_5	57.6614276330927	192	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	193	2583	466312	426497	FALSE	25	TAACTGTGAGACTGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGAARYRLSCSLPGHELDVRGLASCLYPPGAFVSVSRDRTTRLWAPDSPNRGFTEMHCMSGHSNFVSCVCIIPSSDIYPHGLIATGGNDHNICIFSLDSPAPLYILKGHKNTVCSLSSGKFGTLLSGSWDTTAKVWLNDKCMMTLQGHTAAVWAVKILPEQGLMLTGSADKTIKLWKAGRCERNFMGHEDCVRGLAILSETEFLSCANDASIRRWQITGECLEVYYGHTNYIYSISVFPNCKDFVTTAEDRSLRIWKHGECAQTIRLPAQSIWCCCVLDNGDIVVGASDGIIRVFTESEDRTASAEEIKRFEKELSQATIDSKTGDLGDINAEQLPGREHLNESGTRDGQTRLIRDGEKVEAYQWSVSERRWMKIGDVVGSSGANQQTSGKVLYEGKEFDYVFSIDVNEGGPSYKLPYNTSDDPWLTAYNFLQKNDLNPMFLDQVAKFIIDNTKGQMLGLGNTNFSDPFTGGGRYVPGSSSGSSNAPPAADPFTGAGRYVPGSTSTGTPMAGADPFTGNSAYRSATSKIVNIYFPKKEAVTFDQANPTQILGKLKELNGTAPEEKKLTEDDLILLEKILSLICNNFSEKPTAQQLQILWKATNWPEDIVFPALDILRLSIKHPSVNENFCNEKEGAQFSSHLLNLLNPKGKPANQLLALRTFCNCFVGQAGQKLMMLQRESLMSHAIELKSGSNKNIHIALATLTLNYSVCFHKDHNIEGKAQCLSVISTVLEVVQDLEATFRLLVALGTLISDDSNAVQLAKSLGIDSQIRKYASVSEPAKVSECCRLILNLL	466504	426334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_427063_428147_428313_437038_437141_440154_440224_443645_443718_445542_445763_446431_446590_450083_450254_452010_452147_452600_452769_454509_454631_454717_454819_458228_458423_466163
906469	contig_14744_pilon	+	3194	25	Intergenic	novelGene_66143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_15	254.557701246473	263	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	4	1776	1626203	1674165	TRUE	35	TTTTAGGTATTAATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMATRGHVQDPNDRRLRPIYDYLDNGNNKMAIQQADKLLKKHKDLHCAKVLKAIGLQRTGKQEEAFTLAQEVAALEPTDDNSLQALTILYREMHRPELVTKLYEAAVKKVPNSEEYHSHLFMAYARVGEYKKMQQAGMALYKIVPKNPYYFWSVMSLIMQSISAQDENLSKMMFLPLAERMVEKMVKEDKIEAEAEVELYYMILERLGKYQEALDVIRGKLGEKLTSEIQSRENKCMAMYKKLSRWPECNALSRRLLLKNSDDWQFYLTYFDSVFRLIEEAWTPPAEGEHSLEGEVHYSTEEAVKFIEDRITEESKSSRHLRGPHLAKLELIRRLRRQGCNDEYKLGDPEELMFQYFKKFGDKPCCFTDLKVFVDLLPATQCTKFINQLLGVVPLSTPTEDKLALPADIKALQQHLCVVQLTRLLGLYHTMDKSQKFNVVRELMLRYQHGLEFGKSCLKTELQFSDYYCLLAVHVLIDIWRETGDETAVWQALTLLEEGLTHSPSNAQFKLLLVRIYCTLGAFEPVVDLYSSLDAKHIQHDTIGYLLTRYAESLGQYAAASQSCNFALRFFHSNQKDILQANSSPRCPVGV	1626199	1689309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626261_1636644_1636731_1637172_1637312_1639735_1639855_1643389_1643465_1644572_1644681_1645031_1645111_1647616_1647729_1648307_1648398_1649657_1649828_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1674120_1674250_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324_1685472_1689043
906470	contig_4125_pilon	-	1765	12	Intergenic	novelGene_25239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	24.8429779559337	149	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	207	1229	2820071	2798528	TRUE	10	TCATTGATGCTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGGHGGRPGGGRPGGSGWDRGGPAGLQARVRPGHSLGPPAALQRSRSRRRGLLRRDSGPWALGREAAMNFSEVFKLSSLLSKFSPDGKYLASCVQYRLVVRDVNTLQILQLYTCLDQIQHIEWSADSLFILCAMYKRGLVQVWSLEQPDWHCKIDEGSAGLVASCWSPDGRHILNTTEFHLRITVWSLCTKSISYIKYPKACQQGITFTRDGRYMALAERRDCKDYISIFVCSDWQLLRHFETDTQDLVGIEWAPNGCVLAVWDTCLEYKILLYSLDGRLLSTYCAYEWSLGIKSVAWSPSSQFLAVGSYDGKVRILNHVTWKMITEFEHPVTINNPKIIVYREAEKSPKLGLGGPSLPTPESSGQASLHHGDEIRDCLPASLSADPETRHRQGKPQDRRRHAGLQP	2820277	2797178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2797497_2797876_2798069_2798501_2798628_2799703_2799811_2801538_2801617_2801731_2801867_2802243_2802331_2803167_2803272_2806527_2806601_2811280_2811398_2811967_2812121_2820002
906471	SIRV3	+	458	3	NIC	SIRV3A	novel	2373	3	NA	NA	-946	-4759	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183461	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGATACCGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	998	1959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_+_1168_1532_1765_1902
906472	contig_10986_pilon	+	2509	6	Intergenic	novelGene_71497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	11	298	138024	138311	TRUE	10	CAGGCTCGCTCTGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQVMEIISEVGLGLVATAPGPGAPCGHPEIPGSDTSVQVPTILPAPQPSWRKASFFHLPAFFLTSWDPHGPNALLIAVPTKGRGSSVQVGIIITKFRK	138013	146347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_+_139813_142329_142529_143578_143691_144691_144826_145833_145984_146232
906473	contig_7009_pilon	+	4102	1	Intergenic	novelGene_23659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCCCAGCCCTAACTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504087	508189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_504100_508200
906474	contig_5817_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_169579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	491	814	46234	45911	NA	60	TTCTCAACAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLCIKRSPIAFKLPSKAQQLLCICPEQQKGESGIVNWPNNMFSTSVLPFILLRNGRGLKACNWSSKARQLVSILLKQQRKKENQEEEEDMECVAHCLHEQLAPSP	46724	45407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_45400_46700
906475	contig_5799_pilon	-	4124	2	Intergenic	novelGene_50337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTAGCACTGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712181	707509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_710803_711350
906476	contig_11493_pilon	-	3982	2	Intergenic	novelGene_143696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCCACAACCACCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210943	206690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_207021_207291
906477	contig_4732_pilon	-	8042	1	Intergenic	novelGene_75444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	5794	6150	645414	645058	NA	30	GCTAGAGAAATTCTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAPENQYLSVLQKDSIKGNVILSFPYWEARGTSRQYTNCSPSIALSKQRAEQSLNPECHQQGQESGRKEDKSKTGVWKEREDTHRVQMQGPPQTSWWQHSLGRVPCPGPEFGQLGCD	651207	643165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_643200_651200
906478	contig_1154_pilon	+	2711	16	Intergenic	novelGene_87055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCCACATGAATACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105868	200960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_106538_118504_118624_119812_119884_124947_125105_133770_133840_137274_137485_140501_140568_141386_141584_143944_144046_161834_162022_164787_164986_166867_167000_167129_167274_169518_169663_172217_172356_200851
906479	contig_15236_pilon	-	2824	2	Intergenic	novelGene_141625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	519	junction_1	0	35	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAATAATATTATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624885	617768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267
906480	contig_7457_pilon	-	3356	6	Intergenic	novelGene_31394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.4	253	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1386	1688	463835	463533	TRUE	75	CAAACTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLIAQADGQMELGVNSTKDKQAAPGPSVRPGGMKTLLDPPGLLIPMAKGMWKRPVPMSRSHFFKFHKHYFGGVGGRAGLLCRTKGQACLEKNPNQIMG	465778	458356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_458755_459596_459733_460794_460872_462064_462206_462616_464900_465457
906481	contig_11293_pilon	+	4339	34	Intergenic	novelGene_134673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_28	264.203541759797	281	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1006	3021	108	3128	85205	156336	TRUE	45	AGATAATAAATGTGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQVPENINFPAEEEKILQFWSEFNCFQECLKQSKHRPRFAFYDGPPFATGLPHYGHILAGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTLGIRGPEDVAKMGVAEYNSQCRAIVMRYSTEWRSVVTRLGRWIDFDNDYKTMYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMPFSTACSTPLSNFESHQNYKDVQDPSVFVTFPLEEDENVSLVVWTTTPWTLPSNLALCVNPDMQYVKIKDIVKGKLLILMEARLSALYKVENDYEILERFPGAYLKGRKYRPLFDYFLKYKENGAFTVLVDNYVREEEGTGVVHQAPYFGADDYRVCVDFNIIQKDSLPVCPVDASGCFTAEVTDFMGQYVKDADKNIIRTLKEQGRLLVASTVTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVEHMVDRLMSNNDLCYWVPEFVREKRFGNWLKDARDWAISRNRYWGTPIPLWVSDDFQEVVCIGSVAELEELSGAKISDLHRESLDHLTIPSRCGKGSLHRISEVFDCWFESGSMPYAQVHYPFENKKEFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPAFKNVIVNGLVLASDGQKMSKRKKNYPDPVSIIHKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFFIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTAKASTNITDCWVLSCMQSLIEFFKTEMSAYRLYSVVPRLVKFVDILTNWYVRMNRRRLKGENGTEDCIMALETLFSVLFSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKRLIDPVSVQDEDTVSIHYLMLPHVREELLDKKTESAVSRMQSVIELGRVIRDRKTIPIKYPLKEIVVIHQDLGALKDIKSLEKYITEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMVLGKRLKGAFKAVMTSIKQLSDEELELFQKNGTIVVEGHQLHKEDIRLMYTFDQATRGTAQFEAHSDAQALVLLDVTPDQSMVDEGLAREVINRIQKLRKKVQFGSN	65195	193467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_65296_85197_85324_85983_86141_86383_86504_88490_88574_89318_89437_101171_101320_103926_104015_104267_104329_111938_112035_114871_114995_115569_115662_120160_120260_121604_121732_123275_123350_124056_124252_126278_126366_128797_128882_130093_130239_139020_139142_142765_142858_144621_144700_145509_145632_146022_146126_146376_146461_148135_148311_150627_150741_155222_155320_156316_156494_160525_160632_173513_173640_185180_185325_185972_186126_192942
906482	contig_7963_pilon	-	3231	10	Intergenic	novelGene_58446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	709.785013530223	24	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	1164	2618	125592	118219	FALSE	30	AAGTTCTGAGTCATAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGLFIFLFFRHQ	127509	117605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118251_120641_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126556_127309
906483	contig_11081_pilon	+	2047	12	Intergenic	novelGene_167076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_7	37.9617031900692	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	105	782	28022	39147	TRUE	55	AAAAAATTTATGTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSESRFLYVTFNKSIAKQAELVFPSNVICKTFHSMAYGHVGRKYQSKKKLNLFKLTPFMVNSVLAEGKGGFIRAKLVCKTLENFFASADEELTIDHVPIWCKNSQGQRVMVEQSEKLNGVLEASRLWDNMRKLGECKEEAYQMTHDGYLKLWQLSKPLLASFDAIFVDEAQDCTPAIMNIVLSQPCGKIFVGDPHQQIYTFRGAVNALFTVPHTHVFYLTQSFRFGVEIAYVGATILDVCKRVRRKTLVGGNHQSKAFS	27917	55813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_28048_28770_28994_29968_30057_30140_30228_30935_31073_39030_39347_41149_41226_41852_42051_42593_42720_44461_44569_54697_54830_55386
906484	contig_17454_pilon	+	1182	3	Intergenic	novelGene_177272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	18.5	108	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTGATCAGGCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4442	21455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17454_pilon_+_4594_9642_9890_20671
906485	contig_15371_pilon	-	5969	1	Intergenic	novelGene_151440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	563	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGAATTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126742	120773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_120800_126700
906486	contig_3277_pilon	+	3916	7	Intergenic	novelGene_74721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_3	535.286968726952	212	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	176	1081	240775	262544	FALSE	75	GAAAAGAAAAAAAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAVSKPYYLFNVLCIFLFSVYLYIRICIYIYICIYTHSGLNILRCCF	188801	265379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361
906487	contig_2867_pilon	+	1552	2	Intergenic	novelGene_135232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTTCAGCTTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1211682	1261629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1213193_1261587
906488	contig_16231_pilon	-	1845	1	Intergenic	novelGene_176714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1246	1575	89535	89206	NA	35	GTATGAATGGAAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQIITAPQDFLGCNLCGIRWPGLLSGKPLGGFEPPTFRLEAKHKLFVQIKQDIHIYEYQYEYMYTCLFIYCYIYFYKTSLSELHVNEYPDICSYMYIFLDSILGFTGN	90780	88935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_88900_90800
906489	contig_19402_pilon	+	1982	6	Intergenic	novelGene_80863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	555	899	167276	167620	TRUE	15	AACGGGCGGGCGGCGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAFSLSPWPSLWPDSDLACSRSFDTERDRDLDWERSVSSFFFLLLPDLLSRLPPRFLLRSLLLGLRLRLRLSSRLLFLPFLLSLLLLRLLLRLLLPPLLLLLLRLLLSRRLCS	166721	193291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_167937_168202_168293_170795_171012_174051_174164_175050_175194_193085
906490	contig_12951_pilon	+	4362	1	Intergenic	novelGene_68229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1383	1727	796605	796949	NA	45	AAGGGCCGTAATCAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795222	799584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_799600
906491	contig_4604_pilon	+	2599	13	Intergenic	novelGene_19154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1345.13428439526	1	98	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	406	717	365452	372064	TRUE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKGG	364339	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367448_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379456_379808
906492	contig_8161_pilon	-	2607	7	Intergenic	novelGene_156742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.0765376089501	266	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	88	1107	254273	230026	TRUE	45	CAAGGAAGTATCACCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254360	226173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227391_229742_230067_231373_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
906493	contig_13905_pilon	+	3801	1	Intergenic	novelGene_130415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4477	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGTTAGTAATCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81059	84860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_81100_84900
906495	contig_1452_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_115130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTGGGTAAGGCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696603	698444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_696600_698400
906496	contig_9924_pilon	+	4746	16	Intergenic	novelGene_175919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	621.812883609066	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1399	4197	548	4744	116907	171886	FALSE	30	AACCAATTTGTTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSSEEEKHNKKGMANQREKSLKTAREKSSDNVERKQEREKFFSAEGTVDKDKTIMELRDGLSKKQQPSVSSDGTDKPSSRRGEGFNSPEDKKVAETKEKSKHLKTKMCMKVQGGLSGVAEKFPKKEQTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDGEKKSKKIKEKISKKKNELSDNAEKLPGKGDSYDSSEDKKSRNGASDREKKRCNLPEKSSRRRQDCSSSDTEKYYLKEDGCDSSDKRLKRTELRERRNLNSKRSTKEIQSGSSSSDAEESCSEDNKKQKKQRPTAKKKTNNVKEKKRNSLRTSTKRKQAEITSSSSDIGDDDQNSVGDGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPLTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKSQLNSDSDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTMSDGESGEEKKMKPKEHKEAKGRNRRKVSSDDSEDSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSGEEEKEEEEEEEEEEDDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEEEERRKRIAEREREREKLRE	15733	171888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_59992_60101_99138_99252_114522_114563_115839_115893_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352_130436_136325_136399_147476_147611_148061_148239_166286_166381_170996_171100_171664
906497	contig_17769_pilon	+	2122	13	Intergenic	novelGene_124240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	188.396062562063	37	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	31	1563	14031	43853	FALSE	60	GAAATAAACCTTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRALRRLRGKQRGQEPLGPGALQFVLREDDDAEEEGPKRGPAGRRPRGTGKESVRVNNRFELINTEELEEEPVVNGDKSDCMPTDTVVSGNKGRAKHGNTETKKDGEGVEKAAASEQSNSSGKLRKKKKKQKNKKSTTGETLENGLEDIDRILERIEDRGGLARPGPPPLSSRKHVLHVEHRHLNPDTELKRYFGARAILGEQRSRQRQRVYPKSMWLTTPKSTWPRYSKPGLSMRLLETKKGLSSFMFEHSEEYQQVQHKFLAAVESMEPNNIVLLQTSPYHVDSLLQLSDACRLQEDQEMARDLIELDEDTWLRDTAVTSVSVSTERALYSMECAFHPLFSLTSGTCRLDYRRPENRSFYLALYKQMVFLEKRGCPRTALEYCKLILSLEPDEDPLCMLLLVDHLALRARSYDYLIFLFQDWEAHRNLSQLPNFAFSVPLAYLLLSQQADHPQHERSAAREKASVLIRQALTMFPGVLMPLLEYCSVRPDATVANHHFFGPNAQIR	14000	44412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_14223_30169_30335_31842_31918_32653_32773_33781_33848_36592_36676_37784_37913_38560_38661_39448_39603_40697_40791_40858_40965_42217_42378_43761
906498	contig_5727_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_7998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAATAAATAAACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	991844	993603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_991800_993600
906499	contig_15276_pilon	-	2542	1	Intergenic	novelGene_176894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGTGCCACCAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20673	18131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15276_pilon_-_18100_20700
906500	contig_11816_pilon	+	3077	17	Intergenic	novelGene_98592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGTGGTCCGGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394679	1504463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1395541_1396106_1396224_1400377_1400468_1401435_1401514_1405081_1406059_1406277_1406364_1415484_1415583_1415674_1415754_1418076_1418144_1427539_1427682_1428831_1428892_1434443_1434517_1436863_1436903_1438840_1438936_1442047_1442126_1454938_1455048_1504435
906501	contig_11815_pilon	+	5007	8	Intergenic	novelGene_50886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	255.532736830013	512	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	86	547	66460	78116	TRUE	25	ATGACCTCAGCCACTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRYRDEEDEDESQHSALANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPELNLNSLPRKSKEEWNEIRHQIGNTLIRRLSQRPTLEELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAELLARKILRFNEYVEVTDAQDYDRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESKHFTRYHRP	65614	82963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_65659_66418_66573_71283_71340_73042_73105_74400_74539_75147_75225_78100_80563_80949
906502	SIRV6	+	735	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	15	-49	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	20	6	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAACGAGTCGAAGTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	10739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
906504	contig_5684_pilon	+	1755	3	Intergenic	novelGene_81041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	224	7	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	33	500	403611	441865	TRUE	80	GTAAGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVARPPGSWRMELRCGGVGSQAVGRGMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403578	443567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_442095_442541
906505	contig_8576_pilon	+	2744	8	Intergenic	novelGene_88802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	555.437536670738	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	511	1248	910723	915551	FALSE	70	GCAAAAAAAAAACAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLQVLHPVDAAQRSQHIKSCIEAHEKDMELSFAVQRSKDMVCGICMEVVYEKANPSERRFGILSNCNHTYCLKCIRKWRSAKQFESKIIKSCPECRITSNFVIPSEYWVEEKEEKQKLIQKYKEAMSNKACRYFDEGRGSCPFGGNCFYKHAYPDGRREEPQRQKVGASSRCRAQRRNHFWELIEERENSNPFDTDEEEVVTFELGEMLLMLLAAGGDDDLTDSEDEWDLFHDELEDFYDLDL	893700	917047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_893804_902715_902845_909860_910078_910661_910783_913245_913461_914198_914310_914837_914977_915338
906506	contig_2867_pilon	-	3447	16	Intergenic	novelGene_135209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_4	61.875645900108	79	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	218	2248	979252	967714	TRUE	15	TGTCACGGCCCTCTGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAWLYLALNENSLESYLRLFQENLGLLHKYYVRNALVCSHDHLTLFLTLVSGLEFIRFDLDLDAPYLDLAPYMPDYYKPQYLLDFEDRLPSSVHGSDSLSINSFNSITSTNLEWDDSAIAPSSEDGDLTDTVSGPHSTASDLTSSKASTKSPTQRHNPFNEDHSEGMSSSDTTPVHTTSLEKEESQALDLLEACAELEVIRVTKKKKTGKKKKTKSDEEASPLHPASTQQKCARHGDGPGHGQDSSDTTLASPPEEGEGPGSTAESSEGAELGHMGLLIPAMKDTSMERLGQPLSKVIDQLNGQLDPSTWHSHAQPPNQSFRTGSPGDAPERPPFCDFSEGLPAPMDFYRFTAESPSTAASGGGHHDPAGPGQPLHVPGSPAAAGQEEERGGEGQAPRPLEDTCGEAREPETQELETQLPLVSEGPVLGPEPGTQEAICRLRRDQPSPCLSSAEDSGVDEGQGSPSEMIHSSEFRVDNNHLLLLMIHVFRENEEQLFKMIRMSTGHMEGNLQLLYVLLTDCYVYLLRKGATEKPYLVEEAVSYNELDYVSVGLDQQTVNLVCTNRRKQFLLDTADVTLAEFFLASLKSAMIKGCREPPYPSILTDATMEKLALAKFVAQESKCEASTVTVRFYGLVHWEDPTDESLGPVPCHCSPPEGTITKEGVLHYKAGTSYLGKEHWKTCFVVLSNGILYQYPDRTDVIPLLSVNMGSSLLTGPPWSSALTARRRWPTGCSTSARPCPRGSSPRG	980948	965651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_966573_967360_967478_967552_967733_968064_968164_968818_968885_969260_969452_969743_969877_970468_970558_970891_970957_971274_971366_971503_971574_971803_972626_973788_974018_979095_979283_980195_980284_980849
906507	contig_12923_pilon	-	3492	5	Intergenic	novelGene_30118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	465	junction_4	209.081921743607	241	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	97	645	93727	73221	FALSE	25	GGACCAGATGGTTGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAG	101264	70373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
906508	contig_4429_pilon	-	3261	2	Intergenic	novelGene_50810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	377	697	180081	179761	FALSE	25	CAGATGTTACCCTAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVTTLISLGYISRSGIAGSNGMSISSFLRKGHIIFQNGCSILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAAVRWYLTVVLICIYPMASDHEHFLMCLLAI	223621	177196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_180316_223479
906509	contig_13519_pilon	+	1929	13	Intergenic	novelGene_124628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	429.584384091828	10	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	230	1519	66308	114549	TRUE	50	GAAAGAAAATAATGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQFLWIRIQKQLS	57028	115611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66198_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_114513_114862_115513
906510	contig_17144_pilon	-	2400	14	Intergenic	novelGene_29410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1675.27574697492	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	154	1842	179764	166631	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLHQ	183235	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166640_168208_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
906511	contig_3004_pilon	+	2094	10	Intergenic	novelGene_127549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_3	65.819243686829	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	384	1493	818573	855040	FALSE	30	ATACTGGTAATTGGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSPWGCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESNVFVSNSTNASNLCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVFIRDLKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVIRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTALYVTLATLGYMCFREEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIPVVTSKFHAKWKQICEFGIRSFLVTITCAVAILIPRLDIVISFVGAVSSSTLALILPPLVEILTFSKEHYSIWMILKNISIAFTGIVGFLLGTYVTVEEIIYPAPSVMADTPQSLSLNLNTTCLTSGLK	802176	855641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989_814114_815278_815370_818526_818623_820752_820838_827930_828159_833489_833589_837198_837369_850865_851036_854732
906512	contig_9121_pilon	-	5975	4	Intergenic	novelGene_134445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1268	143	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3742	4158	150753	150337	TRUE	10	TTGTTTCGTCTCCCACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKQKKKQERPPKKQKRKKKTNVKRNALRDPSALLWKPKGRLPATLLSLAIKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNKQKPRDPTSVAAQTGKQLHTRTKLRSPSGRSKDGARSQVLERREGEVVRGK	154683	107116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_108355_149757_151121_151179_153332_153461
906513	contig_8594_pilon	+	2083	7	Intergenic	novelGene_140016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	77.5908070156081	109	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1626	457	2082	142242	188487	FALSE	25	ACTCACCCAGCAGTTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFKIKLICTNLDELRELITKIENELKDLENSRKKSGKWYLRRQAVKELHSTLIRLLNELLPWEPKLMKAFQRNRSRLKKDYDDFRRQPDHDKFTRELWTTEEGEGDPGKDSPPVEVRKSVDSTEPLDILEKDRLDSDDVKLSEIDFPVGRSKLLKKELPSKDVLKTLPKTLKRQSKQTSYLDDSTKELSPRKKVKLSTNEMTVVNLEGDMQIDCVNESKHTEPPFPESFASVDSTPVSSLQKGTKPIQALLAKNIGNKVTLTNQLPPSTGRSAPAVEKPVLSPPRASSIKPASTCHASTKGPLQMVYKMPCGQWLPVDLHNSSVKIQMQPMVDPKTGEKVMQQVLILPKNFVIQHKEGKAVAKEIPPLQQKGTEQLCSSLPHTANVNSSLTSVLVNSTGTVSAQLPSPVFNKTIASLSNASSARPQPLSPITSISNLLTPPVKTSQNEAGKPKNAVSTATFPQPIASPTISSTVQPVVSATTLSGSTNPGSSLNSFVQQAADSFEAKQELQTVCIRDSQSILVRTRGGNTGVVKVQTNPDQ	126011	188488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_126284_136959_137040_142137_142260_145285_145376_180568_180685_184917_185106_187273
906514	scaffold_9100_pilon	+	3333	4	Intergenic	novelGene_83325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	969	1574	868423	869028	FALSE	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLLGRLMIFLEEIVSETTVHLGFMGAPELLTVCPGLKLLTGLLIVLPAETEPLPDCPGPLTDRPGGPEPLAGRRRSCRLLTGRPGPLELPRGLPEPPEPLMGRPGPLELLAGRPGPLVPLTVRLEGFESPAGLLAPLVDRSGPKLELPSWRLDTEPELMVGRAVPVLGRPRAELELLPGCLTPGLFTLLFGVTMSPSLE	862200	870787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_862875_863858_863931_866854_867031_868376
906515	contig_9406_pilon	+	3258	4	Intergenic	novelGene_136167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	121	396	82106	82381	TRUE	75	AAAAAAAAATTAAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISFSLGWPLCISCRAIWFTTATREAWLFISGSRLSNLCWMTSRSSSFSGICMLLSHCSFSSIQSSQASASLNILYRARVSWSACFRSRVSSATSLYRSSMPDSRPLTSRDSACSWGRAPACSCSVSMVGL	81892	88183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_82004_82096_82970_83739_83895_86064
906516	contig_6807_pilon	-	3108	1	Intergenic	novelGene_84573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	288	785	162278	161781	NA	40	AAATTTCATATGATTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPIWPVEYYNYGILGSQYFSSGKHYWEVDVSEKTAWILGVYCRTFSRNIKFGIRRDTNHQNVYSRYRPQYGYWVIGLRNQFEYNAFEDSSPSGPQVLTLSMPVPPRRVGIFLDFEAGTVSFFNVTNHGFLIYKFFKCCFSQKIFPYFNPWNCPGPVSLCPPSS	162565	159457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_159500_162600
906517	contig_16103_pilon	-	3321	3	Intergenic	novelGene_118880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	564	90	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	719	1081	735016	734654	TRUE	40	ATGTACAAAACTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKVLTIKPTERLHVRCGFVWFVFILQLRPPPLIGLWCAFSSLHGMLHSLPLTWHFFFSFFPSCFTAFPQGLSFPWVIWGTVFELGTHSPPPLQAAVLPRSW	735734	722622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542
906518	contig_16917_pilon	-	2461	2	Intergenic	novelGene_161931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGCCAAATGTCTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122146	118922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_121265_122027
906519	contig_6710_pilon	+	4150	1	Intergenic	novelGene_97012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGAGCACAGTGACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653370	657520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653400_657500
906520	contig_5999_pilon	+	3021	3	Intergenic	novelGene_45656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2158	2592	276320	276754	FALSE	50	GAAAAAAATTACCCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEKSHIGGARGNTENHSSSTPSFPDYTIASIIHFKVQILYKKNTRNFSVVEQWPSEVKLTIIFGCRVGHLSILCFMATFTPTQGLIYQMFALGPKPQPSRLVSSFKLILAYMFLSRSDLIFSFFSFPPPPCLPLSRIRKQKG	273188	277183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_274167_274224_274539_275454
906521	contig_4857_pilon	+	5864	6	Intergenic	novelGene_48881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	4172	4672	1723322	1723822	TRUE	45	CATAGACTTAAATGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDWSTRTGGITENKERIVEDLLAENFPDIMKDEKISIQDAHRTPHKLDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESRISSDYSAETMQARRQWDDLYKALKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGKIRAFPDKQKFREFAKTKPKLQEILKGVLRLENQ	1389645	1725085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1393064_1504236_1504499_1519472_1519605_1535240_1535400_1723121_1724339_1724409
906522	contig_14397_pilon	-	4141	1	Intergenic	novelGene_134655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAATATGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123022	118881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_118900_123000
906523	contig_14441_pilon	-	808	5	Intergenic	novelGene_100451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	140	352	126577	125875	TRUE	5	TCTGGCTGGGGCTGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	126716	82328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_82382_121646_121687_125511_125900_126157_126282_126513
906524	contig_8820_pilon	-	1311	2	Intergenic	novelGene_79313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGACAGGAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256211	254192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_254740_255447
906525	contig_20199_pilon	-	944	3	Intergenic	novelGene_82559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	1276	42	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	201	536	43987	41055	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44187	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_43906
906526	contig_12299_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_29739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTTGATTCCAACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130680	129280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_129300_130700
906527	contig_10225_pilon	+	1737	13	Intergenic	novelGene_86804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	20	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	89	1090	20776	42680	TRUE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20687	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46266_47347
906528	contig_8075_pilon	+	2574	10	Intergenic	novelGene_42503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	358.906294727554	4	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	104	820	719960	785961	TRUE	15	GTCTTATCGCATTGTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLAPGFDHRRALCCSFARVTSQLGQAREKPSGAMEDEVVRIAKKMDKMVQKKNAAGALDLLKELKNIPMTLELLQSTRIGMSVNAIRKQSTDEEVTSLAKSLIKSWKKLLDGPSTDKDSEEKRKEPAITSQNSPEAREESSSSGNVSSRKNETNARDTYVSSFPRAPSTSDSVRLKCREMIAAALRTGDDYIAIGADEEELGSQIEEVPIYQEIRNTDMKYKNRVRSRISNLKDAKNPNLRKNVLCGNIPPDLFARMTAEVMMSSKRCGKT	719856	796417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_720023_751376_751440_772190_772297_776800_776889_780609_780756_781906_781964_782964_783127_785929_786052_793313_793386_794825
906529	contig_5236_pilon	+	2228	4	Intergenic	novelGene_100902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	195.77708412035	191	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1663	1986	81606	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	77498	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_78549_80993_81775_83310_83427_84046
906530	contig_12901_pilon	+	3725	3	Intergenic	novelGene_142982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCAAAAAAAAGCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115463	119439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_+_116324_116497_118399_118475
906531	contig_8597_pilon	-	1232	1	Intergenic	novelGene_158730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	624	1082	194660	194202	NA	50	AAGAAAGCAACAGGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLQERPVNTTIIQIYIPTTNAKDEEMKDFYQLLQSEIDPTSNQDALTITGDWNVKVGNKEGLVVGKYGFGDKTDAGNCMTEFCKANDLFIGNTFFNNINSDYTCGPHWMEHTGIKSMVSVERDDAEAQYHQSEQGQELTAETINCPYANSR	195283	194051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_194100_195300
906533	contig_6445_pilon	+	4934	3	Intergenic	novelGene_77063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5.5	30	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCAAAACTTTTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667681	677374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_672040_674895_675036_676938
906534	contig_2009_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_165441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAAAAACCTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28020	30110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_28000_30100
906535	contig_7009_pilon	-	6620	3	Intergenic	novelGene_23666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2970	3371	537017	536616	TRUE	20	TACAGTATCTGGGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	540207	520042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_523001_536324_538012_538232
906536	contig_19402_pilon	+	7247	16	Intergenic	novelGene_80762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	1757.94036556673	73	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	3282	4412	57720	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_138560_138663_142957_143063_143802_145588_145669
906537	contig_5059_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_140754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	672	1091	435431	435850	NA	60	AAGAAAAGACCAAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRTLSDIVLEDEPLRLEGTQNTIGKELPPQSRVNLNNVDGVKFSGPSFADVARCKMRINGCKHPLRIRMWNVQSMNLRKLEVIKSEMGRIKMDILGISKLKWTGIGHFESDSHIVCCARNDRLERNVVTLLAKKNI	434759	436551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_434800_436600
906538	contig_8453_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_125125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1377	1682	198971	198666	NA	65	TACAATTTAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSFTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	200347	198094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_198100_200300
906539	contig_19032_pilon	+	3617	6	Intergenic	novelGene_172518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	92.6964940005824	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	171	704	139993	147826	TRUE	30	ACTTACAGTCAACTCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADAAQGRGGGEAGTAPADCTSSALRWGTGTARMVRRGFPLWAVLGGSRTGPAARLVPMAAEREPGEPGKGKPFKLLGILDVENIPCARDSVLYGSLGSVVAGLGHFLLTSRIRRSCDVGVGGFILVTLGCWLHCRYNYAKLRIQERIAREGIKNKILYESTHLDPQRKQTDRNSSN	139822	153227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_140209_146611_146727_146810_146875_147687_149036_149650_149750_151622
906540	contig_15323_pilon	-	2102	2	Intergenic	novelGene_148517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	248	616	83536	82477	FALSE	50	GTCTCAGTAAAAACAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREYGKTDSRSSQQETEHLFLVSPLQQQAPSALVLSFGSCFSLLSLFFPIPKLVPHITTFPSLRTAYLHNVLNTAFPNTTGTDYWNLPCTDPQLALSAQYVPQTIHPSSSPSAGHALLHHS	83783	80990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_-_82786_83476
906541	contig_7408_pilon	-	2160	7	Intergenic	novelGene_168733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	227.565863481811	7	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	496	1317	36909	12597	FALSE	35	AATCAAAGTTCTGAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGWTAINAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48720	11753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_36880_36938_38375_38596_47312_47360_47877_48040_48682
906542	contig_6612_pilon	+	2944	2	Intergenic	novelGene_148167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTCAAACCCACCCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32763	87133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_35681_87106
906543	contig_10523_pilon	-	2081	5	Intergenic	novelGene_120944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.504792152571	120	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	182	739	39240	20830	TRUE	50	TACACTGAGAAAAACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIAKFDFTASGEDELSFHTGDVLKILSNQEEWFKAELGSQEGYVPKNFIDIQFPEWFHEGLSRHQAENLLMGKEVGFFIIRASQSSPGDFSISVRHEDDVQHFKVMRDSKGNYFLWTEKFPSLNKLVDYYRTTSISKQKLIFLRDRSQEDQVCLWRPPHRLPSREASMRPQENAFEAQVLGVF	39421	18717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_19412_20181_21098_26582_26703_31045_31138_39162
906544	contig_5649_pilon	-	2667	7	Intergenic	novelGene_82362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	51.4522432293611	7	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	232	552	1061995	1057321	TRUE	70	TTTAAAAAAAAAGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLLTDLDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGLWQGTRQVEPYRRGGF	1064357	1055057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1057119_1057266_1057437_1057659_1057712_1058327_1058457_1061971_1062041_1063968_1064019_1064221
906545	contig_5062_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_157827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGAATGAGAGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250105	251685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_250100_251700
906546	contig_3277_pilon	+	5156	4	Intergenic	novelGene_74723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	816	junction_3	702.879948655688	372	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	173	541	240775	250715	FALSE	35	CACCCAGCAGCACCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLR	188804	255330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_188880_190986_191077_240767_240964_250535
906547	contig_6677_pilon	-	3270	11	Intergenic	novelGene_114182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCGAACCCCTCCTTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483627	473867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_474002_474108_474309_475744_475964_476660_476793_477179_477328_477796_478292_479320_479406_480553_480658_481425_481634_481820_482106_482367
906549	contig_13301_pilon	+	2998	6	Intergenic	novelGene_153119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	284.201055592691	92	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	37	606	169218	171678	TRUE	45	CAGACCTCAATAAACCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQVSSGGSTVLNMTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPSE	169181	174478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_172375_172631_172824_172974
906550	contig_7593_pilon	+	1868	2	Intergenic	novelGene_127298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCTACAGATTCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182804	206587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_184657_206571
906551	contig_2940_pilon	-	4105	9	Intergenic	novelGene_81945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	252.604928693009	320	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	222	1943	765078	756839	TRUE	25	TCCTATGGAGCACAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPSTGDCGADPSVAASERLDPDRPCHLREEDVALGSERVREDEKQTVIKSSSECNPLLEEPIASQFGGTAATECHKSVPCGWKRVVKQRSSGKTAGRFDVYFVSPQGLKFRSKSSLANYLHKNGETSLKPEDFDFTVLCKRDIKSRCKDCSISPLTSQVQKESNNSNWNLRTRRGRKNDVFPMPHGSSELQDGRGLSNLTAIHLSLKEDEGVNAVDSRKVRKSKGKMTILKGIQIKKTKKRCSKSLSDSVQNNRKRESVCSEADVEGEPVAQESQLGRTLYISDVKASDETLVVTNEEKRLVKEKSLQSESNVHFEKLTSGSINKLCLTKEAEHNKKCENTFLDCEEIKTEVEVGERKKHLHTDVLKCGSEMDNSCLQAEKNFTSVKKFQEDTPVPRTQIEKRKTSLYFSSKYNKEALSPPRRKAFKKWTPPRSPFNLVQETLFHDPWKLLIATIFLNRTSGKMAIPVLWEFLEKYPSAEVARTADWRDVSELLKPLGLYDLRAKTIVKFSDEYLTKQWKYPIELHGIGKYGNDSYRIFCINEWKQVHPEDHKLNKYHDWLWENHEKLSLF	765299	729679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_729884_754880_756917_757853_757958_758454_758605_759195_759331_759407_759486_762008_762869_763289_763518_764989
906552	contig_8594_pilon	-	1790	6	Intergenic	novelGene_140014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGCCAAATTTTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188241	125934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_126285_136961_137038_145283_145375_180567_180682_184914_185101_187268
906553	contig_14924_pilon	+	3261	2	Intergenic	novelGene_104141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGTGAGATGTAGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6084	181502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_8510_180666
906554	contig_4315_pilon	+	1928	6	Intergenic	novelGene_46712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.9861464645983	355	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTTGTCCTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43139	68338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_43221_48690_48789_49226_49368_62740_63167_63254_63361_67262
906555	contig_6028_pilon	-	1819	12	Intergenic	novelGene_156576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	193.593465158476	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	532	1524	323759	309678	FALSE	25	TTTATAGACGTCTTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	353870	309382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_323940_324003_326490_326709_332025_332108_353771
906556	contig_4315_pilon	-	5415	8	Intergenic	novelGene_46753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2601	2930	237304	236975	TRUE	15	ATCTTGCTACCTCTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGRPAKVRICQKQTKKPNTLAGQQAKDSRVRALSCPVFGWSPYGENSGHSGLMTIITSLPLLFPSRVAESQLQTWVLPCSGKLQYLNIPKQLEASTTFPSLPIPQNT	239904	230518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_230587_232203_232314_232739_232905_233335_233421_233650_233813_234674_234851_235087_235135_235302
906557	contig_7657_pilon	+	4047	3	Intergenic	novelGene_30039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	433	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1996	2589	386349	386942	FALSE	25	GTAGAATTTTTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSSILLIPSSILSNLFLSPSMTLSISEVLLFNFWISNCCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMDLSVFFSFLPAFSFNSWITLNIRDLNSLSVRSSAFYFTGKSSGVMFWTPTGTILSRFCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFIYCRFVCFILVFRFILLCLSKQAVSSLLFVCGHNTFHFLLQ	258901	388400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_259577_261899_262180_385308
906558	contig_14970_pilon	+	2280	9	Intergenic	novelGene_45055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_4	5618.23023736123	32	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	447	1202	198516	231550	FALSE	50	GAAGCCAATGGAAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTALTSTTGTTPETITKREEVKDWFSQWFQPSHSKNHLHTTTKMAGTDSNTMSAGWDPNEENEDETGKPPSYSGSGIDDDEDFISRTNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192000	232628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_196136_196257_198393_198523_199729_199856_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
906559	contig_15893_pilon	-	3063	1	Intergenic	novelGene_128510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1593	1898	64753	64448	NA	15	CCTGTTGTTAATTTCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPGTLLNLSISSSSFLMDSLGFSMYSIISSTNRDSLTPSLPIWMPFISFSCLTALARTSSTMLNRSGDEEHPCPVAVLKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	66345	63282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_63300_66300
906560	contig_15407_pilon	+	2210	1	Intergenic	novelGene_123087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	152	529	470408	470785	NA	25	TTAATTCATTGTGTAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKLKKRTHIEEGGGCFLDIDTGGHAFHNHHLVVAESPRCNHSVIILNCMHYYIKELDILHECSLLCLGILCHSCCEIEVHVEKTFYCMKLYNTYKNNSVWFMHSVIFLQVSPKIPHRQGFRPH	470256	472466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_470300_472500
906561	contig_9119_pilon	-	1233	1	Intergenic	novelGene_169746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAATGAATAACGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197261	196028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_196000_197300
906562	contig_7452_pilon	-	2515	1	Intergenic	novelGene_109154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTGGGGTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157414	154899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_154900_157400
906563	contig_9221_pilon	+	2269	17	Intergenic	novelGene_176239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	341	junction_11	182.403741737937	179	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	742	2226	44	2269	16309	33219	FALSE	20	TAACTCCTCAACTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQISDIYISGESGDMSAKEKLLLWTQKVTAGYTGIKCTNFSSCWSDGKMFNALIHRYRPDLVDMERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKVPEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKSFPQNPVELKALYNQYIHFKETEILAKEREKGRIEELYKSLEVWIEFGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLRPAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEKLTLAKNTLQADAAHLESGQPVQWESDVIMYIQECEGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELAFRVMRLQDELVTLRLECTNLYRKGHFTTLELAPPSGLTTTHLKAEPLTKGTHSSSTSWFRKPMTRAELVSISSSEDEGNLRFVYELLSWVEEMQMKLERAEWGNDLPSVELQLETQQHIHTSVEELGSSVKEARLYEGKMSQNFHTSYAETLGKLETQYCKLKETSSFRMRHLQSLHKFVSRATAELIWLNEKEEEELAYDWSDNNPNISAKRNYFSELTMELEEKQDVFRSLQDTAELLSLENHPAKQTVEAYSAAVQSQLQWMKQLCLCVEQHVKENTAYFQFFSDARDLESFLKNLQDSIKRKYSCDHNTSLSRLEDLLQDSMDEKEQLIQSKSSVASLVGRSKAIVQLKPRSPDHVLKSTISVKAICDYRQIEITICKNDECVLEDNSQRTKWKVISPTGNEAMVPSVCFLIPPPNKDAIEMASR	16265	33219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_+_16440_17236_17350_17455_17563_18328_18449_18591_18688_19402_19531_19616_19711_19922_20078_20807_21085_22041_22171_22833_22912_23690_23853_25347_25453_26075_26172_27873_28000_30773_30927_33063
906564	contig_7050_pilon	+	3382	1	Intergenic	novelGene_153609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578308	581690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_578300_581700
906565	contig_5684_pilon	+	2563	4	Intergenic	novelGene_81055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	187.446584984155	12	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1346	1909	443906	447039	FALSE	35	TTTCTCTTTTCATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403666	447693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_442785_443891_443949_446518
906566	contig_11338_pilon	-	2702	3	Intergenic	novelGene_6266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.5	89	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATGAAAAACTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315974	121707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_122402_310367_311160_314758
906567	contig_9366_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_166233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTACCAGGCGCAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757696	756248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_756200_757700
906568	contig_14643_pilon	-	5328	20	Intergenic	novelGene_99118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	443	junction_16	159.655949343157	97	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1096	3291	5	3295	65336	34514	TRUE	35	TAAGGGACTCAGTTAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDICVIRAIQKIIWASGCGALQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTSETGVEETILEGHLGVTKELLAFQTPEKKYHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCSSPATINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLERDNVNPESQLIQQNEQSESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSLEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEIAMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVKGK	65340	25842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_27249_28761_28858_29238_29452_29640_29798_34352_34750_35222_35409_40986_41117_41617_41844_42998_43123_43496_44251_45619_45762_48091_48266_52009_52201_53787_54009_56215_56439_57092_57240_57838_57986_58214_58324_64086_64254_65222
906569	contig_15697_pilon	+	3756	1	Intergenic	novelGene_173307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2	319	55209	55526	NA	30	ATAAAATTTCTACTCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFSLYCSPHPSPFTPPIPPLSLCHLTFPKTFPSSKPSPNRINQGLQSEFECPNLAPPFQPAAPCSSKCPWCWLPPSPCALFIFGPDAGQPVWNAPPTPSGLSKST	55207	58963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_55200_59000
906570	contig_11258_pilon	+	3165	2	Intergenic	novelGene_67824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1620	2123	330494	337208	FALSE	25	GGAAGCAGGAGGCTAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTGAPCLRLWLCLEFSWLLVLWVAPAVVSVVDSTGGPSVVVVEVVVLVGVLDVAAGTQRSSRTESSHTALSRWVIPRRQVSAEIAWAPAGYQVSALPKKGGPNLQDSHFCFSLCQSAASFLSLFLLELVRKWWTLSGQSGPWLADATWNCVVFFLIPDESRIPSNF	328874	338250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_330663_336873
906571	contig_7342_pilon	+	2603	11	Intergenic	novelGene_71228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_5	228.920968895381	968	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	67	900	716998	727771	TRUE	45	GCCTGGAGACATTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSEPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVDGEGFGDTLDASSLDFKVTPDIEEPLLEPGTDKRNTTVTVCEFSFTLLFFLSCVCIKLCYGLVYGFSGGQSRSFKDQRLETHSYHQICASGVLVS	716931	738082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723168_726444_726508_727543_729013_729437_729488_730009_730111_734516_734667_734756_734870_738034
906573	contig_11852_pilon	-	5169	2	Intergenic	novelGene_178819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	713	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1957	2529	252165	251593	TRUE	55	GAAATAGCAAAGAGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEVSMADRDAVWSLWQAPIGESQCRPLVFWSKALPSSADNYSPFEKQLLACYWALVDTERLTMGNQVTMRPELPIMNWVLSDPQNHKVGHAQQHSIIKWKWYIRDRVQAGPEGTSKFHEEVAQMPMVSTPVTLLSISQSAPTASWGVPYDQLTEEEKTRAWFTDGSAKYADATRKWTAAHYNPFLGPP	254121	236061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11852_pilon_-_236397_249287
906574	contig_12125_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_76214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATATGAATTGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215315	214358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_214400_215300
906575	contig_3975_pilon	-	1350	7	Intergenic	novelGene_54834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	189.457705629046	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	197	889	2063938	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079236	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063940_2066201_2066307_2079146
906576	contig_6446_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_149194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCATTCTTTTCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251758	249273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_249300_251800
906577	contig_6361_pilon	+	2857	5	Intergenic	novelGene_23978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	137	481	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405223	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
906578	contig_19061_pilon	-	5312	5	Intergenic	novelGene_173505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	396.946706120608	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	231	647	44044	41546	FALSE	15	TATTCTGGTTTTCATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAALRLVPRPSFPGLACTRPQGPGRCCRCGPVTLLAHLTKCPVHPPAGQCHHTPPPPTLTRLPCTLCEVPTPSRAHMHSKARTTHSPCMQPPPHVIHHTTVVQPNGMPATVYPAPIPPSQRQWSYHGYGGWDHYGHVSRDPTDSSLPNSCCPPPGHCANVPGPRNTHLQLRAPSVVITLQMFGWSCAVTSLRFHSWCCRPRASNQDSLLNTLDT	93327	36880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_41649_42169_42296_43730_43911_44036_44180_93232
906579	contig_16121_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_6886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	100	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	29	526	58910	59407	NA	25	ATCCCCTTACAAGTATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDSKAKQRVMDIVRTLGLTPLDQGSLVAAKEIENYPLQLFPMWRFPIYLSAVLCIFLFFYCVVREVIYPYVYKKKDETFRMAISIPNRVFPIAALTLLALVYLPGVIAAILQLYRGTKYRRFPDWLDHWMLCRKQLGLIALGFAFLHVLYTLVIPIRYYVRWKLRNITVTQVNL	58881	60612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_58900_60600
906580	contig_4131_pilon	+	3093	7	Intergenic	novelGene_127838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	98.62175216452	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	1748	3091	87286	97745	FALSE	20	TAAGTCTCCTTCTTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLDVKDTLNRSWAVKLETPEALSLELNTVYSVPELYFDVKKMLRSYQVGVTLDPDTAHRELILSEDRRQVTRGYPQDNLDTSSRRFSAFPCVLGCEGFTSGRHYFEVDVGEGTGWDLGVCIENVQRDKSMKQKPEFGFWTIRLCKKKGYIALTSLPVYLHLKEQPLVVGVLLDCEAGVVSFYNMTTGSHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPDEEGKK	85377	97747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_87694_91474_91571_93160_93329_94308_94332_94426_94540_97209
906581	contig_12157_pilon	-	4233	6	Intergenic	novelGene_135880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	127.072577686927	260	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1304	3915	223	4137	294914	22177	FALSE	85	GAAAGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAAAPPSFGLPRVFLTINQQIWFGKRTPPLRNIASEGEGQTLEPIGTENKVSGKNKEFSADQMSENTDQSDAAEQNNKEEQSLHVQDPSSSSKKDLKSSVLSEKAGFNYESPSKGGNLPSFPHDEVTDRNMLAFSSPAAGEVCEPLKSPQRAEADDPQDMACTPSGDSLETKEDHKMSPKATEETGQTPSGQANCKGSSPVSVASKNPQVPSDGGVRLNKSKTDLLVNDNPDLAPLSPELQDFKCNICGYGYYGNDPTDLIKHFRKYHLGLHNRTRQDAELDSKILALHNMVQFSHSKDFQKVNRSVLSGVLQDINSSRPVLLNGTYDVQVTSGGTFIGIGRKTPDCQGNTKYFRCKFCNFTYMGNSSTELEQHFLQTHPNKIKASLPSSEGAKPTEKNSNKSIPALRPSDSGDLGKWQDKITVKAGDDTPVGYSVPIKPLDSSRQNGTDATSYYWCKFCSFSCESSSSVKLLEHYGKQHGGAQSGSLNPELNDKLSRGSVINQNDLAKSSEGEPVSKADKGSSGAKKKDFSSKGAEDNMITSYNCQFCDFRYSKSHGPDVIVVGPLLRHYQQLHNIHKCTIKHCPFCPRGLCSPEKHLGEITYPFACRKSNCSHCALLLLHLSPGAAGSSRVKHQCHQCSFSTPDVDVLLFHYESVHESQASDVKQEANHLQGSDGQQAVKESKEHSCTKCDFITQVEDEISRHYRRTHGCYKCRQCNFTAADTQSLLEHFNTVHCQEQDITTANGEEDGHAISTIKEEPKIDLKVYSLINPDSKMGEPVSESVVKREKLEDKDGLKEKVWTESSSDDLRSVTWRGAEILRGSPSYTQASLGLLTPVSGTQEQTKTLRDSPNVEAAHLARPIYGLAVETKGFLQGVPAGGEKSGALTQQYPASGESKSKDESQSLLRRRRGSGVFCANCLTTKTSLWRKNANGGYVCNACGLYQKLHSTPRPLNIIKQNNGEQIIRRRTRKRLNPEALQAEQLNKQPRGSSEEQVNGSPLERRSEDHLTEGHQREIPLPSLSKYEAQGSLTKSHSAQQPVLVSQTLDIHKRMQPLHIQIKSPQESTGDPGNSSSVSEGKGSSERGSPIEKYMRPAKHPNYSPPGSPIEKYQYPLFGLPFVHNDFQSEADWLRFWSKYKLSVPGNPHYLSHVPGLPNPCQNYVPYPTFNLPPHFSAVGSDNDIPLDLAIKHSRPGPTANGASREKTKAPSNGKNEGPLNVVKTEKVDRSTQDELSTKCVHCGIVFLDDVMYALHMSCHGENGPFQCSICQHLCTDKYDFTTHIQRGLHRNNAQAEKNGKPKE	295136	22080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_23239_25954_26078_214059_214664_231126_232257_246066_246997_294848
906582	contig_5602_pilon	-	6419	20	Intergenic	novelGene_133022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	194.645440854466	7	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	1558	3636	558046	536944	TRUE	5	AGTTCTCTTTTGGTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSIMDSTEAQLRYGSALASAGDPGHPNHPLHASQNSARRERMTAREEASLRTLEGRRRATLLSARQGMMSARGDFLNYALSLMRSHNDEHSDVLPVLDVCSLKHVAYVFQALIYWIKAMNQQTTLDTPQLERKRTRELLELGIDNEDSEHENDDDTNQSATLNDKDEDSLPAETGQNHPFFRRSDSMTFLGCIPPNPFEVPVAEAIPLADQPHLLQPNARKEDLFGRPSQGLYSSSASSGKCLMEVTVDRNCLEVLPTKMSYAANLKNVMNMQNRQKKEGEEQNVLPEEAESSKPGPSAHDLAAQLKSSLLAEIGLTESEGPPLTSFRPQCSFMGMVISHDMLLGRWRLSLELFGRVFMEDVGAEPGSILTELGGFEVKESKFRREMEKLRNQQSRDLSLEVDRDRDLLIQQTMRQLNNHFGRRCATTPMAVHRVKVTFKDEPGEGSGVARSFYTAIAQAFLSNEKLPNLDCIQNANKGTHTSLMQRLRNRGERDREREREREMRRSSGLRAGSRRDRDRDFRRQLSIDTRPFRPASEGNPSDDPDPLPAHRQALGERLYPRVQAMQPAFASKITGMLLELSPAQLLLLLASEDSLRARVDEAMELIIAHGRENGADSILDLGLLDSSEKVQENRKRHGSSRSVVDMDLDDTDDGDDNAPLFYQPGKRGFYTPRPGKNTEARLNCFRNIGR	560083	527497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_529784_532440_532527_533905_534051_535767_535882_536791_536948_538832_539009_541141_541203_544245_544377_545526_545672_546195_546308_548651_548896_551216_551316_551403_551525_553165_553387_554338_554453_554548_554722_555888_555963_556444_556676_557873_559366_559845
906583	contig_9177_pilon	+	2195	7	Intergenic	novelGene_32795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	90.2799657854511	235	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	372	1334	1514587	1569099	FALSE	75	TAGAATAAAAAAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHIGNNRSSGRWTHRYYSANKNVTCRNCDKCGHLSKNCPLPQKVRPCCLCSERGHLQYACPARFCLDCSLPMSSTHRCLKRSFWRKRCDRCDMIGHYADACPEIWRQYHLTTTPGPPKKPKTPSGQSTLVYCYNCAQEGHYGHECAERRMFNQTFPTSPFIYYYDDKYEIREREQRIKRKVKELQKNGDFPRQFKRPHMEAVDKKPHRDMRKSHGSWRNNRWPQEKKEAQKEMMSRNSRDGEKHRKADKYHEVDEDFPRGPKLHQKPDRSSRHSSHYHRPRGEKLPKEAKRGKHKKKERGLEDDDNDNLFLIKQRKKKI	1514215	1569960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1514590_1515807_1515934_1516870_1517042_1535922_1535959_1558471_1558568_1566718_1566837_1568686
906584	contig_3956_pilon	+	1591	7	Intergenic	novelGene_14980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1597.50489479341	17	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	335	1072	1287290	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPVEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1287253_1287536_1287968_1288077_1288874_1288993_1289819_1289892_1290297
906585	contig_6291_pilon	-	3339	1	Intergenic	novelGene_164801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCATTTTCTTTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386818	383479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_383500_386800
906586	contig_15664_pilon	+	3387	12	Intergenic	novelGene_171499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_10	81.2136250426121	57	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	145	1806	22071	78854	FALSE	30	TGTGTTACCTAAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMMEKGPELLGKNRSANGSAKSPAGGGGSGASSTNGGLHYSEPESGCSSDDEHDVGMRVGAEYQARIPEFDPGATKYTDKDNGGMLVWSPYHSIPDAKLDEYIAIAKEKHGYNVEQALGMLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKSFHRIQQMLPDKTIASLVKYYYSWKKTRSRTSLMDRQARKLANRHNQGDSDDDVEETHPMDGNDSDYDPKKEAKKEGNTEQPVQTSKIGLGRREYQSLQHRHHSQRSKCRPPKGMYLTQEDVVAVSCSPNAANTILRQLDMELISLKRQVQNAKQVNSALKQKMEGGIEEFKPPESNQKINARWTTEEQLLAVQGVRKYGKDFQAIADVIGNKTVGQVKNFFVNYRRRFNLEEVLQEWEAEQGTQASNGDASTLGEETKSASNVPSGKSTDEEEEAHAPQAPRTLGPSPPAPSSTPTPTAPIATLNQPPPLLRPALPAAPALHRQPPPLQQQARFIQPRPTLNQPPPPLIRPANSMPPRLNPRPVLSTVGGQQPPSLIGIQTDSQSSLH	21926	80435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_22237_22618_22676_30013_30092_33059_33113_35501_35664_37092_37218_37969_38049_53258_53478_59964_60043_69704_69763_77804_78047_78509
906587	contig_11846_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_105979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGGCAAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339660	341679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_339700_341700
906588	scaffold_13505_pilon	+	3571	6	Intergenic	novelGene_111569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	65.1478318902479	248	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAACCAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608579	620865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_609623_609748_610099_612389_614334_620104
906589	contig_12701_pilon	-	2542	5	Intergenic	novelGene_169542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	70.1141925718324	42	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	197	625	33228	24829	FALSE	20	CCCGACATTCAATTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKRLGFTLRHFSMDWGILSLCIPQCCVHF	52391	22911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_24911_29682_29809_30464_30610_33152_33253_52219
906591	contig_13004_pilon	-	4822	1	Intergenic	novelGene_112602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	701	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTCTCCCCCAGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156981	152159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_152200_157000
906592	contig_4782_pilon	-	2345	2	Intergenic	novelGene_73684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAACACAATTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680515	677995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_679245_679419
906593	contig_15123_pilon	-	1143	2	Intergenic	novelGene_110924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGAGTGAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277606	276307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_276397_276552
906594	contig_17687_pilon	+	1556	5	Intergenic	novelGene_177973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3.64005494464026	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGTCTAGCTCAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6919	35614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_+_7069_28472_28551_28635_28736_30614_30766_34536
906595	contig_9706_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_20788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392	2724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1400_2700
906596	contig_567_pilon	-	2187	2	Intergenic	novelGene_34007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	388	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCCTGAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621236	618928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_620743_620863
906597	contig_2646_pilon	-	2701	2	Intergenic	novelGene_69564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	0	104	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	132	302	877063	874665	FALSE	25	TTATCCCCATTTTTAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRHKPATKPWRWWPRQRRRQRRRQLWGLRLGLCRPPLLLGPGMYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLGTEY	877194	872265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_874735_876962
906598	contig_5590_pilon	-	2798	2	Intergenic	novelGene_163014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	105	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAATATGGATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302144	294572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_295076_299849
906599	contig_1516_pilon	+	4548	13	Intergenic	novelGene_49910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	503	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1176	1622	35319	35765	TRUE	60	AAAGAAGGGGGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDGGKGEETMEEADTEFRFAPEVARAGRIKGTGKVDPKATSGLRKQHNIFSKHSLIFDGKRTVASTSQVTTFSKRKSRVDSAKPNLGKRPEESEPTSQWSNKMYSARADKAASQMVNTPLGARHLKEDKEVLSQNWYLILKPLNLVA	34143	105389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_37478_38500_38612_41324_41588_50508_50561_53833_53968_57306_57382_57902_57944_62432_62540_63896_63963_74471_74529_75065_75159_84084_84226_105315
906600	contig_15384_pilon	-	2596	21	Intergenic	novelGene_85129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_17	23.6293779012483	198	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	57	2363	100041	85128	FALSE	15	AGCCCTGGCCCTCTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLTKFRKFLQENANGRGNMPVLCPPEYMVCFLHRLISALRYYWDEYKASNPRASFSEEAYVPPQVFYNGKVDYFDLQRLGGLLSHLRKTLKDELASKANILIDPLELQAATMDDLDEDEEPAPAAAQRPMQALAMGGTLPLPRPGWLSSPTLGRASRFLSTAAVSLMTPRRPLSTLEKVKVRTLSAEQRTREDIEGGPWNEGLLLGRPPEEPEQPLTENSLLEVLDGAVMMYNLSVHQQLGKMVGVSDDVNEYAMALRDTEDKLRRCPKGRKDILAELTKSQKVFSEKLDHLSRRLAWVHATLYSQEKMLDIYWLLRVCLRTIEHGDRIGPLFAFMPEFYLSVAINSYSALKNYFGPVHSMEELPGYEETLTHLAATLAKHFADTRIIGTDIRDSLMQALASYVCYPHSLRAVERIPEEQRIAMVRNLLAPYEQRPWAQTNWILVRLWRGCGFGYRYTRLPHLLQTKPEDAHLPSLQKPCPSTLLQQHMADLLRQGPDVAPSFLNSVLNQLNWAFSEFIGMIQEIQQAAERLERNFVDSRQLKVCATCFDLSVSLLRVLEMTITLVPEIFLDWARPTSEMLLRRLAQLLNQVLNRVTAERNLFDRVVTLRLPGLESVDHYPILVAVTGILVQLLVHGPASGIERATSVLLADPCFQLRSICYLLGQLEPPAPGTALPAPDRKRFSLQSYTDYISAEELAQVDRMLAHLTSASAQAAAASLPTSEEDLCPICYAHPISAVFQPCGHKSCKACIDQHLMNNKDCFFCKATIVSVEDCEKSTSATSSAA	100299	84894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_85243_85328_85415_85529_85625_85813_85957_89584_89670_89897_89974_90062_90252_90358_90499_91737_91823_91910_91999_92096_92185_92335_92411_93217_93396_95525_95634_96428_96513_96812_96959_97307_97507_97751_97859_99218_99321_99923_100045_100246
906601	contig_854_pilon	-	2740	11	Intergenic	novelGene_36670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1566	2285	1714455	1710659	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFLRELTSRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLVSLSSCSSSCAILASRAAMEALYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAPLPLLLAISSASSSRSCWAWRLARSAAASSSCS	1716403	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1709552_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
906602	contig_11337_pilon	-	3468	6	Intergenic	novelGene_107204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_4	76.3450063854867	306	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	609	1328	360451	359175	FALSE	30	TACCATAAAAGGTTCGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLTTNGVLVMHPRNGFTEDSKPGIWREISVCGNVFSLRETRSAQQRGKMVDIETNQLQDGSLIDLCGATLLWRTAEGLSHTPTVKHLEALRQEINAARPQCPVGFNTLAFPSMKRKDVVDEKQPWVYLNCGHVHGYHNWGNKEERDGKDRECPMCRSVGPYVPLWLGCEAGFYVDAGPPTHAFSPCGHVCSEKTTAYWSQIPLPHGTHTFHAACPFCAHQLAGEQGYIRLIFQGPLD	371113	357034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_359742_360298_360488_360579_360779_364785_364888_367866_367997_370972
906603	contig_7963_pilon	+	2711	2	Intergenic	novelGene_58525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_1	0	110	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1385	1834	197649	199536	FALSE	10	TATCCATGTCTTTTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSFMTMFLFYIGLPSVKVAPVTPFNTREPVMLACYVWGFYPADVIITWRKNGQLILPHSSAQKTSQPNGDWTYQTVSHLALTPSFGDTYTCVVEHIGAPLPILADWTPGLSLMQTVKVSVSTVTLGLGLIIFFLGLISWRRARSFSE	196264	200413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_197974_199411
906604	contig_10104_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_160144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACGCTGCTCACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561470	559297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_-_559300_561500
906605	contig_9843_pilon	+	2262	2	Intergenic	novelGene_114302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	140	319	3696	4094	FALSE	55	AATTTCTAAAAGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRQPTDWEKIFGYNQSDQCLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKRAKDMNRHFTKETWDFLKKLEIEVPYDLAIPLLGIYPTEIRAVARIDTCTPMFTAALFTIAKR	3556	6037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_3720_3938
906606	contig_6364_pilon	-	2747	4	Intergenic	novelGene_51806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	36.5726066278513	206	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGCAGAGCTAAAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489274	1458049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1458107_1472653_1475003_1481687_1481810_1489055
906607	contig_15327_pilon	-	787	3	Intergenic	novelGene_70673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	288	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	272	322	900954	900904	FALSE	90	AAAAAGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901439	900438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
906608	contig_2093_pilon	-	4413	4	Intergenic	novelGene_152944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCACCCTTTTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127002	957764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_961193_992038_992224_1033187_1033729_1126743
906609	contig_848_pilon	-	2045	1	Intergenic	novelGene_83328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACAGATTGGAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498692	496647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_496600_498700
906610	contig_14528_pilon	-	2092	3	Intergenic	novelGene_111273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	248	junction_2	31	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1209	1865	192862	190953	FALSE	0	CCTTGGTTCTTTGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVQLPASSVTKVSIQFERALLKWTEYTPDPNHGFYVSPSVLSALVPSMVAATPVAREEGPLFNTLFPVTDGSSYFVRLYTEPLLVSLPTPDFSMPYNVICLTCTVVAVCYGSFYNLLTRTFHIEEPNKGGLAKRLANLIRRARGRPAALRGTLFSSCSCCFSLGQGVVTPGAVSATCSPGHSPALTFEPNYPWTSQDLELCRPVQKPLTACGCLNLH	194070	190725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_-_191413_192556_192641_192749
906611	contig_4857_pilon	-	1556	3	Intergenic	novelGene_48654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	222	junction_2	42	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	459	764	448153	444994	FALSE	50	GAAAAACATAAGCAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVNDPLLFIKDIKPGLKNLNVVFIVLEIGRVTKTKDGHEVRSCKVADKTGSITISVWDEIGGLIQPGDIIRLTRGYASMWKGCLTLYTGRGGELQKIGE	448611	444201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_445070_447620_447760_448062
906612	contig_3382_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_124058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236062	234524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_234500_236100
906613	contig_2799_pilon	-	642	6	Intergenic	novelGene_85544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCTGTCAAGCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755383	704652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_704825_721142_721217_729184_729365_748947_749014_751382_751452_755302
906614	contig_5317_pilon	+	790	4	Intergenic	novelGene_76512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5602.73808061737	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	382	432	43276	43326	FALSE	30	GCAACTAAATGGTGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAAAAPPSLSNASARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33681	43684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33725_35303_35410_36684_36839_43197
906615	contig_4103_pilon	+	3117	15	Intergenic	novelGene_52002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTTCTCACTGCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229220	352790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_230026_238932_239036_239970_240116_240286_240414_243056_243146_264114_264230_269085_269274_269524_269763_276614_276710_282405_282640_286813_286960_287685_287837_289084_289200_300390_300544_352377
906616	contig_17936_pilon	-	1955	2	Intergenic	novelGene_29949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60755	56595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_57804_60008
906617	contig_6299_pilon	+	3617	9	Intergenic	novelGene_172940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_8	84.2502781894517	280	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	785	2358	224	2581	956551	968048	FALSE	20	CAAATCTTGATGTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQLLPLALYLSNMRKAVKIRERTPEDIFKPTNGIIHHFKTMHRYTLEMFRTCQFCPQFREIIHKALIDRNIQASLESQRKLNWCREVRKLVALKTNGDGNCLMHAASQYMWGVQDTDLVLRKALFSTLKETDTRNFKFRWQLESLKSQEFVETGLCYDTRNWNDEWDNLVKMASTDTPGARGGFQYHSLEEIHIFVLCNILRRPIIVISDKMLRSLESGSNFAPLKVGGIYLPLHWPAQECYRYPIVLGYDSQHFVPLVTLKDSGPEIRAVPLVNRDRGRFEDLKVHFLTDPENEMKEKLLKEYLMVIEIPVQGWDLGTTHLINAAKLDEANLPKEINLVDDYFELVQHEYKKWQENNQQGRREMHVQNPLEPSMPQLSLMDVKCETPNCPFFMSVNTQPLCHECSERWQKNKNKPPKLNCKLGPEAPPGMALGASRGEACEPLVWTPEEPAGGPHSAPPTAPSLFLFSETTAMKCRSPGCPFTLNVQHNGFCERCHNAQQLNTSRNVDPKRHLDAGKCRACLQDATRTFNGICSTCFKRTTTEPSSSLGPSALPSCHQRSKSDPSQLTQSLSPHSCHRAGGEAPSGCLSQAARTPEDRTGTSKCRKAGCMYFGTPENKGFCTLCFIEYSENKHFVAASGKANPTASRFQNTVPCLGRECGTLGSTMFEGYCQKCFIEAQNQRFHEAKRTEEQLRSSQRRDVARTTQSSSRPKCARASCKNILACRNEELCMECQHLSQRVAPAPLRGEPAPEEPPQAALPGPCLRALRQHQVQRLLQRVLSV	952670	969084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_952879_956535_956846_960604_960796_961448_961597_961938_962110_963194_963376_964792_965713_966637_966820_967778
906618	SIRV4	-	471	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGTAATCCACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2318	1486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
906619	contig_4429_pilon	+	3129	2	Intergenic	novelGene_50793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155078	160662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_158140_160594
906620	contig_11815_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_50958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	370	1419	500776	501825	NA	55	ATAAAGTCTCAGCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	500406	502116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_500400_502100
906621	contig_10930_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_37074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	346	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAACAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289048	287333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_289000
906622	contig_9479_pilon	-	2652	4	Intergenic	novelGene_176671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_3	196.439982352541	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2109	544	2652	20698	14311	FALSE	30	CTTCACAACTGCCCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQSLLVYMDGPEVIGNSLGAQMEMDDGMSIKGTTAVPFRATQEKNIIQIEGYMPLDCMFCSQTFTHSEDLNKHVLIQHRPILCEPAVLRVEAEYLSPLDKSQVRAEPPKDKNCQEDEDFSCEVCGQTFRVAFDVEIHMKKHKDSFTYGCNVCGRRFKEPWFLKNHMRTHTGKSGARNKLQQGLESPVTINEVVQEHAAESISSPYKICMFCGFFFPDKESLIEHSKVHTKETVSSTSETQADSRQEGTLSPREEFLQFLNLRPKSHPENVKKPAKWIPQLDPFNTYQAWQLATKGKVAIGRGEVKEPGQEGSTDNDDSCSDKEELGEIWSANKSHSEGSGKSKTNKNSCTGLSQDKEKPRHANGEVPSVDADPKLAHNKEKPTHCSECGKAFRTYHQLVLHSRVHKKDRRTDAESPTMSVDGRQPRTCSPDLATPLDENGAMDRGEGGSEDGSEDGLPEGLHLDKNDDGGKMKHLTSSRECSYCGKFFRSNYYLNIHLRTHTGEKPYKCEFCDYAAAQKTSLRYHLERHHKDKQMEVATEVKNDGKSQDTEDALLTAESGQTKNLKRFFDGAKDVKGSPPAKQLKEMPPAFQDALGSTVLSPVHKDSQDFRKNATDDSADKMSKNPTPAYLDVLKKRSVIEPQADSLLCKPEVDAVPHSDGSATHSMEVSHREKTGEAAADCKPKPTTDCQEKPLNLSLGA	32184	14310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_-_14907_15747_15865_19302_21083_32025
906623	contig_13945_pilon	+	1303	2	Intergenic	novelGene_173449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	65	junction_1	0	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGGAAAAATATAGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28470	76061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_28621_74908
906624	contig_4857_pilon	+	4044	2	Intergenic	novelGene_48727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2422	3126	1194283	1195434	FALSE	40	CAGAATAGACCACATCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSFKFDGEIRSFPDKQELREYVKVKPNLQELLKRVLLSEDKQLQLTGRTYDAGLYQPDTNLGNELSRTTQNQKKYNRESEQLISK	1191861	1196352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1194732_1195178
906625	contig_17976_pilon	+	2019	5	Intergenic	novelGene_32511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	912.27778116098	5	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	182	628	41843	48354	FALSE	60	TGGTTAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQFHS	41661	49745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46608_46826_46951_47092_48339
906626	contig_20825_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_178821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13918	15222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20825_pilon_+_13900_15200
906627	contig_7342_pilon	-	1652	3	Intergenic	novelGene_71177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	315	junction_1	101	176	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	628	1017	482371	476386	FALSE	20	CCACCCAGCAAGGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFAHTHGDRVSSHQTRGQSVGTTRLTGTDLPILRLQTNADLLTLLKLGLHPNWERCPRGLNLPAASELKEIQACPEGTDKPGLSQWGSKKTGQTIELFKVPSGVPKLKLDLWVRPRCARSQSLRRWF	483083	475750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_476762_482357_482474_482558
906628	contig_211_pilon	+	2277	10	Intergenic	novelGene_129882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	38.8215289641084	8	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	62	1759	298337	344432	FALSE	20	TGATGTGGGTTGTAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLLRNSDVASTLINSNFQVLKFDAYFQEDVPMSTEEHYRIRQVSIYYYLEDDSMSVVEPVVENSGIPQGKLIKRQRLTKNDRGDHYHWKDLNRGINITIYGKTFHVVDCDRFTQAFLESQGIELNPPEKMALDPYTELRKQPLRKYVTPSDFDQLKQFRTFDKQVLRFYAIWDDTDSMFGECRTYIIHYYLMDDTVEIREVHERNDGRDPFPLLMNRQHMPKVLVENAKNFPQCVLEISDQEVLEWYTAKDFIVGKPLTILGRTFFIYDCDPFTRQYYREKFGITDLPRIDVSKKEPPPVKQELPPYNGYGQVEDSAQNCFALIPKAPKKDVVKMLVNDNKVLRYLAALESPIQEDKDRRFVFSYFLATDMISIFEPPVRNSGIIGGKYLGRTRVVKPNSFVDNPVYYGPGDFFIGAVIDVFGHRFVILDVDEYVLKYMESNAAEYSPEALSSIQNHVRKQEAPAPELENKQTEEDPGTKELEALIDTIQKQLKDYSCKDNIREAFQVYDKEASGYVDREKFFKICESFNIPIDDSLVEELIRICSHEEGKINYYNFVRAFSN	298275	344950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_298397_306139_306428_311214_311365_312507_312701_315809_316031_323598_323740_332966_333181_333582_333731_342555_342767_344360
906629	contig_5686_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_45322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATAGTATTATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104130	102624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_102600_104100
906630	contig_9801_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_167565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGAATCCATCAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100718	101890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9801_pilon_+_100700_101900
906631	contig_10140_pilon	-	4387	17	Intergenic	novelGene_148387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.4478716080323	349	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	124	2367	185781	141154	TRUE	30	CCATGTAACAAACTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKWRKTTPLGTTLRKQFPLRPGSRWMNQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIIQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTLEGSGGPSTSRVTDPQNKSDIPTDLFDFYEQMDKDEEDEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSKSSQVSRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKTSSKHVHPLFKRFRK	186237	139034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_140573_140671_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163547_163751_178414_178600_180427_180743_181944_182150_182453_182619_182780_182917_183352_183403_184730_184968_185608_185651_185694_185815_186147
906632	contig_15720_pilon	-	3906	5	Intergenic	novelGene_41962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.916206260871	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	285	458	310695	309844	TRUE	45	ATAGTGAGAATAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPARDKESYQQAPGEEDLHKSQSPSRAVSAQHLC	311095	305499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305856_306751_309909_310220_310254_310619_310728_310843
906633	contig_12756_pilon	+	4012	1	Intergenic	novelGene_153210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAGTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149131	153143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_149100_153100
906634	contig_4686_pilon	+	2604	1	Intergenic	novelGene_118577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	661	1026	757962	758327	NA	70	AAAAAAAAAAGCAAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLDLEGNNCILLFSRSIWILFIKLILVLSNTNFLNFHKKRLRHCNKKKISATILERSMTVPKNTIYALTFCPSNDLLGIYPEDLKKKKVAVKSIPTHDGPVCVRVELCSRGFSMAVIFQK	757301	759905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_757300_759900
906635	contig_11908_pilon	+	2382	15	Intergenic	novelGene_133226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_6	64.7398246673497	400	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	109	729	692429	784030	TRUE	30	ATTGATCTGTTTCAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVAAGAASVELVIGWCIFGLLLLAILAFCWIYVRKYQSQRESEVVSTITAIFSLAIALITSALLPVDIFLVSYMKNQNGTFKDWANANVSRQIEDTVLYGYYTLYSVVLFCVFFWIPFVYFYYEEKDDDDTGKCTQIKTALKYTFGFALICALLLLVGAFVPLSVPNNKNSTEWEKVKFLFEELGSSRLWHVSITFKSDKRH	692320	837768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_692510_698010_698188_706180_706242_730044_730143_730567_730636_747323_747413_783983_784110_788412_788566_806974_807040_807396_807500_808053_808159_810281_810432_812167_812247_836668_836761_836941
906636	contig_7009_pilon	-	3699	2	Intergenic	novelGene_23628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1953	2435	435421	434939	TRUE	65	AAAGATTACAGAACGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNDALHHPQTACLGPCSWPGRLPGRDTGPLLKSPSEKRRNGWLLRSMQAQQRTVWHLPITSCVSQSLKESCVSHPNPDFQDPGLWTRCPLESPLTQSIWEGILLQSSCFLLPKVPLLPSGWAPANHLPNMQKRREDKFSCRKTQTEKEPVLPALTKVS	437373	433636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_434133_434170
906637	contig_20293_pilon	-	5688	13	Intergenic	novelGene_153508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_6	295.87478582821	96	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	123	1637	68656	27694	FALSE	20	CTGTTTTGAGTGTTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQVCLCCLNGQLLYLVGNICLFSFWFPIPLVPII	116224	23642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147
906638	contig_5686_pilon	+	2662	13	Intergenic	novelGene_45252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.67684803424	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	616	1161	182699	208330	TRUE	30	GCATTTGCATCTCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPRPRAEVTRGGTHRA	93789	212393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176650_176726_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_202899_208284_208722_211283
906639	contig_8254_pilon	+	2337	10	Intergenic	novelGene_48386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_1	169.511061585963	49	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	755	1477	95019	102563	FALSE	30	CAAGAAAGCAGTGTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFSSNLLTIPKQRSSSVSFTHHISLRRAGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKVCSTN	77450	103423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_77595_82136_82244_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341
906640	contig_12622_pilon	-	5407	10	Intergenic	novelGene_5759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_2	163.953546567614	23	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	259	1842	91249	78255	FALSE	15	CCTAAGAGCTTGCTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPKQPLLGGNSRIMDSPENYGSNMGGPNRNVTVNQTPSSGDWGLPNPKASRMEPMSSNSMGRPGADFNASLPRPAMAGSMPTLPVRSNSIPGTRPMLQQQQQQQQQMLQMRPGEIPMGMGVNPYNQAAPSNQPGSWPDGMLSMEQGPHGTQNRPLLRNSLDDILGPPSNLEGQSDERALLDQLHTLLSNTDATGLEEIDRALGIPELVNQGQALEPKQEPFQGQEAAVMMDQKAALYGQTYPGQGPPMQGGFNLQGQSSSFNSMMNQMSQQGSFPLQGMHPRANIMRPRTNTPKQLRMQLQQRLQGQQFLNQSRQALEMKMENPTAGGAAMLRPVMQPQQGFLNAQMVAQRSRELLSHHFRQQRVAMMMQQQQQQQQQTQAFSPPPNVTASPSMDGVLAGPVMPEAPPQQFPYPPNYGMGQQPDPAFGRVSSPPNAMMSSRMGPSQNPMMQHPQTVPMYQPSEMKGWPSGNLARNSSFSQQQFAPQGNPGAYSMVHINGSSGHMGQMNMNSMPMSGMPMGPDQKYC	91507	74689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_78267_78576_78719_79077_79253_80071_80307_81625_81719_83163_83458_88914_89087_90303_90431_90532_90791_91173
906641	contig_4232_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_63381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATAGACGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468051	467239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
906642	contig_7272_pilon	+	4811	15	Intergenic	novelGene_25376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	128.147575163981	208	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	980	2943	366	3308	724030	769117	FALSE	40	TGCTTAATAAATAACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQWTPVYSELSTLKVDMKSEIPSDAPKTPESLKGILLHPEPIGAAKRFPAEVEMINSKVGNEFTHLCDDSQKQEKDMNGNHPEPEKSVVVRKKRKGQQAGPSYVQNCVKDNQGILGLRQHLQTPSEEENDSSFSDCLSSPSSSLHFGDSDTVTSDEDREVSGRHSQAVLSAKSRTHSARSQKWPRTETESVSGLLMKRPCFHSSSLRRLPCRKRFVKTSSSQRTQKQRERILMQRKKREVLARRKYALLPTSSSSSENDLSSEASSSSSTEGEEDLFVSTSENHQNNPAVPSGSIDEDVVVIEASSTPQVAANEEINVTSTDSEVEIVTVGESYRSRSTLGHSRSHWSQGSSSHASRPQEPRSRSRISTVIQPLRQSAAEVVDLTVDEDEPTVVPTTSSRMESQTTSASMNNSNPSTSEQTSDTASAVTSSQPSTVSETSAPITSNTTTGTSIGDDSRRSVSSAVAETGPPAMPRLPSCCPQHSPCGGPSQSHHALAHPHTSCFQQHGHHFQPHHHHHHHPAHPAVPVSPSFSDPACLVDRPPQVQAPCGANSSSGSSYHDQQALPVDLSSSGIRSHGSSGFHGASAFDPCCPVSSSRAAIFSHQAAAAGPSQPLSIDSYGSSMVAQPQPQPPPQASLSSCRHYMPPPYASLTRPLHHQASACPHSHGNPPSSDSASTSSGLCHPSPCACFPFSDTFSRNISPCGIPATAPPAQRLHPPGHQPVSHHIPATAPPAQRLHPHEVMQRMEVQRRRMMQHPTRAHERPPPHPHRMHPNYGHGHHIHVPQTMSSHPRQAPERSAWELGIEAGVTAATYTPGALHPHLAHYHAPPRLHHLQLGALPLMVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	669565	770620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_669912_724010_724910_731168_731296_734442_734607_736893_737089_745767_746091_749780_750040_757778_757948_758033_758196_759891_760018_760750_760878_763506_763600_766027_766124_767159_767264_768999
906643	contig_5419_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_15535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	717	1175	401614	402072	NA	50	TAAAAACTCAATGCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWNILLTWPIIIFSAFVLPPVHCVLPGVLKACKQPSNNWRLFAWSQSVSRTVRNRRRIWNAWLIASINNCLLYHETRRTGWCPAIITERFDQTFYGKILIKQRKNALQNSQIPWNPEFLELFRLDESPNYCPEIIFKSYALNQKYPLKSS	400897	403420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_400900_403400
906644	contig_19096_pilon	-	2655	3	Intergenic	novelGene_173094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124	378	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGACTTGGTGTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15992	9175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_10771_13922_14884_15893
906645	contig_500_pilon	+	1536	9	Intergenic	novelGene_31041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_1	896.788776343125	7	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	53	763	1492663	1496733	TRUE	20	ATGTTTGACTGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMA	1485761	1499588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
906646	contig_4857_pilon	-	2270	12	Intergenic	novelGene_48720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2114.85031023729	5	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1052	1642	1226315	1205473	TRUE	25	CAATCTTCCTCCATAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRDQLY	1227454	1178615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1205397_1205488_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
906647	contig_9609_pilon	+	3734	2	Intergenic	novelGene_22921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	544	1107	16568	17131	TRUE	20	GCCTGTGAGCGGCCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYAGNDKLRRNDIAFIVKKNISRSILKYNTVSDRIISIHLQGRPVNTTIIQIYSTTTNAKDEEIEDFYQLPQSEIDQTCNQDELIITGVWNVKVGNKEEGLVVAKYDLGDRNDTGDQMTEFCKTNDLFVAYIFFNNINSDYTCELLWMEYTGIKSTTSVERNNGEAQYYQSEQGQESTVEQTINH	16024	20942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_19608_20791
906648	contig_14680_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_132740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCTAATTATTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7071	5410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_5400_7100
906649	contig_18829_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_177708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACTATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124294	122586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_-_123045_123580
906650	contig_14684_pilon	+	3181	2	Intergenic	novelGene_99678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365024	369077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_365827_366698
906651	contig_6137_pilon	+	3490	16	Intergenic	novelGene_59263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1409.36230812221	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	785	1414	1328176	1337740	TRUE	40	AAATGAGATTTTGAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKLNYLKFQ	1320912	1354913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337716_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345038_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512_1354130_1354175
906652	contig_6375_pilon	-	2230	11	Intergenic	novelGene_72957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_10	207.546645359543	452	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	274	1809	229189	202748	FALSE	10	GCTTTCAGTGGCTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234070	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_230125_230210_233928
906653	contig_7396_pilon	+	2562	15	Intergenic	novelGene_79555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACACCCTACTGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245195	255356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246416_247186_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248604_248869_249062_249736_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254699_255103_255194_255298
906654	contig_21007_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_161505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_0_1400
906655	contig_14397_pilon	-	2613	2	Intergenic	novelGene_134645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTATTCAAAGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76116	73458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_74428_74472
906656	contig_11258_pilon	+	1996	2	Intergenic	novelGene_67865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	61	438	373676	374053	TRUE	25	ATCTGACAATGTTGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSKSLGRLERTVGGITDMKGNSGEGSEGSEESSKAGDGTDCENQRQRNSGSRTRILMQDSIRADPWLKRAECLQTERTRNQEVEDEKTRTWLVPLIPSFPPISLIGKENVYLVPVLPLYFGSR	373615	375872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_374661_374921
906657	contig_5782_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_162140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTGACCTACCTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1149663	1147596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5782_pilon_-_1147600_1149700
906658	contig_16846_pilon	+	2165	8	Intergenic	novelGene_82860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	557.338244127699	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	202	591	179165	201236	TRUE	45	AAAAAAATGTGGTTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPEQVAICLQLLDFIAPRAELSVRLRSRPVGRQCRADSPLGWGIQCVCARSGAAVLDWAALAGVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKGRVPSRMSSSCTA	178963	208031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206637_206739_206859
906659	contig_14970_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_45129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	147.811323991093	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	313	807	285706	268709	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERERVPHRSRLCRHPQHLPRSSSSVPLPRPPLTLSRPSQLTLVPSVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315751	268158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291011_315615
906660	contig_13300_pilon	-	3304	7	Intergenic	novelGene_125798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25.2432609268736	56	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1614	2096	239982	239274	FALSE	15	CTTGGTTCTCAGTCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRHKSELTQQQHNWAAPAGPDSPSALPAEAAVREGDPFLKDPWSVGGTRSSLGQNSEEKRGQESSSSYNISRLSWLPHRGREWLTWSREWTQSRFLPRPCKQGGRVGCQARSLQGHLPAQPQGYGSVRGNEDFLEQRSVLSSPLSWECSGVRLPCSQNW	250780	238065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_239615_239840_240268_241165_241338_242243_242458_244230_244442_246913_247440_250575
906661	contig_18538_pilon	+	1660	14	Intergenic	novelGene_163885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	61.2015778889293	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1623	38	1660	9299	53992	FALSE	20	TATGTAAGTTGATGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAAGSAGRAAVPLLLCALLAPGGTYVLDDLDGLGREFDGIGAVSGGGATSRLLVNYREPYRSQILDYLFKPNFGASLHILKVEIGGDGQTTDGTEPSHMHYALDENYFRGYEWWLMKEAKKRNPNITLVGLPWSFPGWLGKGFNWPYVNIQLTAYYVVAWIVGAKHYHNLDIDYIGIWNERTFDISYIKMLRKMLNHQGLEQVKIIASDNLWEPISASMLLDSQLLKVIDVIGAHYPGTYSVRDAKLTEKKLWSSEDFSTLNNDVGAGCWGRILNQNYINGHMTATIAWNLVASYYEQLPYGGCGLMTAQEPWSGHYEVEPPIWISAHTTQFTQPGWYYLKTVGHLEKGGSYVALTDGLGNLTIIIETMSHKYSMCIRPFLPYFNVSRQVATFTLKGSFSQIPELQVWYTKLGKPSKKFLFKQLDPIWILDLNGHFTLELEEDELFTLTTLTTGQKGSYPLPPESQPFPPVYKDDFNIYDPPFSEAPNFADQTGVFEYFVNRDDPGEHHFTLRQVLNQRPITWAADASNTISIIGDYEW	9261	53992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18538_pilon_+_9446_14567_14637_14892_14957_17568_17683_20198_20339_22202_22242_22738_22870_36096_36253_39289_39415_41766_41895_48482_48573_49392_49480_51530_51682_53810
906662	contig_7775_pilon	+	4581	1	Intergenic	novelGene_37509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAAAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327327	331908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_327300_331900
906663	contig_5765_pilon	-	4973	14	Intergenic	novelGene_141354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	62.940189510529	486	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	170	1450	587164	386026	TRUE	25	TTTTTCAATCCCAGTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDLEPEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERLRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMATYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQESPDEVGSQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCGVDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELENNIRKALSFDNRGEDHRAAASTDGQLGSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKVLGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDLKLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPRDLTRVGVWPFGGLVGPGGANV	744235	350312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_353565_380033_380181_385901_386091_392572_392713_463984_464140_556479_556654_559952_560153_563192_563290_568125_568269_580592_580723_583210_583297_584771_584807_587108_587269_744170
906665	contig_2114_pilon	+	1681	4	Intergenic	novelGene_104227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	273.954172972212	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	96	716	136332	137672	TRUE	35	TTAAAAACTATGCATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEVGYTLNSFLWPELDTVVLNSGI	136236	139923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_138332_139617
906666	contig_7915_pilon	+	4918	1	Intergenic	novelGene_42992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGACTGGCTTCTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145293	150211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_145300_150200
906667	contig_13863_pilon	+	2794	12	Intergenic	novelGene_42063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	356.885216633079	4253	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	289	1737	474588	490279	FALSE	35	AATCGACTAGCATATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455639	491336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
906669	contig_17976_pilon	+	2356	4	Intergenic	novelGene_32490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	219	1112	41843	49590	FALSE	35	GAACGTAGGTGTACAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIGSCFLPAPATAAPARSD	41624	50834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47209_49536
906670	contig_15777_pilon	+	2602	1	Intergenic	novelGene_75758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAAAAACCAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262012	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_262000_264600
906671	contig_4402_pilon	-	1991	1	Intergenic	novelGene_140807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	416	748	357377	357045	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSISGKKAQHLAMFFCFFYSCPKSKSMVLRKTSSPVNKNKTKKKKKKLLVVSYRKKRKTPTFSTDTTYCSVKEFSLPKKEKRLKLEFDILLSDAVFLLVSDDGLLIINR	357792	355801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_355800_357800
906672	contig_5039_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_64862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTGTAGTTCAACCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356132	355239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_355200_356100
906673	contig_11285_pilon	+	629	3	Intergenic	novelGene_5488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_2	1	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCGATGACATCTTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052	6808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_1116_1783_1916_6374
906674	contig_17427_pilon	+	2186	11	Intergenic	novelGene_30400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	143.750617389979	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	12	1343	331916	367940	FALSE	40	AGCACTGGATGACCAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAASRTVSVGSGLRGLRRTLPLVVILGATGTGKSTLALQLGQRLGGEIVSADSMQVYEGLDIITNKVSAQEQRICQHHMISFVDPLVTNYTVVDFRNKTNECGFLLIPSSQPREMNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPSVPPVYGLEVSDVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGRKPAATPIKMPCNETENKRSYHVCDLCDRIIIGDREWAAHTKSKSHLYQLKKRRRLDSDAVTTLGSQSISPERDKELKEKGSSGRNDQELKSSI	331904	368783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351791_355635_355675_356562_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365288_367770
906675	contig_9091_pilon	+	6725	16	Intergenic	novelGene_32420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATGCAGTGAAGATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10843	46734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_16067_18581_18790_24579_24692_25320_25450_28659_28781_31154_31255_32012_32105_33092_33198_34423_34547_37956_38059_40451_40527_40774_40844_43445_43507_44146_44256_45906_45973_46704
906676	contig_7123_pilon	-	3946	1	Intergenic	novelGene_170575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	380	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1453	1830	434051	433674	NA	25	AGTATAAGGTTGTCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWNPCQSPTTSNFDDVGVLQKKLVPFVTDLTIHLAQELEKQKEDPGKVEQLQAWLQAWLLPHTNEVSQQINDNLCELQQRLVPCTNHPSVKTVCCCFTSTLQLSHTMSVWPILTGNMGKGVLEM	435503	431557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_431600_435500
906677	contig_14682_pilon	-	2661	8	Intergenic	novelGene_139109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	100.984743240486	2	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	387	1664	137297	94370	FALSE	30	GTAATCATTTTTCACACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEENKYDYLPTTVNVSSELVKLVFCVLVSFWVIKKDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	141993	93372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96558_119740_119809_122397_122529_124154_124254_137167_137317_141487_141588_141726
906678	SIRV6	+	1185	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-434	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	96	29	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	111	336	151	486	2002	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1851	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2737_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
906679	contig_7599_pilon	+	3562	4	Intergenic	novelGene_73763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	4.49691252107735	309	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	115	2136	19763	26604	FALSE	20	ATATTGCCTTGAGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGFRLAYFSGKSEEPNCACDQFRCGNGKCIPEAWRCNNMDECGDSSDEEICSKEANPPTAAAFQPCAYNQLQCLSRFTKVYTCLPESLKCDGNIDCLDLGDEIDCDVPTCGQSLKYFYGTFNSPNYPDFYPPGSNCTWLIDTGDHRKVILRFTDFKLDGTGFGDYVKIYDGLEENPHKLLRVLTAFDSHAPLTVVSSSGQIRVHFCADKVNAARGFNATYQVDGFCLPWEIPCGGNWGCYSEQQRCDGYWHCPNGRDEVNCTMCQKEEFPCSRNGVCYPRSDRCNYQNHCPNGSDEKNCFFCQPGNFHCKNNRCVFESWVCDSQDDCGDGSDEENCPVIVPTRVITAAVIGSLICGLLLVIALGCTCKLYSLRMFERRSFETQLSRVEAELLRREAPPSYGQLIAQGLIPPVEDFPVCSPNQASVLENLRLAVRSQLGFTSIRLPTAGRSSNIWSRIFNFARSRHSGSLALVSAEGDEVVPSQSTSREPERNNTHRSLFSVEPDDTDTENERRDTGGASGGVAAPLPQKVPPTTGVEATVGAYGSSSTQSTRGGNTDHGRDVTSMEPTSVSPARHQLTSALSRMTQRLRWVRFTLGRSSSVNQNQSPLRQLDNGVNGREEDDDVEMLIPVSDAASDFDVNDCSRPLLDLASDQGQVFRQPFSATNPGVRPSNPGDGPCERCGIVHTAQIPDACLEATLKNETSDDEALLLC	18460	28030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7599_pilon_+_18489_19676_20782_22338_22472_25734
906680	contig_16098_pilon	-	1507	11	Intergenic	novelGene_45993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1404.8586441347	20	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	125	1309	352350	348487	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLLGSPRTPCPGWRRR	354113	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348534_348988_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
906681	contig_7345_pilon	+	2524	1	Intergenic	novelGene_159199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	745	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATAGATAATGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341009	343533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_341000_343500
906683	contig_4782_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_73610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGACAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161626	159279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161600
906684	contig_11163_pilon	-	4212	5	Intergenic	novelGene_153054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	23.4240794909853	226	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	36	749	117379	73437	FALSE	50	AAAAACTTAATATATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GARDVLRAAAGMASGSTRLQRCMVLPAGRHTASLIFLHGSGDSGQGLRKWIKQVLTQDLAFQHIKIIYPTAPSRPYTAMNGGLSNVWFDRFKISNDCPEHLESIDVMCQMLTDLIDDEVKTGIKNNRILVGGFSMGGCMAMHLAYRNHQDVAGVFALSSFLNKTSAVYQALQKADGVLPELFQCHGTADELVPYSWAEETNSVLRSLGVSTQFHSFPGVHHDLSKTELQKLTSWILNKLPGDMERQGE	117414	69973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_73677_74073_74190_83582_83753_110644_110745_117291
906685	contig_9098_pilon	-	2119	12	Intergenic	novelGene_75834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	143.393580777748	212	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	185	1594	350397	335775	FALSE	5	GGACTCGGTCTTGGTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350581	335249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330
906686	contig_7272_pilon	+	2277	8	Intergenic	novelGene_25391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_6	118.311591372364	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	81	1214	750014	769117	FALSE	15	CTACATGTCTCTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLYATSLCVFDKTTSSSSLCLPPLSWKPPLLRLSLHLQWIMSSLTLCMLSILRYLLTQHLTLWHPPPPTHVASAAAPVPQHLAPGHQPVSHHIPATAPPAQRLHPPGHQPVSHHIPATAPPAQRLHPHEVMQRMEVQRRRMMQHPTGLFVFCVSRRAHERPPPHPHRMHPNYGHGHHIHVPQTMSSHPRQAPERSAWELGIEAGVTAATYTPGALHPHLAHYHAPPRLHHLQLGALPLMVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	749933	770180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_750040_757778_758196_759864_760018_760750_760878_763506_763600_766027_766124_767159_767264_768999
906688	contig_4857_pilon	+	4214	2	Intergenic	novelGene_48872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	610	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCATACTGTGACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361245	1365938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1361544_1362022
906689	contig_3424_pilon	-	3592	13	Intergenic	novelGene_55580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	20.9408890292015	289	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	6	1583	1138079	1128729	FALSE	30	CTAGATTGAACGCCGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAATVLAVRRLLRGSGSWGRSRLRSGPPTYRPFSSGSAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILINSGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTARFGSKDEILLALEKHGGICDCQTSRDTTMYAVSADAKGLDTVVGLLADVVLQPRLTDEEVERTRLAVQFELEDLNMRPDPEPLLTEMIHEAAYRGNTVGLHRFCPPENITKIDRQVLHAYLRNYYTPDRMVLAGVGVEHEHLVQSARKHLLGTRPAWGDQKAVDIDRSVAQYTGGIVKLERDMSSASLGPTPIPELTHVMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFTRLYLNVLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGAVDVVELERAKTQLMSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRCRKLPHELCALISNVTAEDIKRVASKMLRRKPAVAALGDLSDLPTYEHIQAALSSRDGRLPRAYRLFR	1138084	1126719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1128899_1129047_1129193_1131124_1131188_1131436_1131528_1131649_1131769_1131852_1131946_1132268_1132533_1133189_1133291_1134086_1134182_1135433_1135517_1135956_1136037_1136559_1136763_1138008
906690	contig_4924_pilon	+	4215	1	Intergenic	novelGene_84698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74739	78954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_74700_79000
906691	contig_10456_pilon	+	4186	1	Intergenic	novelGene_163461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTATTAAATCTTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32199	36385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_32200_36400
906692	contig_10437_pilon	+	2604	22	Intergenic	novelGene_38227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_21	140.835762568108	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	139	2505	318795	392342	FALSE	5	CCTTCCCTCACCCCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGVIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGTYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGDSSVGPVSMNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPTCTDMSNICQPTEFISRHNIEGTFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTTVKNSSQEPRSALSGTIQRPQLGPTANLSLEMGSGQLAPRQQQQTELEVVPGRDGLAGYNHPQVSVQPVTAPGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYSNISADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPSTPRPAENFRNSGLAPSVTIVQSSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPPWTPSTRPGFSAQQVASQATAKTRSPQFAVGNFQAPSSFSPMSLPGAPTTSPGAAYPSLTNHGSSFAPETGQTAGQFQTRTAEGVGVWSQWQGQQPHQRSSSGEHHVQQPTAQQAGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTMFPSFSE	318656	392441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_318820_349796_349909_355625_355671_360481_360527_364273_364319_366332_366547_369227_369442_371770_371874_373765_373832_374209_374296_375720_375798_376665_376801_379153_379229_380474_380627_387220_387332_387492_387563_387716_387841_388029_388133_388508_388657_389963_390124_390570_390738_392252
906693	contig_4180_pilon	+	2049	4	Intergenic	novelGene_8329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	347	junction_2	83.814610235262	9	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	432	1523	813066	821915	FALSE	55	GGTGGTGTATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHLYHMLGLFGLYSDPLSYLYSVLLNIDLGYFLASGGSKFPSLQRKLLNENKYKLITEYCLSRIMIYDFFLSFFFNSARDQFLNYLLECSLELILLLRYMNAFKFKKFRIIFAFFPKWKLLNKMYSDIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	812634	822441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_813616_814802_814973_820004_820097_821635
906694	contig_12626_pilon	+	2397	2	Intergenic	novelGene_80460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1063	junction_1	0	194	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGTCGAAAAAACATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177288	180410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_179511_180235
906696	contig_13807_pilon	+	2986	1	Intergenic	novelGene_154567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1219	1539	5677	5997	NA	30	GCCTCCCCATCAATAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKITFLQEDQSKHGELEGTIGIIWSDPLAVQMGKLGLRGSDMATITKQVRDELRLDLEAPHSWATEPSSLLLLPGKRLVSVLVKLPQGTLLTKLVLALLLKWMTWL	4458	7444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13807_pilon_+_4500_7400
906697	contig_12540_pilon	-	2578	2	Intergenic	novelGene_148046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	283	501	111449	111162	FALSE	15	TCCACAGTTCTTCGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQDKSKNETITQAEKPNNKRSRRQRNNENRENASNNHDHDDITSGTPKEKKAKTSKKKKRSKAKAEREASPADLPIDPNEPTYCLCNQVSYGEMIGCDNDECPIEWFHFSCVGLNHKPKGKWYCPKCRGENEKTMDKALEKSKKERAYTSLLRCEDCEMYIFKEG	111731	109084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_111211_111279
906698	contig_19986_pilon	-	2876	2	Intergenic	novelGene_159223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1629	2366	12638	10140	FALSE	35	TAATGAGAAACTATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNRTADDLPVEEKPLELTDRESKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFKEKADKFMGNTDKKKKEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDRVIEGLRSRFETMEGRVREIEDKYLYTTLFEEKSEKRMKKNEETLRILWDMIKSKNLGMTGVPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIIKLAKTTIQLGIGQPDKTKQD	14266	9629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19986_pilon_-_10187_11947
906699	contig_5769_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_138762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1960	2265	162683	162378	NA	20	CCTATTGCCATTGAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSEQDHNRGFWAELEKDVEHNSNLHKKYQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFIFSSVVKLSPRFTVQPGNGQPRKTRWD	164642	161943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_161900_164600
906700	contig_15410_pilon	-	2898	3	Intergenic	novelGene_130595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.5	14	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAGAGAAAAACAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145369	136568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_139125_144781_144916_145161
906701	contig_11318_pilon	-	2465	3	Intergenic	novelGene_48162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAGATTCAATCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67575	58538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_58595_63935_65695_66925
906702	contig_16578_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_148612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	965	131	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1978	2619	33887	34528	TRUE	20	TACTCTCAGGAATCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILRKYSVGSSSMILSVFSVFFPSSGIPITHKVLLLMISHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRFVSKCLSSIPLILSSTISNLLLSPSMTPSISEILLFIFSISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNCSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWTPSGTILSCFCKCFDIVYCLQGIQ	31909	91543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_35091_91273
906703	contig_12142_pilon	+	3040	14	Intergenic	novelGene_147804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	79.5839031031784	4	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	51	656	88852	100349	TRUE	40	CACAAACCAACATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVSRLSYSWGAGRHLLMLVPPMPGQKLGKCCLPLLENAFQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTEDFFGQ	88801	137300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_89007_94352_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100331_100403_104919_105002_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121990_124835_124924_135489
906704	contig_9363_pilon	-	4267	25	Intergenic	novelGene_6745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	245.576161387189	26	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	911	2736	412	3147	1539150	1506537	TRUE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1539561	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505530_1505625_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509595_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039
906705	contig_3095_pilon	-	2306	4	Intergenic	novelGene_75257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1432	junction_2	950.078710189611	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	41	778	255481	248388	TRUE	40	ATAATTATGAATTATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQIPRGLWTAAVMVMLMLLSIPKAEGRDSPQDFVVQDKFLCYFTNGTERVRLVYRDIYNREEIVRFDSDVGNFVALTPLGRPAAEYWNSQKDILEEYRAYVDTLCRHNYRIEERFTVQRRVEPEVTISLAKTETLNHHNLLICSVTDFYPGQVKVRWFRNDQEETAGVVSTPLIRNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCRVEHPSLRSPITVEWRKRQFVSFHCGIHKTEGRAPSCPSHPLLS	255521	246387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_247387_247858_248759_253535_253806_255384
906706	contig_252_pilon	+	3767	1	Intergenic	novelGene_99930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	408	1227	64	1290	380149	381375	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLDGGDKLPCAKNRDLATPDHAAGDSDPHQYRSLRREADVTQVMADMAGVTLETAADSLDCGFALRFRVPINRNQAAAKVGQEKAPPPAGRPKAASASAAFDHSLKNGRLGGELRSPAGEKALEACGAVGLGSQMMAGGKAKEVTTKKCAISVAAEKKREAEGVAEGKKVVQKERKAGGEMKEEKGARVPKVNNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPAFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMMKYMINLEVEELKHPRAGCKFKFIFQCNPYFRNEALVKEYERRSSGRVVCLATPIRWHRGQDPQTHVHRNQDGNTIHSFFSWFSDNNLLEFDKIAEIIKEELWPNPLQYYLMGEGARRGMRGPGRQPVENPMSFRFQSG	380085	383852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_380100_383900
906707	contig_11752_pilon	+	4735	2	Intergenic	novelGene_37675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3060	junction_1	0	40	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTGACTCTTGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96571	105928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_100976_105597
906708	contig_11386_pilon	+	3562	4	Intergenic	novelGene_82805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.4761503252086	236	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACTCCAGCTGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91713	99991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_91950_93601_96764_98903_98963_99886
906709	contig_6227_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_49643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTCCCTCAAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388443	386207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_386200_388400
906710	contig_2646_pilon	+	3330	15	Intergenic	novelGene_69692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_11	36.3793084270805	596	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	5	2008	2354789	2391654	FALSE	15	TTGTATAACTCTTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNLNGDYATIFNNLLLGETPPVEINSKKETSGSQKKPQDKGPKTGSVKKEKAVKPEEGQLVQVEEKGQGSVPWSVYGVYIQAAGGPLAFLVIMILFMLNVGSTAFSTWWLSYWIKQGSGNTTVTRGNRTVVSDSMKDNPFMQYYASIYALSMAVILFLKAVRGVVFVKGTLRASSRLHDELFRRILRSPMKFFDTTPTGRILNRFSKDMDEVDVRLPFQAEMFIQNVILVFFCLGMIAGIFPWFLVAVGPLVILFTVLHVVSRVLIRELKRLDNITQSPFLSHITSSIQGLATIHAYNKGQEFLHRYQELLDNNQAPFFLFTCAMRWLAVRLDLISIALITTTGLMIVLMHGRIPPAYAGLAISYAVQLTGLFQFTVRLASETEARFTSVERINHYIKTLSLEAPARIKNKAPSPDWPQQGEVTFENAEMRYRENLPLVLKKVSFTIKPKEKIGIVGRTGSGKSSLGMALFRLVELSGGCIKIDGVRISDIGLADLRSKLSIIPQEPVLFGGTVRSNLDPFNQYTEDQIWDALERTHMKECIAQLPLKLESEVMENGENFSVGERQLLCVARALLRHCKILILDEATAAMDTETDLLIQETIREAFADCTMLTIAHRLHTVLGSDRIMVLAQGQVVEFDTPSVLLSNDSSRFYAMFAAVENKVAVKG	2354784	2392976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2354858_2357521_2357625_2360466_2360652_2361053_2361201_2361415_2361546_2367733_2367888_2367976_2368106_2369902_2370090_2372472_2372563_2374633_2374824_2378534_2378695_2387446_2387526_2389129_2389244_2389979_2390145_2391552
906712	contig_3588_pilon	+	3319	1	Intergenic	novelGene_72894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCGGGAATAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134752	138071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_134800_138100
906713	contig_7396_pilon	-	2445	17	Intergenic	novelGene_79562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3280.45378851673	64	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	200	1585	255163	246385	TRUE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257468	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245858_246184_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
906714	contig_17144_pilon	-	3063	2	Intergenic	novelGene_29152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	0	100	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1195	1917	104479	103757	TRUE	15	GCCACCCGTAACTGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLTLLKPMLIYHSKNPRALKNYAKSTLPVLYKWNNKAWMTPHLFTTWLTEYFKPTVEIYCSEKKIPFKILLLIDNAPSHLRALMYKEINLVYVPANTASILQPMDQGLISTFKSYYLRIRFCKAIAAIDSDCSDGSGQSKLKTFWKGFSILDAIKNIHDSWEEIKISTLKGVWKKLIPALMDDFEGFKTSVEEVTANVVERARQLELEVEPEDVTELLQSPDKSLTDEELFLMDEQRK	105673	100961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_101701_103349
906715	contig_8377_pilon	+	4652	1	Intergenic	novelGene_35045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAATAAAGAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83312	87964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_83300_88000
906716	contig_11281_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_125454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGATTCCCCAGCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827315	825243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_825200_827300
906717	contig_1450_pilon	+	3115	22	Intergenic	novelGene_27344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	496.04959612327	2	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	241	2919	244426	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243315	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
906719	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_95619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	14	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
906720	contig_7119_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_41034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1345	1653	392853	392545	NA	10	ATGTCCCTACGTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFIHSFKKLLLGTFYVPHSSPDAVRVTYPCPCPYVEEAAAGTDHDTVSALRCHIKPGFAANWPHWACITDREGSPHSPPLPIVALSLLRVSAVAEIRAI	394197	392471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_392500_394200
906721	contig_8462_pilon	-	3408	18	Intergenic	novelGene_159429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	500.146151650076	32	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	28	2016	245320	231564	TRUE	25	GCCTTGTTCTAAAACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPSSRYSSGMSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRNDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFSKFERGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYSRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLEEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEEPDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNVNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLESMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQSSGASSSGFSSSRAGSSRSGGGGHGGSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN	245347	230116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_231019_231073_231644_231853_231994_232351_232506_232811_232930_233055_233238_233431_233577_233656_233802_234185_234347_234449_234549_234760_234847_235892_236029_236489_236590_236676_236836_237573_237707_239551_239600_240961_241020_245275
906722	contig_15500_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_128967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGTAACTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26810	25610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_25600_26800
906723	contig_10003_pilon	-	1634	12	Intergenic	novelGene_88165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	208	junction_9	1117.9761155952	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	306	1562	626149	402728	FALSE	40	CATTTGGAGAGATAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQESGTETKSNGSALQNGSSSGNHLLECGGLREGRSNGETPAVDVGAADLAHIQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKTAPQPVSTNPRQVARKTKCLTVCFSLLPHPSLLW	967378	402655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_402902_416834_416923_430739_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195_473334_531527_531657_625975_626164_750293_750355_806943_807043_967247
906725	contig_12299_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_29738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTAGGAGTCAGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130681	128876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_128900_130700
906726	contig_12503_pilon	-	2283	3	Intergenic	novelGene_143834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGTTAACTTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177194	167663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_169134_172703_172867_176544
906727	contig_3233_pilon	+	2507	11	Intergenic	novelGene_56540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	262.34587856492	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	1581	2462	740857	747909	FALSE	25	GTGCTGGAAGGGAGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHVVAVLPEIDPVLFQGEIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFVLALTHGREMQAQNSFSSFTLMKLRHSSALGGASLGAKHIGHLLPMDYNVNAVAFYTYTFS	736624	747954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_736685_737380_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745378_746325_746424_746936_747016_747718
906728	contig_826_pilon	+	6821	3	Intergenic	novelGene_154930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1160	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGCGGCCGCCCCCTATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7295	16577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_13341_15627_16347_16520
906729	contig_8676_pilon	-	4129	1	Intergenic	novelGene_142203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCAGAGGGTCTCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244715	240586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_240600_244700
906730	contig_9471_pilon	-	1996	9	Intergenic	novelGene_21702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	219.531888344268	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	835	1659	81103	71045	FALSE	20	ACTGACTGTGTCTAGTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPHRRSPGKMNMKEGVMEAAVYRMNRKHRGHCVIVNNHTFTSMKARPGTHKDAESLKCVFQWLGFAVRIYDDVTKGGLEEALQEYKSHSGHADGDCFVCCILTHGKFGAVYSADGALIPIRDIMSHFTAQQCPGLAHKPKLFFIQACQGDEIQPSVTIEADALNPEKVPSAPREVNLRESIPVEADFLLGLATVPGYVSFRHLEKGSWYIQSLCNHLKDLVPRHEDILSILTAVNNDVSRQAGKDGTKKQMPQPAFTLRKKLIFPVPQEALSL	105641	70707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_71199_73862_74371_74919_75029_79129_79170_81089_81200_100470_100565_102085_102215_102735_103086_105476
906731	contig_15543_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_164368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGGAGGGACCAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242883	245276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_242900_245300
906732	contig_8452_pilon	-	1389	6	Intergenic	novelGene_48075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	888.80886584237	24	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	37	498	991128	957279	TRUE	30	TGGATGTACTGGGTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRAVLSGYPDANMDQETLGNVVLLAIVTLISVVQNGFFAHKVEHESKTQNGRSFQTTGTLAFERVYTANQNCTDAYPTFLAVLWCAGLLCSQVPAAFAGLMYLFVRQKYFVGYLGERTQRIKRKHLAMAMKALYSLVPVDLSEFLSFAHLAPATLAFVLFPPQDL	991164	955107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_955961_957240_957418_968669_968752_972861_972933_981637_981738_991058
906733	contig_8375_pilon	+	3362	1	Intergenic	novelGene_141281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2520	2843	71986	72309	NA	35	AAAATTTTTTGTGTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCRGHQGAWTLVPKFPALIEVPTPLRWQGACGASCLLGTLGAWTPRNSSSEHDRNLAPSQFFRNHMSLPDSRATSGRRRDLQIEANIKFPNTLAGWGLRDRLYLI	69466	72828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_69500_72800
906734	contig_15867_pilon	+	3145	10	Intergenic	novelGene_170887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.5132451642575	182	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	566	1198	69257	81657	FALSE	5	GTCTTTCGTTTCTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKRPGRLLRSDQQQLKECKLGRRTEICLEPLQKKENLGPQDLLLRTQMRLPGERSYSLPEDMVWDTVRSCTAASLRQKVADFYSLPVEKIEIAKYFPEKFEWIPISSWNQQIAKRKKKKKQDNLQGAPYYLKDGDTIGVKNLLVEDDDDFSTIRDDIGKEKQRQLALGKKKSQEALHVQSSDVFSSVETSARPRGPEASLSIHVGTFR	63296	83604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_63519_65548_65604_67369_67497_67830_67926_69190_69310_69687_69754_72612_72824_73055_73152_76882_76978_81545
906735	contig_7172_pilon	-	3715	4	Intergenic	novelGene_178823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	139	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACACCCTTTTAGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411764	317575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7172_pilon_-_318272_318524_320097_409602_410479_411193
906736	contig_18420_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_109378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACAAAACCTAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119259	120934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_+_119300_120900
906738	contig_8100_pilon	+	3869	2	Intergenic	novelGene_176007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	188	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385365	389296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_+_385535_385596
906739	contig_8174_pilon	+	5170	4	Intergenic	novelGene_160042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	133.906269042524	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	216	1316	246362	294744	FALSE	45	GACATAATTTTAGTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAITLWQFLLQLLLDQKHEHLICWTSNDGEFKLLKAEEVAKLWGLRKNKTNMNYDKLSRALRYYYDKNIIKKVIGQKFVYKFVSFPEILKMDPHAVEISRESLLLQDRDCKLPPEVREAHKHSLSALKSTSRNEYIHSGLYSSFTINSLQNPPDSFKAIKTEKLEEQPEGSPPVEEVRTVIRFVANKTNKHVTRPVVSLPSTSEAAAASAYLASSVSAKISSLMLPNAASISSASPSSSRSPSLSPNSPLPSEHRSLFLEAACHDSDSLEPLNLSSGSKTKSPSLPPKAKKPKGLEISAPPLVLSGTDIGSIALNSPALPSGSLTPAFFTAQFPTLLNGHMPVPIPSLDRAASPVLLSSSSQKS	211046	298598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_211260_246359_246569_274876_275672_294645
906740	contig_4732_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_75380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2056	2490	216528	216962	NA	70	AGGGGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGGDATGIWRVHARDAAQHPTMHRMASSRIIWPNNKDKQPNFKTSEHLNRHFFTENIQMAKKRMKKCSTTSLATGETYIKTTMRSHLTPTRMAITFKKKKKKKRKVTSVVQDVEKLEPLSIAGRIVKWCSPRGKQFGGSSKS	214472	217491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_214500_217500
906741	contig_9656_pilon	+	2834	10	Intergenic	novelGene_121885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGGGCTAGAAGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69214	101198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_70528_71787_71960_73707_73892_79686_79885_81811_81947_85797_86020_86793_86915_88747_88883_97153_97332_101022
906742	contig_19362_pilon	+	5527	1	Intergenic	novelGene_157786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	4318	4677	25560	25919	NA	70	TCAACATAAAGAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLPFKRGVAKAKGRSEKVKELNRRFQRATQEDKVKCYNDMCKELEIENQKGRIHLAFLKLKEPKKKFKPRVAVMKDSMGKILNNAGSIKRWEEYTVIIPKRIGQHSAISRGSI	21242	26769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_21200_26800
906743	contig_8377_pilon	-	2637	5	Intergenic	novelGene_35109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAGTCACAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174585	160064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_161386_164383_164588_169243_169315_172903_173004_173644
906744	contig_12528_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_81301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTACATAGCCTGGGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926290	927987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_926300_928000
906745	contig_12793_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_164132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1550	1849	266183	265884	NA	50	GTATTATGCAACAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAVYKCNAILIQIPTTFFKEMEKLIINFIRKGKRPQISKVLLKQKNKVGGLVLPDFRTYYAAMEVETAWYWYNDRHIDQWNRIENPDVNPHMVT	267732	264988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_265000_267700
906746	contig_15114_pilon	-	3123	5	Intergenic	novelGene_121102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	798.515928144204	88	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	179	682	43115	39465	TRUE	40	CAGTACGCAACATCATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILGNHSDKWQQIPGCENVRATQCVFPQKVFSKGAYFLRVQASDGNKTSFWSEEKRLDTEMQTVILPPVISMKSVDNSLHIYIGAPRETENKSTSQHYPLIYEIIFWENTSNAERKILQKKTDFIVPNLQPLTVYCVKARAVIEDEKWNKSSVFSDILCEKTKPGNTSITWIIAGVCTALFSIPVAIYVVKGLLRCINYVFFPSCKPPPNIDQVCYLFLSAAGFFLK	43293	36586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_37539_37975_39656_40366_40518_42847_43003_43108
906747	contig_15596_pilon	-	1174	8	Intergenic	novelGene_139546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	154.550038129126	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	90	989	217105	199776	TRUE	75	GAAAGAATAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEETPGRLSHQPSVRLLASPGGASSEPLAMTSERPREPGGEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWSESSEARVFPGCAATYYPFVQELPVTEQKTNAEDTAFGASTFPPQYLSSDVTIHPFTYSPYTFESTQNVCSVPGSQYEYSQPGCYEGFQTVTPQSERMCPLPQEAKGLLKKKTYSEPKFDNKRADGTISSDIKSAKGSHLSVHAENSLKSVTDVCHKRTDRKSRITEKSGSTSRPEFEFTRLDFPELQSPENSGILEIPEQPKWGPLHSAATSVSLLRERKPPAVLAEGEIAVKSKNPAASVADSAASSSSSCTRDIVYRTVTSP	217194	198088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_198135_199636_199808_201847_201930_204476_204710_206206_206328_206575_206826_215682_215829_217069
906748	contig_9098_pilon	+	2139	2	Intergenic	novelGene_75804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCTCATACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290411	292595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_291995_292039
906750	contig_8616_pilon	+	5543	3	Intergenic	novelGene_72617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1504	4515	92	4606	464532	469046	TRUE	20	TTCCCTGCCTAAGGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGPKVKGEYDVTVPKLEGELKEPNVDISAPDVEIHGPDWNLKMPKMKMPKFSMPSLKGEGPEVDVNLPKADVDISGPKLDISAPDVSFEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKMSLPGVDPDLKGPKMKGNLDVSAPKVEGEMKVPDVDIKGPKVDIKAPDVDVQGPDWSLKMPKMKMPKFSMPSFKAEGPELDVNLPKADIDVSVPKVDIDAPDVSLEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDADLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGEMKVPDVDIKGPKVDINAPDVDVQGPDWNLKMPKIKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKANIDVSGPQVDVSAPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKPQKISTPDVGLHLKGPKMKGDYDVTVPKLEGEIKAPDVGIKGPKVDMNAPDVEVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPSFKGEAPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPSMNIQTHKISMPDVGLNLKSPKLKSDVDVSLPKVEGDLKGPEIDVKAPKMDVDVGDIDIECPEGKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPEVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGQMKVPDVDIKGPKVDIDAPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADINISSPKVDIDAPDLDIEGPEGKLKGSKFKMPKLNIKAPKISMPYVDLNLKGPKLKGGIDASVPELEGDLRGPQVDIKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLHLKGPKVKGDVDISVPKLEGDLKGPNVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKTPKISMSDVDLNLKGPRVKGDVDISVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKIKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIQSPDVGLECPEGKLKGPKFKMSDMHFKTPKISMPDVDLHLKGPQVKGDVDISVPKLEGELKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLNLKGSEVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDIGAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLRKPDVDISGPKVDIEPPDVSIEGPEGKLKGPKFKMPEIHAPKISMPDIDFNLKGPNIKGHVDVSAPKLERELKGPELDVRGPKLDVDMPDVAVEGPDGKWKSPKFKMPDMHFKAPKLSMPEVDLHLKAPK	464057	470025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_464109_464491_469878_469919
906751	contig_9109_pilon	-	3090	2	Intergenic	novelGene_175308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	220	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	1747	2658	19046	17171	FALSE	10	CCTCAGTCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRWPSHLTSHVRCHSGERPYECKECGKAFHTSSNLTIHMKIHSGERPYECKECGKAFRQSSGLTTHKRTHSGERPYECKGCGKAFRLSSHLTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTTHVRTHSGEQPYECEECGKAFSQSSYFTKHISTHSGERPYEYK	20792	16738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17991_18954
906752	contig_9696_pilon	+	5026	2	Intergenic	novelGene_68771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCTCCTGAAGTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140035	145228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_144383_144549
906753	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_96565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	47	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	657520	653562	FALSE	20	AAATGCCTTGCACCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657521	653366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
906754	contig_6048_pilon	+	3892	23	Intergenic	novelGene_73112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_14	312.063169066142	41	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2190	1701	3890	1275218	1323081	FALSE	40	GCCATACCCGTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSPSQSESAGSASEGEEIDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNRLFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEPAQPSSASSSGNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALNPALKQEPLSQTDITILTPKLLSTSPMSSVSSYSPIAISLKKPSSAPDPSVSALPNPSAIKKEPQDATGPELPGATEAAQGVLRHVKNELGRSGVWKDHWWSTIQPERRNTTVSSEEMKVEEASSGKEKASSSQARAERNQLQGPSSSEYWKEWPNAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPIVPMSKPSKPSVPPLTPEQYEIYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVIQSVMSLHDPLLQGSVSSESTPKTSASCSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPPIETSKEGKPPEPSEPPASDSQPTTPLPLSGHSALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLTDNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCESPSVGIDYSQGASPQPQHQLKKPRVVLAPEEKEALKRAYQQ	909020	1323083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_909157_994644_994756_1108443_1108492_1156243_1156323_1184026_1184165_1187737_1187862_1192174_1192252_1193826_1193894_1238343_1238393_1251239_1251345_1258621_1258811_1269186_1269246_1272874_1272924_1273712_1273810_1274845_1275519_1276690_1276757_1278059_1278162_1280997_1281831_1283686_1283853_1284466_1284524_1310375_1310679_1316005_1316195_1322908
906755	contig_4678_pilon	+	1641	1	Intergenic	novelGene_126024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	343	1032	315	1346	331385	332416	NA	35	GTCAAGCATGGAATTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPPADTNQTLSLSKKALAGTCQRPPLPERPLERTDCRPQPLDRVRDLAGPGTKPQSLGSSQRPLDRPPATAGPRPQLSDKPSPVTSPSSPSLIRSQPLERPLGMAGSRLDKSIGAASPRHQPLEKAPVPTGLRLPPPERLLITSGPKPQASDRPPDKSHASLSQRLPPPEKVLSAVVQTLVAKEKALRPVDQNTQSKNRAALVMDLIDLTPRQKERAPSPHEGTPQADEKMPVLESSSWPPSKGLGQMPRAGERGSVSDPVILPPGKAAAPSEHPWQAVKSLTQTRLLSQPPAKAFLYEPATQASGRPPAEAEQTLGLPSQAPGLVKQMAGGQQLPGLAAKGTTLSGQSFRPLGNAPASLPTEKKTLATTEQSPWVLGKASLGPGLWPMVAGQTLTPPCWSSGSTQTLAQTCWSLGRGQDPKPEQNTVPALNQAPSSHKCAESEQK	331070	332711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_331100_332700
906757	contig_903_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_178824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGCCCAAGTTCTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48403	46262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_903_pilon_-_46300_48400
906758	contig_8065_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_107333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAACCCCATTTGTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142568	141061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_141100_142600
906760	contig_12612_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_178826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	663	1942	2604	453959	454621	NA	55	CTAAAGACAGACAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIDIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRIKKNEETLRVMRDTIKSKNIRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAK	452017	454622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12612_pilon_+_452000_454600
906761	contig_15135_pilon	-	6579	9	Intergenic	novelGene_119861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	300.812000051527	67	153	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1307	2083	55161	49378	TRUE	45	TTAGCAAGAAAAATGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRVFDTYMLFFQVNQSAAALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKMEKICTPSLLLEDAHPCDSNPLLTTPGGGSE	56467	43193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_44640_44777_44901_46298_48600_48751_49485_49803_49862_51681_51898_53360_53472_54019_54203_55059
906762	contig_16632_pilon	+	2656	1	Intergenic	novelGene_154136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAAATAGCATATAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91650	94306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_91600_94300
906763	contig_15067_pilon	-	1995	4	Intergenic	novelGene_154328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	51.0511725842044	5	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	171	476	93847	92165	TRUE	10	ACGGTGGTTGCCTGCGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	94017	90591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_91283_91336_92279_92840_92941_93755
906764	contig_9122_pilon	-	3798	2	Intergenic	novelGene_178827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	13	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	706	1050	25211	24867	TRUE	10	GGGGTGTTTTTTGATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKDALNILMLWILFKLALWPNMWSILENVPCVLEKKIYSAAVGWSVCYMSMRSNWLIVAFRSSLSVLSFSLDVLSFTECGVLKSPTIVELSVSLFSAVRVCFMYFGALSLGA	25916	17624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9122_pilon_-_18687_23180
906765	contig_7035_pilon	-	2541	15	Intergenic	novelGene_83558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_10	55.2554826903805	195	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	127	2004	958719	946793	FALSE	0	TGGTCCCTGCCTTCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDLAKKKAAKKKEAAKARQRPRKGHEENGDAATEPQVAEEKNEEANGRETTEVDLLTKELEDFEMKKAAARAVTGVLASHPNSTDVHIINLSLTFHGQELLSDTKLELNSGRRYGLIGLNGIGKSMLLSAIGKREVPIPEHIDIYHLTREMPSSDKTPLQCVMEVDTERAMLEREAERLAHEDAECEKLMELYERLEELDADKAEMRASRILHGLGFTPAMQRKKLKDFSGGWRMRVALARALFIRPFMLLLDEPTNHLDLDACVWLEEELKTFKRILVLVSHSQDFLNGVCTNIIHMHNKKLKYYTGNYDQYVKTRLELEENQMKRFHWEQDQIAHMKNYIARFGHGSAKLARQAQSKEKTLQKMMASGLTERVVSDKTLSFYFPPCGKIPPPVIMVQNVSFKYTKDGPCIYNNLEFGIDLDTRVALVGPNGAGKSTLLKLLTGELLPTDGMIRKHSHVKIGRYHQHLQEQLDLDLSPLEYMMKCYPEIKEKEEMRKIIGRYGLTGKQQVSPIRNLSDGQKCRVCLAWLAWQNPHLLFLDEPTNHLDIETIDALADAINEFEGGMMLVSHDFRLIQQVAQEIWVCEKQTITKWPGDILAYKEHLKSKLVDEEPQLTKRTHNV	959491	946255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_946931_947076_947281_947994_948124_948581_948645_949522_949634_950033_950124_950435_950556_950732_950829_951250_951354_952255_952352_953359_953532_953614_953798_954256_954470_958559_958762_959407
906766	contig_6589_pilon	+	1745	15	Intergenic	novelGene_25740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	55.4949896616895	3	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	725	1381	479605	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	460731	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467099_467169_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
906767	contig_10734_pilon	-	3367	2	Intergenic	novelGene_51254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	273	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGGTAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1278103	1273580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1276018_1277173
906768	contig_2438_pilon	-	2124	6	Intergenic	novelGene_112021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8	20	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCGCAGCGGCGGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314525	305083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310766_311903_312081_312303_312405_312725_313115_313328
906770	contig_2100_pilon	-	1687	12	Intergenic	novelGene_50680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	838.285706438941	8	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	85	1338	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRNPFAN	1185495	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170287_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
906771	contig_5452_pilon	+	2419	3	Intergenic	novelGene_101028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529313	532642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_529487_530021_530058_530432
906772	contig_3122_pilon	-	3876	21	Intergenic	novelGene_64382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	135.106587552199	259	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	356	2041	270409	256447	TRUE	0	TTTCTGTGTTTGTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDGS	277586	249591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256451_257996_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_273623_273699_276264_276420_277512
906773	contig_1836_pilon	+	2628	1	Intergenic	novelGene_71042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTTGAAATATCAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691747	694375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_691700_694400
906774	contig_7695_pilon	-	2623	4	Intergenic	novelGene_41570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	94.3197870132361	9	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	15	1679	397040	389866	TRUE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGPAFCHPGSSVPHSVVSLLGCFVCCPAASPGCCLLPWPAGQCLRWGRSAVCSLPVHVPGGRCQRQQHPAAL	397054	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793_390079_390143_391259_396703
906775	contig_10437_pilon	-	2043	8	Intergenic	novelGene_38319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1155	1478	446992	443860	TRUE	30	CTCCAAGGCTTCCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHILSAGWVKVDATFVEEESWATCIHTNRHGPFVSHGLCQGNLTAIGKLSVLGTRGSSVFGVIPALSIHGFVGIGSFRIDAFVIDDVLESPGHEATVAAFIAVFFI	452167	431138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_431191_432086_432214_439689_439814_441716_441866_443746_443976_445308_445475_446950_447053_451073
906776	contig_11572_pilon	-	1960	5	Intergenic	novelGene_100060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGACTATCAAAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268835	263855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_265320_265590_265721_266166_266309_267010_267158_268758
906777	contig_5794_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_69737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCACCATCTAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398353	399381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_398400_399400
906778	contig_20889_pilon	-	3951	1	Intergenic	novelGene_127640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	872	1240	24267	23899	NA	10	CTGCGGGGCCCTGAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLHSGCNNGVKRRNDCEDGAGLGSASFCGTRGHHELELTRWHLTTTTTWYMHTIRMIHQKDSSCLRMMNFMAGSSLPFSVYVFQYLVQWTYLNSTPVVRNLISPKERATAAGWHKPLVPDY	25138	21187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_21200_25100
906779	contig_3747_pilon	+	2085	7	Intergenic	novelGene_24928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4393.17446601986	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	57	797	202422	203804	TRUE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202365	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204156_204261
906780	contig_13571_pilon	-	2628	3	Intergenic	novelGene_128122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTACCATTTTGCATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442743	244907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_244990_404168_405059_441087
906781	contig_14553_pilon	+	3652	2	Intergenic	novelGene_124985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTCCCGGACCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586	5402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_+_3744_3907
906782	contig_6227_pilon	-	2312	10	Intergenic	novelGene_49653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	55.0308555423991	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	415	972	442717	429379	FALSE	25	GTTTATGTTTTTTAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANSNSGLPCWGSPGLAAFLRLGNNRITAAGAEVLAQGLRDNVSLQFLGFWGNRVGDKGAQALAEALSNHRSLKWLSLVGNDIGSLGAQALALMLERNVVLEELCLEENHLHDEGVCFLAEGLKRNSSLKVLKLSNNCISCVGAEALLQALERNDTILEVWLRGNTFSPEEIETLSHKDTRLLL	446070	428038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_429452_431540_431625_436287_436372_438963_439048_439707_439792_442026_442111_442652_442851_443269_443354_443545_443630_445957
906783	contig_3270_pilon	+	955	7	Intergenic	novelGene_104488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_6	61.9661646025922	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	305	886	323665	338530	FALSE	25	CTGTCGAGTTTCAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGVLPECLTDGSDVVSDLEQEEMKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	323360	338599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_323672_324439_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337728_338428
906784	contig_13863_pilon	+	1801	10	Intergenic	novelGene_42002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_7	299.801045139384	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	795	1691	69446	81541	FALSE	30	TAGTAAACTTGGTAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	68023	81651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
906785	contig_3233_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_56507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81000	78883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_78900_81000
906786	contig_14142_pilon	-	3659	16	Intergenic	novelGene_120609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	148.739593473516	20	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	977	1324	591064	589263	TRUE	15	TTTGCTCTTTCCTTCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWNAGSSFRATSWYIRRSTRIL	592255	584554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585573_585651_585762_586213_586388_587233_587404_587508_587604_587720_588616_588714_589273_589369_589422_590500_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232_592067_592149
906787	contig_8978_pilon	-	7308	35	Intergenic	novelGene_49422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	6124	6423	435105	434462	TRUE	55	GTTTAACATAAAATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDILPIPNDIILPVQLGHHQEVFISQKISATALLKLPKVLYHSTFYHRFVFCLSQFEAIVKPTAIFRDTQHIVPQSGRPITPLSHSWFGICYFVYISS	527300	432742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_433377_433788_433999_434420_434640_434983_435191_436446_436626_436996_437128_437226_437333_437452_437627_441937_442113_442337_442438_444372_444581_444737_444879_445345_445478_446146_446228_467259_467413_467596_467717_467995_468179_468892_469067_470545_470761_471240_471407_472561_472772_476207_476319_476539_476637_477345_477525_503618_503686_504880_505006_505917_506009_506090_506177_516763_516828_517067_517188_520495_520620_521403_521510_521768_521923_522549_522726_525410
906788	contig_4732_pilon	+	2126	1	Intergenic	novelGene_75481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGACTGACTTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724451	726577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_724500_726600
906789	contig_10424_pilon	+	2525	13	Intergenic	novelGene_56803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	939	1256	310888	312522	TRUE	25	TCCCAGCTCAAATTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNDSVMQSTISSAASALLRQKTIASPISFFLGVNPRKISSNLSLCSSLSAPFLLGSSTKASVSCSSDIPCRYGFNGGGLQKDPFLNIRKSSVLHLVGESPCRIE	294293	314646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_294324_296962_297077_298980_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305802_307378_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312428_312505_312572_313426
906790	contig_1836_pilon	+	1479	2	Intergenic	novelGene_71087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	115	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	790	1089	1137914	1138213	FALSE	50	TTTTAAAGGACAAATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTNVAGSLFWPVEARRQGVLLNAVSLTLGCFPRRELWPLLRLEGCIHFSPSHSCLLYRQFLLAVHKPRIKLVFKSQRQNFDNKMGRDIIKTVKKKRR	1123358	1138603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_1123452_1137217
906791	contig_19098_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_65780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCAACCAGGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45303	46725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_45300_46700
906792	contig_6544_pilon	+	2939	1	Intergenic	novelGene_142110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTAGAAGAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308612	311551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_308600_311600
906793	contig_10861_pilon	-	2654	12	Intergenic	novelGene_39352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	141.682394200713	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	315	2315	1523683	1517702	FALSE	30	TATTTATATTACCCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRRRRRWRWTTKKTGKPLVADPTALTTDRKNTENSQSLRDLTKSLTVMRGKTRERDATGSHQLTLQTTNLLIMAMFSLLRLLPVLRCVWTTTDPQRRTTSPLFYTRSLEKATVMPFRTDWGSVKNDTWEHKSSHKEKRLLDAKGDEKSSAVSREKSHKAVSKEENRRPLSGDSTKEKPPPSGAKKEREREGSSIKKKSLPPLEVASDNHLKKPKHKDSEKTKSDKNKQGLDSLDIGKGAGDLVPKVKEKVSNSLKSQEGKLKTSSLDRKSAGSLPKAEEADMDDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGEKGLKKSDSKSTSKNLDSVRKLPKMNESKSEKLQPSGADSAKLKKVPTDILPVLPDLPLPMIQANYRPLPSFELLSSLQTKRKALSSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPYSVLEPVLERCTPEQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKTHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIRSAHANRPKGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPERVKIKSDLYATGSSHTPSSSGSSNSFNPSTEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSSVSYDPRKPAVKKIAPMMAKTIKAFKNRFSRR	1535559	1517362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1517764_1518732_1518915_1519500_1519613_1519942_1520124_1520947_1521046_1521152_1521309_1522064_1522180_1522550_1523256_1523293_1523743_1524776_1524884_1530182_1530240_1535468
906794	contig_11427_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_79032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838742	838071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_838100_838700
906795	contig_3529_pilon	+	2214	8	Intergenic	novelGene_105402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	101.692012007446	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGTGTTCTCTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790436	810494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806771_806844_807636_807746_808481_808551_809397
906796	contig_10235_pilon	+	3723	5	Intergenic	novelGene_46521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2840	3289	329626	331112	TRUE	25	GAGCTTCCATGATTCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENLMPQDLLLRKESIFLQREGRSPFWGIPQTLHKAAPVPISQDRHLNARTWSRGKHLSADVQGEVLGFAPGKAIVLAPHQHGGGHLAAELVSTEGVEKEHHSCLSIAHHCPQVQPIRGLPIIYDELCWGPRAALVNGPPQSDELGPHI	326506	331913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_328440_328536_328761_328943_330026_331062_331260_331626
906797	contig_2867_pilon	-	1285	8	Intergenic	novelGene_135207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.7508384374352	14	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	173	868	969848	965992	FALSE	5	ATGGCTGTCGTTGGCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPYLVEEAVSYNELDYVSVGLDQQTVNLVCTNRRKQFLLDTADVTLAEFFLASLKSAMIKGCREPPYPSILTDATMEKLALAKFVAQESKCEASTVTVRFYGLVHWEDPTDESLGPVPCHCSPPEGTITKEGVLHYKAGTSYLGKEHWKTCFVVLSNGILYQYPDRTDVIPLLSVNMGGEQCGGCRRSNTTDRPHAFQVVLADRPSLELSADSEAEMADWMQHLCQAVSKGVIPQGVAPSPCIPCCLVITDDRLFTCHEDCQTSFFRSLGTARLADISAACSGPIWGP	970946	965574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_966018_967584_967733_968064_968225_968818_968885_969260_969452_969743_969877_970468_970558_970891
906798	contig_5684_pilon	-	4760	12	Intergenic	novelGene_81002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_11	119.099097567204	54	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	253	1929	317651	301299	FALSE	65	CTCAGAAAAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRIGISCLLPASWHFSISPVGCLRILNTNLRQIIVISILAATVSLLYFSVVIIRNKYGRLSRDKKFQRYLARVTDIEATDTNNPNVNYGIVVDCGSSGSRIFVYCWPRHNGNPHDLLDIRQMRDKSRKPVVMKIKPGISEFATFPEKVSDYISPLLNFAAEHVPRAKHKETPLYILCTAGMRILPESQQKAILEDLLTDIPVHFDFLFSDSHAEVISGKQEGVYAWIGINFVLGRFEHIEDDDEAVVEVNVPGSESSEAIIRKRTAGILDMGGVSTQIAYEVPKTVSFASSQQEEIAKNLLAEFNLGCDVHQTEHVYRVYVATFLGFGGNAARQRYEDRIFANTAQKNRLLGKQTGLTPDTPYLDPCLPRDIKDEIQQNGQTMYLRGTGDFDLCRETIQPFMNKTNETQTSLSGIYQPPIHFQNSEFYGFSEFYYCTEDVLRMGGDYDAAKFTKAAKDYCATKWSILRERFDRGLYASHADLHRLKYQCFKSAWMFEVFHRGFSFPVNYKNLKTALQVYDKEVQWTLGAILYRTRFLPLRYGCEFGNGNQKKMLFSS	326623	298467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_301516_302452_302539_304368_304694_308102_308270_309973_310129_310411_310472_312163_312268_312910_313062_315407_315614_316151_316350_317643_317745_326464
906799	contig_9571_pilon	+	4863	1	Intergenic	novelGene_136282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACTCTAGAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442934	447797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_442900_447800
906800	scaffold_19766_pilon	-	3695	2	Intergenic	novelGene_34390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	3	479	813289	812813	TRUE	80	CGAACAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPWAREALLGALAGQGVAPGDVTLVVGTHGHSDHIGNLGLFPGAALLVSHDFCLPGGRYLPHGLSEERPLRLGPGLEVWATPGHAGQKDVSVVVAGTALGTVVVVGDVFERDGDEDSWQALSEDPVAQERSRKRILSAADVVVPGHGAPFRVVREAS	813291	809201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_811906_812300
906801	contig_13048_pilon	+	1626	2	Intergenic	novelGene_138917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATGTGTAGTGGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388809	535799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_388910_534273
906802	contig_5196_pilon	+	4077	11	Intergenic	novelGene_38691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	91.5155178098228	3	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	354	1349	302305	336267	FALSE	40	AGAATTCAAAATATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYLVAIFLSAIFLYYVLHCILWGTNVYWVPPVEMKRRNKIQPCLSKPAFASLLRYHQFHPFLCASDFKKIASLYGNDKFDLPYGTKTSAEYFRVALSKLQSCDLFDEFDNVPCKRCVVVGNGGVLKNKTLGEIIDSYDVIIRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKINSHGFWKKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKNAYHNVTAEQLFLKDIIDKNYVISLTQE	246919	338995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_247090_281606_281779_302293_302394_304819_304898_309130_309235_310808_310873_328015_328112_331045_331233_331341_331480_334900_335054_336180
906803	contig_1154_pilon	-	6729	5	Intergenic	novelGene_87190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	57.7364702765938	380	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	147	587	1062369	1059759	FALSE	55	TGATCCAGAAACAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTKGSFTYSSGEEYRGEWKEGRRHGFGQLIFADGGTYLGHFENGLFNGFGVLTFSDGSRYEGEFAQGKFNGVGVFIRQDNMTFEGEFKNGRVDGFGLLTFPDGSHGIPRNEGLFENNKLLRREKCSAVVQRAQSASKSARNLTA	1069329	1053616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_1059908_1060161_1060272_1060698_1060814_1062302_1062401_1069214
906804	contig_15327_pilon	-	858	4	Intergenic	novelGene_70691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2958.06336796372	479	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	109	576	901528	900840	FALSE	30	TCCAAGTGTTTAACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGARLVKRTWLGYLKTLICVPSTPRESPSCPKTSSWLAGYGGRELKWKAVFMVFCSKFCKILRFNL	902159	900557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901133_901281_901400_901536_902058
906805	contig_5571_pilon	+	2516	2	Intergenic	novelGene_75526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	206	784	210578	211156	TRUE	65	AAAAAAGAAAGAAATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQICGTTTKAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQGALIITGDWNAKVENKEGLAVGKYNPGDRNNVGECMIEFFNTNDFFIANTFFQQHKRPLYTWPSPDGIQRNQIDHIYEKRQWKSAISSVRTRPEADCGTDHQMLLCKFKLKLKKIRTSLQESKYDPEYIPPEFRDHLKNRFDLLTTNDQRAVEGHHT	210372	222405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_211781_221297
906806	contig_3018_pilon	+	3391	10	Intergenic	novelGene_78790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	767.564112414505	66	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	2619	3389	478971	499417	FALSE	45	CATTGAGAAAGATGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQHKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAVPSNEQDDDYCSEVKLKTAGLEEAAEAETENDNGEAEDQEEKEDAEKE	447644	499419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_450007_455281_455434_478866_478976_479810_479899_480125_480214_483780_483888_495536_495703_497048_497075_498505_498753_499373
906807	contig_5613_pilon	-	5391	2	Intergenic	novelGene_176653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	360	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	4875	5390	86613	86098	FALSE	55	CTAGAAAGAGCAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRAGVAILISDKIDFKTKSTTKHKEEHYLMIKGRIHHEDITIKTSTHTPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTAKKKLSKDTQDLKGTISQLDRIDMYRTLHPTAAKYTFFSNVHGTFSRIDHILGHRAMLNKVQNVVIIQSIFSDHNAIKVEIN	160298	86096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5613_pilon_-_87222_156032
906808	contig_1107_pilon	-	3643	2	Intergenic	novelGene_126609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	0	293	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1747	2070	1246877	1246554	FALSE	80	AACCAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQAGHLDCCPGCPGRTPCFCGVHSDDRAASPLHSDSLAIPVVLPCFLPFPQPLSHTHTPRYPIPRQLVDPEASRVAGVLMCMHRCTSVCPLEGLLQSQKWPRRFC	1252671	1244980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_1248502_1252549
906809	contig_5260_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_144360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCTTTAATTCACCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140984	139486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_139500_141000
906810	contig_14925_pilon	+	4794	2	Intergenic	novelGene_55364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTACACTTAGGTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116340	123547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_118879_121291
906811	contig_9471_pilon	+	3183	1	Intergenic	novelGene_21699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAGTATAAAGTCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66422	69605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_66400_69600
906812	contig_3818_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_99231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	303	912	1193	2104	407161	406250	NA	15	TTTAGCCCTATTTTCGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPALGRRCGCVLVELECMCKCEKLPGDVLCLVHQNKNQPAVPRRSNSSLKASLCTGSHLDVHKTVQWFRNMMGNAWALVAHKYDFKLSLPPSTTSCKLRLDYRSGRFLSISLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQLTSVNWPESFAACEHLFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLWELQDLSPGASCPVLTSYHFKTALMHLLLRLPLTDWEPGLLSQRLQDLLWFLGRGLQQRSLHHFLIGNTLLPLTIPIPKTFRDAEPVNLFQHLVLNPTAHSQAVEEFHNLLTRVKTLPCGPLAGTH	408353	405675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_405700_408400
906813	contig_9656_pilon	-	3078	10	Intergenic	novelGene_121884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	125.323581180878	71	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	264	1787	97308	70323	FALSE	50	GTTGCAAATATATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLPSFHLKDALTTIGEKVCVEVSSCLSLCGFTPFTTDQETVLKGQIQAVASPEDPIRRIMDSRILTFLETYLASGHQKPFPTVPGGLGPIQKELEEVAVKFVRLVNYNKMVFSPYYDAILSKSLVRS	100847	69031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_70526_71786_71960_73707_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_100608
906814	contig_3825_pilon	+	1967	4	Intergenic	novelGene_77951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1676	junction_3	685.131779700486	44	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	12984	13848	TRUE	25	GCCCAGGAGTTTTATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGKKAKGKKVAPAPAVVKKQEAKKVVNPLFEKRPKNFGIGQDIQPKRDLTRFVKWPRYIRLQRQRAILYKRLKVPPAINQFTQALDRQTGEFCGIKSAFGKVTVFALTVSKQAF	12982	15856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_14198_14390_15302_15498
906815	contig_13863_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_42056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCCTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354335	356425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_354300_356400
906816	contig_9363_pilon	+	1862	10	Intergenic	novelGene_6689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1291	1851	1277414	1278156	FALSE	5	CCCCTTCAGCTGGTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTLSLCSLGADLYISSSSFISFWLSWAFLSSARRPLRSSDSFLLASSTLAFSRSTLERAEAADGGPRPGPSRSRSSRLGLPSGSRPREEGPWAPRVRAWVSSSEGTSSSFLTDEAVMVAPGIEVISFLPSGAPPGPGPPSSFPGAGAPRLESSGWPRLGMEWVEPLAWARTLPISACTSRSFRL	1271732	1278167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1272009_1272690_1272941_1275151_1275259_1275342_1275478_1276489_1276614_1276692_1276911_1277097_1277255_1277390_1277503_1277593_1278021_1278111
906817	contig_50_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_122206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14925	16986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_14900_17000
906818	contig_501_pilon	-	3220	1	Intergenic	novelGene_134895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1613	1963	745267	744917	NA	20	TATCTCCCTTTCTACAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSKGVTLRAKMRLAQAMVFSIASYACESWTMNKEDRRKTDAFELHCWQRILNILPCPKKEQIYLGRSRARMLLRSKDGKTSSHLLWDVFSGGTSPSRRTLCLVKQRVNRREEGP	746879	743659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_743700_746900
906819	contig_12123_pilon	-	7196	9	Intergenic	novelGene_144606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGCACGTTCTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181799	133301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_133342_138305_138495_141346_141464_143150_143232_154194_154285_167972_174256_176520_176606_180995_181171_181663
906820	contig_8570_pilon	+	2491	24	Intergenic	novelGene_120139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	527.45233884613	330	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1299	1191	2489	366003	439552	FALSE	30	GTGAGAGCTTATGATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLTQNVGLLGLLKWRMKPQLLQENLEKLKIVDGEEVVKFLQDTLDALFNIMMEHSQSNEYDILVFDALIYIIGLIADRKFQHFNTVLEAYIQQHFSATLAYKKLMTVLKTYLDTSSRGEQCEPILRTLKALEYVFKFIVRSRTLFSQLYEGKEQMEFEESMRRLFESINNLMKSQYKTTILLQVAALKYIPSVLHDVETVFDAKLL	284283	439554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594_361731_364110_364150_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530_379715_379853_379952_382407_382498_383493_383595_384451_384587_425585_425695_439483
906821	contig_15720_pilon	-	1444	2	Intergenic	novelGene_41925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	872	1327	307437	306982	TRUE	40	ACAGAATGATAAAGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	308308	280525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_280538_306876
906822	contig_6286_pilon	+	2452	4	Intergenic	novelGene_165649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	13	junction_1	63.0678646820673	199	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	75	824	116810	123785	FALSE	75	AACCAAAAAAAAGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWRRRIQENPGPWGELATDNIILTMPTVNLRTLENPEPLLRLWDEVMAAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQISVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGAVHELGRNQQRQEWEFPPHTIEATCNLWCVYVHETVLGIPRGRANIALWPPVREKRVRIYLGKGPNIKNWNAWTALETYLQLQEAFGWEPFIRLFTEYRNQTNLPTDNVDKMNLWVKMFSHQVQKNLVPFFEAWAWPIQKEVATSLAYLPEWKENIMKLYLLTQMPH	116735	125413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_116961_118026_118365_120574_120826_123775
906823	contig_14829_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_163821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATGCCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126109	126750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_126100_126800
906824	SIRV6	+	1383	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	127	18	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	282	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	10	ATGGGGTTTGCCGATGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
906825	contig_6576_pilon	-	1769	4	Intergenic	novelGene_42280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_2	498.939096706424	55	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	466	1104	329188	323781	FALSE	65	GTGGTAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLVSCLQFFTSRISLESVVATCPLLRS	329653	323115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_325444_325538_326528_326687_329121
906826	contig_8866_pilon	-	1361	1	Intergenic	novelGene_77854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	612	971	657272	656913	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLMFSFLPVLGALSSALASGGSLPITSLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSGPVASLHATSTSAESIQNSLFTVASASGAASTTTTASKAQ	657883	656522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_656500_657900
906827	contig_6919_pilon	+	2390	2	Intergenic	novelGene_163982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55650	58094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_55923_55976
906828	contig_12079_pilon	-	2812	5	Intergenic	novelGene_67503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	385.640052380455	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	561	2042	864606	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	868550	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_867247_867410_868246
906829	contig_14976_pilon	-	2621	2	Intergenic	novelGene_139962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	293	junction_1	0	636	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	1413	2621	28944	2771	FALSE	45	AATTTTAGAAATACAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDYGFGVLVQSNTGNKSAFPVRFHPHLQPPHHHQNATPSPAAFINNNTAANGSSAGSAWLFPAPATHNIQDEILGSEKAKSQQQEQQDPLEKQQLSPSPGQEAGILPETEKAKSEENQGDNSSENGNGKEKIRIESPVLTGFDYQEATGLGTSTQPLTSSASSLTGFSNWSAAIAPSSSTIINEDASFFHQGGVPAASANNGALLFQNFPHHVSPGFGGSFSPQIGPLSQHHPHHPHFQHHHSQHQQQRRSPASPHPPPFTHRNAAFNQLPHLANNLNKPASPWSSYQSPSPTPSSSWSPGGGGYGGWGGSQGRDHRRGLNGGITPLNSISPLKKNFASNHIQLQKYARPSSAFAPKSWMEDSLNRADNIFPFPDRPRTFDMHSLESSLIDIMRAENDSIKG	30356	2770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_2855_27819
906830	contig_1372_pilon	+	2048	12	Intergenic	novelGene_140516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	32.4946276551414	156	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	405	1568	457535	484809	FALSE	20	ACAGTTATTTCATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQGMKFDPEITVLQTMLAECQEKLKKLSWLESRVECLEEKMKGKVMVNEKTWTNLLSRVTLLETEMLLLKKNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451710	485289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_454521_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_470835_471043_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
906831	contig_9321_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_174714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	385	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGAATGTCAGAGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13408	15719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_13400_15700
906832	contig_5649_pilon	+	1863	2	Intergenic	novelGene_82439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	518	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	303	602	1485115	1485414	FALSE	40	TGCCCATAAAGAAATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTADCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTFQPGIGQPHKTKRD	1483791	1486675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1483800_1484820
906833	contig_19816_pilon	-	1917	2	Intergenic	novelGene_156505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	23	373	125833	125483	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	125855	123037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123308_124208
906834	contig_13421_pilon	+	4974	11	Intergenic	novelGene_166801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3653	3961	158531	162121	TRUE	15	CAGGCTGGAGGTGGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEAVELKEEPASALVESLSGRVDDGEVIAGTAPNHQIEWAPLLDMLLGDAADVADVHDLPLVPHHAHCDGVLTHLRRNVAVHLDAQVLQHQKPCSDSIEQG	146687	164251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_149959_150951_151072_152113_152183_157256_157344_158425_158575_158764_158856_159814_159960_162092_162178_162446_162629_162834_162955_163596
906835	contig_1734_pilon	-	1424	5	Intergenic	novelGene_164382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGCTTTGGTATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	879806	607425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_607878_680188_680475_713433_713785_724485_724494_879479
906837	contig_5779_pilon	+	4505	3	Intergenic	novelGene_106417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGAGAATAGCAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53239	347487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_56989_166802_166810_346738
906838	contig_6028_pilon	-	2055	11	Intergenic	novelGene_156577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	158.377050105121	287	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	450	1760	332055	309678	FALSE	25	TTTATAGACGTCTTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	353991	309382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353594
906839	contig_5954_pilon	-	3347	3	Intergenic	novelGene_28490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	845	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1667	2422	365425	361098	FALSE	15	GCTTTTGGTGTCTAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGMVGGVGAGRGRSLVPPLGGWDQVRGQVGGQLMALQLDLDEVVGQGKLLVVQQPVLVHVGQLPDLPQHRVGQLGLDHLFLGVGPRDLAVDGREGIEDLIIGGLVLAHHPLNIVDALAGPLAVAVPKGPVHGAVEGTALHSLRWHLGLLLAHHHHQPGNVVGQHVVHRVQQLGFQGLELAKVLRLEEFLHLAEVREVAGGDLMLPLNLLVDLTQVVHQLLLFALLTKDVGHLLLEGTDDVGGLPWPAAPA	367091	360172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_361128_364261_364418_364855
906840	contig_11505_pilon	-	3422	1	Intergenic	novelGene_140920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	885	1349	55467	55003	NA	40	GGAATAAATCTAACCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKWSAHQEDITIINIYTPSDRAPKYTKQTLTALKREIDSCTIIIGDFNTPLTVKGRTSRKKLNKVTENLSATINQLDLIDITEHSTQQQQSIHSFPTHVEHSPEWTTLGHRASLTKIQSIEIIQSVFSDHDATKIGVSNRNSKGEKIKYMETE	56351	52929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_52900_56400
906841	contig_7702_pilon	+	5901	5	Intergenic	novelGene_177297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2302	2790	88463	88951	TRUE	40	TACCCTTCGAAAGAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKQTVTVLKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSKKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNAHGAFSRIDHILGHKASLNKIQSVEILQSIFSYHKAIKVEISNRKTKGKKSNPWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGRKKFIESDKNENISY	86013	260351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_+_87063_87167_87495_87537_89024_89069_90950_259192
906842	contig_18799_pilon	+	2633	7	Intergenic	novelGene_171414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	104.797291101546	3	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	720	2615	53724	74299	FALSE	50	GGGAAAAGCTACGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRIPADPEAGGIGRVVNGAFMVLKGHRSIVNQVRFNPHTYMICSSGVEKIIKIWSPYKQPGCTGDLDGRIEDDSRCLYTHEEYISLVLNSGSGLSHDYANQSVQEDPRMMAFFDSLVRREIEGWSSDSDSDLSESTILQLHAGVSERSGYTDSESSASLPRSPPPTVDESADNAFHLGPLRVTTTNTVASTPPPPTCEDAASRQQRLSALRRYQDKRLLALSNESDSEENACEVELDTDLFPRPRSPSPEDESSSSSSSSSSEDEEELNERRASTRQRNAMRRRQKTPREERPSAPTKSTSTYIGEDNYDYPQIKVDDLSSSPASSPERSTSTLEIQPSRASPTSDIESVERKIYKAYKWLRYSYISYSNNKDGETSLVTGEADDGRAGTSRKDNPIPSSSKEVCLNTAVAKDAFKEGTSTRNPSNGPGHEHSSHTWAEVPEGTSQDTNNSGSVEHSFETKKLNGKALSKALSSRSEESPSPPVPKASGSTPSSGSGNCPRTQSDDNEERSLETICANHNNGRLHPRPLHPHNNGQNFGELEMMAYSSPGHSDTDHDNLSLAGTLLHRDCCGSEMASETPSAGMREDPTDPPATDSSSRGIHGHSGLKRHRVELEDGDPENSSSEKKLKT	9152	74317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_9486_11208_11341_35285_35504_53687_53755_65757_65886_72526_73603_73638
906843	contig_6102_pilon	-	2371	4	Intergenic	novelGene_32342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	481	junction_2	203.480274774294	62	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTTTTCAATGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688901	1685789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226
906844	contig_13044_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_99994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	21	66	303	368	170400	170465	NA	40	CCTCTACACTAACAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNIKPKTIKFTEEKIGPTVEALIHGIKKIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDWENIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKANNPIKKWAKEMSRHFTKEDIQMANRHMRKCS	170097	172679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_170100_172700
906845	contig_11677_pilon	-	7112	1	Intergenic	novelGene_85871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATTTAAGAAAGCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103227	96115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_96100_103200
906846	contig_9848_pilon	+	3003	3	Intergenic	novelGene_79928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCGCAGACGGCGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69188	205779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_71512_203297_203481_205282
906847	contig_4131_pilon	+	3172	3	Intergenic	novelGene_127835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	10	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	459	1001	87286	87828	FALSE	35	CTTTCTGTGAAAATGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPQQEFLCPQCRAPFQMASLRPNKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKVSMGARKARQGLVSCCSSRPEIVQSETQDYDPEMQLSLCHSSEK	85371	89999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85845_87139
906848	contig_7695_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_41591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	35	400	476317	476682	NA	25	ATTTAAAGTTATTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSAKNRRRFLMKAPEGTPRKDKNLPNVIISEKRNIRATAHQVHVLPYPFTHHQQFERTIQTPVGSTWNTQRAFQKLTSPKVVTKPGHIIKPIEAEDVGYRSSSRSDLSVVQKNPKRLSIRHKRQLKKNSVD	476282	478989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_476300_479000
906849	contig_9345_pilon	-	3157	21	Intergenic	novelGene_24561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	235.868029838721	6	105	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	142	2718	919846	881092	FALSE	5	TGGCATCCCCCTTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQESPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEVEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDTHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRIMEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRERKSRLSSTSSGAVLYGQPLLVSVPKHKLTLEFLYQAVCERISRYIKQPLPDEFGSSPLELGACNGSRGSCEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEEELGSDPSETIQKKVKGQPCPKRLFTFSVVNSYGTADINSLATDGKLLKLNSRSTLAIDWDSETRNLYYDEQESETCEKHVSMLQPQKKKKTSVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPVRALNMSEFVCDLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFSKTPSPITLPGSSDGGMRPSSSQQGLGDDEACSMDTN	921989	880652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053_890270_893010_893100_893734_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023_900183_902070_902245_905275_905394_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
906850	contig_15087_pilon	+	1662	1	Intergenic	novelGene_37166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	87	308	84659	84880	NA	75	CAAAAAAAAACAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQKGLAQREELGNRWSQREGRQSLSYRGMRAGRECPKMPASATPSSSSLRTKAGEGMRLAQGPTNSSDTGDANPGLLKASVHSLHHHTTVPQSSLEENRHV	84572	86234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_84600_86200
906851	contig_2726_pilon	-	1917	3	Intergenic	novelGene_165900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACTACTTAGCAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334153	181171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_182037_307865_307965_333200
906852	contig_3155_pilon	+	2196	2	Intergenic	novelGene_26420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1141	junction_1	0	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	553	879	259780	261211	FALSE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	259227	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259978_261082
906853	contig_8050_pilon	+	5441	23	Intergenic	novelGene_114818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	450	junction_22	366.560752296215	528	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1035	3108	128	3235	294062	361371	FALSE	30	GGCAGGCATACATTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGNCQGCEEENEGTLKKLIVRLNNVQEGKQIQTLVQILEDMLVFTYADHASKLFQGKNIHVPLLIVLDSYIRVACVQQVGWSLLCKLIEICPDTMQNLIGPQDVGHDWEVLGVHQLILKLLTVHNANVNLSIVGLKALDLLLTSGKITLLILDEESDIFLLIFDAMRMFPANDEVQKLGCKALHVLFERVSEEQLTEFIENKDYMILLTALKNFKDEEEIVLHVLHCLHSLAIPCNNVEVLMSGNVRCYNIVVEAMKAFPINEKIQEISCCLLHRLTLGNFFNILVLNEVHTFVVKAVKQYSENATLQISALSCLALLTETIFLNQDLEEKNENQESDTEEEEDKLFWLEACYKALTWHRKNKHVQEAACWALNNLLMYQNNLHEKIGDEDGQFPAHREVMLSMLMHSSSKEVFQASANALSTLLEQNVNFRKILLSKGIYLNVLELMQKHIYSPEVAESGCKMLNHLFEGSNTALDTMAAVAPKIITVMKSHETSLSVQLEALRAILHFIVPGMPEESREDTESQHKLNMVKKQCFWNDIHKLVLAALNRFIGNPGIQKCGLKVISSVAHFPDALEILSLEGAIDSVLHTLQMYPDDQEIQCLGLSLIGCLIMKKNLCVGTGHLLAKILVSSLQRFKDVAEVQMNGFQAILAILELSESFSKLLMHHSFDSVIFCHMSSSINEQKNQQFLNLCCKCFAKLAMDDELKSVMLERACDQNNSIMVECLLLLGADANQAKESTSLICQVCEKESSPKLVELLLNSGPREQDVRKALTISIGKGDSQIISLLLQRLALDLANNSICLGGFCMGKIEPSWLGPLFPDKTSNLRKQTNIGSTLARMVLRYQMKSAGEEGAASGSDGNFSEDVLVKFDEWTFIPDSSMDCVFGQSDDLDSEGSEGSFLVKKKSNSISVGEFYRDPALQHCSPNLQRHSNSLGPIFDQEDLLKRRRKILSSDDSLRSSKLQSHMRNSDSTSSLASEREYITSLDLSSNELRDIDALSQKCCISGHLEHLEKLELHQNALSSFPQQLCEVI	293934	363577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_294216_294460_294547_300021_300132_305551_305641_308803_308939_312623_312759_315912_316045_320805_320926_321619_321763_321858_321939_323425_323533_327139_327270_330653_330779_335562_335676_341428_341574_341712_341853_343856_343986_344062_344234_350645_350905_353778_353968_359355_359475_360574_360645_361144
906854	contig_11896_pilon	-	2013	2	Intergenic	novelGene_88040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	153	359	166222	165927	FALSE	30	ACAGGGTAGAACTGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVTGYKICTQKPVIFLYTHNEQSKKGIKKTIQFTIASKRIKYIGISLNKEMQNLYTETLLKEVKDLSKWKDILCSWIGKCNIVKMTVLPKAVYRIAITVLEKLGDSHFPILKLTTKLQ	166374	164272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_166003_166091
906855	contig_11816_pilon	+	3235	3	Intergenic	novelGene_98461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACATGTTGGATTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407452	485239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_410155_418862_419322_485165
906856	contig_8174_pilon	+	1829	6	Intergenic	novelGene_160051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	232.811855368235	5	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	666	1214	275345	294744	FALSE	50	TTTTATAAGAACAAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNAASISSASPSSSRSPSLSPNSPLPSEHRSLFLEAACHDSDSLEPLNLSSGSKTKSPSLPPKAKKPKGLEISAPPLVLSGTDIGSIALNSPALPSGSLTPAFFTAQTPNGLLLTPSPLLSSIHFWSSLSPVAPLSPARLQGPNTLFQFPTLLNGHMPVPIPSLDRAASPVLLSSSSQKS	240804	295359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_240870_246359_246569_256625_256780_275107_275672_291256_291380_294645
906857	contig_165_pilon	+	4682	2	Intergenic	novelGene_117074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	451	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2986	3459	182083	182556	FALSE	5	CTCTGGTTTGTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSQQLGLVPFLLLEGHLVFYFGRLLDSSCPVFVNVLILSAVFGAFSGYFPCLLIVDLFCPAFLLYLVMSEQVGCAFFIVCLSVGMILFTSFSNGQGQSLGYGTAGQVQLKESCWDRFFSGTYQG	178969	183779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_181095_181222
906858	contig_13901_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_146666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCACTAGCAGTGAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272524	271287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_271300_272500
906859	contig_1143_pilon	-	3903	17	Intergenic	novelGene_86601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_16	135.613882032777	172	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	286	2406	249983	207933	FALSE	40	GACCTAGCAAATTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKDASWELEENAYQELLQHYERCDVRRCRCKEGREYNAPNSKWEIKRCQCCGSSGTHLACSSLRSWEQNWECLECRSIIYNSGDFQKAKKHALPNSNSMGINDCLLEESSPKLLKQSPGAQSKDLLRQGSKFRREISTILIEIGFQIKKKPKKLYINKANIWNSALDGLKNQNFNPSFTIEVAYINENDKFGREHPGSKQEFLSLLMQHLENSSLFEGSLSKNLSLNSQALKENLYYEAGKMLAISLVHGGPSPGFFSKTLFNCLAYGPENTQPILDDVSDFDVVQVIIRINTATNMDDLNSAINECYNYLKLIGCLKVTRTLSDKYHLVNDILFYHVIKRVQAPFESFKQGLKTLGVLEKIQTYPEAFCSILCHKPEAPSAKVLSDLFTVHTLSDVQALGFWNTYLQTVEGGKSATTMEDILIFATGCSSIPPTGFKPTPSIECLHMDFPIGNKCNNCLALPMTSTYKEFQENMDFAIRNTLRLEKEESSHYTER	295029	206435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_208190_208911_209103_214458_214632_224261_224444_226132_226441_228833_228967_229069_229195_231297_231415_232073_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_254862_254932_255613_255726_294929
906860	contig_4105_pilon	-	3830	15	Intergenic	novelGene_21498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	189	junction_2	697.253332142395	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	36	1859	137447	100151	FALSE	30	CTTTAAAGTTCATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEESLGNRRIRVDVADQAQDKDRDDRSFGRDRNRDSDKTDTDWRARPATDSFDDYPPRRGDDSFGDKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137482	98179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
906861	contig_2917_pilon	-	2490	1	Intergenic	novelGene_147595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTAAAATGAATCTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107850	105360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_105400_107800
906862	contig_16098_pilon	-	2196	8	Intergenic	novelGene_46015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_6	1133.04684053976	6	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	961	2046	350111	348441	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDLPPPFSCQEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354097	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350643_350765_350889_352152_352352_353990
906863	contig_17413_pilon	+	5048	1	Intergenic	novelGene_177200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	591	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAGTTTAAGGGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22602	27650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17413_pilon_+_22600_27600
906864	contig_12948_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_126231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	89	439	372558	372208	NA	60	ACATGCTAATCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIAHTSKILLKIIQKRLQQNINRELPEIQARIRGRSGTRDITADVRWIQAESREYQKDVYLCFIDYAKAFSCVDHNKLWITLQRMGIPKHLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQGHTV	372646	370756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_370800_372600
906865	contig_5788_pilon	+	2297	2	Intergenic	novelGene_178564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTTGGATGCCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86022	131109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_+_87015_129804
906866	contig_7078_pilon	+	2707	8	Intergenic	novelGene_130112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	141.850740756124	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	814	2442	264	2705	182358	244400	FALSE	25	CAGTCCTGCAGTCCAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNSILWKKKVSQMQQTVKVVCQKDDLPADQTVLPGSSDREGNAQSCWEDDGKERQEILGPEAQADEARCTVKDDECDSDAENEQNRDPNVEEFLQQQDTAVIYPEAPEEDQRQGTPEAGGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLMPVNGRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFSGGGPLQATSSPQGVVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQASLASKEQETISASSIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENLVPTNGCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVDDSTCLLCDGRPGDPNALPELKHHDLKQPARPPQLPAAEAEKPESSVSSGTGDGSLSPSQPPLKNLLSLLKAYYALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSELSSPEPGQVNIPAENSDQPPSTNADEPQDSTINPQSPLKMSKSPVLPVGSTVSGSRGRTPSPSPLNLSSSRNAQGYVYTADSAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSSITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTT	29759	244402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_29835_106254_106398_182312_182515_219236_219297_227970_228133_231995_232199_236108_236215_242646
906867	contig_5479_pilon	+	3015	1	Intergenic	novelGene_133623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATATCTGTTATGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444932	447947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_444900_447900
906868	contig_9297_pilon	-	8244	25	Intergenic	novelGene_69853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	114	junction_17	121.682411937798	439	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1411	4236	152	4387	869848	815535	FALSE	10	TCATTGGGTTTTATGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAECCQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNCIMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVEDEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVDSNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSLRWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQLAMTGSEEGDPRTKGSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPMSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNFMKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPQAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNMLMDQHMDHEVSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKLRKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGAGSVLLDPCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSGISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEVTHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAVVRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHILTPSEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEDRELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSEGAMANYESTEVMGDGESAHDSPRDETLQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIHDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRMCSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEFIKTIDDRK	888917	811677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_815676_817041_817240_818233_818307_820253_820468_820936_821125_821982_822143_822472_822580_824360_824491_825846_825970_830434_830523_846690_847062_847191_847270_850644_850765_851230_851366_852427_852569_854324_854499_856635_856762_858605_858673_860827_860989_863937_864128_864267_864403_865293_865381_866832_867677_869663_869882_888799
906869	contig_6576_pilon	+	2676	3	Intergenic	novelGene_42247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	553	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGCAAGCTAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299094	485609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_301544_474181_474281_485481
906870	contig_2894_pilon	-	3601	10	Intergenic	novelGene_86546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.6525640409779	337	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	65	1582	301130	292620	TRUE	15	CCAGCTTAGGCCCTCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGITFHSSYRAPLQLLSPETMALGTPRRGLLMLLMALGLTHSDPVRPSRGPLVTCTCENPHCRGPTCQGAWCTVVLVQEEGRHPQVHRGCGNLHQELCRGRPTEFVNHYCCYSPLCNYNVSLVLKATRTPPEQPQVDGQLPLVLGPVLALLALVALGALGLWHVRRRQEKHRGLHSELGESSIILKASEQGDSMLRDLLDSDCTTGSGSGLPFLVQRTVARQVALVECVGKGRYGEVWRGLWHGESVAVKIFSSRDEQSWFRETEIYNTVLLRHDNILGFIASDMTSRNSSTQLWLITHYHEHGSLYDFLQRQTLEPQLALKLAVSAACGLAHLHVEIFGTQGKPAIAHRDLKSRNVLVKSNLQCCIADLGLAVMHSQGSDYLDIGNNPRVGTKRYMAPEVLDEQIRTDCFESYKWTDIWAFGLVLWEITRRTVVNGIVEDYRPPFYDAVPNDPSFEDMKKVVCIDQQTPTIPNRLAADPVLSGLAQMMRECWYPNPSARLTALRIKKTLQKLSHSPLEEPKVIH	301194	290355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_291903_292147_292758_294323_294455_297454_297653_298352_298629_298942_299090_299450_299551_299888_300101_300285_300538_301066
906871	contig_10074_pilon	+	373	4	Intergenic	novelGene_57079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	594	junction_3	1721.06071944019	10	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	27	371	27966	36437	FALSE	40	GTAGGAAGATGTCTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLADHAARQLLDFSQKLDINLLDNVVNCLYHGEGAQQRMAQEVLTHLKEHPDAWTRVDTILEFSQNMNTKEEKGCLPVQLTQLGFDGRPPQVLWTTNFGKCDKNKVEDTSQEPV	27939	36439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_28074_32708_32811_33925_33990_36366
906872	contig_3584_pilon	+	2219	1	Intergenic	novelGene_108135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	960	1268	308531	308839	NA	15	TGTATATTTGTACTTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVRNLLALCWEIFTLLLPWGRGGLPHYAIIKQASGSLQLSVALSTLGSIFGPEAWSGPRMTLALEMLESTALSPYLQTMHSAWGRRRDGAVRPAEPPQQEQ	307571	309790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_307600_309800
906873	contig_16775_pilon	-	3622	11	Intergenic	novelGene_107803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_7	56.495044030428	99	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	19	942	235740	209272	FALSE	30	GGAATTGACTCAGTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPTPPLFSLPEARTRFTKSTREALNNKNIKPLLSTFSQLPGSENEKKCTLDQAFRGVLEEEIINHSSCENVLAIISLAIGGVTEGICTASTPFVLLGDVLDCLPLDQCDTIFTFVEKNVATWKSNTFYSAGKNYLLRMCNDLLRRLSKSQNTVFCGRIQLFLARLFPLSEKSGLNLQSQFNLENVTVFNTNEQESTLGQKHTEDRDEGMDVEEGEMGDDEAPTTCSIPIDYNLYRKFWSLQDYFRNPVQCYEKISWKTFLKYSEEVLAVFKSYKLDDTQASRKKMEELKTGGEHVYFAKFLTSEKV	235758	206591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_209410_210581_210691_217036_217111_219402_219486_227461_227558_227944_227994_228445_228565_231987_232055_233245_233307_233399_233474_235686
906874	contig_19402_pilon	-	4507	17	Intergenic	novelGene_80759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23926_36968_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_102161_102225_107509_107689_138560_138661_139813_139895_142955_143058_143796_145888_146409
906875	contig_9687_pilon	+	4592	6	Intergenic	novelGene_172729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.2534428245464	271	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	256	954	78766	111266	FALSE	20	ATCTTGAACATTTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFKPGFRKNTCCPQNQSSERDKDRLDRCFAEDRGIRTNVVAGVAGQLSQSADSSVSSDAAAGTGESTLEKTNVPCGDADRKVDFRMEGDIPRNESSDSALGDSDDDTCASAAPSLGHRSDRTEESLEVELPLPRSQSFSNQSVRNFGRSLLAGYCPTYMPDLVLHGTSNDEKLKQCLMADLLHTVHHPVLDEPIAEAVCIVADTEKWSVQVVTSQRKVADGVKLGQDVLVSSQVSSLLQAILQLYKLHFPADFCVMHLEDRLQEMYFKSKMLSEYLRGHTRVHVKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL	78417	114904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_78632_78724_78912_80008_80166_104516_104718_108429_108546_111187
906877	contig_11720_pilon	-	7526	2	Intergenic	novelGene_43767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	582	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAATGTGATTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78061	53671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_54439_71302
906878	contig_12869_pilon	+	2831	2	Intergenic	novelGene_75356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1050	1442	351017	366485	FALSE	55	CAAAATTCACCATAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEMLLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFFSVFSMNLSNFFSCLSAFCLSSWKIPKKIDKIMENRQNRQKHSQNQGKHRQSNRRIQENNTRAKNQNKYTIRNHTKTATRNPKDKQ	349967	367874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_351228_366303
906879	contig_15952_pilon	-	4447	7	Intergenic	novelGene_154052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	312	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	3313	3831	189087	188005	TRUE	25	ACCTCAGCCTCTAGCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLKTFLLLTPPGIVEMNTAATGQGQDLAIRGECQAAQHGACLFKAACPQQIGVLLLLVFHICVPQFPCTILGDRGHPPGVIGESEEVDSCRVALQFKGSHDLLEVPFFSKADFPNFYIWGKTTRGHKPATWGYGSVCIVHLVGVDGRQYSTFQIPDEDSRVTGSSHDELS	192399	184533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_184679_186381_186513_186948_187130_187595_187755_188004_188132_188478_188634_188850
906880	contig_14513_pilon	-	502	2	Intergenic	novelGene_70398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGGCAGTGCGCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19054	11671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11955_18835
906881	contig_10904_pilon	+	1861	2	Intergenic	novelGene_22662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3141	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCAGAACTTTGGAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530951	535187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531362_533736
906882	SIRV6	+	1150	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	154	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	11690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
906883	contig_9903_pilon	-	1879	7	Intergenic	novelGene_172008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	81.7740790226341	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCGCAGCCCTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106271	81398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98162_98328_101465_101531_106177
906884	contig_14536_pilon	+	3749	4	Intergenic	novelGene_69289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTGTTTTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82288	208288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_84784_101561_102013_177788_178043_207739
906885	contig_9548_pilon	+	3249	1	Intergenic	novelGene_141092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAATAAATTTGAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323532	326781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_+_323500_326800
906886	SIRV6	+	756	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-32	577	11	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGAAGTTGTTCAACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	10754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
906887	contig_10732_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_114709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACATATATATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126714	129477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_126700_129500
906888	contig_8210_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_30235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2832	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTTTAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30136	22975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_24081_29712
906889	contig_2730_pilon	+	1995	5	Intergenic	novelGene_135366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.650551831383	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291631	392479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685_391887_391953
906890	contig_16045_pilon	+	597	1	Intergenic	novelGene_130863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGGCGCGGCGGGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359847	360444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_+_359800_360400
906891	contig_18967_pilon	-	3074	1	Intergenic	novelGene_165320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72556	69482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_-_69500_72600
906892	contig_1450_pilon	-	2011	2	Intergenic	novelGene_27436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTCACATCCCCGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424786	420101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_421057_423730
906893	SIRV3	-	1383	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	1889	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4269	37	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACTGTAACAAAGTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	6870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
906894	contig_935_pilon	+	2585	2	Intergenic	novelGene_45534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1691	2053	263649	264413	FALSE	60	AAGCTGAAAAGAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLKLPEAEYKRLIYRTLQEIRKEINQNAEHAIEEIKKIREEHNDKCNRPQESTERQQSEIQKINNKISELDNSVESHLQRRVNKNKLELLSRNHTGKKAME	261958	264945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_263932_264333
906895	contig_6842_pilon	+	5401	4	Intergenic	novelGene_130787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.2593655651606	280	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTTTCTAAAATTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385272	1396161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1385327_1388526_1388596_1389248_1389322_1390956
906896	contig_10904_pilon	-	4251	9	Intergenic	novelGene_22512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_1	337.245251078499	204	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	82	774	362437	352112	TRUE	25	AACACCATCTCCTTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSREDILSNTNGKTEGISVEEAEGAAMISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362518	345615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354693_354962_354999_362403
906897	contig_4759_pilon	+	2502	8	Intergenic	novelGene_106317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	318.329055782067	450	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	119	1147	464361	499784	FALSE	15	TTAAGTGAGTTCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNIKIFSGSSHQDLSQKIADRLGLELGKVVTKKFSNQETCVEIGESVRGEDVYIVQSGCGEINDNLMELLIMINACKIASASRVTAVIPCFPYARQDKKDKSRAPISAKLVANMLSVAGADHIITMDLHASQIQGFFDIPVDNLYAEPAVLKWIRENISEWKNCTIVSPDAGGAKSRKFQAWCPEATHTGFNSEHPLFGRVTSIADRLNVDFALIHKERKKANEVDRMVLVGDVKDRVAILVDDMADTCGTICHAADKLLSAGATRVYAILTHGIFSGPAISRINNACFEAVVVTNTIPQEDKMKHCSKIQVIDISMILAEAIRRTHNGESVSYLFSHVPL	464242	501139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_464483_473999_474184_475323_475423_485950_486076_493372_493399_494105_494326_498625_498786_499691
906898	contig_9527_pilon	+	3797	7	Intergenic	novelGene_134075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	373	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1104	1604	490691	492078	FALSE	25	CGGGGTGACAGCGTAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTSSPNPRDMKRERWPWPEPTSTTWVQPVRSLSFFTNSPSLRISCCFLGLTCFRNRGVSRELWLGFSRNSEGVWNPGVRVKARAEAVDFRASRVSGHTDLYLTTSPSPGIPSSSVASCGGFSLSSASCHEQGSVLHRLSVKNSCRRWEEAISRLLPVLFFPPHL	488329	494271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_488671_489069_489256_489661_490149_490601_490743_490975_491040_491533_491723_491882
906899	contig_20165_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_54484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	878	1261	108439	108822	NA	50	TACCTAAACTAACACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANDTQKRAGVAILISDKIDFQVKSTAKDKERDYVTIKGPVHQEAITTINIYTLNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNIPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNATINQLDLMDIYRTLH	107561	109562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_107600_109600
906900	scaffold_13505_pilon	-	1976	8	Intergenic	novelGene_111512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	435.116357883681	27	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	43	1332	603235	589159	FALSE	5	CTCCGTGTCCATTCTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEVSVDHECAGPTGPWKTRTCPTPCLAII	603277	588514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
906901	contig_17270_pilon	+	3241	30	Intergenic	novelGene_67222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_29	202.548031619566	200	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	536	2455	65291	120028	FALSE	90	AAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILENYDSLRVQNIERNGNIIYTYKDDKGNVFFGLYDRQTRQNEHLYTFETDFQVVSCSVNSERTLLAVSLVQATKEGRRNEHQPESKCLTLLVEIHPINNVKVLKAVDSCIWAQFLYPHVESHPLSENRLLLISEEKYIEQFHIQVTQEDGDKVVIKNSGHLPRDRVAEDFVWAQWDMLEQRLYYIDLKNSRTILKCIQFNADENFTLMFEASLDISLKDSGFKLVNFGCDYLQDQEKFSKHLSLCVFTNKTGSLCVCYSPKFDSGKQITYSVFYFHKGHSKTFTAALGSADSHVTKGITFLNLDCYVAVYLPGHFFHLLNIQHPDLICHSLFLTGKNEMIDMLPHSPLQSLSGSMVLDWNSGKLYRALLNQSYLLQLLWNTPLDCERMAVLHCVLSCGRDSRFLEAQIIQWISENISACHSFDLIQEFIIASSYWSICPETSNVDKLLPYSSVITWNTEIPGITLVTEEIALPLMKVHSFKGYWEKLNYNLEYVKYAKPHLHYNNSVIRKEWNNLISEEKTGKRRSTAYVRNILDNAMKVIFNLEARSLEPRLTPLFQEEDNHQRLLVGLMVSELKDHLLRHLQGVEKKKIEQMVLDYISKLLDLICCILEASWRKHNLHPWVLHFDRRGSAAEFAVFHLMTRILEATNSLFLPLPPGFHTLHMVLGVHCLPLHNLLHYIDNGVLLLTETAVTRLVKDLDNTERNEKLKFSIIARLPPLIGQKISRLWDHPMSSNIISRNHVKQLLQNYKKQPRDSMTDKSSFSVEFLPLNYFIDILTDIESSNQALYAFEGHDNVDAKFVGEAALKHTTMLLGL	43368	120814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17270_pilon_+_43445_44984_45042_47966_48037_48353_48408_56453_56543_59598_59669_60936_60987_65221_65327_65552_65613_66552_66597_67525_67612_77986_78065_79454_79533_84312_84406_84529_84748_87306_87377_88027_88111_91559_91614_99658_99788_100590_100650_101556_101589_104487_104550_107823_107920_110175_110247_110710_110806_116857_116978_117835_117898_119125_119228_119382_119483_119936
906902	SIRV7	-	2416	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	47	-1	42	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	75	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147876	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
906903	contig_11448_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_66367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	1336	1854	262916	262398	NA	65	AAAATCCCAACCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKMYQTNSNQNRAGVAILISDKIDFKIKSTIKDKEGEGPYIMIKGTIHHEEITIINVYAPNDRAPKYIKQTQTALKREIDSSTIIVGDFNTLLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKATINQLDLVDIYRTLHRTAAKYTFFSTTHGTFSRTDHILAHKAPSTKSKTLKSKTKHLL	264251	261702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_261700_264300
906904	contig_9415_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_109739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAGAGATATACGTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560301	561986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_560300_562000
906905	contig_10163_pilon	+	2800	14	Intergenic	novelGene_82611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	44.7164637485738	128	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	206	2137	11226	38156	FALSE	45	TCAAGAGAGAGATTCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENMKLATVEDTVEYCLFLIPNEPRNPEKHKEILLKYIERIMTHFAPILVPYIWQNQPFNLKYKPEKGDVPAHMFGMTKFGDNIEDEWFIVYVMKQITEEFPELVARIEDNDGEFLLIEAADFLPKWLDPDNSTNRVFFHHGELCIIPAPRKPRAISWLPTTTPTIPQALNIISTHPEKILASESIRAAVNRRIREYPEKIQASLHRAHCFLPAGIAVVLKQRPRLVAAAVQAFYLRDPFDLRACRVFKTFLPDTRIMTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLAHGFEILCSKSSPHFSDSKKSLVTTSPLWPGFLDSLKKNDYFKGLIEGSAQYQEKLEMAKNYFQVSVNQPESSLAMSPGEEILTLLQTTPFDIEDLKKEEANLPPEDDDQWLDLSPDQLDQLLQEAAGKKESELISKGEEQNYDLTQVSESMKAFISKVSTHKGAELPREPSEAPITFDTDAFLNYFDKILGPGPHESDSDDLDEEDFECLDSDDDLDLETQEPGEEASLKGALDNLKSYMAQMDQELAHTSIGKSFTTQKQVEPLSQAADNNSDEEDSGAGESVMSPVDVDLNLVSNILESYSSQAGLAGPASNLLQSMGVQLPDNTDHRPSSKPTKH	6672	38819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6865_11212_11431_13892_14011_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602_24732_26559_26689_29381_29468_33534_33642_33771_33956_34842_34911_36263_36479_37925
906906	contig_16122_pilon	-	3214	20	Intergenic	novelGene_134536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_12	20.1020939910618	228	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	40	2706	231823	219244	FALSE	5	TGTGTGCCGTTTCCCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESSVEQLRKEGNELFKCGDYEGALTAYTEALSLDAGPQDQAILHRNLAACHLKLEDYGKAETEASKAIEKDGGDVKALYRRSQALEKLGRLDQAALDLQRCVSLEPKNKVFQEALRNIGGQIQEKVRYMSSTDAKVEQMFQILLDPEEKGTEKKQKASQNLVVLAREDAGAEKIFRNNGVQLLQRLLDTGETDLILAALRTLVGICSEHQSRTVATLSMLGTRRMVSILGVENQAVSLAACHLLQIMFDALMEGVRKGFRGKEGAIVVDPARELKVLISNLLELLTEVGVSGQGRDNALTLLIKVAPRKSPKDPNNSLTLWVIDQGLKKILEVGGSVQDSPGELAVTANSRMSASILLSKLFDDLKCDAERENFYRLCENYIKSWFEGHGLAGKLRAIQTVSCLLQGPSEAGNRALELSGVMESVIALCASEQEEEQLVAVEALIHAAGKAKRASFITANGVSLLKDLYKRSEKDSIRIRALVGLCKLGSAGGTDFSMKQFAEGSTLKLAKQCRKWLCNDQIDAGTRRWAVEGLAYLTFDADVKEEFVEDEAALKALFQLSRSEERSVLFAVASALVNCTNSYDYEEPDPKMVELAKYAKQHVPEQHPKDKPSFVRARVKKLLAAGVVSAMTCMVKTESPVLTNSCRELLSRVFLALVEEVADRGTVVAQGGGKALLPLALEGTDVGQIKAAQALAKLTITSNPEMTFPGERIYEVVRPLVSLLHLNCSGLQNFEALMALTNLAGISERLRQKILKEKAVPMIEGYMFEEHEMIRRAATECMCNLAMCKEVQDLFVAEGNDRLKLLVLYSGEDDELLQRAAAGGPGHAHLFAAVALQPHPTSDHPLAGDLAGTASEPQPGAAAPGRCGGAEHGRGLEGDRQHLNGE	231862	218735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_219378_219472_219630_219716_219835_220669_220786_221002_221117_221575_221643_221827_221956_222156_222298_222932_223075_223335_223431_224213_224515_225137_225310_226075_226247_226546_226716_228333_228502_228973_229067_230706_230883_231180_231218_231454_231617_231817
906907	contig_5196_pilon	+	2147	11	Intergenic	novelGene_38697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_7	79.2921181455004	42	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	424	1419	302305	336267	FALSE	20	AAATCTGGTGGCTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYLVAIFLSAIFLYYVLHCILWGTNVYWVPPVEMKRRNKIQPCLSKPAFASLLRYHQFHPFLCASDFKKIASLYGNDKFDLPYGTKTSAEYFRVALSKLQSCDLFDEFDNVPCKRCVVVGNGGVLKNKTLGEIIDSYDVIIRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKINSHGFWKKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKNAYHNVTAEQLFLKDIIDKNYVISLTQE	281093	336995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_281334_281606_281779_302293_302394_304819_304898_309130_309235_310808_310873_328015_328112_331045_331233_331341_331480_334900_335054_336180
906908	contig_2867_pilon	-	2879	12	Intergenic	novelGene_135206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_4	18.5757328587507	285	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	117	2018	972405	966435	FALSE	0	TGGCTGTCGTTGGCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGPGHGQDSSDTTLASPPEEGEGPGSTAESSEGAELGHMGLLIPAMKDTSMERLGQPLSKVIDQLNGQLDPSTWHSHAQPPNQSFRTGSPGDAPERPPFCDFSEGLPAPMDFYRFTAESPSTAASGGGHHDPAGPGQPLHVPGSPAAAGQEEERGGEGQAPRPLEDTCGEAREPETQELETQLPLVSEGPVLGPEPGTQEAICRLRRDQPSPCLSSAEDSGVDEGQGSPSEMIHSSEFRVDNNHLLLLMIHVFRENEEQLFKMIRMSTGHMEGNLQLLYVLLTDCYVYLLRKGATEKPYLVEEAVSYNELDYVSVGLDQQTVNLVCTNRRKQFLLDTADVTLAEFFLASLKSAMIKGCREPPYPSILTDATMEKLALAKFVAQESKCEASTVTVRFYGLVHWEDPTDESLGPVPCHCSPPEGTITKEGVLHYKAGTSYLGKEHWKTCFVVLSNGILYQYPDRTDVIPLLSVNMGGEQCGGCRRSNTTDRPHAFQVVLADRPSLELSADSEAEMADWMQHLCQAVSKGVIPQGVAPSPCIPCCLVITDDRLFTCHEDCQTSFFRSLGTARLADISAACSEPGKEYCVLEFSQDGQQLLLPWVIYLSCPSELDRFLSALGAAWKTIYQVDLPLKAIQEASSQKKFEDALSLIHSAWQRSDSLCRGRASRDPWC	972521	965573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_966573_967360_967478_967552_967733_968064_968225_968818_968885_969260_969452_969743_969877_970468_970558_970891_970957_971274_971366_971503_971574_971803
906909	contig_9014_pilon	+	2205	4	Intergenic	novelGene_106794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2902	junction_1	1514.61568282739	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGTATAGTCATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150633	153646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151763_152234_152334_152425
906910	contig_1867_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_54585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCATGCTTTCCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485459	484317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_484300_485500
906911	contig_9706_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_20776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTAACAAGAATTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167	777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_800
906912	contig_10000_pilon	-	1264	10	Intergenic	novelGene_139302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	245.155632100544	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	36	1085	234091	159846	TRUE	15	AAGAGTGTGGTGTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKEPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPGNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDEKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDENEQSEASATDDE	234126	158965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_159120_159820_159882_162495_162639_163653_163787_167966_168069_168530_168637_182891_182946_192582_192801_225789_226009_234052
906914	contig_1301_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_47349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAGCTGAAAGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317848	319263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_317800_319300
906915	contig_6102_pilon	-	2483	14	Intergenic	novelGene_32345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_11	303.605922559191	61	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	249	1607	1690955	1687112	FALSE	55	TATACTTGAATTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRQSPSPSCQSPPCTVTWWNFAAVPGPHPQALHAPPLQRLDSWEQHLDPSSGRCFYINSLTGCKSWKPPRRTCSRETNPGSMEATQALNRDNGALQPQAKGSGSDTEKPELPDPQGSRCLCGQTCRLDTSEPPPALQPPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRKNWGPSWVVLAGNSLVFYREPPSTVPSSGWGPAGSRPESSVDLRGAALAHGRHLSSRRNVLHIRTVPGHEFLLQSDHETELRAWHRALRAVIDRLDRENPLELRLSGSGPAELGELSAGEDEEEEEAEPLLKPLLRLSSRRRSSRCPEGTEQNRVRSKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQRERNTVPSFVRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYLFPEQPGQEGRLDLDSVEWDDIHVITGALKLFLRELPQPLVPPVLQPHFRAALALAESEQRLSQIQELIGSMPKPNHDTLRYLLEHLCRSGRLNIFVCAGGRRSRTCSVRVKVS	1691395	1686235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1687297_1687629_1687765_1688022_1688077_1688226_1688305_1688481_1688581_1688896_1689005_1689102_1689248_1689467_1689567_1689732_1689829_1690053_1690145_1690266_1690329_1690549_1690655_1690853_1690968_1691159
906916	contig_4496_pilon	+	3851	3	Intergenic	novelGene_66632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGAAGAGGTTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632139	703627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_633493_641209_643675_703594
906918	contig_18163_pilon	-	1318	3	Intergenic	novelGene_35308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2998.5	105	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	90	665	10631	9401	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAQTLRVNLRTALRYYNQSDNGSHTFQWMFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11024	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10375_10652_10955
906919	contig_1759_pilon	-	3274	17	Intergenic	novelGene_171323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	213	junction_3	1018.50576059981	335	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	829	2487	787	3273	97828	11650	FALSE	25	GTATGTATCCAAATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNNKKLSENTQNASLCSGTVVHGRRFHHANAQISVVKTAAQSSLDRKERKEYPPHVPKIEINPVGLSRPHSVECIMKKSQESESQLEPEIKRKVQQKRHCSTYQSMSSLSPASKKCLTNLEVSEQHEYCPKCGKEKENQTKCQSCGINFSKDLQRNCRQGITSSESTGPLLRTSIHQNSGGQKSQNTGLTIKKFYGSSMGKVPIDIIVNCDDSRQNYLQTNGKVILPGAKIAKITHLKERKTSLSDLNDPIILSSDDDDDSDRTNRRESVSPQPADSACSSPAPSTGRVEAALNENTCRVEHELRSIPADSELNTVTLPRKARMKDQFGNSIISTPLKRRKVVSQESSVDPMSLSCQSSFDSVILNCRSIRVGTLFRLLIEPVIFCLDFIKIQLEEPESDPVAITLNTSDLTKCEWCNVRKLPVVFLQTIPAVYQKLSVQLQMNKEDKVWKECKGINKLTNLEEEYIILIFQTGLDHQANMVFESIITEIGIKNNISNFFAKIPFEEANSRLVACTRTYEESIKGSCVQKENKIKNVSFESKIQLRNKQEFQFFDDEEETGESHTIFIGPVEKLIVYPPPPAKGGISVTNEDLHCLNEGEFLNDVIIDFYLKYLVLEKLKKEEADRIHIFSSFFYKRLNQREGRNLHETTNLSIQQKRHGRVKTWTRHVDIFEKDFIFVPLNEAAHWFLAVVCFPGLEKPKYEPNPQYHENTVIQKCSTLEDSCISSPSANEMDSCSQNSSAKPVIKKIINRKHCIAVIDSNAIQEESDPRYRRNICSVKCSLKKINHTASENEESNKGESACQKVVDRTKSENGLQNEYLSSIHHT	126361	11648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_12080_15718_15812_16816_16940_28010_28128_28214_28325_29890_30118_38870_39066_39454_39489_43310_43482_45375_45606_50292_50681_56768_56915_64867_64939_92396_92418_96839_96945_97802_97949_125695
906920	contig_9363_pilon	-	4428	32	Intergenic	novelGene_6769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	333.147931443024	41	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	98	2512	1548961	1520055	TRUE	25	ATGTGAAATTCTGCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSSPASDPLSQHVCGADTE	1549058	1505337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505545_1505923_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101_1510216_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520109_1520465_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
906921	contig_3095_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_75056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	34	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	144	767	149709	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVCTASLLSSTDSYQITPEDNGFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147245_149632_149896_150413_150696_150996_151163_151848
906922	contig_1225_pilon	+	2374	4	Intergenic	novelGene_44182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	157	612	253442	275036	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQARNTGGRKQTQEEREKSCLKNTLSRELQPGNTPGAFALAARAPENKVFISLQSHPPSTLCFDFKCVSLSVCYGRRKGEQE	251372	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274359_274794
906923	contig_5039_pilon	-	622	1	Intergenic	novelGene_65034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGACACAGCTTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796143	1795521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1795500_1796100
906924	contig_6898_pilon	+	2561	5	Intergenic	novelGene_35763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2937.94318997151	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	13	519	122694	125646	FALSE	35	AAGTTTAGGAATACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	122681	127688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_122743_122983_123145_124370_124464_124782_124888_125547
906925	contig_7915_pilon	+	2208	6	Intergenic	novelGene_42976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	246.447884957449	12	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	958	1677	129893	137758	TRUE	45	AACTCCATGAGAATGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	128935	138494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137787_137991
906926	contig_12098_pilon	-	3406	1	Intergenic	novelGene_160665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACCTACAGCACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109953	106547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_106500_110000
906927	contig_18168_pilon	-	1300	5	Intergenic	novelGene_122079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	208.538215922166	2	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	232	741	26622	25870	TRUE	35	GAAGAAATATGTGGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTGTRGRGTWCLLQLTLSWGCVPSWPLERRGGK	27136	23459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_25725_26241_26483_26754_27036
906928	contig_5832_pilon	-	6628	1	Intergenic	novelGene_134121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	660	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	2489	2860	128329	127958	NA	45	CGACTGTGAAGACAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNFTSFYYKELLQKMQIPVLEKYVPLHGLQRNNADKRHGPIRCHHPTLSTNSERFGSQGDQPKRVPAQFLPSSCLPTGIPACPTRYVVVTASSTHQPAQEVIEPQQYATSRLPGCRKPCCQV	130817	124189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_124200_130800
906929	contig_5994_pilon	+	1589	2	Intergenic	novelGene_178828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGTCTTGTTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224316	226778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5994_pilon_+_224594_225466
906930	contig_4364_pilon	-	2862	11	Intergenic	novelGene_213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_10	13.0169120762184	239	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	89	952	1347888	1341325	FALSE	20	CAACCCATGGCTGTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDSEHSVPSAAGSTSHPAGTGPALCRIWAMAAEARVSRWYFGGLASCGAACCTHPLDLLKVHLQTQQEVKLRMTGMALQVVRSDGILALYNGLSASLCRQMTYSLTRFAIYETVRDRLSKGSQGPPPFYQKVLLGAIGGFTGGFVGTPADMVNVRMQNDMKLPPSQRRNYAHALDGLYRVAREEGLRKLFSGATMASSRGALVTVGQLSCYDQAKQLVLSTGYLADNIFTHFVASFIAGGCATFLCQPLDVLKTRLMNSKGEYQGVFHCAVETAKLGPLAFYKGLFPAGIRLVPHTVLTFVFLEQLRKHFGIKVPS	1347976	1339414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1341427_1341520_1341578_1342084_1342163_1342351_1342445_1342914_1342986_1343155_1343200_1343705_1343748_1344091_1344141_1344231_1344347_1344598_1344719_1347795
906931	contig_19744_pilon	-	3312	1	Intergenic	novelGene_120399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219310	215998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_216000_219300
906932	contig_10339_pilon	-	4699	8	Intergenic	novelGene_125267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.2920787400265	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	194	1099	357260	332025	TRUE	15	CTTCGTCCTCAGAGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSGVMMLQLLEKVVELENWTEGKGLIVRGANNTFSSGSDLNAVKALGTPEDGVALCMFMQNTLTRFMRLPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSGRELRLEEALLTERDLVGTVWGGPANLEAVARKGKSSK	366757	292296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_292503_308600_308709_328738_332434_346586_346668_348532_348586_354102_354246_357040_357263_366566
906933	contig_14686_pilon	+	4207	1	Intergenic	novelGene_88069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	109	480	66935	67306	NA	65	CAAACTTTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSKEKGKCERRPSVPGAFFPAVTLISPVLLIPFPHCGRLHYLGVAMSTFFGVGDECGLMVYSRESLGLRGLGFLQPFPGVCHSRRVPLPKTHYLAKVPNRLYFQPWLGREERGKAWRQRRLR	66826	71033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_66800_71000
906935	contig_4783_pilon	+	3524	1	Intergenic	novelGene_108385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGTGTATGTATTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217408	220932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_217400_220900
906936	contig_1719_pilon	-	2125	13	Intergenic	novelGene_87281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	514.918999832875	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2070	55	2124	376173	362018	FALSE	40	TGTGGGAGCAGCAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPERYVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQVAQIYQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQVRIDHSSRTLSFGSDLNYATREDAPLGPHLQSMPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKELQERLKNQEKKIDYFERAKRLEEIPLIKSAYEEQRIKDMD	376227	362016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375727_375868_376035
906937	contig_16369_pilon	+	2940	2	Intergenic	novelGene_98694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	366	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	478	900	11092	14583	FALSE	40	TGTGAAAAAAACGCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSLSAPASLDTLIAIPLPQVVKTHKRLHNFYYKGGRPSTEVGLSSGSSRPASVIKANMGYTGVRGTEVSHRPMEDRWWGEVSASQSSSPDDVAAPCTHSSKVCCLVESSCAPPTTKTKGYSAPKPTAQTIHPALPTAF	10614	16623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_+_11430_14498
906939	contig_14744_pilon	-	5228	28	Intergenic	novelGene_65965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_27	71.4843407603155	319	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	497	2749	723229	694609	FALSE	15	TAAATCTGGCTGCTGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKNAKALAAYLFAHNHLFYLMELSTALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFIEAIVVLVRQTSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGIRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSTNPSDPYFNTLENSIISLFVLLTTANFPDVMMPSYSRSPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYHLLISRRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSAGERYLTFKALNQSNTPQLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTAFLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGIWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYIVFLTIYGVELFLKVAGLGPIEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALAFNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKKRYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGILYPNCCNTSTVADAYRWVNHTIGNKTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKSQDSEVDSGITLEKELSKEELVTILELYREVRGATSDITRLLKTLSQMERYEQNSVVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHARKQEEQQRQLGGSGGVPSTQQPPGSRQHSQTIT	755089	692129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_694732_695156_695238_695434_695575_696895_696981_697163_697233_697849_697897_699217_699334_701102_701193_701643_701716_702819_702928_704154_704228_705006_705061_705149_705207_707711_707757_708810_708875_709350_709400_710548_710674_710890_711008_712801_712902_713164_713224_713712_713748_715243_715333_716365_716497_717492_717607_719368_719546_723196_723326_752195_752433_754926
906940	contig_3382_pilon	+	2800	7	Intergenic	novelGene_124176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	396	junction_2	192.081073739421	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	129	2063	951880	967658	FALSE	5	GGGGTCCCCCGAGGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGEVLCLATVGVAPIQRGG	951751	968395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481
906941	contig_11538_pilon	-	4443	10	Intergenic	novelGene_152301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_2	174.246313527081	158	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	73	1638	296872	226813	FALSE	60	TTATCAGAAACAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYSFYQQLHEQKRSEKFFKVLYDRMKAAQKEIRSTVTVNTIDLGSKKRDDDNELMTSGPRMRVRDSSLYLKEGMKGQLTEASSATSKAYCVYRREMDPEIDIMCTGPDAGNAEEKSAEEVTMSPAIAIMQPILRFLQLLCENHNRELQNFLRNQNNKTNYNLVCETLQFLDCICGSTTGGLGLLGLYINEKNVALVNQTLESLTEYCQGPCHENQTCIATHESNGIDIIIALILNDINPLGKYRMDLVLKLKNNASKLLLAIMESRHDSENAERILFNMRPRELVDVMKNAYNQGLECDHGDDEGGDDGISPKDVGHNIYILAHQLARHNKLLQQMLKPGSDPDEGDEALKYYANHTAQIEIVRHDRTMEQIVFPVPNICEYLTRESKCRVFNTTERDEQGSKVNDFFQQTDDLYNEMKWQKKIRNNPALFWFSRHISLWGSISFNLAVFINLAVALFYPFGDDGDEGTLSPLFSVLLWITVAICTSLLFFFPKPVGIRPFLVSVMLRSIYTIGLGPTLILLGAANVSTWLCTVIIKSVLNVKLS	296944	224007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_227049_234663_234790_237544_237738_252861_252970_284064_284188_285673_285770_290036_290148_292981_293183_295778_296036_296757
906942	contig_299_pilon	-	11180	26	Intergenic	novelGene_129442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	532	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2730	3059	1008698	1008369	TRUE	15	AGTGCGGTCCCGCCGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRATCFPFPFTERPGFSSVAEPSLLLTFSFTCGSISTSSWKFTLHVKFVVARSGYFSSELLHNTTKILVSYRKVWLSHRRCCPRMLGAQRLCISQQFRYGFRAHSPK	1011427	920445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_920782_921469_921590_930100_930279_931296_931510_939521_939631_947654_947874_948406_948528_951183_951353_951478_951570_952205_956426_965974_966074_970898_971071_971911_972145_973395_973562_974105_974264_980748_980852_981043_981157_982235_982309_984209_984360_985538_985650_988195_988383_989173_989269_991474_991639_994861_994961_1003994_1004083_1008034
906943	contig_10058_pilon	+	2959	12	Intergenic	novelGene_67717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	172.278555910033	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	74	1066	72602	99568	TRUE	30	TAAACGTTTATTTTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILSFLASFQDCPTSGCNYFLRSFLSTMKCHFGSCLWMSPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKTSGKKVIYSQPTARNEGDFRQTSSFLV	72528	101624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_96622_96728_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99357_99407_99532_100507_100564_100777_100881
906944	contig_16411_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_77354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	564	863	242905	242606	NA	30	CCCAAGAAATTTCTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSQTSCHGPFLCSFHGVTNDPLALGRGFFFSFSIFLPELGRGISNVTLCMFFKAQDHRVSLKMTCSAMRHLLPKDICPSKQFPQAWWEILQRNFGSI	243468	242436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_242400_243500
906945	contig_4486_pilon	+	2503	15	Intergenic	novelGene_38587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1438.99339108692	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	633	1490	377420	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311787	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_332818_332991_342989_343093_344726_344770_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
906946	contig_4659_pilon	-	3487	8	Intergenic	novelGene_118230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	366	junction_7	89.2595390203336	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	104	1087	860030	819799	FALSE	40	AATCTTGTAGCCAAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884072	817398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_883977
906947	contig_2036_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_131821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCACTTGACTTACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604830	606277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_604800_606300
906948	contig_12429_pilon	-	3488	2	Intergenic	novelGene_136199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	933	1277	36830	36486	TRUE	75	AAAAAAAAAAAACTCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEESKRSLKKLERKRSPKWMSEETLKLALERRANKVNGRNNEVKELNRRFQRATQDKVKYYNDMCKDLELENQKENMLIISQTEKTESKLQALSCSIKGSYRQLLNEARSIKR	37762	9518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_-_11427_36182
906949	contig_3132_pilon	-	1624	10	Intergenic	novelGene_127420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	123.585328147533	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	124	657	229252	223829	TRUE	20	GTTTTTCTATTTTGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKP	229375	210429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_223835_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
906950	contig_7022_pilon	+	3824	22	Intergenic	novelGene_142122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	156.834647243406	9	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1273	3819	4	3822	34270	164168	FALSE	40	TGATGAACAAGCTGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGHLFRAAGDQPFNLSTVSSAFPMVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSESDSNSESDTEGSEEEDDDDDKDQDESDSDTEGEKTSMKLNKTASSVKSPSMSLSAHSTPRNLHIAKAPGSAPAALCSESQSPAFLGTPSSTLTSSPHSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQERERRRQHMMLMKAMEARKKAEEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDD	34266	164170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_119394_119692_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_148267_148334_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011
906951	contig_6885_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_83705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302075	299544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_299500_302100
906952	contig_6227_pilon	+	2574	2	Intergenic	novelGene_49711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTGACAGAAAGTAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1172137	1174861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1172475_1172624
906953	contig_11656_pilon	+	3089	4	Intergenic	novelGene_53947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114291	124501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_114525_117215_117528_120350_120955_122561
906954	contig_5623_pilon	-	5120	4	Intergenic	novelGene_154851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1311	1697	255505	224071	FALSE	15	AGCTTCCCCCCTTTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCSRIPILCIVCHNITHTVECLCVVYNDIFLVFSAFSQDPSDISNDIPCSMSSSESGLNFGQFPVDVVSAATALELYSAKFYLCMILMILFNNFHILLDHLFFGMGTDMDLFQSVGQHCIHLLKHLN	282770	220647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_224104_224149_224232_255233_256424_282378
906955	contig_17880_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_167317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCAGTCTCCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11424	9041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_9000_11400
906956	contig_3601_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_132843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTTCCCCACATCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123730	125746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_123700_125700
906957	contig_15412_pilon	-	2781	1	Intergenic	novelGene_165475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGGTTCTCTAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285073	282292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_282300_285100
906959	contig_10861_pilon	+	1903	8	Intergenic	novelGene_39297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	176.294743922483	2234	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	31	1047	1437804	1452005	TRUE	20	GCATGTTGTAACTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPGVLGAALLLLLVLRAAQSRRGAWPRHGAHRRYTPDWKSLDGRPLPAWYDEAKFGVFLHWGVYSVPAWGSEWFWWHWKGEGRPLYELFMKENYPPGFSYADFGPQFTATFFEPNDWADLFRAAGARYVVLTAKHHEGFTNWPSPVSWNWNSQDLGPHRDLVGELGTALRKRNIRYGLYHSLLEWFHPLYLLDKKNGFKTQYFVSSKTMPELYDLVNRYKPDLIWSDGEWECPDTYWNSTDFLAWLYNDSPVKDQVVVNDRWGQNCSCHHGGFYNCQDKYMPESLPGHKWEMCTSVDKLSWGYRRNMVMASIASEEEIISVRAPLSYFLTTSLKTVF	1437773	1455013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1438187_1442887_1443023_1444871_1445010_1447273_1447380_1451750_1452085_1453025_1453217_1454226_1454327_1454527
906960	contig_9468_pilon	+	7041	36	Intergenic	novelGene_59515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	5	90	junction_35	171.523840194598	578	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1573	4722	36	4757	444813	641023	FALSE	30	GTTTGTGAAAGGCCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTYPEDKLIYGMQEPSAGTSTLAVQGFAGATGTLGQVDSSDEEDQDGSQGLGKRKRVKLSSGTKDQSIMDVLKHKSFLEELLFWTIKYEFPQKMVTFLLNMLPDQEYKVAFTKTFVQHYAFIMKTLKKSHESDTMSNRIVHISVQLFSNEELARQVTEECQLLDIMVTVLLYMMESCLIKSELQDEENSLHVVVNCGEALLKNNTYWPLVSDFINILSHQSVAKRFLEDHGLLVTWMNFVSFFQGMNLNKRELNEHVEFESQTYYAAFAAELEACAQPMWGLLSHCKVRETQEYTRNVVRYCLEALQDWFDAINFVDEPAPNQVSFHLPLHRYYAMFLSKAVKCQELDLDSVLPDQEMLMKLMIHPLQIQASLAEIHSNMWVRNGLQIKGQAMTYVQSHFCNSMIDPDIYLLQVCASRLDPDYVISSVFERFKVVDLLTMASQHQNIVLDAEHERSMLEGALTFLVILLSLRLHLGMSDDEILRAEMVAQLCMNDRTHSSLLDLIPENPNPKSGIIPGSYSFESVLSTVADFKAPVFEPGGSMQQGMYTPKGEVWDQEFDPVMVILRTVYRRDVQSAMDRYTAFLKQSGKFSGNPWPPYKKRTPLHPSYKGLMRLLHCKTLHIVLFTLLYKILMDHQNLSEHVLCMVLYLIELGLENSPEEESDEEAPVGGPERCHDSWFPGSNLVSNMRHFINYVRVRVPETAPEVKRDSPASTSSDSLGSLQNSGTAQVFSLVAERRRKFQEIINRSSSEANQVVRPKTSSKWCAPGSAPQLTTAILEIKESILSLLIKLHHKLSGKQNSYYPPWLDDIEILIQPEIPKYSHGDGITAVERILLKAALQSRMNKRLIEEICRKVTPPVPPKKITAAEKKTLDKEERRQKARERQQKLLAEFASRQKSFMETAMDVDSPETDIPMEITTAEPQVSEAVYDCVICGQSGPSSEDRPTGLVVLLQASSVLGQCRDSIEPKKLPVTEEEQIYPWDTCAAVHDVRLSLLQRYFKDSSCLLAVSVGWEGGVYVQTCGHTLHIDCHKSYMESLRNDQVLQGFSVDKGEFTCPLCRQFANSVLPCYPGSSVENNLWQRPSNRSMQDLIKEVEELQGRPGVFTSETNLSKEMESVMKDIKNTTQKKYRDYSKTPSSPDNDFLFMYSVARTNLELELIHRGGNLCSGGASTAGKRSCLNQLFHVLALHMRLYSIDSEYNPWRKLTQLIEDMNSQLRNEEQLEVPILYHDVTSLLLIQILTMPHPLHKDHFTCIVKVLFTLLYTQALAALSVKCSEEDRSAWKHVGALKKNPCDAEKSYEVLLSFVISELSKGKLYHEEGSQECAMVSPIAWSPESMERYLQDFCLPFLRITSLLQHHLFGEDLPSCQEEEEFSVLASCLGLLPAFYQTAHPFISASCLNWPVPAFDIISQWCFEINSFTERHAEQGKALLIQESRWKLPHLLQLPENYNTIFQYYHRKTCSVCTKVPKDPAVCLVCGTFVCLKGLCCKQQSYCECVLHSQNCGAGTGIFLLINASVIIIIRGHRFCLWGSVYLDAHGEEDRDLRRGKPLYICKERYKVLEQQWISHTFDHINKRWGPHYNGL	444777	643307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_444856_445432_445483_466031_466099_469950_470082_471219_471449_478818_478999_479583_479718_487495_487583_496649_496716_496850_496941_498092_498222_498304_498358_498457_498592_499547_499634_501080_501223_504231_504329_532181_532324_535652_535758_536801_536976_538982_539444_545928_546018_554519_554670_565952_566087_571276_571388_576691_576893_578062_578200_584327_584414_598619_598726_611818_611920_623011_623137_627691_627800_627928_628055_629842_630023_639704_639915_640471_640612_640905
906961	contig_6287_pilon	-	6042	2	Intergenic	novelGene_160428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	0	288	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	103	1014	156633	154921	FALSE	15	TTGTTGTTTGAGCATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPAAGCPGGVSQLAAWTKAGPAGAGPVGSRTDTMWRLRCKAKDGTHVLQGLSSRTRVRELQGQIAAITGIAPGGQRILVGYPPECLDLSNEDTILEDLPIQSGDMLIVQEDQTRHRTSPAFAEYGASSYYRETSPVLTRTAVPADNSCLFTSVYYVVEGGVLNPACAPEMRRLIAQTVASDPEFYSEAILGKTNQEYCDWIKRDDTWGGAIEISILSKFYQCEICVVDTQTVRIDRFGEDAGYTKRVLLIYDGIHYDPLQRNFPDPDTPPLTIFSSNDDIVLVQALELADEARRKRQFTDVNRFTLRCMVCQKGLTGQAEARDHAKETGHTNFGEV	156735	149892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_-_155625_156425
906962	contig_5434_pilon	-	1884	9	Intergenic	novelGene_74659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_5	124.23811562882	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1462	1785	259223	258608	FALSE	45	AAAAAATGTGGCCTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTSLEASNITTKKKDNQNDEHEVHDDDGYRIADDSADSLPGFLTIGEKKKIGHLCKLLIDQGRVQYLQQKGFSPALQYYTDPLVSLENVLLTALPSHSSSPEAVA	282129	258508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_258804_259095_259529_262817_262893_273748_273822_275490_276121_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
906963	contig_9609_pilon	+	4924	13	Intergenic	novelGene_23022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	336	junction_10	187.88264658794	125	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	2109	3140	325779	331538	FALSE	35	CTTGAAAAATGATACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPFVGARGTLGDARERRALRPTASRSLRIESKASFLPGMTVCGIIFAAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVYVLCTFSSLLTGALAI	320946	333322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_321040_321846_321908_322284_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388
906964	scaffold_13505_pilon	-	783	5	Intergenic	novelGene_111435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	273.662543107383	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	271	546	532469	531050	TRUE	25	GACCTTAGCAGGACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRVRERLPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	532951	530641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_530809_530979_531164_531299_531369_532376_532496_532707
906965	contig_8377_pilon	+	792	10	Intergenic	novelGene_35117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4766	junction_9	1187.84851675853	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	271	792	176610	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	164541	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
906966	contig_10377_pilon	+	1563	8	Intergenic	novelGene_115383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	355.815934988635	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	475	987	227522	245851	FALSE	60	AAAACGCAATAAAATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVNYAHAASSFQC	209083	246427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_220809_220952_227487_227752_235978_236012_240234_240355_245160_245257_245817
906967	contig_10263_pilon	+	5172	13	Intergenic	novelGene_135839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	25.1213720432092	49	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	377	1417	867684	876447	FALSE	55	AAAAAAAAGGGAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKGHLSIWTFFPGSPCTSFPIFSARPSSKLSSLAFSLDRAPCVHHALPKARQPESTCLGLRKQFLEAVTAILLVVVTLYYALDRARGKLPREHERKQQCQYTAEEYQAIQNALRQRLGPEYISSRMAGGGQKVCYIEGHRVINLANEMFGYNGWAHSVTQQNVDFVDLNNGKFYVGVCAFVKVQLKDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQAVLPAPPVKHSTPVTAVPEPLAEKDSLADNLEMWDMTPDLGDIIKSLPKPEPPQTLATPVLKNHMVTRNRTPQRLCLQEPQSKSGPSHPQTHNTNQHLTGDCDSSRKSQDMKKRKLYPT	858833	880202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_866403_866504_866965_867009_867602_867705_868279_868374_868550_868619_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165_874273_875307_875392_875712_875926_876385
906968	contig_3975_pilon	-	1700	8	Intergenic	novelGene_54797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408.266319643321	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	696	1400	2018596	2016131	TRUE	10	CTCTACTCTCCCGAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2019291	2015535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2015703_2015997_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502
906969	contig_5832_pilon	+	1168	2	Intergenic	novelGene_134111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAATTGTCAAGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5427	21115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_5529_20048
906970	contig_3825_pilon	+	1048	8	Intergenic	novelGene_77932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1471.68343146513	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGGAGTTTTATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12212	15856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13643_13772_14056_14198_14390_14456_14768_14912_15231_15302_15498
906971	contig_3584_pilon	+	5180	9	Intergenic	novelGene_108149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	130.863239681738	634	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	297	656	351589	354433	TRUE	25	AGAAAACGGTTTGGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILELYCDLLLARFGLIQSMKELDSGLAESVSTLIWAAPRLQSEVAELKIVADQLCAKYSKEYGKLCRTNQIGTVNDRLMHKLSVEAPPKILVERYLIEIAKNYNVPYEPDSVKLLLG	341257	368895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_341314_350949_351055_351453_351654_352275_352364_352717_352802_353357_353463_354415_354619_355225_356548_365878
906972	contig_15787_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_143978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATGGTTACAGAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70493	68046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_68000_70500
906973	contig_3132_pilon	-	1936	2	Intergenic	novelGene_127441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCACACTCCTCCTTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341516	289232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_289336_339683
906974	contig_4857_pilon	+	2628	2	Intergenic	novelGene_48865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGCCTGTCAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354049	1356884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1356283_1356489
906975	contig_13265_pilon	+	3204	8	Intergenic	novelGene_146005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_3	55.6362090288514	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	798	1496	78687	113433	FALSE	45	TGAAAGAAAAGTACTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLRTIMEIEESRQKCGATPKTNLGKMISHGIKLSQKQRKMIAVTTKENNSGMNSMETVLTTPSKSPKPVNAWAFSLHSVSSKSFWDFSLDEKKSVTGHSSGDHVKKICFKGIESSQDPKVIRYPTQGTPGEGNHISDLPLQDSANPWLSSSLTGPSVAPVTFASIVEEELQQEAALIRSREKPLALIQIEEHAIQDLLVFYEALSNPDEFVIVERTPQGPLAVPMWNKHGC	74158	115141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_74773_76338_76503_78667_78761_79357_79502_97722_97873_111915_111985_112372_112503_113301
906976	contig_9098_pilon	-	2643	12	Intergenic	novelGene_75781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	455.290335122764	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	342	1142	288130	264388	FALSE	70	GCATCACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295246	262886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292151_292190_292840_292905_294101_294181_295200
906977	contig_9471_pilon	+	2113	7	Intergenic	novelGene_21823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	526.354021126044	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	281	997	412726	415737	TRUE	40	AAATTTATATGAATCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILGLALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPVSDNDLF	412445	417517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_414940_415628_416273_416936
906978	contig_1715_pilon	+	5930	10	Intergenic	novelGene_127170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	157	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1755	2075	206217	206537	TRUE	25	AGAGGTAGACAGCTGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLVLECGVAKVKGRNEEVKDLNSRFQRAAPEDKVKYYNEMCKDLELENQKRRARSAFLKLKELKKKFKPQTAILKDSTGKILKDSGSIKRRWKEYTESLY	86538	390171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_87122_91361_91863_101983_102508_206070_206587_207130_207826_300804_301134_305920_307276_307403_307690_348567_349302_389764
906979	contig_8674_pilon	-	3285	1	Intergenic	novelGene_102930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCTCCGGCCTGGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445714	442429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_442400_445700
906980	contig_12923_pilon	-	2896	14	Intergenic	novelGene_30067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	327.257024009132	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	6	1460	93727	52220	TRUE	10	GGTTCTACTGATCTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKVNVLLVENDQQLQKILSIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWATWKGRMPPRRWWTRTAGCTQGTWAVWIVRVSSTSLAGSKSSSSLPAARTCPPFPSRTWSRRRSPSSVMPCWWETGPSF	93732	45336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_53982_57497_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602
906981	contig_6208_pilon	+	5285	1	Intergenic	novelGene_53023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCACAGTCAAATACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487937	493222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_487900_493200
906982	contig_5302_pilon	-	3897	21	Intergenic	novelGene_81530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3110	3439	1585397	1585068	TRUE	25	CCGCCCCAATTCATGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQPGVFQGWKSVIWSVLIQAGLFSGYCSHYCCMSHGHASGYYCWCCYCHLHWSVDCCVHSVGRRTVSETEKCWVQVLPESICYSDASSHVSVQRNLGWIFHLLLVVL	1653609	1553502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1553717_1581891_1582021_1584952_1585748_1587120_1587166_1590793_1590876_1622182_1622224_1624389_1624439_1633904_1633958_1634423_1634462_1634943_1635107_1635795_1636714_1640299_1640393_1641104_1641344_1644303_1644397_1645012_1645084_1645201_1645338_1645592_1645666_1647208_1647302_1648198_1648242_1649688_1649912_1653303
906983	contig_14474_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_144212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1310	1678	77501	77869	NA	70	AGAAATTAAAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDERRIDAFELWCWQRLLTTLWTARRMNKSVLASTARTLLRSKVTRLRLTFFGHVISRDQSLEKDFMFGEVEGQRKRGRPSARWIDTVAATLDSDIAMTVRMAQDLAVYRSVVRRVTVN	76191	77967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_76200_78000
906984	contig_11171_pilon	+	1373	9	Intergenic	novelGene_48533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1458.45521335933	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	501	1115	51117	65045	FALSE	45	GAAAGAAAGGTAGATGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPEEEPLVLMCGPPAHDPVCLPTQPGLRGPPQGALLCLLIGGGGCAHRLPTHSPRTCPRPPLRAIVL	31037	65303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48814_49084_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785
906985	contig_8631_pilon	-	4389	1	Intergenic	novelGene_121940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	235	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCAAGGAAGTGATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653692	649303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_649300_653700
906986	contig_16098_pilon	-	1593	11	Intergenic	novelGene_45967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1578.56656495695	5	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	116	946	352350	349639	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTVKAPGGAAVPAGAGHEQWRPAALL	354104	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349047_349194_349231_349346_349493_349604_349710_349951_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
906987	contig_7457_pilon	-	4076	4	Intergenic	novelGene_31604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.3528991596531	32	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	128	835	962606	960191	TRUE	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRGFSRKSHTFLPKIFFRKMSSSGAKDKPELQFPFLLDEETVATLQECKTLFILRGLPGSGKSTLARIITDKYRDGTKMLSADAYKITPGSRGAFSEEYKRLDEDLAACCRRDIRVLVLDDTNHERERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPKTAWRLDCAQLKEKNQWQLSADDLKKLKPGLEKDFLPLYFGWFLTKKSSESLHKAGQIFLEELGNHKAFRKELRQCRWQGWGWQGS	962733	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956618_956857_956939_958234_960896_962603
906988	contig_6364_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_51740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAAGTTATTATATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502671	500063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_500100_502700
906989	contig_12229_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_169394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109550	110510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_+_109600_110500
906990	contig_4232_pilon	+	625	1	Intergenic	novelGene_63415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCGCACAGCTCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467510	468135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467500_468100
906991	contig_11061_pilon	+	2496	3	Intergenic	novelGene_173343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTTGAAGCACAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24932	102586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_+_26801_63094_63467_102330
906992	contig_11363_pilon	+	2761	2	Intergenic	novelGene_160479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32489	142888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_33209_140846
906993	contig_5539_pilon	+	3047	1	Intergenic	novelGene_104769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTTTTAATTTCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172983	176030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_173000_176000
906995	contig_10904_pilon	-	1810	7	Intergenic	novelGene_22719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	43	junction_1	365.068220413056	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	60	1145	662714	651376	FALSE	65	AGAGCCAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662773	650710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662408_662445_662665
906996	contig_10500_pilon	-	4838	1	Intergenic	novelGene_41252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	816	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTCAATAATTCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1631659	1626821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626800_1631700
906997	contig_9121_pilon	-	5408	1	Intergenic	novelGene_134449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	519	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139420	134012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_134000_139400
906998	contig_16385_pilon	+	2537	14	Intergenic	novelGene_86197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_10	200.145479633569	51	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	14	1180	8986	32765	TRUE	40	TAATGATTAAAAGTGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMLPSYGLAEGEDDFIEEGIVVMEDDSPVEAVSTPNTPRNLAAWKISIPYVDFFEDPSSERKEKKERIPVFCIDVERNDRRAVGHEPEHWSVYRRYLEFYVLESKLTEFHGTFPDAQLPSKRIIGPKNYEFLKSKREEFQEYLQKLLQHPELSNSQLLADFLSPNGGETQFLDKILPDVNLGKIIKSVPGKLMKEKGQHLEPFIMNFINSCESPKPKPSRPELTILSPTSENNKKLFNDLFKNNANRAENTERKQNQNYFMEMMTVEGVYDYLMYVGRVVFHVPDWLHHLLMGTRILFKNTLEMYTDYYLQCKLEQLFQEHRLVSLITLLRDAVFCENTQPRSLQDKQKRAKQSFEEMMNYIPGLLRIVLNLHCLCSINGTTKPG	8972	36818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_9040_14038_14241_17195_17280_20584_20686_22395_22508_24752_24794_24966_25087_27157_27282_27562_27728_27908_28005_32697_33767_34231_34324_35622_35680_36611
906999	contig_4845_pilon	-	2156	8	Intergenic	novelGene_53675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1513	1833	923136	810620	TRUE	55	ACTTTAAAAAAAAAACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAVAAFKTRGSVFVVIIEAVVTVCEAVKLGEGAADCCAWWWWYCCCCCSCCSGCCCAVCSLFSDCGNGCIWNLSGCSCLTIRFFRSCSTTLFCFSLKAVILAWSS	930232	767031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_767111_794493_794534_802940_803086_807468_807502_810593_810661_916630_916838_923063_924607_930190
907000	contig_2758_pilon	-	1965	2	Intergenic	novelGene_166431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTGGAAGGAAATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38288	35586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_-_36075_36811
907001	contig_3956_pilon	+	1691	8	Intergenic	novelGene_14848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_7	1448.14924814328	3336	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	84	1172	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1290413
907002	contig_5092_pilon	-	3642	5	Intergenic	novelGene_62258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1411	1728	169058	168741	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPKAEGAELLSQRAWKAELKPRAEGPPPRIQKAWPAPGVWAKAWLLPRWSQREDYFQSLRTHVNYAGFWTSLVPVIPSFPPISPICNGNVYLGLVPPLYFGNR	227970	166826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_169743_169782_170025_170192_170300_208016_208270_227846
907003	contig_10197_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_115323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGTATGTAGTACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1609663	1611472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1609700_1611500
907004	contig_8663_pilon	+	2980	1	Intergenic	novelGene_58008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	107	316	96791	97000	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRAPPPHQATQPQPLASGSFLHQLDQVTSQVLARLMEAQKSAVPGDLLTLPGTTERLRFTRPFTMAELSRLRRQFISYTKMHPNNENLHQLANMFLQYLSQSLH	96684	99664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_96700_99700
907005	contig_12540_pilon	+	4413	1	Intergenic	novelGene_148133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTGTAGGTCCTGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298932	1303345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1298900_1303300
907006	contig_9903_pilon	-	2527	7	Intergenic	novelGene_172006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	56.6992553351061	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	69	554	101500	82602	FALSE	20	TCAATGTCCCTATCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRRAGAKGTGTEDGLRQILEEMKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQHFLPRWKCEQLIRQGILEHVLS	106290	80628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106252
907007	contig_7165_pilon	+	2674	2	Intergenic	novelGene_116864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	29	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACAAGGCCAGGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405117	421931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_407341_421480
907008	contig_10947_pilon	+	2541	4	Intergenic	novelGene_167138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.9702791020762	319	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	64	426	69353	90668	FALSE	35	TTTACATCATCTTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPRRRCCRCCCWCSCPAPRAMSSSAGSGHQPSQSRAIPTRTVPISDAAQLPHDYCTTPGGTLFSTTPGGTRIIYDRKFLLDRRNSPMAQTPPCHLPNIPGVTSPSTLIEDSKVEVNNLNNLNNHDRKHAVGDDAQFEMDI	69083	92783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10947_pilon_+_69132_69337_69498_89244_89431_90636
907009	contig_11258_pilon	-	1044	4	Intergenic	novelGene_67843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	143.766013600804	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	28	483	360591	354704	TRUE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSTRAA	360618	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353217_354626_355099_360530
907011	contig_14225_pilon	-	3377	1	Intergenic	novelGene_52763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGCCCAGATAGTTATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481158	477781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_477800_481200
907012	contig_14953_pilon	+	2490	22	Intergenic	novelGene_137276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_14	116.756117311708	274	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2415	75	2489	98786	458555	FALSE	45	GAAAACCACCACCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQTVSLELENSVYRREAGFVNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEVHGTGNEPPLLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGTQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGTSPPYCCVDLYSLRTGEMVKSIQFKTPIYDLHCNKRILVVVLQEKIAAFDSCTFTKKFFVTSCYPCPGPNMNPIALGSRWLVYAENKLIRCHQSRGGACGDNIQSYTATVISAAKTLKTGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTEDDVAIHSNSRRSPFVPGIITVIDTETVGEGQVLLSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQSAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAVFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVEHMMEPRPLSTASKISDDTPLEIMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLLAGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSCPVSDRRGVSTVIDAASG	97331	458556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_97389_98768_98857_101504_101560_110603_110680_117909_118017_152898_152981_192349_192423_258284_258393_278944_279022_287831_287909_292039_292124_301000_301172_310457_310552_359693_359828_372501_372767_400496_400648_419395_419521_421867_422034_423962_424064_451465_451567_455028_455226_458455
907013	contig_10855_pilon	+	1837	2	Intergenic	novelGene_124334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	534954	535310	TRUE	5	GGAGCTGCTGCCTTGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAVIYCLTVLEARNGNSGCWQGRAPSEGSGEGPSLASSSFWWPGIPARGHLPDWGAWEGDWSWRSEQGVLVTGRWTGTSGRRHFRVASSFFFSLSLRPFFIRHQADGIWTYRAQYELN	534953	540913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_535824_539946
907014	contig_854_pilon	+	3455	12	Intergenic	novelGene_36390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGAGATGACACATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974793	991209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976255_977360_978094_978795_978892_979721_979779_980007_980100_980727_980893_981768_981907_984025_984183_984331_984468_985010_985183_985262_985419_991117
907015	contig_12622_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_5752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_0_1300
907016	contig_14687_pilon	-	4864	6	Intergenic	novelGene_107903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	636	junction_3	282.060702686496	123	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	3404	4285	431370	426438	FALSE	40	CAAGACTATGATGCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESQQQTTPQKSETNGSSSPGSDISTDSKSTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKECTLEKQIKEEQEQDNPDSPNCRTSPPVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPNKASKINVKSELKEEPKESRKPAMNENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSNNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKDSIISNGSVKEFWDGFEEVSSMFFRFTVFLAYPSKK	444601	425858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_426657_429457_429737_430476_430692_431201_433660_442444_442598_443640
907017	contig_15047_pilon	+	2281	5	Intergenic	novelGene_52227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	37.2390923627309	135	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	362	856	3242	3736	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHGVPDPPAAALGGPGPDPSRPAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPRERAFLSETVTVTGSSL	2188	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2547_2826_3221_4676_20997_21062_21232
907018	scaffold_13505_pilon	-	1923	8	Intergenic	novelGene_111529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_3	463.515272847902	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	2	1171	603276	590218	TRUE	5	TCATTTTCTCTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPQREHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGLAARVTLDISSP	603277	588570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
907019	contig_8050_pilon	+	2832	1	Intergenic	novelGene_114864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGAAAAAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398966	401798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_399000_401800
907020	contig_602_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_134942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGTCAGCGGTGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270947	269733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_269700_270900
907021	contig_2798_pilon	-	3168	5	Intergenic	novelGene_120017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	803.435863961773	2	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	657	1157	116233	115733	FALSE	15	AATTCAGTTTGCCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193419	113721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116352_116545_116680_120452_120595_170381_170519_193294
907022	contig_5586_pilon	-	1899	11	Intergenic	novelGene_143507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAGAAGAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430617	224684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_224694_369080_369241_373452_373623_380617_380719_383470_383572_384575_384733_391063_391238_392797_392875_392971_393126_416879_417011_429952
907023	contig_19185_pilon	+	3783	2	Intergenic	novelGene_163672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGTGCAGTGGTTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172540	177862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_173735_175273
907024	contig_1836_pilon	+	5458	3	Intergenic	novelGene_71032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGCAATTCTACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368102	685150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_368564_508053_508396_680495
907025	contig_10982_pilon	+	5896	4	Intergenic	novelGene_87869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	224	junction_2	70.153799295231	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTTTAATCCTTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111953	124514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_113147_114323_114502_118118_118243_120113
907026	contig_11493_pilon	+	4645	1	Intergenic	novelGene_143663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCCTTAGTGCTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129462	134107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_129500_134100
907027	contig_5372_pilon	+	2531	1	Intergenic	novelGene_149711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157585	160116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_+_157600_160100
907029	contig_10766_pilon	-	3497	1	Intergenic	novelGene_151243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595944	592447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_592400_595900
907030	contig_10042_pilon	+	2246	9	Intergenic	novelGene_79109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	335.861741457702	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	8	631	6321	45886	TRUE	40	ATCAATGGGAAATTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVSGDDEAALHPPPRQLQPPELHLQVPP	6313	54053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42736_43884_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50046_53261
907031	contig_17074_pilon	-	577	1	Intergenic	novelGene_145193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCATGGCCCCCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637272	636695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_636700_637300
907032	contig_16204_pilon	-	2604	2	Intergenic	novelGene_154474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2088	2447	110034	101638	FALSE	10	GTGTAGCTCCACTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDVGEIQGPVPPYSGQTPSRVQPGSGRALVRSPQALADVGGTLGPAPPHSWLTPGPVLPGTGRTLTTPHLALADVGGISGSTLAVFGVTPGLDLADAGGDPGPGSGCLRGDPSPTSC	112121	101480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_101990_110026
907033	contig_12402_pilon	-	3339	5	Intergenic	novelGene_133371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_4	41.9106191793918	154	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	705	2118	561	2678	616971	594743	FALSE	35	CATATTTATACTGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVAVEFTQEEWALLDFSQKKLYRDVMMETFSNLDSVFKQDNNEQALSVKSDSWSSVLGEICEFHGSIHQYNNQGRHLKTCTVESLYENKDGKVNKGEEGNQCGKNFSWIGNLTSLKRTSAGVNPFECLECGKTFINHLSFKYHIKSHTGYKPYHCKECGEDCICHSYLKPCVREKLCKCKDYGKPCNCFLSLTKRIRIHSGERPYGCKECGKAFSYLSSLTRHIRTHSGERLFECKKCGKTFSCSSSLATHIRTHSVERPYECKECGKDFRYFSDLTKHIKTHSGERPYECKECGKAFIYLSSLTRHIRTHSGERLFECKECGKAFSRSSSLAKHIKTHSEEKPYECKECGKAFRYFSDLTRHIRTHSGERPYECKECGKAFICSSSLTTHIRSHSGERPYECQECGKAFTRSSHLTTHIRTHSEERPYECKECGKAFKQFAELTRHVKVHSGENPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRSHSGERPYECEECGKTFIRSSHLTTHLRTHSEERPYECKECGKAFKHFSELTKHVRIHSGEKPYECKECGKAFSQFSRLTRHVRVHSGEKPYECKECGKSFSQFSYLSGHIRAHNGYRPYECKECGKAFIRSSHLTEHIRTHSGERPYKCKECGKAFFQSSHLTNHVRSHTGEKPYECKECVKPFSCFSSFRKHVRTFHEVRPYDRNVRKPLVSSHISLTI	620203	594081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_596607_597128_597256_598199_598324_616968_617210_619881
907034	contig_10861_pilon	-	2679	6	Intergenic	novelGene_39262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCGAGACTTCACTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346587	1337581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1337766_1339481_1339654_1340017_1340391_1343175_1343280_1344610_1345070_1345200
907035	contig_11448_pilon	-	3532	6	Intergenic	novelGene_66349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	68.973618144911	320	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	447	2450	186389	165976	FALSE	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERIHSINLHNFSNSVLETLNEQRNRGHFCDVTVRIHGSMLRAHRCVLAAGSPFFQDKLLLGYSDIEIPSVVSVQSVQKLIDFMYSGVLRVSQSEALQILTAASILQIKTVIDECTRIVSQNVGDVFPGIQDSGQDTPRGTPESGTSGQSSDTESGYLQSHSQHSVDRIYSALYACSMQNGSGERSFYSGAVVSHHETALGLPRDHHMEDPSWITRIHERSQQMERYLSTTPETTHCRKQPRPVRIQTLVGNIHIKQEMEDDYDYYGQQRVQILERNESEECTEDTDQAEGTESEPKGESFDSGVSSSIGTEPDSVEQQFAGVARDSQAEPAQPEQATEAPVEGGPPPHPLETGASTPERSNEVEMDNTVITVSNSSDKSVLQQPSVNTSIGQPLPSTQLYLRQTETLTSNLRMPLTLTSNTQVIGTAGNTYLPALFTTQPAGSGPKPFLFSLPQPLTGQQTQFVTVSQPGLSTFTAQLPAPQPLAPSAGHSTASGQGEKKPYECTLCNKTFTAKQNYVKHMFVHTGEKPHQCSICWRSFSLKDYLIKHMVTHTGVRAYQCSICNKRFTQKSSLNVHMRLHRGEKSYECYICKKKFSHKTLLERHVALHSASNGTPPAGTPPAAHAGPPGVVACTEGTTYVCSVCPAKFDQIEQFNDHMRMHVSDG	436787	164893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_166398_184807_186410_216685_216874_225366_225468_349238_349276_436687
907036	contig_6914_pilon	-	3624	1	Intergenic	novelGene_151767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	842	2529	5	2533	426159	423631	NA	10	ATGTTTCTTTCTGGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAEKNEPSHIPEQMLPPLPPPPPPPPPPPPVLPHPAAPSPAQANAVLAPVKSNPAVSQALSPGFLAPNILNPVLPVAIVASAQPAAIPSDETAPGVSESDRDQALFSLLVRPPPPLSSVFSEQAKKLEKRNSCLATANAKDLYDIFYSSGGKGAPETKLSSGPLANGENGNLSRAESSNNSSTSTLNSSASQEQLPQDRGLVTAPLVSSPEKPIAKTVVSLGKWSVVEHIDQKSRDSSHGFLQPLTRLCQSKHYETITPKTDTLAMWTSSSFQSDANKDMPSEGKIKLDLGEPGPPGIEPAPQRSDTHCPTMGSQKLLAVHLIESGNQDEENQELHQSEDCREGEVETNTALKKTGAKLSKGMVEEGVGINLKPHSIENSNLNDGNRYMWEGEAEQPKLLMTDREAEQPKKLMKGSETQSKVVIELSARAVSSTKAKRDSFPSDVRSLLQNPQDKPVKNSAPKLLLQSSVRSDTCLTDSPQEQGVSVGSEEWLENSAPESASKISRYRSLKLKRERSKGLQGKMIYGLAVWDENMKKPETWGNPEKPESEALELRGVHPELTVTIESKTSQDFETTDLKLEELAALGNMGDICVDFCSTQVEPAHRSPTAVSQKLCQENSASLIGCNPSTPADFEPIPSFPGFPLDSSKPLVLNFGAEGEQNSSNPRNGRITPNILKTRLPIENVDLGLGSLEVTHQALDLLAGGRLPEEVEETSQLEKQESLRLESETINSSGLGPSPCLPDLVDFVTRTSGVQKDKLCSPLSEPGDPPECSSLEMGPLQLEIPNASITEVAIPQVDEDNSRSLPREQVVGGNLVPQQMPAQEATVDAVQELMESSVHN	426163	422539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_422500_426200
907037	contig_12312_pilon	+	5196	21	Intergenic	novelGene_63949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3623	4027	235129	242359	TRUE	15	CTCGCAAGCCAGGGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFGHKPPDGSLTYSPVIHCGIINPPLGLLNLALKMDSCFGGSAVGHSPIGFGLQVLQGRGHLFGQRPGLWSISLPCLRRSANLEVRADISPSERRMSSLSLGSSHNSAIFRASAKAPRLRAAFSTFAVSTSRP	213837	326162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_215980_218216_218326_218673_218880_223841_224029_225333_225458_226679_226983_228087_228196_229392_229543_233702_233833_234965_235165_237713_237905_241325_241455_242310_242408_245860_246008_246881_246973_256293_256456_257907_258034_259774_259880_260265_260421_278131_278200_325895
907038	contig_6544_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_142074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCAAGGTCAACTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50743	48033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_48000_50700
907039	contig_2054_pilon	-	9888	16	Intergenic	novelGene_51670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	72.9275439505998	357	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2568	7707	1187	8893	97338	49983	FALSE	20	GACTGTTGATTATGCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSGSGQGSAARMDHETASVLSSSSTHSAPRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQSGCLPLLIQLLHGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRGRREIRVLHLLEQIRAYCETCWEWQEAHEQGMDQDKNPMPAPVEHQICPAVCVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQVDCEMYGLTNDHYSITLRRYAGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDLQQVIASVLRNLSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCTENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNEDHRQILRDNNCLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWDMGAVSMLKNLIHSKHKMIAMGSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLPSLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLSPKASHRSKQRHKQNLYGDYVFDASRHDDNRSDNFNAGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGSLDSSRSEKDRSLERERGLGLGSYHPATENPGTSSKRGLQISTTVAQIAKVMEEVSAIHTPQEDRSSESTTELHCVPDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCPLPYAKLEYKRSSNDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSVESYSEDDESKFCSYGQYPADLAHKIHSANHMDDNDGELDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWARPKHIIEDEIKQSEQRQSRSQSTTFPVYNESTDDKHLKFQPHFGQQECVSPYRSRGPNGSETNRVGSNHGINQNVNQSLCQEDDYEDDKPTNYSERYSEEEQHEEEERPTNYSIKYNEEKHHVDQPIDYSLKYATDIPPSQKPSFSFSKSSSGQSTKTDHISSGSENASTPSSNAKRQNHLHPSSAQTRSGQTQKAASCKVPSINQETIQTYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCDQTTQETDSANTLQIAELKENGGTRSNEETVSEVPAVSQHIRTKSNRLQASGLSSSESARHKAVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQETPLMFSRCTSVSSLDSFESRSIASSVQSEPCSGMISGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPPPPPQTVQTKREASKNKVSNAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGFSCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPEESNENQEKEAEKPVDSEKDILDDSDDDDIEILEECIISAMPTNSSRKNKKPAQTASKVPPPVARKPSQLPVYKLLPSQNRLQAQKHVMPRVYCVEGTPINFSTAASLNDLTIESPPDELAAGEGVRAGAQSGEFEKRDTIPTEGRSTDEAQRGKTSSITIPELDDSKTEEGDILAECINSAMPKGKSHKPFRVKKIMDQVQQASASSSGTNENQSDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNTDTKNNLNAERTFSDNKDSKKQNLKNNSKDFNDKLPNNEDRVRGSFTFDSPHHYTPIEGTPYCFSRNDSLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKGKENKESEAKVTSHTELTSNQQSANKTQAVTKQPINRGQSKPVLQKQSTFPQSSKDLPDRGAATDEKLQNFAIENTPVCFSRNSSLSSLSDIDQENNNNKENEPIKETEPPDSQGEPSKPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQECISSAMPKKKKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILAEDLTLDLKDTQRPDSEHGLSPDSENFDWKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHLTPDQEEKPFTSNKGPRILKPGEKSTLETKKIESENKGIKGGKKVYKSLITGKVRSNSEVSSQMKQPLQTNMPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKGPPLKTPASKSPSESQTATTSPRGAKPSVKSELSPVTRQTSQPSGSNKGPSRSGSRDSTPSRPAQQPLSRPMQSPGRNSISPGRNGVSPPNKLSQLPRTSSPSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGFPKNGSSIPRSESASKGLNQMNNSNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSPTLRRKLEESASFESLSPSSRPNSPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQPGGWRKLPPNLSLTVEYNDGRPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKREHSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSESSEKAKSEDEKLVNSISATKQTKENQVPTKGTWRKIKESEISPTNSTSQTTSSGATNGAESKTLIYQMAPAVSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVTEKGNSDVKDSKDYQGHQNVGNGSAAVRTVGLENRRNSFIQVDSPDQKGTEAKLGQSNAVPAPENSESSIAERTPFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADGTSARPSQIPTPVNNNTKKRDSKTDNTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV	203994	48987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_56542_58136_58352_65648_65766_66046_66125_66710_66851_72068_72165_74194_74574_77018_77118_97314_97418_105084_105169_124994_125109_127144_127254_130938_131141_132268_132354_150798_150952_203634
907040	contig_5302_pilon	+	2114	1	Intergenic	novelGene_81545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636729	1638843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1636700_1638800
907041	contig_7415_pilon	-	2835	10	Intergenic	novelGene_168673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	24.0452248795093	163	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	212	1633	304553	234983	FALSE	70	ATTGCAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAAENEGIAGGDCLSGAEGARLRPESCREEVLAGMAKACGGEEGNGLTGMEKTGVGGEGSGQKEEDMQVDLKVVKQEIIDWSEIEEYKLDAQWVKQEVEDGPEVKDEKADTLEVKQEMDASLVIKEEKMDELEIKEEKVKVKKEVVDWLEVKEEKEIKFEIKKEEILGDQNIKEEEMMDGVCVKEEKDILKREVMDDTKVKEEPEINPPVSCKRKLAMSRCETCGTEEAKYRCPRCMRYSCSLPCVKKHKAELTCNGVRDKTAFVSIQQFTEMNLLSDYRFLEDVARTADYISRDTFLKRPTGNKHMYYLKNRARRQGIYLKLLPNGFTKRKENSTFFDKKNQQFYWHVKLLFPQSQAVYIEKRVPDNKTINDILRTYIDPEKSDPVIRQRLKAYIRSQTGVQILMKVECVQQNLVSYYELDPCRSLLDNLKNKVIIEYPTLHVVLRGSSTDMKVLQQVKSESTKNFGSES	304764	233780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_235024_239414_239540_259273_259352_261404_261486_265596_265666_294721_294826_302270_302357_302441_302549_302634_302701_303888
907042	contig_6065_pilon	+	1789	2	Intergenic	novelGene_132706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	11	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	26	349	507715	509792	FALSE	45	CGCAGCATCCAATAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESHLRSGKMACGMLVLVVPLWPSTGGLLRNCLERLQRNFLQSRPGFPSPPWGPTLAVQGPAVFGEPANDSSGSKEISSLLDSIFWMAAPKNRRSIEVNRCRRRNPQKLIKVKVTY	507689	511232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_+_507845_509598
907043	contig_9919_pilon	-	4340	26	Intergenic	novelGene_137958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	218.315785961529	118	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	1430	3136	591968	546439	FALSE	55	TTCTGAGAGAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGAPEVIASLCKPDTVPADFEKVLEKYTKEGFRVIALAHRKLESKLTWHKVQNVNRDTIENNMDFLGLIVMQNKLKQETPAVLAALHNADIRTVMVTGDNMLTALSVARDCGMILPQDKVIIAEALPPKDGKVAKINWHYADTVSQCSSSSAIDSEAIPVKLAHDSLEDLRVTRYHFAMNGKSFSVIQEHFQDLVPKLMLHGTVFARMAPDQKTQLVEALQNVDYYVGMCGDGANDCGALKRAHGGISLSELEASVASPFTSKTPSISCVPNLIREGRAALITSFCVFKFMALYSIIQYFSVTLLYSILSNLGDFQFLFIDLAIILVVVFTMSLNPAWKELVAQKPPSGLISGTLLCSVLSQIIICIGFQSLGFFWVRQQPWYEQWHPQSDACNTTGGLYWNSSHSDNVTEHDEHNIQNYENTTVFFISSFQYLIVAIAFSKGKPFRQPCYKNCLFVLSVIVLNVFVLCIMLYPIAPVDQALQIVCVPNQWRIIMLTIVAANALVSFLVEGSIDRWGGCCLSWVLGCRKKMPEAKYMYLAQELLVDPEWPPKPQTTTEAKTLCKENG	613652	545234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_546613_555959_556041_568214_568304_578847_579036_580713_580892_582979_583053_583935_584033_584332_584443_584535_584579_585204_585285_585362_585486_585998_586175_587892_588018_591702_591824_591919_592095_592768_592886_595914_596066_597726_597789_600464_600654_601369_601528_601674_601855_602967_603100_608944_609018_609550_609686_611332_611403_613616
907044	contig_16122_pilon	-	4855	5	Intergenic	novelGene_134487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	107.565096569473	80	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAACAAACAAACAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110577	102770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_103436_103517_107484_108757_108867_110332_110368_110497
907045	contig_8588_pilon	-	1960	4	Intergenic	novelGene_146511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTAGTAAGTTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403105	396096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_-_397477_400437_400565_401630_401719_402740
907046	contig_9127_pilon	+	1810	8	Intergenic	novelGene_103026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	72	junction_3	86.8066112407462	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	629	1339	237446	251465	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPNVDPYDTYEPNVLGGTLVAHSDAVWGLAYSGIKNQLLSCSADGTIRLWNPQEKLPCICTYNGDKEHGIPTSVDFIGCDPAHMVTSFNTGSTIIYDLETSQSLVILSSQVDSGLQSSNHINRVVSHPTLPVTITAHEDRHIKFFDNKTGKMIHSMVAHLDAVTSLAVDPNGIYLMSGSHDCSIRLWNLDSKTCVQEITAHRKKLDESIYDVAFHPSKAYIASAGADALAKVFV	236340	251936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_236836_237035_237084_237360_237483_241423_241592_242594_242736_245261_245370_251124_251212_251295
907047	contig_1532_pilon	-	5801	3	Intergenic	novelGene_37439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_2	639.5	308	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	66	332	32217	29406	FALSE	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLLLKRQTANSPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMVYLIFYSPNN	34926	23936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_29505_32049_32227_34870
907048	contig_14563_pilon	-	3269	5	Intergenic	novelGene_135026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_4	352.42117913088	28	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	2800	3267	59477	55404	FALSE	65	AATGAAGAAGAAACAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHKSIPVDPEEKKKYCLSCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVESDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGVVKGGEEAKLKKRKPRVKKENKAPRLKDEHGIEFSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKS	62276	55401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_55425_56439_56569_57838_57962_59087_59239_59433
907049	contig_10323_pilon	-	2491	9	Intergenic	novelGene_123570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	1324.6380637744	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1483	1935	468796	452590	TRUE	65	GAAAAAATGAAAGCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFLQDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLVWFGPRVLA	470278	447097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_447164_448195_448301_449824_449905_450804_450923_452277_452328_452452_452619_463310_463453_467386_467480_468607
907050	contig_9609_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_22929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGACAACCCAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47723	49693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_47700_49700
907051	contig_13051_pilon	+	2425	3	Intergenic	novelGene_140120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1033	1395	367911	368273	FALSE	10	CCAGCTGCTTTTGCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVWSPAFSSTGYRADIKSKRKSFPSAYAKWPIPSNWMHICQMLLFIEQTVGLGFDKAGEDVTWQVCALDVMAWRLDCFIVSSSPISSASIQVTKYQFSWLVYSSSTDVTISRSSSGLV	347675	369303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_347700_360683_360902_367120
907052	contig_14727_pilon	+	2240	2	Intergenic	novelGene_56633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATGCCAATTGAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159502	164160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_160237_162654
907053	contig_8174_pilon	+	1832	4	Intergenic	novelGene_160052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	131.029258819039	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	68	1168	246362	294744	FALSE	35	GTAAATGTTCTAAAGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESAITLWQFLLQLLLDQKHEHLICWTSNDGEFKLLKAEEVAKLWGLRKNKTNMNYDKLSRALRYYYDKNIIKKVIGQKFVYKFVSFPEILKMDPHAVEISRESLLLQDRDCKLPPEVREAHKHSLSALKSTSRNEYIHSGLYSSFTINSLQNPPDSFKAIKTEKLEEQPEGSPPVEEVRTVIRFVANKTNKHVTRPVVSLPSTSEAAAASAYLASSVSAKISSLMLPNAASISSASPSSSRSPSLSPNSPLPSEHRSLFLEAACHDSDSLEPLNLSSGSKTKSPSLPPKAKKPKGLEISAPPLVLSGTDIGSIALNSPALPSGSLTPAFFTAQFPTLLNGHMPVPIPSLDRAASPVLLSSSSQKS	240804	295408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_240870_246359_246569_274876_275672_294645
907054	contig_10176_pilon	+	2694	2	Intergenic	novelGene_72710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	545	junction_1	0	100	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1440	1772	252607	253257	FALSE	10	GCTCTGACTTTGCCCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIQLVEALCGFQKPISTLDNRTIVITSHPGQIVKHEDIKCVLNEGMPIYRRPYEKGRLIIEFKVSYKVACEYLRTVNLLKSGTELHFSECQETLKIYCVLPCPGRNTLI	251167	254179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_252698_253015
907055	contig_14472_pilon	+	2421	19	Intergenic	novelGene_111170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_13	118.58096155979	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2190	232	2421	348317	381586	FALSE	50	AAGAAATTCTACAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAFRNHCPHLDSVGEITKEDLIQKSHGACQDCKVRGPNLWACLENRCSYVGCGESQVDHSTIHSQETKHYLTVNLTTLRVWCYACSKEVFLDRKLGAQPSLPHVRQLHPTQENSVQDFKIPSNTTLKTPLVAVFDDLDIEVEEEDELKARGLTGLKNIGNTCYMNAALQALSNCPPLTQFFLDCGGLARTDKKPAICKSYLKLMTELWHKSRPGFVVPTNLFQGIKTVNPTFRGYSQQDAQEFLRCLMDLLHEELKEQVMEIEEDTHAVTTEESMEEDQSQSDIDFQSCESCGSSDKAENENGSRGFSEDNNETTMLIQENENNSEMSKDWQKEKMCNKINKINSEGELDRDSVSETVNLNNQETVKVQIHSRASEYITDVHLNDLSTSQILPSNEGVNPRLSASPPKSGNLWPGLASTHKKAQSASSPKRKKQHKKYRSVISDIFDGTIISSVQCLTCDRVSVTLETFQDLSLPIPGKEDLAKLHSSSHPTSIIKAGSCGEAYAPQGWIAFFMEYVKSWFWGPIVTLQDCLAAFFARDELKGDNMYSCEKCKKLRNGVKFCKVQKFPEILCIHLKRFRHELMFSTKISTHVSFPLEGLDLQPFLAKDSPAQIVTYDLLSVICHHGTASSGHYIAYCRNNLNNLWYEFDDQSVTEVSESTVQNAEAYVLFYRKSSEEAQKERRRISNLLNIMEPSLLQFYISRQWLNKFKTFAEPGPISNNDFLCIHGG	317619	381586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_317800_348265_348398_348572_348627_349053_349117_350953_351107_356818_356922_359568_359639_362186_362301_364657_364737_368352_368765_369622_369764_375655_375772_377265_377439_377559_377631_378279_378314_379351_379398_379974_380156_380607_380735_381414
907056	contig_20670_pilon	-	3117	7	Intergenic	novelGene_144836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.516416373165	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	148	861	60880	52878	TRUE	45	AAACACTAGAATTTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGCRCPADSNFPSHVSAGSSSAWTEGGGLPVSQSQEIFSSLQPFRSQVYMHPSLSPPSTMILSGGTALKPPYSAFPGMQPLEMVKPQSGSPYQPMSGNQALVYEGQLGQAAGLGASQMLDSQLPQLTMPLPGSQLPLPRYGSGQQPLILPQSIQLPQGPSLSVGAPRRVLPPGSQPSVLNTSRESSQMEMKGFHFADSKQNIPSGGSVPSPQTYRPSSASPSGKPSGSAVNMGSVQGHYVQQAKQRVDEKPSLGSVKLQEAPSAASQIKRTGAIKPRAVKVEESKA	61591	50203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_50431_50848_53013_54342_54425_56700_56793_57515_57693_60652_60894_61457
907057	contig_6497_pilon	-	2879	7	Intergenic	novelGene_35642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_6	495.293431546728	37	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	1685	2878	754656	751350	FALSE	55	AACTTGAAATGTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAGASLKLAQFPKSHCELSTTPKGIYSLIQSLQNFNALGFLSIFKLQASETLRNSTHSSTAADLLQAKQQILSHQQQLEEQDHLLEDYQKKKEDFKMQISFLQEKIRAYEMEQSKKVENSNKEEIQEKEAIIEELNTKIVEEEKKTLELKDKATAADKLLEELQEQVVQKNQEIKNMKLELTNSKQKERQCSEEIKQLMGTVEELQKRNHKDSQFENDIVQKMEQETRRKLEQLRAELDEMYGQQIVQMKQELIKQHMSQLEELKTQHKGEVENALRSYPNINEDQIKLMNVAINELNIKLQDTNSQKEKLKEELGVISGEKSALQKQLKDLLEELSFSRDQIQRARQTIAEQESKLSEAYKSLSTVEDLKAEIVSASESRKELELKHEAEVTNYKI	790218	751348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_752208_754320_755555_756694_756863_757225_757280_764427_764473_767272_767531_789957
907058	contig_13295_pilon	-	3053	3	Intergenic	novelGene_31239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	75.5	106	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134802	96698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_99517_101889_102009_134686
907059	contig_4125_pilon	+	2092	7	Intergenic	novelGene_25063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1207	1689	408465	410346	TRUE	0	GCCGCTCGCCGGGCGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNKFASAPPRSPWWRLACCSPGGFGPATGTCPLNSGAPCWPRWASPSGTTSGRGRVGGLLLSSSWAFCFCLISSTTSGNNSQKTLSFRLNTKLCAASCLFVKSEVSMLPSVGPFSTMKLRSPVRMVETDHAGFHVSGWKSVMERHSLVLHLNLPLGVII	407258	420310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_408685_409386_409469_410086_410225_410303_410407_413266_413308_415858_415991_420140
907060	contig_5260_pilon	-	5216	1	Intergenic	novelGene_144346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAGGTCAGCAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76029	70813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_70800_76000
907061	contig_6710_pilon	+	3629	2	Intergenic	novelGene_96820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACAGTGATGGCTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653369	657177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_655547_655725
907062	contig_6635_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_127026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGACAAGGGCCAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469935	467629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_467600_469900
907063	contig_4508_pilon	+	6096	5	Intergenic	novelGene_177527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	14.0890028036054	404	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2920	3231	38589	42568	TRUE	50	AATAAAAGACTGGTATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGNKGRGRAAYTFNIEAVGFARGEKLPDVVLKPPPVFPDTDYKPVPLKTGEGEDYMLALKQEFRETMKRMPYYIETPEEKQGSQPGYQIIFSSHVPLGSSRL	21667	45899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_+_24554_38555_38706_41058_41189_42503_44517_44982
907064	contig_12151_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_54987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATTAGAAAAAGACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002812	1005252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_1002800_1005300
907065	contig_610_pilon	+	2829	8	Intergenic	novelGene_76674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGAGAGTTTGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31072	68978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_32983_34644_34710_35446_35548_37078_37131_37767_37832_38333_38536_44933_45277_68886
907066	contig_14060_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_156061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152076	148959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_149000_152100
907067	contig_7707_pilon	+	3608	3	Intergenic	novelGene_72136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_1	12	10	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTACCACTTGGGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95767	105012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_97575_97780_97876_103306
907068	contig_3832_pilon	+	4291	3	Intergenic	novelGene_161459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	750	1139	346235	346624	TRUE	80	GGAAAAAATATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLQLENLKGRTHSAFLKLKELKKKFKSRVAILKDSIGKKLNDTGSIKRRRQEYKESMYQKELVDVQPFQEIVCDQELMILKEEVQAALTALAGKKRHQELMEYQLRCFNKQMQLWKCSLVYVKKFR	345485	486879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_347024_424346_424525_484304
907069	contig_15047_pilon	+	1631	6	Intergenic	novelGene_52211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	71	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4687_21013_21062_21232
907070	contig_4339_pilon	+	3015	1	Intergenic	novelGene_146094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	7	297	1106032	1106322	NA	35	ATATTTACCTTAGCAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPMNHRYHSLSQTESSTTRWCLATTTNCSDRNHNRGFWMELEKNVEQNSNSQKKISLTSLTETRNPESMASGHLLNSVLKSLLRFTLQPKIRQAHKTK	1106025	1109040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1106000_1109000
907071	contig_854_pilon	+	5455	28	Intergenic	novelGene_36608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	3536.14775053026	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	1690	4032	1702628	1714980	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1687058	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701371_1702561_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
907072	contig_7428_pilon	-	3375	3	Intergenic	novelGene_77702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	20	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAAGTGTCTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397107	274784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_277358_396249_396420_396475
907073	contig_13215_pilon	+	2345	10	Intergenic	novelGene_145875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	115.225811580223	162	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	85	846	15741	35589	FALSE	50	TAAAACTCAAATAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLETLETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETEAE	14557	37088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_14640_15738_15798_20939_20986_22257_22313_23901_24029_27021_27188_27729_27768_29075_29223_32859_32954_35557
907074	contig_13740_pilon	-	2757	12	Intergenic	novelGene_34759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_2	217.510444320335	4	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	45	662	873748	745268	TRUE	80	AGAAAGGAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNPSCTFSPYPLPEEIRNLLADVETFVADVLKGENLSKKAKEKRESLIKKIKDVKSIYLQEFQDKGDAEDGEDYDDPFTGTPDTMSLASERFDKDDDAPSDGNQFPPIAAQDLPFVLKAGYLEKRRKDHSFLGFEWQKRWCALSKSVFYYYGSDKDKQQKGEFAIDGYSVRMNNTLRKDGKKDCCFEVSAPDKRAYQVEVFMLP	873792	686472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_687218_687597_687700_701868_701982_707486_707568_743868_744007_744351_745417_757233_757318_758391_758470_855034_855143_863132_863159_863777_863884_873681
907075	contig_4604_pilon	+	1691	2	Intergenic	novelGene_19193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAATTTTGCTCTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527250	532768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_528923_532749
907076	contig_12528_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_81341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTGGACATATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951681	954786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_951700_954800
907078	contig_366_pilon	+	4047	11	Intergenic	novelGene_51578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3481	3786	802966	803271	FALSE	30	GAAAGCGATCTCGAGCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKEPEPIFRTSLYFPPTMNSALEPLLLAILRNEDGRLGPSPDTYEGRMGPLGLVHGAKLRRASGNGKWRSFLGVTEHRTGLGNLITAAQSGFFLPGRSL	754619	803532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_757104_764197_764353_765330_765429_768020_768099_769051_769129_770343_770482_774320_774407_776793_776894_780059_780183_802169_802276_802930
907079	contig_18108_pilon	-	2715	1	Intergenic	novelGene_33484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247825	245110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_245100_247800
907080	contig_12793_pilon	-	2376	10	Intergenic	novelGene_164112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_9	99.6906325700776	151	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	30	1319	256471	134019	FALSE	35	ATATTCTTGAAGTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDGNALVPLRQKQRKKTQGFFTMSRRRVSCKDLGHADCQGWLYKKKEKGTFLSNKWKKFWVVLKESSLYWYSNQMAEKADGFVNLSDFTVERASECKKKHAFKISHPEIKTFYFAAENLQEMNVWLNKLGLAVIHQASTAKDEECYSESDQEDPEGAVETPPPPSSSETLAASAARQASSSSSKLSEASCSFSSLENARKMSSNVSSSSSKEMQSWLDIVNSSSAAEDAGQSITFAVRGHSPLPSEANSRKVQEDATSESGFLNSLSSDDTSSLSSNLDHLTVPDKPTGSKTPEREEIKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIRTLNSTLKCKEHDLAVINQLLDDPKLTARKYREWKVLNTLLIQDIHQQQRAMPAPESNPQELEKQPPSAYVESSI	256500	132961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_134223_149112_149307_178540_178908_190430_190520_191880_191940_207042_207115_208603_208678_238094_238265_238907_238945_256447
907081	contig_9668_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_58122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	516	842	223428	223754	NA	45	CAAATAGTTATACATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEIICDLLMCCKLYHCDEVILMRFTRLDSILIQCLLRYKRERRTETHGNLTSPRKQCREQSASFGPVVPALRCSQTKGRLMHHKDLPPELTERERAFFWS	222912	223863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_222900_223900
907082	contig_6108_pilon	+	2260	2	Intergenic	novelGene_171297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1725	2168	903194	1094043	FALSE	45	AATTACAGACAAATATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKNKNEKKRKRVKEKNEEIDKLEMKKDKKGIREENKTKKQKKIKNEMGDITTDPTETKRILTEYYEKLYSNKFENLEEMDTFLETHGLPKLPQSDVENLNRPITREEIEKVKKKLPTKNTPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLF	901469	1094135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6108_pilon_+_903323_1093728
907083	contig_9363_pilon	-	808	8	Intergenic	novelGene_6747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	607.080702700915	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	61	714	1546072	1505415	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSFSFQDSLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITLMREPVGRCRKVWMDYGSHILQGSAFPVSPLLHSLSWDSNTPYAVAPVRL	1547691	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505568_1539105_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546222_1547667
907084	contig_10580_pilon	+	3855	2	Intergenic	novelGene_178829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	0	187	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	357	965	513	1903	FALSE	30	TGAATTGTATGGCATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQHPQVKGPGIGLLGISLGADICLSMASFLKNISATVSINGSGFSGEKTIQYKQTNIPSLGHELRRIKVTFSGLMDIVDIRNDIVGGCEHPSMIPIEKAQGPILFIVGQDDHNWRSEFCAQLASERLQAHGKEKPQIISYPGTGHYIEPPYFPMCPASLHRLVDKPVVWGGEPRAHSKAQVDAWKQILIFFCKHLGASPKL	156	4793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10580_pilon_+_531_1312
907085	contig_10861_pilon	+	944	6	Intergenic	novelGene_39238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	186.4	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	19	321	603123	605721	TRUE	20	CCCAGTCAGGTTGATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELLEVMVGAVALEDLLKETTYEFFEGGWMFSWVVSLAVTGNEMKRMMSYSQTRMLMSAFFCLTGDLLLLCLGGGGIRLGGVLLLGDGRLLGLGRLLGEYDLDRDL	603104	609018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605072_605190_605701_605897_606400_606601_607921_608038_608886
907086	contig_10135_pilon	+	1610	2	Intergenic	novelGene_106630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_1	0	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	513	854	90686	91027	FALSE	15	TTGCTGTGGAGTCAATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSPQNSLSQPPSAHIAFPGVSLAQLFTVLSSTFRFVLLYFTLILHNCNRGAKITEKSLGAHLANRNPPSYSCHSTVSMGSPYSVLGAHLLSWHLSHRSGIFVLPDFLSTRL	88421	91783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_88709_90460
907087	contig_6279_pilon	+	2470	5	Intergenic	novelGene_164758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	604	1074	31631	32101	TRUE	45	TGAAGGAAGTGGAGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSSPAAIPWEKHMAVYFCKDLQLWKPYGAVLLCSIASLRVRIDWMAMGLVWFLTYVRRCIIIPFILYTKMTARKQLEDILRTFMYLRYMKIRLMGIFILGLNMFTVSNFLAVSVPCSVLPITLLNFLYCHFHSRTMQVVFEKTSMFRKIILLLY	31027	123710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_+_32991_91068_91224_94232_94345_118670_118767_123566
907088	contig_18162_pilon	-	3415	3	Intergenic	novelGene_122290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAACAATTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9148_9271_10809_16364
907089	contig_6097_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_174439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACACTACAAGGCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131518	128896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_-_128900_131500
907090	contig_5889_pilon	-	3813	2	Intergenic	novelGene_133690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCATAGAGATGTCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246748	242879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_245863_245918
907091	contig_3747_pilon	+	1788	6	Intergenic	novelGene_24876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4644.22791861037	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	235	846	201313	204240	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFAN	201078	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202892_204223
907092	contig_21232_pilon	+	3909	9	Intergenic	novelGene_165972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	189.666154070778	261	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	2536	3153	19639	26084	TRUE	20	GTCGATTCCAATTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTYRLLISGNSSNPVENITGVGTTYATVCGLIPGSSYTVEIFAQVGNVTEGASSSASFCTDAAPVNFSCEPVPREPTLVLTWALPPGNNAGFKLEVSSGACDNMTCLENCSLENGTSCMAEVTHLNFCTSYNISITTLSCGKNASSVQKTCTTDSTDPPPSVEAPVITSVSHNSIKVTFSEFNDSHGPIKAYALIVTTEKGSFS	3276	28261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_4059_17885_19823_22219_22508_25330_25463_26070_26242_26445_26571_27267_27477_27592_27718_28121
907093	contig_9809_pilon	+	3145	7	Intergenic	novelGene_176758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	139	junction_2	132.51215877127	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1699	2040	112291	114954	FALSE	70	GTAAAGTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVILYFLLEN	108290	116059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_110410_110496_110652_111871_112241_112362_112466_112590_114806
907094	contig_4496_pilon	+	3979	1	Intergenic	novelGene_66708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAATGTGTTCTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000968	1004947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_1001000_1004900
907095	contig_14243_pilon	+	1193	7	Intergenic	novelGene_57434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.6766812457914	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	495	1028	695243	700060	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVHTLSTYPELNSSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIKHMEIDIIKRETTGTGPNVYHENDTIAKYEIMDGAPVRGESIPIRLFLAGYELTPTMRDINKKFSVRYYLNLVLIDEEERRYFKQQEVVLWRKGDIMRKSMSHQAAMASQRFRGHSLPG	672135	700225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_672237_672718_672903_690570_690728_695190_695356_697328_697505_699384_699528_699958
907096	scaffold_880_pilon	-	4062	3	Intergenic	novelGene_121431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	950	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTGAGGAAGTGAGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428563	408584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_408780_420187_420364_424872
907097	contig_5419_pilon	+	1965	4	Intergenic	novelGene_15554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_1	16.3571255285137	139	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTATTGATACTTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539408	552332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539733_540053_540147_541812_541927_550898
907098	contig_18055_pilon	+	1637	7	Intergenic	novelGene_117829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	723	junction_1	275.779350205921	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	113	643	77213	80793	TRUE	70	AGGAAGAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	77100	85628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
907099	contig_1154_pilon	+	2520	1	Intergenic	novelGene_87127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAAAAAACTTTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452065	454585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_452100_454600
907100	contig_665_pilon	+	5556	17	Intergenic	novelGene_158220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_10	73.5773402617953	365	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1175	3528	42	3569	340792	373206	FALSE	20	ATAAAGCCTTGTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRSMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGSRATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHYRILDFTATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLKSKTSCANLKKFEEVINQETFWVASEILREPNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFSSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRSLSQGSTNATLLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKCETSPVAPRAGSQQKAQPQPPPQKVSQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSSERHKKQAEDTISNVSSQLSSPPTSPQTSPRKGYTLAPSGTVENFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVPLHDERPQRHSVSIVETSLGVGRMERRPLLEPDQYSLGSYAPVSESRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPPGLWASSSHMDQIVFADHSTKYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEGSEGDTGTIKRRGGKDVPTDAESSSTAPVPPEDARPAPVPAHGATTSSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSEGPGPSPVQQPHGHPASSRPTSKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSAEEDEDEQVSAV	340750	375193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_340849_343184_343293_343388_343593_343692_343802_344599_344847_352162_352321_352918_353160_355476_355861_356888_357101_357187_357312_359001_359226_360623_360813_364669_364823_366913_367140_367656_368217_370986_371293_373180
907102	contig_11186_pilon	-	2451	2	Intergenic	novelGene_98880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCTAGGCCTGTACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264515	261840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_261945_262168
907103	contig_16496_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_5196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3926	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1676_3255
907104	contig_6797_pilon	-	2388	3	Intergenic	novelGene_178239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAGATGATGTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276723	225196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6797_pilon_-_225777_226045_226869_275738
907105	contig_8377_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_35020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTTCTGGAAAGCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69517	68224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68200_69500
907106	contig_14953_pilon	+	3460	19	Intergenic	novelGene_137278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_18	87.8097691350772	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	441	2243	287858	470162	FALSE	20	GTATGTTGAACTTGTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPIALGSRWLVYAENKLIRCHQSRGGACGDNIQSYTATVISAAKTLKTGLTMVGKVVTQLTGTLPSGVTEDDVAIHSNSRRSPFVPGIITVIDTETVGEGQVLLSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQSAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAVFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVEHMMEPRPLSTASKISDDTPLEIMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLLAGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSCPVSDRRGVSTVIDAASAQQSFLRKCSASHLGERHLRS	110639	471379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_110680_117909_118017_152898_152981_258284_258393_278944_279022_287831_287909_292039_292124_301000_301172_310457_310552_359693_359828_372501_372767_400496_400648_419395_419521_421867_422034_423962_424064_451465_451567_455028_455226_458455_458554_470097
907107	contig_5286_pilon	+	2504	1	Intergenic	novelGene_157383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	532	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	190	507	609772	610089	NA	50	TAGACAAATTCATGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLAGDRTTGNQKHTLSHPPPLFIPTQPPLLPVAKVTWLGGTSFSPVPLGFHLPTLASSLSAVCLLLMLLFPILLVSFIYLTTFPSFLSNTWLHVPSLLLLERL	609582	612086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_609600_612100
907108	contig_2342_pilon	+	2539	2	Intergenic	novelGene_132777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGAAACTATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599387	602101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_600210_600384
907109	contig_15610_pilon	+	565	2	Intergenic	novelGene_154274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	46	junction_1	0	45	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTGCTGTGGGAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368128	373471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_368423_373200
907110	contig_5894_pilon	+	3919	2	Intergenic	novelGene_83061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	25	junction_1	0	352	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3	449	703234	703956	FALSE	20	TATGTCTGGTCTGTTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPGPFRRTPLVCLSVCGGGGRICGYFVAESGPGFPAAAEVGPGRPWAPGLGRKRLRRCSGLSSERRYVPVLERSETTRLRARGRWRPEVPRPVLSAKARILLFLQEKEIYIQRLHPTESLRLKRFKRLRSTGSPDERGSAGNRERENV	703231	707426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_703292_703567
907111	contig_4884_pilon	-	3863	4	Intergenic	novelGene_63826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACTTAAATTTGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585231	577839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_581361_582398_582484_584841_585018_585150
907112	contig_15371_pilon	+	2758	1	Intergenic	novelGene_151466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAGTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195547	198305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_195500_198300
907113	contig_9484_pilon	+	1319	9	Intergenic	novelGene_105653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	658.736847591662	6	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	76	861	126829	201271	FALSE	65	TGGGAAAAATAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKESTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSEPVWWVQEPPSCLDSEPRHVHSTADKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDVSQRHPEYCGSACWIH	126753	201729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198282_198435_201121
907114	contig_19802_pilon	+	2433	3	Intergenic	novelGene_176324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	50.5	525	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	409	618	5875	6084	FALSE	30	TCAGGCTACTTCCAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEITVENLPTYLRLQKPLLILFSDGSINHKYEEVILTLIKQKHLDSLTPCWLNLKNTPVGRGILQAYFDPLPPLPLLVLVNLHSGGQVFAFPSDQSITEQNLLLWLQKLEAGLESYIRILPAEEWKPPLPAYDFLSMMDDATSQHPIRKAPKCMKETDVQENDKEQHEDKSTVRKEPVETLRIKHWSRSNWFKEAEKSFRHEKEL	1150	7899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19802_pilon_+_1312_3510_3702_5818
907115	contig_2703_pilon	+	3780	14	Intergenic	novelGene_101723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	818.714528568988	72	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	280	1461	559489	609419	FALSE	60	AAAAAAAAAAAAGTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESSLFLGLCFQGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLEVKKIK	526187	611738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_584431_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320
907116	contig_1146_pilon	-	13491	61	Intergenic	novelGene_84824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	142	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	11819	12133	876925	874888	TRUE	10	TCTCTTCCAGACCCGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQCTVMLGSKLPSKTPTHSLAAVNTASEKNTWFAAVTHLITLYRTSVTYASVIGGPRIGLKRSPMLLTTVLNTRRSAASFGNDTDGGGTSSSTDSPEATWLRS	931355	841595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_841936_865013_865171_865678_865835_868286_868425_869380_869439_870487_870702_871486_871614_872211_872283_873172_873270_874887_875066_876788_877013_879120_879222_879760_880032_881586_881722_881884_882047_882476_882593_886933_887020_887107_887210_887694_887837_888385_888585_889036_889233_889417_889581_890324_890483_892190_892335_892483_892688_894773_894883_895698_895850_896203_896362_897119_897247_900251_900497_900831_901128_902632_902784_902900_903041_904053_904283_904385_906056_906353_906511_906921_907143_908828_909064_909504_909744_910896_911148_911586_911723_911811_911930_912053_912264_912882_913074_913797_913972_914117_914399_914863_915135_915357_915593_915931_916159_917815_917968_918060_918251_918623_919094_920840_920979_922487_922641_923843_924025_924831_925056_926472_926687_926837_926941_927733_927918_927996_928104_930141
907117	contig_19812_pilon	+	1912	3	Intergenic	novelGene_101000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTCCCGCAGAAGAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42932	48253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_44694_46709_46845_48237
907118	contig_5959_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_150234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	142	360	600860	600642	NA	70	AAAAAAAAAAAGATTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RACSTATAQRDLTRLEWGRDPVEGGWERPAQWFSLAPGPLSWSSLQFMASLLSRPLSHGWKFPPLHLHPHSFWYQHSIFRSCLLKCNYFLQGCRLNTGRHQLGFIDYLMGTWEGNEIRS	601001	598555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_598600_601000
907119	contig_8377_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_35065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGGGTAGAACTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119978	116992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_117000_120000
907120	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	92	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
907121	contig_12402_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_133358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATCCCAGGAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494889	496635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_494900_496600
907122	contig_2988_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_136528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAAGAAGGAGGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5579	3824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_3800_5600
907124	contig_8278_pilon	+	2887	9	Intergenic	novelGene_165290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	35.6467039149484	170	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	12	1703	186687	212295	FALSE	70	AAAATGAAAAATAAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMRPGPEPWNRLKIPKAGSCTAVVVREPSAALDLCTAAVIKECHSVTLLLKSQALDAETDVLCAVIYSNHNRMGRHKPHLALKQVEQCLKRLKTMNLEGSIQDIFELLSSNENQPVTTKERVIPSEPVVELVLMKVLGACKLLLRLLDCCCKTFLLTVKHLGLREFIILNLVMVGLVSRLWVLYKGVLKRLISLYEPLFGLLQEISRIQPMPYFKAFTFPSDIVEFLGQPYFEVFKKKMPTAFVTKGVTRLLNKLFLTKEQHQMSSEEALLRITKKAKQMKTNIEDSVDLGQPVKKRKVFAEKSSEFDVRAFCKRLKHRATQETNFKCSQSKIKATKCSQKVIEISCANSFVQRFREAETFIKLSEEIQMAVIWCRSRKLKAQATFLGNKLLKSNRLKHVEAQGYSLPKKLECIKTSICNCILRGSGNKTSKHHLSQRRSQNKFLLRRRKPQRKLQSALLKEIHQFPQGTQKGATDTSAKRRLSHRTVHRADLYPYSKQLIGSRASNPVVRTKKKQNHENLTRSNDNETGSWTMTQTSEHNTSETIKQRDDIDDIFALMGV	186675	213479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_186790_191016_191172_191874_191955_192321_192454_192904_192983_194339_194702_195002_195065_206483_206735_211826
907125	contig_19816_pilon	-	4208	4	Intergenic	novelGene_156477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	250.32112708812	50	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1650	2054	124800	124293	FALSE	25	AATGTGAGTGGATGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	126820	122138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_124556_124658_125854_125927_126435_126731
907126	contig_14094_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_145905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACACCACCACCCCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201394	200475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_-_200500_201400
907127	contig_9335_pilon	-	1865	3	Intergenic	novelGene_147459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTAATCCTAAAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669151	640825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_642427_663314_663496_669068
907128	contig_16400_pilon	+	5130	3	Intergenic	novelGene_150900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	300	junction_2	17	1951	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	172	366	16949	36995	FALSE	60	ATATGAAAATCAAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLQIEESSKPVRLSQQLDKVVTTNYKPVANHQYNIEYERKKKEDGKRARADKQHVLDMLFSAFEKHQYYNLKDLVDITKQPVMYLKEILREIGIQNVKGTHKNTWELKPEYRHYQGEEKSD	3464	41759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16400_pilon_+_3567_16879_17024_36875
907129	contig_7308_pilon	-	2559	11	Intergenic	novelGene_159602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_10	321.042427102712	30	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2376	183	2558	524476	496563	FALSE	20	CCTCCCAGAGGCCACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGLDWSEESGEELEDSEQASPYQVAWSIRETLRYERHASDDDDTESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASREPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPATCSGTVKGEPCRNQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDSSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPTSVSLPVEASQIRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQAVTSLECLSTIGVLTQSDGVPVQELSDRGIGVFSTGTGASGIQSLSREVNTDLGELLNGHIVHDNFSSLELDENLLRSATLSNPPTPLAGQIQGQFSAPANVGLTSATLISQSALGERAFPGQFHGLHDGSH	543366	496561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_497021_499098_499257_500223_500442_502542_502677_503758_503869_506830_507056_511182_511292_518702_519449_524258_524506_524610_524704_543306
907130	contig_6898_pilon	-	3300	15	Intergenic	novelGene_35701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2555	3079	115957	64026	TRUE	15	GCTCAGCTTCCTGCTAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDPLLPLVLVEFVLLQDPLGQQLVPSQVARLVHLFIEVTVLGLDSIGGQQHGSLRWAVNIIIENALLHLQEEQALGDVLDQFLGYILRVKFGPELEEQGAFLPYILGSHLIEFQPGGEALSVLVLQTKKPNFPQANSFHHLVKQLLAGGVGLDGKLQFCIHGGHTHIDLSN	127704	59534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59682_63951_64036_104550_104633_112966_113062_114249_114525_115894_115979_116669_116817_117863_117962_119611_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126696_127404
907131	contig_14665_pilon	+	1177	5	Intergenic	novelGene_171044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTTTAAACACATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43722	54368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_43861_44989_45102_50142_50321_52452_52581_53747
907132	contig_2332_pilon	-	3357	11	Intergenic	novelGene_58702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_10	47.4885249297133	259	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	334	2040	751696	706999	FALSE	30	TTTTAATTAACTGATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGKPAPTPTRPLIRSPAPFGADRGVCRPQPGCSVTEGEWSAPGRPAPGVRLPGRGWGRPRSPASRSSACRPLPPAFPPSAAWPPRPSVTPSCRWSPTRTSNSSQTLSSCHTMEPCSSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEDVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFLEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNALFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQTYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL	789388	705681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_707056_711189_711362_715304_715518_722550_722714_726010_726236_728845_729033_739447_739661_745665_745863_746364_746502_751553_751737_789095
907133	contig_11338_pilon	-	1412	9	Intergenic	novelGene_6363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.965387637965	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	299	874	319426	295354	FALSE	30	AGAGTTGATTCAGGGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_315289_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
907134	SIRV6	+	982	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	539	7	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
907135	contig_8122_pilon	+	1925	2	Intergenic	novelGene_40234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTCATGTGTTCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603518	605922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_604021_604499
907136	contig_4402_pilon	+	3251	20	Intergenic	novelGene_140785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_10	229.124021382559	390	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	76	2403	145647	245151	TRUE	40	TATGAAAACTTTATAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVGAARPLPALPGRAPRAAATAAAMKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDVVRSMCHQSHKRLTGCFQGQHGTDAERRHKKLPLTALAQSMQEASAQLEDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEREISDPLNVIAEVEIPNIQKQRKQLAKLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKALPEMRAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIAVPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYDEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSEINKMTPSNIAIVLGPNLLWAKNEGSLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEIEFNVSETFVPLAIPNSNHSPHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESPPIPKDSVSAAVPTPGRNSSQVTPGPNQAQAATSSHQLSVGPAHNSAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSPGTSQHPPSLSPKPSTRSPSPPTQHTGQASGQPSAAPQLSAPRRYSSSLCPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPSSQGSPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNSGLPASQTQAVSNPETVQPHGGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPHPPGAHSAGDGSLTSTVPTASKIVTDALPNALTGGEGSRD	145571	253964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_145700_193471_193512_197144_197250_203276_203351_204868_204981_205222_205300_208980_209093_211528_211598_211755_211838_217018_217147_223678_223791_224379_224462_226245_226327_228336_228451_230977_231070_232549_232707_236194_236365_243517_244139_245104_245153_253117
907137	SIRV7	-	2449	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	8	5	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	44	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147915	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
907138	contig_20641_pilon	+	1168	4	Intergenic	novelGene_52873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2741	junction_3	164.092115051949	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	74	895	41548	56882	FALSE	80	ATATTAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	41474	57155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_41619_45848_45965_54835_54968_56379
907139	contig_5999_pilon	-	3464	19	Intergenic	novelGene_45613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_14	201.364665209817	210	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	187	2349	243370	102914	FALSE	55	AAAAAAAGAAGCCTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGALTAANAKGAAMSPFLRIGLSNFDCGSCQPCQGETVNPYCAVLVKEYVESENGQMYVQKKPTMYPPWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNARYFLEMSDTRDMSEFETEGFFALHHRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCQQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAVNSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEHICREGPVEIGLPRSMKEETKLPYLPTPGKREPQGISWESPMDGMDKTCHLPEPEMNIERPSLRIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQICHKFDLCRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDARTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIEPPFKPKVKSPYDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFINPGMERLIS	270581	101798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_103070_105836_105966_116920_117110_125646_125786_134991_135055_137193_137286_163379_163554_167255_167417_168956_169075_169873_169984_175793_175924_180637_180724_180817_180850_182002_182166_191342_191404_194816_195017_199940_200068_243337_243476_270500
907140	contig_5769_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_138751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18626	19932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_18600_19900
907141	contig_8161_pilon	-	2306	6	Intergenic	novelGene_156746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	28.7151527943001	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	108	1154	254273	227334	FALSE	50	CAAGCAAACAAGGAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSGFHTFQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFIIFQKDTLSWIAVDSVAQITKRAWEANRHELQYQKNWLETECIAWLKRYLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAISGGRSLSSIFSWTRSFSVQGPRVQRTHSAPSASFLVV	254380	226181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227449_231420_231479_232136_232413_235310_235587_236172_236434_254212
907142	contig_2100_pilon	+	6051	9	Intergenic	novelGene_50766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	241	681	1172405	1178775	TRUE	15	CGACTCACCGGGATCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHHDAPPAGLGQLARLKRLGHGTDLVHFEQETVVVNFSSDAHSLLEVCCSDGQDHELLHGQLVASMRATIDHIESRNWQDDFGIASQVSNVTVQGHPLLNSSSLADSKGHAQNGICTEFHIYSQFHPSLSSVCRSSPVPQHSVSC	1170219	1185508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173225_1175656_1175785_1176282_1176415_1176761_1176836_1178767_1178825_1180187
907143	contig_9515_pilon	-	2257	3	Intergenic	novelGene_73842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	8	72	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1039	1368	105286	104957	FALSE	25	TTGAGTTGTATCACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPECTDPYRELFSTMNHQIFLRTYFVPSNIGGSVVEFSPSMQETQVGFPANAPQEQPPPICQWRLACCCDVEQVSLELPEQVSESLLTSILVFSFFPIFLMTSCFLHV	108101	104067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_106138_107123_107276_108066
907144	contig_16205_pilon	+	3214	2	Intergenic	novelGene_156858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	902	1603	43736	44437	TRUE	70	AAAAATTTAAAAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILSKAIYKCNAIPIQIPTTFFKEMEKLINFIWKGKRLWISKALLKTNKVGGLALPDLRTYYTAMVVKTAWYWYNDRYTDQWDRTENSDVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWGTDNLFNKWCWQNCMSICKKNGTGPIPHTIYKTNSKCIEDLNIKPKTIKFIQEKIGSTLEALIHGINRTQTITNNTQTLEDKLDNRDLLKIKHLCSSKDYQKSKTRTYRLEKNFLAITNSTKV	42834	63273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_44696_61920
907146	contig_5777_pilon	+	2936	5	Intergenic	novelGene_173321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCCAACAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41878	56540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_44439_46524_46683_47289_47416_53621_53664_56490
907147	scaffold_880_pilon	+	1587	3	Intergenic	novelGene_121493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_2	90.5	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	825	1256	534082	536133	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFLWIMKNADQSLIRKWIADLPSMQLNRILDLLFICVSCFEYKGKQSSDKVSTQVLQKSRDVKARLEEALLRGEGARGEMMRRCRTPGNDRFPGLSENLRWRKEQTHWRQANEKLDKYVAQPLCATFTQSPELLFPGYLHY	533257	536464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_534217_534657_534791_535969
907148	contig_11026_pilon	-	1801	4	Intergenic	novelGene_167657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	387	959	124969	121958	FALSE	40	CACAAGGCCTAATCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLHLVQVPLFWSKHWVNLHDAMADGAVLSLPQHHQADDYDGGNGHRNDQQANESTTAQAEVLPQRPHGLRLFLKASDSLGIEDHFLNIQCLVDDHILVHFTLTVNRFFFSTYQSSVLLFRSRSYADREDGAETWCRSHKSSKLAREGRGGYSICYSGHTAEDAPRSVRMSGTGFLQRADGHNEGDRVWT	125355	121115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_122245_123350_123426_123809_123965_124913
907150	contig_11316_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_122657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138042	138863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138000_138900
907151	contig_5485_pilon	-	2304	1	Intergenic	novelGene_37719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGAGAGCTCACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208019	205715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_205700_208000
907152	contig_3410_pilon	-	3430	2	Intergenic	novelGene_58933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCAGCGTCAGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43845	39878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_42733_43269
907153	contig_13379_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_175874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGCTGTAAATCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160040	158368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_158400_160000
907154	contig_2798_pilon	-	4660	1	Intergenic	novelGene_120054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	502	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCCCAGCAAATGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177397	172737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_172700_177400
907155	contig_8330_pilon	-	5383	15	Intergenic	novelGene_71919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_1	370.748085439619	694	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	892	2679	524	3202	1308802	1284042	FALSE	25	ACAGGTAGCATTTTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLNQLLSKTTAEKVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHSGTGTTPPVKKKPKLLSLKDSSMADASKHGVGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELFNWFKNFLGYKESVHLETFPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTPLCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEAIQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIVLKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIESIYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLVYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQIMHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEATGASKKHNGVGGSPPKSKLLFSNTAAQKLKGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLMRICSQAERQIEEENRERVWEHDMPGVRRDKSDSPAIQLRLKEPMDVEVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYEDSLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLSENNNGATGGQLNTQTSRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQDKVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDYVERYMNSDTTSLELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDSLDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEHVPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP	1309894	1281860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1284273_1286210_1286419_1286966_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295230_1297668_1298243_1299199_1299384_1300722_1300962_1303329_1303447_1303744_1303956_1304515_1304635_1306743_1306834_1308628_1309077_1309645
907156	scaffold_16735_pilon	-	3922	13	Intergenic	novelGene_160360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.0187856346266	439	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	333	1466	398709	365642	FALSE	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASTLTSSTLKDFLTQPSLGLLVRTCPEPAGGAELLESPPHRLDGPPDPSENPLAFLTSNPGPSLCSEQGGSAETAPEETEGPDLESSDETDRSSKSTEQVATFCRSLHEMHSPDQSSSPQDSSGPQLAAMRQLTDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKARTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLKELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPSSLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGAHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSAPARKVNTEI	430536	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_365676_372785_372874_376138_376242_376749_376809_382011_382121_385895_386015_386104_386285_390415_390525_396416_396543_396836_396906_398571_398752_410583_410688_430350
907157	contig_11338_pilon	-	2843	13	Intergenic	novelGene_6334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	235.54629174656	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	152	655	319426	307334	TRUE	55	AAATCAATATCACTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSGGRPRADCDHLHGARPLSPLPSSGGPHLCPV	323314	293896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_298989_299044_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230_307429_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
907158	contig_8552_pilon	+	3554	12	Intergenic	novelGene_80084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_5	56.4083400433507	33	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	461	1033	512086	517971	FALSE	35	TTTAACACAAATTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETAIKESAASSKSPPRKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	501328	520492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_501430_509984_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512138_512711_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912
907159	contig_11281_pilon	-	3156	2	Intergenic	novelGene_125515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCTCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972057	966656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_967718_969962
907160	contig_14546_pilon	+	3156	3	Intergenic	novelGene_157406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23465	27314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_23630_24277_25613_25657
907161	contig_4091_pilon	-	3671	4	Intergenic	novelGene_173019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	2842	3288	11776	11330	FALSE	30	CAAACCCATTGTCACTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASQRGSLFATQHRLAKKGSQLKKRKRKQTINSKETNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTQTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVIGKEEIKTSRKKSNTSSQQIALREPASVGWWNPSSWCFSDKRLCPWEAEEAEWG	149800	10946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_12966_55035_55176_146600_147853_149540
907162	contig_8153_pilon	+	1495	9	Intergenic	novelGene_34805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	283.214141596072	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	936	559	1494	153036	167674	FALSE	25	ATGATATTCTTTTGCATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIVGLHCSSEDLHAGQIALIKHGSRLKNCDLYFSRKPCSACLKMIVNAGVNRISYWPADPEISLLTEASSSEDAKLDAKAVERLKSNSRAHVCVLLQPLVCYMVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTEDHKTGVGAVIWAEGKSRNCDGTGALYFVGCGYNAFPVGSEYADFPHMDDKQKDREIRKFRYIIHAEQNALTFR	138304	167675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_138493_140987_141086_148680_148756_149871_149929_150015_150123_153002_153181_158353_158924_164642_164693_167503
907164	contig_7119_pilon	+	3063	5	Intergenic	novelGene_40901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	437.763349311018	9	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	203	1603	137033	140225	TRUE	25	CAGTGGGTCAAATTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127455	141916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139455_139635_140971_141201
907165	contig_12570_pilon	-	3780	3	Intergenic	novelGene_79330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACTGGTTGCAATCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224833	33094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_33253_37068_37451_221593
907166	contig_11396_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_71415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCCATGTTTTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1658171	1656873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1656900_1658200
907168	contig_2854_pilon	+	2407	2	Intergenic	novelGene_120826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	150	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	428	1276	246682	247530	FALSE	30	AAAACTCTTAATGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQTATALPTGTSKCTPSQRVPALTGTTASNNDLASLFECPVCFDYVLPPILQCQSGHLVCSNCRPKLTCCPTCRGPLGSIRNLAMEKVANSVLFPCKYASSGCEITLPHTEKADHEELCEFRPYSCPCPGASCKWQGSLDAVMPHLMHQHKSITTLQGEDIVFLATDINLPGAVDWVMMQSCFGFHFMLVLEKQEKYDGHQQFFAIVQLIGTRKQAENFAYRLELNGHRRRLTWEATPRSIHEGIATAIMNSDCLVFDTSIAQLFAENGNLGINVTISMC	243863	248661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_244289_246679
907169	contig_7380_pilon	+	3647	20	Intergenic	novelGene_157515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	65.1204296677379	232	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1129	3390	102	3491	139473	299870	FALSE	20	TTTTCAAAGTGCCTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGIPVSDAGGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFAPQEAYSHLKNILEQINALTGALFTSKVLEERAERETESQGNSSSEQGEQVYDWSTGLENTDDSHLYFSPDQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFAEIYSQKIGIKKEVLLKTLWGDYYINMKAKRIMKVDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKEKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQISAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVEKLMCTGSQTFDSLPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQAEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSVLETNPKGEELRAGNEEQVESMTPKPVPQEESNQESFVAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPVEFLQRVPLGFSAPPDDLPPVPHMAYCTLENLYLLMGRELEDLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPHLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIQISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQTKEDQSKIPEGIQVDSDGLVTLTTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSIQQLTSSLNEGRNTQMIHQKTLEKIWEFKGKLEQHLTGRKWRNVVDQIWSFGPRKCGPNILVNKNEDLQNSVWPGPVSKASKEVTKYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEGQGANDKQNQEQSDLVKEGQRGDETRSSGDENQELQDGCPEPCEKRTVQKGEASLSDCYGPFSGQLIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK	138605	300026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_155567_155702_157165_157304_159811_160027_167053_167178_168704_168782_169532_169670_170631_170755_173428_173529_177572_177725_177966_178137_193986_194126_255947_256080_259679_259828_268343_269327_280006_280192_299681
907170	contig_1274_pilon	+	2767	4	Intergenic	novelGene_137764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	41.0636362518253	74	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	64	426	3825	78812	FALSE	15	TTTACCCAGCTGCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTVRVWLKRDSGQYWPSIYHAMPSPCSCMSFNPETRRLSIGLDNGTISEFILSEDYNKMTPVKNYQAHQSRVTMILFVLELEWVLSTGQDKHFSWHCSESGQLLGGYRTSAVASGLQYPLLDEILGGSFAVSLAAVLGMCK	3761	81153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3832_33354_33429_66680_66736_78585
907171	contig_12677_pilon	-	407	1	Intergenic	novelGene_110889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCATTTACACCCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	3359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3400_3800
907172	contig_15543_pilon	-	4857	2	Intergenic	novelGene_164352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAGAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60999	56084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_-_59844_59901
907173	contig_10930_pilon	-	2383	7	Intergenic	novelGene_37024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	48	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	25	1587	280370	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
907174	contig_11285_pilon	-	6948	9	Intergenic	novelGene_5715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	22	junction_6	127.626163070117	627	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1420	4263	303	4565	846282	804977	FALSE	15	GCAGAGTCTGTTGTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMGRMEMELDYAEDATERRRVLEVEKEDTEELRQKYKDYVDKEKAIAKALEDLRANFYCELCDKQYQKHQEFDNHINSYDHAHKQRLKDLKQREFARNVSSRSRKDEKKQEKALRRLHELAEQRKQAECAPGSGPMFRPTTVAVDEEGGDDEKDESSTNSGTSAAATSGLGSELSTDKGGPFTAVQITNTTGLAQAPGLASQGISFGIKNNLGTPLQKLGVSFSFAKKAPVKLESIASVFKDHAEEGTSEDGTKADDKGSDQGLQKVGDSDSSSNLDGKKEDEDPQDGGSLASTLSKLKRMKREEGAGATEPEYYHYIPPAHCKVKPHFPFLLFMRASEQMEGDNSAHPKNAPESKKSSSPKPKGSCKVAASQGAEKTVSEVSEQQKESSVTESSEPGSKTETKKASGGDVSEQSLESQKALEMQSCESITSKETSQATPAGKESQEGPKHPTGPFFSVLSKDESTALQWPSELLTFTKAEPSISYSCNPLYFDFKLSRNKDARAKGTEKPKDIGGPSKDRLQDLDPEEPNKSKEEGENVVHSSGGRVDAPASGSACSSLNKQDPGGSHGSETEDTGRSLPSKKERSGKSHRHKKKKHKKSSKHKRKHKVDPEEKSSKAESGEKSKKRKKRKRKKNKSSVPADSEWGPKPEPPGSGSPAPPRRQRQAQGDSQRRSLPAEEGSSGKKDESGGGSSSQDHGGRKHKGEPPASSCQRRAGTKRSSRSSHRSRPSSGDEDSDDASSRRQHQKSPSQYSEEEEEESGSEHSRSRSRSGRRHSSHRSSRRSYSSSSDASSEQSCYSRQRSYSDDSYSDYSDRSRRHSKRSHDSDDSDYASSKRRSKRHKYSSSDDDSSLSCSQSLSRSRSHSRERSRSRGRSHSSSCSRSRSKRRSRSTTAHSWQRSRSYSRDRSRSTRSPSQRSGSRKGSWGHESPEERRSGRRDFIRSKIYRSQSPHYFRSSRGEGPGKKEDSRGDDGKGTGPSSQNSSASAGRGSDGDCSPEDKNSVTAKLLLEKIQSRKVERKHSVSEEVLATPNKAGLKLKDPPQGYFGPKLPPSLGSKPVLPLIGKLPATRKPNTKKCEESGLERGDEQEQSETEEGPPGSSDAPFGHQFPSEQTAGPLSDLPPEEPKSEEATADHTVAPLGTPAHSDCYPGDPAISHNYLPDPSDGDTLESLDSSSQPGPVESSLLPIAPDLEHFPSYAPPSGEPSIESTDGAEDASLAPLESQPITFTPEEMEKYSKLQQAAQQHIQQQLLAKQVKAFPASAALAPATPALQPIHIQQPATASATSITTVQHAILQHHAAAAAAAIGIHPHPHPQPLAQVHHIPQPHLTPISLSHLTHSIIPGHPATFLASHPIHIIPASAIHPGPFTFHPVPHAALYPTLLAPRPAAAAATALHLHPLLHPIFSGQDLQHPPSHGT	910569	802593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_808851_811244_811376_824751_824896_845502_845590_846255_846324_848376_848422_868989_869063_877365_877441_910501
907175	contig_11427_pilon	+	2035	4	Intergenic	novelGene_79008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATATCCAGAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686610	848791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_686751_739753_739973_758361_758663_847416
907176	contig_16126_pilon	-	6202	11	Intergenic	novelGene_141871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	291	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAGCAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48314	25589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_26297_30658_31080_32275_32418_33643_33705_37209_38016_40708_40839_41656_41811_42293_42403_43852_44032_44232_44398_44986
907177	contig_6374_pilon	-	2679	4	Intergenic	novelGene_158431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39744	26642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_27066_27345_28394_38334_39302_39503
907178	contig_3153_pilon	+	4483	14	Intergenic	novelGene_104663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGTTCTCGGGGCGCGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191305	247654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_194870_204931_204999_206342_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212283_214487_214574_217125_217170_217855_217937_221159_221226_224955_224999_229052_229140_233950_234036_247617
907179	contig_1348_pilon	-	1746	1	Intergenic	novelGene_174371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGGATAAAAACTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568282	566536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_566500_568300
907180	contig_12677_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_110701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1100
907181	contig_3018_pilon	-	2039	15	Intergenic	novelGene_78857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	498.783729870646	6	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	961	2037	583440	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	625103	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585123_600008_600194_600806_600912_603367_603441_624772
907182	contig_2799_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_85523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCAGCTTCCACAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631453	629995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_630000_631500
907183	contig_10225_pilon	+	1306	3	Intergenic	novelGene_86867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	134	808	46473	47254	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVGGPWPTAEQCPLPPCGSRGLTSWQHPSGFARPPPR	45216	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_45263_46385_47037_47143
907184	contig_2636_pilon	-	3828	1	Intergenic	novelGene_52079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63385	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_59600_63400
907185	contig_15327_pilon	+	2185	2	Intergenic	novelGene_70588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	214	junction_1	0	250	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	1476	2162	844160	844846	FALSE	30	AGGAATCAATGCGCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARSWGILLLHPSSARYLCPTAAWQLPRPPGSSWGQCCFPSRGRPAASAGGSFIFRVLWQLSFPPAEEPSVREGSRAVKSHVVSMTGQGYGEGGLRWWPEECDEHCPQVPKIKLDLPLPPSPQRRTPSTPEEFSSRPPLRQQDYNPGRGAVRSAAGESLGSFLPSAPSWGLLLAQGACGGLWEMVWGREDTRKCGVRALVWSPHLKQGVWSWALHLCKPVALSVLSR	842423	844869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_842958_843218
907186	contig_9578_pilon	+	4136	15	Intergenic	novelGene_67967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTTCCGGGTCGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057716	1276422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1088497_1088585_1088854_1090411_1099514_1099645_1100874_1100922_1134922_1135018_1145925_1146041_1182313_1182678_1198800_1198894_1214892_1215009_1238379_1238502_1251583_1251618_1276189
907187	contig_5297_pilon	-	1277	6	Intergenic	novelGene_175669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGCTGCGAGGGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91278	82577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_83227_84767_84897_89131_89239_89739_89798_90586_90762_91119
907188	contig_11448_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_66373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAATATACTTCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298987	301078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_299000_301100
907189	contig_13021_pilon	-	3617	12	Intergenic	novelGene_8131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCCTCCACCGCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181152	174465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_180209_180438
907190	contig_13525_pilon	-	1577	2	Intergenic	novelGene_145091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGAACACTTGGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87291	81497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_-_81589_85805
907191	contig_5286_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_157380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAGCAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602642	600907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_600900_602600
907192	contig_12964_pilon	-	1525	3	Intergenic	novelGene_131681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	134	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATGCTGGGTAACAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421207	386900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_387252_387825_388513_420720
907193	contig_9197_pilon	+	2764	3	Intergenic	novelGene_154373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	9	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	300	611	81747	82058	FALSE	45	ACAGTCCAATCCACAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGPHHLSPRSRGKLLYKFLGPQLQDRLRRVSGRATLGRIASAAPAAMVYLFFQLLCYPENCLGYGMPVITNPPGAGLAPSADFFFFFKLCTLLLSVWSWKDN	80386	84211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80506_80734_80892_81723
907194	contig_1996_pilon	+	2596	1	Intergenic	novelGene_131876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	264	638	135511	135885	NA	50	ACCACTAAGGAGATAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVSFSTISFHRCSQLDSCVFHLARSTCIVAIFVVEKRYCNEEVAGLAEFCRVISSIISVTKAIYSSYQSFFVSSFRIPVTSNYQCILIAFLINFRLQKLVKIFSFFIFGLSGWCINWNNSHIN	135247	137843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_135200_137800
907195	contig_12081_pilon	+	1084	5	Intergenic	novelGene_166967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1087.82110202	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	194	763	16400	18277	FALSE	15	TAGGATGTTGCATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPLARLVKLQCAENSAKQEAEDCVSDKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSAFFLFCSEHRPKIKSEHPGLSIGDTAKKLGEMWSEQSAKDKQPYEQKAGKKGPGRPTGSKKKNEPEDEEEEEEEEEEDEDDEEEDEDEE	15689	18598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16550_16845_16992_17069_17219_18152
907196	contig_8681_pilon	-	2517	13	Intergenic	novelGene_157210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	105.559225082415	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	120	1721	254247	224312	FALSE	35	TGTCAGTAACATACATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIQLHHGDRILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEEHDNSMKNDNSSEQLDIDGDSSSEVSSEINFNYEYAQMEVTMKALGNNDPMQSILNSLEQQHEEEKRSALERQRLMYEHELEQLRRRLSPEKQNYRSSVDKFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREASYIAEELDKRTEYKVTLQIPASSLDANRKRDSVLSEPAIQVRRKGKGKQIWSLEKLDNRLLDMRELYQEWKECEEDSPVIRSYFKRADPFYDEQENHSLIGVANVFLESLFYDVKLQYAVPIINQKGEVAGRLHVEVMRISGEIGERIAGGDDAADISFDKETQENKLVCMVKILQATGLPQHLSHFVFCKYNFWDQQEPVIVAPEVDTSSSPVSKEPQCMVVFDHSNEFSVNITEDFTEHLSEGALAIEVYGHKMTDPRKNPALWDLGIIQAKTRSLRDRWSEVTRKVEFWVQILEQNENGEYCPVEVISAKDVPTGGIFQLRQGQSRRIQVEVKSVQESGTLPLMEECILSVGVGCIKVRPFRSPKTHETFHEEEEDMDSYQSEEQCVWFP	256529	223515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_224342_224476_224507_225106_225254_229705_229839_230866_231025_232264_232436_242855_242985_243301_243452_247899_248047_251364_251528_252400_252615_254117_254309_256471
907197	contig_5423_pilon	+	3502	1	Intergenic	novelGene_85250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	589	993	533993	534397	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEKPSRHTLLGGGRKGQGGWIGKTSELRLAYFRAWSCSENEQRLWTTASLEKAAGWLRRVSAQSQVSGTKDRRLCFPRSSPSTLLLPRFPKCRSARVRMNTQTYTHTRACAKCSSTAPPTFPSALGGQTPR	533404	536906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_533400_536900
907198	contig_5623_pilon	-	1777	13	Intergenic	novelGene_154840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	412.023866622635	21	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	150	1148	212265	209309	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGGPGPSHRGVHPFLCWLLCGHLCAGHRRSAQ	214738	206942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207497_209058_209106_209280_209405_210043_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212469_213895_213944_214681
907199	contig_6227_pilon	+	2491	14	Intergenic	novelGene_49631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	114	320	341314	341520	TRUE	35	TAGTTTTTAAGAGAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQKQFIFKHRNPFRRDSHHKDIHCRQWTLNKTASLSQMQRWNPAFRLAASPGDLFTCTNSWLDSGTCTCTHRREVFARILGSFWNLRNAALPETFSSTRLLQGMG	341200	395336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_341549_342963_343183_343465_343585_344676_344785_345744_345879_349057_349124_349955_350052_352948_353135_354366_354511_355149_355317_356187_356565_359403_359520_392431_392538_395031
907200	contig_11281_pilon	-	2803	4	Intergenic	novelGene_125483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1175	junction_3	392.268615449499	13	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	43	399	972015	886939	FALSE	35	ATTTTCCCAGGCAGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAKNLPTYPGPNKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIRKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLEMRLSEVITDTGVVCHKLATR	972057	884534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_887020_900630_900726_925832_925937_971938
907201	contig_12677_pilon	-	293	2	Intergenic	novelGene_110882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCAGTGGCATTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3531	3017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3098_3318
907202	contig_6589_pilon	+	2289	3	Intergenic	novelGene_25927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48	104	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	295	2184	1208834	1211526	FALSE	15	GAGCAACCTCTCGGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQVPPLATPWRDVHPFFLLSPLVGLVRQAWSHLRGPGPPESWLVEAVTEEAALDGEAKASLAFHHAAWGEHPQGEAEDSRTAEEDGEADRRACPDLKDSSSFLDASNDDDEEYGEEEATSVAREQGGEFTDGRPAPLPSSFLIRTLRDPPGEKESEKEKEAPEEGVANNTEMTKVFFYPLSPLECYPGVEEKEDEDREAVKKEAPRISIPPLSLGSKPSAWVCCPGEGEEEEKNEEEARPPEEERRAENKEATKIAISPSCSGSNPRAWEYCSGESEEEKDKNAKEATEKGEADPEPHSSSLIRRPLLRAWVYRPGGDTEEEDDEDSDSGAAAEGPSRIPSTGAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPPTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEEYEENENGDDSEATEGEAADSGQHPSLQTQSAVLRTWTYQPGEDTEEDGTTEEWGEAEPSPFRVAIYLFQRGTGAPLWPHPLPPLRASPCLLV	1207797	1211631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1208083_1208824_1210646_1211448
907203	contig_7963_pilon	+	1274	6	Intergenic	novelGene_58389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1368.62158393034	55	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	67	891	51450	58782	TRUE	20	CTGGTGTGTATATAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPLSLPINDLSVMMTTSYYYCYC	51383	63233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_58718_58936_63003
907204	contig_10377_pilon	+	1454	7	Intergenic	novelGene_115384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_6	329.983164553722	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	201	845	219517	245851	FALSE	60	CAAAAAGAAAACAATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVNYAHAASSFQC	209083	246460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_235978_236012_240234_240355_245160_245257_245817
907205	contig_9038_pilon	-	2985	1	Intergenic	novelGene_143333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTACGTTCATCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445659	442674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_442700_445700
907206	contig_11548_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_66754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAGTAGAGCTGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72864	74972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_72900_75000
907207	contig_12464_pilon	-	2301	2	Intergenic	novelGene_68626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGGGTTGCGCCACACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54004	45206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_45305_51801
907208	contig_9377_pilon	-	4724	4	Intergenic	novelGene_176307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1627	2112	955465	954980	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPIGIQNKTPDDSPLEENTLELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKNLEEFRKIMQEQNAKINSQLEILQRQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVKTVSVELKTNTWIQLCLRTTQKKEQRKMKRP	957357	949043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9377_pilon_-_951169_951410_951812_954893_956657_956922
907209	contig_8210_pilon	-	2517	1	Intergenic	novelGene_30245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAAAATTGAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43435	40918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_40900_43400
907210	contig_3241_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_146381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713020	711761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_711800_713000
907211	contig_8354_pilon	+	2253	3	Intergenic	novelGene_24096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAACCCACAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185225	305367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_186266_198210_198537_304480
907212	contig_15384_pilon	+	1745	4	Intergenic	novelGene_85154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGCTGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121617	125384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_122566_123182_123282_124095_124157_124747
907213	contig_15172_pilon	+	1926	8	Intergenic	novelGene_158754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_7	144.244548583017	10	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	12	635	243174	267627	FALSE	25	AATGACTCTTCCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECNMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243162	268918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534
907214	contig_7285_pilon	-	2847	1	Intergenic	novelGene_143403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282574	279727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_-_279700_282600
907215	contig_10500_pilon	+	1993	2	Intergenic	novelGene_41226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	728	1141	1633560	1633973	FALSE	15	TGTGCATCCTTTGGACCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKRFLKLWMEERQWQRTSNSREPAAAEKGQWQKTNSTRTRRPVRDGAGADPRSKRAECLCARGFLAEWGAFRHLSVELGLLTHSEGAECLCAGGFLAEWRASRHLISGATELWNTCPSRADAGLRPEGQEATGSRS	1626404	1634825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1626973_1633400
907216	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
907217	contig_12864_pilon	-	2220	8	Intergenic	novelGene_76378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_7	130.475738615832	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	117	1307	208748	202064	FALSE	65	AAAAAAAAATCTCTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQCDEPPASPDDSDNSVSESLDEFDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMAVDLDDQDWLDMNNIEQALFSRLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSTDRDAGEKHSFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDVLLEAIQGAHFEDVTEFLEEVIEALTTDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAYLDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPSNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQVGLFTGVFQFPDLRLRVSPGKRRR	213591	201150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_202331_202552_202756_203081_203242_203717_203871_204758_204872_205606_205781_208627_208790_213516
907218	contig_10973_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_150326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCACACTTACATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028	34	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_0_1000
907219	contig_12923_pilon	-	3091	1	Intergenic	novelGene_30179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGTCTGGATAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328170	325079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_325100_328200
907220	contig_11709_pilon	-	4236	1	Intergenic	novelGene_168207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGACAACAAAAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35360	31124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_31100_35400
907221	contig_16411_pilon	+	4834	1	Intergenic	novelGene_77372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	481	894	312972	313385	NA	20	TTTTGAGATACTGTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSNGSQTSSSSSGLMAKEAVVHGGNWSHVPHPPLIPDSPFFLCCSTGIQTSCHALDGCSQAFKTPDTMKGTRRYKNTKCILSQLTGMFHETMTLNLQTKEPNPMKRLVVHKQPQQLLYFFICFGINIYITQLSTGF	312491	317325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_312500_317300
907222	contig_17796_pilon	+	4985	5	Intergenic	novelGene_33774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	663	junction_2	51.9085734729823	156	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2998	3327	33220	33549	TRUE	35	TCTTGTAAAAGGAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKLSEKLDYMKKELSIRIGGRLINNPRYADDTTLLAESEEDLKYLLMKIKDYSLQYGLHLNIKEIKILTTGPISHIMTKREKIEVIKDFIFLGSPINAHESSSQEIK	16764	42424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_18200_20417_20604_31843_34981_40843_40949_42302
907223	contig_12677_pilon	-	1070	1	Intergenic	novelGene_110698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1100
907224	contig_5196_pilon	+	3667	1	Intergenic	novelGene_38700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGATTGTTTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314526	318193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_314500_318200
907225	contig_9479_pilon	-	1993	3	Intergenic	novelGene_176673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	213.5	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	499	1992	20698	15767	FALSE	35	ATCTCAGAACGCATACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTQSLLVYMDGPEVIGNSLGAQMEMDDGMSIKGTTAVPFRATQEKNIIQIEGYMPLDCMFCSQTFTHSEDLNKHVLIQHRPILCEPAVLRVEAEYLSPLDKSQVRAEPPKDKNCQEDEDFSCEVCGQTFRVAFDVEIHMKKHKDSFTYGCNVCGRRFKEPWFLKNHMRTHTGKSGARNKLQQGLESPVTINEVVQEHAAESISSPYKICMFCGFFFPDKESLIEHSKVHTKETVSSTSETQADSRQEGTLSPREEFLQFLNLRPKSHPENVKKPAKWIPQLDPFNTYQAWQLATKGKVAIGRGEVKEPGQEGSTDNDDSCSDKEELGEIWSANKSHSEGSGKSKTNKNSCTGLSQDKEKPRHANGEVPSVDADPKLAHNKEKPTHCSECGKAFRTYHQLVLHSRVHKKDRRTDAESPTMSVDGRQPRTCSPDLATPLDENGAMDRGEGGSEDGSEDGLPEGLHLDKNDDGGKMKHLTSSRECSYCGKFFRSNYYLNI	35528	15765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9479_pilon_-_15865_19302_21083_35414
907226	contig_11285_pilon	+	2713	3	Intergenic	novelGene_5722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGCAAATGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840004	1057374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_840279_1053082_1053416_1055268
907228	scaffold_13505_pilon	+	2229	4	Intergenic	novelGene_111557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	40	junction_1	59.7048295087313	135	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCACTTCTCCAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608562	613609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_610099_612389
907229	contig_854_pilon	-	3022	1	Intergenic	novelGene_36539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGACTTCCCAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1617107	1614085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1614100_1617100
907231	contig_7904_pilon	+	6242	17	Intergenic	novelGene_160017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_1	217.86240461298	415	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1138	3417	93	3509	361442	524351	FALSE	5	TTTGCTGAGTGTTGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLFQKLFSKRSGLCAPGRDARDPDCAFSWPLPEFDPSQIRLIVYQDCERRGRNVLFDSSAKRKTEDITVSKLCSDAQVKVFGKCCQLKPGGDSSSSLDSSVTSSSDIKDQCPKYQGSRCSSDANMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHQIRSPPQLMLSKVFTARTGSSICGSLNTLQDSLEFINQDNNTLKADNNTVINGLLGNIVHSNPMDMPGRELNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPNSSLTRSCASSYQRRWRRSQTTSLENGVFPRWSIEESFNLSDESCGPNPGIVRKKKIAIGVIFSLSKDEDENSKFNEFFFSHFPLFESHMNKLKSAIEQAMKMSRRSTDASQRSLAYNRIVDALNEFRTAICNLYTMPRIGEPVWLTMMSGTPEKNQLCYRFMKEFTFLMENAAKNQFLPALITAVLTNHLAWVPTVMPNGQPPIKIFLEKHSSQSVDMLAKTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLARTVIVGKRQDMVQRLLYFLTYFIRCSELQETHLLENGEDEAIVMPGTVITTTLEKGEIEESEYVLITMHRNKSSLLFKEPEEARTSNCSCKYCSRPLLEQSIETVSQQDREDIQNISKKLLETSDECRMISPSDCREENAFDTEQYRDKLRTCLDTKLETVVCTGSAPVDKRALSESGLEPAEETWQSEELLDSDNHMGKMMRSTGMIVEKKPPDKLVPAAFSCEAAQTKVTFLIGDSMSPDSDTELRSQAVVDQITRYHTKPLKEEGAAIDLHQETKKTTKDQSGESGVQNMVSGEACALPCWNHSDPESMSLFDEYFNDDSIETRTIDDIPVNTSTDSKEHCCMLEFSKRLCTKNSKENNGFCKCVETIHQDACKTCFPQQDQRDTLSILVPHGDKESSEKKVAVGTEWDIPRNESSDSALGDSESEDTGHDTTRQVSSYYGGEQEDWAEEDEIPFPGSKLIEVSSVQPNIANFGRSLLGGYCSSYVPDFVLQGIGSDERLRQCLVSDLSHAVQHPVLDEPIAEAVCIIADMDKWTVQVASSQRRMTDNKLGKEVLVSSLVSNLLHSTLQLYKHNLSPNFCVMHLEDRLQELYFKSKMLSEYLRGQMRVHVKELGVVLGIESSDLPLLAAVASTHSPYVAQILL	361349	527084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_361534_442515_442643_458570_458706_464767_464869_465302_465378_469399_469492_477700_477773_478378_478515_479041_479244_482720_482807_507729_507877_510084_510255_512732_514153_515324_515494_521100_521299_521880_521997_524272
907232	contig_14682_pilon	+	2255	2	Intergenic	novelGene_139119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAGTAGAAAAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118051	122893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_119813_122399
907233	contig_8712_pilon	-	2967	6	Intergenic	novelGene_58736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACGAAACAAGGCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81022	73580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_73686_74519_74582_76380_76571_78080_78240_78481_78566_78655
907234	contig_16098_pilon	-	2646	20	Intergenic	novelGene_45846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	583.606691259707	24	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	932	2563	215535	201500	FALSE	25	TTGCTACAGTTCCTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLDLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230486	201416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202151_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215667_226281_226371_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
907235	contig_19579_pilon	-	2308	6	Intergenic	novelGene_59400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	499	junction_4	454.931643216868	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCAGATGATTCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13737	7763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8616_8704_8825_12012
907236	contig_7119_pilon	+	2424	3	Intergenic	novelGene_40954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	125	1279	137033	139798	FALSE	30	TGAACACTGATGGCTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127533	140943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
907237	contig_8377_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_34898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACTACATAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68036	69583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68000_69600
907238	contig_15114_pilon	-	1120	8	Intergenic	novelGene_121150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_7	199.380059592892	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	117	1058	154964	136951	FALSE	20	GTATGTGTATGTATGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLSQNASAIRPLNLYPWVYISLVFGASLALPDKACTFKVALQNFQTIFSWELKNHSIVPTHYTLWYTIMSKYEDMKIVEDCTNITRLFCDLTGLWDNMPETYIPRVVGFKGNTVLVSCIDSVFLPMNMTLEPPDFEIVGSADHINVIVKFPSRAPKTIDVERLQHHFYLIIEQRSEEMVKKHKPRINGNITGDFIYVMDKLIPNTNYCVSIYFEPKNLGTITKSPLKCALLPGQEPESSESAKIGGIITAFLIATVFISSVVTLKRTGYLCLRLDLPSALVCSLSGFVCYFLISVFIFYFNLNIFTEENLIF	164572	136888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_137181_141879_142046_147669_147831_150654_150828_152061_152177_153332_153375_154909_155006_164497
907239	contig_3077_pilon	+	1826	10	Intergenic	novelGene_26665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2999.26442834091	540	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	650	1333	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9616	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12127_12953_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
907240	contig_3095_pilon	+	967	5	Intergenic	novelGene_75192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1676.52631950709	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	136	687	225596	226800	TRUE	25	TTTCATCTCAAGGCTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	225460	227338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_225711_226126_226409_226645_226824_227001_227089_227168
907241	contig_12464_pilon	-	5455	5	Intergenic	novelGene_68643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	81.0632469125189	212	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3440	3892	98468	96686	TRUE	15	CCTTGATCTCTCATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAMQNLGFPPDNISGKPARSHLLGSGGGLDNRLALTSGTTRRFLPETLEQPWKLICLRLNHDSAGDTKCARVIWQSDPDIQKKTSRNMREVWSWGSHGLISLPTRYIPTGIRNRKRKKSLIRRVRSHSWLPPCREMTHLPADQEEEGP	101907	93013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_94328_95478_95560_95791_95948_96673_96912_98241
907242	contig_16322_pilon	-	3747	3	Intergenic	novelGene_87517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_2	106	151	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2982	3470	33723	33235	FALSE	25	AGCCCCACCTATCAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFVKICFLSGYVSTYIISLSGSDRDYISSEARNIYCLVTYSLSALDLAPAHLSSPLYPSSPANLTFSLNVTSSFQAFTIPSASEVFWLLLPRTPLYFGDFSLSFRSPFKWHYFSDQLVLEACVVCASHSTFSPSSFNLSSWHDCNFVVNLCSSVSATRM	57621	32957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_36438_36986_37098_57465
907243	contig_4151_pilon	-	7686	1	Intergenic	novelGene_65258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	900	1400	588143	587643	NA	65	GGGAAAAAAAAAAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSIWLTQSSSEPWDMGTIIPRLQVRKRSSVKLTYLFSGMPRYEPRYVLFLICFSLHIITQVSLVHQTESINIGLSGKKKRTPGNSPFKARSINELNSVNRCCWGPALATETWLGWRSLKSGLCQLPFRTFRQKGLHKKMSVARQDFLSHTMCFYVLAMNFIKCHL	589042	581356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_581400_589000
907244	contig_19032_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_172514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	356	1087	2776	3507	NA	65	CAGAAAAAGAAAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGGSEWQARIQKKQKKKKGEKKKKQHLQPTNGTQRAARPVARNPSSRQPRVQSLRPREAEEQTNKGPEFSPARQPRPGSSRTPERSPTAPQEGAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKKQPQHPTNGPLRAACPGAQNPSSRQPWVKSLGPRETEEQTNKGPGI	2420	3656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_2400_3700
907245	contig_10042_pilon	-	1558	4	Intergenic	novelGene_79086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	326	715	43415	43026	TRUE	40	AAAGATCAAATGTTATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGCEVGLLSSVLTLSIRDDEIRNACVRERKNPEVFFCCCCSFQPQLPIGSVITICNTACSRACTNSHEAGALLKPEQLLLTELEEMCPTALSACKQSPGADPLYSNSVSKGIQSACLIPNTEIFFSSV	43740	6311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_6398_8813_8934_26598_26806_42595
907246	contig_5556_pilon	-	3047	1	Intergenic	novelGene_173275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1702	2025	148925	148602	NA	55	CCACAAACAAAAGGAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGVQNKTPDDFPVEEKTLELSDREFKSLIFRIIQELNQKADKNEEKIDKFIDKADQFMENTDKKMEEFKKIQEQNAKMNSQLEIIQKQQLEIEKITRSQKWTVS	150626	147579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_147600_150600
907247	contig_5794_pilon	-	2665	2	Intergenic	novelGene_69752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTATTTTTTAATAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508150	505386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_506618_506716
907248	contig_11933_pilon	+	3266	1	Intergenic	novelGene_107251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2478	2783	104471	104776	NA	5	CAGGGCTTTTTTTGGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISFSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPLISFSCLIAPARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKRNVFSLSPLRMMLAVCFA	101993	105259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_102000_105300
907249	SIRV6	+	1277	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	32	2	32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3137	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
907250	contig_11924_pilon	+	2157	7	Intergenic	novelGene_128022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	216.002057603368	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	269	403	42174	58696	TRUE	10	CCTCTTGTATTTCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHNEEDNSESSATEQPSTSNATPQIVQTAPSTPVLETNSSPPPYSSITVEVPTTSDTEAYSEFYPVPPPYSVATSLPTYDEAEKAKAAAMAAAAAETSQTIQEEECPPRDDFSDADQLRVGNDGIFMLAFFIP	38812	72571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_+_38980_42072_42207_50560_50655_58688_58762_61408_61476_64467_64574_71055
907251	scaffold_880_pilon	-	2109	12	Intergenic	novelGene_121483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCGCAGAATTAGGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536425	493080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_493346_496768_496865_501311_501407_506099_506251_509154_509269_510286_510443_514142_514285_525270_525440_528123_528271_534032_534215_534655_534785_535962
907252	contig_13074_pilon	+	4370	1	Intergenic	novelGene_153409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCAATTCTGTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117684	122054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_117700_122100
907253	contig_6102_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_32322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624632	1625654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1624600_1625700
907254	contig_12638_pilon	+	643	4	Intergenic	novelGene_33322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12069	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCAGCCCAGGCCCGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298308	1325618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1298672_1303534_1303702_1310600_1310677_1325581
907255	contig_3627_pilon	+	2280	2	Intergenic	novelGene_78517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGGAAGACGGTGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623270	627354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_625202_627005
907256	contig_6885_pilon	-	2798	1	Intergenic	novelGene_83668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	174	476	210312	210010	NA	30	ACAGTCATTCATTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	210485	207687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_207700_210500
907257	contig_10734_pilon	+	2655	18	Intergenic	novelGene_51419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_11	78.2627992340207	378	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	66	1517	2116886	2147963	TRUE	30	ATTTTGTTGCTAGAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVHESLYFNPMMTNGVVHANVFGIKDWVTPYKIAVLVLLNEMGRTGEGAVSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQVLC	2116820	2156140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2147951_2148138_2148599_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
907258	contig_3009_pilon	-	2970	2	Intergenic	novelGene_132514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCAATAAAATAGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69665	66214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_-_68173_68653
907259	contig_3601_pilon	+	2600	1	Intergenic	novelGene_132972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGAATGAATGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148187	1150787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1148200_1150800
907260	contig_1301_pilon	-	9852	6	Intergenic	novelGene_47307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_3	702.626614924314	631	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1077	1502	284738	278293	TRUE	45	AGGTAAGAAGACCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSR	285814	268651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_278465_279344_279450_283355_283451_284684
907261	contig_17344_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_169588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56903	59273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_56900_59300
907262	contig_16714_pilon	-	3707	3	Intergenic	novelGene_161552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAATAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508458	471182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_-_473027_505498_506051_507147
907263	contig_4232_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_63359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAGTATTTTAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_468100
907264	contig_6410_pilon	-	3387	11	Intergenic	novelGene_108611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	408	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	840	1181	52453	52112	TRUE	20	CGAGCCACCGGACCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGRQRKESFVLQNKVQRRIAGTNLLIRSSNNISMLFSIGYFEFDLGADLELPNVPSCQYQQSLSASISLFIEVITITVSHCWAGFKPTNIPVSRTSATVLTLPSPLKIYKF	53292	17409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_17496_34562_34629_44080_44539_44879_45006_45509_45675_46756_46924_48160_48333_48828_48934_49953_50081_50311_50475_51540
907265	contig_3525_pilon	+	4505	2	Intergenic	novelGene_135138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2311	2742	653388	653819	FALSE	55	TAACTAAAACTTCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIVTLAKTKDRQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDVYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDEQKLRDYVKTKQNLRDLLKEVLQSENKQYQTTG	596911	655582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_598092_652257
907266	SIRV6	+	1364	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	32	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	204	43	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	164	495	176	670	1733	10736	TRUE	20	AGTTTGCGTTTGGTCGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKKCV	1169	11740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031_11109_11205
907267	contig_13699_pilon	-	3698	4	Intergenic	novelGene_158319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	27	323	72699	70979	TRUE	80	AAAAAGAAAAAAAAAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAWSLFMRSAARSSKPWRGRATVSKRFFSSSLRYCSPMSTESSSHSVWASLISLSSCSKSDRISLVSSNCCFTASGWVLMADWPLSRCPTAFTFSDKSWSNSWY	72725	63571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_66536_67774_67974_70766_71263_72686
907268	contig_11136_pilon	+	2713	2	Intergenic	novelGene_169027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1329	1685	140038	140394	TRUE	55	AAAGAAAAATCTGTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALIQGINRIQNITNNAQTPEEQLGNRELLNIKCLCSSKDFTKRVKRPSTHWEKIFGYDISDQGLISKIYKILQNFNHKKTNNPMKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRREETLTIISH	138709	141897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11136_pilon_+_140565_141039
907269	contig_9297_pilon	-	6396	26	Intergenic	novelGene_69855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_22	117.274147193659	406	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1459	4380	109	4488	869848	815535	FALSE	45	CTGTGGAAATAAATATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAECCQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNCIMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVEDEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVDSNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSLRWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQLAMTGSEEGDPRTKGSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPMSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNFMKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPQAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNMLMDQHMDHEVSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPDKTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKLRKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGAGSVLLDPCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSGISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEVTHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAVVRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHILTPSEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEDRELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSEGAMANYESTEVMGDGESAHDSPRDETLQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIHDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRMCSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEFIKTIDDRK	888874	813626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_815676_817041_817240_818233_818307_820253_820468_820936_821125_821982_822143_822472_822580_824360_824491_825846_825970_829400_829482_830434_830523_846690_847062_847191_847270_850644_850765_851230_851366_852427_852569_854324_854499_856635_856762_858542_858673_860827_860989_863937_864128_864267_864403_865293_865381_866832_867677_869663_869882_888799
907270	contig_6118_pilon	+	2517	4	Intergenic	novelGene_178830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGGCTGTTGAAAATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130507	280623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6118_pilon_+_131845_152360_152488_279382_280369_280556
907271	contig_9571_pilon	+	6209	1	Intergenic	novelGene_136269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAGAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403550	409759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_403600_409800
907272	contig_11338_pilon	-	2198	11	Intergenic	novelGene_6341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_6	206.215518329732	47	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	299	970	319426	300286	TRUE	45	GTCTTAATCAATAGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLCQFSFLSDDLLDFEKQTLVPQQ	323314	294438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
907275	contig_10953_pilon	+	1944	9	Intergenic	novelGene_42518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	210.087333030814	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	23	631	126980	145057	TRUE	25	CATCAGCCTCACTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASIKRDKD	126957	148056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144779_145040_145132_145408_145519_146927
907276	contig_1263_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_170388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTGCAAATTCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53583	51682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_51700_53600
907277	contig_8578_pilon	-	3469	1	Intergenic	novelGene_178831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	586	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	3147	3467	323	3	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTTSQNKESINSLEEENFLELPEAEYKRLLYRTLVEIRKEIRQNAGMARDHTDKVVAKLKKVIQEHNDNFSRLQEFIERQQSEIQRIKNKISELDKSIHSHKSGI	3469	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8578_pilon_-_0_3500
907278	contig_11338_pilon	-	2113	12	Intergenic	novelGene_6352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_11	183.136719014073	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	6	1574	321458	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	321463	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_321311
907279	contig_9484_pilon	+	3378	17	Intergenic	novelGene_105670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	598.930241007874	15	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	91	1116	138653	206935	TRUE	35	GGGAGTGAAGCCAGTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRVSLHRRERGTSQGKIEGSWYPSAPRPCLMRLYVCILPGYDKWVTSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	138562	214546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_138701_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513_211798_212489_213375_213461
907281	contig_5600_pilon	+	1883	11	Intergenic	novelGene_174955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	592	1158	199814	206969	TRUE	45	CTGCAACAGAAAAGATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTTFWNCFSLRTSTITSPSFTKPSPTSPLESANCRVTWGQPALRCSTLSKHWVFWMSRTTLSTASVRTHILGHLDEGEGVLCGLSWQHPSAEGGWQDSQAAGRQDLPVAIINVEDVHFGRRLHFLYSGALPLSIHEFGNAELSPAGGVGALHRWVAGDVVAHVLHQLLQLEPHQSPHPARRSAGRR	196938	412072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_197502_199785_200021_201565_201686_202859_202926_203787_203912_206919_207068_212781_212971_296650_296765_356452_356592_394480_394557_411963
907282	contig_678_pilon	+	940	2	Intergenic	novelGene_167812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117179	118307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_117589_117776
907283	contig_9400_pilon	-	2043	6	Intergenic	novelGene_146582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_3	601.050613509378	42	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	115	426	135537	121567	FALSE	15	GGACCAAGTGGTTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTECTPVQGPLLISGLGIIALAELLGLVSMKVVASSQGTIQPPRNN	158630	119949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_125262_125295_130570_130664_132506_132600_135452_135561_158539
907284	contig_10403_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_175796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	62270	61929	NA	55	ACTTTATTTACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAAPHSNGALQPLRRKQRWHTEPGTRAKGGGGGKRQVRKEAEKKATLAANKWPSENQLVWAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGRQWESIYHKLLVLCSPSGRGKDGARSKVLK	62272	60272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_60300_62300
907285	contig_11335_pilon	-	4001	5	Intergenic	novelGene_104903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_4	17.1901134376711	238	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	393	1385	313749	298186	FALSE	15	TTACCATTCAGTGTTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYCHVCKLPGRVMGIRVLHFSLVVILVLLLVAGALTALLPNIKEDKMLTSRREVKSQGKSTMDSFTLIMQTYNRTDLLLRLLNHYQAIPHLHKVIVVWNNIGEKGPDELWNSLGPHPVPVIFKLQTANRMRNRLQVFPELETSAVLMVDDDMLISAQDLVFAFSVWQQFPDQIVGFVPRKHVSTSSGIYSYGGFELQTPGFGNGDQYSMVLIGASFFSSKYLELFQKQPAAVHALIDETQNCDDITMNFIISKHTGKPSGIFVKPVNMGSLEKETNAGYSGMWHRAEHFLQRSYCINKLVKIYDSMPLKYSNIMISQFGFPYANHKSKM	316675	295569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_298675_301078_301150_301792_302221_313744_313822_316355
907286	contig_17684_pilon	-	3652	1	Intergenic	novelGene_178835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1954	3363	4239	2830	NA	50	TACAAACCATAACCATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRETIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNTVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPRTFFKEMEKLIINFIWKGKKPLISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYID	6192	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_2500_6200
907287	contig_12923_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_30119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTTTTTAATGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72468	70543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_70500_72500
907288	contig_3018_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_78809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524817	526927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_524800_526900
907290	contig_7644_pilon	+	3333	6	Intergenic	novelGene_64251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	139.390100078879	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2591	2968	177957	182983	FALSE	75	AGAGTACAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLERMNLLRGLLLLSTSSSDATTLTSWILGCSFCTSKSIQCIKAVDNQVYVATASLARDDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLARAGPEETIVYSDIDLKKLAEIRQQIPIFSQKRSDLYAVEAKKL	174159	183348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_176654_177755_177835_177939_178088_179596_179696_182476_182533_182891
907291	contig_10013_pilon	-	2926	1	Intergenic	novelGene_125063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACGCCCGCTGGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291385	288459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_288500_291400
907293	contig_12970_pilon	+	778	1	Intergenic	novelGene_50533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACTACATCCTGCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254470	255248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_254500_255200
907294	contig_16496_pilon	-	1533	2	Intergenic	novelGene_5141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	7	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	309	326	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3593	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
907295	contig_5556_pilon	+	4172	15	Intergenic	novelGene_173268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	87.0132818855248	342	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	187	1995	102745	199359	FALSE	70	AAATGTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLTKRRQADTKAIQHLWAAIEIIRNQKQIANIDRITKYMSRVHGMHPKETTRQLSLAVKDGLIVETLTVGCKGSKAGIEQEGYWLPGDEIDWETENHDWYCFECHLPGEVLICDLCFRVYHSKCLSDEFRLRDSSSHWQCPVCRSIKKKNTNKQEMSTYLRFIVSRMKERAIDLNKKGKDNKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYDEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSKNEDRGEEEAESSISSTSNEQLKVTQEPRAKKGRRNQSVEPKKEEPEPETEAVSSSQEIPTMPQPIEKVSVSTQTKKLSASSPRMLHRSTQTTNDGVCQSMCHDKYTKIFNDFKDRMKSDHKRETERVVREALEKLRSEMEEEKRQAVNKAVANMQGEMDRKCKQVKEKCKEEFVEEIKKLATQHKQLISQTKKKQWCYNCEEEAMYHCCWNTSYCSIKCQQEHWHAEHKRTCRRKR	40975	201536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_+_41143_102725_102861_152373_152534_163577_163740_176932_177011_177490_177584_179812_179901_180497_180554_181688_181767_183150_183270_186756_186965_187377_187447_188210_188484_188799_188986_199236
907296	contig_10734_pilon	+	1828	2	Intergenic	novelGene_51537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	69	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGCTACTGAATTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2307685	2309609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2307732_2307827
907297	contig_2455_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_119223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAACCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1400021	1401361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_1400000_1401400
907298	SIRV6	+	1339	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	62	127	12	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	196	687	1733	10736	TRUE	10	ATGGGGTTTGCCGATGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1149	11698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
907299	scaffold_13505_pilon	+	1420	3	Intergenic	novelGene_111563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	92.5	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAACAAACAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608572	634293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610126_633993
907300	scaffold_880_pilon	-	2071	5	Intergenic	novelGene_121448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCATAGCTTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444013	432473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_433596_437560_437774_439123_439212_441361_441427_443430
907301	contig_3233_pilon	-	3820	1	Intergenic	novelGene_56496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	458	829	34462	34091	NA	30	ATTTTGTGTGGTAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSAANQKVGSSSSPRGTSEERPGDILPKTQLLKTLRNTVLLWHTWGHHELTQQHLIWLTSSEPSGRVCLEIEQSQRAVGISGQIYERGNQSFIFCFVACLVCCFIFERRNLTFLFIFKHLEK	34919	31099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_31100_34900
907302	contig_3956_pilon	+	2903	13	Intergenic	novelGene_15077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	952.267830409771	22	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	81	2372	1281682	1290491	FALSE	15	TACGCGACTTATTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
907304	contig_12969_pilon	-	3811	2	Intergenic	novelGene_61679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	174	479	456780	456475	FALSE	35	TAAAGATAGCATATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRYLIIHQQTHTAEKNHICSECGKGFTTKSELIDHQQIHTGEKPYECKECGKGFTVKSRLIVHQRTHTGEKPFICSSCGKAFSSKRNLLVHQQTHNGGKP	457302	453142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_456848_457196
907305	contig_3153_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_104656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCACTCTCTGTACTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132246	130148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_130100_132200
907306	contig_10324_pilon	+	5521	35	Intergenic	novelGene_7860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_5	93.6745867388378	528	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2397	315	2711	413857	459647	TRUE	10	CAGCCGTGCCTCTGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQMHKPMDSMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPTVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEESGSEEEDEEEEEEQPQPAQPPALPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARRAFVPQLRKRKVQRLADDVRVHHQR	394168	501875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_394250_413623_413875_415778_415912_416934_417340_417638_417738_420904_421164_423328_423456_424008_424183_425715_425890_427061_427230_427317_427369_432384_432516_432694_432753_446755_446878_448140_448292_450008_450173_458179_458247_459551_459664_462317_462561_464661_464776_465503_465612_467732_467820_468651_468699_469777_469945_472375_472540_475369_475598_475850_475950_476201_476280_477030_477251_482693_482948_497674_497784_498130_498233_498971_499105_499247_499391_501377
907308	contig_7333_pilon	-	3868	1	Intergenic	novelGene_142740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	480	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1349	1648	40941	40642	NA	55	GTGTATATTTAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYCFQLANLCFKEKQSVMFQNTKMLVHARCLILLIFPGNSFPFIICPISFDSIHLINEITSNSCGHFYVSANSSALLYFMAPSPYKLSSVHVGSLTRV	42289	38421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_38400_42300
907309	contig_14142_pilon	-	4778	23	Intergenic	novelGene_120564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	231.521936379241	13	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1299	3900	477	4376	447028	432882	FALSE	40	TTTTGAAGTTTAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDTTRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQDPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	457324	432479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_433015_433161_433456_437084_437192_437299_437525_440116_440323_440419_440526_440624_440797_441202_441387_441757_441981_442128_442333_442469_442565_442751_442921_443005_443216_443747_443959_444068_444194_444641_444775_445000_445222_445364_445527_445868_446151_446345_446520_446613_446751_446901_447035_456854
907310	contig_6059_pilon	-	1666	11	Intergenic	novelGene_44849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	5292.55238613658	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	50	1225	584239	569146	TRUE	30	TCCTTAAACCGTGCACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVSFERHEDAQKSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584288	567804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573391_576550_576584_580921_581116_584181
907311	contig_7260_pilon	+	5941	1	Intergenic	novelGene_169140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3808	4167	313757	314116	NA	55	CAAAATACCAAATTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLNAYGFAVFSLDELYGSHFLGFSVSSCHAGSENKVCELHLAHDWPSSVNTKLRVYLQMTASRCSRNLLDIAGILYRQIFPSVEITTSHFYLHPYCYQQPRNYLLVWLPEAQVEFARG	309949	315890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_309900_315900
907312	contig_5317_pilon	-	2239	3	Intergenic	novelGene_76493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	153	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	932	1333	24062	23608	FALSE	25	ACCAAGCAACCTTGGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCMANEAVQGQEHLLGCARRTMVEQCVMGTTLSAQNCREHGAIQNQRHCSLGLRRPLSPGTPIGHSEEHWAAPRSQLQCHGLREPSLSPYLPCPTPPSILYSITVPCSFPSQQVSQADILFVCWFVVSPTRL	33354	22701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_23889_23941_24900_33260
907313	contig_19941_pilon	+	3269	21	Intergenic	novelGene_139750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	186	563	8159	12011	TRUE	35	TAACCCGGACGGGAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHCPGASSSVTSTSGSGPMSPSSILFTSIQVQLKEGTLRLHFFIFISASMAQRRPLVPPSKRERRKAGEPMGTLSFSEESCLRVESLPRRLFALIPDSDVCIINCVARNCWICSKTSRCISTAM	7973	40664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_+_8340_9971_10020_10607_10713_11967_12143_12518_12591_12786_12878_13071_13286_14069_14118_14325_14419_14708_15162_15535_15817_17308_17451_17842_18062_18600_18740_21162_21227_21656_21741_21862_21984_22540_22591_23512_23582_38941_39040_40327
907314	contig_13592_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_33734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269883	268172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_268200_269900
907316	contig_15449_pilon	-	3624	1	Intergenic	novelGene_33618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAGTTTCTGCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56579	52955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_53000_56600
907317	contig_14405_pilon	+	1630	7	Intergenic	novelGene_85643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGGGAAAGAGCGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434595	439327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_435104_435408_435550_436258_436354_436693_436806_437339_437798_437895_438147_439262
907318	contig_11548_pilon	+	2261	11	Intergenic	novelGene_66737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1012.96924435049	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	195	1433	63836	119638	FALSE	40	AAACTCTGGAAACCATTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63641	120466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117769_118987_119121_119346_119402_119491
907319	contig_2798_pilon	-	2079	2	Intergenic	novelGene_119997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	39	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGAAGACTCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81280	77572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_79536_81164
907320	contig_10734_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_51233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTAACCAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204797	1203465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1203500_1204800
907321	contig_13565_pilon	+	1470	2	Intergenic	novelGene_162368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	126	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	255	557	132515	132817	FALSE	30	CATTCAGGGTCAATGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFMSTHPKSRGSKLLSPVVILTWLPKMQGLFHKRWVRNHFLIRPRTFQSCYVFSIISFPPPLHFLFFLPLSPPPPHLSSRIPCCLRTGTKRQALIIMIS	86258	133730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_86325_132326
907322	contig_5041_pilon	-	4201	1	Intergenic	novelGene_27104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATTTGAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585521	581320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_581300_585500
907323	contig_19352_pilon	-	4034	1	Intergenic	novelGene_122344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAACAAACACCATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91090	87056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_87100_91100
907324	contig_6062_pilon	+	4301	17	Intergenic	novelGene_5259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	254.992279294884	51	106	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1803	2606	732420	758793	TRUE	40	GAAAGTTTATAAGAATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQRICTILGL	652569	767022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_652698_661999_662943_710266_710406_711937_712070_715125_715284_725918_726112_732310_732485_734987_735112_738368_738447_739518_739796_744245_744299_748666_748740_752906_753014_758766_758931_759167_759267_761712_761981_765831
907325	contig_1331_pilon	-	1513	8	Intergenic	novelGene_37882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTGAACTGTTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499271	432494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_432607_453619_453789_467369_467464_476544_476676_479879_480045_483063_483692_488007_488103_499152
907327	SIRV7	-	907	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	42	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
907328	contig_20116_pilon	+	3429	2	Intergenic	novelGene_159081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCATCTGAGAACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5244	13679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_+_7691_12696
907329	contig_6217_pilon	-	1723	10	Intergenic	novelGene_109701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	81.091169542545	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	132	1226	1083143	1070321	TRUE	25	AGAACTGGTGTAATCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHRKKKPFIEKKKAVSFHLVHRSQRDPLAADETAPQRVLLPTQKVNDDERRAEQRKYGVFFDDDYDYLQHLKEPSGPLELIPTSSFSAHNWKDEKEEILVIPSTGIKLPSSVFASEFEEDVGLLNKAAPVSGPRLDFDPDIVAALDDDFDFDNPDNLLEDDFILQANQPTGEEEGMDIHKSEAEDGSEWEDVDDEKESGCDSDDYDSEGPLSNEGDMSALGRPHGAIKNDLFWEEETKSRFTEYSMTSSVMRRNEQLTLHDERFEKFYEQYDDDEIGALDNAELEGSIQVDSSRLQEVLKDYYKEKAENCVKLHTLEPFEDQDLLMNELNESEEEEMVTVVVEEIKEKWDCESICTQTNPNIF	1083274	1069698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1070021_1070145_1070347_1071533_1071674_1072706_1072835_1074265_1074528_1074890_1075033_1076417_1076506_1080492_1080667_1081975_1082108_1083140
907331	contig_9815_pilon	-	5368	5	Intergenic	novelGene_164227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	4386	5237	983	132	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGGGERQVRSQKKQKKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKGGGGGERQGRNKKKRKKSNTSSQQMALREPPVRVCGIQAAAVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGWESVYHQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSVLR	66087	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_1673_4412_5196_42825_45301_65481_65685_65852
907333	contig_383_pilon	+	1329	8	Intergenic	novelGene_126104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	723.052006484757	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	11	952	123694	130389	TRUE	30	TCAGCATCTACAGCCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGMSSGPELFSIHFSGQVLEQNHHKISAIILTSAMSTTANMTVSPQGRWAISSLIPKHFQAGMHAYINIENCPKKTRSPKKLTRDQRRHIKRWEYFVAAEEVIWDYAPIIPANMDKKYRSLHLDNFSNQIGKLYKKVVYKQYQDESFTKRMENPNAQEDGILGPIIRAQVRDTLKIVFKNMASRPYSIYPHGVTFSPYEDEVNSSSISGGTFMIRPVQPGETYTYKWNILESDEPTENDAQCLTRPYYSDVDITRDIASGLIGLLLICKSRSLDKRGIQRGQQTLSNRLCLLCSMRTRVGTLRTTSTSFVKILIK	123683	134616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_123869_125164_125331_126209_126388_127895_127996_128779_128992_130278_130432_132625_132839_134494
907334	contig_5039_pilon	+	4659	3	Intergenic	novelGene_64760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAGTTAAAACCAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118844	179123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_120671_120756_123177_178710
907335	contig_2054_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_51661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTATTTTTATTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17217	19451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_17200_19500
907336	SIRV6	+	894	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	781	351	-417	143	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	134	466	2002	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1868	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
907337	contig_1274_pilon	-	4179	1	Intergenic	novelGene_137773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	1264	1845	38725	38144	NA	30	TCCCTATCACCAGCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAWPLCPALPCCQESLEDRRTQMEPAKLSLASPSNFSYSRHSRCCSAQEARVPGRPACHSSSCSFSSTTTWPCSTAAWVHSSRQVATEPTESSRHSAFTAWALVNGAVHPLLPLSAQPFFCTSLLHSPKLTAQVCLFFYPCYSFFLKYLIFLSLFNQILTSLNPAQVWSPESSSRPFSPTLFRPHCLFNITH	39988	35809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_35800_40000
907338	contig_16594_pilon	-	1767	3	Intergenic	novelGene_53874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	643	junction_2	188.5	132	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	870	1307	272836	165385	FALSE	30	TTAGTTTTGAGAAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVVSVFSVFIEFVIPCAQLHVGDDRPGSSEHR	335619	164924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_165649_272662_273670_335583
907339	contig_5389_pilon	+	3463	21	Intergenic	novelGene_143015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	247.169875793957	251	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	1138	2262	385302	395369	TRUE	25	CTCGTCACCATGGAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIFLIDCPGVVYPSEDSETDIVLKGVVQVEKIKTPEDHIGAVLERAKPEYISKTYKIDSWENAEDFLEKLAFRTGKLLKGGEPDLQTVGKMVLNDWQRGRIPFFVKPPNAEPPAAPQLPSSSSSSLEVATETTQNNLEEQHTGTVGEESESVIEKEKGENDPCDANSEMQQILARVRQNFGKINVAPQFSGDDLVPLEMSDIDEEPESFSEEEEEEQEQQGDEEEESCRESQEEHVENDTKAVIKALDEKIAKYQKFLNKAKAKKFSAVRISKGLSEKVFAKSEEQEDVEDKAPAKKGKKRKAQREEEHSNKTCRMLTSKERRRAARQQQSRRVGVRYYETHNVKNRNRNKKKTSDSEGQKHKHRKFKHNKQ	367760	409647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_367929_369967_370053_371025_371121_372878_373019_377126_377312_379222_379290_380211_380345_380931_381046_384409_384539_385280_385386_386173_386333_386546_386661_392759_393218_394078_394147_394470_394557_395213_395775_397684_397851_398202_398382_402877_403047_408829_408976_409511
907341	contig_8412_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_118401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1402	1809	773897	773490	NA	80	AGTCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRHPFNSVLKSLPRLTLQAKIRQAYKTNNNTHSSTVYTRLNGHASLGARTRSQEETGKLDENGNGKLELKRGTVLTRHRVGNQCHKTICVLFNEKLICSVNFHQKYNKKNLLKEKKRNDISFMLRSLSKLRWQ	775298	773308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_773300_775300
907342	contig_1719_pilon	-	880	5	Intergenic	novelGene_87360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_3	399.987812314325	7	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	31	576	803613	754873	FALSE	30	GGTGAAGCCCAGAAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803643	754568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
907343	contig_16122_pilon	-	1769	11	Intergenic	novelGene_134549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_10	42.6076284249663	131	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	122	1315	285892	280796	FALSE	25	TAAATGTGGACGTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVHLLQDDRHSTSSSPGHPLTSVPGLRSRSERGGRTPTLEMLKSHISGIFRPKFSLPPPLQLVPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLMHSGDFLVRQSQGKQEYVLSVLWDGQPRHFIIQSADNLYRLEGDGFPSIPLLINHLLHSQQPLTKKSGVVLNRAVHKDKWALNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNSLVAVKSCRETLPPDLKAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGPRLRVKILLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNILKISDFGMSRQEADGVYAASGGLRQVPVKWTAPEALNYGRYTSESDVWSFGILLWETFSLGASPYPNLSNQQTRDFVEKGGRLPCPELCPDAVFRLMEQCWAYEPGQRPSFSIICQELQSIRKRHQ	286098	280341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_280939_281380_281504_282123_282282_282524_282649_282739_282835_283182_283302_284184_284239_284662_284786_285120_285331_285847_285968_286052
907344	contig_10749_pilon	+	243	1	Intergenic	novelGene_133488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167462	167705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_167500_167700
907345	contig_567_pilon	+	2004	4	Intergenic	novelGene_33973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	54.420175997102	137	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	29	334	338793	359131	TRUE	50	CACCTACAGCACAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLFSTPKLVSAVASARSLSGCMSRSQRKYSLQPILERKIPNRYLGQPSPLTHPHLLRPDPSVAARRCHPHCSNEDLKVKKKKTVKGYIKGNEYHPKELV	338764	361148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_338857_358266_358384_359006_359608_359954
907346	contig_5145_pilon	+	1115	3	Intergenic	novelGene_131453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	564	881	936106	937483	TRUE	15	AGTTGGCATCTGTCTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTKLIKKKKKKPTKRLTDSMTSKNTSFFRYLIPSDLQDTALVTVAGGPWGPRLQLVALLSDVLLQDLAVCGLRVAEVHELIQQLIDDDKVVTDALLLQLLKVF	935542	939322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_936297_937356_937494_939098
907347	contig_5389_pilon	+	2118	15	Intergenic	novelGene_143014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	246.480501774688	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	968	2092	385302	395369	FALSE	55	TACAAAAATATGCAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIFLIDCPGVVYPSEDSETDIVLKGVVQVEKIKTPEDHIGAVLERAKPEYISKTYKIDSWENAEDFLEKLAFRTGKLLKGGEPDLQTVGKMVLNDWQRGRIPFFVKPPNAEPPAAPQLPSSSSSSLEVATETTQNNLEEQHTGTVGEESESVIEKEKGENDPCDANSEMQQILARVRQNFGKINVAPQFSGDDLVPLEMSDIDEEPESFSEEEEEEQEQQGDEEEESCRESQEEHVENDTKAVIKALDEKIAKYQKFLNKAKAKKFSAVRISKGLSEKVFAKSEEQEDVEDKAPAKKGKKRKAQREEEHSNKTCRMLTSKERRRAARQQQSRRVGVRYYETHNVKNRNRNKKKTSDSEGQKHKHRKFKHNKQ	367760	395395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_367929_369967_370053_371025_371121_372878_373019_377126_377312_379222_379253_380931_381046_384409_384539_385280_385386_386173_386333_386546_386661_392759_393218_394078_394147_394470_394557_395213
907348	contig_9197_pilon	+	3510	2	Intergenic	novelGene_154369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	124	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	47	562	80748	81263	FALSE	45	ACAGTCCAATCCACAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAETANGPTEDQVEILEYNFNKVNKHPDPTTLCLIAAEAGLSEEETLVSAACTPTPPSASTPARPVRPRLRSPPPASLLQGSSSSSPTPRPGSPPFTLILHRFTPLCPLLPILGAQTLHPFHRCISASRLPSQCPSTLTPGSSPRTCLETTRAPFFHLAFHPSLTTRDER	80229	84211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_80263_80734
907349	contig_12644_pilon	+	2817	1	Intergenic	novelGene_44568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1158	1715	2004770	2005327	NA	15	CCTGCCCAAGGTCTAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSTVLARGQLGPSPPHWADATVRCELNTGLQAPVPRAVGRLGRKKEKWATEHKGDGLERRAMPWAKGAKAGLQGTETRSLSQGAHGGVHYGWGGKLCWATSGNASREGPLEGYSTGHFNKQLNRGSWVPSTDSSVESTLCWGQEGVRDLGHVLTSGHSWVRVTFTAKRRCVSNSPDSKTQDRHR	2003612	2006429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2003600_2006400
907350	contig_6589_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_25713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	343	690	446704	447051	NA	25	TTGGAAGGAGACTGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSPVQPLSEELASETGLIENLGAMLSRVAPISVRPLSLVFLLEFQFCTPSFSCSIRDSLLCSLSGQSPSSSSGLRLMKSLVYVALSVSWATTFLVSLVFILLYSRWLGPIDAS	446361	447914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_446400_447900
907351	contig_567_pilon	+	5479	21	Intergenic	novelGene_34013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	222.620366318987	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1201	3606	1414	5019	635972	660604	FALSE	10	GTCTCCCAGCTCTCCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRGSVPNQMMPRITPPGLNQFGQMSMAQPPIGPRQTSPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSSQSQFLPQTPFSTQGMNVSNMPLGQSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCATLPQPALHQNSPSPVPSRTPTPHHTPPSIGAQQPPAAAIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPPQVQPSLPAAPSADQPQQQPLSQQSTAASVPTPLSQPAVSIDGQASNPPSTSSTEVNSQTIPEKQPSQEVKMEAKMEVGQPEPVDTQPEDIPETKTEDCKVEPTETEERGTELKTEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHFCEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVLHHEVIWPTGFVCDGCLKKTGRTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGEVTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQEYGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNKSSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIPCDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESSNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTGQQPTTPQTPQPPPPLSPSLLLPAACLPTCPELRLLVLCPRARQQAR	634558	661064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_636024_636376_636487_638170_638309_638917_639320_640637_640818_641259_641405_643230_643350_644447_644688_645326_645416_647348_647430_649002_649060_649752_649831_651517_651586_652502_652654_652765_652913_653597_653712_654923_655090_656043_656209_657400_657563_659406_659689_659944
907353	contig_14333_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_49084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	272	819	701	1519	262547	263365	NA	20	AGGTGTCACTTGTAGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEGNMGVTLEASTETDVKTLNSCSESVPSRSKLRKPKPVSQRKKTISGEFSETETMVEGTPLPKAPYQVSLDELDENTYSSLIGGARIQKPPTEVKETSSTPSSDTNDSGVELLEESRSSPLKLEFDFTEDVENVEAKKALPRKLGRKLGNKLTPKAQKDGISKPVGGKGVEQPADIKAEDTPVLHTSSKLDPSQWDNPNFNPFGVHSTLQNSPSLSSKSSYHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTCNDFRSTTGNHVNEILESPKKAKSRLIT	261846	263728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_261800_263700
907354	contig_8110_pilon	+	1067	2	Intergenic	novelGene_158620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATGGAGTCTGTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316531	317663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_+_316985_317049
907355	contig_12852_pilon	+	3206	22	Intergenic	novelGene_141446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_20	96.6355333397342	226	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1004	3012	195	3206	522067	573125	FALSE	20	TACTTTGACTTCTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKNGANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVVELLLSHGANPCVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTETCTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAKVSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILTQIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLEDEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGFGLLFAFTIDPNLGIAVSLSLLALLHIFFIVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRLARHIGYLELLLKLMFVNPPELPEQTTKALPVRFLFTDYNRLSSIGGETSMAEMIATLSDACEREFGFLATRLFRVFKTEDTQGKKKWKKTCCLPSFVLVLFIFACIIAGITLLAIFRVDSKHLTVNAVLISVASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLNSQRKRLHSAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDGFTQNQTRLVVIIDGLDACEQDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHLPVFLNSRGLSSARKFLVTSATNGDIPCSDPAGIQEDSDRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNRRDTYRRRQIQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISFNWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGVPDQMTLKTIYER	500084	573125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_500253_522040_522175_528611_528711_529715_529815_532304_532404_533817_533917_536110_536210_537625_537824_538980_539080_544679_544779_547316_547416_552414_552593_556068_556234_557275_557456_558800_558967_560765_560918_561120_561411_562499_562641_563421_563666_563833_563923_565488_565634_572961
907356	contig_7342_pilon	-	3086	2	Intergenic	novelGene_71180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	517	junction_1	0	147	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTGTTGTAGACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482809	479638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_482474_482558
907357	contig_8057_pilon	+	5216	3	Intergenic	novelGene_176641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58456	314370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_+_59865_178017_178139_310683
907358	contig_3679_pilon	+	3678	16	Intergenic	novelGene_112118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	82.4588786406089	632	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	70	1581	1025707	1048171	TRUE	35	TGCCACTACTACCTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPEIRSTAAPLWYSVNQQKSKSMEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHCILTEDGNQHVYKKLCLCAGAKPKLICEGNPYVLGIRDTDSAQEFQKQLTKAKRIMVIGNGGIALELVYEVEGCEVIWAVKDKNIGNTFFDAGAAEFFTSKLITEKSEAHVAHKRTRYTTEGKRKEAKTKAKASNVGSALGPDWHEGLNLKGTKEFSHKIHIETMCEVKKIYLQEEFTILKKESLIFPRDHHNKLVKTTDKEMWPVYVELTNEKIYGCDFIVSATGVTPNIEPFVHGNNFNLAQDGGLEVDDHMHTSLPDIYAAGDICTASWHPSPVWQQMRLWTQARQMGWYAAKCMAADSLGDSIDMDFSFELFAHVTKFFNYKVVLLGKYNAQGLGSDHELMLRCTKGQEYVKVVMQNGRVMGAVLIGETDLEETFENLILNQMNLSSYGEDLLDPDIDIEDYFD	1025637	1054188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211_1032332_1034957_1035087_1037196_1037271_1040377_1040539_1041248_1041350_1042779_1042919_1043849_1043963_1044587_1044711_1046980_1047119_1047922_1049228_1049811_1050516_1051622_1051715_1053425_1053567_1054084
907359	contig_3523_pilon	-	2804	3	Intergenic	novelGene_171484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACCTAAAACTCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235726	85881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_86867_86984_88192_235114
907360	contig_16722_pilon	-	4043	17	Intergenic	novelGene_118277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_9	263.246082591935	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	877	2634	415	3048	132864	91874	FALSE	15	TTGTTGTATCATCCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETKITTTEIIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPEAPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIAASTTSPTNSTTSTVSPAQKVMVAPISGSVAPGAKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSTSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGTPQQVVTQIIRGQPVSTAVSAPNAVSSAPGQKALTSSAPTASLQSPTSQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGQGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTSTTVSTTAAGTSEQRQSKLSPQTQVQQAKTLPPAQSSSVSPPETPPPTAQPSAQPQPPAQPPAPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPIQTQSSKPQAAVQCQPQSNVQGQSPVRVQSPPQTRIRPSTPSQVSPGQQPQVQTTASQPIAIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVVMKQNAVIEHLKQKKTMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKKDLKLKKEKDLAQAAAVAAALPVTAAPPAPPPSPPPALQPPGLLSTPTIPAASQKRKREEDKDSTSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDLCTNWYHGECVGITEKEAKKMDVYICNDCKRAQEGSSEELYCICRTPYDESQFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYERLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS	143914	90878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_91911_96293_96481_103887_103973_105711_105905_106668_106843_109688_109997_115770_115997_116286_116370_121589_122078_122764_122988_125204_125423_130776_130886_131819_131972_132713_132961_136189_136233_136609_136761_143790
907361	contig_3679_pilon	+	3291	17	Intergenic	novelGene_112119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	83.788400711256	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	70	1581	1025707	1048171	TRUE	40	AAAATGTTTTAACATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFPEIRSTAAPLWYSVNQQKSKSMEAVRPPPTAGKFVVVGGGIAGVTCAEQLAVHFPSEDILLVTASPVIKAVTNFKQVSKILEEFDVEEQPSTLLENRFPNIKVIESGVKQLKSEEHCILTEDGNQHVYKKLCLCAGAKPKLICEGNPYVLGIRDTDSAQEFQKQLTKAKRIMVIGNGGIALELVYEVEGCEVIWAVKDKNIGNTFFDAGAAEFFTSKLITEKSEAHVAHKRTRYTTEGKRKEAKTKAKASNVGSALGPDWHEGLNLKGTKEFSHKIHIETMCEVKKIYLQEEFTILKKESLIFPRDHHNKLVKTTDKEMWPVYVELTNEKIYGCDFIVSATGVTPNIEPFVHGNNFNLAQDGGLEVDDHMHTSLPDIYAAGDICTASWHPSPVWQQMRLWTQARQMGWYAAKCMAADSLGDSIDMDFSFELFAHVTKFFNYKVVLLGKYNAQGLGSDHELMLRCTKGQEYVKVVMQNGRVMGAVLIGETDLEETFENLILNQMNLSSYGEDLLDPDIDIEDYFD	1025637	1054202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_1025791_1028188_1028270_1032211_1032332_1034957_1035087_1037196_1037271_1040377_1040539_1041248_1041350_1042779_1042919_1043849_1043963_1044587_1044711_1046980_1047119_1047922_1049233_1049852_1049940_1050276_1050516_1051622_1051715_1053425_1053567_1054112
907362	contig_12638_pilon	-	2222	19	Intergenic	novelGene_33110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	45	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAATGGCGGCCGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199744	170812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_171970_172044_172974_173135_173511_173560_178085_178283_180795_180859_180952_181013_182933_183049_183449_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191356_191725_191804_195518_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199501
907363	contig_12790_pilon	-	4914	5	Intergenic	novelGene_35287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	249.21714928953	730	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	318	695	456865	455080	FALSE	45	AAGACAGCAGGCTAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKFGITAAFSMIYVYTAELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTILTAILTLFLPESFNIPLPDTIDQMLRVKGIKYRQSPTHTRVLKDEEESPTILKSTAF	462319	450860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_455168_455548_455685_456711_456895_460276_460378_462132
907364	contig_4732_pilon	+	5487	18	Intergenic	novelGene_75464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	4289	4591	706365	712844	TRUE	10	GTCAGCTTCTCCTGCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEASSLISSYFRTATWRRQAFWMVRAKPSNLRSRISSRRKSDSGFLMKTLVPPIWYWSGSMLTAWSRCWTPWRSSPRHRGHVSGVRMAYLCRNLGNWRR	696185	727231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_697276_697641_698951_699477_700819_703598_703696_703912_704058_704407_704554_706204_706377_706557_706671_712566_712710_712809_712910_713352_713461_715492_715578_720152_720235_721483_721654_722527_722615_723829_723916_724035_724122_727104
907365	contig_12951_pilon	+	1689	10	Intergenic	novelGene_68204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	346.482679096056	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	329	1345	820027	837330	FALSE	15	CTCCATATTTATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSST	755186	837674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813286_813354_816866_816958_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934_836131_837306
907366	contig_16205_pilon	+	831	5	Intergenic	novelGene_156873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATTTAAAGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87149	105895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_87425_88540_88737_89467_89552_103299_103466_105785
907367	contig_6760_pilon	-	3357	5	Intergenic	novelGene_150781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	2938	3357	94711	94292	FALSE	35	GCCATCCAAGAAGCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGATEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEEPLRVTWDTIKSKNFRVIGIPEEGEKTENTDRIIEELLTENFPNIMKDETL	160795	94291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_95317_95393_96827_107447_107573_117194_117304_160130
907368	contig_5429_pilon	+	2370	14	Intergenic	novelGene_127800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	195.247710970073	14	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	1440	2294	467314	498838	FALSE	85	AAGTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLINPKASDSPIDLFHGDIAGGISEAVIQKFLYLGDDRNIEEVYVAGKQVVPFSSSV	427334	498914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_427405_457958_458048_460504_460677_462742_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586_495718_497667_497696_498767
907369	contig_10766_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_151204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGAACAATGTACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141156	143102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_141200_143100
907371	contig_11281_pilon	-	2593	7	Intergenic	novelGene_125456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	566.342554368722	96	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	10	978	847447	837822	TRUE	30	AAGAATTTTTACTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKMPLPHASFSLCVFSRYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTVSEPWSTVRAVKALVNEQISSVPASYGALLASGRCSGVLGGRCIVKWSINMSHTCHTPVTSLAYK	847456	826831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_827259_836633_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246
907372	contig_17274_pilon	+	2607	16	Intergenic	novelGene_26552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	257.090904804766	1	75	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	89	1021	181233	213531	TRUE	10	TAGGGCTTATTGTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAASTSALRSQLELSEREEPQEATCSQSQMTPEPMDFRKSPIFRKRVVSYNSSSESSEDEVHWKAQRLVFSSGPSEEDISSDDSVEPSSEEGPQEASPSVPRSALGRMRRRPRKHLAQRSRVPLKRRRPRGPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	179153	216907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_179192_181182_181243_182427_182470_184627_184721_186547_186632_195741_195817_203685_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439_216329_216364
907373	contig_10953_pilon	+	2960	4	Intergenic	novelGene_42597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	20426.3046584545	80	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	5	331	460344	461721	TRUE	30	TAGTGAGTAGTGGAACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKGTVRECFGVPGPWGLPQALLELPSFAP	460339	464448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_460404_461127_461224_461550_464195_464292
907374	contig_4962_pilon	-	4911	13	Intergenic	novelGene_107373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	190.816720528714	323	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	166	1704	225354	114908	TRUE	35	ATTTACAACACTGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLYGQACPSVTSLRMTSELESSLTSMDWLPQLTMRAAIQKSDATQNAHGSGISKKNVLLDPNTTLDQEEVQQHKDGKPPYSYASLITFAINSSPKKKMTLSEIYQWICDNFPYYREAGSGWKNSIRHNLSLNKCFLKVPRSKDDPGKGSYWAIDTNPKEDALPTRPKKRARSVERASTPYSIDSDALGMECIISGSASPTLAINTVTNKVTLYNTDQDGSDSPRSSLNNSLSDQSLASVNLNSVGSVHGYTPVTNHPEPVSQSLTPQQQPQYNLPERDKQLLFSEYNFEDLSASFRSLYKSVFEQSLSQQGLMNIPSESSQQSHTSCSYQHSPSSTVSSHPHNNQSSLSNSHGSGLNTTGSNSVAQVSLSHPQMHTQPSPHPPHRPHGLPQHSQRPQHPAPHPQQHSQLQSPHPQHPSPHQHMQHHPNHQHQTLTHQAPPPPQQVSCNSGVSNDWYATLDMLKESCRIASSVNWSDVDLSQFQEFDGEYETSRSQELVFRSGPICRSLFFS	264974	101867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_104860_107117_107226_114800_114993_115419_115523_119615_120033_122650_122826_125923_126053_137495_137598_149604_149689_179094_179170_197929_198255_225310_225372_264826
907375	contig_2209_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_141001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAGGCCCAGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121791	119750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_119800_121800
907376	contig_15304_pilon	-	1137	4	Intergenic	novelGene_30675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	1400	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	10	GACTGGCATGGTTCTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
907377	contig_14326_pilon	-	2065	1	Intergenic	novelGene_120769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	893	1255	724947	724585	NA	35	AACATGCATTATCAGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDVLDIIPQLIWSSVIMFNASNLFFEMVSKFRWDILKVVLWLSWTCSNFLTFNLNLCNKLWITLQRIGITEHLIVLMKNLYIDQETWFKVRKGVHQGCILSPYIFNLYAEQIILRHWTI	725839	723774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_723800_725800
907378	contig_16431_pilon	-	4154	2	Intergenic	novelGene_87615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2575	3018	223047	222604	FALSE	40	AAAGGGGGGGTTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVIYRYNAISIQIPTAVFNETEKQISYFIWKGNRPPISKALFKKNNKVGGLILPDFRTYYTATVVQIAWYWYNNRCIDQWNRIENPIENPEVNASTYEQLIFDKGPKSVNWGNDSLFNKWCWHNGISSCKKLKQDPYLTHKK	247968	221467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_224507_246853
907379	contig_3424_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_55513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAATAATTTTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218979	221762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_219000_221800
907380	contig_14467_pilon	-	1596	12	Intergenic	novelGene_138274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCACACGCCGCCCGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397409	352161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_352318_369702_369808_371154_371253_371359_371541_373147_373288_374527_374630_375778_375959_377841_378015_384888_385027_386923_387012_391848_391941_397266
907381	contig_20527_pilon	+	2854	4	Intergenic	novelGene_138569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	1293.85547879197	9	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	35	108	403	510	13271	13378	TRUE	25	TTGTGACCCTAACTGACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPLIPRTLSPPVSPLSSWTGGGAIFNKAKNAKEEGALSDTYPASDFIRVECLENESYILCLVDSGRRVNLVLVILSWQERTTSTSGRNFAFYNSKGCVSVADILLTTHSTLYRIIAFILEGIFFQGQLLCPLSMAEAQEIFTVLIDFYKPLISKVVVVRPRPHCAHSQ	12868	29201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_26238_26346_27308
907382	contig_5039_pilon	+	1703	8	Intergenic	novelGene_65018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	441.19883064585	41	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	135	653	1773369	1786952	FALSE	15	TAGTTGGGTCTTTGATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFLDNFRWPECECIDWSERRNAVASVVAGILFFTGWWIMIDAAVVYPKPEQLNHAFHTCGVFSTLAFFMRRDQKIGLSLTQLRINAVSNAQVRGDSYESGCLGRTGARVWLFIGFMLMFGSLIASMWILFGAYVTQNTDVYPGLAVFFQNALIFFSTLIYKFGRTEELWT	1756777	1788002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1756871_1773327_1773468_1775230_1775344_1776677_1776720_1776931_1777000_1781414_1781508_1784537_1784596_1786906
907383	contig_5988_pilon	+	2989	11	Intergenic	novelGene_16092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1936.41955422889	5	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	212	886	1218380	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1210385	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1210565_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221799_1222048_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
907384	contig_9389_pilon	+	397	4	Intergenic	novelGene_84021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	22	396	584401	586173	FALSE	15	TCAAGCACGGCCGGCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKP	584379	586174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
907385	contig_6375_pilon	+	2166	6	Intergenic	novelGene_73075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.7168101704379	70	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	310	510	747459	751268	TRUE	65	ATTAAAAAAATAATGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTHTFSLRLHKDRSHWPSCCSSKGQDFSEEWLKWNPVVVNSPETASLIRYAESCRASEDGPLNSRAISPWRYELDRDLDRLPQDLYHARCLCPHCVSLQTGSHMDPLGNSELLYHNQTVFYRRRCRGLPPLCQCYRHLPGDLHRCCDLPGWSCHCCFCFWHHPGFCLCL	744992	758630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_745211_747367_747529_750937_751031_751230_751316_754269_754351_757102
907386	contig_10749_pilon	-	1062	7	Intergenic	novelGene_133512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	42.381861948506	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	558	1043	305939	305197	FALSE	5	GTCCTTGCCCCATCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVDSSGEILELAKGGCPWKDHLYSLESELAPPVAIAFVIYTDQAGQWRVQCVPKEPHSFQSRLPLPESWRGLRDKALDQVTGIPGCIFVHASGFIGGHHTREGALSMARATLAQCSAPMPSTNPLVQ	311439	305177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305396_305535_305718_305834_305958_306076_306202_308321_308482_310998_311112_311298
907387	contig_9429_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_155110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCAAACAGGAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108163	110364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_108200_110400
907388	contig_11538_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_152296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	727	1095	205888	205520	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGAGVAILISDKIDFKTKSTMKDKEGHCIMIKGMIRHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTRIALKREIDSSTIMVGGFNPLLSIKDRTSRRKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTATK	206614	205107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_205100_206600
907389	contig_11417_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_103342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGCACTGTCTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663458	661923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_661900_663500
907391	contig_2854_pilon	+	2528	2	Intergenic	novelGene_120825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	600	1448	246682	247530	FALSE	20	AAGATGTTTTTGTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQTATALPTGTSKCTPSQRVPALTGTTASNNDLASLFECPVCFDYVLPPILQCQSGHLVCSNCRPKLTCCPTCRGPLGSIRNLAMEKVANSVLFPCKYASSGCEITLPHTEKADHEELCEFRPYSCPCPGASCKWQGSLDAVMPHLMHQHKSITTLQGEDIVFLATDINLPGAVDWVMMQSCFGFHFMLVLEKQEKYDGHQQFFAIVQLIGTRKQAENFAYRLELNGHRRRLTWEATPRSIHEGIATAIMNSDCLVFDTSIAQLFAENGNLGINVTISMC	243853	248610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_244451_246679
907392	contig_7398_pilon	-	4064	4	Intergenic	novelGene_166158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	34.2150064542836	7	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	556	1947	143386	126302	FALSE	10	CTGTATTCTCTAGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKACRTWSALYDGESPNHETFLQGLSEEGSRDSAYPVLRLQHPFPSKMESHSAPGKEKSQTELEWDDSYDTGISSGADVTSPGPYESMDNSGPPVPISPPKHIQEMKKNAILLFKGSYIEESDFQDDVMVYRLCAEKDCEDTRNSQEETAGASAKAQTEDQGAPMNNCPLPSPQPETDSGEEHNRDNMNLFQTVSKETAQENDPEVVAPESNSELTPPVSEAEHSASLTVVNPESEDFIAQYDQIIKELDSGTEGLIEQNFPTPDPLLLTKEGERKGEESKEEEEEEEEEGKKGLDEDEDDFDSFMAETPTAETVPSPFGARDETAFASHQVRTQSAPFTGPFISVVLSKLENMLENSLHVNLLLIGIITQLASYPQPLLRSFLLNTNVVFQPSVRSLYQVLASVKNKIEQFASVERDFPGLLIQAQQYLLFRVDMSDTDPESLTKDPIQNASWTDTGRNLFG	143941	124184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_126355_133734_133874_134181_134361_142365
907393	contig_12951_pilon	+	3053	1	Intergenic	novelGene_68233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1090	1434	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795515	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795500_798600
907394	contig_16091_pilon	+	3916	10	Intergenic	novelGene_112340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_2	253.019103363099	1224	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	313	1194	14294	37985	FALSE	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVEHYSYKPDGLLRVLTVPCQKIGADNGNINFGARPQLSSSHSVTWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKTPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	1462	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_1548_1933_1984_3659_3729_12750_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912
907395	contig_8291_pilon	-	2773	4	Intergenic	novelGene_99971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCCAACTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886797	832333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_834611_844014_844314_868717_868890_886772
907396	contig_10163_pilon	+	2211	14	Intergenic	novelGene_82608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_1	42.1601623566706	148	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	229	2160	11226	38156	FALSE	15	TGTGTTCATTTCTATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENMKLATVEDTVEYCLFLIPNEPRNPEKHKEILLKYIERIMTHFAPILVPYIWQNQPFNLKYKPEKGDVPAHMFGMTKFGDNIEDEWFIVYVMKQITEEFPELVARIEDNDGEFLLIEAADFLPKWLDPDNSTNRVFFHHGELCIIPAPRKPRAISWLPTTTPTIPQALNIISTHPEKILASESIRAAVNRRIREYPEKIQASLHRAHCFLPAGIAVVLKQRPRLVAAAVQAFYLRDPFDLRACRVFKTFLPDTRIMTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLAHGFEILCSKSSPHFSDSKKSLVTTSPLWPGFLDSLKKNDYFKGLIEGSAQYQEKLEMAKNYFQVSVNQPESSLAMSPGEEILTLLQTTPFDIEDLKKEEANLPPEDDDQWLDLSPDQLDQLLQEAAGKKESELISKGEEQNYDLTQVSESMKAFISKVSTHKGAELPREPSEAPITFDTDAFLNYFDKILGPGPHESDSDDLDEEDFECLDSDDDLDLETQEPGEEASLKGALDNLKSYMAQMDQELAHTSIGKSFTTQKQVEPLSQAADNNSDEEDSGAGESVMSPVDVDLNLVSNILESYSSQAGLAGPASNLLQSMGVQLPDNTDHRPSSKPTKH	6463	38207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6679_11212_11431_13892_14011_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602_24732_26559_26689_29381_29468_33534_33642_33771_33956_34842_34911_36263_36479_37925
907399	contig_15304_pilon	-	1780	3	Intergenic	novelGene_30633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	439.5	41	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	16	345	106308	103245	FALSE	20	TCATGGAGGTAGTCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	106323	101809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103329_103548_103645_106158
907400	contig_4812_pilon	-	3019	4	Intergenic	novelGene_103634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_3	3759.06646212416	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	142	582	82626	81138	FALSE	20	AAGTATTGTCTGAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQVNNICIKGVYSFN	82767	78700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_81286_81547_81739_82268_82343_82598
907401	contig_6445_pilon	+	4745	1	Intergenic	novelGene_77061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCAAAAAAAGAATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667681	672426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_667700_672400
907402	contig_18055_pilon	+	2069	15	Intergenic	novelGene_117805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	373.839380821579	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	632	1162	77213	80793	TRUE	65	GAAAAGGAAGAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40641	85624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_81158_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
907403	contig_5434_pilon	-	3535	10	Intergenic	novelGene_74652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	135.528594768779	362	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1329	1652	259223	258608	TRUE	25	TAATCTCAGTTGTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTSLEASNITTKKKDNQNDEHEVHDDDGYRIADDSADSLPGFLTIGEKKKIGHLCKLLIDQGRVQYLQQKGFSPALQYYTDPLVSLENVLLTALPSHSSSPEAVA	282195	256506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_257654_257871_258804_259095_259330_262817_262893_273748_273822_275490_276121_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
907404	contig_6612_pilon	+	2780	13	Intergenic	novelGene_148161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGAGAAAAAATGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16670	72767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_16945_19325_19517_21399_21824_36293_36454_46708_46877_50106_50274_60836_61008_61951_62141_64167_64578_67226_67269_67493_67657_71390_71525_72480
907405	contig_14225_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_52749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGATAAAATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308497	305929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_305900_308500
907406	contig_7568_pilon	+	3587	3	Intergenic	novelGene_174003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	83	382	62531	62830	TRUE	50	GAAAAATCACTCCTAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYRYKAIPIQTPMGFFKEMAKQITDFIRKRKRLQISKTLLKKNKVRGLTQPDFRTYYTVTVVKIAWYWYNNRYIDQWNRIENPDINLSTYSS	62448	131195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_62928_74960_77594_130720
907407	contig_7333_pilon	-	1830	2	Intergenic	novelGene_142794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGCTGTTCTGATTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236127	234134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_235168_235330
907409	contig_16685_pilon	-	3862	11	Intergenic	novelGene_115047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_5	217.683003470643	199	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	126	1601	476360	451901	FALSE	45	ATCTGTCCCCAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLSTSAQCAASDSACRISAEHITQVRPKLPLLKILHAAGAQGEMFTVKEVMQYLGQYIMMKQLYDQQEQHMVYCGGDLLGELLGRQSFSVKEPSPLYDMLRKNLVTLATPATDAAQTLALAQDHSMDIPSQDQLKQSEEESLNSRKRTEEGNVPLLPTSQNNCKNSRQDEDLIENLTPNKKSGLDLGFEEWDVAGLPWWFLGNLRNNYTPRSNGSTDLQTNQDIGTALVSDTTDDLWFLNDSVSEQLGVGIKAEAADTEQTSEEVGKVNDKKVIEVEKNDDFEDSKSLSDDTDTEVTCEDEWQCTECKKFNSPSKRYCFRCWALRKDWYSDCSKLTHSLSTSDITAIPEKKENEGIDVPDCRRTVSAPVVRPKDGCIKEGDSKPLDPCSSVEFLDLAHSTESQETISSMGEQPDHLYEPRAGAENMEECQTLLKPCSLCEKRPRDGNIIHGRTGHLATCFHCARRLKKAGASCPICKKEIQLVIKVFIA	494483	449639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_452474_454314_454396_456468_456619_458410_458572_461581_461682_462423_462492_466390_466447_467509_467644_473177_473253_476282_476396_494393
907410	contig_5954_pilon	+	2033	2	Intergenic	novelGene_28546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACACAGTCGAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543674	593879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_545481_593652
907411	contig_14300_pilon	+	2194	8	Intergenic	novelGene_133088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACACTTTAAAGAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142262	185200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_143327_148561_148682_149579_149698_154430_154578_155812_155889_157171_157298_180214_180362_184804
907412	contig_9901_pilon	+	6092	14	Intergenic	novelGene_126935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	317	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACAGAACCGGCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173656	249459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_177915_178178_178342_184550_184689_185238_185382_185867_186004_197332_197518_198642_198796_199191_199293_204138_204298_207321_207492_215524_215674_216086_216260_245845_245929_249378
907413	contig_6365_pilon	+	2254	4	Intergenic	novelGene_133992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1658	2017	3059	10383	TRUE	20	TTTAATTTTCTTTGCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQARRQWDDIYKILKERNCQLRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLPELLKGVLQSEDKQLQLTCRIWDAESYQPDTNLGNDLSRNCCVLLHWCGCCISLTLLLPQLRK	1401	11176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_3345_10080_10135_10363_10541_11096
907414	contig_9843_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_114319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	7	528	48874	49395	TRUE	30	ACCAGACGTACGTGGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REMQMKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLPGIYPREKRVITRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYTHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMNLYCKNP	48867	50898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_49618_50060
907415	contig_5878_pilon	-	3351	26	Intergenic	novelGene_145718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_10	156.49509129682	36	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	1203	2480	247379	216504	TRUE	20	ACAGTTTTGTGCTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTFVTQQWKQSKEKSNCLHNKKLSEKKVKSPLHLFSTLRRSPSYPPPGCGKGKCKLKSEQDGISKTHKLLRRTCSSTVKTDDVCATKSHRTFGRSLSSDPRAEQAMTTIKSHKLLNRPCPATVKQEDCLTLKSHKLLTRSCSGDPRCEHNTSLKPHKLLSRSYSSNLRMEELYGLKNHKLLSKSYSSAPKSSKTELFKEPNSEGRRLSLTSGLIGILTPSSSSSSSSQPAPNGAKCIPVRDHGFLVQTIEFAEQRIPVLNEYCVVCDEPHVFQNGPMLRPTVCERELCVFAFQTLGVMNEAADEIATGAQVVDLLVSMCRSALESPRKVVIFEPYPSVVDPNDPQMLAFNPRKKNYDRVMKALDSITSIREMTQIERRTSKHHWKTSDSLSVHHIWKSRSRWINRIPLLIPYCNGLFRVIGHIL	388520	202734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203104_208192_208278_209329_209400_210462_210537_213578_213649_214925_214999_215168_215282_216486_216536_219428_219497_221330_221384_221820_221887_223064_223191_229679_229773_244459_244556_244657_244709_246120_246692_247257_247384_249147_249215_259787_259879_260322_260384_273638_273734_275282_275361_276632_276704_277247_277338_288356_288395_387913
907416	contig_12464_pilon	+	2701	1	Intergenic	novelGene_68719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	377862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375200_377900
907417	contig_9272_pilon	-	3581	1	Intergenic	novelGene_125895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258197	254616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_254600_258200
907418	contig_6286_pilon	-	3379	4	Intergenic	novelGene_165674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATACGGATACATGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493120	488050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_488064_488869_489251_489349_490020_490805
907419	contig_3942_pilon	+	618	6	Intergenic	novelGene_128645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1325.51324399268	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGACTGATGATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176956	180106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_176966_177638_177695_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
907420	scaffold_12124_pilon	-	2152	11	Intergenic	novelGene_22245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGCCGGAGGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509728	1473571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473668_1486527_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1508646_1508757
907421	contig_1244_pilon	-	1614	3	Intergenic	novelGene_37924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	48	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCTTGACAACTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327908	317058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_318435_320710_320803_327762
907422	contig_4974_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_161413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGCCTGGTGATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103117	104952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_103100_105000
907423	contig_10904_pilon	+	3891	10	Intergenic	novelGene_22668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	415	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCAGGATAGACGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535196	544662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_537771_539116_539169_539421_539464_539552_539595_540490_540604_541596_541649_542245_542549_543361_543659_543822_544125_544548
907424	contig_11978_pilon	+	7683	14	Intergenic	novelGene_63144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_13	104.722682531944	636	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1494	4485	59	4543	2017388	2054395	FALSE	15	TACTACTTTTGCTCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSERHGGKKDGSGGASGTLPPSSGGSSSNSRERHRLLSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAAPLGTIIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLERRENDERRGTDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKTKQTEKEKNQDVSTKSGSMKDRISGSSKRSNEENDDYGKTQPSKSSSNKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRETPKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSPKQDDSPSGASYSQDYDLSPPRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSISPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGRRRSSSPFMSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPGYARHSSSHSKKKRSGSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKVDGKESKGSPIFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRVLKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSLDTGKLKLDENSEKHPILLKDLKAQGTKDCKPIGSKEEIVTPKEPETSEKETLPPLPTITSPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPLPATPQQPPLPPPQPAFSQVLASSTSTLPTSTHPRTSALSSQTNSQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHSLMDLPLPPELPGGDPSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGIVVEEPPPSKAPRKETTSGTSAEPVKNSSPAPPPQPAPSKVEPGAGDAVGLGDITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSEPVAPEESLKEASPAPVVQPSIEQTTPEISSTPADMQNMLAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNGDKNSGPQGPRRTPTMSQEEAAACPPHILPPEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEHQALRPMEYSTRPPPNRTYGNTDGPETGFSATDTDERNSGPALTESLTQTLVKNRTFSGSVSHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHSVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYGELGPGTTGASSSGACLNWGTPAQTSAYGKLYRAPTRVPPRGGRGRGVPY	2017329	2057535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2018437_2023005_2023897_2029719_2029897_2030714_2030855_2032205_2032377_2035142_2035333_2040228_2040286_2040680_2040783_2045221_2045300_2046295_2046413_2046729_2046862_2048249_2048465_2049429_2049883_2053682
907425	contig_4339_pilon	-	3394	2	Intergenic	novelGene_146098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_1	0	245	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACCAATTGTCTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209045	1205040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1205939_1206549
907426	contig_14727_pilon	-	8173	1	Intergenic	novelGene_56650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1059	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATAGCAAGTATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294565	286392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_286400_294600
907427	contig_9243_pilon	-	4793	1	Intergenic	novelGene_60331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTGCTTTTTAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41324	36531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_36500_41300
907428	contig_5428_pilon	+	4231	11	Intergenic	novelGene_160422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_5	199.266680606668	2	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	1331	2527	226333	244245	FALSE	50	TGTCGATTTGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTTNLSSKLMEFNLGTDKQTFLSKLIKSIFISYLENYIEVETGYLKSRSAMILQRYYDSKNHQKRSIGTGGIQDLKERIRQRTNLPLGPSIDTHGETFLSQEVVVNLLQETKQAFERCHRLSDPSDLPRNAFRIFTILVEFLCIEHIDYALETGLAGIPSSDSKNANLYFLDVVQQANTIFHLFDKQFNDHLMPLISSSPKLSECLQKKKEIIEQMEMKLDTGIDRTLNCMIGQMKHILAAEQRKTDFKPEDENNVLIQYTNACVKVCAYVRKQVEKIKNSMDGKNVDTVLMELGVRFHRLIYEHLQQYSYSCMGGMLAICDVAEYRKCAKDFKIPLVLQLFDTLHALCNLLVVAPDNLKQVCSGEQLANLDKNILHSFVQLRADYRSARLARHFS	222653	245949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_222692_223937_223983_224084_224226_225226_226551_228104_228253_234515_234625_238132_238254_239776_239864_242911_243021_243192_243409_244056
907429	contig_9436_pilon	+	1104	1	Intergenic	novelGene_60880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTATTTGTTCTGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231237	232341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_231200_232300
907430	contig_6589_pilon	-	2943	1	Intergenic	novelGene_25843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	371	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTATTTCTTGTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925774	922831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_922800_925800
907431	contig_15866_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_63656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTATTCTACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550765	551971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_550800_552000
907432	contig_6515_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_177993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCCTCCAGATTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432629	430993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_-_431000_432600
907433	contig_13145_pilon	+	1926	8	Intergenic	novelGene_116628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_3	1123.50286776561	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	393	764	43606	57392	FALSE	55	TAGTAAGAACAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35338	58554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43477_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324
907434	contig_5020_pilon	+	2092	7	Intergenic	novelGene_27899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	905.436803733731	23	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	284	1102	122915	125094	FALSE	0	TTGGTGTCTCCTCCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKG	119476	126084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119579_121886_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909
907435	contig_1699_pilon	+	2185	13	Intergenic	novelGene_72826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_11	140.247598513803	289	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	412	1860	94670	101704	FALSE	80	CTGAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDFSESVSGTKFEEDHLSHYSPWSCGTIGSCINAIDSEPKDVIANSNAVLMDLDSGDVKRRVHLFETQRRAKEEDPIIPFSDGPIISKWGAISRSSRTGYHTTDPVQATASQGSATKPISVSDYVPYVNAVDSRWSSYGNEVTSSAHYVERDRFIVADLSGHRKHSSTGDLLSIELQQAKSNSLLLQREANALAMQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVILWFLSRAPILQGGAKNNSAGNFLL	89502	102029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_89550_93132_93348_94520_94955_95512_95684_97598_97746_98067_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_100430_100462_101662
907436	contig_1715_pilon	-	1351	11	Intergenic	novelGene_127182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	234.190435329883	31	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	140	1351	284622	248292	FALSE	80	CAAATAAAAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEAAAAPAPAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIDGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPK	312030	248291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
907437	contig_11505_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_140937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTACATAGGGTAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305806	303492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_303500_305800
907438	contig_20314_pilon	+	2243	3	Intergenic	novelGene_125636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5744	8242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_6485_6566_7775_7947
907439	contig_10689_pilon	+	1531	4	Intergenic	novelGene_118610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	11081	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	530	1048	57608	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	50832	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
907440	contig_6630_pilon	-	3378	23	Intergenic	novelGene_30735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	164.392451466524	219	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	806	2421	90	2510	836018	797930	FALSE	5	CCTAGCCTCTCCTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSPFLELWHPKAVSIRERLGIGDQPNDSYCYNSAKNSTVLQGVNFGGIPVVLLIDVSCFLILILVFSFIRRRFWDYGRIAMVSSETESESRFRRLSSSSSSGQQDFENELGCCPWLTAIFRLNNDQILEWCGEDAIHYLSFQRHIISLLVVVNFLSLCIILPVNLTGDLLDKDPYSFGRTTIANLQTDNNLLWLHTIFAVIYLILTVCFMRHHTQSIRYKAESLVRRTLFITGLSRDANKELVESHFRDAYPTCQVVEVQLCYNVAKLMYLCEERKKTKKSLRYYTNLQVKTGQPVLINPKICGQFCCCEVSGCEREDAISYYTRMKDRLTEKIAEEECRFQYQPLGMAFVTFQEKSMATYILKDFNACKCQGLQCKGEPQPSSHSRELCTSKWTVTFATYPEDICWKNLSIQGLRWWLQWLGINFTLFVGLFFLTTPSIILSTIDKFNVTRPIHALNNPIISQFFPTFLLWFFSTLLPTIVYYSTLLESHWTKSGENQIMMTKVYIFLIFMVLILPSLGLTSLDLFFRWLFDKTFSEASVRLECVFLPDQGAFFVNYVIASAFIGNGMEMLRLPGLILYTFRMIMAKTAADRRNVKQNQAFEYEFGAMYAWMLCVFTVIVAYSITCPIIAPFGLIYILLKHMVDRHNLYFAYLPTKLEKKIHFTAVNQALAAPILCLFWLFFFSFLRLGLKAPTTLFTLLVLLLTILVCLAYTCFGCFKHLSPLNYKTEESASDKGSEAEAPAPPPFTPYVPRILNSLASERTALSPQQQQTYGTVHNISGALPGQWLAQNPADSVAAAFQEA	841947	797061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_798098_799295_799359_799668_799785_800695_800864_802841_802948_803730_803894_807531_807595_808267_808355_808463_808571_811335_811490_812935_813074_813793_813928_814029_814154_814425_814507_818072_818144_819255_819365_820022_820075_822710_822854_827394_827433_828351_828419_833067_833151_835832_836033_841872
907441	scaffold_880_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_121521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCATGAAGCAGGCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578972	577738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_577700_579000
907442	scaffold_12124_pilon	+	2583	12	Intergenic	novelGene_22086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_11	187.586145499797	215	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	904	1380	879089	889101	FALSE	25	CAGTCTCATATAGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRFSVVQKIFPPVPGIRDPIKDFFHNNRLVDWEAGAEGWQECSVEEVQAVGET	859955	890304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026
907443	contig_14925_pilon	-	3734	4	Intergenic	novelGene_55252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	314	junction_3	824.788592441859	577	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	86	499	116065	114666	FALSE	75	TCAGCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTQLIFGTGTQIIVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	121493	111430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_114779_115150_115208_115821_116101_121443
907444	contig_9415_pilon	-	1490	15	Intergenic	novelGene_109733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	1058.3962068206	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1461	29	1489	598837	537227	FALSE	30	TTGGAATGCAAGTATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLESVVADLLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGKLTLKIPWKNLYGEAVVATLAGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELSRIEEALQKAAEKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVKITDIHIKYEDDVSDPTRPLSFGVTLGELSLLTANEHWTPCILNEAEKIIFKLIRLDSLSAYWNVHCGISYQGSREQILAQLKSEIITSSNRSPHHQYIFQPISASAKLYMNPYAETELKTPKLDWNIEVQNIAIELTRPQYLSMIDLLESVDYMVRNTPYRKYKPYLPLHTNGRQWWKYAIDSVLEVHVRRYTQMWSWSNIKKHRQLLRSYRSAYRNKLTQTKVSEEIQKQIQDLEKTLDVFNIILARQQAQVEVIRSGQKLRKKSADPGEKRGGWFSGFWGKKEAKKKDEESLIPEAIDDLMTPEEKAKLFTAIGYSESTRDLTLPKQYVAHIVTLKLVSTSVTIREKENIPEILKIQIIG	598865	537225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_537326_540958_541054_541866_541997_550108_550172_551526_551699_552261_552369_553463_553592_555373_555432_556367_556449_557255_557316_561643_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_598737
907445	contig_2703_pilon	-	1653	9	Intergenic	novelGene_101775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGATCTGTGGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611733	596357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_596399_599679_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
907446	contig_4812_pilon	-	3322	3	Intergenic	novelGene_103632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_2	1451.5	108	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGTCTGAGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82806	78698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_81739_82268_82343_82598
907447	contig_16532_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_110065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	498	1136	1633	582739	582242	NA	35	TGAACATCCTGCCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLVGDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKDQLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQFKDLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGSSHMAGDLPSDEDEGEDEK	583874	582240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_582200_583900
907449	contig_16228_pilon	+	3289	6	Intergenic	novelGene_147935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	278.57465785674	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	57	668	47816	71852	TRUE	10	CCACTTGTGGTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47759	75089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_69477_69790_71434_71573_71760_71853_72142_73821_74146
907450	contig_8552_pilon	+	2567	11	Intergenic	novelGene_80087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_10	82.6080504551463	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	948	1508	512672	517971	TRUE	10	GGCATTTTTATGTGTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTNSNLKFLFKGKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	509982	519831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912_517986_518786
907451	contig_7707_pilon	-	2810	1	Intergenic	novelGene_72218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790045	787235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_787200_790000
907452	contig_7327_pilon	-	6324	21	Intergenic	novelGene_172115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_17	183.266274857105	482	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	307	2604	258002	101495	FALSE	40	CACCCCGCCCCGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQSSSGSLEGPPSWSQLSTSPTPGSAAAARSLLNHTPPSGRPREGAMDELHSLDPRRQELLEARFTGVASGSTGSTGSCSVGAKASTNNESSNHSFGSLGSLSDKESETPEKKQSESSRGRKRKAENQNESSQGKSIGGRGHKISDYFEYQGGNGSSPVRGIPPAIRSPQNSHSHSTPSLSVQPTSPSTALAFGDHPIIQPKQLSFKITQTDLTMLKLAALESNKNQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKTVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGQLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYYKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYRKEDRFDVHQLANDPYLLPHMRRSNSSGNLHMAGLTVSPTPPSSSIISY	258308	97774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_101672_104392_104501_105464_105577_108514_108651_108909_109080_109401_109492_109571_109664_116207_116290_119065_119164_131696_131764_143596_143786_145398_145536_145643_145755_151591_151685_152705_152793_154310_154407_156070_156118_158972_159049_179909_179982_191072_191192_257863
907453	contig_4315_pilon	+	1754	1	Intergenic	novelGene_46856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612608	614362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_612600_614400
907455	contig_9738_pilon	-	6054	14	Intergenic	novelGene_169259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	286	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4551	4880	207727	202436	TRUE	20	ACCAGTCGGGACTGGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSTAPMPGPTLSKLELTRSRPIPSPPVTLFMLLIPPPSLPKESPKLRLIPISPRPKSLSMLLVTAPRYSSPIRPTPPNPPMLFIASRPPNPIPLGPIFPITPPMFN	218510	173506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_173798_180046_180253_181490_181553_182889_182983_186782_186977_187640_187795_188312_188364_188497_188563_202377_202479_205048_205117_205424_205525_207608_207819_207898_207950_214102
907456	contig_5779_pilon	+	5066	5	Intergenic	novelGene_106425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1732	2049	89703	90294	TRUE	30	ACAGCTTCTCTTGAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSAKGKSSPALPSVAAFKSLTCKHCCLESMLWFPHSTLHTRGALWIFQGVRALAPLPISQHRVALIVELRSALLSPMTAFTTAGTLLGWKFSGNGIQLKAEVG	87971	156567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_89986_90259_91037_141924_142843_144023_144744_155930
907457	contig_709_pilon	+	3165	5	Intergenic	novelGene_57587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTTTGAAGTCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2219466	2245373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2222159_2222683_2222756_2224147_2224299_2227041_2227235_2245316
907458	contig_15327_pilon	+	800	6	Intergenic	novelGene_70749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045261	1051607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1045295_1046422_1046591_1047039_1047155_1047296_1047420_1049071_1049179_1051353
907459	contig_16228_pilon	-	2819	2	Intergenic	novelGene_147953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89312	86170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_88042_88364
907460	contig_14682_pilon	-	2506	6	Intergenic	novelGene_139107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	97.6413846685922	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	424	1506	137297	94370	FALSE	25	ATCATTTTTCACACTTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	141891	93369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96484_119765_119809_122397_122532_137167_137317_141487
907461	scaffold_13505_pilon	+	1997	3	Intergenic	novelGene_111564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	92.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAGAACAGCCACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608577	613601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_610103_612696
907462	contig_4654_pilon	-	1471	2	Intergenic	novelGene_103093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494477	492936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493450_493519
907463	contig_3787_pilon	+	6367	6	Intergenic	novelGene_102364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	423	junction_1	181.918003507075	373	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	489	959	360651	519060	FALSE	70	ATTCATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVIEKECSALGGLFQTIISDMKGSYPVWEDFINKAGKLQSQLRTTVVAAAAFLDAFQKVADMATNTRGGTREIGSALTRMCMRHRSIEAKLRQFSSALIDCLINPLQEQMEEWKKVANQLDKDHAKEYKKARQEIKKKSSDTLKLQKKAKKGNS	360162	524468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_360723_395746_395809_401341_401416_515231_515317_517945_518038_518974
907464	contig_21083_pilon	+	2286	7	Intergenic	novelGene_58020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_6	92.46335610512	212	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	143	2071	40804	50528	FALSE	45	TATACCATAAAAAGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGGYGGRDDMEERFLFPEYVAEQEPERTPEEQLEQLQQRQEEEERQKQQLREERRQQKLRASRRVHPDVGHPDPAVPPSGVNCSGCGAELHCQDPGVPGYLPSEKFLSAAAQVDGGLARTVCQRCWLLVHHRRALRLQVSREQYLELVSAALRRPGPALVLYMVDLLDLPDPLLPDLPALVGPKQLIVLGNKVDLLPQDAPGYRRRLRERLWNDCARAGLLPPPSYRGPQHPGGDGPGDGKENPNPSAELRTVLRDVRLVSAKTGYGVEELISALQRSWRYRGDVYLVGATNAGKSTLFNTLLESDYCIAKGAEAIDRATISPWPGTTLNLLKFPICNPTPYRMFQRQKRLKKDATKAEEDLTEQEQNQLNLLKKHAYVVGRVGRTFLYSKEQKDEATFEFDADSLAFDMENEPVVVDKSTKRVELTPQDVKDAHWFYDTPGITKENCILNLLTEKEVNVVLPTHSIVPRTFMLKPGMVLFLGAIGRIDFLQGSHSAWFTVVASNFLPVHTTSLDRADAVYQKHAGHTLLKVPMGGEERMAEFPPLVAEDITLEEGLGESEAVADIKFSSAGWVTVTPRFKDRLHLRGYTPQGTVLTVRPPLLPYVVNIKGKRIKKSVAYKTKRPPSLVYHLQKKKHLNV	40661	50743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_+_41786_43549_43715_44298_44502_47156_47289_48321_48439_49951_50073_50319
907465	contig_3153_pilon	-	2043	12	Intergenic	novelGene_104669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	77.8616064056356	31	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	147	509	229080	214636	TRUE	25	AATTTTTTTTTTCATATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTIHLFRKPQRSFFGKLLQEFRLVAADRRSWKILLFGAINLICTGFLLMWCSSTNSIALTAYTYLTIFDLFSLMTCLISYWVMMRKPSPVYSFGFERLEVLAVFASTVLAQLGALFILKESAERFLEQPEIHTWNNSSDSNSANIKPLKQTTPPFHLLVSLHTAQEIT	234038	203814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_205002_206345_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212283_214608_214745_217133_217170_217855_217937_221159_221226_224955_224999_229052_229138_233949
907466	contig_14683_pilon	+	3206	3	Intergenic	novelGene_166052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	436	930	173384	173878	TRUE	35	AGAAGAAGAAGTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKVLVVWIEDQTSHNIPLNQSLIQSKALTHFNSMKAKRGEEAAEEKLEASGGWFMGFKERSHLHNMKVQSEAASADVEASASHPEDLAKITDEDGYTKQQIFNVGKTALYWKKMPSKTFTASEEKSMPGFKASKDRLTPLLGANAAGDFKSQCSFTIPKSQGP	172802	176338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_173149_173294_174202_174385
907467	contig_12079_pilon	-	2096	11	Intergenic	novelGene_67511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	307.743545829965	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	167	1120	871668	861571	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDFLL	872424	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861585_862587_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
907468	contig_7057_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_123392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTAGCCAGGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1212174	1212728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1212200_1212700
907469	contig_16411_pilon	+	2771	1	Intergenic	novelGene_77267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATCTATTGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18218	20989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18200_21000
907470	contig_10324_pilon	+	3591	1	Intergenic	novelGene_7899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCATAGTGACCATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752956	756547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_753000_756500
907471	contig_2342_pilon	+	2423	2	Intergenic	novelGene_132764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGGTCATCCTAAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425389	427882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_426476_426545
907472	contig_3386_pilon	+	1937	2	Intergenic	novelGene_34539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAACAGTTATCGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406508	410001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_407835_409390
907473	contig_3747_pilon	-	1679	3	Intergenic	novelGene_24891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTAAACGGCGTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201223_203496_203649_203766
907474	contig_2867_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_135234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGAGACAAGAAACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222577	1224096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1222600_1224100
907475	contig_4857_pilon	+	2803	1	Intergenic	novelGene_48869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAGAAAGAAACTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356622	1359425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1356600_1359400
907476	contig_8263_pilon	-	1346	6	Intergenic	novelGene_83095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGGTGTCACCACCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192936	139813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_140166_179977_180103_187956_188095_188936_189000_189256_189389_192400
907477	contig_12528_pilon	-	3837	2	Intergenic	novelGene_81291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	559	870	335789	335478	TRUE	75	AAAAAAAAAAAATCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCCQLPSSWPPTHGDSMSYTTGSDCCEPEGFHWLMFKVDPRPFFLVHLSLEVPLKPVQHHSNTQASTTTRVVAASEVHSSGIKPGSPIWKARILLRNHYCSH	336347	328589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_330506_334426
907478	contig_4754_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_35984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGAGTAGAACTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495328	497190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_495300_497200
907479	contig_1150_pilon	-	291	2	Intergenic	novelGene_61386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	344	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309349	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308936_309065
907480	contig_19560_pilon	+	2341	2	Intergenic	novelGene_178839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGGGAACAACAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58	2576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19560_pilon_+_758_934
907481	contig_4736_pilon	-	2546	1	Intergenic	novelGene_168636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTTAATTAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304003	301457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_301500_304000
907483	contig_14445_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_137392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCTGTAAAATATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432256	433059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_432300_433100
907484	contig_16951_pilon	+	2618	6	Intergenic	novelGene_98646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	261.730089978206	2	137	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	2317	2616	111216	111515	FALSE	20	CAATTTGCTTTGTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGCPEMLFPVPAWRCQPQQQLPLHVHTTCASSLTPGCIAKGSGLGTSASRVPSPAKVVLVKDNSFTDNWKLDFWKSSMYLRENRSYLLPPVKYYGNMSA	85835	111517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91172_91463_103952_104099_106692_108229_110476_110582_111169
907485	contig_2577_pilon	-	3282	3	Intergenic	novelGene_172048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2746	3054	9601	9293	FALSE	30	GAATCCTGAGAGCAGCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDKFMENTDKKMGEFRKIMQEQNAKINSQLEVIQKQQLEIQKISNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTALFEENSEKRTKKNEETLRIL	148976	9064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_9878_10092_11044_147458
907486	contig_7630_pilon	-	3168	3	Intergenic	novelGene_133647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	327	junction_1	52.5	93	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	37	327	444531	439435	FALSE	40	GGACTCACAGTAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPLVLRERCTWKMIHAILVFNNHGKPRLVRFYQRFPEEIQQQIVRETFHLVLKRDDNICNFLEGGSLIGGSDYKLIYRHYATLYFVFCVDSSESELGILDLIQVCVVG	444567	436593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_439565_439983_440076_444462
907487	contig_14666_pilon	+	1076	2	Intergenic	novelGene_39564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	120	776	477340	484940	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477220	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_484340
907488	contig_15741_pilon	-	1262	7	Intergenic	novelGene_159661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	665.224961948964	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	282	641	60544	50182	FALSE	0	GCCTTGTCTGTGCGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFTGGQQAVTQVGVDGAAQRPGPTAASVPPGPAAPFPLAVIQNPFSNGGSPAAEAVSGEARFAYFPASSVGDTTAVSVQTTDQSLQAGGQFYVMMTPQDVLQTGAQRTIAPRTHPYSPKIDGTRTPRDERRRAQHNEVERRRRDKINNWIVQLSKIIPDCNADNSKTGASKGGILSKACDYIRELRQTNQRMQETFKEAERLQVENELLRRS	61368	49560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_50191_50294_50418_50651_50747_60113_60173_60470_60559_60681_60833_61252
907489	contig_2215_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_163851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATTGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175724	175145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_175100_175700
907490	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_93343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657831	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
907491	contig_7642_pilon	+	4892	5	Intergenic	novelGene_178841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1066	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1997	2791	358074	437405	FALSE	35	GAAATCTAAGATTGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVQENTLEVPDRELKSLILGIFQELRRKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDCPL	30635	439506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7642_pilon_+_31519_31790_32022_219469_219506_357227_358842_437378
907492	contig_13592_pilon	-	4219	5	Intergenic	novelGene_33699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCACCGTCGCTGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261438	249301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_249570_255365_255593_256586_256708_257701_257884_258017
907493	contig_3745_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_85100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	268	807	1053	1859	456820	456014	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVIIDWFKPRWIKVNFKVTTKKVNKPTYQNKEEKHKVSVKTKSTKTKEMKKKNPKTKGIQHKRVRGTKKTLAPQKKKHYKMTAINSNLSIITLNVNGLNAPTKRWRVTEWIKIQDPSICCLQETYLRNKDVNLLKIKGWKKIHQANSYQKRAGVATLISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNYRAPKYIKQTLTALKREINSSTITVGDFNTPLSVKDRTSRKKLSEDTEDLKGTISQRDLTDT	457872	455579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_455600_457900
907494	contig_13244_pilon	+	2464	2	Intergenic	novelGene_86957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCTAGTGTACTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291803	294315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_292870_292917
907495	contig_16496_pilon	-	1398	2	Intergenic	novelGene_5142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3593	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1242_3436
907496	contig_14415_pilon	+	3552	1	Intergenic	novelGene_77579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	550	930	986	1366	NA	65	TAAAAGGAAAGAAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSIRISTKLVAVRRRLKMSQMSSSSRLLSHPSSLNINYSPSPQHCPPVFRFHNLLQHLTELTNRISKWLTQLWRLANPKSVGQMSGWRLFLTHVAATADRPKLAGQTTGCSRLTRLWKLTNHVRQ	436	3988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_400_4000
907497	contig_4812_pilon	-	775	6	Intergenic	novelGene_103662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5435	junction_5	5247.34498198851	32	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	34	552	82626	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82659	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
907498	contig_10176_pilon	-	2366	9	Intergenic	novelGene_72729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	227.840816141446	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1170	1937	268025	261068	FALSE	35	TGGAGGCAATTTTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYISEHCILLGSVGYSGHSVDKFLLFFIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
907499	contig_9099_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_149903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTGATGGATAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313958	312433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_312400_314000
907500	contig_11248_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_142561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	287	586	382764	382465	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSSPRFTIQPGSGQPQKNKWD	383050	381704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_381700_383000
907501	contig_6227_pilon	+	2697	3	Intergenic	novelGene_49616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1926	2258	371080	588469	FALSE	15	TTTGAGTGCGGAACTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPEDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKTDKFMENTEKKLEEFRKIMQEQKAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISNEEIKNSAKHQME	316023	588908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_317388_370518_371368_588424
907502	contig_5130_pilon	+	4497	6	Intergenic	novelGene_178439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1640	2035	1646	5146	TRUE	40	GAATTATGCACTCTGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETLEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRHSKISWIPIHQ	6	227155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5130_pilon_+_2005_5109_5522_5762_6798_64106_64484_200116_200669_227032
907503	contig_5039_pilon	-	3125	2	Intergenic	novelGene_65067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	2714	3124	1868534	1868124	FALSE	30	ACACACGTGGAACATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKDISSKQHSKRAGVAILIPDKTDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYAPNHRAPKYIKQTLTALKREIDSSTTVVGDFNTPLSVKERTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDTYRTLHPTAAKHTFFS	1871433	1868122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1868798_1868983
907504	contig_7057_pilon	-	2010	5	Intergenic	novelGene_123382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	69.4167667066106	45	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTGTCCCTTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197062	1182307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1183963_1191057_1191154_1191418_1191546_1194045_1194109_1196993
907505	contig_12638_pilon	+	6426	1	Intergenic	novelGene_33125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	399	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGATTCCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172083	178509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_172100_178500
907506	contig_5023_pilon	+	2185	14	Intergenic	novelGene_7148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	213.789394791799	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	889	2184	359358	405522	FALSE	35	GGATCTCAGCGAGGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCA	349675	405523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_349802_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
907507	contig_7657_pilon	-	2042	7	Intergenic	novelGene_30017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	584.507389935225	287	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	225	671	174162	149028	TRUE	40	CTGAAAATGATAAGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEADNLDSIKEEWVCETGSDNPPVSDNRQRNCEYFVDSLFEEAQKIGAKRLSPTEKKKQVDVSIKLWKNGFTVNDDFRSYSDGASQQFLNSIKKGELPLELQGIFDKEEVDVKVEDKKNEVFMSTKPVFQPFSGQGHRLGRFRHTDL	204368	143537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_144622_148740_149050_154455_154594_159603_159711_167271_167411_174121_174177_204158
907508	contig_4857_pilon	-	2555	4	Intergenic	novelGene_48812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2636.56548478424	74	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1253063	1249328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1249555_1249909_1251151_1251526_1251568_1252016
907509	contig_3077_pilon	-	3361	8	Intergenic	novelGene_26778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	81.6835606571644	336	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	78	1208	241006	221977	FALSE	25	ATTGCTTTATAATTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGPGPLGQPRSNTVAMPKRGKRLKFRAHDACSGRVTVADYANSDPAVVKSGRVKKAVANAVQQEVKSLCGLEASQVPAEEALSGAGEPCDIIDSSDEVDAQEESIYERTVSRKKKSKRHKEDLDRAGGEEYPMDIWLLLASYIRPEDIVNFSLICKNAWTVTCTAAFWTRLYRRHYTLDASLPLRLRPESMEKLRCLRACVIRSLYHMYEPFAARISKNPAIPESTPSTLKNSKCLLFWCRKIVGNRQEPMWEFNFKFKKQPPRLKSKCMGGLQPPIQYEDVHTNPDQDCCLLQVTTLNFIFIPIVMGMIFTLFTISVSTDMRHHRVRLVFQDSPIHGGRKLRSEQGVQVILDPVHSVRLFDWWHPQYPFSLRA	241083	219823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_222163_227127_227284_229751_229833_233967_234149_235066_235227_239666_239835_240624_240715_240897
907510	contig_15775_pilon	+	348	3	Intergenic	novelGene_148371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.5	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCCCAAGAACCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1913	6256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_1945_2675_2707_5970
907511	contig_16532_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_110066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	498	1136	1633	582739	582242	NA	35	TGAACATCCTGCCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLVGDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKDQLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQFKDLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGSSHMAGDLPSDEDEGEDEK	583874	582240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_582200_583900
907512	contig_8412_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_118394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGGATATTAATACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687995	686329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_686300_688000
907513	contig_5921_pilon	-	3359	2	Intergenic	novelGene_142233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1458	2840	35698	34316	FALSE	45	TGACCAGGATCACAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYSAIPIQIPATFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKFIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECTMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDLCTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	68829	33796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_35917_67590
907515	contig_3787_pilon	+	3751	7	Intergenic	novelGene_102438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	94	junction_1	74.3617285077927	160	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	19	555	702836	751384	FALSE	10	CTCCCTAATTTGCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPKKEPMEALNTAQGARDFIYSLHSTERSCLLKELHRFESIAIAQEKLEAPPPTPGQLRYVFIHNAIPFVGFGFLDNAIMIVAGTQIEMSIGIIFGISTMAAAALGNLVSDLAGLGLAGYVEALASRLGLSIPDLTPKQVDMWQTRVSAHLGKAVGVTIGCILGMFPLLFFGGGEEDEKLEEKN	702817	754580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_702954_734124_734170_737419_737488_745015_745071_746544_746588_748622_748729_751282
907516	contig_15407_pilon	-	3389	9	Intergenic	novelGene_123069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCATACTGTGTAAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472471	449440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449869_463733_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467592_467703_467850_467976_468070_468151_468305_470254
907517	contig_9099_pilon	+	5426	30	Intergenic	novelGene_149886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	86	junction_1	93.138384249941	352	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1239	3720	46	3765	212448	362116	FALSE	25	TGGATACTGTATATCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVDLHRRGIPPARLEMIFAKFDEVQNSGGMILSVCKDKSFDDEESVDGNRPSSAASAFKVPAPKTSGNPVNSARKPGSAGGPKVGAGASKEGGAGAVDEDDFIKAFTDVPSIQIYSSRELEETLNKIREILSDDKHDWDQRANALKKIRSLLVAGAAQYDCFFQHLRLLDGALKLSAKDLRSQVVREACITVAHLSTVLGNKFDHGAEAIVPTLFNLVPNSAKVMATSGCAAIRFIIRHTHVPRLIPLITSNCTSKSVPVRRRSFEFLDLLLQEWQTHSLERHAAVLVETIKKGIHDADAEARVEARKTYMGLRNHFPGEAETLYNSLEPSYQKSLQTYLKSSGSVASLPQSDRSSSSSQESLNRPFSSKWSTANPSTVAGRVSASSSKASSLPGSLQRSRSDIDVNAAAGAKAHHAAGQSVRSGRLGAGALNPGCYASLGRVRAKLSAPLAGMGSAKTDSRGRSRTKMVSQSQPGSRSGSPGRVLTTTVLSTVSSGVQRVLVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVGPGYGISQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVADALKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSERSYSSRNGSIPTYMRQTEDVAEVLNRCASSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHGKVFSMFLETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAKVQKALDVTRESFPNDLQFNILMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPGDFVNSSETRLAVSRVITWTTEPKSSDVRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLRNTGNGTQGSMGSPLTRPASRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPSAFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFRSQEDMNEPLKRDSKKEDGDSMCGGPGIPDPRAGGDATDSSQTVLDNKASLLHAMPAHSSPRSRDYNPYNYSDSLSPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSNHNERVEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPMIRALALKVLREILRHQPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRAAEDAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQTADYPINLAAIKMQTKVIERVSKDTLNLLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHAVIGDELKPHLSQLTGSKMKLLNLYIKRAQTGSGGADPTADVSGQS	194827	363777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_194866_212440_212512_235166_235314_252149_252233_254418_254512_258009_258156_262920_263057_266421_266493_269764_269825_271536_271615_272220_272389_277019_277076_278300_278475_291553_291656_298023_298195_304225_304333_307780_308026_310698_310763_317447_317612_319277_319357_323119_323264_339866_340011_341164_341272_343109_343264_347621_347851_349109_349304_349803_349933_352095_352303_360160_360278_362029
907518	contig_1428_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_158410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTAGCGGTACTTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143185	141054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_141100_143200
907519	contig_12123_pilon	+	3182	14	Intergenic	novelGene_144583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	1103	junction_12	964.883210273376	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	10	2073	61563	169928	FALSE	30	AAGTAACTGTTGTAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTPRLHGGRAPLPQDRGFLVVQSDPRELRLWARGDAWGASRTDEKPLRRRRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVVVALARDSLALARPRSSDVYVSYDYGKSFKKISEKLNFGVGNNSESVIAQFYHSPADNKRYIFVDAYAQYLWITFDFCNTLQGFPIPFRAADLLLHSKASDLLLGFDRSHPNKQLWTSDDFGQTWFMIQEHVKSFSWGIDPYDEPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSLENQEVILEEVKDFQLRDKYMFATKVVHLLGSPQQPSVQLWVSFGRNPMRAAQFVTRHPINEYYIADALEDQVFVCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGLQGVYIATLINGSMSEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQRLSQLLNFQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSGGARWREALPGPHYYTWGDHGGIIMAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFLFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIFGSNKEDVHSWLIFQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRIPHATCFNGEDFDRPVIVSNCSCTREDYEWSVL	61553	171037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_61848_82114_82232_91500_91627_98944_99107_100690_100759_109332_109514_131864_131967_133170_133341_138303_138497_141348_141467_143157_143232_154195_154285_167972_168152_169728
907520	contig_5096_pilon	-	2678	7	Intergenic	novelGene_111980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	66.6499979161457	166	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	697	1197	73021	65579	FALSE	55	AAGACACAAGGAAAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLAMECGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVQIKKKGNIYSLNEGYAKDFDPAVTEYIQRKKFPPDNSSPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFLYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYIMEKAGGLATTGKEAILDIVPTDIHQRAPVILGSPDDVTEFLEIYGKHAAR	98533	64097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_-_65771_67647_67768_69426_69565_72970_73112_79489_79583_80101_80273_98191
907521	contig_16109_pilon	-	3778	11	Intergenic	novelGene_80327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_10	74.9026034260492	198	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	57	1781	282019	237556	FALSE	25	CTCTGAATTTCTGTATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLVVNKPGAGLDGSRQGSRGTAVVKVLECGVCEDVFSLQGDKVPRLLLCGHTVCHDCLTRLPLHGRAIRCPFDRQVTDLGDSGVWGLKKNFALLELLERLQNGHIGQYGAAEEAIGISGESIIRCDEDEAHVASVYCTVCATHLCSECSQVTHSTKTLAKHKRVPLADKPHEKTMCSQHQVHAIEFVCLEEGCQASPLMCCVCKEYGKHQGHKHSVLEPEANQIRASILDMAHCIRTFTEEISDYSRKLVGIVQHIEGGEQIVEDGIGMAHTEHVPGTAENARSCVRAYFSDLHETLCRQEEMALSVVDAHVREKLIWLRQQQEDMTILLSQVSTACLHCEKTLQQDDCRVVLAKQEITRLLETLQKQQQQFTEVADHIQLDASIPVTFTKDNRVHIGPKMEIRVVTLGLDGAGKTTILFKLKQDEFMQPIPTIGFNVETVEYKNLKFTIWDVGGKHKLRPLWKHYYLNTQAVVFVVDSSHRDRVSEAHSELAKLLTEKELRDALLLIFANKQDVAGALSVEEITELLSLHKLCCGRSWYIQGCDARSGMGLYEGLDWLSRQLVAAGVLDVA	282075	235558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_237736_241970_242096_244533_244645_245177_245308_247888_248024_252725_252942_256707_256891_257468_257748_269392_269515_273743_273907_281938
907522	contig_6048_pilon	+	2146	1	Intergenic	novelGene_73171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1206872	1209018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1206900_1209000
907523	contig_5988_pilon	+	1634	4	Intergenic	novelGene_15944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	133.096456251347	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	1056	1634	783406	786147	FALSE	20	CGCCTTATTAGCCAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLN	651787	786147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_652838_783400_783527_783653_783803_785838
907524	contig_2438_pilon	-	4797	3	Intergenic	novelGene_112025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	126	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	4406	4729	310899	310576	TRUE	5	GTGGGGCGCAGCGGCGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLREKLETVCPQLPLLQVEQSPGPHTQPCSLALPTHSGPSSHRAILEPVLEVFPARLRPAHILAALGGDPLDQDLLQVCVILLLNLLLHLPAQAIGRSPVGHSEG	315527	305085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_312081_312303
907525	contig_9839_pilon	+	874	7	Intergenic	novelGene_88498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_4	779.358853303292	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	124	858	49467	61360	FALSE	35	ATTTGCCAGAAAATTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45317	61376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
907526	contig_10749_pilon	-	1301	7	Intergenic	novelGene_133514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	42.1679841691406	341	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	484	1284	308465	305197	FALSE	15	AAGTCCTTGCCCCATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLSPGKPWQTKLSSAGLIYLHFGRKLLAQLLGTSEEDSMVGTLYDKMYENFVEEVDAVDNGISQWEEGEPRYALTTHLSARVARLNPTWNQPNQDTEAGFQHAMALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVDSSGEILELAKGGCPWKDHLYSLESELAPPVAIAFVIYTDQAGQWRVQCVPKEPHSFQSRLPLPESWRGLRDKALDQVTGIPGCIFVHASGFIGGHHTREGALSMARATLAQCSAPMPSTNPLVQ	311551	305179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305396_305535_305718_305834_305958_306076_306230_308321_308482_310998_311213_311298
907527	contig_6707_pilon	-	5504	1	Intergenic	novelGene_167038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	456	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAAAGGTGAGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140040	134536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_134500_140000
907528	contig_9011_pilon	+	2120	14	Intergenic	novelGene_159346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	164.106834880324	69	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	37	1080	719386	764494	TRUE	10	AAGTTGTTTGTCGTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEALNVTSHRIEMPRQNSDPTSENPPLPTRIEKFDRSSWLRQEEDIPPKVPQRTTSISPALARKNSPGNGSALGPRLGSQPIRASNPDLRRTEPVLESPLQRTSSGSSSSSSTPSSQPSSQGGSQPGSQAGSSERTRVRANSKSEGSPVLPHEPSKVKPEESRDITRPSRPADLTALAKELRELRIEETNRPLKKVTDYSSSSEESESSEEEEEDGESETHDGTVAVSDIPRLIPTGAPGSNEQYNVGMVGTHGLETSHADTFSTSISREGTLMIRETSGEKKRSGHSDSNGFAGHINLPDLVQQSHSPAGTPTEGLGRVSTHTQEMDSGTEVVWHGEQHQSLLYPLCGSQSIPDVSYR	719349	784325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_719497_722081_722189_731969_732134_733842_733941_739981_740167_757471_757602_763089_763259_764414_764527_765328_765500_767170_767315_770170_770306_779445_779547_781749_781900_784018
907529	contig_7873_pilon	+	3424	7	Intergenic	novelGene_169573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	478.740506143174	46	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	190	876	69396	74655	FALSE	40	CAATGAACAGGTGTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRGKTETSKLKQNLEEQLDRLMQQLQDLEECREELDTEEYEETKKETLEQLSEFNDSLKKIMSGNMTLVDELSGMQLAIQAAISQAFKTPEVIRLFAKKQPGQLRTRLAEMDRDLMVGKLERDLYTQQKVEILTALRKLGEKALETKSLLWQVLRLKKPKNDMMWNLEDIDHILGNDIFLLGILSHCKEIKRFSNCINNLRKGDIKMYRWLLLMPFITVLCLELPL	63388	77203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7873_pilon_+_63410_63989_64150_69387_69497_71230_71367_71739_71839_73550_73647_74400
907530	contig_19330_pilon	+	5342	7	Intergenic	novelGene_163691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_5	54.2568480060863	107	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	27	1160	33108	48192	TRUE	20	TGACGTATGTCCACTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEVVKCPEHGTFCFLKTGVRDGPNKGKSFYVCPADACEFVQATNIPVSYCLLHEDFVVDLQGLLLPQGKNEYRVFFRCTGSKAKGKPWCGSIPCQDPNSKEHSVTSKVQDAPEPFHHLSSQQRNPFKVLDKNQEPSLWKQLIRGEGEEKMVDKKQREKGDQIFNQKKEQKPESKCWMEKALSSGMVVKKKQSAVQEKKQGERREFQCEAKETEGSHKRNVSEVKPKQCPGNELRKPSASSQEKSNGESGDVQNESEPLREKETKLLPLNVHSQNSVSKPQKGGHLSRDHPKNWEARETKAKDDSSTQTVQKRLPHGNFQTQSETPDVPALQGPATQSAPAAAGLSRGEGRKADTSSDGSEEEGVIFVSFKPGNPPT	33081	53028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_33139_33218_33322_35893_35981_45283_45351_47346_48351_48653_48769_49119
907531	contig_17144_pilon	-	2074	11	Intergenic	novelGene_29337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2158.0621422934	109	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1060	1779	167982	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183394	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169025_174866_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
907532	contig_2214_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_144259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGCCTGCCCAGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290428	293048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_290400_293000
907533	contig_10904_pilon	-	1448	5	Intergenic	novelGene_22716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_3	281.613653788306	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	34	783	662714	651376	FALSE	65	AGAGCCAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHYNLSAPPRTMGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662747	650710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665
907534	contig_8631_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_121967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAATTCTAGAAAGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769603	767371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_767400_769600
907535	contig_3747_pilon	+	4202	1	Intergenic	novelGene_24770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2813	3139	203794	204120	NA	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200981	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201000_205200
907537	contig_19237_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_162962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCTCTGTAAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67339	65842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_65800_67300
907538	contig_5696_pilon	+	1418	11	Intergenic	novelGene_117507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	333.217061387919	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	93	1064	319727	344587	FALSE	40	AGTACTACAGCAAATTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLPDYVTFKSFPGIPLQHIFIAAGDDLLDLIQGLFLFNPCTRITATQALKTKYFSNRPAPTPGCQLPRPNCPVETLKEQPNPAVATKRKRTEALEQGGLPKKLIF	319634	344941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_319793_320115_320176_325481_325516_328900_328969_330561_330673_331781_331901_333678_333779_335425_335513_341540_341691_343997_344146_344558
907539	contig_12951_pilon	+	4700	3	Intergenic	novelGene_68185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2737	3081	796605	796949	FALSE	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	564268	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_564321_700913_702220_795226
907540	contig_1372_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_140522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	315	629	462730	462416	NA	60	GGAAAAAAAAAAATCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHILHQPEPRRTRWCPATTTNCSDRDHNRGSWTEWEKNVEQNSKKTKKKTRLIGLTETGGASETMAPKYPTKSELKPLLKSTFQPKIRQAYKTNKNTCEEHTA	463044	460482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_460500_463000
907541	contig_5018_pilon	-	3810	1	Intergenic	novelGene_47172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	2233	2637	1548222	1547818	NA	35	CTCACCATATCAGAAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAPTPSLLTSSSVFCFLATIPVLRASLFPPLRLPTWVKGQKTATVTGAGARPGGAEAHYTFLARPGGPSRRRAQLRQPADLRSNQRGAHATLSTFPRPMMPRQSWAPGLPSQGARVGTGCLHSPCQSLTLPL	1550454	1546644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1546600_1550500
907542	contig_501_pilon	+	2735	2	Intergenic	novelGene_134908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTGGCGGTTCCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798032	800821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_+_798186_798239
907543	contig_5779_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_106526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGTGAGTCGATTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324026	325436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_324000_325400
907545	contig_401_pilon	+	1971	12	Intergenic	novelGene_42827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1396.75363871827	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	57	989	1711949	1715475	TRUE	10	GTTCTCGGTCCTTCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711892	1728755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713640_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716_1716273_1724169_1724348_1728517
907546	contig_9439_pilon	-	2636	1	Intergenic	novelGene_176913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATGTCTGCCTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172590	169954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_170000_172600
907547	contig_5640_pilon	-	990	8	Intergenic	novelGene_27232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	251	junction_7	170.003361311307	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	85	990	63466	13928	FALSE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEVPSGTCRPDVPESPDSRQKSPLFQFAEISSSTSHSDVPSKQCQASALLQFAEISSNTSQLGGAEPGKRYGKSALFQLAE	138281	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206
907548	contig_3424_pilon	-	1533	2	Intergenic	novelGene_55456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	1229	1531	37615	37313	FALSE	30	GTAAAACTCAGCGTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPKDAIPSLSECQCQICVEILIEPVTLPCNHTLCNPCFQSTVEKASLCCPFCRRRVSSWTRYHARRNSLVNKELWEIIQKYYPEECKLRACGQESQEIG	41061	37310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_38235_40452
907549	contig_16666_pilon	-	3902	19	Intergenic	novelGene_61814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	67	junction_13	69.3893114478727	225	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	14	1621	328015	285756	TRUE	30	TACATAGTACACATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHHRQNTAGRRKVQVSYVIRDEVEKYNRNGVNALQLDPALNRLFTAGRDSIIRIWSVNQHKQDPYIASMEHHTDWVNDIVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALAYAKDKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNTVTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPRTCAKLMKLKGHTDNVKALLLNRDGTQCLSGSSDGTIRLWSLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYCTDLRNPDIRVLICEEKAPVLKMELDRSADPPPAIWVATTKSTVNKWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPLTPLCTQPDQVIKGGASIIQCHILNDKRHILTKDTNNNVAYWDVLKACKVEDLGKVDFEDEIKKRFKMVYVPNWFSVDLKTGMLTITLDESDCFAAWVSAKDTGFSSPDGSDPKLNLGGLLLQALLEYWPRTHVNPMDEEENEVNHVNGEQENRVQKGNGYFQVPPPHTRRLRRSWRPHAVQAALPRLRG	328028	279212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_281163_281721_281915_283328_283406_285694_285783_286685_286793_289939_290036_290525_290623_290948_291057_295863_295962_296833_296937_298351_298427_300178_300404_311349_311452_311843_311933_313887_314018_314136_314220_314818_314898_317273_317415_327967
907550	contig_11309_pilon	+	2595	7	Intergenic	novelGene_149858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACCCCTTTAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54566	64491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_+_56391_56927_57018_60169_60348_61240_61442_62840_62964_64221_64342_64432
907551	contig_10583_pilon	+	1374	1	Intergenic	novelGene_167926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	944	1282	248070	248408	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQITKIRNESRDITTDTTEIKRIMTEYHGQLYSNELDNLDEMDKFLEAHNLPKLTQEETKSLNRLITSEQTESVIKNLPASKKKKKKKVLDQMTSLGNSTKYLEKKSDNNPV	247126	248500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_247100_248500
907552	contig_2504_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_166850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGTTTTCCTGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389036	390468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_389000_390500
907553	scaffold_880_pilon	+	3141	21	Intergenic	novelGene_121460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	422.250506216393	101	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	914	2745	70	2814	456080	536133	FALSE	75	GTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVRLLRLEISPAPEILNCCLTPEMLPLRPFSENRTRPHKEILEFPTREVYVPHTVYRNLLYVYPRRLNFASKLASGRNITIKIQFMCGEDASNALPVIFGKSSGPEFLQEVYTAVTYHNKSPDFYEEVKIKLPAKLTANHHLLFTFYHISCQQKQGALVESLMGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAERVPLQNPPIKWAEGHKGVFNIEVQAVSSVHTQDNHLEKFFTLCHSLESQVTFPLRLLDQKISEGMLEHELKLSIICLNSSRLEPLVLFLHLVLDKLFQLLVQPMVIAGQTANFSQFAFESVAAIANSFHNSKDLSKDQHGRNCLLASYVHYVFRLPEPHRDAPKSGGPTPVPDPRYHTYGRTSAAAVSSKLLQARVMSSSNPDLAGTHSAADEEVKSIMSAKIADRNCNRVSYYSAGNSDLPNSTSAPRPASKKHFHEELALQMVVSTGIVRETVFKYAWFFFELLVKSMAQYIHNLDKQDTFRRTRFSDRFKDDITTIVNVVTSEIAALLVKPQKENEQAEKINISLAFFLYDLLSLMDRGFVFNLVKHYCSQLSAKLNNLPVLISMRLEFLRVLCSHEHYLSLNLFFMNADTAPASPCPSISSQNSSSGSSLQDQKIASMFDLTPEYRQQHFLTGLLFTELAAALDAEGEGISKVQRKAVSAIHSLLSSHDLDPRCAKPEVKVKIAALYLPLVGIILDALPQFYDFTAADARGGKSRCNGSDEEQEGGSTINQNVALAIAGNNFNLKTSGVILSSLPYKQCNVLSADTTRNLMICFLWIMKNADQSLIRKWIADLPSMQLNRILDLLFICVSCFEYKGKQSSDKVSTQVLQKSRDVKARLEEALLRGEGARGEMMRRCRTPGNDRFPGLSENLRWRKEQTHWRQANEKLDKYVAQPLCATFTQSPELLFPGYLHY	455197	536460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_455205_456017_456181_479497_479616_482290_482362_484798_484938_485540_485643_488541_488638_490479_490715_492352_492518_493177_493348_496770_496867_501313_501410_506103_506254_509157_509272_510289_510446_514145_514286_525271_525442_528125_528272_534033_534217_534657_534791_535969
907554	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_95574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
907555	contig_15087_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_37293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCCTTTGTCTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302157	303739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_302200_303700
907556	contig_14652_pilon	-	2664	1	Intergenic	novelGene_178843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1900	2295	59770	59375	NA	0	CGGCTGTTTTTTTCTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNLLLSPSMTSSISDILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWMPTGTILSCFCKCFDTVCCFWGIQ	61669	59005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14652_pilon_-_59000_61700
907557	contig_5935_pilon	+	3193	2	Intergenic	novelGene_102773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	416	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCCTTCTGATACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410677	1414003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1411349_1411481
907558	contig_14618_pilon	+	4395	6	Intergenic	novelGene_136783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	127	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3202	3543	38271	38612	TRUE	25	TCCGCCAGAACTACAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRLNLYARFPPSPSCCASSSSRCQPPPLTSAFSPTLGSVIHCNASRNSQNLLTVKWFIEIQLRRQLRIGCNLKVTRCNSACSWPVKTPLCHQGISVANWPSSQPVEQLAQLS	24338	39703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_26735_32004_32151_35602_35665_35838_36098_37932_39388_39626
907559	contig_18511_pilon	+	1725	10	Intergenic	novelGene_126874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_7	373.348213989151	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	166	1326	47371	57017	TRUE	30	TATTTAATTGTGCTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGKKM	35406	59948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_57005_57119_59151_59255_59753
907560	contig_4900_pilon	-	2114	7	Intergenic	novelGene_159068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1179994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181416_1181611_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
907561	contig_10627_pilon	-	3349	21	Intergenic	novelGene_60053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_17	180.812305997131	10	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2250	3	2252	1309781	1186515	FALSE	10	CTTTCCTCTGTTAGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELHSLDPRRQELLEARFTGVGVSKGPLNSESSNQSLCSVGSLSDKEVETPEKKQNDQRNRKRKAEPYETSQGKGTPRGHKISDYFEFAGGSGPGTSPGRSVPPVARSSPQHSLSNPLPRRVEQPLYGLDGSAAKEASEEQSALPTLMSVMLAKPRLDTEQLAQRGAGLCFTFVSAQQNSPSSTGSGNTEHSCSSQKQISTQHRQTQSDLTIEKISALENSKNSDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKMLEKYKERLNRCVTMSKKLLIEKSKQEKMACRDKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGYAFQNLIKQQERINSQREEIERQRKMLAKRKPPAMGQAPPATNEQKQRKSKTNGAENETLTLAEYHEQEEIFKLRLGHLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRIHNEDNSQFKDHPTLNDRYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLTEQRYVAVKIHQLNKNWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDSFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIIMQIVNALKYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVNGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYNSVDGMELTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFYQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPPKPVVTPEAKAFIRRCLAYRKEDRIDVQQLACDPYLLPHIRKSVSTSSPAGAAIASTSGASNNSSSN	1309783	1185417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1186689_1190759_1190868_1192352_1192465_1195940_1196080_1197348_1197519_1200974_1201065_1205309_1205402_1208025_1208108_1209964_1210063_1211767_1211835_1215549_1215703_1219545_1219683_1222442_1222554_1228834_1228928_1230067_1230164_1243530_1243699_1261928_1262025_1262746_1262791_1263818_1263889_1265398_1265471_1309703
907562	contig_20199_pilon	-	985	4	Intergenic	novelGene_82514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	112	447	43987	41055	TRUE	25	GGGACATCCCAGTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44098	27557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_27692_40650_41250_42110_42171_43906
907563	contig_12019_pilon	-	2756	1	Intergenic	novelGene_87703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATATATGTAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196580	193824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_193800_196600
907564	contig_19012_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_159498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCTACCATTACTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117422	119018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_117400_119000
907565	contig_5794_pilon	-	1511	2	Intergenic	novelGene_69769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTTTTCGAGTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716042	713090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_714154_715594
907566	contig_16594_pilon	-	4688	10	Intergenic	novelGene_53808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2630.01917093891	15	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	503	1372	165546	121101	TRUE	30	CCTAATAAAACTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	272930	115146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115991_116096_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272530
907567	contig_16185_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_144756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAGAAGAAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100450	101637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_100400_101600
907568	contig_5794_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_69770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTAAAAAATAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719182	721738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_719200_721700
907569	contig_3509_pilon	+	1461	3	Intergenic	novelGene_160694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	78	junction_2	52	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGTACTTTTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2735	8141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_3994_6899_7004_8042
907570	contig_854_pilon	+	3017	1	Intergenic	novelGene_36538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGCTAAATAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614085	1617102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1614100_1617100
907571	SIRV6	+	677	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	8503	2	288	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTTTGGGGTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	2828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
907572	contig_20199_pilon	-	955	4	Intergenic	novelGene_82561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1249.87386030218	8	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	150	431	42313	41171	FALSE	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGIGFWNSEPPCSPPQINIVHEALRTTMLRSSSSCLSALGCETGAVWVLFHDAEDIQDHLGPKDQAVPTFASLHRMRIQKNTLIQLKVNLQNLNRTWLTHLPNGGWSYMKVTGGRSYTHC	44190	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42347_43906_43951_44118
907573	contig_3754_pilon	+	1958	2	Intergenic	novelGene_146816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATACTCATTGGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56995	81201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_57838_80085
907574	contig_4418_pilon	-	3206	16	Intergenic	novelGene_98368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACGTACCTTAGAACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909477	761162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_761314_840079_840233_849055_849240_851944_852455_867699_867790_870491_870640_871274_871431_877335_877477_879762_879823_880147_880296_887087_887276_890610_890707_891011_891138_901271_901411_904304_904445_908701
907575	contig_16846_pilon	+	1938	3	Intergenic	novelGene_82917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	199	14	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTATGTATGTGTCTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476337	479005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_476387_476830_477168_477453
907576	contig_11656_pilon	+	2468	7	Intergenic	novelGene_53954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTATCCTGATGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138167	224414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_139258_157927_158047_160486_160803_164497_164577_165174_165290_169385_169499_223778
907578	contig_14441_pilon	+	810	4	Intergenic	novelGene_100673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	428.475073824475	97	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	197	625	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112617	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_116578_116963_117220_117344_117539
907579	contig_3285_pilon	-	2746	1	Intergenic	novelGene_153381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69796	67050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_67000_69800
907581	contig_19402_pilon	-	3825	1	Intergenic	novelGene_80829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTTATCCTGTACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121159	117334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_117300_121200
907582	contig_10500_pilon	-	3815	7	Intergenic	novelGene_41262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	805.477291217243	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	702	1295	1635596	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1637621	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940
907583	contig_10482_pilon	+	828	1	Intergenic	novelGene_152840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACATTTGTGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132949	133777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_132900_133800
907584	contig_2933_pilon	+	4122	24	Intergenic	novelGene_111310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	111.612972259319	256	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	104	1681	291427	317720	TRUE	15	TTGATTTTCTACCACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEVLNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVVEEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLAKSRQLEDEKKQLTLIRVELQTFQERYYKMKEERDGYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKMEEECKLERNQSLKLKNDIENRPKREQVLELERENEMLKTKIQELQSVIQAGKRSLPDSDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEMYRHRMNTVMLQLDEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIEKVRREACIVNLESKLRRLSKDSGTLDQSLPRNLPVTIISQSFGDGSPRTNGQEADDSSTSEESPEDSKYFLPYHPPKRRMNLKGIQLQRAKSPISLKQASDLQG	291323	336950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_291434_296669_296886_299379_299518_301622_301949_307613_307794_308707_308861_309617_309744_310407_310606_311512_311690_315832_315889_317719_317803_318830_318932_320205_320259_323290_323424_324000_324203_324808_324936_327620_327862_329145_329243_330116_330213_331268_331405_332891_333072_333395_333521_334388_334505_336198
907585	contig_14030_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_62245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGCTCACAGGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361550	363290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_361600_363300
907586	contig_3832_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_161429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAACTAGAATAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71553	73212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_71600_73200
907587	contig_6079_pilon	+	1105	2	Intergenic	novelGene_160092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCCGCTCACAGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421166	567446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_422037_567211
907588	contig_8712_pilon	-	1277	1	Intergenic	novelGene_58858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGTTGAGAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737511	736234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_736200_737500
907589	contig_854_pilon	-	3327	14	Intergenic	novelGene_36702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.13175484008477	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	2970	3326	1706853	1704900	FALSE	25	TCAACCTACACAGGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQ	1716403	1704898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715071_1715208
907590	contig_12312_pilon	-	4118	17	Intergenic	novelGene_63967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	11	junction_3	877.807920956373	4	129	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	148	1884	278150	218747	TRUE	45	AAATTACATTTATAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENQAGTDSMRQGHRQGLR	324167	213925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218796_229509_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_324071
907591	contig_5698_pilon	+	2593	3	Intergenic	novelGene_55048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1802	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGAAGTACAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31349	105860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_32995_91270_91892_105533
907592	contig_14643_pilon	+	4168	2	Intergenic	novelGene_99126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	545	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2134	2484	38549	38899	TRUE	65	CAAAAAAACCCAAAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALIYGINRISGITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKPLCSSKDFTKRAKREFLHWEKIFGNNTFDKGLISKIYRKLKQQKDKQPNHPMGKGHEQTLHQRGHLGGQQIREKMLASLSH	36415	40627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_+_40351_40394
907593	contig_4754_pilon	+	4226	4	Intergenic	novelGene_35879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_3	16.996731711976	318	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2448	168	2615	9354	29883	FALSE	75	GTAAAAAAAAAAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVSQEKKKMVKAQESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDPAQKDLYWDMMLENYSNLVSVGCQVNKPDALSKLERGEQPWTILDESHSGIFSEIQKVDDHLLGHSQNGSRVDSMEQCCEHNALENTVHWHKTHFPLRENHTMFDLHKKAVKSNLTLLALNQSRSDEIKNSAELNGDEKTFLHDDQEQFCTAVKFPESQKSSSTKSQLIQHQKTPKIEKMHVCSECGKAFIRKSFLTNHQIIHTGEKPYRCSLCGETFFKKFKLIEHYHTTHKGQKPYKCMDCGKAYLHKSLLNKHQKTHMAEKPYICCECGKGFIREMHLTIHQRTHSGEKPYVCHECGKSFIQKRNLTIHQLTHTGEKPYICRECGKGFIQKRNLIIHQRTHTGEKPYMCSECGKGFIEKSSLIIHQRTHTGEKPYICSECGKDFIQKRNLIIHQRTHTGEKPCVCSECGKGFNHKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFNQKGNLLIHQRTHTGEKPCVCGECGKGFIHKGNLIIHQRTHTGEKPYICNECGKGFSHKGDLTVHQRTHTGEKPYICTKCGKGFIQRRYLIIHQRNHTGERPYICSECGKGFNQKSCLIAHQIFHTGKMPFSCSECGKSYSQKSSLIRHQKIHTGEKPFQCSECWKAFETKQELIVHQRSHTGEPTYGCNEYGKAFPYASNFYSHKGSHKREKCIDSVKVEDPSTAHHSSSHISDLMQEKSPVNTVTMKMPSVAAQTSVNISGLLTNRNIVLVGQPVARCEPSGDNREFVQERNLMDTVNVVVPMNAVNVVVPVNAVNVVVPSVSNCILFYAPQNP	9186	31494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_9399_18874_19002_19260_19357_27703
907594	contig_14208_pilon	-	3891	5	Intergenic	novelGene_129070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1151	1915	243966	243202	TRUE	25	ATTATCTTACTGATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLYIENPKDSTRKLLALIERFSSIAGYNINIQKLVGFLYTNKENKKKEIRKTIPFIIASRKIKYLGINLTRYVKDLYKENHKTLLQETQRDLHKWKNIPSSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKIIINFIWKWKKPRISKALLKKNKAGGLTLPDLRTDCTAMVVKTAWYWYNRYIDQWNRIENSDVNPSTNGHLIFKKGAKSIKWGKDSLFNKMVLAKLDVHLQKNETGPITHTIHKN	247503	89175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_89911_89986_91003_229180_229329_243124_244873_247259
907595	contig_7962_pilon	-	3383	2	Intergenic	novelGene_149289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	0	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTGTTTTCATGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193632	128524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_131733_193457
907596	contig_5316_pilon	-	5123	1	Intergenic	novelGene_61259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACATGGCCATGCAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539453	534330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_534300_539500
907597	contig_7009_pilon	+	3017	7	Intergenic	novelGene_23622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	574.051512400141	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	373	1233	444955	518263	FALSE	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	431128	520047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_435035_435244_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991
907598	contig_5539_pilon	+	2250	3	Intergenic	novelGene_104764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAGACTTTAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151864	182331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_152624_152712_153838_181965
907599	contig_5799_pilon	+	2674	2	Intergenic	novelGene_50335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGAAGTCCTTTAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707235	716948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_708983_716021
907600	contig_8317_pilon	-	880	2	Intergenic	novelGene_19374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGCTCTCAACACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17243	16264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16281_16379
907601	contig_4364_pilon	-	382	3	Intergenic	novelGene_4579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.5	26	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACACCGGCAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1968334	1963512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1963668_1967871_1967911_1968146
907602	contig_8570_pilon	-	1787	2	Intergenic	novelGene_120149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318859	317020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_318591_318642
907603	contig_12490_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_169052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTAAATATGGTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266526	268887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_+_266500_268900
907604	contig_10331_pilon	-	1944	18	Intergenic	novelGene_54104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_13	224.408380207305	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	495	1787	350171	304759	FALSE	30	ACTAATGATTTTCTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGATKGLCILNAGTQQGDPLSVPTSQLSKLQEVSLRNCAVNGAGGKGGIAETCPNIRKLDLSRNLLSSWDEVILIADQLKHLDVLNLSENKLQFPSGAPSLTGTFSAMKVLVLNRTGITWAKVLQCVPGWPALEELYLESNNIFISERPTDVLQMLKLLDLSGNQLIDENQLFLIAYLPRLEQLILSNTGISSIHFPDAGIGCKTSMFPSLQYLVVNDNQISQWSFINELDKLQSLHSLSCLRNPLTEVNKDAQTVRQLIIARIGQLKTLNKCEIPVEERRGAELDYRKAFGNEWKKAGGHQDPDKNRPNEEFLAAHPRFQLLCLKFGAPEDGELKTQQPFMLKNQLLKLKIKCPNQLDQKVIEKQLPDSMTIQKVKGLLSRLLKVPVSELLLSYESPKMPGREIELGNDQQTLQFYSVENGDCLLVRW	365350	304601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311286_312014_312168_312477_312543_312623_312689_318101_318198_318788_318866_320092_320196_321424_321525_325324_325414_333007_333045_350131_350217_355498_355627_364604_364909_365333
907605	contig_4315_pilon	-	2106	6	Intergenic	novelGene_46820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	309	junction_2	128.192667497014	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	82	801	358035	349993	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKGFQWLKAAHAALEEEYLKACRDQHLAQQSASSEGMPGQFDPSRELEAEIFQLGIRLEELKDHMDQHQQKPERVVSDSALESPPPSPSPGQPTGLPSPSKQARMPAIQTPCPEVMLYPAIFVCFSIYSFLY	363191	348687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_350258_350759_350888_353295_353356_357009_357165_357923_358081_363155
907606	contig_10003_pilon	-	4331	1	Intergenic	novelGene_88172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCCAGCTGAAGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422760	418429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_418400_422800
907607	contig_6544_pilon	-	3759	1	Intergenic	novelGene_142073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAGATAGAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50341	46582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_46600_50300
907608	contig_7083_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_125157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAATGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151338	153655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_151300_153700
907610	contig_3956_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_14708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2120	2452	45380	45048	NA	40	CAACCAATGACCACCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYNEITCDLLMCCKFHHCDEVILMRFMRLDSVLIQSLLRYKREKRAETHGNLTPPRKQCQERSASFGPEVPALRCSQTKGRLMHHKDFPPELTEKEGLVLELMP	47499	44946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_44900_47500
907611	contig_5961_pilon	-	4517	16	Intergenic	novelGene_144168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_2	61.1258810434118	314	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	63	2186	304661	262724	FALSE	30	CAGAATGGGAGAAGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFLTEEDQKKLHDFEEQCVEMYFNEKDDKFHSGSEERIRVTFERVEQMCIQIKEVGDRVNYIKRSLHSLDSQIGHLQDLSALTVDTLKTLTAQKASEASKVHNEITRELSISKHLAQNLIEDGPLRPSVWKKRSIVNTLSSSLPQGGLQSNNPFLCNVFMKDEKDPQSKVFGQDLPVLPQRKEFLFPEAGSSCGALFPSAVSPLELRQRLHGAETLKMFSKNQKLGSSSNSIPHLSSPPMKFFVSTPSQPTCTSQLETVTKDQEVVCSKAAEGDNTEFGAFVGHRDSMDLQRFKESSNKAKEVLSEQWNDVRNTILENREMPKHQSDIPSENALKHVNSHVGFIDCHKACVPLHSGQMESSCRRPSAEETHEVNSKAALLPDWLQDTPSDRQMPSEEGTLNGLASPFKPVMDTNYYYSAVERNNLMRLSLSIPFTPVPPRGELVTVYRLEESSPNILNNSMSSWSQLGLCAKIEFLSKEEMGGGLRRAVKVQCTWSERDILKSGHLYIIKSFLPEVVNTWSSIYKEDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSPRFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLAFSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEKRSCDMVFGPANLGEDAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYTPDKIVFPQDEPSDLTLQPGNSTKESESTNSVRLML	304723	260392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_262855_269740_269848_269949_270002_273290_273497_273652_273736_273882_274167_274753_274820_274898_274950_278589_278616_280925_280961_282955_283027_285492_285590_298496_298557_299562_299631_303272_303989_304590
907612	contig_14727_pilon	-	3071	1	Intergenic	novelGene_56640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1097	1609	257805	257293	NA	70	CAAAAAAAGAAAATTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLHNENYKTLLKEIKEDLNKWKDIPCSWIGKCNIVKMSILPKVIYAFNTIPIKIPTAFFTEIEKPVLNFVWNGKGPRVAKAMLKEKNKVGRLTLPDLKTYYTAIIIKTAWYWHNNRHIDQWNRIENPEINPHIYGQLIFNRGTKSILWGKKSLLNKWCWKIGFPHAEK	258901	255830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_255800_258900
907613	contig_57_pilon	+	1950	12	Intergenic	novelGene_44901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	215.788540508703	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	562	1875	106702	129471	FALSE	70	AAAAAGAAAAAGATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGSLQQNDKENLKRM	106140	129546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120796_122503_122543_129464
907614	contig_19096_pilon	-	2655	3	Intergenic	novelGene_173095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGACTTGGTGTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15992	9175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_10771_13922_14884_15893
907615	contig_5083_pilon	-	1142	10	Intergenic	novelGene_151660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATCACCCCCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658100	461714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_461967_462226_462294_462499_462627_474733_474802_546408_546514_600069_600212_648609_648742_651097_651204_653251_653337_658042
907617	contig_7165_pilon	+	3629	1	Intergenic	novelGene_116844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTCTCTAAAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275326	278955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_275300_279000
907618	contig_17976_pilon	-	2664	6	Intergenic	novelGene_32474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCCAGCTGAGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53517	41594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_46635_46697_47194_47594_48852_53120
907620	contig_3832_pilon	-	3706	15	Intergenic	novelGene_161426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_14	344.805365091552	283	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	823	2472	59	2530	116478	63968	FALSE	15	CCCCCTTTGATCAGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSEPGGRRPRRHRGDPFAMEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDEMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGPVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQSQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEVPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGGNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSSSEKLQNINLAMSPLPASETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQPASPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFDVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPQSASTISVFQQTQMQEPAVIANTSTATTDELKTVTKDGMEDIKILIASPSPTHVLKETTSATTSPYSDTQSRTASPSRAGKGVIEQTEKSHPRSPNLLSVTLSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLSQAVGIGTLLQQPDDRATTTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPVQGSRNLLQGEELLRALDQVN	116536	62791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_64120_64556_64684_65240_65350_68428_68854_68979_69103_73716_74004_74874_75096_78251_78400_79712_79820_84657_84861_85664_85778_90473_90559_90641_90788_91722_91914_116443
907621	contig_5532_pilon	-	3808	8	Intergenic	novelGene_175861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_7	25.3811757338515	268	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	914	2092	42273	21368	FALSE	25	AAACACTGTTGAGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVRESFNPESYELDKSFRLTKFTELKGTGCKVPQDVLQKLLESLQENHFQEDEQFLGAVMPRLGIGMDTCVIPLRHGGLSLVQTTDYIYPIVDDPYMMGRIACANVLSDLYAMGVTECDNMLMLLGISNKMTDRERDKVMPLIIQGFKDAAEEAGTSVTGGQTVLNPWIVLGGVATTVCQPNEFIMPDNAVPGDVLVLTKPLGTQVAVAVHQWLDIPEKWNKIKLVVTQEDVELAYQEAMMNMARLNRTAAGLMHTFNAHAATDITGFGILGHAQNLAKQQRNEVSFVIHNLPVLAKMAAVSKACGNMFGLMHGTCPETSGGLLICLPREQAARFCAEIKSPKYGEGHQAWIIGIVEKGNRTARIIDKPRIIEVAPQVATQNVNPTPGATS	43186	19651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_-_21583_23301_23515_29293_29394_31725_31817_32957_33113_34163_34272_36309_36414_42080
907622	contig_18859_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_150557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGGACCAAGTGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194390	192361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_192400_194400
907623	contig_6589_pilon	+	1838	13	Intergenic	novelGene_25714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_12	67.2916537667686	58	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	129	1385	460735	485809	FALSE	15	TCTTATGCTGTGAGGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGYQEQPVISHDLGTHLSLLLPPVCPTKNQSSLLSVVGLGGWPETV	451662	486262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_485672
907624	contig_15500_pilon	-	612	2	Intergenic	novelGene_128973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCCAGAAAACAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161485	159766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_160168_161274
907625	contig_7915_pilon	+	5888	34	Intergenic	novelGene_42959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	6	junction_29	131.394561387324	375	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1125	3378	177	3554	72330	119850	TRUE	15	TTGGGTCTATCATCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQKRGKEQQLDVMNKQYKQLESRLDEILSRIAKETEEIKDLEQQLTEGQIAANEALKKDLEGVISGLQEYLGSIKGQATQAQNECKKLQVEKEALLQRLTEVEQERNQLEIVAMDAENMRKELAELETALQEQHEINVSLQQTQGDLSAYEAELEAQLRMRDAEASQLKEELERLTRLSQLEQSALQAELEKKRQALENALGKDQLSEEEKQENSELFTQLKHLQDDNNLLKKQLKDFQNHLNHVVNGLIRPEEVAARVDELRRKLKSGAGEMRIDSPSDVLGKSLANLQKQFNEILARSQWEREEAQVRERQLQEEMTLQQEKLANGQEEFRQACERALEARINFDKRQHEARIQELENEIHYLQENLKSMEEIQGLTDLQLQEADEEKERILAQLQELEKKKKLEDARSQEQFLGLDKQLKKLKKAVAASDKLATAELTIAKDQLKSLHGTVMKINQERAEELQETERFSRKAARAARDLTRAEAEIELLQNLLRDKEDQFLMEMEKADAGTLVANSQVLEIDKLNETMERQRTEIARLWNLLDLTGADSKGGFENILEEIAELRREVSHQNDYISSIADPFKRRGYWYFMPPPSSKVSSHSSQATKDSGVGLKCTASAPVRKAHPGQQDGKEGSGPPPASGYWVYSPIRSGLHKSLSNRDEDSGGDSQEESDLDDREEPPFVPPPGYMIYTVFPDGSPVPQGMALYAPPPPLLNNSRPLTPGTVVYGPPPAGAPVVCGPPPPNFSIPLIPIGVLHCNVPEHHNLENEVSRLEEIVQHLKSKRREERWMRISKRQCEKEIEELHHNIDSLLQEKKDLEHEVEELHRTIQKHQQPKDFIDGNVESLITELEIEKSLKHHEDIVDEIECIEKTLLKRRAELREADRLLAEAESELSCTKEKTKNAVEKFTDAKRNLLQTESDAEELERRAQETAINLVKADQQLRLLQAEAKDLEQHKIEQEEILKEINKVIAAKDSDFQCLNKKKETLTEELQKLQKDVETAECNEDHHLQVLQESETLLQAKRAELEKLKSQVTSQQQEMAILDRHLGHKKEELHLLQGSMVQAKADLQEALRLGETEVAEKCSHIREVKSLLEELSFQKGELNVQISEKKISTCTYKAGN	70509	138426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_70680_72323_72478_74217_74439_76564_76742_80928_81064_84930_85077_97639_97848_98326_98507_100977_101158_101928_102046_102320_102466_102937_103084_104341_104532_105588_105903_107407_107617_109754_109948_114219_114351_114495_114637_114722_114850_118815_118981_119745_119907_121147_121264_121345_121564_123136_123295_124358_124433_125539_125729_126153_126380_128202_128409_129868_130010_133759_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137785_137991
907626	contig_6182_pilon	-	4576	23	Intergenic	novelGene_171655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_16	51.9367065532972	234	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	895	2688	97	2784	300205	262329	FALSE	30	ATACACGTATATCATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPARIQPRDPRTGRGSRFPAGPEPKGAGTVAAMEQSAEGRTASALFAGFRVLGLFSNDIPHVVRFSALKRRFYVTTCVGKSFHTYDVQKLSLVAVSNSVPQDICCMAADGRLVFAAYGNVFSAFARNKEIVHTFTGHKAEIHLLQPFGDHIISADTDSVLIIWHIYSEEEYLQLTFDKSVFRISAILHPSTYLNKILLGSEQGSLQLWNVKSNKLLYTFPGWKVGVTALQQAPAVDVVAVGLMSGQVIIHNIKFDETLMKFRQDWGPITSISFRTDGHPVMAAGSPCGHIGLWDLEDKKLINQMRNAHSTAIAGLTFLHREPLLVTNGADNALRIWIFDGPVGEGRLLRFRMGHSAPLTKIRYYGQNGQQILSASQDGTLQSFSTIHEKFNKSLGHGLINKKRVKRKGLQNTLSVRLPPITKFAAEEARESDWDSIIACHQGKLSCSTWNYQRSTIGAYFLKPKELKTDDVTATAVDITSCGNFAVIGLSSGTVDVYNMQSGIHRGAFGKEQAHKGCVRGVAVDGLNQLTITAGSEGLLKFWNFKNKILIHSMNLTSSPNMMLLHRDSGILGLALDDFSIIVLDIETRKVVREFSGHQGQINDMAFSPDGRWLISASMDCSIKTWDLPSGCLVDCFLLDSAPLNVTMSPTGDFLATSHVDHLGIYLWSNISLYSVVSLRPLPTDYVPSVVMLPGTCQTQDMELPEDTIEPSDEMIAYDSPEQLNEQLVTLSLLPESRWKNLLNLDVIKKKNKPKEPPKAPKSAPFFIPTVPGLVPRYAAPEQSNDPHQSKVVNLGILAQKSEFCLKLEEGLVNNKYEPALSLLKELGPSGIETELRSLSPDCGGSVEVMQSFLKMIGMMLDRKRDFDLAQAYLALFLKLHLKMIPSEPVLLEEMTKLSSQVEENWIHLQSLFNQSMCVLNYIKSALL	300301	260536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_262479_263547_263736_265213_265296_265494_265615_266572_266719_267107_267206_272596_272705_278734_278815_280884_280994_281223_281390_282207_282323_284109_284256_285504_285592_286704_286771_287233_287355_287621_287798_288142_288276_289657_289713_291670_291804_293562_293681_295424_295526_297792_297821_300043
907627	scaffold_12124_pilon	-	367	1	Intergenic	novelGene_22132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTATGACTTGAAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937878	937511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937500_937900
907628	contig_6138_pilon	-	2235	19	Intergenic	novelGene_159688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_16	103.092311504583	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2088	146	2233	619342	569531	FALSE	65	ACAACAAACAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSVAQIKHSSGHDRRENYNSHQRTSSPEDRSRDREKRRERDMDRKRSRKSPSPGRRSPEPSVTQSSSAQDEPTAKKKKDEVDPLLTRTGGAYIPPAKLRMMQEQITDKSSLAYQRMSWEALKKSINGLINKVNISNIGIIIQELLQENIVRGRGLLSRSVLQAQSASPIFTHVYAALVAIINSKFPQIGELILKRLILNFRKGYRRNDKQLCLTASKFVAHLINQNVAHEVLCLEMLTLLLERPTDDSVEVAIGFLKECGLKLTEVSPRGINAIFERLRNILHESEIDKRVQYMIEVMFAVRKDGFKDHPVILEGLDLVEEDDQFTHMLPLEDDYNPEDVLNVFKMDPNFMENEEKYKVIKKEILDEGDSDSNTDQDAGSSDEEEEEEDEEGEEDEEGQKVTIHDKTEINLVSFRRTIYLAIQSSLDFEECAHKLLKMEFPESQTKELCNMILDCCAQQRTYEKFFGLLAGRFCMLKKEYMESFESIFKEQYDTIHRLETNKLRNVAKMFAHLLYTDSLPWSVLECIKLSEETTTSSSRIFVKIFFQELCEYMGLPKLNARLKDETLQPFFEGLLPRDNPRNTRFAINFFTSIGLGGLTDELREHLKNTPKVIMAQKPDVERNKSSPSSSSSASSSSESDSSDSDSDSRDNSSESSSEESGSSSTGSRSSASAKNIRKKAQGKTRSKEVDKLIR	636869	569528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_569596_575307_575529_575621_575724_577345_577474_579122_579276_579911_579990_583601_583663_591382_591465_592701_592807_598577_598641_598732_598940_599038_599175_600629_600684_601111_601281_606576_606706_608024_608265_614956_615025_619315_619456_636837
907629	contig_11855_pilon	+	2639	4	Intergenic	novelGene_66897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1206	1637	811323	811754	FALSE	10	TGTGCTGGGAACTCTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCLNPWIILNIRDLNSLSIRSSAFSSTGRSSGVLFWTPSGTILSCFCKCFDIVYCLQGTQWLFSLFIDCRFVCFVLLFCFIWLCLSRQAVRSLLFARLWAQYFSPPSPLGRVSHSGMVQQGRSS	701612	812756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_701742_707711_708268_810191_810596_811206
907630	contig_10377_pilon	+	1660	7	Intergenic	novelGene_115386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_3	467.735561568239	200	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	574	1053	227522	245851	FALSE	65	AACAAAAAGAAAACAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVNYAHAASSFQC	209085	246458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_220708_220952_227487_227752_240234_240355_245160_245257_245817
907631	contig_10749_pilon	-	1447	3	Intergenic	novelGene_133516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	24	365	311520	310880	FALSE	60	TTTAACATAAGAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHQGTCMGHRFLGRLIQWLPLAVPPPLQPRHRMLGTESVPPPKRPRGDFMAPPRIGTHNGTFHCDEALACAMLRLLPEYQDAEIVRTRDPEKLASCDIVVDPSTTVVRGSCQRRELPHH	311543	309797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_310937_311048_311112_311298
907632	contig_10599_pilon	-	2698	2	Intergenic	novelGene_49902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCCAATTTAGGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317721	314049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_315345_316318
907633	contig_12677_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_110681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_700
907634	contig_9239_pilon	+	2366	6	Intergenic	novelGene_137180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1741	2076	203989	204324	FALSE	30	AATTGACTAGCCATATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPTYDGVVGTEPRRKSGITCIHLLYESHLILNRDVKQRQHGKTEKKKAFISNIQGSILILMLFCSVDWPRYLLFEPQWLQLLRGNSNIFLTSRDENTQYTKRYILVLNK	179889	204614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_180079_180650_180853_188347_188446_191866_192002_192333_192529_203067
907635	contig_11215_pilon	-	5235	2	Intergenic	novelGene_118965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1468	1821	5042	4689	TRUE	25	CGAGAAGACTTTGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLLISLTPHSLVSSVNPPKAVVSLDPPWYRLLEKDNVSLKCLPEGNSTQWWHNGSLISSQSSSYFIKSARVNDSGEYQCQTSSTLHSDPVQLEVHIGESIKGKREITKKGWNKRP	6509	1221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_1565_1617
907636	contig_7338_pilon	-	3088	20	Intergenic	novelGene_156795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_19	57.8728666825909	63	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	836	2511	12	2522	295082	253985	FALSE	30	GAGGTGAGAGAGGCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPTMAAEEADVDVEGDVVAAAAQPGSDENTVSVLQQDHYLDSSWKTDNDLIPWTLDSTISEENKAVIEKMLLEEEYYLSKKSLPEKFWLDQKENDKKYVKSLQKTGKIMVHSPTKPASYSVKWTIEEKELFEQGLAKFGRRWTKIAKLIGSRTVLQVKSYARQYFKNKVKLGGLEKETPNQKSNSDLQIKNEDEGTKAWSPSLSGLRGLADPNLNAVKIEKLSDDEEVDITDEADELTTHAPEKNPSSGRLVDIPDSITHETNQGEFIASHTEKESFSKSSKEGLRNVKQGEAEILSSSVITLWTEKQSTSDKKSVDLNNQKCNELIKNCDKHCENGIRDGARQLPFPEPCEVQKDLIDKEMLFHSSCQIKEENREEEELKPPEEEVEIDRNIIQEEEKQAIPEFFEGRQAKTPERYLKIRNYILDQWEICKPKYLNKTSVRPGLKNCGDVNCIGRIHTYLELIGAINFGCEQAVYNRPQPVDKVRIKDRKDTVEAYQLAQRLQSMRTRRRRVRDPWGNWCDAKDLEGQTFEHLSAEELARRREEEKCKPVKSSKVPRSTKSSFDPFQLIPCNFFSEEKQEPFQVRVASEALLIMDLHAHVSMAEVIGLLGGRYSEVDKVVEVCAAEPCNSLSTGLQCEMDPVSQTQASETLAVRGYSVIGWYHSHPAFDPNPSLRDIDTQAKYQSYFSRGGAKFIGMIVSPYNRNNPLPYSQITCLVISDEISPDGSYRLPYKFEVQQMLEEPRWGLVFEKTRWIIEKYRLSHSSVPMDKIFHRDSDLTCLQKLLECLRKTLSKVTNCFIAEEFLTQIENLFLSNYKSKHENGEAEENCTMGPKELLM	295093	253418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7338_pilon_-_254153_255164_255223_255412_255519_263219_263353_264324_264514_265113_265189_265899_265951_266484_266540_269922_270012_271333_271412_272611_272716_274052_274184_278434_279214_281304_281404_284800_284880_286095_286120_286206_286285_289074_289146_290818_290898_295017
907637	contig_5039_pilon	-	2139	2	Intergenic	novelGene_64782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAGCATCAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140044	137837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_138402_138469
907638	contig_16113_pilon	+	2007	2	Intergenic	novelGene_140550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGAATTTTTTACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85192	87256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16113_pilon_+_86852_86908
907639	contig_3747_pilon	-	2434	8	Intergenic	novelGene_24914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	348	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCGGCCAGCCACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203330_203495_203649_203766
907640	contig_960_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_108325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAACCCCATCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065180	1062986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1063000_1065200
907641	contig_18162_pilon	-	2241	3	Intergenic	novelGene_122291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAACAATTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_8789_10087_10809_16363
907642	contig_7695_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_41685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	523	882	1074355	1074714	NA	20	TCTCTCAGTCTAGGAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSVISHQRYANQNHNEIPFPPLGWLKTKKKKKIKITNAGKDMGKLEPLPHCWWECKMVQPFRKTVWWFLKTLRIELTYDPAITLIGIYPKNLKADTQTDSYTTVHCSTIHNSQKVEST	1073832	1075823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1073800_1075800
907643	contig_8167_pilon	-	2248	9	Intergenic	novelGene_155654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	13.2800367092866	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	432	1364	148855	137246	FALSE	20	ACTCACGTCACAGCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKALLPSMIERRQGHVAVISSIQGKISIPFRSAYAASKHATQAFFDCLRAEVRQHEIEVTVISPGYIRTNLSLNAITADGSRYGAMDKTTAQGRSPADVARDVLTAVGKKKKDVILADLLPFLAIYLRTLAPRLFFSLMASRARKERKSKDL	180414	136361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_143387_143934_144152_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_180258
907644	scaffold_880_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_121403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGCTATTTCTTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293277	294717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_293300_294700
907646	scaffold_13505_pilon	-	2187	9	Intergenic	novelGene_111522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_4	436.960739083044	239	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	2	1147	603276	594258	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPQREHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603277	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
907647	contig_8174_pilon	+	3063	3	Intergenic	novelGene_160039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2266	2571	254118	254423	FALSE	35	CGAAGAGCATTATAATCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLIASYACESWTMNKEDGRRIDTFELWCWQRILNIPWTAKRTNTSVLEGVQPECSLEASMARLCLRYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVERQRNRGRTSTR	131600	254915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_131917_252125_253072_253114
907648	contig_11417_pilon	+	7109	8	Intergenic	novelGene_103322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1924.67761413888	398	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	698	1648	567459	572821	TRUE	50	TGAGACCACTATTATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNINDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSQFVKEDNNLTLQEKKEKIQSGLKKLTELGTVDPKNRYQELINDIARVLHLGGQCGPGLVESCFRGSYRRQ	566761	581143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_567662_568279_568413_569457_569561_570060_570197_570597_570686_572533_573637_575930_580250_580816
907649	contig_753_pilon	+	2645	4	Intergenic	novelGene_113022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGCATAATCCACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1372808	1380285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1373004_1375806_1375955_1376473_1376643_1378152
907650	contig_16123_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_164288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATGAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250054	250895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_+_250100_250900
907651	contig_3754_pilon	+	4823	3	Intergenic	novelGene_146820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3535	3969	320761	321195	FALSE	55	CTCAGCAAAAACAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPNHFPVEEKALELPDKEFKSLILRIVQQLKQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEKNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRIGGNEDKHLEQLCFRKTQKKEQRKTKIH	106702	322049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_108931_283831_284149_319771
907652	contig_2577_pilon	+	3512	2	Intergenic	novelGene_172068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	2066	2494	213117	213545	FALSE	25	TACTCCACCCAGCAGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKWTNVLPQPCLPESKEYFRIGKTGKTDKRAARARVCPNPRKYHRTDKSGKTDKHASTAMSARVQGTITEQTKVEKWTSMLLEPCLPESKEYYRIGKNGKTDDMLPQPCLPEPKEYYRIDKNGKMDKHAATAMSARLHKNY	210552	214563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_210845_211343
907653	contig_10904_pilon	-	3575	1	Intergenic	novelGene_22683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	821	1261	559314	558874	NA	30	GTTGCCATAACCCCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLTNQETFQNQEKFYHITCQSLPSGLSIFTLSTTGLSAINLSAQSWICSSFRQIAKLLASSFISCSSLSCIRPLHCLASLPLGSLPSGSLPSVSLLLAYPWLASPSSELLLPQQWLFSAQLSQLTGPALNRHLSQLQFSQQHLS	560134	556559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_556600_560100
907654	contig_3077_pilon	+	1567	10	Intergenic	novelGene_26672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3292.65545580118	5	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	52	1074	9676	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9624	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13055_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17040_17528
907655	contig_3601_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_132899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACAGATAAGGCAACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191515	193190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_191500_193200
907656	contig_6583_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_174581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTATTTTTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1779	166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_200_1800
907657	contig_13295_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_31206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTAAAGTCTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48078	49200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_48100_49200
907659	contig_11572_pilon	-	4029	3	Intergenic	novelGene_100068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_2	6	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	158	1366	290529	289321	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNFEDELTCPICYSIFEDPRVLPCSHTFCRNCLENVLQASGNFYIWRPLRIPLKCPNCRSIIEIASTGIESLPVNFALKAIIEKYQQEDHPDIVTCPEHYRQPLNVYCLLDKKLVCGHCLTIGQHHGHPIDDLESAYLKEKDTPQKLLAQLTDTHWTDVTRLTEKLQEQKFHSEKMVQGDKEVVLQYFKELSDILEQKKNFFLTALCDVGNLINQEYTPQIETMKEIREQQLELMTLTTSLQEESPLKFLEKVDDVRQRVQTLKQRPLPEAQPVEIYPRVSQVLKEWCRTEIGQIKKVLIPEMKISSKKMPSSWPDRDEKEVEFFKILNIVIVTLISVILMSIFFFNQHVITFLNEVTLVCFSEVSLSVYQSFSNSLYDLKDSLCYTLYLLKEFMWKIVSH	304671	286657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_290533_303584_303663_304595
907660	contig_12528_pilon	+	4739	23	Intergenic	novelGene_81285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	266.9905591546	65	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	493	2379	294021	344698	FALSE	25	GTATACAGTTGCTTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPASPSTADKEENPAVLAENCFRELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVQCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKDSPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVDFEASDLQGSSACSTALSTSSKDSDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTTTHNLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTMVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDASFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLVIALQDSVIINEDNLPMFQRCGIMALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKYTLPKSLEKHDKNLYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVKDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILPNSVPSDDVVSNTEEITFEALKKAIDTNGIEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY	281552	347058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_281620_284324_284453_286846_286907_286973_286998_289038_289161_293929_294080_295481_295620_297531_297611_299724_299861_301889_302058_305296_305412_306949_307002_307896_308070_308532_308609_312425_312588_313171_313304_315483_315552_316469_316598_327245_327338_332992_333042_337048_337153_338090_338141_344592
907661	contig_12951_pilon	-	2488	4	Intergenic	novelGene_68175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_2	72.6697247062963	204	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	515	1210	343432	337718	FALSE	30	TGGAAATTCAGATGCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPCISWGRPSKGVIKARSVMGGQGVLCPSPHPQPIFFSSTVAGALVADFLSGVVHWGADTWGSVELPIVGKAFIRPFREHHIDPTAITRHDFVETNGDNCLVTLLPLLNMAYKFCTQSPEALEQLYPWESFVFCVMIFGTFTNQIHKWSHTYFGLPPWVTLLQDWHVILPRKHHRIHHISPHETYFCITTGWLNYPLEKIGFWRRLEDIIQGLTGEKPRADDMKWAQKIK	343946	336439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_337840_340198_340412_341610_341756_343216
907662	contig_8616_pilon	+	4171	2	Intergenic	novelGene_72461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	76	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	213	1769	284915	286471	FALSE	65	GAATTATAACTCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMVGSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELEKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLALWGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKWRLQARALAEADSTKKEEETSSQPPSFEFLSSTSHGLQPSLASAETSGNWGKGDWKDPAAPSPTVRPPDEPPVSGGADTTQPGMEVDSPQLRAPPPPVADVTLASPSSSTEIIPANYFSSGLSTVSAEPLAPLDVGPESLRVVEPRGTGGPLQGFYPPASAPAPVPAPDPSQPPGPAEAELVQVKVEAIVISDEEPDVSDEQPRGPGELFPPGGAMFGGRPPQPEAFEESGAAGLEEVGPSDQFLPPDLHLPYHLLPGPGQYHRGLVISPLPAPQALHEPLYLPSKYEAAPGSFGVFTEDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRRYTQSGDLYRHIRKAHNEDLAKCSKPDPEAGPLLGGQPLPNSPTADRQSSGGGGPPKDFVLGPKN	284425	288873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_284598_284874
907663	contig_3469_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_34239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	396	1362	1757	644476	644871	NA	40	ACCAATATCCCTCATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITDYYEKLHSDRFENLEEMDKFLESHYLPKLTQTEIEQLNKPITKEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYQTFREKITPLLLKLFQSIEKDGILPNSFYEASIILIPKPGKDTTKKK	643114	644872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_643100_644900
907664	contig_3130_pilon	+	5088	8	Intergenic	novelGene_103552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	404	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	592	951	31823	32182	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFCISIDNRGYNRKQRMCNAGSPSSKGEEAGWTTEKSPKGIKVVEIEHSSRNVLAQYLHSIFKLHFPFKKFVFLKMPLPGMGGEIKNLKTKQKITNSHTLKSSKSYAVIFTHIIKSRY	31231	76113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_32391_34073_34216_35869_35991_62840_62922_63987_64151_68857_70805_73826_73982_74793
907665	contig_7644_pilon	+	1301	1	Intergenic	novelGene_64235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAAAAAGGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128825	130126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_128800_130100
907666	contig_10793_pilon	+	1265	13	Intergenic	novelGene_83426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3610.81212779372	3	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	15	920	146975	163940	TRUE	35	TACAATTTTAGTTCTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAVEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	146960	167265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161462_162559_162690_163141_163288_163929_164090_165325_165377_166401_166473_167191
907667	contig_6509_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_145637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	379	747	91164	90796	NA	70	AGCCCAATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHRLCLEWLTVARAGSQGGQHSPSLCSSSAWPCAHRPSQPDGHNPQQRPGMSPTLGLCCLVASSSNTRTATQDPRLEARPRRAVRVSVEKSADHTRGESGEIQVMGMKQQRLGQAQEIPQ	91542	89878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_89900_91500
907668	contig_15407_pilon	+	3049	10	Intergenic	novelGene_123063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	717.925406214942	10	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	335	1189	449761	470398	TRUE	55	AAAGCCTAGCAAAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449426	472307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468204_470303_471505_471553
907669	contig_2311_pilon	-	3430	3	Intergenic	novelGene_169826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	47	junction_1	210.5	118	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	39	572	534789	512643	TRUE	30	ACCCCAAACCCAACTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAPLRLHPHYFQLPLLSGLHREEGLEPWPTVRTMILRLFLALNFFPSIQATAENKIFVKQAPMLVAYNNAVNLSCEYTNNLFSKEFQAALYKGVDSDVEVCVVNGNYSLQPQFHSNTGFNCDGKLGNETVTFYLWNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYILNEKNNGTIIHVKGNIQL	534827	509742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_511997_512038_513017_534629
907670	contig_13718_pilon	+	3192	2	Intergenic	novelGene_142879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAGAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42411	124464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_43352_122212
907671	scaffold_4438_pilon	+	3408	1	Intergenic	novelGene_174551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	778	1305	422390	422917	NA	60	AGGATAACCACAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGPLSANVTQIHHLGLLSEISRHGVQENRFTELPAGDRAPGNQRDMLSYPLPCLPCSTFTTSQLANSYLPGGSSPSFLEDRFTASWWANSQFPRGLIPGFPMGQSTGSRQATTVAWEVLVPCHTDSPCPHWLASSLPFLCCCVAFFWPLFVSSVPVTSSPSFLLNTACVIYAS	421612	425020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_421600_425000
907672	contig_5947_pilon	-	2335	1	Intergenic	novelGene_101534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539555	537220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_537200_539600
907673	contig_2043_pilon	-	3327	4	Intergenic	novelGene_169905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.033545322706	133	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1561	2598	687176	682199	FALSE	65	TAAAAAAAAAAATGGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTSTPQGVPPSSQLKSQGNSSVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQVPSQTVQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDLLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDVRMLELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTDEDLDYRTENQHAPTASSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDEPKREGGIDYQAGDTYVPTADYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGGSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSAGPPQPAAFSESFASSVAGYGDIYLNSGPMLFSGDKDHRFEYSKDAQL	688736	681469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_682218_682291_682893_683464_683738_687031
907674	contig_10861_pilon	-	2827	3	Intergenic	novelGene_39276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATCACTCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345660	1341369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1343280_1344610_1345070_1345202
907675	contig_5711_pilon	+	4346	4	Intergenic	novelGene_80273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTTTGGTATTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69176	129422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_71952_103787_104041_104435_105600_129268
907676	contig_5936_pilon	+	2433	1	Intergenic	novelGene_53582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTAACAACAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376799	379232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_376800_379200
907677	contig_12802_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_114248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	73	405	101880	102212	NA	35	ATTACAGACCAATATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHRLRETLAQLSQVTLVFQLEWHQMEGLLKHRFLGLISRISDSAGLVWDLSMCISSKFWVDTDAAGLGTLRTTEFLDVSGMTTPNVGRFILSKAPGSLLILEKGPPERNLALLIVAENVGLAEKELEMMPLVFL	101807	103228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_+_101800_103200
907678	contig_4093_pilon	-	2556	5	Intergenic	novelGene_27629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_4	997.723001388662	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	35	640	69245	45596	TRUE	15	CTGTCATTGTCTGCCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPDTEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTVCILPVL	72458	40028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45784_46300_46425_68951_69257_72435
907679	contig_19634_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_168197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCACGGTATTAGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2725	3196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19634_pilon_+_2700_3200
907680	contig_11932_pilon	-	3150	18	Intergenic	novelGene_85404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	52	junction_9	38.9702219738616	172	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	974	2925	58	2982	261770	245563	FALSE	15	TAATTCCTTTTTGTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGQEVESGQKKKVVILNVDMLKLEVHVSLCQDLVNRKHKKLKKGSEHQATVQHLEQSFAIASLVETGQLAAFSLTSHLNDTFRFDSEKLQVGQGVSLTLKTTKPGVTGLLLAVEGPAAKRTMRQTQKESETVDEDEEADPALVVGTVKKHTLSIGDMVTGTVKSIKATHVVVTLEDGVIGCIHASHILDDVPEGTSPTSKLKVGRIVTARVIGGRDVKTFKFLPISHPRFIRTIPELSVRPSELEKDGHTALNTHSVSPSEKIKQYQGGQTVTCFLKRYNVVKKWLEVEIAPDIRGRIPLLLTSLSFKVLKHPDKKFRIGQALRATVVGPDSSKAFLCLSLIGPHKLQKGEVAMGRVVKVTPNEGLTVSFPFGKFGRASIFHVSDSYSETPLEDFVPQKIVRCCVLSTADHVLTLSLRSSRTNPETKSKIEDPEINSIQDIKEGQLLRGYVKAVEPHGVLFSLGPSVVGLARYSHVSQYRPSKKALYSKYLPEGKLLTAKILSLNHKRSLVRLSFLPSDTGKPDVLPASVGLPLLEEEERETEAERGDQKGNAAKKNQERKEKKNQKGQEEVKWPSKEKSEPRQPQVKKQGKRGRPESGSEQERVNKKQKKAGLSEEDDSGVEVYYREGEEETEEMTVLPKEKPTKLTEVPRLQLSSGFMWDVGLDSLTPALPPRGESSDSEEDERPHEATKKKSKKEKALEKQNAEKELSRIEEALMDPGWQPESADDFDRLVLSSPNSSILWLQYMAFHLQATEIEKARAVAERALKTISFREEQEKLNVWVALLNLENMYGSQESLTKVFERAVQYNEPLKVFLHLADIYTKSEKFQEAGELYNRMLKRFRQEKAVWIKYGSFLLRRGHAGASHRMLQRALECLPKKEHVDVIAKFAQLEFQLGDVERAKAIFENTLSTYPKRTDVWSVYIDMSIKHGSQKEVRDIFERVIHLSLAPKRMKFFFKRYLDYEKQHGTEKDVQAVKAKALEYVEAKSSVLED	261827	245394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_245735_246484_246651_247156_247311_247906_248076_248805_249054_249251_249402_250265_250383_250607_250906_251489_251613_252213_252337_253075_253133_255349_255528_255959_256063_256271_256362_257885_257995_258833_258897_259827_260370_261707
907681	contig_4857_pilon	-	3573	1	Intergenic	novelGene_48895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTATAACTTACTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458522	1454949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1454900_1458500
907682	contig_2758_pilon	+	1742	2	Intergenic	novelGene_166430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	506	junction_1	0	91	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	85	1227	35671	37550	FALSE	80	TTAAAAAAAAAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLEEKNATVVYNPKLQTPKTLQDAINDMGFDATLHNPNPLPVLTDSVFLSVSSSFAPPWDHIQSTLLKTKGVTDIKISPQQRTAVVTIIPSIVNANQIIELVPGVSLDTGTLEKKSGTCEDYSMAQGGEIMLKMKVEGMTCHSCTSTIEGKIGKLQGVQRIKVSLDNQEATVVYQPHLITVEEIKKQIEAVGFSVFIKKQPKYLTLGAIDIERLKNTPVRSSEGSEQRSPSYTNDSTATFIINGMHCKSCVSNIESALSTLQYVSSIAISLENRSANVKYNASLVTPETLRKTIEAISPGQYSVSITSDAESTPSSPSSSYHQKIPLNIVSQPLTQETVINIGGMTCNSCVQSIEGVISKKAGVKSIQVSLVNSSGIIEYDPLLNSPETLREAIENMGFDAALSGNY	35586	38065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_+_36077_36813
907683	contig_7294_pilon	-	5029	4	Intergenic	novelGene_172595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	49.8062914365913	241	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	111	1544	180403	102388	FALSE	25	AAATTCCAGCACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPAPPSAAAPGESPSTAGSSRHRVPRIRESSSSRAAMPGSDTALTVDRTYSDPGRHLRCKSRVEPHDMNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLNTDSLKQKILKVTEQIKIEQTSRDGNVAEYLKLVNSADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIEQNGASRSSKDVSKDNLKDMHPSLKDAHAKSRTAPHSMESSKSGMPGVSLTPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKTSLEEFRPDASARAYGGSTTIVNKPKYGSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGASMLDSQGKLPMIMEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTELHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSQDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQVLQTDAVNAKVLLGKCINVILAFMTVILVCVSTLARFVSPMMRSRFHILGTFFAVTLLAIFCKNWDPILCAIERKIIPR	180513	98902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_-_102691_107451_107588_109656_110574_180325
907684	contig_12677_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_110775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2917	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
907685	contig_5566_pilon	-	3923	2	Intergenic	novelGene_153681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	16	348	274892	274560	TRUE	15	AGTATTGTCTGTGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIKTTMRYHLTPALLARIKNTRNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIRCCLRKLEIEIPYNPAIPLLRIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALSTIAKDGNNLDAHQQTNG	274907	251001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_253242_273224
907686	contig_16907_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_87440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTCTCACAGGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396439	397373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_396400_397400
907687	contig_7207_pilon	-	1807	3	Intergenic	novelGene_72030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	103	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAATGTGTGTGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294990	290535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_292044_293060_293264_294894
907688	contig_7912_pilon	-	3642	3	Intergenic	novelGene_129565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_2	54	171	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	249	563	79123	74525	FALSE	30	TAACGCCAGGTGGGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAALRDLAEGCVNFEDVAIDFSQEEWGLLDETQKLFYCDVKLENFAVISSLACWHGVEEEKASSEQSVSLEGVLQVRTPQEVHPPRRLTPGDMCPCLERYCD	79371	71445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_74680_76009_76137_79090
907689	contig_2069_pilon	-	2549	2	Intergenic	novelGene_23206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	450	929	109121	97569	FALSE	10	TGCTTCTGTGGTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRPSCKSSQVLGLEQQPLLPEPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPGESPAALLTLVLAPPLPTSSSSASLPLAVLLIPTGTPSCGPSLMDRPIWGGLRLKGPNFSSPQGAAEPWRERQVQLPTYYPPAAYKTTWGWKCSVWSSGS	109570	95948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_98025_109097
907690	contig_10258_pilon	-	6834	8	Intergenic	novelGene_155043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	6454	6759	80335	61367	FALSE	25	CGAGAGTGCGCCACTACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIWVLFKIVKEFVQVTDCCFKITVHLTCRFIQNLTLECLENILEKISNRQLNIRIWSSGEKSEIDKDLEVGSTQLLMGEITSPHPCGALGNSRRHCPDE	94126	61291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_-_61423_64179_64308_79559_79668_80321_82598_83425_83521_86741_86910_87993_88133_90337
907691	contig_6062_pilon	+	3205	8	Intergenic	novelGene_5309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	194.410254201715	817	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2586	3041	815981	822602	FALSE	50	AGCTGTTAAAAATTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	811467	822766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_811872_811912_813515_814664_814766_815502_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
907692	contig_15105_pilon	-	2122	2	Intergenic	novelGene_151040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTCTTTTGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837088	833375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_833639_835229
907693	contig_4519_pilon	-	1611	2	Intergenic	novelGene_123708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	122	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCCTCTTCTCTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639176	637200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_638558_638922
907695	contig_18869_pilon	+	2783	3	Intergenic	novelGene_56464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	253	junction_2	116	43	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1960	2358	188225	189734	FALSE	35	CAGGATGTCATCATTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLINLGRHRLMDCIMALPQFYQASIVAQAYDFVPDWVEILYQRVILKGDFNYLEEFKQQRLLRSSIFEEISNKCKQHQPTDAMEKNLKQSLTYCEDIYLYYKLAYEHKFYDVVNVLLKDPQTGCCLKDMLAS	186265	190159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_188291_188948_189101_189553
907696	contig_7909_pilon	+	2265	2	Intergenic	novelGene_155897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCAACTGTATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394707	397014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_395331_395372
907697	contig_4754_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_35878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGACTAGTAGTAATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9186	9857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_9200_9900
907698	contig_7272_pilon	-	3457	11	Intergenic	novelGene_25387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2205	2513	758190	757882	TRUE	15	GTGGAAATCCTGCTGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHHPPPLNFHPLHHFMRMQSLCRRRRCWDMVGNRLVPRRMQSLCRRRCSGDVVGNRLVPRSKVLRDWRGRTGYMSWGRGVPQGEMLREKVSENGKHAQGEG	770651	734544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_734606_736892_737087_745765_746089_749778_750040_757776_758196_759891_760015_760747_760876_763503_763594_766021_766122_767157_767262_768997
907699	contig_6059_pilon	-	2596	2	Intergenic	novelGene_44784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	338	junction_1	0	156	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	344	1021	126340	125663	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQETGFISKYNEGLCVNTGPDLILMSILDMSLHRQMGSDRDLQSSASSVSLPSVKKAPKKRRISIGSLFRRKKDNKRKSRELNGGVDGIASIESIHSEMCTDKNSIFSTNTSSDNGLTSISKQIGDFIECPLCLLRHSKDRFPEIMTCHHRSCVDCLRQYLRIEISESRVNISCPECTERFNPHDIRLILSDDILMEKYEEFMLRRWLVADPDCRWCPAPDCG	152150	124087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_126435_151901
907700	contig_2332_pilon	+	4168	15	Intergenic	novelGene_58693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_2	33.4014694776339	298	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	188	1405	520595	530185	TRUE	30	CTTTCATGTAGATTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGPKALGSKEIPKGAENCLEGLIFVITGVLESIERDEAKSLIERYGGKVTGNVSKKTNYLVMGRDSGQSKSDKAAALGTKIIDEDGLLNLIRTMPGKKSKYEIAVEAEMKKEKSKLERTPQKTDQGKRKISPNKKDSESKKSKLTPKRGGSLKSVKKEPSVFQKGLDFEEQVAEETSVDSGARNLTDDSSGHKVESLLWVDKYKPTSLKTIIGQQGDQSCANKLLRWLQNWHKSPSEDKKHAAKFGKFAGKDDGSSFKAALLSGPPGVGKTTTASLVCQELGYSYVELNASDTRSKNSLKEIVSESLNNTSIKGFYSGGAVHSASTRHALIMDEVDGMAGNEDRGGIQELIGLIKHTKIPIICMCNDRNHPKIRSLVHYCFDLRFQRPRVEQIKGAMMSIAFKEGLKIPPPAMNEIILGANQDIRQVLHNLSMWCAQSKALTYDQAKADSSRAKKDIKLVKYISFS	516472	543785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_516516_520450_520631_521828_521934_524087_524488_526117_526231_527899_528015_529287_529380_529567_529706_529852_529949_530062_530974_531094_531213_535481_535628_539618_539833_541129_541322_542480
907701	contig_6740_pilon	-	1657	2	Intergenic	novelGene_142660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGGTAGAATGTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585580	337901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_338302_584323
907702	contig_9682_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_125316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATTAAAATTAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552412	549836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_549800_552400
907703	contig_12789_pilon	+	1962	3	Intergenic	novelGene_176627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1376	1927	238255	238806	FALSE	80	AAAAAAAAAATCATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKPDEFKSGISQALLELEMSSDLKAQLRELNITAAKEIEIGGGWKAIIIFVPVPQLKSFQNIQVRLVCELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSHTLTALHDAILEDLVFPIEIVGKRIRVKLDGSRLIKFHLDKAQQNNVEHKAETFSGVYKQLTGKDVNFEFPEFQL	230497	238841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_+_230665_231250_232390_238185
907704	contig_10126_pilon	-	1584	2	Intergenic	novelGene_105758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCACACAGATGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166772	164577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_165722_166332
907705	contig_7078_pilon	+	1282	3	Intergenic	novelGene_130194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	303	junction_1	137.5	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGGCCTTGGAAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951233	966185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_951557_963633_963733_965325
907706	contig_7051_pilon	+	3340	2	Intergenic	novelGene_64328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	454	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGATTGGTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310452	313878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_312322_312407
907707	contig_14208_pilon	-	3166	8	Intergenic	novelGene_129071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.874433356656	231	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	250	1005	172552	99659	TRUE	10	CATGTTTCTTGCTTGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLNDSTGRIYQRVGKEGEKLKEEPQDSDLIWPQRLNSSAEAPQSLRPSSGGELPVVNSSGESNCCTCNCQSTLQAILQELKTMRKLMQIQAVGTQNRQQPPISLICSQRTAVSRKRNKKKKVPPKTVEPLTVKQKPSVLETEKKTTVASEQSDLQAAEHISTEENHVLGFGIVLESPSSDPEVQLAEGFDVFMPKSQLDSILSNYTRSGSLLFRKLVCAFFDDKTLANSLPNGKRKRGLNDNRKGLDQNIVGAIKVFTEKYCTANHVDKLPGPRDWVQILQDQIKLARRRLKRGSAEVADCDERLDRVSLPPTGNIFDTGTENMDDTEADFTV	175869	97347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_98162_98311_99721_113879_113934_132888_133009_157699_157926_168730_168997_172524_172648_175715
907708	contig_7057_pilon	-	2854	4	Intergenic	novelGene_123432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_3	31.4360020076062	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2	337	1655124	1643373	TRUE	20	GGAAAGTGTATGTCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAGRLIGSRVCQRLFRNGTTSFSGLQPQDRQRVPVYCFRGIRGSGCGLHPGRVVVAEPCSEDPVQRSDAGDLQPLGLTGHSIFQTKTHYSAGAQGGAPERGRENICWTPV	1655125	1635175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1637693_1643372_1643470_1643924_1644052_1655012
907709	scaffold_13505_pilon	+	1667	4	Intergenic	novelGene_111552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	220.800563606366	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACAGCCACTTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608086	613605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_609105_609537_609623_609748_610099_613391
907710	contig_9225_pilon	-	2023	10	Intergenic	novelGene_160158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	25.4650571529394	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	222	1331	39444	20369	FALSE	45	CACCAAGGAAGTACTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKFNNSRKYISITVPSKTQAMSPHIKSIDDIVVLGINLSRFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQELIFSVEGFKSYGWYLTLVQFGFYSIFGLIELQLIQDKRRRIPGKTYMIIAFLTVGTMGLSNTSLGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMLGGVFIQGKRYNVADVSAAVCMSLGLIWFTLADSTIAPNFNLTGVILISLALCADAVIGNVQEKAMKLHNASNSEMVLYSYSIGFVYILLGLTSTSGLRPAVTFCSRNPVRTYGYAFLFSLTGYFGISFVLALIKIFGALLAVTVTTGRKAMTIVLSFIFFAKPFTVQYVWSGLLVVLGIFLNVYSKNMDKIRLPSLQGLINKSVDERKSRMLAQTV	47834	19676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_20520_21666_21737_25587_25700_26119_26213_29397_29496_30632_30741_32028_32184_35968_36091_39243_39535_47703
907711	contig_4730_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_71712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140674	139651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_-_139700_140700
907712	contig_8571_pilon	+	2526	3	Intergenic	novelGene_169178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGGAGGACATTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440077	564063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_441192_561881_562950_563719
907713	contig_233_pilon	-	2758	16	Intergenic	novelGene_14594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1444.36292146015	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	883	2319	104176	78579	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126988	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105606_107333_107472_108401_108583_108724_108861_109914_109976_126898
907714	contig_2161_pilon	+	4323	5	Intergenic	novelGene_114936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	123.096252989277	24	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	270	1358	941059	953538	TRUE	10	CCCCCTGTCTCACTGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAALLGSRSRGPAANTRVGPAVAQDASHGLESQARPARPLALLPRGVRSRPRRPGADRPLPAPGAPRTAAPPGSRCNQFLPRDSLSEPTMCGGLMEKYVAAMVLSAAGDALGYFNGKWEFLQDGEKIHQQLAQLGGLDAIDVGRWRVSDDTVMHLATADALIEAEKTRDLARLYSLFAKHYQNCMEDMDGRAPGATSAQNAMQLEPHKANGWRIPFNKYEGGCGAAMRAMCIGLRFPHCSQRDTLIQVSIESGRMTHHHPTGYLGALVSALFTAYAVNGKPPQQWGNGLMEVLPEAKKYIVQSGYFVEENLQHWFYFQDQWEKYLKLRGIWDGKSAPIFPKPFDVKERDQFYVSVSYSGWGGSSGHDAPMIAYDAILAAGDSWKELAHRAFFHGGDSDSTAAIAGCWWGVMYGFKGVSPSNYEKLEYRKRLEETARALYSLGSKEDTVTAL	937882	956674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_938119_941025_941372_951472_951834_953123_953912_954082
907715	contig_16237_pilon	+	3062	5	Intergenic	novelGene_162668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_3	17.8378109643532	217	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	132	1214	3839	6758	TRUE	15	ACATTTTGTGTCTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPLPLLPEDKILETFKLSHKVKGSVEETSATGTEKNPKEDHEAELEAASSPLDPSENLETVTSLGSKLKKALLPSEPSVKSTKEEASENGSAKPTESLPSTHNLCNANKSTLGDDQLSKLCDPGNLTSDQIKPSQDTNGTLIESPQGRASVETAEKMTPAPSVNSADECEHKLLVYISREKCREPEDLPQSSGMSTSELPSPQLDTITENHSDKALEQSNGERREENKVGQKVQDHSPVKEKISSLRKVDRGHYRNRREHSSSSERARESRSKTEDRYHKQRHPYTRERPKQDRHKPEHCNGSQQHLAHGERGSPRRAPLPGPVQPPPLSEPERVRPGMGQVPPLRKRVRLGPGEVLP	3707	15952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_+_3931_5767_7264_8355_8658_13587_13628_14951
907716	contig_12479_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_56898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCCTGTGCCCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625925	623846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_623800_625900
907717	contig_17074_pilon	+	3846	6	Intergenic	novelGene_145198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	267.011310621854	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	92	472	648264	657604	TRUE	15	GACACGTGTGGATTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQAPPAGQIQRG	646932	661307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_647014_648253_648361_648912_649014_651584_651734_657570_659049_659377
907718	contig_15120_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_108030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAACACAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309302	307234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_307200_309300
907719	contig_2463_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_43009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCAGCAGTTTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400453	401888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_400500_401900
907720	contig_7898_pilon	-	1089	8	Intergenic	novelGene_47536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	19	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	73	1029	285587	282118	FALSE	20	TTCTCTTAAAAGCCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286098	282057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
907721	contig_854_pilon	-	1724	1	Intergenic	novelGene_36371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTGTGTGTATGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976418	974694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976400
907722	contig_9304_pilon	+	685	1	Intergenic	novelGene_177838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACCCTTTGAAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19586	20271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_+_19600_20300
907723	contig_10126_pilon	+	4036	10	Intergenic	novelGene_105715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1710.00778281385	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	468	1220	162172	166639	TRUE	5	CCCCTTTGGGTGTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139630	186778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_140705_140794_161984_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074_186126_186216
907724	contig_10973_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_150365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	704	1216	2730	2218	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3433	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3400
907725	contig_8866_pilon	-	6579	1	Intergenic	novelGene_77834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	243	732	4648	5379	605073	604342	NA	30	GCTAGAAACCGTTCAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTQHFYLQPQLSLKSKLEYPLGYLMDHSGLACPKQSSFLLMHPTYSFGGSSSSQSMATVPCKSLKPKNVVMPLAPFSPTSHPICQKICCSTRKYFQDPPLLLSCQTKSLSSLTWIIAIASPLISLIPLFPLQHTNDSDHNLRSGEAVCSSPCWTCSATPASLLFLRQPRLAPTRGCFNLIFPLPGIPFPQMSPWFLPSLPSHFASLLCTLYTRGIHPFPSKYCKCFPRCYLPFIGHTEIEI	609720	603141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_603100_609700
907726	contig_9924_pilon	+	3244	8	Intergenic	novelGene_175909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	202.1127186013	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1008	3024	220	3243	15841	129822	FALSE	80	AAAAGAAAAGTAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDLKTQTEKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSTKSSIISKKKRQNQSESSNYDSELEKEIQSMSKIGAARTTRKRVPNKEDYDSSEEEKHNKKGMANQREKSLKTAREKSSDNVERKQEREKFFSAEGTVDKDKTIMELRDGLSKKQQPSVSSDGTDKPSSRRGEGFNSPEDKKVAETKEKSKHLKTKMCMKVQGGLSGVAEKFPKKEQTDESSGDDKKQGKKGTEEKENKTTNLKKKVIKMEQHYDSSSDDNEKLPEGEEICHFPKDIKQNKNDTTDG	15621	129823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15861_99138_99203_115839_115893_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352
907727	contig_9373_pilon	+	2235	2	Intergenic	novelGene_162735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATAGGCCTATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339522	408038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_341385_407665
907728	contig_11720_pilon	+	1113	11	Intergenic	novelGene_43827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2297.89230382975	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	17	1078	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67966	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67975_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
907729	contig_4232_pilon	+	323	1	Intergenic	novelGene_63399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCCTGATACCTTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467267	467590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467300_467600
907730	contig_10011_pilon	+	3554	14	Intergenic	novelGene_68038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_12	136.664362322421	500	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	173	916	133188	140376	TRUE	20	CCTTGATTCTGGGACAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDDGAGSIAEALASSRTLCMLHLQKNSIGPVGAQRMADALKQNRSLKELMFSSNSIGDGGAKALAEALKVNQGLESLDLQSNSISNAGVAALMGALYTNQTLLSLNLRENSINPEGAQALARALCTNSTLKNLDLTANLLRDQGAQAIAEAIRENRALTSLHLQWNFLQAESGQGPGTSTTAQQQPGQLGFTGERHRGRRSFRSGQGAEGKHGPHRPLPPGDLHRCLWGPGPGGSPGGEQNLGDS	131475	144397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_131551_131630_131715_133174_133259_134695_134780_135379_135464_136140_136225_136715_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139856_140292_140377_141077_141162_141581_141666_141927
907731	contig_5125_pilon	-	2838	2	Intergenic	novelGene_43474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_1	0	26	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2217	2576	79555	75819	FALSE	85	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWSLLFGILNSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVKEKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQQSGAQQTKKDKDKKK	81771	75556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_76011_79387
907732	contig_6028_pilon	-	2459	12	Intergenic	novelGene_156584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	170.17215396025	2	130	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	881	2191	332055	309678	FALSE	35	GTGCTGCAAGCAACAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	354135	309409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_335867_336332_353771
907733	contig_7412_pilon	-	2498	3	Intergenic	novelGene_76299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	10	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	488	1765	328722	326809	FALSE	25	TCAGAACCAGGCTTTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEANDDKKPTTKFELERETELRFEVEASQSVQLELLAGMAEIFGTELTRNKKFTFDAGAKVAVFTWHGCSLQLSGRTEVAYVSKDTPMLLYLNTHTALEQMRRQAEKEEERGPRVMVVGPTDVGKSTVCRLLLNYAVRLGRRPTYVELDVGQGSVSIPGTMGALYIERPADVEEGFSIQAPLVYHFGSTTPGTNIKLYNKITSRLADVFNQRCEVNRRASVSGCVINTCGWVKGSGYHALVHAASAFEVDVVVVLDQERLYNELKRDLPHFVRTVLLPKSGGVVERSKDFRRECRDERIREYFYGFRGCFYPHAFNVKFSDVKIYKVGAPTIPDSCLPLGMSQEDNQLKLVPVTPGRDMVHHLLSVSTAEGTEENLSETSVAGFIVVTSVDLEHQVFTVLSPAPRPLPKNFLLIMDIRFMDLK	329519	326075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_327481_328116_328745_329054
907734	contig_9113_pilon	-	1738	5	Intergenic	novelGene_68595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_4	586.258635330858	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	345	1592	348515	347268	FALSE	20	GTGTTTTCTCATGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	364480	347121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348568_352030_352088_354153_354278_364042_364108_364434
907735	contig_7322_pilon	+	2575	11	Intergenic	novelGene_164908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	113.335607820314	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	604	2139	221528	236335	FALSE	60	GTTAAAAAAAAAAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLSRRLGKRSLLGARVLGPTASDGPPGTVQPLEPQVELLERAAPQPFLAYKDSSCPEQPKEVLKAPGISGLQQVAFQPGQKVYVWYGGQEYTGLVEQHSWAEDKVTVWLLDQKLQICCKAEEVWLAELQGSISQVPPTEQGAQVPAYRPVSRNIDVPKRKSDAVEMDEMMAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSARKARGEAKKCRKVYGIEHRDQWCTACRWKKACQRFLD	185078	236771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_185195_210387_210862_221514_221780_222894_223128_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236223
907736	contig_9363_pilon	+	3889	3	Intergenic	novelGene_6481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	2.5	264	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	853	1797	357223	358167	FALSE	5	GTGTTCTTTGGACCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQSRYPSVLKTENSLEVEGFTSFSVLSKNGSTEKGDSKNSEFGNSTKMSNFVFHQHIQAADRPINSDERGNNCKQGLDTVRYQVLIPHKSIDREEIFHSSRLLGTQKQFRQEKPYKCDDCEKSFKQRSDLFKHQRIHTGEKPYECQECGKSFSQSAALVKHQRTHTGEKPYTCPKCGESFRQSSHLNRHQRIHTGDKCYKCNECGKTCNISNLFRHQRIHKGERPYKCEECEKSFKQRSDLFKHQRIHTGEKPYGCTVCGKSFSQSATLIKHQRTHTGEKPYKCPECGENFRQSSHLIRHQRIHRHKAPPF	348334	360259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_348919_352046_352174_357081
907737	contig_13952_pilon	+	4218	1	Intergenic	novelGene_133273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	842	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1120	1443	214644	214967	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFKLYHYDEVLLMCCKFYHCDEVILMRFTKLGSVLMQSLLQYKREKRAETQRNLIPPRKQCREQSASFGPEVPAQRSSQTKERLMHYKDLSPEPTERESLLLELTP	213524	217742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_213500_217700
907738	contig_9389_pilon	+	3106	5	Intergenic	novelGene_84003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	25.6063956854533	221	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	2	670	514663	520821	FALSE	10	AGAGCTCTGGTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLITDYRVRLGCGSFSGSFLEYYAADISYPVRKSIQQDVLGAKFPRLSGGNPEEPGAGSPLGRSQPCRKVLPDRSRAARDRANQKLVEYIVKAKGAENHLRAILRRRKPSRWLKTFLSSGPYVTCVETYLEDEEQLDLVVKYLQGIYQETNSTVLTRVNGDRIRFILDVLLPEAIICAISAVDAVDYKTAEEKYIKGPSLSYREKEIFDNQLLEERNRRPR	514661	523257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_514697_515070_515122_515966_516404_517921_518011_520763
907739	contig_15498_pilon	-	1469	11	Intergenic	novelGene_42660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	116.451534983443	27	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	16	852	697708	688820	TRUE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEAL	697723	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688828_689608_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
907740	contig_15135_pilon	+	9483	1	Intergenic	novelGene_119877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	584	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAAGTTGCCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85425	94908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_85400_94900
907741	contig_5586_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_143566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTCAAACATCAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387046	388064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_387000_388100
907742	contig_9578_pilon	-	2453	5	Intergenic	novelGene_67969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	60.757715559425	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	165	1604	1090238	1058571	FALSE	25	TTAAATCTCTGCTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWSYISKFLNRSPEGSLDIQDGKKSTLSQVHLQQPASSPQDSSSFESRGSDGGSMLQVLPLKTSLTPSSQEDSTQEDAGQDSSPEWPDSGSSSEEECTTSYLTLCNEYGQEKIEPGSLNEEPCVKTEDVKAIQRFPAPLPADPASRSTQLKFFPEDDNPEAVSSPKTSDSLSRSRSSPMEFFRIDSKDSTSEPLGGDFGEKLYSLKSEPLKPFFSLPYGESASRSLNTGEGKAELKAHDTISRGSNDSVPVISFKDAAFDDVSGTEEGRPDLLVNLPGELEPTKEAAAMGPTSFAQANIGLMESKLLEAPDVLCLRLSAEQCQPHGEKGTEELSDPQRPKSHSVTEKHYAQEDLGMFFVAAVDHGCPGDMPLLPSPDPKFQGLRVIGSALTSNSTEESLFRLSNPLSGHIQLTYFSRWSEVEDSCDSTAMERMYCAPEVGAITEETEACDWWSLGAVLFELLTGKTLVECHPAGINTHTILNMPGSISEEARSLIQQLLQFNPVERLGAGVAGVEDIKSHPFFTPVDWAALTR	1090402	1057721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069750_1088497_1088588_1089178
907743	contig_11855_pilon	-	1627	13	Intergenic	novelGene_66944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2154.06948201151	62	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	322	1257	1087425	1080724	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKGQKIRLLD	1091803	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079259_1079454_1080623_1080750_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736
907744	contig_9833_pilon	+	2037	14	Intergenic	novelGene_68565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	67.2059450737391	149	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	284	1699	296592	329211	FALSE	40	AACACTTGAATCAAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGDEAERRTRGAQHKGLSPRAASSATSTAVSLEPPAEAEPAPGPSSPPVPGGGCCRSSRSQGARVPSALLPRLRWDRAPAQPPRIPTVGGPRSMSEESEMEKAIKETSILEEYNINWTQKLGAGISGPVRVCVKKSTQERFALKILLDRPKARNEVRLHMMCATHPNIVQIIEVFANSVQFPYESSPRARLLIVMEMMEGGELFHRISQHRHFTEKQASQVTKQIALALQHCHLLNIAHRDLKPENLLFKDNSLDAPVKLCDFGFAKIDQGDLMTPQFTPYYVAPQVLEAQRRHQKEKSGIIPTSPTPYTYNKSCDLWSLGVIIYVMLCGYPPFYSKHHSRTIPKDMRRKIMTGSFEFPEEEWSQISEMAKDVVRKLLKVKPEERLTIEGVLDHPWLNSTEALDNVLPSAQLMMDKAVVAGIQQAHAEQLANMRIQDLKVSLKPLHSVNNPILRKRKLLGTKPKDGVYIHDRENGAEDSNVALEKLRDVIAQCILPQAGENEDEKLNEVMQEAWKYNRECKLLRETLQSFSWNGRGFTDKVDRLKLAEIVKQVIEEQTMSHESQ	296308	329549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_296628_307424_307499_308575_308652_309404_309503_310848_310958_312370_312461_313108_313205_318932_319014_321424_321613_324259_324381_325691_325823_326085_326202_327254_327360_329116
907745	contig_12119_pilon	-	1394	3	Intergenic	novelGene_88670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACTTTGACTAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330595	325367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_325736_329485_329655_329738
907746	contig_6842_pilon	+	3114	2	Intergenic	novelGene_130639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAATAACCTGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95712	198699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_96521_196393
907747	contig_12677_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_110833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTCATCACAATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2500_3900
907748	contig_12410_pilon	-	3769	4	Intergenic	novelGene_167264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCCAACATCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91373	37141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_39421_61876_62642_90125_90726_91248
907749	contig_11720_pilon	+	1285	11	Intergenic	novelGene_43770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	725	junction_1	2169.21812872749	6973	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	75	1136	68064	98482	FALSE	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67773	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
907750	contig_1399_pilon	-	2626	9	Intergenic	novelGene_166664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	25.0895271976177	129	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	308	2332	96384	74308	FALSE	30	CCTAATGTTAAACTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEPPNGEAAEIKIIREAYQKAFLFVNKGLNTDELGQKEEAKTYYRQGIGHLLRGISLASTEPEHTGPEWESARQMQQKMKETLQNVRTRLEILEKGLATSLQNDLQEVPKLYPEFPPKEMPEKPPSFGSLLWHAEVNGDTPATSGASASAPGPLPSAPQGRPTEAPPAYTPQAAEGHYTVSYGTDSGEYSSVGENFYRNHSQPPPLETLGLDADELILIPNGVQIFFVNPAGEVSAPSYPGYLRIVRFLDNSLDTVLNRPPGFLQVCDWLYPLVPDRSPVLKCTVGAYMFPDTMLQASGCFVGVVLSSELPEDDRELFEDLLRQMSDLRLQANWSRAEGETEFQIPGRIRHSSDQMGKASGPDKRLLGSPSDPGTKDVRYKGKRGKKVKDTSSEEMNLSHIVPYEPVSEEKAKELPEWSEKVAQNILSGASWVSWGLVKGAEFTGKAIQKGASKLRERIQPEEKPVEVSPAVTKGLHIAKQATGGAAKVSQFLVDGVCTVANCVGKELAPHVKKHGSKLVPESLKKDRDGRSTLDGAMVIAASSVQGFSTVWQGLECAAKCIVNNVSAETVQTVRYKYGHKAGEATHYAVDSAVNVGVTAYNIDHIGLKAMVKKTAKQTGHTILEDYKIVDNSQGKDREGGASVKVTGQKEEQLEVEEQKEELEKKAKKKEK	111527	74013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055_82215_83948_84144_87124_87249_88846_89015_92501_92700_95583_96387_111222
907751	contig_3449_pilon	+	3020	3	Intergenic	novelGene_73725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_2	222.5	150	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAGAAAATACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493422	514600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_512069
907752	contig_6027_pilon	-	4284	3	Intergenic	novelGene_74412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTGATTTACTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79462	16512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_19820_20168_20352_78668
907753	contig_12312_pilon	-	1711	1	Intergenic	novelGene_63975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATTAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251911	250200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_250200_251900
907754	contig_34_pilon	-	5027	6	Intergenic	novelGene_40033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1261.03424219963	517	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	46	753	247052	224546	TRUE	60	GAATGAAATGAAATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNDFKRTHLFASLKLQICSSPGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	247097	220025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_221305_221368_222053_222234_224818_230228_230387_243214_243411_246970
907755	contig_9706_pilon	+	4297	1	Intergenic	novelGene_20924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	15	470	174011	174466	NA	35	AGATGGGGAAATTGAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPLLMKILKMIGIEGKFLNMIQGMYEKPTANIILTGERLRAFPLKSGTRQWCLLSPLLFNTVLAVLARAIRQRKRNKRYSDWKRRSKIISVNGMSLYIENPKKSIRKLLELIEELEKLQGTVNKQKSLGFLHTKSIAIELILTHSDTIEQSRTVP	173996	178293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_174000_178300
907756	contig_10722_pilon	-	4237	6	Intergenic	novelGene_70969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	316.903392219143	8	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2563	2946	6730	6142	TRUE	25	CTGCTTCAAATATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPCKIFFRIEMTCRAL	9345	3717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_6328_6423_6529_6637_7697_7749
907757	contig_11071_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_131033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	90	389	133291	132992	NA	10	TGGAGGTGGGACTGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFTFQVSLPYKILYIHCYVTLIAHPILQQHTPPFRPRVPMSNQPAPNPLCLPISPLDRSCAFGRLYLLELRGTLLTSITLCPTVQSNPCLKSWAQKLF	133380	132668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_132700_133400
907758	contig_7412_pilon	-	5685	17	Intergenic	novelGene_76265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_16	90.68480785115	389	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	830	2493	184	2676	225095	209111	FALSE	40	GCCCAAATCTTTAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVPMGPDGLPVDASVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYNRHYEDGYPTGSDNYGSLSRVTRIDERYRPSMEGYRVPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPSSWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWELVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALVFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQIHREIPQAERYQEASPTVANNTGPHAASCFGAKKGKGKKPTEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPDLVNNLPGGQQSSSWNFSEDTVVSVLNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKTDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTLNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTPLMQKI	253280	206101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_209123_209858_209963_210617_210681_212732_212821_213392_213508_213863_214057_214971_215123_215224_215353_216349_216419_217238_217393_217855_217974_219101_219286_220381_220846_224026_224560_224978_225132_225891_225964_253205
907759	contig_3754_pilon	-	2913	15	Intergenic	novelGene_146813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	130.273750233883	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	198	1982	358540	48636	TRUE	10	GCCTTTGCTGATGTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPAGGAGAGQPLTPAIKGPGRLGSHRLACARRLRPHHLPAFGAPAPAQALLDPLGPRLLGLRQKMAAAPEDVPELARLLEIDPYLKPFAPDLQRRYRQFNKTLNDIGENEGGIDKFSKGYESFGVHRCADGGLYCKEWAPGAEGVFLTGDFNGWNPFSYPYKKRDFGKWELYIPPKQNKSTVVPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVTREGCNVNYDWIHWDPEHPYKFKHSRPKKPRSLRIYESHVGISSHEGKVASYKHFTCNVLPRIKDLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQITSFFAASSRYGTPEELKELVDTAHSMGITVLLDVVHSHASKNSEDGLNMFDGTDSCYFHSGPRGNHDLWGSRLFAYSSWEVLRFLLSNIRWWLEEYAFDGFRFDGVTSMLYHHHGVGQVFSGDYHAYFGLQVDEDALIYLMLANHLAHTLYPDSITIAEDVSGMPALCSPVSQGGGGFDYRLAMAVPDKWIQLLKEFKDEDWNMGNIVYTLTNRRHLEKYIAYAESHDQALVGDKTLAFWLMDAEMYTNMSVLAPFTPVIDRGIQLHKMIRLITHALGGEGYLNFMGNEFGHPEWLDFPRKGNNESYHYARRQFHLADDDLLRYKFLNNFDRDMNKLEERRGWLSAPQDTFQNVSFNS	358737	39822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_40608_48489_48669_83405_83591_126848_127021_131262_131374_135593_135693_140691_140820_146139_146256_195328_195539_197735_197827_200348_200485_201192_201319_250723_250840_294903_295074_358448
907760	contig_15518_pilon	+	3964	1	Intergenic	novelGene_127623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	526	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1691	2005	24727	25041	NA	45	GACATCTAACTACAATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTSQVLLLASACTLRPMQPAGCQLGEVRQILTASELSLLPLAAQSNSSTLSLIFRAPRLSYIIGSLVVLGLYCKRDHRKHLTTPPSWPLLLACLYLNRNIYS	23036	27000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_23000_27000
907761	contig_8687_pilon	-	4680	8	Intergenic	novelGene_169669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGGGCAGCTGCATAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343373	298868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_298954_317428_317620_318318_318430_319479_319545_322800_322935_328569_328668_329956_330143_339563
907762	contig_19812_pilon	+	2023	18	Intergenic	novelGene_100993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1527	1832	35180	40325	TRUE	40	GAGTCATGAAATGCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCLILLVGLVERHEQVLLHRERCLHDAVEARLEAAQVLLFHLNLLEDFLLVGQTFSVLLCQPFPLLQLPVQACKGLLMRISHGDFSLADIWRSLLIKLL	15758	42629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_15942_19009_19204_19863_19979_22716_22804_22949_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26045_28173_28309_29840_29948_31756_31858_32100_32144_33048_33130_35121_35254_38512_38631_40211_40355_42335_42435_42566
907763	contig_50_pilon	-	2728	1	Intergenic	novelGene_122225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTCCAGCCTCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91950	89222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_-_89200_92000
907764	contig_13301_pilon	+	1727	6	Intergenic	novelGene_153125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	277.96517767519	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	658	1053	171771	172166	TRUE	65	AGAAAATGAGAAAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALGISHPCLSQYMGPGPPGAPGSPARAPAMVDAMRLRRDEAAPVLHLSPPQSLLGSPAQGQPMSSGAALACHPVQVCRDEAFDTLPMILLIQGIDTLPFQRIAISDGVTMELFIWGHSALRVQGLRDVV	169193	173245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169397_169520_170822_170999_171499_172378_172631_172824_172974
907765	contig_9982_pilon	+	1865	15	Intergenic	novelGene_55734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	128.202327337275	1074	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	181	1770	311199	338304	FALSE	65	GTAATAATAAAAAAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPILTRNPLKGSGSTSVIHTCKLCPQRKY	307550	338399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313217_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_337965_338119_338220
907766	contig_11448_pilon	+	2564	1	Intergenic	novelGene_66406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTCAATGGCAACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504120	506684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_504100_506700
907767	contig_9708_pilon	-	3104	3	Intergenic	novelGene_67282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGGGGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793991	785187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_787724_788303_788381_793500
907768	contig_3529_pilon	+	1991	8	Intergenic	novelGene_105395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	108.003590265343	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	157	930	790486	809429	FALSE	20	GAAAGATGTGTGTTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEVMRMGLSPLWTRRMQVMPLAQLCTPSVSPGWCSPHTVFPSWPLSVKTAHLPCWTQAFPRCLEAEPTETL	790329	810490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_807636_807746_808481_808551_809397
907769	contig_7410_pilon	-	10897	18	Intergenic	novelGene_106045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	687	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCAATTTTAACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138620	46204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_49595_60119_60231_60313_60413_75321_75447_76247_76906_86473_86560_87331_87451_90596_90701_91877_92102_93486_93608_98686_98848_107336_107452_123305_123479_123675_123793_125038_125304_131165_131211_132873_132993_133755
907770	contig_8578_pilon	-	3469	1	Intergenic	novelGene_178832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	321	3147	3467	323	3	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTTSQNKESINSLEEENFLELPEAEYKRLLYRTLVEIRKEIRQNAGMARDHTDKVVAKLKKVIQEHNDNFSRLQEFIERQQSEIQRIKNKISELDKSIHSHKSGI	3469	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8578_pilon_-_0_3500
907771	contig_10299_pilon	-	1927	4	Intergenic	novelGene_79760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.0631496343164	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	510	1712	592066	579859	FALSE	0	TGCTGTGGGCTTCTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSALPSRASWCTHECQTPGPAEPSIPEKEAFTLVGKVLLKNQSQVVFNHRGFKARAPFGPAEATLPSPAIVAQELWNKGAISLSYVAHLKICITHVTGSSIPCIKRLEVWGQPAKTCSQEVIDSVLLVASESLPQGLALQAPALPMESDCDPGGQSECHQAPSSLQELAEVIQDVPEEFLDPITLEIMPCPMLLPSGKVIDQSTLEKCNRSEAAWGRVPSDPFTGVAFTLHSQPLPHPSLKARIDHFLLQHSIPGCHLLGRAQTAVAATPSSIVTPSRKRKMEQAEQAPDSSLGINASCFSATSPLVSPTTSEHTAKKMKAASELGLTHMDCSTGPISHEQKLSQSLEIAVTSTLGSMPSFTARLSLLSCASLPVPLPDLRAYWSQPHPGQDHPAEGP	593494	579643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_579964_584797_584887_591057_592481_593399
907772	contig_4974_pilon	-	1080	2	Intergenic	novelGene_161399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTTTGGTTAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44198	40068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_40654_43703
907773	contig_3382_pilon	+	2619	5	Intergenic	novelGene_124155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	243.488192732214	148	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	79	1071	931459	960719	FALSE	25	TCAGTTAGCAGCTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGFFYRIFDQNVQ	931380	962267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_958285_960681
907775	contig_854_pilon	-	2187	6	Intergenic	novelGene_36360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1422.3902418113	28	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	477	845	993124	976030	FALSE	15	TGTGTATGTGTTGGAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTQGLLPIILLALYWRPSMTGAQEAIPLQSLRCYNDYTSRIECRWADTEATQRLINVTLYHRMDNDPPEPVPCNLSDNKPWSDCPSPPCVSIVTPRIDATRGGGMKGERERMFVSLWDSC	1001721	974687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_976120_991229_991309_991918_992043_993048_993301_994869_995130_1001681
907776	contig_9363_pilon	+	5021	2	Intergenic	novelGene_6735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	216	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	733	1191	1489029	1489487	TRUE	15	CTACTTTGAGTGCTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPLAPLPAGEPNGARPKCRKAEPVSFAEVAVYFSPEEWACLRPAQRALYRDVMRETYGHLGALGESPTYSPGPTFSYIPLRLWILHVEWEALGPQVGTAWGFLLSAWALRSLPHAPPQDSEAPSQPSSPGWRKRPNCGVRMPRIRRQERI	1488296	1494093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1489500_1490275
907777	contig_7963_pilon	-	3161	12	Intergenic	novelGene_58451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	493.933160399409	46	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	707	3160	125592	118203	FALSE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKGKVSLPACAASDAASFCSGRWRIVITGTHRSLLLMCGLCSPTAISTIPQTTMLWPWHESYRMCLSSVMPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	126298	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121122_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
907779	contig_938_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_143914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1234	1539	73311	73616	NA	75	TAAAAAAGAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLLPVLKPYSVTLSIALIGFNQTRSFSLLKFCEELPSWLPRSTHGAHCPPFWPLPKLSLNSPHCRGQELKMCSQITCNSWRESHTVKESPRLEEQWLHP	72077	74202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_72100_74200
907780	contig_4093_pilon	-	1888	5	Intergenic	novelGene_27636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_4	997.723001388662	2	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	83	688	69245	45596	TRUE	30	TTTATGAATGGACTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTVCILPVL	72506	40744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45784_46300_46425_68951_69257_72435
907781	scaffold_880_pilon	+	2412	3	Intergenic	novelGene_121475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_2	117.5	12	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	193	468	483336	483611	TRUE	40	AAAAATTTTTTGTGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYLFFCALGESLQFKLVSHQKFIHRLFCDIGCNPRNVTARSPFPPRVPHVHSSSFPVPSCLLLLMLSWSCSFGLVCLTELSSTFLLCVIVCFIGLSNLCLKSGLWVWFQFWVSRVSGGRSLRGSSSVCQTVSLVFSCESEFCSTFFSCSVQDYLL	483143	489057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_484938_485540_485643_488541
907782	contig_12842_pilon	-	2624	2	Intergenic	novelGene_168337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	638	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCACGGAAGCCTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198070	91061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_91318_195702
907783	contig_3817_pilon	+	2142	15	Intergenic	novelGene_78288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	539.006573925304	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	248	886	84310	99372	TRUE	5	ATTTTTCTTGTTGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRLPCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQILQAELLAVYGADPGTQDSNGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPGKNGQHFIIPQMADSSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRRETDAAPW	77951	116511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_78000_82067_82210_84252_84351_84975_85082_86589_86677_86784_86916_89566_89666_94141_94181_95299_95352_99010_99084_99361_99435_100448_100561_110568_110712_113091_113242_115722
907784	contig_10299_pilon	+	2285	16	Intergenic	novelGene_79746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	71.2065540054659	1	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	97	1752	463466	517350	FALSE	20	CCTGAGGAAATGTCTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQSVPLLARSPSTNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILPYDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTCNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDVSKDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK	463369	517883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_463505_488618_488710_489793_489871_493160_493198_497085_497184_498369_498490_499230_499398_499838_499975_500712_500863_502292_502387_502702_502787_503348_503426_511686_511810_511888_512041_516300_516437_517275
907785	contig_8122_pilon	+	1288	1	Intergenic	novelGene_40209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATGACACTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358388	359676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_358400_359700
907786	contig_6292_pilon	+	4396	7	Intergenic	novelGene_178628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1367	1822	140070	140525	TRUE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLQKQDRMVPVGIQIKTPDDSPVEENALEVPDREFKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTADKHLDTTLFQENS	137566	310645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6292_pilon_+_138248_138546_138950_139787_140746_140819_141477_234744_234891_308963_309269_309399
907788	contig_10930_pilon	+	2322	6	Intergenic	novelGene_36999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1701	2273	276899	280292	FALSE	50	GCAGAAGTTGGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALLSCLCNRFLQNIYILVHQEQGIFLRNGCFCFVWQYDSMFIHCS	267429	280341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_273945_274324_276722_277013_278443_278637_279700_279834_280159
907789	contig_15047_pilon	+	1565	6	Intergenic	novelGene_52242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3077.58024428284	15	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	275	529	3242	4409	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWRPGLRGMGPSRSGQPLWRPLERSKDTHVVCSTRG	2571	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3388_4300_4434_4552_4664_19368_19622_21013
907790	contig_18990_pilon	+	2403	3	Intergenic	novelGene_177452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	1	junction_1	5.5	124	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	301	462	3883	4143	TRUE	55	CAAGAAAAAAAATGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLEAAAPIAPFLLQSNKFTFLISHLGLLFLGCNKSHRVKPGVLTWQRFWQASQESSLGSRDRPCWGPCLRRPSAQLCQKNLSQTEREAEASPPPEPLVIMKVEGEPVKFLVDTGVTHSPLDNPSPQITSYSDKADSVCCVAVTNGPHYWAAN	3582	20065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18990_pilon_+_4003_4101_5990_19970
907791	contig_14441_pilon	+	846	6	Intergenic	novelGene_100423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	160	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	9	806	81887	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLCTSVPAVKAQQHTGYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81878	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81896_82331_82375_121190_121239_125517_125902_126159_126283_126514
907792	contig_16125_pilon	+	2867	15	Intergenic	novelGene_155243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1945	2268	236051	236374	FALSE	50	GGAACAAAAACTAGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAASIFLSSFFPSAFLERLGDPLLAAGFRTTPGKGELDVLPPWSLFSGSSLAGFKGPGLDLAPRGAGGPFCGDTFLVRLSSSWEASVLRDGFWPKAGLGKRGLGS	118857	236973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_137851_137946_138906_139406_144626_144710_148096_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_153471_153486_155566_155618_179440_179596_235794
907793	contig_11281_pilon	-	2647	14	Intergenic	novelGene_125460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	918	junction_8	774.602383207672	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	752	1348	844638	830355	FALSE	35	GTACCATACATTGAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEVITDTGVVCHKLATRIFECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPYRSEAKKTKVKKKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPGDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASGAHILGEVCREKQEAAIPLVRLFLHYGKIVPFISAIANAEVKRTQDPNTIFRGNSLTSKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPIIEEICQSHKSCEIDPVKLKDGENLENNMENLRHYVDRIFNVITKSGVSCPTVMCDIFFSLRESAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTIQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDHKSIEQPILLKEG	886993	829055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_830433_833041_833120_835835_835914_838019_838127_841079_841204_843380_843456_844581_844697_846305_846455_847246_847404_849225_849331_853751_853829_859558_859632_860043_860125_886942
907796	contig_15135_pilon	-	2857	17	Intergenic	novelGene_119878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_16	536.862176069194	101	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	40	1755	122783	96493	TRUE	85	AACAAACAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGTLQGRRSTELTDLGLDSLDNSIACECAPEETESSESSLHPDFAKYLAETEETVKMTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNKQFCSKLGKYHMPFAWAVRSVFKDNQGNVDKDSRFSPLYRQEASKISTEDLLKLVSDYRRADRVSKTQTIPGSLDIAVDNVPSEHPNCVTSSFIPVKPFNVTAQPEPTVEVEEFVYDSSKYCRPYRVYKNQIYIYPRHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDEEGAKPMKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHVLFSFYHVTCDINAKANSKKKEAPETSVGYAWLPLKRHDQIASQEYNIPVATSLPPNYLSFQDSASGKVLSNV	122822	92027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_92251_94677_94797_95329_95423_95825_96633_96824_96949_98619_98713_100999_101066_101588_101777_103604_103685_105120_105244_110796_110880_113400_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
907797	contig_13211_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_123135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	538	873	86376	86041	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKVPEDKVSPSSLLSSILAAPRQICTKRDLFVLLAVHGISNILHQHHNSKASILQSFLFTLQLSHAHEVTENTMPWVRRTLVLKVTSLLFNNLNRSSAGDLPSAIRSLIS	86913	85333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_85300_86900
907798	contig_4180_pilon	+	3544	6	Intergenic	novelGene_8372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	9	156	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	320	856	875200	888134	FALSE	20	CTTTTTCTGTCAGTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874105	890822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
907799	contig_7963_pilon	-	2212	7	Intergenic	novelGene_58533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.186466104126	494	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	28	687	245666	240504	TRUE	50	AGCTTAAAAGACAGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRGARHQAGMLRRGAPAGDLPGAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245693	237413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_238082_239646_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_245606
907800	contig_14679_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_174182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCATTTGCCATGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71403	70345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_70300_71400
907801	contig_4857_pilon	-	4790	2	Intergenic	novelGene_48863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1648	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATCCACAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356884	1351887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1356284_1356490
907802	contig_6364_pilon	+	4504	14	Intergenic	novelGene_51811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	30.1538461538462	483	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	647	1648	1496669	1506374	FALSE	25	CAATTTCTGGCCTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLEEARLHKEIPETTRTSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLHTLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDQKDVNLASCAADGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLRQRRCVYTIPAHQNLVTGVKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGLDISADGQLIATCSYDRTFKLWMAE	1489324	1509230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1489429_1490190_1490372_1492200_1492390_1495819_1495908_1496409_1496490_1496664_1496759_1497349_1497445_1498589_1498649_1501348_1501473_1502898_1502989_1505101_1505225_1505334_1505443_1505533_1505653_1506180
907803	contig_16951_pilon	+	4022	4	Intergenic	novelGene_98637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	300.299110147792	21	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	110	568	85909	91405	TRUE	75	AAAAAAAAAAATCAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAEGLPCLPEHGARAGTWRSPERSVREGCLVAETQPPKRVGTVLPGKGLPRLSPRWPLELLSDLCFSALPSCLAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	85799	109943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91066_91463_103952_104099_106692
907804	contig_6227_pilon	-	2226	3	Intergenic	novelGene_49677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1487	1861	848450	848076	FALSE	45	ACAACAACACACTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHFNIKKTKILTTRPISNIMINGENTEVIKDFILLGCTINAHGSSSQKNQTTYCRIALGKSAAKDLFKVLKSKDATLRTKMSLTKAMVFSTASYSFERWTMNKEDERRINAFE	862155	847710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_848656_856398_856544_861019
907805	contig_4742_pilon	+	2084	10	Intergenic	novelGene_131008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_9	278.972718698044	18	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	163	1359	267289	283345	FALSE	65	TGAAAAAATAGATAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKASKLGTHEKQEIKKKKVDKGGVPNVHPSAASTSKPSADQIRQSVRHSLKDILMKRLTDSNLKVPEEKAAKVATKIEKELFSFFRDTDAKYKNKYRSLMFNLKDPKNSILFKKVLKGEVTPDHLIRMSPEELASKELAAWRRRENRHTIEMIEKEQREVERRPITKITHKGEIEIESDAPMKEQEAAMEIQEPTANKSLEKIEESEKQKEEIDSMSKDTTSQHRQHLFDLNCKICIGRMAPPVDDLSPKKVKVVVGVSRKHSDNEAESIADALSSTSNILASDFFEDEKQESPKSTFSPVSRPEMPGAVEVESTFLARLNFIWKGFINMPSVAKFVTKAYPVSGSPEYLTEDLPDSIQVGGRISPQTVWDYVEKLKASGTKEICVVRFTPVTEEDQISYTLLFAYFSSRKRYGVAANNMKQVKDMYLIPLGATDKIPHPLVPFDGPGRCTF	263307	284070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_263327_267145_267297_267378_267536_268999_269117_270854_270987_271584_271721_276598_276795_278132_278281_280583_280674_283132
907806	contig_19269_pilon	+	2954	3	Intergenic	novelGene_175624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	347.5	174	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2381	2776	13388	13783	FALSE	70	AAAGGAAAGAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYFEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPLLLKLFQSIEKKATLPNSFYETTITLIPKPGKDITKK	794	13961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_904_7478_7587_11224
907807	contig_8676_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_142201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGTTCCTCAGGTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228273	229963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_228300_230000
907808	contig_6364_pilon	-	5768	28	Intergenic	novelGene_51793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	89.3190670999169	308	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1219	3660	134	3793	1426712	1378139	FALSE	60	AAAAAATTCTAAATAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFGSSRRASLRYCRKTVRHAAFYDDGSEGAFENLRLPSRGKASPMFSAGDEDDSDFLSPSGGARLASLFGLDQTAAGHGNEFFQYTAPRQPKKGQATTTTGNQATQKIAPTTAGTSTVLFATAVHAYRYINGQYVKQGKLGAAVLGNHTAREYRILLYMSQQQPVTVARIHLNFELMVRPNNYSTFYDDQRQNWSIMFESEKAAVEFSKQVCIAKCNSTSSLDAVLSQDLIVVEGPSVEVGDSLEVSYTGWLFQNHVLGQVFDSTANKDKLLRLKLGSGKVIKGWEDGMLGMRKGGKRLLIIPPSCATGSEGVIGWTQATNAILVFEVEVRRVKFARDSGSDGHSVSSRDSAAPSPTPGADNLSANPAVSPPTSVPFKSGEPALRTKSNSLSEQLTNPDTVKAKLISRMAKMGQPMLPGLPPQLDSNDSEIEDVNALRGAGQPMVTPSIQPSLQAAHPVLPQMTSQVPQPSVSGLQAPSAALMQVASLDSHSAVSGNAQSFQPYAGMQAYAYPQVSTVASQLQPVRPLYPAPLTQSPHFQGSGDMASFLMTEARQHNTEIRMAVSKVADKMDHLMTKVEELQKHSVGNSLLIPGMSVTVETSMIMSNIQRIIQENERLKQEILEKSSRIEEQNDKISELIERNQRYVEQSNLMMEKRNNSLQTATENTQARVLHAEQDKARVTEELTAATAQVSHLQLKMTVHQKKETELQMQLTENLKETDLLRGQLAKLQAKLSELQETSEQAQSKFRSEKQNRKQLELKVTSLEEELTDLRAEKESLEKNLSERKKKSVQERCQAEEEIDEIRKTYQEELYKVRQLLKKARVSTDQATAEQLSLVQTELQTQWAAKCEHLLASAKDEHLQQYQEVCAQRDANQQNLTQLQEKYLALQAQVTVLTEQNEQYIKELENNKSQTSGNEAATTDPSEKVKKIMNQVFQSLRGEFELEESYNGRTILGTIMNTIKMVTLQLLNHQEQEKGESSSEEEEEGGGGARPQRPSQEQSISADSGLSQESMNREGQESPPVPLEQVAEEAIPSLPQTIPTPQDDVQRRKGETLESEELAEIKDGSLPPELACIPSQRVQGPPASIPPKPPGSVTVDPECEEILAASLMAAKSDDPLRKDFVGAVAPDGPLQESSTTPSLTSDPKKGDPLALGPESPGEPQPPELDKKEDLTSLTGPSKELLSIEAGSTDPAAVRSSHGSQHSSLSGDEEDDLFKGATLKVTKPKEDHEEEDEDEVSMKGCPPPAPLFGDDDDDDDIDWLG	1426845	1376163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1378217_1380541_1380639_1382149_1382878_1383149_1383258_1383899_1384026_1385066_1385220_1386043_1386200_1387880_1388018_1389690_1389863_1394975_1395079_1395893_1395989_1396486_1396595_1396896_1397007_1398414_1398530_1399923_1400031_1400507_1400611_1402168_1402277_1403484_1403534_1404003_1404147_1406303_1406451_1407788_1407858_1408768_1408919_1413050_1413150_1413482_1413558_1417008_1417079_1417539_1417625_1421731_1421848_1426659
907809	contig_11855_pilon	-	1340	5	Intergenic	novelGene_66971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	717	junction_1	2521.40506464154	37	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	416	1150	1085092	1079293	TRUE	25	CAGGACTCATGTGTGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1085507	1077578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963
907810	contig_12327_pilon	-	2240	9	Intergenic	novelGene_140692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_8	206.183777247387	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	99	1337	1155014	1145558	FALSE	60	GAAATAAGACAGAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGFCLLSASGVSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKVCLF	1155112	1144654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
907811	contig_11034_pilon	-	2646	18	Intergenic	novelGene_175018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_5	24.478364149156	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	728	2187	121	2307	169539	138985	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSERNCIEIVNKLIAQKQLEVVHTLDGKEYITPAQISKEMKDELHVRGGRVNIVDLQQVINVDLTHIENRIGDIIKSEKQVQLVLGQLIDENYLDRLAEEVNDKLQESGQVTISELCKTYDLPGNFLTQALTQRLGRIINGHIDLDNRGVIFTEAFVARHKARVRGLFSAITRPTAVNPLISKYGFQEQLLYSVLEELVTSGRLRGTVVGGRQDKAVFVPDIYSRTQSTWVDSFFRQNGYLEFDALSRLGIPDAVSYIKKRYKTTQLLFLKAACVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDIAPLLPSSLSVEDAAMLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFSELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTTKKDKKDERRRKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDDDTDDEPQSSHPGKKKPEITFMFQDEVEDFLRKRIQDAPEGFISELAEYLIKPLNKNYLEVVRSVFLSSTSATGTGRKRTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGTKFFADDTQAALTKHLLKTVCTDITNLIFNFLASDLMMAVDDPAAITNEVRKKILSKLSEETKAALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSAAEACDIMVKKGDKKRERQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFLTHSMLHAPGRCVPQIIAFLNSKIPEDQHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGDDPLSDELGKEQEDITNTTRKELQELSSSIKDLVLKSRKSSVTEE	169659	138645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139204_139835_140017_140824_140911_141256_141338_142543_142675_142753_142918_144261_144380_147253_147377_149780_149902_151930_152111_153304_153481_154730_154878_158969_159029_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511
907812	contig_14445_pilon	+	1737	8	Intergenic	novelGene_137368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	202.049397880007	16	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	398	940	331159	360205	FALSE	15	GCGGCTGCTCCCACAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWCRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMVWYAEHYGHREKTYSECEDGTSSPDISWPHAKGTKGSEDSPPKHSGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK	330556	361002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_330827_331031_331174_333377_333491_337617_337684_348959_349060_356702_356772_357542_357613_360095
907813	contig_4486_pilon	-	2152	4	Intergenic	novelGene_38540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	244.450858501708	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	354	824	177451	131456	FALSE	30	GTAAACTGTCTTATGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPMVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMVC	177996	130127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_131583_132279_132485_177312_177724_177915
907814	contig_5669_pilon	+	3725	10	Intergenic	novelGene_86074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	163.125567025172	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGGTCCAGGGTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186097	207236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187367_189642_190126_191880_194419_196364_196458_201969_202085_205123_205291_207172
907815	scaffold_13505_pilon	-	5156	2	Intergenic	novelGene_111588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	654	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	4644	5000	643372	643016	FALSE	25	GTCTGCAAGTGATTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTITKHFQKQDRIVPVSIQNKTPDDSLLEEKALELPDREFKSLTLRILQELRQKADKHEEKVDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKITRFQKWTVS	648179	642859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_644341_644504
907816	contig_3382_pilon	+	1871	3	Intergenic	novelGene_124179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	509.5	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTATCTGTCTTTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958956	962031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_959116_959551_959914_960681
907817	contig_11448_pilon	-	1978	2	Intergenic	novelGene_66339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAAAAAAAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147910	145874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_147217_147274
907818	contig_14814_pilon	-	4815	2	Intergenic	novelGene_137725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACTCTATTTTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315309	310432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_314962_315023
907819	contig_2988_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_136551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	494	1003	161414	160905	NA	45	GAATTCCTATACATCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWLFERINKIDKPLVKLTKEKQERMSITQIRNEMGDITTDATEIRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLMQTEVENLNRPITKEEVEKVIKKTPNKKRPWPRWLHWSILPNIQRRAYTSTNHIISEHRKGRDTSKFIL	161907	160235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_160200_161900
907820	contig_8254_pilon	+	3192	17	Intergenic	novelGene_48363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	299.024605749677	54	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	819	2460	114	2573	72814	109211	FALSE	25	AAATGTGTCTTACATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKGLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFSSNLLTIPKQRSSSVSFTHHISLRRAGAVSCVTPVNSPSHGPVSAGSLTNRSSIEFPDTADFLTKPSVILHKSVGNVPNTPDSYQQLRNSDSNLCNSCGHQILKYVSTSESESGTDCQSGKSGKEKNTIFSKESFKLTETQQEEKTERRDCKQLFLEVDGQLIEEAQNAQQPNIEQESSLDLILIEDHDSLIEKMSNWNFQIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFHALENGYRDIPYHNRIHATDVLHAVWYLTTRPIPGFPQIHNDHGTGNEADSDGRINPGRIAYISSKSCSIPDESYGCLSSNIPALELMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLNLDHVEFKRFRFLVIETILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCMKLADINGPAKVRNLHLKWTEGIVNEFYEQGSAVKKRRDDLKSTCKIQLWTFQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGEWIEAEEDDDIESGDEEEDGEELDTDDEEMEDTLNSKPQRRKGRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIIEEEEKCKADGNKLQVDNSSLPQADDIQVIEEADEEEERQFE	14902	109830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_15016_72813_72865_74714_74964_77451_77595_82136_82244_86618_86830_87387_87465_93959_94112_94955_95094_95727_95840_97732_97847_100696_100897_102341_102546_104501_104664_107118_107188_107499_107756_108996
907821	contig_8447_pilon	-	4583	17	Intergenic	novelGene_69385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	559	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3288	3692	54631	44867	TRUE	40	TGGAAAGAGAGGAGGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLHLLYLLLLLTLQVLQLCVKVLLLGLDFLFETFMHLLQLQLMLAAQLGLVPMFFFLEQPELSEFLAPEGNLISSSFFSSSLMILEVVMLTSTPSTTNLRVRLRVLLCSFESLMDREPVSLFRDRSAEREVL	84483	5773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_5924_21257_21329_22347_22545_23214_23296_40690_40826_44386_44514_44736_44929_48348_48477_53956_54085_54544_54726_61156_61252_65554_65685_67606_67732_69678_69866_70807_70941_71849_71961_82071
907822	contig_14341_pilon	-	858	2	Intergenic	novelGene_111897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCATGAATAGGGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742935	735037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_735096_742135
907823	contig_7915_pilon	+	5223	4	Intergenic	novelGene_42964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	890	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1400	2038	92428	93066	TRUE	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMMLGKFSVSSSSMILSVFSVFCPCSGIPITRKFLLLIVSHITLRVSSCFFVLFSEFSSNRVVCKCLSSIPLILPSTISNLLLSPSVTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSSFLSVFSINLSVFSLCLSGFCLSSWRILSIRDLHSLSGSSSAFSSAGESSGVLFWTPTGTIMFCFCKCFDIVCCLWSI	91028	199964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_93814_93857_94755_198311_199221_199332
907824	contig_233_pilon	-	2891	16	Intergenic	novelGene_14568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	1428.46360354987	6	56	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	290	1891	108727	92266	TRUE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTRVLGHEWGHARPACPAAHSGGTALPRVCCAGAATTTHRPVCLLVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92355_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108861_109914_109976_126898
907825	contig_8866_pilon	+	7003	13	Intergenic	novelGene_77894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	82.2004241000144	531	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	212	574	1084163	1091883	TRUE	60	TGGCTAACCATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRSCQTALVEILDVIVRSFAPILPHLAEEVFQHIPYAKEPKSVFRTGWINTSSIWKKPGLEEAVESACAMRDSFLGSIPGRNAAEYQVVIVIEPGLLFEIMEMLQTQETSSTSQLNELMMASETTLLSQEPREVTADAVALTGTFVINLEGKEEVRVTSVYGELNDNSGHLELSMCVEYIFLWEQWPSF	1083500	1119735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1083620_1084070_1084262_1091619_1096523_1096721_1096881_1097926_1098150_1098414_1098504_1103847_1104067_1104286_1104365_1111858_1111958_1113971_1114039_1116434_1116543_1116645_1116818_1119159
907826	contig_16205_pilon	+	2003	1	Intergenic	novelGene_156884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	899	1237	99369	99707	NA	40	AATAATACTCGTGAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHTLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAITLLGIYPREIRAITQTDTCTSMFPAALFTTAKRWKQPRCPSVDERINKLWYIHTMEYYPTIKNNNEAMKHLVTWRNLEGIMLSRFH	98470	100473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_98500_100500
907827	contig_11386_pilon	+	3272	2	Intergenic	novelGene_82782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	812	junction_1	0	8	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	107	631	17940	20053	FALSE	35	AATATTCGTGTTGTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDGEQQGHPTQGRGFAELTSSARAYR	17833	22694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625
907828	contig_6710_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_98339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATCAGCAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657176	655548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655500_657200
907829	contig_19744_pilon	+	1682	3	Intergenic	novelGene_120381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_2	75.5	1	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1650	33	1682	152971	177945	FALSE	65	AAAAAGAAAGAATGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVL	152938	177945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_153059_156119_156243_176506
907830	contig_13740_pilon	-	1676	8	Intergenic	novelGene_34704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	3406.46190260181	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	309	776	161718	160791	TRUE	50	AAAAAAATGCCTTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNF	162224	157083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160904_161058_161270_161574_161722_161919
907831	contig_6163_pilon	-	1702	8	Intergenic	novelGene_103814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_2	229.230300379869	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	38	847	93933	77771	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPLPPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRVVALSMSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGGYANSKAVTLEASFTPDSQFIMIGEVPLSSLALVFL	93970	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77882_78301_78458_78698_78816_79347_79448_86907_86975_89577_89676_93772
907832	contig_5316_pilon	-	2049	8	Intergenic	novelGene_61202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCGAGCAGAGCGAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551008	395998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_396221_453778_454078_521385_521502_523561_523610_540824_540999_543404_543542_544137_544267_550084
907833	contig_13740_pilon	-	1422	10	Intergenic	novelGene_34696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2934.73660037494	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	152	916	165243	157474	TRUE	40	TAATTCTAAAGGAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165394	156814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160698_161185_161270_161574_161722_161919_162031_165237
907834	contig_9682_pilon	+	2210	10	Intergenic	novelGene_125284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_5	112.972410048201	372	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	186	878	10767	27135	FALSE	35	GAGCAGGACAAATGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLDQEEKAKFGEYCSSENAKGREWFARYVSAQRCNSKCVSEPTFYRLVQSFAVVLFECYQMDDFGPAKNLMTMCFTYYHIGKPHLLPSESKEKPVGSIDSYLKSANSWLAEKKDIAERLLKNTSVKTENMKGFFGGLETKLKGPLVKRNEEDDNKPKEKQQKTVTVYSPEEEKKGEKIYLYTHLKQQPIWHTLRFWNAAFFDAVHCERRKRSPTTREKWCHMTQEERDDSLRFNENIAFGQLGTFIHNMLAFGLNKKLCNDFLKKQAVIGNLDEEQYKLLSDHIEQMAIE	2375	28467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_2477_3414_3489_10756_10828_12614_12823_14041_14083_14645_14725_18990_19069_24144_24226_24854_24950_27085
907835	contig_2323_pilon	+	6547	4	Intergenic	novelGene_151838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	2732	3184	75750	76202	FALSE	60	TATTTTACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGQYKSDKGLISIIYMKIQHLYNKKTNHPIKKWAKEMNRCFTKEDIQTANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMKYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLKIDIPFDPAIPLLGIYPRELRVIT	27124	79565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_27665_70171_71689_74843_75248_75479
907836	contig_14415_pilon	-	2037	2	Intergenic	novelGene_77580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATATTTAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14274	7284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_7671_12623
907837	contig_8624_pilon	+	1874	2	Intergenic	novelGene_112573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1214	1555	1059289	1059630	TRUE	20	TGGGGAAGTAGACGCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLITPYAYESWTMSNEDLRRRRIDAFELWCWRRILNVPRTARRMNKSVLEEIQPEYSLEAKMMRLHLAYFGRVIRRNQSLEKDIMLGKVEGRQKRGRSSTRWTDTVAPTVG	1058075	1062116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_+_1059724_1061890
907838	contig_14441_pilon	-	1169	5	Intergenic	novelGene_100568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	811	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	169	381	126577	125875	TRUE	10	GCAGTGCTGGCTGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	126745	111196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111390_121195_121428_125511_125900_126157_126282_126513
907839	contig_4315_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_46829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCGGGGAACATCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371778	374086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_371800_374100
907840	contig_15092_pilon	-	1055	1	Intergenic	novelGene_57782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATGGAAAAAAAAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310218	309163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_309200_310200
907841	contig_9235_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_156232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	382	1149	157	1305	45805	46953	NA	35	GAAAGATCCCTTTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45648	48317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45600_48300
907844	contig_5894_pilon	+	3805	5	Intergenic	novelGene_83001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAAGTATAGACATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81099	270328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_81773_120992_121479_159675_159825_160018_160390_268202
907847	contig_5686_pilon	-	1335	5	Intergenic	novelGene_45461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAACAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250383	221439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_221883_222751_222914_224040_224201_241595_241799_250016
907848	contig_7045_pilon	-	3387	20	Intergenic	novelGene_77432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	24.6893160470234	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	19	2367	279183	230622	FALSE	85	AAAAGTAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAPVLETSHVFCCPNRVRGSLSWSPGPGGLLAFGTSCSVVLYDPQKRVVITNLNGHTARVNCIQWICKQDGSPSTELVSGGSDNHVIHWEIENNQLLKAVHLQGHEGPVYSVCAVYQRRASDVTLHTLIVSAASDSTVRIWSKKGSEVTCLQTLDFGNGFGLALSLSFLPNTDGRDLFLASCSQDCLIRIWRLYIKSTSLEIQDDDNIRLKENTFTIENESIKIEFAVTLETVLAGHENWVNAVHWQPSFYKDGVLQQPMKLLSASMDKTMILWAPDEESGVWLEQVRVGEVGGNTLGFYDCQFGDNGSMIIAHAFHGALHLWKQNAANPKEWTPEIVISGHFDGVQDLMWDPEGEFIITVGTDQTTRLFAPWKRKDQSQVTWHEIARPQIHGYDLKCLAMIHRFQFVSGADEKVLRVFSAPQNFVENFCTITGQSLNHILCNQESDLPEGATVPALGLSNKAVFQGDITPQPSDEEELLTSTGFEYHQMAFQPSVLTEPPTEDHLLQNTLWPEVQKLYGHGYEIFCVACNNSKTLLASACKAAKKEHAAIILWNTTSWKQVQNLVFHSLTVTQMAFSPNDKFLLAVSRDRTWSLWKRQDTVSPELEPVFSLFAFTNKVTAVHSRIIWSCDWSPDGKYFFTGSRDRKVVVWGECDSSDDSMEHSIGPCSSVLDVGGAVTAVSVCPVLNLSQRYVVAVGLECGRICLYSWKKTDQIPEINDWTRCVETSQSQSHTLAIKKLCWKNYNGRTEQNEAESTEWLHFASCGEDHTVKIYRVNRCAL	279201	229601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_230779_233777_233892_234417_234552_235994_236117_237758_237952_241137_241211_242171_242230_242377_242474_243839_243910_246433_246623_251145_251296_254076_254209_254418_254520_255616_255713_256874_257016_260770_260849_261668_261826_272262_272334_275191_275271_279045
907849	contig_15897_pilon	+	2609	5	Intergenic	novelGene_49512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	36.8951216287465	7	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTGACCCCCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156309	161655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_156994_158052_158119_158627_159871_160305_160452_161185
907850	contig_9177_pilon	-	2812	11	Intergenic	novelGene_32636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_2	38.5913202676457	56	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	245	1522	39805	37263	FALSE	45	AAAAAAAGAACCTCTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGQVHYRRYTRFFGKDGEAAPALSHYALCRYADWEEKISAWQSPILEDRSLPAWYKSALFNELYFLADGGTVWLEVPEDSLMEELEEGMRQLRPVLREYGRFGYLEGQEYRMYNTYDVHFYASFALVMLWPKLELSLQYDMALATLREDLTRRRYLMSGLIAPVKRRNVIPHDIGDPDDEPWLRVNAYVIHDTADWKDLNLKFVLQVYRDYCLTGDQGFLRDMWPVCLAVMESEMKFDKDNDGLIENGGYADQTYDGWVATGPSAYCGGLWLAAVAVMVQMATLCEAQDIQEKFSSILSRGKEAYERLLWNGRYYNYDSSSQPQSRSIMSDQCAGQWFLRACGLGEGDTEVFPTPHVVRALQTIFEFNVQAFAGGAMGAVNGMQPHGVPDTSSVQSDEVWVGVVYGLAATMIQEGLTSEGFRTAEGCYRTVWERLGLAFQTPEAYCQQQVFRSLAYMRPLSIWAMQLALQQQQCKKASRPVVEQNTGLNTGPKSGPKEAMANLSPE	40344	35972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_37542_37808_38001_38095_38212_38304_38448_38596_38704_38823_38976_39077_39186_39396_39502_39729_39903_40109_40236_40323
907851	contig_2069_pilon	+	3475	2	Intergenic	novelGene_23189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTGGAGGAAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71703	286822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_74724_286367
907852	contig_7396_pilon	+	2655	14	Intergenic	novelGene_79558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACTAAATGGACACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245197	255169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246467_247179_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249062_249736_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254699_255104
907853	contig_9345_pilon	-	3316	1	Intergenic	novelGene_24710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2707	3030	987245	986922	NA	20	TAAGACAGGCCCTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQGIWKKLLNYVNMLQAFDQDNMMEEIGGKIIHMARTLNLELDTTDVEQLIDHKEGGLTDQDLMDFEEERSAEEERNKKRKEKLSKIFTVKALAEVFSELNRALVA	989951	986635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_986600_990000
907854	contig_835_pilon	-	2056	6	Intergenic	novelGene_152128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAATTAAGAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381722	70840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_71095_88203_88305_164339_164559_320239_320435_321696_321828_380566
907855	contig_6102_pilon	-	1955	6	Intergenic	novelGene_32040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	180.883830123093	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	475	918	555780	553797	FALSE	35	TTCCATATTTAGTGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVENYVRVVGRSGESSELDLQGIRIDSDISGTLKFACESIVEEYEDELIEFFSREADNVKDKLCSKRTDLCDHALHISHDEL	556885	552759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_554538_555412_555529_555692_555806_556436
907856	contig_8386_pilon	+	1965	7	Intergenic	novelGene_82219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCCAAGTGACCCGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30194	46223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_31423_34573_34665_35174_35316_36096_36156_36676_36781_38376_38472_45976
907857	contig_16496_pilon	-	788	3	Intergenic	novelGene_5223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	311	430	1225	836	FALSE	35	TCAAAGTGGACAAATTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKKRKPFAVESIPTHSEDSLGGCNCHHETHQKYSIPR	3595	477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_942_1211_1354_3413
907858	contig_3155_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_26350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	725	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGCCTGAATGTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199307	197244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_197200_199300
907860	contig_14017_pilon	+	6252	2	Intergenic	novelGene_165680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	0	190	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	33	521	29686	34756	FALSE	30	TCCCAGCAATGTATGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKVSKPEHLLPSLKWQ	29653	40487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524
907861	contig_3627_pilon	+	3787	9	Intergenic	novelGene_78462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_6	274.054026379836	168	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	2667	3785	316044	330874	FALSE	40	ACAGGAATCAAAGGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSKKDERKDKKEERDDETDEPKPKRRKSGDDKDKKEDRDERKKEDKRKDDSKDDDETEEDNNQDEYDPMEAEEAEDEEDDRDEEEMNKRDDKRDVNRYCKERPSKDKEKEKTQMITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTV	313377	330876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_316050_318589_318776_320225_320418_323439_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842
907862	contig_14220_pilon	-	503	3	Intergenic	novelGene_159864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	307	junction_2	199.5	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	41	502	355422	325917	FALSE	20	TAATTTTTCCGATTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEEYLQAYGGQQGMQKQEDYVAEDKLDEITDSQVAPETEEGSMETLELQKEVKEESDEEDDDDEESGRLRFKTERKEGTIIRLSDVTRERRNIPETLELSAEAKAALLEFEERERQHKQGRYGSRRGGRRGGSLMCRGMGDQRRENSDRGRIKDHRPALLPTQPPVV	355462	325915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_326126_331917_332090_355341
907863	contig_10074_pilon	+	2311	15	Intergenic	novelGene_57123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_11	353.817180106868	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	29	1363	321058	356550	TRUE	30	GTACAGGGATCAGCTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKGRDDVYDRTLLDYFFSYHQFIHLLCRVAINCEKFTETLVKLSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAVSKTCIKLLWEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCASLISTLTTNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASASLNGKT	321029	359877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329877_330002_338513_338594_341265_341407_341507_341652_356541_356737_356964_357079_358110_358289_359407
907864	contig_7057_pilon	-	3041	3	Intergenic	novelGene_123437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	2	52	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	96	1292	1665702	1663001	FALSE	15	TTGCCTATTCTGGACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLVTFKDVAVDFTQEEWECLDSSQRHLHREVMLENFENLVSLGHLLSKPEMIFHFERLDDVWMEEEMPRSSCSGVRDEKDGTLPWQVSPGEKPYSCPHCGQDFCQHRNLLIHQQTHTGEKPSPYNRCGKAFSERTTDLNLPVLLPGEKPYQCVKCSRVFTSVSALGRHKKGHVGKKPHTCEECGKDFSCSSNLSIHQRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHRRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHQRIHTGEKPFRCCDCGKDFSRKAALQIHQSVHTGRKPHARKACDQGFTSRSALARHQQDHAGSNAYVCDTCGRGFGHRANLYLHQRVHSGERPFRCEACGKCFSWRKDLGIHQRVHTGERPYRCGACGRDFRHRSSLKRHERVHTGEKPYTCAVCGKGFSQRVHLQTHQRLHSKEKL	1665797	1661251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1664071_1664462_1664556_1665668
907865	contig_854_pilon	+	2172	10	Intergenic	novelGene_36664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2961.33631413794	1	79	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	620	1114	1712393	1714980	TRUE	25	CACCCCCCTTTTTTATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1699278	1716287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711649_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715304_1715552
907866	contig_10263_pilon	+	6171	11	Intergenic	novelGene_135838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_2	18.5407658957229	46	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	176	1060	866420	874310	TRUE	55	AAAAAAAAGGGAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIEEAVLGSRDSHPAGGGNSVLCFGQCQYTAEEYQAIQNALRQRLGPEYISSRMAGGGQKVCYIEGHRVINLANEMFGYNGWAHSVTQQNVDFVDLNNGKFYVGVCAFVKVQLKDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQGQISVERKSQCV	858826	880202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_866403_866504_867602_867705_868279_868374_868550_868619_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165_875392_875712_875926_876385
907867	contig_8866_pilon	+	5288	15	Intergenic	novelGene_77893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	103.325224610529	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	148	747	1081602	1091761	TRUE	40	AAAAAACGTGCTTCCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNVFTEVTVGPSVLNAARDDISKLRNTLRFLLGNVSGFNPETHSIPAKDMYVIDQYMLHLLQDFANKITESYKQYDFGRVVRLLQAFYTRELSNFYFSIIKDRLYCENEDDPKRRSCQTALVEILDVIVRSFAPILPHLAEEVFQHIPYAKEPKSVFRTGWINTSSIWKKPGLEEAVESACAMRDSFLGSIPGRNAAEYQVVIVIEPGLLFEIMEMLQTQETSSTSQLNELMMASETTLLSQERSSSI	1080900	1114025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1080970_1081523_1081656_1082453_1082561_1083473_1083620_1084070_1084262_1091619_1091701_1091740_1091765_1092905_1096523_1096721_1096881_1097926_1098150_1098414_1098504_1103847_1104067_1104286_1104365_1111858_1111958_1113971
907868	contig_8263_pilon	+	1435	7	Intergenic	novelGene_83096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	120.246506070747	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	313	1386	140133	192899	FALSE	80	AAACACGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGEDFRPGKSWEVINSKPDERTRLSHCIAESWMNFSIFLQEMSVFKQQSPGKFCLLVCSVCTFFTVLGSYIPGVILSYLLLLFAFLCPLFKCNDIGQKLYNKIKSVLLKLDFGIGEYINQKRRERSEADKEKSHKDDSELDFSALCPKISLTVAAKELSVSDTDVSEVSWTDNGTFNLSEGYTPQTDTSDDLDRPSEQEAFSQELSEFPSLENGMGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139820	192948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959_188098_188939_189005_189258_189386_192402
907869	contig_1535_pilon	-	1671	3	Intergenic	novelGene_127223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	511	junction_2	415	21	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCCAGCAGCCACTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45891	40616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40707_41658_41853_44504
907870	contig_7207_pilon	-	2543	9	Intergenic	novelGene_72069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	259.565472231959	16	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	1630	2541	696514	671657	FALSE	45	GAAAAGTAAGTATACCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKE	757918	671654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_716956_717963_737456_737530_737916_738105_757787
907871	contig_10126_pilon	+	4007	8	Intergenic	novelGene_105717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1657.52301058303	2	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	221	1096	162049	166639	TRUE	25	AACAATGACCCCTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139718	186770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139823_161932_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181575_184074
907872	contig_5718_pilon	+	4286	1	Intergenic	novelGene_110417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	271	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	937	1371	1445826	1446260	NA	55	AATAAAAAAGATTTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAVPFETKAAQLLVSLVSSPSASVSCGLLALGPHARICPAWASVPKLSSSTGKCPEAPYSTRRPSAHRHSAPSLRGLASLAPPISAQRHPTPPESLLLTDIQLSRSVGWLQRHLSPVSSFCCCWFSAAAASLLL	1444889	1449175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1444900_1449200
907873	contig_3787_pilon	-	3273	1	Intergenic	novelGene_102383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTTTACCATACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421334	418061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_418100_421300
907874	contig_8820_pilon	+	3142	3	Intergenic	novelGene_79303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	50	219	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	38	1747	241873	306395	FALSE	25	GATAATTTATGCTGGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEGGGKEMNEIKTQFTTREGLYKLLPHSEYSRPNRVPFNSQGSNPVRVSFVNLNDQSGNGDRLCFNVGRELYFYIYKGVRKAADLSKPIDKRIYKGTQPTCHDFNHLTATAESVSLLVGFSAGQVQLIDPIKKETSKLFNEERLIDKSRVTCVKWVPGSESLFLVAHSSGSMYLYNVEHTCGTTAPHYQLLKQGESFAVHTCKSKSTRNPLLKWTVGEGALNEFAFSPDGKFLACVSQDGFLRVFNFDSVELHGTMKSYFGGLLCVCWSPDGKYIVTGGEDDLVTVWSFVDCRVIARGHGHKSWVSVVAFDPYTTSVEESDPMEFSGSDEDFQDLLHFGRDRANSTQSRLSKRNSTDSRPVSVTYRFGSVGQDTQLCLWDLTEDILFPHQPLSRARTHTNVMNATSPPAGSNGNSVTTPGNSVPPPLPRSNSLPHSAVSNAGSKSSVMDGAIASGVSKFATLSLHDRKERHHEKDHKRNHSVGHISSKSSDRLNLVTKTKTDPAKTLGTPLCPRMEEVPLLEPLICKKIAHERLTVLIFLEDCIVTACQEGFICTWGRPGKGVSFNP	241835	307790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_242122_292797_292981_305117
907875	contig_3469_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_34237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCAGCATGTATCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640218	638239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_638200_640200
907876	contig_14047_pilon	+	2502	2	Intergenic	novelGene_176577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACCCTCAGGGGTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9878	50752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_9931_48302
907877	contig_12624_pilon	+	2054	3	Intergenic	novelGene_61092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTCCACCCAGATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895161	945441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_895171_895207_895402_943590
907878	contig_14687_pilon	-	3949	2	Intergenic	novelGene_107927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1239	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3090	3461	470153	469782	FALSE	80	TAAAAAAAAGCAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPAITTDCSDQDHNSGFWTELENYVEQNSNSQKKNRFTGLTDWRNPESMAPGHPFSSVMKPLLKFTVHLGTGQPHKTKGLMRHSSPGTRTRRQEGTGKLVIGTQG	473294	469293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_473077_473128
907879	contig_11702_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_141967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	717	1136	293413	293832	NA	65	GGGAAAAAAAAAAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGNRNTYPRLVGMQNGTATVENSVALPQKTENRTIKCPGHSTPRYIPQRLESRDSNRDLCTNVHCSTIHSSQKGETPSTPIHRRVDKQDVLHIYTEYYSASRRNEVLIHATAWMELGDIILSEISQSQKDKYCMTSLT	292696	294958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_292700_295000
907880	contig_10042_pilon	-	4834	2	Intergenic	novelGene_79251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3763	4134	1204454	1204083	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHPTAHPDACLDLLPPYLLHSLLPVTKSCLPVPYAQQKRAVPSPGSLLPLIASSFCTDPWVSKKLSSQLLDERLVVQTHLEVPWKTVLVICFGKVTALKTYGTVLFCTHGVTMSRNRLDSN	1208519	1203382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1207411_1207713
907881	contig_11138_pilon	+	4025	3	Intergenic	novelGene_178678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	162	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1964	2398	47868	48302	TRUE	15	CTGGGATTTTTTGAAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLSSVPLILSSTVSNLLLSPSRTSSISEILLFIFWISNCCFCMISTCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLCIFSSCLSAFCLSSWKIPSIRDLNSLTGTSSAFYSTGGSSGVLIWTPTETILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	1737	50470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11138_pilon_+_3417_47583_49350_49890
907882	contig_7707_pilon	+	3102	1	Intergenic	novelGene_72134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	132	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAGGAAATGGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88208	91310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_88200_91300
907883	contig_10093_pilon	+	694	4	Intergenic	novelGene_147505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	86.1561889180858	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTGCCTTTTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73161	98503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_73290_90936_91006_93068_93140_98077
907885	contig_610_pilon	+	4287	2	Intergenic	novelGene_76851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	598	junction_1	0	195	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	2309	2863	373231	373785	TRUE	40	ATTACTCTTTCAGTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERKERKSEMQPPKDQGKPLLRFPRPHLRKESEQVWILAAKQKMGVDMFLIYPEPTVSHSLYTMLPQGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKVTPFDQHIFPPPPTSRTIQYPA	370922	376638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_374155_375583
907886	contig_11594_pilon	-	2257	5	Intergenic	novelGene_80939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAGATACATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568798	561829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_563102_563558_563656_566671_566776_567338_567455_568130
907887	contig_9809_pilon	+	2825	12	Intergenic	novelGene_176757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_10	166.224631445444	42	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	101	2416	108357	117674	FALSE	25	GAGGTTATATGTTTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQKSLELREKQAEKEERQKTKKIETSAEKLRKLLKEEKRLKKKKRKSTSSSSSISSADESVSSSSSSSSSHKRRKKRKRNRSESSRSSKRHSSKASSSQIDQNRQDEYYPLPVNTSASFLNQKQEVEKLLEKQDRLPYQKTQVKDKDRYPLSSSSVEIPDDSGGRSEDPRDFYNSCKTQASSSKTEKPYKSERHFSNRRDSADSFCRSSEDKIKNYGYRRVDRDVEGRKEQSRRWEPGSGRYSASPASSEYSWKSLEKYKKCTYSGSRDFSKHEQRYQLNTNQGEYEREDSCGEDAKTEVPEEDGLSSKEQSESRVKKNLPQNLLNIFNQIAEFEKEKGNKPKNL	108256	118083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_114925_115880_115991_116752
907888	contig_7932_pilon	+	2879	1	Intergenic	novelGene_128430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	902	1288	217199	217585	NA	35	GTTCAAACCACCAACCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEGEKLSKYFTVKGLAGVFSKLYQGLQLLENMDLNTDCFAKVDRQIREAVSFHYEMHEEKKKRTMQITLTNFLTRNAIPIPKDKPDGPELSTSGVTTATNKMPMSSTLHHQGSKFLQFVYFYVCMY	216297	219176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7932_pilon_+_216300_219200
907889	contig_10882_pilon	-	3714	1	Intergenic	novelGene_172750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATCTCTGTCCTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24113	20399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_20400_24100
907890	contig_14814_pilon	-	2885	1	Intergenic	novelGene_137729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAATGGATGATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334377	331492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_331500_334400
907891	contig_9437_pilon	-	3235	1	Intergenic	novelGene_141748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCTGAACAATAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549560	546325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_546300_549600
907892	contig_7272_pilon	-	1427	11	Intergenic	novelGene_25365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	752.886339363386	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	474	899	610299	609217	TRUE	55	ATCGATTAAAAAAAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQVNMAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKLLKGI	633095	604478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604931_605073_606908_607028_609184_609235_609891_610302_616561_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
907893	contig_9705_pilon	-	3297	14	Intergenic	novelGene_41705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	806.560166246231	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	4	981	125597	108404	TRUE	60	TGAATAAAAATAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMRVFCQICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFILDHVFIEQDDDSNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYMKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSPTFSGIKELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKLLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAAEDQLCGVKNQNQLLENGKWLRACSSHSLKKVVVVIVCG	125600	97249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_97716_97762_99143_103788_103867_104931_105059_108048_108160_108249_108440_111276_111360_111402_111501_113489_113619_115153_115303_116984_117087_118624_118765_122724_122900_125531
907894	contig_5814_pilon	+	3298	1	Intergenic	novelGene_143051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2570	2896	321409	321735	NA	10	CTGAGCCTGGGCTCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYFVHQESSGQICVSVSLLNTIQNNCVWERRYTAESLPRVREGAATVLCRGQEIKYAPHLPPKMRQKIVSGFYHLGTVQLPDSNFFGPRLVKRGYQVEVGEAKRIW	318839	322137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_318800_322100
907895	contig_11815_pilon	-	3073	2	Intergenic	novelGene_50890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	683	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTAAAAATTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151526	98018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_98967_149401
907897	contig_15866_pilon	-	2593	21	Intergenic	novelGene_63604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	422319	422017	TRUE	70	AAAAAACAAACAAAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSPTWDFASRSPSCGLGGRSFICGLGGKSESWGLGGRSPSCGLGGSSPGLGGKSAIWGLGASSVGFGGRSPGGGFWGNSANWDDFWKISGGTLALSRER	422319	325797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_326014_327159_327248_336076_336153_337477_337565_345219_345320_351322_351394_368539_368628_371353_371403_374371_374534_376728_376863_378938_379033_381903_382089_382343_382429_386494_386613_386774_386841_388053_388168_389788_390016_402956_403129_411431_411501_414423_414483_421986
907898	contig_10982_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_87850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25735	27745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_25700_27700
907899	contig_20819_pilon	+	5440	1	Intergenic	novelGene_55645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCACTTTATCCTCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33261	38701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_33300_38700
907900	contig_408_pilon	-	2906	9	Intergenic	novelGene_84903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.76512915211	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	25	768	233759	133567	TRUE	10	GGTGAATCCTTTGTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSHVQIPVMLMPDDFKAYSKIKVDNHLFNKENMPSHFKFKEYCPMVFRNLRERFGIDDQDFQNSLTRSAPLPNDSQARSGARFHTSYDKRYVIKTITSEDVAEMHNILKKYHQYIVECHGITLLPQFLGMYRLNVDGVEIYVIVTRNVFSHRLSVYRKYDLKGSTVAREASDKEKAKELPTLKDNDFINEGQKIYIDDNNKKVFLEKLKKDVETRLGKKCTLWQLLTFLLIMMQKRKLPTPQKPLSMALVQRSQR	233783	131316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131625_131736_133592_136727_136832_147687_147802_167538_167578_181038_181186_209757_209911_232035_232133_233694
907901	contig_7963_pilon	+	3336	9	Intergenic	novelGene_58461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGGAGCCTGTGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118286	124042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118735_118954_119260_120105_120366_120488_121959_122054_122270_122349_122461_122993_123131_123406_123502_123747
907902	contig_6076_pilon	+	4820	3	Intergenic	novelGene_81771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGTCTCTCAAATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445654	489344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_447349_480724_483027_488520
907903	contig_5236_pilon	-	2911	14	Intergenic	novelGene_100955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	190.38764566353	788	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	69	2009	1011714	1006770	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKFSRTSLAQISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011782	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007944_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
907904	contig_17059_pilon	+	2138	6	Intergenic	novelGene_166085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	137.903734539714	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	314	1858	421631	429087	FALSE	60	GAAAGAAAAAAAATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLGLRDDIPFNFQKLEKEMDSVIIEDVAVLFSQEEWALLDLAQRRLYRDVMMETFRNLASVVSLHLNDGENLSSEHIMVRLMKNNTWSSMLGEISDSLGNKDHHKNQWRHVRSHTVQNHCESNEGNQCEKPFSQIPPKVNPFEFCECGKAFMDHSSHKHDARSHTGCNTRPCKECGEASSCSSHLTTPIRTLNGKKPHKCKVCGKYFICISTLRNPVTTLTGEKWYECNQCRKDFCSFSSFWIHMRGHKHECKECCKTYSPSSLILQKKIHNKDNPYKCKVCGKAFSCSSSLSTHMRTHTGERPYDCKECGKAFSQSSHLTEHMRTHSGERPYECMECGKAFMCSSHLTKHLKTHNGQRPYECKECGKAFSEASSLTRHIRTHSGVRPYKCKECGKAFSRSSSLTKHIRTHSGERPYVCKQCGKAFSCSSVLTNHIRIHSGERPYECKQCGKAFSQASALITHRRIHSGERPYECKECGKSFSRSSSLTRHIKTHSGGVMNVRNVGKSLVRP	419534	429367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_419664_421446_421694_425605_425733_426717_426869_427547_428485_428820
907905	contig_10386_pilon	+	2077	2	Intergenic	novelGene_173543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124895	129431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_+_125534_127992
907907	contig_10642_pilon	-	3938	2	Intergenic	novelGene_78666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	33	1313	173190	171910	TRUE	30	TATTGGTGTTCAGCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTSVCILLHGFSLSNLLHRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARATDSVLNGHRSKGLCDSAKKEDLPELAGQALSAGPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNGSGGVDKASPSESNAGGGSPSSGSGGNPSNTSGTTRRCAGPVGSVQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLRGGTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQAPAVGRIKFFSDHVSAPTAELERIKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRGPKEGLLCASSQASCCHVI	173222	169187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_170808_170904
907908	contig_12312_pilon	+	4366	20	Intergenic	novelGene_64002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	69.0430031798201	15	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1868	2671	506925	533697	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKVRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476950	535968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152_535634_535766
907909	contig_2703_pilon	-	4408	10	Intergenic	novelGene_101724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCAGGCACTCTCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599929	526191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526411_559432_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584591_594567_594672_596349_598662_598704
907911	contig_9594_pilon	-	3126	3	Intergenic	novelGene_73912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1673	2542	113553	112684	FALSE	60	AGGAAAGAAAAGAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHDDITIINIYAPNDRAPKYIKPTLTTLKIEIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILAHRAILKKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKIKEKQSATWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLDSNENENTSYQNLWDRAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQPK	115807	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_-_114421_114485_114870_115386
907912	contig_2892_pilon	-	1750	2	Intergenic	novelGene_119020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	7	junction_1	0	36	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCTGTCTTACGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276157	272199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_273175_275382
907913	contig_10095_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_57230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGTGTATTCTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187004	184266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_184300_187000
907914	contig_10930_pilon	-	1640	5	Intergenic	novelGene_37015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1836.06937505095	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	504	731	276835	268438	FALSE	30	CACTATTGAACCATTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSTY	279833	267528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268447_274217_274325_276723_277013_278443_278637_279700
907915	contig_18850_pilon	-	3154	1	Intergenic	novelGene_142443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGCAGAAACAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182429	179275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_179300_182400
907916	contig_8651_pilon	+	3663	14	Intergenic	novelGene_168169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	68.0536683445347	184	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	623	1456	161133	169918	FALSE	30	TCCAGGTGCAACTACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQALEEVRKQREELQQQAANLTAVIDEKEQGLQEKTEMVFQKEQEILQLKKGHECALLQMHQLQSELEALRSLRAEEPGAAAAPEDLQRLPDQEQEPVTLKAMKAPVFQLSAAEGTPNGEVGTMDLGQLQKEKQDLEQQLIEKNKIIKQMQQRMLELKKTLQKELKIRPDELFEVREKPGPEMSNLAPSVTNNADLTDAREINFEYLKHVVLKFMSCRESEAFHLIKAVSVLLNFSQEEENMLKETLEYKMSWFGSKPAPKGSIRPSISNPRIPWS	134936	172125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_134965_137183_137280_150980_151077_153059_153210_154276_154371_159412_159535_161096_161187_162015_162119_162222_162360_162811_162956_167797_167858_168455_168624_169186_169274_169837
907917	contig_12938_pilon	-	7243	3	Intergenic	novelGene_99706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	502	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAAGGAGAAGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86323	51945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52049_78102_83468_84548
907918	contig_5389_pilon	+	3999	4	Intergenic	novelGene_143021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	155.30042569878	238	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	47	1009	410753	425370	FALSE	35	CGAATTGAAAACTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVRGSVLFVSQDRGMKEVKSKSSGRRSKSPRSKRSRSPHHSAVKVKQEREDHPRKGREDRQHREPSEQEHRRARNSDRERHRVHSHQRRTSNERPGSGQAQGRDRDIQNLQAQEAEREFYNARRREHRQKNEVSGNDNDSQELVPRPGGNNKEKEVPVKEKPSFELSGALLEDTNTFRGVVIKYSEPPEARIPKKRWRLYPFKNDEVLPVMYIHRQSAYLLGRHRRIADIPIDHPSCSKQHAVFQYRLVEYTRADGTVGRRVKPYIIDLGSGNGTFLNNKRIEPQRYYELKEKDVLKFGFSSREYVLLHESSDTSEVDRKEDEDDEEEEEVSDS	410706	428360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_410765_413043_413131_423555_424155_425105
907919	contig_10985_pilon	-	1221	1	Intergenic	novelGene_175542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACAGCTCACACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15877	14656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_14700_15900
907920	contig_13421_pilon	-	4900	1	Intergenic	novelGene_166800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAATAGAGCTGCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146756	141856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_141900_146800
907922	contig_7291_pilon	-	2100	9	Intergenic	novelGene_106304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	317.036842299125	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTATCTTTACCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213309	172394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_173727_176384_176468_178180_178254_179492_179590_180125_180179_180619_180758_183797_183868_206194_206350_213210
907923	contig_9415_pilon	+	2149	11	Intergenic	novelGene_109832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	306.590753285222	131	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	126	776	1925966	1983904	TRUE	40	ACATACATATGTGAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQPPSAERPARSDPRQSLPNPSAPTSPGPGAAVLPAVLLVAMECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGHAKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKAQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNV	1925840	2001008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983979_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077
907924	contig_5605_pilon	+	1041	3	Intergenic	novelGene_143953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	6	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGCTTTTGAAGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466105	485394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_466402_472975_473133_484806
907925	contig_5372_pilon	-	4558	1	Intergenic	novelGene_149710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2561	2923	157556	157194	NA	60	AATAAAAGGCAATAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEEALKLALEGRAAKAKGGNDEELNRRLQRAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHLAFLKLTTAEEKIQASNCSTEGFYREFQFPYMHAKAGQGIRKTKEELMPVNYGVGEEYRICH	160116	155558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5372_pilon_-_155600_160100
907926	contig_14575_pilon	+	9091	45	Intergenic	novelGene_101867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_40	112.547352293443	355	227	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	3070	5361	72160	108581	TRUE	35	TATGTAGTAGCATTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTPKAKHKGKKKKPKDLKPMLVGSGTPSVIPSVKSETVTSGSKNKGSSHSSGPFAVPEHLRKDIEEFEAYYKKRQQRNNEYDSQNKKMGEANPKQKCSTLYDYFSQYLEDNGPLDIRHRVFNEYRFYPEETRQIVQKAGGLRQFLLRCPRFVVIDNCIALRKVSTRIKRKRKKKVIKEEVDEISSIDDEMYLPFFLSLHPDTREFTPESGSSSAPASEDVMPKPVSADSPNSACKDVKPELASGDFSRPVAADGEPKCVSSDSPQPVSEDANHTPVSSQSPKPASEDVKPTYWAQPCLVTGYYPYLPYQGFDITQSPPAYINMLSSMPQYAGIYTPLATISEYQLQGAIPVVPSFVAHDRPDPNAAAAFEGHHVNAENTSGNRIASETQILQGSLETSVKSHCGLGDADTALKESSRNDSHGGRSAKKGEGSRVRMRAVAAHPPTQMAAVQVSWDVAHQEVNTEPYERFEAEPGDISRMEKEYRKLQEKLENAYEKYEQTRFKGLAEIRDLEEKLKRNSERCQVSKTELEWFIQDLEKETKKWQQEKKETQEKVKALKKKVRRLSIASETCTQKNDEKDEEHGLHLDESLEIRNPFANEKAKLEERIKKSKENYEEVHERAVAAEVSVLTCWKDIHVWKLEVTKTQGEAYVECLKSRRSDHEPYLVDAVLYEWESYFASVEEELETIDSQLEDKVDEVKSGTWVSEITKVLSLPVFDKTYWPDRDWRNPESTAPGHLFSSVMKSLPRFTLQPKIRRAHRTK	17090	117727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_63867_64005_68967_69220_70559_70634_72115_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556_81605_83153_83220_85345_85496_91828_91969_96889_96959_98192_98290_105307_105409_107167_107256_107681_107772_108449_108645_109654_109822_111287_111566_113159_113278_113464_114813_115971
907927	contig_16846_pilon	-	1906	1	Intergenic	novelGene_82898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413582	411676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_411700_413600
907928	contig_8045_pilon	+	3272	10	Intergenic	novelGene_35443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	119.022354991213	54	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	367	1983	452026	462377	FALSE	35	TGACAAAATCTTTGCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	434941	463666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_438292_438463_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
907929	contig_8674_pilon	-	2720	6	Intergenic	novelGene_102896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	199.848342500007	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	56	661	158339	137996	FALSE	30	TTCATGAGAAACTATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITDIKPLPPNIKDRLIKIMSMQGRITDSNISEILHPEVQTLDLQSCDISDTALLHLCNCRKLKKLNLNSSKEDRISITSEGIKAVASSCLYLHEAFLKRCCNLTDEGVLALALNCRLLKVIDLGGCLGITDVSLHALGENCLFLQCVDFSATQVSDSGVIALVSGPCSKKLEQIHMGHCVNLTDEAVEAVLTCCPQICIFLFHGCPLITVFLSGKNGVL	158394	135936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_138028_140502_140615_148677_148735_149048_149267_154628_154774_158297
907930	contig_2419_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_137139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACTGAAAGAAAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189685	191921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_189700_191900
907931	contig_14357_pilon	-	4941	16	Intergenic	novelGene_121651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.210093484152	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1101	3306	188	3493	589649	454808	TRUE	25	AAGTTACAGAGTGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPALTDAAAEAHHIRFKLAPPSSTLSPGSAENNGNANILIAANGTKRKSIAAEDPSLDFRNNPTKEDLGKLQPLVASYLCSDVTSVPSKESLKLQGVFSKQTVLKSHPLLSQSYELRAELLGRQPVLEFSLENLRTMNTSGQTALPQPPVNGLAKKLTKSSTHSDHDNSTSLNGGKRALTSSALQGGEVGGSESGDLKGGMTNCTLPHRSLDVEHTTIYSNNSTANKSSVNSMEQPALQGSSRLSPGIDSSSDFGGVKLEGKKPPLSSILFSALDSDTRITALLRRQADIESRARRLQKRLQVVQAKQVERHIQHQLGGFLEKTLSKLPNLESLRPRSQLMLTRKAEAALRKAASETTASEGLSNFLKSDSISEELERFTASGIANLRCSEQAFDSDVTDSSSGGESDIEEEELTRADPEQRHVPLRRRSEWKWAADRAAIVSRWNWLQAHVSDLEYRIRQQTDIYKQIRANKGLIVLGEAPSPEQTTDFLLPLSSEVKTDHGTDKLVESVSQPLENHGASVIGHPSESLSTKSCGTLRPVNGVINTLQPVLADHIPGDGSDAEEQLHKKQRLNLISSSLDGTCVAARTRPVLSCKKRRLVRPNSIIPLSKKVHRNSTVRSGCDVNPSCALCGSGSVSTMPPEIHYEAPLLERLSQLDSCVHPVLAFPDDVPTSLHFQSMLKSQWQNKPFDKIKPPKKFSLKHRAPMPGSLPDPTRKDRHKLVNSFLTTAKLSYHQIRPDRTHRQHLDDVGAVPMVERVTAPKAERLLNPPPPVHDPNHSKMRLRDHSSERSEVLKHHTDMSSSSYLAAAQHPPHSPLVRQLSTSSDTSAPTSSSSQVTAGTSQPIRRRRGESSFDINNIVIPMSVAATTRVEKLQYKEILTPSWREVDLQSLKGSPDEENEEIEDLSDAAFAALHAKCEEMERARWLWTTSVPPQRRGSRSYRSSDGRTTPQLGSANPSTPQPASPDVSSSHSLSEFSHSQSPRSPISPELHSAPLTPVARDTLRHLASEDTRCSTPELGLDEQSVQPWERRTFPLAYSPQAECEDLLDAQERAARCTRRTSGSKTGRETEVAPTSPPVVPLKSRHLVATVTAQRPTHR	608873	453270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_453726_453814_455036_455317_455571_456379_456493_456691_456750_457400_457523_461010_461160_461503_461693_462177_462361_468377_468550_487291_487488_488234_488354_494961_495064_508525_508668_588369_589742_608778
907932	contig_18511_pilon	+	1126	4	Intergenic	novelGene_126892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	811	junction_3	166.517933635456	11	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	219	488	59795	61308	FALSE	30	ATTGTGATCCCAGTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	57044	61946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_57119_59151_59255_59753_59948_61191
907933	contig_3018_pilon	-	3955	1	Intergenic	novelGene_78929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCAGAACTGCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642523	638568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_638600_642500
907934	contig_9423_pilon	-	2152	2	Intergenic	novelGene_99162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTCCTCCAGTTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4069	1832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_-_2393_2477
907935	contig_6684_pilon	-	947	1	Intergenic	novelGene_168593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAATTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88339	87392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_87400_88300
907936	contig_5423_pilon	+	1104	2	Intergenic	novelGene_85295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCAAGATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583596	586451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_583954_585704
907937	contig_12379_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_148928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	273	572	89632	89333	NA	15	GTCTATCAGTGCCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLHQTESSTTRWCPATTTDCSDRDNNRGSWTELEKNVEQNSNSEKKDQTYWPEKAWRNPESMAPGHPFSSVMKSLLRFTLWPKIRQPHKTKQD	89904	88405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_88400_89900
907938	contig_34_pilon	-	2999	6	Intergenic	novelGene_40031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1927.33913985059	4	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	219	662	243257	224546	TRUE	30	GTAGAGGCTTATATATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTSTAPIWNLKYDLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	247092	216242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_216250_222169_224052_224097_224818_230228_230358_243214_243354_246970
907939	contig_14167_pilon	-	2584	3	Intergenic	novelGene_105526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	84.5	65	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1692	2033	22677	22336	TRUE	5	GAGGCTTGGTCGGTCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSHSGRPFFLPIWNDFQGLPQTWWSVPKAGLRYELWLLSWPVLVRPTIHGPICLCELCLVSMLAPKTARTLCAMPGSRVAEQLSQSAAADKGPERACFGGTTQWPHGDLTQA	26732	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_22035_22173_24343_26706
907940	contig_1575_pilon	-	3390	1	Intergenic	novelGene_45163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1250	1693	70659	70216	NA	25	TTTTAACCCTGGAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPFSMNLYIFSSFLSVFCFNSWIILNIGDSNSLSVRSSAFSSTGWSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQYLFSSFIDCRFVCFVLVFLFYLVMSEQAGCAFFVCSSVGTILFTSFSNGQCQSLRYGTAGQVQLKGSY	71908	68518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_68500_71900
907941	contig_15491_pilon	-	3783	1	Intergenic	novelGene_75967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	71	328	46982	46725	NA	70	AACAAGAAAGAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGNFSFFLQYFQHHHLKHLSEENLRLVICRTFINMLFNVRFSEVTEDHSNTS	47052	43269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_43300_47100
907942	contig_14727_pilon	+	3105	1	Intergenic	novelGene_56641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATGATATTAGACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255830	258935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_255800_258900
907943	contig_16846_pilon	+	4714	15	Intergenic	novelGene_82867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	432.896367859702	743	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1001	1795	211075	228852	FALSE	30	AATTTTAGGCAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQDGDVIAPLITPRKQQWNCPDLAQSSTHHQEAPKPRVRLFKD	179095	231771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201286_205360_205461_206637_206739_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_224514_224620_225189_225328_228726
907944	contig_11338_pilon	+	3995	16	Intergenic	novelGene_6148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_6	446.334025391547	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	447	2141	6086	11749	FALSE	45	ATCAAAAGCTGAATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	744	13603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
907945	contig_8057_pilon	-	3580	1	Intergenic	novelGene_176647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAAGTGTCTGTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314370	310790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_310800_314400
907946	contig_11851_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_146547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGATTTATTAACTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16178	18349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_16200_18300
907947	contig_7527_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_139580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAGAGATGTAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119405	117619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_-_117600_119400
907948	contig_6102_pilon	-	2718	6	Intergenic	novelGene_32235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	15.9824904192056	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1028	1561	916882	910606	FALSE	35	GCAAAATTCATCAGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFLNDPSPMHDELQQGFQKCHSSLQRWEHLKEVTSRCQSNVKNDKCGPWLEWEIMLQYCFPRLDINVSKGINHLLKSPFSVHPKTGRISVPIDLQKVDQFDPFAVPTISSICHELDLISTNEEENEAESDVKRRTRDYKKTSLAPYVKVFEQFLEKLDESRKGELLKKSDLQKDF	917909	909448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_910626_912576_912676_914069_914153_914802_914873_916454_916597_916762
907949	contig_6102_pilon	+	2339	1	Intergenic	novelGene_31765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCATGTTAAGTGTCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296182	298521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_296200_298500
907950	contig_11815_pilon	-	3901	3	Intergenic	novelGene_50951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	565	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1087	1452	501134	500769	TRUE	20	CAGGTAGCTGTCTTCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFWGIQ	502220	471506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_471861_497682_499138_500128
907951	contig_18303_pilon	-	2934	1	Intergenic	novelGene_146811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTCAGAAAATATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75228	72294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_72300_75200
907952	contig_8812_pilon	+	4938	3	Intergenic	novelGene_57262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	137	junction_1	47	481	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	4336	4827	25180	25671	FALSE	5	TTTGTATTTGGTGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRKEREEEASEIEAVSVAMEKEFELLDKVKGKTQKRSVANKLKDSSSLKRKRLSDSKRENERGGFLGEAYLSESSDAYSGEDAESLSLINIRRGKAAKESKISPSDLQNTVKHSHVKDEGETTSSSSDDDEEKTKVVLVTARSVFGKKKRKLRNAGGRKRKT	18712	25782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_22864_23482_23568_25080
907953	contig_5862_pilon	+	5402	2	Intergenic	novelGene_54956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	156	145	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	4609	5049	330293	330733	FALSE	55	AAGGGAAGCGCCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPIQETPQRKSPRYIIITLGKTKDKQRTLRAGQEKQKVTYREETIRLSSDNSTETMKARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYLAKLSFKYDDEIRTFPDKQKLRENEKNQTKLTRIIKGAFDLRTNNFSSQAESRCRIIPARYQSRK	189527	331086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_+_192912_329068
907954	contig_10042_pilon	+	1355	3	Intergenic	novelGene_79088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	192.5	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6311	43745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_42598
907955	contig_14566_pilon	-	3947	1	Intergenic	novelGene_148844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102226	98279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_98300_102200
907957	contig_6496_pilon	-	2010	6	Intergenic	novelGene_103477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.0773587805384	239	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	59	496	285171	248786	TRUE	30	TCTTATAATGGATTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPSDKAVKYYTLDEIKKHNHAKSTWVILHHKVYDVTKFLDEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDAREMSKAYIIGELHPDDRSKLAKPSVSVFQESLITTIDSNSRFKLPQSIGVLVHPLPSGSTSTNFPESFFLNRN	285229	246330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247790_248730_248886_249540_249585_263142_263179_264936_265066_285042
907958	contig_385_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_177047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	110	457	261055	261402	NA	25	TATTTTCAACAGGACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPGDAGCVASGEVMELVRATGYADRPGAKMRVRNSGMVMRRQTADGAETGVETEKRVQAKPWALAAARFEADSMAETEEGLGAKSGPDVKAEVLSGPQSGGGLEAKAKLFSAH	260945	263479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_385_pilon_+_260900_263500
907959	contig_6958_pilon	+	3281	1	Intergenic	novelGene_69950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	362	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGCAAAACGTATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166587	169868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_166600_169900
907960	contig_9471_pilon	+	4888	1	Intergenic	novelGene_21846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	133	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1681	2040	423764	424123	NA	45	AGTAAGGGCATTTATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRQQSISNHTKRKSMMASASSQNKESRNFPEEAEYKRLIHITSRNRKKIKQNAEHAINVIKKIREEHNDKFNRPQESIERQQSEIQKIDNKISESDNSIESYRRRIEAMEVRISETR	422083	426971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_422100_427000
907961	contig_3601_pilon	+	983	2	Intergenic	novelGene_132983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	91	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAAGTTTTAGAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194657	1204563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1194849_1203771
907962	contig_14871_pilon	+	1747	10	Intergenic	novelGene_63709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	684.290729492323	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	43	1320	201945	233293	FALSE	65	GCAAAAAAAAAGAATTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSATLTSCEPRPREMADTANGEPPASPMELFNSIAAQGEIVRALKAEKASKDEVDAAVEMLSSLKASYRSAVGEDYKADCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQHSP	201902	233720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_202056_213480_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233281
907963	contig_4125_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_25039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	393	770	174134	174511	NA	20	ACTACTCCTCTCAGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAILHHNCQTPENHGPAKLTYNVNDHRRGVLGTPPIWDKLIPRWELPIPMPPQSWTSLSLWTVGAPHSGAPNLGQARPLDCQLLVLVPLNLGQAHPPGPWVSPIQCPPTWDKFLPLDHGSSLNE	173741	174622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_173700_174600
907964	contig_12677_pilon	-	458	1	Intergenic	novelGene_110880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGACAACACCTAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3418	2960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3000_3400
907965	contig_14441_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_100782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	274	717	125667	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCTHAIHTHTYTHTRTRAHTRGLCLPQSPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125393	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126496
907966	contig_57_pilon	+	2839	23	Intergenic	novelGene_44893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	225.12171638934	1	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1857	981	2837	100667	129542	FALSE	65	AGAAAAAGAAAAAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKD	66868	129544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82179_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
907967	contig_11896_pilon	+	3101	1	Intergenic	novelGene_88030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACTTGAGCTGTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155858	158959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_155900_159000
907968	contig_4315_pilon	-	3403	2	Intergenic	novelGene_46872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	0	211	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCCCCAGCAAGCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881037	867487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_870405_880551
907969	contig_9272_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_125938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420546	418074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_418100_420500
907970	contig_8674_pilon	+	4494	1	Intergenic	novelGene_102914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGATCTCTCACTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191985	196479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_192000_196500
907971	contig_9939_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_158603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCTCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339339	337175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_337200_339300
907972	contig_5602_pilon	-	2283	2	Intergenic	novelGene_133051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	42	302	868855	868595	FALSE	40	AAAATCCTTGTGACTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGATSGVSGRTSVMFVVPQPVVQNTKPPVVSPNGTRLSPIAPAPGFSPSTAKVTPQMDSLRIRSHICSHPGCGKTYFKSSHLKAHMRTHTGTNLFLFMS	873238	866613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_868859_873200
907973	contig_6102_pilon	-	4608	11	Intergenic	novelGene_32091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_10	121.720335195069	128	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	3508	4608	795596	791050	FALSE	50	GTCAAGAGGGAAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEKLKEK	809022	791049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_791098_791584_791651_791969_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_796446_797091_797278_798168_800495_808876
907974	contig_11548_pilon	+	1335	6	Intergenic	novelGene_66782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1352.34099250152	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	17	607	112832	119638	TRUE	15	CATTACGCTGTTCATTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112815	120479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491_119760_119872
907975	contig_7408_pilon	-	3033	6	Intergenic	novelGene_168729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_5	151.814360322072	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	1104	2183	38514	12597	FALSE	25	GTTCTGAGTGTACTAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48334	11746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47312
907976	scaffold_12124_pilon	+	2451	11	Intergenic	novelGene_22092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	205.410418431004	33	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	857	1333	879089	889101	FALSE	5	GTCCCCCCCGCACCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRFSVVQKIFPPVPGIRDPIKDFFHNNRLVDWEAGAEGWQECSVEEVQAVGET	860112	890219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860365_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026
907977	contig_15092_pilon	+	3454	1	Intergenic	novelGene_57765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTTTATCTGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272588	276042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_272600_276000
907978	contig_5092_pilon	-	2372	5	Intergenic	novelGene_62267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	569.066944655899	7	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATTGTTGCTTCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252589	232277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_232668_239950_240038_247335_247406_248480_248541_250824
907980	contig_8671_pilon	+	2528	2	Intergenic	novelGene_126259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	87	junction_1	0	82	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	216	1406	499677	500867	TRUE	15	TTTTGGTCGTTAGTCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVTNNSGILGVQRSNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIGPQPPNILNNSGILALQPPSVSSSSGLLGVLPPNMPNSAGLVGIQPPNVPNTSGLMGTQPPAGPQNLPPLSISSQRMPAMPMLDIRPGLMPQAPGPRFPLMQPGIPPHRGLPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSHPERPFLAPGRQGVDSVPNPEKRLPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISMPPPVDVRDVVGRPVDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDMRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKHWGHRGDFDEREHRVLPVFGGPKGLHEERGRFRPGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREINGNRLGRDRIPNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPLQVQNDPELYEKLASSSEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT	499461	570166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_500882_569058
907981	contig_9161_pilon	-	698	3	Intergenic	novelGene_160644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	45	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCTGTTAAAACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94072	79684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_79929_83051_83346_93912
907982	contig_8850_pilon	+	3453	5	Intergenic	novelGene_172433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2612	2977	287645	288010	FALSE	35	GCACAGAATCTTCGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCARKQLEIIQFQMTLLDTHLQIHHSALCVLLNPSFCPVPPCLAQHSCCWKSNGVVSPSAPAADNSATIFICKALDTFPSLWVVQTVKHSTTSGKAGSSNPPRAISGDKPVDTQKGSKQD	59058	288486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_59953_76200_76335_85653_86048_90593_90600_286461
907983	contig_10990_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_7415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCCTTCACCTGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564278	562793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_562800_564300
907984	contig_20614_pilon	-	2911	2	Intergenic	novelGene_107580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAAGCCAGGTTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291201	257290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_259979_290978
907985	contig_3956_pilon	+	2732	9	Intergenic	novelGene_14981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1136.37894620369	22	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	287	1678	1286130	1289956	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1286122_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
907986	contig_833_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_176487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAGAGAAAATGATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600554	602538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_+_600600_602500
907987	contig_7730_pilon	-	3195	3	Intergenic	novelGene_156278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAGAGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430994	296365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_296678_348705_348821_428226
907988	contig_11088_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_85046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	73	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
907990	contig_19132_pilon	-	1303	2	Intergenic	novelGene_169984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATCCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293781	280633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_-_281772_293616
907992	contig_11034_pilon	-	2582	18	Intergenic	novelGene_175019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	34.3724763150356	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	879	2243	152071	138985	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFSELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTTKKDKKDERRRKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDDDTDDEPQSSHPGKKKPEITFMFQDEVEDFLRKRIQDAPEGFISELAEYLIKPLNKNYLEVVRSVFLSSTSATGTGRKRTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGTKFFADDTQAALTKHLLKTVCTDITNLIFNFLASDLMMAVDDPAAITNEVRKKILSKLSEETKAALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSAAEACDIMVKKGDKKRERQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFLTHSMLHAPGRCVPQIIAFLNSKIPEDQHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGDDPLSDELGKEQEDITNTTRKELQELSSSIKDLVLKSRKSSVTEE	171124	138645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139204_139835_140017_140824_140911_141256_141338_142543_142675_142753_142918_144261_144380_147253_147377_149780_149902_151930_152111_153304_153493_158980_159029_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511_169658_171040
907993	contig_5769_pilon	-	1852	2	Intergenic	novelGene_138768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTCTTTTGATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254504	250608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_251822_253865
907994	contig_12340_pilon	+	2399	2	Intergenic	novelGene_122112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81755	93148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_81928_90921
907995	contig_6980_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_36054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGGAGTTGATTTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351189	349338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_349300_351200
907996	contig_1076_pilon	+	3073	4	Intergenic	novelGene_101119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	487	789	657759	953594	TRUE	55	TATCTGCAATACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALERRASKAKGRNDEVKELKRRFQRAAREDGVKYYNDTCKDLEIENQKGRTRSAFLKLKELKKKFKPQVAIVKDSTEKILTQETSKEDGRNI	563953	974685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_564009_657327_658044_953576_954978_973784
907997	scaffold_880_pilon	+	2752	4	Intergenic	novelGene_121497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGGACAGAGAAACAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538914	717301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_541035_563178_563692_632677_632751_717255
907998	contig_7979_pilon	-	2659	17	Intergenic	novelGene_125542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_12	116.370367791805	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	323	2443	1104746	1048799	FALSE	45	CACTAGAAACACATGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSRSWSKERLRDRDRDRSRTRSRSRTRSRERDLVKPKYDLDRTDPLENNYTPVSSVPSISSSHYPVPTLSSTITVIAPTHHGNNTTESWSEFHEDQVDHNSYVRPPMPKKRCRDYDEKGFCMRGDMCPFDHGSDPVVVEDVNLPGMLPFPAQPPVVEGPPPPGLPPPPPILTPPPVNLRPPVPPPGPLPPSLPPVTDDISYSLVLTGPPPPLPPLQPSGMDAPPNSATSSVPTVVTTGIHHQPPPAPPSLFTADTYDTDGYNPEAPSITNTSRPMYRHRVHAQRPNLIGLTSGDMDLPPRAEKPPNKSSMRIVVDSESRKRTIGSGEPGIPTKKTWFDKPNFNRTNSPGFQKKVQFGNENTKLELRKVPPELNNISKLNEHFSRFGTLVNLQVAYNGDPEGALIQFATYEEAKKAISSTEAVLNNRFIKVYWHREGTTQQLQTASPKVMQPLVQQPILPVVKQSVKERLGPVPSSHTEPAEAQSASSDLPQVLSTSTGLTKTVYNPAALKAAQKALLVSTSAVDNNEAQKKKQEALKLQQDVRKRKQEILEKHIETQKMLISKLEKNKAMKSEDKAEIMKTLEVLTKNITKLKDEVKAASPGRCLPKSIKTKTQMQKELLDTELDLYKKMQAGEEVTELRRKYTELQLEAAKRGILSSGRGRGIHSRGRGAAHGRGRGRGRGRGVPGHAVVDHRPRALEISAFTESDREDLLPHFAQYGEIEDCQIDDSSLHAVITFKTRAEAEAAAVHGARFKGQDLKLAWNKPVTSISAVETEEAEPDEEEFQEESLVDDSLLQDDDEEEEDNESRSWRR	1107409	1048582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1048889_1050534_1050649_1061526_1061614_1065029_1065231_1077636_1077742_1078315_1078484_1080366_1080442_1080767_1080894_1089707_1089840_1090379_1090545_1095872_1096033_1097020_1097136_1102867_1103009_1103395_1103567_1103979_1104220_1104715_1104977_1107317
907999	contig_16121_pilon	+	3671	1	Intergenic	novelGene_6881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	584	1075	57746	58237	NA	25	GAGAGAATTCCGATTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQVKLNDKFTLNL	57162	60833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_57200_60800
908000	contig_11563_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_142301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCAGTGTTTAACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108180	107043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_-_107000_108200
908001	contig_7593_pilon	+	1409	4	Intergenic	novelGene_127279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.8158185969358	102	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43577	111313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_43689_50348_50494_51977_52124_110306
908002	contig_8729_pilon	+	3834	1	Intergenic	novelGene_40139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	2458	2874	659298	659714	NA	65	AGACCAAGGAAGAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTRPEIRKKIKENADKTKEKVDKMMENIAKIKENIEKAIEEFRKIIQEQNVTINEQSETIQKQQLEIQKINNKISEKDNSIGFRSKFETMEDRISEIEDKSMASTLFEEKSEKNEENLRITWDTIKSKNFLIGVPE	656840	660674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_656800_660700
908003	contig_7165_pilon	+	2629	7	Intergenic	novelGene_116906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	40.7202515818467	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	106	2124	1198317	1228955	FALSE	15	ACCTCTGAGGGGGTGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRLLLRVWPRGLAVGPGAPCRPLSARSGPSQYLQSSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLDDGHFRKTEQFCKSFENGSGKELHEQLVAQDKKNKHTSYISGPWFDMYLAARDSIVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTFRAGLLEPEVFHLNPAKSDTDTFKRLIRLVPPSLSWYGAYLVSAYPLDMSQYFRLFNSTRIPKPGRDELFTDDKARHLLVLRKGHFYVFDILDKDGNIVSASEIKAHLKYILSDNSPAPEFPLTYLTSENRDIWAELRQKLVSDSNAETLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGTAAVHFEHAWGDGVAVLRLFNEVFQDSTQNPAVTPQSRPATTDSSVAVQKLSFKLSDALKTGITTAKRKFDETMETLTIDCIQFQRGGKEFLKKQKLSPDSVAQLAFQMAFLRQYGKTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASIFTMRCSEAFVREPSKHSAGELQQLMAECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRYLAAAKGIPLPELYLDPAYGKINHNILSTSTLSSPAVNLGGFAPVVPDGFGIGYIPRCGIAESCGHRFPRRHTYLRLEINWFETPAFKLYYRLELFTVFSLEGKRVEAVGPS	1198211	1229460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1210507_1210589_1211668_1211776_1216675_1217981_1220614_1220808_1222375_1222411_1228809
908004	contig_7171_pilon	-	1180	2	Intergenic	novelGene_101374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTTGACACACATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361001	1359462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1360465_1360823
908005	contig_10855_pilon	-	1921	3	Intergenic	novelGene_124338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACGTAAGAGGCATTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546871	542979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_543068_544100_545488_546425
908006	contig_17936_pilon	+	4501	10	Intergenic	novelGene_29944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	722.519203897031	108	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	3110	4084	54277	118660	TRUE	10	CCCAGTTCTGTTCCCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPVAIQGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSCMRSLTD	51167	125972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_54301_68275_68391_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_118635_118827_121017_121063_125766
908007	contig_10990_pilon	-	4363	19	Intergenic	novelGene_7458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	934	1356	744373	743951	TRUE	45	ACCAGCAGAAATCCAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	752160	708563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_708669_709186_709395_714556_715994_722232_722431_723510_723633_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_743881_744386_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
908008	contig_14773_pilon	-	2695	2	Intergenic	novelGene_174761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	10	342	17792	16904	FALSE	30	AATAAAAGTCTCCCTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALMAMDGYRGFLGLLVSALLVGFLSVIFTRRLKSPPVERSAPSRARKQSLGEAFRCSCFQGCKATGKNAGTRVIALSCNILRFALCEGAGQSVPGVSEASATVFTPPEALNC	17801	14550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_-_17155_17710
908009	contig_19132_pilon	+	6097	6	Intergenic	novelGene_169987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	573	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4146	4535	328835	329224	FALSE	25	CCGGTTCCTGTAGACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGPACQQAASGPCLALRADCPLVAMKNFVGSCSYQMLSHQCLTHLMTLCFQKAHWASDPEVVPGSWKASPCWVGMAPSRACRQTGGLEMRRVTVRRRKMTLTVSHPLAQKHSLAEPTGASVDGRDPF	308203	330786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_310668_316392_317289_318309_318411_323453_323623_327346_327514_328486
908010	contig_13403_pilon	+	1276	2	Intergenic	novelGene_158099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGTTAAGTAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94678	96000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_95080_95125
908011	contig_16703_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_72763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAAAAAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17947	15690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_15700_17900
908012	contig_3975_pilon	-	1540	9	Intergenic	novelGene_54840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	215.61641287249	17	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	228	1079	2065927	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRCETHWSPTRVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079250	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064179_2065888_2065941_2066196_2066307_2079146
908013	contig_17144_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_29494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCACAGCGGAGGTAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166078	166559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166100_166600
908014	contig_9515_pilon	-	2215	6	Intergenic	novelGene_73834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.9751143988641	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	310	333	95790	95767	TRUE	40	GAAGTCAGAATTAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFCLQRPWKLEEPVSRDSACAHHSCGPLSLAQRPASWWELLLSTRTVPVCGLEGKLIKASKPGTLSIASNFLPRKEFSQLFEGLGLLPSGTSSSVLQSSTRVSMRKGTWS	96099	74235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_75622_78356_78510_79453_79531_91824_91956_95358_95482_95754
908015	contig_11096_pilon	+	3237	7	Intergenic	novelGene_143484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	150	junction_3	46.7240718354992	197	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	238	981	275201	296279	FALSE	15	ATATTCTTTTGGTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPTVVEEYTKREEEIEQLTEELKRKKVELDKYRENISQVKERWLNPLKELVEKINEKFSSFFSSMQCAGEVDLHTDNEDDYDKYGIRIRVKFRDTTQLHELTPYHQSGGERSVSTMLYLMALQELNRCPFRVVDEINQGMDPINERRVFEMVVKTACKENTSQYFFITPKLLQNLPYSEKMTILFVYNGPHMLEPNRWNLKAFQRRRRRITVTQPSQ	274963	298535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_275204_275631_275728_276192_276298_276520_276641_294619_294800_294880_294977_296135
908016	contig_10990_pilon	-	4605	2	Intergenic	novelGene_7430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGATTCAACCAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684706	679548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_682961_683513
908017	contig_20889_pilon	-	3315	1	Intergenic	novelGene_127650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTTCACCACTGACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48979	45664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_45700_49000
908018	contig_6898_pilon	+	2642	3	Intergenic	novelGene_35771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1755.5	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	252	635	124789	125646	FALSE	20	TATGCTGACCCTATGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124369	127653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124503_124670_125008_125481
908019	contig_13633_pilon	+	1862	14	Intergenic	novelGene_15309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	441.561310049402	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	52	1518	20259	49142	FALSE	15	GAACTCTGCCTTTCGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLAGDPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQISTESFPSYPVFSPVSWDYSSEPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5027	49486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_24111_24178_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
908020	contig_2311_pilon	-	1576	1	Intergenic	novelGene_169816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	548	1003	275062	274607	NA	65	GAAATGAAAAAAAATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSAIEELRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIRIPEQWEKTENTERITEELLAENFPNIMKDEKLIQEAQRTLYRIDPKRKSPRRVIITLAKTKDKQRILSTAQEKQKVIYRGETIRLSSD	275609	274033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_274000_275600
908021	contig_13428_pilon	+	4319	5	Intergenic	novelGene_143431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	429.799080966909	11	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2891	3190	51740	52039	FALSE	55	AAAAAAATTAATCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRKLFSVVECQQEGVPGYINQKGRVSEEGARSRMLCVLQSAFRWSYPAVLSSATIFLNREWPNPVLLKQPEECNLNLPVWDPRVSVLFFPLQIHIMQ	40733	53168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_+_40908_45011_45073_46681_46792_47241_47296_49248
908022	contig_9011_pilon	+	3754	1	Intergenic	novelGene_159298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTGATTTCATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427471	431225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_427500_431200
908023	contig_2114_pilon	+	2088	1	Intergenic	novelGene_104232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACATTTTTTTAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137824	139912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_137800_139900
908024	contig_12638_pilon	+	4385	17	Intergenic	novelGene_33093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_11	643.556497009975	5	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	2245	2973	182987	194329	TRUE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAGKNRQIVL	170781	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_171972_173560_178085_178281_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194303_194442_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
908025	contig_11512_pilon	-	5088	6	Intergenic	novelGene_43306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_3	358.905558608389	15	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	132	638	396169	374504	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSGKQQPAR	409405	370053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108_396210_409314
908026	contig_1867_pilon	+	2842	1	Intergenic	novelGene_54619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGTGAGCAAAAGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556110	558952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_556100_559000
908027	contig_13780_pilon	-	3311	2	Intergenic	novelGene_149091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1315	1614	682943	682644	FALSE	60	GCAAAAGATCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSALLGQVFQTSVVPAMVSAWRHPTPPGSLLCTGTQLSLCGSAPVLSSAELLVLPLLVLCCCPFTAAADSLPLLVLCCCRTSIHSQLQNYFHILGIC	728922	680946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_684085_728749
908028	contig_10667_pilon	-	2311	4	Intergenic	novelGene_137308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	47	junction_3	104.097176821575	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	556	1011	50400	44225	FALSE	25	TTTCAGCTTATAATTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKFWKILLKYPGVVVGRGVRLYYIGGEVFAECLSDSAIFVQSPNCNQRYGWHPATVCKIPPGCNLKIFNNQEFAALLAQSVNQGFEAVYQLTRMCTIRMSFVKGWGAEYRRQTVTSTPCWIELHLNGPLQWLDKVLTQMGSPSVRCSSMS	50955	42924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_44349_48258_48404_48582_48721_50351
908029	contig_8801_pilon	-	2945	4	Intergenic	novelGene_66251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.1279508585037	275	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	204	659	199038	193594	FALSE	30	TCTAGGGTCACACATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	218809	191307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_193615_194487_194715_198830_199065_218632
908030	contig_5019_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_109178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAACCCTGGTGGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105659	107688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105700_107700
908033	contig_9177_pilon	+	5295	38	Intergenic	novelGene_32575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.162162162162162	61	97	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	433	786	10465	11652	TRUE	0	CTCGTTCTCCCGGTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARPSGLIWAGMLENSGLDAKALRLSTASSRGAVAARHWARFSSVKAPSSALMVLTRLAVLLATSLADCTNWRLAVGLAVRAEARRQLLHSAEVCLATMVAAESTWAWVQPGSPKL	1712	32804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2084_10403_10478_10571_10713_10958_11120_11613_11759_12844_12968_13080_13173_13274_13368_13554_13696_13890_14089_14296_14415_14809_15020_15162_15267_15424_15553_15705_15844_16051_16170_16268_16379_16549_16677_17437_17611_18199_18494_18834_19005_20027_20127_20274_20480_20695_20809_20907_21027_21214_21390_21607_21689_21873_21972_22740_22896_23253_23353_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327_25480_25583_25714_25970_26070_26312_26474_32757
908034	contig_15327_pilon	+	2144	13	Intergenic	novelGene_70771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	162	494	1129881	1130213	TRUE	70	ATAAGAAAGCACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSRPQHGRANVKSTVLMKHNTAPGPTRDGVDSPRVRHRLKGVTAHTGPDGRDPSPGGVGDRVTLHTFTGRGQAPSCTGLRMQVHKHTRHRNAGLWTSSSHPGPMRTWI	1129719	1157914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1130520_1131004_1131064_1131796_1131868_1134015_1134151_1135051_1135151_1135694_1135848_1137307_1137381_1138469_1138566_1149209_1149359_1153219_1153296_1153706_1153820_1155464_1155669_1157798
908035	contig_17144_pilon	-	2705	18	Intergenic	novelGene_29548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2157.30638307354	2	55	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	1010	2650	173384	166152	FALSE	15	CTTAAACTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183404	166096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166755_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173740_174568_174761_174876_175001_175973_176047_179700_179786_181794_181850_183158
908036	contig_14651_pilon	-	2881	12	Intergenic	novelGene_157219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.7510506324204	18	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	586	1317	107627	87171	TRUE	35	GCACCAGGAAAACAGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKAFCFLSPGAIGCFPYWTSLWKIPEGVALREAAVLPISYGTAVLALEHRARTQPGETVLVTAAAGATGLAMIDVATNVLQAKVIAAAGNEQKCKLAMQRGAQSSVNYSQGSLKEAVRKLVGSGGVNVVIDTVGGDVFLEALRSLAWEGRIVVVGFAGGTIASVPANVLLLKSISATGMSWGQYKNKNFSLFSSILSSVLRYCQQGRIQPYIGAEFKLEEVNDAFLHVTRRKSTGKVLLSLK	112713	85291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_85648_85962_87240_97825_98055_100098_100281_106152_106235_107093_107204_107567_107696_107844_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
908037	contig_20241_pilon	+	2388	10	Intergenic	novelGene_159741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	44.6818658496092	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	155	817	239418	252665	TRUE	40	TTAAAAGTTTATAGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFVVNKKMEFGVVYSCVEDKMYTGRRGHGAFCDGQKLQVSQQEEHQRLSELSFLIWKNFFAFLFMGSGELEQQLLICALWQLEEQMRITKWEFTAGIWQELVLLLQKLVVC	235256	255006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235947_236036_239404_239481_240085_240220_241925_242031_243723_243770_246679_246789_248365_248432_252525_252678_253447
908038	contig_12402_pilon	+	4687	5	Intergenic	novelGene_133361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_3	28.9698118737419	268	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	292	1914	534709	560336	FALSE	15	CTTTTTGTTTTAGAATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVVEDVAVDFTQEEWVLLDVSQRKLYRDVMMETFRNLASVVSQNLNDGEKLSSEQIIVRLMKNSTSPSMLREIREFHGIEDKRNNQERHMRRHMLEKLHESNECIEYGKTFSWIPNATVLNRILPKVNLSECCECGKFMDHSSLKHHIRSHNGCNTYQCKECRDLCSCYSHPSIPVRTLIVEKPYKFKVCGKGFIGISTPKNHVTTLIGKKPYECNETGSFSSFGMHMRSPKYECKKYWKIYTHPLSLTLDKKTHSRDKIYECMKREKASSIIKHIRKHNEERPYECKECGKAFSRFSSLITHVRIHSGERPYECKECGKAFSHSSSLTEHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLINHVRTHNGERPYKCKECGKAFSHFSILTRHTRIHSGERPYKCKECGKAFSHSSTLTKHVRIHSGERPYVCKECGKAFSWASSLTIHRRTHSGERPYECKECRKVFSSSSSLTEHVRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHIRTHSGERPYECKECGKVFSNLSYFSFHIKNHTGQKPL	531080	563109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_531111_534447_534712_554791_554919_558487_558639_558994
908040	contig_9937_pilon	+	1533	1	Intergenic	novelGene_129226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACATTGATGTACATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310524	312057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_310500_312100
908041	contig_10627_pilon	-	4213	1	Intergenic	novelGene_60019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	116	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3402	3788	390953	390567	NA	40	CGATAAACCATTGGCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQQDITIINIYAPSDRAPKYIKQTLTALKGDTDSSTIIVGDFTPLLVKDRTSRKKLNEDVEDLNAIINQLDLRDVYRTLHPIAAKYTFFSSTHGTFSRTDHILGHKASLNRIQSINTTKHLF	394354	390141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_390100_394400
908042	contig_9424_pilon	+	3499	1	Intergenic	novelGene_143762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGAAGCTCTGTTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3117	6616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_3100_6600
908043	contig_10050_pilon	-	3780	1	Intergenic	novelGene_119632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	571	1716	905	2620	252696	250981	NA	65	TATTAAAAAAAAAACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYTEILEDSTRNLLELTERFSRVAGYKINIQKAVGVLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYFGINLTREVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFMWKGKKPRISKALLKKKNKVGRLTLPDFRTYYTPTAVKTAWYWYNDRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIVDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTLYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSVAIREMQIKITMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLLHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFVAALFTIAKRWKQHRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	253600	249820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_249800_253600
908044	contig_6163_pilon	-	2235	8	Intergenic	novelGene_103811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	339.524216923552	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	493	1065	79431	78086	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVSWQPLSMAISMLIPPGLRVVLAGWWRPALARDSLVRVWACVLFLRMNSFPLDSEAVEHIIFHPVTQVWTS	93884	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_78458_78698_78816_79347_79448_86079_86279_86907_86975_89577_89676_93772
908045	contig_1406_pilon	+	2452	3	Intergenic	novelGene_25506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	58.5	165	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAGTCTAGGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1456108	1460407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1456276_1456887_1457041_1458275
908046	contig_10467_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_175407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCAGTTTTTTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94886	96804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_+_94900_96800
908047	contig_7271_pilon	-	2980	5	Intergenic	novelGene_159954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	201.771374332436	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	8	454	556626	479323	TRUE	15	CCCCAGCTGTGGTCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMHMLNGALLALLFPVVNTRLLPFELEIYYIQHVMLYVVPIYLLWKGGAYTPEPLSSFRWALLSTGLMFFYHFSVLQILGLVTEVNLNNMLCPAISDPFYGPWYRIWASGHQTLMTMTHGKLVILFSYMAGPLCKYLLDLLRLPIKKID	556633	476757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_-_477027_477065_479530_481255_481357_515238_515318_556566
908048	contig_10058_pilon	+	3037	9	Intergenic	novelGene_67716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	157.852779513064	8	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	75	668	72602	98267	TRUE	30	ACATTGAGTTTGTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELV	72527	101640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100651_100827
908049	contig_9481_pilon	+	4624	1	Intergenic	novelGene_149690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1957	2337	572149	572529	NA	15	GGGCACGTCCTACCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEGESATGGKTGGHKAGDNTKSWTASTPVTRVQKVAGLGERGEKETKCPNNLMVELRESIYSYSGLSNKKLFLGAQTFLILVSLSDSAGAHAGSRPLAQYESTEGLAASGQHTANERLDSPHDPH	570192	574816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_570200_574800
908050	contig_10134_pilon	-	4124	2	Intergenic	novelGene_16226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_1	0	52	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39688	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_35178_38558
908051	contig_11056_pilon	+	2542	3	Intergenic	novelGene_130355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	2	208	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	530	1642	112932	114044	FALSE	30	GATTATATACAGCGTGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETGEEEKVSAEALGFSDLSDSEFLDLEDAQGLDASLSKPGPSCELSGNDGKPRSLQKWKRGLDVSSPMERFHFKYLCVTDLSTQNWCEQQMVYGKEFPGFLTPEKAALLDTGASIHLARELEVHDLVTIPITTKEDAWAIKFLNILSMIPTLQSEGHIREFPVFGEVEGVLLVGVIDELHYTAKGELELAELKTRRHPMLPVEAQKRKDYFQVNLYKYIFDAMVQGKVTPASLIHHTKLCPEKPLGPSVLRHAQQGGFCVKSLGDLMELVFLALTLSDLPVIDILKIEYIHQDTATVLGTEIVAFEEKEMKGKVQHYMAYWMGHREPQGVDVEEAWKCRTCNYVDICEWRKGGWVPTSTLEPKTKKKK	102507	114944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_102669_103220_103559_112901
908052	contig_3956_pilon	+	2501	12	Intergenic	novelGene_14869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1229.36136077717	228	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	84	1979	1281682	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287496_1289754_1289892_1290297
908053	contig_12964_pilon	-	6045	1	Intergenic	novelGene_131712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	4053	4409	578155	577799	NA	80	CCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGETLKLALKSRVDKVKGRNEEVKELNKRFQKAAQEDTIKYYNDMCKDLQLENQKGRTRSAFLKLKELNKKIQASNCNTERFYGQNIEQRRKHQKKMEGVHSHCTTKSLSMFIHFGR	582207	576162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_576200_582200
908054	contig_9668_pilon	+	3853	3	Intergenic	novelGene_58170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGAACATCTTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496930	508185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_498599_498772_500393_507620
908055	contig_8377_pilon	+	6421	2	Intergenic	novelGene_35034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	135	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAGAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76947	83461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_82089_82181
908056	contig_1275_pilon	-	2477	2	Intergenic	novelGene_108794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATTTTAACCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484933	482238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_484482_484699
908057	contig_8149_pilon	+	4324	14	Intergenic	novelGene_169955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	279.002576815739	303	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	223	1974	651613	701661	FALSE	40	AAGTGACAAAAGCTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLKLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLRQIEEQTMKAQKELEEQTRRALELDQERKRAKEEAERLEKERQAAEEAKAAIEKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIAPTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM	634956	704011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_+_635128_651561_651625_657499_657584_670299_670396_670909_671185_680143_680228_680438_680586_684627_684725_687251_687416_692837_692969_696289_696451_697721_697815_699996_700240_701496
908058	contig_6975_pilon	-	1931	1	Intergenic	novelGene_74233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGCTAGTAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17777	15846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_15800_17800
908059	contig_12528_pilon	-	1866	9	Intergenic	novelGene_81320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	547.041131908744	3	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	529	1335	966228	937552	TRUE	35	TATATTCTTCCAAAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLACK	968139	932847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933350_937522_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
908060	contig_8377_pilon	+	2729	15	Intergenic	novelGene_35128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_5	1805.62906246673	18	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	228	1931	179603	197939	FALSE	50	AAACAAATATTATTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	177266	198737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
908061	contig_11656_pilon	+	3670	1	Intergenic	novelGene_53941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGAAAAAAAAAAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112782	116452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_112800_116500
908062	contig_2770_pilon	-	2121	4	Intergenic	novelGene_107434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3383	junction_3	841.282090357067	54	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	117	422	750561	744552	FALSE	15	CCACCGCCCAGCATTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQQPQRLPQKQQRHPRRHSPCAGEATLAPSALPLFASTMADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKVILHLC	750677	742852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_744680_746600_746745_747765_747797_750558
908063	contig_12709_pilon	+	1910	6	Intergenic	novelGene_147421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCAGCGCCGGGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84895	110693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_86237_87708_87836_88734_88900_94624_94684_102695_102768_110547
908064	contig_6199_pilon	-	2187	17	Intergenic	novelGene_126398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1281	1670	592951	585713	TRUE	15	CCGGTACACTTCCGGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRMPRPVCERLGRNSSLKGFPQNDSPPVPVPVGSPPLDLKVPDGPVEDGAIVVVLLAEPDEVFTGLWRLVAVQLQVEVASVGVEPHVALLLYKLVAQDKGSSVSRSRKFLALIFSCSTAYRHRHCQSF	604667	559398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_559595_564010_564055_565836_565879_568952_569019_570035_570091_574877_574930_585650_585738_586796_586865_589685_589773_590253_590345_590818_590855_592868_592988_602081_602138_602797_602867_603003_603068_603214_603355_603752
908065	contig_7376_pilon	+	1875	5	Intergenic	novelGene_108080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.2249924196476	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAATTCCTGAATGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79680	114023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_+_79792_102779_102959_104743_104851_112441_112496_112599
908066	contig_13097_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_107731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTGATTAATTCCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236607	234462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_234500_236600
908067	contig_2703_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_101689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTTATTTTCTCATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358159	359839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_358200_359800
908068	contig_5590_pilon	-	3479	5	Intergenic	novelGene_163037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1460	1759	358153	357854	FALSE	35	CACACACCTGAAAAGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAARWQRKWAGSPPGLWEPSEAWTKSISVATETEEDLPRVLLRAFTMMWSHMAMSPEGSDKVSPLLSHPHCSLYRLPSVQPQGGNTAPARTLSQQWFC	364813	356133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_358981_359429_359631_360013_360308_361038_361156_364793
908069	contig_7321_pilon	-	2968	6	Intergenic	novelGene_53136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	152.718040846522	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	76	711	208319	169423	TRUE	50	ACTAAAAAAGATATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYGWTFCSTFLHITYCVLE	208394	165881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_167336_168619_169617_173563_173702_203985_204078_207655_207860_208311
908070	contig_12046_pilon	-	3067	20	Intergenic	novelGene_83477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	29	junction_19	58.7563163340017	87	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	148	2427	440574	372677	FALSE	30	TCTTTAACCAGAAGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA	459031	372036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_372872_376165_376290_376967_377087_377866_378029_378820_378997_379312_379437_382569_382702_383556_383690_387355_387421_389900_390009_390220_390352_391727_391822_404547_404629_404711_404858_408214_408357_410629_410807_417122_417223_440503_440614_442835_442912_458999
908071	contig_9242_pilon	-	4910	1	Intergenic	novelGene_155069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAGATGAAAGGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642393	637483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_637500_642400
908072	contig_10140_pilon	-	4166	17	Intergenic	novelGene_148388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	81.6582053439824	2	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2313	6	2318	186175	141154	TRUE	25	AACCTACTTTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMGKRDRADRDKKKSKKRHYEDEEVEEDDTPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTLEGSGGPSTSRVTDPQNKSDIPTDLFDFYEQMDKDEEDEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSKSSQVSRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKTSSKHVHPLFKRFRK	186180	139126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_139205_139284_140573_140671_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163547_163751_178414_178600_180427_180743_181944_182150_182453_182619_182780_182917_183352_183403_184766_184968_185608_185815_186147
908073	contig_13699_pilon	+	1089	9	Intergenic	novelGene_158306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_6	225.719405457307	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	381	1088	16972	26910	FALSE	35	TGGCCCAGCAGACAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGYEIKLSQEEGVPADLSALESHRSTLRHWLSHVKEKNSVFSVLDEEIAKAKVVAEQLSRLTPERNLDLERCQEKGSQLQERWHRVIAQIETRQSELESIQEVLGEYRACHGTLIKWIEETTAQQEMMKPGQAEDSRVLSEQLSQQTDLFAEIERNQTKLDQCQKFSQQYSTIVKDYELQLMTYKAFVESQRKSPGKRRRMLSSSDAITQEFMDLRTRYTALVTLTTQHVKYISDALRRLEEEEKVVEEEKQEHVEKVKELLGWVSTLARNTQGKTTSSQTKGSTDIEKAILEQQILSEELTAKKEQVSEAIKTSQIFLAKHGHKLSEKEKEQISQQLNALNKAYHDLCDSSSNQLQQLQSQ	14835	26911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_14922_15605_15800_16871_17035_19204_19289_22109_22218_22414_22514_23788_23942_24250_24340_26798
908075	contig_3449_pilon	+	2850	13	Intergenic	novelGene_73737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	353.992574859354	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	486	1832	512166	524912	TRUE	20	AGTTCCTTATTTTCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGPSCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQDAGITSDTMMKNFFFVPSCIQLNQEDSFSTEA	493522	526078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523891_524008_524356_524572_524800_525027_525174
908076	contig_14698_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_168133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTCCCCAGCATGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86125	88705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_88103_88363
908077	contig_15031_pilon	-	3924	1	Intergenic	novelGene_138407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATAGTAAAACAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99166	95242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_95200_99200
908078	contig_7179_pilon	-	5361	25	Intergenic	novelGene_78068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	21	junction_23	142.476697656143	330	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2613	169	2781	547098	414067	FALSE	30	TGCTCAAGTGGAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSFVEVAVDGLPSETKKTGKRIGSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENTQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGSVPNGSAVTDGSQPPSRESSGTAVPPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGGSARTTTGSNEQSPGTRNRHRQPIKNPSHNGLPNGTVNDEATAATDPEEPSVVGVTSSPAAVSNVTLNPNAASLPAPATPAEGEEPGTSGTQQLSTTAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGTMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGQVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKNTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCVDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLYAIEETEGFGQE	570893	411486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_414167_414702_414776_414985_415083_416809_416915_417289_417411_418627_418769_419104_419239_420731_420892_423002_423092_423303_423376_423673_423750_424227_424357_424852_424935_428464_428520_434575_434751_451375_451466_468437_468649_480130_480259_501923_502021_503927_504066_540603_540726_541039_541188_547028_547114_561877_561983_570845
908079	contig_15146_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_116959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTATAGAAGAATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556148	557699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_556100_557700
908080	contig_17144_pilon	-	746	1	Intergenic	novelGene_29480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	18	461	166806	166363	NA	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	166823	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166100_166800
908081	contig_11720_pilon	+	2935	1	Intergenic	novelGene_43869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2424	2786	98120	98482	NA	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGAQCLPYNSSVPLPEESLALSISCWCRFGIPFLVQECGVGGRVSQKVAFTLTLFLLKGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	95696	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_95700_98600
908082	contig_5019_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_109224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334430	332989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_333000_334400
908083	contig_19990_pilon	-	4537	1	Intergenic	novelGene_30775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	856	1440	159397	158813	NA	30	CTCCTTGAATGGGAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNAIKKWAKDINRHFTKEDTLEANRQMRKCSQSLAIRETQIETIVRYRLTSTLLGLNQKTEDNKCQSSCEATGTLTHSWWECEMVQPLWKTLWCLHKKLEIGTPHNPAISHLGIYTREIGAITRIDTCTPMFTAALFTTAKGWKQPICPSTDEWINKLWYIHTMQSYTKIKNNDESVKNTTTRMTLQSITKA	160252	155715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_155700_160300
908084	contig_1719_pilon	+	2091	3	Intergenic	novelGene_87391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	11.5	152	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1167	1532	935452	935817	FALSE	0	TTCTTGGTGGCTTCCGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANGPSREGSRLLPVKEGHPVYPQLRPGYIPIPVVHEGAESRHPFRTYPQPGPQRFRTEAAAATAPQRSQSPLRGVVEAAQPDKQSGQAAAAVAAQPLAAHRPEQSQSPAASDCSSSSSSASLPSSSSRSSLGSHQLPRGYIPIPVIHEQSVARPTAQPSLHQAQKTHYPAQQGEYQTHQPVFHKIQGDDWEPRPLRAVSPFRSPARGASSREGSPARSSTPVHSPSPVRVHSVVDRPQQPVAHRESFPIPPPENKPESKPGAAGPDLAPGHIPIQVIVKEADAKPVSQKPPPPSEKVEVKVASLSAPVPCPPSPGPSAVPSAPKDVAAEEKAAPSPAPTEAVPTKAGDAEPPPKHPGVLKVEAILEKVQGLEQAVDNFEGKKTDKKYLMIEEYLTKELLALDSVDPEGRADVRQARRDGVRKVQTILEKLEQKAIDVPGQVQVYELQPSSLEGDRPLQEIMEMGTMATDKKSAGNEGEPQTETQQPEAKEAAAPDPASTTETAGNPAAP	930235	936376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_930547_932148_932554_935001
908086	contig_3414_pilon	-	2760	12	Intergenic	novelGene_80974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	293.38798952359	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1787	2689	89176	67173	FALSE	15	TTGCTTCTCTATAGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKVTWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGETKIKGDYAQLLEDMQNAFRSLED	96691	67101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_67266_69036_69209_70780_70876_76898_77103_78456_78521_79117_79233_79321_79445_89139_89249_89789_89949_93529_93682_95073_95212_95426
908087	contig_7229_pilon	-	711	4	Intergenic	novelGene_39814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2656	junction_3	638.233499590863	49	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	46	660	877522	875654	FALSE	25	CGTCTACTTAAAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878223	875602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877535_878190
908088	contig_2550_pilon	-	398	1	Intergenic	novelGene_135680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGATAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1367129	1366731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1366700_1367100
908089	contig_12277_pilon	-	4594	3	Intergenic	novelGene_139687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1982	2413	235091	234660	TRUE	10	TGTTCTGTATCCCACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKTIYEYNAIPIQIRTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPQISEALLKKKKKVGGLTLPDFRTYYTATVVKIAWYWYDRYIDQWNRTENPDVNPSTYGHLIFDNGPKAIKWGKDSLFNKWCWQNWISIAKNETGPIPHAIYKN	237072	228828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_229350_232560_233067_233505
908090	contig_1127_pilon	+	4480	8	Intergenic	novelGene_98854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_1	66.3795518059529	286	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	433	2526	19107	62381	FALSE	40	ATGAAAAACACTGTGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERAKSPDTNQERNSGKHHDSYCSSDFETSLQSSGRSSVANLSSPTSVKEKNPKRHISDSQVYHQAPGKSSPKGLPNRRGVRVGYRSQSLNREPLRKDLDLVTKRVLSARLLKINELQNEVTELQVKLAELLKENKALKRLQYRQEKALNKFEDTENEISQLILRHNNEITALKERLRKSQEKERATEKRVKDTEGELFRTKFSLKKLKKISEARHLPERDDLAKKLVSAELKLDDTERRIKELSRNLELSTNSFQRQLLAERKRAYEAHDENKVLQKELQRLYQKLKEKERELDIKNIYSNRLPKSSPKKEKEFALRRNAACQSDFTDQCTKGVQTSEDFELEEFPITPQTVMCYENKWEESEHLTLNLESQERGGHEEAEILNPIVEGEESMKELDAIKQEVEKLENEWEREEHDKKQSENTFLLKREEKPELEMRRYQIGMNQFQDTDKLEEDEEDRLKREMLLAKLNEINRELEDSQNLKYPPLPLLPDFESKLDSPEKNPKTYTFSEPSKRSFNGHHLQDISFLTTKGEGQNLRDTRSAASPNEFAFGSYVPSFAKTLAKSNLFSPRSGLLEFQSNTMEKLNKDNVDLITRKERKANLMEQLFGASGSSTISSKSSDPNSLSVSRGDFDPLNFLSGDKSSRSIEQDEDDDFFLSEGRSFNPNRNRLKHANSKPTVKAVDSVEDEIEEVALR	7808	64335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1127_pilon_+_8048_18913_19306_26353_26884_52678_52817_53736_53834_54557_54701_56936_57061_61518
908091	contig_7898_pilon	-	4338	25	Intergenic	novelGene_47509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_5	35.3057823010465	206	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1228	3687	47	3733	238799	217935	FALSE	20	CAGAAGCCGATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKNFRRREGALFAFEMLCTMLGKLFEPYVVHVLPHLLLCFGDGNQYVREAADDCAKAVMSNLSAHGVKLVLPSLLAALEEESWRTKAGSVELLGAMAYCAPKQLSSCLPNIVPKLTEVLTDSHVKVQKAGQQALRQIGSVIRNPEILAIAPVLLDALTDPSRKTQKCLQTLLDTKFVHFIDAPSLALIMPIVQRAFQDRSTDTRKMAAQIIGNMYSLTDQKDLAPYLPSVTPGLKASLLDPVPEVRTVSAKALGAMVKGMGESCFEDLLPWLMETLTYEQSSVDRSGAAQGLAEVMAGLGVEKLEKLMPEIVATASKVDIAPHVRDGYIMMFNYLPITFGGKFTPYVGPIIPCILKALADENEFVRDTALRAGQRVISMYAETAIALLLPQLEQGLFDDLWRIRFSSVQLLGDLLFHISGVTGKMTTETASEDDNFGTAQSNKAIITALGVDRRNRVLAGLYMGRSDTQLVVRQASLHVWKIVVSNTPRTLREILPTLFGLLLGFLASTCADKRTIAARTLGDLVRKLGEKILPEIIPILEEGLRSPKSDERQGVCIGLSEIMKSTSRDAVLYFSESLVPTARKALCDPLEEVREAAAKTFEQLHSTIGHQALEDILPFLLKQLEDEKVSEFALDGLKQVMAIKSRVVLPYLVPKLTTPPVNTRVLAFLSSVAGDALTRHLSVILPAVMFALKEKLGTTGEQLEMANCQAVILSVEDEAGQRIIIEDLLEATRSPEVGMRQAAAIILNIYCSRTKADYTNHLRSLVSGLIRLFNDSSPVVLEESWDALNAITKKLDAGNQLALIEELHKEIRLAGSESRGEHVPGFCLPRKGVTSILPVLREGVLTGNPEQKEEAAKALGLVIRLTSADALKPSVVSITGPLIRILGDRFSWNVKAALLETLSLLLAKVGIALKPFLPQLQTTFTKALQDSNRGVRLKAAEALGKLISIHVKVDPLFTELLNGIRAVEDSGIRDTMLQALRFVIQGAGAKVDAIIRKNIISLLLSMLGHDEDNTRISSAGCLGELCAFLTEEELNTVLHQCLLADVSGVDWMVRHGRSLALSVAVSVAPGRLCAGKYSSDIQEMILSNAVADRIPIAVSGVRAMGFLMKYHIETGGGQLPARLSTLFIKCLQNPSSDIRLVAEKMIWWANKDPLPPLDPQAIKPILKALLDNTKDKNTSVRAYSDQAIVNLLKMRQGEEVFQSLSKILDVASLEVLSECHRRSLRKLACQADSTEQVDDTILT	239334	217329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_218061_218608_218828_220058_220167_220651_220801_221472_221570_223563_223679_223817_224012_225685_225917_226382_226497_227483_227754_227852_227997_228233_228327_228598_228761_230138_230304_231418_231635_231777_231896_232995_233139_233322_233520_233606_233746_233942_234012_235316_235538_237289_237470_238217_238333_238697_238820_239308
908092	contig_5300_pilon	-	2823	2	Intergenic	novelGene_144242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1185	1637	2821	38571	37387	FALSE	35	GTAAGATTAATACCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKGSLKPSIREETLSSVVGQERGNVMDFYKTLRGGATVKVPASSPSLAAASQSDSKQQRLLVDFPKGSVHNEQQPDLSKAVSLSMGLYMGETETKVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDFRLLEESIANLSKSTSVPENSKSSASAAVSAAPTEKEFPKTHSDLSSEQQNLKGQSGTNGGSVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPSKETNENPWKSDLLIDENGLLSPLAAEDEPFLLEGNPNEDCKPVLLPDTKPKIKDNGDFILSSPSSVPLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEKLGPVYCQSTFSGANIIGNKTSAISVHGVSTSGGQMYHYDMNTASLSQQQDQKPIFNVIPPISVGSENWNRCQASGDDSLTSLGTLNFPGRSVFSNGFS	40308	37384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_38585_38685
908093	contig_14525_pilon	+	889	9	Intergenic	novelGene_149755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGATTTTTAGTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127728	140260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_127860_128433_128597_132106_132147_134605_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137066_138536_138602_140183
908094	contig_4232_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_63334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
908095	contig_13863_pilon	+	2605	12	Intergenic	novelGene_41998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_9	264.038658576998	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	1788	2603	70318	81514	FALSE	70	GAAAAAGAGAAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDAL	64083	81516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
908096	contig_13496_pilon	+	3871	12	Intergenic	novelGene_107624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	326.35343108886	155	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	149	1786	225105	444936	FALSE	60	AAGAAACAAATAGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGKLNMHMNVQNGKWESDPSGTKTCIGTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHAHIVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLADESDSVDSADAEDDDSDVWWGGADTDYADGSDDKVVEVAEEEEVADVEEEEAEDDEDDEGGEEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSVIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVGK	224956	447021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_225162_285095_285264_309234_309365_343908_344022_347585_347780_378499_378703_392486_392655_409208_409343_415282_415358_416490_416650_443901_444031_444828
908097	contig_12789_pilon	-	3641	1	Intergenic	novelGene_176631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATGGTAGATAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306958	303317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_-_303300_307000
908098	contig_12938_pilon	+	1889	4	Intergenic	novelGene_99699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	983.463720169122	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGGAACTCAGTAACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51945	86181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_83391_83470_84550
908100	contig_3612_pilon	-	1662	12	Intergenic	novelGene_87810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_4	151.998368847272	24	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	10	1281	881794	869393	TRUE	45	GGAAATTTGAATGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAARTVLLPAARRWLRGFTERILVGGAAGRSLYFGGSRLRSTQAAAQVVLNVPETRVTCLENGLRVASEDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLNAYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSINRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDELLDLAKFHFGDTLPTHKGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDTISLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSRLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCEPATVADMLHSVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGKDKDISCFM	881803	868735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_868909_868997_869074_869260_869511_871145_871307_872192_872337_872981_873095_873945_874026_874616_874816_878786_878917_879316_879404_880323_880465_881695
908101	contig_7378_pilon	+	2223	2	Intergenic	novelGene_120235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1073	1396	183358	183681	FALSE	30	AGTCTGTTTATTAGAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLDSIHVINSDSTLRRQLFPSHILRAFQHEGLIFWHFTRQCSPAMHKVSLANFSEADFQVLLPSLSYSGSSAESYPSRVTLLVFEIPVAKLPVSQPRTSHHSMTN	122947	184508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_123092_182429
908102	SIRV6	+	1058	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-6	36	0	16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	45	TGGTAACAATGTAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
908103	contig_9468_pilon	-	2792	2	Intergenic	novelGene_59522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	612	914	505735	505433	FALSE	35	CTTCATCTTAAGTGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTESSTARRSPATTTDFSDRDHNRGSWTELEKDAEQNANKKKTRFTGLTDWRNPDSMAPGHPFSSVMKPLPKFTIQPGTGSLIKQNRTNEA	564326	503554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_505860_563839
908104	contig_10801_pilon	+	7480	1	Intergenic	novelGene_74033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	377	730	240415	240768	NA	60	AAAAAATAGTTATTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAFFVCVCVCVLVLFAFPLFMKFHLHILCLFTTALIYPTLLCKFVSFQIIVTVVVASSQISIQNLETDTKHLVDSGEGYPKGSGSVPETLPAHCQNTSFIGTLISFLFSEMHYTLI	240038	247518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_240000_247500
908105	SIRV7	+	1654	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATACTTGTGTCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	2669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1000_2700
908106	contig_1725_pilon	+	1957	14	Intergenic	novelGene_24286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	525.613859210431	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	268	1638	207418	255543	FALSE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQVNKARGN	201485	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_255519
908107	contig_10734_pilon	+	3394	1	Intergenic	novelGene_51253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTCATATCACCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273580	1276974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1273600_1277000
908108	contig_11258_pilon	+	2566	5	Intergenic	novelGene_67825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1616	2074	330494	354816	TRUE	25	CCCTTCCCAAGAGAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTGAPCLRLWLCLEFSWLLVLWVAPAVVSVVDSTGGPSVVVVEVVVLVGVLDVAAGTQRSSRTESSHTALSRWVIPRRQVSAEIAWAPAGYQVSALPKKGGPNLQDSHFCFSLCQSAASFLSLFLLELGTQISSPGRWDLSNKLHLSTIFY	328878	360650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_330663_336873_337092_354744_355098_358489_358583_360532
908109	contig_3243_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_147533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	808	1113	25282	24977	NA	5	CTGCGGCTGCGGGCGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESVSVSFLWVLSPRRSLIFQHLGNAINHKHQEVPYMVKREKEGRNPTKPLHFKGALLLFEEHHVALVLLATSAPTLLTDIKRWRTSRTFSLVSTLSIFK	26089	24055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3243_pilon_-_24100_26100
908110	contig_12528_pilon	-	3851	6	Intergenic	novelGene_81342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	632.556527118328	149	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	521	1024	966228	956024	TRUE	30	GTTCAGTCAAGTACAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGEFKCPFPW	968131	952347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_952544_953392_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
908111	contig_10323_pilon	-	1652	2	Intergenic	novelGene_123605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1341	311	1651	460768	459428	FALSE	50	TCCAGTCAGAATACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGD	463406	459426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460979_463306
908112	contig_9809_pilon	+	3399	12	Intergenic	novelGene_176752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	181.22334514749	9	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	116	1081	108357	111861	TRUE	25	GGTTTTCATCGAAATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKWYEDFVFQQLHHLV	108241	118040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111871_112241_112362_112466_112590_114806_114925_115330_115991_116752
908113	contig_753_pilon	+	3622	14	Intergenic	novelGene_112887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	56.9493702268144	16	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	1596	3014	219758	243573	FALSE	25	AAGATTATGGTCAGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTSEITSPEEGTTIHWMSSVEAKIEDKKVKGENKLTSGKMEQLRKEKINFFRNKHKIHVQGTDLPDPIATFQQLDQEYKINSRLLQNILDSGFQVPTAIQMQAIPVMLHGRELLASAPTGSGKTLAFSIPILMQLKQPTNKGFRALIISPTRELASQIHRELLKISEGTGFRIHLIHKAAVAAKKFGPKSSKRFDVLVTTPNRLIYLLKQDPPGIDLTSVEWLIVDESDKLFEDGKTGFRDQLASIFLACTSHKVRRAMFSATFAYDVEQWCKLNLDNVITVSIGARNSAVETVEQELLFVGSETGKLLAMRELVKKGFNPPVLVFVQSIERAKELFHELIYEGINVDVIHAERTQLQRDNTVHSFRAGKIWVLICTALLARGIDFKGVNLVINYDFPTSSVEYIHRIGRTGRAGHKGKAVTFFTEDDKPLLRSIANVIQQAGCPVPEYIKGFKKLLSKQKKKMIKTIPET	218162	244181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_219771_220904_221036_224101_224288_228022_228167_228849_228962_231047_231121_231755_231960_233089_233181_236184_236308_236440_236592_236763_236840_237845_237918_238494_238520_243555
908114	contig_2278_pilon	+	1697	1	Intergenic	novelGene_118088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATGAAAAAAAAAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644069	645766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_644100_645800
908115	contig_5434_pilon	-	3209	1	Intergenic	novelGene_74640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTATTAGGAATCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29463	26254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_26300_29500
908116	contig_18487_pilon	+	2149	16	Intergenic	novelGene_172672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_10	36.94223719388	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	12	1859	196748	210098	TRUE	60	TTTCTCAATAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPIRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYAFVHFETQEAADKAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGAKAKEFTNVYIKNFGEEVDDESLKELFSQFGKTLSVKVMRDPSGKSKGFGFVSYEKHEDANKAVEEMNGKEISGKVIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKNLDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGSKPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRTLPASAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRPPYYTPNQLAQMRPNPRWQQGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGNAPASRGLPTTTQRVGSECPDRLAMDFGGAGAAQQGLTDSCQSGGVPPAVQNLAPRAAVAAAAPRAVAPYKYASSVRSPHPVMQPLQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKVGAVAAATS	196736	211411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_196806_199297_199492_200490_200607_201851_201992_202356_202452_203123_203262_204011_204108_206117_206391_206751_206840_207019_207140_207594_207682_207774_207903_209065_209160_209271_209403_210008_210112_211134
908117	contig_10907_pilon	-	2956	7	Intergenic	novelGene_144900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	291	junction_6	78.0478841623668	5	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	84	776	41010	16683	TRUE	40	AAACCAAACTCATTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPIRVLVTGAAGQIAYSLLYSIGNGSIFGKDQPLILLLLDITPMTGVLEGVVMELQDCALPLLKDIIATDKEEIAFKDLDVAILVGSMPRREGMERKDLLKANVKIFKSQGAALDKYAKKSVKVIVVGNPANTNCLTAIKSAPSIPKENFSCLTRLDHNRAIGQIVLKLGVTAKDVRNVIIWGNHSSTQYPDFSHAKVKFQGKEVGVYEALKDDSWLKGEFITVRNIC	41093	13938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_14923_15486_16878_28331_28455_30318_30495_36029_36127_36951_37051_41007
908118	contig_1348_pilon	-	3977	1	Intergenic	novelGene_174373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	622	1035	610424	610011	NA	20	GTGCAGTGTAAATTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGCIISPYLFSLYAEQIILEAGLYEEEHGIKIRGRLINSLRYAGNTTLPAESEEDLKHLLMKIKNYSLLIGLHLNIKETKILTTGPISNIMINREKIEVVMDFILLGSTINTRGNSRSRNQTRYCIGQICCKRPP	611045	607068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_607100_611000
908119	contig_10355_pilon	-	2313	2	Intergenic	novelGene_175251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTAGAAAAAACCCAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41477	34368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10355_pilon_-_36038_40833
908120	contig_14223_pilon	+	5801	5	Intergenic	novelGene_156974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	399	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	5253	5777	170977	186639	FALSE	30	CTGTGGGAGAGAAGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANLVKSAAKEILPFSSSSMALKRSATGSSATPTAVFRMQDRSRSFMQPSSCDAYILNASWMVSRVLDGLQTTDKAITYSRRSILPLPLSSNSENMPSSVSEMGTSRYAANSARSIFWPFFSLALSEYLSRSFSSFSGFSPRPLTSLANSRRQVSEGRRSCPSARASWQSSNV	165724	186663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_+_171005_174941_175084_182080_182182_185313_185466_186537
908121	contig_6795_pilon	+	3773	29	Intergenic	novelGene_27732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_28	397.47447614114	23	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1157	3474	29	3502	320577	333469	FALSE	35	TCAGTATTTTTAATATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGRCESGAMEGTGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNHTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSYNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVQLQTLVLSGNPLLHAQLRQLPAMLALQTLHLRNTQRTQNNLPTSLEGLSNLSDVDLSCNDLARVPECLYTLPSLRRLNLGSNQITELSLCIDQWTHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLTKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLASLEEFMAANNNLELIPESLCRCMKLRKLVLNKNRLVTLPEAIHFLTEIENQLRLAGASPATVAAAAAAGSGPKDPLARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEERTDTPGPGGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGDATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGASLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGTQATLGSTTKARLFAEKMNKNERKGKAEITLLVQGQEPPEFWEMLGGEPSEIKRHVPDDFWPPSPKLYKVGLGLGYLELPQINYRLSIEHKTRPRVELMPGMRLLQSLLDTRCVYILDCWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHAAVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQGQGLAGKVKRDAEKTDQMKANLTALFLPRQPPMALTEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFHTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEKEEEEEEKARAESKEEATVEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKVARGALQPSLYQIRTNGSALCTRCIQISTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGLGAQKPYDDNAEYMKYTRLFRCSNEKGFFAVTEKWAVPTPHNSAL	320548	333740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_320640_322238_322350_322666_322739_323612_323694_324015_324102_324237_324400_324827_324932_325282_325459_325544_325703_326319_326405_327187_327243_327427_327565_327760_327974_328198_328379_329029_329113_329237_329313_329537_329622_329775_329948_330465_330571_330652_330845_331221_331411_331552_331693_331766_331990_332117_332273_332376_332438_332541_332671_332735_332843_332948_332991_333435
908122	contig_6361_pilon	-	4168	3	Intergenic	novelGene_24021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_2	3621.5	140	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	81	410	420979	419370	FALSE	15	CCAGGGATCAGTGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPVSHFQYCIIQICNHTQNNCYKYSCHLMVSFI	436345	415611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_419591_420870_421003_436288
908123	SIRV7	-	565	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113328	23	113150	-18	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACCTATTCTTCCAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1588	1023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_1600
908124	contig_1918_pilon	+	2590	3	Intergenic	novelGene_168326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	10.5	187	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	411	1070	50221	51989	FALSE	40	AAGAGACAGGCAGCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGLTEVERKFVPGPGTEERLQELGGTLEHRITFRDSYYDTPELSLMRADHWLRQREGSGWELKCPGVAGVSGPHTEYMELTAEPAIVAQLCEVLGAEGLGAGGVAAVLCPLGLQEVASFVTKRSAWKLVPLGAEELPLWVHLDTADFGYAVGEVEALVHEEAEVPAALEKIHSLSSLLGVPAQEKPPAKLMVYLQCFRPQDYQLLLEENSSREKPRD	49490	53509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_50215_50762_51870
908125	contig_14326_pilon	-	2386	8	Intergenic	novelGene_120724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_7	42.1179102917861	474	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	16	1245	493216	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSVGPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPATSCRSFKSQLVTREGNELYHCVIYLAPGDYHCFHSPTDWTVSHRRHFPGSLMSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	493231	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443932_444094_444332_473560_473737_487113_487194_493151
908126	contig_20596_pilon	-	3054	2	Intergenic	novelGene_157235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	500	904	94206	93802	FALSE	30	GATCCTGAAGCTGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVQLGLLPSVPSVLDHMLPPEIIECQTIHFGTVTLYFFHLLLMLPVSFSILPIEFLRIATRGLIFFFSSFSLRNVEHVLCFWFSNFRSLHISLYYFYFVFSSHPLISSVQLFIIFPFCFSSSTFKSKFQSLF	95025	91651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_94308_94627
908127	contig_14651_pilon	-	3684	10	Intergenic	novelGene_157216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	50.4667107001129	341	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	56	1108	112577	87171	FALSE	35	ATTTGAATTAATTGTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVAWGRFFARAWLCRRAWQGCSRQYRAAFCAELKQPLAIEKVDHRPVCPHEVRVNVHFCGVNFADILVCRGQYQEEPHLPFTPGMEFSGIVLETGTDVSTVKEGDRVIGVCGFNGMAEECITDQKSLWKIPEGVALREAAVLPISYGTAVLALEHRARTQPGETVLVTAAAGATGLAMIDVATNVLQAKVIAAAGNEQKCKLAMQRGAQSSVNYSQGSLKEAVRKLVGSGGVNVVIDTVGGDVFLEALRSLAWEGRIVVVGFAGGTIASVPANVLLLKSISATGMSWGQYKNKNFSLFSSILSSVLRYCQQGRIQPYIGAEFKLEEVNDAFLHVTRRKSTGKVLLSLK	112632	84594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14651_pilon_-_87240_97825_98055_100098_100281_106152_106235_107093_107204_107844_107911_108633_108693_109977_110075_112325_112435_112527
908128	contig_2730_pilon	+	2114	2	Intergenic	novelGene_135375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCATTGTTATATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309897	312104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_310128_310220
908129	contig_401_pilon	+	3472	24	Intergenic	novelGene_42907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	386.313774933296	13	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	32	1477	1929703	1946502	TRUE	20	TCTATCTGCTGGTGACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSAYEHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKKTCSDPKSKPPFLLEKSMESSLKYINKKFPNIDIRNSTQHLGPVHREKSEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSLYFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSVISTPSAMINPAGSDTMACEYLSMDVMERWIIIGFLLCHACLNSNTQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSGLKGYGKRVADIKESKEYVIANSGQLHCQRRQFLRMAVKELGSVLTDEPGLLGPKALLAFMALSFIRDEVTWLVRHAENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEEIRALVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSTLSSLNLKQGNWREMRE	1929671	1973178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940691_1941959_1942009_1942104_1942262_1943853_1943911_1944536_1944634_1945199_1945310_1945464_1945598_1946394_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1955935_1964496_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968844_1972807
908130	contig_6020_pilon	-	1584	5	Intergenic	novelGene_155568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	282.776744977376	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	331	702	349599	293623	FALSE	70	AAAAAAAAAAAGATTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFDEIYEEEEDEERALEEQLLKYSPDPVVVRGSGHVTVFGLSNKFESEFPSSLTGKVAPEEFKASINRVNSCLKKNLPVNTRRSIEKLLEWENNRLYHKLCLHWRLSKRKCETNNMMEYVS	349929	292740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_293692_293857_293915_318353_318426_318550_318606_349480
908131	contig_299_pilon	-	1809	1	Intergenic	novelGene_129446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTAGGGGTGTGTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933762	931953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_932000_933800
908132	contig_14796_pilon	-	6851	3	Intergenic	novelGene_159363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	5210	5563	82064	81711	FALSE	35	TCATACTCAATGGTGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKLNDTGSIKSRWKEYTESLYQKELVNIQPFQEIAYGQELMILKEEIQASLKALEKNKAPGIDGIPIEMFQQMDATLEAHTLPKIWKTATWPTTRKRSVFVPIPKKGDPTERGNY	201868	80422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_82651_108898_109735_198081
908133	contig_14441_pilon	+	1172	5	Intergenic	novelGene_100736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	114	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	332	1132	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120686	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120854_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
908134	contig_3818_pilon	-	413	2	Intergenic	novelGene_99309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	1069794	1068645	FALSE	20	TTGTTAAAGCTGTCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLTSWCAGHSEGWGLLLLAELAVHIPHRITRRKPETCVDSERWQRGRRIVTELSWLWRQSTEEASRETGVPHTTKKAVLGAERVLWTWGSCVEKLLVQGKIDDKDLPPEPTEKAFPWS	1069794	1068591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_1068815_1069604
908135	contig_9705_pilon	+	4834	4	Intergenic	novelGene_41736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGCCCGGGCGCGCGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290948	340876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_294900_311376_311949_337253_337342_340653
908136	contig_12677_pilon	-	784	1	Intergenic	novelGene_110785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
908137	contig_13123_pilon	+	2126	5	Intergenic	novelGene_136892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.757888874354	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	149	586	434529	444679	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTFGCFITTAFKDQDFTGPRERSDLGFITFDITADLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434380	446219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434578_436408_436472_439024_439102_443433_443550_444546
908138	contig_15897_pilon	+	2240	9	Intergenic	novelGene_49508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.1869176962472	9	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1164	1709	156970	161266	FALSE	20	TCTTATTTCCCATTGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFTANLEPVSLADREVISRLRNCIVSMVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG	153132	161797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_153272_154566_154682_155344_156188_156903_156994_158052_158119_158627_158697_159745_159923_160322_160452_161185
908139	contig_10541_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_144637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGAAAAAAGCAACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188080	185050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_185000_188100
908140	contig_12090_pilon	-	2470	2	Intergenic	novelGene_80511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	132	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2147	2470	303292	302969	FALSE	20	CCGTCCTCATTAAGTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWRHQGRSLLEHDKLITAHPKTHQFTRGLSHARKCVRASTGLSLVVTGVSFYREGNWLRLPRWRLEEGGRNPDGPPLACDPIPTAAKYEGRHGAVAGIAGVGGEVGI	305663	302968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_304172_304396
908141	contig_5988_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_16042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1429	1833	998548	998144	NA	50	TGACCAGAAGAAATAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEVICDFLMCCKLYHYEEVILMRSMGLDSVLSQSLLRYKREKQAETHGNLTPPRKQCREQSASFGPEVPVLMHHKDLPPELTERESLLLELTPQIWTYSLLDYERINLSLLKPSTCGISVTAALDD	999976	997517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_997500_1e+06
908142	contig_8317_pilon	-	1410	4	Intergenic	novelGene_20746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_2	2.16024689946929	35	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	109	1068	70020	56357	FALSE	30	TTTGACTATTTCTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLQSRARRVAGSLGSLIKQHLSLARFSGESGAPRSPHFDVVVIGGGHAGTEAAAAAARCGSRTLLLTHRVDTIGQMSCNPSFGGIGKGHLMKEVDALDGLCSRICDQSGVHYKVLNRRKGPAVWGLRAQIDRKLYKQNMQKEILNTPLLTVQEGAVEDLILTEPEPEHAGKCRVSGVVLVDGSTVYAESVILTTGTFLRGMVVIGLEMHPAGRLGDQPSIGLAQTLEKLGFVVGRLKTGTPPRIAKDSINFNILNKQMPDNPSIPFSFINETVWIKVSKFMKSLLYSLYWLFVTRESLALFFYFTIHYCSECKNMIF	70128	56014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_56773_64086_64205_64292_64493_69794
908143	contig_12938_pilon	-	2464	3	Intergenic	novelGene_99750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	465	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACAGTGGTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86327	81948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_83468_84548_84632_85465
908144	contig_14933_pilon	+	4862	17	Intergenic	novelGene_165042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	89.707837415412	262	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	232	1707	10009	49725	TRUE	25	GAAAACAGCCGGTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELDQNATEKVQAMFTAIDDLLYEKKLSIHTKSLQEECQQWTSSFPHLRILGRQIIAPSEGYRLYPRSPSAASASLEATLPQERDSTIFGIRGKKVHFSSSYAHKASSIAKSPSLCSMEREEEKDCVIFSEGIIEEYLAFDCTDMEEEFHGTKSEVAAEKQKLGYPPIAPFYCMKEDVLACVFDNVWSKVLGCMEELIRNHWEGYVSDDESNVAVTRPDSGSPCVLSEPQPLVLPRVPQSKVLPITSNPMSLCQAASSHQPNMNGLLVHGMPLQPRNLSLMDKLLDLDDKLLMRPGSSTILSTRNWPNRALELSTSSLSHTVQSVRRRNPPPRTLHPISTSHSRAGTPRPVEDLLRGTRVPAAADSLSSPSPMPLSRNNLLPPIGTAEVEHLSAVGPQRQMKPHSDSSRARSAVVDEPNHQQPQERLFLPDFFSRPNTTQSFLPDAQCHRSCAVEYPHQARPGRGSAGPQLRGSTKAQSRGGPVSRTRQGP	8034	56087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_+_8141_9883_10012_18502_18646_19714_19832_30860_31032_36413_36602_37750_37876_39877_39985_44024_44250_45721_45846_46085_46212_48389_48463_49651_52188_52534_52619_54752_55006_55563_55704_55871
908145	contig_7870_pilon	-	3358	1	Intergenic	novelGene_108903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1764	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2178	2621	200478	200035	NA	50	ACTTAGAAAAATAGGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEISKEIKQNTDHAIEEVKKIREEHNDKFNRLQESMERQQSEIQKINNKISELDNSAQSHTSRIEAMEVRISETEDKALDTNLFEETSDKRIKKNEETLRIMWDSIKRNNL	202655	199297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_199300_202700
908147	contig_10627_pilon	-	2809	20	Intergenic	novelGene_59956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1437	1943	176023	175195	TRUE	20	TTTCACCACACCTGGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSPSSAMETPGRSIFSSTRSRCFLCSRSSFFFFLRGCGCGIEPVFCPALKMPHPGPAVSSPIFTYEGILGGGGRRFPHLFSSATSCAFISARVWFNCSSSSSSLEGCLLVPAVDSSSLPSSSSSPELRLMSSAFACSFSFLATCLRSFVLQFSRDLSSLRPSTLIS	179327	172577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_172592_172705_172809_172976_173077_173387_173435_173554_173634_174245_174346_174429_174624_174766_174823_174938_175045_175127_175228_175457_175538_175629_176052_177070_177254_177414_177536_177620_177893_178136_178220_178307_178408_178514_178699_178781_178877_178957
908148	contig_8864_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_136007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAGGAAATTAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737967	736334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_736300_738000
908149	contig_10063_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_127747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	31	303	432647	432919	NA	35	TTGACCCACAGAAATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEPECSLEAKMVRLCLTYFGHVIRRAQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPLTRWIDTVAAVMGSSRTMIASMAQDRAVFRSVVHRIAVSCNCLDGTYLQQQQQ	432616	434675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_+_432600_434700
908150	contig_1244_pilon	+	2197	20	Intergenic	novelGene_37912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	138.820556166601	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	33	1097	260557	280434	TRUE	55	AATCTAAAGAAACTGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPGFPDADSFVKFALGSVVAVTKASGGLPQSGDEYDFYRSFAGFQAFCETQGDRLLQCMSQVMQYHGCRSNIKDRSKVTELEDKFDLLVDTNDVILERVGILLDEASGVNKNQQPVLPAGLQVPKTIVSSWNRKAGEYSKKTKSETFRLLHAKNIIRPQLKFREKIDNSNTPFLPKIFIKPNAQKPLPQALSKERRERPQDRPEDLDVPPALADFIHQQRTQQVEQDMFAHPYQYELDYFTPPDSVLQKPQPQLYRPVEETPCHFISSLDELVELNEKLLNCKEFAVDLEHHSYRSFLGLTCLMQISTRTEDFIVDTLELRSDMYILNESFTDPAIVKVSQPFPALACLPRC	260524	290045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_260599_262586_262724_266552_266677_273675_273781_274112_274279_274467_274583_278843_278920_279131_279243_279450_279623_280417_280609_281618_281776_281917_282067_282243_282295_282949_283062_284465_284517_284679_284759_284858_284969_287074_287171_287422_287498_289999
908151	contig_3424_pilon	-	4867	1	Intergenic	novelGene_55544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACCAATGTTCACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295539	290672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_290700_295500
908152	contig_5684_pilon	+	2939	4	Intergenic	novelGene_81048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	184.896968306376	1	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1868	2431	443906	447039	FALSE	70	TTTAATTAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLLHDAVMNPAEVVKQRMQMYNSPHRSALSCIRMVWTTEGLGAFYRSYTTQLTMNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403582	447547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_443223_443891_443949_446518
908153	contig_1575_pilon	+	2357	4	Intergenic	novelGene_45189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_2	207.417453460407	939	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2051	2356	183620	190544	FALSE	30	GTAATGCCATTTCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLR	181481	190545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_183487_183574_183665_185018_185124_190388
908154	SIRV6	+	724	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-11	588	-5	-45	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	25	6	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGTCGAAGTCGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119	10743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
908156	contig_10377_pilon	-	2063	8	Intergenic	novelGene_115388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.349927106111883	20	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAACAAAGGCTACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257732	209087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_209211_219443_219613_227485_227764_237453_237773_251668_251752_252537_252616_255019_255167_256866
908157	contig_3956_pilon	+	2231	11	Intergenic	novelGene_15178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1465.82775591131	8	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	169	1338	1282879	1289629	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSAVSPSSPRESPVFSRPGQGVALDGMVTACTIVILPGRDGDIMYRHLGDRGLVFPATGRYNLVRCCWPLVAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSLC	1282710	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283097_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286422_1289621_1289677_1289758_1289892_1290297
908158	contig_4845_pilon	+	2360	2	Intergenic	novelGene_53690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860846	863611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_862536_862940
908160	contig_14041_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_144033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTACCTGTATAACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37142	38265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_+_37100_38300
908161	contig_19032_pilon	+	2954	4	Intergenic	novelGene_172523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	99.6036590135568	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACCAGTCGGCAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143198	148299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_144306_145555_146727_146810_146875_147687
908162	contig_7976_pilon	-	6854	20	Intergenic	novelGene_169410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	167.670845603444	451	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2889	280	3168	870263	763627	FALSE	5	GCTCATTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENEDEKQTQAGQIFQNFVQASTCKGTLQAFNILVRHLDLDPLDHRNFYSKLKSKVTTWKAKALWHKLDKRGSHKEYKRGKSCMNTKCLIIGGGPCGLRTAIELAYLGAKVVVVEKRDTFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGSIDHISIRQLQLILFKVALILGIEIHVNVEFVKVLEPPEDQENQKIGWRAEFLPADHSLSEFEFDVIIGADGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNSTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQDLKEETGIDLENIVYYKDCTHYFVMTAKKQSLLDKGVIIDDYTDTEMLLCAENVNQDNLLSYAREAADFATNYQLPSLDFAMNHYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVRERQAHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGCARGFLAAFDTAWMVKSWDQGTPPLELLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYTLDPGTRYPNLNSHYVRPHQVKHLYITEELHCYPLERVGSVRRSVRLSRRESDIRPSKLLTWCQQQTEGYQHVNVTDLTTSWRSGLALCAIIHRFRPELINFDSLNEDDAVKNNQLAFDVAEREFGIPPVTTSKEMASAQEPDKLSIVMYLSKFYELFRNTPLKTVDSWGKYYGENADLSLAKSSISNNYLNLTLPRKRTPRVDGQTEESDMNKRRRKGFNNLDEPSCFSSRSVGPNQECVSIKEGGNQNKVKSIANQLLAKFEESTLNPSLLKQDCMRKVCPLNLGGSDTCYFCKKRVYLMERLSAEGHFFHRDCFRCSICATTLRLAAYAFDCDEDKFYCKPHFIHCKTNNKQRKRRAELKQQREEEETWKEQEAPRRDTPTESSCAAVAIGTPEGSPPGITTSFFRNVLSQLLRVPRDLLDIPSSLLNWMRGLLRRAGLHIRDNAYNYCYTYELLSLGLPLLWVFSEVLATMYQEAEVSLESIRNSLLRCFPVKLH	925013	759940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_764026_766970_767060_768542_768730_787569_787720_791542_791612_802717_802825_803218_803419_804513_804662_806660_806752_807379_807507_808599_808716_810109_810368_815178_815280_818142_818299_821105_821208_822558_822676_826025_826234_869999_870339_894010_894077_924875
908163	contig_546_pilon	+	5815	1	Intergenic	novelGene_117196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAATAAAATTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77050	82865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_77000_82900
908164	contig_13625_pilon	-	4833	9	Intergenic	novelGene_150154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_3	113.994448878005	129	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	57	1481	43661	27060	FALSE	20	GTCATGCCTTATTTATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAADLLRKMATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	43717	23707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27253_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
908165	contig_9415_pilon	-	2022	2	Intergenic	novelGene_109740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2010	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1512	1826	560813	560499	FALSE	70	TAAAAAATATATAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCIFTQITCAFCVCLLALPSPPPQVTLTSAALPLPHVAVKKKIRIVHLTKIAHGVGGEGVASKQRQKLCSISIKIQYIELKNKAETSYEEKELEKQRKESQGG	565838	560302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_561704_565217
908166	contig_11285_pilon	+	2062	9	Intergenic	novelGene_5491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_5	52.5153251441901	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	17	1549	109495	120031	FALSE	0	TTTCTGTGGCTGTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR	109478	120544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_109685_110050_110233_112310_112452_115160_115317_116758_116897_117804_117934_118111_118309_118809_118990_119811
908167	contig_14829_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_163820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGCCAAGCAGTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118253	117103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_117100_118300
908168	contig_5686_pilon	+	3728	5	Intergenic	novelGene_45481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	432	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCTGTGTTCTTACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232607	389722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_234706_268803_268942_271005_272097_389184_389336_389472
908169	contig_9720_pilon	-	4142	7	Intergenic	novelGene_116797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	78.6209259675819	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	373	2250	443336	424148	FALSE	0	TTGTGTGTTTTTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RISKNIPTTKDVEPLLEIDGDIRNFEVFLSSRTPVLVARDVKTFLPCTVNLDPKLREIIADVRAAREQINIGGLAYPPLPLHEAPPRPPSASSQPPSVCSSTSFTGPFGGGVVSPQPHSSYYSGMTGPQHPFYNRPFFAPYLYTPRYYPGASQHLISRPSVKTSLPRDQNNGLGSGPASGPLISLNSMNVDAVCEKLRQIEGLDQSVLPQYCATIRKANINGRVLAQCNIDELKKEMNMNFGDWHLFRSTVLEMRNAENQVVPEDPRLLNENSGGPVPHGEPARRSSHSELPHTELSGQTPYTLNFSFEELNTLGLDEGAPRHSNLSWQSQTRRTPSLSSLNSQDSSIEISKLTDKVQAEYRDAYREYIAQMSQLEGGAGSTTISGRSSPHSTYYMGQSPSGGSIHSNLEQEKGKDSEPKQDDGRKPFVMKRGDVIDYSSSAVSTTEASPLDPITEEDEKSDQSGSKLLPSKKSSERSSLFQTDLKLKGGGLRYQKLPSDEDESGTEESDNTPLLKDDKDKKAEGKIERVSKSPEHGAEPIRTLIKAKDYLSDALLDKKDSSDSGVRSNESSPNHSLHNEAADDSQLEKTNLIELEDDSHSGKRGIPHSLSGLQDPIIARMSICSEDKKSPSECSLIASSPEESWPACQKAYNLNRTPSTMTLNNNSAPANRANQNFDEMEGIRDTSQVILRPGSSSNPTVIQNENLKSMTHKRSQRSSYTRLSKDTSELRAVASSDSAGFGEERESIL	444744	422255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_425411_428094_428332_428864_428964_431982_432115_440769_440884_443303_443528_444563
908170	contig_10500_pilon	+	2780	8	Intergenic	novelGene_41268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACTCTGTCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626845	1640141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1628751_1629390_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635144_1635517_1635615_1636938_1637052_1640001
908171	contig_12970_pilon	+	3320	1	Intergenic	novelGene_50553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTTGTCATATACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587183	590503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_587200_590500
908172	contig_20332_pilon	-	2763	2	Intergenic	novelGene_156186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACAAAATGGCCGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645784	641989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_642273_643304
908173	contig_12178_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_156547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	636	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248142	250661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_248100_250700
908174	contig_1154_pilon	+	4093	4	Intergenic	novelGene_87043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1909	2256	58156	58503	TRUE	55	CTTTTTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKQITNFIWKGKRSHISKELLKNNNKVRSLTLPDFRTYYTATIVKTACYWYKRYVDQWNRIENPDTNLSTYEQLKFDKGPKPVKWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTP	56247	102817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_58720_59263_59361_59455_60091_101928
908175	contig_10857_pilon	+	381	4	Intergenic	novelGene_160890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	587.899651301138	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	1	381	21948	66847	FALSE	10	CCCTCTGCCCCCGCGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRQGSTGDLRLCSGPCIPPCPLLH	21947	66847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56565_66784
908177	scaffold_12510_pilon	+	1828	6	Intergenic	novelGene_151411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25.981531902488	13	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	268	582	625218	632145	TRUE	25	TGCTTTCAAGTCACTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRRWQKRICRPQPAVGQLSTVRGSQHSSAPPTPTSCASLRPGVTTSSSACALRSCASGSCAPRGAPLLPGTPSPPVHLSLEALLKPVRHQIATHKPLLTHG	624746	649325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_624862_625065_625453_632065_632202_633376_633447_633947_634084_648341
908178	contig_3525_pilon	-	1971	2	Intergenic	novelGene_135139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	79	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAATAAAGAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599724	596977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_598639_599414
908179	contig_10399_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_114478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142392	144012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_142400_144000
908180	contig_7744_pilon	-	3865	21	Intergenic	novelGene_62499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_20	65.334887311451	294	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2760	225	2984	807379	796392	FALSE	25	TCAGTTACTTCAACCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTYGVGCIALGEAGPVGSMTVVDSPGQEVLNQLDVKASPEMTNAEASIEMSLPTPLPEFEDSPDKKRFPLEQESLSRLEQQDLSSEMSKVSKPRASKPGRKRGGRTRKGPKRPQQPNPPSAPLVPGLLDQSNPLSTPMPKKRGRKSKAELLLLKLSKGLDQPESPPPKRPPEDFEAPSGERPRRRAAQVALLYLQELAEELSTALPAPVSCPESSKLSSPTKLKKSQADADPQGGGGEDDTAQDEDFVLQVEAEDEEESEIPSESSSDPEPAVLAVPQVPTVSAVPQVPAVPEVSTVPAVPAVPRSAPRGSTSGKQKPHCRGVAPNGLPNHIMAPVWKCFHLTKDLREQKHSYWEFAEWIPLAWKWHLLSEIEAAPYLPQEEKSPLFSVQREGLPEDGTLYRINRFSSITAHPERWDVSFFTGGPLWALEWCPVPEGATASQYVALFSSPDMNETHSLSQLHSGPGLLQLWGLGTLQQESCPDNRAHFVYGIACDNGCIWDLKFCPSGAWELPGTPRKDPLLPRLGLLALACSDGKVLLFSLPHPEALLAQQPPDAMKPAIYKVECVATLQVGSVQASDPSECGQCLSLAWMPTRPHHHLAAGYYNGMVVFWNLPTNSPLQQIRLSDGSLKLYPFQCFPAHDQAVRNLQWCKANSHFLVSAGSDRKIKFWDLRRPYEPINSIKRFLSTELAWLLPYNGVTVAQDNCYASYGLCGIHYIDAGYLGFKAYFTAPRKGTVWSLSGSDWLGTIAAGDISGELIAAILPDMALNPINVKRPVERRFPIYKADLIPYQDDPEDQDHYSASSGAPNPPKARTYAETVSHHYLLFQDTDLGSFHDLLRREPMLRMQEREGHSQLCLDRLQLEAIHKVRFSPNLDSYGWLVSGGQSGLVRIHFVRGLTSPLGHRMQLESQAQFNAMF	816509	795510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_796545_796822_796931_797074_797228_797492_797622_797871_797960_798152_798315_798409_798555_800374_800505_800664_800691_801772_801882_802094_802207_802379_802608_803112_803212_803357_803436_803703_803799_805487_805864_806637_806960_807132_807404_812401_812512_813382_813452_816488
908181	contig_5485_pilon	-	3283	6	Intergenic	novelGene_37738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_5	56.8774120367655	136	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	1522	2082	356011	352675	FALSE	35	AATGGGATGAATTTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIGYSRTVEAFLREAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEIAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTILANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPELITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL	357654	351473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_352833_354028_354096_354566_354705_355166_355263_355909_357315_357436
908182	contig_6674_pilon	-	4419	1	Intergenic	novelGene_147980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATATTTTCAAGAGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41078	36659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_36700_41100
908183	contig_10904_pilon	-	3700	8	Intergenic	novelGene_22669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	165.375515795083	18	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	578	1483	542583	537619	FALSE	50	ATAAAGGAAAAGCACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCTLWPLSLTGTYEKPSLSAHPGPSVTSGESVTLQCCSDDSFDTFHLFKEGFTAPPQRLHWQNNTGPFQANFTMSPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGGSKDQRQTPRESDPLTGLQEYLKVLIGVLVAFILLVLLFLLLFLFIRHQRHGKHRTAVSEPKDRGLPKGSSPATTDQEENLCEGERRCEISGNLAKKQVPLVLSLPDAAVIDKQPEEEMELDSQDMKDRQVEEGSQRDSQAATLEDPQEVTYAQLNHSTLRRETTTSPSSQSGKPSGEPSIYAALAIH	543160	535401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_538072_538121_539112_539228_539412_539464_539552_539596_540491_540606_541598_541650_542246
908184	contig_10904_pilon	+	4925	2	Intergenic	novelGene_22774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATAATAGAGGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707328	713731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_709103_710580
908185	contig_10311_pilon	-	2882	9	Intergenic	novelGene_50472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_8	1030.11655135475	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	322	972	68953	67177	FALSE	25	GTGTTAAGTGTGAACTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR	71555	65266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
908186	contig_10985_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_175548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTCAGTAAAACACAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237286	235475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10985_pilon_-_235500_237300
908187	contig_7396_pilon	-	1296	1	Intergenic	novelGene_79533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246397	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245100_246400
908188	contig_5317_pilon	+	3893	3	Intergenic	novelGene_76593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2985	3356	359295	359666	FALSE	35	ACGGGGGGAAACCACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNQEVCQGCILSPYLFNLYAEQIIQEAGLYEEHSIRIGERLINNLCYADDTTLLPKSEQDLKHLLMKIKDHGLQFGLHLNIKPKILTTGPISNIMINRENTEIVKDLILLGSTINTHGKSS	355267	360203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355763_356222_356341_356923
908190	contig_13702_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_102625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1	444	211415	210972	TRUE	35	AACCCACAATATCTACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFFVLGYNIFLKVALLWSGNLKYPNACFPRWSQPEELPPSLDVPGLRLDRIFLWTELHVPCLLTGGKRVGGSSCQSCAHNIPAVASFEADVLCLYTAASVVSSLCLLLSHARPHPAVTLLILPLEPKGQVCFRLLENRVGLDLEHS	211415	207782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_209202_210760
908191	contig_7151_pilon	+	4849	7	Intergenic	novelGene_40740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	152.775434325461	49	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502269	509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503041_503212_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440_508007_508218
908192	contig_5236_pilon	-	3304	12	Intergenic	novelGene_100964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_8	189.543601473392	4	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	85	1671	1011714	1007644	TRUE	30	AATAAATTGCCTTTTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYGRVCGRRGLLWAPLPPQVPL	1011798	1005873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
908193	contig_5590_pilon	-	3069	1	Intergenic	novelGene_163023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	608	982	334619	334245	NA	30	GAATTGCAGACTTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAETAAQSLVICSQQEAMLGGNLRRTSLLAQTGSRVTKTKLLPVLLNSQGLGKCGLGLVSRQARWWSTPLASALTRVHYEFTAAHILQTDKTTCLLLHGSCTIIGEIQDSPQGQRDEDGGPGL	335226	332157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_332200_335200
908194	contig_3095_pilon	+	3992	2	Intergenic	novelGene_75159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAACACACCCAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220468	228083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_224229_227851
908195	contig_5788_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_178563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTATTTTCCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4603	3481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_-_3500_4600
908196	contig_2069_pilon	-	2317	4	Intergenic	novelGene_23207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	193.868225578327	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	16	705	114391	97981	FALSE	30	AAATTGTTTTGTGATATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCCARCVLSAGAKQVTLHLPLSQKGLFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQIFSSLRTGATTSAA	114406	96368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_98025_109097_109509_111852_111994_114297
908197	contig_9471_pilon	+	3147	3	Intergenic	novelGene_21682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1112	1420	51749	52057	TRUE	35	CTATTATCAGACAATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVQLGLLPSVPSVPDHMPLPDLVERQSILYGIVTVSFFHLLLMLPSLFNIFPHRILQYCNSRWNFFIQFFQLEKCQTCSSFLVFYLQVFAHVIIILYFVF	11662	59202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_11752_50726_52185_57602
908198	contig_19378_pilon	-	3217	1	Intergenic	novelGene_73797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACCTTTAATACTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38748	35531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_35500_38700
908199	contig_17144_pilon	-	2918	17	Intergenic	novelGene_29445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1761.80323882769	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	108	2630	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183189	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
908200	contig_5020_pilon	+	2324	8	Intergenic	novelGene_27793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	186	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	466	1395	122915	125772	FALSE	30	CAGGAGCAAACTTCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118359	126701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
908201	contig_16103_pilon	+	4522	2	Intergenic	novelGene_118765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	270	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3820	4221	459238	459639	FALSE	30	GCCTTCACCTGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSWQGLHQTESNAARWCLATATDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGGWGNPESTAPRHPFTSVVKLSPRFTVSPGVDSPVKPNGTNEAQQSRDKGRKTEGDREAADREPRLSKGSVDVL	448498	459940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_452244_459163
908202	contig_17618_pilon	+	2871	1	Intergenic	novelGene_173355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGTTTGACTAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19661	22532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_+_19700_22500
908203	contig_6552_pilon	-	3537	2	Intergenic	novelGene_163594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2797	3141	111010	110666	FALSE	85	GCAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSFSKVLSCQTKATKGQLTKLSLAFLIFRWNWEKFIVIFKCHLSKPDHLTLVGRIILKNEPDYSSCADLEITYSFDPVIDKNKQRKGEKAKSSNLCSLPSPMAGQSRAMAHY	114680	110269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_113291_114164
908204	contig_7396_pilon	-	2589	14	Intergenic	novelGene_79561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3441.03917323183	5	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	97	981	255163	248261	TRUE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPRWFQC	257083	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248838_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
908205	contig_2078_pilon	+	2723	12	Intergenic	novelGene_100171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1325	1744	529532	530319	TRUE	35	GCTCAGATGAGGTCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQREVEGHSSSRGGRVVPQDDILMIEPVQDRGRASLGLTVKLHHIPHHTLGPGSPEGEDRTRHWNSHDDCNPLAEDGAVNVVSCTVVSASIAFLHSEDWQLCPQGTLRLSSQTYSAFSVPGECDSACTLGYRADKD	504737	535450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_505666_505745_505778_508728_508798_514637_514725_515321_515345_521683_521793_529455_529735_530102_530387_531774_532061_532301_532572_533234_533481_535340
908206	contig_5686_pilon	+	2187	2	Intergenic	novelGene_45478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTAGGTCTTCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227236	234060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_229347_233983
908207	contig_5574_pilon	+	3515	1	Intergenic	novelGene_155866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	707	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1205	1600	205138	205533	NA	15	TCTGCCCTTCAAGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLMTTNSILKIHLRPGTVSITLPEASWFKVHPSIPGQGLLPFLESPDSSTPLSFPLVPPSASVLTTTKCPVFLYSCLGHHYSHSVGTMFISPCPHYLGILERRHPAARSCDLLACGSSWNLVGRSGVQVT	203933	207448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_203900_207400
908208	contig_11986_pilon	-	2737	17	Intergenic	novelGene_69215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1267.29261123862	2	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	115	2235	792566	734510	FALSE	35	GTAATAAATGTGAACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKYQSPVRVYKHPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVDSDTVNEFKSEDGAVHVIERRCKLDIDAPRLLKKKNSLNSRERTLHIEAHNETFSNRVIINEHCCVHPENEDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLHQLEEEGITFVPRWTPPSLAPSSEAASSCKKRAVATAVVIPDTALTEGPSSEALSNAGGAPEPLVGTPDDKLDADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTWRKQHQVDYILDTWNPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSRWRFC	794699	734007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_734526_736172_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135_744308_745285_745357_747984_748074_751501_751692_753182_753293_755576_755812_756609_756739_757974_758068_758220_758371_792503_792597_794615
908210	contig_3789_pilon	-	2165	2	Intergenic	novelGene_79899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCTCACGTAGCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636919	634688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_635744_635809
908211	contig_9332_pilon	+	5142	1	Intergenic	novelGene_60737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	245	646	570965	571366	NA	75	AAAAAAAAAAGATAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDGKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLTKTKDKERILRAAREKQKVTYGGETVRLSSDYLAETMQARRQWDDISKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRLFPDKQKLRDYVKTKPNTRIIKGSPSI	570720	575862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_570700_575900
908212	contig_3975_pilon	-	2043	13	Intergenic	novelGene_54826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	245.101155421367	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	261	1217	2066301	2060077	TRUE	15	GTACATCTCTCTGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITPH	2079242	2056371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060090_2063831_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
908213	contig_3155_pilon	-	3753	1	Intergenic	novelGene_26445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	380	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	52	330	332640	332362	NA	5	TTTCCACCCTTTGGCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTTGSRARAGRPQGAGRMAESKAGGAAGLFAKQVQKKFSRAQEKVGDRISPPACPSEARTAGGACRALKGPGSPGRERRVSDFSRKWEWKMGFHVYGQTERERKKTTQS	332691	328938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_328900_332700
908214	contig_8898_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_137248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	731	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATCATCCAATAGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302744	304881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_302700_304900
908215	contig_2219_pilon	-	1806	2	Intergenic	novelGene_67174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106250	98832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_100143_105754
908216	contig_6062_pilon	-	2606	14	Intergenic	novelGene_5287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	27.8425412021194	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	118	942	791135	766811	TRUE	35	AAGATCTGGTAAACGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTGVGTLCAAARAVIPCLWRGKCFSSGKELGENSPVTPMLRHLMYKIKSTGPITVAEYMREVLTNPAKGYYVHHDMLGEKGDFITSPEISQIFGELLGIWLISEWMATGKSSTFQLVELGPGRGTLTGDILRVFSQLGSVLKNSDISVHLVEVSQKLSEIQAVTLIEENVPLEQNAGSLVYMKGVTKSGLPISWYRDIQDVPKGYSFYLAHEFFDVLPVHKFQKTPQGWREVFIDIDPQASDKLRFVLAPCATPAEAFIWSGETRDHVEVCPDAGVIIQELSQRIARAGGAALIADYGHDGTKTDTFRICTH	791565	748692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_748738_752904_753014_758766_758929_759165_759264_761709_761979_765829_766826_772256_772401_774626_774738_775433_775493_776297_776512_783038_783150_784740_784822_791045_791210_791522
908217	contig_7963_pilon	-	865	4	Intergenic	novelGene_58411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	284	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACTATATGTCTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63233	56764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_56970_57284_57563_57781_57934_63003
908218	contig_5958_pilon	-	2939	3	Intergenic	novelGene_140076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	238	546	142381	142073	TRUE	25	TCCGCTAATGTTTTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAGDRTTSNQQYMLSHPPPFFTPTWPPLLPAATVSWPGGNGFIPVLPGFHPHTLTSSLSAICCWLLFSASVSSIPLTTSPSFLSNTWLRVPSLLLPERL	142618	6615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_7417_7735_8378_141122
908219	contig_6742_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_144558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTAATGGGGCCAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45068	43820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_-_43800_45100
908220	contig_13295_pilon	-	2889	3	Intergenic	novelGene_31226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	286	103	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAAGTACGTTGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134765	80533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_83228_85560_85677_134686
908221	contig_16310_pilon	-	2433	14	Intergenic	novelGene_70036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1050.03124213875	3	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	138	1160	66135	61549	TRUE	10	GTGCCAGACTTGTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKLAKAGKNQGDPKKMAPPPKEVEEDSEDEEMSEEEEEEEESSGEEVIIPQKKGKKNTTVPSKKVVVSPTKKVVVAAPAKKVSVTPGKKAAATPAKKAVTPAKAVATPGKKGAAPGKAVVATPGKKGAATPAKGAKNGKNAKKDESDEEDDEDSEDDEDEEEFEPAMMKSAAPASEDEDDEDEEEEEDDEEEEEEEDEDDSEEEPMETTPAKGKKAPPKAAGKAKSVAEEEDDDDEDEEDDEEEDEEDEEEDDEEEEDDEEEEPVKEVPGKRKKEMSKQKAAPEAKKQKVEAVEPTSAFNLFVGNLNCSKSAPELKTGISDLFAKNDLAVVDVRIGMSR	66272	56152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_56616_57150_57199_57599_57727_58458_58593_58807_58932_59409_59542_59986_60111_60991_61113_61548_61695_61891_61979_62085_62275_63077_63538_64831_64955_66117
908222	contig_12841_pilon	+	3684	1	Intergenic	novelGene_55902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAATAAATAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919806	923490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_919800_923500
908225	contig_9036_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_155462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTGCCCAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180943	179258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_179300_180900
908226	contig_5951_pilon	+	3527	1	Intergenic	novelGene_153244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	729	1085	194315	194671	NA	20	TCTGGCTCATAGTTTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSLSFLDGQLFIFHDIGEVFCQQFFNDPVFSVFSPGSGTPITCKFFLLIVSHITVRFSSFFFVLFSEFPLNRIVSKCLSSIPLILSSTNSNLLLSSSMTLSICEILLFIFWISVIFV	193586	197113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_193600_197100
908227	contig_20662_pilon	-	1661	15	Intergenic	novelGene_177643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_9	205.086691475601	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1050	611	1660	68547	42666	FALSE	25	TGTCAGTACTGGGAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAFVYGTTYQFVLTTEIAVLESIGTEDIEYAHLYFLHCKPVLDFIQQCRRTLMEQPLTTLNIHRFIKTMEAPLLTEVAKDPQQVSTIHLQLGLPLVFIVSQQVTYEADRRTAEWVAWRLLGKAGVLLLLRDSLEVNIPQHANVVFKRAEEGMPVEYLVLDDIDLIISRVESNVHTQEIQEDEDDDMEDPDMETEDDEVAETVYRDRKRQLPLELTVELTEETFNTTVMASDSIVLFYAGWEAVSMAFLQSYLDVAVKLKGTSNMLLSRVNCGDWSDVCTKQNVTEFPFVKMYKKGENPVSYAGMLGTEDLLKFIQLNRISCPVNITSVQEAEEYLSGKLFEDLLSYSS	110025	42664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_42763_43103_43273_47171_47232_48321_48466_55419_55544_57089_57151_57534_57702_63603_63755_68470_68562_85171_85247_86052_86127_96395_96479_97739_97817_98606_98718_109849
908228	contig_10042_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_79245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGACTCTGGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1201060	1199318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1199300_1201100
908229	contig_17144_pilon	-	2179	13	Intergenic	novelGene_29428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1773.74385129308	5	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	205	1890	179764	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183286	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173440_179738_179786_181794_181850_183158
908230	contig_3747_pilon	+	2328	5	Intergenic	novelGene_24826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	915	1241	203794	204120	FALSE	20	GTTGAGTTTTTTGTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201370_202933_203128_203228_203386_203498_203651_203768
908231	contig_10263_pilon	-	5143	12	Intergenic	novelGene_135835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	3921	4397	875821	873847	TRUE	55	AAAAAAGAAAGGGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWFFRTGVASVWGGSGLGRDLIMSPKSGVISHISRLSARGVFLSEWFWHSSYRSAVLHRRGRQHCLLLFLHLLPELLLQLLLPELPLVRGITLRSRRGHASGSCRPYPSVSQCGDHLSGLVCKGRSPPVALGVLEPCSVGSCYIAPVPQMVQNLVSLL	880202	858821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_858986_866403_866502_867600_867703_868277_868373_868549_868617_870538_870655_871590_871671_873822_874020_874162_874271_875305_875385_875704_875919_876379
908232	contig_2940_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_81918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1230	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	286	585	543771	544070	NA	45	CTAAATCAGAAAGGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATSTDCSDHDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNRESTAPRHPFSSVVKSFPRFTIRPGSGQPRKTKCD	543485	545630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_543500_545600
908233	contig_15327_pilon	-	2107	12	Intergenic	novelGene_70763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	78.1646915701998	40	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	14	1264	1169101	1135719	TRUE	15	GTGGAGACTCTGTCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169114	1129702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
908234	contig_6102_pilon	-	3665	6	Intergenic	novelGene_32077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	105.218629529186	67	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	53	1027	786149	784393	FALSE	35	AGATTCAAAAGACTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLAPQRKTTNPLDLAVMRLAALEQNVERRYLREPLWSPHEVVLEKALLSTPNGAPQCTTTEISPFLPSRSYEITPRIRAWRQTLERCRSAAQVCLCLGQLERSIAWEKSVNKVTCLVCRKGDNDEFLLLCDGCDRGCHIYCHRPKMEAVPEGDWFCAVCLAQQVEGEFTQQPGFPKRGQKRKSGYVLNFPDGDGRQRRLLSRGRENLVVPQCSEEGLSPSKRRRLSMRNHHSDLTFCEIILMEMESHDAAWPFLEPVNPRLVSGYRRIIKNPMDFSTMRERLLRGGYTSSEEFAADALLVFDNCQTFNEDDSEVGKAGHIMRRFFESRWEEFYQGKQANL	786201	781754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_784559_784646_784791_784899_785127_785506_785654_785774_785929_786012
908235	contig_5071_pilon	-	3340	2	Intergenic	novelGene_171273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1277	1672	34133	33738	TRUE	70	AGGCAAGAAAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQENNTGTKCQNEFITRNNTKTKFKIQKINNKISEMDSVIEGLSRFEMMEDRICKIEDEHLDTTLFEEKSEKRTKKNEENLRIMWATIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTERIIENLLTENFPNIMKDDKLTI	35409	30933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_-_32171_33306
908236	contig_10904_pilon	-	2464	12	Intergenic	novelGene_22670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_10	166.819494669097	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	60	1535	544621	537619	FALSE	15	TTTTATGCCTGATATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYPARLCGHCSSSAVLETMQGSATTLTLTALLCLGLCRGQRNQVHTGTLSKPSIWATPASIITKGSSVTIWCQGSLQAGICRLYRDGDPQYWDEHSLWNSRDLCSFSIKSMDVHYAGQFWCAYNRWSGWWSGWSERSDPLLLVMTGAYSKPSLSAHPSPLVTSGGKASLMCSSNDTMDTFHLLKERGASPPQHRKSQFSPGTHHATFPVNPVSTSHGGTYRCYGSSRSSPQVWSHPSDPLDLKVTGTYEKPSLSAHPGPSVTSGESVTLQCCSDDSFDTFHLFKEGFTAPPQRLHWQNNTGPFQANFTMSPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGGSKDQRQTPRESDPLTGLQEYLKVLIGVLVAFILLVLLFLLLFLFIRHQRHGKHRTAVSEPKDRGLPKGSSPATTDQEENLYAAVIDKQPEEEMELDSQDMKDRQVEEGSQRDSQAATLEDPQEVTYAQLNHSTLRRETTTSPSSQSGKPSGEPSIYAALAIH	544680	536689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_538072_538121_539112_539166_539425_539464_539552_539596_540491_540606_541598_541650_542246_542547_543359_543660_543823_544121_544311_544348_544572
908237	contig_5337_pilon	-	3265	1	Intergenic	novelGene_136574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1156	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCCTTCACCAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383601	380336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_380300_383600
908238	contig_6446_pilon	-	2457	2	Intergenic	novelGene_149191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	611	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	559	879	245575	245255	FALSE	55	GAAAACATAAACCATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFSDRDHNRGFWTELQKDVEHNSNSQKKDQLYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKLSPRFTLQPGSGQPRKTK	295741	243676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_245830_295437
908239	contig_9481_pilon	-	5471	1	Intergenic	novelGene_149685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTCCCCAGTAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469836	464365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_464400_469800
908240	contig_11307_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_105243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCAATCTGTAAGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75551	77929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_75600_77900
908241	contig_7563_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_145555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGGCCCATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99525	102052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_+_99500_102100
908242	contig_1452_pilon	+	2055	3	Intergenic	novelGene_115144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGAGAGACGAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698262	715442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_699952_700533_700690_715232
908245	contig_18511_pilon	+	2083	11	Intergenic	novelGene_126878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	373.733273873226	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	155	1840	47371	61308	FALSE	20	TTTGAATGTTCTGAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35417	61551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47538_48149_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
908246	contig_6593_pilon	+	2873	1	Intergenic	novelGene_49849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGGGAAGATTAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1207989	1210862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1208000_1210900
908247	contig_14243_pilon	+	1367	7	Intergenic	novelGene_57433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.6766812457914	136	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	206	1171	672680	700060	FALSE	20	TTCTTTTCTCTGAAGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFFGFGQSVEVEILLSDAESRKRAEHKTEDGKKEKYFLFYDGETVSGKVSLVLKNPNKRLEHQGIKIEFIGQIELYYDRGNHHEFVSLVKDLARPGEITQSQAFDFEFTHVEKPYESYTGQNVKLRYFLRATISRRLNDVVKEMDIVVHTLSTYPELNSSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIKHMEIDIIKRETTGTGPNVYHENDTIAKYEIMDGAPVRGESIPIRLFLAGYELTPTMRDINKKFSVRYYLNLVLIDEEERRYFKQQEVVLWRKGDIMRKSMSHQAAMASQRFRGHSLPG	672130	700256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_672300_672643_672903_690570_690728_695190_695356_697328_697505_699384_699528_699958
908248	contig_7333_pilon	-	2828	1	Intergenic	novelGene_142805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTGACCTTTTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386872	384044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_384000_386900
908249	contig_16255_pilon	-	3079	2	Intergenic	novelGene_176100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	25	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAGACTTTTTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34673	28395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_30158_33356
908250	contig_4674_pilon	-	4073	5	Intergenic	novelGene_174134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	2564	3259	57745	57050	TRUE	25	AACAGTAGGTGTATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFTGLTMFPIILKWLLDKMMEWPSTDTVTGPARWQYLAWLRQCSPGGCICSKPASNIWCYLSYSQDSWVQESKGGNGNGTTHYYPSDQLARFLLPVPVTLCSAGLEVLVPKGGMLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHSGLLMPLDQQAKKGATILAGVIDPDYQEEIGLILHNGGEEEYVWNAGDPLGRLLVIPYPVIKVNGKLQQLNSDMTTNDPDPSGMKVWVTPPGKEP	342439	56124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_56363_56473_58835_116185_116738_301202_302110_342424
908251	contig_5423_pilon	+	5222	3	Intergenic	novelGene_85302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_1	107.5	446	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATATCTCATAGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710160	777683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_710242_765713_765859_772687
908252	contig_3472_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_166934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCATTTTCTGTGTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263361	264916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_263400_264900
908253	contig_5196_pilon	+	4493	2	Intergenic	novelGene_38706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATTTAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333663	339283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_335054_336180
908254	contig_17427_pilon	+	2244	9	Intergenic	novelGene_30281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	259	junction_8	126.277905331851	3	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	22	942	147949	175576	FALSE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTTLYIQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147927	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
908255	contig_1596_pilon	-	3225	1	Intergenic	novelGene_131601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGTAATTTCAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133657	130432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_130400_133700
908256	contig_6020_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_155556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAGGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287259	284517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_284500_287300
908257	contig_4418_pilon	+	2347	8	Intergenic	novelGene_98389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.361557932949	11	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	878	1831	887097	908961	FALSE	15	TGATGTTCAGGCTTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLYCVPRFSLVGSKFTVRTKVGIDGMKIVETHNEEYPHTFQVSGKERTLELQAGSEQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGHVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRKGILEIESAEVSGNSMVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDDMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADNEELKQKWLKIILLAVTGETPPSPNEHPATLDDHAEPMKKSEC	886124	909477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_886620_886714_887261_890387_890419_890613_890707_891011_891138_901271_901413_904305_904447_908703
908258	contig_8576_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_88735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGGGTTTGGGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632411	631291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_631300_632400
908259	contig_6842_pilon	+	1839	2	Intergenic	novelGene_130692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1220	1699	371958	373517	FALSE	25	TTTAGAAGTATGTAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKVGFMVPFTALSVVSHGETSSGRLPSWPWLLPSYNWSVELNLALSSSLTVKMQDSAGYLYACFFIFLSH	370738	373657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_372024_373103
908260	contig_6958_pilon	+	1302	10	Intergenic	novelGene_69992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_3	228.421637426152	32	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	265	1056	737723	769290	FALSE	15	TTCTAAATGTTCCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVVFSLFKNERSFICNYKEHWFTVRKLGKQWFNLNSLLTGPELISDTYLALFLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFEKQQQQQQQQQQQRQQQVDLPGPVSQPCERPTTSSGALGSDLGDAMSEEDMLQVAMSMSLETIRNNLETEGEK	728649	769536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_728730_737250_737416_737703_737749_739744_739812_743783_743872_750150_750284_750917_751082_752856_752954_758481_758604_769195
908262	contig_17993_pilon	+	3463	1	Intergenic	novelGene_61945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTCTTGCCTTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111099	114562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_111100_114600
908263	contig_1301_pilon	+	5391	1	Intergenic	novelGene_47382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3193	3492	693850	694149	NA	15	CCTAGCTCTCTCTAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRRFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRLTIQPGSGQPRKTKWD	690657	696048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_690700_696000
908264	contig_10434_pilon	+	2294	3	Intergenic	novelGene_82030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	36	181	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAACCCAGAGTTACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130365	133650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_131104_131445_131609_132257
908265	contig_11978_pilon	+	9169	4	Intergenic	novelGene_62798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_3	59.4866931898779	391	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	121	459	299759	380065	FALSE	30	GGCCTAATATAGAACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVTGVSAAAPRFTFQSAGLWSRPSSPSSLTLRPRYGARQMQAAVTLPEEILWLLEDSEEFLLEGLRNENLSAGARDLRDHILRGFQQIRAKYHWDIQPQGGDQAESYLGQDSSDDNHSGTHGPSLMSDAPFMSDYQDEGECHLLSFGVRQL	299638	388775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_299808_335602_335709_362735_362762_379907
908266	contig_10494_pilon	-	3328	4	Intergenic	novelGene_102124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	23.0362033908947	226	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	27	404	260043	256727	FALSE	20	ATTAGAAGTCTTGCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLYAFSKDIFSVINFFSFFNWLCVALAIIGMMWLRYKKPELERPIKVNLALPMFFTLACLFLIAVSFWKTPVECGIGFAIILSGLPVYFIGVWWKNKPKWLLQGVFSTTVLCQKLMEVVPQET	261017	253802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_256783_257904_258083_259899_260050_260997
908267	contig_16360_pilon	-	5059	20	Intergenic	novelGene_170071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	155	junction_8	87.6904338475164	223	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	286	2976	93797	60579	FALSE	40	TTTAAAAAAAGTTTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTGFSSPNPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLNSSSSSSSNSSNEREDFDSTSSTSSTPPLQPRDSASPSTSSFSCLGVSVAASSHVPIQKKLRFEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKHKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDKCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDVCFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA	94082	58495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_60675_62928_63082_64785_64959_66015_66122_66850_66965_67812_67921_69026_69113_69545_69657_70139_70245_71270_71464_73796_73916_74877_74946_78935_79019_79317_79408_79553_79717_80613_80688_81738_81809_82437_82542_90999_91116_93238
908268	contig_17144_pilon	-	2492	2	Intergenic	novelGene_29569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4521	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1663	2214	179815	175834	FALSE	80	TAAGAAAGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTNLLCLQVSTQVGAMAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGCKFLQPSTHSVSNVLLPILIRYLPILFNKHFMGILPGNFPTSGYYY	181477	175555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_176271_179700
908269	contig_5935_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_102685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGTACAATAAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781321	782486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_781300_782500
908270	contig_15732_pilon	+	2928	2	Intergenic	novelGene_88890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAGAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218178	221182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_219795_219870
908271	contig_4103_pilon	+	1247	1	Intergenic	novelGene_51982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAAACAACTGCTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195236	196483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_195200_196500
908272	contig_10506_pilon	-	4992	1	Intergenic	novelGene_125179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73731	68739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10506_pilon_-_68700_73700
908273	contig_8818_pilon	-	5300	9	Intergenic	novelGene_178231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	110	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	4027	4548	56887	56366	TRUE	40	AGGCACCTGAGCCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSAILLHVYGSQRGVSLACSSAWPERAPNSRKGKENRQTIQNEEMPWDPTSTVTQTGKQLHTRMELHSPSGKSKDGARSQILERKEGEAARGKQEIQRREKKKKSNTSSQQMALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRMSVGEEGWRVGKCISQIAGALEPLRKKQRWRTEPGT	240629	618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_975_39481_39663_55834_55940_56255_57059_137105_137531_145637_145714_178332_179176_238042_239512_239587
908274	contig_1143_pilon	-	2835	15	Intergenic	novelGene_86602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	117.407996981049	109	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	136	2256	249983	207933	FALSE	35	AATTGTACAAATCTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNENKSDDSRNLACVFCRKNDDCPNKYGEKKTNEKWKLTVHYYCLLMSSGIWQRGKEEEGVYGFLIEDIRKEVNRASKLKCCICKKNGASIGCVAPRCKRSYHYPCGLQRECIFQFTGNFESFCWNHRPVQIIPPNNYRDSLPCTICLEFIEPIPTYNILRSPCCKNAWFHRDCLQVQAINAGVFFFRCTICNNSDIFQQEMLRMGIHIPEKDASWELEENAYQELLQHYERCDVRRCRCKEGREYNAPNSKWEIKRCQCCGSSGTHLACSSLRSWEQNWECLECRSIIYNSGDFQKAKKHALPNSNSMGINDCLLEESSPKLLKQSPGAQSKDLLRQGSKFRREISTILIEIGFQIKKKPKKLYINKANIWNSALDGLKNQNFNPSFTIEVAYINENDKFGREHPGSKQEFLSLLMQHLENSSLFEGSLSKNLSLNSQALKENLYYEAGKMLAISLVHGGPSPGFFSKTLFNCLAYGPENTQPILDDVSDFDVVQVIIRINTATNMDDLNSAINECYNYLKLIGCLKVTRTLSDKYHLVNDILFYHVIKRVQAPFESFKQGLKTLGVLEKIQTYPEAFCSILCHKPEAPSAKVLSDLFTVHTLSDVQALGFWNTYLQTVEGGKSATTMEDILIFATGCSSIPPTGFKPTPSIECLHMDFPIGNKCNNCLALPMTSTYKEFQENMDFAIRNTLRLEKEESSHYTER	295060	207353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_208190_208911_209103_214458_214632_224261_224444_226132_226441_228833_228967_229069_229195_231297_231415_232073_232181_238972_239139_240171_240297_240570_240673_243019_243118_249946_249988_294929
908275	contig_4857_pilon	-	3267	1	Intergenic	novelGene_48700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154983	1151716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1151700_1155000
908276	contig_7051_pilon	+	1731	3	Intergenic	novelGene_64316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCACTAAACACTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216268	231148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_217734_217824_217997_231054
908277	contig_8617_pilon	-	264	1	Intergenic	novelGene_73498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64124	63860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_63900_64100
908278	contig_9668_pilon	+	4254	6	Intergenic	novelGene_58093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAACCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143773	559328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_144175_157268_157482_173432_173848_316221_316332_556033_556625_556804
908279	contig_15047_pilon	+	1528	6	Intergenic	novelGene_52114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	277	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	33	656	2194	4178	TRUE	20	TTCCAGAATCTGCATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2161	21656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4276_4554_4687_21013
908280	contig_11328_pilon	+	1296	8	Intergenic	novelGene_88452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	227.769306849841	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	85	1059	830591	845054	FALSE	15	ATCCACTTGTGGTACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVAGDPQPSVVTRVANLPLVSSTYDLVFSAYISTKDQYPYLKSVCEIAEQGMKTITSMAVMSALPIIQKLEPQIAVANTYACKQLDKIEEKLPILNQPTHQVVANAKGAVNGAKDAVTTTVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITRVVDKTKGAVTGSVERTKSVVNGSINTVLGSRMIQLVNSGVENALTKSELLVDQYLPLTQEELEKEAKKVEGFDMVQKPSYYVRLGSLSTKLRSRAYQQALSRVTEAKQKSQETISQLHAIVNLIEFARKNVHGANQKIHNAQDKLYLSWVEWKRSIGHDDTDESHCAESLLRYKREK	829367	845291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_829427_830565_830621_830709_830906_833268_833352_836364_836684_837929_838112_839250_839386_845024
908281	contig_9653_pilon	-	2100	13	Intergenic	novelGene_48309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	954.306303465157	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	32	1783	1040020	1007791	TRUE	55	AAAAAGAAGAAATTCCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINESDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQILQSPAFREDLECLIQEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEGIQCNFP	1040051	1006971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007171_1007672_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286_1025426_1039825
908282	scaffold_14325_pilon	+	2181	2	Intergenic	novelGene_162655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	540	899	24383	24742	FALSE	60	AAAATATATCAAGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQETISKHIKKEDRMVPVGIENKRADDFPVEEKALELPDREFKSLIFRAVQELKQKVDKKEEKIDKFMENKDKKKMEEFRKILQEKNARINSQLEIIQKQQLEIQKIKRFQKWTVS	22798	26024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_+_22955_23999
908283	contig_3747_pilon	+	2164	6	Intergenic	novelGene_24819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5425.41060565926	27	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	752	1078	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201227_202403_202458_202636_202740_203211_203386_203498_203651_203768
908285	contig_14509_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_168561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGTCAAATAAGACATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269295	268432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14509_pilon_-_268400_269300
908286	contig_9297_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_69814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTAAATTCTTGTGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306932	309423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_306900_309400
908288	contig_6589_pilon	+	2246	3	Intergenic	novelGene_25930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	48	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	230	2221	1208834	1211575	FALSE	50	ATATAAAGAATAAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGQVPPLATPWRDVHPFFLLSPLVGLVRQAWSHLRGPGPPESWLVEAVTEEAALDGEAKASLAFHHAAWGEHPQGEAEDSRTAEEDGEADRRACPDLKDSSSFLDASNDDDEEYGEEEATSVAREQGGEFTDGRPAPLPSSFLIRTLRDPPGEKESEKEKEAPEEGVANNTEMTKVFFYPLSPLECYPGVEEKEDEDREAVKKEAPRISIPPLSLGSKPSAWVCCPGEGEEEEKNEEEARPPEEERRAENKEATKIAISPSCSGSNPRAWEYCSGESEEEKDKNAKEATEKGEADPEPHSSSLIRRPLLRAWVYRPGGDTEEEDDEDSDSGAAAEGPSRIPSTGAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPSTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEGEDSDSGAAEEEGEAEGPSRIPPTSAFLRAWVYRPGEDSEEEEEYEENENGDDSEATEGEAADSGQHPSLQTQSAVLRTWTYQPGEDTEEDGTTEEWGEAEPSPFRVAIYLPGEKPPPPWAPPRLPLPSSSEAREPRCGHTLSLPCVQVPVSLSEPRGEAWLRPGVLCVI	1207862	1211600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1208083_1208824_1210692_1211441
908289	contig_7051_pilon	-	1357	5	Intergenic	novelGene_64318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	98.8407810572134	225	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	58	474	231129	217282	TRUE	25	GTGCATTTTCGGTAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGVRRKRKCLVRSGREPKMVQPGLLLWSVRRAVLGSAKPALLGLKSIKGSCHNFCTAASKDVTYKELKNLLNSKNIMLIDVRETWEILEYGKIPGSINIPLVEVGHALQMNPRDFEDKYNEVKPSESDKLVFSCLAGVRSKKALDTAISLGFNRLL	231186	216300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_217052_217149_217292_217573_217734_217824_217999_231056
908290	contig_7657_pilon	+	3624	25	Intergenic	novelGene_30036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_21	296.007917968422	162	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	988	2964	659	3622	264903	405223	FALSE	55	TTTAAAAAAAGATGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRKSCRSRKNRFESVNQSLLFDQLVNSTAEAVLQEMDNINIRRNRRSGEVERLRMWTDTEFENMDMYSRVKRRRKSLRRNTYGIQNHHEVSTEGEEEESQEEDGDIEVEEAEGEENDRPYNLRQRKTVDRYQAPPIVPAHQKKRENTLFDIHRSPARRSHIRRKKHAIHSSDTTSSDEERFERRKSKSMARARNRCLPMNFRAEDLASGILRERVKVGTSLADVDPMNIDKSARFDSIGGLSHHIHALKEMVVFPLLYPEIFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKKVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYLMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDNRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFNLPDQKARKHILQIHTRDWNPKLSDAFLGELAEKCVGYCGADIKALCTEAALTALRRRYPQIYASSHKLQLDVSSVVLSAQDFYHAMQNIVPASQRAVMSSGHALSPIIRPLLERSFNNILAVLQKVFPHAEISQSDKKDDIEALLLDDSEDENALSIFETSCHSGSPKKQSSAAAVHKSYLHFTMSPYHQPTSYRPRLLLSGERGSGQTSHLAPALLHTLEKFSVHRLDLPALYSVSAKTPEESCAQIFREARRTVPSIVYMPHIGDWWEAVSETVRATFLTLLQDIPSFSPVFLLSTSETMYSELPEEIKCIFRIQYEEVLYIQRPIEEDRRKFFQELILNQASMAPPRRKHTALCAMEVLPLALPSPPRQLSESEKNRMEDQEENTLRELRLFLRDVTKRLATDKRFNIFSKPVSDYLEVIKEPMDLSTIITKIDKHNYLTAKDFLKDIDLICSNALEYNPDKDPGDKIIRHRACTLKDTAHAIIAAELDPEFNKLCEEIKEARIKRGLSVTAEQIHPHGTGARKTETRVEEAFRHRQRNPMDVWHNSANKCAFRVRRKSRRRSQWGKGIIKKRKVN	218033	405225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_218422_255711_255864_264416_264467_264834_264989_266973_267077_268682_268792_271571_271689_274530_274607_294983_295083_296346_296459_312105_312222_315213_315389_320379_320469_329527_329688_331094_331186_336468_336781_339854_339991_348595_348783_365439_365626_372397_372534_374528_374711_377784_377945_397498_397622_400622_400761_405152
908291	contig_3774_pilon	-	1945	5	Intergenic	novelGene_142047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	109.089412868527	62	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1450	1758	153169	144743	FALSE	10	CCAGTTGCCTGTGTGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRFGQIMIENLRRRQCDLAGVEMCKSLASQKERLLSNGWETASAVDMMELYSRLPRSEVVRIESLEFLDEMELLEQLMQHYCLCWATKGGNELSLKEITY	166972	144555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3774_pilon_-_144766_146370_146469_152053_152146_153073_153176_165529
908292	contig_6914_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_151756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	380	709	287589	287260	NA	35	AAAATGGCGGCAGTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVIKNEMEHIKIDILGFSELKWTRIGHFELDNHTVYYAENDKLKRNGIAFIVKKNISRSILKNNVVSDRITSIRLQERPVNMTIIQIYTPTTNAKDEEIEDFS	287968	285131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_285100_288000
908293	contig_7050_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_153641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853518	855211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7050_pilon_+_853500_855200
908294	contig_6854_pilon	+	3743	3	Intergenic	novelGene_169489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	124	133	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	276	617	185866	186207	TRUE	75	TATAAAAAACTAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMMLGRFSVSSYSMILFVFTVFSPCSGTLITHRFLLLIVSQVILRVSSFFFVLFSEFSTNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLRPSMTPSISEISLFIFGFLIVVFV	185590	228069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6854_pilon_+_188249_222730_223605_227858
908295	contig_14389_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_178733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGTTCCTGTATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12123	9368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14389_pilon_-_9400_12100
908296	contig_15634_pilon	+	4081	3	Intergenic	novelGene_178844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1512	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2334	2930	66674	115052	FALSE	70	ATAATAAAAAAAAGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRSCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMTLENLMLSEISQSQKDKYCMRPLL	33620	116203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15634_pilon_+_35807_66526_67084_114865
908297	contig_12790_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_35191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	447	773	1219	176035	175589	NA	65	AAAAAAAACACATGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHLHQEDIIIINIYAPNDKAPEYIKQTLIALKREKDSSTIIVGDFNTPLSVKHRTSRKKLSTDTKDLNATINQLHLVDIYRTLYPTAAKYTFFSNSHGTVFRIDHVLCHKASLNRIRSIEILQSIFSDHKAIKVEINYRKSKAK	176807	175587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_175600_176800
908298	contig_5419_pilon	+	5264	2	Intergenic	novelGene_15524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1208	1645	267930	268367	TRUE	90	AAAAACAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYVEDPKESTRKPLKLMNEFSKVRGYKVSTQKSVEFLCISNEKYEMEIKKTIPFIITSKRLKYLGINLTKEVKALYTENYKILLKYIKEDLNKWKDIPCLRIGKLNIVKMSTLPKAVYRLDTIPIKIPTAFFSETKTPILTFT	266722	399386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_271262_398661
908299	contig_854_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_36546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645691	1644820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1644800_1645700
908300	contig_9051_pilon	-	1318	2	Intergenic	novelGene_170808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	994	1317	1039186	1038863	FALSE	10	GCCCCGAGGAGCTGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPHLLSRWPAWLFSVAPGWWRKGHSHALVRTACAPGATLEQRRWPGGPQWVPGASPLTCRGCSSASKRPAEVMLTQERYPVRRLPFAAASEEDLAAFERILPGRVVT	1047251	1038861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_1039337_1046408
908301	contig_1275_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_108768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCGAAGTGTTTGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502482	408414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_409188_501146
908302	contig_2278_pilon	-	3518	4	Intergenic	novelGene_118103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_3	26.5873821368124	460	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	459	2330	760719	748144	FALSE	25	TTTTTTTGTGATGAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTQDERQINTEYAVSLLEQLKLFYEQQLFTDIVLIVEGTEFPCHKMVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAATLQIIITYAYTGNLAINDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRMVEHKFTAVYHQEAFMQLSHDLLIDILSSDNLNVEKEETVREAAMLWLEYNTESRSQYLSSVLSQIRIDALSEVTQRAWFQGLPPNDKSVVVQGLYKSMPKFFKPRLGMTKEEMMIFIEASSENPCSLYSSVCYSPQAEKVYKLCSPPADLHKVGTVVTPDNDIYIAGGQVPLKNTKTNHSKTSKLQTAFRTVNCFYWFDAQQNTWFPKTPMLFVRVKPSLVCCEGYIYAIGGDSVGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVMTLNLMYCYFSRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSSVTVEIYDVNKNEWKMAANIPAKRYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVTYQYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDGTEEFELDGEMVALPPV	773562	746955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_749680_752005_752172_760549_761065_773449
908303	contig_5317_pilon	-	3652	4	Intergenic	novelGene_76542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCACTACATGCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205962	35226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_38006_204005_204371_204874_204944_205523
908304	contig_5302_pilon	-	2822	8	Intergenic	novelGene_81443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	725.880549008286	15	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	335	1093	209238	177300	FALSE	20	TGGGTTTCCTTTTCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209572	175570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209142
908305	contig_5201_pilon	-	3535	5	Intergenic	novelGene_82179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	742	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	784	1182	477421	303638	TRUE	20	CCCTCAGTTTTAGTGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKEKTVAAEAPYIQPNTLWDLVSWFGGLGSWFHGTSQLIGLITCLVLLFYLLVLCVMAGVLKLPSCHRRHNILSLFAWSNRGRRKLRNKRRMWNVWLIASRNNCLHCQKTRRTGQLPLQNILIKDSIKES	504460	291892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_291904_301295_303789_477173_477522_493069_493597_504304
908306	contig_4350_pilon	+	2897	8	Intergenic	novelGene_136363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	85.1687400735404	157	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	906	2721	9	2729	15185	103649	FALSE	15	TTCTATAAGGTTTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSQVYIFWGAPVLPLKMTVSQEPTSVIPTADPWKKIQLLYSQHSLHLKDEKYKHKNPENYQVLDNIDPLGLNSHCSLSSRKRSVHLKDDLICCISETQNIKSQKCSPSGMNGLTDSSVQVCGFKSRVQHVTGEEKNQKLVTENKKITVEQHQEQSSICAPNLTKTPLQLGHKCAAILDLVCSTKQINIGPEAVETTYVPRVHHEMQNLCVEFLFSKTVDKPRSKRGVKKVSNLKISTDTEFLSIMTSSQVAFLAQRKCKGQNSLNKETINMEIGPKASHEEVRGTEDNLIQHSDDFAEGYKSGQNEAYSLELFSPVGPETKNNHILINSDTNLEENIGSQELFSPEETLPPNEICIESFSSGILCSQLNTFHKISIERSLISEDKLGHSKAPSKGFQVSKKTKLLSNARDLAVTLDRRNVSEFKYIKKTSLIKNCNCKSQKYNCLVMVLSPCHVKEVNIKSGPPSGSAVPVAATTVIDQSEIKKKVFMWRTAAFWALTVFPGDIILLTDVTVHEDQWVGETVLQSTFTSQLLNLGSYSSVEPEEYSSIVSAVVLQDLLAYVSSKHSCLRDLPQRQPQKMNSIEFVELKHLQPEILVHAVLRVVDITILTEALYSYRGQKQKKVVLTVEQTQGQHYVLVLWGAGAAWYPQLQRKKDYIWKFKYLFVQRNCILENLELHTTPWSSCECLFDDDIRAIKFKAKFQTSAPSLVKMSDLAAHLEDKCSGVVLIKAQILELVFPITAVQKKQITLNVHSSLKSIFSSLPNIIYTGCAKCGLELETDENKIYKQCFSCLPFAVKKMYYRPALMTVVDGRHNVSIQVGSELIEKILLNIPPDWLNRVIVSSSGITYGMVAADLLHAFLALSEAPCLLKIQSLFVLDENSYPLQQDFYLLDFYPDNVKHDPTP	15176	103817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_16716_20730_20839_31781_31977_32123_32259_51616_51824_70900_71136_92364_92481_103455
908307	contig_7457_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_31267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	0	8	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAACTCCCCTTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53084	47806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_49925_53004
908308	contig_6195_pilon	+	3205	19	Intergenic	novelGene_71026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_15	126.884133497192	209	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1027	3084	55	3138	94384	140294	FALSE	30	ACAGTAGTAACTTCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTQLWAPVKTRLPVASAMEAVVAREVENEDGDSSCGDLCLLDKGLRSISELSLDSTLHTINLHCNKISKIKAIDHIWNLQHLDLSSNQISQIEGLSTLTNLCTLNLSCNLITKIEGLEELINLTKLNLSYNQISDLSGLIPLHGIKHKLRHIDLHSNCIDNIHHLLQCMIGLHFLTNLILEKNGDDNPVCHIPGYRAIILQTLPQLRTLDCKNIFGEPVNLSEINLSHLQCLEGLLDNLISSDCPLNISEEETVDSMPVVTTNVDQLVPLDQFACTPTDTALTSVDSVCPSSEPEKINHENDFQNEMKLQKIDDQISQLLTETSKSLIDNIPEKDFRPKRDTDVTSESDSGNRKEINRKISRRSKIPYYSKTTQTIKHHSKNGPLISCNRKMRQPYFKELYVRSSLANCNTVAESEEPKTEIIKVDRSSSEDITYRSLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSCLQERDEDIKTLQEKISEIQKCTQEQLEEKSSQLDVVIEKLERHNERKGKLKQQLKEKEEELEEIRNAYSTLNQKWHDKGELLSHLETQVKEVKEKFDDKERKLKEERDKSIEMQKNALEKLQSMDDAFKKQVDAIVVAHQAEMLQLSNEKQKCIESANEKVYQVEEEMRGLLEETTKNKRAMEEKIKQLAFALTEIQQEF	94329	140361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_97122_97329_97627_97694_102785_102954_104900_105077_105171_105382_109777_109972_111005_111154_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_131449_135278_135488_135574_135713_137404_137541_140171
908309	contig_6902_pilon	+	3034	4	Intergenic	novelGene_135560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_3	16.0069429380573	30	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	666	2369	3034	283781	295289	FALSE	40	ATCACAAAGGGGTACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRVYKSLVTNVCKEMSCYSDFPFQEDYPNFMKQEKFWHYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSVTKCPDFSVSGQWDVITETEDKKDRAVFDAVMVCTGHFLNPRLPLESFPGIHNFKGHILHSQEYKIPVGFQDKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGAWVVGRSSHGGYPFNMMITRRCYNFIEQILPSCVLKWIQERQMNKIFNHENYGLS	281412	295289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_283952_284527_284691_294102_294246_295100
908310	contig_3394_pilon	-	4273	6	Intergenic	novelGene_152719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	608	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	3094	3519	553044	552619	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEITCESPGSFRPLTCFLTVTPALVVERFLLQVFSFHCPTGTFLRAERIWGLTSGLLTATDSCFHERSILPTPKRAHPLRVGVRCSKWCHAHCTDTKVGTVFLIFVCCLQTKALCLIRKLWRGHVTLGRESPFVLFFLPS	564735	551864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_553427_554593_554772_556303_556462_558674_558836_561416_561530_562634
908311	contig_16666_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_61714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTTCCATGACCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4009	1843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_1800_4000
908312	contig_13021_pilon	+	4141	9	Intergenic	novelGene_8171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4139	junction_1	2176.26778783655	2350	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	169	1020	174676	177567	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRVIAFEHCIFKFGS	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177792_178170_178585_178670
908313	contig_10126_pilon	+	3577	6	Intergenic	novelGene_105760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1038.11567756199	3	141	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	142	744	165426	166639	TRUE	5	CCCCTTTGGGTGTTACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	165284	186778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_165724_166334_166667_169472_169584_181507_181563_184074_186283_186346
908314	scaffold_880_pilon	-	1817	15	Intergenic	novelGene_121398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	291.094530196299	192	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	42	476	311045	299627	TRUE	35	TTTCACATGATTAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQANGAEAEEEEQAEEDCPELVPIETKRREEEEKPGPGAKIPVTIISGYLGAGKTTLLNYILTEQHSKRIAVILNEFGEGSAVEKSLAVSQGGELYEEWLELGNGCLCCSVKDSGLRAIENLMQKKGKFDYILLETTGLADPE	311086	271358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_272251_272382_275217_275456_277107_277160_281388_281446_286464_286513_289339_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_299564_299632_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
908315	contig_17074_pilon	-	4173	1	Intergenic	novelGene_145147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAACACTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245004	240831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_240800_245000
908316	contig_8254_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_48400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGATTGTCCTCCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121737	119835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_119800_121700
908317	contig_16122_pilon	+	1913	8	Intergenic	novelGene_134488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTCCGCCCTCCGGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103446	110604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_104558_104828_104918_104996_105116_105255_105406_108756_108866_109867_110061_110332_110367_110496
908318	contig_10904_pilon	-	2135	15	Intergenic	novelGene_22576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	24.9760088967025	88	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1697	2101	427369	426454	FALSE	5	TGGCCACTGTCTGCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVLDSYGDDYRASQFTIMLEDEGSQGTDAPTPGNAENEPPEKEGLSPPRRTPAPPEPSSPAAGEGPSGRKRRRAPRDGRRGAGTALTPELAPVQIKVEEDFGFEADEALDSSWVSRGPDKLLPYPTLASPPFD	449484	426419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_426574_427000_427223_427306_427377_433351_433423_437884_438466_439124_439310_439429_439491_440064_440151_441447_441544_442678_442790_444465_444565_445264_445406_448331_448431_449225_449354_449453
908319	contig_2219_pilon	-	2486	1	Intergenic	novelGene_67171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100563	98077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_98100_100600
908320	contig_10953_pilon	+	1196	8	Intergenic	novelGene_42586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	17272.463956913	664	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	78	665	455261	463828	TRUE	30	TGGAGAAAGGTCTCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455183	469191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817_464344_469175
908321	contig_10732_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_114722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	613	927	158251	157937	NA	60	TTAAAAAAAAAAAGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIIQIYASTTNAKNEEMEDFYQLLQSEIDQICNQDALIVTGDCNSTVGDKEEGTVVGKYGLGDRNNARDRMIEFCKTNDLFTGNTFLTAWNTQESINYICGRR	158863	157305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_157300_158900
908322	contig_14441_pilon	+	4497	1	Intergenic	novelGene_100796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	764	1072	137283	137591	NA	75	GAAGAAAAGAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRAQSEGSGSLELGLRQVCLSAVTHPRPGDSPASGIISPAIALCWCPRVETSPVNRRLLSGAPERPPGASADMGELVLAVMRGIGSLKLGAGSGLPLGAEG	136519	141016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_136500_141000
908323	contig_678_pilon	-	1610	2	Intergenic	novelGene_167788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	836	junction_1	0	122	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	298	624	32837	31694	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGKQMGCHLF	33134	30707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_31882_32698
908324	contig_15087_pilon	+	5453	2	Intergenic	novelGene_37237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168740	174376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_169942_170124
908325	contig_8773_pilon	-	2631	2	Intergenic	novelGene_74513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	328	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1126	1527	29392	28991	TRUE	30	TTTTTTAAAATGTTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIAFDPAVPLLGIYPREIRFVTQIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	30517	27832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_28888_28941
908326	contig_16722_pilon	-	4270	16	Intergenic	novelGene_118276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_9	214.49272455934	319	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1020	3063	213	3275	132864	91874	FALSE	15	TTGTTGTATCATCCCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIAASTTSPTNSTTSTVSPAQKVMVAPISGSVAPGAKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSTSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGTPQQVVTQIIRGQPVSTAVSAPNAVSSAPGQKALTSSAPTASLQSPTSQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGQGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTSTTVSTTAAGTSEQRQSKLSPQTQVQQAKTLPPAQSSSVSPPETPPPTAQPSAQPQPPAQPPAPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPIQTQSSKPQAAVQCQPQSNVQGQSPVRVQSPPQTRIRPSTPSQVSPGQQPQVQTTASQPIAIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTLSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIPSQVVAQIQAQQGGVSQQIQLQLPIQIQQSRPVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIEIKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKQNAVIEHLKQKKTMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKKDLKLKKEKDLAQAAAVAAALPVTAAPPAPPPSPPPALQPPGLLSTPTIPAASQKRKREEDKDSTSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDLCTNWYHGECVGITEKEAKKMDVYICNDCKRAQEGSSEELYCICRTPYDESQFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYERLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS	136682	90878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_91911_96293_96481_103887_103973_105711_105905_106668_106843_109688_109997_115770_115997_116286_116370_121160_122078_122764_122988_125204_125423_130776_130886_131819_131972_132713_132961_136189_136233_136609
908327	contig_10126_pilon	+	3235	2	Intergenic	novelGene_105742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTACAAAGAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155050	158419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_155895_156028
908328	contig_9132_pilon	-	1161	1	Intergenic	novelGene_121377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAGTTCACAAAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111340	110179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_110200_111300
908329	contig_11845_pilon	+	2749	1	Intergenic	novelGene_148143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTCTCAGTTTGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31548	34297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_+_31500_34300
908330	contig_12786_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_103383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTTGTGTCTGCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585800	583356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_583400_585800
908331	contig_6445_pilon	-	2772	6	Intergenic	novelGene_77053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1318	1638	670531	665788	TRUE	15	TTCCTTCCCATCTCTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSGKSTIPERRPDWAMGIAEPQEAYCRKKRNKKASSSAAWGCHFRLRFQVLHSRADQSLFARVLSRPVETSRPSGFSWEGSPRGSGSCTPPLGIFGIFVQIDFDI	671848	655497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_656116_661689_661823_663380_663503_663787_663925_665663_665823_670245
908332	contig_9646_pilon	-	3571	4	Intergenic	novelGene_117421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1365	2204	65585	64746	TRUE	65	AGGCAAGAGAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	205098	62285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_63603_64695_65604_202912_203730_204569
908333	contig_2438_pilon	+	1250	4	Intergenic	novelGene_112056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	500	junction_2	2640.58911777067	8	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	10	426	310588	312372	TRUE	10	TTTTGGATGGACTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEELGLCTADTDEPGWAGSSPE	310578	313517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_310768_311907_312083_312310_312409_312729
908334	contig_5189_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_34882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242151	240926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_240900_242200
908335	contig_7815_pilon	-	6754	2	Intergenic	novelGene_134401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	155	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	4705	5160	841117	840662	FALSE	40	CCAGAGGACAAATATTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKTNSVIHHINKTKDKNHMILSINTEKTFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLSIIKGIYTKPTASTILNGETLKAFPLRTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAVRLEKEIKGIQIGREEVKVSIFANDMIYTEKILKNPQENYWN	884676	839067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_845511_884365
908336	contig_15668_pilon	-	5284	15	Intergenic	novelGene_169625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_6	131.643380357072	325	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1216	3651	371	4021	118957	72021	FALSE	15	TTCAAATTTGTGGTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDKNGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATLYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQNTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELATIFESIQKDSSSTNLESMDTS	119327	70757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_72246_73013_73122_75051_75217_75976_76147_79706_79803_80555_82050_82392_82535_85231_85525_92449_92596_93791_93898_93984_94242_96028_96153_104432_104588_110764_110909_118931
908337	contig_9653_pilon	+	4215	1	Intergenic	novelGene_48330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	241	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATTCAAGTAAGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033514	1037729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1033500_1037700
908338	contig_2799_pilon	+	10732	3	Intergenic	novelGene_85564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	696	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTAAAGCAAAGAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728248	741134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_729744_730068_734144_735972
908339	contig_12677_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_110845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAATGGGAGTCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3700
908340	contig_6630_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_30709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374057	372252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_372300_374100
908341	contig_9406_pilon	+	2329	15	Intergenic	novelGene_136158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1646	1954	57950	61949	TRUE	25	CTCCAGCAGCTCCATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRRSAQASLRPSFHSAMVAASECPELMSSSAMWLTVSTRSCPMFPVSRANSRNRSCSIVTSRIWCFFNMETALCFTLAFSSDIMYSSCSLIHASASAASK	34740	63182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_35002_35740_35787_37598_37771_38921_39192_44724_44851_45934_46132_48558_48618_49506_49579_51140_51389_57755_58129_58526_58534_60484_60528_61869_62160_62332_62423_63107
908342	contig_14666_pilon	+	3127	1	Intergenic	novelGene_39480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	1199	1801	42512	43114	NA	30	CTAGTATTAATTTTAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLNVLGFIWTCQRKMCSRIDFEVVSRNLNSSPECGSIQVVQTDHGLSLQALPQPPLPTACVPSGSPLSPRRVSRQAAPSPHGVCPVRQPPLPTACVPSGSPSPHGVCPVRQPPLPTACVPSGSPLSPRRVSRQAAPGCLISGLAIERSRGAISGNSILFPKKQLLIRKGGQGIRTQPLLGHRQNVGLLQVLRVGVGIL	41313	44440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_41300_44400
908343	contig_3252_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_61482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAACACTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197296	199244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_197300_199200
908344	contig_6710_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_98348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTACTCCAAGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656661	657512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_656700_657500
908345	contig_2577_pilon	+	2379	2	Intergenic	novelGene_172051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATACTTGTACGGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91427	195721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_91788_193702
908346	contig_11816_pilon	+	4033	2	Intergenic	novelGene_98597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCAGCCAAGTTCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419734	1423837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1420745_1420814
908347	contig_709_pilon	-	3141	13	Intergenic	novelGene_57551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_10	84.7113973048098	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	145	2412	1564759	1540432	FALSE	45	TCGAATAAACTTCACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRVLVTWNGEPPVCCCSSILHWESSLVAGLLPRFVSVIVQFLPLKCSMWMTVTHVFFSAFLFSSYKIIASANYMLSELFQLDEPKKEESSESPLNENSDESYSEEEEEEMVDSDENGPYSAGADPSEDSKAVAIIQSVGELSVPEKYKSIHQIRPSCAFPVCHDTEERCRLVLSYVLEGLKSVDNSIKKESDLPAADPNTPIPLKYEDESSRGGPEGLEKQMALFLDKMGSLQKGNYSSQSGMIPGSWQHKMKLQLILKSSKAYYVLSDAAMSLQKYGRALRYIKLALQSHDTYCCLCTNMLSEVLLFLSQYLTLCGDIQLMLAQNANNRAAHLEEFNYQTKEDQEILHSLHRESSCQGFAWATDLSTDLESQLSVSCKCYEAANEILQFSDLKSQNPEHYVQVLKRMGNIRNEIGVFYMNQAAALQSERVVSKSVSAAEQHLWKKSFSCFEKGIHNFESIDDATNTALLLCNTGRLMRICAQAHCGAGDEFKREFSPEEGLYYNKAVDYYLKALRSLGAREMHPTVWDSVNWELSTTYFTMATLQQDYAPLSRKAQEQIEKEVSEAMMKSLKYCDVDSVSARQPLCQYRAATIHHRLASMYHSCLRNQVGDEHLRKQHRVLADLHYSKAVKLFQLLKDAPCELLRVQLERVAFAEFQMTSQNSNVGKLKTLSGALDIMVRTKHAFQLIRKELVEEFDQPESDGPPPAAESSRGLDQEEVTKLLSIFESRLSFLLLQSVKLLSSTKKKTSSNTEEDVVLKANKQIYSQLLRATADRGTAVLERIDVVVHLLDQLACSGSAGQ	1564903	1539702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1540592_1548421_1548574_1549329_1549446_1550433_1550588_1552711_1552862_1553201_1553361_1554974_1555199_1556514_1556734_1558380_1558582_1558925_1559115_1561194_1561346_1561639_1561712_1564438
908348	contig_13481_pilon	-	5314	1	Intergenic	novelGene_119357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	526	885	439997	439638	NA	25	ATTTGGGGTAAAGTCTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLQKSIWCFLKKLEIEAPYDPAIPLLGIYPRDIRAVTRIDICTLMFTAALFIIVKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMQYYATIKNNDKSMKHRITWMNLGGIMLGEISCKRANIV	440522	435208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_435200_440500
908349	contig_7708_pilon	+	2831	6	Intergenic	novelGene_61529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_3	122.474487139159	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	177	788	250654	255201	TRUE	45	AAGCCTTGAACTAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLDDHFCSCSCPASERHRKQLRAGAGGLAAKVEEMISPSVSSPSLLVDHSALNTSPSHRRHSSGHSTGVSVHRCNSSHANSWHHHLVQRSLVLFSVGVVLALVLNLLQIQRNVTLFPEEVIATIFSSAWWVPPCCGTAAAVVGLLYPCIDSHLGEPHKFKREWASVMRCIAVFVGINHASAVRFLESCQFISGNRIIPDGE	249522	265045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7708_pilon_+_249669_250623_251078_254843_254969_255138_256787_257187_257288_264687
908350	contig_8167_pilon	-	2192	10	Intergenic	novelGene_155658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_9	13.6626010212795	166	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	505	1437	148855	137246	FALSE	35	CTGAGTAGGTCAAATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKALLPSMIERRQGHVAVISSIQGKISIPFRSAYAASKHATQAFFDCLRAEVRQHEIEVTVISPGYIRTNLSLNAITADGSRYGAMDKTTAQGRSPADVARDVLTAVGKKKKDVILADLLPFLAIYLRTLAPRLFFSLMASRARKERKSKDL	180445	136490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_143387_143934_144152_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_168994_169037_180258
908351	contig_15021_pilon	-	3502	1	Intergenic	novelGene_26926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1887	2249	94415	94053	NA	25	TGTAAGTAAGGTGTGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDPPPRERPEDTSLTTTVRNKCVRAPASLKSAVINLFCRSDTTVGTATTGLTMGVTESQDGRGHVAAEIPKDKMGMVPIMDSRVKAAIRIQVYLGEVVGLVPEHCNKVSHTKFLVFLCI	96301	92799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_92800_96300
908352	contig_1225_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_44146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	182	331	275008	275157	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSVESVDLCLLCRRRWLWGCFGKADPAKPSSRIRLPACLPACRASVCARVILAWDALSVMGGGKESRSSWLLADQLEVMGEGGEERRTLFLLHPIPLLPAVVKTTSLR	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250764_274998
908353	contig_12324_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_166650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	777	1079	139235	139537	NA	15	CCCGGCCCCATGCTAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLWSPNSPLLTQAHSSEVSKHTWALALLSFTNTQLPSPSANPESQPATSDVNKCQQKPHRLGECAVEDLFLPQSCYLPKSGSSRAYFPMGRIRGSRFK	138458	139957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_138500_140000
908354	contig_19237_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_162961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCTCTGTAAGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67093	65842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19237_pilon_-_65800_67100
908355	contig_6975_pilon	+	4044	5	Intergenic	novelGene_74239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_3	82.4818161778704	261	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1925	2500	29375	42387	FALSE	30	TCAACAATTGTTTCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVICTYPLDMVRVRLAFQVKGEHTYSGIIHAFKTIYAKEGGFLGFYRGLMPTILGMAPYAGVSFFTFGTLKSVGLSYAPTLLGRPSSDNPNVLVLKTHINLLCGGVAGAIAQTISYPFDVTRRRMQLGTVLPEFEKCLTMWETMKYVYGHHGIRKGLYRGLSLNYIRCVPSQAVAFTTYELMKQFFHLN	27450	43931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_29495_29744_29812_35586_35750_41045_41115_42230
908357	contig_10734_pilon	+	2919	2	Intergenic	novelGene_51530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1385	1714	2289899	2290228	TRUE	40	ACTTGAGTGAAGATATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWHFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYPRETRAVTRIDICTPMLIAALLTIAKRWKQPRCPSADEWINKLWYIHAMEYYPPIKNYDEAVKHRINMVEAGTYYAE	2288514	2291997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2290258_2290821
908358	contig_14357_pilon	-	1938	8	Intergenic	novelGene_121652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	132.327361540404	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	38	712	461540	455322	TRUE	45	ACATCACCAAAAAGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPVHDPNHSKMRLRDHSSERSEVLKHHTDMSSSSYLAAAQHPPHSPLVRQLSTSSDTSAPTSSSSQVTAGTSQPIRRRRGESSFDINNIVIPMSVAATTRVEKLQYKEILTPSWREVDLQSLKGSPDEENEEIEDLSDAAFAALHAKCEEMERARWLWTTSVPPQRRGSRSYRSSDGRTTPQLGSANPSTPQPASPDVSSSHSLSDSSHPCSSGHSATPSQRRHPLFHARAGAG	461577	453813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_455036_455317_455410_455462_455571_456379_456493_456691_456750_457400_457523_461010_461160_461503
908359	contig_2069_pilon	-	2062	2	Intergenic	novelGene_23382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	519	1457	1059334	1058396	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTTEQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSAEATKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPPEIGLGNPQQTQHPGQQCGPDPGHTPPSAVWRSCIAPWCASSVTERTRYAGRWLWYCWLTWLRVTAWRPAPLQCRRAASATFWAS	1059852	1057751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1057952_1057990
908360	contig_4783_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_108384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACCCAGCAAACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217947	215963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_216000_217900
908361	contig_4469_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_21890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTTGTGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285610	285012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_285000_285600
908362	contig_10958_pilon	+	2275	4	Intergenic	novelGene_5450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5067.1271939828	3	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTTGTGAATCATATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888593	901689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_889054_893824_893833_895279_895855_900457
908363	contig_21369_pilon	-	3045	3	Intergenic	novelGene_176296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	6	206	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	160	387	19962	7730	FALSE	55	CAGAATGTCATAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSDSSFRFFVFFFIYICQFAVHVLQAAGFHNWGNCGWISSLTGLNKSIPVGVLMIIIAALFTASAVVSLVMFKKVHGLYRTTGASFEKAQQEFATGVMSNKTVQTAAANAASTAATSAAQNAFKGNQI	23354	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_7895_19899_20018_23250
908364	scaffold_16735_pilon	-	3837	12	Intergenic	novelGene_160358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	75.3512984746659	3	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	119	1381	405618	365642	FALSE	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALWTRKRKPRIANSDESGGSMYRTLHLSTEQVATFCRSLHEMHSPDQSSSPQDSSGPQLAAMRQLTDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKARTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLKELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPSSLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGAHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSAPARKVNTEI	405736	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_365676_372785_372874_376138_376242_376749_376809_382011_382121_385895_386015_386104_386285_390415_390525_396416_396543_396836_396906_398571_398752_405531
908365	contig_5084_pilon	+	1075	9	Intergenic	novelGene_64505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348015	353696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_348126_348371_348483_349383_349481_349949_350027_350978_351040_351226_351346_352302_352384_353178_353285_353383
908366	contig_11548_pilon	+	1605	4	Intergenic	novelGene_66772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1725.00711753765	3120	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	227	697	112832	119573	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKSLFLVLTMLQLTLRRPVMTLKTSIRG	112605	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119491
908367	contig_9345_pilon	-	2872	21	Intergenic	novelGene_24566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_15	232.826389183013	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	3	2750	922013	881092	FALSE	75	CAGAAGAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQESPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEVEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDTHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRIMEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRERKSRLSSTSSGAVLYGQPLLVSVPKHKLTLEFLYQAVCERISRYIKQPLPDEFGSSPLELGACNGSRGSCEGEEEMEHQEEGKEQLSETEGSGEEELGSDPSETIQKKVKGQPCPKRLFTFSVVNSYGTADINSLATDGKLLKLNSRSTLAIDWDSETRNLYYDEQESETCEKHVSMLQPQKKKKTSVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPVRALNMSEFVCDLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQRRDDEFSKTPSPITLPGSSDGGMRPSSSQQGLGDDEACSMDTN	922015	880969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053_890276_893010_893100_893734_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023_900183_902070_902245_905275_905394_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
908368	contig_6881_pilon	-	2676	1	Intergenic	novelGene_164829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTACATGAGTCCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65023	62347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_62300_65000
908369	contig_3747_pilon	-	2477	9	Intergenic	novelGene_24905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTCGTTAAAGATCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201559_202129_202203_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766_204986_205035
908371	contig_9571_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_136288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCCACATCCTTGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474207	472197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_472200_474200
908372	contig_3956_pilon	-	1381	5	Intergenic	novelGene_15280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	762	1379	1289815	1288053	FALSE	15	CCTCCAGGTCCTTCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVV	1290982	1288050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
908373	contig_3612_pilon	-	1217	11	Intergenic	novelGene_87811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	214.19358066945	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	482	1114	872315	868844	FALSE	40	TATTTGGAAATTTGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLAHLAIAVEAVGWAHPDTISLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSRLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCEPATVADMLHSVQKECLKMITAFLKMWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYNRRIPIPELEARIDAVDAEIVREVCTKYIYDKSPAIAAIGPIEQLPDFNRICSNMCWLHD	878852	868740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_868909_868997_869074_869260_869350_869424_869511_869751_869785_871145_871307_872192_872339_872981_873095_873945_874026_874616_874816_878786
908374	contig_11448_pilon	+	4258	1	Intergenic	novelGene_66424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	3140	3544	577513	577917	NA	40	AAAAAAGGCCTGGCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVIEGLRTKFEITEDRIIEIEDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEKNLRIKWDTIKSKNWLVIGVPELGEKTENTERITEELLTENFPNIIKDEKLTTQEAQRTPYRIESKRKSPQHIIITFAKAKDKERILRAA	574373	578631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_574400_578600
908375	contig_11498_pilon	-	1295	2	Intergenic	novelGene_65505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	98	616	153582	152581	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSIFTHITSSCLTSLRLLSCPRSRWVTQAPRGEYLTLAHYTACLFAWPVALSLAAGEPQQRRLLPCCSARLTLPPSSTADALWMGSFLSPSWMAWAVRGAQEGGISFTGGGSLAILEAEWPSEVLSPRMAAIKHVQHHAAAAPDVHLSITGLAHHHLWSHVGLCAGDVVP	153679	151901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_152749_153231
908376	contig_5093_pilon	+	2909	1	Intergenic	novelGene_135093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607655	610564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_607700_610600
908377	contig_15105_pilon	-	1611	2	Intergenic	novelGene_150956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	365	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441138	439390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_440006_440142
908378	contig_3233_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_56587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTACTGGCAGTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752833	751080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_751100_752800
908379	contig_10793_pilon	+	1651	14	Intergenic	novelGene_83382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3556.83818437422	148	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	169	972	152887	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054_165377_166401_166473_167141
908380	contig_4125_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_25191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1060	1371	1373150	1373461	NA	35	CTTCCCAGCAATGCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFLDSQFYFVDLDICYCTVPGCFNYCGFEIRRCESYFILLQDCFSYSESLALPYKFEDWLFHFCKEGCWNFDRDYIEFIDCFDILTILSLPIHEHNVLPFL	1372090	1374227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1372100_1374200
908381	contig_8628_pilon	+	3478	19	Intergenic	novelGene_164430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	96.0949890138932	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	395	2608	646321	693676	FALSE	20	TTTTTATATATGTGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQVQAQAVGASTPTTSSPASAVSTSTSSSTPSSSTSTTTTATSVSQTVSTTPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVAMMQIVSCPYVKTVATTKTGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLEEKIKEPIKEPSEEPLPMETEEEDPKEEPIKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGMEEGKKLRHPTPTMLSIQKWQFSMSAIKEDQELMEEINEDEPVKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIKAARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERREKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKELERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRKKQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRKLIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK	641584	694546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_641872_646213_646373_650736_650800_651943_652145_653088_653202_654184_654274_666378_666540_667579_667637_667780_667848_670361_670498_671316_671407_677682_677802_682463_682615_686718_686884_687300_687484_689577_689758_690449_690534_692225_692327_693474
908382	contig_11816_pilon	+	3123	1	Intergenic	novelGene_98519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	2134	2739	988219	988824	NA	25	GAACAATTTTGTTACCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGVISIFKSYYLRNTCKVIAAIDSASSDGSGQSKPKIFWKGFTILDAIKNIHGSSEEVKISTFTGVWNKLIPTLMDDFEGFKTSVEKVTADVVETARDLKAEVEPKDVTELLQSPDKTLIDEEMLLMDEQRKWFLEMESTPGENAVNIVEMTRKHTAYYINLVDKAAAGFEMTDSNFERSSIVGKMLSNGIAYYREIFS	986085	989208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_986100_989200
908383	contig_15866_pilon	-	3805	1	Intergenic	novelGene_63620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2756	3103	417865	417518	NA	60	AAACAAAACGAGACTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCFLRKLEIKIPYDPAIPLLGIYPREIRAVTQTDTCTPMFTAAKFTTAKRWKQPKCPSTDERINKLRYIHTMEYYAMTKNNDESAKHLTTWMNLEGIMLCKTSQSQKDKYCMR	420620	416815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_416800_420600
908384	scaffold_12124_pilon	-	3244	2	Intergenic	novelGene_22150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGAAAAGTTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987353	971615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_972865_985358
908385	contig_11422_pilon	-	936	3	Intergenic	novelGene_99106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAACAACAACTAACCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2239	906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1686_1943_2007_2145
908386	contig_5684_pilon	+	906	1	Intergenic	novelGene_81001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGATGCAAGGAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296728	297634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_296700_297600
908387	contig_6496_pilon	-	2017	7	Intergenic	novelGene_103475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	94.1198998913384	720	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGATTTGAAGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285287	246325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_247790_249540_249576_250300_250387_250690_250719_263148_263179_264936_265066_285042
908388	contig_18055_pilon	+	2095	13	Intergenic	novelGene_117809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	404.9109984511	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	568	1098	77213	80793	TRUE	70	AAGAAGAAGAAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40651	85631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_77210_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
908389	contig_7333_pilon	-	1873	4	Intergenic	novelGene_142762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_3	40.0360948256556	115	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	141	701	170084	149653	FALSE	20	TGGGAATCTAATTTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEEGGAERMEVSTELPQGPQQLASWWDQQADFYTAFMHRLAQLVPEIYFSEMDPDLEKQEESVQMSIFTPLEWYLFGEDPDVCLEKLKHSGAFQLCGKVFKSGETTYSCRDCAIDPTCVLCMDCFQNSAHKNHRYKMHTSTGGGFCDCGDTEAWKTGPFCVSHEPGRADTTKEVRLYTVFLRK	170224	148480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_149797_151937_152017_156508_156766_170003
908390	contig_6364_pilon	-	2525	15	Intergenic	novelGene_51725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1126.40145134487	30	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	352	1710	472628	436151	TRUE	20	TCAGGTCTATCATATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEEAAVTMVNYYTPVTPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAISAAQPGSLALSGAPTNEGTVLSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFTDAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALVELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI	521157	435273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_435349_435410_436284_436419_436498_439764_439982_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466369_472493_472649_477601_477736_490716_490802_521045
908391	contig_5461_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_156840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAACAGAAGATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832407	833921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_832400_833900
908392	contig_12841_pilon	+	666	2	Intergenic	novelGene_55834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGAAATGGCGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13861	212877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_14209_212558
908393	contig_13300_pilon	+	3490	5	Intergenic	novelGene_125793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2532	2900	190664	193287	TRUE	20	CGAACCTGAGCGGCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAALAAHHLHPLRVLVQHLACGGGPLLAQAAHVQMLVFHGQPLGFEAFADGPVTVGQDHPGHGLGALNLVDHARPVVHRVELPVEDNQLRELHAPPLLRQVGLQDLVAWVPLHNQPVPAV	185557	209036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_188030_190604_190809_193063_193716_198975_199108_209006
908394	contig_8362_pilon	-	4968	1	Intergenic	novelGene_150688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGTTTATTTCCTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110631	105663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_105700_110600
908395	contig_13292_pilon	+	2465	7	Intergenic	novelGene_142960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_4	163.811544838031	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	21	995	389707	549829	FALSE	55	AATGAACATTAACAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCLGLLMHYPPIGDVHSLILKALFLRDPKRNPRPVTYQFHQNLDYYKARGADLMNKSRTNAKGAPLNINKVSNSLINFGRKLISPAVAPGSAGGPVPGGSGGSSSTAGIPTRTSAEAPKPHLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRLMKSESMPVQLNKGQSSKNISSSPSIESLPGGREFTGSPPSSATKKDSLFSNISRSRSHSKTMGRKESEEELEAQISFLQGQLNDLDAMCKYCAKVMNTHLVNIQDMIVQENLEKEDQILVSLAGLKQIKDILKGSLRFNQSQLEAEENEQINITDDHYCSSGRGQGQGRLPAGAAKQVQEL	389686	551299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_389776_426697_426784_445078_445390_471397_471562_516722_516823_548771_548852_549664
908396	contig_12057_pilon	+	2343	21	Intergenic	novelGene_131627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	44.6011210621437	2	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	49	1929	99524	161653	FALSE	5	TGCCCTGTTCAGTTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRKPPRVRANHRDFQLRNLRIIEPNEVTHSGDPGSETDGRMAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKGHLLDSFARSALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYKTFSDEPLEAGMIVTDEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99475	162067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_114853_114943_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145826_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_155467_155642_156319_156397_157622_157722_161524
908397	SIRV6	+	1266	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	162	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	38	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	97	429	1673	2560	TRUE	45	GTAGATTAACTGGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVNRSKAKLLDKQLCVTVKQGAQTERQSKPAPMNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDALCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1465	11665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1645_1736_1845_2026_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
908398	contig_9221_pilon	-	2272	17	Intergenic	novelGene_176240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAGGACACAGAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33219	16265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_-_16438_17234_17348_17453_17562_18327_18447_18589_18686_19400_19529_19614_19709_19917_20076_20805_21082_22038_22169_22831_22910_23688_23853_25347_25451_26073_26170_27871_27999_30772_30925_33061
908399	contig_6027_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_74413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTCCAGATTCCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63053	65551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_63100_65600
908400	contig_3975_pilon	-	1921	12	Intergenic	novelGene_54848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	200.503457236119	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	9	1463	2066301	2056837	FALSE	20	GAACGTTGTACATCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2066309	2056378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064260_2064638_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196
908401	contig_11318_pilon	+	2450	2	Intergenic	novelGene_48160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	0	253	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAACGGTCATATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58526	74315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_58595_71933
908402	contig_2703_pilon	-	3481	9	Intergenic	novelGene_101779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611736	597746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_598348_598414_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
908403	contig_17859_pilon	-	4572	18	Intergenic	novelGene_155722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	69.5352341545445	7	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	197	2245	222369	206195	TRUE	35	TGTACATAGTGTATGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSVSSIVRQWNRKINHFLGDHPASTVNGTRPARKKFQKKGASQSFSKAARLKWQSLERRIIDIVMQRMTIVNLEADMERLIKKREELFLLQEALRRKRERLQAESPEEEKGLQELAEEIDVLAANIDYINDSITDCQATIVQLEETKEELDSTDTSVVISSCSLAEARLLLDNFLKASIDKGLQVAQKEAQIRLLEGRLKQTDMTGSSQNHQLLDALREKAEAHPELQALIYNVQQENGYASTDEEISEFSEGSFSQSFTMKGSTSHDDFKFKGEPKLSAQMKAVSAECLGPPLDISTKNITKSLASLVEIKEDAVGFSIRDSYYRDKVSRTISLPTRGSTFPRQSRGTETSPLTRRKSYDRGQPIRSTDVGFTPPSSPPTRPRNDRNVFSRLTSNQSQGSALDKGIITPVGGAKGARTAPLQCVSMAEGHTKPILCLDATDELLFTGSKDRSCKMWNLVTGQEIVALKGHPNNVVSIKYCSHSGLVFSVSTSYIKVWDIRDSAKCIRTLTSSGQVISGDACAATTTRAITSAQGEHQINQIALSPSGTMLYAASGNAVRVWELSRFQPIGKLTGHIGPVMCLTVSQTSSHHDLVVTGSKDHYVKMFELGEGVTGTVGPTHNFEPPHYDGIECLAIQGDILFSGSRDNGIKKWDLEQQELIQQIPNAHKDWVCALAFVPGRPMLLSACRAGVIKVWNVENFTPIGEIKGHDSPINAICTNTKHIFTASSDLTVKFWSVRRLPSGPP	222761	202078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_202480_204268_206250_207351_207552_208424_208596_209876_209995_210286_210452_212722_212904_213787_213925_217560_217675_219177_219253_219331_219538_220298_220357_220539_220592_220739_220906_221708_221811_221897_222093_222315_222464_222659
908404	contig_15897_pilon	-	1274	10	Intergenic	novelGene_49591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTTCTTACTGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888799	881029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_881114_881726_881868_882515_882660_884357_884436_885030_885222_885376_885582_886069_886148_887317_887421_887605_887772_888715
908405	contig_3948_pilon	+	4212	2	Intergenic	novelGene_53251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	148	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCATCTTGCTGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229629	1261696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1229684_1257538
908406	contig_1261_pilon	+	2146	4	Intergenic	novelGene_168143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15924	26680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_+_17000_17757_17907_24338_24484_25903
908407	contig_3469_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_34200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	25	TTTGTCGATAGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531100_533600
908408	contig_15114_pilon	-	2179	11	Intergenic	novelGene_121101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_9	597.644216905008	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	504	1982	46974	35002	FALSE	15	TCTGTATTCTCTTTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNWIELPGCQYITGTTCDFSSVKLSVFEKIQLRIRAEKGNRTSPWHEVGSFIPFRKAQIGPPKVHLKAEDKAIIVNISPPGTKDSLMWAMDILSFTYSVVIWKNSSSVDERTETVYPGGKIYKLSPETTYCLKVKARLRLHRKVGSYSPVYCVNTTVENKLPSPENIEVDVKDQSYVLKWDYTYENMTFQAQWLRAYFKKILGNHSDKWQQIPGCENVRATQCVFPQKVFSKGAYFLRVQASDGNKTSFWSEEKRLDTEMQTVILPPVISMKSVDNSLHIYIGAPRETENKSTSQHYPLIYEIIFWENTSNAERKILQKKTDFIVPNLQPLTVYCVKARAVIEDEKWNKSSVFSDILCEKTKPGNTSITWIIAGVCTALFSIPVAIYVVKGLLRCINYVFFPSCKPPPNIDQCFSEQSLKNLLLSASEEQTERCFIIENSYSLVTVEETSQVDEDHKQYSSQTSRDSGNYSNEDENSGSKTSRELLQQGLV	56359	34804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_35242_39509_39656_40366_40518_42847_43003_43108_43309_43981_44097_45363_45506_45615_45774_46802_47165_50036_50158_56167
908409	contig_10766_pilon	-	4023	10	Intergenic	novelGene_151184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3351	3659	114363	113090	TRUE	25	TCCCCTCCTCACAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVQHHRVAEQGAGGSPVEQRALRVHVVGAPYPDSQAQQQHHHLRDGGRSGADPAPRFLSHAFSEGNIQYQTATAPKLFGMRRSASRGCSRLSFRETPLLNL	181779	110691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_110898_112931_113143_114107_114377_114740_114860_135916_136029_136123_136253_138017_138086_139434_141377_141773_142517_181555
908410	contig_753_pilon	+	5462	23	Intergenic	novelGene_112893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	126.586828724838	375	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1384	4155	50	4204	246568	319276	FALSE	10	CTTGTATGCTTCATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRPGTGSGGDSAAGAGAGATGGGSFMFPVASGIRPPQAGLMPMQQQGFPLVSVMQPNMQGMMGMNYSSQMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYMGQTSFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQRLLEEERKRRQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKTRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPDCPTSSHSTVTVSPSPAFLDEEEFSDFMQGPVEVPKCGPSSTSQPFQSFHPTTPAGQLHTQKVGAQPLPAGPSLEEKLLVSCDISTSGQERIKLNTSEVEHKALGPASSKNHPSLTASSWGAVNGRVSGATTAEAEKTSDQNRSIESGVGVFPSQDPVQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTVTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFPMTLPTPVSQPTVMPSGPAGSTPLSLGQPVMGINLVGPVGGAAAQASSGFLPTYPANQVIKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFTDFQELPASSKTSNSQQGSSAPSLLIPLPGTKTSASMDKYAVFKGTAADKTSENTVPFGEPGDKYSAFRELEQTAESKSLGESFAEFRCTGTDDGFTDFKTADSISPLELPTKDKTFPASFPSGPVQQKQQTQVKTPLNLADLDLFSSVSCSNEKPVSFSAAFSVSKSIPTRPQPTDSTATTTALASTKTSSLADDFGEFNLFGGYSSPASVGEQDDFADFMAFSNSSVSSEQKADDKYDALKEEISPIPLTSTSGSTVKSVQNAAAAPSKYDVFKQLSLEGSGLGVEELRDCTASGKSDDDFADFHSNKFSSMNSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAADIEDLKYAAFGTYSSNFAVSSLTSYDWSDRDDASQGRKLSPFVLSAGSGSSSAASVLQKKETPFGSSESITTTSFSKVTTFASEGVLPETTFPAFASFKDGILQTSEQKDYESGNYKDFTSQDLPSAEQSQEVTSPSPASSGASHETPKECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLLANSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLSEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWRRCLGSALDVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLGVVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQELACGVCLLNVDSRSRKEEKPAEEHPKKAFNSDTDNFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLILPDLL	246518	320534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_246645_257421_257463_262704_262827_265306_265438_267401_267508_268241_268354_272793_273004_273981_274213_275337_275416_276273_276471_277118_277368_278530_278665_283985_284105_284315_284379_289135_290084_298790_299385_300688_300853_301710_301765_302270_302368_304404_304554_317594_317706_318057_318094_319144
908411	contig_5023_pilon	+	1662	9	Intergenic	novelGene_7244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2242.65578820625	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	83	1060	607279	646990	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQKSFLILFRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580846	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_639049_639197_643413_643539_646857
908412	contig_12019_pilon	-	1359	2	Intergenic	novelGene_87685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTCAATGTGGCCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8654	5222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_6226_8298
908413	contig_14722_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_110213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGACTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40414	42353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_40400_42400
908414	contig_3832_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_161432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCATCAGCCACTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95531	96834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_95500_96800
908415	contig_2365_pilon	-	3483	23	Intergenic	novelGene_103729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGGCAGCGGCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261792	116733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_116901_130178_130243_158561_158688_165787_165855_168857_168923_169336_169483_171534_171669_173637_173732_190641_190682_193762_193970_195602_195781_206221_206320_212135_212253_219465_220179_227529_227616_229217_229305_229386_229535_248940_249030_254096_254240_256887_257044_258064_258246_260405_260535_261544
908417	contig_14953_pilon	+	1412	10	Intergenic	novelGene_137290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	59.3965539175797	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1356	56	1411	310533	458552	FALSE	50	GTAGAAAACCACCACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQSAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAVFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVEHMMEPRPLSTASKISDDTPLEIMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLLAGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSCPVSDRRGVSTVIDAAS	310477	458553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_310552_359693_359828_372501_372767_400496_400648_419395_419521_421867_422034_423962_424064_451465_451567_455028_455226_458455
908418	contig_20748_pilon	+	1062	1	Intergenic	novelGene_138181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATTTTTAAAAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185232	186294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_185200_186300
908419	contig_1037_pilon	+	2648	3	Intergenic	novelGene_84600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1104	1706	303143	303745	FALSE	55	AAAAAAAATTCTTCAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSSPDGIYRNQINYICGKRLWKSSASPVRTRPGGDSGTDHQLLICKSKLKLKKIRASPWEPKYNLKHITTELRDHFKNRFDVLNTNDRRPQELWKDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKLALEHRVATARGRNDEVRELNRRFQKAARKDKVKYYNDMRKDLELENQKGRTCPAFLKLKELKKNSSLELQY	226735	304687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_226900_246090_246487_302599
908420	contig_15897_pilon	-	1217	1	Intergenic	novelGene_49579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	9	443	838955	838521	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTMKFLEEKVGATLSGLAFNNRLSNIIITKVQTAKDKINKRDLIKIKNFRSSKDFTKKEKRQATDWENIFRKHTSDENLITKICMKLQQLNNRKTNHPIMEHIQMVTKHKKRCSASLDIREMQIKTTRRYHFTLTRMAKEPRWRSG	838963	837746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_837700_839000
908421	contig_3627_pilon	+	3193	14	Intergenic	novelGene_78565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	120.22454336949	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	19	1029	1299272	1304132	TRUE	30	GTATTCTACTCTAAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELRAATMLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKRLLVSFLCS	1299253	1309533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304102_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
908422	contig_5236_pilon	-	2822	18	Intergenic	novelGene_100893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	617	1054	83405	77054	TRUE	55	AGGGCAGAGAAAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCGVCFFQDVKLKVFIPNLSISDTVKAWWTLGFCVDLSKAVVAHLVHEAVEQHWRALAVHTELPSRRVVVVLLDVFARVCAASNSDHPQKLVDIVRRIPSEASENDQNVADIKLPHDLIGFFFCGCHCLPYSRNMGIIPCVIVH	84641	61916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_62066_62749_62879_64042_64108_66493_66602_67108_67217_68411_68503_69702_69811_70439_70603_71864_72045_72868_73034_74061_74152_75043_75201_75463_75651_76985_77102_77238_77344_81584_81775_83310_83425_84044
908423	contig_5945_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_104588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGGAGTACATTCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303252	305356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_303300_305400
908424	contig_7357_pilon	+	2363	1	Intergenic	novelGene_36769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81689	84052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_81700_84100
908425	contig_12841_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_55851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAGCTTAGAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282934	281134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_281100_282900
908426	contig_11427_pilon	-	3892	1	Intergenic	novelGene_78994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1554	1853	593699	593400	NA	30	AATTTTTTACCTTGTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAKRSLFCHSPVGYKSKFRVSAPGECFLRQLWRKVCAINLPLVWELLCSGTSGPKDALCFRHCFLGGMRFPCVSARFSLLYLKRDCIKTLILSASSV	595252	591360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_591400_595300
908427	contig_7919_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_28136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACCAAAATGTTTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573268	1571567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1571600_1573300
908428	contig_7182_pilon	-	1198	5	Intergenic	novelGene_117141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1309.87413517483	4	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	88	579	889318	887210	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKYCCIPG	891347	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887231_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
908429	contig_12644_pilon	+	3399	10	Intergenic	novelGene_44559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	49.7656235161443	208	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	13	657	1944794	1982055	TRUE	30	TCATGTGTTATGTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAAMAAGVPCALVASCSSTFTGDRLVQHILGTEDLIAEVTSSDAVRFYPWTIDNKYYSADINLCVVPNKFLITAEIAESVQAFVVYFDSTQKSGLDSVSSWLPLAEAWLPEVMILVCDRVSENGVNRQKAQEWCIKHGFELVELSPEELPEEDDDFPESTGVKRIVQALNANVWSNVVMKNDRNQGFSLLSSLAGANRTTGSAESCRSAAAPFASRR	1944781	1990227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1944867_1963297_1963489_1963619_1963717_1964051_1964142_1965537_1965622_1980989_1981071_1982026_1982127_1986267_1986373_1986824_1986875_1987711
908430	contig_5832_pilon	+	4891	15	Intergenic	novelGene_134140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	85.220871497395	245	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2097	479	2575	248520	269157	TRUE	55	AAATTCTATATAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNANEPHNVIILKHFTEKNRAVIVDVKTRKRKTVKDYQLVQKGGEQECSDSQAQLRQYSQHFAFIASHLLQTSMDSHCPEAVEATWVLSLALKGLYKTLKAHGFEETHATFLQTDLLKLLVKKCSKGTGFSKTWLLRDLEILSIMLYSSKKEINTLTEPGDLELDEQEDKEEEVERLVSSPSETEQKKLDPLEGLDEPTRICFLMAHDALNAPLHVLRAIYELQMKRTDSFFLEVQKRFDGDELTTDERIRTLAQRWQPSKSLRLEEQSVKAVDTDMIILPCLSRPARCDQATAESNPVTQKLISSTESELQQSYAKQRRSKSAALLHKELNCKSKRAVRDYLFRVNDATAVLYARHVLASLLTEWPGHMPVSEDILELSGPAHMTYILDMFMQLEEKQQWEKILQKVLRGCQENMLGTMALAACQFMEEPGMEVQVRESKHPYNNNTNFEDKVHIPGAIYLSIKFDSQCNTEEGCDELAMSSSSDFQQDRHNFSGSQQKWKDFELPGDTLYYRFTSDMSNTEWGYKFTVTAGHLGRFQTGFEILKQMLSEDRVVPHLPLAKIWEWLVGVACRQTGHQRLKAIHLLLKIVRCCTHRDLCDLALLKPLWKLFTHMEYSLFEDVTQPGILLPLHRALTELFFVTENRAQELGLLQDYLLALTTDDHLLRCAAQALQNIAAISLAINYPNKATVLWNVEC	248041	271720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_248623_250921_251122_253270_253391_254717_254910_255752_255854_257370_257507_257597_257958_259490_259635_261151_261321_261494_261594_262052_262219_266355_266510_267125_267198_269076_270562_270808
908431	contig_11986_pilon	-	740	3	Intergenic	novelGene_69265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	60	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTAAATTGTGCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845806	842526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_842855_845153_845483_845723
908432	scaffold_19766_pilon	-	702	1	Intergenic	novelGene_34465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTAATTTTTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919481	918779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_918800_919500
908433	contig_9225_pilon	-	1784	10	Intergenic	novelGene_160161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_9	24.5074944445698	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	208	1317	39444	20369	FALSE	35	TTTTTTAAAAGAATGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAARCRSRRGEGGDGAGPGEGATPRLAEVPPGLGSLFQDVSQQAKERLNKTGNRQDNLGSTGCSKIRTMDLKFNNSRKYISITVPSKTQAMSPHIKSIDDIVVLGINLSRFNKLTQFFICVAGVFVFYLIYGYLQELIFSVEGFKSYGWYLTLVQFGFYSIFGLIELQLIQDKRRRIPGKTYMIIAFLTVGTMGLSNTSLGYLNYPTQVIFKCCKLIPVMLGGVFIQGKRYNVADVSAAVCMSLGLIWFTLADSTIAPNFNLTGVILISLALCADAVIGNVQEKAMKLHNASNSEMVLYSYSIGFVYILLGLTSTSGLRPAVTFCSRNPVRTYGYAFLFSLTGYFGISFVLALIKIFGALLAVTVTTGRKAMTIVLSFIFFAKPFTVQYVWSGLLVVLGIFLNVYSKNMDKIRLPSLQGLINKSVDERKSRMLAQTV	47423	19901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9225_pilon_-_20520_21666_21737_25587_25700_26119_26213_29397_29496_30632_30741_32028_32184_35968_36091_39243_39535_47306
908434	contig_3018_pilon	-	1904	14	Intergenic	novelGene_78851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	489.168307575312	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	825	1904	583440	562929	FALSE	60	GGAAAAAAAGACAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKK	625099	562928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583598_585135_585179_600008_600194_618531_618644_624772
908435	contig_14635_pilon	+	3307	12	Intergenic	novelGene_84367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1900	2394	595447	597691	TRUE	75	CTAGAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFLLVFNKATDAAEILLLFTVCPGFLEVHSSLSLSCKFSSLGWKHCSRHDLILLNISERDSLFSQCLLEALVREKLQEKSTVWEELEKPFSISGSICFRTGSCSVDIRSIITYRPPLPIRLLANPIHLLGTVSVVRQCLYLNLSKSANSEFSNEWLVWSKRGA	581143	629546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_+_582407_583390_583724_584689_584850_586286_586428_595444_595785_595889_596040_597684_597771_603221_603420_605474_605606_606337_606487_612736_612944_629397
908436	contig_6544_pilon	+	1194	1	Intergenic	novelGene_142092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90272	91466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_90300_91500
908437	contig_9415_pilon	+	2192	12	Intergenic	novelGene_109833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	50	junction_2	337.25694645757	151	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	475	1338	1956508	2000181	FALSE	85	AAAAGAAAAAGAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHRKRKLLENSSLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQFCCYFKELPAVELRNGKTAGRRTYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRGKDTFMF	1925862	2001035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1926057_1952293_1952355_1953653_1953770_1956404_1956537_1976238_1976323_1980592_1980675_1981920_1982004_1983786_1983901_1986732_1986847_1993461_1993609_1999791_1999899_2000077
908438	contig_13093_pilon	-	4653	2	Intergenic	novelGene_105202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTTACTATTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22627	17071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_17220_18122
908439	contig_14744_pilon	+	2782	23	Intergenic	novelGene_66141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	264.569512339393	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2433	349	2781	1643447	1689139	FALSE	65	AGACCACAAAGAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIMQSISAQDENLSKMMFLPLAERMVEKMVKEDKIEAEAEVELYYMILERLGKYQEALDVIRGKLGEKLTSEIQSRENKCMAMYKKLSRWPECNALSRRLLLKNSDDWQFYLTYFDSVFRLIEEAWTPPAEGEHSLEGEVHYSTEEAVKFIEDRITEESKSSRHLRGPHLAKLELIRRLRRQGCNDEYKLGDPEELMFQYFKKFGDKPCCFTDLKVFVDLLPATQCTKFINQLLGVVPLSTPTEDKLALPADIKALQQHLCVVQLTRLLGLYHTMDKSQKFNVVRELMLRYQHGLEFGKSCLKTELQFSDYYCLLAVHVLIDIWRETGDETAVWQALTLLEEGLTHSPSNAQFKLLLVRIYCTLGAFEPVVDLYSSLDAKHIQHDTIGYLLTRYAESLGQYAAASQSCNFALRFFHSNQKDTSEYIIQAYKYGAFEKIPEFIAFRNRLNNSLHFAQVRTERMLLDLLLEANISTSLAESIKSMNLRPEEDDIPWEDLRDNRDLNVFFSWDPKDRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLEDTTEIQERIENSLKSLLEQLKDVFSKCKGDLLEVKDGSLKTHPTLLENLVFFVETISIILWVSSYCESVLRPYKLNLQKKKKKKKETSIIMPPVFTSFQDYVTGLQTLISNVVDHIKGLETHLIAFKLEELILEDTSFSPEERKFSKTVQGKVQNSYLHSLLEIGELLKKRL	1626194	1689140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626261_1636644_1636731_1637172_1637312_1643389_1643465_1644572_1644681_1645031_1645111_1647616_1647729_1648307_1648398_1649657_1649828_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324_1685472_1689043
908440	contig_1694_pilon	-	2265	3	Intergenic	novelGene_144917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_2	4.5	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCATGTATTTTGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434864	414155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_416167_419568_419715_434756
908441	contig_18173_pilon	-	2497	2	Intergenic	novelGene_160767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAAAACCATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45379	42793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_45109_45197
908442	contig_6954_pilon	-	6460	33	Intergenic	novelGene_64428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	373	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2694	3071	234205	231341	TRUE	30	GTGCTGACCAGCAACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTLIVITHGALIVSLPRFSLKTLCVFPGVLLGGQPGDKVGFMAFCLVCICGSTPMFLFPLVLLRRGPGQLHSLLTLHVLLPGLPARVMLFPLCSLRYGLLCVRVLLFFLLLPRLKTLVSRDAIL	252529	207752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_207862_208711_208821_209484_209558_210018_210224_211660_211821_213187_213336_215795_215920_216979_217088_217628_217745_218681_219169_219453_219679_220426_220585_220764_220940_221767_221924_223554_223695_223831_223974_225876_226044_226653_226809_228891_229038_231054_231381_231661_231827_233331_233434_234134_234338_235706_235878_237018_237182_237901_237992_244618_244737_245314_245488_247336_247411_247523_247639_248505_248570_250150_250294_251079
908443	contig_12624_pilon	+	2486	11	Intergenic	novelGene_60956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	375.949517887708	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1751	2065	42968	55160	FALSE	30	CTAGGAAAACTCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6095	55581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6196_9753_9852_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_46682_46768_50396_50437_54975
908444	contig_18162_pilon	-	3616	3	Intergenic	novelGene_122282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16364
908445	contig_11253_pilon	-	2995	2	Intergenic	novelGene_126809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAAGACAGCTACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15024	11950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_12823_12901
908446	contig_17618_pilon	+	2896	1	Intergenic	novelGene_173354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAACAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19648	22544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17618_pilon_+_19600_22500
908447	contig_13021_pilon	+	3454	13	Intergenic	novelGene_8137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_11	2480.02312237205	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	171	1487	174676	178956	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGAVFVARPRHDNRRTRGGWRTSDRLAASSRLER	174505	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_178855_180211_180440
908448	contig_160_pilon	-	2339	3	Intergenic	novelGene_156329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTGTTCTGTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425404	225979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_226779_412512_412583_423934
908449	contig_8587_pilon	-	4359	3	Intergenic	novelGene_159153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	385	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520355	514804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_514932_515257_516635_517500
908450	contig_12920_pilon	+	6577	1	Intergenic	novelGene_166331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACCACACAAATGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107634	114211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_107600_114200
908451	contig_8377_pilon	-	4830	17	Intergenic	novelGene_35076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.45236875482778	2	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTGATTATTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180507	128374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_128936_128985_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143589_161226_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179481_179574_179664_180381
908452	contig_4429_pilon	-	4073	2	Intergenic	novelGene_50809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1189	1509	180081	179761	FALSE	25	CAGATGTTACCCTAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVTTLISLGYISRSGIAGSNGMSISSFLRKGHIIFQNGCSILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAAVRWYLTVVLICIYPMASDHEHFLMCLLAI	181492	177196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_181157_181379
908453	contig_15449_pilon	+	3321	12	Intergenic	novelGene_33602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	790.949873556687	1	148	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1687	2283	49356	54621	FALSE	25	CCAATATATTTGTCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	42550	55659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48203_48365_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
908454	contig_6842_pilon	-	4255	2	Intergenic	novelGene_130664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCACTGTGTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270303	265090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_269140_270097
908455	contig_8710_pilon	-	5617	3	Intergenic	novelGene_73530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	334	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	772	1092	443813	443493	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYRKNSLTPQLSQHHAADWIRYRAALPGLSLQGTILPHSTVISSLSCCCCCLWLNYSNTRRLKFGKIKAKLVFNASKSGCGESVSTDVIRIGRRQVCDARLRCRF	444584	437258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_441677_441810_441903_443477
908456	contig_12464_pilon	+	477	1	Intergenic	novelGene_68632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	474	3	476	54087	54560	NA	55	TCTTAGAAAGGAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDLRTKKRIFEAKEELKEFKKPKKDDIKETKELKKVKKGEIRDLKTKVREDFKENKKTKKDKCIESQLESESSVLNDSLSQDDDNEDLHSDNKEEKQKIKSTKDKSGPDIIAGVVFDKQPDGKVSADEDTDVRTKRKKKKLRKTEEHKDSNKLENKDL	54084	54561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_54100_54600
908457	contig_4659_pilon	-	3365	7	Intergenic	novelGene_118233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.777185324321	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	10	384	860030	843333	TRUE	75	AATAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRLIF	860039	817412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843346_847628_847730_853789_853937_859916
908458	contig_34_pilon	-	3606	1	Intergenic	novelGene_40045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	357	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTCAGAAATGATTTGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239348	235742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_235700_239300
908459	contig_8415_pilon	+	2914	13	Intergenic	novelGene_141693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	24.7267005931285	104	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	979	2061	241158	261192	FALSE	80	AAAACAAAAATAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLLRYQAGSGGASENHMRKKLYENGVTNSLQSNFAVLLKLSEELLAKWLSYPESQHVPLCQHMLGFAMKSVTQMVMGSTFEDDQEVIRFQKNHGTVWSEIGKGFLDGSLDKSTTRKKQYEDALMQLESILKKIIKERKGRNFSQHIFIDSLVQGNLNDQQILEDSMIFSLAGCIITANLCTWAICFLTTSEEVQKKLYEELDEVFGKSPITPEKIEQLRYCRQVLCETVRTAKLTPISARLQDIEGKVDQFIIPRETLVLYALGVVLQDPSTWPSPHKFDPDRFDDESVMKTFSLLGFSGTQECPELRFAYMVTTVLLSVLLRRLHLHSVEGQVIETKYELVTTSREEAWITVSKRY	231973	262045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_+_232718_237871_237922_238826_238994_241140_241284_244869_245038_246303_246383_249579_249696_250517_250573_253232_253354_255464_255577_256798_256864_260793_260884_261041
908460	contig_15498_pilon	-	859	6	Intergenic	novelGene_42667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.516690955939	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	12	542	697708	688306	FALSE	20	AAACTTCCATCTGGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTPTTPVPSP	697719	687988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688340_691330_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
908461	contig_6488_pilon	-	3209	3	Intergenic	novelGene_44739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCCCAGCTTTAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183390	62156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_64692_92406_92726_183035
908462	contig_12086_pilon	-	3460	3	Intergenic	novelGene_74704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	41	156	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	140	592	14945	12619	FALSE	50	ATTCCTAGCAATTAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVVRRCPFLSRVPQTFLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEAGAKPAPRALSTSAVHCQQVKETPPANEKDKTAKAEVQQASDGSQKTPDGAQLPSEHLSPATSQGTASKCPFLAAQMSQRGSSVFRKASLELQEDVQEMHALRKGKQKRPDH	16099	9750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_12873_14746_14967_15981
908463	contig_7179_pilon	-	4694	25	Intergenic	novelGene_78070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_24	141.618318955878	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2613	280	2892	547098	414067	FALSE	40	CTTGTGCAATAAATAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSFVEVAVDGLPSETKKTGKRIGSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENTQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGSVPNGSAVTDGSQPPSRESSGTAVPPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGGSARTTTGSNEQSPGTRNRHRQPIKNPSHNGLPNGTVNDEATAATDPEEPSVVGVTSSPAAVSNVTLNPNAASLPAPATPAEGEEPGTSGTQQLSTTAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGTMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGQVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKNTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCVDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLYAIEETEGFGQE	570890	412264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_414167_414702_414776_414985_415083_416809_416915_417289_417411_418627_418769_419104_419239_420731_420892_423002_423092_423303_423376_423673_423750_424227_424357_424852_424935_428464_428520_434575_434751_451375_451466_468437_468649_480130_480259_501923_502021_503927_504066_540603_540726_541039_541188_547028_547114_549412_549632_570845
908464	contig_8773_pilon	+	4314	2	Intergenic	novelGene_74522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	319	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATAACAACCCCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37039	41799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_41031_41476
908465	contig_8616_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_72514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	41	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	25	699	343272	342190	FALSE	25	GCTCTCAGTAAATGTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVRKALIVGALLGAGAGLGSALFVLVTPGEQRTQAMLEVGATGSPEVGHAGRECRAGGRDCAPPFLPSGDAGAGPAAQGGGGQDQGAPAGYPAGGSGHSGKRGLQEEPGGRQWRRWDVGMSADLAPVDAGTSARAQDSEAAFRLRGPVQESGPGMPHPGLSGSPGAVAGMMYIQGGLLLDNMCKYVREVSPSSLLWNILAVILTRQICSFFWRSMAYSSPTP	343296	341501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_342353_342760
908466	contig_11115_pilon	+	1793	7	Intergenic	novelGene_102808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	609.511940453635	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	906	1703	171881	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165319	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171217_171799_171981_172339_172595_172714_172964_173047
908467	contig_17106_pilon	-	3802	1	Intergenic	novelGene_127662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTCTGCCTTGGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29968	26166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_26200_30000
908468	contig_15407_pilon	+	800	5	Intergenic	novelGene_123103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	18.3626659284539	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	29	607	556303	591712	FALSE	15	GAGCTGTCATACTCTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELGIEKFVSLKDIKNSKCPEGTKPMLIFAGDDFDVTEDYRRLKSLLIDFFRGPTVSNIRLAGLEYVLHFTALNGKIHFRSYKLLLKKSGCRTPRIELEEMGPSLDLVLRRTHLASDDLYKLSMKMPKALKPKKKKNISHDTFGTTYGRIHMQKQDLSKLQTRKMKGLKKRPAERKTVEKEENKSKRIKKN	556274	591905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_556351_566034_566135_584666_584770_590554_590700_591529
908469	contig_16541_pilon	-	1392	2	Intergenic	novelGene_126726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTACCCACTCATCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410729	262611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_262912_409637
908470	contig_13481_pilon	-	2116	9	Intergenic	novelGene_119483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_7	41.7161164899131	5	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	686	1519	1331108	1306097	FALSE	35	TAGTTTCACTGAAACTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCDSVPDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISDAKENPYGEDDNKSPFPLQPKNKRSYAQNVTVWIKPSGLQTDVQKILRNARKLPEKTQTFYKELNRLRKAALAFGFLDLLKGVADMLERECTLLPDTAHPDAAFQLTHAAQQLKLASTGTSDYAAYEQNITPLQTDFSGSSTERM	1338603	1305499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1331083_1331445_1332676_1332961_1338538
908471	SIRV6	+	904	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	164	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	37	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	161	486	160	645	1733	10736	TRUE	35	GTAATGGAAATTGGCGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1856_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
908472	contig_16103_pilon	+	3348	25	Intergenic	novelGene_118919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_4	346.003492275247	940	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	963	2892	105	2996	772650	799889	FALSE	0	CTCTGGCGTTCTTTCCGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDITGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGAQTESNEEGKENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRGRGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTRLDFIGVEGSNYPRKFETAPGAWRTTTEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPTSIENDPSNLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQSAISPPASGNTFSHHGMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYDLKNPNDSTVHSPFTKRQAFTPSSTMMEVFLQEKPSAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQPAQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSASSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNSAQGPLYEQRSTQTRRYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGAPGSTVKSDSPPTSSIPPLSETVSAASLLTATSQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTHLHTSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSVATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFPTPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNPALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGYGSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES	771085	800241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_771160_772619_772698_773261_773373_776723_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_780514_780575_782322_782376_784334_784421_785517_785690_788396_788596_789050_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923_794120_794208_794298_795267_795322_795892_795975_797698_797917_798357_798464_799839
908473	contig_5316_pilon	+	9591	2	Intergenic	novelGene_61221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	383	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	7574	7882	418472	418780	FALSE	85	AAAAAAAGAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHIQVYVRGDSTVVLVIFKKVALGSILTHGNSVYVRVDPCSKGFSLVGLSEVDHQTFLPRSFWVDLNHQPFDHTLQGQNYKSVNLLVPAIRQLYIDKPDFS	409155	420489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_414466_416208
908474	contig_15434_pilon	+	4805	3	Intergenic	novelGene_56712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCACTTAGAGCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46214	67942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_50389_55687_55810_67433
908475	contig_5947_pilon	+	3787	7	Intergenic	novelGene_101508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	338.681143063305	5	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	41	2737	413753	420584	FALSE	15	ATCAATGGTCCGTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAGQEERSQKKKMKKRVKSELLKLNTMTEAEANEIQDVWQLNLNSRWQLYRLWLQMYQADTRRKILNFERQYRTSAERMAELRLQEDLHILKDAQVVGMTTTGAAKYRQILQKVEPRIVIVEEAAEVLEAHTIATLSKACQHLILIGDHQQLRPSANVYDLAKNFNLEVSLFERLVKVNIPFVRLNYQHRMRPAIARLLTPHIYQISNRICVALSRAKKGMYCIGNMQMLAKVPLWSKIIHTLRENNQIGPALRLCCQNHPDTHTLVSKASDFQKVPEGGCSLPCEFRLSCGHVCTRACHPYDSSHKEFQCMKPCQKIICGDGHRCPLVCFQQCRPCEVKVPKTIPQCGHEQMVPCSVPESDFCCQEPCPKFLPCGHRCSHPCGEKCVQWCSEMVTAELKCGHSQQVECGQVDAIKYGLPVKCTTKCGTILDCGHPCLGSCHSCFEGRFHEHCQQPCKRLLICSHKCQEPCIGECPPCQRTCQNRCVHSQCKKKCGELCSPCVEPCVWRCQHYQCTKLCSEPCDRPPCYVPCTKLLACGHPCIGLCGEPCPKKCRVCHQDEVTQIFFGFEDEPDARFVQLEDCSHIFEVQGLDCYMNEQKDDEVAIKLKVCPICQVPIRKNLRYGTSIKQRLEEIEVIKERIQGSAEEIAASQERLKDLLEKKNLFYLWLPEEFLMLKKKLAQKNLSVKGLGLVENCISFYDRLAGLWDSLKRVHVLEQNNVSTRLNQVHEWLAKKRLSFTSQELGDLQSEIQRLTYLVNLLTRCKMAEGKVKGSIAEEVCSVRKILMNTCKFTQEDEQLVQKKMEALKASLPCSGLGISEEERVQIVNAMGYPRGHWFKCPNGHIYAISDCGGAMQRGTCPDCKAVIGGVNHTLESSNQLASEMDGAQYAAWSETANNLMNYEEIQRLM	412111	421634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_412134_413734_413869_415242_415398_415803_415950_416710_416822_417146_417198_418466
908476	contig_1472_pilon	+	3843	12	Intergenic	novelGene_86115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	82.4250222779507	162	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	488	1369	382489	750936	TRUE	15	GGTTGACCATGTGGATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAQEENKKVVLAGCVPQAQPRQDYFKGLSIIGVQQIDRVVEVVEETIKGHSVRLLGQKKDNGKRLGGARLDLPKIRKNPLIEIISINTGCLNACTYCKTKHARGNLASYPTDELVDRAKQSFQEGVCEIWLTSEDTGAYGRDIGTNLPTLLWKLVEVIPEGAMLRLGMTNPPYILEHLEEMAKILNHPRVYAFLHIPVQSASDTVLMEMKREYCVADFKRVVDFLKEKVPGITIATDIICGFPGETDQDFQETVKLVEEYKFPSLFINQFYPRPGTPAAKMEQVPAQVKKQRTKDLSRVFHSYNPYDHKIGERQQVLVTEESFDSKFYVAHNRFYEQVLVPKNPSLMGKMVKVDIYESGKHFMKGQPVSDAKVYMPSIIKPLAKGEVSGLTEEFRNRCGNHLSSLSHTSAAIERGLVSSRTVPQMQRLQEDCALKISVGLALLALLFAFFVKVFN	87738	757811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_87836_113737_113787_159870_159992_237311_237416_382372_382540_435498_435645_514443_514625_558385_558449_708522_708607_712301_712467_750744_751824_756224
908477	contig_610_pilon	-	4711	1	Intergenic	novelGene_76703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	630	974	210291	209947	NA	70	TGGGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSVLPPGLLTSYAETTPFAGSSSARTKPDSHVLPQPLVCFSASKFRRGEFSELKPFVFVQRGHSSTCSKFSSRAASCALKSQDKMFQSVLQPVLHSPAALPSAGSTAASSSTM	210920	206209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_206200_210900
908478	contig_17829_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_157030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTTTGGCTATGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25547	23122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_23100_25500
908479	contig_13707_pilon	-	3717	40	Intergenic	novelGene_43515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_12	240.010291802123	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1054	3165	52	3216	181940	117289	TRUE	40	CAAATAAAGGGATGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KENAEVKFKDFLLSLKTMMFSEDEALCVVDLLKEKSGVIQDALKKSSKGELTALVHQLQEKEKLLAAVKEDAAAAKDRCKQLTQEMITEKERSNVVIARMKDRIGTLEKEHNVFQNKMHVSYQETQQMQMKFQQVREKLEAEIAHLKQENGILRDAVSNTTNQLESKQSAELNKLRQDCARLVNELTEKTGKLQQEEVQKKNAEQGVTQLKVQLQEAERRWEEVQSYVRKRTAEHEAAQQDLQSKFVAKEKEVQSLHSKLTDTLVSKQQLEQRLMQLMESEQKRVNKEESLQMQVQDILEQNEALKAQIQQFHSQIAAQTSASVVEELHKVIAEKDKQIKQTEDSLANEHDHLTSKEEELKDIQNMNFLLKAEVQKLQALTNEQAAAAHELEKMQKSVHVKDDKIRLLEEQLQCKISKKMEEFKILNDQNKSLKLEVQRLQTLVSEQPSKDVVEQMEKCIQEKDEKLKTVEELLETGLIQVATKEDELKALRTENSSLTKEVRDLKAKQNDQVSFASLVEELKKVIHEKDGKIKSVEELLEAELLKVANKEKTVQDLKQEIEALKEEIGNIQLEKAQQLSIASQVQELQNLLKGKEEQMNTIKAVLEEKEQDLANRGKWLQDLQEENKSLKAHVQEAAQHKLNEACSASRFKELETVLKEKENEMKKVEAMLKERESDLSSKTKLLQEVQDENKLFKSQIEQLKHQNYQQVLSFPPHEELLKVISEREREIIDLQSELDSLKDAVEHQRKKNNDLREKNWEAMEALASTEKMLQDKVNKTSKERQQHLEAVELEAKEVLKKLFPKVSVSSDLSYSEWLRGFEKKAKECMAETSGSEEVKILEHKLKEADEMHTLLQLECEKYKSVLAETEGILQKLQRSVEQEENKWKVKDDESQKTIKQMQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESSSEKETVSVSLNQTITQLQQLLQAVNQQLTKE	181991	108277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_108760_117269_117388_119119_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906_125000_125128_125219_126019_126101_127930_128021_131443_131531_133608_133700_135226_135265_136413_136483_138446_138538_140267_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_143308_143971_144010_145177_145247_145940_146032_146441_146477_150930_151000_151514_151597_152123_152162_152693_152763_153125_153217_154405_154441_155990_156060_156456_156624_159283_159372_160632_160766_169938_170046_172845_172987_174886_175004_181856
908480	contig_13924_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_147771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCCCATTGTCTTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2701	4311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_+_2700_4300
908481	contig_5961_pilon	-	2045	6	Intergenic	novelGene_144169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_2	46.0017390975602	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	182	709	273684	262724	FALSE	25	CATGTTTCGTGAATTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTWSERDILKSGHLYIIKSFLPEVVNTWSSIYKEDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSPRFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLAFSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEKRSCDMVFGPANLGEDAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYTPDKIVFPQDEPSDLTLQPGNSTKESESTNSVRLML	274012	261387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_262855_269740_269848_269949_270002_273290_273497_273652_273736_273882
908482	contig_9481_pilon	-	6341	1	Intergenic	novelGene_149647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1564	1869	147195	146890	NA	35	CTAGCCAAGTTGATACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASSAPRGNLIDSANEAFSAQPLRGHGLGENGLSLEQVLTPVHSATGADSQGHSVVTKGHTQQGGWAGSVLKKRCGPDGCPAGGVCCVLATVTTSVANTG	148758	142417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_142400_148800
908483	contig_12117_pilon	-	1403	2	Intergenic	novelGene_178845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACAACCTACATATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99397	27106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12117_pilon_-_27339_98226
908484	contig_5482_pilon	-	3980	7	Intergenic	novelGene_144496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCTTATCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589162	566302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_568202_571620_571815_579684_579794_581711_581810_585109_585258_586233_586332_587728
908485	contig_11574_pilon	-	3777	1	Intergenic	novelGene_64040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	2769	3311	323949	323407	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQGSLPCYCQNPLHSMLAVGVAASQNAYFLAHSSLSQQSSAPPGRGNRETETDSQGRLSLGFRSLSYGVCREANRVLTVRTASTAPAFCSNACRLTVDSVQVEEVLAHSRWTLEEVCLVDSRTEAWSSVSLYRQGLWWLGKQAPFLGPLPPVHSSRQPAWLGGEAEAVGKVIPTICDS	326717	322940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_322900_326700
908486	contig_18544_pilon	-	1465	9	Intergenic	novelGene_152743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_3	315.778378574278	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	206	787	54710	39640	TRUE	90	AAAAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGHLQHHPPMPPHPGHYWPVHNELAFQPPISNHPAPEYWCSIAYFEMDVQVGETFKVPSSCPIVTVDGYVDPSGGDRFCLGQLSNVHRTEAIERARLHIGKGVQLECKGEGDVWVRCLSDHAVFVQSYYLDREAGRAPGDAVHKIYPSAYIKVFDLRQCHRQMQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAIKLNS	55008	37912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38279_38472_38686_39540_39654_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54685_54803_54895
908487	contig_610_pilon	-	1263	3	Intergenic	novelGene_76756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_1	811	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	63	731	252557	220501	FALSE	45	ATAAGTTTAGAAGGGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVGKNYL	252619	219968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_220785_234998_235302_252475
908488	contig_1939_pilon	+	2535	5	Intergenic	novelGene_144869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCCAGTGCAATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300735	675864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_302790_499306_499314_551243_551356_675455_675581_675627
908489	contig_3900_pilon	+	4008	1	Intergenic	novelGene_84168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTAATTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149579	153587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_149600_153600
908490	contig_17274_pilon	-	1331	10	Intergenic	novelGene_26584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_9	332.615820355282	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	198	917	251759	232842	TRUE	60	TGTGAATAAAAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	259031	231583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_251831_258905
908491	contig_2596_pilon	-	2107	2	Intergenic	novelGene_53535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATTAACCAGAACAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120598	1118208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1118332_1118614
908492	contig_5451_pilon	-	2631	8	Intergenic	novelGene_167164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_2	86.5954704947325	175	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	187	1413	555647	309127	FALSE	10	ATGCCGTGCATTGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFIQEIEHALGLGPAKQCPLREFLTVYIKNIFLNQVLAEINKEIEGVTKTSDPLKILANADTMKVLGVQRPLLQSTIIVEKTVQDLMNLMHDLSAYSDQFLNMVCVKLQEYKDTCTAAYRGIVQSEEKLVISASWAKDDDISRLLKSLLNWINMAQPKQLRPKREEEEDFIRAAFGKESEVLIGNLGDKLIPPQDILRDVSDLKALANMHESLEWLAGRMKSAFSNLSSSQMLSPGQESHVNMDLPPVSEQIMQTLSELAKSFQDMADRCLLVLHLEVRVHCFHYLIPLAKEGNYAIVANVESMDYDPLVVKLNKDISAIEEAMSASLQQHKFQYIFEGLGHLISCILINGAQYFRRISESGIKKMCRNIFVLQQNLTNITMSREADLDFARQYYEMLYNTADELLNLVVDQGVKYTELEYIHALTLLHRSQTGVGDQTTQNMRLQRLKEIICEQAAIKQATKDKKITTV	555833	307908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_309365_372162_372323_375902_376082_386116_386259_453445_453625_468758_468915_486618_486756_555611
908493	contig_10861_pilon	+	2673	3	Intergenic	novelGene_39227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGTTCTGTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598830	629951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_599530_599970_600503_628509
908494	contig_6589_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_26317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCACAGTAAAAACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2360441	2362811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2360400_2362800
908495	contig_6286_pilon	-	3976	1	Intergenic	novelGene_165665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370761	366785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_-_366800_370800
908496	contig_9516_pilon	+	2450	15	Intergenic	novelGene_106152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	34.8437474261004	183	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	40	1983	690637	708030	TRUE	15	CTAGAGCGTATTCTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCENNAEKMSATSAESLLALRQQEELVDLPKDYPLSASEDEGDSDGERKHQKLLEAISSLDGKNRRKLAERSEASLKVSEFNVSSEGTREKLVLSDLLQPIKPSSSLATVRKQLNRVKSKKTVELPLNKEEVARIHREVAFNKTSQALSKWDPIVLKNRKAEQLVFPLEKEQAAFAPIEHVLSGWKARTPLEQEIFNVLHKNKQPVTDPLLTPVEKASLKAMSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAKARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKDFETLRKVDPTAALEELEKIEKARMMERMSLKHQNSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQAASESEEEGGGVEENELLVPDVVNEVHINANEPNPWMRRSCTSDAKEVEIQKDPEQPPEPMAHEDSESEGEESPVAEEETLLKEFEERRSLRKRPELNQDAEPVGGREAQDASSQEVLSELRALSRKLNKENQEKQSRKQKGNSVRAVLPVQREEPAQEEEEPLLLQRPERVQTLEELEELGKEGYLQNTELPRPVSQGQQTERNPDNQPGAPKKKKRKEEMIDLQNLLTTKSPSVKSLAVPTTIEALEDEEERDQKQMIKEAFAGDDVIRDFLKEKKEAVEASFSLKPLRVLQEKTRICQM	690597	710986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_690684_691718_691795_692663_692735_694231_694297_695915_696059_696331_696488_702047_702168_702265_702361_702961_703086_703168_703247_703704_704096_706498_706912_707643_707750_707971_708072_710560
908497	contig_13215_pilon	+	4020	3	Intergenic	novelGene_145874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	930	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1418	1948	9230	9760	TRUE	30	AAATATTCTGCATCCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTIQELKQKADKNEEENRQIHGKYRKKNGTIQENNAGTKCQNKFHLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRIRETLGYNSEEKSEKRTKKNEETLIIMWDTIKSKNLQVIGIPEWGENRKHRSIEELLTENLPNITKDEKLAIHKAQRTPYRIDPKRKITKA	7468	12263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_8061_8404_11551_11981
908498	contig_3866_pilon	-	3202	1	Intergenic	novelGene_112385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2682	3173	141287	140796	NA	50	GGAAATAATGAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNATINQLDLMDIYRTLYPIAAKYNFFSSAHGTLSRIDHILGHKASLNKMQSIEILQSIFSDPKAIKVEINKRKSKEKESNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKALLRGQFLAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEHVERE	143968	140766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_140800_144000
908499	contig_5033_pilon	+	2150	2	Intergenic	novelGene_28909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGTACCAAACTCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449298	455378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_451402_455331
908500	contig_4891_pilon	-	744	1	Intergenic	novelGene_124579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGAAACCTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752310	751566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_751600_752300
908501	contig_12624_pilon	+	2155	12	Intergenic	novelGene_60953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_1	332.96067322937	42	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	797	1495	39740	55160	FALSE	35	TTAAAAACCAGCTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6075	55820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39362_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
908502	contig_7179_pilon	+	5158	15	Intergenic	novelGene_78102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	396	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGTCCGTTTCGTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638840	781333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_639082_639734_639979_642028_644517_645240_645387_662990_663071_664986_665124_668996_669053_669178_669313_678808_678980_680449_680644_682875_683067_688642_689209_700655_700778_779242_779295_780997
908503	contig_6137_pilon	-	5926	3	Intergenic	novelGene_59153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	540	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTATGAACCAGAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335049	1173471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1173624_1224544_1224995_1329725
908504	contig_17144_pilon	-	2183	16	Intergenic	novelGene_29525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1986.16909876498	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	135	1739	179764	168280	TRUE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEPPPMLQSCI	183216	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166186_167591_167676_167918_168060_168162_168310_169000_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
908505	contig_14515_pilon	-	2181	2	Intergenic	novelGene_178847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAAACCCAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17868	15559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14515_pilon_-_17498_17625
908506	contig_2069_pilon	-	3912	1	Intergenic	novelGene_23224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1749	2240	211419	210928	NA	25	TGTGGATTGTACCTCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFMGLETMHYAFLFSYSAWHSSGYLVGIQFEMQHIKINILGMSELKLTGIGHFQLDNHMVYYAGNDKLKRNGVAFINKKNISRSILKYSVVSDRIISIHLQGRPVNMTIVHIYPPTTNAKDKEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGEWNTKGGNKEEG	213167	209255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_209300_213200
908507	contig_9653_pilon	-	2644	7	Intergenic	novelGene_48289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1056.02547580802	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	92	1045	1016667	1006903	TRUE	20	GAGCCAATGAGCCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1016758	1005120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1006152_1006334_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595
908508	contig_3878_pilon	-	1702	6	Intergenic	novelGene_174795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	6.15142259969188	139	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	67	1332	624087	562953	FALSE	30	GTTTGATGTAGACAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPTSAPAPRADRPDWGPPPALTMYAFVRFLEDNVCYALPVSCVRDFSPRSRLDFDNQKVYAVYRGPEELGAGPESPPRAPRDWGALLLHKAQILALAEDKSDLENSVMQKKIKIPKLSLNHIEEDGEIKDYGEEDLQLRHIKRPEGRKPSEGAHKSIEAVVARLEKQNGLSLGHSTCPEEVFVETSPGTDDMDSLEDAVVPRALYEELLRNYQQQQEEMRHLQQELERTRRQLVQQAKKLKEYGALVSEMKELRDLNRRLQDVLLLRLGSGPAIDLEKVKSECLEPEPELRSTFSEEANTSSYYPAPAPVMDKYILDNGKVHLGSGIWVDEEKWHQLQVTQGDSKYTKNLAVMIWGTDVLKNRSVTGVATKKKKDAVPKPPLSPHKLSIVRECLYDRIAQETVDETEIAQRLSKVNKYICEKIMDINKSCKNEERREAKYNLQ	624153	562582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_563111_574094_574309_580427_580577_597376_597762_600129_600264_623861
908509	contig_5033_pilon	+	1787	1	Intergenic	novelGene_28939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTGAAGGTCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449956	451743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450000_451700
908510	contig_3130_pilon	+	3338	19	Intergenic	novelGene_103562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCATCTTGCTCCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70219	167762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_70806_73826_73982_74793_75050_86941_87113_102958_103149_115882_116108_116475_116552_118126_118337_119672_119816_124091_124206_126473_126635_128372_128513_128962_129113_129928_130032_133509_133641_133928_134042_134805_134978_143289_143384_167614
908511	contig_20641_pilon	+	4178	9	Intergenic	novelGene_52785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1617.68275629061	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	2579	3889	14599	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	9785	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_11876_12293_12417_14233_14771_16769_16916_38522_38658_41511_41619_45848_45965_54835_54968_56379
908512	contig_10569_pilon	+	5903	7	Intergenic	novelGene_44062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.086456138595	776	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTGCCAAATTATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231728	336408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_231795_232306_232520_290798_290895_323271_323378_327955_328036_331017_331937_331985
908513	contig_15897_pilon	+	1924	8	Intergenic	novelGene_49509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	24.6021402752372	18	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	759	1400	158442	161266	FALSE	20	TTTTGAATCTTATTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTREERSGHSDVLWVIPALSQPSGTLRDGKDGYVGARDVGEGGDMRAGSQSCCFFLHHPGQAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFTANLEPVSLADREVISRLRNCIVSMVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG	153140	161790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_153272_154566_154669_156141_156188_156903_156994_158052_158697_159745_159923_160322_160452_161185
908514	contig_12622_pilon	-	3241	21	Intergenic	novelGene_5802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	765	1613	465692	446496	TRUE	20	GGCTCCTAGTTCTCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFLQLAHHCFFLVSSTACCFSSSSCFFTSAMSRSRSCSRLCRISAMVSSRLCFISESSCWCSHWSFSISILSLRISAIVLPVVFFERSLYISVIVPFIASIILLVYLAISAATSAEAVAMGRSALTEDASVLVDPELVTRGDDCVLVTRVMVDVDGLCVISFCWTVDEFHTTRCTAGAVSFGKSGLCFFTGLPVAAATGAMTVDVVLVVAVTPAVGVWEEERVRTGVSEGDWLPAAVVDGGALPTTNCALQLSIVLSRLSWNLLRICRLGEMSGTGADCC	475821	349696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_349753_358490_358562_388905_389052_398341_398489_401823_401939_404555_404648_405787_405877_408751_408807_412054_412116_413361_413486_419331_419814_433571_433715_446448_446599_454871_455116_457156_457348_460455_460535_463382_463463_465540_465779_467739_467905_469395_469464_475376
908515	contig_5023_pilon	+	4201	17	Intergenic	novelGene_7310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	2129.33987625126	1344	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	173	2056	607279	646990	TRUE	35	TCAATGCTCTAAGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	595693	649301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_595842_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_648261_648426
908516	contig_12352_pilon	+	2424	8	Intergenic	novelGene_57459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	217.268666561444	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	55	756	230286	284811	FALSE	15	AAGCTCGTTTGCCTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WCRQFDLSGKSSLGEVRFMAPIRPRVKEIEAMAILFAVVARGTTILAKHAWCGGNFLEVTEQILAKIPSENNKLTYSHGNYLFHYICQDRIVYLCITDDDFERSRAFTFLNEIKKRFQTTYGSRAQTALPYAMNSEFSSVLAAQLKHHSENKGLDKVVETQAQVDELKGIMVRNIDLVAQRGERLELLIDKTENLVDSSVTFKTTSRNLARAMCMKNLKLTIIIIIVSIVFIYIIVSPACGGFTWPSCIKK	230231	286479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12352_pilon_+_230316_238264_238420_245181_245240_247436_247575_252230_252322_268129_268198_277208_277302_284742
908517	scaffold_12124_pilon	+	2288	9	Intergenic	novelGene_22028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	526.344335368967	35	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	214	1215	836073	848022	TRUE	15	CCCCGTAAGTATTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLLDLVWFWMFVAPACCQPEQYQECLSSAVSVTSAGGRVFTRHQFFNISAEKNGSPIINLKLDPRRKILRWNCRRNVTQEMCKIETPLETFCIPETQVQEDGTHYCRFPNALLHRGALLSVAVTSDGDTFQEVLIFNNSGKDSSGAMNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVHDAFGLDFCIWCEVGVQLHSFACGDPVVPAPFVEEAVLHPLN	829531	849825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837452_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_847890_848332_849061
908518	contig_8032_pilon	-	3066	3	Intergenic	novelGene_178848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	905	1576	172706	86371	TRUE	20	CCGGCTACCACCACTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSMRNLLELIERFSRVAAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIMKTIPFIIALKKLKYLGINLTSDVKGLHKENRKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWTGRLNIVKMTILPKAIYKYNTIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFKIYYTATVVKIAWYWYNDRYIDQWNRIENSDINPSTYSHLIFDKGPKSIK	173610	84827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8032_pilon_-_85533_85585_86964_172627
908519	contig_12923_pilon	+	3112	1	Intergenic	novelGene_30120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGTCGAGCACTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70560	73672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_70600_73700
908520	contig_5947_pilon	-	1528	7	Intergenic	novelGene_101507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	102.48644896874	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	465	836	418376	416780	TRUE	20	CTCCTCTGCAATCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDTSKCLGRHEFAQAEELAGVGGEDGDLGGQVFLAQEVLAQLYHKVSLVLVLVAFAFLDFLLREVVFYKEKVGRDPINLLILENRGVILQILVNVGSQKPGNCRAHAVLVIQTDKGNVYFH	418840	411971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_412148_413724_413872_415243_415396_415801_415947_416707_416820_417144_417243_418142
908521	scaffold_13505_pilon	-	313	4	Intergenic	novelGene_111503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6160	junction_1	3957.90696651091	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	279	34	312	547805	541926	FALSE	20	GAGGCTCCAAGAGCGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFS	548328	541924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_542033_547363_547465_547734_547806_548295
908522	contig_10003_pilon	-	3361	1	Intergenic	novelGene_88251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCATGTATCCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722209	718848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_718800_722200
908523	contig_8377_pilon	+	2720	16	Intergenic	novelGene_34896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3699.62253329835	30	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	503	2185	128927	173800	FALSE	35	CTGCTTCCACTAAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERGKYANFLLMNIHTLTFESIQFKKEFSAFDLTQIFSVDET	67971	174335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646
908524	contig_5640_pilon	-	1687	3	Intergenic	novelGene_27264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	2	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGTTTAATATTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873046	860965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_862143_862251_862662_872946
908525	contig_5346_pilon	-	2686	1	Intergenic	novelGene_161854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148249	145563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_145600_148200
908526	contig_6842_pilon	+	3593	7	Intergenic	novelGene_130644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATGCGAAGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187735	216248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_189732_192865_192947_201755_201886_203227_203297_204276_204375_210320_210492_215200
908527	SIRV7	+	1789	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	25	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGATATTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	3112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996
908528	contig_10082_pilon	+	1782	1	Intergenic	novelGene_63890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGCCCAGGGTATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403500	405282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_403500_405300
908530	contig_4812_pilon	-	1016	5	Intergenic	novelGene_103720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	229.970650301294	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	51	323	952187	946876	TRUE	50	AAAGAAAAGAGAGTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQEALKLIVTVVVATIMKAGKLEVAILKETDILKETTEIKQGILHLREDMERETVVTTEKELLCSTPPAAPILCHQCSQIKDQAHQFDIREGMTSLSVMKEERNEE	952237	944333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944451_944834_944939_946403_946960_947329_947384_952052
908531	contig_5463_pilon	-	3006	1	Intergenic	novelGene_144781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATTATAGTCATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53670	50664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_50700_53700
908532	contig_3277_pilon	-	2816	1	Intergenic	novelGene_74732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	768	1124	217074	216718	NA	20	CAAGTTTTTGGGTCTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKLNDTGSIKRRCKEYTESLYQKELVNIQPFQEVPYDQEPMVLKEEVQAAPKALAKNKVPGIDGIPIEMFQQMGATLEALTRLCQEIWKTAIWSTNWKKSIFVPIPKKGDPTECRN	217841	215025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_215000_217800
908533	contig_10377_pilon	+	4228	9	Intergenic	novelGene_115394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	742.892646601782	5	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	95	454	219517	245225	TRUE	10	GTCTGATTCTGATGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCCPGGGGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLHFSMIIRLEFIKKFLQPE	209189	261753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227690_245165_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_257532_258960
908534	contig_9706_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_21054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCCCCTGACCCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725183	726013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_725200_726000
908535	contig_10930_pilon	-	2350	7	Intergenic	novelGene_37020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2072.60949985493	5	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	20	1207	280370	272993	TRUE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYAQC	280389	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273960_274325_276723_276995_278443_278637_279700_279832_280157
908536	contig_9227_pilon	+	3498	1	Intergenic	novelGene_154312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	116	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	1278	1925	248305	248952	NA	60	AAGAATTAACAAAATAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQKTRYLNLSSFKRNEKRTKKSKQTPKEMWDSIKKSNIRITGIPEHHDNNKGIETIFQEIIRENFPDPNRRPSLQIQRAAKTTPSHTSTGQKRHKKINSAPYPNKFLKTKGKERMLKASREKHNLTYQQSFIRISADFSLETLEARRQWCDIYKVLHENNCEKEFFTQKSCHSKLREKSRYSQTNKSSGNLPLSDQLCKYYSKGYSKWKGKSIK	247027	250525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_+_247000_250500
908537	contig_12873_pilon	+	2203	3	Intergenic	novelGene_27166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2101	junction_1	148	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1332	2063	17632	19334	FALSE	60	GAGAGAAGAAATAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	15964	19474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_18014_18984
908538	contig_15929_pilon	+	713	4	Intergenic	novelGene_172460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	334.986898582948	199	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	106	471	87340	92073	FALSE	15	TCCACTTGTGGTATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEGFSRGDSRWRKTAGNRAEEARQAAVGQSSTQKEMRKIPNNGNLKMAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKI	82239	92315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_87307_87623_89766_89844_92067
908539	contig_1213_pilon	+	4275	6	Intergenic	novelGene_76460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	3539	3919	44693	56299	TRUE	5	CCATCTCGCTGCCTGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGVWSDLVQICLHGFPVWSLSGSNSGYLLQLGSPEIHRQWPLALRGKPGQKEKVCNDLLNISLCPSYNGSLRSPSAVSLINFGVSVYSLLYACKVELLTLFPQILGLFFSHVFVQVAYIGFLGI	40290	65721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_43825_44688_44888_48989_49086_56209_56367_62453_62562_65540
908540	contig_10324_pilon	+	3533	11	Intergenic	novelGene_7800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	102.478290383866	2	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	67	786	132046	133875	TRUE	40	AAATAAGGTCACATTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPPPVVEAVSTPSAAFPADSTAENVKQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDAPLALDATPCTMKCPRPQTFVVGEEEGTSVDEGEAEDSAVPTTEAT	131616	142388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_131657_132019_132220_132653_132822_133225_133364_133457_133579_133756_133882_134042_134097_137596_137964_138885_139015_139645_141660_142211
908541	contig_5023_pilon	+	2799	15	Intergenic	novelGene_7175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2404.60299663553	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	313	1698	607279	647201	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	538668	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_538780_540482_540573_580817_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630230_647098
908542	contig_10197_pilon	+	2279	2	Intergenic	novelGene_115300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTAGCAGGTACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307452	1309805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1307632_1307705
908543	contig_11338_pilon	-	1714	8	Intergenic	novelGene_6306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	138.400041288185	121	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	623	979	227968	223100	FALSE	30	TATCTGGAGGAAGAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQVVDNFESLVTSKTLWEKGEKREVASATTSILRNVETSALESALKAPDQKVLKAHNSAMAVETQVVTDNCLEERKIISLQAQRNSMDIHCNAVVQGNTQGTCSDCTSFVQSSIIM	250550	222364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_223270_225108_225293_227965_228010_233579_233736_242914_243038_244695_244747_249573_249784_250509
908544	contig_9731_pilon	+	1171	1	Intergenic	novelGene_154389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34599	35770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_+_34600_35800
908545	contig_13004_pilon	-	2161	1	Intergenic	novelGene_112712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1233	1613	854749	854369	NA	25	GGTCCTCCAAGGCCGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIQGSAACPSLWKLEGPSPSIRTIQSRAEVASQLPSCSSSSLLPSCTLSDSVHFQTWFSCLPSESVSSQHSSNKFPLAYAGQSVFVASRNLRTDTLPTWCFSNCKSGHFIGYEVIKLVMTRIFFF	855981	853820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_853800_856000
908546	contig_17684_pilon	-	3724	1	Intergenic	novelGene_178833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1952	3361	4239	2830	NA	30	CTATGCTCTTCAAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRETIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNTVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPRTFFKEMEKLIINFIWKGKKPLISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYID	6190	2466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_2500_6200
908547	contig_13093_pilon	+	4104	2	Intergenic	novelGene_105205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	2741	3718	20490	21467	FALSE	5	GGGGCGGGTGTCTGGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGKTLQVSKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTTTVVKTALYWYNNRCIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFNKGPKSINWGKYSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTETNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTLLGALIHGINRIRTISNSAQAPEERLDNWKLLKIKHLRSSKVFTKRVKRQPTDGEKILATTQSHQRLISKIYKILQNLNNKKINNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKQCSRSLTIREMQIKTTKRYHFTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHFGGNVKWYNHFGNRFGTSLKN	17359	21853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_18054_18443
908548	contig_8561_pilon	+	2235	2	Intergenic	novelGene_161636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	330	908	94222	94800	TRUE	45	AAAGATCATGTCAGTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDTEAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRHHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYHPAIPLLGTYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPATDEWINKLWYIHTMEYYTTIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEINHKRTNTV	93892	189723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_+_95742_189337
908549	contig_9389_pilon	+	3270	1	Intergenic	novelGene_84120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	680	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1273	1572	1414145	1414444	NA	15	TGCTGCCTCCTGTAACGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDRKVPTFPLYPGPSPANWVHEQPLSQEGQVGTCADGVARVSCGCWHKFPKLSGSKQHIFVTSQGQESYTAPTGLKSRCQLAPSGGSRGDPSPAFSSF	1412872	1416142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1412900_1416100
908550	contig_753_pilon	-	1935	2	Intergenic	novelGene_113029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAATATTTATAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1426241	1394680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1395664_1425289
908551	contig_6163_pilon	-	1582	9	Intergenic	novelGene_103796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGACCGCCGTGCCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71312	67751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_67958_68540_68651_69021_69107_69210_69334_69485_69548_69794_69903_70013_70164_70471_71139_71241
908552	contig_12148_pilon	-	4108	1	Intergenic	novelGene_140333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	861	1226	86534	86169	NA	20	GACCTGGCAATCTACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSRIIFLNSSNFLSVFSKNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGILFWTPTGTILSYFCKCFDIVCCLRGIQ	87394	83286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_83300_87400
908553	contig_13329_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_177849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTCTTTCATCTCAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22812	21409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13329_pilon_-_21400_22800
908554	contig_14925_pilon	-	1535	5	Intergenic	novelGene_55358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	5	TCTACTGTCTTTTGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
908555	contig_15307_pilon	-	1399	3	Intergenic	novelGene_174784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	2.5	21	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGACTAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163319	155786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15307_pilon_-_155829_161809_162880_163032
908556	contig_15327_pilon	+	4054	1	Intergenic	novelGene_70561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	567	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCTAAATGGCAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577729	581783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_577700_581800
908557	contig_9313_pilon	+	3567	4	Intergenic	novelGene_86479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	766.050041881512	3	211	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	46	369	387329	461613	FALSE	45	AAGATATTCTGAAAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387283	464811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601
908558	contig_8122_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_40212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364332	365920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_364300_365900
908559	contig_4754_pilon	-	4314	4	Intergenic	novelGene_35897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1172	1501	124690	124361	TRUE	20	TTCCACTCACTTCCGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDSLWKGFPPCLIYMFLSCVFSFMSKKTRHVEESSSILIAAMPPLSHLSSLMYNKLVLCGESFQTFTALKQFVTILMSNKPRFLDEGFPTFTAYMQFVYLLSFLVLN	125861	114750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_114784_119668_119873_121504_121632_121911
908560	contig_10988_pilon	+	2528	2	Intergenic	novelGene_104718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	828	1208	31782	32162	FALSE	40	ATTTTATACATAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQHKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKNRQIHGKCRQKNGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQDFRNGQCHRRAEEQI	30754	33482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_31070_31269
908561	contig_7342_pilon	+	2981	17	Intergenic	novelGene_71151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	29	junction_16	90.0419823957136	172	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	18	1586	354002	420551	FALSE	5	CCCTGGCCTCCTGCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLANEEKPAIAPPVFVFQKDKGHKRSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSVSKNNVFMPSTFCESSAGNSDSEPEEKSSGFRLKPPTLIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKASSQTVPSTGTNGVSIPTDCTGPVTSTLPNNPARRSPSESADEARALEEKEPQKNESSSTSEEENCERKEQAAQQAFVFGQNLRDRVKLINENTDVADVENAGHPSSETPTATNYFLQYISSSLENSTNSADSSSNKFVFGQNMSARVLSPPKLNEVSSDANRENTAAESRSESSSQEATPEKESLAESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQIQCKLFVFDKASQSWVERGRGLLRLNDMASADDGTLQSRLVMRTQGSLRLILNTKLWAQMQIDKASEKSVRVTATDTEDQGVKVFLISASSKDTGQLYAALHHRILALRSRVEQEQEARVPAPEPGVAPSNEEDDSDDDVLAPSGATGGGAGDEGDGPTAGST	353984	421946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_354024_374955_375012_389060_389098_389178_389266_391607_391680_401006_401073_401988_402082_403298_403427_409403_409524_411476_411581_412888_412968_414068_414172_414733_414844_416559_416681_419315_419459_420116_420301_420507
908562	contig_7695_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_41648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTAAGAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802266	804257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_802300_804300
908563	contig_5686_pilon	+	6263	1	Intergenic	novelGene_45494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATTTTTGAATTACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252986	259249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_253000_259200
908564	contig_3147_pilon	-	2326	10	Intergenic	novelGene_142284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	82.5619109263011	208	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	54	1337	240093	214583	FALSE	30	AAATTGTCTACTAGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDTVDGPGGTDDAILRMEVDRSPSLPVTSDLKTQSVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPISPLHLSPSEDGSNRLPTHELTSLLEKELEQSQKEASELLEQNRLLQDQLRVALGREQSAREGYVLQATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKDRLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSINSDIEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEAGGSPLTQGKDAYELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIVKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPENTTVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVSRQLRNIRSKSLKEGLTVQERLKLFESRDLKKD	240146	213593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_214655_219342_219429_220953_221117_221818_221906_222748_222869_224022_224183_224948_225067_225578_225727_236339_236457_239880
908565	contig_11752_pilon	+	3181	5	Intergenic	novelGene_37612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_3	1190.56192090122	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	106	879	84194	93067	FALSE	30	TCGAGCACAAACCATTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQGE	84088	95369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873
908566	contig_990_pilon	-	2375	14	Intergenic	novelGene_76023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_1	189.549918484902	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	83	1324	848286	714549	FALSE	5	CTGTAGCTTTTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERLCSDKITSNGSRILSSFGSGCFQKMPYLLYVFQKERYIVISKVDEEERKRREQQKHAKELEGLNDAVGFSRVIHAIANSGKLVIGHNMLLDVMHTVHQFYCPLPADLNEFKEMTTCVFPRLLDTKLMASTQPFKDIINNTSLAELEKRLKETPFNPPKVESAEGFPSYDTASEQLHEAGYDAYITGLCFVSMANYLGSFLSPPKIHVSARSKLIEPFFNKLFLMRVMDIPYLNLEGPDLQPKRDHVLHVTFPKEWKTSDLYQLFSAFGNIQISWIDDTSAFVSLSQPEQVQIAVNTSKYAESYRIQTYAEYVGKKNEEKQIKRKWTEDSWKEVERKRLNTQCISCALQNHCYRTNSFTATGTVVKRNLSPSLEEAGLEDSASGEVSDAELEKTDSCAETLSEGRKKAKKLKRMKKELSPAGSISGSSAKLFEVPDTW	848368	713497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_714602_725871_726066_746125_746316_803705_803781_808861_808949_811850_811907_829146_829217_829886_829998_833877_833954_834528_834572_835681_835726_840429_840508_844875_844933_848178
908567	contig_6654_pilon	+	3464	9	Intergenic	novelGene_85751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	157.349481648336	314	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGACACAATGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573059	985989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_578530_578588_600119_600348_602764_602802_613656_615571_795236_795294_983605_984344_985657
908568	contig_20889_pilon	+	2432	6	Intergenic	novelGene_127632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	44.859781542045	16	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	289	2085	39523	63349	TRUE	30	AGAGGCCTTAAGAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVAIEDVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRNNDGGKLSTENTIVGFMKNDTCFSMVGDICKSHGVEDKDNNQKTHVRKHMIENLCERNEDNQCGQTFSQILSHSVLKRTPMEGHPSEFLECGKSLMDHSSLKHHIRSHSGCVASQCKECGQACSCLSYLSTPVRTLTGEKPYESKEYGKAFRHFSVLKTHMRNHSGVRPYECKECGKTFRQSSVLMTHMRTHSGERPYKCKECGKAFSYSSNFTVHIRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDVTRHMSIHSGERPYECKECGKAFRLSSHLSTHMRIHGGERPYECKECGKTFRWPPDLTAHTRTHSGERPYKCKECGKAFRRSSHLTTHTRIHSGERPYECKECGKAFRCSSNFTTHMTTHSGERPYECKECGKAFSCPSHLTTHIRTHSGEKPYECKECGKAFSYSSNFTAHIRTHSGERPYECKECGKAFRRSSYLTRHMSTHSGERPYDCKECGKAFRRSSHLSKHMRIHSGEGPYECKECGKTFCWPSDLTAHMRTHSGERPFECKECGKAFRRSSHLTNHMRIHSGERLMNVRNVGKPLAGHHTSLHI	20026	63862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_39283_39526_59533_59661_60671_60820_61830_63492_63657
908569	contig_6059_pilon	-	3328	8	Intergenic	novelGene_44821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2932.86324541847	20	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	1942	2874	573432	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	575373	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
908570	contig_9481_pilon	+	1960	1	Intergenic	novelGene_149671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386807	388767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_386800_388800
908571	contig_9415_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_109835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTCTGGGAGCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1928481	1927183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1927200_1928500
908572	contig_20662_pilon	-	2056	18	Intergenic	novelGene_177642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_17	195.721431868698	5	8	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1545	512	2056	86072	13982	FALSE	40	GTGAGTATATTTTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAYLFRGNILLREFPTDSLFDVNAIVAHVLFALLFNEVKYITTLEDLQNIENALKGKANIAFAYVRAIGTSEHRAVMEAAFVYGTTYQFVLTTEIAVLESIGTEDIEYAHLYFLHCKPVLDFIQQCRRTLMEQPLTTLNIHRFIKTMEAPLLTEVAKDPQQVSTIHLQLGLPLVFIVSQQVTYEADRRTAEWVAWRLLGKAGVLLLLRDSLEVNIPQHANVVFKRAEEGMPVEYLVLDDIDLIISRVESNVHTQEIQEDEDDDMEDPDMETEDDEVAETVYRDRKRQLPLELTVELTEETFNTTVMASDSIVLFYAGWEAVSMAFLQSYLDVAVKLKGTSNMLLSRVNCGDWSDVCTKQNVTEFPFVKMYKKGENPVSYAGMLGTEDLLKFIQLNRISCPVNITSVQEAEEYLSGKLFEDLLSYSSVSVLGIFSPTMTRAIEDFTEAGNYLRGYVITGVYSEEDVLILSNKYTTTIPALLLARHKEGKIESIPLANTQAQDIVQIITNALLETF	110035	13981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_14121_15770_15856_42625_42763_43103_43273_47171_47232_48321_48466_55419_55544_57089_57151_57534_57702_63603_63755_68470_68562_74943_75066_85171_85247_86052_86127_96395_96479_97739_97817_98606_98718_109849
908573	contig_12750_pilon	+	5615	4	Intergenic	novelGene_172618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	11.0252236056942	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	110	577	14869	31898	FALSE	35	ACTGCGACAATACCCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGRTLQARALLQQCLHAQLQVRPAEGDVAAQWVEVQRGLVIYVCFFKGADKELLPKMVNTLLNVKLSETENGKHTSVLDLPGDILIIPQATLGGKVKGRNMQYHSNSGKEEGLELYSQFVTLCEKELAANNFAAFLDKTPGSHTQLCNLLIG	14759	36936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_14980_27181_27252_31406_31626_31830
908574	contig_12312_pilon	-	4405	16	Intergenic	novelGene_63944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	688.310827719247	8	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	442	2403	242301	215838	FALSE	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	256457	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218770_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242411_245930_246009_246882_246974_256294
908575	contig_10159_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_30804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384075	382394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_382400_384100
908576	contig_13888_pilon	+	2455	3	Intergenic	novelGene_151805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1959	2267	351377	481325	FALSE	55	TCAAAACAAAACAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISTCVWPTMKIKNTPLWEKLLSLLPPYYLLCTGSRTASATAESPGPEVGCFTCPGPFSQPWRGNKLTNRGKNNLLTPLNQEPREGTMPMPTPITHTCLGQ	349418	481513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_351383_427212_427471_481280
908577	contig_8843_pilon	-	2783	2	Intergenic	novelGene_156652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2017	2334	76237	75920	FALSE	20	TCCTCAATTCTGCAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKLAGQTAGCWPMGLWKLVNTRICRAEGGLPAQRATETGKFQSEQVRLQAAGSRPKNQISDDDEPDAGPRARKSFATASIYFGSRSYAQGHSLLIRYLRKGVT	155775	75470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_77331_154852
908578	contig_567_pilon	-	2240	1	Intergenic	novelGene_34006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	484	789	615449	615144	NA	45	AAAAAAGTCGGCTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQKENQLLLDELALLRISRVRSRTHPLGYWSHQAWLLDLRSLLLALRDVTIKTHLALGVRVCYLFNKTGTWTFSIKTFLDTGDSKTIEVGLLPSNSSIQ	615932	613692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_613700_615900
908579	contig_1535_pilon	-	2940	5	Intergenic	novelGene_127252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_4	345.116646947087	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	381	866	132614	129144	FALSE	15	AATGCATTGCTTTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136130	127069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_135888
908580	contig_12157_pilon	-	4409	7	Intergenic	novelGene_135879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	145.052480924051	285	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1289	3870	426	4295	250294	22177	FALSE	35	AAAACTTCATAGAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGMILQIWFGKRTPPLRNIASEGEGQTLEPIGTENKVSGKNKEFSADQMSENTDQSDAAEQNNKEEQSLHVQDPSSSSKKDLKSSVLSEKAGFNYESPSKGGNLPSFPHDEVTDRNMLAFSSPAAGEVCEPLKSPQRAEADDPQDMACTPSGDSLETKEDHKMSPKATEETGQTPSGQANCKGSSPVSVASKNPQVPSDGGVRLNKSKTDLLVNDNPDLAPLSPELQDFKCNICGYGYYGNDPTDLIKHFRKYHLGLHNRTRQDAELDSKILALHNMVQFSHSKDFQKVNRSVLSGVLQDINSSRPVLLNGTYDVQVTSGGTFIGIGRKTPDCQGNTKYFRCKFCNFTYMGNSSTELEQHFLQTHPNKIKASLPSSEGAKPTEKNSNKSIPALRPSDSGDLGKWQDKITVKAGDDTPVGYSVPIKPLDSSRQNGTDATSYYWCKFCSFSCESSSSVKLLEHYGKQHGGAQSGSLNPELNDKLSRGSVINQNDLAKSSEGEPVSKADKGSSGAKKKDFSSKGAEDNMITSYNCQFCDFRYSKSHGPDVIVVGPLLRHYQQLHNIHKCTIKHCPFCPRGLCSPEKHLGEITYPFACRKSNCSHCALLLLHLSPGAAGSSRVKHQCHQCSFSTPDVDVLLFHYESVHESQASDVKQEANHLQGSDGQQAVKESKEHSCTKCDFITQVEDEISRHYRRTHGCYKCRQCNFTAADTQSLLEHFNTVHCQEQDITTANGEEDGHAISTIKEEPKIDLKVYSLINPDSKMGEPVSESVVKREKLEDKDGLKEKVWTESSSDDLRSVTWRGAEILRGSPSYTQASLGLLTPVSGTQEQTKTLRDSPNVEAAHLARPIYGLAVETKGFLQGVPAGGEKSGALTQQYPASGESKSKDESQSLLRRRRGSGVFCANCLTTKTSLWRKNANGGYVCNACGLYQKLHSTPRPLNIIKQNNGEQIIRRRTRKRLNPEALQAEQLNKQPRGSSEEQVNGSPLERRSEDHLTEGHQREIPLPSLSKYEAQGSLTKSHSAQQPVLVSQTLDIHKRMQPLHIQIKSPQESTGDPGNSSSVSEGKGSSERGSPIEKYMRPAKHPNYSPPGSPIEKYQYPLFGLPFVHNDFQSEADWLRFWSKYKLSVPGNPHYLSHVPGLPNPCQNYVPYPTFNLPPHFSAVGSDNDIPLDLAIKHSRPGPTANGASREKTKAPSNGKNEGPLNVVKTEKVDRSTQDELSTKCVHCGIVFLDDVMYALHMSCHGENGPFQCSICQHLCTDKYDFTTHIQRGLHRNNAQAEKNGKPKE	295136	22062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_23239_25954_26078_214059_214664_231126_232257_246066_246997_250273_250432_294848
908581	contig_5549_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_81682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAATGTCATTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582366	584013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_582400_584000
908582	contig_19378_pilon	+	3128	1	Intergenic	novelGene_73792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2710	3066	34820	35176	NA	55	GAGTAAAAGGTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAIETTTGDCCIEFCKTNLLDGNTFFQQQTVTIHVDHAGWNTKESNRPRLWKETREKLNTIGQNKAGADCETDPQLLICKCKLSLRKLKHVHKSQSTTVSISHLNSETISRIDLTH	32110	35238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_32100_35200
908583	contig_12964_pilon	-	4367	1	Intergenic	novelGene_131724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGATTTTGTTGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616969	612602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_612600_617000
908584	contig_13457_pilon	+	1741	14	Intergenic	novelGene_118351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	60.653443733117	161	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	131	1741	60777	71295	FALSE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERSRGCGVCRGCQTREDCGRCRVCLRPPRPGLRRQWRCVQRRCLRHLAHRLRRRHQRCQRRPPLAVAPPAGKHGRRRGGCDPKIAARRHSQTQPLPPPPLLQPPEPTELHPRALAPSSPAEFIYYCVDEDELQPYTNRRQNRKCGSCAACLRRTDCGRCDFCCDKPKFGGSNQKRQKCRWRQCLQFAMKRLLPSVWAGSEDGAELPSPCHRRRRPVSARRPRPGPTLGSPLAMPIARPGHAQAPMKQESGGGFVLPPPGTDLVFLREGAGSPVPVPGPAHSIEAPLQVKQEKMDAQEDWTPGTAILISPVLLPGCPSK	59280	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68682_68839_68969_69134_69210_69321_69439_69522_69592_70247_70416_70761_71059_71202
908585	contig_11538_pilon	-	4580	1	Intergenic	novelGene_152300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGACGGAAGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223806	219226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_219200_223800
908586	contig_6058_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_172382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	156	785	376322	376951	NA	30	TCCTCTAAAATCAGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAILRSSGQGLHRRGTRPTSLLTLSEKGWWAWARRPASLSTLPLSEQCVRAARGRPRPPELEQSAQGAFPDTPSPSLCPEWLRYSCFFRDFSSRSFWGLKTDAQIWGGHGQDEDTRVVQKHRFLPPSSEARSTRGCLGLAQLAARPHAQTDPSSVRWQMFWLLVVIVRLGYRKVGKCSAGVCVWRYFRAPACIFRACRRVTAWLFSV	376166	379130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_376200_379100
908587	contig_10904_pilon	+	2843	2	Intergenic	novelGene_22475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1839	junction_1	0	4227	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	359	1327	149100	150068	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	145869	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097
908588	contig_2704_pilon	+	1630	2	Intergenic	novelGene_75314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGGCTCCTGGCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275553	287289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_277147_287252
908589	contig_960_pilon	+	3157	1	Intergenic	novelGene_108218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTTGAAATGGAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301928	305085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_301900_305100
908590	contig_4732_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_75389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	73	309	446824	446588	NA	45	AGAATTAAACCGAGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSRDLHKWKIIPCSLIGRLNIVKMSVPPKAVYRYNAVPIQMPTTFFNKMEKLITNFTWKGMRPQISKVLKTNKVGGLTQPDLRTYYIATVVRIACYWYNDT	446896	443613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_443600_446900
908591	contig_18081_pilon	-	5559	7	Intergenic	novelGene_23808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1457	1819	147779	147417	FALSE	30	CCCAGCATCATTTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYMRQSLVILASKEHSCCTSSKTDLVVLLTVRVILSILRQHHNSKTSILLQFSLFIVQLSHACEVTENTMAWVRCTLVLKVTTLLFNTFKRSFAADFPNAIHRMIF	498488	143676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_147992_196526_196748_196786_196943_286716_287026_471998_472254_487460_487610_498334
908592	contig_5050_pilon	-	5650	1	Intergenic	novelGene_110289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	118	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAGTGGGAGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604795	599145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_599100_604800
908593	contig_13004_pilon	+	1976	5	Intergenic	novelGene_112729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	244.557764137637	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	116	718	922526	927564	TRUE	25	TAAAATTGACCTTGGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALSKILPLPCTRHP	922410	929302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926980_927526_927669_928148
908594	contig_5686_pilon	-	2255	2	Intergenic	novelGene_45243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1947	2255	94097	93789	FALSE	15	AGCCACGGGCCGCCCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNHKTVQRNHSTPSPILLPCIPSVPRLMSTTPITSRTLSCHHFKVLFEYLQTGRRSCQKDLFTFIKNIIIFIDQELLRLQILHLEEDNQSRQQALNRSCEK	96832	93788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_95340_96128
908595	contig_4315_pilon	+	791	1	Intergenic	novelGene_46851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGTTTTCTCTCTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580086	580877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_580100_580900
908596	contig_9571_pilon	-	3944	2	Intergenic	novelGene_136330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	459	3484	3942	741842	741384	FALSE	30	TCCAAGGCTGCAAATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPHVHQNIDLVTQGISLHSQFVHLPLQAALPALCHVSLDSTVHFSHHPPPNMGSSSEQQLNSSATLHTANSLEHGDQSYKIPRLFNQPKTHTHSPPPQVKLTLLQQGHISLSVTLRLLGIMTKPKKPKPAANESILTHSNATGQSRIAPVG	874731	741381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_743804_873209
908597	contig_19769_pilon	-	2181	5	Intergenic	novelGene_102243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	44.6843093266529	5	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	70	2136	47710	39200	FALSE	20	CTTATTTTATATGGGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRPGGRGLSWPGRVDAHHPQSLMEAVTFGDVAVHFSREEWQCLDPGQRALYREVMLENHSSVAGLAGVLVFKPELISRLEQGQEPWVLDLQASEGRETSKTSQIDSTIRTDNEQAYEEMDILKSELNGMRIKIPPQDFSLSPGFADTSDSEVLLENNQSSSPRLTVMNSLFQKNRLNKGTVMLKKTFTQNSQECNEVRSTGSLDCKLSENQRDTAEETAERCDGCGRSFRSISDIAVCWEVNKQKKLNKCQECQKKLSHCFQGKHQSNCQEEKPYECEECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFKCTDCGKAFRLSSKLIQHQRVHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRECGKAFSQQSQLIRHQRTHTGERPYTCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHTGEKSQMSRTADNPSLAPHQRIHTVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCSSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYACNDCGKAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLECGKAFSMSTQLTIHQRIHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWYYEYGHALESSFVSRKKVNTIKKLHKCNECEKIFRWRSHLIIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFNRSSRLTHHQKSHMG	48837	39154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_-_41020_44714_44832_47196_47324_47707_47758_48815
908598	SIRV7	+	476	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	496	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTACCAGCTACCTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56031	114864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_56098_70883_70987_78840_78963_114679
908599	contig_6612_pilon	-	3166	6	Intergenic	novelGene_148156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	260.400921657355	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	36	1133	46834	16917	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAGACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKKQYKTTTTDGSKRLKLTPEQSQLQQTSVANTPPTESCPRIHQMPLLSPSSSFLTKKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVIKTKEHNK	46869	14883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_23833_24002_36288_36454_46708
908601	contig_10674_pilon	-	2138	2	Intergenic	novelGene_6427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	111	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198454	194527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_196578_198366
908602	contig_10627_pilon	+	2384	11	Intergenic	novelGene_59938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_10	276.322927025609	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	47	913	162810	165929	TRUE	15	AATCCTTTTGTTTATTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATSPFGTAAPLRPGMPPTMMDPFRKRLLVPQPQPPMPAQRRGLKRRKMADKVLPQRIRELVPESQAYMDLLAFERKLDQTIARKRMEIQEAIKKPLTQKRKLRIYISNTFSPSKAEGDSAGTAGTPGGTPAGDKVASWELRVEGKLLDDPSKQKRKFSSFFKSLVIELDKELYGPDNHLVEWHRMPTTQETDGFQVKRPGDLNVKCTLLLMLDHQPPQYKLDPRLARLLGVHTQTRAAIMQALWLYIKHNQLQDGHEREYINCNRYFRQIFSCGRLRFSEIPMKLAGLLQHPDPIVINHVIR	162763	167768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_162893_163077_163121_163245_163369_164176_164333_164971_165068_165234_165337_165488_165651_165827_166259_166411_166535_166672_166775_166851
908603	contig_5236_pilon	-	1609	6	Intergenic	novelGene_100948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	264.108765473621	414	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	42	1052	1011714	1006425	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPCAGPSSSPAAAMLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRRSPQTPLLCQQCAAGYARLGFSVAKRQGDGSSRGPQRLPALLPPCRRRARSCYNHCPLTPTHWVPPHPAQAFLSPCLQTQSIQLLPMAGRPSTRVGNVNDTQEAS	1011755	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006747_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
908604	contig_6602_pilon	-	3638	8	Intergenic	novelGene_166436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_3	61.7063486959628	188	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	159	791	364018	297271	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEEQKSMLTYSQPTRDHEVFWMDGCWKPIAVANSSSTLKDLLWHWVMRISKTYLRVTSIQCYLWLLLNSHFLTEAGIQVFILGCFSASLPKTEANWHDVIRDLKRIEELIQSIHIDATLYTESDAHPNCKVTAMKCFLLELRVISHESRNMDMDETVENLIILANSSLHSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLRSFSHIVQMFINSS	385752	294423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6602_pilon_-_297382_300112_300251_302185_302231_307782_307868_309164_309263_310266_310366_363961_364084_385659
908605	contig_10262_pilon	-	2258	3	Intergenic	novelGene_178849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7069	1867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10262_pilon_-_2057_2176_3121_5944
908606	contig_9738_pilon	+	4764	14	Intergenic	novelGene_169258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	153.03010493936	276	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	134	1807	173640	214267	FALSE	25	TAGAGCGGATGATGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADADKPEVPGAAGDDSPQQKPAETPGEPRRELHSPEPEKQQPHSSSSNGVKMENDESVKEEKSDLKEKSTGNKKANRFHPYSKDKNSGTGEKKGPNRNRVFISNIPYDMKWQAIKDLMREKAFSVVEFKDEEFVKKALETMNKYDLSGRPLNIKEDPDGENARRALQRTGGSFPGGHVPDIGSGLMNLPPSILNNPNIPPEVISNLQAGRLGSTIFVANLDFKVGWKKLKEVFSIAGTVKRADIKEDKDGKSRGMGTVTFEQAIEAVQAISMFNGQFLFDRPMHVKMDDKSVPHEDYRSHDSKAPQLPRGLGGIGMGLGPGGQPISASQLNIGGVMGNIGPSGMGMDSPGFGGMNRIGGGIGFGGLEAMNSMGGFGGVGRMGELYRGAVTSSMERDFGRGDIGISRSFGDSFGRLGGGMSSMNSVTGGLGMGLDRVSSSFDRVGPGIGAVLERSIDMERGFLSGPVGSGMRDRIGSKGNQIFVRNLPFDLTWQKLKEKFSQCGHVMFAEIKMENGKSKGCGTVRFDSPESAEKACRIMNGIKISGREIDVRLDRNA	173506	217224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_173798_180046_180256_182883_182985_186784_186977_187640_187795_188314_188365_188498_188563_202377_202480_204705_204757_205049_205119_205426_205526_207609_207819_207898_207951_214103
908607	contig_7816_pilon	+	1957	12	Intergenic	novelGene_66547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_9	40.3156963464706	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	446	1468	328886	351499	FALSE	15	TTTATCAGCATTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRVTARCRDDGQPGGAGPGGPAGLLRSPHAGIVSTDHLCLKCIYSSLPVQGNCWHSECKANIALLDHHLPGQRGLPQSLSKWRRPARLEPDPQPPVAHVIAESLSVILKSVLTACLVLCSPHWGLYIFSLAQLFYTTVLVLCYVIYFMKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	312132	351988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_312228_317382_317469_321924_322042_325272_325375_328840_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331
908608	contig_14467_pilon	+	3837	9	Intergenic	novelGene_138273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	194.025771484099	138	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	187	1287	369732	385045	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSVGFYS	352160	387595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889
908609	contig_5461_pilon	+	5497	16	Intergenic	novelGene_156808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	84.7174650759151	20	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	184	1515	206753	287473	TRUE	25	TAGTTTTACATATTTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSFQYPDVYRDETAVQDYHGHQVCDPYAWLEDPDSEQTKAFVEAQNKITVPFLEQCPIRGLYKERMTELYDYPKYSCHFKKGKRYFYFYNTGLQNQRVLYVQDSLESEARVFLDPNILSDDGTVALRGYAFSEDGEYFAYGLSASGSDWVTIKFMKVDGAKELPDVLERVKFSCMAWTHDGKGMFYNSYPQQDGKSDGTETSTNLHQKLYYHVLGTDQSEDILCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSIREGCDPVNRLWYCDLQQESNGITGILKWVKLIDNFEGEYDYVTNEGTVFTFKTNRHSPNYRLINIDFTDPDESKWKVLVPEHEKDVLEWVACVRSNFLVLCYLHDVKNILQLHDLATGAFLKTFPLEVGSIVGYSGQKKDTEIFYQFTSFLSPGIIYHCDLTKEELEPRVFREVTVKGIDASDYQTVQVSRI	206569	654443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_206798_213485_213561_233706_233841_235158_235290_239959_240170_242392_242515_264149_264256_277147_277340_281920_282119_287354_288374_301490_302909_431275_431791_447634_447854_595098_595462_650976_651362_654261
908610	contig_11281_pilon	-	3685	1	Intergenic	novelGene_125517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2087	2395	968259	967951	NA	70	CAAGAAAAAAAAAAACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIGEGQSLATEHQSGGSAIDETREDEGPDSYDSYENGRKWTDLRDSYKEGAEWTTSSTQRIFNPWITEVTTSQVLAIASKEAAAALSLLCLMVVTSRIYI	970345	966660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_966700_970300
908611	contig_7816_pilon	+	2228	13	Intergenic	novelGene_66548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	42.8793527107032	114	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	11	1636	312165	351499	FALSE	55	AGAAAAAAAGACGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQEVLGQAARLASSGLLMQVLFRLITFVLNAFILRFLSKEIVGIVNVRLTLLYSTTIFLAREAFRRACLSGGAQRDWSQTLNLLWLTVPLGVFWSLFLGWVWLHLLEVPDPNVVPYYGAGVVLFGLAAVVELLGEPFWVLAQAHMFVKLKVIAESLSVILKSVLTACLVLCSPHWGLYIFSLAQLFYTTVLVLCYVIYFMKLLGSPESTKQQTLPVSRMTDLLPSITGSGAFVNWKEAKLTLSFFKQSFLKQILTEGERYVMTFLNVLNFGDQGIYDIVNNLGSLVARLIFQPIEESFYVFFAKVLEREKGATLQKQEDLAVAAIVLESLLRLALLAGLTITVFGFAYSQLALDIYGGAMLSTGSGPVLLRSYCVYVLLLAINGVTECFTFAAMSKEELDRYNFTMLALSSSFLVFSCLLTNWCGSLGFILANCLNMGIRITQSLYFIHRYYRESPHRPLAGLYLSPVLLGAFALSGGITGISEVFLCCEQGWPARLAHVAVGAFCLGATLGMAFFTETKLIHFLRTQLGVSRPTDKSM	312154	352091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_312228_317382_317469_321924_322042_323163_323354_325272_325375_328840_328979_336282_336362_340273_340325_341297_341429_342559_342705_346827_346934_350736_350987_351331
908613	contig_15120_pilon	+	2395	4	Intergenic	novelGene_108026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253092	478689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_254446_254500_255172_426241_426361_478437
908614	contig_10904_pilon	-	2505	10	Intergenic	novelGene_22671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_8	155.493320883909	19	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	804	1604	543039	537619	FALSE	20	CTTGTGAAATGCTCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGTYEKPSLSAHPGPSVTSGESVTLQCCSDDSFDTFHLFKEGFTAPPQRLHWQNNTGPFQANFTMSPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGGSKDQRQTPRESDPLTGLQEYLKVLIGVLVAFILLVLLFLLLFLFIRHQRHGKHRTAVSEPKDRGLPKGSSPATTDQEENLYAAVIDKQPEEEMELDSQDMKDRQVEEGSQRDSQAATLEDPQEVTYAQLNHSTLRRETTTSPSSQSGKPSGEPSIYAALAIH	544006	536717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_538072_538121_539112_539166_539425_539464_539552_539596_540491_540606_541598_541650_542246_542547_543032_543660_543823
908615	contig_3956_pilon	+	1213	7	Intergenic	novelGene_15263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1406.16959029367	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	240	1049	1287290	1290847	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1285745	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285827_1286084_1286224_1286409_1286416_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289005_1290521
908616	contig_21013_pilon	+	1197	8	Intergenic	novelGene_38521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_6	515.802960322594	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	219	978	1196	82130	84111	FALSE	35	AGCCATCGCTCAATACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REHIYDLRSLENYHFVDEHGKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYVGVSSDSVGGFRYSERYDPEPKSKWDEEWDKNKSAFPFSDKLGELSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIHITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASPDQNASTHTPQSSVKTSVPSGKSSGDLVDLFDGASQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSLPAQGTAASGNGDFGDWSAFNQAPSGPAASSGELFSSASQPAVELFSGSQPALGPPSAASNSSDLFDLMGSSQATMTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMSRSQNTDMVQKSVSKTLPSTWSDPSVNISLDNLLPGMQPSKPQ	58414	84112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21013_pilon_+_58466_59403_59569_62439_62618_69125_69373_71484_71555_78665_78741_81938_82232_83994
908617	contig_6364_pilon	+	4368	15	Intergenic	novelGene_51812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.3517024754683	457	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	647	1648	1496669	1506374	TRUE	25	CAATTTCTGGCCTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLEEARLHKEIPETTRTSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLHTLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDQKDVNLASCAADGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLRQRRCVYTIPAHQNLVTGVKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGLDISADGQLIATCSYDRTFKLWMAE	1489324	1509230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1489429_1490190_1490372_1492200_1492390_1495819_1495908_1496409_1496490_1496664_1496759_1497349_1497445_1498589_1498649_1501348_1501473_1502898_1502989_1505101_1505225_1505334_1505443_1505533_1505653_1506180_1506544_1506679
908618	contig_8712_pilon	+	6283	9	Intergenic	novelGene_58734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	170.444593270071	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	110	586	73618	78256	TRUE	50	GTGTGAAAAAAAAAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPRPLPPPAHFCTVARPPRGLPYRLPIKKVDVQGNMSNVSEERRKRQQNIKEGLQFIQSPLSYPGTQEQYAVYLHALVRNLFNEGNDVYRECDWNGSISQYTEALNIADYAKSEEIVIPKEIIEKLHINRIACYSNMGFHDKVLEDCDTVLSLNASNCKALYRKSKSLSDLGRYKEAYDAVAKCSLAVPQVWN	63515	89589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_63591_73583_73686_74519_74560_76374_76573_78085_80146_83638_86107_87288_87486_87972_88074_88547
908619	contig_9011_pilon	-	3368	1	Intergenic	novelGene_159292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCACTCCTGCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357288	353920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_353900_357300
908620	contig_17200_pilon	-	2274	2	Intergenic	novelGene_178851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	1542	2273	2384	1653	FALSE	25	TCCTGAGAGCAGCTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQR	4251	1651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17200_pilon_-_3643_3968
908621	contig_10734_pilon	-	2385	13	Intergenic	novelGene_51502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	538.103382260324	3	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	957	2015	2274500	2265543	FALSE	40	GCCAATAGAATTCAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305182	2265172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282592_2282772_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
908622	contig_21104_pilon	-	2860	2	Intergenic	novelGene_175444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	187	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTTTTATCAAGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13851	6334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21104_pilon_-_9167_13823
908623	contig_5947_pilon	-	4923	15	Intergenic	novelGene_101554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.814997880122	60	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	90	1844	631846	615871	TRUE	25	CTGGAATTCCTTGCTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFAVFHQAASDHDGNIVELAFQTTGHIVTTIFQYHFPAAIDSFQDAVKCLSEFACNVAFPDTSMEAIRLIRFCGKYVSERPRVLQEYTSDDMNVAPGDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKSYGHTFEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKLPEQQSEKSEWMTTTCNHALYAICDVFTQFYEALNEVLLSDVFAQLQWCVKQDNEQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPGVWDETCSCMLDIFKTTIPHILLTWRPVGMEEDSSEKHLDMDLDRQSSSSIDKNASERGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQKLFASLLIKCVVQLELIQAIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDAEIHIETEDQGMYKYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCLRILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKINDEKFKAHASMYYPYLCEMMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWTPEEPSQLPGTLSAVW	632999	612741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_613653_613702_616048_616415_616534_618097_618237_619910_620080_621279_621411_622981_623097_624139_624195_624301_624441_625293_625430_628123_628254_628401_628533_630200_630362_631692_631866_632929
908624	contig_5602_pilon	-	2209	10	Intergenic	novelGene_133015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	122.986398926823	27	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	649	1503	508819	488176	FALSE	15	CATCATGTTGTGTATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLSKDLPHWNKLTSDEKYFISHVLAFFAASDGIVNENLVERFSQEVQVPEARCFYGFQILIENVHSEMYSLLIDTYIRDPKKREFLFNAIETMPYVKKKADWALRWIADRKSTFGERVVAFAAVEGIFFSGSFAAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	516387	487469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504500_506925_507021_507500_507635_508421_508539_508816_509047_511996_512151_516120
908625	contig_1867_pilon	+	3445	2	Intergenic	novelGene_54521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	5	junction_1	0	301	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCATTTAATGGGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203162	206830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_205988_206210
908626	contig_1244_pilon	-	2623	4	Intergenic	novelGene_38039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1849	junction_1	614.435965382525	117	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	74	583	948448	934320	FALSE	70	AATATTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTVSVLFCDPNSSKFQEYSRKSIGIAHAAKRELSCGVVDSLELVFSYPYTWWMQYTSVTHT	948521	932279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_934566_946439_946620_947578_947655_948440
908627	contig_6710_pilon	-	567	2	Intergenic	novelGene_92218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	181	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
908628	contig_5954_pilon	+	588	4	Intergenic	novelGene_28428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	288	junction_1	2028.5147823524	10	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGCCATCTCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97524	99022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_98163_98637_98694_98857
908630	contig_5686_pilon	+	2007	3	Intergenic	novelGene_45330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCACCAGACCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109351	129163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_109521_123101_124224_128447
908631	contig_5959_pilon	-	872	5	Intergenic	novelGene_150200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	22.7747118532815	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	54	593	352442	324781	FALSE	35	TAACCAAGTGAGTCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQIPIVATSSAPGIARNSKKRPASPANNGISAGGYSTSKKKKTTASNYPQGISMEAISENKMLPSDFSTGPVERAAKPLPFKDPNFVTSVLMLLRPLNQLRSILMFQVFFQFPTPAPSKQKPEFYHCRFILHVLYLHMNGIIWPTTRTPRASCASAPSKSFPTSGGCRPMLSPATWP	352495	324501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_324887_332973_333073_335814_335883_337953_338065_352286
908632	contig_6031_pilon	-	2054	4	Intergenic	novelGene_56754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	844	junction_1	730.016894781666	172	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	102	767	257696	255749	FALSE	10	GTTGCCCTGATGACTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQVSASCLQME	257797	254461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255868_256163_256375_256704_256814_257469
908633	contig_3956_pilon	+	2749	11	Intergenic	novelGene_15217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1279.18014368579	12	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	248	1855	1284120	1290121	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGIVKEVPSPGTCMDPRPLSLWG	1283793	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284054_1284267_1284684_1284757_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289844_1290056
908634	contig_11056_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_130389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	75	443	638388	638756	NA	20	TTCTTCAGACATGAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDILPPSATSLQATPLSWPAAQSKAPSSPLVANPRLPSHWWAQLPLGWVRKHRAGSRAPLAPGPSLCPGQRLLSRRPLRNRSSIAVSFEGQGCHLLLDRDQVMGDTQALINAGIFLGMTL	638313	640883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_638300_640900
908635	contig_17074_pilon	+	2831	13	Intergenic	novelGene_145106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	196.298012527438	22	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	172	1332	212372	223655	TRUE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207885	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452_224834_225254
908637	contig_17212_pilon	+	4936	6	Intergenic	novelGene_88611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2380	2709	87719	88048	TRUE	20	CCTCCGGAAGTCCTCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVGFFFFTALQAGGTKWFSLNSLPSESLQGFLWTLRSNTDSHWTGVLPTPSAFCFTPLDKSSGCWLHTLLKVELAAHSLDILYSSKHGGLTVSLSSLPDKLQAGELL	85339	146247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_89738_95044_95156_120832_120961_128447_128598_143812_143917_146202
908638	contig_16126_pilon	+	1300	3	Intergenic	novelGene_141873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_2	113	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	322	945	37436	38059	FALSE	5	GGTTCCCTGCAGCCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETEIHWKLIPITGGNARSPEDQQGKHGEKRTPDTLKGTTEDDVLTGQVVAEEQCVPAAEPPALSETTERTVLGEYNLFSRKIEEILKQKNVSYVTRIPTPIFSTQEKMKRLSEFIYSKTSKAGVQEFVDGLHEKLNTIIIKASAKGGNLPPVNPNDSGAKMASTAVGRHAVPVSSGDFSGNCLPESLCSDAFKDTNSHEPHSSSAVGLTDVEMSQPHHAAELMVTSDHTVPGDAAREPVEKETKSPSDVNMSAQPALSNFISQLEPEVFNSLVKIMKDVQKNTVKFYIHEEEENMLCKEIKVTTREGGSNAASA	32383	38414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_32421_33646_33707_37211
908639	contig_13481_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_119346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	585	887	372303	372605	NA	55	AAGCCTTAATAAATTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPIQEGPQKKVTKPYHNQTFQNQRQGILRAAREKRNIIYKGAPRRLNTDFSAETIQARRQCDDICKTLKKRIANQKSHIQQNCLSDTVVKLEHSQINRN	371718	373709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_371700_373700
908640	contig_5125_pilon	+	1970	3	Intergenic	novelGene_43413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	74.5	16	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	307	324	26249	26266	TRUE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPLSPAFPARRRGSASVSLFLIFPPFPFLFFFFLFPPSPPFTISPWRRIPRAGAEPVSPSASPRPPPPYGEREPPPHPGTSGGGGWRSGTGGGGGGHRFGVIMELIR	25942	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35689_58657
908641	contig_7513_pilon	-	6669	7	Intergenic	novelGene_89013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	787	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	45	TCTTTTCAAAAAAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	673380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
908642	scaffold_4438_pilon	+	6729	5	Intergenic	novelGene_174539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_4	52.4851169380425	207	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	217	888	395703	414221	TRUE	30	AATCAGCGAGACATGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLSPLALRRLKILEGCGGSKQENVEDGRASIYKSVITDTSKEMSCFSDFPMPEHFPNFLHNSKLLDYFRIVAKKFDLLKYIQFQTTTLIVKKRPDFSSSGQWEIVTKSNGKEQSEVFDAVMVCSGHHILPHIPLQSFPGIEKFKGQYFHSRQYKHPEGFEGKRILTIGIGNSASDIAVELSKKAAQVRCSLLTLYNEGEERGRTYWRTPATQMRLYYLLIS	395486	422518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_395772_407510_407700_411934_412098_413970_419363_421818
908643	contig_9206_pilon	-	2197	6	Intergenic	novelGene_137488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	62.5159179729451	111	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	492	1733	185643	171809	FALSE	25	AACCACTGGCATTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSQGLLTFRDVAIEFSQEEWECLDPAQRALYRDVMLENYRNLVSLGISSSEMNGISILKKKTEPWTLYTMMDIAYDPDVFSTSVIQELSPKEIINKGELFQRVMLERYESHGTEDFDFRQVRENMHQLESSWGDDERNDKGLIITHNKILNAFYSGSTLSEHQILHTGKKLYKCNVCGKVFSQNGHLEDHVRIHTGEKPYRCSICGKAFNFGSNLTRHQRIHTGEKPHKCNICGKTFSRYSGLTAHQRIHTGKKLYNCDVCGKVFSQNGHLEAHLRIHTGEKPYTCNVCGKSLTKGSHLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKFFSRNSGLTTHQRIHTGERPYKCIQCGKAFIRRTHLVEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFTQRANLIEHQRIRLAQRTYKCNMRSKAFNSAKRR	189333	171344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_172813_177222_177319_178238_178366_185628_185716_186799_187032_189146
908644	contig_6735_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_15812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGGTTCTGGGCGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565995	564187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_564200_566000
908646	contig_10437_pilon	+	2223	11	Intergenic	novelGene_38189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	534.567348423003	176	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	173	1315	229668	232651	FALSE	15	CGCGAACACGTCCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLGPQAGWSRATLRPGSGHQGLPRGPAGYISPLTERPEWLEEPPFCLPSPGAFSPRMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225093	233559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225265_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
908647	contig_11285_pilon	-	3535	20	Intergenic	novelGene_5518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	370.196152243286	290	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1036	1959	657064	654651	TRUE	35	GGAGGTAGGGAAAGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANMKDVPSTERMVLCSQQWKLLSQKEKDAYHKKCDQKKKDYEVELLRFLESLPEEEQQRVLGEEKMLNINKKQATSPASKKPSQEGGKGGSEKPKRPVSAMFIFSEEKRRQLQEERPELSESELTRLLARMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSERKPVGEREERGKLPESPKRAEEIWQQSVIGDYLARFKNDRVKALKAMEMTWNNMEKKEKLMWIKKAAEDQKRYERELSEMRAPPAAANSSKKMKFQGEPKKPPMNGYQKFSQELLSNGGAESPATEGAHGGDRQPLAAHLPEPEGALQEAG	665888	651864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_653131_653219_653364_653478_653551_653636_653685_654604_654796_654889_654979_655372_655484_655588_655745_656093_656250_656341_656456_656602_656645_656953_657096_657230_657382_658181_658303_658586_658652_661034_661191_661280_661365_661907_662084_663610_663736_665762
908648	contig_7678_pilon	+	810	2	Intergenic	novelGene_175954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGAGACAAAATTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92064	128049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_+_92748_127922
908649	contig_13625_pilon	-	6916	1	Intergenic	novelGene_150149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGATTTAAAAACATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21627	14711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_14700_21600
908650	contig_7915_pilon	+	3404	20	Intergenic	novelGene_42968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_19	154.682768926504	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	954	2996	119795	137758	TRUE	55	AAGAAGAAAATGTACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLVKKKSQLALIKQEIEKEEENLQVVLRQMFKHKTELKNILDMLQLENNELQGLKLQHDQKVSELEKMQVEVLEEKLELENLQQTAQRQKGEIEWQKQLLEKDKREIERMTAETRALQVCMASLSKEKEDLEEKCDSWEKKLAQTKRVLAATEENSKMEQSNLEKLELSVRKLQQELDQLNRDKLSLHKDILVMQQQLQEKREEVNTLQEELAHVQDHLNLAEQDLLHTAKHRDIQLSEQTRLQKDISEQKKKFEDCQKEGETKQKQLQVLQNEIEENRLKLVQQEMMFQKLQKERESEEEKLEASKMTLKEQQQQLEKELTDQKSELEQVLTKVSVAEEHVKTLQEEKRWNETLEKTLSQTKQQLSEREQELMEKSSELLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	105771	138320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_105903_107407_107617_114219_114351_114495_114637_114722_114850_118815_118981_119745_119907_121147_121264_121345_121564_123136_123295_124358_124433_125539_125729_126153_126380_128202_128409_129868_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137838_137991
908651	contig_8045_pilon	-	1124	2	Intergenic	novelGene_35440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTATTGTGCATAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435383	433702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_434213_434769
908652	contig_5236_pilon	+	1791	10	Intergenic	novelGene_100899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	108.63507834449	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	253	1569	71892	84085	FALSE	40	AAGGGGGGATTTTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	71639	84307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
908653	contig_18108_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_33531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGGGATTAAAAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307120	309659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_307100_309700
908654	contig_13612_pilon	+	1813	10	Intergenic	novelGene_157285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	120.413280101039	16	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	199	1569	51083	57279	FALSE	10	TGTTCTTGAGTCCAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEHQLHSGHQPFRGGDVVPVSHQEPRDAPAVRSWLCDRGCGGTTGPGPWSLSVASASGQGSLLPAALGVLTPSCSNCNLRARFHALPKCGHIWELVSGKLPIAFWPLPRLDDPRDIAE	49360	57523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441_53604_55102_55301_56237_56382_56928
908655	contig_14176_pilon	-	2868	15	Intergenic	novelGene_74834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	155.355566494466	16	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	992	2404	229795	223488	FALSE	20	TTTGGAAACCACGTCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRTLKKRN	232555	223023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_230314_231182_231369_231790_231966_232443
908656	contig_1982_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_151343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689486	688685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_688700_689500
908657	contig_7051_pilon	+	1798	11	Intergenic	novelGene_64351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	463.887755820306	2	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	176	1507	331836	346906	FALSE	50	GGAAAAAGAGACACAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKDWALCTQVDWVVMDQETVKMRGATEALSHLTLMMKNYGTESGKNRKHFGEKKKNSSCYMINRWKKKSNKQKGLQKR	321872	347197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_345346_345538_346867
908658	contig_5136_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_126652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	909	1310	335128	335529	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPESIRHKTLADIPVEGKALELPDREFKTLIFRAVQEMKENTDKNKENINKIMAKTDKTMDEFRKIIQEQDVKLNKQLEIIRKQQLEIQKRNNKISEMDSATEGFRSRFETMQDRVSKFEDKSLNTTSFEEK	334219	336509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_334200_336500
908659	contig_4301_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_65077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCACCCATACTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245297	246763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_245300_246800
908660	contig_9463_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_83847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGTAAAAACTGTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221982	219431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_219400_222000
908661	contig_14450_pilon	+	3823	8	Intergenic	novelGene_48981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	2060	2878	1042789	1169744	TRUE	10	ACCCCGGCTCCAGCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSKQIGDLFLIFWGFLLLFLPLCRPIGDVIQTGPDPRQVQERPRRLLHLLVVALRRLFRASLLEGQRVAGDLPRLGQVLPLPVLGRVAAVSQGILGLLLAVFPVVLLRVAVALMALEAPLAAFAALLAALGGELVVVVGRGGGDGVAGWGGAPGIGGFGTAVVVILLGVAADHWGAARRLALSPHPAAGDAVPHGCCHSNGSDWQRPDAGKHPSAQNPCSILDHSWRKTCLYLRGSIQKHHGSGSINVRILQKGSVSLKEGAARPDGWT	1040729	1502393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1043374_1065852_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689_1311248_1379343_1379461_1502264
908662	contig_12837_pilon	-	2803	13	Intergenic	novelGene_57379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_8	197.48122273607	18	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	801	2615	399021	371718	FALSE	15	TTCACTTACTGGTAGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYGFPPYGFPTYGGIAFHSGTTKSNAGMKHGDIGTPSKKDHKGCDDRDAINLSGKVTETTEQDKESSSEHEEVTLTYTVGVKEENCRFQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQDENGDSVLHLAIIHLHAQLVRDLLEVTAGVISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITSQEDVVEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKILSILLKHKKAALLINQPNGEGLNAIHIAMMSNSMSCLRLLMAAGADIDAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTFDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWERDGEDEGVVPGTTPLDMAANWQVFDILNGKPYESELTSDDLLAQGDMKQLAEDAKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVKELVEALRQMGYTEAIEVIQTAFCSSGTATTSSVKTPSQAHSLPLSPSSTRQQIDELRDNESICDSGVETSFRKLSFTESLTSSGSLLTLNKMPHDYGQHGSIEGNV	399821	371529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_371879_375467_375649_376626_376800_377341_377409_378812_378938_381971_382075_382543_382714_383351_383554_390081_390197_394554_394697_396076_396254_397489_397580_398912
908663	contig_2798_pilon	+	5012	1	Intergenic	novelGene_120063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1548	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTCAACTTTAGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188007	193019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_188000_193000
908664	contig_13295_pilon	-	2423	4	Intergenic	novelGene_31227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_3	226.9116323349	111	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTCATTGCAACAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134802	81155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_83228_85560_85677_101889_102009_134686
908665	contig_9345_pilon	-	3575	1	Intergenic	novelGene_24705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTATTGCACATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970593	967018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_967000_970600
908666	contig_13097_pilon	-	3124	1	Intergenic	novelGene_107730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTGGTGGAATCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230278	227154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_227200_230300
908667	contig_2703_pilon	-	3148	22	Intergenic	novelGene_101690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	2216	2941	564165	461833	TRUE	10	CAGAGGGCCGGGTCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNGRTLKIHFLSFCEHLVASAASCTAGVVMLVTCLQDFSCDELVTGFTFYPKEPLVVLLAVRSTILADVLPGEDFSAGLAFKAPQVPLLIQRQQRLPILDVSSTASAIAGAGGFLRAGGHRLGTELTKAVSPIECDSVSGWKRALADSTGKAVGVVGLAQSSHHLSFHELPTAMAACPIHPLVVQGAEVLPVLDEEAPLCQVTATHFAGETFDVEMPGLDSKHFTLARLPTLMAVNDWLL	611742	429716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_429893_461801_461937_484115_484302_487719_487830_508991_509119_510785_510877_559431_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584591_594567_594672_596349_596399_599679_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
908668	contig_11978_pilon	+	3031	2	Intergenic	novelGene_62818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419727	426971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_421690_425902
908669	contig_12638_pilon	-	2160	19	Intergenic	novelGene_33341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_18	222.335367029402	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1944	215	2158	1412426	1359836	FALSE	25	TCCCCAGCAGTATTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTATLDIYEMLKSNNMKLEEVVVTLQLVGDKEPAEIIGDLSICLDGLQLESEVVINGETTCSESASQNDDGSRPKDETRANTNGSDDPEDAGSGENRRVNGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSATSESDGSSTGSLPPTNTNANTSEGATSGLIIPLTISGGAGPRPLNPVAQAPLPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPSGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGISYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFLGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECGLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEI	1463556	1359833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1359912_1369746_1369888_1370219_1370354_1371188_1371349_1373068_1373158_1374643_1374716_1375548_1375622_1378299_1378429_1380309_1380395_1387355_1387426_1390900_1391076_1393565_1393662_1394913_1395104_1397315_1397474_1405545_1405592_1411272_1411411_1412314_1412440_1415903_1416043_1463494
908670	contig_9180_pilon	+	2081	2	Intergenic	novelGene_109115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAACACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395246	397814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_396216_396702
908671	contig_1699_pilon	+	4938	1	Intergenic	novelGene_72831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAGTTTTTGTTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101981	106919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_102000_106900
908672	contig_8929_pilon	-	3482	4	Intergenic	novelGene_178852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	297	1391	148631	94504	TRUE	50	TTTAAAAACATAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWVLSQQTQMKLKDFYEKLYSNKFENPEEMDKFLETHYLPKLTQTEVEQLNKPITKEEIEKVIKKLPTKKTPGPDGFTGEFYQTFREGITPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEVSIILIPKSGKDATKKENSRPVSLMNIDTKIVNKILTNGIQQYIKKIIHHDQVGFILHMHGWFDIRKTINVIHHINKTKDKNHMILSTDAEKVFDKVQHPFVIKTLNKIGIEGKFLNTIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPLRTETRQGCPLSPLLFNIVLEVLGRAIRLEKEIKSIQISREEIKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLQLIADFSKVSGYKTNMQKSVGFLYTNKENLASKRKSPNQYHLQ	148927	4998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8929_pilon_-_6057_6443_7338_94364_94545_147577
908673	contig_3700_pilon	-	3490	3	Intergenic	novelGene_138058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258137	86216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_86584_86656_86710_255067
908674	contig_8552_pilon	+	4211	1	Intergenic	novelGene_80086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3644	3952	508833	509141	NA	45	AAATCAGCTGAAACTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLTFHREWQVGLLLIPRPQQTPVTTVRLSAGGPVRAICCHCWLRSEMIHEISFPPVCQMLSWLRLRSQNVEVHIPTPPLNTVHSVSPSVKQREDDSASST	505189	509400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_505200_509400
908675	contig_9177_pilon	-	2724	18	Intergenic	novelGene_32577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1366	junction_4	594.362820699409	3	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	64	2286	9011	2152	FALSE	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	9168	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147
908677	contig_12969_pilon	-	4977	6	Intergenic	novelGene_61681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.92506263416	190	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	363	2321	470232	456475	TRUE	45	CAATAAAGATAGCATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDAQELLTFDDVAIKFTWEEWQLLDPAQKDLYLDVMLENYSNLVSMGYQANNPVTLSMLERGEELWTTEDEIHSQICPETCRVDDHLQGQLENQGMLKYTEQHHEHNALGNIVHHSAVHFPFRQNHNMFELHLKTLKLNLSSANQNKSCEIKNSAQFNGGRKSFLHGNHEKFHSEIKFPVSTKLISTKSQVIKHQRLYKIEKAHICSECGKAFMKKSQLTDHQRVHTGEKPYGCSMCGKAFSRKSRLNEHQRIHKREKSYICSDCGKVFTIKSRLIEHQRTHTGEKPYVCSECGKGFPGKRNLIIHQRTHTGEKCYVCSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNDCGKGFTMKSRLNEHQRMHTGEKPYVCNECGKGFPRKSNLIIHQRNHGVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYMCSDCGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICKECGKGFAFKSNLSVHQRTHTGEKPFKCGQCGKGFTMKRYLIIHQQTHTAEKNHICSECGKGFTTKSELIDHQQIHTGEKPYECKECGKGFTVKSRLIVHQRTHTGEKPFICSSCGKAFSSKRNLLVHQQTHNGGKP	474255	453145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_454689_455361_458196_462053_462150_462425_462553_470217_470372_474032
908678	contig_5954_pilon	-	2635	18	Intergenic	novelGene_28742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	195.139804377772	66	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	36	2303	1265881	1249935	FALSE	80	ACCAAAAAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDSKPSSKSNMLRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSNKVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAISTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERTSLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKGSGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGNSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFARRNLNEPESKDRVETLRPHVVGGGVGNDKEKEDFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL	1265916	1249602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1250299_1250886_1250932_1252993_1253021_1254060_1254319_1254916_1255079_1255936_1256035_1256242_1256422_1256798_1256932_1257973_1258087_1258162_1258263_1258369_1258490_1260597_1260835_1261563_1261621_1261767_1261839_1261931_1261998_1262315_1262365_1265268_1265323_1265746
908679	contig_16622_pilon	-	1471	7	Intergenic	novelGene_48464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1071.05773264874	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	727	1206	115540	112116	FALSE	25	GGATTTCATGTCAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSLLQHQSLQLQEQEKFLTKKGQQIYDHTF	121966	111850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115486_115559_118811_118884_121330
908681	contig_8045_pilon	+	2106	2	Intergenic	novelGene_35323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAAACGGTTGATGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64098	86280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_64302_84377
908682	contig_12626_pilon	+	4533	3	Intergenic	novelGene_80455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	581	junction_1	23	85	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	37	2175	167707	169845	TRUE	40	AAGATATTAAATGGCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METECNRRTSQIEAQFRADCQKVTERYEDALQSLEGRYRQELKDLLEQQREEKSQWEFEKDELTQECAEAQEQLKETLQREKATSLVLTQEREMLEKTYQEHLNSMVVEKEQLLKDLEDLKNVSESQQSLLSNQILELQSNHERELKDCEQVLCQAGASEQLASQRLEKLEMEHEQERHEMMSKLLAMESIHKETCEKADRERAEMSTEISRLQNKLKEMQQAVSSLSRLESGCQAMGVGEAEGNGTMSLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHERAVKENVKMATEISRLQQRLQKLEPGSVMSSCLDEPSTEFLGNSLEQTEPFLLQNRMKRIEDITKKRVLSDLQDDETRDLGSTDTSSVRRQEAKIDSEASIESFSELENSEETRAETWDLKIQISQLQEQLTILRADCDRASEKKQDLLFDVSVLRKKLKTLERIPEASPKYKLLYEDASRENDCLQEELRLMETHYDEALENNKELTSEVFRLQEELKKVEEVTETFLSLEKSYDEVRGENEELHVLVLRLQGKIEKLQGRSVLQCDCLSLWEAHLDNLQAEPDEKVLELNQTLEECAPKVTNAHHIIEEHKQENQYLEQENTRVLEKLKAHEVAWLQGTIQTHQEKPRIQNQAILEENTALLGLQDKHFQRQATIAELELEKKKLQELTRKLRERVTALVKQKDVPSQGEKEEELKSMMLDLQSTCSEMQQKVELLR	167670	173951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_171243_171350_171421_173060
908683	contig_5602_pilon	+	3304	17	Intergenic	novelGene_133024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1187	1597	532460	536876	TRUE	25	AGTTTCTGCTGGAAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFSTIDQNQRLNCKSFSAFSPDSSLKEVKLISICTLTSPQPFTKSLKSSAVKSSNEFFGSTSSRPFLIACNGCSATTNILCSAYFRTYSYTFWGVTGIFTPLGMSSTCPPPSSLHKSIANAKSIAEKTASASEL	528616	554674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_529782_532438_532526_533904_534050_535766_535880_536789_536944_538516_538606_538832_539008_541140_541202_544244_544376_545525_545672_546195_546307_548650_548899_551218_551316_551403_551527_553167_553385_554336_554453_554548
908685	contig_5302_pilon	-	2542	4	Intergenic	novelGene_81387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAGAATGACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167116	134152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_134296_134695_135230_161510_161661_165401
908686	contig_4519_pilon	-	5270	8	Intergenic	novelGene_123678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	332	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCTTGCAAATGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256894	77925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_78012_78792_78935_79731_82507_113216_113429_132652_132791_162759_163194_244267_244738_255881
908687	contig_5482_pilon	-	7105	5	Intergenic	novelGene_144510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	242	junction_1	45.5713725928899	447	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	106	717	742552	720591	FALSE	25	TGATCCGTTATGGATCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGEVNEDGEITGEKIAYVYPDERTALYGRFIDGEMIEGKLATLISAEEGRPHFELMPGSSVYHFDKSTSSCISTSALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVIDVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCVYDMFVHPRFGTIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPGKSGPEAPEWYQVELKAFQATQQK	742657	714202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_720772_728612_728771_731866_731985_734957_735040_742479
908688	contig_9609_pilon	+	1978	10	Intergenic	novelGene_23052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	799.528194207892	19	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	43	1059	435659	454609	TRUE	35	ATACCAAGAACTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435616	456274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_456042_456138
908689	contig_720_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_155168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	486	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	460	957	169514	170011	NA	25	GGAATTATCATTAGGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKYHSFHQPEPRRTRWYPATTTTNSDRDHNRGSQTEREKNVEQNSNSHKKTRLTGLTETGKTPETMAHRHTFNSELKPLPKFILQPKIRQVYKTVTNVRNMLLSSVMYTRPKEQHLPQSNDEKAGRDRNNGHIEAGNGGMKGDSVDKSQGLQPMSQNKLCTNC	169054	171065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_169100_171100
908690	contig_10140_pilon	-	3224	1	Intergenic	novelGene_148406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCATGAAAAAAAATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223683	220459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_220500_223700
908691	contig_17769_pilon	+	3651	14	Intergenic	novelGene_124265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	105.499095596112	458	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	2968	3570	115436	116765	FALSE	30	ATAGCATGTCTGATGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQVRAGVTGAGRHHRCRHRHRCGQASQVQASQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	103212	116846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_104851_106410_106480_106928_107054_108444_108716_110387_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_113608_114689_114814_115333_115535_115879_115970_116111_116307_116546
908692	contig_6326_pilon	-	2228	3	Intergenic	novelGene_168538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	82.5	162	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	331	405	621380	621306	FALSE	60	AAAAAGTTATTTTAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQAFFYFQGNSNNIATVDVSAGFVGLEHYVEVPAAFLTTFATYVGPILWASHLVNYLSSESSSHSALRRACFCYALICSIPVSVYIILVTSLRYHLFIWSVFSPKLLYEGMHLFITAALCIFFTAMDQTKLTKP	629889	619482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_621523_628296_628461_629865
908693	contig_9982_pilon	-	2644	5	Intergenic	novelGene_55726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_4	29.7352904811774	143	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	135	797	302785	301370	TRUE	55	CGAGAAGAAAAATGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLACILPFKYPAVLPEITVRSVLLSRSQQTQLNTELHAYLQKNCCGDVCILNATEWVREHASDYISTDSTSSATTGSTAQSLDLILTRLWIYSHHIYNKSKRKNILEWAKELSLSGFSLPGKPGVVCVEGPQSACEEFWSRLRKLNWKRILIRHREDIPFDGTSDELERQRKFSGFEEKAFSADGARGNHMDFGQLYQFLNARGCGGVFQMLFGVEGQ	304880	297818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_299644_301347_301605_302233_302597_302720_302789_304749
908694	contig_10324_pilon	-	3870	4	Intergenic	novelGene_7877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGGGGCCCGAGTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554860	538646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_538814_549472_549586_550276_550398_551391
908695	contig_3832_pilon	-	3705	15	Intergenic	novelGene_161427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_14	344.805365091552	21	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	823	2472	59	2530	116478	63968	FALSE	10	GCCCCCTTTGATCAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSEPGGRRPRRHRGDPFAMEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDEMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGPVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQSQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEVPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTIISLDFGGNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSSSEKLQNINLAMSPLPASETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQDQPASPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFDVDSDMVNEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQDTDLDLEMLAPYIPMDDDFQLRSFDQLSPLESSSASPQSASTISVFQQTQMQEPAVIANTSTATTDELKTVTKDGMEDIKILIASPSPTHVLKETTSATTSPYSDTQSRTASPSRAGKGVIEQTEKSHPRSPNLLSVTLSQRTTVPEEELNPKILALQNAQRKRKMEHDGSLSQAVGIGTLLQQPDDRATTTSLSWKRVKGCKSSEQNGMEQKTIILIPSDLACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPVQGSRNLLQGEELLRALDQVN	116536	62792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_64120_64556_64684_65240_65350_68428_68854_68979_69103_73716_74004_74874_75096_78251_78400_79712_79820_84657_84861_85664_85778_90473_90559_90641_90788_91722_91914_116443
908696	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
908697	contig_16722_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_118269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTTCTGCCAACAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47380	50099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_47400_50100
908698	contig_5023_pilon	+	2510	15	Intergenic	novelGene_7322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_6	1919.93350357851	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	27	1910	607279	646990	FALSE	15	AATCCTACTCTGCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607252	647590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
908699	contig_8616_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_72513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	92	496	343161	342757	NA	20	AGCAGCTGTTTGAGGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIVGALLGAGAGLGSALFVLVTPGEQRTQAMLEVGATGSPEVGHAGRECRAGGRDCAPPFLPSGDAGAGPAAQGGGGQDQGAPAGYPAGGSGHSGKRGLQEEPGGRQWRRWDVGMSADLAPVDAGTSARAQDSEAAFRLRGPVQESGPGMPHPGLSGSPGAVAG	343252	340935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_340900_343300
908700	contig_6020_pilon	-	2597	2	Intergenic	novelGene_155569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	755	junction_1	0	40	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAAAAAAAAAAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295507	292744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6020_pilon_-_293692_293857
908701	contig_6842_pilon	-	983	4	Intergenic	novelGene_130815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	3.39934634239519	69	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGATTCTGGGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758934	1737314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1737748_1739451_1739687_1756851_1757017_1758784
908702	contig_1516_pilon	-	1535	1	Intergenic	novelGene_50028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	399	722	518263	517940	NA	30	CTATGACCCCATAACCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIKDLEYYINLADKAAAGFERTDSNFERSFTVSKMLSNSITCYRETFHERKSQSMQQTSLLSYFKKLLQRPQPSAATTLIGQKPSISRQDPPPAKRLGLTEFSDDG	518661	517126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_517100_518700
908703	contig_15570_pilon	-	3055	15	Intergenic	novelGene_137829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCGCCGCCCGGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493577	445919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_446066_449889_450079_451301_452021_452389_452629_454133_454246_460703_460943_461702_461839_463715_463892_465778_465958_472479_472564_474146_474289_484959_485042_486598_486783_491914_492127_493361
908704	contig_4974_pilon	+	4942	8	Intergenic	novelGene_161391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	48.523505770347	276	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	243	1154	41473	116912	FALSE	30	TTAATGATTCGGAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAGRLHCLTMTAKNPTPRDVAPAPLVTCKLCLCEHSLDKMTTLQECRCIFCTACLKRYVQLAIREGCGSPISCPDVVCLNHGTLQEAEIAGLVPVDQFQLYQRLKFEREVHLDPYRTWCPVADCQTVCRVASSDPGQPVLVECPSCHLKFCSCCKDAWHADVSCRDSQPVVLPTEHGALFGTDAESPIKQCPVCRVYIERNEGCAQMMCKNCKHAFCWYCLQNLDNDIFLRHYDKGPCRNKLGHSRASVMWNRTQVVGILVGLGIIALVTSPLLLLASPCIICCVCKSCRGKKKNHDPSTT	20872	120700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_21079_41436_41638_67772_67878_81738_81800_107592_107798_111020_111166_115425_115516_116771
908705	contig_9706_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_20975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348587	346981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_347000_348600
908706	contig_13021_pilon	-	3195	6	Intergenic	novelGene_8119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_3	53.5589394965957	24	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2605	3030	150141	147970	FALSE	25	CAAGTTACTGCTTTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRMRTREEMLFKKLFEEGLQIQKQRLRDLRNYAKEKRDEQKRQHQNELDSMENYYKDQFSLLADAIAQERQELKTREKSQAQTLHKVKRELRSKMEKEIQQLQNMITQNDEDAFFRELEAERFKSRLHLASFQYSKNPFP	153653	147804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_148147_148412_148485_148777_148925_150111_151842_151957_152128_152919
908707	contig_960_pilon	-	3461	1	Intergenic	novelGene_108306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3039	3359	1041515	1041195	NA	50	TTTTAAAATAGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSASVETYSLGNPMGSPGVRSDSMAVGLVFGVLHKCSYFFLRRNGDWRVEYTKSQQLSEMKGKSKQLSRSPKSTKSQTSRSTADRPGRQQTSLHSSTCPFKERI	1044553	1041092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_1041100_1044600
908708	contig_9696_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_68784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATCAATCAATCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203010	205613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_203000_205600
908709	contig_13863_pilon	-	1875	12	Intergenic	novelGene_42071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGAACACGGACGTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490595	455711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_455791_474557_474681_477706_477791_478582_478757_479276_479366_481368_481474_481992_482172_483173_483273_487478_487581_488864_488996_489554_489676_490006
908710	contig_4754_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_35904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTAGGGCAAAGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129223	126505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_126500_129200
908711	contig_11417_pilon	+	2382	8	Intergenic	novelGene_103306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2617	junction_7	310.300973052859	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	1467	2354	540507	556784	FALSE	20	CAGTCCAATGTCTCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQETQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGVFAINEAVDSGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGATYQSDLAEAKKKKLAAGDNNSKWVKHWVKGGYHYYHNLETQEGGWDEPPDFVQNSVHLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITKLQACCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQVSQSQLFRQQVGF	537773	556812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_537849_538884_539049_539279_540616_542616_542781_551052_551144_551338_551507_552205_552349_556571
908712	contig_3386_pilon	+	2390	5	Intergenic	novelGene_34559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	716.184464715621	165	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	306	695	476280	486630	FALSE	25	ACTTTTTTCCCCCACCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVKTTSSTYQMQKYLRTLKLLTYRKLMLLI	470080	488325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_475713_475783_476268_476405_485246_485299_486417
908713	contig_21007_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_161506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	617	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_0_1400
908715	contig_7730_pilon	-	2237	4	Intergenic	novelGene_156277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	1636	2235	245235	244636	FALSE	40	AACCATGCAGGCAAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLKEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLESQKINNKISEMDRVIEGLRSSPEMVEDRISGIQDKHLDTTLLKENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFRVLGVPEQGEKTENTNRIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYTIDHKRKSPRHIIITLSKTKDKQRILRAAHEKQEVTYREETIRLSSDYSA	268063	244633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_245618_245707_246231_246293_246407_267446
908716	contig_7457_pilon	+	3008	18	Intergenic	novelGene_31642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	142.957103929864	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	133	1209	1005828	1032699	TRUE	10	CTGGTGTCTCATGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDYAKTILSLMTREKHPDGKILIIGGSIANFTNVPTRLLKPQ	1001546	1041116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382_1015427_1032669_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1040131
908717	contig_11417_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_103333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAGGTCATTTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586592	588833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_586600_588800
908718	contig_8447_pilon	+	4552	17	Intergenic	novelGene_69388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	505.312155998646	536	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	1299	2534	48468	82214	TRUE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	5773	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_84008_84266
908719	contig_10609_pilon	+	4634	16	Intergenic	novelGene_123924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	517	junction_5	489.736455203771	49	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	551	1656	186	1841	386471	486656	FALSE	40	CCTCCTAAAAGAAGCACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGIHSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVDCIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHYAAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASGRSCQGSG	361235	489449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_400432_400512_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314_420456_422067_422149_426657_426770_477871_477944_486428
908720	contig_12327_pilon	+	1996	13	Intergenic	novelGene_140689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1327	1752	1148758	1151877	TRUE	20	CAGTTATCTGTACCTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIHMFISKEFDSSLIHFPCVGKIGMFFFKAGILDPVLHIRVYEDKSFVDGAGPIHLFVPQLKVDVGVPGLLLGLPLHPALKHLPGTSNVSQHLLHVRVLVPNWLTRGRVVMARSQIFRAWLTWRFFISISAYFSQSVIFR	1139944	1153715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1140156_1141085_1141330_1141766_1141871_1143499_1143746_1144615_1144694_1145572_1145635_1146316_1146509_1147481_1147629_1148715_1148895_1151136_1151306_1151757_1151913_1152674_1152768_1153599
908721	contig_7457_pilon	-	2973	2	Intergenic	novelGene_31395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	931	1233	463835	463533	TRUE	65	AGGGAAGAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLIAQADGQMELGVNSTKDKQAAPGPSVRPGGMKTLLDPPGLLIPMAKGMWKRPVPMSRSHFFKFHKHYFGGVGGRAGLLCRTKGQACLEKNPNQIMG	464765	461381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_462206_462616
908722	contig_1719_pilon	+	2351	2	Intergenic	novelGene_87344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1393	1692	659483	659782	FALSE	35	AAGTGTAGAGTTTGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIQVMTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRRIIFQNGCIILHFHQQCIRVPISPEPLQHLLFPVFWIHTSNAGGEMVSHCGFNLHFSNG	644031	660441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_644082_658140
908723	contig_5145_pilon	-	2609	13	Intergenic	novelGene_131436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	147.293829545647	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1020	1769	927097	916397	FALSE	5	GATTCCGTCCTGCCTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASHGLNVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947046	915556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_927073_927515_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
908724	contig_1639_pilon	+	2223	11	Intergenic	novelGene_74905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_9	162.016542365278	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	240	578	311986	314011	TRUE	20	CTAGGGATGGCTTGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRHES	309176	331774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_313997_315025_315536_315689_321337_321394_328942_329049_331456
908725	contig_18414_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_170022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	76	489	143056	142643	NA	25	CCAAACCCATTGCTGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQSFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITQIDIFTSMFMAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMQLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	143131	140837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_140800_143100
908726	contig_9429_pilon	-	2944	1	Intergenic	novelGene_155090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTATAAATTTTTGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26787	23843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_23800_26800
908727	contig_2069_pilon	-	3149	1	Intergenic	novelGene_23410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAAAAAATAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240514	1237365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1237400_1240500
908728	contig_5033_pilon	-	2795	4	Intergenic	novelGene_28954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1749	junction_2	452.37447614412	26	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2138	2473	451758	451423	FALSE	75	GCAAAAAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	465154	451100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_453124_456495_456604_462973_463031_464547
908729	contig_7894_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_170783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211444	212908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_211400_212900
908730	contig_4604_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_19167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373817	371469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_371500_373800
908732	contig_13300_pilon	-	1718	4	Intergenic	novelGene_125796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	141.744684399647	33	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	86	1291	193695	187660	FALSE	20	CTAGGTGTCAAGCACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALRPALPLRFAAAGTGAWPAGSCPTPRLMPAPPSEPLEWNESMHALRISVGGLPVLASMTKAADPRFRLRWKVIVFFFVGAATLWMFYAPRSSSLRPPAPNAHNWRLGPGSADRYNDTYPLSPPQKTPGGTRYRIAVIADLDTESKAQKEHTWFSYLRKGHLTLSDSGDRLVVEWDPGHEVLESHLAEKGRGMELSELIVFNGKLYSVDDRTGVVYQIEGSKAVPWVILSDGDGTVGKGFKAEWLAVKDEHLYVGGLGKEWTTATGEVLNENPEWVKVVGRKGSVDHENWVASYNALRAAAGIQPPGYLIHESACWSEVLQRWFFLPRRASRQRYSEKDDEHRGANLLLSASQDFSDVSVRRVGELVPTHGFSSFKFVPNTDDQIIVALKSEEDRGKIATYIMAFTLDGRFLLPETWIGSVKYEGIEFI	209068	187232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_188031_190605_190810_193064_193718_209005
908733	contig_14556_pilon	+	7943	31	Intergenic	novelGene_138515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	267.149188448868	553	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	2439	4550	134563	163173	FALSE	70	AATTAAATAAAAGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDMTYQLKVTQQTLEQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSIFDCDLKQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMSLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLCKELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEEANRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDAQEQLSILKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISSAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSRQLAANKPS	87651	166566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_88273_89459_89561_104950_105089_113991_114253_117474_117620_120787_120927_123065_123158_123904_124065_125600_125666_129197_129283_129472_129522_130125_130262_130435_130528_130750_130986_131381_131489_134550_134711_139779_139941_140333_140519_141523_141594_142703_142808_142969_143157_148074_148169_148267_148363_149315_149496_149682_149852_153089_153161_153808_153898_154311_154391_156136_156399_156488_156703_163169
908734	contig_19737_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_158983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	154	459	78199	77894	NA	20	TCACTCACCCGCCCAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCCRRPRLPLMWGIWVGRALRSERCRTDRTQVGAGDGTGKRACRVRTGSPEEAETECRMNRGGRAPKTDICPCLGPEEEGSWRSCEWRAWSWESPEGRR	78352	75959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_-_76000_78400
908735	contig_9443_pilon	-	2864	4	Intergenic	novelGene_167123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	109.612448603655	144	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	110	307	15537	13771	TRUE	35	TAGCAGCACTGGATGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGWSALPSTRPCAPVRYHCWRVAVSLGPGSISALCMLGSLKLLSSFLYFPFPVPIYGLLTFLHCRCKIGCYSWWTSWTSAPPPTLTIQSTNDTRSWILHI	67146	9790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_-_12199_13621_13880_15448_15600_67099
908736	contig_854_pilon	+	1352	2	Intergenic	novelGene_36760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	32	781	1745134	1745937	FALSE	80	AAAATAATAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILHEALNKLRMDTATEDKDMLQKELLDRDRFLDEFPMVKMELEERISELHALADKVDKTHRDCTISYLVANSVAGVSLALSATGMGLGTAAAITSVSTSIVDHSNRLSAKASASKLMLTGDHESVVKAVLPSLVPITKNCIQVSSKITKTVHAIKLAKDNPRLVANARRLMTTGNISKRRGKQVQKAFGGTSLAMTKEARVMGMATAGVSLLMDVFKLVQESQHLQEGAKAESAEELREEARELERKLEELTEIYKNLQ	1745102	1746508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1745324_1745377
908737	contig_6488_pilon	-	1125	2	Intergenic	novelGene_44732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_1	0	38	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	181	951	91238	53739	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGVPSPLQGGSNSAATLGKPSGELRAGGASPPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQVKSGKINRGGECMCVCVCVCVCARAYACKLVNGGRKGEQFCGHPGILQ	91418	53564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_54122_90850
908738	contig_20357_pilon	+	4897	1	Intergenic	novelGene_178715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAACAAAAAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26053	30950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20357_pilon_+_26100_31000
908739	contig_10973_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_150328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGGTTCTTATAGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127	1028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_100_1000
908740	contig_5686_pilon	+	5086	11	Intergenic	novelGene_45398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1676.90561749909	25	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	124	1113	202891	212669	TRUE	15	TTCATCAGTGTTTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNR	170213	265398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170318_202871_203002_208031_208722_212480_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_265065
908741	contig_3424_pilon	-	3692	1	Intergenic	novelGene_55467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	2326	2823	151207	150710	NA	35	CGGACGGAAACTGAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVRVFLWAHDSTIPSSNPQQYMYKPTRLVRKRSLRAIKSSKPPASTGTACVTRPEGEGGTGNRGGSAPLMPNVSTVQTPNGLYPSRRKPPWEPLSAPGSTPPGPALSSGSILRTLPSLLGPSHSQARVQLLSRAKGSRHPILRAPGCMGIYAEPSRSQPTGRG	153532	149840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_149800_153500
908742	contig_2093_pilon	-	2726	1	Intergenic	novelGene_153009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAGCTATACAACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432658	1429932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1429900_1432700
908743	contig_13542_pilon	+	1473	7	Intergenic	novelGene_131535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	87.8894507637609	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	95	997	535605	546592	FALSE	30	TGCTGAGCAAATACTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLSQTASGALARPATVLGAMEMGRRIDAPTSAAAVRAFLERGHTELDTAFVYSDGQSESILGGLGLGLGGSDCKVKIATKANPWDGNSLKPDSLRSQLETSLKRLQCTQVDLFYLHAPDHSTPVEETLRACHQLHQEGKFVELGLSNYASWEVAEICTLCKNHGWILPTVYQGMYNATTRQVETELFPCLRHFGLRFYAYNPLAGGLLTGKYKYEDKDGKQPLGRFFGNNWAEIYRNRFWKEHHFKAIALVEKALQAAYGPSAPSMTSAALRWMYHHSQLQVGWEQLMHLRRPLASF	535510	547068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_535837_540319_540508_540702_540808_541724_541822_542065_542166_542720_542851_546541
908744	contig_3529_pilon	+	2851	9	Intergenic	novelGene_105401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	78.3428961361526	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	63	935	790486	808554	FALSE	0	CTTTGTTGGCCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGCNASIYLPTSLAWHPQQSEAFVFGDENGTVSLVDTKNASYALSSAVHTQCVTRLVFSPHSVPFLASISEDCSLAVLDSGLSEV	790423	810470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806299_806771_806844_807636_807746_808481
908745	contig_8616_pilon	+	3802	24	Intergenic	novelGene_72528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	232.157880899004	175	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	944	2835	5	2839	362644	380253	FALSE	35	GAGATGAACCATACACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVAAVAARRSWSWPGLVLACLGVCLGITLAVDRSNFKTCEESSFCKRQRSIRPGLSPYRALLDSLQLGPDALTVHLINEVTKVLLVLELQGLQKNMTRIRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPTARLSVSGRDDNSVELTVAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLMHFEHQRAPRVSQGSKDPAEGNGAQPEETPGDGDKPEETQEKAEKDEPGTWEETFKTHSDSKPYGPTSVGLDFSLPGMEHVYGLPEHADSLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPQRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMLDYLQGSGETPQTDVRWMSESGIIDVFLLLGPSVMDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPLTMLERLASKRRKLVTIVDPHIKVDSGYRVHEELRNQGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFNFDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGFYVHMATADGLTLRSGGIERPFVLSRAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISVPMCLSMGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQYHDVIRDALRQRYSLLPFWYTVFYQAHREGVPIMRPLWVLYPQDVTTFSIDDQFLLGDALLVHPVAEAGAHGVQVYLPGQGEVWYDVQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTVVPRWMRVRRSSDCMKEDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPKGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKESPESRLSFQHDPETSVLVVRKPGVNVASDWSIHLR	362639	381216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_362682_366431_366537_366692_366802_367053_367182_372151_372332_373635_373706_373876_373965_374051_374149_374406_374588_375366_375521_375723_375960_376051_376179_376282_376363_376615_376760_376890_376988_377267_377370_377547_377792_378685_378751_378932_379010_379123_379199_379373_379488_379610_379724_379888_379990_380143
908746	contig_11708_pilon	-	3899	1	Intergenic	novelGene_138963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTTTATGATTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250009	246110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_246100_250000
908747	contig_2377_pilon	-	3600	1	Intergenic	novelGene_67932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	309	930	26	955	825073	824144	NA	15	AGTGAATTTGTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKEEPEISMEKEDTVQLDDHEEEEEEDEEPSHNEDHDADDEDDGHMESTEVEKEELPRETFKEVLENQEAFLDLSVQPSHSNSEVLMDCGVDLAASCNSEPKELAGDTETVPESDEEPPEEQAQKQDQKDSQEVDSDFKEGNTATMEIDSETVQAVQSLTQENNEQDDTFQDCAETQEACRSLQNYTHADQSPQIATTLDDCQQSDHSSPVSSVHSHPGQSVRSVNSPSVPALENSYAQISPDQSAISVPSLQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTLGGQHLWKRLFTEQLLL	825098	821498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_821500_825100
908748	contig_13740_pilon	+	8391	1	Intergenic	novelGene_34654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	377	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGAGCCTCTTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156133	164524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_156100_164500
908749	contig_12292_pilon	+	3976	3	Intergenic	novelGene_167005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTAAGTCAAACCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287567	599360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_290296_375231_376015_598895
908750	contig_10958_pilon	+	1640	4	Intergenic	novelGene_5422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5109.3574938538	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	34	498	888255	900560	FALSE	50	TATCTAAAACTAGGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLPSYFNRCIIFYPLDISEFILLDLYYGYFADFQLLL	888221	901702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893955_900451
908751	contig_2834_pilon	+	1436	6	Intergenic	novelGene_27999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2294.97532884343	161	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	53	628	274763	290707	TRUE	20	CTCTTTCAAGTGATGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274710	291723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617_291184_291391
908753	contig_9863_pilon	+	3685	2	Intergenic	novelGene_153989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	465	junction_1	0	195	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	859	1161	20272	20574	TRUE	30	TTGAGATATGGCCTCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILFAFSFTSACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKGSQVVSSPGKEPGSAIFAG	19413	31578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_21947_30426
908754	contig_2078_pilon	-	3039	11	Intergenic	novelGene_100181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	79.0427732307009	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	783	2273	532773	514649	TRUE	20	TGACTGTATCTGAGGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISQGHLLRISPLSRARKNWVLGPCANVGYNIFRQVQSCSSSLLGRNENWKKEAVGDKLNVFLHLFAGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQGIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSVIDPMSLQSLPCPGPLEQVPRSWS	535405	505008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_532301_533475_534554_534576_535345
908755	SIRV6	+	1048	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	9	31	2	21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	401	14	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	206	697	1733	10736	TRUE	40	ACAATGTAATGGAAATTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1139	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
908756	contig_1275_pilon	+	894	2	Intergenic	novelGene_108855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	64	753	747279	747968	FALSE	20	AGCATAATTGTGTCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746573	748109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
908757	contig_18394_pilon	+	677	1	Intergenic	novelGene_178450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGATTTTTTTTGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4626	5303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18394_pilon_+_4600_5300
908758	contig_4364_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_7	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165629	164387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_164400_165600
908759	contig_10930_pilon	-	3780	6	Intergenic	novelGene_36972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_5	1656.1492203301	62	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	661	1179	276835	273918	TRUE	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVISAQVKSLV	280341	267058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279807_280157
908760	contig_10286_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_98418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGGAGATCAGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419275	417118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_417100_419300
908761	contig_12841_pilon	-	938	1	Intergenic	novelGene_55899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTATCCTGTTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906483	905545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_905500_906500
908763	contig_9180_pilon	-	3741	3	Intergenic	novelGene_109109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	51	355	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	42	611	381474	378681	FALSE	25	CGATATCTGTCCAAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGELHASRRSCAAMALLLATLRVLLGGFFVLTGAAKLSEQISAPVSEQMKALFVQFAEVFPLKVFGYQPDPMSYQATVGWLELLAGLLLVLGSPILQEISNLLLTLLMIGAIFTLVSLNESLSTYIPAIVCLSLLILLDTCHFAAQTQDGPDPQGGRLQVHSRNPESRRSLPFGTMPLSQQEHSGAHRLYHPVIRTPRAIQC	381515	375550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_378962_379821_380003_381366
908764	contig_7410_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_106118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGGTGAGAGATCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600121	601547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_600100_601500
908765	contig_854_pilon	+	3798	2	Intergenic	novelGene_36328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	119	568	665259	665708	FALSE	45	TTCAAACACATTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGGDFQKWLSSPFPSSSFSPVGPAPEISPLEVLERDAKAMQLLLRPEDKVPAPSPSSHSHTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPCTEESDEGRPGAPAGSPLPALPPLPGEDDAYCTFPPWGRPAAFLPQSPHWPGSPKQCSPGQRGQGGEAAPLPSWGSFWRLRPQTPGASCPKSPQPSG	661867	668938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_661887_665159
908766	contig_5954_pilon	+	2643	4	Intergenic	novelGene_28475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAACTGACTAGAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189965	270371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_190471_191302_192288_251295_251373_269295
908767	contig_5569_pilon	-	4831	26	Intergenic	novelGene_86737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.9038136689252	242	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	93	1850	463727	430561	TRUE	40	CAAAAACCACACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTGSRSALSGVWFWLGPFGDGGGADSLLAAMHDAFEPVPILEKLPLQIDCLAAWEEWLLVGTKQGHLLLYRIRKDAGCNRFEVTLEKSNKNFSKKIQQIHVVSQFKILVSLLENNIYVHDLLTFQQITTVSKAKGASLFTCDLQHTDTGEEVLRMCVAVKKKLQLYFWKDREFHELQGDFSVPDVPKSMAWCENSICVGFKRDYYLIRVDGKGSIKELFPTGKQLEPLVAPLADGKVAVGQDDLTVVLNEEGICTQKCALNWTDIPVAMEHQPPYIIAVLPRYVEIRTFEPRLLVQSIELQRPRFITSGGSNIIYVASNHFVWRLIPVPMATQIQQLLQDKQFELALQLAEMKEDSDSEKQQQIHHIKNLYAFNLFCQKRFDESMQVFAKLGTDPTHVMGLYPDLLPTDYRKQLQYPNPLPVLSGAELEKAHLALIDYLTQKRSQLVKKLHDSDHQSSTSPLMEGTPTIKSKKKLLQIIDTTLLKCYLHTNVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAHKYSELIILYEKKGLHEKALQVLVDQSKKANSPLKGHERTVQYLQHLGTENLHLIFFLLSVGAERLPRRRPEDIYRRSPRSGGSATRSRAWLLNREF	463819	422614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_423871_423913_424835_425641_425734_426658_426794_426923_427083_427983_428030_428242_428346_429201_429331_429821_429940_430538_430638_431013_431089_431362_431450_431590_431733_432202_432347_434435_434579_435738_435869_441090_441212_441325_441447_446229_446414_448106_448200_448635_448735_450577_450673_451932_451976_452292_452358_455189_455256_463654
908768	contig_2829_pilon	-	2494	6	Intergenic	novelGene_175000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_2	222.64590721592	187	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	498	863	299731	296356	FALSE	20	ATCTTTGAGTTCTCGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAEYTILEGKLQKTLIDLEKREQQLASADSELQREKKELQSERERNLQELQDSIRRAKEDCVHQVELERLKIKQLEEDKHRLQQKLNEAENKYKNLEKEFQHFKDQQSNKPEIRLQSEINLLTLEKVELERKLESATKSKLHYKQQWGRALKELARLKQREQESQMARLKKQQEELEQMRLRYLAAEEKDTVKTEQQELLDIRNELNRLRQQDQKQYQDSREIASGKMDSPHGKGLEEGLDVYLTRLIEERDTLMRTGVYNHEDRIISELDRQIREVLAKNNASNE	331207	294724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2829_pilon_-_296594_299603_299750_311178_311278_326055_326179_329717_329880_331112
908769	contig_4180_pilon	-	921	2	Intergenic	novelGene_8312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGTAAGGGAGAGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749626	745285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_745991_749410
908770	contig_3077_pilon	+	2280	7	Intergenic	novelGene_26746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3805.4329327365	211	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	497	1003	13867	16408	TRUE	10	GTGTGCGGCACTTGCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVMGLGEEVSFPSTTAALGKVILPSPL	11193	18085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16490_16889
908771	contig_19737_pilon	+	3170	7	Intergenic	novelGene_158959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	737	junction_4	159.013626250499	62	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	40	654	16052	41269	FALSE	65	ATAGAAAAAAATAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVSVLFISTFLVYLVAFLIAV	16012	43785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_16055_21809_21912_35434_35528_37367_37499_38872_38933_40063_40173_41152
908772	contig_4429_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_50821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGATTGAAAATAGGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210928	213100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_210900_213100
908773	contig_7411_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_137005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATCGGATGTCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261862	264555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_261900_264600
908774	contig_13004_pilon	+	1559	3	Intergenic	novelGene_112727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	96.5	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	120	647	922526	928394	FALSE	15	ATTGACCTTGGCTTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKRADRNCAQGQPQGQPVQLQPCAQSPPGFQQRGAQPDQHSHRCYSHRPVALERPPQVATKSRGGDTAPPPLLSKNEWCHV	922406	929306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923715_928155
908776	contig_1369_pilon	+	3474	8	Intergenic	novelGene_176795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	43.6180078894589	223	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	100	1932	1109335	1126830	FALSE	20	CTATTGGTATTAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTSSQDGGERVKKLCSPLDCYRTRVKFHSDNKMQYSHHCEHLLERLNKQREAGFLCDCTIVIGEFQFKAHRNVLASFSEYFGAIYRSTSENNVFLDQSQVKADGFQKLLEFIYTGTLNLDSWNVKEIHQAADYLKVEEVVTKCKVKMEDFAFIANPSSTEISSITGNIELNQQTCLLTLRDYNNREKSEGSTDLVQANPKPGALGRKSSQTKKKKKAFNSQKTEQNKTVQYSSDILENASVELFLDANKLSTSITEQVSQRNDSSELELTSVVENTFPAQDTVQTVTVKRKRGKSQPNCALKEHSMSNIASIKNPYELESSGEELDQRYSKAKPMCNTCGKVFSEASSLRRHMRIHKGVKPYVCHLCGKAFTQCNQLKTHVRTHTGEKPYKCELCDKGFAQKCQLVFHSRMHHGEEKPYKCDVCNLQFATSSNLKIHARKHSGEKPYVCDRCGQRFAQASTLTYHVRRHTGEKPYVCDTCGKAFAVSSSLITHSRKHTGEKPYICGICGKSFISSGELNKHFRSHTGERPFICELCGNSYTDIKNLKKHKTKVHSGADKTLDSSAEDHTLSEQDSIQKSPFSETMDVKPSDMTLPLALPLGTEDHHMLLPVTDNQSPTSDTLLRSAVNGYSEPQLIFLQQLY	1108383	1128372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_+_1108452_1109303_1109601_1116399_1117194_1117971_1118132_1119991_1120171_1121546_1121631_1122668_1122756_1126567
908778	contig_3233_pilon	+	1520	10	Intergenic	novelGene_56541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_7	268.405166368558	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	552	1121	740857	746413	TRUE	25	CACTTTACCCACTCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNRAKQKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGEQEDAVRILMEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRCSAGRPPLPVHLQESWGDAGQTRCSRVA	738349	748028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_738776_740577_740664_740817_740917_741759_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745346_746325_746424_746936_747016_747718
908779	contig_4131_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_127855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	841	1152	134423	134112	NA	30	CTATCCTTAACAATGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG	135263	133856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_133900_135300
908780	contig_3948_pilon	-	3740	18	Intergenic	novelGene_53276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_15	120.457920979251	131	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	242	1738	1430935	1414309	TRUE	20	GCTAATGTCTCTTGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGILMAGILPFGAMFIELFFIFSAIWENQFYYLFGFLFLVFIILVVSCSQISIVMVYFQLCAEDYRWWWRNFLVSGGICVLRPGLCHLLFC	1458411	1409183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430942_1434911_1435012_1439634_1439749_1458390
908781	contig_12765_pilon	+	2108	8	Intergenic	novelGene_106553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	91.8379228948077	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	96	977	87118	206168	TRUE	45	TTAAAAAGAGGAATTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKKLKNLEGNELQRHADEFLSDLGHHERSIMTDLYYLSQTDGAGDWREKEAKDLTELVQRRITYLQNPVDCSKAKKLVCNINKGCGYGCQLHHVVYCFMIAYGTQRTLILESQNWRYATGGWETVFRPVSETCTDRSGISTGHWSGEVKDKNVQVVELPIVDSLHPRPPYLPLAIPEDLADRLIRVHGDPAVWWVSQFVKYLIRPQPWLEKEIEEATKKLGFQHPVIGVHVRRTDKVGTEAAFHPIEEYMVHVEEHFQLLARRMQVDKKRVYLATDDPSLLKEAKTKHSDRCWGFLDNQDYRCSQGTTSLEVKRQLRNSVPQL	74085	211795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_74174_87110_87226_132298_132537_191775_192023_197761_197939_198446_198544_206153_206305_210800
908782	contig_6325_pilon	-	3145	3	Intergenic	novelGene_143373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	2307	3143	531842	530605	FALSE	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVMVDCFKLRKIRVKFMVTTKKVNKHTHKKKKEKHKVSAKTKPTKTKEMKKKNPQTKVTQHKRVRRTKKTSAPQKKALQNDSSTRIVGDFNTPLSVKDRTIKKKFRKDTEDLKGTISQLDLIDIYRLLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIPNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNGKSKENKSITWKLNNTVLRHQWVIEEIIDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIERE	563388	530602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_531173_531573_533838_563077
908783	contig_5686_pilon	-	3157	2	Intergenic	novelGene_45369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGAGGTGTCCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138775	134268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_134705_136054
908784	contig_10861_pilon	+	3829	1	Intergenic	novelGene_39293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	2	706	1431167	1431871	NA	60	TAAAAATACATTGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFTASVGSLLLTAIDRYLCLHHPPAYKALLTQRRALVTLGITWVLSALVSYLPLMGWTCCPSPCSELFPLIPNNYLLGWLLFITTLFSGIIYTYGHVLWKAHQHVASLAEHQERQVPGMARMRLDVRLAKTLGVVLAVLLICWFPVLVLMAYSLFTKLSDQVKKVFTFCCILCLLNSMVNPVIYALRSGEIRSSAHHCLAHWKKYLPGLSPEGKEEAPRSSVTETEVDVKITQ	1431165	1434994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1431200_1435000
908785	contig_12050_pilon	-	3973	2	Intergenic	novelGene_62710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3512	3841	643528	643199	FALSE	20	TCCAGATTCACTTTTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRDSASASGWNPSSQCFPAKRLAAGSRGGRVGVKNGRGWESVYHKLPVVLSPAGSSVKLLSRTPYLLVSDRSPRWWIRAALDDTGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	647127	643066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_643770_643857
908786	SIRV7	-	2496	5	FSM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	36	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147916	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_114680_114989_147608
908787	contig_14483_pilon	-	1386	3	Intergenic	novelGene_133736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	803	1384	12105	11524	FALSE	25	TTTGTAATACTTGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKTNVYHNEKVNFHVECKDYVKKAKVKINPVQQTRPLLSQVHTDAAKENTCYCGAVAKRQEKKGMEPLQGHATPALPFKETQELLLSPVPQDGPGSIAAGESSSLSASTLVSDSSQKKEEHNYSLFVSDNMGEQPTKCSPEEDEEDEEDVDDEDHDEGFGSEHELSENEEEEEEEEDYEDDKDDDISDTFSEP	16617	11521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_-_12586_14075_14199_16418
908788	contig_3789_pilon	+	6666	4	Intergenic	novelGene_79865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	427	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	5343	5729	519821	520207	TRUE	65	CAAATTTTTAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALVSRAELYLVVFSGTGTLGTRLIFGGSCTEGMTCPSESWRSSTPPSRERISAASATKWAVPSTWFSAGASSGFLGTFLASAFGFPGFMMGVLLTEIPGSLSPHVGPPWVMEITWLVASMDCSNTV	499054	690862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_502707_518130_520877_599255_599322_690660
908789	contig_6065_pilon	-	6015	2	Intergenic	novelGene_132694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	182	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	34	1416	489679	487691	FALSE	35	TCATGAAAGCTACCAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHPAWQGPAVEMDGAGSEEPVPTRKPPPTYVPPPPHCLSCRRVERNNADSMSAHSMLCERIAIAKELIKRAESLSRSRKGGIEGGAKLCSKLKAELKFLQKVEAGKVAIKESHLQSTNLTHLRAIVESAENLEEVVSVLHVFGYTDTLGEKQTLVVDVVANGGHTWVKAIGRKAEALHNIWLGRGQYGDKSIIEQAEDFLQASHQQPVQYSNPHIIFAFYNSVSSPMAEKLKEMGIAVRGDIVAVNSLLDHPEELQQSESESDDEGPELLQVTRVDRANILASVAFPTEIKVNVCKRVNLDITTLITYVSALSYGGCHFIFKEKVLTEQAEQERKEQVLPQLETFMKDKELFACESAVKDFQSILDTLGGPGERERATMLIKRISVVPDQPSERALRLVASSKINSRSLTIFGTGDTLKAITMTANSGFVRAANNQGVKFSVFIHQPRALTESKEALATPLPKVYTTGREY	489712	483091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_488978_489583
908790	contig_7165_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_116837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATTAAGGACCTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263537	261794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_261800_263500
908791	contig_12410_pilon	-	4729	2	Intergenic	novelGene_167263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1454	1957	84920	84417	TRUE	40	AACAGCCAACATCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPKHKAKSYEVHRKKKIGLTLQALIHGINRIQTITINTQTPGDTLDNWDLLKIKHLCSSKDFDIRVKREPTDWKKIFGQYESDKGLSSIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKRAKGMNRYFTKENIQAANRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRLPSHLSITGMNQKHWK	86373	37141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_39642_84144
908792	contig_17427_pilon	-	3008	11	Intergenic	novelGene_30333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_3	1051.37491410058	5195	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	46	1344	188879	179167	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVGESFSLSQAVLVLEPERARTISPTLFLKILKGYTVDLFPFFSQITVRNSVWCSMTWWALWR	204706	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
908793	contig_1836_pilon	-	3249	1	Intergenic	novelGene_71064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	159	488	934234	933905	NA	35	AAAATGAAGCTGGACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLMARQLAQRPIASKSQIEAIILGFPRTPQPGFLFFHTTTLGRTGKRAIAQSEVPYLINIDTGSSDKIFLPTAICALGPLTFSSYSFSLAWKDAQHHLFITAIIFII	934392	931143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_931100_934400
908794	contig_8550_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_72363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTCGAAAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146096	144438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8550_pilon_-_144400_146100
908795	contig_4689_pilon	-	2430	5	Intergenic	novelGene_165397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.3451740597598	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCCCTCGGAGGTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091718	1084114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1085003_1085500_1086743_1087115_1087251_1090920_1091059_1091691
908796	contig_5317_pilon	+	492	1	Intergenic	novelGene_76564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43196	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_43200_43700
908797	contig_20241_pilon	+	2395	10	Intergenic	novelGene_159742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	44.6777211306944	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	155	937	239418	253563	FALSE	25	TTACATTACTTCTAGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADSWQECMDYAVTLARQAGEVVRDALKNEMNVMIKSSPADLVTVTDQKVEKMLISAIKAKYPSHSFIGEESVAAGEKSILTDNPTWIIDPIDGTTNFVHRFPFVAVSIGFVVNKKMEFGVVYSCVEDKMYTGRRGHGAFCDGQKLQVSQQEDITKSLLVTELGSSRTPETVRTVLSNMEKLLCIPVHGIRGVGTAAVNMCLVAAGGADAYYEMGIHCWDMAGGPFDLMSRRIIAASSRTLAERIAKEIQIVPFQRDDED	235256	255021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_235310_235947_236036_239404_239481_240085_240220_241925_242031_243723_243770_246679_246789_248322_248432_252525_252627_253447
908798	contig_8354_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_24086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTAGGCAGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163421	160391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_160400_163400
908799	contig_5826_pilon	-	754	1	Intergenic	novelGene_71521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAAGCCTTAAAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178511	177757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_-_177800_178500
908800	contig_13224_pilon	+	3077	4	Intergenic	novelGene_104137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2363	2716	417512	417865	FALSE	55	AAACTCAAAACTGTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGFYTFFCYSKKGLVALKRLDVLYKIILGRKPKGRFGKEQTVSVLRLVHCMMKVPPPTITTTHAFIDLRGPLQVSLGPARRYQVSWEFSALSPDYFFCLRVNVPYSVAWKPWWRSG	413007	418226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_413075_413525_415577_416141_416218_417343
908801	contig_13542_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_131549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGGGCCCCTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600073	600899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_600100_600900
908802	contig_5210_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_65429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCAGAGTTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465066	466857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_465100_466900
908803	contig_19330_pilon	+	2625	1	Intergenic	novelGene_163700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77569	80194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_77600_80200
908804	contig_10158_pilon	-	3267	4	Intergenic	novelGene_150764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	25.7207222984806	141	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	548	982	16257	7417	FALSE	25	AATGGGTTCTTTTAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIAYDITSHYPLPPRNVEWGEIRGFETAYCIDSMGKTNGGFVELGPCHRMGGNQLFRINEANQLMQYDQCLTKGPDGSKVMITHCNLNEFKEWQYFKNLHRFTHIPSGKCLDRSEVLHQVFISKCDSSKTTQKWEMNNIHTV	16804	5131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_7555_10794_10924_11648_11748_16188
908805	contig_12490_pilon	+	2114	4	Intergenic	novelGene_169050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	52.5124323903926	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	104	490	263270	267184	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGILLGLIAIFVATMGMKCMKCMEDDEVQKMRMAVIGGVIFLIAGLAVLIATAWYGNRIVQDFYNPMTPVNARYEFGQALFTGWAAASLCLLGGALLCCSCPQKTASYPTPRPYPKPTPSSGKDYV	253811	268808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12490_pilon_+_253901_263255_263409_264566_264652_267021
908806	contig_5643_pilon	+	1462	11	Intergenic	novelGene_38823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1983.98180687223	7	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	839	1264	237186	237983	FALSE	20	ACTGTACCCAGCCACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
908807	contig_5628_pilon	+	2241	2	Intergenic	novelGene_157584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418740	421041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_+_419458_419517
908808	contig_12050_pilon	-	2692	20	Intergenic	novelGene_62670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	169.534526509117	33	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	746	1507	467666	453328	TRUE	15	TATCCTGTCCTGTACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSFSVKPLKQKQIVDRVSYLLQEIYGIENKNTRETKPADDENSDNSNECVVCLSDLRDTLILPCRHLCLCNSCADTLRYQANNCPICRLPFRALLQIRAVRKKPGALSPVSFSPVLAQSVDHDEHSCPFKKSKSHPASLASKKPKRETSPDSVPPGYEPISLLEALNGLRAVSPAIPSAPLYEEITYSGGAQTPCPRPAARLLGSIRSQTAAIRRASHGTGLLTVPCGPHRPPSAKRTKRSSQRTRTPLPR	511565	446058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_446292_446563_446927_447026_447397_448651_448697_451585_451676_452504_452548_453286_453411_454853_455083_456700_456767_458809_458920_461651_461812_465467_465537_467621_467670_470434_470485_471184_471253_480730_480849_482304_482452_483764_483854_486362_486482_511414
908809	contig_11338_pilon	+	3418	16	Intergenic	novelGene_6180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	566.025700241017	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	446	2062	6086	11749	TRUE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	745	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_12920_13430
908810	contig_3153_pilon	-	7849	9	Intergenic	novelGene_104650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	885	233	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	5310	5858	160761	118797	TRUE	85	TAAAAAAAACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIRSVPEALIHGINRIQTVSNNTQTPEDKLDNWDILKIKHLSSSKDFSKRVKREPTDWEKIFGYDKSDKVLISKIYRKIQRLYSKKTYNPIKKWAKDMSRHFTKEDIQAANRHMRKCSRSVTISEMHMKTTMRYHLTPTSLALIKKTENDRCWRGYRDIGTLMCCWWECKMVQPFWKII	258651	108938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_109231_117097_119342_160757_161792_205363_205517_223316_223480_237198_237231_254276_254777_255051_255532_255700
908811	contig_6479_pilon	-	3777	1	Intergenic	novelGene_160614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAATTTCTGAGGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614289	610512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_610500_614300
908812	contig_5686_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_45367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1390	1695	131421	131116	NA	10	CTCCGCTCCTCTCCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVDDVSGQTQRLVQKGYRSKSNRGSQLIGIPGWGVRRKRGTFSEPDKPDRKQKGRNGCMLDNNGPNSHKMPTPVEKASYSIFGNGATIDTVLELQPNAWT	132810	130950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_131000_132800
908813	contig_17968_pilon	-	2539	1	Intergenic	novelGene_154545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	431	847	50466	50050	NA	45	TTAAAATTCCTAACTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPGRGSGRACLLQRSLPEGENKVGRPRTSHSLHCGCASVPGHPGPPTKRTPGLEGNLRQEGPDAAVLQSVCFDPPPHTSALTWLDHQYSTSKRNTVHSSAVFLKKKKKICAILYKGLEHPWILVSAGFLEPVPHRY	50896	48357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_48400_50900
908815	contig_4962_pilon	-	743	3	Intergenic	novelGene_107394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGCCTCCCTGTGCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457520	440470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_440988_441367_441465_457391
908816	contig_177_pilon	+	5641	1	Intergenic	novelGene_41771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	3366	3674	126739	127047	NA	40	CTAACTCCGGACCACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSRDAQVDSPRSSAVVALAGPARRYLKNRAQGLQASPLGLAEQGFWKQVSQDEAKMGTLQGKARQGKAGRLHSQHPKRHQAGSKSEIRLVLERETEDWG	123373	129014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_123400_129000
908817	contig_14525_pilon	+	985	3	Intergenic	novelGene_149763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	623	985	142184	145416	FALSE	25	CTCAGTGCCATCCTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIPYSKRFSQGSRGLLPTWFVYIASKALLNSIACSCFLESLNSTPSALVNFTFFLESKTFWSLLMVMMLFAITASNPTSVGLEFYYLIVKLQSLLCMTLKLQNIGHLTMNDGQFCLWVF	141561	145416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_142374_145156_145218_145304
908818	contig_6217_pilon	-	4024	8	Intergenic	novelGene_109702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_7	45.9160725050141	27	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	213	1232	1083143	1072616	TRUE	25	AGAACTGGTGTAATCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHRKKKPFIEKKKAVSFHLVHRSQRDPLAADETAPQRVLLPTQKVNDDERRAEQRKYGVFFDDDYDYLQHLKEPSGPLELIPTSSFSAHNWKDEKEEILVIPSTGIKLPSSVFASEFEEDVGLLNKAAPVSGPRLDFDPDIVAALDDDFDFDNPDNLLEDDFILQANQPTGEEEGMDIHKSEAEDGSEWEDVDDEKESGCDSDDYDSEGPLSNEGDMSALGRPHGAIKNDLFWEEETKSRFTEYSMTSSVMRRNEQLTLHDERFEKFYEQYDDDEIGALDNAELEGSIQVDSSRLQEVLKDYYKEKAEKYGDFFSLFRWFISFPHKVSSCTAKSKRIT	1083355	1069698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1070021_1070145_1072835_1074265_1074528_1074890_1075033_1076417_1076506_1080492_1080667_1081975_1082108_1083140
908819	contig_3382_pilon	-	1849	2	Intergenic	novelGene_123986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCTCCCTGGTCTCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65992	46153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_47579_65568
908821	contig_11088_pilon	+	2816	1	Intergenic	novelGene_85059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	564	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	2191	2619	17314	17742	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	15123	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_15100_17900
908822	contig_8773_pilon	-	3615	5	Intergenic	novelGene_74505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1060.68598086333	1	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	78	542	57648	5776	TRUE	20	GTATTCAGCATTTGTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSTLSRERKAPPVCTCSLGGPDMIPYFSANAVISQNAINQLISESFLTVKGAALFLPRGNGSSTPRISHRRNKHAGDLQQHLQAMFILLRPEDNIRLAVRLESTYQNRTRYMVVVSTNGRQDTEESVVLGMDFSSNDRYGTTKWKTGRPLFK	57725	2651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_3925_3975_5944_14036_14102_18933_19038_57520
908823	contig_19816_pilon	-	2053	8	Intergenic	novelGene_156472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	261.076030836902	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	7	1248	126795	117638	FALSE	50	AAGAAATTGAATTAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKEKPARSCPWSMHRHPQGDPQQEMSRHYGGNAQARHRILSPAIQSQEPLLRVPT	126801	116832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
908824	contig_5041_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_27116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	470	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	892	1317	607179	607604	NA	65	AAGAGCAACTGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKITTGCPEDSRQYQNIYKKQDRTFPIGVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLIHRIIQELKQKADKNEEKNRQIHGKRRQIHGKYRPKNGGIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTTIRNPKDKQQDFGNRQGHRRAEEQI	606287	610276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_606300_610300
908825	contig_6497_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_35567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATAAATACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169711	171757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_169700_171800
908826	contig_15039_pilon	-	2667	2	Intergenic	novelGene_110194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAGAAAAGGAGAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386908	382425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_382610_384425
908827	contig_16237_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_162669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	3	548	6589	7134	NA	65	CCACAGACACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSTWLTASGAAPGERHSLGRYSHHHSRNRSGSDQEWGRYHHSESEYGWVREKYYPDKTRWDKCRYYHDRYAPYTAWEGREWKLFNGDREYDKAGQYSKRLYKDYCKSRKGCELVAKEKDRHHFSSPRAGPPHALALYPEKYPHEKIALGAEEISCHLSDRFHEHEKRKVPETEIWRCGNE	6586	8403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_+_6600_8400
908828	contig_5566_pilon	+	2614	2	Intergenic	novelGene_153667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTTGATAATTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191725	208377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_194324_208361
908829	contig_17144_pilon	-	2382	16	Intergenic	novelGene_29288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2055.01339709069	234	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	132	2087	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWRDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183213	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170874_173347_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
908830	contig_10732_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_114708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCCACCCAGCATGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124403	125316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_124400_125300
908831	contig_3767_pilon	-	2319	10	Intergenic	novelGene_111139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	129.874678435657	460	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	23	1564	423659	377020	FALSE	20	GGTAGTTACTGAACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FACKILCMADRMAEQASGFVTPSGWFPPPELTPTLGPLGDTAPMRDNWMLWAMMRPPPPPPPSSSHPTAGSEPASETQPSREAQALPGAPPPFDAQLLAGAQPPFDAQSPLDSQPQLNVQPSWNYQASTSWYWRQSPDTFPQHQKSHNPPVKRSFFPRKYDANVNDFNFPPSRKQKKKKRKEPVFHFFCDTCDRGFKNQEKYDKHMSEHTKCPEVDCSFTAHEKIVHFHWKNMHAPGMKKIKLDTPEEIARWREERRKNYPTLANIERKKKLKLEKEKRGAVLTTTQYGKMKGMSRHSQMAEIKSLGTHHRWKNDRDGHRATIGLGSPSCESKPEGPPETNADPLGVLADNDSESDKEDRPLSTVIPKEVTPALCSLMNSYGSLSGSESEPEETPIKTEAEVLTENQVLLNSTHESPSHHVQETIRNFSEAKPKSPRKNFKKTNPKQKKYHNYQTLFKPRTHHPNLLEMLLAPDIRHERNVILQCVRYIIKKDFFGLTANSVKTEDVPACITEACKGVPS	423681	376264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3767_pilon_-_377176_378670_378901_384159_384277_395378_395573_399192_399286_416962_417040_417720_417784_418687_418787_420191_420275_423229
908832	contig_9571_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_136307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAATCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584394	583813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_583800_584400
908833	contig_9484_pilon	+	4299	6	Intergenic	novelGene_105656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_1	272.778738174367	368	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	70	561	126829	193563	FALSE	20	TGGCCCAGCATTCCCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNVSHTFLAFFFFFVMVTFSEILCRI	126759	197301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425
908834	contig_7806_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_157533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTTCCGTCAGTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210085	208079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_208100_210100
908835	contig_6102_pilon	-	1712	5	Intergenic	novelGene_32041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	167.847214751988	81	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	268	516	555780	555368	TRUE	5	CTGTTTTGTCTTTTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIHHVQALPSLRAAPTRRLTSRGHVELLATQVWVLLKAAGVLAPSSRFYGACSRENLEGWVWISLEWGSHGSAPERCLGARWSDPVTLKMKGWDWLALLLGALLGTAWARRSQDLHCGACRALVDELEWEIAQVDPKKTIQMGSFRINPDGSQSVVEVTVPPNKVAHPGCE	556885	553670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_553841_554182_554280_554438_555529_555692_555806_556643
908836	contig_10734_pilon	+	5903	24	Intergenic	novelGene_51223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	459.784304653055	25	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	2576	4438	1281807	1333513	FALSE	40	TAAATTCATATTATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDRDEFLIMHVNICSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198703	1334978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280237_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333251
908837	contig_13041_pilon	+	4992	1	Intergenic	novelGene_127727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACAAAACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263937	268929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13041_pilon_+_263900_268900
908838	contig_8303_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_154907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAAAAAATTTTAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22309	19899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_19900_22300
908839	contig_6102_pilon	-	3325	23	Intergenic	novelGene_31848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.208298895225265	476	15	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGCAAACCGTAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395264	370730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371192_372704_372746_372938_373074_373198_373272_373402_373476_373632_373725_373902_373955_374378_374502_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375730_375966_376037_376205_376292_378875_379020_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
908840	contig_7909_pilon	-	2799	1	Intergenic	novelGene_155889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	586	1761	151	1911	371406	369646	NA	25	TTTGTTTAAAGTCGAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKHKETNNSNAQNLNAEEGGEEQDEDILPLTLEEKENKEYLKSLFEILILMGKQNIPLDGHEAEEIPEGLFTPDNFQALLECRINSGEEVLRKRFETTAVNTLFCSKTQQKQMLEICESCIREETLREVRDSHFFSIITDDVVDIAGEEHLPVLVRFVDESHNLREEFVGFLPYEADAEILAVKFHTTITEKWGLNMEYCRGQAYIVSSGFSSKMKVVASRLLEKYPQAIYTLCSSCALNMWLAKSVPVMGVSVALGTIEEVCSFFHRSPQLLLELDSVISVLFQNNEERGNELKEICHSQWTGRHDAFEILVDLLQALVLCLDGINNDTNIRWNNCIAGGAFVLCSAVTDFDFIVTIVVLKNVLSFTRAFGKNLQGQTSDVFFAASSLTAVLHSLNEVMENIEVYHEFWFEEATNLATKLDIQMKLPGKFRRAQQGNVDSQLTSESYYKETLSVPTVEHIIQELKDIFSEQHLKALKCLSLVPSVMGQLKFNTSEEHHADMYRSDLPNPDTLSAELHCWRIKWKHRGKDIELPSTIYEALHLPDIKFFPNVYALLKVLCILPVMKVANERYENGRKRLRAYLRNTLTDQRSSNLALLNINFDIKHDLDLMVDTYIKLYTTKSELPTGNSETTENT	371556	368757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_368800_371600
908841	contig_1244_pilon	-	3373	3	Intergenic	novelGene_38043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2987	junction_1	142	97	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	79	525	948448	946257	FALSE	50	GAAGTCAATATGTAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRPRVAGFCAWLYLGSPPFATAAVSMAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVRPALLPTASSVTELFPFLLLAFSLLSLQRSSPLLLEVNCSVQQNDCLNVSMLLNLTGSN	948526	943408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_946620_947578_947655_948440
908842	contig_10863_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_59340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	389	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGTTGTGGCTGAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115077	113437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_-_113400_115100
908843	contig_11316_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_122697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTAGGTCGGTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140702	139860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139900_140700
908844	contig_5019_pilon	+	2647	2	Intergenic	novelGene_109192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1302	1637	119214	119549	FALSE	65	ATAACAATGAAAAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKRQTMMASASSRNKESRNRPEEDNFLELLEVEYKRLIYRTIQEIRKEIIQNAEQAKEHTDKAIEELKIIEEHGDKFNRLQESIERQQTEIQEITIKFQK	117867	120559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_118892_118936
908845	contig_13074_pilon	-	521	1	Intergenic	novelGene_153451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATGATCATATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554799	554278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_554300_554800
908846	contig_9807_pilon	+	3226	13	Intergenic	novelGene_32837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	513.826244680264	19	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	161	1783	109130	154326	FALSE	30	TAAGCACACATTTGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSVSGPQPPFSAGGTWRAAT	108969	155769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095
908847	contig_15929_pilon	+	3114	4	Intergenic	novelGene_172463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	356.617753655398	92	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	237	644	87340	89891	FALSE	25	AGGAGTGACCTGAAGTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKIPNNGNLKMAYPLGLFVCLFIYVAYIKWHWASATQAFFSITEAAAGARRGQQAHSPTGTAGHGHEVFYGIMFDAGSTGTRIHIFQFAQQPRETPTLTHETFRALKPGLSAYADDVEKVTRFSEVYLFIKFVL	82253	92361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_82313_83363_83512_87310_87623_89766
908848	contig_17796_pilon	+	2425	7	Intergenic	novelGene_33800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_6	147.083593012046	104	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	133	1074	53527	96917	FALSE	75	AAAAAAAAAAACAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLVISCLYFIKIL	53394	98268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831
908849	contig_13093_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_105208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	325	978	2335	3312	20490	21467	NA	5	GGGGCGGGTGTCTGGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGKTLQVSKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTTTVVKTALYWYNNRCIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFNKGPKSINWGKYSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTETNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTLLGALIHGINRIRTISNSAQAPEERLDNWKLLKIKHLRSSKVFTKRVKRQPTDGEKILATTQSHQRLISKIYKILQNLNNKKINNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKQCSRSLTIREMQIKTTKRYHFTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHFGGNVKWYNHFGNRFGTSLKN	18155	21853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_18200_21900
908850	contig_7025_pilon	-	2698	19	Intergenic	novelGene_104382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	779.883785660275	28	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	149	2035	95047	59373	TRUE	25	AAGCCAATATTTTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSSVLQPVTEGAPPCGSDKEQPNLSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGISRNT	95195	49041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59389_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_94786
908851	contig_1694_pilon	-	1859	3	Intergenic	novelGene_144919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.5	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATAGTTTTATTTATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419715	414398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_415199_415254_416167_419568
908852	contig_6576_pilon	-	4492	9	Intergenic	novelGene_42372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	163.690256276909	376	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	11	607	1263257	1255976	TRUE	30	GCTATAAGATGTGGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSMSLDMGQPSQANTKKLLGTRKSFDHLISDTKAPKRQEMESGITTPPKMRRVAETDYEMETQRISSSQQHPHLRKVSVSESNVLLDEEVLTDPKIQALLLTVLATLVKYTTDEFDQRILYEYLAEASVVFPKVFPVVHNLLDSKINTLVWCTMKNPHHSTKHLTCKVLVLMACGDLQDPFQSKHKSQTMLSLLLSFLMP	1263267	1238306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1242030_1255813_1256031_1257211_1257259_1257592_1257648_1257702_1257736_1258873_1258975_1259161_1259293_1259666_1259790_1263205
908853	contig_10082_pilon	-	2612	11	Intergenic	novelGene_63893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	34.8390585406667	149	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	193	1464	430676	404694	FALSE	5	TTTGCCTGTTGTGTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKVKWVTDIEKSVLINNFEKRGWIQVTENEDWNFYWMSVQTIRNVFSVETGYRLSDDQIVNHFPNHYELTRKDLMVKNIKRYRKELEKEGSPLAEKDENGKYLYLDFVPVTYMLPADYNLFVEEFRKSPSSTWIMKPCGKAQGKGIFLINKLSQIKKWSRDSKTSSFVSQSSKEAYVISLYINNPLLIGGRKFDLRLYVLVSTYRPLRCYMYKLGFCRFCTVKYTPSTSELDNMFVHLTNVAIQKHGDDYNHIHGGKWTVSNLRLYLESTRGKEVTSKLFDEIHWIIVQSLKAVAPVMNNDKHCFECYGYDIIIDDRLKPWLIEVNASPSLTSSTANDRILKYNLINDTLNIAVPNGEIPDCKWNKSPPKEVLGNYEILYDEELAQGDGADRELRSRPGQSLGPKGSRSRDSGRTVLTTWK	441237	403545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_404824_408234_408399_413696_413784_417888_418033_421696_421806_422060_422196_423662_423844_424711_424921_430563_430681_434677_434752_441123
908854	contig_5779_pilon	+	4760	3	Intergenic	novelGene_106450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAAACAAGAAACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98500	120672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_99354_99552_102575_119787
908855	contig_10930_pilon	-	6770	1	Intergenic	novelGene_37045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	1247	1729	274400	273918	NA	50	CTCGAAGGCAAATAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSDRKAGSDGFCCYFKKSCLPSAGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVISAQVKSLV	275646	268876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268900_275600
908856	contig_6164_pilon	-	3519	2	Intergenic	novelGene_121283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	221	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	350	877	569414	568887	FALSE	20	GAACTGACCTTGTTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPSVPPTAPPPGPPAPFPPSGPSCPPPGGPYPAPTVPGPGPTGPYPTPNMPFPELPRPYGAPTDPAAAGPLGPWGSMSSGPWAPGMGGQYPTPNMPYPSPGPYSAPPPPQAPGAAPPVPWGTVPPGTWGPPAPYPAPAGSYPTPGLYPTPSNPFQVPSGPSGAPPMPGGPHVSA	580097	566244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_569629_579962
908857	contig_9239_pilon	-	5320	1	Intergenic	novelGene_137195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	541	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3358	3714	230817	230461	NA	25	GATCCATCAATATGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPTTLFFWLLFLSRLSLLSHTQPSSTHHNLTLLLPPACLHHVLNIALLSSTGMAYRNLPCTDPQLALSTPVCATNNPSQPIHSGWTCPLEKEGKNTMSTDKQTTKNAQPAYTEITK	234174	228854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_228900_234200
908858	contig_11551_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_168473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAACAAGAAAGATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457771	459709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_457800_459700
908859	contig_2867_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_135197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTTTCGCTTCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876726	874427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_874400_876700
908860	contig_8538_pilon	-	2035	2	Intergenic	novelGene_4630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	170	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGTTCCCTAATGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828208	825485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_827405_828092
908861	scaffold_15027_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_163578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	751	1368	116031	115414	NA	15	ATGTATGTCTCCTCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSCLMILSVFSVFFPCPGTPITRKFLLLILSHIILRVSSFSLFSFEFSSNRAVSKYLSSTPLILSSTVSNLLLSPSMTLSISEILLFNFWISNCCFCIISSYEFILAFCCCIIFLNSSIFLPEFSMNLSIFSSFLSGFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGILIWMPTGTILSSFCKCFDSV	116781	113967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_114000_116800
908862	contig_2010_pilon	-	4430	9	Intergenic	novelGene_176265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	53.1807060878285	389	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	2003	3370	156008	149263	FALSE	15	TTTTTAGAGTTGTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGKLRTHICCLNCRSTSQKVEAFTDLSLAFCPSSSLENLSFQDPVSLPNAQDDGLMQASISGPSEEPVVYNPATAAFVCDSVVNERTIGSLPGELRCTENTSVPNESSKILVNKDVSQKPGGETTPSVTDLLNYFLAPEILTGDNQYYCENCASLQNAEKTMQITEEPEYLILTLLRFSYDQKYHVRRKILDNVSLPLILELPVKRTTSLSSLSESWSIDVDFTDISENLAKKLKPSGSEEACRPKLVPYLLNSVVVHSGVSSESGHYYSYARNITGTESAYQMCHHQSETLALASSQSHLLGKDSPTAVIGQDLENKEMSKEWFLFNDSRVTFTSFQSVQKITSRFPKDTAYVLLYKKQNSTNGLNGNNTTSGVWLSGDPPLQKELMDAITKDNKLYLQEQELNARARALQAASASCSFRPNGFDDNDPPGSCGPTGGGGGGGFSTVGRLVF	186866	148202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_-_149425_154802_156169_157367_157468_161136_161237_165254_165449_167411_167571_171573_171676_176916_177047_185809
908863	contig_6842_pilon	-	4360	11	Intergenic	novelGene_130786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	28	junction_10	184.538369993885	265	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	74	1552	1498855	1387659	FALSE	30	TTTATTGCTCAAATTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNQEAEAEEARTEEAELPQSQKNEMDDVPFFDVQLPYELAINIFQYLSRKDLGRCAQVSKTWKVIAEDEVLWYRLCQQEGHLPESSISDYSCWKLIFQECRAKEHMLRTNWKNRKGAVSELEHIPDAVLCDVHSHNGVVIAGYTSGDVRVWDTRTWDYIAPFLESEYEEDELGMQPYVSFVRINSSLAVAAYEDGILNIWDLRTGRYPIHRFEHDARIQALALSQEDATVATASAFDVIMLCPNEEGYWHIAAEFEVQKLVDYLEIVPDTGRYPVAIATAGDLVYLLKAEDSARTLHYVYGQPVTCLDVSANQVAFGVKSLGWVYEGNKILVCSLEAERCISKLGNALGDFTCVNLQDSPPNLMISGNMDRRVRIHDLRTDKIALSLSAHQLGVSSVQMDDWKIVSGGEEGLVTVWDYRMNQKLWEVHSRHPVRHIAFNSHSLITANVPYERVVRNADLDNFTTHRRHRGLIHAYEFAVDQLAFQSTLPICRLSYDTMAGYNYDLALTFPYDTIRE	1534068	1384850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1387810_1388540_1388652_1391177_1391352_1406472_1406601_1431918_1432126_1435587_1435785_1462705_1462864_1478928_1479018_1483247_1483413_1498756_1498862_1534001
908865	contig_12644_pilon	-	2782	1	Intergenic	novelGene_44584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1155	1493	2079828	2079490	NA	55	CACTCAGCTAATAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYTPRSGIAGLNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLILASNAGVRWYLIVVLICISLMASDPEHFLMCLLAI	2080982	2078200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2078200_2081000
908866	contig_2733_pilon	-	7308	1	Intergenic	novelGene_128563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGAGAAGTTAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587672	580364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_580400_587700
908867	contig_17144_pilon	-	2598	15	Intergenic	novelGene_29451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1936.9457982892	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	868	2310	172736	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183223	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173283_174676_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
908868	contig_641_pilon	+	2888	5	Intergenic	novelGene_170135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	14.0178457688762	18	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1948	2301	33475	45324	FALSE	35	AATCTCCTGTGTAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILVDLKNDVWYQKCHDPVCKAENFKSDCFPLPPEVCLLRLFKDEEEFTREDETVETKNNETKNPHKPSSIKLSKGVPSNDDWDNGTDDAYFLEAIEDAELAEAAENSLLSYSSISG	31450	45911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_33291_33367_33477_39359_39443_39526_39574_45102
908869	contig_12638_pilon	+	3118	16	Intergenic	novelGene_33129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_10	609.651681973677	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	978	1706	182987	194329	TRUE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAGKNRQIVL	176353	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_176961_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194303_194442_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
908870	contig_9653_pilon	-	3612	1	Intergenic	novelGene_48338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCATCCATATCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1075132	1071520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1071500_1075100
908871	contig_15320_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_176598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTGGAAATCGGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159045	161030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15320_pilon_+_159000_161000
908872	contig_14953_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_137296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGTCATACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404986	403556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_403600_405000
908873	contig_12837_pilon	+	3991	2	Intergenic	novelGene_57408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1215	1625	488587	489458	FALSE	35	GAATTTAGTCATTCATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPKYLIVLMQNLYIDQEAVIPTEQGDIVWFKIRKGVYQGGILSPYLFNLYAEQIIPEAGLYEEECGIRIGGRLINKLRYAGDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYRLHLNIKKTKYPHNWTNKQHHDKKRKH	487372	491824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_488859_489319
908874	contig_7045_pilon	-	2762	2	Intergenic	novelGene_77466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1610	1963	380901	380548	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFGPNPPEVKENEEHQSHKESRSPTDRKGHINQRLHQPETRRTKWCRATTNDRPDREHNRQSLMEQEKTGVQNSNSSKKTRLNSAAETGQPQKAWPPDCQPRTKNHSQGQFFRQD	382510	379703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_380254_380298
908875	contig_15991_pilon	+	1881	4	Intergenic	novelGene_70945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	428	907	122851	127359	TRUE	25	GGGAGAAAGGTGTGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDSSFERLLELEPGLISLPEWGTEGSVSAWVPDCTSSYSRMVTGAVPSRSGFEAHLGHHLFVDCPCHRRHQGSAEGPGDPALEEATQPVVFKNECSCLANPPTFHRGKLHMSFDNVCGLSDQGGQNTSKYSTAEVHKGNQDRIQLVLGHYVFGLVVKH	122423	129611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_123123_124817_124986_127319_127491_128768
908876	contig_8620_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_173888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCTATGATAAAGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164203	162020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_162000_164200
908877	contig_6241_pilon	-	2716	2	Intergenic	novelGene_156443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAATAAAAATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582626	429122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_429257_580044
908878	contig_9414_pilon	-	1896	4	Intergenic	novelGene_131087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.9938250421547	82	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGCCGTTTTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545552	534370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_535678_536009_536242_536363_536452_545283
908879	contig_16322_pilon	-	1303	12	Intergenic	novelGene_87534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	166.375856481145	33	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	21	683	108570	81605	TRUE	10	TCATTTTTGGCTTTAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALAVIKNSP	108590	77570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81628_89867_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
908880	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
908881	contig_12919_pilon	-	4555	2	Intergenic	novelGene_75908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3039	3377	736784	736446	FALSE	45	ACATATATACAACATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLAIGDEELRSICVWAIISHGYNTSNIVLKIFTVFILRLLASDAVTSSSSTCWIACLNHETLDISVKYTAMVVITGTRGQEILTGFGCPLTKDFYFNITYICMQCHRHSS	740344	735267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_739657_740178
908882	contig_3382_pilon	-	3604	8	Intergenic	novelGene_124108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	351	junction_7	671.227173442306	304	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	346	1323	725157	677147	FALSE	25	GGACACCAGCATCTAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRY	725502	674865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_677346_687631_687724_689133_689311_692725_692870_694303_694415_696445_696545_712955_713051_725096
908883	contig_6446_pilon	-	5443	2	Intergenic	novelGene_149169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	3888	4451	110481	109872	FALSE	15	ACGGTCTATCTTTGGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLPRIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYDLAIPLLGIYPREIRVITQTDICTPKLTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLRYIHTMEYYATRKNSDEPVKHPITWMKLEDIMLSEIGQSQKDKYCMRPLL	114368	108879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_110432_110477
908884	contig_7207_pilon	-	1720	7	Intergenic	novelGene_72077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_6	214.214391569651	19	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	726	1448	696514	675867	TRUE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGRYKKNNTPDTTSKIIVILFTIV	758020	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_757787
908885	contig_9389_pilon	-	3471	5	Intergenic	novelGene_84160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGACCCACGCGGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2003651	1971267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1971333_1973882_1974133_1999041_1999169_2000262_2000323_2000682
908886	contig_1379_pilon	-	9837	3	Intergenic	novelGene_134594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	160.5	425	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAATAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458377	448044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_454309_454565_454621_454859
908887	contig_1107_pilon	-	859	4	Intergenic	novelGene_126566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	403.054173364657	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	221	535	497901	496767	TRUE	10	CTTGCTGCTCACCTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKKKLNFILLLKALLLSSYGKLLLIPAVIWEHDYTPLCLKLIKVFVLTSNFQAIRVTLNINRKLSLLAILSGLLLESTMVYFFQRMEWDIGSDCAIYKSQDF	511630	489826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_490147_496762_496910_497729_497955_511463
908888	contig_753_pilon	-	3460	1	Intergenic	novelGene_112889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244608	241148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_241100_244600
908889	contig_5586_pilon	-	2928	2	Intergenic	novelGene_143544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTATCACTGGCCTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346477	341297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_342485_344736
908890	contig_14415_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_77602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCACCAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29752	28207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_28200_29800
908891	contig_7935_pilon	+	2563	4	Intergenic	novelGene_171796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	2.82842712474619	120	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	11	790	5180	9673	FALSE	15	GACTCTTACCTCGTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAWVRFSAQSQARERLCRAAQYACSLLGHALQRHGASPELQKQIRQLEGHLSLGRKLLRLGNSANALESAKRAVHLSDVVLRFCITVSHLNRALYFACDNVLWAGKSGLAPHVDQEKWAQRSFRYYLFSLIMNLSRDAYEIRLLMEQEPSACSRRLKGSRGGIPEGMETGGPGEPGTPGGGLPQLALKLRLQILLLAQVLRGHPPLLLDVVRNACDLFIPLDKLGLCHCGPGIVGLCGLVSSILSILTLICPWLRLKP	5169	11446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7935_pilon_+_5236_6153_6270_6672_6875_9267
908892	contig_10437_pilon	-	2259	3	Intergenic	novelGene_38267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	79	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGATCTGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422161	405045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_406582_406674_406844_421607
908893	contig_6027_pilon	+	1808	5	Intergenic	novelGene_74458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	28.4824507372522	43	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	652	1512	335806	337400	FALSE	20	TACAATATTTGTCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNVRDQFNSHIQLVRNGAKLSSLPQIPTPTLPPPPSETDFMLQMFQPNPSLPPRMPFSIGQVTMPMVMPSADPRSLSFPILTPALSQPNQPSPPLPGSHGRNSPGLGSLVGPHGPHMPPAASIPPPPGLGGVKASTESPRPQPVDKLEKILDKLLARFPQCNKAQMTNILQQIKTARTTMAGLTMEELVQLVAARLAEHERVAASTQPLGRIRALFPAPLAQISTPVFLPSAQVSYPGRSSHVRLFFFENWNMEKGGVGLQVKCRKKPSSHQLSCLQPHLGKCK	335154	337696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_335824_336016_336116_336309_336687_336820_336954_337166
908894	contig_6137_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_59178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACACATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1260119	1258263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1258300_1260100
908895	contig_15182_pilon	-	3139	12	Intergenic	novelGene_136436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	26.2653339707501	332	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	124	1683	658646	248833	FALSE	80	GTTAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAMRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPREFKMVPSILGSPFWKVYSASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRYHPQETLKEFVQLVCPDAGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSAEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQQTQSWYLG	658769	247376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_248851_282913_283006_306829_306996_309310_309490_329676_329731_332396_332526_359304_359433_367659_367778_387446_387522_450766_450833_647577_648110_658643
908896	contig_13456_pilon	+	4165	17	Intergenic	novelGene_153269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_14	83.895559142007	348	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	1541	3556	95216	128542	FALSE	20	ATCATGTCTTTCTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDKNWNPGTFLPDTISGSDLLGATLSETRPDALPPPSSSDTPAVSDNKEKKNAAKKKCLYNFQDAFMEANKVVMATSSATSSVSCTATTVQSSNSQFKVSSKRPPSIGEVFHGISKDDHRHSAPTAPRSSPTGLAPLPSLSPAALSPASTPHLANLTAPSFPKTATPAPGFVDACKSFCAAPVAPPAPTTDGSLSAPPSVCSDPDCEGHRCENGVYDPQQDDGDESADEDSCSEHSSSTSTSTNQKEGKYCDCCYCEFFGHGGPPAAPTSRNYAEMREKLRLRLTKRKEEQPKKADQISERESVVDHRKVEDLLQFINSSETKPVSSTRAAKRARHKQRKLEEKARLEAAAREREHLHVLEEQRRREEEEEEERLQEELRRLQELQQLRAVKKKKKDRPGKDCPKLDMLARNFQTATELVPSSENIPNGSLEHTEEPETSSRSPSRHVNHAEPRPGPDEDAAEPAGTRDSRLLLRKEVNGKAPEPLSFLFDIMHHHKEGSGKAKLRQSSKASPKATEAPPRARPQTDAKAKAVDLTSLPEQKREEKKVNSNNNNKKQLNHIKEEKATPVPTEPASPGECPQNGKLILADSPQPKGKSKKNKKKKGDRANNSIDDVFLPKDIDLDSVDMDETEREVEYFKRFCLDSARQTRQRLSINWSNFSLKKATFAAH	45734	129151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_45834_52306_52432_66662_66811_68608_68687_69797_69911_70045_70289_72855_73010_73130_73311_79795_80049_95068_95268_96315_96589_97749_98033_98639_98824_100454_100686_104399_105217_119364_119447_128448
908898	contig_11117_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_148599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAATTTCTATTTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94286	97181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_94300_97200
908899	contig_10990_pilon	-	1891	2	Intergenic	novelGene_7472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1010	1498	710709	710221	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	711718	709753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_709972_710045
908900	contig_5605_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_143955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	1158	1706	484434	484982	NA	85	CCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYEAFDRQRKLKGSVNVFVDIPFGEVVLFWITENNSLIWPLLSWNMCPKKMPFEMNAGQTDCALKLFLLSYKKACAWLHLLSGFVQTSRTIDWLLSLGGRSSLNHSGLCWVVVPVVICLVLVPGKLPGSVAGRRKNMSNVLKIVWLCLKTKTRLSLRNSRPSKIFIAIKQSNCLWLGPCLL	483276	485753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_483300_485800
908901	contig_7088_pilon	-	5129	1	Intergenic	novelGene_159800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGGCCAAAGATAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724897	719768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_719800_724900
908902	contig_8354_pilon	+	4608	3	Intergenic	novelGene_24099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1516	1989	193068	193541	TRUE	15	CCTGAGAGTATGGCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTIQILPLCTHASYTTVLGSCTWQVLPTAYVAKPLPRAFLLGKSITARHSCSWEEQKRYACGDQKASRSFKLHKNRSEGTHKSQMQMELNCDVKPGAKRDTAAISRGIRYAKKLQDVKLVGLVLSSHIIWSRVNFTKDSDYFTSQVWGICCTSPKG	191552	199053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_195066_197616_197813_198154
908903	contig_9940_pilon	-	4430	1	Intergenic	novelGene_125351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAAAAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225689	221259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9940_pilon_-_221300_225700
908904	contig_10182_pilon	-	5020	3	Intergenic	novelGene_134628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1420	2007	385722	385135	TRUE	40	ATTCCTCTATACCAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGNFLELLEVEYKRLIYRTLQDIRKEFMQNAEQAKEHTDKAIEELKKIRKEHNHKCNRLQESIERQQSEIQKINNKTSELDNSIGSHRSRIEVMEVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEETLRIMWDWSTRTGEVTENTERILEDLLAENFPDIMKDEKIPIQDAHRTLHKVDPKRQSPRHNQTCQNER	387686	382073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_383320_383367_386802_387346
908905	contig_20527_pilon	-	3599	5	Intergenic	novelGene_138609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGTAGCTAACACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28951	22186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_23738_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308
908906	contig_16722_pilon	+	8201	24	Intergenic	novelGene_118275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	750	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4492	4953	132317	136747	TRUE	35	CCATGGACAGAACCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVADVAAVLVAEFDWPCLTHVAKVWWKFLFCWNVTVAGDPTLVVSTILAPGATEPLMGATITFCAGETVLVVLFVGEVVEAAITVGFCCSNRFLACCSTACAFSFSTLSANALISHNSNSSSATQVSIITGPVCLGVSGLFGRSALDRRPFL	89820	165030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_91909_96291_96481_103887_103972_105710_105905_109688_109999_115772_115997_116286_116368_121587_122080_122766_122990_125205_125419_130772_130882_131815_131970_132186_132351_132713_132961_136189_136233_136609_136761_143790_143925_144487_144606_148847_151156_152222_152398_155147_155290_155908_156034_164406_164543_164933
908907	contig_6098_pilon	-	4105	1	Intergenic	novelGene_145466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCCTAGCTGTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33905	29800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_29800_33900
908908	contig_14353_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_82118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGCTGTATCTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138466	136050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_136000_138500
908909	contig_16722_pilon	+	896	7	Intergenic	novelGene_118287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCAGCTAAGGATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125338	144573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_125419_131812_131970_132711_132961_136189_136233_136609_136757_143790_143925_144487
908911	contig_3575_pilon	+	3528	15	Intergenic	novelGene_141101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3071	3406	397922	400168	FALSE	80	GATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGVTNFRSSEAGEKCSSHSAWIFLRKVSVNNKNFLCSSSCSCLMYFCSSLTIIPATLSAHQGPRTTNTARQSDSICFEIKVESLSFECTDMLQSLIKLSASSNSISSLS	376930	400290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_377867_379072_379249_379798_379905_380155_380339_381294_381449_381650_381867_382096_382273_382845_382985_383782_383859_384617_384752_387107_387263_387868_388108_390074_390212_397678_398152_400062
908912	contig_7563_pilon	+	2138	3	Intergenic	novelGene_145553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	212	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95399	101916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_+_95486_98743_98925_100045
908913	contig_5791_pilon	-	3873	6	Intergenic	novelGene_35871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	180	junction_5	286.365500715432	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	1937	3274	1088908	1083684	FALSE	35	CAAGCAAGGATCAGACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSELKYDFSCELYRISTYSTFPTGVPISERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKQGDNAIEKHKKLYPSCSFMQSLSSVNGLGATSQPAFSSSVINSTHSFLPSLENTGYFSGSYSSFSSNPVNSSANQAFSALRTSPYSCAMNTEKARLLTFQMWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWELKDDAMSEHLRHFPTCPFLENQLQESSRYTVSNLSMQTQAARFKTFCNWPSSVPVHPEQLASAGFYYLGHSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEYLIRIKGQEFISQVQASYPHLLEQLLSTSDTPEDENAESPIIRFGPVENHPEDAVMMNTRVVKAALEMGFSRRLVKQTVQSKILMTGENYKTVSDLVLDLLNAEDEMREEEKERATEEKESGMYIYLYSPCFHKDLISLCVSY	1094468	1083084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1083995_1084899_1084949_1085704_1085784_1087900_1088001_1088109_1090729_1094352
908914	contig_678_pilon	-	3003	7	Intergenic	novelGene_167774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	342	junction_5	312.170225998573	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	52	954	22702	16487	FALSE	20	TTATCTCTGTCTAGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLKEGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNVSFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQRAKSMEGFQDLLNIRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS	22753	14437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_16579_17500_17635_19596_19782_19988_20097_20705_20838_21641_21812_22620
908915	contig_4508_pilon	-	2499	3	Intergenic	novelGene_177535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	399	312	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	131	1051	95472	91206	FALSE	30	ACTTTCAAGAAGTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRHQNRSFPLPGVQSSGQVHAYGNCTDSDVLEEDAEVYELRSRGKEKVRRSTSRDRLDDIIVLTKDIQEGDTLNAIALQYCCTVADIKRVNNLISDQDFFALRSIKIPVKKFSSLTETLYPPKGRQASRPSSVQFAPEQQEIVPANDSLSSSESAGSFLKEVDRDIEQIVKCTDTKRENLNEVVSALTAQQIRFEPDNKNTQRKDPYYGADWGIGWWTAVVIMLIVGIITPVFYLLYYEILAKVDVSHHSTVDSSHLHSGITPPSQQREMENGIAPTKGIHLGQQDDHKLYSQDSQAPAAQHKT	102426	89757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_91872_95217_95489_102312
908916	contig_15135_pilon	-	4417	39	Intergenic	novelGene_119866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	487.488288090012	1	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1448	4347	40	4386	122783	49421	FALSE	35	GGAAGTGAGTGATCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGTLQGRRSTELTDLGLDSLDNSIACECAPEETESSESSLHPDFAKYLAETEETVKMTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSRFSPLYRQEASKISTEDLLKLVSDYRRADRVSKTQTIPGSLDIAVDNVPSEHPNCVTSSFIPVKPFNVTAQPEPTVEVEEFVYDSSKYCRPYRVYKNQIYIYPRHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDEEGAKPMKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHVLFSFYHVTCDINAKANSKKKEAPETSVGYAWLPLKRHDQIASQEYNIPVATSLPPNYLSFQDSASGKHNTSDIKWVDGGKPLFKVSTFVVSTVNSQDPHVNEFFKQCQEREKDTSQSPTSNFILSCKNLLNVEKIHAIMSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEISTPVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRTYKERTIHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQYLIDTNKIELSRAQRFPDSYHHELDTLVMVLCDHVIWKYKDAVEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGFVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQELCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESIQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDIRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYKEPEKHSQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFAVNTSNQGSRDDLSTNGGFQTQTTVKHNSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRVSLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISEETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHTTTSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTILDLLSLFTQVHQRQLQQSDCQNSMMKRVFDTYMLFFQVNQSAAALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGGCYVLHPYSCPHRGIPEKKGLLENGKDLHTIPAPGGCPPL	122822	49389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_49485_49803_49862_51692_51898_53360_53472_54019_54203_55059_55198_57048_57162_58967_59093_62133_62236_62839_62888_63101_63169_63261_63377_63466_63589_64779_64889_65955_66073_66198_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92251_94677_94797_95329_95423_95825_95913_96510_96633_96824_96949_98619_98713_100999_101066_101588_101777_103604_103685_105120_105206_113411_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
908917	contig_6215_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_21177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACACGCTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191955	194333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_192000_194300
908918	contig_15114_pilon	-	1848	8	Intergenic	novelGene_121116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.301786386765	19	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	42	1142	125261	100551	TRUE	55	AGAAAATAACAAACCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125302	91543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_92035_100335_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123705_125212
908919	contig_12102_pilon	-	4942	3	Intergenic	novelGene_151052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCCATACAAAAATTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48005	40126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_-_41260_42653_43442_44984
908920	contig_6084_pilon	+	2907	7	Intergenic	novelGene_127062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTCACCTATGTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430136	438119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_431399_433032_433099_433811_433891_435337_436473_436606_436732_437314_437459_438023
908921	contig_7963_pilon	-	3521	10	Intergenic	novelGene_58472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	605.383155887326	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1847	2686	123098	121251	TRUE	85	AAAAGGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKT	129542	120292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_121257_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563_126910_129471
908922	contig_14970_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_45145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTTGCCCCAGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294999	293160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_293200_295000
908923	contig_10331_pilon	+	2871	2	Intergenic	novelGene_54079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1494	1802	101210	101518	FALSE	45	TTCACCTGAAGTACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSQCTNTLKNNSEQKDKIQKIHKEKSTTTTSCCHVNKEHHIYRIISYRETRVKAANTTMRLLRVSRQEKMSMTWNTVVSVKMGRSRLRGRYFGERINKTY	96942	102587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_97060_99833
908924	contig_10044_pilon	+	2880	5	Intergenic	novelGene_156380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_4	26.5612499705869	263	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	562	2226	134865	136529	FALSE	25	TGCCTTCTTGGAAACAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKECCEHNALENIVHQHKNHFPLRENHGMVDLHDKAVTSNVTLINQTKSYEIKNSAELNRVEKTVLHANPEQFGTESKFLESWISNTTKSQYIKHQKTHKIEKPHVCSECGKGFIRKSFLTNHQIIHTGEKPHKCSLCGKAFSKKVKLAEHYQTTHKGQNPYKCMECGKAYLYESGLAKHQKTHRGEKPYVCSECGIGFFENADFIIHQQIHTEEKLYICSECGKAFSKKYKLIAHHERIHKRQKHECPECGRAFLYNSQLSKHQKRHMAEKPYICSECGKGFIEKSALIIHQRIHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLVIHQRTHTGEKPYMCGECGKGFSHKSCLIGHQRFHTGRSPFVCSECGKPYSKKSGLISHQKIHTGEKPFQCSECGKAFNTKPKLIVHQRSHTGETPYGCNECGKTFAYTSSFYLHKRKHTSEKRVESIKMEDSSTPSHSSSHTKDFMQEKSPVNTVTMQIPSVTVQPSVNISGLPTNGNIVLVGQPVARCEPSGDNREFPQERNLMNAVNVVVPMSAVNGVVPSVMNYILFYATQNL	112298	137183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_112365_117085_117296_131338_131466_131718_131815_134802
908925	contig_302_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_145012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGATTTACATATGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80711	82161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_+_80700_82200
908926	contig_12540_pilon	+	2336	1	Intergenic	novelGene_148138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTCAAGTGGTTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309276	1311612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1309300_1311600
908929	contig_15123_pilon	-	2163	5	Intergenic	novelGene_110933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	67.1137094787645	638	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1183	1647	320397	319343	TRUE	5	TTTTTCCCTTTGTCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEVSGSSRWGWCGAQGGPRLCSNFEGPASGPRAFWVKAKKRNYRRWALRPVEGWSLVPSTKVLQNMYQPARPEVGSTGELGGQSLTPERGCKWASP	321838	318650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_318978_319153_319688_320277_320408_320544_321683_321804
908930	contig_2323_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_151858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTTCTCTTTGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153446	155430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_153400_155400
908931	contig_10238_pilon	-	3363	1	Intergenic	novelGene_170086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	263	792	389	1180	11164	10373	NA	50	GCAGGAAGGAGGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMPLLHPTPPSQLLSVIFLLHSNRAPQKACVTGPKMKGLRKGRPWADTDSAPGQTTALGPAEKPSAAGVAPALPCHQCSMWPSPNPSLQQVGLVLYRLQEEKDHTACRHSWSSHPRTLGKSPTSLRLSSLNCKMGVRRTTPTLQSHQDGYSPKNRKRKQQVWRGCGKIRKLVRFSYFRKLSCRSSISETELPYDLAIPLLGRLPKDVKVEIQAGTCTLMFTVALFTIAKRWKQPKCPPTDEWTNKMWRIHTIEYYLAIKKNY	11552	8189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10238_pilon_-_8200_11600
908932	contig_5816_pilon	-	4077	10	Intergenic	novelGene_158246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	25.5941737197172	304	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	392	2089	274086	210202	FALSE	10	CTTGAAGTGGTCTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEDFKQEEGDGARAQEPTLHADPIDSAHPSMSADPSASVHLSVSAHPSVSTHHSVSAHPSASIHPSASIHPSVSIHPSVSIHPSVSAYPSALARPSALSQPSDSGPEDFSVIKVSKRRWAVVLVFSCYSMCNAFQWIQYGSINNIFMNFYGVSAFAIDWLSMCYMLTYIPLLLPVAWLLEKFGLRTIALTGSALNCLGAWVKLGSLQPHLFPVTVLGQVICSVAQVFILGMPSRIASVWFGANEVSTACSLAVFGNQLGIAIGFLVPPVLVPNIEDRDELAYHISIMFYLIGGVATLLFILVMIVFKEKPKYPPSRAQSLSYALSSPDASYLSSIVRLFKNLNFVLLVITYGLNAGAFYALSTLLNRMVILHYPGEEVNAGRIGLTIILAGMLGAMISGIWLDKSKTYKETTLVVYIMALVGMVVYTLTLNLGHLWVVFITAGTLGFFMTGYLPLGFEFAVELTYPESEGISSGLLNVSAQVFGIIFTISQGQIIDNYGTIPGNIFLCVFLMLGVALTAFIRADLRRQKANKETPEIKPQEEEEEEEESNTSKVPATVSEERL	274477	208213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_210283_216552_216609_217187_217300_217423_217530_218822_218934_222453_222558_224102_224171_233195_233337_237302_237445_273309
908933	contig_6217_pilon	+	6964	35	Intergenic	novelGene_109560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	5833	6321	327944	345472	TRUE	35	CCAGCTGAATGTTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSLYTLFHVVFTVLKLSEIFSLSCKLRLLSESISNSVLFSHLSLSACTSISWVKSVSSRRFSSSSVVDVFCTAFSAFVIQQIISSSLFLYSITCLRSSFSLGCLAFTSAVTALQRWFRPASLSFKKLPLVEESFCTMLSPVPFRAAKLGWWLLMPSSSSC	3179	362577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_5292_14514_14638_15847_15955_19067_19314_20103_20259_35610_35678_36836_36903_42748_42886_64252_64365_70115_70286_71928_72084_77517_77603_83604_83808_90245_90321_91968_92031_105314_105376_108515_108593_113323_113472_118466_118739_147384_147512_184779_184940_198858_199027_292486_292681_314485_314641_317038_317247_322169_322286_324846_325065_327890_327962_330455_330607_338219_338356_344067_344247_345467_345617_350467_350641_355044_355236_362442
908934	contig_3270_pilon	+	1000	6	Intergenic	novelGene_104489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_5	67.8781260790249	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	425	937	324502	338530	FALSE	25	CTTCAACTGTCGAGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	324077	338593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337728_338428
908935	contig_6102_pilon	+	2000	13	Intergenic	novelGene_31917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	351.463240926021	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	356	1246	379014	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRVPSLPALMLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	375665	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_380908_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
908936	contig_10953_pilon	+	3598	7	Intergenic	novelGene_42517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	201.872071702188	223	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	28	642	126980	144801	TRUE	70	AAAAAAAAAAAATGCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLS	126952	148115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_146743_147100
908937	contig_9771_pilon	-	3663	25	Intergenic	novelGene_156926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_12	35.4549792773251	161	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	1999	3447	495683	449898	FALSE	65	ATGGTTAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPGAPLGLALKKKNIPQPTNALKSFNWSKLPENKLEGTVWTEVDDSKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQKEADAIDDTLSSKFKVKELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMDEQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDIDLLEEHKHELDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSSALRQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVEKKYPKVLNLNEELQDIPEAAKVNMTELDKEISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGDKFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTKAVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQAVSEAKQENENMRKKKEEEERRARMEAQLKEQRERERKMRKAKENSEEGGEFDDLVSALRSGEVFDKDLSKLKRNRKRITNQMTDSSRERPVTKLNF	628800	449681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_450108_451212_451384_455036_455169_458394_458456_460179_460288_465945_466115_467002_467092_469257_469365_478192_478278_486565_486673_495140_495249_495581_495887_496502_496691_499955_500015_500297_500437_500869_500988_501378_501446_502642_502747_502858_502970_503716_504051_506012_506108_512259_512332_541177_541268_564979_565200_628602
908938	contig_854_pilon	+	2287	10	Intergenic	novelGene_36665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3098.53581112749	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	18	662	1710001	1713086	TRUE	20	GTTGCAGCTGTCACCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKA	1699278	1716326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712427_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715108_1715226
908939	scaffold_12124_pilon	-	1955	11	Intergenic	novelGene_22229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGCCGGAGGGCGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509577	1473570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473668_1486527_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1509067_1509225
908940	contig_14976_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_139969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCGCAGCAAAATCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30355	29709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14976_pilon_-_29700_30400
908941	contig_12120_pilon	+	2317	4	Intergenic	novelGene_21417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	651	1163	222249	222761	TRUE	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNNCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIKAVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSKDEWINKLWYIHTTEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLS	53510	238843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_54121_222208_223121_224785_224885_238147
908942	contig_5836_pilon	-	2427	2	Intergenic	novelGene_106288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125006	122142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_-_123451_123887
908943	contig_7333_pilon	-	6294	47	Intergenic	novelGene_142744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_17	55.9035930886991	281	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1753	5262	101	5362	170084	41089	FALSE	85	TGAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEEGGAERMEVSTELPQGPQQLASWWDQQADFYTAFMHRLAQLVPEIYFSEMDPDLEKQEESVQMSIFTPLEWYLFGEDPDVCLEKLKHSGAFQLCGKVFKSGETTYSCRDCAIDPTCVLCMDCFQNSAHKNHRYKMHTSTGGGFCDCGDTEAWKTGPFCVSHEPGRADTTKENSRCPLNEEVIVQARKIFPSVIKYIVEMTIWEEEKELPPELQIREKSERYYCVLFNDEHHSYDHVIYSLQRALDCELSEAQLHTTAIDKEGRRAVKAGAYAACQEAKEDIKSHSENVSQHPLHVEVLHSEVMAHQKFALRLGSWMNKIMSYSSDFRQIFCQACLREEPGSQNPCLISRLMLWDAKLYKGARKILHELIFSSFFMEMEYKKLFTMEFVKYYKQLQKEYISDDHDRSISVTALSVQMFTVPTLARHLIEEQNVISVITETLLEVLPEYLDRNNKFNFQGYSQDKLGRVYAVICDLKYVLISKPTAWTERLRVQFLEGFRSFLRILTCMQGMEEIRRQVGQHIEVDPDWEAAIAIQMQLKNILLMFQEWCACDEELLLVAYKECHKAVMRCSTNFLSGSKTVVQLCGHTLATKSYRVSEDLVSIHLPLSRTLAGLHVRLSRLGAVSRLHEFVPFEDFQVEVLVEYPLRCLVLVAQVVAEMWRRNGLSLISQVFYYQDVKCREEMYDKDIIMLQIGASLMDPNMFLLLVLQRYELVDAFNKSISTKDQDLIKQYNTLIEEMLQVLIYIVGERYVPGVGNVTKEEVTMREIIHLLCIEPMPHSAIAKNLPENENNETGLENVINKVATFKKPGVSGHGVYELKDESLKDFNMYFYHYSKTQHSKAEHMQKKRRKQENKDEALPPPPPPEFCPAFSKVVNLLNCDIMVYILRTIFERAVDTDSNLWTEGMLQMAFHILALGLLEEQQQLQKAPEEEVTFDFYHKASRLGSSAMNAQNVQMLLEKLKGIPQLEGQKDMITWILQMFDTVKRLREKSCLIVATTSGSESIKSDEITHDKEKAERKRKAEAARLHRQKIMAQMSALQKNFIETHKLMYDNTSEMPGKEDSIMEEESTPAVSDNCRIALGPKRGPSVTEKEVLTCILCQEEQEVKIENNAMVLSACVQKSTALTQHRGKPIELSGETLDPLFMDPDLAYGTYTGSCGHVMHAVCWQKYFEAVQLSSQQRIHVDLFDLENGEYLCPLCKSLCNTVIPIIPLQPQKINSENAEAVAQLLTLARWIQTVLARISGYNMKHAKGENPAIPILFNQGMGDSTFEFHSILSFGVQSSIKYSNSIKEMVILFATTIYRIGLKVPPDETDPRIPMMTWSTCAFTLQAIENLLGDEGKPLFGALQNRQHNGLKALMQFAVAQRITCPQVLIQKHLVRLLSVVLPNLKSEDTPCLLSIDLFHVLVGAVLAFPSLYWDDTVDLQPSSISSSYNHLYLFHLITMAHMLQILLTIDTGLPLAQVQEDSEEARSAASFFEEVSRLTSGCIGCGIPGWCLWVSLKNGITPYLRCAALFFHYLLGVTPPEELFANSAEGEYNALCSYLSLPTNLFLLFQEYWETVRPLLQRWCSDPALLNCLKQKSSVVRYPRKRNSLIELPDDYSCLLNQASHFRCPRSADDERKHPVLCLFCGAILCSQNACCQEMVNGEEVGACIFHALHCGAGVCIFLKIRECRVVLVEGKARGCAYPAPYLDEYGETDPGLKRGNPLHLSHERYRKLHLVWQQHCIIEEIARSQETNQMLFGFNWQLL	170184	40156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_41231_42221_42324_43178_43350_48483_48562_50657_50715_51142_51252_52507_52642_53508_53597_55282_55434_56481_56550_60048_60146_62498_62555_65943_66093_67174_67269_69865_69964_74058_74209_75170_75265_76684_76891_80004_80187_82208_82296_86400_86511_87642_87743_89314_89470_89856_89906_91540_91644_92739_92793_94694_94820_100047_100112_101606_101709_101975_102042_103024_103136_108095_108158_109748_109930_113624_113754_116956_117057_121505_121664_122522_122622_124171_124261_125089_125198_125537_125662_125898_125962_132524_132664_135310_135442_149685_149797_151937_152017_156508_156766_170003
908944	contig_5605_pilon	+	2051	10	Intergenic	novelGene_143940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_1	17.0170575280681	45	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	633	1433	417967	484951	FALSE	45	AAGTATGTAACAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMETIESQQDGSVTASVAENESAHMQTQTGPNSIPTLAQVSVAGSGTGRGSPAVTVVQLPSGQTVHVIQTPQPSVIQSPQIQSVQVTTITETDESAESEGIIDCHKRREILSRRPSYRKILNELSSDVSGVPKIEEEKSEEEGTPPNIATMAVPTSIYQTSTGQYTTTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKAE	390761	485569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391019_398213_398373_405195_405311_406429_406527_417962_418087_446169_446308_450591_450690_450828_450972_472975_473133_484806
908945	contig_7870_pilon	-	3070	1	Intergenic	novelGene_109027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTAGATGAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573722	570652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_570700_573700
908946	contig_20026_pilon	+	2342	4	Intergenic	novelGene_175413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	16.4991582276861	52	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTGAAACAAAATGAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19571	137437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_+_19710_86483_87310_95321_96269_137006
908948	contig_13740_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_34773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAATGTCATAAAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767037	764825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_764800_767000
908949	contig_12150_pilon	-	3151	1	Intergenic	novelGene_6959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAGTGGTCAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61308	58157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12150_pilon_-_58200_61300
908950	contig_18364_pilon	+	782	7	Intergenic	novelGene_102542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	845.733097509032	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	48	566	16504	32528	TRUE	20	CTGGAGCAACCCCAGGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQEPQFRLCVRVGKMAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSRFAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQKKPGYHAPVALLNDIPQSTEQYDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGGKTPDPKMNARTYMDVMREQHLTKEEREKLGNN	16456	35722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_16532_27319_27487_29080_29186_29563_29679_31509_31590_32504_32678_35655
908951	contig_960_pilon	-	2246	14	Intergenic	novelGene_108237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_11	446.99182577279	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	582	2096	478844	441887	FALSE	80	AAAAAGAAAAAAAAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVEDRFRKTNQSSPEAQSKQTGRVLEPPVPSRSESFSNGNSESVHPALQRPAEPQVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPAGEVVSPMSEEFCIRPTSQLPFKLSFSSAYVSCLSSTCCFFLFYNFKTKLLLQLFLTHKICYVNFFLITEYIF	490104	441736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_442106_442977_443076_443776_443929_445281_445389_449139_449302_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_484616_484672_487135_487267_489758
908952	contig_10976_pilon	-	3266	1	Intergenic	novelGene_155595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193942	190676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_190700_193900
908953	contig_4857_pilon	+	3477	3	Intergenic	novelGene_48777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTACCCTGTTTAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218821	1228404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1220240_1226257_1226317_1226404
908954	contig_854_pilon	+	479	2	Intergenic	novelGene_36746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAATAAAGAGTACCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715556	1716382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715565_1715911
908955	contig_8248_pilon	+	2933	1	Intergenic	novelGene_125025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	217	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATCAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123462	126395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_+_123500_126400
908956	contig_18487_pilon	+	2223	16	Intergenic	novelGene_172671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_10	39.347793951998	261	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	6	1913	196640	210098	TRUE	20	CCTCCACGAAACTGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMASLYVGDLHSDVTEAMLYEKFSPAGPVLSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPIRIMWSQRDPSLRKSGVGNVFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYAFVHFETQEAADKAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGAKAKEFTNVYIKNFGEEVDDESLKELFSQFGKTLSVKVMRDPSGKSKGFGFVSYEKHEDANKAVEEMNGKEISGKVIFVGRAQKKVERQAELKRKFEQLKQERISRYQGVNLYIKNLDDTIDDEKLRKEFSPFGSITSAKVMLEDGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVGSKPLYVALAQRKEERKAHLTNQYMQRVAGMRTLPASAILNQFQPAAGGYFVPAVPQAQGRPPYYTPNQLAQMRPNPRWQQGGRPQGFQGMPSAIRQSGPRPTLRHLAPTGSECPDRLAMDFGGAGAAQQGLTDSCQSGGVPPAVQNLAPRAAVAAAAPRAVAPYKYASSVRSPHPVMQPLQAPQPAVHVQGQEPLTASMLAAAPPQEQKQMLGERLFPLIQTMHSNLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHHAKKEAAQKVGAVAAATS	196634	211431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_196806_199297_199492_200490_200607_201851_201992_202356_202452_203123_203262_204011_204108_206117_206391_206751_206840_207019_207092_207594_207682_207774_207903_209065_209160_209271_209403_210008_210112_211134
908957	contig_2854_pilon	-	2556	7	Intergenic	novelGene_120877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	333.346874724946	61	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	917	1516	1130219	1076098	FALSE	30	TAAAAAATTCTTTTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPDAVIFPPAFLRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDEVPFPQILQY	1132528	1075057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1130167_1131046_1132438
908958	contig_4418_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_98376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTCGAGAACGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794157	795616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_794200_795600
908959	contig_1450_pilon	+	2891	21	Intergenic	novelGene_27365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	513.251427177753	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	131	2695	244426	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244295	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315836_322526_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
908960	contig_7272_pilon	-	3863	22	Intergenic	novelGene_25348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_19	674.116749747586	1116	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	866	3280	610206	593320	FALSE	25	ATAGTTGCTGAAGTGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	633277	592736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610248_611629_611658_616565_616614_617510_617709_617857_618005_620502_620568_632105_632194_633027
908961	contig_1867_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_54584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGCTGAAGGCACCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484187	485436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_484200_485400
908962	contig_20641_pilon	+	1749	7	Intergenic	novelGene_52798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	1379	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	66	1457	14599	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14533	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
908963	contig_10324_pilon	-	2157	2	Intergenic	novelGene_7873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	977	1591	509878	509264	FALSE	15	CCTGATGTTTTCAATCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKILNDSGSIKRKWKEYTEALYQKELVDIQPFQEVVCDQEPMILKEEVSALKALAKNKAPGTDGILTEMFQQTDVTLEALTCLCQEIWKRTTWPSDWKGSILVPISKKGDPTECGNYQTISLILHASKILLKIIQKRFQQYIDRELEEIQIRFIRGHGTRDIITDVKWILAESRQYQKDVYLCFIDYAKTIDCADHEKLWVTL	515142	508697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_510718_515005
908965	contig_12250_pilon	+	3505	21	Intergenic	novelGene_80664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	12	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2137	2559	388071	388973	TRUE	50	GAACAGGAAGTACTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPESWESTTKLGGWASRGRSHIAHSTAADSFSKVQLWQAHWPRASSGSGPPAPWGLSTPSPNPLQPRGRSQATQSTAQGLFRMVQAAQCQGRRALAGSGERRALSPRASREVDWGRGGAGADKLGIRLGAWGVPGSVWRR	381216	390682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_381362_381453_381621_381916_382014_382741_382807_382956_383065_383334_383454_383568_383684_384737_384830_384920_385018_385097_385275_386482_386697_386798_386978_387085_387336_387594_387887_388051_388442_388921_389097_389341_389421_389500_389567_389790_389937_390064_390213_390298
908966	contig_5549_pilon	+	1716	11	Intergenic	novelGene_81687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	257	junction_2	139.418219756243	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	252	1715	830033	907961	FALSE	40	GTAAGAAATTGAACTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRASLQKVSGSSDSVAMLNSEEFVLVPQHADDASTKEDEKPQLKIVSNGDEQLEKAMEEILRDSEKGQSSLLVGCQNSSEISDDSFGDVSARQTNKPPLQLILDPSNTEISAPRPSSPGGLTEEDSVLFNKLTYLGCMKVSSPRNELEALRAMATMKSSSQYPFPVTLYVPNVPEGSVRIIDQSSNVEIASFPIYKVLFCARGHDGTTESDCFAFTESSHGSEEFQIHVFSCEIKEAVSRILYSFCTAFKRSSRQVSDVKDSVIPTPDSDVFTFSVSLEVKEDDGKGNFSPVPKDRDKFYFKLKQGIEKKVVITVQQLSNKELAIERCFGMLLSPGRNVKNSDMHLLDMESMGKSSDGRAYVITGMWNPNAPIFLALNEETPKDKRVYMTVAVDMVVTEVVEPVRFLLETVVRVYPANERFWYFSRKTFTETFFMRLKQSEGKGHTSTGDAIYEVVSLQRESEKEEPLTPTSGGGPMSPQEDEPEE	752355	907962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_752561_829986_830171_831598_831792_842368_842580_844247_844423_852661_852820_854423_854535_875991_876059_882459_882563_887200_887368_907820
908967	contig_2783_pilon	+	4006	2	Intergenic	novelGene_119644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2316	2621	388739	389044	FALSE	15	CCTTTAGGTCTTCTATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLVFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMPLISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGNPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	385996	390429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_386493_386919
908968	contig_9049_pilon	+	3810	3	Intergenic	novelGene_83158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2425.5	62	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTTATGTTACTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108343	115100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_108724_111558_112874_112985
908969	contig_5321_pilon	-	3597	1	Intergenic	novelGene_153866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	636	2960	3595	25544	24909	NA	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSRDSKTCSCRTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELAPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHI	28503	24906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_24900_28500
908971	contig_11417_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_103259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268419	266162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_266200_268400
908972	contig_6175_pilon	-	3808	15	Intergenic	novelGene_16346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	236	junction_14	371.924531515275	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	442	2115	1719629	1683544	FALSE	30	CGGGAACCAGCAGTTAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTSSINGDLIELNSIGVILDMFFKYTWNNFLHTQVEICVALILASPFENTENGTLTDRDTTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCVVHSTDKGPNSTSVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVGFIRLCLYSFCALSLCLFIQKDVKDLPFGPVAVDQGSIHVCLLAREVSIHNILSNSSSQLLITCLGQQ	1793678	1681850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1683840_1685585_1685702_1688442_1688508_1689437_1689588_1691807_1691961_1693918_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719717_1746007_1746156_1770748_1770887_1793610
908973	contig_6453_pilon	-	3365	3	Intergenic	novelGene_177421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_2	9.5	200	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	187	375	34263	25056	FALSE	40	AAACAAACTGGGAGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESYCGPCPKNWICYKNNCYQFFNESKSWYKSRASCESQNSSLLKIYNREDQDFFKLVKSYHWMGLVRIPTNGSWQWEDGSLVLPNQLTIVEMRNGSCVVYGSSFKGYTEDCLTPYTYICMQRIV	36240	22065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6453_pilon_-_25174_34192_34297_36087
908974	contig_17311_pilon	-	3077	1	Intergenic	novelGene_57873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	355	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	69	326	207729	207472	NA	25	CCAGCCACTCTGTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCKLLRPWELHKELGGRTEVLNMLSGQLTGMSHETMTLKLQTKEPNPMRCLVVHKQPLQLFFGHCCKYIYHTMFANLTLFTSDNLLAVITIIGCATPPLINLVFPSP	207797	204720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_204700_207800
908975	contig_15371_pilon	+	4043	2	Intergenic	novelGene_151471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2002	junction_1	0	177	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3252	3584	216320	216652	FALSE	60	AATATTAGAATAGTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDSKYHDGKSREIDGHGFPYLADETGTRGSRGEFSCHSHSAVKRKSQTWDSRILLLHRIQLISWTIFPERRTTLLLF	212170	217111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_215338_216235
908976	contig_13021_pilon	+	2353	6	Intergenic	novelGene_8214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4031.36714279412	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	16	504	177637	178956	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGAVFVARPRHDNRRTRGGWRTSDRLAASSRLER	177621	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_178855_180113_180456
908977	contig_3018_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_78941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTACCAGCTCTGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680474	682683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_680500_682700
908978	contig_6375_pilon	-	2687	7	Intergenic	novelGene_73016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	36.4451642882838	47	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1157	1852	397099	395248	FALSE	40	ATTCATTCAACATATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNVHNHITNDKRFNGSESIKSSWNISVVKFLLEKLKQELVTSPHNYTDKELKGACVAYFLTKRREYRNSLNPFKGLKEKEDKKLRSRRYRLFANRSSIMRHFGPEDQHLWKDVTEELMSDEEDSLNEPGVWVARPPRFRAQRLTELCYHLDANSKHGTKANRVYGPPSDRLPSAEVQLLPPELYNPNFQEEEDEGGDENGLVSPSFDQPHKTFCPDLNSFIEIKVEKDE	408310	394412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_395668_395950_396064_396709_396814_397040_397103_401503_401825_407409_407621_407689
908979	contig_4091_pilon	+	3788	3	Intergenic	novelGene_173007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	162	99	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTACATAGTGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10820	24540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21118_21311_21414
908980	contig_16846_pilon	+	2007	15	Intergenic	novelGene_82869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_4	277.055113135069	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	982	1776	211075	228852	FALSE	15	ACCTTTCTCCTTTAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHTRNCLHRRAYQHKVGNIIETMITDAFLKADPYIEITGAQGKKFHISTAIDDMEAFTKLTDNIFLEILYSTDPKLDIAREILKKIESRKLYKYVGQTQPMGQEKIKKENYESLPQEVADAKPGPDVLLQAELKAEDFIVDVINMDYGMEDKNPIDHVRFYCKNDPNKAIRITKDQVSQLLPERFAEQLIRVYCKKTDNKSLYAAQQHFVQWCVIRGFTKPQDGDVIAPLITPRKQQWNCPDLAQSSTHHQEAPKPRVRLFKD	179165	229083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304_205461_206857_206967_211053_211146_211718_211835_217177_217318_218698_218798_224514_224620_225189_225328_228726
908981	contig_7078_pilon	-	4245	3	Intergenic	novelGene_130206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	576	1403	968635	967808	TRUE	15	TGTAATCCCCCTGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFITTLIQHVLEVLARAIGLEKEINGIQIGRVEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIDFSKVSGYKINIQKSVAFLYTNKENLKEEITKSIQFTVAPKKIKYLGINLAREVNDLYNENYKALLQETRRDLHKWKNIPYSWIGRLNIVKMSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	969210	951295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951555_963631_963733_965325
908982	contig_6361_pilon	+	4878	6	Intergenic	novelGene_23956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	341	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1002	1475	390196	390669	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKTRVVLLKDSTGKIVNDARSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYDREPMILKGEVQVALKALVKNKAPRIDGIPVEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	389194	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_391118_405272_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
908983	contig_299_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_129482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399198	1398241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1398200_1399200
908984	contig_12951_pilon	-	1702	6	Intergenic	novelGene_68176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_5	72.2672816701998	103	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	16	831	366870	337718	FALSE	15	GAGTCTACTTACCCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRVAMADTEDGPGQQPELDEDGGAACPRWGAQHAGARELAALYSPGKRFQEWCCVILCFSLIAHNLVHLLLLARWEHTPLVMLGVVAGALVADFLSGVVHWGADTWGSVELPIVGKAFIRPFREHHIDPTAITRHDFVETNGDNCLVTLLPLLNMAYKFCTQSPEALEQLYPWESFVFCVMIFGTFTNQIHKWSHTYFGLPPWVTLLQDWHVILPRKHHRIHHISPHETYFCITTGWLNYPLEKIGFWRRLEDIIQGLTGEKPRADDMKWAQKIK	366885	336846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_337840_340198_340412_341610_341756_343216_343309_357719_357840_366746
908985	contig_10324_pilon	-	7145	3	Intergenic	novelGene_7736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	18	394	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	6742	7095	158137	157784	TRUE	45	CTAGATAACTAAGACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEHPTHSELKSLLKFTFQTKFSQVYKTITNVRSMLLSLLKYMRANGQFLPKSKTRRQKGQENWTNGHGETEVEKRGGCCHIAGITTNATKRFVYKFFHEKLTCTVNFHLKHNKII	166977	61261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_61300_157771_164091_166189
908986	contig_7695_pilon	-	2675	3	Intergenic	novelGene_41579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	70.5	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	16	2025	397040	388811	FALSE	20	TTGCAGTTTGGAAACCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	397055	388160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793_391259_396703
908987	contig_1535_pilon	-	4346	1	Intergenic	novelGene_127226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTAATAAAATCTCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51206	46860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_46900_51200
908988	contig_12079_pilon	-	3696	4	Intergenic	novelGene_67378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	962	1270	503972	503664	TRUE	70	AAAAAAGGGAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPCLIPYEETNSKWIKDLNVQTKTIKFLEEQARAMLSGLAFNSGLSNIKKAQTAKEKINKWNLVKIKKFAIKRLYQKSEKTSYHLGEYPWKSCIQESNN	504933	369441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_370986_412647_412815_502248_502779_503478
908990	contig_5210_pilon	-	2509	4	Intergenic	novelGene_65427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAAGATGGCCCCGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467077	459126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_459345_460037_460240_463034_463204_465157
908991	contig_854_pilon	+	4251	24	Intergenic	novelGene_36520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	3154.82146145962	25	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	164	2206	1649514	1702551	TRUE	30	TAGAATTCCAAGTCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKV	1612782	1716009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709609_1715130
908992	contig_4180_pilon	-	2044	7	Intergenic	novelGene_8360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGGCTGAAGTAGCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889331	865767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_865879_870552_870716_875180_875393_882871_882924_886076_886187_886317_886467_888084
908993	SIRV6	+	1019	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	74	435	24	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	184	675	1733	10736	TRUE	20	GCCTAATCGTTTACATTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1161	11390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
908994	contig_11338_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_6318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAACAATAAGACTAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248612	246054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_246100_248600
908995	scaffold_13505_pilon	+	2162	1	Intergenic	novelGene_111574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACAGCCACTTCTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611443	613605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_611400_613600
908996	contig_14441_pilon	+	1460	6	Intergenic	novelGene_100327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	455.459065120017	577	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	872	1420	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	5707	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6905_121150_121239_125517_125902_126159_126283_126514
908997	contig_3986_pilon	+	3963	2	Intergenic	novelGene_52727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGGAAAATAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137144	162373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_139566_160831
908998	contig_16532_pilon	+	1775	1	Intergenic	novelGene_110064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGAAGCAAAACTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582234	584009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_582200_584000
909000	contig_14467_pilon	+	794	3	Intergenic	novelGene_138253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	61	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	115	585	318578	319525	FALSE	0	GGCCCTGGCTCCTCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQVLLPIVVPQVRGSQPS	306513	319734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_318998_319474
909001	contig_9633_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_139659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGTGCCACACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221374	1219267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1219300_1221400
909002	contig_151_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_132571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACAATTTAAAAAGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223372	221984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_222000_223400
909003	contig_9863_pilon	+	2736	6	Intergenic	novelGene_153983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	132.718649782161	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	71	676	5445	20574	TRUE	45	TCAATACATGAATGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTDSRAAGALLARASTLHLQTGNLLNWGRLRKKCPSTHSEELRDCIQKTLNEWSAQISPELVREFPDVLECTVSHAIEKINPDEREEMKVSAKLFIVGSNSSSSTRNAVDMACSVLGVAHLDSVIIASPPIEDGVHLSLEHLQPYWEELEYLVQSKKIVAIGTSDLDKTQLEQLYQWAQVKGSQVVSSPGKEPGSAIFAG	5374	31114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_+_5571_13883_13950_15250_15336_18204_18265_20305_21947_30426
909004	contig_14683_pilon	+	3552	2	Intergenic	novelGene_166041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	0	202	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	623	1012	154163	154552	FALSE	20	CTTCTGGTTGAAACTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSSSRIPPPSDVRGRDTPPLAVNFAILPPSLSTPPSALSLPQGSSVRLSPLLLSSCGLGVRTMAERPGASFRLFRALESQQTRQARSRVKAPGAAAAERKAASTAVRACRSVRTARPHSTEWGADQE	138099	157092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_138421_153861
909005	contig_9036_pilon	+	4053	1	Intergenic	novelGene_155470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	808	1173	215109	215474	NA	80	TCGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPLNLSSPPITQGDPARMPTPSHQLWTLPATCYSNRGTQQGPQAPSHHLQTPGHSHLLPRPQGDLSWTPSHFPPMQDPSPLSQDPLQTSAAPLQPPARFMLQTNDPTPPFPSCWTFPAAP	214301	218354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_214300_218400
909006	contig_756_pilon	+	5390	4	Intergenic	novelGene_134770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	265.757199128996	214	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	256	2334	177389	190518	FALSE	35	AGTGGTCAGATTAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFLEDPSVLTKEKLKSELIANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLAASANSKGPPDFSSDEEREPTPVFGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRLEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYGVNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEGKKKEHKKVKSTRDFVPFSELPTTPSGGFFQGISFPEISTRPPLGRTELQATKKVHTSKGDPPREPVTSTALPGRGQLEKLASGGNLFISSKSSHDRCLEKNSSPSQHQPAAVLVSAAASPSVIKETTTTSYKEIVENICCGEKSGIQPLSTGRPRISDQSILSIEREELEESERSQVISPPLAQAIRDYVSSLLVQGGVGTLPGTSHSIPPLNIENIRKRIDRSSFQETESLSPPRKFPRRSEKSVEGRDSGSFVTFQNIPGNESISSFAKTVVSHSLTTLGIEISKQSQHDKIDDPELSFPLHESILKVIEEEWQQIDRRLPSLACKYPVSSREAPRILSVPKVDDEILGFISEATPPAGIEAASTEACDKQLDLALCRTYEAAASAMQIATHTAFVVRAVQADISQAAQILSSDPSKMHQALGILSKTYDAASYLCEAAFDEVKMAARTMGSSTVGRRYLWLKDCKINPTSKNKLAVIPFKGGTLFGGEVCKIIKKRGNKH	177133	193574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_177668_186009_186137_187913_188073_189004
909007	contig_16098_pilon	-	1526	11	Intergenic	novelGene_45974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1410.39946114567	14	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	118	1401	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349448_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
909008	contig_15112_pilon	+	3389	1	Intergenic	novelGene_124764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2713	3066	29852	30205	NA	10	TCTTCCACGACTTTGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTLPLLDLGFPISIHSAFLSPPAFSFLPLGWCAHSVSYTWLNYVYYCFMGLSNLCYLRSDYNTELKGCPGAIFSGFLQSLSDQLSLIFFNEFEFLHFSPDPSRTLYCDLCQRSQWW	27139	30528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_+_27100_30500
909009	contig_3964_pilon	-	3338	5	Intergenic	novelGene_174196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTTTGATACGATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99559	3358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_4045_32575_33186_58955_60700_60925_61104_99439
909010	contig_4103_pilon	-	4772	9	Intergenic	novelGene_51973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	130.339400700632	37	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	91	2025	200670	188639	TRUE	60	AAAAAACCAAGATCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRGQKREEGWKEVVRRSKKLSVPASVVSRIMGRGGCNITAIQDVTGAHIDVDKQKDKNGERMITIRGGTESTRYAVQLINALIQDPAKELEDLIPKNHIRTPASTKSIHANFSSGVGTTAASSKNAFPLGAPTLVTSQATTLSTFQPTNKLNKNVPTNVRSSFPVSLPLAYSHPHFALLAAQTMQQIRHPRLPMAQFGGTFSPSPNTWGPFPVRPVNPGNTSNSPKHNNTSRLPNQNGAVLSSESPGLTTASCPITVSSVVAASQQLCVTSTRTPSSVRKQLFACVPKTSPPATVISSVTSTCSSLPSVSSAPITGGQVPTTFLPASTPQAQLSSQKMESFPAMPAPKEKVSTQDQPMANLCTPSSTANNCSSSASNTPGAPETHSSSSPTPPSSNTQEEAQPSIVSDLSPMSMPFASNSEPAPLTLASPRLVAADNQDTNNLPQLAVPAPRVSHRMQPRGSFYSVVPNATIHQDPQSIFVTNSVPLTPPQGPPAAVQLSSAMNIMNGSQMHINPANKSLPPTFGPATLFNHFSSLFDSSQVPANQGWGDGPLSSRVAADASFTVQSAFLGNSVLGHLENVHPDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSMDPSGSSPSSSSTPLTSFSSIPGTRVFLQGPAPVGTPSFNRQHFSPHPWTSASNSCRNPGGTLPKES	201376	176265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_177160_177306_177478_182405_182516_185838_186004_186703_186880_187407_188854_195525_197139_200563_200714_201329
909012	contig_8138_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_52511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAATTCAAATTAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475986	477851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_476000_477900
909013	contig_17427_pilon	-	2238	11	Intergenic	novelGene_30327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1255.00266533582	3295	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	53	1141	188879	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTKIAG	204695	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178060_179390_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
909014	contig_8538_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_4639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11211	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	67	1668	841460	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRGRCLVLLLCVRCCHHHLGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840311	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841456
909015	contig_6446_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_149174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	603	1313	127278	126568	NA	0	TGTTTGTGTTTTCTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLIFKAIQELKQKADKNKEKKIDKSMEKADKLMENTDKKMEEFRKITQQQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKMSEMDSVIEGLRSRLETVEDRISKIEDKHLDTTLFEEKSDKRMKKNEENLRIMWDTIKSKNLHVISIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKEEKAAIQEAQRTPYRTNPKRKSPRHTIINLPKPKTNEES	127880	125894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_125900_127900
909016	contig_13172_pilon	-	2759	18	Intergenic	novelGene_146317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	68	junction_4	343.894568215962	1	65	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	478	1518	58716	21411	TRUE	35	AAATGTAGGACTGAGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTYQNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVWKGSALAALHCGRPPESPINYGSPPSIVDTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMIAAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLWDAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISELEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMTTRPAGQNLQGIEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFDPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMVAGRNPFVLD	98394	13329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_14186_18768_18995_20711_20841_21380_21444_31868_32004_32449_32604_33381_33481_34200_34242_34337_34439_35847_35919_41247_41349_41643_41866_58632_58794_81115_81215_81309_81461_97928_97989_98179_98210_98334
909017	contig_19518_pilon	-	277	2	Intergenic	novelGene_170730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	14023	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAACTGCTGTAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47662	45358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45597_47623
909018	contig_13481_pilon	+	2118	5	Intergenic	novelGene_119565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	588.817458980285	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	320	613	1576718	1586220	TRUE	20	CCTTATGTTGTCAGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1576149	1587834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080_1586255_1586363
909019	contig_9011_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_159273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGACTAAAAGAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117286	115543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_115500_117300
909020	contig_4754_pilon	+	2030	6	Intergenic	novelGene_35928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	20.7653557638679	756	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	965	1264	283611	283910	FALSE	20	GACAACTTCAGTCTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWESRLLEFCACESQMIHIGRNPHRCSLCGEVFSKKYMITNHRKAHTGEKPYECKESGRAFVTKSGLIVSQKTHTREKPFICSECGKCFSHELSLIVHQ	268760	284676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_268802_276822_277030_277614_277728_280270_280398_280674_280771_283230
909021	contig_1244_pilon	+	2993	4	Intergenic	novelGene_38082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTCAGTTGGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411076	1569154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1411086_1418158_1418856_1531384_1531418_1566900
909022	contig_7378_pilon	-	3329	6	Intergenic	novelGene_120257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	193.004663156101	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	86	724	423719	418800	FALSE	20	TTGATGTCAGGGTGCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAGDNSQSVYIPMSPGPHHFDSLGYPSTALSMHRGPSRGSEIQPPPVNRNLKPDRKAKPTPLDLRNNTVIDELPFKSPVTKSWSRAIHTFNSSSSQYCRPISTQSITSTDSGDSEENYVSMQNPVSASPVPSGTNSPAPKKSTGSVDYLALDFQPNSPSPHRKPSTSSVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQNTMQEWTDVRQSSEPSKGAKL	425174	416194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_418944_419915_420042_421678_421782_422143_422235_423544_423740_425109
909023	contig_12901_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_142981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAACAATACTTCTCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79457	77969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_-_78000_79500
909024	contig_17427_pilon	-	2229	10	Intergenic	novelGene_30359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1276.60189372479	4	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	148	1185	188879	177997	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVRSATGFFALSLHTMG	204808	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178045_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
909025	contig_8122_pilon	-	3137	2	Intergenic	novelGene_40257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740357	736729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_737014_737504
909026	contig_13244_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_86968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTCTAGATTGTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297389	296053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_296100_297400
909027	contig_12951_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_68212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779635	777747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_777700_779600
909028	contig_6199_pilon	+	6366	52	Intergenic	novelGene_126372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	45	junction_40	52.349349953937	352	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1600	4803	99	4901	228985	340038	TRUE	20	GTTCCTGAGGTTTAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTLLSDVAYRDPSLRDEILEVLLQVLQVLLGMCQTLEIQEKEYLCKYAVPCLIGISRAFGRYSNMEESLLSKLFPKIPPHSLRVPEELEGVRRRSFNDFRSILPSNLLTVCQEGTLKRKTSSVSSISQVSPERGMPPPSSPGGSAFHYFDVSCLPDGSALEPDYYFSTVSSSFSVSPLFNGITYKEFDIPLEMLRELLNLVKRIVEEPVLKSLDAVVASVTEANPGADLYYSTFSDPLYVAMFKMLRDTLYCMKDLPTSFVKEIHDFVLEQFNTSQGELQKILHDADRIHSELSPLKLRCQASAACVDLMVWAVKDEQGAENLCIKLSEKLQSKTSSKVIIAHLPLLICCLQGLGRLCERFPVVVHSVTPSLRDFLVIPSPVLVKLYKYHSQYHTVAGNDIKISITNEHSESTLNVMSGKKSQPSMYEQLRDIAIDNICRCLKAGLTVDPVIVEAFLASLSNRLYISQESDKDAHLIPDHTIRALGHIAVALRDTPKVMEPILQILQQKFCQPPSPLDVLIIDQLGCLVITGNQYIYQEVWNLFQQISVKASSVVYSATKDYKDHGYRHCSLAVINALANIAANIQDEHLVDELLMNLLELFVQLGLEGKRASERASEKGPALKASSSAGNLGVLIPVIAVLTRRLPPIKEAKPRLQKLFRDFWLYSVLMGFAVEGSGLWPEEWYEGVCEIATKSPLLTFPSKEPLRSVLQYNSAMKNDTVTTAELGELRSTIINLLDPPPEVSALINKLDFAMSTYLLSVYRLEYMRVLRSTDPDRFQVMFCYFEDKAIQKDKSGMMQCVIAVADKVFDAFLNMMAEKAKTKENEEELERHAQFLLVNFNHIHKRIRRVADKYLSGLVDKFPHLLWSGTVLKTMLDILQTLSLSLSADIHKDQPYYDIPDAPYRITVPDTYEARESIVKDFAARCGMILQEAMKWAPTVTKSHLQEYLNKHQNWVSGLSQHTGLAMATESILHFAGYNKQNTTLGATQLTERPACVKKDYSNFMASLNLRNRYAGEVCGMIRFSDATGQMSDLNQMMVQELSTALDLGSPQDYTQAMFKLTAMLISSRDCDPQLLHHLCWGPLRMFNEHGMETALACWEWLLAGKNGVEVPFMREMAGAWQMTVEQKFGLFSVEVKEADPLAASEACQPKPCPPEVTPHYIWIDFLVQRFEIAKYCSSDQVEIFSSLLQRSMSLNIGGAKGSMNRHVAAIGPRFKLLTLGLALLHADVVPNATIRNVLREKIYSTAFDYFSCPPKFPTQGEKRLREDIIIMIKFWMAMFSDKKYLTASQLVPPDNQDTRSNLDITVGSRQQATQGWINTYPLSSGMSTISKKSGMSKKTNRGSQLHKYYMKRRTLLLSLLATEIERLITWYNPLSAPELELDQAGENSVANWRSKYIGLSEKQWKDNVNLAWSISPYLAVQLPARFKNTEAIGNEVTRLVRLDPGAVSDVPEAIKFLVTWHTIDADAPELSHVLCWAPTDPPTGLSYFSSMYPPHPLTAQYGVKVLRSFPPDAILFYIPQIVQALRYDKMGYVREYILWAASRSQLLAHQFIWNMKTNIYLDEEGHQKDPDIGDLLEQLVEEITGSLSGPAKDFYQREFDFFNKITNVSAIIKPYPKGDERKKACLSRAV	224769	347003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_224826_228942_229016_229690_229951_230737_230805_233843_233993_236488_236555_240625_240723_241916_242109_243176_243278_243910_244041_245010_245144_247754_247851_249100_249285_249755_249860_253552_253722_256238_256290_290939_291049_291850_291988_292175_292310_295428_295512_300584_300656_300736_300862_302151_302234_302465_302550_303432_303523_305505_305626_309919_310013_311260_311418_311659_311788_324496_324656_325000_325153_327408_327517_328083_328212_329706_329827_330014_330095_330193_330388_331381_331473_332150_332319_333010_333065_336584_336706_338881_339012_339983_340056_340939_341013_341097_341169_341873_341981_342314_342420_342521_342648_342874_342996_343440_343601_344479_344570_345199_345284_346492
909029	contig_6654_pilon	-	5525	3	Intergenic	novelGene_85698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1577	2065	119863	119375	FALSE	15	TGTCTTGGTTATCTAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQILTNIKEIENSTIIVGDFKTPLSMIEHFKRKSLTKDIENLNKTISQLAPTEIHRTLHPTSEQYTFFSSACRSFSRIDHMLGHKTSINKFKKTEIIQSIFSDHNGMKLEINNRINKGKKINTWKVDHPLLKICWVIEEIRSEILKFLESNENENTTYQNL	122122	115914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_119890_120380_121243_121434
909030	contig_10658_pilon	-	3272	29	Intergenic	novelGene_130072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_2	121.213606993638	166	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	937	2814	99	2912	360630	171633	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYIETSNLDGETNLKIRQGLPATSDIKDIDSLMRISGKVECESPNRHLYDFVGNIKLDGQSTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNSTSPPLKLSNVERITNVQILILFGILIAMSLICSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLLVTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQFKKCTIAGVAYGQSSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEFLTMMAVCHTAVPEREGDKIIYQAASPDEGALVRAAKQLNFVFTGRTPDSVIIDSLGQEERYELLNVLEFTSARKRMSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDRLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSHHCTTLGDALQKENDFALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVITLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMVHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSCRKENMLKYPELYKTSQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGTAFGNGKTSDYLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSSLWPAVPMAPDMSGEAAMLFSSGVFWMGLLFIPVASLLLDVVYKVIKRTAFKTLVDEVQELEAKSQDPGAVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQDENGIVSQSEVIRAYDTTKQRPDEW	362477	171272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_171731_172967_173060_183419_183513_184459_184549_203778_203887_205223_205281_208328_208391_217083_217163_220411_220535_220638_220714_229460_229572_229667_229852_251942_252116_273600_273666_278118_278258_295746_295887_299521_299607_306829_306900_308978_309029_315395_315479_316792_316899_319557_319631_341019_341109_344331_344410_347204_347333_348575_348742_351493_351606_360544_360673_362421
909031	contig_9146_pilon	-	2262	12	Intergenic	novelGene_79506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	49.2970419711714	60	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	139	1602	338721	264421	FALSE	5	CTTGGTCTTTTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRAETRQRRLEGFDRPEELGLPHTQSPGRPIAATEDGPWTIPDSQWVAPKQLGTELSKETMLSIGVQVTLPFLFAGLGLSMAGVLLNYFQHWPVFVEVKDLLTLVPPLVGLKGNLEMTLASRLSTAANTGQIDDPQEQHRVIGSNLALVQVQATIVGLLAAVAALLLGAVSSEEVDFAKMGLLCASSVLTAFLASLALGILMVCIVIGARKFRVNPDNIATPIAASLGDLITLSILALVSSFFYRHKDSWYLTLLVCVAFVALTPVWGIMAKQSPPIMKILKFGWFPIILAMVISSFGGIILSKTVSEPQYQGMAIFTPIICGVGGNLVAIQTSRISTYLHIWSTPGVLPLWMKKFWPNPCSTFCSSEINSMSARVLLFLVIPGHLIFFLVIYLIEGHSVTSSKTFVVLYLLASLIQVTILLYLAEVMVRVTWHQALDPDSHCIPYLTGLGDLLGTGLLALCFLLDWLLRSKAELDSLSELVSVPP	359474	263760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_264631_265843_265993_272236_272372_274745_274826_275937_276083_279325_279473_284520_284666_289796_289869_315716_315825_338448_338754_353740_353780_359407
909032	contig_7022_pilon	+	3941	25	Intergenic	novelGene_142126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_16	157.055938150499	436	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1312	3936	4	3939	34270	196385	FALSE	45	AAATTGTTTAAATACAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGHLFRAAGDQPFNLSTVSSAFPMVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRIKEKEMRRQQAVLLKHQELERHRLDMERERRRQHMMLMKAMEARKKAEEKERLKQEKRDEKRLNKERKLEQRRLELEMAKELKKPNEDMCLADQKPLPELPRIPGLVLSGSTFSDCLMVVQFLRNFGKVLGFDVNIDVPNLSVLQEGLLNIGDSMGEVQDLLVRLLSAAVCDPGLITGYKAKTALGEHLLNVGVNRDNVSEILQIFMEAHCGQTELTESLKTKAFQAHTPEQKASVLAFLINELACSKSVVSEIDKNIDYMSNLRRDKWVVEGKLRKLRIIHAKKTGKRDTSGGTDLGEEQHPLGTPTPGRKRRRKGGDSDYDDDDDDDSDEQADEDDEDEEDKEDKKGKKADVCEDEDEGDQAASVEELEKQIEKLSKQQSQYRRKLFDASHSLRSMMFGQDRYRRRYWILPQCGGIFVEGMESGEGLEEIAKEREKLKKAESIQIKEEMFETSGDI	34266	196387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332_145399_146699_146745_146989_147017_148267_148334_157310_157452_160296_160552_161502_161718_163103_163179_164011_164256_173416_173480_174477_174623_196293
909033	contig_17470_pilon	+	4173	10	Intergenic	novelGene_110497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	35.1946965701747	142	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	250	1173	233230	244570	FALSE	15	TTGAAGTCCTTGCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQPGIAKANMGVSREDVTFEDHPLNPNPDSRWNTYFKDNEVLLQIDKDVRRLCPDISFFQRGTEYPCLLILDPQNEFETLRKRVEQTTLKSQTVARNRSGVTNMSSPHKTTAPSSLNEYEVLPNGCEAHWEVVERILFIYAKLNPGIAYVQGMNEIVGPLYYTFATDPNSEWKEHAEADTFFCFTNLMAEIRDNFIKSLDDSQCGITYKMEKVYSTLKEKDVELYLKLQEQNIKPQFFAFRWLTLLLSQEFLLPDVIRIWGNNEEGDMHLSRSYHKGSSLPGVVCAPGDTVTKKILFQGLGSKCF	229529	247570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_229585_230688_230793_232992_233055_233201_233302_234313_234397_235483_235644_239899_240111_240667_240832_241963_242059_244431
909034	contig_10777_pilon	+	2226	12	Intergenic	novelGene_101164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_4	254.713321271303	5	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	257	1144	8328	53404	FALSE	15	GACTCCCTTTCATTGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFATLIREWPGDLYNNSVIVQAVRDHLKKDSQNRTLLKTLAELYTYDKNYGNALEIYLTLRHKDVFQLIHKHNLFSSIKDKIVLLMDFDSEKAVDMLLDNEDKISIKKVVEELEDRPEFQHVYLHKLFKRDHHKGQRYHEKQISLYAEYDRPNLLPFLRDSTHCPLEKALEICQQRNFVEETVYLLSRMGNSRSALKMIMEELHDVDKAIEFAKEQDDGELWEDLILYSIDKPPFITGLLNNIGTHVDPILLIHRIKEGMEIPNLRDSLVKILQDYNLQILLREGCKKILVADSLSLLKKMHRTQMKGILVDEENICESCLSPILPSDAAKPFSMVIFHCRHMFHKECLPVPSMNSPAQFCNICSAKSRGPGSAILEMKK	6468	54486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_6598_8200_8346_10720_10763_10907_10959_15087_15226_24486_24542_26584_26726_28511_28649_50355_50456_50560_50606_52656_52737_53323
909035	contig_5375_pilon	+	5045	1	Intergenic	novelGene_169220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	458	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGGAGAAACTGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92357	97402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_92400_97400
909036	contig_5715_pilon	-	3503	1	Intergenic	novelGene_127969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2706	3032	594520	594194	NA	75	TAAAAAAAGAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRNYIKKGESTQKIKWNKETVNNTHKKDIKMTALNSYLSIIMLNVNALNTPVKRQRTAEWIKKQDQSKCFLQETHLRLKDKNKLKLKGWKKIYIKQTTLKKEQEWQY	597225	593722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_593700_597200
909037	contig_6958_pilon	-	4351	16	Intergenic	novelGene_69975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_15	143.177962301776	190	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	234	2582	710143	685179	FALSE	60	AGTATAAACTTAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSIIKLTTLSGVQEESALCYLLQVDEFRFLLDCGWDEHFSMDIIDSLRKHVHQIDAVLLSHPDPLHLGALPYAVGKLGLNCAIYATIPVYKMGQMFMYDLYQSRHNTEDFTLFTLDDVDAAFDKIQQLKFSQIVNLKGKGHGLSITPLPAGHMIGGTIWKIVKDGEEEIVYAVDFNHKREIHLNGCSLEMLSRPSLLITDSFNATYVQPRRKQRDEQLLTNVLETLRGDGNVLIAVDTAGRVLELAQLLDQIWRTKDAGLGVYSLALLNNVSYNVVEFSKSQVEWMSDKLMRCFEDKRNNPFQFRHLSLCHGLSDLARVPSPKVVLASQPDLECGFSRDLFIQWCQDPKNSIILTYRTTPGTLARFLIDNPSEKVTEIELRKRVKLEGKELEEYLEKEKLKKEAAKKLEQSKEADIDSSDESDVEEDIDQPSAHKTKHDLMMKGEGSRKGSFFKQAKKSYPMFPAPEERIKWDEYGEIIKPEDFLVPELQATEEEKSKLESGLTNGDEPMDQDLSDVPTKCISTTESIEIKARVTYIDYEGRSDGDSIKKIINQMRPRQLIIVHGPPEASQDLAECCRAFGGKDIKVYMPKLHETVDATSETHIYQVRLKDSLVSSLQFCKAKDAELAWIDGVLDMRVSKVDTGVILEEGELKDDGEDSEMQVDASSDSSTIAQQKAMKSLFGDDEKETGEESEIIPTLEPLPPHEVPGHQSVFMNEPRLSDFKQVLLREGIQAEFVGGVLVCNNQVAVRRTETGRIGLEGCLCQDFYRIRDLLYEQYAIV	718209	683409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_685272_685648_685784_686965_687266_688393_688620_689379_689533_693317_693519_693876_693978_703239_703531_704194_704383_706661_706778_707488_707619_708640_708747_708826_708987_709994_710177_714420_714480_718068
909038	contig_5758_pilon	-	1196	11	Intergenic	novelGene_119055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	373.277658050947	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	257	787	93059	48324	TRUE	50	GTGATGCAAAAGGATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRGHGADVKCVDWHPTKGLVVSGSKDSQQPIKFWDPKTGQSLATLHAHKNTVMEVKLNLNGNWLLTASRDHLCKLFDIRNLKEELQVFRGHKKEATCGLASCS	179150	45479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_45542_45763_45851_46830_46926_47492_47604_48269_48349_48447_48601_49701_49829_91145_91244_92931_93084_93307_93404_179014
909039	contig_4803_pilon	+	3056	31	Intergenic	novelGene_150711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2235	2672	50077	59986	TRUE	25	GAGGGAGAGGAGCAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYHPLQLLQVPPKCLLSHPKQHPCLTFQMAYSVWIQLVQLLLMVSFLFSCHLVCQMLQLHQQQHSFRHQKLYPVMQSLALLTSLLSAAHLSWELLFYHEHACFPCLLYAWVSSLAESTHAYTRNTLCVPLALFLEFSSHEPQMA	14434	135048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_15020_15970_16039_17579_17650_19567_19664_20125_20170_21584_21678_23597_23714_27344_27441_30768_30847_31014_31065_33243_33328_33806_33910_37478_37574_39338_39438_40572_40618_41848_41933_45460_45566_46891_46980_47113_47207_47702_47742_48039_48124_50057_50156_51364_51434_55797_55882_57974_58121_58516_58574_59983_60023_66817_66877_101679_101754_119613_119677_134896
909040	contig_4689_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_165413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCACCATCTAGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135106	1133609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1133600_1135100
909041	contig_13224_pilon	+	1767	12	Intergenic	novelGene_104129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	76.7740055870755	34	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	639	1526	409113	413551	FALSE	5	ATTCCGTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	393392	413792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405040_405134_408438_408542_409101_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882_413075_413489
909042	contig_3737_pilon	+	4569	4	Intergenic	novelGene_178334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	1223	2278	122879	238589	TRUE	40	CAAAAATTTATGAGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEGRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLRETPARWRSRQKHHAVPPQQRSEKLSQTENQQP	121003	383890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_+_121491_122143_123836_238490_239590_382599
909044	contig_10953_pilon	+	1651	2	Intergenic	novelGene_42528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATATATAAGCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144606	149101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_145934_148777
909045	contig_1263_pilon	+	3216	1	Intergenic	novelGene_170408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCATTGTGTGTGTAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58596	61812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_+_58600_61800
909046	contig_3233_pilon	-	2434	6	Intergenic	novelGene_56574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	87	497	747951	743809	TRUE	10	CCCCATCCCCACTCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTGLGRGGARTRPLGKGVGVEGNGIDVVVHGEEVPDVLSPKAGPTQGRGVPQLHQGEAGERVLSLHLSAMCQRQNETFLQQLPALPHRAHTQDGEANLPLEQVPSAIFRQNPANLHLSKSLYRWVRIPSRSGTWK	748037	739193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_740913_742720_742834_743703_743816_745286_745381_746938_747014_747716
909047	contig_1399_pilon	-	2580	9	Intergenic	novelGene_166663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_8	26.0804045214027	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	246	2270	96384	74308	FALSE	0	TTTTGTGCCTGCTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEPPNGEAAEIKIIREAYQKAFLFVNKGLNTDELGQKEEAKTYYRQGIGHLLRGISLASTEPEHTGPEWESARQMQQKMKETLQNVRTRLEILEKGLATSLQNDLQEVPKLYPEFPPKEMPEKPPSFGSLLWHAEVNGDTPATSGASASAPGPLPSAPQGRPTEAPPAYTPQAAEGHYTVSYGTDSGEYSSVGENFYRNHSQPPPLETLGLDADELILIPNGVQIFFVNPAGEVSAPSYPGYLRIVRFLDNSLDTVLNRPPGFLQVCDWLYPLVPDRSPVLKCTVGAYMFPDTMLQASGCFVGVVLSSELPEDDRELFEDLLRQMSDLRLQANWSRAEGETEFQIPGRIRHSSDQMGKASGPDKRLLGSPSDPGTKDVRYKGKRGKKVKDTSSEEMNLSHIVPYEPVSEEKAKELPEWSEKVAQNILSGASWVSWGLVKGAEFTGKAIQKGASKLRERIQPEEKPVEVSPAVTKGLHIAKQATGGAAKVSQFLVDGVCTVANCVGKELAPHVKKHGSKLVPESLKKDRDGRSTLDGAMVIAASSVQGFSTVWQGLECAAKCIVNNVSAETVQTVRYKYGHKAGEATHYAVDSAVNVGVTAYNIDHIGLKAMVKKTAKQTGHTILEDYKIVDNSQGKDREGGASVKVTGQKEEQLEVEEQKEELEKKAKKKEK	111555	73997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_74597_81885_81977_82055_82215_83948_84144_87124_87249_88846_89015_92501_92700_95583_96387_111312
909048	contig_610_pilon	+	2325	6	Intergenic	novelGene_76786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	158.274950639702	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	24	995	267172	314475	FALSE	80	ATAAATGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLKTEAEMGVMLLQVKERLEPPETGKDKGRSSPRAFRESMALMTLRIQTSILQNWSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTVEKPHSLPMSLDTPGLFTYENII	267148	315805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_267314_304532_304863_306145_306407_309314_309419_313377_313441_314403
909049	contig_10074_pilon	-	6060	13	Intergenic	novelGene_57214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_5	240.959583402141	268	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	801	2090	706839	694926	FALSE	25	CATAATTGGGTGTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIITPAYPQQNSTYNVSTSTRTVMVEEFKQGLAVTDEILQGKSDWSKLLEPPNFFQKYRHYIVLTASASTEENHLEWVGLVESKIRVLVGNLERNEFITLAHVNPQSFPGNKEHHKDNNYVSMWFLGIIFRRVENAESVNIDLTYDIQSFTDTVYRQANNISMLKEGMKIEATHVKKKQLHHYLPSETLQKKKKQSLSDVSRSLGGLQSKRPSLDGSCLDSSRDTDSGTPFTSPVSSVKPSKPDSPGGETERSSAEPAPVGVGKPLSVPAAQGLSIPVIGAKVDVTVKAVSPPAVCTIPTVVGRNVIPRVTTPHSPAQGQPQLNGIANITKNVLPKRSHSPSTDGSSKRLKDIEKFIRLESTFKDSRAAEDRKRKSADAIRGESMPIPTIDTSRKKRLPSKELPDSSSPVPANNIRVIKNSIRLTLNR	708482	690955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_695025_695988_696046_696242_696309_696878_697100_697186_697276_697673_697847_698094_698217_700172_700283_700699_700820_705608_705663_706064_706150_706745_706867_707709
909050	contig_4125_pilon	+	2923	1	Intergenic	novelGene_25155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTCAGATGGCTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881545	884468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_881500_884500
909051	contig_13037_pilon	-	2552	6	Intergenic	novelGene_155147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	456	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	35	520	53179	49727	TRUE	15	GCAGGCGGGAACGCGGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCREPPGSLPAMVLKGFTSSRVAGARASFPTSTASVHTAVFSSSSSSPVCWPELEASPFACTGEARKGLRKGNPQGQPFPLLQGLSVEVLLRVVQAAPLLPGEVQSHILKGHRHLGPGSEERCSHLPVSGSPLPGNSRDLRRGAGSARQKSLLPEATPQGRPPPCTWSPFSL	53213	46802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_48710_49601_49810_50205_50297_50956_51081_52710_52826_53106
909052	contig_6445_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_77031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1228	1824	542546	541950	NA	35	CTTTACATGAGAAACTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRCKQCRCPATDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	543773	540833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_540800_543800
909053	contig_11855_pilon	-	1823	15	Intergenic	novelGene_66950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2018.75048366709	4	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	525	1706	1087425	1078618	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILSVGVVSGP	1102139	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1078576_1078643_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
909054	contig_11294_pilon	+	1748	16	Intergenic	novelGene_50060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_9	153.444655241628	10	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	4	978	251378	333635	TRUE	20	TTTGAGGTAATGTGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVNFCSVYGMDN	251374	349150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_333604_333664_334971_335076_337381_337456_338120_338195_340644_340698_347019_347051_348744
909055	contig_12951_pilon	-	3349	1	Intergenic	novelGene_68225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGAAGTTCTTACTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798568	795219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_795200_798600
909056	SIRV6	+	1241	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	285	2	-150	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	40	ACGAAGAAGCTAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909057	contig_10638_pilon	+	9164	8	Intergenic	novelGene_164306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	40.0316201551336	16	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2108	6327	55	6381	314408	407617	TRUE	75	AAAAAAGTAAAAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVVVEATEPEPSGSLANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDILETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDTARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVIFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAELILPSGQEVDIPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSIQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPSVKQVKLKQRADSRESLKPATKPLPSKSVRKESKEETLDITKANLVEKPPKVESKEKVTVKKDKPTKTDTKPSEKTVKKETKPKPEEKKEEKEKPKKEVAKKEDKTPIKKEEKTKKEEVKKEVKKEIKKEEKKESKKEVKKETPLKEAKKEVKKEEKKEIKKEEKEPKKEIKKISKDVKKPSTPLPEAKKPAALKPKVPKKEEPVKKDDIAAGKPKEKGKIKVIKKEGKTTEAAAAAIGTVATAAAMSVAAGIAATGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDFEELKAEEVDVAKDIKPQLELTEDEEKLKETEPVEAYIIQKEKEVIRGPAESPDEGITTTEGEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEEDVYMRTSKHSPIEDEESVKAEADVHIKEKRESVASGDDRAEEDMDEAVEKGEAEQSEEEGDEEDKAEDAREEEYEPEKIEAEDYVMAVVDKAAEAAGAEDQYGFLTTSTKQPGAQSPVQEPASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPRDVMSDETNNEETESPSQEFINITKFESSLYSQEYSKPVTSLNGLSDVSKTDATDGRDYNASASTISPPSSMEEDKFSKSALRDAYCSEEKDVKASATLEIKDTSAVSDEKLSPSKSPSLSPSPPSPIEKTPLGERSVNFSLMPNEIKVSAEAAVPVSPEVTQEVVEEQCASPEDKTLEVVSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFDDAKDDSEKPSISPMDEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLTGSESAYESFLNADGETPDRCTESPFEGTNGKQGFPDQISPVSEITSTGVFQEKQEKKSTDFIPITEDFGEEKKTDDVEAMGSQPGLALDERKLAGDVSPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATSSFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSISPPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEHSLAMDFSRQSPDHPTVGAGMLHITENGPTEVDYSPSDLQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQIASPLQEDTLSDVVPPRDISLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLCSPSFSDSTSAVKEDTAACHTSSSPSVDAASAEPYGFRASMLFDTMQHHLALDRDLTTSGFEKDSGGKTPGDFSYAYQRSEKTARSPDEEGYTYESYEETSQTPDVGGYYYEKTERTTKSPCDSGYSYETTEKTSKTPEDDGYAYEITETTRTPEEGGYSYMISEKTMRTPEVSGYTYEKTERSRRLLDDVSNGYDDTEDGGHTLGDSSYSYETTERITGFPESESYSYETSTKTTRTPDTSTYCYETTEKITRTPQASTYSYETSDRCYTAEKKSPSEARQDVDLCLVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEVSEKPLIQSGGSPATSRRQATGATV	314353	415006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_+_314592_322304_322407_390302_390386_392936_393078_401701_402995_403093_408197_411567_411807_413041
909058	contig_9484_pilon	+	2061	16	Intergenic	novelGene_105654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	452.358186494827	16	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	74	1084	126829	206935	TRUE	20	CAATGTCTTTATTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	126755	213172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513_211800_212489
909059	contig_5092_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_62290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCAACTGAAAGGTCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423973	425980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_424000_426000
909060	contig_2078_pilon	+	3008	14	Intergenic	novelGene_100169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1686	2105	529532	530319	TRUE	15	CGCATGGAGACCTGCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQREVEGHSSSRGGRVVPQDDILMIEPVQDRGRASLGLTVKLHHIPHHTLGPGSPEGEDRTRHWNSHDDCNPLAEDGAVNVVSCTVVSASIAFLHSEDWQLCPQGTLRLSSQTYSAFSVPGECDSACTLGYRADKD	504719	535374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_505666_505745_505778_506838_506906_508725_508798_514637_514725_515321_515345_521683_521793_522157_522433_529457_529735_530102_530387_531774_532061_532301_532572_533234_533481_535340
909061	contig_18055_pilon	-	1207	5	Intergenic	novelGene_117831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTGACAATTTTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85620	80573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_81304_82068_82235_83358_83468_84603_84757_85571
909062	SIRV6	+	931	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	556	429	340	65	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	6	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	90	581	1733	10736	TRUE	25	TCGTTTACATTCGCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1643	11396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909063	contig_9981_pilon	+	6253	1	Intergenic	novelGene_121040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1693	1998	194020	194325	NA	40	CTAAAATAAGCCCAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRIGSAMGEGGCYFTLYDGGKRKHVPHPLRTLSKSCTNYLHSRSIVQNQVIQPQLDARENGKCRLDSGMHVHSLWERESFVTEGGKNGYWRTNSHSRGLT	192327	198580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_192300_198600
909064	contig_14566_pilon	+	1455	9	Intergenic	novelGene_148839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	302.833261672162	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	339	1292	88884	125267	FALSE	35	GAAACCCACACACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSDQEFDPINLKVKNQKGKLNAVIVNCQSSLEANGNITALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESVPYTLIMNCQHPKEINRNITGKHLS	66811	125430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_70344_70518_88762_88951_90606_90937_94953_95062_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
909065	contig_5964_pilon	-	4966	3	Intergenic	novelGene_80354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	41.5	133	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	604	1896	42416	41124	FALSE	15	CACTGAGCATCTTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNEYLRPGIDPQKEQLPGKISPKYDGLGTDDGACSRILQEPVIPGDAHHESDSHGPAKNAMSHEETNPYICKECGKVFNKRHLLTQHEQIHSGLKPFECTECGKTFSKSTTLLQHHIIHTGEKPYECTECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKPYECSECGRAFTHHSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPGFIRHYSIHTGGKPYECIECGKAFNHRSELTRHQRIHAEKKHYECVECGKAFNYRSHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKPYECSECGKTFAHLSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPALFRHYSIHTGEKPYECSECGKAFNRKSHLTQHQRIHTGRSPISVTDVGRPFTSGQTSVNIQGLLLGMENLWPEETSYSASDHSCQRESSQMSSL	47394	38053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_42566_45794_45923_47068
909066	contig_1244_pilon	-	1652	8	Intergenic	novelGene_38035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_2	1101.37757895672	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	123	1040	948448	926963	FALSE	50	TTCTTTAAGAATAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGNVQLFKKSLLPHCSDLDVLLKYW	948570	926350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
909067	contig_13542_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_131558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1249	1554	643770	644075	NA	25	TTCAGGTTGGCGAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEILLVLKSGKVCVRVVSFHHTYSICFSYLVLVYQKYHKWMDLTKKFIVLQSRRLEVRIHGASSRGRLSLSVALWEGPCHQSYPGLDASQPREPRFKGSA	642521	644507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_642500_644500
909068	contig_7748_pilon	+	2044	7	Intergenic	novelGene_101053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	113	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCAAGTGAGGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149983	157737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_151180_152249_152319_153771_153895_153983_154132_154779_154899_157062_157218_157503
909069	contig_16303_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_34137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66060	66939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_66100_66900
909070	contig_3948_pilon	-	3758	18	Intergenic	novelGene_53277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	120.617987721308	20	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	23	1756	1458393	1414309	TRUE	20	GCTAATGTCTCTTGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLSWSLLLLSLICETRAFYVPGVAPINFHQNDPVEIKLPYEYYSLPFCQPRKITYKAENLGEVLRGDRIVNTPFQVLMNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGILMAGILPFGAMFIELFFIFSAIWENQFYYLFGFLFLVFIILVVSCSQISIVMVYFQLCAEDYRWWWRNFLVSGGICVLRPGLCHLLFC	1458415	1409183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1434982_1439634_1439749_1458390
909071	contig_11656_pilon	-	2982	3	Intergenic	novelGene_53964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1288	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAGCACCTAGCAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151319	148086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_149091_149152_149431_149619
909072	contig_2799_pilon	+	2068	2	Intergenic	novelGene_85497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAAATGCTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576017	617682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_576651_616247
909073	contig_11564_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_158579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAAATTTCATTTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84753	88528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_85087_86402
909074	contig_57_pilon	+	2961	23	Intergenic	novelGene_44875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	204.389844849704	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	928	2784	176	2959	66895	129524	FALSE	60	AGATAAAGAAAAAGATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGCSRAALRRAAWQFASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTVKLSILFFKVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGS	66719	129526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_107538_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
909075	contig_12622_pilon	+	2451	5	Intergenic	novelGene_5857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	94.9289207776008	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	361	2406	1107540	1111730	FALSE	35	GCTTAAATCTTACGAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISHGLVSFKDLIVDFTQEEWQQLDPAQRLLYRDVMLENYSNLVSVGCHVSKPDVIFKLEQGEEPWMEEEFSSQNYSEVDGALKKNEDVQNKHLMQIVFFSNNTLIAERADIFGNTFNLGMNIVPSIKIPYKDDSCGNSSKTNSEVIVKKSYFKRIPNEYSGCGKLLFHTKHEITHSGMKKYKYNQIRKARIQSEDLILHQNIQTLKQAYDYNKCGKTFKRTVLITQKKVNSERKPNECNECKKTFSKKSNLIVHQRIHTGEKPYVCNDCRKTFRVKTHLTRHQRIHTGERPYECSECGKTFTDKSALIVHQKIHRGEKSHECDECGKTFFRKSSLTEHFRSHTGEKPYECEECGNAFSKKSYLAVHQRTHRGEKPNECNECGKTFFCHSALTAHQRIHTGERPYECNECRKTFFCQSALNVHQRTHTGEKPYECSQCGKFLCTKSALIVHQITHRREKSYECNECGKCFCRKSTLTIHQRTHAGEKHSVFNKCGKTFSVKSNHKERKRIYTKENLYECNEHRHAISKSTRLIVHQRSIWERPYECNECGRTYCRKSALTHHQRTHTGERPYECNECGKTFCQKFSFIEHQRTHTGEKPYECNECGKAFCHKSTLRVHRRIHTGEKPYECNECGKTYRQLWTFTEHQKIHTGEKPYECNICEKTFRHKSNFLLHQKTHKE	1098391	1111775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1098707_1107494_1107555_1108522_1108650_1108986_1109080_1109919
909076	contig_10104_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_160146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569747	570912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_569700_570900
909077	contig_7294_pilon	-	4728	3	Intergenic	novelGene_172594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	30.5	226	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	156	1103	110165	102388	FALSE	60	ATTAAGCCAGAATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIEQNGASRSSKDVSKDNLKDMHPSLKDAHAKSRTAPHSMESSKSGMPGVSLTPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKTSLEEFRPDASARAYGGSTTIVNKPKYGSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGASMLDSQGKLPMIMEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTELHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSQDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQVLQTDAVNAKVLLGKCINVILAFMTVILVCVSTLARFVSPMMRSRFHILGTFFAVTLLAIFCKNWDPILCAIERKIIPR	110320	98762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_-_102691_107451_107588_109656
909078	contig_8420_pilon	-	381	1	Intergenic	novelGene_69374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267260	266879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_266900_267300
909079	contig_34_pilon	-	5496	4	Intergenic	novelGene_39984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	4114	4629	212564	212049	FALSE	35	TCCGCAGAAGGTGAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	386642	211181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_216381_225366_225374_339282_339290_386359
909081	contig_6654_pilon	+	2817	20	Intergenic	novelGene_85753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_15	115.696445883301	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2712	106	2817	600138	679545	FALSE	35	ACAGCACGAGGGGAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRRAEKSCEQACESLKRQDYEMALKHCTEALLSLGQYSMADFTGPCPLETERIKIESLLYRIASFLQLKNYGQADEDCRHVLGEGLAKGDGAFRAVLCCMQLKGKLQLVSSILAKSLTGESLNGMVTKDLTRLKTLLTETETATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEATIEEKTKEYIFLRISRECCEELNLRPDCDTQVELQFQLNRLPLCEMHYALDRIKDNGVLFPDITMNPTIPWSPNRQWDEQLDPRLNAKQKEAVLAITTPLSIQLPPVLIIGPYGTGKTFTLAQAVKHILQQQETSRILICTHSNSAADLYIKDYLHPYVEAGNPQARPLRVYFRNRWVKTVHPVVHQYCLISSAHSTFQMPQKEDILKHRVVVVTLNTSQYLCQLDLEPGFFTHILLDEAAQAMECETIMPLALATTNTRIVLAGDHMQLSPFVYSEFARERNLHVSLLDRLYEHYPAEFPCRILLCENYRSHEAIINYTSELFYEGKLMASGKQPAHKDFYPLTFF	573073	679545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_600119_600348_602764_602802_616762_616888_618597_618655_623021_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951_650286_652729_652861_657968_658149_658675_658781_671213_671393_674306_674426_675534_675681_679457
909082	contig_2379_pilon	+	5152	3	Intergenic	novelGene_159432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	4039	4428	177898	178287	FALSE	60	AAAAGCACTACAAAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGVRSRFETMEDRIRETEEKLLDTILFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTERINEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRNSPRHIIITLTKTKDKES	11470	179011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2379_pilon_+_11605_15341_17369_176020
909083	contig_3627_pilon	+	2739	7	Intergenic	novelGene_78460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_3	364.546941040824	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2232	2738	316044	323562	FALSE	70	AAGATGAAAGAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSK	309691	323563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_309770_312560_312787_313379_314205_314941_316050_318589_318776_320225_320418_323439
909085	contig_12464_pilon	-	1905	2	Intergenic	novelGene_68730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGATTACCAGCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377854	375432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_376341_376857
909086	contig_8045_pilon	+	2256	9	Intergenic	novelGene_35446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	109.39121308405	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	157	1239	452026	459508	TRUE	20	TTCTTTTCAGAGTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKQLSQPESVSCWLLTSVLL	434981	462921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458759_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
909087	contig_16883_pilon	+	2703	3	Intergenic	novelGene_161757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	130	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	685	1173	539415	539903	TRUE	30	CCACCAGAGGTGGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLKKIGIEGKFLSMIQGIYEKPMANIVLNGERLRAFPLKVGKRQGCMLSLLLFNIVLEDLARAIRQEKEIKGIQVGKEVELSLSMKDMILYIKNPKEPTRKLLELIEKFSKVTGYKVNKQKSLGFLYTSSEKSEREIRETIPFKIVSKRIKYLGINLTRV	538730	541742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_540357_540534_541095_541225
909088	contig_17158_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_141161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAACGCCACCTTCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204893	204251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_204300_204900
909089	contig_7465_pilon	-	4147	4	Intergenic	novelGene_178258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAGGTGATAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70703	24287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7465_pilon_-_24760_38671_39356_61706_62244_68249
909090	contig_6837_pilon	+	3550	23	Intergenic	novelGene_149831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	47.4551549943438	224	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	889	2670	441	3110	81172	91925	TRUE	15	TCTTAAGTGCAGCCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGPQSSSLSLSVSSSPTAVAFSPNGQRAVVGTANGTVYLLDLNSWQEEKSVVSGCDGISSCSFLSDTSIFLTAFDGLLELWDLQHGCRVLQTKAHRHQITSCCLSPDRRLLATVCLGGCLKQLWDTVRGQLASQHTCPKPLNCVAFHPEGQVIAIGSWAGSFSFFQVDGLKVTKELGAPGASVRTLAFNAPRRVVAVGRLDGMVELWAWQEGARLAAFPAHHGFVACALFLRAGSQLLTAGEDGQVQVWSGSLGRPRGCLRSPSPSPALSVALSPDGDWVAVGYRADGIRIYRISSGSQEGQCPALHVAVSALAWLSPEVLVSGAEDGSLQGWAFKKSSIQSLWLLSRYQKPVLGLATSRELLASVSEDFTVRLWPRGFLTLPQKAEEFPCATELRGHEGPVNCCSFSTDGGSLATGGRDRSLLCWDVRTPNAPVLIRSFSACHRDWVTGCAWTRDNLLISCSSDGSVGLWDPESGQQLGQFLGHQSAVSAVAAVEEHVVSVARDGTLKVWDHQGVELTTIPAHSGPISHCTAAQEPRAAGQPGSELLVVTVGLDGTTRLWHPLLVFQTHTLLEHSGPVSAAAVSDTSGLLLTASEDGSVRLWQVPEEADDTYVPKNPAAITAVAWAPDGSMAVSGSQTGELILWQEAKAVATAQAPGRISALIWYSAHTFFVLSADEKVSEWQVELQRGSTSRNFSLHLNRILQEDIGVLIGLGLAPDGQSLILAKAELELLHMMPGNDPSVIWGCYMEDGLTVLSTHKEYGVFVLQSMAPKGLYLLRQKELGEFEEFLEFNLNLENPSGAVIWVTQAKPESESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKVSLREG	79785	92575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_79886_80160_80276_80946_81189_81374_81499_82406_82532_82661_82762_82973_83133_83270_83484_83744_83899_84007_84221_85328_85490_85761_85876_86798_86907_87398_87532_87635_87713_87817_87951_88073_88211_88372_88498_89574_89719_89856_89957_91500_91607_91698_92134_92343
909091	contig_9098_pilon	-	2549	11	Intergenic	novelGene_75778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	441.534868385273	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	319	1041	288130	264388	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	295261	262879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267437_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289194_289280_292840_292905_294101_294181_295200
909092	contig_1719_pilon	+	2204	16	Intergenic	novelGene_87326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	170.416613691923	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	104	1738	492762	726560	FALSE	80	ATTTACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGRSLLVPHPREGLRGRRSIRGIKASLADCRLSMELENIVANTVLLKAREGGGGKRKGKSKKWKEILKFPHISQCEDLRRTIDRDYCSLCDKQPIGRLLFRQFCETRPGLECCIHFLDSVAEYEVTPDEKLGEKGKEIMTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	492406	727026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_492486_492737_492814_608501_608598_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_723078_723217_724669_724802_726461
909093	contig_2577_pilon	+	1782	18	Intergenic	novelGene_172049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_17	137.98164463455	245	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1710	72	1781	82377	238776	FALSE	20	TAAGTTTTCATGTGATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCNGLINSYEDKSNDFVCPICFDMIEEAYMTKCGHSFCYKCIHQSLEDNNRCPKCNYVVDNIDHLYPNFLVNELILKQKQRFEEKRFKLDHSVSSTNGHRWQIFQDFLGTDQDNLDLANVNFMLELLVQKKKQLEAESHAAQLQILMEFLKVARRNKREQLEQIQKELSVLEEDIKRVEEMSGLYSPVSEDSTVPQFEAPSPSHSSIIDSTEYSQPPGFSGSSQTKKQPWYNSTLASRRKRLTAHFEDLEQCYFSTRMSRISDDSRTASQLDEFQECLSRFTRYNSVRPLATLSYASDLYNGSSIVSSIEFDRDCDYFAIAGVTKKIKVYEYGTVIQDAVDIHYPENEMTCNSKISCISWSSYHKNLLASSDYEGTVILWDGFTGQRSKVYQEHEKRCWSVDFNLMDPKLLASGSDDAKVKLWSTNLDNSVASIEAKANVCCVKFSPSSRYHLAFGCADHCVHYYDLRNTKQPIMVFKGHRKAVSYAKFVSGEEIVSASTDSQLKLWNVGKPYCLRSFKGHINEKNFVGLASNGDYIACGSENNSLYLYYKGLSKTLLTFKFDTVKSVLDKDRKEDDTNEFVSAVCWRALPDG	62008	238777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_62064_82360_82421_86435_86534_96467_96545_97401_97522_109382_109452_120688_120749_122259_122337_137481_137540_160156_160272_168105_168242_188706_188851_190577_190687_192013_192096_200036_200154_233870_233989_237209_237335_238615
909094	contig_11678_pilon	-	2719	8	Intergenic	novelGene_160847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	75.562381310992	423	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGACGGCGGAAGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257547	235591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_235775_248119_248264_249696_251556_252073_252178_252764_252851_253379_253511_253963_254093_257464
909095	contig_7378_pilon	-	2709	2	Intergenic	novelGene_120286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1818	2540	591509	590787	FALSE	40	TTTATAGCAATATATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVNSHLSIITLNVNGLNTPIKRRRVTEWIRKKKDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVATLISDKLDFKTKSTIKDKEGLYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKKTLTALKKIDSSTVIVGDFNTPLSIKDRTSKKKLSKDAEDLKGTVSQLDLIDIYRTFHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNAEIIQSIFSDHSAIKVEINNR	594158	590617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_591525_592356
909096	contig_2596_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_53531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCCTGAGAATTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098952	1096849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1096800_1099000
909097	contig_11435_pilon	+	1926	2	Intergenic	novelGene_178853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1301	1891	583123	583713	FALSE	30	CTGGCCATCCAAGAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	491204	583748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11435_pilon_+_491784_582401
909098	contig_9221_pilon	+	1112	9	Intergenic	novelGene_176237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	500	junction_5	183.182968640646	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	44	1111	16309	20931	FALSE	35	CAGAACCTTTGACCAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQISDIYISGESGDMSAKEKLLLWTQKVTAGYTGIKCTNFSSCWSDGKMFNALIHRYRPDLVDMERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKVPEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKSFPQNPVELKALYNQYIHFKETEILAKEREKGRIEELYKSLEVWIEFGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLRPAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEKLTLAKNTLQADAAHLESGQPVQWESDVIMYIQECEGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELAFRVMRLQDELVTLRLECTNLYRKGHFTTLELAPPSGLTTTHLK	16265	20932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_+_16440_17236_17350_17455_17563_18328_18449_18591_18688_19402_19531_19616_19711_19922_20078_20807
909099	contig_4531_pilon	+	1857	8	Intergenic	novelGene_47847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	99.0295771113719	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	434	1810	124082	157546	FALSE	90	AAAAAAAGAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSNPIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKVG	123648	157593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_124124_145256_145465_148686_148956_149519_149682_152888_153003_153420_153595_156404_156603_157336
909100	contig_4402_pilon	-	2167	3	Intergenic	novelGene_140866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	539	junction_2	53	48	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1024	1380	624811	617078	FALSE	50	TATAAATATGAAGTGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDDNALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPVMGTSKAVCKNTISQFFYTLFLPL	625834	616290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_617169_619559_619660_624645
909101	contig_8452_pilon	+	5141	4	Intergenic	novelGene_48004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	28.8790581563873	4	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1424	1780	263026	263382	TRUE	35	GACACTGAACAACACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVNFAPGNVTTEVKSVEMHHQILSEALPVDNVGFNVKNVSVKHVCHGNVAGDSKNDPPMEAAGFTTQVIILNHPGQISAGCAPVLDCHTAHTACKFAELKERTDLRSGKKWRMALNS	255040	376022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_255187_260988_261402_262161_266647_375925
909102	contig_10044_pilon	-	1795	3	Intergenic	novelGene_156391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATGTTTTTATTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155764	150838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_-_151891_152148_152245_155117
909103	contig_17993_pilon	+	3791	11	Intergenic	novelGene_61931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	123.970157699343	102	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	719	1504	76195	85550	TRUE	35	CCACCCGGCAAATGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRHLYMKWVRLTKPQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLHTIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANADLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISGTVNLEIWLYFIDIEISVFVFCVWCYECVAHVKCRYFMWIVYTSSDNF	55399	88723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_55437_67126_67316_68444_68579_72502_72667_72886_73049_76162_76301_77881_78020_79631_79726_80786_80918_85233_87143_88028
909104	contig_12090_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_80496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGCTGTGGAGGGACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166689	165244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_165200_166700
909105	contig_233_pilon	+	1929	10	Intergenic	novelGene_14503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	342	851	78477	91651	TRUE	20	AGCTTCCCATCCCCGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78135	104225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151
909106	contig_10569_pilon	-	2160	4	Intergenic	novelGene_44077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCATGGGACTTTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410689	282389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_282662_404321_404490_408889_410512_410591
909107	contig_3382_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_124063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTGGACTCGAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268134	269239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_268100_269200
909108	contig_4783_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_108388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTACACTTTACTAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225347	228057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_225300_228100
909109	contig_9653_pilon	-	2186	12	Intergenic	novelGene_48185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	563.719363390293	6	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	670	1521	186221	175913	FALSE	20	TTTGGAGTACATTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200983	175247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192228_194073_194351_196881_196987_200896
909110	contig_6842_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_130695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379619	378436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_378400_379600
909111	contig_13481_pilon	-	4187	4	Intergenic	novelGene_119311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2991	3353	415130	284370	TRUE	10	AGCCGCCACCTCCGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRLTLVPGSQGPRHSGSVARATSHVLTPTDRVRTMICSQGDEMSLLTTGTKRCSGSTAGVETGDSIFSDLTFFSGRHSFSPSSGSGLAPKGLSAAPGSIAILPSGSTAPVSTPALPSY	418120	248634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_248652_251967_252068_283652_284528_414925
909112	contig_13702_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_102652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	847	1146	211071	211370	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210224	211405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210200_211400
909113	contig_2480_pilon	+	3019	14	Intergenic	novelGene_63530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	73.7147870002024	5	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1230	1925	270418	278787	FALSE	15	GTCACCCAAGTCTGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGR	251383	279881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266080_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532
909114	contig_8660_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_136479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATTTAAAACATACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33865	35190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_33900_35200
909115	contig_17427_pilon	+	2662	5	Intergenic	novelGene_30398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44.2549432267176	10	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	16	381	331916	352528	TRUE	10	CCTTCTCCGTGTGTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVFKMAAVAASRTVSVGSGLRGLRRTLPLVVILGATGTGKSTLALQLGQRLGGEIVSADSMQVYEGLDIITNKVSAQEQRICQHHMISFVDPLVTNYTVVDFRNKATTLVPSSQFRLIVTLWTAE	331900	368807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351803_352477_352700_355635_356709_367770
909116	contig_12292_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_166986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	229	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAAATAGAATATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158851	161433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_158900_161400
909117	contig_10104_pilon	+	3737	1	Intergenic	novelGene_160132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2642	3133	415926	416417	NA	60	AAATGGGGAGATAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFLWKGKKPEISKALLKKKNKVGGLALPDLRTYYIATIVRTAWYWNNDRYTDQWNRIENLDVNPSTYSHPIFDKGPKSIKWETDSLFNKWCWQNWKSICKKMKQNPYLKPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKIIEEKTRSTLETLIHGINRIQTITNNI	413284	417021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_413300_417000
909118	contig_10196_pilon	-	3723	1	Intergenic	novelGene_132281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	234	863	2204654	2204025	NA	20	GGAAGTTGTTTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLHHWECFWFFSQVILGFYHPRGQAVYRLQPGGSSGAGGWHWEGPSLSQQIAQASAPRSLCDEETACSPTAAAGPLGAPGVTLWEVSALPSSHSSVACLDTARTGTWGPGVSRNLGPAGISIRRWVGKQPRATFLTCSEFLWCHLPPLDPQYPSWCRAKLGVQSPEMWSWTTTAEHLEQDRPLPQGPCYPSLPPCSTSPIPSLATAC	2204887	2201164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2201200_2204900
909119	contig_10434_pilon	+	2153	3	Intergenic	novelGene_82032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	42	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATCCTCTTTAACAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130400	133665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_130983_131445_131609_132257
909120	contig_1406_pilon	+	2837	1	Intergenic	novelGene_25633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGCACCATCTAGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2624121	2626958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2624100_2627000
909121	contig_11417_pilon	+	3305	1	Intergenic	novelGene_103275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320468	323773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_320500_323800
909122	scaffold_880_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_121425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394732	393079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_393100_394700
909123	contig_3018_pilon	+	1227	3	Intergenic	novelGene_78937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAGAAATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672684	675112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_672769_673847_674105_674226
909124	contig_9389_pilon	+	2991	5	Intergenic	novelGene_84147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	36.3077126792642	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	249	2105	1842058	2002260	FALSE	15	CTGCTGCAGGGCCTGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVVFEDVAVDFTQEEWALLDFAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSQQVDKGQIVSSEHLVMRFVRNNSWYTVLGEICEFHGIEEQHNNQGSHVRRLTVGLCESKEGKVKQRKEGTQCGEPFSKIAHLTSFKRTPARENPSECCQCGKAFMNHSSFKHHFRSHTGCNTNECEECEVACSSPYLSIHVKTLPGQKIDESKKCGITCSSSSLITHIQSHGKERPYECKEFGKAFGQFSAPIEYKNIQNGKQPYDGKEYGNTFSSSSSLSKHISIHSGVRPYECEECGKAFSKSSKLNSHVRTHSGERPHECKECGKAFSCASSLTRHIRTHSGERPYKCKECGKACSQSSHLITHIRTHSGERPYECKECGKAFRWSSHLTTHIRTHTGERPYKCKECGKAFRRASNLMNHIRTHSGEQPYDCKECGKSFSDSSSLTTHLRTHSGERPYKCKECGKAFRQSSHLINHIRIHSGERPYECKECGKAFSQSSHLINHVRTHRGERPYECKECGKAFSRYSNLINHIRAHNGERPYECKECGKAFSRFSNLINHIRAHSGERPYECKECRKAFSQSSHLINHKRTHSGEWPYKCKECGKAFSQASSLSQHVRTHNGERTYECKE	1841809	2003146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1842061_1850502_1850630_1851591_1851743_1852110_1852237_2000810
909125	contig_13101_pilon	-	2909	8	Intergenic	novelGene_172782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_6	78.8177955664784	9	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	432	2054	241813	233529	FALSE	10	CGTTTTTTCAGTGGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVIPSENNGLSRGSPSKKNRLSLKFFQKKETKRALDFTESQENEEKVSEYSGSEIDQVVPAAQSSPINCEKRENLLPFVGLNNLGNTCYLNSILQVLYFCPGFKSGVKHLFNVISRKKEALKDEANQKDKGNCKEDSLASYELICSLQSLIISVEQLQASFLLNPEKYTDELATQPRRLLNTLRELNPMYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWLKSATKQPSILSKFCSLGKITTNQGSKGQLKENEYDLEEDAEKCENDNTLKVNGCGLDSPGNNVKPINVNEDKAINKGVEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERRENFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVGEDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLE	244455	232673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_233735_234695_234867_236439_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240024_241643_241883_244093
909126	contig_10627_pilon	+	2999	20	Intergenic	novelGene_59954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_3	104.766142423676	38	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	51	1913	172734	177898	TRUE	15	GAAATGTCTTGTTGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKGKVGKSRRDKFYHLAKETGYRSRSAFKLIQLNRRFQFLQKARALLDLCAAPGGWLQVAAKFMPVSSLIVGVDLVPIKPLPNVVTLQEDITTERCRQALRKELKTWKVDVVLNDGAPNVGASWVHDAYSQAHLTLMALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFLSKTSEISLDDEELAQHPATTEDVRACCQDIKVLGRKELRSLLNWRTKLRRHVAKKLKEQAKALDISLSSGEEEEEGNEEESTAGTRRQPSKEEEEEEQLNQTLAEMKAQEVAELKRKKKKLLREQRKQRERVELKMDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTSLDSDLDLEEGAGGGGHQGLKDQQRVQFAEVEDDKEEEEEENPLLVPLEEKAVLQEEQANLWFSKDGFAGIEDDADEALEIGQAQLLYESRRKGQEQPQPQPPSSLKTERKSPQCQDEAPKGTETPKGTEAAPDPEGKDKDDSSDSDSSSSEDEER	172569	179343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172594_172707_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174348_174431_174627_174709_174826_174941_175047_175129_175231_175460_175542_175633_175784_175918_176055_177073_177256_177416_177538_177622_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178879_178959
909127	contig_7471_pilon	+	2372	1	Intergenic	novelGene_161285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTGGGGGGTACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29796	32168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_+_29800_32200
909128	contig_3410_pilon	-	1476	2	Intergenic	novelGene_58968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGAGGGGGAAATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469967	468225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_468690_468955
909129	contig_12046_pilon	-	3025	19	Intergenic	novelGene_83479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	76	junction_18	50.0582685169351	101	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	780	2343	406	2748	459023	372677	FALSE	45	ACCCACCAGGAGAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA	459428	372399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_372872_376165_376290_376967_377087_377866_378029_378820_378997_379312_379437_382569_382702_383556_383690_387355_387421_389900_390009_390220_390352_391727_391822_404547_404629_404711_404858_408214_408357_410629_410807_417122_417223_440503_440614_458999
909130	contig_20314_pilon	-	2424	4	Intergenic	novelGene_125642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	986	1381	7302	6907	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEPLRSWPYLLRRRQLGFFCSLSLQLLLPVASWPLGLMPAFALLGQVFQSSVAPLISARRHPTPPGSLLHIGTQLSRAPWVSSSAISHWTPGSAAVGSLPLPLLCCCRASAAAAPLYIHNFKTASTF	11805	5752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_5987_6028_6828_6896_7823_11340
909131	contig_13633_pilon	+	2463	13	Intergenic	novelGene_15312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_11	425.209621507113	28	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	47	1387	20259	49142	FALSE	35	ATAACCCAGTGCCATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGDPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAICAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5032	50218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39379_39433_49019
909132	contig_12327_pilon	-	2133	15	Intergenic	novelGene_140686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	215.780311560492	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	69	2084	1155014	1139988	FALSE	25	AACTCTTGTGACTCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVNSRSQLLEFRGLPRPTAADMAASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVWISFAQFELSAGKEGSLAKCRQIYEEANKTMRNCEEKEERLMLLERVDKLMPEKVKKRRKVQADDGSDAGWEEYYDYIFPEDAANQPNLKLLAMAKLWKKQQQEKEAAEQDPDKDVDERES	1155082	1139938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141149_1141196_1141335_1141771_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
909134	contig_6710_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_89050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAATCAATAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590674	588266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_588300_590700
909135	contig_11294_pilon	-	4011	2	Intergenic	novelGene_50046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2434	2853	225676	225257	FALSE	50	AAAATAAGACCCCAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACVFLWCWKLCHWYFKYQQGHPWWTGFSGPSRLRQTRKKVLEIYFQKFANKNPMNHNRILSNIMVGDRFPRLEVTRTVTGKELPPQNRVDHSDRNRVKPSGPSFADEARLKMRSSKHPLLIRMWNVRSMNQKLNVVKN	276835	224098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_226495_275220
909136	contig_10976_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_155591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126917	130061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_126900_130100
909137	contig_5153_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_74400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAAATACATAAAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005110	1003827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_1003800_1005100
909139	contig_3004_pilon	-	2993	9	Intergenic	novelGene_127469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.971716750144	6	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	599	1147	240486	227587	FALSE	15	ATCTTACATGGGGCTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWKLRKVGDKILGDLSYRSAGSLFPHHGTFEVIKNTDIDLDKKIPEDYCPLDVQIPSDLEGSAYIKVVSIQKHAPDIGDLGTVNLFRRPLPKSKPGSPHWQTKLEAAQNVLLCKEIFAQLSREAVQIKSQIPHIVVKNQIISQPFPSLQLSISLCHSSNDKKSQKSATEKQSPEDHLYVLEHNLHLLIREFHKQTLSSIMMPHPASAPFGHKRMRLSGPQAFDKNEINSLQSSEGLLEKIIKQAKHIFLRSRTAATIDSLASRIEDPQIQAHWSNINDVYESSVKVLITSQGYEQICKSIQLQLNIGVEQIRVVHRDGRVITLSHQEQELQDFLLFFFFNLFFPIQKFIHTLLRDSNCSPHTVRAQSSFPPLIPHVHSTSS	245678	225740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_227727_232336_232450_235817_235956_240328_240514_241444_241576_242528_242682_243050_243136_243228_243369_245616
909140	contig_5023_pilon	+	2433	15	Intergenic	novelGene_7136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	219.458889274581	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	910	2259	359358	405576	FALSE	5	TTTGTTGTTTACTGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	323638	405750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_323839_353197_353304_353356_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
909141	contig_7870_pilon	-	4639	1	Intergenic	novelGene_109030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAATAATTTAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586278	581639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_581600_586300
909142	contig_9414_pilon	+	4006	2	Intergenic	novelGene_131075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	527	junction_1	0	216	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	170	313	370409	370552	FALSE	60	AAAGGAAAAAAGTATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNGRGGAWDRTVKTPLVCPSPACRPCRQSWRPSRFEPCPPSRCLARGTPIDGRSTMNEEEQFVNIDLNDDNICSVCKLGTDKETLSFCHVCFELNIEGKDTL	369479	374245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_+_369642_370401
909143	contig_8153_pilon	+	4217	10	Intergenic	novelGene_34793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	130.751673029449	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	674	2170	27134	46488	TRUE	40	AATACATCAACTGTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVEKDESREVYQGSEVECTVSNLLPGKTYSFRLRAANKMGFGPFSEKCDITTAPGPPDQCKPPQVTCRSAACAQVNWEVPLSNGADVTEYRLEWGGVEGSMQICYCGPGLSYELKGLSPATTYYCRVQALSVVGAGPFSEVIAWATPPSVPAIVTCLQEISDDDIESSHYSPSTCLAISWEEPCDHGSEILAYSIDFGDKQPLTVGKVTSYIIDSLQPDTTYRIRIQAFNSLGAGPFSHVIKLKTKPLPPDPPRLECVAFSHQNLKLKWGEGTPKTLSTDSIQYHLQMEDKNGRFISLYRGPCHTYKVQRLNESTSYKFCIQACNEAGEGPLSQEYVFTTPKSVPAALKAPKIEKVNDHTCEIMWECLQSMKGDPVIYSLQVIVGRDSEFKQIYKGPDSSFRYSSLQLNCEYRFRVCAIRQCQDPVGHQDLVGPYSTTVLFISQRTEPPASTNRDTVESTRRRRALTDEQCAAVILVLFAFFSILIAFIIQYFVIK	26373	48580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_26997_27083_27260_29109_29224_29963_30114_30202_30487_30606_30820_38003_38171_39361_39490_46173_47354_47398
909144	contig_13377_pilon	-	1249	4	Intergenic	novelGene_162527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	57	junction_2	35.6121078036982	32	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	526	1071	4436	246	FALSE	25	TTCCTGGCATATAATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLTLNHDPEKDDTPQVEPLYLSQNRGLTRFCLPSEAPEVTVFPKEPVQLGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIEGVGESIFLPRTDYNFYKFHYLTFMPSAEDVYDCKVEHWGLEKPLLKHWEAQEPIQIPETTETVVCALGLAVGLMGIIAGTVFIIKALHSSSDPRDRGPL	10889	67	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13377_pilon_-_250_3675_3827_4045_4893_10820
909145	contig_3964_pilon	-	2347	2	Intergenic	novelGene_174202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	30	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCCTGGGTAGAACTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60821	49561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_-_49968_58880
909146	contig_16948_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_166402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAAACATGCTCTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190010	191018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_190000_191000
909147	contig_6434_pilon	-	2884	2	Intergenic	novelGene_61840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	49	342	728485	728192	TRUE	45	AGGTGAGAGGAAGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKNVYFAAVGWSVPYMSVRSSWLIVPFSSSVSLLSFFLDILSFTKSGVLKFHSIIVELSISHFSVVGVCLSILEPCHWVCRCLLWLCLHDGLSLHYYIVPFFDFYGKFCFKV	728533	725412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_727394_727630
909148	contig_16666_pilon	+	2109	2	Intergenic	novelGene_61715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGAAATTCCATGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1903	41946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_3907_41840
909149	contig_6576_pilon	-	5069	5	Intergenic	novelGene_42313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAGGAACAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585474	528924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_529824_530165_531322_531461_534254_549588_549667_585330
909150	contig_11328_pilon	+	3289	3	Intergenic	novelGene_88414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3456	junction_2	1647.5	27	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643649	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644383_644805_647223_647899
909151	contig_20944_pilon	+	4632	1	Intergenic	novelGene_167539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACGAACACACTCATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39011	43643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_39000_43600
909152	contig_13945_pilon	+	3360	2	Intergenic	novelGene_173454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACAAACACTCCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68544	91995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_69357_89447
909153	contig_15787_pilon	+	5616	1	Intergenic	novelGene_143964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	467	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTAGTGATAAATGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56149	61765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_56100_61800
909154	contig_12046_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_83476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTTTCTTGCAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372134	369194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_369200_372100
909155	contig_3956_pilon	+	2669	12	Intergenic	novelGene_15050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	111	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	769	2145	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284220_1286150_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
909156	contig_8377_pilon	+	2295	21	Intergenic	novelGene_34937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3482.11680734578	2	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1905	391	2295	131448	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAAGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68094	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68338_128717_128934_131435_131572_135049_135197_136291_136373_140921_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
909157	contig_12427_pilon	-	3427	3	Intergenic	novelGene_40446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	71	313	606280	606038	TRUE	50	CCAAGAAATTTGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKRWLPRSFQVSFLERKGGQKYKMAAHTAELPQRAEMAHARSERSPLLAQTFVSWWALPYLGAVGCCFQAASLCVESTQRRLTTSKDRGLPSWTPCPGNSGAR	606350	301366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_302328_358189_358250_603944
909158	contig_18511_pilon	+	2135	9	Intergenic	novelGene_126873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	356.400209560825	105	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	627	1509	2135	55332	59842	FALSE	50	GAAAAGAGCTATCAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQK	35406	59842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
909159	contig_3956_pilon	+	2179	11	Intergenic	novelGene_15123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1258.04078232782	111	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	74	1660	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281608	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1289162_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
909160	contig_8138_pilon	+	3464	1	Intergenic	novelGene_52507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464047	467511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_464000_467500
909161	contig_5302_pilon	-	2615	11	Intergenic	novelGene_81536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1862	2191	1585397	1585068	FALSE	80	AAGGGAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKQPGVFQGWKSVIWSVLIQAGLFSGYCSHYCCMSHGHASGYYCWCCYCHLHWSVDCCVHSVGRRTVSETEKCWVQVLPESICYSDASSHVSVQRNLGWIFHLLLVVL	1641133	1584643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1585748_1587120_1587166_1590793_1590876_1622182_1622224_1624389_1624439_1633904_1633958_1634423_1634462_1634943_1635107_1635795_1636714_1640299_1640393_1641104
909162	contig_2834_pilon	+	1756	7	Intergenic	novelGene_27986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2494.38719372559	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	470	913	277870	290707	FALSE	50	GTAATTAAAAAGAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	239367	291550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_239472_274712_274868_274988_275172_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
909163	contig_15118_pilon	+	3136	9	Intergenic	novelGene_74566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.4161072783587	259	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	975	1622	239332	252657	FALSE	80	TGGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSSCSWEAEGVHCSCFAQAWPAPFLHWWIGDRLVEGNSSDASFSVTSSSIGPWTKSSLSLSMELTSVLRLCCEAWNDHGNQSVTVLLLPGKSASRAEVALGALGGAGTMALLSLCLCLTFFFIVKARRKQAAERPGGMDDEDPVMGTVTWSCRQKPWPESTPAQQSHSGDTPPSREEQDVHYASLSFHGMKPQKSKDEEATSTTEYTEIKTSK	236724	254171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_236745_236916_237274_237485_237765_238195_238244_238975_239235_239320_239606_239792_239893_240762_240845_252465
909164	contig_8375_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_141322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	242	421	242956	242777	NA	20	TTTTTTCACCTCCCCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKIAWWQELLTSLLRSQGRKRIIISINSPRLISTKRGPLSKLFTNSDTNYPSRGTLYFLAGLDYSLQWPHTIYSQTILTVMGFVQEVTGYNSGSGTLRIQFFDQDSLFSAMPAGRSLSGPLPGLCPARASVTKLFQLCQ	243197	240537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_240500_243200
909165	contig_1428_pilon	+	3049	10	Intergenic	novelGene_158397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_7	31.9583061712184	153	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	488	2047	120025	157443	FALSE	15	TGTATGGTTGACTCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSRTPVLVGSDEFDKCLSNDKFSHEEYSNGALSILQYPYDNGYYLPYYKRERTKRSTQITVRFLNNLNNNKNIRKKDPVLLLHWWKEIVGTILFCIIATTFIVRKLFHPHPHRQRKESETQCQTESKYDSVSGDTNDSSWNDIKNSGYISRYLTDFEPIQCMGRGGFGVVFEARNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLEAPPEKWQEKMDEIWLKDESTDWPLSSPSPMDAPSVKIRRMDPFSTKERIEIIAPSPVRSRSFSVGISCGQTSSSLSPFSPLEFSGADHRDVSGSVDPVCNLQDSCLTDCEGEDGTMDGNDEGHSFELCPSEASSVRSRERTSSSIVFEDSGCDNASSKEDLKTNRLHIGNHYANKLTGCKHASSKSSSEPTLSVSPPRPTTLSLDLTKTTAEKLQPSSPKVYLYIQMQLCRKENLKDWLNGRCAIEERERTVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKIGDFGLVTAMDQDEEEQTVLTPMPAYARHTGQVGTKLYMSPEQIHGNNYSHKVDIFSLGLILFELLYPFSTQMERVRTLSDVRNLNFPPLFTQKYPREYVMVQHMLSPSPMERPEATDIIENAVFEDLELPGKTVLRQRSRSMSSSGTKHSRQSSISHSPLPSNLP	112828	158445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_112951_114892_115114_117018_117132_119993_120117_125569_125720_127694_128473_132955_133124_140936_141039_155714_155778_157236
909166	contig_13349_pilon	-	5503	22	Intergenic	novelGene_161126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	113	junction_21	153.007180481543	808	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	822	2469	367	2835	316661	230884	FALSE	10	CTCAGCCCTGTGGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEEEAIGLLDKVLEDEDVFLLEECELGTPTSPGSGSPFLVAMKVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSEGSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKNEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTTEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV	317027	228215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_-_230974_231585_231734_234531_234638_235549_235685_236844_236985_237663_237774_238053_238114_270978_271111_271521_271620_274916_274992_276017_276123_276597_276674_277015_277139_281507_281674_283361_283484_285319_285461_286030_286084_290960_291022_294272_294381_300000_300187_307204_307304_316526
909167	contig_4402_pilon	-	4401	10	Intergenic	novelGene_140838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	286.116181184851	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1447	4341	61	4401	603870	592346	FALSE	70	CACAAGAAACATAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEQSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSLKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTKRSSEETKSVDKNPCKEREKHISEARNSKESSVNKLLYILNPPDSQTEKEQVTGQIDKNAVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEETSGKISKEMKDKVIEKVKENLDAAAVGQIGITRSQSQSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKK	603930	592345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_595933_596736_596839_597128_597492_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818
909168	contig_11413_pilon	+	2968	26	Intergenic	novelGene_103182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157.766135783317	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	948	2844	123	2966	508645	651880	FALSE	25	TCCCACCGTTGCAGCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFKAGGTLCHVLGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTYTDEKSKASHHIYPYPSSQEDEEWLRPVMRKDKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSSDVDAEIEDPPIPEKSWKVHAKWILDTDVFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAAANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEEEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNPKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTTGGKEDEDPSKGDQSRSVDPGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQDAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPEEPEKLEGAEEEKVEADTDGQQPEKVKSVYLSYPTTGKPQRTCFSEHNSTENKGENEMNDGDKAQDGENEKNSEKEHDSEVSEDIKSEEKEAEENKELTDTCKERESNIGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMVPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQSMSGRM	485129	651882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_485216_508608_508719_526646_526729_527846_527940_532839_532910_542339_542410_546060_546137_549824_549951_551873_551996_557203_557329_565027_565088_574680_574719_577758_577881_579279_579352_581382_581497_582114_582269_583013_583128_590107_590168_596827_597087_598034_598197_607530_607659_610793_610909_611582_611738_620301_620437_629137_629400_651824
909169	contig_5903_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_173226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	168	509	469162	468821	NA	45	GTGTAAACTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTGYKKKDQSKGLMDHSYQGLHQIESGTARWCLATTTDCSYWDHSRGSWTELEKDVEQNSNSQKKTRFTGLKDWRNSESTAPGHRFGSVVKPLLKFTIHPGIAQPHKTKQH	469329	467464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_-_467500_469300
909170	contig_10882_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_172743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAAATGTTGTCTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	1175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_1200_1700
909173	contig_5696_pilon	-	4352	7	Intergenic	novelGene_117575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTTCGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738128	713373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_716735_730426_730595_731912_732064_732416_732504_733582_733650_734430_734592_737771
909174	contig_6842_pilon	+	1800	1	Intergenic	novelGene_130654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGAAGAGTAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246087	247887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_246100_247900
909175	contig_12512_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_24174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTTGGCTGCTAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519720	520541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_+_519700_520500
909176	contig_9656_pilon	-	1740	5	Intergenic	novelGene_121917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	808	junction_2	118.841280706664	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	638	1093	438091	431074	FALSE	30	TTTAACTATAGTCTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVELLGSYTEDNASQARVDAHRCIVRALKDPNAFLFDHLLTLKPVKFLEGELIHDLLTIFVSAKLASYVKFYQNNKDFIDSLGLLHEQNMAKMRLLTFMGMAVENKEISFDTMQQELQIGADDVEAFVIDAVRTKMVYCKIDQTQRKVVVR	438728	430426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_431139_432062_432207_436344_436427_436929_437030_438026
909177	contig_7963_pilon	-	3181	11	Intergenic	novelGene_58429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	571.133959767759	72	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	707	2065	125592	120910	TRUE	20	TCTTAATATTTTTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQVSVKVGWNL	126298	102720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_102728_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
909178	contig_4131_pilon	-	3513	6	Intergenic	novelGene_127834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2511	2828	91609	87511	TRUE	10	GCCACTTCCGGAGTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENSLRSINLDSYLPFAYLLCRQCLQIHTFIVELPQVCHNFLKLFLVPLAYIFNKSCGVPFVLRCPLTAPADELAVVFAEQVELLSVFFTYHFTVYLLDGLNEVS	97872	85370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_85444_85604_85842_87135_87692_91472_93335_94417_94538_97207
909179	contig_5321_pilon	+	4233	1	Intergenic	novelGene_153864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGATAGTTTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17464	21697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_17500_21700
909180	contig_8541_pilon	-	2188	3	Intergenic	novelGene_105591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.5	7	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	209	892	577314	567093	FALSE	70	AGAAAAAATAAATTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNRRRESRSRSRSTNTAVSRRERERERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQKREEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRKDEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKARENFQCRVVPPAQFRKRWNTDYLIPFSSKLTLLRKLIF	577522	565796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_567204_567245_567472_576967
909181	contig_13565_pilon	-	4450	1	Intergenic	novelGene_162380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGTTGGTGCAATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143740	139290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_139300_143700
909182	contig_8377_pilon	+	5246	33	Intergenic	novelGene_34913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3058.13292058421	4	75	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1167	3504	418	3921	128927	197925	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVALRNQKVLPMVLQVQL	68056	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197772_197871
909184	contig_4797_pilon	-	1928	2	Intergenic	novelGene_6899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGCTAACTTGAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354915	315192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_315787_353581
909185	contig_2636_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_52090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTGGGAAGAAGGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60582	62626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_+_60600_62600
909186	contig_8552_pilon	+	4430	34	Intergenic	novelGene_80065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_33	293.119249450681	437	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	979	2940	345	3284	385286	517971	TRUE	25	CTCATTCATTTCTTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVAVSALPVEDEESSESRMVVTFLMSALESMCKELAKSKAEVACIAVYETDVFVVGTERGRAFVNTRKDFQKDFVKYCVEEEEKAAEMNKMKSTTQANRMSVDAVEIETLRKTVEDYFCFCYGKALGKSTVVPVPYEKMLRDQSAVVVQGLPEGVAFKHPENYDLATLKWILENKAGISFIIKRPFLEPKKHLGGRVMVTDADRSILSPGGSCGPIKVKTEPTEDSGMSLEMAAVTVKEESEDPDYYQYNIQGSHHSSEGNEGTEMEVPAEDSTQHVPSETSEDPEVEVTIEDDDYSPPTKRPKSSEPPQPPVTEPANAGKRKVREFNFEKWNARITDLRKQVEELFERKYAQAIKAKGPVTIPYPLFQSHVEDLYVEGLPEGIPFRRPSTYGIPRLERILLAKERIRFVIKKHELLNSTREDLQLDKPASGVKEEWYARITKLRKMVDQLFCKKFAEALGSTEAKAVPYQKFEAHPNDLYVEGLPENIPFRSPSWYGIPRLEKIIQVGNRIKFVIKRPELLTHSTTEVTQPRTNTPVKEDWNVRITKLRKQVEEIFNLKFAQALGLTEAVKVPYPVFESNPEFLYVEGLPEGIPFRSPTWFGIPRLERIVRGSNKIKFVVKKPELVISYLPPGMASKINTKALQSPKRPRSPGSNSKVPEIEVTVEGPNNNSPQTSAVRAPTQTNGSNVPFKPRGREFSFEAWNAKITDLKQKVENLFNEKCGEALGLKQAVKVPFALFESFPEDFYVEGLPEGVPFRRPSTFGIPRLEKILRNKAKIKFIIKKPEMFETAIKESAASSKSPPRKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	354720	519918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_355059_385279_385385_389216_389356_399496_399632_400484_400669_400843_400873_413731_413787_414371_414416_425338_425417_438167_438225_440288_440352_467628_467740_469380_469447_481397_481582_485140_485200_486302_486375_491808_491993_493179_493239_499102_499175_500085_500270_500893_500953_501354_501430_509984_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512138_512711_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912_517986_518786
909187	contig_2892_pilon	+	4076	1	Intergenic	novelGene_119018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	91	378	265507	265794	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGHSFPFPFFRPRVDVIGKERKKKKGIIKWMEIKTGWTGIKIGATAADSSSQRDAITQGFRAWSVFVETHPPRLRFKTKVKNEESSSQLAVDLEKAICRCDDASKRRITVKAAGRVRVCVLHAGK	265416	269492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_265400_269500
909188	contig_11850_pilon	-	1275	8	Intergenic	novelGene_125219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1061.11173890829	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	105	470	286397	285136	TRUE	25	CTTCTGTGTCAGGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVGKTGWQIDRPQKGQSFKRERTPQKGFCGWIEPRYF	286501	281434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285239_285353_285531_286311
909189	contig_18354_pilon	-	3410	1	Intergenic	novelGene_178081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATATTGTGTGAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4601	1191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18354_pilon_-_1200_4600
909191	scaffold_12510_pilon	+	4274	6	Intergenic	novelGene_151402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	107	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGCAATCTAAATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580278	632783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_580286_595342_595495_596708_597091_619508_619823_629141_629501_629723
909192	contig_15687_pilon	+	1638	17	Intergenic	novelGene_129129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	189.292927760125	3	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	615	1637	133346	152128	FALSE	45	TTAAGAACCCAACAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTLNFSGKGYIIQKRERKPSLATDKPTEDILTYEEFHPFLFSQHLQCPYIEFESFDKAVDEFYSKIEGQKIDLKALQQEKQALKKLDNVRKDHENRLEALQQAQEIDKLKGELIEMNLQIVDRAIQVVRSALANQIDWTEIGLIVKEAQAQGDPVANAIKELKLQTNHVTMLLRNPYLLSEEEDDDIDGNIGVEKNETEPPKGKKKKQKNKQLQKPQKNKPLPVDVDLSLSAYANAKKYYDHKRYAAKKTQKTVEAAEKAFKSAEKKTKQTLKEVQTVTSIQKARKVYWFEKFLWFISSENYLIIGGRDQQQNEIIVKRYLTAGDIYVHADLHGATSCV	112925	152129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_113043_113906_113976_114118_114222_122655_122782_129924_129993_131794_131882_133301_133376_134251_134323_134398_134475_134890_134954_136364_136443_136528_136738_136974_137167_137404_137469_140141_140231_151593_151698_152081
909193	contig_8587_pilon	+	3348	1	Intergenic	novelGene_159097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAATGGAAAAACGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7294	10642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_7300_10600
909194	contig_12837_pilon	+	3593	1	Intergenic	novelGene_57376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2673	2993	370145	370465	NA	35	ATAAATCCAACATTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTKLLSIVGSAYAGWVLWEVDLEREISVHDDCVGAPLGLTSVEGKGQQQGGAEGEVVTQTQTAASAELVGSSGTQIALQSCPLLDNFIHPHGLVLADRPPLKWA	367472	371065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_367500_371100
909195	contig_1836_pilon	-	5424	4	Intergenic	novelGene_71031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3635	4018	681498	509020	TRUE	50	AATAATAATAATTTCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTYRTDQKIPTLGKNSLPFTHSFLLCTTPGLASAIVKSPGLQVGLIMRPEPFSRPWRGNKLTHRKNNLPALLSQELRVGTAPLPRHRHKGSMDFKCLSPLHRPVWDNFNSAGPHYHSTTGYIPEA	685132	368102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_368565_418427_418620_508267_509138_681232
909196	contig_7308_pilon	-	2145	10	Intergenic	novelGene_159606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	360.880404935855	8	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1629	516	2144	524476	500355	FALSE	70	CCAAAAAACACAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGLDWSEESGEELEDSEQASPYQVAWSIRETLRYERHASDDDDTESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASREPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPATCSGTVKGEPCRNQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDSSRKVQHQQQRKPRKKTKPPAL	544373	500353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_500442_502542_502677_503758_503869_506830_507056_511182_511292_518702_519449_524258_524506_524610_524704_542084_542241_544136
909197	contig_3601_pilon	-	3431	1	Intergenic	novelGene_132850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1619	1924	130167	129862	NA	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131785	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_128400_131800
909198	contig_16126_pilon	+	4948	8	Intergenic	novelGene_141872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	246.958477878202	7	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	428	1678	37436	45044	FALSE	25	ATATTTGAACTGTCTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNLISVNNFEDCSLCPTVPIEHGFRRQQSKSNDVEETEIHWKLIPITGGNARSPEDQQGKHGEKRTPDTLKGTTEDDVLTGQVVAEEQCVPAAEPPALSETTERTVLGEYNLFSRKIEEILKQKNVSYVTRIPTPIFSTQEKMKRLSEFIYSKTSKAGVQEFVDGLHEKLNTIIIKASAKGGNLPPVNPNDSGAKMASTAVGRHAVPVSSGDFSGNCLPESLCSDAFKDTNSHEPHSSSAVGLTDVEMSQPHHAAELMVTSDHTVPGDAAREPVEKETKSPSDVNMSAQPALSNFISQLEPEVFNSLVKIMKDVQKNTVKFYIHEEEENMLCKEIKVPGLVTLKKLSCVSFAGVDSLDDVKNHTYNELFVSGGFIVSDESILNPEVITIENLKNFLTFLEELSTPEGKWQWKVHCKFQKKLKELGRLNAKALSLLTLLNVYQKKHLVEILSYHNCDSQTRNAPELDCLIRLQAQNIQQRHIVFLTEKNIKMLSSYTDNGIVVATAEDFMQNFKSLVGFHNSDTDETLPLLGANENLESQSDAVLTLTPLELGVGISQH	32277	48314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_32421_33646_33707_37211_38018_41652_41813_42295_42405_43854_44034_44234_44400_44988
909199	contig_3269_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_117047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	816	1157	242545	242886	NA	35	TGACCATCTAAGATACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSLVLQNSIMRSPESFLLPRPYFPTTDPSSLFPTFAFQSPSNYQCILITCLINVRLQNLVKIFNFFIFGISGWCINLNNNHIKWSSLQDMDIILSLTALYFRIDLEMLFCK	241729	243711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_241700_243700
909200	contig_8050_pilon	-	5508	5	Intergenic	novelGene_114808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1095	1712	438618	434548	TRUE	45	TAAAAGACTGGTATAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLENEKIFVPHPPHIMFFSVEFMDSLKHISGVLTFPIFSIFKGATPLHLTALSSKIAKFPSAVPTKRKFFCLLCLENELQYKQVTESVIFSSVCLLFPSSVLMTRRLPDCVPDTIQLSFSTGRYTKAKHNILLSVTSSEVCASVFKSRKESCPLSLCPQPSQMLAFLLLGFVATMHSTAKFLGNKIYLIRQTNSAEFKMSKT	439712	238470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_239635_431915_434745_436251_436446_437188_437261_438463
909201	contig_11318_pilon	-	3830	2	Intergenic	novelGene_48130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	838	junction_1	0	73	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	15045	14674	TRUE	15	AATTTTGATGTGCCCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGMLSFPSFLPFLLFS	15045	8522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152
909202	contig_10003_pilon	+	1976	1	Intergenic	novelGene_88138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTTCCCATGACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369833	371809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_369800_371800
909203	contig_14745_pilon	+	3122	3	Intergenic	novelGene_147852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_2	14.5	369	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1380	1745	61894	75694	FALSE	25	CAAAACCAGTTTTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSYELCCDMIDVVIDVSCIYGLKEDGSGSAYDKESMAIIKLNNTTVLYLKEVTKFLALVCILREESFERKGLIDYNFHCFRKAIHEVFEVGVSSHRSCGHQTSAPSLKALTHNGTPRNAI	60514	77071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_61959_65463_65613_75542
909204	contig_20058_pilon	-	4118	1	Intergenic	novelGene_109289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56778	52660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_52700_56800
909205	contig_19269_pilon	+	3750	1	Intergenic	novelGene_175628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGGAGAGGACACAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9600	13350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_9600_13400
909206	contig_17964_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_33922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTTCAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424525	422504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_422500_424500
909207	contig_15327_pilon	-	2142	14	Intergenic	novelGene_70770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	75.8867109539495	14	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	24	824	1169101	1135844	TRUE	30	GGCAAAGATGGTGGAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRLTKCGSSCWGWLTMKRPSPRLRAKRPRSGCSSPCSASAGTPSRPFGRSSSQIRNREITLLMGSRRRCLICSICTAT	1169124	1129712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149268_1154657_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
909208	contig_7909_pilon	-	2952	1	Intergenic	novelGene_155944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038881	1035929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_1035900_1038900
909209	contig_5623_pilon	-	2314	15	Intergenic	novelGene_154848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	380.654082616021	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	455	1990	212514	207631	TRUE	10	CACCTCTGTGCTGCCGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	213944	207222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207295_207378_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619
909210	contig_20641_pilon	+	1370	1	Intergenic	novelGene_52880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60973	62343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_61000_62300
909211	contig_9415_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_109862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTGAAAGATGGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002844	2005179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2002800_2005200
909212	contig_7867_pilon	+	3143	1	Intergenic	novelGene_162750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276144	279287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_+_276100_279300
909213	contig_14923_pilon	+	2121	2	Intergenic	novelGene_157756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGGGCAAATATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358972	364267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14923_pilon_+_360371_363544
909214	contig_9995_pilon	+	3933	1	Intergenic	novelGene_47789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGGGGTGGCACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766472	770405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_766500_770400
909215	contig_10354_pilon	-	4122	2	Intergenic	novelGene_50863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAAAATCCTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443039	438854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_441516_441578
909216	contig_15732_pilon	-	6672	4	Intergenic	novelGene_88865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTTCTATTACACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211570	88505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_88659_89194_89724_205217_209210_209572
909217	contig_5005_pilon	-	2489	7	Intergenic	novelGene_84318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_6	540.001671808112	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAAAATGCACGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539801	511521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_-_512952_515062_515362_515555_515745_520412_520621_521921_522041_523352_523445_539649
909218	contig_7171_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_101430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	151	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTTGAACCTTAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573788	1578388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1574318_1576514
909219	contig_9345_pilon	-	3164	22	Intergenic	novelGene_24563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	224.839322825069	1	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	11	2011	922013	892982	TRUE	25	GTGGTGAGAGATTTCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSIAPSRNFTTSPKSSASSYSSVSASPIANGDSTNTSGMHGSGVSRGGSGFSASYNCQESPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEVEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDTHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRIMEVFLVPADPCCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVTDVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSADGSECVTLPVYFRERKSRLSSTSSGAVLYGQPLLVSVPKHKLTLEFLYQAVCERISRYIKQPLPDEFGSSPLELGACNGSRGSCEGERSPCCGL	922023	880893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885133_885467_885587_885853_885925_890053_890276_892943_893100_893734_893927_896573_896669_897644_897729_898482_898708_900023_900183_902070_902245_905275_905394_906192_906334_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
909220	contig_3015_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_163321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCTGCTCTATACAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302865	301826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_301800_302900
909221	contig_19816_pilon	-	1408	7	Intergenic	novelGene_156512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	259.030725333244	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	517	1002	125593	123459	FALSE	35	ATGAAGACTTGATAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCSDSSLGSDVSFMASKA	126791	123052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124414_124556_124658_124935_125577_125780_126164_126435_126731
909222	contig_19362_pilon	-	3717	2	Intergenic	novelGene_157790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	34	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3162	3488	30657	30331	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYYNLHQTEPRTTRWSRATTTDCSDRDHNRVSWTEWEKNVEQNSNSQKKKKDQTCWSDRHWRNPESMAPGHTFNSVPKSLPRFTLQPKIRQVYWANNNTCEECAS	37840	30101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_31139_35160
909223	contig_2646_pilon	-	2311	17	Intergenic	novelGene_69553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.2045671823368	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	79	1920	877063	847232	FALSE	20	TAACGCTGGAGCGGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKWLVRILGTIFRFCDRPVPPARALLKRRRSNSSLFSAVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVKNSLYNAASLLGFPFQLTTKPRVTSACNGTRDVAPSEEVFSSSSSGGLTGSGSWNNMLKLGSKSPDGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCSRRPGGRRHGRGNPEGPLTWKPREQAITEMISEEGGKGLRRPHCTVEEGGHGNPAPPAASNPHSSQRSQMDMLKTRGWGEEQNHGVKTTRFVPKQYRVVETRGPLCSVRSEKRCSKGKISDTENTGGIRVENEVRRGHQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLFRSKTLVRETKEKNYSGKERRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGSQDEILSSAFKLRITRGDIQTLRNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHAFSTFFYPKLRSGGYQAVKRWTKGVNLFEQELILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNTDVNLSEWTHYSMKPHVSEGRLMIAECLLVNMQIISLETNLSHLLSTRCLSSGRRWCGRYFISSCCECARPSRWLLVVLPGWFHIPHALWAENSPHRLCSLPGTELSKVHGGL	877141	846840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_847437_852063_852134_853801_853906_856264_856345_856906_857111_858850_858983_860388_860560_862147_862212_863075_863128_863720_863816_863997_864045_865297_865467_867268_867360_869457_869525_869942_870077_874678_874735_876962
909224	contig_16411_pilon	+	2587	9	Intergenic	novelGene_77312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1596	junction_4	475.143646042962	23	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	1278	2393	131665	152673	FALSE	70	TTTAAAAAAAATAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGR	130387	152867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592
909225	contig_16098_pilon	-	1286	10	Intergenic	novelGene_46013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1461.46629396475	19	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	105	1253	352350	348324	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSRAFRRTKAIHLSPFHSHLRSSSHNGR	354093	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348408_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
909226	contig_14882_pilon	-	6197	6	Intergenic	novelGene_114976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2573	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAAGTCCCCCTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349770	15707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_17002_17217_18148_49616_49648_184891_185215_186178_188441_348413
909227	contig_9771_pilon	-	1682	13	Intergenic	novelGene_156928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	30.7303460225665	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1470	213	1682	565162	496593	FALSE	60	AAAGAGAAACTTGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRKRSGRGISYIFCCFRNNDHPEITYRLRNNSNFELQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAMFALPAEKKWQIYCSKKKDQEENKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTIESLKTALRTKPMRFVTRFIDLDGLSCILNFLKTMDYETSESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRDEVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQMFELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQMPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQIVIQNDKGQDPDSTPLENFNIKNVVRMLVNENEVKQWKEQAEKMRKEHNELQQKLEKKERECDAKTQEKEEMMQTLNKM	627932	496592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_496691_499955_500015_500297_500437_500869_500988_501378_501446_502642_502747_502858_502970_503716_504051_506012_506108_512259_512332_541177_541268_564979_565200_627757
909228	contig_15893_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_128500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGCACTGTTCCGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24448	22257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_22300_24400
909229	contig_12915_pilon	+	4217	1	Intergenic	novelGene_148356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTACTAAGGTCTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149789	154006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_149800_154000
909230	contig_9127_pilon	+	3727	1	Intergenic	novelGene_103027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAACAATGCCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237026	240753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_237000_240800
909231	contig_4469_pilon	+	6528	1	Intergenic	novelGene_21907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	284	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTAATCCCGTAATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439556	446084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_439600_446100
909233	contig_6589_pilon	+	1838	17	Intergenic	novelGene_25720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	67.6838930248549	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	89	1474	460735	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKEQGDLVVQRSSSRLLTERLHVPFCLTFWTGSLSSAGTSPSSCREPEQTPDPQRQPTDCPAKPPDPEAEPAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451702	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_464582_464635_465119_465180_466985_467081_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
909234	contig_15108_pilon	+	3388	1	Intergenic	novelGene_131184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118842	122230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_118800_122200
909235	contig_7171_pilon	-	3157	5	Intergenic	novelGene_101427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	29.6763794961582	157	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	151	621	1572420	1568265	FALSE	35	ATCTTAGCCATGAGTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQSAAGRALLALARSCPPTVPAALGRFCERRPLGRNLIRNPCGQEGLQKWMVENGGDGWVVEENKTMVPDAPAQTCFVTSFSWCGKKQILDLEEEGLWPELLDSGKIDIRVSDWWGARHDCGCQYLLVVQLIDANQAALDNFTAAPEPIQQWNNNACFQVTHVFSNIKKGVRFVSFEHRGQDTQFWAGHYGARVTNSSVTVLVHLP	1572836	1565728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1568409_1569297_1569434_1572145_1572242_1572325_1572438_1572703
909236	contig_19558_pilon	+	1494	7	Intergenic	novelGene_164743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	116.598551544272	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	795	1283	25184	31236	FALSE	45	AGAAGAAGCTTACTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQHKSGIESALKETKGFLDKLHNEISRTLEKIGSREKYINNQLEHLVQEYRAAQAQLSEARERYQQGNGGVTERTRLLSEVTEELEKVKQEMEEKGSSMTDGAPLVKIKQSLTKLKQETVQMDIRIGVVEHTLLQSKLKEKSNMTRDMHATVIPEPTIGSY	21139	31447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_21362_21552_22101_25159_25232_25976_26109_27488_27552_29992_30060_31057
909237	contig_2161_pilon	-	1926	1	Intergenic	novelGene_114896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617418	615492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_615500_617400
909238	contig_14472_pilon	+	3161	1	Intergenic	novelGene_111187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCAGCCGTTCAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416665	419826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_416700_419800
909239	contig_5196_pilon	+	2292	9	Intergenic	novelGene_38698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	74	junction_5	67.6807764435368	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	11	1006	302305	336267	FALSE	35	AATATTATTGGGAGACATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAMRGYLVAIFLSAIFLYYVLHCILWGTNVYWVPPVEMKRRNKIQPCLSKPAFASLLRYHQFHPFLCASDFKKIASLYGNDKFDLPYGTKTSAEYFRVALSKLQSCDLFDEFDNVPCKRCVVVGNGGVLKNKTLGEIIDSYDVIIRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKINSHGFWKKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKNAYHNVTAEQLFLKDIIDKNYVISLTQE	302294	337553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_302394_304819_304898_309130_309235_310808_310873_328015_328112_331045_331233_331341_331480_334900_335054_336180
909240	contig_14450_pilon	-	5129	1	Intergenic	novelGene_49052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACTATAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1371872	1366743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1366700_1371900
909241	contig_16594_pilon	-	4754	10	Intergenic	novelGene_53814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2614.72029521749	128	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	490	1359	165546	121101	TRUE	45	CTGTATGGAAAAATAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	272929	115173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_242309_242430_272662
909242	contig_18163_pilon	-	1468	5	Intergenic	novelGene_35313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2581.87174110179	46	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	6	1091	11553	9125	FALSE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTQTGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAQTLRVNLRTALRYYNQSDNGSHTFQWMFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWEPPPQSIMGIVAGLVVFGPAGCWRCGGCSCDLRKKSLGREGWGLSFLIQLEGFDPQVGVFASSASL	11558	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9325_9444_9721_10375_10652_10955_11226_11489
909243	contig_7630_pilon	-	2682	3	Intergenic	novelGene_133654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	11	junction_2	10	75	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	17	382	458381	454700	FALSE	45	GAAGAAAAAAAGGCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAVQIMSRIYHDSALRNKAVQSARLPGAWDPAAHQGGNGILLEGELVDVSRHSILDAHGRKERYYVLYVQPSRIHRRKFDSKGNEIEPNFSATRKVNTGFLMSSYSRYPPPLLLQGSPTSVAFLDP	458397	452399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_454898_456684_456761_458289
909244	contig_6228_pilon	-	2256	3	Intergenic	novelGene_164489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_2	45.5	131	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	131	1675	174788	168240	FALSE	80	AAAAAGGAAAAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLANHGLILLQQLNAQREFGFLCDCTVAIGDVYFKAHKSVLASFSNYFKMLFVHQTSECVRLKPTDIQPDIFSYLLHLMYTGKMAPQLIDPVRLEQGIKFLHAYPLIQEASLASQGAFSHPDQVFPLASSLYGIQIADHQLRQATKIAPAPEKLGREPRPPTSRVSHEQVPEASQLSQLPSNLTQVNRTNMTPSDPLQTSLSPELVSTPVPPPPPGEETNMEASSSDEQPTSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGVPFTSSQPGESRVPLSLCSNAADLGKDAMEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTGKPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNMLVQTNKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSILLGTGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD	188875	167658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_169612_174615_174801_188757
909245	contig_511_pilon	-	839	2	Intergenic	novelGene_132730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	306	junction_1	0	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	321	839	77119	53167	FALSE	30	TAAGAATTTCTACTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGSAELYDQALLGILQHVGNVQDFLRVLFGFLYRKTDFYRLLRHPSDRMGFPPGAAQALVLQVFKTFDDMARQDDEKRRKELEEKMRRNEEEAKAIAAAAAEKEPVPAPVQEIEINSTTELDGPQEMEKVQQPPGAQGAVQEEAHSLEEAEPPGAVVGVAEVPREPPELPK	77439	53166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_-_53494_76927
909246	contig_9455_pilon	-	1713	3	Intergenic	novelGene_161830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCAGCAACAGCGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434422	219869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_-_219999_418393_419954_434398
909247	contig_7909_pilon	+	2408	1	Intergenic	novelGene_155879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79944	82352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_79900_82400
909248	contig_2817_pilon	+	3275	3	Intergenic	novelGene_104342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_1	47.5	42	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	24	2414	282605	289963	FALSE	70	TTGTAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTEKFENMKSLLSNEVNEKAKKLAEMEREYEKSFSEIRQLKRELENFKAKLAQHVRPEEHEQLKNRLEQKSGELGKKITELTSKNQALQKEIEKVYLDNKLLNQQVHDLTVEMKSHYVPLKVSEEMKKSHDVIVEGLNKKLLDVTQKYSDKKLEMGKLLMENDSLSKNVSRLESVFIPPEKHEKETVALKSSITELKKQLSELTKKCGEDQEKIHALMSENTNLKKTISNQYVPLKTHEEVKTALSSTLDKTNRELLEMRKKIEDKNQDSLKIKHENDILKRNLENTHNQMKAEYISLKEHEEKMSTVSKSMKKVEDNSAEILANYRKGQEEIVRLHAEIGAQKKELDTIQECIKLKYTPITSFEECERKFKAAEKELKEQLSEQTQKCSVREEEAKKCKQEIEKLRKEIVSLQKNLKEKNVLIENSHEMERALSRKTEDLNKQLKDLLQKYTEVKNEKEKLAEENAKRTPEILAAQTLLQKQPVPLEQVEALKKSLNDTIENLREELKNKQRCYEKEQQTVTKLHQMLENQKNSSVPLVEHLQIKEAFEKEVGIIKASLKEKEEESQNKTEEVSKLQSEVHNTKQALKKLETREVVDLSKFKAMKSDLETQISNLNEKLANLNRKYEDACEEVLHAKKKELSAKDEKELLHSSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELERRIQESAEQIEAKDNKITELLTDVERLKQALNGISQLTYTCASPSTRQSQLVETLQRQVESLQQQLADTDRQHQEVIAIYRTHLLSAAQVKNCFSFGKEIILENCFLFLYCFSRKNFFFLFASKFM	282581	290824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_+_284663_287013_287167_289783
909249	contig_91_pilon	+	2745	6	Intergenic	novelGene_127136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.7788353860364	98	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	554	2266	1161093	1164566	FALSE	10	GACTGTTGTTTTATTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETFRNLASVVSRNFNDGERLSSEHIMVRFMKNNIWSSMLGAISESHDNKEQHENQKRSSRSRTVKNLCESNEGNWCGNTFSWIPNLTVLKRNPSEVNRFECCEHRKAFMDHPSHKHRTRSHTRCNTCQCKECGETCSSPSHLTTSMRILNRKKLHKCKVCGNDFICISLLKNSVTRLTGEKRYECNECGKHFCTFTSFRTHVRRHKHECKECKTYSHPSSLNLHKFHERDKPYECKECGKAFSEASSLTKHKRTHSGERPYECKECGKAFSETSSLTKHKRIHSGERPYECKECGKAFSQSSHLTIHIRTHSGQRPYECKECGKAFSYASSLTAHIRTHTGERPYECKECGKAFRHASHLTTHVRTHSGERPFECKECGRAFSDSSALTSHIRTHSGEKPYECKACGKAFSHASSLTIHIRTHSGVTPYECKECEKTFSDPSALTLHKRTHTGEKPYKCKECGKAFRCSSHLTAHRRTHSGVRPYKCKECGKAFSRSSHLTTHIRTHSGEKPYKCKECGKAFRDTSALASHIRTHTGERPYECKECGKTFSQASHLTTHKRIHSGEKS	1138973	1165045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1139031_1140644_1140795_1140939_1141193_1160999_1161127_1162309_1162461_1163038
909251	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
909252	contig_13901_pilon	+	4478	2	Intergenic	novelGene_146648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGTGCTTTTAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212532	217305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_215810_216104
909253	contig_13823_pilon	-	6449	43	Intergenic	novelGene_145254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_42	162.662847061211	404	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1566	4701	593	5293	293990	226238	FALSE	45	CAAAAGAAGATGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVRDNVKIAMDQYGKFSKVPEWQRLAGKAAKEVEKFAKEKVDLVLMHWRDRMGIAQKENLTQKPVVLRKRRQRIKIEANWDLFYYRFSQDHARSNLIWNFKTREELRDTLESEMRAFNIDRELGSANVISWNHHEFEVKYECLAEEIKIGDYYLRLLLEEDENEESGSIKRSYEFFNELYHRFLLTPKVNMKCLCLQALAIVYGRCHEEIGPFTDTRYITGMLERCTDKLERDRLILFLNKLILNKKNVKDLMDSNGIRILVDLLTLAHLHVSRATVPLQSNVIEAAPDMKRESEKEWYFGNADKERSGPYGFHEMQELWAKGMLNAKTRCWAQGMDGWRPLQAIPQLKWCLLASGQAVLNETDLATLILNMLITMCGYFPSRDQDNAIIRPLPRVKRLLSDSTCLPHIIQLLLTFDPILVEKVGILLYLIMQDNPQLPRLYLSGVFFFIMMYTGSNVLPVARFLKYTHTKQAFKSEETKGQDVFQRSILGHILPEAMVCYLENYEPEKFSEIFLGEFDTPEAIWSSEMRRLMIEKIAAHLADFTPRLQSNTRALYQYCPIPVINYPQLENELFCNIYYLKQLCDTLRFPDWPIKDPVKLLKDTLDAWKKEVEKKPPTMSIDDAYEVLNLPQGQGPHDESKIRKAYFRLAQKYHPDKNPEGRDMFEKVNKAYEFLCTKSAKIVDGPDPENIILILKTQSILFNRHKEDLQPYKYAGYPMLIRTITIETSDDLLFSKESPLLPAAAELAFHTVNCSALNAEELRRENGIEVLQEAFSRCVAVLNRSSRPSDMSVQVCGHISKCYSVAAQFEECREKITEMPGVIKDLCRVLYFGKSIPRVAALGVECVSSFAVDFWLQTHLFQAGILWHLLGYLFNYDYTLEESGIQKNEETNQQEVANNLAKLSVLALSRLGGYLSEEQATPENPTIRKSLAGMLTPYVARKLAVVSVTEILKMLNSNTESPYLIWNNSTRAELLEFLESQQENMIKKGDCDKSYGSEFVYSDHAKELIVGEIFVRVYNEVPTFQLEVPKAFAASLLDYIGSQAQYLHTFMAITHAAKVESEQHGDRLPRVEMALEALRNVIKYNPGSESECTGHFKLIFSLLRVHGAGQVQQLALEVVNIVTSNQDCVNNIAESVVLSNLLALLHSLPSSRQLVLETLYALASSTKIIKEAMAKGALIYLLDMFCNSTHPQVRAQTAELFAKMTADKLIGPKVRITLMKFLPSVFMDAMRDNPEAAVHIFEGTHENPELIWNDSSRDKVSTTVREMMLEHFKNQQDNPDVNWKLPEDFAVVFGEAEGELAVGGVFLRIFIAQPAWVLRKPREFLIALLEKLTELLEKNSPHGETLETLTTAAVCLFSAQPQLADHVPPLGQLPRIIQAMNHRNSAIPKSAIRVIHALSENELCVRAMASSETIGPLMSGMKKRADTVGLACEAINRMFQREQSELVAQALKADLVPYLLKLLEGIGLENLDSPAATKAQIVKALKAMARSLQYGEQVNEILSRSSVWSAFKDQKHDLFISESQTAGYLTGPGVAGYLTAGTSSSVMSNLPPPVDHEAGDLGYRT	301029	225081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_226345_232332_232433_234344_234489_236001_236143_236458_236639_238299_238474_238831_238875_239040_239211_245507_245621_246031_246107_248110_248211_250428_250521_252324_252503_253629_253747_255806_255921_257972_258141_258856_259037_260010_260131_260991_261067_261509_261695_261870_262007_266185_266265_267103_267220_268941_269144_271338_271494_273581_273628_274136_274292_277434_277520_278617_278821_279642_279748_281226_281329_282907_282971_284642_284803_284885_284990_286911_287066_289450_289534_293008_293153_293957_294054_294291_294412_296579_296702_298909_298967_300113_300264_300949
909255	contig_12951_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_68133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGCAATGGTTAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101945	104063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_101900_104100
909256	contig_6929_pilon	-	6217	2	Intergenic	novelGene_139395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_1	0	192	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTTCTATGCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115519	108247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_113575_114629
909258	contig_5039_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_65057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCACAGGCTGGGGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1830575	1829898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1829900_1830600
909259	contig_2547_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_165460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATGAGAAACTATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17002	19152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_17000_19200
909260	contig_5826_pilon	+	2657	21	Intergenic	novelGene_71516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_4	357.524069119829	204	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	784	2283	189022	228733	FALSE	40	ATTAGATAATTTCAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVSMKENGAEHLCSENLPQSREYPTLPVPGHTSSTDSTVISSDASSEILNMAAGGLDCRSLCEKEEDTRSASTMIETQGTSLAHDDTPLQGSMSEDKAILNLEAKEEPETMEEHRTECAAGDTAVSPLPVTTVKSVNFRQSDNISANEKEVEAEFLRLSLGFKCDWFTLEKRVKLEERSRDLAEENLKREITNCLKLLESLTPLCEDDNQAQEIIKKLEKGITFLSQCTVRMASRAEMLGAINQESRVSKAVEVMIQHVENLKRMYAKEHAELEELKQVLLQNERSFNPLGDEGDCQIKKRSASLNSKPSSLRRVSIVSLPRNTGNVGTMAGMENNDRFSRRSSSWRILGSKQSEHRPSLCRFISTYSWADAEEEKCEVKTKDNSEPPGEETVERTRKPSLSEKRNDPSKWDGSSIYGTIASWATNLKTSFRKANKALWISAAFTVLFAALMSFLTGLFFQKPVDATPTQSGDSWMSLEHALWPFTRLQHNGPPPV	174606	229107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_175006_184633_184715_185354_185452_187989_188138_188963_189046_200475_200523_200613_200679_201039_201148_203439_203511_207726_207785_209562_209627_209712_209741_209994_210136_211764_211900_217606_217755_219138_219183_221155_221219_221336_221387_221686_221789_226859_226968_228489
909261	contig_4754_pilon	+	2198	4	Intergenic	novelGene_35892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	44.1915024511375	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTTACTTTGAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114567	123566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114787_119671_119871_121506_121634_121913
909262	contig_2438_pilon	+	1322	5	Intergenic	novelGene_112037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	42	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	72	671	310588	312871	FALSE	10	GATGGACTCTGGCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305094	313522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
909263	contig_7720_pilon	-	5971	10	Intergenic	novelGene_155759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	162	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	298	690	841562	841170	TRUE	60	CACCCAAAAGAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGEAEGRQGQGSPLVTWIGTVATTMDSTMLAIMRMMQDWASFRSVVHTVTMSQNQLNPQTVPGSPMRTVLPPINQKPELPARVQKEELCSERFNSNPALEPQPGCVAHLPEPTLSSAEGGAWHSINHFA	841859	631105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_631689_642450_642988_643574_643785_665535_665846_682464_682564_712463_713169_784135_784219_837989_838123_838508_840982_841021
909264	contig_11855_pilon	-	1773	5	Intergenic	novelGene_67139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	140.308588475546	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	100	408	2711839	2710017	TRUE	25	CTCCTGTATCACCATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2713546	2708596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2709881_2709935_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483
909265	contig_3161_pilon	+	3301	1	Intergenic	novelGene_84509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1527	1931	358962	359366	NA	30	TTTTAGCAAACTGTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDGSWLKAENTKKDVYLCFTDYAKAFNCVDPNKLWITLQRMGILEHLIVLIRNLYMDQEAVVQTEQGDTAWFKVRKGVRQGCILSPYLFNLYAKQIIREAGLYEEEGIRIGGRLINNLCYADDTTLLAENEDN	357435	360736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_357400_360700
909266	contig_1856_pilon	-	2974	1	Intergenic	novelGene_84879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255732	252758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_252800_255700
909267	contig_7410_pilon	+	3191	2	Intergenic	novelGene_106100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_1	0	44	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAATTTTGATTTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408350	412177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_411246_411881
909269	contig_546_pilon	-	7983	5	Intergenic	novelGene_117218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	174	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1716	2039	136902	136579	TRUE	15	TCGGAGCTGCTGCTGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLQTTKLCPSSVTEKETLVTIISVGRGSQLGHSSLEQSSQTRWSAPSKTSTASTTAATSSTKSAASTKATSATRATSTSSFRFCNWKKPHSFYMYENTHQCTSPV	138617	128820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_129115_129177_129214_130533_132456_132718_132872_133039
909270	contig_6375_pilon	-	2891	1	Intergenic	novelGene_73056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	510	1533	207	1739	662656	661124	NA	5	TCTCTCTCCTCCACTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPNKEASSLNSSPAGLICLPPISEELQLVWTQAAQTSELDDNEHLLQTFSYFPYPSLADIALLCLRYGLQMEKVKTWFMAQRLRCGISWSSEEIEETRARVVYHQDQLHFKSLLSFTHHAGRPLEEIPPSLSEPTQMKGLKVEPEESSQIPPMPLSHQKVKEPLMAHGSRAFPHQSDFWQDLQSSSLSKEQAGRAPDQSHGLGTASWNHSTAAHQPRASEKPSPFSLLASSCKKESASRVTPSSSSTSSFQVLANGATAASKPLQPLDCVPQPLSPNEQTLPPHLEPAWPQGLQHNSVPGRVGPMEYLSPDMQRHQRKTKRKTKEQLAILKSFFLQCQWARREDYHKLEQITGLPRSEIIQWFGDTRYALKHGQLKWFRDNVVPGAPSFQDPAIPTPLPTARSLNEWAETPPLPIPPPPPDIQPLERYWAAHQQLQESDILQLSQASRLSTQQVLDWFASRLPEPAEVVVCLDEEEEEEEEELPEDDGDEEEEEEEDDNDNDDDVIIQD	662862	659971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_660000_662900
909271	contig_11316_pilon	+	1202	2	Intergenic	novelGene_122638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAGACGACCCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137459	138861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137542_137741
909272	contig_15087_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_37253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGAGGGAATATGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229641	231377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_229600_231400
909273	contig_12324_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_166648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTACCTTTATCTTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106988	109049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_107000_109000
909274	contig_12624_pilon	-	3519	12	Intergenic	novelGene_60941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGCCTCTTTATTGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55584	6012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_6094_11631_11707_30347_30421_32959_33049_38761_39838_41855_41950_42821_42971_43099_43146_44518_44852_45913_46766_50394_50433_54971
909275	contig_9415_pilon	-	2287	5	Intergenic	novelGene_109738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1452.94958618666	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	446	508	561640	561578	FALSE	55	ACAAATAGTTTGAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGKLTLKIPWKNLYGEAVVATLAGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELSRIEEALQKAAEKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVKITDIHIKYEDDVSDPTRPLSFGVTLGELSLLVMLTLFQISLKPIMCYFKVTG	598811	559798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_561704_565217_565328_573909_574012_575914_576011_598737
909276	contig_7840_pilon	-	2374	10	Intergenic	novelGene_69034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	274.993512830331	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	51	1064	427684	367613	TRUE	5	GCACTTTCTGTCCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELPAPLSYFQNAQMSEDNHLSNTNDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAATWTGRFHFL	427734	364882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367642_373334_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403145_403288_406624_406882_427609
909277	contig_9011_pilon	+	5760	25	Intergenic	novelGene_159261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_14	90.1883445906399	302	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1037	3114	35	3148	16748	190435	FALSE	75	CTATAAATACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFAFTPSEVNMSLKNEPRVNTSALQKIAADMSNLIENLDMRELHFEGEEVDFDVSPSDPKTREVSIPFSAVYNTQGFKEPNIRSYLSGCPIKVKVLEVERVTSTTKLPSSDFYTIELTHGEFKWQVKRKFKHFEEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVKGEEPREMPSLPRSSENRIREENFLGKRKQLEDYLTKLLKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIRDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNCCGQGRACYRWSRRWLIVKDSFLLYMKPDNGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGLRIDNLSRTLILKCNSYRQARWWGGAMEEFIRKHGSDFLKDHRFGSYAAIQENTLAKWYVNAKGYFEDVANAMEEAKEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFIMLYKEVGLALGINSEYSKRTLMSLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVVIDQSIAFVGGIDLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKHVIMGPSLLSLTAETTESTVSLYLKDKSESNKNLPILKSVDNVDSKMKGIGKPRKFSKFSLYRQLHRHHLQSMDSISSTDSTSNTGSVRSLQTGVGELQGETRFWHGKDYCNFVFKDWVQLDKPFADFINRYSTPRMPWHDIASVVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKPKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELKYQVPESVCAKVQLLRSSADWSAGIKYHEESIHTAYVNVIENSKHYIYIENQFFISCADDKVVFNRIGDAIAQRILKAHRESQRYRVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNAVQAIMHFNYRTMCRGENSIVGQLKAKIGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEIAVIVQDTETVPSVMDGEEYQAGQFAQGLRLQCFRVVLGYLSDLNEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFISKPILAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLRPSVGTKEAMVPMEVWT	16713	193047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_16908_17161_17290_22861_23008_23214_23324_25062_25129_39754_39814_40827_40921_54162_54316_57343_57494_58683_58768_67684_67767_74083_74195_78332_78534_82681_82896_89343_89473_90313_90433_95141_95256_111443_111555_114691_114781_133018_133133_134392_134443_161904_162040_172010_172165_188379_188498_190210
909278	contig_8620_pilon	+	2282	15	Intergenic	novelGene_173879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	165.258424713464	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	431	1948	103890	169521	FALSE	15	CTGAATCTCTCTTCCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFKLRVNSARHYKDLWNMSDDKPFLCTAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHEMTLKFGPARNDSVIVADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEFKKASEDDIKKMPLDLSPLATPIIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKEVPLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNVLLTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQAPSSNRPIVPVPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPASITSSNVHVPATVPLVRPVTMVPSVPGIPGPSSPQPVQSEAKMRLKAALTQQHPPVTNGDTVKSHSSGLVRTQSEESRPQSLQQPATSTTETPASPAHTAPQTQNTSGRRRRAANEDPDEKRRKFLERNRAAASRCRQKRKVWVQSLEKKAEDLSSLNGQLQSEVTLLRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTAMQKKSGYHTADKDDSSEDISVPSSPHGEAIQHSSVSTSNGVSSTSKAEAVATSVLTQMADQSTEPALSQIVMAPSSQSQPSGS	82270	169855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_82467_95446_95548_101046_101137_103846_103922_117607_117678_125936_126034_129109_129229_129388_129518_133511_133691_134326_134442_136639_136727_149880_150031_155160_155368_166442_166549_169294
909279	contig_11422_pilon	-	1523	2	Intergenic	novelGene_99084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGGTGTTAGTAAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2338	745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1842_1911
909280	contig_5236_pilon	-	2127	13	Intergenic	novelGene_100957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	199.371512508683	14	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	90	1790	1011714	1006205	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVSPKHQLGQGDVLQMREKRVPCLPLN	1011803	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006286_1007290_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
909281	contig_9516_pilon	+	2471	15	Intergenic	novelGene_106153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	35.5912882025696	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	644	2326	702153	710833	FALSE	30	TCTATTAACTAGAGCGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLEEAKMRRAELQRARALQSYYEAKARREKKIKSKKYHKVVKKGKAKKALKDFETLRKVDPTAALEELEKIEKARMMERMSLKHQNSGKWAKSKAIMAKYDLEARQAMQEQLAKNKELTQKLQAASESEEEGGGVEENELLVPDVVNEVHINANEPNPWMRRSCTSDAKEVEIQKDPEQPPEPMAHEDSESEGEESPVAEEETLLKEFEERRSLRKRPELNQDAEPVGGREAQDASSQEVLSELRALSRKLNKENQEKQSRKQKGNSVRAVLPVQREEPAQEEEEPLLLQRPERVQTLEELEELGKEGYLQNTELPRPVSQGQQTERNPDNQPGAPKKKKRKEEMIDLQNLLTTKSPSVKSLAVPTTIEALEDEEERDQKQMIKEAFAGDDVIRDFLKEKKEAVEASKPKDVDLTLPGWGEWGGVGLQPSAKKRRRFLIKAPEGPPRKDKNLPNVIINEKRNIHAAAHQVHVLPYPFTHHHQFERTIQTPIGSTWNTQRAFQKLTTPKVVTKPGHIIKPIKAEDVGYRSSSRSDLSMVQRNPKQLSVRHKKQLKKNSVD	690604	710978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_690684_691718_691795_692663_692735_694231_694297_695915_696015_696339_696488_702047_702168_702265_702361_702961_703086_703168_703247_703704_704096_706498_706912_707643_707838_707971_708072_710560
909282	contig_610_pilon	+	2318	7	Intergenic	novelGene_76800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	146.643558785694	1	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	4	969	296038	314475	FALSE	55	AAAAACTTTCAATATAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLQHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAAGETDAPKFILYLLLVPILLIVFVLGFFTWSGQRDRGKEFTEEKKGMETHQEIPDVCSHSGVNTVYDTVSYPNKTTPEEDPTHTLYSVAQTHKTVEKPHSLPMSLDTPGLFTYENII	296034	315824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304854_306145_306407_306612_306733_309314_309419_313377_313441_314403
909283	SIRV1	-	690	4	NNC	SIRV1A	novel	744	3	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGGCGCAAGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11629	10647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV1_-_10792_10882_11022_11061_11243_11403
909284	scaffold_880_pilon	-	2545	6	Intergenic	novelGene_121464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTCTAAGCAACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489052	456032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_456178_479494_479614_482288_482360_484796_484938_485540_486611_488053
909285	contig_7171_pilon	-	3105	9	Intergenic	novelGene_101363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_8	17.1755640373177	243	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	741	1211	1354262	1353537	FALSE	25	CAGGTTGACTCCAATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEARSSGLVSRVFPDKEVLFHAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFRPITVRLPFQCSQSELSSLLYAVCSDWWAIGYPPIFIGPTLIFPASSVAVTLFLPRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1361020	1351642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1357446_1360023_1360113_1360257_1360465_1360899
909286	contig_10734_pilon	+	2279	17	Intergenic	novelGene_51424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	80.5073511783241	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	11	2149	2117048	2156004	FALSE	25	AATTTTATTTTGTTGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLMERRRLNQLLLPLLQGPDITLSKLYKLIEESCPQLANSVQIRIKLMAEGELKDMEQFFDDLSDSFSGTEPEVHKTSVVGLFLRHMILAYSKLSFSQVFKLYTALQQYFQNGEEKTVEDTDMELMNREESERKMEKEELDVSVREEEVSCSGPLSQKQAEVFLSQQASLLKNDETKALTPASLQKELNNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQAELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMDALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLESLNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQVRSSNGIFLPQGCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVAGITALNSMEGVYRKAVVLQAQNQMSEAHKLLQKLLIHCQKMKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPVLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQALSLLHMAIEPILADGAVLDKGRAMFLVAKCQVASAASYDPPKKAEALEAAIENLNEAKSYFSKVDCKEQIRDVVYFQARLYHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL	2117037	2156134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2117093_2120076_2120157_2120917_2121028_2122421_2122615_2123922_2123990_2126464_2126567_2127606_2127798_2142426_2142509_2143153_2143244_2145470_2145653_2146708_2146845_2148566_2148675_2150930_2151053_2151720_2151829_2151907_2152056_2155222_2155386_2155792
909287	contig_8597_pilon	-	3388	1	Intergenic	novelGene_158709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2051	2425	77982	77608	NA	70	GCACAATTAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRPLWKSIWHFIKKLKIEVPYDPTISLLGIYPREIRAVRQINICTLVFIAALFTVAKKMETTYVPINGQIDKLWYSYTRKYYAAIKNNDESAKHLTTWMNLEGIMLSEISQTQKDKYCIRPLL	80032	76644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_76600_80000
909288	contig_19096_pilon	-	1999	3	Intergenic	novelGene_173096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACAATAATAAATGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15992	9831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19096_pilon_-_10771_13922_14884_15893
909289	contig_6374_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_158430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	124	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACATCATAAGTTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14129	16395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_14100_16400
909290	contig_16098_pilon	-	885	6	Intergenic	novelGene_46025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	965.276623564458	39	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	118	765	352350	348413	FALSE	30	TGGTACCAGACTCTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_350329_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
909291	contig_21369_pilon	-	2965	3	Intergenic	novelGene_176297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	6	2	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	151	378	19962	7730	FALSE	10	GCCCTCCATCTGTTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFRFFVFFFIYICQFAVHVLQAAGFHNWGNCGWISSLTGLNKSIPVGVLMIIIAALFTASAVVSLVMFKKVHGLYRTTGASFEKAQQEFATGVMSNKTVQTAAANAASTAATSAAQNAFKGNQI	23345	5142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_7895_19899_20018_23250
909292	contig_14525_pilon	+	3878	11	Intergenic	novelGene_149776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	25.1880924247947	217	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	134	1687	187915	224148	FALSE	30	CTAAATATGCGTGTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEELGIREECGVFGCIASGEWPTQLDVPHVITLGLVGLQHRGQESAGIVTSDGLSVPIFKTHKGMGLVNHVFTEDSLKKLYISNLGIGHTRYATTGNCELENCQPFVVETLHGKIAVAHNGELVNSTRLRKKLLRHGVGLSTSSDSEMITQLLAYTPPQERDDTPDWVARIKNLMKEAPTAYSLLIMHRDVIYAVRDPYGNRPLCIGRLIPVSDINGKGKNPSETEGWVVSSESCSFLSIGAIYHREVLPGEIVKISRHNVQTLDIISRSGGNPVAFCIFEYVYFARPDSIFEGQMVYTVRYRCGQQLAIEAPVDADLVSTVPESATPAALGYAKKCGLPYVEVLCKNRYVGRTFIQPNMRLRQLGVAKKFGVLSDNFKGKRIVLVDDSIVRGNTISPIIKLLKESGAKEVHIRVASPPIRFPCFMGINIPTKEELIANKPEFVHLAEYLGANSVVYLSVEGLVSSVQERIKFKKQKIEKQDIIIQENGNGLKCFEKNGHCTACLTGEYPVELEW	187781	226339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_188043_214285_214353_214853_215061_216794_216908_217010_217157_217657_217731_218588_218741_219766_219895_220851_221074_222759_222881_223951
909293	contig_12837_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_57400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	419	985	449081	448515	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTRYYCKEPKETYISGKNILCSWVGRLNIVKMSVLPKAIYRYSAILIHISPAFFNEMEKQIPNFIWKGKRPQISKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTACYWYNNRYIDQQNRIENPDISSSTYEQLIFDKSPKSVNWGKHSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKTTSKWIKDLNIK	449499	446228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_446200_449500
909294	contig_1719_pilon	+	2238	15	Intergenic	novelGene_87343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	149.045260897213	1	72	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	298	1755	669224	726560	FALSE	40	AAAACACACATCTCGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKYLTPKSPVFVAQVGQDLVSQTEEKLLQRPCKELFSACAQSVHDYLQGEPFQEYLHSMYFDRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKRLEKKRIKKRKGESMALNEKQILEKVNSRFVVNLAYAYETKDALCLVLTIMNGGDLKFHIYNMGNPGFEEERALFYAAEILCGLEDLHRENTVYRDLKPENILLDDFGHIRISDLGLAVKIPEGDLIRGRVGTVGYMAPEVLNNQRYGLSPDFWGLGCLIYEMIEGQSPFRGRKEKVKREEVDRRVLETEEAYSHKFSEEAKSICKMLLTKDAKQRLGCQEEGAVEVKRHPFFRNMNFKRLEAGMLDPPFVPDPRAVYCKDVLDIEQFSTVKGVNLDHTDDDFYSKFSTGSVSIPWQNEMIETECFKELNVFGPNGTLSPDLNRSHPPEPPKKGLLQRIFKRQHQNNSKSTPNSKTSFNHHINSNHVSSNSTGSS	635714	727043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_635845_654878_654992_669169_669248_692692_692794_693635_693729_701325_701390_702702_702844_704841_705033_708745_708784_710506_710597_712334_712544_718062_718201_723078_723217_724669_724802_726461
909295	contig_2739_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_165830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1740	2201	56942	56481	NA	65	AAGAAAAGACCAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHVNIAILGISELKWTGIGHFELDHHVVSYARNDSLKRNDVAFIVKNNISRSILKYSAVSDRIISIHLQGRPVNMTIIQIYAPTTKAKDEEIKDFSQLLQSEIDQTYNQDTVINTGDWNAKVGNIERSVVRKYSLGDRKQCQRSNDRILQDQ	58681	56085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_56100_58700
909297	contig_3394_pilon	+	3192	1	Intergenic	novelGene_152693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGCAAAAATTAGCAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472122	475314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_472100_475300
909298	contig_6102_pilon	-	1710	15	Intergenic	novelGene_31993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	347.68529782913	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	125	1174	432248	422774	TRUE	50	AAGAGAAGGGGAAAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPCKVWRCTGNVQR	432506	421495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_421569_421802_421868_422138_422301_422537_422797_423308_423439_424435_424590_425298_425413_429166_429239_429548_429680_429962_430001_430140_430201_431438_431564_431940_432057_432161_432294_432427
909299	scaffold_12124_pilon	+	3296	4	Intergenic	novelGene_22100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	146	junction_1	185.13238506539	70	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	460	810	867290	872529	FALSE	15	CCATTTGGCTGTACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPGEEKCDFGLFVCNSVF	862996	875015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_863427_867260_867354_869990_870110_872361
909300	contig_6100_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_168110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268462	267186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_-_267200_268500
909301	contig_8674_pilon	-	2263	3	Intergenic	novelGene_102886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGACAAAGAAGGAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189134	80673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_81767_176793_177629_188799
909302	contig_2689_pilon	-	2026	5	Intergenic	novelGene_100824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_3	93.6973185315354	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	23	469	157292	153572	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAKVEKMRQSILEGLNFSRQNHPLPFPPPPALPFYPASMYPRHFGPVPPSQGRGRGFAGVCGFGGPYGETVATGAYRAFRVAAAAGHSGAFSGNDNSRTSKLQGGVQPIPSQGGKLEIAGTVVGHWAGSRRGRGKPRAFPPTGSFCWRTSKRTS	157314	143023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_144493_153483_153581_153954_154098_156318_156457_157135
909303	contig_4364_pilon	+	5625	2	Intergenic	novelGene_110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	0	346	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGTCTGTCCTACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006027	1036631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1011331_1036309
909304	contig_16804_pilon	-	4547	7	Intergenic	novelGene_167282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_1	31.4929445361267	271	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	21	2342	20463	2250	FALSE	30	TTGAGTAAGGATATTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCHCRHMERWKASIENDDFEVEKPKGYNPDLYTSRANNITVESEPAAIPSEPFKVKHELLKEPWKESAEGKRGFPIYPLERSELKSEDMNFENKDDYDRNGHCHSQDYPGRYSEEESKSSTSGIAGDVTDDLQEVRAPTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTLPTPVLASSAGSRNSLSEPEASEHGFSNGAALVAQIQKESFLAPVFTKDEQHHRHPYEFEVERDAKARSLEQFSATHGHPPIVLNGWHGESAIDLSCTSEGSPGATSPFPVSASTPKIGTISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHVEGGMDLIFLKEQTLQAGILEVHEDPGQATLSTTHPEGPVPATSAPETVTAASSQAEKAIPSKSLLDWLRQQSDYSLEVPGFGTNFSDKPKQRRPRCKEPGKLDINFLNGEERVPAVPKEPGPRGFLPENKFNHSLTEPVLRDAGPRRRGRRPRSELLKAPAIVTDSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQNMRNMPGIPLTGLVGFPAGFATMPTGEDVKSTLSMLPMMLPGMATVPQMFGVGGLLNTPMTTTCTSPAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSRDVKTDTLAEDKPGPSPFSDQSEPAITTSSPVAFNPFLIPGVSPGLIYPSMFLSPGMGMALPTLQQARHSEFVGLESQKRKKKKTKGDNPHPHPEPAPRSEREPSSNQNCTEASAPLPPDREHVAQAGDGGPKDSNNNTN	20483	44	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_3147_10676_10797_12070_12263_14536_14990_15984_16192_16602_16755_20162
909305	contig_13481_pilon	-	3368	2	Intergenic	novelGene_119534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1472228	1468574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1471036_1471321
909306	contig_9221_pilon	+	1881	15	Intergenic	novelGene_176238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	288.02856469738	3	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	44	1003	16309	20828	TRUE	40	AACGAAAATATTCCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQISDIYISGESGDMSAKEKLLLWTQKVTAGYTGIKCTNFSSCWSDGKMFNALIHRYRPDLVDMERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKVPEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKSFPQNPVELKALYNQYIHFKETEILAKEREKGRIEELYKSLEVWIEFGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLRPAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEKLTLAKNTLQADAAHLESGQPVQWESDVIMYIQECEGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELAGYAFAG	16265	27931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9221_pilon_+_16440_17236_17350_17455_17563_18328_18449_18591_18688_19402_19531_19616_19711_19922_20073_20807_21085_22047_22171_22833_22912_23690_23853_25347_25453_26075_26172_27873
909307	contig_5686_pilon	+	2857	5	Intergenic	novelGene_45255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_2	2190.19078792237	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	87	437	93877	175592	FALSE	55	ACTCAATACATAAAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMIIFLMKDYQPDSQKSCWCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKVSFHSVLGSC	93790	178012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170248_171643_171800_172507_172587_175535
909308	contig_10890_pilon	+	4109	2	Intergenic	novelGene_166794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTCGGCGCTGCCGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156702	161084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_160681_160953
909309	contig_2450_pilon	-	4014	2	Intergenic	novelGene_160300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCAGTCCTTACTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415281	410433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_410656_411489
909310	contig_13863_pilon	+	2291	16	Intergenic	novelGene_41995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	735	junction_7	314.28038437039	19	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	1338	2291	64621	76043	FALSE	45	GAAATAGACAGTGATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLSFQKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYI	55130	76043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878
909311	contig_15327_pilon	-	501	1	Intergenic	novelGene_70551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGTAATTTAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557276	556775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_556800_557300
909312	contig_7342_pilon	-	2451	3	Intergenic	novelGene_71181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	110	junction_1	203.5	128	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCAGCTGTTGTAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482794	479641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_481479_482095_482474_482558
909313	contig_13740_pilon	-	1650	9	Intergenic	novelGene_34684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_6	3120.78651694969	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	494	979	160838	157474	FALSE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165407	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161574_161722_161919_162031_165237
909314	contig_3095_pilon	+	1357	4	Intergenic	novelGene_75188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2619	junction_3	890.304192709186	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	15	737	220513	226518	TRUE	10	TTTTATTGCATTTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEKMILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWGTYELHPILVSVKSRTSCLLASNSHDPKLVSHTLRF	220498	227316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226824_227001
909316	contig_14840_pilon	-	2477	9	Intergenic	novelGene_66231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	83.6121066293632	537	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1560	2018	15841	11241	FALSE	10	GTTTGCATGCTGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNGADPQLLGKGRESALSLACSKGYTDIVKMLLDCGVDINEYDWNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	22957	10781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13215_13342_13764_13863_15810_15877_18220_18380_19262_19609_21938
909317	contig_9389_pilon	+	386	4	Intergenic	novelGene_84032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	950	junction_1	5609.5467038097	15	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	16	384	584401	586167	FALSE	15	GCCCGTCAAGCACGGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITY	584385	586169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585890_586122
909318	contig_15236_pilon	-	2103	2	Intergenic	novelGene_141550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCATTCTGCAGTAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123857	121000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_121423_122176
909319	contig_9614_pilon	-	4391	17	Intergenic	novelGene_104419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	343.503980144335	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1041	3126	49	3174	155634	107861	TRUE	25	GACATGAGCTAAGGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDGSFSSSSTTACLHRPASRCRYRQEVRKFKMAAAEIPSLREQPEIEDADNSEKSINEENGEVSEDQSQNKHSRHKKKKHKHRSKHKKHKHSLEDDKDKKHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPVINESRSRDRGKKSRSPVDLRGKSKDRRSRSKERKSKRSETDKEKKPIKSPSKDASSGKENRSPSRRPGRSPKRRSVSPKQRDKSRRSRSPLLNDRRSKQSKSPSRTLSPGRRAKSRSLERKRREPDRRRLSSPRTRPRDDILSRRERSKDASPINRWSPTRRRASRSPIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRDRGRRSRSRLRRRSRSRGGRRRRSRSKVKEDKFKGSLSEGMKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDKVTEREKVTVMSTINPTKDLLADLIGCQRLPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQEKI	155682	105363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_105397_106167_106817_107325_108065_109251_109339_110641_110794_111390_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136482_140312_140490_145263_146464_155497
909320	contig_11829_pilon	-	2003	7	Intergenic	novelGene_128139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_6	42.7645361901138	108	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	465	947	176380	171108	FALSE	25	TTCATGTGCAGTGATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSQPLDPRKTIFVGGVPRPLRAVELAMIMDRLYGGVCYAGIDTDPELKYPKGAGRVAFSNQQSYIAAISARFVQLQHGDIDKRVEVKPYVLDDQMCDECQGARCGGKFAPFFCANVTCLQYYCEFCWANIHSRAGREFHKPLVKEGADRPRQIHFRWN	197384	170051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_-_171336_173972_174155_176307_176423_176697_176817_184776_184867_186123_186295_197342
909321	contig_13101_pilon	+	2794	10	Intergenic	novelGene_172785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2296	2601	244100	244496	FALSE	5	CAGCTCGCGCGGGTCCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSEVRGSDAGESKQDKGGCDRLVPAASPGPALRRHQLHSRSGGGLRPPRDGKGARRNGPAHDAPEPLGSFPLHHRGELGAFSLVSGPPCFSLRPRQRCY	233358	244689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_233735_234695_234865_236437_237128_238236_238401_238991_239092_239899_240031_240308_240728_241642_241885_244095_244191_244281
909322	contig_6217_pilon	-	3598	5	Intergenic	novelGene_109618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	694.406356177707	58	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	215	778	442621	433361	TRUE	25	CCCTCCACCCAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMKRQALDQLSEIGQDVGQLLDNTKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQVVAKLGMSQIPQKDLLETVRIREQVTTKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAVSAELLNWILKSKTAIQTTEMKEYKKMQETSELKKKLKELEKEQAERSPKLDELSQTGQILLEQMRKGKILN	442835	430472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_433128_433195_433466_435488_435613_439647_439818_442456
909323	contig_17144_pilon	-	919	6	Intergenic	novelGene_29469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1972.43903834821	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	164	718	174597	166277	FALSE	30	TTAAGAAATTCTTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	174760	166075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172680_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572
909324	contig_5482_pilon	+	4570	2	Intergenic	novelGene_144451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCGGGGCTGAGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288988	302903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_293311_302655
909325	contig_17427_pilon	-	2423	12	Intergenic	novelGene_30342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	8	junction_1	1176.45880604212	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	49	1329	188879	178046	FALSE	10	TTGCTTCGTTGTTTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204709	176951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
909326	contig_1435_pilon	-	6642	3	Intergenic	novelGene_115493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2236	2562	507229	506903	TRUE	75	AAAAAAAAAATTAACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLDIKRDTCIFPSPSLFSPSTTQLQSSQPSLNLTLTIRFPLPWPPGPQLKFTLIALSSHPLTFANVGKVILIRLLLPLLFITFLTVVNIYVTMPFVILTFFTCTIQ	537065	494869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_498931_506883_509213_536813
909327	contig_6257_pilon	+	3220	3	Intergenic	novelGene_178854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACACCTGCAGCCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49722	53817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6257_pilon_+_51337_51550_52477_53137
909328	contig_3575_pilon	+	3693	15	Intergenic	novelGene_141102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1708	2043	397922	400168	TRUE	20	GAAGTCTCCCCTGATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGVTNFRSSEAGEKCSSHSAWIFLRKVSVNNKNFLCSSSCSCLMYFCSSLTIIPATLSAHQGPRTTNTARQSDSICFEIKVESLSFECTDMLQSLIKLSASSNSISSLS	380301	406632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3575_pilon_+_380346_381302_381449_381650_381865_382092_382273_382845_382985_383782_383859_384617_384752_387107_387263_387868_388108_390074_390212_397678_398152_400062_400232_403636_403798_404226_404360_405339
909329	contig_12786_pilon	+	4958	3	Intergenic	novelGene_103389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1906	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCAAGCGACCATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590846	598742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_591049_592787_597029_598227
909330	contig_11338_pilon	+	3069	16	Intergenic	novelGene_6289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2178	2567	213858	233694	TRUE	10	CTGGCCAGCTCTGGAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRETYEIKATALGPIALLWAFRTFWSGAFRALSRALVSTFRRMEVVADATSLFSPFSQRVLLVTSDSKLSTTCCSIFLPLIGGVFEEVVSLTSVLIGILEFCIPRKETVSRDTVTVETSFNILTFSI	195736	250557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_196734_199027_199135_201708_201879_204303_204403_205514_205578_206701_206935_207214_207415_212074_212244_213718_213902_225106_225293_227965_228012_233580_233736_242914_243066_244698_244745_249568_249787_250511
909331	contig_2069_pilon	-	6246	9	Intergenic	novelGene_23201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	255.929677841395	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	15	1313	114391	102836	TRUE	20	CCCAAGGAGCCTGTCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPMQLKDFVRTLDPASLPRVLRVCSGVYFQSSIYEISGNECCLSTGDLIKVTQICLQKVICESLRMGETMELTPNFKGHFSPLTCSQSYGNLEELIAATKQSSKPLPVFFISSYSISIKNNVVPEDQPLLLEAVEMHLGTCFFWIWEPGVPRTLLQAVQEPALRDLPVTCPTLPWSSLILKPQYEIQAIMQMRRTIVKIPSTLEVDVEDVTASSQHIHFIQPLLLSEVLARQGPFPVPMEILEVPDGPRIFLSPWVDSLQQGQRLWIYGQASPRWRVLASSKGRKVPRHFMISGAYQGKLRRRPREFPTAYDLLSAFQPGQPLRVVAMRDYDGEEEENPEFTSLAVGDRLEVVGSSQACGTQGRDTDVLVCQRLSDQAEEEECEEDQGRILLPVYFPGSFVEERKSQNPSWWSAWTLSLVCALRSLPDGWI	114405	92616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_94086_94150_97261_97870_98025_102635_102924_103059_103694_109097_109248_109316_109509_111852_111994_114297
909332	contig_12410_pilon	-	2416	2	Intergenic	novelGene_167260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	12	482	98171	97701	TRUE	25	ACTGTCATGGATTGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRHMKKCPGSLAIRETQIKTTMRCHLTPALLARFKTTGNHKCWRGCRGMGTLMHCWWECKTIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLPGIYPTEIRVVTRIDICTSIFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTVEYYATRKNNNESVKHLIT	98182	25527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_27292_97530
909333	contig_8461_pilon	-	6154	13	Intergenic	novelGene_163922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	80.7205398616458	422	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1271	3816	874	4689	560351	364631	FALSE	75	TTTAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRKQEQPKRLPSHVSRQEEVEGELSEGEHWYGNSSETPSEASYGEVQENYKLSLEDRIQEQSTSPDTSLGSATPSSHTLELVALDGEVLRDSLQCQDHLSPGVSSFCEDDPPGSNKPLSSNLRRLLEAGSLKLDATATANGRVESPVNTGSNLSFSPPSHHAQQLSVLARKLAEKQEQNDQYTPNNRFIWNQGKWLPNSTTTCGLSPDSAILKLKAAANAVLQDKSLTRTEETMRFESFSSPFSSQSASSTLAALSKKVSERSLTPGQEHPPPASSFLSLASMTSSAALLKEVAARAAGSLLAEKSSLVPEDPLPPPPSEKKQEKVTPPPAPPPPPPPPPPQSLELLLLPVPKGRVSKPSNSASEEESGKPFQCPICGLVIKRKSYWKRHMVIHTGLKSHQCPLCPFRCARKDNLKSHMKVHQHQDRGETFQCQLCPFTSSRHFSLKLHMRCHQHFLRTEAKVKEEIPDTDVKGSPHLSDSACLGQQREGGGTELVGTMMTSNTPERTSQGGAGVSPLLVKEEPKEDNGLSTSFTLNAADRPTNHTKLKDPSEYVANSASALFSQDISVKMASDFLMKLSAESYKETPMVKIKEEPMEVDIQDPHVSISPSQNVGYSTLIGREKTEPLQKMPEGRVPPERNLFSQDISVKMASELLFQLSEKVSKEHNHTKENTIRTTTSPFFSEDTFRQSPFTSNSKDLLPVQSVLHGRISAPETEKIVLEAGNGLPSWKFSDQLFPCDVCGKVFGRQQTLSRHLSLHTEERKYKCHLCPYAAKCRANLNQHLTVHSVKLVSTDTEDIVSAVTSEGSDGKKHPYYYSCHVCGFETELNVQFVSHMSLHVDKEQWMFSICCTACDFVTMEEAEIKAHIGTKHTGEDRKTPSESNSPSSSSLSALSDSANSKDDSDGSQKNKGGNNLLVISVVPGSQSSLNSEEKPEKGFECVFCNFVCKTKNMFERHLQIHLITRMFECDVCHKFMKTPEQLLEHKKCHTVPTGGLKCPFCIYSTNRPAAMECHLKTHYKMEYKCRICQTVKANQLELETHTREHRLGNHYKCDQCGYLSKTANKLIEHVRVHTGERPFHCDQCSYSCKRKDNLNLHKKLKHAPRQTFSCEECLFKTTHPFVFSRHIKKHQSGDCPEEDKKGLCPTPKEPAGPGAPLLIVGSSRNLLSPLSVMSASQALQTVALSAAHGSSSEPNLALKALAFNGSPLRFDKYRNSDFAHLIPLTMLYPKNHLDLTFHPPRPQTAPPSIPSPKHSFLAYLGLRERAETV	561224	363165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_365451_368904_369083_369436_369629_380064_380232_381945_382118_385818_385957_425752_425857_447170_447229_449561_449802_498110_498592_505170_505344_518726_519777_560308
909334	contig_9571_pilon	+	2468	9	Intergenic	novelGene_136268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	270	617	398603	405592	TRUE	30	CATGGGATGACATGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKDSLPSSQLCWIPLSLLLTALWAATLTWSPGPGLETLSLFSSQLLETVFFSCSGGGDDIEYVSTNFLSTYFALIYASFSCLLSWLWFLYPHFFHFSFINSIYNVIPQLTHKL	395991	417948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_396235_398576_398669_399560_399747_401698_401791_405588_405661_406000_406208_413387_413494_414097_414198_416578
909335	contig_17144_pilon	+	2208	12	Intergenic	novelGene_29504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	716	1210	166796	168283	TRUE	25	CCAGACGACCAGACTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGMLGSRRLGSWKASHLCHDSGHPGAQAATGWVWDTWPEMILPAGGDLQQSQAAPQREMSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166080	174639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167342_167587_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173308_173463_173583_173751_174572
909336	contig_12644_pilon	-	2163	14	Intergenic	novelGene_44478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	518.144344879086	3	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	1060	1923	1037159	1026128	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAGGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1151239	1025887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043256_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068737_1123231_1123677_1151204
909337	contig_12620_pilon	+	2822	1	Intergenic	novelGene_98810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTTAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381777	384599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_381800_384600
909338	contig_5598_pilon	+	3447	25	Intergenic	novelGene_148287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_13	33.4918885287501	205	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	1219	2712	587023	599425	FALSE	35	AAGAAAGGCCAACTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALYVASHYKNSPNDLQMLSDAPAHHLFCLLPPVPPTQNALPEVLAVVQVCLEGEISRQSILNSLSRGKKASGDLIPWTVSEQFQDPDFGGLSGGRVVRIAVHPDYQGMGYGSRALQLLQMYYEGKFPCLEEKVVETSQEIRTISSEAVSLLEEVITPRKDLPPLLLKLNERPAERLDYLGVSYGMTPRLLKFWKRAGFVPVYLRQTPNDLTGEHSCIMLKTLTEEDETDQGAWLLAFWKDFRRRFLALLSYQFSTFSPPLALNIIQNKNMGKPAQPALRREELEALFLPYDLKRLEMYSRNMVDYHLIMDMIPAISRMYFLNQLGDLSLSAAQAALLLGIGLQHKSVDQLEKEIDLPSVQLMGLFNRIIRKVVKLFSEVQEKAIEEQMVAVKDVVMEPTMKTLSEDLDEAAKEFQEKHKKEVGKLKNMDLSQYIIRGDDEEWNEVLNKAGQNASIVSLKSDKKRKLEAKQEPKQKKKLKKNRDMKNKKDTKLKRRK	573341	600160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_+_573467_574445_574508_576294_576410_576504_576613_580257_580392_581501_581596_581724_581824_585202_585341_585999_586125_586520_586672_586955_587053_587928_588046_588928_589031_589126_589202_589803_589921_590929_591064_591278_591328_592589_592687_592761_592873_593815_593989_594505_594626_595006_595106_595771_595846_596889_596974_599313
909339	contig_13481_pilon	+	1795	6	Intergenic	novelGene_119485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCACTGCTACCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1308119	1326494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1308656_1309838_1309966_1317186_1317312_1318640_1318788_1321351_1321443_1325725
909340	contig_11396_pilon	-	2824	15	Intergenic	novelGene_71416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	237.078476630909	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	235	1713	1689836	1657991	FALSE	30	TAAAGGGAACCCATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEEEFFDAVTGFDSDHSGEFSEANQKVTGGLGSDTSKSQGIGKTEARPPQENGVQTHRTSLPAPMFTRSDFSVWSILKKCIGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHKASRQAHPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPVSAFYSEGLNQDFIFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLQQNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGDKCVLHFKSCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGVDPASYESFKKQERRGEHLKKTKPETSSEKADSDVADNVPETQETMQVIPGSRLLWRINMRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELPTSAAWRMVTWIWQAGRRSAWKRNRGKPGGGGPERRLRGGQGGFTKATTRTQGLPTGCTQGATLSATSRTAQTSTEGSRAPGPEAGHPSRWTPWRFGHGRNQLF	1706355	1656879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_1658182_1660807_1660899_1662172_1662207_1662255_1662297_1663036_1663166_1667761_1667886_1669438_1669529_1670179_1670288_1671109_1671293_1678224_1678323_1680165_1680301_1686029_1686106_1689328_1689471_1689799_1689971_1706255
909341	contig_10163_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_82631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCCAGCAAATCTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101566	99696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_99700_101600
909342	contig_2988_pilon	+	5240	3	Intergenic	novelGene_136527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2114	2665	189401	237162	FALSE	35	ATGGCCTAACGGAATTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEETLRTTLVTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTERIIKELLTENFPNIMTDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHMIITLPKIKDKQRILRAAREKLKVTQRGETIRPNSDYSAETMQARSQGDDIYKILKEKDCQPRIIYPAKLSFKHDGEIRTFPYKQKLRDYVETKPNLQKLLKGLHH	1185	239737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_2304_188405_189941_237150
909343	contig_15114_pilon	+	3709	2	Intergenic	novelGene_121154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCCAGCCCCTGTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141793	151126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_142048_147671
909344	contig_10609_pilon	+	4652	27	Intergenic	novelGene_123964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	100	junction_1	107.568857814879	167	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2769	48	2816	574055	639565	FALSE	15	TCCCAGCTTCATACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGAGSPGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKQDLINLLITQATPHVAPVMPLDRFITDFYMTVNNYWILNAQHINLTTLSVAGGFRDYQVRSGLTFLPQLSHHTSALSVVSSAVPKTWVSTDHLSIVWCKQLQLTTVRAFFDLIDADTKQITQNSKKKLSVLNHHFIRHPAKHFEENPAIISDLTGTSMWVPVKVSKWTYVAYNESDKIYFTFPLANHRKIYTHVYCQSTMLDTNSWIFGCINSTSMCRQGVDLSWKAELLPTIKSLTLRLQDYPSLSHLVVYVPSVHGSKFVVDCEFFKKEMRSIQLPVTHLFSFGLSSRKVVLNTSGLFYNIELLNFGQIYQAFKVNVVSKCSGVKEEITSIYKLHIPWSYEDSLTIAQVPSSTEISLKLHVAQPENDSHVALLKMYTSSDCHYEVTVKTSFPQILGQVVRFHGGALPAYIVSSILLAYGGQLYSLFSIGHCLEYDVMLDKEAKPYKVDPFVIMIKFLLGYKWFKELWDVLFLPELDAMFLTSQSMCFPLVSLILFLFGTCTAYWGGLLSSTAVRLLSSLWLALKRPSELPKDIKVISPDLPFLTVVLIIVSWATCGAFAILLTYLYYVFKIVHLQASLTTVKNSQTANPKHSRRGEKKSNHHKDSTVHHLRLSTSDAEDSLRMHSTVINLLTWIVLLSMPSLIYWLKNLRYYFKLNPDPCKPLAFILIPTMAILGNTYTVSVKSSKLLKTTSQFPLPLAVGVIAFGSAHLYRVPCFVIIPLLLHALCNFM	574007	641401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888_585065_589691_589864_593013_593172_596498_596552_597337_597405_599831_599938_600630_600687_603206_603291_606020_606068_606456_606509_609947_610026_613392_613469_618600_618675_618789_618842_619348_619416_622470_622580_624512_624552_628571_628666_632589_632681_633700_633899_634853_634990_636227_636279_636761_636950_638259_638365_639426
909345	contig_9738_pilon	+	3406	6	Intergenic	novelGene_169268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_3	78.1342434531749	10	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	210	848	205076	214267	FALSE	60	AAGAAAAAGAAACATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSMGGFGGVGRMGELYRGAVTSSMERDFGRGDIGISRSFGDSFGRLGSAMIGGFAGRIGASNMGPVGSGISGGMSSMNSVTGGLGMGLDRVSSSFDRVGPGIGAVLERSIDMERGFLSGPVGSGMRDRIGSKGNQIFVRNLPFDLTWQKLKEKFSQCGHVMFAEIKMENGKSKGCGTVRFDSPESAEKACRIMNGIKISGREIDVRLDRNA	204866	216825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_205119_205426_205526_205818_205891_207609_207819_207898_207951_214103
909346	contig_1442_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_172176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706878	708146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_706900_708100
909347	contig_17833_pilon	-	2540	3	Intergenic	novelGene_174604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	41	165	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	87	467	220909	204150	FALSE	15	TTCCTCGATTCCAGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLWVRWGRRGLGSGAGAGEESPAASLPRMKKRDFSLEQLRQYDGSHNPRILLAVNGKVFDVTKGSKFYGPAGPYGIFAGRDASRGLATFCLDKDALRDEYDDLSDLNAVQMESVREWEMQFKEKYDYVGRLLKPGEEPSEYTDEEDTKDHSKQD	220995	202076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_204248_205306_205463_220782
909348	contig_1339_pilon	+	498	5	Intergenic	novelGene_163131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3948.68100604493	58	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	41	463	431340	434136	FALSE	10	CCAATGCCTGGGCCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVLKRRTGERWRRKPATSYVRTTINKNARATLSSIRHMIRKNKYRPDLRMAAIRRASAILRSQKPVMVKRKRTRPTKSS	430920	434171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_430953_431331_431421_431611_431750_433682_433797_434046
909349	contig_11978_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_63140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1998803	2000877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1998800_2000900
909350	contig_10627_pilon	+	1091	6	Intergenic	novelGene_59924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	108.695170085887	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	386	649	108135	109221	TRUE	25	CAGACTTGTGACATCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFPPGASDVVSGLGSGQSGDHGWAGAVPRAQQLSGGAAAAAFSRKRGLVVEVKCHTNSSNTVKWLRRREKEKEPQPLHLDQIHLLQTQNNTVFTLTIRDIQFEDNGIYFCAQECSEILIQGCGTELRVMGFSTLGQLKRRNTLKDGIIMIQTLLIILFIIVPVFLLLDKDDSKAGMEDDHTYEGLNIDQTATYEDIVTLRTGEVKWSVGEHPGQE	105331	109709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_105461_107878_108139_108453_108573_108962_109005_109122_109265_109310
909351	contig_3004_pilon	-	3414	12	Intergenic	novelGene_127470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_4	139.415545097654	220	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	133	2088	253222	227814	FALSE	30	TCCAAATACTTTCTGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPTAAFLRPGTQVPAFWLPVEASLSPPPFWPRAGVSPPHAATASMSGVRAVRISIESACEKQVQEVGLDGTETYLQPLSMSQNLARLAQRIDFSQGSGSEEEEAAGAEGDAQDWAGAGSSADQDDEEGLVKFQPSLWPWDSVRNNLRSALTEMCVLYDVLSIVRDKKFMTLDPVSQDPLPPKQNPQTLQLISKKKSLAGAAQILLKGAERLTKSVTENQENKLQRDFNSELLRLRQHWKLRKVGDKILGDLSYRSAGSLFPHHGTFEVIKNTDIDLDKKIPEDYCPLDVQIPSDLEGSAYIKVSIQKHAPDIGDLGTVNLFRRPLPKSKPGSPHWQTKLEAAQNVLLCKEIFAQLSREAVQIKSQIPHIVVKNQIISQPFPSLQLSISLCHSSNDKKSQKSATEKQSPEDHLYVLEHNLHLLIREFHKQTLSSIMMPHPASAPFGHKRMRLSGPQAFDKNEINSLQSSEGLLEKIIKQAKHIFLRSRTAATIDSLASRIEDPQIQAHWSNINDVYESSVKVLITSQGYEQICKSIQLQLNIGVEQIRVVHRDGRVITLSHQEQELQDFLLSQMSQHQVHAVQQLAKVMGWQVLSFSNHVGLGPIESIGNASAITVASPSGDYAISVRNGPESGSKILVQFPRSQCKDLPKSDVLQDSKWNHLRGPFKEVQWNKMEGRNFVYKMELLMSALSPCLL	253354	226487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_228026_229329_229490_232331_232450_235817_235956_240328_240514_241444_241576_242528_242682_243050_243136_243231_243369_245616_245837_248684_248852_252972
909352	contig_6885_pilon	-	4142	4	Intergenic	novelGene_83699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1061	1429	343593	343225	TRUE	10	TTCTGCTCGGAAGCGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKTLKLAVECQVAKAKGGNDELKELNRKFQTVAPEDQVKYYNDMCKELEIENQKGRTPSAFLKLKELKEKFKPRVAIMQDSMGKILNDEGSNKRRWKEYIESLYQKELVDVQPFQEVAHD	544066	279590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_281654_342574_343955_371362_371631_543635
909353	contig_6233_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_74762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117628	119691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_117600_119700
909354	contig_10331_pilon	-	3937	7	Intergenic	novelGene_54077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	992	1414	109745	104132	TRUE	65	AAAAAAATAAAAAGGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCFKRCWSFRHQAITVPSLLAVYKWWPSQENVRLTIGLCDLGNVISRTGFKSQVLHNRTIPFSKPPAITLIDTPSGWLEKATEQMISLQWTCPTRSPFTVHSLRSLPPPAESHTVAISPVVSLAETAVTGLLCPAKLCT	110877	93866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_96243_103716_103855_104122_104219_107721_107883_108298_108370_109641_110221_110361
909355	contig_6102_pilon	+	2713	18	Intergenic	novelGene_31841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	509.177435575904	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	81	1988	370803	394528	FALSE	25	TACTCAAACCAGCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPS	370722	395253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379452_394523
909356	contig_10386_pilon	-	2336	4	Intergenic	novelGene_173538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	509	811	128406	123983	TRUE	35	CATCGCATCATACACGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEPLPTLVSFLNELESLFEVLPEVLLVAVRGGQPLVVEQAFLVVVEREVGGDVDDIADVQPLHRVQVLSILLVAKKQEGQDGGQLCILNVGGGGDGLR	128914	85958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_-_86520_88019_88875_123873_124247_128367
909358	contig_2547_pilon	-	3724	15	Intergenic	novelGene_165462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	88.4941194864013	214	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	180	1127	455004	420206	FALSE	35	AGCTGCAAAATTGTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGHGGYDSDFSDEEQCGESSKRKKRTIEDDLLLKKPFQKEKHGKVAHKQVAAELLDREEARNRRFHLIAMDAYQRHKKFVNDYILYYGGKKEDFRRLGENDKTDLDVIRENHRFLWNEEDEMDMTWEKRLAKKYYDKLFKEYCIADLSKYKENKFGFRWRVEKEVISGKGQFFCGNKCCDVKEGLKSWEVNFGYIEHGEKRNALVKLRLCQECSCKLNFHHRKKEVKLKNRKDKTKKDCEESSHKKSRLSSEKETSKKKDKGRSSSKKSEDSINRNSDEEEGASESELWKGPLPETDEKSQEEEFDEYFQDLFL	457361	417608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_420249_423244_423324_429422_429462_433504_433624_435592_435636_436801_436916_438887_438934_442963_443049_443837_443922_444971_445049_453095_453142_453269_453366_454927_455005_457002_457073_457252
909359	contig_19402_pilon	-	2439	2	Intergenic	novelGene_80822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	842	1162	89547	89227	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSSIFFLLRETKEDANKRRDIPCPRTGKLNIVISVFSKLFYRVNSIPIKTLGLFLGKNRQSDSKIHKEMTKAKNSWDNLKRRIELENLQYQIKTYYKPRTIKIV	90388	87751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_87953_88150
909360	contig_10482_pilon	+	10857	2	Intergenic	novelGene_152813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	465	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATTATGTATGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80279	97510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_89664_96037
909361	contig_2278_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_118093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAACCACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664816	663428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_663400_664800
909362	contig_18163_pilon	-	3804	4	Intergenic	novelGene_35302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2828.89852926698	22	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	347	922	10631	9401	FALSE	10	ATTTTCTGTTGTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPLTLKWGERGRGRNFVSGKA	11216	6518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10375_10675_10743_10821_10990
909363	contig_2487_pilon	+	11948	1	Intergenic	novelGene_148481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	479	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCGCCAGTACAAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188118	200066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_188100_200100
909364	contig_7359_pilon	+	2545	9	Intergenic	novelGene_139874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	21.9740614134028	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	259	1602	414222	424725	FALSE	5	CTGTGTGGTTTCTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQGLYLVYHPVQLSNLHAAGVLLLGLLGYYIFRMTNHQKDLFRRTNGRCLIWGQKPKVIECSYTSADGQKHHSKLLVSGFWGVARHFNYTGDLLGSLAYCLACGGGHLLPYFYIIYMTILLTHRCLRDDTAVPTSMAATGSATWPPCLTASCPAFSEGPSRGGAAEAAVESMWSRADGG	402198	425668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_403997_404119_414157_414230_415371_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_424191
909365	contig_9696_pilon	-	2116	10	Intergenic	novelGene_68786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_6	490.520081767591	92	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	642	1172	239300	214683	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLTEIKLLPTLVLLVCCEYLAIFKKTVAMHEVFLCRVAAHPILRKDLNFHVFLEYNQDLSVRGKNKKEKLEDFFKNMVKSADGVIVSGVKDVDDFFEHERTFLLEYHNRVKDASAKSDRMTRSHKSAADDYNRIGSSLYALGTQDSTDVCKFFLKVSELFDKTRVSTVNEPLGI	255824	213738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_214756_216376_216453_224243_224350_226518_226615_238468_238593_239244_239379_240695_240818_242363_242475_243101_243207_255599
909366	contig_854_pilon	+	5118	29	Intergenic	novelGene_36477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3358.92298321097	1	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	990	2973	1135	4107	1679334	1714980	FALSE	30	CCCCCTTGTCATAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPVRAKRAIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612766	1715991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678853_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685267_1702618_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
909367	contig_9668_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_58238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTTTATGAGCTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583133	581742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_581700_583100
909368	contig_8544_pilon	+	578	5	Intergenic	novelGene_55908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	392.969066848779	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	203	577	19363	90624	FALSE	45	TAAGTATTGGTAATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMSQLKSTTAWVRHTLVFKDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQL	18507	90625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_83417_83520_83788_83836_90458
909369	contig_7457_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_31261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTATGTACACTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20847	18563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_18600_20800
909370	contig_10864_pilon	-	1496	9	Intergenic	novelGene_107087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	661.594652619714	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	823	1494	976495	911648	FALSE	20	GGTATGTGCATGAACTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPGSGRKRTPMKDRFSAEDEALSHIAREAEARLAAKRAARAEARDIRMRELERQQKELDEKSDKQYAENYTRPSSRNSASATTPLSGNSSRRGSGDTSSLIDPDTSLSELRDIYDLKDQIQDVEGRYMQGLKELKESLSEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKNNLIYQVDTLKDVIEEQEEQMAEFYRENEEKSKELERQKHMCSVLQHKMDELKEGLRQRDELI	993267	911645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_911738_919440_919612_924360_924433_927814_927932_929301_929347_958175_958263_976405_976552_991282_991466_992684
909371	contig_15047_pilon	+	1517	7	Intergenic	novelGene_52212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	16	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
909372	contig_1759_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_171341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTAAGGCAATGTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82112	80406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_80400_82100
909373	contig_9144_pilon	+	1792	9	Intergenic	novelGene_151132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	241.935392977133	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	423	1280	618610	631487	TRUE	40	CCTATAGGACAGAGTAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPFYSCWRTGLLLLLLQAVAVKVSWQTEEKSCDLVGEKGKESETELALLKRLKPLFNKSFESTVGQGPDTYIYMFRVCREAGNHTSGAGLVQISKSNGKETVIGRLNETHIFNGSNWIMLIYKGGDEYDSHCGKEQRRAVVMISCNRHTLADNFNPVSEERGKVQDCFYLFEMDSSLACSPEISHLSVGSILLVTFASLVAVYIIGGFLYQRLVVGAKGMEQFPHLAFWQDLGNLVADGCDFVCRSKPRNVPAAYRGVGDDQLGEESEERDDHLLPITPSLLSR	615037	656722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_615459_618608_618789_620115_620283_621888_621999_622274_622406_622954_623082_623951_624071_631462_631573_656295
909374	contig_9471_pilon	+	2600	2	Intergenic	novelGene_21763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_1	0	86	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384593	388073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_384837_385716
909375	contig_11756_pilon	-	2282	6	Intergenic	novelGene_106029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACCTAAAATTTGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61464	17233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11756_pilon_-_17518_24799_24910_25035_25161_58286_58397_59018_59201_59993
909376	contig_10437_pilon	+	1423	8	Intergenic	novelGene_38279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1152.93271127794	112	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	383	727	441733	446987	TRUE	30	TCTATCATTGCCACATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNVAQLSSSTKVASTLTHPALRM	431079	451704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439819_441717_441868_443748_443894_445446_445476_446951_447055_451075
909377	contig_18162_pilon	-	3007	3	Intergenic	novelGene_122312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16364
909378	contig_10324_pilon	+	1279	2	Intergenic	novelGene_7774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGCCTGGCGAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79357	80766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_80186_80315
909379	contig_4125_pilon	-	3944	5	Intergenic	novelGene_25131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	577	junction_1	292.955948053628	2	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1269	1964	813454	811045	FALSE	30	AATTCTTAGTATTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPDLSQLSGILGNAAIVLRSRLKVRVVKELRGKKAAAPNGVRENGSLAPDAEVGKQVMQYQVLNEVVIDRGPSSYLSNVDVYLDGHLITTVQGDGVIVSTPTGSTAYAAAAGASMIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	814722	809064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265
909380	contig_5640_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_27244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGCACTACAATGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25766	28533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_25800_28500
909381	contig_3948_pilon	-	3932	30	Intergenic	novelGene_53282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_17	314.505485415943	70	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	201	1553	1494311	1459990	TRUE	60	CTAGAAAAGAGGAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEAVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKKGKDGLCQKLTVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGNFQESGSRSCQVS	1510965	1413931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1414396_1415165_1415286_1416436_1416501_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429120_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1435012_1439634_1439749_1458390_1458578_1459907_1460034_1471756_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485250_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
909382	contig_10259_pilon	-	3012	3	Intergenic	novelGene_177189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1238	1726	62990	62502	TRUE	50	CTATGAGTACAACAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQAADAQWGQLQHRSWRPHCRTGSGLLLSGPAGVLRNPPEGPCLLLQPADSRSLLSSHPAGAVKPAQSRVAGHGEAGTHTPVWRCGRAEAWARCTQPRAWQRRVGFSIPVAPLERRQRLFLKQSKVCPRPHKARWPAPEADTVVPFLGAWASHEPGFMPRV	64227	30719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_30863_52710_52900_61547
909383	contig_8683_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_150262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGGGTGTTCACGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627125	625417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_625400_627100
909384	contig_1435_pilon	-	4015	1	Intergenic	novelGene_115525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	3317	3799	585202	584720	NA	35	TATCATAATCACACTCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQKRQQTISKHIKKQDRMVPVGIQNKIPDDFPVEEKTLELPDREFTSLIFRAIQELKQKADKNEGKIRQIHGKGRQIHGKYKKMEEFRKIIQEQNFRINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLRKNPKKE	588518	584503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_584500_588500
909385	contig_1008_pilon	-	3697	4	Intergenic	novelGene_121617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_3	35.0142828000232	262	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	7	705	1126350	1116371	FALSE	10	TTTTTTGAGTGTGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDVGGRSCTDSELLLHPELLSQEFLLLTLEQKNIAVESDVRINKDGLTDLYVQHAIPLPQRDLPKNRWGKTMEERREHHEIERETKRNTAVDGVRKRPLIVFDGSSTSTTIKVKKTENGDNDRLKPPPQASFTSNAFQKLSNSSPSVSPLILSSNLPMNNKMEHNNNDTKQNHDLTHRKSPSDPVKLPPLSPGGTTSVKLKRAAPKEEAEAVNNLKPPEAKRKIQYVTWP	1126356	1113378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1116428_1118703_1119080_1123561_1123729_1126251
909386	contig_4832_pilon	-	5006	6	Intergenic	novelGene_163401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	349	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACAAGCTCTTTGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406801	369102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_369146_383269_383414_383978_384301_388503_388643_391076_395413_406779
909387	contig_11417_pilon	-	1866	1	Intergenic	novelGene_103324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGGTTAGATAACAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571233	569367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_569400_571200
909388	contig_10324_pilon	+	3957	6	Intergenic	novelGene_7894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.4	289	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCAGACTCCGCCGCCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752068	763764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_755488_760884_761015_761095_761207_761678_761767_761885_761971_763640
909389	contig_1725_pilon	+	2146	14	Intergenic	novelGene_24315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	857	junction_11	479.439317507021	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	37	999	239668	248492	TRUE	45	ATTGTATGAGGGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQVRLLGVGAPPGHLL	239631	255671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
909390	contig_8576_pilon	+	2851	2	Intergenic	novelGene_88747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_1	0	121	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	193	510	690680	694989	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMKSSRSANQERSVSTLFREKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLE	690487	697330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_690845_694836
909391	contig_1986_pilon	+	3381	4	Intergenic	novelGene_64132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	58.970802568352	174	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	225	608	330158	348587	FALSE	70	AAAGTTTAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPPASTSGITGTLSLWNLKILQTNQNTVVEFGSFDPSCLMPTCPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQAIEVDDDQLEQFRTLLFTSEGEKEKRMVDNFRPLQPLMNRTVRSSFPHDYVLNIQV	329390	351360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_329498_330040_330239_342409_342566_348440
909392	contig_15866_pilon	+	2676	1	Intergenic	novelGene_63638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCAGCTGTGCCCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459682	462358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_459700_462400
909393	contig_7051_pilon	-	2651	1	Intergenic	novelGene_64364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341245	338594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_338600_341200
909394	contig_7151_pilon	+	3283	4	Intergenic	novelGene_40694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGGCTCTTACAACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15963	65221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_18482_18573_18879_40399_40716_65077
909395	contig_5317_pilon	-	2020	1	Intergenic	novelGene_76597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391319	389299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_389300_391300
909396	contig_1443_pilon	-	2731	1	Intergenic	novelGene_28365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTTTGGACCATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966296	963565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_963600_966300
909397	contig_3862_pilon	+	6643	3	Intergenic	novelGene_137402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	4837	5265	464771	467920	TRUE	70	CCAAAAAAAAAAGTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYCKLKKSTETKTCHRSVASSPGHCNTDKSNSVAELDPVSFVSTHCYRRSFGEMRPTGGWGNRLKGLVESRVSSGGVTCRQKCPDYSSPRYFQLSGACLWPDAGGNCSSGLVPPGWRPRASRGRCSRPATWPPLWVCYCCC	459934	470536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_465074_467794_468650_469887
909399	contig_9121_pilon	-	5408	1	Intergenic	novelGene_134450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	361	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139420	134012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_134000_139400
909400	contig_9629_pilon	+	1775	2	Intergenic	novelGene_171606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAAGATTTTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74846	91404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9629_pilon_+_75456_90238
909401	contig_7182_pilon	+	2474	3	Intergenic	novelGene_117149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886595	890985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_888961_889168_889254_890961
909402	contig_15412_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_165474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	641	943	280917	280615	NA	45	CTATAGAAAGTGACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHVRNQVNGRALLSLSNADVYFGHSQNLVLLKVLFRRGSPEEVFYISAELFSPVGKKEENLAIRPQISSLYMAVIKSNSFHLRVTKTPTLNFVFVLFSI	281557	278682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15412_pilon_-_278700_281600
909403	contig_1516_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_49922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAGGAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91588	89540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_89500_91600
909404	contig_5571_pilon	+	3062	20	Intergenic	novelGene_75513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1269	1598	142649	150959	TRUE	10	GAGGCTGGCGGTCCAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGCGGKWLPEIYRLSRLSKLLEPASSNCMGGISGSDGRFSGLVTEGISSIAVTDGLVGPRFAFAIVAIVGLVGLIVVLCTDTTGKGPACPGFEHTCLWRWGCIMEY	121086	250121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_121333_121411_121464_122913_123067_124642_124718_126431_126556_128908_129259_130408_130569_140435_140498_142602_142738_147630_147829_150916_151088_151753_152027_153449_153570_154032_154180_156542_156657_159158_159274_183913_184050_184210_184351_184598_184723_249954
909405	contig_14687_pilon	+	6087	5	Intergenic	novelGene_107981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_4	90.7386356520749	310	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1981	2397	825603	848345	FALSE	0	GCTTGTTTTTTTTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFGRQGLNLAATAAVTAAVKSQGAITERLRSFSMHDLTTIQGDEPVGQRPFQPLPEAKKKSKPAPSESAGYGIPLKDGDEKTDEEENGPYSEDEMLTHKGLRRSQSMKSVKTVKGRKEVRYGSLKYKVKKRPQVYF	823451	852035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_825384_825554_825669_836657_836806_842887_843034_848288
909406	contig_5337_pilon	-	3238	1	Intergenic	novelGene_136573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTCTGTTCATTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382870	379632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5337_pilon_-_379600_382900
909407	contig_6228_pilon	-	2257	3	Intergenic	novelGene_164490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	58	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	145	1689	174788	168240	FALSE	60	AAACACTCCCAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLANHGLILLQQLNAQREFGFLCDCTVAIGDVYFKAHKSVLASFSNYFKMLFVHQTSECVRLKPTDIQPDIFSYLLHLMYTGKMAPQLIDPVRLEQGIKFLHAYPLIQEASLASQGAFSHPDQVFPLASSLYGIQIADHQLRQATKIAPAPEKLGREPRPPTSRVSHEQVPEASQLSQLPSNLTQVNRTNMTPSDPLQTSLSPELVSTPVPPPPPGEETNMEASSSDEQPTSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGVPFTSSQPGESRVPLSLCSNAADLGKDAMEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTGKPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNMLVQTNKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSILLGTGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD	188358	167671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_169612_174615_174801_188226
909408	contig_4392_pilon	+	4140	22	Intergenic	novelGene_117310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	81	junction_15	114.867823083949	223	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1055	3168	65	3232	307347	655344	FALSE	5	GTCCTGCCTTCAGCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVAEAESPLNPSCKIMTFRPSMEEFRDFNKCLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDDLLIPAPIQQIVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCEAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVKKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPESTPEVKAWLQRRRKVRKVPKSFQRTRSHPKRPKTEEDEEASAVADGDEFPTPELATDQLKVSEKPEAAVKLGNIGAASEEETFADRMQPDQNLLHNINLSGNSCSSTSIMEEMKTEEDEACATVAPSNPEEADGAVTLSSGCVKSEEADPAKLSWPRSPESCSSVADTNGVWTEGEESDLESCGSGLEPGEVPEVPSGERNGFKVPHRIEAETKTAKSWRHPLSKPPARSPMTLVKQQAASDEELPEVPSTEEEVEETESWAKPLVHIWQTKSPNFVAEQEYNAAVARMAPHCAICTLLMPYYKPDSSNEENESRWETKLDEVITSGEKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEVCDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTQNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCMFCRHRIKKVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKAIAVGQTVITKHRNTRYYSCRVIAVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCVKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYLGSNIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGEKKRQRVLSSRFKNEYVDDPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ	273806	656252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_307329_307491_308176_308353_313024_313140_343418_343613_368063_368114_378934_379039_384173_384312_464336_464531_468579_468819_471078_471399_474144_474254_488930_489113_490691_490906_492144_492222_516721_516778_518997_519107_581318_581505_601911_602083_645308_645429_649029_649123_655167
909409	contig_11720_pilon	+	2086	1	Intergenic	novelGene_43870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1439	1801	98120	98482	NA	15	TTGAGAATTTGGTGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGAQCLPYNSSVPLPEESLALSISCWCRFGIPFLVQECGVGGRVSQKVAFTLTLFLLKGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	96681	98767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_96700_98800
909410	contig_20550_pilon	+	2591	3	Intergenic	novelGene_142627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	304	junction_2	88.5	158	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	390	812	24165	24669	FALSE	65	CAAAAAAAAAAGAATGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQAPMDLLGLQGLERQWGHTILHLIIRDHLALLLMVLQPRMLPRGGEMPIHTGSNRLLLIQVNDAFHSRVICIATFLNFVVLILHYVHCTHSFCQELGTGNKTDINMVSAFMNFFLPAFGFFRLVQQSAESQKLQEEV	21051	26448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_21398_24121_24274_24355
909411	contig_3818_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_99208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111395	112535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_111400_112500
909412	contig_9528_pilon	+	3398	2	Intergenic	novelGene_172342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2464	2877	204621	205418	FALSE	60	GTGAAACAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISNHIKRQSMMASANSQNKESRNFPEEKNFFELLEAEYKRLIYGTLPEIRKEINQNAEHTIEEIKKIREEHNDKFDRPQESIERQKSEIRKINNKIAGLDNSIESHLQRGVNKNKLGLLSRNHAGKKAMG	202157	205939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_+_204955_205338
909413	contig_17194_pilon	+	2623	10	Intergenic	novelGene_155353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_9	83.7148304633425	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	828	1943	256551	294708	FALSE	40	GCCTAGAAATATAGAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRNHKIAPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLTSSSTLADSSMLSPPQATLHRNVSPGAPQRPPSTGNAGGMLNTSDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLIGTTGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLNTQRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFSSPGMLSLGQVSAWQQHHLGQAALSSLVAGGQLSQGSNLSINTNQNINIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQPPPQPPLQPQPQPRQEMGRSPVDSLSSSSSSYDGSDREDPRGDFHSPVVLGRPPNTEDRESPSVKRMRMDAWVT	75819	295388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_75944_190807_190996_232839_233044_256239_256575_259309_259530_260448_260509_272282_272471_288401_288529_292599_292727_294338
909414	scaffold_13505_pilon	-	4883	5	Intergenic	novelGene_111423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	477.318224563027	340	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	42	1328	603235	596651	TRUE	25	GGCAACATTCTTCTTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGKWLPGTSALGSGVGVSLVFLKKFWKKLFSHLCPQVTHKSQNLSLSPPSTSLETVPSSYSSYFSEQTLGPAWNVGRGPSQAQKAPWNGRGLQSGGGKKCPQGQVFSLY	603276	463526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_464180_593748_597232_597627_597907_601873_602237_603171
909415	contig_6576_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_42338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	186	561	961	1521	674992	675552	NA	30	TTGGACATTTTATCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLYIDKEAVIQTEQGDTEWFKSRKGACQGCILSPYLFNPYAEQIIREARLYEKEHDIRIAERLFINLQYADDIILLVKSKEGLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKIKILTTGPVSNIMINVENIEIVKDFVLLGSTNNTRESSGQEIKQCIALGKSAAKDFFKVLKRRDVSLRTKMCLTQARVF	674031	675748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_674000_675700
909416	contig_11590_pilon	-	5057	27	Intergenic	novelGene_125569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	107	junction_3	91.5486742848503	276	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	348	2759	413797	357182	FALSE	10	ACCCATGGGCTTCTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YINYVFPSFDSVKSARAALQENGCLPENSTFLQAELRSEALNGNLDFVLSFLESNTLPFSINSVRGSLILGFRRCVDINLWSKITELLYNDGRYCQEPLGPTEAVGYFLYNLIDSMSDSEVQAKEEHLRQYFHQLKKMNITISQNIYRGLRNLLDIYHVPELIKDVNMLVEREKIDSRKTLQLTSSDLESTLEKLKAENQPIRDVLKQLILLLCSEENMQKALEMKTKYESDMVVGGYAALISLCCRHDNAEDALSLKQEFDHLDSSAVLDTRKYVDLVRVLGKHGKLQDAVNILKEMKEKDVVIKDATVLSFFHILNGAALRGEVETVKQLHEAIVTLGLAKPSTTISSPLVTLYLEKDDLPTALGASIDCYEKYKILPRIHDVLCKLIEKGETDLIQKAMDFVSQEQGEMTMLYDLFFAFLQTGNYKEAKKIIETPGIRARPARLQWFCDRCIASNQVETLEKLVELTQKLFECDRDQLYYSLLKLYKLNGDWQRADVVWNKIQEENIIPRDKTLRLLAEILRNNNQEVPFDVPELWYEDTAHPLKSSSPSPVETHFEKDLLKACQRKKSKDAYNIFLKAQNQNIEFNSETYSTLTRLLLSMDSFTQAMQVKNVAETHIKGFTLNDAANSLLIITQVRRDYLKEALAVLRTALDLEQLPSRIAVTRLIQAFALKGDVESVQTIQKMVKGLENSIGLSNMVFINNIALAQIKNNNIDVAVENIESMLTSGDPAVEPQYFGLAYLFRKVIEERLEPALEKISIMTERLANQFAVYKPVTDLFLQLVDSGKVDDARALLQRCGAIAEQTPILLIFCVRSSRTPGKAPTMKSLMELIPELIEKEEAYASIMKSYALDNDVASAKALYERLTAKNIKLHDLFLKRYAVLLKSAGEPVPFTEPPESFEFYVKQLKESKESPL	442521	354883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_-_357239_358024_358168_360057_360143_361847_361923_364303_364420_364550_364691_366484_366690_370151_370241_378338_378466_382829_382939_383073_383217_390097_390189_390835_390905_399822_399930_400392_400518_409016_409225_410638_410725_411409_411541_412584_412699_413051_413097_413441_413520_413728_413836_414908_414967_416838_416867_434356_434424_437343_437438_442459
909417	contig_2450_pilon	-	3438	17	Intergenic	novelGene_160301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	63.1575101927712	388	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	627	1901	465188	414100	FALSE	25	CATGAAGGGTCAAGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAVEEYEEMQVNLELEKDLRKKAESFAQEMFIEQNKLKRQSHLLLQSSAPDQQLLKALDENAKLTQLLEEERIQHQQKVKELEEQLENETLHKEIHNLKQQLGLLEEDKKELELKYQNSEEKARNLKHSVDELQKRVNQSENSVPPPPPPPPPLPPPPPNPIRSLMSMIRKRSHPSGSGAKKEKAAQPETTEEVTDLKRQAVEEMMDRIKKGVHLRPVNQTGRPKAKPESAKGSESAVNELKGILGTLNKSTSSRSLKSLDTENSETELERILRRRKVTAEADSSSPTGILATSESKSMPVLGSVSSVTKTALNKKTLEAEFNSPSPPTPEPGEGPRKLEGCTSSKVTFQPPSSTGRKRKDVGSEEQAGPVIVLDPISTHASETKDQVAEKDPAQPKEDEGKTKPECKEDSMEKIRETDSSSC	512050	412562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_414323_429888_430082_434029_434151_439736_439791_442635_442746_449367_449451_454610_454711_456701_456856_459105_459253_465098_465194_467980_468063_468956_469059_471060_471230_477376_477472_484775_484837_493885_493939_511991
909418	contig_7840_pilon	+	2470	11	Intergenic	novelGene_68958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_2	423.01588622651	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	352	2133	238014	304775	FALSE	35	GGGAAGCAAAACGATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	130617	305112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_230804_230931_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_304059
909419	contig_17144_pilon	-	3988	15	Intergenic	novelGene_29492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2073.01942359744	33	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	2189	3703	173384	166363	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKGSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168216_168992_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
909420	contig_3250_pilon	-	4593	6	Intergenic	novelGene_178855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	273	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3523	3882	42820	42146	FALSE	15	AGTCTCCCTATTTGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKGGGMQRVASENPREAEKEKGKKKKSNTCSLQTAPKEPPTRARGI	75600	41434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3250_pilon_-_42295_42609_44244_52450_52554_54564_54700_73475_73977_74240
909421	contig_4852_pilon	-	2654	8	Intergenic	novelGene_153976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_7	64.1271059247625	6	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	377	850	94053	91044	TRUE	25	TAATGGATTTTAATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRGNSGLYWCEAKPVKAGVIKSKMLQINVQRVPVSDVNLEARPPGGQVTEGKMLVLVCSVTEGTGNITFFWYKGAMGLKLGTKTQSSLTAEFEILTARESDAEQYYCAADNGYGPSLSELVSITVRSKFHYSSSQPEYLKLGSMFPRGTQKKFKRG	94429	83593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4852_pilon_-_84723_86248_86278_86872_86945_87165_87249_88776_88805_90256_90374_90697_91424_93959
909422	contig_14450_pilon	+	1649	2	Intergenic	novelGene_49037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGACAGAGCTGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290174	1291877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1291211_1291264
909423	contig_7356_pilon	-	3502	8	Intergenic	novelGene_60361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	650.895615318475	137	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	477	1118	342753	340651	TRUE	35	TCTTGAAGCTTAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSEAQKMLSQSLYGMSLISGTVIRRGDPQPVLMCTLVKKENWERPKSMTDLLHHSLLSGSLSAVHKLRRSQARLAQSGIPPPAHTFPYEILIDHANSLKTATVRKKVQNTLVLCKLGISKISVPEKFIVEDKLPKYFLINPEKQFLDLKDLEWRYYKGLVKWTHTTSDSFIDIKCNKEMRFVESQLMPDDIFPPLVRKSWSIFSQNDYSKK	457915	324939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_325071_337232_337295_338459_340863_342323_342830_343906_343999_435516_435623_437474_437529_457767
909424	contig_17768_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_140392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGGCATCCAAAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50703	48443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_48400_50700
909425	contig_8278_pilon	-	1333	2	Intergenic	novelGene_165303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	64	447	229370	228987	TRUE	55	TAAAAAATACCCCCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGLRFRCGIGGLFKVPATQQRRSRAYSVSQDFAEVLRKPKRQLTKLVFPLQELERQLAPDTRPSLHLKLFEPSLEDIARADDLFTATDRHRIEYLSSAVRLEHAPDLLRPEVSASLLTVCSVRGEC	229433	227974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_228843_228968
909426	contig_15731_pilon	+	4743	12	Intergenic	novelGene_171965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	296.303117077905	155	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	209	2320	15182	24981	FALSE	20	GAGTTTAGTTTGTCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSDHMPGPVCLIENIDGKLMVNQEALTILSALTQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKQGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPEKPNHTLVLLDTQGLGGVEKEDNENDSWIFALAILLSSTFIYNSMGAINQQAMDQLHYVTELTNQIRAKSSPDSNEVEDSADFVRFFPDFVWALRDWILKLEADGQSITADKYLENSLKLKPGTSQEEKIFNLPRVCIQKFFPKKKCFVFHPPTKWKKLVHLETLQDDELDSEFVQQVAEFSSYIFSHSKIKILSGGIKVNGPRLKSLVLTYVNAISNGSLPCIENAVLALAQIENSATVQKAIAHYDQQMGQKVQLPTETFQELLDLHRASEKEAIGVFIRNSFKDINHLFQKELAAQLEKKWNDFCEKNLRASSDHCLALLQDIFSPLEEEVKQGVYSKPGGYRLFIQKTQELKKKYLQEPRKGIQAEEILQKYLMSKESVTDAILQTDLTLTEKEKETEVERVKAESAQATAKMLKEMQIKHQQLMEQKEKSHQEHVKQLTEKMEDKNQLLAQQESILALKLQEQEQLLKEGFKEERIKLQKEIQDLQMRSIETSTSVKLVIAEFAQDAKKMLEEMQIKYQQMMEQKEKCHQKHVNQFIEKMERDTEQLFTEQNRTPALNFQVYNCVISISSSIGPVSKTQNRGRVCHPEIDLSSPDTILHFLFPLIVIPHLLLL	11540	27404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_+_11691_15123_15369_15886_16015_17412_17523_17793_17991_18348_18592_19670_19952_20592_20806_21775_21879_22171_22363_23510_23614_24625
909427	contig_16411_pilon	+	2025	6	Intergenic	novelGene_77277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	339.752027219853	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAGAGATTCCCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18757	42733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_18812_20432_20515_21951_22081_30832_30985_35170_35237_41191
909428	contig_16125_pilon	-	3393	2	Intergenic	novelGene_155276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	973	1359	163655	163269	FALSE	55	CAGAATTAAATGAAATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSKNKESRNFPEEENFLELPEAEYERLIYRTLQEIRKEINQNAEHTIEEIKKIKEEYNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKMSKLDNSIESHRRRIEAMEVRISEIEDKALETNLFEEKSDKRI	165083	161234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_163993_164448
909429	contig_13780_pilon	-	2734	16	Intergenic	novelGene_149073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_5	1568.52361438675	22	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	44	2185	761485	657588	FALSE	30	AAAAACTCTCATTGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSVASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	761528	657038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_761434
909430	contig_7428_pilon	-	2732	13	Intergenic	novelGene_77687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_12	74.6894961378997	392	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	112	2079	243098	226517	FALSE	10	GCTGTATGCATTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQLTWTGFAHREGFEYGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILHQQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMVSG	247147	225863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_226706_226838_226955_233975_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236530_236588_236681_236858_242380_243113_247050
909431	contig_6873_pilon	-	1471	3	Intergenic	novelGene_129838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.5	169	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	315	1469	786314	696789	FALSE	30	GGGAGCCCCCAGCAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKTFPATTYSGNSRQRLQEIREGLKQPSKSSAQGLPVGPNNDPSLDTKVLGSKDAARQQQQMRATPKFGPYQKALREIRYSLLPFANELGPPTAAEVNRQMLQELVNAGCDQEGTGDSFPSYHQMSGAAYEGPSFRAEGPTVLKEVTCQYMDFMFSGQRPSRASAHSLPGGHQQPPKGYCANMEAPVLSFPVSNHGGPALQLPGPHSPNGPHYGRPHLMIQGEPLVYGLQRSPSFQNKGSPEAGGYANLPAKGQGTQPNASLTFLPSGVAAGLYLPHPHHKQTGPSSHQIHMMGSRGQVFVNDSPPPSLLTPSRNSLNMDLNEMNTSPVQQWPSSTLSRRDSLQKPGLDAPPRQHVPFRPNGPVPSRTSSFNNHQQQVVVPIR	794887	696786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_697602_785972_786518_794776
909432	contig_12528_pilon	+	4512	9	Intergenic	novelGene_81354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	56.3237017160627	221	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	3555	4511	1011312	1039236	FALSE	80	AGAAGAAGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPQPESTLSNKRKNNQGNSFQAKRARLNKITGLLASKAVGVDGAEKKEDSSETAPMLEQAISPKPQSQKNNEADISSSANTQKPALLSSTLSSGKARSKKCKHESGESSGCIKPPKSPLAPELTQVEDLTLVSQLSSSVINKTSPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEVPDVAHLSLEKLGPCLPLDLSRGLEVTAPVVPDPSYRNEFPRVEKEEAQMLTYPSSKAVADGRGAPTASGISKTEKKVKLEEKSSTTFGKRKEKDKERKEKRDKGPYKPKQ	1002416	1039237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1005731_1010526_1010738_1011282_1011412_1016764_1016848_1020325_1020579_1022683_1022873_1023140_1023348_1037916_1037974_1039168
909433	contig_6677_pilon	+	614	2	Intergenic	novelGene_114190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTCATTTCAAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555488	556473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_556056_556426
909434	contig_12464_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_68721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375161	377865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375959_376058_376344_376860
909435	contig_10196_pilon	+	1206	10	Intergenic	novelGene_132150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	536.740390611309	8	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	4	1044	1034566	1050606	FALSE	50	GAAATTTAAAAAGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWRPRSPVLTCRDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQGPEGRGTATRGQRRGLPWHPGLDSLCHRKVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAVFTGDTLFVAGCGKFYEGTADEMYKALIEVLGRLPPDTKVYCGHEYTINNLKFARHVEPHNAAIQEKLAWAKEKYGIGEPTVPSTIAEEFTYNPFMRVREKSVQEHVGETDPVTTMRAVRKEKDQFKVPRD	1034562	1050768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038466_1039041_1039107_1043788_1043937_1044036_1044124_1044831_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
909436	contig_10973_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_150349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2409	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2400
909437	contig_8898_pilon	+	2117	4	Intergenic	novelGene_137254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTCCAGGGCGGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331613	339826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_333217_334680_334828_335584_335753_339627
909438	contig_14220_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_159881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	721	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	149	478	387746	388075	NA	45	AAAGTCAAGAAGGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHLRYSTGLTPSGARENENRIQGKDQSKGLMDHSYHSLHQTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGSWTELEKDVEQNSNTQKETSFTGLTGTGETPRVWPPDTLLAQC	387597	390136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_387600_390100
909439	contig_7322_pilon	+	1805	10	Intergenic	novelGene_164906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	105.034856060521	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	608	1558	227266	236271	FALSE	50	TTATTTTTTAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAMVLTSLSCSPIVQSPPGAEANFSASRSACDLWKESGDVSDSGSSTTSGHWSGSSGISTPSPPHPQASPKYLGDVFGSPQTDNGFETDPDPFLLDEPAPRKRKNSLKVMYKCLWPNCGKVLRSVVGIKRHVKALHLGDTVDSDQFKREEDFYYTEVQMKEESAAVAGTLAPGTPTTEPAPTPSVTSTPLAILSPPPPKAQSSGPEHPGLETYLPSGTLSKSAPGSFWHIQADHAYQALPSFQIPVSPHIYTSISWAAAPSTASSLSPVRSRSLSFSDPPQPPPAMKSHLIVTSPRAQSSASPWGSEEVPQSVRH	165179	236518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_165274_221514_221780_222894_223112_227234_227345_231051_231288_231798_231900_232716_233015_234790_234884_235798_235900_236228
909440	contig_7189_pilon	+	808	5	Intergenic	novelGene_117664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	265.296414412257	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	351	806	556864	589110	FALSE	70	AAAACATCACAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLMRHSSPGTRTRRQKGTGKLVIGNPCLSCNKDNVRAGCKKCGYPGHLTFECRNFLRVDPKRDIVLDVSSTSSEDSDEENEELNKLQALQEKRVNEEEEKKTTKSKEKIKLKKKRKRSYSSTSTEEDTSKEKKQKYQKKEKNKEKKSKSKK	556513	589112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_556952_562190_562239_580573_580718_585140_585214_589007
909441	contig_12677_pilon	-	1627	2	Intergenic	novelGene_110757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATCAACCCCCAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1745	46	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_257_328
909442	contig_16907_pilon	+	2064	3	Intergenic	novelGene_87421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_2	30.5	55	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	185	529	327210	331921	FALSE	30	CACTTTGATAACTAAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTELIQKAKLAEQAERYDDMATCMKAVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGGRRSAWRVISSIEQKTDTSDKKLQLIKDYREKVESELRSICTTVLVKRDQLLCLGWPLASF	326470	333456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_326528_327082_327504_331870
909443	contig_15172_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_158742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	547	921	223802	223428	NA	55	AAAAAAAAAAGGACTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLWSFTLPLGCPGLPPPPSVKGLKLSLHGGPCPCIGSSIAGEFFHLLWSELCPSKIHIVNPHPYTQGRRPCATVVKCSAANRKVSGLNPPGTPREKDVAVCFHKDLQSWKPYGAVLLCSVGSQ	224348	222586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_222600_224300
909444	contig_7513_pilon	-	3680	9	Intergenic	novelGene_89014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	45	TCTTTTCAAAAAAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	673380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_673485_673568_674533_677437_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
909445	contig_4689_pilon	-	884	6	Intergenic	novelGene_165403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	22.1033934046336	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	135	326	1087205	1086641	TRUE	20	CCCCAAAATTGTCTCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGDSAHGIQPLGKASGRPDFLVRCLFEALTDYTLVGTQNHQGRMNQTLKKTQAKRCQETGETWLRLLPMALLREGEDIARDTPEYTCEPIEDLKFLLKKTAQATDE	1091780	1084183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1084548_1084918_1085003_1085500_1085603_1086632_1086743_1087115_1087251_1091691
909446	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_91794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	67	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657177	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
909447	contig_6079_pilon	+	2676	4	Intergenic	novelGene_160075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_2	150.851656345637	19	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAGAGAAAGATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394875	486563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_395097_432648_432900_439214_439396_484540
909448	contig_7179_pilon	-	5819	2	Intergenic	novelGene_78124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	0	187	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAAAAAAAAAAAACCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781403	773881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_779295_780997
909449	contig_5482_pilon	-	2343	1	Intergenic	novelGene_144438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAGAGAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246557	244214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_244200_246600
909450	contig_13216_pilon	+	2098	3	Intergenic	novelGene_47480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	444.5	110	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	54	434	229682	243959	FALSE	65	GAAAGATAAAGGAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGE	229628	245623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784
909451	contig_19179_pilon	+	2577	2	Intergenic	novelGene_142365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	353	814	18607	19068	TRUE	70	CATTAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTDAKILNKILANRIQHHSKKTKNHDQVEFVPGMQGWFNIRKSINIIHHINKKNHTIISVDTEKAFDKVQHTFLIKTLNKIGIEGKFLSIIKGIYTKPTANIILNRERLETFPLRSGTRQGCPLSPLNVVLAVLARAVRQEKEMAYKLVRKK	18254	22448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_20028_21644
909452	contig_12915_pilon	+	2577	1	Intergenic	novelGene_148355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGATCTACTGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137944	140521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_137900_140500
909453	contig_7357_pilon	+	3621	21	Intergenic	novelGene_36949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_15	31.0404574708557	179	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	395	2650	1156250	1232418	FALSE	15	GTGTATTGGTTATTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAAQQFQYAVRVIGSNFAPTVERDEFLVAEKIKKELVRQRREADVALFSELHRKLHSQGVLKNKWSILYLLLSLSEDPRKQPNKVSSYATLFAQALPRDAHSTPYYYARPQTLPLNYQDRSTQSAQNSGSMGSSGISSISMYALNGPTPTPQSLLPGQSHQAPGVGDCLRQQLGSRLAWTLTANQPSLQTTTSKGIPNAVARNMTRSRREGDTSGTVEITEAALVRDILYVFQGIDGKIIKMSNTENCYKAEGKANLNKSLRDMTIRLAELGWLHNKIRKYIDQRSLDRSFGLVGQSFCVALHQELKEYYRLLSVLHSQLQLEDDQGVNLGLESSLTLRRLLVWTYDPKIRLKTLAALVDHCQGRKGGELASAVHAYTKTGDPYVRSLVQNILSLVSHPVLSFLYRWIYDGELEDTYHEFFVASDPTVKTDRLWHDKYTLRKSMIPSFITMDQSRKVLLIGKSINFLHQLCHDQTPAAKMIAATRSAESPKDAADLFTDLENAFQGKIDAAYFETSKYLLDVLNKNYSLLDHMQAMRRYLLLGQGDFIRHLMDLLKPELVRPATTLYQHNLTGILETAVRATNAQFDSPEILKRLDVRLLEVSPGDTGWDVFSLDYHVDGPIATVFTRECMSHYLRVFNFLWRAKRMEYILTDIRKGHMCNAKLLRNMPEFSGVLHQCHILASEMVHFIHQMQYYITFEVLECSWDELWNKVQQAQDLDHIIAAHEVFLDTIISRCLLDSDSRALLNQLRAVFDQIIELQNAQDAMYRAALEELQRRLQSEEKKKQREIEGQWGVTAAEEEEEKKRIQEFQASIPKMCSQLRILTHFYQGIVQQFLVLLTTSSDESLRFLSFRLDFNEHYKAREPRLRVSLGARGRRSSHM	1143692	1233389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_1143803_1148260_1148329_1155143_1155222_1156111_1156330_1158769_1158943_1159317_1159437_1160209_1160336_1162252_1162322_1162685_1162819_1166928_1167096_1181519_1181631_1181953_1182063_1185221_1185412_1187642_1187779_1188824_1188894_1193485_1193622_1211582_1211672_1211801_1211934_1219910_1220052_1228726_1228844_1232259
909454	contig_4782_pilon	-	2509	2	Intergenic	novelGene_73589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGAAGTACAATAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161821	34	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_1148_160425
909455	contig_602_pilon	-	3788	2	Intergenic	novelGene_134946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2647	3078	451588	451157	FALSE	30	TCCTCAATGAGATGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILKKSAPTQCGNYQIISHASKILLKIIQKRLWKYINRELPEIQAGFRRGRGTRDIIADVRWILAESRVNQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLWRMGILEHLIVLMKNLYMDQEAVIQTEQGDAAWFKVRKGERQSVC	475719	450446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_451907_473391
909456	contig_10323_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_123604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	291	876	19	894	460225	459350	NA	30	AATGTCAGGAAGCACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	460243	459276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_459300_460200
909457	contig_18055_pilon	+	2130	14	Intergenic	novelGene_117815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	340.773589136914	228	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	606	1136	77213	80793	TRUE	70	AGGAAGAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40667	85628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
909458	contig_19990_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_30757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAAGTTGATTCCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47286	45323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_45300_47300
909459	contig_11386_pilon	+	3213	3	Intergenic	novelGene_82807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	52	4	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCTCAGCCCAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92753	98932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_93343_94168_96764_98903
909460	contig_3281_pilon	+	3001	2	Intergenic	novelGene_128520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	243	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1601	1918	13834	14151	FALSE	40	CTTAATTTTTAAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFLKFLLDPFRKREKEDVDIPKYFSLFNPEDKSFLFSSAGDQCCMNAQQRVTSNIYRLCSTSGTDKVAIKSNVLFPPPRMSGATFVWHLRSLMLLQNHILESG	10037	15234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_10616_12811
909461	contig_10323_pilon	+	3310	1	Intergenic	novelGene_123529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTGGTAACATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122106	125416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_122100_125400
909462	scaffold_9100_pilon	+	1167	8	Intergenic	novelGene_83251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	512.55402900871	40	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	114	1082	647136	654763	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESCLSEECVYCVLYSFWFLHPTCLAHFFFPTLSNPGLQCVNPILHVLCITVLKDLMLCTVSQ	644841	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653399_654578
909463	contig_7179_pilon	+	5285	16	Intergenic	novelGene_78103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	423	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGGAATCTGAGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638840	781395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_639082_639734_639979_642028_644514_645237_645389_662990_663075_664990_665124_668996_669053_669178_669313_678808_678980_680449_680644_682875_683067_688642_689207_689653_689716_700652_700778_779242_779295_780997
909464	contig_1734_pilon	-	2437	4	Intergenic	novelGene_164390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCGGAGCCGCCTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661906	654683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_654803_658207_658380_658995_659083_659847
909465	contig_15108_pilon	+	6421	5	Intergenic	novelGene_131179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	15.4110350074224	286	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	521	1780	96977	172769	FALSE	15	TGTCTTGTGTGATTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQDLASITPTPTPGSCSAWDTELEDPAFHPLCSGRVSVRARPPGGAPNPWPSTWEKASEDPRSGPLAQLSLSCASQPGPFLSAITRPPSWPELALPPHSGNPRSGEAEGPFPSLKAEPRLTWCCLSRSLPLPAEQKEKTSSVYLSLHLTGGGPRDEALEGRIRTSQGDSGPAQMSKLSCPIAPGVTSQDWVSEPEQRKGLPRRRAKTSRGISRQKKLRINPKRYKGAFLQSRAQPRASRLCKPHWVLRGGCHPHPHEGRDPCKALQPASSETAGLNPQGEPSGATSQPSRCCGNKEKNEDDGRRISVTLAPSTSPSNVRKIDNVAVKDISPSAGEHGNCFSQSSLQSDPCLAVGKDHFPPCCKGLDVGLLKTQLLLPAEHVSVDPKSGIFADAQGPSSFESEGTLPRHDAATSVAAVGTSLGVKAGHMMLGIPSAEPQGCSWSAEETVLRSSPGRKTIADGTSLPSLPEKPSPGQRISGAAPLESTEKAHLEIPASGLSPTSSHQEEGRHKGFFPSRGQYKCGEKVTPCHPLGNKSEKCQVPGSTSLKDCVVPCSSGQPTDIPEAPSKTIKKRSLEGMRKQTRLEFSDTSSD	96456	177410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_96986_98153_98294_116466_116619_170302_170464_171971
909466	contig_10710_pilon	-	691	1	Intergenic	novelGene_178856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATGAAAAATTCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61405	60714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10710_pilon_-_60700_61400
909467	contig_9668_pilon	+	3068	2	Intergenic	novelGene_58228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATTTAAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556065	559313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_556625_556804
909468	contig_12119_pilon	-	3077	5	Intergenic	novelGene_88669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAGAGGAAAGAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380756	325358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_325736_329485_329646_329743_329831_348675_348977_378604
909469	contig_5084_pilon	+	4701	14	Intergenic	novelGene_64486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACACCGTGTGTCCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82157	138891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_82286_84601_85122_86662_86735_87210_87397_88476_88703_93274_93623_94781_95441_96629_96736_97148_97281_107959_108054_108172_108253_109366_110320_129143_130269_138819
909470	contig_10937_pilon	+	2656	20	Intergenic	novelGene_67345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_19	228.44238319032	36	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	209	2608	194624	209271	FALSE	0	CTGGTGTGGGCCTTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLNSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHSFYQMLRGSEEELLQKLHLQRNPAVYTFTRQGAGLNALDSDERSHQAVTQAMRVIGFSPEEVASVYRILAAILHLGNIEFVETKEEGPEKGGLVVAEEVLVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKAHSTAEACYARDACAKAVYQRLFEWIVNKINSIMEARGRDPRLHGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYQREGIAWQSIDYFNNAAIVELVERPPRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHPHYSSRQLCPTDKSMEFGRDFRIKHYAGNVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSVDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKSSMVALVENLASKEPYYVRCIKPNEEKVAGRLDEGHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDRAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPQTLVTLEQSRAHLIPIIVLLLQKAWRGTLARRHCRRLRAVYTIMRWFRRHKVRAHLVELQQHFQAARQPPLYGRDLTWPPAPAVLQPFQDTCQALFCRWRARQLVKNIPPSDMAQIKAKVAAMGLLQGLRQDWGCRRAWVRDYLSSATDNPTASGLFAQRLQTLREKDGFGAVLFSSHVRKVNRFLKSQRGARRLVSVEVKPEQPVPDFRCSRAGFTLLWPSR	192306	209319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_192474_194582_194677_195626_195793_196159_196214_197960_198057_198304_198422_199075_199301_199399_199546_199988_200104_200426_200598_200863_200935_202226_202302_202488_202622_203444_203612_203904_204113_205662_205887_206409_206555_207238_207344_207621_207642_209162
909471	contig_2892_pilon	+	4246	2	Intergenic	novelGene_119025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1258	1596	276653	276991	FALSE	45	GTACAACTGAATGAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIQVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQQLLFPVFLIRASNAGVSWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	275252	279641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_275681_275823
909472	contig_8330_pilon	-	688	5	Intergenic	novelGene_71859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	272.306353212701	37	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	111	479	916108	902099	FALSE	15	TAACCCTGTATGCCGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSASQVWLSS	916218	901889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_902125_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
909473	contig_12970_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_50527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206936	208004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_206900_208000
909474	contig_177_pilon	-	4138	10	Intergenic	novelGene_41772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	27.4325210266308	17	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1	1038	141065	128141	FALSE	15	GCCCACGGTCTTCTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGDRAGSLPNYATINGKVSSSPVASGMSSPSGGSTVSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPEISREQAIALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTIMQQSKKGDMTHELVRHFLIETGPRGVKLKGCPNEPNFGSLSALVYQHSIIPLALPCKLVIPNRDPTDESKDSSGSANSTTDLLKQGAACNVLFVNSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATTVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPLNTVTFCALDPQERKWMKIEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACHLFAELDPNQPASAIVNFVSKVMQSAGQKR	141065	125040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_128286_131830_131864_132296_132366_133181_133351_133602_133675_135661_135740_136553_136647_137047_137180_138159_138247_140905
909475	contig_19185_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_163668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGTCTTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171261	169455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_169500_171300
909476	contig_9646_pilon	-	1777	1	Intergenic	novelGene_117463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACCAGATTTACATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346715	344938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_344900_346700
909477	contig_15775_pilon	-	1718	4	Intergenic	novelGene_148374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	27	347	26889	7508	FALSE	20	GCACCCTCCCAAGCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAHHQHSLLFQTGQTIAKPKFFSVAARGGERHGLSIYSSRAWSIFKLEKVLALTWLWGRRGEGGASSSGPPSLYPQLSSHISISISLRAFDHHGSRIDLGSILV	26915	6136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_7524_15547_15713_20094_20223_26877
909478	contig_4659_pilon	-	3969	8	Intergenic	novelGene_118234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	204.340052713258	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	10	714	860030	837826	TRUE	75	AATAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQGTQKL	860039	817412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_837252_837843_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916
909479	contig_5765_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_141423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTCCTGGTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926889	925335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_925300_926900
909480	contig_13868_pilon	-	1650	2	Intergenic	novelGene_172653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTAATATGGCTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73706	70870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_71839_73024
909481	contig_6059_pilon	-	2289	15	Intergenic	novelGene_44823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	3964.09952715929	4	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	45	1835	584299	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRPERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584343	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584226
909482	contig_12624_pilon	+	1981	3	Intergenic	novelGene_61079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	35	397	874107	875652	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAGATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPGALELGGAGMSDSGEVSSWRLLLRMDPQLNGFKVVAGNKPLLPVEHDRGPVIIPLLQDKDDVPWHDLELLWCLRYKLKPHTVSLPFQSPAGDQTRDPALSLDHIPSHDAMEQALWTWGQETQLQAPSAI	874072	877236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_874139_875121_875186_875385
909483	contig_12969_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_61648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTTCATGTTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6151	8415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_6200_8400
909484	contig_5686_pilon	+	2704	16	Intergenic	novelGene_45275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1793.66956699264	26	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	356	2506	170242	215504	FALSE	60	AAGAAATGCACGTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQVGLVTAFVF	93819	215702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_129751_129997_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305
909485	contig_14142_pilon	-	2343	9	Intergenic	novelGene_120516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	600	junction_8	213.448142121219	1898	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	7	570	355495	351591	TRUE	5	TGTTTGGGCTTCTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIMSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLCEYLLQVFQSPRSLPP	355501	349028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
909486	SIRV5	+	1995	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	0	34	0	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
909487	contig_6902_pilon	+	2367	7	Intergenic	novelGene_135613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_6	517.977074782273	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	68	1099	534167	540426	FALSE	15	CAGAACTTTGCCGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSQAQELFSSSLQPYRSQPAFMQSSLSQPSVVLSGTAIHNFPAVQHQELAKAQSGLAFQQTSNTQPIPILYEHQLGQASGLGGSQLIDTHLLQARANLTQASNLYSGQVQQPGQTSFYNTAQSPSALQQVTVPLPASQLSLPNFGSTGQPLIALPQTIQPPLQHTTPQAQAQSLSRPAQVSQPFRGLIPAGTQHSMIATTGKMSEMELKAFGSGIDIKPGTPPISGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIAGKAQRVDSDSSKPPETLTDPSGVCQEKVEEKPTPAPTMATKPIRTGPIKPQAIKTEETKS	530912	541694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_530964_534150_534383_534617_534726_535813_536033_536457_536562_536925_537053_540168
909488	contig_16310_pilon	-	471	2	Intergenic	novelGene_70065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	224699	217520	FALSE	20	ATCCATTTGTGATATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDLTLRGQSQPWTPAPQALISDFRNRAIATGSQPERHTRSAGHVEWQAGSRGTVTHSTLGRLALCRDRQNRTRYKREKQAETHGPRTTEKAVPGAERILWT	224699	217354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_217608_224481
909489	contig_5947_pilon	+	4791	1	Intergenic	novelGene_101566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAATACATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784549	789340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_784500_789300
909490	contig_2733_pilon	-	3299	1	Intergenic	novelGene_128555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2659	2976	567240	566923	NA	60	AAAAAAAACAGATAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAAATALVTQRHGGVAVILPSSGLCKRQGPSIFSQQDLHTPHLNETEVTNDCPDREHNTESQTEPEKSAEQTSNSCKKTRLNGLTETGGTPETTAPDTLLTQN	569898	566599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_566600_569900
909491	contig_2854_pilon	-	3276	11	Intergenic	novelGene_120850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	127.008700489376	188	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	105	1907	356512	300448	FALSE	20	ACCCAGCAGCTGCTCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSVNPIQIPSRLPLLLTHEGVLLPGSTMRTSVDSARNLQLVRSRLLKGTSLQSTILGVIPNTPDPPSDAQDLPPLHRIGTAALAVQVVGSNWPKPHYTLLITGLCRFQIVQVLKEKPYPVAEVEQLDRLEEFPSASDSREGLGELSEQFYKYAVQLVEMLDMSVPAVAKLRRLLDSLPREALPDILTSIIRTSNKEKLQILDAVSLEERFKMTIPLLVRQIEGLKLLQKTRKHKQDDDKRVVAIRPVRRITHIPGTLEDEDEKEDNDDIVMLEKKIQTSSMPEQAHRVCVKEIRRLKKMPQSMPEYALTRNYLELMVELPWNKSTTDRLDIRAARILLDNDHYAMEKLKKRVLEYLAVRQLRHNLKGPILCFVGPPGVGKTSVGRSVAKTLGREFHRIALGGVCDQSDIRGHRRTYVGSMPGRIINGLKTVGVNNPVFLLDEVDKLGKSLQGDPAAALLEVLDPEQNHNFTDHYLNVAFDLSQVLFIATANTTATIPPALLDRMEIIQVPGYTQEEKIEIAHRHLIPKQLEQHGLTPQQIQIPQITTLDIITRYTREAGVRSLDRRLGAICRAVAVKVAEGQHKEAKLDHSDMTEGEGL	356616	299078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_300590_303933_304061_305693_305845_310667_310810_319989_320249_330266_330362_333215_333380_338792_338916_340346_340479_347773_348009_356279
909492	contig_6915_pilon	+	2668	3	Intergenic	novelGene_162402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAAGTCTGGTCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173820	178139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_175785_175875_176254_177813
909494	contig_6589_pilon	+	1976	5	Intergenic	novelGene_26056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1344	junction_3	639.797770783863	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	372	1319	1726632	1730190	FALSE	20	CACTTGCTCCAGACCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVIWLRPHSLLAP	1726260	1730847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067
909495	contig_2380_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_117906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTTGCAACCTGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530528	528135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_528100_530500
909496	contig_10765_pilon	+	4084	1	Intergenic	novelGene_122888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCCCAGTATTGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55549	59633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_55500_59600
909497	contig_7333_pilon	+	3511	11	Intergenic	novelGene_142798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	29.9801601063103	244	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	253	1320	372970	384466	FALSE	70	AAAAAAAAAATTACAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEEQQQASKKNFYWELPKVELHAHLNGSISSKTMRKLIAKKPDLKIHDGMTVIDKGKKRTLEECFQMFQLIHQLTTSPEDILMVTKDVIKEFADDGVKYLELRSTPRREDATGMTEKTYVESILEGIRQSKQENLDIDVRYLIAIDRRGGPSAARKTVKLAEEFFLSTEETVLGIDLSGDPTVGQAKDFLEPLLEAKKAGLKLALHLSEIPNQKKETQMLLDLLPDRIGHGTFLNSSEGGSLHLVDFVRQHRIPLELCLTSNIKSQMVPSYDQHHFGFWYSIAHPSVICTDDKGVFATHLSQEYQLAAETFNLTQSQVWDLSYESINYIFASDSTRSELRQKWNHLKPRVLHF	344909	386657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_345112_372919_373033_373308_373440_374120_374182_376461_376550_378625_378708_379411_379539_380757_380839_382110_382250_383458_383560_384271
909498	contig_615_pilon	+	2181	4	Intergenic	novelGene_80036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	136.933885101128	41	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTGTTTGTTACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8773	27136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_8965_10614_10900_22345_22407_25492
909499	contig_19604_pilon	+	2206	4	Intergenic	novelGene_77248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	305.470129472589	31	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	45	476	273206	273921	TRUE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGKFSPALTRGDTVCPSLGLMGRASGYQPLLTEAMDAASWKPAVVPCRCPSEAADPHQVQGDEEGVPQHPAVHHCL	273161	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484_273703_273820_275120_275287
909500	contig_13786_pilon	-	2037	2	Intergenic	novelGene_174579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139958	137859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_-_139590_139651
909501	contig_7165_pilon	+	3369	1	Intergenic	novelGene_116866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2636	2935	409087	409386	NA	50	GGTATATCCATACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHSYQGLHQTKSSTARWCPAITTHCSDKDRNRGFWTDLEKDVKQNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHLFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	406451	409820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_406500_409800
909502	contig_14300_pilon	-	6120	33	Intergenic	novelGene_133124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	109	junction_1	161.408340378526	645	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	954	2865	21	2885	442548	386595	TRUE	20	TGCCCACCAATATTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALESLLDEVALEGLDGLCLPALWSRLETRVPPFPLPLEPYTREFLWRALTTHPGISFYEEPRERPDLQLQDRYEEIDFETGILESKRDPVPLEDVYPIHMILENKDGIQGSCRYFKERKNITNEVRTKSLQPRCTMVEAFGRWGKKLIIVASQDMRYRALIGSEGDPDLKLPDFSYCILERLGRSRWEGELQRDLHSTAFKVDAGKLHYHRKILNKNRLITMQSHVIRLPSGAQQHSILLLLNRFHVDRRSKYDILMEKLSGVLSTRSNQIETLGKLREELGLCERTFKRLYQYMLSAGLAKVVSRPLQEIHPECGPCKTKKGTDVMVRCLKLLKEFKRRYEDDQDEDDDEEVISKAVPPVDIVFERDMLTQTYELIERRGTKGISQAEIRVAMNVGKLEARMLCRLLQRFKVVKGFMEDEGRQRTTKYISCVFAEESDLSRQYEREKARGELLTTVSLASVQEESVPPEGEDTFLSESDSEEESRRSKRKGKGLQGDRRHHSTPAKGGWKVLNLHPLKKQSSCTPGAAEEKSCWSSVSGDGLLHSSGFSDAHCMESNTGDIAVIEEVRLENPKESSSSQKSGKQGQDKPHETYRLLKRRNLIIEAVTNLRLIESLFTIQKMIMDQEKQEGVSTKCCKKSIVRLVRNLSEEGLLRLYRTTIIQDGIKKKVELVVHPSMDQNDPLVRSAIEQVRFRISNSSTASRVKVAQPPVPQGEAEEESQGKEGPSGSGYSHQNASSKSESGRMKKTDEKMGITQLKNYHPVVVPGLGRSLGFLPKMPRLRVVHVFLWYLIYGHPAGNMVEKPGPSSERRMGKQEPGRAGAQLYSGNDSETSSDAPSRDNEDLGTTLEAEVELPTETVYVDEASWMRYVPPIPVHRDFGFGWALVSDILLRLPLSVFVQIVQVCYKVDNLEEFLNDPLKKHTLIRFLPRPVRQQLLYKRRYIFFGHGEPS	442568	359702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_360774_362089_362352_363567_363856_365230_365404_367130_367225_367932_367996_369360_369474_371449_371532_373467_373611_379172_379331_381804_381994_382131_382214_382838_382975_383357_383500_386237_386416_386533_386632_387140_387239_388358_388505_388817_389100_390573_390759_391530_391635_394190_394345_396028_396160_398865_399066_399603_399881_400886_401003_402564_402727_422708_422833_427256_427354_429717_429862_430487_430665_435728_435939_442327
909503	contig_14472_pilon	-	3547	10	Intergenic	novelGene_111194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2598	2933	541923	534100	TRUE	15	GTTTTAAGTTTCTAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEGLNRCLLRGCCRLLVEDFLEYIYKLGVLPGTGMPAFVSFMKYFCTRLATCFAVLLPSSSAIFCQRRDSTSSGGYFRSSCSSFFCSSTVHNWLNVSGLVSSHRRPLII	551103	530596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_530952_533750_533899_533988_534102_534792_534865_535897_536000_539796_539893_541859_542015_546143_546277_548433_548534_548830
909504	contig_9976_pilon	+	3446	13	Intergenic	novelGene_147906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_10	36.6563432437007	154	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	38	1927	15748	56971	FALSE	20	GATTTGTGATTTTAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDVDTRKIIKAMLSYVWPEDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLGFHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVTLVSGVLYYKCGAQFALVTLGTLGAYTAFTVAITRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNEKYEAQRYDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSIGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTRIKDKAMAPPLLITPQTATVAFDNVHFEYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGNIYLAGQNIQDVSLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYTVAKLAGLHDAILRMPHGYDTQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRTSIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANSGSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPKWDAKRENMSKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC	15710	58490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_15832_35332_35466_36345_36615_37643_37733_37824_37913_38811_38987_39936_40095_40674_40839_40996_41127_45612_45785_48336_48441_53683_53792_56755
909505	contig_10904_pilon	-	1697	9	Intergenic	novelGene_22544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	238.253934909793	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	133	891	396033	375280	FALSE	5	TTTGTGTGTGGCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTEGIQSQRTTPPQTSKKIGAAPDKMTKSSLSSKESEEVVTDSSVIMKIRSSALAEVSQASNAEEPQGVTYAEIHTRALRQASSNLTKQPLETCVYAAVKR	396165	374473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378003_378679_378718_379166_379195_381161_381213_388756_389054_389359_389453_389761_389798_395999
909506	contig_2114_pilon	+	2194	2	Intergenic	novelGene_104230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAACTATGCATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137446	139922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_137524_137805
909507	contig_7171_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_101432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCCAATATTATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1578377	1575915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1575900_1578400
909508	contig_2940_pilon	+	2208	2	Intergenic	novelGene_81986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	253	657	1122358	1122762	TRUE	40	ACTAAAAGGCACGAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLQNIFKKKTLTALKREIDSFTITVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNSTTGQLDLTNIYRTLHPTAAKYTFFSSAHGMFSREDPILGHRATHNKIQNAEVIQTFFSDHDAIKVEINRKIKEKNQFHGN	1122105	1126568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1122995_1125249
909509	contig_12312_pilon	+	2093	20	Intergenic	novelGene_63995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	69.0825913825832	15	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	94	816	477005	506242	TRUE	60	AAAAGAAAAAAAGATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSSSCSLGRAAVTVHRRRRGLHRRVRLPASMATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDVRTGSLGS	476911	534357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506321_506746_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
909510	contig_17897_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_153393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCATGGTCCCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12599	11228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_-_11200_12600
909512	contig_8138_pilon	+	2071	7	Intergenic	novelGene_52436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	384.470198238216	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	204	515	280295	305581	TRUE	10	TTAGTAGTGGTGGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQGESES	280091	307939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364_306631_306717
909513	contig_17108_pilon	+	2495	2	Intergenic	novelGene_109506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCCCCTAGGCTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24319	28524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_25914_27623
909514	contig_10904_pilon	-	3569	7	Intergenic	novelGene_22516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	183.503860086557	23	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCCATCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353983	345667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347020_347095_347435_348716_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957
909515	contig_2768_pilon	+	1295	4	Intergenic	novelGene_57493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1.63299316185545	65	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGGTATACTATGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687195	692267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_687287_690283_690365_691053_691163_691253
909517	SIRV6	+	917	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	21	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	28	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	197	688	1733	10736	TRUE	20	TTATTAGCCTGCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1158	11275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1622_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909518	contig_14326_pilon	-	2080	7	Intergenic	novelGene_120718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	67.0060113389504	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	562	939	443129	442066	FALSE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVNPGMARWIKELFCHNERVVLTGDWKHGFFSLTAVGATNVGSIRIYFDRDLHTNSPRYSKGSYNDFSFVTHTNKEGVPMRKGEHLGEFNLGSTIVLIFEAPKDFNFELKAGQKIRFGEALGSL	486161	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443558_443792_443812_445748_445901_473560_473737_486102
909519	contig_960_pilon	+	2497	2	Intergenic	novelGene_108298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038628	1041995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1040641_1041510
909520	contig_13051_pilon	-	2587	3	Intergenic	novelGene_140131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445225	391554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_392077_392490_394361_445030
909521	contig_8317_pilon	+	719	2	Intergenic	novelGene_19369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	21	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCAGTTTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16251	17069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
909522	contig_9235_pilon	+	2404	3	Intergenic	novelGene_156206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	262	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	240	1268	45805	46953	FALSE	35	TAGGGAACATCAGACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43961	48089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_46534_46653
909523	contig_16742_pilon	-	3331	2	Intergenic	novelGene_176572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1454	1759	21929	21624	TRUE	25	ATTATGGCTTTCAGGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKNKIKKRERVAVEAAYVQPNTSWDLVPQFGESGSWFHGISQLIRLLLGAVKSVQQNETLSGSEPSSQSLLCLSSLLQPLCQSISLRVFLFFADPLLYQA	23382	19985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16742_pilon_-_20524_20589
909524	contig_12964_pilon	+	5478	1	Intergenic	novelGene_131715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGGGGTCCCGTGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582505	587983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_582500_588000
909525	contig_11364_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_65174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	216	651	684	1334	128950	129600	NA	65	CAAGGAAAAAAAATCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQIKTPDDSPVEENALEVPDREFKSLMLGIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQYAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	128266	131149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_128300_131100
909526	contig_9091_pilon	+	4408	1	Intergenic	novelGene_32419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	327	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGCACCCCCCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6527	10935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_6500_10900
909527	contig_6361_pilon	-	1940	11	Intergenic	novelGene_23885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	147.775133226128	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	842	1423	98864	90660	FALSE	70	AAAAAAAAAATTACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPFGTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMLSQQGAEPQQQHHHVVISQVVTEKEFLSRSDQLQQVVQSQGFVSYCQKKIEASQTEFEKNVWSFLKVNFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKMDGPDVVRRPLKIPAF	109593	90142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_90732_92886_92962_93900_94138_98473_98627_98819_98982_101424_101525_104334_104476_105426_105523_107165_107365_108691_108816_109529
909528	contig_10734_pilon	-	2094	2	Intergenic	novelGene_51396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACGGAGCACAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2028366	2026098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2028020_2028193
909529	contig_7333_pilon	-	3874	12	Intergenic	novelGene_142742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	18.0476870613512	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	1766	2941	60124	41089	FALSE	85	GAGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFAVAQRITCPQVLIQKHLVRLLSVVLPNLKSEDTPCLLSIDLFHVLVGAVLAFPSLYWDDTVDLQPSSISSSYNHLYLFHLITMAHMLQILLTIDTGLPLAQVQEDSEEARSAASFFEEVSRLTSGCIGCGIPGWCLWVSLKNGITPYLRCAALFFHYLLGVTPPEELFANSAEGEYNALCSYLSLPTNLFLLFQEYWETVRPLLQRWCSDPALLNCLKQKSSVVRYPRKRNSLIELPDDYSCLLNQASHFRCPRSADDERKHPVLCLFCGAILCSQNACCQEMVNGEEVGACIFHALHCGAGVCIFLKIRECRVVLVEGKARGCAYPAPYLDEYGETDPGLKRGNPLHLSHERYRKLHLVWQQHCIIEEIARSQETNQMLFGFNWQLL	64242	40155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_41231_42221_42324_43178_43350_48483_48562_50657_50715_51142_51252_52507_52642_53508_53597_55282_55434_56481_56550_60048_60146_62498
909530	contig_12464_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_68731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	309	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGATTAAGAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379293	381320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_379300_381300
909531	contig_5286_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_157351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	578	1093	537447	536932	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLSELSQQGANHVNFGQQPVPGNTAEQPPSPAQLSHGSQPSVRTPLPNLHPGLVSTPISPQLVNQQLVMAQLLNQQYAVNRLLAQQSLNQQYLNHPPPVSRSMNKPLEQQVSTNTEVSSEIYQWVRDELKRAGISQAVFARVAFNRTQVSFVLFVNDSLLSPFFSLFFS	538024	535715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_535700_538000
909533	contig_8259_pilon	-	1846	10	Intergenic	novelGene_148879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	156.578698707356	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	396	1142	302034	181319	FALSE	25	GAGCGTGCCTCTGAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDLNGDGEVDMEEFEQVQSIIRSQTSMGMRHRDRSTTGNTLKSGLCSALTTYFFGPDLKGKLTIKNFLEFQRKLQHDVLKLEFERNDPVDGRITERQFGGMLLAYSGVQSKKLTVMQKQLKKHFKEGKGLTFQEVENFFTFLKNINDVDTALSFYHMAGASLDKVTMQQVAKTVAKVELSDHVCDVVFALFDCDGNGELSNKEFVSIMKQRLMRGLEKPKDMGFTRLMQAMWKCAQETTWDFAFPKQ	392240	180614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_181480_185324_185415_230425_230535_245398_245537_292588_292787_301983_302067_341439_341479_341829_341945_363021_363066_392075
909534	contig_6710_pilon	-	559	2	Intergenic	novelGene_91542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2	352	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657174	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
909535	contig_2703_pilon	-	5426	17	Intergenic	novelGene_101719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGCCTCCCTCGCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615497	526179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526411_559432_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584589_596349_599819_602056_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754_611245_615173_615258_615385
909536	contig_12622_pilon	+	4405	9	Intergenic	novelGene_5766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	398	793	96341	100801	TRUE	15	TCGCTGTGGAGGGGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLREFVSILTTLPERSCLVMKLSGFDGNTLSAVVMRRATQIMQDCKSSPSSIIARGWDRAKHCIVSYLWRISGLGLMSSSTSCGVFINIRQLNVWLFCLCVSFVQVTPLTVDFGKFLRKSFLSSSCKIL	94700	194581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_94852_95807_95956_96242_96383_99903_100007_100175_100365_100739_103400_103539_104370_125265_125348_194479
909537	contig_7333_pilon	+	5376	12	Intergenic	novelGene_142801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.530976972878	287	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	2685	3752	372970	384466	FALSE	25	TGTTGCTGTAAACAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEEQQQASKKNFYWELPKVELHAHLNGSISSKTMRKLIAKKPDLKIHDGMTVIDKGKKRTLEECFQMFQLIHQLTTSPEDILMVTKDVIKEFADDGVKYLELRSTPRREDATGMTEKTYVESILEGIRQSKQENLDIDVRYLIAIDRRGGPSAARKTVKLAEEFFLSTEETVLGIDLSGDPTVGQAKDFLEPLLEAKKAGLKLALHLSEIPNQKKETQMLLDLLPDRIGHGTFLNSSEGGSLHLVDFVRQHRIPLELCLTSNIKSQMVPSYDQHHFGFWYSIAHPSVICTDDKGVFATHLSQEYQLAAETFNLTQSQVWDLSYESINYIFASDSTRSELRQKWNHLKPRVLHF	365611	386090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_367601_367771_368417_372919_373033_373308_373440_374120_374182_376461_376550_378625_378708_379411_379539_380757_380839_382110_382250_383458_383560_384271
909538	contig_1575_pilon	+	2545	2	Intergenic	novelGene_45156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_1	0	161	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCCCAACAGTCAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39931	46378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_40365_44266
909539	contig_7843_pilon	-	2511	2	Intergenic	novelGene_152044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCAGTCCCTAGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453290	450605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_453011_453184
909540	contig_17108_pilon	+	4905	7	Intergenic	novelGene_109543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_5	291.804015279662	238	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	108	1265	348292	405337	FALSE	30	CTAAATGGATCTACGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERCAETPPGAEVAARPDEASAPLAASQRPAPRAPMAGPRWDPLRNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTIVYTVFYSLLFLFIYVQLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPVCLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKTGTWERKAIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSLCLYKISKMSLANIYLESKGSSVCQVTAIGVTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKNVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVVFGVVLFVWELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGLQGSFAPDYYDWGQQTNSFMAQVGTLPQDSTLDPDKPSHG	348184	408977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_348661_379156_379207_387005_387229_389625_389776_392366_392496_394880_395006_405225
909541	contig_8140_pilon	-	3486	2	Intergenic	novelGene_86444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	767269	766913	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWCFLRKPEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIGKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNCLITWMKLEDIMLSEISQSQKYKYCMRTLL	767269	738632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_-_739269_764419
909542	contig_17603_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_152793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTAGTTTTGCTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65939	68850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_65900_68800
909543	contig_11855_pilon	-	2135	5	Intergenic	novelGene_67107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCTGCTGCAGCACCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2447597	2440100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2440399_2441559_2441663_2443327_2443441_2445372_2445570_2446173
909544	contig_4924_pilon	-	1960	10	Intergenic	novelGene_84684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_3	1175.29984616483	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	552	1274	133038	65524	FALSE	70	GATTAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252595	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
909546	contig_20641_pilon	+	4074	12	Intergenic	novelGene_52771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1326.23817713084	27	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	2838	3779	38659	56882	FALSE	25	AGATCTCTGTGAAAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTLRIFKKCEYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	1176	57177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_1237_2666_4642_5049_5228_11751_11876_12293_12417_14233_14390_14452_14597_38581_38694_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
909547	contig_8660_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_136476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	440	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTCTGCTGAGCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15141	12414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_12400_15100
909548	contig_9955_pilon	+	2996	1	Intergenic	novelGene_21264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCACACAGTGGTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39607	42603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_39600_42600
909549	contig_17274_pilon	-	1276	9	Intergenic	novelGene_26580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_8	326.931543866602	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	145	834	247024	232842	TRUE	40	TTAAAATTTTTTTTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	259039	231555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_258905
909550	contig_11378_pilon	-	6473	3	Intergenic	novelGene_112214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	5970	6473	263627	258311	FALSE	0	GTCGCCCCGCCCTCCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVVKLFSLSMYALLTKQSVYIPCTPLKTFSLPLPFCHVIYQDKVRNEVINANAVATVPFRSLISFHHHTGSYVYDNNRHCFLFILESTKSSTTSGSGPIKTISKKGSCQTFCRRSLAAGLFTIAIQDYLHSLHMLLSQAFFFLPPGLRVLPWPLPRLLLPPLPPLP	270512	258310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_258381_263193_266729_267644
909551	contig_16185_pilon	-	2247	12	Intergenic	novelGene_144737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	97.3927042594835	541	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	99	1577	127403	82386	FALSE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLESLPLLRAQFLSWTRARRRSLLEDSWFTHRKTVPALPCQLHGKTTCELNFLVSTMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	134361	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87051_87208_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
909552	contig_16211_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_150105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCACTGGCCCAGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231298	233100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_231300_233100
909553	contig_9177_pilon	+	736	2	Intergenic	novelGene_32755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	218	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	603	132	734	1299096	1299698	FALSE	20	TTAGTATCATGTTGGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGGYETIEAYEDDLYREESSSESVDSEVEFQLYSQVHYAQDLGNAGEEEHEEKDSGSSESPSSKANQKNLIILSDSEVIQLSDGSEVITLSDEDSIYRCKRKNIRVQPQEKTQCPPAFIHSNELADKKCKRGIEKPKPEERSDMIREVMIIEVSSSEEEDSTISESDNVESWMLLGCEVDDDKDDDILLNLVGCENTVNE	1294550	1299700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1294658_1299071
909554	contig_4900_pilon	+	2542	7	Intergenic	novelGene_159063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	490	984	1180473	1180967	TRUE	30	TGGAGGGCAGAATGGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKVTGLQNLVRECPHGVEGEASCVSRGQEEEGKICSSVKTVRTHASSGRIPGKALSWPLEDSPTAQASNPQLANIIALCRILFHACFMLLDFTCSSRLFCPPAESQTPGQRQPSSHGSHLLATPWPWSSIQGTHHFFPVHLSEGLVHLTQGPPECGAMVCPD	1179983	1218424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_1181715_1184601_1184685_1185056_1185197_1185924_1186024_1187603_1187677_1188057_1188250_1218200
909555	contig_10940_pilon	-	2346	12	Intergenic	novelGene_49197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_7	91.4987241928849	31	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	423	1727	444742	421771	TRUE	40	AAATATGGTATTTTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVNIWLFLLVVLLCGKKHLGDRLEKKPFEKAPCPGCSHLSLKVEFSSTVVEYEYIVAFNGYFTAKARNSFISSALKSSEIDNWRIIPRNNPSSDYPSDFEVIQIKEKQKAGLLTLEDHPNIKRVTPQRKVFRSLKYAESDPLVPCNDTRWSQKWQSSRPLRRASLSLGSGFWHATGRHSSRRLLRAIPRQVAQTLQADVLWQMGYTGASVRVAVFDTGLSEKHPHFKNVKERTNWTNERTLDDGLGHGTFVAGVIASMRECQGFAPDAELHIFRVFTNNQVSYTSWFLDAFNYAILKKIDVLNLSIGGPDFMDHPFVDKVWELTANNVIMVSAIGNDGPLYGTLNNPADQMDVIGVGGIDFEDNIARFSSRGMTTWELPGGYGRVKPDIVTYGAGVRGSGVKGGVSGPIGDQRCFSSGSRCRHLACQHRPET	458364	418079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_418555_421626_421789_423983_424137_426124_426228_428768_428837_429970_430088_431881_431992_432323_432435_434200_434405_443614_443873_444579_445066_458265
909556	contig_5226_pilon	+	3324	1	Intergenic	novelGene_140492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	271	1653	2278	3660	NA	15	TCTGCATGTCAGGGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIASKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLTINFIWKGKKPRISKALLKKKNKLGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLMFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	2007	5331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_+_2000_5300
909557	contig_6870_pilon	+	3404	23	Intergenic	novelGene_103988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	265.787322546517	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	911	2736	303	3038	1493590	1607140	FALSE	55	ATATTAAAGCAAGGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN	1481079	1607506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1488699_1488781_1493506_1493613_1502310_1502447_1504248_1504495_1521425_1521617_1523634_1523857_1524821_1524943_1525069_1525166_1530739_1530856_1532495_1532662_1533390_1533490_1539714_1539975_1547905_1548099_1560663_1560706_1561569_1561717_1564394_1564541_1567438_1567569_1593452_1593538_1594461_1594549_1601696_1601852_1607065
909558	contig_5816_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_158268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTGGTGGAGGCCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382268	380772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_380800_382300
909559	contig_4876_pilon	-	6977	29	Intergenic	novelGene_137882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_24	120.444838758967	310	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1982	5949	85	6033	310787	160251	FALSE	25	TTAGGTGTATTAATATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSGSDSSVGARACFGGLFANLIRPGDAKAVCGEMTRDQLMFDLLKLVNILVQLPLSGNREYSARVSVTSNTTDSVSDEEKVSGGKDGNGSSTSIQGSPAYVADLVLANQQIMSQILSALGLCNSSAMAMIIGASGLHLTKHENFHGGLDAISVGDGLFTILTTLSKKASTVHMMLQPILTYMACGYMGRQGSLATCQLSEPLLWFILRVLDTSDALKAFHDMGGVQLICNNMVTSTRAIVNTARSMVSTIMKFLDSGPNKAVDSTLKTRILASEPDNAEGIHNFAPLGTITSSSPTAQPAEVLLQATPPHRRARSAAWSYIFLPEEAWCDLTIHLPAAVLLKEIHIQPHLASLATCPSSVSVEVSADGVNMLPLSTPVVTSGLTYIKIQLVKAEVASAVCLRLHRPRDASTLGLSQIKLLGLTAFGTTSSATVNNPFLPSEDQVSKTSIGWLRLLHHCLTHISDLEGMMASAAAPTANLLQTCAALLMSPYCGMHSPNIEVVLVKIGLQSTRIGLKLIDILLRNCAASGSDPTDLNSPLLFGRLNGLSSDSTIDILYQLGTTQDPGTKDRIQALLKWVSDSARVAAMKRSGRMSYMCPNSSAVEYGLLMPSPSHLHCVAAILWHSYELLVDYDLPALLDRELFELLFNWSMSLPCNMVLKKAVDSLLCSMCHIHPKYFSLLMGWMGITPPPMQCHHRLSMTDDSKKQDLSSSLTDDSKNAQAPPTLNESHLATLASASQSPEAIKQLLDSGLPSLLVRSLASFCFSHISYSESIAHSIDSSQDKLRRHHVLQQCNKMPITADLVAPILRFLTEVGNSHIMKDWLGGPEVNPLWTALLFLLCHSGSTSGGLNLGAQHTSARSASLSSAAATGLTTQQRTAIENATVAFFLQCISCHPNNQKLMAQVLCELFQTSPQRGNLPTSGNISGFIRRLFLQLMLEDEKVTMFLQSPCPLYKGRINATSHVIQHPMYGAGHKFRTLHLPVSTTLSEVLDRVSDTPSITAKLINEQKDDKEKKNHEEKEKVKAENGFQDNYSVVVASGLKSQSKRAVSATPPRPPSRRGRTVPDKIGSAPSGAETANKIITVPVFHLFHKLLAGQPLPSEMTLAQLLTLLYDRKLPQGYRSIDLTVKLGSRVITDPSLSKTDSFKRLHTEKDHGELLGSCPEDEALTPSDESMEGILDESLLETCPIQSPLQVFAGMGGLALIAERLPMLYPEVIQQVSAPVVTSTTQEKPKDSDQFEWVTIEQSGELVYEAPETIASEPPPIKSAVQTMSPIPAHSLAAFGLFLRLPGYAEVLLKERKHAQCLLRLVLGVTDDGEGSHILQSPSANVLPTLPFHVLRSLFSTTPLTTDDGVLLRRMALEIGALHLILVCLSALSHHAPRVPNSNLSQTEPQVSSSHNPTSTEEQQLYWAKGTGFGTGSTASGWDVEQALTKQRLEEEHVTCLLQVLASYINPVSGAVNGEAQSSHDSRGQNNNALPSVLLELLSQSCLIPAMSSYLRNDSVLDMARHVPLYRALLELLRAIASCTSMVPLLLPLSTEDGEEEEEQSESQTSVGTLLAKMKTCVDTYTNRLRSKRENVKTGVKPDTSDQEPEGLTLLVPDIQKTAEIVYAATTSLRQANQEKKLGEYSKKAAMKPKPLTVLKSLDEKYVAVMKKLQFDTFEMVYEDEDGKLGFKVNYHYMSQVKNANDANSAARARRLAQEAVTLSTSLPLSSSSSVFVRCDEERLDIMKVLITGPADTPYANGCFEFDVYFPQDYPSSPPLVNLETTGGHSVRFNPNLYNDGKVCLSILNTWHGRPEEKWNPQTSSFLQVLVSVQSLILVAEPYFNEPGYERSRGTPSGTQSSREYDGNIRQATVKWAMLEQIRNPSPCFKEVIHKHFYLKRVEIMAQCEEWIADIQQYSSDKRVGRTMSHHAAALKRHTAQLREELLKLPCPEGLDPDAEEASEMCSTATAGAEETPVHDQVKPSSSKELSSDFKL	310871	159306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_160434_163324_163460_164658_164848_180175_180254_182492_182655_195641_195860_199416_199528_200186_200333_220344_220556_256555_256725_258432_258598_263029_263248_266003_266305_285121_285319_286518_286693_288016_288185_289785_289918_293892_294023_294474_294619_296251_297033_297990_298213_301920_302030_302284_302542_305516_305797_306905_307107_307841_308037_308173_308271_309277_309454_310387
909560	contig_11258_pilon	-	2026	3	Intergenic	novelGene_67827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	441	833	358549	330326	FALSE	30	AAGCCTTCATCTTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESTERQIRRLVNNCYCSSSNIKHTYKYHDFHNHNRRSTCAVHHTDHSGCHPQHEQPGELQTEPEPKARCPSSHDLEVGLLGLGCLPDGRWSSKHGLDEGGTHIPAVGISQLPLSQARLDAPGSVFQLV	360939	329132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_330660_358490_358581_360530
909561	contig_5023_pilon	-	2709	1	Intergenic	novelGene_7110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTCCAGCATTATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83604	80895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_80900_83600
909562	contig_11318_pilon	-	5792	16	Intergenic	novelGene_48144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	469.572401233292	3	126	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	4207	5091	49828	30552	TRUE	70	GAAGAAAAGCAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPPHLNRPPMGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKVRGYKCYRNGRRQKRPDIPRDQQIQRHTQEIIW	54329	14976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21500_27675_27736_30499_30566_31126_31211_32289_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_52142_52436
909563	contig_9389_pilon	+	2822	6	Intergenic	novelGene_84106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	273.480529471478	23	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	255	818	1408796	1423232	TRUE	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNPFLKQVFNKDKTFRPKRKFEPGTQRFELHKRAQASLNAGLDLRLAVQLPPGEDLHDWVAVHVVDFFNRVNLIYGTVSDGCTEQSCPVMSGGPKYEYRWQDEHKFRKPTALSAPKYVDLLMDWIEVQINNEDLFPTSVVDRIAQMGAEAHVNTCYKHFYYFVREFGLIDTKELEPLKEMTMRMCH	1390468	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1390486_1398390_1398531_1408698_1409217_1418153_1418267_1423202_1423613_1423728
909564	contig_7446_pilon	-	1742	2	Intergenic	novelGene_101963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	255689	255375	TRUE	90	AAAAAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPVASSHSSLFCLCVCLWLLFLSSLSLIFPIPVLAPHITIYPLLPAYLHCALNITLTSSTGTAYWNLPCTGSRSALSALVHATNNPSQQLPFSWTCPAVPYLID	255691	253839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_254296_254405
909565	contig_14661_pilon	-	711	1	Intergenic	novelGene_47441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAAAAAAAGAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62251	61540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_61500_62300
909566	contig_348_pilon	+	3563	8	Intergenic	novelGene_67613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	11.3945923443482	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1148	2134	320222	344260	FALSE	35	GTATAAAAACTGTATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEKPEVNLCCPLRPPRQAMGCWSLSGVPCPPRDARFLSGAFQVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLLQANRDQLLCLGWPLETVTLTLQTKVPHPMRCFGCT	318281	345689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342659_342990_344146
909567	contig_6488_pilon	+	2174	2	Intergenic	novelGene_44772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAACAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237999	247326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_239402_246554
909568	contig_19098_pilon	-	661	1	Intergenic	novelGene_65793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108256	107595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_107600_108300
909569	contig_3018_pilon	-	3629	3	Intergenic	novelGene_78901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_2	57.5	161	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGGAGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625103	596968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_600194_603367_603441_624772
909570	contig_20928_pilon	-	3570	1	Intergenic	novelGene_178858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	3093	3515	20721	20299	NA	55	GAAGCATCAAAATATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNISSKQQLKKTGVAMLISDKIDFKVKSTTKGKERHYIMIKRSVHLEDITIINIYAPNDRDPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLLVKDRTSRKKLNKGTGALKATTNQPDLTDIYQTLHPTEDKYTFFSNAH	23813	20243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20928_pilon_-_20200_23800
909571	contig_7165_pilon	-	3375	2	Intergenic	novelGene_116874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAAGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644238	635416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_638632_644078
909572	contig_6233_pilon	-	1730	10	Intergenic	novelGene_74764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	313.774079298316	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	128	1015	149777	143464	TRUE	15	GTTTGTGTGTCTGAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKIQTSNVTNKNDPKSINSRVFIGNLNTAVVKKSDVETIFSKYGRVAGCSVHKGYAFVQYANERHARAAVLGENGRMLAGQTLDINMAGEPKPNRPKGLKRAASAIYSGYSFDYDYYRDDFYDRLFDYRGRLSPVPVPRAVPVKRPRVTVPLVRRVKTTIPVKLFARSTAITTSSAKIKLKSSELQTIKTELTQIKSNIDALLGRLEQIAEEQKANPDGKKKGDSASASASGSGSSGGNSRPPAPQEDTASEAGTPQGEAQARDDGDEEGLLTHSEEELEHSQDTDAEDGALQ	250170	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118501_143459_143509_144358_144544_144765_144880_145615_145783_147888_147937_148115_148189_149521_149787_200462_200546_250135
909573	contig_10868_pilon	-	6063	14	Intergenic	novelGene_173896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCCTCGTTCCCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522822	476234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_-_476292_496286_496413_497659_497740_498736_501586_502785_502975_509497_509757_510286_510530_511215_511542_511887_512143_517261_517431_519391_519536_520045_520126_520316_520474_521693
909574	contig_6375_pilon	-	3752	12	Intergenic	novelGene_73052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_9	40.8035000929419	175	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	495	2102	591117	533763	FALSE	35	GGATAAATATTTTTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGARQRSSTEKNHPGGTESDASPETGSGGDGVALKKEIGLVSACGIIVGNIIGSGIFVSPKGVLENAGSVGLALIVWIVTGLITAVGALCYAELGVTIPKSGGDYSYVKDIFGGLAGFLRLWIALLVIYPTNQAVISLTFSNYVLQPLFPTCIPPEYGLRILAAVCLLLLTWVNCSSVRWATRVQDIFTAGKLLALALIIIMGMVQICKGEYFWLEPKNAFENFQEPDIGLVALAFLQGSFAYGGWNFLNYVTEELVDPYKNLPRAIYISIPLVTFVYVFANIAYVTAMSPQELLASNAVAVTFGEKLLGIMAWIMPISVALSTFGGVNGSLFTSSRLFFAGAREGHLPIVLAMIHVKRCTPIPALLFTCISTLLMLVTSDMYTLINYVGFINYLFYGVTIAGQIVLRWKKPDIPRPIKISLFFPIIYLLFWAFLLVFSLWSEPVVCGIGLAIMLTGVPVYFLGVYWQHKPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYPKVEGGLRAEEMTEEMEEQQQPMYSPTPSKEQGSEDQPQA	591861	532112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_533930_534481_534660_536209_536360_538123_538221_541815_541920_543715_543840_544440_544595_547058_547185_568606_568759_569710_569916_590966_591152_591401
909575	contig_9516_pilon	+	3537	15	Intergenic	novelGene_106173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	56	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2795	3121	890793	898590	TRUE	5	CCTCTACCTTCCCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLTSSCTHLLPSEDSHSTILNVRQVLSRHIERRWLEVYASFPFHCLNRNVFVTFGSSENHSSFDRGGRMYGSSGSSDTISTFRSRARMDLAAAKAAVPPPISRKGT	877765	913214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_878029_878367_880184_881624_881764_883610_883754_884207_884297_884628_884732_888747_888858_889792_889867_890735_890818_896961_897060_898255_898386_898516_898634_899605_899705_905483_905624_913080
909576	contig_10766_pilon	+	1661	2	Intergenic	novelGene_151242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	357	1304	1660	593736	594092	FALSE	25	GTGAATTTGCCCAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSADSCDSETTVTSFGEGLVTPKAQDQPYFNESEEESLITLQKGREKAAASADKRKSDSQNFPKSETAEDDGNEQSTCHQEDCVTKITETQEVSSPAQRVELPREESAESDVDKSSE	590851	594093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_592134_593714
909577	contig_12638_pilon	-	757	4	Intergenic	novelGene_33325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1212.46589871862	12170	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	91	402	1303682	1298668	FALSE	10	AATGCTTGTTGCCGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEETLKRLQSQKGVQGIIVVNTEGIPIKSTMDNSTTTQYANLMHNFILKARSTVREIDPQNDLTFLRIRSKKNEIMVAPGHSALLRGIPRAGIHAALASFNLVPLEICLECSGRPEAELVTENDMNPGPVALR	1310671	1298312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1299322_1299483_1303534_1303703_1310601
909578	contig_8616_pilon	+	2699	15	Intergenic	novelGene_72464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	491.772372471788	120	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	749	2250	16	2265	303538	312793	TRUE	35	GCACCAACCAACAGTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKRLKVTELRSELQRRGLDSRGLKVDLAQRLQEALDAEMLEDEAGGVGPGPGGACKAEPRPVAAPGGGPGGDEEEDEEEEDEDEDEEALLEDEDEEPPPAKGSVQAVQPPPEPPEAAAIEAAAEPDASEQPAEATAGSGGVNGGEDQGTGKGEEDEPEERNGDETPGSEAPGDKAAEEQGDDQDSEKSKPAGSDGERRGVKRQRDEKDEHGRAYYEFREEAYHSRSKSPPPPEEEAKEEEEDQTLVNLDTYTSDLHFQVSKDRYGGQPLFSEKFPTLWSGARSTYGVTKGKVCFEAKVTQNLPMKEGCTEVSLLRVGWSVDFSHPQLGEDEFSYGFDGRGLKAENGQFEEFGQTFGENDVIGCFANFETEEVELSFSKNGEDLGVAFRINKESLADRALLPHVLCKNCVVELNFGQKEEPFFPPSEEFVFIHAVPVEERVRAAVPPKTIDECEVILMVGLPGSGKTQWALKYTKENPEKRYNVLGAETVLSQMRMKGPEEPEMDPKSRDLLVQQASQCLSKLVQIASRTKRNFILDQCNVYNSGQRRKLLLFKTFSRKVVVVVPNEEDWKKRLELRKEVEGDDVPESIMLEMKANFSLPEKCDYVDEVTYGELEKDEAQPIVTKYKEEARKLLPPSEKRTNRRNNRNKRNRQNRSRGQGYVGGQRRGYDNRAYGQQYWGQSGNRGGYRNFYDRYRGDYDRFYGRDYEYNRYRDYYRQYNRDWQNYYYHHPQDRDRYYRNYYGYQGYR	303522	313330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_304082_306176_306313_306578_306656_306859_307000_307277_307369_307466_307580_307798_308063_308241_308365_308715_308845_309394_309564_310900_311102_312152_312227_312487_312596_312712_312864_312966
909579	contig_5189_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_34885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATGAAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254222	256249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_254200_256200
909580	contig_2312_pilon	+	5025	1	Intergenic	novelGene_160743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	3618	3983	250090	250455	NA	85	ACAAAAAAAAAAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIKEQHEGCYTDTQRALGTLSLRSLQRHRYQWGTSENNGQTGVLDILRPLKKAFLLHLSDIGVVMEQRGHGLPWSGSASGFGLSGPLLIGASMVLGSSRCWVSRVSIVLWKLNLCVAPS	246472	251497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_246500_251500
909581	contig_12437_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_169063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30650	33055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30600_33100
909582	contig_13481_pilon	+	1477	3	Intergenic	novelGene_119513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTTGCAGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411900	1413946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1411959_1412475_1413255_1413306
909583	contig_6076_pilon	+	2430	1	Intergenic	novelGene_81723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTCAATACCCAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20601	23031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_20600_23000
909584	contig_498_pilon	+	1876	6	Intergenic	novelGene_148553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	68.7470726649506	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	30	1409	755864	768386	FALSE	30	GAAAGCTGAAACTGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADLVNAHVVPGPGVVKGLREVGLPLHRGCLLIAEMSSAGSLATGSYTKAAVRMAKEHSEFVVGFISGSRVSMEPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKQGSDVIIVGRGILTAPNRLEAAELYRKAAWEAYLSRLGM	755834	768853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760354_761766_761913_762926_763042_768216
909585	contig_10042_pilon	-	5514	1	Intergenic	novelGene_79170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	293	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	371	733	765315	764953	NA	55	AATTAAAATAAATGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSTIKSLIYWHLSADLIDLNPIFVQFFFHCKIGFIGRCRKILTGLRFQSGFNSQYSYLLLTNSIYLVKNNYYSYTFSHQNNRKDLLITVPIIRYVVLVTKKCSMLSLWNALIMRPGCK	765685	760171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_760200_765700
909586	contig_2799_pilon	+	2698	2	Intergenic	novelGene_85586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	75	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	64	345	780241	780522	FALSE	20	CTTACTCCCAGCTATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESPLPSAPSVVKSVSLDSELSMSPKRNSISRTHRDRTFHILSSASQTSRVPEGSSQTPVSTSTSARLFGLAKPKEKKEKKKKSKGGRPQPGGEYTHPPAPGSEEWGLRFQKGIF	780177	783901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_780523_781548
909587	contig_10324_pilon	-	5544	2	Intergenic	novelGene_7855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAACCCCAGGTTCCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355191	348912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_351953_352687
909588	contig_5039_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_64798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	758	1207	177650	178099	NA	70	AGAAAAAAAAAAGAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKCKVSRNWLQVPLPVQPPEQCRWGARQTRGLVQRASGVSHGCSRQAQALFLAGRSVAVSGNCGPGCHLGLGNWPWRLCSPPSRQAARTVIAFIAARAVGELDLNGPPPLPASMPCKQQAAQPQDRQSLSPWALGGWPHKICVCTCDP	176892	179004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_176900_179000
909590	contig_8712_pilon	+	5619	1	Intergenic	novelGene_58807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2721	3023	314974	315276	NA	20	CCTGAGCCAAATCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANASKYGCPRPPQPPLSPLPWPWGLLESQERD	312253	317872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_312300_317900
909591	contig_11304_pilon	+	2334	11	Intergenic	novelGene_156696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	166.481110039548	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2253	80	2332	351822	491248	FALSE	25	AGAGGGCATCCTTGACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHDLNAVSALTFQKEFSLEDKEQFTNGKRGIDAKFLAALPKVAELRKIFEPKRKELLEMKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSRSTSHSEMPTAEDEEKVDERAKLSVAAKRLLFREMEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPM	351742	491250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_351860_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803_458483_484415_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491072
909592	contig_6283_pilon	-	3001	15	Intergenic	novelGene_100208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_14	166.426180240333	551	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	38	2098	641399	611758	FALSE	20	CATGAATCTGTTACTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARLIIHFRDIHPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQVSQSSLPMLSSPSPGQQVPTPQSMPPPPQPSPQPGQPSSQPNSNVSSGPAPSPSSFLPSPSPQPSQSPVTARTPQNFSVPSPGPLNTPVNPSSVMSPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	643976	610854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615143_615323_615452_615526_615664_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_643944
909593	contig_3948_pilon	-	3201	11	Intergenic	novelGene_53312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_4	478.507304019489	21	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	214	1308	1494311	1473126	TRUE	20	CTTCATCAACAGGTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGEDRAVQRQKSPRRPAAPKPSERRPSIFFSKVTPFSSRLGLPGTPGAAKLGGRPSCEEPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLGQGGKVLKTEPSSTLQSPTYVPDPTSSGKRGFNSNSKPPASSEVSEDVVVIALYDYEAIHCEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWRARSLATQKEGYIPSNYVAHVNSLETEEWFFKGISRKDAERHLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPQYGDTVKHYKIRTLDGGGFYISPRSTFSTLQDLVDHYKTTYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGKECCQVDPWCPLGRAVSIESYCL	1510978	1467923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471756_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490839_1491191_1491232_1494194_1494313_1510766
909594	contig_5023_pilon	+	2603	13	Intergenic	novelGene_7298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2090.23041493037	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	158	1291	607975	646990	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580874	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_607978_609594_609725_611686_611820_614402_614470_625753_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
909595	contig_165_pilon	-	787	1	Intergenic	novelGene_117076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCCAAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206524	205737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_205700_206500
909596	contig_6673_pilon	+	2408	1	Intergenic	novelGene_164024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAACAAAACTTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111883	114291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_111900_114300
909597	contig_11258_pilon	+	2400	2	Intergenic	novelGene_67853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	981	1505	352833	353357	TRUE	25	CTGTCCCACACAGCTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGLGCPTWPGAEGAERFPLQGCECHHQLGHIWTTRREDAQAEEAHPQVMGTGVPYHGLWLWLEFSWLLGLWVVLTVASAVDGTSRPSVVAVEVVGLVGVLDIGAGAENTRLTQDLSSDPPRPSPPSWLDFTHHAHFGRGRTEEPGAKVSPGPHGPREHFQTGLRKPTVLIPSC	351852	354392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_353588_353727
909598	SIRV6	+	1073	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	815	138	-383	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	52	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	100	432	2002	10736	TRUE	25	TGGTATCTAAAATGGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1902	11687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909599	contig_12886_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_135509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	435	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTCATACCAGAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608323	609916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_608300_609900
909600	contig_11850_pilon	-	3227	9	Intergenic	novelGene_125210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1137.92974711755	3	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	663	1505	285526	281659	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGKKVAITKTITSHTKGGRWRKRRRCKVTHLAG	287048	279936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_281693_282857_282915_283285_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311_286382_286460
909601	contig_17796_pilon	+	2037	9	Intergenic	novelGene_33801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	350.175826371553	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	133	1074	53527	96917	TRUE	55	AAGGAGAATCAAGATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLVISCLYFIKIL	53394	110500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_97303_99332_99648_110237
909602	contig_10982_pilon	-	8217	33	Intergenic	novelGene_87853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	661	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	6397	6771	83391	79887	TRUE	40	ACATCAGGGGGAGCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSALCLRPLTISNPSIFPTTNTKLPGPTNPSNPDRMNGTSPTGEPAEFTGITSNVFFVTPASPKYIMPPVLELTQISPISSVLQSWGGPSGLTMHIIPPGITCPTSWTVSAEFLSSVLTRITP	124514	54172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_54303_55214_55334_59027_59227_60862_60955_63322_63433_64763_64888_65503_65614_70065_70169_72926_72993_75160_75254_75733_75854_77143_77261_79823_79966_80615_80752_82559_82643_83314_83442_85245_85360_89554_89757_94489_94600_94717_94798_98694_98819_100565_100690_101927_102037_104421_104533_105183_105311_106948_107122_107896_108068_109314_109376_110284_110344_113069_113145_114321_114496_118111_118242_120112
909603	contig_34_pilon	-	2717	2	Intergenic	novelGene_40027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	63	767	219099	218395	TRUE	70	AAAGAAATATAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKPTANIILNGENLKVFPLRMGTRQGCPLPPLLFHIVLEILVRAIRLEKEIKGIQIGREEVKVFLFADDTTLYTENPKESTRKLLERIADFSKVSGYKINIQKSVGFLYSNKENFEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTSDVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIDRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPLAFFNKMEKQITNFIWKRKRPRISKALLKKKNNVGGLKLLGFRKYCTATVVKTAW	219161	216045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_216981_217379
909604	contig_3394_pilon	-	3918	1	Intergenic	novelGene_152666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCTAACCTCCTAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370565	366647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_366600_370600
909605	contig_12464_pilon	+	4007	1	Intergenic	novelGene_68664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	818	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTGTGCATATTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131992	135999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_132000_136000
909606	contig_8898_pilon	+	2608	2	Intergenic	novelGene_137244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACAACCCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302056	304718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_302235_302288
909607	contig_17274_pilon	+	3201	2	Intergenic	novelGene_26471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTAGTTAAAGCTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7005	10262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_10109_10164
909608	contig_6102_pilon	-	5161	2	Intergenic	novelGene_32323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	234	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	3412	3789	1633252	1632345	FALSE	40	ACAACATACCATTTACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIENQNGRTRSAFLKLKELKKKFKTGVAVVKDSMGKILNSTGKIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQELAYDQEPRVLKEEVQAALRHWQKTRLQELMDINRDVFSKWMHRWKCSLVYAK	1636663	1630972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1632412_1632941
909609	contig_15135_pilon	-	2860	5	Intergenic	novelGene_119884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	647.165116102529	21	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	316	861	120151	113596	FALSE	25	CATAGGGTTGCTATGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQVTHLIYYRMENACSVVLNNRSYKMGNFPKKYSLKAVL	122822	111596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_113932_119824_119981_120097_120194_120732_120819_122635
909611	contig_15486_pilon	+	2743	7	Intergenic	novelGene_157308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	75.8230762293966	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	9	536	34567	104521	TRUE	25	GACTCTATCTTCAGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLKQLDQRLFENYIELKADPIVGSLEPGIYAGCFDWKDCLPPTGVRNYLKEALVNIIAVHAEVFTVSKELVPRVLSRVVEAVSEELSRLMQCVSSFSKNGALQARLEVCALRDTVIIYLTPESKSSFKQALEVLPQLSSGADKKLLEELLNKFKSNMHLQLTCFQAASTMMKT	34558	106773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_34703_78816_78873_80703_80827_99883_99946_102096_102157_104430_104767_104811
909612	contig_610_pilon	-	2664	1	Intergenic	novelGene_76771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1502	2551	229060	228011	NA	55	ACATCAAGACAATGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	230561	227897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_227900_230600
909614	contig_10734_pilon	-	2186	6	Intergenic	novelGene_51511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	155.839661190597	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	1069	2100	2269689	2265543	FALSE	50	TAACAGGAGAAGAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRVLPVSVKPLSLVFLLEFEFCTPVFFCSVRNSLLYSKRAIFFVIYIYFTTMKFFLKRSLKTYLIKKKKQQQFHECGASAGFPQATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2275778	2265456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754
909615	contig_4486_pilon	+	2200	12	Intergenic	novelGene_38603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1014.31654309036	9	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	51	881	343083	399436	TRUE	30	TGTGATGTAATAGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTK	343032	413467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391206_392818_392871_399306_399437_407559_407696_411177_411318_412424
909616	contig_7806_pilon	+	3236	1	Intergenic	novelGene_157553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTTCTGGTGTTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291815	295051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_291800_295100
909617	contig_10331_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_54083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTCAGAAGAAGTAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102610	100038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_1e+05_102600
909618	contig_6364_pilon	-	2591	5	Intergenic	novelGene_51844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCCCGCCTCTCCTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734247	1708025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1708249_1714422_1714535_1719465_1719510_1727357_1727481_1732158
909619	contig_3018_pilon	+	2257	16	Intergenic	novelGene_78846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGTCACTGCCTCTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561551	625082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_561580_562782_563044_566733_566846_567964_568081_569956_570099_570211_570434_572320_572360_576712_576887_577774_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600189_603361_603439_618529_618641_624772
909620	contig_5945_pilon	-	1903	2	Intergenic	novelGene_104598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364108	360970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_362683_363917
909621	contig_5918_pilon	+	2134	2	Intergenic	novelGene_99540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1164	junction_1	0	119	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAGCACACTGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721264	723555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_723329_723485
909622	contig_8921_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_161623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCCCAGCAGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18046	20701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8921_pilon_+_18000_20700
909623	contig_5461_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_156846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGTCATCTTCCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889058	891388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_889100_891400
909624	contig_9415_pilon	+	2997	1	Intergenic	novelGene_109745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAAACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589660	592657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_589700_592700
909625	contig_11328_pilon	+	3528	3	Intergenic	novelGene_88422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_2	2384	4961	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	52	477	644338	645398	FALSE	65	AAAAAAAAAAGATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGRRDYAA	644286	648449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644383_644805_645017_645228
909626	contig_3956_pilon	+	241	1	Intergenic	novelGene_14802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1225186	1225427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1225200_1225400
909627	contig_5758_pilon	+	7546	9	Intergenic	novelGene_119046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	256	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTGTTTCACAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19704	482802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_21937_283339_283804_283897_284192_284705_285909_291599_291803_479036_479356_479410_480475_480982_481644_481696
909628	contig_4091_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_173030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	456	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	267	801	1089	1889	14387	15187	NA	55	ATCAACAAAATCGACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIHAPNDRASKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAIFNKIQNAEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKRLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKELVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFER	13298	15187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_13300_15200
909629	contig_2940_pilon	-	2868	2	Intergenic	novelGene_81991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTGATAAATACTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145012	1138573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1139876_1143446
909630	contig_12938_pilon	+	1498	8	Intergenic	novelGene_99705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	852.553595179248	20	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	118	717	78117	85540	FALSE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCIDKSSRVLGL	51945	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84626_85507
909631	contig_12886_pilon	+	5762	3	Intergenic	novelGene_135462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	6	280	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTCTGGGTCACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261857	279863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_262045_264277_264334_274344
909632	contig_14970_pilon	-	2403	2	Intergenic	novelGene_45124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_1	0	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1514	1852	280633	268709	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	282146	268157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559
909633	contig_9668_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_58241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCACAATAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588944	586694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_587254_588621
909634	scaffold_9205_pilon	-	3743	13	Intergenic	novelGene_161096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	16.6606239045508	217	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	92	2461	175624	143923	FALSE	30	CAAGTAGTTAATGTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDSAGRSYNKAIVDTVDNLLRPEALESWKHMNSSEQAHTATMLLDTLEEGAFVLADNLLEPTRVSMPTENIVLEVAVLSTEGQVQDFKFPLGIKGSGSSIQLSANTVKQNSRNGLAKLVFIIYRSLGQFLSTENATIKLGGDFIGRNSTIAVNSHVISVSINKESSRVFLTDPVLFTLPHIDPDNYFNANCSFWNYSERTMMGYWSTQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHREIAYKDGVHELLLTAITWVGIVISLVCLAICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTKYMIACPIFAGLLHFFFLAAFAWMCLEGVQLYLMLVEVFESEYSRKKYYYVAGYLFPATVVGVSAAIDYKSYGTEKACWLHVDNYFIWSFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLENIKSWVLGAFALLFLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQGVFIFIFHCALQKKVRKEYGKCFRHSYCCGSLPTESPHSSVKASTTRTSARYSSGTQSRIRRMWNDTVRKQSESSFISGDINSTSTLNQGHSLNNARDTSAMDTLPLNGNFNNSYSLRKGDYNDSVRVVDCGLSLNDTAFEKMIISELVHNNLRGGSKTHNLELTLPVKPMIGGSSSEDDAIVADASSLMHGDNPGLDLHQKELEAPLIPQRTHSLLYQPQKKVKPEGTDSYVSQLTAEAEDHLQSPNRDSLYTSMPNLRDSPYQESSPDVEEDLSPSRRSENEDIYYKSMPNLGAGHQLQMYYQISRGNSDGYIIPINKEGCIPEGDVREGQMQLVTSL	179566	142640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_144678_149936_150034_150798_150928_153211_153381_155228_155321_163062_163130_164478_164700_165643_165854_167066_167241_168344_168551_168809_168936_175500_175685_179535
909635	contig_7909_pilon	+	2402	10	Intergenic	novelGene_155912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_7	150.202414867734	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	239	2230	496523	545022	FALSE	80	GAAGAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSTFVPNILSKSHNYAAVTKLVPTSVIASTTQKPPVVITASQSSLVSSSSSGSSSSTPSPIPNTVAVTAVVSSTPSVVMSTVAQGVSTSAIKMASTRLPSPKSLVSAPTQILAQFPKQHQQSPKQQLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGTTTKITTIPMTSKPNVIVVQKTTGKGTTIQGLPGKNVVTTLLNAGGEKTIQTVPTGTKPAIITATRPITKMIVTQPKGIGSTVQPAAKIIPTKIVYGQQGKTQVLIKPKPVTFQATVVSEQTRQLVTETLQQASRVAEAGNSSIQEGKEEPQSYTDSSSSSTESSQSSQVKEKLESKPRQPTIDLSQMAVPIQMTQEKRHSPESPSIAVVESELVAEYITTVSHRSQPQQPSQPQRTLLQHVAQSQTATQTSVVVKSIPASSTGAITHIMQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVTEY	496284	545194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_496542_511061_511317_516141_516292_517733_517905_524099_524237_526672_526847_528521_528721_538881_539038_542365_542518_544443
909636	contig_11846_pilon	+	4500	1	Intergenic	novelGene_105986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAGATATTCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347659	352159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_347700_352200
909637	contig_6492_pilon	+	2669	2	Intergenic	novelGene_178859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTGTCGTGTTCCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104693	210731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6492_pilon_+_105838_209206
909638	contig_6361_pilon	-	1489	2	Intergenic	novelGene_24022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAAAAAAATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454342	420419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_421676_454109
909639	contig_11816_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_98552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	1125281	1124874	NA	30	ATGCCCTTGAATGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNPGASSSCRTPSRKQVRRRRGCRAHRGRAQAGQPRFKKASGARPGSADLLGGTGLGGDLVSEGGGSRGRLGPVTLAGRCPRPCRPGWVGRRGRGRGGEVARAEVRRVGGLPSSATSLVFFLKPLCVEEYGHKC	1125282	1123765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1123800_1125300
909641	contig_12886_pilon	-	12913	4	Intergenic	novelGene_135443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	877	127	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	8221	8643	299606	299184	TRUE	60	GCATAGAGAAAAGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENFPNLTKDMNLQVQEAQRNPSRIKSKRSTPRQIIVRGSKSENKEIILKAVREQQKVTYKESPVRLSANFSSEILEASRQWNDIFKVLKEKKCQPSILYPVKLSFKNEGKIKTFSDKQKLKEFISTRPALQKILMGIL	307826	85478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_86800_86857_86940_105121_105602_296796
909642	contig_16632_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_154148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	53	562	203769	204278	NA	75	AAAAAAAAAACTGTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKRLHQKSKKRTYGLGKIFGQYKSDEGLISIIYKKIQHLYNKMPNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQIANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPKEIRVIT	203716	206751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_203700_206800
909643	contig_7179_pilon	+	2461	13	Intergenic	novelGene_78105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGAGCCCCGCCCCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644321	781403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_644514_645237_645387_662990_663075_664990_665124_668996_669053_669178_669313_678808_678980_680449_680644_682875_683067_688642_689207_689653_689716_700652_700778_780997
909644	contig_6795_pilon	-	4590	12	Intergenic	novelGene_27772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	44.1327823657068	189	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	532	1053	493668	489374	TRUE	40	TACTGAGGAAAAAGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVSGACAQDLQG	504859	482775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_486660_487526_487616_489014_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_496920_497165_499670_499832_504751
909645	contig_19459_pilon	-	1264	8	Intergenic	novelGene_59880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	8	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	152	937	16240	7003	FALSE	10	TTATTCCTGTCTTCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19115	6675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
909646	contig_13481_pilon	+	1579	2	Intergenic	novelGene_119508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411856	1413952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1411959_1412475
909647	contig_5711_pilon	+	2257	16	Intergenic	novelGene_80290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	545.01761031691	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	18	1925	223504	249320	FALSE	5	TTTTCTGTCTGTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDPHPMLPNYKNFKGTIQELGQNQYAVSGEIFVVDRNTVEITELPVRTWTQVYKEQVLEPMLNGTDKTPALISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYETVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESSKLNNQARFILEKIQGKITIENRSKKDLIQMLVQRGYESDPVKAWKEAQEKAAEEEETQNQQDDSSSDSGTPAGPDFNYILNMSLWSLTKEKVEELIKQRDAKGRELCDVKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVEAQEREDILAGMSGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRVVPEITAMKADASKKLLKKKKGDLDTTIVKVEFDEEFSGTVEGTGEEALTPSAPINKGPKPKREKKEPGTRVRRTPASSGKSNTKKVKKRNPWSDDEYTFSPGKPKATPEKPSHDKKSQDFGNLFSFPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKPTDKVPSKTVAAKKGKPSSDITPKPKRTPKQKKVEAVNSDSDSEFGVPKKTAASKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKTSKTTTSKKPKKSSFDQDSDVDIFPSDFASEPPSLPRTGRARKEVKYFAESDEEEDVDFAMFN	223486	249652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_223507_225166_225302_226378_226580_227663_227860_228004_228097_230875_231032_231179_231264_232672_232868_235431_235574_235807_235889_238078_238122_240295_240376_241604_241716_246411_246535_248135_248234_249152
909648	contig_11564_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_158552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	736	1203	52912	59749	FALSE	35	CCCTCAACAGCTCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLESCFLPVSSDLLPGSGNRFRFSGTEPALPAVGMDPTTFLETEEEGDGTEAKRSKSFSKVLLVLLFAMEQATGASRPNKSMTGAVDFGELFRGSCGSSFFCGIFTFSKTTGSIFFSGAGSLPLFHLSSFSFLKALMSRLRSMYFFFSYLSRIN	40799	59749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_41171_52105_52426_52867_53032_53824_53937_54965_55048_56119_56207_59682
909649	contig_14780_pilon	-	1344	1	Intergenic	novelGene_166390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	163	507	148787	148443	NA	75	CAATAAAAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEDFYQLLQSEINQTCNQDALIITGNWNAKVGNKEEGPVVGKYGLGDRNDARDRMIEFCKTNDFFVANTFFQQHKRQLYTWTSPNRIHRNQINYICGKRRWKSSISSVRTMTGADCITDHQLLICKFKYKLKKIRTSLRKPKYDLEYIPPEFRDHLKNRFDSLKTNDQ	148949	147605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_147600_148900
909650	contig_12866_pilon	-	4436	2	Intergenic	novelGene_174647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	189	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGCAGTTTGTGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659610	655095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_657298_657376
909651	contig_1244_pilon	-	4666	1	Intergenic	novelGene_37916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTGAAAAGAAAAGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272771	268105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_268100_272800
909652	contig_5878_pilon	-	3322	25	Intergenic	novelGene_145716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_9	148.363480082607	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	832	2499	26	2524	389003	203001	FALSE	40	CATCAATTAAAATTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRQERIQKDIDVVIQKSRAEKDCLFADFRFADSTFTFTYVGGPKSVSYSVHVSEDYPDNTYVSSSENDEDVLVTTEPIPVIFHRIATELRKTNDISCCLSIKSKLQKENGEESRQNSTVEEDSEGDNDSEEFYYGGQVNYDGELHKHPQLEADLSAVRELYGPHAVSLREYGAIDDVDIDLHIDVSFLDEEIALAWEVIRTEPIIVRLHCSLTQYLNGPVPTVDVFQISTKERFGLGHQLKKIMQTFVTQQWKQSKEKSNCLHNKKLSEKKVKSPLHLFSTLRRSPSYPPPGCGKGKCKLKSEQDGISKTHKLLRRTCSSTVKTDDVCATKSHRTFGRSLSSDPRAEQAMTTIKSHKLLNRPCPATVKQEDCLTLKSHKLLTRSCSGDPRCEHNTSLKPHKLLSRSYSSNLRMEELYGLKNHKLLSKSYSSAPKSSKTELFKEPNSEGRRLSLTSGLIGILTPSSSSSSSSQPAPNGAKCIPVRDHGFLVQTIEFAEQRIPVLNEYCVVCDEPHVFQNGPMLRPTVCERELCVFAFQTLGVMNEAADEIATGAQVVDLLVSMCRSALESPRKVVIFEPYPSVVDPNDPQMLAFNPRAPYLEIKKQMDKQDPLAHPLLQWVISSNRSHIVKLPVNRQLKFMHTPHQFLLLSSPPAKESNFRAAKKLFGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVVASNTRLQLHGAMYGSGIYLSPMSSISFGYSGMNKKQKVSAKDEPASSSKSSSASQSQKKGQQSQFLQSRNLKCIALCEVITSPDLHKHGEIWVVPNTDHVCTRFFFVYEDGQVGDANINTQEGGIHKEILRVIGNQTATG	389028	202202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_203104_208192_208278_209329_209400_210462_210537_213578_213649_214925_214999_215168_215282_216486_216536_219428_219497_223064_223191_229679_229773_244459_244556_244657_244709_246120_246692_247257_247384_249147_249215_259787_259879_260322_260384_273638_273734_275282_275361_276632_276704_277247_277338_288356_288395_387913_387969_388918
909653	contig_11829_pilon	+	1505	2	Intergenic	novelGene_128140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	507	851	170894	171238	TRUE	15	TTTTTTTTGGTACATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISQKSVSLRCRVLVKNKRLVVFWLLIKMHVFIAGVKSRRMHLFLLQVSIFKHSKPHAPFLSLNRRQFAILSSSGSGSDVGDQHLPLPMAYGTHVLHESGYLPNKTHSNTAGK	170387	174529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_171334_173970
909654	contig_7391_pilon	-	2748	13	Intergenic	novelGene_112142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	82.7782764712793	1	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	464	1834	341704	316481	TRUE	30	TGAATGAATTGAGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLLPFDSLIVNLLGISLTVLFTLLLVFIIVPAIFGVSFGIRKLYMKTLLKIFAWATLRMERGAKEKNHQLYKPYTNGIIAKDPTSLEEEIKEIRRSGSTKALDNTPEFELSDIFYFCRKGMETIMDDEVTKRFSAEELESWNLLSRTNYNFQYISLRLTVLWGLGVLIRYCFLLPLRIALAFTGISLLVVGTTMVGYLPNGRFKEFLSKHVHLMCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKYDPQFGDAFWNSSKYGMVTYLLRMMTSWAIVCSVWYLPPMTRETDEDAVQFANRVKSAIARQGGLVDLLWDGGLKREKVKDTFKEEQQKLYSKMIVGNHEDRSRS	342167	315514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316111_316162_316590_322885_322966_323053_323183_326974_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206_330297_331310_331386_332334_332636_332814_332885_341539
909655	contig_13937_pilon	-	3319	3	Intergenic	novelGene_167371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	120	677	123993	123436	TRUE	35	TCCACTTCAAAAAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARWGRALLLLLAAQAVSAALGAEDDEVPEEWLLLHVVQGQIGAGNYSYLRLNHEGKIVLRMRSLRGDADLYVSDSTLHPSFDDYELQSATCGPDSVSVPAHFQRPVGIGIYGHPSHLESEFEMKVYYDQTVEPHPFVESAYSPEGADPGQRRAQAPEDASQEEESVLWTILISILKLVLEILF	125354	120173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13937_pilon_-_122641_123260_124042_125283
909656	contig_6233_pilon	-	4281	1	Intergenic	novelGene_74811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	915	1280	186910	186545	NA	65	TGGGGAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQMQRGKKKTKNYSIKDPVNTNTTEFASFELPVILYYESPLYSPTLIPPAISPISINLLRVFVLSVQGQETKDTYGIIGLWEVASSHCYATASFPPLYMFLKTLGHMMLEKELPRFESLL	187824	183543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_183500_187800
909657	contig_5031_pilon	-	7634	35	Intergenic	novelGene_133188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	423.455708456294	767	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1281	3846	52	3897	107406	26499	TRUE	35	TTGTAAACTTTCACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRFQNKVIHFSATACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKMRLHPVQETIAKNHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNQPEPTMKEIEDAFQGNLCRCTGYRPILQGFWTFARDGGCCGGNGANPNCCMNQKKNPTEVTLSPSLVNPEDFMPLDPTQEPIFPPELLRLKDVPQKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQYPDAKLVVGNTEIGIEMKFKNKLFPVIICPAWIPELNSVEHVPEGISFGAACPLSSVEKTLVDAVAKLPAHKTEVFRGILEQLRWFAGKQIKSVASIGGNIINASPISDLNPVLMASGAKLTLASQGTKRTVQMDHTFFPGYKKTLLNPEEILLSIEIPFSREGEFLSAFKQASRRDDDIAKVTSGMRVLFKPGTLEVKELAICFGGMADRTISALKTTQKQLSKFWNERLLQDVCAGLAEELHLSPDAPGGMVEFRRTLTLSFFFKFYLTVLQKLGEEDSEDNCGKLDPTFASATLLFQKDPPANIQLFQEVPKDQSEEDMVGRPLPHLAAAMQASGEAVYCDDIPRYKNELSLRLVTSTQAHAKIKSIDTSEAQKVPGFVRFFSADDVPGSNITGLFDDETIFAKDKVTCVGHILGAVVADTPEHAQRAGQAVKITYEELPSIITIEDAIKNNSFYGRELKIEKGDLKKGFDEADNVVSGEVYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEEGEVELFVSTQNTMKTQSFVARMLGVPANRILVRVKRIGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAHKTGCPVRCMLDRDEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGRIVALEVDHYSNAGNTLDLSQSIMERALLHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAEYWMSEVAVTCGLPAEEVRKMNMYKEGDLTHFNQKLEGFTLTRCWDECLASSQYQTRKDEVEKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGALVHVYTDGSVLVTHGGIEMGQGLHTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPNTSPTAASVSSDINGQAVYEACQTILKRLEPFKRQNPSGSWEDWVIAAYQDAVSLSATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTGDHKNLCTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIHAARAQHADYNTKKLFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSLRV	107457	22669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_23531_23622_26550_28333_28511_29750_29940_31415_31482_32666_32782_34524_34578_35158_35234_35920_36050_36699_36796_41694_41777_42565_42712_42904_43097_70817_70905_72100_72189_72791_72926_73683_73809_75208_75306_75992_76113_77689_77814_80342_80513_84576_84661_87127_87303_88120_88306_90741_90852_92327_92422_93663_93816_94581_94675_97342_97485_98635_98726_99042_99112_102699_102762_103672_103800_105906_106016_107368
909658	contig_3111_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_129967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAGATACTCAGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44543	47253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_44500_47300
909659	contig_6270_pilon	+	2367	1	Intergenic	novelGene_99826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAGAGAAAGAAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40641	43008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_40600_43000
909662	contig_4845_pilon	+	2509	1	Intergenic	novelGene_53631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	7	315	235915	236223	NA	20	TGACAGGCTTCCTCACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMLDWSPFSRDPESAGTGLNSSHFWSEILNGHTFLCHPRGKVGGCAGCVRVCVLTLPDGVGELCRIKTGTLSRLMILKLIMDMIIILVLAVTFLNFTNYLINA	235908	238417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_235900_238400
909663	contig_2027_pilon	-	3155	20	Intergenic	novelGene_39924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.223296878269436	42	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2172	2627	164705	163485	TRUE	20	CATAGGCACCACCTCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVAQKLGCKVANLGLEHMGHNGAVVARPCLLHQVCISLCNLTLHAQGVAEVELFQVAIVEEVLGELWHIAEALQSRVHEARVAQICETTDAWLALEVLIFLRHALHDILLCTGPSAIFVSGLHDDHLASLEAGVKYCNVCVAQSLKRAV	170660	155998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_156091_162152_162264_162424_162556_162886_163005_163408_163553_163691_163758_163880_163975_164372_164551_164655_164815_165186_165412_165548_165634_165744_165839_166559_166769_167451_167503_167698_168105_168341_168464_169414_169554_169649_169770_169962_170052_170138
909664	contig_11734_pilon	-	1061	6	Intergenic	novelGene_173216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	148.569983509456	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	275	790	26773	2370	TRUE	25	AAGGGTAATTATTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNDSHTTCQCFHLPSFAVLMALTPKADSALAVITCVGLSLSLLCLLLAAFTFLLCRSIQNTSTSLHLQLSFCLFLAHLLFLVGIDKTEPEVLCSVIAGALHYLYLASFTWMLLEALQLFLTVRNFKVSNYTSEGRFKKNFMYPFGYGIPAVIVAVSAGVGHKNYGTNTQ	28475	973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11734_pilon_-_1157_2281_2374_12055_12292_15047_15243_26692_26861_28288
909665	contig_10252_pilon	+	3394	1	Intergenic	novelGene_162920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	947	1276	132756	133085	NA	55	AAAAAAAAGCCCACAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQQTILKHVKKQDKIAPASDQNKESDNLVEEKSVELPDTGFKRLIFRGLQNVRKEIKENTQNQGKDRQNHRKHRQNQQKHSQNQGRHRQSNRRIQENNTRTEHRNR	131809	135203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_131800_135200
909666	contig_14158_pilon	-	1937	3	Intergenic	novelGene_136131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_2	26.5	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGCAGAGTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34931	30743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_-_31127_31921_31973_33428
909667	contig_17833_pilon	+	1450	3	Intergenic	novelGene_174605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGGTCACGTCGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202973	220802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_204248_205306_205463_220782
909668	contig_16098_pilon	-	1354	10	Intergenic	novelGene_45999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1269.13421446315	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	164	1231	350768	348413	FALSE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352195	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152
909669	contig_16103_pilon	-	1257	2	Intergenic	novelGene_118858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACCCTCTGACCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743701	722285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723398_743556
909670	contig_8628_pilon	+	2215	12	Intergenic	novelGene_164429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.6207211542017	327	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	67	1884	636944	667851	FALSE	35	CCCAGCAAACACCATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRPPFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMGTMPPPPGMMFPPGMPPVTAPGTPALPPTEEIWVENKTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQVQAQAVGASTPTTSSPASAVSTSTSSSTPSSSTSTTTTATSVSQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSTPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPAAAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVAMMQIVSCPYVKTVATTKTGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLEEKIKEPIKEPSEEPLPMETEEEDPKEEPIKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATTPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGMEEGKKLRHPTPTMLSIQKWQFSMSAIKEDQELMEEINEDEPVKAKKRK	630766	668182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_630832_636942_637169_639776_639930_641429_641872_646129_646373_650736_650800_651943_652145_653088_653202_654184_654274_666378_666540_667579_667637_667780
909671	contig_4742_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_131015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	399	1816	2214	283670	284068	NA	65	TGAAAAAATAGATAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPPDKKSKIEVSAEEAPEEENDFFNSFTTVLHKQRNKPQQTLQEDLPAAVEPLVEVTKQEPPKPLRFLPGVLIGWENQPSTLELANKPLPVDDILQSLLGSTGQVYEQAQPVIEQNTLKEIPFINEQTNPK	281854	284070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_281900_284100
909672	contig_11378_pilon	+	2778	7	Intergenic	novelGene_112265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	470	1015	404319	408029	FALSE	70	AAAGATGTTAAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLNRTGCTRSSMPLWISRGRESNSEPGRGIRTLNPSRFPVMTGSMSADELEVAWVTLKVTFLKSVIPRLMSSSIASSSPVGAQQALKLGQQPDGVQLPQEAVIMQAVPQLDDEATDDSRQLGLAEDNVAAVLQAQVHGYGGSAVLHEQEDHRFLGLVTQHGHTVCEGGQQRVKGLTPFT	390257	409792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_390488_395099_395211_401729_401838_404298_404433_404801_404931_406647_406774_407852
909673	contig_14577_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_164652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90249	91494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_90200_91500
909675	contig_8377_pilon	+	4994	7	Intergenic	novelGene_35084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5671	junction_5	2702.39638510383	171	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	3309	4229	136354	161510	FALSE	35	CCTTGGAAGAAAAGCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRKLYASILLSTNGKEESINFLAYSISMFMLYLGNTLTWGIC	133045	162275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226
909676	contig_5602_pilon	-	1837	7	Intergenic	novelGene_133014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	118.849578132285	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	461	877	504410	488176	FALSE	60	AGTCAGTAGAGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLIFQYLVNRPSEERVREIIVNAVEIEQEFLTEALPVGLIGMNCVLMKQYIEFVADRLLVELGFSKVFQAENPFDFMENISLEGKTNFFEKRVSEYQRFAVMAETTDNVFTLDADF	508540	487215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_488329_495028_495143_496600_496706_504365_504523_506925_507021_507500_507635_508421
909677	contig_11493_pilon	-	2744	7	Intergenic	novelGene_143656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	208.527109881558	59	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	15	650	143363	112405	FALSE	60	TACATAAAAGGGAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLAMAFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDTQVSQAGDLLVEVYVERKEPECSIIIPISPIMEAEELTNNILAIKNIIPEKGDLWATFEVIENEELERPLHYTENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKQFLTIDTIRHYSERSALESIKDGVLKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGYLFLFKDLKV	143377	110310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_112411_113510_113651_126283_126413_135824_135943_139148_139224_141334_141404_143264
909678	SIRV6	+	524	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	219	23	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
909679	contig_10494_pilon	-	2378	12	Intergenic	novelGene_102120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_8	27.3722426816198	123	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	12	1622	182001	144239	FALSE	5	GCTAGTCTGCTCCTTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKGKKEKKGRGAEKTAAKMEKKVSKRSRKEEEDLEALIAHFQTLDAKKTQIVETLCPPPSPRLNASLSAHPEKDELILFGGEYFNGKKTFLYNELYTYNIRKGTWTKVEIPNPPPRRCAHQAVVVPQGGGQLWVFGGEFASPDGEQFYHYKDLWVLHLATKSWEQVRSAGGPSGRSGHRMVAWKRQLILFGGFHESTRDYIYYNDVYTFNLDTFTWTKLSPSGMGPTPRSGCQISVTAQGSIIIYGGYSKQRVKKDVDKGTLHSDMFLLKSEDGREGKWAWTRMHPSGAKPTPRSGFSVAMAPNHQTLLFGGVCDEEEEETLEGDFLNDLYFYDTARNRWFAGQLKEPKTEKRKRRRGRKGELRGSDEQAGEEPSPQEPLEVVRKVTTEDGTVITIKQVLPAPGVAGRPPSKDEDDDGAEEAGASLVAPCPRSSAMLAVKHGLLYVYGGMFEAGDRQFTLSDLYCLDLQKMDGWKALVEMDPDTQEWLEETDTEEEGDEVEDGDDDKEEEDTGEGSSEEGSVLMGPRAGEAILA	182012	143482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_144280_147661_147779_148662_149072_149922_150132_150988_151065_153533_153694_156981_157075_167871_168009_173583_173683_174575_174655_177946_178039_181902
909680	contig_4091_pilon	-	3396	3	Intergenic	novelGene_173012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2512	2895	11754	11330	FALSE	25	GCAGCTGAGCTCTTAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVQAKGVVSLPHSTAWPKRAPNSRKGKENKQSIQKKLMNKSPGIPPARQPRLGRSKDGARSQVFERKEGEVVIGKEEIKTSRKKSNTSSQQIALREPASVGWWNPSSWCFSDKRLCPWEAEEAEWG	58329	10828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11554_11594_12708_56771
909681	contig_10596_pilon	+	4503	1	Intergenic	novelGene_173588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795581	800084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_+_795600_800100
909682	contig_4857_pilon	+	1343	4	Intergenic	novelGene_48834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	112.466291246163	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATAAAAAAAAATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331394	1408021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1331552_1343177_1343254_1405453_1405556_1407013
909683	contig_6086_pilon	+	1594	2	Intergenic	novelGene_171454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTACAAAAACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6	2230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_+_1239_1868
909684	contig_16703_pilon	+	996	8	Intergenic	novelGene_72743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1681	junction_1	1054.82922498268	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	207	947	6490	17068	FALSE	25	CACTTGGATGCTTACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKGNSWVLVSVLTGRSKG	5730	17117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921
909685	contig_3700_pilon	+	4756	3	Intergenic	novelGene_138063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131067	136026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_131521_131608_132182_132296
909686	contig_5013_pilon	-	4394	4	Intergenic	novelGene_110093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	343.36601786173	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	2666	3244	195418	194840	TRUE	50	TAAATAAAGTTTCAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKRFLGILIASIITATAIAATAATAVALSQSIQTAQQFNTYMQNVTSEMQTMVHIDQEILKRLGALEASFLWLGEQQEALWEHSQLTCDAEYTRFCITALPYNDSWKDVKNNLLASFASPLKSDIQKLQFQLQEQLLRLQSESNKATLNTLNDFAYWLNPTHWFSGLSLRVWILFAIGCLIVLCLFIVVI	198083	173852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_174716_176215_176266_187933_187998_194666
909687	contig_8412_pilon	-	571	1	Intergenic	novelGene_118359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCAAAAACCCCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272695	272124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_272100_272700
909688	contig_8795_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_146884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTAATATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146898	144599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_144600_146900
909689	contig_14208_pilon	-	5311	1	Intergenic	novelGene_129076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2313	2747	112249	111815	NA	50	CTCAAACTAACACAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKEISQNPSVRRNFRGHLVQSLLFIQFFYFTGKKKKAGGPDTLNDFPKVCLEWLSFCLKAWLEPRSHEAQPRHHIAFLYLNQCQLLSACFLKILRGDLSHRIHNWKFVVSLPTLNPFSWSTFSNFAQGCEVINGHRNRTRLH	114561	109250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_109200_114600
909690	contig_12635_pilon	-	666	1	Intergenic	novelGene_60835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTAGTTGTTCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421884	421218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_421200_421900
909691	contig_12120_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_21434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCATTGGGTTTTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141137	143171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_141100_143200
909692	contig_12139_pilon	-	2180	2	Intergenic	novelGene_146484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	48	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	83	547	313853	313389	FALSE	30	TTTTTAGACAAGAGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTHPHANKLPLKDLFTYEDYRWAVSSVMTRQNQIPTEDGSRVTLALIPLWDMCNHTNGLVRAPSGQVGSGKLLLLSFKMNMPPTHSDWWFLTLNFSPYCLPPKKERSKPCHSPASHKEKPIFFSYRVNLVLKTGSLNLRQLSKTTVNCIYLLSCNSVILILLYHRLNQCFFFLILSKILIY	314781	311755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_313873_314718
909693	contig_7915_pilon	+	4784	22	Intergenic	novelGene_42967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_19	153.517768402943	57	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	2279	3988	119888	134196	TRUE	30	AACAGACTTGGGTCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKHKTELKNILDMLQLENNELQGLKLQHDQKVSELEKMQVEVLEEKLELENLQQTAQRQKGEIEWQKQLLEKDKREIERMTAETRALQVCMASLSKEKEDLEEKCDSWEKKLAQTKRVLAATEENSKMEQSNLEKLELSVRKLQQELDQLNRDKLSLHKDILVMQQQLQEKREEVNTLQEELAHVQDHLNLAEQDLLHTAKHRDIQLSEQTRLQKDISEQKKKFEDCQKEGETKQKQLQVLQNEIEENRLKLVQQEMMFQKLQKERESEEEKLEASKMTLKEQQQQLEKELTDQKSELEQVLTKVSVAEEHVKTLQEEKRWNETLEKTLSQTKQQLSEREQELMEKSSELLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKVAFKKITV	103675	138419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_104532_105588_105903_107407_107617_109754_109948_114219_114351_114495_114637_114722_114850_118815_118981_119745_119907_121147_121264_121345_121564_123136_123295_124358_124433_125539_125729_126153_126380_128202_128409_129868_130010_133645_133919_134106_134219_135458_135669_137701_137838_137991
909694	contig_5769_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_138763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166811	164573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_164600_166800
909695	contig_8020_pilon	-	3349	1	Intergenic	novelGene_114446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAATAAAATACCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346498	343149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_343100_346500
909698	contig_13958_pilon	+	3965	8	Intergenic	novelGene_129529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	284.550200011405	336	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATATCCTTATTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114392	146939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_114472_114645_114718_117494_117590_124361_124496_126638_126723_134555_137201_140713_140870_146239
909699	contig_233_pilon	-	2334	14	Intergenic	novelGene_14641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1444.87015038698	7	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	469	1905	104176	78579	FALSE	15	GGGGTGTCCTAGAAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127026	78149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_108524_108583_108724_108814_109914_109976_126898
909700	contig_610_pilon	-	1939	6	Intergenic	novelGene_76680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	522.60080367332	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	42	911	68933	32930	FALSE	25	GTTCATCCCACTTCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDGENQHMWQKTSWDFKL	68974	31901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887
909701	SIRV6	+	1440	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	80	8	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	30	GCGTTTGGTCGCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909703	contig_10042_pilon	-	973	1	Intergenic	novelGene_79127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTTAGCAGGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54915	53942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_53900_54900
909704	contig_10331_pilon	-	2844	5	Intergenic	novelGene_54121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	81.4984662432367	326	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	447	1184	397775	397038	FALSE	80	ATAACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYICPTEEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSTEYSENKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENVDIKKYCVHYLENVGSFEYTRNTLKELESKAYKQIDACGGNPELIALVEHLSKMFKENE	409095	395377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_397797_398048_398120_398576_398647_401970_402064_408904
909705	contig_12790_pilon	-	5062	26	Intergenic	novelGene_35188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_25	181.03332731848	598	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1312	3939	266	4204	242434	141301	FALSE	35	TAATAAGAGAGCTTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIEKMSILGVRSFGIEDKDKQIITFFSPLTILVGPNGAGKTTIIECLKYVCTGDFPPGTKGNTFVHDPKVAQETDVRAQIRLQFRDVNGELLAVQRSMVCTQKSKKTEFKTLEGVITRTKHGEKVSLSSKCAEIDREMISSLGVSKSVLNNVIFCHQEDSNWPLSEGKALKQKFDEIFSATRYIKALETLRQVRQTQGQKVKECQTELKYLKQNKEKACEIRDQITNKEAQLTSSKEIVKSYENELDPLKNRLKEIEQNLSKIMRLDNEIKALESRKKQMEKDNSELEQKMEKVFQGTDEQLNDLYHNHQRTVREKERRLVDCQRELEKLNKESRLLNQEKSELLVEQGRLQLQADRYQEHIRARDSLIRSLATQLELDGFERGPFSERQIKNFHKLVRERQEREVETANQLMNDFAEKETLKQKQIDEIRDKKIGLGRMIELKSEILSKKQNELKNVKYELQQLEGSSDRILELDQELTKAERELSKAEKNSSVETLKTEVISLQNEKADLDRTLRKLDQEMEQLNHHTTTRTQMEMLTKDKADKDEQIRKIKSRHSDELTSLLGYFPNKKQLEDWLHSKSKEINQTRDRLAKLNKELASAEQNKNHINNELKRKEEQLSSYEDKLFDVCGSQDFESDLDRLKEEIEKSSKQRAMLAGATAVYSQFITQLTDENQSCCPVCQRVFQTETELQEVISDLQSKLRLAPDKLKSTESELKKKEKRRDDMLGLVPMRQSIVDLKEKEIPELRNKLQNVNRDIQRLKNDIEEQETLLGTIMPEEESAKVCLTDITIMERLQMELKDVERKIAQQAAKLQGIDLDRTVQQVNQEKQEKQHKLDTVSGKIELNRKLIQDQQEQIQHLKSTTNELKSEKLQISTNLQRRQQLEEQTVELSTEVQSLYREIKDAKEQVRPLETTLEKFQQDKEELINKKNTSNRIAQDKLNDIKEKVKNIHGYVKDIENYIQDGKDNYKKQKETELNKVMTQLTECEKQKENINKDMGVMRQDIDTQKIQERWLQDNLTLRKRNEELKEVEEERKQHLKEMGQMQVLQMKNEHQKLEEKIENTKRNHSLALGRQKGYEEEIIHFKKELREPQFRDAEEKYREMMIVMRTTELVNKDLDIYYKTLDQAIMKFHSMKMEEINKIIRELWRNTYRGQDIEYIEIRSDADENVSASDKRRNYNYRVVMLKGDTALDMRGRCSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDRENIESLAHALVEIIKSRSQQRNFQLLVITHDEDFVELLGRSEYMEKFYRIKKNMDQCSEIVKCSVSSLGSYVH	242749	140442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_141488_142892_143027_145402_145546_146096_146183_165295_165521_167487_167616_185868_185983_186058_186152_186597_186709_188728_188923_189359_189487_189927_190118_196551_196790_197692_197869_199630_199789_199929_200113_201577_201785_202200_202395_202958_203125_203351_203481_215516_215722_216251_216438_220406_220559_240647_240732_242305_242561_242610
909706	contig_8671_pilon	-	3846	3	Intergenic	novelGene_126292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003407	955357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_958537_958772_959401_1003368
909707	contig_3948_pilon	-	5257	10	Intergenic	novelGene_53273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	57.4726988326728	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	485	1177	1426955	1417019	TRUE	5	TCTCCCTGCTTTGACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVG	1427529	1409045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090
909708	contig_13145_pilon	+	3806	1	Intergenic	novelGene_116656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2398	2754	236504	236860	NA	30	TGTCCTCTTCATAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVHIILILANHKSTECIHLISKSEEKKANNQLLSHSLVCTQTMAVAAAAPLPSSLHSNSLAPSQQPFQKAGPSLGGPRARLKMNLRSTPSASPPEIRTAWRWDCEESALLWTRNFQS	234106	237912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_234100_237900
909709	contig_5590_pilon	+	2537	14	Intergenic	novelGene_163003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	19	junction_5	69.866482978514	49	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	826	2145	250835	259038	FALSE	20	ATAAAGGTTTTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMQGAGSFSSAVPYSCGHTQARIRDRPRWRGFERSGPDGPGRKRRLLQAYEEPDAKQPRVDSEGDYSDNDDGPGDFRSGDEEFRGEDEFGELGRQRGEKDDEDEEVKKRREKQRRRDRMRDRAADRIQFACSVCKFRSFEDEEIQKHLQSKFHKETLRFISTKLPDRTVEFLQEYIVNRNKKIEKRRQEMMEKESTKPKSDPFKGIGQEHFFKRIEAAHCLACDMLIPAQHQLLQRHLHSPDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYLRGEDPFTSEAVDPEAEGEDNLGGEDKEETAEEVAAEVLAEVITAAVRAVDGDRAPAPESSEVPAAVEGLADTSEASGDPLPEQLSASGTSCGTTEKGNTDAEAGNGAAEGTSRAAEALEAEASAAEAYSTGTGLVPGRDTMEGEVEQTDAESKDVLPME	245174	259430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_245238_246760_246800_249116_249150_249754_250032_250421_250916_251581_251712_251914_251962_253027_253062_254826_254915_255250_255393_255759_255854_256233_256365_256696_256793_258561
909710	contig_8546_pilon	-	2773	3	Intergenic	novelGene_178409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2397	2759	240874	240091	FALSE	75	TAAAAATAAAAGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYSCEFILAFCSCIIFLNYSSFWSVFSMNLSIFSAFLSAFCLNSWIILNIRDLNSLSVRSSDFSSTGRSSGVFFWTPTGTILSCFYKCFDIVCSLWGHSYTQTKKSANGVCYWSGERRD	282620	240076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8546_pilon_-_240154_240574_242603_281952
909711	contig_6088_pilon	-	2959	1	Intergenic	novelGene_161276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTGTTCTGTAAATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238143	235184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_235200_238100
909712	contig_3095_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_75172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1676.52631950709	6928	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	356	907	225596	226800	TRUE	10	GTCTTTTATTGCATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220478	227313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220700_225461_225711_226126_226409_226645_226824_227001
909713	contig_7057_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_123305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	935866	935522	NA	20	AACTGTGAGCATGGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTSSPASPGPVEGTWRGLRVGRRITDTTALQGRRVDFHPEARVHPGAGEVFGPLEKALGTRSLPRTCHDKQSVWRPRACFDSHSGDKLRHLWQGLRISGISRALGAARWRSNGG	935868	933965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_934000_935900
909714	contig_5881_pilon	-	3087	1	Intergenic	novelGene_129030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	252	759	448	1206	40660	39902	NA	70	AAAAAAAAAAAGACACCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIPKGKWPRISKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTTWYWYNNRYIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFDKGPKSINWGKDSLFNKQCCHNWISISKKLKQDPYLTPCIKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTTLGALIHGINTTGTISNNAQAPEERLGNWELLKIKHLCSLKDFTKRVKRQPTDWENNFGYDKSDQRLISKIYKILQNLSNKKTNNPIKKWAKDMNRHFAKKIFRRLTDT	41107	38020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_38000_41100
909715	contig_4065_pilon	-	2840	15	Intergenic	novelGene_133399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_14	77.6332297881966	3	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	120	2279	575637	532915	FALSE	30	GTTTTAAGAATTGAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNHVSSKPSTMKLKQTINPILLYFIHFIVSLYTILTYIPFYFLSESRQKSNQIKAKPVNSEPQSAYRAVNSLGGLASVLYPGCDTLDKVFTYAKNKFKKKRLLGTREILTEEDEVQPNGKIFKKVILGQYNWLSYEDVFIQALNFGNGLQVLGQKPKTNIAIFCETRAEWMIAAQACFMYNFQLVTLYATLGGPAVVHGLNETEVTNIITSKELLQTKLKDIVSLVPRLRHIITVDGKPPSWSEFPKGVIVHTMAAVQALGANANVENKPHSKPLPSDIAVIMYTSGSTGLPKGVMISHSNIIAGVTGMAERIPRLGQEDVYVGYLPLAHVLELSAELVCLSHGCCIGYSSPQTLADQSSKIKKGSKGDTSVLKPTLMAAVPEIMDRIYKNVMNKVNEMSSFQRNLFILAYNYKMEQISKGHSTPLCDRFVFRKVRSLIGGNIRLLLCGGAPLSATTQRFMNICFCCPVGQGYGLTESAGAGTITDVWDYNTGRVGAPLVCCEIKLKNWEEGGYFNTDKPHPRGEILIGGQNVTMGYYKNEAKTKIDFFEDENGQRWLCTGDIGEFDPDGCLKIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNLPLIDNICAYANSYHSYVIGFVVPNQKELTELARKKGLKGTWEELCNSCEMENEVLKVLSEAAISASLEKFEIPAKICLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELKTHYQADIERMYGGK	579276	532353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_533073_537024_537183_539173_539289_540798_540991_542038_542114_554280_554454_556053_556194_557839_557912_558147_558272_559953_560105_562271_562411_563238_563349_565931_566110_575262_575673_579192
909716	contig_10297_pilon	+	3037	14	Intergenic	novelGene_112547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1351	1764	599333	619220	TRUE	50	ATTACTGGAAACCTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVKDGDFSLVLSFLLFLLCFWLRNQLLEEESSSKFSEALLEMPLARHLWLQGLEERGDEVGDKLSGAIKLLMISVNCALCFSMFRRSSVGLLGDISKSCSSKESWLSCGTCGFPVVFNEAAWSVNCICFFKMSFGS	560101	694928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_560380_561273_561443_562536_562650_563959_564017_565599_565723_566553_566672_568058_568189_576572_576681_580307_580474_599244_599450_615001_615124_619045_619244_654952_655098_693823
909717	contig_9921_pilon	-	2007	11	Intergenic	novelGene_23710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1423	7	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAAGAGGAGGAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186062	3254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_3512_13615_13714_31048_31167_43116_43198_74151_74249_101231_101356_117948_118045_162395_162515_166368_166588_172565_172738_185436
909718	contig_7912_pilon	-	2264	4	Intergenic	novelGene_129567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	59.8962065205765	1	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	102	416	79123	74525	FALSE	30	AAGGCCTAGTTATTTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLLTRSWHSGDLTEDVRENSWSPLHSALPSRSMAAAALRDLAEGCVNFEDVAIDFSQEEWGLLDETQKLFYCDVKLENFAVISSLACWHGVEEEKASSEQSVSLEGVLQVRTPQEVHPPRRLTPGDMCPCLERYCD	79327	72676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_74680_76009_76137_79090_79143_79245
909719	SIRV6	+	614	6	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-404	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	4	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	121	453	2002	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1881	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11029
909720	contig_6576_pilon	+	2841	3	Intergenic	novelGene_42421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	74	1420	1301228	1302574	TRUE	30	GAACAGAGAAGTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295703	1304276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302867_1303147
909721	contig_6137_pilon	+	2340	2	Intergenic	novelGene_59200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAAAGAAGGGATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305001	1307433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1306374_1306465
909722	contig_10437_pilon	-	3571	5	Intergenic	novelGene_38435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1558	1866	866796	866488	TRUE	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNLLEAIFPSKIKSYQPPGLKRFRSLHKLHELYCWIQPLLFYFYFPGNSCDKEAPKYPKQKKCHCLQTKDLWVISKKITNSSFKRLLSFRITANCDFVSL	868353	858215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_859092_859808_859979_861102_861278_865321_865378_866059
909723	contig_998_pilon	-	5454	14	Intergenic	novelGene_153788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	408.407949548534	496	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	90	1151	365529	330571	FALSE	50	AGAAGAAAATCCTGGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLNRKKTLNLVKELDAFPKVPESYVETSASGGTVSLIAFTTMALLTIMEFSVYQDTWMKYEYEVDKDFSSKLRINIDITVAMKCQYVGADVLDLAETMVASADGLIYEPAIFDLSPQQKEWQRMLQLIQSRLQEEHSLQDVIFKSAFKSASTALPPREDDSSQPPDACRIRGHLYVNKVAGNFHITVGKAIPHPRGHAHLAALVNHDSYNFSHRIDHLSFGELVPGIINPLDGTEKIAVDHNQMFQYFITVVPTKLHTYKISADTHQFSVTERERVINHAAGSHGVSGIFMKYDLSSLMVTVTEEHMPFWQFFVRLCGIVGGIFSTTDLEPTNLSILSPLRMTTQTTTYLF	373656	326267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330617_330785_330814_332165_332329_335041_335140_339138_339238_340126_340183_346966_347063_347977_348080_352615_352657_360154_360226_361730_361778_363672_363782_365423_365570_373607
909724	contig_11564_pilon	+	3452	3	Intergenic	novelGene_158582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCATCGTGACAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84775	89667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_85087_86427_86677_86775
909725	contig_7861_pilon	+	2991	2	Intergenic	novelGene_77408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	81	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1513	2061	112653	113201	TRUE	55	ACACGAAAAGAAACAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQQLKQKADKNEEKTDKFMEKADKFMKNTDKKLEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQKLEIQKINNKISEIDSGKEVLRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIEVPERGENRKHKEDH	111140	114428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_+_114046_114342
909726	contig_7123_pilon	+	3694	1	Intergenic	novelGene_170589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602939	606633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_602900_606600
909727	SIRV1	-	486	2	ISM	SIRV1A	SIRV107	744	3	419	0	419	0	3prime_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1589	7	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGGCGCAAGGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11224	10647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_-_10792_10882
909728	contig_10197_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_115234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAGCTGTAACACGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944477	947021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_944500_947000
909729	contig_12919_pilon	-	4439	4	Intergenic	novelGene_75925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1156	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGCAGAGAATACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872694	860067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_860207_864196_864406_867783_867875_868694
909730	contig_11579_pilon	+	3794	5	Intergenic	novelGene_171941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.89711431702997	118	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACTAGACAGCACCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54831	98803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_55138_58447_60856_61056_62021_93108_93207_98785
909731	contig_7179_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_78108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1598	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	609	935	658654	658328	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATALGQSVCRSGNSRTQEGNHSCAAHLTAVGRPLYLHWSCQQALIFPEQQRETQTWQLLTFYPGAEDPDQVSCSLLPNGRRQPSQQQKVNQAWDLPTLLPQQYWQS	659262	656524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_656500_659300
909732	contig_7810_pilon	-	6546	7	Intergenic	novelGene_144214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	5981	6457	72767	72291	FALSE	40	ATGAAAATCTGTCCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGFQNKTPDDSPVEEYSLEIPDREFKSLILRILQELRKKSDKHEEKIDKFMENRDKKLEEFRKIMQEQNTKINSQLEIIQRQQLDIQKINNKISEMDGVTERLRSRFETVEDRISRIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEKTLRVMWNTIKSKIFE	441092	72201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_73910_138252_138534_193396_193661_205256_206487_206529_207031_340250_340268_438547
909733	contig_7816_pilon	+	1918	12	Intergenic	novelGene_66569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_11	39.2748315934545	58	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	269	1807	507997	528738	FALSE	30	AGGGTTATATGGAGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQIPSSRAVHEGLKNQELNSADSVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLTKTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACVLKKASKRRKRRKNVFVHKKKHSSTSVDNTPAGSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSISEQQDELQEESEMSEKKSCSSSPTQSEISTSLPPDSDRRKRELRTFSFSDDENKPPSPKVPTVKIGFSVFPF	507728	528849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560_517604_518931_518997_522739_522880_523697_523808_524492_524669_528102_528282_528450
909734	contig_11338_pilon	-	1776	10	Intergenic	novelGene_6360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_8	248.68414197358	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	614	1237	306903	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323315	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_321311_321459_323165
909735	contig_4686_pilon	+	2132	10	Intergenic	novelGene_118563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAAAAAAATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642726	664219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_642807_645698_645880_648549_649176_650778_650938_652287_652450_657319_657444_658172_658361_660057_660158_660543_660767_663930
909736	contig_9668_pilon	+	5520	5	Intergenic	novelGene_58100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	141	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGAGCTTGTTATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193763	453406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_195825_196555_198176_270758_271707_272419_273110_453205
909737	contig_10424_pilon	-	3689	19	Intergenic	novelGene_56804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	239.696136085505	16	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	978	2711	3688	310958	296964	FALSE	45	TAAGGAATAAGTATACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFCLNNAEAAEEIVDCITESLSILKTPLPKKIARLYLVSDVLYNSSAKVANASYYRKFFETKLCQIFSDLNATYRTIQGHLQSENFKQRVMTCFRAWEDWAIYPEPFLIKLQNIFLGLVNIIEEKETEDVPDDLDGAPIEEELDGAPLEDVDGIPIDATPIDDLDGVPIKSLDDDLDGVPLDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQR	322241	296962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_297075_298978_299139_303360_303428_304146_304243_305645_305803_307379_307503_308726_308815_309753_309834_310862_311026_312264_312398_312507_312574_313428_313534_316594_316639_317569_317782_317960_318127_319579_319663_319755_319792_319876_319972_320538
909738	contig_10867_pilon	+	3886	1	Intergenic	novelGene_159442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	3475	3828	88997	89350	NA	40	TCCTAAGTAGCAAAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHRLPEEQTGLGSTARGLLKSKDGEASSHLLGLVIRRDQSLEKDIMLGKVKGQQKRGGPSMRWTDTVAATMGSSIRKIVRMAQDQAVFRCFGTDSTAPNNNKAGTISSIYESRQEN	85522	89408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_85500_89400
909739	contig_12148_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_140343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACACTGAGAATCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123663	125577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_123700_125600
909740	contig_4659_pilon	-	2515	3	Intergenic	novelGene_118237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	226	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACGACATAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836866	817420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819485_819566_819944_836792
909741	contig_7009_pilon	+	5015	9	Intergenic	novelGene_23633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	540.624118496391	2	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	150	1679	444955	537035	TRUE	50	AGAGATGAAATGGACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKREKCLSEMAYDSSTNYEKENEMMSSHVMDQAINNAISYLGAESLRPLVQTPPGGSEVVPVISPMYQLHKPHGDGPPRSNHTAQDSAVENLLLLSKAKSVSSERDASPSNSCQDSTDTESNNEEQRGGLIYLTNHINPHARNGLSIKEEHRAYDVLRAASENSQDAFRVISPSGEQMKVYKCEHCRVLFLDHVMYTIHMGCHGFRDPFECNMCGYHSQDRYEFSSHITRGEHRFHMS	435108	540433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_435244_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_522972_536325_538551_538612
909742	contig_10299_pilon	+	3856	1	Intergenic	novelGene_79771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGCTTGAAAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599376	603232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_599400_603200
909743	contig_3747_pilon	+	2274	3	Intergenic	novelGene_24767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5799.5	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	887	1213	203794	204120	FALSE	60	AATAAATAAATTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200981	205181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201496_203308_203386_203498
909744	contig_6434_pilon	+	4823	23	Intergenic	novelGene_61880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	1015.11639197493	10	119	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1137	3414	33	3446	878083	932457	FALSE	30	TACATGCATATGCCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLNIKEDCNAMAFCAKMRSSKKTEVNLEVPEPGVEVIFYLPDREPLRLDSGEYTAEDLCIKAAQECCISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNHTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKVPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQDGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRINNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLLISSENEMNRFHSNDSGNILCYEVMVTGNLGIQWRQKPNVLPVEKEKNKLKWKKLENKHKKDEEKNRIREEWNNFSYFPEITHIVIKESAVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDFDNILMTVTCFEKSQVLGGQKQFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGGLMDHLKKQILRTDNISFVLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDITQGEHLGRGTRTHIYSGTLVDYKDDEGTSEEKRIKVILKVLDPSHRDISLAFFEAASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEYVEGGPLDLFMHRKSDALTTPWKFKVAKQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLTRQECIERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPSCKELADLMTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEAIELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	878050	933834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_878252_882312_882437_887886_888041_892417_892582_894298_894642_896139_896326_900033_900192_902412_902537_904708_904896_913662_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924383_925563_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361
909745	contig_4924_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_84668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTGAACCCTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62969	64903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_63000_64900
909746	contig_8671_pilon	+	2241	3	Intergenic	novelGene_126258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	253.5	14	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	15	1274	498408	500554	FALSE	30	TAACAGTGTTCTAGGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLSMTPETVKDVGFGSLVLPGGSVASSLATSTLPAGNVFNPPAKQAEPEEKGPHFTDHQISSGENPRAVIPNDVSCTPAILGGPPSNVTNNSGILGVQRSNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIGPQPPNILNNSGILALQPPSVSSSSGLLGVLPPNMPNSAGLVGIQPPNVPNTSGLMGTQPPAGPQNLPPLSISSQRMPAMPMLDIRPGLMPQAPGPRFPLMQPGIPPHRGLPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSHPERPFLAPGRQGVDSVPNPEKRLPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISMPPPVDVRDVVGRPVDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDMRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKHWGHRGDFDEREHRVLPVFGGPKGLHEERGRFRPGNYRFDPRSGPWNRF	498393	501521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_498604_499410_500466_500545
909747	contig_7308_pilon	-	3380	11	Intergenic	novelGene_159605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	343.920470457924	258	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	1081	3111	524476	497363	FALSE	25	TTAAAATGTGTGATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGLDWSEESGEELEDSEQASPYQVAWSIRETLRYERHASDDDDTESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASREPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPATCSGTVKGEPCRNQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDSSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPTSVSLPVEASQIRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEVFHTYSFSWKRPEAEKPSLDLSHTTTCLKSDLICFLF	545094	497093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_497476_499098_499257_500223_500442_502542_502677_503758_503869_506830_507056_511182_511292_518702_519449_524258_524506_524610_524704_544136
909748	contig_16541_pilon	+	4204	6	Intergenic	novelGene_126721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCATTTGTTCCTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192411	345298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_192464_236283_236738_237253_237604_237783_238369_238427_238591_342698
909749	contig_14687_pilon	-	1505	6	Intergenic	novelGene_107917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	960.67921805356	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	476	1504	458476	457246	FALSE	45	CAGGAAATAATCAGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRAGQNSNTVHGHYTRAQANSPRPAMNSQAAAPKQNTHQQQQQRNIRAHKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYEYITRGENTKSKNKHLMNKRRKPEEEEKKLNMKRLRTDNVSDFSESSDSENSNKRMIDNSSEQKSENELKNKNTSKINGEEGKSQSNEKTGEQTLIDGPAPWDQIQEGEKHEEVEKLKSVDSQLQEKKIIHPSEQAALSDHNPNDLLLQECNMEKIHTVELVPKEKFVSGPPTPKCVIDITNDTNSQKVAQENSSTFGLQTLQKMDPNVSESKHSIANTKYLETTKQDSDPSWVSDVVKVDLTQSNTNAS	637613	457244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_457977_458081_458275_458371_458516_459915_460088_523429_523544_637463
909750	SIRV7	+	2176	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	50	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCTACTAGTTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1010	147639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3112_43027_43083_114683_114993_147610
909751	contig_6795_pilon	-	2042	11	Intergenic	novelGene_27766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_10	39.1530330881274	2	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	174	695	493668	489374	TRUE	35	AGGAAAAAGCTGGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTASEAASYEFTTLTCIPGVIEYKGANIQLLDLPGIIEGAAQGKGRGRQVIAVARTADVVIMMLDATKGEVQRLLLEKELESVGIRLNKHKPNIYFKPKKGGGISFNSTVTLTQCSEKLVQLILHEYKIFNAEVLFREDCSPDEFIDVIVGNRVYMPCLYVSGACAQDLQG	497075	482770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_483557_484351_484406_486600_486660_487526_487616_489014_489508_490848_490940_491062_491136_491499_491591_493269_493331_493596_493687_496920
909752	contig_8174_pilon	+	2760	2	Intergenic	novelGene_160041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_1	0	128	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCCCTGGCAGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211038	248898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_211260_246359
909753	contig_9369_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_169842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1605	1910	26823	26518	NA	30	CCCTGATTTCAGAACCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFAFLCFFFLVILLFKMAPKHRAEMLSSASKLKKAVMCLKEKIIVLDKLRLDMSNSVIGYELDVNESKIYIEVSLSRSTHKARLCIEKLRHCCDQRLVGN	28427	26398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9369_pilon_-_26400_28400
909754	contig_6837_pilon	+	2575	18	Intergenic	novelGene_149832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_7	50.5804371554593	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2268	219	2486	83355	92466	FALSE	65	AAAATAAAAGTGCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LASQHTCPKPLNCVAFHPEGQVIAIGSWAGSFSFFQVDGLKVTKELGAPGASVRTLAFNAPRRVVAVGRLDGMVELWAWQEGARLAAFPAHHGFVACALFLRAGSQLLTAGEDGQVQVWSGSLGRPRGCLRSPSPSPALSVALSPDGDWVAVGYRADGIRIYRISSGSQEGQCPALHVAVSALAWLSPEVLVSGAEDGSLQGWAFKKSSIQSLWLLSRYQKPVLGLATSRELLASVSEDFTVRLWPRGFLTLPQKAEEFPCATELRGHEGPVNCCSFSTDGGSLATGGRDRSLLCWDVRTPNAPVLIRSFSACHRDWVTGCAWTRDNLLISCSSDGSVGLWDPESGQQLGQFLGHQSAVSAVAAVEEHVVSVARDGTLKVWDHQGVELTTIPAHSGPISHCTAAQEPRAAGQPGSELLVVTVGLDGTTRLWHPLLVFQTHTLLEHSGPVSAAAVSDTSGLLLTASEDGSVRLWQVPEEADDTYVPKNPAAITAVAWAPDGSMAVSGSQTGELILWQEAKAVATAQAPGRISALIWYSAHTFFVLSADEKVSEWQVELQRGSTSRNFSLHLNRILQEDIGVLIGLGLAPDGQSLILAKAELELLHMMPGNDPSVIWGCYMEDGLTVLSTHKEYGVFVLQSMAPKGLYLLRQKELGEFEEFLEFNLNLENPSGAVIWVTQAKPESESSFLCASSDGMLWNVATCTPEGEWITGNIWQNPETQNSGADSPTCLELNVSTNVWPGTRNLMTRLYRKIHSGCVTALHVLPKLLVTASRDRDVKLWERPSMQLLGLFRCEGAVNCLEPCLGPNSTLQLAVGDAQGNVYFLSWE	82998	92555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_+_83133_83270_83484_83744_83899_84007_84221_85328_85490_85761_85876_86798_86907_87398_87532_87635_87713_87817_87951_88073_88211_88372_88498_89574_89719_89856_89957_91500_91607_91698_91905_92028_92134_92343
909755	contig_11493_pilon	-	3380	16	Intergenic	novelGene_143687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	398	junction_15	337.71662019444	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	958	2877	321	3197	332109	188011	FALSE	45	AATTAGAATATTAGACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVSEINVDIKDFLMSINLEQYLSHFRDFGLNTVKDCAAINDSLLHKIGISPTGHRRRILKKLQIILSKMQDTPIYANVHKTKNDETSKDSHALSSEQNSWIELSDSGSAQTTSPVHLETVTKNLDQNDVSVDRSSQSLKLDKLSLPAHNFPIPGKEPHRNLNSFQDSFLGGENFKTESLITKKTVDCTIKEEQTEKVDLMSENLSKLPNSDPNCLSSLGCSILEASSGNGTNGLLAESPPTPFFQFQGEMVVNDLYVPSSPNLAPVKSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPASTKGISGSYFRERRNVTTSAGKFVAQQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKKSIKNEFWTHEEALKGEAATERIYDNRTEKTSEDKVEDIWIPREDKNNVPVDSASESEYSTVEECFHSLRRKTSKASKSRTQKLSNLDTLTRRNYPCSSLSGNADSSTMASCAISPYACFYGSPAVKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAVSTIRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNEWISILLNALKSQSLTPQSQTVAAPEKFGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVRLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTG	356629	187827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_188160_196944_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816_232996_241701_241823_256061_256132_276063_276418_278388_278457_279219_279297_280556_280616_331204_332268_356467
909757	contig_14970_pilon	+	2303	10	Intergenic	novelGene_44968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5460.81810675486	28	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	133	597	136145	191822	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISKCGSLLP	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191800_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
909758	contig_7357_pilon	-	3493	3	Intergenic	novelGene_36864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	430	junction_2	90	106	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCTAGTTACTGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236039	227100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_227239_228379_229258_233562
909759	contig_6361_pilon	+	3823	6	Intergenic	novelGene_23937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	423	773	326956	327306	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKASGIDRIPVEMFQQTDVTLKTRLCQEIWKTAILPTDWKRYLFVPIPKKADPRECRNDWTISLISHVNKILLKIILRWLQQYIDRNCQKFKGDSEENME	326533	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_327415_405285_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
909760	contig_9146_pilon	-	2485	12	Intergenic	novelGene_79507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	44.3261764350973	242	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	440	1825	324555	264421	FALSE	5	CTTGGTCTTTTGTGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTQLNLEFRFQDKKLRGFSCELIRSPYGVFPERVLTTACQILVPILLSGLGMITAGLVLNTVQHWPVFVEVKDLLTLVPPLVGLKGNLEMTLASRLSTAANTGQIDDPQEQHRVIGSNLALVQVQATIVGLLAAVAALLLGAVSSEEVDFAKMGLLCASSVLTAFLASLALGILMVCIVIGARKFRVNPDNIATPIAASLGDLITLSILALVSSFFYRHKDSWYLTLLVCVAFVALTPVWGIMAKQSPPIMKILKFGWFPIILAMVISSFGGIILSKTVSEPQYQGMAIFTPIICGVGGNLVAIQTSRISTYLHIWSTPGVLPLWMKKFWPNPCSTFCSSEINSMSARVLLFLVIPGHLIFFLVIYLIEGHSVTSSKTFVVLYLLASLIQVTILLYLAEVMVRVTWHQALDPDSHCIPYLTGLGDLLGTGLLALCFLLDWLLRSKAELDSLSELVSVPP	359519	263760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_264631_265843_265993_272236_272372_274745_274826_275937_276083_279325_279473_284520_284666_289796_289869_315716_315825_324360_324578_338448_338754_359407
909761	contig_5574_pilon	+	5016	2	Intergenic	novelGene_155841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3687	4001	111141	112150	FALSE	25	CACTTCTTATTAGTGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEVSAFNFHRAGSTPAWLLTWVQSHSCLAAPGDGGRSACSSLPNTAPGCAQQTCGTRDTDADPELERNIAKQVNRMRQRLVGISTLLLPSKGSLSGANSLHSC	107454	113165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_111247_111941
909762	contig_8377_pilon	-	5817	20	Intergenic	novelGene_35063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.33978126961662	38	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTTCTATTCTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180510	114699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_116848_120685_122384_124720_124736_131425_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
909763	contig_12892_pilon	-	2209	2	Intergenic	novelGene_178860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGTTTTCATTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29614	27213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12892_pilon_-_29296_29487
909764	contig_11034_pilon	-	2349	18	Intergenic	novelGene_175022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	41.2009171127811	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	990	2348	152071	138985	FALSE	20	GAGCTTAATTTACTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFSELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTTKKDKKDERRRKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDDDTDDEPQSSHPGKKKPEITFMFQDEVEDFLRKRIQDAPEGFISELAEYLIKPLNKNYLEVVRSVFLSSTSATGTGRKRTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGTKFFADDTQAALTKHLLKTVCTDITNLIFNFLASDLMMAVDDPAAITNEVRKKILSKLSEETKAALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSAAEACDIMVKKGDKKRQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFLTHSMLHAPGRCVPQIIAFLNSKIPEDQHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGDDPLSDELGKEQEDITNTTRKELQELSSSIKDLVLKSRKSSVTEE	171148	138983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139204_139835_140017_140830_140911_141256_141338_142543_142675_142753_142918_144261_144380_147253_147377_149780_149902_151930_152111_153304_153481_154730_154878_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511_169658_171040
909765	contig_15787_pilon	-	5595	1	Intergenic	novelGene_143967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTATTGTTACAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61765	56170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_56200_61800
909766	contig_753_pilon	-	1155	2	Intergenic	novelGene_113009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAGGAGAGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1331587	1329937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1331031_1331525
909767	contig_10904_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_22699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1084	1443	620456	620097	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNMFYQSRKKLIPKSDKKTIKHENLSHKLRCMFLKNVHTPMFMAALFTIAIRWKQPRSPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNDESVNHLITWTKPEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	621539	618612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_618734_619280
909768	contig_5125_pilon	-	4509	1	Intergenic	novelGene_43400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTTGGATAAATAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21464	16955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_17000_21500
909769	contig_628_pilon	-	2985	2	Intergenic	novelGene_130243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	890	1261	193969	193598	TRUE	25	GTGACCTTTAGCATCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETTVPTASRGLSLERLAPRPWSHFLALLSEFMQTAGLFSRPGKERLAEPHGMCSLYCACLHPTEIPAGTANPFCAASDVPGRCGGGQVPSWVPGTYSLVHFYIFMVHASLFRFCVWHMFS	194858	191153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_-_191632_192351
909770	contig_5623_pilon	-	2227	15	Intergenic	novelGene_154831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	376.442721338824	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	1	2025	217477	207141	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLALMACALRKKATVFRQPLVERPEDYALQVNGKYEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPTPQVQKLRTKPPPIPVKKPSSASLWSLEQPFCIELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKMVSSSEVSVCSGPVWNQRLEFDINICDLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRVAAPSLPAGDLGPARLLSSWELPGCRGVGSSSHLVPTVQRGTPVLSPPPATSVLPSPARPPLTVICGGHLQGRPVP	217477	206938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207373_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681_214904_216280_216371_216833_216984_217330
909771	contig_8241_pilon	-	3546	5	Intergenic	novelGene_157508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	15.4333243340507	421	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	74	724	767350	755896	FALSE	60	AAAAACTTGAGAGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFASVFSSRWSRKSASRAEDTDSTMADGEGYRNPTEVQMSQVVLPCHTNQRGELSIGQLLKWIDTTACLSAERHAGCPCVTASMDDIYFEHTISVGQVVNIKAKVNRAFNSSMEVGIQVVSEDLCSEKQWSVCKALATFVAHRELSKVKLKQTTPRTEEEKTEHSVAAERRRMRLVYADTIKDLLANFPIQDGERLLAVGGRAAGTLHAPLHFRPSLGGGREGVYLKCPATGDLRPAWPF	767423	753073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_756178_756651_756751_757958_758020_764979_765050_767211
909772	contig_10904_pilon	-	2479	14	Intergenic	novelGene_22673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	190.916661393481	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1038	1595	542358	537619	FALSE	25	TATGTTGTTCTCAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGGSKDQRQTPRESDPLTGLQEYLKVLIGVLVAFILLVLLFLLLFLFIRHQRHGKHRTAVSEPKDRGLPKGSSPATTDQEENLYAAVIDKQPEEEMELDSQAATLEDPQEVTYAQLNHSTLRRETTTSPSSQSGKPSGEPSIYAALAIH	613969	536734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_539112_539166_539425_539464_539552_539596_540491_540606_541598_541650_542246_542428_564430_564549_565721_565852_566080_566380_566552_566838_567036_567072_567292_567322_613897
909773	contig_5423_pilon	+	4643	15	Intergenic	novelGene_85305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	259.306266403106	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	132	1544	745355	797450	FALSE	40	TCAGAAAATTCTAAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVSVTMAMTAGTTPTFPMSNHTRERVTVAKLTLENFYSNLILQHEERETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKADMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPPEVPVSERAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWGHIRERPAAIPIEIKSIDDTSNFDDFPESDILQPAPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL	710221	800549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_710242_745243_745362_765713_765859_772687_772740_778415_778539_778785_778870_786503_786628_788452_788608_788962_789066_789250_789313_792420_792539_792976_793101_794094_794191_797125_797218_797322
909774	contig_7396_pilon	+	2998	17	Intergenic	novelGene_79572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGAGCGCCCTCCTCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245201	257468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246476_247186_247357_247718_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249062_249736_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254699_255103_255194_255298_255380_257141_257294_257381
909775	contig_13823_pilon	-	4656	21	Intergenic	novelGene_145273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_20	99.3890713308058	267	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2295	257	2551	331195	289447	FALSE	15	AGCCCTGGTGGTGCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIRENKDLACFYTTKHSWRGKYKRVFSVGTHAITTYNPNTLEVTNQWPYGDICSISPVGKGQGTEFNLTFRKGSGKKSETLKFSTEHRTELLTEALRFRTDFSEGKITGRRYNCYKHHWSDTRKPVILEVTPGGFDQINPATNRVLCSYDYRNIEGFVDLSDYQGGFCILYGGFSRLHLFASEQREDIIKSAIDHAGNYIGISLRIRKEPLEFEQYLNLRFGKYSTDESITSLAEFVVQKISPRHSEPVKRILALTETCLVERDPATYNIATLKPLGEVFALICDSENPQLFAIEFIKGQIRKYSSTDRDSLLASLLDGVRASGNRDVCVKMTSTHKGQRWGLLSMPVEEEVESLHLRFLAAPPNGNFADAVFRFNANISYSGVLHAVTQDGLFSENKEKLINNAITALLSQEGDVVASNAELESQFQAVRRLVASKAGFLAFTQLPKFRERLGVKVVKALKRSNNGVIHAAVDMLCALMCPMHDDYDLRQEQLNKASLLSSKKFLENLLEKFNSHVDHGTGALVISSLLDFLTFALCAPYSETTEGQQFDMLLEMVASNGRTLYKLFQHPSMAIIKGAGLVMKAIIEEGDKEIATKMQELALSEGALPRHLHTAMFTISSDQRMLTNRQLSRHLVGLWTADNATATNLLKRILPPGLLAYLDSSDPVPEKDADRMHVRDNVKIAMDQYGKFSKVPEWQRLAGKAAKEVEKFAKEKVDLVLMHWRDRMGIAQKENLTQKPVVLRKRRQRIKIEANWDLFYYR	348913	287341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_289534_293008_293153_293957_294054_294291_294368_296579_296702_298909_298967_300113_300270_300949_301058_303310_303411_303881_304052_304134_304215_304327_304495_308939_309032_309940_310037_310129_310337_312819_313021_315693_315736_316177_316328_317120_317197_331127_331209_348670
909776	contig_3068_pilon	-	1216	4	Intergenic	novelGene_137636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	566.687058456625	38	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	128	367	253056	251746	FALSE	30	GAAAACCCTGAATCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGETLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNSKFPIHNGRSS	253913	250896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_251872_251972_252054_253023_253076_253805
909777	contig_9049_pilon	+	1354	6	Intergenic	novelGene_83149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	1434.45050106304	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	192	704	90226	111692	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGK	89351	112342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558
909778	contig_3426_pilon	-	2158	20	Intergenic	novelGene_57948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	166	junction_8	368.972587170243	28	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	188	1237	424486	385096	TRUE	35	GAAACCTTGACCTGATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKYCLQLTIPGGTVLLQAANSYLRDQWFHSLQWKKKIYKYKKVLSNPSRWEVVLKEIRTLVDMALTSPLQDDSINQAPLEIVSKLLSENTNLTTQEHENIIVAIAPLLENNHPPPDLCEFFCKHCRERPRSMVVIEVFTPVVQRILKHNMDFGKCPRLRLFTQEYILALNELNAGMEVVKKFIQSMHGPTGHCPHPRVLPNLVAVCLAAIYSCYEEFINSRDNSPSLKEIRNGCQQPCDRKPTLPLRLLHPSPDLVSQEATLSEARLKSVVVASSEIHVEVERTSTATPALTASTGNDSEPNLIDCLMVSPACSTMSIELGPQADRTLGCYVEILKLLSDYDDWRPSLASLLQPIPFPKEALAHEKFTQELKYVIQRFAEDPRQEVHSCLLSVRAGKDGWFQLYSPGGGSL	470383	368536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_368800_377192_377264_378652_378759_379664_379812_381350_381399_382220_382362_382859_382977_385067_385177_388422_388472_388767_388795_390086_390153_396399_396754_402888_402994_404477_404582_408759_408841_410894_410958_416789_416832_424408_424571_457797_457849_470331
909779	contig_4232_pilon	+	2102	12	Intergenic	novelGene_63242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	168.369330357279	11	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	78	923	302477	306735	TRUE	20	CTGCCAAGCTGGCCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGEWLGCSARRGPSCDPGPAPGTPAMDDLFPLIFPSEPAQATGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVCFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPLCRSQPAGSRARLHAAAAAFRPGAQ	302399	311904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_302484_303089_303117_303212_303365_303528_303678_304720_304813_305173_305306_306230_306336_306553_306768_309524_309606_309695_309771_310545_311434_311801
909780	contig_6509_pilon	-	4820	2	Intergenic	novelGene_145642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2942	3241	118027	117728	FALSE	25	TCAGTTACCCGAGCGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMEPPLLRPLIWVGEEPATSKLKQLNLDFRYIPCCTVVMRAYAVEMGPHKSMQGERRSMSVDLLCLCLGKGAAPTAGSWLRRAGSLFLHLFVNLFIL	155436	116148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_119581_154048
909781	contig_9614_pilon	-	4844	15	Intergenic	novelGene_104417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	308.794008678793	174	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	777	2334	238	2571	146228	111344	TRUE	15	ATTTTTGTCTTAATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIEDADNSEKSINEENGEVSEDQSQNKHSRHKKKKHKHRSKHKKHKHSLEDDKDKKHKHKHKHKKHKRKEVIDASDKEGMSPAKRTKLDDLALLEDLEKQRALIKAELDNELMEGKVQSGMGLILQGYESGSEEEGEIHEKARNGNRSSTKSSNMKGKLELADNKNSAKRRSKSRSKERTRHRSDKKKSKGGVEIVKEKTTRSKSKERKKSKSPSKRSKSQDQARKSKSPTLRRRSQEKIGKPRSPTDDKIKIEDKNKSKDRKKSPVINESRSRDRGKKSRSPVDLRGKSKDRRSRSKERKSKRSETDKEKKPIKSPSKDASSGKENRSPSRRPGRSPKRRSVSPKQRDKSRRSRSPLLNDRRSKQSKSPSRTLSPGRRAKSRSLERKRREPDRRRLSSPRTRPRDDILSRRERSKDASPINRWSPTRRRASRSPIRRRSRSPLRRSRSPRRRSRSPRRRRLRRRSRSRGGRRRRSRSKVKEDKFKGSLSEGMKVEQESSSDDNLEDFDVEEEDEEALIEQRRIQRQAIVQKYKYLAEDSNMSVPSEPSSPQSSTRTRSPSPDDILERVAADVKEYERENVDTFEASVKAKHNLMTVEQNNGSSQKKLLAPDMFTESDDMFAAYFDSARLRAAGIGKDFKENPNLRDNWTDAEGYYRVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPYLVSRFYRAPEISKCLKVFFDLGHHMQ	146465	105300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_105397_106167_106817_107325_108065_109251_109339_110641_111506_114559_114714_115366_115505_116617_116766_118463_118555_119989_120064_131388_131600_133059_133142_136325_136458_140312_140490_145263
909782	contig_7898_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_47564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGTCTCCTAGCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373761	372441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_372400_373800
909783	contig_16303_pilon	+	2595	7	Intergenic	novelGene_34037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2061	2366	37468	38653	TRUE	40	CTTCAACCAAGGAGCACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLLRVSLSRPHSKYLCSHQMHSFSK	31605	40578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33122_35442_35766_35982_36028_37168_37302_37424_37703_38582_38731_40426
909784	contig_14244_pilon	+	4739	1	Intergenic	novelGene_169446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCAAAAAAAAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3346	8085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_+_3300_8100
909785	contig_14516_pilon	+	2573	19	Intergenic	novelGene_153884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	91.1396296830607	7	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	591	2216	285367	422609	TRUE	35	TATAATTAATTTGTAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMGNPGTLSPTKPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPAASTFPSSFFMQDGHHSSDPWSSSSGMNQPGYGGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLTYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSANRHSLMVGAHREDGVALRGSHSLVPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDEGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITRSRSSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDAANHMGQM	32288	423145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_32561_36343_36417_165669_165732_168803_168901_231881_231947_285345_285476_285939_285990_361653_361760_365817_365952_378665_378799_387106_387175_388339_388419_391026_391104_394147_394352_416430_416567_418184_418348_421549_421780_422472_422614_422792
909786	contig_7056_pilon	-	1874	7	Intergenic	novelGene_43641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_3	1086.14370084666	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	115	426	725582	725118	TRUE	30	TCTTCCTTTTAAAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	725832	721912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724534_725319_725471_725606_725661_725734_725813
909787	contig_7411_pilon	-	875	3	Intergenic	novelGene_136989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	217	567	213727	212970	FALSE	20	CCTGTCTCAGAATTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGASLESKRSPARRRERSRKQRAIVLLYCNSGPEVQVQEAYNTLILTLFPSIFLFSQETWTEKVLVILQAKGTLTLQAGDTLTFLFVVSALTPVGPVKWAVEEPEKGTLRISLQKV	215124	212661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_212988_213394_213873_215053
909788	contig_2703_pilon	+	844	2	Intergenic	novelGene_101627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACAACTCACCTGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	3262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1687_2760
909789	contig_15410_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_130600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCAATGTAGGGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138185	139012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_138200_139000
909790	contig_10377_pilon	-	5246	4	Intergenic	novelGene_115414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2535	2879	259131	258787	TRUE	40	GTACAAGGAAAGGTCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEENHSVGFTQLNILNSFSLSYSVKTVYFTQPYASLSLLIAVDSNAPQPHVCRGELGSVGFFNVNNRIFELRPSEQRKSNPCGFVQRSQELGMGRGGAGGKINGARCRLRGR	261743	254513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_255168_256866_258105_258311_261068_261145
909791	contig_10902_pilon	-	8714	2	Intergenic	novelGene_65667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	377	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	5417	5767	83716	83366	TRUE	20	CTCTCAGATGTCCTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFLGWGHWLSCFLFLQVFPLYPMPVFCNPFLSRPGSLSFFSHHPDPCAFYLPYRPHKSLTHNLGHQSCSANCMLGWSSWKQQFVPETSRYKVGLGQDLVQFYSITWRRYESKAT	89132	79165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_80187_81439
909793	contig_17144_pilon	-	877	3	Intergenic	novelGene_29391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	941.5	7	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	143	586	166806	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183205	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_181790_181850_183158
909794	contig_6227_pilon	+	3580	14	Intergenic	novelGene_49690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1702	2055	887584	887937	TRUE	10	GAGTCGTCCTCCGACCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPAVLPAEQGSEASSTSDPLLSWRQVGASSQDLVHTSETQYDFQEARHSLCQESVPGSLACLVTGMVLVSPWLTSGRETTSQQMLNPLKALSSAPALGTWQCLCRRSKSAVRPCL	885882	898095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_888006_888156_888283_888901_889015_889347_889456_890103_890255_890891_891046_891437_891529_892464_892666_893773_893861_894651_894781_895271_895359_896260_896355_897774_897857_898061
909795	contig_8544_pilon	+	447	4	Intergenic	novelGene_55927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	461	junction_3	239.444263985495	11	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	70	447	90532	120358	FALSE	30	GAGTTTTAAACATTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLDELLSRKKREKKKKTGGKSVDASKLGASEKNERLLTKPQWHDLLPCKLGIWFCLTLKALPHLIQDAGQFYAKYKETKLKEKEDALTRAELETLQS	90462	120358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_90625_91487_91586_92523_92618_120265
909796	scaffold_9100_pilon	+	2986	7	Intergenic	novelGene_83247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_4	378.905771047807	23	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1958	2437	651131	654304	FALSE	25	CTCTGTTAATTTATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644794	654853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
909797	contig_10246_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_46916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTACAAATTTTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181610	183964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_181600_184000
909798	contig_21259_pilon	-	3916	3	Intergenic	novelGene_177448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1610	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCAGCTCCCACCTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12689	6450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21259_pilon_-_9386_10172_10690_12225
909799	contig_678_pilon	-	1081	5	Intergenic	novelGene_167792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	362	junction_2	189.617377895593	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	35	610	38934	35722	FALSE	5	TTTCTGAGTGGTTCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKKKPAKVPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPYV	39950	35250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_35974_36684_36816_37326_37382_38796_38944_39925
909800	contig_6557_pilon	+	3389	7	Intergenic	novelGene_32936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	89.580038699106	30	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	2287	3387	297987	306941	FALSE	65	TGAAAAGAAAAAAATGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPYLYGTSYHLSPKACAAALSLCLCIPCGRGGLALFPFAFLCLPVDRIVGLDQVTGMTETAFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKESLTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACERMIRALELDPNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEEERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKKQQQLSALKVLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTKVKPLLQVTRQEEELQAKDEELLKVKEKQTKVEGELEEMERKHQQLLEEKNILAEQLQAETELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLESRVEEEEERNQILQ	295700	306943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_298320_298413_298536_301503_301574_301658_301820_305588_305698_305804_305937_306767
909801	contig_5780_pilon	+	2782	1	Intergenic	novelGene_29768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	2184	2711	41176	41703	NA	35	ACATGCCCAGAATGTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVIRGNQAEVVTSSEEKSKPHKFIWSKRIVLDWVLWRSKTSELYIRKYIERDLFQGNGSRGCGRWKSKILGSSIDDRRLQAAVVNLLLIIFKSGRSDQSLLQENPTGKEIWLFLWQAKHDNELSPKTVLHKVIISIIVVVRCCRVISDSELPYVQIINIIMNPIFKEYNKPYI	38992	41774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_39000_41800
909802	contig_20378_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_159578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1733	2041	117404	117712	NA	30	AAATTCCACCTCTCTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCAENVIHISEAPEGTALLQNHTVTHTDNHQSTKRGVDRESSQYTLSNTKMSKTVRGKVKIPPLCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKNKRPDLLA	115671	118280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_115700_118300
909803	contig_6929_pilon	+	2618	4	Intergenic	novelGene_139434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	38.9643711898732	190	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	194291	201379	TRUE	25	CTAAACTTTATGATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWLLLQPRRALRESLKIRRFSRRQVRKGCGSGVRRGKEVLTERLIPWASREAKGGSSLPVFLGVYRRKLGGAHPDPRRLGPGEPLPHPPGRGPLRPRGARRAGAEG	194289	204709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_194610_201374_201462_201960_202093_202630
909804	contig_854_pilon	+	3128	11	Intergenic	novelGene_36680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3319.34200708514	53	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	541	1233	1709560	1712303	TRUE	35	CCCCTTTTTTATATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQVLTRSTPT	1701302	1716291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1701348_1701990_1702163_1709236_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711881_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
909805	contig_935_pilon	+	4439	4	Intergenic	novelGene_45567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	763	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGGTAAATGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451471	628498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_451784_457067_457073_469743_469936_624568
909806	contig_11574_pilon	-	2166	11	Intergenic	novelGene_64093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	283.978326637791	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	604	2004	454022	449890	FALSE	45	AGTTACTGTGTAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463691	449727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454019_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
909807	contig_15135_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_119894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133803	134885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_133800_134900
909808	SIRV6	+	1043	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	380	387	164	107	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	252	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	20	TGGGAGTCAATGGCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
909810	contig_7391_pilon	-	1183	9	Intergenic	novelGene_112144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	77.7117068079192	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	48	530	331336	326960	TRUE	10	GCACGTTGTGTGGGGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALAFTGISLLVVGTTMVGYLPNGRFKEFLSKHVHLMCYRICVRALTAIITYHDRKNRPKNGGICVANHTSPIDVIILASDGYYAMVGQVHGGLMGVIQRAVVKACPHVWFERSEVKDRHLVAKRLTEHVRDKSKLPILIFPEGTCINNTSVMMFKKGSFEIGATVYPVAIKVQDP	331383	316147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7391_pilon_-_316590_322885_322966_323053_323183_326957_327061_327812_327869_328762_328879_329933_330028_330206_330297_331310
909811	contig_17603_pilon	+	3301	2	Intergenic	novelGene_152779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	232	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1360	1716	40952	41308	TRUE	25	CTGTTATTTGACAGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISQHLIVLTRNLYIEAVIQTEQGVTAWFKVRKGVCQGCILSPYLFHLYAEQIIREVGLYEEERSIRIGGRLINNLRYADDTTSLTESEEDLKHLLMKIKAYNRQHGLQVTEELSNK	39592	43042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_+_42678_42826
909812	contig_2854_pilon	+	2157	2	Intergenic	novelGene_120814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTAATAAACGTCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87625	90705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_89205_90127
909813	contig_12965_pilon	+	4898	3	Intergenic	novelGene_65196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	161	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGAACGCTCGCTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306234	315890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_+_309785_314014_315059_315586
909814	contig_20357_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_178717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTCTTGTTTACTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28555	31200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20357_pilon_+_28600_31200
909815	contig_12619_pilon	-	5278	6	Intergenic	novelGene_73560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	1891	3051	1034945	893867	TRUE	65	AAAGAACTCAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTASIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLQYTHTHHLPLFIL	1037772	749899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_-_751611_893350_893869_911256_911297_1033826_1035161_1035208_1035356_1036244
909816	scaffold_12124_pilon	-	3979	4	Intergenic	novelGene_22125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	125.865007051205	80	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGCTTGCATTTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987338	936112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_937102_938233_940882_942735_942805_987065
909817	contig_14405_pilon	-	3229	15	Intergenic	novelGene_85660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	185.577765755645	153	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	561	2204	885922	726183	FALSE	45	AAGAAGAGTACTGTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDDEPTDIIPRSCQLTTDVPQVTQLLNMTKLRQTEIQFGGHPLRSAESDQFIHRGGSVRNNKSQDVCHIAFGSKVLGPPPLSGRRNNMRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPRDWLSVFSPPIVPPSQQPTEQRLESSGSLSAQGEDELNVEEDEEVLTLLYDPCLNCYFDPQTGKYYELV	996158	725157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_726296_740543_740639_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827971_844997_845136_866566_866724_885904_886020_989814_989909_993288_993379_995879
909819	contig_302_pilon	-	1366	13	Intergenic	novelGene_145005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_7	264.979558960058	212	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	69	1364	58213	16107	FALSE	35	TAAGTGTAGCATACGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQDLPEQPVKKVKMQESGEQTLSQVSNPEVSDQKPETSSLASNLTMSEEIMTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQSQPYAVYPQATQTYGLPPFGALWPGMKPESGLIQTPSPSQHSVLTCTTGLTTSQPSPAHYSYPIQASSTNASLISTSSTIANIPTAAVASISNQDYPTYTILGQSQYQACYPSSSFGVTGQTNSDTESTTLAATTYQTEKPAVMVPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDADDQSRKNMTGKNRGKRKADTSSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVG	58281	16104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_302_pilon_-_16267_18649_18709_20798_20889_22294_22379_23217_23358_25365_25544_28178_28265_37303_37442_43989_44127_46988_47056_51719_51800_54397_54442_58180
909820	contig_15327_pilon	-	2359	15	Intergenic	novelGene_70769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	73.7335592190018	415	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	24	1778	1169101	1130292	FALSE	30	CAAAGATGGTGGAGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQVGQSADAEGPAAAAARRRQQALPPRPQDLIRLYDIILQNLVELLQLPGLGEDRAFHREIGLKTLVYKAYRCFFIAQSYVLVKKWSEALVLYDRVLKYADEVNSDDNHEAFENSLKDLPDVQELIAQVRSEKCSLQAAAILDASDSHQTETSSQVKDNKPLVERFETFCLDPSLVTKQASLVHFPPGFQPIPCKPLFFDLALNHVAFPPLEDKLEQKTKSGLTGYIKGIFGFRS	1169124	1129710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135790_1138450_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
909821	contig_13421_pilon	+	6258	3	Intergenic	novelGene_166811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	5596	5913	229072	229389	FALSE	15	CAACCGATTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPFCPETQLCKSMAFLANILFFLDAVTNHRAKGMAILSPRSMPEVHTAKLGENNTLRRMNRWLRGCALQKPHLRRRIKWFILTSVTGPVSFNIFAVDGLNKGI	223152	229734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_224435_224607_224865_225015
909823	contig_14868_pilon	+	2280	1	Intergenic	novelGene_150427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55103	57383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_55100_57400
909824	contig_12919_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_75907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	813	1151	736784	736446	NA	45	ACATATATACAACATATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLAIGDEELRSICVWAIISHGYNTSNIVLKIFTVFILRLLASDAVTSSSSTCWIACLNHETLDISVKYTAMVVITGTRGQEILTGFGCPLTKDFYFNITYICMQCHRHSS	737596	735267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_735300_737600
909825	contig_12789_pilon	-	4039	2	Intergenic	novelGene_176630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAAATGGATTATCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307496	303308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12789_pilon_-_306317_306465
909826	contig_11678_pilon	-	1755	7	Intergenic	novelGene_160843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	87.8738047176493	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	26	346	254090	252070	TRUE	20	GGCGGAAGATCTCGGACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATVTGPTTMAKDILGEAGLHFDELNKLRVLDPEVTQQTIELKEECKDFVDKIGQFQKIVGGLIELVDQLAKEAENEKMKAIGARNLLKSIAKQREAQQQQLQALIAEKKMQLER	257487	235584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_235775_248119_248264_249696_249866_251163_252178_252764_252851_253963_254093_257464
909827	contig_6496_pilon	-	3788	1	Intergenic	novelGene_103551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	1310	2065	1234296	1233541	NA	15	TCCACCAGCGTGTCGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSWALLFLQLCDVDQVVLGGLAVGLTEVQFDCVLARKGPVAELALECGAQVLVRSPQRAQGLAGEDFGDILLLLDLAERQLGQVLQAEAQVRLQVTDVRGSSPELRGTIVAKEHRMPCVEVLEELGPPCPAQLVLHVGQPVADGGHRQASELGDVHPLLGAQVRHDVLAFGRLPQAGGKLGLQDEQVLGIPVRLPPLPLVHRRQLVQGLLEAAAVGIRLLRHSGGRGRLGRQAACEVLHHVGDIHQRALP	1235605	1231817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_1231800_1235600
909828	contig_14838_pilon	+	1304	4	Intergenic	novelGene_151919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	6.94422221866655	68	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATATAGAATTCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133254	149910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_133720_137410_137548_148848_148995_149354
909829	contig_19816_pilon	-	2199	4	Intergenic	novelGene_156485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	420	junction_1	129.416639836872	2595	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1023	1427	124800	124293	TRUE	10	GAATCCTGTGTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	125822	123030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124556_124658
909830	contig_11564_pilon	+	2557	3	Intergenic	novelGene_158573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1943	2257	70324	117618	TRUE	30	CCTCTCAAGAATACTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPEMVEHRPIIFATVTVYSFHLLLMLLALFNFLPIESFNTATQSLNFFFSSFSLRNAKCVLPFWFSNSRSLAHFIIMFYFVFLSCPLKSSVLLLLHHFFLLL	68381	121229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_70604_117583_117904_121214
909831	contig_9843_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_114298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	19	615	20	616	NA	35	CCAAAGGACTAATTGTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1	2794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_0_2800
909832	contig_1090_pilon	-	1863	2	Intergenic	novelGene_131112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTCTTGTAGACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342884	336876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_338120_342264
909833	contig_20356_pilon	+	2596	22	Intergenic	novelGene_159528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	669.336033411905	218	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	125	1555	68419	141166	TRUE	35	ACTGAAATGATCAGATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILPHSEVAEVQETLLGDSKDVLGPSTVSVNSDESQLLTPGKMSQRQGKEAYPTPTKDLHQPSLSPASPHSQGFERGKEDVSQNKDESSLSMSKSKSESKLYNGSEKDSSASSKLTKKESLKVQKKNYREEKKRATKELLSTITDPSVIVMADWLKIRGTLKSWTKLWCVLKPGVLLIYKTQKNGQWVGTVLLNACEIIERPSKKDGFCFKLFHPLEQSIWAVKGPKGEAVGSITQPLPSSYLIIRATSESDGRCWMDALELALKCSSLLKRTMIREGKEHDLSISSESTHVTLYGLLRANNLHSGDNFPLNDNEIERQHFKDQDMYSDKSDKENDQEHDESDNEAMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYSEQSHEELGEAGEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSRVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQETHYLQY	37410	159986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_37451_45781_45819_68371_68510_102905_102977_110082_110161_112523_112626_115138_115343_120565_120651_123149_123322_127554_127793_128370_128556_131348_131431_132637_132737_141142_141242_143163_143262_146960_147051_148315_148453_150367_150554_150878_150967_153070_153177_156694_156798_159828
909834	contig_2940_pilon	-	2721	2	Intergenic	novelGene_81992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGCTAGGCAATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144962	1138705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1139892_1143427
909835	contig_6418_pilon	+	3758	1	Intergenic	novelGene_81254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1272	1622	1465326	1465676	NA	25	ATCTTACCTGTGATGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSALLQIYSLRNPMGQFYPIYRVAMSQNRLDSSEFGWLVAPWLKRMAANRKVSGSKSLHQKKMWQSASVKITALETLCSSFTLSYRVTNSWNRLESNGFGLGYIGITLRFELKL	1464054	1467812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1464100_1467800
909836	contig_2069_pilon	+	1581	4	Intergenic	novelGene_23299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAGAAAGAGAAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456674	515261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_457888_458142_458402_513282_513297_515166
909837	contig_13014_pilon	-	3763	18	Intergenic	novelGene_169352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_17	73.8600097350541	236	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	97	2355	460565	407330	FALSE	15	GTTGCTGCCCATCAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAGVTWSTSGCGAGCRADSEAPEVHGCSALAMRLLAAAAAVGRGPLPWVPAALGWQGKQGSWKACRWHSSGVVPNEKIRNIGISAHIDSGKTTLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIIDTPGHVDFTIEVERALRVLDGAILVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMRSKLNHNAAFVQMPIGLETDFKGIIDLIEERAVYFDGDFGQIVRHGEIPADLRAAAADHRQELIECVANSDEQLGELFLEERVPSVSDIKLAIRRATLNRSFTPVFLGSALRNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNFAILNQDDDSKEKTKILMNSERDNSHPFVGLAFKLEAGRFGQLTYVRNYQGELRKGDAIYNTRTRKKVRVQRLVRMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTNRDTSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKAIGRFTREDPTFRVHFDPESKETIVSGMGELHLEIYAQRMEREYGCPCVTGKPKVAFRETITAPVPFEFTHKKQSGGAGQFGKVTGVLEPLDPENYTKLEFLDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACETGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANGTLCILEPVMSVEIVAPNEFQGVVIAGVNRRHGVITGQDGIEDFFTLYADVPLSEMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYCRYQPCSPSTQEDLINKYLEATGQLPVKKGKAKS	460661	405921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_407462_407615_407670_408424_408586_416809_416955_418517_418681_433038_433122_434451_434590_436668_436726_438436_438539_440042_440181_446189_446275_446784_446943_450178_450330_452629_452747_454982_455188_455621_455755_456612_456766_460481
909838	contig_1532_pilon	-	1489	5	Intergenic	novelGene_37441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_4	774.189374442713	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	35	613	32217	27172	FALSE	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPAEENKVFPMASLATSINRFALEFSKKLAESAEGKNIFFSPWGISSSLTMVYLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKLSPRCSLEYFLQVSFCKKILLSVSVID	34895	26295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_27379_28825_28964_29438_29505_32049_32227_34870
909839	contig_10324_pilon	+	2232	12	Intergenic	novelGene_7757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.85567283233	24	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	85	1023	73345	79380	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	73175	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74651_74842_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80099_80276
909840	contig_7123_pilon	+	2369	2	Intergenic	novelGene_170582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTCGAGCGGTGTTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539388	595553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_539478_593273
909841	contig_2783_pilon	+	1973	2	Intergenic	novelGene_119647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1262	1807	393123	393950	FALSE	10	ATTCTCCGTTCTCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKNKQERPPKKQKKKTYEKRNALRDPSAHLCKPRGKSPCHAAPPGQKGLPTQEKEKKTNNSKQTNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTRTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSRKKATLAANKWHSESQLVRAGVSRTRDCVRGKQRGPSRGEEG	391861	394116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_393649_393930
909842	contig_9345_pilon	-	1230	11	Intergenic	novelGene_24446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_5	190.647213459835	54	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	433	1185	433317	400250	FALSE	40	TGGTCAGCCACAGAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGLTELLQGYTVEVLRQQPSDLVDFAVDYFTRLREARRLAPTPPATAPTRVSYGPEPSPEPVADEEDESEDEEDLEVPAPSRFNRRVSVCAESYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKVDEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNHGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEASERMKIVDVIGEKVYKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIKSKTKANKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSMDLNDPMQ	509861	400204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_400384_400875_401018_402295_402362_425106_425182_425344_425447_429802_429957_433237_433345_447365_447450_448981_449035_453971_454008_509629
909843	contig_8880_pilon	-	2339	2	Intergenic	novelGene_165760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAATAATCCAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82068	79369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_80808_81167
909844	contig_19012_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_159490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTTAAAATACATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92371	90024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_90000_92400
909845	contig_5482_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_144483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGCTTCTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494298	496593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_494300_496600
909846	contig_11719_pilon	+	2678	2	Intergenic	novelGene_154762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75573	87735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_75581_85064
909847	contig_15022_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_171808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	394	717	84474	84797	NA	30	GGGAGGCGCCTAACAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRIGLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSTGKILNNTGRIKRRWKEYTGSLYQKELVDVQPFQEGAYDQELMMMKEKVQTVLKALAKNKDSRNWWSTN	84080	86205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_84100_86200
909848	contig_16930_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_139156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCACTGCCACTGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108762	107290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_107300_108800
909849	contig_9895_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_144711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	359	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTGTTAAGAGGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475450	473370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_473400_475400
909850	contig_10734_pilon	+	8011	7	Intergenic	novelGene_51197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_6	411.346434151177	148	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	6498	7004	1134427	1141057	TRUE	35	TCAAAACTGGTGTTAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGVSSFIYSFNSTKENHARSKSSFSLAANQKVDSSNPPAAPWKPYGAVLLCPIESL	1124235	1143371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1141417_1142723
909851	contig_10549_pilon	+	6023	3	Intergenic	novelGene_110593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	749	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2404	2787	148596	148979	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKRRKQNKETKKTQKTKTRKKKWPQGCLSVSAQSKGVSPKPRSTTRPEGAPKPRKEKENNQTNKSKQDKLEQTNRQKAPGGPTSVVAQAGKQFHRKKQRWLQSQVFERREGEVVRGKKEI	117428	152215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_118384_119779_119951_147318
909852	contig_1918_pilon	+	2788	3	Intergenic	novelGene_168328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_2	10.5	203	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	411	1070	50221	51989	FALSE	25	TCATTGACTGTAATAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGLTEVERKFVPGPGTEERLQELGGTLEHRITFRDSYYDTPELSLMRADHWLRQREGSGWELKCPGVAGVSGPHTEYMELTAEPAIVAQLCEVLGAEGLGAGGVAAVLCPLGLQEVASFVTKRSAWKLVPLGAEELPLWVHLDTADFGYAVGEVEALVHEEAEVPAALEKIHSLSSLLGVPAQEKPPAKLMVYLQCFRPQDYQLLLEENSSREKPRD	49490	53707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_49896_50215_50762_51870
909853	contig_12119_pilon	+	3747	11	Intergenic	novelGene_88668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	383.393322842222	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	284	988	325640	387152	TRUE	20	ATACTATGACTGGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKVEKNPPVKGSLSGKVSLPCHFSTLPTLPPSYNTTNEFLRIKWSKIEVDKSGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQGYKGRVSVPTHPEDVGDASLTMVKLRASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAKKTCVDIGAVIANPEQLSAAYEDGFEQCDAGWLSDQTVRYPIRTPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPLETYDVYCYVDHLDGDVYHITAPNKFTFKEAEEECEAQDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDSSVRHPVTVARIQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPTPDSRFDAYELIVAK	325356	425866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_325737_329486_329662_329745_329874_348682_348967_387131_387246_391867_391982_396523_396683_397973_398057_417908_418054_423556_423740_423884
909854	contig_19865_pilon	+	3486	5	Intergenic	novelGene_170149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	102.864899261118	287	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	154	873	43592	79404	FALSE	20	CTAGTCTGTACAGTCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRGLFQDFNPSKFLIYACLLLFSVLLALRLDGIIQWSYWAVFAPIWLWKLMVIVGASVGTGVWARNPQYRAEGETCVEFKAMLIAVGIHLLLLMFEVLVCDRIERGSHFWLLVFMPLFFVSPVSVAACVWGFRHDRSLELEILCSVNILQFIFIALRLDKIIHWPWLVVCVPLWILMSFLCLVVLYYIVWSVLFLRSMDVIAEQRRTHITMALSWMTIVVPLLTFEVSFAEGTFFTS	43438	82017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_43630_64498_64676_67504_67713_72650_72735_79191
909855	contig_3956_pilon	+	1034	5	Intergenic	novelGene_15214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1453.58229901165	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	265	684	1284120	1290665	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKVARGSGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1282895	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1290498
909856	contig_5039_pilon	+	2835	7	Intergenic	novelGene_64997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_4	137.574727168748	90	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	690	1424	1692107	1698825	FALSE	60	TTTGTTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRHGIPTAKWRAFTKPEEACSFIMSADFPALVVKASGLAAGKGVIVAKSKEEACRAVQDIMQDKAFGAAGETIVVEELLEGEEVSCLCFTDGRTVAPMPPAQDHKRLLEGDVGPNTGGMGAYCPTPQVSRDLLLRINNTILQRTVDGMQQEGTPYTGVLYAGIMLTKDGPKVLEFNCRFGDPECQVILPLLKSDLYEVIQSTLDGLLCTALPTWLEHGTAITVVMASKGYPGDYTKGVEITGE	1691417	1700236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1692184_1693734_1693847_1694926_1694996_1696264_1696391_1698032_1698121_1698338_1698425_1698648
909857	contig_5918_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_99549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	206	691	763587	763102	NA	90	AAAAAAACAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKRTTAITCDGERVGGKRAKGKREKTFTVNLFIQILSINVLFTQVFKKQKTVSIRKPEKLHELEVIFKKTDNTLLPSSKSWVHNGFLLLKKLEMNHLTDWLKTGVKKEVSRYVFMILLKKQTNLSPSILTHSNPTCRTAPWVSKEQLMDLHCRSSGLQP	763792	761480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_761500_763800
909858	contig_4745_pilon	+	2206	1	Intergenic	novelGene_175171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAGAAGTAGGGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77884	80090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_+_77900_80100
909859	contig_14068_pilon	+	4056	7	Intergenic	novelGene_165958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1331	1792	144932	145393	TRUE	35	CACAAAGGTCGAAGGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRIENLKKSTRKLPELIKEFSKVAGYKVNKQKSVGFLYTSNKKSEREIRETIPFTIASKKIKYLGINLTRDVKDLYDENCKTLWMWKEIKEDLNKWKDVPCSWTGRLNIVKMSILPKVIYRFNAILIKIPTAFFAKIEKPILNFIWKGNRP	23092	209835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_23419_105755_106226_127298_127833_144931_145733_146120_146557_150285_151229_209289
909860	contig_17432_pilon	-	3404	2	Intergenic	novelGene_159008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	28	420	93385	92993	TRUE	15	TTGTACTTTTGATGGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLLLISTFMALWSEKMLCNTSMLWILLKLALWPNLWSILENVTCALEKKVYLAAAGWSVRYMFMRSKWLTVTFSSSVSLLSFLAVLSFNGSGVLKSPRTIVELTLFSVLLEFVLCILKPYRWVRKYLLYLRPPGVLTL	93412	67747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_67755_90015
909861	contig_1443_pilon	+	2573	2	Intergenic	novelGene_28337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTTGAGAAGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780050	783830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_780191_781397
909862	contig_8161_pilon	-	2416	6	Intergenic	novelGene_156743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	32.1409396253439	214	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	88	831	254273	230026	TRUE	45	GCAAACAAGGAAGTATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLPLIPLIIVLMVNHSDARTHSLRYFRLGVSDPGPGIPEFISVGYMDSHPITTYDSVTRRKESRAPWMVENLPPDHWERHTQLLRGWQQMFLTELKNLQSHYNHSEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEESETILLVMKAISGSIVLAIILAGIGILAWRRRPREQDGIFYLPTPNQ	254360	226178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_227449_229710_230067_231373_231479_232136_232413_236172_236434_254212
909863	contig_7275_pilon	+	4789	3	Intergenic	novelGene_111228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	905	1567	69854	70516	TRUE	75	TTACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIDLSECAKEVKVFVSHVNAHQRVTSAEEDFNNQVDRMTRSVETTHPLSPTTPAIAQWAHEQSCHGGRDGGYAWAQQHGLPLTKADMATASAECLICQQQRPTLSPQYGTIPRGDQPATWWQVDYIGPLPSWKGQHFVLTGIDTYSGYGFAFPARNASAKTTIRGLTECLVLCHGIAHSIASDQGTHFTANEVRQWAHAHGIHRSYHVPHHPEAADLIE	68850	233916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_69403_69501_71027_231204
909864	contig_10296_pilon	+	1955	2	Intergenic	novelGene_168885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_1	0	59	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	1274	1954	904405	905085	FALSE	35	ATTACAGACCAATATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAHIQKEEMARIKTLTLQLEQIEREQQKKTSSTRRKEIIRVRAELNEIENRKTIERVNKTKSLFFEKINKIHKPLVKLTKEKHKKKQITRIRNEVGDITTDSTEIKRVVTEYYETLYANKFENLEEMDKFLETHYLPKLTQTKVEQLNKPVTKEEIEKVNKKLPTKKSPGPGSFTGRVYQTFREELTPLLLKVFWSIEKDGILPNSFHEASITLIPKPGKDTTKKE	898479	905086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_899248_903899
909865	contig_16228_pilon	-	2826	1	Intergenic	novelGene_147946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2037	2336	61969	61670	NA	40	AGTAGGTAGCAGGATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIICVENPKELIKQFLELISSNSKVADQGLHQTESSTARWCLANTTDCSDRNHNGGFWTELKKDVEQNSNTKKETRFTGLTETGEMLRVWPPDTLLAQW	64005	61179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_61200_64000
909866	contig_17158_pilon	+	2011	15	Intergenic	novelGene_141144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	19.3047525078089	76	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	298	1776	121302	152251	FALSE	30	TATATCATCTGACTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVPAASASQLTLVDLVCALSTLKTDTVLHLVKEVVKKPPQIKGDEKSSLVDIPVLQFSYAFIQRLPLPTLQENFPSLLGVLKDSVQLNLAPPGYFLLLSMLNDFVTRTPSLEGKKYQKDLQEVTQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVKAQPQISLEESDAEEDLCAEAAAASSMVSASAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKEKAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSALSGYSYTKRAWKKEVLELFLDPAFFQMDTSCVHWRSIIDHLLAHERTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAIFSGEFDQYHPYLPLIQERLTDNLRVGQTPIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMISELIQTFTQLEEYLKEEDESLRNSNKINRTKVSIPDANGPSMGEIPPSELILYLSACKFLDTALSFPPDKMPLFQIYRWAFVPEVDTEGPALLSDLEENHQECKPHTVRILELLRLKYGEISNSDEITVKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFRTLNCAFKTQSKLPADPSGPPLIEDLVTDSPRILQQLEESVEHDFLEHLEC	115537	152486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_115673_119036_119093_121097_121203_121300_121368_124391_124537_138421_138505_138725_138836_138962_139110_140318_140381_141421_141551_148683_148821_149988_150045_150276_150439_151466_151597_151999
909867	contig_6881_pilon	-	5384	1	Intergenic	novelGene_164833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAGAGAGGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71849	66465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_-_66500_71800
909868	contig_13021_pilon	-	1974	9	Intergenic	novelGene_8239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	491.672385206857	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	126	1172	236115	210494	TRUE	40	ACTTACTAGATGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236240	205442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206217_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
909869	contig_11507_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_103364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATACTCCCTTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117114	119001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_117100_119000
909870	contig_1233_pilon	-	6143	4	Intergenic	novelGene_178861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3606	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	321	5822	6142	78722	78402	FALSE	55	ACCCCAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVVKGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRLTWDKIKSKNLQVLGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRR	279820	78400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1233_pilon_-_80527_112640_113235_133709_135173_277860
909871	contig_17074_pilon	-	3548	12	Intergenic	novelGene_145185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCAGGCCAGGATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660273	616343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_616517_625262_625396_635238_635377_636633_636734_636869_636995_640909_641022_646887_647021_648255_648360_648911_649014_651584_651755_656872_658893_660035
909872	contig_6058_pilon	-	5706	3	Intergenic	novelGene_172366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_2	14	252	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	551	901	243950	239178	FALSE	30	CTCTAATTTAGGATACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRLTLCQAGPVPRPQAHPAPALREVGVAGAHSERGWYWGSSQAAGLRRVTARVGRVWWSRAHAHCFSLVSDADRVDSTTFLGNACQDCAKRKLEENGIEVSKRLRQSDTDDAGGS	244500	234372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_239198_242721_242806_243703
909873	contig_15062_pilon	-	3216	1	Intergenic	novelGene_162291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	799	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	2204	2629	31466	31041	NA	35	TTGATAAAGTAGAGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNCQKFKLNSEGDIKQRDTIADARWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNRSWITLRRMGIQEHLLVLMRNPYIDQEAVVQTEQGDTAWFKIRKGTCPGYNFSPYLCSLYAEQMLFFMKKNGASGLEEDSLTTCVM	33669	30453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_30500_33700
909874	contig_9345_pilon	-	2233	3	Intergenic	novelGene_24728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	241	543	1089183	1088881	TRUE	5	CCACCGCCTCCGCCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQREIYSLTVQWATSPNSGHQLQRNAFSLCRLWRKVRVISLPLVWELLCAGTSGPKDALCSQHCFLGDMRFPYISAHFSLLYLKRDCIKTLILSTLSV	1089423	1042009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1042058_1048109_1048166_1087294
909876	contig_12790_pilon	-	1624	2	Intergenic	novelGene_35286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	139	348	451862	451615	FALSE	50	TACACCACAAACAAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRALEHLPQQGRCGCEARGAERPRIQEAEAEETRNTRSQAASVSKGMVRTLWFQRVELPLRWTRRMVHLKLREQSCCPSGPGRIWRVWPTPRVWRARPLCKLSQRTEYYFQSLEG	452000	450338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_451715_451752
909877	contig_11855_pilon	+	2575	10	Intergenic	novelGene_66928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_7	61.9051444839623	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	74	1186	893507	912090	FALSE	80	CAAAAAAAGGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSLAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNGVIISIPLTETVILHQGRLLGLRANKTSGAPGNRPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSGSSGTDLAADKAGPSAQEPGSQTPLKSMLVISGGEGYIDFRMGDEGGESELLGEDLPLEPSLAKAERSHLIVWQVMYGSE	893433	913479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_893554_895047_895129_895847_895916_897838_897988_899051_899224_900972_901087_902317_902357_903507_903685_906714_906865_911974
909878	contig_12677_pilon	-	1390	2	Intergenic	novelGene_110708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_643_700
909880	contig_13424_pilon	+	2966	4	Intergenic	novelGene_151603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGAAGCCCCTCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121031	147534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_122647_128723_129081_138763_139316_147092
909881	contig_10259_pilon	+	2847	2	Intergenic	novelGene_177192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_1	0	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	899	1288	62280	62669	FALSE	20	AGCTCTGGATCCGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGESPELWPQGPGAVGVSVCAGGHPSGRVACFPRPDVRTAPPTTPLLQRTWLCASDHVFGPLDLAPLTPALVLSHPRHESWLVGSPGSEEGDHSVSLGSRPPGLVGPGTDLGLLEEESLPPFQWSHGD	52733	64228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_+_52901_61548
909882	contig_11416_pilon	-	2603	3	Intergenic	novelGene_145346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCACTTAGTTCACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166770	145957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_145966_161706_161983_164451
909883	contig_7201_pilon	-	3645	2	Intergenic	novelGene_152514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAGAAAGCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333497	266518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_267672_331005
909884	contig_10339_pilon	-	4587	9	Intergenic	novelGene_125270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.8497491631782	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	220	1125	357260	332025	TRUE	15	CTTCGTCCTCAGAGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKCIGPALLRFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSGVMMLQLLEKVVELENWTEGKGLIVRGANNTFSSGSDLNAVKALGTPEDGVALCMFMQNTLTRFMRLPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSGRELRLEEALLTERDLVGTVWGGPANLEAVARKGKSSK	366783	292296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_292503_308600_308709_328738_331524_331661_332434_346586_346668_348532_348586_354102_354246_357040_357263_366566
909885	contig_7171_pilon	-	2123	2	Intergenic	novelGene_101372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTGTCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361014	1358627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1359501_1359764
909886	contig_14519_pilon	+	5997	1	Intergenic	novelGene_66835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	332	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCCAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368899	374896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_368900_374900
909887	contig_12079_pilon	-	2988	9	Intergenic	novelGene_67509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	311.447427345291	1567	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	737	2218	864606	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872423	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
909889	contig_9668_pilon	-	2899	1	Intergenic	novelGene_58162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	340	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATACAAAAACGAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462350	459451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_459500_462400
909890	contig_5794_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_69751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTGCTGTGTATACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505433	503882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_503900_505400
909891	contig_14441_pilon	-	1191	2	Intergenic	novelGene_100701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCCCTTCCCAAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125471	115236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_116358_125401
909892	contig_1082_pilon	+	3738	2	Intergenic	novelGene_170419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGCTTAAAATACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9621	13868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_12550_13058
909893	contig_6677_pilon	+	7010	8	Intergenic	novelGene_114156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	321	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387390	403604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_387721_387767_392196_393287_393417_395897_396142_397786_398683_399092_399236_401865_401997_402895
909894	contig_7151_pilon	-	2535	4	Intergenic	novelGene_40772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_2	704.071492582015	142	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACATCTATATATACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551375	527230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_549638_549729_551152
909895	contig_9239_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_137188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1044	1682	214573	215211	NA	40	GACTAACTTGGAATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTKLGALIHDRNTIRTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLRSSKDFIKTVKRQPTDWEKIFGYDKSNQHLISKIYKILQNLNNKETNNPVKKWAKDMNWHFTKEDIQAANRHMKKCSQSLAIRETQIKTTMRYHLTPTRLALIKKTQNKKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQRLWKSIWRFLKKLEIEVPHDPAILEYILEKQEPSHE	213529	216412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_213500_216400
909896	contig_500_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_31130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	952	1251	1762190	1762489	NA	40	TGAGTGCAATAAGTCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDNYQGLQQTESSTTGWCLPTTTECSDCDHSQGFWTELEKDVEQNSNTEKKTRFTGLTDWRNPKIMAPRHPFSLVVKSLLRFTIQPGIGQPHKTKWDL	1761238	1764121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1761200_1764100
909897	contig_8687_pilon	-	4147	20	Intergenic	novelGene_169660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCCGCGCTCTGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341017	232893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_233077_249703_249835_250658_250806_252257_252397_260931_260977_266532_266733_267219_267341_280561_280682_295433_295569_297032_297131_298709_298951_302182_302321_304020_304229_317426_317620_318318_318430_319479_319545_322800_322935_328569_328668_329956_330143_339563
909898	contig_15732_pilon	+	3084	2	Intergenic	novelGene_88926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	323	junction_1	0	9	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2601	2933	397980	398570	FALSE	25	TCCATACAGCACTGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLKIEIKFEFKDFDVVELYNDCISCKTVDHLARCLYKAIFSMAMKDNYAFVMFLCSALKWRNANSVSFFYSFLLDPKLKKNLVSPAGKITKEGYYKETQESASIVFSG	395379	398721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_398263_398520
909899	contig_5686_pilon	+	2265	14	Intergenic	novelGene_45253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1566.28923776273	3	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	54	1694	93843	230566	FALSE	35	AAAAAGTTCCAATCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTELEKHVKQNSNSQKKTRFTGLTDWRNPEILAPGHPFSSVVKPLLKFTVQPGIGQPHKRKQD	93789	231137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208324_230381
909900	contig_10864_pilon	-	3926	1	Intergenic	novelGene_107062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	766	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTAGAATTGAACTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	830392	826466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_826500_830400
909901	contig_17274_pilon	+	3781	4	Intergenic	novelGene_26467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	242	junction_1	248.642089938306	29	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	50	544	7027	30219	FALSE	35	GTGTATCACACCAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVLHFLTGHDPRPGSMAQQGQERKMAGGGSDLSVRMFTEDQNTEKKNIDERFFHEIFTLFRKNKVEIASAIKKTFPFLMGLRDRGFLSEQKYEHFLDTCGNLVPVERVAYDVLTELEKTFSLPLLEALFSRANLKAYPDLTEVYQSFQNVSCGLVVLQEDEVRESEEMPRLLPYDGEGN	6977	33456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_7086_26184_26360_27831_28001_30127
909902	contig_2365_pilon	+	929	6	Intergenic	novelGene_103733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	155.055602930046	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	452	853	258130	261701	FALSE	15	GTTGACATTTTGCCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVFCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTSDNATSCDIVEDMGYRVIITDYS	116748	261777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_116902_248941_249030_254096_254242_258064_258246_260405_260536_261545
909903	contig_17796_pilon	+	3172	12	Intergenic	novelGene_33798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_11	345.925492383825	18	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	145	1290	53527	120497	FALSE	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLDGGSIAVIVVAVLMAGIVASVFLYKYVGHRRRGKTEVTAEYSTYKDTSASPAEPES	53382	122379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_99617_99648_110237_110283_113363_113400_113849_113911_120424
909904	contig_987_pilon	-	2484	13	Intergenic	novelGene_72277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	226.199702819335	6	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	745	1359	929235	907543	FALSE	15	GGGTAATGGTCTCAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEVIDKYTAVVKMIDSGDKLKLDQTHLETVIPAPGKRILVLNGGYRGNEGTLESINEKSFSATIVIETHGSLGDVWLLTKMLGVQIHLEVPQKKALVIYFQKTRAIENPMEHSSTLKHMWPPWVRIDWTATGLVFRFLLTFSFVIMKFWFWENLVWNNRWSWL	945163	906417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_907831_920068_920170_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936365_937208_937327_937410_937455_941074_941170_945029
909905	contig_4783_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_108395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258991	260430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_259000_260400
909906	contig_610_pilon	-	2216	5	Intergenic	novelGene_76704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	1298.89229249388	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	52	498	252557	222001	TRUE	70	TGGGAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGFCGASRLRWTRKKGLVMSF	252608	206209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_207487_220517_220785_221826_222063_234998_235302_252475
909907	contig_14017_pilon	+	1999	4	Intergenic	novelGene_165677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	62.7180640290782	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	141	629	29686	34756	TRUE	70	AAAAATAAAGAAAATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKVSKPEHLLPSLKWQ	16207	53868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_16319_29656_29943_34524_35860_53601
909908	contig_8106_pilon	-	2174	7	Intergenic	novelGene_139735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	166.354457576452	42	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	110	841	134968	128810	TRUE	15	TCAATCTTTTTTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSQVKPPPQGTFQVLRGNGTSVGTVLLFHCPSGHQMGGSGLVTCAWKGSVAEWSSGTPTCKSVPPHETFGFRVAVIASIVSCAIILLMSVAFLTCCLMKCVKRTEKRHSDRTAQLWYQLRGKDLETLQAASLGLKGLNNNNNSHPSCQPRLGEAALQAHDNHCFTSSSRITRSSAARSLAPLSLERWHGGSSGGLARGPCASVWAASVRFRDHGKGTTELASMGPSVNKHPWTPLPDALSPSVSRVMVHIESPAQTLPASGPTPEMPGMPGQVSANLG	135077	96765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_96892_113164_113900_128337_129015_130900_131036_131522_131688_132743_132892_134889
909909	contig_12299_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_29730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	389	868	78964	79443	NA	30	CAAAGAGTGCCTTCTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVYRTKQFLTKQLVHILPYDSGKQPHDMLTLSFLNLGFPITSFPIAFCLLVLVPGLLCLISTNCFMGLSNPRLKGELRSDFTTELKGCLGAILLGFLQSLSTSKSGLFLCVRILFYILIQLCPGLSVVIPVRAVSGRTRALSSCTGLSLVEVLVAVVR	78575	81075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_78600_81100
909910	contig_4103_pilon	-	2816	16	Intergenic	novelGene_51913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	593.360576153601	22	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	156	683	87845	83775	TRUE	10	TCTTCTCTGTGTTGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCVVGTSALAGVERLRTKCRSETLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSAMLVSLTHSLFSGHSYYAKLRQQEIERERELAEKYRDRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDEDPENKIEFKTRLGEPQCLPHAFQEQSIRAE	91909	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82723_82827_83662_83827_84684_84736_84826_84898_85362_85478_85646_85856_87815_87883_91263_91311_91838
909911	contig_12485_pilon	+	1432	6	Intergenic	novelGene_147299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769458	795863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_769657_770669_770825_779030_779093_789117_789256_789411_789498_795070
909912	contig_709_pilon	-	3865	2	Intergenic	novelGene_57586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	550	junction_1	0	272	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	957	1376	2222900	2221956	FALSE	30	TAGAAGTCTAGCATGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVFKASYLTVFSWKGVILEEVTIKCSCQVYSVMKHRKIFQVCFFVVDIEDLPPTVQEKLFDEVLDRDVQKELEEESPIINWSLELATRLDSRLYALWNRTAGDCLLDSVLQATWGIYDKDSVLRKALHDSLHDCSHW	2223856	2219466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2222159_2222683
909913	contig_6159_pilon	+	3123	1	Intergenic	novelGene_128252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTCTTGGGAATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215800	218923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_215800_218900
909914	contig_10541_pilon	-	3801	1	Intergenic	novelGene_144622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	46	699	57673	57020	NA	25	TAAGGTTATCCGTGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IASEDELPRLEGTQKMTGEELPPQSRVNLNDVDGVKLSGPSFADVAPLKMRRNSCKYPLIIGTWNVRSMNLGKLEIIKNEINIDILGINELKWNGIVYFELDNHMVYYAGNDNLKRNGVAFIVRKNISRSILKYNAVSDKIISGCLQGRPVNATVIQIYAPNTKVKDEEIKDFYQLLQSEIDQTSSQDALIITGDYNVKVGNEGSVVGKYDLGDRNDARDRKGMHDRILQDK	57718	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_53900_57700
909915	contig_18081_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_23803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCACGGTTTAACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134608	135763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_134600_135800
909916	contig_13216_pilon	+	2435	2	Intergenic	novelGene_47487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	0	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAAAACAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229646	245303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994
909917	contig_10500_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_41235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGGACGCGTGCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626415	1627004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1626400_1627000
909918	contig_8955_pilon	+	5352	6	Intergenic	novelGene_175085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_5	60.6926684204938	194	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1055	3168	942	4109	278191	284116	FALSE	35	TTCTTACAAAATCGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPDEKEFTGGQSGGPQQNTGVLDGPQKKPEGPIQAMMAQSQSLGKGPGPRTDMGAPFGPQGHRDVPFSPDEMVPPSMNSQSGPIGPDHLDHMTPEQIAWLKLQQEFYEEKRRKQEQVVVQQCSLQEMMVHQHGPRGVVRGPPPPYQMTPSEGWGPGGAEPFSDGINMPHSLPPRGMAPHPNMPGSQMRLPGFAGMISSEMEGPNVPNPASRPGLSGVSWPDDVPKIPDGRNFPPGQGIFSGPGRGERFPNPQGLSEEIFQQQLAEKQLGLPAGMSMEGIRPSMEINRMIPGSQRHMEPGNNPIFPRIPVEGPLSPSRGDFPKGMPPQMGSGRELEFGMVPSGMKGDVSLNVSMGSNSQMIPQKMREAGAGPEEMMKLRPGGSEMLPAQQKMVPLPFGEHPQQEYGMGPRPFVPMSQGPGSNSGLRNLREPIGPDQRTNSRLSHMPPLPLNPSNNPTSLNTAPPVQRGLGRKPLDIAVAGSQVHSPGINPLKSPTMRQVQSPMLGSPSGNLKSPQTPSQLAGMLAGPAAAASIKSPPVLGSAAASPVHLKSPSVPAPSPGWTSSPKPPLQSPGIPPNHKAPLTMASPAMLGSVESGGPPPPAASQSASVNIPGSLPSSTPYTMPPEPTLSQNPLSIMMSRMSKFAMPSSTPLYHDAIKTVASSDDDSPPARSPNLPSMNNMPGMGINTQNPRISGPNPVVPMPTLSPMGMTQPLSHSNQMPSPNAMGPNIPPHGVPMGPGLMSHNPMMGHGSQEPPMVPQGRIGFPQGFPPVQSPPQQAPFPHNGPSGGQGNFPGGIGFPGEGPLGRPSNLPQNSADAALCKPGGPGGPDSFTVLGNSMPSVFTDPDLQEVIRPGATGIPEFDLSRIIPSEKPSQTLQYFPRGEVPGRKQPQGPGPGFSHMQGMMGDQGPRIGLALPGMGGPGPVGTPDIPLGTAPSLPGHSPLRPPPFLQQGMMGPHHRMMSPAQSAMPGQPTLMSNPAAAVGMIPGKDRGPAGLYTHPGPVGSPGMMMSMQGMMGPQQNIMIPPQMRPRGMAADVGMGGFSQGPGNPGNMMF	271427	285359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_271625_272803_272994_273920_274021_277736_279980_281243_281505_282998
909919	contig_3601_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_132847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTGACTTGATCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129105	127062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_127100_129100
909920	contig_8581_pilon	+	624	1	Intergenic	novelGene_22804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGACTCCCCTCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231401	232025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_231400_232000
909921	contig_11850_pilon	-	2116	7	Intergenic	novelGene_125199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_6	879.906134514106	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	120	746	186097	181211	FALSE	10	CTTTCATTGTTTTATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAESEGAKIDASKNEEDEGHSNSSPRHTEAATAQREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQWGSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRGGHQNSYKPY	197752	179840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_181279_182664_182765_183240_183373_184501_184664_185932_186102_195717_195775_197694
909922	contig_10324_pilon	-	2728	4	Intergenic	novelGene_7926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	11.5566238822398	69	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	246	1733	1098681	1083821	FALSE	25	CCCATTAATCATGAGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVAVEFTQEEWALLDFSQRKLYRDVMMENFRNLDSVFKQDNNGQTSMKNDSWPSMLGEVHEFHGIEHQHNNRRRHVRVYTVERLCESKDGKVNKGEEGNQCGKTLSWIGNLTRLKRTPAGVNPECLECGKAFMDQSSFDHHNRSRSGHKPYHCKECGEYRRCPSYLKPHMREKLYKCQDLGKPCSCSLPLTKHIRTHSEQRPHECKECGKAFGYLSSLTRHIKTHSGERLFECKKCGKAFNRSSVLATHLRIHSGERPYECKECGKTFSRSSNLTRHTRTHSGERAYECKECGKAFSLSSHLTRHIRTHSGEKPYECKECGKAFSRSSSLTTHIRIHSGEKPYECKECGKAFSHSSALTTHIRSHSGERPYECKKCGKAFSCSSALTTHMRTHSGERPYECKECGKAFSFSSSLTIHIRSHSGERPYECKECGKAFSCSSHLTTHIRTHSEKRPYDCKKCGKAFSRFSQLTRHVRVHNREKPYECKEC	1098926	1082825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_1085058_1085397_1085522_1086510_1086635_1098678
909923	contig_5018_pilon	-	2308	8	Intergenic	novelGene_47054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1040	junction_7	435.312836137556	9	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1266	1748	1400899	1399645	FALSE	0	CTCCTGTGTCTCCTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGKWIHPEIDNPEYSPDANIYSYDSFAVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKASEKLMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEAAEDKEEEEDKDEDDEDEEDKEEDEEEDVGQAKDEL	1402861	1399084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1399843_1399929_1400023_1400619_1400764_1400851_1400966_1401052_1401263_1401350_1402078_1402260_1402363_1402701
909924	contig_8289_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_171180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGTTAGTCTCATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212646	210041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_-_210000_212600
909925	contig_1154_pilon	+	5173	5	Intergenic	novelGene_87042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1913	2260	58156	58503	TRUE	50	TAAGAAAAGTAAACAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKQITNFIWKGKRSHISKELLKNNNKVRSLTLPDFRTYYTATIVKTACYWYKRYVDQWNRIENPDTNLSTYEQLKFDKGPKPVKWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTP	56243	404347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_60238_209619_209623_401062_401889_403551_403797_404242
909926	contig_18869_pilon	-	4887	18	Intergenic	novelGene_56440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGAATAAACAAATTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160665	116855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_118816_119693_119919_121690_121891_127623_127762_128531_128981_130279_130426_132148_132284_136509_136664_137077_137254_138331_138510_139403_139476_141301_141429_141769_141943_142670_142885_151305_151510_153834_153941_159329_159477_160582
909927	contig_5894_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_83043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAAATGTTTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440761	443027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_440800_443000
909928	contig_8330_pilon	-	5772	1	Intergenic	novelGene_71894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	318	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACGCTCAACCAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087197	1081425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1081400_1087200
909929	contig_2730_pilon	+	2730	2	Intergenic	novelGene_135358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1131	junction_1	0	100	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATCACCAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291589	311920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344
909930	contig_7009_pilon	-	10777	1	Intergenic	novelGene_23655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	693	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	8592	9008	491660	491244	NA	15	CGCCACCCCCCACCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQWCCYLNCLNPKPPNQSHLHPSLSITNLSLSPFQTFFCFPITSHPSTSLKPLPLPDQVLPARYFLCTVWHMGLLVCIMWPLLSGSTFTLSHRSPKDQSSLMLLLSDLVYFQTFHGSAWLMGQKSHVLCHNPSTTGL	500251	489474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_489500_500300
909931	contig_9903_pilon	-	2428	7	Intergenic	novelGene_172007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.3148340498354	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	87	671	106166	82521	FALSE	15	TTCTTTTATGATTTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEGTEGPAIVWLENGRLTRPRDQGASAMFCEKAMELIRELHHTPEGQLPAFNEDGLRQILEEMKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEMEWFNRYKKSLATYMRSLGGEEGLDVTQDMKPPKSLYIEVRCLRDYGEFEVDDGTSVVLKKNSQPSSLRRLYFCLCTPPPTSLI	106252	80763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82584_85920_85996_89613_89731_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106091
909932	contig_7308_pilon	-	2537	10	Intergenic	novelGene_159604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_9	315.938109269662	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2271	265	2535	524476	496668	FALSE	20	CCCAGCCAACGTTGGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLPPLSTSLKPPAPPQGLVCKSPQPQNTSLPVQGVAPTTHSIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPVVDPPRTDRVLMKATAFSPRFSCISRLQRLMKLCTQKHQLDTDLFPHFGLDWSEESGEELEDSEQASPYQVAWSIRETLRYERHASDDDDTESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASREPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPATCSGTVKGEPCRNQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDSSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPTSVSLPVEASQIRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQAVTSLECLSTIGVLTQSDGVPVQELSDRGIGVFSTGTGASGIQSLSREVNTDLGELLNGHIVHDNFSSLELDENLLRSATLSNPPTPLAGQIQGQFS	544371	496665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_497021_499098_499257_500223_500442_502542_502677_503758_503869_506830_507056_511182_511292_518702_519449_524258_524506_544136
909933	contig_11318_pilon	-	3148	19	Intergenic	novelGene_48132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1007.36388658717	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	963	2822	34012	9367	FALSE	20	TTCTTTTGCAGAATTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPRKRKLVPLDYGEDDKNAAKGTVNTEEKRKHIKSLIEKIPTAKPELFAYPLDWSIVDSILMERRIRPWINKKIIEYIGEEEATLVDFVCSKVMAHSSPQSILDDVAMVLDEEAEVFIVKMWRLLIYETEAKKIGLVK	50227	9040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_9460_12152_12201_13455_13555_14072_14348_14720_15046_17444_17505_17555_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40609_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722
909934	contig_9189_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_165119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTACAATAAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359672	361342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_359700_361300
909935	contig_6403_pilon	-	1610	3	Intergenic	novelGene_139900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160.5	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	258	680	1118208	1117786	FALSE	20	GGTCACGATGCATTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDKQVVVDSSVGLYFRNEEGLVTLISHASKILLKIIRKWLLQYIDMEPPEIQAGFRRGCGMRDIIADIRWILAKGREYQKMFTCVLLTMQRPSTVWIIIIMDNISKNGNSRTINCAHAGPVHKPTGSHSNRTRRYYML	1136951	1116855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6403_pilon_-_1118341_1136753_1136812_1136884
909936	contig_15047_pilon	+	1626	7	Intergenic	novelGene_52213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2814.05288981331	4	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	20	586	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2636_2692_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
909937	contig_10324_pilon	+	3181	2	Intergenic	novelGene_7874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	266	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCCTACGAGAGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513012	517540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_516106_517452
909938	contig_7031_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_132803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCATGAACTTAAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348723	350777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_348700_350800
909939	contig_5864_pilon	+	1911	1	Intergenic	novelGene_162777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96749	98660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_+_96700_98700
909940	contig_10466_pilon	+	5211	20	Intergenic	novelGene_173619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_18	133.086979244107	392	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1477	4434	598	5031	74739	115485	FALSE	25	TTTATGTATGTTTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSPPPPPPPPPPPQPQPNLKRNPKHADGEKEDQFNGSPPRPQPRGPRTPPGPPPPDDDEDDPIPVSVSGDKEEDAPHREDYFEPISPDRNSVPQEGQYSDEGEVEEEQQEEGDDDEDDVDVEEEEDEDEDDRHTVDSIPEEEEEDEEEEGEEDEEGEGDDGYEQISSDEDGIADLERETFKYPNFDVEYTAEDLASVPPMTYDPYDRELVPLLYFSCPYKTTFEIEVSRMKDQGPDKENSGAIEASVKLTELLDLYREDRGAKWVTALEEIPSLIIKGLSYLQLKNTKQDSLVQLIDWTMQALNLQVALRQPIALNVRQLKAGTKLVSSLAECGTQGVMGLLQAGVISGLFELLFADHVSSSLKLNAFKALDSVISMTEGMEAFLRGRQNEKSGYQKLLELILLDQTVRVVTAGSAILQKCHFYEILSEIKRLGDHLAEKTSSVPNHSEPDHDTDAGLERTNPEYENEVEASMDMDLLESSNISEGEIEKLINLLEEVFHLMETAPHTMVQPPVKSFPTMARITGPPERDDPYPVLFRYLHSHHFLELVTLLLSIPVTSAHPGVLQATKDVLKFLAQSQKGLLFFMSEYEATNLLIRALCHLYDQDEDEGLQSDGVIDDAFALWLQDSTQTLQCITELFSHFQRCTASEETDHSDLLGTLHNLYLITFNPVGRSAVGHVFSLEKNLQSLITLMEYYSKEALGDSKSKKSVAYNYACILILVVVQSSSDVQMLEQHAASLLKLCKADENNAKLQELGKWLEPLKNLRFEINCIPTLIEYVKQNIDNLMTPEGVGLTTALRVLCNVACPPPPVEGQQKDLKWNLAVIQLFSAEGMDTFIRVLQKLNSILTQPWRLHVNMGTTLHRVTTISMARCTLTLLKTMLTELLRGGSFEFKDMRVPSALVTLHMLLCSIPLSGRLDSDEQKIQNDIIDILLTFTQGVNEKLTISEETLANNTWSLMLKEVLSSILKVPEGFFSGLILLSELLPLPLPMQTTQVIEPHDISVALNTRKLWSMHLHVQAKLLQEIVRSFSGATCQPIQHMLRRICVQLCDLASPTALLIMRTVLDLIVEDLQSTSEDKEKQYSSQTARLLALLDALASHKACKLATLHLINGTIKGDERYAEIFQDLLALVRSPGDSVTRQQCVEYITSILQSLCDQDIALILPSSSESSVSEVEQLSNSLPNKELMASICDCLLAMLANPDSSYNCLLTCVRTMMFLAEHDYGLFHLKSSLRKNSNALHSLLKRVVSTFSKDTGELASSFLEFMRQILNSDTMGCCGDDSGLMEVEGAHPSRTMSINAAELKQLLQSKEESPENLFLELEKLVLEHSKDDDNLDSLLDNIVGLKQMLESSGDPLPLSDQDVEPVLSAPESLQNLFNNRTAYVLADVMDDQLKSMWFTPFQAEEIDTDLDLVKVDLIDLSEKCCSDFDLHSELERSFLSEPSSPGRTKTTKGFKLGKHKHETFITSSGKSEYIEPAKRAHVVPPPRGRGRGGFGQGTRPHDIFRQRKQNTSRPPSMHVDDFVAAESKEVVPQDGIPPPKRPLKVSQKISSRGGFSGNRGGRGAFHSQNRFFTPPASKGNYSRREGTRGSSWSAQNTPRGTYNDSRGGQSNFNRGPLPPLRPLSSTGYRPSPRDRASRGRGGLGPSWASANSGSGGSRGKFVSGGSGRGRHVRSFTR	66495	115665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_66572_68814_68938_70440_70714_74613_75755_78890_79383_80439_80595_88556_88640_90875_90970_91099_91645_92151_92388_92890_93144_96276_96495_101068_101202_108620_108774_109226_109388_110046_110144_111109_111277_111744_112077_114517_114662_115330
909941	contig_9099_pilon	+	5479	29	Intergenic	novelGene_149887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_14	89.0572147554593	362	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1222	3669	150	3818	218770	362116	FALSE	25	TGGATACTGTATATCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGDDKSFDDEESVDGNRPSSAASAFKVPAPKTSGNPVNSARKPGSAGGPKVGGASKEGGAGAVDEDDFIKAFTDVPSIQIYSSRELEETLNKIREILSDDKHDWDQRANALKKIRSLLVAGAAQYDCFFQHLRLLDGALKLSAKDLRSQVVREACITVAHLSTVLGNKFDHGAEAIVPTLFNLVPNSAKVMATSGCAAIRFIIRHTHVPRLIPLITSNCTSKSVPVRRRSFEFLDLLLQEWQTHSLERHAAVLVETIKKGIHDADAEARVEARKTYMGLRNHFPGEAETLYNSLEPSYQKSLQTYLKSSGSVASLPQSDRSSSSSQESLNRPFSSKWSTANPSTVAGRVSASSSKASSLPGSLQRSRSDIDVNAAAGAKAHHAAGQSVRSGRLGAGALNPGCYASLGRVRAKLSAPLAGMGSAKTDSRGRSRTKMVSQSQPGSRSGSPGRVLTTTVLSTVSSGVQRVLVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVGPGYGISQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVADALKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSERSYSSRNGSIPTYMRQTEDVAEVLNRCASSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHGKVFSMFLETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAKVQKALDVTRESFPNDLQFNILMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPGDFVNSSETRLAVSRVITWTTEPKSSDVRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLRNTGNGTQGSMGSPLTRPASRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPSAFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFRSQEDMNEPLKRDSKKEDGDSMCGGPGIPDPRAGGDATDSSQTVLDNKASLLHAMPAHSSPRSRDYNPYNYSDSLSPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSNHNERVEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPMIRALALKVLREILRHQPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRAAEDAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQTADYPINLAAIKMQTKVIERVSKDTLNLLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHAVIGDELKPHLSQLTGSKMKLLNLYIKRAQTGSGGADPTADVSGQS	218620	363777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_218786_235166_235314_252152_252233_254418_254512_258009_258156_262920_263057_266421_266493_269764_269825_271536_271615_272220_272389_277019_277076_278300_278475_291553_291656_298023_298195_304225_304333_307780_308026_310698_310763_317447_317612_319277_319357_323119_323264_339866_340011_341164_341272_343109_343264_347621_347851_349109_349304_349803_349933_352095_352303_360160_360278_362029
909942	contig_6102_pilon	+	3550	3	Intergenic	novelGene_32183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	18	113	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCAGCTACATATAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867623	871478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_868068_868304_869697_869764
909943	contig_3170_pilon	+	2975	14	Intergenic	novelGene_178864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	36.7336486990547	230	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	765	2273	25207	41640	FALSE	25	AAAATCGTTGGCTGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYNHLQEIPVIALRNRLLLLHHISELFCPCIPMFDLDGCLHETGLGPSVGFDTLRGILISQGKEAAFRKVVQATMVRDRQHGPVVELNRIQVKRSRSKGGLAGPDGTKSVFGQMCAKMSAFSPDSLLLPHRVWKVKFVGESVDDCGGGYSESIAEICEELQNGLTPLLIVTPNGRDESGANRDCYLLSPAARAPVHTSMFRFLGVLVGIAIRTGSPLSLSLAEPVWKQLAGMSLTIADLSEVDKDFIPGLMYIRDNEATSEEFEAMSLPFTVPSASGQDIQLSSKHTHITLDNRAEYVRLAINYRLHEFDEQVAAVREGMARVVPVPLLSLFTGYELETMVCGSPDIPLHLLKSVATYKGIEPSAPLIQWFWEVMESFSNTERSLFLRFVWGRTRLPRTIADFRGRDFVIQVLDKYNPPDHFLPESYTCFFLLKLPKYSCKQVLEEKLKYAIHFCKSIDTDDYARIALTGEPAANDSSDDSDNEDVDSFASDSTQDYLTGH	17047	42342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3170_pilon_+_17228_20017_20180_22345_22434_22645_22786_24412_24601_25200_25399_32176_32261_36289_36432_36576_36772_38045_38159_38723_38915_39463_39570_39985_40199_41367
909944	contig_5954_pilon	-	4477	12	Intergenic	novelGene_28548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	49	384	606690	586610	TRUE	5	CCCCGGCCGGCGGGCGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERVATGGGSKESSVIMGNINSPPSTGLTFLQVLVIARTLSRGHQEVICVLEVVLSLSVGERPRRVVVVAMVVVVSMMVVAMSASRVVAVVSALSSTDGPSPTRRRWPSVRTLGSLSAASASTLSPL	606738	551265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_553828_555688_555814_556233_556616_557243_557434_559237_559413_559725_559847_573000_573183_578667_578838_582927_583018_586513_586837_589106_589190_606664
909945	contig_9471_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_21767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTACAACTTAAAGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395562	394182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_394200_395600
909946	contig_6576_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_42238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	534	881	249815	250162	NA	60	ATTTTAAAAAAAAAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKIQCGSLEKLRYIKGKISEEVELEMGQQKGKVQHEEVNRDGAYRAYSANSQASNMADRFDMFNRVPGQGLDWTAGHKGILTRSVPLSSSRYKRLNRQLLSIGEIGRQRGLAAS	249281	250264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_249300_250300
909947	contig_7045_pilon	-	3594	2	Intergenic	novelGene_77427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	286	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGCCTGATAGAGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209236	205286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_207582_207937
909948	contig_13295_pilon	-	3417	1	Intergenic	novelGene_31251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCCCAGATACATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128835	125418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_125400_128800
909949	contig_7119_pilon	+	2357	4	Intergenic	novelGene_40957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	117	1211	137033	139798	FALSE	30	GAACACTGATGGCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127541	140944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139254_139313
909950	contig_9921_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_23721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCTACAAACAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102337	104929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_102300_104900
909951	contig_1836_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_71078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1635	1991	991669	991313	NA	60	GAAAAAATAGGAAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEPLLNPGKLRREEINHRGKWERSLSMRMFTAKTGHADHLEIMIEDLKMGGKLYKYREFPNFWFCFSTIEPLQMKTYIERNNPVKEIVPLAVWLYKVLPDPVISQIKTTNSREKNQ	993303	990663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_990700_993300
909952	contig_14525_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_149762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGATGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140783	141445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_140800_141400
909953	contig_5602_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_132989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTTGGGACATTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23326	24543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_23300_24500
909954	contig_6445_pilon	-	3776	1	Intergenic	novelGene_77025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTGGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538270	534494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_534500_538300
909955	contig_15666_pilon	-	1853	5	Intergenic	novelGene_70213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_2	96.8410424355294	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	204	575	131534	130511	TRUE	40	ATACAACTGCCAAGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQG	132034	128417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_129110_129280_129375_130018_130795_131446_131711_132007
909956	contig_720_pilon	-	2609	7	Intergenic	novelGene_155166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_6	107.812594605434	449	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	83	1600	190635	162408	FALSE	15	TGTCCTGCTGTGATAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKKLGADFHGTFSYLDDVPFKIGDKFKTPAKVGLPIGFSLPDCLQVVREIQYDFSLEKKTIEWAEDIKKIQEAQREAERKAEEAEATKVNSKSGPEGDSKMSFSKTHSTATMPPPINPILASLQHNSILTPTRVSSSATKQKVLSPPHTKADFNPADFECEEDPFDNLELKTIDEKEELRNILVGTTGPIMAQILDNNLPRGGSGSVLQDEEEVLTSLERATLDFKPLHKPNGFITLPQLGNCEKMSLSSKVSLPPIPAVSNIKSLSFPKLDSDDSNQKTAKLVSTFHSTSCLRNGTFRNSLKPSTQSSASELNGHHTLGLSALNLDSGTEVPALSPSSQTPSLSVLSLYTEESSPPNTGPMVTPPNFSMSQVPNTSSCPQAYSELQTLSPSERQCVETVVNMGYSYECVLRAMKKKGDNIEQILDYLFAHGQLCEKGFDPLLVEEALEMHQCSEEKMMEFLQLMSKFKEMGFELKDIKEVLLLHNNDQDNALEDLMARAGAS	221872	161398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_162549_163166_163269_163993_164177_179283_180217_183857_183983_190601_190643_221797
909957	contig_6743_pilon	+	3737	4	Intergenic	novelGene_33535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	349	705	57105	57461	TRUE	35	CAGATAAAGTAGGCCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWILLRLVLWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGCSVRYMSVRSSRLLVAFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVLKSPTTTVELSISLFNAVRVCFMYFGAMSLGA	56756	66117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_57996_58167_59570_64438_64994_65576
909958	contig_14525_pilon	+	3424	14	Intergenic	novelGene_149784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_2	43.6761887927006	97	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	473	3313	240524	277363	FALSE	30	TGTTTATTTTATTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSDGKEKSEKEKLKNSRGSGNSNEGNSEEYIDLRLKHCLAYVLHTSGTTGIPKIVRVPHACIVPNIQHFRMLFEITQEDVLFLASPLTFDPSVVEIFVALSSGASLLVVPTSVKVLPSKLAAVLFSHHRVTVLQATPTLLKRFGSQLIKSTVLSASTSLRVLALGGEAFPSLTVLKNWRGEGNKTQIFNIYGITEVSSWATVYRIPEEILNSTVKCELPVQLGFPLLGTVVEVRDTNGFTIQEGNGQVFLGGRNRVCFLDDEMTVPLGTMRATGDFVTVKDGEMFFLGRKDSQIKRHGKRLNVELVQQVAEELQQVESCAVTWYNQEKLILFIVSREDLVKDYIFKELQEHLPSYAIPDELVLIDALPFTSHGKIDVSELNKIYLNYMNLKSDCKLNGKEELWGKLQHLWKSVLSLSEDPSMIPKESLFLPSGGDSLKSIRLLSEIENLVGVSVPGLLEIILSSSILEIYSHILQTVFADEDLPLSKSYATKRKFSDINQEEADGKSSHQKCGMPLNCDNAINAFIALNRGSQILSLNTTRFLTKSGHCPSACSSDLTSQINIQNVKSINPPPIIEKSEKPSFVAKVSEEEKPVIGAEKLELRVRWRSDTGKCVDASPLVVVPAIDKSSATVYIGSHSHRMKAVDLYSGKVKWEQILGDRIESSACVSNCGNFIVVGCYNGLIYVLRSNSGEKHWVFTTQDAVKSSATMDPTTGLLYIGSHDQHAYALDIYEKTCVWKLKCGGTVFSSPCLSLIPHHIYFATLGGLLLAINPATGDRVWKHFCGKPLFSSPHCCLQYICIGCVDGNLLCFTHFGEQVWQFSTNGPIFSSPCTSASEQEIFFGSHDCFIYCCNMKGHLQWKFEATSRVYATPFAFQNHNYSDETLLAAASTDGKLWILESKSGQLQSVYELPGEVFSSPVVWESILIIGCRNNYVYCLDLLGGNKK	234637	277474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234736_235512_235779_240415_240736_244876_245070_255509_255752_256129_256237_256782_256956_257389_257583_258438_258555_260123_260920_272787_272952_274254_274378_275133_275266_276973
909959	contig_13412_pilon	-	3229	11	Intergenic	novelGene_80026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2463	2945	736960	734104	TRUE	20	AGGGCTGCGTGCCAGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLVGIGHIGAVVQVVLVAVFINILIAVTGISNAVRIRVQLIWIVFQRTVITLISNPIHIHIPLVNIVHILAVVSFIEDAAVNVCCAGISFPVVVCVSLIWVVVVGTVVTAVSHVISVIVILGWVVMEWTVVLVIWDFIVVIVVITGITNSILVIVFLP	741232	732727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_-_732763_733390_733614_734077_734186_734772_734931_735095_735213_736834_737067_737241_737407_737629_737927_738357_738456_738558_738700_739577
909960	contig_15405_pilon	+	907	5	Intergenic	novelGene_112089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_2	33.4402452144119	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	202	906	15650	31128	FALSE	60	CTGCAAAAAGAAGGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDDYQPVRLLSIPGELRREYEEEIRKVEAERRASEEEENKASEEYIQRLLAEEEEEEKRQAEKRQREMEEQLKSDEELARKLSININNFCERSISASPLNSKKCDSITVKSQKKSKNHQRNAGDIQKYLSPKSQFGSASQSEVVQEDRKSSMSKEIDSRDLTSPTWQDTEIEEDMPTLSPQICLEIEEQGAWSSAESPMPQLSACGSEWCLEGEVKTRPDNHDKELCVADHEQPTTRIPYSREAAVKPGGKTESELSISDITEIIGNNMVETKDEETSLWISSNDISKRKDQESEAVKDPCF	12945	31129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_13024_15526_15707_18310_18433_27711_27794_30684
909961	contig_8538_pilon	+	576	3	Intergenic	novelGene_4637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4416	255	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	67	528	841232	843061	FALSE	30	ATAAAGTTGTTGCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRGRCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840311	843109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228_841575_842942
909962	contig_7408_pilon	-	6410	1	Intergenic	novelGene_168750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	5512	5811	29463	29164	NA	30	AAAATTGGGTTTCTACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFHNICRIFKTRKKPRTNTINTLLNGKTLKAFFLRLGTRQAYELSSFFPNILLEFLANALRQEKEAARKIGKEYIKLLLFANYMVVSIKIPKEYTDIS	34974	28564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_28600_35000
909963	contig_5954_pilon	-	2889	8	Intergenic	novelGene_28759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1727.97110000398	10	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	144	977	1462068	1392815	TRUE	25	CAATAATGGTGGTGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCAVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLIPNCSFSAFQLSMRSTRPRLTTMWAWPGIRPNQLLKRSKQKSLESPKKRQNKHLETRNASVTKTSFNSYNIITCTMKARAQCQLEPAFQAYFF	1462211	1390854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391647_1391694_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396507_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1461926
909964	contig_1725_pilon	+	2713	18	Intergenic	novelGene_24265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	566.696283912902	11	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	78	1505	201480	248624	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFWRRSTK	201402	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_248599_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
909965	contig_18491_pilon	-	4173	1	Intergenic	novelGene_176622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1983	2306	24087	23764	NA	30	ACCACAGGCTGATTCTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYEKVVSRSFQQETEQLVTSDICSPTPHTYSPPLSLLCFLRPQVSWPGSTDFTLVSLGFHAPTLAGSLSAICWQLVLLFPTSLDFFLTSHHLSLKYLAPCAIFASS	26069	21896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_-_21900_26100
909966	contig_14505_pilon	-	1740	9	Intergenic	novelGene_171961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	95.8758963452233	180	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1288	1698	13856	12394	FALSE	40	GTAGATAATTATGTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQSEIQHLSSKLERANDTICANELEIERLTMKVNDLVGTNMTVLQEQRQKDEELKESEKLLEILREEKRELKAALQSQENFIREARLQKETLQAKLRLTDTRHVTGRASVGKEVQLSRARGLRKCALPAGFHPH	61807	12351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14505_pilon_-_12490_13294_13418_13664_13899_30912_31027_36707_36827_37699_37796_45097_45276_46479_46549_61138
909967	contig_7513_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_88931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2	328	30133	30459	NA	40	TTGGTCAAAACATTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLYTAADSLSLYLYLFRACSPPDLKLTERRTASGLPHWICKGSQTATPRPVPHPCCGVRNEGKCEPASFLEAPTSLKSGPDFRPVTQPFFSLRFRLCKWEKLHLAPEL	30131	31513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_30100_31500
909968	contig_5791_pilon	-	3157	1	Intergenic	novelGene_35836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039525	1036368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1036400_1039500
909969	contig_8597_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_158713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCACATCACAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99534	97037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_97000_99500
909970	contig_13593_pilon	-	3092	2	Intergenic	novelGene_156130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTGTGCCTCCATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81213	77484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_77668_78304
909972	contig_14450_pilon	+	3851	3	Intergenic	novelGene_48973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3290	3652	1042420	1042782	TRUE	5	AGGTGCTGCCGCTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFHTCLLGADVSPVALMVTSLRVQPRVSDKLEEATVILAFSVLSSENEKLFVKQLSVNMSSMASISFKNKILKGPKTKERGKLKKKKKERKENQTKKEKKKINKLLILPQIIRNLLTC	1038973	1043026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1040583_1040739_1042833_1042877
909973	contig_9706_pilon	+	2706	12	Intergenic	novelGene_20934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	660.847014716344	133	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	372	1352	231608	365707	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQVSSEGHHI	231236	367061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363789_365684
909974	contig_3588_pilon	+	1145	6	Intergenic	novelGene_72867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	544.30248943028	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	238	660	90170	117203	FALSE	20	TTATTGAACTCCTCTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGFWILSKLSQEINKNEERRSIFTRKPQVQRFPEETESHEEDEGGWSSFEDDYESPTEDQDGEDDNDYESPNEEEEEPVEDDADYEPPPSNDEEALQNSILPAKPFPNSTYIGKGPLPDFCPWQPRAKLPTAAREAVA	84463	117688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_111722_111789_112221_112254_112913_112952_116933
909975	contig_11978_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_63020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	352	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTACAAAGGACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591847	1597012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592065_1592187_1592303_1595888_1595987_1596303_1596391_1596971
909976	contig_3707_pilon	-	4126	2	Intergenic	novelGene_173432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTCATTTATCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745130	740922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3707_pilon_-_741045_741126
909977	contig_6175_pilon	-	4142	2	Intergenic	novelGene_16308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	81	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	139	519	1456465	1456085	TRUE	20	CTGGAGGAGCCCTAGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRELNLSVLSLVVPGITTEQQPHAFGQEVGSRGTGPRSTLSSEKLILSGNRSGRAPGQWSRGLLLMEGHFLLCNAETSSEVNQRWLLVVATPSCQGDIRKVSNRRGQKPRLSKQSRHDCVYFHRK	1456603	1451223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1454116_1455353
909978	contig_12050_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_62619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAGTTTTGGGCTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324991	323226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_323200_325000
909979	contig_4301_pilon	-	3421	1	Intergenic	novelGene_65127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTACCAACCACTGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544437	541016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_541000_544400
909981	contig_4924_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_84728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120527	122741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_122418_122556
909982	contig_15323_pilon	+	3611	1	Intergenic	novelGene_148523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	337	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATAAAAACAGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96558	100169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_96600_100200
909983	contig_20693_pilon	-	3313	12	Intergenic	novelGene_60246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATATGGTTCCCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35163	14710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_-_14791_19345_19469_20341_20419_21179_21260_23922_23999_25832_26022_26224_27525_27886_27969_28864_28996_29787_29965_32925_33013_34252
909984	scaffold_880_pilon	+	2030	2	Intergenic	novelGene_121478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	697	1017	485508	485828	TRUE	40	AAAAAAATTTTTTGTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSPLCHLFQWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAEVTGELAVHCSEWPRSPTTFPDPHVLVLNLTQDACPVSERLSVSTQCLLRAPRTDKTQTRCC	484811	489055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_485872_488085
909985	contig_5686_pilon	+	5534	1	Intergenic	novelGene_45373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3097	3411	143970	144284	NA	20	TTACTCACTGTTCTAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIIIIIPIITTTKTVAIESIPTHGDPMCVRAELCSTGFSVTAFSEVDHQAFLPRAPLRGLELPAFQLAAKCVNCLHYPGTPNNNTINFTECVPSAGIYKFDVA	140873	146407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_140900_146400
909986	contig_11117_pilon	-	2703	1	Intergenic	novelGene_148593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCAACTGGCAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84551	81848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_81800_84600
909987	contig_14397_pilon	-	5327	3	Intergenic	novelGene_134643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1149	junction_2	7	5	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGATATAAAACCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94309	73247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_78179_91746_91805_93971
909988	contig_7840_pilon	+	2664	4	Intergenic	novelGene_69015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.34209919681348	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	561	1328	303444	304775	FALSE	15	GCTCACGAAGGGCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVGRADSASCNGRPTKRTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	300874	306111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_301257_303007_303155_303412_303496_304059
909989	contig_7720_pilon	-	3344	1	Intergenic	novelGene_155789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2277	2663	829012	828626	NA	40	ACATAGGCATGATTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCWAPLAERQFHHITSASGFLQSDCPRATLGAAGTAGGPNPNPCLLPPYQETGPSQQGAPGLGRGPQAHSLVNCTQPVCVRAGTKGLCSCYKDQEALSTGAETQQVRGRPGFGPKGWTPNPGISPLC	831288	827944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_827900_831300
909990	contig_9668_pilon	+	3763	4	Intergenic	novelGene_58097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAAAAAAAACCTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173309	559328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_173848_316221_316332_556033_556625_556804
909991	contig_6445_pilon	-	1516	15	Intergenic	novelGene_76883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_11	426.757183744517	75	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	41	1279	88578	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATNAWAPLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96331	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
909992	contig_13292_pilon	+	2860	1	Intergenic	novelGene_142977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGGCCTCCCTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553958	556818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_554000_556800
909993	contig_13241_pilon	-	6093	5	Intergenic	novelGene_158910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	298	junction_2	138.266725932163	385	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	59	2053	200323	180980	FALSE	30	CGACACTAAAGGAGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRDKYCQTDHHHHGCCEPVYILEPGDPPLLQQPLQTSKSGIQQIIECFRSGTKQLKHILLKDVDTIFECKLCRSLFRGLPNLITHKKFYCPPSLQMDDNLPDVNDKQSQAINDLLEAIYPSVDKREYIIKLEPIETNQNAVFQYISRTDNPTEVTESSSTPEQTEVQMQEISTEQSKTVPVPDTEVEAIEPPPVEIVADEVVATPDEQPQESQADLETSDSSDFGHQLICCLCRKEFNSRRGVRRHIRKVHKKKMEELKKYIETRKHPNQSSKGRSKNVLVPLSRSCPVCCKSFATKANVRRHFDEVHRGLRRDSITPDIATKPGQPLFLDSVSPKKSFKTRKQKSSSKAEYNLTACKCLLCKRKYSSQIMLKRHMQIVHKITLSGTNSKREKGPNNTANSTEIKVKVEPADSVESSPPSITHSPQNELKGTNHSNEKKNTPAAQKNKVKQDSESPKSTSPPAAGGQQKTRKPKLSAGFDFKQLYCKLCKRQFTSKQNLTKHIELHTDGNNIYVKFYKCPLCTYETRRKRDVIRHITVVHKKSSRYLGKITASLEIRAIKKPIDFVLNKVAKRGPSRDEAKHSDSKHDGTSNSPSKKYEVADVGIEVKVTKNFSLHRCNKCGKAFAKKTYLEHHKKTHKANASNSPEGNKTKGRSTRSKALV	200381	176939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13241_pilon_-_180981_182182_183876_186100_186245_194910_195007_200262
909994	contig_6503_pilon	-	3870	6	Intergenic	novelGene_145799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	23.5423023512995	200	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2572	3102	1400961	1400431	FALSE	60	AAAAAAAATAATAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSDSGPAAAEKQQQQRSSSSRTRRPVRDGTGADSRSQRAECLCAGGFLAEWGASGHLHRWSYRALEHLPQQGRCEHEARGPRGHRKQKLKRKGTQEAELPRSQVSEGMAMTSGVSKGGAIASGVSKGGVVTPMDWENGAPKAKGAKLLSQWAWKAELKPRAKRPPLKIQRLANT	1429499	1399662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_1402897_1415203_1415338_1417671_1417744_1423697_1423797_1425476_1425558_1429249
909995	contig_10627_pilon	+	6570	3	Intergenic	novelGene_59971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	382	junction_2	87.5	18	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	5504	6082	224634	226147	FALSE	10	TTCCACCCTTTGGCCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFHTFCVVLLVFGSLSEAKFDDFEDEEDLVEYDDNDFAEFEDVMEDSVTQSPQRVITTEDDEEETTVELEGQDENQEEDFEDADTQDGDTESEPYDDEEFEGYEDKPDTSSSKNKDPITIVDVPAHLQNSWESYYLEILMVTGLLAYIMNYIIGKNKNSRLAQAWFNTHRELLESNFTLVGKCLSHVVLL	219130	226635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_224898_225352_225461_225940
909996	contig_7411_pilon	+	4050	2	Intergenic	novelGene_136993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGGCTACTTCCGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224443	232074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_227821_231401
909997	contig_11396_pilon	+	2297	9	Intergenic	novelGene_71376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	165.916347521876	7	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1944	354	2297	1074136	1092791	FALSE	45	AAAGAGATTTTGTGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKPGQPGKESSGMDDKGDPSSDEAPKAIKPTSKEFRKTWGFRRTTIAKREGAGDAEADSLEQVPQPPQQSLSLRRSGRQPKRTERVEEFLTTVRRRGRKSVPASLEDSAELTSCPVTDVETASEGSVESTSEIKGGPKSGAPDVKERPTSSEKAKGGDEEDDTSDSDSDGLTLKELQNRLRRKREQEPTDRPLKGVQNRLRKKRREEDPTETVDVEAGDAVESPPPSKPEPEADQVAVFQVARDDKESKPEGRAAQGLKEEEPRESIKHKPECEVYDPSALYCLCRQPHNNRFMICCDRCEEWFHGDCVGISEARGRLLERNGEDYICPNCTILQVQDETNSETTDQQDPKCRHGDADGTDFTSIGIVEQKSSEDQGIKGRIEKAANPSGKKKLKIFQPVVEAPGASKCIGPGCCNVAQPDSVYCSSDCILKHAAATMKFLSSGKEPKPRLKEKLKTKPEKLSLPKCTVQAGIKISSMHKRPAPDKKENIVKKTVVAPSRSDAPVTETTPGSSTPSWASDHNYNAVKPEKTAALPVSLLCKSVKDDKRAREKRVAAVTVPKKTAPSGPALSKQPPLSGNLALKKSPAFTRMSAAKQATKKSPSGFKGTIRPPSAPGASPAPGRLGAASPAPSQPNSQIRQNIRRSL	1048438	1092791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1048543_1072807_1073003_1074081_1074176_1075158_1076000_1076764_1077087_1080463_1080677_1082046_1082261_1092330_1092535_1092681
909998	contig_4180_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_8331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAAGAAGGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819906	822457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_819900_822500
909999	contig_14357_pilon	-	3390	12	Intergenic	novelGene_121649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	267.253709898563	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	457	1842	468468	454808	FALSE	5	TGTTGTGTGCCAGGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDFLLPLSSEVKTDHGTDKLVESVSQPLENHGASVIGHPSESLSTKSCGTLRPVNGVINTLQPVLADHIPGDGSDAEEQLHKKQRLNLISSSLDGTCVAARTRPVLSCKKRRLVRPNSIIPLSKKVHRNSTVRSGCDVNPSCALCGSGSVSTMPPEIHYEAPLLERLSQLDSCVHPVLAFPDDVPTSLHFQSMLKSQWQNKPFDKIKPPKKFSLKHRAPMPGSLPDPTRKDRHKLVNSFLTTAKLSYHQIRPDRTHRQHLDDVGAVPMVERVTAPKAERLLNPPPPVHDPNHSKMRLRDHSSERSEVLKHHTDMSSSSYLAAAQHPPHSPLVRQLSTSSDTSAPTSSSSQVTAGTSQPIRRRRGESSFDINNIVIPMSVAATTRVEKLQYKEILTPSWREVDLQSLKGSPDEENEEIEDLSDAAFAALHAKCEEMERARWLWTTSVPPQRRGSRSYRSSDGRTTPQLGSANPSTPQPASPDVSSSHSLSEFSHSQSPRSPISPELHSAPLTPVARDTLRHLASEDTRCSTPELGLDEQSVQPWERRTFPLAYSPQAECEDLLDAQERAARCTRRTSGSKTGRETEVAPTSPPVVPLKSRHLVATVTAQRPTHR	495021	453259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_455036_455317_455571_456379_456493_456691_456750_457400_457523_461010_461160_461503_461693_462177_462361_468377_468550_487291_487488_488234_488354_494961
910000	contig_5316_pilon	+	1572	9	Intergenic	novelGene_61215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	171.927628306215	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	460	1479	511584	550408	FALSE	40	TGCCGTGTGTGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396042	550501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453778_453940_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
910001	contig_17427_pilon	+	2109	8	Intergenic	novelGene_30291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.468476480058	7	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	2	808	147949	175576	FALSE	10	ATCCTTGGTGTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMQDRLGLKEMDNAGKLVFLAIEGDHLQLSEEWLDAHIIPFLK	147947	176877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172264_175450
910002	contig_9482_pilon	-	2401	2	Intergenic	novelGene_44274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	393	488	1100378	1100283	TRUE	5	GCCTAGTTTTTTTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKSPDGDSAAPHPQPSFLLSAAVAESPPGSRRHQHGIAGATLRHLLAGPQPVSQWAAWRRPLSARPAGCAALCEGVGARFPWFSVSFCLQNKTADKTNLVSFIQKEAGRAGLVIGVQGSVIGNVLNVSVMWTFNPEVSLDPELPAGSVENWGEQLCPQPT	1100770	1098276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1099065_1099157
910003	contig_18859_pilon	+	4301	14	Intergenic	novelGene_150524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	295.288526037615	213	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1423	4269	31	4299	28869	67685	FALSE	60	GGAAAAGAAAATAGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLPGGGKLRMAAPVSFPLLVNGSWGPDPPKNLRTKLQVYFQSPKRSGGGECVVREEPGSPLAFLVLFSREDVRQKVLERENHELVWPEKGTFKLTVQLPTPPDEICDVSGRKIPTKESKTKEDARKTDSDVSEELDGKLSLNRRAEKMEDVAEECENIPSSFAFENLKENVTDVMLTLLVENVSDLSANSDFQVELIRDCNVAVVTFQKHIDTMKFVDDCAEYHLAKQLQLSPRLLEVTKTIRIENLPPGVEEYYLKLFFENPHNGGGTVDRVEYFPKESSALIEFSDRKVLDTIMTKKLVFNNMPLSVFPYYPSLGTALYGKEKPLIKLPAPLEVSLALPIWKFLQKKNHLIEEINGEMGHCHCELTWPQLNSVVTIRPAATLVNQGRWTINSWSEDAAAAFSVILSKYQDITFHVDPIVWDNIENDLEDDRILIESDTLKQTVTFVGKSEDIQSIQPQIKKLIESITQKIKREEQSLKEKAAVSPGRYSLLCHSGFLEGLRKECPEVEISYDAGIGLICLNGLRADVYKMKCEIQEKVLTMVQKSIQAPPEVFQFLQQVDCEEYSESLLIAKKILAVFTLEGAAVHLTSCSPEVLLKAEEQMVNALNYRLIEVEDRDVLKDKRWKRHVSTSLKKHNSSSKTVIIDEVTSESTAKVIIAGCATNVNETYDFLSDFAEKHTKIERMIELNSPLVAEYLKMEKKLILSQIKSRNVRVIFNPENNKKGVLLIGPKAEVLDGMNIIKKTWDSVCIRSISIDKPGASYLFQDRERYYISEARRQFGCCIALQKDEDRKEGGSASGKQCCARVCLAPGVSLVVQQGDLTQFPVEVVVNASNESLKHSGGLAAALSKAAGPELQSDCDQIVKRKGKMAPGNAIISKAGNLPYRHVIHAVGPQWKADDPPRCVYLLRKVVEESLCLAEKHKYRSIAIPAISSGVFGFPLHRCVETIVLTIKENFQNNANGRTLKEIYLVDRSEKTVKAFAETVKTVFKDTVPNTASLPSVPAAERTRLRKGSEDSNTLMSPEGLRVHLVRGDVQAVRTDVVVNSIPLDLGLNGGPLSRALLEKAGPELQVELDKTGQGVTVDVGTVLQTSGCNLHCQHVLHVVPLEWGSDNTSSRKIMEDIIKKCLEITEKLSLKSITFPAIGTGNLGFPKKIFAELIISEVFRFSSKNQLRALKEVHFLLHPSDHGNIQAFSDEFARRADGNLVSDKIPKAKDTQALYGTVSSPHLGVHEMKIGSIIFQVASGDITKEEADVIVNSTSNTFNLKAGVSKAILEGAGQGVERQCSLQLQQGKTDYIVTGGGLLKCKNIIHVVGGNDVKKSVSCVLQECEKRNYASICLPAIGTGSANQDPDKVAKAIMDAIEDRIQKGSVHSVKQVKVVILLPQVLNVFYANMKNREGSQTSPRQSMITKLKAFFNSSWQAPKKQASLV	28838	67687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_29056_33257_33392_34322_34357_39738_39991_42502_42740_46060_48310_50960_51198_51818_52041_54990_55070_57387_57538_63025_63089_63427_63596_67346_67554_67635
910004	contig_7106_pilon	+	3979	1	Intergenic	novelGene_148321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	500	802	643125	643427	NA	40	CATGAGAGAATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWLSEVEVSIFYKHIVIANMLHSYAWTWKVYNLEFTAAILPVLALQYRHPYGQHATQFGRKSKTTTTKKRKKGLCTVLYIFPYFFKTKTSPVHHKLSTT	642625	646604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_+_642600_646600
910005	contig_1406_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_25483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311050	1313494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1311000_1313500
910006	contig_9653_pilon	-	4274	28	Intergenic	novelGene_48216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	94	junction_27	480.715849951987	1890	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1115	3348	126	3473	544351	509213	TRUE	20	CTAATTTAGTGTTTTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVKYFTFSFPQSITIEE	544476	507074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_507485_508175_508283_508928_509456_509787_510001_510109_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513575_513728_516115_516269_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_530278_530455_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_543009_543086_544336
910007	contig_13379_pilon	-	4660	9	Intergenic	novelGene_175875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAACAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193172	162963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_165606_168314_168490_168954_169183_172628_172852_176085_176298_178945_179173_189769_189861_189942_190018_192385
910008	contig_2487_pilon	-	2208	6	Intergenic	novelGene_148452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_3	259.524488247256	26	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	248	1072	221828	104086	FALSE	45	TCATATGCACAAAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLLRRNNGPASQHSWRGFVQFAPGAVSSLPPFSPPHFAASSCFFFSPFLAKTTNKTSQIEPACCRSRAPSPCELPSDPLLSMKQPIMADGPRCKRRKQANPRRKNVVNYDNVVDTGSETDEEDKLHIAEEDGIANPLGQETSPASMPNHESSPHVSQALLPRDEEEDEIREGGVEHTWHNSEILQASVDGPEEMKEDYDTMGPEATIQTTVNNGTVKNANCTSDFEEYFAKRKLEERDGHAVSIEEYLQRSDTAIIYPEAPEELSRLGTPEANGQEENDLPPGTPDAFAQLLTCPYCDRGYKRLTSLKEHIKYRHEKNEENFSCPLCSYTFAYRTQLERHMLTHKPGTDQVGGWF	224580	102949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_104319_105009_105199_128409_128482_133370_133629_221755_221898_224402
910009	contig_8687_pilon	-	2281	5	Intergenic	novelGene_169674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATGCGAGGCTTCGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340242	318360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_319545_322800_322935_328569_328668_329956_330143_339563
910010	contig_8598_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_22867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	453	782	3506	3835	NA	80	TAAAAATAAAAAAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVCEFCVANVMIIKPSRKVESAVGGTVGVRIGKMVERGGLSGLHLMRVSLALLILVLLPPCGVGGGQHCPHAIFRTSIATTREMQVKMTMRYYFTPTKVAIINTIYF	3053	5950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_3100_6000
910011	contig_6488_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_44733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	716	1090	54113	53739	NA	30	AAGGCAACCCTAATTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQVKSGKINRGGECMCVCVCVCVCARAYACKLVNGGRKGEQFCGHPGILQ	54828	53589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_53600_54800
910012	contig_1535_pilon	-	1317	4	Intergenic	novelGene_127224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_2	466.183321118301	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCCCCAGCAGCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48213	40618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_40707_41658_41853_45799_45915_47293
910013	contig_13051_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_140115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGTCTCAACAACAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229141	226572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_226600_229100
910014	contig_12970_pilon	-	6989	2	Intergenic	novelGene_50508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1818	2210	36831	36439	TRUE	65	GAATGGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTFLYGKKKLFPFAPAQSIPPQTTNIPHPLVSSRIKKKKKKKKTPSSHILLQLWSLFYAPLSKQNSLTELVTAATFSTHILLATHSSQASICTIPMKIYLSRSPMTTTLHIQWSFLPFCNMTNLTPHSS	38648	29034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_32877_35501
910015	contig_10005_pilon	-	5075	2	Intergenic	novelGene_148915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTTACTTTCTCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178436	130098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_134318_177580
910016	contig_3627_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_78544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCTGAGAAAGAAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657316	654669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_654700_657300
910017	contig_8412_pilon	+	2247	2	Intergenic	novelGene_118377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643204	646393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_644426_645367
910018	contig_14405_pilon	-	3329	16	Intergenic	novelGene_85661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_15	169.861852365058	135	92	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	672	2019	286	2304	995902	726183	FALSE	45	AAGAAGAGTACTGTTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNEYQGGAFVEIFSAQGKNPAAKWKIFGSPSVIWKEFDKEVKSFVFVLEGSSQTNKIQLPKENKQILGLIQRFLVLQIYVPLGQDFSTELLITDLGNIKRRLYLSTVHKELSSTPLHAKIPLFMIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDDEPTDIIPRSCQLTTDVPQVTQLLNMTKLRQTEIQFGGHPLRSAESDQFIHRGGSVRNNKSQDVCHIAFGSKVLGPPPLSGRRNNMRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPRDWLSVFSPPIVPPSQQPTEQRLESSGSLSAQGEDELNVEEDEEVLTLLYDPCLNCYFDPQTGKYYELV	996187	725157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_726296_740543_740639_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827971_844997_845136_866566_866724_885904_886020_979091_979165_989814_989909_993288_993379_995881
910019	contig_11258_pilon	-	1218	3	Intergenic	novelGene_67860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	51	422	353988	353617	TRUE	45	ACATTACCTATAAACTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPSQCPPTLSSTWEYPCRIKVLILQEIHSAATLSRAISLSGAAMQSSLRHCSVAQWGRESGTGTITVQCVLRQTDIQSIADSSSQGVRTQRVTLCHGVREGSLGELTSLLCLDAGEGGAES	354550	352737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_353516_353598_353999_354510
910020	contig_14326_pilon	+	1938	3	Intergenic	novelGene_120675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	60.5	98	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTTTTTCATTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108528	115265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_110160_111831_111935_115061
910021	contig_4803_pilon	+	2073	19	Intergenic	novelGene_150713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAGATGCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17621	48677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_17650_19567_19664_20124_20169_21584_21678_23597_23714_27344_27441_30768_30847_31014_31065_33243_33328_33806_33908_37477_37574_39338_39438_40572_40618_41848_41933_45460_45566_46891_46980_47113_47207_47702_47742_48039
910022	contig_9706_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_20772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCGGGTCGGGCTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	818	161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_200_800
910023	contig_8060_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_104835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAGCAAAAATGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216490	218679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_216500_218700
910024	contig_11816_pilon	-	2137	2	Intergenic	novelGene_98459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1168	1698	408873	408343	TRUE	35	AAGCAGTTTGCCAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYTDQEVVVQTEKWDTVWFKVREGVRQGCILSPHLFNLHADQIIREAGLYEEKTRHQDWRKTHQQLALCRRHNPACRKRRGLEAVTDEDQKPWASVWIHLNIKITKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRCTALANLLQKTSLKC	410040	405737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_405989_408154
910025	contig_1090_pilon	-	2909	7	Intergenic	novelGene_131140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1236	1667	487999	486358	TRUE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCGRIHSTVHYQMDGFPFIGNRSMSNDWIVTIGTFESSFGYFCKAEIRQAFTFWKNIVSLVWEKCDFIQFMKMILPTVASIKPTGQDVAGLVTELISKPGICTSLITVRDTTYPSTKLPGLSNSNTAGAPTSCNIATASTVA	492827	481459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_481993_482797_483383_485103_485228_486357_486564_487773_488876_491873_492069_492663
910026	contig_6302_pilon	-	3502	2	Intergenic	novelGene_171684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTCAGTGCCAGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103373	38772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_40225_101323
910027	contig_10323_pilon	+	502	4	Intergenic	novelGene_123620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	179	502	473509	531243	FALSE	5	ACCCCGGCGGGTCCGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDVSPLPLREDVPPREARVAADKLGMLRDPFSVKSFSGLSSTSFCCRSNSFMRISRASARAARFAASLASACRCASGLRQSSSVLCTAGELAIAPATLASDGGSEH	473330	531243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_473603_474207_474243_513274_513367_531140
910028	contig_149_pilon	+	557	1	Intergenic	novelGene_173785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73649	74206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_+_73600_74200
910029	contig_5260_pilon	-	2945	1	Intergenic	novelGene_144397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCATTAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451043	448098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_448100_451000
910030	contig_11754_pilon	+	3613	2	Intergenic	novelGene_176977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	2508	3272	49660	50709	FALSE	55	ATCCACAAACAAAAGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSDKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTLRVIRIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKHEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	47152	51050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_+_49752_50036
910031	contig_11422_pilon	-	1429	2	Intergenic	novelGene_99065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2348	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1758_1932
910032	contig_14618_pilon	+	2312	1	Intergenic	novelGene_136848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGGCAAAGAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1242610	1244922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1242600_1244900
910033	contig_19402_pilon	+	2745	4	Intergenic	novelGene_80810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACTGAAAGCACAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69052	170027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_71521_117127_117320_162070_162124_169995
910034	contig_10482_pilon	+	3468	2	Intergenic	novelGene_152816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83772	87281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_84205_84245
910035	contig_9098_pilon	+	2279	2	Intergenic	novelGene_75805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCTGTTCTATGAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290509	292836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_291864_291911
910036	contig_2278_pilon	-	4055	2	Intergenic	novelGene_118153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	362	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTCTTTGCCGGCAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492811	1488636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1492435_1492554
910037	contig_2204_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_71652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	148.134792222039	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	30	347	13204	25639	TRUE	55	CAAGGTAAAATTCTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKIFQIPWMHAARHGWDVEKDAPLFRNWAIHTGKHQPGVDKPDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDKSIKKGNNAFRVYRMLPLERRQRQKKKTELSTSSKNQLSHLWGLVME	13174	50996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14896_15422_15470_25596_25715_38679_38845_48673_48717_49912
910038	contig_5084_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_64686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAATAAAAAAAGAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1811531	1810089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1810100_1811500
910039	scaffold_12124_pilon	+	3423	10	Intergenic	novelGene_22093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	209.604919365511	109	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCGTCTAGTCAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860112	892103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_869990_870110_872361_872480_877341_877521_879035_879179_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026_889734_890307
910040	contig_12123_pilon	+	3990	3	Intergenic	novelGene_144620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1310.5	119	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	818	1210	180937	181823	TRUE	30	TAAACTGCCACGGTAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPCKYVWVQSPCCLFVCTEENEFILYATRKSIHRYDLASGAIEELPLTGLRAVVALDFDYEHNCLYWSDLALDIIQRLCLNGSTGQEVIINSGLQTVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVCALLCCP	180119	186420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_181171_181664_182114_183930
910041	contig_9833_pilon	+	4379	4	Intergenic	novelGene_68502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2570	2935	215431	215796	TRUE	5	GCTTCCTGAGTTCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILVFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSVFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRRESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFVIVCCFRGIQ	212616	221929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_214563_214807_216720_217382_217711_221736
910042	contig_5039_pilon	+	2828	1	Intergenic	novelGene_64797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1281	1706	173602	174027	NA	40	TGTGGTATACTAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHSAHPYSTQPIHAALSPSLQHSAHPCSTQPIHAALSPSLQHSAHPCSTQPIPTALSPSMQHSAHHYSTQPIHAALSPSLQHSAHPCSTQPITTALSPSMQHSAHPYSTQPIHAALSPSMQHSAHPCNTQPIPTTCDQLT	172321	175149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_172300_175100
910043	contig_4783_pilon	+	3492	2	Intergenic	novelGene_108436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	390	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1431	1730	466294	466593	TRUE	20	CATTTTATTGATGGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDYSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKYQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	464863	469565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_467721_468930
910044	contig_10962_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_103880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCCTTCATTGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261178	263495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_261200_263500
910045	contig_16411_pilon	+	4402	2	Intergenic	novelGene_77331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4845	junction_1	0	243	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	517	981	166990	169360	FALSE	25	TTCCTTGATTCTTCAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQVLVPMYVVRSLRGSHTCMKGVCKTKCCVCVRLMPKSSAAGVLSGQELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKVSNPAMSYL	166473	172781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_167337_169242
910047	contig_17964_pilon	-	2810	1	Intergenic	novelGene_33942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGTTGGAAAATAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718013	715203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_715200_718000
910048	contig_3866_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_112447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1445	1807	310974	310612	NA	30	GCACATTTGTGTACAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVQLGPLLSVPWVLDRMLPPEMAERRPILFGTVTRYIPFEESPSPQSYLSAFQPEGLIFWHYIRQNVMLLVIRFSLASFSEVDCQVLLPSLSYSGRSAETCPPRVTPLVFKYRWQSFH	312418	310081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_310100_312400
910049	contig_7411_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_136991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	776	1081	218829	219134	NA	20	CTCAGACAATCTTTTCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQLLLKESLFEYSNFRLTFTISHIFPNPILALKDFINWLWKSQSLCTVDQFIDIDITLSLWLLLETFFQAISGVSHCDFFFLFDFLQFPYNRDNLFTVLL	218053	219816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_218100_219800
910050	contig_11071_pilon	-	6737	1	Intergenic	novelGene_131049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCACAGTCTACACAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483198	476461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_476500_483200
910051	contig_6677_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_114224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	999	1322	682176	681853	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVWYIKIILRNNGQLHQTESSTARWCPATTTDCFDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQGKDQIYWPKGDWRNPESTTPRHPFSSVVKSFLRFTVQPGSGQPHKSKWN	683174	681557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_681600_683200
910052	contig_3956_pilon	+	1490	7	Intergenic	novelGene_15102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1600.83162415317	2	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	327	1331	1287410	1290847	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281605	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1287377_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289510_1290446
910053	contig_10627_pilon	-	3744	2	Intergenic	novelGene_60028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	357	908	526277	525726	FALSE	50	TTTTCAAGAACAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPLKPAYDRSCDELSPVSPTQGGYPSEPTRSRTTPFMGIIDKTARTQQYPHLHQQNRTWAVSSVDTVISPTSPGNLPQPESFSPPSSISNIAFYNKTNNAQNGHLLEDDYYSPHGMLANGSRGDLLERVSQASSYPDVKVARTLPVAQAYQDNLYRQLSRDARQGQTSPIKPKRPFVESNV	526736	522889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_526564_526666
910054	contig_10642_pilon	+	4032	6	Intergenic	novelGene_78708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	210	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2555	2929	860008	867795	TRUE	45	AACTAGACTCAGAATTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATSGIFGSGSTVTTGISLLSKNRFSGTGGISSGRTTGFSLLAFESTDFFSLVSLLSELPFGLNECLLLGSSEPLASFRLFLECLTFGLLLCFLLLLLSCSISLSEDDSEEEEELEEESESSE	856197	870487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_858044_859299_860031_866988_867146_867600_867824_868854_869000_869557
910055	contig_15062_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_162304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGCCAACATATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250189	248611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_248600_250200
910056	contig_4982_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_172241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172698	171160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_171200_172700
910057	contig_14602_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_178867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	202321	202004	NA	30	AGACTTCGGTTGCTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSARCGGDRGRGFPFLLTRVESACLRSAPQETGSGRGQQKGGAEKEGDHRTTHPLRPNSRREPSGKQLFSSSITASAVSTCPALQLGVADCPSQPLDDAGCLLSL	202321	200243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14602_pilon_-_200200_202300
910058	contig_7286_pilon	+	799	7	Intergenic	novelGene_108706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	3	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	228	326	288412	288510	TRUE	25	CCTGGAATTGGCACCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCIIFNYTKTLHSCQLEIISPTALFGSQPLVSLFSNGEADTFSSGKRDPWFVAFANNENVGKPSGKAVAIGIFHMNHIKRARMSFSVSDHTNSSQVSTSSNHTQVT	286885	301462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_287049_288347_288512_289252_289422_290758_290857_291315_291499_292022_292030_301447
910059	contig_3095_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_75032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
910061	contig_5415_pilon	-	3978	17	Intergenic	novelGene_146133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	2638	3171	150128	145989	TRUE	40	AGGTATATTTTGATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSASLRNFAPFSALSSICRHSSLGRGSLGSSISGSCVSSIGEVPSKEELPTTNVALFEVSVSVTKGFITSAFLSRFIPASSPVAWNFWLFLTSGDSRLQQLSGTFFWFTTGDVIGFFSDSVDSVSACSKKMYLTARRRAKLRVITCSISMLTILEIKLPERNIWFNSLGHIFIQFQ	156091	140556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_140862_141682_141766_142722_142828_145032_145141_145264_145383_145900_146059_146183_146432_146558_146738_150091_150285_150747_150914_151065_151222_152063_152170_153043_153217_153529_153668_153756_153914_154355_154514_154664
910062	contig_3015_pilon	-	3665	3	Intergenic	novelGene_163317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	376	1020	238652	238008	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIHGVNIIRTTSNNAQAPEERLDKWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFIYDKSDQRLISKIYKILQNLNNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEHIQAANRHMKKCSRSLAIREMRIKTTMRYHLAPTRLALIQKTHNNKCWSGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAISLLGIYPREIRAIT	239027	193315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_195256_195462_196012_237851
910063	contig_10042_pilon	+	4298	2	Intergenic	novelGene_79135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	3519	3980	261906	262367	FALSE	60	AATGAAAAGAGAAGAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKRPANTNIIQIYSPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIGKTCNQDALIITGDWNAKVGNKEEGTVVGKYDLGDRHNARYHMIEFCKTNSLFIGNTFFNSINGNYTHGPRQMEYTGIKSTVSVQRDDGEAQYHRSEQGQGPAVEQTINCSYASSR	78018	262685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_80888_261256
910064	contig_14953_pilon	-	1929	2	Intergenic	novelGene_137293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315507	313488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_314778_314867
910065	contig_7730_pilon	+	3312	4	Intergenic	novelGene_156285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	12.7279220613579	721	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2736	3266	493757	494287	FALSE	15	TCCACTCCCTGCTCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTEAAVKISKDVLHWANLLQKTSFKVLKSKDVTLRTKMPLTQAMIFSFASYTCESWTLNKEDRRRIDAVELWCWQRMNIPWTTRRTNKSVLEEVPPQCTLEARMVRLRLMSFGHVIRRDQSLEKDIILGKVESQQKRGKPSMRWIDTVATTMCPNIATIVRMAQDWAMFCSVVRR	357595	494333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_357786_403495_405614_431891_432139_493576
910066	contig_5258_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_100246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAATAAAAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223034	225221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_223000_225200
910067	contig_14537_pilon	+	5141	2	Intergenic	novelGene_158648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	645	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3676	4014	55142	55480	FALSE	25	TCCCTGCAAAATATGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAIPLQSAQAEGVGPKPCSTAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQKPQVPTTVAAQTGKQFHTRTELCSPPGRSKDGAWSQVFEQKEGEVVRGKEEIKISRKKQHQQPTNGT	51403	56607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_52934_52996
910068	contig_14882_pilon	-	2052	4	Intergenic	novelGene_115006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	100	483	410616	410233	TRUE	10	GCTGTTTGTTTTTTTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSDFSSNRVVSKCLSSILLILSSTISHLLLSPSMTLSISEILLFIFWISGCCFCIISSCEFIFAFCSCIIFLNSSIFWSVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPIGNILSCFCKCFDIVCCLRGI	410715	272663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_273205_273422_274249_347911_347971_410089
910070	contig_160_pilon	-	3282	1	Intergenic	novelGene_156313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTACAGTCCTACCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19090	15808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_15800_19100
910071	contig_9696_pilon	-	2501	3	Intergenic	novelGene_68805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_1	16	52	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1034	1627	372829	370060	FALSE	25	TATGCTCAGCAACGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLTIGCSLKSLDLDSCTLSEILRLHILASGADVTSANAKYRYQKRGGFDATDDACMELRLSNPGLVKKLSSTSVYDLTPGEKMKILHALCGKLLTLVSTRDFIEDYVDILRQAKQEFRELKAEQHRKEREEAAARIRKRKEEKLKEQEQKMKEKLEKLKEDEQRNSTADISVGYGLNYTAHLALFIHVNICNE	373862	369185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_370238_371009_371176_372579
910072	contig_7594_pilon	+	2806	1	Intergenic	novelGene_55390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCACATACAGAGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344641	347447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_344600_347400
910073	contig_361_pilon	-	4180	5	Intergenic	novelGene_166609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_4	48.7974128412562	154	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	477	2165	1011845	983839	FALSE	45	CACCAGGGCAAAAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVDFTQEEWALLDLAQRKLYIDVMLETFINLASVVSRNLSDGKTFSSEHTIVRFMKNDSWSSVLGDIYELHGIEDKHNDQGSYLRRHMVEKFHENNEGNHCGKLSQLPKLTVFKRTPTEVNPECLECGRAFIDHSSHRHCIRSGCKNTCQCKKCGEACSCPYLSAPVNNLSREKPYECNQCGGDFCSVPSFQTHVRGQKGEYKEYWRICPSSLTLHKKVHNGDKPYECKECGKAFRHSSALITHIRTHSGEKPYECKECGKAFSDPSSLTTHVRIHSGERPYECKECGKAFTNSSALTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSDSSSLTAHIRIHSGERPYECKECGKAFSISSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSGSSAFTTHIRTHSGERPYECKECGKVFSQSSSLITHIRTHSGERPYECKECGKVFSNSSALTTHIRIHTGEKPYECEECGKAFSHFSNLTKHIRTHSGERPYGCMECGKLFSRSSHLIRHIRTHSGERPYECKECAKAFTDSSSLTRHTRVHSGVRPYEWKERGKAFIHASVLNEHH	1021099	981823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_985247_985602_985754_986721_986849_1011842_1012073_1020850
910074	contig_17144_pilon	+	1738	8	Intergenic	novelGene_29204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	20	GGCATTGGCTGTGGTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	172731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527
910075	contig_14621_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_105872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410156	412358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_410200_412400
910076	contig_14666_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_39594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	175	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	86	763	477340	485019	FALSE	40	AAAAAAATGTCTTGGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESSSAGFPSTSRPCSEGRRLCTGTRARGWTCRSLERPRGISMTWCPSTNRFKMPRWLWRKAERSRSGRRPSQKTSDVNGREAAGQMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477254	485243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483953_484709
910077	contig_14796_pilon	+	7104	28	Intergenic	novelGene_159365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	133	junction_1	115.454763735135	449	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1355	4068	198	4265	88016	237486	FALSE	40	TACCCCAGCTAGAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGEENQLVPKEIENAAEEPRVLCIIQDTTNSKTVNERITLNLPASTPLRKLFEDVANKVGYVNGTFDLVWGNGINTADMTPLDHTSDKSLLDASFEPGRKNFLHLTDRDGEQPQILLEDSSAVDDNVHDRFIGPLPRECSVGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTPEFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRSFGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQMSNDFSNDDGVDEGICLESNSGNEKISKPGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAAGGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRITQEDIKKTHGGSSGSRGYYSSAFASSTNAYMLIYRLKDPVRNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQREIERNTCKIKLFCLHPVKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMYLEDILPLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEEDTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETRKPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPVTVRAYLNQTITEFKQLISKAIHLPAETMRIVLERCYNDLRLLSVPSKTLKAEGFFRSNKVFVESSETLDYQMAFTDSHLWKLLDRHANTIRLFVLLPEQSPGSYSKRTAYQKAGGDSGNVDDDCERVKGPVRSLKSVEAILEESTEKLKSLSLQQQQDGDNGDSSKSTETSDFENIESPLNERDSSASVDNRELEPHIQTSDPENFQSEERSDSDVNNDRSTSSVDSDILSSSHSSDTLCNADNAQIPLANGLDSHSITSSRRTKANEGKKETWDTAEEDSGTDSEYDESGKSRGETQYMYFKAEPYAADEGSGEGHKWLMVHVDKRITLAAFKQHLEPFVGVLSSHFKVFRVYASNQEFESVRLNETLSSFSDDNKITIRLGRALKKGEYRVKVYQLLVNEQEPCKFLLDAVFAKGMTVRQSKEELIPQLREQCGLELSIDRFRLRKKTWKNPGTVFLDYHIYEEDINISSNWEVFLEVLDGVEKMKSMSQLAVLSRRWRPSEMRLDPFQEVVLESSSVDELREKLSEISGIPLEDIEFAKGRGTFPCDISVLDIHQDLDWNPKVSTLNVWPLYICDDGAVIFYRDKTEELMELTDEQRNELMKKESSRLQKTGHRVTYSPRKEKALKIYLDGAPNKDLTQD	87818	240325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_88055_133685_133890_135131_135246_144040_144180_147454_147552_153677_153824_154317_154398_156873_157024_173550_173647_173726_173880_175674_175843_183008_183141_183610_183688_184310_184367_190606_190720_191657_191763_194637_194846_212694_212811_214863_214984_216879_217658_221587_221764_222095_222177_223640_223757_232385_232505_234237_234369_235852_235901_236002_236134_237311
910078	contig_7678_pilon	-	4076	25	Intergenic	novelGene_175947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_24	103.675776662954	6	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	237	2558	84409	58711	TRUE	35	ACTTTTTATATATTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRASNLQDLVYKNGQAGITKASVSVTFDNSDKKQSPLGFEVHDEITITRQVVIGGRNKYLINGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKKIAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKERSAEELKEMQDKVVKLQEELSENDKKIKELNHEIEELEKRKDKEIGGILRSLEDTLAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLESEENKRKELEKNMVEDSKTLAAKEKEVKKITDGLNALQQASNKDAEALAVAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAETEAKQAQMKLKHAQQELKAKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKKLKEKLEAEMKKLNYEENREESLLERRRQLSRDISRLKETYEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDTEVTGKKLLEKGELKRRYTIIPLNKISAKCIAPETLRVAQNLVGPNNVHVALSLVEYKPELQKAMEFVFGTTFVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAASILTKFQELKDVQGELRIKERELQALEEELAGLKNVAEKYRQLKQQWEMKTEEADLLQTKLQQSSYHKQQEELDALKKTIEESEETLKNTNEIKKKSRRKV	85940	41931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7678_pilon_-_42354_43521_43670_47220_47382_47653_47771_50528_50730_55437_55633_56635_56780_58580_58776_60285_60411_63122_63259_65390_65596_67310_67431_67793_67933_68874_68993_69500_69661_71310_71545_75582_75733_75964_76199_77782_77828_78015_78127_79503_79543_80711_80835_83526_83677_84241_84470_85764
910079	contig_5918_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_99536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCCATTCTGAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707936	706356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_706400_707900
910080	contig_7629_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_153570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCATGGAAATGAATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300329	301319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_300300_301300
910081	contig_3602_pilon	+	1218	2	Intergenic	novelGene_60519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	264	581	169952	170269	TRUE	5	CTTGGCTCCACCCCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPATLWARGTGRGLPGGRSRDRGIVVLVGFGPEGGHRARESRKLAFSYHLRGRLIVGGQGGQHSDPIGCTSETTGDWLSAVRLGGGELLSWPLCKASMPTFLK	169688	171132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170715_170940
910082	contig_3975_pilon	-	1786	1	Intergenic	novelGene_54938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2343166	2341380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2341400_2343200
910084	contig_9995_pilon	-	3835	2	Intergenic	novelGene_47679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATACCAGAACCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233848	228640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_229009_230381
910085	contig_6509_pilon	-	2488	2	Intergenic	novelGene_145632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	147	junction_1	0	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	1976	2488	74414	73431	FALSE	75	GAAAAAAATAAAGTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNLLLGKGTYTSSEESSTESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQK	76389	73430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73886_74356
910086	contig_3956_pilon	+	2780	13	Intergenic	novelGene_15074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1186.51685618031	59	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	81	2252	1281682	1290491	FALSE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289149_1290306
910087	contig_3153_pilon	+	1953	10	Intergenic	novelGene_104667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGGGGCGCGGTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203812	247659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_204999_206342_206394_207413_207514_209572_209694_212244_212313_217815_217937_221159_221240_229039_229140_233950_234035_247617
910088	contig_10042_pilon	+	1558	4	Intergenic	novelGene_79087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_3	126.291549818488	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	10	603	6321	42785	FALSE	80	TGAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVCISLVVLLWKNIIGFL	6311	43740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598
910089	contig_13244_pilon	+	4565	9	Intergenic	novelGene_86998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_6	133.668842199669	79	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	2678	3436	469410	475123	FALSE	30	TAAAAAATTTTTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALHMLDIKEHNGQSAFQVAVAANQHLIVQDLVNLGAQVNTTDCWGRTPLHVCAEKGHSQVLQAIQKGAVRSNQFVDLEATNYEGLTPLHCAVVAHNTVVHELQRNQQPHSPEVQGLLLKNKSLVDTIKCLIHMGAAVEAKDRKSGRTALHLAAEEANLELIRLFLELPSCLSFVNAKAYNGNTALHVAASLQYRVTQLDAVRLLMRKGADPSTRNLENEQPVHLVPDGPVGEQIRRILKGKSIQQRAPPY	466511	476252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_467553_467672_467777_467877_469455_469834_469982_470172_470237_470522_470693_471757_471869_471962_472131_475069
910090	contig_8330_pilon	+	5090	1	Intergenic	novelGene_71999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCGTAGTAGTTAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2105881	2110971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2105900_2111000
910091	contig_8729_pilon	+	1732	12	Intergenic	novelGene_40165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	56.6629880510729	292	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1557	176	1732	772435	920254	FALSE	40	GTAAGAATTATGACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSLDTWNFSSPLISLWINRFYIYLGFAFGISLWICVQIVLKKQGFAEVLAESVTSLDLPATIINLKDYDPDDHLVEEVTSENVCAFLVATYTDGQPAESAKWFCKWLEEAANDFRFGRTYLKGMRYAVFGLGNSAYTSQFNKVGKNVDKWLWLLGARRVLTRGEGDCDTVKSKHGSIEADFSAWKTRLTSRLQELHQGEKKPCGSNCKKGKCESGQHGPEGREPGPHTLEESPHRDAEEEEPFESSSEEECGTEDQQSLNSVVDVEDLGNIMDRVKKEKKEKEQQEEKSSLFRNTGKNEDNERRAMITPALREALTKQGYQLIGSHSGVKLCRWTKSMLRGRGGCYKHTFYGIESHRCMETTPSLACANKCVFCWRHHTNPVGTEWRWKMDQPEMILKEAIENHQNMIKQFKGVPGVRAERFEEGMKVKHCALSLVGEPIMYPEINRFLELLHQCKISSFLVTNAQFPEEIRNLKPVTQLYVSVDASTKDSLKKIDRPLFKDFWQRFLDSLKALAEK	772259	920254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_772439_773318_773450_776209_776312_778257_778453_780469_780758_791743_791867_816963_817082_825451_825505_840183_840303_874362_874473_910607_910786_920118
910092	contig_7398_pilon	-	2866	1	Intergenic	novelGene_166149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2013	2342	32039	31710	NA	25	CTAAAGTTCTCCATTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYHTHNHQHIWNIAPSWKEVMGKCMQGIWEKLLSYVSMLQAFDQDNMKEYIAGKTVHMARTLNLELGITDVEQLTDHKDGELTDQDLMDFEEERNNEEEEEEKLSKIL	34051	31185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_31200_34100
910093	contig_17108_pilon	+	1378	3	Intergenic	novelGene_109499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	833	1378	13842	19722	FALSE	50	GAACTCATCAAAGATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSPGFTYSAPSSLLLSNVPSKLLSHTTVDLFLFFIFFPFSMGLSVPWIHSTLNHKDTLKPSARCGQQFCPSSGKRTGAMCQEESSWWGKFSLSVFFLLRETRALRNNATALLFRIPGHFWDETPLLTFGVCSKGKDRYCEGLTEISVSTIFTIPRRRISVQGDFSRNILKRRVRSSEHVL	13009	19722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_13898_16806_17232_19657
910094	contig_14925_pilon	-	2592	2	Intergenic	novelGene_55365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGACCATTTTAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122636	117631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_118879_121291
910095	contig_18898_pilon	-	4611	2	Intergenic	novelGene_77641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	908	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTTCTTAAGTGATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76310	63916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_-_63924_71706
910097	contig_6445_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_76998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACATGTGTTTTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470782	468993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_469000_470800
910098	contig_5415_pilon	+	3560	17	Intergenic	novelGene_146136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCGTTTGTAGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167558	303110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_167788_172484_172626_174566_174697_175228_175360_177431_177501_179840_179971_182520_182618_191706_191802_194535_194622_200498_200592_204712_204872_210302_210387_218184_218324_219125_219234_252502_252622_294191_294326_301494
910099	scaffold_880_pilon	+	5109	4	Intergenic	novelGene_121383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1236	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATCACTCAGTAAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84187	269334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_85430_114568_114972_248563_248571_265877
910100	contig_7963_pilon	-	1508	1	Intergenic	novelGene_58274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACAAAAGAAAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34880	33372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_33400_34900
910101	contig_11492_pilon	+	3302	2	Intergenic	novelGene_152265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	299	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGGAACTCTGCTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436456	443484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_438248_441973
910102	contig_3948_pilon	+	2565	1	Intergenic	novelGene_53257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1283773	1286338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1283800_1286300
910103	contig_13977_pilon	+	3881	26	Intergenic	novelGene_80954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	367	681	155222	155536	TRUE	5	CCGCCGCGGCCGCCGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDEKINFISLSPLHRWVIPIEKYSSVLPEGWFAGNFLSGMTEIHLNTIGNSASLFLPLGLCRMAYTHYHSLLLKHKTKKPKQKGKRLLGVSFLVGDVRPFTQN	154855	203014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13977_pilon_+_155610_156535_156678_158052_158282_159330_159551_160091_160214_161211_161269_161359_161472_162555_162729_163633_163729_166252_166377_166462_166596_169176_169261_170053_170273_172707_172881_172969_173061_173149_173275_177085_177193_181307_181396_183918_184040_184128_184251_189142_189249_189448_189545_190693_190795_192584_192778_195844_195867_202942
910104	contig_3382_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_124231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGCCTAAATGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1960478	1957390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_1957400_1960500
910105	contig_1244_pilon	-	3414	15	Intergenic	novelGene_38062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_11	58.8268385923934	188	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	163	2091	1214952	1166405	FALSE	35	ACACATTCGGAAGGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVEKYFSGPAITLENTRVVSQSLQHYLELGRQELFKILHSILLNGETREAALSYMAAIVNANMKKAQMQTDDRLVSTDGFMLNFLWVLQQLSTKIKLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETRVNATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKFPTECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTVEDLKNNESQWKDSPLATRHREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYGLLIQLLLRILDPAYPDVTLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQVLYEPCTQDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQPRTQKFFEMIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLWQNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHILTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIYLQLDCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGTIMDRSIILRHLLNSPTDPFNRQTLTESMLEPVPELKEQIHAWMREKQNSDH	1215723	1165081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1166467_1166774_1166922_1167523_1167699_1173244_1173437_1176012_1176148_1182056_1182202_1194055_1194183_1200272_1200509_1201298_1201398_1202252_1202381_1203478_1203579_1211031_1211171_1212965_1213165_1214907_1215022_1215630
910106	contig_9482_pilon	-	1370	12	Intergenic	novelGene_44259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.2701482265612	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	57	1355	759885	738055	FALSE	0	GTTGTGGCCGCTCTTGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGTMKDKIVAHEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKQAALLGSEDTAVEEPVPEVVPVQVETAKKSKKPSKEVLSCVFEPEGNACSLTDSTAEEHVLALVEHAADEARDRINRFLPGGKMGYLKKNGDGSLLYSVVNVAEPDAEEEETIPVDLSSLSSKLLPGFTTLGFKDERRNKVTFLSSASTALSMRHNSVFGDLKADETELLYSAYGDETGVQCALSLQEFVKDAGRYSQKLVDDLLDQITGGDHSRMLVRLKQRRSIPMKPPDEVKVGDSLGDGGGSVLDFMSMKPYSDVSLDISMLSSLGKVKKELDHDEGHLGLDETTKLLQDLHEAQTERGGSRPSSNLSSLSNTSERDAHHLGSSPAAQCQHERAVCCYLCKAVPCPQHVLALGVLAGQLYIASHCKCRP	759941	738039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_738201_740661_740830_742838_742942_744776_744816_747459_747572_748086_748220_749002_749099_751176_751253_754752_754886_757436_757553_758161_758273_759819
910107	contig_5302_pilon	-	2306	10	Intergenic	novelGene_81428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	692.941039303213	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	48	806	209238	177300	TRUE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSCPGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209572	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176839_177071_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209142_209268_209554
910108	contig_11258_pilon	+	1428	8	Intergenic	novelGene_67783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	178.128708339487	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	29	934	279290	292582	TRUE	40	ATGAGTCAGAATCAACTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILGDACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279261	296315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285691_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450_293009_296247
910109	contig_18977_pilon	+	3683	16	Intergenic	novelGene_178869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_5	37.4806616803919	175	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	900	2703	38	2740	752	29523	FALSE	50	AATAGTAAAAATCTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLQQSLRNKSLQMNDYKIALLCNAYSTNSECFTLPMGALVETIYGNGIMRIPLPGTSCVASGSITPLPMNLLDSLTVHAKMSLIHSIATRVIKLAHAKSSVALAPALVETYSRLLVYMEIESLGIKGFISQLLPTVFKSHAWGILHTLLEMFSYRMHHIQPHYRVQLLSHLHTLAAVAQTNQNQLHLCVESTALRLITALGSSEVQPQFTRFLSDPKTVLSAESEELNRALILTLARATHVTDFFTGSDSIQGTWCKDILQTIMSFTPHNWASHTLSCFPGPLQAFFKQNNVPQESRFNLKKNVEEEYRKWKSMSNENDIITHFSKQGSSPLFLCLLWKMLLETDHINQIGYRVLERIGARALVAHVRTFADFLVYEFSTSAGGQQLNKCIEILNDMVWKYNIVTLDRLILCLAMRSHEGNEAQVCYFIIQLLLLKPNDFRNRVSDFVKENSPEHWLQNDWHTKHMNYHKKYPEKLYFEGLAEQVDPPVQIQSPYLPIYFGNVCLRFLPVFDIVIHRFLELLPVSKSLETLLDHLGGLYKFHDRPVTYLYNTLHYYEMHLRERPTLKRKLVHAIIGSLKDNRPQGWCLSDTYLKSAMNAREDNPWIPDDSYYCRLIGRLVDTMAGKSPGPFPNCDWRFNEFPNPAAHALHVTCVELMALAVSGKDVGNALLNVVLKSQPLVPRENITAWMNAIGLIITALPEPYWIVLHDRIVRVISSPSLTSETEWVGYPFRLFDFTACHQSYSEMSCSYTLALAHAVWHHSSIGQLSLIPKFLTEVLLPIVKTEFQLLYVYHLVGPFLQRFQQERTRCMIEIGVAFYDMLLNVDQCSAHLNYMDPICDFLYHMKYMFTGDSVKEQVEKIICNLKPALKLRLRFITHITKMEPAVGPPQAMNSGSPAPQPNQVPVSLPVTQ	714	30466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18977_pilon_+_961_2342_2486_3468_3644_4313_4478_8514_8640_11781_11988_12077_12259_13204_13376_13749_13967_18807_19045_23401_23568_24583_24657_25865_26081_26740_26862_27542_27675_29355
910110	contig_11579_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_171945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTCTCTCTGACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107434	105429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_-_105400_107400
910111	contig_5728_pilon	-	882	6	Intergenic	novelGene_126700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.782734942662	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	247	798	350408	344906	FALSE	25	TTTGCATTGATGTCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVITEETTLQLEDIIKQRIAWDDVVRKEKPKEEAYEYKKRLTLDHEKSKLSLAEIYEQEYIKLNQQKATEEENPEHVEIQKMMDSLFLKLDALSNFHFIPKPPAPEIKVVSNLPAIAMEEVAPVSVSDAALLAPEEIKEKNKAGDTKTAAEKTATDKKRERRKKKYQKRLKIKAQEKWRKLLEKSHPDQEGKYTKAVASEKLKKLTKAGKAALLKDEGKDKALKSSQAFFSKLQDQVKMQINDAKKTEKKKKKTQDISSHKLKL	354513	344821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_345056_345507_345739_346761_346870_350345_350457_353444_353583_354453
910112	contig_19727_pilon	-	2459	3	Intergenic	novelGene_168994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56902	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032_56067_56486
910113	contig_4364_pilon	+	512	1	Intergenic	novelGene_773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCAACGCGGCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532754	1533266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
910114	contig_3942_pilon	+	713	6	Intergenic	novelGene_128626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	1321.78682093596	398	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGACTGATGATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176935	180106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_177603_177695_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
910115	contig_13481_pilon	-	1399	2	Intergenic	novelGene_119529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGATGTAAATTTAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469550	1467845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1469104_1469409
910116	contig_16594_pilon	-	2754	1	Intergenic	novelGene_53854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCGGACTATGAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127490	124736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_124700_127500
910117	contig_15067_pilon	-	2043	3	Intergenic	novelGene_154332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_1	38	9	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	166	471	93847	92165	FALSE	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLKKTFVLAPSSVLRIIVLITSLVVLPYLGVHGATLGVGSLLAGFVGESTMVAIAACYVYRKQKKKMENESAAEGEDSAMTDMPRAEEVADLVEMREESQ	94012	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92279_92840_92941_93755
910118	contig_15093_pilon	-	2388	1	Intergenic	novelGene_143302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	260	649	118564	118175	NA	60	CCACAACAACAATAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTVRYHLTPALLERIKNTGNNKCWRGCGEIGTLTHCWWECIMIQPFWKMIWRFLRKLEIEIPYDSAILLLGIYPTEIRAVTRIDIGTPIFIAALSTIAKRWKQPRCPSTDEWINKSTYTQWSIMQ	118823	116435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_116400_118800
910120	contig_6847_pilon	+	2545	14	Intergenic	novelGene_143856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_13	532.893619278234	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	325	1776	77788	110600	TRUE	65	TTTAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74054	112348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110630_111608
910121	contig_5684_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_81057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCACCTCCCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411272	408345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_408300_411300
910122	contig_1925_pilon	+	4402	3	Intergenic	novelGene_162226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	3325	4194	741403	742272	FALSE	10	TCTGGCTTCTCTTCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPGLARRIQAAGSPGSRDCGPRKQRSKRTKAPGSNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGTRAKGGGRQPVASENPKEAEKEKREKKKKKKQHLQPTNSTHRAARPGARNLSSRQPWVQSLWPREVEEQMNKGPGFLPTRQTRPGWSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRAESKPPAPPSQETLDTGSRGAPARAKRSGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSALR	574216	742480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_575896_576146_576670_740280
910123	contig_10667_pilon	-	3237	11	Intergenic	novelGene_137307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	150.749328356713	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	191	1504	99329	44225	FALSE	25	GTGATTTTTTATTCATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSILPFTPPVVKRLLGWKKSAGGSGGAGGGEQNGQEEKWCEKAVKSLVKKLKKTGRLDELEKAITTQNCNTKCVTIPRSLDGRLQVSHRKGLPHVIYCRLWRWPDLHSHHELKAIENCEYAFNLKKDEVCVNPYHYQRVETPVLPPVLVPRHTEILTELPPLDDYTHSIPENTNFPAGIEPQSNYIPETPPPGYISEDGETSDQQLNQSMDTGSPAELSPTTLSPVNHSLDLQPVTYSEPAFWCSIAYYELNQRVGETFHASQPSLTVDGFTDPSNSERFCLGLLSNVNRNATVEMTRRHIGRGVRLYYIGGEVFAECLSDSAIFVQSPNCNQRYGWHPATVCKIPPGCNLKIFNNQEFAALLAQSVNQGFEAVYQLTRMCTIRMSFVKGWGAEYRRQTVTSTPCWIELHLNGPLQWLDKVLTQMGSPSVRCSSMS	130832	42491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_44349_48258_48404_48582_48721_51600_51814_52670_52725_61282_61358_65888_66024_67021_67216_99093_99383_130367_130454_130781
910125	contig_14142_pilon	+	6582	29	Intergenic	novelGene_120555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	247	28	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	3112	3807	437519	441775	TRUE	70	TCCCAAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNGLVEFRLDLPKQPVKGLPTEPELLSHAAGAECGPQVDVEEQRGVLLSLPAKGVISVHNHQLLAQFLDSLYHLDGVQVRGKARVDVEDFLSIPDHAQQVTGKDNLAVASWEDDPEHLAILTHPLKLPLQLVLYVCIAQHILHQILLQSAPQGPFIGIIKAELLLKSLVRRLKGSQVLELHALARQAILAIAQLHHLVDGVPHSCIVLHHHRLHRLDQPPLDVSWESQQS	432440	457165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_434041_434145_434296_434458_434572_434695_434881_435059_435263_435480_435667_435746_435853_436533_436639_436947_437191_437298_437524_440115_440322_440418_440524_440622_440795_441200_441394_441760_441979_442126_442331_442467_442563_442749_442919_443003_443215_443746_443964_444071_444193_444640_444775_445000_445224_445364_445532_445872_446152_446347_446520_446613_446753_446903_447037_456857
910127	contig_366_pilon	-	16804	9	Intergenic	novelGene_51576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	119	junction_1	511.208311258727	1279	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	7418	7819	769115	764196	TRUE	10	TTTCCCAGCTACCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKG	803555	754192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_759315_760332_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_776893_780057_780185_802171_802279_802934
910128	contig_13888_pilon	-	2197	2	Intergenic	novelGene_151796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGGAATTTGAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343994	338484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_339355_342667
910129	contig_2215_pilon	+	3645	1	Intergenic	novelGene_163859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTTGTTAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217714	221359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_217700_221400
910130	contig_6742_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_144552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACTCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23499	22091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6742_pilon_-_22100_23500
910131	contig_16385_pilon	+	3025	3	Intergenic	novelGene_86200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	392	junction_2	61	7	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	977	1402	32552	32977	TRUE	10	TGATTGGGTTTCTTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTFIAREKAIPGLKASKDRLTLLLGANTAGDFKLKPVLIYHSENPRALENCAKSTLPVLYKWNNKAWMTAHLFTTWFTEYFKPPVETNCSEKKIPFKILLLTDSAPGHPRALMEMYKEINVVFMPANTTSILQPMDQE	31575	36831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_34324_35622_35680_36611
910132	contig_14357_pilon	+	2650	1	Intergenic	novelGene_121668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGACTTATCCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498061	500711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_498100_500700
910133	contig_8286_pilon	+	4229	8	Intergenic	novelGene_139808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	261.898484773262	293	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	173	631	203610	220100	FALSE	35	TAATAACCTGATGTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDRENEKEKKSVICVEGNIASGKTTCLEFFSSTTDLEVLTEPVPKWRNVRGHNPLGLMYSDPSRWGLTLQTYVQLTMLDQHTRPQTSPVRLMERSIHSARYVFVENLYRSGKMPEVDYVVLSEWFDWIVRNIDVSVDLIVYLRTTPETCYQRLKMRCREEEKVIPLEYLDAIHQLYEEWFLKGSPFPVAAPVLVSQSPLQGGGLFQKEE	196630	223698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_196668_199669_199745_200990_201045_203603_203694_205644_205719_217005_217095_217604_217685_219968
910134	contig_9527_pilon	-	1978	2	Intergenic	novelGene_134031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGTTCTTCAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177871	175476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_175572_175988
910137	contig_16826_pilon	-	2371	4	Intergenic	novelGene_176308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.2807651352991	172	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	362	1198	9161	6576	FALSE	25	ATGGACTTTGATAGTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLCATDVSWNRLHGPGPFPGIIDIFGIGGGLLEYRASLLASHGFATLAVAYYEYEDLPKTYDNIHLEYFEEALHYMLQHPQVKGPGIGLLGISLGADICLSMASFLKNISATVSINGSGFSGEKTIQYKQTNIPSLGHELRRIKVTFSGLMDIVDIRNDIVGGCEHPSMIPIEKAQGPILFIVGQDDHNWRSEFCAQLASERLQAHGKEKPQIISYPGTGHYIEPPYFPMCPASLHRLVDKPVVWGGEPRAHSKAQVDAWKQILIFFCKHLGASPKL	9811	5402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16826_pilon_-_7167_7949_8153_9118_9276_9564
910138	contig_10140_pilon	-	3362	14	Intergenic	novelGene_148389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	68.8279735342281	6	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	1410	2996	182513	141154	FALSE	15	TAGGTGTGGGTTAGGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKDEEDEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSKSSQVSRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKTSSKHVHPLFKRFRK	186172	140787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163547_163751_178414_178600_180427_180743_181944_182150_182453_182619_182780_183403_184730_184968_185608_185815_185933
910139	contig_4845_pilon	+	3860	1	Intergenic	novelGene_53702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	3038	3541	949108	949611	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCSNARKIRKLPRVQWLVKGLKSHSLQSYVKLRMLCAEFARSHILSYCPQRRSCILVWWVHRGFCLWLLPVPESALPRQPSGPGIDLSEFLLGSLSAFLPADIILDHVSNQKDCKHVRVQVPRGSLTYSNLAQFTLRVFGRADLVKPRKVRVAPLFPPRQRGSLH	946070	949930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_946100_949900
910140	contig_1008_pilon	+	3793	2	Intergenic	novelGene_121628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATTATTTTGTTTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177497	1181332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_1180675_1180716
910141	contig_15029_pilon	-	1507	6	Intergenic	novelGene_128195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3150	junction_3	65.0058458909658	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	44	619	172327	163104	FALSE	45	GATGTTATACAAAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCRSCCRSSTAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCSVPTATPSPTSSTAKTTTVPSSTTASTTVPTSVTPNTTLTPTSRPGRKSTFDAASFIGGIVLVLGVQAVIFFLYKFCKSKERNYHTL	172370	162215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168144_168220_169581_169654_172158
910142	contig_15732_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_88893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAGCAAAAAAAAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220586	222259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_220600_222300
910143	contig_615_pilon	+	2896	1	Intergenic	novelGene_80041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15205	18101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_15200_18100
910144	contig_6028_pilon	-	1942	11	Intergenic	novelGene_156583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_10	158.377050105121	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	353	1663	332055	309678	FALSE	40	AACAATATGTCCAGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	353894	309398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353594
910145	contig_3081_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_133939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAGAAAAGGACAGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230216	227642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_227600_230200
910146	contig_5981_pilon	+	3483	8	Intergenic	novelGene_35488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	271.039194394389	162	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	2403	2969	30076	37804	TRUE	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23422	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25009_25070_25399_25624_28120_30178_34582_34728_35629_35758_37612_38118_38215
910147	contig_9668_pilon	-	3742	4	Intergenic	novelGene_58096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGGATTGTTTTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559314	173309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_173848_481714_481830_556045_556616_556795
910148	contig_4659_pilon	+	4775	5	Intergenic	novelGene_118236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAACCTCTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817418	844813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_818086_819372_819943_836791_836944_837252_839042_843216
910149	contig_13593_pilon	+	4190	2	Intergenic	novelGene_156113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGAATACAAAATGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19172	23937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_23240_23814
910150	contig_7201_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_152504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	611	916	200434	200129	NA	65	TTGTTAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIRVELYNTLTKVTSHPGSSVKGVSLGVACTTFCLTRDKRKGKQVDNWGPQTTKKAVVRAELIFWTRGSCAQNLLDQGKIDGPFSRGDRENLPLEMPP	201044	199236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_199200_201000
910151	contig_7171_pilon	-	3410	9	Intergenic	novelGene_101362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	16.9221563342264	105	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	759	1229	1354262	1353537	FALSE	25	AGTCATCTAGTGCTGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEARSSGLVSRVFPDKEVLFHAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFRPITVRLPFQCSQSELSSLLYAVCSDWWAIGYPPIFIGPTLIFPASSVAVTLFLPRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1360962	1351355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1357446_1360023_1360113_1360257_1360465_1360823
910152	scaffold_13505_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_111617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCACAAAATCATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662909	660323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_660300_662900
910153	contig_8330_pilon	+	1427	7	Intergenic	novelGene_71799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	642.230661228676	45	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	191	520	853035	856687	TRUE	10	CACCGCTGCCCAGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCQVQLPRHCRARPSLLQRRRAHHCGRHQGPQLVQSQDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837598	857808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853257_856362_856560_856667_856755_856968
910154	contig_9443_pilon	+	2560	3	Intergenic	novelGene_167135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1714	2115	292039	292440	FALSE	40	GCGACATTACAACAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPEYVKQTLTALKREIDSSTITAGDFNTPLSIKDRTTKKKLSKDTEDRKGTINQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGMFSRIDHILGNRLILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKNQLHGH	210817	292885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_211825_266749_267072_291654
910155	contig_8907_pilon	-	945	3	Intergenic	novelGene_85841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTGAAAACAGGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632503	629271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_-_629974_630283_630508_632484
910156	contig_9305_pilon	+	1624	1	Intergenic	novelGene_148185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	48	446	48437	48835	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCVPVRPGPRPLGAHTSVRCQKLNKITSDKTTSCQREIRAKTGRRKQVMGQSLGAGSMGDFLSQDLGDEREQARKIRSKGIPEGTASAKALRGVADWTQRCVGDGGDRRLKRQGQALRAFQEVVRSLDLSY	48389	50013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9305_pilon_+_48400_50000
910157	contig_11417_pilon	+	1770	3	Intergenic	novelGene_103254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCCAGACTCACTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234719	325096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_234800_322818_323322_323909
910158	contig_12464_pilon	+	3260	1	Intergenic	novelGene_68636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAATTAAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64297	67557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_64300_67600
910159	contig_8357_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_39685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	190	507	190506	190823	NA	50	CCAAGTAGATGATATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPKYKTKNYKYHRRTNTRGPNTRHNSIQTITNSTQTPEDKLDNWDLLKTKHLRSSEDFTKRIKREPTDLEKNFSYYKSDKGLISKIYRKIQHLYHKKTNNAI	190316	192804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_190300_192800
910160	contig_15888_pilon	-	917	7	Intergenic	novelGene_84418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1937.42272247322	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	56	304	259726	252829	TRUE	0	TTTCGGCTCCTGTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRRRRLVAAGSEDGRGDMAAALLVVLAAALLGVEGVSGAEGGVSTSVDDFGPKTRLSCTLNSSTTAIEALPGHRGRGPRASHHHLHLREAVEARGGPGR	259781	251596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_-_251848_252029_252301_252468_252539_252807_252833_253402_253494_254597_254685_259659
910161	contig_8412_pilon	+	1366	12	Intergenic	novelGene_118363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	43.3366601816808	5	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	12	1328	460840	538281	FALSE	25	ACCCCCAGCATTGACTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRVMLPYSSGILTAVLPCLAYDDRKKSIKEVANMCNQSLMKLVTPEDDEPDEPKLVVKRQAEPNPDNSQAKQEGTASGGPDGSCDSSFSSSISVFTPASAERAPVTLHLDGIVQVLNCHLSDMVIGMMTRIAVLKWLYHLYIKTPRKMFRHTDSLFPILLQTLSDESDEVILKDLEVLAEIASSPAGQTDDLGPLVGPDLRVGHSELQVPTPGRAGLLHIPGTKGLECSPSTPTMNSYFYKFMINLLKRFSSEQKLLETRGAFIIRQLCLLLNAENIFHSMADILLREEDLKFASTMVHTLNTILLTSTELFQLRNQLKDLKTLESQNLFCCLYRSWCHNPVTTVSLCFLTQNYRHAYDLIQKFGDLEVTVDFLTEVDKLVQLIECPIFTYLRLQLLDVKNNPYLIKALYGLLMLLPQSSAFQLLSHRLQCVPNPELLQTE	460828	543151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_460910_461413_461567_473348_473413_480431_480577_480846_480913_494288_494446_502975_503109_533031_533207_534562_534682_536046_536127_538126_538282_543113
910162	contig_7534_pilon	+	1222	4	Intergenic	novelGene_162117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGGCCTCTTTAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34208	66366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_+_34682_41936_42152_44406_44563_65988
910163	contig_13481_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_119488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320604	1322188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1320600_1322200
910164	contig_10756_pilon	+	4286	1	Intergenic	novelGene_170665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2187	2564	84165	84542	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGMHRVTVSRRIGRCSTISRGVAYDQEPMVLKEEVQAVLKSLEKNKASGIDRIPIEMFQQMMQCWKHLLICAKKFIRQLPGQLTGRDSIFMSIPKKNDPTECGNYQTILLISHISKILLKIIQK	81978	86264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_82000_86300
910165	contig_19362_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_157805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	132	476	86223	86567	NA	45	AAGAGTATGTCTGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPNPLCLPISTPYRSCPFSLLYLLELRDTLLTSITLCPTVQSNPCLKSRPWKLFWFWADRESRDHAFWGTSSLRPLSLVFLLEFEFCTPPFSCSIRTLCCVPCQGSHWR	86091	87360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_86100_87400
910166	contig_18231_pilon	-	4852	1	Intergenic	novelGene_105897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGTAAATAAAGTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305476	300624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_300600_305500
910167	SIRV6	+	798	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	565	337	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	13	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
910168	contig_10734_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_51459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGGAGTCCTGTACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2260936	2262223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2260900_2262200
910169	contig_15327_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_70557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571506	568755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_568800_571500
910170	contig_17144_pilon	-	2829	6	Intergenic	novelGene_29513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1272.79446887547	166	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1563	2549	169039	166363	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170601	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996
910172	contig_8801_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_66256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1179	1628	358109	357660	NA	30	CAGTCATGCTCCTAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDKAAENRNKCMSKKRILKKNMYPWDKYKSHCQCPIKLWSPEFHFVSIFSSQEFLQTIHLSYLLMRFLIMKIKDNFFLVMNGSVTSEGGFVFLKCTDNLSVDSESDCISLLEETIPDVNWCFQQQFHLNVIKQNLNTFPPQIHIHHSA	359287	357550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_357600_359300
910173	contig_10311_pilon	-	408	1	Intergenic	novelGene_50487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAACTCCGGGTTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207967	207559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_207600_208000
910174	contig_12437_pilon	+	3908	8	Intergenic	novelGene_169065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_1	88.3467195607333	199	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	284	1909	36287	49139	FALSE	55	CTAACCAAATAAAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLNCENSCGSSQPDSDCCAAMASSCSVAAKDDSVSGTTSTGNLSSSFMEEIQGYDVEFDPPLESKYECPICLMALREAVQTPCGHRFCKACITKSIRDAGHKCPVDNEILLENQLFPDNFAKREILSLRVKCPNAGCLHKMELRHLEDHQAHCEFALMDCPQCQRPFQKCHLNIHILTECPRRQVSCVNCAILMAFEDKEIHDQNCPLANVICEYCNTVLIREQMPNHYDLDCPTAPIPCAFSTFGCLEKMQRNHLARHLQENTQSHMRMLAQAVQNLSLALTPVPHCDILPYDSAPLSQVSSGCHPEVQNFQETIQQLEGRLVRQDHQIRELTAKMETQSMYVGELKRTIRTLEDRIAEMEAQECNGIYIWKIGNFGMHLKCQEEEKPVVIHSPGFYTGRPGYKLCMRLHLQLPSAQRCANYISLFVHTMQGEYDSHLPWPFQGTIRLTILDQSETPIRQNHEEIMDAKPELLAFQRPTIPRNPKGFGYVTFMHLEALRQRTFIKDDTLLVRCEVCTRFDMGSLRREGFQPRSTDAGV	30668	51138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_30848_35682_35769_36268_36583_40574_40726_41840_42000_43441_43514_46392_46471_48269
910175	contig_6102_pilon	+	1172	4	Intergenic	novelGene_32086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTCATTTTTACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789078	791011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_789230_789439_790060_790454_790708_790863
910176	contig_6677_pilon	+	1293	2	Intergenic	novelGene_114234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAATTATCTATGTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925885	929365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_927108_929294
910177	contig_5399_pilon	+	1430	1	Intergenic	novelGene_176848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279990	281420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5399_pilon_+_280000_281400
910178	contig_13607_pilon	+	4494	2	Intergenic	novelGene_170181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	371	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCCCTATCATGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216082	221815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_218669_219907
910179	scaffold_12124_pilon	-	664	3	Intergenic	novelGene_22135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACGCACGGGGAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987326	940097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_940327_944717_944892_987065
910180	contig_7151_pilon	-	2410	4	Intergenic	novelGene_40687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	271	junction_1	111.134553082688	13	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	29	820	18221	12484	FALSE	55	GGAAAGAAAAGAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGD	18249	10893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12807_13360_13676_13782_13876_18160
910181	contig_9516_pilon	+	2075	13	Intergenic	novelGene_106180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	219	320	878005	878106	TRUE	15	TTTTGTCATCTTTTATAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVNIKNSSTWLKIFTKDLIIHTHTHRESLLNKKCCGTHPIHCQGQRRACPFHCGASVFVNVEELGYFIEIFMLLTVLNDLRERVTRGHSLSLCAFRPGPHNGEA	877786	899674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_878567_880055_880184_881624_881764_883610_883750_884202_884297_884628_884735_888746_888857_889790_889867_890735_890815_896961_897060_898251_898377_898501_898634_899605
910182	contig_7870_pilon	+	5541	1	Intergenic	novelGene_108928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTCATAACCACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269740	275281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_269700_275300
910183	contig_4364_pilon	+	500	4	Intergenic	novelGene_411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	80	499	1530895	1531675	FALSE	5	CTCTGTATGCCTCTGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVL	1530445	1531676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
910184	contig_7410_pilon	-	2231	2	Intergenic	novelGene_106068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1034	1381	318499	318152	FALSE	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEHNAEINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSITEGLRRRFEMMEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKRNEETLRIMWATIKSKNFRVIGVPERGENRKHREDH	320373	317301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_319222_320062
910185	contig_9871_pilon	+	3375	2	Intergenic	novelGene_75643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	169	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2536	2853	398873	399190	FALSE	35	AGAGGCCCTAAAGCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAARNSSCLMHAFPTEVEQSDTQPSCLSSHTVNAHPFHALFNATLFAFLRFLLMISLFKMVLNYSAEVLSCVPTHEKAVMCLTEKIHVLDKLHSAMRFCAIGL	380975	399712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_381322_396683
910186	contig_12427_pilon	-	1547	5	Intergenic	novelGene_40461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2452	junction_4	1844.52900492239	3	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	135	668	316061	314393	FALSE	20	GACTAAAGTTCTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325973	313513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315937_316079_325856
910187	contig_15047_pilon	+	1509	7	Intergenic	novelGene_52151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	67	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	27	650	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
910188	contig_21007_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_161550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	261	308	964	1011	NA	35	CTAAAAACTACGTATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	703	1856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_700_1900
910189	contig_16098_pilon	-	2704	20	Intergenic	novelGene_45851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	531.190556394046	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	62	2626	230275	201500	FALSE	25	TAGAGTTGCTACAGTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230484	201421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215632_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
910190	contig_10312_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_159032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGAAATTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554565	556717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_554600_556700
910192	contig_6980_pilon	+	3279	6	Intergenic	novelGene_36033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	354.611674934709	98	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	84	665	356720	368386	FALSE	20	TTCTAATAGTCCTCTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDR	346099	371000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206
910193	contig_12327_pilon	+	2597	4	Intergenic	novelGene_140673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	59.0160053620108	134	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124029	1133893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1124112_1128342_1128699_1131089_1131157_1131801
910194	contig_14225_pilon	-	4010	10	Intergenic	novelGene_52732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_5	127.565620973368	138	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	43	1689	334571	135576	FALSE	30	AAGATCCCTTTTCATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVAGREQLLAQQRMHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLAIKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSATKDTQTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGNVTENETSVLPPTPNAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEKQKCETQALRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPHVALEGKPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVSGGVPLHPQSPLATKERISPGIRATHKLPRHRPLNRTQSAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGNHLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACADDKLGHVGAVKVKEEPVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQVIGKDLAPGFVIKVII	334613	133254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_135891_154600_154819_155298_155510_158753_158877_169015_169132_214766_214889_216233_216361_217343_217495_221790_222033_334549
910195	contig_9017_pilon	+	3195	4	Intergenic	novelGene_130347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	38.0555150040335	23	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	612	1040	614781	618448	FALSE	25	TATCAAGTATTGGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRCLIRRIEAHLNSHLSAGKPRTWSQIAQGITWAASITALLTLCLCLIFFTVKVYKKKSAEAAASRDDINPVLGTSSKGHLNESWSGSPSDYLSSAVAAPTSREEQELHYASVSFQGVRPWNSQRQEATNTTEYSEIKIHK	610306	620603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9017_pilon_+_610385_614247_614936_616850_616933_618256
910196	contig_11855_pilon	-	2287	14	Intergenic	novelGene_67149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	278.387006600141	2	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	604	1053	2717148	2713545	TRUE	35	AATAACCCTGAATTTATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTEPRNKKTTVEEQLVQEVEHLKAKVEAGKACFLEKYKECQRLHKQIRQLRAAALVGDRDKGPELRPIKKTE	2731339	2709188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483_2713580_2714702_2714881_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718389_2718719_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
910197	contig_4402_pilon	-	3929	13	Intergenic	novelGene_140855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	266.159256836955	6	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1932	1998	3929	610133	595512	FALSE	35	CGTTACAGAGAATGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEESKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKE	614305	595511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610344_612401
910198	contig_17274_pilon	+	4728	1	Intergenic	novelGene_26565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	422	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGCCCAAATTCAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224787	229515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_224800_229500
910199	contig_14666_pilon	+	1700	4	Intergenic	novelGene_39570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1654.15846345573	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	110	883	477340	484940	FALSE	5	TGATGGTCTTTGCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477230	485757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479927_484246_484722_484790
910200	contig_21232_pilon	+	1722	5	Intergenic	novelGene_165976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	774	junction_1	561.027182942146	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	276	1562	4739	18357	FALSE	60	GAAAAAAAAAATCACGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDNRFPFPPFLGPESTAVSVIPVVRVTPTEMELKWQSTDTASQYIYHLDTESEVSSDKTVSPLKAITPSSLMPSTLYNITIIPEMGDVPGKSSSIAEYTQPNPVSGLHVTFMGTTKVTLTWCSDNGTAKCRMLLESIGSQKDSTQDSVFNISDLEPGNRYQFPPPPVVSNETQKDPEDGVEANNTERSPAEKLPSNHTAPVYLGTAASSCHQGSRGTEVQLVGLKPGTQYKATVYSQAADGTEGQPQVIEFRTNRSQVLDIQVVNISATNMSLTWRISGNASSYQILVVRETTFFNLTANEMHVVIPGLTSSTLYNITVYPLHDDGSEGTPGFLQAYTPPGPVSDFRVTSVNTTEIGLAWSSNDSDSFKILTTRDGAGEPRNETTTNHSIIIGGLNPGTKYHFEIFPQGPNGTQGPPQTVEGQTGK	4463	18517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_+_5043_11043_11287_13447_13667_14912_15168_18091
910201	contig_1076_pilon	+	2966	10	Intergenic	novelGene_101145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_6	83.1849048509507	16	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	1545	2906	991014	1005524	FALSE	20	ACTGGAGTGTACTTAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQEKLKELEEENMALRSKACHIKTETITYEEKEQQLVNDCVKELRETNAQMSRMTEELSGKSDELIRYQEEISSLLSQIVDLQHKLKEHVIEKEELRLHLQASKDAQRQLTVELHELQDRNRECLGMLHESQEEIKELRSRSGPAAHLYFSQLYGDFSGESLAAEIEGTMRKKLSLDEESSVFKQKAQQKRVFDTVKAANDTRGRSLPFPALLPIPGSNRSSVIMTAKPFESSLQQTEDKTLLNQDSTSEEVPRNTQEMGQPGPSGDNDLATALHRLSLRRQNYLSEKQFFAQEWERKIQILADQNEGLSGCGTPTKSLATLCTDQSEITDLSSASCLRGFMPEKLQIVKPLEGSQTLHHWQQLAQPNLGTILDPRPGVITKGFTQLPEDAIYHLSDLEEDEEEGITFQVQQPLQVEQEPSVSKPVTGIFLLPITSAGGLDTAEKNAWLNIA	988465	1005584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_989857_990860_991071_991716_991796_993263_993395_993833_993909_995092_995231_1000199_1000280_1000586_1000791_1003260_1003560_1005225
910202	contig_6375_pilon	-	2918	2	Intergenic	novelGene_73057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	0	164	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	162	1766	668107	661124	FALSE	5	TCTCTCTCCTCCACTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGPGKTGALLGAGGQSRSRPSARVGSEEAARGSNRTPTPEAPCPLLPFPPRPMVRGWKPPPGPDCAISDEHKSENTMPPNKEASSLNSSPAGLICLPPISEELQLVWTQAAQTSELDDNEHLLQTFSYFPYPSLADIALLCLRYGLQMEKVKTWFMAQRLRCGISWSSEEIEETRARVVYHQDQLHFKSLLSFTHHAGRPLEEIPPSLSEPTQMKGLKVEPEESSQIPPMPLSHQKVKEPLMAHGSRAFPHQSDFWQDLQSSSLSKEQAGRAPDQSHGLGTASWNHSTAAHQPRASEKPSPFSLLASSCKKESASRVTPSSSSTSSFQVLANGATAASKPLQPLDCVPQPLSPNEQTLPPHLEPAWPQGLQHNSVPGRVGPMEYLSPDMQRHQRKTKRKTKEQLAILKSFFLQCQWARREDYHKLEQITGLPRSEIIQWFGDTRYALKHGQLKWFRDNVVPGAPSFQDPAIPTPLPTARSLNEWAETPPLPIPPPPPDIQPLERYWAAHQQLQESDILQLSQASRLSTQQVLDWFASRLPEPAEVVVCLDEEEEEEEEELPEDDGDEEEEEEEDDNDNDDDVIIQD	668268	659971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_662689_668067
910203	contig_3948_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_53250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	1788	2144	1226166	1226522	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRHSSNLKQNTLPKIMFQPNKRQAYKVNNNTMKNMLLRTINHMRPKGHHLPKNKVQKAGRGSEDGRMETQNSGRKGVECYHIEGTATNVMKQNVYNLLNRKLICSVNFHPNHNKMFK	1224378	1226522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1224400_1226500
910204	contig_9011_pilon	-	3954	4	Intergenic	novelGene_159262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	2460	3233	147511	34771	FALSE	45	ATTGACCAATGGAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYYNKYENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDAENLNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGEDTTKKENYRPISLMNIDAKILKKILVNRIQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINLIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFNKVQHPFLIKTLNKIGREGKFLNIIKGIYTKPMVNIILNGERVKTFPL	183868	34049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_35203_147169_147647_150276_151697_182964
910205	contig_14563_pilon	-	4274	2	Intergenic	novelGene_135037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75320	70862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_74920_75103
910206	contig_14953_pilon	+	2199	10	Intergenic	novelGene_137289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_2	59.3965539175797	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	73	1650	310533	458774	FALSE	45	AAATACTCAGCATTAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSEDSDSDGIVAHFPAHEKPVCCMAFNTSGMLLVTTDTLGHDFHVFQILTHPWSSSQSAVHHLYTLHRGETEAKVQDICFSHDCRWVVVSTLRGTSHVFPINPYGGQPCVRTHMSPRVVNRMSRFQKSAGLEEIEQELTSKQGGRCSPVPGLSSSPSGSPLHGKLNSQDSYNNFTNNNPGNPRLSPLPSLMVVMPLAQIKQPMTLGTITKRTGKVKPPPQISPSKSMGGEFCVAAVFGTSRSWFANNAGLKREKDQSKQVVVESLYIISCYGTLVEHMMEPRPLSTASKISDDTPLEIMTSPRASWTLVRTPQWNELQPPFNANHPLLLAADAVQYYQFLLAGLVPPGSPGPITRHGSYDSLASDHSGQEDEEWLSQVEIVTHTGPHRRLWMGPQFQFKTIHPSGQTTVISSSSSVLQSHGPSDTPQPLLDFDTDDLDLNSLRIQPVRSDPVSMPGSSCPVSDRRGVSTVIDAASGRKPPPNVYWGGSVPFLLIFLHNVQDDIHLSSSLFLVCVCVCFNTVLCLHLLLNNAMRLNILKVGECCGGGGT	310460	459323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_+_310552_359693_359828_372501_372767_400496_400648_419395_419521_421867_422034_423962_424064_451465_451567_455028_455226_458455
910208	contig_9852_pilon	+	1676	3	Intergenic	novelGene_138464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	21	133	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTAGCTGTCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39960	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_40070_40864_41037_43533
910209	contig_5317_pilon	+	788	2	Intergenic	novelGene_76561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	13713	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAACTATACCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36687	43834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_36839_43197
910210	contig_8045_pilon	+	2131	8	Intergenic	novelGene_35449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_2	80.5866247067877	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	124	1098	452026	458443	TRUE	65	CAAAAAAAAGGATGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKVSILSAVS	435014	462503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457235_457457_458269_458820_459450_459568_460378_460493_460729_460877_462224
910211	contig_14575_pilon	+	4806	38	Intergenic	novelGene_101879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	107.425887952968	9	37	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2091	2714	4804	72160	107702	FALSE	35	TGAAGTTAAAAGTGGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVTPKAKHKGKKKKPKDLKPMLVGSGTPSVIPSVKSETVTSGSKNKGSSHSSGPFAVPEHLRKDIEEFEAYYKKRQQRNNEYDSQNKKMGEANPKQKCSTLYDYFSQYLEDNGPLDIRHRVFNEYRFYPEETRQIVQKAGGLRQFLLRCPRFVVIDNCIALRKVSTRIKRKRKKKVIKEEVDEISSIDDEMYLPFFLSLHPDTREFTPESGSSSAPASEDVMPKPVSADSPNSACKDVKPELASGDFSRPVAADGEPKCVSSDSPQPVSEDANHTPVSSQSPKPASEDVKPTYWAQPCLVTGYYPYLPYQGFDITQSPPAYINMLSSMPQYAGIYTPLATISEYQLQGAIPVVPSFVAHDRPDPNAAAAFEGHHVNAENTSGNRIASETQILQGSLETSVKSHCGLGDADTALKESSRNDSHGGRSAKKGEGSRVRMRAVAAHPPTQMAAVQVSWDVAHQEVNTEPYERFEAEPGDISRMEKEYRKLQEKLENAYEKYEQTRFKGLAEIRDLEEKLKRNSERCQVSKTELEWFIQDLEKETKKWQQEKKETQEKVKALKKKVRRLSIASETCTQKNDEKDEEHGLHLDESLEIRNPFANEKAKLEERIKKSKENYEEVHERAVAAEVSVLTCWKDIHVWKLEVTKTQGEAYVECLKSRRSDHEPYLVDAVLYEWESYFASVEEELETIDSQLEDKV	19958	107704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_32691_32850_33862_33922_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47369_51064_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867_64005_68967_69220_70559_70634_72115_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556_81605_83153_83220_85345_85496_91828_91969_96889_96959_98192_98290_105307_105409_107167_107256_107681
910212	SIRV3	+	1519	4	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	2688	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	32	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6691	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_7578_7620_7989_8127_8208_8755
910213	contig_6743_pilon	-	3378	1	Intergenic	novelGene_33549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1742	2131	207475	207086	NA	55	CTAGGGAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVASYAWESWTMNKEDRRIDAFELWCWRRILNIPWTCQKNEQICLGRSTIRMHLRGKDGETSSHVLWTCYQEGPVLEKDIKLGRVSVKKRKTFNEMDWHCGCNSGLKHNKDYGDGVGPGSDSFCFA	209216	205838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_205800_209200
910214	contig_5686_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_45374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1052	1366	143970	144284	NA	40	GTATTAATTAGAGCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIIIIIPIITTTKTVAIESIPTHGDPMCVRAELCSTGFSVTAFSEVDHQAFLPRAPLRGLELPAFQLAAKCVNCLHYPGTPNNNTINFTECVPSAGIYKFDVA	142918	144865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_142900_144900
910215	contig_10158_pilon	+	2033	12	Intergenic	novelGene_150765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	804	1121	21984	27749	TRUE	0	CTCTCTCCTCCTTCCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNPPAMAGDRYGSVFVFLILFSRSVRGTRFQSILQSHAPRAYPSSSPPPWGTISYVLPFMTSISGTVQIVLSLDMGATSGAYQLTATSQWASRYIKTCPSLAF	7406	162553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_7555_10794_10924_11648_11748_16188_16410_20127_20249_21898_22015_24818_25006_27400_27477_27725_27859_32611_32779_77749_78210_162377
910216	contig_6227_pilon	-	4140	7	Intergenic	novelGene_49789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	84.0431436822779	147	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	851	1555	1291269	1260481	TRUE	30	GCCCAGCACATTGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1331889	1249659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250469_1252830_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1292061_1331830
910217	contig_3095_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_75153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156842	154344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_154300_156800
910218	contig_7272_pilon	+	1281	4	Intergenic	novelGene_25359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTCAAAGGGGATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603945	607270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_604610_604708_604812_604920_605071_606906
910219	contig_11720_pilon	+	1423	8	Intergenic	novelGene_43804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2959.65299262172	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	218	520	68064	86308	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADEDTMSLCYMTLKIFLPPRIPSYIRLAC	67846	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_86227_86415_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
910220	contig_14219_pilon	+	4579	1	Intergenic	novelGene_54356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAATCGATGTCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863832	868411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_863800_868400
910221	contig_1443_pilon	+	773	1	Intergenic	novelGene_28200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	7	471	344128	344592	NA	25	CTAATGAGTGAGAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKMVLDLLGCFPHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344121	344894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344100_344900
910222	contig_13481_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_119420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAACGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745654	747344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_745700_747300
910223	contig_9706_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_21030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAAGTCAGGGACTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598703	601442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_598700_601400
910224	contig_12622_pilon	-	3924	4	Intergenic	novelGene_5769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_3	304.176849144631	148	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCCCTGAAATGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194588	100261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_100365_100739_104370_125265_125349_194480
910225	SIRV6	+	1226	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	350	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	23	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	237	569	2002	10736	TRUE	10	GTTTGCCGATGCGGTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1653	11703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
910226	contig_8065_pilon	+	3371	3	Intergenic	novelGene_107337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173333	182908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_+_173365_176757_176960_179770
910227	contig_6291_pilon	+	1073	2	Intergenic	novelGene_164804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTCACGTTGACCTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385678	386799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_385778_385825
910228	contig_1301_pilon	-	4141	5	Intergenic	novelGene_47333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_2	786.159772247347	26	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	166	798	284738	277659	FALSE	20	AGTGGTTAAGAGCTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRCVKVLNSTADISCPVMKVFCFF	284903	274315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_277906_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684
910229	contig_15084_pilon	-	4468	1	Intergenic	novelGene_116702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236533	232065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_232100_236500
910230	contig_9146_pilon	-	2476	13	Intergenic	novelGene_79508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	51.713688280334	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	434	1819	324555	264421	FALSE	5	GTACTTGGTCTTTTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTQLNLEFRFQDKKLRGFSCELIRSPYGVFPERVLTTACQILVPILLSGLGMITAGLVLNTVQHWPVFVEVKDLLTLVPPLVGLKGNLEMTLASRLSTAANTGQIDDPQEQHRVIGSNLALVQVQATIVGLLAAVAALLLGAVSSEEVDFAKMGLLCASSVLTAFLASLALGILMVCIVIGARKFRVNPDNIATPIAASLGDLITLSILALVSSFFYRHKDSWYLTLLVCVAFVALTPVWGIMAKQSPPIMKILKFGWFPIILAMVISSFGGIILSKTVSEPQYQGMAIFTPIICGVGGNLVAIQTSRISTYLHIWSTPGVLPLWMKKFWPNPCSTFCSSEINSMSARVLLFLVIPGHLIFFLVIYLIEGHSVTSSKTFVVLYLLASLIQVTILLYLAEVMVRVTWHQALDPDSHCIPYLTGLGDLLGTGLLALCFLLDWLLRSKAELDSLSELVSVPP	359474	263763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_264631_265843_265993_272236_272372_274745_274826_275937_276083_279325_279473_284520_284666_289796_289869_315716_315825_324360_324578_338448_338754_353740_353780_359407
910231	contig_7695_pilon	-	3098	1	Intergenic	novelGene_41567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	353	1062	344	1405	390800	389739	NA	35	TGGGCGAGGAAAGACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQASASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYCMPPRLCPQLGLRARG	391143	388045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_388000_391100
910232	contig_1244_pilon	-	1932	6	Intergenic	novelGene_38040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1235.51003233482	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	79	519	948448	933701	FALSE	55	CACAATAAAATATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLRPRVAGFCAWLYLGSPPFATAAVSMAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPVSA	948526	932287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_933714_933757_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
910233	contig_11422_pilon	-	591	1	Intergenic	novelGene_98959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_600
910234	contig_2487_pilon	-	8149	1	Intergenic	novelGene_148480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCTAGGAGGTATACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196267	188118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_188100_196300
910235	contig_14526_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_111227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAGGAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465207	463366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_-_463400_465200
910237	contig_8453_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_125140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACTTGTCCAGAATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256840	259396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_256800_259400
910238	contig_821_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_149411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGCGCCAGAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230394	227773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_227800_230400
910239	contig_6612_pilon	-	3369	12	Intergenic	novelGene_148164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	236.640676802099	125	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2715	23	2737	72745	19223	FALSE	75	AATAGCAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPENQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIERKRKPNRNTDNSKGIKPGQKQIQLPKTSAASTPPTDSDPQTTQEPLPTPSSSSLNKEMKYAIPETYDTERIKLPQEQYQLPQTLVTIPPPPHSLHQTPQMLLLTPSSSFFTQNMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKKQYKTTTTDGSKRLKLTPEQSQLQQTSVANTPPTESCPRIHQMPLLSPSSSFLTKKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVGTAWGISFFQCGGLLHLCFKKTRLLLLHREFCR	72767	18590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_19517_21399_21820_23833_24002_36288_36454_46708_46877_50106_50275_60837_61006_61951_62141_64167_64576_67488_67657_71390_71525_72480
910240	contig_1275_pilon	-	2662	4	Intergenic	novelGene_108796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_3	458.10915729769	113	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	244	705	513735	495635	FALSE	20	TGTCGTCTTTATGGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKVNIWSLTL	546950	493677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_495855_505868_506003_513627_513806_546777
910241	contig_1213_pilon	-	1863	2	Intergenic	novelGene_76466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	79	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	906	1250	43739	43395	FALSE	20	GCAGTTTTAATTGTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMSGFSRLLNHAVPRVLPNPKAESLPRCLETPLPAVLPRDAVVEPCSVEDWQVCASYLKTARVNMTVRQVLATDQDFPLEPVEEKKRDITTEGFSHLDDKNSQVKRARLNPDS	45508	42781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_43825_44688
910242	contig_6102_pilon	+	2897	22	Intergenic	novelGene_32350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_19	80.189599588015	129	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	908	2727	95	2821	1699217	1714849	FALSE	15	AGCTGAGACCCTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYSISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQLEEPLELKAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1699122	1714925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714397_1714422_1714505_1714599_1714702
910243	contig_6760_pilon	+	4469	17	Intergenic	novelGene_150783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	76	junction_9	79.8552401223614	204	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1117	3354	646	3999	132806	165420	FALSE	35	GAGAGAGATTGAGAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEICRICARELCGNQRRWIFHTASKLNLQVLLSHVLGKDVSRDGKAEFACSKCAFMLDRIYRFDTVIARIEALSIERLQKLLLEKDRLKFCIASMYRKNNDDSGADTTAGNGTVDISGLPDVRYSALLQEDFAYSGFECWVENEDQLQEPHSCHTFEGPGNRPRRCRGCAGLRVADSDYEAICKVPRKVAKSISCGPSTRWSTSICTEELALSEAGPPDLTSTKVAPDGESMEEGTPGSSVESLDASVQASPPQQKDEEAERSVKELVKCDCCLDEQAPQHLCNHKLELALSMIKGLDYKPIQSPRGSKLPIPVKSSPPAAKPGHNMTDGVSSGFLNRSLKPVHKTAVSYPLEITDLQELWDDLCEDYLPLRIQPMTEELLKHQKLNSNETTVTQQHVSDSQLVELQEKIQQTEATNKILQEKLNEMSFELKSAQESSQKQDGTIESLKETLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQSQLGQLHSSEGTSPAQQQVALLDLQSTLFCSQLEIQKLQRVVCQKERQLADAKRCMQFVEVTAHEREQQKEASWKHNQELRKALQQLQGELQSKNQQLHTLEAEKYNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIQDRDTALERAIDEKFSALEEKEKELRELHLAIRERDHDLERLRGVLSSNEATIQSMESLLRAKGLEVERLSATCQNLQWLKEEMETKFGHWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSAAVLCKLGPGQSEIADELCQRLHQKERMLQDLLNDRNKQAMEHEMEIQGLLQSMSTREQESQAAAEKMVQALMERNSELQALRQYLGGKDFMTSQALMSNQSAEVTAIGLHLGGQPDQDSMQIPSRDDSACLTAKGDSSIPRSTLGDLGTVAGMEKELSNAKEELELMAKKERESRMELSALQSMVAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDIPAMECLTQEVLLLREKVASVESQGQGTSGSRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSERDRTLQVELEGVQVLRGRLEEVLGRSLERLSRLETLAAIGGGELESVQVHHKHAF	132160	165890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_+_133931_143076_143209_143925_144046_144321_144415_144553_144767_146241_146401_147625_147740_147936_148075_149276_149457_150404_150600_153783_153952_154128_154211_156044_156137_162647_162765_163058_163197_164170_164284_165245
910244	SIRV6	+	905	5	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1895	149	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGCTAACCAACCAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7104	11480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7449_7805_7924_10727_10819_11031_11109_11205
910245	contig_11741_pilon	-	2064	2	Intergenic	novelGene_178871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	954	1319	1957	1592	FALSE	75	AAAACAAAACTAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	17071	846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11741_pilon_-_2314_16474
910247	contig_20889_pilon	+	3248	2	Intergenic	novelGene_127648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	118	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1270	1569	46345	46644	FALSE	45	AACTGGACCAGTAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNGVAFIVKKNISRSILKYNAVNGRIISIGLQERRVNTTVIQIYALTAKAKDEEIKCFYQLLQSEIDQTCNQDALIVTGDWNAKVGNRRIGSWKIWPW	44953	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_45863_45984
910248	contig_7179_pilon	+	2352	12	Intergenic	novelGene_78104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAAACTGACGGCCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644321	781359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_644517_645240_645387_662990_663075_664990_665124_668996_669053_669178_669313_678808_678980_680449_680644_682875_683067_688642_689209_700655_700778_780999
910249	contig_18163_pilon	-	1253	5	Intergenic	novelGene_35314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48.2312139594267	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	6	656	11553	9465	TRUE	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMAPGTLLLLLSGALALTQTQTGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAQTLRVNLRTALRYYNQSDNGSHTFQWMFGCEVGPDGRLLRGYEQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEDSGVAKNWKAYLEGMCVEWLRRYLENGKEMLQRAAKIHMPCAARGAD	11558	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9325_9444_9506_10375_10652_10955_11226_11489
910250	contig_12344_pilon	+	2027	5	Intergenic	novelGene_164864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	7.5	31	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCAGACGCCCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30773	97871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_+_30827_52931_52970_65268_65351_72849_72960_96127
910251	contig_6191_pilon	+	2792	1	Intergenic	novelGene_107866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513859	516651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_513900_516700
910252	contig_7943_pilon	+	359	1	Intergenic	novelGene_173148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211563	211922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_211600_211900
910253	contig_12701_pilon	-	2708	7	Intergenic	novelGene_169545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	55.4246234889231	71	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	189	1106	40561	24829	FALSE	35	AATGAGAAACTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQVKKEVGDVSILINNAGIVTGRKFLECPDELMEKSFDVNFKAHLWTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKRLGFTLRHFSMDWGILSLCIPQCCVHF	52393	23226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_24911_29682_29809_30464_30610_33152_33253_35586_35719_40228_40576_52219
910254	contig_5671_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_79479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAATCATGATGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532090	534122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_532100_534100
910256	contig_6735_pilon	-	4315	13	Intergenic	novelGene_15820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_12	48.614341162528	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1403	4209	105	4313	634126	601575	FALSE	40	TGCACTAGATGAACTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRLSGLANVVLHELSGDGTDQDMGPPLDPEIPQESDMEFNNRIQEDVLERLAYAEQLVEELKDIIRQKDIQLQQKDETLQEERKAADNKIKKIKLHAKAKLASLNKHIEEMKAQGGTVLPTEPQSEEQLSKHDKSSTEEEEMEVEKIKHKLQEKEELISSLQTQLIQAQAEQTAQLAKNSTEMEEFVRVKQQLKEKEELISTLQTQLSQTQAEQAAQLSSMQQVVREKDARFETQVRLHEDELLQLVTQADVETQMQQNLRVLQRKLEEREEALSGRAQVVDLLQQELNAAEQRNQVLLQQLQQMEAEQNTLRNTLETERQDSKILMEKMELEVAERKLSFHNLQEEMNHLLEQLEQADQAQAELESQYRSLEQKHKAEMEEKTLHILSLQKTEQELQSSCDTLKDQNSKLLQEKREQSVQSAQAIQQLEDQLHEKSKEISQFLTKSTLQKHETASQTSFPDVSHEGVQAVTEEKIASLQQRVVELENEKGALLLSSMELEVLKAENEKLSSQITLLEAQSRAGKADKEDSQISMVDNTRLNKSNSSTEESGQDVLENTFSQKHRELSVLLLEMKEAQEEIAFLKMQLQGKKTEGDPEDLGQKEVKQMESEGIPPVEMKVLLEDTGQDFPLMSDEESSLPAVKKEEQASNKHQNTTSEEMPFNDTKMELKSTKQDAIDKSPAVIPDISQCQQDELKRLKSQISELEISFHKAEETYEKNLDEKAKEISKLTQLIEEFKKNAENTSNAFTALSEERDQLLSQVKELSIVTELRAQVQQLEANLAEAEKQRRLDYESQTTHHNLLTEQIHSLIIEAKSKDVKIEVLQNELDDMQLQFSEQSTLIKSVQSQLQKKENEVLEGEERLRDMSDKMEELSRALSQKELEIAKLDQLLVEKKKDVETLQQTVKEKDQQVTEISFSMTEKMVQLNEEKFSLGVEIKTLKEQLNLLSKAEEAKKEHVEEDKEVVSGLKHNYNELSPAGLISKEELQHELDLLKKESEQRKRKLQAALINRKELLQKVSRLEEELAKVRDESRKEVPLNANEKREMEEDKENKEDSEKCVSSKCQEIEIYLKQTISEKEVELEHVRKDLEEKVAAEEQLQATVKQMNQNLQDKTNLIDLLQAQITENQAVIQKLITGNKDAGDGDSAAPVKETVVISPAGAGSGEQWKPKLEEKILDLEKEKEQLQKKLQEVLASRKVILKKAQEKEKHLREELKQQKDDYNRLQEQFDEQSKEKENIGDRLRQLQIQVRGSLDRNPPPGIDQEESSSSIQGLEDPVFKAAEQQLDQPVSESPLGPDLPSQHEDANILQSNPYIDQIKAKLKEIESEKEELELKVSSTSSELTKKSDEVFQLQEQINKQVLEIQSLKTAASEAEAHAESLKLTLESNQLEIARLEHLRELQ	645388	601572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_604182_605595_605670_608598_608714_615018_615135_616300_616704_618882_618997_620304_620428_622573_622700_629168_629301_632682_632836_633044_633198_634033_634129_645286
910257	contig_3241_pilon	-	2253	2	Intergenic	novelGene_146403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAGTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832879	829041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_830269_831853
910258	contig_10734_pilon	-	1161	3	Intergenic	novelGene_51128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11	18	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACAAAAAAAAGATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746460	744678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_745084_745262_745320_745761
910259	contig_2476_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_157623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAGGAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110871	108703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_-_108700_110900
910260	contig_12622_pilon	-	3677	16	Intergenic	novelGene_5764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	179	junction_15	193.610192569159	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1112	3339	123	3461	104350	88846	FALSE	25	TAAGCGCTTGACTGTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLGENSLDPLTTDSRKRKLPCDTPGQGLTCSGEKWRREQESKYIEELAELISANLSDIDNFNVKPDKCAILKETVRQIRQIKEQGKAISNDDDVQKADVSSTGQGVIDKDSLGPLLLQALDGFLFVVNRDGNIVFVSENVTQYLQYKQEDLVNTSVYSILHEEDRKDFLKNLPKSTVNGVTWTNETQRQKSHTFNCRMLMKTPHDVLEDISPSPEMRQRYETMQCFALSQPRAMMEEGEDLQSCMICVARRITTAERVFPSNPESFITRHDLSGKVVNIDTNSLRSSMRPGFEDIIRRCIQRFFSLNDGQSWSQKRHYQEAYIHGHAETPVYRFSLADGTIVTAQTKSKLFRNPVTNDRHGFVSTHFLQREQNGYRPNPNPLGQSIRPPVAGCNNSVGGMSMSPNQGLQMLSSRTYGLTDPSTTGQMSGARYGGSSNIASMNPGPGMQSPSSYQNNNYALSMSSPPHGSPGLGSNQQNIMISPRSRGSPKMASHQFSPVAGVHSPMGSSGNTGSHSFSSSSLSALQAISEGVGTSLLSTLSSPGPKLDNSPNMNITQPSKVNSQDSKSPLGIYCDQNPVESSMCQSNSRDHLSDKESKESNVEGSDNQRGPLESKGHKKLLQLLTYSSDDRGHSSLTSSPLDSSCKDSSLSVTSPSGVSSSTSGGVSSTSNMHGSLLQKKHRILHKLLQNGNSPAEVAKITAEATGRDTNSTTSCGEGNVKQEQLSPKKKENNALLRYLLDRDDPSDTLSKELQPKVEGIDSKMSQCGSSAIPSSSQEKDSKIKTETNEEGPGDLDHLDAILGDLTSSDFYNNSVSTNGSSNLGSKQQMFQGTNSLAGLRSPQSLQSIRPPYNRAVSLDSPVSVGSSPPVKSISAFPMLPKQPLLGGNSRIMDSPENYGSNMGGPNRNVTVNQTPSSGDWGLPNPKASRMEPMSSNSMGRPGADFNASLPRPAMAGSMPTLPVRSNSIPGTRPMLQQQQQQQQQMLQMRPGEIPMGMGVNPYNQAAPSNQPGSWPDGMLSMEQGPHGTQNRPLLRNSLDDILGPPSNLEGQSDERALLDQLHTLLSNTDATGLEEIDRALGIPELVNQVGGIKVGMRESVCMCVCMHAYI	194583	88629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_89087_90303_90431_90532_90791_91173_91372_92347_92487_93419_94289_94459_94852_95807_95956_96242_96384_99904_100007_100175_100365_100739_100915_102625_102727_103191_103365_104264_104370_194480
910261	contig_1734_pilon	+	2467	18	Intergenic	novelGene_164395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAAACGGGCAGACGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804430	843606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_804820_813140_813282_815315_815382_816978_817178_818658_818755_819319_819378_819801_819880_822382_822498_824544_824633_827319_827386_827464_827655_834159_834253_835667_835771_838032_838170_838254_838358_840091_840264_840858_841029_843403
910262	contig_7207_pilon	+	1932	3	Intergenic	novelGene_72032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAACAGCGAGCGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290536	295006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_292046_293062_293371_294891
910263	contig_6654_pilon	-	3943	1	Intergenic	novelGene_85699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	3193	3681	119863	119375	NA	65	AGACTGACAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQILTNIKEIENSTIIVGDFKTPLSMIEHFKRKSLTKDIENLNKTISQLAPTEIHRTLHPTSEQYTFFSSACRSFSRIDHMLGHKTSINKFKKTEIIQSIFSDHNGMKLEINNRINKGKKINTWKVDHPLLKICWVIEEIRSEILKFLESNENENTTYQNL	123055	119112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_119100_123100
910264	contig_12638_pilon	+	1976	18	Intergenic	novelGene_33111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	566.150162872374	2	71	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1160	1792	191222	199604	FALSE	25	CTCCCACTGTATACGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170822	199788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_170883_171000_171071_171683_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185699_191174_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
910265	contig_9239_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_137183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTACAAATGTTCTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203957	202956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_203000_204000
910266	contig_16724_pilon	-	6371	1	Intergenic	novelGene_105323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	495	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAATTGAGGGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552866	546495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_546500_552900
910267	contig_6062_pilon	-	3942	3	Intergenic	novelGene_5257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_2	73.5	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	29	634	597983	560745	FALSE	45	AGTGATACACAGGAATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLRPGILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKVSVFLLLIPGIRYIRSDSK	598011	557436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_561084_569595_569743_597863
910268	contig_13702_pilon	+	2922	4	Intergenic	novelGene_102630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2009	2308	211071	211370	TRUE	70	AAACCTAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	208855	273732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210682_210888_211799_229595_229759_273709
910269	contig_5502_pilon	+	2761	6	Intergenic	novelGene_154967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_5	355.080047313278	95	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	81	767	357713	379535	FALSE	25	TAAAGCCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVLVPVQQWTPPCCSVYTPAGTRTLCL	357632	381529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_379456
910270	contig_2310_pilon	+	1823	13	Intergenic	novelGene_71615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	271.81492631323	1	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	432	1703	114979	134479	FALSE	40	GACTAAAATGTTTTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKSGGPSLEQRFESYYNYCNLFNYILNADGPAPLELPNQWLWDIIDEFIYQFQSFSQYRCKTAKKSEEEIDFLRSNPKIWNVHSVLNVLHSLVDKSNINRQLEVYTSGGDPESVAGEYGRHSLYKMLGYFSLVGLLRLHSLLGDYYQAIKVLENIELNKKSMYSRVPECQVTTYYYVGFAYLMMRRYQDAIRVFANILLYIQRTKSMFQRTTYKYEMINKQNEQMHALLAIALTMYPMRIDESIHLQLREKYGDKMLRMQKGDPQVYEELFSYSCPKFLSPVVPNYDNVHPNYHKEPFLQQLKVFSDEVQQQAQLSTIRSFLKLYTTMPVAKLAGFLDLTEQEFRIQLLVFKHKMKNLVWTSGISALDGEFQSASEVDFYIDKDMIHIADTKVARRYGDFFIRQIHKFEELNRTLKKMGQRP	106112	134599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_106130_106691_106767_107849_108061_110704_110785_114930_114991_118098_118169_118360_118435_122881_123054_124481_124637_126508_126680_127456_127955_133367_133449_134440
910271	contig_4486_pilon	+	1607	6	Intergenic	novelGene_38604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	934.804022242095	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	295	594	407576	412464	FALSE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	343039	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343093_360535_360643_385369_385488_407559_407696_411177_411318_412424
910272	contig_3975_pilon	-	2537	6	Intergenic	novelGene_54818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	192.302262077179	34	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	104	679	2063821	2056837	FALSE	30	GGAAAATGAATTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079249	2054978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063849_2079173
910273	contig_11292_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_109478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAGAAGATTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466704	464746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_464700_466700
910274	contig_10861_pilon	-	3561	1	Intergenic	novelGene_39242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATGCTTTGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629775	626214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_626200_629800
910275	contig_14536_pilon	-	4394	1	Intergenic	novelGene_69304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	3622	4179	124401	123844	NA	25	GACCCATAAGGTTTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGIPLCICAEYGSGSKAAQYCPAGRGSQAEKRKRDKQIRTEQYKKKQKTTKKRPRDPTSMAAQAVFSSLSGKSKDGTQRQVFERKEEEEVIRGMEEIKRSGKKPPWQVESKRHQDEANASLPRDCGHRKQRRPSGDEEEWGVGKDVSLVTSCSASCWKLREAAFSYPVRQSPVGVQDGGSMLR	128022	123628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_123600_128000
910276	contig_5302_pilon	+	1848	11	Intergenic	novelGene_81531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_8	475.69633170753	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1641	206	1846	1581898	1636046	FALSE	25	GAAGTCTCCTGCACAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRTIPKLVAIPKSTVPPTADEKSNPNFFEQRHGSSHQSNKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGGSSSTNSSSQRHDRDSYSSSGSSSRKKGQLGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLSSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWDSPSRVPFSSGQHSSQSFPPSLMSKSSSMLQKPTAYVRPMDGQESMEPKLSSEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSSFGSGEQKRYNPSSKTSSGHQSKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSEGADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDPGGPKETSSATPGRDSKTIQKGSEGGRGR	1553517	1636048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1553719_1581893_1582021_1584952_1585748_1587120_1587166_1590793_1590881_1622186_1622224_1624389_1624439_1633904_1633960_1634425_1634464_1634945_1635109_1635797
910277	contig_14225_pilon	-	2634	1	Intergenic	novelGene_52766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1918	2259	495594	495253	NA	30	TATATATATGTATGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIKEYSLQYGLYLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSIINTHGSSSQEISRRIALGKSAAEDLSKVFKSKDVTLRTMVCLTQAVVFSVASYACESWTMHKKD	497511	494877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_494900_497500
910278	contig_7333_pilon	-	3158	5	Intergenic	novelGene_142817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	50.2064487889753	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	644	2734	406076	394458	FALSE	75	GTGCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGFPFPKSGVVSRPEQGEPWILDPLVSKERELPRGSHTGEGRMPADLLPSRSERRSWVEQDHWGFEDENVAGVHWGYEETKTLLAILSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATPQDSDSSSAPVLFRSPGGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407216	394033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_402472_403175_405092_405298_405761_406195_406691
910279	contig_18364_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_102559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGCCAGGACAAAAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102486	99854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_99900_102500
910280	contig_10861_pilon	-	1466	10	Intergenic	novelGene_39236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	335.354244248977	155	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCAGTCAAACCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614410	603077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_603287_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_609058_610716_610847_611134_611258_611521_611612_614296
910281	contig_5286_pilon	+	3052	5	Intergenic	novelGene_157356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539859	566833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_539896_558625_558753_559504_559633_560398_560578_564251
910282	contig_7963_pilon	-	2165	10	Intergenic	novelGene_58471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	702.820824329438	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	883	1953	123098	120628	TRUE	85	AAAAGGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126298	120292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124056_125850
910283	contig_4125_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_25109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761923	763639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_761900_763600
910284	contig_9011_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_159308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTAATATAATGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474405	471566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_471600_474400
910285	contig_14687_pilon	+	1831	2	Intergenic	novelGene_107906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430619	442292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_432087_441928
910286	contig_18303_pilon	-	4371	1	Intergenic	novelGene_146810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	351	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGTCGAGTAGATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75638	71267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_-_71300_75600
910287	contig_1867_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_54583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCACTATATTACTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475104	472290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_472300_475100
910288	contig_9955_pilon	-	2454	4	Intergenic	novelGene_21284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	952.237131997884	7	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	222	914	49296	47546	TRUE	10	TTTTGGTGTCACTTTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46334_47454_47737_48794_49376_49695
910289	contig_12951_pilon	+	4231	1	Intergenic	novelGene_68211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	3603	4037	776800	777234	NA	25	CACAGGTTCCATATGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHVVMEGGKSQISRSGVRVEASPNPRGCRGRQTPTGRSDDRLLAQKAVEAGRSGQMIGCWLKGLWKLANPRISTSDGRLLAQAPRTRGQMITNWMQDPERERTSPEHSYTFDADHPQGNSYLRRQQLESCPLVRVVTGVWMVT	773197	777428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_773200_777400
910290	contig_2444_pilon	-	3340	2	Intergenic	novelGene_83796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTTCTAATCTCCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279813	276380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_279601_279693
910291	contig_9505_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_121881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACCTTTCTCAACAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696621	697842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_696600_697800
910292	contig_1472_pilon	-	3115	4	Intergenic	novelGene_86127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACTTTCTATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685865	505495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_505748_505876_507076_679569_680493_685124
910293	contig_6743_pilon	-	4233	6	Intergenic	novelGene_33536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	94	50	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	24	359	275950	271914	TRUE	65	TATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVGGAGVMAVETLSPDWEFDRVDDGSQKIHAEVQLKNYGKFLEEYTSQLRRIEDALDDSIGDVWDFNLDPIALKVLFYFFTYGYIFRICYILKHFFKWKIYFYYLEFRDLEETWRKKC	275973	57885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_58470_58901_59269_105218_106539_158231_158559_270637_272189_275889
910294	contig_5758_pilon	-	2894	1	Intergenic	novelGene_119131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	300	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAAGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601020	598126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_598100_601000
910295	contig_8354_pilon	-	1669	2	Intergenic	novelGene_24100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	0	30	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	37	414	198044	195537	FALSE	20	TGTATTTCATCTTTGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDFCCENYQWHFMMGDILAHESELLALVREYLDFAEFQDTLKTFSKECKIKGKPLSKAAGGAFRDSTSLIIQVTLLIFDLSIIKIRCSQLVKNATTRECWNSFWGPTWSELLLDCSGVYGQISNVALNLCTYLGNVW	198080	194281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_195861_197990
910296	contig_6557_pilon	+	3223	1	Intergenic	novelGene_32965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378971	382194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_379000_382200
910297	contig_233_pilon	-	2161	12	Intergenic	novelGene_14524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1422.45958562178	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	87	1718	126907	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104302_109914_109976_126898
910298	contig_12920_pilon	+	4442	3	Intergenic	novelGene_166353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCCTCAGAAAAGGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234362	245466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_236298_236544_238835_245249
910299	contig_4845_pilon	-	3501	3	Intergenic	novelGene_53632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	152	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGCAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242039	238141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_238405_238518_240495_240777
910300	contig_10904_pilon	-	2383	11	Intergenic	novelGene_22672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	180.253848779991	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	318	1499	543929	537619	FALSE	25	TATGTTGTTCTCAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVHYAGQFWCAYNRWSGWWSGWSERSDPLLLVMTGAYSKPSLSAHPSPLVTSGGKASLMCSSNDTMDTFHLLKERGASPPQHRKSQFSPGTHHATFPVNPVSTSHGGTYRCYGSSRSSPQVWSHPSDPLDLKVTGTYEKPSLSAHPGPSVTSGESVTLQCCSDDSFDTFHLFKEGFTAPPQRLHWQNNTGPFQANFTMSPVTSAHGGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELVVSGGSKDQRQTPRESDPLTDTNAMENTGQQCQSPRTEACRRAPAQPPRTRRRTCERERRCEISGNLAKKQVPLVLSLPDAAVIDKQPEEEMELDSQDMKDRQVEEGSQRDSQAATLEDPQEVTYAQLNHSTLRRETTTSPSSQSGKPSGEPSIYAALAIH	544437	536734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_538072_538121_539112_539239_539425_539464_539552_539596_540491_540515_541598_541650_542246_542547_543359_543660_543823_544121_544311
910302	contig_10143_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_163330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCTTTCTAAATTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69628	67245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_67200_69600
910303	contig_14687_pilon	+	2490	1	Intergenic	novelGene_107942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521310	523800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_521300_523800
910304	contig_16882_pilon	+	1932	4	Intergenic	novelGene_148222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	47.005909793935	175	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	378	728	242626	261108	FALSE	10	GAGACTCTCGCTTTCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIITICKDKLPNYEEKIKMFYEEHLHLDDEIRYILDGSGYFDVRDKEDKWIRIFMEKGDMITLPAGIYHRFTLDEKNYVKAMRLFVGEPVWTAYSRPADHFDARGQYMKFLAQTA	236111	262312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_236420_242556_242677_258258_258439_260988
910305	contig_3153_pilon	-	2275	2	Intergenic	novelGene_104646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAAATTTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113261	101883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_101975_111077
910306	scaffold_12124_pilon	+	1514	12	Intergenic	novelGene_22103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	196.31716621851	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	786	1262	879089	889101	FALSE	45	AAAGAGCAGATTAAGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRFSVVQKIFPPVPGIRDPIKDFFHNNRLVDWEAGAEGWQECSVEEVQAVGET	864165	889353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_864254_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_888727_888810_889026
910307	contig_3161_pilon	-	4453	2	Intergenic	novelGene_84511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1846	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACATCCAGTAATTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428273	360986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_365424_428257
910308	contig_3754_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_146835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCCAGATGGCCGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293669	291366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_291400_293700
910309	contig_8447_pilon	+	2754	9	Intergenic	novelGene_69410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	416.317618381687	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	82	1011	54716	82214	TRUE	5	TTTTTTGCATTTTTGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	54634	84492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82277_82811
910310	contig_6291_pilon	+	4884	6	Intergenic	novelGene_164777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	417.972726382954	2	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	289	1158	355015	381395	TRUE	35	CTCGAGCTCCTTAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCEVDPVRRAVPDPNLLYDDRILQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETIPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQPREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEDVSSLTGDALTDLLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQFRQDQRDGGKSEDELDQASTPTDVRDIDL	354726	385201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_355210_356958_357175_359961_360122_370429_370579_381245_384911_384990
910311	contig_9981_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_121041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTACCAAGAGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198606	196154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_196200_198600
910312	contig_1694_pilon	+	3793	3	Intergenic	novelGene_145000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	509	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1629	2363	1712834	1713849	FALSE	55	ACAAAAAATCAGCCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSLVEENALELPHREFKSLILGILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIMQSQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTEKIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHTKLTRIIKGSSSI	1710680	1715279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1711105_1711629_1713527_1713807
910313	contig_7009_pilon	-	4354	8	Intergenic	novelGene_23612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	186	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2789	3190	537017	536616	TRUE	25	CAAAACTGATCCTCGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	539805	430909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_430938_444940_444984_453484_453601_506371_506634_512646_512815_517990_518108_522861_523001_536324
910314	contig_6885_pilon	+	3825	3	Intergenic	novelGene_83633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	349	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTGGGTCCATTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114813	287407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_115073_209466_210103_284477
910315	contig_960_pilon	+	5283	1	Intergenic	novelGene_108278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGGTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977610	982893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_977600_982900
910316	contig_4125_pilon	-	5890	4	Intergenic	novelGene_25107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_3	12.1928941054479	389	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1002	1415	761879	757488	FALSE	0	TCCCTGTGTCTTTGGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPAWIFFMDMPVIGRSGKSFQYNQDVVLLLLMDGVLFHLQSVTAYALMGKISPVTFSVASTVKHALSIWLSIIVFGNKITSLSAIGTVLVTIGVLLYNKAKQHQQEAMRSLVASPGRALEEDAEPLLPSDPRSHH	763654	753012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_757726_759918_760065_761849_761923_762696
910317	contig_12624_pilon	-	2404	4	Intergenic	novelGene_61083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1427	junction_2	690.31442111548	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	44	565	903621	884659	FALSE	10	TCTGGTTTATTTTCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEKYDSAIKDLKEALTKLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEHLALAMSMKSEPRHSKIDKAMECVWVSTLVI	903664	882819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_884815_888695_888805_900249_900333_903447
910318	contig_8310_pilon	-	3441	4	Intergenic	novelGene_75592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGACATATCCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326095	314978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316755_317712_317884_320574_320710_324736
910319	contig_7151_pilon	-	7307	2	Intergenic	novelGene_40745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGAACACTTTATCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510463	502319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502454_503290
910320	contig_6102_pilon	-	3233	1	Intergenic	novelGene_31826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	247	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAAACTAGTGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366842	363609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_363600_366800
910321	contig_13952_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_133275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTCTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216086	217739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_216100_217700
910322	contig_8798_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_143184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	987	1352	6084	6449	NA	30	AGGATGCAGCAGGGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWTPTGAILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	5097	6781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_5100_6800
910323	contig_990_pilon	-	1770	5	Intergenic	novelGene_76083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	181	junction_2	29.9614335438076	8	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	15	407	1142804	1123212	FALSE	20	GAATTGGCTTTATTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVFAMDTSLEKIVDPTLAEMGKNLKEAMKMLEDSQRRTEEENEKKLLSGDIPGPLQGSGQDMVSILQLVQNLMHGDEDEEPQSSRIQNIGEQGHMALLGHSLGAYISTLDKEKLRKLTTRILSDTTLWLCRIFR	1142818	1121848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1123363_1125109_1125191_1128026_1128093_1128586_1128661_1142783
910324	contig_5918_pilon	+	1224	1	Intergenic	novelGene_99592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTAATATTTTGCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2025417	2026641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2025400_2026600
910326	contig_16126_pilon	+	4542	14	Intergenic	novelGene_141865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_8	1183.52614258305	74	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1146	3441	52	3492	5097	44524	FALSE	30	TTAAATATGTCCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAFIFFSSPEKLDVETVMSIDHLKQKIPPALFYKETYLCPNEVLKNGMYCSLYEVVEKTRVGSNMESLLQKLEKEKLVLVKPLGDRGFLFLLSPCQMISPYEYQTAKSRVLHALFLFQEPRGIVPSQKGSATAAPQERHESIPDVLKITQFLQFSLIQCRKEFKNINTIKFHSVVEKYVSEFFKRGFGSGKREFIMFPYDSRLDDKKFLYSAPKNKSHIDDCLHTYIFRPEMYQLPICKLKELFEENKKLQQFSPLSDYEGQEEEMNGTKMKFRKRNNSRSEIITSGKQKSSHSLDYDKDRVKELINLIQCRKKNVSGDSDTEDMRSKTVLKRKLEDLPENMRKLAKTSGLSENCHLYEESPQPVGSLISALGHDADLRRQQQDPSNSGVADIHSLFNWLSETLANARHSDASLTDTVNKALGLSTDDAYEELRQKHEYELNSTQDKKEYEQPTCAKIENVHFKGTQSPLLEVDTSSLKYPVGASTSEGGTDLKLHLKEDPNLISVNNFEDCSLCPTVPIEHGFRRQQSKSNDVEETEIHWKLIPITGGNARSPEDQQGKHGEKRTPGMKSPEEQLVCVPPQEAFPHDPRVISRQRSSDYQFPSSPFTDTLKGTTEDDVLTGQVVAEEQCVPAAEPPALSETTERTVLGEYNLFSRKIEEILKQKNVSYVTRIPTPIFSTQEKMKRLSEFIYSKTSKAGVQEFVDGLHEKLNTIIIKASAKGGNLPPVNPNDSGAKMASTAVGRHAVPVSSGDFSGNCLPESLCSDAFKDTNSHEPHSSSAVGLTDVEMSQPHHAAELMVTSDHTVPGDAAREPVEKETKSPSDVNMSAQPALSNFISQLEPEVFNSLVKIMKDVQKNTVKFYIHEEEENMLCKEIKEYLIKLGNTECHPEQFLERRSKLDKLLIIIQNEDIAGFIHKVPGLVTLKKLSCVSFAGVDSLDDVKNHTYNELFVSGGFIVSDESILNPEVITIENLKNFLTFLEELSTPEGKWQWKVHCKFQKKLKELGRLNAKALSLLTLLNVYQKKHLVEILSYHNCDSQTRNAPELDCLIRLQAQNIQQRHIVFLTEKNIKMLSSYTDNGIVVATAEDFMQNFKSLVGFHNSDTDETLPLLGANENLESQSGNFSVVFIFFKADRKRGPGFALLTRKCLFCKHSPREVFEGI	5045	45574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_5173_5251_5356_24197_24271_24354_24427_25596_26299_30660_31080_32275_32421_33646_33707_37088_38018_40710_40834_41652_41813_42295_42405_43854_44034_44234
910328	contig_7870_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_109001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGCCTCACAATTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482063	482677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_482100_482700
910329	contig_11258_pilon	-	2233	3	Intergenic	novelGene_67826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_2	35	6	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	39	800	360471	330424	FALSE	10	TTGACATGTTGTGGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSWGSGRQGECMRGREAKEVSHEEPQIWTLTPFCLPLKDCTRWREGVRSCPSFCTPQPLIASWIVGHRGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRQGAPVPMTWRWAFSVWAASPMVDGHPNMA	360509	328990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_330657_354741_355099_360299
910330	contig_8954_pilon	+	2371	20	Intergenic	novelGene_130256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	412.522595704477	56	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	621	2015	123753	174404	TRUE	70	TTGCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLSLSAGSSPLHSPKITPHTSPAPRRRSHTPNPASYMVPSSASTPVNNPVSQTPSSGQVIQKETVGGTTYFYTDTTPAPVTGMVFPNYHIYPPTAPHVAYMQPKANAPSFFMADELRQELINRHLITMAQIDQADMPAVPTEVDSYHSLFPLEPLPPPNRIQKSSNFGYITSCYKAVNSKDDLPYCLRRIHGFRLVNTKCMVLVDMWKKIQHSNIVTLREVFTTKAFAEPSLVFAYDFHAGGETMMSRHFNDPNADAYFTKRKWGQHDGPLPRQHAGLLPESLIWAYIVQLSSALRTIHTAGLACRVMDPTKILITGKTRLRVNCVGVFDVLTFDNSQNNNPLALMAQYQQADLISLGKVVLALACNSLAGIQRENLQKAMELVTINYSSDLKNLILYLLTDQNRMRSVNDIMPMIGARFYTQLDAAQMRNDVIEEDLAKEVQNGRLFRLLAKLGTINERPE	49603	185924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_49674_51999_52067_53962_54034_66240_66394_102198_102347_123641_123760_144169_144418_147202_147308_148186_148245_159262_159425_159661_159779_159873_159976_163399_163566_164944_165036_169411_169552_173747_173878_174335_174414_175133_175198_182928_183068_185780
910331	contig_1706_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_155036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAGAAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24041	25247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1706_pilon_+_24000_25200
910332	contig_7272_pilon	+	3595	2	Intergenic	novelGene_25333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1517	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACCATTAAAAATGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579419	583153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_580871_581009
910333	contig_9272_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_125899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTTTTGTGAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258210	256550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_256600_258200
910334	SIRV6	-	801	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8561	63	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	25	4	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGCGGTTGACCTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11108	1481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1535_1640_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
910335	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_93308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657830	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657830	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
910336	contig_14687_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_107909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCACAATCATTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432710	435369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_432700_435400
910337	contig_16525_pilon	+	3693	2	Intergenic	novelGene_133814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2892	3293	96770	97266	FALSE	15	ACCAGGGCTGCAGGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSCLGSQLSWNLTSRSFWLQMPGFQHQVQPFGSPSPWTSWGPHSPQPLTWNSSSSTTICRSLSTFIIMAALSVSFRKRNFLSFSFSSGSTSHTTRESDCQWGPVRAELTSGPAPSPKPQFLHPLMKRGPR	93878	97666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_96975_97069
910338	contig_7378_pilon	-	3194	1	Intergenic	novelGene_120291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607651	604457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_604500_607700
910340	contig_14840_pilon	-	1907	8	Intergenic	novelGene_66234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	104.105519467862	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	850	1455	19294	11241	FALSE	10	TCTGTGAGTTTGCATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRIVKIFKIRLTLTWRWHLSYLKVETECNIHTSPSPGIQVRHVYTPSTTKHFSPIKQSTTLTNKHRGNEVSTTPLLANSLSVHQLAAQGEMLYLAARIEQENVINHTDEEGFTPLMWAAAHGQIAVVEFLLQNNGGTPLLYAVHGNHVKCVKMLLENGADPTVETDSGYNSMDLAVALGYRSVQQVIESHLLKLLQNIKE	22473	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14840_pilon_-_11297_12075_12157_12866_12934_13764_13863_15810_15877_18220_18380_19215_19609_21938
910341	scaffold_16539_pilon	+	1259	3	Intergenic	novelGene_68319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	68	400	133965	136322	FALSE	60	AAAAACTTTAAGGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQGIASGPRLHLIVKFHEGDVMPPWDQPDLLEARELVEKHGQHEFVGLLWQVGEEQDVIWWVFRKRLGRWHLSRHKLLWGHGPWWDLARCEARRRDHPWWRHVGRLAWHVVHDAGCLRHRRHALQRERGRT	133897	137181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_134006_135189_135281_136121
910342	contig_15866_pilon	+	1905	1	Intergenic	novelGene_63582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTGGTTTCTGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174039	175944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_174000_175900
910343	contig_15991_pilon	-	3359	3	Intergenic	novelGene_70952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	32.5	164	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	117	1181	182356	181292	TRUE	75	AGATAGAAAGAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYTLQPNVTETDYYYPDVFSSPCDGELIQRGSNFLLAIFYCFLFVFSLLGNSLVILVLITRKKLKSITDVYLLNLALSDLLFVLSFPFLTHYRLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFFSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYAMKVRTASVGTALSLVVWLTAITATSPLLVFYQVASEDGSLQCYSSYNQQTLKWKIFTYFEINILGLLIPFTILIFCYISILHQLRGCQNRNKTKAIRLVLIVVIASLFFWIPFNVVLFLTSLHGMHILDGCVMSQQLIYATHVTETISFTHCCVNPVIYAFMGEKFKKHLSEIFQKSCSYVFVCIRKRVSKEGWERSSSFHQQSSRSSSIDYIF	183507	167529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_169617_181200_182371_183405
910344	contig_233_pilon	-	2702	1	Intergenic	novelGene_14493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2025	2354	56482	56153	NA	65	AAAAAAAAAAAGAATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVIADVRWTLAKSREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHYKLWITLQRVGIPEHLIVLTRNLYVDQEAVVQREQGDTAWFKIRKGVRQDCSLSPYSFNLYAEQIIQAAGL	58506	55804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_55800_58500
910345	contig_19941_pilon	-	3132	18	Intergenic	novelGene_139753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	59.630291180721	8	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	400	2748	38965	11957	FALSE	40	CTGCAGAGTCAGCCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGEKGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQEKYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCSDIAMKKKLEEEEAEVKRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTSATLDEATSGVTPGTLPSTPVISFPGIPDTLPPGSAPLEAPMTPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPPSPRLVSENEMAVTPGHLNSTGVLLEVGGVLPVIHGGEMQQTPNTVAASPAASVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSNEISMIINSIKEECFRSGVAEAPGGSKAPSIDGKEDLDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKAVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSIEIKVEPTEPEQGISGAEIAAVVPALSMEPPELRSHSLDEDPRSTATGEIAEADVSSGKGDETQLTTVKTEASPESLLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQVL	40302	11572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_12144_12519_12589_12784_12878_13071_13287_14070_14118_14325_14420_14709_15160_15533_15815_17307_17453_17844_18064_18602_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_39977
910346	contig_15491_pilon	-	1188	7	Intergenic	novelGene_75960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	438.392391458712	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	167	718	45111	37061	TRUE	60	TTTATCCTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	46950	32011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37014_37200_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46879
910347	contig_8954_pilon	-	1986	2	Intergenic	novelGene_130304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGGTAACATAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653213	528929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_529806_652103
910348	contig_2550_pilon	-	5021	2	Intergenic	novelGene_135677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	3705	4085	1324519	1324139	FALSE	20	CCCCAGAGGAGGAGTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFGGKCIFRLGACGLRCLGNTGTPAVAELRGIQAQRGRRNFSGHSEPRVLKKHLLAQQLLQPRPQLALNDLTHARTLHPYGQAGNHIPRAAPAGGIQTTLLQVLGSHHSVWFWLWFNWLFKLHI	1328305	1323202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1327787_1327868
910349	contig_12841_pilon	+	4044	8	Intergenic	novelGene_55870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_1	60.4311043035533	241	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	326	1102	426350	445524	FALSE	30	AAAATAGGTGTTATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKYQGEVQSLKLDDDSVIEGVSDQVLVAVVVGFALIATLVYALFRNAHQNIHPENQELVRELREQLQTEQDATAAARQQFYTDMYCPICLHQASFPVETNCGHLFCGTCIIAYWRYGSWLGAISCPICRQTVTLLLTVFGDDDQSQDVVRLLQDINDYNRRFSGQPRSIMERIMDLPTLLRHAFREMFSVGGLFWMFRIRIILCLMGAFFYLISPLDFVPEALFGILGFLDDFFVIFLLLIYISIMYREVITQRLNR	419526	448466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_419769_424843_424920_426342_426487_430795_430872_433747_433857_438408_438483_441591_441703_445254
910350	contig_10377_pilon	+	1293	7	Intergenic	novelGene_115375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	350.426763627818	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	132	860	208954	245851	FALSE	55	GAAACTAAATGAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLKGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVNYAHAASSFQC	208822	246284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_208967_219445_219615_227487_227752_235978_236012_240234_240355_245160_245257_245817
910351	contig_17_pilon	+	5453	3	Intergenic	novelGene_173975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1912	2526	354240	536132	TRUE	55	ATATCATGAAAGATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEESINFHL	352328	539354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_354832_536109_537207_537501
910352	contig_3386_pilon	+	5459	5	Intergenic	novelGene_34557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	754.711203043919	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	322	660	494399	498744	FALSE	55	GGAAAATGGATAAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLVSNSCGF	470073	503543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_488105_488190_494393_494549_497716_497820_498658
910353	contig_8773_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_74517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28061	30828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_28100_30800
910354	contig_1225_pilon	+	7223	1	Intergenic	novelGene_44199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	188	862	259756	260430	NA	75	TGAAAAGGAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGSFSSEDMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFSSEGMKAGSFRWVQSCWNFIPFQSGLPLTSPPALPLPQAYLRRRSLSVNQVLSLLVRTDLEKNKICQKFLPTVVKLAL	259568	266791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_259600_266800
910355	contig_16098_pilon	-	1506	11	Intergenic	novelGene_45995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1404.8586441347	51	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	156	1382	352350	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRETVQTK	354144	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348431_348917_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
910356	contig_11396_pilon	-	4463	2	Intergenic	novelGene_71340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	147	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCATATATATCAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491524	486824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_488367_488603
910358	contig_3956_pilon	+	1957	2	Intergenic	novelGene_14766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	167	451	919044	923819	FALSE	30	TGATTTTCATAAAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRRGGRGAGEKAAEAAPTGPLRREGIGGAQGPVACAVCLSRSVCRAGGPTAGSSMSVAGLKKQFYKASQGSKMTCIQICEKCFETWKAQYRDQYITFTLCGPVLRNRCDGRVRLRELSPRLWISLCRVVLSGAPPPPFSSVLFCTSFL	918877	925325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_919089_923579
910359	contig_9705_pilon	-	2245	5	Intergenic	novelGene_41739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	246.302024961225	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	60	1130	311917	294865	FALSE	60	TGTTTAAATATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSFERSKTFAPADINKDEEFVEEFNRLKTFANFPSSSPVSASTLARAGFLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYFENNAAQPTNPGAQNGQYKVEKYPGNRNHFVLERPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPEMCSEEARLKSFHNWPEYAHLTPRELASAGLYYTGIDDQVQCFCCGGKLKNWEPCDHAWSEHRRHFPNCFFVLGRNVNTRSESDVLSSDRNFPNSTNSPRNPAMADYEARIMTFGTWIYSVNKERLARAGFYALGEDDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHDYINNIHLTQSHNLFCVKKE	340688	293749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_294899_308776_308837_309839_309940_311040_311949_340660
910360	contig_14467_pilon	+	1598	12	Intergenic	novelGene_138280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	226.023512270679	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1404	194	1597	369732	397408	FALSE	25	GTAAGTGTCATTCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSTLFGNNKLTTFGTSTTSAPSFGTTSGGLFGFGTNTSGSSIFGNKPATGTLGTGLGAGFGTALGAGQASLFGNNQPKIGGPLGTGAFGGPGFNTTTATLGFGAPQVPV	354795	397409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_354961_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889_385028_386924_387013_391849_391943_397268
910361	contig_5684_pilon	+	2071	6	Intergenic	novelGene_81003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	773	1276	299671	301453	TRUE	70	CAGAAAACAAAAAAAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKCSISKKQGLKTMYFVFVLRNQKDKEKQNRMRIKRRNPEAKMAFPLESPWSSLHPRLIRSQQPSEPQGLPPSRGWQLNRCAVSAGECAGAAAGRGGWTAGPPRSSQKTGSDCRQTRSPASECDWTGKSPAGYLLGVKSESYKGLLLGSTEPPCHKLAMQSLNFCN	298898	309894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_300077_301355_301513_302449_302538_304367_304693_308101_308269_309738
910363	contig_4315_pilon	+	3723	10	Intergenic	novelGene_46852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	157.296448909396	179	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	109	1143	604798	626094	TRUE	35	GCAGGGAGGGTAAGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACEPQTDPCGAASPLPTSSPGWSALPGGSPPGWRQELRNGQVLTVLRIDNTCAPISFDLGAAEEQLQTWGIQVPADQYRSLAESALLEPQVRRYIIYNSRPMRLAFAVVFYVVVWANIYSTSQMFALGNHWVGVLLVTLAAVTLTLTLVLIFERHQRKANANTDLRLAAANGALLRHRVLLGVTDTVKGCQSVIQLWFVYFDLENCVQFLSDHVQEMKTSQESLLRSRLSQLCVVMETGVSPRTAEGPEDQVEEAPLLPSSPRPMERPLMQTELCQLVPEAEPEEMARQLLAVFGGYYIRLLVTSQLPQAAGTRHTDSTRAPCPCQLIEAHILGTGCCPFLAR	600317	629543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_600346_604717_604907_613099_613210_615732_615841_616859_617010_620921_621033_622082_622164_623158_623345_625914_628362_629230
910365	contig_9982_pilon	+	6228	3	Intergenic	novelGene_55780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_1	76.5	302	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	569	2599	638011	650052	FALSE	35	TGATTATATGTCTGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACPQVTVKGFKPLIQFAYTAKLILSKDNVDDVCRCVDFLGVHNIEESCFQFLKFKFLDSTTDQQEGPRKECFLSHCQKTDLQLSPVDQKDLEIDEVEEFLESEHVPIPQCKLSRHQGDARASLALQDSTSQTSESMCSEKDTALTLPSLCPKYRKFQKAFGTDRVHSVDSSVKDSQVSPIQPNETPENECLGGVQDCADLQAILKCEETKTPVEHEETKKQDSASEHPAVKAEATPFAHSSAADPHGLYALSLLHTYDQYGDLNFASMQNTTVLTEKPLSGADGQEEHTLGGSQDLHLKSDPGPREDSSLASGDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDSPCQMQLSPAVARDVPEQMYSQKRFECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLKSVNCPFISTLSTEGCSGSLEIGNDDYVPEAQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESFSAREQECEVKLPFNEQRIISLSRNDFQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQNEKESLLKERDLILSTLGETKQNLTGLCQQVCKEAALSPEQIHILAKYSASDCPLSFLISEKEESTSDGERALPSIFSLRDGPPAVLPASEQSRCYRSSRKNKEPGGGRGQESRQTSTAGGEHAGLLEQCRQSGAISDFCQQMTDKCTTDE	637442	653681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_639376_641682_641890_649593
910366	contig_6117_pilon	-	4758	1	Intergenic	novelGene_167311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGACTCTTTGGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153767	149009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_149000_153800
910367	contig_10948_pilon	-	5566	3	Intergenic	novelGene_124961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_2	3.5	211	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	15	1169	51471	33207	FALSE	30	CACCAGTGTTACTTTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDQMDRQADSSSLLATTGKHHTEELLCSTEATLECHTQSSEAARSRSGPDSFANPHQDDSRLQLTETEACKDVARIEGVVEDPKVFLSSESVIEPLILPGCEHIPPTLISEDKYPQTERKGLLLPLQDACEALPTDQLENNKLNELQQPDLTDRDGKSPRGQTDSDGSESELCENNKISDLSTVLPEVYMAPEEKGDKDEEVNKETEDYLNSLLEGCLKDTEDSLSYEDNQEEDSDPLQDLSPEETSYSLQENLPSDDSCLSLDDLAKRIEIAEVVPAEGLVSILKKRNDTVGNHPSQMQQKSSKRRVRFQEIDDNLDQDEVGGSSCILLILLCIATVILSVGGTALYCSFGDMESPVCTDFADNVDFYYTKLLQGMAQLKHWIYLS	51485	28809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_33413_36842_36979_50658
910368	contig_7411_pilon	+	6140	5	Intergenic	novelGene_136985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_4	26.1856353751441	328	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	674	2025	441	2465	165590	175306	FALSE	35	GTAGAGAACCTCTGAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKSQVSFEDVAVDFTLEEWQLLNLTQKNLYRDVMLENYSNLVFLGYQIIKPNAIFKLEQGEEPWIIDEEMISQNFSEVWLDNNHNMRHEDNQDKLKSMERCHEYDVLGKIFHSGMNFAHLATRPHKYGTGGKNLKHPFDLIIPKSHCGRMQLDAFNKKLLFHIIPDRTHDGIKYCDCNKCRQTSSKESWLITNHITHRGVYLCMECGKAFNKRSQLIIHQRTHTGEKPYQCSECGKAFSQKSLLTIHQRTHSGEKPYGCGECQKAFSRKSLLILHQRTHTGEKPYGCSECGKAFSRKSQLKRHQITHTIEKPYGCSDCGKAFSQKLKLITHQRTHTGEKPYKCNECGKAFFWKSQLITHQRTHTGKKPYACSECKKAFSRNSLLIRHQRIHTGEKPYECNECGEAFMRKPQLIKHQITHTGKKNYQCSDCEEAFFKKSELIRHQKIHLGEKPYGCVECGKTFFGKSQLLTHQRTHTGEKPYECSECGKAFTQKSSLVSHQRTHTGEKPYECGECRKTFSEKSSLIHHQRTHTGEKPFECGECRKAFAWKPQLIRHQRIHTGEKPYECSECGKAFVQKVQLIKHQRNHTGEKTYGCSDCGKAFFEKAQLIIHQRIHTGERPYECDECAKSFTRKSHLMRHQRIHTGEKYYGRNECETTFNRKSQLMIHQKNHIR	162669	178981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_162835_165314_165605_169336_169458_169688_169785_173513
910369	contig_5279_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_105544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73549	74992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_73500_75000
910370	contig_1372_pilon	+	2369	13	Intergenic	novelGene_140513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	38.0660062698116	175	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	726	1889	457535	484809	FALSE	20	ACAGTTATTTCATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQGMKFDPEITVLQTMLAECQEKLKKLSWLESRVECLEEKMKGKVMVNEKTWTNLLSRVTLLETEMLLLKKNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451498	485289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_453467_453577_454521_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_470835_471043_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766
910371	contig_9011_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_159358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCCAAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784277	782258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_782300_784300
910372	contig_10225_pilon	+	2246	14	Intergenic	novelGene_86800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	525.98218072276	30	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	92	1093	20776	42680	TRUE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20684	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46251_46308_46798_47315
910373	contig_4783_pilon	+	2832	1	Intergenic	novelGene_108422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACCAGACAAAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417692	420524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_417700_420500
910374	contig_11056_pilon	+	2804	1	Intergenic	novelGene_130382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	192	341	365534	365683	NA	25	TAGAGATGGGGAGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFACWKLYSVSCGLFVSAPCPQVQLNAGQLQYIRLAQPVSGTQVVQGQIQTLATNAQQVCAPEMQGLSWRPAGAGFCLERVLSLQLSHHLILQQGLSPHPSHVFCTPRDTSG	365342	368146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_365300_368100
910375	contig_10286_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_98439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAAAACCCATTGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501646	498902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_498900_501600
910376	contig_11316_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_122637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	219	731	137674	138186	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137455	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137500_138900
910377	contig_2646_pilon	+	5676	1	Intergenic	novelGene_69539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATGAGTATGGTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576698	582374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_576700_582400
910378	contig_5031_pilon	-	4007	22	Intergenic	novelGene_133204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	503.312785092122	36	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	1166	3181	94666	70632	FALSE	20	AAGATTAGGTTTTGTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFKNKLFPVIICPAWIPELNSVEHVPEGISFGAACPLSSVEKTLVDAVAKLPAHKTEVFRGILEQLRWFAGKQIKSVASIGGNIINASPISDLNPVLMASGAKLTLASQGTKRTVQMDHTFFPGYKKTLLNPEEILLSIEIPFSREGEFLSAFKQASRRDDDIAKVTSGMRVLFKPGTLEVKELAICFGGMADRTISALKTTQKQLSKFWNERLLQDVCAGLAEELHLSPDAPGGMVEFRRTLTLSFFFKFYLTVLQKLGEEDSEDNCGKLDPTFASATLLFQKDPPANIQLFQEVPKDQSEEDMVGRPLPHLAAAMQASGEAVYCDDIPRYKNELSLRLVTSTQAHAKIKSIDTSEAQKVPGFVRFFSADDVPGSNITGLFDDETIFAKDKVTCVGHILGAVVADTPEHAQRAGQAVKITYEELPSIITIEDAIKNNSFYGRELKIEKGDLKKGFDEADNVVSGEVYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEEGEVELFVSTQNTMKTQSFVARMLGVPANRILVRVKRIGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAHKTGCPVRCMLDRDEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGRIVALEVDHYSNAGNTLDLSQSVSRACLLHSRVTSCQGHTPQPLAQAGRVSTTAQPGPSQGLPVPVAIASSLVSPSFRSLATL	117074	69805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_70905_72100_72189_72791_72926_73683_73809_75208_75306_75992_76113_77689_77814_80342_80513_84576_84661_87127_87303_88120_88306_90741_90852_92327_92422_93663_93816_94581_94675_97342_97485_102712_102762_103672_103800_105906_106016_107368_107466_110278_110337_116499
910379	contig_7963_pilon	-	686	2	Intergenic	novelGene_58568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	358	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACCAGTGCAGTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253518	251153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_251284_252962
910380	contig_3252_pilon	-	4008	1	Intergenic	novelGene_61488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	782	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	362	793	248533	248102	NA	20	AGTCCTCCCCCACCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSQWGQAGLAWIGILDSKPASCLLCSESQETAKDHSPSWQVVRFSSWKDSWLENWPLPLVSFFDNLRLLGKRGWEGETEAVPALLLFPKAPVSSLQLSPPSAHGRNSHGRRCFLTLSRGEGCPESGTASGRTCPTPNSGLL	248894	244886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_244900_248900
910381	contig_6477_pilon	+	2305	2	Intergenic	novelGene_154195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGATGACTCCCCTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796444	909685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_797888_908823
910383	contig_12402_pilon	+	3313	5	Intergenic	novelGene_133379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36.5342305242631	2	177	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1762	2607	660943	661788	FALSE	10	TTGTATGGTCTGTGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRSHSGERPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIRTHSEERPYECKQCGKAFKQFTQLTTHIRTHSEERPYECKECGKAFKQFVQLTRHVRVHSGEKPYECKECGKSFSQFSYLTGHIRAHNGYRPYECKECGKAFIRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFFRSSHLTDHVRSHSGEKPYECKECVKAFSCFSSFRKHVRTYHGNRPYDSKECEKAFSQFSHLTDHIRSHSGENLQCSELLSYGPSNHGLVTPTK	636386	662494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_636639_658759_659070_659267_659994_660347_660725_660846
910384	contig_12677_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_110850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35808	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3800
910385	contig_10140_pilon	-	4417	11	Intergenic	novelGene_148386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	88.9472315476991	5	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	669	1625	182494	163544	TRUE	20	CAAACTCCTTTTTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRHRQYLLKSSRLEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNK	183320	139026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163497_163751_178414_178600_180427_180743_181944_182150_182449_182619_182776
910386	contig_7806_pilon	+	3239	1	Intergenic	novelGene_157554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTGGTGTTGGGATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291815	295054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_291800_295100
910387	contig_20293_pilon	+	4005	15	Intergenic	novelGene_153499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAAGGAAAGTAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17105	116224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_19472_20436_20538_27792_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45338_45425_45495_48533_48674_49036_49172_49879_50102_52322_52469_68597_68701_116146
910388	contig_9471_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_21746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAATTCATGCTCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263506	264977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_263500_265000
910389	contig_16067_pilon	+	1685	7	Intergenic	novelGene_169846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.944296437218	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	549	1137	1685	68357	102226	FALSE	45	GTAAATAATAGGAGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNQKNSFQEIPKLNEELLSKQKQLEKIESGELGLKRVWINITEMNKQISLLTSAVNHLKASVKSASDLISLPATVEGLQKSVASIGNTLNSVHLAVEAIQKTVDEHKKTIEILQSGMNQHLLKDTSGSNEITPPPSVTSEADNKTHSENSKQMSDRAATLKRESLDQETNRTDSLKTQSIK	65647	102226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_+_66736_68308_68358_81573_81720_93277_93377_96433_96545_99367_99473_102139
910390	contig_13244_pilon	-	6154	8	Intergenic	novelGene_86995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	547	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3079	3426	468219	467872	TRUE	45	CTTAAACACAGTACCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLLHILVLWRILVQRSLVHHRWGATDLEWLVFLRWRKDLPSVEVLKLLSRGTLGDNHRTHPANLDCVQRDGAAFILNVDNALKQIGIAVMFGFTVMNIFHALPRRWCLGRCL	476252	465023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_467551_467670_469453_469832_469976_470166_470235_470520_470690_471754_471867_471960_472128_475066
910391	contig_5588_pilon	-	1669	5	Intergenic	novelGene_172847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	13.3111795119741	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	132	635	1077373	1064415	FALSE	30	AAAGTAATACTTCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RENGSGRVTDTTSGPEEFSVSEGGPGPSAEQGAGRRSGPGGRIMWWIPGSQQSVELLQVDLRLWSPRLWMWQRQELCWQRRVPALPLGTYSLRCMRSGRHRGCQDYLQVSSLEWQRSVWGVSSFLVLTTKLAACCWDLAERPHESEAAQHPRLSKKGTAVRTISLPMSSCPPFEQNTVLKSNSAKITTLRMCPLWYRLAGMKSSACVPES	1096821	1063380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328_1077399_1096715
910392	contig_5694_pilon	-	4558	3	Intergenic	novelGene_178872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3123	3524	88327	87926	FALSE	40	GAGTGGGGGAGAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKPIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYKDRYIDQWNGIENPDVNPSTYGQLIFNQGPKSIKWGTDSVFNKWCWQNRISICKKN	102896	86891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5694_pilon_-_88804_90522_91540_101267
910393	contig_7009_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_23595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAATATCTGATATAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416574	415541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_415500_416600
910394	contig_11656_pilon	+	4074	6	Intergenic	novelGene_54013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	133.147437076348	150	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	135	503	465719	508529	TRUE	60	GTAAAAAAAAAATTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKPLRLDTFMKTGSSIGI	464970	514356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_508478_508568_510823
910395	contig_12142_pilon	-	3333	19	Intergenic	novelGene_147797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	50	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCTGCGGCGTGACCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137300	87415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_87503_88920_89015_94355_94420_96206_96289_96970_97058_97696_97828_99018_99085_100327_100401_104917_105000_106948_106991_107579_107696_108715_108832_109513_109587_112305_112404_113365_113432_121924_121984_124833_124923_128234_128326_135483
910396	contig_9389_pilon	+	2519	3	Intergenic	novelGene_84153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	14	6	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	421	2436	1850596	1853941	FALSE	45	CTATGAATGTAAAAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETFRNLASVVSQQVDKGQIVSSEHLVMRFVRNNSWYTVLGEICEFHGIEEQHNNQGSHVRRLTVGLCESKEGKVKQRKEGTQCGEPFSKIAHLTSFKRTPARENPSEFRECGKAFKYHSSFKRHLRSHTGYDNYEFKECGVACSCTSYLRTHVKTLTGQKIYKCKECGITCSCSSSLTTHVRSHGREKPYECKEFGKALGEFSALIEHKNVQSGKQPYDGKEYGNTFSSFSSFSKHISIDSEVRPYECKECGKAFSKSSELTSHIRTHGDQPYKCKECGKAFSCASSLSKHKRIHSGERPYECKECGKAFSRSSNLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRYSSSLSKHKRIHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLITHIRSHSGERPYECKECGKAFSCASHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSSNLMNHIKTHSGERPYECRECGKAFSQLSKLTGHIRTHSGEQPYDCKECGKSFCDSSSLTTHIRTHSGERPYTCKECGKAFSQSSHLINHVRTHSGERPYKCKECGKAFSRSSHLTNHIRTQRGERPYECKECRKAFSWRSALNTHVRTHRGEKPYKCKECGKAFSQSSHLINHVRIHSGERPYECKECLKAFSQASSLTQHIRTHGGERPYECKE	1850175	1854024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1850630_1851591_1851743_1852110
910397	contig_12520_pilon	+	3560	1	Intergenic	novelGene_161093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCAAGGACTGTGAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621813	625373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_621800_625400
910398	contig_4180_pilon	+	1701	7	Intergenic	novelGene_8379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	1549.75134206176	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	143	679	875200	888134	TRUE	60	AGAGAACTAAATAGATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874282	890027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888217_889087
910399	contig_10737_pilon	+	2743	3	Intergenic	novelGene_133893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.5	23	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2229	2600	280575	280946	FALSE	20	CACTTATACACTGTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDWFKLRKIGVNIKLTTKETNKPTHQNKKQKHSGNTKSTTMKKMKRKYKKKNDSTRKMKWKKETNNNTKDIKMTARNSYLSIIMLNVNGLNAPIKRVAEWIKKHNPSICCLKETHLRHKDTN	268255	281089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_268390_277195_277341_278625
910400	contig_11825_pilon	+	2789	3	Intergenic	novelGene_155415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATTTGTATTGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89230	96208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_89285_92938_94785_95319
910401	contig_990_pilon	+	3003	2	Intergenic	novelGene_76073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	0	166	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGGCATTTGTTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088266	1091682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1090940_1091352
910402	contig_9311_pilon	+	3477	5	Intergenic	novelGene_178448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTAGTCGGTCACCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72962	204780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9311_pilon_+_73145_117328_118165_165533_165919_174103_175806_204408
910403	contig_14208_pilon	+	3652	1	Intergenic	novelGene_129098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	484	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2036	2389	211390	211743	NA	60	CTCAAAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILALAFNDSCPDFLIFCFLVVQLPALILLSEGAEVSRMGKAEAKCHHLLFTTILWVIHSTGKILSGLSLGSQFANQKPRILGSSRTVFVPKTTRGKRGNIFGYLPIHHHHVATLV	209354	213006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_209400_213000
910404	contig_9177_pilon	+	5061	35	Intergenic	novelGene_32551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	431	94	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	563	991	2759	3724	TRUE	10	CAGGCCCAGCCCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1710	18271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2101_2436_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589_7741_8489_8611_8687_8789_8903_9056_9149_9315_9403_9509_9727_9861_10294_10483_10577_10715_10963_11120_11613_11759_12844_12967_13080_13173_13274_13368_13554_13693_13895_14091_14297_14415_14809_15107_16255_16379_16549_16689_17446_17611_18199
910405	contig_2799_pilon	+	2982	6	Intergenic	novelGene_85540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1051	junction_1	280.611760266743	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	844	1422	704804	749051	FALSE	30	TCACTAATAATTTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCGAFVHKGCRESLASCAKVKMKVRHFWLKEGLQ	703960	750611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189_729365_748947
910406	contig_21104_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_175443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATAATGACTTAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9002	6319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21104_pilon_-_6300_9000
910407	contig_6740_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_142733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTTGTGACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753075	755246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_753100_755200
910408	contig_8538_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_4631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATTATCTACCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827499	825521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_825500_827500
910409	contig_12677_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_110709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
910411	contig_13760_pilon	+	3553	8	Intergenic	novelGene_61357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1074	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2691	3134	361079	363697	TRUE	15	ACTGTGGAGCCTGAGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDVHEGRALLQSGHLLLNGFRSRLARRPQRRPCWPAGCHSVWWSHHDSQTAVGCCLSLLLPSVKSWLCMIFSTMSSASIRVSSTQVGWLSIKSFFRRKERSDRCGGRGGRGGFSGGRCSRSLPSGPSTVMLRPPEALLLVDVLRR	358388	368644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_361182_362648_362719_362827_362948_363546_363747_363835_363937_366252_366411_366571_366615_368576
910412	contig_5125_pilon	-	1482	3	Intergenic	novelGene_43457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCCATTTCCAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59985	54473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_54545_58486_58988_59075
910413	contig_5620_pilon	+	2095	1	Intergenic	novelGene_161332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	104	478	146574	146948	NA	25	GACCAGATTTACTGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNDTTILENDMVLPQLEIPYDPAIPLLGIYPREVKAVTQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQRRHPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQMDKYYMRPLP	146470	148565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_146500_148600
910414	contig_3153_pilon	+	6828	8	Intergenic	novelGene_104625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_7	365.730468391962	237	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	438	923	95088	145130	FALSE	30	AAAATTTCCAGGTGTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEDAIKLAEGLTNLKKLCLLRLTHLSDIGEGMDYIVKSLSAEPCDFEEIQLVACCLSANAMKTLGQNLHNLVKLKILDLSENYLEKDGNEALHELVCRLNILEQLAALMLPWWCDVRVSLTSLLEQLKEAPQLIKLGMKNWRLTDAEIRILERETTGSI	57728	151035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937_63010_95022_95116_99967_100139_101885_101979_111196_111365_145104
910415	contig_10904_pilon	-	3644	7	Intergenic	novelGene_22688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	423.473238036754	9	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	210	875	661760	651590	TRUE	40	GAATGGAAGTCAGAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSEISSL	662738	583127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_585014_650706_651607_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662310_662445_662665
910416	contig_9109_pilon	-	1394	4	Intergenic	novelGene_175309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	103.708994574027	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	218	670	19046	17463	FALSE	10	CCTCAGTCTCTTGTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNDIWSSMVGEIYKLHGIEEQDDNQKTHVSMQPVFNRRHMVENLCESYEDDQCGQTFSWIPDVSVLKRTLIEAYRSECPECGKSFMDHSSLRRHIRSHSGCSACQCKQCGACSCRSYLSTSVSAFTGRKPYECKECGKTFRSVLRPNYT	20792	16738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9109_pilon_-_17491_17657_17991_18954_19136_20664
910417	contig_9297_pilon	+	3416	13	Intergenic	novelGene_69825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.0119412598121	215	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1184	1852	633557	744032	FALSE	25	TACCCTATTTTGCAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEILLKAVKRRKGSQKISGPQYRLEKQSEPNIAVDLESTLESQSTWEFCLVRENSSRADGTFEEDSQIDIATVQDMLSSHHYKSFKVSMIHRLRFTTDVQLGISGDKVEIDPVTNQKASTKFWIKQKPISIDSDLLCACDLAEEKSPSHAIFKLTYLSNHDYKHLYFESDAATINEIVLKVNYILESRASTARADYFAQKQRKLNRRTSFSFQKEKKSGQQ	473689	745596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_473753_473789_473937_514610_514939_517390_517481_539889_540039_605307_605481_617402_617584_633504_633615_675633_675742_696470_696612_713727_713866_739214_739313_743906
910418	contig_12919_pilon	+	4440	6	Intergenic	novelGene_75922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.850878827432	105	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	611	1204	868821	869458	FALSE	15	GTGGTGGTGGTAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESLLLKASSLLEKNRNFISEGKKLSRQSPKGSLQRSNDSLESFRTLVPETTGSGETLVLDTDVFLYLKQKCRCYEGTLKTFNVLSRERVDNDVTTIYLKSVQGGSQPDNVKHVKQLIKEYSYSLQLELRKDTIVLEGKENREQRTIKLACEQLSLIYLQVLVNCYRTHIDIIGSSSDIYLFRKQVMKLIGQKVSY	855495	872694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_855544_860068_860207_864196_864408_867787_867877_868696_868826_868869
910419	contig_5686_pilon	-	1558	1	Intergenic	novelGene_45298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	542	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCATCAAAAATATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95461	93903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93900_95500
910420	contig_3077_pilon	-	2809	4	Intergenic	novelGene_26779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_3	59.8349581952074	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	191	949	234303	221977	FALSE	10	ACTCAGCTTCTGGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVCVCVSIGDKLSTGQWTSAVKFTQRPGAPETDKEQSDRSHIGRSNVSCFRHYTLDASLPLRLRPESMEKLRCLRACVIRSLYHMYEPFAARISKNPAIPESTPSTLKNSKCLLFWCRKIVGNRQEPMWEFNFKFKKQPPRLKSKCMGGLQPPIQYEDVHTNPDQDCCLLQVTTLNFIFIPIVMGMIFTLFTISVSTDMRHHRVRLVFQDSPIHGGRKLRSEQGVQVILDPVHSVRLFDWWHPQYPFSLRA	234493	220116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_222163_227127_227284_229751_229833_233967
910421	contig_20951_pilon	-	5312	5	Intergenic	novelGene_43141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_4	107.30185226733	274	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	560	2710	356666	342274	FALSE	10	TTATGGCTTGCTTTTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSQELVSFKDVAVNFTQEEWQQLDSDEKIIYRDVMLENYSHLISLGFDITKPDVIIKLEQGEEPWIVEDEFPCQICPEEAWKVGDLIERIQGNEDKYSRQTVSINSRSLIEQRENICDKIYNVETNLVPSSIVSLNCVSCGKSLKSISELIISDGSYARKKPDECSECGKTHHGEKPYEFDQNGEAYSQNENILQKINILEKPFEYNECMEALKNEAVFITHKSTYMREKPYDWNDSGPDFIQMSNFNVYQRSRMEIKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYACNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHQRTHSGEKPYECNECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHAEEKLHECNECGKLAQFSNLTNHTTHLGENPYECNECGKIFLENSSFDGHHLLPKGEKSYACNICGKLFSDLSYYTEHYRSHSEEKPYGCNECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVFSQKSYLTVHYRTHSGEKPYECSECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNRNVLDVENFL	358171	339671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_344187_347580_347677_348732_348860_356651_356711_357656
910422	contig_12622_pilon	+	3076	7	Intergenic	novelGene_5841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_6	233.748202607469	10	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	2027	2764	460480	475513	FALSE	70	GGAAAAAAAAAAACAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	455345	475825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
910423	contig_8571_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_169186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	449	748	501263	500964	NA	45	AAGAATCTAGCCTTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTRYKRLMDHNYHSLHQTESSTTRWCSATTTDCSDRNQNRGSWGTSYHQESRARSRAHPLDRGPCADKLLVRGNTEEKKADRDKKPSPGADALNLDF	501711	499069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_499100_501700
910425	contig_7230_pilon	+	2898	4	Intergenic	novelGene_52569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTCTTAGGCATCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289156	347277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_291399_291441_291646_292119_292361_347066
910426	contig_7009_pilon	+	1983	6	Intergenic	novelGene_23618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	626.819080756162	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	385	984	444955	518263	FALSE	85	AGAAAAAAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	431116	519262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_435035_435244_444940_444995_453481_453602_512647_512816_517991
910427	contig_4486_pilon	-	2508	1	Intergenic	novelGene_38547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTACTTTAGATGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137012	134504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_134500_137000
910428	contig_9272_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_125896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGACGCTACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258169	256288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_256300_258200
910429	contig_8676_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_142210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391927	391164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_391200_391900
910430	contig_7179_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_78142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAAACATGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989266	991405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_989300_991400
910431	contig_3721_pilon	-	6398	5	Intergenic	novelGene_123832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	5234	5536	296109	295807	FALSE	30	TTCTAGAGAATCTCCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIFHKNIQLYPFLYQTWEPLYLFVVDYSIDDIVHLNKSLHLHLCLYSHQSFLECGIFFEEEQKYHASLCTQSTQYHHMFHCYFLQVYPTLLQPKILQQN	318036	294944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_296757_297635_298042_298134_298289_300509_300627_314127
910432	contig_8122_pilon	+	2824	1	Intergenic	novelGene_40222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCAGCACAGCAGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507518	510342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_507500_510300
910433	contig_2710_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_161781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCTTGAGTTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949863	952357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_949900_952400
910434	contig_233_pilon	+	5983	3	Intergenic	novelGene_14494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGGCTGCTGAGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56397	63977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_57825_58062_60239_61597
910435	contig_8978_pilon	+	1307	2	Intergenic	novelGene_49427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTAGTCCCAGCTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483417	500014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_483645_498934
910436	contig_6412_pilon	-	1655	1	Intergenic	novelGene_149966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATATATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440100	438445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_438400_440100
910437	contig_7247_pilon	+	6368	12	Intergenic	novelGene_176683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGATGTTGTGTGCCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35612	69793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_40540_41773_41883_43872_43983_48405_48547_50449_50543_52075_52200_52793_52916_54299_54433_59130_59340_63467_63638_67652_67847_69757
910438	contig_16722_pilon	-	3566	17	Intergenic	novelGene_118282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_9	274.49336854467	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	867	2604	415	3018	132864	92686	FALSE	30	AATAAATATTGGCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETKITTTEIIKRRDVGPYGIRSEYCIRKIICPIGVPEAPKETPTPQRKGLRSSALRPKRPETPKQTGPVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIAASTTSPTNSTTSTVSPAQKVMVAPISGSVAPGAKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSTSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGTPQQVVTQIIRGQPVSTAVSAPNAVSSAPGQKALTSSAPTASLQSPTSQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGQGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTSTTVSTTAAGTSEQRQSKLSPQTQVQQAKTLPPAQSSSVSPPETPPPTAQPSAQPQPPAQPPAPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPIQTQSSKPQAAVQCQPQSNVQGQSPVRVQSPPQTRIRPSTPSQVSPGQQPQVQTTASQPIAIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVVMKQNAVIEHLKQKKTMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKKDLKLKKEKDLAQAAAVAAALPVTAAPPAPPPSPPPALQPPGLLSTPTIPAASQKRKREEDKDSTSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDLCTNWYHGECVGITEKEAKKMDVYICNDCKRAQEGSSEELYCICRTPYDESQFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYERLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRL	143914	92137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_92693_96293_96481_103887_103973_105711_105905_106668_106843_109688_109997_115770_115997_116286_116370_121589_122078_122764_122988_125204_125423_130776_130886_131819_131972_132713_132961_136189_136233_136609_136761_143790
910439	contig_13823_pilon	-	6393	2	Intergenic	novelGene_145251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	348	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	3520	4878	244512	243154	TRUE	30	CTAATGAGCGGTTACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVTKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILASRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHTIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGIRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKMIKYLGINLTMDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFI	248031	170657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_171846_242826
910440	contig_15327_pilon	-	2370	15	Intergenic	novelGene_70747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	117.707979199997	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	564	2234	1051469	1042391	FALSE	70	AATGAATGAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPTLLHQATAEQQKRFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLFTQGKGYGLHAFIVPIREIGTHNPLPGITVGDIGPKFGYDEMDNGYLKMDNYRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPVSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARSLSKACTIAIRYSAVRHQSEIKPDEPEPQILDFQTQQYKLFPLLANAYAFQFVGAYMKETYYRINEDIDRGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTTNAGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVTFTPTCTFEGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVYGMVSYLNDLPSQRVQPQQVAVWPTVVDINNPDSLTEAYKLRAARLVEVAAKNLQAEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFSEKLHKIQDKSIQTVLRNLCLLYSLYGISQKAGDFLQGSIMTEPQITHVNQRIKELLTVIRPDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKKSPLNKTEVHESYYKHLKPLQSKL	1064546	1042254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1042442_1043091_1043299_1043418_1043563_1043657_1043764_1043877_1044058_1044474_1044666_1045131_1045295_1046422_1046593_1047041_1047158_1047299_1047420_1049071_1049180_1051354_1051505_1058666_1058839_1063935_1064096_1064350
910441	contig_5316_pilon	-	1811	11	Intergenic	novelGene_61204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGAGCAGAGCGAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550511	395999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_396221_453775_453966_474049_474255_511461_511608_521314_521377_521428_521502_523561_523610_540824_540999_543404_543535_544131_544267_550084
910442	contig_6364_pilon	-	5251	24	Intergenic	novelGene_51792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	99.1133089707072	262	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	1117	3276	1396995	1378139	FALSE	60	AAAAAATTCTAAATAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFLMTEARQHNTEIRMAVSKVADKMDHLMTKVEELQKHSVGNSLLIPGMSVTVETSMIMSNIQRIIQENERLKQEILEKSSRIEEQNDKISELIERNQRYVEQSNLMMEKRNNSLQTATENTQARVLHAEQDKARVTEELTAATAQVSHLQLKMTVHQKKETELQMQLTENLKETDLLRGQLAKLQAKLSELQETSEQAQSKFRSEKQNRKQLELKVTSLEEELTDLRAEKESLEKNLSERKKKSVQERCQAEEEIDEIRKTYQEELYKVRQLLKKARVSTDQATAEQLSLVQTELQTQWAAKCEHLLASAKDEHLQQYQEVCAQRDANQQNLTQLQEKYLALQAQVTVLTEQNEQYIKELENNKSQTSGNEAATTDPSEKVKKIMNQVFQSLRGEFELEESYNGRTILGTIMNTIKMVTLQLLNHQEQEKGESSSEEEEEGGGGARPQRPSQEQSISADSGLSQESMNREGQESPPVPLEQVAEEAIPSLPQTIPTPQDDVQRRKGETLESEELAEIKDGSLPPELACIPSQRVQGPPASIPPKPPGSVTVDPECEEILAASLMAAKSDDPLRKDFVGAVAPDGPLQESSTTPSLTSDPKKGDPLALGPESPGEPQPPELDKKEDLTSLTGPSKELLSIEAGSTDPAAVRSSHGSQHSSLSGDEEDDLFKGATLKVTKPKEDHEEEDEDEVSMKGCPPPAPLFGDDDDDDDIDWLG	1421841	1376163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1378217_1380541_1380639_1382149_1382878_1383149_1383258_1383899_1384026_1385066_1385220_1386043_1386200_1387880_1388018_1389690_1389863_1394975_1395079_1395893_1395989_1396486_1396595_1396896_1397007_1398414_1398530_1399923_1400031_1400507_1400549_1406369_1406451_1407788_1407858_1408768_1408919_1413050_1413150_1413482_1413558_1417008_1417182_1417539_1417625_1421731
910443	contig_12080_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_128361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1151	1516	96145	96510	NA	45	ATGTACATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSSPSVWSHSLVISHRNQTGVSVSKRRKMLAHRTELLKRQERRWPLDPCKPASTALPGPPPPARVSSFLCITTTICHCPIDSNPMCVRAELCSIGLPVADFSEVDHQAFLPQSLWVDSN	94994	97044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_95000_97000
910444	contig_16103_pilon	-	2345	19	Intergenic	novelGene_118918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCGATGTCATCATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794078	771085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_771158_772617_772698_773261_773372_776722_776925_777332_777428_777832_777880_778571_778686_780514_780572_782319_782376_784334_784418_785514_785688_788394_788594_789048_789327_789467_789641_790825_791015_791766_791823_792254_792430_792774_792849_793966
910445	contig_11896_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_88045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTCACTGTCTTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178139	179487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_178100_179500
910446	contig_12709_pilon	-	1514	2	Intergenic	novelGene_147413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCCAGTATTCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62223	53388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_54425_61745
910447	contig_7629_pilon	+	3711	2	Intergenic	novelGene_153577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCTTGGGCTACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322086	479676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_325298_479176
910448	contig_10482_pilon	+	3443	2	Intergenic	novelGene_152814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80426	87280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_81860_85270
910449	contig_11413_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_103213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	339	668	804075	803746	NA	70	AAAAAGAAAAAAAAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKKKKRVAAEAAYIQPNTSWDLDLWFRGLGSWFHGTSQLIGLIMCSVLPFYLLVHCIVPGVLKAYKRPSKAQLVSIHLEQQKKKSQEQQEDMECVASCLHEQLPPLP	804413	803102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_803100_804400
910450	contig_5556_pilon	+	4079	16	Intergenic	novelGene_173270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	98.0216302659775	354	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	49	1902	102745	199359	FALSE	70	AAATGTATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLTKRRQADTKAIQHLWAAIEIIRNQKQIANIDRITKYMSRVHGMHPKETTRQLSLAVKDGLIVETLTVGCKGSKAGIEQEGYWLPGDEIAYSMQPFSRTATPNKDWETENHDWYCFECHLPGEVLICDLCFRVYHSKCLSDEFRLRDSSSHWQCPVCRSIKKKNTNKQEMSTYLRFIVSRMKERAIDLNKKGKDNKHPMYRRLVHSAVDVPTIQEKVNEGKYRSYDEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWKSKNEDRGEEEAESSISSTSNEQLKVTQEPRAKKGRRNQSVEPKKEEPEPETEAVSSSQEIPTMPQPIEKVSVSTQTKKLSASSPRMLHRSTQTTNDGVCQSMCHDKYTKIFNDFKDRMKSDHKRETERVVREALEKLRSEMEEEKRQAVNKAVANMQGEMDRKCKQVKEKCKEEFVEEIKKLATQHKQLISQTKKKQWCYNCEEEAMYHCCWNTSYCSIKCQQEHWHAEHKRTCRRKR	41644	201536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_+_41674_102725_102861_152373_152534_160701_160747_163577_163740_176932_177011_177490_177584_179812_179901_180497_180554_181688_181767_183150_183270_186756_186965_187377_187447_188210_188484_188799_188986_199236
910451	contig_4732_pilon	+	294	1	Intergenic	novelGene_75490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAAAGGCCTGGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756514	756808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_756500_756800
910452	contig_13494_pilon	+	2696	1	Intergenic	novelGene_167503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAGAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12330	15026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_12300_15000
910453	contig_4305_pilon	-	3404	14	Intergenic	novelGene_136653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_13	46.1954940296026	208	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	485	2071	486538	460030	FALSE	35	CAATTTTCTAAACAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEATSSRAESTLQKSSLDVHPESNTGQHKSTLDAVMVSADMESSQDGDSNEDTTPGLDDFSGLSSYEKKRLKNISENANFFASLQLSESAARLREMIKKRQPSESKRKKPKKRENDGTGCRRSMRLLKVDPSEVSLPATPPQPAFVADENPLLPPGPLEMTPENRDDNDELFKGFLQTWEEMSKAGSKNTKELPSLKSYKANVSRMVISEETVCKVTKGSVLSLALHPSETRTLVAAGAKYGQIGLWDVTHQPKEEGVYVFHPHSQPVSCVYFSPANPAHILSLSYDGTVRCGDFSRAVFEEVYRNESSTFSSFDFLAEDASTLVVGHWDGSMSLVDRRTPGTSYEKLSKFSLEKIRTVHVHPVHRQYFVTAGLRDIHIYDARSLTPRGSQPLIALTEHTKSVASAYFSPITGNRLVTTCADSNLRIFDSSCIASQLPLLTTIRHNTNTGRWLTRFRAVWDPKQEDCIIVGSMAYPRRVEIFHETGKRLHSFLSVEYLASVCSINAMHPVRYILAGGNSSGKIHVFMN	490316	458696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_460286_462909_462964_464272_464426_465487_465706_469749_469909_472812_472967_473877_473919_474015_474118_478805_478936_481526_481583_483083_483177_486367_486770_487786_487920_490196
910454	contig_15135_pilon	-	5707	1	Intergenic	novelGene_119881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3195	3509	111869	111555	NA	30	CGCACTGCACCTTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIVWNSIRTNKSDLEEVQPECPLEARMVKPHLKYFGHQSLEDTMLGEVEGQPKRGRPSTRWIDTVAQTVGSNTTVVRMVQDWAVFRSFVHRVAMSQNQLDGT	115063	109356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_109400_115100
910455	SIRV5	+	1993	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	34	2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
910456	contig_12605_pilon	+	762	5	Intergenic	novelGene_64199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	12	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	23	391	3897	4829	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5015_5931_6005_6124
910457	contig_7747_pilon	+	3609	3	Intergenic	novelGene_178873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1492	1965	16300	17709	TRUE	75	GGAAAAAAAAAAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVACPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNQPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGGGKAHTANYQLFCLPLDAP	14808	48946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7747_pilon_+_16547_17482_17983_47575
910458	contig_8312_pilon	+	2971	1	Intergenic	novelGene_152885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1857	2228	271576	271947	NA	5	CCCTCCCTCCCTCATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPRVPVRDEGVVPVSEHFSLHPGFPSGLHPLPGQMLRIWITHILQTSVIPHVISQNGNPLIKVRRAYIVTFQGLRNLHVVVKKDQMLSCKSPEWKPVSRSLYIKKKKKSKKQNKIKQNKTL	269719	272690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_269700_272700
910459	contig_5947_pilon	-	1676	2	Intergenic	novelGene_101490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	529	junction_1	0	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAAAATGTTCTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393946	391383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_392503_393389
910460	contig_2799_pilon	-	2639	5	Intergenic	novelGene_85537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGTCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721224	694740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_696898_704623_704817_707591_707703_718651_718698_721092
910462	contig_348_pilon	-	1801	2	Intergenic	novelGene_67584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGACCATGGAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332432	215058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_-_215588_331160
910463	contig_7840_pilon	-	4194	1	Intergenic	novelGene_69043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTTCAAGTTGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382730	378536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_378500_382700
910464	contig_5605_pilon	+	1313	7	Intergenic	novelGene_143944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.9032381508359	5	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	63	863	417967	484951	FALSE	45	TTTGAAGGCAATACAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMETIESQQDGSVTASVAENESAHMQTQTGPNSIPTLAQVSVAGSGTGRGSPAVTVVQLPSGQTVHVIQTPQPSVIQSPQIQSVQVTTITETDESAESEGIIDCHKRREILSRRPSYRKILNELSSDVSGVPKIEEEKSEEEGTPPNIATMAVPTSIYQTSTGQYTTTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKAE	390960	485401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391019_417962_418087_446169_446308_450591_450690_450828_450972_472975_473133_484806
910465	contig_5297_pilon	-	869	8	Intergenic	novelGene_175663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	180.349434064393	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	429	441	869	44119	41645	FALSE	10	GTAAGCTGCTGGGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWASENGASVEGFEVVNFKEEGFGLRATRDIKAEELFLWVPRKLLMTVESAKNSVLGPLYSQDRILQAMGNITLAFHLLCERANPNSFWQPYIQTLPSEYDTPLYFDEDEVRYLQSTQAIHDVFSQYKNTARQYAYFYKVIQ	71507	41644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_41902_42216_42290_44020_44170_51189_51284_53526_53637_53747_53775_55398_55495_71444
910466	contig_14925_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_55228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCACACTCTCCTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38851	40947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_38900_40900
910467	contig_6898_pilon	+	2171	3	Intergenic	novelGene_35779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	4	387	124789	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124785	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_125818_126088
910468	contig_11026_pilon	-	3159	7	Intergenic	novelGene_167667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATATATATATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213432	165149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_165397_165525_165809_165852_166617_176618_176900_185032_185746_209656_209871_212775
910469	contig_13244_pilon	-	5884	8	Intergenic	novelGene_86992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2444	2842	468219	467720	FALSE	30	CTAACCAATGCGCAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLLHILVLWRILVQRSLVHHRWGATDLEWLVFLRWRKDLPSVEVLKLLSRGTLGDNHRTHPANLDCVQRDGAAFILNVDNALKQIGIAVMFGFTVMNIFHALPRRWCLGRCLKLGMQQSWPFASWSIRQ	475247	464677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_467775_467875_468654_469348_469453_469832_469976_470166_470235_470520_471867_471960_472128_475066
910470	contig_6175_pilon	+	4056	17	Intergenic	novelGene_16304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	227.330396944623	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	108	2162	1466806	1520939	FALSE	35	AGAAGGAAGAGTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1445214	1522833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1445309_1466792_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1518667_1518761_1520852
910471	contig_4093_pilon	-	3855	1	Intergenic	novelGene_27645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1346	1843	53139	52642	NA	35	CGGACCACAGGAACCACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKPAATIILNGERLKAYPFRMSTRRAFSLLLFGIVLDVLARAVRQEREIKGIQIGKEEVKLPLLADGTTIYVENPRDFTGKLLELIEEFSKMAEYKINIQKSVGFLNFNEENLEKEIREKIPFIIAPQKMKYLGISLTRNIKDLYKENYKLQNTTARNQKRPT	54484	50629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_50600_54500
910472	contig_9415_pilon	+	2274	2	Intergenic	novelGene_109915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAACACTGAACACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2138774	2212229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2138832_2210012
910473	contig_11281_pilon	+	3087	1	Intergenic	novelGene_125476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGGGGGGTCATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868223	871310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_868200_871300
910474	contig_4486_pilon	-	3810	2	Intergenic	novelGene_38548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGATGATTCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138976	134640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_137478_138003
910475	contig_19606_pilon	-	5294	1	Intergenic	novelGene_148279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATTAAAAAAAAAAAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67530	62236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_62200_67500
910476	contig_9183_pilon	-	6414	6	Intergenic	novelGene_40282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_5	520.967177468984	60	133	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	197	1705	323783	318047	TRUE	30	GCACCAAGGCCTGGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVSGPATGAGQSQGLWPEEGTLARKRPCAEEQKMQDTKPHENCDTKPLGKLSGPIFFKKNVLLSPP	325954	310545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_318347_320557_320727_322743_323834_325808
910477	contig_7707_pilon	+	5701	34	Intergenic	novelGene_72204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	89	junction_27	319.667897572296	245	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1698	5097	15	5111	688693	799461	FALSE	40	TAATACAAAATTATTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDNMQSDLRALSLECKKKFPPVKEAAESGIIKVKTIAARSTEILAALKENSSEVVQPFLMGCGTKEPKITQLCLAAIQRLMSHEVVSETAAGNIINMLWQLMENSLEELKLLQTVLVLLTTNTVVHDEALSKAIVLCFRLHFTKDNITNNTAAATVRQVVTVVFERMVAEDERHKVIIEQPVLVQGNSNRRSVSTLKPCAKDAYMLFQDLCQLVNADAPYWLVGMTEMTRTFGLELLESVLNDFPQVFLQHQEFSFLLKERVCPLVIKLFSPNIKFRQGSSTSSSPAPVEKPYFPICMRLLRVVSVLIKQFYSLLVTECEIFLSLLVKFLDADKPQWLRAVAVESIHRLCVQPQLLRSFCQSYDMKQHSTKVFRDIVNALGSFIQSLFLVPPTGNPSATTNQAGNNNTSGPASAPANSGMLGIGGGITLLPAFEYRGTWIPILTITIQGSAKATYLEMLDKVEPPTIPEGYAMSVAFHCLLDLVRGITSMIEGELGEAETECQTTTEAASSPAQSSEQQDLQSTSDQMDKEIVSRAVWEEMVNACWCGLLAALSLLLDASTDEAATENILKAELTMAALCGRLGLVTSRDAFITAICKGSLPPHYALTVLNTTTAATLSSKSYSIQGQSVTMISPSSDSHQQVVAVGQPLAVQPQGTVMLTSKNIQCMRTLLNLAHCHGAVLGTSWQLVLATLQHLVWILGLKPSSGGALKPGRAVEGPSTVLTTAVMTDLPVISNILSRLFESSQYLDDVSLHHLINALCSLSLEAMDMAYGNNKEPSLFAVAKLLETGLVNMHRIEVLWRPLTGHLLEVCQHPNSRMREWGAEALTSLIKAGLTFNHDPPLSQNQRLQLLLLNPLKEMSNINHPDIRLKQLECVLQILQSQGDSLGPGWPLVLGVMGAIRNDQGESLIRTAFQCLQLVVTDFLPTMPCTCLQIVVDVAGSFGLHNQELNISLTSIGLLWNISDYFFQRGETIEKELNKEEAAQQKQAEEKGVVLNRPFHPAPPFDCLWLCLYAKLGELCVDPRPAVRKSAGQTLFSTIGAHGTLLQHLTWHTVIWKVLFHLLDRVRESSTTADKEKIESGGGNILIHHSRDTAEKQWAETWVLTLAGVARIFNTRRYLLQPLGDFSRAWDVLLDHIQSAALSKNNEVSLAALKSFQEILQIVSPVRDSEKPETPPAVNVPVPVLIGPMSGPSLSRPFIRTDSIGERLGRYNSSEPPIVNDELEDLNLWWAAWNTWYKIGSESTKPPITFDKLTFIPSQPFLTALIQIFPALYQHIKTGFNMDDLQKLGVILHSAVSVPISSDASPFILPSYTEAVLTSLQEAVLTALDVLQKAICVGPENMQIMYPAIFDQLLAFVEFSCKPPQYGQLETKHIANAKYNQAEWVALNYVPFAERSLEVVVDLYQKTACHKAVVNEKVLQSIIKTLRVPLSLKYSCPSESTWKLAVSSLLKVLSIGLPVARQHASSGKFDSMWPELANTFEDFLFTKSVPPDNLSIQEFQRNESIDVEVVQLISTEILPYANFIPKEFVGQIMTMLNKGSIHSQSSSFTEAEIDIRLREEFSKMCFETLLQFSFSNKVTTPQEGYISRMALSVLLKRSQDVLHRYIEDERLSGKCPLPRQQVTEIIFVLKAVSTLIDSLKKTQPENVDGNTWAQVIALYPTLVECITCSSSEVCSALKEALVPFKDFMQPPASKVQNGES	688678	800051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_688756_700560_700625_709519_709648_710673_710806_711553_711684_721478_721577_722521_722648_727453_727649_737665_737791_738203_738344_741810_741965_745868_746102_748243_748326_749175_749361_750172_750286_750655_750761_751083_751165_751242_751317_751405_751497_754042_754145_755874_755986_757593_757770_759106_759270_760881_761176_762932_763132_766349_766979_773781_773926_774881_775011_778975_779167_782238_782300_783471_783596_786403_786612_792641_792725_799297
910479	contig_1213_pilon	+	3593	1	Intergenic	novelGene_76463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2791	3105	44693	45007	NA	70	ATTTAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGVWSDLVQICLHGFPVWSLSGSNSGYLLQLGSPEIHRQWPLALRGKPGQKEKVCNDLLNISLVNVGKIRKTNNDLRNTGNRGIILLTTLKLSNLHVILKEN	41902	45495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_41900_45500
910480	contig_9706_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_20912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	868	1308	110465	110025	NA	85	CTAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRENVVKMSCRHSNGIFFLQRIKSGTCFRAVSKPRANSASSFHPFQTSDGFGHKILEERFKKHTYTLTSIDHLPRPKNSAVPCCRYFSFYLDKKEEKKKTCYSQVDFDSWQPRVSQRAEPHGVFLAVISTWICAALETLPLWLH	111332	109244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_109200_111300
910481	contig_10235_pilon	+	2360	16	Intergenic	novelGene_46365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACCGTATTGCGCCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133589	141334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_133650_134092_134375_134585_134676_134781_134894_135016_135122_135232_135312_135606_135860_136063_136264_136712_136841_137349_137591_138212_138290_138445_138498_138738_138939_139059_139178_140339_140461_141092
910483	contig_678_pilon	-	2376	2	Intergenic	novelGene_167837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATGGGACAAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430097	417342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_417393_427771
910484	contig_4087_pilon	+	2501	2	Intergenic	novelGene_156067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCAAGAAATGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34151	42944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_34159_40450
910485	contig_9673_pilon	-	2710	2	Intergenic	novelGene_119176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	143	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1154	1615	156755	156294	TRUE	15	GCAGCGGAGGTGTGGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSHCFSACFSLLYLKRLPPDTIQSCRLSPASLTQLPPILPHYCHRGRIYNIYENHTISGIVAQPNRYTHFLGGHNSIHDRSSVTIPFIPPFLFCFVYEVVINFRLTSLVSFFRFCSFILLLRFLYLDWDLGDAVVWFTLRLLLSAVVGSLSE	157908	154898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_-_154987_155286
910486	contig_14871_pilon	-	1085	1	Intergenic	novelGene_63723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCACTCAATTACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288555	287470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_287500_288600
910487	contig_14474_pilon	+	2247	16	Intergenic	novelGene_144203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	248	junction_10	91.5247628908276	167	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2181	65	2245	6842	50744	FALSE	25	AATAGATGTTGTGTTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFPGGVHWVSVGKQDKSGLLMKLQNLCARLDQDNSFSQRLPLNIEEAKDRLRILMLHKHPRSLLILDDVWDPWVLKAFDNQCQILLTTRDKSVTDSVMGPKYVVPVESGLGKEKGLEILSLFVNMKKADLPEQAHSIIRECKGSPLVVSLIGALLRDFPNRWEYYLRQLQNKQFKRIRKSSFYDYEALDEAMSISVEMLREDIKNYYTDLSILQKDVKVPTKVLCILWDMETEEVEDILQEFVNKSLLFCDRNGRSFHYYLHDLQVDFLTEKNRSQLQDLHKKMITQFRRHHQLHRLSPDQEDCMYWYNFLAYHMASASMHKELCALMFSLDWIKAKTELVGPAHLIHEFVEYRHILDEKDYTVCENFQEFLSLNGHLLGRQPFPNIVQLGLCEPETSEVYQQAKLQAKQEVDSGMLYLEWINKKNIENLSRLVVRPHTDAVYHACFSEDGQRIASCGADKTLQVFKAETGEKLLEIKAHEDEVLCCAFSADDSFIATCSVDKKVKIWDSMTGNLVHTYDEHSEQVNCCHFTNDRHHLLLATASSDYFLKLWDLNQKECRNTMFGHTDSVNHCRFSPDDKLLASCSADGSLKLWDVRSANERKSINVKQILNAEETQEDMEVTVKCCSWSADGARIMVAANNIICLFDIDTSDQLAKIHTGHHSTIQYCDFSPCNHLVVVALSQYCVELWNIDPCLKVADCRGHLSWVHSVMFSPDGSSFLTSSDDQTIRLWETKKVCKNSVTVLKQ	6777	50746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_6964_9294_9408_9628_9761_11062_11302_11700_11869_12765_12898_15885_16000_16465_16651_21368_21496_22422_22549_24383_24516_29599_29726_36667_36827_44825_44955_48883_49010_50693
910488	contig_16535_pilon	-	2208	1	Intergenic	novelGene_167717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1167	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1399	1776	396321	395944	NA	30	CCTACTGGACTGTGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDTVLRSGHPVSHASRQASLSAPQPFGPRPGLCLAQANVTKLFSNPTSAWRHLLFQQAYCLKVLCSRSGRMGREAHCTVLNWSPGLVLLLRFLCCRFSLSPVLLLSVCLLSLGGFQPRDPVMD	397719	395511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_395500_397700
910489	contig_14727_pilon	-	6330	1	Intergenic	novelGene_56656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	3	344	325552	325211	NA	70	AAAAAAAAAAATGCTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLKVSTCALKESLISCSNRAAIAENQTQRLTLRVAELQHQLNCQPLKVSKVKVRALIGKKCNPEIWDGDVWADNQKAGDAEPLNSAESLLRREAALSHLKRLLRVSLLNHPPQ	325554	319224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_319200_325600
910490	contig_9706_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_21037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTATGGTGGTCAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635424	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_633800_635400
910491	contig_8161_pilon	-	1519	2	Intergenic	novelGene_156764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	694	1056	303060	302698	FALSE	60	AGGAAATAATAAGAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVISTTKDKEGHYIMTEGSIHQKDITIINIYALNNRAPKYVKQTLTALKREIDSSTILVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNEDTEELNATINQRDLKGIY	554935	302234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_303128_554309
910492	contig_18544_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_152748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAAAAAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43908	45835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_43900_45800
910493	contig_6344_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_157092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	596	1666	779186	780256	NA	15	ACATTTCTAGCCTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGRLTGHWCATSLCLSHPPEPYRFHPELWCSSRSVPLDRQGYGQIKVVRADNDTLGCICDRSKLGEDMLCLLHGKSHMVQPGSEMEDLLCAKESPYLDTVQVMKWFQTSLTRAWHRIAHKYEFDLAFGQLDTPGSLKIRFRSGKFMPFNLIPVIQCEDSDLYFVSHLPRGPSRWTSASSTDWLLSFAVYERHFLRVTSKALPEGACHLSCLQIAAFLLSKQSRLTGPSGLSHYHLKTALLHLLLARRATDWKAGQLDTRLQELLRFLEKSLLEKKLYHFFIGNRKVPEAMGLPEAIRRAEPLNLFQPFVLQRSLYRKTVDSFYEMLKNAPALISEYSLHIPSDHASLPQKAVVL	778590	782579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_778600_782600
910494	contig_2596_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_53504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAAAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017880	1020688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1017900_1020700
910495	contig_8954_pilon	+	5394	1	Intergenic	novelGene_130297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAACTAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179615	185009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_179600_185000
910496	contig_15039_pilon	+	2450	2	Intergenic	novelGene_110101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	125	445	5227	5547	TRUE	85	AAACCAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWCFLKKLKIEVPEIRVVIRIDTCTPMFVAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWITKLWYIHTMEYYTIIKNNDESAKHLTTWMNLEGIMLSEISHKRTNIV	5102	205207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_5759_203413
910497	contig_5316_pilon	+	7043	1	Intergenic	novelGene_61222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	257	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	5026	5334	418472	418780	NA	85	AAAAAAAGAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHIQVYVRGDSTVVLVIFKKVALGSILTHGNSVYVRVDPCSKGFSLVGLSEVDHQTFLPRSFWVDLNHQPFDHTLQGQNYKSVNLLVPAIRQLYIDKPDFS	413446	420489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_413400_420500
910498	contig_11493_pilon	-	1463	2	Intergenic	novelGene_143695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCCAGCATGGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203775	201702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_202592_203201
910499	contig_8866_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_77823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGGCCGTGCCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558766	560839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_560503_560675
910500	contig_9668_pilon	+	3106	2	Intergenic	novelGene_58217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	482	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	282	650	541342	541710	FALSE	15	CCAGGCTGCCTGTGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKGSVSSSSMIFSVFSVFSSCSGTLIARKFLLLIVSHIIPTVSSFLFFLFSEFSSNRVVSKFLSSISLILSSTVSDLLLSPSMTLSISEILFIFWISNCRFCMISSCEFILAFCSSVFS	540951	544166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_541102_541210
910501	contig_826_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_154947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	394	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGTTTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345847	348016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_345800_348000
910502	contig_7378_pilon	+	1942	2	Intergenic	novelGene_120304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1417	1881	688100	689519	FALSE	45	CAGGAGACAGGAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEPVGCAFFVVCSSVGMVLFTSFSNGQGQSLSYGAAGQVQQKGRGWNGLSVACTGADRAGQGVSAGQVLVDCACAVWGCHAQHMMQIGRRGGVWWQRPAKWLPSHAALHSPSRRGRDGIQWQVFRRKEGKMVERETRNREKQKKKNPQGGPLT	686683	689580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_688380_689334
910503	contig_6946_pilon	+	3307	6	Intergenic	novelGene_59745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	15.6384142418597	399	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	24	1472	1729	45946	FALSE	40	AATTTTATTGATATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHVDKLDMFRNMPDILHHLTTDRSTQIHACRHPKAEEYFQWNKLPCGITSKNRIPLHTISIKPSTIWFGERTRKTHVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYIRPMNAYANVIPVGTTMDKVTEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTAHLDSEEEDDDLFDDPPPVPLRHKVPNQETLHPEVFSMTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYLYEKLATGESVIVGRKKKPHS	1705	47781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_28232_28288_35894_35984_38551_38647_44954
910504	contig_6058_pilon	-	1606	6	Intergenic	novelGene_172413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	477.36417963647	4	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	789	1445	390928	385415	FALSE	40	TAAGTGTCAAGAAACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	401601	385253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_397985_398065_401302
910505	contig_12079_pilon	+	1870	6	Intergenic	novelGene_67422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	1264	1869	580987	598147	FALSE	20	TCTCTAGTTGGGGACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLLLGTLPLLLQLQGSLDLLGKFFLGLLGFLLIVLQPQHQFFLLPHHLLFLPLNSFSPLLLSFQLLPLQLFLVLLLAGLGLHLLHLNGVGLATTHVQLMVPHTQLQDPLVDPQTRGVEYEVRCLLVNGLDDKLLVIERDVSDFTPREANLWGQLIIFLINVQPKGINSQPQVCSFLIFYLKIVDSVHLQVLRDLQILQHSA	579723	598148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_580992_584238_584305_585247_585378_585891_586056_591616_591713_598002
910506	contig_14223_pilon	-	4019	17	Intergenic	novelGene_156970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	294	junction_11	96.7508882388167	301	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	16	1632	36125	11518	FALSE	30	CTTCCTTTACAAATAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSGRSSFTSLVVGVFVVYVVHTCWVMYGIVYTRPCAGDGNCIQPYLARRPKLQLSVYTTTRSNLGTENNVDLVLNVEDFDVESKFERTVNVSVPKKTRNNGTLYAYIFLHHAGILPWHDGKQVHLVSPLTTYMVPKPEEINLLTGESATQQIEAEKKQTNALDEPVSHWRPRLTLNVMVDDFVFDGSSLPADVHRYMKMIQLGKTVHYLPILFIDQLSNRVKDLMVINRSTTELPLTVSYDKISLGKLRFWIHMQDAVYSLQQFGFSEKDADEVKGIFVDTNLYFLALTFFVAAFHLLFDFLAFKNDISFWKKKKSMIGMSTKAVLWRCFSTVVIFLFLLDEQTSLLVLIPAGIGAAIELWKVKKALKMTIVWRGLRPEFQFGTYSESERKTEEYDTQAMKYLSYLLYPLCIGGAVYSLLNIKYKSWYSWLINSFVNGVYAFGFLFMLPQLFVNYKMKSVAHLPWKAFTYKAFNTFIDDVFAFIITMPTSHRLACFRDDVVFLVYLYQRWLYPVDKSRVNEFGESYEEKPKWKAHTD	36140	9130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_-_11603_14638_14755_15808_15854_15966_16023_17166_17202_18227_18311_19331_19383_20737_20804_22934_23039_26444_26530_27578_27674_28118_28237_30273_30353_31615_31762_32865_33056_35098_35200_35963
910507	contig_6058_pilon	-	2342	9	Intergenic	novelGene_172367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_6	50.5925822132059	187	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	152	1225	255318	239178	FALSE	0	CCCTGTGTGCTCGGCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVEKTTNRSEQKSRKFLKSLIRKQPQELLLVIGTGVSAAVAPGIPALCSWRGCIEAVIEAAEQLEVLHPGDIAEFRRKMTKDRDLLVVAHDLIRKMSPRTGDTKPNFFQDCLMEIFDNLEQHIQNPLVLQCILSLMERGTMVLTTNYDNLLEIFGQQQSRPMESLDLKDKSKVLQWARGHIRYGVLHIHGLYTDPCGMVLDPSGYKDVTQDPEVMEALQNLYRTRSFLFVGCGETLRDQIFQALFLYSVPNKVDLEHYMVVLKENEDHFFKHQADMLLHGIKVVSYGDCFDCFPGYVQDLTMQICRQCSPDADRVDSTTFLGNACQDCAKRKLEENGIEVSKRLRQSDTDDAGGS	259120	238060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_239198_242721_242806_243703_243737_245311_245598_246881_247011_249235_249458_254038_254292_255271_255328_258978
910508	contig_13067_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_141343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44154	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44200
910509	contig_12250_pilon	-	2634	17	Intergenic	novelGene_80668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	70.6472033682155	212	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	365	2554	388318	381308	FALSE	10	TTTGCCAGGCTTCTTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEFTPLLREIASGPLTRPSVPGSTPGPCFLCGSAPGALHCPACKQTLCSACDSLFHGHPSRAHHLRQTLPGTPQAPNLIPSLSAPAPPRPQSTSLLALGDSALLSPDPASARLPWHCAACTMRNKPWAVLCVACDRPRGCKGLGLGVESPQGAGGPEPELARGQWACQSCTFENESAAVLCAICERPRLAQPPSLVVDSHDSGICLQPLQQGEALLSSSQTQAWSCIHCTFCNSGPGWVCAMCNRTSSPIPAQHTPQPHASSLEERHPEPGPPQRLSAPLPGSCGDPEKQRQDKMQEEGLQLVMMVREGEAAGACPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELPYVLEMVAELAGQRDPGLGAFSCQEARKAWLDRLGNLDEAVEECVRARRRKVKELQSLGFGPEEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDSGPEPTPSWDGPDKQSLVRRLLAVYALPSWGRAELALSLLQETPRNYELGDVVEAVRHSHDRAFLRRLLAQECAVCSWALPRNRMQALTSCECTICPDCFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDTQLLSYFSTLDIQLRESLEPDAYALFHKKLTEGVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQWEEQHRGRSCEDFQNWKRTNDPEYQAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCKKSLHGHHPRDCLFYLRDWTPLRLQKLLQGNAIMFNTEPPAGARAVPGGGCRVMEQKEVPNGLRDEACGKETPAGYAGLCQSHYKEYLVSLINAHSLDPATLYEVEELETATERYLHVRPQPLAGEDIPAYQARLLQKLTEEVPLGQSIPRRRK	389409	381227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_381362_381453_381623_381918_382016_382743_382802_382950_383037_383405_383454_383568_383684_384737_384828_384918_385018_385100_385275_386482_386690_386793_386980_387087_387337_387595_387887_388051_388440_388919_389098_389344
910510	contig_1735_pilon	-	3762	1	Intergenic	novelGene_106899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTTTCCAGGGATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139773	136011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_136000_139800
910511	contig_14970_pilon	-	1874	10	Intergenic	novelGene_45009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1474	1788	188827	177322	TRUE	10	GAGTCCCCAGGCTGCGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232249	136180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192205_196136_196255_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
910512	contig_3747_pilon	+	2295	9	Intergenic	novelGene_24784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3826.39692628718	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	331	1506	201313	203804	TRUE	25	AAAATGTTGAGTTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200982	205202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_203870_204478
910513	contig_13021_pilon	-	3651	3	Intergenic	novelGene_8281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	258.5	95	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2460	2861	253082	252681	TRUE	15	TGAGACTCCTTCCTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKSNHIALGKSAAKDLFKMLKGKDVTLITKVRLTQAMVFSITSYVCESWKMNKEDGRRIDAFELWCWRRILSIPWTDKTTNKSILEVVHPEGSLEAKMARVHLMYFGHVIRRDQPLEKDIMLWKVEGQ	255541	249616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249915_251082_251152_252257
910514	contig_5878_pilon	+	1230	12	Intergenic	novelGene_145719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTAAGAGAGAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202735	246177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_203104_213578_213649_214925_214999_215168_215282_216486_216535_219427_219496_221819_221887_223064_223189_229677_229773_244459_244556_244657_244709_246120
910515	contig_7272_pilon	+	2706	8	Intergenic	novelGene_25392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	120.055769353672	191	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	42	1172	750014	769117	FALSE	20	TTTGTGTTTCATAATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAPAPSTSLALIMSTLYATSLCVFDKTTSSSSLCLPPLSWKPPLLRLSLHLQWIMSSLTLCMLSILRYLLTQHLTLWHPPPPTHVASAAAPVPQHLAPGHQPVSHHIPATAPPAQRLHPPGHQPVSHHIPATAPPAQRLHPHEVMQRMEVQRRRMMQHPTRAHERPPPHPHRMHPNYGHGHHIHVPQTMSSHPRQAPERSAWELGIEAGVTAATYTPGALHPHLAHYHAPPRLHHLQLGALPLMVPDMAGYPHIRYISSGLDGTSFRGPFRGNFEELIHLEERLGNVNRGASQGTIERCTYPHKYKKVTTDWFSQRKLHCKQDGEEGTEEDTEEKCTICLSILEEGEDVRRLPCMHLFHQVCVDQWLITNKKCPICRVDIEAQLPSES	749972	770651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_750040_757778_758196_759891_760018_760750_760878_763506_763600_766027_766124_767135_767264_768999
910516	contig_13453_pilon	+	1542	11	Intergenic	novelGene_146722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	112.162560598446	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	628	1542	135850	149288	FALSE	65	GAAAAGAAAAAGGAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDALPEGFSQEFEEQQPKSRPKFQSPQIQATISPPVQPKTRKQEEDSKIKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQNEEEKSENSKSLEEEEKFDPNERYLHLSAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKDAQEKIRKFQREMETLEDHPVFNPAIKILHQQNEKKKPLLATEGGSALNFNLFEKSAAATEEEKDKKKEPHDVRNFDYTARSWTGKSPKQFLIDWVRKNLPKSPNPSFEKVPVGRYWKCRVRVIKSEDDVLVACPTILTEDSMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDA	126513	149288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_126702_131069_131184_132536_132667_135654_135854_136355_136502_139216_139346_141918_142046_145315_145475_147267_147434_147859_147984_149228
910517	contig_11855_pilon	+	5249	29	Intergenic	novelGene_66908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_26	96.2847074979157	238	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1257	3774	82	3855	776084	912090	FALSE	75	AAAGGAAAAAAAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVVAVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKKDLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLERTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGLFSLPAGDGLLTPDTQKGGETPGSEQWKFQDLSQPRSNTSLKDELSDVSQGGSKATTPASTAASDVATIPTDTPLKEDSEGFVKATDTSDKSEISKHIEVQVAQETRNASTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMDKDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLGMGREVENLILENTQLLETKNALNVVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEEKNKELEEELRKARAEAEDARQKAKDDDDSDIPTAQRKRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVTNGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDASMKLWCAVGVNLSGGKTRDGGSVVGASVFYKDVTALDTEGGKQRSASQSSLDKLDQELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVIIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDYPAGEEISESSQVDKASLCGSVTSNSSAETDSLLGGITVVGCTTEGVTGAATSPSTNGASPVTEKPPETEAENSEVDENVPTAEEATEATEGNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGVQIPEDLSPVYQLSSDSDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHSSLAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNGVIISIPLTETNKTSGAPGNRPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSGSSGTDLAADKAGPSAQEPGSQTPLKSMLVISGGEGYIDFRMGDEGGESELLGEDLPLEPSLAKAERSHLIVWQVMYGSE	776002	913484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_776237_825590_825712_842967_843039_848822_848918_854369_854521_867853_868062_868671_868772_873233_873356_879716_879775_880961_881115_881613_881666_884278_884410_886015_886073_887181_887356_888434_888565_889262_889353_889818_889987_890415_890588_891390_891610_891907_892104_893427_893554_895047_895129_895847_895916_897838_897988_899051_899224_900972_901087_903507_903685_906714_906865_911974
910518	contig_13481_pilon	+	2056	6	Intergenic	novelGene_119479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	366	851	1305851	1306336	TRUE	40	AAAACCACTGCTACCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPLRQQNLGTLSPRKLKLQPNQPTTFQNPSRLIESFKPATGVSEAAAGWSSGSYSKAEQTGKVFTLNQFHSGNEKEAPKSASHSFSAAPREVCLQRCDVLFICSVVRGAGAGQLELLGRVGQLEGSVGVGRVGQQCALPFQHVSHPFEQVQETKGQGSLS	1305485	1326494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1306348_1308588_1308656_1309838_1309958_1318639_1318788_1321351_1321443_1325725
910519	contig_6612_pilon	-	8780	3	Intergenic	novelGene_148169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	372.5	357	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	5409	5786	50271	46664	FALSE	25	AGAGTGTGGATCCTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYAIPETYDTERIKLPQEQYQLPQTLVTIPPPPHSLHQTPQMLLLTPSSSFFTQNMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQVPSSCFDSLCLLTT	56794	43669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_46877_50106_51079_52193
910520	contig_2069_pilon	-	4096	1	Intergenic	novelGene_23301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGAACACTCCCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465147	461051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_461100_465100
910521	contig_7378_pilon	-	7544	2	Intergenic	novelGene_120284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	864	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	5024	5455	592364	591933	TRUE	35	GAAGTCTAATGTGTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDNIYKTLKEKNCQPRIICPEKLSFKYDGEIRTFPDKQKIREYVKTKPNLQELLKGVLRCENKQLWLTG	597387	586515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_587789_591116
910522	contig_12935_pilon	-	1803	3	Intergenic	novelGene_165713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAGGTTTTGCTAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73746	443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_2034_12419_12611_73724
910523	contig_5954_pilon	+	2259	2	Intergenic	novelGene_28472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAGAAATGATGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186894	191309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_187752_189907
910524	contig_6163_pilon	-	673	5	Intergenic	novelGene_103813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	366.02458933793	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	26	517	93933	76115	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPAAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRFRGWQDPRLEWRKWYQSSCAGWKTHRPHHLFAVQPQVHDLCQCMFQHGLLVAYH	93958	75958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_86907_86975_89577_89676_93772
910525	contig_2799_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_85597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGATTGTTGCTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784156	786317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_784200_786300
910526	contig_2310_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_71635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481399	482807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_481400_482800
910529	contig_405_pilon	-	5677	1	Intergenic	novelGene_135330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3811	4155	604787	604443	NA	35	AGAAGGAAGGAGTAGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEASSGTYSEECPLFHPTPTPTFFNAFLFRRTVTLKYLISLFLENSCFLDNPPLTKVSSPIGHPPTVVIPIQTNIHRAPKMVDQYAIEQCYSKVWSAGSVGLHAVCYQPIER	608597	602920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_602900_608600
910530	contig_10058_pilon	+	2868	11	Intergenic	novelGene_67724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	163.105763233553	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	67	885	72602	99369	TRUE	25	TTCACATTGAGTTTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72535	101637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_99623_99685_100798_100893
910531	contig_11754_pilon	-	3474	3	Intergenic	novelGene_176976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATGAGATACAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51068	42259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_-_42983_47757_49890_50449
910532	contig_7171_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_101251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACTAGTGAGTTCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762415	761485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_761500_762400
910533	contig_12677_pilon	+	793	1	Intergenic	novelGene_110846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30807	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAGAAACGATAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3700
910534	contig_17602_pilon	-	4633	13	Intergenic	novelGene_174496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	61	junction_10	53.4696175411794	199	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	97	1812	89826	26148	FALSE	15	TTTTATATCGATTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLLHYCLLALTQGIVVNGLVNISISTIEKRYEMKSSLTGLISSSYDISFCVLSIFVSFFGERGHKPRWLAFASFMIGLGALVFSLPQFFSGEYQLGSIFEDTCLATRNSTSCTSSASSLSNYLYVFILGQLLLGTGGTPLYTLGTAFIDDSVPTHKSSLYIGIGYSMSILGPAIGYVLGGQLLTIYIDTAMGRSTGINKDDPRWLGAWWIGFLLAWLFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAKIQAGKISQAHQDKSSSIRQADENFGKSFKDIPAALKNLMRNTVFMCLVLSTSSEALVTTGFATFLPKFIENQFGLSSSFAATLGGAVLIPGAALGQILGGVIVSKFKLTCKNTMKFSLCTSVVALVLSFVFVYTKCENGPFAGVLEPYKGTGELRNLTAPCNANCNCLRSYYYPVCGEDRVQYFSPCFAGCTNSVSERQPKVYYNCSCIEGTIEITSAESFYFEAKPGKCETQCANLPIFLGIFFVTLIFTFMAGTPITVSILRCVNNKQRSLALGIQFMFLRLLGTIPGPIVFGITIDSTCVLWDINECGVKGACWVYNNIKMAHMLVAISVTCKFITIFFNGLAVVLYRPPPSDTDVSFQKEL	94897	23326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_-_26252_28417_28556_29991_30057_31842_32031_36589_36744_43091_43288_43664_43810_55016_55136_56264_56387_61349_61447_65226_65410_89621_89886_94860
910535	contig_14219_pilon	+	1699	1	Intergenic	novelGene_54353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAGAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851399	853098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_851400_853100
910536	contig_8273_pilon	-	3518	1	Intergenic	novelGene_113103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGATAGCAGTTTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522515	518997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_519000_522500
910537	contig_6740_pilon	-	5038	1	Intergenic	novelGene_142718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	480	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGTTTGCGTAGCTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733631	728593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_728600_733600
910538	contig_4876_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_137895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1870	2217	355656	355309	NA	45	TAAATTTCATAGTAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKQQLEIQKINNKISEMDSVIKGLKNRFETVEDRIGGIINKHLYKTLFEENLEKRTKKNEDTLKIMWDTIKSKNFRVIAVPERGENRIHRILEELLTENFPNVMKGEKLAIQEA	357525	354677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_354700_357500
910539	contig_4232_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_63330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTATCTGCGAGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466956	468067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
910540	contig_2888_pilon	+	3897	25	Intergenic	novelGene_151483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	65.7799229544159	229	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	1432	3288	44947	84985	FALSE	20	ACATGTTTAATTGCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVDELFSSHPDLDSDSELDRAVTQISVDLVDDYPASDPRWAESVPEEAPGFSNTSLIILHQLEDKMKAHSFLMDFIHQVGLFGRLSTFVVRRMPMATRLLLCEHAEKLSAAIVLKNHHSRLSDLVNTAILIALNKRECEIPSNLTPADVFFREVSQVDTIFECLLEHEEQVLKDTSLESVEWAEMVINVNNILKDMLQAASHYRQNRSSLYRREESLGKEPEYVPWTATSGPSGIRTAIVRQHGIVLKMIYPQADSTLRNILTEQLVALVDCFLDGYVSQLKSLDKSSDQERYNNLEMEYLQKRTDLLSPLLTLGQHQWAASLAEKYCDFDILVQMCEQTDNQTRLQRYMTQFADQNFSDFLFRWYLEKGKRGKLLSQPISQHGQLASFLQAHEHLSWLHEINSEELEKAHATLLGLANMETRYFAKKKTLLGLSKLAALASDFSEDILQEKIEEMAEQERFLLHQETLPEQLLTEKQLNLSAMPVLTAPQLISLYICEENRRANEYDFKKALDLLEYINEEEDVNINDLKLEILCKALQRDNWSSSDGKDDPIELSKDSIFVKILQKLLKDGIQLSEYLPEVKDLLQADHLGNLKANPYFEFVLKANYEYYVQGQM	3226	85594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_3347_13326_13431_14698_14807_24625_24761_25348_25520_28060_28217_28527_28599_31254_31403_32748_32897_33874_34033_35624_35715_44924_45089_49743_49839_51309_51535_62634_62758_63487_63588_64154_64407_65343_65478_68033_68193_68820_68957_74130_74250_76573_76655_79515_79581_80892_80982_84848
910541	contig_6208_pilon	-	3435	11	Intergenic	novelGene_53024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	483.773666087769	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	141	2054	513736	493256	TRUE	25	ATATGTGACTTCCAGTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETERWWEKLWKIPECIRGWDDQLKHHVPSQPAFQVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQEREGGKSPFTLENTRTHRDAVLSMTVVKIIIL	530178	489415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_490439_492897_493356_493404_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505104_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_530049
910542	contig_5947_pilon	-	3268	2	Intergenic	novelGene_101579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAAAATGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832779	828873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_829787_830424
910543	contig_13702_pilon	+	1098	2	Intergenic	novelGene_102645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	772	1071	211071	211370	FALSE	90	AAGAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210119	211397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210575_210754
910544	contig_14687_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_107951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1149	1640	580058	579567	NA	20	GTCCCCACAGCCATTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFEIPEVMAIPFETKAAQLLVSLVSSASASVSCDLLALRPHACICPAGASVGSSTGKCPEAPYSSRKPPAHRHSAPLLRGSWVGRPSSTDKCPEAPLSARKPPAHRHSALSLRGLSPVLSHTGLLVLLLLVLCCCRFSAAVGSLLLLVLCHCCTSVHSQF	581206	579258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_579300_581200
910545	contig_13067_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_141342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44153	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44200
910546	contig_12866_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_174649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTCAATTTTTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657039	659155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_657000_659200
910547	contig_6873_pilon	+	2725	1	Intergenic	novelGene_129822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGCAAAGTATCAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431705	434430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_431700_434400
910548	contig_6576_pilon	-	3038	15	Intergenic	novelGene_42244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	704.231742353876	6	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	510	1394	329191	322526	TRUE	75	AAAAAAAAGTTGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339497	291094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_292503_315372_315449_319388_319444_322202_322285_322502_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330841_330914_331028_331200_332093_332203_339389
910549	contig_12841_pilon	-	2103	1	Intergenic	novelGene_55900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAAAAAAAAAAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909493	907390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_907400_909500
910550	contig_11034_pilon	-	2449	19	Intergenic	novelGene_175020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	46.071870853598	1	62	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	193	999	169539	149888	TRUE	30	ATCTCTGGGAAAGGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAWEEIRRLAADFQRAQFAEATQRLSERNCIEIVNKLIAQKQLEVVHTLDGKEYITPAQISKEMKDELHVRGGRVNIVDLQQVINVDLTHIENRIGDIIKSEKQVQLVLGQLIDENYLDRLAEEVNDKLQESGQVTISELCKTYDLPGNFLTQALTQRLGRIINGHIDLDNRGVIFTEAFVARHKARVRGLFSAITRPTAVNPLISKYGFQEQLLYSVLEELVTSGRLRGTVVGGRQDKAVFVPDIYSRTCVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDIAPLLPSSLSVEDAAMLLQQVMRAFSKQTSAVVFSDTVVVSEKFINDCIELFRNEK	171114	138739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11034_pilon_-_139204_139835_140017_140824_140911_141256_141338_142543_142675_142753_142918_144261_144380_147258_147377_149780_149902_151959_152111_153304_153388_154778_154878_158969_159029_165306_165438_167681_167797_168328_168427_169082_169112_169511_169658_171040
910551	contig_9389_pilon	-	1479	3	Intergenic	novelGene_84057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	220.5	179	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCACTTGCCCCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755680	751299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_752443_755168_755405_755580
910552	contig_14792_pilon	+	2740	3	Intergenic	novelGene_170491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAATAAACCAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57392	61355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_57593_57666_57741_58889
910553	contig_9389_pilon	+	1308	2	Intergenic	novelGene_84004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAGAGTCTGTGTAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519335	521191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_520216_520763
910554	contig_6084_pilon	+	1082	4	Intergenic	novelGene_127054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_3	14.8996644257513	226	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	17	841	413016	418549	FALSE	25	GTTATATCATGGTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVAVAVESLAGVKARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAGERPLRLNPGVRSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGGGGGGVYWVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVIAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLAFEGATKRNRPNVQVGDLIYGQFVVANKDMEPEMVCIDSCGRANGMGVIGQDGLLFKVTLGLIRKLLAPDCEIIQEVGKLYPLEIVFGMNGRIWVKAKTIQQTLILANILEACEHMTTDQRKQIFSRLAER	412999	418790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_413337_414082_414233_415928_416081_418347
910555	contig_6344_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_157121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1202268	1199934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1199900_1202300
910556	contig_10948_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_124958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	260	604	23639	23295	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPKYYSLHQTESGTTRWHPATTTDCSDRDHNTGSQTELDKNVEILTHKKKTRPYWSDRDWRNPESMALGHLFSDLMKSLLRFILQRKIRQNETKGGTSAQGQRLESRRVEESW	23898	22302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_22300_23900
910557	contig_3986_pilon	+	4275	1	Intergenic	novelGene_52718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	1846	2499	90094	90747	NA	55	TCAGAAAATAGGTAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAKVPGSFVTECVVQKLSPTVLGGQACLGILGADTSLWLQWCMMQGVKQGPVGCPQLPSQWACPCPLECIVGVGYSQSLAPHAIGWRNWWVPLSLRLQLGAMPTCPASKALVLVIEWGEGCCMSVDPLHQLLGKEVGALDWAESYCLKGCSSVECHRSAAPTWVLSVKMDVSWEPCLPYANVDVLCCLGQQGTGVGDPRGWRALQACGLPVSVAG	88248	92523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_88200_92500
910558	contig_6898_pilon	-	2715	7	Intergenic	novelGene_35755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2111	2437	124838	122725	TRUE	40	TGATGGGAAACCAGCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127701	119611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126549_126827
910559	contig_854_pilon	+	2206	8	Intergenic	novelGene_36721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2625.2705827501	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	73	924	1710642	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1710569	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715052_1715192
910560	contig_12837_pilon	+	4537	1	Intergenic	novelGene_57395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416241	420778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_416200_420800
910561	contig_14441_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_100400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	484.328078372502	279	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	33	1103	67224	126705	FALSE	5	GCAGCCTGGCCGTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGDHITWRLLMGMSSLRERPPALPSLSSMDPTLLCLAVLCFLGAGSMDTEVTQTPRQLVITTKQRATMDCVPIRQHNRVYWYRQKLGEELKFLTYLQNKEALDKSGLPDGRFSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	67191	126737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67327_67434_67705_125517_125902_126159_126283_126514
910562	contig_10990_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_7475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	465	1016	1480	710709	710245	NA	25	ACATTCCCAAACTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNG	711724	710242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_710200_711700
910563	contig_3068_pilon	+	2016	1	Intergenic	novelGene_137655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGTGCTAACTTCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411211	413227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_411200_413200
910564	contig_12540_pilon	+	1054	5	Intergenic	novelGene_148108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	64.0800280898815	95	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	128	436	1056353	1063880	FALSE	25	ACTGAGAGGGGACCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFLKGLPVYNKSNFSRFHADSVCKASNRRPSVYLPTREYPSEQIIVTEKTNILLRYLHQQWDKKNAAKKRDQEQVDLEGESSAPPRKIARTDSQDMHEDT	1056225	1064498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1056356_1061489_1061571_1061790_1061843_1062848_1062911_1063769
910565	contig_13984_pilon	+	2746	3	Intergenic	novelGene_130236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	703	junction_1	408	83	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	162	470	9124	11332	FALSE	40	CCCCACCCCCCCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQQQQQQQNQQQQNQQQQQQLRERELSRQRQAKREEGQQQRQERLRQQAHYDAMDNDIVQGAEDQGIQEEEGGAYERDNQHQGEAEEDTDNGHEPREQRPREDNPESEADVSLLSSDHNTWKLMRRKGNVQDCSHHTSSSRYVCGFISTERRRLA	8141	13608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13984_pilon_+_8281_9101_9185_11084
910566	contig_6958_pilon	+	1544	13	Intergenic	novelGene_69996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	262.317277674702	30	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	363	1061	737719	753910	TRUE	15	TTCTAAATGTTCCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSGFFSIQVISNALKVWGLDLILFNSPEYQRLRIDPINERSFICNYKEHWFTVRKLGKQWFNLNSLLTGPELISDTYLALFLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFENHNSEVYEGKF	728843	769536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_728985_737250_737416_737538_737577_737700_737749_739220_739307_739744_739812_743783_743872_750150_750284_750917_751082_752856_752954_753876_753931_758481_758604_769195
910567	contig_9206_pilon	+	3354	5	Intergenic	novelGene_137494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	400.594792152869	186	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	176	2416	307319	320202	FALSE	40	AACCAAATGAATCATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSQIFNYPIFFRGSTAGLLTFRDVAIEFSQEEWDCLDPAQRALYREVMLENYRNLVSVDIFARKVINKLLPKQDNNKGELHHPVILERHESHGIEDFDFREVWENMHEFESQWGYDQRNYKGMTTTQNKNLSGTKEQHNKSWNNLHLEQSISVRKSMYQYLKHDKSFIRNLLKLKYNIGYAANKSIKYFENRLGLNFPSYLDELQRFQTEEKIYECSQVEKSIKNCSSISSLQRFPPIVKTNICNKNGKDFLSPLPTQLQTTHIREKPYKCNECGKTFSQCSVLTKHERIHSEHRPYKCNECGKAFKQFSNLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFNQNSHLVSHCRIHTGEKPHKCNVCGKVFNQNSHLASHCRIHTGEKPYKCMKCGKAFNKRSYLWDHERIHTGEKPYNCTECGKAFRQWSSLRIHRRIHTGEKPYKCNECGKAFKQCSHLTKHQNIHPGEKQHKCNVCGKTFIHGSGLVKHQRIHTGEKPHKCNECGKAYIQSSSLVEHRRIHTGETPYKCNECGKTFTVRSSLTKHKRNHTGEKPYKCNECGKAYTKFAHLTRHQKIHSEKKHCESDVGGSAFIHSSTLGGCQRAHSREKPYKCNECGKSFNWSSRLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKAFSQNSNLTTHQIIHTGEKPYKCNECDKDFKQYSSLIRHQNIHPGEKPYKCSMCNKAFIRHSHLWGHEKIHTGERTYKCIECGKTFRQWSDFRIHQRIHTGEKP	305300	321140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_305424_307266_307334_308124_308164_309783_309911_318142
910568	contig_19545_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_170837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	300	2032	2331	30584	30883	NA	30	TGGATGGGAAGGAGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLPASTQACSLSALQSRSFTSGGNVLNRSSSTTRPLRLSSGHSPSSTGRHSSRLPRSSIWVRLVSSPTREGSDCSTLLPRCRARSFRHWKSSGGRASI	28552	30883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19545_pilon_+_28600_30900
910569	contig_8520_pilon	-	867	4	Intergenic	novelGene_85442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_3	38.3086877294897	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	41	559	387839	215717	FALSE	25	TGATATTTATGTGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGHLDSWDVGQGAMDDGGGAFISWEALSLIKDLGLRPKRTLRLVLWTAEEQGGIGAFQYYQLHKANISNYSLVMESDLGTFLPSGLQFTGSDKARAIMEEVMRLLQPINITQVFRNAEGTDINYWIQAGVPGASLLDDLFKYFSFHHSHGDTMTVMDPKEMNIAAALWAVVSYVVADMEEMLPRS	387879	215408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_215881_292468_292671_321751_321844_387778
910570	contig_15407_pilon	+	3127	1	Intergenic	novelGene_123050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1150	1500	335829	336179	NA	25	TTTCTGTAAACTTTCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDDIYKTLKEKKCQPRKIYPAKLSFKYDGEIRSLPDKQKLRD	334679	337806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_334700_337800
910571	contig_11846_pilon	-	5761	21	Intergenic	novelGene_105964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_16	138.134164854318	42	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1733	5202	15	5216	437135	290118	FALSE	85	CCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDFVMEGHGKTPPPGEESKQEKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPTGSSPSPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPSTAPGANPSNAQVTGTLLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGPGASSNNGASSNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSALPGSTTSNKGKGSQCQSASSGSECNLGVWKSDPKSKSVQSSSSTTESSNGLGNWRNASGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQDGNSRKGALETDNSNSSAQVSTGGQASREQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMESKGMPFGMGLGNASRSTDAPSQSTGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKDREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSEVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTMWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAPSQSNQTKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTSSSWNENSSKDQGWGGGRQPNQGWTSGKNGWGEEVDQAKNSNWESSASKAVSGWGEGGQNEIGTWSNGGNANITSKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWSKPHQQQQQPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNGRPSNSNWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTGKSASDSKSMQDGWGESDGSVTGTRHPSWEEEDDGGVWNTAGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNSDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVDKKFDVDKRAVNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGNHGLFGNSTAQSRGMHTPVQPLNSSPNLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQPSMKHSPSHPVGPKSHLDNMVPNALNVGLQDLQTKGPIPGYGSGFSSGSMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKLGTKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFSDYKSTWSPDPIGHNPAHLSNKMWKNHISSRNTTLLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPASLLPGDLLGGGSDSI	437149	289572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_290506_291706_291847_295011_295083_295496_295722_298106_298203_298462_298610_299885_300063_302253_302392_307393_307578_308015_308112_308653_308786_319253_319380_324471_324609_326101_326148_327241_327317_329615_329792_334951_337301_339601_339944_352209_352232_356675_356764_437088
910572	contig_12078_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_74137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	716	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCGGCAGCAAGCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751564	748726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_748700_751600
910573	contig_8284_pilon	+	2786	2	Intergenic	novelGene_125657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	95	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	263	433	192176	192346	FALSE	15	AGGACTCCTGGGCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRKQLALEENSAASIITCHPRTLHPEALKSRSCCSTTYPKNVKQRLVHGKPSVNTSPCLNYPSVSKPRETKLKLGWGRENARVPLEMKRMRLRNVGVKAAADDRHKPKAWQQQPAGATRRRKTGDRRGGYICASLREPPSAV	183565	194699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_183649_191996
910574	contig_8161_pilon	+	2242	6	Intergenic	novelGene_156748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCAACACCCAGGGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226190	254385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_+_227339_229787_230067_231373_231479_232136_232413_236172_236433_254211
910575	contig_8210_pilon	+	4699	1	Intergenic	novelGene_30241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30699	35398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_30700_35400
910576	contig_6823_pilon	-	3317	16	Intergenic	novelGene_131242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2967	3287	424451	422697	FALSE	15	AGCAGCTCCTCCTCCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGSFVASSVTFSSIFNSISDMPSSSCIVMTDFKGLIRPLLSASSGAEARDGDGDRAEAWARAGAGAGAEAGVGAEAGAGAGAGAEVWAEVGTRAAFGAGVGTWT	468104	422666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_422897_424330_424476_428291_428402_433829_433952_439791_439850_441233_441365_442745_442870_443348_443427_447722_447978_448361_448573_450035_450227_454497_454578_460583_460750_461441_461505_466646_466776_466880
910577	contig_20753_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_168256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	372	845	63600	63127	NA	65	CACATTACAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSQSTVKTVKYFELVVPRVSSKNVKVLATLLPSLPLPLPAHCGASATQRSLETSDVIRSLLRGRKVGTNNATVPSRSEIYNFMITGSRQNSQFLSISCSSMITNFSIAFGFCFCSVHTIATQSKVLITIPKVQPSRYAYKDVNVFHVCYSNRHKCP	63971	62139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_-_62100_64000
910578	contig_960_pilon	+	2824	1	Intergenic	novelGene_108280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	168	395	987674	987901	NA	35	AGGACAGAGTAGAACTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYIPPEFRDHLKNRFDTLNTNDCRPDELWKDIKDITHEESERSLKRQERKKRQKWMPEETLKLALEHQVAKAKGRNDEVKELKGRFQRAAQEDKVKYYNDMCKELEIENQQGRTCSSFLKLKELKKTFKP	987506	990330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_987500_990300
910579	contig_12677_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_110865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGACACACCAGACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3614	2947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3600
910580	contig_9297_pilon	-	2611	8	Intergenic	novelGene_69876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1553	2425	911013	909231	TRUE	15	GTCTACAGCGCCGTCGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRQGPFGLFYLTPEFLHSSVVFPNIFASLLFIELDKMFHDTLIKVFSTQVSISISGHDFKDTIVNGEKRHIEGSTTQVKHEDVLLTLPLIQAISNSSCCRLINDPHNIQSSNSSSIFGCLTLGIIEIGWYSNNCVGNLFSQISLSSFLHFSENHGRNFFRSKRLCLPTSNVNLNVWFGFLFNHLERQELDVLLHRRVVPSAADEPLGVEDRVLRVGSELVLGGIADQTLPFRGESYVRRRDAVTLIVGDDLHAAVLEHPDAGVSGPQINADHRAHILLLVLLLGMGRA	913029	908961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_909013_909095_909314_909403_909637_910039_910178_910504_910620_910709_911100_911206_911877_912233
910581	contig_5954_pilon	-	2287	6	Intergenic	novelGene_28776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1760.34932896854	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1397063	1390877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392215_1392279_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997
910582	contig_14341_pilon	+	1630	5	Intergenic	novelGene_111899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1097	1447	745238	746072	FALSE	10	TGTCTGCCCCTGGGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGGISGPGSGVWGWKLEGSVFSDSISWPCTWTVTHLRRTPCSWRMPSTRATASSGLLGCCPCTWAWISGGNTPRNCSSTSSSSICSLECASGCSHWWHSSRSWTRASWGPATCW	741695	746255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_742546_744044_744159_744286_744360_745178_745343_745826
910583	contig_17989_pilon	+	2870	2	Intergenic	novelGene_150821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTAGTAGATTTGCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210528	275222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_211401_273224
910584	contig_15327_pilon	-	2908	3	Intergenic	novelGene_70777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	63	11	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATCTTCTATTAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133857	1129729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792
910586	contig_14048_pilon	-	2039	2	Intergenic	novelGene_146339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACACCATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616250	587375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_587829_614664
910587	contig_1143_pilon	+	3570	2	Intergenic	novelGene_86620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	203	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	2364	3083	918948	919667	FALSE	60	TAAAAAGAAAAAGAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPYNNNRLIFLVTIDTKILNEILVNRIQQHIKKIICRDQVGFIPGMQGWFNIRKPINTIYHTNKTKEKDHMIISIDAEKAFDKIQHRFLIKTFTKIGLEGKFLNIIKGIYIKPIANVILSGQRPKALPLRTGTRQGCLLSPLLFKIVLKVLGRAVRQEREIKDIQIGKEEVKLSLFADDVILYIENPRDTTRKLLELIEKFSKVAEYKINIQKSVGFLYTNNENSEKEIRKTIAGHDY	914275	920154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_914942_917250
910588	contig_19816_pilon	-	1499	8	Intergenic	novelGene_156483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.711145489465	16211	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	577	1068	125593	123459	FALSE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126820	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125811_126164_126435_126731
910589	contig_19352_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_122385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTCCCTTAGCAATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143825	141791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_141800_143800
910590	contig_4339_pilon	+	1527	1	Intergenic	novelGene_146109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAACAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1231606	1233133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1231600_1233100
910591	contig_12402_pilon	-	3978	3	Intergenic	novelGene_133362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCCTCACGGTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641819	536876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_537271_578807_581667_641094
910592	contig_11548_pilon	+	1655	6	Intergenic	novelGene_66746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1078.31079007863	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	480	812	118990	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63660	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_117718_117856_118975_119121_119346_119402_119491
910593	contig_5428_pilon	-	2724	8	Intergenic	novelGene_160412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	104.050615626458	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	167	1624	176381	158372	FALSE	50	AATTCAGGTCAAAATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCRLSIRHGSEGSVAHKPRTGNSTLWHREILKGASYVPVPEDVPLLKALLFELRLSDDDKDFVESRDSCSRINKTSVYGLPVGGEELWPVVAFLKNGMIYACVPLVEQTLSPRPPLISISGISQGFELLFGMQDFLYSSQKNDAELNTKLSQLPDLLLQTCPFGTLLDTNLQNSLDNTNFASVTQPQKQPAWKAGTYKGKPQVSISVTEKVKSMQYDKRDVADMWQVIGAVTCKCDLEGIMPNVTISLSLPTNGSPLQDILVHPCVTSLDSAILTSNSIDAMADSAFSGPYKFPFTPPLESFNLCYYTSQVPVPPILGFYQMQEEEVQLRITVNLKLHESVKNNFEFCEAHIPFYNRGPITHVEYKVSFGQLDVFREKSLLIWTIGQKFPKSMEIILSGTVTFEAKNHEKQPFDQICIGGTAYVKLHFKILDYTLTGCYADQHSVQVFASGKPKISTHRKLISSDYYIWNSKAPAPIAYRSLLL	176547	157271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_-_158455_162056_162154_165148_165268_165364_165451_166173_166314_167474_167703_169920_170527_176282
910594	contig_12977_pilon	-	3251	1	Intergenic	novelGene_122813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACCACAGAGCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72736	69485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_69500_72700
910595	contig_7378_pilon	-	2071	9	Intergenic	novelGene_120299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	20.7409618870485	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	13	840	740005	648505	FALSE	60	AATGAAAAAATTGAACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSKMKVSEENFFNVPAFLTVSGQLHLEVMSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMVEAEISFVESLQDLMQVMEGLFKTTLMMVLSNCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLIMSYTEAVEILKKASQNFTFTPEWGADLHTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLVLKPFYMRDNEDSPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGSLREERYHFLEQQLARLGLTEAYQWYLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFTHSCLL	740017	647273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_648650_652564_652592_654936_655035_670656_670795_672133_672201_695658_695697_695807_695907_700436_700570_739922
910596	contig_5586_pilon	+	1249	6	Intergenic	novelGene_143555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	543.056313838629	30	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	364	498	384614	384748	TRUE	45	ATGACAAGTCCCCAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSGNFNSD	369215	386139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_369244_373455_373553_380619_380719_383470_383575_384578_385415_386054
910597	contig_2730_pilon	-	3461	5	Intergenic	novelGene_135350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGTATATTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311896	230801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_231023_284469_285061_305644_306038_308946_309964_310657
910598	contig_13780_pilon	+	1880	1	Intergenic	novelGene_149093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATCAGGGTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689796	691676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_689800_691700
910599	contig_9272_pilon	+	5186	1	Intergenic	novelGene_125903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCCCGCACAAATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275963	281149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_276000_281100
910600	contig_16411_pilon	-	4845	1	Intergenic	novelGene_77376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	364	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3950	4264	331862	331548	NA	75	AAAACAATTAAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGKLINNLRYADDTTLLSESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINREKIAVVKDFILLGSTIQHSWKQQSRNQMTYCIGQIFCKGPL	335811	330966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_331000_335800
910601	contig_1925_pilon	+	3204	7	Intergenic	novelGene_162215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_1	364.266691068813	172	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	195	749	254564	279800	FALSE	35	CAAACGCTAGGAGCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMEEMKNEAETTSMVSMPLYAVMYPVFNELERVNLSAAQTLRAAFIKAEKENPGLTQDIIMKILEKKSVEVNFTESLLRMAADDVEEYMIERPEPEFQDLNEKARALKQILSKIPDEINDRVRFLQTIKDIASAIKELLDTVNNVFKKYQYQNRRALEHQKKEFVKYSKSFSDTLKTYFKDGK	225098	282255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_225172_254442_254654_266322_266377_271779_271898_273239_273367_279311_279391_279713
910602	contig_11855_pilon	-	4765	15	Intergenic	novelGene_67029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	119.199220138525	147	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	1767	3683	1935092	1911014	TRUE	20	AAGTCTGTTTCATCCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSASWYILFPVLIQTHRVKAFMLMSGSMVLQRNAGSSSDGTEDSDFSTDLEHTDSSESDGTSRRSARVTRSSARLSQSSQDSSPVRNLQSFGTEEPTYSTRRVTRSQQQPTPVTPKKYPLRQTRSSGSETEQVVDFSDRETKNAADHDESPPRTPTGNAPSSESDIDISSPNVSHDESIAKDMSLKDSGSDLSHRPKRRRFHESYNFNMKCPTPGCNSLGHLTGKHERHFSISGCPLYHNLSADECKVRAQSRDKQIEERMLSHREDDNNRHATRHQAPTERQLRYKEKVAELRKKRNSGLSKEQKEKYMEHRQTYGNTREPLLENLTSEYDLDLFRRAQARASEDLEKLRLQGQITEGSNMIKTIAFGRYELDTWYHSPYPEEYARLGRLYMCEFCLKYMKSQTILRRHMAKCVWKHPPGDEIYRKGSISVFEVDGKKNKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVMTEADNTGCHLIGYFSKEKNSFLNYNVSCILTMPQYMRQGYGKMLIDFSYLLSKVEEKVGSPERPLSDLGLISYRSYWKEVLLRYLHNFQGKEISIKEISQETAVNPVDIVSTLQALQMLKYWKGKHLVLKRQDLIDEWIAKEAKRSNSNKTMDPSCLKWTPPKGT	1936858	1909421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1910200_1910709_1911116_1911748_1911856_1912484_1912632_1914058_1914153_1915280_1915422_1915657_1915748_1917914_1918107_1919633_1919745_1922355_1922455_1923983_1924074_1927210_1927294_1931559_1931800_1933180_1933358_1934848
910603	contig_16846_pilon	+	3018	8	Intergenic	novelGene_82905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	130.118470351179	23	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	391	1161	459619	477023	TRUE	40	GCCATTCCAAACCAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLRRADPLPVKAMPPPVTVQRMALNWKELDSSFLFSEASATGEASLLSEGLREALSSYIRLTDDISLDDAKAQSRGRKGNQGYSIQHPNSAQPD	456090	480060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459710_464055_464156_465206_465311_475327_475478_476253_476387_476830_478280_479459
910604	contig_17470_pilon	+	1999	12	Intergenic	novelGene_110468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	542	junction_8	231.286627655451	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	76	1836	50344	57764	FALSE	40	TCATTTTTAACTCACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTILSDERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVDNWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYAMEDVATRRDALLSRRNALHERAMYRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEAYKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLWKKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKHALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMIARKQKLADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRIKAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLNELNQKWESLKSKASQRRQDLEDSLQAQQYFADANEAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIHALREQAQSCRQQVAPMDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQ	50268	57927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_50407_50895_51007_51808_51887_52015_52172_52408_52614_53122_53305_53645_53890_54085_54209_54764_54983_55804_55898_56208_56344_57611
910605	contig_12638_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_33271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844957	846717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_845000_846700
910606	contig_16123_pilon	-	4982	4	Intergenic	novelGene_164284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1085	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4228	4740	225806	225199	FALSE	10	AACTCTCTGCTTGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLPLEAPEAIAPPFETPAFMPYLLRLRHLGFWCSLSLQLLLPVASQPSGLKPASALLGQVFQSSVAPLIKCLEAPHSARKPPAHRHSVLLLRGSALAPSRTGLLVLLLLVICCCCFSATAGSLLLLVLCRCCSSIYSQFQNCFHIFRYLLEQHPTPGTKFCLSYLVLL	230394	224956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_-_225432_225526_228221_228360_229257_229477
910607	contig_4496_pilon	-	2740	5	Intergenic	novelGene_66612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACGTCATAGACATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707159	541062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_541962_542064_543113_638621_639035_639875_640204_707107
910608	contig_12414_pilon	-	3109	11	Intergenic	novelGene_59647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	425	junction_1	377.26130201758	131	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1212	2594	783498	756525	FALSE	35	AATCAGAATGATCCTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVANLILCSILFYSEACLQFSQIYPVVCVPSSFFIGDSGIPLEVIAGSVSADELVTRIHKVQQMHSLKVETSVANGSQSESSVSTPCTSFEPKNTSENCQSKNAKLCETPPNSPDAKSDIATGGESSGHATPSQDPSECSNPRPAEDLTVRVERLTKKLEERREEKRKEEEQREIKKEIERRKTGKEMLDYRRKQEEELTKRMLEERNREKAEDRAARERIKQQIALDRAERAARFAKTKEEVEAAKAAALLAKQAEMEVKRESYARERSTIARIQFRLPDGSSFTNQFPSDAPLEEARQFAAQTVGNTYGNFSLATMFPRREFTKEDYKKKLLDLELAPSASVVLLPAGRPTTSMVHSSSGDIWTLLGTVLYPFLAIWRLISNFLFSNPPAQTSVIATSSEPSNSASSSNSEKREPVRKRVLEKRGEDFKKEGKIYRLRTQDDGEDENNTWNGNSTQQM	784709	756009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_756664_759119_759320_760669_760802_762802_762906_765747_765876_766737_766903_767635_767691_774260_774355_781929_782108_782791_782911_783428
910609	contig_1813_pilon	-	4220	4	Intergenic	novelGene_105472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGGAAGAGGCGGTGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118147	102747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_102829_106493_106650_113653_117453_117963
910610	contig_1717_pilon	-	3110	2	Intergenic	novelGene_146118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	449	925	349005	348529	TRUE	15	TCTCATAGATGGCGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARYSSERRGRLREASKKSKEAEKKKATLAANKWHSENQLVQVAVSGQETVSVGSRGGRVWLKKGREWESVYHKLLELCSPSGRSKDGTRSEVLEQKEGEVVRDKEEIKRSGKKQHQQPTNGTQRATHSGVWNPSSRCFLVKRLWPWETEYAESG	349453	180606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_-_182436_348172
910611	contig_14017_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_165687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	427	828	36482	36081	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLQSSNVLELQEPLQNVLPWTSCTHLLLECKTPPNFSCCSHIGPQYFAVSIPVGCFGVLLFSSLQRPHCFRLLPSLQILIKKSVAVKSIPPHSNLQDRVELTHKVSKPVNLFSFSFCVLDKCLQNKLVSY	36908	34131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_-_34100_36900
910612	contig_9706_pilon	-	2956	5	Intergenic	novelGene_21032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	299	685	737938	737552	TRUE	0	GTTTGCTTGTTGCCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRNRISKGSKAPCRGRKFLGLEVRPKKVLTHSFPFPKEDSKAWAGFHSSLPLARFSSFGGGTSGLATSVTVIDEVIVAGLLGDWGRGVGDLNVFEVQEAELDFHAEQGVQVIPGQVAHHVFSQQRI	738236	604764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_604773_607116_607587_729060_730220_730534_731145_737527
910613	contig_9434_pilon	-	1559	5	Intergenic	novelGene_150476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACGCCGCCGCCTCTCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85984	51122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_51255_82161_82290_82390_82474_83182_83868_85453
910614	contig_3942_pilon	+	657	4	Intergenic	novelGene_128748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6530	junction_1	2607.63409157718	38	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	43	420	793521	795263	FALSE	30	ACTGAAGCAGTAACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKYAPTHTVWAVWVGGVSALTALCAPFIV	792272	795500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793624_793794_793882_795075
910615	contig_18214_pilon	+	3683	1	Intergenic	novelGene_166024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGATATATCCAAAAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237594	241277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_+_237600_241300
910616	contig_5084_pilon	-	2604	12	Intergenic	novelGene_64487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	86.098732485079	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2451	153	2603	109613	82170	FALSE	25	GAAGGCGTTTGTCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKYPLFKEPQWKYPDISDSISTEGTYDNSSKGSSGDSFSGKEDLSRKRTTMLKIATAPKSVNASQNTSSNIPGKRGRPRKLKLSKAGRPPKNTGKSLTSTKNTPVGPGSTFPDVKPDLEDVDGVLFVSFESKEALDIHAVDRPTEEPSSLQASTTNDSGCRTRISQLEKELIEDLKSLRHKQVIHPGLQEVGLKLNSVDPTVSIDLKYLGVQLPLAPATSFPFWNLTGTNPASPDAGFPFVSRTGKTNDFTKIKGWRGKFHSASAARSEGGNSEGSLKNRSAFCSDKLDEYLENEGKLMETSMDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQASLKTKPIHTIIRKRAPPCNNDFCRLGCVCSSLALEKRQPAHCRRPDCMFGCTCLKRKVVLVKGGSKTKHFQRKAVHRDAVVYDALGEEPREEGEEGGREEEELLKEKKKRKKLEYTICETEPEQPIRHYPLWVKVEGEVDPEPVYIPTPSVIEPMKPLLLHQPEVLSTTVKGKLLPGIKAARPYTPKPNPVIREEDKDPVYLYFESMMTCARVRVYERKKEDRRQPSPSPSPSPLFQQQSSCHSSPENRSAKEPDSEQQPLKQVTCDPENDSDKSQEKSWKSSCNEGESSSTSYVHQRSPGGPTKLIEIISDCNWEEDRNKILSILSQHINSNMPQSLKHPMPTWLHPGNHAPCCLQHPLPKRHPPRALHQIALGRI	109765	82168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_82284_84933_85122_86662_86736_87211_87395_88475_88703_93274_93624_94782_95442_96630_96736_97148_97281_107959_108056_108174_108254_109367
910617	contig_11849_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_171755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCTCTGCTAACCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151621	155319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_151600_155300
910618	contig_14635_pilon	-	2903	2	Intergenic	novelGene_84378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAAAAGAAGCAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618322	615289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_615532_615661
910619	contig_20293_pilon	-	2259	13	Intergenic	novelGene_153513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_6	295.87478582821	55	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	120	1634	68656	27694	FALSE	75	GTTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISSDEVNFLVYRYLQESGFSHSAFTFGIESHISQSNINGALVPPAALISIIQKGLQYVEAEVSINEDGTLFDGRPIESLSLIDAVMPDVVQTRQQAYRDKLAQQQAAAAAAAAAATNQQGSAKNGENTANGEENGAHTIANNHTDMMEVDGDVEIPSNKAVVLRGHESEVFICAWNPVSDLLASGSGDSTARIWNLSENSTGGSTQLVLRHCIREGGQDVPSNKDVTSLDWNSEGTLLATGSYDGFARIWTKDGNLASTLGQHKGPIFALKWNKKGNFILSAGVDKTTIIWDAHTGEAKQQFPFHSAPALDVDWQSNNTFASCSTDMCIHVCKLGQDRPIKTFQGHTNEVNAIKWDPTGNLLASCSDDMTLKIWSMKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQVCLCCLNGQLLYLVGNICLFSFWFPIPLVPII	116221	27068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_27959_28515_28644_31009_31085_31237_31360_43863_43925_45244_45343_45430_45495_48533_48676_49038_49172_49879_50103_52323_52470_68598_68702_116147
910620	contig_5959_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_150210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTGAAGCTGGAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417406	419023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_417400_419000
910621	contig_1435_pilon	+	5820	24	Intergenic	novelGene_115471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	91.4980760486521	344	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	788	2367	558	2924	300390	329270	FALSE	40	AGTAACTTGGTAACAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQCIPNLVESWYQILQNYQYNNSEVTCQCLEVVGAYVSWIDLSLIANDRFINMLLGHMSIEVLREEACDCLFEIVNKGMDPVDKMKLVESLCQVLQAAGFFNIDQEEDVDFLARFSKLVNGMGQSLIASWTKLIKNGDIKNAQEALQAIETKVALMLQLLIHEDDDISSNIIGFCYDYLHILKQLTVLSDQQKANVEAIMLAVMKKLTYDEEYNFENEGEDEAMFVEYRKQLKLLLDRLAQVSPELLLASVRRVFSSTLQNWQTTRFMEVEVAIRLLYMLAEALPLSHGAHFSGDVSKASALQDMMRTLVTSGVSSYQHTSVTLEFFETVVRYEKFFTIEPQHIPCVLMAFLDHRGLRHSNGKVRSRTAYLFSRFVKSLNKQMNPFIEDILNRIQDLLELSPPENGYQSLLSSDDQLFIYETAGVLIVNSEYPAERKQALMRNLLTPLMEKFKILLEKLMLAQDEERQASLADCLNHAVGFASRTSKAFSNKQTVKQCGCSEVYLDCLQTFLPALSCPLQKDVLRSGVRTFLHRMIICLEEEVLPFIPSASEHMLKDSEAKDLQEFIPLINQITAKFKIQVSPFLQQMFMPLLHAIFEVLLRPAEENDQSAALEKQMLRRSYFAFLQTVTGSGMSEVIANQGAENVERVLVTVIQGAVEYPDPIAQKTCFIILSKLVELWGGKDGPVGFADFVYKHIVPACFLAPLKQTFDLADAQTVLALSECAVTLKTIHLKRGPECVQYLQQEYLPSLQVAPEIIQEFCQALQQPDAKVFKNYLKVFFQRAKP	286745	332166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_286842_295763_295847_297761_297819_298431_298502_299251_299470_300356_300542_300640_300810_302026_302264_303215_303255_303388_303452_307596_307722_308104_308250_308408_308529_308891_308987_309603_309674_311440_311680_312577_312864_314124_314315_314833_314951_317019_317136_317828_317877_319393_319466_326491_326549_329243
910622	contig_5669_pilon	+	3742	7	Intergenic	novelGene_86066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	244.225817636056	5	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	942	1805	186087	189500	TRUE	45	TTGAAAGCCAAAGAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHGEAPPWPLGKLGCERQ	185145	192261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188124_189462_190117_190940
910623	contig_18081_pilon	+	2323	13	Intergenic	novelGene_23763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.0830536906454	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	376	1506	52987	70642	FALSE	30	TTCAGGGTCAAATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVDMSKPWTALDSLQKWASVIREHIDKLKIPPEEMKEMEQKLIRDFQEYVEPGEDFPASPQRRSAASQEDKDDSAVLPLGADTLTHNLGVPVLVVCTKCDAISVLEKEHDYRDEHFDFIQSHVRKFCLQYGAALIYTSVKENKNIDLVYKYIVQKLYGFPYKIPAIVVEKDAVFIPAGWDNDKKIGILHENFQTLKAEDNFEDIITKPPVRKFVHEKEIVAEDDQVFLMKLQTLLAKQPPIAAGRPVDASPRVPGGSPRTPNRSVSSNVASVSPIPAGSKKIDPNMKAGATSEGVLANFFNSLLSKKTGSPGGPGGGSPGGGAGGGSAGLPSSSKKSGQKPILSDVHAELDRIARKPVTVCPPTSTSPTEGEAS	33960	71459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_34091_34234_34313_52132_52199_52885_53117_53944_54115_58521_58616_60426_60563_61143_61256_63529_63590_63721_63767_64421_64543_65401_65552_70529
910624	contig_2854_pilon	-	2123	5	Intergenic	novelGene_120879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_4	135.949209265814	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGTCCTCCAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099158	1075203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387
910625	contig_9414_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_131072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306047	305001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_305000_306000
910626	contig_7056_pilon	-	4286	8	Intergenic	novelGene_43623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_5	709.333863996528	333	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	2595	3284	726042	724627	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMLGGMGLCKYHFSVFF	728636	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813
910627	contig_299_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_129503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTAGAACTACCAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1643120	1641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1641600_1643100
910628	contig_5999_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_45647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCTAACATCTATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258388	260452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_258400_260500
910629	contig_9058_pilon	+	5879	1	Intergenic	novelGene_149368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	419	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67896	73775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9058_pilon_+_67900_73800
910630	SIRV6	+	1929	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	-1234	88	4	-28	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAATTTACACATATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9003	11242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
910631	contig_4923_pilon	+	2514	3	Intergenic	novelGene_109333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGGAGACGGAACCAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490503	587192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_+_491523_514554_514963_586105
910633	contig_8600_pilon	+	2899	7	Intergenic	novelGene_125734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	158.049218775531	9	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	91	942	102400	114451	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIVFLRRALSGRLTPSLKLPDPGASITSVTMGAVLGIFSLASWVPCLCGGASCLLCSCCPNTKNSTVTRLIYAFILLLGTAVSCIMLREEMETHLKKIPGFCEEGLKIKMADIKEDKDCNVLVGYKAVYRIHFALAIFFFVLFLLMLKVKTSKDPRAAVHNGFWFFKIAAVVGIMVGSFYIPGGHFTTAWFAIGMGGAFFFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNKMEEGNPRCWYAALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQVWLFSASFICEWFLINVDVTPR	102309	117196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_102439_107357_107520_107992_108187_109384_109465_110132_110271_114212_115618_116405
910634	contig_16126_pilon	-	3501	3	Intergenic	novelGene_141875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	45578	45207	TRUE	35	AGAGAGCAGTAGGATTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTESCCTNRVLLNCSSLLPSTLYQEKLSLQNQLDKSDLLVNFFACQETTATQYEYSFFDLFHVILWSLSPISLNENCCKLLFVRFHSLNPETYPLHPFHRFLKELHLKNKKSSSIEIHNLFKF	45580	41289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_44032_44232_44398_44986
910635	contig_7963_pilon	-	2604	2	Intergenic	novelGene_58476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	861	junction_1	0	332	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	2307	2603	120716	120297	FALSE	80	AGAAAAAGGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKR	123022	120295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488
910636	contig_817_pilon	-	1099	1	Intergenic	novelGene_132490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	665	997	758128	757796	NA	20	CAGGTGGCGCAGTGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLMRIQLLYITLLCDIFPLWLLLGTLVAEWFRAQAANQKGRQFESSSPLLENPMAQFYSVLYGHCESELTQHQQVWFVWSPGGVAVKSSAANQKIGSLNSTAAPWKP	758792	757693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_757700_758800
910637	contig_5918_pilon	+	3567	13	Intergenic	novelGene_99525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_12	53.2624528996636	217	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	208	2001	622113	654774	FALSE	30	GAAAACATCACTCGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DALVKRREYLDEQIKKVSNKQEKTEDDVEREARLVEQWVGLTEERNAVLVPAPGSGLPGAPANWIPPPGMETHIPVLFLDLNADDLSANEQLVGPHASGVNSILPKEHGSQFFYLPIMKHSDHEVSTIASWDSSVHDSVHLNRVTPQNERIYLIVKTTVQLSHPAAMELVLRKRIAANIYNKQSFTQSLKRRISLKNIFYSCGVTYEIVSNIPKATEEIEDRETLALMAARSENEGASDGETYIEKYTRGVLQVENILSLERLRQAVTVKEALSTKARHIRRSLSTPNVHNVSSSRPDLSGFDEDDKGWPENQLDMSDYSSSYQDVACYGTLPRDSPRRSKEGCTPENPHALMVSPFKAFSPQPPKFFKPLMPVKEEQKKRTALETRPLLSQEDSEEEENELEAINRKLRSSQPYVPVEFADFSVYNASLENREWFSSKVDLTNSRVLEKEVSRSPTTSSITSGYFSHSASNATLSDMVVPSSDSSDQLAIQMKDADTREHSGPSLVPECRLSSDKELTELERGLVKDKLIMVPLKETSALAKGSPSSHSIPEKNSKILCRTGSCSGLDACPSEKGPPAREFSPREVTIEHTTNILEDHSFTEFMGVSDGNSFDGLMDSSAGELLRRRNLPNKTDSERVADGLQDPGQLRSTSDSDQGSTTAATTR	618356	656340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_618421_619858_619986_622096_622153_624119_624245_624514_624692_625600_625694_625825_625979_627948_628027_640112_640161_641201_641308_643749_643902_650855_651648_654744
910638	contig_1244_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_38064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181744	1179703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1179700_1181700
910639	contig_3277_pilon	+	2727	8	Intergenic	novelGene_74728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	612	junction_7	413.912590594997	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	79	1110	240775	263763	FALSE	75	AAAAGAAAAAAAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISIPEYYEGKNVLLTGATGFLGKVLLEKLLRSCPKVNSVYVLVRQKAEQTPQERVEEVISGKLFDRLRDEYPDFREKIIAIRSELTQPTLALSEDDKEIIIDSTNIIFHCAATVRFNENLRDAVQLNVIATRQLILLAQQMKNLEVFMHVSTAYAYCNRKHIDEVVYPPPVDPKKLIDSLEWMDDGLVNDITPKLIGDRPNTYIYTKALAEYVVQQEGAKLNVAIVRPSIVGASWKEPFPGWIDNFNGPSGLFIAAGKGILRTMRASNNALADLVPVDVVVNTSLAAAWYSGVNRPRNIMVYNCTTGSTNPFHWGEVGMILPVFLNIRINLKELKVFTEFIC	191005	265380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_+_191077_240767_240964_250535_250712_258222_258403_261129_261308_262361_262407_262555_262675_263618
910640	contig_6902_pilon	+	2398	8	Intergenic	novelGene_135611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	587.292751113279	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	604	1329	536458	540426	FALSE	30	TCTAGTATTATAGATGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEMELKAFGSGIDIKPGTPPISGRSTTPTSSPFRATSTSPNSQSSKMNSIVYQKQFQSAPATVRMTQPFPTQFAPQILSQPNLVPPLVRAPHTNTFPAPVQRPPMALASQMPPPLTTGLMSHARLPHVARGPCGSLSGVRGNQAQAALKAEQDMKAKQRAEVLQSTQRFFSEQQQSKQIAGKAQRVDSDSSKPPETLTDPSGVCQEKVEEKPTPAPTMATKPIRTGPIKPQAIKTEETKS	530353	541495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_530472_530826_530964_534150_534299_535832_536033_536457_536562_536925_537053_537942_538180_540168
910641	contig_6434_pilon	-	2320	5	Intergenic	novelGene_61920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	6.59545297913646	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	77	700	968167	936004	FALSE	30	ATGCATACATTATATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TELGHHGEAHKTSNLIPTQTTVTAGMGMLPFFPNQLIVGQAGPVHSNTQEKQPATVGMAEGTFSGSQAYLQSFPNLTAGGLLTGHHKQQQSQPKGTEISSGAVSENQTSLLGEPPKEIRLSKNPYLNLASVLPSVCLSSPASKTTVQKTGIASNILDAISQGNESQHTLEKCIAYSQPFGDYAQVSSLRNEKRGSSYLLSAPESGSVKFADQHSQGTGAYYMETYLKKKRVY	973236	934383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_936151_951526_951664_953222_953335_967939_968209_973201
910642	contig_6434_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_61869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	955	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841760	844059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_841800_844100
910643	contig_17144_pilon	-	5547	1	Intergenic	novelGene_29570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	5153	5458	176294	175989	NA	30	CTTTTCAATAAGCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHSLPPQALPSVGTSASQTPSSAWGIPSQPPASLARTATTWTQSQRFCGNWNQSFNLEEDSSAYLMGPGCPPLPCPTSTTLRHVSPAAFSGATACRSWTK	181446	175899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_175900_181400
910644	contig_13300_pilon	-	2668	4	Intergenic	novelGene_125794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_2	67.2755527662166	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	656	739	187743	187660	FALSE	20	TCAGTCTTACCACCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPPPAPERGLPGHSWRKLGKEETFSAIACVEVLLPFIQSPAVESGASPVAAHEGFKAEWLAVKDEHLYVGGLGKEWTTATGEVLNENPEWVKVVGRKGSVDHENWVASYNALRAAAGIQPPGYLIHESACWSEVLQRWFFLPRRASRQRYSEKDDEHRGANLLLSASQDFSDVSVRRVGELVPTHGFSSFKFVPNTDDQIIVALKSEEDRGKIATYIMAFTLDGRFLLPETWIGSVKYEGIEFI	209043	185730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_188031_190605_190810_198979_199106_209005
910645	contig_12841_pilon	-	3173	1	Intergenic	novelGene_55861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	270	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	591	905	329041	328727	NA	30	ATATGCACCCAGTGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDCRSVVPSLMHPAIPPHMIMVWQHPPPPCPLSQGPTDEWHPPFCAPTRAGDPQTGRVCFSNHPLAPGTHGTAVLTFPPSHLHQETGQITPLFCPTTEARSL	329631	326458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_326500_329600
910646	contig_120_pilon	+	660	1	Intergenic	novelGene_165248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCCCTAGAAATAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78803	79463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_+_78800_79500
910647	contig_11677_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_85909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGTTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512791	510223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_510200_512800
910648	contig_720_pilon	+	3048	1	Intergenic	novelGene_155171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATTTTTCTATGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213307	216355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_213300_216400
910649	contig_13481_pilon	+	1208	4	Intergenic	novelGene_119395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGGTCTGTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526363	536879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_527242_527458_527529_536155_536304_536767
910651	contig_7411_pilon	-	2070	11	Intergenic	novelGene_137055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	82.9325629653395	216	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1561	2022	991943	990105	FALSE	20	CACCTTTTCTAGCAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWQPCTTATTCCPTVPTAWRHPPPGIDVATYYSTLPAGVTVSSSTGVTTAPPPPGTTPPPPPSTAETSSGVTSTTTTTSALAPVAAIIPPPPDIQPVIDKLAEYVARNGVKFESSVRAKNDQRFEFLQPWHQYNAYYEFKKQFFLQKEGGDSAQSLQAAAAPEEAPAESAAEKPSEAVDDGASEDVAEGGGRAASGKKEAASGKAVPDGKLVKASFAPISFAIKAKENDLLPLEKNRVKLDDDSDDDEESKEGQESASCATNPNPAVVPPCVVVEEKKPQLTQEELEAKQAKQKLEDRLAAAAREKLAQASKESKEKQLQAERKRKAALFLQTLKNPLAEAEAGKIEESNFTVEEAGTTSPCAPLVAGRGLPALEGKPPDRPSSRSKDAPREEEREKKKKKHKKRSRTRSRSPKYHSSSKSRSRSHSKAKHALPSAYRTVRRSRSRSRSPRRRAHSPERRREDRSVPTAYRVSNSPGASRKRTRSRSPHEKKKKRRSRSRTKSKARSQSGSPSKQSAHRMSAHSASISPVESRGSSQERSRGSFSGKRWSDLVSNCFLCAKQNNSGPDGQSESNACSLQKPADQCLLSPRASCHTAQRQSRHRRGHGLPLQPEASEVTEPAEPRCVLLSRSSQKPPDVPPGLPQTGGGFCKLIFDDIFSLRFLTSSLLPVYL	1030936	990056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_990428_990900_990975_991878_992044_1000030_1000157_1006139_1006409_1020080_1020272_1021423_1021655_1027731_1027910_1028558_1028653_1029523_1029656_1030697
910652	contig_8447_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_69445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGCAGAGGTAACCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129582	130327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_129600_130300
910654	contig_11026_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_167656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120462	119436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_119400_120500
910655	contig_1331_pilon	-	2784	1	Intergenic	novelGene_37887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGAAACCTGTCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472150	469366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_469400_472200
910656	contig_6445_pilon	-	1630	15	Intergenic	novelGene_76927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	613.880846644975	64	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	49	618	88578	73976	TRUE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHIR	96339	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73863_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
910657	scaffold_9100_pilon	+	1401	9	Intergenic	novelGene_83263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	444.090767045432	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	293	1108	649053	654304	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647248_648984_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139_654329_654581
910658	SIRV7	-	1815	3	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	104868	2	71683	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	27	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43055	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028
910659	contig_6740_pilon	+	4516	1	Intergenic	novelGene_142693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGACAGTCGTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632129	636645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_632100_636600
910660	contig_12019_pilon	+	3660	5	Intergenic	novelGene_87778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	32.7137203631748	197	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	279	1427	723054	727571	FALSE	25	TTAAGATGACTGGATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCDGASGGSLNMECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRRTIRMKLEYEKCERSCKIQKKNRNKCQYCRFQKCLALGMSHNAIRFGRMPEAEKRKLVAGLTASEGSRHNSQVADLKAFSKHIYNAYLKNFNMTKKKARGILTGKASHMAPFVIHDIETLWQAEKGLVWKQLVNSLPPYKEISVHVFYRCQCTTVETVRELIEFAKSIPSFGNLFLNDQVTLLKYGVHEAIFAMLASIVNKDGLLVANGSGFVTREFLRSLRKPFSDIIEPKFEFAVKFNALELDDSDLALFIAAIILCGDRPGLMNVSQVEAIQDTILRALEFHLQANHPDAQYLFPKLLQKMADLRQLVTEHAQMMQCIKKTETETSLHPLLQEIYKDMY	722775	729804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_723162_723984_724124_725715_725919_726100_726552_727323
910661	contig_20615_pilon	-	2724	4	Intergenic	novelGene_146914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	30.2691628926573	129	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	730	2193	233	2425	211769	195461	FALSE	15	TTTGGTTTAAGAGTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMENFRNLASIVSRKLNDGNKLSSELIMLRFMKNNTWSSMLGEISESHGTRDQHKNQGRHLRSHTVENLWESNEGNQCGKTFSWIPNLTVLKRNSPELNPFECCECGKAFIDHPSHKHHTISHTGCSTCQCKECAETCGCPSHLFTPMRTLIAKKLYKCKLCGKDLSCMSVLKNSVITLSGEKRYECNECGKHFCSFSSFWTHVRGHKHECKECCKTYSRPSSLILHEKFHIRNMPYECKECGKAFSQSSTLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASSLTQHIRIHSGERPYECKQCGKAFSQASSLTRHVSTHTGEKPYECKECGKAFSRASSLTTHIRNHSGEKPYECEECGKAFSQASSLFKHRRTHTGEKPYECKECGKAFSDSSALTTHVRTHTGERPYECKECGKVFTCFSHLTTHIRTHSGVRAYECKECGKAFSQSAHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASALTRHITTHSGERAYECKECGKAFSRALSLTTHLRTHSGEKPYECKDCGKAFSQASHLTTHARIHNGERPYECKKCGKAFSCSSALTTHIRTHTGERPYECNECGKAFSCSSAFTTHIRTHSGEKPYECTECGKAFSDSSHLTTHVRTHSGERPYECKQCGKAFTQASHLTRHRRTHRGKTTLCEKWDVSFLLL	212001	195161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_197367_197722_197874_198848_198976_211760
910662	contig_11338_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_6391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCCCAGCCAAGTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311452	309505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_309500_311500
910663	contig_6710_pilon	+	575	2	Intergenic	novelGene_92574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGAGCACAGTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653354	657519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653881_657470
910664	contig_3942_pilon	+	1499	12	Intergenic	novelGene_128883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	10.325287901455	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	131	934	1534857	1550436	TRUE	20	GAATGGGGTCTGAGTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLAAHCSFARWLLCNGSLFRYVHPSEEELRALAGKQRPRGKRERWASEEKPLSVPRDAPFQLETCPLTAVDALVLRFFLEYQWFVDFAVYTGGVYLFTEAYYYATCPAREANIAVCWCLLAVAFSIKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMADDAAPPAGLSGACQGACGAAAAGGRPH	1531855	1551324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534080_1534131_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1535916_1536004_1536162_1536941_1537094_1549644_1549706_1549824_1549951_1550354_1550459_1550671_1550769_1550878
910665	contig_8616_pilon	+	6118	1	Intergenic	novelGene_72612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	1962	5889	76	5964	463158	469046	NA	15	TATTTCTATGCCTGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVSLPEVALGGLEGKVKGTKVKTPEMIIQKPKISMQDVDLSLKSPELKGDIKISAPGIQGDVKGPQVAVKGPQVDIEAPSLEGAKLSGPSGKTGTCRISMADVDLNVAAPKVKGGVDVTLPKVEGKVKVPGVDVTGPKVDVSAPDVEVHGPEWNLNMPKMKMPKFRAPGVKGEGPELDVNLPKENVSIAGPKVSVEAPNVNIEGLGGRLEGSDIKLPEVSVKTSKISVPDLDLHVKGTKVKGEYDVTVPKLEGELKGPKVDIDAPDVDVHGRDWHLKMPKMKMPKFSVPGFKAEGPEVDVNLPKASVDISGPKVDVGAPNVSTEGPEGKLKGPKFKMPEMNIKASKISMPDVDLHLKGPKIRGEYDVTVPKVEGEVKVPDVELKSARVDIDAPDVNVQGPDWHLKMPKVKTPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADVDVSASKVNVEVPDVNIEGPEGKLKGPKFKMPVMNIKAPEISIPDVDLHMKGPKVKGEYDVTVPKLEGELKEPNVDISAPDVEIHGPDWNLKMPKMKMPKFSMPSLKGEGPEVDVNLPKADVDISGPKLDISAPDVSFEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKMSLPGVDPDLKGPKMKGNLDVSAPKVEGEMKVPDVDIKGPKVDIKAPDVDVQGPDWSLKMPKMKMPKFSMPSFKAEGPELDVNLPKADIDVSVPKVDIDAPDVSLEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDADLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGEMKVPDVDIKGPKVDINAPDVDVQGPDWNLKMPKIKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKANIDVSGPQVDVSAPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKPQKISTPDVGLHLKGPKMKGDYDVTVPKLEGEIKAPDVGIKGPKVDMNAPDVEVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPSFKGEAPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPSMNIQTHKISMPDVGLNLKSPKLKSDVDVSLPKVEGDLKGPEIDVKAPKMDVDVGDIDIECPEGKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPEVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGQMKVPDVDIKGPKVDIDAPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADINISSPKVDIDAPDLDIEGPEGKLKGSKFKMPKLNIKAPKISMPYVDLNLKGPKLKGGIDASVPELEGDLRGPQVDIKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLHLKGPKVKGDVDISVPKLEGDLKGPNVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKTPKISMSDVDLNLKGPRVKGDVDISVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKIKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIQSPDVGLECPEGKLKGPKFKMSDMHFKTPKISMPDVDLHLKGPQVKGDVDISVPKLEGELKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLNLKGSEVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDIGAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLRKPDVDISGPKVDIEPPDVSIEGPEGKLKGPKFKMPEIHAPKISMPDIDFNLKGPNIKGHVDVSAPKLERELKGPELDVRGPKLDVDMPDVAVEGPDGKWKSPKFKMPDMHFKAPKLSMPEVDLHLKAPK	463082	469200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_463100_469200
910666	contig_4659_pilon	-	2272	10	Intergenic	novelGene_118231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	206.658601993185	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	125	829	860030	837826	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAATCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQGTQKL	884093	817409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_818087_819373_819944_836792_836944_837780_837843_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916_860039_883977
910667	contig_11961_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_153692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1011	1469	112047	111589	NA	55	ATAATACAGGAACAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRNYPRTRSNTSGIPGSFYFFFLIFIYSFFSFYLFSSSPFWFSPFHSLSSLHSNGKLPQHSSSFVCFFLLFLSPLAHTILAPYIKISPLHHAYLRRALHVTPPSSTGTAYWNLPCTDYQPALVAEVSVTKNLSQQLPFSWTCPAVPYLSD	113057	111166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_111200_113100
910668	SIRV6	+	876	9	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	26	732	-11	137	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCTTGTAATTATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113	11105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034
910669	contig_20176_pilon	+	870	3	Intergenic	novelGene_172706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	81	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGAAGCTCAATCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40306	47510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_+_40532_45818_46083_47129
910670	contig_5023_pilon	+	2497	11	Intergenic	novelGene_7263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2137.61245552135	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	79	1203	607279	646990	FALSE	40	AATAAAATATTGCTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580850	648284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609677_625739_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
910671	contig_8671_pilon	-	2556	7	Intergenic	novelGene_126289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	33.5745439283991	17	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	35	994	1006869	944424	FALSE	70	AGATTGAAAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEGLAGTAKPMAAAGKLSTFRLPPLPTIREIIKLFRLQALKQLSQNFLLDLRLTDKIVRKAGNLTNAYVYEVGPGPGGITRSILNANVAELLVVEKDTRFIPGLQMLSDAAPGKLRIVHGDVLTFKIENAFPGSLKRQWEDDPPNIHIIGNLPFSVSTPLIIKWLENVSCRNGPFAYGRTQMTLTFQKEVAERLTASTGSRQRSRLSVMAQYLCSVQHLFTIPGQAFIPKPEVDVGVVRFTPLIEPVIAQPFQLVEKVVQNVFQFRRKYCYRGLGVQSPRTQGASATPAHAGVVLNVPFQVRAEGSIMTQNFFNKIPIFFLSFPQNVIP	1006903	942861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_944590_947222_947351_974244_974365_986850_987003_988546_988656_1003442_1003595_1006736
910672	contig_12852_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_141440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348646	347741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_347700_348600
910674	contig_2054_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_51693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2100	2498	145496	145098	NA	35	GTTAGTGAAGGTCAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVPIPKKSDPTECRNYQIISLISHSSKSLLKIFQKWLQHCINKELPEIQAEFRRRYGKRDIIADVRWILAESREYQKDIYLCFIDYAKVFDCVDHNKLWITLRRTLNCAHEEPIHRPRSSRSDRTRGYCVV	147595	144902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_144900_147600
910675	contig_9578_pilon	-	2348	13	Intergenic	novelGene_67966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	133.212757980941	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	435	1232	1182606	1069722	TRUE	20	TCTCTGCTTTATTTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRNPEDVQEIIVWKRYSDFKKLHKELWQIHKNLFRHSELFPPFAKGIVFGRFDESVIEERRQCAEDLLQFSANIPALYNSKQLEDFFKGGIINDCSELIGPAEAYSDSHPDSFATCSTEDFSSDSDLVSLTVDVDSLAELDDGMASNPNSPVRTFGLSLSSDSSALGAAASDSEQNKTEEERESRSLFPGSLKHKLGKRDYLEKAGELIKLALKKEEEEDYEAASDFYRKGVDLLLEGVQGESSPTRREAVKRRTAEYLMRAESISSLYRKPQLDDSSQPPGSLSSRPPWNLRSPAEELKAFRVLGVIDKVLLVMDTRTEQTFILKGLRRSSEYRGNRKTIIPRCVPNMVCLHKYIISDESVFLVLQHVEGHIQLTYFSRWSEVEDSCDSTAMERMYCAPGGSNHGRN	1251615	1057716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1058682_1068456_1068553_1069666_1069748_1088497_1088588_1099512_1099646_1100875_1100924_1134924_1135018_1145925_1146042_1182314_1182678_1198800_1198895_1214893_1215010_1238380_1238502_1251583
910676	contig_5031_pilon	+	3461	2	Intergenic	novelGene_133186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2253	2558	25252	25557	FALSE	45	CAATGTAATGTAAGAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILCPDTLLKSSISSSSVLVDSLGFSVYKIMSSANRDTLTSSLPIWMPFISFFGLTALARTSSAVLNKSGDKGHPCLVPILRENAFKVSPFRMMLAFGFV	22642	26460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_23645_24001
910677	contig_10323_pilon	+	912	2	Intergenic	novelGene_123609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCCATTGGTAGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460182	463406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_461003_463314
910678	contig_8259_pilon	-	1518	5	Intergenic	novelGene_148850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCGCGCGGAGGGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70838	53080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_53167_57916_58090_62752_62829_63759_63864_69759
910679	contig_7093_pilon	-	1578	1	Intergenic	novelGene_157968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCCCAGGGATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71486	69908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_69900_71500
910681	contig_15185_pilon	+	4343	17	Intergenic	novelGene_99394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	34.9407981448621	222	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	109	1377	130852	162600	FALSE	15	ATGCCCGCGACTCTGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASAAASSLVAAAAAGEVRFRLRCRREAAAARRAESMLDLEVVPERSLGNEQWEFTLGMPLAQAVAILQKHCRIIKNVQVLYSEQSPLSHDLILNLTQDGIKLLFDALNQRLKVIEVYDLTKVKLKYCGVHFNSQAIAPTIEQIDQSFGATHPGVYNSAEQLFHLNFRGLSFSFQLDSWTEAPKYEPNFAHGLASLQIPHGATVKRMYIYSGNSLQDTKAPVMPLSCFLGNVYAESVDVLRDGTGPSGLRLRLLAAGCGPSLLADAKMRVFERSVYFGDSCQDVLSMLGSPHKVFYKSEDKMKIHSPSPHKQVPSKCNDYFFNYFTLGVDILFDANTHKVKKFVLHTNYPGHYNFNIYHRCEFKIPLAIKKENADGQTETCTTYSKWDNIQELLGHPVEKPVVLHRSSSPNNTNPFGSTFCFGLQRMIFEVMQNNHIASVTLYGPSRPGAHLRTAELS	130634	165566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_130686_130794_130916_134957_135041_138911_138996_142573_142618_145900_145981_146274_146370_147003_147102_147192_147306_157716_157851_158234_158319_159829_159913_160339_160384_160838_160883_161001_161061_161709_161783_162513
910682	contig_10958_pilon	+	1757	6	Intergenic	novelGene_5401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	22	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	55	456	888255	894000	TRUE	40	TTGTGAATCATATCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888200	901692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894144_895250_895855_900457_900656_901336
910683	contig_4845_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_53711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	1007717	1008064	NA	60	AAAAAAAAAAAGGTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLPTASGSPLSLFAWVLGVQLLGQLTWQLGGYPVQGRPWKPPEQRPEWPPGWGSAVLNWWHCGLGVWPEGLGLYALWRSQVCPCPPQLLDKLQAGSQLPRKYRAGILFLTVGSQL	1007714	1010268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_1007700_1010300
910685	contig_8354_pilon	-	1936	2	Intergenic	novelGene_24164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_1	0	87	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618560	576992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_578731_618362
910686	contig_1107_pilon	-	3069	1	Intergenic	novelGene_126579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	2406	2912	669936	669430	NA	30	TTTAAAAGGTACCTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHILFLISQIKYGYSLLLRTVLFDPHALCRPPLTQEGAGPIIGVFLNACWEGRSGKTGKEAERLFCPAETQFYSAPRTPGTLTKTDSNRARWGSGENTPHPRGCSPPENSFSPVGLSTVAQTTGTSQKHKDGMKVTPCPLHVSFAVSKYTLMLFCFCDTTRPLGFPPY	672341	669272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_669300_672300
910687	contig_6446_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_149255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGAGAATACTTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642934	641398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_641400_642900
910688	contig_6445_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_77030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGCTCTCTCTAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540752	543773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_540800_543800
910689	contig_4180_pilon	+	3541	6	Intergenic	novelGene_8370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_5	418.638746415092	6	142	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	320	856	875200	888134	FALSE	30	AAACTTTTTCTGTCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874105	890819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
910690	contig_15760_pilon	-	2963	2	Intergenic	novelGene_131065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1011	1523	452087	451575	TRUE	50	AAAAAAGTGTGGGCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKTAWYWYNRYTDQWNRIENPDISSSTYEQLKFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPHLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTMKIMEEKIGTTLGALIHGINTIRTISNSAQAPEERPDKWELLKIKHLCSSKDFTTRVKRQPTDWGKNFWLRQIQSVFNL	453097	449905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_450819_451047
910692	contig_6028_pilon	-	2420	13	Intergenic	novelGene_156581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	194.017539298785	68	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1147	2139	323759	309678	FALSE	35	CAATATGTCCAGTATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLTHNEFTITHVIVPKQSAGPDYCDMENVEELFNVQDQHDLLTLGWIHTHPTQTAFLSSVDLHTHCSYQLMLPEAIAIVCSPKHKDTGIFRLTNAGMLEVSACKKKGFHPHTKDPRLFSVCKHVLVKDIKILVLDLR	354021	309396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316536_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_323940_324003_326490_326709_332025_332108_335867_336332_353771
910693	contig_10323_pilon	-	2543	6	Intergenic	novelGene_123599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_3	1809.98755796829	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	702	2109	88	2196	468739	459350	FALSE	20	GTGCCTTAGGCTGATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEALERQKEFFDSIRSERDDLRDEVAMLKQELKKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	473525	459002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_465065_465159_467386_467480_468607_468779_473477
910694	contig_9363_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_6505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCACGATATAATCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475783	474005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_474000_475800
910695	contig_11681_pilon	+	969	3	Intergenic	novelGene_102967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111110	172565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_111175_118276_118504_171887
910696	contig_7840_pilon	+	3363	3	Intergenic	novelGene_69000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAATGAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276497	280620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_278040_278412_279646_280032
910697	contig_4924_pilon	+	5289	4	Intergenic	novelGene_84739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	324	671	141498	141845	TRUE	45	AAAAACGGAACCGGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVWGHLINVSTCLNIQALCGKGSTVVIKTASSPCTCFKSQMPKPCSDIAKTNEDLMVKSSLCFPTSLKILPICFSRVLAGECWNPVNTAGIFLNKQKVTLNGSEDLTTVYGKEK	141174	252600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_146130_155810_155860_197778_197860_252396
910698	contig_5696_pilon	+	4584	16	Intergenic	novelGene_117490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	43.6421814303547	183	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	764	2295	200	2494	179785	211492	FALSE	15	GGTGGTTGTTGTTTACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKYGGDVLAGPGGSGLGPVDVPSARLTKYIVLLCFTKFFKAVGLFESYDLLKAVHIVQFIFILKLGTAFFMVLFQKPFSSGKTVTKHQWIKIFKHAVAGCIISLLWFFGLTLCGPLRTLLLFEHSDIVVISLLSVLFTSSGGGPAKTRGAAFFIIAVICLLLFDNDDLMAKMAEHPEGHHDSALTHMLYTAIAFLGVADHKGGVLLLVLALCCKVGFHTASRKLSIDVGGAKRLQALSHLVSVLLLCPWVIVLSVTTESKVESWFSLIMPFTTVIFFVMILDFYVDSICSVKMEVSKCARYGSFPIFVSALLFGNFWTHPITDQLRAMNKAAHQESTEHVLSGGVVVSAIFFILSANILSSPSKRGQKGTLIGYSPEGTPLYNFMGDAFQHSSQSIPRFIKESLKQILEESDSRQIFYFLCLNLLFTFVELFYGVLTNSLGLISDGFHMLFDCSALVMGLFAALMSRWKATRIFSYGYGRIEILSGFINGLFLMVIAFFVFMESVARLIDPPELDTHMLTPVSVGGLIVNLTGICAFSHAHNHSHGASQGSCHSSDHSHSHHMHGHSDHGHGHSHGSAGGGMNANMRGVFLHVLADTLGSIGVIVSTILIEQFGWFIADPLCSLFIAVLIFLSVVPLIKDACQVLLLRLPPECEKELHIALEKIQKIEGLISYRDPHFWRHSASVVAGTIHIQVTSDVLEQRIVQQVTGILKDAGVNNLTIQVEKEAYFQHMSGLSTEFHDVLAMTKQMESMKCYKDGTYIM	179585	213582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_179865_187648_187772_188994_189062_191545_191632_195360_195449_196720_196809_198010_198088_198333_198505_198958_199248_199424_199634_200749_200908_201753_201884_204919_205122_206015_206243_210790_210920_211321
910699	contig_3449_pilon	+	2306	4	Intergenic	novelGene_73736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	410.593337608989	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1889	2203	526502	526870	FALSE	40	AATTAATGTAACAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAHLNFMGSINKIKFRTPIHCHLIALGLFEGIMWSFMQRIVACLLYMLCFVVVHKCQTFLKDDATLSSWLDCTTLSYVTCQFCHVHRELFCVKQLRVANTTSE	493459	526973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_496948_524986_526620_526673
910700	contig_4059_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_140582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTATGAGCTGAAATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148991	147230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4059_pilon_-_147200_149000
910701	contig_9997_pilon	+	1592	2	Intergenic	novelGene_169474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAAATGTAGGAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111579	113351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_+_113092_113271
910702	contig_20429_pilon	-	3340	1	Intergenic	novelGene_169253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1248	1547	146217	145918	NA	25	TTTGTTTTTATAGACTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPCGLWVLATPCEFWAKAPRLQLHLPGPMDSNSARLASGSSILLVHPSGDPTTSALAGPVRLPLGHGSPASSALGRGLVPRHTLTTALHSRTELAKM	147464	144124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_144100_147500
910703	contig_5153_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_74384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	2039	2368	980385	980056	NA	30	CAGCTGCAGATCAGACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQGCSSAKGVWAKSYTVPWKNGKKMEGSPRYTHGVRARETQSQQLRQALTSVFSIFRTFAQMFPLPGLPSCLLYAFLVVVVSCHQVSPQLMVTPFTTEQSVAWSSAIPM	982423	980053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_980100_982400
910704	contig_9871_pilon	-	2825	1	Intergenic	novelGene_75674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATACAAATACTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472708	469883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_469900_472700
910705	contig_15118_pilon	+	1406	5	Intergenic	novelGene_74618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	250.978086692843	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	147	941	392523	398903	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAALLQLLAPPESKNLSCPRSKPTIQSPESENNQEEFHYANLNFQGLRSRETREPKDTHTEYAEIKFHRGFAGL	392376	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393630_398683
910706	contig_5023_pilon	+	1984	13	Intergenic	novelGene_7151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191.296817072899	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	462	1811	359358	405576	FALSE	5	CTTTGTTGTTTACTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	353451	405749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_353825_358627_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
910707	contig_10331_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_54167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	302	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAGAAAAAAGAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517774	519554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_517800_519600
910708	SIRV6	+	1234	5	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1895	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	30	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGCTAGAAGACCGGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7104	11821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7434_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
910709	contig_8045_pilon	-	850	2	Intergenic	novelGene_35454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAACTCGATGGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462504	460306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_460875_462222
910711	contig_6807_pilon	-	4427	8	Intergenic	novelGene_84558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_5	107.752929786392	130	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	113	1612	94225	82128	FALSE	30	TTGTAAAAATATTTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVQANIEKEVTCPICLELLTKPLSLNCGHSFCQACITAKNVELQTVISPGGQKSCPVCHASYQPGNLWPNQHLAKIVKGFREAKLSPQEGQKSDRCVHHGEKLLLFCKNDEKVICWLCVRSQEHCGHQTFLVEEVVKECQEKLQETLTRLRKEQQEAEKLEAQIIEERASWKHQTQTERQRILAGFNDLHAILDNDKKRELQKLEEEEVNVLDNLAEVKYQLIQQYQDLSDLISDVEHRMQWSSVDTMQDVIDIVKRSESWTLKKPTIVSKKLKNVCRVPDLKEILQVFRELTDVQCYWVDVTLNQVNTSSNVVISADQRQVAVLRIPNFRNSDQHDFSAFDVLGCQYFSSGKHYWEVDVSRKTAWILGVYCRAKDPHERWASVFAFGLNVSSQNVFSRYRPQYGYWVIGLQNQFEYNAFENSSTSNPQVLTLFMAVPPRRIGVFLDYEAGTVSFFNVTNQGSLIYKFSQCCFSQCVCPYFNPCKCPAPMTLCPPSS	96000	79312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_82724_82972_83000_83306_83408_84988_85012_92028_92260_92917_93014_93799_94287_95949
910712	contig_6418_pilon	+	8329	10	Intergenic	novelGene_81142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	469	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCGAGAGCCATCCCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204139	317825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_211123_212992_213104_214090_214205_218997_219106_219770_219901_222173_222301_228278_228672_231839_231984_250911_250996_317690
910713	SIRV6	+	889	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	224	18	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	21	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
910714	contig_240_pilon	-	5347	34	Intergenic	novelGene_173794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	135.344908514468	241	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1663	4992	241	5232	596894	417830	TRUE	10	TGGTTCCCCCACTGAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLITACKAVESLAEGGGSEIQRVKEDARKKVQQVEDSLTKRILLLEEDVKAAQAELEKAFRGTEKEKALRLSLENKLLEMKKMHEGDLKMALVLEEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMASPDVNMSSGELQGLSAPLREEKERETEAIHMEHQKERNCFEERIQALQEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKEVEELNSEIEELSAAFAKAREVSQKAQTQKFQGSEEYEAALSEKEALLAELRSQNLTKNTENHRLCRNIKKVTQELSDLQQERERLEKDLEEAYREKSKEDCTILDLRNQVEKLRDEVTEREKAVENRYKSLLSESNQKLCSQEQEIKRLTESVNQKDLLLMKVNEKDLEAIQQSCHLMTAEDFEFKNEGLITGKCSQQPPASKIIFFEEKKQSDYEELIQVLKKEQDIYSRLVKSLQDSNSINNLQAELNNIFALRKQLEQDVLSYQNLQKTLEEQINEIRRREEETFSFYSDQTSYLSICLEEHNRLQVEHFSQEELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGSDRLESVEQTELLASKEDEDMIKIGEESDKNHFLSDQRLEQSNEVMEDCSKGGCKNGYLWHTESSVLDYDGACKPGCPGDQSLEEGELINLLAPFLNEKATSLLVSRPDLLQTLHELLLEQICLTKQDVSGEDLDGKTKKTLKQMAIQLRGELRRFIQANSFSKPHDELKSPWGAQLVKLGEVSKVELKDASMQTVVMEGNTLRFKHEGMREAWEEKPTDAVFSAEHQPENLHRMPGRQGTPLSLPSGTDKDAKKSRLPILIKPSRSLENVYRLSATQEVVAQLQGQIMELQGELKEFKTHNKQLHQKLILAEAMMEGKPMADKMLLNAQPLVGTAYQGSPGEQKGIKTTPCVWRDKEMDNDQQTSYETDSEIYQPDDLAILPTCKESPSEDFQGTTSVATYVSSKSQLSVKVNMIETDQSENIDASNGTEYLKQKIRDLETELKGYQSFIFQLQSGKHSQCSEAIITVLCGTEGAQEGLNKPKGGTDDEEMTFSSLHQVRYVKHMKILHPMAPETTDGGMLESLKQQLVEQEYELQKEQNLNMELFSEIHNLQNKFRDLSPSRYDSLVQSQARELSLQRQQIKDSHDICVIYRQHMNTMMKAFEELLQASDVDCYLAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSAEVEVSAQNELMERIEEDNLTYQHTIPESPEPSASHALSDCEMSEKSSFFSRDQKQDSEIEKISVIANSISQDLLMEHIQEIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFDQGSANIFAYGSELHNSLTSEIHFLRKQNQALNMMLAKGSRDKQKENERLRESLSRKIANLENLQQKYSSVKGENERLQKEVSEKERHNQQLVQEIYDRRKELSRAQEEVKLRQQLLLQNDKLLQSLRVELKVYEKLDEEHRRPREARAEASGEGWKGQDPFSDLHGLLREIQALRVQLERSIETNSNLQSKLEEQLAKDGSRCSMANENSYDLFDSTLAVPPKLASETLLLYGDDVDSLSCDSGSSATSSPSTIRLVPGHRLWASKSGRHVLGLIEDYNALRKQIGQGQRLLAKMDVQIQEVSSPTVRELGTKGPYSTPLSRFVTSVNTAKLILEEASRLLKLLWRVSLPTDGQCTLHCEQIGDMKAEITKLQKKLFEQDKKLQNTAKLLQLSKHQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLEVVPL	607376	417333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_417417_417797_417892_422182_422310_430808_430953_433498_433765_434813_434892_441613_441776_443187_443310_444598_444789_446087_446205_450251_450372_456498_456675_459423_459473_470066_470300_472091_472675_476869_476993_480838_481071_488154_488588_501225_501414_503312_503412_516719_516849_518253_518364_519908_520040_526426_526525_534068_534210_547906_548078_569523_569743_584188_584282_586900_587021_587860_587915_589064_589228_596835_596991_600275_600400_607356
910715	contig_10734_pilon	+	1962	7	Intergenic	novelGene_51472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	408	767	2265456	2265815	TRUE	40	ACTGGTTGAGACTAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265048	2276154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266074_2267089_2267192_2269290_2269431_2270438_2270505_2270955_2271050_2274374_2274509_2275753
910716	contig_15039_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_110106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTGTAACAGAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125448	127834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_125400_127800
910717	contig_3277_pilon	-	3041	1	Intergenic	novelGene_74734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227088	224047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_224000_227100
910718	contig_13542_pilon	+	7322	49	Intergenic	novelGene_131563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	173.077444080116	47	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1504	4512	2811	7322	683046	720740	FALSE	30	CCCCAGCAAATCAGAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNNLVHFTESKLPQTETEGVDEGKEPQKQLEGDCCSFITQLVNHFWKLHASKPKNAFLAPACLPGLTHIEATVNALVDIIHGYCTCELECINTASKIYMQMLLCPDPAVSFSCKQALIRVLRPRNKRRHVTLPSSPRSNTPMGDKDDDDDDDADEKMQSSGIPNGGHIRQESQEQSEVDHGDFEMVSESMVLETAENVNNGNPSPLEALLAGAEGFPPMLDIPPDADDETMVELAIALSLQQDQQGSSSSALGLQSLGLSGQAPSSSSLDAGTLSDTTASAPASDDEGSTAATDGSTLRTSPADHGGSVGSESGGSAVDSVAGEHSVSGRSSAYGDATAEGHPAGPGSVSSSTGAISTTTGHQEGDGSEGEGEGEAEGDVHTSNRLHMVRLMLLERLLQTLPQLRNVGGVRAIPYMQVILMLTTDLDGEDEKDKGALDNLLSQLIAELGMDKKDVSKKNERSALNEVHLVVMRLLSVFMSRTKSGSKSSICESSSLISSATAAALLSSGAVDYCLHVLKSLLEYWKSQQNEEEPVATSQLLKPHTTSSPPDMSPFFLRQYVKGHAADVFEAYTQLLTEMVLRLPYQIKKIADTNSRIPPPVFDHSWFYFLSEYLMIQQTPFVRRQVRKLLLFICGSKEKYRQLRDLHTLDSHVRGIKKLLEEQGIFLRASVVTASSGSALQYDTLISLMEHLKACAEIAAQRTINWQKFCIKDDSVLYFLLQVSFLVDEGVSPVLLQLLSCALCGSKVLAAMAASTGSSSAASSSPPVASSSGQATTQSKSSTKKSKKEEKEKEKEGESSGSQEDQLCTALVNQLNKFADKETLIQFLRCFLLESNSSSVRWQAHCLTLHIYRNSSKSQQELLLDLMWSIWPELPAYGRKAAQFVDLLGYFSLKTPQTEKKLKEYSQKAVEILRTQNHILTNHPNSNIYNTLSGLVEFDGYYLESDPCLVCNNPEVAFCYIKLSSIKVDTRYTTTQQVVKLIGSHTISKVTVKIGDLKRTKMVRTINLYYNNRTVQAIVELKNKPARWHKAKKVQLTPGQTEVKIDLPLPIVASNLMIEFADFYENYQASTETLQCPRCSASVPANPGVCGNCGENVYQCHKCRSINYDEKDPFLCNACGFCKYARFDFMLYAKPCCAVDPIENEEDRKKAVSNINTLLDKADRVYHQLMGHRPQLENLLCKVNEAAPEKPQDDSGTAGGISSTSASVNRYILQLAQEYCGDCKNSFDELSKIIQKVFASRKELLEYDLQQREAATKSSRTSVQPTFTASQYRALSVLGCGHTSSTKCYGCASAVTEHCITLLRALATNPALRHILVSQGLIRELFDYNLRRGAAAMREEVRQLMCLLTRDNPEATQQMNDLIIGKVSTALKGHWANPDLASSLQYEMLLLTDSISKEDSCWELRLRCALSLFLMAVNIKTPVVVENITLMCLRILQKLIKPPAPTSKKNKDVPVEALTTVKPYCNEIHAQAQLWLKRDPKASYEAWKKCLPIRGIDGNGEI	665183	720740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_665209_665809_665881_665967_666116_666565_666794_667491_667663_671174_671358_672225_672385_672735_672889_673336_673565_673890_674049_675035_675208_676226_676429_677500_677665_678117_678335_679169_679387_681302_681365_681800_681936_682928_683104_683952_684094_685216_685339_685992_686105_687911_688043_688163_688342_688804_688910_690404_690543_691589_691765_697703_697801_698463_698572_699046_699164_700254_700465_701653_701804_703172_703401_704442_704522_705368_705615_706513_706683_707136_707282_707884_707971_708668_708757_709024_709219_711676_711917_712344_712484_713198_713325_713441_713571_714472_714817_716491_716583_716918_717004_717193_717322_720463_720594_720717
910719	contig_6439_pilon	+	2413	1	Intergenic	novelGene_154250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTATGTTGAGGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391267	393680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_391300_393700
910720	contig_11986_pilon	-	2561	2	Intergenic	novelGene_69249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1889	2269	808626	808246	TRUE	30	GAAGGACGAGGTCCAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLNIISQNKARGQLWNSYQLLICTFELKLKKIRTSPREPKYDLEYIPPEFRDHLKKRFDACNPNDQRQDELLNDIIHEESKRSLKRQERKKRAKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNT	810514	807404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_807507_808055
910721	contig_6175_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_16334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGAAGAGTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1520270	1522833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1520300_1522800
910722	contig_13215_pilon	+	1919	10	Intergenic	novelGene_145876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	115.225811580223	166	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	81	842	15741	35589	FALSE	20	TTTTGTTAAAGACGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSPMVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGNALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVERRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKLETLETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETEAE	14561	36666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_14640_15738_15798_20939_20986_22257_22313_23901_24029_27021_27188_27729_27768_29075_29223_32859_32954_35557
910723	contig_11855_pilon	+	3918	1	Intergenic	novelGene_66891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2545	2853	654905	655213	NA	75	TTAAGAAAAAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPKKQKKKKTTRKERCSGIPLHVCASRGGSLLATQHRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPWDPTSTAAQTRKQLHTQMELHSPSGRSKDGTWSQVFE	652360	656278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_652400_656300
910724	contig_3004_pilon	+	2033	11	Intergenic	novelGene_127550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	76.5417533115097	3	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	855	1202	833493	850982	TRUE	30	TAAAAATATCTTGGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTALYVTLATLGYMCFREEIKGSITFENSIFLWHFCDIFNSVLCSSRDHYSCGHIQISC	802194	855510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_802299_813989_814126_815278_815370_818526_818623_820752_820838_825951_826063_827930_828159_833489_833589_837198_837348_850879_851036_854732
910725	contig_13800_pilon	+	4393	10	Intergenic	novelGene_153729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	489	junction_8	117.042990940915	64	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	50	1294	114337	159799	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGKQPKKHLFLPHEGHFSFSSLGSSVWVSFKLPKQKSKY	114287	162898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543
910726	contig_6885_pilon	-	6521	1	Intergenic	novelGene_83673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	599	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	5328	5630	210312	210010	NA	25	GTTAAATGTTCTGCATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	215639	209118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_209100_215600
910727	contig_5317_pilon	-	623	2	Intergenic	novelGene_76563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCGGAGTGCCACAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43690	36708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_36817_43175
910728	contig_10074_pilon	+	2741	6	Intergenic	novelGene_57162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_5	69.5229458524306	58	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAGCATTTGATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526912	542320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_527450_533079_533137_533990_534068_534161_534218_535282_535401_540424
910729	contig_50_pilon	+	3188	1	Intergenic	novelGene_122224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	307	924	595	1518	88152	89075	NA	50	TATTAACAATAAAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQNCESRHKLSTYEQVIFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTRLGALTHGINTIRTISNNVQAPEERLDKWELLKIKHLSSSNDFTKRVRREPTDWGKIVGYDISDQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIEKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTQNNKCWKGCGETGTLIHCWWECKMIQPLWKSIWCFLKKVRNRSSIQSSYPAPRNISWRNKSRHTNRYMHTHVSLQHCSQ	87557	90745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_87600_90700
910730	contig_18145_pilon	+	2340	13	Intergenic	novelGene_37357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	523.82922365553	1	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	169	1917	92719	100744	FALSE	20	TTTTACATGCTTTTGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	92020	101167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97276_97843_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
910731	contig_10437_pilon	-	2920	1	Intergenic	novelGene_38506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1518	1844	1308573	1308247	NA	25	GGGGGGAGGCAACAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSHPLSTFSLELFPAPVLRAFFSSPLLEGNPVNLTCQTKLSSQSPGLQLYFSFHVGSKNLMGRSTSSEYQILTAKREDSGFHWCEAATEDGNVVKRSPQVELQVLGE	1310090	1307170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1307200_1310100
910732	contig_14445_pilon	-	2744	4	Intergenic	novelGene_137346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACAGTTATAGCTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333153	85670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_86645_176566_176992_275259_275290_331838
910733	contig_14536_pilon	+	2839	3	Intergenic	novelGene_69276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTCCTCCTTTGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49070	118344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_49114_106282_107614_116879
910734	contig_15613_pilon	+	4301	15	Intergenic	novelGene_147188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	302	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3014	3517	90846	111339	TRUE	65	AAAAAAAAGCAAATATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACACWRSCWHCSRSGVPGTGEALERGCTAAGVGTRCQVVFLLKGVLYSHGVPSLSSLYSTMGMRQSSEHPLRGEPSSWGWIMTTFTVTEVRSRSIICSWVRVTTATLHISTRRLPWRRPAFQAKPKGSTSATIPSKFTWKPSWPSPFLLKVISTVSQPLVTIPNL	42622	117891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_43907_48096_48181_49096_49217_58852_58985_68951_69176_71503_71656_76775_77001_84127_84513_86298_86407_86793_86890_88384_88545_90802_91064_107158_107432_111326_111904_117671
910735	contig_9458_pilon	+	3033	2	Intergenic	novelGene_178874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1242	2291	1242	2291	TRUE	65	AGGAAAGAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	0	4479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9458_pilon_+_2726_4171
910736	contig_2646_pilon	-	1740	12	Intergenic	novelGene_69653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	353.091821925606	11	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	95	787	2178950	2174850	TRUE	25	GTTGGCTAAACGATGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2181009	2171576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2171822_2171963_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180956
910737	contig_11279_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_136525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	573	872	20623	20922	NA	75	ATAGGAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEYPANSKLKPLPKSAFQPKIRQAYKTMTHVRNVLFSSVKYIGPSGQHLRKSKDEAEGKGKLDKWTRRTWGIKGKGKTADTLRRLQPMSQNNLCINF	20050	22218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11279_pilon_+_20000_22200
910739	contig_6227_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_49802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTTAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272479	1269151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1269200_1272500
910740	contig_7408_pilon	-	2396	8	Intergenic	novelGene_168734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_7	227.062519485498	8	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	475	1554	38514	12597	FALSE	35	GAATCAAAGTTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48263	11754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47312_47360_47827_48040_48129
910741	contig_6048_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_73165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1183	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAATTATACAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196543	1193766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1193800_1196500
910742	contig_14405_pilon	-	1944	8	Intergenic	novelGene_85641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_3	86.5509169477123	27	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	484	867	437598	436681	TRUE	25	CTATGACTAATTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNFSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGCQSVPIVFRGPNGASAGVAAQHSQCFAAWYGHCPGLKVVSPWNSEDAKGLIKSAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPEAAQSKDFLIPIGKAKIERQGKRT	439471	434589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_435107_435411_435554_436262_436806_437339_437798_437895_437959_438043_438152_439270_439325_439412
910743	contig_6215_pilon	+	882	1	Intergenic	novelGene_21229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	48	422	410021	410395	NA	60	GAGGAGAAAATGGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSIVWLSSIFQSDILFLCVVNPNLCLWLVRQDKIMLKRIRVECNTLTQVTALIRCKGSFPGVWPASPFILQEIKGERRKQRELLLWTGDPCAEKDLKQGKIDDKDLLPEPTERESLLLELMP	409973	410855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_410000_410900
910744	contig_13093_pilon	-	4991	4	Intergenic	novelGene_105218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_3	37.9561150101886	194	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	849	2550	232	2781	80341	58437	FALSE	55	ATGGAAATGAAGAGAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWLQEKRRPTILEPVTFEDVTVVFTEGEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLEPKPELHPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGRSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREVSRPLCGRREERGTSRAFSSPPQTQSASSREDNTEVGVEPNSAQRIKSVERGQGLKLETSRFRAVSSREDEPDCGVKSRFITHQRSLLQKKPCVCSECGRGFHQKSLLFMHQRTHSVEQPYVCSECGRGFTQKSVLFMHQRTHSGQKPHVCKECGRELSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGQGFNRKSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFNRKSNLITHQRTHSVEKLYMCKECGRGFNRKSDLLMHCRTHSGEKPHVCKECGRGFNHKSNLIRHQRTHSGEKPYVCLECGRGFNCKSSLITHQRTHSGEKPFVCLQCGRGFNQKSNLITHQRTHSGEKPYMCLDCGRGFSQKSGLLLHQRTHSDRKLYMCMECGRGFSDKSTLVRHQRTHSGEKPYVCMECGHGFIDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCIDCRRGFSDKSTLIRHQRTHSGEKPYVCMECGRGFSCKSNLITHQRTHSGQKPHVCKECGREFSNKSSLIRHQRTHSGEKPYMCLECGRGFNRRSHLIRHQRTHSGEKPFMCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHSGEKPYVCRECGRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCKKCGRGFNRKSDLLMHCRTLLGEKPHVCKECGQGFTNKSNLLRHHRTHSGEKPYMCLECSRGFNRKSNLITHQRIHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLLIHQRTHLG	80572	56226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_60770_77589_77717_80070_80127_80307
910745	contig_11656_pilon	+	2170	7	Intergenic	novelGene_53997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	212.679466699434	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	177	848	465719	511018	FALSE	50	TACTTACCACAGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTCGVWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLVRNGICVFAYQFVSSLDVSYIRRNCCIKSDPSSI	464928	512340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465700_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823
910746	contig_7810_pilon	-	1941	3	Intergenic	novelGene_144215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTTTTTCCTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146797	128199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7810_pilon_-_128720_143629_143745_145491
910747	contig_15664_pilon	+	2943	14	Intergenic	novelGene_171500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	89.2417765094141	62	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	871	1605	35511	77461	TRUE	50	AAACCACAAAGAATGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKSFHRIQQMLPDKTIASLVKYYYSWKKTRSRTSLMDRQARKLANRHNQGDSDDDVEETHPMDGNDSDYDPKKEAKKEGNTEQPVQTSKIGLGRREYQSLQHRHHSQRSKCRPPKGMYLTQEDVVAVSCSPNAANTILRQLDMELISLKRQVQNAKQVNSALKQKMEGGIEEFKPPESNQKINARWTTEEQLLAVQGDWLLGK	21943	79510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_22240_22618_22676_30013_30092_30263_30641_33059_33113_35501_35664_37092_37218_37969_38049_53258_53478_59964_60043_69704_69763_77438_77557_77804_78047_78509
910748	contig_10494_pilon	-	2568	3	Intergenic	novelGene_102217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	208	459	1185642	1185391	TRUE	25	ATTAGGGTGTCCACAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGSACSGPACTTTALQYGAPLRQGVLLLPGAGGARRGGNGVSQGLSVLTTLLWLATCDRERDCRAASTEMVPVCDRSAACVPRPCEPVLVGTQPVFTPLPLSHFLMVETVSSSLTLTIKQDNAAKWRKGPAHRRAEGAWDPGLLTSCCGSCH	1191481	1183155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1184556_1184681_1185743_1191374
910749	contig_5023_pilon	-	4442	1	Intergenic	novelGene_7305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGACTCTGCCACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592893	588451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_588500_592900
910750	contig_10861_pilon	+	4384	6	Intergenic	novelGene_39275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	349.892211973916	17	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	84	407	1337795	1338118	TRUE	75	CATACAACTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGRRSVERTGAAAAALGRGRGRDEDGGSHAAFGARTRPRRRPQLPLGNERGASGPHTATARSAGRVAAFSFPPPPPQLGGPFFPASSPRLQPPPRPWRARTFAPL	1337711	1350236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1339656_1340022_1340386_1343172_1343280_1344610_1344774_1345020_1345072_1348480
910751	contig_6025_pilon	-	5853	12	Intergenic	novelGene_178033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	92.754808745717	234	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	295	1968	218658	147785	FALSE	40	TTAAAAGTGTAATTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKEKYEPPDPRRMYTIMSSEEAANGKKSHWAELEISGKVRSLSSSLWSLTHLTALHLSDNSLSRIPSDIAKLHNLVYLDLSSNKIRSLPAELGNMVSLRELHLNNNLLRVLPFELGKLFQLQTLGLKGNPLTQDILNLYQEPDGTRRLLNYLLDNLAGTAKRISTEQPPPRSWIMLQEPDRTRPTALFSVMCYNVLCDKYATRQLYGYCPSWALNWDYRKKAIIQEILSCNADIISLQEVETEQYYSFFLVELKERGYSGFFSPKSRARTMSEQERKHVDGCAIFFKTEKFTLVQKHTVEFNQLAMANSEGSEAMLNRVMTKDNIGVAVLLELRKELIEMSSGKLHLGTEKQLILVANAHMHWDPEYSDVKLVQTMMFLSEVKNIIDKASRSLKSSVLGEFGTIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSTGGVETNHKDFKELRYNESLTNFSCNGKNGTTNGRITHGFKLKSAYENGLMPYTNYTFDFKGIIDYIFYSKPQLNTLGILGPLDHHWLLENNISGCPHPLIPSDHFSLFAQLELLLPFLPQVNGIHLPGRR	234164	143899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6025_pilon_-_147998_154519_154723_156942_157174_158148_158304_158893_159049_159769_159928_161132_161202_161282_161388_181777_181864_183775_183963_218546_218661_233872
910752	contig_1263_pilon	-	1989	3	Intergenic	novelGene_170395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1275	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76815	51833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_53418_65169_65324_76564
910753	contig_6589_pilon	+	1615	8	Intergenic	novelGene_26022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	959.418382486526	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	375	977	1726977	1730190	FALSE	10	TTGCACCATTGCGGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVIWLRPHSLLAP	1725369	1730828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725983_1726064_1726937_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067
910754	contig_5145_pilon	-	4960	2	Intergenic	novelGene_131447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	252	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	292	735	922224	921781	FALSE	10	CTCCCAGCTTTGGCACGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRNRRERRDNRHQPSLKPSRTIYISSQGLKIIFSSLRPFRQWCLPDSGGWPRPLDSGWRFLSPGFQLHLPGPPGQQLCSLGFGRPHSFSPHEWQPYYLGPGRPHSSAPWAWQPCPLVLMNGSPTLRNQVADDLTPLNLGGHDSTL	922785	917555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_922306_922575
910755	contig_16525_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_133877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTCACCTGAAGTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184316	184926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_184300_184900
910756	contig_8676_pilon	+	2553	13	Intergenic	novelGene_142204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	28.1878618478869	151	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	357	2063	400076	426463	FALSE	20	TATTTTTAAGGCCTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSKKMDSLGSLQTNPPLKLISDRSAGAAVFVPEQGGYKEKFVKTVEDKYKCEKCRLVLCNPRQTECGHRFCETCMAALLSSASPKCTACQESIIKDKVFKDNCCKREILALQIYCRNESRGCAEQLTLGHLLVHLKNDCQFEELPCVRADCKEKVLRKDLRDHVEKACKYREATCSHCKSQVPMITLQKHEDTECPCVVVSCPHKCSVQTLLRSELSAHLSECVNAPSTCSFKRYGCVFQGTNQQIKAHEASSAVQHVNLLKEWSNSLEKKVSLLQNESVEKNKSIQSLHNQICSFEIEIERQKEMLRNNESKILHLQRVIDSQAEKLKELDKEIRPFRQNWEEADSMKSSVESLQNRVTELESVDKSAGQAARNTGLLESQLSRHDQMLSVHDIRLADMDLRFQVLETASYNGVLIWKIRDYKRRKQEAVMGKTLSLYSQPFYTGYFGYKMCARVYLNGDGMGKGTHLSLFFVIMRGEYDALLPWPFKQKVTLMLMDQGPSRRHLGDAFKPDPNSSSFKKPTGEMNIASGCPVFVAQTVLENGTYIKDDTIFIKVIVDTSDLPDP	307143	426953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_307218_346326_346469_367644_367768_400058_400321_402010_402063_404635_404741_406455_406624_408923_409005_411905_411981_413569_413663_418978_419120_424540_424716_425891
910757	contig_14513_pilon	-	1266	4	Intergenic	novelGene_70235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2428	junction_3	229.539151828663	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	150	566	18880	11982	FALSE	10	TGCTTTTGTCCATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19029	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_18735
910758	contig_5280_pilon	-	4194	1	Intergenic	novelGene_52636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	785	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCAGTGCCATTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79153	74959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_75000_79200
910759	contig_6217_pilon	-	5817	21	Intergenic	novelGene_109559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	119.008613133672	299	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	1376	2932	118695	37112	TRUE	15	TCTACATATTTCCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKQSSEVKEKWESLNAVTSNWQKQVDKALEKLRDLQGAMDDLDADMKEVEAVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKTMAFREEIAPINLKVKTVNDLSSQLSPLDLHPSLKMSRQLDDLNMRWKLLQVAVDDRLKQLQEAHRDFGPSSQHFLSTSVQLPWQRSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQSLADLNNVRFSAYRTAIKIRRLQKALCLDLLELNTTNEVFKQHKLNQNDQLLSVPDVINCLTTTYDGLEQIHKDLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGKIRVQSLKIGLISLSKGLLEEKYRYLFKEVAGPTEMCDQRQLGLLLHDAIQIPRQLGEVAAFGGSNIEPSVRSCFQQNNNKPEISVKEFIDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIVGFRYRSLKHFNYDVCQSCFFSGRTAKGHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLKNKFRSKKYFAKHPRLGYLPVQTVLEGDNLETPITLISMWPEHYE	120070	3161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_5290_9036_9060_14542_14636_15845_15955_19067_19309_20100_20260_35611_35678_36836_36903_37111_37155_42748_42886_64252_64365_70115_70283_71925_72084_77517_77604_83605_83808_90245_90321_91968_92031_105314_105376_108515_108595_113325_113473_118467
910760	contig_13740_pilon	-	3412	8	Intergenic	novelGene_34692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	3461.31654791901	88	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	165	1001	165243	159956	TRUE	40	CTAAAGGAAATTGTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGQFLHIFWIMRSNRIVCFLVHVVYIEFLNGITVYCEYL	165407	156809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
910761	contig_14970_pilon	+	2263	11	Intergenic	novelGene_44931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	6053.6559069706	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	179	1564	136145	231550	FALSE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATKQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135966	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
910762	contig_5686_pilon	-	6624	14	Intergenic	novelGene_45194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	329	126	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2868	3539	208699	203000	TRUE	30	CACTCATGAGGAAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	231137	17226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_17677_33470_33671_187109_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222914_224040_225478_230378
910764	contig_2547_pilon	-	2121	2	Intergenic	novelGene_165468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	1735	2121	447922	447357	FALSE	45	GAAGGAAGGTAGAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKGAVGACHWSGADPGKPYAGGFLARWCGTAYQEEAKLAHAARWVGERKGRKGEINKKLGEKKRKGTRGKVVGRKERKERTERQETKKKKITQESPPEVAPHPSGTAQPIKKEQRWHAAPGVQEKGK	449656	447356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_447419_447597
910765	contig_1699_pilon	+	3744	21	Intergenic	novelGene_72815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	11	junction_13	184.121535948406	264	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	590	1773	259	2031	63889	94583	TRUE	80	CTGAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVQAAQWTEFLSCPICYNEFDENVHKPISLGCSHTVCKTCLNKLHRKACPFDQTAINTDIDVLPVNFALLQLVGAQVPDHQSIKLSNLGENKHYEIAKKCVEDLALYLKPLSGGKGVASLNQSALSRPMQRKLVTLVNCQLVEEEGRVRAMRAARSLGERTVTELILQHQNPQQLSANLWAAVRARGCQFLGPAMQEEALKLVLLALEDGSALSRKVLVLFVVQRLEPRFPQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVTKRDEDSSLMQLKEEFRSYEALRREHDAQIVHIAMEAGLRISPEQWSSLLYGDLAHKSHMQSIIDKLQSPESFAKSVQELTIVLQRTGDPANLNRLRPHLELLANIDPNPDAVSPTWEQLENAMVAVKTVVHGLVDFIQNYSRKGHETPQPQPNSKYKTSMCRDLRQQGGCPRGTNCTFAHSQEELEKYRLRNKKINATVRTFPLLNKVGVNNTVTTTAGNVISVIGSTETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENILKTFSIFKIQGLRYPLKYHNTHRLDTTHHLQRYQLVWLPAFLAL	53753	102029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_53945_63821_64120_67046_67165_70070_70305_76616_76793_80231_80433_80889_81023_81138_81258_82789_82903_89240_89550_93271_93348_94520_94955_95512_95684_98067_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_100430_100462_101662
910766	contig_7182_pilon	-	910	4	Intergenic	novelGene_117150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1512.41682966921	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	15	542	889318	886983	FALSE	40	AAGTAAATACAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKFFFLSIKHLTPLCTTHSF	889332	886614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887040_888169_888345_888814_888961_889168
910767	contig_9815_pilon	+	3754	5	Intergenic	novelGene_164232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1249	1794	1819	86569	TRUE	10	CCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPE	0	204370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_508_1077_2331_86535_86623_202364_203843_203941
910768	contig_11281_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_125501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTTCTTCGAAAAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941695	938821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_938800_941700
910769	contig_16098_pilon	-	1179	8	Intergenic	novelGene_46021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1399.09495527557	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	141	1178	352350	348292	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKCRSYRSAWIDWRRQSRPSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFS	354129	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348469_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
910770	contig_17753_pilon	-	4500	2	Intergenic	novelGene_105076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3163	3495	62808	62476	FALSE	5	CAGTCTGGGCCCTCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLSARRNRNLDCTSLLEVYRSFRAHQVEASAFPSLTLLPSSHITGKVPWLHLGSGGGPPCFLVLLHPHCCHQETPTCLPSLSMKTASSHGLLRPLTVLFTSLNSHPGR	67068	61470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_64691_65788
910771	contig_9121_pilon	-	4736	1	Intergenic	novelGene_134468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATAATCACTATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235821	231085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_231100_235800
910772	contig_13026_pilon	-	1407	12	Intergenic	novelGene_146297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	76.4901549328598	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	614	1024	14211	6494	FALSE	10	TCTCCTGGACCAGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	28106	6110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975_23008_28000
910773	contig_2987_pilon	-	3654	5	Intergenic	novelGene_125862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	149.061229030221	186	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	225	554	539583	538100	TRUE	10	TCATTTGTCTGTGCCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQIAPMLARLGYDPYANPPNYGNPDPIVINNTHRVLKGDYKTPANLKGYFQVRNPNGNSEFWLSWLCTSFLYALGCSTSPVCHSFPFVKLRGGGHRISKWPNLTSPSA	593496	533290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2987_pilon_-_533792_535500_538325_539478_539678_553777_553850_593438
910774	contig_11615_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_151258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCATTAGCTTCAGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49887	51493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_49900_51500
910775	contig_6589_pilon	+	696	1	Intergenic	novelGene_25844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTAAACAGATCCATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925071	925767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_925100_925800
910776	contig_12250_pilon	-	2140	15	Intergenic	novelGene_80669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	59.6623578043603	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	300	1574	387793	383063	TRUE	10	CTCCTTTGCCAGGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLGVESPQGAGGPEPELARGQWACQSCTFENESAAVLCAICERPRLAQPPSLVVDSHDSGICLQPLQQGEALLSSSQTQAWSCIHCTFCNSGPGWVCAMCNRTSSPIPAQHTPQPHASSLEERHPEPGPPQRLSAPLPGSCGDPEKQRQDKMQEEGLQLVMMVREGEAAGACPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELPYVLEMVAELAGQRDPGLGAFSCQEARKAWLDRLGNLDEAVEECVRARRRKVKELQSLGFGPEEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDSGPEPTPSWDGPDKQSLVRRLLAVYALPSWGRAELALSLLQETPRNYELGDVVEAVRHSHDRAFLRRLLAQECAVCSWALPRNRMQALTSCECTICPDCFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDTQLLSYFSTLDIQLRESLEPDAYALFHKKLTEGVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQWEEQHRVPPPVLQWLLQCLLRQE	388257	381231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_381362_381453_381623_381918_382016_382743_382802_382950_383065_383334_383386_383664_383684_384737_384828_384918_385018_385100_385275_386482_386690_386793_386980_387087_387337_387595_387887_388051
910777	contig_10734_pilon	+	2724	1	Intergenic	novelGene_51337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	261	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1632257	1634981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1632300_1635000
910778	contig_546_pilon	+	4818	10	Intergenic	novelGene_117205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	945.506657568403	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	240	1706	119834	152874	TRUE	60	GACAAAAAAAAATCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	103330	156170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_123934_124065_136648_136838_139866_140301_140357_140638_146633_146847_147557_147672_152818_153966_154149
910779	contig_9132_pilon	-	4743	1	Intergenic	novelGene_121378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACATCTATAGGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119107	114364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_114400_119100
910780	contig_14846_pilon	+	2471	1	Intergenic	novelGene_85387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	1322	1939	245755	246372	NA	30	AATGACACCCACCTGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGFLRKVTGYHSGSGKLRIQFFHWDSFFLAVLADTPLSGPRPLPCSGKCYKALLAPASKSSEAPGTQLSHSVGQEACWSLLPHLLGILRVIALSLFQSPGSRSLSAQGSWVQRTCFPVLAVLPWWCWDLLLPVSRVAHFKPSRMAKWTNPLVGHSYSICTVLPSHLGGSYKTMAKKATQKQSITPQVPTNIKYLLSCSILQYT	244433	246904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_244400_246900
910781	contig_8606_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_159398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACATACATACAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88184	89871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_88200_89900
910782	contig_9668_pilon	+	3034	3	Intergenic	novelGene_58227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTTAAAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556019	559314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_556323_556403_556625_556804
910783	contig_15668_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_169628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGTAAAGCCAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80151	77860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15668_pilon_-_77900_80200
910784	contig_6795_pilon	-	906	4	Intergenic	novelGene_27703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_3	134.960076401217	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134357	123741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_124272_128910_129062_129286_129402_134247
910785	contig_10140_pilon	-	5468	17	Intergenic	novelGene_148383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.3739903003587	3	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	55	1065	186175	180566	TRUE	20	TGTGCAGCAGGGCAGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRDRADRDKKKSKKRHYEDEEVEEDDTPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIIQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTLEGSGGPSTSRVTDPQNKSDIPTDLFDFYEQMDKDEEDEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPSSRCGQPLTTARSAASPLMPRTSP	186229	98690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_99929_139034_140573_140671_141286_142597_142751_144596_144716_151331_151450_152553_152651_163547_163751_178414_178600_180427_180644_182038_182150_182453_182619_182780_182917_183352_183403_184730_184968_185608_185815_186147
910786	contig_10405_pilon	-	2738	1	Intergenic	novelGene_165865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338754	336016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10405_pilon_-_336000_338800
910787	contig_5779_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_106479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCAGATACCTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153221	150848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_150800_153200
910788	contig_13004_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_112716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATGCTTTCTGGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864714	862462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_862500_864700
910789	contig_9239_pilon	-	5611	6	Intergenic	novelGene_137189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	249	junction_4	38.4998701296511	715	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	39	746	240474	218395	FALSE	70	TGAGAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILK	240512	213529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_218533_218860_218984_234936_235057_235500_235649_235788_235877_240383
910790	contig_5169_pilon	+	3350	5	Intergenic	novelGene_178876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	231	533	49008	49310	TRUE	40	CAAAAAGGTTTGATGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLAGDRAPGNQQYTLSHPQLFSPIWPPPLPSWLQSLGQLSGPGSELLGFALLTSKSSGQGVWESSFMELPAGDRTLVNQRYTLSHPHLSYPCSASAAF	48777	61514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5169_pilon_+_49315_49728_50034_50357_50422_58799_60203_60473
910791	contig_10377_pilon	+	1116	3	Intergenic	novelGene_115381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	42.5	20	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTTAATCTGAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209083	221526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_220708
910792	contig_15777_pilon	-	2730	10	Intergenic	novelGene_75742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	100.989303919637	93	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	279	2492	259057	205161	FALSE	10	TACCAGTGTTTTGTTTCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRPSPSPASPPSNSRTSLVQVKTKTSFSGHSSASSTSKPFKTPKDNLLTSSSKQHTVFSAKGSKDKQCIPVPVVSLEKIPNLVKADGANVKMNSATTTAVTSSSTSSSAVSSPPLFKPVLMSKQVPPSPEKILNGKGILSATIDKKQQNGTKSSNKPYRRLSEREFDPNKHCGVLDPETKKPCTRSLTCKTHSLSHRRAVPGRKKQFDLLLAEHKAKSREKEVKDKEHLLTSAREILPCQSGPAQESLPGSSGNSGPESKVASPAKSRPPNSILPRPSSANSISSNASSNHSGYTPEPPLAPVGGDLASRLSSDEGEMDGAEESEKLDCQFSTHHPRPLAFCSFGSRLMGRGYYVFDRRWDRFRFALNSMVEKHLNSQMWKKIPPAADSPMPSPAAHITTTVPASVLQPFSNPSAVYLPSAPISSRLTSSYIMTSAMLSNAAFVTSPDPSALMSHTTAFPHVAATLSIMDSTFKAPSAVSPIPAVIPSPSHKPSKTKTSKSSKVKDLSARSNESPSNKKRKPQSSTSSSSSSSLSLQTSLSSPLSGPHKKNCILNASSALNSYQAAPSYNSLSVHNSNNGVSPLCAKLEPSGRTSLPGGPADSVRHVGAVGGGSDSCPLSVPSLALHAGDLSLASHNAVSSLPLSFDKSEGKKRKNSSASSKACKITKMSGMNSVHKKNPPSLLAPVPDPVNSTSCRQVGKNSSLALSQSSPSSISSPGHNRQKTTNRTSRIRTLP	271993	204922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_205203_206905_206981_210067_211020_215408_215531_219618_219812_230740_230998_231845_231929_235217_235502_258851_259075_271732
910793	contig_3822_pilon	-	1655	14	Intergenic	novelGene_133311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_12	951.817240425702	35	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	190	573	306185	296187	TRUE	75	GAAAGAGAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNTTVVPSTAGPGPSGGPGGGGGGSGGGGTEVIQVTNVSPSASSEQMRTLFGFLGKIDELRLFPPDDSPLPVSSRVCFVKFHDPDSAVVAQHLTNTVFVDRALIVVPYAEVKQPTRVVVHKTAFES	306374	277219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_280890_280939_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119_296237_299561_299696_305985
910794	contig_14666_pilon	+	2583	1	Intergenic	novelGene_39503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317233	319816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_317200_319800
910795	contig_5574_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_155836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	557	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	593	922	105560	105889	NA	10	CCTCTGTTTCATTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKTVIHFELSFCVWCEVWVLFHFSTDTHPVLPAPFVKETVSSPFNGLWPFVEDQLSMGGWIYAWVLNSVPLVNVSVVVPVPGCFDYRSCIVSSEIRQCEVSYFVVVLQ	104967	107401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_105000_107400
910796	contig_835_pilon	-	4477	9	Intergenic	novelGene_152120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACAATCAATAAACGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179419	704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_2210_2389_2811_10612_10758_66417_66705_67087_67207_131900_132077_174875_175839_176451_176958_179064
910797	contig_9036_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_155468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAATAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203605	206197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_203600_206200
910798	contig_10702_pilon	+	2359	2	Intergenic	novelGene_176703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAACAATGTAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11235	24387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10702_pilon_+_12478_23270
910799	contig_14970_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_45026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCAGCCAGTCTGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173846	172379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_172400_173800
910800	contig_7359_pilon	-	1871	2	Intergenic	novelGene_139852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	630	1067	49019	40694	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWDKGFWERKDMPLPLYKGSVPTFKETDDCGKRRSSRGNKRVSFSTQGPARSTPTGLPRALPLIPTPGHLTLPGHHLHQDLNPHRAPTSHQGWLLIIQYIYLYMHIYIFFCGAWKGRQDNLCSSQNSFLTMKKAISSHALLIMR	49648	39889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_40856_48743
910801	contig_8866_pilon	+	4198	14	Intergenic	novelGene_77757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	17	484	217672	218139	TRUE	60	AAAATAAATCAGAGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEDGRNTKRISQPFQEVAYDQELMVLKEEGQVALKALAKNKAPGIDRISIEMFQQMDAVLEVLTHLCQEIWKTATWPAYWKRSIFMPIPKKGDPTECRNYQTISLIPHASKIFLKIIQKWLQQYINKELPKIQVRFRRGHGTRDIIADVR	217655	769799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_218351_394458_395298_541542_541799_683077_684273_685274_685423_686663_686798_690843_691022_695556_695652_708098_708224_710869_711060_713011_713132_715095_715148_726513_726616_769730
910802	contig_5964_pilon	+	3864	5	Intergenic	novelGene_80356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCGTCTCAAGCAGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38417	47441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_38571_38934_41383_41803_42566_45794_45922_47067
910803	contig_8848_pilon	-	3064	1	Intergenic	novelGene_140469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331630	328566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_328600_331600
910804	contig_16846_pilon	+	2509	7	Intergenic	novelGene_82910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	21.5284050087837	9	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	348	842	459619	477213	TRUE	40	GCCATTCCAAACCAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLPSRGKTLPNPSSSPSVQGQGRVPMQAEKSKATAVALGSYPVGEQAALPLKLGEPLTIVSEWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQSRRGCYSLSVRLSRPTSWDRIRHYRIQRLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEQGQGSKKKEQNSPGV	456133	480060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459710_464055_464156_465206_465311_475327_475478_477163_478280_479459
910805	contig_3754_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_146819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTAGAACTCCCCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108405	106553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_106600_108400
910806	contig_2438_pilon	+	1547	4	Intergenic	novelGene_112029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	573.046245952279	25	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	77	592	310588	312243	TRUE	10	TTGGATGGACTCTGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGGTGTGCGGCPRGDQRQRGVYVFVLWGELAMLGVGVEKGMGGRVIRRSGLLTE	305089	313519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312409_312729
910807	contig_5594_pilon	-	3455	4	Intergenic	novelGene_150117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227594	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_33530_47603_48497_168300_168313_227547
910808	contig_6477_pilon	+	4247	4	Intergenic	novelGene_154157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	7.87400787401181	86	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	337	672	748456	758421	FALSE	55	AAAAAAAATAACCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEGVLSSPDPALPQEESTGEEGMAAGLLTARPQGSMSFSSMTVAFTQEGCRHPVLAPRDRYKEGIPEKSRNLVLLGLPVSQPGLNSQLEQREEPWMLEGEGLRSTCPGK	748119	761996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_748472_754498_754588_757413_757541_758317
910809	SIRV6	+	1358	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	6	164	6	-29	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	252	743	1733	10736	TRUE	35	CGTCGTAGATTAACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1093	11661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
910810	contig_7919_pilon	-	4036	2	Intergenic	novelGene_28079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	263	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1081133	1073878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1075106_1078324
910811	contig_10609_pilon	+	3081	25	Intergenic	novelGene_123925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	517	junction_5	433.489394974728	28	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	186	2831	386471	504942	FALSE	55	GGTTTAAGACACACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRGTRTGRPPLHVAAANKAVKCAEVIIPLLSSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDKKDRRALHWAAYMGHLDVVALLINHGAEVTCKDKKGYTALHAAVSNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIACYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAASSTHGALCLELLVNNGADVNIQSKDGKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGIHSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVDCIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHYAAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASVINGHTLCLRLLLEIADNPEVVDVKDAKGQTPLMVAVAYGHIDAVSLLLEKEAKVDAVDIMGCTALHRGIMTGHEECVQMLLEQEVSILCKDSRGRTPLHYAAARGHATWLSELLQMALSEEDCSFKDNQGYTPLHWACYNGNENCLEVLLEQKCFREFIGNPFTPLHCAIINDHESCASLLLGAIDSSIVSCRDDKGRTPLHAAAFADHVECLQLLLSHSAEVNAADNSGKTALMMAAENGQAGAVDILVNGAQADLTIKDKDLNTPLHLACSKGHEKCALLILDKIQDESLINAKNNALQTPLHVAARNGLKMVVEELLAKGACVLAVDENGKWKK	361235	505192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_400432_400512_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314_420456_422067_422149_426657_426770_477871_477944_486428_486631_490592_490681_491948_492067_493322_493540_497627_497716_498779_498864_500774_500921_501395_501479_503653_503737_504833
910812	contig_8259_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_148871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1003	1350	162991	162644	NA	15	TGGGAACTTCTGTAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEDGRNTQSPYQKELVDVQSFQEVAYDQEPMVLQKEVQAALKALVKTKAPGIDGVPIETFQQTDAALEVLTCLCQEIWKSASWPTDWKRSTVVPIPRVIQLNAEITEQYH	163993	161390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_161400_164000
910813	contig_3789_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_79869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTGATAGGACTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509696	506896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_507123_507796
910814	contig_13244_pilon	-	3277	2	Intergenic	novelGene_86965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4902	junction_1	0	37	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGCTCACTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299440	296046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_299281_299397
910815	contig_7333_pilon	-	2440	4	Intergenic	novelGene_142809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	58.9594964549581	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	640	2001	406076	394458	FALSE	65	AAAAAAAAAAATACTGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407212	394018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_405119_405298_405761_406195_406691
910816	contig_9180_pilon	+	4065	2	Intergenic	novelGene_109117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	84	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1366	1713	488334	488681	FALSE	35	GCCCAGCAGCCCAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYILFIHSSIDEHLGCFYLFAVVNSAAVNIGVHVSVFVTAFKSPGYILRSGIAGSCGSSMFNFLRNHQTFPQQLYHFTFLPGVDKGSNFSTSSPAFVISLFFTLAILLLLCLSS	470552	491033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_470630_487045
910817	contig_14519_pilon	-	4467	10	Intergenic	novelGene_66819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	134	junction_9	86.619217780403	244	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	126	746	283786	280822	TRUE	40	AATACCTTTTCTTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPLIVKWGGQEYSVTTLSEDDTVLDLKQFLKTLTGVLPERQKLLGLKVKGRPAENDVKLGALKLKPNTKIMMMGTREESLEDVLGPPPDNDDVVNDFDIEDEVVEVENREENLLKISRRVKEYKVEILNPPREGKKLLVLDVDYTLFDHRSCAETGVELMRPYLHEFLTSAYEDYDIVIWCKLCFLFRFHGNKIVHYSILIYEI	287182	269531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_-_270650_272657_272786_275365_275483_277945_278045_278562_280995_282023_282140_282222_282309_282713_282806_283632_283842_287112
910818	contig_15897_pilon	-	2434	5	Intergenic	novelGene_49515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATTTAAAAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161791	156340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_156991_158050_158119_158627_158697_159745_159917_160315
910819	scaffold_12510_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_151384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCATAAACATCAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288597	290001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_288600_290000
910820	contig_12570_pilon	+	2761	4	Intergenic	novelGene_79386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCTGCAGCCTGCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281255	300237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_283697_284048_284255_286406_286483_300199
910821	contig_9272_pilon	+	4656	3	Intergenic	novelGene_125900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	521	junction_1	67.5	43	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	3131	3712	269742	272229	FALSE	20	TGGGGCTAGCTTTCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGWYE	264995	273173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_268051_269666_270183_272088
910822	contig_4874_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_78635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGGCCTTACTTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371376	372694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_371400_372700
910823	contig_8377_pilon	+	1749	17	Intergenic	novelGene_34969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	3093.22165943131	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	785	1747	161364	180500	FALSE	25	TACAAACGTGAGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLN	68100	180502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143491_161286_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
910824	SIRV6	+	635	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-14	8518	-8	273	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAATGCCCTGGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116	2813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
910825	contig_6958_pilon	+	1812	2	Intergenic	novelGene_69949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1119	1427	165593	165901	FALSE	25	TCCCCTCCCCAGCACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSSEDRKMRSGSSMLSLASPLQVFCSHCPCLRGCWAHTLKTCLSPHLHGRGQASLGPPQHLQYSAGTTEDFDVCSVTAPFSPLFCFPENCVPHSLLSSPR	164288	166286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_165014_165199
910826	contig_4103_pilon	-	1298	6	Intergenic	novelGene_51979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_4	140.799147724693	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	76	843	188842	185498	FALSE	10	GTGGGGTGTGATCCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSMDPSGSSPSSSSTPLTSFSSIPGTRVFLQGPAPVGTPSFNRQHFSPHPWTSASNSSTSAPPTLGQPKGGSASQDRKIPPPIGTERLARIRQGGSVAQAPVGTSFVAPVGHSGIWSFGVNAVSEGLSGWSQSVMGNHPMHQQLTDPSTFSQHQPLERDGSGMVAPSNIFHQPMASGFVDFSKGLPISMYGGTIIPSHPQLADVPGGPLFNGLHNPDPAWNPMIKVIQNSTECTDAQQIWPGTWAPHIGNMHLKYVN	195589	185042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_185558_185838_186004_186703_186880_187407_187609_188676_188854_195525
910827	contig_6137_pilon	+	2602	1	Intergenic	novelGene_59294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAAAAAAATTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1363461	1366063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1363500_1366100
910828	contig_7410_pilon	-	6132	19	Intergenic	novelGene_106038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAACAAAAGACAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128174	28633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_28760_38990_39123_41373_41538_43522_43735_49450_49595_60119_60231_60313_60413_75321_75447_76247_76906_86473_86560_87331_87451_90596_90701_91877_92102_93486_93608_98686_98848_107336_107456_123305_123480_123675_123793_125038
910829	contig_854_pilon	+	3281	16	Intergenic	novelGene_36672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4208.96732650131	16	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	165	2075	1705343	1714980	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1699278	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1704899_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1714989_1715207
910830	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	52	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
910831	contig_1009_pilon	+	3871	4	Intergenic	novelGene_121731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGTATTTCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134624	163672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_137045_158604_159037_160676_160828_162804
910832	contig_16594_pilon	+	3632	1	Intergenic	novelGene_53852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAACCTTCTCCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124716	128348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_124700_128300
910833	contig_12842_pilon	-	4216	10	Intergenic	novelGene_168346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.593125944486	248	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	133	1236	201876	169828	TRUE	45	AAGTAAAAAGAATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQSSAKVNARKRRKEATGPNGATEEDGFPSKVARRAFGLREPAPFSDEIEVDFSKPYVRVTMEEASRGTPYERPVRVYADGIFDLFHSGHARALMQAKNLFPNTYLIVGVCSDELTHNFKGFTVMNENERYDAVQHCRYVDEVVRNAPWTLTPEFLAEHRIDFVAHDDIPYSSAGSDDVYKHIKEAGMFAPTQRTEGISTSDIITRIVRDYDVYARRNLQRGYTAKELNVSFINEKKYHLQERVDKVKKKVKDVEEKSKEFVQKVEEKSIDLIQKWEEKSREFIGSFLEMFGPEGALKHMLKEGKGRMLQAISPKQSPSSSPTRERSPSPSFRWPFSGKTSPSSSPANLSRHKATAYDISEDEED	223206	166330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_-_167530_168046_170035_171062_171252_172685_172829_173282_173362_175422_175575_176203_176321_182466_182567_201759_201887_223084
910834	contig_5574_pilon	-	4379	4	Intergenic	novelGene_155848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1278	junction_1	241.687125570781	160	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	278	544	132928	131269	FALSE	25	TCATCCCAGACTCCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNYVAKVNTLETEEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDYDPLHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQSDGLCRRLEKACISPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLMKRLGAGQFGEVWMGECGTMSVSALEVTAGEQGDQTSSVHFLSSH	134243	127433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_131517_132909_133060_133571_133676_134201
910835	contig_3380_pilon	+	585	1	Intergenic	novelGene_60128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACTTGAGAAGTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463540	464125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_463500_464100
910836	contig_6418_pilon	+	2197	14	Intergenic	novelGene_81212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	251.315874228138	8	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	812	2134	1388801	1444680	FALSE	25	TTTTCCCTTCAGAATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKYNSGTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341096	1444743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1342274_1342397_1375717_1375938_1383109_1383285_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429131_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
910837	contig_6630_pilon	-	1789	6	Intergenic	novelGene_30710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	552.275510954451	18	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	109	465	380081	378033	TRUE	55	CGTTGCTGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRKFADGEVVRGRWPGSSLYYEVEILSHDSNSQLYTVKYKDGTELELKENDIKPLTSFKQRKSGSSSSSPSRRRGGVGPGHVPGPQAGHQRVPAGLRLRPTRPALRRQRGNSWKLN	384217	372259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_372710_374298_374492_374845_375104_377609_378225_379916_380096_384123
910838	contig_12050_pilon	+	5630	17	Intergenic	novelGene_62596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4470	4814	304606	311049	TRUE	30	TACCAACAAGTCTTAGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEELLLALSVSSSGSLSQLLNALLQGRGQAFGEGGGLPEFRVRPQPKGSAFIIHIMEGASFRRLTEQPLQVQIGQRAHGSGRLQQVVVRGGAKERQQGVGGALQGPQALSFCG	291797	317215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_294018_296051_296144_296387_296637_297862_299128_300174_300221_300316_300365_302032_302180_302362_302491_302686_302807_302981_303113_304582_304657_310755_311192_311928_312033_312739_312875_313225_313321_313813_313904_316965
910839	contig_10958_pilon	+	2067	13	Intergenic	novelGene_5366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	201.787894004241	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	44	1507	803771	810508	TRUE	15	TCAAGCCTTGAGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLGCEWNLYPAAKMEGPLSVFGDRSTGEAIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYISENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINCDFFANMVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKCHS	803727	811188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807211_807587_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810498_810771_810890
910840	contig_19850_pilon	-	3074	1	Intergenic	novelGene_170855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	518	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	672	947	1618	27704	27033	NA	55	ATGTAAAAAGAAAAACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDTTDIRRIITEYYEKLYSNKFENQEEMDKFLETHYLPKLTQTFGEDSHQTKPALLKIFQNIEKEGILLNSFYEASISLLPKPGKDTTKKENYRPMSLMNIDAKILNKLLTNRIKHHIKKIIHQDQVRFIPGMQGWFNSRKSINVIHHINRIKEKNHMIISINTEKAFDKVRHQFLRKILNKTGIEGKFLNITKGNYTKPTANIILNGDRLKTFPLRT	28650	25576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_25600_28600
910841	contig_10609_pilon	-	7703	2	Intergenic	novelGene_123946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	587	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAATAAAATTAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440828	432957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_440282_440449
910842	contig_14208_pilon	+	4009	1	Intergenic	novelGene_129090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAATATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176252	180261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_176300_180300
910843	contig_2219_pilon	-	2266	1	Intergenic	novelGene_67180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGCAAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120138	117872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_117900_120100
910844	SIRV3	+	744	4	NIC	SIRV3A	novel	779	5	NA	NA	-1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	110	42	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_+_4081_4574_4780_6057_6334_8755
910845	contig_6795_pilon	-	1039	5	Intergenic	novelGene_27702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_4	125.435989652093	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATAAGCTGAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134326	123630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
910846	contig_6076_pilon	+	5542	3	Intergenic	novelGene_81726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	150	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTCAATACCCAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22818	134239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_24192_24389_26758_132438
910847	contig_5696_pilon	-	7512	33	Intergenic	novelGene_117602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	637	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	3210	4853	865440	863138	TRUE	10	CCTTTCTACCCAGCTCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCISGEGIGLQSPLLLCIKFVSISLDVAVSSGSFSLGAVSVFPVFFKSATISSIALISSDPVSLKEISLLVSFKSVSVSSMTVIFPDTLSIRKMFPFPVSFKSISLSLMALTSFTTFSLGDISLPVSSKSVSTSLIVLTSSGVSSHGDISLLPVSSKSPFPSSEAAIISGMFCLGETSLSVSSKSVSTSPTVLTSSGAFSHGDISLPVSSKSASLSSEAAIISGMFCLGETSLSVSSKSVSTSPTVLTSSGASSHGDISLPVSSKSAFPSSEAAIISGIFFLGETSLLVSSKSVSTSPTVLTSSGASSHADISLPVSSKSASLSSEAAIISGNFFLGETSLSVFFKPFSTSPTVLTSSGASSCRDVSLLSGSLKSASLSSEATIISGNFFLGETSFSVFFKPFSTSPTVLISSGAFSHGDISVLSVSSKSVSISSRASITSDSFSLGEISLPVSVKLVSISIVMSIISAIFSLREMSLLPVSFTSVSISLVVLASTGIFSLGEVSSLAISPKSDSISPGSRIFSGTSSLEKISLLPVPLSIIGFGF	920330	806719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_807146_809872_810150_814641_814754_815988_816049_825042_825170_826239_826380_827366_827458_834337_834395_836788_836931_841070_841349_842653_842800_848831_848993_853128_853287_856800_856893_857830_858029_858822_858956_863076_864777_865435_866233_867817_867996_870444_870653_871490_871630_877586_877791_878034_878227_879528_879917_880936_881062_894660_894702_895193_895282_897249_897475_897947_898110_917089_917240_917456_917638_919841_919906_920258
910848	contig_5019_pilon	-	2593	1	Intergenic	novelGene_109221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	265	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTAATTTTATAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329798	327205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_327200_329800
910849	contig_18592_pilon	-	2243	2	Intergenic	novelGene_114780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTATAGATTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12797	10501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_-_12486_12538
910850	contig_7327_pilon	+	3212	1	Intergenic	novelGene_172113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2040	2402	88792	89154	NA	70	GAGAAAAAAGGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIEPEKALLHFGISEALDFSQARGCRPGVGHLFQQHLKAPCVAGQTQREPSTKKSPTRALVRIISEVSLNKETIYKLKNAFGQKCPCLVQAVMLKGAVQGGKRASPHCLKTLFWQKLF	86752	89964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_86800_90000
910851	contig_10930_pilon	-	6221	2	Intergenic	novelGene_37046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	768	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1185	1667	274400	273918	FALSE	35	TTCTAACCAAATTTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSDRKAGSDGFCCYFKKSCLPSAGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVISAQVKSLV	275638	269363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_275241_275294
910852	contig_12626_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_80461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTCCACCCTGCCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180899	178385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_178400_180900
910853	contig_4125_pilon	-	2281	12	Intergenic	novelGene_25103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_11	25.7887155794869	70	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	337	1464	741449	737427	TRUE	20	GAGGGAGAGGCTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERDPLSDLQDVSDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEGSSSEESEEEEEEEEEEEEEEEEETGSNSEDASEQSAEEVSEEEMSDDERENENHVLVVPESRFDRDSGESEEGEEEGGEGTPQSSALTEGDCVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVRHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGVLKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKVSVHRCLGGLQPAGLHGGLTLRPESCLTQLS	741785	735993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_736338_736593_736784_736986_737136_737292_737631_737820_737943_738287_738394_738642_738765_739544_739636_740384_740561_740743_740807_741094_741257_741367
910854	contig_6175_pilon	+	3487	1	Intergenic	novelGene_16306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1643	1963	1447017	1447337	NA	65	AAAAATAGGAAAACATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLGLAPVESCFALCPQSLGCLRAFCRSISPGSASGTGSERRDAAAGGGALAVTFPLLFSAVTWRGGGAAEAAVASGALPRTVQSRPEGGWRRKRGVQARGCVCA	1445374	1448861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1445400_1448900
910855	contig_3380_pilon	-	3942	1	Intergenic	novelGene_60098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATTACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392288	388346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_388300_392300
910856	contig_2739_pilon	+	2476	1	Intergenic	novelGene_165842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACACAATCAATAAACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247084	249560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_247100_249600
910857	contig_12765_pilon	-	5481	4	Intergenic	novelGene_106564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3119	3535	151032	150030	TRUE	40	AAGAGTAGGAGTGGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRDPLSANAAWICHLGLLSEISKQWGTRKQLHRASSRRQNNRFSSLYTFLLFLSPEYLALSDTSTPSNQAVFHGLEATSPDLAASVVGSLGAFHFFFLSNFYLFIFFSFLYFFSFSSPFCFSPFHSLSSLHSNGKLP	184174	147905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_148226_148403_150319_150904_151219_181242
910858	contig_16211_pilon	+	3471	2	Intergenic	novelGene_150099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201651	206049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_204403_205329
910860	contig_5023_pilon	+	3108	18	Intergenic	novelGene_7226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2200.02748960491	1	131	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	465	1898	611764	646990	TRUE	10	TGTCTGTAGATGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	648308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608007_608064_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646872_647642_647749
910861	contig_8616_pilon	+	3116	8	Intergenic	novelGene_72540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_3	16.8765022007113	174	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	1474	3075	421424	424565	FALSE	25	CAAATGCACTCCAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELVGSILRGCVPGVYRVQTVPSARRPVVKFCHRPSGLHGDISLSNRLALHNSRFLSLCSELDGRVRPLVYTLRCWAQGRGLSGSGPLLNNYALTLLVIYFLQTRDPPVLPTVSQLTQKAGEGEQVEVDGWDCSFPRDASRLEPSTNVEPLSSLLAQFFSCVSCWDLRGSLLSLREGQALPVAGGLPSNLWGGLRLGPLNLQDPFDLSHNVAANVTTRVAGRLQNCCRAAANYCRSLQYQRRSSRGRDWGLLPLLQPSSPSSLLSATPIPLPPAPFTQLTAALVQLLRDALGCHIEQGTKRSRSEGDGAGESPQGGTSKRLKRDGQKQSCEEGREEQQECAGGHGEDGVEEMVVEVGETMQDWAMWSPGQPGELSLTTGELLATGEGGQPGHTALAEQGPKGPDTAQKRLPGETGKGAALSSLVSWRCALWHRVWQGRRRARRRLQQQTKGGGAGVGAEWLATEAQVSQELRGLSGGEQRPAAEPLLTFVASASQADQTLTVTPLQDSQGLFPDLHHFLQVFLPQALRHLLK	410514	424606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_410683_412103_412295_419168_419956_421096_421567_422176_422287_422444_422556_422700_422794_423420
910862	contig_5643_pilon	+	1365	10	Intergenic	novelGene_38801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2549.51699129245	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	673	1158	236928	237983	FALSE	15	AGCCACCTCTTTGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_235973_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
910863	contig_17337_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_144723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1228	1665	24054	23617	NA	50	AATTTGAAAACCTAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIYQKDITIINIYAPNDRAPKYINSNGTERTDRQLHTVVGDFNTPLSVKDSTSGKKLHKDTEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRKDHILGNKASLNKMQSIKILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEK	25281	23103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17337_pilon_-_23100_25300
910865	contig_10159_pilon	+	3106	13	Intergenic	novelGene_30784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1839	2195	352738	353094	TRUE	5	CTCGCCGAGCCCGCTGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRDHHCGENKTGKCIKKGQKSLAPLHGVLGALWFWHGDLDHLLPIPIWHPVGFDLDVEAAVKGGEVCANAEVPVGMAILVCFHVVLHFQGLYHVQEPLPIVRGNSAQGGFFEILLR	316532	641990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_317396_317763_318147_318828_318997_319501_319656_338199_338316_352583_353442_431855_431939_456758_456901_577727_577806_597817_597912_606777_606840_637992_638064_641956
910866	contig_8420_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_69353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56955	58939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_57000_58900
910867	contig_9297_pilon	+	3567	2	Intergenic	novelGene_69890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1028	junction_1	0	11	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	91	402	939250	956082	FALSE	25	ACTATGGTTATTTAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFRLRPLPLPSLLQPSPPPQPYPLRLVISKMAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQVKCHEQIFRFCTVLGPCVFRLCCKIYKKEFQSRYTSFLNSHCQYSA	939159	959247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_939325_955845
910868	contig_9981_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_121064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	415	738	316154	316477	NA	20	GAAACTATTTGTTCTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGIHQTKSSTARWCLATTDCSDQDHNRGFWTELKKDVEQNSNSQKKHQIYWPKGDWRNPGVWPLDTLLAHPPRHPFSSGVKSSPRFTLQPGSRQPHKTKRDW	315739	316847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_315700_316800
910869	contig_11849_pilon	+	5006	15	Intergenic	novelGene_171745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_13	73.0788293975926	225	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	38	2194	99682	152337	FALSE	45	AACCCAAAAAAAGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEGSPSLCLLKLMGEKGCTVTELSDFLQAMEHTEVLQLLSPPGIKIIINPESKAVLAGQFVKLCCRATGHPFVQYQWFKMNKEIPYGNSPELVFNTVHVKDSGFYVCRVNNNCTFEFSQWSQLDVCDVTENSRRSLDGVSESKLQICVEPTSQRLRPGKTLVLQCVAVGSPIPHYQWFRNESPLTHETKKLYVVPCVDLEHQGTYWCRVCNDRDTQDSRKVEIIVDELNNLGHPDNRDQTTDQPLAKDKVALLIGNMNYWEHPKLKAPLVDVYELTNLLRQLDFKVVSLLDLTESEMRNAVDEFLLLLDKGVYGLLYYAGHGYENFGNSFMVPVDAPNPYRSENCLCVQNILKLMQEKETGLNVFLLDMCRKRNDYDDTIPILDALKVTANIVFGYATCQGAEAFEIQHSGLANGIFMKFLKDRLLEDKKITVLLDEVAEDMGKCYLTKGKQALEIRSSLSEKRALTDPIQGTACSAESLVRNLQWAKAHELPESMCLKFQCGVQIQLGFAAEFSNVMIIYTSIVHKPPEIIMCDAYVTDFPLDLDIDPKYANKGTPEETGSYLVSKDLPKHCLYTRLSSLQKLKEHLVFTVCLSYQYSGLEETVEEKQEVNVGKPLIAKLDIHRGLGRKTSFQTCLMSNGPYQNPASTSGAAGHYHSSQDSFHDVYHSHAGNSSHALPSDSCHCSRTPDPFISSYTHHYSSHFGRSNVPVETTDEIPFSFSDRLRISEK	99644	155149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_99773_112858_112981_118553_118705_121136_121316_121747_121845_125690_125718_128541_128575_132350_132555_141489_141668_142425_142501_142889_143018_146385_146536_148706_148865_150482_150609_151899
910870	contig_1230_pilon	+	4323	2	Intergenic	novelGene_28848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4638	junction_1	0	77	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	3157	3729	407610	408398	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQVCNFKFLFFFFFKVNGRVFRPSAQPGVSVKHQGHSDEWSKHSRFPPEFDLCWN	404453	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_407788_408003
910871	contig_16385_pilon	+	3094	3	Intergenic	novelGene_86204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2359	2658	55831	56130	TRUE	20	GTTCAGTAATGGTTTCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSAARWCPATTADCSDWVHNRGFWTELEKDVEQNHNTDKKDQTDWPERDCRNPKNMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIGQPHKTKWD	37052	97320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_39309_55728_56144_96897
910872	contig_12479_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_56818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATACAAAATCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6288	4446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_4400_6300
910873	contig_14142_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_120617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	158	337	596103	595924	NA	45	TAGTTCCTCAAAAAACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILVSQTVCEIEFLGSSGSKQVGQGRETYVGVDNNRHCEGQADTGLGNRLRGMDRGLIPDMEQGKQRDGAENTGCVLKMWETKITQENYRPISLMNLDTKILNKILGNRIQ	596260	594131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_594100_596300
910874	contig_14970_pilon	-	6247	5	Intergenic	novelGene_45078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	5371	5688	209638	209321	FALSE	15	CATCCCTATGTTGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKANLIVLDMLISLMEFLSLHWYGDKILILKFFDWLSFSAGMSSEPPAAVCITRVLGLHVVLQSLSIMAPSQSFKLTFFYTTKENLPNGPTHFCQIHALAFLPL	232248	208761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
910875	contig_6898_pilon	+	2185	10	Intergenic	novelGene_35747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2454.51379108313	53	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	47	1183	116718	125646	TRUE	15	GTGGGGCAACCTAGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	116671	127520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126019_126093_126611_127407
910876	contig_15991_pilon	-	2136	2	Intergenic	novelGene_70955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	0	7	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	806	1900	182386	181292	TRUE	35	ACCTTACGGATCATAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYPGPPALMDYTLQPNVTETDYYYPDVFSSPCDGELIQRGSNFLLAIFYCFLFVFSLLGNSLVILVLITRKKLKSITDVYLLNLALSDLLFVLSFPFLTHYRLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFFSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYAMKVRTASVGTALSLVVWLTAITATSPLLVFYQVASEDGSLQCYSSYNQQTLKWKIFTYFEINILGLLIPFTILIFCYISILHQLRGCQNRNKTKAIRLVLIVVIASLFFWIPFNVVLFLTSLHGMHILDGCVMSQQLIYATHVTETISFTHCCVNPVIYAFMGEKFKKHLSEIFQKSCSYVFVCIRKRVSKEGWERSSSFHQQSSRSSSIDYIF	183191	169471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_169617_181200
910877	contig_14687_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_107925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGAACCATAAAGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465316	467294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_465300_467300
910878	contig_20944_pilon	+	2358	2	Intergenic	novelGene_167543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1782	2357	58963	59538	FALSE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITMDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTVTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNLFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINK	57050	59539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_58162_58292
910880	contig_6842_pilon	-	3957	1	Intergenic	novelGene_130788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGCTCGTAACCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396161	1392204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1392200_1396200
910881	contig_4962_pilon	+	1454	3	Intergenic	novelGene_107393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.5	15	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	10	906	440480	443724	FALSE	30	CACAGTGGAAAGACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEVDLAAEFPQPAGVARWAEVMARFAARLGAQGRRVVLVTSGGTKVPLEARPVRFLDNFSSGRRGATSAEAFLAAGYGVLFLCRARSAFPFAHRFPPQTWLSALRPTDSAHSGLLCLEAEEKALPGFAAALRSYQEAAVAGTFLAVEFTTLADYLHLLQAAALALSPLDFYVPVSEMPEHKIQSSGGPLQITMKMVPKMLSPLVKHWAPKAFIISFKLETDPSIVIDRARNALEVYQHQVVVANILESRRSFVVIVTKDSETKLLLSEEEVEKGVEIEEKIVGNLQSQHTAFICDKN	440470	444272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_+_440988_441407_441473_443400
910882	contig_500_pilon	+	2164	9	Intergenic	novelGene_31060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	926.053994106175	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	992	1897	1492663	1499316	FALSE	10	CGGGCATGTTTGACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKSLESALKDLKIK	1491084	1499583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1497955_1499277
910883	contig_11816_pilon	+	1866	2	Intergenic	novelGene_98569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	609	1127	1275034	1275552	FALSE	15	AACTGCTGTCCTTTGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQQSLETVHLFTTRFTEYLKPTVEIYCSEKKIHFKILLLTDNAPGHPRALMEMYKKINVLKPANTTYVLQPVDQGVISTFKSYYLRNTFCMAIAAIDSDSSDGSGQSKLKTFWKGFTILDAIKNIRDSWEEVKISTLTGVWKKLIPTLMDNFEGLKTSVEEVTTDLVEIAR	1273902	1276291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1274328_1274850
910884	contig_15952_pilon	-	6551	32	Intergenic	novelGene_154086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_31	118.906131272152	339	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1003	3012	176	3187	771201	665196	TRUE	30	TGGAGAGTAGTGGTGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVSKMTVSINKAINTQEVAVKEKHARTCILGTHHEKGAQTFWSVVNRLPLSSNAVLCWKFCHVFHKLLRDGHPNVLKDSLRYKNELSDMSRMWGHLSEGYGQLCSIYLKLLRTKMEYHTKNPRFPGNLQMSDRQLDEAGESDVNNFFQLTVEMFDYLECELNLFQTVFSSLDMSRSVSVTTAGQCRLAPLIQVILDCSHLYDYTVKLLFKLHSCLPADTLQGHRDRFMEQFTKLKDLFYRSSNLQYFKRLIQIPQLPENPPNFLRASALSEHISPVVVIPAEASSPDSEPVLEKDDLMDMDASQQNLFDNKFDDIFGSSFSSDPFIFNSQNGVNKDEKDHLIEQLYREISGLKAQLENVKTESQRAVLQLKGRISELEAELAEQQHLRQQAADDSEFLRAELDDLKKKREDTEKAQRSLTEIERKAQANEQRYSKLKEKYSELVQSHADLLRKNAEVTKQVSVARQAQVDLEREKKELEDSFQRVSEQAQWKTQEQTEVLESLKQELATNKQELHVLQGSLETSAQSEAKWAAQITELEKERDSLMSAAACRDEELSVLREQLEHAQLKLSSTQESVEQLVKDQRKVLLTESRMAAERVVREALSQLEEPTLISCAGSADHLLSRIKSVSSCIEQLEKSWSQYLAFPEDISGLLRSVTLLAHLTGDTILHGSATCLRAPPEPADSLAETCKQYGRETLIYLASLEEDESLGKADNTALRSCLSKMAAIGEELLPRGLDIRQEELGDLVDKEMAATSAAIETATARIEEMLSKSRAGDTGVKLEVNERILGSCTSLMQAIQVLIVASKDLQREIVESGRGTASPKEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATVMVDAADLVVQGRGKFEELMVCSHEIAASTAQLVAASKVKADKDSLNLAQLQQASRGVSQATAGVVASTISGKSQIEETDNMDFSSMTLTQIKRQEMDSQVRVLELETELQKERQKLGELRKKHYELAGVAEGWEEGTEASPPTLQGAEAEKE	771376	661495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_664831_665166_665249_665951_666061_669167_669230_669675_669800_672433_672540_672822_672924_674631_674726_675126_675186_676043_676155_680220_680358_680437_680546_680678_680766_682592_682729_683186_683331_683570_683673_684778_684896_685303_685393_685908_686093_686786_686860_687196_687295_687614_687756_687879_687956_690888_690947_693578_693720_701463_701526_702030_702108_722338_722420_727061_727119_727353_727497_738676_738741_771183
910885	contig_12967_pilon	+	2209	7	Intergenic	novelGene_169803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.3869829818504	25	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1310	1807	223761	226703	FALSE	20	TATGTGAATCCTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKVRSKSANREPQGEQPKPGKDQQQKPAQNHTHGQSKASLEPKGKTGSTSWMGFLTKAEVEQVELPDGKKRRKVLVLPSHRGPKIRLRDKGKAKPLPPSKPKPQINQRKQEKQLLSSKQAPKKKAKGNKTEIRFNQLVEQYKQKLLGPSKGAPLAKRSKWFDS	215086	227105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_215133_216536_216673_217583_217649_222570_222636_222763_224024_224607_224708_226568
910886	contig_8864_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_136001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAATGCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719192	717169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_717200_719200
910887	contig_7909_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_155890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCATCATGCCTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368762	370629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_368800_370600
910888	contig_12923_pilon	+	3159	1	Intergenic	novelGene_30114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGATAATGATTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57810	60969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_57800_61000
910890	contig_10752_pilon	+	2995	1	Intergenic	novelGene_153047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAACCCTCACCCTCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222326	225321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_222300_225300
910891	contig_7051_pilon	-	1850	2	Intergenic	novelGene_64314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	291	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATAGAAAAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218202	216261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_217734_217824
910892	contig_12619_pilon	+	2677	2	Intergenic	novelGene_73579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2382	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGCAGTATTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896195	900008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_896574_897709
910893	contig_6138_pilon	-	2165	5	Intergenic	novelGene_159692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	121	junction_4	67.3164170169506	82	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	150	623	619342	607997	FALSE	20	TTCTGACTCATAGTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSVAQIKHSSGHDRRENYNSHQRTSSPEDRYAEQERSPRERDYFDYSRSDYEHSRRGHSYDSGMESRSRDREKRRERDMDRKRSRKSPSPGRRSPEPSVTQSSSAQDEPTAKKKKDEVDPLLTRTGGAYIPPAKLRMMQEQITDKSRHVHITKYR	636873	606454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_608265_613332_613444_614956_615025_619315_619456_636837
910894	contig_10130_pilon	-	1575	2	Intergenic	novelGene_172724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	891	1421	56617	48792	FALSE	20	GGGCAGTGTCTCAGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGCQAPPPGQMELSALKSRAETAGKDRWCPGERCLAPSPDNGKLCEASIKSVTVDENGKSFAVILYSDSLERKVPLRRLQEVKSVKDCSRSFIFDDEDLEKPYFPDRKFPSSAIAFKLSEDGDCIPHTINRYLRDYQREGAQFLYGHYIQGRGCILGDDMGLGKTVQVFTLIAL	57507	48637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_49241_56535
910895	contig_5954_pilon	-	1097	2	Intergenic	novelGene_28784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAATTACTAATGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392220	1390984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390992_1391130
910896	contig_7909_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_155923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	839	1345	544516	545022	NA	75	TATAGGAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVTEY	543677	545189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_543700_545200
910897	contig_15775_pilon	+	1494	1	Intergenic	novelGene_148375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATATAAAAAGAAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11205	12699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_11200_12700
910898	contig_11978_pilon	-	3479	5	Intergenic	novelGene_63113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_1	197.946331110228	15	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1444	1845	1891044	1884840	FALSE	50	TCTCCCCACAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL	1893377	1883205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1884948_1886351_1886565_1887741_1887799_1891020_1891066_1891955
910899	scaffold_12124_pilon	-	1882	10	Intergenic	novelGene_22105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1045	1377	888781	883761	TRUE	15	TCAGATTTTCCGCAGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLIPGTGGKIFWTTENLLQSSTTSRTVRSVPSTMDSIIGQAPRLLSLSHSGCPATRLRQLSQTLKGGVALFAQGSNTLAFLHPPSHTSARPLHPKLRGGLQLLHVFPK	891657	877161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_877261_877340_877520_879034_879150_880640_880669_883676_883807_884852_884983_885379_885481_888725_888807_889031_889899_891505
910900	contig_5961_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_144150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1903	2289	201974	202360	NA	45	AACTTAGACATTAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKVG	200071	203092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_200100_203100
910901	contig_15114_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_121081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	11	361	24966	24616	NA	40	ACGGAGAGGAAGACAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLMRDTGGQESLRSSWNAFCSDTESVIVVVDSTVRGRISVTGEELYKMLAHEDLRKAGLLIFANKQDVKECMTVAEISQFLKLTSMKDHQWHIQACCVLTGEGLCQGLEWMMSRLTIR	24976	24336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_24300_25000
910902	contig_1146_pilon	+	8430	34	Intergenic	novelGene_84822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	251	junction_22	207.627876668526	216	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1621	4866	251	5116	841846	901222	TRUE	25	GTTTTCCCTAATACAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASLSSASLLPRRSRLLVLLCGLRRNPERPSASPALRRLLLHLLLLGFLLSPGPERSVGGGRFGRRLALLRAAALGHVVSGKVMSRRAPGSRLSSGGGGGGTKYPRSWNDWQPRTDSASADPDNLKYSSSRDRGGSYGLQSSNSAVVSRQRHDDTRVHADIQNDEKGGYSVNGGSGENTYGRKSLGQELRVNNVTSPEFTSVQHGSRALANKDMRKSQERSMSYSDESRLSNLLRRITREDDRDRRLATVKQLKEFIQQPENKLVLVKQLDNILAAIHDVLNESSKLLQELRQEGACCLGLLCASLSYEAEKIFKWIFSKFSSSAKDEVKLLYLCATYKALETVGEKKAFSSVMQLVMTSLQSILENVDTPELLCKCVKCILLVARCYPHIFSTNFRDTVDILVGWHIDHTQKPSLTQQVSGWLQSLEPFWVADLAFSTTLLGQFLEDMEAYAEDLSHVASGESVDEDVPPPSVSLPKLAALLRVFSTVVRSIGERFSPIRGPPITEAYVTDVLYRVMRCVTAANQVFFSEAVLTAANECVGVLLGSLDPSMTVHCDMVITYGLDQLENCQTCGTDYIISVLNLLTLIVEQINTKLPSSFVEKLFIPSSKLLFLRYHKEKEVVAVAHAVYQAVLSLKNIPVLETAYKLILGEMTCALNNLLHSLQLPDACSEIKHEAFKNHVFNVDNAKFVVIFDLSALTTIGNAKNSLIGMWALSPTVFALLSKNLMIVHGDLAVHFPAIQYAVLYTLYSHCTRHDHFISSSLSSSSPSLFDGAVISTVTTATKKHFSIILNLLGILLKKDNLNQDTRKLLMTWALEVAVLMKKSETYAPLFSLPCFHKFCKGLLANTLVEDVNICLQACSSLHALSSSLPDDLLHRCVDVCRVQLVHSGTRIRQAFGKLLKSIPLDVVLSNNNHTEIQEISLALRSHMSKAPSNTFHPQDFSDVISFILYGNSHRTGKDNWLERLFYSCQRLDKRDQSTIPRNLLKTDAVLWQWAIWEAAQFTVLSKLRTPLGRAQDTFQTIEGIIRSLAAHTLNPDQDVSQWTAADNDEGHSSNQLRLVLLLQYLENLEKLMYNAYEGCANALTSPPKVIRTFFYTNRQTCQDWLTRIRLSIMRVGLLAGQPAVTVRHGFDLLTEMKTNNLSQGNELEVTIMMVVEALCELHCPEAIQGIAVWSSSIVGKNLLWINSVAQQAEGRFEKASVEYQEHLCALTGVDCCISGFDKSVLSLANSGRNSVSPKHSLNGESRKTVLSKPTDSSPEVINYLGNKACECYISIADWAAVQDWQNAIHDLKKSTSSTSLNLKADFNYIKSLSSFESGEFVECTEQLELLPGENINLLAVGSKEKIDMKKLLPNMLSPDPRELQKSIEVQLLRSSVCLATALNHIEQDQKWQSITENMVKYLKQTSRIAIGPLRLSTLTVSQSLPVLSTLQLYCSSALENTVSNRLSTEDCLIPLFSEALRSCKQHDVRPWMQALRYTMYQSQLLEKIKEQTVPIRSHLMELGLTAAKFARKRGNVSLATRLLAQCSEVQLGKTTTAQDLVQHFKKLSAQGRVDEKWGPELDIEKTKLLYTAGQSAHAMEMLSSCAISFCKSAKAEYAVAKSILTLAKWIQAEWKEISGQLKQVYRAQQQQNFTGLSTLSKNILALIELPTVNTVDVNTMEEVYPRIESESTGWISFISFNILILEVIFPPVSKFTMLCCL	841595	905768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_865015_865174_865680_865837_868288_868426_869381_869441_870489_870704_871488_871615_872212_872286_873176_873275_874891_875066_876788_877014_879121_879224_879762_880033_881587_881719_881880_882043_882473_882593_886933_887022_887109_887212_887696_887838_888386_888587_889038_889236_889420_889586_890329_890485_892192_892336_892487_892690_894775_894886_895701_895850_896203_896364_897121_897243_900249_900499_900833_902786_902902_903042_904053_904285_904387
910903	contig_3111_pilon	+	2280	1	Intergenic	novelGene_129962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	645	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32561	34841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_32600_34800
910904	contig_2940_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_81920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	226	525	543771	544070	NA	30	GCAAGTATTGTTACATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATSTDCSDHDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNRESTAPRHPFSSVVKSFPRFTIRPGSGQPRKTKCD	543545	544847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_543500_544800
910905	contig_12540_pilon	+	2425	2	Intergenic	novelGene_148137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAGGATGCCATATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306997	1311331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1307427_1309335
910906	contig_9415_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_109792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCAGCACTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1678477	1679603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1678500_1679600
910907	contig_4876_pilon	-	3494	12	Intergenic	novelGene_137900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	152	junction_3	125.887986416365	17	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	22	1755	415370	372750	FALSE	30	GGGTAAACCTTTTCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPKLVKGMAGGKYRSFLIHVKAVHERGPDEICNGGIRPVVRLTSLKHQSNKGYSLASLLAKVAAGKEKSSNVKNESASGTRKSENLRGCDLLQEVSVTIRRFKKTSVSKERVQRCAMLQFSEFHEKLLSTLCRKADDGQITEHAQSLVLDTLCWLAGVHSNGPGSSKEGNESLLSKTRKRLSDIVRICFFEAGRSMAHKCARFLALCISNGKCDPCQPGFGSVLLKALLDNMSFLPAAATGGSVYWYFVLLNYVKDEDLAGCSTACASLLTAVSRQLQDRLTPMEALLQTRYGLYSSPFDPVLFDLEMSGSSCKNVYNSSIGVQTDEIDLSDVLAGNGKVSSCTAAEGSFTSLTGLLEVEPLHFTCVSTSDGTRIERDDAMSSFGVTPAVGGLSSGTVGEASTALSSAAQVALQSLSHAMASAEQQLQVLQEKQQQLLKLQQQKAKLEAKLHQTTAAAAAAASAVAPVHSSVPSNPVAAPGFFIHPSDVIPPTPKTTPLFMTPPLTPPNEAVSVVINAELAQLFPGSVIDPPAVSLAAQNRNSNKSRMNSLGSGLALAISHASHFLQPPPHQSIIIERMHSGNL	418686	371010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_372861_373083_373399_374338_374527_386279_386415_395664_395799_396689_396838_398319_398418_399106_399239_399331_399494_400238_400373_415193_415373_418667
910908	contig_8174_pilon	+	1589	2	Intergenic	novelGene_160050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	75	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240804	247883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_240870_246359
910909	contig_7272_pilon	-	1390	3	Intergenic	novelGene_25354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTTGACTACTTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681142	593267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593276_599782_599790_679767
910910	contig_1143_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_86594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCAACACTGAGTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162576	163498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_162600_163500
910911	contig_15628_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_147694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTACTGGATCCACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102768	105265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15628_pilon_+_102800_105300
910912	contig_18108_pilon	+	2970	1	Intergenic	novelGene_33451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	187	324	86558	86695	NA	0	TCTCCTTCTCTCTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFPGRAVWEGTPGKAAYSQLPSHCLGSFSGLCCDSRWKETTLSPLSQEARFPLPLVGWFSVLMPELAPYFLLFFTSGFRASLGRAQCGAQEGWLFCDFLFPVKSQGW	86371	89341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_86400_89300
910913	contig_7411_pilon	-	2762	9	Intergenic	novelGene_137049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_6	41.7095612539859	134	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	218	1210	923719	921269	FALSE	10	TGGGAATTGTTGGCTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHLPGTVRYPTSRTGGPFQAQPLGPGLRPPEEAKGPFGRSLSTGRLTDLLLKAAFGTQALDSGSTESLQEKPMEIAPSTGFGGNLHPGARARGASSPSPVVFTVGSPPSGTTPPQGPRTRMFSVGSSGSLSSAGSSSGRHLLPGACSEAAAPEPPDPGHCCSYVDPIAANLEGVVTFEAPDLPEETLMEQEHTETLHGLRFTLAFVQHVLEIAALKGSAGEAAGGPEYQLQESLVADQISLLSREWSFAEQLVLYLKVAELLSAGLQAAIDQIRAGKLCLSSTVKQVVRKLNELYKSSVVSCQSLSLRLQRFFLDKQRLMDRVHSITAEKLIFSHAVQTVQSAALDEMFHRREDCVQRYHKALLLMEGLQQILVDQADVENIAKCKLCIERRLSALLTGLCA	924096	919716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_921325_921410_921547_921678_921837_922390_922510_922593_922767_922925_923123_923483_923628_923709_923820_923979
910914	contig_756_pilon	+	5428	4	Intergenic	novelGene_134771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	265.757199128996	264	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	256	2334	177389	190518	FALSE	60	GGAATAAAATAGAATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFLEDPSVLTKEKLKSELIANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLAASANSKGPPDFSSDEEREPTPVFGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRLEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYGVNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPAVSSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEGKKKEHKKVKSTRDFVPFSELPTTPSGGFFQGISFPEISTRPPLGRTELQATKKVHTSKGDPPREPVTSTALPGRGQLEKLASGGNLFISSKSSHDRCLEKNSSPSQHQPAAVLVSAAASPSVIKETTTTSYKEIVENICCGEKSGIQPLSTGRPRISDQSILSIEREELEESERSQVISPPLAQAIRDYVSSLLVQGGVGTLPGTSHSIPPLNIENIRKRIDRSSFQETESLSPPRKFPRRSEKSVEGRDSGSFVTFQNIPGNESISSFAKTVVSHSLTTLGIEISKQSQHDKIDDPELSFPLHESILKVIEEEWQQIDRRLPSLACKYPVSSREAPRILSVPKVDDEILGFISEATPPAGIEAASTEACDKQLDLALCRTYEAAASAMQIATHTAFVVRAVQADISQAAQILSSDPSKMHQALGILSKTYDAASYLCEAAFDEVKMAARTMGSSTVGRRYLWLKDCKINPTSKNKLAVIPFKGGTLFGGEVCKIIKKRGNKH	177133	193612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_756_pilon_+_177668_186009_186137_187913_188073_189004
910915	contig_16632_pilon	-	3672	12	Intergenic	novelGene_154135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_2	196.830715536251	218	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2301	274	2574	228974	89540	FALSE	70	GGGTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGRFLAPEAGSRESPGTARSFPEGPDYSSSAWLPGNESLWQATTVPSNHRNNHTRRHSIASDSGDTGIGTSCSDSVEDHSTSSGTLSFKPSRSLVTLPTAHVMPSNSSSSISRHRESLTSDGSKWSTSLMQTMGNRSRGEQDSTLDMKDFRPLRKWSSLSKLTAPDNCSQSSIVYTEEPRNDLEKTGRSKALKSQLRTVGPGCFHDSMEMLKLEDKEINKKRSSTLDCKYKFESCSKEDVRAFPSTLRRQALDMTYSALPESKPIMTSSEAFEPPKYLILGQQEVGGVPIQPSVRTQMWLTEQLRTNPFECRATEDSYSLAPWQPQQIEAFRQGSETPVQVLTGSSRQSYSPSDYQDFSKWESVLKLKEGLLRQKEIVIDRQKQQITHLHEKIRDNELRAQHAMLGRYVNCEDSYVASLQPQYENTTLQAPFSEQSVSNSQQEELEQKLTSAEKEVLQLNEFLKQRITQSSEEKKKLEEKLKTRDRYISSLKKKCQKESEQNKEKQRRIETLEKYLADLPTLDDVQSQSLQLQVLEEKNKNLQETLIDTEKKLEEIKKQCEEKEAQLICQKKKEKELVTTVQSLQQKVERCLEDGIRLPMLDAKQLQNENDNLREQNENASKVIDSQQVEIDRMILEIQSMQGRLSKEKLITQKMVEELEKKERNIQRLTEALLGNQRQTEETCSSLDQGQEAGQSRQQTVLSKWPLFDLTVIDQLFKEMSYCLFDLKALCSILNQRAQGKEPNLSLLLGIRCKWLMICSLLLSN	229247	88441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_89813_93377_93486_102379_102431_102968_103087_108532_108688_109943_110097_118937_119118_131606_131725_141912_142035_173316_174105_207309_207472_228901
910916	contig_821_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_149409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1589	1912	227831	227508	NA	65	ACTCCCAGCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLTLQREQAEREQQKKPLGARRKEIIRIRAELNEIENRKIIESVNKTKSWFSEKINRINKPLAKLTKEKQERKRITRMRNEMGNITTDPTEIKRIITEYDEKIVL	229419	227378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_227400_229400
910917	contig_4295_pilon	+	2285	2	Intergenic	novelGene_169976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCAATATGCTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64128	69036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4295_pilon_+_65416_68038
910918	contig_14768_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_115089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269836	268336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_268300_269800
910919	contig_9471_pilon	-	1671	14	Intergenic	novelGene_21734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCCGCAGTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302895	210860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_211098_211701_211738_248958_249059_259412_259494_260219_260322_261046_261103_271739_271920_275965_276047_278275_278393_289121_289217_293216_293336_293894_293982_297482_297642_302674
910920	contig_10126_pilon	-	3317	1	Intergenic	novelGene_105701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2751	3053	13398	13096	NA	30	TGTGTAAAATTTTAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGAEPGTGAKGGGGGERQQRNQKKQQKAIPAANKWHPRSWPVQAGGIQAAGASWPRDRGCRKQRRPSRGEEGWEVGKYISLVTGYSVSCWKLCEAAFS	16148	12831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_12800_16100
910921	contig_11937_pilon	-	4645	13	Intergenic	novelGene_171579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_12	115.858989964334	364	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	547	1569	69423	38136	FALSE	25	TTCATACTTTTGAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTLDLSSTEVLKELYTLLNENYVEDDDNMFRFDYSPEFLLWALRPPGWLPQWHCGVRVSSNKKLVGFISAIPANIRIYDSVKKMVEINFLCVHKKLRSKRVAPVLIREITRRVNLEGIFQAVYTAGVVLPKPVATCRYWHRSLNPRKLVEVKFSHLSRNMTLQRTMKLYRLPDVTKTAGLRPMEPKDTRAVRELINSYLKQFHLAPVMDEEEVAHWFLPQEHIVDTFVVESSSGKLTDFLSFYTLPSTVMHHPVHKSLKAAYSFYNIHTETPLLDLMNDALIIAKLKGFDVFNALDLMENKTFLEKLKFGIGDGNLQYYLYNWRCPGTDSEKVGLVLQ	123052	35059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_38157_38356_38495_39701_39870_57508_57680_66113_66223_67450_67622_68962_69080_69199_69292_69387_69507_72998_73144_77186_77230_77622_77759_122913
910922	contig_15697_pilon	+	2760	1	Intergenic	novelGene_173308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58988	61748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_+_59000_61700
910923	contig_16724_pilon	-	2138	7	Intergenic	novelGene_105267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_3	195.613280621627	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	340	684	336737	331871	FALSE	35	TTATGTGAGATTTTAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKAPAASVVSVPSQPSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVGASAQTQPASSSVPAPFGAAPSTNPFVAAAAGPSVASSTNPFQTNARGATGLSGAMPSQVFPHAHFAATFGTASMSMPAGFGTPAPYSLPTSFSGSFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGAGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSSNPFMTGAPTGQFPAGSSSTNPFL	346326	330416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_331931_332507_332600_334575_334735_336703_336752_342058_342155_342363_342444_346177
910924	contig_8581_pilon	-	1641	8	Intergenic	novelGene_22830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.011621664006	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	7	1002	323386	307094	TRUE	35	AAGACTCGAGTCATGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPQCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRGEVPPSS	323392	306341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306595_306707_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311
910925	contig_3747_pilon	+	2144	4	Intergenic	novelGene_24921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5683.72907713081	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	840	1166	203794	204120	FALSE	35	ATCTTTTTGTATGGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	202304	205098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202871_203228_203386_203498
910926	contig_13653_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_175688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	321	629	179472	179780	NA	30	TAACAGGCTGGAGAATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQCYEGLHQTESSTARWCPATTTDSSDQDHNRGFQTELEKDVEHNSNSQKKKKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGNGQPCKTKLD	179151	181340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13653_pilon_+_179200_181300
910927	contig_12427_pilon	+	2442	2	Intergenic	novelGene_40511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	39	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCAGCAGAGGCTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460296	464886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_462108_464255
910928	contig_7775_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_37476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCCAGCAATGCCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119911	117761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_117800_119900
910929	contig_854_pilon	-	1304	2	Intergenic	novelGene_36722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAAGAGGACCCAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716405	1711564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1711644_1715180
910930	contig_15172_pilon	+	1712	9	Intergenic	novelGene_158761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	175.912575943279	7	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	5	628	243174	267627	TRUE	30	TAAAGTTAATGACTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243169	268911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534_267735_267934
910931	contig_8284_pilon	+	3977	7	Intergenic	novelGene_125709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	489.487714066678	156	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	216	665	426599	449191	FALSE	30	CTAGTTCCAGCAAGGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKVIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDR	425078	452503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_425283_426587_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073
910932	contig_13607_pilon	+	2183	1	Intergenic	novelGene_170176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	839	1174	190368	190703	NA	45	GACGGTTCCAAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAITKRSLFSHSPVGYKSKFRASALGEGFLSQSALEEGPCDGISPPLVWDHLSAGTSGPKDALCSWHCFPGGMGFPCVSARFSLLYLKRDWLKILYNLVYLISITAANPFY	189529	191712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_189500_191700
910933	contig_6062_pilon	-	987	1	Intergenic	novelGene_5284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	447	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742942	741955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_742000_742900
910934	contig_709_pilon	+	2441	11	Intergenic	novelGene_57626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	28.6707167681591	1	106	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	526	1431	2691473	2701317	FALSE	45	AAGAAATGCTTATTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681021	2702327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2686056_2686096_2688679_2688910_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
910935	contig_14617_pilon	-	1833	1	Intergenic	novelGene_178879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	306	671	1528	1163	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	1833	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14617_pilon_-_0_1800
910936	contig_5253_pilon	-	2693	2	Intergenic	novelGene_61598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	164	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363450	358147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_358828_361437
910937	contig_5947_pilon	-	2997	2	Intergenic	novelGene_101578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832317	828861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_829964_830422
910938	contig_9706_pilon	-	5071	4	Intergenic	novelGene_20938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1019	133	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3703	4059	239002	238646	FALSE	60	CAAACAAAAAATGATAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERLQGDGNSYALLVRMQNGTTILENDMELLRKLEIEIPYDPAIPLLRIYPREIRPVTRMDIYTLMFIAALSTVAKRWKQPRCSSTDEWINKLWYIHTMEYYEMIKNNGESVKHLTT	524088	237633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_239205_276512_276638_360670_361414_521456
910939	contig_5019_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_109225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335391	337783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_335400_337800
910940	contig_10958_pilon	-	2016	4	Intergenic	novelGene_5443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAAGCGCAGGTGCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901686	888228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_888275_888847_889013_895279_895852_900453
910941	contig_9727_pilon	-	1835	3	Intergenic	novelGene_86266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	14.5	35	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	7	378	101964	80787	FALSE	15	CCTACTCCCCTCTCCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNMAEASGCDSSNRCEENGREGSSPKSLLPGTTISRVKLLDTMVDTFLQKLIAAGSYQRFTDCYKRFYQLQPEMTQRIYDKFITQLQTSIWEEISEIKQEGNLEAILNSLDKIVEEGRDRKEPAW	101970	79329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_80892_81860_81967_101803
910942	contig_5063_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_110004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCGGGGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49817	48806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_48800_49800
910943	contig_4364_pilon	+	589	1	Intergenic	novelGene_764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACGGCGACTGGCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532721	1533310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
910944	contig_9014_pilon	+	1580	5	Intergenic	novelGene_106797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1721.96796935948	35	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	58	393	150693	152329	TRUE	35	GTTCATAAATAAAGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150635	153608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150696_150939_151036_151578_151721_152234_152334_152425
910945	contig_12961_pilon	+	3622	2	Intergenic	novelGene_178884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	152	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	936	1526	381523	492438	FALSE	30	CAGTCCCACTCTTAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTNREFISLIFRIIQELKQKTDKTEEKTDKFIVKADKFMENTDKKMEDFKKIIREQNAKINAPLEIIQKQQLEIQKKNNKVSEMDTVIEGLRSRFEMMEDRISKTEEKHLDTTLVFLFLFSAWEPLLARQYHTAWKLVPYSVQTHSDIPGSISFLSLSLFFFWFVSFFFFHFFV	380587	494534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12961_pilon_+_381930_492254
910946	contig_641_pilon	+	1957	10	Intergenic	novelGene_170131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_6	26.5083262018689	167	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	111	1370	2066	45324	FALSE	35	AATCTCCTGTGTAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNLLHCYEVIPENSVCKLYFDLEFNKLANPRADGKKMVALLIEHVCKALRELYNVNCSAEDVFNLDSSTDEKFSRHLIFQLHDVAFKDNIHVGNFVRKILQPALKLIASEDDDKTPETTGCRFSHFSEASIQQGTSFNTMSMEKDTRESWTLNSEKLKRLGSAKQSSPDLSFLVVKNNIGEKHLFVDLGVYTRNRNFRLYKSSKIGKHVALEVAEDNKFFPMQSKNISEENHYFLSSLVSNVRFSDTLQILTCDTSQNKQKQVEYFNHSNTSVETIEGFQCSPYPEIDRFVLSLVNKNGIKGGIRRWNYFFPEELLVYDICRYRWCENIGRAHKSNNIMILVDLKNDVWYQKCHDPVCKAENFKSDCFPLPPEVCLLRLFKDEEEFTREDETVETKNNETKNPHKPSSIKLSKGVPSNDDWDNGTDDAYFLEAIEDAELAEAAENSLLSYSSISG	1955	45911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_2087_15100_15249_18584_18873_20901_21065_23028_23118_33200_33291_33367_33477_39359_39443_39526_39574_45102
910947	contig_11735_pilon	+	3054	1	Intergenic	novelGene_137327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	1264	1809	1264	1809	NA	45	GCTCTGAAAAGAGAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKEPINSLEEENFLELPKAEYKRLIYRTLLEIRKKILQNSEKAKEHTDKVVAELKKATQEHNDTFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSVESHRSRIEAVEVRTTDIEDKALDTNLFEEKSDKKIKKNEENLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERGDNRKYREDGSRFVDRKLP	0	3054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11735_pilon_+_0_3100
910949	contig_7327_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_172114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1503	1865	88792	89154	NA	70	GAGAAAAAAGGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIEPEKALLHFGISEALDFSQARGCRPGVGHLFQQHLKAPCVAGQTQREPSTKKSPTRALVRIISEVSLNKETIYKLKNAFGQKCPCLVQAVMLKGAVQGGKRASPHCLKTLFWQKLF	87289	89964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_87300_90000
910950	contig_4876_pilon	-	7577	27	Intergenic	novelGene_137881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_24	160.369529819959	369	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1124	3375	1910	5284	302483	202965	TRUE	25	TTAATATGTCTTGTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASAAAPTANLLQTCAALLMSPYCGMHSPNIEVVLVKIGLQSTRIGLKLIDILLRNCAASGSDPTDLNSPLLFGRLNGLSSDSTIDILYQLGTTQDPGTKDRIQALLKWVSDSARVAAMKRSGRMSYMCPNSSAVEYGLLMPSPSHLHCVAAILWHSYELLVDYDLPALLDRELFELLFNWSMSLPCNMVLKKAVDSLLCSMCHIHPKYFSLLMGWMGITPPPMQCHHRLSMTDDSKKQDLSSSLTDDSKNAQAPPTLNESHLATLASASQSPEAIKQLLDSGLPSLLVRSLASFCFSHISYSESIAHSIDSSQDKLRRHHVLQQCNKMPITADLVAPILRFLTEVGNSHIMKDWLGGPEVNPLWTALLFLLCHSGSTSGGLNLGAQHTSARSASLSSAAATGLTTQQRTAIENATVAFFLQCISCHPNNQKLMAQVLCELFQTSPQRGNLPTSGNISGFIRRLFLQLMLEDEKVTMFLQSPCPLYKGRINATSHVIQHPMYGAGHKFRTLHLPVSTTLSEVLDRVSDTPSITAKLINEQKDDKEKKNHEEKEKVKAENGFQDNYSVVVASGLKSQSKRAVSATPPRPPSRRGRTVPDKIGSAPSGAETANKIITVPVFHLFHKLLAGQPLPSEMTLAQLLTLLYDRKLPQGYRSIDLTVKLGSRVITDPSLSKTDSFKRLHTEKDHGELLGSCPEDEALTPSDESMEGILDESLLETCPIQSPLQVFAGMGGLALIAERLPMLYPEVIQQVSAPVVTSTTQEKPKDSDQFEWVTIEQSGELVYEAPETIASEPPPIKSAVQTMSPIPAHSLAAFGLFLRLPGYAEVLLKERKHAQCLLRLVLGVTDDGEGSHILQSPSANVLPTLPFHVLRSLFSTTPLTTDDGVLLRRMALEIGALHLILVCLSALSHHAPRVPNSNLSQTEPQVSSSHNPTSTEEQQLYWAKGTGFGTGSTASGWDVEQALTKQRLEEEHVTCLLQVLASYINPVSGAVNGEAQSSHDSRGQNNNALPSVLLELLSQSCLIPAMSSYLRNDSVLDMARHVPLYRALLELLRAIASCTSMVPLLLPLSTEDGEEEEEQSESQTSVGTLLAKMKTCVDTYTNRLRAVITTRFNVCTKQRIPW	308261	159297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_160434_163324_163460_164658_164848_180175_180254_182492_182655_195641_195860_199416_199528_200186_200333_202846_203020_220344_220556_256555_256725_258432_258598_263029_263248_266003_266305_285121_285319_286518_286693_288016_288185_289785_289918_293892_294023_294474_294619_296251_297033_297990_298213_301920_302030_302284_302520_305516_307107_307841_308037_308173
910951	contig_678_pilon	-	2820	7	Intergenic	novelGene_167834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAATAGAAAAAGAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418903	404617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_404869_409167_409337_409907_410060_412084_412235_412607_412734_413754_413845_417021
910952	contig_5918_pilon	+	2319	2	Intergenic	novelGene_99528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	0	207	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	188	757	651108	654774	FALSE	30	TTTTGAAAACATCACTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVEFADFSVYNASLENREWFSSKVDLTNSRVLEKEVSRSPTTSSITSGYFSHSASNATLSDMVVPSSDSSDQLAIQMKDADTREHSGPSLVPECRLSSDKELTELERGLVKDKLIMVPLKETSALAKGSPSSHSIPEKNSKILCRTGSCSGLDACPSEKGPPAREFSPREVTIEHTTNILEDHSFTEFMGVSDGNSFDGLMDSSAGELLRRRNLPNKTDSERVADGLQDPGQLRSTSDSDQGSTTAATTR	650920	656336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_651648_654744
910953	contig_15118_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_74600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACTTAACTCTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384740	386423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_384700_386400
910955	contig_8964_pilon	-	4043	3	Intergenic	novelGene_168698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	130	447	618061	617218	TRUE	50	ATGGAATAAATGCACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRFDILNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSFKREERKKRPKCMSEQTLKLALELRVAKANGRNDEVKEMKRRFHRAAREDKVKYYNDICKDLELGNQKGRTHSAFLKLKELKKKIQASSGKNEEWQCRKHKKKMEGIHRVTVPKRIG	618190	538297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_541858_617181_617460_617985
910956	contig_9293_pilon	-	1282	8	Intergenic	novelGene_175187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_7	155.107336107244	19	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	521	1120	21446	13698	FALSE	20	TTCCCCAGCCTCCCCAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAGHPASRNKKILNKKKLKRKQKSKSKVKTRSKSENLENTVIIPDIKLHSNPSAFNIYCNVRHCVLEWQKKETSLAAASKNSVQSGESDSDEEEESKEPPIKLPKIIEVGLCEVFELIKETRFSHPSLCLRSLQALLNVLQGQQPEGLQSEPPEVLESLFQLLLEITVRSTGMNDSTGQSLTALSCACLFSLVASWGETGRTLQAISAILTNNGSHACQTIQVPTILNSLQRSVQAVLVGKVQIQDWFSNGIKKAALMHKWPLKEISVDEDDQCLLQNDGFFLYLLCKDGLYKIGSGYSGTVRGHIYNSTSRIRNRKEKKSWLGYAQGYLLYRDVSNHSMTAIRISPETLEQDGTVMLPGMLFRWSLFLHK	86173	13535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_13833_15510_15583_15812_16056_21296_21494_25882_26037_34885_35102_44623_44700_86146
910957	contig_11744_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_176855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	255	554	129511	129212	NA	50	TTAATTTCAGCACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNCHGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDRDHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKNDQTYWSDRHWRNPESTAPRHRFSSVMKSLPRFTFQPKIRQPHKTKQD	129765	128224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_-_128200_129800
910958	contig_18934_pilon	+	4530	5	Intergenic	novelGene_175882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGCCGCTCAGTCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48630	134181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_+_52468_54289_54464_75189_75259_77167_77397_133960
910959	contig_3975_pilon	+	1854	2	Intergenic	novelGene_54950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	5530	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAGAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2351375	2354578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2351635_2352983
910960	contig_3269_pilon	+	2296	1	Intergenic	novelGene_117034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	889	1404	187764	188279	NA	15	GTTGTTTTTTAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFLGKSSALCKQSSCTMKCHRNPGHLSQEGSIRQESPNESPHHTPNAGKATPRARPTGGGICLYTNHSPFHLSFPKSHLEMQQSKKKIKTLSLKAGHRSLGKKKKKQKQFFSSSFLKEFPLASLSAEVALKKPLQLPLYPYLILLTVLINLKYMIGNLFWSQRFAEIAR	186875	189171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_186900_189200
910961	contig_17976_pilon	-	1324	2	Intergenic	novelGene_32532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	707	1015	50211	49903	TRUE	35	TCAAGAGTTAATTCCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEARMAGLRLTYFGHGIRRDQSLEKDIMLSKVQGQRKRGRPSMRWIDRVPATMGSSIPTIVRMAQDGAVFWSVMHRVAESEPTRWHLTTTRTAGEREMRS	50917	49432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_49449_49609
910962	contig_5549_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_81708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCCCACAACGTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904482	905463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_904500_905500
910963	contig_6101_pilon	-	3496	2	Intergenic	novelGene_114293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465917	348000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_351109_465529
910964	contig_10044_pilon	+	3005	4	Intergenic	novelGene_156377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	4.64279609239471	102	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	276	1910	34877	45628	FALSE	30	GAACATCGACTTAGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQEQKKTIEAQESLTFSDVAVKFTWEEWQLLDSAQKDLYQDVMLENYKNLVSLEIWKVDDHLLGPWQNESRMDGMEQCDEHNILENIVHQHKSLFPLKQNHGMFDLYEKATRSNLTLINQSRSYEVKNSAELNRDEKTFLHANPEQSGTESKFPESQISNTESQLSKYQKTHKIEKPHVCSECGKAFIKKSWLIHHQIIHTGEKPHRCSLCGKAFSKKYKLTEHHQRTHKGQKPYECTECGKAFLYNSQLNKHQKIHMAEKPYICHECGKGFTEKSFLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLIIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKSCLIAHQRFHTGKSPFVCSECGKSLTQKASLIRHQKSHRREKLFQCSECSKAFLTKHKLIIHQRTHTGERRHGCDECGKTFPYMSCLLRHKRKHTRKKHVESDKVENPSAANHTSSPTSDLIQDKNPVSTVTMQMPSVATQTSVNTSRLLTNRNVVLVGQPVARSEPSGDNREFVQQRVLLNAVNVVVPVNAVNVVVPSVSNYILFYIPQNP	30613	46723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_30714_34701_34913_39399_39527_44156
910965	contig_9463_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_83802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAACCAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4378	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_2100_4400
910966	contig_8820_pilon	+	1728	11	Intergenic	novelGene_79279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	199.059187178085	1	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	737	1399	130268	133257	FALSE	5	ATGGCCCGGCTCCCGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTLHTTASNWLHLIPQTLTHLKRTVENIKDPLFRFFEREVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRSWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERVKQLQSISLAAASGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQYVAQANSWSLEELCLEVNVTTSQGATLDACSFGVTGLKLQGATCSNNKLSLSNAISTILPLTQLRWVKQT	118197	133586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_118399_119176_119390_119528_119577_128890_128939_129050_129155_130145_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132577_133251
910967	contig_7056_pilon	+	1614	10	Intergenic	novelGene_43616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGAAGTCCACCGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721894	727031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724534_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725729_725809_725991_726938
910968	contig_14727_pilon	-	4283	20	Intergenic	novelGene_56686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_9	28.5435954656253	242	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2298	124	2421	472609	431202	FALSE	20	CATTTATTGCATGTCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLISCSGAKGSLVLADGKGDLKFHVTADPFKVDLVSEEDIVMSVNSLGQLYFEHLQISPKQRATKENEDDASVDTSQQENQNDMGLWEEKFGKFVDIKANGPASIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDVYGYKIHDKMGIYGSVPYLLAHKLGRTLGIFWLNASETLVEVNTEPTVEYTLTQMGSVAAKQKVRSRADVHWMSESGIIDVFLLMGPTPSDVFRQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDVMWLDIEHTEGKRYFTWDKKRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHVKVDPDYSVYAKAKEQGFFVRNREGGDLEGVCWPGLCSYLDFTNPKVREWYSGLFAFPVYQGSTDILFIWNDMNEPSVFRGPELTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFYQQMATAEGLIRRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGAVWTGDNRSDWSYLKISIPMLLTLSVTGISFCGADVGGFIGNPEAELLVRWYQAGAYQPFFRGHATMKTKRREPWLFGEEHTQLIRDAIRERYALLPYWYSLFYRAHKTAEPIMRPLWVEFPNELETFGIEDEYMLGSALLVHPVTEPKAAVVDVFLPGSDEVWYDSKTFAHWEGACTVKIPVALDTIPVFQRGGSVVAVKTTVGKSTGWMTESPYGLRVALSSQGSAVSELYLDDGHSFQYCHQNQFLNRKFLFCSGVLINSCADERGRYPSKCVVEQILVLGLRKQPSSVTTHSSDGKDQLVAFTYSATTSTLSLEKLSLDIGADWEVRIK	472732	429339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_431312_431940_432045_432582_432696_433922_434037_436736_436812_440874_440952_442711_442777_444153_444398_445662_445765_449822_449920_451013_451158_452628_452709_453637_453765_457077_457314_459642_459797_460006_460188_461275_461373_462774_462845_465012_465059_472547
910969	contig_8284_pilon	-	3302	3	Intergenic	novelGene_125668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	47	junction_2	87.5	192	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	202	1353	226911	225660	FALSE	10	TGTACGGCATTCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLYFLPKASTPMNEEPMNSSNINDYFGLTDMEYSVDGETSPCSLGEVRKFSSLFVPIAYALICIFGLLGNILVVITFAFYKKAKSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVNHASGAWYFSNVMCKLTKGIYAINFNCGMLLLTCISLDRYIAIVQATKSFRLRSKTLAHNKVICFAVWVVSIIISSSTFIFSQKYSMQGVDVCEPKYHNVLEPIKWKLLMLVLQLIFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLVCQTPHNMVLLVTAVTMGRTDRACSSEKLIGYTKTITEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKIMKDLWCVRRKHQSTGFSCSRMYSESAVSKQTSETVDNENASSFTM	271315	223710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_226764_226863_226980_271182
910970	contig_9389_pilon	+	2413	4	Intergenic	novelGene_84111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	120.208152801713	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	479	814	1423302	1423753	FALSE	5	TATTTGGCTGCTGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLDVHVCFSNPSASVDLASIVARTSSTGPLHFRLPPVLKWPPRVPAFLSLGLLIIPTRRWNLNPHPVCPLTVNGKTHFAFKPLAFARRLESFPRVASSTWSRPPQRPLA	1398367	1425352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1398531_1408698_1408940_1423227_1423613_1423728
910971	contig_12123_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_144621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1137	1595	183855	184313	NA	65	TAGAAAATAGAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCLAANREIGDLNPLAALREKGAAVCFHKALQPWNLRLKDTNRQTQRMEKNISSKLQSKRAGVATFISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSVYQEDITMINIYTPNDTAPKYIKQTLNSTEKRERQLHDSSRRLQHTTFGEGQNIQKEAP	182718	184840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_182700_184800
910972	contig_6975_pilon	+	2831	3	Intergenic	novelGene_74307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2154	2468	527553	527867	TRUE	25	CAGCTGGGCACCTAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQHFLTVSATEVLSFFSPVLEVTFFKSGLSNCSVILSVFLVICTSCDFSSTHPFDSDTSESSILLLVAWSKSVTITEESGGEVLSGELESSEILRGVGGNSDK	521589	530652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_523701_527510_528072_530493
910973	contig_10734_pilon	+	2583	12	Intergenic	novelGene_51278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	91.404468487619	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	57	1511	1336726	1361646	TRUE	15	TGAACCGCTGACCTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLSYGRVNLNVLREAVRRELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSEDRRGPARDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESESAFKQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNSYVEDCIAQKHPLIKVLRLICLQSVCNSGLKQKVLDYYRREILQTYGYEHILTLYSLEKAGLLRPQAGGRNNYPTIRKTLRLWMDDVNEQNPTDISYVYSGYAPSQRAASPAALPARLAEHRGGTPHSPRTPL	1336669	1363089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438_1339505_1339941_1340070_1341846_1342034_1347328_1347504_1352397_1352592_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1361514_1361685_1362055
910974	contig_14467_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_138242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAATTAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280725	283356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_280700_283400
910975	contig_12479_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_56856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAAAGTTGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452849	450306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_450300_452800
910976	contig_3747_pilon	+	2165	6	Intergenic	novelGene_24927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	57	797	202422	203804	FALSE	80	TAAAAAAAAAATAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202365	205172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
910977	contig_11330_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_178885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	402	976	1377	27227	27628	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRI	26251	27628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11330_pilon_+_26300_27600
910978	contig_13453_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_146713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90333	92210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_90300_92200
910979	contig_6102_pilon	-	2710	3	Intergenic	novelGene_32343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	296	junction_2	305	71	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689366	1686225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1687297_1687629_1689005_1689102
910980	contig_16775_pilon	+	2433	18	Intergenic	novelGene_107764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_6	293.605000287413	1290	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	776	1825	152231	174136	FALSE	25	CATTTGATTATACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130359	174744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_133849_133936_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_146028_146154_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
910981	contig_2917_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_147572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	252	569	78716	78399	NA	70	AAGGAAAAAGAAAAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPLQWRSDILPLSNLFTNSDTSCPPHGTPPPGQTSFWTLGQTSTQPPSGKASSQLLPCLGKCYNSFSSTDKCLRHPTPLASLLPEGIQLSCSMGWQAHCSHLAP	78967	76781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_76800_79000
910982	contig_9653_pilon	+	276	1	Intergenic	novelGene_48231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCCGCGCGGGGAAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619254	619530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_619300_619500
910983	contig_5526_pilon	-	4334	1	Intergenic	novelGene_111706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAATACCATTTATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370378	366044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5526_pilon_-_366000_370400
910984	contig_17859_pilon	-	3793	27	Intergenic	novelGene_155723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	109.531256515417	5	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1941	1852	3792	222369	207405	FALSE	20	GCCCCATCAATGCCATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMTIVNLEADMERLIKKREELFLLQEALRRKRERLQAESPEEEKGLQELAEEIDVLAANIDYINDSITDCQATIVQLEETKEELDSTDTSVVISSCSLAEARLLLDNFLKASIDKGLQVAQKEAQIRLLEGRLKQTDMTGSSQNHQLLDALREKAEAHPELQALIYNVQQENGYASTDEEISEFSEGSFSQSFTMKGSTSHDDFKFKGEPKLSAQMKAVSAECLGPPLDISTKNITKSLASLVEIKEDAVGFSIRDSYYRDKVSRTISLPTRGSTFPRQSRGTETSPLTRRKSYDRGQPIRSTDVGFTPPSSPPTRPRNDRNVFSRLTSNQSQGSALDKGIITPVGGAKGARTAPLQCVSMAEGHTKPILCLDATDELLFTGSKDRSCKMWNLVTGQEIVALKGHPNNVVSIKYCSHSGLVFSVSTSYIKVWDIRDSAKCIRTLTSSGQVISGDACAATTTRAITSAQGEHQINQIALSPSGTMLYAASGNAVRVWELSRFQPIGKLTGHIGPVMCLTVSQTSSHHDLVVTGSKDHYVKMFELGEGVTGTVGPTHNFEPPHYDGIECLAIQGDILFSGSRDNGIKKWDLEQQELIQQIPNAHKDWVCALAFVPGRPMLLSACRAGVIKVWNVENFTPIGEIKGHD	256639	207403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_-_207552_208424_208596_209876_209995_210286_210452_212722_212904_213787_213925_217560_217675_219177_219253_219331_219538_220298_220357_220539_220592_220739_220906_221708_221811_221897_222093_222315_222528_222642_222806_227992_228222_229909_230102_231198_231317_231728_231811_232206_232426_232519_232588_233778_233969_235183_235380_235904_236021_236386_236423_256555
910985	contig_14755_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_129387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230231	232209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14755_pilon_+_230200_232200
910986	contig_5316_pilon	+	6992	1	Intergenic	novelGene_61218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	5650	5982	401905	402237	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYLEYKSIFWFQVMIRKTLVCHHPNPFVVHCHSVAQVKSLHLFLKHNQCKQSSEYTQRGSFGGITKEIGDSISNKNCKLITGRFLQESLLFNNANVIETLLILNAVNLK	396255	403247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396300_403200
910987	SIRV6	+	924	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	11	602	11	-35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	86	23	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	45	GGTAAACGTAAATTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
910988	contig_7165_pilon	-	5043	14	Intergenic	novelGene_116849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	260.63105029658	2	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	935	2808	255	3062	369520	309794	TRUE	25	GCCCAGCCAAGTTGACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESKTSKNENHEPKKNAWAICEESKAVKVINNQTLKTRNDKPVKEIGTSSPNRNSSKRNKQNDICIEKTEVKSCKGNAASVAGPKDLGLVLRDQSHCKAKKSPNSPVKAEKAPPSHAKVEKIPSLQAKAEKSPKLPNSPVIAEKPPDLQTAAEKVLSLQRKVEKAPSSRTKSEKMPSTPAEAENVPSLLLKENMRQMELQQIGKKIPSSFTSMDKVNIEVVQGEKSALENSLRSQKQQTCTDNVDDSDDSASGIEDIPDDLSKMKNDESNKENSSEMEYLENATVIDESTLTPEQRLGLKQAEERLERDHIFRLEKRSPEYTNCRYLCKLCLIHIENIQAAHKHIKEKRHKKNILEKQEESELRSLPPPSPAHLAALSVAVIELAKEQGITDDELRVRQEIVEEMSKVITICLPECSLRLYGSSLTKFALKSSDVNIDIKFPPKMNHPDLLIQVLGILKKNVLYVDVESDFHAKVPVVVCKDRKSGLLCRVSAGNDMACLTTDLLAALGKREPVFTPLVLAFRYWAKLCHIDSQIDGGIPSYCFALMVMFFLQQRKPPLLPCLLGSWIEGFDPKRMDDFQLKGIVEEKFVKWECNSSSATEKNSIAEENKAKADQPKDDTKKTETDNQSNAMKEKHGKSPLTLETPNQVSLGQLWLELLKFYTLDFALEEYVICVRIKDILTRENKNWPKRRIAIEDPFSVKRNVARSLNSQLVYEYVVERFRAAYRYFACPQRKGGSKSTVDSKKKEKGKINNKKPVKSDSMAASCCILLGESTEKINTERDQPDKCDEMECTSQRCITDKDLLVNELDLAEHGQKSSSLITSEGSQLEPKSIKKQGDLAPSETCLKKGLSQCNCNEYKSPDPGESASTDCRSNLETESSHQIVCTDMSATSCNCKATEDSSDLNDDDKLLAEELHYVFDKFILTSGKVGYSL	415207	307174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_307445_308082_310510_313695_313871_317440_317654_317820_317941_323804_323932_325237_325308_328631_328684_332778_332868_334397_334576_346283_346401_359141_359306_368733_369612_415044
910989	contig_7843_pilon	-	2601	2	Intergenic	novelGene_152039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCACAAAACAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446837	385926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_386360_444669
910990	contig_12410_pilon	-	3077	3	Intergenic	novelGene_167261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	115	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	223	612	45501	28136	FALSE	35	TGCTGTGTGAAACAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPSWTPIRDQQMWVQESSFTEPPAGNRITGNWQYMLSHPPTFITPTRPPLLPVATVSGPGTTVVLPGCHPTTLANSLSATCWLLVLLFPASFDFLLTSHHLPSFHSNTWLQAPSLLLPEGLQSAGNL	92759	25670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_28158_45133_45526_92561
910991	contig_14970_pilon	+	2796	3	Intergenic	novelGene_45149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	543	887	304789	305133	TRUE	0	TCCCTTTCTCCTCTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFETEAAQLLVSLVSSASAFYGLVALGPHARICPAGASVPKLSSSTGKCPEAPHSARKPSAHRHSALSLRGSAPAWIRHSISPQMVDLAEALCEGKANPYP	304246	315743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_306785_311920_312049_315613
910992	contig_854_pilon	+	3392	15	Intergenic	novelGene_36694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	3717.60021892552	20	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	193	2076	1705343	1714980	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704658	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715654_1715762
910993	contig_11493_pilon	-	3616	22	Intergenic	novelGene_143669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_21	340.614710416889	13	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	935	2808	711	3518	276158	142959	FALSE	55	TGGAAAAAAAGGAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCAISPYACFYGSPAVKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAVSTIRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNEWISILLNALKSQSLTPQSQTVAAPEKFGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVRLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTGPIFTFEIYLPSECVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPFVAENLTEADYDLVGQLYYKDCHALDQWRKGWFAMDKSTLRFCLQMQEAQEDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTIWRTAIEKAAGTDGNALEDQQLSKNDVPIIVNSCVAFVTQYGLGSKYIYQKNGDPLHVSELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTGVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGTFIRSLPVVNRATLAAVIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLAMAFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVNILCPALVKIVLMQTKIRVLGCFYSGLYEYLKIKASYSLLNFIDMTMFLSYSHSFKFRLLLKLSYHLASAGQNGSIYRAFTFFVSSFSFSFSGCVCFMST	319895	142860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_143413_146901_147008_150637_150851_156774_156939_183434_183499_184764_184964_185815_185919_188014_188160_196944_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816_232996_241701_241823_256061_256132_276063_276418_278388_278457_279219_279297_280556_280616_319648
910994	contig_405_pilon	+	5148	24	Intergenic	novelGene_135277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	42.6743504817111	214	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	978	2937	29	2965	37111	112153	FALSE	15	CCTCTGGAGTTTACAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNPAIKRIGNHITKSPEDKREYRGVELANGIKVLLISDPTTDKSSAALDVHIGSLSDPPNIAGLSHFCEHMLFLGTKKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLEGALDRFAQFFLCPLFDASCKDREVNAVDSEHEKNVMNDAWRLFQLEKATGNPKHPFSKFGTGNKYTLETRPNQEGIDVRQELLKFHSTYYSSNLMAICVLGRESLDDLTNLVVKLFSEVENKNVPLPEFPEHPFQQEHLKQLYKIVPIKDIRNLYVTFPIPDLQKYYKSNPGHYLGHLIGHEGPGSLLSELKSKGWVNTLVGGQKEGARGFMFFIINVDLTEEGLLHVEDIILHMFQYVQKLRAEGPQEWVFQECKDLNAVGFRFKDKERPRGYTSKIAGILHYYPLEEVLTAEYLLEEFRPDLIEMVLDKLRPENVRVAVVSKSFEGKTDRTEEWYGTQYKQEAIPDEVIEKWQNADLNGKFKLPTKNEFIPTNFEILSLEKEATPYPALIKDTAMSKLWFKQDDKFFLPKACLNFEFFSPFAYVDPLHCNMAYLYLELLKDSLNEYAYAAELAGLSYDLQNTIYGMYLSVKGYNDKQPILLKKIIEKMATFEIDEKRFEIIKEAYMRSLNNFRAEQPHQHAMYYLRLLMTEVAWTKEELKEALDDVTLPRLKAFIPQLLSRLHIEALLHGNIAKQAALGIMQMVEDTLIEHAHTKPLLPSQLVRYREVQLPDRGWFVYQQRNEIHNNCGIEIYYQTDMQSTSENMFLELFCQIISEPCFNTLRTKEQLGYIVFSGPRRANGIQGLRFIIQSEKPPHYLESRVEAFLVTMEKSIEDMTEEAFQKHIQALAIRRLDKPKKLAAECAKYWGEIISQQYNFDRDNIEVAYLKTLTKEDIIKFYQEMLAVDAPRRHKVSVHVLAREMDSCPAVGEFPCQNDVNLPQAPALPQPEVIQNMTEFKRGLPLFPLVKPHINFMAAKL	37082	114336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_37271_38534_38743_41049_41220_55539_55663_62678_62792_64280_64444_65314_65408_65853_65946_66993_67075_68672_68777_78522_78626_81880_82004_83875_83959_87343_87489_90305_90417_91359_91481_97358_97451_99954_100067_102952_103121_105272_105546_106631_106694_110546_110620_111299_111368_112057
910995	contig_14390_pilon	+	1388	5	Intergenic	novelGene_178886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_1	232.889458756724	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	41	556	6137	24252	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWLKLDKSFIWSFMGPVATIILINLVFYFIILCILKSKVSSLSKEVSTVRNTRVMTFKTIAQLFILSCSWILGFFMVEAVGTTAGLVIAYIFIIINVLQGVLLFVLYCLLNHQVRMEYKKWFSGMRKGFEMESTELSHSTTHTKMEEPGKSSEFVQRRDTKNTTFAQPEPPTHLTTVSSLKTEK	6096	25084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14390_pilon_+_6164_7505_7598_8686_8868_23033_23130_24132
910996	contig_8317_pilon	+	784	2	Intergenic	novelGene_19328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	64	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCCGTATTACATAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16170	17053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
910997	contig_7496_pilon	-	4651	4	Intergenic	novelGene_178889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3849	4151	102813	102511	TRUE	25	CTCCAACACCCCTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPWDPTSVVAQTGKQLHTRMELHSPSGRSKDGARCQVLERKEGEVTRGKQEIKRTEEKKEKKKHQQPTNGTQRAS	118494	98585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7496_pilon_-_98593_102017_103620_115406_116211_116256
910998	contig_11932_pilon	+	2928	2	Intergenic	novelGene_85425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	86	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAACTGTGTTATGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422251	448634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_422321_445775
910999	contig_17616_pilon	-	3000	4	Intergenic	novelGene_178890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1159	1851	2664	1747	FALSE	35	ATGGAACGTTCTCCAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLQKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLVQI	47783	597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17616_pilon_-_2097_2321_3434_3782_3896_47507
911000	contig_10948_pilon	-	4197	4	Intergenic	novelGene_124967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1571	2161	257607	257017	TRUE	50	AACTGTGGAAGATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTITKHLQKQDRMAPLGVQIKTPDNSPVEENALEVPDREFKSLIIGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKQLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEWGRKQKTQRGSLRNC	259333	97342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_98274_98371_98607_256146_258429_258584
911001	contig_11173_pilon	-	1997	13	Intergenic	novelGene_156900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAACCGATGCCGCAACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456130	430623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11173_pilon_-_430721_431752_431847_432245_432342_432690_432789_433343_433426_434011_434132_434778_434946_441136_441287_442830_443096_449936_450040_452958_453049_453724_453813_455583
911002	contig_12919_pilon	+	5306	4	Intergenic	novelGene_75921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.5726066278513	109	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGGTGGTAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855493	872694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_+_855544_860068_860207_864196_864408_867787
911003	contig_15327_pilon	+	2788	2	Intergenic	novelGene_70556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACAAAAAAAACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568748	574044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_570273_572780
911004	contig_8954_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_130326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAAGATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681907	681344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_681300_681900
911005	contig_9738_pilon	+	2952	5	Intergenic	novelGene_169267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_2	24.6817240078565	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1112	1678	205076	214267	FALSE	15	ATTCTTCTTCTCGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSMGGFGGVGRMGELYRGAVTSSMERDFGRGDIGISRSFGDSFGRLGGGMSSMNSVTGGLGMGLDRVSSSFDRVGPGIGAVLERSIDMERGFLSGPVGSGMRDRIGSKGNQIFVRNLPFDLTWQKLKEKFSQCGHVMFAEIKMENGKSKGCGTVRFDSPESAEKACRIMNGIKISGREIDVRLDRNA	203964	215541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_205119_205426_205526_207609_207819_207898_207951_214103
911006	contig_1804_pilon	+	3598	3	Intergenic	novelGene_177417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1939	2424	303105	303590	TRUE	25	TACCGGGGAGCAGTTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSVSNSSMILSVFSVFSPCSGTLITHRFLLLIVSHIILRVSSFSFILFSDFSSNRVVSKCLSSILPLLSSTVSNLLLSPSVTLSISEILLFIFWSSNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLFLFSMNLPAFSVNLSIFSSSLSAF	300975	354558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1804_pilon_+_301382_301572_304636_354429
911007	contig_3077_pilon	-	4268	24	Intergenic	novelGene_26904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_7	56.237748088085	185	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1040	3123	4	3126	1710478	1646859	FALSE	25	TTTAGTCTGTATGGTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAAGAASGLPGPVAQGLKEALVDTLTGILSPVQEVRAAAEEQIKVLEVTEEFGVHLAELTVDPQGALAIRQLASVILKQYVETHWCAHSEKFRPPETTERAKMVIRELLPNGLRESISKVRSSVAYAVSAIAHWDWPEAWPQLFNLLMEMLVSGDLNAVHGAMRVLTEFTREVTDTQMPLVAPVILPEMYKIFTMAEVYGIRTRSRAVEIFTTCAHMICNMEELEKGAAKVLIFPVVQQFTEAFVQALQIPDGPTSDSGFKMEVLKAVTALVKNFPKHMVSSMQQILPIVWNTLTESAAFYVRTEVNYTEEVEDPVDSDGEVLGFENLVFSIFEFVHALLENSKFKSTVKKALPELIYYIILYMQITEEQIKVWTANPQQFVEDEDDDTFSYTVRIAAQDLLLAVATDFQNESAAALAAAATRHLQEAEQTKNSGTEHWWKIHEACMLALGSVKSIITDSVKNGRIHFDMHGFLTNVILADLNLSVSPFLLGRALWAASRFTVAMSPELIQQFLQATVRGLHETQPPSVRISAVRAIWGYCDQLKVSESTHVLQPFLPSILDGLIHLAAQFSSEVLNLVMETLCIVCTVDPEFTASMENKICPFTIAIFLKYSNDPVVASLAQDIFKELSQIEACQGPMQMRLIPTLVSIMQAPADKIPAGLCATSIDILTTVVRNTKPPLSQLLICQAFPAVAQCTLHTDDNATMQNGGECLRAYVSVTLEQVAQWHDEQGHNGLWYVMQVVSQLLDPRTSEFTAAFVGRLVSTLISKAGRELGENLDQILRAILSKMQQAETLSVMQSLIMVFAHLVHTQLEPLLEFLCSLPGPTGKPALEFVMAEWTSRQHLFYGQYEGKVSSVALCKLLQHGINADDKRLQDIRVKGEEIYSMDEGIRTRSKSAKNPERWTNIPLLVKILKLIINELSNVMEANAARQAAPAEWNQDDSNDMWEDQEEEEEEEDGLAGQLLSDILASSKYEEDYYEDDEEDDPDALKDPLYQIDLQAYLTDFLCQFAQQPCYVMFSGHLNDNERRVLQTIGI	1710481	1645716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1646970_1647422_1647500_1647712_1647815_1648285_1648409_1649059_1649194_1650901_1651069_1651352_1651629_1652499_1652629_1653037_1653187_1654253_1654481_1658217_1658378_1664135_1664276_1664648_1664756_1666387_1666487_1667214_1667367_1668185_1668245_1668577_1668679_1668783_1668904_1670202_1670290_1671180_1671270_1680972_1681175_1681899_1681987_1682200_1682263_1710315
911008	contig_9839_pilon	+	1082	8	Intergenic	novelGene_88495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1790.34426059028	8557	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	372	947	52079	61360	FALSE	15	CTTGTTTTCTTGTCATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45310	61495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_49723_49806_52066_52202_54064_54122_57651_57850_59824_59927_61264
911009	contig_610_pilon	-	2841	10	Intergenic	novelGene_76828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1923	2378	363972	361078	TRUE	20	AGTTCTCAGGCTGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	376644	349996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_350134_360751_361082_363028_363298_363789_364137_366324_366510_368139_368245_369603_369656_373433_373715_374080_374152_375580
911010	contig_7513_pilon	-	8784	1	Intergenic	novelGene_88946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	562	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	372	749	140958	140581	NA	70	TGAAAAAGAAAGAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSVRNRQELVNPGPATCVYAHVAPTPLWSPLTLPGIAVLFFFFAILLSKMNVLAQPNHYRKWFLNTFQLKKQVQIKATSDFSTDSCLRLSLVTHTENSQNVAQINQIVNISLFSAGLNTCAIL	141329	132545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_132500_141300
911011	contig_935_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_45585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625801	623023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623000_625800
911012	contig_9706_pilon	+	3531	1	Intergenic	novelGene_21015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCATCACCACAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558821	562352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_558800_562400
911013	contig_11656_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_53958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGTTAAATGAGTTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140497	138290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_138300_140500
911014	contig_3172_pilon	-	4032	1	Intergenic	novelGene_173675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAAATTGTTTACTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11222	7190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_7200_11200
911015	contig_12951_pilon	-	3195	1	Intergenic	novelGene_68232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCTGCCACTCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798568	795373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_795400_798600
911017	contig_7816_pilon	+	2785	18	Intergenic	novelGene_66567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_15	32.6423420016009	80	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	588	1767	505	2271	507997	530659	FALSE	15	TTTGGGGATGATTATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQNKKTLEAPEGIRDKVSDWAAFLRQTLTGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLQSSDNFEHWLYYLDPFLHHIGWATQQGYELQPPLAIRHLKKEAEWQEIVAKVREEEEEPLPSYLFKDKQVIGTHAFSVNMKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQIPSSRAVHEGLKNQELNSADSVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLTKTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACVLKKASKRRKRRKNVFVHKKKHSSTSVDNTPAGSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSISEQQDELQEESEMSEKKSCSSSPTQSEISTSLPPDSDRRKRELRTFSFSDDENKPPSPKEIRIEVAERLQLDSNPLKWSVADVVRFIRSTDCAPLARIFLDQEIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHHIERIKFAFYEQFAN	495139	531173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_495174_502521_502611_506455_506703_507389_507485_507957_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560_517604_518931_518997_522739_522880_523697_523808_524492_524669_528102_528282_528450_528697_529554_529684_530518
911018	contig_4654_pilon	+	2322	2	Intergenic	novelGene_103065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	550	junction_1	0	78	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	124	381	450769	453348	FALSE	70	TTAAACTAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALALVPFSIKPLLRRAAAYEALEKYSLAYVDYVTVLQIDKSMKSAVEGINRMTRVLMDSLGPNWRQKLPPTPLVPVSAQKRWDSMPSENHKDSAKSKPKETTTTKNKGKLWLPPQRVLHLPVTTLE	450645	455289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_450798_453119
911019	contig_2892_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_118986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTAGCAAATCCCTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46754	43880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_43900_46800
911020	contig_16125_pilon	+	6422	2	Intergenic	novelGene_155269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	782	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGATTCACCTAGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149673	158176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_153486_155566
911021	contig_11896_pilon	-	6215	1	Intergenic	novelGene_87989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGCTCCTGCCTTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32206	25991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_26000_32200
911022	contig_16917_pilon	+	4760	14	Intergenic	novelGene_161927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_9	53.4392316495095	220	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	93	2882	97036	173671	FALSE	15	CGCTTTGGTATTATTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAIRAKDYDQAMEIDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSVESFINNEDIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAGLRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVMEYKMNEGISYEFKFPFRNNNKWQRNASKGTHSPQVPSQVQSPMTSRLNAGKGDGKMPPPERAANIPRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVSSIALARSQQCRNSPSNLSSSSETGSGGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSEDSIADQMEPTCHLPAVSKVLPAFRESPSGRLIRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSDEKWYDGDRTESELSSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPGHGSTASLGAATSSPRSGPVKEKVAPLWHSSSEVISLADRTLEAESHGMDRKAESSLSLDIHSKSQVGSGPLTRENSTFSISDAASHTSTMSSRHSASPVVFTSARSSPKEELHPATSSQLAPSFSSSSSSSSGPRTFYPRQGATSKYLIGWKKPEGTINSVGFMDTRKRHQSDGNEIAHTRLQASTRDLRASPKPTSKSTIEEDLKKLIDLESPTPESQKNFKFHALSSPQSPFPPTPTSRRALHRTLSDESIYSGQREHFFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLRRPSYTLGMKSLHGEFSASDSSLTDIQETQRQPMPDPGLMPLPDAAADLDWSNLVDAAKAYEVQRASLFAASDENHCPLSAASNSDQLEDQALAQMKSYSSSKDSSPTLASKVDQLEGMLKMLREDLKKEKEDKAHLQAEVQHLREDNLRLQEESQNASDKLKKFTEWVFNTIDMS	96943	175549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_97300_97934_98210_105111_105382_127348_127499_131499_131625_134340_134460_140290_140734_152838_153079_153838_154005_159256_159504_162525_162673_164204_164320_172778_172864_173527
911023	contig_6488_pilon	+	2516	3	Intergenic	novelGene_44731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCCGGAGACTCCCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51862	91395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_54122_90850_90985_91272
911024	contig_5062_pilon	+	1550	7	Intergenic	novelGene_157860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_6	94.9831856464899	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	64	1005	723798	743539	FALSE	60	GGAAAGAGAAAAAGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRYLI	723734	744084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422
911025	contig_4496_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_66681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGAAGAGTATAATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906753	908056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_906800_908100
911026	contig_14441_pilon	-	2314	2	Intergenic	novelGene_100348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_1	0	95	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTATGTCTTCTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27290	7967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_9744_26752
911027	contig_13749_pilon	+	6985	25	Intergenic	novelGene_156335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_19	61.1799344148063	237	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	490	3156	88031	201529	TRUE	20	GAGTGAATGTTGTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFHAGRMWSYHWKWKPGPQLFLFVLCIACVPHSAWGCANCRVDLSNPSGTFTSPCYPNDYPNSQACMWTLRAPTGYIIQITFNDFDIEEAPNCIYDSLSLDNGESQTKFCGATAKGLSFNSSANEMHVSFSSDFSIQKKGFNASYTRVAVSLRNQKVILPQTLDAYQVSVAKSVSIPELSAFSLCFEATKIGNEANDWTAFSYSDASFTQLLSFGKDQSGYFLTISGLRCFLNSVLPDKENEDVFTESFEQLCIVWNNSLGSVGVYFKRNYEMVPCDSTINRVIPGSGKLLLGSNQNEIASLKGDIYNFRLWNFTMNSKILSNLSCNVKGNVVDWQNDFWNIPTLALKAENNLSCGSYLIPLPAAELANCADLGTLCQATVNSPSATPPTVTTNMPVTNRVDKQKNDGIVYRISIVIENVLHHPEVKVQSKVAEWLNSTFQNWNYTVYVVNISLHLSTEEDKIKVKRSIEDDSRLVIWALLVYNATNNVSLEGKTIQQKLLRNNESLGEGLRLYTVNVRQLDTCPASEDPKGYVWPAIQPSEYSLPCNGKPGFYASRTCHRNLTNASLAYWGVPDVSNCSNDLNNVNTILNLTGEGQNLTSANITSIVEYVKRIVNNEENIDITLGSTLMTIFSNILTSSDSDLLESSSEALKTIDELAFKIDLTSTSRVNITTRNLALGVSSLSPGTNAVSNFSIGLPSNNESYFQMDFESGQVNPLASVILPPNLLENLSKEDSALVKRAQFTFFNKTGLFQDVGTQRDNLVSYVMACSIGNITIQDLKDPVRIIIKHTRTQTVHHPICAFWDLNKNSFGGWNTSGCVAYRGSDESETVCLCNHLTHFGVLMDLQGTASQMDARNTKVLTFITYIGCGISAIFSAATLLTYVAFE	87541	229161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_+_88033_99600_99702_156041_156384_158152_158777_165592_165662_168137_168222_174648_174735_177848_177902_178892_178956_183436_183580_184291_184404_186001_186067_186667_186876_188130_188303_190933_191075_193793_193914_195425_195472_196905_197010_201397_201530_202713_202983_204201_204299_206649_206934_220653_220756_221640_221794_226237
911028	contig_6710_pilon	-	564	2	Intergenic	novelGene_91939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	318	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	657179	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657179	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
911029	contig_5999_pilon	-	8801	4	Intergenic	novelGene_45626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	244	junction_2	50.1752484354144	283	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	274	930	170029	163332	FALSE	30	TCAACTCAGCAGTGTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVTLAHCVAFSLAACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEHICREGPVEIGLPRSMKEETKLPYLPTPGKREPQGISWESPMDGMDKTCHLPEPEMNIERPSLRIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKVWPLLGQPFPLPLTQ	170302	155460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_163554_167255_167417_168956_169075_169873
911030	contig_8394_pilon	-	2407	3	Intergenic	novelGene_27310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83	3	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	816	2060	35322	32466	FALSE	25	ATTAACCCTTTTCATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQEFCEVTPLLIDGAVSPLSPQSPLSASFTSVLPYHKDSGILSEAEAKKAQKALADGNLLEVVFAAIETLRRVPSTRVNIAVTGDSGNGMSTFINALRGIGHEEEASAPTGVVRTTQTRASYSFSCFPDVVLWDLPGMGATSQSLEDYIVEMQFSQYDLFIIIASEQFSMNHVMLAKAIEEMGKKFYIVWTKLDMDLSTRMLTEGQLMKNIRENILENLQKTRVRKPPIFLISSLEPSWHDFPKLRDTLKEDLSDIRYHGPLQNLFHAYKEIINDKVTYLQEKIATNSFQNTPGMRDIDDLAECLKTYRLSFGVNDESLQQLARSMGKESSEYKAIMKSQDLQAVITRGWKLKCLTCRVMKMFLILLSYIPSLDALIAPYIRQEKHNRMLEGVAEDTMTVLKKVLKDFTSS	39381	32118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_33684_35295_35523_38766
911031	contig_16930_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_139147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGATTTTAAATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65636	64156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_-_64200_65600
911032	contig_15114_pilon	-	4176	2	Intergenic	novelGene_121152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAGTTAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192358	138735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_139046_188492
911033	contig_20550_pilon	-	1587	3	Intergenic	novelGene_142628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACTTCATATTAGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25725	21332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_21398_24121_24274_24355
911034	contig_2504_pilon	+	2356	1	Intergenic	novelGene_166858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCTAACTGAAAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403829	406185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_403800_406200
911036	contig_4782_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_73612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGACAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161811	159281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161800
911037	contig_610_pilon	+	2285	4	Intergenic	novelGene_76793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	106.696870723664	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	30	536	296008	314462	FALSE	30	TTAAGTCTTGAAGAAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYENDPRGRPNTYALFCRADAQNGGKTPFTAHVSGHTRAIYL	295978	316211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_313377_313441_314403
911038	contig_18055_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_117798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATCTCTTTATAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37682	36503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_36500_37700
911039	contig_19145_pilon	-	4546	7	Intergenic	novelGene_164141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	3465	4094	159782	145755	TRUE	30	TGCAGGAAGGTGTCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAALLPGQVALDEASDLLWRHEVKEAVTSEQQVVLQAGQLPGGCVCLPGHVGLLENVPNGSGDSQGPVDSPAVHVGYEATQCFNALPLVLSLRPVGLHQLHHLSLLHQDDLGVPEPGDMQGASCDECAYTCGAALQPLSLGFPEKHLVGEPEGFPEGACRVQGQPWLAGSIGVHVHCGKLCGVDPSVTVKHSKVGTVHRVLTGRRAG	163246	131562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_131684_136419_136571_145574_145776_146294_146485_148538_148683_156738_156834_159602
911040	contig_5947_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_101580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACAAACAAACACGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832176	830090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_830100_832200
911041	contig_11176_pilon	+	851	1	Intergenic	novelGene_123449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATTGGTTATCCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130331	131182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_+_130300_131200
911042	contig_7398_pilon	+	5052	4	Intergenic	novelGene_166170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	908	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGATACCATACTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191014	350490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_194173_243554_244315_338833_339900_350422
911043	contig_8617_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_73451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCACAAACATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63325	62046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63300
911044	contig_7898_pilon	-	2306	2	Intergenic	novelGene_47547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1007	junction_1	0	3	123	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	19	384	293293	292088	FALSE	5	CCTGTGCTAGTGCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFINGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC	293311	290165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_292355_293194
911045	contig_2365_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_103769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTCTAAAAAATCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314862	316017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_314900_316000
911046	contig_12464_pilon	+	2170	1	Intergenic	novelGene_68727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACTTTTAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375167	377337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_375200_377300
911047	contig_10339_pilon	-	4654	9	Intergenic	novelGene_125268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	44.8497491631782	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	202	1032	357260	332047	TRUE	15	CTTCGTCCTCAGAGCCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLRFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSGVMMLQLLEKVVELENWTEGKGLIVRGANNTFSSGSDLNAVKALGTPEDGVALCMFMQNTLTRFMRLPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSDSLGWTRKFRGCC	366765	292296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_292503_308600_308709_328738_332090_332142_332434_346586_346668_348532_348586_354102_354246_357040_357263_366566
911048	contig_15327_pilon	-	2260	20	Intergenic	novelGene_70793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_14	122.19107692372	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	707	2124	70	2193	1204638	1185925	FALSE	10	TCTTGGCCGGGCGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLQRLQENVEKTLSCLDHVISYYHVASDTERIIREGPTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNSPDSPELNKVKLLFERGKESLESEFRSLMTRHSKVVSPVLILDLISGEDELEVQEEVPLEHLPEGVLQDVIRISRWLVEYGRNQDFMNVYYQIRSSQLDRSIKGLKEHFRKSSSSSGVPYSPAIPNKRKDTPTKKPAKRPGTIRKAQNLLKQYSQHGLDGKKGGSNLIPLEGHEHDFRVKHLSEALNDKHGPLAGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKLRDKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204707	1185857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186542_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192732_1193632_1193702_1194616_1194710_1197067_1197236_1199990_1200214_1202992_1203099_1203288_1203474_1204300_1204367_1204578
911049	contig_9180_pilon	-	3355	1	Intergenic	novelGene_109121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTTAATGCCAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491028	487673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_487700_491000
911051	contig_13888_pilon	+	1660	1	Intergenic	novelGene_151820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGAATGACTAGTAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368394	370054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_368400_370100
911052	contig_7909_pilon	+	963	2	Intergenic	novelGene_155922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	440	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	254	841	542509	545022	FALSE	30	TATCCCATCAGAAGGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVTEY	542255	545144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_542518_544443
911053	contig_1443_pilon	+	2476	11	Intergenic	novelGene_28247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	61.5486799208561	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1591	2334	538954	541708	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRDLYRCARVSSWGDLLPVITPSDLPPSPAQNDPPEG	536008	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536468_536604_537612_537727_537987_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340_541526_541599
911054	contig_2438_pilon	+	1312	5	Intergenic	novelGene_112046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	13611	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	60	659	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305106	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
911055	contig_11493_pilon	-	4645	1	Intergenic	novelGene_143664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	519	827	133589	133281	NA	35	TACCTAGCTAAAGAATCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEESLKLVLELRIVKVKGRNEVKELDRRFQTAAPEDKIKYYDEMCKDLEIENQKGGTCLTFLKLKELKKKFKPRVAILKDSTGKILNDAGSIKRRWKEYTG	134107	129462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_129500_134100
911056	contig_7728_pilon	+	5023	5	Intergenic	novelGene_64739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	213	junction_2	199.805374051851	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	164	1921	867342	914498	FALSE	15	TCACTCATATCTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSATSVDQRPKGQGNKVSVQNGSIHQKDAVNDDDFEPYLSSQTNQNNSYPPMSDPYMPSYYAPSIGFPYSLGEAAWSTAGDQPMPYLTTYGQMSNGEHHYIPDGVFSQPGALGNTPPFLGQHGFNFFPGNADFSTWGTSGSQGQSTQSSAYSSSYGYPPSSLGRAITDGQAGFGSDTLSKVPGISSIEQGMTGLKIGGDLTAAVTKTVGTALSGTGMTSIATNSVPPVSSAAPKPTSWAAIARKPAKPQPKLKPKGNVGIGGSAVPPPPIKHNMNIGTWDEKGSVVKAPPTQPVLPPQTIIQQPQPLIQPPPLVQSQLPQQQPQPPQPQQQQGPQPQAQPHQVQPQQQQLQNRWVAPRNRGAGFNQSNGAGNENFGLGVVPVSASPSSVEVHPVLEKLKAINNYNPKDFDWNLKNGRVFIIKSYSEDDIHRSIKYSIWCSTEHGNKRLDAAYRSLNGKGPLYLLFSVNGSGHFCGVAEMKSVVDYNAYAGVWSQDKWKGKFEVKWIFVKDVPNNQLRHIRLENNDNKPVTNSRDTQEVPLEKAKQVLKIIATFKHTTSIFDDFAHYEKRQEEEEAMRRERNRNKQ	867178	917600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_867366_867829_867855_873709_873796_883757_885357_914474
911057	contig_7695_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_41686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	275	766	1088438	1088929	NA	55	TTAAAATAATGTAAAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEETVKLALQPRLAKVNVRNDGVKGLNRRFQRVAQEDKVKYYNEMCKDPELENQKGRTHLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSMGKILNDTGSIKRRWRDYTESLYQKELVNIQPFQEPMVLKKEVQAALKSLEKNKSPGIDGISIEMFQQWDATLEALAHLC	1088163	1090846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1088200_1090800
911058	contig_12019_pilon	-	1020	4	Intergenic	novelGene_87628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	54.6829244117597	543	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	284	682	8392	5201	TRUE	25	TTTCGGGAAATTTGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRSWDKKVLPEELLSSLQLRIPEGEFLTFLIPEVDEQPHPKEEQTQNQAPDSTQHLALCRFRLCPPFRCERARQAWVLHLAGVNLSTLRNGFKHHRVWKVQSPFWIRPVETTPASSSWPFRNHVTSMWPG	8675	2043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_2298_5116_5400_6114_6235_8312
911059	contig_19098_pilon	-	1321	1	Intergenic	novelGene_65819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCTTTGTAAACTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351786	350465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_350500_351800
911060	contig_3745_pilon	-	4493	1	Intergenic	novelGene_85088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	457	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAATTATCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398735	394242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_394200_398700
911061	contig_9982_pilon	-	2868	6	Intergenic	novelGene_55725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	39.6918127577968	149	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	149	1021	303078	301370	TRUE	55	CGAGAAGAAAAATGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELEQAEAQLSELELLASMFPSQKEFIVNDQLALAELKDCIEKKTMEGRSSKIYFTVNINLEVSEKEMVMFSLACILPFKYPAVLPEITVRSVLLSRSQQTQLNTELHAYLQKNCCGDVCILNATEWVREHASDYISTDSTSSATTGSTAQSLDLILTRLWIYSHHIYNKSKRKNILEWAKELSLSGFSLPGKPGVVCVEGPQSACEEFWSRLRKLNWKRILIRHREDIPFDGTSDELERQRKFSGFEEKAFSADGARGNHMDFGQLYQFLNARGCGGVFQMLFGVEGQ	304877	297818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_299644_301347_301605_302233_302597_302720_302789_302871_303099_304749
911062	contig_10638_pilon	-	5956	6	Intergenic	novelGene_164308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4966	5295	402306	401977	TRUE	35	CCAGCAAGTAAAACTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGSGFFRFSGTLRNITPKSGEMRFFIQSLFVVEPWDCSSSSSAIFRCSMLFIPGKLSSPMWVSRMESTRSKCRINFQKQDFLSDPPLMSMLNPFTANNAESPLPPGKM	407315	314528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_314588_322301_322408_390305_390384_392934_393076_401699_402975_403018
911063	contig_9098_pilon	-	2392	12	Intergenic	novelGene_75820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_9	166.481279815256	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	837	1706	345261	335775	TRUE	50	TCATGAACAGAAATACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350152	313207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_313368_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_347761_347832_348546_348660_349535
911064	contig_6102_pilon	+	3118	10	Intergenic	novelGene_32394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_7	16.118389160701	187	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	68	1333	1782772	1792104	FALSE	55	AAAATCCTTAACAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSSAPPATVSPATAGPGQGFGFASKTKKKHFVQQKVKVFRAADPLVGVFLWGVAHSINELSQVPPPVMLLPDDFKASSKIKVNNHLFHRENLPSHFKFKEYCPQVFRNLRDRFGIDDQDYLVSLTRSPPSESEGSDGRFLISYDRTLVIKEVSSEDIADMHSNLSNYHQYIVKCHGNTLLPQFLGMYRVSVDNEDCYMLVMRNMFSHRLPVHRKYDLKGSLVSREASDKEKVKELPTLKDMDFLNKNQKVYIGEEEKKVFLEKLKRDVEFLVQLKIMDYSLLLGIHDIIRGSEPEEEGPAREEEAEGEGDCGLTGPPALVGSYGTSPEGIGGYIHSHRPLGPGEFESFIDVYAIRSAEGAPQKEVYFMGLIDILTQYDAKKKAAHAAKTVKHGAGAEISTVHPEQYAKRFLDFITNIFA	1782704	1793889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1782946_1785536_1785635_1786298_1786396_1786744_1786889_1789812_1789960_1790138_1790178_1790750_1790865_1791251_1791520_1791730_1791835_1792023
911065	contig_12410_pilon	+	4338	4	Intergenic	novelGene_167267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	777	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3752	4258	103697	105410	FALSE	20	GGACCTCTGCATGAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTSNPSGKQESQRSRKRKNGKKNKKEKKNKRTKAPGFNPRGSPDLEVAAHPNVAPQPRRKGQRRRTEPRTRAKGGGGSERQVRNQEKQKKQHQQPTNGTQRAARPGARNPSNRRPPAKRPWTREAGEPQLGRRGVGGWKAHTAKYRLFCLPLDAP	40682	105490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_+_43519_102781_103749_104227_104301_105028
911066	contig_15084_pilon	+	3953	2	Intergenic	novelGene_116671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1229	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAATGTTGCTGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22687	27275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_25763_26397
911067	contig_9091_pilon	+	270	1	Intergenic	novelGene_32428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAAAAAAAAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23058	23328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_23100_23300
911068	contig_5605_pilon	+	1597	9	Intergenic	novelGene_143941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	17.6192366463477	17	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	536	1198	417967	485358	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMETIESQQDGSVTASVAENESAHMQTQTGPNSIPTLAQVTTITETDESAESEGIIDCHKRREILSRRPSYRKILNELSSDVSGVPKIEEEKSEEEGTPPNIATMAVPTSIYQTSTGQYTTTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAAKECRRRKKEYVKCLESRVAVLEVQNKKLIEELETLKDICSPKTD	390858	485757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391019_398213_398373_405195_405311_406429_406527_417962_418087_450591_450690_450828_450972_472975_473133_485213
911069	contig_4519_pilon	-	4855	2	Intergenic	novelGene_123644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4278	4622	1955	1611	FALSE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKGNKKTPNQKKPWPRWLHWIILQNVHRRACTSSTQAISEHRKGSNTSKFIL	10849	1377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_2153_6769
911070	contig_5588_pilon	-	1569	4	Intergenic	novelGene_172845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	10.1980390271856	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	28	531	1077373	1064415	FALSE	25	TAATACTTCCTCTTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRSGPGGRIMWWIPGSQQSVELLQVDLRLWSPRLWMWQRQELCWQRRVPALPLGTYSLRCMRSGRHRGCQDYLQVSSLEWQRSVWGVSSFLVLTTKLAACCWDLAERPHESEAAQHPRLSKKGTAVRTISLPMSSCPPFEQNTVLKSNSAKITTLRMCPLWYRLAGMKSSACVPES	1077400	1063376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077328
911071	contig_1301_pilon	-	3591	2	Intergenic	novelGene_47265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	418	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTAGAAACCGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253216	202557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_203367_250434
911072	contig_12951_pilon	+	1368	1	Intergenic	novelGene_68134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATATTCTTCACATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102530	103898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_102500_103900
911073	contig_12951_pilon	+	3347	1	Intergenic	novelGene_68228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1384	1728	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795221	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
911074	contig_16846_pilon	+	2824	7	Intergenic	novelGene_82903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	139.478094656075	30	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1310	1690	477366	477746	TRUE	40	GCCATTCCAAACCAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQAPPLKMTPSSLAHCSEAGHISKCWAGAESQTWHWRAGILPKVLEHLKVVNPLSFQKPRLQPSQLQPWMSLIPIKGKIWLELLRGRGVGGGMAPPLVLLLGSGARGCGGREGSITRYDQQIFN	456060	480060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_459575_459612_465232_465311_475327_475478_476253_476387_476830_478280_479459
911075	contig_4232_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_63252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	133	522	366611	367000	NA	20	TGAGTCAATTGTTTACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEELAVGLGREAWHRTPLLGLSPPALARLSRPFTASPTPPHSGFTYLVPARAIPTSTSVHTPCLSGPVFSWALPCAGCSPVILQVQSQHHLSCEAFPGCAAPPQADLNSGTHSPLGDILGEGGLGSI	366478	368527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_366500_368500
911076	contig_11572_pilon	+	1036	6	Intergenic	novelGene_100061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_3	137.180173494569	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	287	724	265181	266522	TRUE	70	GAAGAAAAGAAATTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHICQYYIYDLQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKVKNKAVKDAEKLPTFEVTK	264894	268856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_265322_265592_265721_266166_266308_266494_266591_267008_267160_268763
911077	contig_10867_pilon	+	819	2	Intergenic	novelGene_159460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	211	531	87035	87845	FALSE	30	TTATTAGGTTAAATCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISPKTNPKESPSSTHLALQLNPGTFLFGFLLFLIIFLHTFQEAISALRVLNVLDTHINSLGKNLALNLFVHNNANSMLGNIVDSSSFAMVTLVGHSFLNSACSL	86824	88133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_+_87236_87725
911078	contig_6589_pilon	+	3540	3	Intergenic	novelGene_25798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	259	597	669284	669768	TRUE	5	GGGCCCTGACTTTGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQESILSPAPGEHRSLTLQSPPPSDTEVQIQPHPPSDPRVPSSSPLLPQTRKSPPPAPSSSDPGVLSLSPLLPQTQEFEPPTLPPSDPGVQVSSILLFVATLDKVSYLEH	669025	672844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_669571_669716_671035_671167
911079	contig_18967_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_165315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	298	630	45754	46086	NA	10	CTAGTGCTCGTTTGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHKKTHRQLQPQSPCAADAGQEQASAAPPEPAAHAAAPASTLPCSDGEGAGAAATAGVQEPGAPGGGAQAGPAGDGWRAAAPKEQRADPAKSQKSLPKKMQKSAGKSRGPGGSCEFCGKHFTNSSNLTVHRRSHTGERPYACQLCPYACAQSSKLNRHRRMHGLGPGSTCFQCPHCCIPFGLRATLDKHLRQKHGEGMSEHRAAPVPHS	45456	46140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18967_pilon_+_45500_46100
911080	contig_13300_pilon	-	1782	5	Intergenic	novelGene_125795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	140.061370477373	9	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	240	1355	193605	187660	FALSE	20	CTAGGTGTCAAGCACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAADPRFRLRWKVIVFFFVGAATLWMFYAPRSSSLRPPAPNAHNWRLGPGSADRYNDTYPLSPPQKTPGGTRYRIAVIADLDTESKAQKEHTWFSYLRKGHLTLSDSGDRLVVEWDPGHEVLESHLAEKGRGMELSELIVFNGKLYSVDDRTGVVYQIEGSKAVPWVILSDGDGTVGKGFKAEWLAVKDEHLYVGGLGKEWTTATGEVLNENPEWVKVVGRKGSVDHENWVASYNALRAAAGIQPPGYLIHESACWSEVLQRWFFLPRRASRQRYSEKDDEHRGANLLLSASQDFSDVSVRRVGELVPTHGFSSFKFVPNTDDQIIVALKSEEDRGKIATYIMAFTLDGRFLLPETWIGSVKYEGIEFI	209036	187232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_188031_190605_190810_193064_193684_198975_199106_209005
911081	contig_16091_pilon	+	3916	10	Intergenic	novelGene_112341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_2	253.019103363099	1229	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	313	1194	14294	37985	FALSE	15	TTAGCTTTGTGATGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVEHYSYKPDGLLRVLTVPCQKIGADNGNINFGARPQLSSSHSVTWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKTPSSQGNRPESSTFNPYEPDRGPWPAERGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRSLLTLEDNELGSGNFGTVKKGYYKMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEECNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADESYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVSAMLEKGERMASPPGCPREMYELMTLCWTYEVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN	1462	40707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16091_pilon_+_1548_1933_1984_3659_3729_12750_12836_14270_14449_16002_16213_17702_17893_28337_28479_29164_29278_37912
911082	contig_12046_pilon	+	5155	6	Intergenic	novelGene_83469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	60.2063119614547	266	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	970	2913	228	3140	289900	302879	FALSE	30	CTATAGTTCACACATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNGNNHDALRQEAQEHFSQICSNIPKKAFKTIVPVEQKCNLDIAFESVPNLNDFNQRGNSDVVCNQHCAELYTSQMSTDTEMTVEVEKNSLSPSVPSESQLQPDQSDIPITSFISLSGEINNENLILSGKSSQLLSPNTSLTGKPSKKSQFCESSNDTVRLKTNFQGSKSPDSSEIHQNKIEINNVLPVVSQLSDCHDNSSLQSKLVPVSVENSGLNVSEQQVDICLRDSVTSVKQPLNDSTCVELKHTENETQPSKPEKVALDSQEPSSSIKEDGDTIFLSLGENSNCVEVALMPPEGNPIEDSHPLPSESVCSSMGDSNPEFQNTGDKPRDNSTEIDPSNIVSLKIIISDDSFVSSDTELNSAVSSISGENLPTIILSSAKSSTKNAELVKCLSPEETAGAIVSAEGVGNSASLEQGLIALKPEDSTVNNTQSEEGIITSANVTPCVSKDGGYIQLMPATSTTFGNSNNILIATCVTDPTALGTTVSQSNVVVLPGNSTPITAQPPAPQLQTPPRSNSVFAVNQAVSPNFSQGSAIIIASPVQPVLQGMVGMIPVSVVGQSGNTFSAPPRQVLHMPLAAPVCNRSIPQFPVPAKSQKAQGLRSKPCTGKQVNNLVDSSNQSVGFHTQRTEISDKNTGTDLGRKLDEITVSFSGESMVPTSKPFESHRRVLCFDNTASPVSNTQGPNHKVVSQNKEKNEISFPNLDSPSVSSPLKSPNNAVKKEREKPPVPKILSKSETTISQHTTIRETQPEKKVLPTEIVIESFHKATANKENELCRDMEKQKNPETTKLSNGQQNGNLRNEKTVASLQELTKKQSTSSNSKNVVSVGAAGKDIKQEQTKSSSCLINPLTKHTTEMLQDVQWHSPVNRLADSGELPVPRTPGSGAGEKHKEEPTDGIKVPSSRRFGEDSSTPKVMVPPVTPDLPACSPASETGSENSVSMAAHTLMILSRAAISRTTSSTPLKDNTQQFRSSRSTTKKRKIEELDERERNSRTSNKNLGNSSIPMKKKKIKKRSYPVHFQLEWMWTNFCYHCIMMNKHSEHI	289672	304894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_291278_292838_292955_293026_293136_300454_300516_300621_301774_302782
911083	contig_6100_pilon	-	5963	2	Intergenic	novelGene_168116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	594	junction_1	0	478	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	715	2448	491916	454299	FALSE	35	GATTACCTCAGCAATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPVNATALYISASRLVLNYDPGDPKAFTEINRLLPYFRQSLSCCVCGHLLQDPIAPTNSTCQHYVCKTCKGKKMMMKPSCSWCKDYEQFEENKQLSILVNCYKKLCEYITQTTLARDIIEAVDCSSDILALLNDGSLFCEETEKPSDSSFTLCLTHSPLPSTSEPTTDPQASLSPISESTLSIAIGSSVINGLPTYNGLSIDRFGINIPSPEHSNTIDVCNTVDIKTEDLSESLQPVCDTVATDLCSTGIDICSFSEDIKPGDSLLLSVEEVLRSLETVSNTEVCCPNLQPNLEATVSNGPFLQLSSQSLSHNVFMSTSPALHGLSCTAATPKVAKLNRKRSRSESDSEKVQPLPISTIIRGPTLGASAPVTVKRESKISLQPIATVPNGGTTPKISKTVLLSTKSMKKSHEHGSKKSHSKTKPGILKKDKAVKEKIPSHHFVPGCPTKTVYKKPQEKKGCKCGRATQNPSVLTCRGQRCPCYSNRKACLDCICRGCQNSYMANGEKKLEAFAVPEKALEQTRLTLGINVTSIAVRNASTSTSVINVTGSPVTTFLAASTHDDKSLDEAIDMRFDC	492630	450783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_-_455891_491774
911084	contig_3956_pilon	+	2292	11	Intergenic	novelGene_14896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1096.98694613929	6	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	793	1773	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284717_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
911085	contig_211_pilon	+	3283	11	Intergenic	novelGene_129881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	35.2591832009762	155	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	640	1923	1188	3110	293674	344432	FALSE	20	AGAATGGTGCCTTCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNPVHGLPFLPGMSFRDPTKTAFHRSQTLGYRNGYAVVRRPTVGIGGDRLQINQLSQAELDELASKRPVLTYGQPKQAPPANFIPAHVAFDKKVLKFDAYFQEDVPMSTEEHYRIRQVSIYYYLEDDSMSVVEPVVENSGIPQGKLIKRQRLTKNDRGDHYHWKDLNRGINITIYGKTFHVVDCDRFTQAFLESQGIELNPPEKMALDPYTELRKQPLRKYVTPSDFDQLKQFRTFDKQVLRFYAIWDDTDSMFGECRTYIIHYYLMDDTVEIREVHERNDGRDPFPLLMNRQHMPKVLVENAKNFPQCVLEISDQEVLEWYTAKDFIVGKPLTILGRTFFIYDCDPFTRQYYREKFGITDLPRIDVSKKEPPPVKQELPPYNGYGQVEDSAQNCFALIPKAPKKDVVKMLVNDNKVLRYLAALESPIQEDKDRRFVFSYFLATDMISIFEPPVRNSGIIGGKYLGRTRVVKPNSFVDNPVYYGPGDFFIGAVIDVFGHRFVILDVDEYVLKYMESNAAEYSPEALSSIQNHVRKQEAPAPELENKQTEEDPGTKELEALIDTIQKQLKDYSCKDNIREAFQVYDKEASGYVDREKFFKICESFNIPIDDSLVEELIRICSHEEGKINYYNFVRAFSN	292486	344605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_293737_297449_297672_306139_306428_311214_311365_312507_312701_315809_316031_323598_323740_332966_333181_333582_333731_342555_342767_344360
911086	contig_13800_pilon	-	2080	14	Intergenic	novelGene_153700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGAGGGGCCTGGGGCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162902	94189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_94286_95566_95665_109043_109069_114286_114435_125047_125209_125886_126029_127747_127805_131979_132053_139616_139768_140991_141077_142265_142360_154784_154913_159543_159682_162218
911087	contig_19816_pilon	-	2795	7	Intergenic	novelGene_156468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	342.223448771251	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	133	642	126303	125483	TRUE	75	ATTTAAAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	126435	116815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_122287_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_125854_126164
911088	contig_11309_pilon	-	2601	7	Intergenic	novelGene_149857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4230	junction_6	1053.49545165922	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	132	875	64259	56293	FALSE	25	CTTCACGAATTTCACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	64481	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427
911089	contig_4091_pilon	+	3892	2	Intergenic	novelGene_172984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2477	2914	13212	13649	FALSE	25	CACTCCATCCAACCGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	10669	14627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12273_12338
911090	contig_12993_pilon	-	6750	1	Intergenic	novelGene_136737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	444	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTCTAGTTTATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126842	120092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_120100_126800
911091	contig_5003_pilon	+	4389	5	Intergenic	novelGene_120215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	27.9910700045568	44	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1051	1443	150707	155300	FALSE	20	GCTGCAGTGAACATGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICPSSFLWRKNTVLLLVDLFRFTKDTARFKDELDIMKFVCKDFWTTVFKKQIDNLRTNHQGIYVLQDNKFRLLTQISAGKQYLEHASKYLAFTCGLIRGGLSNLGIKSIVTAEVSSMPACKFQVMIQKL	143306	158246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_143640_149989_150890_152308_152393_154237_154332_155268
911092	contig_18364_pilon	+	3373	1	Intergenic	novelGene_102578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCCAGCCAATGGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156181	159554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_156200_159600
911094	contig_10756_pilon	+	2482	10	Intergenic	novelGene_170655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	67	junction_9	79.9816336942117	190	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	33	1943	12349	89466	TRUE	60	AAGAAAAATCAGATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLDKHKNTESMVELLELYQREDEAYSSLAEATTELYQYLLQPFRDMRELAMLRRQQIKISMENDYLGPRRIESLQKEDADWQRKAHMAVLSIQDLTVKYFEITAKAQKAVYDRMRADQKKFGKASWAAAAERMEKLQYAVSKETLQLMRAKEICLEQRKHALKEEMQSLQGGTEAIARLDQLEADYYDLQLQLYEVQFEILKCEELLLTSQLESIKRLVSEKRDEVVYYDTYESMEAMLEKEEMAASVHLQREELQKLQQKARQLEARRGRVSAKKAYLRNKKEICIAKHDEKFQQRLRSEDEYRTHHTVQLKREKLHDEEERKSAWVSQERQKTLDRLRTFKQRYPGQVILKSTRLRLAHARRKSTASPVPCEDQCDSLPGALQVEEKTEEVEEGRGNLGSSQTTEPQSLAQLEDTSLAQLEATSLPLSGITSELPPTVSLPLFTNNDLEPCSLTIDPLPPPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSAPETLEKGLPRMEGNENRIPKSASIPSAHLFDSSQLVSARKKLKKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKRGSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKEVLRESFTLLPDTDPLTRSIHEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN	12316	93518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_12493_51671_51823_57254_57425_68698_68865_69529_69718_74475_74563_82043_82140_87557_88159_89158_89470_92982
911095	contig_6344_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_157123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAATAACAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1209678	1207440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_1207400_1209700
911096	contig_6930_pilon	+	4680	3	Intergenic	novelGene_178893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	53	496	1032173	1032616	TRUE	25	TGTGATTTTGATACTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQETDRKQRPRRDTCRGPHQLSRMDPPSWAPIRDQQTGVQESTFTELPAGDRTTGNQQYMLSHPVPFFTPTQPPLLPADTVCWPGSTGFTLVPLGFHTPTLAGSLSAICWLLVLLFSASLDFFLTSHHLPLLSIKYLAPCAIFASS	1032120	1040279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6930_pilon_+_1035528_1038874_1039883_1040014
911097	contig_3866_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_112394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAATAATAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167119	164930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_164900_167100
911098	contig_3170_pilon	-	2428	3	Intergenic	novelGene_178863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2931	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3170_pilon_-_538_752_1538_1824
911099	contig_5684_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_81000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCAGAGATCACCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297601	296630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_296600_297600
911100	SIRV6	+	709	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	341	533	168	10	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATAGTGCAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471	10798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
911101	contig_8354_pilon	+	545	1	Intergenic	novelGene_24158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTACCTCGTTAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561229	561774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_561200_561800
911102	scaffold_15568_pilon	+	2152	4	Intergenic	novelGene_122576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	16.9771087709958	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTAGTGGCCACGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57824	83212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_57935_77519_77787_77969_78026_81493
911103	contig_15500_pilon	+	4078	1	Intergenic	novelGene_128992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	258	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGAGTATCTTACCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237299	241377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_237300_241400
911104	contig_7356_pilon	+	2116	7	Intergenic	novelGene_60365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGCCACAAGCTCCGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339739	457920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_340863_342323_342832_343907_343999_433991_434072_435515_435620_437471_437532_457770
911105	contig_11304_pilon	+	2024	5	Intergenic	novelGene_156729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_3	128.464732514414	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	390	1322	489742	503955	FALSE	85	TAGAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILDSPSKTMSIKERLALLKKSGEEDWRNRLNKKQEYGKASAASSLHIQEPEQSFKKKVILSMLGKGLTDITRGRASNRQACVT	485675	504657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_485743_488982_489227_489663_490241_491075_491299_503744
911106	contig_13216_pilon	-	2906	2	Intergenic	novelGene_47499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248375	243459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_-_243950_245959
911107	contig_16411_pilon	+	4036	7	Intergenic	novelGene_77302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1464	junction_5	940.182901827559	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1930	2802	99661	124701	FALSE	20	TCCTCCACAGTCCACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTHVTLEDALSNVDLLEELPLPDQQPCIEPPPSSIMYQANFDTNFEDRNAFVTGIARYIEQATVHSSMNEMLEEGHEYAVMLYTWRSCSRAIPQVKCNEQPNRVEIYEKTVEVLEPEVTKLMKFMYFQRKAIERFCSEVKRLCHAERRKDFVSEAYLLTLGKFINMFAVLDELKNMKCSVKNDHSAYKRAAQFLRKMADPQSIQESQNLSMFLANHNRITQCLHQQLEVIPGYEELLADIVNICVDYYENKMYLTPSEKHMLLKVNLPAFTHHRASGVSVCTLPFSYLK	97731	125935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_99778_101239_101330_111959_112038_113690_113793_120329_120512_122766_122864_124494
911108	contig_3095_pilon	-	1498	5	Intergenic	novelGene_75190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	527	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGCTGCCGTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227854	220507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_220585_225456_225710_226125_226396_226778_226828_227005
911109	contig_17144_pilon	-	1984	12	Intergenic	novelGene_29533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1790.5046936133	6	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	105	1709	173384	166363	FALSE	25	TTTTTTTCTTTCTTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183207	166087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173385_181794_181850_183158
911110	contig_6375_pilon	+	1575	2	Intergenic	novelGene_73058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAATAAGAAAAGAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661021	662690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_662539_662632
911111	contig_10003_pilon	-	3015	1	Intergenic	novelGene_88173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCCAGTCCTGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421506	418491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_418500_421500
911112	contig_7457_pilon	-	1800	9	Intergenic	novelGene_31414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.238104082643	319	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	35	769	473193	469327	TRUE	25	TTAGCATTGCTCCAAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPGLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473227	468237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469011_469068_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473151
911113	contig_5799_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_50269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAGTGTGAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255395	253616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_253600_255400
911114	contig_2403_pilon	+	4906	1	Intergenic	novelGene_71008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141579	146485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_141600_146500
911115	contig_9177_pilon	+	1852	6	Intergenic	novelGene_32674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	735.495044170931	1126	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	36	500	395377	415476	TRUE	25	TGTAATATCTTCCTCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSRSRGASGPAMGNSASKQFNNEVLKAHNEYRQKHGVPPLKLSKKLNQEAQQYSEALASTRILKHSPESSRGQCGENLAWASYDQPGKEVVDRWYSEIKNYNFQQPGFTSGTGHFTAMVWKNTKKMGVGKASASDGSSFVVARYFPAGNVVNQGFFEENVLPPKK	395341	416878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_395390_405443_405553_405912_406017_407998_408077_415315_416324_416373
911116	contig_11248_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_142563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAATCCTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398476	396697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_396700_398500
911117	contig_9633_pilon	-	1977	4	Intergenic	novelGene_139630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	84.243034660967	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	81	1220	1046629	1042142	FALSE	25	TCCCTGCAATACAGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHDGEFKLLQAEEVARLWGVRKNKPNMNYDKLSRALRYYYVKNIIKKVNGQKFVYKFVSYPEILNMDPMTVGRIEGDCETLSFSEVSSSSKDVENGGKEKPPQPGAKTSSRNDYIHSGLYSSFTLNSLNSSNMKLFKSIKIENPAEKLAEKKSPQEPTPSVIKFVTTPSKKPPLEPVAATISTGPSISPSSEETIQALETLVSQKLPSLEAPASAPSITSAFTTTPPVSSLSPALQEPPRTPSPPLSSNPDIDTDIDSVASQSVELPENLSLEPKDQDSTLPEKDKTNNSSRSKKPKGLELAPTLVITGSDPSPLGILSPSLPTASLTPALFSQTPILLTPSPLLSSIHFWSTLSPVAPLSPARLQGANTLFQFPSVLNSHGPFTLSSLDGPSTPGPFSPDLQKT	1046709	1041384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1042241_1043611_1043729_1044539_1045416_1046581
911118	contig_5794_pilon	+	6702	10	Intergenic	novelGene_69730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1121	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGAATCTGGTTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375741	470451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_381756_408438_408499_410395_410492_418352_418443_422476_422522_433574_433600_440236_440295_454592_454716_465514_465628_470373
911119	contig_5023_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_7377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTAAACCCCAGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634003	635812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_634000_635800
911120	contig_5569_pilon	-	5019	2	Intergenic	novelGene_86713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	54	713	52329	51670	TRUE	30	TTCCTTAATCAATATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLPDVVLEDEPPMLEGPQKMTGKELPPQSRVYLNDVDGVKLSGPSFADVTRLRMRRNSCKHPLIIGTWNVRSMNLGKLEIVKNEMECINIDILGISELKWTGIGHSESDNHMVYYVGNDNLKRNGIAFIIKKNISRSILKYNTVNDRIISTCLQGKPVNTTIIQIYVPTSKAKHEEIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALIITGDWNAKGRNKKKDW	52382	16345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_20564_51581
911121	contig_12654_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_129263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTTGGAAGGTCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85175	87304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_85200_87300
911122	contig_12427_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_40575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	220	522	539681	539379	NA	35	AAGGACCTTGGTTCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTNRDLFSHRLGGWKSKFRVPVPGEVFHSLSALGEGRGHQSFRSLGASHHRDPDPKDACSWLFLLGGNEVPLSLCLLLSFFFLLLSFISQKRLTEDAT	539900	537609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_537600_539900
911123	contig_7963_pilon	+	3632	1	Intergenic	novelGene_58462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	322	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1216	1539	119870	120193	NA	30	AAAATTAGTGTTGATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLFILLLMCAFVLHWQSSCDKELLACKVYLLLDHLQKKSANPWFSEKSTKSWRRQLPLDRLQKQLSSSLLPTLLELTWYHFHQKAQSQEVLVQHHCYSHLLSWTS	118654	122286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118700_122300
911124	contig_20739_pilon	+	1074	2	Intergenic	novelGene_83186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	642	941	162514	162969	FALSE	45	ATTAGAAAATCAATCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKEKQERAQITQIRNEMGDITTRAEVEKVIKKTPNQKKPWPSGFTGGFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASINADTKTRQRRHKKRKL	161872	163102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_+_162582_162737
911125	contig_18272_pilon	+	2891	1	Intergenic	novelGene_7022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2328	2651	201640	201963	NA	30	AGCATTGCAATCACTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTSRPISNIMINGENIEVVKDFILLGSTMNTHGSNSQEIKRRISLGKSAAKYLFKVLKSKDIILRTKVYLIQAMVFSTASYACESW	199312	202203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_199300_202200
911127	contig_14326_pilon	-	3528	1	Intergenic	novelGene_120683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	1827	2312	120980	120495	NA	5	TTCCCCTTCCTCCAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSDSVVRAYSWCLQPITALGDFSCPAVGHSTVSDWGDSSCSGLCNNLKKPVFPEGGLQCLRQPRRRKLEAGHRAICTWSLWPAWLLVLAWEQSGIESMQALNSAKDHEAVANGWSFPLAGKDGRAPGFLLGEEGWWQVGLEGLSLAGSLSWLSKPQGSDG	122806	119278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_119300_122800
911129	contig_6102_pilon	+	2160	17	Intergenic	novelGene_32355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	91.2536814325866	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	86	2083	1699217	1714849	FALSE	10	GCTGAGACCCTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATENNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1699131	1714926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703479_1711402_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
911130	contig_9731_pilon	+	1553	1	Intergenic	novelGene_154390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATACACTTGTCAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49086	50639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_+_49100_50600
911131	contig_12299_pilon	-	5258	6	Intergenic	novelGene_29719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_2	48.0441463656084	1821	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	231	1142	88403	30043	FALSE	20	GGCCATTGTGGGAGATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHGRIAPKSTSAFAVASVGHGVLLPLVILSTLLGDGLASVCPRPPEPENGGYICHPRPCRDPLTAGSVIEYLCAEGYMLKGDYKYLTCKNGEWKPAMEISCHLNEEKDAHTSLGAPTLSIVASTASSVALILLLVVLFVLLQPKLKSFHHSRRDQGVSGDQVSIMVDGVQVALPSYEEAVYGSSGHCVPPADSRVQIVLSEGSEPSGRSVPREQQLQDQGACSSAGGEDEAPGHSGLCEAWGSRGSETVMVHQATTSSWVAGSGNSRPTHKEAPDSESSDIQSLLSLTSEEYTDDIPLLKEA	138781	25926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_30069_32922_33351_43082_43222_44256_44455_88282_88486_138633
911132	contig_6418_pilon	-	3218	1	Intergenic	novelGene_81141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1693	2115	205586	205164	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSLRVMVGFDSSTSEIQIQNNCYIFSYYRERGNSLGKFCMSYRSKRYLHLVFYNKKIWKMADIYIYITYMYMQVTEIFTCYNVSLLSCKDMIQQNLIKQLYTMLYYGSNYVPRNAIATVNLNLLLIVPDTGLHSNPKH	207278	204060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_204100_207300
911133	contig_5236_pilon	-	2273	1	Intergenic	novelGene_100937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952865	950592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_950600_952900
911134	contig_2646_pilon	-	3277	4	Intergenic	novelGene_69570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6.34209919681348	96	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAACTACCATCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125157	1106976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1108971_1112373_1113454_1121746_1121875_1125082
911135	contig_13740_pilon	-	1700	11	Intergenic	novelGene_34686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3987.53262181013	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	289	1182	161944	157474	TRUE	40	AAATTGTGTAATTATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTYRLCGSVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165439	156802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161678_161915_162031_165237
911136	contig_12746_pilon	+	4768	1	Intergenic	novelGene_152200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2484	2873	691827	692216	NA	25	ACTATCTAATCTTGTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSTHQEDITVINIYAPDGRAPKYIKQTLTALKREIDSSTVIVGDFNTPLLVKDRTAQKKLSKDRGSKCHNQPTQPHRYIQKTPPNSSKVYILFQCSWNILPNRPHFRPQRNPQQNSKRQNNTKHFL	689343	694111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_689300_694100
911137	contig_3018_pilon	-	3520	1	Intergenic	novelGene_78820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	885	1475	545677	545087	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLGPFRNSNLTEMGLQEIKTIGYTSPRSRTEVSRQCPGEKEPVTDLQLGLDAIEQTALHKTMETPTHDRTESTSQLESTHSGRATLYSSWVKSPDRTGVNFSVNSNLRDLTPSHQLEVGGGFRVSESKCLMQDDTRGIFMETAVFCTSEDGLVSGFGRTVNDNLIDGSCTPQNPPQKKKVTNLTIYTLLNSVFL	546561	543041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_543000_546600
911138	contig_16951_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_98613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTATGAAGAGGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12028	13811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_12000_13800
911139	contig_7333_pilon	-	5167	38	Intergenic	novelGene_142743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_17	52.4370853326962	1	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1372	4119	117	4235	124210	41089	FALSE	85	TGAGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYKKLFTMEFVKYYKQLQKEYISDDHDRSISVTALSVQMFTVPTLARHLIEEQNVISVITETLLEVLPEYLDRNNKFNFQGYSQDKLGRVYAVICDLKYVLISKPTAWTERLRVQFLEGFRSFLRILTCMQGMEEIRRQVGQHIEVDPDWEAAIAIQMQLKNILLMFQEWCACDEELLLVAYKECHKAVMRCSTNFLSGSKTVVQLCGHTLATKSYRVSEDLVSIHLPLSRTLAGLHVRLSRLGAVSRLHEFVPFEDFQVEVLVEYPLRCLVLVAQVVAEMWRRNGLSLISQVFYYQDVKCREEMYDKDIIMLQIGASLMDPNMFLLLVLQRYELVDAFNKSISTKDQDLIKQYNTLIEEMLQVLIYIVGERYVPGVGNVTKEEVTMREIIHLLCIEPMPHSAIAKNLPENENNETGLENVINKVATFKKPGVSGHGVYELKDESLKDFNMYFYHYSKTQHSKAEHMQKKRRKQENKDEALPPPPPPEFCPAFSKVVNLLNCDIMVYILRTIFERAVDTDSNLWTEGMLQMAFHILALGLLEEQQQLQKAPEEEVTFDFYHKASRLGSSAMNAQNVQMLLEKLKGIPQLEGQKDMITWILQMFDTVKRLREKSCLIVATTSGSESIKSDEITHDKEKAERKRKAEAARLHRQKIMAQMSALQKNFIETHKLMYDNTSEMPGKEDSIMEEESTPAVSDNCRIALGPKRGPSVTEKEVLTCILCQEEQEVKIENNAMVLSACVQKSTALTQHRGKPIELSGETLDPLFMDPDLAYGTYTGSCGHVMHAVCWQKYFEAVQLSSQQRIHVDLFDLENGEYLCPLCKSLCNTVIPIIPLQPQKINSENAEAVAQLLTLARWIQTVLARISGYNMKHAKGENPAIPILFNQGMGDSTFEFHSILSFGVQSSIKYSNSIKEMVILFATTIYRIGLKVPPDETDPRIPMMTWSTCAFTLQAIENLLGDEGKPLFGALQNRQHNGLKALMQFAVAQRITCPQVLIQKHLVRLLSVVLPNLKSEDTPCLLSIDLFHVLVGAVLAFPSLYWDDTVDLQPSSISSSYNHLYLFHLITMAHMLQILLTIDTGLPLAQVQEDSEEARSAASFFEEVSRLTSGCIGCGIPGWCLWVSLKNGITPYLRCAALFFHYLLGVTPPEELFANSAEGEYNALCSYLSLPTNLFLLFQEYWETVRPLLQRWCSDPALLNCLKQKSSVVRYPRKRNSLIELPDDYSCLLNQASHFRCPRSADDERKHPVLCLFCGAILCSQNACCQEMVNGEEVGACIFHALHCGAGVCIFLKIRECRVVLVEGKARGCAYPAPYLDEYGETDPGLKRGNPLHLSHERYRKLHLVWQQHCIIEEIARSQETNQMLFGFNWQLL	124326	40156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_41231_42221_42324_43178_43350_48483_48562_50657_50715_51142_51252_52507_52642_53508_53597_55282_55434_56481_56550_60048_60146_62498_62555_65943_66093_67174_67269_69865_69964_74058_74209_75170_75265_76684_76891_80004_80187_82208_82296_86400_86511_87642_87743_89314_89470_89856_89906_91540_91644_92739_92793_94694_94820_100047_100112_101606_101709_101975_102042_103024_103136_108095_108158_109748_109930_113624_113754_116956_117057_121505_121664_122522_122622_124171
911140	contig_9177_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_32716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAATGAAAAAAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595510	594690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_594700_595500
911141	contig_3151_pilon	+	3266	25	Intergenic	novelGene_139179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	154.450279665946	106	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1007	3024	176	3199	42223	196877	FALSE	65	AAAAAAAAAATTGACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMTVGIFANCTFCLKVKYLPRQQKKKLQTDIKENGGNFSFSLHPQCTHIILDNADVLSQYQMKSIQEKHIHIVNPDFIWNSVKERRLLDVKNYNLNNSLEISLPPGQKESSSDVETDDPSLVNSTEKENIVEFAKFYTDNVEIPHFSQEFEVAKYDTLEKIETEGRKEIVVVEMQCFQEHWDCPFLITACFLLADGIETRRQFSGKKTSADASEYYENYIEELKKQGFLLRENFTPEATQLASEKLQALLLEEVINSDTLSQEVSDLVEMIWAETLGHLEHTLLKPVNKISLNDVSKAEGILLLVKAALKNGETAEQLQKMLTEFYRVIPHKGPTTEEVNLRLLSKKEDLCQLIRDMVNVCESNLYKPNPPSLAKYRALRCKIEHVEQNTEEFFSVMKEVLQNNHSRSPVNILQIYRVGRVNEATEFLSKLGNVKSLLHGSPARNIVGILSRGLLLPKVVEDHGVKRTDVGNLGSGIYFSDSLRTSIKYSHPGEIDGTRLLVICNVALGKCMDLYKKDFSLTEAPPGYDSVHGVSQTATVITDFEDDEFVVYKTDQIKMNYIIKFCIPGDQIKDFHPCGNTELEEYVPEFSSFPKAEDYQLPDTKPFSNIKAGLQDTSGNLVPLEDVHIKGRVIDVVAQVIVFQTYTNQSHVPIEAKYIFPLDDKAAVCGFEAFINGKHIVGEVKEKEEAHQEYQEAISQGHGAYLMDQDAPEVFTVSVGNLPPKAKVLIKITYVTELGVQGTAAVFFMPATVAPWQQDKALNENVQDTVEKICIKEIGTKQSFSLSMYIEMPYVIEFISSDTHKLKQKHTDCKAVISTVEGSSLDSNGFSLHIGLSDAYLPRMWVEKYPDKESEACMLVFQPDFNITLPETAKRSEVIICLDCSNSMKGEAFLQAKKIALYALSLVDKNQKINIVKFGTSYKELFSYPKYITSNEMPTEFIMAASPTMGNTDFWKTLRYLNLLYPSQGLRNILLISDGHIQNESLTFQLVKRNVQHTRLFTCGTG	39967	196944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_40028_42107_42228_95053_95187_97004_97207_102805_102873_103776_103853_104592_104707_107291_107442_120607_120746_122029_122204_125852_126014_127305_127444_135600_135697_140405_140590_140797_140955_142599_142725_147563_147696_148475_148563_166908_167074_168118_168166_168311_168391_178459_178598_194676_194873_195999_196068_196685
911142	contig_5598_pilon	-	2515	2	Intergenic	novelGene_148300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	367	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	84	650	878668	877953	FALSE	30	CCTTTCAGAAACAGATCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISIIYKKTQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLDIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCCRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDRAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYMHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLQDIMLSGILGEG	878751	876087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5598_pilon_-_877976_878124
911143	contig_12327_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_140677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGATGAAATACTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133893	1131123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1131100_1133900
911144	contig_7009_pilon	+	2704	2	Intergenic	novelGene_23662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1228	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1146	1697	512536	518263	FALSE	75	GAAAAAGAAAAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYQTCRAPGGTTFSLRSPLVPVLECCSHTPLPLLLAGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	511390	519270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_512816_517991
911145	contig_8268_pilon	-	1578	2	Intergenic	novelGene_147008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301177	294083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_-_294420_299935
911146	contig_12090_pilon	+	2058	2	Intergenic	novelGene_80510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAATAGAATCAACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299416	305663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_300153_304341
911147	contig_401_pilon	+	1752	10	Intergenic	novelGene_42829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1119.04444466509	1495	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	56	1018	1711949	1715475	TRUE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711893	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
911148	contig_9272_pilon	-	2847	1	Intergenic	novelGene_125974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCCTAACACATAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649857	647010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_647000_649900
911149	contig_5434_pilon	-	3231	8	Intergenic	novelGene_74660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	130.889110256253	14	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAGATAATCAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282113	259182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_259529_262817_262893_273748_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279199_279253_281928
911150	scaffold_13505_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_111648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	644	1102	812996	812538	NA	30	TGACTTGAATTGTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPARLALIQKTQNNKCWRVCGETGTLTHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDSAISLLGIYPREIRAVTRIDTCTPMFIAALFTIAKRWKQPKCPSMDKWINKLWYIHTMEYYAMIKNNNESTKHNKDESGRHYAE	813639	811541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_811500_813600
911151	contig_6098_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_145462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	937	1260	21828	21505	NA	40	TTACATTGGTCAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNQLNSKKFNVCTVKISFVYRESGLVYNVSTASSLLSFKLPIKYSIHILLSVRKYSFWILKYWVLINFRLTHQQVPISVYGGFTFWKMEEILILYSRNCCVSFVF	22764	20334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_-_20300_22800
911152	contig_8045_pilon	-	1544	2	Intergenic	novelGene_35407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAAGGCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119773	118061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_118760_118927
911153	contig_8284_pilon	+	2717	2	Intergenic	novelGene_125723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTAAAGGAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453338	456139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_453656_453739
911154	contig_4315_pilon	+	3752	13	Intergenic	novelGene_46764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_12	302.505647330206	609	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	118	1923	265874	293317	FALSE	20	CGACTATACTCTGTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKGSSTDGKTDLANGSLSSSPEEMSGAEEGRETSSGIEVEASDLSSSLTGDDGGPTRTSTESRGTDTESSGEDKDSDSMEDTSRYSINDENRVHDHSEEEEEEEEEEEEEEEEEQPRRRVQRKRANREQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELGSSARFVYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVLDFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKLALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEKKVGLYTIYVNPANTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENENNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLVYSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGSDCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTELTGLKDVIKKNKRERDEDSLHHTDLFDSHMLWFLMHHLRQRRHHRRWREPGVGATDADSDESPSSSDTSDEEEGPDRVQCMPS	255226	295146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_255321_265850_265923_268802_269489_270465_270607_271713_271809_277695_277807_285725_285799_286277_286336_286848_286957_288344_288476_291955_292076_292480_292598_293200
911155	contig_14621_pilon	-	2354	18	Intergenic	novelGene_105864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	149.038858405715	13	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	793	2073	431670	396356	FALSE	45	AATAATAATATTTCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEPSIKEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALWIRIGANVSNFTFAPSTIIFHLGHAAMLGLMYVYWTQLNMFQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRIAAEQSSRLAKYRTLRTAH	461825	396074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_400410_400459_401994_402125_403705_403782_405151_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431643_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_461683
911156	contig_11316_pilon	+	1752	2	Intergenic	novelGene_122603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	705	1217	137674	138186	TRUE	45	CAACACCCACGATCATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136969	138846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138277_138401
911157	contig_13481_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_119567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1012	1398	1585992	1585606	NA	70	GACAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDFENTNKLNKQPIIYDFIFKQPMIREPRNISFCYTQGSYELEPTPTTSYDNKRSKGFPISDGKVHQSQLNKSSFKESYIAYRFRSEFKPQGYFQSVFNKKSLYTLTLLRGKIKFCTITRFRYFSGI	1587003	1584761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1584800_1587000
911158	contig_8558_pilon	-	2152	1	Intergenic	novelGene_123164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCACTTATCTATTGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539370	537218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_537200_539400
911159	contig_19848_pilon	+	6300	13	Intergenic	novelGene_173813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_10	113.158781021281	345	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	302	2059	26316	89680	FALSE	15	TTTATAGTGTACCTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVELEWIPETLYNTAISAVVDNYTRSRRDIRSLPENIQFDVYYKLYQQGRLCQLGSEFCELEVFAKVLRALDKRHLLHHCFQALMDHGVKVASVLAYSFSRRCSYIAESDAAVKEKAIQVGFVLGGFLSDAGWYSDAEKVFLSCYQLCTIHDEMLHWFRAVECCVRLLHVRNGNCKYHLGEETFKLAQTFMDKLSKHGQQANKAALYGELCALLFAKSHYDEAYKWCIEAMKEITAGLPVKVVVDVLRQASKACVVKREFKKAEQLIKHAVYLARDHFGSKHPKYSDTLLDYGFYLLNVDNICQSVAIYQAALDIRQSVFGGKNIHVATAHEDLAYSSYVHQYSSGKFDNALFHAERAIGIITHILPEDHLLLASSKRVKALILEEIAIDCHNKETEQRLLQEAHDLHLSSLQLAKKAFGEFNVQTAKHYGNLGRLYQSMRKFKEAEEMHIKAIQIKEQLLGQEDYEVALSVGHLASLYNYDMNQYENAEKLYLRSIAIGKKLFGEGYSGLEYDYRGLIKLYNSIGNYEKVFEYHNVLSNWNRLRDRQYSVTDALEDVNTSPQSTEEVVQSFLISQNVEGPSC	26014	93921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_+_26454_48012_48102_53482_53635_57284_57409_70070_70240_76041_76132_77585_77654_77748_77855_78536_78662_81372_81459_83237_83429_84304_84471_89426
911160	contig_6496_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_103503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTATTTTCCCAGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604296	603263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_603300_604300
911161	contig_12969_pilon	-	4232	7	Intergenic	novelGene_61682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	37.1995370341562	188	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	762	2432	458145	456475	TRUE	35	ATAATCATTGCTATGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKYTEQHHEHNALGNIVHHSAVHFPFRQNHNMFELHLKTLKLNLSSANQNKSCEIKNSAQFNGGRKSFLHGNHEKFHSEIKFPVSTKLISTKSQVIKHQRLYKIEKAHICSECGKAFMKKSQLTDHQRVHTGEKPYGCSMCGKAFSRKSRLNEHQRIHKREKSYICSDCGKVFTIKSRLIEHQRTHTGEKPYVCSECGKGFPGKRNLIIHQRTHTGEKCYVCSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNDCGKGFTMKSRLNEHQRMHTGEKPYVCNECGKGFPRKSNLIIHQRNHGVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYMCSDCGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICKECGKGFAFKSNLSVHQRTHTGEKPFKCGQCGKGFTMKRYLIIHQQTHTAEKNHICSECGKGFTTKSELIDHQQIHTGEKPYECKECGKGFTVKSRLIVHQRTHTGEKPFICSSCGKAFSSKRNLLVHQQTHNGGKP	474244	454004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_454697_455366_458196_460650_460773_462053_462150_462425_462553_470217_470372_474032
911162	contig_14556_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_138530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGTAGTATTTTATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162244	164644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_162200_164600
911163	contig_19730_pilon	-	3971	29	Intergenic	novelGene_142484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_6	283.415076993704	157	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1302	3906	65	3970	175963	108943	FALSE	30	CGAAAGATGTACTGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSDNLREILQNVAKLQGVSNMRKLGHLNNFTKLLCDIGHSEEKLGFNYEDIIICLRLALLNEAKEVRAAGLRALRYLIQDSIILQKVLKLKVDYLIARCIDIQQSNEVERTQALRLVRKMITVNASLFPSSVANSLIAVGNDGLQERDRMVRACIAIICELALQNPEVVALRGGLNTILKNVIDCQLSRINEALITTILHLLNHPKTRQYVRADVELERILAPYTDFHYRHSPDTAEGQLKEDREARFLASKMGIIATFRSWAGIINLCKPGNSGIQSLIGVLCIPNMEIRRGLLEVLYDIFRLPLPVVTEEFIEALLSVDPGRFQDSWRLSDGFVAAEAKTILPHRARSRPDLMDNYLALILSAFIRNGLLEGLVEVITNSDDRISVRATILLGELLHMANTILPHSHSHHLHCLPTLMNMAASFDIPKEKRLRASAALNCLKRFHEMKKRGPKPYSLHLDHIIQKAIATHQKRDQYLRVQKDIFFLKDTEEALLMNLRDSQVLQHKENLEWNWNLIGAILKWPNVNLRNYKDEQLHRFVRRLLYFYKPSSKLFANLDLDFAKSKQLTVVGCQFTEFLLESEEDGQGYLEDLVKDIVQWLNASSGMKPERSLQNNGLLTTLSQHYFLFIGTLSCHPHGVKMLEKCNVFQCLLNLCSLKNQDHLLKLTVSSLDYSRDGLARVILSKILTAATDACRLYATKHLRVLLRANVEFFSNWGIELLVTQLHDKNKTISSEALDILDEACEDKANLHALIQMKPALSHLGDKGLLLLLRFLSIPKGFSYLNERGYVAKQLEKWHKEYNLKYVDLIEEQLNEALTTYRKPVDGDNYVRRSNQRLQRPHVYLPVHLYGQLVHHKTGCHLLEVQNIITELCHNVRTPDLDKWEEIKKLKASLWALGNIGSSNWGLNLLQEENVIPDILKLAKQCEVLSIRGTCVYVLGLIAKTKQGCDILKCHNWDAVRHSRKHLWPVVPDDVEQLCNELSSIPSTLSLNSESTSSRHNSESESAPLSMFMMEDDRFGSSSTSTFFLDINEDAEPAFYDRSGPIKDKNSFPFFNSSKLVKNRILNSLTLPSKKHRSSSDPKGGKLSSENKTSSRRVRTLTEPSNVNFNHSDDFTSISTVQKTLQLETSFIGNKHIEDTGSTPSIGENDLKFTKSLGTENHRENTSRERLVVESSTNSHMKIRSQSFNTDTTTSGISSMSSSPSRETVGIDATTMDTDCGSMSTVVSTKTVKTSHYLTPQSNHLSLSKSNSVSLVPPGSSHTLPRRAQSLKAPSIATIKSLADCNFSYTSSRDAFGYATLKRLQQQRMHPSLSHSEALASP	176027	108941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_109881_113816_114047_114603_114711_115099_115193_117651_117740_118144_118255_124596_124676_125123_125201_125369_125535_126907_127035_127352_127553_127965_128102_129434_129482_129577_129680_129957_130124_132679_132781_134663_134745_134879_134947_135060_135152_135686_135775_137002_137086_142773_142842_146275_146344_152133_152304_155552_155680_159325_159390_163461_163594_164440_164506_175927
911164	contig_15882_pilon	-	3802	1	Intergenic	novelGene_144808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGCAAGACATTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59957	56155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_-_56200_60000
911165	contig_5083_pilon	+	1437	8	Intergenic	novelGene_151682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	137.891705511897	5	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	175	672	653331	668840	TRUE	65	AAAAGACTGATTAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFPPHMVPPHHTLHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNDRCKYSKEVSGTVRA	651108	674777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_651204_653251_653339_658044_658171_658766_658927_659475_659584_666163_666213_668793_668871_674042
911166	contig_14925_pilon	-	677	3	Intergenic	novelGene_55209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	247	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAAGAGCAAAGGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28040	25802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995
911168	contig_16303_pilon	-	1936	8	Intergenic	novelGene_34102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.97318410009	10	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1	429	47976	38657	TRUE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAALHQAKVGGQWELHKER	47976	33138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33146_34796_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38710_40433_40731_47897
911169	contig_498_pilon	+	1688	6	Intergenic	novelGene_148558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_5	55.7974909830182	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	9	1451	755864	768386	FALSE	15	CATTTGTTGACAGTGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGGVFKIASWADLVNAHVVPGPGVVKGLREVGLPLHRGCLLIAEMSSAGSLATGSYTKAAVRMAKEHSEFVVGFISGSRVSMEPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKQGSDVIIVGRGILTAPNRLEAAELYRKAAWEAYLSRLGM	755855	768623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760387_761736_761913_762926_763042_768216
911170	contig_18162_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_122297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
911171	contig_1301_pilon	-	1485	13	Intergenic	novelGene_47326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	636.004908043606	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1401	83	1483	322831	269193	FALSE	70	AGAAAATGAAGAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGTFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEIDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTRE	322913	269190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278429_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292313_296638_296765_296918_297008_297691_297757_305326_305410_309751_309912_322794
911172	contig_6137_pilon	+	4147	1	Intergenic	novelGene_59181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATACTATCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264709	1268856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1264700_1268900
911173	contig_4857_pilon	+	1890	1	Intergenic	novelGene_48669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	608	1003	1045972	1046367	NA	70	TTAAAAAAAAAAAGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPCLTAHFCLLYLKRLPQDTIQSCRSGPALHNCHPSSLINIIEAGLQHTGKSHSTRNHSLAKLINTFFGGHNSNHDSNVSESAVRPFSAYGLFCEKHRWAMRGGSPPSVHQNQNSKQPYETNNGVIFEE	1045364	1047254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1045400_1047300
911174	contig_5999_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_45646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTCTGACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257446	259274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_257400_259300
911175	contig_2799_pilon	-	7518	10	Intergenic	novelGene_85578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4051	4548	781803	780209	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHRRAEGGLLCSSSFSPSFPLASLTRTGGRTWRWTLGSGSTPRVLCLSGWLNSVCEKFYLCVSERCCSFLGTLKVLSPVTLI	786068	768210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_770313_771764_771929_772372_772444_772914_772960_776041_776089_777674_778125_780117_780451_781547_783289_783426_785561_785637
911176	contig_15697_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_173309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATAATACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61429	59004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_59000_61400
911177	contig_5574_pilon	+	4668	1	Intergenic	novelGene_155862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTTATTCAACCATAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193758	198426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_193800_198400
911178	contig_16109_pilon	-	2214	1	Intergenic	novelGene_80339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGAACCTTTTATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312537	310323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_310300_312500
911179	contig_6434_pilon	+	3917	7	Intergenic	novelGene_61911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1596.73807251603	124	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2038	2637	927389	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	924300	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_924483_925533_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
911180	contig_14405_pilon	+	5292	1	Intergenic	novelGene_85630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	240	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	33	371	379458	379796	NA	50	AAAAGAGTAGCTATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMTIHLWSFKRNMYVILLQCNFPFKNRHFKCASYFKCKCTRVLMLACVGQDAARHHFSGRLFWVQVNKQKKVHTAFWQQNNFKTTSIKQTKKTPKPQSKAVTMIFSLCLPF	379425	384717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_379400_384700
911181	contig_11564_pilon	-	1443	4	Intergenic	novelGene_158533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	547.492668647008	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	124	663	53021	52040	TRUE	30	CATGAGAAACTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSVSRKVVGSMPTAGSAGSVPENLNLFPEPGSKSEETGKKQLSKDSILSLYGSQTPQMPAQAMFMAPAQMAYPTAYPSFPGVTPPNSIMGSMMPPPVGMVAQPGASGMVAAPMAMPAGYMGGMQASMMGVPNGMMTTQQAGYMAGMAAVPQTMYGVQPAQQLQWNLTQVSYPILLRTVFFKFFIYFIVL	53937	35371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_35692_51579_52426_52867_53034_53826
911184	SIRV6	+	1510	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	8	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2690	14	2	TRUE	0	NA	NA	C	coding	163	492	248	739	1733	10736	TRUE	30	AGTTACGCTAGAAGACCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1642_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
911185	scaffold_880_pilon	-	849	1	Intergenic	novelGene_121523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCGCTCCTTGGAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578731	577882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_577900_578700
911186	contig_3789_pilon	+	977	2	Intergenic	novelGene_79873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	678	977	520781	690869	FALSE	85	TTAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSSALSFLSGFSTGNGNCFNHKARQAASYLRRGWECGDRPGALRRGAGVPKWNSAGSPHPLPTPHRAPGSGSVGTPGRASLPDRQTGKARHGGRWSKF	520103	690869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_520874_690662
911187	contig_8059_pilon	+	3423	18	Intergenic	novelGene_111078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	67.3549704292303	40	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	512	1423	266127	340344	TRUE	85	TTAAAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSQKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKPSCIPNGKENFSGSTALWQNI	59645	343567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_59729_90281_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279455_280289_280333_283697_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338661_338891_340277_340374_341596
911188	contig_14807_pilon	-	712	5	Intergenic	novelGene_124665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	5054.1799223514	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	124	615	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38879	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827
911189	contig_12019_pilon	+	2423	3	Intergenic	novelGene_87634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2043	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_2193_5118_6434_7726
911190	contig_1244_pilon	-	1629	13	Intergenic	novelGene_37982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1029.66539872588	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	62	1540	948448	922865	FALSE	25	TCCAGACTCTTCAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAVQELIMCVTAVRQLLEVVISTCSLWTSEPCKSPWWGQQLSSHRREGF	948509	922775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923012_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
911191	contig_3382_pilon	+	3328	3	Intergenic	novelGene_124170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTCCATCTTCTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944805	951431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_946450_948065_949230_950911
911193	contig_12938_pilon	+	3997	1	Intergenic	novelGene_99735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1302	1610	64769	65077	NA	45	TGAACCCAGCAGAGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRNWSLLITCPKYERQSLTILAFKKHSGCPSSKTDLFVLLSVHGIFSILCQHCNSDASVLLQSSLFIVQLSHAYEVIENTMAWVRHSLILKVSFCFLTL	63467	67464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_63500_67500
911194	contig_4125_pilon	-	4478	19	Intergenic	novelGene_25251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_12	203.126253082555	171	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	320	2488	3031212	3008064	FALSE	25	AAATGTTTTGTCATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLCDNAKTGCKARELKSVYVDAVGQFLKLIFHQNHVNKYNIYNQVALVAINIIGDPADFNDENNVTSREKLIDHYLGHNAEDPALDGTYTGKPDYISPLDDLAFDMYQDPEVAQIIRKLDERKHDAVQKERYDYAKKLKQAIADLQKVGERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAKVYQQLELHNLMDAELMRRPFDLPLQPLVHPGSPRHQKPKPSLPQQEERLTEKRAMEPLLQEQPSSRSRSVPPQHAAVGQVLPSPDPRPKIDVEMLPYDERPLPAIRKQQGETHMEYELSDPDVSEAQKGGISGEPEPLTEKALREASSAIDVLGETLVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRFSVSALAHRVYEVRETAVRIILDMYKQHRAFILEYLPPDDNNTRKNILYKTIFEGFAKIDGKPTEAEIRAQKKAATEEVERQKKEEIKVLQGQLAALKEIQVEVQEKESDAMKLKNQDTQGRKADPPNAPETPDNHYLDHLCIFCGERNESFTEEGLDLHYWKHCLMLTRCDYCKQVVEIASLTEHLLTECDRKDGFGKCYRCSEAVLKEELPRHIKTKDCNPSKSEKLANRCPLCHENFSPGEEAWKAHLMGPAGCTMNLRKTHVLHKVQAPPPGKGSAMTRAGTSGLKAGSKIPTPKRGLSKSSSRTYTKR	3035879	3006073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3013497_3013607_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760_3017869_3018214_3018422_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3026849_3027048_3028987_3029216_3030519_3030676_3031086_3031256_3034948_3035026_3035495_3035559_3035743
911195	SIRV6	+	1215	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	148	337	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	3	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	GAAATTAAAGTGGTATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
911196	contig_13283_pilon	+	3429	18	Intergenic	novelGene_154022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_17	86.0513245094286	211	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	28	2355	90798	166567	FALSE	25	AGTGAGGTTTTTATCACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVPLCSCRMETPKSREITTLANNQCMATESVDHELGRCTNSVAKFELMRPSNRVPLLVLCEDHRARMVKHQCCPGCGYFCTAGNFMECQPESSVSHRFHKDCASRVNNMSYCPHCGEEAAKAREVTIAKADTTSTVTLVPGLEKAAAAEGRADTTTGSGAGTHLMEGDKLQSLTMQAHEGFELTGPSGPVKPAPGLPQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQSKRCPLHAAAEAGHVDVCHMLIQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLDAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYDVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCMEIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYECVVLFLSWDSDITLKNKEGETPLQCASLNSQVWTALQMSKALRDSAPDQPAPKERMVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQYCICIDDCSSSNCMCGQLSMRCWYDKDGRLLPEFNMAEPPLIFECNHACACWRNCRNRVVQNGLRTRLQLYRTHNMGWGVRALQDIPLGTFVCEYVGELISDSEADVREEDSYLFDLDNKDGDVYCIDARFYGNVSRFINHHCEPNLVPVRVFMSHQDLRFPRVALFSTRPIVAGEQLGFDYGDRFWDIKGKLFGCQCGSPKCRHSSTALAQRQASAAQETQENGLPDTSSSATADPL	90770	167641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_90876_104945_105090_112766_112994_114734_114909_116848_116932_118050_118158_127527_127651_142738_142841_143641_143747_153852_154008_155084_155253_155476_155622_156797_156876_158135_158252_159865_159953_161169_161249_164476_164653_166386
911197	contig_19013_pilon	+	2501	1	Intergenic	novelGene_162089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCCCCACAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43237	45738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_43200_45700
911198	contig_4211_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_80242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGCCCAACAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1132946	1131047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4211_pilon_-_1131000_1132900
911199	contig_1443_pilon	-	5329	1	Intergenic	novelGene_28361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	4486	4947	939559	939098	NA	30	TCCCCTTGGCATTAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALMQGGGPGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMGGAASSPHVDSSTMLHHHHPHPHPHHHHHHHPGLRATGYPSSPATTTSGTALRLPPLQPEEDDEDEDEDDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDADD	944044	938715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_938700_944000
911200	contig_16496_pilon	-	1441	3	Intergenic	novelGene_5184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	18	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_880_973_1354_3413
911201	contig_7870_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_108920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGCGCATGACCCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247906	245463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_245500_247900
911202	contig_8447_pilon	+	2542	1	Intergenic	novelGene_69394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	842	1285	14273	14716	NA	40	ATGGACGTGTATCAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWKGGECLHFAGTATNVTKQSVCKVLNEKLICTVNFHLKHNKKFLKSSKIEINLDHIQQTHKCFVRIMRNFYLICIVLIFNEQHCHCNQADRQTHTHTHTHTHRHTHSSSPARMRHCRLSPSVFSVHRKVGTYNGKEHRLDITSVP	13431	15973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_13400_16000
911203	contig_15500_pilon	+	3839	3	Intergenic	novelGene_128970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTGAGGGACCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145953	197608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_147011_194173_195598_196250
911204	contig_13831_pilon	-	3358	12	Intergenic	novelGene_160988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_2	29.5922706012709	129	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	45	1235	124477	69603	FALSE	10	CTAGGCCATTCTGTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWRRPVLKPVRGNGMLGFLSARQVGLDDPLLLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGSGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSGQPYYTCKAVCSVGRSHPDVHKYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKIWDTNTLQTADVFNFEETVYSHHMSPVATKHCLVAVGTRGPKVQLCDLKSGSCSHILQGHRQEILAVSWSPRYEYILATASADSRVKLWDVRRASGCLITLDQHNGKKSQAVESANTAHNGKVNGLCFTSDGLHLLTVGTDNRMRLWNSSSGENTLVNYGKVCNDSRKGLKFTVSCGCSSEFVFVPYGSTIAIYTVYSGEQITMLKGHYKSVDCCVFQSHFQELYSGSRDCNILAWVPALYVSTPDDDETTTKSQLNPAFEDAWSSSDEEG	124521	67479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_69672_77570_77652_84107_84306_90056_90182_91084_91186_97645_97713_98859_98929_99992_100075_105418_105543_108169_108272_121195_121292_124400
911205	contig_11720_pilon	+	1482	10	Intergenic	novelGene_43791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	23	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	250	1050	68064	98324	FALSE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYTFSSR	67814	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98306
911206	contig_12528_pilon	+	1790	14	Intergenic	novelGene_81275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_2	162.54590612388	41	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1416	373	1788	284346	308557	FALSE	65	GATAAAAAGAGAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLRMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCDSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPASPSTADKEENPAVLAENCFRELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVQCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKDSPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVDFEASDLQGSSACSTALSTSSKDSDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTTTHNLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTMVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADL	246098	308559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_246304_281542_281689_284324_284453_286846_286998_289038_289161_293929_294080_295481_295620_297531_297611_299724_299861_301889_302058_305296_305412_306949_307002_307896_308070_308532
911207	contig_8174_pilon	-	5819	16	Intergenic	novelGene_160065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_5	321.490791297183	184	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	462	2033	351298	308281	FALSE	50	GTCAAAATTAGTAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGVSSDDEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHTLSESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS	437930	304494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_308397_309700_309792_311948_311992_313906_314013_315125_315224_317106_317228_323344_323469_326685_326749_326994_327090_328008_328124_329215_329273_340235_340362_340501_340636_343881_344047_351180_351328_437498
911208	contig_17212_pilon	+	3637	7	Intergenic	novelGene_88612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1032	1361	87719	88048	TRUE	20	AGCCTCACTTCCTCCGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVVGFFFFTALQAGGTKWFSLNSLPSESLQGFLWTLRSNTDSHWTGVLPTPSAFCFTPLDKSSGCWLHTLLKVELAAHSLDILYSSKHGGLTVSLSSLPDKLQAGELL	86687	146237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_+_89738_95044_95156_99468_99527_120826_120961_128447_128603_143820_143907_146194
911209	contig_6825_pilon	-	4988	1	Intergenic	novelGene_155111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	2632	3177	2365	1820	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWMGKYQAILLDNSNVVLKAVSSLNPTTLLPISEDAPVHDCLEIIEEVYSSRPDLSDVPLTDPEIEMYTDGSSFLYEGCHKAGYVVVTRTEVLEAAPLPAGTSAQKAKIIALGWALQLGAGRCITVYTDNKYAHLVLHSHGALWKERGLLTSANKEIKHVLEILELLKAINDPLQVAVV	4996	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_-_0_5000
911210	contig_11855_pilon	-	1785	14	Intergenic	novelGene_66955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2039.99869764432	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	553	1743	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1102167	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
911213	contig_13535_pilon	+	3467	2	Intergenic	novelGene_178894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	950	2206	950	2256	FALSE	65	ATAAATAAAGAAGACGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRNYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPINKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLVHTHNGHG	0	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13535_pilon_+_2198_2247
911214	contig_11720_pilon	+	1106	10	Intergenic	novelGene_43836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	10	1071	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68054	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
911215	contig_18303_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_146803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTCACCCCAGCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35732	37920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_+_35700_37900
911216	contig_19007_pilon	+	2000	17	Intergenic	novelGene_168433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_16	178.30924681575	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1869	131	1999	3958	29295	FALSE	25	TCTGCTGAAGCAATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACDPNNKRLRQIKDQILTDCRYNPKILFQLLLDTAQFEFILKEMFKQMLSEKQTKWEHFKKEGSERMTELADVFSGVKPLTRVEKNENLQAWFREIAKQILSLNYDDSTAAGRKTVQLIQALEEVQEFHQLESNLQVCQFLADTRKFLHQMIRTINIKEEVLIAMQIVGDLSFAWQLIDSFTSIMQESIRVNPSMVTKLRATFLKLASALDLPLLRINQANSPDLLSVSQYYSGELVSYVRKVLQIIPESMFTSLLKIIKLQTHDIAEVPTRLDKDKLRDYAQLVPRYEVAKLTHAISIFTEGILMMKTTLVGIIKVDPKQLLEDGIRKELVKRVAFALHRGLIFNPRAKPSELMPKLKELGATMDGFHRSFEYIQDYVNIYGLKIWQEEVSRIINYNVEQECNNFLRTKIQDWQSMYQSTHIPIPKFTPVDESVTFIGRLCREILRITDPKMTCHIDQLNTWYDMKTHQEVTSSRLFSEIQTTLGTFGLNGLDRLLCFMIVKELQNFLSMFQKIILRDRAVQDTLKTLMNAVSPLKSIVANSNKIYFSAIAKTQKIWTAYLEAIMKVGQMQILRQQIANELNYSCRFDSKHLAAALENLNKALLADIEAHYQDPSLPYPKEDNTLLYEITAYLEAAGIHNPLNKEWSAESLLTLLIGRRLSWDCS	3099	29296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_3230_3957_4088_7103_7217_9157_9325_9438_9515_11438_11550_12627_12769_13834_13916_15012_15115_15842_16023_17200_17326_19056_19220_19752_19856_19943_20024_24081_24186_25166_25297_29232
911217	contig_16703_pilon	-	3167	1	Intergenic	novelGene_72772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	187	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1250	1567	26314	25997	NA	70	AAAAAAAAAAACCCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSCDSFIKLSILHHRAAGDQVAVLFQAGACEVRGTSLWSHSRSLDSRLPDLQVPDQSSGGQEVRHPLKNANRMDRKLTRNKYCSSPLTITVLLCSEVVTLFGLR	27563	24396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_24400_27600
911218	contig_5236_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_100938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGGGAACCTGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974987	973009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_973000_975000
911219	contig_4232_pilon	-	2654	3	Intergenic	novelGene_63450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTAGAATTGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546347	542772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544131_544543_545270_545777
911220	contig_2487_pilon	-	3812	1	Intergenic	novelGene_148475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTTTTACTACAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174381	170569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_-_170600_174400
911221	contig_11752_pilon	+	7265	5	Intergenic	novelGene_37632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1804.04412016447	926	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	80	817	84194	88933	TRUE	40	GAGGTCACTACAAGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84114	98101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_95313_98032
911222	contig_17989_pilon	-	3646	12	Intergenic	novelGene_150829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	57.5300137262181	1803	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	299	1480	278347	266567	TRUE	15	GAATCACTTCCGGGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQCACVERELDKVLQKFLTYGQHCEQSLEELLHYVGQLRAELASAALQGTPLSATLSLVMSQCCRKIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDRNFDSEICGVVSDAVWDSREKQQQILQMAIVEHLYQQGMLSVAEELCQESTLNVDLDFKQPFLELNRILEALHEQDLGPALEWAVSHRQRLLELNSSLEFKLHRLHFIHLLAGGPEKQLEALSYARHFQPFARLHQREIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLSVSFASGCVALPVLMNIKAVIEQRQCTGVWSHKDELPIEIELGMKCWYHSVFACPILRQQTSDSNPPIKLICGHVISRDALNKLINGGKLKCPYCPMEQNPADGKRIIF	283794	261787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_262156_264161_264269_264875_266631_266714_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269823_271169_271311_271437_271584_278208_278360_283508
911223	contig_8991_pilon	+	4088	4	Intergenic	novelGene_170939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	519	1004	149296	150468	TRUE	75	AAAGTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAENREYYKDVYLCFIDYAKPFNCVDHNKLWITLAKNGNSRTLTCAHEEPVLRTEQRDTEWFKVKKAGLHEKCGIRIRGRLINNLQYADDTTLLAESEEDLKNLLMKIKDHSLQYRLHLNIKKILTTGPTSNTMLSGEKTEVVEDFILLGLAINAYGSSSQ	148777	189646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_149324_149941_150113_150181_150816_186909
911224	contig_9668_pilon	+	3289	1	Intergenic	novelGene_58247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596201	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_596200_599500
911225	contig_6616_pilon	-	1861	1	Intergenic	novelGene_141754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGTGACTAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282479	280618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_280600_282500
911226	contig_15236_pilon	-	3694	3	Intergenic	novelGene_141637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	586	324	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	5	544	668733	667009	FALSE	20	GTTTAAGTGTCAGTGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMNTFLIIYLIILISEAIISTILKYTWQAEEKWDEPWYNQKTEHQRNSSKILKFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFFIGWDLDLYHEESDQKAQVNTSDLNEELGQVKLMLLFFLFVTFIKIIHFQRLVKQKLLRDFHQRTALLCFTSDFCFPFLNLKPSLFLLYLTLCF	668737	663858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_667030_667097_667470_668586
911227	contig_4686_pilon	-	5236	15	Intergenic	novelGene_118549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	130.150148768604	13	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1046	3141	55	3195	567009	537806	TRUE	45	GAGAAAATGAAATGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIELTTQSLSDLEDQFLKMSKVPTNLVVEEAVSLQDGCRALLGQVVSLGEAVDELNQRKESFQSTGQPWQPNKMLNLVTSYRRLKRQAEQRVSLLEDTTSAYQEHEKMCQQLERQLEAVKKEQSKVNEETLPAEEKLKMYHSLAGSLQDSGILLKRVTMHLEDLSPHLDPLAYEKAKHKLQSWQEELKVLTSAIGETVTECESRMVQSIDFQTEMSRSLDWLRRVKAELSGPVCLDLNLQDIQEEIRKTQIHQEEVQSSLRIMNALSHKEKEKYTKAKELISANLEHTLAELSELDGGVQEALCTRQAALTETYSQCQQYYQVFQAANDWLQDAQEMLQLAGNGLDVESSEGNLKSHVEFFSTEDQFHSNLEALQGLVSNLNPLLKPTGKDDLAQKMASLEERSRGIIQDSHVQLDLLQRCAAEWQDYQKAREEVIELMNDAEKKLSEFSVLKTSSSHEAEGKLSEHKGLVSVVDSFHEKIVALEEKASQLEKTGNGTSKATISRSTTTVWQRWTRLHAVAQDQQKILEDAVDEWKSFNNKVKKATEMIDHLQDKLLESSAEKASKAELVMLLENHDTLVLELEQQQAALGVLRQQALSVLQDGAFPAAPGEEPPVMQEITAMQDRCLNMQEKVKNNGKLVKQELKEREVVETQINSVKSWVQETKEYLGNPTIEIDAQLEELQILLTEVTSHRQNIEKMAEEQKNKYLGFYTILPSELSLQLAEVALDLGTTHDQIQDKVKEVEQSKAMSQELSRQIQKIAKDLTTILTKLKAKTDNLVQAKTEQKVLGEELDDCNVKLMELDAAVQKFSEENGQLGKPLVKKIGKLTELHQQTIKQAENRLSKLSQAASHLEEYNEMLELILKWIEKAKVLVGGNITWNSASQLREQYISHQTMLEESEEIHSDLEAMTEKLQYLTSVYCTEKMSQQVAELGRETEELQQMIKIRLQNLQDAAKDMKKFEAELKNLQTALEQAQTTLTSPEIGRLSLKEQLSHRQHLLSEMESLKPKVQAVQICQSALRIPEDVVTSLPLCHTALRLQDEASRLQHTAIQHCNIMQAGCGTV	567063	530157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_532075_537681_537823_539161_539349_539905_540029_540576_540763_548540_548679_549556_549740_550510_550664_552626_552783_553079_553246_559095_559359_560089_560309_562077_562223_562873_563212_566142
911228	contig_11512_pilon	+	2821	2	Intergenic	novelGene_43305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367726	385838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_370207_385497
911229	contig_10627_pilon	-	2653	3	Intergenic	novelGene_60023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	468	860	484912	484520	TRUE	55	TGACAGAAAGAGCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDKQTTKNAQPTCSDIAKKKKKGMKQTNLQSINEKNNYRMTLRQQTISKHLQKQDRMVPVGFQNKIPDDLPVEEKALELPDMEFRSLIFRAIQELKQKADKNEEKIDKFMEKAILWKIQTKIWKNSGK	486413	482601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_483181_483305_485249_486282
911230	contig_5423_pilon	+	5199	4	Intergenic	novelGene_85194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	504	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTCCATTATTAGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209159	223644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_209527_209722_214315_220440_220602_223565
911231	scaffold_9100_pilon	+	2639	13	Intergenic	novelGene_83238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_11	49.6847701905613	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	201	1643	589899	614785	FALSE	50	AAACGCCTAACTGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSISNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTADIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSTSNSSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQNSEPSSVDGNSRDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSIKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDIINSFQSIRQEMEAYTPKLTQVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRMMKKT	581012	615781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_581208_589893_590053_593147_593341_594141_594308_595020_595115_596712_596863_596993_597074_601279_601411_601516_601605_604259_604349_604701_604820_612962_613056_614698
911232	contig_2834_pilon	+	2973	2	Intergenic	novelGene_28022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTCTTTAATCTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354021	357049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_356050_356104
911233	contig_16259_pilon	-	4659	3	Intergenic	novelGene_174360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	303	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1276	1692	7773	3322	FALSE	35	ATACAAGAGTATTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEDKTIERADSKPSTEEELSMNLRSADGGEPTEGSNLLSSSEKRPQETPTESSHLQRLRQTFARRPRGSLVSKIKVVTKDFLLWAVVWSVTIGTVLPGVNPSGIIILLFFAFLGDTLFWLIKLPTLPPLPGFLGKC	9048	354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_-_3504_6589_6771_7719
911234	contig_14559_pilon	-	1734	14	Intergenic	novelGene_83710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	99.2912159364069	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	1084	1734	213596	208516	FALSE	55	AATATCCAGAAAAAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELT	277542	208515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_208627_211261_211406_212027_212205_213377_213622_214571_214699_223732_223868_224077_224165_228671_228790_229459_229519_230384_230448_249375_249526_251347_251496_253608_253691_277453
911235	contig_9752_pilon	+	4256	1	Intergenic	novelGene_122026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3771	4115	148378	148722	NA	45	TCTATATGAAGAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRDLEDIFVPVLKKDDPTECENYRTISLIPHASKILLKIIQKWLQQYIDKELPEIQAKFRRGCGTRDIRWILAESREYQKDVYLCFIDYTKAFDCVDHNKSWKTLKEWEFQNT	144607	148863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_144600_148900
911237	contig_10990_pilon	-	2168	13	Intergenic	novelGene_7495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	675	1097	744373	743951	TRUE	20	TTAGGCATGCTGGGTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	745359	722386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_722433_722608_722697_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911_731994_733026_733137_733942_733951_736225_736260_738882_738952_743881_744386_744697
911238	contig_12948_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_126230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTTTACTCCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370746	373457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_370700_373500
911239	contig_13760_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_61274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	5	322	65859	65542	NA	45	GAACCTGTGTAAGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMQMRCLRPTKGTGQLANNATKVHGTPVRVGPCIYGVCKPNERIGQFCHSARLKRSQSQKQMRDLTTTKKESQEWSTSFGPRVPELRTSRSRRERERQRGVTPEAV	65863	63429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_63400_65900
911240	contig_5023_pilon	+	1964	9	Intergenic	novelGene_7268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2678.56666136481	38	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	76	726	607279	629238	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAADI	580853	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616483_629227_629284_647108
911241	contig_7630_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_133658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTTAAAACCAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532403	534523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_532400_534500
911242	contig_10437_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_38391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	689640	689945	NA	20	AACCCTCGATTGTGATCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKSLLLKSISYTKIYTHILRDLSCNSDNVTAHSPAPLHLEFPLSIQPAPVPSCLLILPLDRNCPFGLVYLLELTSTLFTSITSCFIVQSNLCLKNGLRERF	689639	691649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_689600_691600
911243	contig_13944_pilon	-	2798	1	Intergenic	novelGene_175283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	55	375	62221	61901	NA	5	CTTTTTTGTGATTTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGQWLTNTRVHQNHLGGLVRTQCAGPARRSSDSADLGWDLRICISYRLQGDDAGPGPHFEKHCPQCVFSDTGATRHMWLFKLKKNFLYIALSPQLLVTTNSPLS	62275	59477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13944_pilon_-_59500_62300
911244	contig_1699_pilon	+	2075	8	Intergenic	novelGene_72829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_6	175.18713027002	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1332	1748	99093	101704	FALSE	85	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQKWNSLDEGRHLTLNLLSKEIELRNGENDYTEDTTDTKPDRDIELELSALDTDEPDGQGEQIEEILDIQLGISSQNDQLLNGTAVENGHPVQQHQKEPLEQKRQSLGEDHVILWFLSRAPILQGGAKNNSAGNFLL	97165	102031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_98282_98526_98612_98876_98959_99044_99180_99438_99547_99643_99793_100430_100462_101662
911245	contig_11281_pilon	+	6143	1	Intergenic	novelGene_125494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	550	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTGGTCTTGCAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	918351	924494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_918400_924500
911246	contig_16951_pilon	+	2690	1	Intergenic	novelGene_98631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1542	2054	76220	76732	NA	10	TTGGGGGGGATTTTTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPYLFNLYAEQIIREAELYEEERSIRIGGRLINNLPYADNTTLFAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLCLNIKKTKILTTRPISNIMINGEKIEVVEVFILLGSTINTHGSSSQEIKRCIALGRSPAKDLFKVLKSKDITLKTKVCLTQAMVFSFASYACKSWTMNTED	74678	77368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_74700_77400
911247	contig_3980_pilon	-	3709	4	Intergenic	novelGene_172329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2714	3202	13149	12661	FALSE	0	TGTGTTCTCTGTTGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLYEEERGIRTGGRLINNLRYADGTIFLVESEEDLKHLLVKIKDHSLQYRLHFNVKKTKILTTGQISNIMINGENIEVVKDFIFLGSTINTNGSSSQEIKKHIALGKSAAKDFFKVLKMKDVTLKTKVHLTQVMVFSVAPYACESWTMNKEDQRRIDAFQL	163009	12153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_14590_118464_118531_147204_147803_162400
911248	contig_7322_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_164911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	856	1188	203657	203325	NA	45	CCAGATACCAACCTAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKITTEYLEDSKQYQNILKKQDRMVLVGVQNKTPDDFPVEKKALELPDREFKSLILRAIQELKQKADKNEEKIDKFMENTNQKMEEFRKIIQEQNAKINSQLKSYKNNN	204512	202574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_-_202600_204500
911249	contig_6898_pilon	+	2746	5	Intergenic	novelGene_35748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2989.55484771563	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	218	691	124380	125646	FALSE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	116757	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_116819_122997_123145_124370_124464_124782_125008_125481
911250	contig_15498_pilon	-	1319	9	Intergenic	novelGene_42653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	127.365554114918	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	5	949	697708	688356	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTAAHAV	697712	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688374_689510_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
911251	contig_11215_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_118967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGATGTGCAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2929	1792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_1800_2900
911252	contig_10259_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_177193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1007	1486	56125	55646	NA	80	AAAAAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWMVPLGGILIPILWWVLGIWRQPLRQSVCATHQPWQYDGLQLLGLGLPLQAALCAHATGLQHRLQERRGSHSSCLGRTPSCLSGAMTTSESVSTTGMFLGEGKSKTAGVPAPEGLLCLPHAWLLEGGPLEEGRPKRILEGKGLVAKKPQGQEEDRRE	57131	55382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_55400_57100
911253	contig_11978_pilon	+	2114	3	Intergenic	novelGene_63115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTGGGCAGTTTGAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1883918	1888613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1884948_1886351_1886565_1887741
911254	contig_5758_pilon	+	3995	1	Intergenic	novelGene_119084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2189	2530	164174	164515	NA	80	TGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGRGLSQVTQLRKLASPRSAGRRAGLLLTGCADQRIPGLADKLTVQVPRMGDEMTGSSPRIQREQKARTSAYIQIQATPPRRLPFIGLATHSIFNHGSDYIKTPRIMAQPS	161985	165980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_162000_166000
911255	contig_15975_pilon	-	3062	3	Intergenic	novelGene_178895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	2061	2816	1252	497	FALSE	60	CAGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGN	91438	250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15975_pilon_-_1981_4281_4784_90608
911256	contig_13547_pilon	-	2007	16	Intergenic	novelGene_104871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_8	331.559480167419	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1116	890	2005	101202	75804	FALSE	60	ACAGGAGAAAGGAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGITPSLDKQYMHGVVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRDSPLHFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADAGLKRGDQIMEVNGQNFENITFVKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKAGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDIEQT	223739	75801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_75929_84852_84962_88970_89175_91157_91266_93752_93918_98147_98301_98903_99063_101109_101247_102504_102613_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
911257	contig_12958_pilon	-	2311	7	Intergenic	novelGene_136188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	277.661314474227	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	410	1189	52455	39829	TRUE	40	GAAAAGGAAATTACTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSFKDENQEFQKQLMCTIEKKKEDFVLQNEEASEKYCQAELKQISEPLMETISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKVEQDYERLPRKGVKANEVLKSFLQSQVAVEESILQSDRALTDGEKAIAAERAKTEAAEKEKELLKQKQEEQQQKMEAQERSFKKNMEQLKEKMERERENLLQEQTMMLEHKLKVQEELLREGFEKKSEELNKEINQLKEEIETINKKRSGFSQFLDEAGNVLLVALPGAGKLFGAGMKLLSSHIK	70637	33728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_34467_39444_40048_40927_41122_41468_41572_50899_51113_52404_52666_70438
911258	contig_2358_pilon	+	2511	2	Intergenic	novelGene_156099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGCTGTTTCTAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51281	60353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_+_53389_59949
911259	contig_17144_pilon	-	2569	18	Intergenic	novelGene_29539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2060.85987025908	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	156	2297	179764	166363	FALSE	10	CTGTTTTTTTCTTTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEAFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183237	166090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173674_174702_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
911260	contig_14882_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_114999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCGGCCACGCTCGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256200	254179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_-_254200_256200
911261	contig_14925_pilon	-	3459	3	Intergenic	novelGene_55381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTGATCACTCAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159722	150113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_150187_153923_154066_156478
911262	contig_8624_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_112577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATATTGTTTTGTGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061631	1059929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1059900_1061600
911263	contig_7963_pilon	-	1061	6	Intergenic	novelGene_58307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	9	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	37	333	48841	43622	TRUE	0	TGTTGTTGTCTGTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48877	38326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
911264	contig_3818_pilon	-	4098	7	Intergenic	novelGene_99249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	13.5123400391395	178	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	107	1126	463498	459686	FALSE	35	TTCAATATTATCGTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDSLVLLGRVPAHPDSRCWYLAWNPAGTLLASCGGDRRVRIWGREGDSWICKSVLSDGHQRTVRKVAWSPCGNYLASASFDATTCIWKKNQDDFECVTTLEGHENEVKSVAWAPSGNLLATCSRDKSVWVWEVDEEDEYECVSVLSSHTQDVKHVVWHPSQELLASASYDDTVKLYREEEDDWVCCATLEGHESTVWSLAFDPSGQRLASCSDDRTVRIWKEYLPGNAQGVACSSSDPSWKCICTLSGFHSRTIYDVAWCQLTGALATACGDDAIRVFEEDPGSDPQQPTFSLTAHLPQAHSQDVNCVAWNPKELGLLASCSDDGEVAFWKYQRPEAL	463604	456713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_459927_460982_461071_461711_461914_462151_462241_462340_462453_462604_462754_463359
911265	contig_9668_pilon	-	3257	1	Intergenic	novelGene_58141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	2560	3072	331345	330833	NA	25	TCTGCTAATCTCCATAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNMASGLEEDSLTTCDMQMTQPCLLKVKRTWKHLVIKIKDYSLQYGFCLNIKKKKKKNLTIGPISNIMINQENIEIVKDFILFGSTINTHESSSQEIKRRTALANLLRKTSLKVLKSKDVTLRTKVRLTPAMVFSIALCACENWTMNKQARRIDAFELWCWQRTVNIP	333904	330647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_330600_333900
911266	contig_5039_pilon	-	5879	7	Intergenic	novelGene_65010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	5341	5688	1704550	1703220	FALSE	45	GGTGTTCAGAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDANTKESTSSFSTSFRDPSDNSFCCIKVEFSTGKVVQEEERLCPLCQNIIYTHGDQILTNSIMFIAQLGNLQFSSNAICSRGQKRIFETGCFQIKKASKTSKINLTAWSGGGSC	1718557	1703028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1703243_1703621_1703728_1704331_1706339_1710620_1713144_1713407_1713551_1717571_1717689_1717788
911267	contig_12528_pilon	+	1458	7	Intergenic	novelGene_81359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	38.1794010778937	13	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	232	894	1011312	1022910	TRUE	80	GAAGAAGAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALVKAAAAAAAKNKTGSKPRTSANSNKDKDERKWFKVPSKKEETSTPSATPEVEKKEDLPTSSETFVGLHVEHVPKMVFPQPESTLSNKRKNNQGNSFQAKRARLNKITGLLASKAVGVDGAEKKEDSSETAPMLEQAISPKPQSQKNNEADISSSANTQKPALLSSTLSSGKARSKKCKHESGESSGCIKPPKSPLAPELTQVEDLTLVSQLSSSVINKTSPPQPVNPPRPFKHSERRRRSQRLATLPMADDSVEKVSAPSPATDGKVFSISAPNPHESSVPEGNVYVDLIPNQT	1010535	1039238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_1010738_1011282_1011412_1016764_1016848_1020325_1020579_1022683_1023348_1037916_1037974_1039168
911268	contig_10404_pilon	-	4907	2	Intergenic	novelGene_138730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	203	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	210	1805	1571917	1570322	FALSE	0	TCTGTGTTCTTCTGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNNFKYRCQNLFSHEGGSRSENVGMNSSRCLSVKERNTSIGDPAPQQQSSPLRENVALHLGLSSSKNSSRRSQNCAAEIPQIVEISIEKENDPCVTTPGTRLARRDSYSRHAPWGGKKKHSCSTKTQSSLDTEKKFGRTRSGLQRRERRYGVSSVHDMDSVSSRTVGSRSLRQRLQDTVGLCFPMRTYSKQSKPLFSNKRKIHLSELMLEKCPFPAGSDLAQKWHLIKQHTAPVSPHSTFFDTFDPSLVSTEDEEDRLRERRRLSIEEGVDPPPNAQIHTFEATAQVNPLYKLGPKLAPGMTEISGDSSAVPQASCDSEEDTTTLCLQSRRQKQRQVSGDSHAHVSRQGAWKVHTQIDYIHCLVPDLLQITGNPCYWGVMDRYEAEALLEGKPEGTFLLRDSAQEDYLFSVSFRRYNRSLHARIEQWNHNFSFDAHDPCVFHSSTVTGLLEHYKDPSSCMFFEPLLTISLNRTFPFSLQYICRAVICRCTTYDGIDGLPLPSMLQDFLKEYHYKQKVRVRWLEREPVKAK	1627316	1567219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1571948_1627137
911269	contig_1637_pilon	+	2947	5	Intergenic	novelGene_142383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	297	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1470	1835	296071	296436	TRUE	25	GGGAGGTGGTGAGAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSREFILAFCSCIIFLSSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSYWKIPSIIGLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFQGIQ	98393	357363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_98451_99432_99744_148058_148786_295696_297171_356985
911270	contig_9121_pilon	+	3703	3	Intergenic	novelGene_134477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATGAAAAAGAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281707	286647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_282360_282555_285112_286152
911271	contig_21162_pilon	+	1268	2	Intergenic	novelGene_152767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCCCTACTCTGGAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24611	26072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21162_pilon_+_25799_25991
911272	contig_7898_pilon	-	2431	2	Intergenic	novelGene_47641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTTTTTTAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795607	745252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_745497_793420
911273	contig_9304_pilon	+	2058	4	Intergenic	novelGene_177835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	12.8322510366134	20	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	587	898	15430	15741	FALSE	45	AAGAATAAATTCTACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMKKLGQSLYYVCFATGERRLQRPHLLTWSPCLRSPLLTPNLLTFDDSVQQSWHRKPSMCRRAGPCHYDVRKWSGYVGSLSLDIKSLMAVVVARCHQVCSNS	1412	16901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_+_1646_13632_13747_14773_14836_15252
911274	contig_11003_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_105448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCCATTACAAATGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393253	391068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_391100_393300
911275	contig_11448_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_66336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	161	388	122535	122308	NA	45	GACCATCCAAGAAGCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPENLSKTETYINLGTLSIKRRDKGLSQAPNGIRNNREQRAGQIHVEVPYQLMQNRFVILDSCWRSEDREYGKAASWSTQQETEQPVTSDIQFSTTTLLHPCSVSSVSCSHSLSARRHWFQPCAAWI	122695	120969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_121000_122700
911276	contig_2323_pilon	+	2086	4	Intergenic	novelGene_151857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.48528137423857	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	152	562	146881	149863	TRUE	70	CACCAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYSVDCRETDRPAPVQSAALRSTSTGDLKPAPCHFLGVVAAAAQETLQPTSGRSAAVSRAIIERQRPHMRPNEALFYLVKLLRGKLRHKITGDQKASLSKGVLSASSRLPPYWQALTLSFSSHLSCLPLPLTPNF	146729	155049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_147118_149689_149871_152987_154324_154868
911277	SIRV5	+	563	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-317	959	-203	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGAAGGGAACGGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7998	10907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
911278	SIRV6	+	885	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-20	223	-14	140	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
911280	contig_6418_pilon	+	2151	2	Intergenic	novelGene_81218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	187	528	1364337	1375941	FALSE	55	AAAAAAATTCCAGCAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQGAHLGLPTTPAPLLRSLLPLLMLLAAAAPPSLAEVHYATVYWKSSEKAMRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAP	1364150	1377564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1364455_1375717
911281	contig_14322_pilon	-	3719	4	Intergenic	novelGene_115620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_3	16.9967317119759	134	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	104	1222	186269	168571	FALSE	25	ATTTTCATTTTTACATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSARPGFESLLPVRASPEVFAPADGTPGGLQKTVMDSVVFEEVAVNFTREEWALLNAAQRKLYKDVMLETFQNLASVDSCTQVKTSGSSPQQGIFGNEIFNGEKIISFIRSDSWSNLEEKGNVHNIEDYPQIQKKRSRERVNSHRGQKIPACEICGKIFMHLSSLKLHLRRHSGEKPYECKECGKAFSCPTYFREHVRMHTGEKPYECKYCWRAFNFYSSLQEHERTHTGEKPYKCKQCGKAFTSYSALHGHEKTHSEQKPYECKQCGKSFRCPKYFRQHVNMHSEEKIYECKECGKVYSMPANLRQHMKTHSDERPYECKQCGKTFRWPTSLRNHMKMHSSEKPYECKPCGKAYRCLISLQEHLRRHTEEKPYECYQCGKVYKYFKYFDMHMKMHSGETQYVCKE	186372	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_169379_169736_169918_174316_174444_186266
911282	contig_11815_pilon	-	3082	2	Intergenic	novelGene_50956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	393	1163	500284	499166	FALSE	25	GTGCCCATCACTGGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKTEGGRERKEKNEQIKIRKVKELQSSQGSHRCRYEVWGSRSQVSQHSLVRRRRGIQCLVFRNQKEKEETERRDQRKQKKKKGKKKKRKNNTCSPQTAPKEPPARSRGIQTAGSPGPRSRSPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNVAPQPRRKGQRRRSEPGTRAKGGRGSEGQARNQKKQKKQHQHPTNGTQRAARPGARNPSNRCPPAKRPWPREAGEPQPGQRGVGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	500676	497246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_499707_500054
911283	contig_5988_pilon	-	2916	1	Intergenic	novelGene_16136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1955	2344	1578859	1578470	NA	55	CAGCATCAGAACAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKADKFMENTDKKMEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDRVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRLTWDTIKSKNLRVIRVPERGENRKHGEDH	1580813	1577897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1577900_1580800
911284	contig_5424_pilon	-	2673	13	Intergenic	novelGene_172811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	113.678976606153	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	591	2078	128724	116731	FALSE	50	AAAGGTTAAGAAAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDTCNTGKWTEEEEKRLAEVVHELTSTEPGDIVTQGVSWAAVAERVGTRSEKQCRSKWLNYLNWKQSGGTEWTKEDEINLIVRIAELDVADENDINWDLLAEGWSSVRSPQWLRSKWWTIKRQIANHKDVSFPVLIKGLKQLHENQKNNPPLLENKSGSGIPNSNSNSSVQHVQIRVARLEENTALSPSPMTALQIPVQITHVSSTDSPAATVDSETITLNSGTLQTFEILPSFHLQPTGTPGTYLLQTGSSQGLPLTLTASPTVTLTAAAPASPEQIIVHALSPEHLLNTSDNVTVQCHTPRVIIQTVATEDITSSISQAELTVDSDIQSADFPEPPDALEADTFPDEIHQPKMTVEPSFNDAHISKFSDQNSTELMNSVMVRTEEEISDTDLKQEEESPSDLASTYGTEDLESPTIEEQVDQTTIDDETILIVPSPHGFIQASDVIDSVLPLTTLTDPILQHHREESNIIGSSLCSPVSEDSKDVEDLVNCH	139195	116135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_116841_117086_117229_117863_118245_118789_118946_120473_120560_123481_123692_124958_125111_126344_126574_128702_128985_129702_129736_131066_131225_135062_135136_139129
911285	contig_20662_pilon	-	1730	15	Intergenic	novelGene_177644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	234.004938461755	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	1121	1729	63669	47185	FALSE	35	TTAAATTGAAAGGTATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPLTTLNIHRFIKTMEAPLLTEVAKDPQQVSTIHLQLGLPLVFIVSQQVTYEADRRTAEWVAWRLLGKAGVLLLLRDSLEVNIPQHANVVFKRAEEGMPVEYLVLDDIDLIISRVESNVHTQEIQEDEDDDMEDPDMETEDDEVAETVYRDRKRQLPLELTVELTEETFNTTVMASDSIVLFYAGWEAVSMAFLQSYLDVA	110032	47183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_47232_48321_48466_55419_55544_57089_57151_57534_57702_63603_63755_68470_68496_74943_75066_78881_78942_85171_85247_86052_86127_96395_96479_97514_97817_98606_98718_109849
911286	contig_15327_pilon	-	883	3	Intergenic	novelGene_70674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	9	419	901528	900904	FALSE	90	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901536	900439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
911287	contig_6375_pilon	+	2178	8	Intergenic	novelGene_72935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	253.293086670564	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	201	992	20973	28930	TRUE	20	GCTGGCAGTGATGATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKPGSSNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMEIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16559	30373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_20907_20995_22474_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28840_29912_30168
911288	contig_678_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_167794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1421	1741	42963	43283	NA	85	GAAAGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEDFLELTEAEYKRLIYRTPQDIRKEISRNSEHATEEIKKIREEHNDKFNRLQGSIQRQQPETQKINNKISELDNSIESHRSRTEAVEVRM	41542	44217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_41500_44200
911289	contig_8210_pilon	+	3709	5	Intergenic	novelGene_30214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	169	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTATTTGCTTAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12666	23985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_15994_18143_18324_19800_19845_21487_21595_23934
911290	contig_15114_pilon	-	1764	4	Intergenic	novelGene_121173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1082	1426	649575	649231	FALSE	25	GTGGTTCAAACCCACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKYCDNKHNQKGKIRDRGIYWKPCSIPPSAEFFLSNLFLHLNSHRYLPVSLSRAISFDVSIPLSSTPVQGSFLSRTKYCIFINQINVSVMGHFLGYCLSSYYFSPIIQRGAA	653706	648892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_649899_651386_651612_652149_652256_653279
911291	contig_10286_pilon	-	3576	1	Intergenic	novelGene_98433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACAACTGCCCCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482536	478960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_479000_482500
911292	contig_272_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_177630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACTTTCTCACCCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69822	67253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_272_pilon_-_67300_69800
911293	contig_10377_pilon	+	4683	1	Intergenic	novelGene_115416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCTTTTAAGAAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257056	261739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_257100_261700
911294	contig_7898_pilon	+	448	1	Intergenic	novelGene_47565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTTATAGCAGCGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379380	379828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_379400_379800
911295	scaffold_4805_pilon	+	626	2	Intergenic	novelGene_161020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408123	415308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_+_408389_414947
911296	contig_709_pilon	-	3443	9	Intergenic	novelGene_57585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_8	168.644550386308	22	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	733	2826	2246128	2212176	FALSE	55	CAAACTGCAAGAAAAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERGIKWACEYCTYENWPSAIKCTMCRAQRPSGTIITEDPFKSGSSDVGRDWDPSSTEGGSSPLICPDSSARPRVKSSYSMENANKWSCHMCTYLNWPRAIRCTQCLSQRRTRSPTESPQSSGSGSRPVAFSVDPCEEYNDRNKLNTRTQHWTCSVCTYENWAKAKKCVVCDHPRPNNIEAIELAETEEASSIINEQDRARWRGGCSSGNSQRRSPPTVKRDSEMKMDFQRIELAGAVGSKEELEVDFKKLKQIKNRMKKTDWLFLNACVGVVEGDLAAIEAYKSSGGDIARQLTADEVRLLNRPSAFDVGYTLVHLAIRFQRQDMLAILLTEVSQQAAKCIPAMVCPELTEQIRREIAASLHQRKGDFACYFLTDLVTFTLPADIEDLPPTVQEKLFDEVLDRDVQKELEEESPIINWSLELATRLDSRLYALWNRTAGDCLLDSVLQATWGIYDKDSVLRKALHDSLHDCSHWFYTRWKDWESWYSQSFGLHFSLREEQWQEDWAFILSLASQPGASLEQTHIFVLAHILRRPIIVYGVKYYKSFRGETLGYTRFQGVYLPLLWEQSFCWKSPIALGYTRGHFSALVAMENDGYGNRGAGANLNTDDDVTITFLPLVDSERKLLHVHFLSAQELGTEEQREKLLKEWLDCCVTEGGVLVAMQRSSRRRNHPPGHTDGREMARPLPTDPALHIPV	2246860	2211558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2212362_2213472_2213703_2213866_2213997_2215315_2215437_2221959_2222159_2222683_2222756_2224147_2224302_2227044_2227233_2245314
911297	contig_11055_pilon	+	3070	11	Intergenic	novelGene_142176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCTCAAGACGAACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158112	189240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_+_159553_159753_159864_162131_162259_167700_167897_173505_173695_174693_174796_175940_176136_176412_176515_177127_177338_188532_188812_189120
911298	contig_11898_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_144292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTACGCAATGGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242219	240612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_240600_242200
911299	contig_10861_pilon	+	4353	1	Intergenic	novelGene_39409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAGAGTAGAGCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1927114	1931467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1927100_1931500
911300	contig_3745_pilon	+	6908	2	Intergenic	novelGene_85104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAGAGGAAAAACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472805	484172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_479278_483736
911301	contig_17470_pilon	-	2914	23	Intergenic	novelGene_110467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	938	1378	54939	53747	TRUE	25	CCAAAAAGCTTCCCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFSRIQDSASLASAKYCWACSESSRSCRRWEALDFSDSHFWFSSLSLAFTSSAAKWPSSTMAFPFCVTALMRGSCPAISACRAWCFFSRFWTPIKSLPLLVDAAMGSFSRIHVSSSSTSRKSCCKRRESASFCFRAIMGSLRAS	65623	46683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_46709_46880_47026_47103_47259_47941_48078_49245_49347_50265_50405_50893_51007_51808_51887_52015_52170_52406_52612_53120_53303_53643_53888_54083_54207_54762_54981_55802_55897_56207_56342_57609_57761_60084_60282_60861_60983_61948_61990_64180_64229_65162_65255_65605
911302	contig_6326_pilon	+	3181	4	Intergenic	novelGene_168533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_2	14.1656862405839	197	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2509	2985	284987	291496	FALSE	5	TGTTTTGCCTTTTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEVEESQLKDEMQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLPNGADILFEPKLKFA	282478	291692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_285143_286930_287015_289403_289467_291322
911303	contig_8898_pilon	+	2282	2	Intergenic	novelGene_137247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACAACCCAATATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302283	304722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_303816_303972
911304	contig_12142_pilon	+	2489	17	Intergenic	novelGene_147799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	62.5292119233083	1	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	24	887	87452	108736	TRUE	25	TCGGCAAGCAAGGTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGPVAIMAGPARRCCLGWDFSTQQVKVVAVDENLNVFYEDSVHFDRDLPEFGTQGGVHIHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKALGFDFSQILALSGAGQQHGSIYWKAGASRALTSLSPALPLHQQLEACFSISDSPVWMDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIRDKVWSQACLGACAPQLAEKLGPPMRSSSVAGTISSYYVQRYGFHPGCKVVAFTGDNPALKMVP	87428	136582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88923_89007_94352_94423_96209_96291_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100329_100403_102360_102480_104919_105002_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
911305	contig_9484_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_105679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATCCAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180483	179282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_179300_180500
911306	contig_3975_pilon	+	3628	1	Intergenic	novelGene_54949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2350945	2354573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2350900_2354600
911308	contig_5317_pilon	+	765	3	Intergenic	novelGene_76550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	348	398	43276	43326	FALSE	15	TGGTGTTTGTAGCATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35294	43693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
911309	contig_14013_pilon	-	3438	3	Intergenic	novelGene_178896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1244	1840	116316	115720	TRUE	10	ATTCTTTCTTTCCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRNNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	195417	55018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14013_pilon_-_56430_115532_116517_194374
911311	contig_15866_pilon	+	2180	7	Intergenic	novelGene_63675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1311	junction_6	244.62857332881	118	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	965	1501	620763	633133	FALSE	10	GCTTGGTTTACTGATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDMKGCIKVLKDQPPNSVEGLLNALRYTTKHLNDETTSKQIKSMLQ	618780	633812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_627916_627988_633069
911312	contig_9389_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_84005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAGCACCAGTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519335	521269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_519300_521300
911313	contig_9571_pilon	+	4927	3	Intergenic	novelGene_136287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACATTGGTTGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469070	738969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_469759_605609_606428_735548
911314	contig_11986_pilon	-	4883	10	Intergenic	novelGene_69103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	118.633682473756	274	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1015	3048	728	3775	76136	50761	FALSE	70	AATGTAAAAAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGSAQGNFTGPTKKTNGNNGTNGALVQSTSNQSALGAGGANSNGNSARVWGVATGSSSGLAHCSISGGDGKMDNMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTDPQTSTSQNVSFSVQPQNLNTDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGGGEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFNQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGNGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNSGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSSSDINGKGSTGWDSPSVSSQNPAMQPGSEQMNSWAKAASSGTATSEGSSDTSGHHNEGSTGREGAGEGRRRDKGVVDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQPSNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVSSPPAAVPANTGWGDSNNKAPNGPGVWGDSISSTAVNNAAAAKSGHAWSGTVSQEDKSPTWGEPQKPKSQNWGDGQKSSPAWSAGGGDWADSASVLGHLGDGKKNGSGWDADNNRSGSGWNDATRSGTSGWGNGTNAKVNPGTNWGESLKPSPQQNWANKPQDINVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTSTSTTTTTTASNNPNMVETPPSHQASTQLNRSPLLGSVSSGWGEMPDVHSKAEKSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPAVTFGRAGAPTAAPALCKPASKSMQEGWGSGGDEVNLSTSQWEDEEGDMWNNAASQDSTSSCSSWGNAPKKGLPKGMKTAGKQDEAWILTRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMVTKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKVGV	157425	49652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_50916_51981_52040_53488_53570_57243_57411_58893_59110_73765_76355_93382_93710_122397_122420_123193_123295_157366
911315	contig_7887_pilon	+	4858	18	Intergenic	novelGene_124869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	55.3882178019863	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	1151	2518	203857	214242	FALSE	25	AACTTTTCCTAACTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKVFRNAEKYYGRKSPIGRDVCRLRKAYYNARHEASAQIDEIVGETASEADSSETSVSEKENGHEKDDDVIRCICGLYKDEGLMIQCDKCMVWQHCDCMGLNSDVEHYLCEQCDPRPVDREVPMIPRPHYAQPGCVYFICLLRDDLLLRQGDCVYLMRDSRRTPDGHPVRQSYRLLSHINRDKLDIFRIEKLWKNEKEERFAFGHHYFRPHETHHSPSRRFYHNELFRMPLYEIIPLEAVVGTCCVLDLYTYCKGRPKGVKEQDVYICDYRLDKSAHLFYKIHRNRYPVCTKPYAFDHFPKKLTPKRDFSPHYVPDNYKRNGGRSSWKSERSKPPLKDLGQEDDALPLIEEVLASQEQAANEMPSLEEPEPEGATAEVSEGGKKQEDSSQESQPACTPEERRHNQRERLNQILLNLLEKIPGKNAIDVTYLLEEGSGRKLRRRTLFIPESSFRK	185851	216582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_186013_186125_186273_193137_193247_196303_196469_196618_196714_200511_200670_201803_201957_203613_203669_203749_203884_204915_205165_206026_206114_207988_208080_208460_208600_208720_208894_210981_211149_212364_212406_213350_213653_214150
911316	contig_6102_pilon	+	4159	31	Intergenic	novelGene_31840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_20	466.616236560862	3034	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	886	2661	87	2747	370803	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370716	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
911317	contig_7272_pilon	-	2770	15	Intergenic	novelGene_25356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	637.430160240064	9	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	711	2136	422	2557	610299	597975	FALSE	65	TTGGGCTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRYPCSFVVIVGWCR	633267	597761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_620476_620568_632105_632194_633027
911318	contig_9440_pilon	-	6971	24	Intergenic	novelGene_59118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	359	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	6622	6969	1967002	1908169	FALSE	80	AAACCTAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHRCDTTSFRSSNTNFFSNILPSWKPQVIFFSFPKGMVKIHLKDWLCLLHSICSARNVTILMYRRCRCSFHVCHCKASHSHAESFSEHWPSREGDERPPFLQKMNSSHLVPTACF	2007789	1908166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1908244_1951008_1951261_1966981_1967114_1970768_1970880_1972466_1972613_1978407_1978730_1979534_1979656_1982195_1982355_1984411_1984522_1986421_1986609_1987262_1987393_1989463_1989597_1991296_1991387_1992099_1992225_1992975_1993119_1994745_1994897_1995049_1995196_1995946_1996081_1998675_1998874_2000140_2000265_2000640_2000813_2002218_2002338_2003853_2003967_2004213
911319	contig_5779_pilon	-	5539	36	Intergenic	novelGene_106456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	341.722157099977	125	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1093	3282	45	3326	358732	156903	TRUE	35	AATAGCCTATTTTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFRRPQPGCYCRTAAAVNLLLGVFQVFLPCCRPGGAQGQAIEPLPNVVELWQAEEGELLLPTQGDSEEDMEEQSEDQSFSDKLFTERGLHFQPSVLDFGIQFLGHPAAKILYAYNPSRDSEVVVNSVFTAARHFHVPPVHCRVIPAMGKTSFRIIFLPTEEGSIESSLFINTSSYGVLSYHVSGIGTRRISTEESAKPLPNAYFLLPQVQSIQLSQTQAETANTSLLQVQLECSLHNKVCQQLKSCYLESDDVLRLQMSIIVTMDSSSKEFEENTQDLLDHLAIVYVAIDNSETSDDSAVNMYILHSGNSLIWIQDVHHFSQRDALSLKFEPVLLPTSTTNFTKIASFTCKATLCDSGMNYMEVVRKTKSTPTLKACLSSPVVPGYFRMDSAAAQFHIETHENTSGVWSMWYLNHFDRSIVLNDIFVSKKTKHILKILNFTGPLFLPPGCWNIFSLKLAVKDIAINIFTNVYLTTNIGAIFAVPLQIYSALTKEGSLGFEVIAHCDMHYFMGKSRAEIPNWQRSLSLDRSTWDVDSELANKLYERWKKLKNGDVCKRNVLGMTRFSHLKKSKESESFVFFLPRLIAEPGLVLNFSATALRSSVVKYFVVQNPSSLPISLQLLPVSSYPKPEAAMRLLHKWFGTDMQMINFTTGEFQLTQACPYQGVNSEESRFGILHLHLQPLEMRRVGVVFTPADYGKVTSLILIRNNLTVIDMIGVEGFGARELLKVGGRLPGMGGSLRFKVPESTLMDCRRQLKDSKQILSITKNFKVENIGPLPVTVSSLKISGYNCQGYGFEVLDCHQFSLDPNTSRDISIVFTPDFTSSWVIRELTLVTAADLEFHFTLNVTLPHHLLPLCADVVPGPSWEESFWWLTVFFVSLSLLGVILIAIQQAQYILTEFMKTRQRQNSSSSLQQNNSPVDVIGSHSHKSNCKNFLDAYGPSDKGRGRNCLPVNAPQSRIQNAAKRSPATYGHSQKKHKCSVYYSKHKAGTSLASSASTTTEEKQTLALGSSLSVLKEDLCPDVMGENWINLKYASGVNVNLQKSLTFPKNLLNKEEIHLSTSQTYQKFPGKIMGVTNKCLSRVKQTIVKL	358776	106688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113291_125880_125961_126872_126952_127357_127544_129215_129380_132098_132224_156804_156957_163902_163956_164145_164529_164893_165044_165624_165811_166004_166192_168165_168309_171097_171226_177330_177404_178739_178850_181059_181202_183540_183659_184755_184826_186322_186494_192963_193118_193832_193933_195520_195630_195919_195979_197650_197805_197995_198074_225516_225628_226486_226604_227922_228047_232247_232317_349588_349633_357795_357867_358608
911320	contig_5033_pilon	-	340	1	Intergenic	novelGene_29093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGACACCAGGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707028	706688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_706700_707000
911321	contig_1699_pilon	-	3506	1	Intergenic	novelGene_72822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCATTGCATTTTCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84688	81182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_81200_84700
911322	contig_16204_pilon	-	2761	1	Intergenic	novelGene_154525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1858	2316	401113	400655	NA	0	TCCCTGTGCCCCCTCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPRDPRTGGPRARPLIRFLNGELSGPLNQLWRQPGFCHRPACRPLPSSPAELVFTRPGMEHLLFFTGRAAPGNWESRFLMDPQVTFARIKGRCLVDETEILKRAFHVHRPLIEAAPWPFIPSTQQEEDTAGGDPVTWLLSLEVPKARPPP	402970	400209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_400200_403000
911323	contig_11422_pilon	-	1574	2	Intergenic	novelGene_99076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1179_1227
911324	contig_7088_pilon	+	3005	5	Intergenic	novelGene_159804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTACCCGCAGAGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731758	749063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_734229_741620_741771_742561_742765_743346_743462_748996
911325	contig_15787_pilon	+	2668	1	Intergenic	novelGene_143990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGCCAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83756	86424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_+_83800_86400
911326	contig_2414_pilon	+	3690	4	Intergenic	novelGene_158525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1558	2076	1155127	1155645	FALSE	55	AAAAAAATCAATCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALECWVANAKRRNDEVKELNRRFQRAAREDKVKYYNDMCKDLEVEKQKERIHMAFLSLKKLKKKFKLQVAIVKDSMGKILNDAGSIERRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEEAYDQEPMVLKEEVQAALKALSKNKDPVTDGISTEKFQQTDAALEMLTRLCPEN	1015127	1157259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_1015167_1042259_1042422_1090008_1090330_1154091
911327	contig_7004_pilon	-	2925	12	Intergenic	novelGene_126490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	39.0511425637867	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	1128	2186	411918	409512	TRUE	10	CTGCACTTGTGCTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAGHFAGAVFQGREVVAHKTFHRYTVRAKRGTAQGLRDARGRAPHSAGANLRRYNEATLYKEVRDLLARPGWAEALREAGTILLRAPRSGRSLFFGGCGAPLQRGDPRLWDIPLATRRPTFRELQCVLHKLTTLHVHGEDPRETVRSDSPQTHWKTVKEERKEAIEEERRKVPSNENEALGKNAESPKQGLEGEDTFQVELELVEMTLGTLDLREFEVLPKQSRKKRNKKERSRNLEAGAHRTLPQQPQEDEALTESALADTTPLGPLLDEAKAPGHPELWDVLLAACRAGNTGMLKLQLAASLTDPGVTSLLSAPLGSGGFTLLHAAAAAGRGSVVRLLLEAGADPTVQ	413946	408280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_408611_408831_408918_409054_409223_409356_409516_409615_410097_410782_410939_411126_411356_411636_411785_411877_411991_412394_412590_412707_412811_413189
911328	contig_498_pilon	+	2146	6	Intergenic	novelGene_148556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_3	68.2800117164606	294	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	16	1044	755864	760433	TRUE	5	CTGTGTCTTGTGTCCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATGALLGPLVTGLYDVQAFKFGNFVLKSGLSSPVYIDLRGIVSRPRLLSQVAEILFQTAQNAEISFDTVCGVPYTALPMATVICSTNQIPMLIRRKESKDYGTKRLVEGAVNPGETCLIIEDVITSGSSVLETVEVLQKEGLKVTDAIVLLDREQGGKEMLEAHGIHLHSVCTLSKMLEILEQQKKIDAEMVRRVKKFIQENVFVAANPNSSLSSVTKAPGELSFGARAELPRIHTVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSEASELLQLADALGPSICMLKTHVDTLNDFTLDVMKELTTLAKRHEFLIFEDRKFADIGNTVKRQYEGKCSIQESMRIRNPV	755848	768864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_+_756020_757430_757585_759714_760597_761736_761913_762926_763042_768216
911329	contig_9571_pilon	-	2633	2	Intergenic	novelGene_136294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGAAATAGAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525195	521734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_521799_522626
911330	contig_9389_pilon	-	4140	8	Intergenic	novelGene_84078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	40.5311671458408	96	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	705	3035	1256305	1243616	TRUE	10	TACTTACCCTCTCTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVLEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQNLNEGEKLSSEHIMVRFMKNNTWSSVLGEISELHGNKHQQKNQRRHLRSRVVENLCESNEGNQCGKTFSRIPNLTVLKRNSPEVNLFACSECGKAFVDHSSYKHHTRSHTGCNARQCKECGEACSCPSHLTTPMRTHNGKKPHKCKSYGKDFICFSTLKNSVTSVTGEKRYECNECKKHFCTFSSFCTHVRDHKRERKEYCKTYSRPSSFILHKKFHNTGMPYQCKECGKAFSKASSLTTHTRTHSGERPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIRTHNGQRPYECKECGKAFTCSSHLTTHIRTHIGERPCECKECGKVFSDSSNLSTHMRTHCRDRSYECKECGKAFMQVSHLTKHVRTHSGEGSDECTECEEVFRRATYLTKHVRTHSGERRYECQQCGKAFSDCSALVKHIRTHTGERPYECKECGKAFSDSRVLTTHKRTHTGERPYECKECGKAFRQDSHLTNHIRTHSGERPYKCKECGKTFRRASNLTMHRRTHSGEKPYECKECGKLFTRSSLLTNHKRTHSGERPYECKECGKAFTQHSALTTHTRTHSGERPYECKECGKAFRQHSVLTIHIRTHSGERPYECKECGKAFRQLSALTAHARTHSGERPYECRECGKHFRQRSALTTHTRTHSGERPYECNDCGKAFRSSSILTSHLRTHSEERPYECKECGKHFRQLSALTTHIRTHSRERPYECMECGKAFGQLSALTTHTRTHSGERPCECN	1264805	1085733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1086191_1117259_1117282_1242989_1245666_1246244_1246396_1247296_1247424_1256302_1256715_1260828_1261050_1264731
911331	contig_13158_pilon	+	4109	1	Intergenic	novelGene_107301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182296	186405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_182300_186400
911332	contig_1867_pilon	+	1972	3	Intergenic	novelGene_54534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	740	1045	327124	327429	FALSE	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMLPVGVQNKTPDDFSVEEKALKLPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMKEQTAKINSRLEIIQR	325209	328356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_325689_325764_325865_326963
911334	contig_7457_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_31275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATGAAATGAAGTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145212	146429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_145200_146400
911335	contig_9036_pilon	+	2043	2	Intergenic	novelGene_155438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	294	794	28637	29137	TRUE	45	GTATGGCTAGATTAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIHVDLSRWNTQESSQLHLWKETMEKLNISQNKAKANCGTDHQLLICKFKLKLKRIRTSPQEPKYDIEYIPPEFRNHLKNRFDVLNTNERRPDRLWDDIKDIIREESKRSLKRQERKKRPKRMSEETLKLALECQVAKVKGRNDEVKELNRRFQSAAGEDKVKY	28343	142701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_29395_141709
911336	contig_12622_pilon	+	2608	9	Intergenic	novelGene_5876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	50.2319619365997	284	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1355	2110	1223766	1229143	FALSE	25	GAGTTGCCTGAAACCCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSSAVLFILVFSLVFKLEELRAALVLVVLLIAGGLFMFTYKSTQFNVEGFALVLGASFIGGIRWTLTQILLQKAELGLQNPIDTMFHLQPLMFLGLFPLFAVFEGLHLSTSEKIFRFQDTGLLLRVLGSLFLGGILAFGLGFSEFLLVSRTSSLTLSIAGIFKEVCTLLLAAHLLGDQISLLNWLGFALCLSGISLHVGLKALHTRGDGGQKPLKGLGSSPDLELLLRSSQQDEEDNEEEQYFVAQGQQ	1215047	1229641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1215082_1221100_1221455_1221992_1222144_1222950_1223832_1224389_1224559_1224678_1224763_1227159_1227336_1228537_1228668_1229012
911337	contig_3754_pilon	-	5445	2	Intergenic	novelGene_146841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	284	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	5020	5325	368812	368507	FALSE	25	TGACTTGATGGCCCCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSISSYACKSWTMNKDDRKKFAVFELWCWQRILNILWTARRMNKPVLEEVQPECFLEARMVRLHLMYSEHVIRRGLSLEKDIMLGRGSSKKRKTLNEMD	373941	368386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_369030_369139
911338	contig_12635_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_60859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGACAGATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601646	603897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_601600_603900
911339	contig_5894_pilon	-	2071	2	Intergenic	novelGene_83003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205628	108917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_109854_204493
911340	contig_16685_pilon	-	5856	1	Intergenic	novelGene_115043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1331	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTAACTTGCCCACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449682	443826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_-_443800_449700
911341	contig_1813_pilon	+	2005	1	Intergenic	novelGene_105500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCTGGTTTAGACCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333787	335792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_333800_335800
911342	contig_10838_pilon	+	3275	23	Intergenic	novelGene_129160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	55	junction_22	77.720161822522	168	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	961	2886	92	2977	35645	103653	FALSE	10	CTTGTCTCTTCTATATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKEPVNASLKAAPYADVIAQLTAPSVINHVMLASYDGQEPEFLIIWVLFHNPKKQMCSSETLDSAEEFLARVDIELDSPNPTPVIKSVSLRARTGVARIHAPKDLQTMHLFASVASSSKQCLPLKNAGNIEVYLDIKIPDQGSHFSVDPENLFLKPGEEREVMVSFTPKDSKTCEKRIMKIFVQPFGPQYEVVLKGEIVSSGNKPLTLGSCCSDIPSVLSNKQFLAWGGVPLGRTQLQKLALRNNSTSTTQHLRLLIRGQDQDCFQLQNIFGTEERLTSNCEIRIRPKEDINIYVLFAPTRLSCMFAKLEIKQLGIRSQLGIKFTIPLSGYGGTSNLILEDVKKLSDSYMVTVNGLIPGKESRIVFSVWNTGSRAAFVKAVCFKDSEKKILLDPKVMRIFPDKFVLKERTQQHVTIIYNPSDREGSYTTTTELSTIYFFGGDEISRQQYRRALLHKPGIIQQILPEHSLLQNINFAEAFQDELLVTEEYDLPQRPNDILLFYGNMRKIILSVIGEFRDSISSREFLQPSSKASLESKSESRTCGKHSGNVSLDVLPVKGPQGSPLLSQAFHPPQDKLASEEIWTVQPEHLILIAPSPCDMAKTRRFQILNNSVRSLKFELYWPAHCLTITPQHGVIEPESKLQILVSPNSSLSTKHSVFPWSGLIYVHCDNGQKKIVKVQIQEDLTQEERPFAHWASSPFGILPPGSELSISHLAKPVTQLPSTKVEIRNKTVTFPATEPGETSENYLELENHGNTEVKWHLSSLAPPYVKGVNESGDVFRATYAAFRCAPVSGLLESHGIQKITITFLPRDGGNYAQFWDVECHPLKEPHMKHTLRFQLSGQSSKAESEPESALISTDTLIKLDHSLKPRRQAVSAASALTPGQIDLTRRGVYAPEDVYMFLPTRVGDSRTLKVNLRNNSFITHLLKFLSPREPFYIKHSKYSLRAQHYINVPVQFRPQSAGAFEALLVIQTDEGKSVAVRLIGEALEKN	35553	103951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_35669_35790_35855_36502_36643_36743_36837_37342_37462_38348_38526_48033_48125_48289_48467_51950_52212_52467_52584_54121_54232_69931_70083_73699_73879_74478_74603_76815_76922_77356_77568_81327_81408_81583_81680_87343_87464_87902_88025_90328_90456_90945_91005_103514
911343	contig_1275_pilon	-	1960	8	Intergenic	novelGene_108786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	640.840392112783	15	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	717	1243	1959	468178	448465	FALSE	80	AAAAAACAGAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKA	469588	448463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468322_468489
911344	contig_11396_pilon	-	1752	13	Intergenic	novelGene_71361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	18	junction_12	104.481258287472	179	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	174	1439	748866	736642	FALSE	20	TGACACGTCTCCCAAGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPRTRKVLKEVRVQDENNVCFECGAFNPQWVSVTYGIWICLECSGKHRGLGVHLSFVRSVTMDKWKDIELEKMRAGGNAKFREFLESQEDYNPCWSLQEKYNSKAAALFRDKVATLAEGKEWSLELSPAQTWNPPQPKTPLPTAHRAAGQPQSVTASSDKAFEDWLNDDLGSYQGAQENRYVGFGHTVPPPRRDGDLLNSAVSSLYSGWSSFTTGASRFASAAKEGATKFGSQASQKASELGHSLNENVLKPAQEKVKEGRILDDVSSGVSQLASKVQGVSSKGWRDMTTFFSGKTEESSDRPPEGSGYQNSSRDHVQGSTIDQSFWDTFGSAEAPRVRQSPSSGSWTCVDNSTERKSSDSWDVWGSGAGSNHRNSNSDGWENWEGGWEGAGGEGRARAVQKAAPPPAPAEEGWDNQNW	752492	736328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_736997_737302_737380_737975_738036_738932_738990_741226_741260_742028_742086_744971_745069_745477_745565_746475_746577_747272_747445_748155_748266_748806_748871_752323
911345	contig_13740_pilon	+	3266	7	Intergenic	novelGene_34698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2627	2959	160875	161667	TRUE	70	AAAAAAAAAACTTACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGMVFLQYNFIHGIMVIKSNKAKASFLSRLPISNYLNGINFSIFLEIISKMMFLSIFFNSTNKQLLHSYVSAWLSRFLSCYSTFWLNHSPINGMGSCSHGRINLSHG	156927	162172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157531_158265_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161269_161573_161719_161916
911346	contig_16045_pilon	-	517	1	Intergenic	novelGene_130864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCGCAGTTTTATCCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360742	360225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_360200_360700
911347	contig_10766_pilon	-	2185	1	Intergenic	novelGene_151202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	395	742	142865	142518	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIEYAMGCQKKEQICLGRSAARMLLRSKDERLRLTYFGHVIRRNQSLEKDIMLGKVEGRGKRGKPSMRWTDTVTTMGSSITTIVRMTKDQAVFRSVVHRVTMSQNQLDGT	143259	141074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_141100_143300
911348	contig_5153_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_74392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993689	991461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_991500_993700
911349	SIRV6	+	637	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-25	8527	18	264	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTACAAATGTTGCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1105	2804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
911350	contig_16622_pilon	-	4986	13	Intergenic	novelGene_48407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.9793985861562	157	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	63	2327	36525	10351	TRUE	60	AAAAAAAAATCTAGGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNFLVWHRTFRVGKPDVSAMGKRGSRSQSQLLNTLTKKQKKHLRDFGEEHPFYDRVSRKETKPQICQLSESSDTSDSESEADSEPEQVSGYCKLLATLKDISEEEEDDEEEEEEIIDEEPEMSGEDGDGDVGVEEEMAAESADMQENMALYTDCQEKGREGPPGKSQQASPEEFTDAKHESLFSLETNFLQEESGGSCSLKVSQDPFLQHVNKELKDKDVQAVGTNPKTTHQLKWPTLGQLVFSSKFQKLETFKPSKDIDLKSLHLQKPLESTWTKTNSQFLSGPQKSSSPFTPLQKELFLIMNSYRDLFYSERTALKNGEEIRHVYCLHALNHVLKANARVLGNNSRRRSQKLGVGDDDDFRDQGLTRPKVLIVLPFREAALRVVQLFISLLEGDSKKKIIVSNKKRFKGEYGSDPEERPPNLKRPEDYEAVFVGNIDDHFRIGVAILQRSIRLYAPFYSSDILIASPLGLRTIIGGEGEKKRDFDFLSSIELLIIDQADIYLMQNWEHVLHLMSHMNLLPLDSHGVDFSRVRMWSLNNWSKYYRQTLLFGALQDAQINSLFNKHCINLQGQVAVRNVPMTGSISHVLVQLPHVFQRMEAENVASVIDARFNFFVNKILPQYRDAVMSHTLIYVPSYFDFVRLRNYFKKEELNFTHICEYTKKSGVSRARQFFLQGEKQFLLLTERFHFYKRYTIKGIRNLIFYELPTYPHFYSEICNMLKATNRGEEATWTCTVLYSKYDAQRLAAVVGVERAAQMLQSKKNVHLFITGEK	36587	7443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_7681_7928_10595_20458_20705_21421_21535_21626_21810_23051_23255_24982_25203_26916_27328_29219_29309_30446_30621_34653_34889_35617_35658_36418
911351	contig_7260_pilon	+	2926	1	Intergenic	novelGene_169139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGACTTTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309860	312786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7260_pilon_+_309900_312800
911352	contig_6079_pilon	-	5828	1	Intergenic	novelGene_160101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAGCTTCACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451962	446134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_446100_452000
911353	contig_16322_pilon	-	1579	5	Intergenic	novelGene_87540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	341	junction_1	69.0484431395814	20	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	394	1269	86481	77890	FALSE	30	TAAATGTAATCATTTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	86874	77579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980
911354	contig_678_pilon	-	3278	3	Intergenic	novelGene_167803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACGAATAAAATAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77206	73767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_76053_76168_76453_76497
911355	contig_11978_pilon	-	3142	5	Intergenic	novelGene_63114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	294.215376042789	26	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1443	1829	1889690	1884840	FALSE	0	CTCCTCCCCGCCCCCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL	1892022	1883526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1884948_1886351_1886565_1887741_1887799_1889681_1891066_1891955
911356	contig_9839_pilon	+	2302	2	Intergenic	novelGene_88573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1177	junction_1	0	60	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265021	268334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_266513_267523
911357	contig_1945_pilon	-	567	1	Intergenic	novelGene_178898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTGGAACTGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2932	2365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1945_pilon_-_2400_2900
911358	contig_4469_pilon	+	5321	4	Intergenic	novelGene_21905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_3	32.782108941718	146	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	458	982	433062	440976	FALSE	40	GAAAATAACGTACCCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQKASVESCIRVLSDVAKSRAIAIPVDLDSQVNNLFLKSHNIVQKTAMNWRLSVRNAARRDSVLAASRDYRNIIERLQDIVSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENTDARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEENEEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGEKVLLFIFK	432604	445315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_433117_435295_435481_439771_439921_440840
911359	contig_5039_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_64815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	115	582	225235	225702	NA	60	TAAAAATCAGAGCAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKTYQVNSQKRARVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYFMIKGMIQHEDIAIIDIYIPNDRAPKYIKQTLTALKREIDNSTIIVGDFNTPLLVKDRKSRKKLIKDTEDLKATVSQLELVGIYRTLHPTASKYTFFSNAHETFSRIDHILGHGSTLNKIQNIEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKGKKINYMETK	225120	225962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_225100_226000
911360	contig_2438_pilon	+	1272	6	Intergenic	novelGene_112019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	2309.15937951455	26	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	83	682	310588	312871	TRUE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305083	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729_313100_313166
911361	contig_240_pilon	-	2234	14	Intergenic	novelGene_173793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	180.303360410027	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	135	2213	472309	417340	FALSE	0	GCCCTCTTGCTGTCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSFIFQLQSGKHSQCSEAIITVLCGTEGAQEGLNKPKGGTDDEEMTFSSLHQVRYVKHMKILHPMAPETTDGGMLESLKQQLVEQEYELQKEQNLNMELFSEIHNLQNKFRDLSPSRYDSLVQSQARELSLQRQQIKDSHDICVIYRQHMNTMMKAFEELLQASDVDCYLAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSAEVEVSAQNELMERIEEDNLTYQHTIPESPEPSASHALSDCEMSEKSSFFSRDQKQDSEIEKISVIANSISQDLLMEHIQEIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFDQGSANIFAYGSELHNSLTSEIHFLRKQNQALNMMLAKGSRDKQKENERLRESLSRKIANLENLQQKYSSVKGENERLQKEVSEKERHNQQLVQEIYDRRKELSRAQEEVKLRQQLLLQNDKLLQSLRVELKVYEKLDEEHRRPREARAEASGEGWKGQDPFSDLHGLLREIQALRVQLERSIETNSNLQSKLEEQLAKDGSRCSMANENSYDLFDSTLAVPPKLASETLLLYGDDVDSLSCDSGSSATSSPSTIRLVPGHRLWASKSGRHVLGLIEDYNALRKQIGQGQRLLAKMDVQIQEVSSPTVRELGTKGPYSTPLSRFVTSVNTAKLILEEASRLLKLLWRVSLPTDGQCTLHCEQIGDMKAEITKLQKKLFEQDKKLQNTAKLLQLSKHQEKVIFDQSQARGCPSRNIQSQQTRLLRRTFSQ	472443	417318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_417417_422182_422310_430808_430953_433498_433765_434813_434892_441613_441776_443187_443310_444598_444789_446087_446205_450251_450372_456498_456675_459423_459473_470066_470300_472091
911362	contig_7366_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_164974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTCACCCAACAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67314	66163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7366_pilon_-_66200_67300
911363	contig_9434_pilon	-	2460	14	Intergenic	novelGene_150492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_13	34.6152136747916	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	98	1576	190983	160855	TRUE	40	ATCAACTATGGAATAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGGWRKRAENEGWQNWGEYMAAKVQKLEEQFRSDAAIQKDGNSSTIFSGVAIYVNGYTDPSAEELRKLMVLHGGQYHVYYSRSKTTHIIATNLPNAKIKELKGEKVIRPEWIVESIKAGRLLSYIPYQLYTKQSSVQKGLNFNPVCKPEDPMPGPSNIAKQLNNRVNHVIKKIETENEVKVNGVNSWSEEDASHDSTDASHDFTCVELEEIFPGWKQNGIPHHRDSPAIVNGHAHSSNGALKTQDCLVPVGNSVASRLSPDSGPEEEAAEKGSTDFRDCAAQQLQQSSRNAAAVRSPHRTNSCSSSSSHSTTKINGAHPSTVQGPSSTKSTSSVPALSKAAPSVPSKPSDCGFISNFYSRSRLHHISMWKCELTEFVNTLQRQNSGVFPGREKLKKMKTGRSALNVADTGNMSVLSSPRHQSCIMHVDMDCFFVSVGIRNRPDLKGKPVAVTSNRGTGRAPLRPGVNPYLEWHYYQNKSLRGKADLAPGL	212893	141469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_141664_146628_146749_149896_150052_152233_152363_158735_158842_160674_160875_163334_163452_165249_165358_168082_168814_171448_171602_182004_182174_189139_189267_190929_190994_212806
911364	contig_6673_pilon	-	4418	1	Intergenic	novelGene_164018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGATACAATTAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102531	98113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_98100_102500
911365	contig_8330_pilon	+	1542	10	Intergenic	novelGene_71821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	233.908339122638	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	107	973	853343	856687	TRUE	5	TTTTTTCTGTGTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853236	857470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
911367	contig_5779_pilon	-	2390	3	Intergenic	novelGene_106494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	795	junction_2	18	108	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	99	374	193912	192922	FALSE	70	GAAAAAAAATAGAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLKFEPVLLPTSTTNFTKIASFTCKATLCDSGMNYMEVVRKTKSTPTLKACLSSPVVPGYFRMDSAAAQFHIETHENTSGVWSMWYLNHFDRSIVLNDIFVSKKTKHILKVHMVFYSDFIFPF	195598	190905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_193118_193832_193933_195520
911368	contig_4392_pilon	+	3882	1	Intergenic	novelGene_117296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAATGCAACAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98799	102681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_98800_102700
911369	contig_14450_pilon	+	3368	3	Intergenic	novelGene_49028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1147	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2555	3106	1309576	1310127	FALSE	30	CAAAGTGACCTGTCCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDLERSKTLGEEVTADVVEIVRELEIEVEPEDVTELLYSYDKTLTDEELLLMDEQRKWFFEMESNPGEDAMNTVEMTTKDLEYYINLFDKSAAGFERTGSNFERSSTAGKTLSNSITCYREIFSERKGQPMWQTSLLSYFKKLPQSPQPSATTTLISQQPSPSRQDLLPAKRLRLTEGSDDG	1233525	1310389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1233610_1294379_1294872_1307597
911371	contig_6164_pilon	+	1980	4	Intergenic	novelGene_121258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAAATAATGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37573	107729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_38209_38452_39410_50070_50393_107663
911372	contig_20951_pilon	-	691	2	Intergenic	novelGene_43081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCTGACTTTAGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27569	26666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
911373	contig_6102_pilon	+	2404	19	Intergenic	novelGene_32353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	81.0739069927047	40	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	744	2235	93	2327	1699217	1714849	FALSE	10	GCTGAGACCCTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1699124	1714926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1701972_1704711_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
911374	contig_5423_pilon	+	4601	14	Intergenic	novelGene_85304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_12	226.320582177494	332	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	81	1475	765725	797450	FALSE	25	TACAGTCATGATTATCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSASRLRSERRLSGLRARPEAVSVTMAMTAGTTPTFPMSNHTRERVTVAKLTLENFYSNLILQHEERETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKADMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPPEVPVSERAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWGHIRERPAAIPIEIKSIDDTSNFDDFPESDILQPAPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL	710172	800576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_710242_765713_765859_772687_772740_778415_778539_778785_778870_786503_786628_788452_788608_788962_789066_789250_789313_792420_792539_792976_793101_794094_794191_797125_797218_797322
911375	contig_10011_pilon	-	2882	1	Intergenic	novelGene_68050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1276	1575	195326	195027	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKQAQLPWTPRSPLPWPLRLGAHCCAPCSGERAAVRHVDQPGSSRAVVGGLEGSSDGGGPERRRKKQPRDGERPVSSEGSLRPPAPSPARASVSSSAE	196601	193719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_193700_196600
911376	contig_12948_pilon	-	4264	1	Intergenic	novelGene_126178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACTGGCCTTCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171760	167496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_167500_171800
911377	contig_5549_pilon	+	2321	7	Intergenic	novelGene_81688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_5	251.280498425343	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	156	893	830033	845821	TRUE	30	ACTGGAGTTAAGATTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVRASLQKVSGSSDSVAMLNSEEFVLVPQHADDASTKEDEKPQLKIVSNGDEQLEKAMEEILRDSEKGQSSLLVGCQNSSEISDDSFGDVSARQTNKPPLQLILDPSNTEISAPRPSSPGGLTEEDSVLFNKLTYLGCMKVSSPRNELEALRAMATMKSSSQYPFPVTLYVPNVPEGSVRIIDQSSNVEIASFPIYKVLFCARGHDGTTESDCFAFTESSHGSEEFQIHVFSCEIKEARWRSRW	752451	848986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_752561_829986_830171_831598_831792_842368_842580_844247_844423_845800_846006_847742
911378	contig_3424_pilon	+	1521	2	Intergenic	novelGene_55510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCAAGTATTCCAGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193125	206444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_193150_204947
911380	contig_10904_pilon	+	1736	2	Intergenic	novelGene_22799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGAATAACTAAGATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860625	862861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_861416_861915
911381	contig_16970_pilon	-	1932	2	Intergenic	novelGene_157591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	231	611	24007	23627	TRUE	15	GGTGGGTAGTAAGCCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEQGDTAWFKIRKGLHQGCILSPYLFNLYAQQIIREAGLYEEEQGIRIGERLINNLRYADDTTLLAESEEDWKHLRMKIKDHNLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLGSTINNHGSSSQEIKQCAALGKSAAKDLLKVLKSKEVTLKTKVHLTQAMVFSTTSYACQSWTMNKKEELMPLNCGVGEEY	24237	19056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_19132_22380
911382	contig_2646_pilon	-	5953	1	Intergenic	novelGene_69715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	391	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2594397	2588444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2588400_2594400
911383	contig_3627_pilon	+	2987	15	Intergenic	novelGene_78568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	117.985990174898	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	137	1363	1299425	1307800	TRUE	25	TGATGAGATTTCTCATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299288	1309511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665_1307835_1307921
911384	contig_9784_pilon	+	1762	7	Intergenic	novelGene_165696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_1	68.0132748480439	110	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	790	1530	24780	262045	FALSE	20	GGAACGTCTCACATTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPWQAWTHGWGRAPTTAAGLTDEKVKAYLSLHPQVLDEFVSESVSAETVEKWLKRKNNKPEDESAPREVSRYQDTNMQGVVYELNSYIEQRLDAGGDNQLLLYELSSIIKIATKADGFALYFLGECNNSLCVFTPPGVKDGKPRLIPAGPITQGTTVSAYVAKSRKTLLVEDILGDERFPRGTGLESGTRIQSVLCLPIVTAIGDLIGILELYRHWGKEAFCLSHQEVRSSQLLVRVFSCTYLI	23990	262277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_24841_147611_147741_218175_218205_244078_244200_245510_245561_257546_257688_261835
911386	contig_11493_pilon	-	2943	1	Intergenic	novelGene_143710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAGAAAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268340	265397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_265400_268300
911387	contig_17274_pilon	-	3308	10	Intergenic	novelGene_26578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_9	327.656700801688	73	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	2141	2860	251759	232842	TRUE	30	TTTTTTTTAAAGATAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	254032	231549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_252231_252363
911388	SIRV7	-	902	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56080_70870_70988_78841_78964_114686_114961_147608
911389	contig_9335_pilon	-	2065	2	Intergenic	novelGene_147456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGTCAGGAGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551112	548977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_550108_550177
911390	contig_15327_pilon	-	2059	18	Intergenic	novelGene_70792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	109.639484716942	2	30	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	43	1992	1204638	1185925	FALSE	10	TCTTGGCCGGGCGAGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPPQEASARRREIEDKLKQEEETLSFIRDSLEKSDQLTKNMVSILSSFESRLMKLENSIIPVHKQTENLQRLQENVEKTLSCLDHVISYYHVASDTERIIREGPTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNSPDSPELNKVKLLFERGKESLESEFRSLMTRHSKVVSPVLILDLISGEDELEVQEEVPLEHLPEGVLQDVIRISRWLVEYGRNQDFMNVYYQIRSSQLDRSIKGLKEHFRKSSSSSGVPYSPAIPNKRKDTPTKKPAKRPGRDDMLDVETDAYIHCVSAFVRLAQSEYQLLTDIIPEHHQKKTFDSLIQDALDGLMLEGENIVSAARKAIVRHDYSAVLTVFPILRHLKQTKPEFDQVLQGTAASTKNKLPGLITSMETTGAKALEDFADNIKNDPDKEYNMPKDGTVHELTSNAILFLQQLLDFQETAGAMLASQETSSSATSYSSEFSKRLLSTYICKVLGNLQLNLLSKSKVYEDPALSAIFLHNNYNYILKSLEKSELIQLVAVTQKTAERSYREHIEQQIQTYQRSWLKVTDYIAEKNLPVFQPGVKERQVIKERFKGFNDGLEELCKIQKAWAIPDTEQRDRIRQAQKNIVKETYGAFLHRYSSVPFTKNPEKYIKYRVEQVGDMIDRLFDTSA	1204680	1185857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1186028_1186260_1186395_1186499_1186530_1186710_1186775_1187739_1187836_1188063_1188185_1188473_1188540_1190078_1190146_1190472_1190536_1191562_1191662_1191963_1192117_1192585_1192732_1197067_1197236_1199990_1200214_1202992_1203099_1203288_1203474_1204300_1204367_1204578
911391	contig_11986_pilon	-	2717	1	Intergenic	novelGene_69171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATCCCCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523405	520688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_520700_523400
911392	contig_17768_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_140400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	103	435	71868	71536	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSMCNKVSLTILASKEYSGYTSSKTDMFVLLAVHGIFKILHQHHNSKASTLLCFSLFIVQLLYAYEATGNSMVWVRCTLVFKVTSLLFNALKRSFAAYLPNAICCLIS	71970	71225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_71200_72000
911393	contig_11978_pilon	+	2829	2	Intergenic	novelGene_62819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419965	426969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_421728_425902
911394	contig_10904_pilon	-	3490	2	Intergenic	novelGene_22796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAACCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849138	845231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_846733_847149
911395	contig_546_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_117234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCATTCTATTACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153170	152233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_152200_153200
911396	contig_10609_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_123972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622049	619812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_619800_622000
911397	contig_9574_pilon	-	3495	3	Intergenic	novelGene_178899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1531	2346	66247	60332	FALSE	50	AAGAGTCAATCAATAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKSLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAALRHSQFFFFLKRDKTNKSTINK	68094	59182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9574_pilon_-_60400_65499_67126_67442
911398	contig_15114_pilon	-	8980	2	Intergenic	novelGene_121159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	499	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCTCTTCCCAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163458	153390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_156864_157951
911399	contig_6871_pilon	+	2919	21	Intergenic	novelGene_21620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_19	36.851696026099	153	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	830	2493	49	2541	534402	548319	FALSE	10	CCCTTTGTGACTGTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLEAGIPAAREKQLAMCLQRLEKTLSSTKNRALLHIAKLEEASSWTAIEHSLLKLGEILANLSNPQLRSQAEQCGTLIRSIPAMLSVHSEQLHKTGFPTVHAVVLLEGTMNLTGETQPLVEQLMMVKRMQHIPTPLFVLEIWKACFVGLIESPEGTEELKWTAFTFLKIPQVLVKLKKYSHGDKDFTEDVNCAFEFLLKLTPLLDKADQRCNCDCTNFLLQECSKQGLLSEASMTNLVAKRTADREHAPQLKSAENANIQPNPGLILRAEPTVTNILKTMDADHSKSPEGLLGVLGHMLSGKSLDLLLAAAAATGKLKSFARKFIHLNEFTTHGNEESTKPASVRALLFDISFLMLCHVAQTYGSEVILSESSTGAEVPFFETWMQTCMPEEGKILNPDHPCFRPDSTKVESLVALLNNSSEMKLVQMKWHEACLSISAAILEILNAWENGVLAFESIQKITDNIKGKVCSLAVCAVAWLVAHVRMLGLDEREKSLQMIRQLAGPLYSENTLQFYNERVVIMSSILEHMCADVLQQTATQIKFPSTGMDTMPYWNLLPPKRPIKEVLTDIFAKVLEKGWVDSRSIHIFDTLLHMGGVYWFCNNLIKELLKETRKEHTLRAVELLYSIFCLDMQQVTLVLLGHILPGLLTDSSKWHSLMDPPGTALAKLAVWCSLSSYSSHKGQASSRQKKRHREDIEDYISLFPLDDMQPSKLMRLLSSNEEDANILSSPTDRSMSSSLSASQLHKVNMRDPLNRVLASLFLLISSILGSRTAGPHTQFVQWFMEECVDCLEQGSRGSILQFMPFTTVSELVKVSAMSSPKVVLAITDLSLPLGRQVAAKAIAAL	534353	548697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_534484_536100_536213_536377_536529_536814_536929_537484_537533_537976_538060_538347_538435_540141_540254_540736_540880_541408_541447_541881_541965_542360_542540_542657_542758_543072_543249_544600_544866_545293_545476_545649_545741_546141_546242_547428_547510_547871_548021_548202
911400	contig_10437_pilon	+	1703	8	Intergenic	novelGene_38276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	677.662368524537	59	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	98	988	431167	446964	TRUE	30	AATTTCTATCATTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSDVLRCHMPFALCLQSYPIIRRLL	431069	451700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446893_447055_451075
911401	contig_990_pilon	-	2940	1	Intergenic	novelGene_76085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCTGAAGTACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1124818	1121878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1121900_1124800
911402	contig_1867_pilon	+	2811	3	Intergenic	novelGene_54620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556115	649355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_558178_648478_648984_649111
911403	contig_14288_pilon	-	2389	2	Intergenic	novelGene_153829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAATAATGAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414426	411790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_413982_414228
911405	contig_19155_pilon	-	2907	4	Intergenic	novelGene_173368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	385	705	571620	571300	TRUE	35	CAAGGATAGCGAAACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTVSIHNIMINREKTDVDKDFILLGSIINAHGRSSQEIKECIASGKSATKALFKVLKSKDVTLRTKGYLTQAMVFSIASYTCES	608926	486069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_-_487858_540930_541160_571114_571846_608767
911406	contig_11417_pilon	+	1782	3	Intergenic	novelGene_103307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3368	junction_2	75	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1322	1777	540507	542963	FALSE	10	TTGTAGTTCTTTGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKAQARAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVRAEVAQHYQDTLIRAKREKAQVSGIRIVSFCSENKDKSEDVSLDSFSECFLGTPRFRALEGHKDIRDIDATFQRAHAILYI	538954	542968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_539049_539279_540616_542616
911407	contig_1435_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_115507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGGATGCAATTAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548879	550419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_548900_550400
911408	contig_11026_pilon	-	1285	2	Intergenic	novelGene_167691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301919	299494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_300434_301573
911409	contig_11708_pilon	+	5072	14	Intergenic	novelGene_138961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	422	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243895	284036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_243932_244261_244394_244650_244829_247677_248356_249277_249413_250376_250540_250737_250953_252345_252444_253646_253769_255578_255803_255956_256156_266615_266680_275494_275913_281626
911410	contig_5059_pilon	-	2311	11	Intergenic	novelGene_140732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_5	315.910446171063	95	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	91	579	292591	270554	TRUE	25	ATTTGTATATGTTCATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEPAPRPRWQDSKEGSAEAAVPCRPSPAATMGIKFLEVIKPFCAVLPEIQKPERKIQFREKVLWTAITLFIFLVCCQIPLFGIMSSDSADPFYWMRVILASNRGTLMELGISPIVTSGLIMQLLAGAKIIEVGDTPKDRALFNGAQKLFGMIITIGQAIVYVMTGMYGDPAEMGAGICLLIIIQVPSLRVQS	292681	262627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_263759_266445_266523_267451_267644_269915_270114_270419_270581_275956_276067_276480_276613_283551_283631_288493_288560_290235_290304_292584
911411	contig_16211_pilon	-	2085	13	Intergenic	novelGene_150096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1194	junction_12	796.675331194166	66	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	55	1428	242940	197073	FALSE	40	TAAATGCTAGTAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDGNRLTFIPGFIGSLTQLTYLDVSKNNIEVVEDGISACENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLTSVEELDCSFNEVEALPSSVGQLTNIRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKG	242994	196415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218_221289_222656_222773_223586_223717_224190_224264_225375_225521_226177_226253_237643_237708_242929
911412	contig_19990_pilon	+	2788	1	Intergenic	novelGene_30758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1918	2223	47241	47546	NA	15	TCTGTATTTATTGTGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPRDHGPQSPPPSNSAWTPFLRVSCSISSSGYTSFCNHSLIVEHLSCFRFPATISNAVLTILITHLACICISFFSFHYIPRSGILGKEWEHFKGI	45323	48111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_45300_48100
911413	contig_20602_pilon	-	1150	10	Intergenic	novelGene_133732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_9	216.29854767981	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1137	12	1148	29552	17150	FALSE	15	GCTTCTAGGTGTACGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSKMAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLR	29563	17147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
911414	contig_6876_pilon	+	2003	1	Intergenic	novelGene_147031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTTCTTCACTGTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196449	198452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_+_196400_198500
911415	contig_4924_pilon	+	3747	2	Intergenic	novelGene_84712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACACGAGAAAAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85689	89705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_88085_88353
911416	contig_9843_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_114334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1332	795	2126	233873	232542	FALSE	30	GAGTCAGGAAGTTCAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNREETLADLTLAQLLAVLRLDSLDIDSERTVCHVAMQWLEAAPKERGPSAAEVFKCVRWAHFTEKDQDYLEGLLTKPIVKKHCLDVIEGALQMRYGDVMYKTLVPKPNSSTSSIVSSAENPPQRMGMCAKEMVIFFGHPRDPFLCYDPYSGDIYTMPSPLTSLAHTKTITSSAVCVSPDHDIYLAAQPRKDLWVYKPAQNSWQQLADRLLCREGMDVAYLNGYIYILGGRDPVTGVKLKEVECYSVQRNQWALVAPVPHSFYSFELIVVQNYLYAVNSKRMLCYDPSHNMWLNCASLKRSDFQEACVFNDEIYCICDIPVMKVYNPARGEWRRISNIPLDSETHNYQIVNHGQKLLLITSTTPQWKKNRVTVYEYDTREDQWINIGTMLGLLQFDSGFICLCARVYPSCLEPGQSFITEEDDARSESSTEWDLDGFSELDS	234707	232541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_233916_233955
911417	contig_4232_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_63349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAAGGGAGGCAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
911418	contig_3153_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_104659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	511	834	150525	150202	NA	10	CTTGCTGCTCACCTCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLVCLFLLTLPSTGSNAETGDQVLLKTWKNQPPEDQLAPQWEGTFEVLLTTHSSLKLTGVATCVHYSRVKAAPPEEEKEAEDREPPYSCTPIRSLKCKFKKLTVQ	151035	149260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_149300_151000
911419	contig_9738_pilon	+	2279	15	Intergenic	novelGene_169260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	134.910949465617	34	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	545	1816	182940	214267	FALSE	40	AAAATTACTGTAAGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYDLSGRPLNIKEDPDGENARRALQRTGGSFPGGHVPDIGSGLMNLPPSILNNPNIPPEVISNLQAGRLGSTIFVANLDFKVGWKKLKEVFSIAGTVKRADIKEDKDGKSRGMGTVTFEQAIEAVQAISMFNGQFLFDRPMHVKMDDKSVPHEDYRSHDSKAPQLPRGLGGIGMGLGPGGQPISASQLNIGGVMGNIGPSGIGFGGLEAMNSMGGFGGVGRMGELYRGAVTSSMERDFGRGDIGISRSFGDSFGRLGSAMIGGFAGRIGASNMGPVGSGISGGMSSMNSVTGGLGMGLDRVSSSFDRVGPGIGAVLERSIDMERGFLSGPVGSGMRDRIGSKGNQIFVRNLPFDLTWQKLKEKFSQCGHVMFAEIKMENGKSKGCGTVRFDSPESAEKACRIMNGIKISGREIDVRLDRNA	173577	214730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_+_173798_180046_180256_181492_181559_182890_182985_186784_186977_187640_187795_188314_188365_188498_188563_202377_202480_205049_205119_205426_205526_205818_205891_207609_207819_207898_207951_214103
911420	contig_12864_pilon	-	3026	6	Intergenic	novelGene_76393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	602	junction_5	372.00913967267	83	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	59	601	223293	217842	FALSE	20	CGTGAGTTGGAGTCAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQGKGLASLTLAIILLQGTMAKLKQDEYLKVDDNREDGSVLLTCDLEDRNITWFKDGKEIHASQKAKNQYNLGSATKDPQGTYQCKGSNVSKSLQVYFRMCQNCIELNAATVTGFIFAEIVSIFFLALGVYFIAGQDGVHQSRASDKQTLLPNDQLYQPLKDREDDQYSHLQGNQLKKN	223351	215416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_217908_218501_218546_219172_219305_219914_220137_220625_220650_223238
911421	contig_14300_pilon	+	2432	8	Intergenic	novelGene_133081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	31	junction_5	35.8955400560901	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	128	1381	127488	140824	FALSE	45	GTCGCAAAAGAGAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGNPWRKEGVGEFRQDGTSLRQPRGTSTPPKRKRGTVRRSQMAEGTNHLGDPQAGTGALWEALRALLPPTKEGLKLDVGEKVERSVVLLLERAAELFYGGRRSECLQTSEMILDYSWEKLNTGPWQDVDKGWRQVYTFGCLLKAVCLCEMPGDTAAVAAALRVCDMGLLMGAAILGDVLIKVATILQAHLPSEKRPAQGPTWEQPSTKKARSDHIPIPDVKLERTVPRLHCPSLEYFKKHFLVPERPVILEGVANHWPCMKKWSLEYIQEIAGCRTVPVEVGSKYTDEDWSQTLMTVNEFISRYVVDEPKDVGYLAQHQLFEQIPELKQDISIPDYCCLGNGEEDEITINAWFGPQGTVSPLHQDPQQNFLAQVIGSKYIRLYSPQESEALYPHDSHLLHNTSQVDVENPDLEKFPKFAEAPFLSCILSPGEVLFIPVKYWHYVRALDLSFSVSFWWS	121544	141875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_+_121652_127467_127989_130319_130487_131727_131861_134772_134818_139428_139579_140462_140556_140659
911422	contig_11117_pilon	-	6895	15	Intergenic	novelGene_148571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	545	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAATGAGGAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139778	17299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_17463_17971_18179_23060_23202_25464_25579_26753_26883_30429_30478_31241_31402_52756_52850_56436_56538_62957_63111_66066_66149_67443_68604_73891_74048_126576_126759_135772
911423	contig_1230_pilon	+	1140	5	Intergenic	novelGene_28880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1058.23092352284	4	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	163	927	406520	408779	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKECLEECLGASLVVELLHLVVRLLDPPLKKLIKPNSEQIP	406261	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407619_408659
911424	contig_14472_pilon	+	4280	14	Intergenic	novelGene_111186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	43.948598270489	158	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	901	2706	442	3147	494021	548978	FALSE	30	CTGTTTATATTATAGAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRSTRVTRSTVGLNGLDESFCGRTLRNRSIAHPEEISSHSQVRSRSPKKRTEPVQIQKGNNNGRTTDLKQQSTRESWVSPRKRGLSSSEKDNIERQAVENCERRQTEPVSPVLKRIKRCLRSEAPNSSEEDSPLKSDKESVEQRSTVVDNDADFQGTKRACRCLILDDCEKREIKKVNVSEEGPLKSTVVEEITGYLAVNGVDSDSAVINCDDCQPDGNTKPNSTGSCVLQEKSVAENGDSDTQTSVFLDRKEDSYIDHNVPCTNSEVQVKLEDHKIVTACLPGEHVNQLTTEPATGPFPEIQSSLRDSEEEVDVVGDSSASKERCNENTNNVLDTSLESVPVSGEPEPSSVLDCVSAQMMSLSEPQEHRYTLRTSPRRAAPARGSPSKNSSPCRENGQFEENTLSPNETNATVSDNISESHTNPDEISQNEKGICCDSENYGSEGLSKPLSEARLNIGHLPSAKESASQHVTEEEDDDPDVYYFESDHVALKHNKDYQRLLQTIAVLEAQRSQAVQDLESLGRHQRDALRNPIGFVEKLQKKADIGLPYPQRVVQLPDISWDQYTNSLGNFEREFKNRKRHTRRVKLVFDKVGLPARPKSPLDPKKDGESLSYSVLPLSDGPEGSNSRPQMIRGRLCDDTKPETFNQLWTVEEQKKLEQLLLKYPPEEVESRRWQKIADELGNRTAKQVASRVQKYFIKLTKAGIPVPGRTPNLYMYSKKSSTSRRQHPLNKHLFKPSTFMTSHEPPVYMDEDDDRSCFHSHMNTAIEEASDDESIPIMYRNLPEYKELLQFKKLKKQKLQQMQAESGFVQHVGFKCDNCGIEPIQGIRWHCQDCPPEMSLDFCDSCSDCLHETDIHKEDHQLEPIYRSETFLDRDYCVSQGTSYNYLDPNYFPANR	416237	550111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_416341_486931_487065_488866_489021_493969_495520_530814_530954_533752_533901_533987_534104_534794_534867_535899_536002_539798_539895_541861_542015_546143_546279_548435_548537_548833
911426	contig_5997_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_168605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	434	1302	618	1919	2768	4069	NA	35	CTCACTACCTACCTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIIMLNVNGLNAPIKRRRVADWIKKHDPSICCLQETHLRLKDTNRLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYAPNNRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNIEILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEQVEREQQKKPTGTRRKEIIRIRAELNEIENRKTIERVNKSKSWFFEKINKIDKPLAKLTKEKQERKQITCIRNEMGDITTDPTEIKRIITDYYEKLYSDKFGKPRGNGQISR	2150	4071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_2200_4100
911427	contig_9919_pilon	-	3210	18	Intergenic	novelGene_137959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	219.749353916485	88	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	259	2166	592763	546439	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSANYEIGIVRQFPFSSALQRMSVVTKVLWDKKMDAYMKGAPEVIASLCKPDTVPADFEKVLEKYTKEGFRVIALAHRKLESKLTWHKVQNVNRDTIENNMDFLGLIVMQNKLKQETPAVLAALHNADIRTVMVTGDNMLTALSVARDCGMILPQDKVIIAEALPPKDGKVAKINWHYADTVSQCSSSSAIDSEAIPVKLAHDSLEDLRVTRYHFAMNGKSFSVIQEHFQDLVPKLMLHGTVFARMAPDQKTQLVEALQNVDYYVGMCGDGANDCGALKRAHGGISLSELEASVASPFTSKTPSISCVPNLIREGRAALITSFCVFKFMALYSIIQYFSVTLLYSILSNLGDFQFLFIDLAIILVVVFTMSLNPAWKELVAQKPPSGLISGTLLCSVLSQIIICIGFQSLGFFWVRQQPWYEQWHPQSDACNTTGGLYWNSSHSDNVTEHDEHNIQNYENTTVFFISSFQYLIVAIAFSKGKPFRQPCYKNCLFVLSVIVLNVFVLCIMLYPIAPVDQALQIVCVPNQWRIIMLTIVAANALVSFLVENVFLDMVLGKVVVSRDKQGEYRFTTTQPPQGSIDRWGGCCLSWVLGCRKKMPEAKYMYLAQELLVDPEWPPKPQTTTEAKTLCKENG	596050	545394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_546613_554218_554309_555959_556041_568214_568304_578847_579036_580713_580892_582979_583053_583935_584033_584332_584443_584535_584579_585204_585285_585362_585486_585998_586175_587892_588018_591702_591824_591919_592074_592757_592886_595914
911428	contig_12464_pilon	-	2972	6	Intergenic	novelGene_68657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAACAATGCTTTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517642	120242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_121683_215603_216185_231839_231847_278234_278630_320934_321018_517176
911429	contig_11594_pilon	-	5888	8	Intergenic	novelGene_80916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3259	3708	352821	343315	TRUE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFQACLFYLYFFVAVCPSEKWPLPSNCCLLEHGAESTLISVLGFDKTLTLVLVFLWYKQAFQVHLQELLPHSVMLSDGAASCVLRCERYSVLLTSVEFWINTGIQTDVEFQSIDRTHSCALALPNRQNVHEVDLESHHIKYDEAKVLE	368233	336973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_338853_341099_341217_341539_341628_343218_343553_347276_347468_352800_352902_361772_361983_365265
911430	contig_5023_pilon	-	2093	7	Intergenic	novelGene_7343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	994	1494	647301	643482	TRUE	55	GCAAAAAAATATAATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648294	609592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_609669_629207_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
911431	contig_7190_pilon	+	2027	3	Intergenic	novelGene_178412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	379	744	101485	101850	TRUE	55	ATAAAGTCTCAGCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISVILLFIFWISICCISIISSCEFILAFCSCIIFLNSSKFLSVLSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRNWSSLSSSSTAFSSTGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIGCCLRGIQ	100976	116484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7190_pilon_+_101087_101216_102626_115976
911433	contig_13863_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_42055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTGTTTTCTTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355980	353630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_353600_356000
911434	contig_10749_pilon	+	4895	10	Intergenic	novelGene_133463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2512	2832	143675	143995	TRUE	55	CCAAAAACTGAAATGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIQNPTDLHINLTEGSKLETQHWLLGFITNLEASKEERGGKGCRNNAGKGSSAHSLQELISCHFLQSPAYWGGGVEARGKGLWYPQRGPKSKHQVLLCFYPFSA	139940	155316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_142365_143587_145263_146512_146554_147654_147751_149597_149681_150651_150788_151767_151899_153557_153676_154232_154268_155160
911435	contig_10437_pilon	+	4014	2	Intergenic	novelGene_38113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	0	19	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2424	2981	80211	80768	FALSE	45	AGGAAACTGAGCTACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGLSEFPLIQQLPESITDLAEVLREVRPVEGREQAPVSEVVKHVADAAVGLGREVVLHQLQQHIPALGQQVGQHGSLEGEVHLAKAECCHGALPQLLAKAGGQVQLTGAKAAAAVQHGDLDGHLDQVLDDPLGLGPALRVLFGHTVELVQHLTACLIDEEMGHGPACHLAQQLLLRLQRQAF	77392	81801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_78092_78486
911436	contig_10403_pilon	-	5561	21	Intergenic	novelGene_175801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_20	86.2087002569926	382	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	771	3014	98427	71308	FALSE	20	CCTCCGCCCAGCAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCLGLLANLCRHNLSVQTHVKTLSNVKSFYRTLITYLAHSSLTVVVFALSILSSLTLNEEVGEKLFHARNIHQTFQLIFNILVNGDGTLTRKYSVDLLTDLLKNPKIADYLTRYEHFSSCLNQVLGLLNGKDPDSSLKVLELLLAFCSVTQLRHVLTQMVFEQSPSGSVILGSRPKCLEPTVALLRWSSQPLDTSENCSVLALELFKEIFEDVIDTASSSSADRFVTLLLTTILDQLQFTEQNLDEPLLRKKCERMVKAIEVLLTLCGDDTLKMHLAKVVTTIKCTTLIEQQFTYGKIDLGFGTKVADSELCKLAADVILKTLDLMNKLKQLIPGMEVSFYKILQDSRLVTPLAFALTSDNREQVQSGLGILLEAAPLPDFPALVLGESIAANNAYRQQETEHVPRRMHLQSLNHSFPASVKCLTPPLLKDNVPGLNIEELIEKLQSGMVVKDQINDVRISDIMDIYEMKLSTLASKESRLQDLLEAKALALAQADRLIAQYRCQRTQAETEARTLASMLREVERKNEELSVLLKSQQVESERAQSDIEHLFQHNRKLESVAEEHEILTKSYMELLQRNETAEKKNKDLQITCESLNKQIETVKKLNESLKQQNEKTIAQLKEKEEQRKEVHSLLVDRECKLANLQQKAVAQEETIETLQKERKDKEETIDLLRKELSRTEQIRKELSIKASSLEVQKAQLASRLEEKESLVKLQQEELNKHSHMIAMIHSLSGGKINPETVNLSI	106883	68760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_71479_72489_72630_73323_73407_73614_73729_75435_75633_78426_78538_78630_78706_79188_79385_81793_81913_83422_83523_84568_84711_86339_86500_87386_87606_93365_93442_96017_96164_96315_96439_98355_98453_99047_99143_99953_100067_101987_102136_106494
911437	contig_151_pilon	-	4959	10	Intergenic	novelGene_132568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_6	169.801918004552	483	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	5	1702	253657	216804	FALSE	25	ATTACAATGTGTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNGRKSDVPGVVRTGSMEELDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEDEVLSCLYSRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDSFLDDHHFTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRKNPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRNDSDAEAQGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ	253661	213546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_217049_219634_219762_219870_220358_223422_223648_226819_226908_228049_228195_231204_231250_231678_231773_233386_233529_253557
911438	contig_11316_pilon	+	821	2	Intergenic	novelGene_122626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCTGATATTAACATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137404	138825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137787_138386
911439	contig_20641_pilon	+	5642	2	Intergenic	novelGene_52800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4404	junction_1	0	561	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	64	423	14599	16957	FALSE	50	TAAAACAACCTATGTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKVSFVENAFTSSVI	14535	22176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769
911440	contig_3103_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_146195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	725	1051	73737	73411	NA	15	CGAGACCTGCCCTGCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVNREYKKAASWSFQQETEQPVTSDICFPTPHPSSSPLWPVSWLGSTTFTPVSLGFHPPALAGSLSAICWLLVLLFSDSLDLFLISHHLTLLSLKYLALCAIFASS	74461	72556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_72600_74500
911441	contig_6842_pilon	-	3067	1	Intergenic	novelGene_130806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	169	468	1681364	1681065	NA	55	TAAGTACAAAAAACATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESGTARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKRMAPRHPFISVVKSLLRFTIQPGSGQPHKIKRD	1681532	1678465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1678500_1681500
911442	contig_8375_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_141325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAAACATTATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279330	280257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_279300_280300
911443	contig_14687_pilon	+	3799	2	Intergenic	novelGene_107967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3027	3344	688667	688984	FALSE	25	GGCCAGGATCCTGAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVPWTDRRINKSVLEEVQPQCSVEVRIARLCLTYFGHVIRRDQPLGKYIMVGKAERQRKRGRSSMRWTDPEAAIMGSNRATIVRMVQVWAVFCSVVHRVTMIWN	685130	689439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_685770_686279
911444	contig_8167_pilon	-	4078	4	Intergenic	novelGene_155643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1226	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTCCACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219911	49055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_49804_50024_52314_208896_209574_219547
911445	contig_20641_pilon	-	4276	1	Intergenic	novelGene_52783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAGAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14060	9784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_9800_14100
911446	contig_5317_pilon	+	3268	6	Intergenic	novelGene_76626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	91.5161187988215	109	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	140	703	896836	905100	FALSE	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARVPRRSRLGEAAWNAALGAAACGVLDVKTLPLQSPQRCIQGGRAMLTFMASDSEEEVCDERTSLMSAESPTPRARQEGRQGLEDGENTTQWRSQESEEDCEEDPDRYVCSGVPGRLRGLEEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVRFYTEKNGQLIYTPFTEDTPSVGQRLLNSVLNTLIMISVIVVMTIFLVVLYKYRCYKRKTDSVPRSSCLGGVGERWRC	885489	907665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_885517_893286_893377_896813_896977_902552_902768_904319_904462_905034
911447	contig_15047_pilon	-	1386	6	Intergenic	novelGene_52118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTCTGGCAGGTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21341	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2248_2548_2825_3220_3495_4155_4433_4551_4683_20996
911449	contig_15449_pilon	+	4045	7	Intergenic	novelGene_33604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	644.480928086058	45	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	1934	2995	46876	51340	TRUE	35	GAAAACCTAGGCCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGKI	44942	55614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51347_54570
911450	contig_14326_pilon	+	2086	6	Intergenic	novelGene_120719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	989	1423	441913	443033	TRUE	40	AAATGCCTCTCAACACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVIGSYPARLHTAQRQPLTWTPCGVSCLIYPRISLPLETIPQQPQPGRDLKGAQSLPKTNLLSCFQLEVEVLGGLKDEHDGGAQVEFTQVLALAHGDALLVGVRHEAEVVVGAFAVPRAVCVQVPVKVNADGTHVGGSHGSQ	440924	486166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_442290_442975_443124_443835_443932_444094_444330_473558_473739_486104
911451	contig_17976_pilon	+	2401	4	Intergenic	novelGene_32526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	15	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	86	418	41843	47764	FALSE	70	GTTAAAAAAAAAAGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQES	41757	49747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46695_47757
911452	contig_9333_pilon	-	3516	15	Intergenic	novelGene_120312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.448865176745	66	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	22	981	142532	125724	TRUE	35	ATACGCAGAGTCATTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEDSAKMAAFSEMGVMPEIAQAVEEMDWLLPTDIQAESIPLILGGGDVLMAAETGSGKTGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGKKGKTTIKTGASVLNKWQMNPYDRGSAFAIGSDGLCCQSREVKEWHGCRATRGLMKGKHYYEVSCHDQGLCRVGWSTMQASLDLGTDKFGFGFGGTGKKSHNKQFDNYGEEFTMHDTIGCYLDIDKGHIKFSKNGKDLGLAFEIPSHIKNQALFPACVLKNAELKFNFGEEEFKFPPKDGFVALAKAPESYVTKSQHTGSAQVAQTKFLPNAPKALIVEPSRELAEQTLNNVKQFKKYIDNPKLR	142553	88265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_88909_89013_89082_123899_125867_126620_126736_126871_126949_128788_128862_131045_131123_131655_131740_131961_132046_133811_133860_136925_137023_137591_137622_138606_138671_139421_139474_142516
911453	contig_2114_pilon	+	1823	3	Intergenic	novelGene_104309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	6.5	88	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	108	323	1066238	1067544	TRUE	15	CTTGAACTTGTTTCTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAREGAVWSAPNIPPPAPAPAPPTGAGPCSCSREMSCNLGGAREWGLNTQRNLDPLLSQPGADFLQEANPFLLPPRLWTVSRGVCMAHSFTSFKSFAQQSSIQSQ	1066130	1085845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_1066383_1067473_1067573_1084373
911454	contig_4797_pilon	+	5454	2	Intergenic	novelGene_6896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	4869	5252	293507	293890	FALSE	35	CCTTCTAATGGAGAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEMLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPGHIIITVTKTKDKQRILRATQEKQKVTYRVETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLLFKYDGKIRSFPDKQKLRDYLKTKLTRLIK	288390	294092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_292820_293067
911455	contig_4315_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_46813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	432	752	334715	334395	NA	40	TAACTAAAGTCCATAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRAGLDGQEGYLEGVMAELRAEGQADKSWNSPRQGIGDRGGERTVCPLSTSPGAQGAVLGHSHVENRSVSLWWNGHRYRVCVWESTGLGSDRGPPLPSSETLANY	335146	332991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_333000_335100
911456	contig_1244_pilon	-	933	1	Intergenic	novelGene_38061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATTCGGAAGGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1166014	1165081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1165100_1166000
911457	contig_11548_pilon	+	2297	11	Intergenic	novelGene_66745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1206.97193007957	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	516	1454	101984	119638	FALSE	10	TTACGCTGTTCATTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGLLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63657	120481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96166_101978_102178_102442_102569_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
911458	contig_6137_pilon	+	2145	14	Intergenic	novelGene_59262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1299.80628506644	1	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	818	1219	1328176	1333472	TRUE	20	ACCCTGAGGTTTATGTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVLEAKNTIGCWTSRCRELYNNCPAC	1320879	1348383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332239_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341641_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
911459	contig_6919_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_163983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56274	58094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_+_56300_58100
911460	contig_12299_pilon	+	3200	1	Intergenic	novelGene_29736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAGAAAATCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124990	128190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_125000_128200
911462	contig_8554_pilon	+	3727	1	Intergenic	novelGene_160284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTCCCTGCGCTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74585	78312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_74600_78300
911463	contig_5084_pilon	-	1862	7	Intergenic	novelGene_64643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	76.0913194056253	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	2	784	1344218	1334876	FALSE	25	TTGAAGACTGCAAGGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAWRQGWRVGRWGLRRPQLPPLAGLVSQRAHSVLPVDDAINGLSEEQKQLRQTMVKFLQEHLAPKAQEIDQSNEFKKLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKSQARQGDPGRGLKRGCWMWQSACCCHT	1344219	1333797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1334960_1335200_1335338_1335727_1335822_1337106_1337277_1340930_1340983_1341204_1341295_1344062
911464	contig_5571_pilon	-	2420	14	Intergenic	novelGene_75511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	123	junction_4	199.493975231951	91	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	112	2268	154158	121121	FALSE	45	ACACATTCTTGTCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQMKLIQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLITFQLRHILKARCDPVPAANGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTPNVVVGQVPPGTNHISKTPGQINLAQLRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRIQQPPAPVPTTTTTTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQTMQRGNINCGAFQAHQMRMAQNAARIPGIPRHSGPQYSMMQPHLQRQHSNPGHAGPFPVVSVHNTTINPTSPTIATMANANRGPTSPSVTAIELIPSVTNPENLPSLPDIPPIQLEDAGSSSLDNLLSRYISGSHLPPQPTSTMNPSPGPSALSPGSSGLSNSHTPVRPPSTSSTGSRGSCGSSGRTAEKTSLSFKSDQVKVKQEPGTEDEICSFSGAVKQEKTEDGRRSACMLSSPESSLTPPLSTNLHLESELDALASLENHVKTEPTDMSESCKQSGLSSLVNGKSPVRSLMHRSARIGGDGNSKDDDPNEDWCAVCQNGGDLLCCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKKGKTAQGLSPVDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPASIPNYYKIIKKPMDLSTVKKKLQKKHSQHYQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEADSEVAQAGKAVALYFEDKLTEIYSDRTFAPLPEFDQEEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKSDERPVHIK	156632	120968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_121334_122913_123067_124642_124718_126431_126556_128908_129259_130408_130569_140435_140500_142604_142738_147630_147832_150922_151088_151753_152029_153451_153570_154032_154180_156542
911465	scaffold_8345_pilon	+	1180	1	Intergenic	novelGene_106988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73986	75166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_74000_75200
911466	contig_12948_pilon	-	5536	3	Intergenic	novelGene_126164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATTTTTTATATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172437	40632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_41776_167963_171925_172005
911467	contig_15897_pilon	+	2392	15	Intergenic	novelGene_49586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	287.939654959089	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	614	1842	550	2391	871366	888825	FALSE	35	TGAAGACAGCAAGCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHWQPVYPPPSHPQRTFYPHHPQMLGFDPRWMMMPSYMDPRITPTRTPVDFYPSALHPSGLMKPMMPQDSLNGTGCHSEEQNCVPPLQERKTTAIEPAPVWTPEGYMALQSKGYSLPHPKSNDTLAMDMHVRSPEEALPGGLGGCSSGSSHSPYTLERAGHANSDIPEASSKKAEKESKLTAQRAGEQGETMKQFDLNYGNTIIENCGSSPGEESEVGSMVGEGFIEVLTKKQRRLLEEEKRKKEQAVQVPVKGRGLSSRIPPRFAKKQNNLCLEQGDVTVPGNSLGTEIWESSNQALPVQASTSDSWSKAVTAFSSTESGSAEGLKSSQGDSGVDLSAESRESSATSSQRSSPYGTLKPEEMNGPGLAEPKADSHKEQAQKQSEQKDSEQGSGQSKEHRPGPIGNERSLKNRKGSEGAERLQGAVVPPVNGVEIHVDSVLPVPPIEFGVSPKDSDFSLPPGSASGPAGNPVVKLQDALASNAGLTQSIPILRRDHHIQRAIGLSPMSFPTADLTLKMESARKAWENSPSLPEQSSPGGTGSGIQPPSSVGASNGVNYSAFGGVSMPPMPVASVAPSSIPGNHLPPLYLDGHVFASQPRLVPQTIPQQQSYQQ	862733	888826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_862836_866905_867141_868810_869008_871350_871547_876434_876652_880901_881108_881722_881869_882515_882658_884357_884441_885035_885225_885379_885578_886060_886148_887317_887423_887605_887796_888727
911468	contig_12123_pilon	+	2596	6	Intergenic	novelGene_144618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	961.038729708642	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1124	1711	174087	181823	TRUE	75	AGAAAAAGCAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDDALTNFHCLFSDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYFPPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYATRKSIHRYDLASGAIEELPLTGLRAVVALDFDYEHNCLYWSDLALDIIQRLCLNGSTGQEVIINSGLQTVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVCALLCCP	172716	184530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_173339_173585_174257_176521_176608_180997_181171_181664_182109_183930
911469	contig_8452_pilon	-	3328	3	Intergenic	novelGene_48120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_2	6.5	146	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2046	117	2162	1075976	1060424	FALSE	55	ATATAAGCTTTAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEKLSPIFMVHFVEGLPHSDLRQYSFHFEDSLYQVTCVIQYQANNHFITWILDADGSWLECDDLKGPCAERREKFEVPASEIHIVIWERKISQRIDTAAAGLPLKKTNDQHAFGSQKPVFPASCSVGDTASAGTSSVTQPSSMSGASASLSQDDAVVIGDHLLSGPHGLVDNNLLTLTLEEIQVNSEDFLLENRPVGENEGVVVTNTLQSQESLTDSSVLAPCMEKLVKDQIVDVRFPSQVTNADVLSVQLNTEDTVITQPGNNGATDLPQGVKSVEIEKSTQLKQFLSPETEKLKPEHVTSQVSNFKKKEAAAYSPTIAARSAHSQPLKENQKKPFVGSWVKGLLSKGASFMPPCVSAHTRNTVTDLQPSVKGASNFGGFKTKGTNQKANRVSKKARKSASKPPLVSTPAPSDPSSDSTASHRRAAGSADSDVVKQCESASRGTHLSHSSCGNENGVSSANHGNSVDGQIHRLRLKLLKKLKAKKKKLAALMSSPQNGTLPSENVEGESHCGSPNDCESIEDLLNELQYQIDIADKSSCTTIPSASQYSGQTQEEILAELLSPATVVSPELPEHGEADFRYLEMGDNHIPAPVSSELSTIPQNTHLRQDHDYCSPTKKHQGEVQTNSLTNNSCVRMLNLETSMKADIFDEFFSTSALNSLANDPLDLPHFDEYLFESC	1076092	1059257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_1062298_1068148_1068307_1075962
911470	contig_15123_pilon	-	2173	2	Intergenic	novelGene_110897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73529	71146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_71510_71719
911471	contig_5878_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_145722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGAACTGTACCATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217371	219301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_+_217400_219300
911472	contig_12277_pilon	-	2835	1	Intergenic	novelGene_139713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	487	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	433	795	396619	396257	NA	55	CTCAGGTAATATGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLRKTIWCFLKKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRAITRTDICTPVFTAALLTTAKRWKQSKCPSTDEQINKLWYIHPMEYYESIKNNDESRKYLTIWINLEGIMLSEISNHKRTNTV	397051	394216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_394200_397100
911473	contig_9011_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_159263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1296	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	670	1194	38667	39191	NA	35	CCCCAAGCAATGTTTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQTEAVAPKQHSTAWIEGAPKPRKGKENKQTKGLGDPTGVGTWARKQFHSRAAFCSLSGRSKDGTWSQVLDRKEEEVVRGVEETKRSRKKQHQQPTNCTQRAGRCGRVESKWKWCKASASWPNDCGRQKQRRPSRGDEGWGVGKHISLVTCCSVSCRELCETAFLYSLFANL	37997	39651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_38000_39700
911474	contig_10042_pilon	+	2079	2	Intergenic	novelGene_79118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39183	43739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_40219_42695
911475	contig_2069_pilon	+	3043	13	Intergenic	novelGene_23261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_12	304.386906566115	13	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	159	1001	333898	341321	TRUE	45	GTAAAATGGCAATAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324028	346415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_344889
911476	contig_9706_pilon	+	3047	1	Intergenic	novelGene_21035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTGGAGAACAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621690	624737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_621700_624700
911477	contig_7412_pilon	-	5173	20	Intergenic	novelGene_76267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	90.8058718981936	13	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	931	2796	261	3056	228446	209111	TRUE	10	TATGTGGGGGGTCTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVPMGPDGLPVDASVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYNRHYEDGYPTGSDNYGSLSRVTRIDERYRPSMEGYRVPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPSSWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWELVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALVFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQIHREIPQAERYQEASPTVANNTGPHAASCFGAKKGKGKKPTEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPDLVNNLPGGQQSSSWNFSEDTVVSVLNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKTDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTLNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTPLMQKI	253455	206841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_207250_207401_209123_209858_209963_210617_210681_212732_212821_213392_213508_213863_214057_214971_215123_215224_215353_216349_216419_217238_217393_217855_217974_219101_219286_220381_220846_224026_224560_224978_225132_225891_225964_228251_228542_229771_229888_253406
911478	contig_13311_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_178900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAGAAGTTCCCTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2778	953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13311_pilon_-_1000_2800
911480	contig_12464_pilon	-	3556	11	Intergenic	novelGene_68703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_8	138.402348245975	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	490	2889	357758	337140	FALSE	35	TATTAACTTAACCTTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQCIMAPKRSKTSASNSSSKRQRKSIDLEVKQKVIKQHEGGKSVNAIARDLGMSHSTITTILKNKEKILQAVKGSAPLKATRLTKMREGPISDMERLLMTWIEDQTQKQIPLSTSTITAKARSLFEMLKEKAGPDYNIEFSASSGWFMRFKQRFSLHNVKLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	382173	336472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_343318_343793_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_376096_376251_378909_379024_381087_381156_382099
911481	contig_15500_pilon	-	2389	3	Intergenic	novelGene_128993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	327	698	241376	239346	FALSE	55	GCAGGCAAGCAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVVTADVDPASAAAGKPADTGASLQGTVMQKVAADTSTALKTVVDEVSAAAALQAAAYRHPEVVDAAVAAGGNEEAVNEVAAISNLPVVVAEVLYAAVEAAEGAPDPIKFLGHFQVSVLLK	241702	237654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_239546_240599_240698_241302
911482	contig_12312_pilon	+	2886	18	Intergenic	novelGene_63993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_12	58.731162775556	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1908	2642	506925	533697	TRUE	45	AAAAGGAATCCGTACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKVRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476910	534384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_526427_526473_527906_527956_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
911483	contig_14683_pilon	-	2314	2	Intergenic	novelGene_166056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTTTAAAGTCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176338	173840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_174202_174385
911484	contig_17127_pilon	+	3110	1	Intergenic	novelGene_168294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCCAGCCCCTCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19853	22963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_19900_23000
911485	contig_6137_pilon	-	4080	2	Intergenic	novelGene_59266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCACAGTGAAAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335049	1327608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1328334_1331694
911486	contig_13519_pilon	-	3930	3	Intergenic	novelGene_124613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	627	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	3070	3459	122648	17553	FALSE	70	ATTAAAAACAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQAESSRARWCPATTTDCFDQDHNRGSWTELEKDVEQKSNSQKKTRFTGLADWRNPEIMAPGHPFSSVVKPSRSSLFSWGLDSLIKQNRTNEAQQSRDKDYKAGGDRKAGDREPKVEKGQC	125809	17081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_17856_122561_124617_124708
911487	contig_7357_pilon	+	2775	1	Intergenic	novelGene_36901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	2045	2575	278388	278918	NA	60	AAAAAAACATTGAAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVKFGIPPHMLFFLFSYLTFNYFIICANQSEYLEILVKRNTCPYSSVRDESIIPVKNQVPLCSLITMLPSTHGLATNSLFSQYILVVTVTLSTSSHSSPSRYVTGSFTSESPNSVPLTVQPLTRPTLPGMRTCSAKSFSGMQMGSLLLRHWTGSSSFNSDKLFSPVSSLYLMCT	276343	279118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_276300_279100
911488	contig_2710_pilon	-	4673	14	Intergenic	novelGene_161778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	230.961022864985	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	951	1436	958392	944051	FALSE	50	AGTCACACTATGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLKAFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIPT	1109377	940813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_944151_948310_948413_950426_950555_956497_956618_958356_958402_958511_958566_960067_960177_961169_961230_961411_961485_985987_986081_992008_992111_1106488_1106653_1108826_1108935_1109199
911489	contig_16411_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_77396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATCGTTTTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413115	414614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_413100_414600
911490	contig_10990_pilon	+	2882	20	Intergenic	novelGene_7451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	384.181404808398	1	99	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	412	2862	722379	752144	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708549	752164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708654_709189_709253_714573_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
911491	contig_19269_pilon	+	1636	3	Intergenic	novelGene_175623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_1	347.5	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	19	348	813	11355	FALSE	50	GTATAAAACTCTTAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESMPHTLTVNCQHPKDVNKNITALTSAPTDFTVFTDTPEVKPHSVVVTSQPPLETNGRTTGKHLS	794	12643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_904_7478_7587_11224
911492	contig_8063_pilon	+	3092	21	Intergenic	novelGene_152409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_10	69.9241732164207	249	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	17	2581	6663	60472	FALSE	30	AGGAAAGCTCGGTGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYFDYMRSWIQMLQQLPQASHSLKNLLEEEWNFTKEITHYIRGGEAQAGKLFCDIAGMLLKSTGSFLESGLQESCAEFWTSADDSSASDEIRRSVIEISRALKELFHEARERASKALGFAKMLRKDLEIAAEFTLSAPIRDLLDVLKSKQYVKIQIPGLENVQVFVPDGLVEEKGIILQLLNAAAGKDCSKDSDDVLIDAYLLLTKHSDRDQDSDDGWGAWEGQPVKVVPQVETVDTLRNMQVDNLLLVVMQSAHLTIQRKAFQQSIDGLMTLRQEQTSSQPVIAKALQQLKNDALELCNRISDAIDQVDRMFVSEFDAEVDECESVTLQQYYREAMIQGYNFGFEYHKEVVRLMSGEFRQKIGDKYISFARKWMNYVLTKCESGRGTRPRWATQGFDFLQAIEPAFISALPEDDFLSLQALMNECIGHVIGKPHSPVTGLYLALHRNSPRPVKVPRCHSDPPNPHLIIPTPEGFRGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEPAYPKGDSSASTRRSWELRTLISQTKDTASKQGPIEAIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEEVSRLGLQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPIPEKLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFIKVCTDEE	6646	60983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_6806_10353_10471_15274_15375_15470_15555_23433_23701_28859_29010_31036_31199_31708_31843_33155_33235_33978_34058_39806_39904_44265_44367_45183_45265_49532_49725_50785_50857_51917_52035_52911_53072_55304_55428_56797_56905_58860_59041_60451
911493	contig_11656_pilon	-	2919	2	Intergenic	novelGene_53956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_1	0	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159765	138176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_139256_157925
911494	contig_3602_pilon	+	2832	2	Intergenic	novelGene_60615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	25	1080	902032	913188	FALSE	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	902007	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135
911495	contig_5732_pilon	-	205	1	Intergenic	novelGene_119594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGTGTACCTTGTCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302748	302543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_302500_302700
911496	contig_5894_pilon	+	3592	3	Intergenic	novelGene_83062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	3	365	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	703270	704134	FALSE	20	TATGTCTGGTCTGTTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSVCGGGGRICGYFVAESGPGFPAAAEVGPGRPWAPGLGRKRLRRCSGLSSERRLLQCFKRLTQKGKVRLHKTQRRDWRTPLWILSGVTAEPEESFLTV	703269	707426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_703292_703567_703707_703995
911497	contig_11816_pilon	+	4190	2	Intergenic	novelGene_98523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1186	1791	988219	988824	FALSE	35	TGAACCAACATCTGGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGVISIFKSYYLRNTCKVIAAIDSASSDGSGQSKPKIFWKGFTILDAIKNIHGSSEEVKISTFTGVWNKLIPTLMDDFEGFKTSVEKVTADVVETARDLKAEVEPKDVTELLQSPDKTLIDEEMLLMDEQRKWFLEMESTPGENAVNIVEMTRKHTAYYINLVDKAAAGFEMTDSNFERSSIVGKMLSNGIAYYREIFS	986855	991223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_987828_988005
911498	contig_8503_pilon	+	1172	3	Intergenic	novelGene_177386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	27	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGGCTGAAATAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62595	65494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8503_pilon_+_63317_63966_64037_65113
911499	contig_13740_pilon	-	4504	4	Intergenic	novelGene_34710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_2	3272.72529994329	6	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164524	157093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648
911500	contig_3935_pilon	+	3053	4	Intergenic	novelGene_178467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2080	2619	83819	84828	FALSE	60	AGCACCACAAAAAAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQIKTPDDSSVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEKKIDKVMENKDKKLEEFTKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEILKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRINGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKENEETLRVMWDTMKLQELLKGIL	58209	85262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3935_pilon_+_58417_58548_60338_83735_84329_84798
911501	contig_3018_pilon	+	3464	2	Intergenic	novelGene_78822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATCTATGTAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543076	547089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_546454_547002
911502	contig_610_pilon	+	2353	8	Intergenic	novelGene_76855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTATTCCAGGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377642	390351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_379090_380220_380277_381346_381413_384549_384627_387145_387216_387815_387929_389658_389854_390022
911503	contig_610_pilon	-	3500	8	Intergenic	novelGene_76663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	478.830974395784	66	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	46	984	68933	34680	TRUE	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EECLSCPQKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQCLPLKKRQ	68978	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35451_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887
911504	contig_16578_pilon	+	5326	1	Intergenic	novelGene_148664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	814	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCGTTTGGACCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217014	222340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_217000_222300
911505	contig_3747_pilon	+	2203	4	Intergenic	novelGene_24948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10121	junction_2	1010.31612214528	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	41	712	202676	203692	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVKIVICPKPSIGC	202635	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202740_202870_203128_203228_203386_203498
911506	contig_13348_pilon	+	2981	2	Intergenic	novelGene_162687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAATAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254306	267263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_256054_266029
911507	contig_6199_pilon	+	1675	19	Intergenic	novelGene_126397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	175.610750816882	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	96	1133	559486	592948	TRUE	20	ATCCCCTCTGCTGAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRQHQKDKMYITCAEYTHFYGGKKPDIPKTNFRRLPFDHCRSILPWLKKYGTNPSNGEKLDGRSLIKLNFAKNNEGKYHCPVLFTVFTNNTHIVAIKTTGNVYAYEAVEQLNIKAKNFRDLLTDEPFSRQDIIILQDPTNLDKFNVSNFFHVKNNMKMTDPDEEKAKQDPSYYLKNTNAETRETLQELYKEFKGDEVLAATMKAPEKKKVDKLNAAHYSTGKVSASFTSTAMAPETTHEAAAVDEDVLRHQFVKKKGYVRLHTNRGDLNLELHCDLTPKTCENFIRLCKKHYYDGTIFHRSIRNFVIQGGRPHWHWHGWRVILGKAFQRRVPAQPLTHGPGHP	559390	603924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_559518_564006_564057_565838_565885_570040_570093_574879_574932_585652_585745_586802_586893_587899_587976_588614_588776_588949_589026_589668_589776_590256_590347_590820_590856_592869_592988_602081_602139_602798_602872_603006_603070_603216_603357_603754
911508	contig_13680_pilon	+	2706	2	Intergenic	novelGene_149599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATAGTTTTCTTCAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402233	405125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_404814_404999
911509	contig_1532_pilon	+	2281	2	Intergenic	novelGene_37440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGGGGCAGTTCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26285	30013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_+_27379_28825
911510	contig_2027_pilon	+	2717	15	Intergenic	novelGene_39917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_11	166.759098518718	6	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	6	1487	145565	150841	FALSE	50	AAAGTCTAAAGTGAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMKKIKRQLSMTLRGGRGVDKTNGAPEQIGLDESGSGGGSDPGEAPTRAVPGETRSGRVLLSAAQEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNVINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHASRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFFSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEANLRSSSMPDSGRPGFRVVDTEF	145559	152071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_+_145758_146389_146524_146606_146733_146821_146879_146977_147093_147768_147864_147964_148028_148274_148399_148701_148823_148930_149029_149113_149220_149304_149348_149494_149586_150639_150718_150803
911511	contig_6028_pilon	-	3241	2	Intergenic	novelGene_156609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2720	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACATTCCACCTGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398515	394693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_397627_398207
911512	contig_10892_pilon	+	2612	2	Intergenic	novelGene_116753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATGTTTAGATTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168318	172492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_168934_170495
911513	contig_6208_pilon	-	2558	8	Intergenic	novelGene_53034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	443	junction_5	336.167414560431	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	209	2473	513736	492858	FALSE	65	AGAATTTAGAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	532031	492772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_531834
911514	scaffold_13505_pilon	-	6085	7	Intergenic	novelGene_111596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	104.34983894999	8	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACACTTCCCCGGCTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662812	652843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_653140_653683_653874_654866_656126_656804_657803_658150_660875_661892_662494_662795
911515	contig_854_pilon	-	2224	7	Intergenic	novelGene_36290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1370	1699	563319	562338	TRUE	0	GGCCTGGGGTGTGGCGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATAASWAGGTGRPG	564688	543590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562377_563028
911516	contig_14925_pilon	+	1185	2	Intergenic	novelGene_55378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACAACTTTTTCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128501	136360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_129513_136186
911517	contig_17144_pilon	-	3021	15	Intergenic	novelGene_29343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2042.16848532362	24	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	323	2122	179764	167373	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSECAVTGLPNSLALPGRGVIHGPFSSTPGLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTTER	183404	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167386_168185_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176346_179691_179786_181794_181850_183158
911518	contig_12297_pilon	+	2293	3	Intergenic	novelGene_161374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	89	358	709018	709287	TRUE	60	AAAAGAATAACAGAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAIRQEKEIKSIQTGKEEVKLFLFADDTMLYVDNPKDSTRKLLELIERFSKVAGYKINIQKSVGFLYTNKENHEKEIRKATPFITAPKKIKYLRINLTRDIKDLYKENYRTLLQETK	708929	720534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_+_711197_713161_713169_720515
911519	contig_8375_pilon	+	3170	1	Intergenic	novelGene_141315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	2470	2907	217548	217985	NA	55	GCAAAAGGTTATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCSLLKRTGSILKYDTVSDRIISMHLQGRPVNTTIIQIYTPITNANDAEIEDFYQLLQSEIDQTCSQDALIITGDRNANVGNEEGLVAGKYGLGDRNDTRDRMIEFCKTNDLFVGNTFFQQHKQRLYMDLIKWNTQESNQLHL	215078	218248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_215100_218200
911520	contig_11258_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_67839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	64	junction_2	119.15349577564	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	396	617	354760	352060	FALSE	15	CAACACCTGTTTGTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVPAQQHPLPAPSLSEGALVLEHAQCCPLGEQASEGS	360587	351836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353152_354741_355099_360530
911521	contig_16110_pilon	+	1986	2	Intergenic	novelGene_126780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAGAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38399	40517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_38453_38584
911522	contig_11386_pilon	+	3512	2	Intergenic	novelGene_82804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	251	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGCAGAGCTGTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91048	96233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_91547_93219
911523	contig_3410_pilon	-	2494	15	Intergenic	novelGene_58944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_10	144.386969421674	42	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	1474	2493	231896	224074	FALSE	15	TCTCCCTCAGCTACGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPNSKCPLLKDDLVLMDSPGIDVTTELDSWIDKFCLDADVFVLVANSESTLMQTEKQFFHKVSERLSRPNIFILNNRWDASASEPEYMEEVRRQHMERCTSFLVDELGVVDRAQAGDRIFFVSAKEVLNARIQKAQGMPEGGGALAEGFQVRMFEFQNFERRFEECISQSAVKTKFEQHTVRAKQIAEAVRLIMDSLHIAAQEQRVYCLEMREERQDRLSFIDKQLELLAQDYKVRIKQITEEVERQVSTAMAEEIRRLSVLVDDYQMDFHPSPVVLKVYKNELHRHIEEGLGRNMSDRCSTAITSSLQTMQQEMIDGLKPLLPVSVRSQIDLLVPRQC	246245	224072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_224142_224607_224711_224981_225087_225485_225613_228580_228703_228843_228912_229142_229297_230655_230764_230875_230985_231840_232724_233603_233767_235393_235530_238597_238777_243934_244071_246213
911524	contig_9373_pilon	+	5343	29	Intergenic	novelGene_162714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1709	2062	168373	173971	TRUE	55	TTTAGACTAAAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLGWLGSSLGSWLTLCSSASESLLSSSCASCPICASGHSSCTSRTSTVSGAGVSGTCKNSILQNRTTPSECPVTMTFCVSHSFISDTQQQTICWLLPVNVFTLTIGFPLMLHTWM	163739	234213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_164910_166746_166946_167449_167568_168151_168475_172383_172479_173814_173997_177768_177949_179898_180061_181223_181377_187686_187838_190826_191039_191244_191340_196022_196175_197720_197825_198894_199013_202169_202291_202558_202614_203330_203410_205288_205377_206754_206876_208020_208169_210657_210822_213362_213535_224540_224769_226242_226320_229821_229981_230791_230974_232303_232415_233989
911525	contig_6576_pilon	-	3086	1	Intergenic	novelGene_42443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	144	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCACATAGTTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1305796	1302710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1302700_1305800
911526	contig_12479_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_56891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTCCTAAACCGTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585375	587696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_585400_587700
911527	contig_3438_pilon	+	2833	1	Intergenic	novelGene_178901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	21	66	376	441	29749	29814	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTIAIIAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDCKKIFGQYKSDKGLISIIYKEIQHLHNRKTTKPIKKWAEKMNRHFTKEDIQMANRYMRKCS	29373	32206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3438_pilon_+_29400_32200
911528	contig_1090_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_131126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423192	421156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_421200_423200
911529	contig_960_pilon	-	2473	19	Intergenic	novelGene_108236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	366.593932179886	425	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	156	2258	545280	441887	FALSE	30	CCAAGTAGATGTACTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAKSLVDIDLSSLRDPAGIFELVEVVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTEDEEEEIKLEINMLKRYSHHRNIATYYGAFIKKSPPGHDDQLWLVMEFCGAGSITDLVKNTKGNTLKEDWIAYISREILRGLAHLHIHHVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLEFRWREMEEHQQAERLQRQLQQEQAYLLSLQHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRSSSKSEGSPSQRLENAAKKPEDKKEVFRPLKPAGEVVSPMSEEFCIRPTSQLPFKLSFSSAYVSCLSSTCCFFLFYNFKTKLLLQLFLTHKICYVNFFLITEYIF	648197	441671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_442106_442977_443076_443776_443929_445281_445389_450484_450719_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758_489850_495560_495672_497062_497189_545265_545323_647749_647816_648150
911530	contig_12032_pilon	+	3349	1	Intergenic	novelGene_139285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	228	554	111306	111632	NA	35	AACGCTCTGAGAAGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVRKRSLAILASKEHSGCTSSQTDLFILLAIHGIFNILRQYHNSKALILLRSFLFTVQLSHAYEAIENTMACVRCTLVLKVTSLLFHTLKGSFAADSLNKMHQLIS	111078	114427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12032_pilon_+_111100_114400
911531	contig_13244_pilon	-	3629	5	Intergenic	novelGene_86996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1551	1898	468219	467872	TRUE	40	CATACGTATATATGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLLHILVLWRILVQRSLVHHRWGATDLEWLVFLRWRKDLPSVEVLKLLSRGTLGDNHRTHPANLDCVQRDGAAFILNVDNALKQIGIAVMFGFTVMNIFHALPRRWCLGRCL	470626	466020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_467551_467670_469453_469832_469976_470166_470235_470520
911532	contig_1301_pilon	+	7546	5	Intergenic	novelGene_47353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	492	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	6434	6733	693850	694149	FALSE	70	TAAAAAAAAAAACAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRRFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRLTIQPGSGQPRKTKWD	492794	694962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_492895_538395_538836_620016_620279_620469_620950_688698
911534	contig_709_pilon	-	2331	6	Intergenic	novelGene_57673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_5	12.5475097130865	93	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	409	1449	3990529	3977760	FALSE	20	CTTGTCTTAAGTTGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVYLREEYCGTSRGRNVCALLDNSEHEIILYKKYLKLESSTHACKVKLLSFGEKHCVFISKVVVHVRPVSASSSTSCPALGSRIDLDRVQTIVESMGSKLSPGAKELMNMVRFQQQNSIPFGEQLQSVLGNTGYKHTVGLQSSSTSGALNKSSSTPFPFRTGLTSGKVTEDLKACIDKNTQPPGGGNTTNLSACESVPQSHTLLEDDLKNLVSSFLPKKTSDNSNIPNSELLPFLQNLCSQVNHLRVGNNTEWQEKVTKPGEGIVGVAVEEQPVCSYLEKILSKNMELMEKNLMDYVDQRICKLQEHIDNKIALLVDLLQNSNSPSSGMPLRQYDSGERLSNGER	3993649	3976877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3977995_3983362_3983818_3986967_3987175_3989281_3989352_3990455_3990660_3993371
911535	contig_20527_pilon	+	2250	5	Intergenic	novelGene_138595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	1339.66730944664	45	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	188	535	23541	26270	TRUE	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVEFPEEIQRSF	13522	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_23436_23740_24905_25023_26238_26346_27308
911536	contig_19098_pilon	+	2670	12	Intergenic	novelGene_65798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_11	186.243375832061	145	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	273	2414	238873	311248	FALSE	80	AGAAAAAACAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRSPDAKEDPVECPLCMEPLEIDDINFFPCTCGYQICRFCWHRIRTDENGLCPACRKPYPEDPAVYKPLSQEELQRIKNEKKQKQNERKQKISENRKHLASVRVVQKNLVFVVGLSQRLADPEVLKRPEYFGKFGKIHKVVINNSTSYAGSQGPSASAYVTYIRSEDALRAIQCVNNVVVDGRTLKASLGTTKYCSYFLKNMQCPKPDCMYLHELGDEAASFTKEEMQAGKHQEYEQKLLQELYKLNPNFLQLSTGSVDKNKNKVTPLQRYDTPIDKSSDSLSIGNGDNSQQISNRDTPSPPPGLCKSNPVIPISSSNHSARSPFEGAVTESQSLFSDNFRHPNPIPSGLPPFPSSPQTSSDWPTAPEPQSLFTSETIPVSSSTDWQAAFGFGSSKQPEDDLGFDPFDVTRKALADLIEKELSVQDQPSLSPTSLQNTSSHTTAAKSPGSGFLHPAAPANANSLNSTFSVLPQRFPQFQQHRAVYNSFSFPGQAARYPWMAFPRNSIMHLNHTANPTSNSNFLDLNLPPQHNTGLGGIPIADNSSSVENLNMKEWQDGLRALLPNININFGGLPNSSSPSNANHSVPPSNTATTDGLSWDSPGSWTDPAIITGIPASSGNSLDSLQDDNPPHWLKSLQALTEMDGPSAAPSQTHHSAPFSTQIPLHRASWNPYPPPSNPSSFHSPPPGFQTAFRPPSKTPTDLLQSSTLDRH	180704	311504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_180886_238781_239047_250454_250653_263214_263302_264076_264179_264786_264913_267841_267976_279915_279974_282009_282260_283414_283913_310045_310259_310946
911537	contig_15974_pilon	+	1255	1	Intergenic	novelGene_164822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACGAGAATTAAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327173	328428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_327200_328400
911538	contig_15325_pilon	+	3053	4	Intergenic	novelGene_157172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	737	junction_1	710.991951821929	4	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	20	313	93248	94570	TRUE	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPAGIMEGVEEKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRG	93228	97560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_95785_96034
911539	contig_10372_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_112518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGTACAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68959	66542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10372_pilon_-_66500_69000
911540	contig_14219_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_54379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAACAACAAAAAGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060584	1062214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1060600_1062200
911541	contig_10732_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_114719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145833	144654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_144700_145800
911542	contig_13158_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_107298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAATAAAAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176029	177531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_176000_177500
911543	contig_3956_pilon	+	1469	7	Intergenic	novelGene_15139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1605.57784682719	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	279	1124	1286460	1290665	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQSGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281614	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282856_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289054_1290511
911544	contig_10016_pilon	-	6841	4	Intergenic	novelGene_117862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_3	47.3943268991366	220	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	79	414	362250	353972	FALSE	40	AACTCTTCTTAAACATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPGDLTQVQKNFSHLVDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVYDEDGKLLEKAVHPGAGYEGISEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVSIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQECKY	362328	347544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_354056_355764_355864_357368_357494_362222
911545	contig_13787_pilon	+	2142	7	Intergenic	novelGene_40604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCTTTTATGGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129647	183769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_+_130997_131064_131436_171775_171862_174977_175113_179558_179670_179767_179843_183754
911546	contig_9706_pilon	-	2556	13	Intergenic	novelGene_20946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGACCACCTGAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556883	262974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_263038_300315_300370_313343_313511_324271_324307_337117_337217_346563_346717_350060_350139_357498_357552_363661_363781_365680_365817_423617_423724_455988_456099_555500
911547	contig_9189_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_165136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538609	537277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_537300_538600
911548	contig_1349_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_171644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	156	629	237621	237148	NA	70	ATGAAAAAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHQKRHTMMASASSQNKESRNFPEEENFLELPEVEHKRLIYRTFQEIRKEIIQNVEHAKEHTDKAIEELKKIREEHNDRFNRLQEYIDSNQKSRRLTIKFQNYTTQWKVIGAELRQWKSELVRLKIKHLIPTYLKKNQIKELKKMKKP	237776	236290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1349_pilon_-_236300_237800
911549	contig_9720_pilon	+	2117	2	Intergenic	novelGene_116767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194000	198538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_195081_197501
911550	contig_998_pilon	+	2864	1	Intergenic	novelGene_153777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1718	2110	301862	302254	NA	40	TCATAGACACACCCAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTNSKWIKDQNIKSKTIMIRDENIGSMLEVLIRGINRIQTITNNTQTLEHKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRIKREPTDWEKIWRYDKSDKGLICKLYRKIQHLYNKKTNNTIKNGQRI	300144	303008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_300100_303000
911552	contig_3747_pilon	-	2717	7	Intergenic	novelGene_24754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1966	2457	202909	201238	FALSE	40	AACAACGATCCGGAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSQSQHVWKSHHLHPVIYTPILSFEGCSQRPLRKLKTELVLILVSRSHDHHLILTCRLVFQEKRVFVAQVIQGLFALLRALHPEDFGHSASQDPDGFDSSHFTHLHYHPASHLLPTAVHLLWVVKDHFERLDLLEHHHDWAGFVQVLETRKKQKTQDPRRTF	205206	200977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202366_202871_203127_203227_203384_203496_203649_203766
911553	contig_9903_pilon	-	2162	8	Intergenic	novelGene_172009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	82.3090244760809	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	211	549	106166	92274	TRUE	5	TCTTCGCAGCCCTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCEKAMELIRELHHTPEGQLPAFNEDGLRQILEEMKALYEQNQSDVNEAKSDGRSDLIPTIKFRHCSLLRNRRCTVAYLYDRLLRIRALRWEYGSVLPNALRFHMSAEEGV	106376	81398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_82671_85920_85996_89613_89731_92124_92283_97560_97652_98228_98328_101465_101531_106091
911554	contig_709_pilon	-	3431	6	Intergenic	novelGene_57583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	263	junction_2	104.008845777655	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	846	1928	2222900	2212176	FALSE	15	TGTCCATGATGTCTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVFKASYLTVFSWKGVILEEVTIKCSCQVYSVMKHRKIFQVCFFVVDIEDLPPTVQEKLFDEVLDRDVQKELEEESPIINWSLELATRLDSRLYALWNRTAGDCLLDSVLQATWGIYDKDSVLRKALHDSLHDCSHWFYTRWKDWESWYSQSFGLHFSLREEQWQEDWAFILSLASQPGASLEQTHIFVLAHILRRPIIVYGVKYYKSFRGETLGYTRFQGVYLPLLWEQSFCWKSPIALGYTRGHFSALVAMENDGYGNRGAGANLNTDDDVTITFLPLVDSERKLLHVHFLSAQELGTEEQREKLLKEWLDCCVTEGGVLVAMQRSSRRRNHPPGHTDGREMARPLPTDPALHIPV	2223745	2210672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2212362_2213472_2213703_2213866_2213997_2215315_2215437_2221959_2222159_2222683
911555	contig_5947_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_101524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	155	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAGAAAAAGCAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491521	493935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_491500_493900
911556	contig_15047_pilon	-	2190	3	Intergenic	novelGene_52298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	8.5	108	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	968	1774	131962	129138	FALSE	10	CACCCGTGTCTGGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQGTLVNNVRLPRGHRLELSDGDLLTFGPEGPPGTSPSEFYFMFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGRE	132929	128721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129148_130052_130621_131733
911557	contig_4364_pilon	+	539	1	Intergenic	novelGene_784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532775	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
911558	contig_5988_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_15858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	775	1143	271065	271433	NA	80	TTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFISSGFEEAILSPPATGILILRAVLSAFSKKGRSGFSEPSMGIFRMTEEWLSRWDRRFWAAYAYCDFTLASIFSNCLFWAANSSACFARYSFSDTLADGTLLLLCFWETNAFEPSCCKE	270290	273189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_270300_273200
911559	contig_12866_pilon	+	2850	2	Intergenic	novelGene_174648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGCCTACAACCACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656338	659253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_657306_657370
911560	contig_14925_pilon	-	1176	5	Intergenic	novelGene_55360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	TRUE	15	TGCCACCCGCTCCTTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
911561	contig_11902_pilon	-	2678	5	Intergenic	novelGene_176147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	20.1370305656023	113	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	464	868	10352	8797	FALSE	50	GTCCCCAAATAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCLLLADVPFLPPKGPPPAFQLPPGRPLSPLHREKHRESVSASGNKARASQSCPCFPGLRSRRDEDSLSGDRSDLKAPSTPGKRKKRRHRTVFTAHQLEELEKAFSEAHYPDVYARETLAVKTKLPEDRVQVWFQNRRAKWRKREKCWGGSSVMAEYGLYGAMVRHSLPLPESIVNSAKGGLAGSCMPWLLGMRKKSIAMTSKRRSEEKLTGLWGSDTPRGDSSPSQVGPQSSSGKVSPEQGLEDEVVDLSSSTRQETQREPRVAQVGASSDSTGLEGLRPGEAGVL	14793	6986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_9087_10237_10419_11454_11579_12057_12137_14599
911562	contig_7415_pilon	-	2760	10	Intergenic	novelGene_168672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	24.0452248795093	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	137	1558	304553	234983	FALSE	70	ATTGCAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAAENEGIAGGDCLSGAEGARLRPESCREEVLAGMAKACGGEEGNGLTGMEKTGVGGEGSGQKEEDMQVDLKVVKQEIIDWSEIEEYKLDAQWVKQEVEDGPEVKDEKADTLEVKQEMDASLVIKEEKMDELEIKEEKVKVKKEVVDWLEVKEEKEIKFEIKKEEILGDQNIKEEEMMDGVCVKEEKDILKREVMDDTKVKEEPEINPPVSCKRKLAMSRCETCGTEEAKYRCPRCMRYSCSLPCVKKHKAELTCNGVRDKTAFVSIQQFTEMNLLSDYRFLEDVARTADYISRDTFLKRPTGNKHMYYLKNRARRQGIYLKLLPNGFTKRKENSTFFDKKNQQFYWHVKLLFPQSQAVYIEKRVPDNKTINDILRTYIDPEKSDPVIRQRLKAYIRSQTGVQILMKVECVQQNLVSYYELDPCRSLLDNLKNKVIIEYPTLHVVLRGSSTDMKVLQQVKSESTKNFGSES	304689	233780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_235024_239414_239540_259273_259352_261404_261486_265596_265666_294721_294826_302270_302357_302441_302549_302634_302701_303888
911563	contig_12624_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_60991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTACAACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97804	99689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_97800_99700
911564	contig_5047_pilon	-	3549	2	Intergenic	novelGene_157984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	212	529	860009	859040	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAAVNWGNGPRKRASFPNYHTPCLYKETRPQASALKSKGRPSWGSMWSVPATPPPRHCRLQAYCELVLKALCSGVCSHSQHSTCLPVHPIAQASETNRIDLPGD	860220	856019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_859115_859766
911565	contig_13481_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_119275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	124064	124417	NA	25	ATTCCTTTTTCTCCACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPRDWSLLITCPKYVRQSLAILASKEHSGCTSSKRDLFVFLAVHGIFSILHQHHNSKASILPQSSLFIVQISHAYEVTENTLASVRWTLVLKVISLLFNTLKKSFADLPDGICRLIS	124062	125283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_124100_125300
911566	contig_6270_pilon	+	2271	2	Intergenic	novelGene_99875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	982	1377	1054926	1055321	TRUE	30	TACAATACTTGGTGTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIGEMQIKTTMRYHLTPALPARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKTIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAK	1053944	1070288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1056202_1070274
911567	contig_11816_pilon	-	3242	23	Intergenic	novelGene_98492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_22	148.476790906918	204	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1049	3147	95	3241	599730	523754	FALSE	15	ACGTAAGTTGTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGAGGLARRSGRSGCCVSPRTGSDRLGQFRMGTRWATPRCAVGFLVLLLRCFARAEPSGTTGNDPFTIVNADTGKCIKPLNDWIVAKDCQETEDMLWKWVSRHRLFHLQSQMCLGLDIAKPVDSLRMFSCDSSAMLWWKCEHKFLYGAAQYRLTLKDGHAIASTNSSDVWIKGGTEESLCEQPYHEMYTRDGNAYGRPCEFPFLINGTWHHECVVDENHSGPWCATTLNYEYDQKWGICLKPENGCGNNWEKNEQIGSCYQFNTQTALSWKEAYISCQNQGAALLSINSAAELTYLKEKEGIARIFWIGLNQLYSARGWEWSDHKPLNFLNWDPDMPRAPTIGTSSCARMDAESGLWQSFSCEAQLPYVCKKPLNNTVELTDVWTYSDTHCDSKWLPNNGFCYLLANESGSWDEAHAKCKALSSDLISIHSLADVEVVVSKLHNGDAKEEIWTGLKNINIPTLFQWSDGTEVTLTYWDENEPNVPYNKTPNCVCYLGKLGQWKVQSCEEKLKYACKKKGEKINDAGSDKMCPPNEGWKRHGDTCYKIYADNVPFGTNCNLTITSRFEQEYLNDMIKKYDKFQRKYFWTGLRDVDSRGEYSWASVGGIKRAVTFSNWNYHEPAFPGGCVAMSTGKSLGKWEVKDCRNFRALSICKKMSEPPEPEEAAPKPSDPCPEGWYSFPSGLSCYKLFHIERVVRKRNWEEAERFCQSLGAHLPSFSHMNEIKEFLQFLMDQFSGQRWLWIGLNKRSPDLQGSWQWSDRTPVSAVFMANEFQQDYDIRDCAAVKVVRRPWRRGWHFYDDREFTYLSPFACDAQLEWVCQIPKGRTPKTPDWYNPERAGIHGPPVVIEGSEYWFVADPHLSYEEAVLYCASNHSFLATLTSFAGLKAIRNKIANISDDEQKWWVRITEQLPDHHFIYSRHPWHHFPLTFGEECLYMSAKTWLRDLNKPADCNTKLPFICEKYNVSSLEKYSPESAAKVQCSGKWIPFQNKCFLMIKPKSLTFSEASDTCHAYGGTLPSVLSQSEQDFITYLLPDMEATLWIGLRWKAYERIHKWTDNKELTYSNFHPLLIGQKLRIPG	599824	523752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_523912_524139_524246_526177_526318_526859_526940_527231_527300_528276_528453_528799_528836_530424_530540_536028_536098_537161_537244_557845_557989_559663_559864_563103_563274_563411_563501_564055_564167_565625_565784_566698_566891_569925_570067_571234_571346_577146_577312_586398_586570_592877_593250_599636
911568	contig_5023_pilon	+	2300	14	Intergenic	novelGene_7233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1298.09182213672	14	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	86	1702	607279	646990	FALSE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVGDDFNHLLTEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580843	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607347_611663_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
911569	contig_13004_pilon	+	4005	2	Intergenic	novelGene_112620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189887	194398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_193558_194063
911570	contig_10286_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_98430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACCATACAATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466710	464357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_464400_466700
911571	contig_6823_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_131238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCACTAGCCATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419707	418992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_419000_419700
911572	contig_19564_pilon	+	3408	19	Intergenic	novelGene_29663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_6	40.1459144178389	253	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1044	3135	188	3322	49202	65924	FALSE	35	AATAGAGCTAGTGGGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAGLERWVQDELHSVLGLSERHVAQFLIGTAQRCASAEEFVQRLRDTDTLDLSGPAQDFALRLWNKVPRKVVVEKPARAAEREARALLEKNRSYKLLEDSEESSEETVGRAGSSLQKKRKKRKHLRKKCHEEEDEEEEVVSEKEKKKTGGSKQQTEKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRKKSRREYLAKREREKLEDLEAELADEEYLFGDVELSRHERRELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPEETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPLAPPPQAQAQQKESIQAVRQSLPVFPFREELLAAIASHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTKKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATLDTARFSTFFDDAPIFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTMSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEEQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG	49014	66010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_49409_50813_51062_51158_51322_51624_51682_58010_58266_58462_58667_58749_58942_59613_59725_59868_59985_60608_60820_61031_61131_61226_61380_62977_63282_63378_63498_63629_63698_64393_64557_64648_64811_65109_65284_65795
911573	contig_4180_pilon	-	4277	2	Intergenic	novelGene_8315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777700	759232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_762885_777075
911574	contig_9297_pilon	+	2161	1	Intergenic	novelGene_69850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTAACAATAAAATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724793	726954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_724800_727000
911575	contig_14133_pilon	-	1005	5	Intergenic	novelGene_119935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3277	junction_3	448.421955305491	9	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGTAGTATCATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209450	206559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207465_208214_208389_208585_209131_209421
911576	contig_12915_pilon	+	3556	1	Intergenic	novelGene_148341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1501	1839	69347	69685	NA	20	TTACTTTAATTCGTCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLIPVYSICQGPRLQSQFMSSKKGICNEELIGLAKFHYMISGVVSITKAIFSSYQPFFFVANFRIPITYDYQCILTACSINFRLQKLVKIFNSFIFGLSGWWVKLNKSCN	67846	71402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_67800_71400
911577	contig_9375_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_136031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATACCATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76288	75384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_75400_76300
911578	contig_6938_pilon	-	569	6	Intergenic	novelGene_69071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	128.979688323395	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	89	430	169148	158147	TRUE	25	GTAAGTTTGAATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQKINEGLEHLAKAEKYLKTGFLKWKPDYDSAASEYGKAAVAFKNAKQFEQAKDACLREAVAHENNRAYLFQLFKAYEQAGMMLKVSTVVLLSCHSCSLGDAETTRGRSAD	169236	157886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_-_157954_158074_158185_162331_162406_163983_164090_165469_165538_169092
911579	contig_3077_pilon	-	7420	24	Intergenic	novelGene_26910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	59.9033563191469	344	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	357	2525	1768280	1726866	TRUE	30	ATACTAGGTAATTGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERPESCDDSSKVGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKPEGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTATVMQTGGSATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSAEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGGRGGPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPSKVPSGRTTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKNQASHPSATKLAELPPTPLRTTAKSFVKPPSLANLDKVNSNSLDLPASSDAHASKVPDLHATSSATGSPLPSCFTPSPAPILNINSASFSQGLELMSGFSVPKETHMYPKLSGLHRSMESLQMPMSLPSAFPSSAPIPTPPAPPAAPPEEETEELTWSGSPRTGQLDGNQRDRNTLPKKGLRYQLQSQEETKERRHSHTISGLPESDDQSELPSPPALPLSLSAKGQLTNIVSPTAATTPRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQMGSTLSLAERPKGMIRSGSFRDPTDDVHGSVLSLASSASSTYSSQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLSANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALNASETTPKELRIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSGKDADAKKKKKKSWLRSSFNKAFSIKKGPKSASSYSDIEEIATPDSSAPSSPKLQHGSTETASPSIRSSNSSSVGIDVTESPANSVPHTRMFHANEEEEPEKKEVSELRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRETMHNMQVGIWWTC	1769429	1715541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1718956_1720957_1721156_1722492_1722612_1723176_1723374_1723856_1723929_1724075_1724231_1724999_1725236_1725654_1725815_1726040_1726137_1726317_1726416_1726715_1726879_1726967_1727172_1727439_1727637_1731514_1731637_1748002_1748115_1748399_1748484_1751532_1751611_1761580_1761634_1762746_1762918_1764799_1764949_1765682_1765725_1766516_1766961_1767780_1768475_1769267
911580	contig_3588_pilon	+	4758	1	Intergenic	novelGene_72893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCCGGGAATAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133313	138071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_133300_138100
911581	contig_16204_pilon	-	1498	2	Intergenic	novelGene_154526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	548	754	402399	402193	FALSE	5	GATGTGGCTGCTTGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVSWSFRGSRGWAPSVVEAGRLAWGPCSASGRWRGCHILPAPLPAGACPSLWISTTSGSCLAWVLDTILAVGLSLLTPLPQPLAPPPLKFKVKVEAELALPVGCHSVPELEGTQPGACRPLRGTHSTHWPLAAGPPGSSSVTGLAAPATLVLPGGSSPLRGRLCECVRVIVTLCLHLPASEPMQNLSATMAMGLWPSIHPLPPPPGSGIFHVVPTPRGAATGVCPLWSRTACPRTVVRVELERGQNEKEQ	429232	401448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_402831_429116
911582	contig_15559_pilon	+	2784	12	Intergenic	novelGene_141891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	897	1304	145261	145668	TRUE	45	CTGGAAGAAAAAAGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGKTLPAGPCVSGSCSKREEDGGPLPTDSAPEVEEDETPAATSSPAASVESPALSSSDSENSPKRSPRAPPLSFSISLDTLRKSSEIVRTRSDAEVISLASVRLVNSDSGDPIILDKRVPDSMSSLNGLLLRGE	144364	174241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_+_146141_149287_149684_153791_153882_164543_164602_164774_164817_165028_165110_167775_167813_169038_169117_170448_170561_171329_171349_173855_173893_174183
911583	contig_17454_pilon	+	2509	2	Intergenic	novelGene_177274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCCTAGGAATATATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25353	31233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17454_pilon_+_25372_28742
911584	contig_15185_pilon	+	2668	16	Intergenic	novelGene_99393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_10	38.7793759619724	211	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	109	1293	130852	162600	FALSE	20	TAAGTGTGATGGTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASAAASSLVAAAAAGEVRFRLRCRREAAAARRAESMLDLEVVPERSLGNEQWEFTLGMPLAQAVAILQKHCRIIKNVQVLYSEQSPLSHDLILNLTQDGIKLLFDALNQRLKVIEVYDLTKVKLKYCGVHFNSQAIAPTIEQIDQSFGATHPGVYNSAEQLFHLNFRGLSFSFQLDSWTEAPKYEPNFAHGLASLQIPHGATVKRMYIYSGNSLQDTKAPVMPLSCFLGNVYAESVDVLRDGTGPSGLRLRLLAAGCGPSLLADAKMRVFERSVYFGDSCQDVLSMLGSPHKVFYKSEDKDILFDANTHKVKKFVLHTNYPGHYNFNIYHRCEFKIPLAIKKENADGQTETCTTYSKWDNIQELLGHPVEKPVVLHRSSSPNNTNPFGSTFCFGLQRMIFEVMQNNHIASVTLYGPSRPGAHLRTAELS	130634	163975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_130686_130794_130916_134957_135041_138911_138996_142573_142618_145900_145981_146274_146370_147003_147102_147192_147306_157716_157851_159829_159913_160339_160384_160838_160883_161001_161061_161709_161783_162513
911585	contig_10609_pilon	-	4011	1	Intergenic	novelGene_123939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTTCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421345	417334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_417300_421300
911586	contig_2377_pilon	-	6084	1	Intergenic	novelGene_67917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGGCCGTTGATTTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264652	258568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_258600_264700
911587	contig_8167_pilon	-	3967	4	Intergenic	novelGene_155642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTCCACACACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219799	49054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_49804_50024_52314_208896_209574_219547
911588	contig_9390_pilon	-	671	2	Intergenic	novelGene_153084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAACGCGCGCACACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583898	572252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9390_pilon_-_572843_583817
911589	contig_3627_pilon	+	3568	15	Intergenic	novelGene_78559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	117.985990174898	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	34	1413	1299272	1307800	TRUE	25	CTTGGCAGATGGTTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299238	1310024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665_1308127_1308195
911590	contig_9119_pilon	+	3829	2	Intergenic	novelGene_169745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	705	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2522	2995	290435	290908	FALSE	65	GAAATGAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDNSPVEENALELLDREFRSLILRILKKLRQKADKHEETIDKFVENTDKKLEESREIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLKIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEIVEDRISGIEEKRLDTTLFQENSEKRTKKNEEILRIMWDTIKSKNL	108316	291742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_+_110582_290178
911591	contig_12786_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_103434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598802	600483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_598800_600500
911592	contig_14208_pilon	-	2325	2	Intergenic	novelGene_129075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	332	655	104941	104125	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGVPLVSVKPLSLIFLLEFEFCTTLFSCSIRDSVVFFVRAVIGGSRAPSNSPGLRLMESLVYVALSVLTKFTWHNTFQIPPCYEVFHRFIIVLYCWVVFHCVNIP	105272	102454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_104240_104732
911593	contig_12142_pilon	+	2791	11	Intergenic	novelGene_147810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	30.7182356264158	28	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	2009	2791	112362	135987	FALSE	10	ACCCAGCCCGCCCCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPIL	102150	135987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_102480_104919_105002_106950_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_111111_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
911594	contig_4364_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTGAACACAAAGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1533303	1532756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1532800_1533300
911595	contig_17796_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_33840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACCCAATCTAACCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121788	119770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_119800_121800
911596	contig_3948_pilon	-	2022	17	Intergenic	novelGene_53281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	135.665489347881	2	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	383	1708	1430884	1414365	TRUE	20	TGTAACTCCTGGCACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVGLSGRISSITSLASCSSSSSSWWCPVPKSASSWYTSSCVQRITAGGGGIS	1458429	1410927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1415286_1417022_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434907_1435012_1439634_1439773_1458390
911597	contig_3174_pilon	+	2658	2	Intergenic	novelGene_144070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2027	2392	57901	58266	FALSE	20	GGTTCCAGTAGACCATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRITSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWMPSGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	46702	58532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3174_pilon_+_48458_57629
911598	contig_4732_pilon	+	4970	8	Intergenic	novelGene_75461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	3926	4552	703995	706799	FALSE	50	GATTAATATTTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRKLSAASSWRMKKSSCLVLPEGDAPQGLELQLLLQDLPHLTLLRPFLHLLPPDHIHILGGQDQVPLDGLEATVVLGDGVSKVHTLPLAQELTQLWPLLQPQVVPNEVPVDAVPPPLLLVEQDVGGFLPHLLILPDRDVAPPGLLDGTGKAIKLAFTHLLQEEKLSKGEGLWAGVSQEAKVSGVPWAIPPTHSCSHTPPYTLIRCI	696183	707217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_697276_697641_698951_699477_700842_703617_703696_703912_704060_704405_704554_706204_706377_706557
911599	contig_6503_pilon	-	2168	6	Intergenic	novelGene_145800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	24.3885218904303	59	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	326	682	1417677	1402680	FALSE	40	GAGAAGGCCGACAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTRKFGPSRHRSFQYGGPQGGGAAKGVNGFEVQKQNCCWLLVTHKPCIKDDVIVALKKANGDAILKFEPFILHVQCRQLKDAQLLHSAAVASGFRNSGITVGKKGKTMMAVRSTHSLEVPLSHNGKLMVTEEYIDFLLNIANQKMEENKKRIERFYNCLQHALERETVTNSHPKIKEKNNSSYTHKKKRTPEKTCGKCITDENDEEPEHDDDDPGISVNIFPEEY	1429541	1401193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_1402897_1415203_1415338_1417671_1417744_1423697_1423797_1425476_1425558_1429462
911600	contig_13093_pilon	+	4269	1	Intergenic	novelGene_105206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	325	978	2906	3883	20490	21467	NA	5	GGGGCGGGTGTCTGGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGKTLQVSKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTTTVVKTALYWYNNRCIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFNKGPKSINWGKYSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTETNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTLLGALIHGINRIRTISNSAQAPEERLDNWKLLKIKHLRSSKVFTKRVKRQPTDGEKILATTQSHQRLISKIYKILQNLNNKKINNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKQCSRSLTIREMQIKTTKRYHFTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHFGGNVKWYNHFGNRFGTSLKN	17584	21853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_17600_21900
911601	contig_14744_pilon	-	1633	7	Intergenic	novelGene_66014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	457.075030310488	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	72	839	969897	964394	TRUE	65	ATAAAAATAATAGCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQEVATIISTHSEDEKTMHPRLYVALPRISGRTRTPAHIGVRSS	969968	960517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_965700_965811_967273_967450_968343_968630_969717
911602	contig_10074_pilon	-	3147	23	Intergenic	novelGene_57215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	186.515304137987	23	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	228	2450	725187	694926	TRUE	5	TTTGTTGTCTCTCTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEMSANTVLDSQRQQKHYGITSPISLACPKEIDHIYTEKLIDAMKPFGVFEDEEELNHRLVVLGKLNNLVKEWISHVSESKNLPPSVVATVGGKIFTFGSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVERSDFFQSFFEKLKHQDGIRNLRAVEDAFVPVIKFEFDGIEIDLVFARLAIQTISDNLDLRDDSRLRSLDIRCIRSLNGCRVTDEILHLVPNKETFRLTLRAVKLWAKRRGIYSNMLGFLGGVSWAMLVARTCQLYPNAAASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEESNLNLPVWDPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSTSTRTVMVEEFKQGLAVTDEILQGKSDWSKLLEPPNFFQKYRHYIVLTASASTEENHLEWVGLVESKIRVLVGNLERNEFITLAHVNPQSFPGNKEHHKDNNYVSMWFLGIIFRRVENAESVNIDLTYDIQSFTDTVYRQANNISMLKEGMKIEATHVKKKQLHHYLPSETLQKKKKQSLSDVSRSLGGLQSKRPSLDGSCLDSSRDTDSGTPFTSPVSSVKPSKPDSPGGETERSSAEPAPVGVGKPLSVPAAQGLSIPVIGAKVDVTVKAVSPPAVCTIPTVVGRNVIPRVTTPHSPAQGQPQLNGIANITKNVLPKRSHSPSTDGSSKRLKDIEKFIRLESTFKDSRAAEDRKRKSADAIRGESMPIPTIDTSRKKRLPSKELPDSSSPVPANNIRVIKNSIRLTLNR	725414	693617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_694201_694811_695025_695988_696046_696242_696309_696878_697100_697186_697276_697673_697847_698094_698217_700172_700283_700699_700820_705608_705663_706064_706150_706745_706867_707709_707783_708422_708562_711022_711113_713762_713875_715712_715767_716823_716934_717177_717260_720397_720465_722180_722343_725170
911604	contig_4754_pilon	-	2523	2	Intergenic	novelGene_35983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATATGTTACAAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496333	493472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_495700_496037
911605	contig_3410_pilon	-	2781	1	Intergenic	novelGene_58893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1914	2222	9993	9685	NA	20	AAGGCCCCCATATGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILSLALTLSHYQEIGFALPEISLLLATLGDGWGGSQETSNVLVILRLLLQFLSSPTLCPGRLTSADGIPRPQASSKFGPSGLGLQPQSCHTAPTLPPLPR	11906	9125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_9100_11900
911606	contig_6175_pilon	+	3728	20	Intergenic	novelGene_16301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	191.819672358184	7	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	70	2391	1466806	1520939	TRUE	25	TGCACAGTGTGAGTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLQLSHEALKQICLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMSTMYAKIDPSLGIIAKINQTLDRTGYMSDQTKNVVSGVLFGTGLWVALIITMRYSLKVLLSYHGWMFDEHGKMSRATKIWMGMVKILSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVDRYLESVRPLMKEEDFRRMTELAQDFAINLGPKLQWYLKLKSWWAMNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYIVPTHIQAARAGNTIHAILLYRRQLDREELKPLCLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHVKDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREIEQQIQRILDDPSEPQAGEAKLAALTAGERVPWARCRQAYFARGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEQGYRKDDPDMSMDAYAKSLLHGQCFDRWFDKSFTFIVFKNGKMGMNAEHSWADAPIVGHLWEYVMATDSFQLGYAEDGHCKGDTNLNIPYPTRLQWEIPEECQEVIETSLNSANLLADDVDFHSFPFNAFGKGLIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREGRTETVRSCTTESCNFVLAMMDPGQTVEQRLKLFRMASEKHQLLYRLAMTGAGIDRHLFCLYVVSKYLAVDSPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFNLERNPDYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGDKLINFHVSSKFSSPETDSHRFGKHLKQAMMDIISLFGFSSNSKK	1444483	1523008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1444540_1466792_1466947_1471081_1471222_1478853_1479026_1481904_1482007_1484447_1484586_1488389_1488468_1489953_1490062_1491423_1491512_1493861_1494058_1495309_1495499_1498492_1498599_1502631_1502749_1505070_1505236_1514158_1514294_1516651_1516805_1517891_1518006_1518667_1518761_1520852_1521354_1522085
911607	contig_10082_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_63889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	71	322	397759	398010	NA	95	AAAAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTTLLCSPADVIWKLPAQGTVGMEEAGLNSGMCSSLLVTVGELAGLGPSPCKLIHYLQVTTHTQETRKYVQRGKGADPTSHSQEVGRASCQALNSRAWALKSDVH	397688	399904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_397700_399900
911608	contig_8241_pilon	-	2028	10	Intergenic	novelGene_157501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	38.2654793982807	476	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	908	1276	625794	621106	FALSE	20	GGGTGATTGTCATATAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDDQGRLSWPVLFLYPEYGQSDFISAFHEDSRFIDHLMVMFGEMPSWDLEQKYCPDNLELYFEDEERAELHQVPPESTLLHTLQHPRYSVKALTPAFLVCVGSSPFCKNYLRGRRVHQIK	638574	620353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_621209_623391_623475_624988_625071_625693_625912_628198_628286_629875_630105_631482_631561_636647_636810_637739_637858_638458
911609	contig_3233_pilon	+	2305	6	Intergenic	novelGene_56579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	429	junction_2	183.65467595463	5	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	459	971	741808	745484	TRUE	25	ACCCACTCCCCAATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGTGGGARFYLAWFPRDLPNWRVEWGLDEDWKPSSL	741349	748034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_741902_742724_742836_743705_743819_745289_746424_746936_747016_747718
911610	contig_7272_pilon	-	1739	13	Intergenic	novelGene_25361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_10	586.27259492113	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	710	1738	610299	604472	FALSE	70	AAAAAAGTGAAGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESI	633160	604470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_616614_617510_617709_617857_618005_620502_620568_632105_632194_633027
911611	contig_12021_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_172196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAACAAATATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60655	59117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_59100_60700
911612	contig_7378_pilon	+	3553	1	Intergenic	novelGene_120228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	56	529	27856	28329	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFETRMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGRGEIGTLMHCWWECKMIQPLWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITQIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWVNKLWYIHTMEYYATRMNNNESVKHLITWMKLEVIMLSEIS	27800	31353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_27800_31400
911613	scaffold_9100_pilon	+	8258	1	Intergenic	novelGene_83304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	6925	7227	775876	776178	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLLSISKTLSQLLLLRDAISLHTYKPLTHKQFSHNYKQFSFATPNLYGSGKQIISPKSSNLNLVDNKRHLDPRLERKQITRPSNFRARIKWDNNTYTI	768951	777209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_769000_777200
911614	contig_15570_pilon	+	2563	11	Intergenic	novelGene_137833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	63.7872244262125	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	549	1067	452558	461801	TRUE	75	TGTAAAAAAAAAAAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITDRSSILLKNFVELISHQQLSKGLINRDRSQSWILSVNPNRRLTSQQWRLKVLVRLSKFLQALADGSSRLRESEGLQEQKENPHATSNSIFINWKEHANDQQHIQVYENGGSQPNVSSQFRLRYLVGGLGGVDEGLSSTENLKGFIEIIIPLLIECWIEAVPPQLAASVGSGVERESLQVMQQVLNIISILWKLSKQHDETHKLESWLRRNYLVDFKHHFMSHFPYALQEITKHKRKETNKSIKHCTILSNNVDHLLLNLTLSDIMVSLANASTLQKDSSWIEMIRKFVTETLEDGSKLNSKQLNRLLGVSWRLMQIQPNRGYGDSNQGSLYFVSAEGPSLASSDFVTEVFQ	451640	487401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_452017_452385_452630_454134_454248_460705_460945_461706_461841_463717_463894_465781_465960_472481_472571_474156_474291_484961_485043_486602
911615	contig_8820_pilon	-	2031	1	Intergenic	novelGene_79311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGGAGTAATGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256215	254184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_254200_256200
911616	contig_12920_pilon	+	3658	3	Intergenic	novelGene_166344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	606	junction_2	25.5	17	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATAATTTTTTTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211526	230693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_212844_217526_217679_228504
911617	contig_3956_pilon	+	3258	14	Intergenic	novelGene_14982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_8	819.82914225173	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	825	2478	81	2558	1281682	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQVREAGPSVHVPGAVPLREPLRASLSLTVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289892_1290297
911618	contig_8484_pilon	+	4120	2	Intergenic	novelGene_178373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	450	1832	5069	6451	TRUE	35	TCACAGCCTTTACACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFKWKGKNSRISKALLKKKKKVEGLTIPDFRNYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFEKVPKCIRWGKDSLFKKWCWQNWISICKKKKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTIQALIHGINRIQTITINAQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGKYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKKNNPIKKWAKEMKRQFTKEDIRMANKHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLALIKNTGNSKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREVRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCSSTDEWINRLWYIRTMEYYATRKNNNESVKHFITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	4619	8983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_+_8237_8480
911619	contig_12951_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_68138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119116	117240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_117200_119100
911620	contig_10904_pilon	-	2422	3	Intergenic	novelGene_22797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACTTGAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849144	845463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_846733_847149_848216_849057
911621	contig_10861_pilon	-	3209	1	Intergenic	novelGene_39182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGGATTAGACAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283641	280432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_280400_283600
911622	contig_3018_pilon	-	4723	1	Intergenic	novelGene_78838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCCTCAGCCCAGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562268	557545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_557500_562300
911623	contig_19863_pilon	-	2172	2	Intergenic	novelGene_148545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	265	junction_1	0	22	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	239	304	17331	17266	FALSE	20	TTCCCAGCACTACTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLKAGGVAGVSVDLILFPLDTIKTRLQSPQGFNKAGGFRGIYAGVPSAAIGSFPNAAAFFITYEYVKWFLNTDSSSYLMPVKHMLAASAGEVVSNKLCV	22951	15397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19863_pilon_-_17400_22781
911624	contig_7079_pilon	-	2567	4	Intergenic	novelGene_129227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGTCATGCTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363698	233174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_-_233183_257146_257391_257514_257950_361818
911625	contig_16103_pilon	-	656	2	Intergenic	novelGene_118686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2194	junction_1	0	2264	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	182	364	18020	17838	FALSE	10	TGAGCTCCCTTAGTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLLGKQVACSNLSREPLSLNGPRPGWLGWPTCYKTELTLSPACPLSSLLRGDLVRQNLGTMLTDLENAMDSLITVYHKYSLVKGNAHALYKDDLKNLLQIEGPCYLKVRRAGVVGFSAWL	18710	17545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_18042_18550
911626	contig_6241_pilon	-	3083	8	Intergenic	novelGene_156410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	77	junction_3	110.053233872132	70	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	478	2256	195215	182242	FALSE	75	GAAGACAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAEDSTAAMSSDSTISSAKVPEGVAGAPNEAALLALMERTGYSMVQENGQRKYGGPPPGWDGPHPQRGCEVFVGKIPRDVYEDELVPVFEAVGRIYELRLMMDFDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMKKREEILEEIAKVTEGVLDVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLMPGRIQLWGHQIAVDWAEPEIDVDEDVMETVKILYVRNLMIETTEDTIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKEQYSRYQKAAKGGGGAEAATQQPSYVYSCDPYTLAYYGYPYNALIGPNREYFVKAGSIRGRGRGAAGNRAPGPRGSYLGGYSAGRGIYSRYHEGKGKQQEKGYELVPNLELSAVNPVAIKPGAVAIPAIGAQYPMFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	365484	181414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095_193303_194092_195247_219950_220075_293626_293710_365087_365246_365403
911627	contig_8885_pilon	+	4985	1	Intergenic	novelGene_115570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	589	960	53281	53652	NA	15	ATGTATTTATTTGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSGIKEANTSLENKGPGRVWAKLPSPVRPRPGPGLLAVSSDVLPERWKGSPMSACKGHCCCARPIDLAFDSSMGLACACRSCHMLGWAEVPEGWPVRDTYISAEPSLSCSSVVTIPSPCHR	52692	57677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_52700_57700
911628	contig_18081_pilon	+	4617	1	Intergenic	novelGene_23789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	3190	3774	101245	101829	NA	15	TGTTGATAGACGTTTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAMLEALTCLCQEIWKTATWPSHWKRSIFVPIPKKGDPSECRNYRTISLILHASKILLEIIRKRLQQYIVRELPEIQARFRRKHGTRNIIADVRWILPKSREYQKDVYLCFVDCAKAFDCVDDNKLWITFQRMGIPEHLIVFMQNLYIGQEAVIRTEQGGTTWFKVRKGVCLGCILSPHLFHLCARQII	98055	102672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_98100_102700
911629	contig_7862_pilon	+	4918	1	Intergenic	novelGene_174932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACATCATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2	4920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7862_pilon_+_0_4900
911630	contig_7748_pilon	+	2551	1	Intergenic	novelGene_101057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACGAGGATAAAATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165826	168377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_165800_168400
911631	contig_2854_pilon	-	3534	3	Intergenic	novelGene_120801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCCCATGGTTTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81479	68390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_69194_77194_77328_78881
911632	contig_1244_pilon	-	4388	7	Intergenic	novelGene_38032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	804	junction_2	942.206408737845	162	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	79	732	948448	931483	TRUE	45	AAGCCCAGCATGTAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWASSRLLFKNVRQHWHVLSDYGPRAQDHRGPSSQLCDKASQSLSC	948526	926294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_927227_928758_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
911633	contig_2078_pilon	-	974	3	Intergenic	novelGene_100195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	2	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	119	463	556747	555958	FALSE	15	GTCATCTACTTGTGGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWRFQSIQRCLRKKKIYFQKLSQGKPYRAQFYSDIHGVAMSCNQLNGNWLVVSQTSRVLGNLLQESQRGNVDESAGPVPHSMCLLGILRVPLGPFSLLLKYMSPGKNDQTSIEIGKIYLITVKQRRYKRREATDKEEFLHNTLQMGSYRQKFY	556865	555446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_556120_556454_556597_556706
911634	contig_14326_pilon	-	2991	9	Intergenic	novelGene_120723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_6	53.2891581374673	498	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	488	1432	447468	443443	TRUE	10	TGTCAGCATTGTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQSEARRGPELRAAAKWLQFPQLALRRRLGQLSCMSRPALKLRSWPLTVLYYLLPFGALRPLSRVGWRPVSRVTLYKSVPTRLLSRAWGRLNQVELPHWLRRPVYSLYIWTFGVNMKEAAVEDLHHYRNLSEFFRRKLKPQARPVCSLHSVISPSDGKILNFGQVKNCEVEQVKGVTYSLESFLGPRTSTEDLPFPPGALSPAGAWRGPAEVGRGGKAGKAVGNKGQSLLRTKLLGPLLGVQVQTAHSFEQVLTIAGWTGAHLRACPKLALVSVPSHLLPLLQEPAGHQGRERALPLCHLPGPRRLPLLPLPH	493224	440924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_442291_442976_443138_443410_443932_444094_444332_445734_445901_447415_447627_473560_473737_487113_487194_493151
911635	contig_7165_pilon	+	3483	1	Intergenic	novelGene_116865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	156	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAAAGTAACAATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405192	408675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_405200_408700
911636	contig_7004_pilon	-	2697	11	Intergenic	novelGene_126493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_3	31.9563765154937	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	105	770	414092	411874	TRUE	50	ATAAAGTTTGGCAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPASAAAPAPTSISLFDLNADALVLQGLSLVSHAPTEALAQALHCPGSGERASPERKLLKCPPDISEKLYCSTCDRTFQNHQEQREHYKLDWHRFNLKQRLKEKPLLSALDFEKQSSTGDLSSISGSEDSDSASEEDLQIVDEKAEFEKPNQQRGFHSHQVLFQNAQGQFLSAYRCILGPRQVPPEEAGLLLQNLQSGGPGYCVVLMATAGHFAGAVFQG	414196	408299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_-_408611_408831_408918_409054_409223_409356_410097_410782_410939_411126_411356_411636_411991_412398_412590_412707_412811_413189_413303_413950
911637	contig_18620_pilon	+	5685	1	Intergenic	novelGene_168571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	561	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32807	38492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18620_pilon_+_32800_38500
911638	scaffold_4438_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_174548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAACAATGGAGGAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417800	419124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_417800_419100
911639	contig_4689_pilon	-	1964	4	Intergenic	novelGene_165400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	32.2524762184584	22	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCCTCTGTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091966	1084175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1085003_1085500_1086253_1086632_1086743_1091691
911640	contig_3571_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_88710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1132	1470	30692	30354	NA	30	ACCCCGAGGTGAGCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	31823	29829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_29800_31800
911641	contig_5357_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_178902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	233	994	26715	20435	FALSE	30	GTGGAGGTCAGACATAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVGAAFEELPHDGTCDECEPDEAPGAQEVCRECGFCYCHRHAEAHRQKFLSHHLAEYIHGAGAWTSGAKREGEGQDKGEAKVENETEIDSEAGEENESEEESESEESETEEESEDESDEDSEEDSEEEMEDEQESEAEEDNQEEGESEAEGETEAESEFDPEIEMEAERVAKRKCPDHGLDLSTYCQEDRQLICVLCPVIGAHQGHQLSTLDEAFEELRGTLKNCVKMAWQRHLTSSNFTRGRRKNHQHQ	26947	20408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5357_pilon_-_20531_26049
911642	contig_17108_pilon	-	2604	2	Intergenic	novelGene_109523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_1	0	136	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGCTCTGTAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87094	50789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_53320_87020
911643	contig_20371_pilon	-	4487	2	Intergenic	novelGene_129181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3752	4084	41891	41559	FALSE	40	AGAACTACCAGTCAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLYLNIKKTTILTTGPINNIMINAENIEVVKDFILLGSTVNTHGSSSQEIKRHVALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVHLIKAMIIFSHLICMQKLDNE	47238	41155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_44403_45998
911644	contig_5947_pilon	+	3114	1	Intergenic	novelGene_101506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411256	414370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_411300_414400
911645	contig_13112_pilon	-	3198	2	Intergenic	novelGene_98833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_1	0	86	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2748	109	2856	288838	281799	FALSE	25	AAAATGTTTTTCTGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGKERSPVKAKRSRGGEDSTSRGERNKKLGGSGGSNGSSSGKTESGGGSRRSLHLDKSSSRGGSREYDTGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGGGESRSSGAASSAPGGGDGGEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDVSVKISHLSGSGSGDERVAFVNFRRPEDARAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDSYPPSASVVGSSVGGHRHAAGGGGGQRSLSPGGAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRELERDRDYSFYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQRANRTLFLGNLDITVTESDLRRAFDRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPIKIGYGKATPTTRLWVGGLGHWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFPLGGPDRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYDLVTDAFGHRAPDPLRGARDRTPPLLYRDRDRDLYPDPDWVPPPPPVRERSTRTAATAVPAYEPLDSLDRRRDGWSLDRDRGERELPSSREQPRKRRLPEESGGRHLDRSPESDRPRKRHCAPSPDRSPELSSSRDRYNSDNDRSSRILLEKASPVRDRRSSLEKNQGDKRDRKNSASAERDRKHRTAAPTEGKSPLKKEDRPDGSVPSTSATSLKLKSPSQKQDGGTAPAAAASPKLCLAWQGMLLLKNSNFPSNMHLLQGDLQVASSLLVEGTTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKVAGPNGYAILLAVPGSSDSRSSSATSDTATSTQRPLRNLVSYLKQKQAAGVISLPVGGNKDKENTGVLHAFPPCEFSQQFLDSPAKALAKSEEDYLVMIIVRAKLVNSG	288946	281456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_281822_286113
911646	contig_4686_pilon	+	3544	2	Intergenic	novelGene_118554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCCTCCTCTTCATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566142	572637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_568306_571256
911647	contig_14970_pilon	+	2127	10	Intergenic	novelGene_44956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1140	junction_5	5247.33635662001	24	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	133	1428	136145	231550	FALSE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
911648	contig_7898_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_47598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGGACATTGCCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539149	539644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_539100_539600
911649	contig_14525_pilon	+	1802	16	Intergenic	novelGene_149756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCGGTGGCGCCGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127728	157385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_127859_128433_128599_134578_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137045_140220_140265_141229_141352_142241_142377_145158_145218_145304_145448_148423_148533_148613_148759_153473_153598_155326_155448_157299
911650	contig_854_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_36745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTGCCGACCCTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716399	1715408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1715400_1716400
911651	contig_1450_pilon	+	1835	11	Intergenic	novelGene_27358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	297.09845169573	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	209	1639	345706	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244198	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244396_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350348_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
911652	contig_7357_pilon	+	3617	5	Intergenic	novelGene_36867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACCCCCGCCGTCGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227550	249483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_229260_233563_235054_240165_240269_247800_247920_249287
911653	contig_20527_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_138602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCCTGGGAGTGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14274	28482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_15960_28387
911654	contig_12964_pilon	-	4913	1	Intergenic	novelGene_131672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTCTGTGGTTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201258	196345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_196300_201300
911655	contig_11104_pilon	+	2900	2	Intergenic	novelGene_112450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTACAACCTTTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139490	298650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_140735_296994
911656	contig_9436_pilon	+	2902	19	Intergenic	novelGene_60911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	177.073396235349	118	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	742	2646	430059	436469	TRUE	25	GAGGAAGTGATTTTGTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAIAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGPEATTPTPSPSPSPGSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLTREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDMANRVWESDTRGRAKPTRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLDTTEEPLGRQLWAAVQAQDVAAVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVSARDAQGRTALFYARHAGSQLCADILLQHGCPGEGSSTATTPSAATTPSIAATPSPRRRSSAASMGRADAPVALV	420733	437808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_+_421028_427395_427455_428096_428185_428349_428436_428568_428718_429993_430129_430451_430562_430977_431137_431289_431377_431461_431567_431981_432145_432324_432445_433424_433554_434784_434934_435026_435118_435252_435476_435602_435859_436226_436487_437569
911657	contig_13558_pilon	+	1799	2	Intergenic	novelGene_123007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	217	junction_1	0	956	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	160	1119	40701	41660	FALSE	10	TGTTGTTAGTTGCTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVSQQTCNGAATAVGNPIAHTSLKTGARSAEAEKTQTQILWIFFTKSSLTYLKMTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36703	42340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_36818_40655
911658	scaffold_13505_pilon	+	3838	1	Intergenic	novelGene_111581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2236	2544	626656	626964	NA	40	GCCAGTAGAAGACTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKILLKIIQKRLQQYIDRERPEIQARFRRGHGTRDIIADVRWILVESREYQKDVYLCFTDYAKAFDCVDFNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLCIDQEAVV	624420	628258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_624400_628300
911659	contig_6102_pilon	+	2419	14	Intergenic	novelGene_31846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	533.518576064524	16	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	74	1279	370803	393578	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVTVPWKQLQGLWAR	370729	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374771_393536_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
911660	contig_5765_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_141379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549371	552134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_549400_552100
911661	contig_11829_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_128141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	495	839	170894	171238	NA	5	CTGTGTATCTTTGGGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKISQKSVSLRCRVLVKNKRLVVFWLLIKMHVFIAGVKSRRMHLFLLQVSIFKHSKPHAPFLSLNRRQFAILSSSGSGSDVGDQHLPLPMAYGTHVLHESGYLPNKTHSNTAGK	170399	172042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_170400_172000
911662	contig_19558_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_164755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTCTTATAATAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174149	176219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_174100_176200
911664	contig_9272_pilon	+	2341	1	Intergenic	novelGene_125990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1621	1953	773755	774087	NA	55	GACTTTAAAAAACAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLSHHHEVLLKYSSELYPGPTALLSLPSCLSHLVLLQQKYHKWLVLMKRSLFPHSQSRLKVQIQGVSSRGRLSLSRPSHQCSPRLGASRRRDPSPKTRSAPSTAFLMV	772134	774475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_772100_774500
911665	contig_8377_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_35029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAGACCCTAAGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69818	69176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_69200_69800
911667	contig_4759_pilon	+	1881	2	Intergenic	novelGene_106319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483720	485707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_484372_484477
911668	contig_10312_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_159039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAATTTCAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641421	644148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_+_641400_644100
911669	contig_12464_pilon	-	4150	8	Intergenic	novelGene_68699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	142.317982571653	27	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	1548	3473	357758	337140	FALSE	20	ACCTTCAAGTCTTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLMDVENSFGDQTSPLVNRSRNPLEDDDDDVVFIESIQPPSVSAPAIANQRNVFTSSRREKLQGNSFVILPSSRDLTSQKRNLSETIVIDDEEDVETNHGQKKNSSSFIEWGLPGIKNRTKDSDFYTSSVSRSKNKTGVGPFNPGRMNVAGDMFQNGGFATHHSPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVALLPKQIFKPSPQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCCTTCLSSFSHKRAPKKRSAMCKTDAPTEKAAAVAQVDSNRSSQEFYSTSLSPCEDKQNLRKRVLNKSRCTICNKLTEIRHEVGINNVIHKLCSNHCFNKYRLANGLIMNCCEQCGKYMPTKNVGNNALMIEGQQKRFCCQSCVSEYKQLMETKSKKLSASENRKRNAVREESERILYGSLNTFLEKVDEIPEKKEKTSELQVSVDCSTGTSLIKKDVNVPSSSMSTIAGKFQEQLKEKKSEVSTIPVVLSADPGTWPRILNIKQWGTLIENDPPQVRNFNFPKDNTGRKFSETYYTRILPNGEKTTRSWLLYSTSKDSVFCLYCKLFGEGKNQLKNENGCRDWQHLSHILSKHEESEMHINNSVKYSKLKSDLKKNKTVEAAEQRLYKDEKNGDVLLLYT	379209	336462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_337899_344406_344620_345552_345716_346267_346554_357014_357109_357347_357838_376096_376341_377985
911670	contig_2403_pilon	-	2707	2	Intergenic	novelGene_71011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1127	1438	145231	144920	FALSE	45	AAGGAGAGCAATATGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSLQQPESRKTRRCPATTTNCSGRDHNRKSWTEWEKNIEQNSNSQKKTRFTGLTEAEGSPKTMAPGHPSNSELKPLAKFTFQPKIRQAYKIHNNTHEERVS	146492	143650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_146265_146399
911671	contig_8412_pilon	-	1807	5	Intergenic	novelGene_118409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	93.9823786674928	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	30	833	817194	814504	FALSE	40	TGGATAAGGACTGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGQKISEQMVIGTPGTVLDWCAKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSVRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN	817223	813529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_814566_814977_815170_815695_815859_816409_816648_817045
911672	contig_13952_pilon	-	3288	2	Intergenic	novelGene_133269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240783	205111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_207369_239752
911673	contig_4105_pilon	+	3302	12	Intergenic	novelGene_21494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	447	794	98626	98973	TRUE	30	TAAGCAGGGAATCCAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAAANKPAPLHGWTGSSLGLMGERLANKRPRCHFSAGTRIPPTKLTRTKAHIKAGNLSYCVARETRTLLNSSLHHHLFSQGKLKNTHTHTHWSRPHYKSKHWCGIIRQKEMCF	98179	117008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_100234_100868_100941_101402_101510_102097_102154_102710_102927_104164_104264_105789_106014_108691_108838_108982_109098_114244_114380_115284_115340_116985
911674	scaffold_13609_pilon	-	4626	21	Intergenic	novelGene_124418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1657	2193	690687	689438	TRUE	45	TAAGCCAAAGAGAAGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGRAARNSGLTSVTPGFPTTVGAELVVEGAVRVGGRMPSWFCRTSRRMSSGKAARKEGSTPSGRLIPARGSSSSLLVEGSGSSRIPRESAPEMATAESLVEELSEDAGGELSSGGWAGSPDPSPLPCTSATTGGASPGVVLPAVGCSELPAAEVSPTASSRVQEARLLVSMGEPSS	693613	659373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_659541_660455_660604_661021_661087_662469_662685_674312_674525_674972_675155_678255_678427_678773_678924_679657_679737_683075_683305_684168_684348_684624_684715_684865_685021_686250_686297_688092_688383_689382_689637_689827_689958_690479_690698_690773_691062_691222_691324_692356
911675	contig_15629_pilon	+	880	1	Intergenic	novelGene_122452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTACTCTCAATGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101200	102080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_101200_102100
911676	contig_11548_pilon	-	1478	1	Intergenic	novelGene_66809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	560	895	263492	263157	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHITERYSQTFSFPYSMQSPDLFPPIPTATDSLGAHPEGATHPGPSGQQQLHALHLALQTGCVKGRDGVHCDLVDTGTTLYQLLQLQCLTPLGCFVHGGPFHPETWKGR	264051	262573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_262600_264100
911677	contig_9481_pilon	-	2177	5	Intergenic	novelGene_149667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	40.751533713469	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	1381	2175	376817	367333	FALSE	60	ACTAGAAGAAGAAAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGSSDVSPIFPRHCPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQMEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEMLRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRQLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELELQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQ	378197	367330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_367417_370848_371086_372984_373144_374657_374820_376664
911678	contig_2069_pilon	-	608	2	Intergenic	novelGene_23532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	0	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTGGCATTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509110	1508372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942
911679	contig_9895_pilon	-	4348	1	Intergenic	novelGene_144695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATTTTAAAAAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179352	175004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_175000_179400
911680	contig_10494_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_102146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	834	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAACAAAAGAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450846	452721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_450800_452700
911681	contig_233_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_14676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCAGAATAAAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86844	84717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_84700_86800
911682	contig_2940_pilon	+	3619	2	Intergenic	novelGene_81870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	216	junction_1	0	237	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	19	390	316098	318127	FALSE	30	GAGAATGCTAGCCATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVFRAPKRKRKVYEHYESPFPIPFGQDHIPKKEFQVYHAEMMDNNVIVRNAEAIEQLYGKGYFGKGILSRSRPNFTISDPKLVAKWKGKLVHHSVLVAKYHFLSFLILHLRLHSKILEEE	316079	321356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_316287_317944
911683	contig_10103_pilon	+	3306	1	Intergenic	novelGene_86166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1077	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTTTCTTAGACTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647991	651297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_648000_651300
911684	contig_6445_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_77099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATCTCAACAGGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141516	1143685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1141500_1143700
911686	contig_2770_pilon	+	2409	3	Intergenic	novelGene_107438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1412	1759	746669	747016	FALSE	30	GAAATTTACTCAGACTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPSSFVVMVPSPSLSNREKASLNSENKSLPFKMNAFTQHSHNIRFPWAWQSKLSKLGKLSETAWSLQLLKQRAPESCQTGLHKTAHKANTILHDQFHKTTGNPGGVVVKSYGC	742934	747666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_744173_744574_744674_746594
911688	contig_9049_pilon	+	1762	7	Intergenic	novelGene_83123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1545.07094407416	18	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	59	721	88356	113077	FALSE	75	AAATAAAAGATCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLTKIYLHLFLFRNGVPRLQKICWRGGM	88297	114118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111654_112993
911689	contig_15952_pilon	+	1973	4	Intergenic	novelGene_154057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	33.2097709851918	89	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACACATTGCATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233537	238655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_233638_234781_234862_235137_235307_237031
911690	SIRV6	+	1948	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	-1234	69	4	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	25	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAACTTTGAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9003	11261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
911691	contig_7025_pilon	-	2288	17	Intergenic	novelGene_104383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	824.680882883646	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	69	2096	95047	49239	FALSE	30	ATTTTAAGCCAATATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95115	49046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58787_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_94786
911692	contig_1009_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_121767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1008	1505	298738	299235	NA	65	TAAATAAACCAAAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHKGLVSHNGSLINVGNLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLGEGPCHGMGSTETKREADPTLSLDFHPLALCFGPCLNSCLFGIIIIFLSPEESHNRFSATEVTNKTLAAEMQELRNRLAEAEETARTAERQKNQLQRLLQDFRRRLTPLQLEMQRMVEKVR	297730	300346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_297700_300300
911693	contig_9415_pilon	-	4550	1	Intergenic	novelGene_109892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3957	4343	2068817	2068431	NA	30	GACCCAGCAATCTACTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNSRAFLPNTLSVVSFFSPFSPNSSFELQGLRPHRSWEPRTGARWLDAACRSALMLWPWRRPAPVAAEHGAPAGKRGRRAQGSTAQLPRGTQRPSLREWMHCSCCCHACRLVSVQNSQIVDFLLLS	2072773	2068223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2068200_2072800
911694	contig_5947_pilon	+	2085	8	Intergenic	novelGene_101536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.329972650142	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	78	695	539951	543577	TRUE	35	ATGGTAATACTAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEILGFKVPQSQPAKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGCTDENGTSNKEDEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDLTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMTEHTKVAV	537749	545606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_537797_539920_540023_541309_541386_541598_541919_542525_542649_543550_543626_544218_545264_545309
911695	contig_7894_pilon	+	3078	1	Intergenic	novelGene_170774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCTCAGCATACGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91235	94313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_91200_94300
911696	contig_2215_pilon	-	2214	2	Intergenic	novelGene_163882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTCCAATTAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569907	567514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_569602_569780
911697	contig_7119_pilon	+	3015	4	Intergenic	novelGene_40930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	387.508279481441	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	908	1873	138713	139798	FALSE	30	TGATGAACACTGATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127501	140940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137227_138155_139230_139349
911698	contig_11338_pilon	+	2303	2	Intergenic	novelGene_6406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCGCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312620	323838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_313630_322544
911699	contig_12151_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_54986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAAAACAAAAAATGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005252	1002809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_-_1002800_1005300
911700	contig_11448_pilon	+	4639	2	Intergenic	novelGene_66353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACCCCAGAACTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173475	280003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_178097_279985
911701	contig_10734_pilon	-	2582	13	Intergenic	novelGene_51491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	506.450413005393	1517	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	234	2096	2305085	2265543	FALSE	80	AAATAAAAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305318	2265056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
911702	contig_709_pilon	+	2643	6	Intergenic	novelGene_57531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2051	2431	1484980	1490572	TRUE	20	TCCCCACGCACAGCGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRAIWGGTLMNLSLRRKPTGLAVSRSSLSSCSTRLSSPLWSQQLRIHSLICSAHWVPFLSVKFKRLMKPKISSSSTSTSSSLPSDTSVCLITLPMWLCCIKRSVSSAVFTGAFRKSCCSNLLIPS	1481725	1498104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1482161_1483364_1485152_1487575_1487673_1489760_1489842_1490541_1490616_1497935
911704	contig_8447_pilon	+	3044	8	Intergenic	novelGene_69414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	440.581017127453	68	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	100	879	65602	82214	TRUE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	61156	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_61211_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_84052_84163
911705	contig_6898_pilon	+	3655	14	Intergenic	novelGene_35684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	134	1867	59668	125646	TRUE	20	TGACCCTATGTTCTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126052_126275
911706	contig_11396_pilon	+	2433	8	Intergenic	novelGene_71375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_1	164.303725720734	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2079	354	2432	1074136	1092779	FALSE	30	GGCGCTCTCTAAAAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKPGQPGKESSGMDDKGDPSSDEAPKAIKPTSKEFRKTWGFRRTTIAKREGAGDAEADSLEQVPQPPQQSLSLRRSGRQPKRTERVEEFLTTVRRRGRKSVPASLEDSAELTSCPVTDVETASEGSVESTSEIKGGPKSGAPDVKERPTSSEKAKGGDEEDDTSDSDSDGLTLKELQNRLRRKREQEPTDRPLKGVQNRLRKKRREEDPTETVDVEAGDAVESPPPSKPEPEADQVAVFQVARDDKESKPEGRAAQGLKEEEPRESIKHKPECEVYDPSALYCLCRQPHNNRFMICCDRCEEWFHGDCVGISEARGRLLERNGEDYICPNCTILQVQDETNSETTDQQDPKCRHGDADGTDFTSIGIVEQKSSEDQGIKGRIEKAANPSGKKKLKIFQPVVEAPGASKCIGPGCCNVAQPDSVYCSSDCILKHAAATMKFLSSGKEPKPRLKEKLKTKPEKLSLPKCTVQAGIKISSMHKRPAPDKKENIVKKTVVAPSRSDAPVTETTPGSSTPSWASDHNYNAVKPEKTAALPVSLLCKSVKDDKRAREKRVAAVTVPKKTAPSGPALSKQPPLSGNLALKKSPAFTRMSAAKQATKKSPSGFKGTIPRRPWFAPAGSAPAAKPPGLAPAAAASTPKKLPGSAVGPAAVAGALRKPGPPSAPGASPAPGRLGAASPAPSQPNSQIRQNI	1048438	1092780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1048543_1072807_1073003_1074081_1074176_1075158_1076000_1076764_1077087_1080463_1080677_1082046_1082261_1092330
911707	contig_4732_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_75447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGCACTCTTTGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650814	649014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_649000_650800
911708	contig_13026_pilon	-	1123	4	Intergenic	novelGene_146300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	64.0017360875642	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	676	981	7416	6268	FALSE	30	AACATTCAGTGAGTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSSSSEGRTCVVWPPVPPTPSLWCEQGRQQQQQLLVVKGRTRQPGPFRENAALEEVVGRPTQGPATFPPHRCARPGIPKQTRKKNSTKQQAHLNLLVQR	13113	6125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667
911709	contig_19098_pilon	-	3084	4	Intergenic	novelGene_65797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAAAGCTGTGCTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367653	158259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_158440_273357_273653_339448_339975_365570
911710	contig_16211_pilon	+	2535	4	Intergenic	novelGene_150101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTACTCTTCTACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202706	221833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_204404_205330_205454_211934_212035_221218
911711	contig_11681_pilon	-	4723	6	Intergenic	novelGene_102962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAAGAAAAAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187412	41244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_41439_52132_52155_67555_68328_122304_122572_122708_124594_185829
911712	contig_11708_pilon	+	2280	11	Intergenic	novelGene_138960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGAGGCTTACAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243895	256255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_243932_244261_244394_244650_244829_247677_248356_249277_249413_250376_250540_250737_250953_252345_252444_253646_253769_255578_255803_255956
911713	contig_1339_pilon	+	862	5	Intergenic	novelGene_163125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	155	583	349662	352748	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDGADGAEAQAERPNPGGPRLGQILLPPVKEQLQPEIENAHEEGEEGTCEMGGLLILFLEIADHRSAEGTEEPRPQDQLIKPPCDSPVPELVVTENADPGGQCSPHIEQLAEDAALRRVRSTETDVGEAFVEVHRFVSYCQRENGPDASDSPEGQEGRQKGQVAPHPGLCSRRRGARLRPLGTRTPHRWPSG	349507	353027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_349689_351689_351815_352077_352146_352234_352295_352599
911714	contig_9415_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_109794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCCCTCCCGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684274	1681702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1681700_1684300
911715	contig_9199_pilon	-	1881	4	Intergenic	novelGene_65624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAACCTGAATGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59158	56352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_56406_57086_57131_57299_58510_58584
911716	contig_6397_pilon	-	1007	8	Intergenic	novelGene_146272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	116.200214267954	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	238	918	554772	516719	FALSE	45	CTGGAAAAAAAATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMNGQASNVNIAATASEKSSSSESLSDKGSELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAVAFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAPIFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGELCHCVFIMPACCSDIISNLSEI	601763	516629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_516920_520171_520265_523269_523360_531873_531958_548552_548604_549683_549789_554715_554859_601612
911717	contig_7056_pilon	-	3025	7	Intergenic	novelGene_43615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_4	750.41077639739	129	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	643	1332	726042	724627	TRUE	10	CAATTTGTCTTGTCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMLGGMGLCKYHFSVFF	726684	721894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813
911718	contig_678_pilon	+	3570	18	Intergenic	novelGene_167838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_17	265.315963623814	206	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	18	2321	421131	472799	FALSE	15	CCATTGTCTCTTTGTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QADKIMEEEFISKKKSGQRSNSLKDNLCINQSYEVRLVIYGERYNDLEKHVCSVKHDDVSFDHYHPCAAVTTDYIEKYGFPCDLTLSPRESIQLYDVMVQVWNTWPRAQELDPEKFSLFKNKAFIKKLDARKYEEILKAELTSWVKNGNIRKAERVLENLSPESVSDSKDMVKMFPLLVEKLRKLNKLPAIVFGFRNGDLEAIAGSLCTFLEEKPESKSPLRTDECHSYDADIAKCLKKEKEINAKQNKIKANDQQKARKLERKLTYTAEHIHFLKNLKKIQEVPQDCTYGDVNALDTKSLKAVFEQVESTRNGKKLKTLAQRGIGFHHNSMYFKEKEFVEILFAKGFIKVVTATGTLALGIHMPCKSVVFVQDSVYLDGLNYRQMSGRAGRRGQDLLGDVYFFGIPLPKIERLMTSNVPELRGQFPLSTTLVLRLMLLASKTDNANAKVLSVLKHSLLSYKQPKVTKMLKLYFLFSLQFLVKEGYLNQKGKPMRFARLVARLCGHEPSNFIFVSFLERGLFHKLCQPTRRGFPQNVVETLMLVLANLFGRKYIPVKSQDANFRFTQSEVILDELPEDFKAALQEYNLKVAKDFASFLLISSKLVNVRNECRLPLSRIKFTGEEYEDSQLVSNLMNCKEGRVAISPFACLSGNTDGNLLQPEIVNHVVLRTVGSSVMQAPVLWSQKIDNQGRRMPLSAYALDFYKHGSLTELTRDTGMSPGELLRLLKDFAFYIKTISYSLSELCENKDDNVVLAFRQLSQIFYEKLQKVQN	421113	474048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_421228_421333_421444_426676_426782_427373_427503_431262_431388_435431_435600_439025_439174_441124_441278_443984_444090_449698_449891_458103_458209_458639_458782_460694_460808_464668_464817_466397_466541_468086_468239_469626_469690_472693
911719	contig_11227_pilon	+	451	1	Intergenic	novelGene_163212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAACTGTAAACTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467601	468052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_467600_468100
911720	contig_11316_pilon	+	1127	1	Intergenic	novelGene_122674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139399	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
911721	contig_12837_pilon	-	3713	1	Intergenic	novelGene_57392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCCCCAGCACTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403429	399716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_399700_403400
911722	contig_14666_pilon	+	862	2	Intergenic	novelGene_39633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	19	456	484023	484834	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAQGFRALLGHVPKEGVCALVHERGDGRAGVWRGREEYP	484004	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484347_484720
911723	contig_10263_pilon	+	5083	12	Intergenic	novelGene_135834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	26.8275792471938	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	253	1302	866491	876421	FALSE	55	AAAAAAAAGGGAGGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWTVPVYSRRVPGHPECPEAEEGHRVINLANEMFGYNGWAHSVTQQNVDFVDLNNGKFYVGVCAFVKVQLKDGSYHEDVGYGVSEGLKSKALSLEKARKEAVTDGLKRALRSFGNALGNCILDKDYLRSLNKLPRQLPPEVDLTKAKRQDFEPSVEQARYSSCRQNMALVPPKPQEVTSPCRPVHSDDPHIVIQRDKDGSSRSVSSSATESDATYQRKLRQKQLQQQFREQMEKQQQAVLPAPPVKHSTPVTAVPEPLAEKDSLADNLEMWDMTPDLGDIIKSLPKPEPPQTLATPVLKNHMVTRNRTPQRLCLQEPQSKSGPSHPQTHNTNQHLTEETVILRGRART	858820	880202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_858986_866403_866504_867602_867656_868291_868374_868550_868619_870540_870660_871596_871673_873824_874022_874165_874273_875307_875392_875712_875926_876383
911724	contig_13905_pilon	+	5774	11	Intergenic	novelGene_130406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	88.4545080818383	466	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	670	1932	100619	116190	FALSE	15	CAATTCTGGTACTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPANTIRKTHTSSSVSQRPYRDRVIHLLALKAYKKPELLARLQKDGVNQKDKNSLGAILQQVANLNPKDLSYTLKDYVFKELQRDWPGYNEIDRQSLESVLSRKLNPSQNAAGTSRSESLICSSKDAASSPSQKRLLDSDFIDPLLNKKARISHLTSRVPPTLNGHLNPTSEKSAGLPLPPAAAAIPTSPPLPSTHLPISNPPQTVNSNSNSPSTPEGRGTQDLPVDSFSQNGSIYEDQQDKYTSRTSLETLPPGSVLLKCPKPAEENHSTSHKKSKKKSKKHKEKDQIKKQDIETIEEKEEDLKSKEEIAKLNNSSPNSNEENILLLSPMSNARITRMTSMLSMMSTEPCMPGWRLWLEDLSNWMRNESAFPQAQKSIRVFMKKSCRNIRRSSSLVPITMKKNTDASIFITSWLTSKD	33969	120032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_34235_52110_52159_87813_87936_93189_93350_100544_100805_104200_104326_104496_104588_106447_107016_113532_113705_115978_116024_116114
911725	contig_295_pilon	+	3223	2	Intergenic	novelGene_176830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	372	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	46	867	409861	410682	TRUE	40	GGACCAACCAGCAACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLMPYTKTTSKWIKNLNIKPKTIKFIEEKIGPTRQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKIEPTDLGKNFGQYKSDKGLISIIYKEIQHVYNKKTNNPIKKWAKEMNRYFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKTIQPFWKMICHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITGINICTPMFMAAVFTIANRNNLDARQQMNG	409815	416228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_295_pilon_+_411764_414953
911726	contig_5445_pilon	-	3910	1	Intergenic	novelGene_135441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAGAAAGGAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182062	178152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_178200_182100
911727	contig_13740_pilon	+	2589	2	Intergenic	novelGene_34700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTGGATGGGACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157082	160406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157531_158265
911728	contig_5084_pilon	-	3168	12	Intergenic	novelGene_64483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	91.281057207718	97	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	940	2820	348	3167	95355	76111	FALSE	10	CTCTCCAGTCTGGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHPGLQEVGLKLNSVDPTVSIDLKYLGVQLPLAPATSFPFWNLTGTNPASPDAGFPFVSRTGKTNDFTKIKGWRGKFHSASAARSEGGNSEGSLKNRSAFCSDKLDEYLENEGKLMETSMDFSSSAPTSPVVYQLPTKSTSYVRTLDSVLKKQSTISPSTSYSLKPHSVPPPSRKAKSQNKQANFSGRTKSAYKSILPYPVSPKQKHSHVIPADRVTKNSSSTISENQVNNFVMPTSEENVFPKQISLRQAHQQQQQLQGTRPPGLSKSQVKLMDLEDCALWEGKPRTYITEERADVSLTTLLTAQASLKTKPIHTIIRKRAPPCNNDFCRLGCVCSSLALEKRQPAHCRRPDCMFGCTCLKRKVVLVKGGSKTKHFQRKAVHRDAVVYDALGEEPREEGEEGGREEEELLKEKKKRKKLEYTICETEPEQPIRHYPLWVKVEGEVDPEPVYIPTPSVIEPMKPLLLHQPEVLSTTVKGKLLPGIKAARPYTPKPNPVIREEDKDPVYLYFESMMTCARVRVYERKKEDRRQPSPSPSPSPLFQQQSSCHSSPENRSAKEPDSEQQPLKQVTCDPENDSDKSQEKSWKSSCNEGESSSTSYVHQRSPGGPTKLIEIISDCNWEEDRNKILSILSQHINSNMPQSLKVGSFIIELASQRKSRGEKNPPVYSSRVKISMPSCQDQDDMAEKSESETPDGPLSLGKMDDLTSMQTDALDSVRERLHGGKGLPFYAGLSPAGKLVAYKRKPSSSTSGLIQVNGKSYPQAKLLLGQMGALHPANRLAAYITGRLRPSVLDLSTLSTVISKVASNANVAASRKPRTLLPSTSTSKTTSSSSTTSNRPGKNLKAFVPAKRPIENAPQIPVAAPQVSPNTLKRTGPRLLLIPVQQGSPTLRPVPNTQLQGQRMVLQPVRSPSGMNLFRHPNGQIVQLLPLHQLRGSNTQPSLQPVMFRSPGSVVGIRLPAPSKPSETPPSSASSSAFSVVNPVIQAVGSSPAVNVITQAPSLLSSGSSFVSQAGTLTLRISPPEPQSFASKTGSETKITYSSGGQPVGTASLI	107983	76109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_76419_76604_76896_82136_82435_84603_85122_86662_86736_87211_87395_88475_88703_93274_93624_94782_95442_96630_96736_97148_97281_107959
911729	contig_12644_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_44511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATTCTGTATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1113418	1115622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1113400_1115600
911730	contig_8044_pilon	-	7745	21	Intergenic	novelGene_132385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	506	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	4303	4842	557764	556940	TRUE	50	GGTTAAAACTGAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLSNCIIKGAPAPNSTQSTCEDGHTYSSTGSTFSSEPLMPYPPPTTGTLSSRTAEPEEPRGEVKRDAGQLQEYSWPLLGKAYVQLERGSGPALWLQGSPMSSVQQKPVTSLPVRLSDWGPHPWEGFSSGQVVQAHIGDGVSPVAEGAKLRAGKGRVLFFIEKWKHMVHEFTQPVLR	562066	482941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_483175_520541_520748_525998_526096_532215_532516_537946_538057_538725_538848_539690_540037_542970_543071_546235_546427_548275_548382_548903_549004_549374_549444_550249_550339_551354_551439_552523_552671_553421_553571_554108_554196_555485_555637_556073_556191_556840_556949_557233
911731	contig_9036_pilon	-	2008	16	Intergenic	novelGene_155447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATATATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233162	82984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_83064_94366_94512_101673_101810_110016_110070_110906_111036_144323_144451_150081_150177_169590_169708_184315_184419_209720_209884_223492_223628_231204_231288_231403_231585_231886_232106_232467_232638_233089
911733	contig_5588_pilon	-	1615	4	Intergenic	novelGene_172846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	14.2672897060218	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	153	578	1071111	1064415	FALSE	25	GTAATACTTCCTCTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVLEAGSCGGFLAVSSLWSFCRCKGLYCTGKDQEGDKNVDLRLWSPRLWMWQRQELCWQRRVPALPLGTYSLRCMRSGRHRGCQDYLQVSSLEWQRSVWGVSSFLVLTTKLAACCWDLAERPHESEAAQHPRLSKKGTAVRTISLPMSSCPPFEQNTVLKSNSAKITTLRMCPLWYRLAGMKSSACVPES	1077398	1063377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1064735_1069720_1069795_1071079_1071145_1077279
911734	contig_10958_pilon	+	2239	11	Intergenic	novelGene_5363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_1	149.322771203859	17	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	1003	2163	807610	811107	FALSE	25	ACTTATCAAGCCTTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDAVLAIKYTDGKGQPRYPVNSVNILKAHGRSQTESLLINGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYEDAVHSGALDD	803655	811183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_803835_804897_804984_805189_805319_806603_806702_807099_807770_808135_808263_808880_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810331_810890
911735	contig_5779_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_106497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203108	205229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_203100_205200
911736	contig_7605_pilon	+	3781	3	Intergenic	novelGene_172952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	2	23	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3018	3401	256740	257123	FALSE	70	GAAAGATAAAAAGAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDGKISIQDAYRTLHKVDPKRKSPRHIILKLAKSKDKETILRAAKDKQKVIYKGESIRISSDCSEETMQARRQWDDIYKALKEKNCQPRIIYPAKLSLKYDGKISHFQINSSLDNLQKPNKNYKKY	235585	257503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_+_235653_238248_238318_253858
911737	contig_8420_pilon	-	2090	14	Intergenic	novelGene_69346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	973	1359	36957	33852	TRUE	5	CAGCCGGGTGTCCGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKILEETVLDNMYMSLRALRSWFFSFQEVKSHHPKRAPNSLPENTLHSPLSCFSATASLSASGSFAKTIWALVLSAKPKDKVTKTPFPSSGFGYFTVGNSGSGSFCSGTATGGAKSKALKADCTKS	58927	10999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_11034_14730_14899_21334_21442_26909_26995_29016_29101_29240_29435_33792_33990_35333_35427_36801_36984_37071_37162_39028_39179_41728_41916_51044_51180_58543
911738	contig_6479_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_160616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATTTTTTGGTGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612700	610617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_610600_612700
911739	contig_5779_pilon	-	2803	1	Intergenic	novelGene_106467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	106	354	123396	123148	NA	15	CACCCAATGTGGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAFIPKRNISRPIYKYSAVSDRIISISLQGGPVNMTITQVYTPTINAKDKETEDFYQLLQFEIDQTCSQNALIITGDWNGKVGSKEKESVVGKYGLIDRNDAEDYMIEFCKTNDLS	123501	120698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_120700_123500
911740	contig_15118_pilon	+	3157	6	Intergenic	novelGene_74536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2440	2763	43045	48080	FALSE	25	TTGGAGGCTGAGAATCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIPGPWSFYSVLKKGLVTLGSVLSSVFSGPFWKLWSDISGPSVTRNNDLPSLESPPSSITQKVLILKSGPEAGYSHSRVHELAIWPKLFADDENAQLTDDLRLYR	33311	48474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_35541_42540_42639_42932_43057_44437_44629_46844_46936_48050
911741	contig_11948_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_174380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	229.071061071468	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1197	118	1314	100672	190659	FALSE	35	GTATGAAAATAGGCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSPSAPRVPAPAASWSLQSSSSASPREDSVLAPCLSRKMKLSRQFTVFGSAIFCVVIFSLYLMLDRGHLDYPKSPRREGSFPQGQLSMLQEKIDHLERLLAENNEIISNIRDSVINLSESVEDGPKNSQGNFSQGAGSHPLPSQQLSLPIDPEDCLFASQSGSQNSDVQMLDVYSLIPFDNPDGGVWKQGFDITYKSYEWDTEPLQVFVVPHSHNDPGWLKTFDDYFRDKTQYIFNNMVVKLKEDSRRKFMWSEISYLSKWWDVIDTQKKDAVKSLLENGQFEIVTGGWVMPDEAGPHYFALIDQLIEGHQWLEKNLGVKPQSGWSIDPFGHSPTMAYLLKRAGFSHMLIQRVHYAVKKHFALHKTLEFFWRQNWDMGSVTDIFCHMMPFYSYDIPHTCGPDPKICCQFDFKRLPGGRVGCPWGIPPETIYLGNVQN	100183	190661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_+_100218_100588_100807_127122_127381_130543_130689_147671_147844_177227_177356_185591_185766_190474
911742	contig_11708_pilon	+	3617	4	Intergenic	novelGene_138983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	496	junction_1	226.24028524263	107	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	1818	2471	386043	386696	FALSE	60	GAAATGAAAGAAAAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLMEEVQAAPKAWRKTRLWELTEYQLRCFNKRMQLWKCSLVYVKKFERQLPGQLTRRDSIFMPTPKKGDPTECGNYQTISLISYASKILLKIIQKELQQFFDRKLTEIQAGFTRRCGTRNIIADVKWILAESREYQKDVYLFFIDYTNALDCVDHNKLWIILQRMGIPERLIVLMRNLNMNQEAVIGTEQGDTAWFKVRESASGLYPFTIPVQSVC	368412	387842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_368815_381081_381142_381835_381944_384795
911743	contig_9290_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_77520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAGACCAAAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164323	161977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_162000_164300
911744	scaffold_19766_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_34393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815263	814161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_814200_815300
911745	contig_6159_pilon	-	3319	1	Intergenic	novelGene_128254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2304	2747	216816	216373	NA	75	ATAAAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHRSRIQAVEVRISETEDKALETNLFEETSDKTVLKNEETLRIMWESIKRNNLRVIGVPEQSGITENTERIVEDFFAENFPDTVKDDKIPIQGSHQTPRKVDPKRKSPRHFIIKLTKTKDKERILRAARDKRKVIYKAELRINSD	219119	215800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_215800_219100
911747	contig_1143_pilon	+	1628	1	Intergenic	novelGene_86606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221827	223455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_221800_223500
911748	contig_3612_pilon	-	2783	1	Intergenic	novelGene_87843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAAGTTTAGTCGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990553	987770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_987800_990600
911749	contig_7887_pilon	-	3348	3	Intergenic	novelGene_124846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATATGATGGCGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194067	40054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_41807_110518_111882_193834
911750	contig_8156_pilon	-	3112	13	Intergenic	novelGene_98905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	616	954	108345	103098	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALVSKQDTSSTTTNSVPVTLTLTSRCLSVDTGREDRLVTTPLFTVLGTTADSLLELRWREGVTISCFLISLGVWRKSWTNSSQSNMRNTRRLLRTTVKQEESLVDLKCSSI	116304	76621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_77685_89206_89395_94122_94338_96176_96390_100454_100629_100814_100926_102903_103117_106859_107125_108290_108426_111006_111163_112362_112575_113094_113168_116210
911751	contig_9389_pilon	+	3962	5	Intergenic	novelGene_84157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	334.398994466192	280	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	328	2607	1880835	1896858	FALSE	30	ATTAAATGTGTTTCTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVAVDFTEEEWALLNFAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRQVDKGQMVSTEHLIMRFMKNNFQYTVLGETCEFPGTEEKCNNKGRHIRWHTDESLHESKERKEKKEGNQRVKLFSKMACLTRLRRTLARENSYQCCVRGRAFRYSSFKRHIRSHTGCDSYQCKECGMACSCSSCLSTHVKTLTVKNVSKCNECGVTCSCFSSFNTHKRTNSRERPHERKEFKKAFGQFSALIEHKKFQSGKQHYDHNEYVNTFSFSSSLSEHISMHSRVSPCEYKECGKAFSKSSKLTGRLRTQSGVQPYECKQCGKAFSCASYLTAHIRIHSGERPYKCKECGKALRYSSSFSKHKRTHRGERPYKCKECGKTYICASHLTTHFLRTHSGERPYKCKECGKAFSCSSSLTTHTRTHSEERSFECKDCGKAFSQFSNLLNHIRTHSGEWLYECKECRKTFSESSHLINHIKAHSGEWPYECKECGRAFTRSSDLTTHVRIHSGERPYECKECGKAFIRSSTLTRHIKTHSGERPYECKECGKSFIWSSDLTTHTRIHSGERPYECKKCGKAFSQSSSLTKHIRTHSGERPYECKECRKTFSQSSHLINHIRTHSGEWPYDCKECGKSFCDFSSFCRHVRTHSGERPYKCKECGKAFTQSSSLTQHKRTHSGERPYECKECGKAFSRVSNLTRHIRTHRGERPFECKECRKAFSLRSALTRHIKTHSGVRPYKCKECGKAFIRSSALNTHMTIHSGERLYECKE	1880423	1898213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1880504_1880587_1880838_1893240_1893368_1894353_1894505_1894859
911752	contig_5019_pilon	+	3756	1	Intergenic	novelGene_109191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2080	2415	119214	119549	NA	40	GGAATACTTCATAATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKRQTMMASASSRNKESRNRPEEDNFLELLEVEYKRLIYRTIQEIRKEIIQNAEQAKEHTDKAIEELKIIEEHGDKFNRLQESIERQQTEIQEITIKFQK	117134	120890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_117100_120900
911753	contig_6230_pilon	-	2331	8	Intergenic	novelGene_102117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_7	13.3630620956212	7	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	143	1051	181988	174937	FALSE	35	TCCTATTTAAATTATTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRTRCSIKDNSFQYTIPHDDSLSGSSSASSCEPVSDFPASFRKSTYLMKMRRIKSAAASRVEGSSGAPTKGKRKPRQEEDEDYREFPQKKHKLYGRKQRPKTQPNPKSQTRRIRKEPPAYAAGSLEEQWYLEIVDKGSVSCPTCQSVGRKTIEGLKKHMENCRQEMFTCHHCGKQLRSLAGMKYHVMANHNSLPILKAGGELDEPSERERLRTVLKRLGKIRCMRESCSSSFTSIMGYMYHVRKCGKGAAELEKMTLKCHHCGKPYRSKAGLAYHLRSEHGPISFFPESGQPECLKDMNLESKSGGRVQRRSAKIAVYHLQELATAELAREWPKRKVLQDLVPDDRKVR	182130	173656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_175141_177889_178058_178660_178760_179186_179274_179800_179926_180772_180857_181156_181253_181942
911754	contig_15323_pilon	+	3124	1	Intergenic	novelGene_148528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	642	1103	116696	117157	NA	75	CAAAATAAAGAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAEKEQPISSDIYSPPPTFFPLTQPLLLPTGCSLLAGRHQLWPHAACIHLAHTGWLHQCYLFVAGVVLFQVFWFLPCPSPPPPPFSQTPSFMCQLYFFLKGCEAPPSWRTTSPVCTAMPMGSLGALLFSSLSLFFSQFLICLYLSSFPVS	116054	119178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_116100_119200
911755	contig_5758_pilon	+	4633	1	Intergenic	novelGene_119067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1388	1768	82132	82512	NA	40	TGTCGCTGGCAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYIYLSPRICQFVALWWLACCCDTASFVPVFQTGAGLPLEDRFQQSFIRLRQTRRKTWQSTSQKLASENLMNSSRTLSDTVPEDEPLRLEDTQNPTGEKLPPHSRVNLNDVSAVKLSGPSFVDVA	80744	85377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_80700_85400
911756	contig_7045_pilon	-	2767	1	Intergenic	novelGene_77465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1570	1923	380901	380548	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFGPNPPEVKENEEHQSHKESRSPTDRKGHINQRLHQPETRRTKWCRATTNDRPDREHNRQSLMEQEKTGVQNSNSSKKTRLNSAAETGQPQKAWPPDCQPRTKNHSQGQFFRQD	382470	379703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_379700_382500
911757	contig_8647_pilon	-	1476	4	Intergenic	novelGene_178122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	156.453045849403	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1308	169	1476	1026786	991566	FALSE	30	GTAAGATATTTGCTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDRQPRVRSGNESHPAPAMEPAGRGAWAHSRPALDRLEKLLRCSRCTNILREPVCLGGCEHIFCSCCVSDCIGTECPVCYTPAWIQDVKINRQLDSMIQLCSKLRNLLHDSKLSDVKEDTRRTSIFNDAENKKNSIKMWFSPRSKKVRYVVSKVSVQTQPQMVKDENAQQASMYEFVSASPPVDLSEKAKKTSTKSRKKQKKKTLAEINQKWSLETEKDDDEPDSKEEFKEKLVSFCSQPSVIASPQLNGEIDLLASDPIAESECFGSLNEISLPLAEQIVSPEVESRDEVVIPEENPCENDLPSKKSLPLGCEGKRGRHNRLSSPISKSCRSNIQSTTRNLVRQTVVSKDSLPECSSPPSSKLKVGGKLRRKNSNTLDESISLSPGMSPSALNSPSYRGMLSSPSAMKLSPSSRMAVKRNHRGETLLHIASIK	1026954	991565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_-_992525_1009758_1009908_1013404_1013462_1026643
911758	contig_2854_pilon	+	2389	1	Intergenic	novelGene_120790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	615	1073	34773	35231	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNKGSAVGVCTSALCRSLWTVLACDDTRTGTKSGCSATLIAVWRYCDFLVIYRSFCSTLEAKAVCIIYAACQPQNLAASDKHHVTLSVGQECGCGPLGAFDSVCPEAAVRLGQGSHLKAQPGDTSMPVTCLLGGLSPDTWTSPYDVAAAS	34158	36547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_34200_36500
911759	contig_10953_pilon	+	3370	2	Intergenic	novelGene_42520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	67	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2721	3041	129678	129998	TRUE	50	CGGGGAAAAAAAGAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTSVLPPSSSRVDCSLKSLPAAAQGTTIGLCSPGAEEEEGVRNRRRIWNVWLIASVSNCFLCHETRRTDWCPATITEHFDQRFHRKILITRGKMQNRISDSYGL	126957	306694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_130123_306489
911760	contig_7333_pilon	+	2583	5	Intergenic	novelGene_142769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171437	234816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_171573_172416_173084_227981_228372_228929_229639_234134
911761	contig_15114_pilon	+	2208	2	Intergenic	novelGene_121092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACGAACACTTCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27105	31479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_28301_30466
911762	contig_6364_pilon	-	4915	13	Intergenic	novelGene_51716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1195.06737083452	4	136	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	177	1190	490750	439867	TRUE	60	AAAATCAACAAGAGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNSTSAPGVYANGNDNKKFKGDRPPCSPSRVLHLRKIPNDVTEAEVISLGLPFGRVTNLLILSGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYARMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLASNESSEWSETLWKSASCHTVQTSSSSASSRGTGRPRSD	521170	432738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439764_439986_440667_440761_444721_444756_445014_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466203_466284_477585_477736_490716_490802_521045
911763	contig_7839_pilon	+	2732	12	Intergenic	novelGene_45734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	589.897805969478	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	282	2450	952473	956984	FALSE	10	ACACTTCTGCTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	951781	957266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_952063_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
911764	contig_7138_pilon	-	6660	27	Intergenic	novelGene_120970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	118	junction_21	133.679145364284	290	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1518	4557	22	4578	134824	79409	FALSE	50	TGAACATACCTACAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGNPDNKPINENTEESYVHLDIYSGLNSHLNRQHHRLESRYSSSSGGSYEEEKSDSMPLYSNWRLKVMEHNQGEPLPFPPAGGCWSPLVDYLPETSSPGLPLHRCNIAVILLTDLIIDHSVKVEWGSYLHLLLHAVFIGFDHCHPEVYEHCKRLLLHLLIVMGSNSNIRTVASILLRNKEFNEPRVLIVKQIAHLDYSFTAGVNDFIPDYQPSPMTDSGLSSSSTSSSISLGNNSAAISHLHTTLLNEVDISVEQDGKVKTLMEFITSRKRGPLWNHEDVSAKNPSIKSAEQLTAFLKHVVSVFKQSSSEGIHLEHHLSEVALQTALSCSSRHYAGRSFQIFRALKQPLSATTLSDVLSRLVETVGDPGEDAQGFVIELLLTLESAIDTLAETMKHYDLLSALSQTSYHDPIMGNKYAANRKSTGQLNLSTSPINSSSYLGYNSNAKSNSLRLSLIGDRRGDRQRSNTLDIMDGRINHSNSLARTRSLSSLREKGMYDVQSTTEPSNLMATIFWIAASLLESDYEYEYLLALRLLNKLLIHLPLDKSESREKIENVQSKLKWNNFPGLQQLFLKGFTSVSTQEMTVHLLSKLIAVSKHTLVDPSQLSGFPLNILCLLPHLIQHFDSPTQFCKETASRIAKVCAEEKCPTLVNLAHMMSLYSTHTYSRDCSNWINVVCRYLHDSFSDTTFSLVTYLAELLEKGLSSMQQSLLQIIYSLLSHIDLSAAPVKQFNLEIIKIIGKYVQSPYWKEALNILKLVVSRSASLVVPSDIPKTYGGDIGSPEIPFTKIFNNVSKELPGKTLDFHFDISETPIIGNKYGDQHSAAGRNGKPKVIAVTRSTSSTSSGSNSNALVPVSWKRPQLSQRRTREKLMNVLSLCGPESGLPKNPSVVFSSNEDLEVSDQQTSLISTTEDIIQEEEVAVEDNSSEQQFGVFKDFDFLDVELEDAEGESMDNFNWGVRRRSLDSIDKGDTPSLQEYQCSSSTPSLNLTNQEDTDESSEEEAALTASQILSRTQMLNSDSAADETMPDHSDSLLQSQDSTSSATTEEVLQIRDETPSLEASLNNANSQLPEDISSALKEEQGITAFEDEGSYIIQEQQDSLVCQGILDLEETEMPEPLAPESYPESICEEDVTLALKELDERCEEEEADFSGLSSQDEEEQDGFPEVQTSPLPSPFLSAIIAAFQPVAYDDEEEAWRCHVNQMLSDTDGSCAVFTFHVFSRLFQTIQRKFGDITNEAVSFLGESLQRIGTKFKSSLEVMMMCSECPTVFVDAETLMSCGLLEMLKFSVLELQEHLDTYNAKREAAEQWLDDCKRTFGAKEDTYRMNTDAQELELCRRLYKLHFQLLLLFQAYCKLINQVNAIKNEAEVINMSEELAQLESILKEAESASETEEIDISTAAQTTIETAIHSLIETLKNKEFISAVAQVKAFRSLWPSDIFGSCEDDPVQTLLHIYFHHQTLGQTGSFAVIGSNQDMSEANYKLMELNLEIRESLRTVQSYQLLAQAKPIGNLVSTGF	134845	77326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_79668_80014_80206_81198_81310_84925_84995_89396_89496_90221_90372_92924_93133_95653_95905_101115_101284_103431_103636_107622_107800_108129_108205_108333_108496_112246_112445_113477_113619_115245_115417_120100_120199_120479_121088_124140_124236_125692_125884_126719_126842_128805_129011_130499_130686_132249_132354_133032_133184_134133_134247_134774
911765	contig_12677_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_110696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1000
911766	contig_3942_pilon	+	2292	3	Intergenic	novelGene_128706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1171	junction_1	25.5	10	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1553	1948	429158	429553	TRUE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLVEGTAYTAALRKVKGCRSGLRAEGKRDGEESSLHLCLEGLHSSVYFKHPLFMGILACCRANCPFFPWLGDQWGTVREITGRKLKQHPTYPPSCTRSACRSMPRRCPQTPSQSAQWGTAAHSSCTSTPS	427605	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_429607_429798_429853_429936
911767	contig_2703_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_101663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGAGCGGGAGGGGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2741	3367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_2700_3400
911768	contig_15689_pilon	+	1909	2	Intergenic	novelGene_164167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTGTGTTGCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226180	229106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_227218_228234
911769	contig_6914_pilon	+	2704	17	Intergenic	novelGene_151747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	18.5708104292731	45	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	68	1915	158855	169723	TRUE	25	CTTCACAGAAGGGTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALHSEHQAVLQSLSHTIECLQQGGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALANHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLRDELAGTQQRLQHSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTAEEKEGDATKDSLDDLFPNEEEEDPSNGLSRGQGTQPGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGRDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEAVERYYRRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAEILYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSQHRDGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRKQGTDPISQTKVAELLGEGDGRRTSQESPGSVKFEGGEDVSVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGNEPRPSSSNMKRAASLNYLNQPNAAPLQGSRGLSASTMDLSSSS	156966	170628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_157010_158830_159113_160372_160604_162201_162284_162874_163086_163550_163639_165457_165560_165775_165950_166274_166375_166573_166627_166835_166907_167096_167206_167762_167901_168470_168587_168934_168999_169672_169744_169859
911770	contig_10235_pilon	-	2184	17	Intergenic	novelGene_46498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	15.5623744974859	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	60	2108	264512	259324	FALSE	15	CCATTTCTTGTCTGTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVHPFLSRSLPIVFDDFVDMEFGTGAVKITPAHDQNDYEVGQRHGLETVSIMDSRGALINVPPPFLGLPRFEARKAVLAALKEQGLFRDIKDNPMVVPLCNRSKDVVEPLLRPQWYVRCGEMAQAASAAVTRGDLRILPEAHQRTWHAWMDNIRDWCISRQLWWGHRIPAYFITVNDPAVPPGEDPNERYWVSGRSEAEAREKAAKEFGVSSDKISLQQDEDVLDTWFSSGLFPFSILGWPNQSEDLSVFYPGTLLETGHDILFFWVARMVMLGLKLTGRLPFREVYLHAIVRDAHGRKMSKSLGNVIDPLDVIHGVSLQGLHDQLLNSNLDPSEVEKAKEGQKVDFPAGIPECGTDALRFGLCAYTSQGRDINLDVNRILGYRHFCNKLWNATKFALRSLGKGFVPSPTSEPGGHENLVDRWIRSRLAEAVRLSNQGFQAYDFPAITTAQYSFWLYELCDVYLECLKPVLNGADQVAAECARQTLYTCLDIGLRLLSPFMPFVTEELFQRLPRRAPQAPPSLCVTPYPEPSECSWKDPEAEAALELALSITRAVRSLRADYNLTRIRPDCFLEVADETTGAQASAVSAYVQALASSGVVAVLALGAPVPQGCAVAVASDRCSVHLQLQGLVDPARELGKLQAKRGEVQRQAQRLQERRAAPGYPAKVPRNVQEADKAKLQQTEAELRKVDEAIALFEKML	264571	259247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_259393_260152_260479_260609_260722_260795_261003_261142_261299_261646_261775_261886_261966_262482_262552_262626_262732_262873_263000_263084_263156_263239_263346_263490_263582_263695_263855_263935_264040_264124_264250_264496
911772	contig_5816_pilon	-	5139	1	Intergenic	novelGene_158258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCTCACACCAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329366	324227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_324200_329400
911773	contig_12180_pilon	+	9097	58	Intergenic	novelGene_160344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_31	164.417881527776	509	118	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2339	7020	75	7094	3097	98823	TRUE	35	AAACAAGAGCTTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAWSSCSEWSIGLRVPFVVDICLMTFEQLDLLLRQVSDGMDGTADWPPPQEKECMAVAVLNLLRLQLHAAVSHQVDPEFLGLGLGSVLLNSLKQTVVTLASSAGVLTTVQAAAQAVLQSGWSLLLPTAEERARALSALLPGAVSGNEVNISPGRRFMIDLLVGSLMADGGLESALNAAITAEIQDIEAKKEAQKEKEIDEQEANASSFHRSRTPLDKDLINTGIYESSGKQCLPLVQLIQQLLRNIASQTVARLKDAARRISLCLDFEQQHSSDRSASLDLLLRFQRLLISKLYPGESTDQISDISSPELMGVGSLLKKYTALLCTHIGDILPVAASIASTSWRHFAEVACIMEGDFTGVLLPELVVSVMLLLSKNAGLMQEAGAIPLLGGLLEHLDRFNHLAPGKERDDHEDLAWPGIMESFFTGQNCRNNEEVTFIRKADLENHNKDGGFWTVIDGKVYDIKDFQTQSLTGNSILAQFAGEDPVVALEAALQFEDTQESMHAFCVGQYLEPDQEVVTIPDLGSLSSPLVDTERNLGLLLGLHASYLAMSTPLSPVEVECAKWLQSSVFSGGLQTSQIHYSYNEEKDEDHCSSPGGTPASKSRLCAHRWALGDHSQAFLQAIADNNMQDHTVKDFLCQIERYCKQYHLTTPITFPPEHPVEEVGRLLLCCLLKHEDLGHVALSLVHVGALGIEQVKHRALPKSVLDVCRVVYQAKCSLIKTHQEQGRSYKEVCAPVIERLRFLFNELRPAVCNDLSIMSKFKLLSSLPRWRRIAQKIIRERRKRRVSKKPESTDDEEKIGNEESDLEEACILPHSPINVDKRPITIKSPKDKWQPLLSTVTGVHKYKWLKQNVQGLYPQSALLSTIAEFALKEEPVDVEKMRKCLLKQLERAEVRLEGIDTILKLAAKNFLLPSVQYAVFCGWQRLIPEGIDIGEPLADCLKDVDLIPPFNRMLLEVTFGKLYAWAVQNIRNVLMDANAKFKELGIQPVPLQTITNENPSGPSLGTIPQARFLLVMLCMLTVQHGANNLNLLLNSGTLALTQTALRLIGPSSDSVEEDTNAFARGASATVLEETRKETTPVQLPVSGPELAALMKIGTRVMRGVDWKWGDQDGPPPGLGRVIGELGEDGWIRVQWDTGSTNSYRMGKEGKYDLKLAELPASTQPSAEDLDTEDDSEAEQIERNIHPTSVMLTSTINLLQTLCLSAGVHAEVMQSEATKTLCGLLRMLVESGTTDKTALPNSQVCREQHRSWCTLGFVRSIALTPQMCGALSSPPWITLLMQIVEGHAPFTAASLQRQILAVHLLQAVLPSWDKTERSRDMKCLVEKLFGFLGSLLTTCSSDIPLLRESTLRRRRARPQASLTATHSSTLAEEVVVLLRSLHSLSQWNGLINKYINSQLQSITCGLAGKQLEGALLEDWFPNSESPEVGGLMAVLAVIGGIDGRLRLGGQVMHDEFGEGTVTRITPKGRITVQFSEMRARRVCPLSQLKALPAVVFSVTNLPFTEPMLSVWAQLVNLAGNKLEKHKIKKSPKQIFAGQVDLDLLRCQQLKLYILKAGRALLSHQDKLRQILSQPAVQETGTTHTDDGAVVSPDTGDMSPEGPQPPITLLQQLLASATQPSPVKAIFDKQELEAAALAVCQCLAVESTHPSSPVCEDCSSSEATTPVTVQHARPSRMRKRKQSPVPALPIIVQLMEMGFPRRNIEFALKSFTGASGTASGLPGVEALVGWLLDHSDVQITDLSDADTVSDEYSDEEMVEDVEDAAYPSIGAVVTESQTYKKRADFLSNDDYAVYVRENIQVGMMVRCCRTYEEVCEGDVGKVIKLDRDGLHDLNVQCDWQQKGGTYWVRYIHVELIGYPPPSSPSHIKIGDKVRVKTSVTTPKYKWGSVTHQSVGVVKAFSANGKDVIVDFPQQSHWTGLLSEMELVPSIHPGVTCDGCQMFPINGSRFKCRNCDDFDFCETCFKTKKHNIRHTFGRINEPGQSAVFCGRSGKQLKRCHSSQPGTLLDSWSRMVKSLSVSSSVNQAARLIDGSEPCWQSSGSQGKHWIRLEIFPDVLVHRLKMIVDPADSSYMPSLVVVSGGNSLNNLIELKTININPTDTTVSLLSDCTEYHRYIEIAIKQCRSSGIDCKIHGLIILGRIRAEEEDLAAVPFLASDNEEEEDDKGSSGSLMRKKTSGLESVATIRTKVFVWGLNDKDQLGGLKGSKIKVPSFSETLSALNVVQVAGGSKSLFAVTVEGKVYACGEATNGRLGLGLSSGTVPIPRQITALSSYVVKKVAVHSGGRHAMALTVDGKVFSWGEGDDGKLGHFSRMNCDKPRLIEALKTKAHPGHRLWELSQRSHHVQWGAVHLGPRRVWSVGTWG	3022	159952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_+_3226_7773_8003_8093_8219_22150_22330_24636_24825_26044_26201_26851_27038_33657_33829_34184_34289_35363_35515_37817_38033_38356_38490_38599_38728_38807_39004_41479_41614_42341_42516_42593_42731_42842_42995_43665_43858_53706_53895_55234_55428_56979_57163_58460_58643_59110_59259_59337_59535_59775_60007_60808_60948_62174_62319_65233_65377_72394_72663_72809_72944_73497_73597_75524_75694_75798_75925_77524_77634_77752_77893_86765_86957_87634_87741_87823_87916_91461_91638_94536_94649_96484_96567_96672_96817_98277_98369_98669_98849_99035_99118_99203_99376_100195_100341_101188_101415_128397_128570_129571_129762_130305_130447_140607_140800_143824_143979_157495_157604_159047_159180_159604_159764_159847
911774	contig_5302_pilon	-	2148	11	Intergenic	novelGene_81448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	503.745411889776	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	203	778	185066	178729	TRUE	35	CAAAACCATTGTAGTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYVKEEALKGKAPRIQHRPWLA	209572	175663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176836_177181_177323_178671_178745_179917_179961_180994_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_209142_209268_209554
911775	contig_1986_pilon	+	3630	7	Intergenic	novelGene_64133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	79.277291129862	187	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	453	857	339967	348587	FALSE	70	AAAGTTTAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGLAVIGVFLKLGKHHKELQKLVDVLPSVKHKNTVVEFGSFDPSCLMPTCPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQAIEVDDDQLEQFRTLLFTSEGEKEKRMVDNFRPLQPLMNRTVRSSFPHDYVLNIQV	329419	351360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_329498_330040_330239_338207_338327_339909_340006_341166_341230_342409_342566_348440
911776	contig_3233_pilon	-	5528	6	Intergenic	novelGene_56495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	80.1039324877375	654	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	141	620	140644	35438	FALSE	35	GAAAGAGTATGTGCTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASPPAPGAGLAFPAPFSPRTAAPLPHSGAAGRAGGWSACCLPARKMVTSAGELALFALGVLLAVCQALENTTSSLSDPPVAAAVVSHFNDCPDSHSQFCFHGTCRFLVQEDKPACVCHSGYVGARCEHADLLAVVAASQKKQAITALVVVSIVALGILIITCVLIHCCQVRKHCEWCRALICWHEKPSALLKGRTACCHSETAV	140784	30529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_35446_37680_37791_38996_39147_45319_45438_104318_104373_140604
911777	contig_12414_pilon	-	2530	1	Intergenic	novelGene_59586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	NA	5	CGCGCTGGCGGCCGAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	372051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_372100_374600
911778	contig_678_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_167828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154938	157261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_154900_157300
911779	contig_7230_pilon	-	2477	8	Intergenic	novelGene_52543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	407.230967909477	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	337	651	164221	134622	FALSE	20	TGAAGATTGACTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177645	132795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177438_177496_177548
911780	contig_7396_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_79529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATCAAACTCAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242458	244930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_242500_244900
911781	contig_8304_pilon	+	3515	2	Intergenic	novelGene_153159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	24	929	7612	8517	TRUE	70	CAGTAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIKNQKGRTCLVFLKLKELKKTFKPQVAIVKDSMGKILNDTGSIKRTWKEYTKSLYQEELVNIQSFQEVAYDQELMVLNEEVQAALKALVKNRAPGIDGIPVEMFQQTDAALGVLTHLCREIWKTATWPTNRKRSIFMPILKKGDPTERGNYRTIALILHASKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQARFRRCGTRDLFADSRWILAESREYQKDVYLCFVDYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGILEHLIVLMRNLYMDQEAVVQTEQGDTAWFKVRKGVRQGCILSPYVFSLYAEQII	7588	11151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_8882_8929
911783	contig_11316_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_122623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	309	821	137674	138186	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137365	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137400_138900
911784	contig_753_pilon	+	4982	2	Intergenic	novelGene_113025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	358	735	1386283	1386660	TRUE	20	TTTTTTTCTCTCAACATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCVLEMCTLQLLGGVFYMSMRSSWLTVAFRSSISLLSFFLDVLSFTKSGALKFPAIIVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGVYLLWLCLWMDCPFNHYMTASLSLTVDFILKSIYFI	1385925	1393256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1387606_1389954
911785	contig_2214_pilon	-	4169	14	Intergenic	novelGene_144245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	49.8721442213062	91	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2127	2513	249141	231326	FALSE	35	AAAATTATTTTCAGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFQKKKDSEKELHILPHRVFVPISGSTVMLCDYKFGDEAAEEIRDHFIEMLDQMIQIEDLEIAEEINTACMSSSMDSEASLDFTDDEQAKQPLKTTIVLKIQQNIGVITAFAVAVLAAGISFHYFSD	271540	229669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_-_231394_232734_232846_243949_244138_249121_249212_250377_250507_254150_254220_255796_255893_256703_256845_257771_257807_259060_259168_261250_261347_265712_265848_268393_268515_270413
911786	contig_3382_pilon	-	3057	6	Intergenic	novelGene_124107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	278.203522623277	203	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	234	776	692770	677147	FALSE	25	GGACACCAGCATCTAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNLERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSVSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRY	693300	674865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_677346_685166_685197_687631_687724_689133_689311_692725_692870_693166
911787	contig_12624_pilon	-	2441	1	Intergenic	novelGene_61082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAAAGAGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	877236	874795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_874800_877200
911788	contig_3081_pilon	-	2976	1	Intergenic	novelGene_133923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1999	2490	181718	181227	NA	30	TGCTGGTGGGAATGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIMSTTIKFIEEK	183716	180740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_180700_183700
911789	contig_11978_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_62939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	401	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCCTTCTGTTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979707	977293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_977300_979700
911790	contig_11117_pilon	+	6827	14	Intergenic	novelGene_148572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	182.508360836286	27	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1014	3045	743	3787	26870	136738	FALSE	75	AAAAAGAAATACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLDVLQQYCMAAGLDFRRLDGSTKSEERIKIVKEFNSAQDVNICLVSTMAGGLGLNFVGANVVVLFDPTWNPANDLQAIDRAYRIGQCRDVKVLRLISLGTVEEIMYLRQVYKQQLHCVVVGSENAKRYFEAVQGSKEHQGELFGIHNLFKLRSQGSCLTRDILEREGQVEAGIMTATTWWREGPPAHKQEMPREPDCQEYRGPEQPAEPLTEEACDLCSDFSDEESVGNSRIKTAKSKASHSSKASGVPGQLTLLQCGFSKLFETNYKAVEDSNEDDASDGESSDEQPTCHFTEAVDDRIVGCQKSQNSRGPLEHQKKAGIINPNEKFIFDKSEKTLKQNISSESSGEKKFKNPIEHQNVTESEDSDVIFPTQYATQRFPKCSIRFKPPLDGSEDSETDNAVKLKNDDDTKTDVRGNGPISKKLNPESITLKSVMKRKGTSDISDESDDIEITSRSRVRKQRATSSLRLKKEKESKSKLYSFPQTTKKTNQVYTTGKGCNSLAIDEFSSSDDDLSVSHISSSRQSRRPKITKDTISFSSKLPNRNKKNTTFISRKQMKFSNERIVSQEQIHESVDKFLDGVQEVAYVHSNQNVIGSSKAENHMSRWAARDVFELKQFSQLPANVAICSSKTYQEKIKKDTSTYTKKGQQPGKGDISFPFYISYPVSQKKKKVYRTDQTTFIIGETPKRIRRKQFEEMASYFNISSVKEFAEHITNGTSEERQKILRDFYGSQYPEIKDFFVDSASKLIKSAHEKGEKIRNKSEERESLMKEELSDSETLSFKDSTKKISQICSPKLYKEKSIKLQSYDFCGEAVFSNDTETEKLPVSSTQEIDDGLKSQLSKDTVASCSPNCKSEVCERKFENTMKDQQDLTKIDISRNGPLFKSETKKIDNPTLGNISMGELLGDTSILDDLFKSHGNSLTRLPKKVLSRPMEKSKQRPKDFWDILNEQNDDSLSKLTDLAVIETLCEKVPLATSSKRKEELETSLWKSNKKFLWKKRNSSDTDENTTST	17299	139778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_17464_17972_18181_23062_23205_25466_25581_26755_26876_31255_31402_52756_52853_56439_56540_62959_63113_66068_66150_67444_68607_73894_74050_126578_126761_135774
911791	contig_10235_pilon	+	2635	15	Intergenic	novelGene_46347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	161.871910182473	480	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	777	2294	125852	128952	FALSE	65	AAAAGGATTAAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGPSPLNAVSSGGPPGSEPSEPLRRRPPAPHDGDRKELPQEQPLPPGPIGTERSQRTDRGPEPGPLRASHRPGPPVQFGTSDKDSDLCLVVGDSLKAEKELTSVPEAIPISRDWELLPSASASASAEPQSKSLGSGHCVPEPTSSGQRLYPEVFYGSPGPPGSQVSGGAIDSQLHPNNGGFRPGTPSLHTYRSHPLYLPPGPATPSALLSGVALKGQFLDFSALQAAELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDPPLLQVRQDLPSPSDFYSTLQPGGQNGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVMNFGSLPPAPPPAPPSLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPPSLGRAELHSVELKPFQDYRKLSSNLGGPGSSRTPPAGRSFSGLNSRLKAPPSTYSGVFRTQRIDLYQQVKLNPKVIIRVPVPVLPV	124183	129293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_124393_124778_125051_125198_125332_125586_125717_125819_125906_126115_126350_126642_126784_126902_126972_127088_127263_127462_127546_127732_127944_128036_128133_128283_128497_128611_128707_128804
911793	contig_4782_pilon	+	1554	2	Intergenic	novelGene_73622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAAGAATTTTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225713	231002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_225783_229517
911795	contig_4974_pilon	+	1053	1	Intergenic	novelGene_161411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAAAAAAAGATGATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85596	86649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_85600_86600
911796	contig_4519_pilon	+	7009	5	Intergenic	novelGene_123686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2685	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAGTTCAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109538	638583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_111950_376729_376737_473223_474335_606199_606533_635436
911797	contig_10042_pilon	+	1572	4	Intergenic	novelGene_79111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	235.73855574909	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	31	603	6346	42785	FALSE	55	AAAAAAAGCTACAGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCIYQEVPSMRFPQTRKKLASLSLKSFQVASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVCISLVVLLWKNIIGFL	6315	43754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6407_8818_8936_26600_26809_42598
911798	contig_16328_pilon	-	2764	2	Intergenic	novelGene_178159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	420	725	79535	79230	TRUE	75	GAGTCAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVECCNLQRFKRRWEFYRRGFLFFAKMCNFFSKCSFISIVFAAKSPLQLSSTRWPFAENLNTVLFLFLSQGVLWTLNHFDNNCKTTSGFPSAMCFWGKN	79954	77146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16328_pilon_-_77590_77633
911800	contig_3475_pilon	+	3175	4	Intergenic	novelGene_177124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1957	2334	566076	566453	TRUE	55	AACAATCCTACACAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLFGHIKTKQNKKLGHSKHKINKYNNLLMVQRQQSISNHIKRQTVMASASSKNKESRNSLEAENFLELPEVEYKRLIYRALQEVKKELRQNSEQAKEHTDKAMRNIRRLHKSIMTNLTGCKNP	375440	567462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3475_pilon_+_376507_565185_566615_566727_567012_567066
911801	contig_10475_pilon	-	2849	1	Intergenic	novelGene_148736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAATTTGTTTCAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224159	221310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_221300_224200
911803	contig_7396_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_79656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGCCCTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271332	269400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_269400_271300
911804	contig_2278_pilon	-	4001	3	Intergenic	novelGene_118129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	128	junction_2	130	98	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	3456	3899	1025665	1025222	FALSE	45	GATGTTGAGGATAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMAAAPVPQNVKRNTRKRRRKKSIRKERKKRKRRKKESTSLPSQMRVQTQTDKDLTCSAFSSQKLNIVAKEQGKTQLERTWEREKPRDIMAVSSHLPSSKDATHRRGSCLFPGACSEQQQISVRKADSVASSRLNRKFVIHLKGLL	1030152	1025119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_1025707_1026465_1029495_1029767
911805	contig_10307_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_170288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAAACTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553832	554427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_553800_554400
911806	contig_11258_pilon	-	3140	2	Intergenic	novelGene_67810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2320	2622	326543	326241	TRUE	30	AGCCAACAGCTCTAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKCSQSLAIREMQIKTTVKYNFAPTLPAIKIIFKKSENNKCWWGCVEIGTLVHCWLEYKMVKPLRKTVWHFLKKLEIEIAYDPAIPLQGIYLKDIRAVT	328862	325303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_325530_325948
911807	contig_7171_pilon	-	1540	9	Intergenic	novelGene_101369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	20.7062792408487	59	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	936	1406	1354262	1353537	FALSE	25	AAGAACCTGCTGACCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEARSSGLVSRVFPDKEVLFHAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFRPITVRLPFQCSQSELSSLLYAVCSDWWAIGYPPIFIGPTLIFPASSVAVTLFLPRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1360992	1353402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1357669_1360023_1360113_1360257_1360465_1360899
911809	contig_12540_pilon	+	3312	23	Intergenic	novelGene_148082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	170.836904484612	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1048	3144	169	3312	935069	975125	FALSE	25	GAAGGTCAGGTGCCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KISSRLPREGREELPRVLLLVARGQRGRTPGIPVQATRRIEDGEDLKHDFERLKQAMEMVGFLPATKKQIFSVLSAILYLGNVIYKKKATGRDEGLEVGPPEVLDTLSQLLKVKREILVEVLTKRKTVTVNDKLILPYSFSEAITARDSMAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDMEESVSCLSIGVLDIFGFEDFERNSFEQFCINYANEQLQYYFNQHIFKLEQEEYQSEGITWHNIDYTDNVGCIHLISRKPTGLFYLLDEESSFPHATSQTLLAKFKQQYEDNKYFLGTPVMEPAFIIQHFAGRVKYQIKDFREKNMDYMRPDIVALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAVHAMAVLREAGRLRAERAEKAAGTDGSGIRNHPGEPQRTASTASEKLYRDLHDQIIRTIKGLPWQGEDPRRLLQSLSRLQKPPAFILKSKGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIISMTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLEALGKAEPFFIRCIRSNAEKKELCFDEELVLQQLRYTGMLETVRIRRSGYSAKYTFQDFTEQFQVLLPKNALPCREVISTLLEKMAVDKKNYQIGKTKVFLKELERQALQETLHREVMRKILLLQSWFRMVLERRHFLQMKRAAVTIQACWRSYRVRRALERTQAAVFLQAAWRGYLQRRAYRHRRQSIIRLQSLCRGHLQRKSFSQMVLEKRKAEEKEREAQLAAGEATEEASGEQELGHMPSEVPEPLAMSEPEPQPSDGPPTVISHPETETPIPEKPTPSQKLPAENHEKAPSSREKRESRRQRGLEHVKFQNKHIQSYKEESALREASGRAGPEQEENLLEDQKDSREEGTPLNAQLEAEPISPAKQPLDISQAVATSETPVDAQEGSPRPDRTERPSSLALDSRAGAPETPKDRSRPDASPRDQPDSPSTSAQIQRYREADLDRLASAVELWRGKNLMNTRPCAMLSQSLDLSEHRRDALTPTEERRISLSTSDVSGLLPSPAKTQSLSETVDGEPSSKKPVVQKKKSGDSASITDARLYPSPQADSKSAFKRLFLYKNKDKKYSLEGVEEVENTGSGPAVLEAATSKKSL	930449	975125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_930486_932606_932688_935017_935107_937837_937968_939379_939470_941457_941575_941792_941928_944555_944678_947808_947951_948990_949196_950806_950886_953923_954038_957543_957584_958647_958771_960893_960975_961437_961549_963670_963794_965075_965226_965306_965474_966214_967070_968471_968539_968690_968816_974995
911810	contig_7179_pilon	+	3958	4	Intergenic	novelGene_78139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	15.6276108929747	229	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	95	349	984541	987796	FALSE	70	AGAGAAAAACATGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNRWVLKFYFHEALRAFRGSRYGDFRQIRDIMQALLVRPLGKEHTVSRLLRVMQCLSRIEEGENLDCSFDMEAELTPLESAINVLEMIKTEFTLTEAVVESSRKLVKEAVPSSQF	984446	991405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_984548_984653_984750_985430_985562_987775
911811	contig_14970_pilon	-	1359	6	Intergenic	novelGene_45046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTGTCTGCTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232251	188775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_188783_191972_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
911812	contig_6576_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_42343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCACCTGAAGTACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715375	713930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_713900_715400
911813	contig_6847_pilon	-	4174	1	Intergenic	novelGene_143881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTATTATCTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107117	102943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_102900_107100
911815	contig_5788_pilon	-	3666	4	Intergenic	novelGene_178561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3220	3540	2719	1518	FALSE	20	AGTCTCTGGCAACAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSACCFVSLWMLREAALSYSRLLVSDRSPRWWIRAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	64240	1391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_-_1699_2579_3826_61889_63364_63601
911816	contig_3942_pilon	-	2546	16	Intergenic	novelGene_128618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_1	80.4946927166975	13	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	1998	548	2545	151625	143946	FALSE	25	CAACTTGGATGGAAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFHKIPSDSLEWHENLGHGSFTKIYRGGRREAVDGEIWETEVLLKVMDAKHKNCMESFLEAASLMSQVSYQHLVLLHGVCMAGDSIMVQEFVHLGALDTYLRKRGHLVPASWKLQVVKQLAYALNYLEDKGLPHGNVSARKVLLAREGADGNPPFIKLSDPGVSPTVLSLEMLTDRIPWVAPECLQDARTLGLEADKWGFGATVWEVFNGVPMPISALDPAKKLQFYQDRQQLPVPKWTELALLIQQCMAYEPRHRPSFRAVIRDLNSLITSDYELLSDPTPGALAPRDGLWNGTQLYACQDPTIFEERHLKYISQLGKGNFGSVELCRYDPLGDNTGALVAVKQLQHSGPDQQRDFQREIQILKALHSDFIVKYRGVSYGPGRQSLRLVMEYLPSGCLRDYLQRYRTRLDSSRLLLYASQICKGMEYLGSRRCVHRDLAARNILVESEAHVKIADFGLAKLLPLDKEYYVVREPGQSPIFWYAPESLSDNVFSRQSDVWSFGVVLYELFTYSDRSCSPSAEFLRMMGCEREAPVLFCLLELLAEGQRLPAPAGCPAEVSTAGPASVSRIGSGVSGKQAGPLGFSPLCLLGVRQKAILASTLLLAHWTASLKHFQSLSLPISKMEMATPYWCRTIRAANTCHQVLNSELAHSQCSINGGDQWYTL	153491	143944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_144378_144598_144717_145140_145314_145603_145729_146097_146288_146396_146537_146849_147001_147127_147280_147361_147495_148193_148322_149259_149345_150888_151021_151586_151715_152262_152450_152746_152860_153333
911817	contig_1213_pilon	-	2893	7	Intergenic	novelGene_76461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_5	18.3908189655116	199	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	462	1379	58748	43395	FALSE	35	GCTTAATAAACCCAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSYKVPSTLATLGFIFIPNPFLPGYQWHWVKQCLKLYSQKPNVCNLDKHMTKEETQDLWEQSKEFLRHKEVNKRRPRSLLEKLRWVTLGYHYNWDTKKYSADHYTPFPSDLAFLSEQVATACGFQGFQAEAGILNYYHLDSTLGIHVDKSELDHSKPLLSFSFGQSAIFLLGGLKRDEAPTAMFMHSGDIMVMSGFSRLLNHAVPRVLPNPKAESLPRCLETPLPAVLPRDAVVEPCSVEDWQVCASYLKTARVNMTVRQVLATDQDFPLEPVEEKKRDITTEGFSHLDDKNSQVKRARLNPDS	65734	41880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_43825_44688_44883_48984_49076_56204_56368_58708_58909_62454_62564_65542
911818	contig_5964_pilon	-	3337	2	Intergenic	novelGene_80346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	175	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	190	1758	22372	8681	FALSE	25	ACTGCCATTGTGGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVRWFFLQELWLQLRYSSLLGFVGPPSLCRSCDPSVTGVSPGPPLGPLVSCCRSTRRPFLQLRMRALGLVRHLYGGDTEARSASQLRSPLPKQEKPRGPHRSPASQYWPLLSTESRDGGGAEAPGAGDKAKLESTEPTAPEPVLSDGASVQAQLTPGASRDSQLRREKDQEGPPEVQDQHLQPGVDPQKEQLPGKMSPEHDGFGTDDGACSRILQERVSPQVAVHDGDSHGPDKDAMTHKERHPYVCNECGKVFNRKHLLVQHERIHSGTKPYECTECGKTFSKSTNLLQHHVIHTGEKPYECTECGKAFSFRSHLTRHQQFHTREKPYVCTECGKAFSHRSHLAQHQRSHTGQKPYKCTECGKTFSRSSYFTRHQWIHTEEKSNKCIECGKAFSRRSHLARHQRIHTEEKPYVCTECGKTFTQSAHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKTFAHLSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPAFIRHYSIHTGDKPYECIECGKAFNRKSHLTQHQRIHTGRSPVSVTDVERPFTSEQTSVNIQGLLLGTDSLNVTTEENLWPEEPSYPASDYSYQSKSSQVSSL	22561	7101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_10060_22182
911819	contig_2716_pilon	-	6879	21	Intergenic	novelGene_173549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	151.701771578317	364	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	87	2486	294268	261661	FALSE	35	ACACAAACTATCTACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARRNKKQVPSFRKLLKTSKVKLENKLKNKQFKQQSTLKKYRKEQRKLRQAVKDAVSKKPIPLEDPKEKRPGKRIEWEGEEEEEVLPLDMMDEDDLQLMKDLGQRASFLTRDLSSSEPVHAKKRKHENIIEKYEKIPRSLQTAPEKELIHLLPIKDKSGIIPQTREKPVIESNKDEEDQEEKGLEEEIIEEPIPELTLEEHVMERKKKLQEKKMHIAALASAILSDPESNIKKLKELRSMLMEQDPDVAVTVRKLVVVSLMELFKDITPSYKIRPLTEAEKSTKIRRETQKLREFEEGLVSQYKFYLENLEQMVKDWKQRKLKRSNVVSLKAYKGLAEVAVKSLCELLVALPHFNFHNNIIVLIVPLMNDMSKSVSDMCCEAVKKLFKQDKLGQASLGVIKVISGFVKGRNYEVRPEMLKTFLYLRIKEVEVKKDTEDINKPKKFMTFKEKRKTLSRMQRKWKKAEEKLERELREAEASESTERKLKLHTETLNIVFVTYFRILKKAQRSPLLPAVLEGLAKFAHLINVEFFDDLLVVLHSLIESGDLSYRESLHCVQTAFHILSGQGDVLNIDPMKFYTHLYKTLFKLHAGATNEDVEIILQCLDVMLTKRRKQVSQQRALAFIKRLSTLALHVLPNASIGILAANRILMHTFPKTDLLLDNESQGSGVFLPELDEPEYCNAQNTALWELHALRRHYHPIVQIFAAHLIAGAPSEGSEVLKPELSRRTAAELFETYSMAAMTFNPPVASSNSKRKDKVLQGDLFLNEDLNQLIKRCCNETATQIPLDFTKYLETSLR	294354	257267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_261790_262104_262190_264283_264382_265036_265166_266696_266879_267341_267414_267497_267562_267651_267725_275461_275563_275885_275967_276801_276934_282470_282600_283227_283404_284297_284392_284557_284720_286613_286745_288014_288069_288998_289157_290608_290742_293028_293237_294259
911820	contig_11094_pilon	-	1929	1	Intergenic	novelGene_177016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	257	664	280677	280270	NA	5	GACTCTTGTCCCCGGTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDKLLEFSPLKSEPQSIVIFLIVFGEKFITCSRIGFPGVVRGATGRSGGAGGSALAVTWPETPAPSRSRRGILFMLQILFPLLITLLCISLSGSKTNNRLWGGACNIARLRLYRPRRENWGDRPHPSGPGPDGS	280933	279004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11094_pilon_-_279000_280900
911821	contig_7171_pilon	-	1587	9	Intergenic	novelGene_101368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	20.5118106221757	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	982	1452	1354262	1353537	FALSE	20	AGAACCTGCTGACCTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEARSSGLVSRVFPDKEVLFHAAFSLAAEISSKSPVAVQGTKVNLLYARDHPVADSLNFVVSVSFRPITVRLPFQCSQSELSSLLYAVCSDWWAIGYPPIFIGPTLIFPASSVAVTLFLPRNWNMSMLQTDDIVKSVQAAMEKKELKSVTFSKL	1360962	1353401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356724_1357398_1357669_1360023_1360113_1360257_1360465_1360823
911822	contig_6137_pilon	+	4193	8	Intergenic	novelGene_59264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_2	536.238181925814	155	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	776	1468	1328176	1337784	FALSE	10	AGGGACTCTCTGTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKVK	1320921	1340509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697
911823	contig_9679_pilon	-	3298	1	Intergenic	novelGene_173415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGAAAAAAAAAAAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71580	68282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9679_pilon_-_68300_71600
911824	contig_19941_pilon	-	3938	19	Intergenic	novelGene_139752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_9	55.9671420357903	112	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1695	2243	3937	16461	10696	FALSE	35	AGTTGATTATGCAAACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFLTSFCVPLCLLGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVQPPVESVSQATIVMMPALPAPSSAPAVSTPESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSNEISMIINSIKEECFRSGVAEAPGGSKAPSIDGKEDLDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSLPGPWEHPIQQERDKAVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSIEIKVEPTEPEQGISGAEIAAVVPALSMEPPELRSHSLDEDPRSTATGEIAEADVSSGKGDETQLTTVKTEASPESLLSPSHGSNPIEDPLEAETQHKFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNATLQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRPMDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLAT	40353	10694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_10711_11965_12144_12519_12589_12784_12878_13071_13287_14070_14118_14325_14420_14709_15160_15533_15815_16208_17453_17844_18064_18602_18740_21162_21228_21657_21739_21860_21984_22540_22591_23512_23583_38942_39040_39944
911825	contig_8447_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_69398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGGCTTTGTAGTCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84485	22414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_22526_23196_23296_40690_40826_44381_44929_48348_48475_53958_54088_54547_54726_61156_61252_65554_65685_67606_67732_69678_69726_84014
911827	contig_10734_pilon	-	3880	4	Intergenic	novelGene_51141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGTGGTCTCCCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1165691	866569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_867229_1009114_1009635_1016623_1017307_1163673
911828	contig_5084_pilon	+	7357	10	Intergenic	novelGene_64473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	386	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3033	3437	60995	61399	TRUE	25	GAGGGTCGAGCCGCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRGGEDTLSGSVGRLDVFFPPSLAFLWETRESFISGSMTILSTSVSEAASASCFSLSERSSSSKCKRRGLMGSLPPCTSGDSFKPVPKWSTWKVPLFPGGSLLIKARRASPGNSVPTGLGSSAMPTESSFSC	57962	80827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_61983_63137_63317_64527_64762_65540_65650_66437_66648_68944_68995_71744_71875_74904_76422_76607_76896_80207
911829	contig_854_pilon	+	2055	5	Intergenic	novelGene_36172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	305	688	470342	470725	TRUE	25	TGCAAGAGGCCGATAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQIPAPTLDGAVSLPDACPPPGTGIASCHKAATPFLSSPDPVEGCGVGGLPLELLLLLGNPPGFCSPTQAGSGAESAPFAVPPPGNFPPGTLRGLCEGVRSASEKQPVHGILLQAGSHLETELPA	470037	474756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_471222_471497_472061_473586_473746_474244_474311_474673
911830	contig_4091_pilon	+	3234	2	Intergenic	novelGene_173004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2379	2816	13212	13649	FALSE	65	AAAAAACGACAAAATGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	10774	14067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12553_12611
911831	contig_12964_pilon	+	5199	1	Intergenic	novelGene_131714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGGTCACTATGCATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582505	587704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_582500_587700
911832	contig_14513_pilon	-	1243	4	Intergenic	novelGene_70362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	1262.5702180693	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	187	702	18880	11833	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12108_13087_13136_14952_15001_18735
911833	contig_4103_pilon	+	2271	12	Intergenic	novelGene_51893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	43.7749692619458	114	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	54	1766	53913	65783	FALSE	20	TGAAGCCTGCCAGTGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAERAALEELVRLQGERVRALKQQKAKAEKIEEEVAKLLKLKAQLGPDEGKQKFVLKTPKGTRDYSPRQMAVREKVFDVIINCFKRHGAEVIDTPVFELKETLTGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGQFDSMIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVRGQAGRLREKECIPCWQAHVHSRPEQKPSIHISPTHKGLNGLTHRTGPVNGICSYGHGKVRSLSPCIQCLSGSPKTRCLPWVV	53859	66288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_58096_58217_60671_60768_61422_61549_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381
911834	contig_10377_pilon	-	1759	1	Intergenic	novelGene_115407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAGAGTTGGTCAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235551	233792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_233800_235600
911835	contig_8598_pilon	-	2740	1	Intergenic	novelGene_22872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGACGTGCTCTCTGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5966	3226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3200_6000
911836	contig_8452_pilon	+	2692	5	Intergenic	novelGene_48077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCAGGAAGGGGAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955107	991186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_957417_968668_968752_972861_972935_981638_981737_991057
911837	contig_5467_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_111948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATTTTGATGATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27905	29561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_27900_29600
911838	contig_2646_pilon	-	665	2	Intergenic	novelGene_69529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAAATCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561047	560264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_560276_560393
911839	contig_15500_pilon	-	4142	1	Intergenic	novelGene_128977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCACAGACCATATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173003	168861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_168900_173000
911840	contig_3155_pilon	-	4208	14	Intergenic	novelGene_26331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	24.6002357231214	48	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	10	1593	83803	61106	FALSE	25	AAATCCTAACCTCTGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGCGSVGQSRECRELADLALAPGKWSCRRGGSLLGGCGAESYSKDTGTPVSIMVLGAEQKMPDDNASGDHGDTASLGAINPAYSNSSLTQSTGHSEEPFTTYFDEKIAIPEVEYSCFSFRKLWAFTGPGFLMSIAYLDPGNIESDLQSGAVAGFKLLWVLLLATIVGLLLQRLAARLGVVTGLHLAEVCHRQYPKVPRIILWLMVELAIIGSDMQEVIGSAIAINLLSVGRVPLWGGVLITIADTFVFLFLDKYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVTVKPSQSQVLKGMFVPTCSGCDTQQIEQAVGIVGAVIMPHNMYLHSALVKSRQINRANKREVQEANKYFFIESCIALFVSFIINVFVVSVFAEAFFGKTNEQVVQVCKNTSIAWTGLFPDNNSTLTVDIYKGGIVLGCYFGPAALYIWAVGILAAGQSSTMTGTYSGQFVMEGFLNLRWSRFARVILTRSIAIVPTLLVAIFQDVQHLTGMNDFLNVLQSLQLPFALIPILTLTSLRPVMSDFANGM	83812	58490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_61184_61623_61774_61928_62049_63201_63289_64439_64599_65464_65621_66761_66830_66955_67027_67553_67661_69829_69950_70306_70433_70992_71142_73248_73321_83682
911841	contig_567_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_33944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	37	450	302	715	NA	30	GGCCTAGAGGAGACTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPTFMAALFTLAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	265	1320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_300_1300
911842	contig_10496_pilon	-	3003	13	Intergenic	novelGene_59427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	124.44365079112	52	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	44	1408	64679	44321	TRUE	30	TATTGTCCAGAGATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHGLRPAPISCSCTMSRRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKLCLQKWKNQSSALYGMARGPE	64722	41860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_42356_42894_43247_43373_43561_43759_44387_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482_64573_64672
911843	contig_5594_pilon	-	1662	2	Intergenic	novelGene_150111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATGGCTCCAACAGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108577	3376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_4206_107744
911845	contig_15384_pilon	+	1970	13	Intergenic	novelGene_85150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	823	1194	120470	123199	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTMGTWVLSGGLLGCRRIASKSRPAYCTFSCSGGGCSTRMSHWMSGMGSASSRGTQNTDFSFPAEGRNPTFWLGGWLGVENCATMRSRSIVRSFQLPAGSPEVREVTLPVWVSTANRSCRLR	118795	125380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_119047_119136_119247_119332_119420_119543_119740_119849_119943_120305_120382_120460_120546_121025_121168_121581_121671_122517_122566_123182_123282_124095_124157_124747
911846	contig_5217_pilon	-	521	6	Intergenic	novelGene_135759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2993.16251479935	122	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	25	519	560372	557641	FALSE	5	TCTTGTGTTTATGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISIKVFIL	560396	557638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557658_558338_558430_558674_558851_559273_559374_559858_559966_560368
911847	contig_11896_pilon	-	5993	11	Intergenic	novelGene_88012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1142.5660987444	10	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1286	3861	15	3875	181620	136922	TRUE	5	TGTATCGTCTCGTCGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVLPLWSDTLIHLDGDGGFSVSTDNRVHIFKPVSVQAMWSALQSLHKACEVARIHNYYPGSLFLTWVSYYESHINSDQSSVNEWNAMQDVQSHRPDSPALFTDIPTERERTERLIKTKLREIMMQKDLENITSKEIRTELEMQMVCNLREFKEFIDNEMIVILGQMDSPTQIFEHVFLGSEWNASNLEDLQNRGVRYILNVTREIDNFFPGVFEYHNIRVYDEEATDLLAYWNDTYKFISKAKKHGSKCLVHCKMGVSRSASTVIAYAMKEYGWNLDRAYDYVKERRTVTKPNPSFMRQLEEYQGILLASKQRHNKLWRSHSDSDLSDHHEPICKPGLELNKKEITTSADQIAEVKTMESHPPIPPVFVEHVVPQDTNQKGLCTKERMICLEFTSREFHAGQIEDELNLNDINGCSSGCCLNESKFPLDNCHASKALIQPGQAPEMANEFPDLTVEDLETDALKADMNVHLLPMEELTSRLKDLPMSPDPESPSPQPSCQAEVSDFSTDRIDFFSALEKFVELSQETRSQSFSHSRMEELSGGRSESCRLSVVEVAPSEVTADDQRSSSLSNTPHASEESSIDEEQSKAISELVSPDIFMQSHSENAISVKEIITEIESISQGVGQIQLKGDVLPNPCHTPKKNTIHELPIERAQALENKPGNLEQNKGSCAAQPELAKDSGKWDPEGCLTTCSFTADLEEEEPAEGEQELRSPEMHPGAKWCPGSVRRATLEFEERLRQEQEHHGAAPVCTSLSTRKNSKNDSLVADLAPKGKSDEATLEHSVVPKESEMSKDKGECSGSKAGSLPLPEQKAIAPAPELLEFHPLPAPQEHPVSDARTQQEGVLKEQRTVLSCQGSETQAVPLSLPKRIEIIEYTHTVTSPDHHGPEAEVATTEKGGEQGLRKVKVEKSITVLCALDENLNRTVCPNQVSVHPQVLPLPHSSSPEHDRPTSPTSTLSSPDDRSNSPSTPLETAAPFVSCTTHVPSANLDYLHPQTVVHLEGFTEQSSSTDNEPSTQQGSWEESQEGPLCSGDELPHKGSQLSSEDLSLISKLDDNIEELQEKLDPSPMACQLPHSSSSDSIKGLSHSAGVVKERAKEIESRVICQAGLTNPSQIRRSASLVKLGYLDLCKDCLPEREPIFSESPHLKLLQPFIRTDSGMHAMEVQEPPENPGVPQNPEPTKYFVEQLKTTECIAQSKPVERPLVQYAKEFGHGQQCSLPRAGPELTSSEGGLALLQTQGLQCAGAAPGLAVAPRQQHGRTHPLRRLKKANDKRRTTNPFYNTM	181634	133211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_-_133964_135555_139013_141210_142046_151206_151408_154471_154619_160037_160085_173160_173290_173423_173518_177241_177437_180738_180805_181564
911848	contig_4461_pilon	+	1258	9	Intergenic	novelGene_177923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	165.866993024532	108	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	337	813	90887	96309	TRUE	25	GTATCGGAAATTTATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMDGTTMDVGAVGDLRRIKNAIGVARKVLEYTTHTLLAGESATKFAESMGFINEDLSTNTSQALHAAWLARNCQPNYWRNVIPDASKYCGPYKPKPPSILKQDYPACKGTGDNYGHDTIGMIVIHKTGHTAAGTSTNGIKFTKPYRRFANTWIWSLC	88560	99582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4461_pilon_+_88757_90746_90901_91605_91719_92618_92732_93946_94068_94643_94710_96259_96373_97609_97744_99334
911849	contig_10434_pilon	+	1193	3	Intergenic	novelGene_82046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	629	982	142594	143658	FALSE	70	GTCAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCPDGERRPSYPPRSGQTFLSYLTLICASFYRHLLCRTTERSKNTPTSFSSYFKIREKREESIKLPWEMIQDYLCSCTIGGPRMMPQEENIELSIANYRTDRHKTQSDRHSHLAI	138990	143869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_139509_142483_142598_143308
911850	contig_11413_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_103200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGGTTGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627258	625932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_625900_627300
911851	contig_6505_pilon	-	8397	16	Intergenic	novelGene_175692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	400	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAATTTCTAGGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177024	79518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_-_79640_93639_93826_101541_101686_103275_103412_111852_111965_116129_116324_119598_119750_142216_142349_149811_149902_151337_151501_156056_156237_157916_158110_162919_163001_165657_165772_167207_167307_170723
911852	contig_3077_pilon	+	2026	8	Intergenic	novelGene_26811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	657.739790991134	14	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	171	1298	473998	481662	FALSE	25	AGATTTAACGTGTGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467736	482390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467813_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
911853	contig_6446_pilon	-	3845	1	Intergenic	novelGene_149219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	582	935	385933	385580	NA	65	AAAAAAAAAAACTGGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLSNIWILWILLRLALWPNMWSILDNVPSALEKKVYLAAFGWSVPYMSVRSSWLTVACRSCVSLLSFFLDVLSFTKSGVLKSPTIIVQQSLFSMLLGVCFMYFGAPSLGV	386514	382669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_382700_386500
911854	contig_9363_pilon	-	4133	30	Intergenic	novelGene_6582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_17	777.632123424495	306	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1123	3372	127	3498	786587	754431	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	787892	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
911856	contig_2854_pilon	+	2908	2	Intergenic	novelGene_120861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	267	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1200	1511	918976	919287	TRUE	90	TAAAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNTAAIVRMAQDQAVSYFVVRRVALSWKRLDSTQQQQQQQDENATKNIHRSFNTFGFPVCITSWQIHLLMPLKWEFKGALVLQWFEPISCSAEEGCGSLLP	917776	921321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_919842_920478
911857	contig_4519_pilon	-	6128	10	Intergenic	novelGene_123664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	5095	5505	78799	69283	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFQSASILPFQSASILFKLLPFRSTSILFFNACKCWSASILGGRLGGRSAFLSLLAVCVMKKYSYNISRRVTSGLWVTSTYGDRKKSGTGLGLLASSVTGLPRCFGKHFNLNATSISTKSSWFDGWHFPELGGLL	463511	68215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_68478_68921_69319_70705_70917_77854_78012_78792_78935_79731_82510_222108_222556_229082_229522_378616_379214_462813
911858	contig_5812_pilon	+	2951	8	Intergenic	novelGene_167489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	41	junction_1	109.785319266879	76	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	102	1019	74742	131964	FALSE	10	ATCTCTCACTGTCTCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLAWGAWRLLSCFLPAGFYQALDDRLYCVYQSMVLFFFENYTGVQILLYGDLPKNKENIIYLSNHQSTVDWIIADTLAVRQNALGHVRYVLKDGLKWLPLYGCYFSKHGGIYVKRSAKFCEKEMRDKLQSHVNAGTPMFLVIFPEGTRYNPELTKVISASQTFAAKEGLAVLKHVLTPRVKATHVAFDSMKNYLDAIYDITVAYEGTVDDKGQRKEAPSMTDFLCKECPKVHIHIDRIDKTDVPEEQAHMRKWLHERFEIKDKLLIEFYDSLDPERRNRFPGKSVNSKLSLKKTLPSLLILSGLTASMLMTDAGRKLYVKTWIYGTLIGCLWVSIKA	74640	133896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_+_74781_90117_90188_94766_94883_101309_101400_109116_109208_123675_123838_129529_129654_131738
911859	contig_9471_pilon	-	3397	4	Intergenic	novelGene_21824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	890	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417524	412448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_416271_416934_417026_417150
911860	contig_5777_pilon	-	3678	1	Intergenic	novelGene_173314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCAAAAAGTGTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43200	39522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_39500_43200
911861	contig_12414_pilon	+	2019	16	Intergenic	novelGene_59617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	99.688760093046	2	62	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	28	663	527780	591484	TRUE	15	TTATACTTTGTCTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGQEKPREIMDAAEDYAKERYGVSSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTVQKADEVVWVRARVHTSRAKGKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISGCQ	527752	607453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_527795_529812_529871_533516_533610_547800_547904_572412_572516_581024_581106_582375_582436_590501_590614_591473_591568_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
911862	contig_16496_pilon	+	2373	2	Intergenic	novelGene_5197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1679_3231
911863	contig_15067_pilon	-	1636	2	Intergenic	novelGene_154329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGGTGGTTGCCTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92879	90592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_-_92190_92840
911864	contig_4065_pilon	-	1879	10	Intergenic	novelGene_133400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	84.1334918117895	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	402	1382	556163	532915	FALSE	25	GATTTGTTGCTATGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKVNEMSSFQRNLFILAYNYKMEQISKGHSTPLCDRFVFRKVRSLIGGNIRLLLCGGAPLSATTQRFMNICFCCPVGQGYGLTESAGAGTITDVWDYNTGRVGAPLVCCEIKLKNWEEGGYFNTDKPHPRGEILIGGQNVTMGYYKNEAKTKIDFFEDENGQRWLCTGDIGEFDPDGCLKIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNLPLIDNICAYANSYHSYVIGFVVPNQKELTELARKKGLKGTWEELCNSCEMENEVLKVLSEAAISASLEKFEIPAKICLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELKTHYQADIERMYGGK	563319	532417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_533073_537024_537183_539173_539289_540798_540991_542038_542114_554280_554454_556053_556194_559953_560105_562271_562411_563238
911865	contig_5947_pilon	+	3064	2	Intergenic	novelGene_101458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTGGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19192	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_21956_44627
911866	contig_14405_pilon	+	2474	9	Intergenic	novelGene_85616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	11.6054943884352	125	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	114	986	307481	325709	FALSE	45	AGAACCAAAGGGCAAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVRYVHHEDYQFCYSFRGRPGHKPTILMLHGFSAHKDMWLSVVKFLPKNLHLVCVDMPGHEGTTRSSLDDLSIDGQVKRIHQFVECLKLNKKPFHLVGTSMGGHVAGVYAAYYPSDICSLSLVCPAGLQYSSDNQFVQRLKELQDSAAIEKIPLIPSTPEEMSEMLQLCSYVRFKVPQQILQGLVDVRIPHNDFYRKLFFEIVSERSRHSLHQNMDKIKVPTQIIWGKQDQVLDVAGADMLAKSIANCQVELLENCGHSVVMERPRKTAKLIIDFLASVHNTDNNKKLD	261264	327197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_261291_285540_285606_307458_307616_308829_308944_310184_310318_312585_312744_317667_317723_318167_318269_325532
911867	contig_9706_pilon	+	2233	2	Intergenic	novelGene_20947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGTAGCCATTTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263369	266495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_263991_264883
911868	contig_13216_pilon	+	732	4	Intergenic	novelGene_47474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_1	371.624362315856	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	68	664	229682	246185	FALSE	55	AAAGAAAGATGTGAATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKGRGGVFWQSPGAASLGGLRGMALYVLLLLVLVVQAQSRTEMSIAEPEPSSVPVPTNVTIESYNMNPVLSWEYQITVPTSVFTVQVKNYGDGKWIDACTNISHHQCNIFKAISDPSSPVWARVKARLGQKESAYVESKEFIMCQQGKVGPPKLDVSKKENQIIIDIFHPSIIVNGEEIGIMSDYDDSCYSFIYNLYVRINGSEVCVSISSFSKWKLFYI	229614	246253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_229773_242994_243110_243784_243952_245961
911869	contig_9484_pilon	-	2717	1	Intergenic	novelGene_105680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAATTTACTCAAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195153	192436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_192400_195200
911870	contig_11285_pilon	-	3607	21	Intergenic	novelGene_5519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	401.666189142178	314	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	1108	2031	657064	654651	TRUE	35	GGAGGTAGGGAAAGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANMKDVPSTERMVLCSQQWKLLSQKEKDAYHKKCDQKKKDYEVELLRFLESLPEEEQQRVLGEEKMLNINKKQATSPASKKPSQEGGKGGSEKPKRPVSAMFIFSEEKRRQLQEERPELSESELTRLLARMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSERKPVGEREERGKLPESPKRAEEIWQQSVIGDYLARFKNDRVKALKAMEMTWNNMEKKEKLMWIKKAAEDQKRYERELSEMRAPPAAANSSKKMKFQGEPKKPPMNGYQKFSQELLSNGGAESPATEGAHGGDRQPLAAHLPEPEGALQEAG	667008	651864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_653131_653219_653364_653478_653551_653636_653685_654604_654796_654889_654979_655372_655484_655588_655745_656093_656250_656341_656456_656602_656645_656953_657096_657230_657382_657713_657825_658181_658303_658586_658652_661034_661191_661280_661365_661907_662084_663610_663736_666921
911871	contig_5586_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_143540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	211	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	921	1391	328955	328485	NA	40	ACAACATAATGCTTACGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSRKFIVLALTFKSFVPFYVSFCAWCDVWILTDFSTYGYSVLPALFVKETVSSPIERTLTFCRRSAARRWIYFWVLNSTPLVYVSVIEPVPGCFDYHGCTISFEIEKREASYFLLLQCCFSYSGSPSFHIKLEISFSISLKNVVGIQIRTVLYL	329875	327865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_327900_329900
911872	contig_776_pilon	-	1512	2	Intergenic	novelGene_139939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCACAGAAATATACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885497	880264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_881339_885059
911873	contig_10722_pilon	-	3982	10	Intergenic	novelGene_70968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_4	263.987794330639	34	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2190	2573	6730	6142	TRUE	50	AAAAAGATGATTTTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPCKIFFRIEMTCRAL	17382	3685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_6328_6423_6529_6637_8262_8496_8562_9665_9787_14372_14446_16247_16358_16853_16929_17168
911874	contig_6612_pilon	+	3479	1	Intergenic	novelGene_148152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9605	13084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_9600_13100
911875	contig_12871_pilon	+	3093	7	Intergenic	novelGene_140380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7.99478997014097	75	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAATGGTGTATGGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37050	88537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_+_37129_39742_39891_42070_42115_43607_43732_49608_49646_51658_54077_88293
911876	contig_10581_pilon	-	1269	2	Intergenic	novelGene_41351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAGGAAGGAAGAACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83906	74563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_74668_82741
911877	contig_6278_pilon	-	2931	14	Intergenic	novelGene_119797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACCCAGCCGCGGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521402	305017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_305210_306429_306612_328188_328439_425873_426021_446643_446797_452855_452982_456817_456958_460975_461061_463899_464033_479219_479424_493770_493957_495545_495916_509371_509466_520733
911878	scaffold_2602_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_127695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43981	42083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_42100_44000
911879	contig_1244_pilon	-	3640	1	Intergenic	novelGene_38033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTGAAAAAGAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929955	926315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_926300_930000
911880	contig_10930_pilon	-	3973	6	Intergenic	novelGene_36977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	968.533200256966	45	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1797	2645	276835	268388	FALSE	90	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280388	267059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_279832_280157
911881	contig_3081_pilon	+	8560	10	Intergenic	novelGene_133899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_6	302.613431441648	288	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	4700	5689	52552	53642	FALSE	40	CATCCTAAAAGAGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTSYSLSSHQGWPQDQESARTEQIYSQKQETSLSGSQYNISFQQGPSVSLHSGLHHRSEKISDHSSVKQEYTHKAGSSKHHGPISATPGVIPQKMSLDKYREKRKLETLDLDVRDHYMAAQVEQQHKHMQPQAVSSSSVTSPIKMKIPITNPEKPEKYVTDKKEKSGSLKLRIPIPPTDKNASKEELKMKIKVSSSERHSSSDEGSGKSKHSSPHISRDHKDKHKEHPSNRHHTSSHKHAHSHGGSSSGGSKHSADGIPPTVLRSPVGLSSDGISSSSSSSRKKLHVNDASHNHHSKMSKSSKSSGGLRTSQHPRETGQEASGDQRS	11185	56513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_14713_15539_15622_37254_37384_38990_39052_42959_43023_46520_46886_48246_48411_51719_51791_52314_53474_53574
911882	contig_2710_pilon	+	3898	1	Intergenic	novelGene_161808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTATACACTTCTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177709	1181607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1177700_1181600
911883	contig_11292_pilon	-	1702	4	Intergenic	novelGene_109475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_2	95.1571799124422	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	533	1069	472330	462291	FALSE	40	CCTGTAAAGCATTGGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLMSKRGKWNMFVRATSPESTSRSSSKTGRDTPENGETAIGAENSEKIDENSDKEVEVEESPEKTKVQTAPKVEEEQDLKFQIGELANTLTSKFEFLGINRQSISNFHMLLLQTETRIADWREGALNGNYLKRKLQDAAEQLKQYEINATPKGWSCHWDRYALFSPFHLSPLTSQT	472862	461657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_462477_463362_463468_464336_464462_472209
911884	contig_10197_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_115317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATACGGAACCCGAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1577666	1578552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1577700_1578600
911885	contig_4884_pilon	-	4636	3	Intergenic	novelGene_63829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585231	579424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_581361_582398_585018_585150
911886	contig_5794_pilon	+	1972	4	Intergenic	novelGene_69775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	545.649663754644	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	50	1516	731364	733994	TRUE	20	TTAGTTCTTCACGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN	731314	734495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_731409_731978_732171_732764_734293_734337
911887	contig_3424_pilon	-	6077	1	Intergenic	novelGene_55536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGAAAAACCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272078	266001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_266000_272100
911888	contig_11656_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_53957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGAAAAACAAGATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141129	138193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_138200_141100
911889	contig_12635_pilon	+	5554	2	Intergenic	novelGene_60841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	474	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539358	545370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_544319_544776
911890	contig_7411_pilon	-	3515	5	Intergenic	novelGene_136971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	111	junction_3	24.9899979991996	125	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	287	2509	119782	106725	FALSE	25	CCAGCATCTCTTTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLQESLSFEDLSVDFTQKEWQLLDPSQKDLYKDVMLENYSSLVSLGYEVMKPDVIFKLEQGEEPWIVDGEIASSDSPEEVWQVDGHMLWHQDNQDKLKNVKRVHGCDAFGKKFDLSMNFVPVRKSHSESDLDGIILKHHVDLLIPKADCEKMEPNDFNVFDKLFLHTKPEETDTWLKYYEYDKYDRISYKKSQIVIYHRTRLGEKLFECCECRKRFSKKSSLIKHQSRHIRELAYGCGKCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYDCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHSGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYECSECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLITHHRTHTGTKPYGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECSDCEKSFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSFCRKAFFEKSELVRHQRTHTGEKPYECSECKKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECHECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSVCKKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYQCSECPKAFSQKSQLINHQRTHTKKTC	121199	105718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_108710_115074_115171_115835_115963_119767_119974_121104
911891	contig_17993_pilon	-	6809	9	Intergenic	novelGene_61929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCGCCGCCACGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86891	55367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_55434_67120_67321_68448_72666_72885_73052_76161_76298_77878_78017_79628_79723_80783_80918_85233
911892	contig_3825_pilon	+	1085	8	Intergenic	novelGene_77936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1519.57079063632	2	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAGTGACTCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12214	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_12235_12983_13105_13626_13772_14056_14198_14397_14471_14813_14912_15231_15302_15498
911893	contig_13021_pilon	+	2007	11	Intergenic	novelGene_8192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.62959425356	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	421	1200	176597	180112	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDVSEKENKTIVFLLRGLYSSNWKNCSQYQNRHSIHFLYT	174558	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175902_176057_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177788_178196_178229_180028_180211_180440
911894	contig_6576_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_42240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACAAAAAAAAAAAACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279847	281692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_279800_281700
911895	contig_11505_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_140934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	694	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	61	504	303540	303983	NA	55	AAAAGGGGAAACTTATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLCTTERNTARSCVILTIITMFELTVAAYYVNPSYPGSSSFSLIFYFTKHDVLLQGLVPNNTSKVCAMKSRHSSFQGAIWRISSKTDFFWQFKVHPIFSADTTNSKVSILLQSSLLIIQLSHVYETTENTMVWVRCTFVLKVTSLLFNTLKRSFAADLPNAIRCLIS	303479	305802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_303500_305800
911896	contig_17144_pilon	-	2553	5	Intergenic	novelGene_29176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1045.0086124047	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1102	1545	166806	166363	FALSE	35	TCCTCCCAACAGCCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168904	165354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168328_168727
911897	contig_4732_pilon	-	2470	1	Intergenic	novelGene_75460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGCTCTTTTAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698653	696183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_696200_698700
911898	contig_11294_pilon	+	2439	20	Intergenic	novelGene_50050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	161.58343899123	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	28	882	251378	312926	TRUE	25	TCAGTTCCAAAGATCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALGAASALKMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSRNI	251350	349451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_312915_313007_319137_319238_323693_323788_325734_325806_332506_332617_333604_333664_334971_335076_337381_337456_338120_338195_340644_340698_347019_347051_348744
911899	contig_2450_pilon	+	2073	9	Intergenic	novelGene_160305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAATTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449420	478575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_449451_454610_454713_456704_456858_459107_459253_465098_465194_467980_468060_468957_469059_471060_471230_477376
911900	contig_11896_pilon	+	5931	1	Intergenic	novelGene_88023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGAGGTTATTCAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149679	155610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_149700_155600
911901	contig_18231_pilon	-	3665	2	Intergenic	novelGene_105903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGTATCTTGAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490243	486488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_486693_486782
911902	contig_16221_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_176609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGGCCATGACCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81316	82845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_+_81300_82800
911903	contig_8050_pilon	-	6427	4	Intergenic	novelGene_114859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	322	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400213	388700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_389488_389631_389824_390689_390843_394918
911904	contig_13267_pilon	+	884	1	Intergenic	novelGene_146613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCATCTTCTTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140882	141766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_+_140900_141800
911905	contig_7446_pilon	-	2182	1	Intergenic	novelGene_101950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTTATAAACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192490	190308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_190300_192500
911906	contig_6364_pilon	-	4353	2	Intergenic	novelGene_51852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTGCGTACTACCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783995	1771971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1773438_1781108
911908	contig_5846_pilon	-	2808	3	Intergenic	novelGene_178903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	366	791	605698	605273	TRUE	90	CAGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPTDAAMRSGEVDPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPACGIQAACSSEPRAHGPGKQRSKRTKAPGCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	607159	603028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5846_pilon_-_604754_604980_605768_606863
911909	contig_15752_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_148786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAATAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362783	360623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_360600_362800
911910	contig_8234_pilon	-	2086	2	Intergenic	novelGene_177887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACAAGGTTCTTGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127931	26868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8234_pilon_-_28006_126982
911911	contig_5826_pilon	+	2348	22	Intergenic	novelGene_71518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	374.356415229635	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	298	2274	174975	228733	FALSE	35	AGCTGAGGAAGGATAGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEQKTSKLKTAIESRQKKLIKEQFHGLRSQSCGDEEFPHYDPLSCPDIIQQPLQQQLKQCCYKLYGSEETRIQRTPLTLKCVCWYTPLLDALHLDSLTGNPRLGLTLFSYVANRIHASCERPKYAEIKDDALDVTRGQKCPGPTGGPHPGADLSGYFRMTDDVSMKENGAEHLCSENLPQSREYPTLPVPGHTSSTDSTVISSDASSEILNMAAGGLDCRSLCEKEEDTRSASTMIETQGTSLAHDDTPLQGSMSEDKAILNLEAKEEPETMEEHRTECAAGDTAVSPLPVTTVKSVNFRQSDNISANEKEVEAEFLRLSLGFKCDWFTLEKRVKLEERSRDLAEENLKREITNCLKLLESLTPLCEDDNQAQEIIKKLEKGITFLSQCTVRMASRAEMLGAINQESRVSKAVEVMIQHVENLKRMYAKEHAELEELKQVLLQNERSFNPLGDEGDCQIKKRSASLNSKPSSLRRVSIVSLPRNTGNVGTMAGMENNDRFSRRSSSWRILGSKQSEHRPSLCRFISTYSWADAEEEKCEVKTKDNSEPPGEETVERTRKPSLSEKRNDPSKWDGSSIYGTIASWATNLKTSFRKANKALWISAAFTVLFAALMSFLTGLFFQKPVDATPTQSGDSWMSLEHALWPFTRLQHNGPPPV	174677	228807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_175006_182808_182871_184633_184715_185354_185452_187989_188138_188963_189046_200475_200523_200613_200679_201039_201148_203439_203511_207726_207785_209562_209627_209712_209741_209994_210136_211764_211900_217606_217755_219138_219183_221155_221219_221336_221387_221686_221789_226859_226968_228489
911912	contig_6098_pilon	+	3385	2	Intergenic	novelGene_145464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACACAAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20453	26685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_21836_24682
911913	contig_8568_pilon	+	6950	1	Intergenic	novelGene_156933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	841	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	6522	6950	62143	62571	NA	55	GGAGAAACAATAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTNLFEENTEKRTKKNEEALRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIIKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDTQRILRAAREKQEVTYR	55621	62571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_55600_62600
911914	contig_13740_pilon	+	4203	15	Intergenic	novelGene_34677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	520.181723544959	2785	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2527	3048	170866	176906	FALSE	15	ATGTGGTTAGACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKQNGKSKKVEEAEPEEFVVEKVLDRRVVNGKVEYFLKWKGFTDADNTWEPEENLDCPELIEAFLNSQKAGKEKDGTKRKSLSDSESDDSKSKKKRDAADKPRGFARGLDPERIIGATDSSGELMFLMKWKDSDEADLVLAKEANMKCPQIVIAFYEERLTWHSCPEDEAQ	156799	178061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157300_157451_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161269_161573_161719_161916_162031_165237_166216_170859_171003_173068_173232_176358_176454_176779
911915	contig_17005_pilon	+	4198	1	Intergenic	novelGene_129904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	97	576	34352	34831	NA	45	TGACATGGAAGAAGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPKYKAQNYKVHRRKKGPMPQTLIHSINRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVNREPTDWEKFFVNFKSDKGLISILYKKIQHLYNKKTNNHIKKWAKEMNRHFTKEDIRVANRYMRKCSCSLTITEMQIKTTMRYHLTPALPV	34255	38453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_+_34300_38500
911916	contig_11258_pilon	+	1790	7	Intergenic	novelGene_67789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_2	86.0569901609135	49	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	17	970	279290	292582	FALSE	55	AGAGAGAAGAAAAGAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACLQEMTQWDRAVWLPSALLLLWVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEKEKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279273	293402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
911917	contig_4783_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_108427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	654	959	443964	444269	NA	35	AATTTTTCTTCTTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKTRLPGLTETGGTPKLMPLDTLLTWNPLPEIIFHPNNRQAYKVNNNTCEECAPQNNQPNKTKREAFAQKQSSEGRKAQKSWANRNGELREEVDRLLSH	443310	445764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_443300_445800
911918	contig_20949_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_178202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTACAAATACGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321	2794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20949_pilon_+_1300_2800
911920	contig_12540_pilon	+	3133	1	Intergenic	novelGene_148073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGTTGTCATAAGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901514	904647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_901500_904600
911921	contig_10054_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_171206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTTAGGTATATTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64109	61740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_61700_64100
911922	contig_4091_pilon	+	6183	10	Intergenic	novelGene_172991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	122.352657672427	187	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1571	1942	27470	28511	TRUE	45	AATGGGAAACCCAAGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSLNNIINITCNGVLSGNCQKFSRFQKRTWTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDRNKLWMTLQKNGNSKTFNCAHEETYIDQEAVFRTEQGDTAWFKIRKGVCQDCIL	10679	207377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_28180_30365_55908_56960_60708_61223_81568_81595_128723_128987_206843
911923	contig_4091_pilon	+	2000	5	Intergenic	novelGene_172983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	147.922910666333	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTTATTTTGTTATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10665	39056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_38681
911924	contig_11825_pilon	+	4814	7	Intergenic	novelGene_155411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_6	209.858417881093	15	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	847	1560	83936	92940	FALSE	50	AGGACACAAAACTACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLYLFGRPEAVYASVNKKPTSAAYTVGDEYIALYSYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWAGSIGARTGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGTSNKKPEIAQVTSAYMASGSEQLSLAPGQLILILKKNASGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERTTPAFHPVCQVIAMYDYVANNEDELNFSKGQLINVLNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQ	83089	96194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_84024_84580_84748_86902_86949_87050_87173_88223_88321_89092_89285_92938
911925	contig_8820_pilon	+	2162	3	Intergenic	novelGene_79305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	34.5	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	14	1525	241873	306395	FALSE	20	GCAGTTTGTAGCACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEGGGKEMNEIKTQFTTREGLYKLLPHSEYSRPNRVPFNHLTATAESVSLLVGFSAGQVQLIDPIKKETSKLFNEERLIDKSRVTCVKWVPGSESLFLVAHSSGSMYLYNVEHTCGTTAPHYQLLKQGESFAVHTCKSKSTRNPLLKWTVGEGALNEFAFSPDGKFLACVSQDGFLRVFNFDSVELHGTMKSYFGGLLCVCWSPDGKYIVTGGEDDLVTVWSFVDCRVIARGHGHKSWVSVVAFDPYTTSVEESDPMEFSGSDEDFQDLLHFGRDRANSTQSRLSKRNSTDSRPVSVTYRFGSVGQDTQLCLWDLTEDILFPHQPLSRARTHTNVMNATSPPAGSNGNSVTTPGNSVPPPLPRSNSLPHSAVSNAGSKSSVMDGAIASGVSKFATLSLHDRKERHHEKDHKRNHSVGHISSKSSDRLNLVTKTKTDPAKTLGTPLCPRMEEVPLLEPLICKKIAHERLTVLIFLEDCIVTACQEGFICTWGRPGKGVSFNP	241859	307032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_241989_292862_292981_305117
911926	contig_10197_pilon	-	1214	4	Intergenic	novelGene_115220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	737.306961553704	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	87	377	918161	910531	TRUE	30	ATGCCAAATATTATTGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ	918247	909620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_910002_910074_910584_915130_915268_918060
911927	contig_12000_pilon	+	4027	9	Intergenic	novelGene_43155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	522.24916227793	30	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	104	835	417192	558606	TRUE	45	AACAGTCCGTATACAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYK	416850	562741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_559172_560114
911928	contig_3975_pilon	-	2095	13	Intergenic	novelGene_54854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_12	180.282571413755	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	110	1639	2066301	2056837	FALSE	20	TTGAACGTTGTACATCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079250	2056380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
911930	contig_4884_pilon	-	3255	1	Intergenic	novelGene_63772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60142	56887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_56900_60100
911931	contig_12148_pilon	+	3617	1	Intergenic	novelGene_140334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2405	2806	86227	86628	NA	35	GGGTAAAATTCATGGCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFLENTDKKLEEFRKIMREQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVKDRISGIEDKHLDTTLFQEN	83822	87439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_83800_87400
911932	contig_5794_pilon	-	7896	20	Intergenic	novelGene_69731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_19	239.559440978169	1101	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	46	2004	559018	381634	FALSE	40	CACTCATTGTTACAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAAAAAAGTGVGSGGATGRDQDQDRARRRLQVLSGHLLGRPQEALGANECKARRAASAATAAPTATPAAQESGTIPKKRQEVLKWNGWGYNDSKFFINKKGQVELTGKRYPLSGMILPAFKDWIQNTLGVSLEHKTTSKASLNPSDTPPSIVNEDFLHDLKETNISYSQEADDRVFRAHGHCLHEIFMLREGMFQRIPDIVLWPTCHDDVVKIVNLACKYNLCIIPFGGGTSVSYGLMCPADETRTIISLDTSQMNRILWVDENNLTAHVEAGITGQELERQLKESGYCTGHEPDSLEFSTVGGWVSTRASGMKKNIYGNIEDLVVHMKMVTPRGVIEKSCQGPRMSTGPDIHHFIMGSEGTLGVITEATIKIRPVPEYQKYGSVAFPNFEQGVACLREIAKQRCAPASIRLMDNQQFQFGHALKPQVSSIFTSFLDGLKKFYITKFKGFDPHQLSVATLLFEGDREKVLQHEKQVYDIAAKFGGLAVGEDNGQRGYLLTYVIAYIRDLGLEYYILGESFETSAPWDRVVDLCRNVKERITRECKEKGVQFAPFSTCRVTQTYDAGACVYFYFAFNYRGISDPLAVFEQTEAAAREEILANGGSLSHHHGVGKLRKQWLKESISDVGFGMLKSVKEYVDPNNIFGNRNLL	559063	375741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_381756_408438_408497_410393_410494_418352_418443_422476_422539_424920_424991_431767_431881_433524_433602_440238_440291_454588_454717_465515_465625_470370_470497_485105_485187_487957_488038_489564_489637_492478_492554_492649_492771_497218_497310_510021_510112_558776
911933	contig_10424_pilon	-	2413	8	Intergenic	novelGene_56802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	370.145862037756	13	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1047	1841	304264	292433	TRUE	40	AGAAAACTATAATGTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHFSPIVDATEDSKKNEPIFKVAPSKWEAVDESELEAQAVTTSKWELFDQHEESEEEENQNQEEESEDEDDTQSSKSEEHHLYSNPIKEEMTESKFSKYSEMSEEKRAKLREIELKVMKFQDELESGKRPKKPGQSFQEQVEHYRDKLLQREKEKELERERERDKKDKEKLESRSKDKKEKDECTPTRKERKRRHSTSPSPSRSSSGRRVKSPSPKSERSERSERSHKESSRSRSSHKDSPRDVSKKAKSNLVSKFMGRDLWK	305310	291091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_291641_292409_292476_292818_292996_294205_294325_296963_297075_298978_299139_303360_303428_304146
911934	contig_7253_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_140200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAGGCTGAGAAGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173210	175534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_173200_175500
911935	contig_10297_pilon	-	3803	1	Intergenic	novelGene_112561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATGGAAGTAGACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732706	728903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_728900_732700
911936	contig_8447_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_69420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAAATGATCCTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72694	73869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_72700_73900
911937	contig_15777_pilon	+	3020	7	Intergenic	novelGene_75747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2311	2658	230750	235234	TRUE	15	GGTGCTGCTGGCAGAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELGGLDFAGDATLDSGPEFPEDPGRDSCAGPDWHGSISLAEVRRCSLSLTSFSRDLALCSARRRSNCFFRPGTALRWLSECVLQVRDLVQGFFVSGSNTPQCLFGSNSLSESLL	209034	258946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_211019_215407_215533_219619_219816_230744_230998_231845_231932_235220_235502_258851
911938	contig_6842_pilon	+	2619	9	Intergenic	novelGene_130756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	377.646991249765	301	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	238	558	1366898	1371326	TRUE	10	GCATGGAGTCCCTGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELVGKTGFSSDQIEQLHRRFKQLSGEQPTIRKENFNKVPDLELNPIRSKIIHAFFDNRNLRKGPSGVADEINFEDFLTIMSYFRPIDISMDEEQVELCRKEKLRFLFHMYDSDSDGRITLEEYRNVVEELLSGNPHIEKESARSIADGAMMEAASICVGQMAHREASGFGETAPLSRLTAAEEGR	1306111	1377405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1306134_1330129_1330200_1347014_1347096_1366833_1366974_1368710_1368773_1368879_1368988_1371251_1373048_1374425_1374474_1377113
911939	contig_5794_pilon	-	4170	3	Intergenic	novelGene_69802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	394	31	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAATATTTGTGTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	749537	743236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_747245_747333_747454_749495
911940	contig_7915_pilon	+	4195	24	Intergenic	novelGene_42966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_3	137.892522734509	73	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	1786	3735	119888	137758	TRUE	15	CTTGGGTCTATCATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKHKTELKNILDMLQLENNELQGLKLQHDQKVSELEKMQVEVLEEKLELENLQQTAQRQKGEIEWQKQLLEKDKREIERMTAETRALQVCMASLSKEKEDLEEKCDSWEKKLAQTKRVLAATEENSKMEQSNLEKLELSVRKLQQELDQLNRDKLSLHKDILVMQQQLQEKREEVNTLQEELAHVQDHLNLAEQDLLHTAKHRDIQLSEQTRLQKDISEQKKKFEDCQKEGETKQKQLQVLQNEIEENRLKLVQQEMMFQKLQKERESEEEKLEASKMTLKEQQQQLEKELTDQKSELEQVLTKVSVAEEHVKTLQEEKRWNETLEKTLSQTKQQLSEREQELMEKSSELLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	102438	138425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_102466_102937_103084_104341_104532_105588_105903_107407_107617_109754_109948_114219_114351_114495_114637_114722_114850_118815_118981_119745_119907_121147_121264_121345_121564_123136_123295_124358_124433_125539_125729_126153_126380_128202_128409_129868_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137785_137991
911941	contig_6412_pilon	+	1620	2	Intergenic	novelGene_149970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	186	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTGACATTGCAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499439	529152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_500949_529041
911942	contig_2069_pilon	-	3519	10	Intergenic	novelGene_23187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	148	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2937	3341	87496	75921	TRUE	45	ACCTGTTTAAAACAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLFAPKLPASPIPGLLISALPAELVVRLAQHHVCIDYFQNMCGELIHILQGYDFKGYQAFFLKRSQVASHFHVCFWRNHSVFTTCIICVNPLANIHGCSCHVIYFVNNVGWCLFCMSDYPHDSDLVKSQHCQF	93097	70297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_70404_75848_75947_76068_76187_80971_81047_81594_81709_87424_87528_87704_87803_89407_90617_90738_91948_92708
911943	contig_13112_pilon	-	6710	1	Intergenic	novelGene_98835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	530	1593	504	2096	287695	286103	NA	35	GTTTTATTCTAAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLDKDSYPPSASVVGSSVGGHRHAAGGGGGQRSLSPGGAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRELERDRDYSFYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQRANRTLFLGNLDITVTESDLRRAFDRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPIKIGYGKATPTTRLWVGGLGHWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFPLGGPDRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYDLVTDAFGHRAPDPLRGARDRTPPLLYRDRDRDLYPDPDWVPPPPPVRERSTRTAATAVPAYEPLDSLDRRRDGWSLDRDRGERELPSSREQPRKRRLPEESGGRHLDRSPESDRPRKRHCAPSPDRSPELSSSRDRYNSDNDRSSRILLEKASPVRDRRSSLEKNQGDKRDRKNSASAERDRKHRTAAPTEGKSPLKKEDRPDGSVPSTSATSLKLKSPSQKQDGGTAPAAAASPKLCLAWQGMLLLKNSNFPSNMHLLQGDLQVASSLLVEGTTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKVAGPNGYAILLAVPGSSDSRSSSATSDTATSTQRPLRNLVSYLKQKQAAGVISLPVGGNKDKENTGVLHAFPPCEFSQQFLDSPAKALAKSEEDYLVMIIVRGAS	288198	281488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_281500_288200
911944	scaffold_9100_pilon	+	3721	12	Intergenic	novelGene_83241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_10	49.8690848104786	16	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	1283	2725	589899	614785	FALSE	50	AAACGCCTAACTGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSISNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTADIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSTSNSSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQNSEPSSVDGNSRDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSIKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDIINSFQSIRQEMEAYTPKLTQVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRMMKKT	588616	615781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_590053_593147_593341_594141_594308_595020_595115_596712_596863_596993_597074_601279_601411_601516_601605_604259_604349_604701_604820_612962_613056_614698
911945	contig_7887_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_124841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	209.5	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1857	109	1965	20087	64277	FALSE	30	AAAGCCAAGTCTGACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRNTAMLGLGSDEEDLRKWNRERNLEAGKDDGLTDAQQQFSVKETNFSEGNLKLKIGLQAKRTKKPPKNLENYVCRPAIKTTIKHPRKALKSGKMTDEKNEHCASKRDPSKLYKKAGDVAAIQCQSEESIHLHSQGENNPLSKKLSPVHSEMADYINATPSTLVGGRDPDLKDRALLNGGTSVTEKLAQLIATCPPSKSSKTKPKKLGTGTTAGLVSKDLIRKAGIGSVAGIIHKDLIKKPAISTAVGLVTKDPGKKPVFNATVGLVSKDSVKKLGSGTTAVFINKDLGKKTGTITTVGLVSKDSGKKLGIGIVPGLVNKESGKKLGLGTVVGLVNKDLGKKLGSAVGLVAKDCAKKIVASSTMGLVNKDIGKKLVTCPMAGLVSKEAINLKAEALLPTQEPLKASCSTNISSHENQELSESLKDNATSKTFEKNVIRQSKESILEKFSVRKEIINLEKEVFNEGTCIQQDSFSSSERGSYEISKHEKQPPVYCTSPDFHMGGASDASTAKSPFSAVGESNLPSPSPTVSVNPLSRNPPETSSQLANPLLLSPTTELMEEISGCVGKNQFTSESAHLNIGHRSVGHSMNIDCKGIDKELSDSKTTHIDIPRISSSLG	19978	64279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_20129_20221_20507_62747
911946	contig_4674_pilon	-	1093	5	Intergenic	novelGene_174146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	137.989809406347	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTGAGACAACCGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357372	334675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_334963_351305_351399_354635_354712_355292_355384_356826
911947	contig_12677_pilon	-	1332	2	Intergenic	novelGene_110748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	12	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_437_549
911948	contig_10134_pilon	-	4121	2	Intergenic	novelGene_16190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1072	junction_1	0	3	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGTCTAAAATTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39681	32179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_35178_38558
911949	contig_7963_pilon	-	3324	8	Intergenic	novelGene_58467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	631.832869919098	33	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1388	2032	125592	122315	TRUE	75	GGAAAAAAAGAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAGRISGNFANGE	129541	120288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_121069_121583_121959_122054_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126910_129471
911951	contig_6710_pilon	-	580	2	Intergenic	novelGene_94661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	314	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	657526	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657527	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
911952	contig_21386_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_177030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAGAGCGTAGTCGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57521	55343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_55300_57500
911953	contig_2215_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_163877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAGAAAAATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398335	400359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_398300_400400
911954	scaffold_4438_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_174545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAAAGTAGAGTTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411881	411144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_411100_411900
911955	contig_7816_pilon	+	5884	2	Intergenic	novelGene_66461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGATCACTCACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103065	109098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_108599_108747
911956	contig_5947_pilon	-	2445	4	Intergenic	novelGene_101516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTGTGAACAACACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494791	472317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_472852_492149_492394_492876_493146_493393
911957	contig_19735_pilon	-	4140	12	Intergenic	novelGene_167882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_11	58.4120444955384	180	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	473	1486	93358	66446	FALSE	20	AGTGTAACTTTGTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTINRMEQARTEYRGALLWMKDVSQELDPDTLKQMEKFRKVQIQVRNSKASFDKLKMDVCQKVDLLGASRCNMLSHSLTTYQRTLLGFWEKTARMMSQIYGECVDSYPYDFVALKRLQDTSSKLTEDHKEEQIENNSLTENLNKLVLLNEEANLGSEPATEDHKEKHFQMRDSGTPLFSNSENVAKDLLVDSLEGEDFEKEFSFLNNLLSPGSSSTSEFTQECQTAHGSPNTSLTSQEPSLGSEPLAHSSGFLPSQLFDLGLHAAGAFNSLARHRGSELPLPHMDNESVPSQSPKKLTSSPNNGNQDMSAWFSLFADLDPLSNPDAIGHSDDELLNA	112116	63791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_66562_75053_75144_77879_78138_83698_83774_85714_85759_87314_87401_88715_88815_90996_91123_93238_93438_100157_100231_101374_101544_111965
911958	contig_5791_pilon	-	2486	1	Intergenic	novelGene_35802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCAAACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116657	114171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_114200_116700
911959	contig_13697_pilon	-	2180	2	Intergenic	novelGene_165937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCACTGTTAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361547	330993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_333153_361526
911960	contig_14575_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_101856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9690	7306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_7300_9700
911961	contig_10297_pilon	+	2890	4	Intergenic	novelGene_112567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGCACCCGCGGAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760301	769838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_762852_764079_764218_766101_766258_769792
911962	contig_4496_pilon	+	5916	1	Intergenic	novelGene_66629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGAATATCCCTTTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612355	618271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_612400_618300
911963	contig_12327_pilon	+	1078	3	Intergenic	novelGene_140679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	44.5	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACAAATGTTTTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1135592	1137643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1136479_1136945_1137041_1137546
911964	contig_5566_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_153642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTATTGTGTAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3640	5294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_3600_5300
911966	contig_5092_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_62317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446944	449613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_446900_449600
911967	contig_6654_pilon	+	2863	20	Intergenic	novelGene_85750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	129.013280683803	1	138	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	815	2445	418	2862	600379	679515	FALSE	30	ACAAGGATTTCTACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFFIDVGRRIGQGRRCLSGSALLHAAERKAPTCVQHSCQVTDRRVPEWDGNKRFDKTKNTSHRNRATSNVLSGYHMEDLEEGSCNGWHFRPPPRGITSSEEYTLCKRFLEQGICRYGAQCTSAHSQEELAEWQKRYASRLIKLKQQNENKQLSGSYMETLIEKWMNSLSPEKVLSECIEGVKVEHNPDLSVTVNTKKSHQTWTFALTCKPARMLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKVYEATIEEKTKEYIFLRISRECCEELNLRPDCDTQVELQFQLNRLPLCEMHYALDRIKDNGVLFPDITMNPTIPWSPNRQWDEQLDPRLNAKQKEAVLAITTPLSIQLPPVLIIGPYGTGKTFTLAQAVKHILQQQETRILICTHSNSAADLYIKDYLHPYVEAGNPQARPLRVYFRNRWVKTVHPVVHQYCLISSAHSTFQMPQKEDILKHRVVVVTLNTSQYLCQLDLEPGFFTHILLDEAAQAMECETIMPLALATTNTRIVLAGDHMQLSPFVYSEFARERNLHVSLLDRLYEHYPAEFPCRILLCENYRSHEAIINYTSELFYEGKLMASGKQPA	573059	679516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_573105_574445_574502_578530_578588_600119_600396_616762_616888_618597_618655_623025_623074_624558_624635_627041_627241_627700_627809_628791_629090_640126_640395_649951_650286_652729_652861_657968_658149_658678_658781_671213_671393_674306_674426_675534_675681_679457
911968	contig_3380_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_60112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATGTTAAAAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433332	431131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_431100_433300
911969	contig_13217_pilon	+	3881	7	Intergenic	novelGene_140891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3400	3816	32675	33091	FALSE	15	TGCAACAGGGTTTCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRKLHSKLCPNPSHIPNSRPKSNPSPGPSTASFSSPVPVPSPLSVQTQPALSLSPMLTSSLTLSLGLFHPQPYAQPQFSSMSIYSPVLSPSLYQPHLSPAPASSPNPNPTHKDPDAKSLRMWSKLQNPLQGEVLCHG	19459	33156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_+_21801_25098_25159_25379_25539_25926_26053_29411_29634_31494_31634_32322
911971	contig_15165_pilon	+	494	1	Intergenic	novelGene_145308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCGCTCCGGGGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1770	2264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_1800_2300
911972	contig_9843_pilon	-	2417	2	Intergenic	novelGene_114324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	151	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCTTCCGAGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67036	63005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_64212_65825
911973	contig_1443_pilon	-	728	6	Intergenic	novelGene_28260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	52.6786484260939	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATATTAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562611	557663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_558046_558985_559049_559584_559691_560831_560913_561588_561649_562575
911974	contig_9363_pilon	-	2530	18	Intergenic	novelGene_6592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	807.068470187588	2	126	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	956	2209	761958	754119	FALSE	35	GAAGTGCAAGAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQRQMPSAQPLWLKRIAWASLSVWVKTLLGLPGWK	775045	753797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754221_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_765967_766066_766235_773175_773315_773610_773741_773893_773968_774893
911975	contig_6375_pilon	-	1994	3	Intergenic	novelGene_73059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	2.5	109	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	360	1892	662656	661124	FALSE	25	ACTGAAAAGCTTTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPNKEASSLNSSPAGLICLPPISEELQLVWTQAAQTSELDDNEHLLQTFSYFPYPSLADIALLCLRYGLQMEKVKTWFMAQRLRCGISWSSEEIEETRARVVYHQDQLHFKSLLSFTHHAGRPLEEIPPSLSEPTQMKGLKVEPEESSQIPPMPLSHQKVKEPLMAHGSRAFPHQSDFWQDLQSSSLSKEQAGRAPDQSHGLGTASWNHSTAAHQPRASEKPSPFSLLASSCKKESASRVTPSSSSTSSFQVLANGATAASKPLQPLDCVPQPLSPNEQTLPPHLEPAWPQGLQHNSVPGRVGPMEYLSPDMQRHQRKTKRKTKEQLAILKSFFLQCQWARREDYHKLEQITGLPRSEIIQWFGDTRYALKHGQLKWFRDNVVPGAPSFQDPAIPTPLPTARSLNEWAETPPLPIPPPPPDIQPLERYWAAHQQLQESDILQLSQASRLSTQQVLDWFASRLPEPAEVVVCLDEEEEEEEEELPEDDGDEEEEEEEDDNDNDDDVIIQD	668278	661021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_662689_667461_667578_668067
911976	contig_20883_pilon	-	2883	2	Intergenic	novelGene_173834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAGACATATGATGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33122	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20883_pilon_-_30528_30655
911977	contig_8269_pilon	+	2384	9	Intergenic	novelGene_106248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_8	478.775113571079	223	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	611	2002	344617	378321	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEGSIISSPHMRRRATSTRECPSRPHQTMPNSSSLLGSLFGSKRGKPPSQAHLPSAPPQPPLHPPILPHPQHPSAGHHQGSAEGQTQAQVHGHHSQYCHMQQNPPPYHHHHHYHPPQHIQHAHQYHHGPHGGHPPYGAHSHGHPPLPSAQVGHAAHHHGQPPAPPPPTSSKAKPSGISTIV	344006	378703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_376430_376481_377781
911979	contig_8702_pilon	+	2356	12	Intergenic	novelGene_157723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	25.6421656877305	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	128	1492	19637	24715	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGPREELVYLPCIYRNTGIEAPDYLATVDVDPKSPQYSQVIHRLPMPNLKDELHHSGWNTCSSCFGDSTKSRTKLVLPALMSSRIYIVDVASEPRAPKLHKVVEPKDIYAKCDLGYLHTSHCLASGELMISSLGDPKGNAKGGFVLLDGETFEVKGNWEKPGAAAPMGYDFWYQPRHNVMISTEWAAPNVLRDGFNPADVEAGLYGTHLHVWDWQRHEIVQTLTLQDGLIPLEIRFLHNPDAAQGFVGCALSSNIHRFYKNEAGTWSVEKVIQVAPKKVKGWMLPEMPGLITDILVSLDDRFLYFSNWAQGDLRQYDISDPKRPRLTGQVFLGGSIVKGGPVQVLEDQELESQPEPLVVKGKHVAGGPQMIQLSLDGKRLYVTTSLYSAWDKQFYPDMIRGGSVMLQIDVDTVKGGLKLNPNFLVDFGKEPHGPALAHELRYPGGDCSSDIWI	19136	25579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_19214_19586_19644_19801_19915_20132_20319_21099_21221_22364_22548_22793_22973_23424_23504_23594_23717_23958_24052_24215_24335_24552
911980	contig_252_pilon	+	1419	1	Intergenic	novelGene_99916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTACTGTTTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45266	46685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_+_45300_46700
911981	scaffold_880_pilon	+	3230	3	Intergenic	novelGene_121476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	684.5	9	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1243	1542	484926	485828	TRUE	5	CTTTTCCTGTCGCTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAEVTGELAVHCSEWPRSPTTFPDPHVLVLNLTQDACPVSERLSVSTQCLLRAPRTDKTQTRCC	483683	488983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_484938_485540_486590_488056
911982	contig_5261_pilon	-	7160	11	Intergenic	novelGene_102465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	62.9476766846879	226	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	181	1680	549414	516658	FALSE	55	TTTTTAAAAAAACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRESLAAGERLVSPAYVRQGFEARRSHEHLIRLLLEKGKCPEDGWDESTLELFLHELAIMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYRFIHGIGRSGDIAAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLDIIKLAGVRTVANCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMITAGFEPVVIENVLEGDELCTDLKAVEAKVQELGPDHVLCIHSTTSCFAPRVPDRLEELAVICANYGIPHVVNNAYGVQSSKCMHLIQQGSRVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNDSFIQEISKMYPGRASASPSLDVLITLLSLGSNGYKKLLKERKEMFSYLSDELKKLSEAYNERLLHTPRNPISLAVTLKTLDEHHDKTVTQLGSMLFTRQVSGARVVPLGSVQTVSGYTFRGFMSHTNNYPCAYLNAASAIGMKMQDVDLFIKRLDKCLKIIRREQNKESDVSGVNSYDTTEDVDIGEMALKLGNVLCDT	549594	511177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_516947_518374_518466_519800_519895_531093_531186_531315_531446_538872_538976_542209_542364_544840_545000_545301_545421_548331_548487_549300
911983	contig_7031_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_132805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356165	353985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_354000_356200
911984	contig_12402_pilon	-	5226	5	Intergenic	novelGene_133356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.6121593216773	79	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	619	1419	596369	477544	FALSE	70	CCAAAACAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRRLHLSFLPKTLCERETFVERPYECKECGKDFRYFSDLTKHIKTHSGERPYECKECGKAFIYLSSLTRHIRTHSGERLFECKECGKAFSRSSSLAKHIKTHSEEKPYECKECGKAFRYFSDLTRHIRTHSGERPYECKECGKAFICSSSLTTHIRSHSGERPYECQECGKAFTRSSHLTTHIRTHSEERPYECKECGKAFKQFAELTRHVKVHSGENPYECKECGKAFSSHPSLNIYRWTVGRGLLNVRNVGKPFVISQISLDI	617210	473736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_477651_595437_596073_596310_596607_598184_598324_616968
911985	contig_16622_pilon	-	5042	3	Intergenic	novelGene_48511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	262	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTATGCATGTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178819	173573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_174958_175121_176710_176749
911986	contig_11986_pilon	-	3472	2	Intergenic	novelGene_69175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	183	299	553058	552942	TRUE	5	CCTTTGATCCTCGCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFGLITKQQAKCLKEQLCRGSSSLLHVPGARPSPWGSSGVLPAFPSQDPAAPSTFPGSANMKAWCWVYLRIPGAHIPAVVTFPTPGSPAWGAHCRPQR	553240	547657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_547706_549816
911987	contig_13828_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_158289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCTTAAACATAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224320	225234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_224300_225200
911989	contig_10953_pilon	+	1020	6	Intergenic	novelGene_42580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	16013.2169784837	662	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	84	671	455261	464114	FALSE	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLAPGSPSSLDTTIVRTAQTIDAGGRLAAMLPNPHPPTGLGLRWAKS	455177	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461180_463971
911990	contig_5918_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_99537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713264	711652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_711700_713300
911991	contig_3386_pilon	-	1403	7	Intergenic	novelGene_34563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTAGCCCGGTCCGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495070	470091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470306_476272_476405_485248_485297_486415_486549_488114_488184_491943_492072_494391
911992	scaffold_12510_pilon	-	6838	12	Intergenic	novelGene_151360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_7	501.737493512987	282	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	2270	3328	240074	191536	FALSE	40	ACATAAGTAAAGCATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYIEHRRISHEGSPIKPLPIREFQKAEDMRRFIHQSRVPVDPSSLLSVSPSHNQLSHTDLELHRRREQLLERTRREAQRAALQYEEEKLRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQAPLDGESLSGLNNQVGCATTLPHSSAFTPLKSDDRSNASSSSPTAETVHHSPAYSFPAAAIQRNQPQRPESFLFRAAVRVETNKGHGSPLLSSSAPATDSTDSITRQDSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPAVPKLTMAKCRRNVENFLEACRKIGVPQEQLCLPLHILEEKGLSQVAVTVQALLELAPPKPQQHQFSAI	242343	188025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_191662_199365_199444_206082_206221_206837_206957_208017_208129_208631_208681_212532_212608_219764_219813_221543_221694_222107_222160_236702_236780_240038
911993	contig_13547_pilon	+	2753	2	Intergenic	novelGene_104892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	116	325	146705	146914	TRUE	75	AATTAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FITTLIQHCAGDPSQSNKARKRKGIQIDKEEVSLFADDMILYIENPKQSTRKLLELIEDFSKVSGDKINIQKSVGFLYTNKENFKKEITKSIPFTIVPKKIKCLGIN	146589	149561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_147837_148055
911994	contig_12550_pilon	+	7148	6	Intergenic	novelGene_175275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	85	junction_2	36.7673768441536	301	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	133	960	37493	79274	FALSE	30	TTCTCATTAGAAATTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLHENGIVHRDLKPENLLYATPAPDAPLKIADFGLSKIVEHQVLMKTVCGTPGYCAPEILRGCAYGPEVDMWSVGIITYILLCGFEPFYDERGDQFMFRRILNCEYYFISPWWDEVSLNAKDLVRKLIVLDPKKRLTTFQALQHPWVTGKAANFVHMDTAQKKLQEFNARRKLKAAVKAVVASSRLGSASSHSSIQESQKASRDPSPVQDGNQDIKAIAEEENVPGDGAQVSFEGAEAELMKEQALGEIKDVDINAAEATKMAPEALDDGIKVAEPEIEEGLTEEKLKTVEEAADLKEAQENPDLELGAQQYDVNLPEY	35324	85462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_+_35416_37451_37527_66419_66496_71648_71776_75741_75895_78836
911995	contig_14219_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_54351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGATAAAAAAAGAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849719	853095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_851777_852749
911996	contig_5279_pilon	+	3927	8	Intergenic	novelGene_105569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	30.1729707398079	3	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	2323	3063	355236	374254	FALSE	35	CAGAAATGGGTTGAGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLKPLWCLRRRPRLGGFLAENLSSREVASGVSSPDSASPRALNIFDRDLKRKQKNWAAQQPEPMKYDYLKEEVGSRVADRVYDIARDFPLALDVGCGRGYIAQHLNKETVGKFFQADVAENALKNTIETEIPTLSVLADEEFLPFRENTFDLVVSSLSLHWVNDLPRALEQIHYVLKPDGVFIGAMFGGDTLYELRCALQLAETEREGGFSPHVSPFTAVSDLGHLLGRAGFNTLTVVTIKRSK	351694	375118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_353746_354964_355458_359419_359461_362129_362194_366354_366403_367738_367843_370230_370271_374032
911997	contig_9481_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_149635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1756	2085	110490	110161	NA	75	AGGAAAAAGAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGIQNKTQDGFPVEEKALELLDREFKSLIFRPIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKNGKIQENNAGTKCKNKFTTRNHTKTTIRKPKDKQQDFRNVQCHRRAEEQV	112245	110091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_110100_112200
911998	contig_19185_pilon	+	6843	2	Intergenic	novelGene_163670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATTGGTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169469	176456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_173590_173733
911999	contig_16594_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_53878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	14	391	175182	175559	NA	25	CTCATAGTGACCCTGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKYKMLYESCPIHHDTILRWITERLSLLSFQDFPDSQRELNFLIRMHIIFFFPLQSFGRLVLAALYRPMPTPRAFIMHEVLIKNHKVEVYLLTRRMTNSHRASNVPGYFKYFAGIDSINSLLITGQEFL	175168	176305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_175200_176300
912000	contig_6576_pilon	-	3982	2	Intergenic	novelGene_42350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	563	junction_1	0	135	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	74	328	730252	729998	TRUE	35	GTAGGGTATTTCTAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLHLKHFLRDLRCSLLFAGQERPMINLQLLLPSLLPLEIQRVSIKKTSLVQLNLLKLLVSKHLFIKVKVCGVRTYIILFLHVNYSLGNNILLIRQIMNKLEFFYIKC	730325	725941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_726022_726423
912001	contig_6079_pilon	-	3276	3	Intergenic	novelGene_160100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448930	440985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_441752_443847_445128_447700
912002	contig_14536_pilon	-	4736	12	Intergenic	novelGene_69279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_1	138.462633321941	545	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	150	1217	137680	54970	FALSE	25	GAAGTCCTGTATTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPAFASVSPSVEEEDLGEDSPRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARSIGSNPPFPIKPLSESKNRLLDSESQWTETGSEEGIVRSGL	137829	51450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_57556_57673_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
912003	contig_16622_pilon	-	2137	3	Intergenic	novelGene_48491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1664.5	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	185	520	121789	113571	FALSE	40	AGAGGTATATAAACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICVSSLTCRRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQGILLGGLRST	121973	111953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113739_115153_115292_121759
912004	contig_2798_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_120029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	578	937	116117	116476	NA	50	TACATACCAACAGGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSKFSVERKTVFLIIFFLSPILRNNQWYHNDNYQQPHTSTGSHSMQFSVEFYFVLALKEDEVPDDQDHHIEQECEVHVYVQHGTHKFAEGQPKYPSLLDEVDQAKRHRQEKNTVYHH	115539	117084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_115500_117100
912005	contig_7045_pilon	-	2860	1	Intergenic	novelGene_77458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2524	2859	368615	368280	NA	35	ATGGGCCAGTAGAATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYGLRKNTSILEKVQPECFLEARTARIHRTYFGHIIRKDQSPEKDIMFDQVEGQQKRRKPTMSWTDMVAATMGLNTGTIMGVMHDQAMFYYVIHKVVMSCSPLDGQLTATT	371138	368278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_368300_371100
912006	contig_11719_pilon	+	702	6	Intergenic	novelGene_154738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2577.87171131536	5	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	308	700	14194	20027	FALSE	30	ACCTCAGTAAAGTTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHLEMRYENLYMLLFFASLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETARPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQ	12999	20029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14251_14331_14504_16247_16326_19126_19183_19997
912007	contig_2988_pilon	+	3549	1	Intergenic	novelGene_136534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCTAGAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22676	26225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_22700_26200
912008	contig_6740_pilon	+	4237	1	Intergenic	novelGene_142650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGTAAAAAAAAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21825	26062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_21800_26100
912009	contig_6954_pilon	-	2399	4	Intergenic	novelGene_64405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	22.0151463012778	63	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	52	1785	15106	9271	FALSE	25	TTATATTTTGGTTAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGLSLPVHPDVLDESCMFEVSTNIALSKDNICSSEKSKPCISSVLLEDLAVSLTVPSPLKSDGHLSFLKPEVSSVSTPEEVISAHFSEDALLEEEDASEQDIHLALESDNSSSKSSCSSSWTSRSVAPGFQYHPNLPMHAVIMEKSNDHFIVKIRRAAPSASPSLKQSIMADESLASLPRVGKEADEATEKECTSCHNSVFKSVDELEKSSKNVDGSRLANEDQNSVIQTQVPDIYEFLKDASGKVGDSHEVADECFKLHQVWEPKVPESVEELPPMEEMPQSVEDHLPNAYIDLTKDPVTETKNLGEFLEVTVLNIDQLGCSGGNLNQNAQILDSSLQLDTVGAFIDLTQDASSESKNEANHSAVADGGLGCQVICIEEENCKEEKVPVADRPLECIVEEACIDLTTESPSPCEVKRDDLKSAQKSNSVSSELPGALDNAHKKRKNLSDLSHSSQKKQRKEIDLTSRKKAKKITQDSGENDEARQRKANKKRFPAVNKDPSALKASPGMQDSSAAPATSPTSLSAKNVIKKKGEIIVSWTRNDDREILLECQKRGPSVKTFTSLAAKLNKNPNQVSERFQQLMKLFEKLKCR	15157	8656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_9275_10772_10826_12377_12478_13529
912010	contig_2332_pilon	+	684	8	Intergenic	novelGene_58672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2964.09580114532	14	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	22	591	331257	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330772	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330793_331255_331303_331377_331485_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
912011	contig_3602_pilon	+	5492	6	Intergenic	novelGene_60557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	33.2228836797771	201	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1495	4488	101	4588	476093	563777	FALSE	30	GGGGAGAGCTGAGGAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLSTSDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRAAATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKFVSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAFSTLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDHLSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDIMDTVPAEQLYESHLEKLRNERKRAEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYSKHQKQIIDRAKEGFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAERDALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEQLISSRFIRPSDRNQKNSLSDSSIDRINLVILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHGCLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGESLHSLIQQGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDMADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLELFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEACSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPPPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGNDGLSFFMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSTWLPLDGFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKGDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPVFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHSLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYSMQSDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPISEPPRGHAQLPLRRGCHRPLPHLHAGHQSAIAPPVASAHSPVPNAATAALPASS	475992	564681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_479774_495921_496067_552544_552623_554951_555084_562471_562578_563431
912012	contig_5640_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_27252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	122	349	99159	99386	NA	15	CACCCACTGCTGTGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKNTNNPIYKWAKEMNRHFTKEDMQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLTHCWWECKMI	99037	101406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_99000_101400
912013	contig_3787_pilon	-	5147	1	Intergenic	novelGene_102429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	272	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614229	609082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_609100_614200
912014	contig_2550_pilon	-	4860	25	Intergenic	novelGene_135695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_12	116.803543218232	295	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1069	3210	52	3261	1801470	1648845	FALSE	30	CAGCATTGGTTTGTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDKASVGKISVSSDSVSTLNSEDFVLVSRQGDETPSTNNGSDDEKTGLKIVGNGSEQQLQKELADVLMDPPMDEQPGDKELVERSHLDGEGDAPLSNQLSASSTVNPVPLVGLQKPEMSLPVKPGQGDSEMSSPFTPVADEDSVVFSKLTYLGCASVNAPRSEVEALRMMSILRSQCQISLDVTLSVPNVSEGTVRLLDPQTNTEIANYPIYKILFCVRGHDGTPESDCFAFTESHYNAELFRIHVFRCEIQEAVSRILYSFATAFRRSAKQTPLSATAAPQTPDSDIFTFSVSLEIKEDDGKGYFSAVPKDKDRQCFKLRQGIDKKIVIYVQQTTNKELAIERCFGLLLSPGKDVRNSDMHLLDLESMGKSSDGKSYVITGSWNPKSPHFQVVNEETPKDKVLFMTTAVDLVITEVQEPVRFLLETKVRVCSPNERLFWPFSKRSTTENFFLKLKQIKQKERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSIRLPQSGSQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLSVRPKQLSSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDHLVEKYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKKLMELACSMKIGQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQLKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIRQKVDDCERCREFFNKEGRVKGISSAKEVLDEDTDEEKEILKNQLREMELELAQTKLQLVEAECKIQDLEHHLGLALNEVQAAKKTWFNRTLSSIKTATGVQGKETC	1801521	1647245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1648968_1650350_1650549_1652243_1652316_1653044_1653129_1654039_1654145_1659994_1660106_1660529_1660623_1671583_1671713_1671975_1672018_1673856_1674001_1674585_1674712_1677962_1678038_1682020_1682135_1743881_1744033_1748640_1748735_1752722_1752898_1769461_1769632_1770656_1770760_1771467_1771535_1772085_1772197_1776275_1776434_1777053_1777229_1777997_1778203_1779819_1780055_1801320
912015	contig_4857_pilon	+	1182	3	Intergenic	novelGene_48699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	273	junction_2	83.5	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	146	334	1152202	1152922	FALSE	60	GCAAAATCACCAACAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELHSFSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLVSEPRNLSFFLNPPCAQWGQLSEVLSWQFSSVTKRGLSVDQLNMLGEKLLGMSMLTFSYI	1151593	1153770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1151661_1152123_1152223_1152754
912016	contig_6506_pilon	-	3789	2	Intergenic	novelGene_153482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCATTTGCTTTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108155	103433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_106978_107910
912017	contig_1084_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_152380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGCCTTTCAGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505070	503835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_503800_505100
912018	contig_6397_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_146238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	529	831	314627	314325	NA	70	AGAAGAAAGAAAATAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKWSIHQEDITIINIYAPNDRAAKYVKQTNSTEKRERQLHNSSRRLQHTTFGEERSSTKTSEELNAAVNQLDLIDTSEHSTQQQPSMLSFPTHMEHSPE	315155	313930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_313900_315200
912019	contig_5696_pilon	+	2390	4	Intergenic	novelGene_117557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTAGATTGTTTCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691765	900892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_693235_720472_720689_899942_900286_900530
912020	contig_5602_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_133027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTATTCTGTAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540621	542630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_540600_542600
912021	contig_10599_pilon	+	2783	9	Intergenic	novelGene_49866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	899.735794553045	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	168	1082	146893	163915	FALSE	20	GAAGCCTGACTGGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVAALVKERRVVAAASAAKKPLFPLPGRRVWCRQDGGRGAERGQSHHPIAGGTRMSSRKDCADDRSRSSGLMYQVSGDLSQPAYSFGIRGTAGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123204	165616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123225_123439_123580_146885_147008_148809_149041_150905_151011_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
912022	contig_15135_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_119889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGTACAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113238	122822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
912023	contig_5649_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_82447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCATTTGGTGCTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504640	1503499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1503500_1504600
912024	scaffold_17907_pilon	+	1860	11	Intergenic	novelGene_150762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	153.898050669916	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	10	1179	55187	81369	FALSE	15	CGTGGATTGGCAGCGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATMVGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLAEWSKHIDSEGRILNVDSVKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSVSEEQERRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDILSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQIQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWTELPCKNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDSRNCHKLFVRSWGFRTVKFQRQIQILVKMKMLA	55177	82050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17907_pilon_+_55355_56657_56787_57275_57380_58385_58481_67571_67689_72988_73090_76862_76963_77368_77467_79542_79660_80188_80228_81267
912025	contig_15327_pilon	-	2191	14	Intergenic	novelGene_70774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	79.9974851675732	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	14	880	1169101	1135844	TRUE	45	ATTAAAAGGCAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEDRNREITLLMGSRRRCLICSICTAT	1169114	1129719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137383_1153236_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
912026	contig_7342_pilon	-	1461	3	Intergenic	novelGene_71173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	55	11	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACACTTAATGTCATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482472	472981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_473470_480882_481479_482095
912027	SIRV6	+	653	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-39	8525	4	266	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAAATGTTGCAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091	2806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740
912029	contig_7051_pilon	-	4421	2	Intergenic	novelGene_64305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACATTGAAAATGTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209417	204505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_207224_207714
912030	contig_13456_pilon	+	7224	1	Intergenic	novelGene_153292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	243	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	3175	3549	327220	327594	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEAQAALKAPGIDGIRTEMFSANGCSTGDTHLSMQEIWKTASWPTDWKRSIFVPILRKGDPTECRHCRTILLISHTSKTLLKIIQKWLQQCISRELPEIQAGFRRGCRMRDIIADQMDLG	324045	331269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_324000_331300
912031	contig_5574_pilon	-	4132	3	Intergenic	novelGene_155819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3261	3614	44818	44465	FALSE	40	CATAAGTGGATGAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTAVNMGVHISILVMALISLGYILMSGIAGSYGTSISSFLRRSQINFQSGYTILHSYQQCISVPISPQHLQHLLFCGFWINACLVGVRWYFIVVLICISLMANDHEHFSMCLLAA	207448	43946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_45024_45165_45276_204503
912032	contig_14559_pilon	-	3960	2	Intergenic	novelGene_83729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3225	3560	331958	331623	TRUE	20	GACACTTGTCTACTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHSSCFYSGFPDSIRPVFLSLLVFSSLLLGICCPFGFIYLIDLRSTFLMWSSFSSELAGCPGPIVSGVPPISVRPVSLIFFVNLNFALHFSPALSRTLYCDPCQSSRWW	335182	330970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14559_pilon_-_331035_331286
912033	contig_5033_pilon	-	1720	5	Intergenic	novelGene_28963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1235.39495202951	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATTTTGCGTTGGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477209	457369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_458261_462973_463031_464547_464983_465790_466032_477113
912034	contig_17274_pilon	-	596	5	Intergenic	novelGene_26492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATAGACTCTGGGTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69917	42488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_42710_47230_47294_51701_51784_54320_54383_69749
912035	contig_7426_pilon	+	2775	1	Intergenic	novelGene_27510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGTCTAGATCCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966966	969741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_967000_969700
912036	contig_2100_pilon	+	2521	1	Intergenic	novelGene_50626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1061	1519	855952	856410	NA	50	ACAGGAGAGGAAGCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMTTFKKKKKKKKDLKNVDIERKSRRYKEIKDWYKLRKIGVNIKVTTKETNNPTSQNKKPEKYKDSANTKSTTMKRKYIKKNNSAQKIKRNKETVNNTQKKDIKMTAINSYLSIITLKVNGLNAPIKRLRVADWIKKTRSDYMLLTRNIP	854891	857412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_854900_857400
912037	contig_12750_pilon	+	2065	4	Intergenic	novelGene_172631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	5.24933858267454	18	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	244	576	146407	147980	FALSE	90	AAAAAACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLSVISSAVKLFGVICAHVGEAQRLLILEQLLDSIKHTKGARQQVVQLHVISSFSSFLKYVAGSKRSLCPEKIRRPALTLVMGALESPNPLLRCAAAEAWARLAQVMDGGAFTAGLAQVSFDKLKSARDVVTRTGHSLALGSLYRYIGGISSSQHLDSCVGILYTLSQDSTSPDMQVSTSSDISLKVMIYR	134428	149469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_134500_143295_143402_146340_146532_147772
912038	contig_8581_pilon	-	1552	9	Intergenic	novelGene_22841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	579.569452266077	17	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	9	1070	324037	306830	FALSE	40	AACTCAAAGACTCGAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTQLMAYNVGYKIECVLLVMSLTSGSSLTRPATLHDLSTTCEA	324045	306347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306956_307219_307245_308912_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016
912039	contig_8138_pilon	+	2145	5	Intergenic	novelGene_52421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	525.65459191374	3515	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280076	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_305564_305650_306364
912040	contig_15691_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_60784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACGCAATGGCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153479	155629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_153500_155600
912042	contig_8729_pilon	-	2383	2	Intergenic	novelGene_40119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCCCCAAAGACACCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625351	428030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_429567_624504
912043	contig_12019_pilon	+	2020	11	Intergenic	novelGene_87734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	141.468017587015	38	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	11	1012	623205	637915	TRUE	10	TTATTGGCTCAGGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEEGAFVKEHFDELCWTLTAKKNYRLDSNGNSLLSNQDAFRLWCLFNFLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623194	642653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_633848_634035_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_637966_639735_639833_639942_640142_641782_641874_642082
912044	contig_14686_pilon	+	1520	2	Intergenic	novelGene_88058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15518	18452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_+_16740_18153
912045	contig_3975_pilon	+	2603	3	Intergenic	novelGene_54677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTATACTTCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981311	1109192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_981322_1079587_1079989_1107000
912046	contig_7057_pilon	-	2636	4	Intergenic	novelGene_123438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.63299316185545	51	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	47	1351	1682309	1663001	FALSE	50	AGAAGTACGATAGTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPSEGSALPWEEKEMPKLQKLVTFKDVAVDFTQEEWECLDSSQRHLHREVMLENFENLVSLGHLLSKPEMIFHFERLDDVWMEEEMPRSSCSGVRDEKDGTLPWQVSPGEKPYSCPHCGQDFCQHRNLLIHQQTHTGEKPSPYNRCGKAFSERTTDLNLPVLLPGEKPYQCVKCSRVFTSVSALGRHKKGHVGKKPHTCEECGKDFSCSSNLSIHQRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHRRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHQRIHTGEKPFRCCDCGKDFSRKAALQIHQSVHTGRKPHARKACDQGFTSRSALARHQQDHAGSNAYVCDTCGRGFGHRANLYLHQRVHSGERPFRCEACGKCFSWRKDLGIHQRVHTGERPYRCGACGRDFRHRSSLKRHERVHTGEKPYTCAVCGKGFSQRVHLQTHQRLHSKEKL	1682355	1661715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1664071_1664462_1664556_1665668_1665796_1682294
912048	contig_10753_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_105140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATACTTAAGCTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307550	305318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_305300_307600
912049	contig_19061_pilon	+	3489	3	Intergenic	novelGene_173513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	66	452	58096	58482	TRUE	40	CAAATCTGGTGGTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIVAATVSFFFFTDPLLYLPSMMSFSRDWSLLITGPKYITQSLTILTSKKHSGCTSSKTDVFVLLAVHSTLNILCQCPNLKVLILLQSSLVVLQLSYAYKVIENTMAWVKCPLIFKVTALLFNTLKRSFAADLPNAIRHLTLDCCFHGH	58030	62556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_+_58666_58788_58947_59860
912050	contig_3394_pilon	-	2899	5	Intergenic	novelGene_152721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCAGCCATGACTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564003	553673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_554772_556303_556462_558674_558835_561414_561528_562633
912051	contig_7165_pilon	+	3627	1	Intergenic	novelGene_116882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2801	3115	728956	729270	NA	20	TTATTATTATTTTGGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKENGKNTQESLYQKELVDIKPFQEVAYDQELMVLKEEGEAALKALAKNKAPGIDGIPIAIFQQMDAVLEVLTHLANKFGRWLPGQPTGRDPYLCLFKES	726155	729782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_726200_729800
912052	contig_2438_pilon	+	1345	6	Intergenic	novelGene_112038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2828.44518419573	24	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	67	399	310588	312207	TRUE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDI	305099	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312059_312205_312409_312729_313259_313312
912053	contig_14441_pilon	+	2037	3	Intergenic	novelGene_100463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	28.5	94	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	12	494	85423	87484	TRUE	40	AACTTTAAAAAATGCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAMRALPLACALLCLLQPGLMGAQVIQTPRYSVRRSEKRVLLECTRQNVLVSTRPSFGAAADPCSYDVDSTEKGDALDGYSVSRKTKGGFSLTLGLASPNQSSVYLCASSESTARCSHIFSEQKAGAGSHITLHQLETVTLRYPACRHTSWQAKHGMPFRPC	85411	93636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_87050_87795_92403
912054	contig_6445_pilon	+	3122	2	Intergenic	novelGene_76986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	148	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406267	409644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_407295_407549
912055	contig_10904_pilon	+	4424	1	Intergenic	novelGene_22685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	2764	3180	566731	567147	NA	25	GCTATGTTCAAAGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFSLQRPLTPDGHRAPPGDDGAWISPDRWFEEGPWKGMRPGVPRGSPPLNPPSFHFDSPPTLVTISLDPLCFPLPPPCKLPRGVHCADQKLDLGGLGRTHLSVPDSVDPGKPWQRIPCEKLILTPTHRNIKCGLGP	563967	568391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_564000_568400
912057	contig_17964_pilon	-	2857	1	Intergenic	novelGene_33943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	313	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACGTTGGAAAATAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718060	715203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_715200_718100
912058	contig_9235_pilon	+	2329	3	Intergenic	novelGene_156220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	381	1445	45805	47303	FALSE	25	TAGTATGGTTTTCAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRMSPCEPSLCLEL	45026	48187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46827_47260
912059	contig_7359_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_139836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	296	703	8449	8042	NA	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSRKCTPTALEREFKIPLLLDNTPGHPPHGDDLNQDVQVVYLPPGTTAVIQPVDQGAIATFKAHHLQTTFARAIATTDGGMVTLCNFWKNYNMLWCIWNIASSWEEIMGKCTQGIWKKLLLCEHAPKHLIKIV	8744	7407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_7400_8700
912060	contig_6795_pilon	+	2281	1	Intergenic	novelGene_27680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTAAATGTAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68642	70923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_68600_70900
912061	contig_13425_pilon	+	2567	4	Intergenic	novelGene_170841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	292.78129873489	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	696	1793	61112	62332	FALSE	20	CAAGAAGTTGTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKHPQELP	59483	63106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60530_60980_62188_62310
912062	contig_1274_pilon	+	1014	11	Intergenic	novelGene_137766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	72.6019972177074	1	25	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	876	137	1012	66711	118866	FALSE	20	CCCAGTAGTGTCTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPVKNYQAHQSRVTMILFVLELEWVLSTGQDKHFSWHCSESGQLLGGYRTSAVASGLQFDVETRHVFIGDQSGQVTILKLEQENCTLVTTFRGHTGGVTALCWDPVQRMLFSGSSDHSVIMWDIGGRKGTAIELQGHNDKVQALSYAQHTRQLISCGGDGGIVVWNMDVKRQETPEWLDSDSCQKCDQPFFWNFKQMWDSKKIGLRQHHCRKCGKAVCGKCSSKRSSIPLMGFEFEVRVCDSCHEAITDEERAPTATFHDSKHNIVHVHFDATRGWLLTSGTDKVIKLWDM	3761	118868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_3832_33354_33391_66680_66736_78585_78737_89062_89176_98288_98416_108170_108277_113876_113979_115514_115646_117618_117728_118854
912063	contig_7321_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_53109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCATTATATGAGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31059	29954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_30000_31100
912064	contig_14513_pilon	-	1442	5	Intergenic	novelGene_70249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1456.57938334991	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	175	393	18880	15853	TRUE	5	CTCTGCTTTTGTCCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGNYKCDLANLSVTRKNCTENAELL	19054	11284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_14952_15001_15772_15927_18735
912065	contig_7996_pilon	+	1822	2	Intergenic	novelGene_165147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTAGATGTCTCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156335	254321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_156343_252506
912066	contig_13112_pilon	-	3354	4	Intergenic	novelGene_98826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	3016	3354	227663	221949	FALSE	20	ACTACAGGCTTTGGGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECQEAILCTATVMPSCFWIIMFPLSDSRHTTGISVGSEVSLAACWARTEITPACSSDRVPRQPRLSPCESVHRTPTMDGFFIVSSKCCSKVVSIPPAVKPGPSFPQHVASFS	230678	221948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_-_222039_223786_223849_226376_226494_227593
912067	contig_11631_pilon	+	2057	15	Intergenic	novelGene_104198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	882	1196	188825	196720	TRUE	60	CTAAAAAAAACAACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGTDGAGGRGVWKATLGLSGGIVSSKCLGVTLSCFSLSGDFSGSCAPEAATLSSKSFSVSCSSVAQPFVPIVLVDISLSFFEQVLYLHLQRPSPQKDYRHLEY	162535	216510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_162667_165441_165552_168677_168834_176482_176631_178697_178827_186502_186625_188739_188944_190902_190959_191897_191992_196674_196759_197826_197925_205541_205985_206683_206780_208083_208168_216408
912068	contig_14727_pilon	-	1598	2	Intergenic	novelGene_56636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	947	1288	163241	162900	TRUE	35	TATAATAAAGCGGGCCGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRDPEHTLLIIFPNQPWIHVAVDLFDEPLPQPPPAVPVTHPWKEDSTFCDVNNIVSFSTMTHGLLSQRLLSGKSEGGDRGGGLGGKPPAPGTQGETCCEKTVLASQAESQE	164187	159604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_159679_162663
912069	contig_10734_pilon	+	6694	24	Intergenic	novelGene_51239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_19	472.41091817862	23	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2316	2239	4554	1268213	1321486	TRUE	25	TTGCCAGTGGTACTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKKTQGIRDSVLHLKSLAGIMAGRREICAQ	1221115	1334964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1221446_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1310195_1310254_1321457_1321506_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
912070	contig_3386_pilon	-	3137	1	Intergenic	novelGene_34597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCAGGAAAGGGAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527786	524649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_524600_527800
912071	contig_6076_pilon	-	3665	2	Intergenic	novelGene_81713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4044	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1725	2222	4786	4289	TRUE	75	GGTACAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQIISKHLQKQDRMVPVGVQNKTTDDLPVEEKELDLTDREFKSLIFRIIQEFKQKADKNEEKIDKLMEKADKYMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSHREIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMMEDRISEIEDKHLDTTLFDEKSEKRMKKP	6510	2077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_3281_4048
912072	contig_7004_pilon	+	2839	15	Intergenic	novelGene_126447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_11	43.4325656057991	221	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	33	1091	273029	278336	TRUE	25	CTTATAATTGTTGCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEVRCEGRVAMTGRARKEAVQAAARELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFCELKETDSWEIKPESKYFLTRNSSTIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRRSRRSQVGFHQVGVETYGGGIWSTWFDRDLTLAGRVIVKCPTSGRLEQRLVHVEQPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNLEMHLVPILATAIQEELEKGNPEPGPLNAVDDRHHSVLVSLLCAHLGLSSEDIVEMELCLADTQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYV	272594	282373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_272621_273022_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274147_274339_274471_274742_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
912073	contig_13547_pilon	+	3107	1	Intergenic	novelGene_104864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAGAAAATAACTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67354	70461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_+_67400_70500
912074	contig_7707_pilon	-	2423	1	Intergenic	novelGene_72105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCCATTATTTTCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5886	3463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_3500_5900
912076	contig_5125_pilon	+	4989	1	Intergenic	novelGene_43401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1997	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATGGCTGTGATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16955	21944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_17000_21900
912077	contig_8978_pilon	+	2246	10	Intergenic	novelGene_49481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	245.23186307384	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	1238	2158	1755032	1772309	FALSE	40	TTTTTTCTCCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1721169	1772397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
912078	contig_13021_pilon	-	3553	2	Intergenic	novelGene_8266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2456	2830	227291	226917	FALSE	50	CAAATATTAAGGTAACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKKSRNFPEEENFLELSEAEYESLIYKTLHEIRKEINQNAEHAIEKIKKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKISNKTSEADISTESHRSRIEAMEVRISEIEDKALHTNLFEEKSDKRI	229854	226193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_229623_229730
912079	contig_546_pilon	+	5774	2	Intergenic	novelGene_117200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	484	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1886	2290	101611	102015	FALSE	10	TTGTATGATTTCTTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKYSIPCQKVDGSNPPRGTSEDRPGDPLPKGHGLKNPPLHIWGHHELELTWQLTTTSRHHEILPVQLDLHLKNLEFERTLDIINANTGILGGAILSITGNFTVWPHPLNPTCPTPITTPCLQLKITPHISVAT	99612	105499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_100141_100253
912080	contig_5020_pilon	+	950	5	Intergenic	novelGene_27856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1040.33900724716	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	360	950	122915	126088	FALSE	5	TGTCTCCTCCCTCTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGPASLFLLPFPLYLSSFPSSCHHIPSLPHILTPPLYLISPFSLSPGGIDPTLAPARIPSPQSLEKLAQISILLPSLASIPPIKQAQPW	118465	126088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123355_125825
912081	contig_5023_pilon	+	2096	8	Intergenic	novelGene_7256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	710	junction_7	2336.24654485937	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	81	1061	607279	618766	FALSE	75	AAAAAAAAAAAGTACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKVGGVDCGRVTDCGLKGNLGVNGKKTKIQGLVF	580848	619801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524
912082	contig_7870_pilon	-	6468	1	Intergenic	novelGene_108901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAATCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192855	186387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_186400_192900
912083	contig_10575_pilon	+	2949	1	Intergenic	novelGene_141820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1994	2455	445682	446143	NA	10	TTTTAACCTCTTTCCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKWQRKDLTFDLEVCLAPKPLCQLSRHKHMPHADLCFHPLMGFPATGKGPAAGQREGVTTPPHRGADQVKGSPAPVPPTRQGLPGSRAPRGLRANRCLWTPRSVGSPGLRVPQACGLPRSEGSPGLWIPGSVGSPGLRAPQVYRIPGLQTP	443688	446637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_443700_446600
912084	contig_12139_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_146472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	183	398	132045	132260	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGDRRGRLRSKGSIRPWEAAEGHIWARALGILGEAAIPLSHRQGHLGARERFSQVQRELMLWLCGEERPKSREKVAVQPHSLLLERSRLGQSVKINHTQHGALPLRAPQTRASRGRAAPKRASTRPPDEL	131862	134182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_131900_134200
912085	contig_6710_pilon	-	574	2	Intergenic	novelGene_92513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657518	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
912086	contig_5947_pilon	-	4630	9	Intergenic	novelGene_101504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.9477013178453	35	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3237	3608	418376	416780	TRUE	30	TGATCTGCCAGGAACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLDTSKCLGRHEFAQAEELAGVGGEDGDLGGQVFLAQEVLAQLYHKVSLVLVLVAFAFLDFLLREVVFYKEKVGRDPINLLILENRGVILQILVNVGSQKPGNCRAHAVLVIQTDKGNVYFH	421612	408922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_409069_410064_410179_411901_412148_413724_413872_415243_415396_415801_415947_416707_416820_417144_417243_418142
912087	contig_4686_pilon	-	5445	1	Intergenic	novelGene_118547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	803	1219	532140	531724	NA	25	TGGACTTTCATAATTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVLFPFDAALTPGGKNMFPQELAQKIKGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMVRISQDRPPGARSLWLHTGVCLLAPSPWLILGISLGCCRFQLRHSFPRTLL	532942	527497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_527500_532900
912088	contig_10437_pilon	+	1133	1	Intergenic	novelGene_38341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488755	489888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_488800_489900
912089	contig_3754_pilon	+	3024	2	Intergenic	novelGene_146821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1805	2245	108837	109277	FALSE	25	CACCAACTAGGGCGGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINPQLEIIQKQQLEIQKINNKISERYDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKRLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRVMWGTIKSKNLRVTGIPEQGKKTENTERIIEDLLTENFPNIRKDEKLVIQEAQ	106762	110056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_107150_107419
912090	contig_11289_pilon	-	5126	3	Intergenic	novelGene_178906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4460	4774	303027	302713	FALSE	35	GAGTTTTATTTTTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGSPSRG	456104	302360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11289_pilon_-_305588_439631_440046_454619
912091	contig_15123_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_110938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTTTTACTGAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333318	335390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_333300_335400
912092	contig_17144_pilon	-	1642	11	Intergenic	novelGene_29556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1744.99409741122	3	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	460	1425	170784	166321	FALSE	15	TTGGTCTCTTAAACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQPAP	174920	166103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166333_166494_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170876_173305_173460_173580_173751_174876
912093	contig_5696_pilon	+	2201	10	Intergenic	novelGene_117605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	201.97384013472	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1947	253	2199	848850	865609	FALSE	40	TACTAATTTAAGGTATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRNQDKADVKNLLGNATVQSGPSKGEKHKNKCESLRPEEKEDECCREQKLSCLQNTSDIVDIPSSEKDEKRTDPILSSSNQKDAMLVSTESSESSTSDLPSSEVGTKALSEVNNAESSCTEERNVDLKNKSLETDQTGNVKPMVRGRLQRPKPNLSRAVGKKPVSSQGKTDAENRSSHPETSVEKNHMEKDQMNIFDSLGMENSEKASTEAETVSNLSEKICLREDKQPKAFRPTQLMRGRLQRPKPNVGKVAERKEILASQEKIGADEEKNENESCIDRDAPEQMEDQSCKNFDCGDIVSQPEKKDTSFHNVQPDEPKTLNECLCIQEDNEANICKQAPIVRTRFQKPKPIIERGTGRREIFSREEVPEKILDPGEMESDLGEIARLETSPREKMPVEANTTKEMETDVKETGRRDISLREKIAEMIDITMEMETSLTETGREISPRENESEVIDALEEIETDFEETERTEISPWEKAPEEVKTVGEVETDLEETEREVSPRQNIPEMIAASEEGKGDFEETGRREISPWEETPEEVKTISEVETDLEETGREMSPREKVVKEVSAIREREIDLKETGKGNIFLMDKVSGKMTVIEETETDLKDTRREISLRETGSEEISAIEEMVADLKNTGKTDTAPRENEPEETATSRLIETNLIQSSSGDCSPMPSPDIQNISSDVLSVVRTSVEEERNSEKEVSSQLSHSKTSLQTSELGKTEDQGMQFPDVPEQFS	841260	865611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_841349_842653_842802_848833_848993_853128_853289_856802_856895_857832_858029_858822_858957_863077_863542_864192_864777_865435
912094	contig_854_pilon	+	1734	10	Intergenic	novelGene_36716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2946.81817525695	25	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	69	1094	1709551	1715343	FALSE	15	TCTACCCACCCCCTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADGDGPECFL	1709309	1715983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713314_1715315
912095	contig_15720_pilon	+	3287	1	Intergenic	novelGene_41941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2920	3219	308157	308456	NA	30	TGGAGGGAGGGAAGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGISLCVCAEKGTSFQATRYCLARRGSQTAKRKRKQTNQNRTNQSKQTNKQKSRGSSTSMVARARKQFHTRAVFHSLSGRSKDGAQTRYLRGRRGRW	305237	308524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_305200_308500
912096	contig_12605_pilon	+	617	3	Intergenic	novelGene_64170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	269	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	29	397	3897	4829	FALSE	25	AAGGAGATGCTGCAGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3868	5049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
912097	contig_13004_pilon	+	3938	1	Intergenic	novelGene_112714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	858864	862802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_858900_862800
912098	contig_15371_pilon	+	2831	4	Intergenic	novelGene_151472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1038	junction_3	432.597580514116	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2236	2616	216320	222120	FALSE	20	CGAGTGGTCGAGAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDTKMVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTR	213186	222335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_215338_216235_216426_220720_220877_222001
912099	contig_8284_pilon	+	2470	3	Intergenic	novelGene_125660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCCCTAGGTTGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183604	194113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_183649_184532_184842_191996
912100	contig_8606_pilon	-	4077	1	Intergenic	novelGene_159388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTGCAGTGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24216	20139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_-_20100_24200
912101	contig_12079_pilon	-	2800	5	Intergenic	novelGene_67519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	415.315843665998	8	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	878	2035	862522	861365	FALSE	35	ACAAACGTTAACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	868548	860599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246
912102	contig_11720_pilon	+	2026	10	Intergenic	novelGene_43810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	3505	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	204	1265	68064	98482	FALSE	25	CTTTATAATGACTACTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67860	99243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
912103	contig_826_pilon	-	3503	2	Intergenic	novelGene_154946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGGGAAAATAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341900	338327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_340952_341021
912105	contig_6217_pilon	-	1759	2	Intergenic	novelGene_109604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356189	352442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_352900_354887
912106	contig_6589_pilon	+	1502	7	Intergenic	novelGene_26042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_2	870.234578847693	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	77	856	1725483	1730190	FALSE	5	TTGCGGCTCTGCACTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQDSCLSLVKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKASFVSFIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATFDKIFFPQLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVIWLRPHSLLAP	1725406	1730836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725727_1726937_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729234_1730067
912107	contig_5569_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_86729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTACACCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203218	205685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_203200_205700
912108	contig_19722_pilon	+	3559	1	Intergenic	novelGene_171898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1109	1600	92069	92560	NA	15	ATATTCTGTGGTTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAGFRRGHETRDIIADVTWILAESRIPEGCLPVFYLLCKGIRYYMDHNKLWITLQRMGIPEHLIVFMWNLYIDQEAVIRAEQGDTVWFKIRKSVCQCCIFSPYLVNLYADQIMREAGLYEEEHGIKIGGRLINNVRYADDTTLLAESKEDLKHLLMKIKDYM	90960	94519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_+_91000_94500
912109	contig_7963_pilon	-	3894	12	Intergenic	novelGene_58442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	478.594550534848	163	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	2243	3295	120716	118203	FALSE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	126298	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121257_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
912110	contig_10235_pilon	+	690	3	Intergenic	novelGene_46303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	39	14	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	77	334	84570	86513	FALSE	70	TAACAAAAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSPNLTPAQSSKSLQKKWSAKSLPMRWAAGSLGLRSVSAFSSGSFWNSGRSTEFMIGGLGGHPCMVPLRGQGPRVHGWSTQIPGGRGKLGNREVKELVEGHTVSSRARI	84058	86869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_84116_84550_84758_86443
912111	scaffold_880_pilon	-	3243	2	Intergenic	novelGene_121413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	235	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2125	2424	339513	339214	FALSE	25	GGAGTACAGCTCCACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRTQVFSDTPLGHLQHFGSWLSFLSPHGCKLTPTIPSSHSTYQPPTKEGGRMKSFHHVQLYLSLSPPRNLPSGQKWKSWWCKWLTRSAANQKVGGLN	342954	338394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_339634_340950
912112	contig_2438_pilon	-	2154	2	Intergenic	novelGene_112065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTAGTGATGCCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313520	311145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_312084_312304
912113	contig_9535_pilon	-	2537	3	Intergenic	novelGene_124491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	302	junction_1	6	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	589097	586593	FALSE	15	CAATTGGCCGTTGTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVNGTDQEEIRTGVDQCIQKFLDIARQTECFFLQKRLQLSVQKPEQVIKEDVSELRNELQRKDALVQKHLTKLRHWQQVLDDINVQHKKPADLPQGSLAYLEQASANIPAPLKQN	589099	584405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_586791_588070_588184_589060
912114	contig_854_pilon	-	2562	4	Intergenic	novelGene_36758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	34.554305086342	46	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAAAAACCTGACAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783752	1735169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1737316_1760381_1760508_1783363_1783486_1783584
912115	contig_11396_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_71341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACATCAAAATGACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489605	486847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_486800_489600
912116	contig_6102_pilon	-	3755	6	Intergenic	novelGene_32096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	287	junction_2	80.3502333537371	91	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	129	1103	797332	795038	TRUE	55	AGGATAAAGCAAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQLKAMILTFALFWDFPELKMCGYNGSVPSVESLHQEVSVLVPDPSVSCLDDPSHLPDQLEDTPILSEDSLEPFNSLAPEQVSGGLYGIDDTELMSGEDKLPLEDSPVISALDCTSLNNTTAFSLLADDSQTSASIFASPTSPPVLGESVLQDNSFDLNNGSDTEQEEMEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHG	797460	792055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_793673_793833_793936_794104_795103_795193_795644_796226_796446_797091
912117	contig_20356_pilon	+	3124	1	Intergenic	novelGene_159525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	2579	2983	16399	16803	NA	40	CACCCAACAGCGGCAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARNSHLSVITLNVNGLNEPIKRQRVTEWIKQQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKTKGWKKIYQANNSQKRPGVAVLISDKIDFKTKSTIKNKEGHYIMIKGTIYHEDITIINIYAPSDRAPKYINSNSTEKRN	13820	16944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_13800_16900
912119	contig_6079_pilon	-	2768	1	Intergenic	novelGene_160093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1824	2132	422184	421876	NA	30	AACAGCACCTTTTGTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVGQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGVDSPIKPNGTNEV	424007	421239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_421200_424000
912120	contig_15087_pilon	-	2779	2	Intergenic	novelGene_37218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	187	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGAGTCTAGCTGTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123098	118859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_120567_122026
912121	contig_5445_pilon	-	5914	4	Intergenic	novelGene_135437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_2	134.69059193409	357	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATGTTGGTAAATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182280	166842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_170156_171151_173661_175154_175195_182228
912122	contig_9177_pilon	+	2220	14	Intergenic	novelGene_32585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	790	1149	2759	3724	TRUE	15	ATGCCCCAGCTCCTGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASWSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1714	7696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3266_3446_3503_3698_3806_4280_4385_4516_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589
912123	contig_16594_pilon	+	2981	1	Intergenic	novelGene_53921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288814	291795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_288800_291800
912124	contig_20028_pilon	+	3240	1	Intergenic	novelGene_170648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATCATAGACCCAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36352	39592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_36400_39600
912125	contig_8059_pilon	-	2964	3	Intergenic	novelGene_111097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATACAGTATTTACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302817	170261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_170634_228898_229185_300511
912126	contig_5484_pilon	-	2581	1	Intergenic	novelGene_151096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	408	2173	2580	255939	255532	NA	55	AAAAGACATAAACTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVIVDCFKLRKIRVNFKVTTKKVNKPTHQNKEEKQSLSKIKSTKTKAMKKKSTKKKKKKRNSAQESQRNKEIISITKKHHKTTKINPHLSIITLNVNGLNAPIKRQSNTMDKKDRIHPYAVYKRHTLE	258111	255530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_255500_258100
912127	contig_8710_pilon	-	1433	1	Intergenic	novelGene_73529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438685	437252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_437300_438700
912129	contig_13744_pilon	+	6460	6	Intergenic	novelGene_77138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	34.4940574592204	292	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	946	2841	92	2932	61367	90932	FALSE	20	TTTGCCTCTAAGTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLGRGEGHGRASGRPKEARGSSSHRLTADMEESSSVAMLVPDIGEQEAVLTADTVISPSLEIDEQRRAKTDPLIHVIQKLSKIVEHEKSQKCLLIGKKRPRSSAATPSLETQELDEVPAKAARSPAADIGRLEMPQTDLIPDSLAQSDGKAMSYQCSLCKFLSSSFSVLRDHIKQHGQQNEVILMCSECHITSKSQEELEAHVVNDHENDANTQAQSKAQQCISPSKSLCQRVIERNKEAIRDIPVNVGNPQTASMAEMGRRKWYAYEQYGMYRCLFCSYTCGQQRMLKTHAWKHAGEVDCSYPIFENENEPLGLLDSSVAAAPSGVDAVVIAIGDSELSIHNGPSVQVQICSSEPLSSLSPLEKSAEGAVHLSQSIALDPSEEEMLEVISDVEENLRADSLLSSAQKIISSSPNKKGHVNVIVERLPSAEETLSQKHFLVNAEMEEGKNLSPTEAQIGCGGTDGVYHADKCTVDIGGLIIGWSTPEKKDSELMNKGLATDENAPPGRRRTNSESLRLHSLAAEALVTMPIRAAELTGASLGHYGDINLLDPDTGQRQVDGTLAAYSKMMSPLKNSSDGLTSFNQSNSTLVALPEDRQELAVGQVKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQCQPSSDPSLSGGNVVEYIPNAERPYRCRLCHYASGNKGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEHIADNSRDLESHMINHCKTRIYQCKQCEEAFHYKSQLRSHEREQHNLPDTLSVATSNEPRLPTDTAEGKCIQEGNKSSVQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRIHNSDKPYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSGRVLGKSPGKTLLNNGEDRSDPISGSSENLVSSSELISQTPSEAVGPNESEKLSLTSNTSCSLEKNFNLAPPGMEYCVLLFCCCICGFESTSKENLLDHMKEHEGEIVNIILNKDHNTL	53128	94460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_53218_61364_63485_64955_65074_69167_69283_90326_90462_90577
912130	contig_4686_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_118578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	173	364	758136	758327	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLDLEGNNCILLFSRSIWILFIKLILVLSNTNFLNFHKKRLRHCNKKKISATILERSMTVPKNTIYALTFCPSNDLLGIYPEDLKKKKVAVKSIPTHDGPVCVRVELCSRGFSMAVIFQK	757963	759899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_758000_759900
912131	contig_11720_pilon	+	1544	9	Intergenic	novelGene_43792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2331.25373994338	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	364	1260	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67817	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68095_78378_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
912132	contig_6137_pilon	-	894	3	Intergenic	novelGene_59131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGGGGCGCTAGCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934668	894984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_895191_898701_898827_934105
912133	contig_13295_pilon	-	2521	4	Intergenic	novelGene_31228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	280.832096931007	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTGTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134127	81170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_83228_85560_85677_101889_102009_133898
912134	contig_18081_pilon	-	3087	1	Intergenic	novelGene_23792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2102	2461	107534	107175	NA	20	CCACTGCCGTCAAGTCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHLPFIKNLRSFLFASKRGVFLQYLLHCFSIPSNIISNLLCTNKKTLPVFEVHSRRYLNKTSFYAPWMLATVPLTRSWPTTARDGRLSFPPRPHHHRHHQPLQTLSLRQKTSSAGKDL	109635	106548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_106500_109600
912135	contig_4103_pilon	-	1641	4	Intergenic	novelGene_51903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACCATCTCATTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66292	62835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_63204_63310_63554_65061_65179_65379
912136	contig_6272_pilon	-	4496	29	Intergenic	novelGene_160451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	283	24	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	106	420	248613	248299	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLRRVAVWLLGLCWGRRGILRGVSLCGCSYRRCHSSSGLCWGRRSILRGVSLCGCSYRRCHSSSGLCWSGGGFLRGVSLCRCSYRRCHSSSGLSLGVCGFWV	248718	153690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_153925_154949_155051_162090_162165_164419_164487_165670_165783_167188_167309_170025_170130_175029_175132_178309_178433_186636_186778_189274_189454_192574_192745_195367_195537_199589_199832_201719_201868_202641_202712_206225_206335_208816_208928_211279_211416_214322_214533_216553_216692_219212_219285_220335_220523_220851_221025_227476_227648_239227_239314_242787_242969_245319_245429_248061
912137	contig_8801_pilon	+	4408	1	Intergenic	novelGene_66265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	287	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2884	3240	384817	385173	NA	35	AATATGTATGCACCCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNVIVFTNRFNQVEERISRLEDRVVKITDGKEQQGPRLKKAEHSLMELWDSNKKPNTHILGIPEGDDREKGTEGIFEEIMTENFPNLTKDLNPQIQEAQRTPKLDKPKEIYTKTHYS	381933	386341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_381900_386300
912138	contig_6058_pilon	-	1203	2	Intergenic	novelGene_172393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAATCCGATGTGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384157	382913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_383048_383088
912139	contig_7840_pilon	-	4733	5	Intergenic	novelGene_69042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	615	junction_2	136.493589593065	168	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	169	759	406713	393023	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDSRERQRHEHIERRRHGNPEPLSNGRPQGNTQQVVEQDEEEDEELTLKYGAKHVIMLFVPVTLCMVVVVATIKSVSFYTRKDGQLIYTPFTEDTETVGQRALHSILNAAIMISVIVVMTILLVVLYKYRCYKVIHAWLIISSLLLLFFFSFIYLGEVFKTYNIAMDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYGKNPGLTYCLSQKCLTAVFFFLF	406881	378511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_378873_389409_393315_395375_395444_403145_403288_406624
912140	contig_7056_pilon	-	2502	1	Intergenic	novelGene_43646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAATCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724976	722474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722500_725000
912141	contig_8284_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_125722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAGAAAATATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447693	450019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_447700_450000
912142	contig_9653_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_48193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1028	junction_11	330.714753124024	1	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	141	1550	196924	175913	FALSE	20	GTGAAGCAGTGTTGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDDQENCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	200974	175269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188958_192144_192240_194047_194351_196881_196987_200896
912143	contig_13740_pilon	-	2705	1	Intergenic	novelGene_34776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	184	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	920	1225	778933	778628	NA	65	AAAAAAAAAAGACTTGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETMVPRALRPAIQSCREFGCVYGASMTFPCTGLNLFFKSNITFCSLDFWCHLTATHWKNDLDERSLVFTFVILITFIKIFIFALYTVLIHVVSAFRIS	779852	777147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_777100_779900
912145	contig_16917_pilon	+	2218	10	Intergenic	novelGene_161928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_7	16.8193010820572	17	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	22	2076	105134	164374	FALSE	40	TAATTATGAATATTCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSETYRMPVMEYKMNEGISYEFKFPFRNNNKWQRNASKGTHSPQVPSQVQSPMTSRLNAGKGDGKMPPPERAANIPRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVSSIALARSQQCRNSPSNLSSSSETGSGGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSEDSIADQMEPTCHLPAVSKVLPAFRESPSGRLIRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSDEKWYDGDRTESELSSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPGHGSTASLGAATSSPRSGPVKEKVAPLWHSSSEVISLADRTLEAESHGMDRKAESSLSLDIHSKSQVGSGPLTRENSTFSISDAASHTSTMSSRHSASPVVFTSARSSPKEELHPATSSQLAPSFSSSSSSSSGPRTFYPRQGATSKYLIGWKKPEGTINSVGFMDTRKRHQSDGNEIAHTRLQASTRDLRASPKPTSKSTIEEDLKKLIDLESPTPESQKNFKFHALSSPQSPFPPTPTSRRALHRTLSDESIYSGQREHFFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLRRPSYTLGMKSLHGEFSASDSSLTDIQETQRQPMPDPGLMPLPDAAADLDWSNLVDAAKAYEVQRASLFAASDENHCPLSAASNSDQLEDQALAQMKSYSRLVTQWRGSPSCSTRHTQ	105112	164516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_105382_127348_127499_131499_131625_134340_134460_140290_140734_152838_153079_153838_154005_159256_159504_162525_162673_164204
912146	contig_18794_pilon	-	1902	10	Intergenic	novelGene_54653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	110.680833542128	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	543	1286	349249	325647	TRUE	55	GCCAAAAGCACATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFYELVTGVWEGKYNFFCQGTRSAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHVSMLNIWWFVMNWVPCGHCYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSVPSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCAFPLGWLYFQIGYMISLIVLFTNFYIQTYNKKGASWRKDYLKDHQNGSVAAVNGHTNSFSSLENHVKPRKQRKD	404610	306283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_306863_325609_325791_327577_327713_330070_330196_331983_332156_333060_333139_349159_349348_351621_351940_353145_353212_404550
912147	contig_1301_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_47397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGTGCTTCAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770943	769097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_769100_770900
912148	contig_6215_pilon	-	2089	2	Intergenic	novelGene_21240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	171	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAATATACAATCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684221	574579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_576594_684146
912149	contig_9937_pilon	-	2222	12	Intergenic	novelGene_129192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	201.110676325827	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	768	1640	59932	14456	TRUE	25	AAATCATTCTCTTTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSFTTGITCLGSVSALSAVMGVTLTAAIGGADMPVVITVLNSYSGWALCAEGFLLNNNLLTIVGALIGSSGAILSYIMCVAMNRSLANVILGGYGTTSTAGGKPMEISGTHTEISLDNAIDMIREANSIIITPGYGLCAAKAQYPIADLVKMLNEQGKKVRFGIHPVAGRMPGQLNVLLAEAGVPYDIVLEMDEINHDFPDTDLVLVIGANDTVNSAAQEDPNSIIAGMPVLEVWKSKQVIVMKRTLGVGYAAVDNPIFYKPNTAMLLGDAKKTCDALQAKVRESYQK	66254	13815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_14289_14346_14606_17373_17490_20228_20348_44130_44213_45066_45227_57847_58028_59866_60028_61158_61397_63472_63669_65136_65283_66162
912150	SIRV6	+	778	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	585	337	-30	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	5	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	45	ACGTAAATTTACACATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912151	contig_12626_pilon	+	5367	1	Intergenic	novelGene_80433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	433	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCACTCTCCCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120565	125932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_+_120600_125900
912152	contig_5389_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_143012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTTTGGTCTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275217	274345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_274300_275200
912153	contig_12622_pilon	+	3438	5	Intergenic	novelGene_5770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCCGCCGCCGTCGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100264	194570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_100365_100739_102726_103190_104370_125265_125348_194479
912154	contig_10904_pilon	-	3296	11	Intergenic	novelGene_22513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	343.760512566525	10	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	91	783	362437	352112	TRUE	25	AACACCATCTCCTTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YCISWSREDILSNTNGKTEGISVEEAEGAAMISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSRSHSFPGKQ	362527	345615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_347435_348716_348863_349527_349624_349922_350113_350832_350938_351954_352140_352530_352697_353957_354255_354560_354693_354962_354999_362403
912156	contig_6842_pilon	-	2902	1	Intergenic	novelGene_130835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTATTGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1825880	1822978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1823000_1825900
912157	contig_5463_pilon	-	3693	1	Intergenic	novelGene_144773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATATTATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23121	19428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_19400_23100
912158	contig_9609_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_22969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTGAGAAGTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274090	273072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_273100_274100
912159	contig_6497_pilon	-	5262	1	Intergenic	novelGene_35554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	2201	2677	139445	138969	NA	60	GGAAAAAAAAAAAGCCCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKLTQFCCYRKLSHCSPFNSTTCSCYCTGHLQGHLTLWGKLLRPDKRRHHPSPTSDWQLLRWPPSRVPNLKQYLKCFSNFIFILLYYHTIVYAYLTKTVTMKSFALIHLYKNKTPRHQKFYIYRLKILLTMLKCMQLIWGLSLIFIFLARQDHGNEH	141645	136383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_136400_141600
912160	contig_5968_pilon	+	3100	1	Intergenic	novelGene_112203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667005	670105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_+_667000_670100
912161	contig_5258_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_100238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	576	911	134364	134699	NA	55	CCTGAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWQFLKKLKIELPNNPAIPFLGLYPKDLKADIQKETCTQMFVAALFTIAKRWKQPKCPSTNEWINKMWYIHTMDYYPARRKNKVLIHATVWMELDDIMLSKIS	133788	135900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_133800_135900
912163	contig_9177_pilon	-	640	2	Intergenic	novelGene_32562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	69	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33324	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1879_32852
912164	contig_4364_pilon	+	1017	5	Intergenic	novelGene_561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	10685.6461520818	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	75	1016	1530895	1532300	FALSE	25	AGGAGATCACAGCGCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQ	1530450	1532301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160
912165	contig_1274_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_137774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAATAATGATTAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39595	42232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_39600_42200
912166	contig_8122_pilon	-	1377	2	Intergenic	novelGene_40211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCATTTTTCTAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363196	361689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_361774_361903
912167	contig_5779_pilon	+	4649	1	Intergenic	novelGene_106518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	117	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288676	293325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_288700_293300
912168	contig_7513_pilon	+	1057	3	Intergenic	novelGene_89016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGATGATCTGGGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673395	676854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_673505_673566_674372_676711
912169	contig_11285_pilon	-	1760	15	Intergenic	novelGene_5520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	117	junction_14	288.778320459391	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1560	199	1758	663668	655439	FALSE	55	CATGGAAAAGAAAGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEADCPTDLEMAAPKGQDRWSQEDMLTLLECMKNNLPSNDSSKFKTTESHMDWEKVAFKDFSGDMCKLKWVEISNEVRKFRTLTELILDAQEHVKNPYKGKKLKKHPDFPKKPLTPYFRFFMEKRAKYAKLHPEMSNLDLTKILSKKYKELPEKKKMKYIQDFQREKQEFERNLARFREDHPDLIQNAKKSDIPEKPKTPQQLWYTHEKKVYLKVRPDATTKEVKDSLGKQWSQLSDKKRLKWIHKALEQRKEYEEIMRDYIQKHPELNISEEGITKSTLTKAERQLKDKFDGRPTKPPPNSYSLYCAELMANMKDVPSTERMVLCSQQWKLLSQKEKDAYHKKCDQKKKDYEVELLRFLESLPEEEQQRVLGEEKMLNINKKQATSPASKKPSQEGGKGGSEKPKRPVSAMFIFSEEKRRQLQEERPELSESELTRLLARMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSERKPVGEREERGKLPESPKRAEEIWQQSVIGDYLARFKNDRVKALKAMEMTWN	665893	655436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_655484_655588_655745_656093_656250_656341_656456_656602_656645_656953_657096_657247_657382_657713_657825_658181_658303_658586_658652_661034_661191_661280_661365_661907_662084_663610_663736_665762
912170	contig_7357_pilon	+	1464	3	Intergenic	novelGene_36839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	267	659	139801	154782	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPILKKENESKHNFELPAALS	138818	155587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_139060_139775_139973_154561
912171	contig_10765_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_122893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	240	720	730	1449	84998	85717	NA	65	TAAATAATGAAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEKQTENMHAMALDVQDRFAEVSHSLMQKRETGHKSLLCRQHRSKTSRQVLIEERGVNTPQTNNWAFFSTSLSDEELQLGSVGQPWFGSWPEGPHTFICEQRPKKGRWRRQACPDGEGGLVTLISTSEGASGPGSSPELLIEKKLLIEDENLPSSTENIDSFIETNIFRSHLPGPDSPRSALVPTKSKRRQIRAFNLAPNFDLQGQAKNVKEREKGVQLTESHGLKLIWEAEEDRLSE	84268	85718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_84300_85700
912172	contig_17427_pilon	-	2443	12	Intergenic	novelGene_30366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1161.66908276464	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	13	1104	188879	179167	TRUE	25	ATACCAAACTTGCTTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTEITVRNSVWCSMTWWALWR	188891	176960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179430_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
912173	contig_7297_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_169691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTACTCTCATTGCTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13169	10556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_10600_13200
912174	contig_17912_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_177350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112161	111129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17912_pilon_-_111100_112200
912175	contig_9668_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_58140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311545	309326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_309300_311500
912176	contig_11258_pilon	-	1676	4	Intergenic	novelGene_67830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	163.403386337819	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	7	24	394	417	354760	337069	TRUE	30	GACCCTGCAGATATTCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPG	360585	329598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_330660_336870_337074_354741_355099_360530
912177	contig_8412_pilon	-	1172	2	Intergenic	novelGene_118371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCGATTCATGAACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680251	618793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_618920_679205
912178	contig_8729_pilon	+	2345	2	Intergenic	novelGene_40134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	18	341	612830	613153	TRUE	0	GCTGGCTTCTTTTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFDRYMSGQTSPRKQESEAWSPDACLGVKQMYKNLDLLSQLNERQERIMSEAKKLEKDLIDWTDGITKEVQDIVEKYPLEIKPPNQPLAAIDSENVENDKLPPPLQPQVYAG	612812	615215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_614171_614228
912179	contig_6361_pilon	-	2309	4	Intergenic	novelGene_24012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	17	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1733	2071	420979	415399	TRUE	45	GAAGATTACATTTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	422711	410981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
912180	contig_13932_pilon	+	3699	1	Intergenic	novelGene_168862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7758	11457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13932_pilon_+_7800_11500
912181	contig_9924_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_175922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29961	28148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_28100_30000
912182	contig_12293_pilon	-	3284	1	Intergenic	novelGene_165587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	853	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1279	1644	14052	13687	NA	70	TAAAAGAAAAAAACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCTISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFSSVFSMNLSIFASCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSSVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	15330	12046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_-_12000_15300
912183	contig_7744_pilon	+	1705	7	Intergenic	novelGene_62534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	55.3644490826218	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	719	1366	829457	830740	TRUE	10	TACCTCTGGTTCCCTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFQFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	828738	831128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830533_830628_830988_831036
912184	contig_3601_pilon	-	3945	5	Intergenic	novelGene_132842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATATCCCCTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391433	123554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_125486_249180_249298_348774_350025_351119_351404_391070
912185	contig_6885_pilon	-	3590	1	Intergenic	novelGene_83641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACAACTTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131278	127688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_127700_131300
912186	contig_10609_pilon	-	3289	1	Intergenic	novelGene_123931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	325	741	369174	368758	NA	25	ATAGGGCCGCTACGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSCGTLSDRVPEDEPPRLEGTQNMTGEELSPQSRVDLNDTDGVKFLRPSFADVAGLKMRTNSCKHPLIMRTWNVKKLEFVKNETEGIKIDILDIGELKWTGTGHFESDNHIVYHARNDKLKRNGVAFIVKRTFQDLS	369498	366209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_366200_369500
912187	contig_2854_pilon	-	3632	9	Intergenic	novelGene_120860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGGGGGTCGTAATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926129	480704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_481128_576207_577000_613566_613582_658347_658613_743156_743795_762344_762359_790263_790555_918337_918784_925381
912188	contig_17074_pilon	-	3350	3	Intergenic	novelGene_145202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2712	3107	657812	657362	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTVLHTILSQIQSRRWDLAPGAMVSTALRIRLLKKASSFLEGLVRYFGISLGLDLACWWGPLPCCFLPPEPGFGRYYTFEVGLLPQGNSTLGVWGRTFCQLHKHRRIAFEIRSIAGKKINSSGQVYNNL	661306	657118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_657597_657651_659933_660715
912189	contig_1172_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_162037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	995	1540	636286	635741	NA	5	CTCCTTTTCTGAGTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNPGELVTRLQYLNCLALVRNNQQAALHCSLVFRCELDQSQWPRPCSSGAPADIHCPPTQSPLSSVPQALPLARPVRSGKRSPSHATCPHKSTHQATWTVYTSGRTWECPCRAAPARLTERRWRLGACRLPAEIESSTQVTHSQHSEPKHTPGTDLGRRENKKDTPVCYRAEGPTFLCG	637280	635053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_635100_637300
912190	contig_4964_pilon	-	3041	1	Intergenic	novelGene_157259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACACATTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149966	146925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_-_146900_150000
912191	contig_4900_pilon	-	1650	7	Intergenic	novelGene_159067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	25	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	135	722	1188120	1180921	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGDRWGERTLSSFNQDKPWLHTQEALG	1188254	1179992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181001_1181662_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
912192	contig_6182_pilon	-	3686	2	Intergenic	novelGene_171652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1256	1618	194394	194032	TRUE	75	CATAAAATAAAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKEEIQAALKALAKNKALGIDVIPVEMFQQTDASLEVVTHLYQEIWETAICPTYWKIYIFVPTQNKSDPTKCRNYQTILLISHANKILLEIIQKWLQQYTDRELPENQKRTWKVRYHC	195649	109427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_110897_193432
912195	contig_19606_pilon	-	5065	2	Intergenic	novelGene_148274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	186	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4714	5019	47441	46891	FALSE	25	CATACTATTTTCAGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGITLQRMGIPEHLIVLMWNLYIDQEAVVRIQQGDAAWFKIRKGVRQGWILSPYLLSLCAEQIIREAGLYEEECNIRIGGRLINNPRYADDPALLSENEEC	52154	46844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_46899_47143
912196	contig_12638_pilon	-	3020	4	Intergenic	novelGene_33122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGGATCTAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175703	170914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171069_171681_171746_171970_172044_172974
912197	contig_3015_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_163322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACGTTATGTATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306394	305392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_305400_306400
912198	contig_6005_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_158886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACATCCGTTTGCCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312098	309790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_309800_312100
912199	contig_12864_pilon	+	4957	1	Intergenic	novelGene_76457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329847	334804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_329800_334800
912200	contig_5669_pilon	+	4352	1	Intergenic	novelGene_86032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCATCATTTCCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4095	8447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_4100_8400
912201	contig_7275_pilon	+	1732	5	Intergenic	novelGene_111237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	49.4640020621057	65	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	9	779	279027	390154	TRUE	35	AAAGATGTTTAAAGCTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFMLAQSSPPLLRSGGGSLPPGSRPTGARATMGGKQSTAARSRGPFPGVSTDDSAVPPPGGAPHFGHYRAGGGAMGLRSRSVSSVAGMGMDPSTTGGVPFGLYTPATRESSDSERAPGGGGSASDSTYAHGNGYQETGSGHHRDGMLYLGSRASLADALPLHIAPRWFSSHSGFKCPICSKSVASDEMEMHFIMCLSKPRLSYNDDVLTKDTGECVICLEELLQGDTIARLPCLCIYHKSCIDSWFEVNRSCPEHPAD	279018	392276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_279538_377478_377575_388334_388441_390096_390189_391357
912202	contig_18919_pilon	+	3053	1	Intergenic	novelGene_156036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACTCCCGTAAACACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146900	149953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_146900_150000
912203	contig_11055_pilon	-	4781	11	Intergenic	novelGene_142170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	107.337272184456	568	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	672	2684	173653	132739	FALSE	20	AGCCATCTACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEEIKYQQMMGQKEKSDQEYVKQLIEEMEKDRDQLLTEQDKTLALNSQETMAFKPIMEAPICLIENQNEQLMVNPKALKILDKISQPVVVVAIVGPYRTGKSYLMNRLAGQNHGFCLGSTVRSVTKGIWMWCIPHPSKPNHTLVLLDVEGLGNVKKSDPKNDSWIFILAMLLSSTFVYNSMKTIDHQALEQLYYVTELTELIRAKSSSRADEVEDSTEFVSFFPDFVWTVRDFTLELKIDGNPITEDEYLEDALKLIPGVNPKIQNSNLSRECIKNFFPKRKCFVFDQPTRDNNLLHQIEGVLEEKLDCNFQVKLKNFCSYIFSHAKIKTLREGIVINGNRLGTLVETYVDTINSGAVPCLEDTVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKQMAQCMRFPTDTLQELLDVHAACEREAIALFMEHSFKDDKREFQKNLMETIEKKKEDFMIQNEEASEKYCQVELKKISEPLMASISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKFEQNYARVPRKGVKANEVLQSFLQCQAPIEEAILQSDRALSDSEKAKAAMQAKKEAAEKKQELLKIKNQEQQKKMKAQERSFKENMEQLKQKIEREIENSLRDKEKMLEHKQKVQKELLNEGFEKKSEMLNKEINQLREKIETTKKNKNSWFSKALDTAGPILLKALPLLIIAAIKLY	174324	130641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_132937_133843_134038_134375_134479_139218_139432_151331_151613_152535_152782_159355_159553_159753_159864_162131_162260_167701_167898_173506
912204	contig_1143_pilon	+	2399	2	Intergenic	novelGene_86565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTTATCTACAGTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79075	102980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_79275_100780
912205	contig_16098_pilon	-	1478	6	Intergenic	novelGene_45984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1966	junction_1	914.353454633382	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	22	1326	350491	348441	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	350512	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236
912206	contig_15105_pilon	-	1321	6	Intergenic	novelGene_151015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1195.08014793988	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	39	650	839916	829338	TRUE	30	TAACGTCTATTTCATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839954	828351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_828853_829167_829398_831006_831085_831461_831509_836187_836548_839849
912207	contig_5317_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_76559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36679	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_36714_43219
912208	contig_7201_pilon	-	741	3	Intergenic	novelGene_152528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	43	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACCGCTTCGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344835	341838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_342258_343525_343710_344697
912209	contig_7775_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_37507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	262	573	311050	310739	NA	60	CACAATAAAATCCAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTQAVVFSIASYTCESWTMNKEDQRIDAFELGCWQRILNMPWTAKRTNKSVLEEIQPGCSLEAGMAKLDLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRKRGRL	311311	310062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_310100_311300
912210	contig_4962_pilon	-	4256	2	Intergenic	novelGene_107396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3579	3941	441560	440816	FALSE	25	AGCTAGATCCACTTCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKGYFQAKRKLTQDWLQGTRSLEEKRLSPAVGPQMTGSCVQAFQRQEHRNLTQPQPGRTSQRSLRTECQGRSLQQMQIVRQSGEFYRKESAGNRSLLVAPQGCSEARECLLFGLQAQQA	445138	440500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_440984_441365
912211	contig_10973_pilon	-	1889	1	Intergenic	novelGene_150371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	695	1207	2730	2218	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3424	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3400
912212	contig_14158_pilon	+	2777	2	Intergenic	novelGene_136129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	2474	2776	32858	33160	FALSE	70	AAAAAAAAAAAGCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCAKAPGKLKHRQEDVKWHPWQDWVPRHSGPRAALTSVGPRVCLQTVFRRKHSGHCLPHMPGKQPSTLAPFMEPNSHVSISLGRCGSSRNKSQEATGSAT	29589	33161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_31127_31921
912213	contig_1443_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_28158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	696	1139	314046	314489	NA	40	CCTTCCTTTGAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRRTRSLFLFLLLTLLGLVLVQPSYGQDRMYQRFLRQHVDPQGTGGNDSYCNLMMQRRKMTTNRCKPFNTFIHENIWNIHSICSTTNIQCKNGKMNCHESVVKVTDCKETGSSRAPNCRYRAMANTRRVVIACDGNPKVPVHFDK	313350	315545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_313400_315500
912214	contig_16125_pilon	+	4490	3	Intergenic	novelGene_155213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1255	1800	50321	50866	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVGIQNKTPDDLPVEEKAPDLTDTEFKSLIFGIILELKKKQTKMRKKIDKFMEKADKFMGNTDKKMEEFKKIIQEQNAEINSQLEAIQKQQLKIQKINKISKMTSVIEGLRNRFEMMEDRISEIEDKHLDTTLFEENLEKRAKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTENTDDH	48853	53753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_49673_49885_50978_51174
912215	contig_9389_pilon	+	2532	4	Intergenic	novelGene_84146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	26.0426999794995	131	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	326	2257	1851642	1853941	FALSE	20	CCTTTGTGTTATAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFVRNNSWYTVLGEICEFHGIEEQHNNQGSHVRRLTVGLCESKEGKVKQRKEGTQCGEPFSKIAHLTSFKRTPARENPSEFRECGKAFKYHSSFKRHLRSHTGYDNYEFKECGVACSCTSYLRTHVKTLTGQKIYKCKECGITCSCSSSLTTHVRSHGREKPYECKEFGKALGEFSALIEHKNVQSGKQPYDGKEYGNTFSSFSSFSKHISIDSEVRPYECKECGKAFSKSSELTSHIRTHGDQPYKCKECGKAFSCASSLSKHKRIHSGERPYECKECGKAFSRSSNLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRYSSSLSKHKRIHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLITHIRSHSGERPYECKECGKAFSCASHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSSNLMNHIKTHSGERPYECRECGKAFSQLSKLTGHIRTHSGEQPYDCKECGKSFCDSSSLTTHIRTHSGERPYTCKECGKAFSQSSHLINHVRTHSGERPYKCKECGKAFSRSSHLTNHIRTQRGERPYECKECRKAFSWRSALNTHVRTHRGEKPYKCKECGKAFSQSSHLINHVRIHSGERPYECKECLKAFSQASSLTQHIRTHGGERPYECKE	1838039	1854216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1838067_1841812_1842061_1851591_1851743_1852110
912216	contig_16411_pilon	+	1662	4	Intergenic	novelGene_77349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	680.682500632025	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	67	558	238160	241370	TRUE	80	GAAAAAGAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	238093	242801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_238336_240227_240376_241202_241778_242104
912217	contig_5375_pilon	-	3490	2	Intergenic	novelGene_169196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1645	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60433	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_662_57604
912218	contig_9972_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_162792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	106	300	249441	249247	NA	40	TTTCTACAAAAAGAAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKHGPWSLRHPRTGTVSKANSSDRDWAELQDIRVMLVRSVPLRQVDIGDQGGWLLSGGEGEGRESWELVGCSWGVGGEGEKCAVAEWGERLGSHNNVC	249546	248833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_248800_249500
912219	contig_8312_pilon	+	2917	2	Intergenic	novelGene_152906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1652	2029	1561522	1561899	FALSE	30	AAGCTAGTTTCTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHPFWKMIWRFLRKPEIEISYDPAIPLLGIYPREIRAITRIDISTPMFTAALFTIVKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIENNDESAKSLTTWMNLERIMLSEISQSQKDKYCKRPLV	1377454	1562787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_1377553_1559968
912220	contig_19606_pilon	+	5606	1	Intergenic	novelGene_148273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	4404	4853	50807	51256	NA	35	TAACCAAAAGGTCGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYIPTTHLQESDSERLKMDGQRNTKQMQTIRKQEMCSCYQARQNSGPKALHETRAIKITTKEHFIMLKAANDNEHTTSNNVLNITVAHSKYKKHMDKDRKTSTKKLNLSLSVQDGSSDQKISKVIEDLKNKISNIDFLNIYNKLCSLI	46403	52009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_46400_52000
912221	contig_10404_pilon	+	860	4	Intergenic	novelGene_138682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2378.22964034641	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTACTGCTGGTCCTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097979	1100322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098110_1098197_1098309_1098722_1098859_1099839
912222	contig_7593_pilon	-	1082	2	Intergenic	novelGene_127322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACTCTATATCTTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445869	442274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_443227_445739
912223	contig_5095_pilon	+	2103	16	Intergenic	novelGene_74930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	55.414639060651	46	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	367	1863	103037	275154	FALSE	10	TTTGTAATTCTCCTTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFRQENVEDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFLKQILSGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSVGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEEEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKPKDTQQALSRKASAVNMEKFKKFAARKKWKQSVRLISLCQRLSRSFLSRSNMSVARSDDTLDEEDSFVMKAIIHAINDDNVPGLQHLLGSLSNYDVNQPNKHGTPPFLIAAGCGNIQILQLLIKRGSRIDVQDKGGSNAIYWASRHGHVDTLKFLNENKCPLDVKDKSGETALHVAARYGHADVVQLLCSFGSNANFQDKEEETPPALCRLARLLLCGQSPL	101820	275394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_102079_102928_103099_225547_225770_260648_260788_262586_262717_262867_262917_263004_263032_263531_263685_264030_264077_265364_265455_267551_267645_270253_270374_271258_271358_272176_272276_273986_274086_275085
912224	SIRV6	+	1079	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	575	262	359	-127	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	71	562	1733	10736	TRUE	25	GTTTAGAAAGTTAGGTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1662	11563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912225	contig_3948_pilon	-	3558	14	Intergenic	novelGene_53283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	137.214857649466	7	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	16	1278	1458393	1422795	TRUE	10	AGTATGGTCCCCCCTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLSWSLLLLSLICETRAFYVPGVAPINFHQNDPVEIKAVKLTSSRTQLPYEYYSLPFCQPRKITYKAENLGEVLRGDRIVNTPFQVLMNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVICECPAGPGVGLSHEEHGGLILRRGCLCHMPPEEQVVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMG	1458408	1415071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1417199_1419325_1419410_1422641_1422711_1422794_1422881_1423672_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1435012_1439634_1439749_1458390
912226	contig_9653_pilon	-	5547	1	Intergenic	novelGene_48321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2147	2449	1025519	1025217	NA	70	AAGGAGAGAAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLIISEQVKFVLFCSKWMYVLSGYFCVIGLSGRPGMPYSRTDEERPQPSWITSITTDCRLHHGQFLLGLYFISPQYVSFGEFGKIIMLSFLWNTVYL	1027665	1022118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1022100_1027700
912227	contig_854_pilon	+	3220	13	Intergenic	novelGene_36707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	4011.8295563108	166	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	55	1938	1705343	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1705288	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715052_1715192
912228	contig_1759_pilon	+	4474	2	Intergenic	novelGene_171339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTTTTGCTTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77402	82099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_78148_78370
912229	contig_11551_pilon	-	2777	2	Intergenic	novelGene_168465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGGGCTTGATAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368275	365083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_367178_367592
912231	contig_16496_pilon	-	964	2	Intergenic	novelGene_5185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_807_3437
912232	contig_15867_pilon	+	1755	17	Intergenic	novelGene_170881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_4	30.9858208500275	120	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1662	94	1755	42776	72823	FALSE	15	GTAAAGTCTGGGGCTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVWDLTFDKRKTLGDLRQSIFQLLEFWEGDMVLSVAKLVPAGLHIYQKLDGDELTLCEMEIANGEDIFVWNGVEVGGVQIQTGIGCEPLLLNILHRAASSEGERCQQLIESAHVFPSNAEMGTIFTALSIPVGVILISSAESTGEESWTAVPREDVKKTFREQGLSNGSSVLIQDSNGDDYSVLTKQGRWSTGSNATNWVQVKNVCQLESEEKQVRIAATSNTVVFDIRIKAIKELKLMKELAENSCLRPIDRNGKLLPPVPDSYTLKEAELKMGSSLGLCVGKAPTSTQLFLFFTVGSDVQPGTEMEVIVEETVSVRDCLKIMLQQAGLPGDTWHLRKMNWCYEAGEALREGDATLKELMLCSGDTLVLMEGTLPPPGFLKVPIWWYQPWDPAGRRESQQGRVNSAASQDGAWRATSSQGVPSNVRTEGTLRYLGDVEILEDATLVDLKCQAITLPSFSEFAVPSPAFLRAWTMESKRPGRLLRSDQQQLKECKLGRRTEICLEPLQKKENLGPQDLLLRTQMRLPGERSYSLPEDMVWDTVRSCTAASLRQKVADFYSLPVEKIEIAKYFPEKFEWIPISSW	39088	72823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_39158_42751_42837_43798_43870_45588_45912_47555_47680_49087_49146_56561_56616_57407_57497_58759_58847_61254_61292_63453_63519_65548_65624_67369_67497_67830_67926_69190_69310_69687_69754_72612
912233	contig_8050_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_114839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACTCAGCAAATACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340018	342452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_340000_342500
912235	contig_1986_pilon	-	942	1	Intergenic	novelGene_64135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATGTTGGGCATACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337671	336729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_336700_337700
912236	contig_9363_pilon	-	1319	9	Intergenic	novelGene_6763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	573.353021706522	6	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	339	938	1546072	1505706	FALSE	10	CCCAGTTGTTGTGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTLSRLPANPKGPLGLEPGSTGPSGSLRDEEFLHHPNDSSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITGQPLPLHLSWVPILYTLLTACTCPSSHGSYLN	1549051	1505324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505804_1539104_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547723_1548933
912237	contig_12919_pilon	-	6705	31	Intergenic	novelGene_75878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_8	110.508199796315	254	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1243	3729	2977	6705	648297	637221	FALSE	25	AGGTCCTATTCTTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSGPYSDATENSQLSVKISGMEIKSSGKRDSLLAQKKDTKENMKPPTKLKRESLSTKIKNEMLLEEEKSTDFVFIPPEAKEAKERILTEHQKEVLKTKRGDIPAMYNNLDVSQDTLFSQYSQEESMGVPSLTEKPKEDSRMRIKEEQMESGVIVSQNVMENCGMDEHLEKASLSHKECGSVEETSPEILSNNTDARRKSLISSKKTSAERASSIENTFVVSSSSVSNAAVSGTPPQPTSRRQTFITLEKFDGSENRPFSPSPLNNMSSTISVKNNRESMTKADIPPKTKRREVTVSKSDSEKIVNGIKRLGRRSSKAEQTGNKRSKPLLRSEQEKNNQEFIDGMVALEYNPPGLLNQTDCVSDNQACLPESTMEYEDTRFKPAVENAIVLEHSVEEKNLGINLESKENTPPVIIPADQMVNEDNQIPITPSQKTLRRSLRRRSEIAESIPDSQDKENNHQKKERRKEEEKFIQKSPVPAKDDMLPKHQLISEQAVQENLIEKGNNLHEKTFGETSSNTEIDQNRRKPDLENIKSEGDGVQDTADKSSEKPIRGRTRYQTRRASQGLLSSIENSESDSSEAKEEGSRKKRSGKWKNKSNDSVDSEDQEEKMVKQECIKVANQAHDTKISSEVDISKTCDKKDESSTAPLQDSTTASDLFEGEDVPNTHEGKSKTNRCAEYSFTSPSVPESNLRTRNANKRLHKRDSSENNSVGETSRTGTSDISLLSEKTLQTLECQHKRSKRVRRSKGCDCCGEKSQPQEKPSKNAENYDIKISETKKTDLQTAVAISETSKANLYSEVELSDEHHSVNFHSGLKEENDNDSSVVLETDLKENTIQESHPSEIVNFKEEICDMDSSEAVSLESQEPSNKEFGTVAPCLDDSKDVSQEEKPEATPKMEPCLENIVSFEVNSCKVKESNLGEIEVTELNLEGNKSETTFSEQENAQTDISEKETTEEKNEGSSDSEADTAEELNVKEAATEKFNSGCVHSGTTTPVKKSAQAEISDPTAVGEPDGGSDKCDPGSSEKVNVELENREEAVVGEVNAETDCFNVTEAGSMTTKTTKPEEAETERLNAEIDSCVPHILEMNTEEGRIDSNKTEKSIELNKSEETKLGDNQMLVDNYDETLEEAHHTSEKVEESPESLTSETAISELITEENLSPQKLRELDPCLVSANDSPSGVQTRCVWSPLASPSTSILKRGQKRPQEDEIPSPVNKVRRVSFADPIYQAGLADDIDRRCSIV	683911	637220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_637299_640938_644149_644518_644574_644667_644749_645115_645268_646904_647025_648264_648365_648909_649109_649691_649735_652475_652741_654779_654880_665193_665344_665700_665809_666746_666928_667154_667229_667875_667939_669617_669719_669995_670059_670788_670900_671132_671307_671991_672107_673449_673602_674447_674587_675459_675553_677549_677740_678656_678752_678848_678977_679888_679986_682512_682592_683331_683446_683836
912238	contig_5997_pilon	+	4235	2	Intergenic	novelGene_168608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	188	307	137851	137970	TRUE	15	AGGCAGCATTTTGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILSQSSRLQVEIQGISSRGTPSPSALEEGPCHQSPLGLGASLHRTLRSKGCTLFPVLLSWVMRFPCASARFSLLYLRRDWLKTLFNLVYLIGITTANMVI	137663	142677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_+_138634_139412
912239	contig_2703_pilon	+	4441	13	Intergenic	novelGene_101803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	35.36034737763	149	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	285	1691	761416	778625	TRUE	40	AAAAAAAGCCTCTGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDARICAFLWRKKWLGQWAKQLCVIKDTRLLCYKSSKDHSPQLDVNLLGSSVIHKEKQVRKKEHKLKITPMNADVIVLGLQSKDQAEQWLRVIQEVSSLPSEGMSEGNQCVPDTQRLSCQKLEIAEKYLLAAEYGGCIDGHPEVPETKDVKKKCSAGLKLSNLMNLGRKKSASLEPSERALETSSYLNILVNSQWKSRWCSVKDSHLHFYQDRNRSKAAQQPLSLVGCEVVPDPSPDHLYSFRILHNGEELAKLEAKSSEEMGHWLGLLLSESGSKTDPEEFTYDYVDADRVSCIVTAAKNSLLLMQRKFSEPNAYIDGLPLQERQEELYDDVEMSELTAMLDPTEEDTLGPDAPCASKPDRVYLDLTPIKSFLHSSGSIQAQATSPSLPCLDDPAEAFPVTLGTTVDTTHLESVSPRPKAASPIPVPDCTPVNSATALKNRPLSVMVTGKGTVLQKAKEWEKKGTS	761131	782236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_761512_762750_762931_766149_766240_767835_767921_768661_768767_771102_771315_773183_773330_774063_774176_774800_774978_777393_777448_777564_777688_778598_779953_780813
912240	contig_17344_pilon	-	5633	20	Intergenic	novelGene_169589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_12	54.142369008787	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1082	3249	116	3364	101818	59988	TRUE	20	TATGTGGACATGTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQADPLNEDVLLAMEDMGLDKERTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRVGAPSMPRAMAFQTPVNIQAEQASTTVNISVPQVQLINPENQIVEADGTVNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGVSPQAQFLQVAPNMNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLLNGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESSDGEPDQEAVQRYLANRSKRHTLAMTNPTAEIPPDLQRQLGQQPFRSRVWPPHLVPDQHRSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAASIQAFKAHLEKMGNNSSIKQLQQECEQLQKMYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPSPPLQATCENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMNSAMIQSHGAASPSQFPGLPSRSAIFQQQPENCSPPPNVALTCLGMQQPTQSQQVTIQVQEPVDMLSNMPGTAAGSAGRGISISPSASQIQMQHRTNLMATFSYGHRPLSKQLSADSAEAHSLNVNRFSPANYDQAHLHPHLFSDQSRGSPSNYSPSTGVGFPPTQALKVPPLDQFPTFPPSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPAEFAQLIKRQQQQRQQQQQQQQDYQELFRHMNQGDAGSLASSLGGQSMTEHQALPYQNADSYHHHHTSPQHLLQIRAQECISQVSSPTATHGYAHQPALMHSESMEEDCSCEGAKDGFLDSKSSNTVTKGCRDSPLLLSTGGPGDPESLLGTVNHAQELGIHSYRHQPTAAFSRNKVPSRESVIGNCMDRSSPGQAMELPDHNGLGYSARSSVSEHHRPRTLQRHHTIQNSDDAYVQLDNLPGMSLVAGKALSSARMSDAVLSQSSLMGSQQFQDEDNEECRESLQGHEHPDLTDGSQHLNSSCYPSTCITDILLSYKHPEVSFSMEQAGV	101933	56953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_59210_59974_60146_61056_61190_62082_62247_71701_72589_73225_73566_74598_74709_75176_75263_75535_75662_76397_76549_80322_80467_82686_82758_86125_86282_86545_86700_88138_88249_88340_88419_88840_88982_89234_89346_89909_90029_101808
912241	contig_5317_pilon	-	3045	2	Intergenic	novelGene_76613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGTGTAATGTCTAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765704	760779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_762564_764443
912242	contig_151_pilon	+	2745	1	Intergenic	novelGene_132560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAATCGACTTGATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163627	166372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_163600_166400
912243	contig_1406_pilon	-	985	1	Intergenic	novelGene_25501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTCTCGAACAGCATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1414276	1413291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1413300_1414300
912244	contig_10339_pilon	-	2355	6	Intergenic	novelGene_125275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_5	26.8596351427193	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	233	1138	357260	332025	FALSE	40	AACATTTTGTGTAAAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQCGKCIGPALLRFTYTYSRDRILSGEGTSGFLHTNSKRRSAPTLRLFAAELPRRPAALCWTGNAGAERRRPTLQEMAAGLLKTSSLSARTKLLPQMGLSPYNTSHGFFEEEVKKKLQQFTDGSVDLQKEDSGIGILTLNNPRKMNAFSGVMMLQLLEKVVELENWTEGKGLIVRGANNTFSSGSDLNAVKALGTPEDGVALCMFMQNTLTRFMRLPLISVALVQGWAVGGGAEVTTACDFRLMTPGSEIRFIHKEMGLIPSWGGTTRLIEIIGSRQALKVLTGAFKLDSEKALNIGLVDEVLQSSDETQSLKEAREWLQQFIKGPPEIIRALKKSVSSGRELRLEEALLTERDLVGTVWGGPANLEAVARKGKSSK	366796	330807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_332434_346586_346668_348532_348586_354102_354246_357040_357263_366566
912245	contig_13021_pilon	+	5129	32	Intergenic	novelGene_8117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3052.50633957962	21	46	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	3014	4747	174676	180767	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSAAGTDTLQAKGVDSIPLEIGKITIEVTLVCLREILGQKLRMVFTVLLQIIPMGALEVILCLLVYRPVLGLVIQQGLTRTVMIALSNMELMFQIYTMV	147801	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_148147_148412_148487_148779_148925_150111_150269_151769_151844_151958_152130_152920_153049_154323_154417_155194_155333_157299_157478_158091_158224_158406_158517_160044_160225_160916_161043_163205_163323_166456_166569_169578_169690_171696_171824_173610_173970_174539_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180474
912246	contig_12622_pilon	-	1903	2	Intergenic	novelGene_5773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATGATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194583	102569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_104370_194480
912247	contig_16970_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_157616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAGCAGTTGAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193282	191255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_-_191300_193300
912248	contig_9836_pilon	-	6122	5	Intergenic	novelGene_176158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	495	165	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	3672	5258	26775	25189	FALSE	35	TCATGGAAGCCCCATAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIAKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKRIHHDQVGFIPAMLGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQQPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIPKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLEINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPHSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKVLLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYINQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTKNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFG	245126	24324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_27266_29934_31502_224588_225622_225805_226270_245009
912249	contig_6740_pilon	+	1050	1	Intergenic	novelGene_142653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	495	812	29871	30188	NA	55	AACACTAGAAAGAGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGAAILILGKIDFKTKSTIKDKEGHYMMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYINSNNTEKRNWQFHNNSSRLQHTTLSKGQNN	29376	30426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_29400_30400
912250	contig_17144_pilon	-	2519	14	Intergenic	novelGene_29386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2102.2601925451	2	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1143	2228	170784	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176188	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172615_173152_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
912251	contig_12250_pilon	+	3218	8	Intergenic	novelGene_80577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_7	68.5788686439912	243	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	224	1492	311980	313990	FALSE	35	AGCCAGCATGCCACCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQLQDMLSWMQPGVSITSSFALSQYGVDMGWTLPECSITDSVTMTQPMEPNPPQQPRLALGSSLPNTKHSPHFPQEPASRTHPEPLTGHHFNLAPIGRRRIQSRWASTRGGHKERPTVMLFPFRNLGSSAQVISKPENRRQHWTHTADPACAVGTRTASAGKPKCPSQHLGGRALKENPVGSSASEQKENCLDCALDPLKLSLSPPRTRKPASSPSLCSPIITIGDLVLDSDDEENGQREGKVSRMEQKDGEGDG	311756	315716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_312793_312871_312969_313132_313596_313684_313753_313856
912252	contig_5389_pilon	+	2328	5	Intergenic	novelGene_143022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	146.937912058121	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	24	1142	410753	425398	FALSE	25	TAGCCCCATTTCGAAGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEVKSEQERGSRRRHRDGDMVAAATVVVKQERLSPETVPPSHRRPDSSGHSPSSPAGEPGRPGHRGNRSRGSSRSPARKKSKSSGRRSKSPRSKRSRSPHHSAVKVKQEREDHPRKGREDRQHREPSEQEHRRARNSDRERHRVHSHQRRTSNERPGSGQAQGRDRDIQNLQAQEAEREFYNARRREHRQKNEVSGNDNDSQELVPRPGGNNKEKEVPVKEKPSFELSGALLEDTNTFRGVVIKYSEPPEARIPKKRWRLYPFKNDEVLPVMYIHRQSAYLLGRHRRIADIPIDHPSCSKQHAVFQYRLVEYTRADGTVGRRVKPYIIDLGSGNGTFLNNKRIEPQRYYELKEKDVLKFGFTSKLRNDSNY	410729	426584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_410977_413027_413131_423555_424155_425105_425267_425366
912253	contig_5628_pilon	-	3815	15	Intergenic	novelGene_157577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_14	47.4544357187793	143	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	1137	2285	427589	410984	FALSE	70	GAAGGAAAAAACAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEKGSAAGSEQNLMCSFLQLLGDRWGRNGPRGWCVIPSDDPFVLYIYAAPQDMRAHTSIPLLGYQVTAGPQADPPGLPAAAVRPAVHVQG	434510	409453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_411104_411655_411803_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266
912254	contig_10981_pilon	+	2351	3	Intergenic	novelGene_178908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGTGTTGCTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31996	259878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10981_pilon_+_32190_130845_131921_258795
912255	contig_14219_pilon	+	1493	2	Intergenic	novelGene_54358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	10	junction_1	0	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864354	868490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_864936_867578
912256	scaffold_19766_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_34392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGGAGTTTGGATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813023	810763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_810800_813000
912257	contig_16846_pilon	+	2478	5	Intergenic	novelGene_82908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.4693443182191	11	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	868	1248	477366	477746	FALSE	50	ACATTTCATATAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQAPPLKMTPSSLAHCSEAGHISKCWAGAESQTWHWRAGILPKVLEHLKVVNPLSFQKPRLQPSQLQPWMSLIPIKGKIWLELLRGRGVGGGMAPPLVLLLGSGARGCGGREGSITRYDQQIFN	456126	478976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_456438_464055_464156_465206_465311_475327_475478_477163
912258	contig_4125_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_25048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTCGCAAGCTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210070	212023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_210100_212000
912259	contig_2278_pilon	+	4007	1	Intergenic	novelGene_118127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAAATATTTTGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023544	1027551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1023500_1027600
912260	contig_14640_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_168046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAGAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342856	341573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_-_341600_342900
912261	contig_9321_pilon	+	2738	1	Intergenic	novelGene_174723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2295	2672	50854	51231	NA	25	TAGAATTGGCATATTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISKHTVWHTLTVIDLVIYSCTTNYPKTFWFKTITILLSLTILWVDWARLGSSSVCDVGWGCSHLRVDRQECPRWITHRSGALVGQLEGCAQLGRLDFSPHLVVSFSMWLLHMASPRGLKQGSWT	48559	51297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_48600_51300
912262	contig_15135_pilon	+	5041	1	Intergenic	novelGene_119890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTGATCAAGTTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115013	120054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_115000_120100
912263	contig_8544_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_55933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	176	472	154749	154453	NA	75	AAAGTACAATAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLNIKQQNELQVDCTYVNVKSRTSKFLGDRRWKYLYDFKVGKDFLNCTQKSPNTKELMDHSYHGLHQTESSTTRWCPATTDYSDGDHNRGSCTELEKDVEQNCNSQKKKTRFTGLTDWRNPESMAPGHPFSSVVKPLLKFTVQPGIGQPHKTKQD	154924	153911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_153900_154900
912264	contig_7962_pilon	-	3173	3	Intergenic	novelGene_149290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	21	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	182	685	147459	131705	FALSE	45	AGCTTATATAACGGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQWNVLRTVSGLVHRTCLEPPKAGVFGHFQSIKGLLLLYNAESKVVLVQGPQKQWLHLSSAQCVAKESKSFIAQPPLLGAFHCKQWEQNILSKRIVSSSATSQGTPTGKKEEPDPLQDKSISLYQRFKKTFRQYGKVLIPVHLISSGVWFGTFYYAAIKLQHLPDIL	193597	129216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_131733_146983_147501_193457
912265	contig_7398_pilon	-	4742	1	Intergenic	novelGene_166157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTGGAATTTGCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123410	118668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_118700_123400
912266	contig_1986_pilon	+	2889	1	Intergenic	novelGene_64156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCCGTAAAGATTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395362	398251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_395400_398300
912267	contig_6914_pilon	-	2808	16	Intergenic	novelGene_151749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1481	1939	166599	163582	TRUE	20	TTGCGAATACTGCCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPDGLVVVIHRPKLLHMGTGQDLFVQYLSLSIFALFQVTGSLVVLGPGYIRVVWPQLPFIDGQSPPVIALHGLILALVLAQQGQVVQLLCHIWVVSTQDLFTNLQCPLAQWLRLLVFAPFAVEHSQIIECGSHSRVVPAQGALSDAEGIIQ	170627	156981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_157007_158826_159108_160367_160604_162201_162282_162869_163085_163549_163639_165457_165557_165772_165947_166271_166374_166572_166627_166835_166905_167094_167203_167759_167900_168469_168584_168931_168996_169669
912268	contig_5039_pilon	+	4051	1	Intergenic	novelGene_64954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAATTATTCAGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634319	1638370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1634300_1638400
912269	contig_11071_pilon	+	4007	3	Intergenic	novelGene_131036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	299	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3288	3608	181233	185149	FALSE	60	CTAAGAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGYLFSSVMKSLLRFTLHPKFRQAESVKGAVRHIVINFLATLVQTGIRRENKTSYPGLDVNVVSIPKNQDAMIYQNKNEMKNADAQQFHFPISTLDKHVCVKEE	175713	185548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_176802_179033_181308_184903
912270	contig_14142_pilon	-	2020	9	Intergenic	novelGene_120459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	215.167921342843	24	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	412	1134	100940	99622	TRUE	55	TTTTTAAAAACAAGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRRSRTAPQEPLLAAVRQTRRTITSSSLAPTSTCPTPSGQWKPQLQELLKLPAFMRVTSTGNMLSHVGHTILGMNTVQLYMKVPGSRTPGHQENNNFCSVNINIGPGDCEWFAVHEHYWETISAFCDRHGVDYLTGSWWPILDDLYASNIPVYRFVQRPGDLVWINAGTVHWVQATGWCNNIAWNVGPLTAYQYQLALERYEWNEVKNVKSIVPMIHVSWNVARTVKISDPDLFKMIK	101472	98552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_98743_98845_99017_99096_99768_99925_100114_100195_100311_100481_100631_100738_100818_100894_100960_101080
912271	contig_2227_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_142339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATCATTAAAAATTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238392	235603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_-_235600_238400
912272	contig_13481_pilon	-	3142	1	Intergenic	novelGene_119533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471716	1468574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468600_1471700
912274	contig_14300_pilon	-	1994	1	Intergenic	novelGene_133103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTGGATAAACATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186535	184541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_184500_186500
912275	contig_4068_pilon	-	2541	22	Intergenic	novelGene_161697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	51.063430387142	9	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2514	27	2540	113659	26532	FALSE	30	CTTATCTTCAAATATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLKLVASGMKKIFGFGSKKGESPLGSSTSPRRDSAGVGRENSKSVNSQPGYHIRDKDLGKIHKAASVGNVAKVQQILLLGKNGLNDRDKTNRTALHLACANGHPEVVTLLVERKCQLNVCDSENRTALIKAVQCQEEECATILLEHGADPNLMDVNGNTALHYAACGQNISIAAKLLSHNANIEARNKNDLTPLLLAVSENKQQMVEFLVKKEANIHAVDKAKSNRQLISEYKEEKRPKNSSQNNNPDIEIQESPRQISRRTESRKVDESSDEDSSSRLSKKPGVDDSWPTSDDEDLDLGIQNVAKPNLTKLITASQQSRKNSKLFEDIVRPEKRTLFEDSNSDSEDEDVVETLPKPSFTVQGFSHPAFPPSDPPLKPSLNFSAVPGVTKEGAAKPAVGKRENSIDIIESAPREQRNNDNLTYIDGAHKNNRSDMMSALGLGEEEDVESPWDSESVSESLAQKYVGHFSGATDEKGENIVNGQIEDSPEKYPHLKPIQPIIEMKDSTPDKAAERKDVQTSKSDLSAELDLEMTSEEERERLDERENNRPQVEEERKKFKSSELEVTENTYDPAIDNGANGFIKQGKSGKSDNQQFCIKENDDSDRPAKKTSDEESKVQKQINSMNDLDDLSQSSETASEDCALPNSNYKNSMLLIEQLGMDCKDSVSLLKIQDAILSYERLVELKKNHCELLTGKIKKMENKVSGLQKELSETKEIKSQLEHQKVEWEREICGLRFTLKQEEEKRRNADMLYEKIREQLRRKEEQYSKEVGMKQQLELTLRTLDMELRTVRNNLNQVVEERNDTQRQLSREQNARMLQDGILTSHLSKRKEIEMAQKKMMQNSEVF	113685	26530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_26682_27264_27449_28917_29132_34322_34465_34756_34791_42831_42996_61062_61146_78188_78271_78366_78396_80957_81052_83468_83531_83831_83962_85997_86185_86276_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102902_108099_108274_109188_109304_113408
912276	contig_5302_pilon	+	2337	2	Intergenic	novelGene_81527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	8	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAGAAACTACTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497082	1500966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1497551_1499097
912277	contig_854_pilon	+	3259	15	Intergenic	novelGene_36656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3734.22762005309	4	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2067	35	2101	1702628	1715249	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1698923	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1698934_1702603_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713152_1715165
912278	contig_10130_pilon	-	1096	4	Intergenic	novelGene_172716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	91.6224135605839	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	822	273	1094	56617	11901	FALSE	35	GTAATGGGAATAATGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGCQAPPPGQMELSALKSRAETAGKDRWCPGERCLAPSPDNGKLCEASIKSVTVDENGKSFAVILYSDSLERKVPLRRLQEVKSVKDCSRSFIFDDEDLEKPYFPDRKFPSSAIAFKLSEDGDCIPHTINRYLRDYQREGAQFLYGHYIQGRGCILGDDMGLGKTVQVISFLAAVLHKKGTREDIENNMPEFLLRSMKKETPSCTARKMFLIVAPLSVLYNWRDELDTWGYFRVIILHGNKKDNELIRVKQRKCEIALTTYETLRLYLDEFN	56889	11898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_12093_19821_19945_48815_49241_56535
912280	contig_18869_pilon	-	2517	2	Intergenic	novelGene_56283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	26367	junction_1	0	216	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	38	415	79419	75455	FALSE	45	AAAATTTGGCTAAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTALRFREVRFGMGPFVALALVALLCLPSLDAVQYAPKVQVYTRHPAEDGKPNFLNCFVSGFHPSQITIDLYKNGQKIANTESSDLSFSKDWSFQLLVHTEFTPNGKDEYSCRVEHVTLKEPKIVKWGEFSSSFLNC	79456	73352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_75766_79352
912281	contig_4103_pilon	+	3261	10	Intergenic	novelGene_51901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.3927475001534	142	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	1590	2756	62257	65783	FALSE	20	TGAAGCCTGCCAGTGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKVNDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKVQAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVRGQAGRLREKECIPCWQAHVHSRPEQKPSIHISPTHKGLNGLTHRTGPVNGICSYGHGKVRSLSPCIQCLSGSPKTRCLPWVV	56877	66288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_58217_60671_60768_61422_61547_62226_62335_62478_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65187_65381
912283	contig_6871_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_21651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGATATTCCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743813	745866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_743800_745900
912284	contig_15084_pilon	-	2645	2	Intergenic	novelGene_116708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	278	319	249082	249041	TRUE	70	GCGGAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRTQRSKFPSLKEYKGWQEKQRNKQLFPPRPLQVEAFYFGEDTNFSHSHTLCLLLKLPTYVLFFKKKNKRDVISVYICKGRCESQKQNSQFMYIFPHIDIPQIV	249359	241948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_242515_247280
912285	contig_8729_pilon	+	174	2	Intergenic	novelGene_40169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAACTTATTTTTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	816961	825505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_817082_825451
912286	contig_3652_pilon	-	2620	4	Intergenic	novelGene_178909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAAAGTGTAAAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132672	23308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3652_pilon_-_24377_96209_96590_126201_127006_132304
912287	contig_6862_pilon	+	3352	16	Intergenic	novelGene_63749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	144.59147047227	176	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	78	2717	49393	148985	FALSE	10	CCCTCTTGTCTTTTGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLKKPRNTPRLPLALNPLKSKDVLAVLAERNHAVVPIGAWVEPASPDSSEMPAYTSACVIEEELKEQLRRKQEALKHFQTQVKHRVNQRVRLRKKQQLQRSYEAAEKKGSIAMQSSDPAHLTPRRRTSVFPNSLNAAVGSSRLPPSPEDEENKNELFQQQAQALSQTMKQVRHQLASFKTMGKKKATVFPDGKRKSVPTQEKALSRKPASIRINIETREGFPLKVHQSLSATVHYHNFMQSEKLDSGESSSIMTDEKWRKNLLWRDQQDLLSEIKNKPFNRVQKVQFKNPLFDVMEEEELKQLHLQDILPRAQDYLPEAQSDLSETQGDLPGIHSVEPEAQNVELDTQAIELEVQAREPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQAGEPEAQAGEPETQAGETETQGGTLEAHSIEPEDGSIVLEALDFLPQNQGFLPKDQDFLPKDQNFLSKEEDFLLRDQSVLLKDQSSLPKDQNILPKCQEQNFLPKDQEIYFRQPSPALTAERWKKKWPTSAQQCLSSMFQGQPSTRDQLDQLEERDEQEKANLKQSASILIGRGEREMFPLDVHQDLLHRRQDQASIRYKKVRFKEPYSDMTDERRREDFALAGYRHLPPKLQAHTCVRDPVEQDKKEGKKQEINSMQLVSDAYQPGLNPEFQAPLALQSGVDQEEDKKVRQKQYLRYKRLFMDMEREQVKEQQRQKEHKKKIEKIKKKKEQERYAEEQRILRMTCHEEPYSGETMSEILAQLQLEEIKGEREKQKQREKEYLRYVEALRVQIQDKMQLYNITLPPLCCCGPDFWDAHPDTCANNCIFYKNPRAYTRALHSVISSCDIPEGNSALRIAIRNFASLHRRTLKNL	49010	149620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_49076_49380_49561_55247_55398_55962_56140_75087_75202_78741_78865_82880_83004_83262_83947_84170_84327_85673_85797_86046_86224_109124_109218_110491_110596_144167_144345_144849_144999_148863
912288	contig_16205_pilon	-	4243	3	Intergenic	novelGene_156879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	445.5	362	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	105825	103176	TRUE	55	CCCAAAATCATGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGGCLIRLRSSLDMQSKYHCYSRVFLHEEAVKTNVRKKVKHF	105895	96924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_97700_100107_103466_105785
912289	contig_3409_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_172302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	340	639	16091	15792	NA	45	AAGCATACATGCATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDGSDWEHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPESMTPRHPFSSVVNSLPRFTIQPGSGQPHKTKWD	16430	14257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_14300_16400
912290	contig_8100_pilon	+	2289	1	Intergenic	novelGene_176005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAATCAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384452	386741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_+_384500_386700
912291	contig_11081_pilon	+	3165	1	Intergenic	novelGene_167085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54286	57451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_+_54300_57500
912292	contig_7635_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_171368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATGCAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109090	108452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_108500_109100
912293	contig_13593_pilon	-	3949	1	Intergenic	novelGene_156120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	223	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTGCAACCATTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54640	50691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_50700_54600
912294	contig_8760_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_175042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGAAAAAAAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84076	55833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8760_pilon_-_56359_84025
912295	contig_8284_pilon	+	4247	1	Intergenic	novelGene_125725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1707	2057	460184	460534	NA	60	AAAAAAAAAACCCACTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWVAIRSEMYSLTVLDVTSPNSGCPLGHVLSKASGKRAFLVSPASHSPRRSLACGHIPPVSASVFMWRLPSVSSRLQGTTQSGSGPNLFSRDLMLTDNIFKDPISKPGHVHRYRA	458477	462724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_458500_462700
912296	contig_3601_pilon	+	713	5	Intergenic	novelGene_132924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4.7169905660283	9	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAAAAAAAATGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355526	391444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_355577_355915_355968_386047_386186_390755_390835_391050
912297	contig_4783_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_108352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103638	106200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_103600_106200
912298	contig_10404_pilon	+	783	2	Intergenic	novelGene_138684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1724	junction_1	0	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098720	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098859_1099839
912299	contig_13823_pilon	+	4177	12	Intergenic	novelGene_145242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	502	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1221	1691	67750	68220	TRUE	25	GAAATCACCTGTCTAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAALEVLTCLCQEIWKTATWPTNWKRSTFVLIPKKGNPTECGNYQTISSMSHTSIILLKIVIIQKWLQYYITRELPEIQLDSEEDMKRGISLLMSDSLAETREYQKDIYLCFITMQRCLISAQRHPPNTHSASKPQPTGAQLSHSMGQLRE	66529	88291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_68998_69545_69650_69801_69883_70154_70287_73340_73471_73848_73953_74891_74978_77312_77399_78234_78346_80965_81058_81172_81217_87552
912300	contig_17194_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_155382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	511	912	293979	294380	NA	65	GAAAAAAAAAGCCATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKRRAGTRVQVAISLPSLFGPRTALATDTVFQLHRYQSCGLIEPVTKGLSCMVFFLPGRGNFFLCQALKETTKTSLWKFRQDLRHGTIFSRAVSVISFQLYRCTHNHLTSLCLSLSLQCWRAVISGFKFIH	293468	295744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_+_293500_295700
912301	contig_8059_pilon	-	2457	1	Intergenic	novelGene_111091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122042	119585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_119600_122000
912303	contig_9995_pilon	+	3293	1	Intergenic	novelGene_47816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGAGTGTCTACTACGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881534	884827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_881500_884800
912304	contig_10500_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_41240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCTTGTATTTCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1627454	1626418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626400_1627500
912305	contig_13004_pilon	+	1965	6	Intergenic	novelGene_112728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	361.652319223864	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	120	995	922526	928299	TRUE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	922406	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134_928325_928366
912306	contig_1276_pilon	-	1503	1	Intergenic	novelGene_159759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112029	110526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_110500_112000
912307	contig_1301_pilon	-	4658	16	Intergenic	novelGene_47376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	110	junction_15	93.7444753927754	223	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	761	2286	69	2354	746763	670942	FALSE	55	GAAATTAAAGCACAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGVVGGGGGTKAPKPSFVSYVRPEEIHTNDKEATEKEVTLHLLPGEQLLCEASTVLKYVQEDSCQRGICGKLVCTDFKIAFLGDDESALNNDETQFKNKVIGENDITLHCVDQIYGVFDEKKKTLFGQLKKYPEKLIIHCKDLRVFHFCLRYTKEEEVKRIVSGIIHHTQAPKLLKRLFLFSYATASQNSTATDTKNHTVMFNTLKDWCWELERTKGSMKYKAVSVNEDYKVCERLPAYFVVPISLPEEDIPHFQGHGIPIWCWSCHNGCALLKMSALPKEQDDGILQIQKSFLDGIYKTIHRPPYEIVKTEDLSSNFLSLQEIQTAYSKFKQLFLIDNSTEFWDTDIKWFSLLESSGWLEMIRRCLKKAIEITECLEAQNMNVLLLEETASDLCCIVSSLVQVMMDPHCRTRFGFQSLIQKEWIMGGHCFLDRCNHLRQNDKEEVPVFLLFLDCVWQLVHQHPPAFEFTETYLTVLSDSLYIPIFSTFFFNSPHQKDTNMTSPGSHRDLCSFGQGRESQDAQSKPLNLLTVWDWHVQFEPKAQMLFRNPLYVEKAKLDKSQRKGMRFKHQRQLSLPLTQSKSSPKRGFFREETDHLIKNLLGKRISKLINSSDELQDNFREFYDSWHSKPTDYHGLLLPYIEGPEIKVWAQRYLRWIPEAQILGGGRVATLSKLLEIMEEVQILQEKIDEKHHSQVALQAEASSLLRNSARLSSLFPFALLQRYSSKPVLPTSGWKALGDEEDLAKREDEFVDLGDV	746831	668637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_671512_675072_675277_676218_676387_678663_678837_681228_681300_682687_682767_684244_684370_685185_685293_695781_695858_703498_703629_710363_710458_712730_712862_713946_714020_715057_715201_717955_718017_746682
912308	contig_15087_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_37245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206471	203986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_204000_206500
912309	contig_753_pilon	+	3010	19	Intergenic	novelGene_112920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	29.7481195587881	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	630	3005	487767	557900	FALSE	35	AAATTGCAGTTGGACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEPSPLAKPLELNQHSRFIIGSVSEDNSEDEISSLVKLDLLEEKEGSLSPASVSSDTLSDLGISSLQDGLALQMRSSMSGMHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNSIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIPTLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLKAAEKVGYPVMIKASEGGGGKGIRKVNTADDFPNLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILADQYGNAISLFGRDCSVQRRHQKIIEEAPAAIAPPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGSFYFLELNPRLQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIAMGIPLYRIKDIRMMYGVSPWGDAPIDFENSAHVPCPRGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNFRSNKNVWGYFSVAAAGGLHEFADSQFGHCFSWGENREEAISNMVVALKELSIRGDFRTTVEYLIKLLETESFQLNRIDTGWLDRLIAEKVQAERPDTMLGVVCGALHVADVSLRNSISNFLHSLERGQVLPAHTLLNTVDVELIYEGVKYVLKVTRQSPNSYVVIMNGSCVEVDVHRLSDGGLLLSYDGSSYTTYMKEEVDRYRITIGNKTCVFEKENDPSVMRSPSAGKLIQYVVEDGGHSLAVSIMSSGLEQLLTLAV	404749	557905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_405353_487740_487994_521427_521561_522567_522707_527749_527860_529193_529276_530244_530344_531718_531826_534593_534705_541160_541371_545059_545231_546635_546798_547155_547320_550546_550698_551513_551618_553508_553591_554535_554682_556359_556478_557840
912311	contig_9185_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_166889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTCCTGGCACAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227895	225284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_225300_227900
912312	contig_8238_pilon	+	1226	6	Intergenic	novelGene_165234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCTCGCGCCCCCGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15070	87061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_+_15166_15915_16151_31590_31688_47079_47686_77636_77685_86916
912313	contig_19606_pilon	-	3034	1	Intergenic	novelGene_148272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2018	2341	47420	47097	NA	30	GTAATTATGGGTATCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMWNLYIDQEAVVRIQQGDAAWFKIRKGVRQGWILSPYLLSLCAEQIIREAGLYEEECNIRIGGRLINNPRYADDPALLSENEEDLKHFLMKIKDYSL	49437	46403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_-_46400_49400
912314	contig_10500_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_41291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAATAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1634974	1632066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1632100_1635000
912315	contig_10609_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_123945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1132	1533	430257	430658	NA	50	ATAAACATACAAACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAYRSKGICPRKEGEKNHCLSHLVLLRQKYQEWMNLAKRSLFSHSPVGYKSKFRASAPGERFLCRLWRKIRVISLPLVWELLWAGTSGPKDMLCSRHCFLGGMRFLCVSARFSLLYLKRDCIKTLILSTSSV	429125	431451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_429100_431500
912316	contig_2704_pilon	+	3743	4	Intergenic	novelGene_75308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	77.4481905677739	481	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	96	551	217418	321113	FALSE	30	CAGAGGCTTTATTTAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGDFLSYLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMAYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNLLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDAWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDVFKIMLKCWDYKPENRPKFTDLQKELTAIKKKMS	217322	324305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_217453_315106_315262_319931_320055_320970
912317	contig_16210_pilon	-	4683	1	Intergenic	novelGene_147677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAGAACTGCCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69860	65177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_65200_69900
912318	contig_8683_pilon	+	2917	10	Intergenic	novelGene_150258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_6	10.2198064778373	149	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	181	1899	606396	626210	FALSE	20	GTGAAATTTGTCGGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPFGKEPFPPSSPLQKGASFWSAIPASPASRPGSFTFSGDSDSLQRQAQRHAAPSKDTDRMSTCSSASEQSVQSTQSNGSESSSSSNISTMLVTHDYTAVKEDEINVYQGEVVQILASNQQNMFLVFRAATDQCPAAEGWIPAFVLGHTSAVILENPDGTLKKSTSWHTALRLRKKSEKKDKDGKREGKLENGYRKSREGLSNKVSVKLLNPNYIYDVPPEFVIPLSEVTCETGETVVLRCRVCGRPKASITWKGPEHNTLNNDGHYSISYSDLGEAALKIVGATTEDDGLYTCIAVNDMGAASSSASLRVLGPGSDGIMVTWKDNFDSFYSEVAELGRGRFSVVKKCDQKGTKRAVATKFVNKKLMKRDQVTHELGILQNLQHPLLIGLLDTFETPTSYVLVLEMADQGRLLDCVVRWGDLTEGKIRMYLGEVLEAVRYLHNCRIAHLDLKPENILVDQSSAKPTIKLADFGDAVQLNTTYYIHPLLGNPEFSAPEIILGNPVSLTADTWSVGVLTYVLLSGVSPFLDDSVEETCLNICRLDFSFPDDYFKGVSQKAKDFVCFLLQEDPATRPSAALSLQEHWLQAGHSKSAATLDTSRLSSFIERRKHQNDVGPIRSIKNFLQSRLLPRV	606215	627228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_+_606453_610841_611090_612362_612502_613571_613600_613805_613969_614233_614356_618295_618375_621688_621890_624513_624653_625667
912319	contig_8598_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_22869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCAATAACGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5967	3053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3100_6000
912320	contig_3956_pilon	+	2153	11	Intergenic	novelGene_15105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	14	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	77	1633	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281605	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287388_1290391
912321	contig_11088_pilon	-	455	2	Intergenic	novelGene_85058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGAACTCCTCCCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
912322	contig_20718_pilon	-	2752	15	Intergenic	novelGene_169148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	185	junction_4	516.511320183354	10	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	890	2670	83	2752	116084	61627	FALSE	25	TTAAACCAGCCTTCTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRLNLLEGSQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSVLPAMLQTNMGNPVTVVTTTTGSKQNCTTGEGDYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIRPILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGEQLLNVGTKSTRFFCRETDISHSGWRLKTLEEHESETGMKSKEARKYIFNSLDDIVHVNTVMDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVKSCFHIMDICKSHPNSFDTNNHNKTSLLRPIASCSAANLTGNFTKIGTLRSQALTTSAHSVVHHGIPLQVGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPAVQPLQIRPGVLSQQTWSGRTQQMLVPAWQQITPLAPATTALTSEGVAGSQRLGDWGKMISHSNHYSSVMPQPLLTNQITLSAPQPISVGIAHVVWPQPVTTKKNKLCQNRGILVKLMEWEPGREEINAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEISCIETQDNHNSGGEARNCCETSVRQDSDSSGSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEDTSQRHSLRECQGNLDCEACQSTLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQFSPSPCKRPNSMSDEEQESGCDTVDGSPASESSGHDSPFAESSFVANSHQNTDLVTSADTKTKPAVCTVVVPPMGLENGLNAEHMANTDSACRPLIKGRSIPGR	116166	61626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_-_61674_61963_62197_64365_64507_64823_65121_65424_65488_65642_65805_65903_66032_66285_66408_71174_71299_71734_71895_73008_73194_73915_74003_74635_74756_79808_79933_115407
912323	contig_14780_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_166389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCCCCTAACTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108870	107948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_107900_108900
912324	contig_16661_pilon	-	2232	2	Intergenic	novelGene_178910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAAAAAGGATGTGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117928	38319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16661_pilon_-_38644_116020
912325	contig_7051_pilon	-	2115	1	Intergenic	novelGene_64315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATAGAAATAGAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218381	216266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_216300_218400
912326	contig_15518_pilon	+	3310	5	Intergenic	novelGene_127597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307.931303215506	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	516	857	15096	38209	FALSE	35	TCAGTAATCTGGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSARQSLHHCF	11046	40662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11270_11338_11422_14886_15202_15808_16019_38183
912327	contig_11171_pilon	+	1298	8	Intergenic	novelGene_48537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_7	1572.66498112508	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	52	846	41803	60933	FALSE	70	CCAGAAAAGAAGAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEGASQRRDPGSKGHAGSWLFFLDGGGISLPPLGWLISNPVEWHN	41751	61385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_60802
912328	contig_7291_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_106311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTCAGAAAATTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204323	201843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_201800_204300
912330	contig_12938_pilon	+	1488	8	Intergenic	novelGene_99722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	842.73139497804	3	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	107	550	78117	83468	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQYNTKILPRRRS	51956	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81452_83431_83470_84550_84635_85468
912331	contig_5302_pilon	-	2045	7	Intergenic	novelGene_81429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.834070794398	34	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	335	1138	209238	176474	FALSE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKETTATTPSPSQTLHGPIMSWFIKQRASKVRTTKLKMTLLSQGTTEALFQKTSCDS	209572	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176638_181242_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
912332	contig_19402_pilon	-	4672	19	Intergenic	novelGene_80776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCATGATGTTGCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	23464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23929_36970_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_102161_102225_107509_107689_109781_109831_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_145888_146409
912333	contig_4659_pilon	+	1550	3	Intergenic	novelGene_118185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCATTTACACTGCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122941	127947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_123068_124450_124554_126626
912334	contig_10143_pilon	+	1929	1	Intergenic	novelGene_163333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101320	103249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_101300_103200
912335	contig_3584_pilon	-	2360	4	Intergenic	novelGene_108160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGGGCTCCCAAGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524193	449853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_450668_451122_451619_519396_520255_524001
912336	contig_13244_pilon	-	2321	2	Intergenic	novelGene_86994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	171	680	468219	466544	FALSE	70	GCTGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLLHILVLWRILVQRSLVHHRWGATDLEWLVFLRWRKDLPSVEVLKLLSRGTLGDNHRTHPANLDCVQRDGAAFILNVDNALKQIGIAVMFGFTVMNIFHALPRRCPKGFMLSETFPTRLLQEFKFTKVWSGVPGANRAFPSALSTHKAGSQILPASHRFLIILDF	468389	464902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_466728_467893
912337	contig_10793_pilon	+	1657	10	Intergenic	novelGene_83432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3430.1890924374	1	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	210	587	160548	163940	TRUE	35	AATACAATTTTAGTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	152919	167263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_152928_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401
912338	contig_1143_pilon	-	3594	1	Intergenic	novelGene_86587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1150	1638	129695	129207	NA	40	TTTTTAAAAAGAGAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCQWECKMVQPLWKTIWCLLKKLEIEIPCYPAIPLLGLYPREIRAITRIDIRTPMFTAALFTITKRQKQPKCPSTDEWINKLWYIHIMENYTTIKNNDEVTKHLTTWMNLEGIMLSEMKSVTKGQILCETTIIKPKKRFTQKKTIFDDFVGGEGGEGEITN	130844	127250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_127200_130800
912339	contig_4125_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_25238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_3	27.109511611881	133	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	174	956	2811991	2799229	TRUE	10	TCATTGATGCTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLSKFSPDGKYLASCVQYRLVVRDVNTLQILQLYTCLDQIQHIEWSADSLFILCAMYKRGLVQVWSLEQPDWHCKIDEGSAGLVASCWSPDGRHILNTTEFHLRITVWSLCTKSISYIKYPKACQQGITFTRDGRYMALAERRDCKDYISIFVCSDWQLLRHFETDTQDLVGIEWAPNGCVLAVWDTCLEYKILLYSLDGRLLSTYCAYEWSLGIKSVAWSPSSQFLAVGSYDGKVRILNHVTWKMITEFEHPVTINNPKIIVYREAEKSPKLGLGGPSLPTPESSGQASLHHGDEIMGTIEDLPQRDAGGPNGF	2820046	2797178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2797497_2797876_2798069_2798501_2799287_2799703_2799811_2801538_2801617_2801731_2801867_2802243_2802331_2803167_2803272_2806527_2806601_2811280_2811398_2811967_2812121_2820002
912340	contig_17470_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_110494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGACTACTGGTTTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199900	201171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_199900_201200
912341	contig_17108_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_109521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCCACCTTATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53278	50747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_50700_53300
912342	scaffold_8345_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_107025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTTCAGAATGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631755	633015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_631800_633000
912343	contig_14970_pilon	-	2547	2	Intergenic	novelGene_45144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	349	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAATCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295020	291330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_292554_293696
912344	contig_2703_pilon	-	4353	1	Intergenic	novelGene_101792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3745	4047	612160	611858	NA	0	GTTTTCCTTTTCTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKHQRPSVKEVVSGMGNVASSKSLSWVHCVYADVAKKVQHSGTNIQAEMRLKSICAHTHTHTARQDGKAKLNQFEAIYFGVAGIEKEKNVPFPSLLLN	615904	611551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_611600_615900
912345	contig_1146_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_84789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	223	672	1407	2078	123347	122676	NA	40	AAGAGAAGCCCACAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKKQDPSICHLQESHLRNKDVNLLKIKGWKKIHQANTYQKRAGVAILISDKLNFKPKFTIKDKEGHYIMIKGTVHHEDITIISIYPPNDRAPEYIKQTLTALKRKIDSSTVIVGNFNTPLLVKDRTSRKKLNRDTEHLKTTISQLDLTGICRILHPTAAKYTFFSNTHGTFSRIDHILGHRATLNKIQNIEMIQSIFSDHHAIKVEINNRKTRKKINYMETE	124753	122461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_122500_124800
912346	contig_3601_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_132840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTAAGACTTCTACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110949	112562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_110900_112600
912347	contig_15118_pilon	-	2195	6	Intergenic	novelGene_74538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_5	12.0764233115604	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1494	701	2194	44453	34285	FALSE	30	ATAATCGGGAATTTCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKAQGSLSFKDVAVGFTWEEWQLLDPSQKDLYKEVMLENYNNLVSVGYPATKPDSVFMLEQGVPPWIVEGVIHSGTSPEEIWATDQMQWQPENQNELKSLERCQQNYAFGNNLDLSKNLVPVKQKQNTFGSHCKSLKSPLDFVIQNRRDAEKDSDEFSGYAKSSVHMKHDRTFPGVKYHGCIKPSSTKSQPNDHPKTYTGEKAHECSKCGKAFSRKAQLIRHQKTERGEKPHKCNDCGKTFMRKIQLTEHQRVHTGEKPHECNECRKAFSRKSQLMVHQRTHTGEKPYVCSECGKAFIRKCRLNRHQQSHTGEKLYGCNECGKAFSQKAYLIAHQRLHTGEKPYECSECRRTFFFKSDLTKHQRIHTGEKPYECSECEKAFRSKSKLIQHQRTHTRERPYGCSECGKAFAHMSVLIKHKKTHSREKAINSLKVRKPSSGSHSSLYMSELLQEQNPVNTAPMELSSAGTQPLLNISELLGGRNVVTVEQPFSRSPALV	48485	34283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_35541_42540_42637_42930_43058_44438_44627_46843_46936_48050
912348	contig_7870_pilon	-	2410	1	Intergenic	novelGene_109023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554483	552073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_552100_554500
912349	contig_9011_pilon	-	5280	1	Intergenic	novelGene_159331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	753	95	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3024	3341	611470	611153	NA	25	AAAGCCCTGGGGATCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVGFFSCSLSICLSCVVNVLILSLSSFLMCASIAVDCPLRTAFAASQRFWYDVLSFSFDSMNFFIPSLISSITQWFVRVHFLGWYLAGTILHPRFSLWSDVVCS	614493	609213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_609200_614500
912350	contig_9363_pilon	-	2832	14	Intergenic	novelGene_6752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	412.790761788284	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	134	1513	1548961	1506640	FALSE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAAIAAADFRGAIQGWLFQTEPEGEDGGCRCPRRKSWRRL	1549094	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508265_1532344_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
912351	contig_10166_pilon	+	4461	2	Intergenic	novelGene_178911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	167	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3701	4258	96527	97084	FALSE	30	TGGAACCTCACCCAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPAWVCGIQAADASWQETVAAGSRGTNKQKPWDPTSVAAQTGKQLHTQMEPRSPAGRSKDGARSQALEQKEGEAARGKQEIQRSRGKKEKKSNTSSQQMAPREPPAWVCGIQAAGASQSRDCGCGKQRSPSRGEGGGGLESAHRKLPAVFSPTGRSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSMLR	67091	97287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10166_pilon_+_68582_94316
912352	contig_9594_pilon	+	4128	6	Intergenic	novelGene_73915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	265	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAGAGTCAAAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116633	219661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_120176_163320_163406_209526_209700_217926_218038_218198_218317_219562
912353	contig_16722_pilon	-	3771	8	Intergenic	novelGene_118273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	339.494943005828	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	606	1718	116363	91874	FALSE	50	TCCTAGAAAATAAAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQNAVIEHLKQKKTMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQEELKKDLKLKKEKDLAQAAAVAAALPVTAAPPAPPPSPPPALQPPGLLSTPTIPAASQKRKREEDKDSTSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYERLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSHNNKLQSTAS	122188	89820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_91911_96293_96481_103887_103973_105711_105905_109688_109997_115770_115997_116286_116370_121589
912354	contig_8377_pilon	-	2303	13	Intergenic	novelGene_35003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGCATACTCCTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178086	68148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68329_136287_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161398_164395_164588_169243_169307_172896_173016_176573_176697_177247_177343_177430
912356	contig_10864_pilon	+	884	9	Intergenic	novelGene_107082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAATAAAGAAACAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897064	976553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_897106_902002_902056_903666_903798_911646_911740_919442_919611_927813_927932_929301_929347_958175_958262_976404
912357	contig_11316_pilon	+	1357	1	Intergenic	novelGene_122641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	163	675	137674	138186	NA	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137511	138868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137500_138900
912358	contig_12142_pilon	+	2496	9	Intergenic	novelGene_147812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_8	18.7733188328542	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	17	1363	106965	136164	FALSE	40	GCTCACAAACCAACATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLAGMRLEEGDIVVSLGTSDTLFLWLQEPMPSLEGHIFCNPVDPQHYMALLCFKNGSLMRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPILTQPAPFSNPDSDHPFPNPGPQSLTPQALAPLSLLSRQLPVSHPETPTSRSLFPPHSAI	106948	137297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
912359	contig_4782_pilon	-	3235	12	Intergenic	novelGene_73645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_10	74.9549727095161	132	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	218	2020	554759	431418	FALSE	30	AAGCAGTGTTTCTATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGGRLRCFKCVSLSAVLPIIRFHALGSRAGLLRVFGVSHSRVSTRNFPIPVTFRITYIVKIRAWCGFDSSVMSELVRTGSKPGFEAAASRREGFHPASSDSSLPFYTLPETPTYPQSIKTERSAQKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLAAASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQYQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFLQLDVKRVTHLLNQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDEPNRQPFMVDILAKVRFPLISKNFLSKTVQAEPLIQDNPECLKMVISGMRYHLLSPEDREELVEGTRPRRKKHDYRIALFGGSQPQSCRYFNPKDYSWTDIRCPFEKRRDAACVFWDNVVYILGGSQLFPIKRMDCYNVVKDSWYSKLGPPTPRDSLAACAAEGKIYTSGGSEVGNSALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCGGSLGNNVSGRVLNSCEVYDPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLDNVEYYDIKLNEWKMVSPMPWKGVTVKCAAVGSIVYVLAGFQGVGRLGHILEYNTETDKWVANSKVRAFPVTSCLICVVDTCGANEETLET	554976	430202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_431702_434696_434795_438418_438621_440983_441225_456248_456392_467773_467949_471146_471323_476983_477109_477443_477538_478827_478931_529405_529479_554670
912360	contig_6445_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_77121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTAGTATTCCCCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438744	1437994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1438000_1438700
912361	scaffold_12124_pilon	+	2699	12	Intergenic	novelGene_22306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3327.82442768359	11	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	18	341	1473608	1496374	TRUE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGRTMARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1473590	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1502265_1502401_1506629_1506687_1508010_1508533_1509081
912362	contig_20420_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_172477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	1651	2235	25087	25671	NA	25	TAGCTAACGTGTCTCCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSLLHSILDMANSSYYSVNCFSFCLLRHTVVPWRPIISFLMSSPSTHTQPSTWLLPSRSIQQHLRSTMAFWSLRSNIFLCYFFCLLCWLILLSLVHEILDSSRLNPEAFFSLHDLTMPRHNYHLYLKSHGVLSLAQTFSQSSRPFPPTAYLVSPLRCPKTQKPKLVVIATLPDRVELPNKVSKVHPVDWNC	23436	25897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_+_23400_25900
912363	contig_19850_pilon	-	1716	11	Intergenic	novelGene_170852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	80.0827072469456	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1605	111	1715	39513	3450	FALSE	25	TAGGTTCTATACATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRQHTVFLKKMTQFILQEMPKARYSSLLNDFVESNYFVIDGDSLLVTCLGDKSFKRGQDLHFFYLVECYLVDLMRNGAQFGIIFFEDAECAYFPFPELLPLRTALILHLQHNTNIDVQTEISGCLSLEWELFLEERHPYFLIVSDEGLNDLQTHLFNFLIIHSWGMGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKEQAHETIFLLRQLWPQGSDIRSVLCVTLCSLSLGRYHCFLENKKKRASDQETSVRQVDTDCSALQEVEDLCRLHCLSIAFLLRLPLSQRAQTRVITSHWIQNIQTFLKMKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTSH	39623	3448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_29232_29398_32120_32463_38256_38447_39010_39081_39509
912364	contig_16205_pilon	+	2576	2	Intergenic	novelGene_156859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1440	1826	119064	119450	FALSE	40	ACTACTCAGTAGAAACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELLEAEHKRLIYRTLQQIRKVEQNTEHAREEIKKTRQEHDKFNRLQESTERQQSEIQKINNKISELDNSMESHRSRTEAREVRISETEDKALDTTYLRKNEIKGFKK	55761	120200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_55787_117649
912365	contig_6823_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_131205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67784	66329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_66300_67800
912366	contig_12142_pilon	+	3534	20	Intergenic	novelGene_147798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_5	58.6738485069367	258	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	596	2392	97732	136164	FALSE	20	CCAACATCTTATTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSTTAQCRQLEAAMGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIFQQNPEAYSLTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIRDKVWSQACLGACAPQLAEKLGPPMRSSSVAGTISSYYVQRYGFHPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIVVSLGTSDTLFLWLQEPMPSLEGHIFCNPVDPQHYMALLCFKNGSLMRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPILTQPAPFSNPDSDHPFPNPGPQSLTPQALAPLSLLSRQLPVSHPETPTSRSLFPPHSAI	87422	137306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_87506_88923_89007_94352_94423_96209_96291_96584_96743_96972_97060_97698_97828_99020_99087_100329_100403_102360_102480_104919_105002_106950_106992_107580_107697_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
912367	contig_7467_pilon	-	1413	6	Intergenic	novelGene_69476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_5	184.049341210448	95	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	227	859	92058	75239	FALSE	35	CAACTTACTATTTCAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSKLRALFCLCSCLTLVHPFVWQDLNPAAQMKSPAWLHKIKALMAAASFGQTKIPRGSGSYSVGCTDLMFDYTNKGSFLRLYYPSQDDDHHDTPWIPNEEYFLGLSKVLGTHSVMAKFLSLFFGSMTTPAKWNSPLRTGEKYPLIVFSHGLGAFRTIYSAIGNDLASHGFIVAAIEHRYVIWYVAGLFSQIKGMLMHITILLNFIKFY	133036	74684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_75402_77514_77609_86020_86166_86612_86735_91949_92093_132844
912368	contig_709_pilon	-	2277	1	Intergenic	novelGene_57588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2223856	2221579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2221600_2223900
912369	contig_5153_pilon	+	3360	1	Intergenic	novelGene_74325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACAGACACGTTGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520454	523814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_520500_523800
912370	contig_13481_pilon	+	3171	4	Intergenic	novelGene_119454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	18.5532267334343	81	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	2557	3171	1074131	1074745	FALSE	45	AATTGCCAGCCAAGAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISEIEDKHLDTTLFQENSEKRAKKNEETLRVMWDTIKSKNLCVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKNKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEK	1066955	1074745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1067059_1071089_1071222_1071560_1073865_1074113
912371	contig_7466_pilon	+	3743	2	Intergenic	novelGene_178912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2747	3052	149145	149450	FALSE	20	GTAATTTCCCCCATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLMESLGFSMYSIISSGNRDGITSSLPIWMPFISFSCLIALARNSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	146358	150141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7466_pilon_+_148106_148145
912372	contig_6365_pilon	+	2117	2	Intergenic	novelGene_134016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATTAGCAGGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132094	134631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_133283_133702
912373	contig_18822_pilon	-	1983	3	Intergenic	novelGene_111711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	623	934	92200	91889	FALSE	55	AAACCAAAACCAATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKIGRKTAGKLLAQVPRTGGQMNRSQLQGPVQANLPPSLARMSTYIGCRPQAQGNSLSTDWLLTADPIMEVITTSYDCQTTEIHGPAKLTHNLNHHNSHGI	108740	90839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_92301_108092_108507_108632
912374	contig_4924_pilon	-	3346	1	Intergenic	novelGene_84713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGATCCTGGAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90718	87372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_87400_90700
912375	contig_8312_pilon	-	3461	2	Intergenic	novelGene_152890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTTCCTGAAGCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277263	273628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_275047_275220
912376	contig_5686_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_45316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTCCAATTCCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101802	99824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_99800_101800
912377	contig_8822_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_117939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAACCAGGTCCTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173136	174089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_173100_174100
912378	contig_1210_pilon	-	7158	4	Intergenic	novelGene_171524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_2	20.0055547841649	126	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	244	1566	318902	300032	FALSE	15	GCTCCCTGAACCCATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVAVEDVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRNLNDGEKLSSENIIVQFMRNDTWSSMVGEIHEFHSTEDQNNNQKTHVRRHMVEDFCESNEDSQCGQTFSRIPSLSVLERTAMETYPSECLECGKSLMDHSSLKHHIKSHSGCSVYQHKECGDPCSCSSYLSTPVRTLTGDKPVEYKECGKAFHHSSNLTRTVRTHFGEKSYICKECGKAFSQSSDLTAHVRMHSGERLYECKECGKAFRWSSNLTIHMRIHSGERPYECKECGKTFSRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSHSSNLTEHIRTHSGEKPYECKQCGKAFSQSSHLTEHIRTHSGERPYECKECGKAFSHSSDLTTHMRIHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSHSSNLSEHIRTHSGARP	319145	294439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_301074_302886_303038_304049_304177_318899
912379	contig_6589_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_25932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	928	1458	1214777	1214247	NA	30	GTTCCGAGGAACTAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRCKYGLHLNINKTKILTTGPIINIMINGKKIEVVKIFILLGSTVNTHGSSSQEIKRHIAWGNSAAKDLFKVLKSKDVFLRTKVPLTKAMVFSVASYACKSWTMNKEDQRRIDAFELWCWGRILTIMWPAKKNKQICLGRSTTRVLFRSKDGEITSHILWTCYQEGSVPGEGHDA	1215704	1214068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1214100_1215700
912380	contig_8174_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_160066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	136	465	318529	318858	NA	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHYIQAANRHVKKRLRSLAIREMPIKTTMRYHLILILLALIKKTENNKCWRGCGEIRTLIHCWWECKMVQLFWKMIRHFLKKLETEMLYDSAIPLLGIYPKEMRAVT	318393	320173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_318400_320200
912381	contig_9839_pilon	+	1410	5	Intergenic	novelGene_88484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2434	junction_4	677.057373861329	119	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	136	708	49467	57885	FALSE	60	TTGAGAAAAAAAGAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVQTSLATNILSCLSAVVGFILLSISLAALGHASQQCDLDKEVMPSSEYNYYYRNPRACFMATTNVTVSILRWDVPTL	45305	58587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54122_57651
912382	contig_10456_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_163468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	109	429	58517	58837	NA	70	AGGAAAAAATAACCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVETLRFPRVRKVGLRSVRARRDSPERQVRAPCSMSDLIGDHFRSGVWNTGGSLEANIKKGTSCVCCQGAALVGRSGDIIGVVLSPLPGGRDVGAQPARDGGLS	58408	60132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_58400_60100
912383	contig_9481_pilon	-	4530	26	Intergenic	novelGene_149618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	260.111440732621	21	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	905	3379	82249	33610	FALSE	5	GTTGGCGCCCACCCGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAKFSQLTSLLSPHRCSIIPPVNFEVVKSESLGIPQKLHLKVDVETGKLIVKKSKDGSEDKYYSHKKILQLVKSQKFLNKLVIVVETEKEKTVRKEYVFADSKKREGFCQLLQQMKNKHSEQPEPDMITIFIGTWNMGNAPPPKKITSWFLSKGQGKTRDDSADYIPHDIYVIGTQEDPLGEKEWLEILKHSLQEITSMTFKTMAIHTLWNIRIVVLAKPEHENRISHVCTNHVKTGIANTLGNKGAVGVSFMFNGTSLGFVNSHLTSGSEKKLRRNQNYTNILRFLALGDKKLSPFNITHRFTHLFWLGDLNYRLELPISEADTIIQKIKQQQYADLLAHDQLLMERKEQKVFLHFDEEEITFAPTYRFERLTRDKYAYTKQKATGMKYNLPSWCDRVLWKSYPLVHVVCQSYGSTSDIMTSDHSPVFATFEAGVTSQFVSKNGPGTVDSQGQIEFLSCYATLKTKSQTKFYLEFHSSCLESFVKSQEGENEEGSEGELLVKFGETLPKLKPIISDPEYLLDQHILISIKSSDSDESYGEGCIALRLEAKETQFPIYTPLTHHGEMMGHFQGEIKLQTSEGKTREKLYDFVKTERDESSGPKSLKSFTSHDPMKLWEPTNRPSDLAKNIAEPLLQEDLPLTKQKPEMFENPLYGSVSSFPKLVPRKEQESPKMLRKEPPPCPDPGVSSPTILLTKAQEAESSKGTSKQVPTPRLRSFTCSSSTAEAGAAAGGEKNHGKPKPAASSQAPAPVPAKRPVKPSRSEMSQPIPPAPTQLRPPLPAKSLAVLHLQHSKGRDYRDNTELLHHGKHRPEEGPLGRTAMQ	170865	32458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_33613_34410_35015_44436_44534_46652_46803_50842_50931_53033_53117_54443_54558_56611_56702_63474_63557_64292_64382_64978_65088_68578_68718_69169_69267_72613_72732_73184_73382_75950_76054_76969_77077_80863_80988_81953_81999_82213_82277_89063_89152_100007_100149_105418_105592_114922_115074_149689_149751_170602
912384	contig_9852_pilon	+	2203	13	Intergenic	novelGene_138471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_12	101.03657203651	88	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	500	1246	333337	364625	FALSE	15	TCCACTTGTGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLCVCEEGSNKVWYKKPGCFQGTLDAFLKIIRNEGIKSLWSGLPPTLVMAVPATVIYFTCYDQLTAILRSKLGGNETYIPIVAGIVARFGAVTVISPLELIRTKMQSKKFSYQELHRFVSKKVSEDGWISLWRGWAPTVLRDVPFSAMYWYNYEVLRKWLCEKSDLYEPTFMINFTSGALSGSFAAVATLPFDVVKTQKQTQLWMYESHKMPVPSNMSTWAIMKNIVGENGLSGLFTGLKSSKIRS	322159	365582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_322339_327725_327795_330053_330175_330286_330328_331882_331943_333307_333415_335289_335358_337777_337903_342138_342313_346567_346678_349920_350003_353927_354009_364596
912385	contig_20889_pilon	-	3503	2	Intergenic	novelGene_127644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1941	2255	42540	42226	FALSE	40	TGCTGAAAGTGAAGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWTGKQFHTRTELHSPSGRSKDGAQSLVFEQKEEEVVIGKEEIQRSGKKQHQQPTNGTQGVGQCGWMESKQPMLPGQETGAMGSRGGRAGVKKGGGWESVYR	44541	40977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_43077_43137
912386	contig_6434_pilon	-	2024	2	Intergenic	novelGene_61863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCCACCAACACCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826768	824591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_825848_826000
912387	contig_5415_pilon	-	2614	11	Intergenic	novelGene_146138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_10	109.10733247587	105	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1224	404	1627	301590	182506	FALSE	25	CTACATTTCTGGTAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNQSWNSSGSEEDPETESGPPVERCGVLSKWTNYIHGWQDRWVVLKTNALSYYKSEDETEYGCRGSICLSKAVITPHDFDECRFDISVNDSVWYLRAQDPDHRQQWIDAIEQHKTESGYGSESSLRRHGSMVSLVSGASGYSATSTSSFKKGHSLREKLAEMETFRDILCRQVDTLQKYFDACADAVSKDELQRDKVVEDDEDDFPTTRSDGDFLHNTNGSKEKLFPHVTPKGINGIDFKGEAITFKATTAGILATLSHCIELMVKREDSWQKRLDKEIEKRRRIEEAYKNAMTELKKKSHFGGPDYEEGPNSLINEEEFFDAVEAALDRQDKIEEQSQNEKVRLHWPTSLPSGDAFSTVGTHKFVQKVEEMVQNHMTYSLQDVGGDANWQLVVEEGEMKVIPTE	301993	181518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_182620_191708_191802_194535_194623_200499_200593_204713_204872_210302_210387_218184_218324_219125_219234_252502_252620_294190_294326_301494
912388	contig_11294_pilon	+	2987	18	Intergenic	novelGene_50053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	154.521988670542	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	434	1603	306332	348804	FALSE	35	AGTAGTAATGTCTCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKPRLGTVMYRVIGLGVLYFIFATIEGVMRVIGGSNHLAVVLGDIILAVIDSIFVWFIFISLAQTVKTLRLRKNTVKFSLYRHFTNTLIFAVLASVVFMVWTTKTFRIAKCQSDWMERWVDDAFWSFLFSLILVVIMFLWRPSANNQRYAFMPLIDDSDDEIEEFMVTSENLTEGIKFRVSKTISNGAAKPATSDNFDEDLKWVEENIPSSFTDVALPVLVDSDEEIMTRSEMAEKMFSSEKIM	251356	350188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_323693_323788_325734_325806_332506_332617_333604_333664_334971_335076_337381_337456_338120_338195_340644_340698_347019_347051_348744
912389	contig_12391_pilon	+	996	7	Intergenic	novelGene_103597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	245	junction_1	230.954120022907	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	10	813	56804	98983	FALSE	40	CATTGACGTTTAGTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAKMSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRGKFGLERVGSKMGRYHGIIAYDCMTLENK	56794	99166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719
912390	contig_12279_pilon	+	1123	6	Intergenic	novelGene_50086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3417	junction_3	967.051187890279	72	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	71	673	68297	77128	FALSE	50	GAGACACTGTAAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENDPEPHLEEDVDELDGKLNYKPPPQKSLKELQEMDKDDESLAKYKKTLLGDGPVVADPTAPNVTVTRLTLVCDSAPGPITMDLTGDLEALKKETFVLKEGVEYKVKIHFKVNKDIVSGLKYVQHTYRTGMKVDKAAFMVGSYGPRPEEYEFLTPAEEAPKGLLARGTYHTKSFFTDDDKHNHLTWEWNLSIKKDWTE	57532	77578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_57597_68290_68475_69362_69447_71633_71711_75031_75096_76928
912391	contig_5586_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_143607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCCCAGTAATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677157	679557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_677200_679600
912392	contig_9727_pilon	+	1156	1	Intergenic	novelGene_86347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTGCAATAAAATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435397	436553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_435400_436600
912393	contig_17796_pilon	+	2625	9	Intergenic	novelGene_33819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	491.150546548612	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	91	885	72417	96579	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKGTKIVYFFLVPFFKLYIFDLKYQ	54004	111364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_54063_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96604_97061_97318_99314_99648_110237
912394	contig_5979_pilon	-	3895	3	Intergenic	novelGene_178444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2865	3230	427258	426893	FALSE	35	CTGGTATTCAGGAATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	542414	426227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5979_pilon_-_427823_540056_541730_541787
912395	contig_7775_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_37503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	519	818	302675	302376	NA	40	GTTATTATCACATCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLVNVALFVSWANIFLVSLVFFILLCSRWIGTNCCILGGCSLAFNTPDTTHQSGMQNIFLINFVMPVDLHVPQNHGSQNSFPATLSLKVFGCVQETS	303193	301790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_301800_303200
912396	contig_5620_pilon	+	1336	2	Intergenic	novelGene_161353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACTGCAGAGCAGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357444	359180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_357533_357932
912397	contig_2032_pilon	-	1787	13	Intergenic	novelGene_175552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	72.5434735559	166	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1596	190	1785	50842	2714	FALSE	35	AGTATTAGCTCAGCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAADKAAEQGAEKPEGTGQSSGITDQEKELSGSAFQAFTAGNYDTCLQHLACLQDINKDDYKIILNTTVAEFFKSNQTTTDNLRQTLNQLKNQVHSAVEEMDGLDDVENSMLYYNQAVILYHLRQYTEAISVGEKLYQFIEPFEEKFAQAVCFLLVDLYILTYQAEKALHLLAVLEKMISQGNNNKNGKNETGNNTNKDGSNHKAESGALIEAAKSKIHQYKVRAYIQMKSLKACKREIKSVMNTAGNSAPSLFLKSNFEYLRGNYRKAVKLLNSSNIAEHPGFMKTGECLRCMFWNNLGCIHFAMSKHNLGIFYFKKALQENDNVCAQLSAGSTDPGKKFSGRPMCTLLTNKRYELLYNCGIQLLHIGRPLAAFECLIEAVQVYHANPRLWLRLAECCIAANKGTSEQETKGLPSKKGIVQSIVGQGYHRKIVLASQSIQNTVYNDGQSSAIPVASMEFAAICLRNALLLLPEEQQDPKQENGSKNSSQLGGNTESSESSETCSSKSHDGDKFIPAPPSSPLRKQELENLK	51031	2711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2032_pilon_-_2796_3835_4013_5602_5725_9058_9262_10212_10363_19939_20058_22166_22251_22801_22889_24609_24753_28502_28654_32973_33136_33906_34002_50820
912398	contig_5765_pilon	-	2283	1	Intergenic	novelGene_141356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1329	1703	354045	353671	NA	80	TGCAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNLFKGNWFTYRKERPMETTWEGDSTLFPGSQARRPQWSQRVMTDARRGSIEWELCIPLPSNTHTYTHTHTQCLWGSHFPAFPSHPLTPLPSHLDSFFFSSVTSWSLGHSSLPHWNSPVCSQ	355373	353090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_353100_355400
912399	contig_8377_pilon	+	2398	20	Intergenic	novelGene_34953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	671	junction_1	2948.89765779043	5	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2238	161	2398	68257	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68096	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128934_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
912400	contig_5643_pilon	+	1264	12	Intergenic	novelGene_38843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2351.35752947206	12	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	51	1052	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233617	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233650_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
912401	contig_10766_pilon	-	3516	2	Intergenic	novelGene_151203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	2	8	junction_1	0	47	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2231	2578	142865	142518	TRUE	75	AGGAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIEYAMGCQKKEQICLGRSAARMLLRSKDERLRLTYFGHVIRRNQSLEKDIMLGKVEGRGKRGKPSMRWTDTVTTMGSSITTIVRMTKDQAVFRSVVHRVTMSQNQLDGT	145095	141077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_141270_141771
912402	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_91309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	657170	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657171	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
912403	contig_11338_pilon	+	3879	15	Intergenic	novelGene_6185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	508.945052364723	2	33	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	984	2225	8000	11749	TRUE	45	CTATCAAAAGCTGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	2630	13601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_13071_13268
912404	contig_14682_pilon	-	2297	7	Intergenic	novelGene_139108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.7290628796456	3	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	512	1303	137297	94366	FALSE	30	TAATCATTTTTCACACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEENKYDYLPTTVNVSSELVKLVFCVLVSFWVIKKEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLSN	141979	93371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94375_96205_96558_119740_119809_122397_122532_124154_124254_137167_137317_141487
912405	contig_7943_pilon	+	2826	1	Intergenic	novelGene_173150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTTGAAGACTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225355	228181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_225400_228200
912406	contig_12920_pilon	-	2535	1	Intergenic	novelGene_166336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGAACTTTTTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178517	175982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_176000_178500
912407	contig_8712_pilon	+	1477	3	Intergenic	novelGene_58774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	227.5	137	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286982	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315059_321912
912408	contig_7229_pilon	-	2376	3	Intergenic	novelGene_39800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3961	junction_1	46.5	1441	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	123	737	877522	875654	FALSE	30	AGCAAATGGACCTTGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877644	874014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350
912409	contig_5586_pilon	+	8107	1	Intergenic	novelGene_143530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTAATGCGATTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297528	305635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_297500_305600
912410	contig_19342_pilon	+	998	4	Intergenic	novelGene_41130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	38	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	120	461	5208	6238	FALSE	15	CAGAATCCTGTGTTTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGAQVEREGATLRLEAATVPRALMCLSQPKGEILNGLHGGGVEAEGT	5088	6775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5534_5955_5994_6139
912411	contig_14666_pilon	+	921	4	Intergenic	novelGene_39562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	120	710	477340	485019	FALSE	85	TTAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSRSSSAGFPSTSRPCSEGRRLCTGTRARGWTCRSLERPRGISMTWCPSTNRFKMPRWLWRKAERSRSGRRPSQKTSDVNGREAAGQMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477220	485230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483321_484709
912412	contig_10756_pilon	-	2682	2	Intergenic	novelGene_170674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCTTTGGCTATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364423	356632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_359046_364154
912413	contig_5447_pilon	+	2887	3	Intergenic	novelGene_178325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCACACGGAGCGAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299165	316676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5447_pilon_+_300808_315189_316216_316457
912414	contig_5928_pilon	-	2649	1	Intergenic	novelGene_40388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	237	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGCAGTTAGGTGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329853	327204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_327200_329900
912415	contig_16098_pilon	+	1362	3	Intergenic	novelGene_46232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.5	17	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	116	493	766291	767253	FALSE	25	GAATCTTTATTGTATCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLRAVAQGIGCGGVRFWARACKPTF	765960	768122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_766076_766290_766598_767182
912416	contig_6612_pilon	-	2755	12	Intergenic	novelGene_148159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_7	214.813699795508	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	24	1214	72745	60977	TRUE	15	TTCTCCCCCGCACCTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNEYKKIVLLKGLEVINEYQFNMIKSLLAHDLQLNKKAQHEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPENQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIEKEKTKQKH	72768	16654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_50106_50275_60837_61004_61951_62141_64167_64576_67488_67657_71390_71525_72480
912417	contig_10481_pilon	+	3066	5	Intergenic	novelGene_170522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	128	706	3283	3934	TRUE	35	GCAAAAAGCCCCGAGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSCFVILGKFSVSSSPVILSMFSPRSGTPVTHRFLLLIVSHITVKVSLFSFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTPSMSEILLFIFWIFYDCFCIVFNCEFILAFCSCIIFLKSSNFCSGFSMNLSAFSINLSVFSSFLFAFSLNSGIALNIRDLNSLSDSFSAFSSTGKSSRVLF	3155	22452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_3596_3668_5078_5351_5535_21264_22067_22220
912418	contig_14397_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_134648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTCGCCGTGAGTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85200	82595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_82600_85200
912419	contig_366_pilon	-	10382	10	Intergenic	novelGene_51574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	616.019560375669	16	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	930	1397	776773	764196	TRUE	10	TTTCCCAGCTACCCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEQRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKG	803510	754192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_759315_760332_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_770382_776758_776893_780057_780185_802171_802279_802934
912420	contig_240_pilon	-	3218	18	Intergenic	novelGene_173792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	163.501563434955	153	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1008	3027	131	3157	488331	417340	FALSE	40	TATTGACATAAAAAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGELRRFIQANSFSKPHDELKSPWGAQLVKLGEVSKVELKDASMQTVVMEGNTLRFKHEGMREAWEEKPTDAVFSAEHQPENLHRMPGRQGTPLSLPSGTDKDAKKSRLPILIKPSRSLENVYRLSATQEVVAQLQGQIMELQGELKEFKTHNKQLHQKLILAEAMMEGKPMADKMLLNAQPLVGTAYQGSPGEQKGIKTTPCVWRDKEMDNDQQTSYETDSEIYQPDDLAILPTCKESPSEDFQGTTSVATYVSSKSQLSVKVNMIETDQSENIDASNGTEYLKQKIRDLETELKGYQSFIFQLQSGKHSQCSEAIITVLCGTEGAQEGLNKPKGGTDDEEMTFSSLHQVRYVKHMKILHPMAPETTDGGMLESLKQQLVEQEYELQKEQNLNMELFSEIHNLQNKFRDLSPSRYDSLVQSQARELSLQRQQIKDSHDICVIYRQHMNTMMKAFEELLQASDVDCYLAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSAEVEVSAQNELMERIEEDNLTYQHTIPESPEPSASHALSDCEMSEKSSFFSRDQKQDSEIEKISVIANSISQDLLMEHIQEIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFDQGSANIFAYGSELHNSLTSEIHFLRKQNQALNMMLAKGSRDKQKENERLRESLSRKIANLENLQQKYSSVKGENERLQKEVSEKERHNQQLVQEIYDRRKELSRAQEEVKLRQQLLLQNDKLLQSLRVELKVYEKLDEEHRRPREARAEASGEGWKGQDPFSDLHGLLREIQALRVQLERSIETNSNLQSKLEEQLAKDGSRCSMANENSYDLFDSTLAVPPKLASETLLLYGDDVDSLSCDSGSSATSSPSTIRLVPGHRLWASKSGRHVLGLIEDYNALRKQIGQGQRLLAKMDVQIQEVSSPTVRELGTKGPYSTPLSRFVTSVNTAKLILEEASRLLKLLWRVSLPTDGQCTLHCEQIGDMKAEITKLQKKLFEQDKKLQNTAKLLQLSKHQEKVIFDQCNGRNPQNPSESQRKPGAQARGCPSRNIQSQQTRLLRRTFSQ	488461	417278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_417417_417844_417892_422178_422310_430808_430953_433498_433765_434813_434892_441613_441776_443187_443310_444598_444789_446087_446205_450251_450372_456498_456675_459423_459473_470066_470300_472091_472675_476869_476993_480838_481071_488154
912421	contig_6902_pilon	+	1362	9	Intergenic	novelGene_135594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	601.560042202771	5	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	810	552	1361	467100	490148	FALSE	60	TGGAGAAAGAAAGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPANLPSLKAENKGNDPNVNIVPKDGTGWASKQEQHEEEKTPEVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQRE	462030	490149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_462152_463503_463599_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471651_489774
912422	contig_6842_pilon	-	3572	5	Intergenic	novelGene_130688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	271.246658965599	28	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	47	616	433953	369446	FALSE	20	TGCGCAAATGCCATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVDLSKWSGPLSLQEVDERPQHPLQVKYAGADIDELGKVLTPTQVKNRPTSIIWDGLDSGKLYTLVLTDPDAPSRKDPKYREWHHFLVVNMKGNDISSGTVLSDYVGSGPPKGTGLHRYVWLVYEQDRPLKCDEPILSNRSGDNRGKFKVASFRKKYKLGSPVAGTCYQAEWDNYVPKLYEQLSGIRI	433999	366489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_369460_429488_429699_431763_431865_432547_432658_433818
912423	contig_938_pilon	-	4883	7	Intergenic	novelGene_143915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAGGAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98736	74774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_76440_82204_82360_82852_83000_91963_93568_95204_95349_96632_96766_97701
912424	contig_12312_pilon	+	1993	21	Intergenic	novelGene_63997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_16	71.6624727455033	49	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	94	1764	477005	533697	TRUE	60	GATTGTTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVSSSCSLGRAAVTVHRRRRGLHRRVRLPASMATTATCTRFTDDYQLFEELGKGAFSVVRRCVKKTSTQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKAAPLRTGNGSSMPEGRSSRDRTAPSAGMQPQPSLCSSAMRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476911	534369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_529242_529357_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
912425	scaffold_15027_pilon	+	4970	15	Intergenic	novelGene_163556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_9	131.104880900439	92	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	128	2158	48927	105053	TRUE	40	CCAGCATCTCAAAAATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKTDAHYSILSLLLCLSDSPSNSNYVGTPRDKEVEKKDDFDWGKYLMEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKDETDGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGLSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLCTPANFLTIEMMESVQYLVAVYF	48799	108635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775_103045_104778_105828_106597
912427	contig_5450_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_170917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATTAAGATTTACAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38984	41140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5450_pilon_+_39000_41100
912428	contig_563_pilon	-	2100	13	Intergenic	novelGene_169752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	79.4233995047359	75	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	96	1589	148760	121355	FALSE	15	CAGCCTGTCTCTGGATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGERTECAEPPRDEPPADGALKRAEELKTQANDYFKAKDYENAIKFYSQAIDLNPTHAIYYGNRSLAYLRTECYGYALADATRAIELDKKYIKGYYRRAASNMALGKFRAALRDYETVVKVKPHDKDAKMKYQECNKIVKQKAFERAIAGDEHKRSVVDSLDIESMTIEDEYSGPKLEDGKVTITFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPGHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGITLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSVSKRGVSCQFGPDVTKTFLEENHLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLRGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYANTLLQLGMM	148855	120843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_121418_121606_121689_122781_122961_123071_123113_124010_124099_124224_124368_126603_126710_127487_127587_127956_128023_132665_132788_133533_133682_140853_141096_148645
912429	contig_10354_pilon	-	3192	4	Intergenic	novelGene_50860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2672	3049	454503	432934	TRUE	25	AGTTCTAATTTATTACGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDRSLLTTCPKYVRRSLAIFAFKEHSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILRQHHSSKASILLQSSLFLVQLSGKAVCQMIHPISLPLQGRLLYVWPSAQRYWNESFHETHVSEGGDLAYFFFP	457174	432347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_432487_432929_433032_434099_434159_454282
912430	contig_18185_pilon	+	5349	1	Intergenic	novelGene_177211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	594	1785	361	2145	4865	6649	NA	40	TGTACTTTAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGKNPRQVELAPQAEPHEELSSLHIWQQIASDLTRCQESVSNRSQFYKQGDSPSPVAGGLSVIHTGEKTFQYNECTETFSDVPSFDLHQQLHSEEKSLTCSECGKSFRYISRLRNHQRVHMGKNRYKSDVCGKEVNQSSHLQSHLNVHTVEKLHKYEECGKRFKHRATLKVHCKGHTGVKLYNCEEYGRDFMYPSHFQEHERIHVGKRSFKCDTCGQNFQCRAALNTHCVVHKGEKPYKCEECGKGFSRRAGFQIHYRIHTREKPYNCEECGKGFSTTSQLLAHQRVHNGEEPFRSEECGKYLSHRSNLQLHHRIHTGEKPYNCEEYGKRVRQATYLLTHQRVYSREKRFKCEECGKGFSTRLNLQVHCRMHTGEKPYKCEVCGKAFRHVSQFLPHQRVHSGEKPFKCEECEKSFRQKSHLKAHRRVHSEEKPYKCEECGRGFKWNGNLNIHLRVHTGEKPYKCGECGKYFSQSSSLHYHERIHTGEKPYKCDVCSKVFSQSSQLQSHQRIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADFHIHYRIHTGEKPYNCEECGKAFRTFSLFLSHHRVHSGEKPFKCEECGKYFRSRSHVQHHRRIHTGEKPYNCEECGKCFRQVVHLLKHHSVHSREKPFKCEECGKCLSHREHLQLHRRIHTGEKPYNCKECGKHFRYPSQRLAHQSVHSGEKPFKCEECGKYLSSKSNLERHRRIHEGEKRY	4504	9853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18185_pilon_+_4500_9900
912431	contig_3155_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_26437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAAGTTTCACCTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298121	296161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_296200_298100
912432	SIRV6	+	888	7	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	880	258	-318	-123	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	35	367	2002	10736	TRUE	25	AGAAAGTTAGGTGCGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1967	11567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912433	contig_6195_pilon	+	7456	16	Intergenic	novelGene_71025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_4	136.453557422785	270	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	816	2339	105184	131553	TRUE	50	CATGTAAATAAAGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVTTNVDQLVPLDQFACTPTDTALTSVDSVCPSSEPEKINHENDFQNEMKLQKIDDQISQLLTESLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSVSLTFYFGIRANGSLEISESKYPKSVCLYDSQLR	94319	141080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_97122_97329_97627_97694_102785_102954_104866_105077_105171_105382_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_135488_135574_135713_137404_137541_140171
912434	contig_7816_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_66550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCAGGTAAGAGTCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323403	325367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_323400_325400
912435	contig_13004_pilon	-	5483	1	Intergenic	novelGene_112717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3513	3872	870128	869769	NA	40	TGAAACTGAATTATACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNSHTFFPNTLSHGFFFPPSTHHSNFELQGIRLHRSWEPRTGTHWHSAACASAWWPLPRKRPAPRGSWMRCPHQQEGVKGEGQLGLASRRPHRDPILKGGDAPQSLLPSPLPYPPPG	873640	868157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_868200_873600
912436	contig_10003_pilon	+	3269	1	Intergenic	novelGene_88245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATCTAGGACACAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689411	692680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_689400_692700
912438	contig_5649_pilon	-	2792	2	Intergenic	novelGene_82434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	0	137	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1424	1798	1468273	1467899	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNWSPPPGVKENEEHQRRKESISPRERKGHMNQRLHQPETRRNRWCPATTNERPDREHNRGSQMEREKGGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTLESMALGFSVSPELKQFPRPTLQTGIGLDCGT	1470744	1466904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1468726_1469773
912439	contig_9981_pilon	-	3324	5	Intergenic	novelGene_121029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTCGTGGCGATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481658	55519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_57515_245970_245981_262325_262765_291638_292348_481487
912440	contig_7816_pilon	+	2382	18	Intergenic	novelGene_66561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_2	32.4444694611565	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2085	297	2381	462329	528281	FALSE	20	TATGATCTGTGTAGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGEQQLDADTGSGVEEVELSWEDYLEDTGSTAVPYGSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVKADPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRKADFWCDIRKTDLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWAAFLRQTLTGACSPPVPLLEGLRNGRNPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLQSSDNFEHWLYYLDPFLHHIGWATQQGYELQPPLAIRHLKKEAEWQEIVAKVREEEEEPLPSYLFKDKQVIGTHAFSVNMKLEAVDPWAPFGISPATVIKVFDEKYFLVEMDDLRPETHARRSFVCHGDSPGIFPVQWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPSSVPEHEFKENMKLEAVNPLLPEEVCIATITAVRGAYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSAPRRARVYKQRKIAVVPPEKQIPSSRAVHEGLKNQELNSADSVMINGKYCCPKIYFNHRCFSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCGEVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLTKTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACVLKKASKRRKRRKNVFVHKKKHSSTSVDNTPAGSPQ	385752	528282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_385922_462201_462357_479393_479489_494932_495174_502521_502611_506455_506703_507389_507485_507957_508060_509102_509254_511377_511461_514682_514810_515865_515980_517560_517604_518931_518997_522739_522880_523697_523808_524492_524669_528102
912441	contig_10324_pilon	-	3808	1	Intergenic	novelGene_7854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	143	301	352578	352420	NA	20	CAGAACCCCAGGTTCCGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSFSHGAARGFKLLTFQLAAEHLTTVPPGLLRGSKILIIVELGYEYMGFVVLFYLRMFVRACGIRGRGGLHDPTPCMQVTQLGTGCCKVRTRARQVLA	352720	348912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_348900_352700
912442	contig_3602_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_60553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426907	425129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_425100_426900
912443	contig_9098_pilon	+	2301	1	Intergenic	novelGene_75829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTGGAAGCCATAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333003	335304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_333000_335300
912444	contig_21007_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_161543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	18	440	589	1011	NA	35	AAAAACTACGTATCTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	571	1858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1900
912445	contig_11512_pilon	+	2220	1	Intergenic	novelGene_43299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1115	1540	367144	367569	NA	55	AGAAGGAGAAATGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAHTVPGPPFCFPTCSLPSPICLALFRTGEAAHICTSGFVSGVCQRYLLIQVCTGGLCASFPSPASPWVPHCLTKPANKEGQHLVSLKSLQRRRGASPRSLDGWVKKAQCREKFASPCLPGHRFVVHGLPRLFSCRSFLE	366029	368249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_366000_368200
912446	contig_6137_pilon	+	7122	17	Intergenic	novelGene_59239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_13	1568.78705135528	6	134	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	4874	5908	1333137	1353702	FALSE	30	TGAGATTTTGAGAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLNWSMHHTSLFSKKQKVIDYYYKEDRLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1315555	1354916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1324083_1324128_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333050_1333220_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
912447	contig_10331_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_54156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTTTATGTTGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473764	472375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_472400_473800
912448	contig_2480_pilon	-	2611	3	Intergenic	novelGene_63542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2208	2522	263153	261703	FALSE	30	TTCTAACTAGGGTGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIQLTTTVAMMPFTTVLSHSTPCIQAAPRDAQTTSGRKSARRMYSSLDIDFRGPGLQMVPEIQRTFRLGTCLLRGEKFPFYKSSDIRAHVCTISTLTPDFFYL	266154	261613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_262003_263138_265134_265927
912449	contig_4418_pilon	+	2334	8	Intergenic	novelGene_98385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	110.361557932949	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	978	1931	887097	908961	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAATACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLYCVPRFSLVGSKFTVRTKVGIDGMKIVETHNEEYPHTFQVSGKERTLELQAGSEQDKEEWIKALQETIDAFHQRHETFRNAIAKDNDIHSEVSTAELGKRAPRWIRDNEVTMCMKCKEPFNALTRRRHHCRACGHVVCWKCSDYKAQLEYDGGKLSKVCKDCYQIISGFTDSEEKKRKGILEIESAEVSGNSMVCSFLQYMEKSKPWQKAWCVIPKQDPLVLYMYGAPQDVRAQATIPLLGYVVDDMPRSADLPHSFKLTQSKSVHSFAADNEELKQKWLKIILLAVTGETPPSPNEHPATLDDHAEPMKKSEC	854139	909364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_854148_886127_887261_890387_890419_890613_890707_891011_891138_901271_901413_904305_904447_908703
912450	contig_10013_pilon	-	586	1	Intergenic	novelGene_125043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAACAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179713	179127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_179100_179700
912451	contig_20356_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_159532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACACCAATTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64682	62802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_62800_64700
912452	contig_408_pilon	+	6678	2	Intergenic	novelGene_84925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCTATAATTACTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153760	160918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_156793_157272
912453	contig_4876_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_137898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1184	1543	365738	366097	NA	30	CTTTGCAATGGAGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVQGLTNRFDTTEDRSSETEDKERCGIQSKGKISSDRSSRTRGEKGKHTKELLTENFPNIMKDEKVAIQEAPRPSYRIDTKRKSPRHIIIILSKTTKSLESSFRKPKLHIERKQQD	364554	366730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_364600_366700
912454	contig_18511_pilon	-	3224	12	Intergenic	novelGene_126862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGTTAACAGGAAACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62237	35381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_35550_47191_47559_48080_48209_49185_49303_51676_51874_52222_52462_55272_55552_56903_57117_57849_58023_59151_59253_59751_59947_61190
912455	contig_10943_pilon	-	3181	1	Intergenic	novelGene_168262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGTGAGCAGCCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41185	38004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_38000_41200
912456	contig_1442_pilon	-	3770	2	Intergenic	novelGene_172167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1845	2177	544642	544310	TRUE	25	GGTTGAATGGACGTGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLPKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNFIWKGKRPRISKALLKKNKMGGLTLPGFRTYYTTTVVKTAWCWYNNRYIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFDKGPKSVN	546486	542439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_543360_543636
912457	contig_8866_pilon	+	1592	3	Intergenic	novelGene_77861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	148	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACAACAATCCAGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682969	686805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_684275_685277_685423_686663
912458	contig_16045_pilon	-	281	1	Intergenic	novelGene_130865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTGGGTATAGGGGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360603	360322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_360300_360600
912459	contig_6048_pilon	-	4752	11	Intergenic	novelGene_73213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_5	28.7888867447145	244	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	365	2239	1645874	1609163	FALSE	45	AAGTAGAGTTACCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMAPGPSLAQVYTSPVAVAVWEWQDELGTWHPYSATVCSYIEQQFVQQKGQRFGLGSLAHSIPLGQADPSLAPYIIDLPSWTQFRQDTGTMRAVRRHLFPQHSAAGRGIVWEWLSDDGSWTAYEASVCDYLEQQVASGNQLVDLGPLGYNYTVNYATHTQTNKTSSFCRSVRRQAGPLYPVTTVIAPLGYTGVTCSCHQCLSGSGTGPVLGRYRHSMTNLPSYPVPQTPHRTTIVFGAHQAFAPYNKPSLSGARSAPRLNTTSPWSGAPPTLGNQPVYRSSLSHLQHLPPGSSTSSGASASLPSGPASSPGSVPASVPVHVPASVPVQMPKPSRVQQALAGMTSILMSAIGLPVCLSRAPQPASPPASCLASKSHSSVKRLRKMSMKGGTPKPEPEQVIKNYTEELKHPPDEDCIICMEKLSLVSGYSDVTDSKTIGPMAVGRLTKCSHAFHLLCLLAMYCNGNKDGSLQCPSCKTIYGEKTGTQPRGKMEVFTFQASLPGHEDCGTILIVYNIPHGIQGPEHPNPGKPFTARGFPRQCYLPDNPQGRKVLELLKVAWKRRLIFTVGTSSTTGETDTVVWNEIHHKTEMDRNVTGHGYPDPNYLQNVLAELAAQGVTEDCLEQ	1661988	1606649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1609388_1611198_1611289_1621379_1621542_1622597_1622757_1624167_1624242_1627230_1627372_1634441_1634567_1643078_1643710_1645606_1645965_1660564_1660730_1661879
912460	contig_17144_pilon	-	1394	6	Intergenic	novelGene_29307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	35	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	147	1310	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166851_174896_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
912461	contig_6862_pilon	-	2644	12	Intergenic	novelGene_63745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGCCCCGCCCCCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144271	48923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_49561_55247_55398_55962_56140_75087_75208_82884_83002_83260_83945_84168_84327_85673_85795_86044_86221_109121_109217_110490_110596_144167
912462	contig_5084_pilon	-	1961	11	Intergenic	novelGene_64687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_10	37.5964094030268	114	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	344	1804	1838867	1815973	FALSE	40	AAGTTATACTGGACACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRGRDEPPESYPQRQDHELQALEAIYGADFQDLRPDACGRVKEPPEINLVLYPQGLAGEEVYVKVDLRVKCPPTYPDVVPDIELKNAKGLSNESVNLLKSRLEELAKKHCGEVMIFELAYHVQSFLSEHNKPPPKSFHEEMLERRAQEERQRLLEAKQKEEQEQREILHEIQRRKEEIKEEKKRKEMAKQERLEIASLSNQDHTPRKDPGGYRTAAILHAGSPDFVGNGKHRANSSGRSRRERQYSVCSSEDSPGSCEVLYFSGSSADQLVVHKGKRIGSDEQLGKSIYNALETTTGSFVLLYEWVLQWQKKMGPFLTSQEKEKIDKCKKQIQGAEAEFSSLVKLSHPNVVRYLAMNLREQDDSIMVDILVEHISGVSLATHLSHSGPVPTHQLRRYAAQLLAGLEYLHSNSVVHKVLSASSVLVDAQGTIKITDYSISKRLADICKEDVFEQTRVRFSDNALPYKTGKKGDVWRLGLLLLSLSQGQECEEYPVTIPRDLPADFQDFLKKCVCLDDKERWSPQQLLKHSFINPQPKMPLLEQSPEDSGGQDYVETVIPSSQLPSAAFFSETQRQFSRYFIEFEELQLLGKGAFGAVIKV	1873178	1815815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1816137_1816521_1816629_1822254_1822791_1823753_1823912_1827624_1827741_1834436_1834586_1836146_1836228_1838717_1838871_1849758_1849862_1852241_1852355_1873054
912463	contig_13952_pilon	-	3607	1	Intergenic	novelGene_133258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	3103	3474	169265	168894	NA	50	GATGAAATACTAGAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSDVAATSVLMTQLPQAGVHVLSIYWACPAMTPAEMFSLLVFPMAICPASGSPSQVCRGIFVCSLLPRPGVALPCETLTSDSLDRFLSLFAVVVTSPSSCPSSEGEELCLEPFSWWVSLA	172367	168760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_168800_172400
912464	scaffold_12124_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_22133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGATGAGAAGTTCGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939575	938325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_938300_939600
912465	contig_14744_pilon	-	2152	5	Intergenic	novelGene_66019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_3	332.410138232876	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	84	1319	969897	962248	FALSE	75	CCTCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPVRPSASSWPSIPPSSRHTAWGLELETILPEEIVSYSYSRRLCSLFYSHLGPSHRVPGILTFLVQSAFLN	969980	961414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
912466	contig_7915_pilon	+	1538	10	Intergenic	novelGene_42954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_6	144.055116338191	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1317	222	1538	39717	63706	FALSE	55	GTATGTAAAAACAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRSLSPLGGPETLPFHSGGQWCEQVEITEESSMPLDYHDHKEADSHPGVRYITEALIKKLTKQDNLALVKSLNLSLCKDGGKKFRYIENLEKCVQLEVLNLSYNLIGKIEKVDKLLKLRELNLSYNKISKIEGIENMCNLQKLNLAGNEIEHIPVWLGKKLKSLRVLNLKGNKISSLQNVSKLKPLQDLTSVILVENPIVALPHYRQFTIFHLRSLESLEEEVERLERDLEKKVMETEELKSKQTRFLEEIKNQDKLNKSLKEEALLQKQSYEELESDLNTKNELLKQKTVELTRACQKQYELEQELAFYKIDAKFEPLTYYPSEYVEIDKAPDESPYIGKSRYKRNMFTTESHIIDNSQPVQIRKMEPDEGEQLRNEQVNLKTQVPLDIQLEDKEKISAAQTRLSELHDEIEKAEQQILRATKEYKQLEEAIQLKK	35875	63706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_35976_39595_39847_41330_41462_44610_44742_46251_46394_48108_48242_53931_54126_60118_60239_61078_61305_63596
912467	contig_14970_pilon	+	1135	5	Intergenic	novelGene_45062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_1	2534.39040994082	432	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	330	434	231446	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192186	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
912469	contig_5062_pilon	-	1686	12	Intergenic	novelGene_157836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	266	568	743819	742961	TRUE	30	AACTCCAACCCTCGCGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSLRTKVTGTWTGCRTHLQPSRNAEMSGTTQSILSPHLYIVSASTSPNHTRKFGVKFCPVSSSMATSPPPFNCNSQKIRMAHPLVKRILCLVCTNDCP	744084	622697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_622736_662399_662571_706256_706293_716399_716498_723731_723898_733902_734080_739284_739423_739579_739691_741720_741846_742902_743019_743398_743525_743700
912470	contig_7426_pilon	-	667	5	Intergenic	novelGene_27519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	293	322	1000590	1000561	TRUE	5	GCTGCCCCGCCGCGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWEQTLVRQHSRCLGQQNGKVLGEHGIQPRAVHNTRLRPRQGQGLVQNPAVCPLTASSFLWSWAVSFHDPSGTAPTAAWLRPSSIWACGGRSRLPSLMASVCTWTM	1001053	994607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_994653_999840_999936_1000045_1000232_1000541_1000601_1000771
912471	contig_7129_pilon	-	4540	1	Intergenic	novelGene_169305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGCTGGGCGCCACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909209	904669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_-_904700_909200
912472	contig_6612_pilon	-	2988	2	Intergenic	novelGene_148166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAGCAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35853	32763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_35487_35588
912473	contig_3018_pilon	+	3770	1	Intergenic	novelGene_78907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCAGGATCACAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614594	618364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_614600_618400
912474	contig_5020_pilon	-	2217	11	Intergenic	novelGene_27943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	18.6785973777476	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1128	1694	184757	166991	TRUE	20	TCTGGAGAGGCCTGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQLKIWSAEDASCVVTFKGHKGGVLDTAIVDRGRNVVSGSRDGTARLWDCGRSACLAVITDCGSSINGVAVGAADNSINLGSPEQTPSEREVGTEAKMLLLAREDKKLQCLGLQSRQPASVSFCWLRCLQLLYFSLWLLTIGWDTGWEHLSVGCEESKGSSTSYPQIRSTSSLLAQFQRWIHCEPR	198347	164170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_164615_166911_166995_171486_171570_173613_173730_175099_175196_178068_178264_184684_185596_187799_187890_190949_191054_196551_196593_198293
912475	contig_6102_pilon	+	3850	30	Intergenic	novelGene_31877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	497.266841377834	4	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	882	2649	16	2664	370803	393075	TRUE	20	CTCAAACCAGCTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370787	395255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374496_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393350_393756_393856_393929_394036_394221_394272_394467
912476	contig_7333_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_142753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAGAGATATCCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96555	98001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_96600_98000
912477	contig_4519_pilon	+	3613	4	Intergenic	novelGene_123681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1212	1736	86529	87053	TRUE	20	AGCCTTAGCCATGTTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNNCTYPLIIRTWNVQSMNLGKLEIIKNEMEHIKIDILGISKLKWTGIGHFQSDTHMVYYPGNDKLKRNGIAFIVKKKISRSILQYNTVSDGIISIGLQGRPVNTTVIQIYKPTAKAKDEETEDFYQLLQSKIDQTCNQDALIITGDWNVKVENKEEGLVVGKYGLGDRYDT	83004	147742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_83596_85908_87541_122388_123027_146990
912479	contig_15104_pilon	+	1183	2	Intergenic	novelGene_163349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	79	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	77	364	586244	587232	FALSE	40	TCAATGTTTTAATCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPGCFCLRPVRAARHPEACRPCAAMHCATVTVAVTGTLSPTPGPPALPLSPSPAPARKLPGAAGAVVRRIPRPAEAHHLWGGEREARSLAASRLMFQVGAFLVKKHGSNSRQVLLLQGA	586167	588051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_586463_587163
912480	contig_7979_pilon	-	698	1	Intergenic	novelGene_125553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCTATTTTTGTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127524	1126826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_-_1126800_1127500
912481	contig_2646_pilon	+	3398	2	Intergenic	novelGene_69537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGTCTACTGTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576411	579864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_578311_578365
912482	contig_9706_pilon	-	4388	1	Intergenic	novelGene_21029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAATGGTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	601442	597054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_597100_601400
912483	contig_10129_pilon	+	1196	4	Intergenic	novelGene_128168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	287.18402926811	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATCCCGTGTATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590661	597387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_590858_592929_593158_595360_595456_596710
912484	contig_7179_pilon	+	2279	7	Intergenic	novelGene_78086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	70.2774264374178	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1447	1983	580349	586612	FALSE	30	CTGTGCACTTTTATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTDFAMQNVLLQMGLHVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMNRVFCSHCGNKTLKKVSVTVSDDGTLLMHFSHNPRVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAVNPHLTEDQRFPQLRLSRKARQKTNVFAPDYIAGVSPFAENDICSRSATLQIRDSTLGAGRRRLNPNASRRKFVKKR	576837	586908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_576910_577030_578226_579657_579710_580221_580373_580923_581022_583194_583340_586342
912485	contig_7471_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_161279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCCTATTAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10862	9865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7471_pilon_-_9900_10900
912486	contig_9011_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_159276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAGAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137429	138264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_137400_138300
912488	contig_15500_pilon	+	2412	2	Intergenic	novelGene_128988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	999	1307	225345	225653	TRUE	15	GTATATGTCAGCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDSMGKILNDARNVKRRYKEYTESLYQKELVDVQPFQEVAYGQEPMVLKEEVQAALKGMVKNKASGIEVRIEMFHQMDATVAMLTHLCQEIWKTATWPTD	224346	226994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_226300_226535
912489	contig_12391_pilon	-	5197	2	Intergenic	novelGene_103608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1969	2607	76635	75997	FALSE	40	TTGACAGAAATAGGGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIPKRGDPTECANYQTIPLISHTSKILLKIIQKWLQQYTDREMSEIQAGFRRGCETKDITADVRWILAKNREYQKDVHLCFTHYAKASDCVDHKLWITLQRMRIPEHLIVLMRNLYIDQEQVVQTEQGDIGLFKVKKGVFQGCILSPYLFNLYAEQIIREAGLYEEEWGIRIGGRLINNLGYTDDTTLLAENEEDLKHLLMKIKDYSLQYR	126033	73406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_77386_124815
912490	contig_14041_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_144032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	731	1135	36989	37393	NA	85	AAAACTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYIQCCKPKKKKKKTHNKLWKTLQTTGIPEHLIVLMWNLYIDQGAVVQTEQGDAAWFKIRKGMQQGCILSPYLFNLYAEQLIQEAGLYEEEWGIRIGGRLIRNLQYADDTTLLAESKEDLKHLLMKIKDYTST	36258	38171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_+_36300_38200
912491	contig_8479_pilon	+	2732	3	Intergenic	novelGene_178913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1178	1687	130537	131046	TRUE	60	CAAAATCAAAACATTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKLEEFRKIMQEQNAKINSKLEIKQRQQLEIQKKNNKISEMDDVIEGLRSRSEMVEDRIGGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVKWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRREPKRKSPRHIIFTLAKTKDK	54346	132721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8479_pilon_+_54757_129769_131066_131695
912492	contig_15491_pilon	-	1415	7	Intergenic	novelGene_75959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	443.342857040563	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	61	672	46982	37061	TRUE	70	CTCAAAAAAAAAAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47042	32005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_33111_33419_37054_37200_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
912493	contig_6102_pilon	+	4233	30	Intergenic	novelGene_31859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	215	junction_20	471.478033705017	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	886	2661	58	2718	370803	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370745	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
912494	contig_15152_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_126960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103807	106052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_103800_106100
912495	contig_8377_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_35031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTGTGTATTACATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74723	73257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_73300_74700
912496	SIRV6	+	1499	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	26	3	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1733	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	232	723	1733	10736	TRUE	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1113	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912497	scaffold_19766_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_34292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTTCAGTGCCTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424910	427413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_424900_427400
912498	contig_17785_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_175577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTGTGCTGATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19776	21163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17785_pilon_+_19800_21200
912499	contig_4065_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_133416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCGTTTATAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	949622	947855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_947900_949600
912500	contig_12113_pilon	+	7106	8	Intergenic	novelGene_134752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	122.907298732145	348	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1133	3402	358	3759	319492	354183	FALSE	30	CAATTGTGGGTAGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTGSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSAEDPRQVRNPPKFGTYHKALQEIRNSLLPFANETSSSSRSTSEVNPQMFHDLQAAGFDEDMVIQALQKTNNRSIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGNVQQSINRKQSWKGSKESLVPQRHGPPLGESVAYRSESPNSQTDVGRPLSGSGIAAFAQGHPSNGQRVNPLPPPQVRSVTPPPPPRGQTPPPRGTTPPPPSWETNSQTKRYSGNMEYVMSRISPSPVPPGTWQEGFPPPPLNTSPMNPPNQGQRGMSSVPVGRQPIIMQSSNKFNFPPGRPGIQNGSGQTDFMIHQTVVPAGAVNRQPPPPYPLTPTNGQSPSTLQTGGSAAPSSYTNGNIPQSMMVPNRNSHNMELYNINVPGLQTAWPQSSSAPAQSSPNSGHEIPTWQPNIPVRSNSFNNPLGNRTSHSTNSQPSATTVTAITPAPIQQPVKSIRVLKPELQTALAPTHPSWIPQPIQTVQPCPFSEGTTSNMTVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYDSINKSSKEDQPSLPKEDEGEKSYENVDSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYFVMDYIPGGDMMSLLIRLGIFPENLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSNCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQVKVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHSFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDGNEEENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQHTGSEIKNPDLVYV	309602	357530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_309822_319353_319843_341211_341360_344843_346364_348741_349325_351458_351642_351855_351963_353673
912502	contig_3975_pilon	-	2244	12	Intergenic	novelGene_54841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	122	junction_11	183.641359067969	865	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1034	1783	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079253	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
912503	contig_11422_pilon	-	1374	1	Intergenic	novelGene_99089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGGTGTTAGTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2121	747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2100
912504	contig_15491_pilon	-	1288	7	Intergenic	novelGene_75956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	416.206545946708	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	57	668	46982	37061	TRUE	30	CCAAAACATGCTTTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47038	31427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_31938_32331_32436_37054_37200_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
912505	contig_3424_pilon	+	2670	4	Intergenic	novelGene_55585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_2	33.95094500403	59	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1362	1745	1144258	1146306	FALSE	20	ATAACACCGGTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIREESDYRDLESVVQQVEQNLELMTKRAVKAENHILKLKQEVSLLQAQVSNFKRENEALRCGQGASLTVVKQNTDLALQNLRVVMSNAHASIKQLVSGAETLNLVAEILKSIDRISEIKDEEEEES	1142896	1147231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1144336_1144708_1144772_1145415_1145556_1146203
912506	contig_5023_pilon	-	1301	2	Intergenic	novelGene_7392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAAGGGAGAAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648303	646857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_646956_647100
912507	contig_12125_pilon	+	1165	3	Intergenic	novelGene_76243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_1	37	41	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	174	1058	569653	605611	FALSE	25	ACGGGGAGGTTCAGCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRDGRLGSHLPSLPSLNLKASRSLSLPEHGPKLPLGTAEDQHSLESVDSGIPTLEIGNPEPVPCSVAHTQRKPSEPEAIPERASQSACPLPSCALPAPTGAEREQGVRKSSTFPRTGYDAVRLCSPTARALSRSDAASVCSVSSLGTELSATLSVSNEDLLDLVTSSSSAIVALENDDDPPFTDVTLGSTKEASGPAQQDGAEEPEEGSKSGLLGPLSHFLARNLLARKQNARLDKQNDLGWKLFGKVLLRENAQKDSKKVQKVYKPWGPRERPLCVQCAPTTCAEVAVPRL	558257	605718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_558369_569590_570327_605400
912508	contig_405_pilon	-	4023	22	Intergenic	novelGene_135318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	121	junction_10	62.6425268312227	70	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1072	3219	283	3501	555100	474443	FALSE	50	CAAAAAAACCTATACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSRLDRLFILLDTGTTPVTRKAAAQQLGEVVKLHPHELNNLLSKVLIYLRSTNWDTRIAAGQAVEAIVKNVPEWNPVPRTKQEPTSESSMEESSTTDRLNFDRFDICRLLQHGASLLGSAGAEFEVQDEKSGEVDPKERIARQRKLLQKKLGLNMGEAIGMSTEELFNDEDLDYTPAAAALVNKQPTLQAAELIDSEFRAGMSNRQKNKAKRMAKLFAKQRSRDTVETNEKSNDSTDGEPEEKRRKIANVVINQSANDSKVLIDNISDSSSLIEETNEWPLESFCEELCNDLFNPSWEVRHGAGTGLREILKAHGKSGGKIGDSTLEEMIQQHQEWLEDLVIRLLCVFALDRFGDFVSDEVVAPVRETCAQTLGVVLKHMNETGVHKTVDVLLKLLTQEQWEVRHGGLLGIKYALAVRQDVINTLLPKVLTRIIEGLQDLDDDVRAVAAASLVPVVESLVCLQTQKVPFIVNTLWDALLELDDLTASTNSIMTLLSSLLTYPQVQQCSIQQSLTVLVPRVWPFLHHTISSVRRAALETLFTLLSTQDQNSSSWLIPILPDMLRHIFQFCVLESSQEILDLIHKVWMELLSKASVQYIVAAACPWMGAWLCLMMQPSHLPIDLNMLLEVKARTKEKAGGKVRQGQSQSKEVLQEYIAGADTIMEDPASRDFVVMRARMMAAKLLGALCCCICDPGVNMVTQEIKPAESLGQLLLFHLNSKSALQRISVALVICEWAALQKECKAVTLAVQPRLLDILSEHLYYDEIAVPFTRMQNECKQLISSLADAHIEVGNRVNHNVFTIDQANDLVTTVFNEVTSSFDLNPQVLQQLDGKRQQVQMTVTETNQEWQLLQLRVHTFAACAVVSLQQLPDKLNPIIKPLMETIKKEENTLVQNYAAQCIAKLLQQCTTRTPCPNSKIIKNLCSSLCVDPYLTPCVTCPVPTQSVQENSKGSNSEKDGMHHTVTKHRGIITLYRHQKAAFAITSRRGPTPKAVKAQIADLPAGSSGNILVELDEAQKPYLVQRRGAEFALTTIVKHFGDEMAVKLPHLWDAMVGPLRNTIDINNFGMYMFF	555382	473920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_474617_476070_476262_477392_477820_484515_484720_486189_486365_488804_488948_489234_489385_492272_492378_504766_504888_507635_507761_510119_510261_512959_513137_513234_513331_513981_514072_515227_515297_515998_516129_519314_519452_522877_523042_529289_529437_531016_531132_534540_534665_555086
912509	contig_3018_pilon	-	2629	3	Intergenic	novelGene_78840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	887	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTTGTACTATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565138	560951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561125_561477_561574_562778
912510	contig_5669_pilon	+	1739	9	Intergenic	novelGene_86059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	237.913849954138	18	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	72	1529	182940	194361	FALSE	15	GTTGGATTTTTACTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGGRRARARRASRSAPHTDTFAMNQPAPGAPPAPRRVRLKPWLVAQVNSCQYPGLQWVNGDRKFFYIPWRHATRHGPGQEGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQKQVHQETNFPPTMPARPQPFFLNRADFPSQSQTGTPLNGLRRLESLPVWRDALVAVKAPLPHGGF	178271	194571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_194163
912511	contig_13067_pilon	-	2199	1	Intergenic	novelGene_141344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44154	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44200
912512	contig_9668_pilon	+	2655	2	Intergenic	novelGene_58206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524690	559351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_524795_556800
912513	contig_1301_pilon	-	1323	5	Intergenic	novelGene_47301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	350	junction_4	1051.35317567409	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	822	501	1322	278481	268651	FALSE	45	GTAAGAAGACCAAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSFSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENER	278981	268649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_277728_277906_278296
912514	contig_5643_pilon	-	1090	3	Intergenic	novelGene_38765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_2	12.5	15	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	148	534	187782	186860	FALSE	45	AACAATTTGTATATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSLSWGAGRLLWGWVPLACRSFSLGVPGLSRVRLTLPPPKVVDRWNEKRAMFGVYDNIGILGNFEKHPKELIKGPKWLRGWKGNELQRCIRKKKMVGNRMFLDDLHNLNKRISYLYKHFNRHGKYR	187929	186303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_187057_187508_187620_187703
912515	contig_7179_pilon	-	2578	6	Intergenic	novelGene_78176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_5	136.829236641881	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	152	535	1071584	1062672	TRUE	75	ACAATAAAAAAAAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPAASGGSAGSRSRPPPRAPRAGPSTWAFRGRTEAASSTAGCGADPGDEMTTSTLQKAIDLVTKATEEDKAKNYEEALRLYQHAVEYFLHAIKYEAHSDKAKESIRAKCMQYLDRAEKLKDYLRNKEKHGKKPVKENQSEGKGSDSDSEGDNPEKKEIARATDGCCCDGEAQHSVE	1071735	1060037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1061362_1061952_1062712_1062826_1062890_1064932_1065081_1065173_1065286_1071563
912516	contig_18824_pilon	-	4165	3	Intergenic	novelGene_178914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	3347	3937	874	284	FALSE	35	AGGCAAGAAGGCAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	19443	55	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18824_pilon_-_1598_2414_2729_17134
912517	contig_13571_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_128128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAGAAAAAATATATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300642	298516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_298500_300600
912518	contig_16122_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_134534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	370	903	219422	218889	NA	15	AGGAGTGTTCCCCCACGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVLLSGHTLPCVLQTTHWLEILQALLLSPSRELQHRGVVVVLNMVEASKETASTLMESEVLEILSVLAKGEEGPVTRGCRSLPGESGGVRAYQTQPGWKVRGCLWFQSSGTPYLHTPPIAAPGAKIEATLAGEGWDAGHSCLCFSAVAVRSHVEPHSPALQHCLQPHPAEPFPVLL	219791	218047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_218000_219800
912519	contig_9785_pilon	+	4789	6	Intergenic	novelGene_157887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	104.568829007501	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	664	1062	235156	236466	FALSE	30	TGAAAATAGTGGTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASYAGISETVIHFVIYENIKQKLLEYKTASAMEEDEESVKEASDFVGMMLAAATSKTCATSIAYPHEVIRTRLREEGTKYRSFFQTLSLVVQEEGYGSLYRGLTTHLVRQIPNTAIMMATYELVVYLLNG	194919	240193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_195154_214250_214416_218397_218476_223917_224019_235070_235361_236272
912520	contig_612_pilon	-	4657	3	Intergenic	novelGene_155625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1591	2223	59770	4224	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKE	61360	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_-_1472_3260_4230_59143
912521	contig_17769_pilon	-	4472	11	Intergenic	novelGene_124248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1892	2626	37896	30055	FALSE	20	TGCTGCTAAGTCAGTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTAARNLCCTCWYSSLCSNIKEESPFFVSSSRIERPGLEYRGQVLLGVVSHMDLGYTRCLCRDLCSPRIARAPKYLFSSVSGFKCLCSTWSTCFLELRGGGPGRANPPLSSILSKMRSISSSPFSKVSPVVLFLFFCFFFFFRSLPLELDCSEAAAFSTPSPSFLVSVFPCLALPLFPETTVSVGMQSDLSPFTTGSSSSSSVFICERRSEGYSGITCMLQSCLNSGTEIQVTERKQEVTHT	44435	28208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_30333_31840_31917_32652_32771_33779_33846_36590_36672_37780_38659_39506_39600_40694_40789_40856_40963_42215_42372_43755
912524	contig_8576_pilon	+	4636	19	Intergenic	novelGene_88727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_1	103.586249623737	171	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	48	2258	670133	747485	FALSE	20	GTTCTTAGTTTGAAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEHIEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDSLQQREQQLLESLGDGAEFSVSSSASTDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVSRTNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPIPQEETSFAETALAPGSSPPAPPSDSPGPPILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRNQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKNAHPGRGLWRICSLQVATPSWQHLLLFLKSCVRTVC	604635	749863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_604665_670114_670217_680144_680409_689820_689925_690741_690845_694836_694986_695960_696081_700724_700885_707554_707592_710387_710525_711469_711588_713469_713555_714881_715059_732575_732623_733369_733489_737195_737328_740379_740515_741564_741720_747400
912525	contig_14034_pilon	+	2678	1	Intergenic	novelGene_72648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1107	1424	278844	279161	NA	40	AGCTTTATAAAGCTGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSMLIYHSENPRAHKNYAKSTLPVLYKWNNKAWMMVHMFTIWFTEYFKPTVETYCSEKKISFKILLLIDSAPGHPRDLMRYTRRLTLFSCLLTQHPFCSSRIKE	277737	280415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_277700_280400
912526	contig_10377_pilon	+	5212	8	Intergenic	novelGene_115402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	694	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCACGGAAACTCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231009	338644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_234611_249973_250131_267722_267962_269085_269248_280150_280747_282853_283023_301211_301410_338554
912527	contig_20602_pilon	-	1607	12	Intergenic	novelGene_133725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	292.465523856451	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	12	1418	29552	10033	FALSE	15	ATTGGTCTAATGTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGEAGVTLGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHLNWLGSDKKRSNNQANSR	29563	9843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13348_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
912528	contig_8254_pilon	+	2067	2	Intergenic	novelGene_48402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	477	839	127000	127362	TRUE	20	CCTTGCTCCTCGAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSVSEILFIFWISNCCLCVISSCEFILEFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLCIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSVVLFWMPTGTILSYFCKCFDIVCCFRGIE	126523	129094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_128121_128624
912529	contig_7457_pilon	+	4642	19	Intergenic	novelGene_31522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	288.304478324951	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1110	2252	759164	771926	TRUE	20	CAATATTGAGTCTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHLQATGTLSAHFRNMSLKRIKRSDRRGAESVTEEKFTILFESQFSVGGNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDNNATATVLWDNAFAEPGRVPFAVPDKVLWPQLCEALNMKFKAEVQSSRGLTKENLVFLAQKLFNSSSNHLEDYSNMSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRLGDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPSKAIDGYVKPQIKQVVPEFVNASADSVGGSATYMDQAPSPAVCAQAPYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLDDTMDVARRVEELLGRPMDSQWIPHAQS	704809	774518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_704906_747082_747221_750076_750173_752688_752810_757014_757146_757403_757556_757976_758133_758570_758753_759126_759215_759289_759413_760428_760522_762657_762865_764333_764429_764530_764662_765741_765898_770753_770806_771159_771268_771799_772852_773053
912530	contig_2332_pilon	+	2787	1	Intergenic	novelGene_58690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGGAAAAAAACAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472624	475411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_472600_475400
912531	contig_2730_pilon	+	2052	3	Intergenic	novelGene_135392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	278	junction_1	216.5	1149	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGATATGGAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376172	392489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_376306_379343_379459_390685
912532	contig_8420_pilon	+	5382	1	Intergenic	novelGene_69371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	249	593	245878	246222	NA	40	ACTTAAATCTAGTGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSSNFHYGMSDLLSVCCQEPSVCEKEALPVSENSFKMLGSSDDLSSDSESRLLEEPAQLSPQQGFRRRANTLSHLPMESQEPLEPAEVSPGVSQRKLTRYHSVSTETPHERK	245629	251011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_245600_251000
912533	contig_12086_pilon	+	3537	2	Intergenic	novelGene_74711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTGAGAGGGACCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11547	16099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_+_14969_15983
912534	contig_9484_pilon	+	3824	13	Intergenic	novelGene_105660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	594.661855361702	9	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	70	978	126829	211628	TRUE	30	GACAGGGAGTGAAGCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPGTESSRIYSQSVTVTKTLNESLQ	126759	214542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_211557_213165_213232
912535	contig_13786_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_174571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATAAAAAGCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78379	80682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_78400_80700
912536	contig_8898_pilon	+	5816	4	Intergenic	novelGene_137261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	8.5764535535124	181	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3	341	340080	374538	TRUE	30	TAACCCTGAGGTAGTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRSIQHVTSLALIRSLSQIGTERSSLQVFPSILLSAFRSEADYHSGATLSWCGGFIEKAGGTHTWRNKQTQTLPGTKSAPPDPVQVAWRAGRTKRRKAICAWGSACWGEER	340077	423024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_340261_374380_374579_378881_378971_417678
912538	contig_7025_pilon	-	2568	19	Intergenic	novelGene_104380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	941.434099435668	1	121	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	72	1316	94822	72953	TRUE	15	GCCAATATTTTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMHTPPFCPGFHMSIQPAPDPLCLPISPLDRSCPFSPMYLLELRSTLFTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGV	94893	49039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65846_66975_67095_72952_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969_91018_91826_91965_94786
912539	contig_5302_pilon	-	2908	9	Intergenic	novelGene_81412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	693.210274285516	2048	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	328	1236	209238	177220	FALSE	25	CCCTGAGGAATAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209565	175547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
912540	contig_7179_pilon	-	5697	7	Intergenic	novelGene_78110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGGAGATTTTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990880	677798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_678119_678283_678746_730175_730770_742683_743691_934103_934288_945827_945993_987915
912541	contig_10801_pilon	+	4069	2	Intergenic	novelGene_74032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	161	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCTTCACCTGAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237173	252135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_237563_248455
912543	contig_7704_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_154632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGGGTGTGGCCTTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424495	423375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_423400_424500
912544	contig_6552_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_163601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132970	135579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_133000_135600
912546	contig_19352_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_122417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	526	855	344860	344531	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSARCSPGRKETSSPVQKDRERFLGVGNSMCQVLRGQSLFVLLQGIKLIQCSWSMKQKKDAIEIAHNRPFVDRGLIKEQILVKWTWTDEELTGVTGEVYKNKLCNSGLL	345385	343950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_344000_345400
912547	contig_8687_pilon	-	2027	1	Intergenic	novelGene_169653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATATCATTAATATCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28950	26923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_26900_29000
912548	contig_12869_pilon	+	2889	6	Intergenic	novelGene_75335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	351	junction_1	264.266834846902	16	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	14	568	67397	85702	FALSE	20	TCCCAGCACCATTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKVI	67383	88023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81994_85623
912549	contig_6902_pilon	+	3328	1	Intergenic	novelGene_135607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2155	2463	510350	510658	NA	55	AAAGAAAATATTGCTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQGIFWDLLPAQGSQTLEGGRPEGCRAGREEVKGREVFSKRVFFFKSLQKAAHIYLCLATWELLFTSSECPSRISAAGSLLMWKLSPECKCAAVCLLHCIR	508195	511523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_508200_511500
912551	contig_19850_pilon	-	1669	12	Intergenic	novelGene_170853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	77.7604926352453	1	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	678	991	1668	22706	3450	FALSE	25	TAGGTTCTATACATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTSH	39623	3448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_29232_29291_30417_30478_32120_32463_38256_38447_39010_39081_39509
912552	contig_6272_pilon	+	4682	35	Intergenic	novelGene_160446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	174.61487033233	60	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1037	3114	131	3244	133604	220365	TRUE	20	TATTAACTGACTTCGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFAIRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWETFKKKPDHFPFFFKCILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQPARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSIPLSEPVTVDKVHYCERFIELTIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCSLSCLVRREEDGHLFSQLLDVLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQRAAFAHFPELYDFALSNVAEVDTRESLVKCFGPLSSNTLHQVASYLCLLPALPKNEDTAFDKEFLLELLVSRHERRISQIQQLNQMPLYPTEKIIWDENIVPTEYYSGEGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYEIRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADITINLNVRDHIKDEWEGLRKHDVCFLITVRPTKPYGTKFDRRRPFIEQVGLVYVRGCEIQGMLDDKGRVIEDGPEPRPNLRGESRTFRVFLDPNQYQQDMTNTIQSGAEDVYETFNIIMRRKPKENNFKAVLETIRHLMNTDCVVPDWLHDIILGYGDPSSAHYSKMPNQIATLDFNDTFLSVEHLKASFPGHNVKVTVDDPALQIPPFRITFPVRSGKGKKRKDADGEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMVVGPPGTGKTDVAVQIISNIYHNFPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIMALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNYVLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASYTCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGNPLPDVAEIATFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRSKYLLVKEAKVIAG	133473	248708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_133679_136037_136095_139069_139111_146394_146431_150176_150298_152348_152490_153855_153925_154949_155051_162090_162168_164423_164489_165672_165790_167196_167311_170027_170132_175031_175135_178313_178435_186638_186781_189277_189457_192577_192746_195368_195539_199591_199834_201721_201869_202642_202713_206226_206338_208819_208930_211281_211418_214324_214535_216555_216635_220357_220526_220854_221027_227478_227650_239229_239316_242789_242965_245320_245435_248067_248408_248488
912553	contig_8866_pilon	+	6064	1	Intergenic	novelGene_77829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCACATCCGAGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576990	583054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_577000_583100
912554	contig_5539_pilon	+	2489	1	Intergenic	novelGene_104760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATCATAAATAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141540	144029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_141500_144000
912555	contig_17274_pilon	+	3939	6	Intergenic	novelGene_26532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	339	junction_1	391.916623786233	127	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	61	597	131715	168617	TRUE	60	GGTAAAGACAGAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGNGHLSAMMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGNGENFHRSLPWLLADLSSRVGLFLLTLFYDS	131654	172397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131747_163816_163980_165066_165236_166823_166899_168519_171637_172074
912556	contig_6958_pilon	+	1282	9	Intergenic	novelGene_69995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	296.934230933384	1	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	481	1029	750213	769290	FALSE	5	TGTTCCTTTTTCTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFEKQQQQQQQQQQQRQQQVDLPGPVSQPCERPTTSSGALGSDLGDAMSEEDMLQVAMSMSLETIRNNLETEGEK	728681	769543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_728730_737254_737416_739196_739307_739744_739812_750118_750284_750917_751082_752856_752954_758481_758604_769195
912557	contig_2480_pilon	+	2927	2	Intergenic	novelGene_63543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_1	0	15	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTACATTTCCCTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262416	266137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_265138_265931
912558	contig_11448_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_66420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	231	812	557833	557252	NA	55	CAGGTAGCCACAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGIPLRICASRSGRFQATQHRPARSGSQLKKRKENKQFKTNRLKPQDPTSVAAQTRKQFHTRSELRSLSGRSKDGAQSQVFERKKGEVVRGKEEIKRSRKKATPAVNKWHSESRPVRAGGIQAAGASRTRDCGCRKQRRLSGGEEGWGVGKHILQITFCSFSHRKLREAAFSYPPICWSLIGFQDGGSVLR	558063	556125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_556100_558100
912559	contig_14796_pilon	-	2569	8	Intergenic	novelGene_159381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	37.5021087842445	102	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	95	1144	293356	247636	FALSE	10	CTCTTCTGCAGTTCTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPARPPRASRSRSRGQAATSGQGGRRRAEMLSLGGTLLCLLLAAAVPTAPAPAPTTTSAPGESGRVLSYPQEKATLNEMLREVGELMEDTQHKLRSAVEEMEAEEAAAKTSSEVNLENFPPSYHNETNIDTRIGNNTIHVHREIHKVTNNQTGQTFFSETVITSMGDEAGKRNHECIIDEDCGPGRYCQFASFEYTCQPCRDQQTLCARDSECCGDQLCAWGHCSETATRGGNGTICDNQRDCQPGLCCAFQRGLLFPVCTPLPVEGELCHDPTSRLLDLITWELEPDGALDRCPCASGLLCQPHSHSLVYVCKPAFVGSHDDDGESLLPREALDEYEDGGFIEEVRKELENLERNLSEEMVPRGPDVASELLDGEEI	294064	246210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_247856_248901_249059_250150_250296_250944_251038_281360_281445_285512_285651_293143_293377_293990
912560	contig_8377_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_35041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCAAAGCAAAATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83472	81241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_81200_83500
912561	contig_835_pilon	+	3417	2	Intergenic	novelGene_152157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	517	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTTATAATGGTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233212	241198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_234312_238880
912562	SIRV6	+	834	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	6	323	6	36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTAAGTAATTGGCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2478	11367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
912563	contig_7963_pilon	+	891	4	Intergenic	novelGene_58381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1497.34720979026	76	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	76	558	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51374	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57782_57934_63003
912564	contig_8317_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_20710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16500	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16500_17200
912565	contig_8065_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_107349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGCTGGAGATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581763	579937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_579900_581800
912566	contig_12724_pilon	-	3899	9	Intergenic	novelGene_146852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTATTGCCGGAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167824	97169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_97191_104643_104784_131760_131865_133210_133261_135162_135256_152854_152948_153692_153877_159771_159955_164793
912567	contig_14744_pilon	+	3392	1	Intergenic	novelGene_66158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTATGGCCTTGTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1688546	1691938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1688500_1691900
912569	contig_14775_pilon	+	1297	1	Intergenic	novelGene_178916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGAATTTGGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19587	20884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14775_pilon_+_19600_20900
912570	contig_10297_pilon	-	1999	14	Intergenic	novelGene_112546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	142.552761954402	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	279	1706	619093	560575	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKWLVDRARVGSRWTWLQAQISELEYKIQQLTDVHRQIRASKGIVILEECQLPKDILKKQIQFTDQAASLNTTGNPQVPQDSQDSLLEQDFEMSPSSPTLLLRNIEKQSAQLTEIINSLIAPLNLSPTSSPLSSKPCSHKCLANGISRSASENLDELSSSSSWFLNQKHSKKRRKDRTRLKSPSLTIMSTAARTRPLQSFHKRKLYRLSPTFYWTQQTLPSKETTFLNSTQMPFLHSASTWSSCEHNSKSRLLREHVSELDSSFHSVLSLPSDVPLHFHLETLLKKTEIKGDLAENKCVGECVISPSPVHRTSLNQWRNGYSPTCKPQIRSESSAQLLQGRKKRHLSETALGERTRFEEFAFQHTEPGSHSSFTAVTNVNVIARTQNSSSQNTARRRLRSESSYDIDNIVIPMSLVAPAKLEKLQYKEILTPSWRMVVLQPLDDYNLAEEEIEDLSDEVFSLRHKTYEEREQARWSLWEQSKWHRRNSRAFNKNAEGQDLLWKEYTNDFSSGQYCAAQSPPELPSESHDPCAHGSPSLNESQETKAENEDQCPMAAYSLPRRGQVKK	655081	560095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_-_560380_560565_560644_561273_561443_562536_562650_563959_564015_565597_565723_566553_566673_568059_568189_576572_576681_580307_580474_599244_599450_615001_615124_619045_619244_654953
912571	contig_8330_pilon	+	1554	10	Intergenic	novelGene_71804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	591.422954501354	20	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	132	905	852673	856687	TRUE	20	GTACGAATCTTATTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837619	857550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855062_856241_856271_856362_856560_856667_856755_856968
912572	contig_16722_pilon	-	4748	16	Intergenic	novelGene_118279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	234.986997276209	135	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	952	2859	213	3071	132864	92686	FALSE	20	GATGGAGGTGTCTTTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIAASTTSPTNSTTSTVSPAQKVMVAPISGSVAPGAKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGVVQVQQKVLGIIPSSTGTSQQTFTSFQPRTATVTIRPNTSGSGGTTSTSQVITGPQIRPGMTVIRTPLQQSTLGKAIIRTPVMVQPGTPQQVVTQIIRGQPVSTAVSAPNAVSSAPGQKALTSSAPTASLQSPTSQPPRPQQGQVKLTMAQLTQLTQGQGGNQGLTVVIQGQGQTTGQLQLIPQGVTVLPGPGQQLMQAAMPNGTVQRFLFTPLATTATTASTTSTTVSTTAAGTSEQRQSKLSPQTQVQQAKTLPPAQSSSVSPPETPPPTAQPSAQPQPPAQPPAPAQPEVQTQPEVQTQTTVSSHVPSEAQPIQTQSSKPQAAVQCQPQSNVQGQSPVRVQSPPQTRIRPSTPSQVSPGQQPQVQTTASQPIAIQPHTSLQIPSQGQPQSQPQVQSSTQTLSSGQTLNQVTLSSPSRPQLQIQQPQPQVIAVPQLQQQVQVLSQIPSQVVAQIQAQQGGVSQQIQLQLPIQIQQSRPVQTHQIQNVVTVQAASVQEQLQRVQQLRDQQQKKKQQQIEIKREHTLQASNQSEIIQKQVVMKQNAVIEHLKQKKTMTPAEREENQRMIVCNQVMKYILDKIDKEEKQAAKKRKREESVEQKRSKQNATKLSALLFKHKEQLKAEILKKRALLDKDLQIEVQKRKREEDKDSTSKSKKKKMISTTSKETKKDTKLYCICKTPYDESKFYIGCDLCTNWYHGECVGITEKEAKKMDVYICNDCKRAQEGSSEELYCICRTPYDESQFYIGCDRCQNWYHGRCVGILQSEAELIDEYVCPQCQSTEDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYERLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRL	136682	91008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_92693_96293_96481_103887_103973_105711_105905_106668_106843_109688_109823_115770_115997_116286_116370_121160_122078_122764_122988_125204_125423_130776_130886_131819_131972_132713_132961_136189_136233_136609
912573	contig_4496_pilon	-	2574	3	Intergenic	novelGene_66631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTATGAATATCCATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741135	627352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_627533_640710_643078_741108
912574	contig_6344_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_157122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGCCTGTTCACAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200039	1202268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_+_1200000_1202300
912575	contig_16211_pilon	+	4763	1	Intergenic	novelGene_150103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCAGGGGTTTGGACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207256	212019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_207300_212000
912576	contig_4151_pilon	+	3452	1	Intergenic	novelGene_65267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	170	487	620441	620758	NA	15	TATCCTTCTCTCTACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEGMILVSLTGGPSSAEECGGRESWKMDGSFRVSRRYLVCSLRLRNRIGGGYTEPDTHLGLGSHQAAVQRGREEESDLAQPAH	620271	623723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620300_623700
912577	contig_5260_pilon	+	4014	1	Intergenic	novelGene_144372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAGACTAATTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282594	286608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_282600_286600
912578	contig_17829_pilon	+	2301	8	Intergenic	novelGene_157043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	42.8309443734126	40	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	40	1029	95456	123303	FALSE	50	AAATAAAAAGGCTAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIVDKASESSDPSTYQNQPGSSEAVSPGDMDAGSASWGAVSSLNDVSNHTLSLGPVPGAVVYSSSSVPDKSKPSPQKDQVLGDGIAPPQKVLFPSEKICLKWQQTHRVGAGLQNLGNTCFANAALQCLTYTPPLANYMLSHEHSKTCHAEGFCMMCTMQAHITQALSNPGDVIKPMFVINEMRRIARHFRFGNQEDAHEFLQYTVDAMQKACLNGSNKLDRHTQATTLVCQIFGGYLRSRVKCLNCKGVSDTFDPYLDITLEIKAAQSVNKALEQFVKPEQLDGENSYKCSKYDSWWRGLDAHCSSGDGREAWLSRVWGVSTTPLDSI	89425	124575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_+_89456_95446_95697_98320_98522_118072_118184_120306_120410_121309_121378_122079_122151_123108
912580	contig_2377_pilon	+	1569	2	Intergenic	novelGene_67870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAATATAAGTATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_1029_1074
912581	contig_4392_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_117294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGCACAGAGTTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83726	81931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_81900_83700
912582	contig_19564_pilon	-	2353	4	Intergenic	novelGene_29603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	733	junction_3	658.809195105499	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	162	1496	15529	12201	FALSE	55	AAAAAAGAAACCTTTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA	15690	11343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_13259_13554_13666_13945_14055_15472
912583	contig_8616_pilon	+	3729	20	Intergenic	novelGene_72529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	257.074431163223	115	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	778	2856	374090	380253	TRUE	20	ATACACTGTCAGGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHVYGLPEHADSLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPQRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMLDYLQGSGETPQTDVRWMSESGIIDVFLLLGPSVMDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPLTMLERLASKRRKLVTIVDPHIKVDSGYRVHEELRNQGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFNFDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGFYVHMATADGLTLRSGGIERPFVLSRAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISVPMCLSMGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQYHDVIRDALRQRYSLLPFWYTVFYQAHREGVPIMRPLWVLYPQDVTTFSIDDQFLLGDALLVHPVAEAGAHGVQVYLPGQGEVWYDVQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTVVPRWMRVRRSSDCMKEDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPKGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKESPESRLSFQHDPETSVLVVRKPGVNVASDWSIHLR	373054	381226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_373706_373876_373965_374051_374149_374406_374588_375366_375521_375723_375960_376051_376179_376282_376363_376615_376760_376890_376988_377267_377370_377547_377792_378685_378751_378932_379010_379123_379199_379373_379488_379610_379724_379888_379990_380143_380306_380405
912584	contig_4857_pilon	-	5560	1	Intergenic	novelGene_48653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	249	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	450	758	448153	447845	NA	25	GCGTGGGGAGTAATACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVNDPLLFIKDIKPGLKNLNVVFIVLEIGKWVPRPSPVRPGRRGRCRHREPGPAPFPSPPFRVLLPSPPTWPHGPRPGSRPACGKNPALGQACLPIFQMR	448602	443042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_443000_448600
912585	contig_4223_pilon	+	3014	2	Intergenic	novelGene_117272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187539	190940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_189630_190016
912586	contig_16125_pilon	-	4741	1	Intergenic	novelGene_155254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAATAAGTTCTCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147219	142478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_142500_147200
912587	contig_10734_pilon	+	1847	2	Intergenic	novelGene_51037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTTCTGTAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385618	387625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_386929_387088
912588	contig_593_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_101993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	689	1045	283131	283487	NA	75	AAGAAAAAGAAAGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGIIQSIFSDYNRVKLEINNRKNKNWKMHKHAEIKQQLLKYQRVKEEIRREITNFLALNQNESKVYLNLWDAVKAVLKGEFLAINAYMGKKKNLKLTAQLDNSRNYKEKSKLRLNLP	282442	284471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_282400_284500
912589	contig_9293_pilon	-	4356	14	Intergenic	novelGene_175185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	123	junction_13	154.170465862884	1334	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	281	2482	86448	2202	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMCSATASPAVVSSGPGGDGFFPAATISSSPAPGAPFMPVSEGSGAAAGLGLGLPAADSRGNYQLLLSGRALADRYRRIYTAALSDRDQGGSSAGHPASRNKKILNKKKLKRKQKSKSKVKTRSKSENLENTVIIPDIKLHSNPSAFNIYCNVRHCVLEWQKKETSLAAASKNSVQSGESDSDEEEESKEPPIKLPKIIEVGLCEVFELIKETRFSHPSLCLRSLQALLNVLQGQQPEGLQSEPPEVLESLFQLLLEITVRSTGMNDSTGQSLTALSCACLFSLVASWGETGRTLQAISAILTNNGSHACQTIQVPTILNSLQRSVQAVLVGKVQIQDWFSNGIKKAALMHKWPLKEISVDEDDQCLLQNDGFFLYLLCKDGLYKIGSGYSGTVRGHIYNSTSRIRNRKEKKSWLGYAQGYLLYRDVSNHSMTAIRISPETLEQDGTVMLPDCHTEGQNILFTDGEYINQIAASRDDGFVVRIFATSTEPVLQQELQLKLARKCLHACGISLFDLEKDLHIISTGFDEESAILGAGREFALMKTASGKIYYTGKYQSLGIKQGGPSAGKWVELPITKSPKIVHFSVGHDGSHALLVAEDGSIFFTGSASKGEDGESTKSRRQSKPYKPKKIIKMEGKIVVYTACNNGSSSVISKDGELYMFGKDAIYSDSSSLVTDLKGHFVIQVAMGKAHTCVLMKNGEVWTFGVNNKGQCGRDTGAMNQGGKGKCLICGY	86728	327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_2387_4851_5017_6688_6894_7745_7823_9284_9424_9784_9859_13735_13833_15510_15583_15812_16056_21296_21494_25882_26037_34885_35102_44623_44700_86146
912590	contig_16411_pilon	+	2664	1	Intergenic	novelGene_77290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTTTAATAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66804	69468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_66800_69500
912592	contig_11751_pilon	+	1223	6	Intergenic	novelGene_150294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	33.8797874845755	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCCAGATAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115578	157838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_115637_116116_116203_117994_118159_144201_144306_151124_151217_157119
912593	contig_7078_pilon	-	4643	5	Intergenic	novelGene_130208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	256	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1433	1801	968176	967808	TRUE	15	TGTAATCCCCCTGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	983424	951295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951555_963631_963733_965325_968220_968674_969231_982591
912594	contig_15047_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_52173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2868.97254643927	10	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	376	696	3242	4413	TRUE	35	ACCGGAGAACCTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQIHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRACGGWDLPEVGSHCGALWRGAKIHMSCAARGAD	2170	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2551_2826_3221_3376_4182_4268_4311_4434_4552_4687_21013
912595	contig_1146_pilon	-	1454	4	Intergenic	novelGene_84835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAGGCAGCAGACGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906056	902934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_903040_904051_904283_904385_904564_905116
912596	contig_5649_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_82286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	789	1166	105035	104658	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLHLIGISLGLMLILILSTPPEIRRSLLLPFLQKHFQVIFAFYLWTNTLYFRAFRIFTCFKREGAYSQYIHGIPAECIHGTLTYYPNYKDIDVNNPKQGNRIFLILKAIYFTQCKMNLILTYF	105823	103502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_103500_105800
912597	contig_10104_pilon	+	2257	2	Intergenic	novelGene_160143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	291	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAAGAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545618	561460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_545668_559252
912598	contig_9945_pilon	+	4523	1	Intergenic	novelGene_104820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTCAGCAAATACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116041	120564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_116000_120600
912599	contig_4759_pilon	+	4064	1	Intergenic	novelGene_106322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGAATTATCATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489643	493707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_489600_493700
912600	contig_10235_pilon	+	2273	16	Intergenic	novelGene_46343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	162.368661453564	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	538	2055	125852	128952	FALSE	45	ATTATAAATATATAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGPSPLNAVSSGGPPGSEPSEPLRRRPPAPHDGDRKELPQEQPLPPGPIGTERSQRTDRGPEPGPLRASHRPGPPVQFGTSDKDSDLCLVVGDSLKAEKELTSVPEAIPISRDWELLPSASASASAEPQSKSLGSGHCVPEPTSSGQRLYPEVFYGSPGPPGSQVSGGAIDSQLHPNNGGFRPGTPSLHTYRSHPLYLPPGPATPSALLSGVALKGQFLDFSALQAAELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDPPLLQVRQDLPSPSDFYSTLQPGGQNGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVMNFGSLPPAPPPAPPSLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPPSLGRAELHSVELKPFQDYRKLSSNLGGPGSSRTPPAGRSFSGLNSRLKAPPSTYSGVFRTQRIDLYQQVKLNPKVIIRVPVPVLPV	114058	129170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_114184_116075_116143_125000_125051_125198_125332_125586_125717_125819_125906_126115_126350_126642_126784_126902_126972_127088_127263_127462_127546_127732_127944_128036_128133_128283_128497_128611_128707_128804
912601	contig_18108_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_33448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77729	77096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_77100_77700
912602	contig_10331_pilon	-	1632	15	Intergenic	novelGene_54142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGATAGACCCCTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546368	409638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_409747_410750_410809_501847_502019_511855_511958_514498_514580_520526_520621_528501_528640_534685_534764_536903_536976_537995_538151_541969_542045_543772_543864_544896_544989_545719_545961_546292
912603	contig_34_pilon	+	1967	6	Intergenic	novelGene_40005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	343	711	212125	212493	TRUE	20	ATTTTGCAAGTTATGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	211782	230248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_213049_214059_214151_215287_215458_224659_224818_228007_228270_230228
912604	scaffold_12124_pilon	-	2845	2	Intergenic	novelGene_22141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCACAATAGCGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962324	948730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_951144_961892
912605	contig_2215_pilon	+	4415	5	Intergenic	novelGene_163883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	2314	2898	573590	587231	TRUE	25	ATGGGAGATGATTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSVFSVFSPYSGTPITCRFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSILLILSSTVSNLLLNPSMTSSISEILLCIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILTIRDLNSLSGGNRAFSSSGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	567853	588856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_568225_568660_569845_572831_573943_586999_588076_588183
912606	contig_1596_pilon	+	4044	1	Intergenic	novelGene_131606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAAAATATATTTAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142194	146238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_142200_146200
912607	contig_7201_pilon	-	2575	2	Intergenic	novelGene_152502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATTCCTATTTCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245419	143402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_144422_243863
912608	contig_9363_pilon	-	3042	19	Intergenic	novelGene_6779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	211.257149780388	35	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	412	2607	1539150	1511746	FALSE	15	CATGGCGTTTTGTGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLFYGKQRGGRVFVYHRKQLRFEEVSELQGDSGYPLGWFGAAITALTDINGDGLMDVAVGAPLEEEGALYIFNGQHGGLSPRPSQRIKGTQVFSGIRWFGRSIHGVKDLGGDGLIDVAVGAEGQVIILSSRPVVDVITTMTFSPAEIPVHEVECSYSTSNRKKEGVNITICFYVKPVLQFQGPLVANLTYTLQLDGHRTRSRGLFPGGRRELSGNTVVSPVRSCFEFWFHFPVCIQDLISPINVSLNFSLQEEEGTPRDHRMWRKDVQPILRPIPHSETKEIPFEKNCGEDKKCEANLELSFSERSRVLHLIPSASMSVELTLSNTGEDAYWVHLGLSFPRGLSFRKVEMLKPHSQMPVSCEELPKESRLLSSALSCNVSSPIFKVGTSVVIQVMFHTLLNSSWGDFVELHANVSCDNEDSGLLEDNSATTSIPVLYPINILVEDQKNSTLYINFKPKGPKIQYIKHIYQQERGVWLSWPCTTGCSGSVSTYTSHVP	1539561	1511310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1511830_1516338_1516415_1517883_1517971_1518081_1518162_1518575_1518687_1519972_1520115_1520469_1520541_1520636_1520694_1526261_1526352_1528122_1528275_1528378_1528537_1529872_1530004_1530147_1530346_1530798_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039
912609	contig_8570_pilon	+	2310	19	Intergenic	novelGene_120152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	653.665665664899	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	607	2163	345735	384590	FALSE	20	GTACCCTCCAAGTTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSEKHPDNLLCTIRENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAVMDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLTQNVGLLGLLKWRMKPQLLQENLEKLKIVDGEEVVKFLQDTLDALFNIMMEHSQSNEYDILVFDALIYIIGLIADRKFQHFNTVLEAYIQQHFSATLAYKKLMTVLKTYLDTSSRGEQCEPILRTLKALEYVFKFIVRSRTLFSQ	323276	384737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_345667_345782_347293_347376_361594_361731_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530_379715_379853_379952_382407_382498_383493_383595_384451
912610	contig_14445_pilon	-	1820	1	Intergenic	novelGene_137378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGCTGTAGTCTTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346484	344664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_344700_346500
912611	contig_12810_pilon	-	2953	3	Intergenic	novelGene_145692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	473	junction_2	19	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	2473	2952	253501	252073	FALSE	30	GTATTTAGAGACCATCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGVMFPGNSPSYTERSNINGPGTPRPLNRPKVSLSAPMTTNGLPDNTDIKEANLQQNEDKSHSDSLTSESEGSSVSPIKNKHPDEDAVEPEGHEVKRLRFDKEGEVRETASQTTSSEISSVMLEETEASSSSQDKDKESSGTRQHCTEEDEDEDEEEEE	255973	252071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_252362_253056_253201_253454
912613	contig_19412_pilon	-	3123	3	Intergenic	novelGene_178700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2399	3043	1193	549	FALSE	20	GCACCCAGAGAGCCGCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKRTRKAPKKTEKKKQRKKKCSQGSLCTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGRSKDGAWSQALERKEGRRREASKKSKEAEKKKKATPAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPALWSPSGRSKDGARSQALE	4216	468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_1636_1721_3347_3885
912614	contig_9633_pilon	-	3629	2	Intergenic	novelGene_139655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	127	489	1196788	1196426	TRUE	25	ACAGTCCAGTCCAATCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRDHLFKVLVVGDAAVGKTSLVQRYSQDSFSKHYKSTVGGETSLGPRGRLGGGPDYGLELWAQAGWRGGGFGVLGSFLSQEVRVWDPQGRHCWVFDLRIPLGFPLLSFPSLSRLPGKR	1196914	1192576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_1195071_1195779
912615	contig_854_pilon	+	3500	14	Intergenic	novelGene_36698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_12	3967.21686237797	761	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	165	2075	1705343	1714980	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704891	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
912616	contig_3956_pilon	+	3181	15	Intergenic	novelGene_15008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1087.84470727345	3	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1285	2661	1286460	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286228_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
912617	contig_4924_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_84670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	120	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTGAAAATATATAGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65919	63005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_63000_65900
912618	contig_9440_pilon	-	3475	2	Intergenic	novelGene_59050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCAGATTTTATATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473130	469282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_472249_472621
912619	contig_17989_pilon	-	2044	11	Intergenic	novelGene_150836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_8	53.3269162806176	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	494	1540	272731	266567	FALSE	10	CCTGTCACCTGCCCTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQGTPLSATLSLVMSQCCRKIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDRNFDSEICGVVSDAVWDSREKQQQILQMAIVEHLYQQGMLSVAEELCQESTLNVDLDFKQPFLELNRILEALHEQDLGPALEWAVSHRQRLLELNSSLEFKLHRLHFIHLLAGGPEKQLEALSYARHFQPFARLHQREIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLSVSFASGCVALPVLMNIKAVIEQRQCTGVWSHKDELPIEIELGMKCWYHSVFACPILRQQTSDSNPPIKLICGHVISRDALNKLINGGKLKCPYCPMEQNPADGKRIIF	283763	266062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_266631_266714_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269823_271169_271311_271437_271584_272727_272819_278208_278360_283508
912621	contig_12139_pilon	-	2261	1	Intergenic	novelGene_146475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGGGGCCCCAGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152996	150735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_150700_153000
912622	contig_8631_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_121951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692955	689672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_689700_693000
912623	contig_4469_pilon	-	4066	11	Intergenic	novelGene_21899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3747	4055	417909	414662	FALSE	55	CCCTTTATAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQPHYLLHLGVFSLLVRDLQQLQHHSVGAHVSEQPLLLLPALSDRGTLLDTEFAKSNQNLFYHPVVVAARTFMLLRLVIPLLGTKINITVFCITLGLLCIC	443339	414650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_414788_415611_415749_417863_417993_421054_421255_423550_423803_426384_426512_428315_428440_432989_433115_435293_435478_439768_439921_440840
912624	contig_3832_pilon	+	2642	1	Intergenic	novelGene_161486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484253	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484300_486900
912625	contig_10182_pilon	-	1897	1	Intergenic	novelGene_134612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCCTGTTGTCTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105055	103158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_103200_105100
912626	contig_9177_pilon	-	2585	17	Intergenic	novelGene_32549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	779.998237177495	24	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	51	2144	10300	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECESAIAALNSCLRDLDQASLAAISQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAEIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	10350	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_3455_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407_9510_9728_9862_10295
912627	contig_6375_pilon	-	2442	7	Intergenic	novelGene_72959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	353	junction_3	100.198830110713	5	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	49	960	229189	205052	TRUE	20	CTAAGCTTTCAGTGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGDARELVKAFLSSSAMVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVVKDFG	229237	202330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_205194_206631_206777_207612_207739_228690
912628	contig_1639_pilon	-	6365	7	Intergenic	novelGene_74874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	778	160	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3593	3916	349213	348890	TRUE	65	TGATACAAAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNAKINPQPETIQNQQLEIQKMNNKISEMDSVIEGLRSRSETVEDRISEIEEKHLDTTLFEQKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKRKNLRVIQVPERGR	584090	273134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_273800_347067_347482_347519_350000_514102_514972_523898_524556_549590_550740_583959
912629	contig_9705_pilon	-	2877	7	Intergenic	novelGene_41740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	19	junction_1	182	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	24	1517	311917	295287	TRUE	45	ATAGTTGTTTAAATATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSFERSKTFAPADINKDEEFVEEFNRLKTFANFPSSSPVSASTLARAGFLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYFENNAAQPTNPGAQNGQYKVEKYPGNRNHFVLERPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPEMCSEEARLKSFHNWPEYAHLTPRELASAGLYYTGIDDQVQCFCCGGKLKNWEPCDHAWSEHRRHFPNCFFVLGRNVNTRSESDVLSSDRNFPNSTNSPRNPAMADYEARIMTFGTWIYSVNKERLARAGFYALGEDDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHDYINNIHLTHSLEESLARTAEKTPSLTKRIDDTIFQNPMIQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQTSGSNYKSFEALIADLVSAQKDNAQDESSQTSLQKEISTEEQLRLLQEEKLCKICMDRNIAVVFIPCGHLVTCKQCAEAVDRCPMCYTVITFKQKIFMS	311940	293754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_294902_295073_295481_302377_302579_307358_307402_308757_308837_309839_309940_311040
912630	contig_8570_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_120162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAATAAAAAAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350159	352774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_350200_352800
912631	contig_12943_pilon	-	1912	1	Intergenic	novelGene_140360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53590	51678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_51700_53600
912632	contig_1263_pilon	+	2427	6	Intergenic	novelGene_170407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	119	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTAGTGCCAGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57112	76775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_+_58320_59765_60191_63287_63454_63985_64103_65022_65323_76563
912633	contig_10467_pilon	+	3194	1	Intergenic	novelGene_175412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAGGGGGAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125942	129136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_+_125900_129100
912634	contig_233_pilon	-	2891	16	Intergenic	novelGene_14634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	654	junction_14	1221.65528143854	2	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	139	2460	126907	78579	FALSE	15	GGTGTCCTAGAAGCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127045	78147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
912635	contig_3414_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_80976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	470	802	73900	73568	NA	25	ACCCTTACTAAGGTCACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEISGKIVHMAKTLYLSITDVEHLIDRKDGELTDRNVMDFEEERNAEEEKDNEEEDGEKLSKNFTVEGLAGVFSKLNQGLLLLENMDPNADRFAKVDRQIQEAVRCFL	74369	71796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_-_71800_74400
912636	contig_19990_pilon	+	2573	1	Intergenic	novelGene_30756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2027	2332	47241	47546	NA	30	GCCCAGAAATTGGTAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPRDHGPQSPPPSNSAWTPFLRVSCSISSSGYTSFCNHSLIVEHLSCFRFPATISNAVLTILITHLACICISFFSFHYIPRSGILGKEWEHFKGI	45214	47787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_45200_47800
912637	contig_10482_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_152817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86161	87277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_86200_87300
912638	contig_500_pilon	+	1995	5	Intergenic	novelGene_31085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	539	junction_4	1041.91998253225	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	581	1279	1495241	1498065	TRUE	10	GCATGTTTGACTGTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLQGPQGAWGLWGVEAHGCPPVSLRSPPAHLSPVCRWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1494660	1499586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882
912639	contig_10011_pilon	+	3954	13	Intergenic	novelGene_68035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_11	135.702569983033	157	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	2172	2915	133188	140376	TRUE	60	GAAAAAAAAACCCAGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDDGAGSIAEALASSRTLCMLHLQKNSIGPVGAQRMADALKQNRSLKELMFSSNSIGDGGAKALAEALKVNQGLESLDLQSNSISNAGVAALMGALYTNQTLLSLNLRENSINPEGAQALARALCTNSTLKNLDLTANLLRDQGAQAIAEAIRENRALTSLHLQWNFLQAESGQGPGTSTTAQQQPGQLGFTGERHRGRRSFRSGQGAEGKHGPHRPLPPGDLHRCLWGPGPGGSPGGEQNLGDS	129556	142798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_131715_133174_133259_134695_134780_135379_135464_136140_136225_136715_136800_137346_137431_137809_137895_139771_139856_140292_140377_141077_141162_141581_141666_141927
912640	contig_13021_pilon	-	2331	10	Intergenic	novelGene_8240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	441.257742211656	39	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1272	1733	213104	206041	FALSE	40	ACTTACTAGATGAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQISIETKQIKNLCHAWNQGSMFPQPKMVPTPRSYITLPPHSRRWHQESMKPVTITKLTITKLTTYILTSSEIERYKLHLRIFLQSEDQKTTTATGNIAASATSASCPETGDLTVECRALPLQTSACQPQLPPRFYSPNSSTHIQLVEDKPHP	236248	205442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215506_218018_218304_231351_231421_231599_231882_236024
912641	contig_9995_pilon	-	2356	1	Intergenic	novelGene_47782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGAATGACCTGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746495	744139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_744100_746500
912642	contig_6710_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_98340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATAATCTAACAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657825	655826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655800_657800
912643	contig_3004_pilon	-	2530	3	Intergenic	novelGene_127540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	25	57	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACTAAACAGGTCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576291	567659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_570022_573821_573937_576238
912644	contig_4496_pilon	-	288	1	Intergenic	novelGene_66709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCAGATAGAAAGACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224856	1224568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_1224600_1224900
912645	contig_9272_pilon	-	1509	1	Intergenic	novelGene_125962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTAGTCGATTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497307	495798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_495800_497300
912646	contig_20670_pilon	-	2774	7	Intergenic	novelGene_144835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.329787205376	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	148	864	60880	52878	TRUE	30	GAATTTATTTATATGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGCRCPADSNFPSHVSAGSSSAWTEGGGLPVSQSQEIFSSLQPFRSQVYMHPSLSPPSTMILSGGTALKPPYSAFPGMQPLEMVKPQSGSPYQPMSGNQALVYEGQLGQAAGLGASQMLDSQLPQQLTMPLPGSQLPLPRYGSGQQPLILPQSIQLPQGPSLSVGAPRRVLPPGSQPSVLNTSRESSQMEMKGFHFADSKQNIPSGGSVPSPQTYRPSSASPSGKPSGSAVNMGSVQGHYVQQAKQRVDEKPSLGSVKLQEAPSAASQIKRTGAIKPRAVKVEESKA	61591	50195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_51349_52120_53013_54342_54425_56700_56793_57515_57696_60652_60894_61457
912647	contig_15327_pilon	-	1121	3	Intergenic	novelGene_70675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_2	1286	24	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902154	900439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901536_902035
912648	SIRV6	+	1283	6	FSM	SIRV6A	SIRV613	1311	6	28	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGACCGGGAGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3133	11824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_3165_7104_7449_7805_7924_10724_10819_11031_11109_11205
912649	contig_7056_pilon	-	2630	8	Intergenic	novelGene_43634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1201.00265934556	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1364	1678	725582	724580	TRUE	25	AAACTGCAATTTGTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYDM	727025	721900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724588_724685_724746_725182_725319_725471_725734_725813
912650	contig_10937_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_67318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	195	629	96433	95999	NA	15	AGTTGGTGGTGGTAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDLFLLITHPNYMRRSFAILSVKEHSGCASSKTHLFVLLAVHGIFSNLHQHHNSEASILLRSSLFIVHLSHTYEAIENTVVWVRCTLVLKVLSLLFNTVKRSFAADLTNAVCRLISSFLLLVFLNYCPLDEGLQNKLASH	96627	95638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_95600_96600
912651	contig_2867_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_135222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGGCCAAAACGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186681	1189319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1186700_1189300
912652	contig_11258_pilon	-	3486	1	Intergenic	novelGene_67752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTGGCTGTGAGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53625	50139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_50100_53600
912653	contig_17964_pilon	-	4403	4	Intergenic	novelGene_33931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3830	4135	624708	624403	FALSE	30	TCCTCAACGAGATGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYNLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRCIALGKSAAKDLFKLVLKSKNITLRAKVCLTQAMIFSVT	718075	624134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_624820_625370_626187_692011_692426_715587
912654	contig_3822_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_133285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	510	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGACAGGAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158918	157125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_157100_158900
912655	contig_8538_pilon	+	5933	1	Intergenic	novelGene_4621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTCAATAAAAACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768691	774624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_768700_774600
912657	contig_2036_pilon	-	3152	4	Intergenic	novelGene_131808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2462	2947	422313	421828	TRUE	50	AAAAAGCAACACTAGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRISESGSRAKGGRRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKATPTAYKQHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRILAHAAAQTWKEPHTRT	701605	421103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_421152_421670_423093_506354_506865_700433
912658	contig_12528_pilon	-	1308	7	Intergenic	novelGene_81345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	648.41593304161	59	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGTACATCTCTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968105	955639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_955837_956052_956217_959917_960131_963878_964021_964909_964971_966191_966274_967656
912659	contig_4364_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_96	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCGCTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933400	932617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_932600_933400
912660	contig_3975_pilon	-	2560	3	Intergenic	novelGene_54672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1632	2156	542249	451298	TRUE	50	AATTTCTAGACAAACAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDWCRHRHLAAAGDKVSKHKINKYNNILIAWRQQSITNHIKRQTTMASVSFQNRESRNFPEKDNFLELLEAEYKTLIYRTLQDTRKEISQSAEQAIEELKKIREEHNDNFKRLQEFIERQQSEIQKINNKISELDYSIESHRSRIEAMEVRISETEDKALDTNLFDEKSDKRV	543880	450838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_451006_451060_451781_542207
912661	contig_19007_pilon	+	1885	15	Intergenic	novelGene_168435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	226	junction_9	149.275683189985	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	62	1795	3958	24243	FALSE	35	AATCCATCTTTAAAAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKILFQLLLDTAQFEFILKEMFKQMLSEKQTKWEHFKKEGSERMTELADVFSGVKPLTRVEKNENLQAWFREIAKQILSLNYDDSTAAGRKTVQLIQALEEVQEFHQLESNLQVCQFLADTRKFLHQMIRTINIKEEVLIAMQIVGDLSFAWQLIDSFTSIMQESIRVNPSMVTKLRATFLKLASALDLPLLRINQANSPDLLSVSQYYSGELVSYVRKVLQIIPESMFTSLLKIIKLQTHDIAEVPTRLDKDKLRDYAQLVPRYEVAKLTHAISIFTEGILMMKTTLVGIIKVDPKQLLEDGIRKELVKRVAFALHRGLIFNPRAKPSELMPKLKELGATMDGFHRSFEYIQDYVNIYGLKIWQEEVSRIINYNVEQECNNFLRTKIQDWQSMYQSTHIPIPKFTPVDESVTFIGRLCREILRITDPKMTCHIDQLNTWYDMKTHQEVTSSRLFSEIQTTLGTFGLNGLDRLLCFMIVKELQNFLSMFQKIILRDRAVQDTLKTLMNAVSPLKSIVANSNKIYFSAIAKTQKIWTAYLEAIMKVGQMQILRQQIANELNYSCRFDSKHLAAALENLNKYVPGSETAICGPGSFSVN	3168	24333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19007_pilon_+_3230_3957_4088_7103_7217_9157_9325_9438_9515_11438_11550_12627_12769_13834_13916_15012_15115_15842_16023_17200_17326_19056_19220_19752_19856_19943_20024_24081
912662	contig_4232_pilon	-	1975	4	Intergenic	novelGene_63431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5728487143349	38	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGATAAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515191	498963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_500641_514516_514663_514766_514851_515123
912664	contig_5732_pilon	+	1832	2	Intergenic	novelGene_119600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTGTATGAGAGACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340590	439387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_342018_438982
912666	contig_10341_pilon	-	3774	1	Intergenic	novelGene_47248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	220	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1526	1888	163245	162883	NA	70	AAACCTACAAAAACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQGFSFSFLELGACSSQAVLCGLGPTPSVCKDVQRDPWEHFFFLFFFLGGVLILFFVFLFFFPFCLSSLLIFSSVYTYLLFLSPEYLPLSDTSTPPSQAVLHSLGATSPNLTAILV	164770	160996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_161000_164800
912667	contig_5234_pilon	+	1376	2	Intergenic	novelGene_169487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	131	700	217393	217962	TRUE	25	ACTTTTCAATATTTGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGHDPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDDSLREHFEKWGTLTDCAVMRDPQTKRSRGFGFVIYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRTVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVNKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGSGGNFGGRGGYGGGGGS	217262	218704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5234_pilon_+_218006_218071
912668	contig_11978_pilon	+	564	5	Intergenic	novelGene_63015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43619	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCGCCGGAAAAGGACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591847	1596987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592065_1592187_1592304_1595890_1596019_1596303_1596391_1596971
912669	contig_11292_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_109479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	579	1795	2373	470368	469790	NA	40	CCTTAAGAACAACTGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANSNQKRAGVAELISDKIDFKTKSIVRDKEGYYIMIKGIIHCEDITIINIYTPNDRAPKCIKQTLTAVKREFDSSTVKVGDFNPPFSVTDRISRKKVNKDTEELTATINQLDLMNVCRILYSTAAKCTFFSNAHGTFSRIDHVLGYKATLIKIQNIEIIQSIFSDHNAVRVEITGRARKKIKYMKTEYHL	472162	469789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_469800_472200
912670	contig_14142_pilon	-	2196	10	Intergenic	novelGene_120537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	436.055297206928	35	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1101	1568	351794	350546	TRUE	35	GAAGGAACCGTGAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREVGPSTGGGPGNKLLGIAPD	355498	349386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350750_351180_351291_351640_351810_352763_353631_354021_354071_354787_354931_355472
912671	contig_13481_pilon	+	4189	1	Intergenic	novelGene_119345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	305	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2312	2614	372303	372605	NA	35	TGACAAACTATGGGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPIQEGPQKKVTKPYHNQTFQNQRQGILRAAREKRNIIYKGAPRRLNTDFSAETIQARRQCDDICKTLKKRIANQKSHIQQNCLSDTVVKLEHSQINRN	369991	374180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_370000_374200
912672	contig_8020_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_114412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAACTTCATCGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187947	188644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_187900_188600
912673	contig_4125_pilon	-	2971	12	Intergenic	novelGene_25119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	446.334381563071	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	111	791	822728	813780	TRUE	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846554	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809861_810234_811099_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
912674	contig_6710_pilon	-	576	2	Intergenic	novelGene_92601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657520	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657520	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
912675	contig_6079_pilon	+	3721	4	Intergenic	novelGene_160073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	830	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACTATTATTCAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29983	81507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_32947_34065_34260_74882_75091_81151
912676	contig_2988_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_136552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160383	161975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_160400_162000
912677	contig_6876_pilon	-	2656	1	Intergenic	novelGene_147035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	333	1002	37	1038	271955	270954	NA	70	GTACAATAAAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRCSQRPCHLVQMESSGITEFTTAFDYEFTSFLCESETFVFATRITTILYCLVFLLSLVGNGLVLWILMKYESLESLTNVFILNLCLSDLIFSSLLPVWLSAYYWKWVLGEFLCKLLNLFFSVSLYSSIIFLTIMTIYRYLSVVSPLSTLRVHTLRCRVWATIAIWAASILSSIPDAISHEVISGQCEYSEPRWFLASVYQHNIFFLLSLGIILFCYVEILRTLLRSRSKRHHRTVRLIFTIVVAYFLSWAPYNLVLFLKTLQQLRIIQSCEVIQQLEYAVQVCNKVAFSHCCFNPVLYVFVGVKFRRHLKSLLRQFWLCKQQVPSPIPTPHSPGAFNYEGASFY	271991	269335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_269300_272000
912678	contig_833_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_176488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTTCCCAGCAGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602538	600554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_-_600600_602500
912680	contig_19378_pilon	-	2224	4	Intergenic	novelGene_73777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3	368	19144	18070	TRUE	5	TATGTCTTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVLSGSVRGALPASSKRLHAGSGYLRSRSRSRSRSRSRSRSRYSRSKSRSRTRSRSRSTSKSRSARRSKSKSSSVSRSRSRSRSRSRSRSPPPVSKRESKSRSRSKSPPKSPEEEGAVSS	19146	15988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16747_16791_17502_17681_18353_19061
912681	contig_17684_pilon	-	1788	2	Intergenic	novelGene_178838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1160	1696	4239	3579	FALSE	70	AGGCAAGAAAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTSFLMERD	5398	3486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_3603_3726
912682	contig_11548_pilon	-	4677	6	Intergenic	novelGene_66747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	489	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCTGCCCGCCACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108425	63666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_63880_84700_84810_86979_87079_96085_96222_101978_103981_106307
912683	contig_2367_pilon	-	3291	1	Intergenic	novelGene_65334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	703	1140	275215	274778	NA	25	TATTGTTTCATTCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLPKVMYRYNAIQFQKPTTFFNEMEKININFIWKGKRPQINKALLKTKNKVGGITLSDLRNFYTATVVKTACYWYNDRHIDQWKRIENPVVNPTTYAQLIFDKGPKFIKCGKDNLFNKWCWQNWMSICKKNEIGPTSHITHKN	275917	272626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_272600_275900
912684	contig_13542_pilon	+	1512	8	Intergenic	novelGene_131491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_5	981.96223793723	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	91	792	346638	505589	FALSE	80	AAAAAACAACCAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPGEVEAPGSVAGGRVTNAGTGTAVAAATMSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	346547	506309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_346641_417046_417137_453984_454107_464621_464736_487359_487502_499871_499938_500886_500964_505501
912685	contig_16496_pilon	+	1603	2	Intergenic	novelGene_5236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771	3926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1669_3220
912686	contig_2069_pilon	+	914	2	Intergenic	novelGene_23317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	357	680	523820	524143	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVEDAPGCSPAVAGRGRQRAAVLPNRSPGAWPGQGFGLMALTKLPLPLLSRKGEASATFYHSALTLKGAVLAWLLEWTESTVERAGGRRRWGGALPVEGRIRSLAQ	523183	524377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_523394_523673
912687	contig_16098_pilon	-	792	6	Intergenic	novelGene_46033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1250.80543650881	10	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	21	683	349988	348413	FALSE	15	GCTTTATTTTCTGGTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	350008	348303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955
912689	contig_6028_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_156564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAAAAAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239606	237244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_237200_239600
912690	contig_13744_pilon	-	4968	7	Intergenic	novelGene_77139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2653	3036	64973	63119	TRUE	0	CGCTTCTCTCCCGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPQLTLIMKSFFTLLALVYSRFTVVDHVALQIPAVVSDVLTDGTLVWLSLTVDSQVLLDVALVATRIVTQAAAVGSLGVRDVFHHVASRQTRVTAGLALGVVLQLFQNVIIRGILVCPFPQFFNYS	92879	53133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_53216_54611_54707_61363_63483_64953_65072_69165_69280_90323_90460_90575
912691	contig_1301_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_47351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327398	329017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_327400_329000
912692	contig_6488_pilon	+	3126	2	Intergenic	novelGene_44736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	676	1041	62689	63054	TRUE	25	CCCCATGGAGCACAGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKWNWVKKRSLPSEIHIPEGKDSSQRVVSVHLSASSLGCHGHGIHQQILAEWTAHNYSLCFYATDTSNKEDFNKPKRKLDGKAGHRELPEGTLNSHVNRFSLSFKIELMKASKILKMTHV	62013	65808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_64783_65451
912693	contig_6069_pilon	-	2981	1	Intergenic	novelGene_8021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCACCTGAAGTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118511	115530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_115500_118500
912694	contig_7775_pilon	-	4265	2	Intergenic	novelGene_37482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTCCCTGGGTGGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193826	146695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_148988_191853
912695	contig_10976_pilon	-	4966	2	Intergenic	novelGene_155596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	246	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3835	4164	194585	194256	FALSE	45	TCATGGTAGAAAAAACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSINAEKAFDKVQHPFMIKTPSKIGIEGKYLNIIKGTYTKPTANIVLNGESLKAFPLRTGTKQGCPLSPFLFNIVLEVIARAIRLEKEIQDIHLVRKKSKHLFLQMI	198924	193453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_197944_198448
912696	contig_233_pilon	-	2299	12	Intergenic	novelGene_14505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1004.7439540615	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	264	1856	105485	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	107345	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300
912697	contig_10311_pilon	-	3319	9	Intergenic	novelGene_50415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	938.112033554628	4	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	32	574	71526	68843	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLCKYCPLRA	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_66893_67089_67261_67491_67582_67823_67962_68264_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
912698	contig_7527_pilon	+	4544	2	Intergenic	novelGene_139582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAATTGAGCTAGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118234	124114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_119497_120832
912699	contig_6164_pilon	-	2140	2	Intergenic	novelGene_121307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1632	1961	738777	738448	FALSE	40	CTCTTAGAATAGTAAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSQASCLKMPSSTGDLLLGGVQLHSMGNSTHHHHLLMGQLCPPLPSGISWLPPLTPLPAFLCCSALLCLPSFFSVFSVISSVSVTSTALKPLSCITALLGGCQHRSP	774429	738268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_740051_774071
912700	contig_1428_pilon	-	2026	1	Intergenic	novelGene_158402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGGGCTGGTGGGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128725	126699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_126700_128700
912701	contig_5041_pilon	+	2525	2	Intergenic	novelGene_27098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTCATGTTGTACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574131	580927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_576605_580875
912702	contig_12312_pilon	-	2901	1	Intergenic	novelGene_64007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCAAGTCTTCTTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497519	494618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_494600_497500
912703	contig_3900_pilon	+	3473	1	Intergenic	novelGene_84207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCGTCAGGGAGAGAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556447	559920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_556400_559900
912704	contig_11448_pilon	-	4519	1	Intergenic	novelGene_66440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACTAAATGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659645	655126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_655100_659600
912705	contig_5921_pilon	-	3029	1	Intergenic	novelGene_142260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTGAAGATGTCATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480605	477576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_477600_480600
912706	contig_12810_pilon	+	1614	1	Intergenic	novelGene_145696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCCCCTTAGGATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264187	265801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_+_264200_265800
912707	contig_7009_pilon	+	1516	7	Intergenic	novelGene_23641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	510.325631337482	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	14	943	444955	528034	FALSE	25	AGAAATTTTCTCCCCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKPPYIVPGVLKACKSLSKAQQLVSICLEEQRKKERQE	444941	528607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_522972_527924
912708	scaffold_9100_pilon	+	1838	8	Intergenic	novelGene_83264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	507.112272719619	74	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	813	1292	651131	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649306_650417_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
912709	contig_10990_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_7471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1005	1397	710709	710221	FALSE	55	AAAAGCCTTGAAAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	711713	709745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_710392_710487
912710	contig_3602_pilon	+	2993	6	Intergenic	novelGene_60598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCCATAAAAGTGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825668	1276302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_825792_1049360_1049707_1235085_1235541_1244665_1244802_1268259_1268605_1274714
912711	contig_12437_pilon	-	1886	7	Intergenic	novelGene_169081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	260.280457711805	80	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	408	857	136889	98126	FALSE	40	TAACACAGCAATTAGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRGFPPSLPTEFHKMGSFRRPRPRFMSSPVLSDLPRFQAARQALQLGSNSAWNSVQTAVINVFKGGGLQSNELYALNENIRRLLKSELGSFITDYFQNQLLSKGLFFVEEKIKLCEGENRIEVLAEVWDHFFTETLPTLQAIFYPVQK	166573	97096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_98132_98421_98514_104172_104231_115539_115589_134563_134645_136725_137020_166296
912712	contig_14513_pilon	-	810	2	Intergenic	novelGene_70399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	15	TGTAGGCAGTGCGCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
912713	contig_12866_pilon	-	2939	1	Intergenic	novelGene_174644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCACTTTTTTTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644550	641611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_-_641600_644600
912714	contig_10638_pilon	-	1235	2	Intergenic	novelGene_164304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCTCTCCTTTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314225	310298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10638_pilon_-_311326_314017
912715	contig_6710_pilon	-	503	2	Intergenic	novelGene_97925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	34	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	40	TTAACTTTAATCATACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
912717	contig_7963_pilon	+	3522	9	Intergenic	novelGene_58552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	175.181156235481	52	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	885	1742	247659	250653	TRUE	15	ACAGTGGTTTCTAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKVQLTNACIPSSLLSTLPS	246163	253517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247479_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_251683_251956_252094_252903
912718	contig_4426_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_15354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACTGCCCCATAAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36208	36858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_36200_36900
912719	SIRV7	-	2433	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	1	28	1	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTATAAAACCTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
912720	contig_8260_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_163224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTGAACAACATGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10090	7319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_7300_10100
912721	contig_17144_pilon	-	2620	16	Intergenic	novelGene_29508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2086.95256827323	8	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	134	1552	179764	168048	TRUE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHRPLSWGRAPLHTIPSSGPRLRSNLSPPS	183215	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166845_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168236_170887_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
912723	contig_12837_pilon	+	2320	4	Intergenic	novelGene_57350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1871	2182	296052	304875	FALSE	40	TCACCCAGCAGAGAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFSVQNLLHPGDRRDGEKWWQKNGGSRTRGLARGSAKGFPAHRVRPLPWHVDPWVRELSTFGQEVFWQSRVPPGSYWQSRAETRPRGQGAGLPAGTAKKKLY	227606	305013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_227885_293341_293617_294734_296070_304581
912724	contig_10023_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_123496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	78	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAAAGCTGTACTGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226869	230827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_227179_228964
912725	contig_6079_pilon	-	2156	5	Intergenic	novelGene_160079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACAGAATACAGGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448658	394888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_395095_432646_432898_439212_439394_444570_445131_447700
912726	contig_11364_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_65157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1208	1507	74020	74319	NA	60	CCAAATAATGGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEYSTARWCLATTSDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNTRKKDQIYWPEKDWRNPESMAPGHPFSSVMKSFLRFTIQPGIGQPRKTERD	72812	74899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_72800_74900
912727	contig_755_pilon	-	2234	3	Intergenic	novelGene_119775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	423	junction_1	81	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1314	1724	87736	83959	FALSE	35	AGAAATTTGACATTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	83448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670
912728	contig_2455_pilon	+	3503	2	Intergenic	novelGene_119197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTTTAGAAGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795565	799299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_+_798840_799070
912729	contig_4232_pilon	-	2957	3	Intergenic	novelGene_63151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAACAAAAACTCAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13274	10163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_10842_10883_11185_11296
912730	contig_16221_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_176611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAAAACTTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88421	89809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_+_88400_89800
912731	contig_614_pilon	+	3500	2	Intergenic	novelGene_132663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2311	2616	1140025	1140330	FALSE	25	AGTACCTGATATCTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGKTKVGQTERWKKVAGQQTANSVLASGSLPHSSFDLSFPCSMKFFIPQCLCAYLRHEARLQVAADNSRCPLILKSPCPPLPAPAPGLQLLASGKACVT	1137618	1141214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_1137815_1137910
912732	contig_7840_pilon	+	3089	2	Intergenic	novelGene_68971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1261	1809	158677	159225	FALSE	35	ATGGGGTAGAGGGAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIIKKRLQQYIDRELLEIQAGFRRGCETRNIIADARQILAECREYQKNVYLCFMTMQRDLTVDHNKLWIALQRMGILEHLIVLMWNLYIDQEAVVQGMDAASFKIRKGVHQGFFSPYLFCLYAEQIILKTALYEEEQGIRIRGRLINNLGYADNTTLLAENEEDLKRLLMKIKNYSLWCG	130910	160505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_131186_157691
912733	contig_10437_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_38374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCTAAAGTACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611096	610057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_610100_611100
912734	contig_11378_pilon	-	6789	1	Intergenic	novelGene_112218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	5327	5905	263627	263049	NA	70	ACTGTATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQVVKLFSLSMYALLTKQSVYIPCTPLKTFSLPLPFCHVIYQDKVRNEVINANAVATVPFRSLISFHHHTGSYVYDNNRHCFLFILESTKSSTTSGSGPIKTISKKGSCQTFCRRSLAAGLFTIAIQDYLHSLHMLLSQAFFFLFRGERERRTSSVMQNIAFFIYYSLPVFGFINRLLAGRNCICKDCSHI	268953	262164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_262200_269000
912735	contig_2636_pilon	-	3424	4	Intergenic	novelGene_52084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	350.689162776509	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85677	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_62548_80580_80787_81113_81216_85551
912736	contig_10904_pilon	-	1848	6	Intergenic	novelGene_22717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_4	251.015856072878	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	284	1183	662171	651376	FALSE	65	AGAGCCAAAAGAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662764	650710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
912737	contig_4924_pilon	-	2974	14	Intergenic	novelGene_84663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1127.9628230476	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	185	1729	452629	65524	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSFKLDFLPEMMVESRLLVSDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGAEETYSCPEEQQCSVLCSAELQLLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	452813	62882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_128835_128901_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_452555
912738	contig_9195_pilon	-	2815	11	Intergenic	novelGene_155682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	722	1297	302899	298788	TRUE	25	GCTGGGAAGCTAGACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVEAHAFLNQRHRQGVTQVLLCDVLPNAPRPVPHEVVPVTQTARLVHDLAHQVVHGPAEHGRGTQLVRQGLLLIGRGPAVLLHGRCVVNLVCAGDHFKHAQLAPGLPHVPLLLRTHVRARPNKSPRFVQVGPLHPSLPHDSVPLVQQTVLLLGGLSHGAHQGTEGGHAGPEALGALGARIEGVSLKLQGL	307358	291306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_292348_292559_292786_296228_296308_296541_296688_298761_298952_300977_301116_301894_302092_302822_303092_305147_305310_306038_306202_307154
912739	contig_16103_pilon	+	2091	2	Intergenic	novelGene_118907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGCAATGGCACCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	764191	766661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_766010_766388
912740	contig_10749_pilon	-	1426	14	Intergenic	novelGene_133461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	1141.93716342323	47	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	11	1354	155193	139545	FALSE	30	CCAAACAATTGTGAGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVSLENAKPSSQAASVTIPDHLSINLSQPSTPSSSSSSTTTPSLATAGTSDAPSSLPNPLPTAPCVSSLLGMKPIPLLALNVVSAAKGTGASATTTTTSAVPCVTNKLKGEKQRYSPY	155203	139472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_139894_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181
912741	contig_14643_pilon	-	1442	6	Intergenic	novelGene_99130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	400	junction_5	219.939628080071	45	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	5	955	75692	64083	FALSE	85	TAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHPRYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAVCLDHAKLGESSLSPSLDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVSSMTSVNQVTHDQAVVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSIRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASGCGALQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSK	75696	63595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_64254_65222_65349_66319_66446_68611_68891_69089_69221_75574
912743	contig_7378_pilon	-	3547	1	Intergenic	novelGene_120283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	378	887	588214	587705	NA	35	ACACACTCTTCAAGAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRHHLTPALLARIKNTGNNKRWKSCREIGTLMHCWWEWTIQTFCKMIQRFLRKLEIDVPYNPAIPLLGIYPRAIRAVTRIDICTLMFIAALFTVAKRWKQPRCLSTDEEINKLWYIHTREYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISHSQRDKYYMRPLL	588591	585044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_585000_588600
912744	contig_15114_pilon	+	3317	16	Intergenic	novelGene_121174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	62.5198279659253	139	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	64	2262	649813	677858	FALSE	25	AATAATCCTTTGTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHIKDPSQEDGVIINEHGEDEMDMESEKEEEKPKAGGAFSNALSSLNVLRPGEIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFPPHDTEPGKGRLVREDENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQIRKGINIPQVQASQPTEVNMYYQNTFQTMPYGSSYGIPYSYTTYGSSDAKSQKTDNTAPFKTPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRRLDSMKELHRTNQQQHEKHVQSRVDSSRAIERLEGSSGGIGERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSEFSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLSSDDEETSTDVTNFSLEKDRISKESSKIFEDVLESFCSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAYIGLCLPKLFNPLIRLQLLIWTPLEAKCQDFESMLWFESLLFYGCEEREQEKDDVDVALLPTIVEKVILPKLTVIAENMWDPFSTTQTSRMVGITLRLINGYSSVVNAENRNTQVYLKALLLRMRRTLDDDVFMPLYPKNVLENKNSGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSNKTLQELSIDGLLNRYILMAFQNSEYGDDSIKKAQNVISCFPKQWFVNLKGERTISQLENFCRYLVHLADTIYRNSIGCSDVEKRNARENIKQIIKLLASVHALDHAMTVAGDHNVKEFKSLIEGK	649749	678913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_649904_651391_651614_652151_652256_653279_653498_654004_654198_658662_658787_662559_662660_662747_662864_665290_665491_667331_667477_668358_668481_669734_669812_670208_670276_675200_675348_676587_676743_677740
912745	contig_7612_pilon	-	2481	3	Intergenic	novelGene_170367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2136	2465	208950	208621	FALSE	40	CTAAGAGCAAAATTTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMLLFSGKRAKVAFGNRSNRSVFSNSQPASESPDCWTQPRVPDSVSLRLSEEAPRWLEAPGACRAGGGDSALKLPRKQGLSAGPGRRSLDHRPPRPSPLPPADRTLG	364405	208604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_210667_293424_293519_364080
912746	contig_2358_pilon	-	3070	1	Intergenic	novelGene_156109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGATTGGACAGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207550	204480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2358_pilon_-_204500_207600
912747	contig_11574_pilon	-	6625	19	Intergenic	novelGene_64034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_18	42.7349352562751	571	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	986	2961	262	3222	418299	271982	FALSE	15	CCACTTCTTTTTTTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGPGCEPCTKRPRWGAAATSPPAPSDARSFPGRQRRVLHPKDASVQFRVLPSSPGCVPGRAGPHRGSATSLVLKQKPITSWMDTKGIKTAESESLHSKENNNTRVESMMSSIQKDNFYQQNMEKLENVSQLNLAKSPIEKTTQYLNQHQTATTCKWQNEGKHMEQLLESDPPTVTLVPEQFSNANVDQSPQNDDHSDTDSEENRDNQQFLTPVKFANAKQTAEGELAREARSNQKFSKSCHAVEECASCQQEEIGVPESPLSDVGSEDIRTAPKNANKLRGQESSLGNSLPLEKESEPESPMDVDNSKNSCQDSEGDEEPSPGSDEQEDGPSSQTADKPSRFQAREIDTQTRKQHSTKGGEVRLHFQFEGGESCTGINDVNARLPGSTPTLNVECRNSKQPGKKDSKITDHFPRMSKAEDKRKELRRESQMGSRNSKGLDKKWLGTPIEEMRRMPRCGTRLPPLRPSANHTVTVRVDLLRAGEVPKPFPTHYKDLWDNKHVKMPCSEQNLYPVEDENGERTAGSRWELIQTSLLNRFTRPQNLRDAILKYNVAYSKKWDFTALVDFWDKVLEETEAQRLYQSILPDMVKLALCLPNICTQPIPLLKQKMNHTITVSQEQIASLLANAFFCTFPRRNAKMKSEYSSYPDINFNRLFEGRSSRKPEKLKTLFCYFRKVTEKKPTGLVTFTRQSLEDFPEWERYEKPLTRLHVTYEGTIEGSGQGMLQVDFANRFVGGGVTSAGLVQEEIRFLISPELIVSRLFTEVLDHNECLIITGTEQYSEYTGYAETYRWVQSHQDGSERDDWQRRCTEIVAIDALHFRRYLDQFVPEKIRRELNKAYCGFVRPGVSSEHLSAVATGNWGCGAFGGDSRLKALIQILAAAAAERDVVYFTFGDAELMRDVYSMHTFLTERKLTVGEVYKLLLRYYNEECRHCSTPRTGYQALPVHIPCCGLVCRGLRPAWEKDRALRSRDNGTSFCLTPEMFC	418560	268578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_272191_272867_272997_292491_292598_300747_300857_302274_302354_314091_314240_318467_318544_322160_322222_333974_334055_342356_342515_347375_347469_391734_391810_396223_396308_396544_396668_408536_408644_408795_408849_409880_410865_411470_411538_418079
912748	contig_7571_pilon	+	3833	5	Intergenic	novelGene_106406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	50.236316544906	154	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	296	670	298104	309198	FALSE	60	AAAAAAAAATTCTATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKCELQRIFDTYVGAQRTHRIENSLTYSKNKVLQEATHVMQGEVDKRVEDIMKEKNINPEKDASFKICMKACLLQISGYKQLYVDVENERKKPYDSDNLQHEKLLLKVNFCFLYLELLNIEK	296764	312361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_296983_298026_298174_300480_300510_303823_303922_309020
912749	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
912750	contig_16411_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_77317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACATGGAAAGATATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134405	135865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_134400_135900
912751	contig_16594_pilon	-	3192	1	Intergenic	novelGene_53893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGAAGTAGATCGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233527	230335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_230300_233500
912752	scaffold_12124_pilon	+	1978	10	Intergenic	novelGene_22217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3350.51412306961	14	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	38	364	1473608	1494774	TRUE	25	CTTCACTGAATACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGTVSRLTTT	1473570	1509371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494329_1494758_1494857_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
912753	contig_9423_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_99163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2060	4069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_2100_4100
912754	contig_14666_pilon	-	948	5	Intergenic	novelGene_39508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1028.79817627171	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	382	831	451985	322918	FALSE	60	TCCATAAGAAAAAGAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSPESPKCLLGTQQPLCRRLSTEHQQLDRINIKRKGAWPSTLLSVQNVIDCGDAGSCEGGNDLLVWAYAHTHGIPDETCNNYQAKDQECDKFNQCGTCTEFKVCHVIQNYTLWKVGDYGSLSGRKKMMAEIYANGPISCGIMATESMDKYSGGIYAEFSEEASINHIVSVAGWGVSNGTEYWIVRNSWGEPWQLVLTKVHALDDVTAIVEHATNVLGVHSASEVGVAVVAPISTGSADSLWAQTEGPVSDTPSRVSPLPTGPLTSTTVHHPLKLY	475139	322800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_323170_450765_450929_451950_452102_453686_453867_475054
912755	contig_2215_pilon	+	4198	2	Intergenic	novelGene_163861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTAAAAACGTAGTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228232	379273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_231387_378229
912756	contig_8823_pilon	+	2462	5	Intergenic	novelGene_53055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	18.3762754659371	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	218	535	76251	77224	FALSE	55	AACGAAAAAAGACGGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPVVLRLRRQADCVILNCSQHCASCSGRNQEPRLSFLEEHSSLVEVLTSACRQSHTQTSGCFFPIPGFFRLMEGRENAGDLREEKAKRGGTRGWEEEKDLLQAIVSRARTWVCRLPLLLHSQVQTLTGDPLLRRNHGKYYGCQRYNFKTAIKAAPDAHCVSKHHSKHVTCSITHSS	51763	79151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_+_51824_72945_73072_76219_76301_76878_76985_77062
912757	contig_6048_pilon	+	6171	1	Intergenic	novelGene_73085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	409	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	264	795	349	1143	81234	82028	NA	35	TGCAAAAAATTCTAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTQGDDATQGQGEDQAETEKKGGGVQSQSEDVTKFQKEEKAQIQREDGAQTPKEDRAQIQRENGAQTPREDGEAHCQRSGRSNRRRRFKGRLKSISREPSPAPGSNLEGSGLLPKPMFSCSFPTRMPGDKWSPRITGLCPFGPQEILVADEQNKVLKRFSLNGDYKGTVPIPDGCSPCSVAALQGAVAFSAGSRLYLISPDGEVQWRRALSHSQASHAVAALPSRDRVAVSVSGFVEVYNMEGSLATRFVPGGKASRGLRALVFLATSPQGNFVGSDWQQNSLVVCDGLGQVIGEYSGPGLHGCQPGSVSVDKKGYIFLTLREINKVVVLDPKGSLLGDFLTAYHGLEKPRVTTMVDGRYLAVSLSNGTIHIFRVRSFDS	80885	87056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_80900_87100
912758	contig_5881_pilon	-	2964	14	Intergenic	novelGene_129063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	118.041813873242	170	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	39	1532	755253	722141	TRUE	5	TGTCTTGTGTCCTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYQEGRLQKLLKMNDSEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAKYDKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEDMVKHDWEKMTEAVQNYIGSLNWGYRVALREKKVTYENAYGQFVGPHRVKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYSPGKTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGVKFIRQFVPIKIEQIEAGTPGRLKVVAKSTNSEETIEGEYNTVLLAIGRDACTRKLGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKLELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSNVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVVKFGEDNIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIVCNIKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKQQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGGSILQSGC	755291	720206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_720607_721108_722204_728543_728679_729732_729829_732845_732954_737069_737227_738424_738502_739101_739195_741825_742052_743360_743477_744092_744236_752280_752401_753461_753535_755166
912759	contig_18055_pilon	+	1773	16	Intergenic	novelGene_117806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	399.463217608608	150	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1344	430	1773	73614	85633	FALSE	70	GAAGAAGAAGAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKE	40641	85633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_43421_43502_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
912760	contig_13301_pilon	+	755	6	Intergenic	novelGene_153126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	250.644289781355	62	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	9	725	169218	174473	FALSE	45	AAAGTTCTTTGAAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNMTAQAQASGLLVLLLLTLPTTGSDPVLCFTQYEESTGKCKDLLGGGVSAEDCCLNTAYAFQEPGSGLCQACRSPLWSPWSVWAPCSVTCSEGSQLRYRRCIGWGGQCSEKVEPGTLEWQLQACEDLPCCPEMGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTAMSTRTCLQRPKQEALTPLPSTLTP	169209	174503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_170999_171499_171671_171809_171885_174393
912761	contig_8570_pilon	-	2329	1	Intergenic	novelGene_120161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1470	1853	350649	350266	NA	70	AATAATGAAGAAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDLNSLSGSSSAFFSTGDSSGVLIWTPSGTILSCFCKCFDIVCVFRAFSSYFSHLLIVYLFVSSFFFVLFGYVCTSGLCVLCCLLICGHDTFCFPLQLAGSVAQIWYSRAGLGEEELLGWVVCGTY	352118	349789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_349800_352100
912762	contig_12000_pilon	-	3027	7	Intergenic	novelGene_43170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2702	3025	449734	416991	FALSE	45	CAGCAGAGAAGCAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQREQAVDIQHAGDAPVTHVHFRLVLLAALLHQLFQRLRHGLYQTTTTKHVGNGEEGAGTERKNPPAATPQSSPALESRHRRADPDAARGMGKVGQGNGKGPAPFWP	560698	416988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_417301_449720_449772_484101_484221_488474_488596_490220_490304_490573_490685_558468
912763	contig_546_pilon	+	4779	6	Intergenic	novelGene_117224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1067.08380177004	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	42	1232	136801	152874	TRUE	55	CCCCCAAAAAAATCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNDSGGSRPPVLPPGGRPTSSKSFSPPSGPGRFPVPSPGHRSGPPEPQRNRMPPPRPDVGAKPDNVPPPVPNTPRPVQSSLHNRGSPPVPGAPRQPSSGPAPPPFPGSRGAAFGGGSMRQSPPGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	136759	156560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_136838_139866_140638_146633_146847_147557_147672_152818_154385_154523
912764	contig_513_pilon	-	3102	1	Intergenic	novelGene_80143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTGTTTGCACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356982	353880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_353900_357000
912765	contig_1372_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_140523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	894	1208	462730	462416	NA	45	GCAAAAGACAGCTAACGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHILHQPEPRRTRWCPATTTNCSDRDHNRGSWTEWEKNVEQNSKKTKKKTRLIGLTETGGASETMAPKYPTKSELKPLLKSTFQPKIRQAYKTNKNTCEEHTA	463623	461538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_461500_463600
912766	contig_10263_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_135859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	225	347	946864	946742	NA	55	GCAAAAGGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAWPCRLSGAGSLLVQKTCLSSTAAYLPYGSPPKLIRPEGLRLSPGQVWQLLAASEPSLPPPATQSGSSTLPLMFRAPRLPYIIESLFWGGLCYKRVHQKCLTTPPCWPCLRI	947088	944881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_944900_947100
912767	contig_13565_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_162381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGTACTGCCAGAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143740	141902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_141900_143700
912768	contig_4962_pilon	-	2429	2	Intergenic	novelGene_107370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTACTACTGTTTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112146	39287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_39360_109789
912769	contig_13542_pilon	-	1973	4	Intergenic	novelGene_131568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	257	703	705480	703145	FALSE	30	GGGGACACCAAGGCAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASTLLPQRAQESSCSSTGDTPSSTRKLTWRRKYRTASSLMQNFCQLMVLCAAISAQALRCSIWLMSVSYCKAEPELAVTTLARRNIPCSSSSFLIPRTWESRVCKSRSWRYFSFDPQMKSRSLRTCRRTNGVCWIIRYFREKQHKG	706649	701874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_703398_704439_704520_705366_705627_706539
912770	contig_19850_pilon	+	3072	1	Intergenic	novelGene_170856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACAGCAATATCCAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25578	28650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_+_25600_28600
912771	contig_18419_pilon	-	1903	3	Intergenic	novelGene_141462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	6	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	46	381	31314	30259	TRUE	20	TGAAAGTGTCCTAGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEPARQQPSKRRKRKMSGGSTMSSGGGNTNNSNSKKKSPASTFALSSQVPDVMVVGEPTLMGGEFGDEDERLITRLENTQFDAANGIDDEDSFNNSPALGANSPWNSKPPSSQESKSENPTSQASQ	31359	28638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29300_29397_30490_31209
912773	contig_2940_pilon	-	4077	8	Intergenic	novelGene_81944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	274.453668815942	28	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	187	1830	765078	756839	TRUE	25	GTTGGTTAACCCCCAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPSTGDCGADPSVAASERLDPDRPCHLREEDVALGSERVREDEKQTVIKSSSECNPLLEEPIASQFGGTAATECHKSVPCGWKRVVKQRSSGKTAGRFDVYFVSPQGLKFRSKSSLANYLHKNGETSLKPEDFDFTVLCKRDIKSRCKDCSISPLTSQVQKESNNSNWNLRTRRGRKNDVFPMPHGSSELQDGRGLSNLTAIHLSLKEDEGVNAVDSRKVRKSKGKMTILKGIQIKKTKKRCSKSLSDSVQNNRKRESVCSEADVEGEPVAQESQLGRTLYISDVKASDETLVVTNEEKRLVKEKSLQSESNVHFEKLTSGSINKLCLTKEAEHNKKCENTFLDCEEIKTEVEVGERKKHLHTDVLKCGSEMDNSCLQAEKNFTSVKKFQALSPPRRKAFKKWTPPRSPFNLVQETLFHDPWKLLIATIFLNRTSGKMAIPVLWEFLEKYPSAEVARTADWRDVSELLKPLGLYDLRAKTIVKFSDEYLTKQWKYPIELHGIGKYGNDSYRIFCINEWKQVHPEDHKLNKYHDWLWENHEKLSLF	765264	729612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_730115_755093_756917_757853_757958_758454_758605_759195_759331_762008_762869_763289_763518_764989
912774	contig_14405_pilon	-	2051	7	Intergenic	novelGene_85639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_3	93.3959611308517	9	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	585	968	437598	436681	TRUE	20	CTAATTGTATTTTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNFSMQAIDQVINSAAKTYYMSGGCQSVPIVFRGPNGASAGVAAQHSQCFAAWYGHCPGLKVVSPWNSEDAKGLIKSAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPEAAQSKDFLIPIGKAKIERQGKRT	439474	434583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_435107_435411_435554_436262_436806_437339_437959_438043_438152_439270_439325_439412
912775	contig_5848_pilon	-	425	1	Intergenic	novelGene_163805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATCTAAAGTACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204505	204080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5848_pilon_-_204100_204500
912776	contig_11720_pilon	+	2766	2	Intergenic	novelGene_44023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGCTCTCATAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341933	421993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_342678_419971
912777	contig_6397_pilon	-	4564	7	Intergenic	novelGene_146236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_5	14.5564037072654	268	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	300	881	306494	301542	FALSE	20	TGTATCATCTTGTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKVVFKPKRYSRDYVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFRRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDTMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAHDPIAPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGADAVLVEDRMPLSHL	333114	297858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_301774_304420_304481_305995_306188_306396_306569_319806_319917_326638_326726_333086
912778	contig_9516_pilon	-	3651	12	Intergenic	novelGene_106181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_10	91.8243922292136	23	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	30	1412	913190	883534	FALSE	55	CCCAACATACTGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRGGAVAEMFWCRALAASALRQKLTPLVRTVCVRSPRQRNRLPGNLFQRWHVPLELQMTRQMASSGASGGKIDNSVLVLIVGLSTIGAGAYAYKTIKDDKKRYNERISGLGLTPEEKQKRATTPASEGEPVPQVRVPSHVPFLLIGGGTAAFAAARSIRARDPGARVLIVSEDPELPYMRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVVSVNKSAQWCAKAYPQLNQIGEKCL	913219	881294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_898505_898631_899602_899703_905481_905625_913084
912779	contig_8317_pilon	+	688	1	Intergenic	novelGene_19401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTCAGTTTGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	17068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
912780	contig_10140_pilon	-	3923	2	Intergenic	novelGene_148399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	628	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2171	2479	207562	206537	FALSE	40	GCAAATACTACTACTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVGCTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH	209732	205092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_206763_207479
912781	contig_12677_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_110725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
912782	contig_6870_pilon	+	3011	2	Intergenic	novelGene_103955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTGACTATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1266524	1269841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1267042_1267347
912784	contig_546_pilon	+	4666	9	Intergenic	novelGene_117209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	974.65686269579	21	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	183	1343	119834	152874	TRUE	60	CCCCAAAAAAATCCATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPPPPAPPPPPTLALANTEKPTLNKAEQAGRNALLSDINKGKKLKRTVTNDRSAPILDKPKGAGAGGSGGAGGFGGGGGFGGGGGSSSGGGGSFGGGGPPGLGGLFQAGMPKLRSTANRDNGSSSPFSNRPPLPPTPSRALDDRAPPPPPPMGNRPSLHRETGPPPPPQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	103387	156561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_103532_119795_119885_123934_124065_136648_136838_140229_140638_146633_146847_147557_147672_152818_154720_155083
912785	contig_3956_pilon	+	1753	8	Intergenic	novelGene_15094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	13	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	78	1190	1281682	1290447	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALRDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPAEPSPSVCSTTGRSCPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1281604	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284148_1286112_1286224_1286409_1286606_1287276_1287478_1290335
912786	contig_2367_pilon	-	2597	2	Intergenic	novelGene_65338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_1	0	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGAAAATAACACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282713	279126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_279571_280560
912787	contig_12074_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_53773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCAGTTTAGTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39461	38299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_38300_39500
912789	SIRV6	+	1418	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	2	108	2	27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	99	18	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	256	747	1733	10736	TRUE	35	TCTTCAAAGTCTAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1089	11717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912792	contig_12425_pilon	+	2660	9	Intergenic	novelGene_46660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	465	2195	2659	207290	211082	FALSE	30	CCAGCTCATCAGACAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTWRDGVGSAAYMGVIEATGNQAFLSPEIPSSSRKAPIAAVPTLHVTAGEQVLCRHLHIDVLTGVNADPVRNGLHSPKCPTRATGTLVSDLFDGWTVWPVFPGIKVFRQIHFLSKVNSLGQLGSIQQGATQSLHVAHINIVEVHVVLCLLTWL	202474	211083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_+_204319_204832_204962_206555_206673_207185_207327_207650_207738_208645_208764_209380_209497_210302_210380_211052
912793	contig_15886_pilon	+	3882	1	Intergenic	novelGene_144328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	334	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGACATAATCAACCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1878	5760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_1900_5800
912794	contig_9177_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_32807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1176	1637	1568638	1569099	NA	65	AAAAAAAAAAGCTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCPAVNMQKIPLCFPELQKNGDFPRQFKRPHMEAVDKKPHRDMRKSHGSWRNNRWPQEKKEAQKEMMSRNSRDGEKHRKADKYHEVDEDFPRGPKLHQKPDRSSRHSSHYHRPRGEKLPKEAKRGKHKKKERGLEDDDNDNLFLIKQRKKKI	1567462	1569398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1567500_1569400
912795	contig_6544_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_142119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGTGCACCCTTTCGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405378	404478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_404500_405400
912796	contig_6079_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_160099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAACAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438955	440400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_439000_440400
912797	contig_20357_pilon	+	2326	2	Intergenic	novelGene_178716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	81	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAACAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27782	30955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20357_pilon_+_27870_28716
912798	contig_4426_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_15450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGGCAATAATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864541	867892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_864500_867900
912799	contig_5964_pilon	+	2692	2	Intergenic	novelGene_80355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCTTATGCAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38417	41473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_38571_38934
912800	contig_13148_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_162926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAACAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77057	79390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_77100_79400
912802	contig_753_pilon	-	2317	5	Intergenic	novelGene_112901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGTGGTCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277351	271424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_272998_273976_274212_275336_275414_276271_276469_277116
912803	contig_13699_pilon	-	3553	7	Intergenic	novelGene_158322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCAATTTCTCATACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105824	65400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_-_65586_66407_66536_67774_67974_70766_71263_72686_74162_104575_104736_104914
912804	contig_8829_pilon	+	1625	1	Intergenic	novelGene_140945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTAATTTGTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11515	13140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_11500_13100
912805	contig_15325_pilon	+	2853	3	Intergenic	novelGene_157181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_1	385.5	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1191	1544	95198	96243	FALSE	70	GATCAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIVEPYIAWGYPNLKSVNELIYKRGYGKINKKRIALTDNALIARSLGKYGIICMEDLIHEIYTVGKHFKKANNFLWPFKLSSPRGGMKKKTTHFVEGGDAGNREDQINRLIRRMN	94007	97552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_95233_95674_95785_96034
912806	contig_9319_pilon	+	5018	1	Intergenic	novelGene_154645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	125	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	997	1344	82214	82561	NA	20	ATCATGTTCCCCATCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKVKVRALIGKKWDPETWDGDIWADNQEAGGIEPLNSIESLLPAEPALSLPSEEITPCLSAKPTCPVKPLAPPLPSNEINPAAFKAPELLPVASPEADSLQDKVNVLKTFPHRF	81217	86235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_81200_86200
912807	contig_15114_pilon	+	1620	4	Intergenic	novelGene_121149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAGATTTCCCAGCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136351	151120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_137183_141881_142048_147671_147816_150641
912808	contig_5988_pilon	-	3398	11	Intergenic	novelGene_15846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	152.371421204897	820	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	30	1073	259970	251825	TRUE	50	AAATAATCATCTGAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHRGSGGSGMNRIRIHVLPTNRGRITPVPRSQEPLSCSFTHRPCSQPRLEGQEFCIKHILEDKNAPFKQCSYISTKNGKRCPSAAPKPEKKDGVSFCAEHARRNAMALHAQMKKTNPGPMGETLLCQLSSYAKTELGSQTPESNRSEASRILDEDSWSDGEQEPITVDQTWRGDPDSEADSIDSDQEDPLKHAGVYTAEEVALIMREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTQKDAPAIGDLLTLYSGLMETALD	260590	241630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243004_243289_249401_250665_251800_251896_253927_254025_254689_254857_255235_255400_257593_257709_258760_258940_259719_259979_260569
912810	contig_6377_pilon	+	3326	2	Intergenic	novelGene_178919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	420	2907	3326	2994	3479	FALSE	50	AAAAAAGCAACACCTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPQRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDERAKTALGVRHLSQKRGRQRAASENPKEAEKEKRGRKKK	87	3479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6377_pilon_+_3297_3362
912811	contig_5669_pilon	+	3800	9	Intergenic	novelGene_86072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	267.359513342989	5	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	157	1332	186087	189303	FALSE	25	CACAGGGTTCCCAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQRWCPWRPDCCWRCSQGSFPGRLTVSGFRSQTQTSKTAWWSSLRSSITSGSPSSGGPGPCTQLACNNEAADSDWPGLPRWL	185869	191771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_185931_185991_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187512_187718_188112_188198_188318_189009_189171_189221
912812	contig_15952_pilon	+	2341	9	Intergenic	novelGene_154072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	197.280099097704	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	53	1162	314905	347741	TRUE	35	CTTGTAACAAATTGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVIALQASVIKKFLQGFMAPKQKRRKLQSEDSAKTEEVDEEKKMAEEAKVASALEKWKTAIREAQTFSRMHVLLGMLDACIKWDMSAENARCKVCRKKGEDDKLILCDECNKAFHLFCLRPALYEVPDGEWQCPACQPATARRNSRGRNYTEESASEDSEDDESDSEEEEEDEEEEDYEVAGLRLRPRKTVRGKQGVIPAVARPGRRPGKKPHPTRRARPKAPPVDDTEVDELVLQTKRSSRRQSLELQKCEEILHKIVKYRFSWPFREPVTRDEAEDYYDVITHPMDFQTMQNKCSCAGYRSVQEFLTDMKQVFTNAELYNCRGSHVLDCTVKTEQCLVALLHKHLPGHPYVRRKRNKFPDRLPEDEGDSEPEPVGQSRGRRQKK	314852	349536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_315001_327535_327684_328687_328836_330661_330772_344969_345116_346376_346481_347383_347757_348269_348760_348862
912813	contig_4469_pilon	-	1362	2	Intergenic	novelGene_21868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATTTCATGAGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145236	16304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_17363_144932
912814	contig_10451_pilon	-	4197	10	Intergenic	novelGene_138317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_4	65.4437841883313	189	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	49	2376	306575	260269	FALSE	20	GTGTACAATTTTGTGGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLDQTLIHTTEQHCQQMSNKGIFHFQLGRGEPMLHTRLRPHCKEFLEKVAKLYELHVFTFGSRLYAHTIAGFLDPEKKLFSHRILSRDECIDPFSKTGNLRNLFPCGDSMVCIIDDREDVWKFAPNLITVKKYVYFQGTGDINAPPGSRDTQMRKKVNHSSKGADASEHTLSGKDPEEGKPASGVEQSNGLRKPPTELNGSKAGTGDPSSGDTPAHEKADGNDPLCPALSAVTGSSEPVGGKEPLMSLEQGGRASPDQQSARGTPGNDLDFDLSSDSESNSELDGHRSSSSSASDSDSEGKRGRRKSRVTRKGTSTHPRAEKPTGVAPSGTCGSSVRPQDKGPDLEAPEEGEQGGLCDLGNGCADRKEAETESQNSEQSGITVGESLDQSMEEEEEEDADDDDHLVHLEEILVRVHTDYYAKYDRYLNKETEEAPDIRKIVPELKSKVLADVAIIFSGLHPTNLPVEKTREHYHATALGARILTNLVLSPDDPNRATHLIAARAGTEKVRQAQECRHLHVVNPDWLWSCLERWDKVEEQLFPLRDDYARTQSRETSPAAFADRQSAFQTALFHPTPVHPRSLPNPEARIYDASTGKLIRKGTQPTAPPPYAQAPAPPTSLPAHGEHSSFRVVQPHQQQMFDEELRDNPDEEQPGPSRRKRQPSMSETMPLYTLCKEDLESMDKEVDDILGEGSDDSDSEKKKLEEEEEEGKPLSGEAEAPGAETEPKSASSWSSEQSLAGGSVPRGHKRKLNEDDVASDSSKESSNEDEEGSSSEADEMAAALEAELSDFM	306623	258447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_260411_271840_272023_285762_285926_293849_294084_295188_295331_297593_298638_299696_299864_301178_301270_303534_303686_306563
912815	contig_13004_pilon	+	5010	2	Intergenic	novelGene_112646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	447	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTACCTAGCAATTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414004	422646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_418754_422385
912816	contig_7285_pilon	+	5613	2	Intergenic	novelGene_143406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	731	junction_1	0	215	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	20	343	312564	313995	FALSE	95	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRVSSIPVYTNVYGNHVS	312544	319265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_312674_313781
912817	contig_7356_pilon	-	1683	9	Intergenic	novelGene_60362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	628.796158842434	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	477	1211	342753	336759	TRUE	10	ATGCTTCATTGGTTTCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSEAQKMLSQSLYGMSLISGTVIRRGDPQPVLMCTLVKKENWERPKSMTDLLHHSLLSGSLSAVHKLRRSQARLAQSGIPPPAHTFPYEILIDHANSLKTATVRKKVQNTLVLCKLGISKISVPEKFIVEDKLPKYFLINPEKQFLDLKDLEWRYYKGLVKWTHTTSDSFIDIKCNKEMRFVESQLMPDDIFPPLVLAIKMILTHGGPMGCRVRLLHREFTAVITRPLFQGTPGHIGKLHQS	457915	329289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_329714_336710_336787_337826_337939_340697_340863_342323_342830_343906_343999_435516_435623_437474_437529_457767
912818	contig_7870_pilon	-	1228	8	Intergenic	novelGene_108912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	523.735717743994	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497931	216787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_217381_295249_295385_370811_370890_402901_403001_441672_441714_441753_441796_496464_496595_497821
912819	contig_14225_pilon	-	898	8	Intergenic	novelGene_52740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	168.230648279106	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	42	896	547702	169055	FALSE	20	TGAGACCTCAGTTTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSSTGCGTGKDPGNSKSNPISFTDGVAGREQLLAQQRMHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLAIKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSATKDTQTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGNVTE	547743	169052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_169132_214766_214889_216233_216361_217343_217495_221790_222033_334549_334613_433087_433145_547686
912820	contig_13800_pilon	+	2654	5	Intergenic	novelGene_153748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGAAATACTGGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174719	213925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_175885_193490_193574_197498_197576_199920_199993_212668
912821	contig_15361_pilon	+	3717	1	Intergenic	novelGene_167878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTATCTTGATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506949	510666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_506900_510700
912822	contig_9335_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_147439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297722	295367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_295400_297700
912823	contig_19735_pilon	-	676	2	Intergenic	novelGene_167885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	29	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAATATTTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112035	106244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_106851_111965
912824	contig_6079_pilon	+	4685	1	Intergenic	novelGene_160107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	307	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAGACATAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470931	475616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_470900_475600
912825	contig_18990_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_177453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTCACGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16920	15926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18990_pilon_-_15900_16900
912826	contig_5033_pilon	-	5785	4	Intergenic	novelGene_28973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	12.2565175405668	659	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1441	1755	474714	474400	TRUE	45	TGCAAATAATTATAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMRGHLNARRHLAASSTEEPITEMGWLCPGAPCGCFNFPINGTKVPCWGLVFSVRMWPRQEVHCWEGATPLVCMQCVCVVVGVLGTKEKKEGRQGGVLSAYLV	476394	469613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_469969_470655_471803_471871_476098_476337
912827	contig_20199_pilon	-	654	3	Intergenic	novelGene_82598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_2	216	5487	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	59	180	206	385	43987	40928	FALSE	30	GCTGAAGTCAAAGAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGFFAHWTGRSHRRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQVPPIELKELAAM	44192	40658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_42110_42171_43906
912828	contig_21232_pilon	-	3735	3	Intergenic	novelGene_165985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1489	1881	25361	19749	FALSE	65	TTAAATTAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGASTEGGGSVLSVVQVFWTEDAFFPQDKVVMLMLYEVQKFKCVTSAMQLVPFSKEQFSRHVMLSQAPLLTSSLKPALLPGGRAHVRTKVGSLGTGSQLKFTGAASVQNDAELDAPSVTFPTCAKISTV	26849	17894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_19820_22216_22505_25327
912829	contig_16647_pilon	+	3353	1	Intergenic	novelGene_170314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	952	1290	340512	340850	NA	25	TTACCTTAACCGGAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPAQAHQQCPAVGYFFLRHTVSLKYSPHSAALAVPPGTSALPPWPSARFNSTLVQCHGLPSPPPNYMVCELPQTIYAALKNKSGYSFLRLALFLCSLFGVLPIPVLKWLW	339560	342913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_339600_342900
912830	contig_13425_pilon	+	2449	3	Intergenic	novelGene_170846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_2	299.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	171	1688	59913	62332	FALSE	30	TATTTTACGTTTTCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDGETDKHWRYRREFLLRNAGDLAPTGGVASSNTDEAADAKSGTCSRQLQQLISFSMAWANHVFLGCRYPQKVMDKILSMAEGIKVTDAPIHTTRDELVAKVKKRGISSSNEGVEEPSKKRGIEGKNNSAVEQDHAKTSAKTEYPLAKQENSSTCMGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKLFLKKKVVVKICKRKYRGSEIEDLVLLDEESRPVNLPPALKHPQELP	59742	63093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60429_60561_60980
912831	contig_8069_pilon	-	525	2	Intergenic	novelGene_136778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGACTTCTTGATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562716	535839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8069_pilon_-_536239_562590
912832	contig_6946_pilon	+	3823	4	Intergenic	novelGene_59755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3302	3613	108557	111997	TRUE	10	CACTGCGCCGGTCGATCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGRGDLMPLCGGCTRSVSAGAGAGTGLTGHTQSRHGAALTGSNCTSEKVVGAAVAGGPLRAPFCQGSALLSLLYLKYFLFYFALLPVQLPLHFWSKQQQLE	105255	113139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_108747_111801_111883_111956_112040_112971
912833	contig_5419_pilon	+	3521	9	Intergenic	novelGene_15508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	697.528449240603	1	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	44	1309	241951	249830	TRUE	35	CATATGACATCACAGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLWSVSVAVFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	241907	252115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_241998_243791_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614_251434_251506
912834	contig_935_pilon	-	2540	2	Intergenic	novelGene_45582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAGGTATTTCCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625662	623010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623566_623677
912835	contig_9924_pilon	-	1781	1	Intergenic	novelGene_175928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133652	131871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_131900_133700
912836	contig_19459_pilon	-	1132	8	Intergenic	novelGene_59824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	8445.25837741063	41	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	76	795	16240	7003	FALSE	15	CTTCTTGTATTTATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16723	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12638_15503_15702_16203_16265_16672
912837	contig_7410_pilon	+	2200	8	Intergenic	novelGene_106051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_7	301.280938795724	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	497	1714	90675	125316	FALSE	20	ATCTTGCTGGTGGTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFIGTVRGKAMKKWVESITKIIQRKKIARDNGPGHNITFQSSPPSIEWHISKPGHTETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYRAVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVAVVSRIIEILQVFQELNNFNGVLEVVSAMNSSPVYRLDHTFEQIPSRQKKILEEAHELSEDHYKKYLAKLRSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKRHGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRVESGIKKFFENLNPMGNSMEKEFTDYLFNKSLEIEPRNPKPLPRFPKKYSYPLKSPGVRPSNPRPGTMRHPTPLQQEPRKISYSRIPENETESTASAPNSPRTPLTPPPASGASSATDVCSVFDSDHSSPFHSSRC	90178	125802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_90703_91879_92103_93487_93608_98686_98850_107338_107457_123306_123480_123675_123793_125040
912838	contig_3975_pilon	+	2719	12	Intergenic	novelGene_54760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	94.3190470935118	24	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	14	1306	1961329	1984755	TRUE	45	TTAACAGCATTAAAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGEDVGWWRSWLQQSYQAVKEKSSEALEFMKRDLTEFSQVVQHDTACTIAATASVVKEKLATEGSSGATEKMKKGLSDFLGVISDTFAPSPDKTIECDVITLMGTPSGTAEPYDGTKARLYSLQSDPATYCNEPDGPPELFDAWLSQFCLEEKKGEISELLVGSPSIRALYTKMVPAAVSHSEFWHRYFYKVHQLEQEQARRDALKQRAEQSISEEPGWEEEEEELVGVSPTSPKEAKVPVTRTSTSPEGRAEPQSPCGENLVTPVETPAEVTPSESSESISLVTQIANPATSPEAPVLPKDLSQKLLEASLEEQGLPVDMGETGPPPPAHPKPLAPPGLSSSPERRPPARVETLREEAPTDLRVFELNSDSGKSTPSNNGKKGSSTDISEDWEKDFDLDMTEEEVQMALSKVDASGELEDVEWEDWE	1961315	1986245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1961340_1961599_1961661_1965790_1965908_1968015_1968184_1970744_1970800_1972854_1972971_1973385_1973455_1973621_1973701_1975614_1976095_1983156_1983261_1984722_1985362_1985438
912839	contig_15118_pilon	+	2721	10	Intergenic	novelGene_74608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_6	211.339525554801	4	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	53	1183	392042	394049	TRUE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTGMKEGQRTTPWDRVSGTLV	391989	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
912840	contig_6325_pilon	+	3959	1	Intergenic	novelGene_143353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGTATTCTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348753	352712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_348800_352700
912842	contig_3270_pilon	+	3270	6	Intergenic	novelGene_104486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_5	57.7165487533688	16	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2664	3236	324502	338530	FALSE	50	ACATTTTCTTAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILREVLRKSKEEYDQEEERKRKKQLSEAKTEGPSVHAGEATKMDNFQGDGEPFAHPPPEVEVHFANRSAQPLARKLGMLPESSSLPQRGLKMPDLEHASVEGPITNLSALGTEELRQREHYLKQKRDKLMSMRKDVRTKQLENTEPQGTPAGEVEEMTEKPEMTAEEKQTLLKRRLLAEKLKEEVINK	321838	338564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_324528_326867_326920_336188_336292_337334_337475_337637_337788_338428
912843	contig_7412_pilon	-	6088	18	Intergenic	novelGene_76266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_17	87.4937862351252	416	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	931	2796	284	3079	228446	209111	FALSE	40	GCCCAAATCTTTAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVPMGPDGLPVDASVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYNRHYEDGYPTGSDNYGSLSRVTRIDERYRPSMEGYRVPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPSSWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWELVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALVFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQIHREIPQAERYQEASPTVANNTGPHAASCFGAKKGKGKKPTEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPDLVNNLPGGQQSSSWNFSEDTVVSVLNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKTDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTLNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTPLMQKI	253668	206101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_209123_209858_209963_210617_210681_212732_212821_213392_213508_213863_214057_214971_215123_215224_215353_216349_216419_217238_217393_217855_217974_219101_219286_220381_220846_224026_224560_224978_225132_225891_225964_228251_228542_253480
912844	contig_10023_pilon	+	2215	1	Intergenic	novelGene_123490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1192	1590	214533	214931	NA	35	GCCACCGCCACACAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTTGKNENSRTLNCAHKEPVHRSRGSLRTEQADTTWFKIRKGVNQGCVLSPYLFNLYAEQIIQEAGLYEEEQGIRTGGRLINNLLYADDTTLVAESEEDLRHLSDEDQRLQPSVWITAQHKKKKKSSQLHQ	213341	215556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_213300_215600
912845	contig_6441_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_172891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTTCATACAGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310533	313273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_310500_313300
912846	contig_2711_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_178920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2711_pilon_-_0_1100
912847	contig_20165_pilon	-	1719	2	Intergenic	novelGene_54476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAGAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113786	60999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_61524_112591
912848	contig_6227_pilon	+	4391	3	Intergenic	novelGene_49615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1224	2195	373504	374475	FALSE	65	TTTAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLMPYTKTTSKWINDLNIKPKTIKFIEEKIGRTLQALIHGINRIQTITINAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKTVKREPTDCEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKEWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAITEMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMTWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFAIAKRWKQPRCPSTDEWINKLRYVHTMEYYAMRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQMDKYL	296806	376671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_296835_370462_370968_372813
912849	contig_8683_pilon	-	1420	1	Intergenic	novelGene_150270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	980	1318	715042	714704	NA	55	AAAAGAAGAAATTACAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSKHYLYICISSTDSAMLTNYSPKNVEQNSNSKKHQTYWPDWRNPESMAPGHPFSSVMKSLLRFTLQPKIRQPIKRNETSGAQQSRDKDWKAGGDRKAGNREPKVEKGQC	716021	714601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_714600_716000
912850	contig_4783_pilon	-	4832	3	Intergenic	novelGene_108358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	152	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3736	4203	117613	117146	FALSE	50	AACAGGCTAAATCTCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDWSIRTEEITENTERIVEDLLAENFPDIVKDDKISIQDAHQTPHKVDPKRKSPRHIVIKLAKTKDKERILRAARDKRKVIYKGEPIRISSDYSEETMQARRQWDGIYKALKENNCQPRIIYPAKLSLKYDGEIRTFPDKQKFREFAKTKPKLQ	121572	116516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_117665_117840_119994_120041
912851	contig_11564_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_158577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGCTCAGTTGCTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79172	81275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_79200_81300
912852	contig_7993_pilon	-	2788	2	Intergenic	novelGene_170970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	309	665	197606	197250	TRUE	25	GCTTGTGAGCAGCCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNILMLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAVVGWSVWYTSLRSSWLTVAFSSSVSLLSFFLDVLSFTECGVLMSPTITVELSISLLSAVRACFMYFGALSLGA	197914	74387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_75565_196303
912853	contig_2988_pilon	+	2889	2	Intergenic	novelGene_136547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1512	1847	84357	270056	FALSE	20	CTTTTTATTTATTTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRALSDIVPEDEPLRLEAIQKTTGEELPPQNRVDLNDVDRVKFSEPSFAHVARLKMRRNNCKYPLIIGMCNVRSMNLGKLEIVKNEMECININILGISALERTGIGHF	82845	271098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_84368_269731
912854	contig_13097_pilon	-	2639	18	Intergenic	novelGene_107694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	116	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	2100	2639	191638	184482	FALSE	5	TGGGCCTCGTCGCGCATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIILIIITVTITIVFSLGHFRFWYAVFSSFIFNSRWRISTSIFFFWPFNFIFICPLPYHCAHARPMGRHRATLLPHPLRSRRSAPTLGARPRRPTWPPRAQLKSSDQQPPQTPSPASLPRSAREVRTRQRVNEESTRLKPREGNEGRKAEEPSSGQPAQAQQHPSRTASLRGLASAAAT	265038	184481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_184817_185979_186022_186122_186162_190436_190497_191574_191683_195144_195197_195747_195862_196269_196392_196694_196758_205975_206071_215270_215380_225263_225358_226994_227151_243880_243932_245488_245544_253985_254198_263404_263546_264247
912855	contig_3252_pilon	-	3681	5	Intergenic	novelGene_61502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	265.581790603196	273	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2558	2938	333561	332004	TRUE	40	ACAAGAAATGCCCCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETAENYLGHAAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKIIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKREVSYRCS	336118	326271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_326647_331635_332188_332682_332790_332880_332955_333545
912856	contig_10734_pilon	+	2036	10	Intergenic	novelGene_51286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	109.232451199548	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	35	487	1346949	1353345	TRUE	35	GATCTGTCTGATAAGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFERKPAVL	1346914	1362873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1347012_1347328_1347504_1352397_1352592_1353324_1353436_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1361514_1361685_1362055
912857	contig_405_pilon	-	2331	1	Intergenic	novelGene_135293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTTGGCTATGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142108	139777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_139800_142100
912858	contig_12468_pilon	-	3202	1	Intergenic	novelGene_164878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTCAGGGAGTTTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67361	64159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_64200_67400
912859	contig_8065_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_107347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCACAATAATCCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261818	260491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_260500_261800
912860	contig_9972_pilon	-	1369	1	Intergenic	novelGene_162795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298574	297205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_297200_298600
912861	contig_4388_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_161985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	804	1175	1304641	1305012	NA	40	TTTGAACAAGGAAGCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRGLRTVLLYALTIRRQPGSLEFSHPVPTPTRAKCQTELGLFRSGAEQPLNRIPLFWGCLMSAFWKFISKSSGIRRWIKAPAVFRQGKNKHADPGSPCWSLVHLPCDHCMPCLGPGTSVLD	1303837	1306248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_+_1303800_1306200
912862	contig_19560_pilon	-	2237	2	Intergenic	novelGene_178840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGCAACCAGACATCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2579	165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19560_pilon_-_758_934
912863	contig_12951_pilon	+	2510	8	Intergenic	novelGene_68125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_7	70.3559463277516	89	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	62	775	61341	102198	FALSE	70	GCAAAAAAGAAAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKMAEEEFPNTTHEGLNVTLHTTLVITTKLVLPTPAKPILPVQTGEQAQQEEQSSGMTIFFSLLVLAICIILVHLLIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTK	61279	103933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_61367_63778_63958_74877_74959_86814_86874_91427_91512_95327_95430_96507_96543_102050
912864	contig_19076_pilon	-	4408	1	Intergenic	novelGene_74220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1659	1997	131230	130892	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILTGNTTESPGWSRSKVGCRTQILVKKTRLNGLTETKGTLKSMAPGFSISPELEQFPRPTLQTGTGLDWTVGRKVMLVRSVPLSSSRYKRLSGQLLSRGEMERQRWLGAG	132888	128480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_128500_132900
912865	contig_19179_pilon	+	2971	1	Intergenic	novelGene_142363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAGAAATTCAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14501	17472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_14500_17500
912866	contig_14807_pilon	-	738	6	Intergenic	novelGene_124692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1	645	39773	37247	FALSE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39773	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
912867	contig_6182_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_171661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	970	1320	321903	321553	NA	20	ACCTCGCATTGTACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLSSVPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFFSCLSAFCLSSWKIPSIRDLNSLSGTSSHFLPQESHLVF	322872	321117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_-_321100_322900
912868	contig_16303_pilon	-	4712	9	Intergenic	novelGene_34035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	687.80946444128	21	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	95	1186	45428	35759	TRUE	60	AAAAAAAGATACAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45522	31523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_32288_32436_33007_33566_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
912869	contig_11316_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_122690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCAGAATGATATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140126	139802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139800_140100
912870	contig_11448_pilon	-	3769	2	Intergenic	novelGene_66451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	142	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2878	3315	706969	706532	TRUE	45	CAATATGCAGATGACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRNSIGKKLNNAGSIQRRWKEYTETLYQNELVDVQPFQEVAYDQELMILKEEIQAALKALLKNKAPGTDGILIEMLPQTNASREAFTRLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGDPTEYRNYRTISLILHASKIMLKIIQKYL	709846	705883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_706072_706265
912871	contig_9161_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_160643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCACCCTAGAAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81840	79623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_79600_81800
912872	contig_10489_pilon	+	1756	2	Intergenic	novelGene_165637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCAGCATCACAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549981	551793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_550473_550528
912873	contig_8955_pilon	+	2065	1	Intergenic	novelGene_175084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCGCCAGGCCTTTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236667	238732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_236700_238700
912874	contig_7513_pilon	-	6276	7	Intergenic	novelGene_89019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	25	CCGGTGGTAGGGAACGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	673773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
912875	contig_17976_pilon	-	1453	2	Intergenic	novelGene_32501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGACAGTCACCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47786	41660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41811_46483
912876	contig_10904_pilon	+	4852	1	Intergenic	novelGene_22777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2673	3008	721033	721368	NA	85	TAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHIPLKGVCPATTLWTEELERAGNPLPTPASSAQHCLPPDTGAECPGFPLCPHENQVSMISAVSEVRRDRCAEGARQVWEERLEEGRGSVERWWSWGQDPGPGDKHEERV	718360	723212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_718400_723200
912877	SIRV3	+	521	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4748	1726	2689	495	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTAATAAAGAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6692	7213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6700_7200
912878	contig_10093_pilon	-	4459	1	Intergenic	novelGene_147506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	652	1959	1017	2975	81708	79750	NA	60	AAAAAAAAAATTACAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQQQLWLLHQTPIQKQKRKNEWLSLAVPVAWRGLEASFSRAEETFLTTGTLFTFTKSQVYIFVFLFQILTASASTTYWAHVLNPPVFRPVTWEEPEPPLSSNDTSVTGGQYLAYFKPLINSSEEGWFVLSTNWILYADALPLCFTTQPHTTSVCVPILEQWYMNHIYYNDTYRISAYFKQIFIKAIGVNGTFSNNSAFITHSPPSIPVCQHPQLSLTDPIDSTWVTCRTTNFSSYSLPFNISLENWGPHGLILLPNLSTWQWATPYHYLRHSQSWNPSLAGPILRLRYPGGQFSPLKIFSWRLGLPFFERTLRSGDFLRGTKNAKNPLPKLRWTLHDHNDSVLICTSRPYIFAITANPPDIIKINTSFQLTLSSVSTWITPCLSRQNVSTLNISSVFVLRQRSHLWLPVNLTRPWQDSSPLAQVVNALQKMRTKRFLGILIASIITATAIAATAATAAVALSQSIQTAQQFNTSMQNVTSEMQTMVHIDQEILKRLGALEASVLWLGERQEALCEHSQLTCDAEYTRFCVTALPYNDSWKDVKNNLLASFASPLKSDIQKLQFQLQEQLLRLQSESNKATLNTLNDFAYWLNPTHWFSGLNLRVWILFTIGCLIVLCLFIVVIRCLYSLRASHRQQKSAFLAWTIHYQLHK	82724	78265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_78300_82700
912879	contig_9653_pilon	-	4812	28	Intergenic	novelGene_48215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	94	junction_27	482.765208888938	1680	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1248	3747	126	3872	544351	508011	FALSE	15	TTTAGTGTTTTATGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVIFFYMKSKFCTVFNLFCLNSSFMLLVLKGNLESHCLSDDDIYIKSSSANAYEV	544476	507070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_508283_508928_509107_509263_509456_509787_510001_510109_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513575_513728_516115_516269_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_530278_530455_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_543009_543086_544336
912880	contig_12886_pilon	-	1470	2	Intergenic	novelGene_135473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAGATGAAGGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298724	293035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_294322_298540
912881	contig_15689_pilon	+	786	3	Intergenic	novelGene_164166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGAGTATGGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226041	228726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15689_pilon_+_226161_227042_227218_228234
912882	contig_10140_pilon	-	2432	2	Intergenic	novelGene_148434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	498	983	378193	377708	TRUE	55	AAAGAATTTAGAATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTERYHLTPTRLALIKKKQKQNNECWRGRGETGTLIHCWWECKMVQPLSKSIWRFLKKLEIEIYPREIRAVTQIHICTPMFTAALFTIAKRWKRPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYTMIKNNDETVKHLIAWRKLEGIMLSEFSQSQEGKYCITPLL	378690	375847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_377060_377470
912883	contig_5423_pilon	-	1163	5	Intergenic	novelGene_85192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	416	junction_4	209.807501057517	5	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	189	824	208344	205810	FALSE	25	CCTTCCAGTTGTAATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TITALLHNNRKLLEKHITAKEIETFVSLLRRNREPRFLDYLSDLCVSNTTAIPVTQELICKFMLSPGNADILIQTKVVSMQVDNPMESSILSEDIDDEEVWLYWIDSNKEPHGKAIRHLAQEAKEGTKADSEVLTYYRYQLNLFARMCLDRQYLAINQISTQLSVDLILRCVSDESLPFDLRASFCRLMLHMHVDRDPQESVVPVRYARLWTEIPTKITIHEYDSITDSSRNDMKRKFALTMEFVEEYLKEVVNQPFPFGDKEKNKLTFEVFF	214251	205470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_205967_206438_206691_207998_208185_208303_208424_214142
912884	contig_14068_pilon	+	2036	4	Intergenic	novelGene_165963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	814	1158	59935	159620	TRUE	70	CAACAGCAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLKSVLPRSSETHKTKWAAPIWRQDEKAKELVEWTQENQGGKEECAVTLQGEQLGSRNNVCINFSMETNLKCKLHLITTIKKLMKRFTHRKKQSLIVTREGRGREGKTLTRR	59121	177520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_+_60134_146019_146068_159522_159625_176646
912885	contig_2496_pilon	-	4825	13	Intergenic	novelGene_168512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	4144	4611	71756	48071	TRUE	60	ATGAAAAGAAAATACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRSHFPSPLYIRGLSLSSVFSLLANSRKSSIKSRDMRDWLKTRTLSPISSAIRRISKRSTIFPECSKTSASASVTKSLYQSGAGLLGLEEEVALLSSSFKETEGLFPVSSTFPSPPPRDLEFQTLITSTSLSLPLPLELLSFFPFFPFVFFFFV	182765	47167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_-_47300_47988_48080_48208_48382_54940_55095_57992_58098_71729_71839_128911_129090_130236_130434_175986_176137_176958_177085_177843_177942_178432_178561_179581
912886	contig_8317_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_20749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	924	1292	106867	107235	NA	20	CCTGGCAATGTCCTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQVHRKRMYSLLLLGRVFYMSVRSNWLILAFRSSISLLNFFLDVLSFTSMIGVLKSPTVIVELFISLFSAVRVCFTYFGALSLAVLDICYGYIIMVDCLFNHCIMSFLAFYGGFCLKVYFI	105943	107975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_105900_108000
912887	contig_6374_pilon	+	3262	1	Intergenic	novelGene_158429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAACAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13051	16313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_13100_16300
912888	contig_4342_pilon	+	2732	1	Intergenic	novelGene_178761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTGCAAAAAATACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84554	87286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4342_pilon_+_84600_87300
912889	contig_9406_pilon	-	3011	5	Intergenic	novelGene_136173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1838	junction_3	271.163234971115	196	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	43	519	102326	95459	FALSE	15	GATGCTCCTAAGTGCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSGERLPKPTKGRMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLIWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKDALLLWCQMKTAGYPNVNIHNFTTSWRDGMAFNALIHKHRPDLIDFDKLKKSNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTKLLDPEGKDSRDTRWNF	112719	92966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_95610_96485_96567_98217_98310_102173_102348_112698
912890	contig_7843_pilon	-	1050	5	Intergenic	novelGene_152007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	233.006974144552	1	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	94	606	197188	156539	FALSE	45	AAAGGTCAAGAAGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYKGRPSGCWGRRGPLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRLVNTSENLSKSRKILRSMSRKPPGEPLTSRI	197281	156094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_156573_181233_181296_182917_183092_187939_188132_197137
912891	contig_10367_pilon	-	3107	2	Intergenic	novelGene_169456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	216	743	134029	133502	TRUE	40	ACATATTAGCATATAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQYSRDLKGHLASLFLNENINLGKKYVFDIKRTSKEVYDHARRALYNAGVVDLVSRSNHSPRSSPLKSSESSMNCSSCEGLSCQHTRALQEKLHKLKEAMLCMVCCAEEIDSTFCPCGHTVCCEGCAAQLQVSRCTGLAQTPTWNLDFHPEGFFISHDSKGTAWETFRISILVQ	134244	130582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_132633_133187
912893	contig_10973_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_150389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	116	316	2418	2218	NA	40	CGAGTAATCTCAATGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2533	1620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1600_2500
912894	contig_4857_pilon	-	952	2	Intergenic	novelGene_48870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	371	700	1358485	1358156	TRUE	20	ACCAGTTTTTTTCTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDWTLLITCPKYMRQSLAIVTSKEHSHCTSSKADLFILLAVHGIFSILCQYHNSKASVLLWSSLFIVQLSYAYEVIENTMAWVRCTLVLKVTSLLFNTLNEFTV	1358855	1357841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1358016_1358077
912895	contig_9099_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_149906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	429	734	317255	317560	NA	55	GTATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSCITESKENQERLFFRLAANRCASDSCIPFYFSCELCTEVNISSFFSSPPLLALPSPFLSTVGVQHVFGDPGGLHPSPQGRSSRLVVCIADTAAKKNGC	316826	318384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_316800_318400
912896	contig_5020_pilon	+	1228	6	Intergenic	novelGene_27911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_1	512.132248545237	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	143	913	123186	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	122931	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
912897	contig_3382_pilon	+	2174	4	Intergenic	novelGene_124090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	11.8977121983832	8	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	352	567	556750	560191	FALSE	20	GTCACTGTGGAATCGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VHGCSGPAQHALADGGSPDLCPARPLPASSHRVSPWLPRVAGLSLKACWLLSANGERRAYCHPSPRSSASSDPARSACPAGLAQWDPADPAPPPTWQQLTGVATHTSVQHATVIPETMAGTQQLADWRNTHAHGSHYNPIMQQPALLTGHVTLPATQPLNVGVAHVMRQQPASTTSSRKSKQHQSSAR	542396	561798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_542513_544213_544336_556636_556782_560007
912898	contig_5019_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_109211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1000	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1626	1931	204798	205103	NA	80	CAATTAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHQTESSTAGWCPATTTDCSDQHHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKKDQIYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKLPPRFTVQPGSGQPRKTKGD	203172	205514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_203200_205500
912899	contig_7119_pilon	+	2261	3	Intergenic	novelGene_40971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	111	5	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	54	1001	137044	139689	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVALVAFESTPAHGDLMCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALDQKPCPWGPQPQRHCPYCS	136990	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137048_138707_139591_139628
912900	contig_11318_pilon	-	2696	8	Intergenic	novelGene_48153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	403.184264351187	2	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	304	870	42716	31247	TRUE	40	AGGTAAGATTACTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDVFAY	50070	28859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_30566_31126_31258_33894_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42784_49722_49844_49955
912901	contig_13800_pilon	+	2882	2	Intergenic	novelGene_153732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1702	2136	143980	146986	FALSE	50	GGGCAAACTGATGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSPYQLLHHGSTILDSYRRSANREYEKAASRSFQQEQKKQYKMTAINSHLSIITLNVNGINATIKRWRVAEWIRKQGPSICCLQETYLRNKDVDLLKIKGWKKISKQLPKKRAGVEILISNKIDFKTKSTIKDKGGHYIMKT	142278	147732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_144094_146665
912902	contig_1986_pilon	-	1581	2	Intergenic	novelGene_64122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	229	528	97611	97312	FALSE	85	AAAAATTAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNCQGLHQTESSTARWCPAATNDYSDWDHNRRSWTEMEKDVEQNSNTHKKDQIYWPERDWRNPESLASRHPFSSVMKSLPRFTIQPKIRQPHKTKRD	156841	96258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_97818_156819
912903	contig_7088_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_159795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGGGTTTTCAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707687	710097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_707700_710100
912904	contig_11448_pilon	-	3030	7	Intergenic	novelGene_66350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	146.206095024189	317	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	451	1458	186389	184876	TRUE	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERIHSINLHNFSNSVLETLNEQRNRGHFCDVTVRIHGSMLRAHRCVLAAGSPFFQDKLLLGYSDIEIPSVVSVQSVQKLIDFMYSGVLRVSQSEALQILTAASILQIKTVIDECTRIVSQNVGDVFPGIQDSGQDTPRGTPESGTGGAAVRRGGTGQPGRACSTRTGHGSPCGGRPAAAPARDRRVYSGEKQRGGDGQHGHHCQQQLRQERLAAAFGQHVHRAAIAKYPALLTPDRNPHQQPEDASDLDQQHTGHWHSRQHLPAGPLHYPARGQRPQAFPLQPAAAPDRPADPVCDSVPARLVDLYCTAASATAPGPIRRPQHSQWAGRKKAL	436787	164893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_166398_184807_185444_185949_186410_216681_216874_225366_225468_349238_349276_436687
912905	contig_5686_pilon	+	2898	14	Intergenic	novelGene_45228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1684.90262742549	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	509	1651	176692	208558	TRUE	75	TAAAAACATGAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTF	93785	212367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208477_208553_208722_211283
912907	contig_9363_pilon	-	1533	1	Intergenic	novelGene_6730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCCCAGAATGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466807	1465274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1465300_1466800
912908	contig_16228_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_147950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	327	686	75129	75488	NA	20	GACCTCAGTTGTGCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMIMSCLFLNPNSSSLSSLSTDYFAFYCTDNIEVIRRTSRGSITRPTHLPASELLSSAFALVTLNNRSSCKPGVPLEHQILSLGYAVTSLHKFFPALAFKNLYWIILISMRAYCNFSH	74802	76260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_74800_76300
912909	contig_4093_pilon	-	1834	6	Intergenic	novelGene_27631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	415	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	93	830	69245	41737	FALSE	20	CTTTTCAACTACTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72516	40732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
912910	contig_7022_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_142132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGATGAGACCAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55179	56566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_55200_56600
912911	contig_253_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_129651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	37	114	202	315	276912	277025	NA	35	CATCGTCCAGCAAATATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVRRSLANLASKEHSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILRQHHYSKASILGSSLFIVQLSHAYEAIENTMSWVRCTLVLKVTFLLFNTLERSFAADLPNAIRCLIS	276710	278729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_276700_278700
912912	contig_14450_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_48991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGTGTAATGATCAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060222	1061361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1060200_1061400
912913	contig_14687_pilon	+	3340	4	Intergenic	novelGene_107912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTAAGTGGGGTGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443777	456689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_443856_445842_446047_450570_453231_456291
912914	contig_13481_pilon	+	2154	5	Intergenic	novelGene_119561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	619.519773695723	2	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	210	340	549	1576718	1586220	FALSE	15	GGGACTATTCCTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRVRLPLLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568694	1587825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568717_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578101_1586133
912915	contig_5403_pilon	+	3490	3	Intergenic	novelGene_87982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	561	968	447344	447751	TRUE	10	TGCGCTACGTGGCCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRTSYMKKAKKVIKKTGKKRPRWMSEETLKLALECQVAKANGRNDEVKEMNKRFQRAAQEDKAKNYNEMCKDLELENQKGRICLAFLKLKELKKKFKLRVAILKDSMGKRVNDAGSIERRWKEYIVTVPRRIG	446783	458285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_+_450040_453795_453875_458130
912916	contig_5236_pilon	+	855	3	Intergenic	novelGene_100940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTAGTGTACAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000377	1005568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_1000744_1004817_1004873_1005134
912917	contig_6726_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_86217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAGCACAATGCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74718	72552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_-_72600_74700
912918	contig_19459_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_59832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6037.35383535977	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	25	810	16240	7003	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16264	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203
912919	contig_2770_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_107399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGTATTCTCTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71060	70261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_70300_71100
912921	contig_10855_pilon	-	2966	2	Intergenic	novelGene_124391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1513	1884	869880	869509	TRUE	40	GGACTGCCAGAAGAACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEDKVKYYNDMCKDLEIENQKGRTHSAFLKLKELKKKFKPLVAILKDSMGKILNDTGSIKRRWKKYTESLYHKESVSSQSFQEVGYDQEIMVIKEKVQAALKTLAKNKAPGIERIPTEMFQ	871392	867906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_868185_868704
912923	contig_7378_pilon	-	1422	9	Intergenic	novelGene_120301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	20.7409618870485	171	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	13	840	740005	648505	FALSE	80	TGTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSKMKVSEENFFNVPAFLTVSGQLHLEVMSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMVEAEISFVESLQDLMQVMEGLFKTTLMMVLSNCPEDVELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLIMSYTEAVEILKKASQNFTFTPEWGADLHTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLVLKPFYMRDNEDSPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGSLREERYHFLEQQLARLGLTEAYQWYLDLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFTHSCLL	740017	647922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_648650_652564_652592_654936_655035_670656_670795_672133_672201_695658_695697_695807_695907_700436_700570_739922
912924	contig_835_pilon	-	2478	1	Intergenic	novelGene_152134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77572	75094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_75100_77600
912925	contig_11417_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_103336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593196	591982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_592000_593200
912926	contig_3832_pilon	+	5547	7	Intergenic	novelGene_161420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	159	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21212	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_21703_91454_91670_95335_95895_146268_146620_345302_346387_346734_346945_484257
912927	contig_15039_pilon	-	2365	6	Intergenic	novelGene_110150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_5	474.019577654763	58	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	443	820	200602	197500	FALSE	45	AACAGAGAAGAACTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGLCMN	260918	195954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_197618_198506_198613_200448_200620_208401_208526_222093_222255_260778
912928	contig_19816_pilon	-	2442	3	Intergenic	novelGene_156464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1786	2139	117189	36246	FALSE	15	CGCCCAGGTCGATGGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGRTSPWRRTSCFAPSTCTLQRLLPVLQASSEGLLTYALHIVPDVVCSPGLLPLALGDLSSRVRRRPGAQVLIQGEVIAASIGLLTVLAEETPIGPHFTVRHHLDGRHSPASLWL	118974	35942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_36278_36567_36844_117143
912929	contig_20407_pilon	-	417	2	Intergenic	novelGene_178500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGTTTTCCTCAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4860	4196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20407_pilon_-_4324_4570
912930	contig_8843_pilon	+	3809	5	Intergenic	novelGene_156662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	252.071790369331	27	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	677	1426	107363	117048	TRUE	20	CAGCTTAAGTTTATTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSDGSEAMLNRVMTKDNIGVAVVLEVHKELFGAGMKPIHAADKQLLIVANAHMHWDPEYSDVKLIQTMMFVSEVKNILEKASSRPGSPTADPNSIPLVLCADLNSLPDSGVVEYLSNGGVADNHKDFKELRYNECLMNFSCNGKNGSSEGRITHGFQLKSAYENNLMPYTNYTFDFKGVIDYIFYSKTHMNVLGVLGPLDPQWLVENNITGCPHPHIPSDHFSLLTQLELHPPLLPLVNGVHLPNRR	106686	119488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_107469_110287_110516_112586_112790_116835_119276_119332
912931	contig_8663_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_58006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	354	1065	12	1076	95936	97000	NA	45	CTGATTATAAAAATTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVFCGLPYSGKSRRAEELRGALAAEGRVVYVVDDAAVLGAEDATVYADSAREKALRGALRASVERRLSRQDVVILDSLNYIKGFRYELYCLARAARTPLCLVYCVQPCGPSRRPQVAGAEEIGGRKVDVSWQPRTEQGGRPPEAGTGIVREPQAAGSEVNGRPRAEVPKKLEPEETRAPNSPALVIPESEKSSEHTFGAFYPPELLEALTLRFEPPDSRNRWDRPLFTLVGLEEPLPLAEIRAALFENRAPPPHQATQPQPLASGSFLHQLDQVTSQVLARLMEAQKSAVPGDLLTLPGTTERLRFTRPFTMAELSRLRRQFISYTKMHPNNENLHQLANMFLQYLSQSLH	95924	97965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_95900_98000
912932	contig_16125_pilon	-	4783	9	Intergenic	novelGene_155256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_8	600.063121679711	170	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	778	1788	236037	146011	FALSE	50	AAGCTAAAGCAAAAATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHSQSGSGGKSHTFIRNFSTNLRHFYVC	236814	143015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
912933	contig_8375_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_141255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAGCAGATAGTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_0_1600
912934	contig_6102_pilon	+	1724	7	Intergenic	novelGene_32142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCTTCCTTCAGACGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838827	867350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_839996_841186_841256_844910_845000_846086_846187_846752_846826_846981_847093_867236
912935	contig_10017_pilon	-	2725	2	Intergenic	novelGene_157004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	116	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACTCACAGATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422582	417330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_-_419130_421656
912936	contig_14474_pilon	+	1253	8	Intergenic	novelGene_144202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	252	junction_4	44.7560279830139	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1188	65	1252	6842	16633	FALSE	25	TTTACCTGGAGTGGATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFPGGVHWVSVGKQDKSGLLMKLQNLCARLDQDNSFSQRLPLNIEEAKDRLRILMLHKHPRSLLILDDVWDPWVLKAFDNQCQILLTTRDKSVTDSVMGPKYVVPVESGLGKEKGLEILSLFVNMKKADLPEQAHSIIRECKGSPLVVSLIGALLRDFPNRWEYYLRQLQNKQFKRIRKSSFYDYEALDEAMSISVEMLREDIKNYYTDLSILQKDVKVPTKVLCILWDMETEEVEDILQEFVNKSLLFCDRNGRSFHYYLHDLQVDFLTEKNRSQLQDLHKKMITQFRRHHQLHRLSPDQEDCMYWYNFLAYHMASASMHKELCALMFSLDWIKAKTELVGPAHLIHEFVEYRHILDEKDYTVCENFQEFLSLNGHLLGRQPFPNIVQLGLCEPETSEVYQQAKLQAKQEVDSGM	6777	16634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_6964_9294_9408_9628_9761_11062_11302_11700_11869_12765_12898_15885_16000_16465
912937	contig_4857_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_48742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	473	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACCTAATTTCACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196723	1195210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1195200_1196700
912938	contig_10734_pilon	+	2249	11	Intergenic	novelGene_51187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460.033314011062	17	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	144	1439	1124953	1142903	FALSE	20	CAAGTCCTTCGTATGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTFFPRKKASDTERDGLAPEKMSPDRDKKKEQSDVSVSPRASKHHYSRSRSRSRERKRKSENEGRKHRSRSRSKEARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123700	1143713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1124903_1124980_1127587_1127745_1128560_1128605_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
912939	contig_1230_pilon	+	2259	9	Intergenic	novelGene_28851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	797.671141511337	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	72	1616	405241	408016	TRUE	25	ACCATATAGTTGTTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGNHRPFE	404454	408991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407792_407997_408237_408568
912940	contig_7356_pilon	-	2097	7	Intergenic	novelGene_60366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	674.954484062115	22	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	697	1338	342753	340651	FALSE	60	GAATGAAAAAGAGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSEAQKMLSQSLYGMSLISGTVIRRGDPQPVLMCTLVKKENWERPKSMTDLLHHSLLSGSLSAVHKLRRSQARLAQSGIPPPAHTFPYEILIDHANSLKTATVRKKVQNTLVLCKLGISKISVPEKFIVEDKLPKYFLINPEKQFLDLKDLEWRYYKGLVKWTHTTSDSFIDIKCNKEMRFVESQLMPDDIFPPLVRKSWSIFSQNDYSKK	457913	339891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_340863_342323_342830_343906_343992_410406_410636_435516_435623_437474_437529_457767
912941	contig_7587_pilon	-	3468	2	Intergenic	novelGene_163716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTACAAAGCATCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169483	152193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_155568_169389
912942	contig_13863_pilon	-	4163	2	Intergenic	novelGene_42058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTTCCCATATCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502986	364209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_364681_499294
912943	contig_14445_pilon	-	3164	6	Intergenic	novelGene_137385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.3073719256664	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2730	3056	366611	366285	FALSE	45	AAGTACTGAATCAAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTSGKGRGGLAISNEAGARDLSHAGLLQGEGGRPRRRWRQGNGASLSVYQLFRLARGVPGRRQYQKVGSLSPPRGTLEESPGGFLLENHPLKTVWSTALLIYMGLP	499241	366176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_366918_367965_368150_397246_397399_431381_433063_497997_498280_499117
912944	contig_4232_pilon	-	2302	5	Intergenic	novelGene_63430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.3603892158874	55	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGTAAAGATCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515174	498795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_500705_503598_503711_514516_514663_514766_514851_515123
912945	contig_8650_pilon	-	2719	1	Intergenic	novelGene_162640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAACACAAAAGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403059	400340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_-_400300_403100
912946	contig_9440_pilon	+	2503	1	Intergenic	novelGene_59027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATCTTTATGGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251761	254264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_251800_254300
912947	contig_2312_pilon	+	1649	3	Intergenic	novelGene_160730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAGAAAAATAAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191733	202959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_192125_199524_199609_201785
912948	contig_7321_pilon	+	3084	3	Intergenic	novelGene_53105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1985	2884	6550	7449	FALSE	45	GGGCCAGAAGAAAGGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNPQTKGSHHRRVRGTKKTSAPHTHEKKHYKMTAIILHLSIITMNVNGLNAAIKRQRVTEWTKKKQDPSICCLQETHLRNKDINVFKSKGWKITYQAKRYQKKAGVATLILDKIDFKTKSTIKNKERHYIMIKGTFHHEDVTIINIYTTNDRAPKYIKKTLTALKREIDDSLIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNAAIKLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNTHGTFSRIDSILGHKASLNKIQSIKILQSILPDHKAIKVEINNRKNKGKEIKHMETKKHLAQKLPGYRRN	4278	7649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_4295_4440_4500_4640
912949	contig_15596_pilon	-	4879	1	Intergenic	novelGene_139535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3334	3660	130251	129925	NA	15	TGGGCTTCTGGCAGGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWSICPPAGTATQARDCALNPSVHQEHSPLSLVITPFSSHFCNQVFSWKIYIQRASLGLGVTLQCCVRLSFLLCRGCLYLSWHSGEAQADFPLFQEEEGLALPRRTS	133584	128705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_128700_133600
912950	contig_854_pilon	+	1673	2	Intergenic	novelGene_36394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTGGGCACCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974801	977696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976140_977361
912951	contig_11294_pilon	-	3298	2	Intergenic	novelGene_50043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCAACAAACAGATGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216535	212213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_212660_213683
912952	SIRV6	+	968	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	549	11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	71	14	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	20	TATTAGCCTGCCTAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
912953	contig_12644_pilon	-	1263	10	Intergenic	novelGene_44614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGTGTTTAGCACTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2680621	2675473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2675528_2677222_2677394_2677583_2677693_2678054_2678192_2678718_2678843_2679071_2679210_2679514_2679665_2679882_2679959_2680105_2680186_2680397
912954	contig_563_pilon	-	4643	7	Intergenic	novelGene_169770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_6	25.3486795623669	589	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2	514	716122	713740	TRUE	10	AAGCCTCTGTGGGTCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWAKLPCVPGAVGGPGYGSGSAASWSPPSPPKRRLLPRAQLLPLLLLALAVGSALYTIWSGWHRGTEELPAPVIGSLSEAQLRRVIGQLDPQRLWSNYLRPLLVVRTPGSPGSLQVRKFLEATLRTLTAGWHVELDPFTASTPLGLLNFGNVVATLDRGGCPPSHSRLPL	716123	706151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_709785_710438_710556_711065_711167_711268_711423_713615_713899_715249_715394_715912
912955	contig_10500_pilon	+	3417	2	Intergenic	novelGene_41159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGACTATAATATACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1249584	1254508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1252941_1254447
912956	contig_13067_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_141340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44146	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44100
912957	contig_8050_pilon	+	4844	2	Intergenic	novelGene_114831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1177	junction_1	0	207	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGCTAAGAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320426	325366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_321763_321858
912961	contig_14184_pilon	+	3599	3	Intergenic	novelGene_66579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACATTTTCCCTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27267	31683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_27493_27546_28453_29215
912962	contig_5840_pilon	-	3831	4	Intergenic	novelGene_178921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2081	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1044	1640	339399	338803	TRUE	55	GGAACATCATACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAGIKNTGNNKCWRGCGEISTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPCNPAIPLLVIYPREIRVVTRIDICTPMFISALFTIAKRWKQPRCPSTDKWINKVQYTHTMEYYATRKNNNESLKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	467063	336478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5840_pilon_-_337480_337612_339582_445931_446421_466691
912963	contig_15327_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_70467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGATGCAGTGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351551	354282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_351600_354300
912964	contig_6227_pilon	-	3291	17	Intergenic	novelGene_49630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	238.01916939608	20	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2391	244	2634	398743	343524	TRUE	25	TAGAAAGTATGTTTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLWSQEKVTSPYWEERIFYLLLQECSVTDKQTQKLLKVPKGSIGQYIQDRSLGHSRIPSAKGKKNQIGLKILEQPHAVLFVDEKDVVEINEKFTELLLAITNCEERFSLFKNRNRLSKGLQIDVGCPVKVQLRSGEEKFPGVVRFRGPLLAERTVSGIFFGVELLEEGRGQGFTDGIYQGKQLFQCEEDCGVFVALDKLEIIEVDDTGLESDYAGPVDTMQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPDSVTQERRPPKLAFMSRGVGDKGSSSHNKPKPTGSTSDPGNRNRSELFYTLNGSSVDSQPQSKSKNTWYIDEVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKIRSAGQKVQDCYFYQIFMEKNEKVGVPTIQQLLEWSFINSNLKFAEAPSCLIIQMPRFGKDFKLFKKIFPSLELNITDLLEDMPDMWRTCNVRMQRVL	406501	341168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343574_344676_344786_345745_345879_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_359403_359521_361757_361857_392432_392539_395032_395336_398239_398898_406412
912965	contig_10904_pilon	+	4252	1	Intergenic	novelGene_22684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	2764	3180	566731	567147	NA	25	CATTAATTTAAGCCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFSLQRPLTPDGHRAPPGDDGAWISPDRWFEEGPWKGMRPGVPRGSPPLNPPSFHFDSPPTLVTISLDPLCFPLPPPCKLPRGVHCADQKLDLGGLGRTHLSVPDSVDPGKPWQRIPCEKLILTPTHRNIKCGLGP	563967	568219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_564000_568200
912966	contig_13295_pilon	+	282	1	Intergenic	novelGene_31240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATTGCCTTATGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96699	96981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_96700_97000
912967	contig_4924_pilon	-	3482	2	Intergenic	novelGene_84776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1974	2429	352001	351546	FALSE	40	GCATTCCTAGAAAATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSPPDDTILLAERGEDLKHLLMRIKDYSLQYRLHLNVKKTEILTTGPISNIMINGEKIQVVKDFISLGSTINTHGSSSQEIKRRIALGKSAAIDLFKVLRSKGVTLKTNVRLTQAMPFAVASYACKSWTMNKEDKELTPLNCGVGGEY	354128	350492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_352900_353053
912968	SIRV5	+	2092	4	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	177	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11310	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_12159_12214_12407_12473_13030_13110
912969	contig_11986_pilon	+	10913	2	Intergenic	novelGene_69234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1137	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1010	1381	777540	777911	TRUE	45	AAAAATTAACCACTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDERIQWNPNHAMIFKNHSLTHGFLSSKEETENKCIYDNKAAIRHVPLQIQLDLAEYCFTFHSVKNKFVDFRKAFGVPGNCSCQLLKRPCVCPHRECSELWKYYLVSRTRIQTLESQQADSMS	776530	789999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_777956_780511
912970	contig_3747_pilon	-	3110	3	Intergenic	novelGene_24917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAATCAACACAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205182	201739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_203101_203314_203648_203766
912971	contig_9706_pilon	-	6746	1	Intergenic	novelGene_21002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCTTCCCCTCTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484821	478075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_478100_484800
912972	contig_5031_pilon	-	4257	2	Intergenic	novelGene_133196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1609	1998	40092	39703	TRUE	50	ACAACCATCTCAAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECININILDISDLKWTGIGHFQLDNHIVCYVGNDKLKRNGVAFIIKKNISRFILKCNAVSDRIMSICLQGQAVNTTITQIYTSTTKAEDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGECKGKVRNKEEE	41700	37074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_38044_38412
912973	contig_6552_pilon	-	1912	1	Intergenic	novelGene_163585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTGACTGAGAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59552	57640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_57600_59600
912974	contig_3382_pilon	-	10845	4	Intergenic	novelGene_123993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	548	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1623	2024	94542	94141	TRUE	25	AACCCTGCAGGCTCAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSLPQAWPLTAVGLTGVNAQSLQQAWPLTAVGLSRVNAQSLQQAWPLTAVGLSRVNAQSLPQAWPLTAVGLSRVNAQSLQQAWPLTAVGLSRVNAQSLPQAWPLTAAGLSRVNGSVLTAGLASDCSGAEQS	96339	79359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_82720_86825_86945_88798_94580_94754
912975	contig_14744_pilon	+	5924	1	Intergenic	novelGene_65926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	132	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTTGTTAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151853	157777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_151900_157800
912976	contig_5075_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_174075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	735	1040	453894	453589	NA	45	TTTACAAATACAATGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYAENLKDSTRKLLELIERFSRVAGYKINIQKSFGFLYTNKENDEKEIRKAIPFIIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWRNIPR	454628	453539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_453500_454600
912977	contig_20371_pilon	-	5282	1	Intergenic	novelGene_129182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	4726	5058	41891	41559	NA	60	AACAAAAAAGAGGAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLYLNIKKTTILTTGPINNIMINAENIEVVKDFILLGSTVNTHGSSSQEIKRHVALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVHLIKAMIIFSHLICMQKLDNE	46616	41334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_41300_46600
912978	contig_20895_pilon	+	4069	2	Intergenic	novelGene_171409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	222	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1323	1778	7233	7688	TRUE	50	GAAGAGATTGAAAAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISSHINRQTMMASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHTIEELKKIREEHNDKFNMLQESIERQQSEIQKINNKILELDNSIESHRRRIDATEVRISEIEDKALDTNLFEENQIKRFKKINKH	5910	10038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20895_pilon_+_8417_8475
912979	contig_5041_pilon	-	3445	20	Intergenic	novelGene_27055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	623.642614646661	34	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	1006	2331	576515	521597	FALSE	20	ATGGGTTTGCCAAGTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERVAECFP	636087	520482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_521619_525501_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581103_581143_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
912980	contig_3155_pilon	+	1081	4	Intergenic	novelGene_26395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1052.66846104977	14	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	47	484	258156	261927	FALSE	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPTPLLLLLHLLRQKWRVPCR	258109	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261867
912981	contig_4402_pilon	-	2869	4	Intergenic	novelGene_140823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1393	1737	445932	445588	FALSE	20	GCCCAGCACAGCCATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLCPYLFVFPCLKAHFSSVFIEILPPFKVQINFLLFHEAFHGCNSSYSCLMFLNLLTACTKCLLIFLFRVCSIIFPIKLYSLKSCFLFGLSQCTADCLAVRLNVLSTFLLVD	723980	444455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_446307_633515_633962_636155_636406_723658
912982	contig_4686_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_118556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	531	junction_1	70.5	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1296	855	2150	572898	567583	FALSE	35	TCAAAATGAAGTCACTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGDSNDIRTYVWARGQVKESHHYFIEHQCFHLSVLTFPPFSLKIEQRLAQAQTLTQGWEEIKHMEAELWIYLQDADQQLQNMKRRHAELELNIAQNMVSQIKDFVKKVQSKQASVTAIIEKVNKLTKKQESPEHKEISHLNDRWSDLCLQSNNLCAQREEDLQRTRDYHDCMKVIEVFLEKFTTDWDNLARSDAESTAVHLEALKQLALMLQERKYAIEELKDQKQKMIEHLNLDDRELVKEQTGHFEQRWFQLEDLVKRKIQVSVTNLEELSVVQSRFKELMEWAEEQQPSIAEALKQSPPPDVARKLLMDHLAICSELETKRMLLKSLMKDADRVMVDLGLNERQQIQKALSDAQRHVSCLSDLVGQRRKYLNKALSEKTQFLMAVFQATSQIQQHERKIMFREHICLLPDDVSKQVKTCKSAQASLKT	573752	567580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_568304_571254_571521_572589
912983	contig_10456_pilon	-	2997	1	Intergenic	novelGene_163457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	2216	2731	18373	17858	NA	20	TGCATAAATCTCCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDVAAGLTVDEGTKISCCLFGKGADGTCHVTGVTDDVMCLSSWSPEHVVHGGCGMGMGRAGRSLWTQVQQCGDACHGSLGGGGGNEGTPTLVTGLWRGIEGNMFPRSLTWALGHSPQSAASNQGLALTKCKERGAVQSLDRWGISSRYSKDPPLRQLAPHAQMIRAPAGE	20588	17591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_17600_20600
912984	contig_10437_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_38393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCATTTATAAAATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696483	695539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_695500_696500
912985	contig_6785_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_132583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAACTCATTGCTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547453	545248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_545200_547500
912986	contig_3925_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_178922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	365	1098	18	1115	1737	2834	NA	35	CAAACTGTAACAATCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGARQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKERKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYLENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENNEKEMRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLIIVKMTILPKAINKYNGIPIQIPTTFVKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGFTLPDFRTYYTATVVKTAWCWYNNRYIDQWNRIENPDVIPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKNMKQDSYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRLQTITINT	1719	3673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3925_pilon_+_1700_3700
912987	contig_2323_pilon	+	3259	3	Intergenic	novelGene_151856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	9	138	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	192	602	146881	149863	TRUE	70	TTTAAAAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYSVDCRETDRPAPVQSAALRSTSTGDLKPAPCHFLGVVAAAAQETLQPTSGRSAAVSRAIIERQRPHMRPNEALFYLVKLLRGKLRHKITGDQKASLSKGVLSASSRLPPYWQALTLSFSSHLSCLPLPLTPNF	146689	154056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_147118_149689_150619_152154
912988	contig_9177_pilon	-	4660	32	Intergenic	novelGene_32591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1494.47912057393	1	34	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1405	4218	7	4224	25708	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQAVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKCAQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	25714	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_18254_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584
912989	contig_14357_pilon	+	373	1	Intergenic	novelGene_121688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576279	576652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_576300_576700
912990	contig_15327_pilon	-	2280	15	Intergenic	novelGene_70765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	79.0124312099956	39	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	24	956	1169101	1135844	TRUE	20	GATGGTGGAGACTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLKRPRSGCSSPCSASAGTPSRPFGRSSSQIRNREITLLMGSRRRCLICSICTAT	1169124	1129706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138557_1153255_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
912991	contig_6102_pilon	-	2196	1	Intergenic	novelGene_32097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGGACAATACCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800750	798554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_798600_800800
912992	contig_3832_pilon	+	1719	1	Intergenic	novelGene_161431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82152	83871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_82200_83900
912993	contig_383_pilon	-	5156	10	Intergenic	novelGene_126083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	67.3665118109899	5239	153	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	125	1030	385190	359561	TRUE	10	ATGGCGGATCTGTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLESLETKATLTSTPIRGAGDGMETEEPHKSIEATSGVQSIKRHILQSPQKKAVASESLGVLHLGKILTEKAVEVEAVRILVPKAAITHDIPNKNAKVKSLGHHKGESLGHSEGVVEPRKELSEVKHVLEKLKNSERRLLQDKEGLSNQLRVQTEVNRELKKLLVASVGDDLQYHFERLAHEKNQLILENEALGQNTARLSEQLERMSIQCDVWRSKFLASRVMADELTNSRAVLQRQSRDAQSAIQDLLSEREQFRQEMLATQKYGTFLYSDLHNILLQFCYCGSFGFFFSFFFFIVV	386630	29866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_30181_30265_30996_31083_32681_167312_167376_357659_357982_358460_359796_361353_361554_363254_363695_385159_385241_386556
912994	contig_14467_pilon	+	1936	10	Intergenic	novelGene_138278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	132	junction_1	218.794677977119	4	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	199	1299	369732	385045	FALSE	85	TAAAAAAAAACAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMGLFGVTQASQPGGLFGTATNTSTGTAFGTGTGLFGQPNTGFGAVGSVGFYS	352183	385682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_367941_367977_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851_378016_384889
912995	contig_12344_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_164870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCCACTTGTGGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123197	122643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_-_122600_123200
912996	contig_2799_pilon	+	3271	1	Intergenic	novelGene_85516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	627	601	1227	614692	615318	NA	70	TTAAAAAAATTAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKTAWYWYNNRYVDQWNTIENPDINSSTYEQLIFDKGPRSVNWGKDSLLNKWCWHNWIYICKKLKQDPYLTPCKKTNSKWIKDLNIKSKMIKIMEEKIGTTLGALIHGMSRIGTISNNVQALEERLDNWELLKIKHLCSSKEFTKRVKRHRTDWEKIFGYDKSDQCLISEIYKILQNLNNKKTNNLIKNWAKDMSRHFAKERYSGG	614091	617362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_614100_617400
912997	contig_16098_pilon	-	1561	8	Intergenic	novelGene_46113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2023.61852095877	5	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	751	1353	457605	456273	FALSE	5	GAGTCTGTTGTCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460379	456064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_458344_458618_458704_458838_460148
912998	contig_6975_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_74242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38546	40792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_38500_40800
912999	contig_8330_pilon	+	1317	10	Intergenic	novelGene_71807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	649.378240138544	90	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	122	1012	852673	857510	FALSE	5	GCCCAGCCTTGGCGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEPPISHLLRVLFLSFFEIFFCVFIFYYFSR	837629	857815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855703_857419
913000	contig_12624_pilon	+	3597	13	Intergenic	novelGene_60958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	358.682881836062	11	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1375	1851	39740	44609	TRUE	25	GGAAAACTCTTCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGRWASFAPACTWPTTAARTWHLRMSLHSTT	6105	55584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_8278_8344_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_44521_44852_45912_46768_50396_50437_54975
913002	contig_10861_pilon	-	2133	4	Intergenic	novelGene_39315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1459	1812	1470772	1470419	FALSE	20	GGTTGACATGTTGAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISEKHAKNQRKSPLKPPRHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTQKTDQIYWSERGWRNPESMAPRHPFSSVVNSLPRFTIQLGIGQPHKTKWD	1478169	1470097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1471909_1472609_1472706_1473367_1473529_1478104
913003	contig_4364_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGACATTAATTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272361	1274496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1272400_1274500
913004	contig_12000_pilon	-	3485	2	Intergenic	novelGene_43191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTGTTGTACATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588451	582728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_585375_587612
913005	contig_6102_pilon	-	4760	27	Intergenic	novelGene_32284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	294.840055426707	559	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1016	3051	249	3299	1580397	1467555	TRUE	15	GAGTCAGCGCTGCCCCGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDAIPALDSWRLNIYSGVHRGYCILLKMSNSNATQETLEIMKESEKKLVEESVNKNKLISKASSKEEIEKEGEDISLRQESQRRTSNHGHARKRAKSNSKLKLVRSLAVCEESSTPFADGPLETQDIIQLHISCPSDKEEEKSTKDVSEKEDKEKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRDRMMLLKLEQEILDFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQIRVPLQDGRRSKSIEEREEEYQRVRERIFARETGQNGYLNDIRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCHQVTSSQSIRGLLPCTAQQQQQQQQLPALPPTPQQQQPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSAEAADPSSALFQPPLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSSYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHSVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLSNQRSSLGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGNDSQNVVQPPFQQPMLVPASQSVQGGLPAGGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQFQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVVVMQLNVPNGPQAPQNPSMVQWSHCKYYSVDHRGQKPGDLYNPESSPQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSNVCTGLSPLPVLTQFPRPGGTAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPSGGGGDNGGTAENGRHADLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRVAKKNYDLRILERASSQ	1640693	1454117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1454138_1457953_1458099_1462012_1462055_1466300_1467896_1468791_1468877_1469246_1469345_1470544_1470693_1471105_1471276_1476418_1476520_1477699_1477855_1478313_1478475_1478715_1478843_1479142_1479386_1487616_1487784_1489610_1489844_1494350_1494383_1497284_1497381_1500130_1500240_1500663_1500805_1501393_1501454_1502108_1502188_1503077_1503205_1503732_1503820_1505750_1505793_1510400_1510598_1580345_1580409_1640456
913006	contig_3956_pilon	+	2741	14	Intergenic	novelGene_15210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1279.66584488147	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	668	2227	1286091	1290491	FALSE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282854	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284139_1284803_1284864_1285066_1285173_1285712_1285779_1285979_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
913007	contig_9484_pilon	+	1762	12	Intergenic	novelGene_105632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	534.854780630814	2995	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	853	1629	101690	104965	FALSE	5	TTGGTGGTGGTTTTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95815	105098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101300_101599_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
913008	contig_13112_pilon	+	6181	1	Intergenic	novelGene_98834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	178	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	5075	5434	286563	286922	NA	10	ATTGCTAGTTTGGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGKLLFFSRSMPCQAKQSLGEAAAAGAVPPSCFWEGDFSFNEVALVLGTLPSGRSSFFSGLFPSVGAAVRCFLSRSADAEFLRSRLSPWFFSKLLRLSLTGDAFSKRIREDRSLSLL	281488	287669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13112_pilon_+_281500_287700
913009	contig_9363_pilon	-	2589	11	Intergenic	novelGene_6690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	178.049684077226	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	59	1684	1279335	1272765	TRUE	20	CTCGGCCTACAGTCGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSTHSIPNLGHPEDSSLGAPAPGKEEGGPGPGGAPDGRKEMTSMPGATITASSVRKEELVPSEEDTQALTLGAQGPSSRGREPEGRPKRELREREGPGLGPPSAASALSRVDREKAKVEEAKRKESELLKGLRAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGNLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRVYIS	1279393	1271732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1272086_1272212_1272942_1275152_1275255_1275337_1275479_1276490_1276617_1276695_1276909_1277098_1277249_1277385_1277504_1277594_1278023_1278113_1278236_1279286
913010	contig_13481_pilon	-	471	4	Intergenic	novelGene_119381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	202	junction_1	501.119635305671	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	28	321	536852	527468	TRUE	25	AAGACCCAGGTTTCCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEFAKANTKMAKSKLMATPNPSSAHPALGAHFIARDPYDLMGAALVPASPEAWAPYPLYTTELTPAISHTAFTYPAGTAATTLHAQVRWYPSSDTAQQGWKYRQFC	536879	521181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_521325_527460_527531_536157_536304_536767
913011	contig_7593_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_127306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATATGTTTAATAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196748	199183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_196700_199200
913012	contig_18491_pilon	-	2384	3	Intergenic	novelGene_176619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	1721	2383	2307	1645	FALSE	60	CTAAAGACAAACAAAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLPVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHITFTLAK	4589	1643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_-_3134_3463_3631_3862
913013	contig_3400_pilon	+	4224	2	Intergenic	novelGene_178923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1778	2395	162920	163537	FALSE	30	TTAACTTATTGATGCAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKQAFTQASVAASKAWSKILDARTATGSFTTIRQAANEPYIDFINDLQMAISRQVDNQQAAEVLCLQLAYENANADCRAVLAPLKAQNPNLAEMIRACQNVGTETHKAQVLAAALRPSTATCFGCGKPGHFKKDCHSSKNKNANTKLPTRKCPHCGKGFHWANQCRSQLNNQGNPMSGNGKRGESSHVPKNPGSPRVWSVETTA	161029	165366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3400_pilon_+_161539_161651
913014	contig_13123_pilon	-	1977	3	Intergenic	novelGene_136905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTTCTCCAAGCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446080	438774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_439102_443433_443548_444544
913015	contig_7247_pilon	+	4406	13	Intergenic	novelGene_176684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAGAGAAATCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37787	70758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_+_40540_41773_41883_43872_43983_48405_48547_50449_50543_52075_52200_52793_52916_54299_54433_59130_59340_63467_63638_67653_67851_69757_69953_70707
913016	contig_12411_pilon	-	5084	19	Intergenic	novelGene_145668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	46.1224885562052	171	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	51	2381	338111	151563	TRUE	45	CCAAATTCCAAACCAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNPLIKLDDAVNVDEIMTDTSTNYLLCICENKETVKDKKKGNIYIGIVGVQPATGEVVFDSFQDFASRSELETRILCLQPVELLLPSDLSQQTETLIRRVTAASVRDDRIRVERMDNIYFEYSYAFQVVIDFYANDIVDVKGSQNFSGIMNLERPVICSLAAVIRYLKEFNLEKILSKPKNFKHLSSEMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDRKTHGSLLWVLDHTKTSFGKRKLKKWVTQPLLKLRVINARLDAVSEVLHSESSVFGQIESHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKLEFQALIPAANSHIQSKLLQTVILEIPELLSPVEHYLKILNEHAAKIGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQEVTNKIQIHLQEIRRVLKNPSAQYVTVSGQEYMIEIKNSALSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLGFLENFNEHYHSLCKAVYHLATLDCIFSLANVAKQGNYCRPTLEEGRKIIIKNGRHPVIDVLLGEQYVPNSTNLSGDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEHFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKSYSQQVGNYHMGFLVNEEESKQDPGEEEEQVPSFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKTAAHKSKDLEGLVNMKRKRLKHFAKLWTINDPKDLQKWTDEFAVEEITDFSS	338161	48345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_48448_148961_151672_154340_154516_160741_160872_165770_165958_185799_185958_207318_207425_215556_215665_224983_225101_227463_227529_235274_235444_236180_236369_241554_241688_260096_260207_271517_271603_281634_281750_283601_283715_332037_332205_338015
913017	contig_11370_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_98700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGATTTGATGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17889	15987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_16000_17900
913018	contig_7657_pilon	-	4136	3	Intergenic	novelGene_30044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1902	2297	286969	286574	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLLNGQSSIKCQEPATSQLKQLKLDFRYIPCCTAVMRSYAVEMGPHKSLQGERHSKSVDPLCLILAYMIQPWVPGLGEPTVYFFPFVNLFTFQGRKNGSGCVTDPTSGPGYSAIAEAGPGPSAEQGAGR	303919	283671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_285421_286483_287759_302807
913019	contig_10627_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_60013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGACCAGACCCTTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368387	371098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_368400_371100
913020	contig_18843_pilon	-	778	7	Intergenic	novelGene_165618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTAAAAGTGAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45489	32865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_-_32947_36857_36935_37160_37296_38393_38561_40032_40122_44188_44348_45419
913021	contig_6278_pilon	+	6479	10	Intergenic	novelGene_119800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_5	81.8698153574727	102	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	175	1656	306445	479500	FALSE	30	CCTTTAAGTTAGCAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANSMNGRNPGGRGGNPRKGRILGIIDAIQDAVGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPHDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPFCRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDEDDDREESLMMNRLANVRKVKLETIGVVRVLCGHVKEVMPSQT	305050	484323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_305211_306430_306613_328189_328441_425875_426023_446645_446803_452861_452984_456819_456958_460975_461064_463902_464035_479221
913022	contig_19185_pilon	-	3858	1	Intergenic	novelGene_163669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173327	169469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_169500_173300
913023	contig_6137_pilon	-	3302	20	Intergenic	novelGene_59135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	94.8518015955837	72	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	832	2499	323	2821	961692	914015	TRUE	75	CCTAAAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEYRGRGFGHGRFQSWKRRRGGGNCSGKWRERECRPDLSKTTGKRTSEQTPQSLLLQSTLDQFIPYKGWKFYFSEVYSDSSPFIEKIQAFENFFTRRIDLYDKDEIERKGSILVDFKELTKDDEITNLIPNIANELRDTPEKTLACMGLAIHQILTKDLERHAAELQAQEGLPSDGETMVNVPHVHARVYNYEPLTQLKNVRANYYGKYVALRGTVIRVSNIKPLCTKMAFLCAACGEIQSCSLTDGKYNPPTKCPVPACRGKSFTALRSSPLTVTVDWQSIKIQELMSDDHREAGRIPRTIECELVHDLVDSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSVSNSKGQKTKTSESGSKHGTLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLTLALFGGSQKYADDKNRMPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFTLEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEDHDHLLSEHVIAIRAGKQRAVSSATVARYSQDSNTSVLDVVSDKPLSERLKVAPGETTDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTDAAQVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTEARARLELREQATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYSDEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNIAERTYNNLFQFHQLRQIAKELNIQVVDFENFVGSLNDQGYLLKKGPKVYQLQTT	974760	911233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_911701_914000_914108_914827_915018_917441_917519_918808_919019_919305_919523_921675_921872_928492_928635_930458_930600_931359_931391_936359_936556_936784_936937_941886_941973_955838_956038_956812_956917_958799_958950_959361_959445_961182_961267_961544_961698_974443
913024	contig_13224_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_104077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	683	985	125928	125626	NA	60	AAAAAAAAACAGGATCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPGGIRNKTQDDFPVEEKALELPDREFKSLIFTAIQELKQKENENEEKTDKFMENTDQKNGRIEWTWEIWGRKEKCAITVWGVQLGSHSSGYIQFCMRN	126610	124262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_124300_126600
913025	contig_7861_pilon	-	5429	2	Intergenic	novelGene_77410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	668	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2752	3123	123949	123578	TRUE	40	GCCTGAGACCAGAAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKRPLIIGTWNVQSINLGRLEVNKNEMECINIDILGISELKWADIGNFESDNRLVSCARNDKLRGNDIPFIIKKNISRSVLKYNTVSDRKVSICLQGRSVNLTVMDWTVSPQNTCQLG	126700	121197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_121353_121426
913026	contig_5959_pilon	+	1504	3	Intergenic	novelGene_150181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATAGCATGGCTTCGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175566	197065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_176521_187194_187268_196588
913027	contig_19604_pilon	-	2370	4	Intergenic	novelGene_77247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1689	2060	274123	273583	TRUE	15	CAGCCCCACCGTCCGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLWGRHVQESRGKWSRDSPAVPGGGKGSGAQQTHACTPRVPGQCSGQGQGLGQADPKPGLGTGIGVVTDSDEPQDAGELLLHRLVLDGDQPLLMGTCKAQGTGLAPGPCRMAERCPLWSGLG	275811	270835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_270866_273136_273317_273482_273614_273782
913028	contig_18869_pilon	+	2250	17	Intergenic	novelGene_56426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.36439916082772	160	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	114	1991	94417	113479	FALSE	35	TAGAATGATGTGTTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTRSEEISERKRKDHHFFSLLQFSQRLLRTDYVPDTVSSAGGTKVYLLEAGNALSLEETAVEGVHQPAKMKCLEGPCLTDQGPGKHCGPLTPEEELVPASQLEEEEEVEEEEEEEDLDPDRAPDLEEEENDLRDPAVLSAVHNTQRGFHGSSRIKAPGVLGKSSTSLHFLWQPNASSPLRPFGLRLPSSDPSLFYSPPTSWSPAFSLPSHLTQLHPWHQRILQQQQRDQKPSPPAKKPWSQQPDPYANLMTRKEKEWVIKVQMVQLQSEIPHLDDYYYQEHYQKLEKQADEELLGQRSWVESLKLVTPYIQKAEAYESVVRIEGSLGQVAVSTCFSPRRAIDAVPHGTQEQDTGAANSQRLWVLYRIEKMFLQLLEIEKGQKDGFAKPSSSEQQSIQVEKLFQTLMTQEQNNLEALKMPPTPRLACREAADGFLQVLSVRKGKALVARLLPFLPRDRTVSLLLAITHHLPFLVQRDVADQALQILFKPLGKFISHLTFHELLQGLQGLTLPPASEKPVTVVLQNQFGISLLYALLSHGEQLLSLDSSLEKPNSDHTAWTNMVVLIAWEIAQMPTASLAEPLTFPSNLLPLFCRHVDKQLVQQLEARMELSDGRNKITAPCSSLI	93580	114072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_93624_94346_94552_104855_104947_105508_105721_106311_106393_107259_107361_107868_107947_108169_108312_109773_109892_109985_110084_110307_110362_110456_110591_110694_110894_111620_111756_112386_112485_113277_113480_113813
913029	contig_6477_pilon	+	3122	6	Intergenic	novelGene_154189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_4	21.3784938665005	65	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	286	714	776734	779173	FALSE	15	ATCCCAGCACTGCCCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFRKRKPSEEARKRLEYQMCLAKEAGADDILDISKCELSEIPFGAFATCKVLQKKVLIVHTNHLTSLLPKSCSLLSLTTIKVLWSFSQASDSAPFQPMPKETPFMSPLLKFLPDGSDTIVNLGFDQHGLFITFYMPCLG	773322	781581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_773356_773675_773896_776701_776806_777237_777295_777831_777877_778918
913030	contig_14220_pilon	-	3818	1	Intergenic	novelGene_159861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCACCATAATTTGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324751	320933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_320900_324800
913031	contig_8447_pilon	-	1805	9	Intergenic	novelGene_69380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	35	760	54952	44867	TRUE	40	TGGAAAGAGAGGAGGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAEATWQDLPGMKSTQESKVQCMEKWLLMTQLNTWLQLCLDLAFQLHELPKIPHRGDKVLLGLLLLASERVLILLEPPCLGPACTHLLLHQFELFLEPGTVPLLFQADPLGLLPAAHGMFLLHLLYLLLLLTLQVLQLCVKVLLLGIDFLFETFMHLLQLQLMLAAQLGLVPMFFFLEQPELSEFLAPEGNLISSSFFSSSLMILEVVMLTSTPSTTNLRVRLRVLLCSFESLMDREPVSLFRDRSAEREVL	54986	5773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_5924_21257_21329_22347_22545_23214_23222_40690_40826_44381_44929_48348_48477_53956_54088_54547
913032	contig_7663_pilon	-	3832	1	Intergenic	novelGene_178924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	2839	3594	123904	123149	NA	35	TACAGGTGCCAGAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLNAPIKRRRVADWIKKHDPSICYLQEMHLRLKDTNRLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYASNNSAPKYIKQTLTALKTEIGSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNIKILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKNQTHGN	126742	122910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7663_pilon_-_122900_126700
913033	contig_211_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_129883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTTAAAAAAAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305724	304748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_304700_305700
913034	contig_2480_pilon	+	3690	8	Intergenic	novelGene_63527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_3	53.6971857279508	102	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	2541	3005	265974	271963	FALSE	70	AATTTAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKVEAPGLWSGVFHEGETPRGQEFPTLDLSH	251381	272648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261836_262006_263141_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795
913035	contig_6084_pilon	+	3899	2	Intergenic	novelGene_127040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTTTTTAAAAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326379	330620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_330184_330525
913036	contig_5686_pilon	-	2302	14	Intergenic	novelGene_45286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	515	1186	208699	203000	TRUE	20	AGTCTAGGCAGCAGGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	215612	93826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93902_170213_170341_171641_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199887_200469_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303
913037	contig_20614_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_107523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61960	63451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_62000_63500
913038	contig_7457_pilon	-	1880	8	Intergenic	novelGene_31405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_7	152.914275037369	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473120
913039	contig_10496_pilon	-	2616	10	Intergenic	novelGene_59423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_2	94.9081427252454	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	48	1880	64609	38747	FALSE	35	GAGACTAATAAAGTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSAPRLSPSAGRSVSLWFPLLLLLLPPPRVLAAAPAAPAPVNPCCSFPCQHQGVCVRFGLHLYQCDCTRTGYSGPNCTVPKLWTWFRTALRPSPSFLHFLLTHGRWFWEFVNATFIREMLMRLVLTVRANLVPSPPTYNSAHDYISWESFSNQSYYTRILPSVPQDCPTPMGTKGKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	64656	38010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52847_55299_55444_55640_55782_56170_56288_64482
913040	contig_9036_pilon	+	3865	10	Intergenic	novelGene_155446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	198	junction_9	366.039463567644	27	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	86	1189	94373	209926	FALSE	75	ACTAAAAAAAAAAATAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGIQKLASQYLKRDWPGIKADDRNDYRSMYPVWKSFLEGTMQVAQSRISICENYKNFISEPARTVRSLKEQQLKRCVDQLTKIQTELQETVKDLAKGKKKYFETEQMAHAVREKADIEAKSKLSLFQSRISLQKASVKLKARRSECNSKATHARNDYLLTLAAANAHQDRYYQTDLVNIMKALDGNVYDHLKDYLIAFSQTELETCQAVQNTFQSLLETSSKVIRDYNLQLFLQENAVFHKPQPFQFQPCDSDTSRQLESETGTTEEHSLNKEARKWATRVAREHKNIVYQQRVLDELECHGVAASEQSRAELEQKIDEARENIRKAEIIKLKAEARLDLLKQIGVSVDTWLKSAMNQVMEELENERWARLPAVTNNGTLHSVWFSSCIRWTDLH	82984	212602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_83066_94368_94514_101675_101810_110016_110072_110908_111038_144325_144449_150080_150177_169590_169708_184315_184421_209722
913041	contig_8174_pilon	+	3325	1	Intergenic	novelGene_160060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAAATTTATGGTGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292544	295869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_292500_295900
913042	contig_10500_pilon	+	4877	2	Intergenic	novelGene_41219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	568	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAATTACTGAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1623614	1628590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1626681_1626779
913043	contig_5327_pilon	-	3052	4	Intergenic	novelGene_178587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2482	2787	176536	176231	FALSE	20	TTTTTGCATCCATATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESLTSSLPIWMPFISFSCFIAPPRTFSTMLNRSGDKGHPCLVPVLEGNVFSFSPLRMMLAVGFA	381980	175965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5327_pilon_-_176784_337257_338480_350086_350920_381801
913044	contig_21174_pilon	+	4231	9	Intergenic	novelGene_178927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	312.406686068016	298	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	3000	3809	10586	12469	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRARWMEQEGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWIHCPHHGDHCCPGSPCGHCSCGGWSCDLEEEELRYRGWA	2456	13792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21174_pilon_+_5167_6233_6293_8297_8420_10477_10725_11037_11314_11957_12234_12350_12478_13210_13259_13426
913045	contig_12923_pilon	-	977	11	Intergenic	novelGene_30148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	202.026755653799	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	27	863	230672	225749	TRUE	0	CCCGTTTCTTGCCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIPLFKLYMVMSTCFLAAGIFWVSVLCRNTYNVFKIHWLMAALAFTKSISLLFHSINYYFINSQGHPIEGLAVMHYITHLLKGALLFITIALIGSGWAFVKYVLSDKEKKVFGIVIPLQVLANVAYIVMESREEGASDYRLWKEILFLVDLICCGTILFPVVWSIRHLQDASGTDGKVAVSLAKLKLFRHYYVTVICYIYFTRIIAILLQVAVPFQWQWLYQLLVEGSTLTFFVLTGYKFQPAGDNPYLQLPQEDEEDVQMDQVMTDSGFREGLSKVNKAGGRELL	230698	225504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_225570_225699_225819_226184_226310_226394_226479_228671_228722_229336_229381_229470_229602_229674_229793_229876_229951_230433_230510_230607
913046	contig_3077_pilon	+	2135	8	Intergenic	novelGene_26685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	3501.81429361107	1058	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	4	576	9676	15245	TRUE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKTPGFHHSHDLPVSWGLASDHRTSQPPVQRPEGRKF	9672	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_15137_15262_16144_17054_17449
913047	contig_5033_pilon	+	2683	7	Intergenic	novelGene_28937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGTGAGCGCAGAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449642	477308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_452153_452916_453121_456492_456604_462973_463033_464549_464982_477115
913048	contig_6102_pilon	+	2812	22	Intergenic	novelGene_31743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	167.843153756829	438	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	84	1103	216236	220361	TRUE	20	CTAGGCTATCTGTTGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVL	216152	229248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220358_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_227023_227264_227330_227565_227657_227964_228161_228274_228396_228586_228648_228903
913049	contig_14744_pilon	+	2649	1	Intergenic	novelGene_65927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAATACCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155160	157809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_155200_157800
913051	contig_6589_pilon	+	2894	1	Intergenic	novelGene_25833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATCATCAAGCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	899696	902590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_899700_902600
913052	contig_11386_pilon	-	3953	1	Intergenic	novelGene_82810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	356	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2241	2594	103302	102949	NA	20	CGCAGTGGTTAAGCACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDMVLPRNISTICSRTPLLGIYLREVRAITRIDIRTPIFTAALFTIAKRWKQPKCPATDEWINKLWSIHTVEHYATMKNNDESSKHLATWMDLEGSMLSEIAKSQKDKYCMRPLS	105542	101589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_101600_105500
913053	contig_1275_pilon	-	870	1	Intergenic	novelGene_108811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCCAAACTCCTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649827	648957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_649000_649800
913054	contig_8866_pilon	+	3224	3	Intergenic	novelGene_77815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2422	3015	679856	680449	FALSE	45	ACGTAATCCACCACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRILTEYSEKLYSNKFENLEEMDKFLETHSLSKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIYRRACTSTTQAISEHRRGSNTSKFIL	550088	680658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_552297_652914_652922_679649
913055	contig_20211_pilon	+	3722	1	Intergenic	novelGene_147666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCAGAACGTAAGAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36254	39976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20211_pilon_+_36300_40000
913056	contig_5642_pilon	+	2623	1	Intergenic	novelGene_153021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31361	33984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_31400_34000
913057	contig_5947_pilon	-	4100	21	Intergenic	novelGene_101556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_2	32.9127255024557	116	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	926	2781	657	3437	649460	615871	FALSE	75	GCAAGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTPLLAAYSIGLQNCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFGMQLERDAYVQALARFSLLTASSSITEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKTRYLSGSGREREGSLKGHTLVGEEFMGLGLGNLVSGGVDKRQMASFQESVGETSSQSVVVAVDRIFTGSTRLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELASPHHPRMFSLQKIVEISYYNMNRIRLQWSRIWHVIGDHFNKVGCNPNEDVAVFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKKNRSPTIRDMVIRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFAVFHQAASDHDGNIVELAFQTTGHIVTTIFQYHFPAAIDSFQDAVKCLSEFACNVAFPDTSMEAIRLIRFCGKYVSERPRVLQEYTSDDMNVAPGDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKSYGHTFEKHWWQDLFRIVFRIFDNMKLPEQQSEKSEWMTTTCNHALYAICDVFTQFYEALNEVLLSDVFAQLQWCVKQDNEQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPGVWDETCSCMLDIFKTTIPHILLTWRPVGMEEDSSEKHLDMDLDRQSSSSIDKNASERGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQKLFASLLIKCVVQLELIQAIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDAEIHIETEDQGMYKYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCLRILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKINDEKFKAHASMYYPYLCEMMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWTPEEPSQLPGTLSAVW	650116	615207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_616048_616415_616534_618097_618237_619910_620080_621279_621411_622981_623097_624139_624195_624301_624441_625293_625430_628123_628254_628401_628533_630200_630362_631692_631866_637454_637607_639735_639906_640004_640046_642051_642152_644406_644555_646855_647015_648230_648360_649352
913058	contig_9995_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_47739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1395	1790	548424	548819	NA	45	TAACAATCCTTCAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRNCNAVARETSAGHAGSSRSGMARQSCSELIIYRTLQEIRKEIKQNAEHAIEEIKKITEEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHTSRIEAMEVRISEIEDKALGTNLFEEKSGKRI	547029	549637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_547000_549600
913059	contig_8954_pilon	+	2468	1	Intergenic	novelGene_130273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	1743	2342	114717	115316	NA	45	AGGACAGACAAAGAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLPKQNRMVPVGIQNKTPDDFPIEEKVLKVPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMESTVKIMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLQIQKINKVSEMDCHRRAEEFEMVEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEWGENKTQRRSLKNC	112974	115442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_113000_115400
913060	contig_14970_pilon	-	1939	5	Intergenic	novelGene_45142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	43.7342828911141	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	9	569	323552	291094	TRUE	35	TCAAACAGTTGGTCCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYMSTTVIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVTKKVLVAPKSEEEANATSAIVSLLNETVTEAPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGEQAKLMVEFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPPGYCLPNLWEDHCNQGLGGGC	323560	284595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_285807_290934_291170_311919_312047_317271_317441_323363
913061	contig_3956_pilon	+	3022	16	Intergenic	novelGene_15160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1086.40744147345	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	29	2503	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANITRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281653	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282752_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
913062	contig_11548_pilon	-	5196	5	Intergenic	novelGene_66756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	783	142	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2524	2964	91073	90633	TRUE	35	ATTTGCCAATGACACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQHTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDIPVLEKALELPDREFKSLILRIIQGLKQKADKNEEKTDSWKTQTNSWKIQTKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQLEIQKINNKISEKDSVIEALRKRFETVEDRISGIEANT	317859	86696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_88878_90581_91183_107242_107381_150975_150999_315606
913063	contig_10235_pilon	+	2357	2	Intergenic	novelGene_46510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	206	1783	297036	298726	FALSE	40	ATCAAAAATGTGTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKSTAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVRVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRGTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTRDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITGVVRLQHEERSGGRGAQGQDQ	296830	299300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_298546_298658
913064	contig_854_pilon	-	4937	26	Intergenic	novelGene_36635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.56767343538123	245	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2970	3557	1706853	1702673	TRUE	25	ATGGAGTTCGGAGTCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1716403	1694486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1694524_1695119_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1698983_1699024_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715071_1715208
913065	contig_17940_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_173958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	96	291	21	311	8254	7964	NA	15	GTCACTTTCTTATTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFFETLMYSQSSEVFIINAVLLTVMFFLGRIAVIPAFYYCMYYVYGNVVYTGLELLIPCSLASGLVVLQVMTIIWMIQIIRMWLCLNQHSHKTRQSNWKCSS	8274	7349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17940_pilon_-_7300_8300
913066	contig_15047_pilon	+	5330	6	Intergenic	novelGene_52165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	3059.86722587762	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	26	1000	2194	4686	TRUE	25	AGCAAGTTTGTGGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2168	9857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4158_4434_4552_5423_6263
913067	contig_6208_pilon	-	3264	10	Intergenic	novelGene_53031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	481.787412777784	5	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	280	2640	513736	492858	FALSE	45	GTCTATAAAATAATGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETERWWEKLWKIPECIRGWDDQLKHHVPSQPAFQVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	530178	492233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505104_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_529506_529646_530049
913068	contig_7182_pilon	-	3071	1	Intergenic	novelGene_117111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAGGGGACCAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158272	155201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_155200_158300
913069	contig_3602_pilon	-	1797	1	Intergenic	novelGene_60548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAGATTAAAAACAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314971	313174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_313200_315000
913070	contig_12750_pilon	+	5767	3	Intergenic	novelGene_172619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	15	661	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	90	554	14869	31732	FALSE	30	ATACCCTTATAAGTTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGGRTLQARALLQQCLHAQLQVQRGLVIYVCFFKGADKELLPKMVNTLLNVKLSETENGKHTSVLDLPGDILIIPQATLGGKVKGRNMQYHSNSGKEEGLELYSQFVTLCEKELAANSKCAEAGVVVKHGTYGNRQVLKLDTNGPYTHLIEF	14779	36945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_14938_27181_27252_31406
913071	contig_91_pilon	+	2327	6	Intergenic	novelGene_127135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	20.0658914578944	69	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	292	1848	1141190	1164566	FALSE	10	GACTGTTGTTTTATTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVVEDVAVEFSQEEWALLDLAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSRNFNDGERLSSEHIMVRFMKNNIWSSMLGAISESHDNKEQHENQKRSSRSRTVKNLCESNEGNWCGNTFSWIPNLTVLKRNPSEVNRFECCEHRKAFMDHPSHKHRTRSHTRCNTCQCKECGETCSSPSHLTTSMRILNRKKLHKCKVCGNDFICISLLKNSVTRLTGEKRYECNECGKHFCTFTSFRTHVRRHKHECKECKTYSHPSSLNLHKFHERDKPYECKECGKAFSEASSLTKHKRTHSGERPYECKECGKAFSETSSLTKHKRIHSGERPYECKECGRAFSDSSALTSHIRTHSGEKPYECKACGKAFSHASSLTIHIRTHSGVTPYECKECEKTFSDPSALTLHKRTHTGEKPYKCKECGKAFRCSSHLTAHRRTHSGVRPYKCKECGKAFSRSSHLTTHIRTHSGEKPYKCKECGKAFRDTSALASHIRTHTGERPYECKECGKTFSQASHLTTHKRIHSGEKS	1138326	1165045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1138368_1140939_1141193_1160999_1161127_1162309_1162461_1163038_1163731_1163982
913073	contig_14687_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_107945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562682	560487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_560500_562700
913074	contig_7051_pilon	+	2192	13	Intergenic	novelGene_64286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	164.103541162957	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	131	706	184159	200642	TRUE	25	CCAGCTATATTGACTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAAERSRADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLL	184028	207358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200023_200640_200715_201833_201914_203048_203168_206143
913075	contig_14333_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_49167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACACTGAACTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570657	569051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_569100_570700
913076	contig_14575_pilon	+	4751	28	Intergenic	novelGene_101884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	123.630850137108	109	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	12	506	19976	26356	TRUE	60	GATAAAGAGGAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	19964	80748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51061_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59985_61543_61637_63867_64005_68967_69220_70559_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556
913077	contig_7396_pilon	-	1955	15	Intergenic	novelGene_79603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3251.19129186926	5	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	182	1447	255163	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247787_248566_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
913078	contig_14144_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_175659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	348	773	1120	31689	32036	NA	35	TGAGCATAAGAGCGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCHNQQVNSASTPSPEPPTPDDPILDYAGGNSASMTKLALFTRHTPSSVPAERGPQACGGASLNSESNGDSGNYDALAGDTLLGDCELSRQMGAQLKLLPMNDQIRELQTIIRDK	30916	32036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14144_pilon_+_30900_32000
913079	contig_4068_pilon	+	2861	24	Intergenic	novelGene_161695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGCCGGTAAACACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24768	113826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_+_24790_26542_26680_27259_27449_28917_29134_34324_34462_34753_34793_37127_37294_42831_42994_61060_61146_78188_78271_78366_78395_83465_83531_83831_83963_85999_86201_86292_86354_87764_87837_94686_94722_96362_96420_98713_98789_102797_102904_108101_108276_109190_109303_112699_112790_113406
913080	contig_16525_pilon	-	808	5	Intergenic	novelGene_133813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	2218.54930078193	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACGTGTGAGATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97168	91526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91862_93365_93449_95674_95725_96733_96975_97069
913081	contig_5350_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_99373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1019	1384	262420	262055	NA	20	GTCCAGAACCCTCTGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLCISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSRLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFVIVCCLWGIQ	263438	260806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_260800_263400
913082	contig_593_pilon	+	3237	1	Intergenic	novelGene_102000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2253	2627	327366	327740	NA	80	AAAAGAAAAAAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFFFLFLNRRERVRVCTYPSLLGAAFHWFGVSKQNLCCRVSLDVEISFRVCAQHSCLPASLRPGVAVSLQFRHHDSSAPPLFQTVFLSGMTQMDFLSLPCSGLPDVHIESNHLFFQIFVVRGI	325113	328350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_325100_328400
913083	contig_8365_pilon	-	1129	2	Intergenic	novelGene_150920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211395	144510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_145047_210802
913084	contig_13348_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_162685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTATCTTTGGCTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242207	243375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_242200_243400
913085	contig_5039_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_65032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTGATTTAAGATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796522	1794602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1794600_1796500
913086	contig_12528_pilon	-	3712	1	Intergenic	novelGene_81290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGTTCAAGTACACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332090	328378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_328400_332100
913087	contig_12312_pilon	+	3700	17	Intergenic	novelGene_63956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAAGAAGTGAGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213839	256316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_215246_215868_215984_218222_218326_218673_218880_223841_224029_225333_225458_226679_226983_228087_228196_229392_229543_233702_233833_234965_235165_237713_237803_241337_241503_242253_242408_245860_246008_246881_246973_256293
913088	contig_6364_pilon	+	6067	15	Intergenic	novelGene_51709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	143	10	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGAGAGTGGGAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431225	521182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_432749_433367_436291_436434_436500_439765_439975_440671_440788_445010_445156_447080_447147_457089_457255_458660_458773_466203_466309_472476_472646_477571_477736_486627_486714_490719_490802_521045
913089	contig_4857_pilon	-	1355	14	Intergenic	novelGene_48718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2452.78415166817	28	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	66	725	1234343	1199940	TRUE	35	TAATGTGAGCAATATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFDYVMQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRG	1238601	1178602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1199875_1199946_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1234301_1234361_1238553
913090	contig_15093_pilon	-	4606	27	Intergenic	novelGene_143287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTTGGGAGAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91836	4665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_4782_5834_5912_7071_7140_25204_25391_31332_31417_31809_32004_34183_34262_36386_36538_40090_40251_40853_40934_43499_43592_44993_45111_49896_50054_50313_50413_52151_52331_52485_52593_54048_54256_66946_67176_67986_68122_74115_74298_77044_77174_77912_78033_78742_79024_83961_84214_87049_87308_88496_89335_91806
913091	contig_12644_pilon	-	3275	1	Intergenic	novelGene_44577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2060652	2057377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2057400_2060700
913092	scaffold_12510_pilon	+	4539	1	Intergenic	novelGene_151406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAAGTAATGATTAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610234	614773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_610200_614800
913093	contig_5169_pilon	+	2845	5	Intergenic	novelGene_178877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	195	695	49008	49923	TRUE	50	TTCTCAGCAAAATAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLAGDRAPGNQQYTLSHPQLFSPIWPPPLPSWLQSLGQLSGPGSELLDSPRPQWRSVDREYGKAASWSSQQETEHLVTSNKRYPTPHSSSSHLAYAASCQPQSLGQEALALAPCCLNLLCPHWPAPLVPFLCSWCCFFPLLLVSSLPPPSSFKHLAPCAIFASS	48813	78061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5169_pilon_+_49156_49570_50058_50260_50930_52859_54110_77964
913094	contig_7119_pilon	-	3062	1	Intergenic	novelGene_40872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1782	2168	106316	105930	NA	65	GATGAAAAGAAAATAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELQEAEYKRLTYRTLQEIRKEIKQNAEHTIEEIKKIREEHNDKFKRLQESIERQQSEIQKINNKFSELDNSIESHRSRIEAMEVRISETEDKALDTNLFGEKSDKRI	108097	105035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_105000_108100
913095	contig_16221_pilon	+	3461	1	Intergenic	novelGene_176612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92424	95885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_+_92400_95900
913096	contig_12964_pilon	+	2196	2	Intergenic	novelGene_131671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCTGATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196345	201240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_197903_200601
913098	contig_15108_pilon	-	2788	3	Intergenic	novelGene_131180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1177	1725	116560	97839	FALSE	10	CTCACCACTCCTGGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAASSQHPVWFAQSAGSRLSTALQERPFLPFGVDPQFFLPADPTRCLRPPSRQSFPLLRLRHPVLGRHSWGDWAGELKIPVMLAPHCSHDGDSPEGFSFHRQGACLGKLRHGNAASSSGLSLRGVLIRQLQSVPGQTRLELCLGWIHRGKTRPLVLTRDSGNSVASSFFSSHSTYPGNPA	171420	96775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_98298_116470_116617_170300
913099	contig_10990_pilon	-	3020	2	Intergenic	novelGene_7442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1366	1854	710709	710221	TRUE	25	TCAAAGATGGCGCCCGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPATKSLLNFLARSNFFRRLFPLIRKPFFLFFLAGNFASLSTPSATIFASTTSSSSVLELVGTHPRIPVPVKVLHLLPGESEETGTFKVHILILFMSPKLVPESGSGFTTQAEIQLFLSTCIAFSPISMGSQVPSGPTTSKPGYFWRKSDSNGEHSQTFS	712074	708536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_708669_709186
913100	contig_11896_pilon	+	3757	1	Intergenic	novelGene_88031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	276	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTTGTGATTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155858	159615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_155900_159600
913101	contig_13760_pilon	-	2184	5	Intergenic	novelGene_61336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	38.8522843601248	5	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	264	704	327934	324174	FALSE	15	GGCTTGGTTCCTTGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALGGRTYRTLLHLTQMYPGLQVYTFTERMMAYCDQLFQDETGKNRRQSGSFLSTGWFTMILALELCEEIVVYGMVSDSYCREESHPSVPYHYFEKGRLDECQMYLAHERAPRSAHRFITEKAIFSRWAKKRPIVFAHPSWWAQ	334595	322693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_324364_325617_325726_327791_328010_333959_334018_334465
913102	contig_15273_pilon	-	1898	2	Intergenic	novelGene_140434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	617	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCGAGTCAGTTCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205792	117072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_118606_205427
913103	contig_16303_pilon	-	3395	8	Intergenic	novelGene_34044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	711	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	63	1175	47976	35759	TRUE	25	GTCTTCAGACATGATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48038	32070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33558_35025_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
913104	contig_4659_pilon	-	5076	8	Intergenic	novelGene_118207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1625	1948	595744	595421	TRUE	0	TCCCGGCTCCGCTCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCGYWSQKSLLRKKKLSEINFEARTSSPHKLGAHAFCQRELALLASRPFSSLRDPHVRPGRNRGETEPRTPSPGRIQESFLCFEDFLMKQMVVGACLSYFSFSGG	597368	373686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_373803_417410_418316_443640_444578_475372_475519_490292_490487_509597_509660_565957_566118_594812
913105	contig_14744_pilon	+	3551	10	Intergenic	novelGene_66140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	36.6093828625975	41	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	9	1058	1626203	1649841	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRGHVQDPNDRRLRPIYDYLDNGNNKMAIQQADKLLKKHKDLHCAKVLKAIGLQRTGKQEEAFTLAQEVAALEPTDDNSLQALTILYREMHRPELVTKLYEAAVKKVPNSEEYHSHLFMAYARVGEYKKMQQAGMALYKIVPKNPYYFWSVMSLIMQSISAQDENLSKMMFLPLAERMVEKMVKEDKIEAEAEVELYYMILERLGKYQEALDVIRGKLGEKLTSEIQSRENKCMAMYKKLSRWPECNALSRRLLLKNSDDWQFYLTYFDSVFRLIEEAWTPPAEGEHSLEGEVHYSTEEAVKFIEDRITEESKSSRHLRGPHLAKLELIRRLRRQGCNDEYKLGKEQ	1626194	1652334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1626261_1636644_1636731_1637172_1637312_1639735_1639855_1643389_1643465_1644572_1644681_1645031_1645111_1647616_1647729_1648307_1648398_1649657
913106	contig_9389_pilon	+	3618	30	Intergenic	novelGene_84093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	106	junction_12	148.969420446948	248	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1131	3396	20	3415	1345661	1384114	FALSE	10	TCCTGCAGCCAGCGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIIEVMSASKFTFKRIGYLAASQCFHEGTDVIMLTTNQIRKDLSSPSQYDTGVALTGLSCFVTPDLARDLANDIMTLMSHTKPYIRKKAVLIMYKVFLKYPESLRPAFPRLKEKLEDPDPGVQSAAVNVICELARRNPKNYLSLAPLFFKLMTSSTNNWVLIKIIKLFGALTPLEPRLGKKLIEPLTNLIHSTSAMSLLYECVNTVIAVLISLSSGMPNHSASIQLCVQKLRILIEDSDQNLKYLGLLAMSKILKTHPKSVQSHKDLILQCLDDKDESIRLRALDLLYGMVSKKNLMEIVKKLMTHVDKAEGTTYRDELLTKIIDICSQSNYQYITNFEWYISILVELTRLEGTRHGHLIAAQMLDVAIRVKAIRKFAVSQMSALLDSAHLVASNTQRNGICEVLYAAAWICGEFSEHLQEPQQTLEAMLRPKATTLPGHIQAVYVQNVVKLYASILQQREQAAEHEAAQAATQLLVDRLPQFVQSADLEVQERASCVLQLVKYIQKLQAKDVPVAEEVSALFAGELNPVAPKAQKKVPIPEGLDLDAWINEPPSDSESEDEAPKAIFHDDEQKPTRHRQPEADEEELARRREARKQEQANNPFYIKSSPSPQKRYQDTPGVEHIPVVQIDLSVPLKVPGMPASDQYVKLEQERRHQQRLEKKRKKQRKEKQREGRRRRHSSLHTESDEDIAPAQQVDIITEEMPENALPSDEDDKDPNDPYRALDIDLDKPLADSEKLPVQKHRSAETLQFPDREEVPAVEKKSKKLKKKEKKHREKGREKARKKGKEKGDDLDFWLSTTPPPAAAPGPAPSPDEPEADAVVAAPKEECEEAKREEPENNEDDEEQEVEQKPSKHKKKKHKKEKEEKSKDKKKSRRKKPPSEAVAEPVQNGALEEEPLPPMSSYCLLAENSYIKMTYDVQGSLQKDSQVTVSIILENLSSSFLKNMELNVLDSLNTKMVRPEGASVHDGVPVPFQLPPGVSNEAQFVFTVQSIVMAQKLKGTLSFIAKNDEGSTHEKLDFKLHFSCTSYLITTPCYSDAFAKLLESGDLSVSSIRVDGITMSFQNLLAKICFHHHFSVVERVDSCASMYSRSIQGHHVCLLVKKGENSVSVDGKCSDPTLLGNLLDEMKVTLAQC	1345641	1384317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1345688_1346161_1346243_1347822_1347931_1349659_1349790_1353856_1353997_1354671_1354746_1355757_1355808_1360491_1360542_1361530_1361580_1363470_1363617_1364517_1364667_1366928_1367160_1368029_1368262_1368450_1368597_1369019_1369162_1370057_1370130_1370328_1370405_1370581_1370782_1371209_1371284_1374076_1374255_1374465_1374538_1375217_1375329_1376651_1376799_1377110_1377159_1377525_1377716_1377913_1378003_1378115_1378202_1378442_1378565_1378810_1378891_1384018
913107	contig_13101_pilon	-	2167	9	Intergenic	novelGene_172786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	109.570111686536	15	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1106	2158	237115	233529	FALSE	60	ATAAAAGATATTTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWLKSATKQPSILSKFCSLGKITTNQGSKGQLKENEYDLEEDAEKCENDNTLKVNGCGLDSPGNNVKPINVNEDKAINKGVEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERRENFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVGEDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLE	244444	233519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_233735_234695_234867_236439_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240024_240305_240421_241643_241883_244093
913108	contig_835_pilon	-	2391	3	Intergenic	novelGene_152119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11687	211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_414_532_1451_10416
913109	contig_1008_pilon	+	935	1	Intergenic	novelGene_121609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	387	704	760524	760841	NA	35	GCTTGGACAAGATGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPESLEPVRILNSFLHFSPFDRDSFVESFIKMFSNGSWAPPSSLVSWQRRQLFIERWPSLVEGLLVLCLFIIFSLKYGGLKECWSGHKKTWMYRIYKQERQWPC	760137	761072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_760100_761100
913110	contig_16098_pilon	-	3158	10	Intergenic	novelGene_45776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	309.97124518172	14	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	210	338	35038	34731	TRUE	5	AGCTCTCTTGGCTTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCRELPGSYETASSDSLYPSNILIKRPHTLAPWPPVTSYPPVTSYPPLSEPDLLPIPRSPQPPGGTHRMPSSRKDSDAANSVASYENEEAACEDMDEDEDEEDYHNEGYL	35931	31090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_32099_32666_34799_34882_34913_35007_35073_35215_35304_35567_35603_35720_35749_35907
913111	contig_11629_pilon	+	1272	2	Intergenic	novelGene_161199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	566	junction_1	0	36	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCTGACAATTACAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420360	424812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_420448_423627
913112	contig_15350_pilon	+	3605	1	Intergenic	novelGene_164250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	115	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1292	1741	222582	223031	NA	35	ACAACTCAACTGTCCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFQLLGQVALLQTSWHRRVSASSIAFSIHLLKHFNWYCQFLEPCFCQCLQCSLDFFLQYHWFLIICYLLKWLNADQFFLVRRLSVFYLLLMLPGSFSFLPIESFNIATRGLNFFFSSFSLRNANHVLPFWFFNSRSLHISLYFIFSS	221290	224895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15350_pilon_+_221300_224900
913113	contig_567_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_34005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGTAATAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613600	612108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_612100_613600
913114	contig_14687_pilon	-	3779	2	Intergenic	novelGene_107928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	230	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATGAAAAAAAAAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499265	470977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_471791_496299
913116	contig_11338_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_6262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	180	614	123021	122587	NA	20	CCCCATGGAATTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLRGDQNSSALLGECKMIQPFWKMIWRFLRKLETEIPYNPAIPLLGIYPREIRVFTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRNNNDESVKHLITCLKLEDIMLSEISQSQKDKHCIRPLL	123200	121014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_121000_123200
913117	contig_7594_pilon	+	4782	2	Intergenic	novelGene_55440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	1931	junction_1	0	118	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGATTGAAAGCAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548108	554552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_551292_552953
913118	contig_13607_pilon	+	3285	1	Intergenic	novelGene_170216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTCCCCAGCAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404279	407564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_404300_407600
913119	contig_7342_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_71158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	336	359	401394	401417	NA	20	TAACTGGCCCGGATGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVQVGCAKEKEVGRDSFLYLHGPSAQRLCPAGSPTDPFRAPLPYVSSLSPDVGAESKPGRLTPLTNSRGHAGDGEEARLDVGWGSCGPVPSDGSAGSDRLLRAFCPQHATMLTLVAE	401058	403173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_401100_403200
913120	contig_3153_pilon	-	7559	9	Intergenic	novelGene_104626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	363	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	249	590	152705	152364	TRUE	30	GCCAAATGCACATTCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESPTERTEPDFSPASLRGTEEGRELGSKSPTSSGMVSPPTHTRQGTVFGKGTAGALAGQFPLRNIPAERGTMLHTPSSTPTRIIGRITILLIGVTQIRWQSCFFSFSTDPA	152953	57728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_57889_57972_58109_62933_63010_95022_95112_99963_100135_101882_101978_111195_111362_145101_150480_151665
913121	contig_8552_pilon	+	2627	1	Intergenic	novelGene_80074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	533	1602	102	1703	456900	458501	NA	35	CAGGGCTTCTTGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDDSEEECDEDASEELSHLGESEAHCDGDDDSEMLSEDEEAVTGAQQRGQPDDGGRDDSEEHEGEWSRDVSHFMQIRSSLQQDARVYPDFTQEDTEVDYFLSVFTEETLEIIKNQTNLYAAQECVSRYRGEEIRVPSKNWHPTTVDELKTFIAVHILMGICVLPQIKQYWSRYPIFAVTAVPELMSKTRFKKLTENIHCNDNSKAVPKGQPGYDRLHKLRPIIDALNSRLKEVYVPSSVMSVDESLVPFKGRSSVKPIKRGYKVWCLADSQTGFISHFEIYSGKKDVNNDSLLSLGESVVLGLCHSYNHSHRLIAFNSFFSSYNLMKTMHDRGLYALGAVQASRKGLPGMMRRKDELQRGESLFRTKGCVSAVKWQDSKPVTVLSTFHNPKDITTVRSKSKDGPSSVIPCPRAVAEYNAIMGGVDRFDQRRERYGIGRRSAKWWHRLLYFLIDLAIVNSFIMWNCTHGGRCDQLSFRTALIRQLGVGRGTKSRGRPSYLVKNKQRVSGVPDDVRLLQVGKHLPVKATRRRCRECSTKKKQTRTTIICSQCRVPLCVTPCFQNFHSE	456798	459425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_456800_459400
913122	contig_13456_pilon	+	5559	2	Intergenic	novelGene_153283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	722	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1508	1861	287072	287425	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDFPVEEKALDLPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMERIQEDNAGTKCQNKFTIRNYTETTIRNPKNKQQDFRNGQCHRRAEEQI	285398	291123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_286327_286492
913123	contig_2219_pilon	+	1246	3	Intergenic	novelGene_67214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTTTTAAAAAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384821	450795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_385005_385431_385644_449944
913124	contig_12886_pilon	+	4122	1	Intergenic	novelGene_135469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTTTATAAACTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291464	295586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_291500_295600
913125	contig_9434_pilon	-	4175	23	Intergenic	novelGene_150490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_9	34.4508573223938	229	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1261	3786	98	3883	190983	126044	FALSE	10	TTTTGTACAGGCTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGGWRKRAENEGWQNWGEYMAAKVQKLEEQFRSDAAIQKDGNSSTIFSGVAIYVNGYTDPSAEELRKLMVLHGGQYHVYYSRSKTTHIIATNLPNAKIKELKGEKVIRPEWIVESIKAGRLLSYIPYQLYTKQSSVQKGLNFNPVCKPEDPMPGPSNIAKQLNNRVNHVIKKIETENEVKVNGVNSWSEEDASHDSTDASHDFTCVELEEIFPGWKQNGIPHHRDSPAIVNGHAHSSNGALKTQDCLVPVGNSVASRLSPDSGPEEEAAEKGSTDFRDCAAQQLQQSSRNAAAVRSPHRTNSCSSSSSHSTTKINGAHPSTVQGPSSTKSTSSVPALSKAAPSVPSKPSDCGFISNFYSRSRLHHISMWKCELTEFVNTLQRQNSGVFPGREKLKKMKTGRSALNVADTGNMSVLSSPRHQSCIMHVDMDCFFVSVGIRNRPDLKGKPVAVTSNRGTGRAPLRPGVNPYLEWHYYQNKSLRGKAEIPDSAVWEARDSAQTNGIDSVLSTAEIASCSYEARRVGIKNGMFFGQAKQLCPNLQAVPYDFHAYKEVARTMYETLASYTHSIEAVSCDEALVDITEILAETRLTPDEFANVVRMEIKDQTKCSASVGIGSNILLARMATRKAKPDGQYHLKPEEVDDFIRGQLVINLPGVGHSMESKLTSLGIKTCGDLQYMTMAKLQKEFGPKTGQMLYRFCRGLDDRPVRTEKERKSISAEINYGIRFTQPKEAEAFLLSLSEEIQRRLEAAGVKGRRLTLKIMVRKPGAPLEPAKFGGHGICDNINRTVTLDQATDSAKIIGKAVLNMFHTMKLNISDMRGVGIHVNLLVPTHQTPPSCPGRPSAQSSHFSGGPHSVIDLFQVQKAKKSAEEEHKEVFLAAVDLEIASASRTCSLLPSCSTHLTSTVSPVTSKAESSVKWNGLHSPVSLKSRLNLSIEVPSPSQLDQSVLEALPPDLREQVEQVCAVQQGEPQGDRRKEPVNGCDTGTLPQPVGAVLLQIPEPQESASDTGVSVIALPALSQVDPEVFAALPAELQKELKAAFDHRQRQGEHATHQQPASSTAVPKNPSLQLKPAGAKEKKRNKKKKPISPTKKVQSPLKNRLFSSPAKSLPGPCGSPQKLISGFPKQEGPACENPPGEVTASASGEPSLADLHADLSGCARPPAPNLAGAVEFNDVKTLLREWITTISDPMEEDILQVVKYCTDLIEEKDLEKLDLVIKYMKRLMQQSVESVWNMAFDFILDNVQVVLQQTYGSTLKVP	212893	125751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_126156_126513_126617_126916_127074_127192_127414_127699_127824_128359_128594_129913_130117_130358_130525_131654_131758_140198_140372_141442_141664_146628_146749_149896_150052_152233_152363_158735_158842_163334_163452_165249_165358_168082_168814_171448_171602_182004_182174_189139_189267_190929_190994_212806
913126	contig_5375_pilon	+	1966	2	Intergenic	novelGene_169206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGGAGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55194	59148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_55610_57597
913127	contig_4091_pilon	-	2746	4	Intergenic	novelGene_173014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	492	794	56589	56287	TRUE	20	GCTAGTGGATTCGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	57080	10861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_55003
913128	contig_19628_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_166571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTCTCCTGGGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21427	20491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_-_20500_21400
913129	contig_6795_pilon	+	3189	1	Intergenic	novelGene_27762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	561	872	382847	383158	NA	75	TAAGAGACAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATIQEESKRSLKRQERKKKPKWMSEETLKLALECRVAKANRRNDKAKKMNRRFQRAAREDKVKYYNNVQKPEVKKTNGKNTLGISQAERTEEKIQASSLQY	382286	385475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_382300_385500
913130	contig_10309_pilon	+	2318	3	Intergenic	novelGene_178929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	8	681	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	87	347	87	14504	TRUE	75	GGAAAGAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSKRRGRRQEARKKSKEVEKSNTSSQQMAPREPPAWVCGIQAVGASQSRDCSRAKQRRPSQGKEGRGVGKHTPQITGCFVSRWMLREAAFSYPRLLVSDRSPRWWIRAALTGK	0	63403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10309_pilon_+_340_14496_14630_61557
913131	contig_10904_pilon	-	1150	6	Intergenic	novelGene_22577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	44.0617748167275	86	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	353	1117	437907	426454	FALSE	5	GTGGCCACTGTCTGCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEQREGTMAAVGFEEFSAPPGSELALPPLFGGHILESELETEVEFVSGGLGGSGLRERDEEEEAARGRRRRQRELNRRKYQALGRRCREIEQVNERVLNRLHQVQRITRRLQQERRFLMRVLDSYGDDYRASQFTIMLEDEGSQGTDAPTPGNAENEPPEKEGLSPPRRTPAPPEPSSPAAGEGPSGRKRRRAPRDGRRGAGTALTPELAPVQIKVEEDFGFEADEALDSSWVSRGPDKLLPYPTLASPPFD	438259	426420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_426574_427000_427223_427306_427377_433351_433423_437070_437330_437884
913132	contig_18822_pilon	-	1954	7	Intergenic	novelGene_111712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_3	73.6832560506267	139	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	188	856	119254	94921	FALSE	35	ATATACAAGGTACCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLKRCKQGLPAFRQSQPSREVLADFQRREPYKFLQFAYFKANNFPKAIAAAHTFLLKHPDDEMMKRNMAYYKSLPDAEDYIKDLETKSYESLFIRAVRAYNGENWRTSVTDMELALPDFFKAFYGCLAACEGSREIKDFKDFYLSIADHYIEVLECKIQCEENLTPVIGGYPVEKFVATMYHYLQFAYYKLNDLKNAAPCAVSYLLFDQNDKVMRQNLVYYQYHREKWDLSDEHFQPRPEAVQFFNVTTLQKELYDFAKENVTDDDEGEVVEYVDDLLEMDETS	127147	93822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_94975_106124_106209_109003_109150_112955_113085_115302_115475_119170_119321_127026
913133	contig_9112_pilon	+	2610	5	Intergenic	novelGene_60193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	463.177341846511	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	428	1279	108641	114303	FALSE	65	AGAAAAAAAAAAAATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108014	115634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108241_108439_108743_111553_112128_113625_113750_114251
913134	contig_16666_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_61794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	830	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTCTTCGAGTTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120496	118874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_118900_120500
913135	contig_9809_pilon	-	1812	6	Intergenic	novelGene_176769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	17.511139311878	94	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	273	836	127128	121810	FALSE	20	TACATCAATGTTGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAQEKEELQREGDSLDAKINKAEKEIHALGNTLQVLNSCNNSYKQSFKKVTPSSDEYELKIHLEEQKRAADEKYRYKQRQIRELQEDIQSMENTLEVLEHLTNNIKGKLTEKQAYSFQLSREIAEQKPKLDRVTKQCSKLTKEIRLMKNTVNEILEEKDIKLREVKEFHKMIDKMLVDVTEENSDIRIILQTYFQQNGLELPTASSKGSRQSSRSSSQTSLLSARSSRSTASTSAFQAPIKVLELNLPASPSRSRSTSRPGTASSSSSNGKGKKGNK	128777	120833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_121970_126436_126523_126666_126847_126990_127132_128077_128185_128615
913136	contig_8848_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_140455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTTTTTTTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56293	54716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_54700_56300
913137	contig_9435_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_156952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGGTGTCCAAAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206041	203870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_203900_206000
913138	contig_11316_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_122652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	150	350	137986	138186	NA	40	GACGACCCACCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137836	138867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137800_138900
913139	contig_10937_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_67328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1478	1957	161343	161822	NA	70	GAAAAAAAAAAAAAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSLVWRFRVMVSWDIPVNWPNNMFSVSILLPSSLCSAWGLKCLQAAIYGTRIGLYPSGATKEEGESGIEGGYGMWIWLIAYMNNCHSQSQLFIQRLDWTMVHKVILMRSVLLSSSRYMRLMGSSCLEVKREGREGQELVEGTQEICDRKEEGAVTV	159865	161915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_159900_161900
913140	contig_16622_pilon	+	2419	3	Intergenic	novelGene_48499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCATTGCACTGGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117599	159593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_118623_157798_158399_158797
913141	contig_13494_pilon	-	4317	11	Intergenic	novelGene_167508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_2	262.40800292674	182	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	167	838	84021	29429	FALSE	55	ATACCTCAAAAAGATTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKLEFPSLPQCKDDAEEWSYPMRREMQEILPGLFLGPYSSAMKSKLPILQKHGITHIICIRQNIEANFIKPNFQQLFRYLVLDIADNPVENIIRFFPMTKEFIDGSLQTGGKVLVHGNAGISRSAAFVIAYIMETFGMKYRDAFAYVQERRFCINPNAGFVHQLQEYEAIYLAKLTIQMMSPLQIERSLSVHSGTTGSLKRTHEEEEEFGSMQVATAQNG	84187	25949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_29503_32996_33091_41549_41623_45170_45222_45317_45358_48686_48724_49145_49207_51817_51916_55521_55576_58442_58476_83964
913142	contig_10225_pilon	+	1055	6	Intergenic	novelGene_86854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	591.964323249298	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	131	937	42629	47636	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	41026	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46308_47165
913144	contig_14925_pilon	-	1619	4	Intergenic	novelGene_55325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	954.787701824628	8	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	82	438	116065	114666	TRUE	10	CACTTGCCTTTGGCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115821_116101_129436
913145	contig_9471_pilon	+	3051	2	Intergenic	novelGene_21847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	906	1265	423764	424123	FALSE	50	TGGAATAAAGAAATTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRQQSISNHTKRKSMMASASSQNKESRNFPEEAEYKRLIHITSRNRKKIKQNAEHAINVIKKIREEHNDKFNRPQESIERQQSEIQKIDNKISESDNSIESYRRRIEAMEVRISETR	422402	425909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_423033_423488
913146	contig_6320_pilon	+	3382	10	Intergenic	novelGene_158079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	189.442912994787	161	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	27	1301	33191	145533	FALSE	20	ACCCACTTGTGATATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALADQFEDMTTSVLERLKIFYCCQVPPHWAIQRQLAGLLFELGCTGSALQIYEKLEMWEDVVICYERAGQHGKAEEILRQELEKKETPSLYCLLGDVLRDHSYYDKAWELSRHRSARAQRSKGLLHLRNREFKDCVECFERSLKINPIQLGVWFSLGCAYLALEDYGGSAKAFQRCVTLEPDNAEAWNNLSTSYIRLKQKVKAFRTLQEALKCNYEHWQIWENYILTSTDVGEFSEAIKAYHRLLDFQDKYKDVQVLKILVRAVIDGVTDRSGDVATSHRGKLQELFGRITSRVTNDGEIWRLYAQVYGNGQSEKPDENEKAFQYLSKAYKCDTQSSGWEKDMTSFKEVVQRALGLAHVAIKCSKNKSSPQEAVQVLSSIRLNLRGLLSKAKQLFTDVASGEISSELADEIAAMDTLVTELQDLSNLFRNQY	33164	147614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6320_pilon_+_33263_36803_36927_55137_55366_69588_69688_82049_82103_94330_94497_133033_133232_134530_134643_139607_139709_145410
913147	contig_7612_pilon	-	3228	6	Intergenic	novelGene_170353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	73.7308619236206	126	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	631	2196	57595	35290	FALSE	15	TGGCCCAGCAATTCCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVVFEDLAVDFTQEEWALLDFAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQQGNNERIILQFMKNDSWSSMLGEICEFHGIEDQHNNQRNPVRSHTIEIICESKEGNIKKTKENNQCGKPFSQIANLIRLKKTLARVYSSECHRCKETFVDHSLFNHHITYHTGCNTYQCKEYGVTCISSSYLRTHVETLTGEKLYKCKECGIVCSCSSSLITHTRTHSREKPYCKCKKFREDIGDVSALVKHKKTQSGKAFSSSFISKRLRTHSRERTCECKECGKVFSCSSSLRKHIRTHSGDRPYKCKECGKAFTRSSSLNTHTRTHSGERPYRCKECGKAFFYSSSFTTHMRIHSGEKPYECKQCGKSFCDISPLNRHIKTHSGERPYECKECGKAFNRSSHLTFHIRTHRGERPYECKECGKAFSWPSALTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHVRTHSGERPYECKECGKVFISSSSLTKHIRTHNGDGPYKCKECRKAFSWPSALTRHIRTHSGERPYEFKE	61105	34257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_36593_37087_37221_38230_38358_57592_57823_57944_58028_60785
913148	contig_9121_pilon	-	3790	3	Intergenic	novelGene_134432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11	45	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTGACATGGATTGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116766	55387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_55664_56174_59491_116568
913149	contig_7056_pilon	-	2168	14	Intergenic	novelGene_43657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_10	1135.7275123235	33	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1272	2018	725925	723226	TRUE	75	TTAAGAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730997	722484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727715_728561_728706_728906_729063_730383_730496_730979
913150	contig_5779_pilon	+	3863	1	Intergenic	novelGene_106451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCTTTCACTTGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98529	102392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_98500_102400
913151	contig_11448_pilon	-	4422	3	Intergenic	novelGene_66411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	3108	3530	527181	526699	FALSE	35	ATAACTCTAAGTACTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLEDSYLANRLEEIHISHTSKILLKTIQKQLQQYIDRELPEIQARFRRGCGMRDITADVRWILAESKECQKDVYLFFIDYAKAFNCVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVLIRNLYIDQKAVVQTEQGDTLWFKIRKGVR	709845	525806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_527064_527123_528131_707687
913152	contig_18195_pilon	-	1635	2	Intergenic	novelGene_138445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAATAATAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6509	2790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18195_pilon_-_4187_6270
913153	contig_7357_pilon	-	424	3	Intergenic	novelGene_36849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGCGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172293	170068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_170319_171344_171470_172244
913154	contig_13348_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_162676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1359	1697	36893	36555	NA	25	TGGGTACATAGCAGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRGQLQDPEQAKAPARRAGRARSRGQRATTGPAPTSTHSRSHHGGDHISDLNREVITTLYDCQNTENHGLAKLTHNLNHHTGFEQISVKKKKCFNILVTLLALRCFCISLH	38251	36174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_36200_38300
913155	contig_15122_pilon	+	4403	2	Intergenic	novelGene_162698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	799	2400	373	2772	435073	437472	FALSE	40	ATTGTGCAAGTGTAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFKKEPAASAAAFPSQRTSWGFLQSLVSIKQEKPTDPEEQQSHHHHHHHHFGGLFAGAEERSPGLGGGEGGSHGVIQDLSILHQHAQQQPAQHHRDVLLSSSSRTDDHHGNEEPKQDTNVKKAKRPKPESQGIKAKRKPSASSKPSLVGDGEGAILSPSQKPHICDHCSAAFRSSYHLRRHVLIHTGERPFQCSQCSMGFIQKYLLQRHEKIHSREKPFGCDQCSMKFIQKYHMERHKRTHSGEKPYKCDTCQQYFSRTDRLLKHRRTCGEAIAKGAASAEPGSSNHNSMGNLAVLSQGNTSSSRRKTKSKSIAVENKEHKTGKTNESQISNNINMQSYSVEMPTVSSSGGIIGTGIDELQKRVPKVIFKKGSRKNADKNYLNFVSPLPDIVGQKSLSGKPSGSLGIVSNNSVETISLLQSTSGKQGQISSNYDDAMQFSKKRRYLPTASSNSAFSINVGHMVSQQSVIQSAGVSVLDNEAPLSLIDSSALNAEIKSCHDKSGIPDEVLQSILDQYSNKSESQKEDPFNITEPRVDLHTSGEHSELVQEENLSPGTQTPSNDKASMLQEYSKYLQQAFEKSNNAGFTLAPSFQFVSLSSPLHNHTLFPEKQIYTTSPLECGFGQSVTSVLPSSLPKPPFGMLFGSQPGLYLSTLDATHQQLTPSQELDDLIDSQKNLETSSAFQSSSQKLTSQKEQQKNLESSTSFQIPSQELASQIDPQKDIEPRTTYQIENFAQAFGSQFKSGSRVPMTFITNSNGEVDHRVRTSVSDFSGYTNMMSDVSEPCSTRVKTPTSQSYR	434478	439103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_434552_434773
913156	contig_7327_pilon	-	2856	1	Intergenic	novelGene_172112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACCCTATTGTTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89528	86672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_86700_89500
913157	contig_18544_pilon	+	2395	9	Intergenic	novelGene_152732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATGTTTTAGTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36879	63373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_38276_38470_38677_40175_40323_49265_49321_53231_53283_54687_54803_54895_55020_58040_58245_63276
913158	SIRV6	+	1170	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	7	351	7	143	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	251	742	1733	10736	TRUE	40	CAAATTCGGCTAACCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1094	11474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
913159	contig_14441_pilon	-	2016	5	Intergenic	novelGene_100617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1479	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118825	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
913160	contig_2596_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_53505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTCTCTGCCTTCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021080	1020534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1020500_1021100
913161	contig_854_pilon	+	2151	14	Intergenic	novelGene_36512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_13	2458.73114676473	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	173	1645	1649514	1715899	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMTGAEGS	1612773	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685146_1715877
913162	contig_3780_pilon	-	3070	3	Intergenic	novelGene_169783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	283	junction_1	179	235	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	206	889	17102	15808	FALSE	30	AGCTTTCCTTTTTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISDLYKSLEQKESKIQQLAETVKKFEKEFKQFSQLFGKNGNLLSNIQALASHIDKSAWLEAQVRQLLQMANQQQTKLDLRPLVEAIDTIKQKITTLETNDQILVVLEGQTNKHDAHINIHKAQLNKNEERFKLLEGACYNGKLIWKVTDYKMKKREAVDGHTVSIFSQPFYTSRCGYRLCARAYLNGDGSGKGTHLSLYFVVMRGEFDSLLQWPFRQRVTLMLLDQSGKKNHIMETFKADPNSSSFRRPDGEMNIASGCPRFVAHSTLENAKNTYIKDDTLFLKVAVDVTDLEDL	19018	13626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3780_pilon_-_16386_16996_17166_18876
913163	contig_14536_pilon	-	4898	1	Intergenic	novelGene_69316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACATAGGAAATATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236770	231872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_231900_236800
913165	contig_5317_pilon	+	4052	1	Intergenic	novelGene_76574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	81	317	158476	158712	NA	60	ACTAGTAAAAAGAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDPAISLLGIYPREIRVVTRRDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINQLWYIHTTEYRATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	158395	162447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_158400_162400
913166	contig_19730_pilon	-	6279	6	Intergenic	novelGene_142494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	254	junction_5	123.625887256675	293	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	65	688	175963	152104	FALSE	30	ATCACCCAACCAAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSDNLREILQNVAKLQGVSNMRKLGHLNNFTKLLCDIGHSEEKLGFNYEDIIICLRLALLNEAKEVRAAGLRALRYLIQDSIILQKVLKLKVDYLIARCIDIQQSNEVERTQALRLVRKMITVNASLFPSSVANSLIAVGNDGLQERDRMVRACIAIICELALQNPEVVALRGGLNTILKNVIDCQLSRINEALITTILHLLNHPKTRQYVRADVELEVGTSYSFQF	176027	146512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_152304_155552_155680_159325_159390_163461_163594_164440_164506_175927
913167	contig_3153_pilon	-	4558	17	Intergenic	novelGene_104683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	146	junction_13	67.1430376137392	213	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	136	1728	407184	294494	FALSE	25	TATTTTGCCTTTAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKRSSRASPASASASPPAPVPGGEADHVRAFHKQAFEYISIALRIDEDEKGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVIGQGEPCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLEKLQPVLQFSKSQTDVYNDNTNLTCRNGHLQSESGAVPKRKDPLTHPSNSLPRSKTVTKTGSTSLSGHHRAPSCSGLATVSGVRQGPGPATAIHKGTPKTNRTSKPSSTPPTAGQKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQELAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESSATFFNISAASLTSKYLGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQTAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV	407319	291663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_294617_302677_302719_305883_305955_307190_307271_308828_308872_311036_311117_311333_311426_311663_311740_331542_331615_332327_332403_336638_336733_337192_337330_337884_338073_366753_366850_373045_373130_383893_383978_407027
913168	contig_6743_pilon	-	761	2	Intergenic	novelGene_33542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201563	189577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_190127_201351
913169	contig_19469_pilon	-	3691	14	Intergenic	novelGene_134995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	44.0072613696244	222	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	25	1578	157514	134615	FALSE	15	GGTATTTGTCGCAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGEPNPSASLIDRTIKMRKETEARKVVLAWGLLNVSMAGMIYTEMTGKLISSYYNVTYWPLWYIVVQTTPPHDLAATQIPSSPPSPSIQGQSVLSYSPSRSPSTSPKFTTSCMAGYSPQLQGLSSGSSGSYSPGVTYSPISGYNKLASYSPSSCSSPYPTTVGPVESSGLRSRYRSSPIVYNSPTDKEDYMTDLRTLDTFLRSEEEKQHRVKLGSPDSTSPSTSPTFWNYSRSVGDYAQTLKKFQYQLACRSQAPCANKDEADLSSKQAAEEVWARVTMNRQLLDHMDSWTAKFRNWINETILVPLVQEIESVNTQMRRMGCPELQIGEASITSLKQAALVKAPLIPTLNTIVQYLDLTPNQEYLFERIKELSQGGCMSSFRWNRGGDFKGRKWDTDLPTDSAIIMHVFCTYLDSRLPPHPKYPDGKTFTSQHFVQTPNKPDVTNENVFCIYQSAINAPHYELIYQSHVYSLPKGRNNMFHTLLMFLYIIKTKESGMLGRVNLGLSGVNILWIFGE	158442	132501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_134670_139384_139459_141415_141514_141610_141726_142377_142476_144912_145039_145321_145419_147709_147782_148424_148601_153483_153689_155488_155731_157184_157244_157377_157515_158418
913170	contig_17989_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_150844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTATGGACTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275222	272955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_273000_275200
913171	scaffold_13505_pilon	-	4086	9	Intergenic	novelGene_111523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_5	432.259398394066	23	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	43	1047	603235	596556	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGTYKSLNRLMCFPK	603277	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_596600_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
913172	contig_14513_pilon	-	1185	5	Intergenic	novelGene_70366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1207.97524291684	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	198	614	18880	11982	TRUE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_11587_11705_12158_13087_13136_14952_15001_18735
913173	contig_17144_pilon	-	1191	5	Intergenic	novelGene_29432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	872.33479811366	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	184	903	167982	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168268	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162
913174	contig_8050_pilon	-	1189	2	Intergenic	novelGene_114858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394978	388700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_389823_394911
913175	contig_12948_pilon	-	4189	2	Intergenic	novelGene_126169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGAATGCAGTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171868	109233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_109889_168334
913176	contig_4246_pilon	+	2768	4	Intergenic	novelGene_178565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1117	1698	170950	361990	TRUE	35	AGCAAAGGTGGCACGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHSPSGRSKDGARSQVFEQKEGEVVRGKEEVKRSGKKQHQQPTNGTQGVSQCRWVESKQPVLPSQETVAVGSRGGRVGVKKGGGWESVYRCLLVVLSPAGSSVKLLSCTPYLLVSDRSPRWQIHAALAVRGPLHESLFAVRSLSVFSLRLVLDVLGFQDCCFCMISSCEFILAFCSGIIFLNYSIFCLHFP	169833	363226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4246_pilon_+_171326_267287_267399_361895_362749_362914
913177	contig_6885_pilon	-	2862	2	Intergenic	novelGene_83670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	121	540	523703	210010	FALSE	30	ACAGTCATTCATTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVIKNEVEHVKIDILGISELKWTGIGHFETGNHTVYYSGNGKLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	523823	207687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_210278_523551
913178	contig_7396_pilon	-	2339	16	Intergenic	novelGene_79613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3261.97104967057	664	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	443	1831	255163	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257645	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257294_257381
913179	contig_6102_pilon	-	1483	6	Intergenic	novelGene_32141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	641.110474099433	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	56	457	867239	839854	FALSE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSCRQRGPSTHPPAPFTMQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILYLPEVDGADDNSFRNARPGVRNIVVTGILRKKNNFSAKDFIIERIPELIDLKADDICLL	867294	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_840004_841192_841222_846150_846188_846753_846824_846979_847094_867237
913180	contig_1435_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_115503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGAGTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532403	530362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_530400_532400
913181	contig_11978_pilon	+	2846	12	Intergenic	novelGene_63145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_7	94.0196919764091	38	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	622	1869	424	2292	2023889	2049911	FALSE	50	GAAGTTAACATTACATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDCKPIGSKEEIVTPKEPETSEKETLPPLPTITSPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPLPATPQQPPLPPPQPAFSQVLASSTSTLPTSTHPRTSALSSQTNSQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHSLMDLPLPPELPGGDPSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGIVVEEPPPSKAPRKETTSGTSAEPVKNSSPAPPPQPAPSKVEPGAGDAVGLGDITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSEPVAPEESLKEASPAPVVQPSIEQTTPEISSTPADMQNMLAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNGDKNSGPQGPRRTPTMSQEEAAGKQTGHESH	2023465	2050465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_2023897_2029719_2029897_2030714_2030855_2032205_2032377_2035142_2035333_2040228_2040286_2040680_2040783_2045221_2045300_2046295_2046413_2046729_2046862_2048249_2048465_2049429
913182	contig_15897_pilon	+	4153	1	Intergenic	novelGene_49575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTTATCTTTACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832554	836707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_832600_836700
913183	contig_9931_pilon	+	5246	1	Intergenic	novelGene_134834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	3432	3761	334501	334830	NA	45	AAGGTGAAATTGCAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSRVHSRGFMEQKDFPTLITTAGDFYLCCAEETDIRYIEILEKHSKWTLPVASFLIRLQITICVPVESFLAIWTGLDFQGKILFTHKKKKTRRTLALCMQISGNEDT	331069	336315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_331100_336300
913184	contig_6898_pilon	+	2781	13	Intergenic	novelGene_35687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1697.37304180771	4	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	134	1618	59668	126530	FALSE	30	TAGGAATACTTTACTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALPQISSS	59534	127693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124800_125008_125481_125488_126509
913185	contig_10734_pilon	-	2151	11	Intergenic	novelGene_51283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAACGGTTTCCTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1362884	1339986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1340068_1341844_1342032_1346892_1347012_1347327_1347510_1353326_1353431_1354477_1354613_1355744_1355811_1356734_1356873_1359064_1359203_1361512_1361685_1362055
913186	contig_11309_pilon	-	1666	1	Intergenic	novelGene_149865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACACCTGGCTTTAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57526	55860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_55900_57500
913187	contig_19052_pilon	-	1295	1	Intergenic	novelGene_178930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTTTCACCTAATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113549	112254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19052_pilon_-_112300_113500
913188	contig_2940_pilon	-	3941	2	Intergenic	novelGene_81875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3384	3698	338327	338013	FALSE	75	AAAGCACAAGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLCTNLALSHINQRLHQPETRKTRWYPATTNDHPDREHDREFLMEQEKRRVQNSNSSKKTRLNGLTETRGTPENRAPGLSVNPELKPFLKPTLQTKIRMDYKT	349484	337769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_340503_348276
913189	contig_11525_pilon	-	3545	1	Intergenic	novelGene_171075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	2238	2720	38269	37787	NA	50	TGAAAAGAGAGATAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLTENTERIVEDLLAENFPDIMKNEKISIQDARRTPHKVDSKRKSPRHIIIKPVKTKDKERILRVARDKRKVVYKGESIRLNLDDSAETMQARRQWDDIYKALKEKNSKPRIIHPAKLSLKYDGEIRAFPDKQKFWEFAKTKPKLQEILKGVLRFENQ	40506	36961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_37000_40500
913190	contig_6552_pilon	+	3775	1	Intergenic	novelGene_163591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	392	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTATCCTTTAATTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100734	104509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_100700_104500
913192	contig_19701_pilon	+	8294	2	Intergenic	novelGene_147898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	490	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAACTGTGCTTTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131001	139352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_132103_132159
913193	contig_8616_pilon	+	3383	19	Intergenic	novelGene_72530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	257.086861432061	161	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	342	2420	374090	380253	FALSE	35	GAGATGAACCATACACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHVYGLPEHADSLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPQRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMLDYLQGSGETPQTDVRWMSESGIIDVFLLLGPSVMDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPLTMLERLASKRRKLVTIVDPHIKVDSGYRVHEELRNQGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFNFDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGFYVHMATADGLTLRSGGIERPFVLSRAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISVPMCLSMGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQYHDVIRDALRQRYSLLPFWYTVFYQAHREGVPIMRPLWVLYPQDVTTFSIDDQFLLGDALLVHPVAEAGAHGVQVYLPGQGEVWYDVQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTVVPRWMRVRRSSDCMKEDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPKGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKESPESRLSFQHDPETSVLVVRKPGVNVASDWSIHLR	373490	381216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_373706_373876_373965_374051_374149_374406_374588_375366_375521_375723_375960_376051_376179_376282_376363_376615_376760_376890_376988_377267_377370_377547_377792_378685_378751_378932_379010_379123_379199_379373_379488_379610_379724_379888_379990_380143
913194	contig_7076_pilon	+	2197	2	Intergenic	novelGene_178670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAAGATTTAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40713	60145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7076_pilon_+_41850_59084
913196	contig_5033_pilon	+	1848	3	Intergenic	novelGene_29069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	635	1078	540608	542909	FALSE	70	AAAAAAAAAAAACCACGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHHLDSNFRILVDVVLAHVSQTRPQAVTLLLDMIHQGLDKGGVGPYSNLDVSHQLNAVLTNVPISLWLGLAVGPLLRVEEKGDIGHEGSHHLGHVQFGNLIGLELFLVIQLSQVLLKRLAESESGAYLLRPALVGKEVQLKTLSQE	539973	543679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_540662_542092_542236_542662
913197	contig_4783_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_108354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTTTTATAACAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111104	109109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_109100_111100
913198	contig_3386_pilon	+	3578	1	Intergenic	novelGene_34582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAGCATCCTAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492035	495613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_492000_495600
913199	contig_14017_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_165679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_1	0	76	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	33	521	29686	34756	FALSE	45	GAAAAAAGATTTACAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIKCPLFEHFLKYNYSTAHSAGLTLIWYWTGQDRDLEEPINFRLPENRIIKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTYCSKVAFPLEVVQKDRCFKSSMKLPVRRLYLEHSLQKIICPNVDGFFPSSVKPNVTWYKVSKPEHLLPSLKWQ	29653	36135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_29943_34524
913200	contig_4754_pilon	+	2055	4	Intergenic	novelGene_35900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	95.7635978160108	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTTTACTTTGAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114898	123566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114975_119671_119871_121506_121634_121913
913201	contig_12411_pilon	+	784	1	Intergenic	novelGene_145672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178322	179106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_178300_179100
913203	contig_5196_pilon	+	4393	2	Intergenic	novelGene_38686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3878	4279	227903	362703	FALSE	30	CATATGCATGCGAAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCGLKLGKVCVMVVSFSPYLFNLYAEQIIQEVGLYGEEHSIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTAPISNIMINRENTEVVKHFFLSGSTINTHGGSSQEIK	224025	362817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_228181_362579
913204	contig_610_pilon	-	2649	10	Intergenic	novelGene_76678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	571.137742569736	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	488	1357	68933	32930	FALSE	40	TAGGCAAAAAGAATGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHHLWILLLCLQTWPEATGRDTDILVVNGILGESVTFPINIQESQQVINIAWTSKTSVAFVEPGDSGIAPRVTVTHRNYYERLNVSGQNYNLVISNLRREDAGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDGENQHMWQKTSWDFKL	93795	31637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935_45278_68887_68955_69978_70099_72506_72694_81741_81821_93715
913205	contig_678_pilon	+	3518	23	Intergenic	novelGene_167782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	13	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	406	951	20083	23908	TRUE	40	CCATCCTAGAAAGCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSCLTISTTSTSASMRRWYRKVARSFFIWILLSSSWATVKIRMLHFRHTLCCLRRKGKSMSIPPSCTIHHTSMLPSENCSTLLGKKETFLATRRARWAAVVTRTVPINVFHARASSLWRQPLGQPITTVLCFMPPRPQDWMRWEMPSFSLAATTSWQNPFTFSASIRCFMVCSAAKASP	17508	125639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_17634_19595_19781_19987_20094_20696_20836_21639_21811_22619_22817_23880_24060_25344_25446_26392_26516_28138_28233_29695_29819_30103_30276_31115_31176_31453_31550_31719_31887_32703_32913_35730_35971_36681_36816_37326_37384_38796_38942_39923_40057_41345_41442_125173
913206	contig_15666_pilon	-	1339	5	Intergenic	novelGene_70182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	439.390131318399	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	217	648	108757	107848	FALSE	25	AGGGAAAGTGATGTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQRLWPSSPLFPTAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110645	107156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108103_108198_108579_108821_110179_110246_110558
913207	contig_6958_pilon	+	4857	10	Intergenic	novelGene_70019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	95.1957048517538	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1353	4059	798	4856	797705	811864	FALSE	60	TGAAAGAAAAAGAACAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGDIISSQQEINRLSNEVSRLESEVGHWRHIAQKTTAQGADSSDQSEICKLQSTIKELKQNRSQDIDVHQHEMSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSDAENEIMKLKSLNQDSSLTEDNLKLEKHVQALEKENSLLSQEKEELHISLLKLNSEYEVIKSTATRDMTLDSELNDLRLNLEAKEQELNQSITENKILVAELEELDKQNQEATKHMILMKDQLSKQQNEGDNMISKLKQDIHDEKKRVHQLEDDKMNITKELGVQREKLIQSELALNDLHLTKQKLEDKIEDLVDQLNKLQKNNLNIQKENFELKEHIRQNEEELSSVRNELTQSLGQDSNSNLKDDLLKEREAEVRNLKQDLSEMEQINETLEKVAFDLKMENEKLVLACEDVRHQLEESLADKSQISLEKDTIVEALKLEKGQLEAELCQAEKRLLEKANKYEQTIEELTNARNLNSSALQLEHEHLIKLSQEKDFEISELKKNIEQVNADHQVSKEVLSSSLEEQKQLTQLIKEKEMFIEKLQGRSSELQDELDKYTQALRKSEISRQTIEEKDRSLASMKEENNHLKEELERLREQQSRATPVAEPKSLDVITELESEVSRLNIIKGDLEEEIKHYQKITEDQNQSEMQLLQSVQEQKKEMDEFKYQHEQMNVTHTQLFLEKDEEIKSLQKTVEQIKTQLHEERQDIQTENSDIFQETKVQSLNIENGSEKHDLSKAETERLVKGIKERELEIKLLNEKNISLTKQIDQLSKDEVGKLTQIIQQKDLEIQALHARISSASYTQDVVYLQQQLQTYAMEREQVLAVLSEKTRENSHLKTEYHKMMDIVAAKEAALIKLQDENKKLSARFESSSQDMFRETVQNLSRIIREKDIEIDALSQKCQTLLTVLQTSSTENAVGSVNSNQFEELLQERDKLKQQVKKMEEWKQQVMTTVQNMQHESAQLQEELHQLQAQVSVDSDNNSKLQVDYTGLIQSYEQNETKLKNFGQELAQVQHSIGQLCNTKDLLLGKLDVISPQLSSGSSLSSPSAEPLRASKSDQLSESSKLLQQEIEELRKSLQEKDATIRTLQENNHRLSDSIAATSELGRREHEQTDSEIKQIKEKQDVLQKLLKEKDLLIKAKSDQLLSLNENFTNKANENELLRQAVTNLKERILILEMDICKLKEENEKIIDASRGKETEYQALQETNMKFSMMLREKEFENHTMKEKALAFEQL	782684	811865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_792713_792825_797530_797810_799938_800008_801481_801648_802350_802717_805686_805728_806275_806363_808034_808248_808852
913208	contig_7323_pilon	-	2868	1	Intergenic	novelGene_173210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACACAGAGTCACTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46676	43808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_43800_46700
913209	contig_7058_pilon	-	3276	1	Intergenic	novelGene_136017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGCAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73741	70465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_70500_73700
913210	contig_5317_pilon	-	3320	1	Intergenic	novelGene_76577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	288	659	238259	237888	NA	55	GGCAAAAAAAAAAAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNRLWIRLQILGIPEHLIVLMRNLYVDQEAVVQTEQGNSAWFKVRKCMRQGCILSPYLIDMYAEQVIREAGLSEEEHSIKFGGRLINNLQYGDNTTLLAESEEDLTDEDQRLQLSVWITST	238546	235226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_235200_238500
913211	contig_12410_pilon	-	3333	2	Intergenic	novelGene_167258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27222	23179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_25500_26209
913212	contig_13101_pilon	-	3530	1	Intergenic	novelGene_172777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	2049	2573	72996	72472	NA	25	AGTCTAACATTGTTTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIKEREKKPRKKKCPQGCPCASIQSKGVASKLCDTAQLEGAPMPRKEKENKQTNQNRTNQTNKQKSPRGPTSVAARAGKQFHSHTVFRSLSEEAKMAHGAKYLRERRGRWGDVRKKSKEAEKSNTSSQQNTLRELASAGGWNPSDIGVKLVFPAKRLWLQEAEEAKWG	75044	71514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_71500_75000
913213	contig_3956_pilon	-	1957	2	Intergenic	novelGene_14767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCCTCGCGCGCCCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925325	918877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_919086_923576
913214	contig_990_pilon	-	2396	9	Intergenic	novelGene_76101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	234.310691177334	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1578	2330	1369421	1365428	FALSE	65	CAATAAAATTTAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCATKSPSAIADKVKSPKKLKNLKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNANVKSLQELCHMESKTGNRNSEPQQGNMSLAAPPHSNSSAAVPTYKNSGMAESVYKGNQKKENLSARSVPSSPVERKDKEESMFQVSYPSAFSKLIVSRQVGPLLTSQSWSSR	1376858	1365361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1365591_1365679_1365838_1366036_1366463_1369415_1369589_1370161_1370280_1371538_1371764_1372672_1372848_1373529_1374220_1376656
913215	contig_16098_pilon	-	816	5	Intergenic	novelGene_45924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	830.446378461608	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	187	810	349190	342409	FALSE	20	TGAGTTAAGGGTACCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDEEGPLCCPHPGCPLRAHVICLAEEFLQEEPGQLLPLEGQCPGCKNSLLWGDLIWLRQTGTEEDEEDSELEEVRGGSGPSLLSPAPSSRLPLTSSLVITGTLDRHAGELTPVPLNPHFFFVPLFFTCVQ	349494	342402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_342671_342825_342954_348845_349062_349172_349244_349361
913217	contig_8712_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_58790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTGTTGAGAATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295141	293211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_293200_295100
913218	contig_1596_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_131609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1434	1763	152496	152825	NA	40	AAAAAAATCCTCCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCHVVLASFMTMASGQKRRQHRASGCPLWVPNSHVAQGPASQNCCGVGREERKRHQRRCLEEMHASLKTSQSELNWVWSFCLGGARCAARSPALSREALVTCQAWRV	151062	153109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_151100_153100
913219	contig_4769_pilon	-	6801	3	Intergenic	novelGene_117953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	323	junction_2	110	1072	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1102	3309	1080	4388	382123	375175	FALSE	30	TTTAAAAGAATGTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQLPVNNLGSLRKARKTVKKILSDIGLEYCKEHIEDFKQFEPNDFYLKNTTWEDVGLWDPSLTKNQDYRTKPFCCSACPFSSKFFSAYKSHFRNVHSEDFENRILLNCPYCTFNADKKTLETHIKIFHAPNASAPSSSLSTFKDKNKNDGLKPKQADSVEQAVYYCKKCTYRDPLYEIVRKHIYREHFQHVAAPYIAKAGEKSLNGAVPLGSNTREECSIHCKRCLFMPKSYEALVQHVIEDHERIGYQVTAMIGHTNVVVPRSKPLMLIAPKPQEKKGMGLPPRIGSLASGNVRSLPSQQMVNRLSIPKPNLNSTGVNMMSNVHLQQNNYGVKSVGQGYGVGQSMRLGLGGNAPVSIPQQSQSVKQLLPSGNGRSYGLGSEQRSQAPARYSLQSANASSLSSGQLKSPSLSQSQASRVLGQSSSKPTAAATGPPPANTSSTQKWKICTICNELFPENVYSVHFEKEHKAEKVPAVANYIMKIHNFTSKCLYCNRYLPTDTLLNHMLIHGLSCPYCRSTFNDVEKMAAHMRMVHIDEEMGPKTDSTLSFDLTLQQGSHTNIHLLVTTYNLRDAPAESVAYHAQNTPPVPPKPQPKVQEKADTPVKSSPQAAVPYKKDVGKTLCPLCFSILKGPISDALAHHLRERHQVIQTVHPVEKKLTYKCIHCLGVYTSNMTASTITLHLVHCRGVGKTQNGQDKTNAPSRLNQSPGLAPVKRTYEQMEFPLLKKRKLDEDVDSPAFEEKPEEPVVLALDPKGHEDDSYEARKSFLTKYFNKQPYPTRREIEKLAASLWLWKSDIASHFSNKRKKCVRDCEKYKPGVLLGFNMKELNKVKHEMDFDAEWLFENHDEKDSRVNASKTADKKLNLGKEDDSSSDSFENLEEESNGSGSPFDPVFEVEPKLPNDNPEEHIPKVIPEEDLEAEEKLDQKEENSSKYETIHLTEEPTKLMHDASDSEVDQDDVVEWKDGASPFESGPGSQQVSDFEDNTCEMKPGTWSDESSQSEDARSSKPAAQKKATMQGDGEQLKWKNSSYGKVEGFWSKDQSQWKNASENDERLSNPQIEWQNSTIDSEDGEQFDNMTDGVAEPMHGSLTGVKLSSQQA	383202	372761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_378283_380136_380230_382015
913220	contig_10434_pilon	-	8952	10	Intergenic	novelGene_82043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	251.482763319703	529	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	8098	8883	137443	132856	FALSE	40	GCTCTTTAAACTACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSESDRATLPVVATVFDKLNHEYKRYLDAEQSYTMAVEAGQSRSNPLLKRPVRTQAVVDQSDMYTHVLSVFTDKKEMPHKFVIAVLMEYIRSLNQFQIAVQHYLHELVIKTLVQHNLFYMLHQFLQYHVLSDSKPLACLLLSLESFYPPAHQLSLDMLKRLSTANDEIVEVLLSKHQVLAALRFIRGIGGHDSISARKFLDAAKQTEDNMLFYTIFRFFEQRNQRLRGNPSFTPGEHCEEHVAFFKQVFGDQALMRPTTF	148252	132786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_132936_133784_134011_134095_134165_134264_134370_134777_134856_135201_135322_136831_136939_137442_143887_144005_145589_148181
913221	contig_9363_pilon	-	1928	13	Intergenic	novelGene_6590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	598.022778040733	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	195	1295	759301	754431	FALSE	35	GAAGTGCAAGAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	766199	753797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_766074
913222	scaffold_9100_pilon	+	2306	2	Intergenic	novelGene_83327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	8	589	868447	869028	TRUE	80	TTATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLMIFLEEIVSETTVHLGFMGAPELLTVCPGLKLLTGLLIVLPAETEPLPDCPGPLTDRPGGPEPLAGRRRSCRLLTGRPGPLELPRGLPEPPEPLMGRPGPLELLAGRPGPLVPLTVRLEGFESPAGLLAPLVDRSGPKLELPSWRLDTEPELMVGRAVPVLGRPRAELELLPGCLTPGLFTLLFGVTMSPSLE	868439	870787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_869389_869430
913223	contig_6059_pilon	-	1897	15	Intergenic	novelGene_44868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	3964.09952715929	16	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	365	1804	580626	569146	TRUE	60	AACATTGCAAAATATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSPAVSAESAECVLRDRNTHLLLKKSKKNIKKPFKKPKKNLQKIRVSPAGDFYFFLFLFYKITDIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584875	568152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581011_584684
913224	contig_13037_pilon	-	2841	1	Intergenic	novelGene_155151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTATTGTTTGACCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72211	69370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_69400_72200
913225	contig_2257_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_122507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTCTCTGAGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340204	338446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_338400_340200
913226	contig_9363_pilon	-	1837	9	Intergenic	novelGene_6773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	488.972887157356	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	178	1041	1548961	1506155	FALSE	35	TGCATATATCTTACCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIHRCLRLPH	1549138	1505358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506181_1539053_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
913227	contig_7285_pilon	+	2148	11	Intergenic	novelGene_143389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	458	junction_9	142.226720414977	6	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	84	938	222945	324708	TRUE	40	AACAAAAGGTGTCATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWQGQPVYPITGGFRQPYPSSLSVDTSMSRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	221431	343310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_310159_310244_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_342106
913228	contig_14732_pilon	+	4775	2	Intergenic	novelGene_169706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3227	3571	69371	69715	FALSE	25	GCTATCAGTCGGAACCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRWKEYTKPLYQKELVVVQPFQEVAYDQKPMVLKEEVHAALKGMAKTRPQELTEYQLRCFNKQMQCCKCCLVYAKKFGRQLPGQPTGRGPHLCLFQRKVIQPNAEVVIKQYH	65112	70919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_+_66668_67699
913229	contig_4012_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_176883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623527	625127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4012_pilon_+_623500_625100
913230	contig_5575_pilon	+	2431	2	Intergenic	novelGene_122053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	1418	2179	105403	106164	FALSE	45	GGAAATGGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTNPHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVKEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNSLKVKGWKKIFQANNYQKRAAVAILISDKIDFKTKSTIKDKEAHYITIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTMKREIDSSTIIVGDFNTPFSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTVSQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHETFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFADHYAIKVEINNKKSKEKKINYMETE	4241	106416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_+_5519_105262
913231	contig_4732_pilon	-	2813	1	Intergenic	novelGene_75452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	655	1038	672315	671932	NA	70	GTTAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASSSTKGTCKASSKVATLHLNGTVKAGAATATHGQAHALDPGAQGRAHGRTHALQAVGAHALQAHALETVGAHALQAHALEVVGAHALQASGHAIYHGAHALQASPYTCGHHALHAQAHAVDGRAHALHTRAHALNGLANTVDGRGHTLKAEAHASTHALHTRANAFHGLAHALDAGGHVVEAQRAHALNAGAHALHRAHAVHDQAHALDLGAHAIHSMAQACAHALHASAPNAVNAGAHPLDPGNTASASTWNRAAKHRQVSGVHHARMGPGRRGPCTCPQTKHWQELSPTVIPHSESPQRLVATAKLGSEYVGVLTSFFLLLCHSCNFHDKIQSGKKPLEHLC	672969	670156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_670200_673000
913232	contig_17964_pilon	-	2387	1	Intergenic	novelGene_33898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGTTTAACAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342822	340435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_340400_342800
913233	contig_11855_pilon	-	3494	13	Intergenic	novelGene_66959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2116.96438030969	23	14	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	447	1400	1087425	1079418	TRUE	25	CTAGTCCGTTGTTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKAHKKREDLMIKKVV	1102061	1077218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1079208_1079312_1079454_1080623_1080632_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
913234	contig_9177_pilon	+	2641	3	Intergenic	novelGene_32750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	1550	2527	1241587	1242564	FALSE	5	CTAGCCCTCCGCCTGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGRAYSVFPSGRSRLQAGPRRRLPAPRGCPGRLGNRAARPGTVRAELRKHCWSFGASLRAALPEIADSGAERREIALVLSGWERASNSGWFHSPAGSGSDSEPGPGQQWPRRPRLPGHNVGARLPEGWKPPAPVGVSLRRPAGHTALGFTQGAARPGECQASLSASLPLGSVFDPSASAGSFLSASLSLWSSDLPLQPLYTRLRRLGRSCKELPPWRRWGPGGFRDASAADARADTPASRELAALTPRDPLPSKFPRLTLLLHRWDPEWGQQRRTPLASVSASRLPTPQTPLPSLGGLVRLSFRCLFRDGRRAFPRRGARERG	1230020	1242678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1230191_1235396_1235565_1240375
913235	contig_10732_pilon	+	3201	4	Intergenic	novelGene_114697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	566.366194848056	122	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAGAAAACGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95305	125043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_95458_118293_118377_120070_122517_124523
913236	contig_5031_pilon	+	3490	1	Intergenic	novelGene_133161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	920	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAACAAAAATGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5005	8495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_5000_8500
913237	contig_1369_pilon	+	3310	8	Intergenic	novelGene_176796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	60.367581514909	193	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	278	1768	1116476	1126830	FALSE	20	CTATTGGTATTAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFAFIANPSSTEISSITGNIELNQQTCLLTLRDYNNREKSEGSTDLVQANPKPGALGRKSSQTKKKKKAFNSQKTEQNKTVQYSSDILENASVELFLDANKLSTSITEQVSQRNDSSELELTSVVENTFPAQDTVQTVTVKRKRGKSQPNCALKEHSMSNIASIKNPYELESSGEELDQRYSKAKPMCNTCGKVFSEASSLRRHMRIHKGVKPYVCHLCGKAFTQCNQLKTHVRTHTGEKPYKCELCDKGFAQKCQLVFHSRMHHGEEKPYKCDVCNLQFATSSNLKIHARKHSGEKPYVCDRCGQRFAQASTLTYHVRRHTGEKPYVCDTCGKAFAVSSSLITHSRKHTGEKPYICGICGKSFISSGELNKHFRSHTGERPFICELCGNSYTDIKNLKKHKTKVHSGADKTLDSSAEDHTLSEQDSIQKSPFSETMDVKPSDMTLPLALPLGTEDHHMLLPVTDNQSPTSDTLLRSAVNGYSEPQLIFLQQLY	1108417	1128372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1369_pilon_+_1108452_1109303_1109471_1116399_1117194_1117971_1118132_1119991_1120171_1121546_1121631_1122668_1122756_1126567
913238	contig_8377_pilon	+	2009	19	Intergenic	novelGene_34888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2958.06445987329	4	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1875	135	2009	68257	180503	FALSE	30	ACAAACGTGAGTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNI	21354	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_21452_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
913239	contig_9363_pilon	+	4075	3	Intergenic	novelGene_6493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGACTGCCAGGTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399224	405781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_400132_400274_400460_402798
913240	contig_15866_pilon	-	4418	1	Intergenic	novelGene_63580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATAATAAAAAATCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176376	171958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_172000_176400
913241	contig_8616_pilon	+	3027	5	Intergenic	novelGene_72608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	328.577996828759	21	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1830	1197	3026	460232	464693	FALSE	30	CCAGCCTCAAAGGAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMEKEEEETRELLLPNWQGSGSHGLTIAQRDDGVFVQEVMQNSPLARTGVVKEGDQIVGATIYFDNLQSGEVTQLLNTMGHHTVGLKLHRKGDHSPEPGQTRTHEVFSSFSSEVVLSGDDEEYQRIYTTKIKPRLKSEDGAEEDPGETQSRTITVARRVTAYTVDVTGREGAKDIDISSPEFKIKIPRHELTEISHTDVETQPGKTVIRLPSGSGVVSPTTGSAVDIQAGAISASGPEFQGAGHSKLQATMPGIKVGSPGVNVSAKGLDLGGKGGIQVSGVDISSSPGGGAVSVQGPSLESGGNGKIKIPTMKMPKFGVSTGPEGQVPGVGLSVSAPEFSMGHKGSKPGLTIGANIQAPQLEVSAPSTSIEGFVGKLKGPQITGPSLEGDIGLKGAKPQGSIGVDISAPKVEGSITGPSVEVQAPDVNVHGAGGKLNMPKMKVPKFSLSGSKGEGAGIDVTLPEGEVTLPGVSGDVSLPEVALGGLEGKVKGTKVKTPEMIIQKPKISMQDVDLSLKSPELKGDIKISAPGIQGDVKGPQVAVKGPQVDIEAPSLEGAKLSGPSGKTGTCRISMADVDLNVDISAPDVEIHGPDWNLKMPKMKMPKFSM	458671	464694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_459868_460231_460395_460854_461043_462008_463401_464606
913242	contig_12000_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_43202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTATGAGGATGGTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623203	621102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_621100_623200
913243	contig_20951_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_43140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTAGCTCCATTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341730	339541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_339500_341700
913244	contig_5936_pilon	+	4906	1	Intergenic	novelGene_53538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGGAAAAGAAAATCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35489	40395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_35500_40400
913245	contig_8177_pilon	+	6866	7	Intergenic	novelGene_86500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGGTACTCCCCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39102	60309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_39420_40644_40815_41311_41483_45742_45913_46557_46728_50691_50865_54614
913246	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_93178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657827	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657827	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
913247	contig_6278_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_119804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	429	2338	2766	336577	337005	NA	50	AATTTGAAAACCTAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHPTRTSFDAPKAVLKGPFIAINAHIQKEEKAIIKTLTPQLEQAEREQQKKPSGARRKEIKRIRAELNEIENRKTIERVNKTKSWFFEKINKIDKPLAKLTKEKQEKKQITRVRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSN	334239	337006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_334200_337000
913248	contig_6929_pilon	+	1045	4	Intergenic	novelGene_139409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4020.57826133948	322	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	135	515	127176	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127041	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127242_127703_127787_130707_130975_131821
913249	contig_13481_pilon	-	3109	11	Intergenic	novelGene_119482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_8	22.2180107120327	4	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	1542	2501	1326661	1306097	FALSE	30	AAACTAATGGGCATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGKLIDLAYTPFHAVLKCGHLTADVQVFPRPEPFVVDEEIDPIPKVINTDLEIVGFIDIADISSPPVLSRHLVLPIALNKEGDEVGTGITDDNEDENSANQIAGKIPNFCVLLHGSLKVEGMVAIVQLGPEWHGMLYSQADSKKKSNLMMSLFEPGPEPLPWLGKMAQLGPISDAKENPYGEDDNKSPFPLQPKNKRSYAQNVTVWIKPSGLQTDVQKILRNARKLPEKTQTFYKELNRLRKAALAFGFLDLLKGVADMLERECTLLPDTAHPDAAFQLTHAAQQLKLASTGTSDYAAYEQNITPLQTDFSGSSTERM	1338619	1305488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308656_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1325725_1325869_1326653_1327730_1331083_1331192_1332676_1332961_1338538
913250	contig_2646_pilon	-	4567	41	Intergenic	novelGene_69576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_30	214.788145622611	155	29	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	1401	4040	1461487	1308912	FALSE	5	TGATGCTCCCCCGGCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEVLFHCADRALKKCPEQGKIQVMEQHFQDMVPVIVDYCLVLQRKDLLFSQMYDKLSENSVAKGVFLECLEPYILSDKLVGITPQVMKDLIVHFQDKKLMENVEALIVHMDITSLDIQQVVLMCWENRLYDAMIYVYNRGMNEFISPMEKLFRVITSPLNAGKTLTDEQVVMGNKLLVYISCCLAGRAYPLGDIPEDLVPLVKNQVFEFLIRLHSAEASPEEEIYPYIRTLLHFDTREFLNVLALTFEDFKNDKQAVEYQQRIVDILLKVMVENSDFTPSQVGCLFTFLARQLAKPDNTLFVNRTLFDQVLEFLCSPDDDSRHSERQQVLLELLQAGGIVQFEESRLIRMAEKAEFYQICEFMYEREHQYDKIIDCYLRDPLREEEVFNYIHNILSIPGHSAEEKQAVWQKAMDHIEELVSLKPCKAAELVATHFSEQIETVIKKLQNQILLFKFLRHLLDPREGIHINQELLPISPCITEQFIELLCQFRPTQVIETLQVLESYRLQETIQITQKYQLHEVTAYLLEKKGDIHGAFLITLERLQSKLQGITHEDENTKKDPSLKDVEDTLVETIALCQRNSQNLNQQQREALWFPLLEAMMAPQKLSSSAAPHPYSEALKSMTMQVLNSMAAFIGLPSILQRILQDPVYGKGKLGEIQGLILGMLDTFSYEQTLLETTTNLLNQDLHWSLCHLRASVTRGLNPKQDYCSVCLQQYKRRQEMADEIIVFSCGHLYHSFCLQNKECTLETEGQTRWTCYKCSSGHKGGQLSENSSGIKQGRITPSQVKMSPSCRPAKGDQVAKATSEPVLDPQQIQAFDQLCRLYRGSSRLALLTELSQHRSSESYRPFSGSQSGPAFNSIFQNENFQLHLVPPPVTED	1492731	1308384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1309062_1311718_1311800_1335967_1336019_1350969_1351136_1353740_1353911_1356045_1356127_1367725_1367809_1368142_1368225_1372911_1373016_1375630_1375674_1376638_1376729_1381360_1381509_1395580_1395628_1398953_1399044_1404853_1404953_1405842_1405928_1406702_1406786_1410934_1410992_1412018_1412139_1417987_1418060_1424561_1424682_1425273_1425347_1427216_1427260_1429521_1429574_1431894_1431985_1432732_1432956_1438058_1438106_1461397_1461488_1462692_1462740_1463164_1463254_1464121_1464158_1465150_1465226_1467346_1467518_1471527_1471609_1474912_1475021_1476564_1476625_1476727_1476882_1478147_1478216_1481740_1481828_1482718_1482844_1492432
913251	contig_17144_pilon	-	2680	17	Intergenic	novelGene_29400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1998.78930445251	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1477	2475	170784	166277	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPVS	183405	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_166458_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172622_173391_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
913252	contig_14556_pilon	+	5033	20	Intergenic	novelGene_138525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	305.548596132167	4	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	523	2634	134563	163173	FALSE	10	CCTGATTTTGTGCCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQHKNAEYQRKADHEAEKKRNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQSSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIISRISSLEEDLKNGRSLLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVTQQTLEQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSIFDCDLKQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMSLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLCKELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEEANRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDAQEQLSILKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISSAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSRQLAANKPS	130185	165572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_130262_130435_130528_130750_130986_131381_131489_134550_134711_139779_139941_140333_140519_141523_141594_142703_142808_142969_143157_148074_148169_148267_148363_149315_149496_149682_149852_153089_153161_153808_153898_154311_154391_156136_156399_156488_156703_163169
913253	scaffold_13505_pilon	-	1758	6	Intergenic	novelGene_111533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	322.661060557359	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	3	491	597835	595273	TRUE	5	CCCTCATTTTCTCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	597837	588573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589288_590176_590259_594013_594275_595062_595299_596976_597232_597627
913254	contig_10225_pilon	+	1235	3	Intergenic	novelGene_86865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	510	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	763	1119	47280	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	44830	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_45259_46110_46392_47226
913255	contig_5623_pilon	-	2482	11	Intergenic	novelGene_154841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	361	junction_7	282.304817528855	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	72	923	212514	210901	TRUE	60	TTAAAAAGTGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDGEQAGPGREPTEAFPPSMPVLAWGTPGCDSYGES	212585	206952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424
913256	contig_14683_pilon	-	3352	2	Intergenic	novelGene_166053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAATGCAATAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176338	172802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_174202_174385
913257	contig_16796_pilon	+	2000	2	Intergenic	novelGene_178932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAGCTGCATAGTAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2265	19493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16796_pilon_+_3412_18639
913258	contig_16125_pilon	+	3659	6	Intergenic	novelGene_155265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2723	3046	236051	236374	FALSE	35	CTGAGAGACAGAAGTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAASIFLSSFFPSAFLERLGDPLLAAGFRTTPGKGELDVLPPWSLFSGSSLAGFKGPGLDLAPRGAGGPFCGDTFLVRLSSSWEASVLRDGFWPKAGLGKRGLGS	147477	236987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_148240_148782_148943_151728_153054_155553_155618_179440_179596_235794
913259	contig_2547_pilon	-	2967	15	Intergenic	novelGene_165464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_14	91.4833820082832	107	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	178	1125	455004	420206	FALSE	30	AATGCCCATAGCTTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVARLRGVCHGGGSAAAHSGGRSSLQPRGKKEETTRFWREPASPFLIFSRPLTVDSWTEMHGHGGYDSDFSDEEQCGESSKRKKRTIEDDLLLKKPFQKEKHGKVAHKQVAAELLDREEARNRRFHLIAMDAYQRHKKFVNDYILYYGGKKEDFRRLGENDKTDLDVIRENHRFLWNEEDEMDMTWEKRLAKKYYDKLFKEYCIADLSKYKENKFGFRWRVEKEVISGKGQFFCGNKCCDVKEGLKSWEVNFGYIEHGEKRNALVKLRLCQECSCKLNFHHRKKEVKLKNRKDKTKKDCEESSHKKSRLSSEKETSKKKDKGRSSSKKSEDSINRNSDEEEGASESELWKGPLPETDEKSQEEEFDEYFQDLFL	457313	418363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_-_420249_423244_423324_429422_429462_433504_433624_435592_435636_436801_436916_438887_438934_442963_443049_443837_443922_444971_445049_453095_453142_453269_453366_454927_455005_457002_457073_457206
913261	contig_7919_pilon	+	2240	16	Intergenic	novelGene_28065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	152.384542814844	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	535	1899	1079469	1131662	FALSE	30	TTATTTAGTATACATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYTCLYSKFISDRESRRSLTNSHLEKKKCDEYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLILLTSVTLLSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKLVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNELPSAIKCLMGKEEDFSAWYVDGRFLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFLIVVIYKKFQIPCIVPELNSTISANSTNADVCTPKYVTFNSKTVYALPTIAFAFVCHPSILPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFSMFVMYFLTAIFGYLTFYENVHSDLLHKYQSKDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTKFNLCRHILVTFILLVIINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITSQDGDKGTQRIWAALFLGLGVLFSLVSIPLVIYDWACSSSSGEGH	1036406	1132003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1036493_1068304_1068519_1079234_1079568_1079847_1079964_1113436_1113511_1114965_1115059_1115363_1115446_1116449_1116533_1118753_1118813_1118934_1119052_1120392_1120473_1122282_1122384_1124642_1124762_1125500_1125643_1125751_1125850_1131560
913262	contig_17470_pilon	+	5459	41	Intergenic	novelGene_110469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	288.349266298702	2	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1185	3558	313	3870	53769	81447	TRUE	20	CTGCTTAGCTTGGGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIARKQKLADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRIKAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLNELNQKWESLKSKASQRRQDLEDSLQAQQYFADANEAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIHALREQAQSCRQQVAPMDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELGEKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDLKANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPKDETESKTASPWKSARLMVHTVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDNYGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQAWNSLGKRADERKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLERHQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKEKLDILDQERTDLEKAWFQRRMMLDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEKIAALQSFADQLISAGHYAKEDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDVDEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERGACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEALLASEDYGKDLASVNNLLKKHQLLEADISAHEDRLKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVKDKRDTINGRFQKIKSMAASRRAKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIGKEEIQQRLAQFVEHWKELKQLAAARGQRLDESLEYQQFVANVEEEEAWINEKMTLVASEDYGDTLAAIQGLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCTNGQDLIKQSPRGEHLFKDEGLKWESI	53115	90083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_53305_53645_53890_54085_54209_54764_54983_55804_55898_56208_56344_57611_57761_58846_58907_60084_60284_60863_60969_61418_61443_61955_61992_64182_64231_65164_65257_65607_65753_65836_66019_67629_67730_67882_68081_68185_68333_69020_69125_69295_69459_71520_71653_71908_72047_73069_73175_76238_76448_77264_77386_77636_77759_78136_78270_79627_79722_81385_81546_82226_82304_82984_83195_83604_83902_84382_84496_84990_85009_87600_87656_88113_88311_88455_88510_88596_88744_88834_88920_89845
913263	contig_9571_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_136328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAAAGTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	740160	738902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_738900_740200
913264	contig_16098_pilon	+	4043	1	Intergenic	novelGene_45855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTGACATGTCGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203334	207377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_203300_207400
913265	contig_5889_pilon	-	3179	1	Intergenic	novelGene_133688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGGTGGGCACAGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204944	201765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_201800_204900
913266	contig_10176_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_72736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTATATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261709	262310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_+_261700_262300
913267	contig_6028_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_156574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATGTTTCTCTGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309169	309922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_309200_309900
913268	contig_6691_pilon	+	2898	9	Intergenic	novelGene_60157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	43.4712548703163	8	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	27	977	360462	403257	FALSE	65	AAAAAAAAAGAATTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEIHSRPQSSRPVLLSKIEGHQDTVTAALLIPKEDGVITASEDRTIRVWLKRDSGQYWPSIYHTMASPCSTMAYHHDSRRIFVGQDNGAIMEFHVSEDFNKMNFIKTYPAHQNRVSAIIFSVATEWVISTGHDKCVSWMCTRSGSMLGRHFFTSWASCLQYDFDTQYAFVGDYSGQITLLKLEQNTCSVITTLKGHEGSIACLWWDPVQRLLFSGASDNSIIMWDIGGRKGRTLLLQGHHDRVQSLCYLQLTRQLVSCSSDGGIAVWNMDVNREEAPQWLESDSCQKCEQPFFWNLKQMWDTKTLGLRQVSSQC	360435	405178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_360599_380587_380656_385552_385627_389195_389251_392238_392390_394037_394151_396243_396371_399448_399555_403137
913269	contig_18545_pilon	+	1847	1	Intergenic	novelGene_161885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCAATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281361	283208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_+_281400_283200
913270	contig_3424_pilon	-	1600	2	Intergenic	novelGene_55561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAATAAACACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982433	980750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_980914_980996
913271	contig_678_pilon	+	2589	1	Intergenic	novelGene_167764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	497	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	101	337	6485	6721	NA	10	TTCGCTTCGTTTCTCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLEIDIPFDPAIPVLGIYPREIRVVTQIDIRTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTEEWINKLRYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	6384	8973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_6400_9000
913272	contig_3787_pilon	-	3281	2	Intergenic	novelGene_102431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTAAATTACAGACCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621725	617075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_620222_621590
913273	contig_15248_pilon	-	2660	2	Intergenic	novelGene_149155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1025	1444	152376	151957	TRUE	40	CAGTTCTCCCAAAAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIRETIPFTVASKRIKYLGINLTRDVKDLYSENYKTLLKENKENLNKWKDILCSWGRRLNIVKMSVLPKEICRFNIIPIKIPTAFFTEIEKLILNVMWNGKRPRIAEVMLKEKNKVGGLTLPNFKAYYTAKVIKTAWY	153400	150660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_150855_150934
913274	contig_8160_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_136400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	966	1385	81210	81629	FALSE	70	CATAAATAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHSLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKKIIDLYLS	30737	81774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_30920_80426
913275	contig_11259_pilon	-	2724	8	Intergenic	novelGene_144529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	167.534096438271	103	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	25	531	159043	144277	TRUE	30	TTTATTCAGACTCATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWGWRSAAMLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKASSQESKTASEAESRIFWLGLIMCPVLWVIFAFSALFSFRVKWLVSVKPECLNSPVDT	159067	130598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_131914_133312_133442_139870_139990_143646_144454_147760_147851_153631_153777_155716_155800_159031
913276	contig_16869_pilon	-	2299	9	Intergenic	novelGene_137589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_8	86.5881054187006	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	537	1328	79386	46172	FALSE	45	AATAACTGCGGATATAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFGVIAMFSSFFLLGKTLMQTLAQMMADSSSSYSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSIHNEQVLQVVVPGINLPVNQLTYFFAAVLISGVVHEIGHGIAAIREQVRFNGFGIFLFIIYPGAFVDLFTTHLQLISPVQQLRIFCAGIWHNFVLALLGILALVLLPVILLPFYYTGVGVLITEVAEDSPAIGPRGLFVGDLVTHLQDCPVTNVQDWNECLDTIAYEPQIGYCISAATLQQLSFPVRDWRYLRNKSKLLELN	84046	45200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_46219_51938_52120_53045_53165_65286_65415_67157_67262_79173_79400_80690_80840_82132_82316_83855
913277	contig_16930_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_139158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	383	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAAGCACTATACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114909	116991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16930_pilon_+_114900_117000
913278	contig_9098_pilon	-	4769	2	Intergenic	novelGene_75823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAACAAACATTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324942	317151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_317293_320314
913279	contig_7179_pilon	+	1095	1	Intergenic	novelGene_78117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTCTGTCTGGAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728483	729578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_728500_729600
913280	contig_16098_pilon	-	2906	3	Intergenic	novelGene_45784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	871	junction_1	78	59	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTAGCTCTCTTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34252	31094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679
913281	contig_4151_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_65228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519125	517664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_517700_519100
913282	contig_5961_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_144131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGATCCTCCAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147712	147081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_147100_147700
913284	contig_11413_pilon	-	2399	13	Intergenic	novelGene_103161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	1976	2398	368281	367859	FALSE	10	TGAGTGGGGCCACCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMTRATSSGSRGTSLTGATSVSEDGAKSLTGATSVSEDGATSLTGATSVSEDGATSLTGATSVSGDGAKSLTGATSVSEDEATSLTGATSASEDGATSLTGATSVSGGRAIPLAGVISVSGDAATSLTGATTVSADGVKT	424257	367857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_368531_369196_369320_401249_401348_402176_402396_406038_406228_406836_406895_407018_407313_408830_408946_410819_410913_419493_419573_421704_421819_423789_423982_424105
913285	contig_9177_pilon	+	5202	34	Intergenic	novelGene_32589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.171419825742193	37	74	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	789	1217	2759	3724	TRUE	25	CATGATAGTCTTCACAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWLAWPCTAALAASHKLLVAAATIRAAEIRPWDHCPSSSALAGMAPTFPWATSSRWAADAAFTRALVAAAMDLAASSICSSKFKDSSASLGLARGFSCSSFLAAASMAAAAPRSSFSAMTVGSSGSTHSVPASWPQQPG	1715	25639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2844_2939_3006_3138_3262_3373_3503_3698_3806_13323_13368_13554_13698_13895_14089_14296_14415_14809_15267_15424_15566_15717_15844_16051_16170_16268_16376_16548_16677_17437_17611_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20809_20907_21023_21210_21390_21607_21689_21866_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327_25480_25583
913286	contig_9216_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_163513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTGAGAAGTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620738	620124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_620100_620700
913288	contig_15991_pilon	-	1030	7	Intergenic	novelGene_70928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	20	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	663	1028	101267	100448	FALSE	15	AGCTGCCCTTGCACAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106352	100445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102344_103583_103703_104975_105142_106315
913289	contig_17059_pilon	+	2102	6	Intergenic	novelGene_166074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	26.2190770241822	57	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	294	1277	377667	391557	FALSE	15	GTAAATGGTTTGTGTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIVEDVAVLFSQEEWALLDLAQKTLYRDVMMETFRNLASVVSGNLKNGEKLSSEHIMVRLLKNETWSSMLGEISDQSHGNKDKHENQGRHVRSYPVENHCESNEGNQCGETYSQIPNLTVLKRNPPEANPFEGCECGKASMDHSSHKNQTRSHTGCSTCQCKECGKAFSCLSHLPTPMRTLNGKKPHKRKVCEDFISIATLKTPVTTLSGEKCCERNKCGKAFCSFSSFRTSMTGHNHESIESKTYSCPSSVILHIRSHDRDKPYEYKECGKAFSEATSLTHVRSHCGERPYECKKCGKAFSRPSDLTKHVRTHNGERPYGCKK	375786	392382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_375836_377422_377670_386832_386960_388080_388235_390188_390887_391555
913290	contig_6589_pilon	+	2864	1	Intergenic	novelGene_25836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	610	1191	910243	910824	NA	10	TTTCCTTTTCGAGTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNNTRSIERRWKEYTELLYQKESVTIQTLQEAAYDQDPMVLKEEVQAALKALTKNKRPGTDGIPIEMFQQMDAALEVLIHLCQKIWKTDTWPSSWKRSICVPIPKKDDPTECGNYQTISLISHTSRILLKIIQRWLQQYINRELPEFTLKRGMSLLMSDGSWLKAENIRKTFTCVLLIMQRHLTVWIIANNG	909633	912497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_909600_912500
913291	contig_4689_pilon	-	2333	3	Intergenic	novelGene_165398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_1	8	134	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCCTCTGTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091955	1084175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1085003_1085500_1086743_1091691
913292	contig_16882_pilon	-	5044	4	Intergenic	novelGene_148223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1647	1952	240413	240108	FALSE	20	CATTTCCTCCCAGAAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISLGYIPRSGMAGMYGISISSFLRKCHIIFQNGCIILHSHQQCLRVPISPKPLQHLLFPVFLIHASNAGVRWYLIVVLICISLMANDRKHSLMCLLAT	441730	237015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_240850_325425_325898_422149_422749_441591
913293	contig_9375_pilon	+	2600	1	Intergenic	novelGene_136060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAGTTCATGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303827	306427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_303800_306400
913295	contig_5686_pilon	+	3153	1	Intergenic	novelGene_45485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	1223	1777	239068	239622	NA	40	AGAGACTAACTTGAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPTYKSKMIKIMEEKIGTTLGALIHGINRIRTISNNTEIPEEKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDKSNQRLISKICKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDINMHFAKEDIQAANRYMRKCSQSLAIKRNANQNYSEIPSHPTKASINKKTKTTVRYHFTPTRLALIKNTK	237845	240998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_237800_241000
913296	contig_13481_pilon	+	3424	5	Intergenic	novelGene_119433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1836	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	318	944	928206	928832	TRUE	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETLIINFIWKGKKPRISKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRVENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIILKKTQYLYNKKTNNPIKKWAKEMNTHFTKEDIHMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYYLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWKCKMIQPF	927888	933575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_929173_929284_930854_931824_931909_932718_932881_933250
913297	contig_2932_pilon	-	2527	1	Intergenic	novelGene_47958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1616	1939	325554	325231	NA	45	ACACTCGCTAACACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKLENTERITEDLLTENFPDTMKDEKLIIQETQRTPYRIDPKRKSPRHIMSTLTKTKDKERILRAAGEKRKVTYRGETIRLRFGSNCAARRQWDDRYKTFKEIFG	327169	324642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2932_pilon_-_324600_327200
913299	contig_12969_pilon	-	5523	5	Intergenic	novelGene_61653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	211	1584	358084	356711	TRUE	20	TTATCGCATTGGGTTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTEFNGDGQPFLQDKHEQVYSDNTFPKSPKPISNKSQIINHQRTAKIVNAHVCSECGKAFIKKSQFIDHQMVHTGEKPHRCSMCGKAFSRKYRLIEHQRTHAGLKHYECTECDKIFLKKSQLNIHQKVHMVEKPYICNECGRAFSKKCLLIYHQRTHTGEKPHGCNLCGKAFCTKSSLTTHQKTHTGEKPYICSECGKGYMEKRRLIAHHLTHTGEKPFICNECGKRFTLKNSLIAHQQTHTEEKSYICSECGKGFSMKHCLIRHQRIHTGEKPYICTECGKGFPLRSPLIRHQRTHTGEKPYVCNECGKGFTMKIDLIIHQRIHTAEKPYMCNDCGKGFTVKSRLIEHQRTHTGEKPYLCSECGKGFSAKIRLIGHQRTHTGEKPYICNECGKCFTERSHLNVHRRTHTGEKPYVCNECGKALSGKSVLIAHQRTHTGEKPYVCNECGKGFARKSNLVDHQRSHTGEKSYICGECGKSFSVKRTLIIHQQTHIAEKSYIYNEFEQASKQNALSLYISELILKRNPM	358294	70456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_70888_75372_75429_88661_88716_318613_318842_353540
913300	contig_15047_pilon	-	2427	3	Intergenic	novelGene_52297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	6	72	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	859	1896	131962	129252	FALSE	10	ACCCGTGTCTGGCTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQGTLVNNVRLPRGHRLELSDGDLLTFGPEGPPGTSPSEFYFMFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGNRRGRPRKHPVSAHMAPPAAGGGEPCAAPHCCLPQEETVAWVQCDGCDTWFHVACVGCSIQVAREADFRCPGCRVGIQA	132820	128720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129493_130052_130621_131733
913301	contig_11476_pilon	-	2810	2	Intergenic	novelGene_170501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	106	462	147827	147471	TRUE	30	ATGCTTTCAAACTCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLWSEKMLCNILMLWILLRLALWPNRWSLLENVPSALEKKVYLAAVGWNVQYMSMRSSWLIVAFSSSVFLLSFFPDVLSFTKSGVLKAPTNIVELSISLFSAVGVCFMYSGALLLGA	147932	39197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_40575_146499
913302	contig_7165_pilon	+	2430	6	Intergenic	novelGene_116907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	41.629797020884	142	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	532	2154	1216690	1220946	FALSE	15	AGATGTTTCCTCTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLAARDSIVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTFRAGLLEPEVFHLNPAKSDTDTFKRLIRLVPPSLSWYGAYLVSAYPLDMSQYFRLFNSTRIPKPGRDELFTDDKARHLLVLRKGHFYVFDILDKDGNIVSASEIKAHLKYILSDNSPAPEFPLTYLTSENRDIWAELRQKLVSDSNAETLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGTAAVHFEHAWGDGVAVLRLFNEVFQDSTQNPAVTPQSRPATTDSSVAVQKLSFKLSDALKTGITTAKRKFDETMETLTIDCIQFQRGGKEFLKKQKLSPDSVAQLAFQMAFLRQYGKTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASIFTMRCSEAFVREPSKHSAGELQQLMAECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRYLAAAKGIPLPELYLDPAYGKINHNILSTSTLSSPAVNLGGFAPVVPDGFGIGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAHEFLHCVEKALDDMFDALEGKSIKT	1198220	1221222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1208557_1208639_1210507_1210589_1211668_1211776_1216675_1217981_1220614
913303	contig_5696_pilon	+	3253	17	Intergenic	novelGene_117523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	160.815111230257	176	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	93	2222	439152	482909	FALSE	10	GGTATTTCTGTTGTTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLPESELYFNILQIICYGWELSKFIMSKTFLRPKLSSTKVADWVDPSFDDFSENTNISTTLTASSLGVNNSSYRRKNVPSTLENRFPARKKGKLSSLEQICGLENSKDYLPENEPWVDKYKPETQHELAVHKKKIEEVETWLKAQVLERQPKQGGSILLITGPPGCGKTTTLKILSKEHGIQVQEWINPVLPDFRKDDFKEILSPESSLHIFPYQSQMAVFKEFLLRATKYNKLQMVGDDLRTDKKIILVEDFPNQFYRDSQILHEILRKYVQIGRCPLIFIISDSLSGDNNQRLLFPKEIQEECSISNINFNPVAPTIMMKFLNRIMTIEANKCGGKIIVPDKASLESLCQGCSGDIRSAINSLQFSFSKGEKNLWPRKKGVSSLKSDVMLSKSKRRKKPDGIFENQEIQAVGGKDVSLFLFRALGKILYCKRTSLTELDSHRLPSHLSEYERDTLLIQPEEVVEMSHMPGELFNLYLHQNYIDFFVEIDDLVRASEFLSFADILSGDWNTHSLLREYSTSISTRGVIHSNKARGFAHCQGGGSSFRPLHKPQWFLINKKYRENCLAAKALFSDFCLPSLCLQTQLLPYLVLLTIPMRNQAQISFIQDIGRLPLKRHFGRLKMEALTDREHGMIDPDSGDEVQLNGGQPAEEAQDAPPQTAEPEAWSLPPSQNSGSELPASQPQPFSALGDMEEEDMIIEDYESDET	439059	483940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_439168_440564_440669_442021_442280_442985_443070_450686_450844_452268_452406_459650_459704_459787_459914_460007_460078_464403_464516_466265_466452_467608_467695_467830_467978_469257_469408_470622_470744_480288_480347_482644
913304	contig_12938_pilon	+	3608	6	Intergenic	novelGene_99717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	653.52508750621	63	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1575	1967	80440	80832	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNMYCVHGALIAQWIGKNNVRRQLICPLEAWSLVVGKEYIFLMKQEKAYKGLSRQEQKPPAHVWTSLVVSRVKWEWEENLNLCCEHVSALPQFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	51950	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_81459_83391_83470_84550_84635_85468
913305	contig_9807_pilon	+	2138	16	Intergenic	novelGene_32843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	533.029188277298	23	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	916	1914	140826	158783	FALSE	30	CCACGTGTGGAGCATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	108989	159007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128613_128656_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
913306	contig_12920_pilon	+	2919	3	Intergenic	novelGene_166347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	606	junction_2	25.5	83	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCATATGATAATTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212163	230591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_212844_217526_217679_228504
913307	contig_12701_pilon	-	3042	1	Intergenic	novelGene_169563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCCTCTCCTCCCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65217	62175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_62200_65200
913308	contig_15327_pilon	-	6385	2	Intergenic	novelGene_70505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	91	junction_1	0	371	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	448	975	438445	437918	TRUE	40	CCCAAAAGCAATGCATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLDARAAGAPTPLLPQTLQRVSRCGLEANVPSWRCRSHSSCQCCHFSSSSVKVCVFPGYGETGRGCHGRTTLCVSWRTHLPGLLTLRMGIVLIRSPRTLHVPAEAGLASASLESICRASSSWPCSTKMVTWEDIQDHMHSWETRGPALQRRAGLSPRATLWLSNSSDRQIPVP	438892	432365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_434294_434435
913309	contig_5484_pilon	+	2091	2	Intergenic	novelGene_151097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTATTACAAATAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256883	259154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_257403_257582
913310	contig_15777_pilon	-	3020	1	Intergenic	novelGene_75740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTCTGGTTTTTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204405	201385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_201400_204400
913311	contig_12540_pilon	-	1968	5	Intergenic	novelGene_148126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	285	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	9	512	1253116	1251241	TRUE	40	ATGTGACAATACATATATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSMFLLISSLLKATARGLSHSGALVASGSATRLCSNSQECGGEWGPAPEGPSHSGTRGPKPWCLPSGLQRGVLLEGHSQQAGGRLIQEPAQLPRVWLDQSSRERVLLVVFQDALQNSCLAFSSCHEDDSSGCVQHGKCEGDTLRWWLWGVTDGGHNLLLLLQERVVWEE	1253124	1248829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1249765_1249863_1250309_1251164_1251269_1251603_1251745_1252781
913312	contig_7285_pilon	+	4366	11	Intergenic	novelGene_143384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_10	228.07270770524	179	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	337	1248	220216	324708	TRUE	80	AAAAAATTAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	219879	336705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_220225_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_333593
913313	contig_4783_pilon	-	1957	20	Intergenic	novelGene_108341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	258	junction_11	337.161821953236	41	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1749	207	1955	335593	35764	FALSE	25	GTAAGTATGATGGCCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERILMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFSDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVTLKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQNEGMAQLDSIGFSVIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQETRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDAPLSNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVVSSNANSILNSSSSLQPNMNSSDPDLDVVKPTRPNS	473260	35761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_35916_56452_56592_81553_81714_155408_155515_157883_157943_159655_159744_173638_173714_178145_178212_203798_203836_272584_272664_292845_292941_300778_300880_302093_302224_303697_303803_313098_313210_322707_322810_330045_330118_333871_333934_335583_335680_473140
913314	contig_9177_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_32724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAAAGGGGGTACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615192	616702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_615200_616700
913315	contig_4103_pilon	-	3312	1	Intergenic	novelGene_51870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	497	928	8887	8456	NA	20	CAATGATGTGGGTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLNWFSSLTSLTGADDSVSSSEEGAAKSWNEVVILIHKISSPIDHIVVRGKVLCNRMFDTFLQFCQNVKYREDDWLVLLLLDKVVKERDELRRMSQLKCYKKDLKVATCALKESLTSCSNRADIAKKQTQSFTITVAELQC	9383	6071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_6100_9400
913316	contig_18491_pilon	+	3419	2	Intergenic	novelGene_176624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1258	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGCATGAGCTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32322	36550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_+_35650_36458
913317	contig_709_pilon	+	5552	5	Intergenic	novelGene_57669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	243	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	4816	5370	3935381	3936359	FALSE	70	GAGGCGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVLLGGADIWHPLTAAIKKQSRYFNSSCRSNFHWDGNGRALAPSRNASGMTSSYATMPMAQPCCCRSWWPRARAKVDFPAAGRPQRTQSPSFRGPSLSVPLASSSAFIIPRETRRLETLFPEHCQAAAHAQSPAALLRFLVPNWRNRRVFESKQGCVVPACSEPAPAVPGVQSYVSELLGIS	3926865	3936541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3930886_3931179_3931278_3932354_3932430_3934758_3935494_3935917
913318	contig_16999_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_84993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTGGAGGGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132890	131221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_131200_132900
913319	contig_6576_pilon	+	3446	3	Intergenic	novelGene_42419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	75	1421	1301228	1302574	TRUE	35	TTTCTCCATAACCTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295688	1304669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301225_1303338_1303407
913320	contig_6871_pilon	-	3434	3	Intergenic	novelGene_21549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGAGGAAGTGGTACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137234	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_121977_129786_129841_133938
913321	contig_9578_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_67992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTACTCACCAAGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210567	1208735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1208700_1210600
913322	contig_9752_pilon	-	7550	1	Intergenic	novelGene_122003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	1547	2080	28496	27963	NA	25	TGGCACAGTGGTTAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLPCSALPPPTVNRQRHICFHLAPDTKCLHAEIALHGAWALRYLFESTDILSLHAHFLHPCFPSFLLCLPFFHFEATASNTAISGGRPVMAAQSSEAAWFCETQSLLLGVRKRGVLAELVSRPASKHEVQSEAQELFCSGNAAKTLAGNPNGRRTVCTKVINWEKLLGRCGVGSGR	30042	22492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_22500_30000
913323	contig_12503_pilon	+	2162	2	Intergenic	novelGene_143837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATCTAGCCTTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170953	176793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_+_172867_176544
913324	contig_18829_pilon	+	659	1	Intergenic	novelGene_177704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14626	15285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_+_14600_15300
913325	contig_9436_pilon	-	1978	4	Intergenic	novelGene_60909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	15.3260852434302	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	56	460	418405	417285	TRUE	65	AAAGCCAGAGAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGFACSKNALCALNVVYMLVGLLLIGVAAWGKGLGLVPSIHIIGGVIVVGVFLLFIAVAGLVGAVYHHQVLLFFYMIILGLVFIFQFGISCSCLAINRSKQVRGYPLKYLPPTPPPNSLFSVWLQLPKDQF	418460	415667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9436_pilon_-_416064_416162_417459_417701_417870_418342
913326	contig_12624_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_61084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTGAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886410	883255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_883300_886400
913327	contig_19459_pilon	-	985	8	Intergenic	novelGene_59892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	106	891	16240	7003	FALSE	40	CGATGCTAGCAAGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19069	6908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
913328	contig_10434_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_82023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGTTTACAATTCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115439	113987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_114000_115400
913330	scaffold_12124_pilon	+	3174	12	Intergenic	novelGene_22296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3332.81743418189	11	122	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1203	1982	1508626	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473583	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1477435_1477588_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508119_1508220
913331	contig_7093_pilon	+	2833	1	Intergenic	novelGene_157963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACATGTTTTTTTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40470	43303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_40500_43300
913332	contig_8045_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_35414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAAAAGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163890	161380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_161400_163900
913333	contig_5502_pilon	+	2501	1	Intergenic	novelGene_154985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAAATATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391885	394386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_391900_394400
913334	contig_9668_pilon	-	2296	2	Intergenic	novelGene_58239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGAAACTATATGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584998	581776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_583205_584130
913335	contig_17769_pilon	+	1520	10	Intergenic	novelGene_124269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	107.003057531024	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	308	1375	110839	116700	FALSE	25	TATAGCATGTCTGATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARKNAPCILFIDEIDAIGRKRGRGHLGGQSEQENTLNQMLVEMDGFNSTTNVVVLAGTNRPDILDPALMRPGRFDRQIYIGPPDIKGRSSIFKVHLRPLKLDESLSKDALARKLAALTPGFTGADISNVCNEAALIAARHLSPSVREKHFEQAIERVLGGLEKKTQVLQPSEKTTVAYHEAGHAVVGWFLEHTDPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPREQYLYTREQLFDRMCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKRSPPTRSLWKALAAWRRTRPSPRG	108565	116845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_108716_110387_110527_110820_110975_111900_112009_112757_112884_113496_113608_114697_114814_115333_115535_116111_116307_116625
913336	contig_15407_pilon	+	3119	1	Intergenic	novelGene_123049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1150	1500	335829	336179	NA	35	TATGAGAATTTCTGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDDIYKTLKEKKCQPRKIYPAKLSFKYDGEIRSLPDKQKLRD	334679	337798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_334700_337800
913337	contig_16098_pilon	+	2498	2	Intergenic	novelGene_46246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	222	581	826543	826902	TRUE	45	GAAAAAGTGATGGGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFNNCDKYNKPFIIIFITGKFGPLSIIFYIFLLFLFLPFSFQVLQYLLFSLLPTTPSRELKGLHSVCSAELLMVPLPVLCICHLLCPECPSPFSAWQNPSHPSKSQELSHSFIQMNTY	826321	828872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_827385_827437
913338	contig_10404_pilon	-	769	1	Intergenic	novelGene_138645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGTAGATACCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503037	502268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_502300_503000
913339	contig_16776_pilon	-	3183	3	Intergenic	novelGene_130494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	516	4	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGTCTGCAAACCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39632	34363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_38779_39080
913340	contig_753_pilon	+	5324	23	Intergenic	novelGene_112894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	131.524791051562	348	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1338	4017	50	4066	246568	319276	FALSE	10	CTTGTATGCTTCATTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRPGTGSGGDSAAGAGAGATGGGSFMFPVASGIRPPQAGLMPMQQQGFPLVSVMQPNMQGMMGMNYSSQMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYMGQTSFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQRLLEEERKRRQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKTRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPDCPTSSHSTVTVSPSPAFLDEEEFSDFMQGPVEVPKCGPSSTSQPFQSFHPTTPAGQLHTQKVGAQPLPAGPSLEEKLLVSCDISTSGQERIKLNTSEVEHKALGPASSKNHPSLTASSWGAVNGRVSGATTAEAEKTSDQNRSIESGVGVFPSQDPVQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTVTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFPMTLPTPVSQPTVMPSGPAGSTPLSLGQPVMGINLVGPVGGAAAQASSGFLPTYPANQVIKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFTDFQELPASSKTSNSQQGSSAPSLLIPLPGTKTSASMDKYAVFKGTAADKTSENTVPFGEPGDKYSAFRELEQTAESKSLGESFAEFRCTGTDDGFTDFKTADSISPLELPTKDKTFPASFPSGPVQQKQQTQVKTPLNLADLDLFSSVSCSNEKPVSFSAAFSVSKSIPTRPQPTDSTATTTALASTKTSSLADDFGEFNLFGGYSSPASVGEQDDFADFMAFSNSSVSSEQKADDKYDALKEEISPIPLTSTSGSTVKSVQNAAAAPSKYDVFKQLSLEGSGLGVEELRDCTASGKSDDDFADFHSNKFSSMNSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAAGSGSSSAASVLQKKETPFGSSESITTTSFSKVTTFASEGVLPETTFPAFASFKDGILQTSEQKDYESGNYKDFTSQDLPSAEQSQEVTSPSPASSGASHETPKECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLLANSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLSEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWRRCLGSALDVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLGVVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQELACGVCLLNVDSRSRKEEKPAEEHPKKAFNSDTDNFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLILPDLL	246518	320534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_246645_257421_257463_262704_262827_265306_265438_267401_267508_268241_268354_272793_273004_273981_274213_275337_275416_276273_276471_277118_277368_278530_278665_283985_284105_284315_284379_289135_290084_298928_299385_300688_300853_301710_301765_302270_302368_304404_304554_317594_317706_318057_318094_319144
913341	contig_14563_pilon	-	4237	8	Intergenic	novelGene_135033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	301	junction_3	492.527425943086	58	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	138	1043	82463	65159	FALSE	25	TATAATCCTGTTTGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTVLENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVSTSATDELLSQFKVANFATMEDEEELEERPHKEWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETDDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCASAMQEYEEQLKENASEGKSVSFRDHSKPAICILGFLLLKGSFRIQLYVTLF	83349	61964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_65406_66607_66650_75198_75375_76341_76513_80680_80774_81216_81314_82383_82533_83281
913342	contig_9656_pilon	-	2169	5	Intergenic	novelGene_121933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	987	junction_2	183.995923867894	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	90	656	446594	440889	FALSE	75	AAAAAAAATCAGAAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVRCHRAALFSFPIGVARDWSVRGVRAFAMSVPAFIDISEEDQAAELRAYLKSKGAEISEENSEGGLHVDLAQIIEACDVCLKEDDKDVESVMNSVVSLLLILEPDKQEALIESLCEKLVKFREGERPSLRLQLLSNLFHGMDKNTPVRYTVYCSLIKVAASCGAIQYIPTELDQVRKWISDWTLTTEKKHTLLRLLYEALVDCKKRYSELMNYLTI	446683	439375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_441018_441183_441308_442128_442268_443248_443382_446552
913343	contig_9423_pilon	+	5858	1	Intergenic	novelGene_99167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAGAAGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11231	17089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9423_pilon_+_11200_17100
913344	contig_16411_pilon	+	3047	3	Intergenic	novelGene_77327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3021	junction_1	912	9	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1210	1590	160929	169360	FALSE	70	TTTAAAAAAAAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNRFVRTAIPFTQEPQRDKPANVQPYYLYGSKVSNPAMSYL	159719	170817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_160992_167136_167337_169242
913345	contig_8885_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_115594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	414	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTACAAGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364441	366996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_364400_367000
913346	contig_12923_pilon	+	5781	4	Intergenic	novelGene_30177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTGAAGGCATCTGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319743	329514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_319809_321677_321973_323765_324292_324619
913347	contig_11986_pilon	-	486	4	Intergenic	novelGene_69161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1534	junction_1	26.1321428300262	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	58	339	514917	507353	FALSE	15	TCATCTTGCGTGTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	515289	507205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235
913348	contig_3986_pilon	+	4063	1	Intergenic	novelGene_52728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	411	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	557	931	144914	145288	NA	60	AAATTATATTAAAGACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSEWIKDLNTKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINGIQTIIINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPI	144357	148420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_+_144400_148400
913349	contig_10196_pilon	+	2651	2	Intergenic	novelGene_132349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATGGATTTCGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477287	2481206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2479266_2480533
913350	contig_4486_pilon	+	2160	1	Intergenic	novelGene_38554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148469	150629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_148500_150600
913351	contig_13787_pilon	-	2720	1	Intergenic	novelGene_40626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1829	2200	165280	164909	NA	65	AATCTATAATAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNEENLRIMWDTIKSNNVLVIGVPELGGRGIVENLLAENFSNIMKNKKLTIQGAQRTPYRIDPKRKSPRHIMITLAKTKYKERILRAAWEKGKVTYKREAIRLNSDYSAETMQARRQWDNI	167108	164388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_164400_167100
913352	contig_9579_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_150594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1469	1792	820447	820124	NA	35	TAACCCAGCAACACTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEDELKFSTRSGSKPMLSAPLTKESSTLCGSYPWIRRSLRDVCSWSPELELGKDLPRETMLYIQVKYSSDIYLHSLVIKKKTKNKPAAIESILTHSDSVGQSRTAP	821915	819602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_819600_821900
913353	contig_16532_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_110042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTCTCTGTCAGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171706	170968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_171000_171700
913354	contig_1516_pilon	+	5277	2	Intergenic	novelGene_49937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTGTTGCTGAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147392	152777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_149088_149195
913355	contig_16125_pilon	-	3132	8	Intergenic	novelGene_155259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1177.01734767789	545	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	54	1493	236934	152973	TRUE	40	GTAAGTATAATCAGTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKTCMSYIFYQDMFLLR	236987	144626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_153054_155553_155618_179440_179598_235796
913356	contig_7138_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_120972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATGTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92667	91863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_91900_92700
913357	contig_8138_pilon	+	1899	5	Intergenic	novelGene_52438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	201	740	280295	306697	FALSE	35	TACATACTGCGGAAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKNSVVSSSFSSSLEPSEPFKRLFIFLTLFVFFCFFF	280094	307856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306531_306591
913358	contig_11607_pilon	-	4768	2	Intergenic	novelGene_177217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	138	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1445	1789	35541	35197	TRUE	25	AATTGTATGGCTTCTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSPHQPLQPVPFRHQSGSIQQLPSLLSRNSGLSVPKPISQLLKTPRSLSWELRACQEALPLCLGSGIRVPQTLPLPRPVWADSTPHSFISIKQGIHLQPIFNCSSQGGVADS	36985	8583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11607_pilon_-_9067_32700
913359	contig_10042_pilon	+	1448	8	Intergenic	novelGene_79090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	257.798054171659	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1437	10	1446	6321	50033	FALSE	45	AGTATATGAGGAGCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQK	6311	50035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529
913360	contig_14871_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_63720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAACGCCTGTGGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286155	283321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_283300_286200
913361	contig_610_pilon	-	4299	1	Intergenic	novelGene_76688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGATGACCTTATGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66186	61887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_61900_66200
913362	contig_253_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_129770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTTTTGGTGAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788924	786148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_786100_788900
913363	contig_14525_pilon	-	1949	11	Intergenic	novelGene_149786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCGCAAAGAGGAAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260270	234656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_234736_235512_235778_237243_237366_240415_240735_244875_245068_255507_255752_256129_256235_256780_256954_257387_257577_258440_258553_260121
913364	contig_6137_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_59195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCATGTATGTGCAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1296530	1298795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1296500_1298800
913365	contig_5286_pilon	-	4479	2	Intergenic	novelGene_157322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	487	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTCGTGGGGTTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495216	430235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_430846_491347
913366	contig_20719_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_140573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGGGAAAAAAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62747	59820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_59800_62700
913367	contig_12837_pilon	-	3710	7	Intergenic	novelGene_57289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	430	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACAGCCAAGGTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354140	115838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_116344_302237_302867_310869_311035_329871_330018_338909_339056_339886_340145_352279
913368	contig_960_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_108262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	696	1037	618450	618109	NA	70	GGCAATAATAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNLGLDIADVEQLKNHEEEGELMDQDLMDFEEERNAKEERNNEEKGEKLSKIFIVKRLSEVFSKVNRGLQLLESLGPNADCFAKGNRHIQEAVICYYEIYWGKRKDDTVNSH	619145	617864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_617900_619100
913369	contig_4305_pilon	+	3112	4	Intergenic	novelGene_136643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	345	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGATATTAATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7014	153230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_7555_8204_9694_33297_33656_152505
913370	contig_7594_pilon	-	2189	8	Intergenic	novelGene_55411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_7	77.8606814399008	8	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	65	967	519064	469850	FALSE	30	AAAGGGCTGAGATGGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGRLGFASLLCLSLVFGSLAMAWAAARIGGARGALSARTLLFDLPPTLLGELCAILDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEKYVEQGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQILQEMGHHRAIHLITNHGAALNPSEQSHQGDEFPNISSKETATVTVDNVLIPQRNEKGMLHRSSVSFQNIIEGTKNFHKDFLIGAGEMFEVYRVEIQNRAYAIKLFKQEKKMQCKKQWKKFLSELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCLVYPYMRNGSLFDRLQCVGKTAPLSWHIRISILIGTSKAIRYLHNIEPCSVICGSISR	519128	468627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_469973_472008_472124_477177_477243_481294_481447_483904_483960_484575_484641_500701_500885_518919
913371	contig_5643_pilon	-	1236	11	Intergenic	novelGene_38854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25935	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGGAGAAAAGGAAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238195	233951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_233995_236009_236110_236191_236300_236418_236509_236637_236752_236844_236930_237127_237280_237375_237456_237550_237631_237716_237816_237910
913372	contig_17144_pilon	-	1918	10	Intergenic	novelGene_29383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1723.24980097002	81	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	23	1627	173384	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173406	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305
913373	contig_13894_pilon	-	4739	7	Intergenic	novelGene_62069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_2	46.1254328495198	167	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	1088	1945	296206	294812	FALSE	20	GCTCATGTTTGGTAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRDMYLSGSLYDDLQVVTADHIQLIVPLVLEQNLWSCIPGEDTIMNVPGFFLVRRENPEYFPRGSSYWDRCVVGGYLSPKTVADTFEKVVAGSINWPAIGSLLDYVIRPAPPPEALTLEVQYEHDKHLVIDFLPSVTLGDTVLVARPHRLAQYDNLWRLSLRPAETARLRALDQADSGCRSLCLKILKAICKSTPALGHLTASQLTNVILHLAQEEADWSPDVLADRFLEALRGLISYLEAGVLPSVLNPKVNLFTELTPEEIDELGYTLYCSLSEPEVLLQM	308788	292017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_295619_296155_296333_296627_296807_300214_300366_301643_301813_306248_306605_308682
913374	contig_10103_pilon	-	1824	6	Intergenic	novelGene_86173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_2	37.4667852904409	13	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	124	1650	686830	672305	FALSE	40	ACACTAATTTCATTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYLCLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVVERNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDGSSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESNMPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPTVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLNYIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM	694513	672130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_673256_683709_683874_684193_684353_685338_685526_686764_686857_694416
913375	contig_6410_pilon	+	1789	4	Intergenic	novelGene_108634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	163.658859284251	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTGCTGTTGTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306703	314655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_306947_310261_310369_312966_314117_314366
913377	contig_13593_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_156131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGAAAACATCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79303	77497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_77500_79300
913378	contig_5039_pilon	-	3604	2	Intergenic	novelGene_64871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1239	1544	387995	387690	TRUE	30	AAATCTTCTCTCAGAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGEEIQKEERKSRPREDSRPQHLHSPLAFTPHPLVPNVKNKQREPPLLEMCLTRPSLSQTGVRLGLTRGQHLQYWSQPWEPRTCRNPPVMPLQPARDSTI	389233	381264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_382658_387022
913379	contig_753_pilon	+	1336	1	Intergenic	novelGene_112950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCCCATGAGGGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825091	826427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_825100_826400
913380	contig_6842_pilon	-	2476	10	Intergenic	novelGene_130727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_2	17.344725600967	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	116	946	536822	529944	TRUE	65	TAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRANSKCEGPGTDRGYSLLAPAGRCDPSGPRHLRLPAMETSVLKQQQQQPAAATSRNLPWVEKYRPQTLNDLISHQDILSTIQKFISEDRLPHLLLYGPPGTGKTSTILACAKQLYKDKEFGSMVLELNASDDRGIDIVRGPILSFASTRTIFKKGFKLVILDEADAMTQDAQNALRRVIEKFTENTRFCLICNYLSKIIPALQSRCTRFRFGPLTPELMVPRLEHVVEEEKVDISEDGMKALVTLSSGDMRRALNILQSTNMAFGKVTEETVYTCTGHPLKSDIANILDWMLNQDFTTAYRSILCCALLTVY	536937	526255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_527152_528255_528311_529364_530109_530509_530592_531310_531471_532659_532734_533361_533442_534598_534736_535005_535071_536754
913382	contig_11563_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_142305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACCCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211926	213867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_211900_213900
913383	contig_6477_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_154188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	744	1043	774048	774347	NA	70	GATAAAATATATATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVGEGVSEGWSLGSWGVRAGRQGRIDESCFLTIPHACWHGEVTGGAWAGSAGLAASPDSPCPCGRKPVIFTPPSEDRVCLQLHSPLPLLPCSLICSC	773304	775560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_773300_775600
913384	contig_4732_pilon	-	2400	1	Intergenic	novelGene_75462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTGCTCTTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698585	696185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_696200_698600
913385	contig_11816_pilon	-	1035	11	Intergenic	novelGene_98596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	140.170753012174	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	544	1035	1436893	1415542	FALSE	55	GAAAAACAGCTACAACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPFKISCEAEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLF	1504495	1415541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1415584_1415675_1415754_1418076_1418144_1427539_1427683_1428832_1428893_1434444_1434517_1436863_1436903_1438840_1438937_1442048_1442126_1454938_1455240_1504435
913386	contig_15327_pilon	-	1024	4	Intergenic	novelGene_70658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2497.06601167584	84	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901187_901406_901536_902035
913387	contig_13244_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_86911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTTCCTCGCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179125	177722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_177700_179100
913388	contig_6189_pilon	+	3553	1	Intergenic	novelGene_164966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTTGTTGTTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215721	219274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_215700_219300
913390	contig_11855_pilon	+	1479	4	Intergenic	novelGene_67055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	50	junction_3	109.137018874848	200	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	110	571	2002362	2007496	TRUE	25	GCATGAGGTTCTGTTAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDIPDGHRAPAPPQSSSCDPSLLPLEPGNLASSPSMPLASPQPSGCASHEEHRGAVEELASIPSDKASSPGHPAFLEEGSPSPVLAFAASPRPNHSYVFKREPPEGCERVRVFEEATSPGPDLTFLTSCPDKNKVHFNPTGSAFCPVNLMKPLFPSMGFIFRNCPSSPGSPLPPDQPQATSSEGSRGL	2002252	2008515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2002456_2004013_2004165_2007279_2008136_2008246
913391	contig_2716_pilon	+	3994	8	Intergenic	novelGene_173561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	63	392	874888	875217	TRUE	25	TTTGCATTCAGGCAACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATALLSAQSPSSRDQHCDPSMVPFLKVIIQQPGGGLITLDHFHHGEANILFLLEQTLTLDMNLPSLHRTLLPKLPSPDLQNALSTIMVYHTTSLQIKELTSQQMKCSNGPMLMESTGLTMFPIILKQLA	874825	914188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_+_877674_879324_879467_885311_885504_888598_888741_892560_892739_893873_894035_896837_896988_914007
913392	contig_13055_pilon	-	2313	9	Intergenic	novelGene_104954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	61.6723955672228	14	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	783	1667	119291	88287	FALSE	15	CAGTGCTTTGGTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDVEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHIRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGPQITYVTGVEGEDVVSAQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQVKQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD	140058	87640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_88364_89890_90042_103038_103188_106943_107172_112066_112247_115852_115940_119278_119368_138770_138846_139427
913393	contig_5302_pilon	-	2576	9	Intergenic	novelGene_81447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	710.044496845092	1	110	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	326	910	185066	177300	FALSE	30	GTACTGTTAATGCATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209572	175633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209418
913394	contig_9705_pilon	-	5175	8	Intergenic	novelGene_41738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	188.765700793122	200	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	281	1774	311917	295287	FALSE	45	CTTTTTTAAAAACTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSFERSKTFAPADINKDEEFVEEFNRLKTFANFPSSSPVSASTLARAGFLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYFENNAAQPTNPGAQNGQYKVEKYPGNRNHFVLERPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPEMCSEEARLKSFHNWPEYAHLTPRELASAGLYYTGIDDQVQCFCCGGKLKNWEPCDHAWSEHRRHFPNCFFVLGRNVNTRSESDVLSSDRNFPNSTNSPRNPAMADYEARIMTFGTWIYSVNKERLARAGFYALGEDDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHDYINNIHLTHSLEESLARTAEKTPSLTKRIDDTIFQNPMIQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQTSGSNYKSFEALIADLVSAQKDNAQDESSQTSLQKEISTEEQLRLLQEEKLCKICMDRNIAVVFIPCGHLVTCKQCAEAVDRCPMCYTVITFKQKIFMS	341146	291885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_295481_302377_302579_307358_307402_308757_308837_309839_309940_311040_311949_340660_340787_341023
913395	contig_16211_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_150092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTTGAGAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187613	189815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_187600_189800
913396	contig_15775_pilon	+	1004	6	Intergenic	novelGene_148359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	213.551305310925	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGGTAATCTTTACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157	6183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_340_409_491_1829_1945_4617_4641_4989_5140_5730
913397	contig_10940_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_49210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTGGGAATTCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832532	831467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_831500_832500
913398	contig_5023_pilon	-	4021	2	Intergenic	novelGene_7166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	579	995	562590	562174	TRUE	50	TATGTATATATAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLFSHSLAGYKSKFRATAPREHFFCQLWRKVRVINLPLVWELLCSGTSGPKDAFCSQHCFLGSIRFSCVSACFFYISKETGLRHNLADLISITATSPSHYIIVIEFTTHKEIISDYRMVHNHTILGIMIQPS	563168	412275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_412858_559729
913399	contig_8447_pilon	-	3400	12	Intergenic	novelGene_69390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2078	2482	54631	44867	TRUE	35	TCTGGAAAGAGAGGAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLLHLLYLLLLLTLQVLQLCVKVLLLGIDFLFETFMHLLQLQLMLAAQLGLVPMFFFLEQPELSEFLAPEGNLISSSFFSSSLMILEVVMLTSTPSTTNLRVRLRVLLCSFESLMDREPVSLFRDRSAEREVL	67442	5775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_5921_21254_21329_22347_22550_23216_23292_40688_40826_44382_44641_44839_44929_48348_48477_53956_54088_54547_54726_61156_61252_65554
913400	contig_5967_pilon	-	2052	1	Intergenic	novelGene_44402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCACGCGAACCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416377	414325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_414300_416400
913401	contig_6058_pilon	-	2122	9	Intergenic	novelGene_172368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_4	67.9585121599936	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	170	937	255318	242770	TRUE	0	CCCTGTGTGCTCGGCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVEKTTNRSEQKSRKFLKSLIRKQPQELLLVIGTGVSAAVAPGIPALCSWRGCIEAVIEAAEQLEVLHPGDIAEFRRKMTKDRDLLVVAHDLIRKMSPRTGDTKPNFFQDCLMEIFDNLEQHIQNPLVLQCILSLMERGTMVLTTNYDNLLEIFGQQQSRPMESLDLKDKSKVLQWARGHIRYGVLHIHGLYTDPCGMVLDPSGYKDVTQDPEVMATCRTSPCRSADSAAQMRTVWTAPHFWVTHVRTVQRGS	259138	238060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_239198_242721_242806_243703_243737_245311_245360_246881_247011_249235_249458_254038_254292_255271_255328_258978
913402	contig_9705_pilon	+	1843	2	Intergenic	novelGene_41730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATAACAGTTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222171	225978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_223453_225416
913403	contig_4213_pilon	+	2124	1	Intergenic	novelGene_124823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGGAATGGGCATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153671	155795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_153700_155800
913404	contig_10801_pilon	+	8222	4	Intergenic	novelGene_74038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	135	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2799	3197	264743	265141	TRUE	55	CTCAACAAGAGAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRLCTFIFSSLKNTEFYLKTFSSCNISPSLSPCGTVVKHLPANRKVSSLNPPVTPRVKDVAVCFRKDLQPLRKAPAVESAPIVSILPTSLCSPIALASETNRMYLSGGQLGLACPASGRYRGLLTEVSAC	261944	413262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_268620_402604_403274_408829_409146_412700
913405	contig_9319_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_154635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	133	junction_1	0	59	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATGAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37746	44844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_38127_43253
913406	contig_5649_pilon	-	2193	2	Intergenic	novelGene_82449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTCTTTTTCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514272	1509819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1511361_1513620
913407	contig_10331_pilon	+	3013	1	Intergenic	novelGene_54153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTAGTATACCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450794	453807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_450800_453800
913408	contig_6327_pilon	-	2921	12	Intergenic	novelGene_147477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGCGACGACGAAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59529	17068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_17230_20373_20478_21487_21690_24027_24195_29407_30714_33668_33855_44194_44526_45809_45922_49723_49774_56656_56761_57606_57769_59493
913409	contig_8663_pilon	+	1599	2	Intergenic	novelGene_58007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	95936	96332	FALSE	25	CCAAAGTTTCGTTTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMPLVVFCGLPYSGKSRRAEELRGALAAEGRVVYVVDDAAVLGAEDATVYADSAREKALRGALRASVERRLSRQDVVILDSLNYIKGFRYELWRARRRSGAGKLM	95932	97613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_+_96208_96289
913410	contig_15108_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_131196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGGTGAGCTCAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172971	171388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_171400_173000
913411	contig_6215_pilon	+	4079	6	Intergenic	novelGene_21221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACAGCGCCTTTCTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226907	243071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_228220_231690_231760_231861_234147_235190_235361_238588_238755_242994
913412	contig_11396_pilon	+	3728	7	Intergenic	novelGene_71378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_2	157.789680693426	136	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	303	1997	1074136	1082325	FALSE	35	TCTCAAATTCCCAGCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKPGQPGKESSGMDDKGDPSSDEAPKAIKPTSKEFRKTWGFRRTTIAKREGAGDAEADSLEQVPQPPQQSLSLRRSGRQPKRTERVEEFLTTVRRRGRKSVPASLEDSAELTSCPVTDVETASEGSVESTSEIKGGPKSGAPDVKERPTSSEKAKGGDEEDDTSDSDSDGLTLKELQNRLRRKREQEPTDRPLKGVQNRLRKKRREEDPTETVDVEAGDAVESPPPSKPEPEADQVAVFQVARDDKESKPEGRAAQGLKEEEPRESIKHKPECEVYDPSALYCLCRQPHNNRFMICCDRCEEWFHGDCVGISEARGRLLERNGEDYICPNCTILQVQDETNSETTDQQDPKCRHGDADGTDFTSIGIVEQKSSEDQGIKGRIEKAANPSGKKKLKIFQPVVEAPGASKCIGPGCCNVAQPDSVYCSSDCILKHAAATMKFLSSGKEPKPRLKEKLKTKPEKLSLPKCTVQAGIKISSMHKRPAPDKKENIVKKTVVAPSRSDAPVTETTPGSSTPSWASDHNYNAVKPEKTAALPVSLLCKCMYLLELSLVGPSRGPFPFSA	1061077	1084056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_1061113_1072807_1073003_1074063_1074176_1075158_1076000_1076764_1077087_1080463_1080677_1082046
913413	contig_2365_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_103745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTATTTTCTCTAATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187058	186198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_186200_187100
913414	contig_8594_pilon	-	3292	7	Intergenic	novelGene_140007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	216	521	188273	187968	TRUE	5	CCCTCGGCCCAGGTCGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEAMGWGNVAVETAFLGFPASFWLVLTGGVNKLLMEVIGDKGCGLALLAFDNDAIVLLKTGLGSWAETVPVELTRTDVKEEFTFAVCGRDEQSCSVPFC	188488	83136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_83206_106423_106625_124863_126289_136961_137038_180566_180682_184914_185101_187268
913415	contig_10642_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_78709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	362	1086	1281	2366	858068	856983	NA	20	ATACTCTTCTGTTAGCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIMTFCRLSDPCSSRWDERSLSQRSRSWSYNGYHSDLSTARHSDGHHKKRRKERKVKHKKKAKKQKHCRRHKQTKKRTVIVPSDVESSKSSTRQTKFSCDRERRSRSSSLSSRHSSRRDWSKSDKDNQSSSTHSSRDSYRSKSHSRSYSRGSSRSRTASRSSSHSRSRSKSRSSSKSGHQRTASKSPRTASQLSENKPVKTEPLRVTVPQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSRWKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTDLLPTQSAYSLANVKETGSSSSYHKREKHPESDRSAYSKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSHSLVSSHSRSRSPSSRSHSRNKYSDHSEYSRSS	859348	856980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_857000_859300
913416	contig_10252_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_162918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACATTTTCAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126312	128454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_126300_128500
913417	contig_3612_pilon	+	3943	7	Intergenic	novelGene_87826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	101.629501403655	6	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	193	921	955615	965834	TRUE	25	TTTAGTCTAAGATGCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETESNQFLMTSSQYPKEVVRKRQNSARNCRESDSSGFSRKSFKLDYRLEEDVTKSKRGKDGRFVNPWPTWKNLSIPNVLRWLIMEKDHSSIPCSKEELDKELPVLKPYFIDDPDEAGVREAGLRVTWLGHATVMVEMDELIFLTDPIFSHRASPLQWMGPKRFRHPPCAISDLPPIDAVLISHNHYDHLDYNSVIALNERFGNELRWFVPLGLLDWMQKCGCEDVIELCLHLPSTGVRGL	932560	980750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_932626_953607_953719_955598_955909_965350_965745_965793_965998_969734_969850_978006
913418	contig_6434_pilon	+	4356	6	Intergenic	novelGene_61912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1551.19920061867	132	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	2477	3076	927389	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	924912	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
913419	contig_6059_pilon	-	2444	7	Intergenic	novelGene_44846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	3166.50799602478	86	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	482	1330	573432	569817	TRUE	30	CTTAAACCGTGCACATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVI	573913	567802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
913420	contig_10082_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_63901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	253	633	489688	489308	NA	25	GTCTTGTTTGCCAGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSFLLKNKTQKTPVQNSGGGPALPQGLNIKRGTSENRQKKKQDIKTRPHATSRVVVAGAEASPAPAAQQHHLGRMRWSTTPSSSSSSMKGSTCSHTWVGDTCRRKVGRSEGPQHSVPGRFWVVR	489940	488006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_488000_489900
913421	contig_18081_pilon	+	1589	2	Intergenic	novelGene_23794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGGGCCCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111709	113336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_111923_111960
913422	contig_4232_pilon	+	2690	4	Intergenic	novelGene_63428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	846	1208	507089	507451	TRUE	75	CAACCAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMECISINILGISELKWTSIGHFKLENHRVYYAGNDKLKRNGFSFIIKKNISRSILKYNAVSNRIISISLQGRQVNTSIIQIYAPTTKAKGEEIEVFYQLLQSQIDQTCNQDALTITGD	493077	511870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_493183_495615_496135_506867_508689_511625
913423	contig_16594_pilon	+	3113	11	Intergenic	novelGene_53848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTCAGACGTTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118435	273989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124270_124967_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165648_239220_239785_242309_242430_272662
913425	contig_5979_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_178445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	987	1352	427258	426893	NA	50	GGAGCAGCAGCAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	428244	426487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5979_pilon_-_426500_428200
913426	contig_8412_pilon	+	3033	1	Intergenic	novelGene_118378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643360	646393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_643400_646400
913427	contig_21208_pilon	+	1659	1	Intergenic	novelGene_175779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72220	73879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_72200_73900
913428	contig_9527_pilon	+	2472	1	Intergenic	novelGene_134087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	779	1159	505224	505604	NA	25	GTGGGGAGTTTTATGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASYQRRSQARLSLAPGLSPKALSFLSLWAGKPTALSPAARYLLAPLLTVFRVTACSHSLDLLLPGTSQLRDPGSKEHTLLLVALDDVGSSSLLWNWLSFKAKLTSPLGGPQLPYRTGPPCHLGGS	504445	506917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_504400_506900
913429	contig_1435_pilon	+	4223	1	Intergenic	novelGene_115489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCCAGCATAAGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487365	491588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_487400_491600
913430	contig_13823_pilon	+	1074	2	Intergenic	novelGene_145247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAAACCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129017	131795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_129698_131401
913431	contig_19402_pilon	-	5335	3	Intergenic	novelGene_80838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAGTACAATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146711	140115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_143058_143796_145888_146409
913433	contig_6102_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_32344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTGAATTAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689287	1686231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1686200_1689300
913434	contig_18208_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_176199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATATGCCAGAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154813	154387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_154400_154800
913435	contig_7457_pilon	+	2471	9	Intergenic	novelGene_31385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_4	62.9801556047617	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	38	1438	446391	463076	FALSE	30	CTGCTGCTAGTAAAATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEPEGVAAAPGPSSGPTFRGRRALSGSWERDQQVEAAQRVLVEVLGPYEPLLSRVQAALVWERPARSALWCLGLNAAFWFFALTSLRLVFLLAFGLMIIVCIDQWKNKIWPEIRVPRPDALDNESWGFAHPRLLSVPELCHHVAEVWVSGTIFIRNLLLFKKQNPGKFCLLSCGILTSLAILGRYIPGLLLSYLMLVTVMMWPLAVYHRLWDRAYVRLKPALQRLDFSVRGYMMSRQRERQLHRRGLHREHAVDNHSDSEEELAAFCPQLDDSTVARELAITDSEHSDAEVSCTDNGTFNLSRGQTPLTEGSEDLDGHSDPEESFARDLPDFPSINVDPPGLDDEDDTSIGMPNLMYRSPPGAEEPQAPPASRDEAALPGLLLGALPAGSNLTSNLASLVSQGMIQLALSGASQPGPSGPAPRRATRGFLQAPSSDLDTDAEGDDFELLDQSELNQLDPASSRSH	446353	464109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_446630_455291_455399_456967_456999_457906_458034_458669_458755_459596_459735_460798_460882_462074_462208_462618
913436	contig_16496_pilon	-	1529	2	Intergenic	novelGene_5204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	59	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
913437	contig_753_pilon	+	4704	22	Intergenic	novelGene_112892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	128.687742801684	336	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1372	4119	50	4168	246568	319276	FALSE	30	TGATTAAACTGATGCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRPGTGSGGDSAAGAGAGATGGGSFMFPVASGIRPPQAGLMPMQQQGFPLVSVMQPNMQGMMGMNYSSQMSQGPIAMQAGIPMGPMPAAGMPYMGQTSFLGMRPPGPQYTPDMQKQFAEEQQKRFEQQQRLLEEERKRRQFEEQKQKLRLLSSVKPKTGEKTRDDALEAIKGNLDGFSRDAKMHPTPASHPKKPDCPTSSHSTVTVSPSPAFLDEEEFSDFMQGPVEVPKCGPSSTSQPFQSFHPTTPAGQLHTQKVGAQPLPAGPSLEEKLLVSCDISTSGQERIKLNTSEVEHKALGPASSKNHPSLTASSWGAVNGRVSGATTAEAEKTSDQNRSIESGVGVFPSQDPVQPRMPPWIYNESLVPDAYKKILETTVTPTGIDTAKLYPILMSSGLPRETLGQIWALANRTTPGKLTKEELYTVLAMIAVTQRGVPAMSPDALNQFPAAPIPTLSGFPMTLPTPVSQPTVMPSGPAGSTPLSLGQPVMGINLVGPVGGAAAQASSGFLPTYPANQVIKPEEDDFQDFQDASKSGSLDDSFTDFQELPASSKTSNSQQGSSAPSLLIPLPGTKTSASMDKYAVFKGTAADKTSENTVPFGEPGDKYSAFRELEQTAESKSLGESFAEFRCTGTDDGFTDFKTADSISPLELPTKDKTFPASFPSGPVQQKQQTQVKTPLNLADLDLFSSVSCSNEKPVSFSAAFSVSKSIPTRPQPTDSTATTTALASTKTSSLADDFGEFNLFGGYSSPASVGEQDDFADFMAFSNSSVSSEQKADDKYDALKEEISPIPLTSTSGSTVKSVQNAAAAPSKYDVFKQLSLEGSGLGVEELRDCTASGKSDDDFADFHSNKFSSMNSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAADIEDLKYAAFGTYSSNFAVSSLTSYDWSDRDDASQGRKLSPFVLSAGSGSSSAASVLQKKETPFGSSESITTTSFSKVTTFASEGVLPETTFPAFASFKDGILQTSEQKDYESGNYKDFTSQDLPSAEQSQEVTSPSPASSGASHETPKECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLLANSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLSEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWRRCLGSALDVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLGVVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQELACGVCLLNVDSRSRAFNSDTDNFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLILPDLL	246518	319812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_246645_257421_257463_262704_262827_265306_265438_267401_267508_268241_268354_272793_273004_273981_274213_275337_275416_276273_276471_277118_277368_278530_278665_283985_284105_284315_284379_289135_290084_298790_299385_300688_300853_301710_301765_302270_302368_304404_304554_317594_317706_319144
913438	contig_11256_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_150885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAAACAGGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_0_1700
913439	contig_6028_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_156605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAGAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384393	386685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_384400_386700
913440	contig_9471_pilon	-	2702	6	Intergenic	novelGene_21826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417406	412451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_415729_416213_416271_416934_417026_417150
913441	contig_10749_pilon	-	1703	16	Intergenic	novelGene_133458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_13	1237.94544126773	8	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	540	1535	155250	136250	FALSE	15	TTTCTCTGTTCAGCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	169052	136081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_167011_167395_168302_168346_169012
913442	contig_6364_pilon	-	2662	4	Intergenic	novelGene_51808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.709270666846	7	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATACCTTTCATTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489238	1472653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1474912_1481681_1481810_1487048_1487142_1489055
913443	contig_16211_pilon	-	2461	9	Intergenic	novelGene_150065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_7	323.081815296064	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	448	858	91808	87602	TRUE	60	GGAAAGAGTGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLK	121222	79961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80505_85311_85427_86272_87785_87912_88078_91745_91862_92147_92272_97474_97609_121086
913444	contig_8260_pilon	-	4819	1	Intergenic	novelGene_163268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGACTCCCTAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534383	529564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_529600_534400
913445	contig_15867_pilon	-	3708	13	Intergenic	novelGene_170903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	85.2005803318786	549	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	129	1313	292187	266482	FALSE	25	TCAATGAGCTTAGATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDLERVNQTLKDEYDALQITFTALEEKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQEANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVLPDETSEQAEETSPVRAISRAATRRSVSSPPVPPDNMDSHPGSSKDVRVPATALYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGDKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCIKTVFAGSICNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREMELLGKVTALDLNPERTELLSCSRDDLLKIIDLRKNVVRQSFSAPGFKCSSDWTRAVFSPDGSFVTAGSAEGSLYVWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVSVDKGSKAVLWSDY	292315	264086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_266576_267613_267716_268416_268465_268577_268728_269505_269612_269872_269994_276046_276119_277272_277344_279096_279203_281340_281444_282977_283065_286507_286574_292128
913446	contig_6059_pilon	+	995	8	Intergenic	novelGene_44871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACCCTCCATCATAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568176	573421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165
913447	contig_1450_pilon	+	2713	21	Intergenic	novelGene_27393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	508.728461460532	2	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	93	2105	308979	351400	TRUE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENLL	308886	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351332_351390_351414_352392_352474_354170_354330_355589
913448	contig_5201_pilon	-	1940	3	Intergenic	novelGene_82178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCCTTTGGCCATTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291144	287313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_287390_288465_288538_289352
913449	SIRV6	-	759	3	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAACACTGAGCATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11328	10261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_10825_11035_11109_11205
913450	contig_8820_pilon	+	3871	27	Intergenic	novelGene_79278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_26	169.368497276862	8	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2715	48	2762	116849	128775	TRUE	0	GCCCGGCTCCCGCCTCGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGESTTDWKQIRSIIMRENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQANIQFRTDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATEFIMNEYKDRKITRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDVESYDPVLNPVLNREVRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDLCSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERPDVDEKRSDLLKLQGEFQLRLRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRKVEETDIVMQEVETVSQQYLPLSTACSSIYFTMESLKQIHFLYQYSLQFFLDIYHNVLYENPNLKGITDHTQRLSIITKDLFQVAFNRVARGMLHQDHITFAMLLARIKLKGTIGEPTYDAEFQHFLRGKEIVLSTGSTPKIHGLTVEQAEAVMRLSCLPAFKDLIAKVQADEQFGIWLDSSSPEQTVPYLWSEDSPATPIGQAIHRLLLIQAFRPDRLLAMAHMFVSTNLGESFMSIMEQPLDLTHIVDTEVKPNTPVLMCSVPGYDASGHVEDLAAEQNTQITSIAIGSAEGFNQADKAINTAVKSGRWVMLKNVHLAPGWLMQLEKKLHSLQPHACFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGVKANMLRTFSSIPVSRICKSPNERARLYFLLAWFHAIIQERLRYAPPGVVQEVRVRGSQTCGQPVTPWTRGWMTRPREGITSLQTRSRGRRSRP	116801	133589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_116902_117978_118097_118182_118399_119176_119390_119528_119657_121126_121281_121899_122047_122133_122285_122429_122684_122779_122915_122999_123095_123227_123403_123536_123613_124231_124393_124608_124721_124822_124884_124982_125107_125955_126070_128313_128487_128720_128939_129050_129155_130145_130358_130834_130989_131751_131895_132048_132218_132475_132523_133472
913451	SIRV6	+	930	10	FSM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	18	589	18	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
913452	contig_2278_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_118090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	165	464	652204	651905	NA	30	ATTGTTGGTGGCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKDWSLLITCSKHAILFSKDHSGCTCCKVFVCLAVHDIFSGVPYSLSSFPMHNETNENTMVWVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFATDLPHAMCLLIS	652368	650470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_650500_652400
913453	contig_6795_pilon	-	2229	5	Intergenic	novelGene_27706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	141.632226205762	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATCACTAGCCAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134357	123792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_125593_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
913454	contig_537_pilon	-	2729	3	Intergenic	novelGene_167589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	776	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGAAGTGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236137	232995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_537_pilon_-_234182_234386_235636_235843
913455	contig_5896_pilon	-	2035	3	Intergenic	novelGene_159232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	136	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	416	1585	20653	19484	FALSE	75	AGAAGAAAAGAAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLPKQSRLLLFLISQVVIFALFFQLYSYNPSSLPSEEDPKPVHVLILSSWRSGSSFVGQVFGQHPDVFYLMEPAWHVWMSFTQSTALRLHMAVRDLVRSVFHCDMSVFDAYMQPGPRRQSTLFQWETSRALCSPPACNVIPRGRIISQAHCKILCNQQPFEMVEKTCRSYNHVVLKEVRFFNLKSLYPLLTDPSLNLYIVHLVRDPRAVFSSRERTTSELETDSRIVLGEKWQQLKEEDRPYHLMQTICKSQQEIFEAIQLLPKALQQRYLLVRYEDLVRAPQAQTSQMYDFVGLKFFPWLQTWVQNITQGKGMGDHAFHTNARNALNVSQAWRWTLPFKKVIRLQKICSDTMNLLGYRHVMSEQQQRNLSLDTLSTWLFSKQDSLKG	28540	19033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_-_20672_27816_27888_28214
913456	contig_1339_pilon	-	4231	2	Intergenic	novelGene_163100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCTTTCAGAGTCTCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134977	130676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_132222_132291
913457	contig_10953_pilon	+	866	5	Intergenic	novelGene_42596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	17711.467824548	10	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	76	525	459504	464119	FALSE	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTQRQLLTPAIPTWPQLSCSPRTPRSEPPSPFPCVPFRLWPCTSSHQRPGTWLSIILGHDNRQNSTDHRRRRALGSHAAQSPPTNWPRPEVGQKLG	459428	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461134_463834
913458	contig_10042_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_79126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	211	585	54058	54432	NA	10	TTTGTGAGAGCTTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLYSNKAKKKKKKNSRTIPNPCNTFVRIFKRHPLPWADAPLAMTLAGFQWPGPAQVYMEGLGAKASTMMCPPWRPVGGLDSNNYENNIYFFCFTKMQSISLFKGKSGTGEELGEELSQQTAD	53847	54895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_53800_54900
913459	contig_2867_pilon	-	3824	2	Intergenic	novelGene_135268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCACCGCATTCAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1543396	1474888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1475409_1540092
913460	contig_10074_pilon	+	6824	1	Intergenic	novelGene_57169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	5593	5892	551756	552055	NA	25	TACTTGAAGGGGTATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDIEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRFTIQPGSGQPCKTKWD	546163	552987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_546200_553000
913461	contig_2278_pilon	-	5695	2	Intergenic	novelGene_118104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	306	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAATAAAAAGTCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758068	752306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_753131_753197
913462	contig_8972_pilon	+	3206	1	Intergenic	novelGene_167634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTGTTTTTTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604371	607577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8972_pilon_+_604400_607600
913463	contig_8616_pilon	+	2367	2	Intergenic	novelGene_72620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	164	1429	478331	479676	FALSE	15	CATTGTTAGGGTTGGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSFGISAPQVSIPDVNVNLKGPKVKGDVPSVGLEGPDVDLQGPEAKIKFPKFSMPKIGVPGMKMEDGRAEVHAQLPGLEGGLSAPDVKLEGPDVSLKGPKVDLPSVNLSMPKVSGPDLDLNLKGPSLKGDLDASIPSMKVHAPGLNLKGVGGKVQMEGDGVKVPGIDATSLNVHAPDVTLKGPSLQGDLNVSGDINCPEVSVGAPDLSLEASEGGIKLPKMKLPQFGISTPGSDVDINIKGPQVTGELKGPGMDMNLGGVNLKGPQISAPHISAPDGDFSLEGPKVKGEMKGPSVGGGLAGINVQGLEGSLQMPGIKSSGCDVELPGVNVKLPTGQISGPEIKGDLKGTGLGFDGAAPDIGVKGPSFNMAAPESDFSVGLKGPKIKGAVDVSGGVSAPGISLGEGHISVKGSGAEWKGPQVSSALNLDATKFAGGLHLSGPKVEGDVKGGQIGLQGPGLSVCGPQGHLGSGSGK	478167	480614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_479594_479673
913464	SIRV6	+	886	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	591	439	375	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	55	546	1733	10736	TRUE	20	GCGCGCCTAATCGTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1678	11386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
913465	contig_11370_pilon	-	2278	4	Intergenic	novelGene_98771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	21.9241115365405	159	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	193	636	274546	231148	FALSE	55	GCGTAAAAGAAAGAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPAPARSLDDIDLSALRDPAGIFELVEVVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTEDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKSPPGNDDQLWVRMPLPATRPSYIFCLQAAVLELGVSTWSLFLSRHRLLSESRGTL	274738	229505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_231412_231502_231560_233212_233279_274489
913466	contig_3602_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_60681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATCATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237198	1234620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1234600_1237200
913467	contig_4131_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_127848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAATAGTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98346	100595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_98300_100600
913468	contig_2726_pilon	+	4494	2	Intergenic	novelGene_165901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	333	junction_1	0	162	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGGCATTTTGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182194	187136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_186552_186999
913469	contig_12625_pilon	-	3964	8	Intergenic	novelGene_140481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1171	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32459	14364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12625_pilon_-_15437_15913_16071_16676_16912_23319_23463_27151_27238_28478_28594_28843_29009_30468
913470	contig_9235_pilon	-	3094	2	Intergenic	novelGene_156196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1350	1688	46974	46636	TRUE	40	AAAAAGAAGGGGCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDVTGLHLAAHI	48323	43625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_44038_45641
913471	contig_2799_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_85489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537260	539787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_537300_539800
913472	contig_12180_pilon	+	7277	34	Intergenic	novelGene_160343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_25	196.376589546582	306	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1879	5640	75	5714	3097	75938	FALSE	20	AAGCAATTTCTGTTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAWSSCSEWSIGLRVPFVVDICLMTFEQLDLLLRQVSDGMDGTADWPPPQEKECMAVAVLNLLRLQLHAAVSHQVDPEFLGLGLGSVLLNSLKQTVVTLASSAGVLTTVQAAAQAVLQSGWSLLLPTAEERARALSALLPGAVSGNEVNISPGRRFMIDLLVGSLMADGGLESALNAAITAEIQDIEAKKEAQKEKEIDEQEANASSFHRSRTPLDKDLINTGIYESSGKQCLPLVQLIQQLLRNIASQTVARLKDAARRISLCLDFEQQHSSDRSASLDLLLRFQRLLISKLYPGESTDQISDISSPELMGVGSLLKKYTALLCTHIGDILPVAASIASTSWRHFAEVACIMEGDFTGVLLPELVVSVMLLLSKNAGLMQEAGAIPLLGGLLEHLDRFNHLAPGKERDDHEDLAWPGIMESFFTGQNCRNNEEVTFIRKADLENHNKDGGFWTVIDGKVYDIKDFQTQSLTGNSILAQFAGEDPVVALEAALQFEDTQESMHAFCVGQYLEPDQEVVTIPDLGSLSSPLVDTERNLGLLLGLHASYLAMSTPLSPVEVECAKWLQSSVFSGGLQTSQIHYSYNEEKDEDHCSSPGGTPASKSRLCAHRWALGDHSQAFLQAIADNNMQDHTVKDFLCQIERYCKQYHLTTPITFPPEHPVEEVGRLLLCCLLKHEDLGHVALSLVHVGALGIEQVKHRALPKSVLDVCRVVYQAKCSLIKTHQEQGRSYKEVCAPVIERLRFLFNELRPAVCNDLSIMSKFKLLSSLPRWRRIAQKIIRERRKRRVSKKPESTDDEEKIGNEESDLEEACILPHSPINVDKRPITIKSPKDKWQPLLSTVTGVHKYKWLKQNVQGLYPQSALLSTIAEFALKEEPVDVEKMRKCLLKQLERAEVRLEGIDTILKLAAKNFLLPSVQYAVFCGWQRLIPEGIDIGEPLADCLKDVDLIPPFNRMLLEVTFGKLYAWAVQNIRNVLMDANAKFKELGIQPVPLQTITNENPSGPSLGTIPQARFLLVMLCMLTVQHGANNLNLLLNSGTLALTQTALRLIGPSSDSVEEDTNAFARGASATVLEETRKETTPVQLPVSGPELAALMKIGTRVMRGVDWKWGDQDGPPPGLGRVIGELGEDGWIRVQWDTGSTNSYRMGKEGKYDLKLAELPASTQPSAEDLDTEDDSEAEQIERNIHPTSVMLTSTINLLQTLCLSAGVHAEVMQSEATKTLCGLLRMLVESGTTDKTALPNSQVCREQHRSWCTLGFVRSIALTPQMCGALSSPPWITLLMQIVEGHAPFTAASLQRQILAVHLLQAVLPSWDKTERSRDMKCLVEKLFGFLGSLLTTCSSDIPLLRESTLRRRRARPQASLTATHSSTLAEEVVVLLRSLHSLSQWNGLINKYINSQLQSITCGLAGKQLEGALLEDWFPNSESPEVGGLMAVLAVIGGIDGRLRLGGQVMHDEFGEGTVTRITPKGRITVQFSEMRARRVCPLSQLKALPAVVFSVTNLPFTEPMLSVWAQLVNLAGNKLEKHKIKKSPKQIFAGQVDLDLLRCQQLKLYILKAGRALLSHQDKLRQILSQPAVQETGTTHTDDGAVVSPDTGDMSPEGPQPPITLLQQLLASATQPSPVKAIFDKQELEAAALAVCQCLAVESTHPSSPVCEDCSSSEATTPVTVQHARPSRMRKRKQSPVPALPIIVQLMEMGFPRRNIEFALKSFTGASGTASGLPGVEALVGWLLDHSDVQITDLSDADTVSDEYSDEEMVEDVEDAAYPVSIGAVVTESQTYKKRADFLSNDDYAVYVRENIQVGMMVRCCRTYEEVCEGDVGKVIKLDRDGLHDLNVQCDWQQKGGTYWVRYIHVELIGYPPPSSPSHIKIGDKVRVKTSVTTPKYKWGSVTHQSVGVVKGTII	3022	77501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_+_3226_7773_8003_8093_8219_22150_22330_24636_24825_26044_26201_26851_27038_33657_33829_34184_34289_35363_35515_37817_38033_38356_38490_38599_38728_38807_39004_41479_41614_42341_42516_42593_42731_42842_42995_43665_43858_53706_53895_55234_55428_56979_57163_58460_58643_59110_59259_59337_59535_59775_60007_60808_60948_62174_62319_65233_65377_72394_72663_72809_72947_73497_73597_75524_75694_75798
913473	contig_14441_pilon	+	769	4	Intergenic	novelGene_100764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	505.486124658454	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	189	737	125667	126705	FALSE	5	GCAGCCTGGCCGTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121651	126737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121691_125517_125902_126159_126283_126514
913474	contig_2703_pilon	+	2286	15	Intergenic	novelGene_101703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1049.20805897611	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	838	1431	602068	610870	FALSE	50	TCACTCTTGGCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526167	611725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578904_582631_582668_584461_584592_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
913475	contig_10258_pilon	-	2425	4	Intergenic	novelGene_155047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTACTTTGTTCTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91471	85593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_-_86579_86742_86910_87993_88133_90337
913476	contig_5039_pilon	-	4513	2	Intergenic	novelGene_64791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTTAAGGCATATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165631	159097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_162600_164620
913477	contig_16211_pilon	+	1988	3	Intergenic	novelGene_150061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTAGGCAAGAGCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79707	86886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_80000_80383_80504_85310
913478	contig_12931_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_166773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGTCCTAGAGAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123972	125579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_124000_125600
913479	contig_6364_pilon	-	2444	3	Intergenic	novelGene_51777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACTCAACAGCACACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218181	1054893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1055070_1121382_1122617_1217147
913480	contig_998_pilon	+	3696	2	Intergenic	novelGene_153780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1908	2246	409007	409345	FALSE	55	AAGAAGATATAAACTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPKNQTLTLIKRIHQKSEKTTYRLGKNFGYDKSKQHLISKIHKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALI	300148	410795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_301943_408893
913481	contig_1717_pilon	-	2267	3	Intergenic	novelGene_146112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	250	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	53	162	152	313	138527	138366	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPQFRGRGAARRALLLLSRSSPGWLLPSATSAGPRGTTRGTGGLLNALLMRWRPQAASTRQQSLLLQPRLSPRALAGTGLQKGGSSHVCPAVTDYVLGDLPS	138678	125022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_-_126638_137617_137905_138313
913482	contig_6735_pilon	-	3136	9	Intergenic	novelGene_15816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	44.3816896366058	28	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	875	2628	158	2785	597763	573953	FALSE	45	TTCCAATAAACCTAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLEKCKENKENLEGIVKQQEADIQNCKFSYEQLEADLQASRELTSRLHEEINMKEQKIISLLSAKEEAVQVAISELHQQHDKEIKELENQLSQKEEENKKAVDKTSQLMETLNTIKKESTQQKAQLDSFVKSMSSLQDDRDRIVGDYQQLEERHLSVILEKDQLIQDAAAENNKLKEEIRCLRSHMDDLNSENAKLDAELIQYREDLNQVISIKDCQQKQLLEAQLQQNKELKSEYAKLEEKLKESEEAKENLQRSSNTLQEEKQGLSKEIESLKISISQLKGQVTDLQEEGTLGVFQAQLKVKEEEVQKLSTTLSSSQKRIKELEEELVHVQKEAAKKVGEIEDKLKKELKHLHHDAGIMRNETETAEERVAELARDLMEMEQKLLTVTKENKDLTAQIQSFGKSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDASLKEVAQLREKQGLLSREREVLVSKAASPKSSTEDNSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSFSKAMASLQNERDHLLNELARFRKSEEGKQRSAAQPATSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQYLQINQEIPELRPLKAQLQEYQDKTKTFQIMQEELRQEHLSWQHELHQLRMEKSSWEVHERRMKEQYLMALSDKDQQLNHLQNLMRELRASSSQTQNLKVQYQRQASPETPTSLDGSQNLVYETELLKTQLNDSLKEIHQKELRIQQLNSKFSQLLEEKNTLSVQLCDTSQSLRESQQHYSDLYNHCAVLEKQVQLLQAGPLNLDVAPGAPQEKNGAHRKSSPEELREPQLSFSEAQQQLCNTKQEVSELRKLLEEERDQRVAAETALSVAEEQIRRLEHSEWDSVRTPIIGSCGTQEQAILIDLTSSGCRRTRSGAGWKRVLRSLCHSRTRVPLLAAIYFLMVHVLLILCFTGHL	597920	573601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_574088_574402_574509_577251_577387_577834_577933_578709_578854_584144_584283_584476_584643_588711_588891_596236
913483	contig_19816_pilon	-	1484	8	Intergenic	novelGene_156494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.711145489465	32	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	22	1059	126795	123459	FALSE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126816	123033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125806_126164_126435_126731
913484	contig_5419_pilon	+	2766	5	Intergenic	novelGene_15495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	241.621087655858	3	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATGACATCACAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238763	252114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240679_241836_241949_249660_251008_251074
913485	contig_9471_pilon	-	1925	14	Intergenic	novelGene_21732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGTAGCCTGCCAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303327	210853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_210896_211704_211737_242818_242894_248956_249059_259412_259494_260219_260322_271739_271920_275965_276047_278275_278393_289121_289217_293216_293336_293894_293982_297482_297642_302674
913486	contig_16722_pilon	-	2736	4	Intergenic	novelGene_118297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	234.495676340145	14	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	1635	2735	151100	150000	FALSE	60	CTGACAAAAAGAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDDDVKLESHMNCQEISQVDVVNVSEGFHLRTSYKKKTKSSKLDGLLERRIKQFTLEEKQRLEKMKLESGIKGIGKTSTNSLKSLSESPVITKVKEECDLLRQVQSRNASNDKSENLIQGCSQSDSSVLGISDSNHTTNKLYPKDQGLDDVPIQSPEANCQKQNSVVNDIDKRLSEPTSKGQEPSNIKTKGTDLLMDDSKLASTNEIGTLIYKNKKPLLQEDNDTIVSPSESSLLPSLPRSSSDRENPSLSKAVDFEGKLGCDSEYNSTLENSSDTMSIQDSSEEDMIVQSSSESISEQFTAQEQGIEDSEPLKREFVSDKSPGKCGDRLQANVSEANGEKLSQEPKLEERPVNKCIDQINLRNI	164524	149998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_152398_155147_155287_155905_155984_164404
913487	contig_15491_pilon	-	3253	2	Intergenic	novelGene_75965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1238	junction_1	0	712	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	83	298	46982	45094	FALSE	20	GTCTTGCTTGCTGAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFCPQAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGEYW	47064	42138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_45207_46879
913488	contig_3571_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_88707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1012	1350	30692	30354	NA	70	GAAAGAAAAAGAAGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDRWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI	31703	29708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3571_pilon_-_29700_31700
913489	contig_20596_pilon	+	3401	2	Intergenic	novelGene_157240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	205	576	111883	112254	TRUE	30	AGCGATAGCCAGGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRSSSWIERLNIVKMSILPKANYRFNAIKIPTAFFTEIEKPILNFIWKGKRPQIVKTMLKEKSKVGGLTFTDFKTYYTATVIKTAWYLYNNIHIDQWNRIESPELRNKPTHLWSTDFSQGC	111678	115137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_112397_112454
913490	contig_15666_pilon	+	2903	2	Intergenic	novelGene_70124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2328	2636	108776	109324	FALSE	40	GTTAGGAAGATAGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEACQESRASVTEKALHYFFNISVAIEHPADILGPTPCSWRRLPGIPLETQEICSLIRPFKEAF	106448	109591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_108859_109098
913491	contig_14925_pilon	-	1683	5	Intergenic	novelGene_55269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	60	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	10	CCTTTGGCTTGATTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	112090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
913492	contig_14687_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_107952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	1171	1587	580058	579642	NA	5	TTCTCTGCTGCTGTAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFEIPEVMAIPFETKAAQLLVSLVSSASASVSCDLLALRPHACICPAGASVGSSTGKCPEAPYSSRKPPAHRHSAPLLRGSWVGRPSSTDKCPEAPLSARKPPAHRHSALSLRGLSPVLSHTGLLVLLLLVLCCCR	581228	579641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_579600_581200
913493	contig_8278_pilon	+	2462	6	Intergenic	novelGene_165292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_4	32.6643536596088	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	466	1854	192287	212295	FALSE	30	GCTTTTGAAGTTCTCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVINTFLFLSSENQPVTTKERVIPSEPVVELVLMKVLGACKLLLRLLDCCCKTFLLTVKHLGLREFIILNLVMVGLVSRLWVLYKGVLKRLISLYEPLFGLLQEISRIQPMPYFKAFTFPSDIVEFLGQPYFEVFKKKMPTAFVTKGVTRLLNKLFLTKEQHQMSSEEALLRITKKAKQMKTNIEDSVDLGQPVKKRKVFAEKSSEFDVRAFCKRLKHRATQETNFKCSQSKIKATKCSQKVIEISCANSFVQRFREAETFIKLSEEIQMAVIWCRSRKLKAQATFLGNKLLKSNRLKHVEAQGYSLPKKLECIKTSICNCILRGSGNKTSKHHLSQRRSQNKFLLRRRKPQRKLQSALLKEIHQFPQGTQKGATDTSAKRRLSHRTVHRADLYPYSKQLIGSRASNPVVRTKKKQNHENLTRSNDNETGSWTMTQTSEHNTSETIKQRDDIDDIFALMGV	191821	212903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_+_192454_192904_192983_194339_194702_195002_195065_206483_206735_211826
913494	contig_16103_pilon	+	5335	11	Intergenic	novelGene_118759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3455	3799	440325	441510	TRUE	5	CCCGGCTAGCTCGCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRKVGATGEETGQGFKAGAGQTDRRYFCPLMDCDIDRGGIMSKRYSRCRSARLGALCPPMPVLKYAMLTPGMPRRPPGTDSWGACAKVESMERADVGMPRWRLLWGCGACRSV	436870	541645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_440534_441202_441322_441493_441608_442492_442693_443770_444088_444594_444766_445743_445877_446221_446353_447204_447336_453894_454230_541624
913495	contig_5258_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_100239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	377	712	134364	134699	NA	55	CCTGAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWQFLKKLKIELPNNPAIPFLGLYPKDLKADIQKETCTQMFVAALFTIAKRWKQPKCPSTNEWINKMWYIHTMDYYPARRKNKVLIHATVWMELDDIMLSKIS	133987	135900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_134000_135900
913496	contig_1893_pilon	+	5727	5	Intergenic	novelGene_172347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3581	3949	294260	305789	TRUE	30	GCTAACATGTCTCATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLTARIKRQRVGEWIKKHDPSICCLQETHLKDTNELKCKGWKKYIKQTTLKKEQEFFQSLAKCLSSILLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLSFKFLIFLYDFLL	119241	314293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1893_pilon_+_120661_220975_221548_292670_294472_305632_307526_314251
913497	contig_678_pilon	-	3191	2	Intergenic	novelGene_167779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1221	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTGGCAGAAAAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20387	16989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_19782_19988
913498	SIRV7	+	2117	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	26	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTAATTAAATAGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	114958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
913499	contig_9995_pilon	+	4922	1	Intergenic	novelGene_47748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	165	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2899	3207	620527	620835	NA	35	AAAGACCTCTTTAAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTHWTYLKLKELKKKIQASSCSIEGFYGQYIEQRRKHQKKMERIHRVAILKRIGGYSTISEGSIWSRTDGTEGGSLSCTEGIGDKQGSRN	617628	622550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_617600_622600
913500	contig_11448_pilon	-	2922	1	Intergenic	novelGene_66433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACCTGAAAATATATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630901	627979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_628000_630900
913501	contig_11615_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_151246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	157	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	348	1047	52	1098	385	1431	NA	40	AGCCCACAACCACCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGIQIKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFSNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPNRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	333	2845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11615_pilon_+_300_2800
913503	contig_3004_pilon	-	3239	16	Intergenic	novelGene_127501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_7	43.3415376848686	144	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2769	405	3173	304682	287258	FALSE	10	CATATGTCTTTTTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVTDSGRTQEPFPTRSNNSIPSNLPEIPGTHDRLLSLSQSVLPQQDNLDLQELLDLQRKAVCSSEKTQEKLLLNKQSKLSRSESSEHTVFSVSVPKESKHSFIPLPFAETKPRRICECYSSNSEHKVPSSDFMIPKLQDILSFSQPVLAYQDNSGLQKQLDLQKEALRYSQKAQEELLVQRQAALQQQIQKHQETLKDFFKDSQASKPTFENDLKTQKMEQLREWFPHIQDLVTDDQEDINHVDRNNSDDNQLLSQDLTTKQRGEHLDKELSRRFSKPPLAKVKCGLDLNQHELSAIQEVESPGSGRASILGKTDFSQDRDPVRVSVSREQSLLGSSLDHNSFGHHQPVTQKNVYGDNYDETVKVEETVADCHAALSDAVEERERTYLESIVKPDNKAETQEISHEPLSSITVSTGSLLSYENTDLSLTDPESFAEQVDSRQQESTAGKEEETDLLSSAVPPIQATYQRQSSSDIHKSPLLLVEELTSGQMHIQQIIDKYINEANLMPGKTNFMVPSVDLDLSELEQTFPNLHRQLFKPLEPHPDFDLLSSFSGISQDSRDFYKGSESSSESQHATGSSKSTVSFSTPRNLHFSLNVSLDPQLDPNSAHVAAQSCVTENVIEGSEQSFQQLLPEFSSQEGSQHVDLPSIFSIEERDSSQGLENQNYPSEEVLQIKKEGVPFPVSLENLLSSSDEVNVFNQLNVQHNTPCGSTSSECSIKDQPEDRKRRLSFKELSERRLGVMLDDQGLTEDDKNEAGGVLDIRPHAEEIDSQLHVRTVEMGTSLHTPHSLTIRNEKYFENSTKRETPEILKNLSQSAQSELFLSSGTFSVQNCIPVWETESGHGIMEEPELTLVSTSDISIAETDFENLTLEERSETEAKSCFQVSEFLPLVPETETSACPSVSEHSGEELVTQPAETLPKFIAIPETAIPESLQEAFLKRKKTFIERSTQRQKEVRNRVHVTENSQVKAAEKPTGSSVSHLKGVSKVRVSLPEDRRTAQALMCQRALRSYNQLAEVKQQKEEKARKAAYAQNRARAKEFHQKTLEKLRAKTTG	305086	287191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_287297_287378_287479_287553_287654_287741_287919_288082_288180_289880_290022_290784_291429_292146_292322_295191_295341_296096_296346_296718_296822_297388_297493_301054_301208_303502_303647_303786_303965_304466
913504	contig_10892_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_116738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTCTACACCACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81266	83564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_81300_83600
913505	contig_5039_pilon	+	4512	2	Intergenic	novelGene_64776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	463	1104	128505	129146	TRUE	45	TCAGAAATCCCAAAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSIILSVFSVFSPCSGTPITQKFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVPKCLSSIPLILSSTISNLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCFRIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLLAFCFSSWRILSNRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTLTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIH	128042	132811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_129693_129949
913506	contig_14744_pilon	-	1338	1	Intergenic	novelGene_65947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCTGCAGCAAACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241293	239955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_240000_241300
913507	contig_3009_pilon	+	5961	9	Intergenic	novelGene_132507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_7	16.4464091825541	292	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	155	1492	46230	89002	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRGASASAARGAGIRVGCPPGTRRSWGARLQLQSSGYALRKAKSHVFVALSMLLLVPADSAVIRLQDRIGKLWWELCPAGYHMLLTTGDCILCSYGVDYTNHSNDLPSCLPCTVCKPDEDEISPCILTRDTACRCKAGTFLGSDAPEICQKCSPGCPDGMVQDSPCTPWSNLKCVPREAGTKATGEATVSGEPVASGPKTPTTASPSSGFGNLEIWIRIWIGLGIGLWIVMVMLVLLRRRIIQGCGVVSKFVNRVLFGQPCSRKGPEAHDNAHNEALSNRESQPRLDPELEREGQEEQAGVTGAMRQTPVDAQPLLGHPNAEGSQMRRMLLVPANGADPTETLKAFFDYFISVVPFCSWNAVMRRMGLTDNEIHVARASAVGPKEEPYKVLVQWLHKTGKAASINTLLDALEAVGERNARETIQDYLVDSGNYTFEEDRADNR	46075	93471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3009_pilon_+_46401_60930_61004_81092_81207_81961_82074_84107_84374_84812_84845_85308_85495_87807_87884_88694
913508	contig_7342_pilon	-	1791	5	Intergenic	novelGene_71218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	498.377555172783	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTAAGACAGCCAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700653	693323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_693417_694223_694274_694924_696409_698784_698848_700552
913509	contig_2033_pilon	+	1460	3	Intergenic	novelGene_71535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130665	133047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_131255_132092_132252_132335
913510	contig_6102_pilon	-	3032	2	Intergenic	novelGene_32179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_1	0	78	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	867507	847043	FALSE	50	AAAATATACCCACGAAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867509	844333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_847094_867237
913511	contig_15236_pilon	-	2684	2	Intergenic	novelGene_141642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	378	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGTCTTTAGCGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700465	672189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_674082_699673
913512	contig_16125_pilon	-	3294	1	Intergenic	novelGene_155287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	312	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACGCGTGACACTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184181	180887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_180900_184200
913513	contig_16387_pilon	-	2724	2	Intergenic	novelGene_174519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTACAATAAGCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5828	1100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_-_1256_3259
913514	contig_8304_pilon	+	5840	38	Intergenic	novelGene_153164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	195.449753854943	139	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	995	2988	151	3138	32105	112550	TRUE	15	CCAGACCCGCTACCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VADWDVSSASTQVLIAASLRAVPQITGRGPRPSVRLEPGSVSGGSGGGARMSAEAADREAATSSRPCTPPQTCWFEFLLEESLLEKHLLKPCPDPAPVQLIVQFLEQASKPSVNEQNQVQPPPDNKRNRILKLLALKVAAHLKWDLDILEKSLSVPVLNMLLNELLCISKVPPGTKHVDMDIATLPPTTAMAILLYNRWAIRTIVQSSFPVKQAKPGPPQLSVMNQMQQEKELTENILKVLKEQAADSILVLEAALKLNKDLYVHTMRTLDLLAMEPGMVNGETESSTAGLKIKTEEMQCQVCYDLGAVYFQQGSTNSAVYENAREKFFRTKELIAEIGSLSLHCTIDEKRLAGYCQACDVLVPSSDSTSQQLTPYSQVHICLRSGNYQEVIKIFTEDNLTFSLPVQFRQSVLRELFQKAQQGNEALEEICFKVCACNTVRDVLEGRTISVQFNQLFLRSNKEKIDFLLEVCSRSINLEKTSDSLKGNMAAFLKNVCLGLEDLQYVFMISSHELFITLLKDEERKLLVDQMRKRSPRVNLCIKPVTSFYDIPASASVNIGQLEHQLILSVDPWRIRQILIELHGMTSERQFWTVSNKWEVPSVYSGVILGIKDNLTRDLVYILMAKGLHCSTVKDFAHAKQLFAACLELVTEFSPKLRQVMLNEMLLLDIHTHEAGTGQSGERPPSDLISRVRGYLEMRLPDIPLRQVIAEECVAFMLNWRENEYLTLQVPAFLLQSNPYVKLGQLLAATCKELPGPKESRRTAKDLWEVVVQICSVSSQHKRGNDGRVSLIKQRESTLGIMYRSELLSFIKKLREPLVLTIIVSLFVKLHNVREDIVNDITAEHISIWPSSIPNLQSVDFEAVAITVKELVRYTLSINPNNHSWLIIQADIYFATNQYSAALHYYLQAGAVCSDFFNKAVPPDVYTDQVIKRMIKCCSLLNCHTQVAILCQFLREIDYKTAFKSLQEQNSHDAMDSYYDYIWDVTILEYLTYLHHKRGETDKRQIAIKAIGQTELNASNPEEVLQLAAQRRKKKFLQAMAKLYF	31954	126024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_32235_33741_33917_35975_36117_36439_36512_38069_38122_39238_39422_42480_42589_44139_44296_47259_47361_47796_47939_71427_71499_71879_72056_73545_73680_75538_75650_80246_80449_83945_84068_99265_99451_99869_99904_100595_100653_100735_100798_103202_103322_104607_104712_105336_105388_106811_106886_106965_107031_107187_107232_112433_114101_114530_114688_115188_115303_117182_117320_118693_118788_120014_120157_122522_122665_123626_123779_124713_124767_124853_124954_125055_125094_126001
913515	contig_6795_pilon	-	3050	10	Intergenic	novelGene_27666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_4	99.8017788505215	84	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	217	753	129029	74696	TRUE	30	TTAACATGCTGTGGATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKADPRLQECSDCGQVSSLRQEGTVFCGAPAPGDSCDSWGSTGC	134316	45566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_72054_74615_74765_110795_110852_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
913516	contig_2933_pilon	-	1924	3	Intergenic	novelGene_111357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.5	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	128	1387	850204	848945	TRUE	10	GATCTTTCCGCGTACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874204	848360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_848597_848643_850290_874162
913517	contig_1146_pilon	-	1474	2	Intergenic	novelGene_84836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGATTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904766	903189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_904283_904385
913518	contig_5999_pilon	+	3535	2	Intergenic	novelGene_45616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	124	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	364	714	110697	111047	TRUE	35	TAATAATAGTAAGCCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKSVVQNSISCKKTRLNGLTETRGIPEDVAPGLSVSPEVKPFPKPTWTLIFTSPIARIQERTTFPVEKGHGIFTNLTEIISSNSSMWEEEFFPSPTSPYFPLLYPRLSWFLFY	110333	259650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_113618_259399
913519	contig_3747_pilon	-	2796	8	Intergenic	novelGene_24836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTCAACAACGATCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	200984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202418_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
913520	contig_5999_pilon	+	2166	16	Intergenic	novelGene_45620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAATGATAACATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116719	243477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_117112_125648_125788_134991_135053_137191_137286_163378_163552_167253_167415_168952_169074_169872_169984_175793_175924_180637_180724_180817_180848_182005_182168_191344_191404_194816_195017_199940_200062_243351
913523	contig_935_pilon	-	2973	11	Intergenic	novelGene_45565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	334.467173277139	96	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	264	1034	401933	383823	FALSE	45	CAGTTTTATAATAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISVSHSPPSYSRHALPTSPPGEVGELKAPVINRFTRRASVCAETYNPDEEEDDTESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKEGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEVSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDLADSFFIVESGEVKISMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNITTYEEQLVALFGTNMDIVEPTA	482730	381883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_383957_387086_387226_387362_387429_389707_389783_391649_391752_397891_398046_401832_401940_411089_411174_416859_416913_455249_455286_482646
913524	contig_7963_pilon	-	2175	10	Intergenic	novelGene_58449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	796	junction_1	410.065848370722	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	140	1210	123098	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	123237	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993
913525	contig_17144_pilon	-	1995	14	Intergenic	novelGene_29522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1805.43152572532	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	16	1950	179764	166129	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLIPTH	179779	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_167620_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
913527	contig_17171_pilon	+	3934	1	Intergenic	novelGene_147365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACGTTAGTGCTGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239298	243232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_239300_243200
913528	contig_4754_pilon	+	2310	2	Intergenic	novelGene_35976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCAGAGTAGAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465362	497187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_465424_494938
913529	contig_15974_pilon	-	2000	12	Intergenic	novelGene_164810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_9	145.433407554997	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	32	1141	169125	136171	TRUE	25	TGTTTATATATATGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFAACTTDTTMNSSLSEPLYVPVKFHDLPSEKPDSTNIDTEKTPKKSRVRFSNIMEIRQLPSSHALEAKLSRMSYPAVKEQESILKTVGKLNATQVAKISFFFCFVFFLANLSYQEALSDTQVAIVNILSSTSGLFTLILAALFPSNSGDRFTLSKLLAVILSIGGVVLVNLSGSEKSAGRDTIGCIWSLVGAMLYAVYIVMIKRKVDREDKLDIPMFFGFVGLFNLLLLWPGFFLLHYTGFEDFEFPNKVVLMWIIINGLIGTVLSEFLWLWGCFLTSSLIGTLALSLTMPLSIIADMCMRKVQFSWLFFAGAVPVFFSFFIVTLLCHYNNWDPVMVGIRRIFAFICRKHRIQKIPEDSEQCESLIPMHSVSQEDGAS	169156	131988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_-_132830_136152_136247_136787_136943_146877_146969_150801_150962_155693_155799_158364_158430_159636_159725_160408_160491_165238_165430_166245_166328_169110
913530	contig_3747_pilon	+	2644	7	Intergenic	novelGene_24837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3858.80004736648	8	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	329	898	201313	203229	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAHVRHGVAKAFGSRRSGLPFWAATSFELNTPY	200984	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_203029_203128_203228_203386_203498_203651_203768
913532	contig_7963_pilon	+	2547	2	Intergenic	novelGene_58565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_1	0	459	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1696	2145	251857	253116	FALSE	10	CAGTGGTTTCTAGTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLVLCVCVCTHTVALVHTCSYSAVTLALVSAEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	250161	253518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_252094_252903
913533	contig_6958_pilon	-	2257	8	Intergenic	novelGene_70004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACTCCCCTTGCAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770717	737308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_737413_737700_737749_739744_739810_750148_750282_750915_751080_752854_752954_758481_758602_769193
913534	contig_6710_pilon	-	560	2	Intergenic	novelGene_91642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	51	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657175	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
913535	contig_9363_pilon	+	3047	17	Intergenic	novelGene_6782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGAAAATGCTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515274	1538861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1516415_1517883_1517973_1518084_1518160_1518573_1518687_1519972_1520113_1520467_1520541_1520636_1520694_1526261_1526349_1528119_1528274_1528377_1528539_1529874_1530004_1530147_1530346_1530798_1530939_1532248_1532394_1535522_1535664_1535774_1535849_1538730
913536	contig_2480_pilon	+	1810	4	Intergenic	novelGene_63520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTATGAGAAACTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134021	181612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_135061_143978_144242_149223_149659_181539
913537	contig_8598_pilon	-	2914	1	Intergenic	novelGene_22870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCAATAACGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5967	3053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3100_6000
913538	scaffold_12510_pilon	+	3518	2	Intergenic	novelGene_151400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTTAAAGCCATTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573750	632723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_573894_629348
913539	contig_13021_pilon	-	1986	9	Intergenic	novelGene_8231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	500.18290404611	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	107	1096	236115	210534	TRUE	50	CTAGATGAAATATTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGTNSQELHYATPTFQKVASGKHEN	236221	205437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210542_211873_211940_212067_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
913540	SIRV6	+	521	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-39	3	11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	124	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCACAAGTCAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	2117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
913541	contig_10861_pilon	+	3161	1	Intergenic	novelGene_39425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2219211	2222372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2219200_2222400
913542	contig_6048_pilon	-	4600	1	Intergenic	novelGene_73103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	3587	4198	232074	231463	NA	75	AAGCAAAAGGAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHLLIIGTWNVQSMNLGKLEIVKNEMERINIDILGISELKWTGIGHFESDNHMVYYAGNNTLKRNGVAFIVKKNISKSILKYNAVSNRMISIRLPGRPVNTTIIQIYTPTTKAKDEEIEDFYQLLRSEIDRTCSQDALIITGDWNVKVRYKEEGSVIGKYGLGDRNDAGDHMIEFCKTNSFFIANAFFHQRKWRLYR	235660	231060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_231100_235700
913543	contig_4686_pilon	+	2729	12	Intergenic	novelGene_118508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGTCCTAAAGAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397660	447993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_398633_413090_413260_417840_417997_425619_425769_430253_430384_434748_434945_437360_437598_441488_441582_443749_443898_444553_444708_447064_447212_447815
913544	contig_13004_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_112627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212830	210279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_210300_212800
913545	contig_1406_pilon	-	2678	1	Intergenic	novelGene_25663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCAAGCAAATAGCAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2808879	2806201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2806200_2808900
913546	contig_7457_pilon	-	1291	4	Intergenic	novelGene_31679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	22	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	136	477	1176842	1174926	FALSE	10	GCTGGCTTGCCGATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176977	1174111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
913548	contig_19098_pilon	+	2511	2	Intergenic	novelGene_65828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAGAACCAAAAGGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387746	392136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_388340_390218
913549	contig_8992_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_174430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACCAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204619	205327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_+_204600_205300
913550	contig_6885_pilon	-	793	1	Intergenic	novelGene_83676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	59	361	210312	210010	NA	65	AAAAGACAGGAAAGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	210370	209577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_209600_210400
913552	contig_10511_pilon	+	2540	2	Intergenic	novelGene_126904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAACAATAAACAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580462	596096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_+_582072_595165
913553	contig_854_pilon	+	1937	8	Intergenic	novelGene_36639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2098.87619103799	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	183	875	1696571	1715343	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQRKSDQRALQPFLAKKHKMASQGGQAPGDGPECFL	1695134	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1695283_1696536_1696646_1697677_1697729_1698369_1698430_1698914_1699035_1702012_1702204_1702545_1702638_1715239
913554	contig_18055_pilon	+	2766	24	Intergenic	novelGene_117804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	399.195627904884	3	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1320	1445	2764	81149	94911	FALSE	65	AAAGAAAAAAAGACAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFARVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKEEEEEKQKSLLRERRRQRKNRESFQIFLDELHEHGQLHSMSSWMELYPTISSDIRFTNMLGQPVFSLGSTALDLFKFYVEDLKARYHDEKKIIKDILKDKGFVVEVNTTFEDFVAVISSTKRSTTLDAGNIKLAFNSLLEKAEAREREREKEEARKMKRKESAFKSMLKQAAPPIELDAVWEDIRERFVKEPAFEDITLESERKRIFKDFMHVLEHECQHHHSKNKKHSKKSKKHHRKRSRSRSGSDSDDDDSH	40633	94913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40863_41921_42054_43421_43502_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81059_81158_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571_85706_90730_90846_91000_91105_91211_91329_91842_91981_92274_92371_94711_94799_94881
913555	contig_4832_pilon	-	3223	3	Intergenic	novelGene_163412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAAGCCCCGGGCGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499361	495510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_497860_498384_498643_498745
913556	contig_1379_pilon	-	3375	4	Intergenic	novelGene_134601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	404	junction_3	97.6194425079121	160	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTAAATGAAGAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488761	477049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_477214_479324_479402_482411_482553_485768
913557	contig_2227_pilon	+	3756	1	Intergenic	novelGene_142344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1479	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAGAAGGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249743	253499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_249700_253500
913558	contig_14202_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_157144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACACAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139096	141144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14202_pilon_+_139100_141100
913559	contig_10331_pilon	+	1616	10	Intergenic	novelGene_54170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	433.575345524758	21	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	709	1614	545772	582853	FALSE	45	TTATGAAGAAGAGGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKKSEENENLEDKDDETARVDESLSIKVEAEEEKAKSGYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNLSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQDDETSAQDIDNNGKQDSKTDHLAHNRNDLISKEEQNSSSLLEENKVHAELVISKPVSKSPERLRKDTEGLSEDT	534684	582855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_534767_536900_536978_537997_538151_541321_541453_541971_542135_545669_545964_546296_546473_573425_573511_575995_576195_582599
913560	contig_12050_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_62766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	432	1034	809447	808845	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWARYLACGQSRPLVSRLHSQPLLQGGTLEAAAEWPGFCRPEGIISSSRHSHFPLQHPGNSALGASGCSSDRQAEGGVLIEPPPPSGESREEPRQSGLQGTEAVGPSQICHSTTLQAQADTHSSSLSEIVWSNLHFTDGKLRCVLVLSTLCKQVLWFCCCCFYDLRRPHYRLERLHRVFLAVMFIGADRQACLFHRAAG	809878	807563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_807600_809900
913561	contig_4426_pilon	+	3883	20	Intergenic	novelGene_15378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	53.0136657236849	166	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	39	1691	306001	374400	TRUE	15	AGTAGTTTAGTGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLSLLQEDLPEDADGFGVDDYSSESDVIIVPSALDFVSQDEMLTPLGRLDKYAASENVFNRQMVARGLLDTLREVSDDERDCIAVLERISRLADDSEPTVRAELMEQVPHIALFCQENRPSIPYAFSKYLLPIVVRYLADQNNQVRKTSQAALLALLEQELIERFDVETRVCPVLIELTAPDSNDDVKTEAVAIMCRMAPMVGKGLTERLILPRFSEMCCDCRMFHVRKVCAANFGDICSVVGQQATEEMLLPRFFQLCSDNVWGVRKACAECFMAVSCATCQEIRRTKLSALFINLISDPSRWVRQAAFQSLGPFISTFANPSSSGQYFKEESKHAEGNLSIEGKNRVSDGEEAPEAAQTRPEAVHSDLSVSDSSVSLENPVEEHVETLQKLPGDRSVPVDSSLLCSLSSDPHQDAASNVNDKKPDNCKSLLRPEVGTSSQDSTLSDQELYNSFHFWRTPLPEIVELELDLWGGLSPERPEETPQVDVLCSPNITMATRRELEEMIENLEPHIDDPDVKAQVDVLSAALRASPSGRSRGDCQYREEK	305962	392372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_306008_306188_306234_331608_331745_332621_332729_342649_342793_343262_343410_346586_346695_346836_346903_347584_347744_359078_359210_368171_368690_374314_374489_375798_375892_378854_379041_380263_380426_383540_383642_387661_387783_387876_388012_388898_389041_391208
913562	contig_504_pilon	+	1254	5	Intergenic	novelGene_54460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGATTGTCTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703068	706433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_703943_704068_704123_704934_705013_705982_706126_706328
913563	contig_5423_pilon	+	1353	5	Intergenic	novelGene_85265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_1	987.600975850065	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	440	862	542216	545856	FALSE	20	CTCTTTCTCCATCGAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCTIEKALADAKALVERLRDHDDAAESLIEQTTALNKRVEAMKQYQEEIQELNEVARHRPRSTLVMGIQQENRQIRELQQENKELRTSLEEHQSALELIMSKYREQMFRLLMASKKDDPGIIMKLKEQHSKVIHSINIT	534850	546347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_535231_541109_541167_542213_542351_544406_544525_545686
913564	contig_9673_pilon	+	2610	1	Intergenic	novelGene_119177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACTATAAAATTAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155298	157908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_155300_157900
913565	contig_4180_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_8428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1082880	1081334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_1081300_1082900
913566	contig_13800_pilon	-	2924	2	Intergenic	novelGene_153739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGATAAAGTGTCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152879	149839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_152182_152297
913567	contig_8820_pilon	-	2163	11	Intergenic	novelGene_79299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1085.73074010088	1	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1518	645	2162	169721	166519	FALSE	20	GCAGTGCTGCTGTCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADD	171330	166517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169796_170151_170503_170600_170763_171273
913568	contig_9002_pilon	-	3652	10	Intergenic	novelGene_116719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_9	41.3790070231539	33	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	97	1284	331854	319614	TRUE	25	CATTGCTGTAGTCACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGGYKVGGGQVLCPQAATGSVRSESLWLQSTMCGIWALFGSDECLSVQCLSAMKIAHRGPDAFRFENVNGYTNCCFGFHRLAVVDPLFGMQPIRLKRYPYLWLCYNGEIYNHKEMQCQFGFDYQTKVDGEIILHLYDKGGIEQTVCMLDGVFAFILLDTANKKVFLGRDTYGVRPLFKAMTEDGFLAVCSEAKGLVNLRHSTTPFLKVEPFLPGHYEVLDLKPNGKVASVEMVKYHHCRDEPLHALYDNVEKLFPGFELETVKSNLRILFNNAVKKRLMTDRRIGCLLSGGLDSSLVAATLLKQLKEAQVQYPLQTFAIGMEDSPDLQAARKVANHIGSEHHEVLFNSEEGIQALDEVIFSLETYDITTVRASVGMYLISKYIRKNTDSVVIFSGEGSDELTQGYIYFHKVNTLKWNDTGARLRKE	337848	316734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_317088_317509_317666_317754_319772_321085_321213_322698_322827_324213_324316_324589_324776_328155_328394_331605_331878_337775
913569	contig_2161_pilon	+	2844	5	Intergenic	novelGene_114951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTTTGGACACCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976551	1027602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_978763_979598_979731_980257_980376_1024503_1024511_1027226
913570	SIRV3	+	369	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4894	1732	2835	489	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAGGGTAATAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6838	7207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6800_7200
913571	contig_4884_pilon	+	3950	3	Intergenic	novelGene_63825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1156	junction_2	44	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	655	921	578494	578896	TRUE	45	AACATTTGGAACAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIIYNECNPELPSSSLLIIHRFTDEESRVFLLDRGNTRDKEAPKEKGSEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKDSGKQKFNDSEGDDTEETEDYRQFRKSVLADQGKNFATTSHRNAEEEGPKYKSKVSLKGNRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKGMFTMVN	577839	582963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_578568_578703_581363_582400
913572	contig_960_pilon	-	3883	13	Intergenic	novelGene_108240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_2	414.798913799071	346	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	408	1916	487192	443706	FALSE	85	TAAAAAAGAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVEDRFRKTNQSSPEAQSKQTGRVLEPPVPSRSESFSNGNSESVHPALQRPAEPQVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRCRVAFFFPLPLSNIGLDQCIGSL	490091	441738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_443929_445281_445389_449139_449302_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758
913573	contig_6412_pilon	-	4276	3	Intergenic	novelGene_149935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1526	1957	99721	99290	TRUE	35	GTAATACTTATACTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPNREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFIENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINKSSEMDSVTEGLKSRFEMVGDRISGIEDKHLDTTLFENNQKKE	110326	60191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_60876_97654_100644_109723
913574	contig_14508_pilon	-	1163	15	Intergenic	novelGene_79041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1242.33196621745	13	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1005	157	1161	172340	37044	FALSE	50	TGAGATTATCAAATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCARVKVLGGAAGGIEAKVLLLQVVAACTCCRARVPVHSRRPPPSPAPAVRAMAPRKNAKGGGNTSSSSSGSGSTSAGSSSSSGSSRARREAKHGGHKNGKKGGLSGSSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEILAKAKDFRYNLSEVLQGKLGVYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHGEDLYQEEDEPTRDQQLEDEDFLTGSDADDKIENLETETFHEETEDSYQVEETAPQDYNQDMEEIIYEQENPGSSEPVVDDERLHHDADDITYQVYDEQVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPETSRKTNDPEQKEK	172496	37041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_37085_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387_63421_64057_64106_64597_64655_65526_65560_69277_69404_74524_74600_77847_77941_109280_109350_110781_110827_111889_112040_172225
913575	contig_11779_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_146441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGGCACCATCTAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7595	5651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_5700_7600
913576	contig_13740_pilon	-	4787	8	Intergenic	novelGene_34624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	3598.3569152873	29	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	191	907	161718	159956	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGQFLHIFWIMRSNRIVCFLVHVVYIEFLNGITVYCEYL	162106	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919
913577	contig_18511_pilon	+	2293	12	Intergenic	novelGene_126855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	386.396511970294	7	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	219	1373	47371	55982	TRUE	15	TTATACCTTGGGCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGA	35352	61450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35547_47346_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_55976_56134_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
913578	contig_12479_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_56851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTGAAATGGCGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233689	235964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_233700_236000
913579	contig_4083_pilon	-	2450	2	Intergenic	novelGene_152335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	35	junction_1	0	110	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	259	1296	143757	142720	FALSE	40	TTGAGAACTAATCTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSTQDRIPVYSAFRAARPGAGGAEQRWLVEPQIDDPNSNIEEVINEADAITLVNNLGSKQALNTDYLDSDYQRGQLYPFPLSSDFQMATFTLTNAAPMTPSFRERWYMNLNSLMDRALAPHCGNGEDLYIITGAVPSDHKVKDKVKIPEFVWLAACCAIPGGWAMGFVKHTQDGDVIEDVMVKDLEKLLPSDPQLFHNNCGETEQDTEKMKKILEMVNQVQDEERGVQSKVSAIPLSSTRNKRSALLSPEAPEESSSLLGKLMGIIATPFIKLFQLLCYLVVGILKYSVYFLWYITKQVINGIESCLYRLGSATISYFMAIGEELVSIPWKVLKVTVKIIRAILRILCCLLKAVCRVLGIPVRVIVDVATFPVYTMGAIPIVCKDIAMGLGGTVSLLFDTAFGTVSGLFQVVFGICQRIGYRVTFDNSAEL	179548	141565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_143920_179452
913580	contig_16970_pilon	+	2952	1	Intergenic	novelGene_157592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	814	1113	22403	22702	NA	25	TTGTAACTGTAGATCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSYITREDQYSKPPHKKLKDRQIDRQNRLNSPPSIYKPNCTTVYNGYGKGHSGGSSGGGGGGSGGGPGIKKTERRARSSPKSNDSDLQGNAQDVCHQE	21589	24541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_21600_24500
913581	contig_10861_pilon	-	3025	2	Intergenic	novelGene_39291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAAAGCTCAGCAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449690	1397145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1397329_1446848
913582	contig_10403_pilon	-	2687	19	Intergenic	novelGene_175802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_11	89.5471632406323	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1446	1240	2685	87545	73334	FALSE	35	ACTAGCAAGTAAGTAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFEQSPSGSVILGSRPKCLEPTVALLRWSSQPLDTSENCSVLALELFKEIFEDVIDTASSSSADRFVTLLLTTILDQLQFTEQNLDEPLLRKKCERMVKAIEVLLTLCGDDTLKMHLAKVVTTIKCTTLIEQQFTYGKIDLGFGTKVADSELCKLAADVILKTLDLMNKLKQLIPGMEVSFYKILQDSRLVTPLAFALTSDNREQVQSGLGILLEAAPLPDFPALVLGESIAANNAYRQQETEHVPRRMHLQSLNHSFPASVKCLTPPLLKDNVPGLNIEELIEKLQSGMVVKDQINDVRISDIMDIYEMKLSTLASKESRLQDLLEAKALALAQADRLIAQYRCQRTQAETEARTLASMLREVERKNEELSVLLKSQQVESERAQSDIEHLFQHNRKLESVAEEHEILTKSYMELLQRNETAEKKNKDLQITCESLNKQIETVKKLNESLKQQNEKTIAQLKEKEEQRKEVHSLLVDREC	106906	73331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_73407_73614_73729_75435_75633_78426_78538_78630_78706_79188_79385_81793_81913_83422_83523_84568_84711_86339_86500_87386_87575_93365_93442_96017_96164_96315_96439_98355_98453_99047_99143_99953_100067_101987_102136_106494
913583	contig_11338_pilon	-	2321	6	Intergenic	novelGene_6298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	241	junction_2	92.007391007462	15	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	913	1716	207307	198987	FALSE	30	GTATGTGTGGATGAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGIDQTKPQVLCAIIAGALHYLYLAAFTWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSVNKLMRKLMFPVGYGVPAVIVAISAASRPHLYGTPERCWLHLDQGFIWGFLGPVCAIVCVNLVFFILVLWILKRKISSLNSEVSTIQNTKMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQFMTYLFTIINSLQGVFVFLVYCLLSQQVWKQYQTWFREIVKSKSEPETYTLSSKFGPDSKPSQVREPVAYSSVSPP	208219	198381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_199137_201710_201880_204304_204397_205510_205578_206701_206938_207217
913584	contig_7078_pilon	-	2545	3	Intergenic	novelGene_130214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGCTCTCTACAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	960820	957608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_958594_959199_959984_960044
913585	scaffold_12124_pilon	+	1937	11	Intergenic	novelGene_22221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	5	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	TRUE	30	CGAAATGTGTGGTAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508065_1508224
913586	contig_7253_pilon	-	5113	1	Intergenic	novelGene_140192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3375	3734	151562	151203	NA	80	TACAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALLTVAKGWKQPKCPSADKWINKMWYRHTVEYYSASRRNEVLLHATIWMDLEDNMLIEISQSQKDKYCMTSLTYIKKIRQMYRDQSLFVVTGGRKGECHGLNYVPPRCLSTWLVI	154936	149823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_149800_154900
913587	contig_2100_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_50594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668422	669900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_668400_669900
913588	contig_15720_pilon	-	1098	8	Intergenic	novelGene_41890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_6	1144.15679673295	22213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	103	1056	283894	278542	FALSE	10	CTTTTTGGAAGTGTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHSKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR	283996	278499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_278608_279004_279116_279713_279855_280270_280382_281459_281556_281786_281935_282577_282750_283785
913589	contig_10689_pilon	+	1540	1	Intergenic	novelGene_118607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	220	543	45923	46246	NA	35	TAACTCATAGCGACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHLQCCIHLLKHLNWYSNNSWTLVFHQCLQCSLYFFLQYHGFLIICCLLKWVYSFHLLLMLPASFNTFPIESFNIATQGLNSFFSSFSLRNASFLVFWLSNSGSL	45703	47243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_45700_47200
913590	contig_3004_pilon	-	2167	10	Intergenic	novelGene_127502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_6	33.7902023932645	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	278	1567	296169	288072	TRUE	50	AAAATTATTTAATGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETQEISHEPLSSITVSTGSLLSYENTDLSLTDPESFAEQVDSRQQESTAGKEEETDLLSSAVPPIQATYQRQSSSDIHKSPLLLVEELTSGQMHIQQIIDKYINEANLMPGKTNFMVPSVDLDLSELEQTFPNLHRQLFKPLEPHPDFDLLSSFSGISQDSRDFYKGSESSSESQHATGSSKSTVSFSTPRNLHFSLNVSLDPQLDPNSAHVAAQSCVTENVIEGSEQSFQQLLPEFSSQEGSQHVDLPSIFSIEERDSSQGLENQNYPSEEVLQIKKEGVPFPVSLENLLSSSDEVNVFNQLNVQHNTPCGSTSSECSIKDQPEDRKRRLSFKELSERRLGVMLDDQGLTEDDKNEAGGVLDIRPHAEEIDSQLHVRTVEMGTSLHTPHSLTIRNEKYFENSTKRETPEILKNLSQSAQSELFLSSGTFSVQNCIPVWETESGHGIMEEPELTLVSTSDISIAETDFENLTLEERSETEAKSCFQVSEFLPLVPETETSACPSVSEHSGEELVTQPAGMP	296819	287226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_287297_287378_287479_287553_287654_287741_288180_289880_290022_290784_291429_292146_292322_295191_295341_296096_296346_296718
913591	contig_16934_pilon	-	2664	5	Intergenic	novelGene_132530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	66.6989505164811	47	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGGGGAAAATAGTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208144	183264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_185572_185729_185822_193540_193592_201300_201390_208019
913592	contig_14684_pilon	+	4583	4	Intergenic	novelGene_99656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTAGCTTAGGATATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262837	457393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_266818_346676_346684_443379_443958_457375
913593	contig_16870_pilon	+	2449	3	Intergenic	novelGene_155535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_2	7	9	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCCCACTATCTCCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310906	315258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_310989_312531_312581_312940
913594	contig_15105_pilon	+	3750	1	Intergenic	novelGene_150976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623079	626829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_623100_626800
913595	contig_4125_pilon	-	6150	18	Intergenic	novelGene_25256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	212.193585310817	154	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	2827	4062	3027134	3010848	TRUE	35	GAACTGAATTTGAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSMKSQCVMVGAVSTLGSGLPASAPFQVEMLPYDERPLPAIRKQQGETHMEYELSDPDVSEAQKGGISGEPEPLTEKALREASSAIDVLGETLVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRFSVSALAHRVYEVRETAVRIILDMYKQHRAFILEYLPPDDNNTRKNILYKTIFEGFAKIDGKPTEAEIRAQKKAATEEVERQKKEEIKVLQGQLAALKEIQVEVQEKESDAMKLKNQDTQGRKADPPNAPETPDNHYLDQWWR	3036592	3006376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760_3017869_3018214_3018422_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3026849_3029216_3030519_3030676_3031086_3031256_3034948_3035026_3035495_3035559_3035743_3035883_3036451
913596	contig_13145_pilon	+	2968	1	Intergenic	novelGene_116643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAAGGGAAAATTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160177	163145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_160200_163100
913597	contig_11742_pilon	+	4140	5	Intergenic	novelGene_166536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	51	junction_3	446.758044135749	651	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	334	729	151161	152752	FALSE	25	ATGTGCAACTTCTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGKAVEHMFETEDGSKDEWRGMVLARAPIMNTWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPDSNDSPPAEREPGEVVDSLVGKQVEYAKEDGSKRTGMVIHQVEAKPSVYFIKFDDDFHIYVYDLVKTS	72789	156163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_72827_115621_115831_129991_130041_151122_151357_152552
913598	contig_5429_pilon	+	4310	2	Intergenic	novelGene_127782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGAGTCTCGCCTCGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115070	158511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_119162_158292
913599	contig_9646_pilon	-	825	2	Intergenic	novelGene_117479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTATGTTTTCTTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436185	430846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_431183_435696
913600	contig_8453_pilon	+	3652	1	Intergenic	novelGene_125141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256840	260492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_256800_260500
913601	contig_4857_pilon	-	2346	7	Intergenic	novelGene_48693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1767	2171	1135132	1134728	FALSE	50	AAAAAAAAAGTCCTCCGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELENNILTHTKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIRTAPQNKMGLMRHSSPGTRTRRQKKTRKLVIGNPRLSKDSVDMQWGC	1145945	1134552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1136236_1137331_1137424_1137632_1137784_1139970_1140131_1141537_1141631_1143087_1143159_1145849
913602	SIRV6	-	854	9	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	276	1	NA	NA	-8519	441	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	18	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCGACATTTAAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11066	1103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1183_1466_1533_1637_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035
913603	contig_15188_pilon	+	5131	5	Intergenic	novelGene_163075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	10.6301458127346	152	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	442	2406	110021	125134	FALSE	25	TTGAACATAACCCTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPAPKLEETALSSQDPASPFKENPEDKESVTFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYRNLLALGPPVCKPDVISHLERGEAPWCSQRGGHAAACPEWEPPPPMREERMYKEEPTREATLEKLKKPSRHSCVWGDAWGWKEQADALSGSEGVLWKPAPATCEDVSREQDSSPGLGESEGGSPFRSALFVQQSIPAEAGFHDNIHVTSFRSIEAVTQHQRTCAGRNAFRSIDHGKYCRAGKLRGTGPGDGLFACGECGKAFRQSSSLALHRRWHTREKAYKCHECGKAFTWSTNLMEHQRIHTGEKPFFCSECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCTACEKAFSCSSLLNMHLRVHTGEKPYQCAECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYKCSACGKAFTCHSSLTVHETIHNGEKPFKCSECEKAFNNRSRLTLHQRIHTGEKPFKCSDCGKGFSCHSYLIVHQRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHSYLIVHQRVHTGEKPFDCSRCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCAECGKAFSQNHCLIKHQKIHTGEKSLKCNECGEMFSWSSHLIEHQRLHSPEKPFAVQFSKHLLSTYYVPGSLLHAGGPGLGDVDAVSAMDVAELLCAVQPSPSRTFPLGNKPGN	109579	127859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_110055_110466_110520_117665_117793_118407_118504_123479
913604	contig_12790_pilon	+	1937	4	Intergenic	novelGene_35263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	514	junction_3	72.8209371601938	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	128	610	308748	310194	FALSE	75	ATAAGTAAATATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQIPWKHAAKHGWDINKDACLFRSWAIHTGRYKAGEKETDPKTWKANFRCAMNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	308620	311521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_308842_309578_309756_309873_309924_310032
913605	contig_8377_pilon	+	1440	4	Intergenic	novelGene_35149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3811.77170821595	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2	640	192289	197939	FALSE	45	ACAAATATTATTTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFQRKVKVIVMLTELKTGDQGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	192287	198739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_192352_194358_194523_196081_196218_197663
913606	contig_6842_pilon	+	2322	1	Intergenic	novelGene_130840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAACACCAACATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1864430	1866752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1864400_1866800
913607	contig_7410_pilon	-	2510	2	Intergenic	novelGene_106069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGCTGATTACCGACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321971	319015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_319673_320118
913608	contig_2924_pilon	+	3152	2	Intergenic	novelGene_140243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	177	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCTAGCTTGGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17804	69047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_17944_66034
913609	contig_16322_pilon	-	3571	6	Intergenic	novelGene_87547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	129.587962403921	118	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	14	499	108570	91465	FALSE	20	GCTTCTCTATACCTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRNKMAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFSMG	108583	88392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
913610	contig_7411_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_137050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCCTTTCGCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921031	919765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_919800_921000
913611	contig_19352_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_122421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATTAAATTAATCGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365204	366425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_365200_366400
913612	contig_3469_pilon	-	2429	3	Intergenic	novelGene_34151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	TRUE	50	CCCAAACAATAGAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	350027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_350429_379062_379312_531824
913613	contig_2311_pilon	-	2349	2	Intergenic	novelGene_169827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	0	112	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	14	547	534789	512643	FALSE	65	AGTCAAAGGTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGPWMTAPLRLHPHYFQLPLLSGLHREEGLEPWPTVRTMILRLFLALNFFPSIQATAENKIFVKQAPMLVAYNNAVNLSCEYTNNLFSKEFQAALYKGVDSDVEVCVVNGNYSLQPQFHSNTGFNCDGKLGNETVTFYLWNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYILNEKNNGTIIHVKGNIQL	534802	510840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_513017_534629
913614	contig_8594_pilon	+	2961	1	Intergenic	novelGene_140020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTCAGTTTCTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167318	170279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_167300_170300
913615	contig_10259_pilon	+	2676	3	Intergenic	novelGene_177188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	40	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGATTGGGTTATCTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30717	109616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_+_30864_31804_33887_109168
913616	contig_8443_pilon	+	3021	2	Intergenic	novelGene_150604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	464	763	712764	713063	TRUE	10	ACTCACTTTCGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVSRRLPGGVGCFWALTGGARLADPRSEGAEYLCAEGFLAEWGASGHLYGWSYRALECLPQQGRCGHEARGPRGHRKQKQKLKRQGTQEAELLQSQKV	712300	829763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_713465_827906
913617	contig_11304_pilon	-	3075	1	Intergenic	novelGene_156717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437106	434031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_434000_437100
913618	contig_4315_pilon	-	2117	8	Intergenic	novelGene_46808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	289.64200281713	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	12	722	344558	338005	TRUE	55	AATATTGATCTTAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMAVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRAVNPQRDCLLSLEVQSKPSSQEDGEPGPPRCLGRCPG	344569	327103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_335678_335775_337185_337333_337998_338117_339015_339142_340931_341095_343485_343698_344460
913619	contig_9535_pilon	+	5555	2	Intergenic	novelGene_124487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	183	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2976	3623	374783	375430	FALSE	30	CTGAACAGAGTATGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRNPSPDPLSESESEEEENANYLNESSGEEWDSSEEDPVVPNLTPLESLAWQVKCLLKYSTTWKPLNPNSWLYHAKLLDLSTPVHILREIGLRLSHCSHCVPKLEPIPEWPPLASCGVPPFQKPLISPSRLSRDHATLNGALQFATKQLSRTLSRATPIPEYLKQIPNSCVSGCCCGWLTKTVKETTRSEPINTTYSYTDFQKAVNKLLTASL	371583	377362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_373931_374154
913620	contig_13004_pilon	-	3458	7	Intergenic	novelGene_112690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	31.1483903632631	328	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	147	773	832347	819971	FALSE	35	TTATTTTGAAATAATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGRHGGSSRGRQLRNDISEIGRSAKSYCEHTARTQPTLSDIVVTLVEMGFNVDTLPAYAKRSQRMVITAPPVTNQPVTPKALTAGQNRPHPPHIPNHFPEFPDPHTYIKTPTYREPVSDYQVLREKAASQRRDVERALTRFMAKTGETQSLFKDDVSTFPLIAARPFTIPYLTALLPSELEMQQMEETDSSEQDEQTDTENLPLHISTDDSGAEKENTSVLQQNTSLSGNRNGEENIIDNPYLRPVKKPKIRRKK	836497	817285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_820115_827778_827922_829552_829701_830675_830801_831944_832008_832343_832443_836446
913621	contig_10765_pilon	-	1414	3	Intergenic	novelGene_122875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2	427	85710	85285	TRUE	45	GCTGAAATGAAAGTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSSASQISFSPWLSVNWTPFSLSFTFLACPCKSKFGARLKALICLLLLFVGTKALLGLSGPGRWLLKIFVSINESIFSVEDGKFSSSINSFFSINSSGLLPGPDAPSDVEINVTRPPSPSGQACLRHLPFFGLCSHINV	85711	32033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_32121_34727_34873_84529
913622	contig_3601_pilon	-	2445	2	Intergenic	novelGene_132900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194716	192078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_193002_193194
913623	contig_3077_pilon	+	3045	8	Intergenic	novelGene_26875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_7	60.5208683860706	6	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	1290	2228	1338455	1346705	FALSE	65	TAAAAAAGAAAGAGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337165	1347522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
913624	contig_3077_pilon	-	1631	9	Intergenic	novelGene_26663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGACAGGGCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18016	9616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9705_11258_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17048_17444
913625	contig_17440_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_7573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAGTTCAATTTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2199	1512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1500_2200
913626	contig_4315_pilon	-	1842	6	Intergenic	novelGene_46823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	251.269098776591	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	137	1624	366414	353236	FALSE	20	GTCACTTCTGTTTAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEEEPDEALGSPQEVEEGGESSPRLRYETGQDSEGNGSSSSVALGQDQARGWVASGNKASGDKLSEHSEVSPSVDLCSARSWSSGTVSLGHPSDILDSTWEGETHIPQPTPLVETLPQSLGCHLLNPDDRTRGSVAQATPTEFHDSSAAPPQSLQCPGDGWRETTSLSHLQPGDQAWKRTRIPAKPLPSRFIGSVSPPNPRPRPAQQDRLPRQGATLAGRSSSDASKYGQGRLNYPLPDFSKVGPRVRFPKDESYHPPKAKSHSWQSQGPAGPLIFKSPAEIVQEVLLTSEEASPAKDPPPAHPITRVPQEFQTPEQATKLVHQLQEDYHKLLTKYAEAENTIDHLRLAAKVNLYSDPPQPSHSAHMGTVSQGTKVLSFTIPQPRTAEWRPGPTEAPQPSEVSGWQSAQGDPRPSSPTNASTPGWLQKNQVVASDQPSGERTQSVASQASRFLAKVESFEGLVHAGRLMPQDQLKVLPSLGDAHGASRQLLHLQ	376068	353017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_353356_357009_357165_357923_358081_363155_363231_365433_366498_376015
913627	contig_5794_pilon	-	5862	3	Intergenic	novelGene_69765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAGAAGGAGGCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715445	701519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_702649_704874_707482_713319
913628	contig_15531_pilon	-	1530	2	Intergenic	novelGene_176726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	291	983	288275	287134	FALSE	65	ACTAAAAAAGAAAGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVRKDIEKDNAGQVTLVPEEPEDMWHTYNLVQVGDSLRASTIRKVQTESSTGSVGSNRVRTTLTVCVEAIDFDSQACQLRVKGTNIQENEYVKMGAYHTIELEPNRQFTLAKKQWDSVVLERIEQACDPAWSADVAAVVMQEGLAHICLVTPSMTLTRAKVEVNIPRKRKGNCSQHDRALERFYEQVVQAIQRHIHFDVVKCILVASPGFVREQFCDYMFQQAPPFRH	288565	286586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15531_pilon_-_287152_287600
913629	contig_15327_pilon	-	1802	7	Intergenic	novelGene_70417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1436	1771	29775	29440	FALSE	25	AGCTCCAACTGGGAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRDITSQITPSGQWGACPQTPPLWSLFFWGLCLLFSQHSRARGAWEPAWLSPRLDRQHKVDTGVPAPPHFSLPLPELSPITATWLSETRCLPAARDLRGWDLSAGVSFL	33695	29408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_29941_30441_30510_30604_30657_31689_31756_32349_32408_32487_32566_32747
913630	contig_5023_pilon	+	1483	5	Intergenic	novelGene_7285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2933.6510528691	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	68	520	607279	618824	FALSE	45	ACCTCAACTGCTCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSVEKRQRSRALSSDNPGSVSEYLVLFWLLLVF	580861	619787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_618729
913631	contig_5780_pilon	-	2127	1	Intergenic	novelGene_29796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAGGAACAAAGGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113728	111601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_111600_113700
913632	contig_6059_pilon	-	1893	15	Intergenic	novelGene_44865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	4658.69413745167	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	683	1774	576206	569146	TRUE	55	AAAAAGGAAAGGAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGKELNGKQIYVGRAQKKGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584308	568126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576149_576217_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
913633	contig_8284_pilon	-	2358	2	Intergenic	novelGene_125661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTATTCAATATCACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189837	187273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_189162_189367
913634	contig_11986_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_69102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1990	2385	50380	49985	NA	75	TAAAAAAAGGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYRFKLREGTRSGSGLGRCVRPALAGVSPDTCSATSASTAGVSCKNSPGTSSVLSGLVMGHGRVGVTSKGRENIALNSIRILNLENKIETKKDKFLKMTRIQRRHLNITDETLLLFSNKRGPPSRSAAV	52369	49648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_49600_52400
913635	scaffold_880_pilon	+	6754	37	Intergenic	novelGene_121463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_26	493.896383988873	2	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1179	3540	64	3603	456080	554445	TRUE	40	TTAAGTACCATTTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLRLEISPAPEILNCCLTPEMLPLRPFSENRTRPHKEILEFPTREVYVPHTVYRNLLYVYPRRLNFASKLASGRNITIKIQFMCGEDASNALPVIFGKSSGPEFLQEVYTAVTYHNKSPDFYEEVKIKLPAKLTANHHLLFTFYHISCQQKQGALVESLMGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAERVPLQNPPIKWAEGHKGVFNIEVQAVSSVHTQDNHLEKFFTLCHSLESQVTFPLRLLDQKISEGMLEHELKLSIICLNSSRLEPLVLFLHLVLDKLFQLLVQPMVIAGQTANFSQFAFESVAAIANSFHNSKDLSKDQHGRNCLLASYVHYVFRLPEPHRDAPKSGGPTPVPDPRYHTYGRTSAAAVSSKLLQARVMSSSNPDLAGTHSAADEEVKSIMSAKIADRNCNRVSYYSAGNSDLPNSTSAPRPASKKHFHEELALQMVVSTGIVRETVFKYAWFFFELLVKSMAQYIHNLDKQDTFRRTRFSDRFKDDITTIVNVVTSEIAALLVKPQKENEQAEKINISLAFFLYDLLSLMDRGFVFNLVKHYCSQLSAKLNNLPVLISMRLEFLRVLCSHEHYLSLNLFFMNADTAPASPCPSISSQNSSSGSSLQDQKIASMFDLTPEYRQQHFLTGLLFTELAAALDAEGEGISKVQRKAVSAIHSLLSSHDLDPRCAKPEVKVKIAALYLPLVGIILDALPQFYDFTAADARGGKSRCNGSDEEQEGGSTINQNVALAIAGNNFNLKTSGVILSSLPYKQCNVLSADTTRNLMICFLWIMKNADQSLIRKWIADLPSMQLNRILDLLFICVSCFEYKGKQSSDKVSTQVLQKSRDVKARLEEALLRGEGARGEMMRRCRTPGNDRFPGLSENLRWRKEQTHWRQANEKLDKTKAELDQEALISGNLATEANLIILDMQENIIQATSALDCKDSLLGGVLRVLVNSLSCDQSTTYLTHCFATLRALIAKFGDLLFEEEVEQCADLCQRVLHHCSSSIDVTRSQACATLYLLMRFSFGAVSNFARVKMQVTMSLASLVGKAPDFNEEHLRRSLRTILAYAEEDTAMQTTLFPAQVEELLCNLNSILYDTVKMREFQDDPEMLMDLMYRIAKSYQTSPDLRLTWLQNMAEKHTKRKCYTEAAMCLVHAAALVAEYLSMLEDHSYLPVGSSEHLLQRAGGVCSL	456016	579521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_456181_479497_479616_482290_482362_484798_484938_485540_485643_488541_488638_490479_490715_492352_492518_493177_493348_496770_496867_501313_501410_506103_506254_509157_509272_510289_510446_514145_514286_525271_525442_528125_528272_534033_534217_534657_534791_535969_536058_539121_539219_541591_541727_542997_543151_544244_544404_546050_546152_547343_547525_554400_554549_556534_556668_557474_557610_559501_559592_563957_564195_567763_567909_569211_569319_575187_575319_575843_576931_577881_578360_579016
913636	contig_10598_pilon	-	3026	3	Intergenic	novelGene_178934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGGTTGACGTTGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170054	74189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10598_pilon_-_74753_159566_160064_168088
913637	contig_9366_pilon	-	4338	27	Intergenic	novelGene_166228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	3937	4338	778817	710011	FALSE	15	ACACGCGGGCGCGCGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSSSTVVFPLLRGFFLALWKGEAPSLRGRPRGLLSAAAGLGAGAPGSSGGGGGGCGCSALRSSSDDILVTRKDTWIPALLPGAPPAAGAAAAAALVPPPRLSLSHLPQPREQPQVPGEEATWSEQDAHSHTS	998991	710010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_710368_778772_778859_845089_845226_855677_855882_859063_859207_869111_869230_918087_918251_926693_926866_928718_928834_942410_942579_942982_943138_943922_944038_944953_945026_946753_947470_950768_950875_961763_961897_964176_964294_968999_969099_969269_969377_975721_975905_976156_976320_977277_977390_977889_977953_979021_979237_986836_986966_996450_996572_998921
913638	contig_18869_pilon	+	2009	15	Intergenic	novelGene_56428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.38882882049645	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	194	1822	104931	113872	FALSE	50	ATTAAAGAGATAGTAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EISERKRKDHHFFSLLQFSQRLLRTDYVPDTVSSAGGTKVYLLEAGNALSLEETAVEGVHQPAKMKCLEGPCLTDQGPGKHCGPLTPEEELVPASQLEEEEEVEEEEEEEDLDPDRAPDLEEEENDLRDPAVLSAVHNTQRGFHGSSRIKAPGVLGKSSTSLHFLWQPNASSPLRPFGLRLPSSDPSLFYSPPTSWSPAFSLPSHLTQLHPWHQRILQQQQRDQKPSPPAKKPWSQQPDPYANLMTRKEKEWVIKVQMVQLQSEIPHLDDYYYQEHYQKLEKQADEELLGQRSWVESLKLVTPYIQKAEAYESVVRIEGSLGQVAVSTCFSPRRAIDAVPHGTQEQDTGAANSQRLWVLYRIEKMFLQLLEIEKGQKDGFAKPSSSEQQSIQVEKLFQTLMTQEQNNLEALKMPPTPRLACREAADGFLQVLSVRKGKALVARLLPFLPRDRTVSLLLAITHHLPFLVQRDVADQALQILFKPLGKFISHLTFHELLQGLQGLTLPPASEKPVTVVLQNQDKHGCFDCLGDSPDAYSLSGRTPNLPQQPSSPVLPPRGQTIGTAAGSQDGVKRWQKQDYSPLFKPNLDLPGPTDLAVLEHTYVEKV	94433	114059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_94552_104855_104947_105508_105721_106311_106393_107259_107361_107868_107947_108169_108312_109773_109892_109985_110084_110307_110362_110456_110591_110694_110894_111620_111756_113277_113480_113813
913639	contig_4674_pilon	-	1088	5	Intergenic	novelGene_174147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	144.418662228952	33	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCTAAATCCATCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357391	334723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_334987_351305_351399_354635_354712_355292_355384_356826
913640	contig_3700_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_138081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGTCAGGTTTATTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254442	256799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_254400_256800
913641	contig_13496_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_107644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAAAGAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351461	348766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_348800_351500
913642	contig_12627_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_177366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAGAAAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3799	7533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12627_pilon_+_3975_5737
913643	contig_14167_pilon	-	3926	3	Intergenic	novelGene_105540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	3023	3475	66541	65997	TRUE	10	TTTTGCCGCAAGTCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKSEKKTNLKKKTGKKKQKKSNKKRNEKGKANKQFKTNKRTKAPGSLQRGSPDREAAPHSELQSLSGRSKDGAWSQVFERKEGEVVRGKEEMKRSREKSNTSSQQTALREPASAGWWIPRSWCFLDKRLCPREAEGPSVGEEG	69563	65381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_-_65702_65865_66349_66440
913644	contig_12873_pilon	+	2035	3	Intergenic	novelGene_27201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1198.5	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1174	1905	17632	19334	FALSE	45	GAAGTGGGAGGAGAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	16018	19464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16245_16684_18014_18984
913645	contig_2739_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_165843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCAACACCTGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280834	247865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_249013_280230
913646	contig_15105_pilon	-	3061	2	Intergenic	novelGene_151020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATAACGTCTATTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835992	828354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_830541_835117
913647	contig_13901_pilon	+	1253	6	Intergenic	novelGene_146631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_1	59.700586261778	50	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAATGATTTGCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106599	138225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_107323_119255_119371_120602_120748_120858_121009_135113_135190_138181
913648	contig_253_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_129737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTCTATGAAGGATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642643	644438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_642600_644400
913649	contig_9678_pilon	-	603	1	Intergenic	novelGene_146364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218558	217955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_218000_218600
913650	contig_12644_pilon	+	1364	10	Intergenic	novelGene_44621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4617.72161499372	31	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	53	1069	2675526	2680331	FALSE	30	TGAGAAATATGTGTTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEKSPEEEPTEKPENHVEAQPICKDHAPEHHSSTGQESQTQGG	2675473	2680626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679938_2680123_2680229_2680311
913651	contig_11493_pilon	-	2012	11	Intergenic	novelGene_143673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	296.083856365051	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	271	1536	201958	156713	FALSE	80	AAGTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNLLKLSLPIGSEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTGPIFTFEIYLPSECVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPFVAENLTEADYDLVGQLYYKDCHALDQWRKGWFAMDKSTLRFCLQMQEAQEDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTIWRTAIEKAAGTDGNALEDQQLSKNDVPIIVNSCVAFVTQYGKYHRVFNSTPRTQYHSYSF	215251	156236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_156939_183434_183499_184764_184964_185815_185919_188014_188160_196944_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212281_215218
913652	contig_4974_pilon	+	4260	6	Intergenic	novelGene_161392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.6654593089768	4	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	216	608	41473	81861	TRUE	70	ATAAATAAAAGGAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVVGRHGCWGPCGVRLSAQSTQEEEADDETVLPPGSRSSGSQPGGRRVRRPELGATELPCRGLKKCPDGLMGSAGRLHCLTMTAKNPTPRDVAPAPLVTCKLCLCEHSLDKMTTLQECRCIFCTACLKRYVQLAIREGCGSPISCPDVVCLNHGTLQEAEIAGLVPVDQFQLYQRLKFERGTRSAFYPDGSCGFTVSSLH	20889	100301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_21079_41446_41638_67772_67878_81738_82147_82790_84914_99057
913653	contig_10058_pilon	+	2141	10	Intergenic	novelGene_67727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	152.47351520676	21	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	64	882	72602	99369	TRUE	30	ACATTGAGTTTGTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72538	101640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_99764_100649
913654	contig_6364_pilon	+	3525	7	Intergenic	novelGene_51859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.9338912036228	86	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	128	2176	2205208	2236315	FALSE	30	ATAGTCATGTTCATCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPYTPPSVPPPGGSHRTIQTRVLSVHIQRSPRLHASWQRRPRRTSRGKKAPASVVRCTTLLHRTPPATQTQTFRTPNSGSPASKATAAESAFSRRVEGKAQNHFEETNSSSQNSSEPYTCGACGIQFQFYNNLLEHMQSHAADNENNMASNQSRSPSAVVEEKWKPQLQRNSANNTTTSGLTPNNSMIPEKERQNIAERLLRVMCADLGALSVVSGKEFLKLAQTLVDSGARYGAFSVTEILGNFNTLALKHLPRMYNQVKVKVTCALGSNACLGIGVTCHSQSVGPDSCYILTAYQAEGNHIKSYVLGVKGADIRDSGDLVHHWVQNVLSEFVMSEIRTVYVTDCRVSTSAFSKAGMCLRCSACALNSVVQSVLSKRTLQARSMHEVIELLNVCEDLAGSTGLAKETFGSLEETSPPPCWNSVTDSLLLVHERYEQICEFYSRAKKMNLIQSLNKHLLSNLAAILTPVKQAVIELSNESQPTLQLVLPTYVRLEKLFTAKANDAGTVSKLCHLFLEALKENFKVHPAHKVAMILDPQQKLRPVPPYQHEEIIGKVCELINEVKESWTEEADFEPATKKPRSATGENPTAQEDDRLGKNEVYDYLQEPLFQATPDLFQYWSCVTQKHTKLAKLAFWLLAVPAVGARSECVNMCEQALLIKRRRLLSPEDMNKLMFLKSNML	2198814	2237664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2198876_2205141_2205232_2217260_2217502_2221248_2221333_2224627_2224706_2234023_2234126_2234795
913655	contig_8544_pilon	-	1944	1	Intergenic	novelGene_55930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127266	125322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_125300_127300
913656	contig_3132_pilon	-	2319	9	Intergenic	novelGene_127423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	107.852909093821	12	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	132	683	229252	224837	TRUE	20	CCTGCTTTTTCTCAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKVREEQDK	229383	210768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_220009_221632_221776_222117_222250_223790_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
913657	contig_5423_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_85220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACAAAAAAAAAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397285	400004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_397300_4e+05
913658	contig_13592_pilon	-	4353	4	Intergenic	novelGene_33696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCACCGTCGCTGCCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261438	249299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_249570_255365_255593_256586_256713_257708
913659	contig_6838_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_171789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATTCTCAGATATTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37214	35967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6838_pilon_-_36000_37200
913660	contig_10951_pilon	+	2582	9	Intergenic	novelGene_61626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_8	31.6257410980359	31	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	911	1570	160598	209117	FALSE	55	TCTTACAACAAAGACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGAQYKLLVTKIKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSIVSIQNLMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSFFIQEKENQTWNLQRTKNLKVTIVPSIKGSVYVKSILLSFLIFFSFYLGCLLVAFVHYVRFRRKSIDGRFCSSDDKIHLTSAMISLIQCLLLNLAC	159687	210129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_160660_186217_186264_189499_189602_190250_190335_193060_193149_194837_194910_195358_195453_202326_202371_209049
913661	contig_16205_pilon	-	5219	2	Intergenic	novelGene_156882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	891	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	105825	103176	FALSE	70	TTTAAAAAAAAGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGGCLIRLRSSLDMQSKYHCYSRVFLHEEAVKTNVRKKVKHF	105895	98356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_103466_105785
913662	contig_5951_pilon	+	1954	2	Intergenic	novelGene_153239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	239	427	153192	153380	TRUE	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLLFCRHDTFRLLLQLAGSVAQIWYSRAGLAEEELLGWVVCGTYYSQQGGSVISVGQVLVGCACAVWWCDVKRTVQVGRMDGGEIVTCGAKMDMGERREEQEPKTYKQTKKRLGELAVGEMRDYEMEKNKKGKKKKKKRKE	152953	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_153406_153604
913663	contig_10331_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_54154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	43	396	458445	458092	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCFSRDWSLLVTCSCTSDKVLEFSLPKSILAVLLPRQICSQSIHGIFNILHQHHDSKASILLQSSLFTVQLSHAYEVTENTMAWVRRTLVLKVTSLRFDALKRSFASDLPNEIRLI	458487	456096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_456100_458500
913665	contig_18055_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_117794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAACAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23521	24655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_23500_24700
913666	contig_15327_pilon	-	2183	15	Intergenic	novelGene_70761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	76.0126197900516	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	91	825	1157860	1137332	TRUE	25	AGACTCTGTCCAGTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSEGV	1167413	1129698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137342_1138516_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375
913667	contig_4876_pilon	+	2738	6	Intergenic	novelGene_137899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCAAATCTTCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370983	396779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_372861_373083_373401_374340_374527_386279_386411_395661_395799_396689
913668	contig_8202_pilon	-	2651	1	Intergenic	novelGene_177153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAATAAATAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117666	115015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8202_pilon_-_115000_117700
913669	contig_13780_pilon	-	5365	6	Intergenic	novelGene_149121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1295.3055238051	170	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2345	2851	824289	822800	FALSE	75	AAAAAAAAAAAGCTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLIENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRVSKLCLGL	827964	820285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_822989_823722_823882_824130_825305_825624_826714_827630_827825_827918
913670	contig_9995_pilon	-	463	1	Intergenic	novelGene_47740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTCATCCCATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549661	549198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_549200_549700
913672	contig_15361_pilon	-	4798	1	Intergenic	novelGene_167874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	4000	4311	494947	494636	NA	20	ATGTCCCAGCACCTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVSSYAYKSWTVSKEDQRRINAFELYCWQRILNIPWTARSMNKSVLEEVQPECSLEASMARLHLIYFGHLIKGDQSLEKDIMLGKVEGQQKKRKTLNEMD	498946	494148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_494100_498900
913673	contig_9272_pilon	+	2947	17	Intergenic	novelGene_125894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_13	215.595940070772	31	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2433	514	2946	262760	303928	FALSE	30	CTGAGTGCCTGAACAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQTKYQPYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHTEVPNTRPHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDIVSEKPREDPVPKEETLVQPMLSPVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKINTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPRPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKNVASKAEVKKTRRPRSVPNTQPEQTNTGEAVSSPSSTEMRRHSQRRHTSVEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQDRLIISTPYQRNEKATQSMSSPEAASGPTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIKKEQVESVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVSFGKQVDSPSATADADISDVQSVDSSLSRRSFGMNKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLTLLPDGKFICMECQTGQHPCFSCKVSGTDVKRCSVGACGKFYHETCVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSVEKDIYKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSIFVSSYILICSNHSKRSSNSSSAVNVGFCFVCARGGRLLCCESCPASFHPECLSIDMPEGCWNCDDCKAGKKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAETCNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANKVVGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLE	251396	303929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_251829_262340_262413_262750_262914_267895_268051_269666_270183_272088_272216_276540_276642_278946_278993_281875_282007_282540_282670_283486_283614_289341_289540_290013_290188_298470_298628_302280_302484_303122_303236_303826
913674	contig_4686_pilon	-	2015	1	Intergenic	novelGene_118541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTATTTAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504203	502188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_502200_504200
913675	contig_2323_pilon	+	3309	2	Intergenic	novelGene_151854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1284	1592	136463	153471	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRVSEIEDKHLATTPFEEKSEKRMKKNEENLRIIWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTEDTERITEELLTENFSNIMKDEKLTIQEAQQNPYRIDPKRKSPAY	135179	155188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_136762_153461
913676	contig_8354_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_24064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACACTACAACGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28302	26350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_26400_28300
913677	contig_20662_pilon	-	1979	16	Intergenic	novelGene_177641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	220.355430056887	1	30	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	1227	1979	55438	13982	FALSE	40	GTGAGTATATTTTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPDMETEDDEVAETVYRDRKRQLPLELTVELTEETFNTTVMASDSIVLFYAGWEAVSMAFLQSYLDVAVKLKGTSNMLLSRVNCGDWSDVCTKQNVTEFPFVKMYKKGENPVSYAGMLGTEDLLKFIQLNRISCPVNITSVQEAEEYLSGKLFEDLLSYSSVSVLGIFSPTMTRAIEDFTEAGNYLRGYVITGVYSEEDVLILSNKYTTTIPALLLARHKEGKIESIPLANTQAQDIVQIITNALLETF	98719	13981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_14121_15770_15856_42625_42763_43103_43273_47171_47232_48321_48466_55419_55544_57085_57151_57534_57702_63603_63755_68470_68562_85171_85247_86052_86127_96395_96479_97514_97817_98606
913678	contig_21386_pilon	+	1109	1	Intergenic	novelGene_177034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77114	78223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_+_77100_78200
913679	contig_8687_pilon	+	4035	19	Intergenic	novelGene_169662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_15	32.7489986653065	4	27	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	83	2251	232985	328457	TRUE	10	TTGCTCATTTTTCATTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRVGNNFLRLCVLKVTQQSEKHLEKILNVDEFVKRIFSVIHSNDPVARAITLRMLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLDSHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLVTSYPSTRMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSREDIQALCECALQTPYDSLKLGMLSVLATLSGTIAIKHSSSLAPGDAGSSPRASDLVKLAYECCYHNSRGIAAHGVRVLTNIAVSCQEKDLLALEQGAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPHLSQSVVEALLTQLHSAQDAARILLCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLVELYKVIGRSATDKQQELLVSLATVIFVASQKALSAEVKAVIKQQLESVSNGWTVYRIARQASRMGNHDMARELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEEDYSSALSCIAEALKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGRISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELCTQFLDVKPVFPIDLLL	232902	341053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_233079_249705_249836_250659_250807_252258_252397_260931_260979_266534_266735_267221_267345_280565_280684_295435_295571_297034_297133_298711_298952_302183_302322_304021_304229_317426_317622_318320_318425_328402_328469_328570_328670_329958_330145_339565
913680	contig_16666_pilon	+	787	1	Intergenic	novelGene_61727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30650	31437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_30600_31400
913681	contig_7963_pilon	+	2007	10	Intergenic	novelGene_58562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_8	114.790630666831	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	38	1600	247452	253116	FALSE	5	GTTTCTAGTGTGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQVAAVGQEPQIFGRSFRENIAYGMTQEPDMEEITAAAKESGAHSFISVLPQGYNTEVGEAGGQLSGGQRQAVALARALIRKPRVLILDDATSALDADNQSRVEQLLYDSPHRFSRSVLLITQRLSLVQRANQILFLEEGTISEARTHQQLMENGGRYWAMVQAPEGPDAPE	247414	253523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251281_251519_251683_251956_252094_252903
913682	contig_7593_pilon	+	1970	1	Intergenic	novelGene_127334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGTTACAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547556	549526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_547600_549500
913683	contig_5461_pilon	+	2751	1	Intergenic	novelGene_156826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGCCCAGCGTTCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302364	305115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_302400_305100
913684	contig_19777_pilon	-	2218	11	Intergenic	novelGene_29702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATTGCCGACATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19477	5393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19777_pilon_-_5445_5560_5687_6101_6189_9829_9882_10496_10573_12875_12976_13206_13283_13382_13517_15437_15559_16872_17031_18240
913685	contig_3153_pilon	+	2717	3	Intergenic	novelGene_104633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	785	junction_1	58.5	94	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGGCTTCCCCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57816	65442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_57890_57973_58113_62937
913686	contig_14522_pilon	+	4098	1	Intergenic	novelGene_147324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCCAGAAATAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105921	110019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_105900_110000
913687	contig_17440_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_7536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTTATCAAACCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498	2142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_500_2100
913688	contig_1443_pilon	-	3949	4	Intergenic	novelGene_28164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	25.2234458831901	2	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAAGATGTAGTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343416	323404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_323931_323983_327123_331883_331945_343193
913689	contig_6915_pilon	-	4093	2	Intergenic	novelGene_162404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3170	3499	175956	175627	FALSE	40	GAGGGAATAAACGGCATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEIDDVIEGLRSRFQTVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVRWDTIKSKNLRVIGIPKRGENRKHREDH	179351	175032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_176026_176251
913690	contig_5018_pilon	-	4437	4	Intergenic	novelGene_47209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGATCACCTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1631124	1626176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1627291_1627450_1627597_1627731_1628247_1628462
913691	contig_10980_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_162570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATTTTCCCAAAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360442	357622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_357600_360400
913692	contig_8866_pilon	+	2758	1	Intergenic	novelGene_77890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	366	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1489	1794	1060801	1061106	NA	30	CCGGAGAGCTATTGTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISPGYIPRSGIAGSYGISISSFLRKCHAIFHSGCIILHSHQQCTGVPVSPQPRQHLLFSVFLISAIITGVRWYLIVVLICISLMANDHKHLFMSLLAA	1059312	1062070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1059300_1062100
913693	contig_11224_pilon	-	399	1	Intergenic	novelGene_124454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	50	153	196	348	81641	81489	NA	15	GTGTGTTATTTTTCTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKRKNIKHSGNTTFDEIVGIARQMRHRSLAKELSGTIKEILGTTQSVGCNVVGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	81836	81437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_81400_81800
913694	contig_8978_pilon	+	2780	18	Intergenic	novelGene_49420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_1	129.453816697073	104	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	916	2748	31	2778	426211	446196	FALSE	40	GGAAGATTTTCAGATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSDSDEDSAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGTLITELTANEELTGTDGALVNDEGWIKSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPVLIKKDKDQDTIASVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESDMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVDSEVNQKSLWNYDYAPPPPPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKCRMIEDFRKLEESSGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFTATLDDDKPWYSIFPIDNEELVYGRWEDNIIWDAQSMPQLLEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGTLSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEEN	426180	446198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_426331_427385_427501_427646_427764_431918_432039_433127_433370_433781_434001_434422_434642_434985_435194_436449_436627_436997_437126_437226_437335_437454_437629_441939_442114_442338_442444_444381_444583_444739_444882_445348_445480_446148
913695	contig_10437_pilon	+	3180	8	Intergenic	novelGene_38310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	1152.18617401522	23	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2699	3142	443902	451175	FALSE	20	CTGCTTTCTTCTAACTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431122	451213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_441868_442737_442910_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
913696	contig_6885_pilon	-	5128	1	Intergenic	novelGene_83651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1635	1967	152566	152234	NA	10	TCTGTCCCCAGCACTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFMPLQTSPREDWHPLALPFPPSFSTHPSPSSSFMESLSFSQHPRVWFCFLSFLSSQAVNLHRHLNIKSTAGLLYWIRPIGGILSDLNRAFEEISTFIFINVLHYLLTL	154200	149072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_149100_154200
913697	contig_18687_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_178195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAACTTCTGCAGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13478	16060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18687_pilon_+_13500_16100
913698	contig_19185_pilon	-	3713	1	Intergenic	novelGene_163653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	252	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAGAAACAGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143247	139534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_139500_143200
913699	contig_7342_pilon	+	2466	7	Intergenic	novelGene_71147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	17	junction_1	33.5331510929442	128	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	1639	2466	317937	329907	FALSE	15	CCCAGCTTCCCCAAGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQSQHHQQYIDVSHVFPEFPAPDLDGMLLQGDLTLRDVKALQLAYRRHCEATLDVVMNLQFHYVEKLWLAFWSSKATSSDGPASIPASEEELEGAIIAKDKLISLCKYDPILKWMRTCDHILYQALVETLIPDVLRPVPSTLTQAIRNFAKSLEGWLTNAMSDFPQQVIQTKVGVVSAFAQTLRRYTSLNHLAQAARAVLQNTSQINQMLSDLNRVDFANVQEQAAWVCQCEESVVQRLEQDFKLTLQQQSSLDQWANWLDNVVTQVLKQHAGS	316298	329907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_317974_320669_320789_321078_321192_325196_325352_327181_327280_328607_328758_329751
913700	contig_10054_pilon	-	4492	2	Intergenic	novelGene_171207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_1	0	177	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	4	999	76628	65831	FALSE	15	TTCCGTGATCCATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMFSAGVLGNLVALALLARRWRGDAGHGANRGSSISLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALEPESRACTYFAFTMTFFSLATMLMLFAMALERYLSIAHPYFYQRHITRRGGLAVLPAIYAISLLFCSLPLLDYGQYVQYCPGTWCFIRHGQTAYLQLYATLLLLLIIAVLACNFSVILNLVRMHRRARRSRWGHSLGSGRGGPGTRRRGVRMSMAQETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTIFAYMNETSSRKEKWDLQALRFLSVNSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRVSLKTQDAAQTSCSTQSNSGKQAELCGQ	76631	62337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_-_66074_75875
913701	contig_9995_pilon	-	2577	2	Intergenic	novelGene_47786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGAAGTCCACCTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760749	758011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_758464_758624
913702	contig_10297_pilon	+	2188	5	Intergenic	novelGene_112540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	101.83657250713	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	128	610	553283	557159	FALSE	35	CAAGCAGAAGTTTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEAGANMIVSGSAIMRSEDPRSVINLLRNVCSEAAQKRSLDR	543839	558737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543965_553280_553421_553806_553942_554385_554473_557036
913703	contig_12414_pilon	+	1765	9	Intergenic	novelGene_59652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCATTTCTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759119	784114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_759319_760668_760804_762804_762903_765743_765875_766736_766901_767635_767693_781931_782108_782791_782911_783428
913704	contig_16103_pilon	-	5192	2	Intergenic	novelGene_118850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTCTGACCTGCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729785	722282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_727447_729757
913705	contig_9363_pilon	-	2525	1	Intergenic	novelGene_6496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402785	400260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_400300_402800
913706	contig_10074_pilon	+	2254	16	Intergenic	novelGene_57147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_15	55.3708306682218	49	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	183	1655	467237	540589	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSSSPFLRGGRSSSLRVVGEGEAARSEVRVRTVRGRVEAAGRLPLAGAAFSKERIQLFSMFPLIAENKRVAWLLLSTGTCPRCIFRFCAVDFHAPYKLPYKELLDELQKFLETEKDTLIMEVPNPPLKKIRLEESEDAIDNLNQNGEGRISVIGDGSIASKNSNINVCNVCLGILQEFCEKEFIKKVCRKVEASGFEFTNLVFSVSFPPQLSVREHAAWLLVKQEMGKQSRSLGRNDIVQLKEAYKWITHPLFSEELGVPVDGKSLFEVSVVFAHPATVEDCHFLRAICPDCFKPAKNKQSVFTRMAVMKALNKIKEEDFRKQFPCPPNSPKAVCTVLDIECAHGAVFVAGRYNKYSRNLPQTPWIIDGERKLESSVEELISDHLLTVFKAESFNFSSSGREDVDVRTLGNGRPFAVELVNPHRVHFTSQDIKELQQKINNSSDKIQVRDLQLVTREAIGHMKEGEEEKTKTYSALIWTNKAIGKEDIEFLDDIKDLKIDQKTPLRVLHRRPLAVRTRIVHTMETRYVDEHHFRLHLKTQAGTYPSAQQ	464021	541188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_464189_467221_467363_478322_478578_479301_479389_514040_514076_518439_518552_520697_520760_521057_521104_524518_524584_526219_526306_527323_527450_533079_533137_533990_534068_534161_534218_535282_535401_540424
913707	contig_10331_pilon	+	4200	1	Intergenic	novelGene_54075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGATACGTTTATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88362	92562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_88400_92600
913708	contig_3018_pilon	+	2802	9	Intergenic	novelGene_78889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2344	2652	600066	624953	FALSE	20	GGGAAAATGGCGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLMTFASGKFDYYGVLCIGIQNTGACQPQCSLQTSKCIHKSCDVHTADTRTPVICSTPRESLHTSAIRGPPIAVTADSGPGSTHPLPKQQRAASSPAIEE	569617	625103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_570088_570203_570434_572320_572360_576712_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600196_624774
913709	contig_2093_pilon	+	3401	2	Intergenic	novelGene_152943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	27	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	877	1488	958641	959252	TRUE	60	TTTAAAAAAAAGTGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957764	1080361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_960985_1080180
913710	contig_7051_pilon	+	5427	9	Intergenic	novelGene_64343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_5	403.397136826726	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	187	1341	331836	343526	FALSE	70	AGAGAAACAAAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKGILWVSWFWFCGVFWFW	321861	347612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373
913711	contig_5003_pilon	-	1049	5	Intergenic	novelGene_120224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_3	53.9212388581716	83	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187431	182142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_182791_183049_183140_186591_186675_186854_186940_187288
913712	contig_10734_pilon	+	2306	13	Intergenic	novelGene_51281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	89.98005180162	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	15	1436	1336726	1361646	TRUE	20	GGTAAATCTGTGTAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLSYGRVNLNVLREAVRRELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSEDRRGPARDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESESAFKECYLESDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNSYVEDCIAQKHPLIKVLRLINNYPTIRKTLRLWMDDVNEQNPTDISYVYSGYAPSQRAASPAALPARLAEHRGGTPHSPRTPL	1336711	1362887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438_1339505_1339941_1340070_1341846_1342034_1346894_1347012_1347328_1347504_1352397_1352592_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356802_1359143_1359205_1361514_1361685_1362055
913713	contig_11512_pilon	-	2299	11	Intergenic	novelGene_43363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1282.54622138931	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	52	951	592804	556515	TRUE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVPASPPWRVPAAAPTLAKVPAAALTPVRVLVSTSFPAPAPLGTVPGPSPWRCPARQPCGLRPWTWICSSPLPSSPFPPPACHAAHNLTLIQSLFSKSELW	592855	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556146_556350_556818_570048_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797
913714	contig_10904_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_22555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTGGAAGCAGATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391691	394655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_391700_394700
913715	contig_8597_pilon	-	2790	1	Intergenic	novelGene_158714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	213	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCACATCACAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99827	97037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_97000_99800
913716	contig_4496_pilon	-	3803	2	Intergenic	novelGene_66637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	548	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTGAGAATAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643902	632382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_633493_641209
913718	contig_3077_pilon	+	1691	10	Intergenic	novelGene_26664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	60	1211	9676	17590	FALSE	45	TACAAAAGATTAACAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9616	18070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
913719	contig_15897_pilon	+	1681	1	Intergenic	novelGene_49511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAAGTGAAAGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156304	157985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_156300_158000
913720	contig_6279_pilon	-	1235	5	Intergenic	novelGene_164759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	160	junction_3	54.5177723315984	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	39	641	123672	32855	FALSE	15	AGGGCAGTTCTACTTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHYVVEVKLPARMFESLPLQIKEGQLLHVYPVLFNVGINEQQTLAERFGDVSLQESINQENFELLKEYYKMFMEKMPPDYISHFQEQNDLKGLLENLHQNIQAKKRKNVEIMWLAATICRKLNGIRFTCCKSAKDRTSMSVTLEQCSILRDEHQLHKDFFIRALDCMRREGCRIENVLKNIKCRKYAFNMLQLMAFPKYYRPPEGTYGKADT	123710	32260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_32988_91066_91222_94231_94345_118670_118769_123568
913721	contig_8330_pilon	-	1697	1	Intergenic	novelGene_71997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	338	760	2101085	2100663	NA	70	TACGAAAAAAAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCNQDKAEMTTFHSSNVFIYVLEDIWRCYDLVLQNILPVLRDFVFAFFILALVFNQMIVFKADFDRMRCLIVCLVQNDKSNNLKCPVETAFRPLAFLKTHGKKSLFTTNFRPNFHFRRKCFRDLSDFLMYRECGIVIYS	2101422	2099725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_2099700_2101400
913723	contig_11318_pilon	-	2941	1	Intergenic	novelGene_48152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAACTGGAAGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30679	27738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_27700_30700
913724	contig_7045_pilon	+	4259	6	Intergenic	novelGene_77446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_1	299.399398796992	110	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGTAGGTTATTTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323192	392486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_323475_361980_362088_362189_362288_363879_364007_364111_364288_389017
913725	contig_4442_pilon	+	728	1	Intergenic	novelGene_127925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTACATCAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5049	5777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_5000_5800
913726	contig_14357_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_121682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTTGTCCTGCTAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564951	566679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_565000_566700
913727	contig_4114_pilon	-	5308	2	Intergenic	novelGene_15585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCGAAATGCGGAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227968	218145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_218360_222874
913728	contig_5686_pilon	+	5375	4	Intergenic	novelGene_45433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2357.57592077588	228	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	3449	4321	202891	211355	FALSE	5	TCAGGTGTCGTGTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	199018	212409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_201400_201823_203002_208031_208722_211283
913729	contig_7056_pilon	-	2155	14	Intergenic	novelGene_43612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1008.14308766519	5	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	67	1008	730480	725294	TRUE	5	TTTGTCTTGTCTGTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFHHSTL	731013	721891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725315_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
913730	contig_16148_pilon	-	3096	1	Intergenic	novelGene_50370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72833	69737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_69700_72800
913731	contig_2550_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_135705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATAGGTAATTAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1721638	1719360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1719400_1721600
913732	contig_5041_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_27119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	39	458	613499	613918	NA	35	ATAACATGGCTGTAGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNRHFTKEDIQMANKHMKKHSASSAIRQMQINTTMRCHFAPTRMAITKKKKQKTTNVGKDVAKLLLLPIAGGNTNGIAVVENSVAVHQKTQNTTTIRPSNFTPRYTLKRLQGRDLNRDLYTNVHCSTIHNSQKVATF	613460	615999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_613500_616000
913733	contig_10143_pilon	-	2696	1	Intergenic	novelGene_163331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCTTTAATGGCTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83600	80904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_80900_83600
913734	contig_1443_pilon	-	4278	5	Intergenic	novelGene_28149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	221	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3387	3725	260042	165728	FALSE	25	CAGACACCCCTTTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIIQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYYNKFENLEEMDKFLETHYLSKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKLPTEKSTSLDGFTQKVIIFVGYEGWEGWVGLLNRQ	326178	165174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_165801_170624_170672_259823_260701_323395_323906_323960
913735	contig_5023_pilon	+	2414	9	Intergenic	novelGene_7361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	912	junction_3	1052.46436252018	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	5	1105	618569	646990	FALSE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	618564	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
913736	contig_3018_pilon	+	2026	4	Intergenic	novelGene_78916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	5.65685424949238	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGGTAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626271	675101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_626378_671676_671970_672275_672752_673950
913737	contig_13481_pilon	-	2645	1	Intergenic	novelGene_119535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTGTTAACCAATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471323	1468678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468700_1471300
913738	contig_9609_pilon	+	2439	19	Intergenic	novelGene_23017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	192.304871441799	14	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	327	2204	318500	331717	FALSE	20	TTGGGTAAAACCTGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEVSGRVGL	318173	331952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563
913739	contig_6683_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_178935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCAGTGACCACAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3165	6980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6683_pilon_+_4785_6140
913740	contig_12837_pilon	-	2121	2	Intergenic	novelGene_57349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218384	214857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_215500_216905
913741	contig_9919_pilon	+	2370	2	Intergenic	novelGene_137981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAATATCTACAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633904	636379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_635929_636033
913742	contig_13244_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_86950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	33	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	224	883	292294	283950	FALSE	80	AAAAAAAGAAAGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSRQRIPRAGEVQFPLVTNSSALPSPCGCRRKELTKAQPFLPIVSPLLLCIPPELVRCLPPLPLTGALREPPSAMSSEESYRAILRYLTNEREPYAPGTEGNVKRKIRKAAACYVVRHGTLYYQRRQRHRKTFAELEVVLQPERRRGLIEAAHLGPGGTHHTRHQTWHDLSKTYWWRGILKQVKDYIKQCSKCQEKLDRSRPISDASEMLEELGLDLESGEESNESEDDLSNFTSPPTTASKPVRKKPVSKHELVFVSGTFHSTLTFVDSMSVFADLENFIFLKSPRLSDCWH	292517	282924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_284300_291984
913743	contig_9183_pilon	-	2889	4	Intergenic	novelGene_40342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	803	junction_3	265.067287054941	17	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	206	1714	323783	318047	FALSE	10	TGAGTGCACTCTTGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQEARELLLPQPRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVSGPATGAGQSQGLWPEEGTLARKRPCAEEQKMQDTKPHENCDTKPLGKLSGPIFFKKNVLLSPP	326023	316871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_318347_320557_320727_322743_323834_325868
913744	contig_5457_pilon	+	992	1	Intergenic	novelGene_138998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTGGAACAAAGTAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41929	42921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_41900_42900
913745	contig_5779_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_106490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGACTTGCTAAAAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174551	176901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_174600_176900
913746	contig_13823_pilon	-	3771	15	Intergenic	novelGene_145272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	114.38076404568	41	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	327	1223	304427	294408	TRUE	15	AGCCCTGGTGGTGCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSTDESITSLAEFVVQKISPRHSEPVKRILALTETCLVERDPATYNIATLKPLGEVFALICDSENPQLFAIEFIKGQIRKYSSTDRDSLLASLLDGVRASGNRDVCVKMTSTHKGQRWGLLSMPVEEEVESLHLRFLAAPPNGNFADAVFRFNANISYSGVLHAVTQDGLFSENKEKLINNAITALLSQEGDVVASNAELESQFQAVRRLVASKAGFLAFTQLPKFRERLGVKVVKALKRSNNGVIHAAVDMLCALMCPMHDDYDLRQEQLNKASLLSSKKFLENLLEKFNSHVDHGTGALVISSLLDFLTFALCAPYSETTEGQQFDMLLEMVASNGRTLYKLFQHPSMAIIKGAGLVMKAIIEEGDKEIATKMQELALSEGALPRHLHTAMFTISSDQRMLTNS	310200	287341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_289534_293008_293153_293957_294054_294291_294412_296579_296702_298909_298967_300113_300270_300949_301058_303310_303411_303881_304052_304134_304215_304327_304495_308939_309032_309940_310037_310129
913747	contig_9363_pilon	+	2259	4	Intergenic	novelGene_6480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_2	22.4251842554055	135	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	947	1891	357223	358167	FALSE	30	TAGAAGTATCTTTCTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEQSRYPSVLKTENSLEVEGFTSFSVLSKNGSTEKGDSKNSEFGNSTKMSNFVFHQHIQAADRPINSDERGNNCKQGLDTVRYQVLIPHKSIDREEIFHSSRLLGTQKQFRQEKPYKCDDCEKSFKQRSDLFKHQRIHTGEKPYECQECGKSFSQSAALVKHQRTHTGEKPYTCPKCGESFRQSSHLNRHQRIHTGDKCYKCNECGKTCNISNLFRHQRIHKGERPYKCEECEKSFKQRSDLFKHQRIHTGEKPYGCTVCGKSFSQSATLIKHQRTHTGEKPYKCPECGENFRQSSHLIRHQRIHRHKAPPF	348316	358535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_348919_352046_352174_356233_356310_357081
913748	contig_12644_pilon	+	2876	1	Intergenic	novelGene_44580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAGAAAGAAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2072892	2075768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2072900_2075800
913749	contig_20314_pilon	-	2378	1	Intergenic	novelGene_125635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	821	1216	7302	6907	NA	60	AAAAAAAAAACCCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEPLRSWPYLLRRRQLGFFCSLSLQLLLPVASWPLGLMPAFALLGQVFQSSVAPLISARRHPTPPGSLLHIGTQLSRAPWVSSSAISHWTPGSAAVGSLPLPLLCCCRASAAAAPLYIHNFKTASTF	8122	5744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_5700_8100
913750	contig_5222_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_59018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTTGTTGTTGTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381787	383695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_381800_383700
913751	contig_15456_pilon	-	5816	6	Intergenic	novelGene_139486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4789	5094	63149	62844	TRUE	15	CCCCTGTCTCAGAATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLVCLFLLTFPSTGSNPEIGDQVLLKTWKNQPPEDQLAPEVLLTTHSSLKLTEVAVWVHHSRVKAAPPREEKEAENREPPYSCTPIQGLKYKFKKLTVQ	128295	61729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_-_61915_61947_62273_62498_62673_62805_67882_115145_115172_128265
913752	contig_15135_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_119870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAAAATGATGCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65978	63756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_63800_66000
913753	contig_7571_pilon	+	2319	5	Intergenic	novelGene_106404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	50.9626088421698	113	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	172	546	298104	309198	FALSE	70	AAGAAAACACCAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGKCELQRIFDTYVGAQRTHRIENSLTYSKNKVLQEATHVMQGEVDKRVEDIMKEKNINPEKDASFKICMKACLLQISGYKQLYVDVENERKKPYDSDNLQHEKLLLKVNFCFLYLELLNIEK	296695	310971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_296790_298026_298174_300480_300510_303823_303922_309020
913754	contig_2214_pilon	+	4247	3	Intergenic	novelGene_144268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_2	66.5	54	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3184	3633	330472	332897	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESATSDASEHASQSVPMVTTSTGTLSTTNETATGDDGDEVFVEAESEGISSEASLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSSVGKFLPLATIQLWYIKLVCKDAVLLVTIL	327288	333511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_330560_330691_330849_332692
913755	contig_5041_pilon	+	2648	1	Intergenic	novelGene_27118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	318	2329	2646	613499	613816	NA	45	TACACTCAAAAGACTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNRHFTKEDIQMANKHMKKHSASSAIRQMQINTTMRCHFAPTRMAITKKKKQKTTNVGKDVAKLLLLPIAGGNTNGIAVVENSVAVHQKTQNTTTIRPSNFTPR	611170	613818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_611200_613800
913756	contig_13093_pilon	+	4780	1	Intergenic	novelGene_105212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	227	142	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3823	4149	50440	50766	NA	20	CTACAGGTGAGGTCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILQKKNSISLPISSPKKQFCALIDKCCCIYNTESEVLQNIVAVEAHEKQLLMLPMYKLTPHEICFLGSETLGSWFHWLFQTVGLILLLVFLFYFLVCCMVPGILKTR	46617	51397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_46600_51400
913757	contig_4812_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_103691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1837	2202	216063	215698	NA	25	GGGACCTCCACTCCACGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGARYSGERKRRKVERDKKLRNEEKQKKKNIPRESTGLVAQTREMAPQPSGTAQPVKEWRWHTEPGVREKGKEGGEREETKSKKKKKKKRNNSQQKMALKELAGVGGANPSGKKPASPQ	217899	215497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_215500_217900
913758	contig_4654_pilon	+	2995	5	Intergenic	novelGene_103038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCCACACCAGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186101	290459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_187693_224484_224985_281765_281969_282070_282557_290244
913759	contig_4470_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_171774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTATTTATGCCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240332	237746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_-_237700_240300
913761	contig_2715_pilon	-	3910	12	Intergenic	novelGene_173172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAGAAAATGAAAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148640	104305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_-_104425_105645_105760_109708_109897_114179_114292_115463_115578_117346_117519_119794_119967_123688_123840_137516_137692_139256_139317_142204_142294_146196
913762	contig_10756_pilon	+	3291	3	Intergenic	novelGene_170670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	679	981	105021	105323	TRUE	50	TCCACAAACAAAAGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNINQCLKDACEVNDIADRRKLPWERVAKYKKQASCWWAESQGPSTGRHHVLGKVGMRSRVEKRDSGGKSETGAVRRPPPLILLLHYKTLEVHSLNTMS	104342	108210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_106638_106742_106830_107301
913763	contig_10297_pilon	+	2034	6	Intergenic	novelGene_112543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	85.3229160308062	6	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	109	675	543963	557159	FALSE	25	TAAATTTTTGTTTAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFVPNITFGHPVVESLRKQLGQDPFFDMHMMVSRPEQWVKPMAVAGANQYTFHLEATENPGALIKDIRENGMKVGLAIKPGTTVEYLAPWANQIDMALVMTVEPGFGGQKFMDDMMPKVHWLRTQFPSLDIEVDGGVGPDTVHKCAEAGANMIVSGSAIMRSEDPRSVINLLRNVCSEAAQKRSLDR	543854	558518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_543965_548403_548484_553280_553421_553806_553942_554385_554473_557036
913764	contig_7416_pilon	+	3352	1	Intergenic	novelGene_134339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893570	896922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_893600_896900
913765	contig_11417_pilon	+	3294	1	Intergenic	novelGene_103327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1417	1773	577169	577525	NA	70	AAAGAAAATCAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPINLTIHRASINLSYCGGLCVAVIMEAMPLVFQIAAGSPMVEIIKQYHYYHTRVKRLQQHIDRKLPEIQAGFRRGRGTRDIIADVRFWLKAENIRETFTCVVLTMQKAFDCVDHNK	575752	579046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_575800_579000
913766	contig_19737_pilon	+	1673	2	Intergenic	novelGene_158969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_1	0	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGAGTAGAATGAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39747	42400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_40173_41152
913767	contig_3382_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_124020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATTAAAAGACAAAGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160017	159316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_159300_160000
913768	contig_1301_pilon	+	4679	1	Intergenic	novelGene_47270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	434	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGAGAATCTATCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231226	235905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_231200_235900
913770	contig_4754_pilon	+	3215	5	Intergenic	novelGene_35895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	86.1840327438906	114	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAAAGCCCATGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114736	125861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_114787_119671_119871_121506_121634_121913_122010_123118
913771	contig_3068_pilon	+	1250	2	Intergenic	novelGene_137647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACGAAACAAAAAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305925	308339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_305978_307141
913772	contig_17796_pilon	+	5608	2	Intergenic	novelGene_33773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	746	junction_1	0	597	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3287	3589	22093	22395	FALSE	65	GCTACAAAAAAAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTMFKESKKHTEIKLVEIRKQMKEQNERLNKEIENLKQNQRELLKLKNKATQLEKAKETLNNRVEQTADRLHEVENKITEFISSQEKQEKRPKKSKQT	16588	24414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_18200_20417
913773	contig_7909_pilon	+	4637	20	Intergenic	novelGene_155901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	53	junction_16	145.836815418131	299	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1272	3819	255	4073	444983	550408	FALSE	45	AGATCACTAACCAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVVWPTLLDLSRDECKRILRKLELEAYAGVISALRAQGDLTKEKKDLLGELSKVLSISTERHRAEVRRAVNDERLTTIAHNMSGPNSSSEWSIEGRRLVPLMPRLVPQTAFTVTANAVANAAIQHNASLPVPAETGSKEGVSCSDEDEKPRKRRRTNSSSSSPVVLKEVPKAVVPVSKTITVPVSGSPKMSNIMQSIANSLPPHMSPVKITFTKPSTQTTNTTTQKVIIVTTSPSSTFVPNILSKSHNYAAVTKLVPTSVIASTTQKPPVVITASQSSLVSSSSSGSSSSTPSPIPNTVAVTAVVSSTPSVVMSTVAQGVSTSAIKMASTRLPSPKSLVSAPTQILAQFPKQHQQSPKQQLHQVQQQTQQQVAQPSPVSHQQQPQQSPLPPGIKPTIQIKQESGVKIITQQVQPSKILPKPVTATLPTSSNSPIMVVSSNGAIMTTKLVTTPTGTQATYTRPTVSPSIGRMAATPGAATYVKTTSGSIITVVPKSLATLGGKIISSNIVSGTTTKITTIPMTSKPNVIVVQKTTGKGTTIQGLPGKNVVTTLLNAGGEKTIQTVPTGTKPAIITATRPITKMIVTQPKGIGSTVQPAAKIIPTKIVYGQQGKTQVLIKPKPVTFQATVVSEQTRQLVTETLQQASRVAEAGNSSIQEGKEEPQSYTDSSSSSTESSQSSQDSQPVVHVIASRRQDWSEHEIAMETSPTIIYQDVSSESQSATSTIKALLELQQTTVKEKLESKPRQPTIDLSQMAVPIQMTQEKRHSPESPSIAVVESELVAEYITTECTDEGTEVAFPLLVSHRSQPQQPSQPQRTLLQHVAQSQTATQTSVVVKSIPASSTGAITHIMQQALSSHTAFTKHSEELGTEEGEVEEMDTLDPQTGLFYRSALTQSQSAKQQKLSQPQLEQTQLQVKTLQCFQTKQKQTIHLQAEQLQHKLPQMPQLSIRHQKLTPLQQEQAQPKPDVQHTQHPMVAKDRQLPTLMAQPPQTVVQVLAVKTTQQLPKLQQAPNQPKIYVQPQTPQSQMPLPASSEKQPTSQVEQPIITQGSSVTKITFEGRQPPTVTKITGGSSVPKLTSPVTSISPMQASEKTAVSDILKMSLMEAQIDTNVEHMVVDPPKKAFATSMLTGEAGSLPSTHVVVAGLANSTSQQQKCRESCSSPSAVGPPLTTRKIDAPGVPITGQFMRIQNIGQKKPEESPAEIIIQAIPQYAIPCHSSSNVVVEPSGLLELNNFTSQQLDDDETAMEQDIDSSTEDGTEPSPSQSSAERS	442858	550972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_443074_444943_445053_451521_451622_453110_453186_458393_458570_462225_462486_496264_496542_511061_511317_516141_516292_517733_517905_524099_524237_526672_526847_528521_528721_536900_537066_538881_539038_540065_540108_542365_542518_544443_545008_545965_546467_550213
913774	contig_8044_pilon	-	4219	7	Intergenic	novelGene_132391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAAAATTACTATAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554617	545831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_549004_549374_549444_550249_550339_551354_551439_552523_552671_553421_553571_554108
913775	contig_2069_pilon	+	2948	16	Intergenic	novelGene_23339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2445	2798	624934	668604	FALSE	70	AGGAAAGGGAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSFLWCSGSHTIVCWSSEPEANKSPFSFHSRQFTHPEWPYLQLCFQAQPPDKGVSDMVAPLEAQSTPLLDLPMDDVSSYVDFCHLLLMSSTEGGYRRIFRTFVHSSQAQVHKTHI	607339	668754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_608195_609280_609472_610321_610499_611899_612130_615181_615369_616161_616269_616879_616954_618581_618700_619111_619211_620026_620209_621870_622058_624896_625009_625436_625485_650648_650735_652121_652266_668603
913776	contig_10855_pilon	+	2450	6	Intergenic	novelGene_124390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	18.9799894625893	56	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	76	1365	846062	852937	TRUE	15	TTTTTCTTTTATGTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLSAALGARPQGRRSGVPQKRDREMESVIFEDVAVDFTLEEWALLDPAQRKLYRDVMLETFRNLASLDDETQFKDIGSVSLQNIYGKQIFKGHKILKFTRRDSLASILGKIWEGLSIEDQHKNLGKYLRNHMVERLCEGTKRNRCGETFSQIPNISMYKKTLTGVNPYRCSECGKIFIHHTSLKRHIANHTGYKPYQCQECGKSFRFPSDLRTHVKSHSGERPYACKLCSRTFIYLHSFLRHERTHTKEKPYECKECGKTFKCHSSLPVHMRMHNGGKPYECKQCGKVFLCAPSLQNHMRLHSGEKTYDCKQCGKAFIHPTHLQRHMRTHTGEKPYECKHCGKAFSDSDYFQRHERTHSKEKPFECKECGKTFKWSSSLRTHKRLHSEEKTHECKQCGKVFLLSSSLQQHTRLHSGEKPGFRTGSFQFEPLLRICISTSDILSQNLHFNDIPR	845986	1052516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_846065_850641_850769_851233_851418_851961_853387_867592_868073_1052360
913777	contig_9839_pilon	+	789	6	Intergenic	novelGene_88501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1668.35480638862	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	117	668	49467	61360	FALSE	35	TTTTTAAAAAATCACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFCFVISGSLGIITEKKSIKTLVSMRTGVMSMMLIFTVLEFCLAVIATVLWWKQAQSDFLGSVLFLPQSDNSKSKILSRMTFDPVYEELLTS	45324	61481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52202_54064_54137_59824_59927_61264
913778	contig_20670_pilon	-	2865	4	Intergenic	novelGene_144838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_1	197.376684427405	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	41	340	56783	52878	FALSE	40	ACTCAAGAAGTACATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSVLNTSRESSQMEMKGFHFADSKQNIPSGGSVPSPQTYRPSSASPSGKPSGSAVNMGSVQGHYVQQAKQRVDEKPSLGSVKLQEAPSAASQIKRTGAIKPRAVKVEESKA	57546	50352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_-_53013_54342_54425_56700_56793_57515
913779	contig_8122_pilon	-	2824	1	Intergenic	novelGene_40223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGAGCACTTAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510342	507518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_507500_510300
913780	contig_17936_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_29958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTTTCTTGGACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69328	69977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_69300_70000
913781	contig_7119_pilon	+	2306	2	Intergenic	novelGene_40956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	70	1155	138713	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127537	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707
913782	contig_8597_pilon	-	2519	6	Intergenic	novelGene_158697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_1	161.049557590203	35	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	804	1716	2519	37948	24293	FALSE	20	GACTTGATTTCTCCCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRKDFKIDRKKANMQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQLAEESTHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQEKEQSNPSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKEVEMEPVQQAEKANFQNHKGHEFIPTLYHFPANCEACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKE	39663	24292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_24533_24693_24773_29196_29286_29492_29564_36373_36534_37783
913783	contig_7379_pilon	+	3381	4	Intergenic	novelGene_150008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCATGAATTGCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143815	443745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_144237_263961_265149_418713_419284_442542
913784	contig_9345_pilon	+	2243	18	Intergenic	novelGene_24569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCCGCGGCCCCGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885472	922014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_885589_885854_885927_890055_890275_893009_893100_893734_893929_896573_896669_897644_897729_898482_898706_900021_900183_902070_902245_905275_905394_906192_906334_913553_913620_913749_913901_914489_914558_916170_916212_919782_919909_921910
913785	contig_5302_pilon	-	2340	7	Intergenic	novelGene_81421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	769.793569009828	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	444	887	182005	177300	TRUE	40	AAAACCTGACCCTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209566	175556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176899_177188_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_209142
913786	contig_16299_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_178936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAAACTCTCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16838	15401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16299_pilon_-_15400_16800
913787	contig_1618_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_141777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1442	1744	110226	109924	NA	45	ACAGATATATTTACAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRTTMRYHFPPTRMAKIKNNNNKWWRVCGKTGTLTDCWWEWKMVQQLWKILWPFLKKLKIELLYDRAFPDIYPKDLKVETQTDFYTNVHCSTIHNRQK	111667	109543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_109500_111700
913788	contig_5280_pilon	-	2516	1	Intergenic	novelGene_52634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTCTTTAGGAGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65477	62961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_63000_65500
913789	contig_1261_pilon	-	2266	2	Intergenic	novelGene_168144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	284	junction_1	0	79	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	466	771	24481	24176	FALSE	10	TATGTTTGCTCACTGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVPALAQPVTTSNVSEATSGQKIAVPAASHHFCFSIDLRSVHDLEVSFPVNCILRCDLILFQGIIFYGEMPFLCFESCRERNVTKEVTGSPQITNEFHS	26366	22680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1261_pilon_-_24484_25903
913790	contig_9183_pilon	-	1502	5	Intergenic	novelGene_40344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	537.341837194909	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	259	1398	323689	318047	FALSE	55	GTGGAGCTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCCYSPMSTWVKKMGRRVTQMGPCQSWTLPMVLPKFTRQQTTAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVSGPATGAGQSQGLWPEEGTLARKRPCAEEQKMQDTKPHENCDTKPLGKLSGPIFFKKNVLLSPP	325982	317942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_318347_320557_320727_322743_323282_323556_323834_325868
913791	contig_12948_pilon	+	2453	1	Intergenic	novelGene_126214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	445	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTTGATTAACTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265626	268079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_265600_268100
913792	contig_14970_pilon	+	1901	5	Intergenic	novelGene_45082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2928	junction_1	4009.92577861486	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213108	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
913793	contig_13292_pilon	+	771	2	Intergenic	novelGene_142936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCTTGGTTGGCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181063	211740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_181159_211064
913794	contig_11378_pilon	-	2845	2	Intergenic	novelGene_112299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	170	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1702	2103	1037955	1037554	TRUE	30	AAAAGAGCCCCCCGACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTNEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIILSEISQSQKDKYCMRPLL	1039656	1036372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1036878_1037316
913795	contig_19354_pilon	-	3355	2	Intergenic	novelGene_178937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	456	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	283	1140	109233	108376	TRUE	30	GCCTTCACCTGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEWLNIRKSINVIHHINKRKEMNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLLKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPFKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLPLFAYDMILYTENPQDSTRRLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTVPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGMKP	109515	105971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19354_pilon_-_107043_107231
913796	contig_9481_pilon	+	4525	26	Intergenic	novelGene_149616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	720	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGCCACCAGCTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32458	170854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_33613_34410_35014_44435_44534_46652_46802_50841_50931_53033_53116_54442_54557_56610_56704_63475_63557_64292_64382_64978_65087_68577_68718_69168_69273_72617_72734_73185_73337_75950_76054_76969_77077_80864_80983_81951_82031_82197_82275_89061_89152_100007_100148_105417_105592_114922_115084_149697_149748_170599
913797	contig_10766_pilon	+	1734	10	Intergenic	novelGene_151237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_6	82.7322022186683	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1485	249	1733	576899	594083	FALSE	25	GCAGCGAATGTGAATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVPNEKIAIWLKDCRTPLGASLDEQSSSTLKGVLVRNGGSFEDDLSLGAEANHLHESDTQIENCSNILAKERRLQFHQKGRSMNSTGSGKSSGTVSSVSELLELYEEDPEEILYNLGFGRDEPDIASKIPSRFFNSSSFARGIDIKVFLSAQMQRMEVENPNYALTSRFRQIEVLTTVANAFSSLYSQVSGTPLQRIGSMPSITSNKEIDSPPPLTRSNTANRLMKTLSKLNLCVDKTEKGEGSSPSPAIEKGKILNFTAVEESVNKNDQKSQKIIKKKDSSFLLATVKEEASGSSAAVTENADTDKLSDEASSNFNQETEDEQSKASQTHENRLGEESGIIESDLSSDFNMSSHSELENSSELKDIHMSTAEKEPSAPLTNPSIRNVMVQQKDSFEMEEVQSTEGEAPHVPAAYQLGLTKSKRDHLLRTASQHSDSSGFAEDSTDCLSLNHLQVQESLQAMGSSADSCDSETTVTSFGEGLVTPKAQDQPYFNESEEESLITLQKGREKAAASADKRKSDSQNFPKSETAEDDGNEQSTCHQEDCVTKITETQEVSSPAQRVELPREESAESDVDK	569551	594084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_569598_573216_573267_574086_574144_576716_576757_576843_576943_578166_578376_579271_579973_587957_588031_592044_592134_593714
913798	contig_1435_pilon	+	3313	3	Intergenic	novelGene_115496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	203	316	508249	508362	TRUE	20	AAATCTTTTCTTCAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCSLAILASKERSGCTSSKTDLFILLAVHGIFSVLCQHHNSKVSVLLRSSLFIVQLSHAYKAVENIMAWVRCTLIFKMTSLLFNTLKRSFAEYLLDSIRCLIS	508046	537200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_509702_535266_535397_535672
913799	contig_2703_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_101625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGCGTGAAACCGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344	1753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1300_1800
913800	contig_7744_pilon	+	3458	2	Intergenic	novelGene_62587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024328	1027981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_1024490_1024684
913801	contig_11375_pilon	+	1352	4	Intergenic	novelGene_152650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	606	974	108246	121146	TRUE	40	CAGATAGAGGCAGCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPISAPKSPISMYHSLHKECCLSFVSSQPISSKRLVSSTLCHRLGSLEAGTHRVESWVQDVEKSTPVYPYKRNSFPEVAWMCLWFLQPERAERRLPTSLFVQSSQVFVCFLFPVDRRVEDA	107640	133346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_108447_120978_121171_132528_132679_133142
913802	contig_16072_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_175858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGGGTTCTCTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36154	37539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_+_36200_37500
913803	contig_7963_pilon	-	3986	13	Intergenic	novelGene_58443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_6	549.034778042339	136	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	2335	3387	120716	118203	FALSE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	126298	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121257_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563
913804	contig_11003_pilon	+	3017	1	Intergenic	novelGene_105440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2641	3006	92008	92373	NA	20	GGAAGGCTGGGAGAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKPEEGKNQDDLIQRVSSRARTSSPNSLGSAISHSPLCRKEQSQGVKLQGVCRVTLRLTWVFATRRPGIPHSVKEKRCKYFAKGKSRKIWGKRSLREFKHKDTNMGLNVQGFCEGKCL	89367	92384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_+_89400_92400
913805	contig_1076_pilon	-	3447	12	Intergenic	novelGene_101127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	47.8681039096059	106	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	289	1029	941921	926810	TRUE	70	TAAAGAAAAAAAAGAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLDCFCTSRTRVESLRPEKQSETSIHQYLVDEPTLSWLPPSTGASEVISSANVSHYELQVEIGRGFDNLTSVHLAKHTPTGTLVTIKITNLEDCTDERLKALQKSVILSHFFRHPNITTYWTVFTVGSWLWVISPFMAYGSASQLLKTYFPEGMSETLIRNILFGAVTGLNYLHKNGYIHRSFKASHILISGDGLVTLSGLSHLHSLVKHGQRHRAVYDFPQFSTSVQPWLSPELLRQTGFTWI	945436	922599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_924642_925149_925193_925886_926132_926721_926831_927127_927300_928560_928685_929758_929868_932572_932695_935550_935651_940096_940178_941909_942019_945245
913806	contig_10930_pilon	-	2542	7	Intergenic	novelGene_37034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	9	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	905	1753	276835	268388	FALSE	15	CCTATGATTTTCCAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277179_278443_278637_279700_279832_280157
913807	contig_3386_pilon	+	1991	9	Intergenic	novelGene_34551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	711.634551139136	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	510	1124	498670	508362	FALSE	35	CCCACAAGTGTTGCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	470046	509229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_488105_488190_494393_494549_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507645_507741_508231
913809	contig_16185_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_144732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82713	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_81700_82700
913810	contig_11386_pilon	+	2942	3	Intergenic	novelGene_82803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	168	junction_1	2	80	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	273	821	90888	93371	FALSE	75	ATTAAAAAAAAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWEATYLLAPVLLVLRVSDSREQETAPVLLQKLEGETVSLICWYQFQKDSNKLKIWCKKTSENLCIPLVTSSRSQVQKSRYSIQDERSSGYFIINMTGLRTADSGFYYCGNYNSFSSVVHILRSFHLIVSQASTPSTTRSTVSTTVQASATNLATDRYCHHLCLFSPPFPPTLSPVPNTPT	90615	95492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_90946_91207_91547_93219
913811	contig_12786_pilon	+	1648	8	Intergenic	novelGene_103453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAAACTACTAGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651779	674517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_652512_653181_653397_655353_655455_660806_660964_664260_664369_669384_669571_673970_674044_674441
913812	contig_3004_pilon	+	3857	6	Intergenic	novelGene_127494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_1	257.316458859514	79	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAAAGTCAGCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277852	287249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_277919_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_282619_284105
913813	contig_10126_pilon	+	3985	3	Intergenic	novelGene_105716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	260	4	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	144	602	140715	162312	FALSE	25	ACGGCCAACTTGTCTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSGE	139702	165695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140705_140794_161932
913814	contig_15752_pilon	+	2420	15	Intergenic	novelGene_148758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	65.4181214362267	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	203	1990	193923	203535	FALSE	25	CATCTTCGCATCAAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPGPPSEEEEFQRDAAARACLQQLKGTTELLPKRPQHLPGHPGWYRKLCPRLDDPEWTPGPSLISLQMRVTPKLMALTWDGFPLHYSERHGWGYLVPGRRDNLAKVPVGTDLASAGVACPYGAIESLYRKHCLEQGKQQPEPQEAGMAEEFLLTDNSTMWQMVEELGCLELEAEAKMENFQAAVLGQPSVLTAPGDPKISKPTFHHGNGPYNDVDVPGCWFFKLPHKDGNSCNVGSPFAKDFLPKMEDGTLQAGPGGASGPRALEINKMISFWRNAHKRISSQMVVWLPRSALPRAVTRHPDYDEEGHYGAILPQVVTAGTITRRAVEPTWLTASNARPDRVGSELKAMVQAPPGYVLVGADVDSQELWIAAVLGDAHFAGMHGCTAFGWMTLQGRKSRGTDLHSKTAATVGISREHAKVFNYGRIYGAGQPFAERLLMQFNHRLTQQEAAEKAQQMYAVTKGLRRYRLSDEGEWLVRGLDLPVDRTEDGWVSLKDLRKIQREASRKSRWKKWEFMTSRVNWVVQSSAVDYLHLMLVAMKWLFEEFGIDGRFCISIHDEVRYLVREEDRYRAALALQITNLLTRCMFAHKLGLSDLPQSVAFFSAVDIDRCLRKEVTMDCKTPSNPTGMEGRYGIPQGEALDIYQIIELTKGSLEKRSQPGP	192769	203965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_192899_193849_194087_196001_196123_196336_196424_196724_196833_197280_197442_198218_198273_198373_198492_199154_199291_199401_199649_200976_201100_201239_201262_201602_201812_202782_202944_203458
913815	contig_3956_pilon	+	2224	11	Intergenic	novelGene_15051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1288.02936301934	168	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	81	1700	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286588_1289793_1289892_1290297
913816	contig_14618_pilon	+	3415	20	Intergenic	novelGene_136825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2261	2683	1099084	1103948	TRUE	10	CTGGAGGCGGGGCCGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVPSSGTSGSVCTGFLERADKELAQLPGWGERESRSGAGGRMLRVPSSRIYRPAQEGFAKVEMKGPRDWKAAWRTHRQGSLMSLIKSGDSLALRTSGDVVQDTAMKHSAQAFRIPQTLSEQSSKNFGIKNFSVASCPTA	1083345	1187131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_1084064_1084655_1084797_1087551_1087690_1088497_1088618_1090569_1090673_1091541_1091702_1091953_1092139_1093021_1093118_1096279_1096475_1098679_1099138_1100186_1100358_1101297_1101459_1103911_1103976_1105516_1105628_1115195_1115340_1126053_1126200_1127697_1127805_1149595_1149729_1186922_1186968_1187112
913817	contig_13028_pilon	+	3001	3	Intergenic	novelGene_175957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	14	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	355	822	11637	13798	FALSE	15	GTATGTTTTTCTGTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMHPVASSNPAFCGPGKPSCLSEEAMRAADQFDIYSSQQSKYNHTVSHKPMACQRQDPLNETHLQTTSGRSIEIKDELKKKKNLNRSGKRGRPSGTTKSAGYRTSTGRPLGTTKAAGFKTSPGRPLGTTKAAGYKVSPGRPPGKKQQAFRCSSDA	6770	15977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13028_pilon_+_7122_11633_12064_13757
913818	contig_18272_pilon	+	1589	2	Intergenic	novelGene_7097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAATGATGTGGGTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540183	541836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_541566_541629
913819	contig_20371_pilon	-	1686	2	Intergenic	novelGene_129177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACACCTGATACTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36580	26225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_27203_35871
913821	contig_6870_pilon	-	3090	1	Intergenic	novelGene_103970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCTATTTTGAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1433867	1430777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1430800_1433900
913822	contig_8616_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_72512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCACTGCTCATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338675	340888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_338700_340900
913823	contig_9771_pilon	-	4326	6	Intergenic	novelGene_156920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	95.5531265841155	134	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2577	3044	346973	339557	TRUE	25	GCAGCGGCATAATTGTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLCKFDG	350142	332276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_338905_339756_341990_342198_346911_347067_347659
913824	contig_12644_pilon	-	2063	2	Intergenic	novelGene_44569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTCTGTAAGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2006429	2004142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2005638_2005861
913825	contig_16594_pilon	-	3303	11	Intergenic	novelGene_53837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2933.04413366045	2	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	164	1087	165546	121101	TRUE	35	TGAAATCCCTGAATATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335644	116295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_116620_116676_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_134026_134081_135251_135510_149149_149351_165477_165649_335583
913826	contig_10811_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_165809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATTTCTTTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427344	428910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_427300_428900
913827	contig_7044_pilon	-	4194	3	Intergenic	novelGene_178938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	162	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAATCAAAAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208448	200606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7044_pilon_-_202557_202825_203655_207033
913828	contig_10734_pilon	-	1511	1	Intergenic	novelGene_51383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTAGTTGCTTAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1890946	1889435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1889400_1890900
913829	contig_15325_pilon	+	3145	1	Intergenic	novelGene_157183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94413	97558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_94400_97600
913830	contig_16632_pilon	-	4564	2	Intergenic	novelGene_154142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTATCTTCATATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137438	132829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_133335_133379
913831	contig_17427_pilon	-	1862	10	Intergenic	novelGene_30335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1276.60189372479	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	54	1154	188879	177657	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPFSVSAQPHHQFILKELQTRIGRFWLSAFGGYSTKSLLGRIKQSLGINRSECSHKLIFF	204714	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177835_179724_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
913832	contig_4962_pilon	-	3675	1	Intergenic	novelGene_107372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTACAACACTGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105542	101867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_101900_105500
913833	contig_16782_pilon	-	3184	4	Intergenic	novelGene_176771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.4991582276861	204	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	80	628	60012	58220	TRUE	50	TTCAAGGGGGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLERGRCRESQRSIIPSTTLKLCWVTMPGPECKFSAGTSVICCSWITASLARMAQVFVYGTLKRGQPNHQVMLDGTNGSSAFQGRGRTVEPYPLVIAGQHNIPHLLNLPGRGHCVAGEIYAVDDQMLQFLDEFEGCPDMYQRTLVRIEVLEWEGERTAPEETPAADRIVQCFVYSTATYSPEWVHLPYHDSYDSQGEHGLRYNPRENR	60091	40993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_-_41135_52906_52982_55879_58705_59948
913834	contig_3956_pilon	+	2248	9	Intergenic	novelGene_14744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	19	junction_1	21.3245017526788	126	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	226	1164	627594	638067	FALSE	15	GTCACTGCCAACTGCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEFKCPIKEEIALTSGEWEVLARHGSKIWVNEETKLVYFQATKDTPLEHHLYVVSYAAAGEIVRLTTPGFSHSCSMSQNFDMFVSHYSSVGTPPCVHVYRLGGPDNDPLHKQPRFWASMMEAASCPPDYVPPEIFHFHTRSDVQLYGMIYKPHTVQPGKKHPTVLFVYGGPQVQLVNNSFKGIKYLRLNTLASLGYAVVVIDGRGSCQRGLRFEGALKNQMGQVEIEDQVEGLQYVAEKYGFIDLSRVAIHGWSYGGFLSLMGLIHKPQVFKVAIAGAPVTVWMAYDTGYTERYMDIPENNQHGYEAGSVALHVEKLPNEPNRLLILHGFLDENVHFFHTNFLVSQLIRAGKPYQLQIYPNERHSIRCPESGEHYEITLLHFLQEYL	623466	639151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_623548_627449_627603_628530_628667_631001_631148_632330_632478_633006_633160_633775_633919_635465_635578_637974
913835	contig_4732_pilon	+	2424	2	Intergenic	novelGene_75465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	657	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTACGTCGACATGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696231	737548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_698528_737420
913836	contig_8636_pilon	+	1283	2	Intergenic	novelGene_141920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAACTTGAGTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382204	421400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_+_382795_420707
913837	scaffold_9100_pilon	+	1560	8	Intergenic	novelGene_83272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	599.953297502125	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	108	947	647136	654237	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSMPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKDS	644847	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651201_651950_652069_653324_653449_654228
913838	contig_6445_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_76997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAAAGCTTTCATTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462691	465182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_462700_465200
913839	contig_15043_pilon	+	3791	11	Intergenic	novelGene_175505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_10	44.6313790958783	49	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	205	765	237734	259060	TRUE	15	CATATTTTAGCCTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRLHELLIEYRKKLLREFPKSTKRNCKKRAWTDQEYGLIIDGATLSLILNSSQECGSSNYKSIFLQICMKCTAVLCCRMAPLQKAQIVRMVKNLKGSPITLSIGDGANDVSMILESHVGIGIKGKEGRQAARNSDYSVPKFKHLKKLLLAHGHLYYVRIAHLVQYFFYKNLCFILPQFLYQFFCGFSQQPLYDAAYLTMYNICFTSLPILAYSLLEQHINIDTLTSDPPIVYEYFWQCHAAVGPLLILDISGRL	234231	279369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_234318_237615_237788_241267_241371_242571_242718_251418_251479_257151_257281_258991_259128_261387_261454_264269_264374_267370_267525_276734
913840	contig_9199_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_65658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190379	189153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_189200_190400
913841	contig_11816_pilon	+	4135	1	Intergenic	novelGene_98480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAGAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462211	466346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_462200_466300
913842	contig_10299_pilon	+	2199	1	Intergenic	novelGene_79770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1392	1829	597290	597727	NA	35	GAGTCAGAGGAAACCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGGSGQARAGSALQPRLEVPDAPCAVAPPCTGTLCPVPPPLPFSEPLPPPFRWPPSDPTPEPQLTLAPRPPGMNTEMPPSDPKAPLPPGMDTEQQRSAILVTWGGLKALSAKAEHILSTTGAPLTPENLFLAMVSLVIINPQ	595898	598097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_595900_598100
913843	contig_854_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_36265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3372	junction_2	2142.67945572827	32	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	86	784	543600	558002	FALSE	5	CCCATGGGTCTCGGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIGIGLGLKGEELAVGDPDSASWRLWAPEPGSAPHSHGPCPSCVTLSESLSLSVPVSSSIKHGDSHSSYLIGWLGELSELIQLKL	543514	558460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591
913844	contig_12019_pilon	+	1368	3	Intergenic	novelGene_87671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	9166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5530_6114_6226_8322
913845	contig_14537_pilon	-	4717	1	Intergenic	novelGene_158665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	3980	4531	107875	107324	NA	55	AATACCAAGTAATAATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFCNIMKDEKLAIQEAQRTSYRIDPKRKSLRHITITLAKTKDRQRILRAAQEKQKVTYRRETTGLSSDYLAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKVLFRYDGEIRTFPGKQKLRDYVKTKPNFQELLKGVLRSENKQHQLTG	111854	107137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_107100_111900
913846	contig_5640_pilon	-	923	7	Intergenic	novelGene_27235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	236.570461666991	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	86	712	63466	24907	TRUE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMAGSLGHLQA	138282	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206
913847	contig_20641_pilon	+	609	3	Intergenic	novelGene_52854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_2	2143	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	23	376	14599	26895	FALSE	60	GAAAAAGAAAAAATCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKLLNRASVEGLF	14576	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_26859
913848	contig_1150_pilon	-	157	1	Intergenic	novelGene_61440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTGGCTGGTGTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309091	308934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_308900_309100
913849	contig_13612_pilon	+	3033	3	Intergenic	novelGene_157301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_1	16	49	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	2086	2514	55151	57016	FALSE	25	CAGTGGTTGTAAGATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	53065	57535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_55301_56237_56382_56881
913850	contig_13542_pilon	+	3637	25	Intergenic	novelGene_131564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_21	159.726192583503	67	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	977	2934	45	2978	676236	703179	TRUE	20	GCAGGCCCATTGCCTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEIKTLPAKAKIQDMVAIRHTACNEQQRTTMILLCEDGSLRIYMANVENTSYWLQPSLQPSSVISIMKPVRKRKTATITTRASSQVTFPIDFFEHNQQLTDVEFGGNDLLQVYNAQQIKHRLNSTGMYVANTKPGGFTIEISNNNSTMVMTGMRIQIGTQAIERAPSYIEIFGRTMQLNLSRSRWFDFPFTREEALQADKKLNLFIGASVDPAGVTMIDAVKIYGKTKEQFGWPDEPPEEFPSASVSNICPSNLNQGNGTGDSDSAAPTTTSGTVLERLVVSSLEALESCFAVGPIIEKERNKNAAQELATLLLSLPAPASVQQQSKSLLASLHTSRSAYHSHKDQALLSKAVQCLNTSSKEGKDLDPEVFQRLVITARSIAIMRPNNLVHFTESKLPQTETEGVDEGKEPQKQLEGDCCSFITQLVNHFWKLHASKPKNAFLAPACLPGLTHIEATVNALVDIIHGYCTCELECINTASKIYMQMLLCPDPAVSFSCKQALIRVLRPRNKRRHVTLPSSPRSNTPMDKDDDDDDDADEKMQSSGIPNGGHIRQESQEQSEVDHGDFEMVSESMVLETAENVNNGNPSPLEALLAGAEGFPPMLDIPPDADDETMVELAIALSLQQDQQGSSSSALGLQSLGLSGQAPSSSSLDAGTLSDTTASAPASDDEGSTAATDGSTLRTSPADHGGSVGSESGGSAVDSVAGEHSVSGRSSAYGDATAEGHPAGPGSVSSSTGAISTTTGHQEGDGSEGEGEGEAEGDVHTSNRLHMVRLMLLERLLQTLPQLRNVGGVRAIPYMQVILMLTTDLDGEDEKDKGALDNLLSQLIAELGMDKKDVSKKNERSALNEVHLVVMRLLSVFMSRTKSGSKSSICESSSLISSATAAALLSSGAVDYCLHVLKSLLEYWKSQQNEEEPVATSQLLKPHTTSSPPDMSPFFLRQYVKGHAADVFEAYTQLLTEMVLRLPYQIKKIADTNSRIPPPVFDHSCT	675172	706649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_675208_676226_676429_677500_677665_678117_678335_679169_679387_681302_681367_681800_681936_682928_683104_683952_684094_685216_685339_685992_686105_687914_688043_688163_688342_688804_688910_690404_690543_691589_691765_697703_697801_698463_698572_699046_699164_700254_700465_701653_701785_703172_703401_704442_704522_705368_705621_706542
913851	contig_8317_pilon	+	971	2	Intergenic	novelGene_19336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	151	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16179	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
913852	contig_211_pilon	+	2086	2	Intergenic	novelGene_129892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385685	428275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_387373_427876
913853	contig_11855_pilon	-	2255	12	Intergenic	novelGene_67152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.103532487417	1	102	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	77	847	2723908	2716444	TRUE	40	ATTTTAAATAACCCTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPPLSLALPGCCCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQVAVNSRERNGEAYSGRSR	2731365	2709194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2711716_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716497_2717117_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719721_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
913854	contig_678_pilon	-	2227	4	Intergenic	novelGene_167790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_3	348.430130091465	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	515	1273	36798	31694	FALSE	45	AACCTTCACCTAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGKQMGCHLF	37312	30739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_31882_32698_32914_35731_35974_36684
913855	contig_5136_pilon	-	2239	2	Intergenic	novelGene_126622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	696	junction_1	0	106	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCCGCCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226345	222911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_223424_224618
913856	contig_15165_pilon	+	2688	1	Intergenic	novelGene_145301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAAAGTCAGCCCTCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453	3141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_500_3100
913857	contig_14566_pilon	+	1177	7	Intergenic	novelGene_148838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_3	331.759660329917	12	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	169	1014	88884	125267	FALSE	35	GAAACCCACACACTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLFWHLGCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSALTSAPMRLTHISRGDDLRAILLNCHPTLTINGEKTDPNSANMDLKDINLEGEQRFVFGSCQPPLEDSGKITDPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESVPYTLIMNCQHPKEINRNITGKHLS	66808	125430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_88762_88951_90606_90937_99199_99308_108219_108328_118470_118579_125142
913858	contig_15851_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_164093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTCAGAGAAGGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16968	15348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15851_pilon_-_15300_17000
913859	contig_10475_pilon	-	3400	1	Intergenic	novelGene_148745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAATTTTTGTTTTATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259514	256114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_256100_259500
913860	contig_10753_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_105134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76841	74770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_74800_76800
913861	contig_17108_pilon	+	5210	3	Intergenic	novelGene_109547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	413.5	149	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1851	2291	389593	395009	FALSE	15	GGTATTTCTATTTCTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPLTLLLFQGSSVCQVTAIGVTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKNVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVVFGVVLFVWELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGLQGR	387742	397928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_389776_392366_392496_394880
913862	contig_9668_pilon	+	2130	9	Intergenic	novelGene_58106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	420.704097317818	4	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	486	1397	282781	359314	FALSE	25	TGGAGAATTATGGTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD	214013	360047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_214246_281470_281586_282642_282811_331983_332161_337930_338032_339303_339445_342688_342790_355527_355714_359138
913863	contig_16387_pilon	+	1589	1	Intergenic	novelGene_174521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATTTTCCCATTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3260	4849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_+_3300_4800
913864	contig_7056_pilon	-	2110	14	Intergenic	novelGene_43626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1156.40864176361	18	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	58	747	730480	725835	TRUE	10	CTGCAATTTGTCTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGRISKSLRAVELKLELTMIHLENLWPCSGQVPMTDLGLAEGITVLAEELALKG	731004	721897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724534_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726944_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
913866	contig_14133_pilon	-	2315	3	Intergenic	novelGene_119947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3618	junction_1	329	41	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	383	694	208493	208182	FALSE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKALLNPFPSDDRALSCGPGAQRAREASPSLLLEQVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209451	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_208728_209012_209131_209421
913867	contig_1443_pilon	+	3240	7	Intergenic	novelGene_28242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	47.1548866325997	292	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2341	2640	540049	541250	FALSE	25	TGAATTTTGTGATTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMVCTLGVLGQGENSLESRKKRIRWEELENLENSLEILRHTCV	535997	541850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536604_537612_537727_537987_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028
913868	contig_2710_pilon	+	3690	1	Intergenic	novelGene_161809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	179	478	1189511	1189810	NA	20	CGGGCGACAGCGTGAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRRSPVQLDGARLPLSALTGIPTEGFGQHWRRMQNKTVTHKKKDEIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGTGQPHKIKQDS	1189332	1193022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1189300_1193000
913869	contig_11493_pilon	-	7507	32	Intergenic	novelGene_143647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_24	292.783292199994	789	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1054	3165	2183	5347	215291	81106	FALSE	20	CTTGAACATGACTGTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTGPIFTFEIYLPSECVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPFVAENLTEADYDLVGQLYYKDCHALDQWRKGWFAMDKSTLRFCLQMQEAQEDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTIWRTAIEKAAGTDGNALEDQQLSKNDVPIIVNSCVAFVTQYGLGSKYIYQKNGDPLHVSELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTGVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGTFIRSLPVVNRATLAAVIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLAMAFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVSQAGDLLVEVYVERKEPECSIIIPISPIMEAEELTNNILAIKNIIPEKGDLWATFEVIENEELERPLHYTENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKQFLTIDTIRHYSERSALESIKDGVLKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGYLFLFKDLKSSKHDKMFSLSSMKFYLGVKKKMKPPTSWGLTAYSEKHQWHLCCDSLQTQMEWMASVFIAQHENDIWPPAGEERKRSITKNPKIRGLPLIPIQQETNTTLARRNIESARAELERLRLSAKHDKESVDSSLKERATIVAHCLEHKEDKVRNRTRKHRSFNCLEDTGAEVPHGQQKFYKGVKTLRKTEDRNSKATLDSDNKLPSKVIEELNVVLQRTRTLPKEFEDEQILQKEIK	356629	78945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_81490_86865_87001_91512_91577_94186_94223_95325_95409_113510_113651_126283_126413_135824_135943_139148_139224_143264_143413_146901_147008_150637_150851_156774_156939_183434_183499_184764_184964_185815_185919_188014_188160_196944_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816_232989_241701_241823_256061_256132_276063_276418_278388_278457_279219_279297_280556_280616_331204_332268_356467
913870	contig_5003_pilon	-	1304	3	Intergenic	novelGene_120225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	188	junction_2	22.5	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTGCTCATTCCTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187443	182165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_182791_183049_183140_186854
913871	contig_8674_pilon	-	2882	1	Intergenic	novelGene_102926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCGAGGCGCCGCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430917	428035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_428000_430900
913872	contig_938_pilon	-	2975	8	Intergenic	novelGene_143905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCCAGCACAGCCTTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92731	24218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_24342_32067_32151_64172_64300_68843_68954_74980_76455_82216_82360_82852_83000_91963
913873	contig_12964_pilon	-	1464	2	Intergenic	novelGene_131706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTTCACAGACCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557997	555699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555940_556773
913874	contig_5331_pilon	-	4833	12	Intergenic	novelGene_112808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3666	3998	730938	730606	TRUE	5	TCTCGCTTTCCCCCTAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFPCFRRWLELNRLSMEMQKQISYVFQSLLSTENPMDKTKLGKRRKGLLLPHSTASSSPPTSAHASTIKSPSSPAPVIRATHAPVLSWSGKSSRLLTINTHATGVVLSE	741610	711250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_711303_715043_715080_715219_715271_716506_716641_724567_724746_727438_727606_729395_729611_730603_734167_734488_734608_737889_737931_741172_741240_741400
913876	contig_14563_pilon	-	4171	27	Intergenic	novelGene_135023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	50	junction_5	386.843471318536	725	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	930	3620	116123	58252	TRUE	25	GGATGATGATCTGGATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPYSECSWEDEALIGKKFQSCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPTYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKSNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEVWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTVLENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVSTSATDELLSQFKVANFATMEDEEELEERPHKEWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETDDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCASAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLSCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKLQGVPAPGRRKSTTAGML	120555	53140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_53242_55283_55425_56439_56569_57838_57962_58194_58309_59087_59239_59433_59573_65265_65406_66607_66650_75198_75375_76341_76513_80680_80774_81216_81314_82383_82533_83281_83432_89281_89354_91431_91585_91924_92088_96551_96741_107765_107957_108805_108896_110642_110860_113623_113749_115997_116177_116346_116392_118159_118261_119825
913877	contig_11855_pilon	+	1662	6	Intergenic	novelGene_66942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069843	1085507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1069851_1077664_1077733_1079097_1079210_1079314_1079454_1082885_1083047_1084332
913878	contig_15434_pilon	-	3520	1	Intergenic	novelGene_56715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	348	3173	3520	68480	68133	NA	25	CCCAGAATGGACAGGGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSGRHPRGRTAQSLGSEVRPGPRAALPRTPPQDSKGRKLLRLSLPRSGRSCTQTGAGETSEAAATPSRPCWSLMAQAPHLQLPQPFYPDIKHPIHSLSPPVRFRTAEYSKPARR	71652	68132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_68100_71700
913879	contig_6102_pilon	-	2237	2	Intergenic	novelGene_32163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTTGTCCTTTTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842497	839081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839996_841174
913880	contig_3747_pilon	+	2326	7	Intergenic	novelGene_24786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4393.17446601986	22	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	248	988	202422	203804	FALSE	25	TATTTTCACCCTAAGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201174_202364_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
913881	contig_16041_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_178361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTAGCTACCAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5927	9370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16041_pilon_+_5900_9400
913882	contig_11846_pilon	-	2324	5	Intergenic	novelGene_105926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCATCTGAGGTGGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184173	174455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_176134_177092_177256_180799_180973_181529_181682_184015
913883	contig_7410_pilon	-	2649	1	Intergenic	novelGene_106035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCCAATGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12165	9516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_9500_12200
913884	contig_18804_pilon	+	598	3	Intergenic	novelGene_163798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	139	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	93	401	43789	45206	TRUE	30	AGAATTTGCTTCCAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWQSFCTQKNFAWKEEYDTRQASNRWEKRAMEKENKKIRDKARKEKNELVRQLVAFVRKRDKRVQAHRKLVEEQNAEKARKVEEMRRQQKLKQAKYAGRTVQRTELDDGGQFGEGAQGDGGAVWKGVWRWIG	43696	47151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_43987_45095_45248_46995
913885	contig_10074_pilon	-	5049	1	Intergenic	novelGene_57213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAATTGGGTGTTGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696004	690955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_691000_696000
913886	contig_12923_pilon	-	2240	15	Intergenic	novelGene_30196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_7	57.0903776873984	139	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	79	1965	577741	511076	FALSE	30	CAATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVVSGTIGLKKKIYLSKPVFLTFKHTQADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585703	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_533560_533746_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
913887	contig_5231_pilon	-	1667	3	Intergenic	novelGene_65877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTACAAGGGTGGACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118068	36121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_36270_92834_93030_116744
913888	contig_7457_pilon	+	2807	14	Intergenic	novelGene_31560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_12	52.2193824678677	149	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	74	850	859493	862434	TRUE	30	CTTTATGGCTATATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRPYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRAAAYVAKRHLETVDKAKVVVLVNRVHLVTQHREEFSRMLDGRWAIATLSGDMGPRAGFGHQARSHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELSDFSLLVVDECHHTHKDTVYNIILSRYLEHKLRRVWPLPQVLGLTASPGTGGASMLSGAIDHVLQLCANLDTWRIMSPQEHQPQLQEHIRQPCKQYDLCQQRSQDPFGDLLKKLMDQVHDYLEMPELSRDFGTQIG	859193	868016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_859661_859839_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862164_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_865537_865734_865911_866031_866783_866881_867222
913889	contig_9656_pilon	-	2466	12	Intergenic	novelGene_121886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	134.931632520123	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	428	1951	97308	70323	FALSE	10	TGTCCTTTCTATTTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLDQSNINEAGKSNDSEQDLGGAVEGSDEALEKRIKPGSPSPQRVQRPHSSPPRFVTVEELLETAKGVTNMALAHEIAVNGEFRIKPVELPEDSLEKRVKDIVHKAFWDCLSTQLSEDPPTYDHAIKLVGEIKQTLLSFLLPGHTRLRNQITEVLDLDLIKQEAENGALDISKLAEFIIGMMGTLCAPARDEEVKKLKDIKEIVPLFRAIFSVLDLMKVDMANFAVTSIRPHLMQQSVEYERKKFQELLEKQPNSLDFVTQWLEEASDDLMNQKYKNSLPAAGGAAGSGDATMLSPVAVQNYAYLKLLKWDHLQRPFPETVLMDQSRFQELQLQLEQLTILGAVLLVTFNMAAPGISSQADFAEKLKMIVKILLTDMHLPSFHLKDALTTIGEKVCVEVSSCLSLCGFTPFTTDQETVLKGQIQAVASPEDPIRRIMDSRILTFLETYLASGHQKPFPTVPGGLGPIQKELEEVAVKFVRLVNYNKMVFSPYYDAILSKSLVRS	101207	69807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_-_70526_71786_71960_73707_73890_79685_79883_81810_81948_85798_86020_86793_86915_88747_88881_97151_97333_98895_98958_100608_100766_101023
913890	contig_12948_pilon	+	4281	1	Intergenic	novelGene_126177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGACATATTATAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167479	171760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_167500_171800
913891	contig_16883_pilon	+	4166	2	Intergenic	novelGene_161759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2301	2654	547212	547565	FALSE	55	ACGCTCAAAATGACAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARTGKHFHTRTELHILSGRSKDGARSRVFEQKEGEVGRGKEEIKRGGKKQHQRPTNGTQGVGQCGQVESKQLVLPGQETVAVGSRGGRVGVKKGRGWESVYIAVYQLFCLLLEAP	544835	549077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_545860_545935
913892	contig_4952_pilon	-	965	2	Intergenic	novelGene_145539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTCTTTTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516390	507759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_507821_515486
913893	contig_6363_pilon	+	3580	3	Intergenic	novelGene_178940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	377	1033	186092	186748	TRUE	50	GTAAACAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILFIFWISNCCFCMVSSYELILAFCSCITFLEFFHFLSVFSLNLSAFSMNLSIFFLIFVCFCFISWIIVNIRDLNSLSDKSNAFSSTGSSSGVLFGCLLEPSCPVFVNVLILSAVFRAFSHYFPHLLIVDLFILSYFCFIWLSEQVGCSFVTVCLSVGTILFTSFSNGQGQSLRYGTAGQVQLKESSWDGFLVTLTRADSVDGESVQSRFQ	185715	242045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6363_pilon_+_187225_228744_229683_240912
913894	contig_6227_pilon	-	6335	6	Intergenic	novelGene_49792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	84.655537326273	109	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	850	1554	1291269	1260481	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAGCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1308753	1249825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1292061_1308695
913895	contig_1694_pilon	-	4014	1	Intergenic	novelGene_144981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTTCCCCACCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1636690	1632676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1632700_1636700
913897	contig_2341_pilon	+	2041	2	Intergenic	novelGene_84346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24986	32555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_25895_31422
913898	contig_15371_pilon	-	3914	24	Intergenic	novelGene_151445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1320	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1180	1479	225596	220873	TRUE	45	CAGATGCCTAACAGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSGKHIEESLYNLFSERHTHLYSKASKQSEEEAQHLISHI	231359	151005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_151088_154076_154189_155015_155213_160079_160241_162796_162876_177202_177656_180954_181081_186470_186584_195431_195543_196973_197071_198102_198175_205109_205138_205189_205265_208940_209036_212974_213118_215188_215336_216233_216426_220720_220875_221999_222115_222287_222460_225585_225700_226860_226960_227138_227371_230614
913899	contig_14441_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_100483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	849	1181	93021	93353	NA	40	AACTTTAAAAAATGCCGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKFCEVEIKCNTSCISYSKYSFFKGRINQRLQQPETRRSRWCPATTTDRPDGEHNREFLLEQEKSGVQNSNSSENTRLNGLTENGGTPESTAPRLSVNPALKQLPRPTL	92172	93636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92200_93600
913900	contig_11378_pilon	-	3401	3	Intergenic	novelGene_112271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGGGTGTTGTACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627791	414208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_416649_477001_477923_627751
913901	contig_15691_pilon	-	3773	1	Intergenic	novelGene_60775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2530	2859	88021	87692	NA	35	GATGCACATTGCAAAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGLYLRNSKESAPAGATRSPTLELRTWLKALRGAADSCRVHFRSLLWPVLLLSLQAAACLGHFCLILTCNFSAYPLLLLGAMSQFQLIATPCTTDSQFQLIVTQCTTE	90550	86777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_86800_90600
913902	contig_960_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_108272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATATTTACTGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720069	721535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_720100_721500
913903	contig_6914_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_151757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	892	1221	287589	287260	NA	65	AAAAAAAAAGACCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVIKNEMEHIKIDILGFSELKWTRIGHFELDNHTVYYAENDKLKRNGIAFIVKKNISRSILKNNVVSDRITSIRLQERPVNMTIIQIYTPTTNAKDEEIEDFS	288480	286364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_286400_288500
913904	contig_5258_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_100242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTTCTCTTGTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195674	197907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_195700_197900
913905	contig_8594_pilon	-	4580	3	Intergenic	novelGene_139999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCCAATGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99771	35372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_36358_41347_41443_96271
913906	contig_7151_pilon	-	3207	11	Intergenic	novelGene_40684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_4	107.224111094474	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1017	2190	3206	12708	3156	FALSE	25	TGAGTGAGAAGCATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPG	40810	3154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_13676_13782_13876_18160_18880_40400
913907	contig_6101_pilon	-	3493	4	Intergenic	novelGene_114297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.5356882927706	100	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	159	1790	615605	612113	FALSE	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETFRNLASVVSRNLDNGEKLSSEHIMVQFMKNKTWSSMLGDISKLHGNKDQHKNQERHLRSHAVENLCECNEGHQCQKTFSQIPNLTMLKRNPPEVNPFECHACGKAFMDHSSHNHHTRSDSECSACQCKECGEACSCPSHLNTPVRILNGKKPHKCKVCGKDFICISTLKNPVTTLTGEKRYECNKCGKDFCSFSSIWIHVRGHKLECKECCKTCVPSSLILHKKSHNRDNPYECKECGKAFSYSSSLTTHMRTHSGDRPYECKECGKAFSQTSNLTTHMRTHSGERPYKCKECGKAFRCSSHLTTHMKTHNGQRPYECKECGKAFSQVSSLTQHIRTHSGVRPYKCKECGKAFRCSSHLTTHIKTHSGQRPYECNECGKAFSNSSALTKHTRTHSGATPYRCKECGKVFRQASNLTTHRRIHSGERPYECKECGKAFSRSTHLTTHIRTHSGERPYECKECGKTFSHSYCLSEHIRTHSGERPYECKQCGKAFSCSSSLTKHIRTHSGERPYECKQCRKAFSQASSLTKHIRTHSEGRP	647424	610409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_613560_614430_614582_615571_615699_647359
913908	contig_9471_pilon	-	1602	13	Intergenic	novelGene_21733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCCCGCAGTAGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302809	210860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_211115_242808_242894_248956_249059_259412_259494_260219_260322_271739_271920_275965_276047_278275_278393_289121_289217_293216_293336_293894_293977_297472_297642_302674
913909	contig_11248_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_142536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCATAGCGACACTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145968	147865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_146000_147900
913910	contig_7297_pilon	+	2698	3	Intergenic	novelGene_169692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	2346	2696	15084	19327	FALSE	10	TCCACAGTGCTGCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEITLYQILSWKGLHHTTAKLHHNCQTTENCGPAKLTHNLNHHSPLPTETPLKEKPHGLTSPVLLSSHLTWLEYGCSKPLAIELIPTHDDPIHYKVELLHRVFWVVIFMEADCQTF	12221	19329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_+_12656_13172_15316_19208
913911	contig_9527_pilon	-	1896	8	Intergenic	novelGene_134076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_3	24.5032276091397	16	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	252	1679	494027	488550	FALSE	10	TTATTTCCCTTGCATTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVSARGLSLEERRQLAVKLTRVLALYRSILDAYIIEFFTDNLWSTLPCSWQEALDRLNPPQLATLLLGMPGEGEVVRYRSVWPLTLLALKSTASALAFTRTPGFQTPSEFLENPSQSSRLTPLFRKHVRPKKQHEIRRLGELVKKLSDLTGCTQVVDVGSGQGHLSRFMSLGLGLLVKSIEGDQRLVERAQRLDQELLLALEKEKKRTPQVVHAGPRHPPHHVVRWVDPTALCEELLLPLEPAPQGGARLLLTGLHACGDLSVALLRHFSCCPDVAALASVGCCYMKLSDPGGYPLSQWVAGLPGCELPYRLREGACHALEEYAKRLHKAGPGLRTHCYRAALETVIRCAQPELRRPGVQGIPRVHELKIEEYVQRGLQRVGLDPQLPLNLAALQAHQAQEHRVVAFFSLALLLAPLVETLILLDRLLYLQEQGFHAELLPLFSPELSPRNLVLVATKTPLGQAFSVLETEDS	494278	488332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_488672_489070_489256_489661_490147_490599_490744_490976_491040_491533_491727_491886_492012_493916
913912	contig_16126_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_141881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	109	327	61786	61568	NA	60	AATAAAATAAATCTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGLKSLQAAIQGTTVGLYSLGVTVRRSFRNRKKVWNMWLIAFMNHCFLLCHETRRTGWCLANITEHFDQRFSRRILIKREKRQNNFRFSWPLNFLELWRVDEPLKLLP	61894	60634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_60600_61900
913913	contig_10296_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_168897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1158	1475	981885	981568	NA	45	GTGGCATGAAAACAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLQQFSHIFRLCSTSKYSSLAISTMSAVTSPTEVLNPSKSSRKSGIEFFQTPVNVDILTSSNESQMFFMASRMVNPFQKVFNLPRSINGITIFGSYSLMKYILK	983042	981510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_981500_983000
913914	contig_19402_pilon	+	3922	12	Intergenic	novelGene_80813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1551.91684194016	18	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	533	1147	97756	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	72683	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_72691_79132_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_142957_143063_143802_146482_146623
913915	contig_299_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_129505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGTAAAAGAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1653016	1655076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1653000_1655100
913916	contig_2646_pilon	-	2479	8	Intergenic	novelGene_69716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_7	158.802534293251	97	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	181	1983	2623501	2595042	FALSE	25	TGATTAATTTTTGAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLILGRRLNREDLGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGREFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGREFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFEDVSQHEEFLELGKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMSPRTRPRRSTGYSEVIVVVGGCERVGGFNLPYTECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILVSGGRINSRDVWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYDGQNRLSSVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDKVQSYDPETNSWLLRAAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGGLTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQENCGMSVCNGKIYILGGRRENGEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHRYNEKCFKL	2632901	2594545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2595243_2599698_2599888_2600887_2601077_2607808_2607928_2608692_2608878_2622581_2623563_2627147_2627211_2632845
913917	contig_11493_pilon	-	3250	12	Intergenic	novelGene_143692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_11	439.999229901655	87	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	711	1931	276158	200892	FALSE	75	ATAAAAAAAAAAAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCAISPYACFYGSPAVKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAVSTIRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNEWISILLNALKSQSLTPQSQTVAAPEKFGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVRLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKVFDEMYQHNWILFYFFKYVPGFLVRSEILYYLIKLLFNCILFLLMRLHWWFSHCFP	319895	199572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816_232996_241701_241823_256061_256132_276063_276418_278388_278457_279219_279297_280556_280616_319648
913918	contig_10904_pilon	-	3060	1	Intergenic	novelGene_22775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	325	660	713233	712898	NA	20	ATGAGGTGCTTCACAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFMVFGFIFRSLIHFELVFVYGVRYGSCFIFLQMDIQFCQHHLLKKIAFSPCNELWAFVEDQVTVGGWIYTSVFNSVPLVNVSVVVSVLDCFDYHSCTVHSSKYFLLLLK	713557	710497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_710500_713600
913919	contig_1575_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_45193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTTTTGCAATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194089	191709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_191700_194100
913920	contig_16211_pilon	-	2379	9	Intergenic	novelGene_150066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	323.92222735558	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	121	912	121247	87472	TRUE	55	GGAAAAGGAAAGAGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLNNWQFVERKTLC	121367	79967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80505_85311_85427_86272_87509_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
913921	contig_6634_pilon	+	3636	3	Intergenic	novelGene_171134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	634	1143	107989	108498	TRUE	80	AATCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFIWKGKKPRIAKAILKKKKKAGGFTLHSIKTYNAASVIKISLYWFNDRHIEQWNRIENSDLNLATYGQLIFDQGSKSIQWDRNSLFNKWCCQNWISTCRKMKQNSYLTPYTKSNSKWINNLNVKCKTMILLEENKGRRLWDLIFCKNRITNITTNAQVEEKIEGNS	107355	111625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_108757_108925_109160_109624
913922	contig_12038_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_165818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428068	426330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12038_pilon_-_426300_428100
913923	contig_383_pilon	+	1567	2	Intergenic	novelGene_126148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAAAAAAAAAAAGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353263	359430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_354478_359077
913924	contig_9633_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_139631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGATGTTTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047284	1049036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1047300_1049000
913925	contig_12948_pilon	-	5507	4	Intergenic	novelGene_126173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACCACAGTACAACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172437	165392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_165512_166101_166420_167286_171925_172005
913926	contig_9995_pilon	-	2258	1	Intergenic	novelGene_47689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAACCATCTCCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280402	278144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_278100_280400
913927	contig_11338_pilon	-	1696	10	Intergenic	novelGene_6354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	294.07070620331	12	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	299	1153	319426	295358	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLC	323314	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
913928	contig_12967_pilon	+	3802	18	Intergenic	novelGene_169802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	92.4711495268102	26	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	164	1822	203707	222680	TRUE	20	TATGTGAATCCTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEDVQRALKEITTFEGCKINVTVAKRKLKHKSKEKGKNENLESPKKVLKPKKAKMADKKARLIIRNLSFKCSEDDLRTVFAQFGAVLEVNIPRKPDGKMRGFAFVQFKNLLEAGKALKGMNMKEIKGRTVAVDWAVAKDKYKDTQSASVSGEGKNPEPKQQGSGKENGQEKEDDDDDDDEEDDAEEDEEDEEEDEGESKMTKPVQIQKRAVKRVAAAESSEEDHSNEDSDLEQRDGIDDGEELAQSDMDTEEREDEDAQISKKKKRKLPSDVNEGKTVFIRNLSFDSEEEDLGELLQQFGDLRYVRIVLHPDTEHSKGCAFAQFLTQEAAQKCLAAASPETEGGGLKLDGRQLRVDLAVTRDEAAKLQTKKVKKPTGTRNLYLAREGLIRAGTKAAEGVSAADMAKRERFELLKHQKLKDQNIFVSQTRLCLHNLPKAVDDKQLRKLLLSATRGEKGVRIKECRVMRDLKGAHGKGKGQSLGYAFAEFQAHEHALTALRYINNNPDVFGPQKRPIVEFSLEDRRKLKMKELRIQRSLVQNFSVVLFFKERI	199376	227105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_+_199499_203665_203825_204148_204244_204685_204762_205336_205430_206211_206284_207096_207272_207449_207593_208984_209058_211660_211771_215058_215133_216536_216673_217583_217649_220107_220267_222096_222247_222560_224024_224607_224708_226568
913929	contig_1813_pilon	+	3504	1	Intergenic	novelGene_105490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115168	118672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_115200_118700
913931	contig_20502_pilon	-	2372	1	Intergenic	novelGene_178941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	426	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAAAGCCATCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20404	18032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20502_pilon_-_18000_20400
913932	contig_8006_pilon	-	3749	4	Intergenic	novelGene_173932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	884	1288	557928	557524	TRUE	45	ACAAGAGCAGGAGTAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPARRAESKLPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQSLARAADQTRKEPHTRTQPPQPHRKGQRRRSEPGT	558811	411609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_-_411900_529392_530978_552666_552787_557057
913933	contig_19160_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_178942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAGCCAGGCTGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8037	9299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19160_pilon_+_8000_9300
913934	contig_5988_pilon	+	3027	10	Intergenic	novelGene_16040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.6254752248883	26	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	856	1725	954094	998155	FALSE	75	AAAAAATTTAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKQSQKDSSGFIFDLQSNIVLAQGGTFENMKEKINAVRAIVPNKSNNEIILVLQHFDNCVDKTVQAFMEGSASEVLKEWTVTGKKKNKKKKSKPKPAAEASNSIPDSSKLASIQEEQSAPSSEKGGINGYHVNGAINDTESVDSFSEGLETLSVDARELEDPEPATPDIQTLDRTGSTLENGISDFEPKSLAMHSTQNSQQSRNAAKSLSRPTTGAQFSNLGMEDVPLSSTNKKLGSNIEKSVKDLQRCTVSLARYRVVVKEEMDASIKKMKQAFAELQSWEVVLVI	877139	999457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_877211_943074_943614_953848_954119_981234_981315_984813_984923_986634_986685_989510_989779_993269_993450_997210_997347_998133
913935	contig_9363_pilon	-	4039	4	Intergenic	novelGene_6488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	111.251466906683	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	2989	3978	373380	372391	FALSE	30	ATTAGATCGTTTCCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	571050	372329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_377125_405212_405436_570857
913937	contig_14133_pilon	+	2227	2	Intergenic	novelGene_119980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	64	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	68	313	265958	266266	FALSE	80	ATAAAAAATATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEIEKPILNFIWNGKRPRVAKAMLKEKNKVGGLTLSDFKNTLYSSTAIKTAWYWYNNRHMDQWKRIENPEIKPHAYGKLIFLARVLSPFDGRKSLFNKCGWEN	265890	268180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_+_266025_266087
913938	contig_2504_pilon	-	2732	1	Intergenic	novelGene_166863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACAGGTGCATATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424144	421412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_421400_424100
913939	contig_6137_pilon	+	2054	2	Intergenic	novelGene_59288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATTTTGAGAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352770	1354916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1353823_1353914
913940	contig_10734_pilon	-	2018	13	Intergenic	novelGene_51506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	539.699890885872	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	235	1734	2285163	2265543	FALSE	50	AACCAGGCAAAGACATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305083	2265258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286353_2286447_2304960
913941	contig_3469_pilon	+	2462	1	Intergenic	novelGene_34201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAACAACATGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531141	533603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_531100_533600
913942	contig_13740_pilon	-	3610	8	Intergenic	novelGene_34637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_2	3490.77189288605	43	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	170	658	165243	161045	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165412	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919_162031_165237
913943	contig_401_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_42760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTTTATGAAGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987775	988394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_987800_988400
913944	contig_5280_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_52646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224435	226538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_224400_226500
913945	contig_8377_pilon	-	3096	16	Intergenic	novelGene_35129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.81582827759238	9	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCGTGGTATGCTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199250	177268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180460_182890_183046_183256_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660_197778_197878
913946	contig_17796_pilon	+	6218	4	Intergenic	novelGene_33817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	466.126115504759	209	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3945	4355	77343	77753	FALSE	35	AGTACAGGAAGCCAGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVPATMSPHVRTPATHLPLFLDLASRGTRELLHLTTSARAVVQRRLLLPPTTCTGSLRTGSTSSPAARCSGQGHALQPGTYGLVTSPLPCPPHCPLYNWRLVPSLTTPTQPILPGMVNESFFTTHPVTDDLDTLN	53856	79616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_54063_72384_72571_72904_74664_75549
913948	contig_8538_pilon	+	353	2	Intergenic	novelGene_4673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842546	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_842764_842991
913949	contig_9649_pilon	-	2711	1	Intergenic	novelGene_160690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGACTGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32531	29820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_-_29800_32500
913950	contig_9571_pilon	-	2296	3	Intergenic	novelGene_136247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10	62	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	43	441	352858	276763	FALSE	15	CCCACCTACACTGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSSTEKSRFFKPDYEAWLRIQRAERGGVIFHDVAVLTDKLFPIVEAMQKHFSAGSGTYYSDSIFFLSVAMHQIMPKDRIIFIYLYSSSILKSSRISFYFNQQSTPMEAAVKKSNNILHQSKLWQKISLKS	352900	274907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_276927_321690_321839_352771
913951	contig_3789_pilon	-	5299	3	Intergenic	novelGene_79864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	37.5	3	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	1	1017	519822	518806	TRUE	50	ACCACTAGATAACTAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKMSQPILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKRPHVAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDNAEVYRLIEVTGLSRSEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESIAKDQMALAATRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKVLEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGTGKKRPRCGGPQWCSLST	519822	499054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_502708_518131_518245_518289
913952	scaffold_13505_pilon	+	9033	8	Intergenic	novelGene_111601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	4212	4724	659510	660022	TRUE	50	CACTAAATGACTAAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	653032	728039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_653142_653684_653874_654866_654959_655009_656131_656809_661376_661523_663802_663887_664210_727683
913953	contig_15629_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_122459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCTCTCACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119012	116696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_116700_119000
913954	contig_16496_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_5240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATAAATTTACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3926	2233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_2200_3900
913955	contig_13224_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_104089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	307	636	222032	222361	NA	30	GCCTTCACCTGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAMPPVFRTPAGLPMMDRFQQSFQTKTDYKGSPVYFQKLASENPMGHNRIWSDIVLEDEPSRLEGIQNTVATTDSTIPTIVKMAQDPAAFLSVVRGVAVSWSQPNGN	221725	223627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_221700_223600
913956	contig_14846_pilon	+	4489	2	Intergenic	novelGene_85368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2885	3373	132665	133153	FALSE	80	AAAACAAAAGAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDIQAVNRHTKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIHKTQNNKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAIPFLGIYPRETRAITRIDICTPMFIAALFTIAKGWKQPKCPSMDEWINKLVYPHNGILHNDKEH	34393	134269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_36796_132182
913957	contig_8045_pilon	+	2257	9	Intergenic	novelGene_35447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	111.802280835411	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	151	1719	452026	462377	FALSE	25	TACCAATTCTTTTCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKKMGIPAKLIVCGMTSNGFTIADPDDRGMLDMCGFDTGALDVIRNFTLDVI	434987	462915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460777_460877_462224
913958	contig_11720_pilon	+	2957	3	Intergenic	novelGene_43866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3591	junction_2	2187	49	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1656	1955	94193	94492	TRUE	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGSEMERIPKSQREGGACRSAQGPKGTTWVFTWLVPWDGLFSAPSQSSSSSLPALIKAWKVWVFRPLVLGSQSKNIGCSLEPSFSECLLCISAPAT	92537	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_95061_95383_95486_98299
913959	contig_10779_pilon	+	3123	2	Intergenic	novelGene_165513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTAGTGTCTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26530	29698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_28812_28856
913960	contig_8045_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_35404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTCAAACGGGCCTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120263	117275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_117300_120300
913961	contig_14219_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_54352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTAAAAAGAAACTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850017	852336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_850000_852300
913962	contig_12630_pilon	-	2471	2	Intergenic	novelGene_173064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATTTACAGAACAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59068	50715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_52948_58829
913963	contig_10446_pilon	-	5095	22	Intergenic	novelGene_162434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_4	289.779821021412	207	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	966	2901	175	3075	233785	145906	FALSE	25	GGCCCGCATGGAGAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELFMECEEEELEPWQKKVKEVEDDDDDEPIFVGEISSSKPAISNILNRVNPSSYSRGIKNGALSRGITAAFKPTSQHYTNPTSNPVAASPVNFHPESRSSNSSVIVQPLSKPGCKMKSRVVSNNSPQLLFDLTQDTGLSHYQGAPALSIAGMNESSFVSKRPSTSEVNSVNPKKPKPSEGVSGTSSSGAFSSVTSASVTSPQAMPSKGTNTSSNQSKNGTPFPRACPKCNIHFNLLDPLKNHMKYCCPDMINNFLGLAKTDFSSTTNKNKTVDSEKGKLIMLVNDFYYGKHEGDIQEEQKTHTTFKCFSCLKVLKNNIRFMNHMKHHLELEKQSSESWENHTTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHGFSTICKICELSFETEHVLLQHMKDNHKPGEMPYICQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYMHHYMKHQKKGIHRCTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGSLPTPSISASTSTLQLSPPRTKTLTAKNPIKSNTNKPNAPKPSASKPNASKPPNGSKSKCKPKISNMQKKQNTLTGSNKKSKVNTALRNLRCRRGVYNCIECCSEIKDFANHFPTYVHCSFCRYNTSCSKAYVNHMMSFHSNRPSKRFCIFKKHSEDLRGITIVCLNCDFLTDVSGLDNMATHLSQRETHTCQVIMKTVSVCIPTSEHLSELKNETPTVEQEPVSEDISRPNVAEGETETSKSECKQDKASSEEEKNGCDASSFEGSSVTKSEESIAVSLKKNDTCLTDQETGSKKIFGYDSNIGEDKVEKEKQIELIGPETVLKMRPSSENTVSCDPIKAHSSGEARLPSKNIKDLRLTSGDVSIDQFLRKRDEPESASSDVSEHGRIHLEPLTPSEVLEYEATEIFQKGSGDPSAKTDEVVSDQADDVPRGSSPNTTGTAADLAGDRERR	260063	143885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_146531_148893_148950_157704_157751_172873_172911_173060_173180_181196_181260_187599_187741_188328_188640_190513_190649_198634_198782_199736_199838_200515_200674_204441_204666_213505_213616_213761_213933_218320_218436_228939_229080_229179_229246_233649_233797_235004_235074_235188_235234_260014
913964	contig_9098_pilon	-	3316	1	Intergenic	novelGene_75824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAAAAAAAAAACTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321218	317902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_317900_321200
913965	contig_11512_pilon	-	2738	15	Intergenic	novelGene_43348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	883.612102078042	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	409	1098	580140	556654	TRUE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	609616	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556376_556430_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_582678_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587
913966	contig_6509_pilon	+	5358	2	Intergenic	novelGene_145643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAGAACAGACCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116148	155806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_118692_152991
913967	contig_5799_pilon	-	2835	1	Intergenic	novelGene_50266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTTCTGGCAGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250258	247423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_247400_250300
913968	contig_5999_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_45658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	936	1370	276320	276754	NA	65	GTAAAAAGAAAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEKSHIGGARGNTENHSSSTPSFPDYTIASIIHFKVQILYKKNTRNFSVVEQWPSEVKLTIIFGCRVGHLSILCFMATFTPTQGLIYQMFALGPKPQPSRLVSSFKLILAYMFLSRSDLIFSFFSFPPPPCLPLSRIRKQKG	275384	277176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_275400_277200
913969	contig_10937_pilon	-	12724	1	Intergenic	novelGene_67323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	506	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	7504	7941	117719	117282	NA	80	AAAGAAGAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSNHCHFYLQPGIVSPFKRVFLKGEKSRDKKAHEKVTERRPLHTVVLSLPDRVEPDILLNDYIEKEVKVSCHRQQEVTAKLKKKGNAFYPPGALKFMQHFHVNTFVDSPTCRLAYGNRSNTWKKQNSDPCLLVPFIIAYHVLFS	125222	112498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_-_112500_125200
913970	contig_1143_pilon	+	2474	16	Intergenic	novelGene_86603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTCAAATTCACCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207761	295029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_208189_208911_209103_214458_214634_224262_224446_226134_226440_228832_228966_229068_229195_231297_231417_232073_232179_238970_239137_240169_240301_240573_240673_243019_243113_249937_249992_254864_254932_294929
913971	contig_2062_pilon	-	3660	1	Intergenic	novelGene_139032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCAACACCTGACCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1179504	1175844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1175800_1179500
913972	contig_5686_pilon	+	4635	8	Intergenic	novelGene_45417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1602.26946191065	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	2460	3401	189037	208515	TRUE	15	TTTTTTTTTTTTTACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTACPHRMRAQMTLAQHLPEAPRQKAKSRSHTWRNTQSIRKLPWLRLRPANSPQVLGPTACSWKITLLRLFCKHPMRPLNSSLWNWTLLKATSQSSWSRD	186577	212311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208165_208216_208722_211283
913973	contig_19098_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_65857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGCTGAGCCCGGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478794	482109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_479927_481385
913974	contig_10126_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_105712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	558	923	132039	132404	NA	25	GGAAGAATTGGGTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEQAPNILFSCHLLISLSLMHQSPLHLFSDEETEAETCSCPSSHGSEGQSQELSAALCHCAILSHQNWKGSQSPVIHQILVCLCRVSRLSTGTWKPSSQRLSGGRDPERVLWPPKLVAK	131481	133248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_131500_133200
913975	contig_5467_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_111977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	167428	167748	NA	80	AAAAAAATATAAAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDGGVVRWLPISLLQQRPGKTSDWIVYESLGALNKAKLRNRTEWWGRGRRFRRSKECRTGLGGSRSSSAPTSPGCAVKWAYSSAHVLGRQFPHRERSSSRDSAWTL	167425	169972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_167400_170000
913976	contig_5686_pilon	+	2792	12	Intergenic	novelGene_45285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1726.48747222085	10	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1593	2432	202891	215344	FALSE	55	GAAATGCACGTAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKLQVSTSGSQGAS	93824	215704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176652_176726_182642_182789_189033_189098_198550_198595_199758_200560_202871_203002_208031_208722_215305
913977	contig_7410_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_106064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGGCTAGAAGGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317301	319381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_317300_319400
913978	contig_2715_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_173170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	816	1232	94155	94571	NA	70	CAACAGAAAAAGCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIYQEDVTIINIYAPNDKAPKYIKQTLIALKREKDSATIVVGDLNTPLSVKDRTSKKKLNKDMEELNATTNQLDFKDIYRTLYPTAARYTFFSNAHGTFSRIDHVLGRKARLNKIQSIKILQSIFSDHKAIKVEV	93339	94573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_93300_94600
913979	contig_17989_pilon	-	1971	10	Intergenic	novelGene_150838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	54.7499365803793	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	650	1468	271232	266567	FALSE	15	ACCTGTCACCTGCCCTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVEHLYQQGMLSVAEELCQESTLNVDLDFKQPFLELNRILEALHEQDLGPALEWAVSHRQRLLELNSSLEFKLHRLHFIHLLAGGPEKQLEALSYARHFQPFARLHQREIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLSVSFASGCVALPVLMNIKAVIEQRQCTGVWSHKDELPIEIELGMKCWYHSVFACPILRQQTSDSNPPIKLICGHVISRDALNKLINGGKLKCPYCPMEQNPADGKRIIF	283810	266063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_266631_266714_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269823_271169_271283_271437_271584_278208_278360_283508
913980	contig_8598_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_22873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACCTTAGCCCAAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5946	3380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3400_5900
913981	contig_4924_pilon	-	2936	1	Intergenic	novelGene_84752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGAAACTCAGAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190539	187603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_187600_190500
913982	contig_11250_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_127161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGGTCCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196583	194014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11250_pilon_-_194000_196600
913983	contig_13740_pilon	+	3735	8	Intergenic	novelGene_34630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGACCCGGCGCTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155093	165389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157528_158261_158393_160070_160138_160651_160729_160800_160904_161058_161719_161916_162027_165236
913984	contig_1618_pilon	-	2367	7	Intergenic	novelGene_141801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_6	310.663090108168	49	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	44	1177	353751	327195	FALSE	35	AATATTGGTTACTGATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPDVEKLGRRRGRKMDSVEKGATTSVSNPRGRPSRGRPPKLQRNSRGGQGRGVEKPPHLAALILARGGSKGIPLKNIKYLAGVPLIGWVLRAALDSGVFQSVWVSTDHEEIETVAKQFGAQVHRRSSEVSKDSSTSLDAIIEFLNYHNEVDIVGNIQATSPCLHPADLQKVADMIREEGYDSVFSVVRRHQFRWSEIQKGVREVTEPLNLNPAKRPRRQDWDGELYENGSFYFAKRHLIEMGYLQGGKMAYYEMRAEHSVDIDVDIDWPIAEQRVLRYGYFGKEKFKEIKLLVCNIDGCLTNGHIYVSGDQKEIISYDVKDAIGISLLKKRGIEVRLISERACSKQTLSALKLDCKTEVNISDKLAIVDEWRKEMGLCWKEVAYLGWYLFI	353794	326004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_327369_328178_328351_328733_328829_338948_339083_340959_341116_342025_342169_353491
913985	contig_15039_pilon	-	2525	2	Intergenic	novelGene_110180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	360720	360349	TRUE	20	ATGTATTTTGTAACTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSTSPVPPSRSAGWSGLVPASRGLAPFGSAGGIGVAAPRRSSPVDAASAWPAGSAWHSSQLQPPFYAEAGSSSHFSAFGFSPRPCPHPTGSADLRESHGSARCTPSFGSLDPRRAAASTTPRP	360721	357817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_359936_360314
913986	contig_6823_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_131252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGATGCGTGAAATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456098	457932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_456100_457900
913987	contig_10581_pilon	+	3767	12	Intergenic	novelGene_41371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	50.877912530597	463	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	36	1640	465818	485194	FALSE	5	TGTGGTTTGTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAVIAAAVVRARILQVSSRVNSTRYPSSSFSSSSVSTVKLFINGKFVESGSDKWIDIHNPATNEVIGRVPQTTKAEMDAAIASCKHTFPAWADTSVLSRQQVLLRYQQLIKENLKEIAKLITLEQGKTLADAEGDVFRGLQVVEHACSVTSLLLGETMPSITKDMDIYSYRLPLGVCAGIAPFNFPAMIPLWMFPMAMVCGNTFLMKPSERVPGATMLLAKLFQDSGAPDGTLNIIHGQHEAVNYICDHPDIKAISFVGSNQAGEYIFERGSRHGKRVQANMGAKNHGVVMPDANKENTLNQLVGAAFGAAGQRCMALSTAILVGEAKKWLPELVERAKNLRVNAGDQPGADLGPLITPQAKERVCNLIDSGTREGASILLDGRKIKVKGYENGNFVGPTIISNVKPNMTCYKEEIFGPVLVVLETDTLDEAIKIVNDNPYGNGTAIFTTNGATARKYSHLVDVGQVGVNVPIPVPLPMFSFTGSRASFRGDTNFYGKQGIQFYTQVKTITSQWKEEDATLSSPSVVMPTMGR	465782	487321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_465866_473582_473643_474623_474699_474870_475033_475281_475361_475781_476085_477421_477544_478888_479079_479280_479463_480930_481111_481387_481487_485089
913988	contig_9243_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_60326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAGACGGTATAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24218	22447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_22400_24200
913990	contig_12139_pilon	-	2976	1	Intergenic	novelGene_146467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2371	2679	91093	90785	NA	60	AACAAAAAACAGATCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLMDHSYHGPHQTQSSTARWCPVPTTDCSDRDCNRGSWTELEKDVEQNSNTQKKTRFTGLTDWRNPESMAPRHPSSSKVKSLLRFTIQPGIGQPHKTKRD	93463	90487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_90500_93500
913991	contig_16072_pilon	-	3317	1	Intergenic	novelGene_175855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTTAGCCAGCGACAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32079	28762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16072_pilon_-_28800_32100
913992	contig_17440_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_7528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	466	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATATTAAGTATTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242	2259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_200_2300
913993	contig_9561_pilon	-	2491	1	Intergenic	novelGene_100856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	340	765	196361	195936	NA	65	AAAAAAAATGCAAACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNNDPEINGILIEIFQRMDTTLEVLTHLCEQIWKTVTWSTDWKRSIYMHIPKKGDPTECGNYLKISLISHASKILLNIIQKRLQQYIDRELPEIQDRFRRGCGTRDIIADVRWIFAEREYQKDVYLYFVDYAKAFNCVES	196700	194209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_-_194200_196700
913994	contig_10609_pilon	+	4825	29	Intergenic	novelGene_123966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	116.644213096834	158	32	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	33	1361	574055	606051	TRUE	15	TCCCAGCTTCATACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSGPRGGGTMFLHSVNLWNLAFYAFMIFMATLGLWDVFFGFEENKCSMSYMFEYPEYQKIELPKKLAKRYPAYELYLYGEGSYAEEHKILPLTGIPVLFLPGNAGSYKQVRSVGSIALRKAEDIDFKYHFDFFSVNFNEELVALYGGSLQKQTKFVHECIKTILKLYKGQEFAPKSVAIIGHSMGGLVARALLTLKNFKQDLINLLITQATPHVAPVMPLDRFITDFYMTVNNYWILNAQHINLTTLSVAGGFRDYQVRSGLTFLPQLSHHTSALSVVSSAVPKTWVSTDHLSIVWCKQLQLTTVRAFFDLIDADTKQITQNSKKKLSVLNHHFIRHPAKHFEENPAIISDLTGTSMWVPVKVSKWTYVAYNLSWMLIIDMSRMKLLITSVSSPFIVMLLIDPVVKIFVFLTFRNLIRYILHFLLQIIEKSTLMSIVRAPCWIQIVGFLDA	574022	641401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_574202_580521_580676_584888_585065_589691_589864_593013_593172_596498_596552_597337_597405_599831_599938_600630_600687_602791_602917_603206_603291_606020_606068_606456_606509_609947_610026_611589_611653_613392_613469_618600_618675_618789_618842_619348_619416_622470_622580_624512_624552_628571_628666_632589_632681_633700_633899_634853_634990_636227_636279_636761_636950_638259_638365_639426
913995	contig_10130_pilon	-	978	3	Intergenic	novelGene_172718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_2	62	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	264	902	56617	19813	FALSE	60	ACATGAAAATTTAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGCQAPPPGQMELSALKSRAETAGKDRWCPGERCLAPSPDNGKLCEASIKSVTVDENGKSFAVILYSDSLERKVPLRRLQEVKSVKDCSRSFIFDDEDLEKPYFPDRKFPSSAIAFKLSEDGDCIPHTINRYLRDYQREGAQFLYGHYIQGRGCILGDDMGLGKTVQVISFLAAVLHKKGTREDIENNMPEFLLRSMKKETPSCTARKVK	56880	19736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_19945_48815_49241_56535
913996	contig_1244_pilon	-	2805	4	Intergenic	novelGene_38042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1408.08530360281	7	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	70	585	947731	946257	TRUE	70	AAATAAAAGACAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWVPELDRLSGTDTFFFVLFSLSFRADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVRPALLPTASSVTELFPFLLLAFSLLSLQRSSPLLLEVNCSVQQNDCLNVSMLLNLTGSN	947800	943232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_943985_944422_944605_944970_946620_947578
913997	contig_10958_pilon	-	1327	2	Intergenic	novelGene_5383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1201	junction_1	0	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAAAGTTCAAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854520	845697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_846924_854419
913998	contig_854_pilon	+	3473	17	Intergenic	novelGene_36616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	2927.90855323279	173	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	1	2451	1692680	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1692679	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165
913999	contig_8581_pilon	+	4473	1	Intergenic	novelGene_22849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	686	1129	308696	309139	NA	35	CTCTCGATCTGAGAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVRAGQVQPLLCLLKDPGQTSELIIISSQTSPIPEHSKPFGWLCPGENFPGRNHTLMLWEALPTQTQSHLLGVKFVQRPVHSHSHIQMVQSPVLTDLIHHGRHARATQLRGPPGHHPTHSLHEDTVITGAVQSQLLEDGPNLEQC	308010	312483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_308000_312500
914000	contig_10197_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_115196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	91	276	54	329	553082	553357	NA	20	AGTCGTTGGAGGCCTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSVKYDSERHFINDIHMPLGLAVASCSQTVTCVPNCTWRNYRAEVRFEPRHKPARFLSTTIVYPKYPKTVYTTTLDYNCRKTLRRFLSSVELEATEFLGGDCLSDEC	553028	555286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_553000_555300
914001	contig_9267_pilon	+	2186	5	Intergenic	novelGene_162007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	51.9615242270663	43	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1880	2185	338541	339591	FALSE	20	CCACCCAGCAATGGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGKKSVPGFDVPFMTSLCAQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKFCFDAISHNSPVTLYDCHSMKGNQLWKYRKDKTLYHPISGSCMDCSESDHRIFMNTCNPSS	231885	339592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_232179_265041_265210_306808_307027_337340_338754_339498
914002	contig_160_pilon	-	1494	2	Intergenic	novelGene_156314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	214	junction_1	0	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCCAGAATTATATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18171	16569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_17976_18083
914003	contig_9011_pilon	-	2457	1	Intergenic	novelGene_159264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTCAGAAAATTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50200	47743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_47700_50200
914004	contig_10609_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_123970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCACTTAGGTAATAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594233	595950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_594200_596000
914005	contig_5375_pilon	+	2896	1	Intergenic	novelGene_169207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1107	1451	64953	65297	NA	10	TGTTTATTTCGCTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRDHSLQYGLHLNIKKTKILTNGPISNIMINGEKIEIVKDFILLGSIINAHGSSSQEIKRCITLSKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVPLTQAIVFSIASEKCEIWTMNMEDQ	63846	66742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_63800_66700
914006	contig_6885_pilon	-	5500	2	Intergenic	novelGene_83632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	168	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1609	1911	210312	210010	TRUE	45	ATCTGAAGAGATCCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	211920	99268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_100533_207684
914007	contig_9484_pilon	+	2532	10	Intergenic	novelGene_105636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	608	junction_8	412.807491079508	15	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	672	1598	100737	103702	TRUE	15	TTTTCTGTAGTTAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYCELCFIWSSSYCMLRSGNTT	95832	105108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_104412_104883
914008	contig_9177_pilon	+	2100	4	Intergenic	novelGene_32801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	184	junction_3	59.1100668245266	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1286	1798	1566737	1569099	FALSE	55	AAAAAAAGCTCATCTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNQTFPTSPFIYYYDDKYEIREREQRIKRKVKELQKNGDFPRQFKRPHMEAVDKKPHRDMRKSHGSWRNNRWPQEKKEAQKEMMSRNSRDGEKHRKADKYHEVDEDFPRGPKLHQKPDRSSRHSSHYHRPRGEKLPKEAKRGKHKKKERGLEDDDNDNLFLIKQRKKKI	1534787	1569401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1535959_1558471_1558568_1566718_1566837_1568686
914009	contig_11396_pilon	-	968	4	Intergenic	novelGene_71335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.52017775607	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	58	423	492260	491586	TRUE	40	ACTGGACGGTGAGAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDIISIPDGSQPQIQGDAAMRTPWNHPSPWGKGEKGPGWGESDLALGGSVPHPGVSLPPSPYPVPLASLHCESYRYPCPSHDHHHCPQTLWTLPGALRPGPELEAAWSHVADEDDGGEDLSDKWPPPAPADTLCLQALLL	492317	477781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_477986_478315_478373_491301_491633_491941
914010	contig_6635_pilon	+	4566	24	Intergenic	novelGene_127020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_22	42.5193828812803	177	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1000	3003	367	3369	454257	558334	FALSE	50	CAAATTATAATATTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLKVKIVAGRHLPVMDRASDLTDAFVEVKFGNTTFKTDVYHKSLNPQWNSEWFKFEVDDEDLQDEPLQITVLDHDTYSANDAIGKVYIDIDPLLYSEAATVISGWFPIYDTIHGIRGEINVVVKVDLFNDLNRFRQSSCGVKFFCTTSIPKCYKAVIIHGFVEELVVNEDPEYQWIDRIRTPRASNEARQRLISLMSGELQRKIGLKVLEMRGNAVVGYLQCFDLEGESGLVVRAIGTACTLDKLSSPAAFLPACNSPSKEMKEIPFSEDPNPNTHSSGPSTPLKNQTYSFSPSKSYSRQSSSSDTDLSLTPKTGMGSGSAGKEGGPFKALLRQQTQSALEQREFPFFTLTAFPPGFLVHVGGVVSARSVKLLDRIHNPDEPETRDAWWAEIRQEIKSHAKALGCHAVVGYSESTSICEEVCILSASGTAAVLNPRFLQDGTVEGCLEQRLEENLPAGCGFCHIPYDELNMPFPAHLTYCYNCRKQKVPDVLFTTIDLPTDATVIGKGCLIQARLCRLKKKAQAEANATAISNLLPFMEYEVHTQLMNKLKLKGMNALFGLRIQISVGENMLMGLASATGVYLAALPTPGGIQIAGKTPNDGSYEQHISHMQKKINDTIAKNKELYEINPPEISEEMIGSPIPEPRQRSRLLRSQSESSDEVTELDLSHGKKDAFVLEIDDTDAMEDVHSLLTDVPPPSGFYSCNTEIMPGINNWTSEIQMFTSVRVTRLSNLNLTNQALNKNFNDLCESLLKSLYFKLRSMIPCCLCHVNFTVSLPEDELIQVTVTAVAITFDKNQALQTTKTHVEKSLQRASTDNEELLQFPLELCSDLLPPHPFPPAKAAAVEKASPMGEGNFRNRSAPSCTSSTVGVVKMTPLSFIPGAKITKYLGIINMFFIRETTSLREEGGVSGFLHAFIAEVFAMVRAHVAALGGNAVVSYIMKQCVFMENPNKNQAQCLINVSGDAVVFVRESELEVVPTQQPPANCQPACTGGEVTT	453890	559531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_454347_464448_464536_467028_467201_470250_470347_471537_471694_488730_488930_493985_494138_498870_498957_504577_504687_516865_516981_519814_519911_521784_521977_525903_526091_528935_529101_533073_533215_535390_535455_535846_535909_536115_536215_536709_536800_537289_537378_538636_538724_549367_549559_554975_555123_558202
914011	contig_610_pilon	-	2051	9	Intergenic	novelGene_76840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1158	1613	363972	361078	TRUE	20	GGGTTCGCCATGATGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	376073	350021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_350134_360751_361082_363028_363298_363789_364137_366324_366595_368137_368245_369603_369656_374080_374152_375580
914012	contig_8702_pilon	+	2350	12	Intergenic	novelGene_157722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	23.6877064743831	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	68	1486	16952	24715	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATNCSKCGPGYSSPLEAMKGPREELVYLPCIYRNTGIEAPDYLATVDVDPKSPQYSQVIHRLPMPNLKDELHHSGWNTCSSCFGDSTKSRTKLVLPALMSSRIYIVDVASEPRAPKLHKVVEPKDIYAKCDLGYLHTSHCLASGELMISSLGDPKGNAKGGFVLLDGETFEVKGNWEKPGAAAPMGYDFWYQPRHNVMISTEWAAPNVLRDGFNPADVEAGLYGTHLHVWDWQRHEIVQTLTLQDGLIPLEIRFLHNPDAAQGFVGCALSSNIHRFYKNEAGTWSVEKVIQVAPKKVKGWMLPEMPGLITDILVSLDDRFLYFSNWAQGDLRQYDISDPKRPRLTGQVFLGGSIVKGGPVQVLEDQELESQPEPLVVKGKHVAGGPQMIQLSLDGKRLYVTTSLYSAWDKQFYPDMIRGGSVMLQIDVDTVKGGLKLNPNFLVDFGKEPHGPALAHELRYPGGDCSSDIWI	16884	25579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_16956_19586_19644_19801_19915_20132_20319_21099_21221_22364_22548_22793_22973_23424_23504_23594_23717_23958_24052_24215_24335_24552
914014	contig_12414_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_59624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTTAATAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602435	600692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_600700_602400
914015	contig_7933_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_164664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCACCAACACCATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106462	104680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_104700_106500
914016	contig_12677_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_110883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATCACCTTCATCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3787	3060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3100_3800
914018	contig_6440_pilon	+	2477	2	Intergenic	novelGene_161666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTGTCTGGTGTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44005	47286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_44365_45168
914019	contig_6544_pilon	+	1344	4	Intergenic	novelGene_142068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	89.0393171582083	5	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	856	1248	22871	24564	FALSE	35	ATTGTAAGCAAAGGTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWVLFPGPTWVCRLSQVESSTSGFTSSGGGSSVSMIASRKPTDGASSSNCVTDISHLVRKKRKPEEESPRKDDAKKARQEPEVNGSSGDAVPSGNEVSENMQEAENKAESRAAVEGTVEAGATVESTAC	22015	24660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_22979_23075_23154_23866_23993_24483
914020	contig_10855_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_124333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGCCACCCACTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536789	534953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_535000_536800
914021	contig_5023_pilon	-	1616	1	Intergenic	novelGene_7179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	808	1128	542356	542036	NA	35	CCATTACAGTGAGATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAGDIFGLRFKDYLRAIVSGVYLPSMAPESLQFMRVLNSILNFPHFDQYSSMEFFIKMFSNGSWAASSSSDFLTKEGVVQGHNKPHIPYPPPISDSSSSSFAPGK	543163	541547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_541500_543200
914023	contig_6239_pilon	+	2784	2	Intergenic	novelGene_178350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	1870	2784	3546	4460	FALSE	50	CTCAATAATCTCAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAH	1585	4460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_2396_2486
914024	contig_19402_pilon	-	3675	9	Intergenic	novelGene_80820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCTGAGTCCGGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	83659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_83748_97643_97802_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_145586_145665
914025	contig_10930_pilon	-	2336	7	Intergenic	novelGene_37032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	5	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	698	1546	276835	268388	FALSE	15	CTATGATTTTCCAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280393	267597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278483_278637_279700_279832_280157
914027	contig_10753_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_105133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77313	74756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_74800_77300
914028	contig_14519_pilon	+	3712	1	Intergenic	novelGene_66833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1524	1907	360035	360418	NA	15	TTTTCTTTTCTTGGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTRWNMQKQIDYICGKKHWRSSISSFRISPGVHCGADHQLFICKFKLKLKKIRVVHESQNITLSISHLNLETILRINLMNTKDQKLHELWNDTKDIIYEESKRTLKRQEREKIKTGVRRDSETCL	358511	362223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_358500_362200
914029	contig_12010_pilon	-	2997	9	Intergenic	novelGene_160947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCGCGGCCCATAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225942	194755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_194853_200897_200999_205107_205253_209285_209370_211706_211951_216635_216835_219001_219056_220047_220623_224444
914030	contig_9815_pilon	+	5116	4	Intergenic	novelGene_164226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	134	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	2402	3985	5142	6725	TRUE	20	GTCATCCCCGAGGTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQGKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVARYKINIQTSVGFLYTSKENDEKEIRKSTPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKVIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPMSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTRNINTQNPTDKLDNWDVLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKISGHYKSDKGLISIINKKIQYLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKDDIQASNRHMRRSSRSPAIREMQIKTTMRYHLTPALLA	0	45466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_1674_4413_7213_9872_9877_44826
914031	contig_13855_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_178944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1109	1564	39215	38760	NA	50	CCACCGGAAGAAAGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHHEDITIINIYTPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVEEFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIPSIFSDHNAIKVEINNRKSKGKKINYIETE	40323	38519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13855_pilon_-_38500_40300
914032	contig_3956_pilon	+	2980	14	Intergenic	novelGene_15052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1066.43507224472	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	791	2376	81	2456	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGERYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284245_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
914034	contig_2161_pilon	-	2454	7	Intergenic	novelGene_114933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	36.5999392834955	80	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	221	1078	898136	865203	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHTLMRGTPPLQRPHFKLFQLLVLTGLFHFCLGDSQVTKAVKEMAVLSCDYNIPTQQLMNFRIYWQKNNEVVLTIISGNISVWPKYKNRTIVDIANNLSIVILALRLSDKGTYTCIVQKTDNGVYRREHLALVKLSIRVDFHDPIITDLGNPSADIKKILCSTSGGFPEPRLSWLENGEQLNVINLTVSQDPETELYNISSELHFNLTRNHTFVCLIKYGDQQVSQTFPWIISKPSPLVDPFPLWVTILITIIGICGMTVLITCCWNHTRAYLQGPAASSRGNI	899980	861690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_863065_865200_865253_866440_866549_866810_867093_872539_872858_898036_898148_899771
914035	contig_5279_pilon	-	1156	7	Intergenic	novelGene_105563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_5	258.328387049421	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1119	36	1154	340212	322496	FALSE	65	TAAGAATTAAAAACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSEDEEKIEEELQGDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEKKGKENDMEMEIKWVP	340247	322493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885
914036	contig_10766_pilon	-	4459	4	Intergenic	novelGene_151212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	650	949	224163	220041	TRUE	35	TCACATAAATTTCAATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPGDHGPHSPLPSNSVPQGVWMCLWSFHDLSLYKLCWLPQYCLFMGAFRPFIFSVIIDRCEFIAVIWWRLFLYWKVIWHFILDAYWNHSVLFL	224812	177773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_180657_184535_184562_219439_220197_224019
914037	contig_14711_pilon	-	7912	9	Intergenic	novelGene_68923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	117.199616040327	670	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	416	997	99514	94482	TRUE	15	GCCTGGGCTACCTGACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQASLLACEGLAGVSLVPTAASKKMMLSQIASKQAENGERAGSPDVLRCSSQGHRKDSDKSRSRKDDDSLAEASHSKKTVKKVVVVEQNGSFQVKIPKNFICQHCFGAFRSSYHLKRHILIHTGEKPFECDICDMRFIQKYHLERHKRVHSGEKPYQCERCHQCFSRTDRLLRHKRMCQGCQSKTSDGQFSL	100759	85944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_86002_86145_86238_87715_94572_95550_95670_95985_96110_96595_96686_97032_97183_99505_99821_100650
914038	contig_9833_pilon	-	2307	3	Intergenic	novelGene_68511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2803	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1637	2185	215789	213399	FALSE	25	GGTCTTAAAAGCCTGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKSWKPHRHIETP	217689	213276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_213435_215276_216992_217255
914039	contig_299_pilon	+	3616	5	Intergenic	novelGene_129440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_1	261.129637345132	111	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	179	703	930104	939658	FALSE	70	CCAGAAAGAGAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTCCWCTPGGGSTIDFLKRYAARTNTSEFQTADEDLCYCLECVAEYHKARDELPFLHEVLWELETLRLINHFEKSMKAEIGDDDELYIVDNNGETHLFDFTGQDFENKLRVPLLEILKYPYLLLHERVNELCVEALCRMEQANCSFQVFDKHPGIYLFLVHPNEMVSMSGRQW	920426	942571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_920482_921469_921586_930096_930281_931298_931510_939521
914040	contig_6785_pilon	-	3054	10	Intergenic	novelGene_132593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	71	junction_8	218.527394672206	101	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2073	292	2364	865289	813218	FALSE	20	CATTCATTACTTTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTKLKDLKITGECPFSLLTPAQLPKEPAEEDAEGSDCCKATPPICQDVPEKNVQENLPQRKTSRSRVYLHTLAESICKLIFPEFERLNLALQRTLARHKIKESRKSLEREDFEKIIADQAIAAGVPVEILKESFGEELFKICYEEDEHILGVVGGTLKDFLNSFSTLLKQSSHCQEAEKRGWFDDASILCLDKDHNFLNVYCFFPKRTTSLILPGIIKAAAHILYETEVEVSLMPPCFRNDCSEFVNQPYLLYSVHVKSTKPSLSPGKPQSSLVIPASLFCKTFPFHFMFDKDMMILQFGNGIRRLMSRRDFQGTPNFEEYFEILTPKINQTFSGIMTMLNMQFIVRVRRWDNSMKKSSRVMDLKGQMIYIVESSAILFLGSPCVDRLEDFTGRGLYLSDIPIHNALRDVVLIGEQARAQDGLKKRLGKLKATLEQAHQALEEEKKKTVDLLCSIFPCEVAQQLWQGQVVQAKKFNNVTMLFSDIVGFTAICSQCSPLQVITMLNELYTRFDQQCGELDVYKVETIGDAYCVAGGLHKESDTHAVQIALMALKMMDLSDEVMSPHGEPIKMRIGLHSGSVFAGVVGVKMPRYCLFGNNVTLANKFESCSVPRKINVSPTTYRLLKDCPGFVFTPRSREELPPNFPSEIPGICHFLDAYLQGTNSKPWFQKRDKEDGNANFLGKALGVD	895437	812527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6785_pilon_-_813420_822248_822404_834701_834846_840529_841016_842847_843558_852849_852909_858805_858868_865034_865404_894880_894955_895334
914041	contig_10756_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_170662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	1235	1720	60746	60261	NA	45	GAGGTAATTATACATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWDIPVNWPNNMFSASVLPLSSLCSAWGLKRLQATMQGITISLYPPGTIEEGESGIGGGYGICGQLPLRTTVSFTMRPELDGARLSLLNILIKDSLGESCSKGEKCRTEFQILMDSKLSGATEGARMPETIALRYSLNLKPKISPEVILKPNNSKKGLL	61980	60040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_60000_62000
914042	contig_5502_pilon	+	1490	5	Intergenic	novelGene_154973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_1	265.857457108128	57	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	51	662	357713	377829	FALSE	25	CAAACCAAGCCTCTTCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKV	357662	378657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698
914043	contig_16790_pilon	-	1697	2	Intergenic	novelGene_171674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGGTCTACAACCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7814	5961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_-_6157_6312
914044	contig_15172_pilon	+	2528	1	Intergenic	novelGene_158777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1062	1499	290381	290818	NA	20	GTGATCATGGGTGGAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREVAVAEDQEQQRTCSGREAAAAENQQQQNQETSARWHWRGPTERESRVPLHQRLPGRVGCLQALIGRARLADPQSKGADCMCAGGFLVEWGASRHLLVELPSFGTLAAAGLEARGPRGHRKQKLKREGTQEAELPQSQKVWP	289319	291847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_289300_291800
914045	contig_8820_pilon	+	2521	4	Intergenic	novelGene_79306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	77.6330399307465	109	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	694	1884	305205	306395	FALSE	20	GCAGTTTGTAGCACTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLYNVEHTCGTTAPHYQLLKQGESFAVHTCKSKSTRNPLLKWTVGEGALNEFAFSPDGKFLACVSQDGFLRVFNFDSVELHGTMKSYFGGLLCVCWSPDGKYIVTGGEDDLVTVWSFVDCRVIARGHGHKSWVSVVAFDPYTTSVEESDPMEFSGSDEDFQDLLHFGRDRANSTQSRLSKRNSTDSRPVSVTYRFGSVGQDTQLCLWDLTEDILFPHQPLSRARTHTNVMNATSPPAGSNGNSVTTPGNSVPPPLPRSNSLPHSAVSNAGSKSSVMDGAIASGVSKFATLSLHDRKERHHEKDHKRNHSVGHISSKSSDRLNLVTKTKTDPAKTLGTPLCPRMEEVPLLEPLICKKIAHERLTVLIFLEDCIVTACQEGFICTWGRPGKGVSFNP	241866	307032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_242122_292797_292981_294015_294184_305117
914046	contig_5196_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_38687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1109	1408	231398	231099	NA	80	ACAAAAAAAAAAAGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRAPKYIKQTLTAMKRETDSSIIIVGDFSTLLLVKDKTSRNKFNKDRGDLKATINQLDLIDIHTTLLPTAAKYAFFSNKVATNNRKSKEKKIKNMETE	232506	230274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_230300_232500
914047	contig_12654_pilon	-	2379	2	Intergenic	novelGene_129296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGATTGTCTCTCCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757114	754683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_755572_755623
914048	contig_5092_pilon	+	2822	1	Intergenic	novelGene_62259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	326	661	175395	175730	NA	55	GATATATAAAAGACAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCNISVLWILLRLALWPNMWSLLENVPCALEKKVHLAAVGWSLLYMSMRSSWLIVAFKSSVSLLSFSLDVLSFTKTGVLTSPTIIVELSISLLNAVRVCFMYFGALSLGV	175069	177891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_175100_177900
914049	contig_7051_pilon	+	3015	13	Intergenic	novelGene_64277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_7	185.263775916035	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	777	1133	199288	206198	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	183948	208080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_198953_199025_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
914050	contig_4125_pilon	-	3200	13	Intergenic	novelGene_25120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	427.510103844212	18	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	111	791	822728	813780	TRUE	25	AAAAGCTGGGTTGTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846554	808957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_809861_810234_811211_812053_812171_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
914051	contig_9843_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_114318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	318	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	536	1057	48874	49395	NA	70	AAAAAAGTATATAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLPGIYPREKRVITRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYTHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMNLYCKNP	48338	50574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_48300_50600
914052	scaffold_16539_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_68328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	303581	303928	NA	50	AGCCTCCTAAACAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLVGVFSAAVTSNGLGLCIAIRTDIKSRAGSWVSSAAITEIPQVDGFNKQKFILSQFRRLEVQSQGVSSKGRLSFSVGSGGRSLSSIFPWSRSFSAQGPRVQGTCYSPGSCFLVV	303579	305502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_303600_305500
914053	contig_4519_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_123748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263093	1260928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_1260900_1263100
914054	contig_348_pilon	+	4142	4	Intergenic	novelGene_67609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.0485374896143	51	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	211	411	320570	321824	TRUE	55	AAAGGGCCAAAATCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRPRTEEGAFPRPQALGRGRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWVSVP	314501	326479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_314564_320421_320655_321708_325451_326374
914055	contig_2444_pilon	+	2411	1	Intergenic	novelGene_83791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGAGTGACTAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262827	265238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_262800_265200
914056	contig_19727_pilon	-	2145	2	Intergenic	novelGene_168988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56168	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032
914057	contig_4593_pilon	+	3137	3	Intergenic	novelGene_178617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	353	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	61	360	127629	127928	TRUE	20	CACGCTCTGAGTATTTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALENNVYFAAVGCSVLYTSMRSILLIVPFRSSVSLLSFFVDVLSFTESGVLMSPTVIVELSIPLFSAVRVGFMLFWSPVIGSVDVYYGYIFLMDHPLNHYIVSFFVFYVGFCFKDYFI	127568	204097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4593_pilon_+_128669_198664_199402_202797
914058	contig_4072_pilon	+	1861	1	Intergenic	novelGene_168922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCTATAGGACAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42909	44770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4072_pilon_+_42900_44800
914059	contig_16204_pilon	+	2140	12	Intergenic	novelGene_154517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_9	431.816937797251	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	36	1745	369321	396848	FALSE	20	TCTGAGGACTATAGCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRLKQEEVAPMGSQQPPLTTVYLLGVLVTSCLGGFIREDSEIQIRLSNSSSRCQGRLEVRHLDRWLSVCSESWGHSRYHEEDATRLAKNLCPQLRCGRALELALSLFSSTQNKVLCHGSLGSFSNCTSQGASPCRTLILICLEPTTAAPLPTSPPPTTTPEPTAPPRLQLVEGPGGLSCAGVVEFYHGSLGGTISNGTQNLTQGLGDLICRHLRCGSFLRHLPEATLKATPDTRQEWMQWEIQNASCASLEQCFQKRQPWERGTAIGLICSDFQPKVQSRLVGGRGTCEGTVEVRQGGQWAALCDSFPAKNTARWEEVCQEQQCGGVNTYRQLDASEKTSLGLICPQKKLSQCHELHKKQFYCKRVFVTCQDLRPAGLGAGTVMSIILALLLLAVLLVVCGPLAYKKLVKKFRQKKQRQWIGPTGMNQNTTARATQRIEPSSCLPVHLLPPFPAQRPNPSRRLSVAVFSAIRRPSALAYWEYLSIATTRQLSGPRSRTAQPHTWITNTVSPPGIPTSRLIRLLKGPCTVLLPSLITLLTVTTICTGLRGCKRSGSRDRNSRARPISPENILHSPLGNDV	369285	397243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_369373_383917_383957_387991_388298_388738_388802_389404_389729_391946_392241_392978_393105_393877_393932_394535_394691_394977_395098_395665_395758_396763
914060	contig_16387_pilon	+	1368	2	Intergenic	novelGene_174518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_1	0	136	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAAAGACCTGGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1100	4472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_+_1258_3261
914061	contig_2504_pilon	-	6183	10	Intergenic	novelGene_166837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	179	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1089	1520	375165	374734	TRUE	40	CACTATGATTTAGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAALEALSHLCQEIWKTATWPTYWKRSIFIPIPKKGDPTECRNYQTISLISHTSKILLKIIQKQLEQYMDKELPEIQARFRRGHGTRDIIADVRWILAESREYKKDIYLCFIDYAKALDCVDHKKLWITFQRMEFWNT	376627	138955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_139569_164666_164675_221408_223168_329359_329606_359643_360133_361233_361472_362382_362576_371275_371523_373863_376120_376493
914062	contig_9706_pilon	+	960	1	Intergenic	novelGene_20815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2700
914063	contig_5093_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_135108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCATTGAAGAATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897045	898142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_897000_898100
914064	contig_6418_pilon	+	2122	6	Intergenic	novelGene_81202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_2	152.909908115858	6	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	984	1517	1361867	1390427	FALSE	45	ACAGAAAACCACGTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPAQLKEEVHYATVYWKSSEKAMRVKDILDKNGDAYGFYNDSMQTTGWGILEIKAGYGSQALSNKIVMFAAGYLEGYLTAPHMYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKVRLLRSCLEFMWYDRDIKICL	1341071	1391032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1361198_1361892_1375717_1375938_1388796_1388881_1390222
914065	contig_9839_pilon	+	3437	2	Intergenic	novelGene_88473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	585	977	38317	70744	FALSE	55	TACGACACAAGAGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQRRRTCLAFLKLKELKKKFKPRVAVLKDSMGKIMNEPRNIKRIWKEYTESLYKKELVDTQPFQEVAYDQELMVMKEEVQAALKALVKNKATGTDRIPIEMFQQVDAVLEVPRNLEDSYLAN	37732	73204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_38582_70616
914066	contig_18734_pilon	+	2745	1	Intergenic	novelGene_172361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGAACAGCCAGCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25335	28080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18734_pilon_+_25300_28100
914067	contig_6272_pilon	+	5290	2	Intergenic	novelGene_160439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	330	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	341	2431	122506	124596	FALSE	35	AATATCCCAGCTAGTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKPFECEVCHKTFRQLVHLERHQLTHNLPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQSDVKQVRRLEAKQEKPVYGVYRTFAPEERWTLHPCSKPDATYNPTKRRKTIHACTICGKMFPSQSKLDRHTLIHTGQRPFKCVLCSKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSKLLKHKQIHTRNKTFQTLSLKVKSPESCPLPSKLNAKQDGFENGDMGESEENSPLDVHSIYIVPFQCPECEECFESEQILNEHKCFPARGGKIPSRLKRSYNYKTTVKKILAKLKRAGGKKLDNFRSEKKVFKTSFLKNCDLTSGEQSSEQTQKTFMGSLGKYGTYKTVGNQKKKTLTLPFSWQKQFQTQNVGKNLKGVLTTESMLTMDSSVNNKDMSVYGSSGEEFFDNCEVLQCGFSVPSENIHTGHKTCPCDKCEKVFPSISKLQRHYLIHTGQRPFGCNVCGKSFRQSAHLKRHKLTHIEKIPYRRSLCQVEFENLNKLFNRPGDNVNCNAFQQYQALGFHKCEVSESDQMSEIKVKAESEDFLLGAHCGNRQPCLSGTRPESEQRCCRRGPSSGRPERNEGLLYRCSVCSKSFRSPSKLERHYLIHAGQKPFECSVCGKTFRQAPHWKRHQLTHWKERPQEEMVVLNSVM	118173	127455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_118434_122425
914068	contig_15047_pilon	+	1334	5	Intergenic	novelGene_52255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	84	359	3242	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2762	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4639_21030
914069	contig_2703_pilon	-	5588	1	Intergenic	novelGene_101680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTCAATAGAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244910	239322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_239300_244900
914070	contig_15777_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_75731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	278	589	7014	7325	NA	50	AAAAAAGGTTGAGAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLGHTQQQNKVAPTKTKKEKPLRLIAVLTNNSVLLSHSRAQLQADSLNPPAALWKPYRQFYCVLQSHYELESTQWQWVWFWFGCVPFTHTLASQLRLQVLH	6736	8832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_6700_8800
914071	contig_7816_pilon	-	2610	2	Intergenic	novelGene_66460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	909	1217	104767	104459	FALSE	65	AAAAAAAAAGATAAGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINNYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINTENTVVVNSFILLGSPIIVHGSSSQETALGKSAAKDLFKVLKSKDVTSRTKTRLTQAMVFSIASYVCKS	105774	103065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_105635_105733
914072	contig_9808_pilon	-	1742	1	Intergenic	novelGene_165952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAGCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6195	4453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9808_pilon_-_4500_6200
914073	contig_12464_pilon	+	4816	1	Intergenic	novelGene_68660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTAAATAATGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126589	131405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_126600_131400
914074	contig_7179_pilon	-	2865	1	Intergenic	novelGene_78126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATGAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780627	777762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_777800_780600
914075	contig_10106_pilon	+	4527	1	Intergenic	novelGene_73874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1579	2082	134057	134560	NA	75	ATAACAAAAAAAAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGQLSFLALLLPLGWTVGLARKWSGHHVTKGPWPDYRFLTSLGYSGRKCPCWLGEGVYGRLPDSRGEAGRRIGDPKSSSGLAVFLLLSPRVRNGADLSNVLGMEQAVQSPSSSLSCPESCSWACKLGQQALLPPPRCSHHCSQHSSALYPNDTLSSLNTSLPPHKN	132478	137005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132500_137000
914076	scaffold_13505_pilon	-	3766	10	Intergenic	novelGene_111537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	421.482070558724	6	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	1	1434	603255	596651	TRUE	10	ACCGTTTCCCCTCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGKWLPGTSALGSGVGVSLVFLKKFWKKLFSHLCPQVTHKSQNLSLSPPSTSLETVPSSYSSYFSEQTLGPAWNVGRGPSQAQKAPWNGRGLQSGGGKKCPQGQVFSLY	603255	588581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_595062_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
914077	contig_4754_pilon	+	7513	5	Intergenic	novelGene_35936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_4	19.0591185525459	146	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	580	2520	318328	325529	FALSE	25	AATCCCTGCAAGGTGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKTQVSLELDDVAVKFTWEEWQLLNRAQKDLYWDVMLENYNNLVSLGYQVSKPDVLSRLERGEPPWSLEDEIHSGNFSELQKINDHLLGHKQNESKVNRIEQCYEDNVFENTVHQHNSHFALKQDHSVFDLHGKTVRSILTLISQRQRYEVKNSIKFDRGKEIFLHANYGQFHTEFKYCESRKSKNMKSQLTEYHKTDKIEKPHICSECGKAFFWKSVLMNHQMIHTGEKPHRCNLCGKVFSKKYMLTEHQRIHTLEKSYKSMECGKALSMKSELNMHRKTHKVEKPHRCSVCGKAFSRKFMLTTHEKAHTEEKPYECTECGKVFVTKSGLNMHQKTHTGEKPCICNECGKCFTRELSLIVHQRTHRQSSYTCVDCGTVFVKKSWLTIHQKTHKVRKYFQCSECGKAFNQKKQLLLHKSVHTGERPYVCSECGKCFIRELSLIVHQRTHTRQISSTGTDCGKILLKSWLSIHQKTHKLEKSFQCSECGKVFYRKKQLNLHKRMHTRNRPCVCNVCGKTFDSTLERFNHKLIHTREKRVTSGNLEDPSVSRSSSHTSDLLQDKNPVNTVTLQMPSAASQSSLNTSGLLTNRNIVLVGQPVSRCEPSGSNREFVQEGNLINPVNVVVPSVINYVLFYVAENVTLQLI	310481	330522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_310871_318137_318343_320928_321056_321323_321420_323826
914078	contig_4519_pilon	+	4151	7	Intergenic	novelGene_123670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	95.4365699765498	25	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	812	1189	69586	69963	TRUE	25	GCCCAGCTACCATCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDGPAPCGPSPGSGSSLGVSPQRVLPFSGLPEHASGRMTCLKLNPDRVIPLHTPPSHLTGPKLLSVVPKAPPCLAPPTSPAQAPWAPTSTPSVAPYTSIKLVCFLFRETHSAGREQAADPSAGG	68330	229637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68480_68923_70919_77856_78014_78794_78937_79733_79866_79973_80919_229006
914079	contig_18162_pilon	-	2364	3	Intergenic	novelGene_122298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16364
914080	contig_20356_pilon	+	1042	1	Intergenic	novelGene_159543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110401	111443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_110400_111400
914081	contig_16964_pilon	-	2837	20	Intergenic	novelGene_143125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_18	15.1121385416472	96	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	869	2607	230	2836	208608	152780	FALSE	30	TTTCTGAATTACAAGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNLNQDGAPRPSYVFSADPIERPSEINFDGIKLDLSHEFSLVASSAEVNSLESKDYLQVCLRIRPLTQLEKEHESEGCVCILDSQTVLLKDPQSIIGQSTEKSSGQMAQKFSFSKVFGPETTQKEFFQGCIEQLAKDLLKGQSRLIFTYGVTNSGKTYTIQGTEENIGILPRTLNVLFNSLREKLYTKMNLKPHRSREYLRLSPDQEKEEIACKNALLRQIKEVAMHNDSSDTLYGSLINSLNTPECEESVIDCEQASLNMDDNIKFSVWVSFFEIYNECIYDLFVPGSPKFQKRKMLRLSQDVKGYSFIKDLQWIQVSDSKEAYRLLKVGIKNQSVAFTKLNNASSRSHSIFTIRILQIEDSEMPRVLRVSELSLCDLAGSERSMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNSEKSKFQQHVPFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCCFAYDETLNVLKFSATAQRVFVPDTLNTSLGKSFAPVKSSQDTSLDINDLDNKTLNVKRTTISWESNLEDLAEDEDLTEDLEKAEENKNVGTEFTEEDLDQTLEEDKALISQEKRKLLDLIEDLKKKLINEKKEKLTLELKIREEVTQEFTQYLAQREADFKETLLQEREILEENAECRLAIFKDLVGKCNLQEEPTNEDPAMKVETEEAIACLELKFNQVKAELAKTKEELIKTQEKLKKRENESEINLNSLVQELENSNKDNTDASSLIIKNKLTCPEIVEVPEDSKTKTSSGRKRSNENELLQQDEPPAKKGPIYISSSISEYRKKSEDMQQSISKEKEDIRVLKKNNEELKTHLLIVENEFINEKEEKAELNKQIVSLREELSSSEKKIFNLSIEVQQIQSKYENA	211801	152778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_153067_161815_161973_168859_168913_170403_170513_171620_171760_172030_172171_176809_177098_177656_177820_181125_181273_181354_181427_182336_182449_183426_183655_184133_184171_186622_186808_187732_187872_188347_188465_188560_188648_208461_208689_210743_210815_211723
914082	contig_4426_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_15379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAATTTAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308228	310451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_308200_310500
914083	contig_5643_pilon	+	1236	12	Intergenic	novelGene_38813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2465.37546802655	89	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	68	1024	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236886_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
914084	contig_1146_pilon	+	1955	2	Intergenic	novelGene_84817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	661	972	512947	513258	TRUE	10	TTTGCCAGGTGTGACGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFEGQRRNTVRKTGLESIYSFFFLDINIIRLGIFCSQQEPILKSLLSLLISNSPQFSSVNLKVSFSLEWSIIPLRAWVAANLKIGGLSPPSGTMEERPGELLP	512286	514305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_513533_513596
914088	contig_6795_pilon	+	4207	2	Intergenic	novelGene_27653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	229	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCTAAGGGATGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34563	66234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_35509_62972
914089	contig_7870_pilon	+	2165	2	Intergenic	novelGene_108950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTATTGGCAAGCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306623	309036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_308659_308906
914090	contig_9235_pilon	+	2849	3	Intergenic	novelGene_156203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	462	1610	45805	46953	TRUE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43739	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_47019_47147
914091	contig_6870_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_103996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1223	1600	1495628	1496005	NA	50	TCAGTTAAAAAAATGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNSGCQLQGNSSLSALEEGPCHQSSLVWELLCTGTSGPKDALCSWHCFLGSVRFPCVSARFSLLYLKRDWLKTLSNLVDLISITAPNPSYYIIVIEFITHTEIRLDYKMARNHTIVGIMTQPS	1494405	1496707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1494400_1496700
914092	contig_17014_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_163166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1017	1355	69259	69597	NA	10	TTCCACCCTTTGGCCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFETEAAGFLCSLSLQLLHPVASRPLGLACICPAGVSVPKLCSSTSKCLEAPHSARKPPVHRHSALLLHRLAPALSGAGLLVLLLPFLCCCRLSIHSHFQKCFHILAFC	68242	70139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17014_pilon_+_68200_70100
914093	contig_8377_pilon	+	4480	28	Intergenic	novelGene_34935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3332.11045716756	4	101	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	982	2949	83	3031	68257	197665	FALSE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSGWISANRTILCLIKSPGKCRNRRGGRRFSSSQISTQSKAGNGFLL	68093	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194500_196081_196218_197663
914094	contig_10437_pilon	+	1587	8	Intergenic	novelGene_38309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	6	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	47	1069	431167	451175	FALSE	25	GTCTTCAAATTTCTATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431120	451693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
914095	contig_6364_pilon	+	1207	1	Intergenic	novelGene_51752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCAGCATGCACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611731	612938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_611700_612900
914096	contig_15518_pilon	+	3765	5	Intergenic	novelGene_127599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	145	junction_3	202.39982089913	242	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	585	1133	15096	37386	TRUE	30	GTAATCTGGATCTTAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	40665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_37273_37389_38035
914097	contig_9976_pilon	+	2360	13	Intergenic	novelGene_147902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_10	36.6563432437007	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	46	1935	15748	56971	FALSE	25	AGGACAGTGTAGTTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQQLKDVDTRKIIKAMLSYVWPEDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLGFHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVTLVSGVLYYKCGAQFALVTLGTLGAYTAFTVAITRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNEKYEAQRYDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSIGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTRIKDKAMAPPLLITPQTATVAFDNVHFEYIEGQKVLSGISFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGNIYLAGQNIQDVSLESLRRAVGVVPQDAVLFHNTIYYNLLYGNISASPEEVYTVAKLAGLHDAILRMPHGYDTQVGERGLKLSGGEKQRVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMKDVVKHRTSIFIAHRLSTVVDADEIIVLDQGKVAERGTHHGLLANSGSIYSEMWHTQSSRVQNHDNPKWDAKRENMSKEEERKKLQEEIVNSVKGCGNCSC	15702	57396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_15832_35332_35466_36345_36615_37643_37733_37824_37913_38811_38987_39936_40095_40674_40839_40996_41127_45612_45785_48336_48441_53683_53792_56755
914098	contig_10734_pilon	+	4981	6	Intergenic	novelGene_51191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	563.542935365177	4	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1856	2260	1131100	1134382	TRUE	25	CCTCAATCAGGTGGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKINPLRNTSLRNIMTKNILLIREESDLIHLKMVRTGTNAKKGSHQEAEVTPDLDPVKGAIVVEAGSGRSLGPEAERERNHDPEAGRGNGGSDLVPAQDQDTGIGVEAEVGQGVEVEIERRELRNQEDLAEV	1123712	1165262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1128560_1128605_1129370_1131281_1132609_1132784_1134332_1135685_1163843
914099	contig_9901_pilon	+	5707	1	Intergenic	novelGene_126949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCCAGCTGCTTCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305059	310766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_305100_310800
914100	contig_8140_pilon	+	5886	16	Intergenic	novelGene_86452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.8156864676334	131	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	3631	4347	868629	905791	FALSE	30	TACCCAGCCTCACATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAISEFLAGDYSGSWYLDGQTLLIIICIAIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMVFFALVVIIKKWSIPCPLPLNHIEEYFQISNATVDCKPKLFHFSKESAYAIPTMAFSFLCHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAVALSFLLYFISALFGYLTFYDKVESELLQGYSKYLPHDVIVITVKLCILFAVLLTVPLIHFPVSTLKGFVA	831909	907330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_833552_833913_834565_837449_837575_840317_840975_842150_842522_843683_843815_865395_865449_868628_868669_881391_881471_888214_888298_888758_888818_892629_892696_892905_892960_895088_895169_895520_895622_905636
914101	contig_10958_pilon	+	2283	5	Intergenic	novelGene_5425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	16	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	34	486	888255	895311	TRUE	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNLSGEIPLTLIENCFIIRR	888221	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893996_895255_895855_900457
914102	contig_7333_pilon	-	2724	4	Intergenic	novelGene_142811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	61.7467947886096	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	874	2289	405837	394458	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRKWRRGGGSGGRFRKRAWKTWTFGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407207	394022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_405761_406195_406691
914103	contig_11846_pilon	-	2869	6	Intergenic	novelGene_105977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	261	junction_2	70.0274231997722	54	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	948	2844	24	2867	467861	335022	FALSE	20	TTCCCAAGGGGGCCCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAQSTPMQTNEGEISEESSSKVEQEDFVMEGHGKTPPPGEESKQEKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPTGSSPSPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPSTAPGANPSNAQVTGTLLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGPGASSNNGASSNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSALPGSTTSNKGKGSQCQSASSGSECNLGVWKSDPKSKSVQSSSSTTESSNGLGNWRNASGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQDGNSRKGALETDNSNSSAQVSTGGQASREQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMESKGMPFGMGLGNASRSTDAPSQSTGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKDREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSEVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTMWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAPSQSNQTKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTSSSWNENSSKDQGWGGGRQPNQGWTSGKNGWGEEVDQAKNSNWESSASKAVSGWGEGGQNEIGTWSNGGNANITSKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWSKPHQQQQQPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNGRPSNSNWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDK	467884	335019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_337301_339601_339944_352209_352232_356675_356764_437088_437157_467816
914104	contig_19606_pilon	+	2045	4	Intergenic	novelGene_148262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGGTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8867	49291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_8956_20173_20246_47155_47276_47526
914105	contig_3900_pilon	+	1953	1	Intergenic	novelGene_84213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTATATACAATAGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674034	675987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_674000_676000
914106	contig_3081_pilon	+	3368	2	Intergenic	novelGene_133921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2484	2867	181955	182338	FALSE	10	GTTCCAGTAGGCTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENIPCALEKNVYFAAVEYRVLYLPVRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVSKSPTIIVELSIPLFNAVRVCFMYFGACHWVRRCLLWYIFMMDCHLNQCIVSFFVFYGRFCFKVCFI	179423	182839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_180267_180314
914107	contig_8278_pilon	-	3518	1	Intergenic	novelGene_165296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	438	779	211237	210896	NA	10	CTCTCCAGCCCTCACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKRLKLPRISFYLDPQSTPMEAAVKKSKDALHWAKSAAKDLFKVLKGKDVTLRTKVRLIPAMVFSLASCACKSWTMNKEDPRIDTFELQCWQRILNRPQTARRTNTFVLEEV	211674	208156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8278_pilon_-_208200_211700
914108	contig_2646_pilon	-	2180	18	Intergenic	novelGene_69575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	301.094887847485	75	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	74	1645	1412135	1308912	FALSE	5	CCCCGGCCTGTGGCAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEDFKNDKQAVEYQQRIVDILLKVMVENSDFTPSQVGCLFTFLARQLAKPDNTLFVNRTLFDQVLEFLCSPDDDSRHSERQQVLLELLQAGGIVQFEESRLIRMAEKAEFYQICEFMYEREHQYDKIIDCYLRDPLREEEVFNYIHNILSIPGHSAEEKQAVWQKAMDHIEELVSLKPCKAAELVATHFSEQIETVIKKLQNQILLFKFLRHLLDPREGIHINQELLPISPCITEQFIELLCQFRPTQVIETLQVLESYRLQETIQITQKYQLHEVTAYLLEKKGDIHGAFLITLERLQSKLQGITHEDENTKKDPSLKDVEDTLVETIALCQRNSQNLNQQQREALWFPLLEAMMAPQKLSSSAAPHPYSEALKSMTMQVLNSMAAFIGLPSILQRILQDPVYGKGKLGEIQGLILGMLDTFSYEQTLLETTTNLLNQDLHWSLCHLRASVTRGLNPKQDYCSVCLQQYKRRQEMADEIIVFSCGHLYHSFCLQNKECTLLTELSQHRSSESYRPFSGSQSGPAFNSIFQNENFQLHLVPPPVTED	1418057	1308376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1309054_1351084_1351136_1353740_1353911_1356045_1356127_1367725_1367809_1368142_1368225_1372911_1373016_1375630_1375674_1376638_1376729_1381360_1381509_1395580_1395628_1398953_1399044_1404853_1404953_1405842_1405928_1406702_1406786_1410934_1410992_1412018_1412139_1417987
914109	contig_1055_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_149726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTTTAAGTGCAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103123	104240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_+_103100_104200
914110	contig_2069_pilon	+	1607	7	Intergenic	novelGene_23175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_6	153.264114811292	20	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	131	553	70041	81061	TRUE	40	TAGCACTCATAAACATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGSVIRGRSLGRQLKVDTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQVKSE	69910	88006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81709_87422_87531_87707
914111	contig_8710_pilon	+	2264	16	Intergenic	novelGene_73517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	69.2865226593327	1	65	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	36	1472	368593	438135	TRUE	25	CATATTGTACATCTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YASTEVDGEHYMTPEDFVQRYLGLYNDPNSNPKIVQLLAGVADQTKDGLISYQEFLAFESVLCAPDSMFIVAFQLFDKSGNGEVTFENVKEIFGQTTIHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKNKSGLISGLDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTLAGTRKDVEVTKEEFAQSAIRYGQVTPLEIDILYQLADLYNATGRLTLADIERIAPLAEGALPYNLAELQRQQSHGLGRPVWLQIAESAYRFTLGSIAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRGSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFTKRDGSIPLFAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRVSALSVLRDLGLFGLYKVGCQSVFPPRHSLLCNLFSCLCSLQATPG	368557	443968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_368703_378227_378344_386208_386349_398322_398470_401126_401266_401941_402036_403627_403713_416879_416962_418229_418389_421453_421507_421746_421828_436144_436290_438049_438189_441520_441680_441813_441905_443479
914112	contig_6919_pilon	-	1984	1	Intergenic	novelGene_163995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	884	1237	84430	84077	NA	20	TGATTCCTGTCAAAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGSGSWGHTAMSCKASATGDAPGNTSGDISDKDSSGTAGLISSDEGGRDNGFTGEGGLVDKDGVISSEGIRTLVHLARVIQQNLGAQYSQLPDYLPICSHPKFQDTISSQSILLF	85313	83329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_83300_85300
914113	contig_14225_pilon	-	1196	9	Intergenic	novelGene_52737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_8	139.888348335378	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1017	179	1195	334562	155387	FALSE	40	AGGGAAAGCCCAACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLAIKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSATKDTQTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGNVTENETSVLPPTPNAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEKQKCETQALRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPHVAL	334979	155385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_155510_158753_158877_169015_169132_214766_214889_216233_216361_217343_217495_221790_222033_334549_334613_334851
914114	contig_11846_pilon	+	6179	13	Intergenic	novelGene_105955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1982	2314	298570	302369	TRUE	25	CCCCATTTGAGTATCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWIPFHGTPGWNSGGQLALLDLVPSLFVGGDLAGNQLSPAGPVWPPSVSPGMISNWLYGDPPRVLPGATIAPFLCILASCVATEGSPSIMEVHCLKRDSVPASFPPTMP	286951	322687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_287772_289982_290501_291703_291847_295011_295085_295497_295722_298106_298202_298461_298610_299885_300062_302252_302393_307396_307580_308017_308111_308652_308788_319256
914115	contig_11564_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_158570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGTATGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58970	59324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_59000_59300
914116	scaffold_9100_pilon	+	2415	1	Intergenic	novelGene_83301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGGTGGTCTTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752728	755143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_752700_755100
914117	contig_299_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_129483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399198	1398241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1398200_1399200
914118	contig_12919_pilon	-	2795	1	Intergenic	novelGene_75916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGATAACTAAGACACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814009	811214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_811200_814000
914119	contig_12123_pilon	-	2113	1	Intergenic	novelGene_144614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTGATGAGAACATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160959	158846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_158800_161000
914120	contig_12528_pilon	-	1891	9	Intergenic	novelGene_81333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_8	556.332128768418	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1035	1724	966228	933323	FALSE	35	TTACACTTCTAATTGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968126	933155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967137
914122	contig_5549_pilon	+	859	6	Intergenic	novelGene_81568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1400.89234418638	11	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	358	687	91781	96749	FALSE	10	TTTTCTTGGGATTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDPAEKDEKGMPVTARVVFIFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKQLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP	82076	96921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_82121_82164_82250_86661_86824_91714_91835_93264_93412_96620
914123	contig_16211_pilon	-	4392	9	Intergenic	novelGene_150067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_7	299.585103726804	185	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	801	3591	4391	91808	79973	FALSE	50	TCAAGGAAAAGGAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPESGKSNERKGGRSRSHTRSKSRSSSKSHSRRKRSQSKHRSRSHNRSRSRQKDRRRSKSPHKKRSKSRERRKSRSRSRSRDKRKDTREK	121403	79971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80505_85311_85427_86272_86404_87605_87785_87912_88078_91745_94948_97474_97609_121086
914124	contig_15613_pilon	+	4908	13	Intergenic	novelGene_147200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1358	1861	90846	111339	TRUE	20	TTAGTACTTCTTTCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAACACWRSCWHCSRSGVPGTGEALERGCTAAGVGTRCQVVFLLKGVLYSHGVPSLSSLYSTMGMRQSSEHPLRGEPSSWGWIMTTFTVTEVRSRSIICSWVRVTTATLHISTRRLPWRRPAFQAKPKGSTSATIPSKFTWKPSWPSPFLLKVISTVSQPLVTIPNL	83565	161983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_84517_86299_86407_86793_86890_88384_88545_90802_91064_107158_107432_111326_111904_117671_117832_126060_126163_130741_130917_136894_137084_139303_139440_160262
914125	contig_20314_pilon	+	2051	2	Intergenic	novelGene_125640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGATTGTGTAATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5752	7872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_6825_6893
914126	contig_1484_pilon	+	2192	2	Intergenic	novelGene_177620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	759	1163	158892	159296	TRUE	25	TGTCGGTGGGAATGTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSQAVPQHLRATSPDLIAAPVGSLGTLRFSFLPPPLSVFLHFIVSHLSTPTASSPSILFVCLYVFGSCSSLLSPISILAPHITISPLHPAYLRCALDITPPSSTGTAYWNLPCTDYRPTLVALVSATNNPSQ	158133	164401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1484_pilon_+_159730_163805
914127	contig_6576_pilon	-	3399	2	Intergenic	novelGene_42303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGACCAAATGGGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514569	463413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_466654_514410
914128	contig_8254_pilon	-	2085	1	Intergenic	novelGene_48377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63344	61259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_61300_63300
914129	contig_990_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_76094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1060	1506	1345563	1346009	NA	70	AAAAAAAAAAATCCATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNGASGLEEDSLTTCVMQMTQPCLLKVKRTHLLRKMKDRSLQYGLQLNTKKTKILTTGPIRNIMINGEKTDVVKDFILLGSTINAHRSSSQEIKGRIALGKSAAKDIFKELKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSIVSYACESWTMAKED	1344503	1346888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1344500_1346900
914130	contig_11335_pilon	+	2565	2	Intergenic	novelGene_104910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	111	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAATCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317604	320406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_317835_318071
914131	contig_9505_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_121876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGGGACCCCACAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667665	666541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_-_666500_667700
914132	contig_1442_pilon	-	1184	4	Intergenic	novelGene_172151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	14.522013940528	63	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	56	583	369310	304636	FALSE	30	ATTTAACTTTATTCCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFVTAHAGNRPLPRSVVVMESPWDELTLAFSRTSMFPFFDIAHYLVSLMAMKRQPGAGGTIITNFEQLIKGTWKPEADEWLKMSYPSKVTLLGSVMFTFQHTKHLAISKHNLMFFYTVFLVATKITMMLTETSTVSFAPFEDALGRMLFGCHQRFSPRVKKNETKSNGTGSSTSKPTADASDKLKKKHSKKTE	369365	304034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_304846_333688_333807_340251_340340_369198
914133	contig_8063_pilon	+	3087	1	Intergenic	novelGene_152419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGATGTCATTGTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60061	63148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_60100_63100
914134	contig_4103_pilon	+	3390	5	Intergenic	novelGene_51964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_2	81.7262962576917	1496	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	2438	3112	171333	175646	FALSE	15	CTGCCCTGCTCCTTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELYVKPGNKERGWNDPPQFSYGLQTQAVGSKRTPLTKRVAAAQDGSPRAPASETTPGPPPKGPPPPSDKAPRPSPVGSCPASSVKPPSFPVIKSETLLEDVLRPLEQALEDCRGHMRKQVCDDISRRLALLQEQWAGGKLSMPVKKRMALLVQELSSQRWDTADDIHRSLMVDHVTEVSQWMVGIKRLIAEKKSLSSEEEAAEKSAATTEENQTVPGFFGAP	168895	175924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_171358_171515_171642_174223_174430_175196_175306_175437
914135	contig_8964_pilon	-	648	2	Intergenic	novelGene_168687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	136	516	423240	422860	FALSE	70	GCACAATAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHNLHLPEPRRIRWCSATITDCSDRDHNRGSWTEQEKNVEQNSNSQKKTRLTDLTETGETPETVAPRNPANSELKSLPKSTFQPKIRQAYKTNNNLVQSCIPDQRGNTCPKAKTGRQKGRGKLGE	425269	422727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_423307_425200
914136	contig_13093_pilon	+	4260	1	Intergenic	novelGene_105207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	325	978	2897	3874	20490	21467	NA	5	GGGGCGGGTGTCTGGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGKTLQVSKALLKKKNKVGGLTLPEFRTYYTTTVVKTALYWYNNRCIDQWNRIENPDINSSTYEQLIFNKGPKSINWGKYSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTETNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIGTLLGALIHGINRIRTISNSAQAPEERLDNWKLLKIKHLRSSKVFTKRVKRQPTDGEKILATTQSHQRLISKIYKILQNLNNKKINNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMKQCSRSLTIREMQIKTTKRYHFTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHFGGNVKWYNHFGNRFGTSLKN	17593	21853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_17600_21900
914137	contig_15354_pilon	+	4531	7	Intergenic	novelGene_65743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	0.372677996249965	1319	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	265	333	622238	622306	TRUE	30	TTCATTATAATACTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSSAGPEGTGAALAPNSPRVTLRWTEVVTVWPEDWQIGPRATILFSNKRWRAERLRKDASANVGCVVLVKSLDQHLNLIFKQIKFIEGMNPGRACVQFGCNGMPCLTSKT	621973	711709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_622372_623710_625756_625853_626423_667159_667558_680698_680721_700683_701059_710985
914138	contig_8452_pilon	+	2014	6	Intergenic	novelGene_48076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTGTGCAGGAAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955107	991181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_955959_957238_958027_968671_968752_972861_972935_981638_981737_991057
914139	contig_7457_pilon	-	2381	6	Intergenic	novelGene_31726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307777	1302744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1304229_1306169_1306255_1306471_1306627_1306915_1307079_1307188_1307315_1307409
914140	contig_15825_pilon	+	946	1	Intergenic	novelGene_160209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCACCCAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185105	186051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_185100_186100
914141	contig_9049_pilon	-	1568	4	Intergenic	novelGene_83159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAGTTAGCATAGGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114141	108667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_-_108722_111556_111682_112566_112795_112980
914142	contig_16716_pilon	+	1931	11	Intergenic	novelGene_169281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	23.3871759731696	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	423	1481	166845	204432	FALSE	15	TGGTGTTCTCCATTGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQELQENRECQLEKQTGEETLEQEDFITKREDFQEEEFQNDVEKAIVGHNQKDLTFRVSCRCSGAVGKTFTAQEVGRIIGIALMKQFGWKADLRNPNLEIFIHLNDIYSVVGIPVFRVPLANRAYIQTAGLRSTIAWAMASLAEIQAGALVLDPMCGLGTILLEAAKEWPDVYYVGADVSDSQLLGAHDNLKAAGLKDKIELLKASVIELPLPSESVDIIISDIPFGKKFKLEKDIKSILQEMERVLRVDGAIVLLLSEDHHRCLQDCEESGIPLNSKSSHIDEPGMKKCLNPEGENGISETASSSFQASNQEGLDRTSPFGSLVPVECYKVSLGKTDAFISKYRKSHSSGL	155547	204882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_155588_159793_159846_164327_164464_166650_167064_168148_168227_170652_170706_177235_177324_183761_183834_184294_184410_194792_194902_204107
914143	contig_3721_pilon	-	1410	6	Intergenic	novelGene_123781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_3	10.1705457080729	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	216	1409	37992	13554	FALSE	40	AAGCCCAGCAAGTGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDSGLSDPQKDSQKDLENVPSVNSQAQETTVTASATREAQTPHPASGVNKNHQGVEVIGPGSADETTDGKYPKDEAEQETKWSSQDGEEGHHFHPGSLGAEALDPDPNRSPSDRGERADAHLGSRSAALPEEASVRTTASQEPPAPDSQDAQTPGRSNAGLESQYTLRRRPAAPDSQKDLENVPSVNSQAQETTVTASATREAQTPHPASGVNKNHQGVEVIGPGSADETTDGKYPKDEAEQETKWSSQDGEEGHHFHPGSLGAEALDPDPNRSPSDRGERADAHLGSRSAALPEEASVRTTASQEPPAPDSQDAQTPGRSNAGLESQYTLRRRPAAPEVGSHVQEAQKLEENKENAQDTRRKILSCSGLHGYIVIALLAMALCIFLLSPISSYYFS	58911	13552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_13631_14269_14369_16664_17157_35282_35775_37958_38139_58842
914144	contig_4305_pilon	-	2430	1	Intergenic	novelGene_136720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTATGGGATTTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824653	822223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_822200_824700
914145	contig_10331_pilon	+	2146	5	Intergenic	novelGene_54068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_4	404.36153377887	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	5	1066	71891	89117	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMEYGTGESSGEGTVDAVPVWPRALSHGLCSDPLSYQYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQDQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNLPPWARNDPRLFILIHRQALESDCVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAVEDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRSGSKLNIEGELPAAVGLLVQLAFRETREQVKEITYPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLEALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQGKIKV	71886	90197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_72156_75274_75416_79165_79384_83233_83465_88910
914146	contig_10042_pilon	+	1467	9	Intergenic	novelGene_79121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	332.486465889967	97	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	37	906	42715	93486	FALSE	30	ACACATATTGTTTTGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQRFAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTAEKTALAKWRGTFGNQQRCGETHVRLCTTDNLEALLKPVQHHSNTEASTDRRVMDAFEVHWLGIKPRLLLGSRISEGAHGPRFEEPWNLGESAGRTESQMGPQLTKSLCIMPGVLKACKGAIQVTTIGLCWPGATEEERESGIGGQNGMCG	42678	94047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_42736_43878_43953_45874_45997_46837_47035_71545_71638_74027_74151_75524_75572_76060_76119_93350
914147	contig_7333_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_142750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACCAAACTATTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63493	65835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_63500_65800
914148	contig_6175_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_16309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1483	1830	1453040	1452693	NA	25	AGCTCAGGTATTTCCCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQGWKGGVCCHSIGRAIRVTSQCMYKFLYGRLTCNVNFHLNYISLKKKKKGFLHHRYKIRSLCCNPNNVTAVSNKTTVTTNLAGASSQLIHTHWSSRWNCTTHRPRRTGTAFY	1454522	1452152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1452200_1454500
914149	contig_12299_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_29725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAGAACTGCCTCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66487	63649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_63600_66500
914150	contig_10095_pilon	-	4230	22	Intergenic	novelGene_57243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	232	32	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1777	2088	374496	356427	TRUE	15	GTGGGCCGAGCTTTGACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIILTMSVWVISRNASPSICSSLNTFPCSSHPGKLCINSDTSSVLHLETLLAGIPATVGRSLLCCSQRKGRHGIGDLKERKTADRRCACCTVGSSRATSGFL	376272	256863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_257036_258548_258623_279144_279262_284448_284562_286432_286593_287730_287865_289680_289766_291771_291863_294280_294383_307090_307234_308681_308776_311869_312022_322917_322991_327583_327671_330134_330246_335200_335312_336785_336893_342407_342551_356353_356448_370498_370663_370892_370958_374434
914151	contig_8978_pilon	+	3818	25	Intergenic	novelGene_49358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	131.597450161046	6	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1216	3651	166	3816	209454	222124	FALSE	25	AGTTTTAGTATTTTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNALLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGNTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQTAPPQPQPQSQPQVAAGLQPQAQGQLPSSSARAFSRPSSSNRQQRWFGNSNNSFPIRSHSPIPTYLDASEPPGGAACALDVALPFPLNSQSPSRASTSSGWDPSLRLHF	208898	222126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_209003_209392_209621_209795_209941_210110_210232_210608_210711_210998_211113_211361_211538_211718_211899_213239_213312_213789_213924_214092_214255_214572_214685_214875_214966_215483_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218251_218449_218625_218704_218794_219010_220556_220750_221307_221520_221675_221758_221959
914152	contig_5779_pilon	+	2616	17	Intergenic	novelGene_106464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	44	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGATACAGGAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107494	178850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_107822_108756_108862_125901_125959_126869_126948_127353_127544_129215_129379_132097_132224_156802_156956_163901_163948_164137_164529_164893_165044_165624_165809_166002_166195_168166_168308_171096_171225_177329_177402_178737
914153	contig_20371_pilon	-	3825	1	Intergenic	novelGene_129184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGCTATTAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52985	49160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_-_49200_53000
914154	contig_6434_pilon	-	3283	1	Intergenic	novelGene_61865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1247	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAACCATGTCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840395	837112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_837100_840400
914155	contig_6740_pilon	-	4295	1	Intergenic	novelGene_142696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	138	542	641138	640734	NA	85	TAGAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRNKLKFSVFKNTKRLYQVVCQVYSYAHFFLIISVTFFPKHFTHEINYYWVVFFFSLANKSVKCYVMYLDYEMNDLYLSVVCVCLGLGCRHGGSGMWRVTPLGQVKLRLCSIVLLMSEDVFFPSEVLRLSLSA	641275	636980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_637000_641300
914156	contig_5696_pilon	+	1710	11	Intergenic	novelGene_117508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_10	324.414611261577	26	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	254	1006	329809	344165	FALSE	35	AAACTACCTCATACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLPDYVTFKSFPGIPLQHIFIAAGDDLLDLIQGLFLFNPCTRITATQALKTKYFSNRPAPTPGCQLPRPNCPVETLKEQPNPAVATKRKRTEALEQGKTPVL	319752	344869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_319793_320115_320176_325481_325516_328900_328969_329757_329827_330561_330673_331781_331901_333678_333779_335425_335513_341540_341691_343997
914157	contig_10235_pilon	-	1268	9	Intergenic	novelGene_46366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	127.385242473373	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	775	1266	137459	135806	FALSE	30	TGCCAATGCAGAGGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEEVEERAPAQNPELTPSGPAPAGPTAAPETNAPNHPSPAEYVEVLQELQRLESRLQPFLQRYYEVLGAAATTDYNNNHEGREEDQRLINLVGESLRLLGNTFVALSDLRCNLACAPPRHLHVVRPMSHYTTPMVLQQAAIPIQINVGTTVTMTGNGTRPPT	140535	135803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_135860_136063_136262_136710_136841_137349_137591_138212_138288_138443_138498_138738_138939_139059_139178_140339
914158	contig_12864_pilon	+	3586	2	Intergenic	novelGene_76344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGGAAACTATCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82673	86665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_85899_86304
914159	contig_6807_pilon	-	3982	8	Intergenic	novelGene_84574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	48	junction_5	86.100795227312	367	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	163	1659	169453	161781	FALSE	40	AAATTTCATATGATTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRSQGSSAMASKILVSLEEEVTCPICQELLTEPLSLDCGHSFCQACITAHNNEAVIGPEGESSCPVCGIRYLLGKLWTNQHLSNIVERLKKVKLTPEEEQKRELCVHHREKCLFFCKEDGRIICWLCRWSQEHRGHHTFLMENVVKECQEKLHAALERLRKEQQEAEKWQAVIREERASWKNQIQTERQRIQAEFNHLRGILDSEELRELQKLEEEERKVLDNLAETEDELVQQSQLVRELISDLELRCQWSTVELLQDMSGIMKWCEIWTLKKPKTVPKKPKHIFRAPDLSGMLQVFKELTDAQHYWVDITLNPVNLNLSLVLSEDQRQVMSVPIWPVEYYNYGILGSQYFSSGKHYWEVDVSEKTAWILGVYCRTFSRNIKFGIRRDTNHQNVYSRYRPQYGYWVIGLRNQFEYNAFEDSSPSGPQVLTLSMPVPPRRVGIFLDFEAGTVSFFNVTNHGFLIYKFFKCCFSQKIFPYFNPWNCPGPVSLCPPSS	172377	159457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_-_162347_162609_162637_162945_163047_164273_164297_167441_167673_168289_168386_169000_169487_172248
914160	contig_5643_pilon	+	659	7	Intergenic	novelGene_38781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1788.3746500353	276	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	71	484	233973	238020	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGPQQQH	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236715_238002
914161	contig_7840_pilon	+	3198	1	Intergenic	novelGene_69019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	949	1266	311076	311393	NA	90	GAAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNCFGVVFRAVIPTARWAEHEAGNGNSWHSRSWSNIHCHRAGPAGSNHSWPAQAGRCTPCQGPSAGQPVLQNNKGESSEEAQCMWKHRRLLSYHCISLKGKQHNC	310127	313325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_310100_313300
914162	contig_5871_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_160177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAACAACAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358693	356121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_356100_358700
914163	contig_15244_pilon	-	3603	3	Intergenic	novelGene_118077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGTTCTCTAATTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	793777	789931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_792367_792550_793073_793131
914164	contig_11734_pilon	-	1684	7	Intergenic	novelGene_173217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	149.787627437427	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	819	1682	26229	976	FALSE	25	AAGGGTAATTATTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRFNGFWNGKRLLFCKRESQLNLPGQTKRKADSALAVITCVGLSLSLLCLLLAAFTFLLCRSIQNTSTSLHLQLSFCLFLAHLLFLVGIDKTEPEVLCSVIAGALHYLYLASFTWMLLEALQLFLTVRNFKVSNYTSEGRFKKNFMYPFGYGIPAVIVAVSAGVGHKNYGTNTHCWLKLDTGFIWSFMGPAAVIILINLVFYFIILWILKSKLSSLNKEVSTIQNTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFIVEVVGKTAELVIAYIFTIINVLQGVFIFVVHCLLNRQ	28475	973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11734_pilon_-_1157_2281_2374_3730_3798_12055_12292_15047_15243_26136_26861_28288
914165	contig_5686_pilon	+	2311	8	Intergenic	novelGene_45403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1602.26946191065	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	14	1285	189037	211355	FALSE	45	AAAGAACTGAAAGCATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLKNMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	171691	212381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_171702_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
914166	contig_15952_pilon	-	3083	1	Intergenic	novelGene_154097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	246	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1020	1658	732221	731583	NA	70	AAAAAAAAACTACAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSIDAEKALDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNEETLKTFPLRTRTRQGCLLSPLLFNLVLEVLARAIRLEKEIKCIHIRREEVKVSLFADDMILYAENPQRIHRRTTGMNKDFSKVSGYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDIKDLYNEKYKTLLQETRRECTSGKTYLVHG	733240	730157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_730200_733200
914167	contig_8476_pilon	-	2963	1	Intergenic	novelGene_121349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACTTTTGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182015	179052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_179100_182000
914168	contig_13300_pilon	-	1296	2	Intergenic	novelGene_125766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGATTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46258	44920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45882_45923
914169	contig_10064_pilon	-	4708	11	Intergenic	novelGene_122717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	35.154089378051	183	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	48	1346	327716	279319	TRUE	45	CAAAGACTAACAGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLILWVRRSAGVDFSFASYIDNSMVLQKEPAGAVIWGYGIAGATVTVTVGQAQETVMKKVTRVKADSNTWMVVLDPMKPGGPFEVMAEQTIGRMNFTLRVHDVLFGDVWLCSGQSNMEMTVSQIFNATREMSDTAAYQSVRILSVSLVQAEQELEDLAGLDLPWSKPTSENLGHGNFQYTSAVCWLFGRYLYDTLQYPLGLVSSSWGGTPIEAWSSQRSLKACGISKQGFIPPDSLGGPSKHSVLWNAMIHPLRTMALKGMIWYQGESNTNYNMDLYNCTFPALIEDWRQAFHHGSQGQTERFFPFGFVQLSSYLSNTTSGDGFPQIRWHQTADLGFAPNVRMPNTFMAVAMDLGDRNSPFGSIHPRDKQTVAYRLHLGARAVAYGEKHLTFQGPLPEKMEHLVDKGLLNLTYYQKIHVQRQDNKIFEGFI	327763	275037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_278209_279127_279331_280577_280774_281772_281931_290015_290150_290613_290724_292116_292295_301466_301606_308134_308311_319152_319315_327682
914170	contig_5698_pilon	+	2145	8	Intergenic	novelGene_55018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	852.735837269236	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACCTGTCTGAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_7900_7975_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
914171	contig_18544_pilon	+	3697	1	Intergenic	novelGene_152728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	937	1260	33639	33962	NA	55	AAGAAAAAGAAACTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVLAKNTEYIPWTARRTNKSDLEEVQPKCSLEARTARLRLTYFGHVIRRDQPLEKDIMLGKVEGQQKRGRLLTRWTDTVAVTMGLNSNDCEDGTGLGSVSFCCAQS	32702	36399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_32700_36400
914172	contig_12279_pilon	-	1914	2	Intergenic	novelGene_50129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAAGATGAAAGAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73320	71356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_71849_71898
914173	contig_4496_pilon	-	2887	1	Intergenic	novelGene_66638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643203	640316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_640300_643200
914174	contig_2636_pilon	-	2917	1	Intergenic	novelGene_52052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGTTCCCTTTAAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52389	49472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_49500_52400
914175	contig_11281_pilon	+	2370	1	Intergenic	novelGene_125518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAGTTCATAGTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969140	971510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_969100_971500
914176	contig_10225_pilon	+	2386	8	Intergenic	novelGene_86790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	670.621855794596	4	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	672	2270	42629	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20679	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35619_35800_40236_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42660_45216_45259_46110
914177	contig_19185_pilon	-	3865	1	Intergenic	novelGene_163671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTAGAGGGCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175221	171356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_171400_175200
914178	contig_10331_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_54149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAGCCTAAAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428476	429069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_428500_429100
914179	contig_19098_pilon	-	1595	2	Intergenic	novelGene_65827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378204	374957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_376467_378118
914180	contig_10000_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_139327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTTCCCAAGGCTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241276	240392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_-_240400_241300
914181	contig_16211_pilon	-	2238	6	Intergenic	novelGene_150095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1474	junction_3	897.615374199885	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	613	1323	221239	197073	FALSE	30	GTATCTATATACACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKTVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVAFECDEDKDEREAPPREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLRDEETSEDSGKDLKPHEDQQVVNKDVGVKTSESTTPVKSKADEREKYMIGNAAQKVNEPEAEVSPGSRPVTAREKSKHVVNHGDVFEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINHPKVVALSNNKKG	221851	196157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_197193_201424_201599_204230_204405_205331_205454_211934_212035_221218
914182	contig_15720_pilon	-	5088	3	Intergenic	novelGene_41935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4	120	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	572	1414	297062	293946	FALSE	45	AACCACACAGTTCTACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCATTNPMQTLQKEAVCAICLDYFKDPVSIGCGHNFCRGCVTQLWGGEDEDRDKEEDEWEEEEEDEAVGATGGWDNSIREVLYRGNANEDFQDQEDEPWVGDGGVRNWDNMNCVWDQEEDEEDRDYYLEGLRHDLRIDVYPEEQERLEEYDDDEELYPDTHLPLPSTPQRQFTCPQCRKNFTRRNFRPNLQLANMVQIIRQMCPTPYRGSQGNDQGTCSKHQEALKLFCEVDKEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVLEYKEVKLERTPWLVGIQRR	297728	290271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_293997_296270_297411_297505
914183	contig_2093_pilon	+	3403	3	Intergenic	novelGene_152941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	877	1488	958641	959252	TRUE	55	AATTTAAAAAAAAAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957764	1023235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_960752_1002801_1002820_1022837
914184	contig_2100_pilon	-	971	8	Intergenic	novelGene_50677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	849.207505710531	74	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	84	776	1182812	1170114	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFNSPLNPGDVLTASLELL	1185494	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170170_1175592_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
914185	contig_11413_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_103146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAATGCCTGAAGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138872	139489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_138900_139500
914186	contig_11115_pilon	+	1207	4	Intergenic	novelGene_102837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	811.922820634244	6	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	36	1124	165608	173241	FALSE	15	CTCCGGAGTCTGTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQGEQRWGCGSGRASPGGGGACLHSALLRTDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165572	173324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166478_172339_172595_172714
914187	contig_1452_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_115149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
914188	contig_6137_pilon	+	3198	1	Intergenic	novelGene_59272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2147	2545	1339458	1339856	NA	10	AGGGACTCTCTGTTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISNIESYSRDRLPGVSIQLYHLPAVTWERLLLLNHSVPHFPQSLPSLPTTSFCDFTLLCTPIELNSQYHLFEAYRILFFFLVYVMSLQLKYQLLKDRENIFYVLRDSCNALRIVGIQQIFVCTFDNCTV	1337311	1340509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1337300_1340500
914189	contig_10734_pilon	+	3817	22	Intergenic	novelGene_51091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	96.4025949726475	107	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1116	3351	61	3411	545373	596401	FALSE	30	AGCTTCCGTAATGATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSGKTRPSVIQGTVEVLTSLMQELQNSGKTDPELWKTCETRWLQLFSLVEKQCQEQIVAQQEQFHNQIQRIQEEIKNLVKLQTSNASWAPYDSSSSKQISSESPMGFFYENSERNESVLSLPKSKEPEMQQESSPSQPDCNVDSSSVSSGYGTFCISELNACKSKDPKEFMEDTEVSKEQYVAPVVQTDSLLGGVKNKSFYIQTAEEFSASLKDDISVFPGEFEHNFLGENKISEVYSGKTNSKSITSWAQKLKQNQPKRAHIEEGRSKSMQGSEQAKKSLSEKPDFTAATQSHAFYLSKPDESPDSWISDSGTGLTYWKLEEKDMYHSLPEALEKTLVPSSSTDMSPSQSNTSNEMKLPSLKDIYHKKQRENKQLPERNLTFASTPNHPPEVLTLDPTLHRKPNQQISGIQPHDFVNILDDRISFSPESVLEPSMSSHSDIDSFSQASNIASQLSGFPNYPSNTKTSPVDCWKNHAFQNESRSSSTFPSVYTVSSNNISVNTIDEENTVMVTPASVSQSQLPGTANSVPECISLTSLEDPVILSKVRQNLKEKHARHIADLRAYYESEINSLQQKLEAEEISAVEEWKKTNRILADRCGQLDSALNEATSRVRTLENKNNLLETEVNDLKERFSAASSASKILQERIEEMRTSNKEKDNTIIRLKSRLQHLEEAFENAYKLSDDKEARLKQENKMFQDLLGEYESLGKEHERVKDTLNTTENKLLDAHTQISDLKRTISKLEAQVKQVEHENMLSLRHNSKTHTRPSRANTLATSDVSRRKWLLPGAEYSIFTGQPLDVQESRAGSQQDTCAPGYHSPPEKDSPCGDSPASLLIKKQRGTSDTPIMKAFKELNEEKIFKNWGTQTEKEDASNKLLNPQQTETSAGASRSPEKCAQQRQKRFNSASQRSSSLPPSNRKSNTPTKREIMLTPVTVAYSPKRSPKENLSPGFSHLLSKNESSPVRFDILLDDLDAVPVSTLQRTNPRKQLQFLPVDDSEEENYSEKASDSHVNRNSCPEPLPNGVKKVPARSAWEKNISISYEQCTPGSGTPHGNDFEYTAKIRTLAETERFFDELTKEKDQIEAALSRMPSTGGRITLQTRLNQEALEDRLERINRELGSVRMTLKKFHVLRTSANL	545312	596807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_545430_555001_555092_557793_558315_559408_559533_563827_563919_566009_566117_569961_570088_570252_570714_571056_571213_573658_573747_575343_575560_578094_578143_579087_579153_580585_580688_588583_588716_589208_589385_590256_590404_591227_591349_592161_592266_592944_593193_593511_593581_596299
914190	contig_14326_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_120711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332278	330975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_331000_332300
914191	contig_9668_pilon	+	491	1	Intergenic	novelGene_58262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACAGCCCAACGTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644593	645084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_644600_645100
914192	contig_7119_pilon	+	2397	4	Intergenic	novelGene_40912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	191	1261	137033	139798	FALSE	40	AATATCTGATGAACACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREAQALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127467	140934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139251_139334
914193	scaffold_12124_pilon	+	2125	2	Intergenic	novelGene_22402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	283	933	1508755	1509405	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508408	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508570_1508633
914194	contig_19098_pilon	-	4176	2	Intergenic	novelGene_65841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1064	1699	407806	407171	FALSE	20	CTGAGGGGGATCAGCACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	424582	404693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_408352_424064
914195	contig_16098_pilon	+	4319	2	Intergenic	novelGene_45827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	3860	4270	197511	197921	FALSE	15	TTTTGCTGTCTGCACCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLVHTENQRKPFSCSLLSGTPTYPLAPQGPIFPVLWQEKQGSIGILVAYAITTAVSLWRSFRIHWAKPEKNKMAILLLHTSVPFSCFLCPVSATASHTTAALQLLPALSRAEGGVRWGGGDFPLCSPAHRGPLS	193421	197970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_193722_193951
914196	contig_15108_pilon	-	4043	1	Intergenic	novelGene_131194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	184	495	174203	173892	NA	25	TTGTGAAGTGGCACCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGVAAFPLKYRMSSEHRYIKVKPKELSYKFQVVQNHTKSKYKILLKCSSVNLFKFLLSHLRRKRGMGKPKASLSGPADADLLFSSVPGCAGSEYWGILSVLF	174386	170343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_-_170300_174400
914197	contig_5236_pilon	-	2084	13	Intergenic	novelGene_100949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.187005789627	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	867	1901	1008939	1006051	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCLAPQMMRSDSRPLVFCVFTICTCSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTSCPRLESRCTLACPLCGRELSEGYRLPHRPASFFSS	1011771	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006162_1007047_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1009053_1009468_1009603_1009854_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
914198	contig_16532_pilon	-	2473	1	Intergenic	novelGene_110050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1910	2230	200269	199949	NA	60	AAAAAAAAAATCCAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVNQRLHQPETRRTRWCLAITNVCLDREHNRESLMEQDKSGMQNSKSSKKIRLNGLTETGGTPQSMTPGLSVNLELKPFLSPTLQTKIRLDYGTENDTHEECAS	202178	199705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_199700_202200
914199	contig_4519_pilon	+	4646	2	Intergenic	novelGene_123700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3467	3796	553452	553781	TRUE	20	CACAAAGTGCTTTTGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPCFIPYTETNLKWIKDVSVQTRTMKFLEEQAGATLSGLAFNNGLSNIIAKPQIAKDKINKWNLVKIKNFCSSKDFSQKVKRQAANWENIFRNHISNKNLITNVFI	549985	555191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_554615_555174
914200	contig_7644_pilon	+	3214	4	Intergenic	novelGene_64246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	25.5255862921022	78	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	37	396	162753	169460	TRUE	10	CTGACAGTTTTCTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSVATCAKRVRPMVLSRGAMAAFRLALIQLQVSSIKSDNVTRACGLVREAAAQGAKVISLPECFNSPYGLKYFPEYAEEIPGESTQKLSEVAKECSIYLIGGNYPSARYNGLNIENVRMTVLVAFKLGNTI	162716	172870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_162781_167121_167241_169247_169575_170166
914201	contig_9997_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_169478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133085	135677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_+_133100_135700
914202	contig_18544_pilon	-	4928	1	Intergenic	novelGene_152733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	348	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42084	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_37200_42100
914203	contig_9995_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_47714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAAAAAAAAAAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365795	368474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_365800_368500
914204	contig_14666_pilon	+	773	4	Intergenic	novelGene_39614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	37	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	68	376	477340	484834	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHRVWRGREEYP	477272	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_484802
914205	contig_2799_pilon	+	1091	5	Intergenic	novelGene_85514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_4	1042.53669000184	28	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	53	739	608027	699261	FALSE	65	TGTAGGAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRRYRVH	607974	699613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191
914206	contig_10158_pilon	-	1570	11	Intergenic	novelGene_150766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_10	28.8251626187954	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	266	1570	32696	7417	FALSE	75	AAAGAAAAAAAGAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTVHSVIKRTPRKYLAEIVLIDDFSNKEHLKGRLDDYIKLWNGLVKVFRNERREGLIQARSIGAQKAKLGQVLIYLDAHCEVAVNWYAPLVAPISKDRTICTVPLIDVINGNTYEIVPQGGGDEDGYARGAWDWSMLWKRVPLTEREKRMRKTKTEPYRSPAMAGGLFAIERDFFFELGLYDPGLQIWGGENFEISYKIWQCGGKLLFVPCSRVGHIYRLEGWQGNPPPIYVGSSPTLKNYVRVVEVWWDEYKDYFYASRPESKALPYGDISELKKFREDHNCKSFKWFMEEIAYDITSHYPLPPRNVEWGEIRGFETAYCIDSMGKTNGGFVELGPCHRMGGNQLFRINEANQLMQYDQCLTKGPDGSKVMITHCNLNEFKEWQYFKNLHRFTHIPSGKCLDRSEVLHQVFISKCDSSKTTQKWEMNNIHTV	162561	7416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_-_7555_10794_10924_11648_11748_16188_16408_20125_20249_21898_22017_24820_25004_27398_27479_27727_27859_32611_32779_162378
914207	contig_12450_pilon	+	2752	10	Intergenic	novelGene_162328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	224.717325863428	7	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	505	1386	444699	451984	TRUE	20	TTCTTAAGAGGAGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDDFVQVGKGATNNTCVIRTVSVGLTLLSVRDTEHAGLADFIPLPVLQAISPELPGTVWVGDILCLASALISLEGLSGTWSSSANSILLIDPKTGVAVAQDVGSVTVYYEVAGHLRTYKEITIGVPPRIVARHVRAVQTGSQEVTASRVTIALGDRSSNLIGECTPAQMDVIKSLHPESLISCQLQFKWDVFDFPARDIFTAEPRFDAAQGQYFCAIMMHRLTDKQQKHLSMKKTPLVVTAFLSGGSSGEQVGAEVPFSPGLYADQAEILLSNHYTNSEVKVFGAMEILENLEVKSGSPAVLAFVKEKSFGLPSFVTYTVSISDPAAGSQGPLSTALTFSSPVTNQALTLPVTVAFVMDHRGPGPHGATLFQHFLDSYQVMFFTLFALLAGTAVMIIAYHTVFTPPRARRRASLLTHSQPAAQPQLFCCLITTVFQRTASWSQSQPFLRPLEPSICLPLGS	439205	453467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_439429_440947_441085_443605_443730_444678_444826_447112_447361_448210_448428_450336_450433_450512_450598_451875_452985_453101
914208	contig_5021_pilon	+	1806	1	Intergenic	novelGene_167098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304069	305875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_304100_305900
914209	contig_17859_pilon	+	2546	11	Intergenic	novelGene_155725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1300	1641	232399	235242	TRUE	35	TAAAAATTGTCGCCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSRSFVLQLLNLPDVVLDQSSDGLVAITCLGQEQVGLLAHEVGDTVVDGIDGLLHGLHPQPQCPVLLLQHGVLPEQVAVALGTILPNYPLALLCTPSVPSAGARSQPAVR	229195	237472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_+_230104_231199_231316_231727_231811_232206_232430_232526_232591_233781_233971_235184_235386_235911_236023_236389_236558_236890_237024_237122
914210	contig_6028_pilon	-	1885	11	Intergenic	novelGene_156585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	19	junction_4	167.220363592476	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	372	1322	332055	316454	TRUE	35	CCAAATACTGTGACCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLCQSNLQDQTTVTWRM	354135	309440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316502_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_353816
914211	contig_6497_pilon	-	3928	1	Intergenic	novelGene_35597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1910	2215	371418	371113	NA	35	GCACCGACCACTAATGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKKTECLRAGGLLLEEGASRHLVELGLPTHGTRAEHLQAKAYWQKELCNTCPSRAEARLRDQEAKGQGDTCLWTWLRTDCPDGKTVSRAFLNLNYNLLVP	373327	369399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_369400_373300
914212	contig_19342_pilon	+	1074	6	Intergenic	novelGene_41105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.61109401705356	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	355	645	4215	6183	TRUE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3618	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4338_5430_5522_5960_5994_6139_6186_6353
914213	contig_9888_pilon	+	1355	6	Intergenic	novelGene_162270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	15.72768260107	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGTACGGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206878	219761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_207343_207725_207793_214907_214991_217014_217142_217416_217516_219246
914214	contig_11978_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_62959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAGGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1080422	1078710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1078700_1080400
914215	contig_4931_pilon	+	2207	5	Intergenic	novelGene_138347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	84.1486779456457	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	67	1143	212295	231692	FALSE	10	GTCCCTCTATTATGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEVVVVAKFDYVAQQEQELDIKKNERLWLLDDSKSWWRVRNSMNKTGFVPSNYVERKNSARKASIVKNLKDTLGIGKVKRKPSVPDSASPADDSFVDPGERLYDLSMPAYKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVTEEGDSPLGDHVGSLSEKLAAVVNNLNTGQVLHVVQALYPFSSSNDEELNFEKGDVMDVIEKPENDPEWWKCRKINGMVGLVPKNYVTIMQNNPLTSGLGPSPPQCDYIRPSLTGKFAGNPWYYGKVTRHQAEIALNERGHEGDFLIRDSESSPNDFSVSLKAQGKNKHFKVQLKETVYCIGQRKFSTMEELVEHYKKAPIFTSEQGEKLYLVKHLS	123288	232756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_123337_212276_212521_228217_228328_228384_228931_231497
914216	contig_7078_pilon	+	3732	1	Intergenic	novelGene_130126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1559	1900	73753	74094	NA	10	CTGAGCAGTGTTTCGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATIHVTLPDGIHRNQTDDICGKRQWKNLISSVRTRPGANCGTNYQLLICKFKLKQRKLDQVHEYQGMTLSISHLNLVTISRIDLTHCMLITEDQTSCEMTSRTSYMKKARDH	72194	75926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_72200_75900
914217	scaffold_19766_pilon	-	2570	9	Intergenic	novelGene_34247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	85.615419172016	12	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	112	504	156580	155425	TRUE	20	TGCCTGACTGAGTGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLKEKEKPKEEEREKPKEAPGLECKPRPLHKTCSLFMRNIAPNISRAEIISLCKRYPGFMRVALSEPQPERRFFRRGWVTFDRSVNIKEICWNLQNIRLRECELSPGVNRDLTRRVRNINGITQHKQIVRNDIKLAAKLIHTLDDRTQLWASEPGTPPLPTVSDSP	156691	152668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_152861_152963_153091_153209_153312_153489_154263_154454_154609_154706_155632_155935_156015_156138_156201_156535
914218	contig_7679_pilon	-	2927	22	Intergenic	novelGene_173743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_13	52.8380059737633	177	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	248	2398	151083	87422	FALSE	45	TGTAGAAAGCAAACACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRPTAHSDHAERDQEIQCLKMGMETLLVANEDKDRRIEELMGLLNRYRRVNEIVMATQGPSERTLSINEEELDGSFRKWNAVNKGPEELFKPEMPPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRSEFVEKGVDRNQLSPVVQHKDSPFLAEHKCPTLPGKLSGAMPNGEAAKSTPTASQPDPTGSGLLRLRETESSWDDTAMANNLSSTSSGTESGPQSPLTPEGKQSPKGIKKFWGKIRRTQSGNFNTDAPGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDASAPFAQWNTERVCAWLEDFGLGQYVIFARQWVTTGHTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFYALIGPEAEQEKREKMALPAYTALTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPSDGAGDGHSVYSGYRCLGPLDAPELDGLDQVGQIS	179191	86892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7679_pilon_-_87617_88872_89062_89755_89882_91148_91272_91801_91891_92129_92242_92526_92678_101890_102020_102791_102934_104587_104727_109816_109859_110800_110859_112630_112699_115222_115327_116440_116517_118886_118949_121594_121704_126255_126349_137177_137310_151071_151186_155221_155309_179133
914219	contig_10581_pilon	-	3794	2	Intergenic	novelGene_41383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2365	2709	574999	574655	TRUE	60	AAAGATTACAGCCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTSTRLALIQTQNNKCWTACGENGTLTHCWWECKMVQPLWKSIWCFLKKLEIEVPYNPAIPLLGIYPREIRTITRIDICTPMFTAALFTTAKRWKQPRCPSVDE	577363	573525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_574267_574310
914220	contig_1154_pilon	+	3537	4	Intergenic	novelGene_87250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	96	401	2211142	2211447	TRUE	40	TTTAGCACTTCCATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSVRSSWLTVPFRSTVSLLSFLLVVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSVVRVCFMYFGALSLAAWMFIVVMSS	2211046	2381466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_2212180_2377393_2378535_2380097_2380705_2380810
914221	contig_10434_pilon	+	2866	8	Intergenic	novelGene_82024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_1	16.3594820535744	7	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	621	1736	125128	132340	FALSE	25	CAGACTCGGCTATGTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCGGTGCNNDSLVQQLFNAAELDSYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVSNITNQFCNASVIDPACVRCRPLTPEGRQRPQGKDFMKFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILGNNTSVGATYFMTYHTVLQTSADFIDAMKKARLVASNITKTMGINGSNYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTFVLLGCELWSAVIMCITVAMILVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSTKGSRVGRAEEALSHMGSSVFSGITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGVTHGLVFLPVLLSYVGPSINKAKSSATQERYRGTERERLLNF	124507	133470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_125205_125544_125661_126692_126823_128279_128481_129476_129709_130607_130722_131445_131609_132257
914222	contig_21399_pilon	-	4379	2	Intergenic	novelGene_173670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	140	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTGTTAGTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148118	139199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21399_pilon_-_143350_147889
914223	contig_1982_pilon	-	3993	7	Intergenic	novelGene_151311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_4	89.4886709154976	149	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	42	1451	153114	146164	TRUE	50	AGTACATAAGTGTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTRYAESQKELQMCNQVPLNTSQSESSDLASRLKRKKLLKEYYSTESEPLTDSGQKPSSSDTFLRSSSDADIHVLVHIHKHVSMQINHYQYLLLLFLHESLILLSENVRKDVEAVTGSPASQTSVCIGILLKSAEVALLLHPVDQANTLKSPVSESVSPVVPDCLPTENGEFLSSKRKQVNNSINQIRSVTVNHMADSRSMSVDLSPVPLKDPLLFKSASDTNLQKGISFMDYLSDKNLEKINEDESCGIVYKSGSGEFGSEISDKKDSSTNSHSVLPYREDSSMLSFDNCGNQNVFSSNGKESETMELFVKAEDFVPETASLSENLDIGKEEISTVRTLKSQSSLSGKPKERCPSNMAPLSVSYKNMKRSPSQTSLDTISLDSMILEEQLLESDGSDSHIFLEKGIKKNSVTNYQSPAESVNASANVQSYGETSPDAISTNSEGAQENHDDLVIISERVYEEKCYQLYLLRIQYVHILAP	153155	115850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_117110_119054_119222_138854_138964_139307_139562_145410_146394_150729_150906_152110
914224	contig_15236_pilon	+	3186	1	Intergenic	novelGene_141639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1322	1633	666178	666489	NA	15	ACTTTTTGGTCTCCTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDFSKATLEARKQRSNTVKILRKNCLQRGMPHPVTPSIRCEKDKHVLRQQSLKIFSSYASFFEKLLEDVLQQNKRISHRWEDMGSREQEIPNRKGAKEFPM	664856	668042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_664900_668000
914225	contig_13428_pilon	-	3639	8	Intergenic	novelGene_143443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1332	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAGGCATAAAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84326	61298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_62032_66262_66384_70357_70502_73400_73502_73730_73951_78059_78123_80037_80118_82149
914226	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
914227	contig_6227_pilon	-	2443	11	Intergenic	novelGene_49788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87.3077316163924	5	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	740	1444	1291269	1260481	TRUE	30	GCCCAGCACATTGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1308753	1249659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250002_1250370_1250469_1252830_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1291552_1291831_1292061_1292294_1292465_1308695
914228	contig_2703_pilon	+	3132	10	Intergenic	novelGene_101836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	35	junction_4	45.498338051319	84	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	69	1196	1256056	1421377	FALSE	25	TGAACACTTTTGCTTGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPVARFARISRSVPPGAGAPAMTASPAAMRVFLEVRRRLQSALLILGEPKEGDMPVDISVMPSSLQMRTPGSCTELWFPAEVRLVPSSCRGLQYVAGDGLHLRLQTQAELSTKPLSLFTQSPQVQECCTFYCQSCGEVIIRDRKLLRVLPLPSENWGALVGEWCCHPDPFANKPLHPQENDCFTGDSFFLVNLRSNSWQPRPELGRKPKTNTKVICKRCKVMLGETMSSETTKLYMTEIIIQPSERNFPILPRSQFVQSVIAQCLVELSSARSTFRFTIQGHDGKAYVLLWLLNSDSLVIESLGNSKSIKKFPLLEDILKDDSSSAWNAIKVLYQPCIKNRNKKLAGSWESDISIHSLTLPAATCLELLLILSRSNAMLPPSLRYMNSFQVAFLKM	1255987	1423313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1256133_1276412_1276610_1278881_1278973_1292401_1292592_1298443_1298514_1305353_1305424_1306570_1306680_1311292_1311457_1362117_1362257_1421356
914229	contig_11631_pilon	-	2148	2	Intergenic	novelGene_104212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270145	267957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_268270_268309
914230	contig_17753_pilon	-	3383	2	Intergenic	novelGene_105106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	766	1092	146777	146451	FALSE	30	GGGAAGGTATGGATGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIRILSTCCLVSIFDALFARSWNVPRSPARTACLIMPDKARVSRGINLKTFFPAQIPLQSQTLQIPKGGESRAWGRRGPQGCEAGVGFAAGGSSSMKPGPRPARGH	147587	144159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_147188_147232
914231	contig_5958_pilon	+	5054	8	Intergenic	novelGene_140088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	72.2108590397961	13	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	194	496	154917	181669	TRUE	20	TTAAGCACTTTGGCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFKRHLNDDDVTGSVKSERRNLLEDDSDEEEDFFLRGPSGPRFGPRNDKIKHVQNQVDEVIDVMQENITKKVYRIMQLLLATDPNNFEDKCGGVDAK	151792	187324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_151932_154862_154983_160822_160870_167909_167961_176696_176752_177740_177821_181665_181718_182814
914232	contig_10399_pilon	-	2875	1	Intergenic	novelGene_114504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1808	2137	445725	445396	NA	60	TAAAAGTGAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQVLFQYALHNCHASEMKKYCLEEGIPFKILLIVDSAPGCLPFIGDLHPNIKVVFLPPNTASLIQPVGHGVIAAFKAFYLKRTFVQAIAATDDTVKTLLRFWKECNIY	447532	444657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_444700_447500
914233	contig_13244_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_86953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCCCCCCCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288091	286579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_286600_288100
914234	contig_6958_pilon	-	2358	5	Intergenic	novelGene_69946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	571.501749778599	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	153	908	190008	154575	TRUE	15	CCCCTGCGGCAGGAGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPEFRGSLASLSDSLGVPASAADQDSYSTSSTEEELEQFLSPSVKKKPSMILGKARHRLSLASFTNVFQAFLSSNRKLYKKVVELAQDKSSYFGSLVQDYKVYSQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEV	190160	148637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154580_160928_161061_183108_183418_189698
914235	contig_12312_pilon	-	2357	3	Intergenic	novelGene_63939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGGAGATGTTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218301	213826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214669_214713_216169_218241
914236	contig_2414_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_158454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	880	1266	132973	132587	NA	15	ACCTCAGCCCTGATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQHLPQKLLGYRRNQGENKFTESSENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAVNAHIQKEERAKIKTLSLQLEQVERDQQKKPTGNRRKEIIKIRAEINKRTEKQLKELIRSKAGSLKRSTKWINHWPN	133852	132320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_-_132300_133900
914237	contig_7398_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_166188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395553	394101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_394100_395600
914238	contig_18977_pilon	-	3238	5	Intergenic	novelGene_178868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAAATTCCAGATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11022	714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18977_pilon_-_959_2340_2486_3468_3639_4306_4476_8512
914239	scaffold_880_pilon	+	2555	1	Intergenic	novelGene_121441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAGAAAGAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422548	425103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_422500_425100
914240	contig_1146_pilon	-	2217	5	Intergenic	novelGene_84804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_4	45.4230117891802	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	615	1848	203	2050	274691	265659	TRUE	40	GATTGCAAAAGGTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYEKFCEKSLTRIQETSLSRESFLPAQSESISLIRFHGVAVLSPLLDIERRKEMQQEKQKALDIEARKHVNRKKALLTRVQEILENVQVRKAPNASDFDHWETETIYSNSEVTNLNVPVTFPNSLPSPTEHSTSTKLEKITGVLPLDNEDQFKSNGIDVAGDSEGFSSLKQCDNSGITHAENEASPKTSSVTPQETLISDSLFPKNEEQDPSLLEEVSPDPYIMSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSRPSSACHILINNPVNACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQHLLEKKIP	279859	262453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_262571_265608_267237_270972_271102_274550_274707_279672
914241	contig_6017_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_152559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	606	548	1153	469570	470175	NA	35	ACTCTGATTATCAGTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGRQRKNEALTPPLLQDAELARGTGGRGGEHSAVSVGIRRVSNDSAAPLVPAAPQPEADNLTLRYRSLVYQLNFDQTLRNVDKSGSWAPPELVLVVQVHNRPEYLRLLLDSLRKAQGIDKVLVIFSHDFWSTEINQIIAGVDFCPVLQVFFPFSIQLYPNEFPGSDPRDCPRDLEKNAALKMGCINAEYPDSFGHYREAKFSQTKHHWWWKLHFVWERVKILRDYAGLILFLEEDHYLAPDFYHVFKKMWKLKQQECPECDVLSLGTYTASRSFYGIADKVDVKTWKSTEHNMGLALTRDAYHKLIECTDTFCTYDDYNWDWTLQYLTVSCLPKFWKVLVPQVPRVFHAGDCGMHHKKTCRPSTQSAQIESLLNNNKQYMFPE	469022	470175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_469000_470200
914242	contig_6270_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_99835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192609	190695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_190700_192600
914243	contig_5794_pilon	+	1683	5	Intergenic	novelGene_69774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	526.786187651119	13	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	283	1629	731364	733984	FALSE	15	GTTTTTTTGTACTGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEEAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSESASYSQVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLNIPCSQKQEARC	730291	734038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_730529_731318_731409_731978_732171_732764_733838_733947
914244	contig_10126_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_105730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAAAACCCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145622	143927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_143900_145600
914245	contig_4754_pilon	-	2455	3	Intergenic	novelGene_35881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTCGGCATAAATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128651	31000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_31397_80423_80594_126762
914246	contig_10517_pilon	+	363	2	Intergenic	novelGene_178945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGTCTCAGAATAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68	477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10517_pilon_+_200_245
914247	contig_5258_pilon	-	3468	1	Intergenic	novelGene_100244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	393	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCATAGTAGACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208627	205159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_205200_208600
914248	contig_14985_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_169089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	910	1473	1590	1027	NA	20	CTGAGTTGGGAGCCTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTIKCSGIPILHNVIHTVECLFIVNKTQVDVLARWRSRQKHHAVPPQQRSEKLSQTECNNPETLEHQMKREKTQPSTKWSENTERERRARRDSCRGPLPANAARIHHLGFLSETSKRGVRESSLTEHPVGEKTAGNLRCALSHPPPLFTSAPPPLLPAASLLTGKRPLLGFHTPKRAALWVPFVGC	2499	131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_100_2500
914249	contig_11328_pilon	-	3504	3	Intergenic	novelGene_88403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCCAACTTCCGCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648038	643645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_645014_645225_647221_647897
914250	contig_6846_pilon	-	3619	3	Intergenic	novelGene_107311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	486	797	330507	330196	FALSE	55	AACGAAATAAAAATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTEFGTERLGCCTNRYLKCGSSFKTVNGWTCGSDRGPAAAEKQQQQRTNSSRTRTPVKDGTGADPRSERAECLFARGFLAEWGASEHLLVELGLPTMEQGS	441952	327373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_330749_427117_427248_441838
914251	contig_12079_pilon	-	1353	4	Intergenic	novelGene_67451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.535243298843	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTGAAATAAAAGATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638737	579749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580913_601814_601879_609189_609274_638695
914252	contig_2342_pilon	-	4307	6	Intergenic	novelGene_132772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	515	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATTTTTTTTATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643551	544785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_544987_571349_571808_583024_583711_601905_602224_640277_642753_643382
914253	contig_7720_pilon	+	3351	17	Intergenic	novelGene_155732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	22.130207720444	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	401	1729	210130	238168	FALSE	35	CAAAAGGCACTCTCGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGRDCANKGTISVGVDATDLFDRYEEEYEDVSGSGFPQIEINKMHISQSIEAPLTATDTAILSGNLSTQNGNGGGSINFALRRVTSAKGWGELEFGAGDLQGPLFGLKLFRNLTPRCFVTTNCALQFSSRGIRPGLTTVLARNLDKNTVGYLQWRWGIQSAMNTSIVRDTKTSHFTMALQLGIPHSFALISYQHKFQDDDQTRVKGSLKAGFFGTVVEYGAERKISRHSVLGAAVSVGVPQGVSLKVKLNRASQTYFFPIHLTDQLLPSAVFYATVGPLVVYFAMHRLIIKPYLRAQKEKELEKQRESTATDILQKKQEAEAAVRLMQESVRRIIEAEESRMGLIILNAWYGKFVNDKSRKNEKVKVIDVTVPLQCLVKDSKLILTEASKSGLPGFYDPCVGEEKNLKVLYQFRGVLHQVMALDSEALRIPKQSHRIDTDG	164843	239790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_164919_185031_185124_188254_188385_196990_197093_210128_210157_215025_215155_216144_216268_217282_217357_220310_220501_221166_221253_221648_221766_231415_231572_232815_232886_233778_233837_233960_234104_234824_234955_238142
914254	contig_10106_pilon	-	1010	1	Intergenic	novelGene_73846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTTAAAGCCGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18707	17697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_17700_18700
914255	contig_7549_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_164545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	216	656	981506	981066	NA	20	TGGGTTCGAACCACCTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNSSQIMKKAIDRSHLDGFGRRNAEEERNNEEQEREKLSTKFYSGRISWSFSKLNQGFQLLVNMNPNANLFAKVDRQIREAARCYRGMYEVKKKRTRQTTLTHFLTRNAIPIPRDNPDDPEHSTSGVITAADKMPTLSISSSSSE	981721	980381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_980400_981700
914256	contig_10479_pilon	-	2898	1	Intergenic	novelGene_147101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATCAGCTATCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63839	60941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_60900_63800
914257	contig_19269_pilon	+	1678	3	Intergenic	novelGene_175626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	376.5	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGTAAAAAAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796	12655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_904_7446_7587_11224
914258	contig_5954_pilon	-	3322	5	Intergenic	novelGene_28513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGAATGTTCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440888	436251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_438840_439037_439128_439443_439627_439714_440047_440759
914259	contig_7019_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_149455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGCATTTAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515712	517498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_515700_517500
914261	contig_12123_pilon	+	2810	1	Intergenic	novelGene_144579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATAAAAATAAAAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38378	41188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_38400_41200
914262	contig_2215_pilon	-	4739	4	Intergenic	novelGene_163845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1604	1987	162329	161946	TRUE	35	TATATTTTATACACGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDCPLEENALELPARELKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENNGQKIGRIQENNAGTKYQNKFTTRNYTKTAIRNPKDKQQDFRNGRCHRRAENQI	164198	129642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_-_130293_130449_132116_161509_163468_163733
914263	contig_13542_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_131540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1458	1850	546668	547060	NA	35	ACAATCTTCTTGCTTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNREDQRRIDAFELWSWQRILNIPWTAKRMNKSVLEEVQPECFLEARMARLCLTYFGHVIRRDQSLVKDIMLSKVESQQKRGRLSTRWIDTVAAPIGSSITRIVRMVQDWAVFRSVVHGVTMSQYQLDGT	545210	547795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_545200_547800
914264	contig_15371_pilon	-	2650	2	Intergenic	novelGene_151474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	293	664	222500	222129	TRUE	45	AAAACCCAATGCTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNAGDHLSPSYLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSTDKRKSLNNQGNTSSGASMKTNAVVSEEEEQTTPWGCSQVHYFSPESENYSQ	222792	219017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_220875_221999
914265	contig_7744_pilon	-	1574	9	Intergenic	novelGene_62514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	328.336883969803	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	790	1545	822294	820619	FALSE	30	CTCCCTAAACTCAGCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNAIKFLNKEITGVSSSKREEEAKSELQAAIDRYVQEKIVLAAQAISRFAYKKISNGDVILVYGCSSLVSRILREAWAKGRQFRVVVVDSRPRLEGRHMLRCLVRAGVPTSYLLIAAASYVLPEVSKVLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAYNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLLCERGEHVALANWQNYPSLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ	823964	820589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_820819_820944_821126_821546_821725_821878_822007_822225_822316_822501_822579_822778_822894_823128_823501_823760
914266	contig_9415_pilon	+	2030	1	Intergenic	novelGene_109918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	155	301	2166510	2166656	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKQDLYKRIPRGTVVKYLVANQKADSSNSPAAPWEKDVAVSFRKDYSLGHSMEQFYSVLQGHYEWEFDSTNGFGLVWSYTTDLCNGFSLVSYNGPVQWV	2166355	2168385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2166400_2168400
914267	contig_7996_pilon	+	4228	5	Intergenic	novelGene_165158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	167.154681358316	187	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	28	537	312212	342097	FALSE	25	TCCTTAATATTTAACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIASLVVWCMAVGISYISVYDHQGIFKRNNSRLMDEILKQQQELLGLDFSKYSPEFANSNDKDDQVLNCQSAVKVLSPEDGKADIVRAAQDFCQLVAQQQKRSTDLDVDMLDSLLSSNGFPDPDLVLKFGPVDSTLGFLPWHIRLTEIVSLPSHLNISYEDFFSALRQYAACEQRLGK	312184	345788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7996_pilon_+_312255_332966_333093_333762_333913_339223_339324_342006
914268	contig_3700_pilon	+	1860	2	Intergenic	novelGene_138094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCTCTCCTCACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343830	345775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_344918_345002
914269	contig_5961_pilon	-	5394	1	Intergenic	novelGene_144123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTTTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123148	117754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_117800_123100
914270	contig_10252_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_162911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTAAGTTGCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77138	75778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_75800_77100
914271	contig_10765_pilon	+	4063	1	Intergenic	novelGene_122887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTACAAGTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55549	59612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_55500_59600
914272	contig_15304_pilon	-	1311	4	Intergenic	novelGene_30605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_1	193.325861924598	19	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	186	1004	66228	64723	FALSE	5	GCCCTGGGCTGTTCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VATASSDRPYVFPLNFCCNDEVKASVTLGCLVTGLISKPVTVKWYTGSLNSSSVTFPTTLHMASSLYTTVSQVTASGEWAQQKFTCSVVHEPPKSSINRTFTACSKNITSPTVKLFHTACDPRGDSQSTIQLLCRITGYTPGSIEVTWLVNGEKTRGLYSTTTQPKQEGKLASIYSEVNITQGQWVPEKTYTCRVTVHGRSYESSAQRCLDSEPRGVSAYLIPPSPVDLYVNKMPKLTCLVVDLASEDGVKVNWSRSRGTSVHADPHTAKRQQNATVSIMSTLPVDTKNWIEGETYHCVVSHPHLPREIERSITKAPVAVQQGARAFGPGLHH	66413	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_64773_64988_65310_65396_65721_66104
914273	contig_11579_pilon	+	3165	4	Intergenic	novelGene_171944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	609	962	109617	109970	TRUE	10	CTTCCACTGCACCGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRGAAAAENLQQQRSSSVREPAAAEKQQCQRTSSSRTRSPALDSTGADPQSERAACLCTRGFLAEWGASGYLSVELGLLIHGARELSACVQEAPWWSGVPPGTYWWSYRASEHLPQ	98934	115246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_98942_109015_111031_111120_112220_115202
914274	contig_2892_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_118990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTTTTTTTAATGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64625	66550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_64600_66600
914275	contig_10930_pilon	-	1483	6	Intergenic	novelGene_37043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	192	1406	279066	268388	FALSE	50	ACTAAGTAGTATAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSQERFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279257	268310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276992_278443_278637_279049
914276	contig_5964_pilon	-	3384	3	Intergenic	novelGene_80347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	35.5	121	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	198	1862	22372	8681	FALSE	45	TATCACGTTAAAGAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGVRWFFLQELWLQLRYSSLLGFVGPPSLCRSCDPSVTGVSPGPPLGPLVSCCRSTRRPFLQLRMRALGLVRHLYGGDTEARSASQLRSPLPKQEKPRGPHRSPASQYWPLLSTESRDGGGAEAPGAGYPVLKPELTYDLKLGQELWAMKKDLSQSTCPGDKAKLESTEPTAPEPVLSDGASVQAQLTPGASRDSQLRREKDQEGPPEVQDQHLQPGVDPQKEQLPGKMSPEHDGFGTDDGACSRILQERVSPQVAVHDGDSHGPDKDAMTHKERHPYVCNECGKVFNRKHLLVQHERIHSGTKPYECTECGKTFSKSTNLLQHHVIHTGEKPYECTECGKAFSFRSHLTRHQQFHTREKPYVCTECGKAFSHRSHLAQHQRSHTGQKPYKCTECGKTFSRSSYFTRHQWIHTEEKSNKCIECGKAFSRRSHLARHQRIHTEEKPYVCTECGKTFTQSAHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKTFAHLSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPAFIRHYSIHTGDKPYECIECGKAFNRKSHLTQHQRIHTGRSPVSVTDVERPFTSEQTSVNIQGLLLGTDSLNVTTEENLWPEEPSYPASDYSYQSKSSQVSSL	22569	7158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_10060_16454_16551_22182
914277	contig_2438_pilon	+	1206	5	Intergenic	novelGene_112031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2518.41959371349	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	77	379	310588	312372	TRUE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSCTADTDEPGWAGSSPE	305089	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_311980_312321_312409_312729
914278	contig_6101_pilon	+	1836	4	Intergenic	novelGene_114289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	191	junction_3	72.7369690505912	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	221	613	338371	356265	FALSE	30	TAGTTTTATGAGTAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFCSYPNPHEDKCPGNYTNPLKVQTVIILGKVILWILHVLLERYIQYHHSKVRNRGYNTIYRSTRHLKRLALMVHSTGNTALLLILCIQHSFPQPSDLYLDFILSVLALELICSLTCLLMYTVKIRKFNKAKPRPDVLEEEKIYAYPSSINSETGFRTISSLEEIVEKQGDIIVYLKRHNALLSKRLLALTSSDLGSQPGRV	338150	357488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_338387_342293_342429_345878_345982_356126
914279	contig_12837_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_57355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAATGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264223	265618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_264200_265600
914280	contig_17144_pilon	-	1470	7	Intergenic	novelGene_29197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1345.91121549677	20	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	189	1175	169039	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170877	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169095_170744
914281	contig_11096_pilon	+	2333	3	Intergenic	novelGene_143487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_1	1.5	1	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	60	368	294731	296279	FALSE	35	ACCTTAAGGTGGCAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLHELTPYHQSGGERSVSTMLYLMALQELNRCPFRVVDEINQGMDPINERRVFEMVVKTACKENTSQYFFITPKLLQNLPYSEKMTILFVYNGPHMLEPNRWNLKAFQRRRRRITVTQPSQ	294671	298244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_294800_294880_294977_296135
914282	contig_14519_pilon	+	2468	11	Intergenic	novelGene_66813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGTCCGCCTGTGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269461	287407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14519_pilon_+_270647_272654_272793_275371_275479_277941_278044_278561_278601_280895_280995_282023_282140_282222_282308_282712_282805_283631_283840_287110
914283	contig_9297_pilon	-	3859	15	Intergenic	novelGene_69856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	108.677603159857	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2031	636	2666	854445	817185	TRUE	45	AAACCCCAAACAGAACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGAGSVLLDPCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSGISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEVTHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAVVRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHILTPSEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEDRELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSEGAMANYESTEVMGDGESAHDSPRDETLQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIHDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQCISGRHRGRLLNQKSGQ	855080	814625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_815676_817041_817240_820253_820468_820936_821125_821982_822143_822472_822580_824360_824491_825846_825970_830434_830523_846690_847062_847191_847270_850644_850765_851230_851366_852427_852569_854324
914284	contig_12031_pilon	-	3771	1	Intergenic	novelGene_137576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAACAAATCAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397567	393796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_393800_397600
914285	contig_3975_pilon	-	2389	14	Intergenic	novelGene_54842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	236.924150846717	1078	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	272	1288	2066301	2060446	TRUE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENDSASRLPVCEKGLVASP	2079253	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060499_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
914286	contig_12623_pilon	-	2046	9	Intergenic	novelGene_138166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	174.033761092496	32	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	5	1213	214398	51811	FALSE	40	TTGATAGAAGTGAATTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDCSNDTTTLDASKPATEEVKSNSEESVMAQESPKNSAAEIPVTSNGELDESHEHGFNRDLKRSLPAGLGLSETQITSHGFDSTKEGVIEAGAFQGSPTPPLPSVMSPSRVAASRLAQQGSDLIVPAGDQRTQTKSGPVILADEIKNPAMEKLELVRKWSLNTYKCTRQIISEKLGRGSRTVDLELEAQIDILRDNKKKYENILRLAQTLSTQLFQMVHTQRQLGDAFADLSLKSLELHEEFGYNADTQKLLAKNGETLLGAINFFIASVNTLVNKTIEDTLMTVKQYESARIEYDAYRTDLEELNLGPRDANTLPKIEQSQQLFQAHKEKYDKMRSDVSIKLKFLEENKVKVLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQKQLEQTLKQFHIKLKTPGVDAPSWLEEQ	214402	50977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_51967_105702_105878_118230_118389_125633_125856_139956_140070_141648_141745_147430_147540_177617_177720_214320
914287	contig_563_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_169781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCATCCACTTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791886	792750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_791900_792800
914288	contig_8615_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_165214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67411	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_64400_67400
914289	contig_19812_pilon	-	2260	20	Intergenic	novelGene_100988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	107.616895150732	2	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	39	1277	46806	26013	TRUE	5	AGTGGTTTTTGTCTTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRTLQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISARQLTWPLSLFSSISSQGACEESGQVLSTDEALVTCCLLTQS	46844	15743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_28567_28663_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35237_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44700_46760
914290	contig_12654_pilon	+	8803	42	Intergenic	novelGene_129273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_41	136.770423414565	858	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2122	6369	499	6867	662573	736428	FALSE	20	GGATCAACTGCTTTCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGGDPFEEGMNDPDLASWSNEMVDDRLNNMDWSGQQKKANRSSEKNKKKFGVEGDKRVTNDISPESSPGVGRRRTKTPHTFPHSRYVTQMSVPEQAELEKLKQRINFSDLDQRSIGSDSQGRATAANNKRQLSENRKPFNFLPMQINTHKSRDAAASPPRRQAVGAAQCKELFASALSNDLLQNCQVSEEDGRGEPAIESSQIVSRLVQIRDYISKASSMREDLVEKNERSANVERLTHLIDHLKEQEKSYMKFLQKILARANEEEDVRTIDSAVGSGSVAESTSLHVDVQSEASDTTARDPQQEPVEEIEDLKKQHDLLRRMLQQQEQLRALQGRQAALLALQHKAEQAVAVMDDAEKAAGTTADHPTAPGRQPARSPLHQRVPLRETTGSLSGISITSELNEELNDLIQRFHNQLRDSQPPAVPDNRRQAESLSLTREVSQSRNPSVSERSPDEKVQLFSKMRVLQEKKQKMDRLLGELHTLRDQHLNNSSFVPSAASPLRSVDQRSTSSAPSAPGGLAAVGNGEPTSLTSSVPYPTAALVSQNESENEGHLNPTEKLQKLNEVRKRLNELRELVHYYEQTSDMMTDAVNENTKDEETEESEYDSEHESPEPVTNIRNPQVAATWNEVNTNTNAQCISNNKDGRSVNSNCEINNRCAASMRAPNLPSSLDCRYNREGEHGIHVAPGEEDDEEEEDAEEEGASGASLSSHRSSLVEEAPEDAEFEQKISRLMAAKQKLRQLQDLVAMVQDDDADQGVTSANTSNLDDFYPTEEDTKQNPNNTRGIANKTQKDAGVDEKEREQFYEAKLRQQQRELRQLQEERRKLIEIQEKIQALQKACPDLQLSATSVGNCPTKNYLPAVTSTPTAHENDTNTGKSVLEPEESSVVDNELWTEMRRHEMLTVELRQRRKQLEALMAEHQRRQGLAETTSPVAVSVRSDGSENLCTPQQSRTEKTMATWGGSTQCALDGEDGDEGGYLSEGIVGTDEEGEEEEQDASSSDSFSVCPPNSVNRNSYNVKETKNRWKNNRPFSADGNYRPLAKTRQQNVSMQRQENLRWVSELSYVEEKEQWQEQINQLKKQLDFSVSICQTLMQDQQTLSCLLQTLLTGPYSVMPSNVASPQVHLIMHQLNQCYTQLTWQQNNVQRLKQMLNELLRQESQHPEKPGSKERGSSASHPASPSVFCPFSFPAQPVNLFPLPGFTNFSSFTPGMNFSPLFPSNFGDFSQNISTRTEQQQPLAQNPSGKTEYMAFPKPFESSSSAGAEKQRNQKQPEEEVENSRPPWLYDQGGEVEKPFINAGFAASVEKTTNSNRKTHFDSSRRSRQFDEESLESFSSMPDPIDPTTVTKTFKTRKASAQASLASKDKTPKPKSKRRSSTQLKSRVKNIGYESASMSSTCEPCKSRNRHSAQTEEPVQAKAFSRKNHEQLEKIIKYSRSAEISSAHARRVPQQANRNACNEAPETGSDFSLFEALRDTIYSEVATLISQNESRPHFLIELFHELQLLNTDYLRQRALYTLQDIVSRHVSERREKEEQDGKLVNSGTWIASNSELTPSESLATTDDETFEKNFERETHKISEQNDADNASVMSVSSNFEPFATDDLGNTVIHLDQALARMREYERMKTEAESNPNLRCTCRIIEEEDGAAATTAVNSVEETPVAENHSSQQPASEVSNIPCPRIDTQQLDRQIKAIMKEVIPFLKEHMDEVCSSQLLTSVRRMVLTLTQQNDESKEFVKFFHKQLGSILQDSLAKFAGRKLKDCGEDLLVEISEVLFNELAFFKLMQDLDNNSITVKQRCKRKIEAAGVIQSYAKEAKRILEGDRGSPAGEIDDEDKDKDETETVRQTQTSEVRDGERPKNGTSDPSDQEEDEESEGCPVSINLSKAETQALTNYGSGEDENEDEEMEEFEEGPVDVQTSLQANTETTEENEPEQVLQHDSEKTADSKNIPTEQEPTIIKDDQAGTPVKPCYLHISENEQPPSSAARKDSLVTPESWKQPDPLPLPFPEGDTLVPGVKEAKSAQETPESSLAGSPDTESPVLVNDYEAESGNISQKSDEEDFVKVEDLPLKLTIYSEADIRKKMVEEEQNNNLSGEILRETQTEELAGNSQKLKEPETVGAQSI	650834	738364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_651238_652960_653031_662547_662669_664432_664679_666373_666644_667358_667530_667762_667880_672271_672450_672567_672658_675037_675139_676079_676297_678631_678834_680073_680248_680750_680909_681009_681246_685943_686096_686234_686365_687385_687527_688080_688272_689701_689909_690459_690680_690797_690944_691580_691772_693759_693932_696417_696777_701085_701251_703482_703540_705915_706089_706404_706537_710696_710818_712276_712436_712984_713122_718652_718788_720588_720787_722411_722475_726471_726608_727102_727261_730463_730540_731073_731331_734140_734234_734328_734447_736402
914291	contig_14744_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_66033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATGGTAGATGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1301830	1300080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1300100_1301800
914292	contig_6275_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_142469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	254	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATAATATTAAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146398	148287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_146400_148300
914293	contig_5280_pilon	+	1096	2	Intergenic	novelGene_52637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75273	106464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_75290_105384
914294	contig_6795_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_27682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAACACCAGACAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69654	71318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_69700_71300
914295	contig_2209_pilon	-	1844	6	Intergenic	novelGene_141017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	85.1704173994703	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	49	630	248781	184503	FALSE	60	CAAACCTGACTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGVCLRRPQTAAAACAMCAHNPGTEFDLSWISNIQVNQPAVLRRAEQIQARRTVKKEWQAAWLLKAVTFIDLTTLSGDDTSSNIQRLCYKAKYPIREDLLKALNMHDKGITTAAVCVYPARVCDAVKALKAAGCNIPVASVATGFPAGQTHLKTRLEEIRLAVEDGATEIDVPFMMRFVSFARPVERLISKPSWQQENLDVSLTSTKPA	248829	183288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_184617_202275_202371_205518_205615_207423_207572_208709_208808_248750
914296	contig_17180_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_178947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATAAGTGGCCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36893	38563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17180_pilon_+_36900_38600
914297	contig_4686_pilon	-	2960	19	Intergenic	novelGene_118523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_11	183.204196943678	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	957	2871	88	2958	487240	447862	FALSE	20	TGCCCTCGAACAAGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSAVTSLLDGLNQAFEEVASQGGGTKRQNMHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERALQDLADLLETGQEKMAGDQKIIVSSKEEVHQLLGKHKEYFQGLESHMILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLESQLNHLGEHWLTNTSKVAKELHRLETILKHWTRYQSESAALIHWLQSAKDRLEFWSQQSVTVPQELEMVRDHLNAFLEFSKEVDAKSSLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQDLEDVIKAKEKEVETIEQNGLALIQNKKEDVSGVVKCTLQELTQTWENLDRMARQLKILLKSVLDQWSHYRAAFDEINSYLMEARYSLARFRLLTGSLEAVQVQVDNLQSLQDDLEKQEQSLQKFGSITNQLLKECHPPVTETLTNTLKEVNMRWNNLLEEIAEQLHSSKALLQLWQRYKDYSKQCASTVQQQEGQTNELLKAATNKDIADDEVATWIQDCNDLLKGLGTVKDSLFVLHELGEQLKQQVDASAASAIQSDQVSLSQHL	487517	447859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_448000_450451_450657_451228_451363_453259_453431_455599_455756_460692_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464565_464977_465111_465975_466173_466705_466838_470300_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454
914298	contig_990_pilon	-	1356	3	Intergenic	novelGene_76135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAAAAAAGAAATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1635365	1629800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1630733_1634280_1634336_1634996
914299	scaffold_880_pilon	+	2145	9	Intergenic	novelGene_121487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_5	489.403974238052	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	42	1154	506113	534279	TRUE	45	TATTTAAAACTGTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYAWFFFELLVKSMAQYIHNLDKQDTFRRTRFSDRFKDDITTIVNVVTSEIAALLVKPQKENEQAEKINISLAFFLYDLLSLMDRGFVFNLVKHYCSQLSAKLNNLPVLISMRLEFLRVLCSHEHYLSLNLFFMNADTAPASPCPSISSQNSSSGSSLQDQKIASMFDLTPEYRQQHFLTGLLFTELAAALDAEGEGISKVQRKAVSAIHSLLSSHDLDPRCAKPEVKVKIAALYLPLVGIILDALPQFYDFTAADARGGKSRCNGSDEEQEGGSTINQNVALAIAGNNFNLKTSGVILSSLPYKQCNVLSADTTRNLMICFLWIMKNADQSLIRKWIADLPSMQLNRILDLLFICVSCFEYKVSVGRLVVCRPLSPTLRPGL	501377	536449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_501410_506103_506254_509157_509272_510289_510446_514145_514286_525271_525442_528125_528272_534033_534791_535969
914300	contig_14445_pilon	-	4331	4	Intergenic	novelGene_137394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	34.1792659696229	64	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGAATGCGCCATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503139	481589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_485379_497997_498280_499117_499252_503013
914301	contig_12672_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_141489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAGACACAGAATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214191	216007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_+_214200_216000
914302	contig_11594_pilon	+	2866	12	Intergenic	novelGene_80910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_6	43.5301738229685	23	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	39	2402	275667	365784	FALSE	15	CATACCGTTGATGTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIVLRRVAWRRRMTPDFDEEVVFENSPLYQYLQDLGHSDFEICSSVSPKTEKCTAREGPQKTPMRALSEQGILLKVAETIKSWISFSQCSKKDDLLHKLDIGFRLDSLHTILQQEVLLQEDVELIELLDPSILSAGQPQQQENGHLPTLHSLATPDIWDVSMLFVFISLLVMLPAWWIVSSWLVWGVILFVYLVIRALRLWRTAKLQVTLKKYTAHLGNTAANSRAFTNLVRKSLRLIQETEVISRGFTLLLDRVSAACPFNKAGQHPSQHLIGLRKAVYRTVRANFQAARLATLYMLKNYPLNSESDNVTNYICVVPFKELGLGLSDEQISEEEAHNLTDGFSLPALKVLFQLWVAQSSEFFRRLALLLSTANSPPGPLLTPALLPHRILCDVIQGLPHAHSACLEELKRSYEFYRYFETQHQSVSQCLSKTQQKSRELNNVHTAVRSLQLHLKALLNEVIILEDELEKLVCTKETQELVSESYQILEQKLKLIQPHVQASNNCWEEAISQMDKLLRRNTDKKGKPEIACENTHCTAVPLMQPTVHIADKDPIPEEQELEAYVDEIDMDSDFRKDDFYYLSQEDKERQKREHEESKRVLQELKSVLGFKASEAERQKWKQLLFSDHAVLKSLSPVDPVEPISKSESSMNSDMGKVGKNDTEEENSKPSTTDSEISRTENLCENPLGSKNKDISANEVFLQGAEERVCYQYKSEDESQQAEVGDLATAHPTPKDPVQPSIKQRLARLQLSPDFTFTSGLAAEVAARSFSFTTMQEQTFGDEEEEEEQITQEIKNGIEEK	275628	366248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_275703_318196_318332_326126_326217_330580_330757_332491_332768_335649_335800_341481_341630_343220_343553_347276_347471_352803_352905_361775_361984_365266
914303	contig_3103_pilon	-	4265	2	Intergenic	novelGene_146176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	467	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGTGGGGGGGTCGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10866	4819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_8832_10613
914304	contig_4531_pilon	+	5724	25	Intergenic	novelGene_47943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	143.662020178148	190	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	839	2520	1383	3902	739965	773874	FALSE	30	ACATTCATATTCTTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPNVSVYSGLKEEHVVKASALLRLYCALMGIAGLKPTEEEAEQLLQLMTSRPPATPAGVRFVSLSFCMLLAFSTLVSTPEQEQLMVVWLSWMIKEEAYFESTSGVSASFGEMLLLVAMYFHSNQLSAIIDLVCSTLGMKIVIKPSSLSRMKTIFTQEIFTEQVVTAHAVRVPVTSNLSANITGFLPIHCIYQLLRSRSFTKHKVSIKDWIYRQLCETSTPLHPQLLPLIDVYINSVLTPASKSNPEATNQPVTEQEILNVFQGVIGGDSIRLNQRFSITAQLLVLYYVLSYEEALLANTKTLAAMQRKPKSYSSSLMDQIPIKFLIRQAQGLQQELGGLHSALLRLLATNYPHLCIVDDWICEEEITGTDALLRRMLLTNNAKNHSPKQLQEAFSAVPVSHIQVMQILEHLTLLSASELIPYAEVLTSNMNQLLNSGVPRRILQTVNKLWMVLNTVMPRRLWVMTVNALQPSIKFVRQQKYTQNDLMIDPLIVLRCDQRVHRCPPLMDITLHMLNGYLLASKAYLSAHLKETAEQDRPSQNNTIGLVGQTDAPEVTREELKNALLAAQDSAAVQILLEICLPTEEEKAKGVNPDSLLRNVQSVITASTPNKEVEEGEDNLLCNLREVQCLICCLLHQMYIADPNIAKLVHFQGYPCELLPLTVAGIPSMHICLDFIPELIAQPELEKQIFAIQLLSHLCIQYALPKSLSVARLAVNVMGTLLTVLTQAKRYAFFMPTLPSLVSFCRAFPPLYEDIMSLLIQIGQVCASDVATQTRDIDPIITRLQQIKEKPSGWSGLCKDPSYKNGSREARSMDPDVQLCHCIESTIIEIINMSVSGI	727775	775696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_728072_729014_729322_729945_730085_732799_732903_733741_733856_737433_737565_737988_738163_739846_740072_741751_741878_745249_745322_745408_745524_747221_747291_748460_748596_749941_750119_750882_750992_758281_758387_761007_761173_762183_762386_764958_765085_769749_769949_771220_771473_771814_771923_772078_772185_773403_773581_773704
914305	contig_3818_pilon	+	3110	3	Intergenic	novelGene_99270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	60	485	548343	548768	TRUE	65	ATAGAGAAGAAAAAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGGHEPPTFQLAANTSADCTTQGVLPSVLHALFYPRQSNPLAPHPPSRKPCTPSPDSQALWETYPLTSQPSSTQGSLLRLLPRSLINLLSFFLNDRNLLFTDLEAESGSRMLALQGFPVSPCSGSSKHSLACTVSLLLC	548283	674315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_550237_668773_669127_673511
914306	contig_8600_pilon	+	6123	3	Intergenic	novelGene_125730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	6	249	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1434	1862	112173	114451	FALSE	15	CTTTTCCAGCATTCGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLRLTYFGHVIRRDQSLDKDIMLGKVEGQRKRGRPLRWIDTVAATVGSSITMIMRMMQDQSALLFFTSLSYILSIIFVVLFYIFFTKPDGCTENKFFISINLILCIVVSVLSIHPKIQVWLFSASFICEWFLINVDVTPR	96953	118712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_97808_111593_112363_114212
914307	contig_11815_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_50939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318408	317297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_317300_318400
914308	contig_3004_pilon	+	2296	2	Intergenic	novelGene_127499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	272	junction_1	0	3	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGCTCGAAGTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284732	287267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_286875_287113
914309	contig_4364_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017201	1015830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1015800_1017200
914310	contig_10159_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_30834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569120	570156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_569100_570200
914311	contig_401_pilon	+	1637	9	Intergenic	novelGene_42841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1670.87701054716	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	97	1035	1712860	1715250	TRUE	35	AATTACAGAATTTATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYNNGGGGGGFGGGSGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGIVYM	1712530	1716285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1714325_1714476_1715077_1715298_1715730
914312	contig_12967_pilon	-	2874	20	Intergenic	novelGene_169799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1087	1449	222129	216568	TRUE	20	CACCGGAAGTGCACGCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFQVSHHPTLLDAHPLLPSSGTQQQLPELLVIHGLWEIVQAQPRLGDKDILVLEFLMLQELKPALFWPYRQRSRPLQPSSQHESSLLWPDRDSGFLLASSPSSSEALQLHHGSLPSQL	227105	199326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12967_pilon_-_199537_203663_203824_204147_204242_204683_204760_205334_205427_205593_205704_206209_206282_207094_207270_207447_207591_208979_209056_211658_211770_215056_215128_216532_216673_217583_217649_220106_220265_222094_222245_222558_222633_223763_224020_224603_224706_226566
914313	contig_253_pilon	+	2270	1	Intergenic	novelGene_129628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCCCTTCTAGTCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159083	161353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_159100_161400
914314	contig_7201_pilon	+	3756	6	Intergenic	novelGene_152518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	3392	3754	640987	641419	FALSE	35	CCAGTGAGGCCCAAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSEVKARAFIGKKWDPETCDWDIWAENQEVGDPETLNFIESLLPKEPYPLYPSDEINPTISEDPLSEISPGLVSESSPGKASESLPGASPEEDALQDTDGCSQNTSPPPIFASRPITRLK	312773	641421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_315044_412114_412288_481566_481692_481745_482054_640471_641131_641200
914315	contig_10609_pilon	-	4351	3	Intergenic	novelGene_123936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	137	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1919	2353	397224	396749	FALSE	25	CCCCACCTCCCCCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYARNNKLKRNGVTFIIKKNISGSILKYIVASDRIISIHLQGRPVIMTIIQIYAPSTNAKDEKIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNEKVANKEGTVVGKLVVRKGVHQGCILSQYLFNLYAEQIDWRKTHQQPTTCR	444156	394750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_396791_396831_397361_442374
914316	contig_6208_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_53043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAAAAGAAGCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525730	523282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_523300_525700
914317	contig_4857_pilon	-	2972	1	Intergenic	novelGene_48779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGAGTAGCTCTCCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1221876	1218904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1218900_1221900
914318	contig_11422_pilon	-	1166	1	Intergenic	novelGene_99047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1910	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1900
914319	contig_18081_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_23770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGAAAAAAAGAAACATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69141	70219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_69100_70200
914320	contig_10951_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_61629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	679	1233	168221	167667	NA	10	TTCCTGGAGCCATTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWCFSFGVYPIWSLLSFVDGRLFIFHDITGVFCQQIFNDPLCVFSPCSGTPIICKVLLLIVSHIILRIFSFFFMLFSDFSSNQVVPQDLSSILLILASIVSNLLLKSSVELFISEILFIFWISNCCFCTVSSYLFILTFCSCIIFLNSCIVLSVFSMILSVISMILSIFPYFCVHFPSSVGEP	168899	167582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_167600_168900
914321	SIRV6	+	1203	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	402	205	186	-70	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	33	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	138	629	1733	10736	TRUE	45	TGCGACAGTTAAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1489	11620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
914322	contig_11316_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_122633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137400_138900
914323	contig_5415_pilon	-	1469	12	Intergenic	novelGene_146128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	361	441	146254	146051	TRUE	35	GAAGAAACCCTCGACTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASLRNFAPFSALSSICRHSSLGRGSLGSSISGSCVSSIGEVPSKEELPTTNVALFEVSVSFLSRFIPASSPVAWNFWLFLTSGDSRLQQLSGTFFWFTTGDVIGFFSDSVDSVSACSKKMYLTARRRAKLRVITCSISMLTILER	150122	134774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_-_134849_139715_139904_140370_140484_140772_140862_141682_141766_142722_142828_145032_145141_145264_145383_145900_146063_146185_146432_146585_146738_150091
914325	contig_15407_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_123040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCACCAAACTGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240098	241882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_240100_241900
914326	contig_1867_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_54577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGGAAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463620	466691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_463600_466700
914327	contig_17989_pilon	-	2029	11	Intergenic	novelGene_150837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_10	54.4022058376313	11	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	479	1525	272731	266567	FALSE	10	CCTGTCACCTGCCCTTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQGTPLSATLSLVMSQCCRKIKDTVQKLASDHKDIHSSVSRVGKAIDRNFDSEICGVVSDAVWDSREKQQQILQMAIVEHLYQQGMLSVAEELCQESTLNVDLDFKQPFLELNRILEALHEQDLGPALEWAVSHRQRLLELNSSLEFKLHRLHFIHLLAGGPEKQLEALSYARHFQPFARLHQREIQVMMGSLVYLRLGLEKSPYCHLLDNSRWAEICETFTRDACSLLGLSVESPLSVSFASGCVALPVLMNIKAVIEQRQCTGVWSHKDELPIEIELGMKCWYHSVFACPILRQQTSDSNPPIKLICGHVISRDALNKLINGGKLKCPYCPMEQNPADGKRIIF	283804	266062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_266631_266714_266870_266955_267059_268253_268420_269335_269503_269721_269823_271169_271311_271437_271584_272727_272819_278208_278360_283564
914328	contig_10437_pilon	-	1196	1	Intergenic	novelGene_38396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGAAAAAAGAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720938	719742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_719700_720900
914329	contig_17274_pilon	-	2895	2	Intergenic	novelGene_26545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAGAAAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165153	155711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_156379_162925
914330	contig_990_pilon	+	1878	2	Intergenic	novelGene_76084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATTTAGTAAGCATGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121875	1125500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1123363_1125109
914331	contig_5686_pilon	-	1668	2	Intergenic	novelGene_45244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1360	1668	94097	93789	FALSE	15	AGCCACGGGCCGCCCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNHKTVQRNHSTPSPILLPCIPSVPRLMSTTPITSRTLSCHHFKVLFEYLQTGRRSCQKDLFTFIKNIIIFIDQELLRLQILHLEEDNQSRQQALNRSCEK	96914	93788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_94100_95557
914332	contig_2798_pilon	+	4498	1	Intergenic	novelGene_120003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGGTTGAGAAGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100141	104639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_100100_104600
914333	contig_6599_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_175967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCGGGACGCGCGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261614	260715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260700_261600
914334	contig_7587_pilon	+	922	3	Intergenic	novelGene_163705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_2	44	146	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	124	921	43424	47378	FALSE	25	GTAGGGATTTGCCTATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYKEKDKHKQKHKKQPEPSPALVPSLTVTTEKTYTSTSSNSMSGSLKRLEDTAARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSEARGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFQQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTESDLRNDSYSHSQQSSSTKDVHKGESGSQEGGVNSFSSLIGLASTSAVISQPKSFENSPGDLGNSSLPTTGYKRAQTSGIEEETVKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENISHLSVSSASPTSSVASATGSVTSCSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGS	26893	47379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_26990_43396_43653_46809
914335	contig_3627_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_78484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTGTATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463021	461842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_461800_463000
914336	contig_5039_pilon	+	2762	1	Intergenic	novelGene_64778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	133	387	130182	130436	NA	45	TCAGAAATCCCAAAGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARPGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRYPASAASQTGKQLHTRMELHSPSGRSKYGTWSQVFEQTEGEVVRGEEEIKRSGKKATPAANKWHSDSWPVWAGGIQAAGASRTRDCVRGKQRRPSVGEEV	130049	132811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_130000_132800
914337	contig_17427_pilon	+	2075	11	Intergenic	novelGene_30399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	141.972532554716	26	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	517	1497	356572	367940	FALSE	50	AAGCGAGCAGAAAGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEKVIDLKVELEKEDGHALHKRLSQVDPEMATKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHSECLHRQHAEEGGGPLGGPLKFPNPCILWLHADQTVLDERLDKRVDDMLAAGLVEELRNFHRCYNQKKVAENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLTTEGKCTPEISNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPSVPPVYGLEVSDVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGRKPAATPIKMPCNETENKRSYHVCDLCDRIIIGDREWAAHTKSKSHLYQLKKRRRLDSDAVTTLGSQSISPERDKELKEKGSSGRNDQELKSSI	331904	368518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351791_355635_355829_356562_356709_359336_359480_361254_361367_361741_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365288_367770
914338	contig_7323_pilon	-	5072	3	Intergenic	novelGene_173206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1985	2284	49666	49367	TRUE	65	GCACAGTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIRERRKQNKETNKNQKEKKNARKKKCPQECPCASVQSKGVASKPCGTARLERAPKLRKEKENKQTNQDRTNQTKKQKSDTGWESVSQLSGVL	51650	12824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_14847_42640_42821_48780
914339	contig_7229_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_39834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	36	410	937118	937492	NA	35	GAAAGTTGACTATGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMITTIREMQIKTTMRHHLVPTLLAQIKQQKKNKCWRSCREPGTLMHCWQECKMVQPFWKTIWCFLKKLEIEIPYDPAIPLLGKYPREIRAVTRIDICTPMFTAALFTITKRWKQLKCPSTDG	937082	939615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_937100_939600
914340	contig_13224_pilon	+	1565	12	Intergenic	novelGene_104132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	75.6544995739521	88	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	603	1565	408503	413527	FALSE	45	GAGATTGAGAAAATCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSQVEPTNRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNIIKLKREEETLDTIKQYYVLCSNRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIEGHFNKKIERLDTDDLD	393518	413527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_393585_402584_402634_403571_403626_404568_404705_405013_405151_408342_408542_409052_409168_410878_411057_411401_411640_412194_412358_412882_413075_413489
914341	contig_16098_pilon	-	3126	10	Intergenic	novelGene_45931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_6	1438.75694804771	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	719	1681	349988	348441	FALSE	40	CTGGCCTTGAAAACATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354075	346995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350331_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
914342	contig_9373_pilon	+	1891	3	Intergenic	novelGene_162715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	672	1031	166781	167140	TRUE	80	AAAAAAAAAAAATAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSFSERKPHRAARTAVPSFIFHPVVGSRTAWLVTHRPAENSASTITNENPAVIPAGGQHRKSPHGRPLHSHLAESLFLFFSDLLLSALQCSVCACVCTCVCWSESVGGCSEGHGDGR	164272	168584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_164910_166746_167568_168151
914344	contig_16826_pilon	-	2381	4	Intergenic	novelGene_176309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.09120616516523	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	841	1371	7106	6576	FALSE	45	AAAAATCCTCATATCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFLKNISATVSINGSGFSGEKTIQYKQTNIPSLGHELRRIKVTFSGLMDIVDIRNDIVGGCEHPSMIPIEKAQGPILFIVGQDDHNWRSEFCAQLASERLQAHGKEKPQIISYPGTGHYIEPPYFPMCPASLHRLVDKPVVWGGEPRAHSKAQVDAWKQILIFFCKHLGASPKL	9836	5565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16826_pilon_-_7167_7801_8153_9118_9276_9564
914345	contig_6233_pilon	-	1383	9	Intergenic	novelGene_74750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGGAACAACACCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131698	112898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_113034_117975_118129_119657_119754_123346_123483_125127_125215_125872_126038_127998_128054_130492_130581_131230
914346	contig_14441_pilon	+	1686	7	Intergenic	novelGene_100358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	119.708558127182	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	500	1654	26678	126705	FALSE	5	GCAGCCTGGCCGTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMSSLRERPPALPSLTSMGPIVLYLAVLCFLGAGSMETEVTQTPRQLVKARQQTAKMDCVPMEGHAYVFWYRQKLGEELKFLIYFQNEDAMDKSGMPNDRFSAKCPENSPCSMEIQSMEPGDSAVYFCASSQTTVLHSPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	23049	126737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_23399_25816_25950_26660_26781_26886_27198_116535_116963_117220_117344_126514
914347	contig_3426_pilon	+	7863	1	Intergenic	novelGene_57986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	358	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGACTTTAAGTAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663055	670918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_663100_670900
914349	contig_10766_pilon	+	2123	2	Intergenic	novelGene_151201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCAAAAGACATCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140784	143246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_141435_141773
914350	contig_11708_pilon	+	3324	2	Intergenic	novelGene_138967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2089	2436	262786	263133	TRUE	60	CCAAAAGAAGTGGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLFISEILFIFWISNCCFCMISSCEFILAFCCCIIFLNSFMSVLSMNLPAFSMNWSIFSSFLSAFCFNSWKALNTRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGSILPCFFKMF	260697	264239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_263726_263943
914351	contig_14472_pilon	+	3250	2	Intergenic	novelGene_111177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATACCCAGTAACACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352228	356824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_352426_353771
914353	contig_7870_pilon	-	3259	1	Intergenic	novelGene_109006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTGAAGAACACACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493066	489807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_489800_493100
914354	contig_5153_pilon	+	2973	2	Intergenic	novelGene_74376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	962021	965057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_962494_962556
914355	contig_6102_pilon	+	4423	25	Intergenic	novelGene_32282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2.64049658629248	542	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1386	1907	1467480	1469267	TRUE	55	AACAAGTCTAACCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLDPSTPSTLSPSLLCWSLPVLRSLGAGSLQDPQVIVLFGHSKFEATHGVVEAKGGVLGSQGAGEHSHDGVQGSKVRVAAVLSSPTVVPPAPAGQPLSILEPLDLGAGHGELGEEFVRLGTGDALREICHLQHPTQDNICCPQVSGGRFECLSLAPVSMLQSTLSLVHCVS	1454117	1580401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1454141_1457956_1458101_1462015_1462057_1466302_1467896_1468791_1468876_1469245_1469343_1470542_1470695_1471107_1471280_1476422_1476520_1477699_1477859_1478317_1478479_1478718_1478848_1479145_1479388_1487618_1487781_1489607_1489843_1494349_1494387_1500133_1500240_1500663_1500805_1501393_1501456_1502110_1502188_1503077_1503204_1503731_1503820_1505750_1505795_1510402_1510597_1580344
914356	contig_6795_pilon	-	1599	3	Intergenic	novelGene_27705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	99	junction_1	129	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	277	684	129930	129523	TRUE	75	ACAAGAAAGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGHLLGGGEVPVFGGGDFSLNCNFLIFARRMCLCVTYIIRNNNRKVWLGFSPFVISTNCPRAMPRKHRSEETKWACRGGAVSPPPTRRLLLHLVQHPHCVIKALNPESGLFNQPYVPVEEHEDDKVSFGHDLGI	130206	123743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_124272_128910_129062_129286
914357	contig_19735_pilon	+	2625	2	Intergenic	novelGene_167886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115637	119250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_+_117553_118540
914358	contig_7909_pilon	-	4489	20	Intergenic	novelGene_155906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3496	3813	496311	460356	TRUE	20	GCAGTGCCTCTGAAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTKVELGDVVTIITFCVVVFVVCVEGLVKVILTGDICGGKELAMLCMMLLILGLPLTGTVIVFETGTTAFGTSFRTTGEELEEFVRLRFLGFSSSSEQLTLLT	550972	442999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_443070_444939_445052_451520_451617_453105_453186_458393_458568_460211_460367_462225_462484_496262_496537_511057_511321_516143_516291_517732_517902_524094_524237_526672_526845_528519_528719_538879_539035_540062_540104_542361_542516_544439_545005_545962_546462_550208
914359	contig_11851_pilon	-	2865	2	Intergenic	novelGene_146557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGACATTGAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49775	46870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_-_47017_47056
914360	contig_14727_pilon	-	2143	3	Intergenic	novelGene_56634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	894	1235	163241	162900	TRUE	80	TTACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPRDPEHTLLIIFPNQPWIHVAVDLFDEPLPQPPPAVPVTHPWKEDSTFCDVNNIVSFSTMTHGLLSQRLLSGKSEGGDRGGGLGGKPPAPGTQGETCCEKTVLASQAESQE	173648	159516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_160186_162660_164119_173632
914361	contig_3382_pilon	+	1714	4	Intergenic	novelGene_124050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTGCTCGGGCGCCTCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217579	231383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_218778_224726_225047_229630_229762_231318
914362	contig_11538_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_152306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGCAGATAACAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257142	258983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_257100_259000
914363	contig_6364_pilon	+	4854	8	Intergenic	novelGene_51785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTGAAGATGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094088	1437442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1096803_1209998_1210337_1216843_1217199_1218181_1218453_1221321_1221674_1258817_1259177_1411300_1411344_1437020
914364	contig_17427_pilon	+	1566	8	Intergenic	novelGene_30282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.468476480058	85	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	21	770	147949	176082	FALSE	5	TCCTTGGTGTCATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLSPVNAQFCWWRFNVCLGKYCLDNMSPSVVS	147928	176878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172236_175985
914365	contig_610_pilon	+	2918	2	Intergenic	novelGene_76838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGGGATCTCATTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350004	449306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_352797_449180
914366	contig_1450_pilon	+	2506	17	Intergenic	novelGene_27370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	586.208887151159	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	977	1843	347091	354198	TRUE	15	CCATCCTTTTATTGACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQQAMAKRLTGLGLAIPSRERQSLPAS	244356	356121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339517_347021_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354120_354330_355589
914367	contig_7415_pilon	-	2592	10	Intergenic	novelGene_168674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	48	junction_2	24.0452248795093	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	212	1633	304553	234983	FALSE	15	TGTATTGCATCTGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAAENEGIAGGDCLSGAEGARLRPESCREEVLAGMAKACGGEEGNGLTGMEKTGVGGEGSGQKEEDMQVDLKVVKQEIIDWSEIEEYKLDAQWVKQEVEDGPEVKDEKADTLEVKQEMDASLVIKEEKMDELEIKEEKVKVKKEVVDWLEVKEEKEIKFEIKKEEILGDQNIKEEEMMDGVCVKEEKDILKREVMDDTKVKEEPEINPPVSCKRKLAMSRCETCGTEEAKYRCPRCMRYSCSLPCVKKHKAELTCNGVRDKTAFVSIQQFTEMNLLSDYRFLEDVARTADYISRDTFLKRPTGNKHMYYLKNRARRQGIYLKLLPNGFTKRKENSTFFDKKNQQFYWHVKLLFPQSQAVYIEKRVPDNKTINDILRTYIDPEKSDPVIRQRLKAYIRSQTGVQILMKVECVQQNLVSYYELDPCRSLLDNLKNKVIIEYPTLHVVLRGSSTDMKVLQQVKSESTKNFGSES	304764	234023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_235024_239414_239540_259273_259352_261404_261486_265596_265666_294721_294826_302270_302357_302441_302549_302634_302701_303888
914368	contig_21386_pilon	+	4825	1	Intergenic	novelGene_177028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	277	834	253	1086	38348	39181	NA	65	GTAAATTTAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWHNWISICKKLKQDPYLTPGTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMVEEIGTTLGALIHGINTIRTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLRSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDKSDKRLISKIYKILQNLSNKKTNNPIKKWAKHMNRHFTKEDIQAANRHTKKCSLSLAVREMRIKTTMRYHLSPTRLALIQKTQNNKCWRSCGETGTLIQCWWERKMVQPLWKSIWLSLKKLEIEVPYNPAIPLLGIYPREIRAVPRIDICTPMFIATLFTVAKRWK	38095	42920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_+_38100_42900
914369	contig_7410_pilon	+	3212	19	Intergenic	novelGene_106039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_1	250.438331779884	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1042	3126	87	3212	28720	132958	FALSE	25	CCAGAATCTGCCCCAGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQGQVHPTLESNDDALQYVEELILQLLNMLCQAQPRSVLDVEEVLGYKIDHQVSAYIVAVLEYISADILKLVGNYVRNIRHYEITKQDIKVAMCADKVLMDMFHQDVEDINVLSLTDEEPSTSGEQTYYDLVKAFMAEIRQYIRELNLIIKVFREPFVSNSKLFSTNDVENIFSRIVDIHELSVKLLGHIEDTVEMTDEGSPHPLVGSCFEDLAEELAFDPYESYARDILRPGFHDRFLSQLSKPGAALYLQSIGEGFKEAVQYVLPRLLLAPIYHCLHYFELLKQLEEKSEDQEDKECVKQAITALLNVQSGMEKICSKSLAKRRLSESACRFYSQQMKGKQLAIKKMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGTLTRVGAKHERHIFLFDGLMICCKSNHGQPRLPGASNAEYRLKEKFFMRKVQINDKDDTNEYKHAFEIILKDENSVIFSAKSAEEKNNWMAALISLQYRSTLERMLDVTMLQEEKEEQMRLPSADVYRFAEPDSEENIIFEENMQPKAGIPIIKAGTVIKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLIIERFEIPEPEPTEADRIAIENGDQPLSAELKRFRKEYIQPVQLRVLNVCRHWVEHHFYDFERDADLLQRMEEFIGTVRGKAMKKWVESITKIIQRKKIARDNGPGHNITFQSSPPSIEWHISKPGHTETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYRAVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVAVVSRIIEILQVFQELNNFNGVLEVVSAMNSSPVYRLDHTFEQIPSRQKKILEEAHELSEDHYKKYLAKLRSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKRHGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRVESGIKKFFENLNPMGNSMEKEFTDYLFNKSLEIEPRNPKPLPRFPKKYSYPLKSPGVRPSNPRPGTMRHPTPLQQEPRKISYSRIPENETESTASAPNSPRTPLTPPPASGASSATDVCSVFDSDHSSPFHSRSASVSSISLTKGTDEVPVPPPVPPRRR	28633	132958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_28762_41375_41541_43526_43737_49452_49597_60121_60233_60315_60415_75323_75452_76251_76908_86475_86558_87329_87453_90598_90703_91879_92103_93487_93608_98686_98850_107338_107457_123306_123480_123675_123793_125040_125306_132875
914370	contig_2988_pilon	+	4273	12	Intergenic	novelGene_136544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_7	68.1552675577447	173	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	39	1055	72354	170354	FALSE	35	GTTTTATAAAAAGTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGLRARILETLVMLILLALLILGIVWVASALIDNDAASMESLYDLWEFYLPYLYSCISLMGCLLLLLCTPVGLSRMFTVMGQLLVKPTILEDLDEQIYIITLEEEALQRRLNGLSSSVEYNIMKLERELENVKTLKTKLERRKKASAWERNLVYPAVMVLLLIETSISVLLVACNILCLLVDETAMPKGTRGPGIGNASLSTFGFVGAALEIILIFYLMVSSVVGFYSLRVFGNFTPKKDDTTMTKIIGNCVSILVLSSALPVMSRTLGITRFDLLGDFGRFNWLGNFYIVLSYNLLFAIVTTLCLVRKFTSAVREELFKALGLHKLHLSNTPRDSETTKPSANGHQKTL	72315	173572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_72448_73194_73264_74216_74282_77024_77098_111693_111775_116385_116463_117111_117190_120549_120624_120865_120957_122408_122476_167987_168150_170268
914371	contig_5039_pilon	+	2260	2	Intergenic	novelGene_65058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	73	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTCCACTTGGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1829904	1832932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1830575_1831342
914372	contig_16951_pilon	+	10184	2	Intergenic	novelGene_98657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	8098	8415	102689	103006	FALSE	75	AAGACAGTAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLFTKHFAQGLAQRRYSANCGVVKKRILRKFKVTDKYTYNCNTRGNIESILREGQTKISGLKREEGGIQVARSREILLVKELGFTRALAAGGLQQKGGKVNAF	92567	104775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_97146_99169
914374	contig_4950_pilon	+	4118	4	Intergenic	novelGene_150639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	394	1020	205265	205891	TRUE	70	ATAAAAGCAAACAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNVLSMNLGKLEFIINEMEHINIDILGISELKQTGIGHSESDNHMLYSSGNDNLKRNGIAFIVKKNILRSILKYSAVSNRIISICLQGRPVNTTVIQIYTPTTKAKDEETEDFYQLLQSEFVQTCNQDALIITGDWNVKVGNKERLVVGKYGLGDQNDARDPMIEYCKTNDFFIANTFFRQHKQRLYTWTSPDGIHKNQINYLSGKR	204871	253036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4950_pilon_+_206013_206528_207788_208040_208515_251792
914375	contig_7151_pilon	-	2920	4	Intergenic	novelGene_40689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	240.142087569468	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	183	608	13837	13305	TRUE	55	AGTCTGGAAAGAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSGLCPCTHIGGGSKKLHRG	18191	10898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12398_12491_13676_13782_13876_18047
914376	contig_34_pilon	+	3666	2	Intergenic	novelGene_40030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	871	1251	222931	223311	FALSE	20	CTGTCGAGTCAACTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAVSTGGHLLFMGPYCRWLGGVGGATSPQAPDVGRRRLCLMARVCQMSRTCHFTAETVEVRVLVYTLLYCSNEGLCCSNGPTQVYARGKALKVHGSLMPVPGQRAVPTLGSWLRGAGSLFFPVC	216242	225726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_216250_222067
914377	contig_12622_pilon	+	2400	7	Intergenic	novelGene_5805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	193.4698512258	25	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	42	584	349741	403121	TRUE	5	CTCTATGGTGCTGCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTKLYLLKTVYKKKRFM	349699	406077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398346_398491_401825_401940_403070_404650_405789
914378	contig_13224_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_104070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	586	909	90993	90670	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNIKIFEFSPTTFIQIKKKIHSPGQKWMIHPQNTPGGCHHSLGFGKWHFWSVACKWVPQKMSVQDGTSRLVLQYHSGCRTSPSARFVRCCGFYLQDREISVAPWR	91578	90664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_90700_91600
914379	contig_10324_pilon	+	3453	22	Intergenic	novelGene_7722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1377.87054968915	5	141	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	867	2066	72983	79380	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSWTSASKRTSVCICTCGRPGWPSVMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	51824	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68709_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72951_73065_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76233_76450_76530_78365_78451_79273
914380	contig_8289_pilon	+	4276	1	Intergenic	novelGene_171179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	3585	3914	209642	209971	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIVFLVLSPILKALIYSVIIIRLSMDQSPLPDLPELILTKRSPKHARWYPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKTRFTGLKETGETSRVWPPDTLLAQW	206057	210333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8289_pilon_+_206100_210300
914381	contig_20293_pilon	-	1211	1	Intergenic	novelGene_153511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28275	27064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_27100_28300
914382	contig_12951_pilon	+	3348	1	Intergenic	novelGene_68227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1385	1729	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795220	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
914383	contig_18081_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_23828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAACAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204407	202884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_202900_204400
914384	contig_10765_pilon	+	3708	9	Intergenic	novelGene_122857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	214.158491251223	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1177	3534	172	3705	18249	91849	FALSE	30	AATGAGCATCTCTTGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYGEMEVKSLGHGEELVSGPHYKRLKPTEESWVFSHHAGADFCRIQEKTGNDWVPVSTVDFKGAGPPQGDKSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLSRILLGQSRDGIVFSTDDYFLYQDGYKYNVNQLGDAHDWNQNRAKQAIAQGRSPVIIDNTNTQAWEMKPYVKMAIGKGYRVEFHEPETWWKFDPEELEKRNKHGVSRKKIAQMLERYEYQMSISIVMNSVEPSHKSTQRPPPPQWRQRESDLKETGHGPRRLKQKRNRKRNKTRTNYSEITAKAAWDTLGYLAPGAQEPSPSEEEDLEETRREPRCSLTGGLGNKLRGFVNGSKEESWKNIHPEESFPSVTSVVELYNTPKDYPPEDGDKLLLSLSSIPNGSSVACQAVTRNLSCVTRGDCSGMKVEKQTENMHAMALDVQDRFAEVSHSLMQKRETGHKSLLCRQHRSKTSRQVLIEERGVNTPQTNNWAFFSTSLSDEELQLGSVGQPWFGSWPEGPHTFICEQRPKKGRWRRQACPDGEGGLVTLISTSEGASGPGSSPELLIEKKLLIEDENLPSSTENIDSFIETNIFRSHLPGPDSPRSALVPTKSKRRQIRAFNLAPNFDLQGQAKNVKEREKGVQLTESHGLKLIWEAEEDRLSEINNEKEKKENRVPSDHHPLCFYRGIMKNPPLDIGGQLYPRFLSFIRLGSSVYFYKSLIPSLRLQYASSFWKVSFMSTTPFLTSGSQTRVDSKRDDMGLVSPEILCHQPLKVPSDLRFLNESVGEKLKREEEARPLKSSQTEDKQDFTRTSCTPPGLPLSQEFASQLVRLFGSPGVPMESLLPEDYVVPLDWKTLKGIYLQWKTSIEKRQKKIA	15647	91852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_15767_18196_19517_28914_29040_32032_32122_32463_32541_34727_34875_84531_86250_90454_90541_91825
914385	contig_3382_pilon	-	5968	1	Intergenic	novelGene_124127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATATTATCCCTGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773404	767436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_767400_773400
914386	contig_6829_pilon	+	373	2	Intergenic	novelGene_123778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88663	90560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6829_pilon_+_88789_90312
914387	contig_5918_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_99607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCCTTTTTATAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2092879	2093656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2092900_2093700
914388	contig_211_pilon	+	2956	1	Intergenic	novelGene_129879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATGGAAAAAAAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278346	281302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_278300_281300
914389	contig_11071_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_131030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTAAGCCTTTACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99631	101006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_99600_101000
914391	contig_5718_pilon	+	2649	7	Intergenic	novelGene_110441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	52.1751856728848	96	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	944	1483	1623232	1625636	FALSE	25	GAAGCCTGTGAGCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKVSPAAD	1617847	1626802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477
914392	contig_6365_pilon	+	3125	2	Intergenic	novelGene_134013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	64	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	57	629	121179	123101	FALSE	30	TATCCCAGACCTACTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDHANHTWTQNFILAGFTTTGTLRSLAFLGTLCIYLLTLTGNRFIIVLVQADSGLSTPMYFFISVLSFLEFWYVSTMVSTLLHTLLHGHSPISSTLCFIQFYVFHSLGMTECYLLTVMALDRYLDICHPLHYHTLMSRQTYTHTHLQRCEVMARGEGTAWLGKEKMGKTNVSLTEVYSDIFPKPQTLES	121122	125597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_121599_122948
914393	contig_11328_pilon	+	4288	17	Intergenic	novelGene_88464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	35	junction_14	157.585381123218	151	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	872	3052	874166	896136	FALSE	25	GCTCTGTGAACCAGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPYDDQSNLQEKVQKVRSLWASVNETLMFLEKEREVVSSVLSLVNQYSLDGTNVAINIPRLLLDKIEKQMGQLHIGNVYEAGKLNLLTVIQLLNEVLKIMKYEHCQADQARLTIDLHYLEKETRFQRERLSDLKQMRYKIKEDLITIRRSIVEKQGEWYKKWKEFLGLSPFSLIKGCTPAVDLLPPMSPLSFDPASEEVYARSILFKYPASLPDTSKQCNQENDCRREKDTWGTVNELANSPASFLLQSAPLSDRNSVTLLEKDMKMRTPREKDETISKKTPESEMEDSPSSDIAKNSESSAVGGSLPAQKSDPFQKEQEHLVEEVARAVLSDSPKLSEGKDVKLEELIDSLISNPFLTRNQIPRTPENLISEIRSSWRKAIEMEDEGSTEPIQMDTEHKEVLPESVPVLHNQTEFNMASFLSTTTVSDFSQSHLPEEKVVSDCLKCVSQKHMAASHLGDPPTQNQSDLLNKKIICEQDSECMALRTKLSETSQIFSPAVHNRIDAMGGSEKESVEMSDHLQASYKEPSMQKTMLWNSFQISSGISSKSLDTDFGILHETLPEEVGHLSLNSSNNTEVSFELEPNSPRHSGIFPEDVVGEIRTTPKSDFNLQAICSRYEAVKKSLSKKKEESYLSYPETLERHKSELNLTPNNLQTDDMFNFLDTRGSHADYTKPSLRNSLGERKRSLSPLIKFSPEEQRFRTTVPRSLGEFLPNLKEEEILNKS	861946	897372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_862294_864326_864423_866368_866448_867431_867565_870446_870596_873783_873850_874164_874214_876287_876459_877906_878101_878735_878863_879546_879650_885276_885359_889847_889915_890211_890398_892942_893079_894236_895278_896110
914394	contig_6842_pilon	+	2077	12	Intergenic	novelGene_130662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_11	246.471496013449	19	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	233	1204	335003	370168	FALSE	35	CAATATGTTAGTCATGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKGVSKDPELADLFYKDDPEELFIDLHEIGHGSFGAVYFATNARTNEVVAVKKMSYSGKQMHEKWQDILKEVKFLGQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAITQGALQGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASVASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRVILASGYGVSFSEKTHFRGRYFIKNRSKSRSSPGSKVRVRSHKTCRLLFP	249556	371041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_249600_329516_329616_334912_335123_339831_339904_340282_340385_342593_342640_343777_343875_346231_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_370015
914395	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
914396	contig_5331_pilon	+	2532	1	Intergenic	novelGene_112823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAACCTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730299	732831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_730300_732800
914397	contig_18272_pilon	+	3907	3	Intergenic	novelGene_7054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	164	463	473715	474237	TRUE	45	AATCTCTTTAACAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGALRVREVKALPAVPGGFLIAESDGLLMTCVFGPLGEGPTGAVPGPATQRCCFRRMLKGSSRLTCSREAEDLGFRFFQCLPLRLLFMQQISFYFSKI	473551	488793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_473964_474186_477312_488423
914398	contig_1867_pilon	+	1551	6	Intergenic	novelGene_54505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5518.78245267921	8	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	178	897	194973	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVTFNSALAQDPDEVVPVAQRRAWCWCMCFGLAFMLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194795	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_195009_213515_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
914399	contig_8397_pilon	-	4014	3	Intergenic	novelGene_177731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	2222	2731	3375	2866	TRUE	65	AGGAAAGAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTIPRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNRRDPESYVGHN	18709	136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8397_pilon_-_445_1890_4164_17276
914400	contig_4402_pilon	-	3264	3	Intergenic	novelGene_140804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTTCGGGGGTGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253957	243552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_244138_245103_246942_253116
914401	contig_3866_pilon	+	3413	1	Intergenic	novelGene_112388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACTGTTCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153810	157223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_153800_157200
914402	contig_5551_pilon	+	3469	1	Intergenic	novelGene_134219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAATTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99828	103297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_99800_103300
914404	contig_4315_pilon	+	5555	3	Intergenic	novelGene_46754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_2	10	365	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTCAAAGACTTAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233944	239904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_234854_235090_235136_235303
914405	contig_6102_pilon	-	1027	7	Intergenic	novelGene_32292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	273.057635348697	47	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	323	985	1489722	1478453	FALSE	25	GCCACAGAACCAGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCHQVTSSQSIRGLLPCTAQQQQQQQQLPALPPTPQQQQPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSAEAADPSSALFQPPLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSSYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHSVAYSPQRGQQLPQPSQQPAHDA	1497453	1478410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1478467_1478715_1478843_1479142_1479386_1487616_1487784_1489610_1489844_1494350_1494383_1497284
914406	contig_3602_pilon	-	2884	1	Intergenic	novelGene_60528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	84	320	182882	182646	NA	65	ATTAAAAAAAAACAATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNPILDPWVFILFRKTVFQRLRLWLCCMGRGTARGDLQTPNAGPASASGRKDSNCSPALGGKKGSWVPLSAWGEGRVAPSPPAQVSGSTVGTPAKAESTVACSLC	182965	180081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_180100_183000
914407	contig_12464_pilon	+	1718	1	Intergenic	novelGene_68690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	323	886	335015	335578	NA	20	AAGCATGCAGGTCTTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHMNIDILGISELKGTGIGHFESDNHMVYYAGNDKLKRNGVAFIFKKNISRPILKYNTVSDVKIFIYLQGRPVKTTIIQIYATTTKAKDEKIEDFYPPLQSEIDRTCNQDALKIIGDWNAKVGKKEENMALVIEMMAMVLFFFFWFRGLVSSPQVSLCSQGSQEPKTNCFLHVTVCNIIEEMNKFK	334692	336410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_334700_336400
914408	contig_6497_pilon	-	2749	2	Intergenic	novelGene_35593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	231	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360935	355882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_357392_359695
914409	contig_6361_pilon	-	2946	5	Intergenic	novelGene_23988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	10	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	15	CTCCGGTACTTCTTCGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436455	408802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
914410	contig_19342_pilon	+	1731	5	Intergenic	novelGene_41102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.8613807855649	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	233	655	4349	5544	TRUE	30	AGAACCTTCCAGAATCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGRDGGGV	3618	6766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3788_4285_4365_5016_5293_5413_5994_6139
914411	contig_13014_pilon	-	1123	1	Intergenic	novelGene_169363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGCTGGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451678	450555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_450600_451700
914412	contig_3471_pilon	+	4268	2	Intergenic	novelGene_178948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	848	1363	31303	31818	TRUE	10	ATTACCGGTTGTTTTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWKQQSISKHIKRQSMMASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRTLQEIMKEIKQNVEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSVESHRSRMEAMEVRIRETEDKVLDTNIFEAESDKRIKKKEEIMWDSIKRNNLQVSGIPERGG	30455	66669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3471_pilon_+_32055_64000
914413	contig_8978_pilon	+	2658	17	Intergenic	novelGene_49360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	138.752125546782	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	848	2547	5	2551	213258	222124	FALSE	25	CAAAGGGAGTGTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNALLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGNTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPDPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVAVPPDLLHHPASGSISHLSYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPATMTSVMGLDPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQAKIQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTTQRFSHQTLQQTPMIGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQHSSSSSSSSSSSSSSSSSNNSSSSSSSSSNSSNNNNTSSSNRQLLPSPSPSPSPSSSARAFSRPSSSNRQQRWFGNSNNSFPIRSHSPIPTYLDASEPPGGAACALDVALPFPLNSQSPSRASTSSGWDPSLRLHF	213253	222231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_213312_213789_213924_214092_214255_214572_214685_214875_214966_215483_215594_215829_215966_216226_216389_217346_217722_217945_218097_218251_218458_218625_218704_218794_219010_220556_220710_221313_221476_221675_221758_221959
914414	contig_11470_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_178950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCAGTTCTTGGAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1852	680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11470_pilon_-_700_1900
914415	contig_10042_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_79185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATATATAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844071	842311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_842300_844100
914416	contig_8681_pilon	+	1101	1	Intergenic	novelGene_157189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	537	998	8814	9275	NA	65	CACATAAATAAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTGPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLGTHSITKLQQGDVEYLKIPITREEIEKVIKILPTKKSSGPDGFTGESYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLTPKPGKDVTKKRKLQTNISHKYRCKNFQQNSSQ	8277	9378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_8300_9400
914417	contig_13593_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_156128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAGAAAAATAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76037	72704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_-_73816_74902
914418	contig_12050_pilon	-	2959	13	Intergenic	novelGene_62592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_12	19.4672088965579	193	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	10	1410	145979	129439	FALSE	15	CTTCTCTTTGTCAAAGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASCAALLLTSLLLALLLLLGVWKRWRRWRTTARHVAVVVLGDLGRSPRMQYHALSLAKCGFSVTFLGFYNSKPRAELLQNDRIGIVGLTELQMLAVGPRVLQYGVKVVVQALQLLWAFVKMEPAVYIFLQNPPGLPGIAVCWLVCCLCGGKLVVDWHNYGYSIMGLVHGPTHPLVLLAKWYEKLCGRLSHLNLCVTYAMREDLAQNWSIKAVTVYDKPASFFRETPLDLQHQLFVKLGCLHPAFRAGSEPSDLTTERSAFTERDVTSGLVTHQRGRPALLVSSTSWTEDEDFTILLEALEKFERLTVDGENLPSLVCVITGKGPLKEHYSRLIGQKRFRHVRVCTPWLEAEDYPLLLGSADLGVCLHKSSSGLDLPMKVVDMFGCCLPVCAVNFQCLQELVKHEENGLVFRDSEDLAAQLKMLFSKFPDPAGKLNQFRKNLRESRQLRWHESWKQTVLPLLVDT	145988	127889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_129571_130995_131072_133131_133247_137725_137837_138222_138283_138590_138630_138766_138889_140578_140690_141013_141104_142258_142408_144187_144292_144391_144470_145765
914419	contig_20614_pilon	-	6065	5	Intergenic	novelGene_107513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	389	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	816	1550	237859	237125	TRUE	25	TATGTGTACTGACTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIERLRSRFETMEDRISEIEDKHLATTLSEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQREKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETVRLSLDYLAKTLQARRQLDDIYKTLKEKNCQPRMIYPAKLSFKYDGEIRSFPEIRGLCKNQTKLTRIVKGSPLIREQTTSDHRLSIGHRIVLARYQLS	238742	36839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_37578_167392_169482_234440_235114_236109_238369_238436
914420	contig_10734_pilon	-	5856	24	Intergenic	novelGene_51221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1098	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	5291	5704	1247520	1243236	TRUE	20	AGGGGCGGGGAGAGCGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFKGSHWKYRTPATEPSFLPIASSKTIPAHWPGANWVSPRNWINPGLLPFTQTRSPTRKSSTNSSCVSAEGVLDAFSLDVVLSTGTTTATGVFRAVLPGFRILVGALSPLGLSILIVLTVSELVSCRLLSLSFPNH	1334970	1198703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1198809_1243188_1243382_1247252_1247830_1260391_1260515_1262351_1262578_1267422_1267618_1268185_1268292_1270216_1270278_1279285_1280231_1281765_1281884_1284376_1284434_1284977_1285061_1286266_1286427_1288094_1288258_1288358_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306212_1321455_1321509_1327927_1328053_1328140_1328285_1328866_1328917_1332592_1332718_1333285
914421	contig_9363_pilon	-	3838	5	Intergenic	novelGene_6489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.958840623296	76	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	2788	3777	373380	372391	FALSE	30	ATTAGATCGTTTCCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTSVQKISEELVSDKVSVVQQEKAKKTSKKLYKCNEFVGNFRLALPTCGDECKKGFLENLNFTEDQNSQTNKQGKYDDYGKPFNQRSLLFRHNQILTRPKCYECSECGIVIRHETDFVRHQRIHTSENPFECNICGQAFKQKSSLIVHKCCHPPDKPYKCHDCGKFFRQISYLVEHKRIHTKEKPYKCSECERTFSQNSTRIRHQLTHSGEKPHKCLECGKAFSRHSTLISHQQIHTRQNTHGCSECGQSFGRNVDLIQHQRTHTKEEFFQCTDCGKTFSFKSNLYRHKVIHTGERPYRCDKCGKSFNRRASLVKHQGTHRGQIST	571069	372329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_373401_374572_377013_397284_397367_570639_570685_570869
914422	contig_20356_pilon	-	5071	3	Intergenic	novelGene_159530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	306	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2375	2713	49907	49569	FALSE	35	ACATTGTAACCAGTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSTASGLEEDSLTTCSMQMNTILLAESKGDLKHLLMRVKDYRLQYGLNLSVKKTHILTPGLINNVIINGKEIDIVNDYILLGSIIKAHGSSSQEIRRMYSMHWENLLQKSL	85347	47210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_-_50622_55122_56673_85237
914425	contig_11493_pilon	-	6478	3	Intergenic	novelGene_143654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219	67	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATAACATATGTGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127785	108163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_108376_108886_113651_126283
914426	contig_10722_pilon	-	1412	3	Intergenic	novelGene_70965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATAGTACAATGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5971	3675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4677_5474_5645_5730
914427	contig_11989_pilon	-	2942	24	Intergenic	novelGene_68431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	367.318454315744	9	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	6	950	226870	67058	TRUE	10	TTTTTTTTTTTAATGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMASIMEGPLSKWTNVMKGWQYRWFVLDYNAGLLSYYTSKDKMMRGSRRGCVRLRGAVIGIDDEDDSTFTITVDQKTFHFQARDADEREKWIHALEETILRHTLQLQGLDSGFVPSVQDFDKKLTEADAYLQILIEQLKLFDDKLQNCRDDEQRKKIETLKETTNNMVESIKHCIVLLQIAKSTINPVDAIYQPSPLEPVISTMPSQTVLPPEPAQLCKSEQRPSSLPVGPVLATLGHHQTPTPNSTGSGHSPPSSSLTSPSHVNLSPNTVPEFSYSSSEDEFYDADEFHQSGSSPKHLIESFTHIFHWLSKLVR	226875	45607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_46310_46597_46734_48155_48251_49066_49146_53542_53684_53802_53861_54141_54253_54940_55026_56307_56480_59328_59415_65761_65881_65998_66112_66962_67104_71209_71370_74969_75075_76359_76451_90226_90278_91047_91078_92003_92052_92290_92387_135427_135505_166938_167018_191091_191143_226759
914428	contig_7963_pilon	+	2354	7	Intergenic	novelGene_58484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTGGAGCTGCTGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120308	123988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_120366_120488_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123131_123406_123502_123747
914429	contig_8273_pilon	-	3935	2	Intergenic	novelGene_113099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	575	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCAGTGTATGAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483008	477409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_477694_479357
914430	contig_10311_pilon	-	3495	7	Intergenic	novelGene_50424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1096.96059890752	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	178	570	70287	68584	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLRSLQLFSRELLFLIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVSFFSPCCTAGDVVKCRYC	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67962_68264_68754_68868_69038_70233_70358_70446_70493_71497
914431	contig_20670_pilon	+	2724	2	Intergenic	novelGene_144828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCTAATTTGTCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25556	28353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_27917_27989
914432	contig_10749_pilon	+	2039	14	Intergenic	novelGene_133508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_12	33.292321910988	221	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	521	1597	292847	301392	TRUE	20	CACGTACCAGACCTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFGVLNEIANSEEEVFEWVKTASSWALALYRWASSLHGSLFPHLSLRSEDLIAEFAQVTNWNSCCLRVFAWHPHTNKFAVALLDDSIRVYNANSTIVPSLKHRLQRNVAALAWKPLSASVLAVACQSCILIWTLDPTSLSTRPSSGCAQVLSHPGHTPVTSLAWAPSGGRLLSASPVDAAILVWDVSTETCVPLPWFRGGGVTNLLWSPDGSKVLATTPSAVFRVWEAQMWTCERWPTLLGRCQTGCWSPDGNRLLFTVLGEPLIYSLSFPERYGEGKGRVGGAKSATIVADLSETTIQTPDGETRLGGEAHSMVWDPSGERLAVLMKGNPRVQDGKPVILLFCTRNNPVFELLPW	289043	301963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_289557_292839_292896_293218_293311_293490_293538_293798_293898_294233_294378_299644_299766_300107_300233_300392_300454_300609_300701_300909_301004_301090_301159_301306_301599_301727
914434	contig_3832_pilon	+	2519	1	Intergenic	novelGene_161493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484376	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484400_486900
914435	contig_7322_pilon	+	2101	1	Intergenic	novelGene_164920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATTAAAAAAGAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244458	246559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_244500_246600
914436	contig_4924_pilon	-	2468	3	Intergenic	novelGene_84733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAATAAAGCGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127457	124759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_125101_125143_126784_126970
914437	contig_5023_pilon	+	2413	10	Intergenic	novelGene_7296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1260.18911964988	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	65	1087	607279	646990	FALSE	20	GATGTTTCCTTTTGAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSSQDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580864	648316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607294_622521_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
914438	contig_2062_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_139041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACCAGATGACTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205064	1207701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1205100_1207700
914439	contig_7396_pilon	-	1740	6	Intergenic	novelGene_79590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3469	junction_3	626.102036412596	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	157	564	248983	248155	TRUE	30	TATTGGATATAAGCGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYRVLACIPVI	249139	245828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_247878_248278_248552_248608_248753
914440	contig_9053_pilon	+	2574	2	Intergenic	novelGene_87940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	368	832	181291	181755	TRUE	55	AGGAAAAAAAAATTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFTWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTAAVVKTAWYRYDDRYIDQWNIIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKFGKDGLFNKWCWKNWISIYKKKKETRPIPTPYTKTNSKMDQRPKFKAKNYKVHRRKNRTTTTGPNAWH	180923	224140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_182555_223197
914441	contig_12864_pilon	+	7838	25	Intergenic	novelGene_76348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	599	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	2878	3432	100848	103353	TRUE	45	AGGAGACAGCAGAGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVKIPKPPISHTFSASQSSLKSTLILWTPSAGIFCLELVPLERVLRMFKVPAFSCLLTGGGFSFSFGFCFTGILGRGATFFCLLCSGPDSGGGGCFFLGSLGVVLGTSFFSGPVLGGCGGMTGAGWETCLLDFLEAGVVTCLDSGPGAEVFPSSLFSSVGFRRGGSLLLFFGAGSSLADGVGF	85244	112245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_85899_86304_86497_87062_87219_87915_87996_88116_88233_88494_88657_89649_89787_90596_90705_91060_91255_91867_91942_92230_92344_93080_93256_94373_94557_94969_95079_95989_96114_96355_96456_97639_97787_100794_100909_101973_102103_102643_102717_103061_103442_103881_103946_105652_105889_106730_106908_108404
914442	contig_13800_pilon	-	2902	2	Intergenic	novelGene_153742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGCATTTCTCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152879	149861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_152182_152297
914443	contig_16666_pilon	+	4294	1	Intergenic	novelGene_61819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTTCCATCATGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303572	307866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_303600_307900
914444	contig_13806_pilon	+	1318	5	Intergenic	novelGene_173653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_1	61.6091511059842	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	364	852	105222	106644	FALSE	45	ATACTTTATAAGAGAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGGPFAEEKVEDVKALVKIVPVFLALIPYWTVYFQMQTTYVLQSLHLKIPAISSITTTPHTFPAAWLTMFDAVLILLLIPLKDKLVDPVLKRNGLLPSSLKRIAVGMFFVMCSAFAAGKGISTSLLRQTDVGRCGWFGIWCLIPDCAGCDSGSVCILVMV	93254	107110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_93322_99845_100142_105221_105333_105797_105876_106344
914445	contig_4508_pilon	+	3383	7	Intergenic	novelGene_177528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	9.28559218478941	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCAGATGAGGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21667	77811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_+_24554_38555_38706_41058_41189_60170_60228_70514_70566_73487_73571_77785
914446	contig_3956_pilon	-	1057	5	Intergenic	novelGene_15168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGCAGATACGAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291015	1281657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281683_1282698_1282909_1284054_1284266_1284683_1284780_1290500
914447	SIRV6	+	622	6	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	554	513	381	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
914448	contig_14925_pilon	-	1098	5	Intergenic	novelGene_55085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1563.50397744937	207	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32680	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569_29828_32530
914449	contig_7271_pilon	+	726	1	Intergenic	novelGene_159947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCATAATAGCCCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368338	369064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7271_pilon_+_368300_369100
914450	contig_14472_pilon	+	1782	2	Intergenic	novelGene_111180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1153	1476	371907	384476	FALSE	45	TAATAGGGGAGAAACAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSLVWRFLVIVSWDIPVNWPNKVFSASVLPCSSLCSARGVKSLQMAIQGTTICFYSPGATEEGESGIGGGYGMCALTVSMNNCLLCHETRRTGWCLATITEHFD	370754	384782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_372141_384386
914451	contig_366_pilon	+	4370	17	Intergenic	novelGene_51625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_3	48.6440756284874	174	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	974	2925	513	3437	1357302	1404950	FALSE	25	AAATTATCTGGTTTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLPAYPVVENPTSIKLTTTYTRRGHGTCTSPGCSFTYVTRHKPPKCPTCGNFLGGKWIPKEKPAKVKVELTSGVSSKGSVVKRNQQPVTSEQNSPKENASKLTLENSEAEVPGNRGIAVTKTPVVKSSVQPEVTLGTTENDSPGSDIPPPAEGTSNSSLLPSSKKPPGVDLTPGPRAPELKGRARGKPSLLAAARPMRAILPAPASVGRGSSMGLPRARQAFPLSDKTPSVRTCGLKPSTLKQLGQPIQQPSSTGEVKLPNGPAHRTSQVKVVEVKPDMFPPYKYSCTVTLDLGLATSRGRGKCKNPSCSYVYTNRHKPRICPSCGFNLAKDRTEKTTKAVEASSPLPDVLSATEPLSAAQREIQRQSTLQLLRKVLQIPENESELTEVFALIHELNSSRLILSSVSEETVTIEQTSWSNYYEFPSTQCLLCSSSLFKGGQNSMAGPQECWLLTANRLQVVTAQVKMCLNPHCLALHSFMDIYTGLFNVGNRLLVSLDLLFAVRNQIKLGEDPRVSISAVLKSVQEQTEKTLTSEELSQLQELLCSGYWAFECLTVRDYNDMICGICGVAPKVEMAQRSEENVLALKSVEFTWPEFLGSSEVNMEDFWATMETEVIEQVAFPASIPITKFDASVIAPFFPPLMRGAVVVNTEKDKNLDVQPAPGNGSALVRLLQEGTCKLEQIGSYSEEELRQLLGQCGIPFGAEDSKDQLCFSLLALYESVQNGARARQPPPHLTGGKIYKVCPHQVICGSKYLVRGESARDHVDLLASSRHWPPVYVVDMATPVALCADLCYPELTSQMWGRNQGCFSSPMEPPLSVSCPELLDQHYTVDMTETEHSVQHPVTKTATRRIVHAGTQPSPGNPSAGHHSLTLCPELAPYATILASIADSRPNSVRQRPIAFDSATHYYLYNRLMDFLTSREIVNRQIHDIVQSCQPGEVVIRDTLYRLGVAQIKTETEEEGEEEEVAAAAE	1356789	1405883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1357356_1370054_1370187_1376068_1376216_1376311_1376488_1378235_1378409_1378544_1378643_1382776_1382876_1385430_1385581_1389169_1389472_1389982_1390111_1392303_1392436_1393328_1393514_1397420_1397641_1398993_1399128_1400037_1400155_1403162_1403373_1404482
914452	contig_16999_pilon	-	5119	2	Intergenic	novelGene_84944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	3835	4371	7036	6500	TRUE	60	TCCACACAAAAAGAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIEIPTFLKEMETPVINFMWKGKKPQLSKALLKKNNKVGGLILPDLITYYTATVVKTAWYWYNNRYLDQWNGIKNPDVNPSTYGHLIFDKDPKYIKWGKDSLFNKWCWENWMSICKKMDQDTYLTPYTKTNSVWIKDLNIKPTSLKIIEEKIGSMLEVLTGCRS	10870	5659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_6226_6317
914453	contig_15666_pilon	-	2148	6	Intergenic	novelGene_70162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	640.037811383046	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	191	550	110619	109319	TRUE	25	CACATGAAATGTTTCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFE	110809	106970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109321_109948_110246_110558
914454	contig_16836_pilon	+	198	1	Intergenic	novelGene_177788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCACCAGACTTGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053	1251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16836_pilon_+_1100_1300
914456	contig_14513_pilon	+	5303	4	Intergenic	novelGene_70380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	79	306	11375	11602	TRUE	25	CTTTCATATATATTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNLLFLYIKNKVQNSSSKEGGFREYKMEGFKVVIWLRNTLSGHGRSPWVVQMVKCSSANQRVGDSSPLRSASVERPCDLLLKSSHENPVEHSSTLTQMGSP	11296	18426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12187_13073_13213_13255_14418_15314
914457	contig_7357_pilon	-	1585	2	Intergenic	novelGene_36845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_1	0	56	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167042	158718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_160034_166772
914458	contig_17897_pilon	+	3467	2	Intergenic	novelGene_153392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3024	6661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_+_5982_6151
914459	contig_4486_pilon	-	3364	7	Intergenic	novelGene_38543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	9	junction_6	222.260857752527	62	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	512	1456	177451	132276	FALSE	35	CTTGCCCAGCCATAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYL	178154	130367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304_177724_177915
914460	contig_854_pilon	-	2266	5	Intergenic	novelGene_36134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	165.566263169765	91	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1274	1846	471014	470442	FALSE	0	GCCTGGGGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAESIPDRRDSSKTGGSTKRPRRLCFVSCGYQKGCLEAAPELTRDAGLMPGEAESQPQLPCWTTSQGPVAVRDSPSELQGPKTLCSSPARVELTSYPRQAALSPGGTQPGGGFHEQAASQKHFSLPRTGPGESLEGNSLAGEQQMELTLPHCQPVWASRSQVDSPGGAAAPRATPPPHTLPQGRDCSRME	474728	470021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471720_471769_472061_473586_473742_474241_474314_474678
914461	contig_2770_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_107488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746852	743764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743800_746900
914462	contig_8587_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_159155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACCAATTGCCATCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517760	523012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_519375_523001
914463	contig_12327_pilon	-	2337	14	Intergenic	novelGene_140683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.493053252468	2	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	366	2069	1151840	1139972	FALSE	40	ATTCCAGACTATTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTAAGKQRIPKVAKVKNKAPAEVQITAEQLLREAKERELELLPPPPQQKITDEEELNDYKLRKRKTFEDNIRKNRTVISNWIKYAQWEESLKEIQRARSIYERALDVDYRNITLWLKYAEMEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKFTFAKMWLLYAQFEIRQKNLPFARRALGTSIGKCPKNKLFKGYIELELQLREFDRCRKLYEKFLEFGPENCTSWIKFAELEAILGDIERARAIYELAISQPRLDMPEVLWKSYIDFEIEQEETERTRNLYRRLLQRTQHVKVYGSVLLSLSCLQEKKEVWLNAGKFMKRLTKPCETVKRRKRDSCCSNLGETLKMSLEPYLIRREWTNSCQRKSRRGERSRPTMGLMQAGKNTTITSFPKMLLTSPTSSSWRWPNFGRSSNRKRRLLSKTQIRTLMRGNPDFFSY	1155010	1139703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1140156_1141085_1141335_1141769_1141874_1143502_1143743_1144612_1144694_1145572_1145633_1146314_1146507_1147457_1147616_1148711_1148895_1151136_1151304_1151754_1151914_1152675_1152768_1153599_1153753_1154963
914464	contig_5686_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_45498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266578	268887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_266600_268900
914465	contig_15498_pilon	-	2066	1	Intergenic	novelGene_42664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1345	1674	688710	688381	NA	20	AAACTTCCATCTGGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLQDNVTGRWSPPLACSHEAQQRNTLRNPSLLFVDSSLGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSTGAGLHFQPACPLPGLLGGQARPPLSCCRCQ	690054	687988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688000_690100
914466	contig_10765_pilon	+	3002	1	Intergenic	novelGene_122881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1604	1933	44451	44780	NA	45	AAAGCAAAGATGTCACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLSLESRVAKANGRNDEVKELNRQFQRATRENKVKYCNKMWKDLELENQKGRICSAFLKLKELKKKFKPRVARVKDSTGKILTQESSKEDGRNTQSHCTRRIG	42847	45849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_42800_45800
914467	contig_8606_pilon	+	2607	1	Intergenic	novelGene_159383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	639	1430	2068	4793	5431	NA	30	CAGTGCAGAACTGCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFPRSCLRAEAVCKKGEKKKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSFEPRARGPGKQRSKRTNAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPLAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYPVCWSPIGVQDGGSALR	3363	5970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_3400_6000
914468	contig_10005_pilon	+	2648	1	Intergenic	novelGene_148910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATAGAATAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114526	117174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_114500_117200
914469	contig_14445_pilon	-	1215	2	Intergenic	novelGene_137388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTATCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498273	399681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_400621_497997
914470	contig_15732_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_88891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	800	1186	220171	219785	NA	55	AAGAAAGAAGAAATGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLTISEILLSIFWISNCCFCMISSCDFILAFCSCIIFLNSSIFLSLFSMNLHAFPMNLSIFSSFMSAFCFNSWIALNIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSFGVLFWMRTRNILSCFCKCFDIFCCLWGIW	220970	219002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_219000_221000
914471	contig_9683_pilon	-	2561	9	Intergenic	novelGene_151290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	123	junction_8	121.992571495153	105	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2412	148	2559	557131	541377	FALSE	25	GGTGAGAGAAATGTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRCMPARPGFPSSPAPGSSPPRCHLRPGSTAPAAAGKRTESPGDRSPSITDFFKPASKQDRHMLDSPQKSNIKYGGSGLLQFKRKLSSPKKSKPKRIPSEKSPILEAFLKGVKEHHKDHGVHESRQPCVSLATRFSKGVTEVYVPSSYCLSKEMKARKKKHRSPERRKSVFIHENSRKESDRDRDKRNADSKDQATVAEADIFKNNSRSLSRSSLSRHHSGESPLGAKFQSSLASYCRERALRKMRKEQIKQRINSENSLSEASNLPLKSPSIGRNFKPRQEQSKQSNVIPGKSNLSNLENGHLSRKRSSSESWEPASAGSKNKFSDKRKRNSVNSDLKSTRESIIPRAEESFLEKHPDGPHRREKFIRHIALKTPGDVLRLEDISSKEPNDEGDRSSVGLAPSHSGHHSSKNNDQIRVASTKETKIQKPHLPLPQERSAVKKASSLPKNKTASSVTSKETKLVPLLSHVPSAGSSRVPLNAKNCTLPVSKKDKDRSSSREYSGHSTESSKHKEHKSKTNKADSNMSSGNVSGESLRSEYGTPTKSPPAALEVVPCIPSSTAPSDKAPPDKESSGNSNAGSSALKRKLRGDFDSDEESLDYNLDSDEEEETLKSLEEIMALNFSQTPAAARKSPALPKGLSSQSSDYTEHVHCGTYTNTLERLVKEMEDTQRLDELQKQLQEDIRQGRGIKSPLRIGDPDTTGDEDGLLEEHREFLKKFSVTVDAIPDHHPGEEIFHFLSSGKIFNQHTLDLRDSGFIGQSAVEKLILKSGKTDQIFLTTQGFLTSAYHNVQCPVPVLKWLF	557278	541374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_-_541477_542459_542628_543443_543567_545257_545329_546305_547295_551180_551239_553326_554046_554505_554550_556991
914472	contig_15449_pilon	+	2734	12	Intergenic	novelGene_33603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	667.828416128297	1	111	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	52	1680	44312	54580	FALSE	20	TTGGTTATACGTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLNF	44260	55634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51330_51809_51928_54570
914473	contig_12583_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_175075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAATTTGCGGTGTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2302	773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_-_800_2300
914474	contig_8377_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_34925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAGAAAAGAAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68089	69364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
914475	contig_13901_pilon	+	2658	1	Intergenic	novelGene_146621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATGACAGATGTGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2215	4873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_2200_4900
914476	contig_7359_pilon	+	2825	10	Intergenic	novelGene_139875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	21.0718933975574	6	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	182	1156	414164	423877	TRUE	5	CTGTGTGGTTTCTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKSQPSAPKTKSPGSVSNGTAASQGQWGRAWEVDWFSLASVVFLLLFAPFIVYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQFCC	402217	425668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_403997_404119_414157_414262_415308_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_423865_424070_424191
914477	scaffold_21177_pilon	-	3615	6	Intergenic	novelGene_145482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	294.526739023811	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	81	1040	221483	182162	TRUE	10	TATTATTCTGTCTGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLDVAEIADEVYMEVIVGEEDAAAAAAAAAAAHEQQIDDNEIKTFMPIAWAAAYGKSRSNC	255198	178763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_180678_181500_182341_183067_183218_217716_218287_221422_221512_255146
914478	contig_5039_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_64792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCATAATTCTACTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163451	161866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_161900_163500
914479	contig_10286_pilon	+	6881	1	Intergenic	novelGene_98438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	5281	5667	500349	500735	NA	15	GGGAGTCATGTTCTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSEKFKSHLPNSYNWYRVGALFKISSPDSQFSAPSSPSLWDTAGSPHLNGEALEGGAFLQVGARVLSLSPHIHTHTQTHTHTHTHTHTHTQSHNSDSRCGLQEGARPNVSNIHHANQANQGNILWLD	495068	501949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_495100_501900
914480	contig_4857_pilon	-	2447	10	Intergenic	novelGene_48719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2247.0985132822	3	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1575	1994	1216861	1182148	TRUE	25	CTTCCTCCATAATGTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVSKILVCFVSHGHGTARL	1227769	1178611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1213420_1213529_1214576_1214709_1216723_1216896_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
914481	contig_14970_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_45097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAGTAGAAAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232251	231690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_231700_232300
914483	contig_11258_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_67832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAGAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342660	340013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_340000_342700
914484	contig_9415_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_109822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCTCAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1817508	1815503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1815500_1817500
914485	contig_6589_pilon	+	1932	14	Intergenic	novelGene_25717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.7434381796524	38	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	233	1489	460735	485809	FALSE	45	GAAAAAAAAGTCTTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGYQEQPVISHDLGTHLSLLLPPVCPTKNQSSLLSVVGLGGWPETV	451699	486252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_452179_452321_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_485672
914486	contig_1516_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_49929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCCAGCCAAGTAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123366	121069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_121100_123400
914487	contig_3787_pilon	+	4681	1	Intergenic	novelGene_102376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCACCTTAGGCGTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404242	408923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_404200_408900
914488	contig_16647_pilon	-	3786	2	Intergenic	novelGene_170313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1497	1808	339399	339088	FALSE	35	TGAAGCCAGCATAACCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFLKTKDKGKILKAAREKRNITCQGTFVRISVYFFPEILEDRRQWSNIYKIMKENNCQPRILYPAKLSFKNQGEIKTFSNKQKLWEFATTRPALQILFKGVL	341066	337109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_340125_340295
914489	contig_16211_pilon	-	2516	8	Intergenic	novelGene_150064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	315.889544115713	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	137	895	121247	87602	TRUE	55	AGATAGAGAAAAGGAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLK	121383	79943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80505_85311_85427_86272_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
914490	contig_10042_pilon	-	1874	12	Intergenic	novelGene_79107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATCAAATGTTATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94042	6311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_6398_8813_8934_26598_26806_42594_42730_43876_43947_45868_46003_46924_47034_71544_71638_74027_74149_75522_75572_76060_76117_93348
914491	contig_6735_pilon	-	2223	10	Intergenic	novelGene_15813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	49.9075688858791	28	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	41	1183	596782	583837	TRUE	30	CAGTATCATTTTGATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEERVAELARDLMEMEQKLLTVTKENKDLTAQIQSFGKSMSSLQNSRDHANEELDELKRKYDASLKEVAQLREKQGLLSREREVLVSKAASPKSSTEDNSLSHLEKLNQQLLSKDEQLLHLSSQLEDSYNQVQSFSKAMASLQNERDHLLNELARFRKSEEGKQRSAAQPATSPAEVQSLKKAMSSLQNDRDRLLKELKNLQQQYLQINQEIPELRPLKAQLQEYQDKTKTFQIMQEELRQEHLSWQHELHQLRMEKSSWEVHERRMKEQYLMALSDKDQQLNHLQNLMRELRASSSQTQNLKVQYQRQASPETPTSLDGSQNLVYETELLKTQLNDSLKEIHQKELRIQQLNSKPLGMIWRSLEYKSKKPTPLESHPSQHCCPLLGSRKLP	596822	573574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_574088_574402_574509_577251_577387_577834_577933_578709_578854_583792_583951_584144_584283_584476_584643_588711_588891_596236
914492	contig_14744_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_65935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTTGGAATGGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170697	172925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_170700_172900
914493	contig_11386_pilon	+	3472	1	Intergenic	novelGene_82806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92020	95492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_92000_95500
914494	contig_4219_pilon	-	1104	3	Intergenic	novelGene_178744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	599	967	216944	216576	TRUE	45	CAGTGAGAGGCAAGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTRDCVRGKQRRPSVSEEGWRVGKHISQIAGALGPLRKEQRWCTGPGTRVKGGGGGKRQVRNQKKQKKKKAPPAANKQHPESRPARCAESKQPAPPQPRDRGRGKQRNK	219416	216273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4219_pilon_-_216288_216452_216998_218871
914495	contig_7129_pilon	+	3989	1	Intergenic	novelGene_169303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTTAGTGGTTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904669	908658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_904700_908700
914496	contig_6364_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_51741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAGCTGCAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511871	509431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_509400_511900
914497	contig_9858_pilon	+	3078	3	Intergenic	novelGene_140526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	13.5	80	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	23	430	213461	216880	FALSE	55	TCTAAAAGAGAATAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNPFINIAEPLDPAQPGKKFFNLNKLEDSRYGHLPFSIRVLLEAAIRNCDEFLVKKNDIENILNWNVMQHKNIEVPFKPARVILQDFTGVPAVVDFAAMRDAVKKLGGDPEKINPVCPADLVIDHSIQVDFSRR	213438	219528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_+_213558_215389_215559_216738
914498	contig_2069_pilon	+	2508	13	Intergenic	novelGene_23236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	339.18820570428	3	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	1071	1808	341330	344117	FALSE	10	TGATGTGGTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPTSEQIGHSVVI	323950	344817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_333852_334103_334697_334805_335598_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766_343960_344080
914499	contig_6109_pilon	-	2148	2	Intergenic	novelGene_160371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	559	870	507315	507004	FALSE	70	AAAAAAAAAACCCAACACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLTTSVFSPFIMMLLIGPVVGMFVFFMLRCNPYSRLWSLIFISKCFKSSSLSASKVVSSAYRRLLMSLPSILMPCSSSYSPASQIICSAYRLNRCGERIQP	681086	505725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_507634_680846
914500	contig_7593_pilon	-	3293	1	Intergenic	novelGene_127375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGCACTAGGATATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757841	754548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_754500_757800
914501	contig_19402_pilon	+	3327	17	Intergenic	novelGene_80773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1638.83922335292	11	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	625	2289	29462	139850	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKKRWDVRDSN	23463	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139820_139887_145719
914502	contig_6846_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_107303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAAAAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212603	211213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_211200_212600
914503	contig_10263_pilon	+	2498	1	Intergenic	novelGene_135866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	441	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACTCATAATACCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005667	1008165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_1005700_1008200
914504	contig_5451_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_167187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTTTTAGATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705391	707628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_705400_707600
914505	contig_4754_pilon	+	3490	2	Intergenic	novelGene_35934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2690	3262	295781	296353	FALSE	40	TATATTTCCCAGCACACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVNKPAGVGRVNLHGMELAPPVLWIWPAGKQPIALPGSCKLAHQEAADWVARKWQRLSRGRQGRGWESVSHWLPDVLSPAGSSVNLLSHTPCPLISDRSPRWWNCAALADRGPPLVTLLAVCSLSVSYSIWCLAGFFIYLKLRVPGLMFVSVLLGFLGLCCGGMAWCFCLYRHVSSTFIINFLIVLVTI	292517	296581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_293499_294072
914506	contig_15666_pilon	+	3847	1	Intergenic	novelGene_70113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTAGATTTATTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96693	100540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_96700_100500
914507	contig_9995_pilon	+	4218	1	Intergenic	novelGene_47794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTTTATATAGGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791437	795655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_791400_795700
914508	contig_253_pilon	+	3598	4	Intergenic	novelGene_129648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	6.59966329107444	6	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	672	1040	275184	275552	TRUE	20	GGACTGAATTGCTGGGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPEHLPVWGPTPAPRAVGAQQSPWDSGAVTAVWCQVVREGPHGRDKFVESPGRGRIHSGKEERREERVSQAQPVTCAEAGVSRGGHTWGSGEASGPSLRAAGALCDVLPAVGTPQHNVRAR	271578	437953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_271763_274696_276112_276173_277157_436937
914509	contig_13295_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_31241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTAGAGAGAGGCGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99897	98504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_98500_99900
914510	contig_14034_pilon	-	3943	4	Intergenic	novelGene_72627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_3	57.4514287608817	175	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGTTCCCGGCTTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94598	83737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_86861_89954_90031_93389_93545_94009
914511	contig_11883_pilon	+	6621	7	Intergenic	novelGene_163764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	268	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	899	1300	36195	36596	TRUE	15	GCCTCCTAGGTTGGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNSCNSFIGSMTPESGWPDEELPVGKTSVKLIASLLVSAWGRTSCSSITPSVGSAVQTCLTKTGFFCLTSLALELSGSNGPISVVQTAPFSSLARFWCFSMAMSKLFAGESILLLEVEDSCWGESLPTDIF	25744	147901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_+_25853_30491_30662_31600_31734_35707_41643_67302_67356_140649_140790_147819
914512	contig_11548_pilon	+	1990	9	Intergenic	novelGene_66738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1305.3594093199	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	194	784	63836	102181	TRUE	20	TCCCTGTAACTTTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDE	63642	120103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102332_112809_112904_117683_117856_118975_119125_119462
914513	contig_10319_pilon	-	3230	2	Intergenic	novelGene_147255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	506	808	229988	229686	TRUE	75	TAGATACAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFPGGLFLMYAQVCLFIHQEPLGAHSLVSSLVAGAQELLTLEKSISKGFESNPNVTSTHHRSPSGSFSPVPAFITHSLNLPHAGAAAIWWSNELSKCL	230493	225324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_227655_229593
914514	contig_14536_pilon	-	4796	14	Intergenic	novelGene_69278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_4	167.40808658969	556	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	87	1049	137680	58055	TRUE	25	GAAGTCCTGTATTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARRSKLQR	137766	51450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_56408_56487_57556_57673_58028_58074_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
914515	contig_12620_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_98812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAACAAAACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429079	430784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_429100_430800
914516	contig_4783_pilon	-	7008	15	Intergenic	novelGene_108340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.27330701862	243	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	426	1376	272647	35758	TRUE	50	CATAGTTACAACAATGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQNEGMAQLDSIGFSVIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQETRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDAPLSNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVVSSNANSILNSSSSLQPNMNSSDPDLDVVKPTRPNSL	302221	30015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_30876_30985_35916_56452_56592_81553_81714_155408_155515_157883_157943_159655_159744_173638_173714_178145_178212_203798_203836_272584_272664_284594_284684_292845_292937_300778_300880_302093
914517	contig_18610_pilon	+	3730	1	Intergenic	novelGene_168061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	189	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	2714	3307	28784	29377	NA	20	CTGGTGATTGTGTCCAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKRHSIKVHQPFLIKTLNKIGTEGKFLNTIKGIYTNPTANISLHGERLKTFPLRTGTRQGCPLLPLLFNIVLKVLARVIRQEKEIKGIQICKEEVKMSLFVDDMLLYIENPKNSTRKLLELIERYSRLAGYKINMKKSVGFLYTNKENYEKEIGNNTIYNSPPKNKILRNKSNWGCKKPIQRKLQNTTARNQMRPT	26070	29800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_26100_29800
914518	contig_7758_pilon	+	2793	3	Intergenic	novelGene_163531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117865	140077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_117981_131722_131950_137626
914519	contig_4974_pilon	+	4010	6	Intergenic	novelGene_161393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	79.3811060643526	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	198	590	41473	81861	TRUE	30	AGCTGGTGATAGGGAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSAGRLHCLTMTAKNPTPRDVAPAPLVTCKLCLCEHSLDKMTTLQECRCIFCTACLKRYVQLAIREGCGSPISCPDVVCLNHGTLQEAEIAGLVPVDQFQLYQRLKFERGTRSAFYPDGSCGFTVSSLH	20917	103161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_21079_41436_41638_67772_67878_81738_84174_100968_101938_103022
914520	contig_2940_pilon	-	3938	8	Intergenic	novelGene_81946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_7	262.242915898172	9	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	88	1809	765078	756839	FALSE	50	TGTTCTAAACAATAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSASPWRLPGCKAAPVGAAGACARSTAGMEGPSTGDCGADPSVAASERLDPDRPCHLREEDVALGSERVREDEKQTVIKSSSECNPLLEEPIASQFGGTAATECHKSVPCGWKRVVKQRSSGKTAGRFDVYFVSPQGLKFRSKSSLANYLHKNGETSLKPEDFDFTVLCKRDIKSRCKDCSISPLTSQVQKESNNSNWNLRTRRGRKNDVFPMPHGSSELQDGRGLSNLTAIHLSLKEDEGVNAVDSRKVRKSKGKMTILKGIQIKKTKKRCSKSLSDSVQNNRKRESVCSEADVEGEPVAQESQLGRTLYISDVKASDETLVVTNEEKRLVKEKSLQSESNVHFEKLTSGSINKLCLTKEAEHNKKCENTFLDCEEIKTEVEVGERKKHLHTDVLKCGSEMDNSCLQAEKNFTSVKKFQEDTPVPRTQIEKRKTSLYFSSKYNKEALSPPRRKAFKKWTPPRSPFNLVQETLFHDPWKLLIATIFLNRTSGKMAIPVLWEFLEKYPSAEVARTADWRDVSELLKPLGLYDLRAKTIVKFSDEYLTKQWKYPIELHGIGKYGNDSYRIFCINEWKQVHPEDHKLNKYHDWLWENHEKLSLF	765165	754709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_756917_757853_757958_758454_758605_759195_759331_759407_759486_762008_762869_763289_763518_764989
914521	contig_15596_pilon	+	2242	14	Intergenic	novelGene_139525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	317.999665066252	4	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1923	318	2240	126064	157043	FALSE	25	GCCCAGCCAGTGTCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVPARGLLTALAVVFGMAVAFAPVPRITWEHRDVGLVRFHEPGVFNYSTLLLSEHKDTLYVGAREAVFALNALNIAEKQHEIYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLDTNTLYVCGTNAFQPTCDHLSLTAFKFLGKNEDGKGRCPFDPAQSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRHSSQSPLRTEYAIPWLNEPSFVFTDVIRRNPNDTEGEDDKVYFFFMEVSVEYEFMFKLMIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSNLVFNMLPRLIQKDVNYTQIVVDRVQALDETICDVMFISTDRGALHKAVSLENGVHVIEETQLFQDFSPVQTLLLSSKKGKRFVYAGSNSGMVQAPVAFCGKHSTCVDCVLARDPYCAWSPHTTACVTLHQEHGSGRGLIQDMSGDVSACPDKVQGSSQQHFFKHGGTAELKCSQKSNWARVVWKFQNGVLKADSPKYSLVGRKNLLIFNLSTGDSGVYQCLSEETVKNKTVSQELAKHVLEVKVVSSPPVAPTLLAVQTEGSRIATRVFAGATLGASPPKPAVRVTTPGAVMTPPSHLTPTSTPCQPKIVINTIPQIHSEKTMYLKSSDNRLLMFLFLFFFLLFLCLFSYNCYRGY	104262	157045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_+_104363_125846_126164_128203_128350_136550_136614_138346_138446_141831_141926_142805_142920_144894_145047_148473_148578_150151_150253_151133_151250_154928_155102_155198_155243_156426
914522	contig_2487_pilon	+	736	3	Intergenic	novelGene_148490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATGCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223879	225197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_223945_224422_224574_224677
914523	contig_11719_pilon	+	669	6	Intergenic	novelGene_154732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2577.87171131536	694	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTGGAGGGGATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12997	20037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_13034_13920_14190_14313_14504_16247_16326_19126_19183_19997
914524	contig_2596_pilon	-	4113	1	Intergenic	novelGene_53515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACCAACCAGGACTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039368	1035255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_1035300_1039400
914525	contig_14023_pilon	+	1887	1	Intergenic	novelGene_165358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGTATCTCTCATGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84340	86227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_84300_86200
914526	contig_615_pilon	-	4984	1	Intergenic	novelGene_80043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	303	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1733	2044	36687	36376	NA	70	TAATAAAAAAAAAAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKAKRYQVIIDWFKSRNIRVNSKVTTKEVNILTHENPEEKHKVSVETKPTKKEEMKQKSTNKRNSAQESKRNKINVSTTKKALQNAIPLLGIYTREIRAVI	38419	33435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_33400_38400
914527	contig_17106_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_127670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGGTTCCCCTTCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82191	79139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_-_79100_82200
914529	contig_13992_pilon	+	2695	4	Intergenic	novelGene_147610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	190.768620759984	463	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	372	704	33152	34857	FALSE	35	GGGAAAAGTGAGTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKKLEEQDRRALSIKEQLQHEHRFLKRRLEQLSVQSMERVRTDSTGSAISTDDSEQEVDIEGMEFGPGELDSVGSSSDADDHYSLQSGGSSDGSYESPCRRPGRPGLS	32099	36848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_+_32368_33048_33164_34085_34249_34699
914530	contig_5894_pilon	-	4780	3	Intergenic	novelGene_83031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGGTTAAAGAGTAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518833	357297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_360066_436850_437878_517848
914531	contig_5279_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_105573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACCCTTGGGGTCTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377747	376251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_376300_377700
914532	contig_10902_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_65677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	106	junction_1	295.140022113337	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	963	469	1431	189165	218576	FALSE	35	GTATGCAAACCTGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCY	160602	218578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
914534	contig_11498_pilon	-	4621	7	Intergenic	novelGene_65498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCGCTGAGCTCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148320	116326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_116399_139573_139858_141461_141525_142747_142959_143057_143261_143618_143679_144592
914535	scaffold_15027_pilon	+	5153	3	Intergenic	novelGene_163554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	647	979	48927	49259	TRUE	25	TCCTACTGTCATGGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRCGPRRLVEPPVELGVWARPAAAGLRALRSLECARMASRKRSQALLLLLPHDSLVPSIPLSR	48280	54620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_50839_51819_53824_54029
914536	contig_8576_pilon	+	4132	3	Intergenic	novelGene_88732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACCACTAGGGCCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623853	631231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_624166_624559_628254_631105
914537	contig_21315_pilon	-	2503	2	Intergenic	novelGene_151561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11493	8868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_-_10992_11113
914538	contig_12943_pilon	-	5914	1	Intergenic	novelGene_140349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5914	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12943_pilon_-_0_5900
914539	contig_7151_pilon	-	3385	3	Intergenic	novelGene_40725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3002	3322	442148	441828	FALSE	40	CACCTTATATGCATATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVRLINNLRYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLYLNIKKTKILTNGLINNIMINGENIEVAKDFLLLGSTVNDHGSSSQELKDASHWANLLQKTSLKR	521119	441764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_442295_442880_443961_519344
914541	contig_5201_pilon	-	2788	1	Intergenic	novelGene_82183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCACTCCTAGGTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303796	301008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_-_301000_303800
914542	contig_6677_pilon	+	3076	15	Intergenic	novelGene_114160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.772618130456569	2	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTACAACAATATGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391626	427446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_392196_393287_393417_395897_396142_397786_397998_398501_398683_399092_399236_401865_401997_402895_403019_407403_407629_408422_408587_409063_409245_409923_410013_410838_410961_418248_418373_427006
914543	contig_9646_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_117429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGGAAAAAAAAGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144262	146995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_144300_147000
914544	contig_1443_pilon	+	3710	2	Intergenic	novelGene_28147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1518	2193	3710	324365	325882	FALSE	25	GCAGATGTAACTATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTTPPFSTPPKADFSQHESLMEKCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFKELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWKLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDNLNHNIPISLDMLLCSGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASNAATKAWGKVPDSKTPTGSFATIRQTANEPYIDFINRLQTAISRQVDNQQAAEVLCLQLAYENANADCRAVLTPLKAQNPNLAEMIRACQNVSTETHKAQVLAAALRPSTATCFGYGKPGHFKKDCHSSKNKDANTKLPSRKCPRCGKGFHWANQCRSQFDNQRNPLSGNERRGESSRAPEKSREPLSIDSKQQRLQINDLKVATKESARLDLPLAEGAILDKAGKVFLIATQVWGPLPRGYVGLLLGLSEVTSQGLTIHPSVIDSKYKGQIKIMVSSLSYWNITLSDKIAQLLLLPFVVPFARTTPGRGEGSDHTDAFWVTKVQSSRPYLTVQVNDRIFKGLVDSG	144213	325882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_145441_323399
914545	contig_16110_pilon	+	6048	18	Intergenic	novelGene_126784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	316.794443958829	1522	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	2578	5073	53111	131269	FALSE	55	CTAAAAAAAAAATGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQENSLYYAIYNLTMHSIFREPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVESPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLCDISEGTVVPEDRCKSPTSAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISALHFCETFTRKADSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTILRLKGAILRMAFLDTTGCLVPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCVYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPLETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGELARARLALDERGQKLSDLEERTAAMLSSADSFSKHAHEMMLKYKDKKWYQF	50377	132244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_50490_50645_53331_54084_54158_55828_55977_56201_56270_56530_56572_57352_57574_58499_58679_68233_68360_70187_70340_75391_75458_100046_100098_105752_105993_109402_109773_110061_110228_118994_119107_128398_128620_131227
914546	contig_7839_pilon	-	2831	2	Intergenic	novelGene_45753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	535	903	1125091	1124723	TRUE	65	ACCAAAAAAAGAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLEIQVKLALKSGIPFIYQKFHFGLNCNSRDSLILLPSRKKIYSSKSFSNLGHSTLAPLHVRFLGFFFPRSFFSFLHSEMDNSPILNSVTTALLLFVSSSLKLVVQDLCLISAMILKGSKI	1125625	1100968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_1101282_1123107
914547	contig_6189_pilon	-	2004	6	Intergenic	novelGene_164962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	352	junction_3	287.89275781096	19	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	34	966	200369	190994	FALSE	65	ATAATATCAGGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEEKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDIEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKCMLKRWARKKEGVLTLGLFFIS	200402	189955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_191253_192144_192288_193662_193833_198484_198644_200065_200169_200270
914548	contig_8570_pilon	+	2466	24	Intergenic	novelGene_120144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	545.391997559453	29	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	27	1883	284365	379874	TRUE	30	GTGAGAGCTTATGATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWRKTDKERQGVAIYNFQGQGVPQLSLQIGDVVRIQETCGDWYRGHLIKHKMLEGIFPKSFIHIKEVTVEKRRNTENIIPAEIPLAQEVTTTLWEWGSIWKHLYVASKKERFLQVQSMMYDLMEWRSQLLSGTLPKDELKELKQKVTSKIDYGNKILELDLIVRDDDGNILDPDNTSVISLFHAHEEATEKITERIKEELSKDQPDYGMYSRISSSPTHSLYVFVRNFVCRIGEDAELFMSLYDPNKQMVISENYLVRWGSRGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIYLICQIVRVGKMDLKDTNIKKCTQGLRRPFGVAVMDITDVIKGKSESDEEKQHFIPFHPITAENDFLHSLLGKVTASKGDSGGQGLWVTMKMLVGDTVQIRKDYPHLVDRTTVVARKLGFPEIIMPGDVRNDIYITLLQGDFDKYNKTTQRNVEVILCVCTEDGRTMPNAICVGAGDKPMNEYRSVVYYQVKQPRWMETVKVAVPIEDMQRIHLRFMFRHRSSLESKDKGEKNFAMSYVKLMKEDGTTLHDGCHDLVVLKGDSKKMEDASAYLTLPSYRHHTEIKGSTLSRSSSSVGGLSVSSRDVFSISTLVCSTKLTWACWVY	284338	439554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_284408_306601_306686_321021_321063_322726_322783_323278_323376_325407_325557_332072_332209_343190_343346_347293_347376_361594_361731_364110_364187_365140_365218_365988_366115_367599_367725_373527_373627_377064_377138_377249_377354_379530_379708_379853_379952_382407_382498_383493_383595_384451_384587_425585_425695_439483
914549	contig_10003_pilon	-	3157	1	Intergenic	novelGene_88295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTTTAGCATTTCTCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907247	904090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_904100_907200
914550	contig_5649_pilon	-	2055	2	Intergenic	novelGene_82435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGACATACTAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1486862	1467699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1468140_1485247
914551	contig_16211_pilon	+	2529	7	Intergenic	novelGene_150097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAATTAAAAAATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199788	223717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_201603_204232_204404_205330_205454_211934_212037_221218_221291_222658_222772_223583
914552	contig_9727_pilon	-	3214	4	Intergenic	novelGene_86385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAGATGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634131	606550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_607155_607545_609874_610335_610508_634021
914553	contig_16643_pilon	-	3517	3	Intergenic	novelGene_158138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1015	1560	308986	308441	FALSE	10	TTGGCGCCTGCGCAGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIIADVRRILAKSRDYQKDVHLCFSDYAKTFDCVDHNKLWITLQRTGIPEHLIMLMRNLYIVHEAVVRTKQGDTAWFKVRKGVHKGCILSPYLFNLYAAQIIQEAGLYEEQGIRTGRLINNPCYADDTIFLAESEEDLKHLRMNIKDPQPLVWIIPQHKEDKNPHNWTNKQHHGKWRKD	430149	306483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_309225_428535_428620_429457
914554	contig_6045_pilon	+	4765	4	Intergenic	novelGene_178951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2129	2512	221493	221876	TRUE	45	TAGACTAACTTGAAACGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLITNFIWKGKNPRISKALLKKKNKVGGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWNNDRYIDQWNTIENPDVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWSWQNWISICKKMKQGPYLTPYTKINSKWIKT	117613	336574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6045_pilon_+_118844_220594_223254_258044_258184_335837
914555	contig_13021_pilon	-	4786	17	Intergenic	novelGene_8122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	122.842823864481	181	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2629	3111	173629	166343	FALSE	60	AAAAAAAAAATTGATATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSEAEWITIANNLLLKCHIHLRIHALEDCDANVFIALYQSILGERVPDLIVIPRSQEDDAHNVQAVIDSLALDYLQVSLSHITGENIVRGDKESIKNLLEIFDGLLEYLTEHSSETSHEKSKFKNQNLVWFTLCHVPFYRFPPTGSRIINTVHLIKCR	181149	164667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_166570_169579_169688_171694_171824_173610_173969_174538_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
914557	contig_16846_pilon	+	3419	7	Intergenic	novelGene_82868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_4	238.246137895711	193	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	11	883	179165	205481	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAMQNADSEQPFKRPRRDGSPRTPPSAHTAAAEKSPGHELHPDHKTWCPEQVCAFLRRSGISDPLLQTRFRENKITGSLLPFLDESLLENLGVSSLGERKKLLHHIQRLSETQVDTVKVINDPIHGHIELHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGSYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVRALHEKQPELQISERDMLCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWKHEEGSVKMFEHLVDSNGLRDVMQHYGLIPEEDICFIKEQITGPLESPTKSLVVSLCTT	179154	208017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_179373_194033_194101_196986_197060_200125_200287_201194_201311_203101_203173_205304
914558	contig_13494_pilon	-	3861	9	Intergenic	novelGene_167509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	312.221250678105	13	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	219	803	84021	29429	FALSE	45	ATTAGAAAAAGTAAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKLEFPSLPQCKDDAELPILQKHGITHIICIRQNIEANFIKPNFQQLFRYLVLDIADNPVENIIRFFPMTKEFIDGSLQTGGKVLVHGNAGISRSAAFVIAYIMETFGMKYRDAFAYVQERRFCINPNAGFVHQLQEYEAIYLAKLTIQMMSPLQIERSLSVHSGTTGSLKRTHEEEEEFGSMQVATAQNG	84239	26370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_29503_32996_33091_41549_41623_45170_45222_45317_45358_48686_48724_49145_49207_51817_51916_83964
914559	contig_13044_pilon	+	4016	2	Intergenic	novelGene_100002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	566	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAAAAATATCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220291	224433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_224062_224187
914560	contig_10637_pilon	+	2424	4	Intergenic	novelGene_178952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	356	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAATAAAAAAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13556	89248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10637_pilon_+_14635_37577_37808_87328_88097_88900
914561	contig_19352_pilon	+	3041	2	Intergenic	novelGene_122403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1063	1497	282907	283341	TRUE	50	TCAATGTAAATGGAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYGGNDKLKKNGITFILKRNISRSILKYNPVSDRIISIRLQGRPVNTTIIQIYTPTTKAKDEDIEDLYQLLQSEMDQTCNQDALIITGNWNAKVGNEEGSVVGKYSIGDRNDAGDHMIEFCKTNNLFIVNTFFQQHTWQLYM	281844	284960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_283924_283998
914562	contig_15047_pilon	+	2467	4	Intergenic	novelGene_52160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	67.7839705731869	72	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	27	869	2194	3736	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPRERAFLSETVTVTGSSL	2167	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_4687_21013
914563	contig_5549_pilon	+	1666	5	Intergenic	novelGene_81675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAGGGAATAAGATTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535243	551371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_535892_539397_539551_546164_546332_546787_547307_551192
914564	contig_2219_pilon	-	4349	2	Intergenic	novelGene_67170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	365	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCGGGACCATCCGGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94249	89477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_92152_92574
914565	scaffold_12510_pilon	+	2024	5	Intergenic	novelGene_151412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.60965203320114	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	466	780	625218	632145	TRUE	25	TATGCTTTCAAGTCACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRRWQKRICRPQPAVGQLSTVRGSQHSSAPPTPTSCASLRPGVTTSSSACALRSCASGSCAPRGAPLLPGTPSPPVHLSLEALLKPVRHQIATHKPLLTHG	624752	649323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_625453_632065_632202_633376_633447_633947_634084_648341
914566	contig_4496_pilon	-	3162	2	Intergenic	novelGene_66621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	203	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	975	1286	595106	594795	TRUE	30	ACTCAAACACTGTGTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLGLKESSVPVGTLSICIHKQSSVQDKPSNCSNLHQLTVSNILLFISLGSGQLSLTHSSYVTMDTSCRLGNSCIPPSTSDQPAPSFSLSSLAPMGEVNGHHP	596080	592655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_593055_593317
914567	contig_19342_pilon	+	3559	2	Intergenic	novelGene_41047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAGAACCAAATGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6	4051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3357_3842
914568	contig_17522_pilon	-	4084	1	Intergenic	novelGene_160812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAAATTTAGTCTCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91353	87269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_87300_91400
914569	contig_12919_pilon	-	1888	1	Intergenic	novelGene_75917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCCTGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814231	812343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_812300_814200
914570	contig_2703_pilon	+	5142	14	Intergenic	novelGene_101694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1157.73669222354	11	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	303	875	559489	596431	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHGKTRSPPRSF	526164	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_597819_599674_599822_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607646_607732_609320
914571	contig_753_pilon	-	2133	9	Intergenic	novelGene_112910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAATCGTCATCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319793	289806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_290084_298788_299379_300682_300851_301708_301765_302270_302366_304402_304552_317592_317705_318056_318094_319144
914572	contig_6191_pilon	-	3058	5	Intergenic	novelGene_107811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111844	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_1010_68397_68432_82331_82924_94534_94632_110518
914573	contig_10990_pilon	-	5421	18	Intergenic	novelGene_7485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1913	2380	751953	749304	TRUE	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGQILLVVRDLSLVFSVSGTVTDLSSERSGTTATAALLAGLSCRMPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWVLQEATSP	753865	714806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715652_715701_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731660_731910_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736266_738882_738952_743881_744391_744708_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751517_751914
914574	contig_2757_pilon	+	2801	2	Intergenic	novelGene_164609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	1736	2710	542360	543334	FALSE	35	CCAAAACCTTTGGGACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDCFKLRKIRVKFMVTTKKVTKHTHKNKEEKHKVSAKTKEMKKNPQTKETQHKRVRRTKKTSAPQKKHYKMTATNSHLSIITLNVNGLNAPKKRQRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKNVNLLKGKCWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRSPKYIKQTLTTLKRETDSSTVIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIDRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAIINKSQNAELIQSIFSDHSAIKVEINNRKSKEKKINYMETE	539646	543425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_541323_542300
914575	contig_12964_pilon	+	5199	4	Intergenic	novelGene_131670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAAGTAAAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192327	302308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_197018_199100_199320_233571_233805_302251
914576	contig_10003_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_88179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGGTGACTTCATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437548	435567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_435600_437500
914577	contig_12629_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_150642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTTAAACATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173	1278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_+_200_1300
914578	contig_8801_pilon	+	3581	2	Intergenic	novelGene_66278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAAACACATCCTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438440	442112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_439548_439638
914579	contig_17440_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_7567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGGTCGGGCTAGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2977	1430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1400_3000
914580	contig_11258_pilon	+	2372	7	Intergenic	novelGene_67786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	168.926677059079	6	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1263	1721	285721	292582	FALSE	35	GAAGAGATTTGTTCACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	279264	293233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_279351_283717_284123_284949_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
914581	contig_1699_pilon	+	3187	11	Intergenic	novelGene_72816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_7	141.802150900471	69	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	116	2206	70109	95707	FALSE	75	ATTGAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKHYEIAKKCVEDLALYLKPLSGGKGVASLNQSALSRPMQRKLVTLVNCQLVEEEGRVRAMRAARSLGERTVTELILQHQNPQQLSANLWAAVRARGCQFLGPAMQEEALKLVLLALEDGSALSRKVLVLFVVQRLEPRFPQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVTKRDEDSSLMQLKEEFRSYEALRREHDAQIVHIAMEAGLRISPEQWSSLLYGDLAHKSHMQSIIDKLQSPESFAKSVQELTIVLQRTGDPANLNRLRPHLELLANIDPNPDAVSPTWEQLENAMVAVKTVVHGLVDFIQNYSRKGHETPQPQPNSKYKTSMCRDLRQQGGCPRGTNCTFAHSQEELEKYRLRNKKINATVRTFPLLNKVGVNNTVTTTAGNVISVIGSTETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDVRKILIT	67087	96688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_67165_70070_70305_76616_76793_80231_80433_80889_81023_81138_81258_82789_82903_89240_89550_93132_93348_94520_94955_95512
914582	contig_4884_pilon	+	2478	2	Intergenic	novelGene_63785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	240	junction_1	0	98	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTAACATGACTGGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166448	171846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_166515_169434
914583	contig_4088_pilon	+	5071	5	Intergenic	novelGene_178065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	2025	2549	111832	112356	TRUE	35	AAACACTGTGGTACTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	109487	396210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4088_pilon_+_109947_110266_112402_342992_343399_354574_355195_394759
914584	contig_8019_pilon	+	3511	2	Intergenic	novelGene_126988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1301	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGTGCGCCTAGCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144363	148034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_+_144815_144974
914587	contig_9363_pilon	-	2863	18	Intergenic	novelGene_6557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	702.305550672348	2	117	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	1119	1859	757196	754431	TRUE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	765900	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754308_754348_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758722_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791
914588	contig_19402_pilon	-	3199	1	Intergenic	novelGene_80837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTAAAGTACAATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143314	140115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_140100_143300
914589	contig_14481_pilon	-	2812	6	Intergenic	novelGene_153848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGGCAGCTCCGCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124392	108113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_-_108257_108927_109035_113715_113931_121338_121637_121720_121883_122505
914590	contig_7657_pilon	+	5858	7	Intergenic	novelGene_30016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGAGCGATCGGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141329	204362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_144624_148742_150663_154454_154593_159602_159708_167268_167410_174120_174179_204160
914592	contig_14481_pilon	+	4918	1	Intergenic	novelGene_153857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	953	2862	33	2894	206021	208882	NA	35	AAGCTTGTGTAAAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGKVTSEKEMALISQMNNMLQTVNNEKSVSFLPTPSEFVTASVNLTTKVETRDNVDLRGNHITQSHPQVLGTTIKSPDKVNYTVKPNAYNSGDMHNYCINYVNSELPVESSNQGSLPFHNYSKMNNSNKHRRFSGTAVYENPQRESSSNKMMVQQPISESVLSLVKKESSNPDSLLASISLLNPKYGTIKTQAEIEEPCDLGRGHNIDGHNLYTNENQNLESVTEKPKWDSFSSVDSPMMPRITSVFSLQSQQASEFLPPEVNQLLQDVLNTKSDVKQDSHNTPSKGLPLHADQSFRKHEGEGKRVESSRDLKMQGIFPIPSGSVGVSELTNDLNLKCNGKQVLSMSQNVRDSEKTPRISGIGTLLKTQSDAIITQQLVKDKLRATTQNLNSLCIQSPLLNSEQKKAIFVQTPKGLFVPLHIANKPGLHVSGRPLSLVNTQSVPASLLLNKKPGMILTFNNGKLEDVSSVKIENAQSCGGVTTKEPCRTPFLKVEPSNNCLTPTLCSSVGSCLSMKNSSENTLSLKGPYVIKTSANSSVKTVPTPVLSEHQGTKLNILDSVKQPNEVFPKPPLYTLLPDGKQAVFLKCVMPNKTDLLKPKVVQNSTYHQNIQPKKPEGTPQKILLKVFNPVLNVTAASNLPVSHSASLLQKAEVPSNQPVEGQQKEPESSRDALPVLLDDLMPANEIVITSTAACPESPEEPVCITNCSDARVLRSKTDCTNERSFNRKKASKRKFSRIKAHVGSKDFETAFATRDRNCKRKCRNSYQEPPRKKATLHRKCKEKANPENSHETFEPRFSKDTVRTLRLFPFSSKQLVKCPRRNQPVVVLNHPDADVPEVVNVMKTIAKFNGRVLKVSLSKRTVNALLKPVCWNPSKTTYDEFSKRHKTFKPVSSVKERFVLKLTLKKTSKNNYQIVKTTSESVLKAKFNCWFCGRVFDNQDAWAGHGQRHLVEATRDWNMLQ	205988	210906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_206000_210900
914593	contig_11839_pilon	-	1866	1	Intergenic	novelGene_155350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAAGCCGGGGCCGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16361	14495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11839_pilon_-_14500_16400
914594	contig_614_pilon	-	3969	1	Intergenic	novelGene_132640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1990	2352	925722	925360	NA	80	AGAAAAGAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGISTEIFQQTDVELEVLTHLCQEMWKTATWPTDWKGFIFMPVLKKSDPTECRNYRTVSLISQTSKILLKIIQKRLQQYIDRNSSQIQKRMWNQGYHS	927711	923742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_923700_927700
914596	contig_7629_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_153588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGACCCTAATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348845	351379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_348800_351400
914597	contig_12019_pilon	+	5872	23	Intergenic	novelGene_87711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_16	67.3378830664268	253	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2304	181	2484	275625	395056	TRUE	30	TAAAACCAGCCATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHTKVNEQNALEIKEFKKYGPFDRYINAKNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEKGSALHEAALFGKTDVVQILLAAGIDVNIKDNRGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKPPTPQLPLISNMDSISQRSQGNVEKAVTELIIDFDTTAEEEGPYEALYNAVSCYSLDSVASGRSSDRDSVNKEAEAAGVKAAGVRTRERPPPPAKPPPDEEEEDRADKKYLPLTASEVLAMRPRSQGSAAREEDEHPYELLLTAETKKLASVDGRPKDHRQSSSSRSQDSAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLLSATGQGNPEESPQQGACHEASMQLEEMGVHTPGASQPSALDHSRRVGYPPGLPTTNSQSHPGTLTHTTSPHPGGAEEEGDRSGARSRAPPTSKPRAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQEQQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNGFDDVRFLGPNVMEEQDLREIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSMPSWLDSLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVHLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQKPPRFSQLRCQDLLSQTSSPLSQNDSCTGRSADLLLPPVDTGRRRHDSLHDPGAHSRAERLRIQEEHHEAKLTLRPPQPGCPLRPCAELATSARETHLRVLWL	265243	403992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_265268_267170_267234_275531_275829_276591_276668_276959_277062_277169_277272_278884_279082_282552_282646_288576_288698_317399_317990_358508_358576_363961_364069_390144_390244_391583_391737_391898_392007_393339_393505_394936_395064_395391_395464_395635_395723_396410_396549_398336_398508_399527_399626_401177
914598	contig_2487_pilon	+	4000	9	Intergenic	novelGene_148446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATCTCTTTCGGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96214	224580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_97084_98484_100449_101381_101495_104103_104319_105009_105199_128409_128484_133372_133629_221755_221898_224402
914599	contig_1544_pilon	-	2744	7	Intergenic	novelGene_167933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	13.8051922599192	64	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	103	606	426889	56828	TRUE	50	AAACATATTCACGGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNIYQSESEGLEFSKDLRRQLGHLESELSLLSTLMGINIRKHSKKTEDLSSTEMTEKNIKKVLQRHRLSGSCHMVTFQLEFQILEIQNEKNLSSVITDLNIIMEPTEYSELSEFVSRAEERRDLFMFFRSLHFFVEWCEYRKRTFKHFKEKYPDVVQLPEGAASSCMGIQSASQPGPGAGQEESYRKCSSQLPHPPGSAWN	426991	53658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_55251_56281_56907_58080_58161_321855_321953_396186_396276_407426_407516_426819
914600	contig_1472_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_86125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAGACACCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400804	398253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_398300_400800
914601	contig_7563_pilon	-	4277	23	Intergenic	novelGene_145549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	46.0844535554468	194	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1287	3864	140	4003	100225	21990	FALSE	25	TCTTGTAAATTTTGACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKDQKKHRKKNSGPKAEKKKKRHLQDLQLGDEEDARKRNPRAFAVQSAVRMARSFHRTQDLKTKKHHIPVVDRTPLEPPPIVVVVMGPPKVGKSTLIQCLIRNFTRQKLTDIRGPVTIVSGKKRRLTIIECGCDINMMIDLAKVADLVLMLVDASFGFEMETFEFLNICQVHGFPKIMGVLTHLDSFKYNKQLKKTKKRLKHRFWTEVYPGAKLFYLSGIVHGEYQNQEIHNLGRFITVMKFRPLTWQTSHPYILADRMEDLTNPEDIRTNIKCDRKVSLYGYLRGAHLKNKSQIHIPGVGDFAVSDVSFLPDPCALPEQQKKRCLNEKEKLVYAPFSGVGGVLYDKDAVYVDLGGSHVFQESDEVKPTHELVQNLISTHSTIDAKMASSRVALFSNSKPLGLEDIDNQGLQMPKEEKQVDLLTGRVRRKAIFGDKEDESGDSDDEDDAQMSEGDSLENGSSVDETEEEEDNEMIDKEHMTVEGIRRQKLEEMEEDIEVDLPVFADSDDDLERSSGDEEEAEKASGSSEEEEDSTAEAESDILDSKAVGEGGKSRLSGVNGLSDRLNQEISLTMKKAIVTISDSGHCIAEEAFASEDESEESSSLSSEEEDTENEEVRKKLPKPSQEGGGRKLGPENIIGETSDVEDLFKEEEDYKEENNYSTETSGTLKWKEDLSRKAAEAFLRQQQATPNLRKLIYGTVTEDNEEDGGDPREEIGGLFHISQPDRECKHKADSLDCSKFLVEAPHDWDLEEVMNSIRDCFVTGKWEEDKDAAKILAEDEELYGDFEDLETGDVHMENSGPDIQIEDVEEVKEENEPKPEESAKKKRMDKKRKLKEMFDAEYDGGESSYFDELKEEMHKQALLNRGEFEDQDDETRVQYEGFRPGMYVRIEIENVPCEFVLNFDPHHPIILGGLGNSEGNVGYVQMRLKKHRWYKKILKSRDPIIFSVGWRRFQTIPLYYIEDHNGRQRLLKYTPQHMHCGAAFWGPITPQGTGFLAVQSVSGIMPDFRIAATGVVLDLDKSIKIVKKLKLTGFPYKIFKNTSFIKGMFNSALEVAKFEGAVIRTVSGIRGQIKKALRAPEGAFRATFEDKLLMSDIVFMRTWYPVSIPAFYNPVTSLLKPVGEKDTWSGMRTTSQLRLAHSIRLKPNKDSLYKPIVRQKKHFNSLHIPKALQKALPFKNKPKTQAKAGKVPKDRQRPVVIREPHERKVLALLDALSTVHSHKMKKAKEQRHLQNIEHFKVKQKEEEEKLTQRKELRKKLFRIQGQKERRNNKSSLKGHQDQLK	103495	21715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_-_22221_22987_23150_30908_31085_31420_31569_32518_32642_52647_52707_52893_53075_53159_53349_55432_55607_56395_56470_73916_73999_76095_76254_83613_83716_83916_84687_86754_86895_90394_90589_90874_90997_91662_91806_92463_92653_95399_95480_98736_98928_100049_100260_103390
914602	contig_15518_pilon	+	961	3	Intergenic	novelGene_127608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	508	junction_1	93.5	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	443	916	15096	16176	FALSE	15	ACTCATGCTTGTTGTCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGEASIPLHLALF	11188	16221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808
914603	contig_6227_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_49654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432870	435418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_432900_435400
914604	contig_3601_pilon	-	2372	2	Intergenic	novelGene_132845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATACTTGTACACCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300695	125594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_126377_299105
914605	contig_10377_pilon	+	1423	8	Intergenic	novelGene_115374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	752.095521506004	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	475	840	219517	227755	TRUE	55	AACTTTGGGGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDR	208809	257055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227769_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868
914606	contig_16322_pilon	-	5712	2	Intergenic	novelGene_87516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	166	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	4947	5435	33723	33235	FALSE	25	AGCCCCACCTATCAGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFVKICFLSGYVSTYIISLSGSDRDYISSEARNIYCLVTYSLSALDLAPAHLSSPLYPSSPANLTFSLNVTSSFQAFTIPSASEVFWLLLPRTPLYFGDFSLSFRSPFKWHYFSDQLVLEACVVCASHSTFSPSSFNLSSWHDCNFVVNLCSSVSATRM	38740	32957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_38352_38422
914607	contig_16846_pilon	-	2286	1	Intergenic	novelGene_82926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487492	485206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_485200_487500
914608	contig_19362_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_157807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2312	2611	90777	90478	NA	50	TAAGCAGTAGTAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSVQAESLLPDLSRYGNSFLSVRTAICLLHCGPGAAEELPARRRRSGVAGFFRAVSLFPCHSVRFLNFALFRTPTYSHIIKSLVFPGLCCKRDIGHV	93088	90193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_-_90200_93100
914609	contig_8167_pilon	+	2721	1	Intergenic	novelGene_155647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1486	1884	68880	69278	NA	25	TTTCCAGATTATTCGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQTILIVKWFIKEVTVQLGIRINRLQSRIWIRKQVDKVLKDPLKWRVHPSLFHCRTAISAPLWARKQALLSAADTTSQPCKPPLSPIRTGFFLLPQDRLLQYGLHLNMKKTILTAGPINNIMINRKD	67394	70115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_67400_70100
914610	contig_4604_pilon	+	2457	14	Intergenic	novelGene_19151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1123.28620810791	14	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	46	1629	363883	379891	FALSE	20	TGAATCTTGTTTTTTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKEAEDGIIAYDDCGVKLTIAFQAKDVEGSTSPQIGDKVEFSISDKQRPGQQIAACVRLLGRNSNSKRLLGYVATLKDNFGFIETANHDKEIFFHYSEFSGDVDSLELGDMVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSTKHIINPL	361509	380719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367453_372056_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378475_379863
914611	contig_4232_pilon	-	1067	2	Intergenic	novelGene_63337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468141	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467778_467895
914612	contig_14868_pilon	-	2508	10	Intergenic	novelGene_150438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	31	junction_1	117.033497367945	35	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	367	1944	154533	109646	FALSE	20	TGTATATTTCAGATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVRGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSELELSKSACTKSIDSKVADAATEVQHKATEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEQSALKSDGKPEEKNHETGMSGCSIDSKQVEEQPAAANEEVLFPLCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDIPSPHTTGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHKPKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMIWERTEVDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKAQATEKHQDQAVTSSAHHRGGHGVPHGKLLKQKSEEPSVSIPFLQTALLRSSGSLGHRSSQEMDKMLKNQATSATSEKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEARKMIDKVNN	185393	109081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_109952_110137_110302_115027_115505_123470_123606_124638_124802_124892_124949_130555_130638_139495_139586_154428_154575_185068
914613	contig_3081_pilon	+	3095	2	Intergenic	novelGene_133925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1025	1408	181955	182338	TRUE	15	CAGATCTTTGCTGTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENIPCALEKNVYFAAVEYRVLYLPVRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVSKSPTIIVELSIPLFNAVRVCFMYFGACHWVRRCLLWYIFMMDCHLNQCIVSFFVFYGRFCFKVCFI	180930	184116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_183573_183663
914614	contig_11752_pilon	+	2727	7	Intergenic	novelGene_37629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1377	junction_6	1216.45433078636	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	87	1175	84194	96579	FALSE	45	AGCACCCAACAATAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGT	84107	98131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442
914615	contig_5602_pilon	-	4449	23	Intergenic	novelGene_133025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	201.245809976401	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	42	1619	559969	551513	TRUE	45	AATGTCAAGTAATATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGQHDEHDEDGSDMELDLLAAAETESDSESNHSNQDNASGRRSVVTAATAGSEAGASSVPAFFSEDDSQSNDSSDSDSSSSQSDDIEQETFMLDEPLERTTNSSHANGAAQAPRSMQWAVRNTQHQRAASTAPSSTSTPAASSAGLIYIDPSNLRRSGTISTSAAAAAAALEASNASSYLTSASSLARAYSIVIRQISDLMGLIPKYNHLVYSQIPAAVKLTYQDAVNLQNYVEEKLIPTWNWMVSIMDSTEAQLRYGSALASAGDPGHPNHPLHASQNSARRERMTAREEASLRTLEGRRRATLLSARQGMMSARGDFLNYALSLMRSHNDEHSDVLPVLDVCSLKHVAYVFQALIYWIKAMNQQTTLDTPQLERKRTRELLELGIDNEDSEHENDDDTNQSATLNDKDEDSLPAETGQNHPFFRRSDSMTFLGCIPPNPFEVPVAEAIPLADQPHLLQVLPTKMSYAANLKNVMNMQNRQKKEGEEQNVLPEEAESSKPGPSAHDLAAQLKSSLLAEIGLTESEGPPLTSFRYLLM	561126	528616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_529784_532440_532527_533905_534051_535767_535882_536791_536948_538520_538606_538832_539009_541141_541203_544245_544377_545526_545672_546195_546308_548651_548896_551216_551316_551403_551518_553154_553387_554548_554722_555888_555963_556444_556676_557873_558086_558257_558527_559107_559366_559845_559978_561093
914617	contig_2168_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_147260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAACTACTTGTGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77915	79876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2168_pilon_+_77900_79900
914618	contig_6497_pilon	+	3553	5	Intergenic	novelGene_35620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTCCCTATCCAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662060	668781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_664674_665764_665951_667477_667584_667899_668109_668342
914619	contig_9752_pilon	-	2865	1	Intergenic	novelGene_122024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTCAGGATGTCAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137093	134228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_134200_137100
914620	contig_6217_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_109692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	131	439	942040	941732	NA	65	AGAAAGAAAAATAAGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSASTSLSPEELEGARLPTPRALSGITIEGSGQAGEKCRTKFKSTKNTRLTGLTETGGVSETMAPRHPSNSELKPLPKFIFQSNIRQVYKTNNNTHEECAS	942170	940499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_940500_942200
914621	contig_12120_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_21426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2090	2467	88931	89308	NA	65	CTCAGAAAAAAGAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRWQTISKHLQKQDRMLPVGDQNKIPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQQQKQKADKNKEKIDKFMENADKNWKIQENTEGKKYQNKFKTSNYTKTTIRNPKDKQDFRNRRYQRRAEKQI	86841	89374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_86800_89400
914622	contig_7909_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_155878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATTACAACCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65018	67028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_+_65000_67000
914623	contig_4659_pilon	+	3621	1	Intergenic	novelGene_118223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	773010	773354	NA	80	GACCAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVISSQTCLFVWAPLPRCMSWLLSDGSGCLLDGFDMNVAHVGGSLVKKPESFKKKKKKFMPVNISVDPNIVTALSAVGVGKSLSWNVHCLVVVFRVHNPEKVPLTYLRGRTVGS	773007	776628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_773000_776600
914624	contig_12951_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_68147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCCTAAACCAGTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192291	194857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_192300_194900
914625	scaffold_12124_pilon	+	2333	9	Intergenic	novelGene_22003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	137.725043111266	34	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	210	1070	800112	810748	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGACAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKR	791850	812011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647
914626	contig_5389_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_142997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71387	72094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_71400_72100
914627	contig_4531_pilon	+	6350	32	Intergenic	novelGene_47848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	290	junction_25	201.316230756164	974	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1644	4935	348	5282	145308	188820	FALSE	40	AAACCAAACACGTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSNPIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFSKVKQLSLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM	123827	189888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_124124_145256_145465_148686_148956_149519_149682_152888_153003_153420_153595_156404_156603_157336_157538_159683_159837_160317_160441_160733_160872_161120_161286_161407_161589_163103_163268_170545_170672_171257_171401_173517_173753_175671_175795_176806_176953_177159_177344_177523_177717_178063_178222_178428_178594_178903_179012_179091_179260_179392_179543_179789_179922_180347_180459_181219_181391_181727_181950_186848_186925_188695
914628	contig_19744_pilon	+	1547	2	Intergenic	novelGene_120384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1377	169	1545	176608	177984	FALSE	80	GGAAAAAAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAK	156175	177986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_156243_176506
914629	contig_14077_pilon	+	3075	1	Intergenic	novelGene_174862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30984	34059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_+_31000_34100
914630	contig_9858_pilon	-	3954	1	Intergenic	novelGene_140536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1121	1498	258078	257701	NA	50	TCAGTCACAATAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMIFLKSQLCTGSNVFLCVFLSLCLQESQFAVVGDAFRECFVSKPHPKPKSYGSFEKRAKIYCARQDCSHDWGIYVKYKTFEIPVIKIESFVVEDVATGTQTLYARWKDFHFEKIPFDAAEMAK	259198	255244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_255200_259200
914631	contig_16907_pilon	+	996	1	Intergenic	novelGene_87433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	318	662	385306	385650	NA	20	GTTTTCTCCTTGAGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTNKLDNLCEMEKFLETYKLPKLTQEEIENLNRPITSKETESVIKNLPTEKKKPWRRWIHWGSQPNIYKNDILLKLFQKIEEETLPNLFYEVRITVIPRPDEDTTRKLHTKIP	384988	385984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_385000_386000
914632	contig_12677_pilon	+	1113	1	Intergenic	novelGene_110700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATTCTTGAGAGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1100
914633	contig_12157_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_135877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGCTTAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17451	20217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_17500_20200
914634	contig_7080_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_100109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAGAGCCAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494026	496063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_494000_496100
914635	contig_11986_pilon	-	3244	1	Intergenic	novelGene_69121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1521	1838	118929	118612	NA	35	CAGAGACTTACTCTAACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKIGRRYSRPLSQVPRTRSQMMLSWRWDPEASKQAVPESLNIYWMQATPPGKLPLELIDSLHQITSWRITTSLRNCQITSLHNCQTTENHGPAQLTHDLNQYR	120449	117205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_117200_120400
914636	contig_7261_pilon	-	1337	1	Intergenic	novelGene_178619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	212	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	279	840	427	1266	215674	214835	NA	50	ATACAACAGGGAATCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	216100	214763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7261_pilon_-_214800_216100
914637	contig_10143_pilon	-	5161	3	Intergenic	novelGene_163332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_1	1042	187	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1224	3675	155	3829	125005	85250	FALSE	15	TTCAAAGCCTGGCTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKPPPPPPLPPPPPPPEAPQTPSPLAAAAAAAAPGGLSKRRDRRILSGSCPDPKCQARLFFPASGSVSIECTECGQRHEQQQLLGVEEVTDPDVVLHNLLRNALLGVTGAPKKNTELVKVMGLSNYHCKLLSPILARYGMDKQTGRAKLLRDMNQGELFDCALLGDRAFLIEPEHVNTVGYGKDRSGSLLYLHDTLEDIKRANKSQECLIPVHVDGDGHCLVHAVSRALVGRELFWHALRENLKQHFQQHLAQYQALFHDFIDAAEWEDIINECDPLFVPPEGVPLGLRNIHIFGLANVLHRPIILLDSLSGMRSSGDYSATFLPGLIPAEKCTGRDGHLNKPICIAWSSSGRNHYIPLVGIKGAALPKLPMNLLPKAWGVPQDLIKKYIKLEDDGGCVIGGDRSLQDKYLLRLVAAMEEVFMDKHGIHPSLVADVHQYFYRRTGVIGVQPEEVTAAAKKAVMDNRLHKCLLCGALSELHVPPDWLAPGGKLYNLAKSTHGQLRPDKNYSFPLNNLVCSYDSVKDVLVPDYGLSNLTACNWCHGTSVRRVRGDGSIVYLDGDRTNSRSTGGKCGCGFKHFWDGKEYDNLPEAFPITLEWGGRVVRETVYWFQYESDSSLNSNVYDVAMKLVTKHFPGEFGSEILVQKVVHTILHQTAKKNPDDYTPVNIDGAHAQRVGDVQGQESESQLPTKIILTGQKTKTLHKEELNMSKTERTIQQNITEQASVMQKRKTEKLKQEQKGQPRAVSPSAIRDGPSSAPATPTKAPYSPTTSKEKKIRITTNDGRQSMVTLKSSTTYFELQESIAREFNIPPYLQCIRYGFPPKELMPPQAGMEKEPVPLQHGDRITIEILKSKVEGGQSAAAHSAHTVRQEEIAVTSKLSSKEFKEQADKEMYSLCLLATLMGEDVWSYAKGLPHMFQQGGVFYNIMKKTMGMADGKHCTFPHLPGKTFVYNASEDRLELCVDAAGHFPIGPDVEDLVKEAVSQVRAEATTRSRESSPSHGLLKLGSGGVVKKKSEQLHNVAAFQGKGHSLGTASSNLHIDPRARETPVVRKHSTGMDFSISSTKTEPSVFTAAPSNSELIRMAPGVVTMRDSRQLDPDLVEAQRKKLQEMVSSIQASMDKHLRDQSTEKSPSDLSQRKVEVVSSAAESGTVQTGLPESLSLTGGTENLNTETTESSAADALGAAFATRSKAQKGNSVEEPEEMDSQDAEMTNTTEPMDHS	125159	83917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_86122_113579_113667_122289
914638	contig_12630_pilon	-	2090	6	Intergenic	novelGene_173079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	390	junction_1	30.1024915912288	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	52	942	100972	76619	FALSE	35	CGAATCATTTTTTTAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRKCKPMKTETIQVSAEDEMQPYASYTEKNNQLYDTVNRVMTSQGLQTEVAGMDLHTLYVVGI	101023	75470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81810_81934_82253_100938
914639	contig_5280_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_52650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAACAAAAGAAGAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266337	267975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_267466_267533
914640	contig_6048_pilon	-	1102	2	Intergenic	novelGene_73179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1294040	1291335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1292007_1293609
914641	contig_11248_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_142548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260345	258903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_258900_260300
914642	contig_7119_pilon	+	2335	4	Intergenic	novelGene_40882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	257	1186	137044	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127412	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_139194_139358
914643	contig_11088_pilon	+	5531	3	Intergenic	novelGene_85023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	25	239	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	231	554	10016	10339	TRUE	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIISPVVLRIRRHDIRKALGIVPATLYSYFSASYYFSLHPHIHGCYIRSSSQICQSPSRYQSTAIVQAIITLCLDYSSSPQTHLLISPLAFFHIQFILYSVVSDV	9785	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_16250_16348_17119
914644	contig_13481_pilon	-	2565	3	Intergenic	novelGene_119327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAGTTACCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347687	313374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_313981_334954_335192_345965
914645	contig_10324_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_7805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCATCTGACCCGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139663	140336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_139700_140300
914646	contig_4486_pilon	-	2681	3	Intergenic	novelGene_38621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACTGAAACCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731419	416832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_417135_602206_604295_731128
914647	contig_7356_pilon	+	5293	10	Intergenic	novelGene_60413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	347	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472744	488203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_476290_479029_479145_479854_479948_480030_480083_482348_482528_483360_483436_483606_483721_484518_484608_485069_485173_487275
914648	contig_7568_pilon	+	2320	11	Intergenic	novelGene_173997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCAATTCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16679	113096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_16790_18066_18255_18619_18905_20825_20909_28445_28592_50582_50720_64618_64681_93727_93897_103969_104061_104597_104647_112096
914649	contig_14023_pilon	+	4872	19	Intergenic	novelGene_165374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_3	48.1504842738105	132	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1023	3072	270	3341	224290	299986	FALSE	10	AGCGTGTGACTTTCTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSACGKRACTENNECCHAECLGSCSAPDNATACVACRHYYYAGVCVPTCPPNTYKFEGWRCVDRDFCANIPNAESNDSEGFVIHDGECMQECPSGFIRNGSQSMYCIPCEGPCPKVCEEEKKTKTIDSVTSAQMLQGCTIFKGNLLINIRRGNNIASELENFMGLIEVVTGYVKIRHSHALVSLSFLKNLRQILGEEQLEGNYSFYVLDNQNLQQLWDWDHRNLTIKAGKMYFAFNPKLCVSEIYRMEEVTGTKGRQSKGDINTRNNGERASCESDVLHFTSTTTWKNRIIITWHRYRPPDYRDLISFTVYYKEAPFKNVTEYDGQDACGSNSWNMVDVDLPTNKDIEPGILLHGLKPWTQYAVYVKAVTLTMVENDHIRGAKSEILYIRTNASVPSIPLDVLSASNSSSQLIVKWNPPSLPNGNLSYYIVRWQRQPQDSYLYRHNYCSKDKIPIRKYADGTIDVEEVTENPKTEVCGGEKGPCCACPKTEAEKQAEKEEAEYRKVFENFLHNSIFVPRPERKRRDVTQVANTTTSSRSRNTTMADTYNVTDPEELETEFPFFESRVDNKERTVISNLRPFTLYRIDIHSCNHEAEKLGCSASNFVFARTMPAEGADDIPGPVTWESRPENSIFLKWPEPENPNGLILMYEIKYGSQVEDQRECVSRQEYRKYGGAKLNRLNPGNYTARIQATSLSGNGSWTEPVFFYVPTKVRPYENFIHLIISVPVAALLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEWEVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEIENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTHSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKDEMEPGFREVSFYYSEENKPPRTGGAGPGAGEYGECPPGPLCLLVLPAAARQTLRTQG	224020	301517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_224334_232653_232803_235971_236117_248128_248344_250658_250786_252314_252554_257066_257235_257414_257620_261871_262156_263140_263278_263983_264144_271001_271108_271590_271662_277609_277840_278172_278284_282120_282281_285038_285169_290650_290786_299730
914650	contig_8303_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_154906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTAGGACAGAGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20904	19129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_19100_20900
914651	contig_7870_pilon	-	1527	1	Intergenic	novelGene_108974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTATAACAGCTTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383402	381875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_381900_383400
914652	contig_16126_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_141884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACTACCAGAGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74519	76328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_74500_76300
914653	contig_6710_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_97306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
914654	contig_4686_pilon	-	2278	13	Intergenic	novelGene_118527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	242.825769156955	22	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1797	481	2277	487240	460693	FALSE	25	TAACCTGGCCAAGTGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLEQKLYDGVSATSTWLDDVEERLFVATALLPEETETCLFSQETLAKDIKEMSEEMDKNKNLFSQAFPEKGDNRDVIEDTLGCLLGRLSLLDSVVNQRCHQMKERLQQILNFQNDLKVLFTSLADNKYIILQKLANVFERSVAEQIEAIQEAEDGLKELDAGIIELKKRGDKLQIEQPSMQELSKLQDMYDELMVTIGSRRSGLNQNLVFKSQYERALQDLADLLETGQEKMAGDQKIIVSSKEEVHQLLGKHKEYFQGLESHMILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLKSSVLSTGNQLLRLKKVDTAALRTELSHIDSQWTELLTHIPVVQEKLHQLQMDRLPSRHAITEVMSWISLMESVIQKDEENIKNAIGYKAINEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNIQSLKTWFEIQEKRLKQQHQIGDQASVQSTMKDCQ	487910	460691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_460849_461778_461956_462939_463090_464381_464529_466076_466173_466705_466838_470300_470475_473494_473696_475795_475916_480572_480675_486303_486514_487108_487265_487454
914655	contig_567_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_33967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTAAATTTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332989	334910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_333000_334900
914656	contig_14566_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_148830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	61	309	14310	14062	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLQIPFFTDIKGTYTCRPHQMEYTGIKSTTSVERQWRSSTSSVRTMLGDDCGTDHQFLVCKFKWKLKKIRISPQEPKYDLEYIPSEFRNHHKNRFDTLNTND	14370	12102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_12100_14400
914658	contig_817_pilon	+	4697	2	Intergenic	novelGene_132445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3491	3817	551593	551919	FALSE	35	ACCAATCCCAGCTAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSYLCASMWWLVYVLVVNCHDLVRKGMFSTRSLVLRFGSLGCPMGCLPHGVKLLNLRLAGRIKWLGALTSTLLLPLTCKVFNLEKGHYLNVGSAVFRLFKYYAEMSL	545220	552799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_546810_549691
914659	contig_14157_pilon	-	4261	5	Intergenic	novelGene_171783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_2	68.1322243875833	174	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	456	3805	4260	303521	300351	FALSE	15	GTGAGTACTCGACCTGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAIIERTANFVCKQGAQFEIMLKAKQARNSQFDFLRFDHYLNPYYKFIQKAMKEGRYTVLAENKNEEKKKPGVSSDNEDDDDEDGNYLHPSLFASKQCSRLEELMKPLKVVDPDHPLAALVRKAQADSATPTPQAAEGTAAQPPQVEYTTD	316534	300349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14157_pilon_-_300486_301849_301960_303310_303537_309332_309419_312831
914660	contig_15952_pilon	-	2221	1	Intergenic	novelGene_154084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGCAAGAGAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554513	552292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_552300_554500
914661	contig_15304_pilon	-	932	3	Intergenic	novelGene_30563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	126	770	54100	53061	FALSE	25	TCCGTGCTCCACCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPELPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54225	52898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53314_53529_53813_53991
914662	contig_12938_pilon	+	4469	5	Intergenic	novelGene_99700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1022	junction_1	500.410581422895	22	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2441	2833	80440	80832	TRUE	30	CTCAACCGCAATATTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNMYCVHGALIAQWIGKNNVRRQLICPLEAWSLVVGKEYIFLMKQEKAYKGLSRQEQKPPAHVWTSLVVSRVKWEWEENLNLCCEHVSALPQFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	51945	86316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_81459_83391_83470_84550_84635_85468
914663	contig_12677_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_110840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGAATAGAGATTAAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3500
914664	contig_17743_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_176426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75021	74342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_-_74300_75000
914665	contig_2332_pilon	+	573	6	Intergenic	novelGene_58681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	5697	junction_3	627.65710383935	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	139	480	332129	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	331430	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
914666	contig_821_pilon	+	3878	1	Intergenic	novelGene_149389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	329	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGACTTCACCAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128946	132824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_128900_132800
914667	contig_610_pilon	-	2160	7	Intergenic	novelGene_76804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	873	1415	309376	306252	TRUE	85	AACAAAAACAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGADVRNFLMCFHSLLLFSELFSSVSLPTPSKESKYKDNEQDGHQQEVQDKLGGVCFTSGTFKERMAGAQEREEGQLGKMTRMLEQLPPSSQPGNFRVASSFCIKSVPMGTRGRKRLATRGSWREGRAAPSQRFQEEMGFEKFLLMGFLAMQMKVIFFSPSVQEMGRMEPSWDSLAVFQL	324196	304223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_304861_306143_306731_309312_309419_313377_313440_321675_321769_323056_323187_323651
914668	contig_10904_pilon	-	1346	8	Intergenic	novelGene_22722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	372.54968166155	35	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	14	1129	662714	650974	FALSE	10	TTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGTLPKPFIWADPGTIITMGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLKEKREGKQAES	662727	650756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651008_651379_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662408_662445_662665
914669	contig_12961_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_178882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGGAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177158	177757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12961_pilon_+_177200_177800
914670	contig_4083_pilon	-	3920	1	Intergenic	novelGene_152317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCCTAACATAAACCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32912	28992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_29000_32900
914671	contig_3721_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_123817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	984	1316	155386	155054	NA	20	CTTGGTGCCTAAAGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSKLHHYDDVICDLLMCCKSYHCDEVILMRFTRLDSVLIQCLLRYEREKRAETHANLTPPGKQCGEQSTSFGPEVPVLRCSQTKGRLMHHKDFPPEPTEKESLLLELMP	156369	154510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_154500_156400
914672	contig_1443_pilon	+	6589	2	Intergenic	novelGene_28159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	564	1007	314046	314489	TRUE	10	GTGTTGTTACTGTTAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRRTRSLFLFLLLTLLGLVLVQPSYGQDRMYQRFLRQHVDPQGTGGNDSYCNLMMQRRKMTTNRCKPFNTFIHENIWNIHSICSTTNIQCKNGKMNCHESVVKVTDCKETGSSRAPNCRYRAMANTRRVVIACDGNPKVPVHFDK	313482	320162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_318344_318434
914673	contig_5686_pilon	+	2062	3	Intergenic	novelGene_45274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1539	1	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTGATGGGGACGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93819	172646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170674_171126
914674	contig_5758_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_119121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAATGAGTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439917	441440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_439900_441400
914676	contig_9455_pilon	+	2304	1	Intergenic	novelGene_161841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGATATATATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320016	322320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_320000_322300
914678	SIRV6	+	1133	5	NNC	SIRV6A	novel	1311	6	NA	NA	-1777	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTAGAAGACCGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7222	11822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_7449_7805_7924_10723_10819_11031_11109_11205
914679	contig_11855_pilon	-	6414	11	Intergenic	novelGene_66948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2145.58836685884	498	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	5182	6372	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1093017	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858
914680	contig_4531_pilon	+	2303	7	Intergenic	novelGene_47850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	565	junction_1	104.573339495941	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	147	1373	124082	156662	FALSE	85	CAAAAAAAGAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSNPIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKVNKQLRKLSCHDWINILYF	123935	157592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_124124_145256_145465_148686_148956_149519_149682_152888_153003_153420_153595_156404
914681	contig_3584_pilon	-	3110	2	Intergenic	novelGene_108126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1908	2240	244202	243870	TRUE	55	GTGACAATGAAAACACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALARSQNKETRNFPEEENFLELPEAEYKRLVYGTLEEIRKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHKDKFNRIEESIERQQSEIQKTNNKISKLDNSVESHRSRIEAMEVRISEI	246109	242919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_243357_243436
914682	contig_15105_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_151041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCACTGTGGCATCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834007	836354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_834000_836400
914683	contig_10500_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_41298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640223	1638740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1638700_1640200
914684	contig_13215_pilon	-	2950	1	Intergenic	novelGene_145901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1530	2072	261176	260634	NA	0	TTCGTTTTCTGCTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPARAHRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREEKKKKATPAAYKRHPKSRQPGHAESKRPAALGPEPAAPGSRGANKQRPQSLVRAGDQTRKELHTRTQPPQPHRKGQRRRSEPGT	262705	259755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_259800_262700
914686	contig_7963_pilon	-	2668	10	Intergenic	novelGene_58447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	727.248968186546	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	1146	2252	123098	118203	FALSE	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGPSSSSSSSDTSDSDSG	126279	117786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118253_120641_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563
914687	contig_7229_pilon	-	2060	4	Intergenic	novelGene_39801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1867.23330685328	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	11	559	877468	875654	TRUE	35	AAGCAAATGGACCTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQDRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877478	874015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875260_875396_875960_876729_876855_877350
914688	contig_16829_pilon	+	3817	4	Intergenic	novelGene_178953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTAGTGATAGAGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48576	184612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16829_pilon_+_49248_49297_49810_132910_134220_183287
914689	contig_6058_pilon	+	2051	5	Intergenic	novelGene_172409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	697	1017	390799	391119	TRUE	25	CCAGCTTTCACATCCCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTPSGAQSSASPKLHCRFSCRSETRHLLLLGTGPSSQMRPPSSSRTEPQFCCHGTKTLILAVILLNQTVKEAVLQPTPCQCHFQNYCRCRSRAAVRYLLSVSRSL	385247	393294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_385617_386564_386683_387838_387921_390671_391337_392477
914690	contig_11422_pilon	+	1841	2	Intergenic	novelGene_98995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12748	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCATGGGCTAGGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_1484_1588
914691	contig_11678_pilon	+	3925	3	Intergenic	novelGene_160833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATGAAAAGGATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143227	148888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_143341_144995_148368_148448
914692	contig_14415_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_77583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGACAAAGACCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11668	10123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_10100_11700
914693	contig_6458_pilon	-	1180	1	Intergenic	novelGene_163742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114563	113383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_-_113400_114600
914694	contig_1275_pilon	-	1803	15	Intergenic	novelGene_108785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_13	589.559088105125	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1026	776	1801	485958	448456	FALSE	70	AAAAAAGGAAGAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKT	546970	448453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_505963_513627_513806_546777
914695	contig_10904_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_22691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	75	464	588418	588029	NA	65	TTGCAAAATATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSKGFGFVCFSSPEKATNAVTEMNGRIVATKSLYVALAQRKEELQAHLTNQYMHRMASVRAVPNPVINPYQPARLSGYFMAAIPQTQNHAAYYPPSQIAQLRPVLAGLLRVPELIHSKICLVLSAQLLLDYHLVLETSFFTGSTSHVNTTC	588492	587473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_587500_588500
914696	contig_10795_pilon	-	2798	1	Intergenic	novelGene_171289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCATTACCAAGAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104241	101443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_-_101400_104200
914697	contig_5811_pilon	-	2962	1	Intergenic	novelGene_177402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1129	1524	41449	41054	NA	10	TCCCATGTGTCTCTGCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHDFVYFFIGFVCFPWSLSQSSSAAPTEIPQVDGFNKEKFISSQFSRLQVQIQGVSSRGTLSLLALQEGPCHQSSFGLGASLHRNLRSKRRTLLPALVSWWYEIPMCLCSPHQYNLITVIEFITHEEITY	42577	39615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5811_pilon_-_39600_42600
914698	contig_16884_pilon	-	6966	23	Intergenic	novelGene_161814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	33	junction_17	70.4238642873069	348	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1383	4152	15	4166	100466	36659	FALSE	10	TGGTTAGCCGCTGAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYATNSRGYSPAFLQPQNGNSHRSSGYVPGRVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRQEARATFALSHEEQRAQGENRKQKRHKNTFICFAITSFSFFVALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRLRNWDPGQDSTKQVVIKEGDMLRLTSDVTVNSIVIQDGGLLVFGDDKDGSRNITLRTRYILIKDGGALHIGAEKCRYKSKATIALYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKTSWTLLVRTLHSSGLTFGSYAFEKDFSRGLNVRVIDQNTAKILENVRFDTHEYQNESKRLQEFLRVQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQDRLGSKLIQGLSYRQAWALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQGEFYTMDGQKFAVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVMLHLLDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCPECSRFQVKVKETPQFLHMGEIVDGVDMRAEVGILTRNVVIRGEMEDSCYAENQCQFFDFDTFGGHVMIKKNFTSVHLSYVELEHMGQQHLGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDTLGHCFFLEDGVEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTAMRDRVFGNYIPVPATDCMAVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYIFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNRVHSSFKAGLFIDKGVKTTNASAADPREYLCLDNSARFRPHQDADPEKPRVAALIDRLITFKNNDHGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGFLGGQNKYAGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIGFLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCELDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDTYVGRIDNYLIRHPSCVNVTKWNAVVCSGTYAQVYVQAWSTQNLTMTITRDEYPSYPMVLRGINQKAAFQQYQPVIMLEKGYTIHWNGPAPRTAFLYLINFNKNDWIRVGLCYPSDASFQVTFGFLQRQNGSLSKMEDYEPVRSLDELQKQQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKGNRDSHSYCSSQGCERVKIQATTDSKDISNCMAKAYPQYYQKPSTVKRMPAVLSGPCPGCGTSQVVFTSDPHKSYLPVQFQSPSKAEAQRGDPTVISVNGTDFTFRSAGLFLLVVDACNVPFRLTEKKIFSLADVSRMEEYLKTGVPPRSIVLLSTRGEIKELNVSDSLVLLGLAKPAHLYNKGSTVFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGLLEQFIPLQLSEYGCHRTAAIRRRDLELLKQASKAH	100480	33858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_36856_37192_37297_40219_40375_42506_42606_46317_46538_48806_48990_53115_53325_55951_56168_59142_59321_62251_62408_63117_63154_64395_64528_67819_67909_70921_71051_74977_75048_75188_75395_75740_75951_77300_77471_80258_80448_87088_87259_91474_92037_92958_93100_100135
914699	contig_11986_pilon	-	2679	7	Intergenic	novelGene_69096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	338	junction_3	124.453025497798	25	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	1365	2468	47052	38914	FALSE	35	AAGTTTCCAATTCAAATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQPQPPPAQPLSSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPSTFTPYPLAGLNPNMNVNSMDITGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSVDNLPSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIRPPAKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGEESGCSSAHVRESPPKLPQVRHL	48416	38702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_39132_39598_39791_41122_41291_42013_42246_42365_42450_44628_44749_46962
914700	contig_10197_pilon	-	3098	3	Intergenic	novelGene_115284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	161	junction_2	132	83	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAGAGAGACAGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197671	1194291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1194317_1194408_1197400_1197589
914701	contig_5727_pilon	-	2565	3	Intergenic	novelGene_7992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_2	86	80	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	319	945	544040	529020	FALSE	65	AAAGAAAAATGGTAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSAPGSAEMPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKEAKERELQRELAEQKSVETVKRKKSFKMIRSQSLSLQMPTQPDWKGPTTTSPVMSPMTPVVTGTPQLMPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGVRSLPLPTGSSGGLCGCCVCPVYTDQRPLGSLWLCPPLKPGPVWWVSGRWQEGGAGV	544358	527399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_529396_539591_539818_544015
914702	contig_10494_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_102153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	734	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGCATGTCACCCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	863529	866020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_863500_866000
914703	contig_10948_pilon	-	1626	1	Intergenic	novelGene_124979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAATAATAGAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174586	172960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_173000_174600
914704	contig_6182_pilon	+	2700	3	Intergenic	novelGene_171648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1153	1455	143186	143488	FALSE	35	AACCGTAACTGTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKYYSLHQTESSTTGWCPATTTDCSDRDHNRRSQTELEKNVDQNPHSHIQKKKARLTGLTEAGENPKSMAPRHPFSSVLKSLLRFTLQPKIRQTHKTK	43050	144733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_43439_129152_129796_143064
914705	contig_11417_pilon	+	1188	3	Intergenic	novelGene_103304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4057	junction_1	963	46	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	774	1103	528512	529400	FALSE	55	AAGAAATGTATATATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDHRIPADTFTALKNPNAMLVNLEEPLASTYQDVLYQAKQDKMTNAKNRVKMKYLFFLTELYSFIV	526351	529485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_527108_528494_528609_529167
914706	contig_14577_pilon	-	1268	13	Intergenic	novelGene_164638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	400.504855012881	2	7	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1122	146	1267	127106	51312	FALSE	45	TAGAGATGACTGAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLAFTLSPGPARPRATALPPTPTPPPPSLFRSPVPLPRPAVASPDEVMASSNFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPTSSAKVNKIVKNRRTVASIKSDPPLRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNARRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKAL	127251	51310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_-_51348_54480_54583_59169_59248_68264_68356_70388_70552_70949_71005_72982_73079_77950_78052_78685_78752_83233_83289_84848_84969_86764_86860_127042
914707	contig_6488_pilon	-	3153	2	Intergenic	novelGene_44730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_1	0	6	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	119	889	91238	53739	FALSE	60	CAATTATAAAGTCAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFREPFLGGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLSGRDLSLLPRLIGVPSPLQGGSNSAATLGKPSGELRAGGASPPLPLDASSEPHPSRGPGPASNLTTALVAPTTAVLLSACPEESPLLVGPMMIEFNMAVDLERVAKQNPEVKVGGRYAPKNCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPILQRQQLDYGVYVINQVKSGKINRGGECMCVCVCVCVCARAYACKLVNGGRKGEQFCGHPGILQ	91356	51474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_54122_90850
914708	contig_7019_pilon	-	1532	4	Intergenic	novelGene_149450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_3	10.3387082795139	97	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	108	725	507011	506394	TRUE	30	GAGAATGTATTCATGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQPDPETLNENSELLFSFGVIADIQYADLEDGYNFQGNRRRYYRHSLHHLQDAIEDWKKESNIPCCVLQLGDIIDGYNAQYQASEKSLELVMNTFEMLKVPVHHTWGNHEFYNFSRDYLTNSKLNTKFLEDQIVHHPETIPSENYYAYHFVPFPKFRFILLDSYDLSVLGMDQSSPKYQQCMKILKEHNPNAELNSPQGELFL	519446	500855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_501475_505161_505279_506322_507037_519364
914709	contig_10042_pilon	-	3040	2	Intergenic	novelGene_79250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	144	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAACCCGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1213673	1203374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1203718_1210976
914710	contig_6616_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_141771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACGGGTGAAGACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439154	438605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_438600_439200
914711	contig_4531_pilon	+	2623	2	Intergenic	novelGene_47869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAGAGATATTTAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192277	195145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_194705_194949
914712	contig_8616_pilon	-	10792	8	Intergenic	novelGene_72604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	2144	2869	475107	474382	TRUE	10	AGTGGCCAGGCCCCCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSGPFRSPSTLGRGTSISPFTFGPFRLKSTSGMAILGALRCRSGILNLGPFSFASGPSIFTSGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFRCQSGPWTSTSGTSTSTLAASISTSGAFKSPSTLGRETSTSPFTLGPFRCKSKSGMEILGALMFISGILNLGPFSFASGPSTFTSGTSMSTLGPETSMSALGRFTSTFGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFKCQSGP	477250	447690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_447825_459761_459866_460229_460394_460853_461040_462005_464700_466619_467642_468225_469013_471549
914713	contig_12090_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_80502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAATAACATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247436	249852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_247400_249900
914714	contig_18506_pilon	+	3264	1	Intergenic	novelGene_67942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAGCCTTCATCTAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729	3993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_700_4000
914715	contig_8317_pilon	-	818	2	Intergenic	novelGene_19330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAACGGCGATCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17086	16170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16282_16379
914717	contig_6028_pilon	-	5355	3	Intergenic	novelGene_156552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	409	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAAATTTATTAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227522	171901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_172256_172458_172484_222546
914718	contig_5125_pilon	+	1868	5	Intergenic	novelGene_43453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1418.85118581901	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	73	891	53703	58893	TRUE	20	TTAATGTTTGTATCTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	53630	59986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_53708_53844_53984_54293_54525_58449_58958_59073
914719	contig_9091_pilon	-	7983	11	Intergenic	novelGene_32442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	81.8284180465442	548	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	100	690	119179	100303	TRUE	20	CAACCAGGGTTCTGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVLESVTLEPELEEALANASDAELCDIAAILGMHTLMSNQQYYQALGSSSIVNKEGLNSVIKPTQYKPVPDEEPNATDVEETLERVKNNDPKLEEVNLNNIRNIPIPTLKAYAEALKENSYVKKFSIVGTRSNDPVAYALAEMLKVNKVMKTLNVESNFISGAGILRLVEALPHNTSLVELKIDNQSQPLGNKVEMEIVSMLEKKTQRFSNSATTSPSRGPGCGRPMQ	129653	67280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_67362_72066_72281_73532_73848_80354_80473_85765_92313_100284_100432_113240_113385_116248_116357_118029_118161_119100_119191_129565
914720	contig_12864_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_76405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCTGTATAACCAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227763	229817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_227800_229800
914721	contig_4125_pilon	-	2033	2	Intergenic	novelGene_25044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	748	1101	205135	204782	FALSE	25	GCCTTCAGTATGGATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSAAVNMSVHISIRVMALNSLGYIPRSGIAGSSGTSISSFLRKRHINFQSGCTILHSHQHCISVPVSPQPLQRLLSCVFWINASLVGVRWYLIVVLICISLMANDREHFLMCLLAA	206309	203849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_205558_205984
914722	contig_13244_pilon	+	4485	6	Intergenic	novelGene_86984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	25.9722929291967	148	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	324	1460	400503	432170	FALSE	25	GATGGTCTTCATAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTNFFTLRVFCCLFAVLMVAVLIINVTQVEFLDNETVSATFIDNSGQFLPPQVTGISRNPYCGYEHQALSSRERVEEDSLLAALQWQVPGMGTVPFVKSTDPASSYFVILNSAAFFKVGSQLEVLVHVQDFQRKPKKYGGDYLQARIHSPKLQAGAVGRVVDYQNGFYKVFFTLLWPGKVRVSISLVHPSEGIRVLQHLQEEKPDRVYFKSLFRSGRISETTECNVCLPGSLPRCNFTDLYSGEPWFCFKPKQLPCSSRINHYKGGYLKGLLTAADSAFFQSGVNIKMPINSSGPDWVTVVPRRIKDTDNPELSQGSGTFPSGYYYQGLWQPRKFRMRQFNDPDNVTECLQRKVVYLFGDSTIRQWFEYLTTFVPGW	394021	435195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_394149_400306_400596_408864_409620_420747_420822_429530_429745_432169
914723	contig_5018_pilon	-	2831	12	Intergenic	novelGene_47117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	42.7645871879453	5	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	118	1434	1434602	1429922	TRUE	20	GTTCTAAGTGGACCTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRGVSTRLLSPCPGLRVLRLWGSVAAQTEKDGKTQNRAAKSSRPEFDWRDPLVLEEQLTADEILIRDTFRTYCQERLMPRILLANRNEVFHREVISEMGELGMLGPTIKGYGCAGASSVAYGLLARELERVDSGYRSVMSVQSSLVMHPIYAYGSEKQRQKYLPRLAKGELLGCFGLTEPNHGSDPGSMEARALHNPSSKSYTLNGTKTWITNSPVADLFVVWARCEDNCIRGFLLEKGMQGLSAPKIEGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPNASGLAGAFGCLNNARYGITWGVLGAAEFCLHTARQYTMDRIQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLSLHACLQLGRLKDRNKDTPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHVIRHAMNLEAVNTYEGSWMGHSRNSKREDCGVGIINAWE	1434719	1427829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_1429164_1429858_1429996_1430768_1430930_1431273_1431400_1431672_1431777_1432207_1432425_1432505_1432636_1433362_1433534_1433804_1433868_1434048_1434193_1434388_1434425_1434511
914724	contig_9912_pilon	+	3397	8	Intergenic	novelGene_177454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	159.512138876575	125	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	130	2013	10257	22228	FALSE	30	GAACCTTGCCTTTGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVRQSVPRLELLTPDCAEHSDRAPAPAATPQSENFDHSRDKTVMTSVDQVREGTNILKPKTKMADKENANRPTWSKNNIMMEKNCIPLKPNELTNSTIEIDTHTCEDNNQLLSFLLIKDDPQIQHMSLNQTFHLKRNNKEKLMPTEKPKQDVNIPKKPVLGFYRGKVVESKINSFRKPLQVKDESSATNKKPSAIISNATKPQPMSTSNVTVKSDRASNVTTTTKIVSSVSQSRRLVQPPIRSHHDHTQYKVKQGISRTSANVTIQKGPRRKELIQLKTDLSCVKTSSAQDIKRNEARSRSIASEIVARPASSSNIKLIEKSETIDQRRHTIAKTSVSNRSAQPKETTEQRKARLTEWKAGKGRVLKRPPSSAVTQPEAAGQNEKPAGSFWTTMAEEDEQRLFTEKVNKTFSECLNLINEGCPKEEILVTLNDLIKNIPDAKKLVKYWVCLARLEPVTSPIEHIITIYEKAILAGAQPIEEMRHAIADILTMKSQEKVNFGENIEEGDATKEQVQEVSMEDAGVNLEPGKPKLENKHHRSVMFHDCEKEQEDKTKDPGNDIKTPDKETRESCLIKYNVSSTPYLQSAKKKIQFDNTNSIFKELKFLTPVRRSRRLQDKTSKLPDMLKDHYPCVSSLEQLTELGRETDAFVCRPNAALCLMHSETETTEEK	1661	23612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9912_pilon_+_1775_10240_10317_10432_11299_11762_11968_13253_13425_15360_15431_21198_21455_21972
914725	scaffold_17542_pilon	+	2529	2	Intergenic	novelGene_139249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514471	517558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_516405_516962
914726	contig_14635_pilon	-	3439	6	Intergenic	novelGene_84366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	110.701400171814	138	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1020	2249	596075	582334	FALSE	30	ACATGGACATGCTGCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFFGLFSLQPRLDQTNHSFENSELADLDKLRYRHCLTTLTVPSRCIGFARRRIGRGGRVIMDRISTEHDPVLKQIDPEMLNGFSSSSQTVDFSCNFSRTNASNKHCENRLSLSEILSNIRSCRLQCFQPRLLNLQDSDSEECTSRKPGQTVNNKRISAASVALLNTSKNGISVTGGITEEQFQTHQQQLVQMQRQQLAQLQQKQQSQHSSQQTHPKAQGSSTSDCMSKTLDSASAHFAASAVVSAPVPSRGEVAKEQNTGHNNINGVVQPSGTSKTLYSTNMALSSSPGISAVQLVRTVGHTTTNHLIPALCTSSPQTLPMNNSCLTNAVHLNNVSVVSPVNVHINTRTSAPSPTALKLATVAASMDRVPKVTPSSAISSIARENHEPERLGLNGIAETTVAMEVT	597094	581143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_582407_583390_583725_584690_584851_586287_586425_595441_595786_595893
914727	contig_5153_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_74385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACGGCAACTGGTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982430	980752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_980800_982400
914728	contig_7093_pilon	-	3270	1	Intergenic	novelGene_157964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAGATGTGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48453	45183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_45200_48500
914729	contig_3797_pilon	+	6182	1	Intergenic	novelGene_120102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAAGCAGGAAAAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394789	400971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_394800_401000
914730	contig_10904_pilon	+	3496	2	Intergenic	novelGene_22682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	322	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGGTGTGAGGACAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556297	560134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_556373_556713
914731	contig_11258_pilon	-	1296	4	Intergenic	novelGene_67844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	143.766013600804	57	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	89	553	360591	353476	TRUE	30	GAATATTCAACACCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPGEPLPHTSCWAQWGL	360679	351843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_352171_353059_353501_354719_355099_360530
914732	contig_13607_pilon	+	1861	2	Intergenic	novelGene_170204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCGTCATCTACCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315605	318576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_315688_316797
914733	contig_13778_pilon	+	7604	2	Intergenic	novelGene_70846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	6232	6570	220192	258601	FALSE	45	AAAGAAGCAGAGGTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYFGAGSRKFEPEVTAEHEDQGMDEDKVREIFGIPVEGSLITYLVYKTVLLEVQICLQSFHFHSGRVSSRRFRWRQWSGTGNRLGDIRNRRMVLRGLHSFRKADDLVLHDL	213960	259635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_220523_258593
914734	contig_7758_pilon	+	3539	12	Intergenic	novelGene_163542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_4	184.096498231653	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	735	2396	172815	193745	FALSE	80	TAAAAAAAGAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLEMIDVHVLADAFKRYLLDLPNPVIPVAVYSEMISLAQEVQSSEEYIQLLKKLIRSPNIPHQYWLTLQYLLKHFFKLSQTASKNLLNGRVLSEIFSPMLFRFPAASSDNTEHLIKVIEILISTEWNERQPAPALPPKPPKPTTVVNNGMNNNMSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFSDPLTFNSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYNTQFQEKSREYDRLYEDYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFKREGNEKEIQRIMHNYEKLKSRISEIVDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQLRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNENTEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR	172080	194888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_172936_173723_173926_174126_174207_188333_188437_189040_189140_189241_189423_189675_189802_190755_190899_191131_191309_191409_191479_192171_192343_193555
914735	contig_17108_pilon	-	3846	1	Intergenic	novelGene_109522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGTAAACCTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54629	50783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_50800_54600
914736	contig_6795_pilon	-	2027	9	Intergenic	novelGene_27685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_8	89.4269953649344	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	446	1072	119175	71902	FALSE	45	CTATTACAACTACATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVVCQPIIITLLVFAVIVLLISWLPVCL	134340	70946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_128910_129062_129286_129402_134247
914737	contig_8978_pilon	+	2823	17	Intergenic	novelGene_49421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_3	125.946665299245	4	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2694	129	2822	427299	446175	FALSE	45	TTGCCCCAGAAGAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGNEPCGVGSLWCWKLLPSTLVLSLFQECKKHLAGLGALGLGTLITELTANEELTGTDGALVNDEGWIKSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPVLIKKDKDQDTIASVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESDMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVDSEVNQKSLWNYDYAPPPPPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKCRMIEDFRKLEESSGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFTATLDDDKPWYSIFPIDNEELVYGRWEDNIIWDAQSMPQLLEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGTLSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSF	427170	446176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_427501_427646_427764_431918_432039_433127_433370_433781_434001_434422_434642_434985_435194_436449_436627_436997_437126_437226_437335_437454_437629_441939_442114_442338_442444_444381_444583_444739_444882_445348_445480_446148
914738	contig_8377_pilon	+	1891	18	Intergenic	novelGene_35012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3537.0134949796	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1206	685	1890	154883	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68216	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142384_143466_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176691_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
914739	contig_6364_pilon	-	1435	3	Intergenic	novelGene_51729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2939	junction_1	126.5	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTCAGTAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447419	443805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_444756_445014_445155_447074
914741	contig_3960_pilon	-	4130	1	Intergenic	novelGene_138004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2168	2479	337009	336698	NA	30	TGAAGCAGGGCTGGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIRDVMLTSWYKTGLLNCKHRTFKYMENSSLHILMLATFCKESEIGQRKMKISLLVDHKVNFHNSSMNYTVEFKLHFLRFLKFFTPPSYCFYSTHQLNIYYT	339176	335046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_335000_339200
914742	contig_18799_pilon	-	4770	4	Intergenic	novelGene_171420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	480	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2214	2654	74059	73619	TRUE	70	AAGAAAAAAAAACAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWRRISHHLQFPKVLPIVVGMKGAGVQASIVVVGTDGFKAPLFVVIRLGPGTVARPTAGSGARCLGDRRRGRLLRPAAQGLAQGFSIELLGFKRVFYRATIVSVLRGALWHLCPSMAAVLMAWAIAGVSSRSPFFKSVLAAAFRG	76272	34670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_-_35498_53685_53752_65754_65884_72524
914743	contig_753_pilon	+	2632	8	Intergenic	novelGene_112907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	54.5624525153497	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	418	2109	289558	319276	FALSE	45	AAATGGGGAAATGTGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAEFRCTGTDDGFTDFKTADSISPLELPTKDKTFPASFPSGPVQQKQQTQVKTPLNLADLDLFSSVSCSNEKPVSFSAAFSVSKSIPTRPQPTDSTATTTALASTKTSSLADDFGEFNLFGGYSSPASVGEQDDFADFMAFSNSSVSSEQKADDKYDALKEEISPIPLTSTSGSTVKSVQNAAAAPSKYDVFKQLSLEGSGLGVEELRDCTASGKSDDDFADFHSNKFSSMNSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAAAGSGSSSAASVLQKKETPFGSSESITTTSFSKVTTFASEGVLPETTFPAFASFKDGILQTSEQKDYESGNYKDFTSQDLPSAEQSQEVTSPSPASSGASHETPKECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLLANSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLSEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWRRCLGSALDVIKKANDTLNGISSSSVCTEVIQSAQGMEYLLGVVEVYRVTKRVELGIKATAVCSEKLQQLLKDIDKVWNNLIGFMSLATLTPDENSLDFSSCMLRPGIKNAQELACGVCLLNVDSRSRAFNSDTDNFKLAYGGHQYHASCANFWINCVEPKPPGLILPDLL	289140	319799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_290084_298925_299385_300688_300853_301710_301765_302270_302368_304404_304554_317594_317706_319144
914744	contig_15135_pilon	+	3579	1	Intergenic	novelGene_119882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAGCATAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109657	113236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_109700_113200
914745	contig_12677_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_110884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCACCCTGGCCTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3849	3100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3100_3800
914746	contig_14682_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_139118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGACCCTGCCTGTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112563	110553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_110600_112600
914747	contig_9995_pilon	-	1920	1	Intergenic	novelGene_47773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	677	1033	728005	727649	NA	80	AAACGAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGLLGALVFTPNTVFKAQTERKVSRWESELKANTEVQVWAVGLFSPARHAPGTRLKAGNQLTPPPPRNRGKSVLAWEWERVPAGPRARGGSGLQSPAIQSAVPGPMPVCRLLDTSP	728681	726761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_726800_728700
914748	contig_13697_pilon	-	5167	1	Intergenic	novelGene_165922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	4466	4840	199607	199233	NA	25	ATCCTTTCGCATCACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPSWRFLPGVYVSVGEKALRHSFHCYVIQCATVLGEQGPIVVLVVRGHVLPRGWEGTVRLSALEALVPAVCVLRVPLLTSQIHPLQAVIGSLIIVFHFYFKSDFIRKKLIVHLWTSFLAIIHD	204072	198905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_198900_204100
914749	contig_10600_pilon	+	2733	5	Intergenic	novelGene_169873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGGACCTCCTTTGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275949	337885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_278299_280314_280396_283114_283284_304752_304849_337847
914750	contig_5092_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_62260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	2159	2701	175897	175355	NA	80	AAGAAAGAAAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLYQANDTQKRAGVAILISDKIDFKVKSITKDKEEHYIMIKGSVHQEDITIINIYTPNDRAPKYIKQTLTALRREIDSSTIIVGDVNTPVLVKDRTSREKLNKDTEDLNATINQLDLIDIYRRLHPTAAKCTFFSNAHGTFSRRDHILGHKASLNRIQSTEILQSIFSDHYAIKSRNQ	178055	175069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_175100_178100
914751	contig_15165_pilon	-	2210	3	Intergenic	novelGene_145323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGGAACCCTGACTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364727	238725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_240804_299110_299206_364690
914752	contig_5566_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_153669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTAGATTTGTCATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195495	194388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_194400_195500
914753	contig_12142_pilon	+	1733	7	Intergenic	novelGene_147783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	85.5	89	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2	508	1746	13560	FALSE	40	AATTTTTATATACGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRVKEPLNSELFPTADPVGTLLQVPEQISAHLPQPAGQTPAQPTQVSLPPPTEPAKPAQALSSGAGSQETKTPISLVLRLRNSKKELNDIRFEFTPGRDTAEGVSQELISAGLVDGRDLVIVAANLQKIVEDPQSNRSVTFKLASGVEGSDIPDDGKLIGFAQLSIS	1744	14785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_1779_4547_4695_6021_6087_9949_10003_11934_12004_13028_13094_13485
914754	contig_7057_pilon	-	3771	5	Intergenic	novelGene_123386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCTGGTGCGGATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1241033	1197186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1197287_1221230_1221290_1224821_1224919_1226133_1226260_1237644
914755	contig_9571_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_136329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGAAAAAAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741381	744053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_741400_744100
914756	contig_8160_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_136404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAACACGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73411	71163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_-_71200_73400
914757	contig_7728_pilon	-	2935	3	Intergenic	novelGene_64746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905761	888817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_889414_903232_905187_905376
914758	contig_1719_pilon	-	3611	3	Intergenic	novelGene_87286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	386	junction_1	177	88	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	209	433	373576	373352	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQVCCELLASLSGNRLCIFFFLNGYFYLDIY	375336	368752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_370181_371601_373642_375193
914759	contig_3975_pilon	+	3119	10	Intergenic	novelGene_54819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.314269680527355	18	11	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2332	2682	2060191	2065900	TRUE	10	ACCCTGACTTCCTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAIWAAMSKSLLTVSLMPGGVLRKSTRLPVLHVFRDDVDGLLGDHGIQPDQPLVLQLLHEIGLGQKGVGRHAALLQALHRHFRVPVVVPHPHLPELASPQTLHQLQRLPGNPRR	2054978	2079271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2057046_2059841_2059965_2060049_2060205_2060294_2060374_2063812_2063991_2064110_2064174_2065883_2065941_2066196_2066303_2075015_2075182_2079146
914760	scaffold_6394_pilon	-	1589	1	Intergenic	novelGene_110962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	528	839	237858	237547	NA	35	AGAAGTATCAGTATGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHQTPHSRTANTVPSEHLTETKPNSHLNSGKPLSSKCPRTNGRGTPSLDGGGSSQNLTEDPAGHPAWILPRMKCRKERAPREPARPKAPDTLPIEVWVWCGS	238385	236796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_236800_238400
914761	contig_13481_pilon	-	3238	1	Intergenic	novelGene_119324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	30	299	310463	310194	NA	55	GCGGGGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDIQGANRHMRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHVTPALLARIENTGNNKCWRGCGEIGTLKHCWWECKMIQPFRKMMALPQKARNRHTIPSSNPTPRNIS	310492	307254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_307300_310500
914762	contig_6159_pilon	-	4597	2	Intergenic	novelGene_128256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAACACTACTAATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232517	227729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_228843_229033
914763	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
914764	contig_21369_pilon	-	1803	3	Intergenic	novelGene_176298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	6	7	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	129	356	19962	7730	FALSE	65	GCAAATCATATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFIYICQFAVHVLQAAGFHNWGNCGWISSLTGLNKSIPVGVLMIIIAALFTASAVVSLVMFKKVHGLYRTTGASFEKAQQEFATGVMSNKTVQTAAANAASTAATSAAQNAFKGNQI	23323	6282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_7895_19899_20018_23250
914765	contig_19402_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_80815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAGAAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74958	75943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_75000_75900
914766	contig_5023_pilon	-	1702	11	Intergenic	novelGene_7160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATCATAGTCAGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406197	369309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_369354_369821_369876_370401_370537_373060_373207_375330_375398_387160_387277_388219_388290_394024_394116_402039_402192_403086_403177_405460
914767	contig_12079_pilon	+	3884	2	Intergenic	novelGene_67359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	370	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAGATCAATAAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176734	373887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_176870_370138
914768	contig_6576_pilon	-	5198	21	Intergenic	novelGene_42373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	37	junction_18	124.4428684176	35	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	891	2676	800	3475	1277711	1241887	FALSE	45	CTGGGAAAAGTAAGAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPWLSNLVRFCKHNDDAKRQRVTAILDKLITMTINEKQMYPSIQAKIWGSLGQITDLLDVVLDSFIKTSATGGLGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGRMCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDIAILARYMLMLSFNNSLDVAAHLPYLFHVVTFLVATGPLSLRASTHGLVINIIHSLCTCSQLHFSEETKQVLRLSLTEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVIAFRSSYRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEALLEIMEACMRDIPTCKWLDQWTELAQRFAFQYNPSLQPRALVVFGCISKRVSHGQIKQIIRILSKALESCLKGPDTYNSQVLIEATVIALTKLQPLLNKDSPLHKALFWVAVAVLQLDEVNLYSAGTALLEQNLHTLDSLRIFNDKSPEEVFMAIRNPLEWHCKQMDHFVGLNFNSNFNFALVGHLLKGYRHPSPAIVARTVRILHTLLTLVNKHRNCDKFEVNTQSVAYLAALLTVSEEVRSRCSLKHRKSLLLTDISMENVPMDTYPIHQGDPNYRTLKENQPWSSPKGSEGYLAATYPTVGQTSPRARKSMSLDMGQPSQANTKKLLGTRKSFDHLISDTKAPKRQEMESGITTPPKMRRVAETDYEMETQRISSSQQHPHLRKVSVSESNVLLDEEVLTDPKIQALLLTVLATLVKYTTDEFDQRILYEYLAEASVVFPKVFPVVHNLLDSKINTLLSLCQDPNLLNPIHGIVQSVVYHEESPPQYQTSYLQSFGFNGLWRFAGPFSKQTQIPDYAELIVKFLDALIDTYLPGIDEETSEESLLTPTSPYPPAVQSQLSITANLNLSNSMTSLATSQHSPGIDKENVELSPTTGHCNSGRTRHGSASQVQKQRSAGSFKRNSIKKIV	1283895	1240163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1242030_1255813_1256031_1257211_1257259_1257592_1257736_1258873_1258975_1259161_1259293_1259666_1259790_1263205_1263364_1264922_1265059_1266074_1266207_1267687_1267815_1269416_1269558_1274013_1274116_1274635_1274751_1274903_1274966_1275176_1275392_1275828_1276109_1276266_1276408_1277549_1277744_1282535_1282877_1283469
914769	contig_1062_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_171381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCACAAACAAAAGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168647	169635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1062_pilon_+_168600_169600
914770	contig_9739_pilon	+	3301	2	Intergenic	novelGene_165083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGCCAAGTGGAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9601	155183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_12616_154896
914771	contig_10953_pilon	+	5219	13	Intergenic	novelGene_42522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	191.572929977072	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	16	903	126980	145572	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLHQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRVSVPFCRVTICPREKQK	126964	162309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_127115_131419_131491_133875_134055_140562_140607_143067_143176_144723_144798_145018_145132_145408_145958_148777_151710_155379_155435_156488_156597_158745_158844_161571
914772	contig_3095_pilon	+	2785	3	Intergenic	novelGene_75062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	7866	junction_1	151	68	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	64	759	147241	150781	FALSE	20	TTATATTTGGAGATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWGMNHPSISFVAWFPQMMHASGPLGPRVP	147177	152807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413
914773	contig_16231_pilon	+	676	5	Intergenic	novelGene_176707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.362154520432	33	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCTTCCTCTTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12663	73882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_12735_16381_16450_25333_25521_46642_46803_73692
914774	contig_5083_pilon	-	3646	1	Intergenic	novelGene_151687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCTGCCCGACAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674789	671143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_671100_674800
914775	contig_1516_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_49918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGTTGATTCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78981	81027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_79000_81000
914776	contig_5727_pilon	-	2007	6	Intergenic	novelGene_7975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	268	junction_1	347.0392485008	36	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	174	926	228154	222262	FALSE	60	TAAAATATTATTGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGSIEIPLRDTDEVIELDFDQLPEGDEVISILKQEHTQLHIWIALALEYYKQGKTEEFVKLLEAARIDGNLDYRDHEKDQMTCLDTLAAYYVQQARKEKNKDNKKDLITQATLLYTMADKIIMYDQNHLLGRACFCLLEGDKMDQADAQFHFVLNQSPNNIPALLGKACISFNKKDYRGALAYYKKALRTNPGCPAEVRLGMGHCFVKLNKLEKARLAFSRALELNSKCVGALVGLAVLELNNKEVCK	228327	221180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_222423_224370_224461_224907_225026_225530_225771_226761_226861_228109
914777	contig_5586_pilon	+	3081	2	Intergenic	novelGene_143513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	460	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGTGGGACTAATAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244711	260750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_247776_260733
914778	contig_12179_pilon	+	2675	10	Intergenic	novelGene_128002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_5	141.566631347614	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	25	1698	510055	530744	FALSE	45	AAAAATCCTAAATGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVNNIKDAMPKMQIGAPVRQNIDVGERPCLQGYYTAAELKPVLDRPPQDPNAPGASGKAFKTNNLSAEEQKEKERGEAKHCFNAFASDRISLHRDLGPDTRPPECIEQKFKRCPPLPTTSVIIVFHNEAWSTLLRTVHSVLYSSPAILLKEIILVDDASVDEYLHGKLEEYIRQFSIVKIVRQKERKGLITARLLGASVATAETLTFLDAHCECFYGWLEPLLARIAENYTAVVSPDIASIDLNTFEFNKPSPYGSNHNRGNFDWSLSFGWESLPDHEKQRRKDETYPIKTPTFAGGLFSISKEYFEYIGTYDEEMEIWGGENIEMSFRVWQCGGQLEIMPCSVVGHVFRSKSPHTFPKGTQVIARNQVRLAEVWMDEYKEIFYRRNTDAAKIVRQKSFGDLSKRFEIKHRLQCKNFTWYLNTIYPEVYVPDLNPVVSGYIKSFGQHLCLDVGENNQGGKPLIMYTCHGLGGNQYFEYSTQHEIRHNIQKELCLHAAQGPVQLRTCTYKGHKTVAAGEQIWEIQKDQLLYNSFLKMCLSANGEHPSLVPCNPSDSLQKWIFSQND	510030	531721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_510342_514346_514520_518688_518839_520568_520804_521256_521375_522882_523084_525287_525420_525624_525727_529373_529527_530621
914779	contig_19269_pilon	+	1518	4	Intergenic	novelGene_175622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	341.329101536267	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	19	351	813	11458	FALSE	45	TTTTTTAAAAACTCAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPNSASMYLTVIPEKGKPRAVIVSCKPLLEANWKIFAPTCAPMNFILIYQESMPHTLTVNCQHPKDVNKNITALTSAPTDFTVFTDTPEVKPHSVVVTSQPPLETNGRTTASPLAP	794	12625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_904_7478_7587_11224_11339_11438
914780	contig_4519_pilon	+	3094	4	Intergenic	novelGene_123675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_3	37.7741828354882	27	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAACAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70886	82496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_70919_77856_78014_78794_78937_79733
914781	contig_6862_pilon	-	2779	2	Intergenic	novelGene_63765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	43	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1976	2338	262257	261895	FALSE	70	AAAAAATTTGAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKRCPAYSHEGLRDDFHGEKRAKVETKFLCKHQHYHLMFFTHVNDKFVCQGLAFGKKCTLWDVEQNSNTKIDQIYWPDRDWRNPESIAPGHPFSSGVKSLPTFTIQLGIGQPHKTKRD	301628	261453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_264174_301569
914782	contig_8636_pilon	-	4782	3	Intergenic	novelGene_141910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGCACTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420994	355594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_358539_409689_411127_420593
914783	contig_11986_pilon	-	3261	1	Intergenic	novelGene_69120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1522	1839	118929	118612	NA	75	CGTACAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKIGRRYSRPLSQVPRTRSQMMLSWRWDPEASKQAVPESLNIYWMQATPPGKLPLELIDSLHQITSWRITTSLRNCQITSLHNCQTTENHGPAQLTHDLNQYR	120450	117189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_117200_120400
914785	contig_17144_pilon	-	826	6	Intergenic	novelGene_29424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	202	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	135	623	179764	166277	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFISGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183216	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166342_174937_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
914786	contig_21412_pilon	-	4072	1	Intergenic	novelGene_142850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	106	456	25729	25379	NA	35	TGAGGAAATATGATGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEHKEAKANERTDEVKELNRRCQRAAREDKAKYYNEICKPLELENQKNMLSISQAERTEEKIQDSSCNFEGDYGQNIERPRKKQKKMEGIQSHCSKKNWSMFNHFKR	25834	21762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_21800_25800
914787	contig_4425_pilon	-	2271	2	Intergenic	novelGene_178175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATAAAGAAAAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180524	177955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4425_pilon_-_179638_179935
914788	contig_11364_pilon	+	3628	1	Intergenic	novelGene_65193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	548	976	263812	264240	NA	30	ATAAAATTGTTTTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQFYSDTWGCHELELTGQQSVCRSSGGDLLDPCSSLESVALSRMWANCSMAFLGHWSVWALHFVSVARGDIQRKDCWASHGVCLPLSLPALRGPSRASVLLSRHCTLRAPPSPSAHLKLSSSSHIPLSLESYPRKIVSVFF	263264	266892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_263300_266900
914789	contig_10494_pilon	-	2708	2	Intergenic	novelGene_102238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	271	633	1285435	1285073	TRUE	10	CCTAACCCTCTCTGCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLQTYGVAGSQGTPTLLGFPPAHLAPLLCDLGHRWQQFLGEDWLSNVAGPPPSTPLQADETDNTQGSGAVGAAPTPPRSQNACLFPQHSLVSLSDVCSILFPSASGYRGGEGRRTGRAL	1285705	1282639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1282808_1283165
914790	contig_19957_pilon	-	2600	1	Intergenic	novelGene_57749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTGACCATCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395081	392481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_392500_395100
914791	contig_4385_pilon	-	1859	3	Intergenic	novelGene_141515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	702	1133	452770	452339	TRUE	30	ACCTAGGAGGGGACAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSSMCLIRGFEPGCLLPGPWGDPGLPTHGTLQKHTAMNHHTFGPSSKGVMPLPTLRVTPAMPTKKLRKRTYPKEGRTKKPQSFLTQVSCGSGTASSSGDEPSHTTCMYLQSGSQKGSSNSRKTLLLVPKPIFLIASAFSGG	453471	448720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_449206_450019_450218_452295
914792	contig_10106_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_73853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAGAATCACATGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55225	53872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_53900_55200
914793	contig_16098_pilon	-	1682	10	Intergenic	novelGene_45943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1427.76936443695	5	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	118	1128	352350	349343	TRUE	30	CAGACTCTGAAGACTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	354106	348286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348455_348845_349062_349172_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
914794	contig_11160_pilon	-	2777	4	Intergenic	novelGene_168807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15.4128373622625	89	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318695	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_312363_313958_314071_315639_315780_318369
914795	contig_4364_pilon	-	2889	2	Intergenic	novelGene_36	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	295	660	331673	331308	TRUE	30	TAACACCACCTTTACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMVWILLKLALWPNKGSVLENVPCALEKKVYLAAVGWNVRYMSMRSSWLIVVFRSSLSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPITIVELSICLFSGVRVCFILESSRWVCNYLL	331967	289721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_291381_330737
914796	contig_15371_pilon	-	3591	1	Intergenic	novelGene_151475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	136	507	222500	222129	NA	60	TATAAAACCATTAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGNAGDHLSPSYLSNDGIHLLHAQGDDAGKEWLEHLARLLDHHLQDLQKLLDHSTACAAFVEDALSQLFSTDKRKSLNNQGNTSSGASMKTNAVVSEEEEQTTPWGCSQVHYFSPESENYSQ	222635	219044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_219000_222600
914797	contig_6277_pilon	-	4787	1	Intergenic	novelGene_80389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	3589	3909	55786	55466	NA	40	AACTAAATGCTGAGTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSAYSKSAPLTLYYALIFTGGFGGLFSSMQLRDLSHLVYMSSNHWPMHSPGNWWFNLIFFSFIHLLETSLSTQLPLNPFRMYGRQCCPSTFSSSKVSWNSWWHSG	59374	54587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_54600_59400
914798	contig_8310_pilon	+	7859	1	Intergenic	novelGene_75564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	248	103	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	6730	7311	229585	230166	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARNPVGLGQPPPQTLQLQLCQVRTVCPRGRHPSISLLGSPELTVRCGKSRAVQGRECPLLPGLLPYLSLFAATSHQAGKPGERAPQEEGVKVVFAESLYRGGPLRGSGGKQVREHASGGSQYWGLLSNPSGPGDGKPVLRWLIDSQEDTGRRGGKGMSEPLETRKVNELGLSASPQLLAPPCQVADVLVRVE	222855	230714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_222900_230700
914799	contig_4442_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_127935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCAATGTCTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166880	168860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_166900_168900
914800	contig_8772_pilon	-	1311	9	Intergenic	novelGene_21116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAGCTCGGCCAGCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23422	15761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16603_19014_19117_19199_19362_19994_20123_20475_20695_21476_21522_21965_22051_23061
914801	contig_8674_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_102902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCGCCCAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166826	168502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_166800_168500
914802	contig_10003_pilon	+	5649	1	Intergenic	novelGene_88296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCCCCTATAGAGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912192	917841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_912200_917800
914803	contig_21174_pilon	+	1000	5	Intergenic	novelGene_178928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_1	306.300914135103	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	774	225	998	10586	12419	FALSE	30	AGCTGTGATCTGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEPQYSGHGTRDPPLAALGGPGPDPDPGWLPLPEVFPTPPCPGPAAGSPSFISVGYVDDTQFVRFDSDAASPRMEPRARWMEQEGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVV	10066	12421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21174_pilon_+_10158_10452_10725_11037_11314_11957_12234_12336
914805	contig_6175_pilon	-	5151	25	Intergenic	novelGene_16336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_2	356.951755221284	423	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	847	2544	453	2996	1719629	1647652	FALSE	0	CCCTTTTCTCCTGTCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIIRLSRDQMLQIQNSAEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACLVNKSVLEAIRGRLRSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTSSINGDLIELNSIGVILDMFFKYTWNNFLHTQVEICVALILASPFENTENGTLTDRDTTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCVVHSTDKGPNSTSVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQDLFESRGANAEDKMEVDLNEPPSWSANFDVPMETTHGAPLDSVGADVWSTEELMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPLDPLTTSVTALTAQAEVPGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKSEDGKLSTSQDAACKYVVEESPEMAEVKSAAPQLPSSSPEQRTDQPSVPGDTSVNGPV	1793689	1645496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1647704_1650560_1650684_1654371_1654523_1656082_1656190_1657674_1657829_1661563_1661686_1669608_1669740_1670848_1670904_1672947_1673046_1677386_1677474_1683753_1683840_1685585_1685702_1688442_1688508_1689437_1689588_1691807_1691961_1693918_1694049_1700125_1700240_1705471_1705585_1708004_1708071_1710414_1710553_1713810_1713998_1719483_1719717_1746007_1746156_1770748_1770887_1793610
914806	contig_1535_pilon	+	1594	4	Intergenic	novelGene_127245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTGAGCTTCTAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127063	129790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_128327_129138_129338_129572_129677_129762
914807	contig_15849_pilon	+	2556	6	Intergenic	novelGene_176056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	38.9389265388762	49	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	10	942	89786	109653	FALSE	65	ATCTGGAAAAAAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESRKCSSSDCCTPTISTARLASWQSLMTCKTMATGVPSPAGPSSGQTCVLILIFTLLLQSLSVAVTYLYFTKELKQMQDKYSRSGVACFLKEDDSFGDPDDEDSMDNPCWQIKWQLRQLVRKMVMRIYEETTPTGQEKQQDSPYLGRERSLPRVAAHITGNSRRTSTFLPPSSGNEKALGQKIKTWESSRKGHSFLNNLHLRNGELVIHQTGFYYIYSQTYFRFQEKETVPTVSLEENRKKNKQMVQYIYKYTSYPDPILLMKSARNSCWSKDSEYGLYSIYQGGIFELKENDRIFVSVGERCDSLLL	89776	111267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_90020_97054_97193_100149_100193_106574_106680_108831_109212_109620
914808	contig_20026_pilon	+	943	1	Intergenic	novelGene_175418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAAAAACAAAAGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169851	170794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_+_169900_170800
914809	contig_14219_pilon	-	2790	1	Intergenic	novelGene_54327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	607	975	747883	747515	NA	25	TTTCCTCCCAAAGAGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQLVPTTWSKGELRTPKESSSPRERKGHINQRLHQPETRRTRWCPAPTNDRCDREHNRESLMELEKGGVQNSTSSKNTRLNGLTETGGTPESMTPRLSVNPELKQFPRPPLQTKIRPDCGT	748489	745699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_745700_748500
914810	contig_6291_pilon	-	3067	2	Intergenic	novelGene_164794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGAGGGAAGGAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386818	382462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_383501_384789
914811	contig_8820_pilon	-	1740	7	Intergenic	novelGene_79301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	541	junction_6	1188.72840557556	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	46	1317	170675	168278	TRUE	65	TGAAGAAGAGAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNSSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRMKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERDKEVSDDEAEEKEEKEEEKEKEEKESDEKPEIEDVGSDEEEEEKKDGDKKKRKKIKEKYIDQEVLNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRAPFDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKVRNHV	170720	167625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_167801_168029_168487_168647_168814_169016_169338_169664_169799_170135_170503_170600
914812	contig_15449_pilon	+	3542	14	Intergenic	novelGene_33564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	821.664272994021	8	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	1583	2629	45599	49661	FALSE	25	TTACCCACTGCACTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVKKDFILNNFRSDKCCKLFTLAKSDLGCYSEKNV	11188	50574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_11236_15759_15842_32835_32912_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45019_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186
914813	contig_6028_pilon	+	4357	1	Intergenic	novelGene_156590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2738	3037	321260	321559	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFCLVDIVIIFTLYLITIQKSSHIDDTITFHQHGQLLFQPNVILTKFKTLICIFKAYMIKYMRNHILLSLPPPASVHLAKSSHLAQGYTGKRWTKSSI	318522	322879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_318500_322900
914814	contig_19735_pilon	-	1809	13	Intergenic	novelGene_167884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_10	61.1198731092342	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	130	1581	101536	66446	FALSE	50	GTCCAAAATAGATACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSFGQPRSEDNQSVVSRMQKKYWKTKQVFIKATGKKEDEHVVASDAELDAKLEVFHSIQETCTELLKIVEKYQLRLNVISEEENELGLFLKFQAERDVTQAGKIMDATGKALCSSAKQRLALYTPLSRLKQEVATFSQRAVSDTLMTINRMEQARTEYRGALLWMKDVSQELDPDTLKQMEKFRKVQIQVRNSKASFDKLKMDVCQKVDLLGASRCNMLSHSLTTYQRTLLGFWEKTARMMSQIYGECVDSYPYDFVALKRLQDTSSKLTEDHKEEQIENNSLTENLNKLVLLNEEANLGSEPATEDHKEKHFQMRDSGTPLFSNSENVAKDLLVDSLEGEDFEKEFSFLNNLLSPGSSSTSEFTQECQTAHGSPNTSLTSQEPSLGSEPLAHSSGFLPSQLFDLGLHAAGAFNSLARHRGSELPLPHMDNESVPSQSPKKLTSSPNNGNQDMSAWFSLFADLDPLSNPDAIGHSDDELLNA	112087	66217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_66562_75053_75144_77879_78138_83698_83774_85714_85759_87314_87401_88715_88815_90996_91123_93238_93438_94779_94904_100157_100231_101374_101544_111965
914815	contig_17440_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_7556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTACGAAAGGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1409	2859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2900
914816	contig_10500_pilon	-	2013	2	Intergenic	novelGene_41215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571948	1569859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1570109_1570184
914817	contig_10074_pilon	+	4914	1	Intergenic	novelGene_57153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGCACGTGCTTACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483653	488567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_483700_488600
914818	contig_12312_pilon	-	1384	1	Intergenic	novelGene_63963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	306	329	214932	214909	NA	35	GTGCATTTGTATAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215237	213853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_213900_215200
914820	contig_11832_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_106983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGTATGCAGCCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494658	495493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_+_494700_495500
914821	contig_4604_pilon	-	1066	3	Intergenic	novelGene_19166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373781	371465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_372163_372785_372961_373587
914822	contig_14034_pilon	-	1875	3	Intergenic	novelGene_72666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTAAAAGGATGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395094	364241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_365508_394257_394735_394962
914823	contig_5643_pilon	+	1309	11	Intergenic	novelGene_38802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2617.70533101035	61	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	579	1133	236700	237822	FALSE	15	AGCCACCTCTTTGTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233607	238190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237823_238014
914824	contig_5419_pilon	+	4044	1	Intergenic	novelGene_15563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	639	3405	4043	572827	573465	NA	40	ATGAACAGCTGACCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKAEKKQEKIDRFMEKVDKFMENTDQKMEEFRKIIQEQNAKMNSQPEITQKQQLEIQKMSNKISEMDSVIEGLRSRFQTVEDRISGIEDKHLDTALFEEKSKKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIGVPKQGEKTEDTERITEELLTENFPNIMK	569422	573466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_569400_573500
914825	contig_11779_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_146443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGCTTCTTCTGTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10592	9477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_9500_10600
914826	contig_3155_pilon	+	1668	4	Intergenic	novelGene_26368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1052.66846104977	37	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	78	410	258156	261298	FALSE	25	CTCCAAGGATTCTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTISVPGKTSHTFSTSHNVTALVILT	258078	262556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259860_261225
914827	contig_7357_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_36843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCTGTAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153303	155384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_153300_155400
914828	contig_6163_pilon	-	1034	3	Intergenic	novelGene_103841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74	1	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	251	1033	435578	430033	FALSE	10	GAGGTTGGTTTCTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPMQQKLNEVYEAVKNYTDKRGRRLSAIFLRLPSRSELPDYYLTIKKPMDMEKIRSHMMANKYQDIDSMVEDFVMMFNNACTYNEPESLIYKDALVLHKVLLETRRDLEGDEDSHVPNVTLLIQELIHNLFVSVMSHQDDEGRCYSDSLAEIPAVDPSFPNKPPLTFDIIRKNVENNRYRRLDLFQEHMFEVLEKIYEDAVELQQFFIKIRDELCKNGEILLSPALSYTTKHLHNDVEKEKKEKLPKEIEEDKLKREEEK	440523	430031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_430230_434992_435617_440311
914829	contig_2849_pilon	-	2058	1	Intergenic	novelGene_178954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTATTTTTTTTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2133	75	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2849_pilon_-_100_2100
914830	contig_7146_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_162048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	284	604	115826	115506	NA	35	AGGAGCATACCTAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLYLKIKKTKIFTTGPVSNIMINREKIEVVKDFILLESTINTHGNIGQEIQRHIVLDKSAAKDLFKVLKSKHITLNTKVRLTQTMVFSIASYACES	116109	114682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_114700_116100
914831	contig_4754_pilon	-	4251	5	Intergenic	novelGene_35905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1699	2007	153863	151161	TRUE	60	CACACAGAAAAGACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTITSSIHLIFIVPLNLYMFVTNTMGRRAILSHSAHKVLKVEMGPRWRSSQTLLVEPLTTETRKTSKLIIYGNLGALNIKGRVEELDRVAGEEAARSCQT	497190	148612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_149215_149518_151370_153763_154104_349033_349129_495827
914832	contig_7057_pilon	+	2517	3	Intergenic	novelGene_123400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	107	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292354	1300247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1292854_1296828_1297620_1299020
914833	contig_15264_pilon	+	2152	1	Intergenic	novelGene_158864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGCTCCATAAGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17337	19489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_17300_19500
914834	contig_7357_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_36776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGTCAGAAGGTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117996	116452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_116500_118000
914835	contig_5261_pilon	+	2149	25	Intergenic	novelGene_102493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	56.9193965914374	1	95	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	624	1766	814858	841869	TRUE	30	AGTGAGATGGACTAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSCTCCCGGKQDSLNEPVNCKGLKKAWPVYRVVIFQYTEVGYQSLGSESLLYHLSELKGMALWKQKYEPLGLDAAGIEDAITAVGSFILKANELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVADFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVEKVGQYLKDEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDHCLQKPADVIGKSMNQAICIPLYKDVRSEDSTRRLLKFPFLWNNKTSNLHYLIFTILEDSVYKMCILRRHTDISQSVSNGLIAVKFGSFTYATTEKVRRSTYSCLDAQFYDDETVTVVLKDTVGREGRDRLLVQLPLSSVYNSEDSADYQFKAR	806791	842850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_806925_808682_808762_809011_809062_810213_810299_810897_811003_812382_812439_814199_814287_814829_814895_816130_816161_816240_816311_818001_818103_818185_818238_825709_825766_828096_828144_829243_829301_829622_829680_835108_835203_836966_837065_838349_838412_838491_838531_838610_838713_839556_839632_840531_840687_841858_841985_842582
914836	contig_4974_pilon	-	4221	1	Intergenic	novelGene_161409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	425	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATAGGGTTTTCTTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86439	82218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_82200_86400
914837	contig_5059_pilon	+	5452	1	Intergenic	novelGene_140713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3557	3880	183055	183378	NA	25	GGCCACTCAGGGACCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSSTESGELKSPTIIVELSISLFSTVKSLFYVLWLSVCFSLLKNVSNFSSVRSQL	179498	184950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_179500_185000
914838	contig_11872_pilon	+	2135	8	Intergenic	novelGene_143145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_7	103.266249894856	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	64	1194	42170	92509	FALSE	20	ATTAAATCTGTTTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAGACQSSLLLEEVGGGSCIMSEADGLRQRRPLRPQVVTDDGQAPEAKDGSTFSGRVFRVTFLMLAVSLTVPLLGAMVLLESPIDPQPLSFKEPPFLLGVLNPNTKLQQAKRLYENQLIGPESIAHIGDAMFTGTADGRVVKLENGEVETIARFGAGPCSEVKMLLSSETPIEGKKISFVNDLTITRDGRKIYFTDSSSKWQRRDYLLLIMEGTDDGRLLEYDTVTKEVKVLMDQLRFPNGVQLSPAEDFVLVAETTMARIRRFYVSGLMKGGADMFVENLPGFPDNIRPSSSGGYWVGMATIRSNPGCSMLDFLSERPWIKKIIFKLFSQETVMKFVPRYSLILELSNSGAFQRSLHDPNGLVASYVSEAHEHDGHLYLGSFRSPFLCRLSLESV	42106	93450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_+_42262_52013_52131_60111_60228_62392_62486_68492_68668_70194_70330_70717_70911_92299
914839	contig_8676_pilon	-	2610	4	Intergenic	novelGene_142209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAGGTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564415	371224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_372434_388913_389294_389334_390271_564330
914840	contig_3878_pilon	-	1202	5	Intergenic	novelGene_174796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	7.71362431027076	90	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	67	840	624087	574280	TRUE	0	GCCTTTGCGTTTTCCTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPTSAPAPRADRPDWGPPPALTMYAFVRFLEDNVCYALPVSCVRDFSPRSRLDFDNQKVYAVYRGPEELGAGPESPPRAPRDWGALLLHKAQILALAEDKSDLENSVMQKKIKIPKLSLNHIEEDGEIKDYGEEDLQLRHIKRPEGRKPSEGAHKSIEAVVARLEKQNGLSLGHSTCPEEVFVETSPGTDDMDSLEDAVVPRALYEELLRNYQQQQEEMRHLQQELERTRRQLVQQAKKLKEYGALVSEMKELRDLNRRLQDVLLLRLGSGPSGKRDLG	624153	562933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_563111_574094_574309_597376_597762_600129_600264_623861
914841	contig_9345_pilon	-	1558	6	Intergenic	novelGene_24450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_1	100.934830460055	19	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	433	699	433317	429770	FALSE	40	GTAAACAAATTCTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGLTELLQGYTVEVLRQQPSDLVDFAVDYFTRLREARRLAPTPPATAPTRVSYGPEPSPEPVADEEDESEDEEDLEVPAPSRFNRRVSVCAESYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKVDEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNHGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLVSEGNGSILN	509861	428910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_429957_433237_433345_447365_447450_448981_449035_453971_454008_509629
914842	contig_5258_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_100245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1279	1581	207524	207826	NA	40	AAAATTTTTGAAATGGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECTLKERMVRLRLTYFGHVVRRIQSLEKDIMLRKVEVSKKEDPQQRWNDTVASTMGSSITMIVRMAQDRAVFHSVVHRVAVSRNQLNGT	206245	208575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_206200_208600
914843	contig_91_pilon	-	3405	18	Intergenic	novelGene_127119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_17	43.4296153320436	64	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	97	2316	726431	675794	FALSE	15	TTTTTCGGTAGTGGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSFLPGNQEGLGPIVHARKSQTLPVSRNRAGMLHGRLQPLSSLDNALAVNHSYGHSDADVLHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEADTALRREPPLLPHSHSACQRRSQGGMFRQGCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLTELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPVYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTDFERSHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVAEQCKRRTVLTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCASAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQICPLEEKSSVLPNSLHIFNAISGTPTSTVVHGMTSSSSVV	727007	674704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_675917_677827_677967_678081_678183_679766_679958_683470_683682_687700_687848_689417_689532_691101_691225_700335_700443_702215_702294_703347_703406_706814_707031_707149_707264_710648_710832_710963_711102_717754_717871_726370_726508_726987
914844	contig_21381_pilon	+	478	1	Intergenic	novelGene_178955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCCACCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32802	33280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21381_pilon_+_32800_33300
914845	contig_2798_pilon	-	3419	3	Intergenic	novelGene_120031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1658	junction_1	31	583	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193421	117439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_120595_170381_170519_193294
914846	contig_17144_pilon	-	2870	13	Intergenic	novelGene_29232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1922.69656378454	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	624	1875	701	2575	174597	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176270	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_175001_175973
914847	contig_10013_pilon	-	1601	6	Intergenic	novelGene_125057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	468	821	264730	261244	TRUE	35	CTAAAACCCAGTCAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFCRDTTGSFESCREAKTYFWSFSCSSRRTSVSRTASTSFRRPDVLFQHSAPSRWSCRCSISSLRKVSPFLSLLEDFRSIFPAISRRRWPFSHSLTLASTCEMMSLMRFRAWVRSS	265197	256448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_256969_257945_258073_260051_260171_261229_261478_263046_263121_264684
914848	contig_13004_pilon	+	2574	2	Intergenic	novelGene_112685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGCATGTCTGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694338	697517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_695290_695894
914849	contig_835_pilon	+	1783	4	Intergenic	novelGene_152140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGGAGGTGAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106577	195508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_107100_130573_131159_177606_177810_195035
914851	contig_12113_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_134751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTGTATTATTCTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282422	284793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_282400_284800
914852	contig_9988_pilon	-	3460	1	Intergenic	novelGene_113052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTTCCAGCATTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59889	56429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_56400_59900
914853	scaffold_880_pilon	+	2027	2	Intergenic	novelGene_121492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	415	junction_1	0	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533257	536463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_534791_535969
914854	contig_3123_pilon	-	3607	11	Intergenic	novelGene_162975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTTTACAGCTTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291914	133877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_134753_143330_143448_152154_152232_156082_156161_156616_156704_168134_168227_168934_169049_177470_177592_220726_220826_231751_231835_290050
914855	contig_15361_pilon	-	2564	1	Intergenic	novelGene_167857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAATGGAAATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420137	417573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_417600_420100
914856	contig_11081_pilon	-	2059	2	Intergenic	novelGene_167078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	169	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTATTCTTTGATATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35058	32139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11081_pilon_-_32832_33691
914857	contig_10904_pilon	-	2478	1	Intergenic	novelGene_22534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAGCACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358245	355767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_355800_358200
914858	contig_1836_pilon	+	2385	2	Intergenic	novelGene_71073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_1	0	1	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	335	1249	994248	995162	FALSE	40	ATAATTTGAAAATTAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLCGPLLSVRTRARRPDSKAEIATAVPRSFLVRSYVGDFEKISHEEFEEKNETKLHEDRLISVNKSHPLQKPPSVFISEEASGYLTSPWLTVFIPAIYTGVFVVSLPLNIMAIVVFIVKMKIKKPALVYMLHLAMADVLFVTVLPFKISYYFSGSDWKFGSEMCRFVTAAFYGNMYASIMLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFICLAIWAVAIGAVMPLVLKEQTTQVPGLNITTCHDALNQTLHDSYYTYYFTAFSAVFFFVPLSISTVCYVSIIRCLSSSKVANRSKKTRALFLSAAVFCVFIICFGPTNVLLIVHYSLLSYNSSVEAFYFAYLLCVCVSSISCCIDPMIYYYASSDCQRYLCSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSTNLNSSIYKKLLT	970890	996298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_970944_993966
914859	contig_5317_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_76608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGAAAAAAAAAAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735596	736919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_735600_736900
914861	contig_9183_pilon	-	2262	7	Intergenic	novelGene_40341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	238	junction_2	367.911862935797	1	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	175	2055	323783	312131	FALSE	35	TAAACTGTAGACTGTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPRQEDAAGGSSCTLACCPGPGVALQTTASTEGEPGRRVSPAHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325992	311923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314888_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_323834_325868
914862	contig_11512_pilon	-	2217	8	Intergenic	novelGene_43333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	661.256534244942	1	125	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	304	603	566314	556654	TRUE	0	GCCTGTGTCTTTTTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622325	554955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555400_555483_556866_561325_561378_566278_566340_592848_592904_608476_608513_609587_609669_622219
914863	contig_5423_pilon	-	2913	17	Intergenic	novelGene_85232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_6	218.065500480933	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	528	1838	532780	502673	TRUE	40	TGCAAAATATTGGAGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKSLWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWAQEDQNLQELMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMENAERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQRCELVLIHTYPVGEDSLVSDRPKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNILVQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDTHLGGSSREGPFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCLTNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITTPDIKSMEVLRSLWNEQKIS	534610	497050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502736_504059_504239_506641_506732_506931_507022_515749_515835_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_530046_530122_532555_532792_534094
914864	contig_14687_pilon	+	2360	1	Intergenic	novelGene_107946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATGACAAATGTAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560748	563108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_560700_563100
914865	contig_6137_pilon	+	2900	19	Intergenic	novelGene_59193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	528	junction_1	938.892958571062	158	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	79	1956	1300382	1348329	FALSE	30	TAAGTAGTTTTTTTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAALALGAWRRRGPADPAASKRKTIRMTPSQVTFEIRGTLLPGEVFAICGSCDALGNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRYLFFMKNFHGMIGTK	1294894	1349273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1294950_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
914866	contig_7057_pilon	-	961	4	Intergenic	novelGene_123353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCACAGGTACTTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943717	941088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_941105_941206_941285_941402_941523_942970
914867	contig_9809_pilon	-	2030	6	Intergenic	novelGene_176768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	17.511139311878	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	273	836	127128	121810	FALSE	45	AAAATATTATTTTAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAQEKEELQREGDSLDAKINKAEKEIHALGNTLQVLNSCNNSYKQSFKKVTPSSDEYELKIHLEEQKRAADEKYRYKQRQIRELQEDIQSMENTLEVLEHLTNNIKGKLTEKQAYSFQLSREIAEQKPKLDRVTKQCSKLTKEIRLMKNTVNEILEEKDIKLREVKEFHKMIDKMLVDVTEENSDIRIILQTYFQQNGLELPTASSKGSRQSSRSSSQTSLLSARSSRSTASTSAFQAPIKVLELNLPASPSRSRSTSRPGTASSSSSNGKGKKGNK	128777	120615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_121970_126436_126523_126666_126847_126990_127132_128077_128185_128615
914868	contig_3181_pilon	+	3666	2	Intergenic	novelGene_136927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2201	2536	268937	269272	TRUE	5	TTGGGGTTGTGATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFFHQDSLFPAMLTGTPLPGPKPLPKGTQLSLCVGLEAHHTVSCCRVSATASHHLLSYNLLSVSWVQELLSAGIPGPKDMLAPGCSSLEVVEFSLPPLRWLTSSPAGWQN	266736	393028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_270121_392746
914869	contig_7898_pilon	-	1132	3	Intergenic	novelGene_47626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_2	5.5	283	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCTTATGGAGTTAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603757	601573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_602062_602165_602576_603523
914870	contig_9730_pilon	-	2540	13	Intergenic	novelGene_150629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	70.8082308461068	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	91	2379	466312	426497	FALSE	25	TTAACTGTGAGACTGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGAARYRLSCSLPGHELDVRGLASCLYPPGAFVSVSRDRTTRLWAPDSPNRGFTEMHCMSGHSNFVSCVCIIPSSDIYPHGLIATGGNDHNICIFSLDSPAPLYILKGHKNTVCSLSSGKFGTLLSGSWDTTAKVWLNDKCMMTLQGHTAAVWAVKILPEQGLMLTGSADKTIKLWKAGRCERNFMGHEDCVRGLAILSETEFLSCANDASIRRWQITGECLEVYYGHTNYIYSISVFPNCKDFVTTAEDRSLRIWKHGECAQTIRLPAQSIWCCCVLDNGDIVVGASDGIIRVFTESEDRTASAEEIKRFEKELSQATIDSKTGDLGDINAEQLPGREHLNESGTRDGQTRLIRDGEKVEAYQWSVSERRWMKIGDVVGSSGANQQTSGKVLYEGKEFDYVFSIDVNEGGPSYKLPYNTSDDPWLTAYNFLQKNDLNPMFLDQVAKFIIDNTKGQMLGLGNTNFSDPFTGGGRYVPGSSSGSSNAPPAADPFTGAGRYVPGSTSTGTPMAGADPFTGKLKELNGTAPEEKKLTEDDLILLEKILSLICNNFSEKPTAQQLQILWKATNWPEDIVFPALDILRLSIKHPSVNENFCNEKEGAQFSSHLLNLLNPKGKPANQLLALRTFCNCFVGQAGQKLMMLQRESLMSHAIELKSGSNKNIHIALATLTLNYSVCFHKDHNIEGKAQCLSVISTVLEVVQDLEATFRLLVALGTLISDDSNAVQLAKSLGIDSQIRKYASVSEPAKVSECCRLILNLL	466402	426335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9730_pilon_-_427063_428147_428313_440154_440224_443645_443718_445542_445763_446431_446590_450083_450254_452010_452147_452600_452769_454509_454631_454717_454819_458228_458423_466163
914871	contig_5696_pilon	+	2304	2	Intergenic	novelGene_117541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_1	0	151	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTGATCTAGATCCCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646522	649402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_647567_648142
914872	contig_16685_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_115048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTATTTGTTCTGTAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458091	460394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_458100_460400
914873	contig_10599_pilon	+	8543	1	Intergenic	novelGene_49877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAGCAAGATCCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129371	137914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_129400_137900
914874	contig_10479_pilon	-	3025	2	Intergenic	novelGene_147090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATGCCAAAACAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99891	2741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_-_4290_98414
914875	contig_7357_pilon	-	2278	9	Intergenic	novelGene_36783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2201.45065808889	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	219	1388	166824	136424	FALSE	20	CCTAGTACTTTTGTCAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167042	135533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139856_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
914876	contig_11498_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_65519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	49	363	197854	197540	NA	25	AGCAGCCTCAGCAGCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGICLRGASILGCSQHMPLACAQECGHLTRLCGVVRTALRMTWVLGVLFWLAPPHLGLVVESKGRCHGSVALGLSSLLCGGAEYVFVLFYFFLNFIYFVVIVENIHSKTYTNPTISTSTI	197902	196643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_196600_197900
914877	contig_15325_pilon	-	3841	5	Intergenic	novelGene_157157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_4	59.2426155735886	146	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1149	1676	89409	62826	FALSE	25	ACCATTGTTGGTAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNCHAHFWTTKAFLPTMLEINHGHIVTVASSLGLFSTAGVEDYCASKFGVVGFHESLSHELKAAEKDGIKTTLVCPYLVDTGMFRGCRIRKEIEPFLPPLKPDYCVKQAMQAILTDQPMICTPRLMYIVTFMKSILPFEAVVCMYRFLGADKCMYPFIAQRKQATNNNEAKNGI	90557	60660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_-_62950_63054_63187_65383_65530_66729_66829_89382
914878	contig_6975_pilon	+	3218	2	Intergenic	novelGene_74306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2154	2468	527553	527867	FALSE	75	AAAAAAAAAACCCTCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQHFLTVSATEVLSFFSPVLEVTFFKSGLSNCSVILSVFLVICTSCDFSSTHPFDSDTSESSILLLVAWSKSVTITEESGGEVLSGELESSEILRGVGGNSDK	521589	528617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_523701_527510
914879	contig_5623_pilon	-	2729	2	Intergenic	novelGene_154844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	942	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	69	533	210277	209176	FALSE	30	AATATATATGCGGGTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQVGGVGSCHVGSLWPLAFLPCTQFPGKVPCEPKSL	210345	206979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_209405_210041
914880	contig_6076_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_81747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTCACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96062	93383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_93400_96100
914881	contig_5302_pilon	-	2964	10	Intergenic	novelGene_81426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	696.188636278955	187	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	330	1637	209238	176894	FALSE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDPGSPKKCRARFGLNQQTDWCGPCRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTSTATGISQIGSLAGPRHLASSRSPPPERRRQSPKARGNRPGALLTPS	209567	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_178671_178745_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
914882	contig_14405_pilon	-	2292	14	Intergenic	novelGene_85663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_13	184.916421229259	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	507	2150	885922	726183	FALSE	35	TAATGTTCAATGTTAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDDEPTDIIPRSCQLTTDVPQVTQLLNMTKLRQTEIQFGGHPLRSAESDQFIHRGGSVRNNKSQDVCHIAFGSKVLGPPPLSGRRNNMRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPRDWLSVFSPPIVPPSQQPTEQRLESSGSLSAQGEDELNVEEDEEVLTLLYDPCLNCYFDPQTGKYYELV	996196	726040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_726296_740543_740639_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827971_844997_845136_866566_866724_885904_886020_989814_989909_995881
914883	contig_6361_pilon	+	3149	6	Intergenic	novelGene_23954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	429	773	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	380224	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_380471_405177_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
914884	contig_3956_pilon	+	2682	14	Intergenic	novelGene_14983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1342.77064531407	4	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	472	2163	1284763	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283822_1284199_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287507_1288932_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
914885	contig_13067_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_141339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACATCATTTACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41955	44133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_42000_44100
914886	contig_6599_pilon	+	303	1	Intergenic	novelGene_175998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTCGGAGGGGAGAGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262413	262716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_+_262400_262700
914887	contig_15135_pilon	-	2494	5	Intergenic	novelGene_119887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	884	junction_4	183.058733744118	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1564	2145	120151	113374	FALSE	50	GAAGAAAAATTCAGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQAIFSVSNPHSEIVLVAKIEKILMGNIASGAEPYIKNPDSNKVMHNLPYK	122265	113024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_113524_113709_113932_119824_119981_120097_120182_120732
914888	contig_12622_pilon	-	2103	13	Intergenic	novelGene_5996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2086.84591049906	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	5	1723	1590968	1585459	TRUE	35	ATTTCTAATAAATTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMNPWQLLVLVLLVLGGCCAAPRPRQPTFVVFPGDQQTNLTDLQLAEDYLYRYGYTHVAEMNREKTSLGRALRRLQQNLALPETGELDNATLEAMRAPRCGVPDLGSFQTFEGDLKWHHHDITYWVQNYSEDLPRGVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTQVYPQDVKDLKDVDIVIQFGYKEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFTFEGRSYTACTADGRSDGMLWCSTTADYDTDHKFGFCPSERLYTQNGNADGKPCEFPFTFEGRSYSACTTDGRSDGQLWCATTASYDQDRLYGFCPTRADSTVTGGNSPGKMCTFPFVFLGQEYSTCIREGRRDGRLWCSTTSNFDRDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHTSVPEALMYPMYRFTEEHPLHEDDVKGIQHLYGPRAEPEPRPPTTTAPEPQPTAPPDCLPHSTADCPPLRAPHYWSHWPPSFLQSWTLPLRTRSPRRFSSSLGARCGCTQARRRWARGGWTSWAWVRRWITSPASFLGARVRRCYSAGNDSGGST	1590972	1583579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1583867_1585365_1585470_1585553_1585705_1586266_1586334_1586697_1586840_1587628_1587785_1587864_1588042_1588434_1588609_1588835_1589010_1589098_1589228_1589523_1589691_1590000_1590234_1590830
914889	contig_2040_pilon	-	1982	2	Intergenic	novelGene_178956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGAAATAAAACTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46565	22946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2040_pilon_-_24013_45649
914890	contig_1443_pilon	+	5606	3	Intergenic	novelGene_28153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1518	4089	5606	324365	325882	FALSE	25	GCAGATGTAACTATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTTPPFSTPPKADFSQHESLMEKCLREGREKEGLSAYPVIRGSGLPRHDGLDFQVFKELRKSMIENGLQSSFTRGYVEAIGQNYEMTPWDWKLLMRTVLTPAQFSVWSQEYKEHCNLYAVDNLNHNIPISLDMLLCSGNYSTPQAQSQMNRQTFSQASNAATKAWGKVPDSKTPTGSFATIRQTANEPYIDFINRLQTAISRQVDNQQAAEVLCLQLAYENANADCRAVLTPLKAQNPNLAEMIRACQNVSTETHKAQVLAAALRPSTATCFGYGKPGHFKKDCHSSKNKDANTKLPSRKCPRCGKGFHWANQCRSQFDNQRNPLSGNERRGESSRAPEKSREPLSIDSKQQRLQINDLKVATKESARLDLPLAEGAILDKAGKVFLIATQVWGPLPRGYVGLLLGLSEVTSQGLTIHPSVIDSKYKGQIKIMVSSLSYWNITLSDKIAQLLLLPFVVPFARTTPGRGEGSDHTDAFWVTKVQSSRPYLTVQVNDRIFKGLVDSG	255753	325882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_257161_318685_320414_323411
914893	contig_15114_pilon	-	1800	3	Intergenic	novelGene_121151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_2	69.5	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGGTTATCTATGCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149215	137092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_137181_141879_142046_147669
914894	contig_835_pilon	+	2779	3	Intergenic	novelGene_152156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTAGATTTAGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232554	240292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_233523_233912_234307_238875
914895	contig_17796_pilon	-	1537	9	Intergenic	novelGene_33770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGAGGAGGGGGGCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35245	11990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_12178_13652_13827_13904_14010_15232_15320_16867_17090_17996_18199_20415_20617_31849_31872_34908
914896	contig_7457_pilon	-	2868	5	Intergenic	novelGene_31477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	181.605857559716	7	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	49	549	549396	537177	TRUE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEVRLLFLLVFEQLIFHPHKGAIFLFQ	549444	534691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_535395_535560_537384_537938_538037_539131_539211_549279
914897	contig_16622_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_48494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	635.725482334072	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	210	692	115540	115058	TRUE	70	AAAAAAAAAAAATTGATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDELWVGASAVWWWCFWRTDQRQGKTKQKQELKPSDQHQGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQVWGFCRVLGAEDPGGQLWGAMEPATHFPGIPKAPPLLSDLPQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQVPGTWGGERRQALASNETADELGAPKAAENI	121449	114067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_114360_114528_115559_118811_118884_121330
914898	contig_16237_pilon	+	3805	7	Intergenic	novelGene_162667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_5	15.2059929706094	240	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	212	1957	3056	6758	TRUE	15	ACATTTTGTGTCTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSHDVKNGGELTHSTHSPGQSSPRPVISQRVVNNKQAASGFIGPQLPSHVIKNPPHLNGTGPLKETPSSSMSSPNGNASVNRASPVNASTSVQNWSVNRSSVIPEHPKKQKITISIHNKLPVRQGQSQPNLRNNSLENPSKPVPSSTITNSSAIQSTSNASPVSVSSKVTKQITPSESCPKPVMNGKSKLNSSVLVPYGAESSEESDEESKGLGKENGLGTTKSSHSSGQDVEDDEASQHELQAPITLNGANSTDSDPKENGLPFDGASCQIQPSLSENPFSKANGLPAKLMPAPLPLLPEDKILETFKLSHKVKGSVEETSATGTEKNPKEDHEAELEAASSPLDPSENLETVTSLGSKLKKALLPSEPSVKSTKEEASENGSAKPTESLPSTHNLCNANKSTLGDDQLSKLCDPGNLTSDQIKPSQDTNGTLIESPQGRASVETAEKMTPAPSVNSADECEHKLLVYISREKCREPEDLPQSSGMSTSELPSPQLDTITENHSDKALEQSNGERREENKVGQKVQDHSPVKEKISSLRKVDRGHYRNRREHSSSSERARESRSKTEDRYHKQRHPYTRERPKQDRHKPEHCNGSQQHLAHGERGSPRRAPLPGPVQPPPLSEPERVRPGMGQVPPLRKRVRLGPGEVLP	1156	15952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16237_pilon_+_1314_3001_3716_3835_3931_5767_7264_8355_8658_13587_13628_14951
914899	contig_7663_pilon	-	3832	1	Intergenic	novelGene_178925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	326	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	2839	3594	123904	123149	NA	35	TACAGGTGCCAGAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLNAPIKRRRVADWIKKHDPSICYLQEMHLRLKDTNRLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYASNNSAPKYIKQTLTALKTEIGSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNIKILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKNQTHGN	126742	122910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7663_pilon_-_122900_126700
914900	contig_11631_pilon	+	2325	7	Intergenic	novelGene_104167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	543	junction_1	208.841580044673	96	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	479	1087	24431	36039	FALSE	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEIKTETEKQSPPHGEAKAGSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGSAPDSTTPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYNIYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQQHLLLQSPGSHHEPESPQLRYLPPQTVDHMPQEHEGDLDPHTNDVDKSLQDDTEPENGSDLSSAENEQTEADQATAAETLSKNDILYDGENHDLEEKPQDIVQSIVEEMVNIVVGDMGDGTTVNANADGNVGTLEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQV	12717	37277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_12751_13292_13450_14553_14701_24289_24470_30904_31182_34366_34478_35857
914901	contig_9235_pilon	+	2302	3	Intergenic	novelGene_156211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	228	1313	45805	47334	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDFFTLV	43973	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_46872_47315
914902	contig_3747_pilon	+	1963	8	Intergenic	novelGene_24760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	3	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	333	1436	201313	204640	FALSE	65	CTTTGTAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSFVKFFSPPHL	200980	205167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203582_204607
914903	contig_12080_pilon	+	4312	1	Intergenic	novelGene_128354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	540	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1533	1958	65019	65444	NA	80	AGGTAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDDFSVEEKAHQLPDREFKSLIFRDIQELKQKADKKEEKIDKFMEKADKIMANTDKTMEELRKIIQEQNIKINSQLEIIHKQQFESQKINNKISEMDTIIEGLRSRCETTEDGISKIEDKYLATSLFEEKS	63486	67798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_63500_67800
914904	contig_6088_pilon	+	3809	3	Intergenic	novelGene_161265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCCTAGCAATGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51639	135242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_+_51731_71850_71858_131531
914905	contig_6227_pilon	+	3833	2	Intergenic	novelGene_49805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCCTCTCTGTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1276390	1280391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1277157_1277324
914906	contig_987_pilon	-	2429	5	Intergenic	novelGene_72311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	2085	2429	996028	991266	FALSE	5	CTCCGCCTCCCGCTGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINPHKLESFTNIIQNWVRSAIELRVPMAAPSQLLQIALQHVREEMAGAESRSVDSTAVLAATSLQPHRLTLAEPPIHPPGPLWRGNRPLDPWRPPQSLSNTEPASLRVAILDS	1194032	991265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_991457_991536_991623_995960_996202_1169534_1171364_1193950
914907	contig_7707_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_72166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTAAGCCTTCATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272990	274906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_273000_274900
914908	contig_6975_pilon	+	3438	3	Intergenic	novelGene_74293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431400	435018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_431904_431994_434310_434398
914909	contig_12740_pilon	-	2381	1	Intergenic	novelGene_159207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1393	1716	50023	49700	NA	45	ACACACATACACGACCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENHKGRTNLAFLKLKELREKIQASRCNIEGFLGKILNDSGCNQRRWKEYTESLYLKELVKVQPFQEVAYDQEPTILKEEVQAVLMTLVKNKAPGADWNTS	51415	49034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_49000_51400
914910	contig_11448_pilon	-	3892	1	Intergenic	novelGene_66377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTGTTTATATAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308106	304214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_304200_308100
914911	contig_18976_pilon	-	1916	4	Intergenic	novelGene_174894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.5764535535124	54	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	49	420	23591	10456	TRUE	35	GGAGGAAGAAAGGGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIFRFLQHSLRNKSLQMNDYKIALLCNAYSTNSECFTLPMGGLVETIYGNGIMRIPLPGMSCVDSGCITPLPVNLLDSLTVNAKMSLIHSIVTRVIKLAPAKSSVTLAPVLVEIHSRLLVYMEIESLGIKGFIIFFYRL	23639	8779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_-_9268_9447_10476_21879_22023_23382
914912	contig_16673_pilon	-	2417	2	Intergenic	novelGene_178957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGTCAAAATAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71699	69242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16673_pilon_-_71137_71176
914913	contig_15114_pilon	-	3077	2	Intergenic	novelGene_121142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	157	junction_1	0	29	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	77	304	125261	123526	FALSE	35	AAATACCAGTGGCAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGTRRARSRQWPLWPDRLPSSDAAMARTLGISLGGCLLLTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQRWVWRHWWRESPEVGGKF	125337	120752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_123705_125212
914914	contig_10479_pilon	+	2761	1	Intergenic	novelGene_147097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTATCAGAAGTATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44841	47602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10479_pilon_+_44800_47600
914915	contig_5779_pilon	-	3321	2	Intergenic	novelGene_106458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	160	junction_1	0	50	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2775	3185	108909	107541	FALSE	15	TCTAGGCACTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFPNGFPCPVEVQTDFIDNNPQSTWNTATSMPTAWGHASFINSTPYLASTRSLSPMSGLFGSIWAPQSDVYENCCSINPTTEHATHMENQAVMCKEYYPGFNPFRAYMNLDIWTTTANRNANFPLSRDSSYCGNV	111683	107404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774
914916	contig_12437_pilon	+	2950	1	Intergenic	novelGene_169084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCAGAGAAAAAGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122846	125796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_122800_125800
914917	contig_16122_pilon	+	2535	9	Intergenic	novelGene_134548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	394	9	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	841	1347	282240	283427	TRUE	10	GCATCTCCAGGGTGGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSVTRQFRAARSRWMQHLLSRYSMPAAASPTICSRIFTRRRGPSVRRKVRKSPPLHELHDNVDGLFLGADANETHNVGVAVLLQDPRFLQKLRLEVRGERLSARFHGYEAVVSSQASTEHFAKVPLKQPWAPTKVFPEPPSSSPRLRGDSPPCPHPFFTECPHARH	280341	285888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_280941_281381_281503_282119_282281_282523_282651_282740_282837_283184_284236_284656_284786_285120_285331_285847
914918	contig_6088_pilon	-	2742	3	Intergenic	novelGene_161273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCGAGGATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318588	159306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_161545_264847_264936_318172
914919	contig_4305_pilon	+	336	2	Intergenic	novelGene_136686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTTCTGGCGGGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513034	514007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_513297_513933
914920	contig_5727_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_7987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTGGGCACCATCTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471172	469879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_469900_471200
914921	contig_10801_pilon	+	4423	1	Intergenic	novelGene_74035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCACCAAAATAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247603	252026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_247600_252000
914922	SIRV6	+	782	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
914923	contig_2365_pilon	-	3311	2	Intergenic	novelGene_103760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	151	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAATTATCAGATATACGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267285	254304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_254312_263981
914924	contig_14397_pilon	-	4276	1	Intergenic	novelGene_134652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	757	1176	111082	110663	NA	40	CTTCACCTGAAGTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKRSITSQSRRGCECWTSDLCCLSLHYLNYKIVLTIHVQSLYIINKCKNEWCSLEARMARLRLTYFGHVIRRDQSLEKDIMPGEGQRKKGRPSTRWIDTVAATMGSSITTIIRMAQDWALFRSVVRRVAMSRNRLDGT	111838	107562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_107600_111800
914925	contig_2577_pilon	-	2405	3	Intergenic	novelGene_172047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTACTTCTCAGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148691	8538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_8758_10092_11058_147470
914926	contig_5765_pilon	-	2365	1	Intergenic	novelGene_141400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716173	713808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_713800_716200
914927	contig_14326_pilon	-	2166	4	Intergenic	novelGene_120742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	29.7806797922561	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	105	458	487141	473411	TRUE	60	TATCAAAAAAGAAGAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPWCLRLLRGVTPLQSSRLHCENTALSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVGIRWTHHGSSSSTAVSCFLNCPEVETFEKVKCAFLELMSPVGFGQIWK	493203	469744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_470732_472689_473737_487113_487194_493151
914928	contig_20026_pilon	+	3539	1	Intergenic	novelGene_175415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1410	1712	41441	41743	NA	40	AAATACTGACCCTACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSASNQNKEPRNLPEEENFLELPKVEFKTLIYRALQHFRKEIRQNADQAKEHTNKATEELKKVIQEYNGKFNRLQESTEREQTEIQKINNKISELDKKS	40031	43570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_+_40000_43600
914929	contig_17274_pilon	-	3338	10	Intergenic	novelGene_26582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_8	323.922182394034	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	2271	2906	251759	232842	TRUE	35	ATTTTTATACTTAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	259035	231565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_252231_252363_254033_258905
914930	contig_8322_pilon	+	4645	1	Intergenic	novelGene_143246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	2153	2764	294578	295189	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKVSMVNLPTFLARMIPLLVIWRSFINEYTGNWRKLTTS	292425	297070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_292400_297100
914931	contig_11378_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_112290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	950	1249	523319	523020	NA	50	ACCACTGGAAGAAAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKVGKYQGNNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMKT	524268	522349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_522300_524300
914932	contig_12852_pilon	+	1363	12	Intergenic	novelGene_141447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	141.2621383653	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	158	1000	522067	539027	TRUE	30	CGAGACCCCTTACAACATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKNGANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVVELLLSHGANPCVTGLQYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVTLEWRYCVDWCRQRWSC	500107	552527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_500214_522015_522175_528611_528711_529715_529815_532304_532404_533814_533917_536110_536210_537625_537806_538970_539080_544679_544779_547316_547416_552414
914933	contig_11493_pilon	-	6938	3	Intergenic	novelGene_143707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.5	174	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTCATTTTTGTTCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275334	264401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_266626_270046_272903_273476
914934	contig_9177_pilon	-	1495	2	Intergenic	novelGene_32767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATGGTGTTATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336469	1334872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1336228_1336329
914935	contig_9177_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_32717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATTATAATGAACAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594690	596690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_594700_596700
914936	contig_2257_pilon	+	2522	5	Intergenic	novelGene_122497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	500	junction_4	173.049667725772	1	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	429	983	291452	331989	FALSE	50	GATGAGAGAAGAAATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCTLAAWLINKAGHLFEQPQEYDDPNATISNILSELRSFGRTADFPPSKLKSGYGEHVCYVLDCLAEEALKYIGFTWKRPAYPVEELEEETVPEDDAELTLTKVDEEFVEEETDNEENFIDLNVLKAQTYRLDMNESAKQEDILESTTDAAEWSLEVERVLPQLKVTIRTDNKVQKREHILFK	291023	333528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_291572_292340_292460_299387_299479_310267_310337_331833
914937	contig_8452_pilon	+	2091	2	Intergenic	novelGene_48047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1115	junction_1	0	2	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	37	1122	432928	434013	FALSE	5	CGTATGCTTGGTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423993	434982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909
914938	contig_10404_pilon	+	1995	3	Intergenic	novelGene_138680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	1384	junction_2	2148.5	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	78	458	1098040	1098926	FALSE	50	AAAAAATTACAATTTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEGNSVTLATLFCALTLNLKILVG	1097962	1100463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1098110_1098197_1098305_1098722
914939	contig_13787_pilon	+	2505	1	Intergenic	novelGene_40627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGGATGGCTGTGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164410	166915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_+_164400_166900
914940	contig_9833_pilon	-	3450	4	Intergenic	novelGene_68512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	15	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	20	GATGGGAGGGATGGGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	213547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
914941	contig_20356_pilon	+	2561	1	Intergenic	novelGene_159524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACACTACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13820	16381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_13800_16400
914942	contig_11417_pilon	-	1192	8	Intergenic	novelGene_103311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGGCCAGGCGGTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560802	556436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_556738_557383_557471_557567_557642_557739_557806_558175_558386_559104_559261_559485_559656_560674
914943	contig_5196_pilon	-	2204	2	Intergenic	novelGene_38685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260522	224025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_226135_260427
914944	contig_10182_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_134632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389568	390649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_389600_390600
914945	contig_6724_pilon	-	6404	1	Intergenic	novelGene_167979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCCAGCCAAGTACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375721	369317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_369300_375700
914946	contig_12008_pilon	-	1427	1	Intergenic	novelGene_24989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4670	3243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_-_3200_4700
914947	contig_10930_pilon	+	504	6	Intergenic	novelGene_37088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7400	junction_5	5111.4698316629	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	83	481	339608	342083	FALSE	5	GTGCTTTTTGTGTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK	339417	342106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_339463_339570_339622_339803_339921_340994_341098_341522_341625_342020
914948	contig_11493_pilon	+	3588	1	Intergenic	novelGene_143665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2565	3008	134355	134798	NA	60	AGTAAAAAAAAAAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQETKVRFPINAPEEQPPPICQWRLVCCCDTKQVSVELSDMAIYQNQPTKTLWITTVQFSCAWSLHELGANSVTANNNNKNVFWKKQFTHISQAQRMEEIIYKETCKMRIQSALKAPTERTSKVAHKAIPLDLAVRGHRSHFPEQFP	131790	135378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_131800_135400
914949	contig_7188_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_108533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCCTATTCCAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131484	132628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_+_131500_132600
914950	contig_10642_pilon	-	4169	2	Intergenic	novelGene_78647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1816	2289	102327	101854	FALSE	90	ATACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPYCRWLGGVGGATSSQAPDVGKVKTLPNGQSSVKWQEPATSQLKQLKLDFRYIPCCTGVMRAYAVEMGPHKSMQGERHSKSMGPLCLCLGKGAVATLGSWLRGASSLFFPLFVNLFTLQGRENGSRCVTGPTSGPGDSAIAEAGPGPSAEQGAGR	251014	99973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_102348_249219
914951	contig_5153_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_74378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1027	1500	967665	967192	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSFEQNKGIPRGLESRKECVSVASFHHTYSICMLSKIIREAGLYEGERGIRIGRRLIKNLCYSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQNHNRGFRTELEKNVEHNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSHRFTVQPGSGQPRKTK	968691	966896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_966900_968700
914952	contig_12958_pilon	-	1708	10	Intergenic	novelGene_136194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	212.798867536205	1	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	16	1155	70610	51103	TRUE	60	TAAAGAGATAAATCAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAPICLVENQKEQLTVNPKALKILNEIYQPVVVVAVVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFRLGSTVRSETKGIWMWCVPHPSKPRHILVLLDTEGLGDVEKADPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSSSRSDEVEDSTEFVSFFPDFVWAVRDFSLELKLGECPITEDEYLENALKLIPGRNPKIQNSNLPRECIRHFFPKRRCFVFDRPTSDKNLLAHVEELPEEQLDCNFQMQAKNFCSYIFTHAKTKTLRQGIIVTGNRLGTLVETYVDAINSGAVPCLENAVTTLAQRENSAAVQKATDHYSKQMAQCLRLPTDTLQELLEVHAVCEREAITIFMEHSFKDENQEFQKQLAP	70625	39994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12958_pilon_-_40048_40927_41122_41468_41572_50899_51113_52408_52686_61224_61471_63129_63327_63529_63640_65624_65753_70438
914953	contig_4686_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_118542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGATCTCATCAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502785	504845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_502800_504800
914954	contig_13481_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_119335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAGCAAGTAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336428	337119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_336400_337100
914955	contig_14661_pilon	+	1974	3	Intergenic	novelGene_47435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATAAATAGATAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	23082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_+_734_1045_1813_22608
914956	contig_12250_pilon	-	1649	1	Intergenic	novelGene_80608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGAACCGGGCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347735	346086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_346100_347700
914957	contig_5758_pilon	+	2686	1	Intergenic	novelGene_119086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	879	1220	164174	164515	NA	80	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGRGLSQVTQLRKLASPRSAGRRAGLLLTGCADQRIPGLADKLTVQVPRMGDEMTGSSPRIQREQKARTSAYIQIQATPPRRLPFIGLATHSIFNHGSDYIKTPRIMAQPS	163295	165981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_163300_166000
914958	contig_6375_pilon	-	2002	11	Intergenic	novelGene_72956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	203.482701967514	1	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	235	1581	229000	202748	FALSE	10	GCTTTCAGTGGCTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVSFADQIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234041	202326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204879_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229030_229144_229237_233928
914959	contig_9415_pilon	+	4701	6	Intergenic	novelGene_109800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	65.590853020829	169	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	298	735	1720811	1737702	FALSE	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLAYVSGLGFGIMSGVFSFVNTLSDSLGPGTVGIHGDSPQFFLHSAFMTLVIILLHIFWGIVFFDGCEKKRWHTLLVVLLTHLLVSALTFISPHYGINLASAYTAMVLMGVWAFFVAGGSCRTLKLCLLCQDKDFLLFSQRSR	1712855	1741668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1712945_1714635_1714792_1720758_1720830_1721860_1721984_1733129_1733258_1737534
914960	contig_5758_pilon	-	5861	3	Intergenic	novelGene_119078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	114	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3441	3749	133782	133474	FALSE	45	GTAAAACGATTAAGATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNAIVSQLDPIDVYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFFRIDHVLGHKASLNKTQSIKILQSIFCDHKAIKVEMNNRESKQKKVKHMETEQHLAEKLLGYRRN	466095	131361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_134405_314422_315297_464151
914961	contig_6275_pilon	-	977	2	Intergenic	novelGene_142473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAATAAAACAAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198043	194912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_-_195678_197831
914962	contig_1986_pilon	-	2231	1	Intergenic	novelGene_64142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGCAACGGTTATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374733	372502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_372500_374700
914963	contig_12931_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_166774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1301	1870	125321	124752	NA	40	GAAATACTAAAGGGAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISSHIKRQSMMASARSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRRICRTHLGIRKEIQQSAEIARQHTDTVVAELKKVMQEHNAKFNRLQEYTERQQSEIQKINNKISELDNSIESHKSRIEAVEVRISDIEDKALDGNLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERGRNRKYRENC	126621	124345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_124300_126600
914964	contig_1301_pilon	-	3351	13	Intergenic	novelGene_47310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	669	junction_3	596.960286227931	58	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	83	1291	322831	279341	TRUE	55	GAGAACGAAAGAGGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKR	322913	268662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_277728_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
914965	contig_2093_pilon	+	3410	1	Intergenic	novelGene_152937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	877	1488	958641	959252	NA	40	AAAAAAGTCCCTCTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957764	961174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_957800_961200
914966	contig_10602_pilon	-	1328	5	Intergenic	novelGene_159641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_3	103.20973791266	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	5	742	37611	33752	TRUE	50	AAGGAATTTTAATAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAAARCWGLLPRIRGLSLHTAAKVDVVAPETSGPDVASAPVARYPPIVASLTAKSKAARQRRIERWQAAVHAAESVDQKLRILTKMQFMKYVVYPQTFARNADRWYQGFTKTVFLSGLPSPLVEPAPALELASLRAAACDCLLQEHFYLRRKRRAPLYQDREAIASPFLDQLVAALVGLLSPHNPALAAAAIDCKRPVHFYWMRGEEIIPSGHRKGRVDALRYQIDDKPHNQIRISKQLTEKSLL	37615	30042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10602_pilon_-_30392_32554_32732_33691_33767_35529_35676_37034
914967	contig_2969_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_157082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	448	813	978848	979213	NA	25	CCAGTACAGCTAGATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSWLSKKLTTPYRIDPKRKSLRHIIITLVKTKDKQRILREAHEKQEVTYSGETIRLSSDSSAETMQARRQWDDIHKTLKEKNFQPSITYPAELLFKNDGEIRTFPDKQKLREYVKTKPNL	978400	980056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_978400_980100
914968	contig_11846_pilon	+	6395	25	Intergenic	novelGene_105960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	4117	4473	336000	336356	TRUE	60	CCCCAGAAACTAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVTTSCFVVASSALTSNFTSCGAGRSSPTGSLGIALVFREGVALLIVPCSSARIWLVWTTPFSNFQLIRPSRLFPFSLRDLRCHFVPFTPFIVIRVLRAKVPGPTRRPVIVIPRVIF	289563	557965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_290503_291703_291847_295011_295085_295497_295722_298106_298202_298461_298610_299885_300062_302252_302391_307392_307580_308017_308111_308652_308784_319251_319382_324473_324609_326101_326151_327244_327317_329615_329792_332588_332748_334951_337301_339601_339947_356655_356764_437088_437159_467818_467905_476995_477075_526040_526173_557807
914969	contig_7909_pilon	-	3789	2	Intergenic	novelGene_155909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1046	1627	483704	483123	FALSE	50	GTATGATATAGCAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMAPIGVQIKTQDNSPVEENALEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGGENRKRREDH	484934	480960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_484499_484683
914970	contig_21369_pilon	-	1783	3	Intergenic	novelGene_176299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	6	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	156	383	19962	7730	FALSE	40	CTTGATTTTAAATAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSFRFFVFFFIYICQFAVHVLQAAGFHNWGNCGWISSLTGLNKSIPVGVLMIIIAALFTASAVVSLVMFKKVHGLYRTTGASFEKAQQEFATGVMSNKTVQTAAANAASTAATSAAQNAFKGNQI	23350	6329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21369_pilon_-_7895_19899_20018_23250
914971	contig_6286_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_165673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1295	1786	460384	460875	NA	55	AAAAAAGAATATGGAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQRQRQEDRLLGKPLGPVHAGPVTSGAPSPRVALHVAQTAQATASTPLGRSRIHLSIHLSIHPSIHPSMSHQPKGSLLPLTHTAFYLPGPLRIWRNSSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKTRFTSLKETGETPTVWPPDTLLAQW	459089	461361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_459100_461400
914972	contig_13481_pilon	+	1519	3	Intergenic	novelGene_119511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAGAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1411860	1413952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1411959_1412475_1413250_1413305
914973	contig_2892_pilon	+	4164	2	Intergenic	novelGene_119021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	548	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACAGTTTTCAGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272605	285415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_276683_285328
914975	contig_14666_pilon	+	1586	6	Intergenic	novelGene_39577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1732.84568268499	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	86	1387	477340	485019	FALSE	30	GTGCTCCCTTTATTAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQGQMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477254	485218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484089_484127_484864_484957
914976	contig_13720_pilon	-	1206	3	Intergenic	novelGene_178767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21504	1955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13720_pilon_-_2436_20598_20899_21078
914977	contig_821_pilon	-	4751	8	Intergenic	novelGene_149379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_6	446.69466355552	444	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	343	2364	171190	39265	FALSE	10	GCTGTTGTTATCTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRVKLLIGPVQEIPAGQDQPPSGLMHQAFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQVPTGHGTQEQDVYQVPPSVQRSIGGTNGPHLSKKVITPVRMGHGYVYEYPSRFPKDTYDIPPSHATQGVYDIPPSSMKGPVFSVPVGEIKPQGIYDIPPSTGMYAIPPSSCRDEVGLRGKEYDIPPPMRQAGRLQVTPEGVYDIPPASTKPVGKDVSMKYNCDVPGAAELMSHRHQNMSLNHAPSLLGLPVGTQNDAYDIPRGVQFLEPPAETSEKANPEEKDGVYDVPLHNPADTKGSQDVVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTTSKESSLSASPSQDKKLLLDPDTAIERLHRLQQTLEMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTVVDKVELFLREYLLFAKGALANASCLPELILHNKIKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECNWSLNILAISKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPDDAKQLTTTINTNAEALFKAGPGSSHLKNGPESILNSTEYPHAGSHKAQAHNKTLHPSLGKDQPPDCSSSDGSEKSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIIKQNKMQLEHHQLSQFQLLEQEITKPVEQ	264078	36877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_39319_42364_42455_44311_45527_46810_46913_47427_47530_68762_69210_171178_171366_263911
914978	contig_4091_pilon	+	3028	3	Intergenic	novelGene_173006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2280	2717	13212	13649	TRUE	80	AAAAGAAATAAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	10817	149508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12128_12242_13920_149467
914979	contig_13481_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_119273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTTCACCTAATACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106675	105655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_105700_106700
914981	contig_6062_pilon	-	4890	2	Intergenic	novelGene_5308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1722	2087	868245	867880	TRUE	55	TTATGTAGTAAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTTLGALIHGINTIRIISNNAQVPEERLDTWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYDKSDQCLICKIYNILQNLNKKKTNNPIKKWTKNINRHFTKEDIQAANRHMKKYS	869966	806566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_808883_867392
914982	contig_13051_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_140113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAGTACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181614	183216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_+_181600_183200
914983	contig_5317_pilon	+	894	4	Intergenic	novelGene_76536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	44	454	35282	43326	FALSE	35	ATGCAAGTACATGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33745	43766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
914984	contig_3900_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_84202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGAATAAAACCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542997	552645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_543600_544126_544277_544468_544563_547039_547229_547795_548009_548731_548812_550975_551137_552489
914985	contig_15108_pilon	+	4941	1	Intergenic	novelGene_131176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71144	76085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_71100_76100
914986	contig_7035_pilon	+	5356	1	Intergenic	novelGene_83518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	148	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAAAGTTTAAACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268812	274168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_268800_274200
914988	contig_6929_pilon	+	2416	6	Intergenic	novelGene_139430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	58.1996563563738	67	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	35	625	194296	202816	TRUE	40	ATGCTGAATAAAACTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPATTARTEGVTENQAVQSATGSLVELTPTPGGLALVSPYHTHRAGDPLDLVALAEQVQKADEFIRANATNKLTVIAEQIQHLQEQARKILEDARRDADLHHVACNIVKKPGNIYYLYKRESGQQYFSIISPKEWGTSCPHDFLGAYKLQHDLSWTPCEDIEKQDAKISIVDKLLHQPVALPTCTEPNFQGLTH	194261	204681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_194366_194493_194610_201374_201462_201960_202093_202630_204324_204397
914989	contig_9535_pilon	+	4895	1	Intergenic	novelGene_124486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	3200	3847	374783	375430	NA	30	TTCCACATCCATGCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRNPSPDPLSESESEEEENANYLNESSGEEWDSSEEDPVVPNLTPLESLAWQVKCLLKYSTTWKPLNPNSWLYHAKLLDLSTPVHILREIGLRLSHCSHCVPKLEPIPEWPPLASCGVPPFQKPLISPSRLSRDHATLNGALQFATKQLSRTLSRATPIPEYLKQIPNSCVSGCCCGWLTKTVKETTRSEPINTTYSYTDFQKAVNKLLTASL	371583	376478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_371600_376500
914990	contig_5643_pilon	+	504	6	Intergenic	novelGene_38793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1022.79292136776	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	68	502	233973	236753	FALSE	20	GTGAGGATGGCAGGGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIV	233607	236755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639
914991	contig_16632_pilon	-	3570	7	Intergenic	novelGene_154132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	349.685453896308	153	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	2962	3570	103037	86027	FALSE	30	TGCATTACCCAGTGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDAKQLQNENDNLREQNENASKVIDSQQVEIDRMILEIQSMQGRLSKEKLITQKMVEELEKKERNIQRLTEALLGNQRQTEETCSSLDQGQEAGQSRQQTVLSKWPLFDLTVIDQLFKEMSYCLFDLKALCSILNQRAQGKEPNLSLLLGIRSMNCSAEETENDHSPETLTKKLSDVCQLRRDIDELRTTISDRYAQDMGDN	170735	86026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_86176_89580_89813_93377_93486_102379_102431_102968_105700_105807_105880_170508
914992	contig_21232_pilon	-	2163	7	Intergenic	novelGene_165973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	296	622	18251	15001	TRUE	80	AAATAAATTAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILWLVVVSFRGSPAPSRVVSILNESESLLLQAKPISVVLTLVTRKSETGPGGVYAWRKPGVPSEPSSCKGYTVILYKVLDVSPGMTTCISLAVRLKNVVSLTTSIW	19536	4049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21232_pilon_-_5041_11043_11285_13445_13665_14910_15168_18091_18347_18623_18751_19463
914993	contig_5217_pilon	+	516	4	Intergenic	novelGene_135756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTCTTGTTGCCTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557638	559321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_557801_558300_558430_558673_558849_559271
914994	contig_1274_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_137782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAATTAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76158	78352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_76200_78400
914995	contig_5297_pilon	-	1149	2	Intergenic	novelGene_175673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	91290	90627	FALSE	30	TCCATGCCATTTGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSVGAGAARSLEVAGAAAPVALVVWTEETGAAAAGGGCDGASAVSLVSTGPGSGGRYLPKRRQGHLEQTAPTISCTWVWRSTLGSQTCTNVLRDTSPPPL	91290	89783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5297_pilon_-_90762_91119
914996	contig_3077_pilon	-	1169	6	Intergenic	novelGene_26767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGTCTCTCCGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18088	13149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13166_13858_13962_15155_15270_16147_16326_16934_17052_17447
914997	contig_2799_pilon	-	593	7	Intergenic	novelGene_85549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	122	541	751411	718679	TRUE	30	CATTAATGAGATGGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKAPFGLLHFDLCTGSQTFSTAFVDKSAAICTSVGIFVGERLHTLATADGTHNRNGTKGVAIESLLVLLLLFRIFLLLLNFVFLFFLFFALLTAGHFIFDVAECATDFCSTLSFKVFLGRALWQEIIVLFCYTFQPD	755383	707677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_707703_718651_718698_721092_721224_729189_729365_748947_749014_751382_751452_755302
914998	contig_6488_pilon	+	2451	2	Intergenic	novelGene_44747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1028	1357	163597	163926	FALSE	20	TTTTTTTTTTTTTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIDKKHKKCPTSLVLREMEIKSTMRYHFTPTSMVNSKMLRMWRNWRHLDISLTSSLSHTHTVVNDDSFLGSPIQFLYKRRTQSGICTLLLVKPRKLRDQKTNLMFSIS	162402	165020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_163060_163226
914999	contig_4418_pilon	+	1018	1	Intergenic	novelGene_98383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAACTGACCCATAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	821827	822845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_821800_822800
915000	contig_15897_pilon	-	2966	2	Intergenic	novelGene_49561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1242	2012	819785	819015	TRUE	70	AAGAAAAATACTAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKNSSKDFTKRVKREPTDWEKNFGQYESDKGLISIIYEKIKHLHNKKTNNPIKKWAEEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSCSLAIRETQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMMQPFWKMILHFLRKLEIEIQYDPAIPLLGTYPREIRAVTRIDICTPMFKAALFTIAKRWKQPRSPSADERINKLCYIQTTEYYATIKNNDESVKHLIA	821026	804082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_804103_818080
915001	contig_11987_pilon	+	717	2	Intergenic	novelGene_168959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	38	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTCTCTGTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470977	472366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11987_pilon_+_471255_471926
915002	contig_8620_pilon	+	1788	1	Intergenic	novelGene_173883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGATTTATTCGTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102932	104720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_102900_104700
915003	contig_5797_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_56964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCAGTTTGTTTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418730	420268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_418700_420300
915004	contig_5423_pilon	-	1973	2	Intergenic	novelGene_85183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	816	1121	179978	179673	FALSE	35	TAGGACAGAGTAGAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKYKKEKKREKKTKTKKRKKKCPEGSHHAAVQTGVVSPKPRSTAQLEGAPKLRKEKQNKQNKTKQTKAPEDPPAWRHGSGSSSTVKQHFTAFQEEAKMAH	181797	178820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_180306_181309
915005	contig_11316_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_122650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGTGAATAGTGTTGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137800_138900
915006	contig_12931_pilon	+	4641	1	Intergenic	novelGene_166769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAAAAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105289	109930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_105300_109900
915007	contig_8174_pilon	+	3013	1	Intergenic	novelGene_160063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1717	2196	300835	301314	NA	15	GTATTGGCTATTCTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSEYLIVLMTNLYKDEEAVVGTEQRDTAWFKARKGVRQGCILSPYLFNLYAEQIIQETGLYEECNNRIRGRFINNLCYADDTTLLAENEEDLKHLLTKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMMNGEKTEIVKHFILLGSTINVQGSSSQKIK	299118	302131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_+_299100_302100
915008	contig_4426_pilon	-	5195	1	Intergenic	novelGene_15365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCCCAGCCAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109223	104028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_104000_109200
915009	contig_1150_pilon	-	578	3	Intergenic	novelGene_61409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36526	74	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309886_311002
915010	contig_15325_pilon	+	2416	2	Intergenic	novelGene_157186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	875	junction_1	0	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94700	97558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_95233_95674
915011	contig_16036_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_114804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCTTTATATATGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27183	24850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_-_24800_27200
915012	contig_12249_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_121011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCAAGTGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159193	157745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_-_157700_159200
915013	contig_9995_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_47732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	1122	1652	510457	510987	NA	25	GAAAACATTCTTTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKADIQAANRHMKKCSQSLAVREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQETQNNKCWRGCGETGTLIYCWWECKMVQPLWKSIWHFLKKLEIEVPYDRGIPLLGIYPREIRAVTRIHICTPKFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWIKKLWYMDTMAYYAMIKNNDEAVKEAGGHYAE	509335	511064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_509300_511100
915015	contig_6440_pilon	+	6054	3	Intergenic	novelGene_161656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	706	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCATGAATCAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17631	25066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_21205_21590_21703_22697
915016	contig_2054_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_51678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTAATGATGAAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90586	89224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_89200_90600
915017	contig_13878_pilon	+	1213	1	Intergenic	novelGene_165749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	86	325	655879	656118	NA	45	CAGACTGCTGTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPRGTPLCQQASCPKALSFLAPWSGKPTMLSPASLLVLLPLLLLCPCQCFSPSCTVSSVTALSLSAGSRRFSAQGSWVQRMHSAPSSSFLVVVRYPLSAFCLWDGSF	655793	657006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13878_pilon_+_655800_657000
915018	contig_9955_pilon	-	3140	2	Intergenic	novelGene_21354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCACAGTGCCAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167630	145994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_148765_167260
915019	contig_9575_pilon	-	4214	15	Intergenic	novelGene_169713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_6	4.77717788777313	143	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	63	2099	142259	53153	FALSE	25	CACTCCCAGAATTATCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRCRVPGARSHPCSRRRPRGMACLMAAFSVGTAMNASSYSAEMTEPTSVCVSVDEVVSSSMDATEKDLLNGHLKKVDNSFMEAQRFSSLPRRAAVNIEFKDLSYSVPEGPWWRKKGYKTLLKGISGKFNSGELVAIMGPSGAGKSTLMNILAGYRETGMKGAVLINGMPRDLRCFRKVSCYIMQDDMLLPHLTVQEAMMVSAHLKLQEKDEGRREMVKEILMALGLLSCVNTRTGSLSSGQRKRLAIALELVNNPPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKGLAQGGRSIICTIHQPSAKLFELFDQLYVLSQGQCVYRGKVSNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYGDQNSRLVRAVREGMCDADYKRDLGGDAEVNPFLWHRPSEEVKQAKRLKGLRKDSTSMEGCHSFSASCLTQFCILFKRTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYLAKTMADVPFQIMFPVAYCSIVYWMTSQPCDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFDTIPTYLQWMSYISYVRYGFEGVILSIYGLDREDLHCDIDETCHFQKSEAILRELDVENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLKYKIRAER	142321	51037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_53382_55929_56049_59434_59594_59842_59944_61202_61372_62303_62406_62544_62730_66366_66482_67734_67859_69401_69548_77666_77718_81504_81638_83716_83835_135916_136161_142217
915020	contig_11227_pilon	-	3492	1	Intergenic	novelGene_163189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2105	2410	202089	201784	NA	20	CCCACACTTTGCTATTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLQADVIWGCGHLKARLHWMSKMASLTCLGSLAGLSTRAPTWDVSRMAVSGSLTSYLVSDFPQSEQMEASWPFTDSLGSHLASLPLVQTVMSPLRFKRDS	204193	200701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_200700_204200
915021	contig_11364_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_65160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	152	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTACATGTCAACACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76875	74423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_74400_76900
915022	contig_11855_pilon	-	2835	10	Intergenic	novelGene_67018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	419	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	739	1137	1609033	1608635	TRUE	10	GCACTGCCCCCCGAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLPKTRVSAARPPRLTPAPPWHSQAWPGNLDPREATEQFQEEVMAIWHLGEGRHTDKVGAAAPGEGELGTRCPRLSLLPTLTLLSQRSEKSVQGQNQPPGSGVDPTLPGRGTETAGCVEATPPSRRVRMQ	1609771	1592866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1593001_1597291_1597425_1599449_1599571_1601562_1601669_1602724_1602860_1604237_1604391_1604501_1604556_1607226_1607459_1607798_1607894_1608099
915023	contig_253_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_129768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTGTTAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782359	781214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_781200_782400
915024	contig_5031_pilon	-	2990	1	Intergenic	novelGene_133179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	97	357	25346	25086	NA	35	ACTATGCTGCTTAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEVLARAVRPKKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRTLLELIEDFSKVSGHKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPFTIASEKIKYLRMNLTREIKDLYNENYRILL	25442	22452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22500_25400
915025	contig_15821_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_25019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAATTTCATTATTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121971	120113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_120100_122000
915026	contig_11294_pilon	-	1668	16	Intergenic	novelGene_50062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGGCCCGGAACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349148	273327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_273384_290298_290443_306280_306334_309926_310014_311590_311631_311864_312062_312946_313009_323745_323786_325731_325807_332507_332618_333598_333664_334971_335074_337379_337456_338120_338195_340644_340722_348738
915027	contig_5686_pilon	+	4026	22	Intergenic	novelGene_45214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_21	1403.87279368954	479	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1086	3261	7	3267	93669	265109	FALSE	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMLKKPIHTNEAVFLEANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAPSKLPAQQEVLRTLALLLTQDDNEVSKAVTLCLAAASKNQHFREKALLYYCEALTQANLQLQKAACLALKSLEATESIKMLVMLCQSDTEEIRKVASETLLSLGLLRKDVSLLSKVK	93662	265868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597_241801_250018_250103_253205_253297_265065
915028	contig_12102_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_151064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	8	325	92205	92522	NA	65	AAAAAAAGAATATAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKMSHPIGRGRGISPPPRKKSQEWSTSFRPRIPTLRSSWNQETKRERAVTLKMASSGRETVAAELRDQEETALWAACGARVPSGRRLPGRVWCLQVLGGARFANSRS	92197	94128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_92200_94100
915029	contig_4091_pilon	+	1148	2	Intergenic	novelGene_173018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	318	833	11260	13649	FALSE	70	AAAACCTACAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAGAKTTGNLQYMLSHRPPFFIPTQPPLLPMDTAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	10942	13964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11368_13241
915030	contig_14467_pilon	-	3025	3	Intergenic	novelGene_138240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAATTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265005	261074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_263622_264479_264590_264637
915031	contig_18231_pilon	+	2305	2	Intergenic	novelGene_105892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261516	269943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_261612_267733
915032	contig_12313_pilon	-	1700	3	Intergenic	novelGene_171852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_1	2	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	440	844	75466	73274	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQFLGAIPGWAGPHDALHPVFRCRVGASGGQGHADLGAAVPLQIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPTERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS	75905	72417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12313_pilon_-_73358_73942_73989_75191
915033	contig_1399_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_166671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTTAAAAAAAAAAAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459469	458485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_-_458500_459500
915034	contig_20610_pilon	-	3622	1	Intergenic	novelGene_67658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	406	768	116992	116630	NA	85	AGAAAAGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVKTEMERLKVDILDVSEVKWASISHFKSGSRMVYYAGNDKLKRNGVAFIVKKNISRSVLKYNTVSDKIISIRLQGRYINTIIILPLMPKMKKLKIFTNFCSVKLIKHAIKMH	117397	113775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_113800_117400
915035	contig_20614_pilon	-	2179	2	Intergenic	novelGene_107530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68928	66667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_68789_68870
915036	contig_500_pilon	+	2973	1	Intergenic	novelGene_30938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGTTGCTGAGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216502	1219475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1216500_1219500
915038	contig_154_pilon	+	2980	1	Intergenic	novelGene_178021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGAAAAAGAGGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163246	166226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_154_pilon_+_163200_166200
915039	contig_5019_pilon	+	3646	4	Intergenic	novelGene_109216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCCTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249789	286298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_250025_250217_250789_253714_253737_283480
915040	contig_13823_pilon	-	4511	2	Intergenic	novelGene_145259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	1761	3119	244512	243154	TRUE	10	CGGCTACCACCGCTGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVTKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILASRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHTIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGIRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKMIKYLGINLTMDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFI	246272	241379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_241575_241956
915041	contig_16098_pilon	-	1970	16	Intergenic	novelGene_45850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	601.635304815135	22	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	56	1834	230275	201555	FALSE	25	AGTTGCTACAGTTCCTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDEDEDSEDSEDDEDWDTGSTSSDSDSEEEEGKQAAPASRFLKKAPTTEEDKKAAEKKREDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQAQGWLPQK	230478	201418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201578_212747_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215681_226249_226378_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
915042	contig_13424_pilon	+	5162	2	Intergenic	novelGene_151601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	204	junction_1	0	246	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	115	1509	84284	92756	FALSE	25	CAAATTGTCTTTCAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSHEVLPLLYPLFVYLHLNLVQNSPKSTVESFYSRFHGMFLQNASQKDVIEQLQTTQTIQDILSNFKLRAFLDNKYVVRLQEDSYNYLIRYLQSDNNTALCKVLSLHIHLDVQPAKRTDYQLYASGSSSRSESSGLEPSDMPTPILQNEAALEVLQESIKRVKDGPPSLTTICFYAFYNTEQLLNTAEISPDSKLLAAGFDNSCVKLWSLRSKKLKSEPHQVDVSRIHLACDILEEEDDEDDSAGTEMKILRGHCGPVYRTRFLSDSSGLLSCSEDMSIRYWDLGSFTNTVLYQGHAYPVWDLDISPHSLYFASGSYDRTARLWSFDRTYPLRIYAGHLADVDCVRFHPNSNYLATGSTDKTVRLWSAQQGHSVRLFTGHRGPVLSLAFSPNGKYLASAGEDQRLKLWDLASGTLYKELRGHTDNITSLTFSPDSSLIASGSMDNSVRVWDIRNTYCSAPPDGSSSELVGVYTGQMSNVLSVQFMACNLLLVTGITQENQEH	84169	96409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_84881_91958
915043	contig_6084_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_127031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	1192	1728	222883	222347	NA	60	AAAAAAAAACTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALHFVPWPRPCDFTQEVLAKQEKLFTESICYHLFPFIYSPYRFAFLYSFIQSINTEPRRKSSGGTLIKCSAVNQKVGGSTHQSLLGRKMWQSASVKITGLKKDQIYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKLPPGSLFSLGVDSPIKPNETNEVQESSDKGQKAEGDKEAGDREHKIE	224074	222129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_-_222100_224100
915044	contig_11779_pilon	+	2823	1	Intergenic	novelGene_146440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAATCAGAATCTATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4299	7122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_+_4300_7100
915045	contig_8045_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_35335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCACTAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83552	85594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_83600_85600
915046	contig_3781_pilon	-	2992	5	Intergenic	novelGene_178958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	178	477	54922	54623	TRUE	20	CCCCAGCCGGGGCGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQSLHQTESSTTRWCPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDAEQNSNTHKKDKIYWPEGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLPRFTVQPGLGQPHKTKQD	55099	130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3781_pilon_-_1263_48716_49027_49599_50086_52187_52344_54191
915047	contig_6102_pilon	-	3795	12	Intergenic	novelGene_32253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_5	146.907571999349	109	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	234	1187	1311623	1308361	TRUE	15	TGTGTTCTCACAGCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWGLVSKMPPEKLQRLYIDFPQHLRHLLGDWLENQPWEFLVGSDAFCCNMASALLSATVQRLQTTAGEQGEGSTILQHISTLESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKAVMEQFHHLPRPFHWKQEELKFNTALQRLQHRVRKICLLREALQQGPEAGQVSLHSLIETPVNGSGSKEALPKLLQESVGELEVVQTLVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRALLVSRLDEVLRTLVTSSFLVEKQPPPGFEDSDKVPGRGPVSAGLAVPGTPSQAPACQGGHGD	1315080	1304906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1306243_1306604_1307741_1307870_1307959_1308312_1308503_1308637_1308770_1309563_1309713_1309901_1309955_1310052_1310192_1310628_1310713_1310972_1311112_1311507_1311645_1314868
915048	contig_19816_pilon	-	1479	8	Intergenic	novelGene_156482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_5	229.611473083181	11630	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	22	612	126795	124895	TRUE	5	TCCTGTGTTTGCTGTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCPKDTGDSPPRL	126816	123027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125636_125854_126164_126435_126731
915049	contig_6137_pilon	+	952	3	Intergenic	novelGene_59261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1736.5	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAAATGGTTTCTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320879	1324184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1324074_1324112
915050	contig_19402_pilon	-	2056	5	Intergenic	novelGene_80862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	622.921493849747	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	248	1531	175076	167101	FALSE	25	ATATTCTGGTATTGTGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTVLDAVSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	175323	166575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175048
915051	contig_2940_pilon	-	3000	1	Intergenic	novelGene_81973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2570	2911	1087180	1086839	NA	55	TTAATGAAAAATCAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPAEKQCVPWNGWPVSGLVKRLERGDMSDLHLRGISLGLMLILILSPLPCEVTRGGLTSPSCHYYTEELKILSYFLIKVLNLNSPHVVSGYHIGWCKRTLGDLEREQMSVNK	1089749	1086749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1086700_1089700
915052	contig_6412_pilon	-	2252	2	Intergenic	novelGene_149944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGCTAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286794	138266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_140466_286741
915053	contig_3123_pilon	+	3408	18	Intergenic	novelGene_162973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_2	273.624803100838	1	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	74	1711	115920	290217	FALSE	50	ATTACTAAAATAGTTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTEVLFIDIFHEYNQTLTPVLLEMMQTLQGPTNVEDMNALLIKDAVYNAVGLAAYELFDSVDFDQWFKNQLLPELQVIHNRYKPLRRRVIWLIGQWISVKFKSDLRPMLYEAICNLLQDQDLVVRIETATTLKLTVDDFEFRTDQFLPYLETMFTLLFQLLQQVTECDTKMHVLHVLSCVIERVNIQIRPYVGCLVQYLPLLWKQSEEHNMLRCAILTTLIHLVQGLGADSKNLYPFLLPVIQLSTDVSQPPHVYLLEDGLELWLVTLENSPCITPELLRIFQNMSALLELSSENLRTCFKIINGYIILSSTEFLQTYAIGLCQSFCELLKEITTEGQVQVLKVVENALKVNPVLGPQMFQPILPCVFRGIIEGERYPVVMSTYLGVMGRVLLQNTSFFSSLLNEMAHKFNQKMDQLLGNMIEMWVDRMDNITQPERRKLSALALLSLLPSDNSVIQDKFCGIINISVEGLHDVMTEDPETGTYKDCMLMSHLEEPKATEDEEPPTEQDKREKMLALKDPVHTVSLQQFIYEKLKAQQELLGEQGFQSLMETVDTEIVTELQEFLQGF	115846	291914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_115939_117815_117864_118663_118770_127073_127201_128642_128677_128881_128923_130235_130353_134640_134755_143332_143449_152155_152233_156083_156164_156619_156701_168132_168229_168936_169051_177472_177595_220729_220826_231751_231837_290052
915054	scaffold_12124_pilon	+	2792	7	Intergenic	novelGene_22370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2171.50644714677	10	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	891	1454	1508626	1509259	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQFSPASPWVPCG	1491956	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509223
915055	contig_10930_pilon	-	5139	8	Intergenic	novelGene_37007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	98	junction_7	1615.47714566417	49	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	2583	4190	280415	268388	FALSE	35	GGAAACTAAGACTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVTYDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	285017	267438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157_281806_283825
915057	contig_9053_pilon	-	2938	1	Intergenic	novelGene_87955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1048	1404	306601	306245	NA	50	GTTGGAAGAATTCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPPSLTPIGDQQMGYEKAASWSFQWETKQPVICNICFPTPHPSSPRLGLLCFPWPQSLDRETAAAWIPHTQTGGSLSAICWLLMLLFSTSFDFFLASPHLPLLSLEYLALCAIFASS	307648	304710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_304700_307600
915058	contig_5344_pilon	-	5223	1	Intergenic	novelGene_125334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2301	2657	51609	51253	NA	35	GTAATTACCCAGAGATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLPFLIYTTLNGNIALSFQNHSSFYILYMNMTILSQKMKEKKYDLVKFESSLSLHEFKGKCEHRGLDLLQNSVSKPQKKNFILLLHVTCGLNIVLQAPNSNLGNECIKYDVISRNC	53909	48686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5344_pilon_-_48700_53900
915059	contig_8195_pilon	+	3584	2	Intergenic	novelGene_170063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAATAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461281	465839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_461392_462365
915060	contig_8210_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_30215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACTAGTGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15018	13574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_13600_15000
915061	contig_8721_pilon	-	2944	2	Intergenic	novelGene_178959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	79	2562	279031	233442	FALSE	15	GTCCTGTAGATTGTATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDNDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQLLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKITMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESDNTTANFIYLSFF	279109	233059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8721_pilon_-_233484_276589
915062	contig_1172_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_162029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGCAAATGGTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607919	605733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_-_605700_607900
915063	contig_17796_pilon	+	2326	8	Intergenic	novelGene_33802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	361.669823491662	1	112	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	129	1070	53527	96917	TRUE	85	TACAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSGLVISCLYFIKIL	53398	111358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_97053_110237
915064	contig_4686_pilon	+	4055	19	Intergenic	novelGene_118487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACACAGACCCAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352946	422895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_354076_363011_363075_364486_364579_366025_366244_367773_367898_369727_369928_373536_373750_375402_375535_377527_377672_381282_381622_382964_383154_384984_385130_385370_385550_388438_388514_389373_389561_398466_398633_413090_413260_417840_417998_422761
915065	contig_20398_pilon	-	3719	24	Intergenic	novelGene_155204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	69	803	181349	177810	TRUE	20	AGACGCGCTCGCTCCCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWDVDTTVVLTGTCRTVGAPVPMLIGVLAAPDATATVLDTAAFILGTDTAEACTVPDPLATEDPCLAWAATVMVWPALGGIMPRPCTMRMVAAAFPSEETTVLFPFWSATLTPRAGIKRKAEPEASAGLRSGVTLTTVVPAGVDAGALAELALAGLSAAWTGLEVTCKVAEMPLPAVLLPVPKRSWVSLTVVTWDLANVAIMSGVIRRTVWPLASVVMEEGGRRSTSLPWIRKLVAARGMLLPVWGLTPSCPVIATCLMMFCPGTF	181417	140774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_140826_142042_142128_143078_143262_146128_146333_159646_159773_160561_160733_161325_161426_162430_162510_163394_163477_163840_164025_164277_164386_164613_164747_165007_165073_171160_171240_171839_171889_173423_173483_173870_174047_175000_175104_175628_175756_175965_176047_176207_176428_176513_176783_177627_177841_180645
915066	contig_6164_pilon	+	2525	3	Intergenic	novelGene_121304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.5	135	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	127	540	722963	746475	TRUE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKGPVRAPAEKPRGSRCSNGFPERESPRPGPSRPAEKTPGPEAKSAQPADGWKGERPRSEEDNELNLPNLAAAYSSILRSLGEDPERQGLVKTPWRAATAMQFFTKGYQETISGQQGEWLRACDRSYFWPRRLGNC	722836	768987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_723310_746408_746516_767042
915068	contig_15839_pilon	-	3092	1	Intergenic	novelGene_136421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAACCAAACCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135254	132162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_132200_135300
915069	contig_11896_pilon	+	3757	1	Intergenic	novelGene_88032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTTGTGATTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155858	159615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_155900_159600
915070	scaffold_15027_pilon	-	700	1	Intergenic	novelGene_163552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25227	24527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_24500_25200
915071	contig_19438_pilon	+	2680	1	Intergenic	novelGene_175892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAAGAGTGTGCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5132	7812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_+_5100_7800
915072	contig_15327_pilon	+	5228	3	Intergenic	novelGene_70460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	38.5	62	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2385	2834	309852	310301	FALSE	30	CTTTGAAATCTTGAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLTRQILMVRRAVQQSVSLKLLLLLYSHRAAAKPSQAWPQWRSVPSKPKEPPPPPAGIRRQKPAFVFLASVITNLYHSSWARFPVGAFMGIWGKGKRRAPLLVNGLHHEDLEQAKEDVSPSCAVFSPECAKVDVCSCFVTVSSSLLP	305385	312695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_305882_307847_308987_309102
915073	contig_4604_pilon	+	1701	2	Intergenic	novelGene_19168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3846	junction_1	0	52	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGGTTGTGATCCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371478	373806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372964_373590
915074	contig_3068_pilon	+	2959	1	Intergenic	novelGene_137663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGACCTTTTTGACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431526	434485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_431500_434500
915075	contig_15991_pilon	-	1072	7	Intergenic	novelGene_70888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3092.83518348816	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	635	1003	101267	100445	FALSE	5	GGTTGTGTTTGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106345	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102319_103579_103703_104975_105142_106315
915076	contig_5832_pilon	-	3316	2	Intergenic	novelGene_134156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443005	439398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_440946_441236
915077	contig_2341_pilon	+	2878	2	Intergenic	novelGene_84343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTAGTTTGTTCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24108	32514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_25895_31422
915078	contig_12250_pilon	-	1593	10	Intergenic	novelGene_80666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	69.7232624977728	10	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	148	1572	387634	381240	FALSE	5	CTTCTTAGTGGTCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSPIPAQHTPQPHASSLEERHPEPGPPQRLSAPLPGSCGDPEKQRQDKMQEEGLQLVMMVREGEAAGACPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELPYVLEMVAELAGQRDPGLGAFSCQEARKAWLDRLGNLDEAVEECVRARRRKVKELQSLGFGPEEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDSGPEPTPSWDGPDKQSLVRRLLAVYALPSWGRAELALSLLQETPRNYELGDVVEAVRHSHDRAFLRRLLAQECAVCSWALPRNRMQALTSCECTICPDCFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDTQLLSYFSTLDIQLRESLEPDAYALFHKKLTEGVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQWEEQHRGRSCEDFQNWKRTNDPEYQAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYNAFYAKNCYHVLSPAEADRRGALGTEYPPQEEVAEGSGPAEGPMARLPQEHLQHQ	387781	381218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_381387_383334_383454_383568_383684_384737_384828_384918_385018_385100_385275_386482_386690_386793_386980_387087_387337_387595
915079	contig_2830_pilon	-	3979	3	Intergenic	novelGene_165849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2544	2930	701732	701346	TRUE	40	TACTGAAAGAAGTCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGTWNVQSMNLGKLEIVKNEMECISINILGISVLKWIGNGHFEQDNHMVYYAGNDNVKRNGAAFIVKKNISRSILKYNAVSDRILSICLQGGPVNTTNIQIYEPTTKAKDEEIEDFY	704275	670456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_670587_685608_685855_700672
915080	contig_2403_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_71017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1364	1765	166761	166360	NA	20	CTATTGCAGGTCTTCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQNDAVLEVLTHLCQEILKTTTWSTDWKRSIFMPIPKKGDPTKCGNYQILSLISHACKILLKTIHKRLQQYIDRELPEVQARFRRGCGTRDISLLMSDRSWLKAENTRKMFTCVLLTMQRHWTVWIITNYG	168124	165332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_165300_168100
915081	contig_15066_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_149529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	303	656	80745	81098	NA	20	CTACTAGATTGGACTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPKIQEGNYTKVQFFRLSQTQQGGIWGSLSFLVPGDSFTSQRFVLRNGVTVVNKARVPPFSLIDAQPLPNPSSCSVFSSPSPQFAPSPSCPVSCPHGWAHSDLSFASGLILTASRC	80442	84140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15066_pilon_+_80400_84100
915082	contig_19957_pilon	-	5404	2	Intergenic	novelGene_57703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	336	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	4906	5403	157675	157178	FALSE	40	AGGTAATTTAAGAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGQFIAIYAHIKKEERDKVKTLATQLEQIESEQQKKPTATKRKEIIKVRAEINEIENRKTIEIINKTKSWFFERINKIDKPLAKLTKQKQERMPVTQIRNEMGDITTDPTEIKRILTEYYQKLYSNKFKNLEKMGRFVGTHYLPKLSQIDVENLNRPITREEIE	163617	157176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_158430_159466
915083	contig_5485_pilon	+	4163	1	Intergenic	novelGene_37755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTATATTCTGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462248	466411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_462200_466400
915084	contig_13888_pilon	+	1997	3	Intergenic	novelGene_151814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	663.5	7	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTTATAATTACCATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359615	361905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_360983_361172_361707_361809
915085	contig_17274_pilon	-	2186	7	Intergenic	novelGene_26569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	388.430459956763	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	3	647	247033	232822	TRUE	25	GGAAAGCTGGAGTGGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGKDRQPWAPGCQGPRSCYEIKKSQKT	247035	230438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237075_237212_240084_240145_243020_243105_246141_246311_246874
915087	contig_4868_pilon	-	917	1	Intergenic	novelGene_136760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116784	115867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4868_pilon_-_115900_116800
915088	contig_1225_pilon	+	2381	4	Intergenic	novelGene_44183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	281.947197578238	231	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251372	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222_274362_274790
915089	contig_13348_pilon	-	3990	10	Intergenic	novelGene_162678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_4	96.2967378907254	118	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	63	1511	106149	41552	FALSE	30	TGACATAGTGTGTAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAAQKAAARGGGCGSGCGLMDELVHDLASALEQTSEQNKLGELWEEMALSPRQQRRQLRKRRGRKRRSDFTHLAEHTCCYSEASESSLDEAIKDCREVAPVTNFSDSDDTMVARRHPALNTIVKSKQHSWHESDSFTENAPCRPLRRRRKVKRVTSEVAASLQQKLKVSDWSYERGCRFKSAKKQRLSRWKENTPWTSSGHGLCESAENRTFLSKTGRKERMECEADEQKQGSDENMSECETSSVCSSSDPGLFTNDEGRQGDDEQSDWFYEGECVTGFTVPNLLPKWAPDHCSEVERMDSGLDKLSDSTFLLPSRPAQRGYHARLNRLPGAAARCLRKGRRRLIGKETSISTLGTERIGHIISDPRQKEKNKALASAFPHISTCAHEFNPLSPFYSLDVLADASHRRCSPAHCSARQASIHLGPPCSRDVKRKRKPVATASLSSPNAVHTDTMEPATPASQVQKSPNSEWLIRTSAAEKATDSTTATFFKMPQEKSPGYG	108418	39072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_41713_58224_58320_71496_71583_74021_74077_81903_81972_84730_84811_86601_86779_92543_92609_105487_106160_108366
915090	contig_4689_pilon	-	2479	4	Intergenic	novelGene_165401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	23.8094285712381	130	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCCTCTGTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091966	1084175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1085003_1085500_1086743_1087115_1087251_1091691
915091	contig_3410_pilon	-	1754	1	Intergenic	novelGene_58966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1092	1589	429469	428972	NA	40	CCTATGAGAATGGTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHSPSGRSKDGTRSQVFEQKEGEVVRGKEEIKRSRKKQHQQPTNGTQGVGQCGQVESKQPVLPCQETGAAESRGGRVGVKKGGGWESVSYQLPVLSPAGSSMKLLSHTPYLLVSDRSPRWQIHAALVIGDLSMYVSSPSVLCQFLIPFGAWLSSLSLHLILGF	430560	428806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_428800_430600
915092	contig_5452_pilon	+	3663	2	Intergenic	novelGene_101023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2613	2975	471507	471869	FALSE	60	CCAAAAAAAAAAAGACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSTTGLPPKYIEQTLTALKRERDSSTILVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDREELNATINQLDLIDIYATLHPTAAKSTFFSSAHRTFSRTDHILGHKACLNKLQSIDILQSIFSDHKAI	468785	472557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_469797_469905
915093	contig_5062_pilon	+	2038	11	Intergenic	novelGene_157831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	189.897051056619	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	821	1990	723873	744018	FALSE	65	GTTGACAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	621959	744066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622506_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422_743527_743702
915094	contig_15325_pilon	+	1486	7	Intergenic	novelGene_157176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	872.788634206473	1	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	13	444	93248	95236	TRUE	35	AGTAAAAGAATTTTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAGIMEGVEEKKKKVPAVPETLKKKRRNFAELKIKRLRKKFAQKMLRKARRKLIYEKAKHYHKEYRQMYRTEIRMARMARKAGNFYVPAEPKLAFVIRIRGINGVSPKVRKVLQLLRLRQIFNGTFVKLNKASINMLRIVEPYIAWG	93235	97263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15325_pilon_+_93262_94007_94117_94399_94567_95094_95244_95674_95785_96034_96245_96548
915095	contig_614_pilon	-	2939	1	Intergenic	novelGene_132651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGATTTAGTAAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1033923	1030984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1031000_1033900
915096	contig_16870_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_155481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	94	285	116	400	40616	40900	NA	25	GTATATTCTTCTTTGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVLLYTGSWAVANGSAGWSGAWKEHDWKIGDKELWGRGMGIDLSVSHMNAHQRVTLAEDDFNNEVDRMLHSVESSHRLFPATPIIAQWALEQSGHGGKDGGYTWAQQCGLPLTKADLATATDECLICQQQRD	40500	42827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_40500_42800
915097	contig_6871_pilon	-	2183	4	Intergenic	novelGene_21546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	590	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1460	1819	134596	134165	TRUE	30	GCGGAGGAAGTGGTACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMRGIRKPTTIWATWMVIKASTCSVMREHRNACSLLLFWMPLYSTSGMERTTASIQMPTQESLLMQRSRSMPLKKLILYTLKMNLQKWTPKSQDLAALYAQKGRVRRKRISAMARLSK	136055	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_121977_129786_129841_133938_134327_134398
915098	contig_20293_pilon	-	2877	1	Intergenic	novelGene_153509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAGTCAAGAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27060	24183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_24200_27100
915099	contig_7230_pilon	+	4863	5	Intergenic	novelGene_52527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2498	2809	36695	37006	TRUE	45	GGCAGAGTACCAGAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHQNISRCSGFLLSLDPAAASCRLISSSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSPTCPSWACQFLRLCDLEEASTLVHRLGSF	34197	88134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_37147_54953_55366_74607_75159_79929_80413_87666
915100	contig_8978_pilon	-	4812	1	Intergenic	novelGene_49499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGTGGAATGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2057202	2052390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_2052400_2057200
915101	contig_6195_pilon	+	2961	17	Intergenic	novelGene_71022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	139.403290290258	40	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	926	2781	114	2894	94415	140294	FALSE	30	ACAGTAGTAACTTCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSGLSDRALGPSSGRRLRPGSPSPVPWRRWWRGKSKMRTATAAAGICASWIRACGGLIPLHGIKHKLRHIDLHSNCIDNIHHLLQCMIGLHFLTNLILEKNGDDNPVCHIPGYRAIILQTLPQLRTLDCKNIFGEPVNLSEINLSHLQCLEGLLDNLISSDCPLNISEEETVDSMPVVTTNVDQLVPLDQFACTPTDTALTSVDSVCPSSEPEKINHENDFQNEMKLQKIDDQISQLLTETSKSLIDNIPEKDFRPKRDTDVTSESDSGNRKEINRKISRRSKIPYYSKTTQTIKHHSKNGPLISCNRKMRQPYFKELYVRSSLANCNTVAESEEPKTEIIKVDRSSSEDITYRSLVEQLDQEREKRWKAQQTEKKLIDYINELHKNAKEKKDVHSLALLTTDRLKEIIFKERNSKVQLEVMVHTLQSEIKKLSIELLKARDQQEGHVRDLRTLEKALEKLERQKFHQQTAQIKLIQEVELKASAADREINILRTSLHQEKEKLQQLHELFALKEQEHRKELETRELFSEADFQNALAKEIAKRESKHEQDIKEYQEKIDMLIQQYMDLEDEFRIALTVEARRFKDVKDGFENVATELAKSKHALVWAQRKENESSSLIKDLTSMIKEQKTKLAEVSKSKQETAANLQNQMNTLELLIEDDKQKSIQIELLKQEKVQLISELAAKESLIHGLRTERKVWGHELAQQGASMAQNRGNLEAKIESLCRENESLRKANERDCDALRIKSKIIEDQTETIRKLKSCLQERDEDIKTLQEKISEIQKCTQEQLEEKSSQLDVVIEKLERHNERKGKLKQQLKEKEEELEEIRNAYSTLNQKWHDKGELLSHLETQVKEVKEKFDDKERKLKEERDKSIEMQKNALEKLQSMDDAFKKQVDAIVVAHQAEMLQLSNEKQKCIESANEKVYQVEEEMRGLLEETTKNKRAMEEKIKQLAFALTEIQQEF	94301	140361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6195_pilon_+_94473_102785_102954_104900_105077_105171_105382_109777_109972_111005_111154_112373_112523_117100_117306_117849_117990_128539_128742_129277_129464_130236_130412_131284_131449_135278_135488_135574_135713_137404_137541_140171
915102	contig_6497_pilon	+	4037	5	Intergenic	novelGene_35589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGTTTTTCTTCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335408	882498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_335707_535182_535566_539760_540007_794165_795291_880513
915103	contig_2100_pilon	-	1847	12	Intergenic	novelGene_50709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	856.81537978804	205	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	72	1115	1182812	1172599	TRUE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLSPSCPS	1185482	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172621_1173216_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
915104	contig_16951_pilon	+	10836	4	Intergenic	novelGene_98643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	18.1536650722535	736	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	10037	10354	102689	103006	FALSE	20	CATACGGTTTCCAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLFTKHFAQGLAQRRYSANCGVVKKRILRKFKVTDKYTYNCNTRGNIESILREGQTKISGLKREEGGIQVARSREILLVKELGFTRALAAGGLQQKGGKVNAF	85835	103488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_86165_86411_91066_97146_99169
915105	contig_10861_pilon	-	1726	3	Intergenic	novelGene_39423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_1	42	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	24	539	2220976	2220461	TRUE	30	GCTAGAAGCTACATCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKIPDPSVNGQQGCRMHPNPCSASLSSSSSLATSFPSSWFHSPAQQPFTFSAEQPLPQLLCFCCRHQQGCWRRPGHLQAPGSGLQRLHVIRKQPHQQGSGSQGCQHRLHSGTLTPLPVVTSLRPLSPEPTRVPSPSPAASTALTHPHAWQGWPSVSSGYSSQALSGGLP	2220999	2209164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2209212_2218122_2218218_2219415
915106	contig_1274_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_137783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	831	1244	79774	79361	NA	20	ACCCCGGTAGATGGGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKKVLLLCLLLLTSDLFPPTSSHVRRWRDIPCCFHYEFQGPLLLMETLVVQWLSATAANQKVSSSYPPGGPWKLYGAVLLCPIGLPGVRIDSTATGLGFVFFFYTTAVVSTTQASHLSWLCSLESSGPDLRITWH	80604	78416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_78400_80600
915107	contig_9177_pilon	-	4040	1	Intergenic	novelGene_32777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTAGAAGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380542	1376502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1376500_1380500
915108	contig_7358_pilon	-	3945	4	Intergenic	novelGene_178262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1604	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGAAGAAAACCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316778	72527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7358_pilon_-_72774_72896_73892_243705_244039_314407
915109	contig_3155_pilon	-	2707	1	Intergenic	novelGene_26444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGTCAGCTCCTGCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330691	327984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_328000_330700
915110	contig_6279_pilon	-	3551	1	Intergenic	novelGene_164757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATATTTCTGTCTTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30058	26507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_26500_30100
915111	contig_2215_pilon	+	3117	2	Intergenic	novelGene_163844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTACAGGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129024	132298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_131635_131791
915112	contig_12073_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_178960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	768	1358	1792	1202	NA	35	ATCAATATGCTGTCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	2559	212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12073_pilon_-_200_2600
915113	contig_17144_pilon	-	1267	9	Intergenic	novelGene_29421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2471.6723557897	34	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	123	554	179764	167588	TRUE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQ	183204	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166330_166473_166843_167248_167331_167581_167590_174931_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
915114	contig_10629_pilon	-	4381	9	Intergenic	novelGene_52884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	33.2544639860576	668	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	157	1353	83101	78772	FALSE	80	TAAAATAAAATAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEGNAAGEPSIPGGPRPLLSGARGLIGRRPAPAVTAGRLPSVRSRDLTLGGVKKKTFTPNIISRKIKEEPKEEVIVKKEKRERDRDRQREGHGRGRGRPEVIQSHSIFEQGPAEMMKKKGNWDKTVDMSDMGPSHIINIKKEKRETDEETKQILRMLEKDDFIDDPGLRNDNRNMPVQLPLAHSGWLFKEENEEPDVKPWLPGPKEEDMEVDVPVVKVKEEPRDEEEETKIKAPPRAARKTPSLPKDVSVAELLRELSLTQEEELLFLQLPDTLPGQPPTQDIKPIKTEVQSEDGQTVVIKQEKDREARLAENTCTLGDLTEGQVGKLLIRKSGKVQLLLGKVTLDVTMGTSCSFLQELVSVGLGDSRTGDMTVLGHVKHKLVCSPDFESLLDHRQR	83501	75743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_78895_79065_79219_79647_79914_80303_80473_80678_80804_80964_81117_81759_81804_82936_83107_83350
915115	contig_13699_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_158327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	37	444	73778	74185	NA	75	CAATAAAAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLADLDDELDGMGAIGRDTDSLQSQIEDVRLFLNKIQVLKLDIEASEAECRQMLEEEGTLDLLGLKRELEALNKQCGKLTERGKARQEQLELTLGRVEDFYRKLKVLNDMTTAAEEGEALQWVVGTEVDVINQQLADFKVSLMLVC	73741	76126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_73700_76100
915116	contig_9706_pilon	+	2688	2	Intergenic	novelGene_20927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGCTCCATAGGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181337	353309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_182775_352058
915117	contig_12622_pilon	-	1970	3	Intergenic	novelGene_5772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_2	97	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194564	102566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_104370_125265_125349_194480
915118	contig_19564_pilon	+	4205	6	Intergenic	novelGene_29654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	30.3512767441503	158	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	2053	2874	27567	30060	FALSE	15	TTAGTTTTGTGCACTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISHSQKRPTPQPLISPSLPSLEAPIPRTRQKGSPQAVETPLSSELELLHPKPKVRPRGSSRVTPSSVSSTALEPHPPAPTDQPVSTEPTSWVTRGKTRRSSVRTPEPVEPTAPELQPSTSTDQPVALKPTSRVTRSRTRRSSVKTPEPVEPTAPELPPSTSTDQPVALKPTSQATQGRTRRSSVKTPEPVEPTAAKLQPSTSTDQPVFLKPTSQATRGRTCRSSVKTPEPAEPTACEVQPSTSTDQPVTPEPVSQAIRGRTLRSSVRTPEPIECTAPELQCSTFTDQPVTSKPTRGRTHRSSVKTSEPLVPTAPELQPSTSRHQPVTPKPTSRATRGRTNRSSVKTPEPTEPTAPDLKPPTPTDQPVTSEPILWATQDRTHRSSVKTSEPVEPTALEFQPSTSTHQPSTSKDQFVTPKPTSRANQGKTHRFSVKTAEPDVPVSSDLKPLDSIDQPVTLEPILRTTRGRTRRSSVKTPELGEPTALELQPSTSKDHPVTPEPISRATRGRTPRSSVKTPESVEPTAPDLKPPTPADQHVTPEPLAQGSQSKTLKSSTVNAVPVPITPEFQSPVPTDQPIPPEPIPQASCNRRQRATRKHESLTAPIVHEPCSVPPEPKSQSSRSQRQGAVRAAESLRTPEPSCPQLLEAPTYAPQFQKIEAAGRSGFTPEPQPKASQSRKRTLATMDSPPPQKRTQRGPVPQKTELLKEEEEEDTAERPGKKENIVIPGPGKRKRDQTEEEPKGTLSRNLRRTKPNQESAAPKVLFTGVVDARGERAVLALGGSLAGSVTEASHLVTDRIRRTVKFLCALGRGIPILSLDWLHQSHKAGCFLPPEEYVVTDPEQEKNFGFSLRDALRRARKRRLLEGYEIHVTPGVQPPPPQMGEIISCCGGTLLPNMPRSYKPQRVVITCSQDFPRCSIPFRVGLPLLSPEFLLTGVLKQEANPEAFTLSTLEMSST	25514	31391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_27681_27765_27886_28025_28209_28445_28572_28674_28786_29892
915119	contig_3866_pilon	-	3670	1	Intergenic	novelGene_112387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	3150	3641	141287	140796	NA	50	GGAAATAATGAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNATINQLDLMDIYRTLYPIAAKYNFFSSAHGTLSRIDHILGHKASLNKMQSIEILQSIFSDPKAIKVEINKRKSKEKESNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKALLRGQFLAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEHVERE	144436	140766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_140800_144400
915120	contig_6898_pilon	+	2093	3	Intergenic	novelGene_35781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	33	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	31	366	124837	125646	TRUE	15	TTTACTGTGACTTGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124806	127702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_126506_126834
915121	contig_214_pilon	-	1662	3	Intergenic	novelGene_178961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATAAAAATTAGAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72111	22713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_214_pilon_-_23831_43920_44001_71646
915122	contig_10711_pilon	+	3680	1	Intergenic	novelGene_118466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATCTGGGAAATATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890577	894257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_890600_894300
915123	contig_12464_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_68634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	308	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTAAAGGGCAGAATATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61729	59445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_59400_61700
915124	contig_10095_pilon	+	3185	22	Intergenic	novelGene_57242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_1	60.476602923228	162	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	757	2274	161	2434	279163	374578	FALSE	25	TATTTGAATGGCATCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDESEMENVKKATATTTWMVPTAQEVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDIGDDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADPKEDGEDRDDEMENKQDGRILRGSQRARRKRRGDPAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEEEKAVAVPTKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSMYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEDEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMRLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRIKVHFDGWSSSYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHSLQPPLGPLELMEVSEQSGCLTPGCKGIGHFKRSRHLGPQNSATCPYSDVNLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDTNESSSSPETRDQRGGDVPAREDTEEKTESEVKTSQEARGTREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL	255009	375329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_255080_258550_258625_279146_279265_284451_284564_286434_286595_287732_287866_289681_289767_291772_291865_294282_294388_307099_307236_308683_308776_311869_312022_322915_322993_327585_327672_330135_330247_335202_335318_336788_336892_342403_342554_356356_356443_370494_370665_370894_370958_374434
915125	contig_12570_pilon	-	2966	4	Intergenic	novelGene_79387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	16.6733320005331	120	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	49	789	300289	283433	FALSE	75	GTAAATGAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQCSETQQPEPGRGVGMVEFAPLSVPWERRLQTLAVLQWVFSFLFLAQICTVVFIGLLFTKFWFLTVLYAIWWYLDWDKPWQGGRSIQFVRRSIVWKYMKDYFPVSLVKTAELDPSRNYLAGFHPHGVLAAGAFTSLCTESTGFSTLFPGIRPHLMMLSLWFRAPFFRDYIMAGGLVASDKESVDHLLRRKEGGNLLAIIIGGSKEALDAQPGAYRLLLQNRKGFVKLALMHGYQAFGTSTLGSIGNWQGLYFGGKTETNAD	300337	281255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_283699_284049_284255_293908_294088_300198
915126	contig_10734_pilon	-	2211	11	Intergenic	novelGene_51476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	665.589069922276	1	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	660	1718	2274500	2265543	FALSE	65	AGGAAAGAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2282743	2265049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277114_2277191_2280839_2280937_2281233_2281302_2282464
915127	contig_5236_pilon	-	2380	12	Intergenic	novelGene_100952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	205.421719018774	21	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	61	1155	1011714	1007317	TRUE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKRATARTPPALPWRPSPMRVTKASMWCWWTQLAACKTMPP	1011774	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007758_1008817_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
915128	contig_4469_pilon	+	2077	3	Intergenic	novelGene_21928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	1	28	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTTATTAGGGAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612270	725251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_612345_616121_616324_723450
915129	contig_6470_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_145598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTGTCAGCCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967860	969022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_967900_969000
915130	contig_3095_pilon	+	1095	4	Intergenic	novelGene_75142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_2	1046.09570414098	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	62	685	149709	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	149647	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150696_150996_151163_151848
915131	contig_12391_pilon	-	1992	13	Intergenic	novelGene_103594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGAGAAATTGGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107970	56782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_56855_82434_82551_82753_82832_94093_94220_96526_96638_96771_96848_98715_98893_101752_101932_102039_102093_104598_104697_105917_105998_106555_106620_107208
915132	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_93059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4915	junction_1	0	137	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657824	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657824	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657793
915133	contig_17144_pilon	-	1650	11	Intergenic	novelGene_29370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2126.36744002536	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	157	840	179764	170838	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPPSLRPT	183238	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_167885_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170861_174584_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
915134	contig_3233_pilon	+	1851	7	Intergenic	novelGene_56607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	374.333036509232	21	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	712	993	966219	979952	FALSE	20	AGCTTTCTAACATGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNEGSRKEDQTPRRRSHSPTPRRSRRSSSSHRFHRSRSPVRYIYRPRSRSPRVGHRFFPRYRSRSRSPNPAYRIRVPFSPECYRSLRSERTSRRSSDRKKASEDTVQRSRHGSESSKKKHSEAVDKGHSPAQKPKTSSGSKPSVKSTSSTKSDSNIRYKSKNPEDGSLPECKQVSDKAVSLQRKLRKDQSLNYGSVLVVSELPEDSCTEEEIRKVFQPFGKVSDVLIVPYRKEAYLKMEFKEAITAVMKYAETMPLLIKGKSVKICVPGKKKSQNKEVKKKTSDSKKTSASTLKKDTDASKAIETVTPTSTGGGLDHGSSAPAEWCFTAC	962264	980810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_962554_963815_964079_965123_965271_966206_966330_970629_970689_970913_970967_979893
915135	contig_5084_pilon	+	3187	5	Intergenic	novelGene_64664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	11.2555541844904	121	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	234	788	1673302	1689853	FALSE	0	CTCCCCCGCTTCCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYREVPSRRLPRWPAPAAAAVPFRASRLPPLPAELFSSFPIESGRQAPRVLVTLDPGAEPWHHDSEAETLPWSHPGEMEPPQCVEELEDDVFQLEDVEPGTQPGALLSPDLFAQSQLDCPLSRLQLFPFTHCCGPGLRPTSQEDKGTQTLSPASPSQGVMLPCGVTEEPQRLFYGNAGYRLPLPASFPAGLPLGEQPPEGQWQHRAEVQVARKLQCIADQFHRLHMQRHQQNRNRAWWQILLFLYNLAVNGEENRNGAGPR	1670517	1692252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1670617_1670999_1671129_1673296_1673594_1675095_1675257_1689751
915136	contig_4924_pilon	-	1640	8	Intergenic	novelGene_84679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1359.09785504644	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	20	946	252576	65524	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252595	64829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_114575_114711_127720_127785_132966_133122_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
915137	contig_14925_pilon	-	1783	6	Intergenic	novelGene_55315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	909.532715189509	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	187	600	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	276332	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129531_276275
915139	contig_3747_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_24741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAAAAGATTTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112723	111782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_111800_112700
915140	contig_5899_pilon	+	2174	1	Intergenic	novelGene_146950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5829	8003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_5800_8000
915141	contig_10904_pilon	+	456	1	Intergenic	novelGene_22433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGCTTCGTGTCTTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8035	8491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_8000_8500
915142	contig_4339_pilon	-	3768	1	Intergenic	novelGene_146073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGTGTGATATTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015209	1011441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_1011400_1015200
915143	contig_7457_pilon	-	2249	1	Intergenic	novelGene_31390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458421	456172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_456200_458400
915144	contig_2311_pilon	-	2970	6	Intergenic	novelGene_169807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTTTGTGAGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296531	122899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_123926_239986_240590_245658_245786_293337_293931_294155_294299_296053
915146	contig_13707_pilon	-	2899	6	Intergenic	novelGene_43518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	289	junction_1	77.7663166158717	55	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	662	1162	124127	119036	FALSE	45	AAAGGAGTAAGGACACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSSFTSSEQELERLRRENKDIENLRREREHLEMELEKAEIERSTYVTEVRELKDLLTELQKKLDDSYSEAVRQNEELNLLKAQLNETLTKLRTEQSERQKVAGDLHKAQQSLDLIQSKIVKAAGDTTVIENSDVSSESVCIFFNPKSLGLIPYKLCEEKNVQVSD	125567	117298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_119213_120858_120943_123491_123576_123738_123823_124055_124128_124906
915147	contig_253_pilon	+	1214	2	Intergenic	novelGene_129621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133426	138476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_133442_137277
915148	contig_14666_pilon	+	1581	5	Intergenic	novelGene_39603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	622	1281	484281	484940	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477256	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483970_484127
915149	contig_13300_pilon	-	2088	3	Intergenic	novelGene_125770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	740.5	16	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCGCTGTAATCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49682	45537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_46425_46475_47630_49635
915150	contig_16103_pilon	+	3726	1	Intergenic	novelGene_118778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACACAAAAGTAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530119	533845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_530100_533800
915151	contig_14694_pilon	-	2745	1	Intergenic	novelGene_152472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATTTAATTGTATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116529	113784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_113800_116500
915153	contig_4125_pilon	+	3205	4	Intergenic	novelGene_25111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	223	705	788242	789367	TRUE	25	CTTCCAAGGCTGTAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSISQAERTEEKIQALSCSIEEFEPWQNIELHRKHQKKMEGRHSHYTKKNWWIQSFQEAAYDQELMVLKKEAQAGLKALAKNKALGTDRIPTEMFRQMDAALEVLTRLRQEIWKAAIWPIDWKRSIYVPIPKKGDPTECGNCQTMSSISHASKIMLKII	788019	838801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_788322_788490_788570_789043_789383_836316
915154	contig_6958_pilon	-	3508	2	Intergenic	novelGene_70013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACTGTTATGCACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829064	765143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_768619_829031
915155	contig_16387_pilon	+	1420	2	Intergenic	novelGene_174520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	110	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGGTGTCTCTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1293	4479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16387_pilon_+_1496_3261
915156	contig_19098_pilon	+	2471	3	Intergenic	novelGene_65875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCAGCCCCACATGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507835	513522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_510048_512916_513149_513495
915157	contig_14603_pilon	-	2459	1	Intergenic	novelGene_165989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	1	564	16015	15452	NA	40	ATCAAAGGCTTTTAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRHMRKCSRSLAIREMQIKTAMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCSWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	16015	13556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14603_pilon_-_13600_16000
915158	contig_6434_pilon	+	3493	2	Intergenic	novelGene_61839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1319	1636	726821	727138	FALSE	65	AGAGAATAGAAAAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRIETMEDRISETEDKHLDNTLFEEKPEKRMKENEETLRMMWVTIKSKNLRLIGVPEQREKTENIGRIIEELLTENFRNMKDENLTTQEAQRTPIG	725391	728995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_725796_725906
915159	contig_2940_pilon	-	4150	1	Intergenic	novelGene_81966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTAATTTCAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053983	1049833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1049800_1054000
915160	scaffold_16539_pilon	+	3250	7	Intergenic	novelGene_68379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_3	29.448637018073	33	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	2437	3198	613220	617625	FALSE	25	TAAAACCTTTTTATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEIDTRYFDDEFTAQSITVTPPDRYDSLGSLELDQRTHFPQFSYSASILE	610783	617677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_613244_614032_614156_615281_615411_615536_615752_616279_616368_616464_616568_617545
915161	contig_5605_pilon	+	868	6	Intergenic	novelGene_143942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	22.8683186963974	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	444	791	450926	485358	FALSE	10	TATGGCTTTTTTCCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVPTSIYQTSTGQYTTTGDMPAYQIRAPTTALPQGVVMAASPGSLHNPQQLAEEATRKRELRLMKNREAAKECRRRKKEYVKCLESRVAVLEVQNKKLIEELETLKDICSPKTD	390929	485435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_391019_398213_398373_450591_450690_450828_450972_472975_473133_485213
915162	contig_2341_pilon	+	1859	4	Intergenic	novelGene_84360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.7463177033243	20	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGTCTTCTGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129523	161008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_129631_155756_155831_157464_158592_160457
915163	contig_10958_pilon	+	2456	5	Intergenic	novelGene_5402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	8690	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	54	455	888255	894000	TRUE	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888201	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894144_895250_895855_900457
915164	contig_5482_pilon	-	3006	6	Intergenic	novelGene_144447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	140	junction_5	184.825972200879	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	1952	3004	291537	271655	FALSE	35	TGCCAAAATTATCACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGILIFQLFFIVEVFVPPCVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEPMKKKKVGRKPKTQQSPISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKDMPKNIVVIDDDKSEACNEDLTAATDEKSIERVSLSAESLLKAATSVRGGKNSSPLNCSRAEKGVARVVNISSPGHDASSRSPTTTASVPATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKISTVAVQSVNAGAPLITSTSPTTAASPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQ	302833	271652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_271863_272267_272619_274810_275004_288090_288178_291323_293311_302655
915165	contig_4783_pilon	-	3109	1	Intergenic	novelGene_108378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181014	177905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_177900_181000
915166	contig_8616_pilon	-	6977	3	Intergenic	novelGene_72614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1199	1831	469186	468554	FALSE	35	CAGCCACATTTAAGTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVRHLELGTFQFALWSFNVDVWPTDVHMWPFEVSFQFGNICVHLSLYFGAFKCRSTSGMESLGALKCMSGILNLGLFHLPSGPSTATSGISTSNLGPLTSNSGPFNSLSSFGAETSTCPLILGPFKLKSMSGMEILGAWISGILNLGPFSFPSGPSMLTSGGSMSTLGPEMSTSGLRKFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFILGIFRCQSGP	473660	463407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_470105_470266_470526_473639
915167	contig_10003_pilon	-	2436	16	Intergenic	novelGene_88148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	465	junction_15	833.047417617989	10	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	205	1938	473315	374355	FALSE	15	GTTGGGATGGGGAAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEIQRQTVRAHSVKLFIFSALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKTAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTTPITPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPITSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHSYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFDHDRDYEDEPVNEDME	548588	373856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_374500_380678_380846_385999_386070_387779_387902_391285_391388_391978_392059_392162_392365_402817_402902_416834_416923_430739_430845_460909_461115_466538_466693_472049_472140_473195_473334_531527_531657_548531
915168	contig_9484_pilon	-	4268	5	Intergenic	novelGene_105685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	214	309	214283	214188	TRUE	20	CCCACGGTCCAGTCCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNKEKFILSQSGRLQVQIQGISSRGRLSLLALEEGPCHQSSLGLGAFQHRNLRSKGYVLLPALLSSWYEVPMSLCSLLSFISQKRLAQDTTQSCRTHRYNCH	214496	201513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_202616_202732_202821_204857_204893_206883_206943_211512
915169	SIRV6	+	921	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	30	577	-7	-22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	25	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	228	719	1733	10736	TRUE	40	TTACACATATGACACGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1117	11248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
915170	contig_12485_pilon	-	4691	1	Intergenic	novelGene_147301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	282	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAACTAACCAGTTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788990	784299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_784300_789000
915171	contig_5903_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_173224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGCTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383595	382375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_-_382400_383600
915172	contig_9070_pilon	-	2895	22	Intergenic	novelGene_171948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	46.5095021135259	89	39	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	97	2295	211963	125813	TRUE	30	GCATCTCTTTTGAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGNKAAVVLCMDVGFATSNSSPGEESPFEQAKKVMTMFVQRQVFAESKDEIALVLFGTDGTENALAQADQYQNITVHRHLMLPDFDLLEDIQSKIQPGSQHADVLDALVVCMDVIQQETVGKKFDKRHIEVFTDLSSPFSKDQLDVIIHNLKQSGISLQFFLPFPLGKEDGTGDRGDGNLLLDHHEPSFPQKGITEQQKEGIEVVKRVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRQLCVFKKIERRSVPWPCQLTIGSHLSIKIVAYKSIIQEKIKKTWTVVDARTLKKEDIQKETVYCLNDDDETEVPKEDTIQGFRYGSDIVPFSKVDEEQMKYKLEGKCFSVLGFCRSSQVQRKFFMGNQVLKVFAAKDDEAAAVALSSLIHALDELNMVAIVRYAYDKRANLQVGVAFPHIKDAYECLVYIQLPFMEDLRQYMFSSLKNNKKYTPTEVQLNAVDALIDSMSLVKKDEEEDTIEDLFPTTKIPNPEFQRFFQCLLHRALYPQEPLPPIQQHILNMLDPPTEVTAKSQIALSEIKTLFPLTEAIKKKDQITAQDIFQDNHEEGPDSKKRKTEEGDIHFSISSMTEGSVTSVGSVNPAENFRVLVRQKNASFEEVSHQLISRIEQFLDTNETLYFMKSMDCIKAFREEAIQFSEEQRFNSFLKALQEKVKMKQLNHFWEIVVQDGITLISKDEASGSSVTAEEAKKFLALEEKPDEEAAIYEEGGDVDDLLDMI	212059	122102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_-_122516_125625_125828_126588_126661_136752_136821_138562_138660_140716_140827_164934_165005_166989_167084_175326_175524_179635_179770_182146_182238_183166_183305_188282_188346_192414_192528_195700_195840_197627_197743_200693_200886_204870_204994_205822_205872_206906_207091_209908_210023_211942
915173	contig_935_pilon	-	1539	11	Intergenic	novelGene_45566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_2	322.958139702346	72	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	198	1208	482922	383823	FALSE	25	GTAGACAACATGTGTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTVEVLRRQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGAARFGHEGRTWGDAGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMHADSENGEEEEAADSGAFNAPVINRFTRRASVCAETYNPDEEEDDTESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKEGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEVSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDLADSFFIVESGEVKISMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNITTYEEQLVALFGTNMDIVEPTA	483119	383491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_383957_387086_387226_387362_387429_389707_389783_391649_391752_397891_398046_401832_401940_411089_411174_416859_416913_455249_455286_482861
915174	contig_5210_pilon	+	2875	3	Intergenic	novelGene_65428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_2	2.5	124	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTGGATATTCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463020	467699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_463207_464921_465072_465160
915175	contig_9363_pilon	-	4289	1	Intergenic	novelGene_6607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATAATAAATCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772690	768401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_768400_772700
915176	contig_10722_pilon	-	3593	11	Intergenic	novelGene_70960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	301.142092707081	128	184	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	2209	3108	6730	4150	FALSE	20	CAATGGCTGCACTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	17181	3664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637_8562_9665_9787_14372_14439_16247_16358_16861_16929_17168
915177	contig_7031_pilon	-	2956	1	Intergenic	novelGene_132797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTCCCAGCACCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326039	323083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_323100_326000
915178	contig_21412_pilon	-	3533	5	Intergenic	novelGene_142857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	53	junction_2	61.3534840086527	178	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	286	636	57833	50354	FALSE	20	CAGCTGCATTTTGGCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVYVVLPLEIKTDAYVRGYVGEEIKLKCTFTSTSDVTDKLTIDWTYRSASSSRTESIFHYQSFTYPTTSGRFRDRISWVGNVYKGDASISISNPTMKDNGTFSCAVKNPPDVHHNIPATELTVTERSFGTMLSSVALLSILVFIPSAVVVVFLLVRMGKKSAGLKKRSKSGYKKSSIEVSDDTDQEEGENCMGRLCVRCAECLDPDYEDTY	61892	47456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_50381_53352_53417_55920_56087_57739_57951_61724
915179	contig_12277_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_139707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAACCTTTAGGAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350161	347676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_347700_350200
915180	contig_3747_pilon	+	1989	9	Intergenic	novelGene_24886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4881.08602157348	8	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	486	1400	202144	203804	TRUE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201089	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201545_202113_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204090_204878
915181	contig_5799_pilon	-	4058	2	Intergenic	novelGene_50283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_1	0	151	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTCCTAGGAGTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369249	322083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_325795_368902
915182	contig_20614_pilon	-	1664	1	Intergenic	novelGene_107536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGCATTGACCCGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71378	69714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_69700_71400
915183	contig_11720_pilon	+	628	5	Intergenic	novelGene_43779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1035.51131693478	84	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67787	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78462_98357
915184	contig_19342_pilon	+	1188	7	Intergenic	novelGene_41100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.41565025531987	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	325	801	4349	6183	TRUE	45	TCTGAGAGAGGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTDPPKTHVTHHPISDREAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3618	6738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3880_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
915185	contig_1154_pilon	+	3099	3	Intergenic	novelGene_87074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGTGGCGGAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211433	406546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_211679_403191_404392_404892
915186	contig_7357_pilon	+	3090	4	Intergenic	novelGene_36842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCCGCAGCGCAACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152269	167073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_154720_154860_155083_159916_160034_166772
915187	contig_6410_pilon	+	3476	1	Intergenic	novelGene_108613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	1304	1966	27848	28510	NA	15	GGAGGGATGGCATGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFSSLRLLGKFSVSSSSVILSVFSIFSSCSGTPITCRFLLLIVSHIILRGSSFFFILFSDFPSNKILSKCLSSVSLILSSVVSNLLLSPSMTLSISEILLLIFWISNCCFRMISSCEFILAFCSCIIFLNSPVFLSVFCMNLSAFSVNLPIFSSFLSAFCFNSWIALNIRDLNSLSGNSSAFSSTGTSSGVLFWMAAGTILSCSFICFDIVCCLWDIQ	26544	30020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_26500_30000
915188	contig_13158_pilon	+	1734	2	Intergenic	novelGene_107290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	556	855	131989	132288	TRUE	35	AGAATTTGGTACCGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFLTELEKDVEHNSNLQRKEQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	131433	159888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_132719_159439
915189	contig_9177_pilon	-	2064	14	Intergenic	novelGene_32545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	897.683725487946	6	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	568	1623	6586	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	9307	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2742_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6742_8508_8608_8686_8789_8903_9054_9147
915190	contig_8354_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_24089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	1284	1946	175468	174806	NA	40	GAAATGATGACGTCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGKWNVQNMNLGKSEVVINEMEHINIDILGISELKWTGIGHFESDHHMVCCAGNDTLKRNGIMFIIKKNISGSILKYNVVSNRITSICLQERPVNMTIIQIYTSTTKAKYEMEDFYQLQQSEIDQICDEHALIITGNWNAKVGSKEEGLIVGKYGLGDRHNARDLMIEFWKTNNLFFANTFFQQHKGDYTCGPHRMKYIGIKSTTSVGR	176751	174449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_174400_176800
915191	contig_18364_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_102590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCATGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213756	212988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_213000_213800
915193	contig_17144_pilon	-	4046	12	Intergenic	novelGene_29222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_8	1930.8248826014	66	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	2666	3751	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	175602	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580
915194	contig_5698_pilon	+	2211	7	Intergenic	novelGene_55030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	730	junction_1	590.437314388431	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	15	701	4103	19370	FALSE	20	TGTTCTAAACCTGTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4088	20880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
915195	contig_9995_pilon	+	2093	2	Intergenic	novelGene_47681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	233	397	263701	263865	TRUE	75	GTGACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSRFALSDHAPLSDPQGGFCPTDLQSDLLPPRKQSKEAWVLPQELDRFPGRSAWAESGWGDCTFGEPSGYAPAAADCMLDKRTQVRTVLCCIFPPEQVDRVMALFPAQSDITRLILLIQRFQRAAAPLGTP	263468	279666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_264296_278400
915196	contig_8269_pilon	+	3682	8	Intergenic	novelGene_106212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_7	238.766387406398	11	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	374	1165	324084	324875	TRUE	30	GGTATTTGCAGTGAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGAVEASWALELRETTSPSTLRCVEGEAPSSETGTSLDSPSAYHQGPLVPGASLSPDHYEHTSLGAYGLYSGPPGQQQRTRRPKLQHSTSILRKQAEEEAIKRSRSLSESYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGVLVPSECGDLGKPAAIKSPATSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHAEEAPASDAARARDTEPKPTLHGMDHHKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQVGERPSSTESDLRLRAGGSSQDYWALGHKDDKGDTDTSCRSTPSLERPEQRLRGGAPAAVDHRAA	233270	360406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_233343_318457_318753_324077_325330_339814_339977_342676_342800_344516_344684_358162_358306_358938
915197	contig_17753_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_105031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16317	14903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_14900_16300
915198	contig_10345_pilon	+	1335	13	Intergenic	novelGene_158371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2127	junction_1	641.766588540309	14	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	55	1095	11670	24141	FALSE	40	TAGTAACACTACCCGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	4384	24381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
915199	contig_1301_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_47381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3193	3492	693850	694149	NA	70	TAAAAAAAAAAACAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRRFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSPRLTIQPGSGQPRKTKWD	690657	694962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_690700_695000
915200	contig_12622_pilon	+	7824	18	Intergenic	novelGene_5754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	23.257844604351	763	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	911	1360	67905	72916	TRUE	50	AAAAGACATTTGCAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDSGDKVDAQEENFLPKYQRVKDLCQRTEYQTACEQLGQKWQCVEDATGKLKLHKCKGPERLSSGGSRALSNLVPTYYGQGSEACPCDRVDYKLSLAGRRKKVFKKKYKASYAHNRYIRSVAIELDGEVYHVGLDDASQPRNLTKRHWPGAPEDQDDKNGGDFSGTGGLPDYSAPSPIKVTHRCYILENDTVQCDLDLYKSLQAWKDHKLHIDHEIETLQNKIKNLREVRGHLKKKRPEECDCHKISYHAQQHKGRLKHKGSSLHPFRKGLQEKDKVWLLREQKRKKKLRKLLKRLQNNDTCSMPGLTCFTHDNQHWQTAPLWTLGPFCACTSANNNTYWCMRTINETHNFLFCEFATGFLEYFDLNTDPYQLMNAVNTLDREILNQLHVQLMELRSCKGYKQCNPRTRNMDLGLKDGGSYEQYRQFQRRKWPEMKRPASKSLGQLWEGWEG	54420	89089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_54539_58445_58648_65357_65587_65697_65795_66105_66201_67049_67113_67798_67969_68247_68391_69488_69613_71599_71634_71871_71926_72885_78269_78578_78721_79079_79252_80070_80307_81625_81719_83163_83457_88913
915201	contig_2342_pilon	+	3431	4	Intergenic	novelGene_132763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	254	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAACTAGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417035	585321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_417340_438613_439142_439992_440071_582800
915202	contig_8866_pilon	+	4296	3	Intergenic	novelGene_77808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAATAAATAGGTTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432303	477020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_435151_462523_462596_475643
915203	contig_12080_pilon	+	4242	2	Intergenic	novelGene_128353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1463	1888	65019	65444	FALSE	80	AGGTAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDDFSVEEKAHQLPDREFKSLIFRDIQELKQKADKKEEKIDKFMEKADKIMANTDKTMEELRKIIQEQNIKINSQLEIIHKQQFESQKINNKISEMDTIIEGLRSRCETTEDGISKIEDKYLATSLFEEKS	63218	67798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_63898_64235
915204	contig_11825_pilon	+	1659	2	Intergenic	novelGene_155404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGGCAACTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41163	42875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_41317_41369
915206	contig_8978_pilon	-	2617	9	Intergenic	novelGene_49365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	30.0330547064397	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	445	1455	306006	302321	FALSE	10	TTCTGAGGCACCTGGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYANGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCLGIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQLGVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAPVRQRKGRDTGPGKRKREDEAPVLEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYLQPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD	306877	301158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_302514_302624_302743_303567_303823_304345_304461_305048_305201_305515_305685_305997_306160_306403_306612_306794
915207	contig_7707_pilon	-	2256	2	Intergenic	novelGene_72154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATAAACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224375	214702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_216323_223739
915208	contig_12464_pilon	+	3510	3	Intergenic	novelGene_68629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	9	434	45237	45662	TRUE	25	CGTAGTCTCTGGATTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVMASASAAERVIATAVPASGTNSNGESSEVEGGVGAVGEEKDAPVKAEAAGDSEEDGEDVFEVEKILDMKTEGVRVRPGRAEAGGLVFSFSSLQAGRGTVGTSGLWRREGNGWVEMETPLRWLAECFTLRFSLCFMPQRHSF	45228	106533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_47528_48193_48511_105639
915209	contig_1442_pilon	-	1516	7	Intergenic	novelGene_172150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	12.5786415094088	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	208	915	349761	304636	FALSE	30	ATTTAACTTTATTCCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHCFGGGILSCILLAEPPVRFLANNTNILLASSIWYIIFFCPCDLVCQAYSFLPVQLLAAGMKEVTRTWKIVGGVTHANSYYKNGWIVMIAIGWARGAGGTIITNFEQLIKGTWKPEADEWLKMSYPSKVTLLGSVMFTFQHTKHLAISKHNLMFFYTVFLVATKITMMLTETSTVSFAPFEDALGRMLFGCHQRFSPRVKKNETKSNGTGSSTSKPTADASDKLKKKHSKKTE	369279	304034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_304846_333688_333807_340251_340340_342041_342227_349654_349812_361331_361408_369198
915210	contig_4924_pilon	-	3526	1	Intergenic	novelGene_84724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	3021	3464	114708	114265	NA	55	TTCCAAGGAAAAGATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPGKKCCSSLSDDAGRAVHILTAVESILTHSNPIRQSRVSEAVNLYGSRLPHLSPVEWLVDSNYQPFSQQPSTLTTAPLRLHEQCICLDKGRCVQDRDRKLFLGI	117728	114202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_114200_117700
915211	contig_6102_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_32312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGGCAATGCCTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1571213	1573812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1571200_1573800
915212	contig_7058_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_136027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183235	180789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_180800_183200
915213	contig_10296_pilon	+	1588	5	Intergenic	novelGene_168880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	91.3492610807553	21	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	56	1045	861599	904096	FALSE	65	TGACAAAAGAAAAACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEAAAGPGRATGGSGGGTMEAAAAAPRPQLLILVLAAAATLVPGTTALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVTETTDKVIHNSMCIAENDLIPRDRPFVCAPSSKTGSATTTYCCKQDHCNKIELPTAVKPSSGLGPVELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICHNRTVIHHRVPNEEDPSLDRPFISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVSVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGNSLSSPII	861543	904639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_861684_888643_888890_894422_894654_899016_899248_903899
915214	contig_13021_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_8261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	65	397	226773	226441	NA	55	GGAAATAATAAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITENTERTVEDLLAENFPDIMKDDKISIQDAHRTPHKVDPKRRSPRHIIIKLAKTKDKERILTAARDKQKVIYKGESIRISSDYLAETMQARRQWDDIYAFPDKQKFREFAKTKPKSQEILKGVPRLENQ	226837	225001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_225000_226800
915215	contig_10958_pilon	+	2411	6	Intergenic	novelGene_5442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	10	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	27	428	888255	894000	TRUE	60	TAAAAAGTAACATCAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888228	901650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894042_894804_894978_895278_895855_900457
915216	contig_7378_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_120287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	907	1338	592364	591933	NA	70	AAAAGATGAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETIRLSSDYSVETMQARRQWDNIYKTLKEKNCQPRIICPEKLSFKYDGEIRTFPDKQKIREYVKTKPNLQELLKGVLRCENKQLWLTG	593270	591605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_591600_593300
915217	contig_5020_pilon	-	2780	1	Intergenic	novelGene_27946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174020	171240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_171200_174000
915218	contig_12057_pilon	+	2253	20	Intergenic	novelGene_131634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_17	44.2330143307768	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	10	1836	99524	161653	FALSE	5	CCTGTTCAGTTGTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRKPPRVRANHRDFQLRNLRIIEPNEVTHSGDPGSETDGRMAPKVTSELLRQLRQAMRNSEYVTEPIQAYIIPSGDAHQSEYIAPCDCRRAFVSGFDGSAGTAIVTEEHAAMWTDGRYFLQAAKQMDSNWMLMKMGLKDTPTQEDWLVSVLPEGSRVGVDPLIIPTDYWKKMAKVLRGAGHHLIPVKENLVDKIWTDRPERPCKPLLTLGLDYTGISWKEKVADLRLKMSERNVVWFVVTALDEIAWLFNLRGSDVEHNPVFFSYAIIGLETIMLFIDGDRIDVPSVKEHLLFDLGLEAEYRIQVVPYKSILSELQALCADLSPREKVWVSDKASYAVSEAIPKDHRCCMPYTPICIAKAVKNSAESEGMRRAHIKDAVALCELFNWLEKEVPKGGVTEISAAEKAEEFRRQQADFVDLSFPTISSTGPNGAIIHYAPVPETNRTLSLDEVYLIDSGAQYKDGTTDVTRTMHFGTPTAYEKECFTYVLKGHIAVSAAVFPTGTKEPGYYEDGAFGIRIENVVLVVPVKTKYNFNNRGSLTFEPLTLVPIQTKMIDVDALTDKECDWLNNYHLTCREVIGKELQKQGRQEALMWLIKETQPISRQH	99514	162070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12057_pilon_+_99556_114853_114943_121140_121266_135367_135432_136621_136727_140422_140516_140832_140977_142177_142274_143969_144052_145734_145946_147495_147586_148243_148295_149412_149472_149670_149749_151783_151856_152877_152939_154468_154539_156319_156397_157622_157722_161524
915219	contig_12079_pilon	-	2890	12	Intergenic	novelGene_67514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	362.577982492635	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	223	1668	871530	861925	TRUE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSTPHHSPLPLTKEGRPKPPAVGLGSTKAFPETK	872429	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861054_861161_862025_862130_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
915220	contig_16999_pilon	+	4292	2	Intergenic	novelGene_84943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1156	1476	5920	6240	TRUE	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICLTDLISLGYIPKSGTTGSYGISISSFLTKCHIVFKNGCTILHSHQQCIRVPISLQHLQHLLFSVGLISASNAGVRCYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAA	4764	14423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_6658_12024
915221	contig_3700_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_138091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319620	320788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_319600_320800
915222	contig_1867_pilon	+	6228	2	Intergenic	novelGene_54552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCTGGTACAATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420007	427230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_423807_424801
915223	contig_1836_pilon	-	3464	10	Intergenic	novelGene_71036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCTCCGTTCGTATCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	844528	623591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_623741_675424_675527_790990_791154_812783_812858_818777_818855_833372_833446_833755_833869_834579_834762_838180_838268_842084
915224	contig_8571_pilon	-	3081	4	Intergenic	novelGene_169179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1039	1404	508209	507844	TRUE	55	ACAAAGAAGGACACTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRYTLSHPQPFFIPTRPPLLPAATVSWPGSTGFTLVLLGFHQPTLAGSLSAICWLLVLLFSPIFDFFLTSPFSQIPGSVCHCCFFLKGCETPHDCKTASQPTPPWWWDLRGFFLCLFVLF	509247	444764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_445326_446303_446765_466497_467011_507701
915225	contig_11285_pilon	-	2492	24	Intergenic	novelGene_5684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	450.402651195748	13	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	767	2301	192	2492	796510	784062	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPKTWAPKPFKPSRPGKDWGLLSSAGGTTLWCGRGTEDRVQAGELVLGAPGGYFFLGLLARASVADIVSGYSRRRDSLLWHVPTSFTSDYSNSEFFDGYRGYSVAVGEFDRNPNTTEYVFGAPTWSWTLGAVSARRPAPRHPEVPNRSSQLDNSCVGAGMTPSHAHPAQVEILNSDLKMLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPAP	798408	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784069_787082_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794820_794965_795014_795339_795472_795574_795621_796384_796514_796604_796727_798342
915226	contig_12540_pilon	-	3884	1	Intergenic	novelGene_148135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	267	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1987	2436	1301369	1300920	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKGIKYYVKAQNTQKIYMWKKLLFWTYVLIRKKTSLMNPEHITKPIVTELILTHSDPMCVRVEPGSIGFSVADFSEVDCQAFLPRHHWVDLSLRLFALHHPGTVLTLVKTQKYQGAIPCPATKGSHRQNLLEAGVVVSCQRVHSDSW	1303355	1299471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_1299500_1303400
915227	contig_7457_pilon	+	2842	13	Intergenic	novelGene_31563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	53.8880011381631	6	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1378	2280	863440	867405	FALSE	5	TGATCTGCTTTGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTVDIRAQLLIGAGNSSQGIHMTQRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKILCVCESCLQPFWKQIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFSIYYTVSQKPVVIDRDFKDWSPGGTISCRNCGEAWGLQIIYKSVKLPVLQVRSMLFETPRGRLQAKKWSRVPFPVPDFNYVQHCAQNLRDLSL	859209	867967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_859266_859491_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862164_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_864686_864732_865537_865729_866783_866881_867222
915228	contig_678_pilon	-	2121	5	Intergenic	novelGene_167786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	682	junction_4	304.182100065076	69	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	654	1412	36798	31694	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFLSDDALKEPAAMLNNMRVYGTAFLILMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEMNNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIVTENLWSNYLPKGEIIEKASVKSSDVLGSLNHEYVLVDMTTSFTLLVGIFFPSVTGKQMGCHLF	37451	30706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_31176_31453_31882_32698_32914_35731_35974_36684
915229	contig_3529_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_105362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTTTACCAATATTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551845	553488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_551800_553500
915230	contig_18406_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_88056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAAATGGAAACAGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111076	112664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18406_pilon_+_111100_112700
915231	contig_12106_pilon	+	2790	1	Intergenic	novelGene_83738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	919	1266	144956	145303	NA	35	GGAACTACTCAACGGACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METASFLKPHEPTSASFKFVFYSFLTSLYLHKIEELGPSSGLGFSLRECCCWFDLLFRPLKLPHISNKAASLSYHSYVHWSSTFNFLHFLCVHKSADCLVQEAHLSFRHAFLTSF	144037	146827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_+_144000_146800
915232	contig_8415_pilon	-	2019	2	Intergenic	novelGene_141680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTTGTTGTTAGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106245	4358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_-_5285_105152
915234	contig_3956_pilon	+	1897	11	Intergenic	novelGene_15202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1386.72995208151	226	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	306	1373	1284838	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVWPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282827	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284061_1284805_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287530_1289851_1289892_1290297
915235	contig_15047_pilon	-	2840	5	Intergenic	novelGene_52258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	79	378	6719	6420	TRUE	15	CTCGGAAAGTCTCTGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	21707	2780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_2825_3220_3499_4160_4433_4551_6785_21694
915236	contig_3818_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_99268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	60	485	548343	548768	NA	10	GTCTTTTCTCTGTTTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGGHEPPTFQLAANTSADCTTQGVLPSVLHALFYPRQSNPLAPHPPSRKPCTPSPDSQALWETYPLTSQPSSTQGSLLRLLPRSLINLLSFFLNDRNLLFTDLEAESGSRMLALQGFPVSPCSGSSKHSLACTVSLLLC	548283	550515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_548300_550500
915237	contig_5075_pilon	-	4692	4	Intergenic	novelGene_174074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1407	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4037	4435	325883	325485	FALSE	20	TCTCACCTTTATTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSPGIPPAWQPRPGSSCTLEWSPAAPQEEAKMALRARYSSKRQGRRREASKKSKEAEKKSNTNSQEMAPREPPAWVCGIQAAGASQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKCKPQINGCFVSHWTLSEAAFS	582266	325227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_-_326024_326295_327805_380685_380792_579985
915238	contig_5590_pilon	-	3641	3	Intergenic	novelGene_163016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	608	982	334619	334245	TRUE	25	GAATGGTCTGACTGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAETAAQSLVICSQQEAMLGGNLRRTSLLAQTGSRVTKTKLLPVLLNSQGLGKCGLGLVSRQARWWSTPLASALTRVHYEFTAAHILQTDKTTCLLLHGSCTIIGEIQDSPQGQRDEDGGPGL	335226	299746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_300674_332095_332452_332868
915239	contig_1406_pilon	-	5433	1	Intergenic	novelGene_25659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	647	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	189	488	2800360	2800061	NA	55	TGAGGAATAAAAATATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFASTSSSKAVYLCQCPVSHNICSVSLYSLKFLALYGERYQGASGILCLFPCSHKLPPLYLHQDWLSLIFCTGLICSHGHLVEAMEKSFQSSMSSPCV	2800548	2795115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2795100_2800500
915240	contig_10766_pilon	+	2351	4	Intergenic	novelGene_151221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACATAAAAATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195038	340204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_195218_195396_196758_274597_274831_339626
915241	contig_5084_pilon	+	3722	4	Intergenic	novelGene_64494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1549	2040	369492	369983	FALSE	30	CTTGGATCCACCATCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHFQHCICLLTHLNWYFVNSWSLVFSLCLQCSLDFFLQYHWFLIICYFLKWLNVNQFFLVQLLCVFLPSSFDVSCIVQYFLHRLLHYCNLRLDIFLRFFQLEKCHTCSSFLVFKLQVFAHFIIILSLLELSLKSSVQLFYFIISSIGFSCSTFKGKFLSLF	190832	371665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_191058_192511_192698_192754_193481_369080
915242	contig_7057_pilon	+	2313	3	Intergenic	novelGene_123402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	8	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1292439	1300253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1292854_1296828_1297620_1299145
915243	contig_5961_pilon	+	3895	1	Intergenic	novelGene_144171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTTAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266462	270357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_266500_270400
915244	contig_10370_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_178748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1404	1712	3881	3573	NA	60	GGATTCTAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFLNVQKAGLVVFSIQRINFDKRSLHMGLLNSLSVKRKRKSRLHKYLKLKKKSYIHTHTHTHTHTHTPCKNYEKARGHKEARLMETQNNQNANNENTDVS	5284	2675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10370_pilon_-_2700_5300
915245	contig_9471_pilon	-	3106	1	Intergenic	novelGene_21688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	133	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1298	1627	52162	51833	NA	35	ATTTTTGTATGAGAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVALELRVAKAKRRNDEVKGLNRRFQRVASEDKVKYYNDMCKDLEIENQKGRTCLAFLKLKELNKKIPPRVAVLKDSMGENIKQRRKHQKKMEERHSHYTIKN	53459	50353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_50400_53500
915246	contig_7286_pilon	-	1120	7	Intergenic	novelGene_108687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4087.57262932416	16	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	456	1052	291382	286948	FALSE	0	TTGCCTTGTGGGTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	293145	286879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_291785_292101_293119
915248	contig_5711_pilon	-	4112	3	Intergenic	novelGene_80258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAGGCGCCTCAGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73671	52478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_52655_61876_61997_69855
915249	contig_1856_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_84874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACCATAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225897	226733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_225900_226700
915250	contig_6228_pilon	+	2838	5	Intergenic	novelGene_164507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_1	18.6882315910308	136	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	107	1423	252696	273949	FALSE	25	GCATTGAATAAGTTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSPEPLSGQDVGSFAYLTIKDRTPQILTKVIDTLHRHKNEFFEKHGEEGTEAGKKAISLLSKLRNELQTDKPIVPLVEKFVDTDIWNQYLEYQQSLMKESDGKPRWFHSPWLFVECYMYRRIHEALTQSPPIDDFDVFKELKEQNFFESQESIISLCTYLQELMRTIEELDEDQLKNEFFKFLQISLWGNKCDLSLSGGETSSQKNDLISSLEDLKPFILVNDMERLWSLLSKKTREKASVRVDIVLDNSGFELTTDLVLADFLLSSKLATEIHFYGKRIPWFVSDTTIHDFNWLIEQVKHSNHKWVAKCGVDWENCVKMSRWVYHDHIFWTLPHEYCAMSQVAPDLYAELQKADLILFKGDLNYRKLTGDRKWAFTIPFHQALSDFHPAPLCSIRTLKAEIQVGLQPGQGEELAASEPSWLTSGKYGIFQFDGPL	252589	275364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_+_252737_254681_254788_256073_256319_272093_272260_273190
915251	contig_1964_pilon	-	3917	12	Intergenic	novelGene_130903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_10	245.282566013328	72	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1209	2709	3917	153067	116037	FALSE	35	ACCCCAGCTGAACGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSSEENHTLHFYSLLLCLLKTAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGVPWGVYPANLFQQQAAAAANNTASQQAASQAQPGQQQVLRAGASQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYYDQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTAGSLTGTTNGLFRPIGTQPPQQQQQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLSNSSQSTSLFSHGPGQPGSASLGFGSSGSLGAAIGSALSGFGSSGGLTNGSGRYISAAPGAEAKFRGASSTSSLFSSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIVEFSQDQHGSRFIQQKLERA	210239	116036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_116065_119210_119479_142615_142907_143025_143170_148382_148522_150074_150218_152871_155125_157972_158143_158726_158915_166164_166274_173681_173751_210124
915252	contig_13014_pilon	-	2969	1	Intergenic	novelGene_169339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAGTCAGCCCCGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375205	372236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_372200_375200
915253	contig_19696_pilon	-	700	4	Intergenic	novelGene_178963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	15.1510909031513	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	203	649	9289	4414	FALSE	60	TAAAAATACATACAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKRYNIMAFNAADKVSFATWTQARLERDLSNKKIYQDEELPESGAGSEFNRRLREEARRKKYGIVLKEFRPEDQPWLLRVNGKAGRKYVGVWPGRVPASPPARAPSPHPTQLVISLNLSFSSVQRG	9491	4362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19696_pilon_-_4729_7639_7713_9150_9198_9277
915256	contig_6418_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_81163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAATAAAAGCATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485294	484580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_484600_485300
915257	contig_935_pilon	-	2031	7	Intergenic	novelGene_45544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	262.161156966897	4	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	523	951	352691	345477	FALSE	5	TTTCTGACTTCTGCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	377415	344396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_368167_368292_370637_370822_377395
915258	contig_9981_pilon	+	3138	2	Intergenic	novelGene_121067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACCCAAAAGTATCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395513	580082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_396112_577542
915259	contig_11656_pilon	-	2526	6	Intergenic	novelGene_53951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_5	265.767116099791	5	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	738	1787	2524	157979	123507	FALSE	30	CCCTCAAGACATTACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKDMELFRDIQEQALQKVGVTGPPDPQVRCPSVIEFGKYEIHTWYSSPYPQEYSRLPKLYLCEFCLKYMKSRTILQQHMKKCGWFHPPANEIYRKSNISVFEVDGNVSTIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTQNDVKGCHLVGYFSKEKHCQQKYNVSCIMILPQYQRKGYGRFLIDFSYLLSKREGQAGSPEKPLSDLGRLSYMAYWKSVILECLYHQNEKQISIKKLSKLTGI	159765	123504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_123677_129280_129375_130456_130619_132521_132664_139139_139256_157925
915260	contig_9053_pilon	-	2375	1	Intergenic	novelGene_87925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAACTTAAGACAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90809	88434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_88400_90800
915261	contig_1516_pilon	-	2546	23	Intergenic	novelGene_49946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	135	521	326392	325490	TRUE	10	AGCGGCCCGGGACGCCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPLLYFSCLLEMAPRFLRAASSAALEPFRKGRWILGEQRGTRAGAPSVCVNLSSDHTHDFLLYLGVLSIYVGIAHLTIFIYKEEPCADMVGHRADPDVPVLLEVLRCNHWSQSAIQFRFRLCRNLD	326526	290350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_290390_291589_291851_294251_294452_295126_295204_296179_296277_296703_296761_297001_297095_297537_297608_300556_300696_301696_301856_302432_302486_304167_304266_304856_304950_305752_305879_306833_306898_307824_307896_309114_309164_309410_309524_310247_310321_324999_325078_325474_325541_325721_325811_326145
915262	contig_8661_pilon	+	2268	1	Intergenic	novelGene_137939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305234	307502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_+_305200_307500
915263	contig_4845_pilon	-	2736	1	Intergenic	novelGene_53707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCAGGTAGCCAGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973960	971224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_971200_974000
915264	contig_7816_pilon	+	3934	2	Intergenic	novelGene_66462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTGTCTTATCAGTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115805	123441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_119189_122890
915265	contig_15188_pilon	+	3119	3	Intergenic	novelGene_163077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_2	1	36	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	824	2719	117648	125134	FALSE	25	CACCATTATCTTCCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSFQESVTFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYRNLLALGPPVCKPDVISHLERGEAPWCSQRGGHAAACPEWEPPPPMREERMYKEEPTREATLEKLKKPSRHSCVWGDAWGWKEQADALSGSEGVLWKPAPATCEDVSREQDSSPGLGESEGGSPFRSALFVQQSIPAEAGFHDNIHVTSFRSIEAVTQHQRTCAGRNAFRSIDHGKYCRAGKLRGTGPGDGLFACGECGKAFRQSSSLALHRRWHTREKAYKCHECGKAFTWSTNLMEHQRIHTGEKPFFCSECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCTACEKAFSCSSLLNMHLRVHTGEKPYQCAECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYKCSACGKAFTCHSSLTVHETIHNGEKPFKCSECEKAFNNRSRLTLHQRIHTGEKPFKCSDCGKGFSCHSYLIVHQRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHSYLIVHQRVHTGEKPFDCSRCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCAECGKAFSQNHCLIKHQKIHTGEKSLKCNECGEMFSWSSHLIEHQRLHSPEKPFAVQFSKHLLSTYYVPGSLLHAGGPGLGDVDAVSAMDVAELLCAVQPSPSRTFPLGNKPGN	116824	125534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_117793_118407_118504_123479
915266	contig_9345_pilon	+	3610	3	Intergenic	novelGene_24461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACACTTTCAAGCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508373	699957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_508613_694449_695015_697151
915267	contig_7080_pilon	+	2425	8	Intergenic	novelGene_100088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	36.8992008098843	266	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	273	923	400695	411954	TRUE	25	ATTACACCATGGTGGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSIGVGALGAAAVALLLANTDIFLSKPQKATLEYLEDIELKTLGKEPRTFKAKELWEEKGAVIMAVRRPGCFLCREEAADLSSLKPKLDELGVPLYAVVKEHIRTEVKDFQPYFKGEIFLDEKKKFYGPQRRKMMFMGFVRLGVWSNFFRARNGGFSGNLEGEGFILGGVFVVGSGKQGILLEHREKEFGDKVNPVSVLEAARKIKPQTLAPEGK	387059	519263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_387152_400138_400278_400653_400834_405131_405224_408227_408369_409029_409195_411840_413066_518872
915268	contig_19604_pilon	-	1898	1	Intergenic	novelGene_77261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	199	357	328405	328247	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QYIDRELSEIQAGFRRGHGTRNITADVRWILAESREYQKDVYLCFIDHAKLSDCVDHNKLWIALRRMGIPEHLIVLIRKSKRQSLEKNKGIPHGIKSGKVCVRVVSFHHTYSICMLSK	328603	326705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_326700_328600
915269	contig_15491_pilon	-	2852	7	Intergenic	novelGene_75942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	363.493542660053	12	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	804	1349	45111	32303	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47076	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_31954_32008_32436_37440_37560_38887_39040_40178_40317_45107_45207_46368
915270	contig_13258_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_146925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19539	17320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_17300_19500
915271	contig_20356_pilon	+	2726	1	Intergenic	novelGene_159523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAGAAAACTTCTCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13193	15919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_13200_15900
915272	contig_9206_pilon	+	3874	3	Intergenic	novelGene_137497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	462.5	24	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1887	1988	3874	318283	320169	FALSE	40	CACCAAAGAATTCATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEFESQWGYDQRNYKGMTTTQNKNLSGTKEQHNKSWNNLHLEQSISVRKSMYQYLKHDKSFIRNLLKLKYNIGYAANKSIKYFENRLGLNFPSYLDELQRFQTEEKIYECSQVEKSIKNCSSISSLQRFPPIVKTNICNKNGKDFLSPLPTQLQTTHIREKPYKCNECGKTFSQCSVLTKHERIHSEHRPYKCNECGKAFKQFSNLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFNQNSHLVSHCRIHTGEKPHKCNVCGKVFNQNSHLASHCRIHTGEKPYKCMKCGKAFNKRSYLWDHERIHTGEKPYNCTECGKAFRQWSSLRIHRRIHTGEKPYKCNECGKAFKQCSHLTKHQNIHPGEKQHKCNVCGKTFIHGSGLVKHQRIHTGEKPHKCNECGKAYIQSSSLVEHRRIHTGETPYKCNECGKTFTVRSSLTKHKRNHTGEKPYKCNECGKAYTKFAHLTRHQKIHSEKKHCESDVGGSAFIHSSTLGGCQRAHSREKPYKCNECGKSFNWSSRLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKAFSQNSNLTTHQIIHTGEKPYKCNECDKDFKQYSSLIRHQNIHPGEKPYKCSMCNKAFIRHSHLWGHEKIHTGERTYKCIECGKTFRQWSDFRI	308160	320169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_309911_310383_310481_318142
915273	contig_12923_pilon	-	2416	16	Intergenic	novelGene_30197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_15	55.1081361204193	164	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	87	2141	577741	511076	FALSE	30	CAATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVVSGTIGLKKKIYLSKPVFLTFKHTQAVGTETKHLCVYWEASKEGGSWSTEGCSHMGSNNSHTTCQCFHLSSFAVLVGLTPKADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585711	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_531948_532117_533560_533746_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
915274	contig_2646_pilon	-	685	5	Intergenic	novelGene_69662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	291.070867659407	20	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	44	619	2178950	2171647	FALSE	30	AATTGTTGGCTAAACGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPLSPSSALG	2178993	2171580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2171676_2175088_2175213_2175957_2176041_2176757_2177024_2178876
915275	contig_15236_pilon	-	4653	6	Intergenic	novelGene_141563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCACAAGTGGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443872	418983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_419280_425595_426336_428008_428137_437905_437963_440212_443283_443510
915276	contig_15760_pilon	-	3431	1	Intergenic	novelGene_131068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTCAAGAAGAAGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455582	452151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_-_452200_455600
915277	contig_6544_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_142115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378521	376661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_376700_378500
915278	contig_7230_pilon	+	1228	4	Intergenic	novelGene_52531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCATAAACCCTAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59897	141737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_60668_82277_82353_95734_96074_141693
915279	contig_19990_pilon	-	3923	4	Intergenic	novelGene_30762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGGGTGGCATTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70177	59280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_62811_64726_64824_64989_65065_69956
915280	contig_3410_pilon	-	2905	19	Intergenic	novelGene_58949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	22.196721479634	89	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	646	1728	267758	257666	TRUE	10	GAGTGGGAGCTGCTGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAPSPTGLAASGQSEGRRPAGGQPISPYGGHQRDRGIPTLQALSPVLQLQDPGGEDWKSGHKTLAGGGQKVRLLKRALEKHADKENLVILFTDSYDVVFASGPRELLKKFRQAKSQVVFSAEELIFPDRRLEAKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPSLSKLVSEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPERQQRINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRVRNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRRLKGIRDEALPTVLVGIFIEQPTPFLLLFFQRLLRLHYPWKQMRLFIHNHEQHHKAQVEQFLAEHGSKYQSVKLVGPEIRMASADARNMGTDLCRQDQSCTYYFSIDADVALTEPDTLRLLIEQNKNVIAPLTTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRIGVWNVPYISNIYLIKGSALRADLQQKDLFHYSKLDPDMSFCANIREQGRVHVPDQPAHLWPPAFPGQLPDHPPPQRPLGGVQQPRGLEGEVHPRELHQGPGGKAGRDALPGRLLVPYLHGGSLQRASGGDGTLRPVVSR	283058	253711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_254609_255350_255477_256317_256465_257658_257764_258380_258447_259093_259208_260224_260368_260658_260785_261235_261341_262897_263020_265758_265891_266463_266566_267683_267782_269580_269645_271188_271302_273136_273301_273743_273868_275006_275099_282993
915281	contig_854_pilon	+	3330	18	Intergenic	novelGene_36487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2801.89438264327	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	176	1543	1649514	1702631	TRUE	25	TTTCCACTGAGCGTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQVGCHRGLGQGHLRADVPLAGAAHQQGSGQDQEAGRRPRPMRPRSRR	1612770	1716367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681894_1683933_1684029_1702591_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165
915282	contig_5539_pilon	-	3655	2	Intergenic	novelGene_104787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	26	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGGACACAAAAATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396339	291337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_293867_395213
915283	contig_16782_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_176772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	16	486	58690	58220	NA	20	ATTCATGCTATTATTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQVFVYGTLKRGQPNHQVMLDGTNGSSAFQGRGRTVEPYPLVIAGQHNIPHLLNLPGRGHCVAGEIYAVDDQMLQFLDEFEGCPDMYQRTLVRIEVLEWEGERTAPEETPAADRIVQCFVYSTATYSPEWVHLPYHDSYDSQGEHGLRYNPRENR	58705	57535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_-_57500_58700
915284	contig_17214_pilon	+	4079	1	Intergenic	novelGene_153469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72474	76553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_72500_76600
915285	contig_6446_pilon	-	2759	3	Intergenic	novelGene_149183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1479	1796	191644	191327	FALSE	30	GATTTTCCACACAGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGRHYAEGSKSITEGQTLYDLTYIKRKGKRIDNKVYLWLPWAGWRGKGGINDDENIALIKGRVAEPITVTVVNKLYTCKKLNWHKLCNRRIYNNNKKKKSSC	279824	190363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_192074_231243_231626_279157
915286	contig_6102_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_32032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1883	2182	536230	535931	NA	50	AGGAATCATCTAAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKCIMAAKCSKTIANDSSSKRQRRSIDLEVKQKVVKQHEGRKSVNAVARDLRHVHTASCFTEHIVAVKQHMTVLYTQGYCIQTNSLCFFQANSSSLF	538112	535541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_535500_538100
915287	contig_9481_pilon	+	2721	1	Intergenic	novelGene_149634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	389	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	1446	1907	111300	111761	NA	20	GGACAGGGAGCAGGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPGIPLCSCADWGSSSQAVQYSPARRGSQTKKRKREQTNKQIKTEQIKTNKKALGIPTAWQYGLRSSSSVKRHFTAFQEEAKMAHRATYLRERRRRWREVWKKPKEAEKSNTSYQQMTLREPASVGRWNPSGTGLKPVPPGQETVARGSRGG	109854	112575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_109900_112600
915288	contig_13863_pilon	+	2388	3	Intergenic	novelGene_42100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	822	junction_1	45.5	30	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1621	1950	489950	490279	FALSE	40	TGCCCCCAAAAATACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFYCCLTCPCKYFSPLLKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	481738	490717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_482174_487480_487584_488867
915289	contig_2062_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_139037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACATGGTATCAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1192195	1191250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1191200_1192200
915290	contig_14445_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_137359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGTACTACTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288063	285664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_285700_288100
915291	contig_3956_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_14805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCGCGGTGAAGTACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1226140	1225632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1225600_1226100
915292	contig_9239_pilon	+	5260	1	Intergenic	novelGene_137177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCCACCCAACTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173551	178811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_173600_178800
915293	contig_14666_pilon	+	862	4	Intergenic	novelGene_39587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	86	562	477340	484940	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483289_484712
915294	contig_19352_pilon	+	2622	1	Intergenic	novelGene_122392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184118	186740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_184100_186700
915295	contig_16125_pilon	+	3175	1	Intergenic	novelGene_155282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	349	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACTGGCTGATTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170903	174078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_170900_174100
915296	contig_4131_pilon	+	1878	8	Intergenic	novelGene_127833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	89.0040127506299	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	480	1166	87286	94426	TRUE	5	ATTTGGTCTGTTTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATPAKKMKEEATCSICLNLMVDPVSISCGHSYCRLCIEGFLENVSHTQPKQLGNLIEAIKEINCEMVCEEHGEQLHLFCEDDGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVSQGYKEKLQKVVTNLRQLNNECMNLKALTTKQISEWKEKVEVQRKKLQSDFQNLQIFLHEEEKCCLWRLEREEEQTLRRLKDSEENLELKSCELMSYLLDLEDKCQGSPQELLLVRLF	85350	97808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_85447_85607_85845_87139_87441_87503_87694_91474_91571_93097_93337_94419_94540_97209
915297	contig_6677_pilon	-	3447	3	Intergenic	novelGene_114153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486379	188994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_189368_228821_229255_483738
915298	contig_11978_pilon	-	5235	1	Intergenic	novelGene_62811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTCTTTGTTATGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388775	383540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_383500_388800
915299	contig_10044_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_156375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCAACTTTGTGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5564	7656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_5600_7700
915300	contig_7272_pilon	+	6377	6	Intergenic	novelGene_25298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	129	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	4080	4406	535714	536040	TRUE	25	CCTGGATGAGATGGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGGRLTNNLECVDDTALLAGSEEDLKHLLMKIKDHRQPSVWIAPQYKENRNPHTGLISNIMINRENIEVKDFILLGSTINAMEATVKKSNDVLHWANLLQKTSLKC	352920	623939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_354481_533194_536539_563916_564329_564959_565253_583508_584180_623842
915301	contig_6576_pilon	+	5262	1	Intergenic	novelGene_42335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAGCATGTCTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665809	671071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_665800_671100
915302	contig_4782_pilon	-	2779	2	Intergenic	novelGene_73621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGACTATCAAGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231121	225173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_226359_229527
915303	contig_7272_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_25382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGAAGTGAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702086	700096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_700100_702100
915304	contig_2888_pilon	-	4659	1	Intergenic	novelGene_151492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTTACCATTATCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218914	214255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_-_214300_218900
915305	contig_9415_pilon	+	2566	6	Intergenic	novelGene_109799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	45.6569819414293	97	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	35	808	1712832	1737702	FALSE	20	ATGTCTGGTTATTACTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAVFFGCAFIAFGPAFALYIFTIATEPLRIIFLIAGAFFWLVSLLLSSLVWFVAGTTVGHKDGPVQKYLLIFGVLVSVLIQEAFRLAYYKLLKKANEGLKAINPEETAPSMRLLAYVSGLGFGIMSGVFSFVNTLSDSLGPGTVGIHGDSPQFFLHSAFMTLVIILLHIFWGIVFFDGCEKKRWHTLLVVLLTHLLVSALTFISPHYGINLASAYTAMVLMGVWAFFVAGGSCRTLKLCLLCQDKDFLLFSQRSR	1712797	1739460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1712945_1714635_1714807_1720758_1720830_1721860_1721984_1733129_1733258_1737534
915306	contig_14970_pilon	+	1995	11	Intergenic	novelGene_45034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_6	6582.63906119726	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	8	1294	177395	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATQQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	177387	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_210859_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
915307	contig_2703_pilon	-	5245	16	Intergenic	novelGene_101727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCAGGCACTCTCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611132	526191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_526411_559432_559521_564146_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584591_594567_594672_596349_599819_602056_602141_603369_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
915308	contig_10163_pilon	+	2223	13	Intergenic	novelGene_82607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	58.2778307382452	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1143	1080	2222	24013	38141	FALSE	50	CAACGAAACATTAACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLAHGFEILCSKSSPHFSDSKKSLVTTSPLWPGFLDSLKKNDYFKGLIEGSAQYQEKLEMAKNYFQVSVNQPESSLAMSPGEEILTLLQTTPFDIEDLKKEEANLPPEDDDQWLDLSPDQLDQLLQEAAGKKESELISKGEEQNYDLTQVSESMKAFISKVSTHKGAELPREPSEAPITFDTDAFLNYFDKILGPGPHESDSDDLDEEDFECLDSDDDLDLETQEPGEEASLKGALDNLKSYMAQMDQELAHTSIGKSFTTQKQVEPLSQAADNNSDEEDSGAGESVMSPVDVDLNLVSNILESYSSQAGLAGPASNLLQSMGVQLPDNTDHRPSSK	6458	38142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6865_11212_11431_22629_22722_22832_23012_23828_24022_24602_24732_26559_26689_29381_29468_33534_33642_33771_33956_34842_34911_36263_36479_37925
915309	contig_13697_pilon	+	1036	2	Intergenic	novelGene_165923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCCTCCGGGCACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212719	213891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_+_213512_213647
915310	contig_13823_pilon	-	4331	2	Intergenic	novelGene_145250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	1460	2950	244512	172016	FALSE	35	ATATGTATGCTATATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVTKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILASRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHTIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGIRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKMIKYLGINLTMDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLISNFIWKGKRPRIAKALLKKKNKEQRPHTSRPQNSVYSHGNQNSLVLVQ	245971	170634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_172179_243184
915311	contig_15114_pilon	-	1097	3	Intergenic	novelGene_121157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	627	junction_1	6.5	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	150	395	152066	150587	FALSE	10	GATGGTCCGTCGTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISLVFGASLALPDKACTFKVALQNFQTIFSWELKNHSIVPTHYTLWYTIMSKYEDMKIVEDCTNITRLFCDLTGLWDNMPETYIPRVVGFKGNTVLVSCIDSVFLPMNSELKFCFLSLSSSSRSALSALP	153371	149884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_150828_152061_152177_153332
915313	contig_10752_pilon	+	5092	4	Intergenic	novelGene_153050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTCTGATCATAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259042	322961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_+_261872_320542_321387_321438_321827_321930
915314	contig_7356_pilon	-	3099	1	Intergenic	novelGene_60426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAATTCTTTGAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509377	506278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_506300_509400
915315	contig_4797_pilon	+	410	5	Intergenic	novelGene_6908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4737	junction_4	1790.90680592263	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	29	409	368372	370974	FALSE	45	ATTATAAGACGAAGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLAR	368343	370975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_368395_368541_368591_368764_368844_369855_370026_370914
915316	SIRV6	+	574	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-29	8714	14	77	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	24	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTGAGTGTGGCTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101	2617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470
915317	scaffold_13505_pilon	-	964	2	Intergenic	novelGene_111637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	55	168	130	297	766115	765948	FALSE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGGGGSGCESLGAKSRLGQGRPLASAATWGSGTGQLFRREGRMTPLPHHFYIVSSLLLPGCLEISMCLGISVPPSLLACLFNLFYISKDIDSGYTLY	772683	765280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_766133_772571
915318	contig_5779_pilon	+	6251	2	Intergenic	novelGene_106472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	750	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135146	176379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_138212_173193
915319	contig_14603_pilon	-	4408	1	Intergenic	novelGene_165986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	365	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4417	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14603_pilon_-_0_4400
915320	contig_10708_pilon	-	3054	2	Intergenic	novelGene_174359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1002	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAAATGAAATGAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510466	482907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_-_484516_509020
915321	contig_6589_pilon	+	3810	1	Intergenic	novelGene_25799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	248	550	669284	669586	NA	5	GCCCTGACTTTGCCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPQESILSPAPGEHRSLTLQSPPPSDTEVQIQPHPPSDPRVPSSSPLLPQTRKSPPPAPSSSDPGVLSLSPLLPQTQEFEPPTLPPSDPGVQVSSLLHQ	669036	672846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_669000_672800
915322	contig_15353_pilon	-	2364	16	Intergenic	novelGene_151969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	89.8298144023217	49	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2289	74	2362	321243	287840	FALSE	45	AAGTATTGAAGACATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKIKDEPDNAQEYGHGQQQKTQEGELKISAVFSVSAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPPTKKTCSSCSKDILNPKDVINAQFENATTSKDFCSRSCLSTYELKKKPVVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSICITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKIVTSTGVQVQCNSCKTSAVPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPAGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGTTSAVSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAICEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDGCKRQGKLSESLKWRGEMKHFCNLLCILMFCNQQSMCDPPSQNNAASISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVTVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLVPISMDNENKVT	321316	287837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_287894_288582_288702_291408_291554_292917_292956_293299_293441_295456_295608_296143_296317_297315_297467_297638_297915_298579_298696_299181_299333_308271_308485_308596_308772_313488_313745_314003_314077_321186
915323	contig_4486_pilon	+	2517	8	Intergenic	novelGene_38542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCGCTCCCTTCCTGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130367	178005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_131585_132281_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162154_177296_177724_177915
915324	contig_6464_pilon	-	1352	8	Intergenic	novelGene_176355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_7	51.2556617081748	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	745	1350	222493	165678	FALSE	15	CATGTATGGTGTTGACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKAEKISQKATKKTKTVQCKVTLLDGTEYSCDLEKRAKGQVLFDKVCEHLNLLEKDYFGLLFQENPEQKNWLDPAKEIKRQLRNLPWLFTFNVKFYPPDPSQLTEDITRYFLCLQLRQDIASGRLPCSFVTHALLGSYTLQAELGDYDPEEHGPDVFSDFQFAPTQTKELEEKVAELHKTHRGLSPAQADSQFLENAKRL	366651	165675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6464_pilon_-_165733_167326_167546_171170_171247_177519_177563_193896_194002_222385_222603_223329_223816_366502
915325	contig_5696_pilon	+	4011	4	Intergenic	novelGene_117558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCAAGGGGAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	692635	910411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_692940_849518_850423_907363_909531_909775
915326	contig_8412_pilon	+	2994	1	Intergenic	novelGene_118381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTAACCAAAAGGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664247	667241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_664200_667200
915327	contig_7293_pilon	+	2306	4	Intergenic	novelGene_54244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4979.55607124437	13837	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	403	729	335695	336451	TRUE	35	CAATTTCACCACTTGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRSSGTWHAQPSPGLLLLGLLLLPAVVAFASASADPAEEDSDLHCMCVKTTSTVHPKHVTSLEMIKSGLHCPKAQMIATLKNGRKICLDPQAPMYKKIIRKLLGN	335292	338075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363_337205_337251
915328	contig_12919_pilon	-	5583	1	Intergenic	novelGene_75906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3332	3670	736784	736446	NA	45	TCACAGCTAATCAGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLLAIGDEELRSICVWAIISHGYNTSNIVLKIFTVFILRLLASDAVTSSSSTCWIACLNHETLDISVKYTAMVVITGTRGQEILTGFGCPLTKDFYFNITYICMQCHRHSS	740115	734532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_734500_740100
915329	contig_5758_pilon	+	2782	3	Intergenic	novelGene_119088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCTATGAGTTGGAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164942	176267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_167269_167330_167497_175977
915330	contig_14445_pilon	-	1172	4	Intergenic	novelGene_137386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.69967317119759	43	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTATTTCTACTGAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498294	395125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_395757_397246_397399_404094_404187_497997
915331	contig_5023_pilon	+	2182	14	Intergenic	novelGene_7245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2057.1822229022	13	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	83	868	607279	625842	TRUE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELQQIPCPAQTREPGHRLGGS	580846	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616566_625779_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
915332	contig_6192_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_170338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716229	714978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_715000_716200
915333	contig_14775_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_178915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCAGCAACCCTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17910	15799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14775_pilon_-_15800_17900
915334	contig_8729_pilon	-	3272	4	Intergenic	novelGene_40161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	599	junction_2	39.668067202166	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	95	568	770511	768606	TRUE	30	TTTATTCTAATTCTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFTPTNQIRLTNVAVVRMKRAGKRFEIACYKNKVVGWRSGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSKGQVAKKEDLVSAFGTDNQTEICKQILTKGEVQVSDKERHTQLEQMFRDIATIVADKCVNPETKRPYTVILIERAMKDIHYSVKTNKSTKQQVSGF	770605	765007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_765720_766613_768822_769438_769569_770383
915336	contig_1082_pilon	+	2936	3	Intergenic	novelGene_170428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	4.5	91	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCTTAGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43077	47595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_43123_43495_43567_44775
915337	contig_9297_pilon	-	5159	22	Intergenic	novelGene_69854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	131.081702378374	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	1521	3251	846918	815535	FALSE	45	CTGTGGAAATAAATATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEDRELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSEGAMANYESTEVMGDGESAHDSPRDETLQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIHDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRMCSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEFIKTIDDRK	865327	813626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_815676_817041_817240_818233_818307_820253_820468_820936_821125_821982_822143_822472_822580_824360_824491_825846_825970_829400_829482_830434_830523_846690_847015_850557_850765_851230_851357_852427_852569_854324_854499_856635_856762_858542_858673_860827_860989_863937_864128_864267_864403_865293
915338	contig_11594_pilon	+	2506	2	Intergenic	novelGene_80904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	216	671	159867	160322	TRUE	80	TTAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKGYTRKLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLHINKENNEKEIRKTIPFIIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLQQKTQRDLHKWKNIPYSWIGRLNIVKMTILRKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIISFIWKGKKP	159651	163772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_161205_162819
915339	contig_10500_pilon	-	3431	8	Intergenic	novelGene_41270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	181	1089	1640040	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640220	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627888_1628159_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
915340	contig_15456_pilon	+	3153	2	Intergenic	novelGene_139513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2453	2782	148649	148978	FALSE	40	ACAACGGTACCTAGCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNINKNPHNRTNSNIMINGEKIEVVKDFILLGSVVNVHGSSSQEIRQCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRIRCPCLTQVMVFSITSYACGSWTIE	145789	149349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_146739_147145
915341	contig_16125_pilon	-	2421	8	Intergenic	novelGene_155266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_7	475.198433310136	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	649	1950	99	2048	236934	147968	FALSE	35	AATTGTGATGATCACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISRYVQTQILRLIRLSEMMYFKILEFNLPYFLLFSIMKLNYHLQ	237032	147594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
915342	contig_3525_pilon	-	2773	5	Intergenic	novelGene_135130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	11.6913429510899	18	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACTTAACCATCAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600737	497262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_497282_511250_511694_584131_584380_597898_598639_599414
915343	contig_6929_pilon	+	1922	2	Intergenic	novelGene_139440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAGGTAGCTGAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262799	322945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_264051_322274
915344	contig_10642_pilon	-	3287	2	Intergenic	novelGene_78680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTAGGAGACTTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204421	201087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_202109_202155
915345	contig_15093_pilon	+	4807	3	Intergenic	novelGene_143296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3701	4033	62250	62582	FALSE	25	AAGTCCCAGCAGGTCGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKEEIKRSGKKSNTSSQQMVLREPANSGGWNSSSHCFLDKRLCPREAEEAEYMKKGGAWESIYQKLSELRSPSGRSKDGTQSQVFEQKEGEVVRRKEEIKRSGKKRHQ	58077	63356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_59165_59291_61071_61415
915346	contig_4678_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_126012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259702	258069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_258100_259700
915348	contig_12948_pilon	-	616	1	Intergenic	novelGene_126159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTGCAAGCATTTAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712	1096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_1100_1700
915349	contig_12964_pilon	-	1427	2	Intergenic	novelGene_131708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTATGCATTTATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557982	555718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_555937_556773
915350	contig_2257_pilon	-	2392	5	Intergenic	novelGene_122493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	2000	2392	292431	288361	FALSE	30	ACCCGTAACTAGGCAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLQLNNQEHSIHALHNQTLILKEENLQFFPGRGLQVVLPEEFLLIAEQLQLLHQVLHHHEHVVGRARPSLHDHLSGPFAPRPRHPILQTRRCDHCGGGSHHRTNRGRGGGSGPQTPPASANRAVVASAAA	333643	288360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_288660_292337_292458_299385_299478_310266_310333_331828
915351	contig_16594_pilon	-	3702	2	Intergenic	novelGene_53787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGCTTGCCATAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253151	73271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_73325_249502
915352	contig_6102_pilon	+	2699	22	Intergenic	novelGene_32352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	87.7381953866457	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	93	1847	1699217	1712041	TRUE	60	AATAAATAAATATACAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLICY	1699124	1714895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711483_1712029_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714397_1714422_1714505_1714599_1714702
915353	contig_5649_pilon	+	3976	6	Intergenic	novelGene_82459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	681	989	1564215	1564523	TRUE	5	GCACGTCTTCGGGGCGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDWSALRVRPCLERGGWGLLFQDQSHLPTVNKHEKKTISVVTSPDNVLGEGKVTPWPLPHMQSGQAGGTPGSDVLGWVGSARGLHSCAGDVSLVLNIASSK	1563534	1573890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1566866_1567380_1567509_1569708_1569838_1570664_1570739_1570825_1570904_1573654
915354	contig_6453_pilon	-	3952	2	Intergenic	novelGene_177422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	0	14	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAGAAAATAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35874	22903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6453_pilon_-_25174_34192
915355	contig_17127_pilon	-	9630	32	Intergenic	novelGene_168295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	241.105432009387	173	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2828	8487	228	8714	57714	23774	TRUE	35	GAAATCAGTTTGGAAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLKTVKESHGSVELSSLSLATAINSKGTYFIEAPKDGQKISPDSVLRLVLPESHSDSGEIRAYSLEELRELLNKLMLMSGKKEQNNVEVEVFSEVFGNVQRLVQSFINLYSAGNMLFRTWTAEVYCSPRRGISIHMDFNLELVGQLAGSGKVARLLEALCRQMEHFLDHWKRFVAKKRAEHFYLNFYTAEQLVYLSMELKKPSPSEAALMMLSFIKGNCTPSDVSKASSRTDGAASRHCVKTGMAELSPMCFSEFILVDKLRVIMEQSMECMSTFLPHCLDLDALGHCLAHLSTMSGTPVERHLPRGLQVGQPNLVVCGQSEVLLAALAIYMEAPSQPLPTYDEVLLCTPGTTFEEVALFLRRCLTLGSRGHKVYSLLYADQLSYEVGSRAEELFQSLCLQRHREDYQLVLVCDCDREHCYLPSAFSQYKVLVTPQASLETIQTYLARHFQVPQQTLSAAAVFQDRMCVGVVASQRAGVGKSLYVKRLHSKLKMKFTGTKVPLKVIRLMDPQVDESQVLGTLLPFLDAQHQKRPTIFHFDVTSSVQSGIWGFLFKLLVLQYLMDVNGKMWLRNQCHLYIIEILEGNSVLPKRSSKLVTHAPQFAFLDIFPKVTCRPPKEVIDMGLNPESSHREPGMDHTEFCSETFQRPYQYLKRFHQKQNLDTFQYQEGFIEGTPEECLQHFLFYCGVINPSWSELQNFARFLNYQLKDCEASVFCDPNFIGDTLRGFKNFVVTFMIFMARDFATPTLNTSDQSPGKHMVTMDGVKEEDLAPFTLRKRWESEPHPYVFFNGDHISMTFIGFHFQPNKNGGVDAISHLHGKVIKKDVMMMELYRGLLLQRVPFNVDFDQLPRHEKLEKLCLALGIQWAIDPDETYELTTDNMLKILAIEMRFRCGIPLVIMGETGCGKTRLIKFLSDLRRGGVDAETMKLVKVHGGTTADMIYSKVREAENIAIFNKSHHQLDTILFFDEANTTEAISCIKEVLCDHTVNGEPLVENSGLHIIAACNPYRRHSQEMICRLESAGLGYRVSAEETAEKLGSIPLRQLVYRVHALPPSMIPLVWDFGQLNDAAEKLYVQQIVQRLVDSIKIEQNEICLITEVLSASQGFMRKRENECSFVSLRDVERCVKVFKWFHDHSEMLLSKLESFLCKSSVIKNKFKRNPVLWSLVQAIGVCYHASLEKKESYRKAICSFFPEPYNDSKVIRDEVTQTQDLFLNCVPPRENIAKNLALKENVFMMVVCIELKIPLFLVGKPGSSKSLAKTIVADAMQGQAAYSDLFRNLKQVHLVSFQCSPHSTPQGIIGTFKQCARFQQGKDLQQYVSVVVLDEVGLAEDSPKMPLKALHPLLEDGCIEDDPAPHKKVGFIGISNWALDPAKMNRGIFVSRGSPNEEELIESAKGICSDSLIQDRIQEYFASFAKAYEAVCKSQDKEFFGLRDYYSLIKMVFARAKASNKKPSPQDIAQAILRNFSGKDNIHALDIFMANLPETKCFKEVSTIQLIQQNIYGGHQKGSGRELEDAECRYLLVLTKNYVALQILQQTFFSKEQQPEIIFGSSFPKDQEYTQVCRNINRVKICMETGKMVVLLNLQNLYESLYDALNQYYVYLGGQKYVDLGLGTHRVKCRVHPDFRLIVIEEKDVVYRYFPIPLINRLEKHYLDINTMLEKWQKNIVEKLKEWVGEFIHVEADHFQAKHKYSPSDVFIGYHSDTCASVVLQVIERQGHRDLTVDLYQTVLKEAKLIMLGCATPDAVVRLSMSSLGKSAIQSLSRQYYYRQQHNSFADFLQAHLHRTDLEHQAIFTEITTFSRLLTSHDCEIRESKVKGRALRPNILSLQQFDTEYSFLKEVRNCLTNTARCKILIIQSDFEDGAHDAQLIASAKYSAVNEINKIQANKDRILVYFITKLSRMGSATSYVGFHGGLWQSVHIDDLRRSTIMVSDVTKLQEVSISQLFRPQDKPEVEMGVGAEDQAEDEEMETEMNGPGDTAEVETESSEGMESEASGLGSSEILDTTRLLRSCVQSAVGMLRDQNKSSPRNMRRVEILLHLFNKDDEFRASFLRVSKEHLYFLLKKQEENMFNLKEWVVREASNQEALQEAGTFRHTLWKRVQTAVTPLLASMISFIDRDGNLELLIKPDFPPWARDLWMFIFSDIKLLNIPSVINDARSKSKMSCIVVQNDMKLSENDVPFSWRIKDYLEELWVQAQYITDVEGLSEKLVEIFQQTPLGRFLAGLSGEQQQRLIHWYLKDFLLLTMSVSTGDELKFLRMALWSCIGQLKAVSGRPEEGASLPWVHLAYQHFRSRLQNLSRILAVHPQVRDSLTEVTQNCSLPECEMALDALAAVVCAKTLTRDTLWLSPQAWLQTVKNLSTPLEFVCSEGHMRGSGNTTMALVRELRTQWSRIFSVALFVEHVLLGTQSQIPELRELVTNYAASLNKCLQDNSDVKTRRPFVAVMTILRECKDQASRTFTRFGVRPCPICQGDAQDPVCLPCDHVYCHACIKTCLIPGQMRCPFCMTDLPDNFSLTVSQEHRDATEKHAQFRQMCNSFFVDLVSTMCFKDSTPPQRDVIEVLLSLLFVQKELLREAPQRHREHTKSLSPFDDVVDKTPVIRSVVLKLLLKYSFHEVKDYIQDYLSMLEKKAFLSEDKTEVYTLFINCLEDSIREKISACSENEELNYLREEGHFLRTYSPQRRGPEQAKEASIEYLQEMARVRLCLDRASDFLFEAHTNSEMAEEKQGYLQQVEHFCTQTKNDWFRVYLVRKLTSQHTMEFVQSLAKQGHPAHWVFPTEVIAQQKDHPGQLDRFLVYGQAYKALRDAVGKAVLECKSKGITATLEACRDPKTQQAVHLLLALFREVTVLYRSHNVSLHPKPEQREAVNRFIEETKTLSPEIRLFCDIPGGQHSAIAEDRSQ	58052	21042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_21721_22019_22055_23255_23338_23652_23894_24323_24435_25235_25359_26165_26357_26604_26819_27370_27483_29287_29388_29506_29677_30456_30640_30753_30855_32728_32850_34383_34566_35119_35333_35437_35593_37073_37211_38306_38499_39123_39260_39547_39690_40419_40563_41103_41224_41969_42089_46249_46346_46963_47101_48511_52118_53699_53856_54072_54267_55035_56192_57657_57823_57933
915356	contig_9995_pilon	+	2644	6	Intergenic	novelGene_47672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	93.902928601828	58	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1349	1750	264271	278777	FALSE	85	CAAAAAAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQWEDTPGINSHMWLMSPYWAVWDPAKSSCAPGTGWFVMFLGVCLLCSLHLNMLFAGCLLTPEREENKNPNNWTDKKVMINEEEIEVVNGFILLGPTINVHGRSSQEIKRRTALGKSAAEDLFKVLKSKRSL	216918	279671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_217166_219506_219655_224036_224177_224397_224598_263657_264296_278400
915357	contig_19696_pilon	-	605	6	Intergenic	novelGene_178962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	50.3213672310282	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	206	565	9289	69	FALSE	45	AGCAATACGTAACTGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKRYNIMAFNAADKVSFATWTQARLERDLSNKKIYQDEELPESGAGSEFNRRLREEARRKKYGIQQLPGRDGEQAHSDQAGGGAQGCGRAEREQRGE	9494	28	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19696_pilon_-_106_289_355_4602_4729_7639_7713_9150_9198_9277
915358	contig_11986_pilon	-	1647	8	Intergenic	novelGene_69092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_1	180.994756942891	168	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	359	1627	42419	29109	FALSE	20	CCACCAGGGCAATGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQAQRNVSGPMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFSPHPQAPGLPDLQTKEQQSSPSTFTPYPLAGLNPNMNVNSMDITGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSVDNLPSAASPLDQNPSKHGAIPGGLSIRPPAKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKSTWSAGPASHTQASLSHELWKVPRNTTAPTRPPPGLANPKPSSTWGASPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVPPAPWPTARPGSGWGLGCWLC	42777	29088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_29322_30356_30428_31251_31447_38987_39132_39598_39791_41122_41291_42013_42246_42365
915359	contig_10235_pilon	-	1814	7	Intergenic	novelGene_46328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	27.9508497187474	15	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	184	777	94532	92415	TRUE	30	CCTTACTCATGCAATATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWMLLLIFIMVHPGSCALWVIQPPEIRTQEGATTSLPCFFNASQGRPAIGSVTWYRDEVAHGKEVRNRTPEFWGRLVPLGSVRFLCDHQAELHIRDTRVNDAGVYLCRVEVLGLGIGTGNGSLLVVEKVPTLPSPFLSTTPRSGSCQLETSTILYLLLRAAFYAFSFLSVAMGSTIYYQGKCPCCMGTPCHALDGL	94715	90010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_90033_90393_90490_90831_90898_91561_92462_92591_92751_92878_93224_94489
915360	contig_7411_pilon	+	3190	9	Intergenic	novelGene_137017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	61.1165638350194	138	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	24	1850	337637	353291	FALSE	20	CCTTAACTTCTCAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVAAKENQASLCQLTLETLENPEFMRLMYPDDDESMLRKRICYILDLYLNTPDKMGYDTPLHFACKFGNADVVNVLSSHPLIVKNSRNKYGKTPEDVICERSKSKSLELKERIREYLQGHYYVPLLRAEDTSSPVIGELWSSDQTAEAPHAGRFGGSPRDPVLTLRAFAGPLSPSKAEEFRKLWKTPPREKAGFFHNVRKSDPERGVERVGRELAHELGYPWGEYWDFLGCFVDLSSQEGLQKLEEYLIQQEMGKKTQQEPGENKACLQDKASGGGKKCSNSISVRAFLDEDEDMSLEEIKNWQNAARSASQPPAGAFGDTGCDILPVGQDTYLTDSLDASGTCDGRNGFCSPLSQARPRRGKRPMPHCREGSLLSPVSNLTVEFDKLNLQTLGSSFCKTSNNIETKDKIIVTSRMNSVGSDLLEPASAAEKTESNQVRTENQISAETAEVSLDPDSPGHEAPRSCDPELQSAPACPASSELTTRLFLLGGEPSKLDRDVLAALEHADIDPHQYPAVLRWKGAVLAYSPSDRQSWPSPALKGKFKSQWPALGSAHSCSSGICGPATGSPGKPSVSPHLPGMGSPGRYSPVHGSHLRRMARLAELAAL	337613	354631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_337805_339427_339551_341196_341264_345706_345880_346963_347071_347963_348149_350123_350773_352337_352470_353068
915361	contig_11142_pilon	+	1705	6	Intergenic	novelGene_176214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_4	98.3410392460848	15	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	17	835	7978	25818	FALSE	35	ATTAGCATAACCAGTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKQRPPGHAGYPAPPAGFPVQHQPMTNQPGGPAGVPWMTAPPPPLDCPPGLEYLTQIDQILIHQQVELLEVLIGFETNNKYEIKNSFGQRIYVAVEDTDCCTRNCCGSDRPSTIKIIDNMGREVITLERPLRCSSCCCPCCLQELEIQAPPGVPVGYIVQTWHPCLPKFTVQNEKGEDVLKISGPCVVCSCCGDVDFEIKSLDEETVVGKISKHWSGVMKEVFTDVDNFGIQFPIDLDVKMKAVMLGACFLIVSLLSLILVTDVFSSIVLK	7961	26688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11142_pilon_+_7991_16256_16415_17813_17857_21241_21463_23177_23340_25596
915362	SIRV6	+	1225	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	285	18	-150	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	8	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	40	ACGAAGAAGCTAAACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
915363	contig_6654_pilon	-	2502	2	Intergenic	novelGene_85730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	42	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTGATCTTCAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413522	410398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_412367_412988
915364	contig_11338_pilon	-	3257	1	Intergenic	novelGene_6401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	190	630	313440	313000	NA	75	TAAAATAATAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	313629	310372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310400_313600
915365	contig_19145_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_164147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGGTCTCCAGGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217575	216093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_216100_217600
915366	contig_9972_pilon	-	604	1	Intergenic	novelGene_162794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGAAACCCTGGTGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271836	271232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_271200_271800
915367	contig_8248_pilon	-	2346	12	Intergenic	novelGene_125027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	31.542179552293	38	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	278	1567	158805	129579	FALSE	40	AAAGGTTGAGAAGTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSGLGKAATLDELLSTCIEMFDDNGELNNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCMYQNASGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRITEEFREVASQLGYEKHISLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWMEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSQPTSPTMPNKPVVPLEWISGVMPKPDPTVINKHIRKLVEVSG	201970	128799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_129708_136163_136242_146568_146845_148727_148845_149217_149392_151124_151273_152671_152804_153329_153393_157647_157751_158735_158924_160569_160597_201838
915368	contig_7201_pilon	-	2432	11	Intergenic	novelGene_152536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	43	junction_1	50.5390937789747	78	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	120	1199	997351	967123	FALSE	25	GGATATTTAATGTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDLEDLIINWDESKSIGDIFLKYSKDLIKTYPPFVNFFEMRKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRPVQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVFYEVDGCPANLLSSHRSLVQRVETVSLGEHPCDRGEQVTLFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHSHTRPPPPLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSEELPKESWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSRASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKSALRRALMTSHGSAEGRSPPSNNKHVVNRLTSTSSLAGIPSPSLVSLPSFFERRSHTLSRSTTHLI	998638	965889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_967213_970338_970486_971451_971560_984322_984478_985806_985946_990533_990654_990817_990897_994839_994922_996533_996631_997288_997400_998567
915369	contig_6795_pilon	-	2119	10	Intergenic	novelGene_27684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_9	90.0190651960207	83	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	258	1142	129029	71902	FALSE	50	AAAAAAAACAGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCVAPSELETKMNVTKGGLVLFSANSNSSCMELSKKIAERLGVEMGKVQVYQEPNRETRVQIQESVRGKDVFIIQTVSKDVNTTVMELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVVCQPIIITLLVFAVIVLLISWLPVCL	134357	70924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
915372	contig_9370_pilon	+	3095	6	Intergenic	novelGene_177244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	36.0077769377672	231	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	988	1731	72887	75603	TRUE	45	TAAAGCCCAAAATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIFGCLPEADGTVFRIHTKAEGLTDVDIPLELVFHLPVTYPLCLPGISVNSECLTRAQCAMVKEKLLEQAKNLLSEPMVHELVLWVQQNLRHILNQPETGGGSEECTFPPSITVDDGLWITLLHLDHMRAKTKYIKTVEKWASDLRLTGRLMFMGKIILILLQGDRNNIKEYLILQKTSKVDVDSSGKKCKEKMISVLFETKVQTEHKRFPAFEVKEYSSLDELQKEFEMAGLKNLFSEFVLGLVK	59916	116514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_+_59940_71922_73400_75275_75392_75488_76628_89442_89480_116211
915373	contig_366_pilon	-	8634	9	Intergenic	novelGene_51593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	543.746135043735	14	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	7418	7786	769115	757099	FALSE	30	ACTGTTTCTGTAAGGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF	803555	756250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_757107_764236_764350_765322_765430_768021_768097_769049_769129_770343_776893_780057_780185_802171_802279_802934
915374	contig_4425_pilon	+	2197	1	Intergenic	novelGene_178176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	286	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAAAAAAAACGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184419	186616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4425_pilon_+_184400_186600
915375	contig_11709_pilon	-	4548	1	Intergenic	novelGene_168208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	236	711	1210	1920	37196	36486	NA	25	GGCTGATTTTTCAGAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDKAISHHAYWKLTWNAKHGLPLMKERKEKNKIKKSCSPYLSNKAGEQNIKYVVVAEAAKTVSYKLRQNGCKCQNQASPLTCPHPQSTRLRLALSLHPTPNHEFNAIRTSNFQLHIMTGVGKEKKTTDTLQEMKACRREETTGNRKHKPTPVEREDMAAVGLAGPTPRAEGGSTFDLLSGCGGPSSLPSVLRGNLDSPGDIISARPIDANRKQEKELRIIHVVCQTVFPLTQVTA	38405	33857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_-_33900_38400
915376	contig_10003_pilon	-	4734	2	Intergenic	novelGene_88287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAGTAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881059	876281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_876507_876550
915377	contig_12919_pilon	-	2758	2	Intergenic	novelGene_75870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	239	568	296996	268311	FALSE	65	CAAAAAAAAAAAACTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINVVCVLTAPLTSIPPISLPLLRPPHSLRHDNIEIRPINNPMITSKCSSGRKSPTFLTLNQKLEMIKLSEEGMSKAKTGQKLGLLCQTVSQVVNAKEKFLKEIKSATP	297234	266120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_268314_296669
915378	contig_15114_pilon	-	6205	3	Intergenic	novelGene_121089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2211	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36052	27096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_27594_29188_29380_30535
915379	contig_8269_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_106224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	161	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATTTATTATATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272649	270298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_270300_272600
915381	contig_6929_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_139441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	118	555	269554	269991	NA	60	AAAAAAAAAAGCCCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKIYQANSYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKGGHYIVIKGTIQHEAITIINTYVPNDRAPKYIKQTLTALKREIESSTIIVGEFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQLDLIKIYRTLHLQLQTTHSFPTHVERSPE	269436	270359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_269400_270400
915382	contig_5316_pilon	+	2309	10	Intergenic	novelGene_61238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	325.01897380512	37	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	417	1718	453918	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	451604	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_451882_453778_453972_474052_474257_511463_511608_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550182
915383	contig_6364_pilon	+	2686	13	Intergenic	novelGene_51857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	10.2669236980812	97	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	626	2674	2205208	2236315	FALSE	70	AGGAAGAAAAGAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPYTPPSVPPPGGSHRTIQTRVLSVHIQRSPRLHASWQRRPRRTSRGKKAPASVVRCTTLLHRTPPATQTQTFRTPNSGSPASKATAAESAFSRRVEGKAQNHFEETNSSSQNSSEPYTCGACGIQFQFYNNLLEHMQSHAADNENNMASNQSRSPSAVVEEKWKPQLQRNSANNTTTSGLTPNNSMIPEKERQNIAERLLRVMCADLGALSVVSGKEFLKLAQTLVDSGARYGAFSVTEILGNFNTLALKHLPRMYNQVKVKVTCALGSNACLGIGVTCHSQSVGPDSCYILTAYQAEGNHIKSYVLGVKGADIRDSGDLVHHWVQNVLSEFVMSEIRTVYVTDCRVSTSAFSKAGMCLRCSACALNSVVQSVLSKRTLQARSMHEVIELLNVCEDLAGSTGLAKETFGSLEETSPPPCWNSVTDSLLLVHERYEQICEFYSRAKKMNLIQSLNKHLLSNLAAILTPVKQAVIELSNESQPTLQLVLPTYVRLEKLFTAKANDAGTVSKLCHLFLEALKENFKVHPAHKVAMILDPQQKLRPVPPYQHEEIIGKVCELINEVKESWTEEADFEPATKKPRSATGENPTAQEDDRLGKNEVYDYLQEPLFQATPDLFQYWSCVTQKHTKLAKLAFWLLAVPAVGARSECVNMCEQALLIKRRRLLSPEDMNKLMFLKSNML	2176337	2236327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2176515_2191684_2191763_2192448_2192488_2197501_2197592_2198666_2198704_2198797_2198876_2204538_2204599_2205141_2205232_2217260_2217502_2221248_2221333_2224627_2224706_2234023_2234126_2234795
915384	contig_3153_pilon	+	3441	10	Intergenic	novelGene_104635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	378.19937259612	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	508	2634	67771	99804	TRUE	10	TGCTCTGGGGGCCTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEDDLDNLAQDLKKLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVEQLTLSGLLEALQSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGKCRALAKFKFVFFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDMPDKILKWTFRATLLRLQQSVLFLLDGYNEFKPQKCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTVEVGDMTEDSAQTLIQEVLIKELAEGLLMQMKKSSSLRKLMKTPLFVVITCAIQMGETEFHASTQTTLFHTFYDLLIHKNKHKHKGIAASEFTWSLKHCGDLALEGVFCHRFDFKPEDLSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYIAGRRLSSLLTSHEPQEVTKGNGYLQKMASISDITSMYSNLLLYTCGSSTEATRIVMKHLATVYQHGSLLGLCIAKRPLWRQESMQNVKNTNEQEILKAININSFAECGINLFHESMSKSALSKEFEAFFRGKSLYINSENIPGYLFDFFEHLPNCASALDFIKLDFYGKAVAAWDKTVEDPSRTHTGESSETYIPSRAVSLFFNWKQEFKTLDVTLRDFNKLSKQDIKYLGKIFSSATSLRLHIKRCAGMAGRLSSVLSTCKNIHSLMVDASPLTIEDEQHITSVTNLKTLTVHDLQTQRLAGGLTDSLGNLNNITKLILDNIKMNEEDAIKLECNLNINDLCMIQETGK	58005	190738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_58113_62937_63010_66684_66946_67703_69752_95022_95116_99751_99862_99967_100139_101885_101979_111196_111365_190420
915385	contig_5899_pilon	-	5268	2	Intergenic	novelGene_146959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACTATAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40706	24000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_29253_40690
915386	contig_9335_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_147453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTGCCAAAATCAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489000	487869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_487900_489000
915387	contig_513_pilon	+	4371	9	Intergenic	novelGene_80127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	769	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTCAGAAAGTATCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302424	322134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_+_304850_306468_306524_308604_308702_311803_311881_313010_313123_315694_317047_318373_318454_319439_319534_322055
915388	contig_6946_pilon	-	3139	2	Intergenic	novelGene_59757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	12	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	142	1227	109810	108224	FALSE	65	GATAATATAACCAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAISPEREESAGSWKYTESTQSFPTPSDLHLAVQELSSASLPSQFTMASTNNSAGIRWSRQETRTLLSILGEAEYIQRLQTVHHNADVYQAVSKRMQQEGFCRTERQCRSKFKVLKALYLKAYVAHATSMGDPPHCPFYDTLDQLLRNQIVTDPDNLMEDAAWAKHCDQNLVAPDPPGEEGTSILKAKRTQAADHQPILKTVKESDEDCHLRLSDRMQETSDLEDSWDEFSGAGCSQGTPSYSSSHNLFRGAVAPCQSSTMTRLGVSGEPSPCTSTSRNAPGAASTQRHQVSSSRVHFVSGGDRPLTSEPPPRWARRRRRSVSRTIAAELAENRRLARELSKREEEKLDRLIAIGEEASAQQDTANELRRDAVIAVRRLATAVEEATGAFQLGLEKLLQRLISNTKS	109951	106311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_108748_109248
915389	contig_6842_pilon	+	4124	12	Intergenic	novelGene_130733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_1	27.4268373123603	165	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	16	1878	1224478	1267295	FALSE	25	AACCACCCAGATGGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVDSAMEVVPALAEEAAPDTAGLSCLVNLPGEVLEYILCSGSLTAADIGRVSSTCRRLRELCQSSGKVWKEQFRVRWPSLMKHYSPTDYVNWLEEYKVRQKAGLEARKIVASFSKRFFSEHVPCNGFSDIENLEGPEIFFEDELVCILNMEGRKALTWKYYAKKILYYLRQQKILNNLKAFLQQPDDYESYLEGAVYIDQYCNPLSDISLKDIQAQIDSIVELVCKTLRGINSRHPSLAFKAGESSMIMEIELQSQVLDAINYVLYDQLKFKGNRMDYYNALNLYMHQVLIRRTGIPISMSLLYLTIARQLGVPLEPVNFPSHFLLRWCQGAEGATLDIFDYIYIDAFGKGKQLTVKECEYLIGQHVTAALYGVVNVKKVLQRMVGNLLSLGKREGIDQSYQLLRDSLDLYLAMYPDQVQLLLLQARLYFHLGIWPEKVLDILQHIQTLDPGQHGAVGYLVQHTLEHIERKKEEVGVEVKLRSDEKHRDVCYSIGLIMKHKRYGYNCVIYGWDPTCMMGHEWIRNMNVHSLPHGHHQPFYNVLVEDGSCRYAAQENLEYNVEPQEISHPDVGRYFSEFTGTHYIPNAELEVRYPEDLEFVYETVQNIYSAKKENIE	1224462	1269541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1224717_1225661_1225798_1227793_1227889_1235867_1235990_1239171_1239319_1239615_1239753_1241367_1241505_1243647_1243828_1244604_1244738_1250282_1250474_1254659_1254818_1267107
915390	contig_10299_pilon	+	3201	21	Intergenic	novelGene_79742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_19	111.393850817718	288	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	1042	2301	497121	516149	TRUE	15	GGAAATGTCTCTCCCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQNTATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQQVGDMTNRKPQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTCNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVIDAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCRGSSRLSGSAEQR	445839	517888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_445909_446647_446990_461790_461876_463092_463167_463367_463505_484139_484234_488618_488710_489793_489871_493160_493198_497085_497184_498369_498490_499230_499398_499838_499975_500712_500863_502292_502387_502702_502780_503290_503426_511683_511810_511888_512041_516109_516437_517275
915391	contig_11855_pilon	-	1946	15	Intergenic	novelGene_66952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2148.41621779812	1	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	977	1576	1085092	1080724	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKGQKIRLLD	1102160	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079259_1079454_1080623_1080750_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085158_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1089856_1089920_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
915392	contig_6599_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_175976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGGAAGTCGGAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261328	260826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260800_261300
915393	contig_4659_pilon	-	2238	10	Intergenic	novelGene_118238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	221.128977502629	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	10	714	860030	837826	TRUE	50	GAGAAGCTTTATTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQGTQKL	860039	817438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_818087_819373_819944_836792_836944_837252_837363_837780_837843_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916
915394	contig_11292_pilon	-	2341	10	Intergenic	novelGene_109387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_4	28.2833982626549	16	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	487	1086	20569	16156	TRUE	10	TTAGTGCTATTTCTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPALARSLRFVTLLYRHGDRSPVRTYPKDPYQEEDWPQGFGQLTKEGMLQHWELGQALRQRYHGFLNTSYHRQEVYVRSTDFDRTLMSAEANLAGLFPPNGMQRFNPNISWQPIPVHTVPVAEDRLLKFPLGPCPRYEQLQNETRQTPEYQNESTQNAQFLDMVANETGLTDLTLETIWNVYDTLFCEESCWLRYGRT	21055	12794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_13717_15571_15748_15898_16006_16105_16189_17583_17674_17752_17852_17959_18113_19161_19249_19564_19661_20527
915395	contig_10252_pilon	-	3094	2	Intergenic	novelGene_162908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	198	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGCTTCAACAATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66271	62147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_62438_63467
915396	contig_34_pilon	+	3403	2	Intergenic	novelGene_40050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAGATACTTAGATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240852	247115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_244100_246959
915397	contig_5324_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_102076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCGTGCCCACGGAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442185	444003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_+_442200_444000
915398	contig_12871_pilon	-	3228	7	Intergenic	novelGene_140377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	46	471	53995	53570	TRUE	25	ATGCTACCGAGTCTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLLSHSLVGSKSKFRASAPVEGFLCRPWRKVLVISLPSFWEHLCTGASGPKDVLCSWCCFLGGMRFPCVSARFSLSYLKRDWLKTLSNLVNLISITPTNPSYYIIVIEFTTHKEITSDDTMVDSHTRLGITNQPN	54040	34156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_34357_35810_36148_37042_37126_42067_42114_43603_43732_49608_49644_51641
915399	contig_15047_pilon	+	1473	6	Intergenic	novelGene_52138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	35	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	29	652	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2165	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21232
915400	contig_233_pilon	-	2040	11	Intergenic	novelGene_14595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1408.99101842418	2	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	722	1540	93993	78640	FALSE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	126988	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98438_101600_101770_104152_104223_109914_109976_126898
915401	contig_15063_pilon	+	1827	7	Intergenic	novelGene_12285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	100	1572	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28064	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
915402	contig_9177_pilon	+	4137	29	Intergenic	novelGene_32568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.185576872239523	47	41	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	433	786	10465	11652	TRUE	20	AGCCCAGCGTTTGATATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARPSGLIWAGMLENSGLDAKALRLSTASSRGAVAARHWARFSSVKAPSSALMVLTRLAVLLATSLADCTNWRLAVGLAVRAEARRQLLHSAEVCLATMVAAESTWAWVQPGSPKL	1712	22761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2084_10403_10478_10571_10713_10958_11120_11613_11759_12844_12968_13080_13173_13274_13368_13554_13696_13890_14089_14296_14415_14809_15020_15162_15267_15424_15553_15705_15844_16051_16170_16268_16379_16549_16677_17437_17607_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20809_20907_21023_21210_21392_21611_21689_21867_21972_22740
915403	contig_11986_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_69107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTCAGCAGTTCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67743	70054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_67700_70100
915404	scaffold_12124_pilon	+	2274	10	Intergenic	novelGene_22253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	7	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	196	573	1490385	1508039	FALSE	25	CGCATTTTTCTTTAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473572	1509740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
915405	contig_20371_pilon	+	2766	1	Intergenic	novelGene_129180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGTTGTTCATAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40587	43353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20371_pilon_+_40600_43400
915406	contig_5280_pilon	+	2402	8	Intergenic	novelGene_52622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	603.976449061061	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	884	1453	47432	62372	FALSE	20	TCTCATGATTTCAGGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTELPRAPQKPTSATVPGAMILASGKSGSQTVKRECHHCGMYNPYSWKRILSFNCLRSTVKMQCLWLPKRKRVNAFQHVLWMPLGTRYVPKYSQPCSCSKVIFGQLQIIWPISQILLRAHCLKASF	38736	63321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38946_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56384_62043
915407	contig_4470_pilon	+	4773	1	Intergenic	novelGene_171775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	268	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTAATGTCTGAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241906	246679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_+_241900_246700
915408	contig_3789_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_79872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	282	849	101	949	519654	518806	NA	45	AAAATAACAGAGTCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKMSQPILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKRPHVAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDNAEVYRLIEVTGLSRSEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESIAKDQMALAATRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKVLEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGTGKKRPRCGGPQWCSLST	519754	517410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_517400_519800
915409	contig_8050_pilon	-	3986	5	Intergenic	novelGene_114816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGGGCCCCCGCTCCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312741	293928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_294215_294459_294545_300019_300132_305551_308935_312621
915410	contig_5832_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_134190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	705692	707396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_705700_707400
915411	contig_10973_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_150355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_3000
915412	contig_6795_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_27724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	6	341	277134	276799	NA	50	TAGGTATATACCGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMQKKYLTKSDTFDGKNTQKTRNGRELPQHDKGHLQKTHNQHHIQWLKTESFPPKIRNKTRMPAFVTTIQHCVGSCRHSNYTRKRNKKSLFLQMTWSYIETVLKNQQNKYQS	277139	274854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_274900_277100
915413	contig_14563_pilon	-	5636	2	Intergenic	novelGene_135030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	120	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2372	2674	65461	65159	TRUE	20	GTGCAGTGCGATTGATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENWAQGLEVSPYLSFLRLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCASAMQEYEEQLKENASEGKSVSFRDHSKPAICILGFLLLKGSFRIQLYVTLF	67832	61773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_62227_62649
915414	contig_3424_pilon	-	3395	12	Intergenic	novelGene_55581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_11	24.8046916383318	249	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	256	1386	1134171	1128729	FALSE	30	CTAGATTGAACGCCGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVSADAKGLDTVVGLLADVVLQPRLTDEEVERTRLAVQFELEDLNMRPDPEPLLTEMIHEAAYRGNTVGLHRFCPPENITKIDRQVLHAYLRNYYTPDRMVLAGVGVEHEHLVQSARKHLLGTRPAWGDQKAVDIDRSVAQYTGGIVKLERDMSSASLGPTPIPELTHVMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFTRLYLNVLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGAVDVVELERAKTQLMSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRCRKLPHELCALISNVTAEDIKRVASKMLRRKPAVAALGDLSDLPTYEHIQAALSSRDGRLPRAYRLFR	1138090	1126719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1128899_1129047_1129193_1131124_1131188_1131436_1131528_1131649_1131769_1131852_1131946_1132268_1132533_1133189_1133291_1134086_1134182_1135433_1135517_1135956_1136037_1138008
915415	contig_10159_pilon	+	4347	4	Intergenic	novelGene_30841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2339	2779	609318	609758	TRUE	70	CCACAACAACAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSQQTISKHLQKQDRMAPVGVQNKTPDDSLVEENALEPPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLLEFRKIMQEQNAKTYSQLEIIQRQQLEIQNINNKISETDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDTLGYKSV	606825	677229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_608185_608338_610015_659868_660207_676255
915416	contig_18610_pilon	+	2769	1	Intergenic	novelGene_168060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2333	2662	28403	28732	NA	45	TAAAATTGGTACAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLEESTKHSENSFHQHLLKLFQNTEKERILPNSFYEASITLIPKPGKDTAKKENSRPISLMNIDEKILNKILANRIQHHVKKKKYTPAKWDSCQVCKDGSTLENQSM	26070	28839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_26100_28800
915417	scaffold_880_pilon	-	3487	2	Intergenic	novelGene_121386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	692	1003	268671	268360	FALSE	35	TATCCGGCATTAGGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTNGPFLCERKERDSGYRVGDGCVSAEIEGRWGDGKGQLGDRAPPQLLSVPCELGNTLRVTLLLSLSVSQGDSETPLEITNSLSIESILTPNNPIGQSRTAP	280051	265875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_269132_279820
915418	contig_4103_pilon	-	2586	1	Intergenic	novelGene_51937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCCTAGTCTTGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94750	92164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_92200_94800
915419	contig_6027_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_74427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208922	211269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_208900_211300
915420	contig_12021_pilon	-	1744	1	Intergenic	novelGene_172179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAGACATACTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3769	2025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_2000_3800
915421	contig_6397_pilon	-	4575	1	Intergenic	novelGene_146260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	180	842	471903	471241	NA	40	CTTTGAATGAAAGAGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELKKKFRPRVAIPKDSTGKILNDAESIKRRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEVAYDQELMVPKEEVQATLKALAKNKASGIDEIPIEMFQQIDATLEALTCLCQEIWKTASWPTNWKRSIFMPIHKKGDPTECGNYQTMSLISHASKILLKSIQKRLQQYIKRELPEIQARFRRGRGTRDIIADVRWILAESREYRKDVYLCFIDYAKTFDCVDHNKLRMALQRMGIPEHLLVLMRNLYIGQEAVVRTEQRDTAWFKIRKGVHQDCILSPYLLVCMLSE	472082	467507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_467500_472100
915422	contig_5935_pilon	+	3119	2	Intergenic	novelGene_102767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTGTTGTTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392763	1413711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1392780_1410608
915423	contig_15732_pilon	-	5504	2	Intergenic	novelGene_88885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	460	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGGTGCACCTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211570	205703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_209210_209572
915424	contig_8712_pilon	+	1911	4	Intergenic	novelGene_58811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	577.82407934134	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	2	607	314974	322185	FALSE	30	CCATAGCTTTCAAGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHTRDPNSSHLTGVVALSEYLLAICHGLAPFPASVGPSGGGLELRSHRLPYFLRLCWPE	314972	323489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684_321745_322010
915425	contig_177_pilon	+	1684	3	Intergenic	novelGene_41830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	70	1146	417672	418748	TRUE	10	CTAGTTTGTGGTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415661	420148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419139_420000
915426	contig_18039_pilon	+	4572	1	Intergenic	novelGene_171246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	10	33	989	1021	129677	129709	NA	15	CAGTTATTTGAGGTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRHVKENILEFESQWGDDERNDKAVIITHNRTLNAFYSGSNLTKHQRIHTRKKLYKCNVCGKVFSLNEHLEAHLRIHIGEKPDRCNVCSKAFNFGSNLTRHQKIHTGEKPHKCNTCGKTFSRHSGLTAHQRIHTGERPYRCIECGNAFIRRSKLVEHRKAHAGEKLYTCNVCGISLTKGSSLTRHQRIHTGEKPYKCNVCGKVFSRNSGLITHERIHTGERPYKCIECGKAFIQRTHLVQHERIHTGEKPYQCNECGKAFTQRANLTEHQRIRLVQKSYKCNVCGKAFNSASLLTTHQRICTGKQPYKCNVCGINFSQNSNLTIHLRIHMAEKPYKCIK	128688	133260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_128700_133300
915427	contig_18804_pilon	-	5947	14	Intergenic	novelGene_163787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	23.0779486951577	652	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	3589	4146	11234	4088	FALSE	50	CCCTGAAAACAGCAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLLTQQIQAEDEQYSLVASLDNVRNLSTILKAIHFQDYATCFATKNGIKVTVEKAKCVQANAFIQAGIFQEFMVQEDSVTFRIHLTVLLDCLSIFGSSPMPGTLTALRMCYQGYGYPLMLFLEEGGVVTVCKINTQEPEETLDFAPNKNELRRLPARWRSRQKHHAVPPQQRSEKLSQTENQQS	26860	2286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_-_4210_7620_7750_9513_9623_11036_11296_11773_12257_14600_14713_17737_17781_20344_20419_20695_20747_20842_20917_21080_21129_21270_21374_24072_24203_24451
915428	contig_6823_pilon	-	891	1	Intergenic	novelGene_131217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGCAAGGACACAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244420	243529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_243500_244400
915429	contig_9440_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_59088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1686991	1685655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1685700_1687000
915430	contig_13760_pilon	-	2801	1	Intergenic	novelGene_61314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2345	2695	192204	191854	NA	75	AAAAAGGAAAAGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPNTKRARDQQPAREAQEVGPEPHLVSRGLPDPPGLEAVKEVVVQANSPLDDTPAVKPNPSAVEIGPTRKPEDPKVDMEEESAPRDVPSER	194548	191747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_191700_194500
915431	contig_10377_pilon	+	4032	8	Intergenic	novelGene_115387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	698.592637714847	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	199	864	219517	255047	TRUE	15	ATTTGAGTTTCCTTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAARIDFPRHLDFYVKDLIRKLLVVDRTRRLGNMKPPHRAQSDL	209085	259915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_240234_240355_245160_245257_251691_251750_255017_255169_256868
915432	contig_13409_pilon	+	5645	10	Intergenic	novelGene_128443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCAAGATTTCATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30283	50594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_34677_37831_37973_39052_39181_40021_40146_41442_41592_41832_41972_42918_43054_45499_45691_48687_48867_50528
915433	contig_2480_pilon	-	3233	3	Intergenic	novelGene_63515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	44.5	76	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1659	2105	127614	127168	FALSE	40	GGAATATTAGTCATCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLVAAVLDSAVLTAWQQLPRPQRVLPVVSVYSSPRVCTGPLSHQEPTQVWLPCFCAGVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQVIMLWGERF	137887	126039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_128962_130073_130253_137755
915434	contig_8174_pilon	-	3022	1	Intergenic	novelGene_160061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTCCCCATGTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301154	298132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_298100_301200
915435	contig_10377_pilon	-	3103	9	Intergenic	novelGene_115401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	205	549	259131	258787	TRUE	30	CCCTGGAGAAGGACATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEENHSVGFTQLNILNSFSLSYSVKTVYFTQPYASLSLLIAVDSNAPQPHVCRGELGSVGFFNVNNRIFELRPSEQRKSNPCGFVQRSQELGMGRGGAGGKINGARCRLRGR	259335	227108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_227185_227485_227750_240232_240353_245158_245257_251691_251748_252535_252616_255019_255167_256866_258105_258311
915436	contig_6862_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_63759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGCAGATAACCCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136936	138395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_136900_138400
915437	contig_8167_pilon	-	2160	2	Intergenic	novelGene_155662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGATGCTCCTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167701	165124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_165471_165887
915438	contig_15244_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_118074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCCTAGCAATCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	784408	786590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_784400_786600
915439	contig_4364_pilon	-	2763	9	Intergenic	novelGene_212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	15.5382592332603	210	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	47	853	1347888	1341325	FALSE	20	CAACCCATGGCTGTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHPAGTGPALCRIWAMAAEARVSRWYFGGLASCGAACCTHPLDLLKVHLQTQQEVKLRMTGMALQVVRSDGILALYNGLSASLCRQMTYSLTRFAIYETVRDRLSKGSQGPPPFYQKVLPRFHRWLCGDPCGHGERQVSACPPGSPPSSSEGLRKLFSGATMASSRGALVTVGQLSCYDQAKQLVLSTGYLADNIFTHFVASFIAGGCATFLCQPLDVLKTRLMNSKGEYQGVFHCAVETAKLGPLAFYKGLFPAGIRLVPHTVLTFVFLEQLRKHFGIKVPS	1347934	1339414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1341427_1341520_1341578_1342084_1342163_1342351_1342445_1342914_1343006_1344071_1344145_1344246_1344347_1344598_1344719_1347795
915440	contig_14796_pilon	-	2626	8	Intergenic	novelGene_159382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	36.9782064884445	108	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	152	1201	293356	247636	FALSE	10	CTCTTCTGCAGTTCTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAALSAPPPARPPRASRSRSRGQAATSGQGTAGLARSAARSSQGGRRRAEMLSLGGTLLCLLLAAAVPTAPAPAPTTTSAPGESGRVLSYPQEKATLNEMLREVGELMEDTQHKLRSAVEEMEAEEAAAKTSSEVNLENFPPSYHNETNIDTRIGNNTIHVHREIHKVTNNQTGQTFFSETVITSMGDEAGKRNHECIIDEDCGPGRYCQFASFEYTCQPCRDQQTLCARDSECCGDQLCAWGHCSETATRGGNGTICDNQRDCQPGLCCAFQRGLLFPVCTPLPVEGELCHDPTSRLLDLITWELEPDGALDRCPCASGLLCQPHSHSLVYVCKPAFVGSHDDDGESLLPREALDEYEDGGFIEEVRKELENLERNLSEEMVPRGPDVASELLDGEEI	294079	246210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_-_247856_248901_249059_250150_250296_250944_251038_281360_281445_285512_285651_293143_293377_293948
915441	contig_7272_pilon	+	5061	2	Intergenic	novelGene_25334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTCATAATAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579419	584619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_580871_581009
915442	contig_5189_pilon	-	1976	4	Intergenic	novelGene_34875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2180	junction_1	495.663864596429	65	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGGCGGTAGATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228936	204931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_205790_218496_218671_220258_220403_228136
915443	contig_9049_pilon	+	2070	1	Intergenic	novelGene_83160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110272	112342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_110300_112300
915444	contig_9121_pilon	-	5113	3	Intergenic	novelGene_134430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	134	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTTACTTAAAAAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59770	54067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_55011_55111_57234_57722
915445	contig_12622_pilon	+	3860	22	Intergenic	novelGene_5795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_14	175.63720079714	136	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	1718	3556	446467	475513	FALSE	90	AAAAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	349662	475817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
915446	contig_11937_pilon	+	1848	10	Intergenic	novelGene_171580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTTTCTCTTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37528	77699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_+_38155_38354_38495_39701_39870_57508_57678_66111_66223_67450_67622_68962_69079_69198_69322_73002_73141_77613
915447	contig_5812_pilon	-	2668	8	Intergenic	novelGene_167491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	193	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGCAATATCTAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133909	90128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5812_pilon_-_90186_94764_94881_101307_101399_109114_109206_123673_123837_129528_129654_131738_133317_133462
915450	contig_14219_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_54303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639915	637909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_637900_639900
915451	contig_10095_pilon	+	2420	22	Intergenic	novelGene_57244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_2	60.6869219381826	87	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	735	2205	216	2420	279163	370957	FALSE	25	GTAAGTGTTCTGCTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDESEMENVKKATATTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDIGDDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADPKEDGEDRDDEMENKQDGRILRGSQRARRKRRGDPAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEEEKAVAVPTKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSMYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEDEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMRLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRIKVHFDGWSSSYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHSLQPPLGPLELMEVSEQSGCLTPGCKGIGHFKRSRHLGPQNSATCPYSDVNLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDTNESSSSPETRDQRGGDVPAREDTEEKTESEVKTSQEARGTREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKVFKDE	256912	370957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_257038_258550_258625_279146_279265_284451_284564_284930_285006_286434_286595_287732_287866_289681_289767_291772_291865_294282_294388_307099_307236_308683_308776_311869_312022_322915_322993_327585_327672_330135_330247_335202_335318_336788_336892_342403_342554_356356_356443_370494_370665_370894
915452	contig_8544_pilon	+	886	6	Intergenic	novelGene_55905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_3	400.775548156322	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTATTGGTAATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18367	90625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_27777_27946_83417_83520_83788_83836_90458
915453	contig_1406_pilon	-	1786	2	Intergenic	novelGene_25517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCTAAATATTGACTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689759	1651672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1653380_1689680
915454	contig_11855_pilon	-	2676	9	Intergenic	novelGene_67019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	418	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	739	1137	1609033	1608635	TRUE	20	TCGTTGGAGTAGGTGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLPKTRVSAARPPRLTPAPPWHSQAWPGNLDPREATEQFQEEVMAIWHLGEGRHTDKVGAAAPGEGELGTRCPRLSLLPTLTLLSQRSEKSVQGQNQPPGSGVDPTLPGRGTETAGCVEATPPSRRVRMQ	1609771	1597316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1597425_1599449_1599571_1601562_1601669_1602724_1602860_1604237_1604391_1604501_1604556_1607226_1607459_1607798_1607894_1608099
915455	contig_854_pilon	+	4894	28	Intergenic	novelGene_36547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3526.23194478115	29	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	1973	3883	1705343	1714980	FALSE	30	CCCCCTTGTCATAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1649639	1715991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649712_1649759_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672852_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685220_1702597_1702691_1704481_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
915456	contig_3602_pilon	-	1218	2	Intergenic	novelGene_60520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGGGGAGCGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171132	169688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_170717_170942
915457	contig_3700_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_138065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133649	136026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_133600_136000
915458	contig_13740_pilon	-	3490	10	Intergenic	novelGene_34635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_9	4649.11018965517	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	169	1110	165243	157474	FALSE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_162127_162164_165237
915459	contig_6102_pilon	-	1592	7	Intergenic	novelGene_32170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.201183262411	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	271	720	867239	841181	TRUE	10	TTTTGGTTGTCCTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDVSL	867509	839082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839955_841180_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
915460	contig_10976_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_155592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCAGCAGCCTCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131121	133357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_131100_133400
915461	contig_14732_pilon	+	2922	6	Intergenic	novelGene_169702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.9426117765301	90	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	137	1861	26423	77307	FALSE	10	AGTGTTTTTGTGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSSEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSHIVSVGYCVTKPEVIFKIEQGEEPWILEEGFSSLRHPEDWKVDDLIERSQENQDEHFWQFVVTNNKTLSKQSGNRTVKTFNLGIDPVPSRNNPCRICDSCEMSLKNISDLIISKRNSSGKKLDEFNVCEKLLIDTRHEKIPTGEKSYNQKRNVLNHSKDLTQTIFDQPFEYNENERDFHEEAVFTNKAHIGETLCKYNECERAFIQSVKFNMSQRTHLEMEPYECSICGKPFYLDLRLGHQRALTEVIPYTYNEYGEILCDNSTFIIHQGAYRRKIHREYEVSDKTWEKPILFKHQIVQMEEKSYEYNENGNNFSKKSHLTQLRRAHSGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECIECGKSFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNVCGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECKECGKTFSQRSVLTKHQRIHTRIKAISAS	24579	78368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_+_24654_26030_26075_26404_26438_63421_63549_63841_63938_75820
915462	contig_9189_pilon	+	2736	2	Intergenic	novelGene_165138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCGAGGATATTAGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569649	576081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_569996_573691
915463	contig_8885_pilon	-	4840	1	Intergenic	novelGene_115571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	3943	4536	53735	53142	NA	25	AAGTCCCAGCAGGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGREPTSRPGFLASHLLLALACSWLSCPHLWHGEGIVTTELQERDGSADMYVSLTGQPSGTSAHPNMWQLLQAHASPIELSKARSMGLAQQQCPLQADMGLPFHLSGSTSELTASKPGPGLGRTGLGNFAHTRPGPLFSSEVFASFMPEVSMSQHTCLLCLCSQQSRYASTALALPAIQPPTKYSRAPVLEAHILQG	57677	52837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_52800_57700
915464	contig_15114_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_121223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCTACTCATCAAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661452	1664523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1661500_1664500
915465	contig_16322_pilon	+	2241	3	Intergenic	novelGene_87548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGATACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90452	94101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_91557_91946_92049_93066
915466	contig_10377_pilon	+	3250	5	Intergenic	novelGene_115336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.0634601017102	123	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	419	2398	16672	22862	FALSE	30	TGATACACGTTGTAACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVVVEDVAVVFSQEEWALLNLTQRKLYRDVMIQTFRNLASVVSQNLKDGEKLSSEVIMVQYMKNNTWSSALGEISQSHGNKDHHKNQERHLRSHTVENICETNEGNQCEKTFSQVPNLTVLKGNHTEVNPFECSECGKVFTDPSSHNCHTRYHNGCNTCQFIACGEACSCTTPMRTLNGTKPHNCGVCGNDLVCISTIKNPVTILTGEKHYNCNEYGKDFYSFSSFWTHVRGHKSECKECCKTYSHSLSLILHNRDKPYEYWECGKAFSEASSLTQHVTTHRGERPYKCKRCGKTFSQSSHLSNHIKTHNKHRPYECKECGKAVSQASTLTRHITTHTGERPYECKECGKAFSWPSRLTAHMRTHSGEKPYECKECGRAFRWPSQLATHMRTHSEERPYECKECGKAFRQSSHLINHVRTHNGQRPYECKECGKAFSQASTLTTHVTTHSGERPYQCKECGKAFRYFSNFASHIRIHSGERPYECKECGKVFRQASNLITHRRIHSGERPYECTECGKAFNCSSHLTNHLRTHSGDKPYECTECGKAFTQASSLTTHIRTHNGERPYECKQCGKAFSQASSLTKHIRTHSGGRPYECKECGKASSCCSELTSLRGTRSGERPYECKERVKAFRHSHLTSHVRSHSGETAVSKEIFHP	6645	23714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_6798_16405_16675_19231_19359_20190_20342_21163
915467	contig_11126_pilon	+	2976	2	Intergenic	novelGene_138147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	80	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAATAAAACCAGAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	797359	817837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_797380_814881
915468	contig_15135_pilon	-	2606	2	Intergenic	novelGene_119865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	761	junction_1	0	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	447	764	51924	49787	FALSE	60	AAGAAAAAAAAATCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQALSFPKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGKRTK	52370	47944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_49862_51681
915469	contig_6946_pilon	-	4463	1	Intergenic	novelGene_59749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACTCACATGATTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44408	39945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_39900_44400
915470	contig_12923_pilon	-	2570	17	Intergenic	novelGene_30194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_16	56.861639914357	137	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	55	2295	577837	511076	FALSE	30	CAATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRFDGTQQLQQHANILLIISGGGRPGLGTMGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRGARGVGSHSYVQQNETAQSHAILTIVVTTPDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVVSGTIGLKKKIYLSKPVFLTFKHTQAVGTETKHLCVYWEASKEGGSWSTEGCSHMGSNNSHTTCQCFHLSSFAVLVGLTPKADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585698	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_531948_532117_533560_533746_535163_535254_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577845_585651
915471	contig_6691_pilon	-	3892	1	Intergenic	novelGene_60190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGGCCTCTGCCATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528126	524234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_-_524200_528100
915472	contig_8386_pilon	-	4462	13	Intergenic	novelGene_82208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	230.745214829402	3	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	973	1596	35180	20556	TRUE	40	AAGTCATTCACACTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDHFHVFVGDLSPEITTEDIKAAFAPFGRISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQFQSGVSWIAVVT	38442	16175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19900_20485_20595_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_34662_35173_35933_36104_36160_36681_36781_38376
915473	contig_2438_pilon	+	845	2	Intergenic	novelGene_112073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6285	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312362	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312409_312729
915475	contig_13680_pilon	+	3448	10	Intergenic	novelGene_149608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	30.1899337323789	131	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	221	1789	430059	515145	FALSE	35	AGAACTTACCATTGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFREAYSNTCSAVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSAECLRMLIHADSSENYIKTKTFEGFCALHLAASQGHWKIIQVLLEAGADPNATTLEETTPLFLAVENGQIDVLKLLIQHGANVNGSHSMCGWNSLHQASFQENAEVIKLLLQKGANPECQDDFGITPLFVAAQYGKLESLTELISSGANVNCQALDKATPLFIAAQEGHTKCVELLLSSGADPDLYCNEDNWQLPIHAAAQMGHAKVLELLIPFTNRACDTGPDKVSPVYSAVFGGHEDCLEILLQNGYSPDAQKCLVFGFNSPMCMAFQKDCEFLGIVNMLLKYGAQLNELHLAYCLKYEKLSVFRYFLKKGCPLASWSHISEFISHAIKAQARYKEWLPHLLLAGFDPLNLLCSSWIDSVSDEILVFTLEFTNWKRLPPTVEKTLSVHASSSSWLLQQHLASIPSLTHLCRLEIRSSLKPEHLRSDRFICQLPLPRSLHDYLLYAEVLRMHEVPELPVTQDGEAP	428389	516804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_428597_430045_430255_435344_435504_465576_465690_466281_466418_470331_470510_472905_473104_481305_481564_487417_487552_514948
915476	contig_854_pilon	+	2574	9	Intergenic	novelGene_36586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1815.58698755389	17	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	81	1202	1679334	1715035	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIISPLLLLRRWTDDSTSPS	1679253	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692776_1714981
915477	contig_20944_pilon	+	3798	2	Intergenic	novelGene_167537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	2297	2857	33015	33575	FALSE	10	TTGACTCTCTCCTTTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMFTLAHQRGSDRQGAKWAPGGGQGSRLGGTQVLSLMGEGQGGQPVGRTDAFPSGGGVGWSFGWHADALSSGGWGEAGSWEGEERKKEGFVCRSVLATHPVRYCSWKVTLSLSLGFLPAVCTLGTLKLLSSFLYFPSLAPVHVLLTLFHSKYVDTVSLSPIGSSVMLSSRVTTGCLKMAPLCQVV	30396	34516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20944_pilon_+_30967_31288
915478	contig_15384_pilon	+	1828	4	Intergenic	novelGene_85114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	137	junction_1	69.3990073576144	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	239	1090	75617	79189	FALSE	20	CAGTGTCCCAGCAGGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVSVCFEGDSDGYINLVAYPYVESETVEQDDTPEREQPRRKHSRRSLHRSGSGSDHKEEKASLPLETSESSQEAKSPKMELHSHSDVPFQMLDGNSGLSSEKISHNPWSLRCHKQQLSRMRSESKDRKLYKFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMRHKHLDTGLPEVASPCGSSTSPEAGPSSPPKVDVRMIDFAHSTFKGFRDDPTVHDGPDRGYVFGLENLINIMEQMRDENQ	72008	79927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_72222_75591_75774_77964_78141_78670
915479	contig_7870_pilon	-	3994	1	Intergenic	novelGene_109014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1767	2204	524171	523734	NA	45	CAAAAGTTGAACCTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETPKLGLERRVAKANDEIKELYRRFQRAAQEDKVECYNDMCKDVELENQKGRTCLAFLKLKELKKKFKPRVAILKNSTGKILTNAGSIKRRWKDYTESLYQKQLVDVKPFQELTYDQELMVLNEEVEAALKALAKNKAPGND	525937	521943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_521900_525900
915480	contig_5346_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_161862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407147	409267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_+_407100_409300
915481	contig_4832_pilon	-	4360	15	Intergenic	novelGene_163426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.1008329224934	159	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	63	1946	523677	515860	TRUE	45	CTACAAAAACAGTGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPGPELGLGLGLRRLRCLKMAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKELYRRRFPRKTLGPSDLSLISLPPGTPPVGSPGPLAPIPPALLAPGTMLVPKREVDMHPSLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSRELLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCTHLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILNSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDGLQYSPVQEGNPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCPVTSAASPALPGSKGVLTSSHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHDYPPAFPLGADMQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPLGSSHRSSPPAPPPGRVSSIVAPGGTLREGHGGPQPSGPSLTGCRSDIISLD	523739	513161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_513418_513701_516124_516588_516627_516812_516947_517131_517301_517380_517515_518264_518426_518546_518621_519179_519286_519510_519646_520274_520366_520609_520661_520887_520973_521131_521550_523653
915482	contig_14536_pilon	-	2037	12	Intergenic	novelGene_69284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_7	185.19000740584	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	71	1135	137680	56449	TRUE	35	AGATAGGCAGGATATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDMVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARSIGSNPPFPIKPLSESKNRLLDSESQWTETGSEEGIVRSGTNNHVTVTIEN	137750	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_56408_56487_57556_57673_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_83271_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
915483	SIRV6	+	239	1	NIC	SIRV6A	novel	1435	9	NA	NA	1	-15	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGCAATCGGTAGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2286	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV6_+_2300_2500
915484	contig_8673_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_129940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441245	444038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_441200_444000
915485	contig_6710_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_91268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2	322	653882	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653883	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
915486	contig_15365_pilon	-	3137	10	Intergenic	novelGene_111125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	69	junction_1	76.8949901240181	149	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	11	1948	95445	21917	FALSE	20	TGCATTTAGATTGTGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REDMKYKDASNKHSHLHREDKHITVEDLWKRWKTSEVHNWTLEDTLQWLIEFVELPQYEKNFRDNNVKGTTLPRIAVHEPSFMISQLKISDRSHRQKLQLKALDVVLFGPLTRPPHNWMKDFILTVSIVIGVGGCWFAYTQNKTSKEHVAKMMKDLESLQTAEQSLMDLQERLEKAQEENRNVAVEKQNLERKMMDEINYAKEEACRLRELREGAECELSRRQYAEQELEQVRMALKKAEKEFELRSSWSVPDALQKWLQLTHEVEVQYYNIKRQNAEMQLAIAKDEAEKIKKKRSTVFGTLHVAHSSSLDEVDHKILEAKKALSELTTCLRERLFRWQQIEKICGFQIAHNSGLPSLTSSLYSDHSWVVMPRVSIPPYPIAGGVDDLDEDTPPIVSQFSGTMAKSAGSLARSSSLCRSRRSIVPSSPQSQRAQLPPHAPPHPRHPHHPQHTQHSLPSPDPDILSVSSCPALYRNEEEEEAIYFSAEKQWEVPDTASECDSLNSSIGRKQSPPSSLEIYQTLSPRKTSRDELSLEGSSRGDSPITVELSRGSPDCVGLTETKSMIFSPASKVYNGILEKSCSMNQLSSGIPVPKPRHTSCSSAGNDSKPVQETPSVARISSIPHDLCHSGEKSKKPSKIKSLFKKKSK	95455	20727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_22395_27743_28012_38227_38467_38706_38808_39524_39693_44611_44790_45255_45434_48562_48679_52578_52691_95345
915487	contig_4769_pilon	+	2191	1	Intergenic	novelGene_118017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAGATAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1112439	1114630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_1112400_1114600
915488	contig_15744_pilon	-	1692	2	Intergenic	novelGene_83563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	187	384	11194	10997	TRUE	55	ATATATCAAGCAAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSNSIPWFLSDLRVAWHLSSPICASLFVCLICSCYISKVIGLRNTLHGYVLINITKKAIFQMRLHPKVLGLGFTALIFKVHNSILNRGQAANTHPEVMRLHSLFPKWCQKKSFKIEDLNTIKSRIT	11380	5149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_5176_9714
915489	contig_19941_pilon	-	2821	2	Intergenic	novelGene_139755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTTACAAAATACCTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20119	16814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_19473_19956
915490	contig_7919_pilon	-	1165	6	Intergenic	novelGene_28035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	26.8849400222504	27	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	234	347	186678	186565	TRUE	35	TAGAATCCCATTTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDRPPTVVSSKGNERPQDPRGCHKRKHQKSTEDFTSCPTQSKHQEKKKQDKRLKSPAEVTKQSRCVPARPIARRTKMTSRPTSGQEPTSDSVAYPLAFLPSSSLFLWTKQCWK	348733	172659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_173247_173956_174159_186535_186686_307718_307808_312840_312939_348694
915491	contig_14333_pilon	-	1479	1	Intergenic	novelGene_49127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	565	867	411880	411578	NA	25	GGCATACAAGGCTATGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRTECLERFLFGFHVSQTTISSPKLSPKLLTSRVSCAFDKYLFSTTNVSGTVYPIFPWMSPKCYKLRTTHANLTSPPNSSSSPALTAVTGAISHAEAQA	412444	410965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_411000_412400
915492	contig_10414_pilon	-	6771	12	Intergenic	novelGene_146936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	294	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	5358	5873	98551	95799	TRUE	20	CGGGAGGGCAGCTTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFRAARSRCTNFLAFKYAIPSAISAAIWIISCRVGGRAAGIVLNLWPQRTEVALQVPVSHELHHHQRRLTFGHHPQEADHVVAGETLHDRGLVEELDPLAQAGRLVNRLHCHTGLRLALDDVPGIALVHHAEGALAQLSQEGDLLAGHLPFVRHVHRAGKHVAGAKVLRV	110066	67672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_67854_78859_79135_82076_82217_90890_91053_94314_94416_95759_95829_96538_96784_98221_98329_98417_98582_100274_100405_101273_101411_105006
915493	contig_19812_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_101001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGGGCTCTCACAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43532	44442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_43500_44400
915494	contig_9345_pilon	-	3071	21	Intergenic	novelGene_24538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_4	168.931487591864	6	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	1525	2766	726614	724143	TRUE	10	CTGGAGTCTGTGTTATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTWLGYTPYKVTYASDYFDQLYTWAVELIRRGQAYVCHQRGEELKGHNPLPSPWRDRPVEESLLLFEAMRKGKFAEGEATLRMKLEMEDGKMDPVAYRVKYIPHHRTGDTWCIYPTYDYTHCLCDSIEHITHSLCTKEFQARRSSYFWLCNALDVYCPVQWEYGRLNLHYAVVSKRKILQLVAAGAVRDWDDPRLFTLTALRRRGFPPEAINNFCARVGVTVAQTTMEPHLLEACVRDVLSDTAPRAMAVLEPLRVIITNFPAAKSLDIQVPNFPADESKGFHQVPFAPVVFIEQSDFKEEPEPGYKRLAWGQPVGLRHTGYVIELQQVIKGPSGCVESLEVTCRRADAGEKPKAFIHWVSQPLTCEIRLYDRLFQHKNPEDPAEVPGGFLSDLNPVGSWGVCEVRVVGLSA	730167	723450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_723603_723989_724261_724352_724481_724617_724711_724888_724994_725133_725278_725368_725457_725543_725682_725809_725903_725997_726129_726226_726336_726417_726497_726598_727218_727393_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729770
915495	contig_11816_pilon	+	4278	2	Intergenic	novelGene_98472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1572	1949	447507	447884	TRUE	35	AAAAATTGGGGGAAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKGRKNSDCESLTEAIGFLVFFFSFLVQVLVDLFMRTQLYQQLQYFKVIFQHQDLCVGSCVKALNAQIFTGICTAYQAYRLFKDLQTQGYFILGGLRYWWLRNSFWESEDYPTSPYLFYFLT	445935	450256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_450071_450113
915496	contig_665_pilon	+	5379	5	Intergenic	novelGene_158182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	123	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	299	598	97357	97656	TRUE	35	GCCTTGAACTCAAACATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCAGNDKMKMNDIAFIVKKNISRSVLKSKTVSDRIIYICLQGRPFNTTIIQIYTLTTNAKGEEIEDFCQLLQSEIDQTCNQSRCIDSYHWLGCRNWE	45433	241594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_45490_97114_99819_159040_159058_238878_239787_239900
915497	scaffold_9100_pilon	+	835	4	Intergenic	novelGene_83266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	728.031745339599	23	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	113	406	647136	654618	FALSE	45	GGAAACCCATAATATAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDILRLPIRRMCVLCVV	644842	655047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_654568
915498	contig_18081_pilon	-	1521	4	Intergenic	novelGene_23782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	726	1157	112611	108496	TRUE	10	GGGGCGTACACCGCTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYRNNWPLPPKKTTFEASFNRYKEKLKTKRLWSPRELTHGPRVVQTAVCLPSRSPNEVVSTITQILQERLCTRAQASRRVTTLCNVCPQSLSVQWFREGLCPGGHLWFSQLGLLVFSMEHDGEVQQKHQTCQKPKHDCSGLS	113336	90742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_90852_104503_104680_108416_108517_112200
915499	contig_19960_pilon	+	2739	1	Intergenic	novelGene_164184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGAAGTTCCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5644	8383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_5600_8400
915500	contig_5331_pilon	+	5002	3	Intergenic	novelGene_112820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1053	junction_2	129.5	74	133	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1925	2518	727412	730788	FALSE	10	GTGGGTGTTTGGGATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCFIFPFRPQDGSKPAETSQPQSSTGGYNQPSMGYGQSNYSYPQVPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSSQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQSSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMG	725487	733272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_727609_729398_729611_730603
915501	contig_8204_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_176988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	438	1558	1995	18967	19404	NA	70	AACTAAAAAAGAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPE	17409	19405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_17400_19400
915502	contig_5918_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_99615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACACTGTTAGCAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139269	2140694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_2139300_2140700
915503	contig_18976_pilon	+	6273	2	Intergenic	novelGene_174893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	444	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	4917	5294	13373	13750	FALSE	65	AAACCTACAAAGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISNHLQKQGRMVPVGIQNKTPDEFPLEEKVLELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMENTGKKREEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKLQLEIQKINNKISEIVS	7870	14729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_+_12084_12669
915504	contig_13786_pilon	+	2076	1	Intergenic	novelGene_174578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCATAAGTAATTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137859	139935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_137900_139900
915505	contig_3077_pilon	+	1626	4	Intergenic	novelGene_26822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	702.489066739753	8	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	422	901	479489	481662	FALSE	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	476514	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_476905_479457_479646_481023_481218_481533
915506	contig_5539_pilon	-	1817	2	Intergenic	novelGene_104771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	51	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	718	1017	242245	241946	FALSE	70	AAAAAAAAAACAGTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIHYATIKNNDESTKHLTTWMNLEGITLSEISRSQKDEYCMRPLLEKPKKRLMHKKQQSLMVSREGKGGERKSELDRRQVVTLVKEKTTQYIGEVSTT	243802	241145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_242594_243433
915507	contig_14405_pilon	-	2666	15	Intergenic	novelGene_85662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	177.340212643405	120	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	286	2100	995902	726292	FALSE	50	AAAAAGAATAGCTTTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKNEYQGGAFVEIFSAQGKNPAAKWKIFGSPSVIWKEFDKEVKSFVFVLEGSSQTNKIQLPKENKQILGLIQRFLVLQIYVPLGQDFSTELLITDLGNIKRRLYLSTVHKELSSTPLHAKIPLFMIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDDEPTDIIPRSCQLTTDVPQVTQLLNMTKLRQTEIQFGGHPLRSAESDQFIHRGGSVRNNKSQDVCHIAFGSKVLGPPPLSGRRNNMRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPR	996187	725725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_726296_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827971_844997_845136_866566_866724_885904_886020_979091_979165_989814_989909_993288_993379_995881
915508	contig_16831_pilon	-	4727	1	Intergenic	novelGene_134790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAATAAAATACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379165	374438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16831_pilon_-_374400_379200
915509	contig_12140_pilon	+	2718	2	Intergenic	novelGene_86518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATAGACTCTCAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17389	28005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_+_17857_25754
915510	contig_14208_pilon	+	3007	1	Intergenic	novelGene_129096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1941	2273	203512	203844	NA	65	GGGAAAAAAAAATACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSKAKIYKLIGAPKREKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQISYKTDPKRKTPRLIIITVTKTKGKERILRAAQEKQEVTYTGETIRLSSDSLAKTMKTMK	201571	204578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_201600_204600
915511	contig_16999_pilon	-	3104	8	Intergenic	novelGene_84969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGTCTCCGGCTCGCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113853	50655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_50803_53402_53555_55615_55690_56116_56155_73925_74017_79793_79984_81566_81687_111561
915512	contig_15063_pilon	+	1855	7	Intergenic	novelGene_12281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	131	1603	28164	39515	FALSE	15	TTATACTGCGTTCTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28033	39767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
915513	contig_13097_pilon	+	3224	16	Intergenic	novelGene_107706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_9	547.4906960143	5	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	195	1802	184733	264394	FALSE	65	AAATATAAAAATTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184538	265816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
915514	contig_15135_pilon	+	1645	1	Intergenic	novelGene_119862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACTCTGACACACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43541	45186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_43500_45200
915515	contig_10183_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_169499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTTTGAATTTTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52514	9217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_-_11824_52373
915516	contig_12677_pilon	-	731	2	Intergenic	novelGene_110780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2933	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2593_2633
915517	contig_695_pilon	-	2886	11	Intergenic	novelGene_177163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGAAACACAGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69705	17566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_-_17610_19782_19852_25388_25433_28498_29156_42860_43142_44103_44215_45898_46055_53344_53492_58808_58950_67537_67591_68521
915518	contig_16951_pilon	-	6611	2	Intergenic	novelGene_98655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	5767	6141	93365	92991	FALSE	50	TTATGGAACAGAATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKEEVQAAPNALAKNKAPGINRIPTEMFQQMDAMLDMLTHLCQEIRKTANWPVDWKRSIFVRILKKGDPIECKNYQTISYTSTILLQIIQKGLQQYIDKELPEIQARFRRGREMRDIIADVR	101155	92520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_97148_99171
915519	contig_9471_pilon	-	3335	7	Intergenic	novelGene_21715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_5	58.1052684549536	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	1002	1811	144817	126302	FALSE	35	TAAAAAAGTCTATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVEQLGIQREPVKTSIQESGTFLPQHIPEERYRMQSKPLGICLIIDCIGNDKDLLQDTFTSLGFEVQYFRYLSVDGIIQILHQVACMPQHQNYDSFVCVLVSRGGSQSVFGVDQTRSGCPLDQIRRMFMGDLCPSLLGKPKLFFIQIYVVSEDQQEVSSLLEVDGAGMNIVESKVRQPGPCMVHREADFLWSLCRADVALLEQSPCSPSVYLQCLSQKLQQERKRPLLDLHIELHSKVYDWNSRVSAKEKYSVWLQHTLRKKLILSCK	149644	124777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_126441_128295_128807_140993_141076_141797_141848_144789_144848_147757_147847_148762
915520	contig_6616_pilon	-	1057	1	Intergenic	novelGene_141755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCATCTAGTTCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282200	281143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_281100_282200
915521	contig_7357_pilon	+	3815	1	Intergenic	novelGene_36871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGCGCGCGCGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236935	240750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_236900_240800
915522	contig_3948_pilon	-	2809	1	Intergenic	novelGene_53170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAAAGACAACATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277435	274626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_274600_277400
915523	contig_11823_pilon	+	1017	2	Intergenic	novelGene_171033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90165	91772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_90609_91198
915524	contig_10732_pilon	+	3200	1	Intergenic	novelGene_114676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGGGACAGGCTCCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57886	61086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_57900_61100
915525	contig_19850_pilon	-	1960	13	Intergenic	novelGene_170849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_10	83.0913152300929	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	739	1959	32225	3450	FALSE	25	TAGGTTCTATACATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKENQMMSQSAYKSLIQHLEEDKILALTSHFGHLRWEDMVEEQAHETIFLLRQLWPQGSDIRSVLCVTLCSLSLGRYHCFLENKKKRASDQETSVRQVDTDCSALQEVEDLCRLHCLSIAFLLRLPLSQRAQTRVITSHWIQNIQTFLKMKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTSH	39565	3448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_29232_29398_30360_30478_32120_32463_37650_37836_38256_38447_39010_39081_39509
915526	contig_6102_pilon	+	3113	20	Intergenic	novelGene_32354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_4	72.4490459973627	295	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	845	2538	86	2623	1699217	1714324	TRUE	35	TATACAAAGCTGAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQVRKLKTILFLTQQQPQCHLLSVSK	1699131	1714918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714599_1714702
915527	contig_9406_pilon	-	4682	2	Intergenic	novelGene_136166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1465	junction_1	0	69	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	7	837	80811	78918	FALSE	30	CCCAAGCAGAGAGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALQRKLTGMERDLVAIEAKLSDLQKEAEKLESEHPDQAQAILSRLAEISDVWEEMKTTLKNREASLGEASKLQQFLRDLDDFQSWLSRTQTAIASEDMPNTLTEAEKLLTQHENIKNEIANYEEDYQRMRDMGEMVTQGQTDAQYMFLRQRLQALDTGWNELHKMWENRQNLLSQSHAYQLFLRDTKQAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIKKQEDFMTTMDANEEKINAVVEAGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRCGFLSFFYLLF	80817	75072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_79158_80220
915528	contig_5341_pilon	-	1007	2	Intergenic	novelGene_168021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAATCTCAGTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340861	337809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338614_340658
915529	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
915530	contig_6914_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_151725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTATTGCTTATGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111278	109016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_109000_111300
915531	contig_7019_pilon	-	1278	5	Intergenic	novelGene_149452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.6424902109607	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	181	798	507011	506394	TRUE	15	GCTTTCCATTTTTAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDQPDPETLNENSELLFSFGVIADIQYADLEDGYNFQGNRRRYYRHSLHHLQDAIEDWKKESNIPCCVLQLGDIIDGYNAQYQASEKSLELVMNTFEMLKVPVHHTWGNHEFYNFSRDYLTNSKLNTKFLEDQIVHHPETIPSENYYAYHFVPFPKFRFILLDSYDLSVLGMDQSSPKYQQCMKILKEHNPNAELNSPQGELFL	519417	501178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_501475_505165_505279_506322_507037_507474_507577_519364
915534	contig_17993_pilon	-	3028	1	Intergenic	novelGene_61936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2394	2696	84498	84196	NA	10	GGCCTGCCCCTCACTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKRDKIEIVKDFILLGFTINTHGSSSQVIKECTALGKSATKDLFEVLKSKDVTLNTKVPLTQAMVFSITSYACKSWTMNKEDQKRTDELTPLNYSVGKE	86891	83863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_83900_86900
915535	contig_12139_pilon	-	2616	3	Intergenic	novelGene_146455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAGAAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69666	64952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_66994_67172_67669_69587
915536	contig_2323_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_151855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141615	142760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_141600_142800
915537	contig_6710_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_98344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTCAGTATGTATGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657825	656547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_656500_657800
915538	contig_4659_pilon	+	4511	1	Intergenic	novelGene_118257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	308	670	884590	884952	NA	70	ATCTTAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERRCLVWDAAKVQGRARRERKGQLRLYKRLLGLRPGRTLEHEDHCAGLEAENFPGLLHCSENQRGNLAPANQVFSKGEAALPYPPPPLSGSAKRQHLAEFSPAARAARTVSYIISPRT	884282	888793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_884300_888800
915539	contig_8044_pilon	-	1206	8	Intergenic	novelGene_132392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGCTTTAACTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555607	548544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_549004_549374_549444_550249_550339_551354_551439_552523_552671_553421_553571_554108_554196_555485
915540	contig_10766_pilon	-	2334	6	Intergenic	novelGene_151189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGGTGCTCGCGAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140896	113932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_114377_114740_114860_135916_136029_136123_136253_138017_138086_139434
915541	contig_4103_pilon	-	2052	2	Intergenic	novelGene_51952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTGTGATAAAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	110131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_112147_114901
915542	contig_299_pilon	+	1399	2	Intergenic	novelGene_129485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAAAAAGAAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1398241	1584464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1399191_1584014
915543	contig_7056_pilon	-	3365	4	Intergenic	novelGene_43653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2598	junction_1	589.976270709255	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	926	1255	726042	725633	TRUE	80	TAAGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRGKVRIEFIS	726967	722483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_725734_725813
915544	contig_1725_pilon	+	2925	20	Intergenic	novelGene_24287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	80	junction_12	536.685854454159	19	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	266	1543	207418	248320	TRUE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKLLHMGLSIP	201487	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248287_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
915545	contig_10082_pilon	-	2555	1	Intergenic	novelGene_63837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCCCTGATGTGGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33147	30592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_30600_33100
915546	contig_10399_pilon	-	2349	2	Intergenic	novelGene_114505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1553	1882	445725	445396	FALSE	70	ATGAAGAAAAGAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQVLFQYALHNCHASEMKKYCLEEGIPFKILLIVDSAPGCLPFIGDLHPNIKVVFLPPNTASLIQPVGHGVIAAFKAFYLKRTFVQAIAATDDTVKTLLRFWKECNIY	447939	444928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_447141_447802
915547	contig_5189_pilon	-	2184	10	Intergenic	novelGene_34846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1338.57835956337	2	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTCTCTAATGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247739	198102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218673_228127_228229_230380_230485_235747_235848_244163_244289_247694
915548	contig_5258_pilon	-	4011	1	Intergenic	novelGene_100243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACAGATGCATGGGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208627	204616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_-_204600_208600
915549	contig_12644_pilon	+	3418	11	Intergenic	novelGene_44560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	52.4884749254539	193	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	309	899	1963683	1987332	TRUE	30	TCATGTGTTATGTAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVASCSSTFTGDRLVQHILGTEDLIAEVTSSDAVRFYPWTIDNKYYSADINLCVVPNKFLITAEIAESVQAFVVYFDSTQKSGLDSVSSWLPLAEAWLPEVMILVCDRVSENGVNRQKAQEWCIKHGFELVELSPEELPEEDDDFPESTGVKRIVQALNANVWSNVVMKNDRNQGFSLLSSLAGANRTTGSAESCRSEQQPHLPAGDRTESLLDHRGGASNTAETQVDSIVDPMLDLDIQELASLTTGRGDSENFERLFTKLKEMKDKAATLPHEQRKLHAEKGALLAQQLKYSAAN	1944812	1990227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1944867_1963297_1963489_1963619_1963717_1964051_1964142_1965537_1965622_1980989_1981073_1982026_1982127_1986267_1986373_1986824_1986875_1987287_1987336_1987711
915550	contig_294_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_166738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117668	116643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_-_116600_117700
915551	contig_6364_pilon	+	2279	3	Intergenic	novelGene_51850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_1	421.5	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	103	1290	1772471	1781329	FALSE	30	CTTAGAATCTGGGGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFETEADEKREMPLDEGKGPGAEDPSASKDPFPGQEPPPRQDLPPNKDSSSGQETSPGQESLTSKDSPSCKELPPGQAPPPSKDSPPYRDTPAGPNPPPCQDLPANQEPSASQDPPLSQDLPAIQEPPAQDLPPCQDLPPSQSSLPAEALAKETTGSGEPPAATGGPPVASRPTFVIPEVRLDSAYSQKAGAEGGSSGNEEEAEEGDEGDEGEEDEDEDTSDDNYGERSEAKRSSMIETGQGAEAGFSLCVQNSLRRRTHSEGSLLQEARGPCFASDTTLHCSDSEGATPTWAIPSPCALKKELGRNGGSVHHLSLFFTGHRKISGADGAGDDDEASQKRKSKNLYVEKIHGPRSYDQRGSPTPLFLLALRLASPPRILVLPTAPDTSEQQDHGA	1771076	1782318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1771179_1772470_1773440_1781110
915552	contig_15236_pilon	-	4635	3	Intergenic	novelGene_141609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3077	3388	593334	593023	TRUE	35	TGGGACACAGCAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKIHKFMEKADKFMENTDQKMEEFRKRQEQNVKINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEKDSVIEGLRNRFETMEDRISEIEDNHLNTTLRKNQKKEQRKMKKP	596493	591202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_592179_592751_596247_596329
915553	contig_5988_pilon	-	3683	2	Intergenic	novelGene_16163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	71	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1153	1602	2001579	2001130	FALSE	65	CTAAAGTACAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPKNQTLMLIKRLKRQPTNWEKKFGYNKSNQSLISKIYKILQNLNNKKTNNSIKKWAKDMNRQFAKEDIQAANRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYLLTPTRLALIKQTQNNKCWRGCGETEHLYTVGGNVKWYNHFGNQFGTSLKS	2092707	1999048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_2001771_2091746
915555	contig_16303_pilon	-	1940	2	Intergenic	novelGene_34051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATGTGTACAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34596	32573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33751_33833
915556	contig_7521_pilon	-	2559	1	Intergenic	novelGene_160568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTTACATAGCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469961	467402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_467400_470000
915557	contig_854_pilon	+	5498	32	Intergenic	novelGene_36565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_19	2918.14307305127	28	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	419	2353	1679334	1704498	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESESQP	1672818	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698946_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713152_1715165
915558	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
915559	contig_3077_pilon	+	1973	6	Intergenic	novelGene_26818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1060	junction_4	351.32355457612	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	971	1870	475601	481662	FALSE	40	AACCTCTTAAGAGAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	474630	481765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
915560	contig_5967_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_44411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1682	1981	433192	433491	NA	85	AAAAAAAAAAAAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTSDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTQKKDQIYWPERVWRNLEIMAPRYPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKWD	431510	433912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_431500_433900
915561	contig_6266_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_170992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACGAGACCAAATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498112	497344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_497300_498100
915562	contig_6710_pilon	-	882	2	Intergenic	novelGene_93135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	33	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657826	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
915563	contig_15236_pilon	+	4412	6	Intergenic	novelGene_141548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	402	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1884	2291	122756	123163	TRUE	30	ACTGTGTAACACATGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	120872	382625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_123345_216595_217331_217953_217974_220266_221157_222636_222777_382470
915564	contig_3469_pilon	-	3290	4	Intergenic	novelGene_34192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	397	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	22	363	480246	479905	TRUE	25	AACAATCTTTGTTGGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVFIVTMCSAECKAALTTISLLGRNSQQRWLQRCSHPGPYKIIKHRRSSFQHEVQNPIDSQTSQDRRQSTEGTLIGANPMPEFVFLLVADESRHHSVRGPALPAAGMSGLTEQHEAAHW	480267	475541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_476292_476337_477279_478004_478200_478863
915566	contig_16594_pilon	-	5644	1	Intergenic	novelGene_53849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAGAAAAAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124747	119103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_119100_124700
915567	scaffold_13505_pilon	+	915	4	Intergenic	novelGene_111461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	469	915	531330	532999	FALSE	15	TGCGGAGAGGAGGGCGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDHPELFILPSFLCSSVPGTTAQNSRMIPSAVMMRFLVPSPMSRKGLGSRSTHTKVGAAGALGFGVLPEPALVYAPVALVHILDDQLARRARARAQECGRPLDVVPREDEPPCDVGASGIGAAVVQAVQVGVFPNNYRHRGLIPVLMV	530727	532999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_531168_531301_531374_532385_532498_532708
915568	contig_14704_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_82696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	192	491	78565	78266	NA	55	CCTTAAAAAAAAAGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITWENLCVGEGGQTGSCTCVLPLFMDFFIRTCSCFIFFMFIVVTLITNFYFGGRRQYKINTTNIAVKNYINIDFDFTTSKGHPLKSSNSSRNPVSVYF	78756	76057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_76100_78800
915569	contig_2113_pilon	+	3182	2	Intergenic	novelGene_161149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	542	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCCCAAGCTGTGCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349061	455236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2113_pilon_+_351146_454138
915570	contig_10904_pilon	-	1606	7	Intergenic	novelGene_22724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	420.512650093774	40	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	108	773	661760	651590	FALSE	10	TTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCPTEDHGRHAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSEISSL	703414	650756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651607_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665_662704_703383
915571	contig_5770_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_74149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTGGTTAATGACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78052	80779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_78100_80800
915572	contig_34_pilon	-	1583	7	Intergenic	novelGene_40009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	1628.32296141357	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	538	1317	215393	212049	FALSE	80	AGAATGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKSDRFLTETILKVTGVHGVQVTTSELQKPMAQMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247146	211782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214147_215288_215458_224659_224818_243214_243354_246970
915573	contig_2646_pilon	+	2341	2	Intergenic	novelGene_69723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCCAAAACACTGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2621366	2632990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2623569_2632851
915574	contig_3975_pilon	+	3346	1	Intergenic	novelGene_54915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1972	2388	2232611	2233027	NA	20	GCACCCTGAACTTGGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKSRHIKLGRSAAKDLFKVLKSKDVTLRTQMCLTQAMMFSIASYSRESWMMNKEDRRIDTFELWCWRRILNIPWTPKRKNKSVLEEVQPECFLEAKMMRLCLTYFEHAVRRDQSLEKHIMLGKVEGQRKRRRP	2230639	2233985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2230600_2234000
915576	contig_11104_pilon	+	644	1	Intergenic	novelGene_112472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCACTTTCTCAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473724	474368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11104_pilon_+_473700_474400
915577	contig_8772_pilon	-	4576	2	Intergenic	novelGene_21127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	864	1163	23619	23320	TRUE	25	AAGGGAGTTTGCTGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQSDVKIKKTKPNLLLSIPLIETLQKLYSAVLLLSYRVAMSRNRLASNGFGFDFLVLSNKLTQQEFFQRFIEAETSWSDICWKKAVLMVFKNTFKKVF	24482	19553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_20123_20475
915578	contig_3956_pilon	+	2510	13	Intergenic	novelGene_15026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1311.14170721127	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	1008	1988	1287527	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1285100_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287381_1287453_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
915579	contig_9982_pilon	+	1567	5	Intergenic	novelGene_55735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	95.7349857680044	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	319	666	311199	315276	TRUE	70	TGAAAATAAAAAATTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKRTKGKTVLIDDSSESLEPVCRHTRKGLEPSNLKRALVGVEWNVCQDCKTDNKVKGKSEEETEENPSVWLCLKCGHQGCGRNSQEQHALKHYMTPRSEPHCLVLNLDTWSVW	307568	317285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307846_311157_311260_313037_313217_315168_316153_317260
915580	contig_5628_pilon	-	2629	17	Intergenic	novelGene_157574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	61.4883118974655	70	40	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	897	2030	427589	411690	TRUE	45	TTAAAAAAATATGGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEALPRLLPCCCWGTGCVQLCSTNTMPTSPDIGYQHPTGRVDIPLSLGERVGSGVRAEPDVQLPAASWGQVGQERPPGLVCDPLG	434506	405574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_406140_411655_411803_412210_412350_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427629_427864_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266
915581	contig_5945_pilon	+	8822	2	Intergenic	novelGene_104551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	6495	6911	219888	220304	FALSE	35	CTTTTTCCTAAAACGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPQTAYSIFQKTKPDKIHETKSAKFLLISCFPHFIKKKWGGGQEKKKPFRKSCLQLLCLLLHLPFIRQLFNSLQTGFCPQPLGTLPLDIKQGMQMKHVSKMNSLSFHIKPASLSKQFPSWLKVPVICPNKKPSPCL	212606	222215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_212993_213779
915582	contig_15449_pilon	-	612	1	Intergenic	novelGene_33631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATAGGTTTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65456	64844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_64800_65500
915583	contig_3463_pilon	-	3415	1	Intergenic	novelGene_62020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCTGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615275	611860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_611900_615300
915584	contig_10106_pilon	+	1513	7	Intergenic	novelGene_73877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_4	440.771671806012	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	380	1183	151101	167294	FALSE	45	ATAGAGCGGGAGAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKASVLCWSAISGCLYALVAPSRVVGEAVESVGEGRPGGGSGLFRSSLLKARCPNL	132481	167624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132829_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027
915585	contig_7275_pilon	+	3540	25	Intergenic	novelGene_111230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	687	1007	159569	167481	TRUE	15	CTCGGGGTTCTCCACACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGTLKCEAFANGTLRATDLTPTVAAVHAKFDPFVRIRGTGNKLQHFCSFLSQTPAIEDFSIAFLKVIKLLCIGRVQKPFVFIVLVTLSLTRITVGQTPKTYFFW	158882	269417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_+_159664_167105_167248_167397_167526_168466_168540_168639_168789_170149_170263_173031_173116_174208_174348_183446_183590_187176_187242_187778_187939_188092_188189_190413_190579_193242_193368_202185_202319_203309_203389_205997_206162_207656_207733_213939_214057_216127_216226_221084_221205_233034_233121_236677_236818_251108_251157_269301
915586	contig_9482_pilon	+	2401	8	Intergenic	novelGene_44230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_3	92.7854668422962	12	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1833	2162	233348	235868	FALSE	10	GCTTTCTCTTATTTCCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWNTDLVETLELQNLMLCALQTIYGAEARKESRGAHAREDYKVRIDEYDYSKPIQGQQKKPFTEHWRKHTLSYVDVKTGKVTLEYRPVIDRTLNEADCATVPPAIRSY	220971	236107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_221056_221736_221862_223619_223789_226155_227119_230423_230543_232975_233477_234032_234147_235781
915587	contig_8729_pilon	-	4485	12	Intergenic	novelGene_40088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_11	120.431318515322	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1956	22	1977	223115	209748	FALSE	25	TCTTACATATTTACATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSCSAGAMARTAAVAVAVLGPLLWGCGLALQGGMLYPRESPSRERKELGGLWSFRADFSDSRRQGFEEQWYQRPLRELGPTLDMPVPSSFNDVTQDRWLRGFIGWVWYEREAALPQRWTQDLRTRVVLRIGSAHYYAIVWVNGVHVAEHEGGHLPFEVDISKLVQVGPLESCRITIAINNTLTPNTLPPGTILYKTDTSKYPKGYFVQDTNFDFFNYAGLHRPVLLYTTPTTYIDDITVTTGVDQDNGLVNYQASVQGSARFELAVRLLDAEGQVVAHHTGAQGQLQVPSAHLWWPYLMHSYPAYLYSLEVRLTAQTAAGPVSDFYTLPVGIRTVAVTNSQFLINGKPFYFHGVNKHEDADIRGKGFDWPLLVKDFNLLRWLGANAFRTSHYPYAEEVMQLCDRYGIVVIDESPGVGIVLAESFGNVSLHHHLEVMEELVRRDKNHPAVVMWSVANEPASFLKPAGYYFKTLIAHTKALDPYRPVTYVTNSNYAVDLGAPYVDVICVNSYYSWYHDYGHLEVIPLQLTTQFEQWYSTYQKPIIQSEYGAETIAGFHQDPPLMFTEEYQRRLLEQYHLVLDQKRREYVVGELIWNFADFMTDQSPQRAMGNKKGIFTRQRQPKGAAFILRERYWRIANETKHLPSVVKAQCLGNSLFTL	223136	207239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_209918_212114_212251_213980_214158_216069_216155_217871_218019_218101_218281_218513_218667_219481_219670_220489_220633_220770_220953_221162_221349_222905
915588	contig_6743_pilon	-	4789	1	Intergenic	novelGene_33540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACGATTTAGCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194212	189423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_189400_194200
915589	contig_9871_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_75668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432216	433937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_432200_433900
915590	contig_5033_pilon	-	2259	7	Intergenic	novelGene_29068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_4	1972.26382193999	9	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	24	887	566787	540518	FALSE	15	TCTTGTGGTGCAGTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMVGGRRNPFSALFFVSNFVFSRKFGNRVD	566810	539145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
915591	contig_11594_pilon	-	2782	12	Intergenic	novelGene_80909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1276	1725	352821	343315	TRUE	30	GGCGGGAGAACAGGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFQACLFYLYFFVAVCPSEKWPLPSNCCLLEHGAESTLISVLGFDKTLTLVLVFLWYKQAFQVHLQELLPHSVMLSDGAASCVLRCERYSVLLTSVEFWINTGIQTDVEFQSIDRTHSCALALPNRQNVHEVDLESHHIKYDEAKVLE	366250	275623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_275701_318194_318332_326126_326216_330579_330760_332494_332768_341099_341217_341539_341628_343218_343553_347276_347468_352800_352902_361772_361983_365265
915592	contig_7333_pilon	+	3334	1	Intergenic	novelGene_142749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACCAAACTATTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62501	65835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_62500_65800
915593	contig_10976_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_155587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAAAGAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116107	118073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_116100_118100
915594	contig_14744_pilon	-	1389	5	Intergenic	novelGene_66000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	450.923150326084	5	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	72	1064	969897	960824	FALSE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGCKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	969968	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_968320_968630_969717
915595	contig_3900_pilon	-	2528	14	Intergenic	novelGene_84204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	240.582035855405	22	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	137	2032	561497	543507	FALSE	70	GGAAATAAATAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLWTRVVQAAFIFLTTESIGVLLDPCGHISPESPVVQLGSNFTAVCVLKEKCMDNFAVNADNIFWKTNHAIVPKEQYTVINRTASSVTFRDVSSLNTQLTCNIYAFGQIEQNVYGITIISGLPPEKPKNLNCIVNEEKNMMCQWDPGRKTYLETNYTLKSEWATEKFADCKAQRDTPNSCTLDYSPVYFVNIEVWVEAENALGNITSDHINFDPIDKVKPNPPHNLSVRSSEELSSILKLAWINPSIKSFLRLKYSIQYRTKDASTWSQIPPEDTSSTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGFWSDWSEEASGITYEARPSKEPSFWYKIDPSHTHGYRPVKLIWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHFQNYRVNDTKLTVNLTNDRYIATLTARNLVGRSDASVLTIPACDFRAAHPVMDLKAFPKDNKLWVEWTAPTESVNKYILEWCVLSDKSPCIPDWQQEDGTVHLTYLRGNLMESKCYLITVTPVYADGPGSPESVRAYLKQAAPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTILYKTAFGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGMQLVSIHLEQQKKESQEQEEDIECVVNCLHE	575810	543010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_543601_543696_543800_544127_544275_544465_544568_547045_547229_547795_548007_548729_548813_550976_551137_552489_552645_553164_553332_556398_556520_557421_557728_561433_561513_575689
915596	contig_5033_pilon	+	2449	13	Intergenic	novelGene_28974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_11	58.4693651980819	95	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	461	1654	521595	529828	FALSE	35	AAATTAAGTTATTCCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDADEGPNAIVYYFIAAGNEEKNFHLQPDGRLLVLRDLDREREAVFSFIVKASSNRSWTPPRGPSSALDLLADLTLQEVRVVLEDINDQPPRFTKAEYTAGVATDAKVGSELVQVLALDADIGNNSLVFYSILAIHYFRALANDSEDVGQVFTMGSVDGILRTFDLFMAYSPGYFVVDIVARDLAGHNDTAIIGIYILRDDQRVKIVINEIPDRVRGFEEEFIRLLSNITGAIVNTDDVQFHVDKKGRVNFAQTELLIHVVNRDTNRILDVDRVIQMIDENKEQLRNLFRNYNVLDVQPAISIRLPDDMSALQMAIIVLAILLFLAAMLFILMNWYYRTIHKRKLKAIVAGSAGNRGFIDIMDMPNTNKYSFDGANPVWLDPFCRNLELAAQAEHEDDLPENLSEIADLWNSPTRTHGTFGREPAAVKPDDDRYLRAAIQEYDNIAKLGQIIREGPIKGSLLKVVLEDYLRLKKLFAQRMVQKASSCHSSISELIQTELEEESGEHSPGQGSLRFPPQATHGVQGPRRDPRGAWQHWHAADHRPQQPSRG	520953	530623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_521004_521098_521351_521436_521599_523214_523472_523880_523979_526462_526584_526707_526788_526934_526976_527130_527192_527670_527801_528243_528367_528752_528858_529654
915597	contig_3241_pilon	-	3841	1	Intergenic	novelGene_146378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAACCATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708602	704761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_704800_708600
915598	contig_12896_pilon	-	3971	2	Intergenic	novelGene_178432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	281	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	292	978	4639	2997	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKESDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRINIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFCKEMAKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKKKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRHTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQTPIDKLDNQDLLKIKHLCSSKDFTKRGRRAVGTMVSGNI	4930	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12896_pilon_-_3039_3994
915599	contig_6795_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_27696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGAAACTGCGGATGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91198	93965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_91200_94000
915600	contig_18055_pilon	+	2217	15	Intergenic	novelGene_117814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	410.7024843025	226	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	409	1221	73614	80793	TRUE	70	GAAGAAGAAGAAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKVLLFHI	40662	85630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_43421_43502_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
915601	contig_13697_pilon	-	360	1	Intergenic	novelGene_165924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231949	231589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_231600_231900
915602	contig_2310_pilon	-	3138	8	Intergenic	novelGene_71632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	92	junction_2	123.242419148405	182	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	4	1104	495339	468648	FALSE	35	ATAGATTGTACTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMTTAAQAISGFFVWTALLITCHQIYMHLRCYSCPNEQRYIVRILFIVPIYAFDSWLSLLFFTNDQYYVYFGTVRDCYEALVIYNFLSLCYEYLGGESSIMSEIRGKPIESSCMYGTCCLWGKTYSIGFLRFCKQATLQFCVVKPLMAVSTVVLQAFGKYRDGDFDVTSGYLYVTIIYNISVSLALYALFLFYFATRELLSPYSPVLKFFMVKSVIFLSFWQGMLLAILEKCGAIPKIHSARVSVGEGTVAAGYQDFIICVEMFFAALALRHAFTYKVYADKRLDAQGRCAPMKSISSSLKETMNPHDIVQDAIHNFSPAYQQYTQQSTLEPGPTWRGGAHGLSRSHSLTGARDNEKTLLLSSDDEF	495342	466613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_468890_472011_472207_472686_472857_474008_474101_477143_477220_477728_477820_493510_493677_495270
915603	contig_20951_pilon	+	1303	3	Intergenic	novelGene_43078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGATCTGTGGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26603	28216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_27293_27504_27686_27783
915604	contig_11338_pilon	-	4785	6	Intergenic	novelGene_6392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.00459012076	411	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	3	728	321458	315122	TRUE	40	TCTGTGAGAGAAAAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHVSPGGI	321460	309855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310235_311443_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_321311
915605	contig_12644_pilon	+	2795	1	Intergenic	novelGene_44498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1209	1628	1044885	1045304	NA	25	TACAGCCAGAGTGTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALECRATKTNGRNDEVKELNRRFQRAREDKVKYYNDMCKDLESENQKGTTHRAFLKLKELKKKVKPRVAILKDSMGKILNDAGSNKRRWEEYKESLYQKQLVDIQSFQKVTYDEELMVLKEELQAALKALA	1043676	1046471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1043700_1046500
915606	contig_6102_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_32240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAAAACCACTTGCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196958	1199573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1197000_1199600
915607	contig_4151_pilon	+	2895	2	Intergenic	novelGene_65248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554072	557142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_556474_556648
915608	contig_14142_pilon	-	2565	1	Intergenic	novelGene_120506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGACGCCACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344288	341723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_341700_344300
915609	contig_7031_pilon	-	2424	2	Intergenic	novelGene_132784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1794	2237	202455	202012	FALSE	20	CAGTAGAGCCCTGGTAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVLVVWVEDQTSHNIPLSQSLIQSKALTLNSMKAKRGEEAAEEKFEASRCWFMRFKESSCLHNTKVQRKAASADVEAAASYAEDPAKIIDEGGYAKQQIFSVDQTALYWKKMPSRTLIAREEKSVPGFKGQADSCQGLMQLVTLS	204299	201824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_202650_202700
915610	contig_4305_pilon	+	4447	21	Intergenic	novelGene_136688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	8.42184659086117	626	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	52	1236	523601	526749	TRUE	10	GCGCGTCTGGCCCACCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEPQEPLNGKLRLCFSPAARTSLLLLRLNHAALRALQECQRQQVRPVISFQGSRGYLRFPGPGWSCLFSFIVSQCGQEGPSGGLDLVYQRLGRSGLNRLHCLGPLRERLTFWAAMDSIPAPSLVQEHILTEEARDPGSWHNTGHDSEGGTVSQPQVTLEEGPDPLASNQGQSLPGSSRDHMAQWEVRNQTHLPKREPDQRLPSSASQKHLYRKRPASAAATGLEEKRLRALPLASSPLQELPSQDLQEEDWGQEDEDMGPRLEDSPSIQTDSESPSPEEVPDYLLQYRAIHSAEQHHAYEQDFEADYAEYRILHARVAAASQRFIELGAEIKRVQRGTPEHKVLEDKIVKEYKKFRKRYPGYREEKRRCEYLHQKLSHIKGLILEFEEKNRGS	523549	549962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_523733_523963_524000_524333_524447_524555_524758_524847_524928_525063_525140_525317_525493_525571_525615_525757_525930_526512_526558_526638_528686_529940_529981_531018_531129_532179_532366_532964_533089_533404_533520_536850_536979_538237_538356_541827_541941_543484_543564_549700
915611	contig_8571_pilon	-	2943	16	Intergenic	novelGene_169166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	124.896686193919	148	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	752	2259	210	2468	425430	379028	FALSE	70	AACTTAAAAAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIESSAQYKARVALENDDRSEEEKYTAVQRNSSEREGHSINTRENKYIPPGQRNREVISWGSGRQNSPRMGQPGSGSVPSRSTSHTSDFNPNSGSDQRVVNGGVPWPSPCPSPSSRPPSRYQSGPNSLPPRAATPTRPPSRPPSRPSRPPSHPSAHGSPAPVSTMPKRMSSEGPPRMSPKAQRHPRNHRVSAGRGSISSGLEFVSHNPPTEAATPPVARTSPAGGTWSSVVSGVPRLSPKTHRPRSPRQNSIGSTPSGPVLASPQAGIIPTEAVAMPVPAASPTPASPASNRAVTPSTEAKDSRLQDQRQNSPAGNKENIKPSETSPSFSKAENKGVSPIVSEHRKQIDDLKKFKNDFRLQPSSTSDSVDQLLNKNREGEKSRDLIKDKIEPSTKDSFIENSSSNCTSGSSKPNSPSISPSILSNSEHKRGPEVTSQGVQTSSPGCKPEKDDKEEKKDAAEQVRKSTLNPNAKEFNPRSFSQPKPSTTPTSPRPQAQPSPSMVGHQQPTPVYTQPVCFAPNMMYPVPVSPGVQPLYPIPMTPMPVNQAKTYRAGKVPNMPQQRQDQHHQSTMMHPASAAGPPIVATPPAYSTQYVAYSPQQFPNQPLVQHVPHYQSQHPHVYSPVIQGNARMMAPPTHAQPGLVPSSATQFGAHEQTHAMYVSTGSLAQQYAHPNATLHPHTPHPQPSATPTGQQQSQHGGSHPAPSPVQHHQHQAAQALHLASPQQQSAIYHAGLAPTPPSMTPASNTQSPQNSFPTAQQTVFTIHPSHVQPAYTNPPHMAHVPQYKPTTNSSCKAALEEPKGQIPSSLLLLLPTGSTEN	427164	378552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_379136_382304_382533_383145_383292_393535_393669_393989_394175_406977_407045_407394_407548_408131_408196_409255_409561_417312_417384_417656_417765_418151_418350_420335_420519_423257_423468_425330_425510_427034
915612	contig_9053_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_87931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	554	1135	119772	119191	NA	80	ATTAAGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYTVNDKLKRDGVALITKKKISRFILKNNTVNDRIISICLQGSTVNMTVIQIYAPTTTTKDEEIEYFYQLLQSEIDQTCDQDDLIITGDWNMKVGNKEEGSVVGKCGLGDRNDARDHRIEFCKTNDLFIANTFLHHVNDNYTCEHRCKEYTRIKLTTSVERDDEEGQYHQSEQGQGPTAEQTISCTYVSSS	120325	118149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_118100_120300
915613	contig_13800_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_153740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAACTGTGTAATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149861	151755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_149900_151800
915614	contig_9988_pilon	+	5074	3	Intergenic	novelGene_113049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	136	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACGATGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42152	62639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_44198_58479_58758_59888
915615	contig_16103_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_118908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTGTATTTGCTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766661	765055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_765100_766700
915616	contig_9177_pilon	-	2311	1	Intergenic	novelGene_32815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAGGCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1645901	1643590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1643600_1645900
915617	contig_7806_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_157542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	505	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAAACCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252044	250163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_-_250200_252000
915618	contig_12733_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_129604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACTAATCAGGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388471	386381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_386400_388500
915619	contig_7627_pilon	+	6106	6	Intergenic	novelGene_175558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	125	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	1282	2127	11389	138810	TRUE	30	ATGTAATGTATGGTATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQMLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSPL	9524	313584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_9853_10435_12208_138783_140907_253059_253309_311468_312364_312845
915620	contig_19908_pilon	+	2069	1	Intergenic	novelGene_167614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	558	1004	37927	38373	NA	20	CTTTATTGTTGAGAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPENSTDFCVLILYPVTLLNSSIRCSSFLVESLEFSKYRIMLSVNRNSFTSSFPIWIPFISLSCLTVLARTSSTVLNKNSDNGHRCLIPILKGKALSLSPLRIMLAVGFAYMPLIMLRNFPSVFILREFLSGKGTGFYEMPFLHQLR	37369	39438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_+_37400_39400
915621	contig_6137_pilon	+	3905	1	Intergenic	novelGene_59174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	2163	2636	1252692	1253165	NA	30	ACAGGTATATTGATACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIENQTGRTHSAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSMVKILNDSGSIKRRWKEYTESLYQKELVDDQPFQEVPYKQEPMVLKEEVQVSLKALAKNRAPGIDGIRIEMFQQIVAVLEVLTCLCQEILKTATWPTDWKRSIFMLIPKKGDPTKCRNY	1250529	1254434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1250500_1254400
915622	contig_15022_pilon	+	2636	1	Intergenic	novelGene_171805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2202	2525	70705	71028	NA	20	CCCTCCCCAGCAGAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPASVTPPPPLPRSWLRESLTSLTSSLWGKSWSCTDSPPSPPWGPSSFLDRPWRFLPQPVYASLPLALEEGQEWEVLTPLYHLCGPACDRPVWLPSSPSLEGIPLV	68503	71139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_68500_71100
915623	contig_3525_pilon	+	3822	7	Intergenic	novelGene_135145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_5	62.2934364297092	269	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1957	2412	641940	643700	FALSE	35	ACTTTATGGATATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPALPLLPHPSQGCRRPPQWQLSPRCLSLQQPRHLPQSSQDLRQRLVPTSTPLWLHKPDYHLGFKLQVALFFRAFCPSQVSQGFPRILHSPLCKNYSIMQLHSQHCYSRSIQLRLWRAIQLNLMGFLVTLQRQEHHLLCNQASPRVGGSE	623589	645110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_623703_625201_625286_626932_627012_627754_627851_640355_642118_642586_642738_643573
915624	contig_7720_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_155736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGCAGAAAACTTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204616	207297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_204600_207300
915625	contig_3252_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_61509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	439	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGTACTGAGAAATAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618005	620226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_618000_620200
915626	contig_11294_pilon	+	3772	8	Intergenic	novelGene_50052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_7	108.321893692186	141	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	22	876	251378	312061	FALSE	20	ATCTGGAGGGCATTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAASALKMSAACRAWAFFLPRRRSCFPAEVPLLHVALCLLCWAPAAVDAVPELGLWAKTVNDKSGPLIFRKTMFNSTEIKFSVKSFSCSGPVKFTIEWYLKYHTCHNEYSELEELSQKHELSVDEDFCGHYFKNIDCWTTKNENLDCNSDLQVFPSLTNKELIPNIRNVSNQEGSMDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSSKL	251356	314957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_273297_273390_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866
915627	contig_859_pilon	+	3123	2	Intergenic	novelGene_132827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATTCTCACAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121025	129446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_123967_129264
915628	contig_9036_pilon	+	4953	2	Intergenic	novelGene_155457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	207	junction_1	0	141	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146109	170476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_150177_169590
915629	contig_10399_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_114506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	306	921	137	1057	449156	448236	NA	65	AAAAAAATCATTATAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLYSLDHGHEKPQDKKKRTSGLATLKKKFIKRRKSNRSADHAKQMRELLSGWDVRDVNALVEEYEGTSALKELSLQASLARPEARTLQKDMADLYEYKYCTDVDLIFQETCFPVHRAILAARCPFFKTLLSSSPEYGAEIIMDISTAGIDMPMFSALLHYLYTGEFGMEDSRFQNVDILVQLSEEFGTPNSLDVDMRGLFDYMCYYDVVLSFSSDSELVEAFGGNQNCLDEELKAHKAIISARSPFFRNLLQRRIRTGEEITDRTLRTPTRIILDESIIPKKYAKVILHCMYTDVVDLSVLHCSLSVGSLSEVQALVAGKPNMTRAEEAMELYHIALFLEFNMLAQGMEF	449292	447634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_447600_449300
915630	contig_9053_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_87957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1547	1888	309340	308999	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTDSKVTEMMEFEVKDFKIAIINMIKHLKENMTIMRREIRDIKGNQMELLELKNSKFERKTLLHWHNRRLETAEKKISECEDKAIETIQSETCAERKRLKQTNRASEIYGAT	310886	308432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_308400_310900
915631	contig_11512_pilon	+	861	10	Intergenic	novelGene_43390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	266	739	556850	580118	TRUE	20	AGCATTTCAGCCAGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGMYPMPCTKYLKASASLAGCKRKGHHCFACTLRRVVFVGSSLELHSTYSVHGRRIVPNHQQCRALQGDGVGARHGPLDLQVPPAVVGVDEQVQVGGVHVVHDVLAVGVDHLHVVMHFFLPEEVRHHHVRQGLGPPRDLGERPSPSSLLHKGSR	556584	582740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556866_561325_561394_567731_567802_570037_570086_571046_571107_573287_573391_576894_576961_580075_580156_581645_581706_582715
915632	contig_19606_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_148265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGCACCATTTATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20172	48862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_20246_47155
915633	contig_10732_pilon	-	2230	7	Intergenic	novelGene_114666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	344	847	30393	29890	TRUE	50	CAAAGAGCCCAGAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDRATPQFQRGSGGWPQPLLSDTEALARKQGGAGAGREGRASRVQQVRADEGTRERGGSPLPCSRAPVPELGRDPTVCEHKDSDPHRWGPALRSSLTLRLLSWCFKCHQEVLISECPCSAVQAYRLALGHPQTAAGGTTLGAWERWATGVPTRPLVKSTEMHSSRK	30736	21543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_21777_24088_24671_25271_25467_28069_28171_28819_28936_29548_29682_29866
915634	contig_8978_pilon	-	1484	7	Intergenic	novelGene_49486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	152	454	1772261	1762767	TRUE	30	CCTCCAATCGGTGCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDIFFCYDAKEASVVSHKALPQTQLSEDIHHDLHRGVICHCKRAHVKNASKLQGSGTFCRKRWGVLCKTHPRTANNTFLLFSGTFYCNCQVSSEGKPH	1772412	1753163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1753184_1754510_1754603_1754683_1755057_1758865_1759050_1762405_1762808_1764920_1765139_1772217
915635	contig_5033_pilon	-	2018	1	Intergenic	novelGene_29088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCCTGATTAAATTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684144	682126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_682100_684100
915636	contig_10958_pilon	+	2040	4	Intergenic	novelGene_5441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAGGGATAAATACAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888227	901710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889013_895279_895855_900457
915637	contig_7151_pilon	-	3324	8	Intergenic	novelGene_40686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	175.372955353406	12	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	835	1821	18419	12393	FALSE	55	AGAAAAGAAATGCTTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAD	65221	10889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_12398_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18486_18570_18880_40400_40716_65077
915638	contig_14219_pilon	+	3792	1	Intergenic	novelGene_54325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	726	1103	737742	738119	NA	40	TACTCCTTTTAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKEYNLQYGLHLNIKKTKILTTGPIRNIMINGEKTEVVKDFIFLGSTINAYGSSGQEIKCCIAQGISAAKDLFNVLKSKDVTSRANVLLIQAMVFSIASYACESWTMNKEDQRRIDASELWCW	737016	740808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_737000_740800
915639	contig_5238_pilon	-	4305	2	Intergenic	novelGene_176261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	489	950	129195	86936	FALSE	45	ACCAGGAGATAAGCTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLNKTGIEGKFLTIIKGIYTKPTANIILNGKSLKAFPLRTGTRLGCPLSPLLFNIVLEVLARAMRLEKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKQNFEKEIWKAIPFTIAPKK	129683	83580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_86986_128783
915640	contig_6031_pilon	+	4804	5	Intergenic	novelGene_56723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTCATCAAAAGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122393	248366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_125581_125648_125893_239233_239479_239584_240240_247893
915641	contig_720_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_155161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	57	461	160568	160164	NA	30	TTATACTCTTAATATTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQNGDETGTWPDNQFDAEMLQAMILASTSEAVDGSTTMGGGASTMDLSAQYDPQFTLQHMAYRQNVYIPGSDATLANAAGKRDGKTPADGNSSKKLSMTPQEVMWRPVPEPQGSLPPTPVQPLPTCTQASEFQGYPHNAGRGQGHASLGKQK	160624	158624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_158600_160600
915642	contig_10904_pilon	-	2845	9	Intergenic	novelGene_22435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	20.3803673911929	81	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	720	1655	78169	61644	FALSE	5	CCCGTCCTGCGCTGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLWLDSCGLTAKACEDLSSMLGVNQTLTELYLTNNTLTDTGVRLLCKRLSHPSCKLRVLWLFGMDLSKMTHGALAALRVKKPYLDIGC	96551	60453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_61732_63514_63686_71079_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_93272_93354_96091
915643	contig_10500_pilon	+	1932	7	Intergenic	novelGene_41288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGGGGCCGACCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628557	1640161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637066_1639870
915644	contig_17427_pilon	+	1098	1	Intergenic	novelGene_30396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGAAGAGAAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254535	255633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_254500_255600
915645	contig_16259_pilon	-	2152	3	Intergenic	novelGene_174361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	50	472	7773	3322	FALSE	25	GTGGGATATTTGAACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEDKTIERADSKPSTEKQEELSMNLRSADGGEPTEGSNLLSSSEKRPQETPTESSHLQRLRQTFARRPRGSLVSKIKVVTKDFLLWAVVWSVTIGTVLPGVNPSGIIILLFFAFLGDTLFWLIKLPTLPPLPGFLGKC	7822	1641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16259_pilon_-_3504_6589_6777_7719
915646	contig_11816_pilon	-	2595	2	Intergenic	novelGene_98554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTGTACTAAATATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184789	1156545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1158595_1184243
915647	contig_12414_pilon	-	2987	12	Intergenic	novelGene_59667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_11	118.892965267431	125	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	219	1997	896846	820951	FALSE	20	TACATACTCACTTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVASPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPIRTQVPGPPQPPLPPPPPQQQAANHIFSQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHATMFQSTVVLQSPQQSGYIVTAAPPPHPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTVSYSASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCTPGHYHSSQPQYRPVPSVHYSSHLNQPLPQPAQQTGYQVMPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSSHPNNIGNQIQGVVIPYPSVPSYQVSLPQGSQGIAHQTYQQPVVFPNQSNQGAMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCTSQQLQSHQCTAVPPPPPVGGMVMMQLNVPNNPQPRAHSPPWKQNKYYCDHQRGPKCVEFSNVDNIVQHSPQLSSPIISPAQSPAPAQLSTLKAVRPSGQPLSIMPQFSRPFVPGQGDTRYPLLGQPLQYNPPAVLHGHIPNQQGQPGNRHGNRGRKQAKKAASTDLGAGEAVVGKVLEITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPQLRRHPLCCGSGDSTVNPERSKPSDLASTYTVLATFPSISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYDFHILERASSQ	900322	819960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_821313_822251_822337_822761_822845_830403_830549_835796_835967_838083_838188_868323_868476_871631_871787_886849_886974_890249_890547_896744_896897_900154
915648	contig_10481_pilon	-	3636	2	Intergenic	novelGene_170523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	183	320	48353	48216	TRUE	40	ATCTCACTCTATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFNPAIALLGIYPREIRAITLIDIRTFIFIEALFTIAKRWKQPRCPSTDECINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLVTWMKLEDIMLSEISQSQKDKHCMRPLL	48535	13253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_-_16078_47723
915649	contig_990_pilon	+	2777	1	Intergenic	novelGene_76060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGCCTTCAGTATGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059998	1062775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1060000_1062800
915650	contig_1082_pilon	-	4030	2	Intergenic	novelGene_170427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCTGAGCGACGGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47469	43066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_43122_43494
915651	contig_253_pilon	+	4933	1	Intergenic	novelGene_129781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	103	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	4072	4398	1072688	1073014	NA	50	CAACATGATAAATGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDHSLKYRLRLNVKKTKILKTGSISNIMINGKKIEVIKDFILLRSTINTHGSSSQEIERRTSLGKSAAKDLFRVLKSKDVTLKTKVSLTQAMIFSVASYACKKLDNE	1068616	1073549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_1068600_1073500
915652	contig_14556_pilon	+	670	4	Intergenic	novelGene_138526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	499	junction_1	378.234788928194	8	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	97	669	130420	134661	FALSE	40	ATAAGATCTATGAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFIIVNSLKDQLEDLKKRNQSSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIISDLQGRISSLEEDLKNGRSLLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVTQQTLEQEEAEHKATKARLADK	130323	134662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_130528_130750_130998_131381_131489_134550
915653	contig_4114_pilon	-	4376	1	Intergenic	novelGene_15633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	3565	3912	483517	483170	NA	35	AACTGTCTCTCAAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEYTRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHAIEEIKKTREEHNGKFNRLQESIERQQSEIQKINSKISKLDNSIESHRSRIEAVEVRISEIEDTAL	487081	482705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_482700_487100
915655	contig_15498_pilon	-	1317	8	Intergenic	novelGene_42663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	122.840696573627	60	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	90	692	697795	688828	TRUE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGGAPHSVPPKLQLQTPGPDVFRSLPGGMSRPGAAIGQPWKGHFRCPSAGLFGRRKKMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIGV	697884	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_691319_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
915656	contig_7912_pilon	-	3527	1	Intergenic	novelGene_129564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	191	946	74397	73642	NA	20	CATATTTCCTGCCACCGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHPEDSPQEICVPALKDIVTEHKTANPGQKLYLGGACVRTSWLNASLPQHQKHHSGEKPFRRNMDGTLCVNSCRFQMSRQLFTRRELGKDSPVPLGSLQHQATPTGEKTHSSSICETFHSGKSHYRWDECEKASSNNHTFVHHQRICAGEGLCEDSKYGKAVSCKYRLVQCQGIHARERRYQCCECRKIFSRHSSLSRHQRIHTGGRTYECSECGKFFIQKSSLLQHQRRHTGAQPYECVKCRRTFSESSTLIQHCRVHTGEKPYECCECGKSISCSSTLNTRDLTLEKGLLSAVHVRNPFTKDLGFFNTRGVT	74587	71060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_71100_74600
915657	contig_6589_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_25838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	401	982	910243	910824	NA	25	CCTTTATGACAGCAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNNTRSIERRWKEYTELLYQKESVTIQTLQEAAYDQDPMVLKEEVQAALKALTKNKRPGTDGIPIEMFQQMDAALEVLIHLCQKIWKTDTWPSSWKRSICVPIPKKDDPTECGNYQTISLISHTSRILLKIIQRWLQQYINRELPEFTLKRGMSLLMSDGSWLKAENIRKTFTCVLLIMQRHLTVWIIANNG	909842	912390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_909800_912400
915658	contig_6740_pilon	-	3014	2	Intergenic	novelGene_142671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTTCACCTTCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588963	581031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_583813_588730
915659	contig_18511_pilon	-	3987	1	Intergenic	novelGene_126883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	347	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	359	763	40641	40237	NA	40	AAAAAACCTCACTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLYIEHPKDSMRKLLEVMERFSRVAGYKINIQKLVGFLCSNKENNEKEIRKTIPFIIAPKNIKYLGVNLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRELHKWKNIPCSWIGRLKIVKMKILLKAIYKYNAIPIQIPTNIL	40999	37012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_37000_41000
915660	contig_6552_pilon	-	2210	2	Intergenic	novelGene_163602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135883	132977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_135056_135751
915661	contig_6191_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_107856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGATGTACTGACAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186335	187049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_186300_187000
915662	contig_854_pilon	+	3125	16	Intergenic	novelGene_36533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2734.8047990467	3	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	82	1968	1649514	1715249	FALSE	5	ATGCGTGTGTCCCGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1612864	1716406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679325_1702030_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706827_1715165
915663	contig_7179_pilon	+	8113	6	Intergenic	novelGene_78177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	290	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	7717	8112	1104630	1122711	FALSE	15	CGCCTTCCCATGGCAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGLHCCLPPSSFACSASQAMCLTSLLPPAVLAAPSMALSSANTCGRRAIMLVWIATNQECAVAVSLHRRIKVFLLSGECSSINLFSRSGMLRFLAAKHILRGMTFLSLVLFWCFGEPESSLPLKFGDWGA	1075624	1122712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1082863_1084432_1084617_1091331_1091525_1104528_1104676_1112385_1112597_1122572
915664	contig_9437_pilon	+	2646	4	Intergenic	novelGene_141722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_1	10.5303793326209	72	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCTGTGATCTTGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188836	196097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_190961_192107_192213_194006_194046_195719
915665	contig_15376_pilon	-	2531	2	Intergenic	novelGene_154690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAATTAGTGCGTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224519	221305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_221564_222246
915666	contig_1084_pilon	+	3324	17	Intergenic	novelGene_152384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	58.6677282988697	180	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	122	2131	506537	533085	FALSE	75	AATGTTAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVLAVRGWRRGRALVRWAPGAVCLGLPWPRCAATRGAAAEPWALARLYSSGDRKEKIDMSRFPVENIRNFSIIAHVDHGKSTLADRLLELTGTIDKTKNNKQVLDKLQVERERGITVKAQTASLFYNCEGKQYLLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLSACQGVLLVVDANEGIQAQTVANFFLAFEAQLSVIPVINKIDLKNADPERVEKQIEKAFDIPSDECIKISAKLGTNVESVLQAVIERIPPPKAHCKNPLRALVFDSTFDQYRGVIANIALFDGVVSKGDKIVSAHTQKIYEVNEVGALNPNEQPTHKLYAGQVGYLIAGMKDVTEAQIGDTLYLHKQPVEPLPGFKSAKPMVFAGMYPIDQSEYNNLKSAIEKLTLNDSSVTVYRDTSLALGAGWRLGFLGLLHMEVFNQRLEQEYNASVILTTPTVPYKAVLSSAKLIKEYREKEITIINPAQFPDKSKVTEYLEPVVLGTIITPDEYTAKIMMLCQARRGVQKNMMYIDQNRVMLKYLFPLNEIVVDFYDSLKSLSSGYASFDYEDAGYQTAELVKMDILLNGNIVEELVTVVHKDKAHSVGKVICERLKDSLPRQLFEIAIQAAIGSKIIARETVKAYRKNVLAKCYGGDITRKMKLLRRQAEGKKKLRKVGNIEVPKDAFIKVLKTQPDK	506415	534278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_+_506702_510943_511056_511205_511355_511637_511719_513334_513413_514222_514307_520225_520291_520820_521025_523013_523154_524331_524456_524808_524942_526371_526516_527362_527497_529125_529228_530300_530421_532131_532169_532947
915667	contig_5031_pilon	+	2425	3	Intergenic	novelGene_133185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTATCGTAAATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22633	47289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_23506_23619_24115_46231
915668	contig_5605_pilon	+	4975	3	Intergenic	novelGene_143948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1753	2289	478682	479218	FALSE	65	AAAAAAAATGATAAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVASLTITPSDPLARFLLPVPSTLCSSGLEVLVPKRGMLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHFGLLMPLAQQAKKGVTILTGVIDPDYQEEIKLILHNGGKEEYVWNAGDSLGHLLVLPCPVIKVSGKLQLPNSDMTANDTDPSGMKVWVTPPGKEPQPAEVLAEGKGNTEWVVEEGSSK	427884	481904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_428433_428531_429493_478438
915669	contig_935_pilon	+	3864	1	Intergenic	novelGene_45561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365186	369050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_365200_369000
915670	contig_9415_pilon	+	806	3	Intergenic	novelGene_109922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCAGCAGCGGCGACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2190420	2226067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2191038_2205491_2205586_2225972
915672	contig_12919_pilon	-	6733	31	Intergenic	novelGene_75877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	114.416374119558	216	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1243	3729	3005	6733	648297	637221	FALSE	25	AGGTCCTATTCTTCTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESSGPYSDATENSQLSVKISGMEIKSSGKRDSLLAQKKDTKENMKPPTKLKRESLSTKIKNEMLLEEEKSTDFVFIPPEAKEAKERILTEHQKEVLKTKRGDIPAMYNNLDVSQDTLFSQYSQEESMGVPSLTEKPKEDSRMRIKEEQMESGVIVSQNVMENCGMDEHLEKASLSHKECGSVEETSPEILSNNTDARRKSLISSKKTSAERASSIENTFVVSSSSVSNAAVSGTPPQPTSRRQTFITLEKFDGSENRPFSPSPLNNMSSTISVKNNRESMTKADIPPKTKRREVTVSKSDSEKIVNGIKRLGRRSSKAEQTGNKRSKPLLRSEQEKNNQEFIDGMVALEYNPPGLLNQTDCVSDNQACLPESTMEYEDTRFKPAVENAIVLEHSVEEKNLGINLESKENTPPVIIPADQMVNEDNQIPITPSQKTLRRSLRRRSEIAESIPDSQDKENNHQKKERRKEEEKFIQKSPVPAKDDMLPKHQLISEQAVQENLIEKGNNLHEKTFGETSSNTEIDQNRRKPDLENIKSEGDGVQDTADKSSEKPIRGRTRYQTRRASQGLLSSIENSESDSSEAKEEGSRKKRSGKWKNKSNDSVDSEDQEEKMVKQECIKVANQAHDTKISSEVDISKTCDKKDESSTAPLQDSTTASDLFEGEDVPNTHEGKSKTNRCAEYSFTSPSVPESNLRTRNANKRLHKRDSSENNSVGETSRTGTSDISLLSEKTLQTLECQHKRSKRVRRSKGCDCCGEKSQPQEKPSKNAENYDIKISETKKTDLQTAVAISETSKANLYSEVELSDEHHSVNFHSGLKEENDNDSSVVLETDLKENTIQESHPSEIVNFKEEICDMDSSEAVSLESQEPSNKEFGTVAPCLDDSKDVSQEEKPEATPKMEPCLENIVSFEVNSCKVKESNLGEIEVTELNLEGNKSETTFSEQENAQTDISEKETTEEKNEGSSDSEADTAEELNVKEAATEKFNSGCVHSGTTTPVKKSAQAEISDPTAVGEPDGGSDKCDPGSSEKVNVELENREEAVVGEVNAETDCFNVTEAGSMTTKTTKPEEAETERLNAEIDSCVPHILEMNTEEGRIDSNKTEKSIELNKSEETKLGDNQMLVDNYDETLEEAHHTSEKVEESPESLTSETAISELITEENLSPQKLRELDPCLVSANDSPSGVQTRCVWSPLASPSTSILKRGQKRPQEDEIPSPVNKVRRVSFADPIYQAGLADDIDRRCSIV	683696	637220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12919_pilon_-_637299_640938_644149_644518_644574_644667_644749_645115_645268_646904_647025_648264_648365_648909_649109_649691_649735_652475_652741_654779_654880_665193_665344_665700_665809_666746_666928_667154_667229_667851_667939_669617_669719_669995_670059_670788_670900_671132_671307_671991_672107_673449_673602_674447_674587_675459_675553_677549_677740_678656_678752_678848_678977_679888_679986_682512_682592_683331_683446_683617
915673	contig_4659_pilon	-	3975	1	Intergenic	novelGene_118190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAAAAGCATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141726	137751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_137800_141700
915674	contig_3878_pilon	-	1312	6	Intergenic	novelGene_174797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	11.1462998344742	98	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	542	1300	597614	562953	FALSE	15	TCTTAAAGCCTTTGCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLEDAVVPRALYEELLRNYQQQQEEMRHLQQELERTRRQLVQQAKKLKEYGALVSEMKELRDLNRRLQDVLLLRLGSGPAIDLEKVKSECLEPEPELRSTFSEEANTSSYYPAPAPVMDKYILDNGKVHLGSGIWVDEEKWHQLQVTQGDSKYTKNLAVMIWGTDVLKNRSVTGVATKKKKDAVPKPPLSPHKLSIVRECLYDRIAQETVDETEIAQRLSKVNKYICEKIMDINKSCKNEERREAKYNLQ	624037	562940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_-_563111_574094_574309_580427_580577_597376_597844_600129_600266_623861
915675	contig_9481_pilon	+	949	1	Intergenic	novelGene_149631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	251	601	104575	104925	NA	65	ACAATGAAATAAATAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVHHLYKHKAKIFTTGSINNIVINREKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKKCIALSKSAAKDLLKVLKSKDVTLRTKMRLTQAMVFSITSYTCESWVMNKEDRRRIEAFELWC	104324	105273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_104300_105300
915676	contig_7058_pilon	-	5849	1	Intergenic	novelGene_136021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145755	139906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7058_pilon_-_139900_145800
915677	contig_12327_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_140676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131108	1133891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_1131100_1133900
915678	contig_16411_pilon	-	1597	2	Intergenic	novelGene_77353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	1214	1597	241559	240349	FALSE	10	GTCCTGCCTCTGTACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMSWESMHRPTLGSGGDGLGEALVWFQSIPLAVQLDTTVGWLWCSLSGFSSSSRSKACRAIRLAGGGQGLVDGWLEAAHMLHGGTVRLYRLHVLVQDGKHLIVQDLVLPDAVCHLLQGHILNDFILP	242772	240348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_240375_241201
915679	contig_12677_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_110861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACACACCAGACACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3766	2946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
915680	contig_7979_pilon	+	4721	16	Intergenic	novelGene_125535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAAGTCTCCTGTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048090	1106667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1048889_1050534_1050648_1061525_1061614_1065029_1065230_1077635_1077742_1078315_1078484_1080366_1080441_1080766_1080892_1089705_1089845_1090384_1090543_1095870_1096035_1097021_1097132_1102864_1103012_1103398_1103539_1103981_1104222_1104716
915681	contig_5921_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_142236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAAATAAAAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71721	68520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_68500_71700
915683	contig_14357_pilon	-	5502	19	Intergenic	novelGene_121696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_18	115.209055821189	154	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	824	2475	97	2571	750698	680130	FALSE	40	CAATTTATAATCAAGTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLQEPVQAAIWQALNHYAYRDAVFLAERLYAEVHSEEALFLLATCYYRSGKAYKAYRLLKGHSCTTPQCKYLLAKCCVDLSKLAEGEQILSGGVLNKQKSHDDIVTEFGDSACFTLSLLGHVYCKTDRLAKGSECYQKSLSLNPFLWSPFESLCEIGEKPDPDQTFKLTSLQNFSNCLPNSCTTLVSNHSLSHRQPETVLTETPQDTIELNRLNLESSNSKYSLNTDSSVSYIDSAVISPDTVPLGTGTSILSKQVQNKPKTGRSLLGGPAALSPLTPSFGILPLETPSPGDGSYLQNYTNTTSVIDVPSTGAPSKKSVARIGQTGTKSVFSQSGNSREVTPVLVAQTQSSGPQTSTTPQVLSPTITSPPNALPRRSSRLFTSDSSTTKENSKKLKMKFPPKIPNRKTKSKTNKGGITQPNINDSLEITKLDSSIISEGKISTITPQIQAFTLQKAAAGLMTLLREMGKGYLALCSYNCKEAINILSHLPSHHYNTGWVLCQIGRAYFELSEYMQAERIFSEVRRIENYRVEGMEIYSTTLWHLQKDVALSVLSKDLTDMDKNSPEAWCAAGNCFSLQREHDIAIKFFQRAIQVDPNYAYAYTLLGHEFVLTEELDKALACFRNAIRVNPRHYNAWYGLGMIYYKQEKFSLAEMHFQKALDINPQSSVLLCHIGVVQHALKKSEKALDTLNKAIVIDPKNPLCKFHRASVLFANEKYKSALQELEELKQIVPKESLVYFLIGKVYKKLGQTHLALMNFSWAMDLDPKGANNQIKEAIDKRYLPDDEEPITQEEQIMGTDESQESSMTDADDTQLHAAESDEF	750794	677198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_680213_681404_681562_682631_682707_692429_692559_701617_701736_703788_703998_704578_704732_707164_707335_707544_707753_708798_708899_714388_714505_716530_716646_717420_717633_717737_717893_718717_718816_725296_725423_729785_729934_734288_734365_750671
915684	contig_14556_pilon	-	2783	1	Intergenic	novelGene_138507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	439	795	23740	23384	NA	45	TAAAATATTTCATACTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIEIMEGKTGTMLGAIIHGINTIQTITNNAQTPKDKVDNWEPLKIKYLCSSKDFTKRVKREPTNWEKIFGHDISDKGLISKICKIF	24178	21395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_21400_24200
915685	contig_18081_pilon	+	1478	4	Intergenic	novelGene_23785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	118	480	104555	112338	FALSE	25	CAGCTGGGCCCTCTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90788	113336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
915686	contig_8020_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_114466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	70	381	419722	419411	NA	35	GGTGGTAGCAGATGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERASPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAAASCGLISHSRDLSCQLIWRTWDSSICTACEWEPCSPTFRSWACQLLQLCDLGEASTLIHRLGMF	419791	417546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_417500_419800
915687	contig_10074_pilon	-	5222	2	Intergenic	novelGene_57203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGGGGGAAACCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605446	597493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_601268_603998
915688	contig_2125_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_147722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCCTATCTCAATATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446795	449159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_446800_449200
915689	contig_12019_pilon	-	763	3	Intergenic	novelGene_87663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	7	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8667	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
915690	contig_10386_pilon	-	1471	2	Intergenic	novelGene_173539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCCAAGTAGATTGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89016	86045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10386_pilon_-_86520_88019
915691	contig_11564_pilon	-	2573	1	Intergenic	novelGene_158578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAGAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82577	80004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_80000_82600
915692	contig_14562_pilon	+	4157	7	Intergenic	novelGene_174068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	30.7340744668411	170	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	95	1396	5152	10001	FALSE	45	ACATATAAAACTTTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVVVEDVAVDFTQEEWALLDHSQRQLCRDVMMEIFRSLASVASQNLIDGDKLSAENIIVRFMKNDTWSSMVGEICELPGTEDQNNNQKTHVRRHMLENLCESNDDNHCGQTFSQIPNLPVLKRTPMEAYPSECLECGKSLMNHSSLKHHIKSHCGYSAYQCKECGEDCGCPSYLSTAVRTLTGQKSYECKECEKAFSRSSDLTVHRRAHSGERPYECKECGKAFSRSSILTSHVRTHSGERPYECKECGKTFRHSSDLTSHKRTHSGERPYACKECGKAFSQSCLTSHIRTHSGERPYECKDCGKAFSQSSHLTSHIRTHSGQRPYECKECGKAYSRFSHLTSHIRTHSGEKPYECKECGKAYSRSSHLTSHVRTHNGERPYECKECGKAFSCSSHLTSHVRTHSGERPYECKDCGKAFSQSFCLTSHIRTHSGERPYECKDCGKAFSRSSHLTSHIRTHSGE	5057	12762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14562_pilon_+_5186_6318_6470_8467_8758_8841_9054_9137_9574_9657_9829_9993
915693	contig_5780_pilon	+	1416	6	Intergenic	novelGene_29772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	11	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	281	625	107519	112561	FALSE	25	GTTTGAAATACGCAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMKAEHHPLTAGLAPPVPCLQAVPPMSFPLLR	73990	113352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_110064_112467
915694	contig_14822_pilon	-	2957	1	Intergenic	novelGene_145411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGACAAAACTTAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180447	177490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_177500_180400
915695	contig_9242_pilon	+	2307	2	Intergenic	novelGene_155079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1385	1690	751685	751990	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSYGIQISNIQNYPSVSSSDFSSTGMSSGILFWMPSGTILSWFFLICFDIVRCLQDIQ	748889	752607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_+_749374_750784
915696	contig_7775_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_37467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGCCTATGGAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93175	94479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_93200_94500
915697	contig_753_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_112895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGGGATTTGGACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249886	247339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_247300_249900
915698	contig_2476_pilon	+	1897	1	Intergenic	novelGene_157639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGAGCTAGTTTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434355	436252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_434400_436300
915701	contig_12837_pilon	+	3087	8	Intergenic	novelGene_57356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	69.3002930170205	42	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	665	1231	289976	311123	FALSE	75	GAGGAAAAAAAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVRRFHSGIEHASAVNIRDHVDFAGLVG	267000	312979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_267058_282716_282869_285252_285351_286821_286909_287496_287698_289906_290075_302652_302872_310874
915702	contig_8210_pilon	+	3421	8	Intergenic	novelGene_30223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	178	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACTTTCCCAGACGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13593	53017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_15993_18143_18324_19800_19851_21486_21616_23937_24081_29712_29927_37638_37800_52872
915703	contig_6589_pilon	+	1628	14	Intergenic	novelGene_25736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.6552990272854	6	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	608	1264	479605	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457290	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457360_463619_463770_465119_465180_466985_467081_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
915704	contig_5961_pilon	+	1207	7	Intergenic	novelGene_144122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	496.780300199864	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	92	670	144074	175683	FALSE	25	CACTTAGCACAGTACCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGKCRSQQRNYTQ	113804	176220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172992_175653
915705	contig_3132_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_127467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544701	546217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_544700_546200
915706	contig_10751_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_174822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	632	1039	244507	244914	NA	80	AAGATAAAACAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSPVPRIFIELNKYLQNDELICVCRGPVMLDRKGNWLSQDSAPWPSTQGVCNPIVKSSTEPAPFPCPVNRTPHSQPKHIGATLYFPLSFHLLIQSIGKSCQFTSKMFHIRPRTRTISEANSSDRDWTGLWDIK	243875	245171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_+_243900_245200
915707	contig_10064_pilon	-	2668	10	Intergenic	novelGene_122718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	29.698484809835	131	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	131	1597	319276	277957	FALSE	45	AGGATAATAATCCAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLQKEPAGAVIWGYGIAGATVTVTVGQAQETVMKKVTRVKADSNTWMVVLDPMKPGGPFEVMAEQTIGRMNFTLRVHDVLFGDVWLCSGQSNMEMTVSQIFNATREMSDTAAYQSVRILSVSLVQAEQELEDLAGLDLPWSKPTSENLGHGNFQYTSAVCWLFGRYLYDTLQYPLGLVSSSWGGTPIEAWSSQRSLKACGISKQGFIPPDSLGGPSKHSVLWNAMIHPLRTMALKGMIWYQGESNTNYNMDLYNCTFPALIEDWRQAFHHGSQGQTERFFPFGFVQLSSYLSNTTSGDGFPQIRWHQTADLGFAPNVRMPNTFMAVAMDLGDRNSPFGSIHPRDKQTVAYRLHLGARAVAYGEKHLTFQGPLPEKMEHLVDKGLLNLTYYQKIHVQRQDNKIFEISCCSDHQCTWLPAPMNASTTWTLALDVCPCHGTLGALRYAWTTWPCEYKQCPLYHPSSTLPAPPFVAFMTHQTPGHHSKDAR	327774	276885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10064_pilon_-_278209_280577_280774_281772_281931_290015_290150_290613_290724_292116_292295_301466_301606_308134_308311_319152_319315_327682
915708	contig_15146_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_116964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCACTGCAAGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595158	593570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_593600_595200
915709	scaffold_13609_pilon	+	2202	7	Intergenic	novelGene_124421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	60.7273048599685	92	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	28	660	779035	794586	TRUE	30	TAACTATCATTTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACEEALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGRVDVAVNCAGIAVAIKTYNLKRSQAHTLEDFQRVLNVNLIGTFNVIRLVAGEMGQNERDQGGQRGVIINTASVAAFEGQVGQAAYSASKGGIVGMTLPIARDLAPIGIRVMTIAPDVVDLIPVFSIW	779007	796261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780437_780559_780689_780768_780878_794548_794627_794759
915710	contig_6137_pilon	+	2965	2	Intergenic	novelGene_59187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTACTATTACCATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1288462	1292277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1291314_1292163
915711	contig_9706_pilon	+	2248	12	Intergenic	novelGene_20945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	830	junction_6	445.625681411972	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	166	1362	313386	456283	FALSE	20	TCTCCCTATACTGTGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELRKYTCFLRGCEAWQRPSFKGCAPTNKEISQGAVSFTQSSQCIQHPLVQPPGVCISACLLWE	262970	457169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989
915712	contig_6434_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_61864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGCAACCTGGCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824934	826732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_824900_826700
915714	contig_17440_pilon	+	1632	2	Intergenic	novelGene_7586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAAAGAAATATGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2317	4004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_2729_2783
915715	contig_8328_pilon	-	3429	4	Intergenic	novelGene_174038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1105	1434	41105	40776	FALSE	85	AAAAAAAGAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKNRGLFSSLESNVMCSADFLGACYPFFPSNFSHLQWKCLPYACSTIVLWKQMTCILDFTDEEEFCPRMEFGLGVDVRLLLGYHGVNVFYMCKDMNFWVPKVGNVMD	94282	38780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_-_41282_41458_41828_41946_42079_93855
915716	contig_4924_pilon	-	6809	1	Intergenic	novelGene_84738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTTCCATAGGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147983	141174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_141200_148000
915717	contig_15114_pilon	-	2541	15	Intergenic	novelGene_121134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	258.754907278715	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1715	2431	112655	100551	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	164572	100440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_115534_115955_123580_123705_137049_137181_141879_142046_147669_147831_150654_150828_152061_152177_153332_153375_154909_155006_164497
915718	contig_3832_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_161487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484257	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484300_486900
915719	contig_12299_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_29724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCCACACACCTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63279	64791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_63300_64800
915720	contig_7119_pilon	+	2449	3	Intergenic	novelGene_40937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	9	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	149	1303	137033	139798	FALSE	30	GAACACTGATGGCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127509	140944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
915722	contig_11498_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_65544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319286	318512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_318500_319300
915723	contig_6364_pilon	+	1283	2	Intergenic	novelGene_51794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAAAGCCATTCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380083	1381733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1380916_1381282
915724	contig_14219_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_54320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGAAAAAAAAAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710563	711805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_710600_711800
915725	contig_408_pilon	-	5801	2	Intergenic	novelGene_84937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	445	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAGAGAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230871	223167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_228609_230511
915726	contig_10456_pilon	-	2250	2	Intergenic	novelGene_163469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1768	2184	61594	58514	FALSE	10	GCCTTGGAGTTCTGCGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASWRSSGCTRRLVMVSHRAMISSLSKRPSRLRQPSISGWLSPDISTPRKGGEDDANNIAAPAHQGGALATDTGSAFLDVRLQRASGIPDSGAEVIANEVTHGTRCSDLPFRAVPPGPDRAESHLSHSGEAQRFYREH	63361	58447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_58922_61585
915727	contig_13206_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_161909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1338	1844	203815	204321	NA	55	TGGAAGAAATGATGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPGWKALKRQLVKSCLLKEELTLMTWMESSFWDLFADVAQLKMRRDGCKHPLIIRMWNVRSINLGKLEIIKNEMEHINIDILGISELKWTGIGHFESDNHMVYCAGNDSLKRNGIAFIVQKNISRSILKYNAVSDRIISIHLQGIPVNTTITEIYAPTTKVKDEEI	202477	204965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_202500_205000
915728	contig_14727_pilon	+	2131	1	Intergenic	novelGene_56665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	101	436	341727	342062	NA	55	AAATATGTGGACATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPILETYEPSERPDQVPCNLSRERRNSRSQTSADATLLPTPFFPVFLDPSQVSPSSTSSIFQVSGIVPAPDSSVQIKQEPMSPQRDENVNVVPQGSAGSVSKELSQTNSM	341626	343757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_341600_343800
915729	contig_7915_pilon	-	1733	2	Intergenic	novelGene_42963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAGTGAGAATAACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119306	87238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_87595_117929
915730	contig_6881_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_164836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATGTCAACACTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80643	81616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6881_pilon_+_80600_81600
915731	contig_13699_pilon	+	2410	11	Intergenic	novelGene_158333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_1	121.427179823959	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	49	1791	123817	135191	FALSE	15	TGCCCGCTGGCAACAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAKEETYNQLLDKGRLMLLSRDDSGSGSKTEQSIALLEQKWHVVSSKMEERKSKLEEALNLATEFQNSLQEFINWLTLAEQSLNIASPPSLILNTVLSQIEDHKVFANEVNAHRDQIIELDQTGNQLKFLSQKQDVVLIKNLLVSVQSRWEKVVQRSIERGRSLDDARKRAKQFHEAWKKLIDWLEDAESHLDSELEISNDPDKIKLQLSKHKEFQKTLGGKQPVYDTTIRTGRALKEKTLLPDDTQKLDNLLGEVRDKWDTVCGKSVERQHKLEEALLFSGQFMDALQALVDWLYKVEPQLAEDQPVHGDLDLVMNLMDAHKVFQKELGKRTGTVQVLKRSGRELIENSRDDTTWVKGQLQELSTRWDTVCKLSVSKQSRLEQALKQAEEFRDTVHMLLEWLSEAEQTLRFRGALPDDTEALQSLIDTHKEFMKKVEEKRVDVNAAVAMGEVILAVCHPDCITTIKHWITIIRARFEEVLTWAKQHQQRLETALSELVANAELLEELLAWIQWAETTLIQRDQEPIPQNIDRVKALIAEHQMFMEEMTRKQPDVDRVTKTYKRKNVEPTHAPFIEKSRSGGSMFPAHSVKMLHSY	123768	135810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_123925_126297_126454_126560_126768_126902_127023_127467_127638_129029_129190_130128_130324_130676_130806_131648_131793_132306_132496_135026
915732	contig_5698_pilon	+	3046	4	Intergenic	novelGene_55033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	870.102037439033	5	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATACCTGTTTTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6817	20868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8025_11129_11210_18732_18853_19229
915733	contig_13612_pilon	+	2076	3	Intergenic	novelGene_157300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_2	0.5	11	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	319	903	52289	53792	FALSE	10	TCCTCCCTCACCCCCCACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLGQHFQNVSLNQLHPGCLGSWFPGPHPLL	51970	54965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_52428_52776_52872_53441
915734	contig_11328_pilon	+	2938	4	Intergenic	novelGene_88415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_2	704.732731056407	13	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	589	975	644800	645398	TRUE	25	TCATCTTTACACAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGRRDYAA	643649	648038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643689_644250_645017_645228_647223_647899
915735	contig_18850_pilon	-	2119	10	Intergenic	novelGene_142420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGCCACTCGTACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186081	171870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_172057_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178299_178939_179146_180513_181085_185500
915736	contig_10765_pilon	-	3979	1	Intergenic	novelGene_122886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59528	55549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_55500_59500
915737	contig_8978_pilon	+	2732	12	Intergenic	novelGene_49463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	210.17269561832	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	810	2642	1749586	1772309	FALSE	50	TTTTCTCCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680826	1772399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
915738	contig_6477_pilon	-	534	5	Intergenic	novelGene_154175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5152.21056319518	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	317	361	770078	770034	TRUE	5	CCAGTGGGCTTGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGGEGATFFGRPASGFIRHQPPPPCLPSSTPTRSKSVGALDVAGAAGWSIPPHRSPSGLRPPSPKKVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQLSTVEISLLMRLSALPVRCDTDL	773196	769325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_771241_771341_773006
915739	contig_8273_pilon	+	1402	1	Intergenic	novelGene_113101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAACAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503702	505104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_503700_505100
915740	contig_7119_pilon	+	2451	4	Intergenic	novelGene_40899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	203	1324	137033	140507	FALSE	35	TAAACAGTTTTCACTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYL	127455	141634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139759_140500
915741	contig_15118_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_74570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTCTCTGGGTCCAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256264	254430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_254400_256300
915742	contig_18272_pilon	-	2359	1	Intergenic	novelGene_7087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGTGAGTGTGAGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541831	539472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_539500_541800
915743	contig_7272_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_25381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694944	693141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_693100_694900
915744	contig_10958_pilon	-	1818	2	Intergenic	novelGene_5468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901699	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
915745	contig_16385_pilon	+	2103	2	Intergenic	novelGene_86205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCACCTAACAGCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37052	136175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_38782_135801
915746	contig_3077_pilon	+	2338	4	Intergenic	novelGene_26780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAAATGGCTCATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220123	234029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_222166_227130_227283_229751_229835_233968
915747	contig_16148_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_50368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71764	69732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_69700_71800
915748	contig_366_pilon	+	2761	9	Intergenic	novelGene_51630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	64.1774882649672	169	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	230	1822	1389987	1404950	FALSE	15	TCTGGTTTGGGTGAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STLQLLRKVLQIPENESELTEVFALIHELNSSRLILSSVSEETVTIEQTSWSNYYEFPSTQCLLCSSSLFKGGQNSMAGPQECWLLTANRLQVVTAQVKMCLNPHCLALHSFMDIYTGLFNVGNRLLVSLDLLFAVRNQIKLGEDPRVSISAVLKSVQEQTAEKTLTSEELSQLQELLCSGYWAFECLTVRDYNDMICGICGVAPKVEMAQRSEENVLALKSVEFTWPEFLGSSEVNMEDFWATMETEVIEQVAFPASIPITKFDASVIAPFFPPLMRGAVVVNTEKDKNLDVQPAPGNGSALVRLLQEGTCKLEQIGSYSEEELRQLLGQCGIPFGAEDSKDQLCFSLLALYESVQNGARARQPPPHLTGGKIYKVCPHQVICGSKYLVRGESARDHVDLLASSRHWPPVYVVDMATPVALCADLCYPELTSQMWGRNQGCFSSPMEPPLSVSCPELLDQHYTVDMTETEHSVQHPVTKTATRRIVHAGTQPSPGNPSAGHHSLTLCPELAPYATILASIADSRPNSVRQRPIAFDSATHYYLYNRLMDFLTSREIVNRQIHDIVQSCQPGEVVIRDTLYRLGVAQIKTETEEEGEEEEVAAAAE	1389246	1405889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1389472_1389982_1390111_1392303_1392436_1393325_1393514_1397420_1397641_1398993_1399128_1400037_1400155_1403162_1403373_1404482
915749	contig_1379_pilon	-	2375	12	Intergenic	novelGene_134597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	274	junction_3	121.89549785244	25	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	1509	2375	470335	454213	FALSE	25	CAGTGTGAAGATTCCGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQPEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDVECRSLIYKPLDGEWGSNPRDEECERIVRGINQLMTLDIASPFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEEEEKDADVPGTSTQKKKDHQPRRRLRNRAQSCDIQAWKKQCQELLNLIF	478007	454212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_454309_454569_454621_454859_454930_459279_459406_461733_461855_463209_463366_465455_465518_465697_465810_470262_470590_471166_471275_474270_474391_476981
915750	contig_12951_pilon	+	3349	1	Intergenic	novelGene_68178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	266	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	48	147	243	389	340840	340986	NA	55	AAAAAAAAGCAGCTACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQWADSGLSTSNGYERGFWTQLELGSDPALTVRGCVSLGQWLFLSLNLVIRKTGICQRSLEAEFETGILFRNIKGSEGRRMRQGEACSMGSSGAGMAPQSQPTRCKGAGLLSGFSGPRNSLLEPRPTL	340597	343946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_340600_343900
915752	contig_15720_pilon	-	2945	2	Intergenic	novelGene_41936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	672	1514	297062	293946	FALSE	35	ATTACCTATACTTTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCATTNPMQTLQKEAVCAICLDYFKDPVSIGCGHNFCRGCVTQLWGGEDEDRDKEEDEWEEEEEDEAVGATGGWDNSIREVLYRGNANEDFQDQEDEPWVGDGGVRNWDNMNCVWDQEEDEEDRDYYLEGLRHDLRIDVYPEEQERLEEYDDDEELYPDTHLPLPSTPQRQFTCPQCRKNFTRRNFRPNLQLANMVQIIRQMCPTPYRGSQGNDQGTCSKHQEALKLFCEVDKEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVLEYKEVKLERTPWLVGIQRR	297733	292514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_293997_296270
915753	contig_2933_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_111342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738319	739243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_738300_739200
915754	contig_19269_pilon	+	1830	2	Intergenic	novelGene_175634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	908	junction_1	0	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTGTTTAAGATGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20324	24405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_22045_24295
915755	contig_2733_pilon	-	2778	2	Intergenic	novelGene_128561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTAACTTGAAATGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578074	575076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_576383_576602
915756	contig_17127_pilon	+	5198	12	Intergenic	novelGene_168303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	213	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66780	90175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_66979_67918_68609_68896_69786_72709_72832_73557_73647_76028_76201_81043_81199_83646_83708_84607_84824_85440_85634_87090_87349_88020
915757	contig_10904_pilon	+	2975	2	Intergenic	novelGene_22708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	429	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	248	574	636835	637161	TRUE	60	CTAATAAAAAGAACTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTGYKGLMDDSYHGLHQIESSTARWCLYTTTDYSDWDHNRGCWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHPFGSVMKSLPRFTVQPGGGQPHKTKRD	636587	712552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_637580_710569
915758	contig_9982_pilon	+	2269	6	Intergenic	novelGene_55773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	359.210244842766	26	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	84	2057	635612	748008	TRUE	30	GTGACCAATGTAAACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEKLVFAYESSVHSANVLLSLNDQRKKDVLCDVTVFVEGQRFRAHRAMLAACSSYFHARIVGQMDAELSITLPEEVTVKGFKPLIQFAYTAKLILSKDNVDDVCRCVDFLGVHNIEESCFQFLKFKFLDSTTDQQEGPRKECFLSHCQKTDLQLSPVDQKDLEIDEVEEFLESEHVPIPQCKLSRHQGDARASLALQDSTSQTSESMCSEKDTALTLPSLCPKYRKFQKAFGTDRVHSVDSSVKDSQVSPIQPNETPENECLGGVQDCADLQAILKCEETKTPVEHEETKKQDSASEHPAVKAEATPFAHSSAADPHGLYALSLLHTYDQYGDLNFASMQNTTVLTEKPLSGADGQEEHTLGGSQDLHLKSDPGPREDSSLASGDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDSPCQMQLSPAVARDVPEQMYSQKRFECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLKSVNCPFISTLSTEGCSGSLEIGNDDYVPEAQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESFSAREQECEVKLPFNEQRIISLSRNDFQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQTQSHLKSLPLPKSVGNVCKEQLDSFFSPEKTSRIGLCKPQLFICCSPAWTVHSGKQISFL	608043	758453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_608063_635547_635846_638028_639376_641682_641890_747822_748021_758253
915759	contig_11126_pilon	-	1751	3	Intergenic	novelGene_138120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGGGAACTTCCACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185147	183133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_184706_184917_185012_185062
915760	contig_5686_pilon	-	4045	4	Intergenic	novelGene_45305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCACACATGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100408	94171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_94915_96942_97693_97783_99563_99635
915761	contig_15034_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_143634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35912	34422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_-_34400_35900
915762	contig_19730_pilon	-	2188	5	Intergenic	novelGene_142495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	356	junction_4	87.2249247635101	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	503	829	155679	152104	FALSE	70	GAAGAAAAAAATACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITVNASLFPSSVANSLIAVGNDGLQERDRMVRACIAIICELALQNPEVVALRGGLNTILKNVIDCQLSRINEALITTILHLLNHPKTRQYVRADVELEVGTSYSFQF	164746	150744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19730_pilon_-_152304_155552_155680_159325_159390_163461_163594_164440
915763	contig_20141_pilon	+	2377	11	Intergenic	novelGene_173466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_10	22.1936927977297	45	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	405	1589	15621	39691	FALSE	70	ATAAAAAAAAACCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLSEDPLGKILASIYLPKSLRERLHLNNLQTILFNFFGQTSLFKIKNFTKALTTYVVSASISDTSIQNLADPVVITLHHIEGSPNYGQVHCAFWDFGKNNGLGGWNSSGCKVNETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDTVNERILVLITYAGCGISSIFLGIAIVTYIVFHKLRKDYPSKILINLCTALLMLNMMFLVNSWSASFQKVGLCITAAVALHYFLLVSLTWMGLEAVHMYFALVKVFNIYIPNYILKFCLVGWGIPAVMVAIILSVKKDLYGTLSSGTPFCWIKDDSIFYISVVAYFCLIFITNLFMFCAVIVQLNSVKAHSQKTRRKMILHDLKGITSLTFLLGLTWGFAFFAWGPVRILFLYLFAIFNTLQGFLIFVFHCAMKENVREQWQIHLCCKWFRLDNSSDVSSRCGLNVGYKQEKSRKTFEHKLLTPSLKSTTTNSTFKSLGCTQGTPSEISFPSDGFDEDPLSCEVVANCGRSILPVEIKMNSIHEQRFLQYFPAEIPSPLPDWGKF	6934	40479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20141_pilon_+_7072_12034_12155_13309_13356_15519_15624_18320_18443_22450_22720_26749_26829_29201_29483_35827_35930_37077_37246_39530
915764	contig_6003_pilon	-	1585	1	Intergenic	novelGene_176392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	63	192	140	331	41333	41142	NA	65	AAAAAAGAAAAGAGATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVPKLGSSTIKRSEATHSTRKPPAQRHSPPLLCGSESLAPPISAQMHPTLTGSLLHTRTQLSRSVGRLQRRLTLVSRFSCCWFSAAAPSVLLQVLCHCRTSIHPQFQN	41472	39887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6003_pilon_-_39900_41500
915765	contig_12479_pilon	-	2073	2	Intergenic	novelGene_56884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTGCAGTGAACATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560481	557421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_558293_559279
915766	contig_2066_pilon	+	4724	11	Intergenic	novelGene_176530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCACAGTGCACAGCGCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90377	125690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2066_pilon_+_93603_96480_96627_97625_97791_98442_98602_100453_100576_102937_103053_112263_112357_113143_113370_120400_120525_122354_122477_125463
915767	contig_19687_pilon	+	4204	2	Intergenic	novelGene_170768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	176	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1257	1667	73773	74183	TRUE	45	GTTGGGGCTTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKGNNKISEMDSVIEGLRSKFETMEDRIKTNTWIQLWLRKNRKKITKINEETLRMVSDTIKRKNLQVIGVPEQGEKTENTDRIIELLLTENFPNIMKHEKLTIQEVR	72516	80238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19687_pilon_+_75484_79001
915768	contig_5280_pilon	+	4339	3	Intergenic	novelGene_52656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGCAGAAGTTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298580	303633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_301378_301934_302990_303146
915769	contig_6062_pilon	-	840	4	Intergenic	novelGene_5256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	212.079125695	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	40	591	597983	552797	FALSE	20	ATCCATTTGTAGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCPGNLRPGILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKI	598022	552547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_552803_560804_561084_569595_569743_597863
915770	contig_3956_pilon	+	1903	10	Intergenic	novelGene_15009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1319.39875008596	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	81	1202	1281682	1290310	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKDRPAPPHGAYLPCGDPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285743_1289627_1289677_1289758_1289892_1290297
915771	contig_1225_pilon	+	2107	3	Intergenic	novelGene_44197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	319	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	50	316	253442	274411	TRUE	45	GTTGTAAATAAAGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWSGFLGSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	253392	276768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_253520_274222_274846_275411
915772	contig_12479_pilon	-	5011	1	Intergenic	novelGene_56835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	188	550	136313	135951	NA	30	CAATACTTGTCTACTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDCSLLITSPKYVRCSLATLASKEHSGVLLPRQICWFFWQSMVYSIILCQQHSSKASILLQSSLFIVQLSDAYEATENTTAWVRCTLISKVTSLLFNTLKRSFVEDLPNAMHLRIS	136500	131489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_131500_136500
915773	contig_15545_pilon	-	2883	1	Intergenic	novelGene_120128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATGAATAAAGAAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23215	20332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15545_pilon_-_20300_23200
915774	contig_4519_pilon	+	2696	4	Intergenic	novelGene_123673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	153	junction_3	37.7741828354882	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTGAGTGAAATAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69779	80991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_70919_77856_78014_78794_78937_79733
915775	contig_990_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_76033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAGTCTTTTTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	820493	822423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_820500_822400
915776	contig_11026_pilon	+	3872	2	Intergenic	novelGene_167679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	343	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATTTATCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254169	258160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_257421_257539
915777	contig_9571_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_136331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAAAAAAGGAAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743034	743826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_743000_743800
915778	contig_5083_pilon	-	414	1	Intergenic	novelGene_151643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAGGATTTCCAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230978	230564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_230600_231000
915779	contig_11493_pilon	-	3375	3	Intergenic	novelGene_143713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	450.5	65	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	328	453	276158	276033	TRUE	65	TCAAAGCAGATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSIKNEFWTHEEALKGEAATERIYDNRTEKTSEDKVEDIWIPREDKNNVPVDSASESEYSTVEECFHSLRRKTSKASKSRTQKLSNLDTLTRRNYPCSSLSGNADSSTMASCAISPYACFYGSPAVKVKSGWLDKLSPQGYVFILSFPK	278456	272369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_272908_273648_276418_278388
915780	contig_10197_pilon	-	2959	5	Intergenic	novelGene_115270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	245.883610677898	119	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	141	689	1143371	1131196	FALSE	15	ATATTTCCCCAGCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTSGTVGGTAEPEHEETSWMNGWLSCKAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRLLGSACFAVSCLLIAYGASNPDSLSVLIFISLALNGFGGMCMTFTSLTVSVDFLKFSSSVIYL	1144378	1128925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1131321_1132154_1132211_1133770_1133979_1143211_1143420_1144286
915781	contig_8122_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_40220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCCAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496295	494788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_494800_496300
915782	contig_8712_pilon	-	3953	2	Intergenic	novelGene_58855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1670	2047	908965	908588	TRUE	20	GCCTCAGTAGCAATGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRIHTYTILDISKTRYIKELNVKPITIKIMEKKRGANLGALIYGINRLSNTTKNAQTEDKLDDWDLLKNIKHLRASKDFSQRVKREPTDWEKMFGKDVSEKGLMSKIYRKLQHLNSKKTNNPIK	910634	718652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_718711_906739
915783	contig_3588_pilon	-	1497	2	Intergenic	novelGene_72873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCAGAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95979	93154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_93326_94653
915784	contig_15666_pilon	-	1854	8	Intergenic	novelGene_70137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.587160220749	5	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	90	1253	110619	107816	TRUE	25	TGTAAACTACGTGTTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESNPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110708	106762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107004_107414_107497_107537_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110564
915785	contig_13780_pilon	+	3375	2	Intergenic	novelGene_149067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTAGTGGGAGTGGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654608	682619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_655099_679734
915786	contig_9696_pilon	+	2661	2	Intergenic	novelGene_68815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTTTTCTACTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391842	395564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_392347_393407
915787	contig_3241_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_146391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATAAAATCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766992	768580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_767000_768600
915788	contig_14687_pilon	+	2741	2	Intergenic	novelGene_107963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2339	2725	687283	687810	FALSE	50	CTAATGAAGTGGAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMGKRRERREEQEEKRRKQNKETKKQKQTRKINAPRDVTVRLHRAREYLPSRTALPGQKWLPSRENNQKNKSKQYKSEQTKKSPGGPTSVSAGARKQFHGRVAPCSPPGRRKDSHGARYFRERRGRW	684944	687826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_687325_687465
915790	contig_4364_pilon	+	547	1	Intergenic	novelGene_776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532762	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
915791	contig_7887_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_124872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTGTAAACCTTCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206607	207644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_206600_207600
915792	contig_7009_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_23637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443365	443828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_443400_443800
915793	contig_6047_pilon	+	3924	3	Intergenic	novelGene_24238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	52	junction_1	19.5	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	89	697	256199	261205	FALSE	45	ATGTAAAATAAAGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGEQQWCDVGIFKNNTALVSQFYLLPKGKQSIAKVGNADVPDYSLLKKQDLVPGTGYRFRVAAINGCGIGPFSKISEFKTCIPGFPGAPSAVRISKNVEGIHLSWEPPTSPSGNILEYSAYLAIRTAQIQDNPSQLVFMRIYCGLKTSCIVTSGQLANAHIDYTSRPAIVFRISAKNEKGYGPATQVRWLQGNSKKAPLS	256110	264432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_256307_258525_258712_260890
915794	contig_12790_pilon	-	7516	32	Intergenic	novelGene_35182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	191.202493028387	547	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1173	3522	1673	5194	216385	141301	TRUE	40	GTCCACCAGCAGGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSLGVSKSVLNNVIFCHQEDSNWPLSEGKALKQKFDEIFSATRYIKALETLRQVRQTQGQKVKECQTELKYLKQNKEKACEIRDQITNKEAQLTSSKEIVKSYENELDPLKNRLKEIEQNLSKIMRLDNEIKALESRKKQMEKDNSELEQKMEKVFQGTDEQLNDLYHNHQRTVREKERRLVDCQRELEKLNKESRLLNQEKSELLVEQGRLQLQADRYQEHIRARDSLIRSLATQLELDGFERGPFSERQIKNFHKLVRERQEREVETANQLMNDFAEKETLKQKQIDEIRDKKIGLGRMIELKSEILSKKQNELKNVKYELQQLEGSSDRILELDQELTKAERELSKAEKNSSVETLKTEVISLQNEKADLDRTLRKLDQEMEQLNHHTTTRTQMEMLTKDKADKDEQIRKIKSRHSDELTSLLGYFPNKKQLEDWLHSKSKEINQTRDRLAKLNKELASAEQNKNHINNELKRKEEQLSSYEDKLFDVCGSQDFESDLDRLKEEIEKSSKQRAMLAGATAVYSQFITQLTDENQSCCPVCQRVFQTETELQEVISDLQSKLRLAPDKLKSTESELKKKEKRRDDMLGLVPMRQSIVDLKEKEIPELRNKLQNVNRDIQRLKNDIEEQETLLGTIMPEEESAKVCLTDITIMERLQMELKDVERKIAQQAAKLQGIDLDRTVQQVNQEKQEKQHKLDTVSGKIELNRKLIQDQQEQIQHLKSTTNELKSEKLQISTNLQRRQQLEEQTVELSTEVQSLYREIKDAKEQVRPLETTLEKFQQDKEELINKKNTSNRIAQDKLNDIKEKVKNIHGYVKDIENYIQDGKDNYKKQKETELNKVMTQLTECEKQKENINKDMGVMRQDIDTQKIQERWLQDNLTLRKRNEELKEVEEERKQHLKEMGQMQVLQMKNEHQKLEEKIENTKRNHSLALGRQKGYEEEIIHFKKELREPQFRDAEEKYREMMIVMRTTELVNKDLDIYYKTLDQAIMKFHSMKMEEINKIIRELWRNTYRGQDIEYIEIRSDADENVSASDKRRNYNYRVVMLKGDTALDMRGRCSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDRENIESLAHALVEIIKSRSQQRNFQLLVITHDEDFVELLGRSEYMEKFYRIKKNMDQCSEIVKCSVSSLGSYVH	264677	64491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_64541_65278_65959_89069_89795_140432_141488_142892_143027_145402_145546_146096_146183_165295_165521_167487_167616_185868_185983_186058_186152_186597_186709_188728_188923_189359_189487_189927_190118_196551_196790_197692_197869_199630_199789_199929_200113_201577_201785_202200_202395_202958_203125_203351_203481_215516_215722_216251_216438_220471_220559_240647_240732_242305_242843_254730_255031_262956_262992_263998_264126_264227
915795	contig_3960_pilon	-	1593	2	Intergenic	novelGene_138014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380795	377759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_378714_380156
915796	contig_11932_pilon	+	1797	1	Intergenic	novelGene_85427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGACTTTCAGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436612	438409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_436600_438400
915797	contig_6862_pilon	-	2840	2	Intergenic	novelGene_63764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	163	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2020	2382	262257	261895	FALSE	25	GTACTATGTGTACAGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKRCPAYSHEGLRDDFHGEKRAKVETKFLCKHQHYHLMFFTHVNDKFVCQGLAFGKKCTLWDVEQNSNTKIDQIYWPDRDWRNPESIAPGHPFSSGVKSLPTFTIQLGIGQPHKTKRD	267991	261436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_264174_267888
915798	contig_9839_pilon	+	2765	2	Intergenic	novelGene_88584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	96	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGCCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331256	334380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_331425_331783
915799	contig_17144_pilon	-	1178	5	Intergenic	novelGene_29291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1849.33952737187	2055	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	135	1094	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTIMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166850_176072_176271_179700_179786_181794_181850_183158
915800	contig_10159_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_30843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	177	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	326	919	613990	614583	NA	75	CAGAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVEREPTDWENIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQMKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLGTDIPLNPAIPLLGIYPRAIRVVTRIDICTPMFMAALFTITKRWKQPRCPSTEEWINKLWYIHTMEYYGKRKNNESVSHLITLMKLKDIMLSEISQSQKDKYCTRPLL	613664	616030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_613700_616000
915801	contig_14553_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_124988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCTACTTCCACTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5409	2998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14553_pilon_-_3000_5400
915803	contig_14333_pilon	-	2247	1	Intergenic	novelGene_49116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392908	390661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_390700_392900
915804	contig_10740_pilon	-	3362	2	Intergenic	novelGene_152245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGCAGAGTTTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38086	34547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_35015_35191
915805	contig_12250_pilon	+	2604	5	Intergenic	novelGene_80571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	36	junction_4	45.9639804629669	32	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	240	770	311980	312816	TRUE	20	AGCCCTAGCATCTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQVLLGQNT	311740	314739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_313596_313684
915806	contig_18869_pilon	-	1216	4	Intergenic	novelGene_56450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTCTGGTAGCATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160745	150709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_151510_153834_153941_159329_159477_160582
915807	scaffold_15027_pilon	+	1291	3	Intergenic	novelGene_163576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	118.5	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	185	334	104904	105053	TRUE	35	GTAAAATATGGGAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLKNLQCVESARCQAAARDAERKSLYNLFLESVQSRLRHGEDTTPCILTEQQTTKESLIKMQSIAERHLELDDVHDPLLAINFARLCTPANFLTIEMMESVQYLVAVYF	102985	106780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_103045_104778_105828_106597
915808	contig_12923_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_30162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATCCTAGCAACACACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294707	297023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_294700_297000
915809	contig_14415_pilon	+	817	4	Intergenic	novelGene_77604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	208.225838934557	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	79	471	33410	37984	FALSE	25	ACTCCCGACCACTCAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEGFPCFVPFTESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33331	38330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36075_36199_37805
915810	contig_3386_pilon	-	1761	7	Intergenic	novelGene_34501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	779.879834048525	4	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	20	514	409604	404912	TRUE	5	GTCTTGTGGTTTAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTQDFEMHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAADAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRSFSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK	412113	403519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_404207_404351_404940_405102_405190_405426_405466_407702_407838_409398_409607_412096
915811	contig_10756_pilon	-	2159	1	Intergenic	novelGene_170675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCCATGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364456	362297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_-_362300_364500
915814	contig_3241_pilon	-	2617	1	Intergenic	novelGene_146394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1356	1703	772529	772182	NA	25	GCCATCACAGCATTGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLPRTTFLDSCHHPLTPGLCRGRAEEHRASSCCGLNVTLVSSAQAAAQHEALFLLESEPCVRFSPHFHVCLPNRHKARSVLESWRGCQGPLEGEALKSHFIKHPCSSKPSHEA	773884	771267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_771300_773900
915815	contig_16036_pilon	+	4066	1	Intergenic	novelGene_114805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	1831	2316	28917	29402	NA	50	AATGAAAACATATCTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQESISNHIMRRSKMASASSQNQESRNFPEKGNFLELLEAKYKRLIYRILQEIRKEIMQNADKAIEEIEKIREEHNDKFNRLQESIERQQSEIHKINNKISELDNSIEGHRSRIEEMEVRTREIEDKALDTNLYEEKSDKRILKNEETKNYVGFYQEE	27086	31152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_+_27100_31200
915816	contig_12654_pilon	-	2250	1	Intergenic	novelGene_129297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAAATTTATGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758223	755973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_756000_758200
915817	contig_5928_pilon	+	1155	8	Intergenic	novelGene_40367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCAGCCTGGGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213970	251835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_214563_217591_217681_220329_220383_221490_221589_229383_229465_230828_230935_249346_249421_251773
915818	contig_12437_pilon	-	3562	8	Intergenic	novelGene_169076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	71	junction_1	234.480232838158	134	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	131	1237	136889	74868	FALSE	15	CCCTGTTCTCTTGATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRGFPPSLPTEFHKMGSFRRPRPRFMSSPVLSDLPRFQAARQALQLGSNSAWNSVQTAVINVFKGGGLQSNELYALNENIRRLLKSELGSFITDYFQNQLLSKGLFFVEEKIKLCEGENRIEVLAEVWDHFFTETLPTLQAIFYPVQGQELTIRQISLLGFRDLVLLKVKLGDLLPLAQSKLPSSIVQMLLILQSVHEPTGPTESYLQLEELVKQVVSPFLGLSEDRGFSGPTYMLARRHSRVRPKVTLLNSASPMTTVSRPLNEMVLTPLTEQEGEAYLEKCGSIRRHTVANAHSDIQLLAMATMMHSGLGEEAGSEDKCLLLPPSFSPPHRQCSSEPNITDSPDELEEVAGASQEDEELNCASLS	137019	72542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_75263_85002_85130_87166_87308_98421_98514_104172_104231_115539_115589_134563_134645_136725
915819	contig_7870_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_109005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTGAATGATGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491763	489561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_489600_491800
915820	contig_3975_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_54943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2347154	2344433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2344400_2347200
915821	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
915822	contig_854_pilon	+	4508	1	Intergenic	novelGene_36340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGGGCTTCTTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972586	977094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_972600_977100
915823	contig_13612_pilon	-	3040	1	Intergenic	novelGene_157274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAGAGGGTCCTAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31239	28199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_28200_31200
915824	contig_10890_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_166795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCGGGGATGAAACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159444	161157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10890_pilon_+_159400_161200
915825	contig_6048_pilon	-	2817	1	Intergenic	novelGene_73301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATACAATATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2015059	2012242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2012200_2015100
915826	contig_6489_pilon	-	1328	5	Intergenic	novelGene_128963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	127	junction_1	306.889536315594	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	18	761	395604	389842	FALSE	50	AAAGAAACAACTTTATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDGSMGLWEVTDDVLTKSDARHNVSRVPVYAHITHKALKDIPKEDTNPDNCKVRALAFNNKNKELGAVSLDGYFHLWKAENTLSKLLSTKLPYCRENVCLAYGSEWSVYAVGSQAHVSFLDPRQPSYNVKSVCSRERGSGIRSVSFYEHIITVGTGQGSLLFYDIRAQRFLEERLSACYGSKPRLAGENLKLTTGKGWLNHDETWRNYFSDIDYFPNAVYTHCYDSSGTKLFVAGGPLPSGLHGNYAGLWS	395621	389274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_390001_390538_390718_392609_392773_393919_393986_395427
915827	contig_19558_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_164739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATAAAAAAGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_0_2500
915828	contig_12638_pilon	-	2327	1	Intergenic	novelGene_33074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCTGAAAAGTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137071	134744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_134700_137100
915829	contig_8452_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_48007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAATGATAATGAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295720	297391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_295700_297400
915830	contig_15518_pilon	+	1775	4	Intergenic	novelGene_127589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	251.384168157026	29	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3	488	11049	37386	TRUE	65	GCATTAAAAAATTAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_37273_37389_38035_38508_38555
915831	contig_3975_pilon	-	2044	13	Intergenic	novelGene_54843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	220.960827976363	1329	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	113	1051	2066301	2060338	TRUE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPI	2079253	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060339_2063837_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
915832	contig_5640_pilon	+	4460	1	Intergenic	novelGene_27295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1026	1334	1268017	1268325	NA	40	TTTAAAAATTTAGTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPGQANVKATVLPNDGKNTCFKTFGHQILARMGVVFFCIVCLFRLLFFQIQIHLTQKNHLSFHGSPLLEFRLLLVLRLPGWRGTTRDCRFFAGVLTTLRY	1266991	1271451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_+_1267000_1271500
915833	contig_11978_pilon	+	4623	22	Intergenic	novelGene_62937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1886	2248	978493	980911	TRUE	15	GGGAAGGGAGGGTGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTDQAWFFSFLSSFVAHVARVFALLVFDLRPSVNSSWIMGLASTNFSTSFPNAVHKSLYQSSSTSYYSICMILISSNVVNERQNKFYSGLDQHHIRVYVLLIPLQSLDDSSIGFQAAFP	976607	1000801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_978505_979252_979417_980041_980156_980838_980947_981063_981206_981761_981868_982381_982467_983632_983780_985167_985240_985570_985716_986637_986772_987381_987574_988451_988681_990290_990389_991157_991270_991611_991698_992358_992423_993262_993415_994977_995178_998149_998337_1000508_1000571_1000674
915834	contig_11902_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_176148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGCTTTCCTGACATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9803	7967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_8000_9800
915835	contig_12786_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_103447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATGTCCCCCCAAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625220	628131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_625200_628100
915836	contig_11258_pilon	-	1917	1	Intergenic	novelGene_67862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	42	533	371665	371174	NA	20	TGTCCTCTCTGACTAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYTAQSLPIENKAMVPSSSSWIKGTPFHGTQRHQSLPKLSWDLWCPGVATLCGVLGWDFIASSHSLSRIQPRGRQRSSIVGLLGLILRSGKAPTIKSLPSWYLKSHCQPFMHLNLIMSLPKSFYKADTPGKVSLEIPVPWLEFICWALLLLTLGRAAPALGTLGAPQSTEPQSLLA	371706	369789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_369800_371700
915837	contig_546_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_117256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745294	744349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_744300_745300
915838	contig_14680_pilon	-	2812	1	Intergenic	novelGene_132737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7071	4259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_-_4300_7100
915839	contig_15866_pilon	+	5974	1	Intergenic	novelGene_63661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGGCATAGTAGACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581726	587700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_581700_587700
915840	contig_10074_pilon	-	4394	14	Intergenic	novelGene_57082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	580	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTTTATACTAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67612	56593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_58120_59039_59178_59383_59569_59650_59811_59890_60049_60341_60479_60822_61006_61333_61440_62884_63080_63904_64074_64617_64752_64829_64996_65085_65181_66570
915841	contig_7963_pilon	-	2009	6	Intergenic	novelGene_58541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	110.856664211043	926	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	48	707	245666	240504	FALSE	70	AACTTTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRRGAPAGDLPGAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLAPLHQRIYCALSGSAADAQAVADMAAYQLELHGMELEEPPLVLAAAHVVRNISYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTLGGMLTRQPFAIGGSGSTYIYGYVDAAYKPGMSPEECRRFTTDAIALAMSRDGSSGGVIYLVTLTAAGVDHRVILGNELPKFYDE	245713	239201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_240632_241183_241326_241572_241703_242815_242948_243719_243788_245606
915842	contig_4797_pilon	+	4401	1	Intergenic	novelGene_6895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCACCTGCTCAGACATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288390	292791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_288400_292800
915843	contig_8291_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_99972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACCTTCATCTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834563	832363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_832400_834600
915844	contig_4426_pilon	-	2200	7	Intergenic	novelGene_15428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_6	672.092007590231	33	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	704	2112	87	2198	904546	820604	FALSE	65	GGAAGAAAAAAAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTDSDPGHTSENWGERLISSYRTYSEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSF	904632	820601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_895571_895641_904482
915845	contig_13421_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_166804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154342	155814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_+_154300_155800
915846	contig_7229_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_39875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATCAATTTTAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556694	1558631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1556700_1558600
915847	contig_15486_pilon	+	2743	7	Intergenic	novelGene_157309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	75.8230762293966	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	9	536	34567	104521	TRUE	25	GACTCTATCTTCAGTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLKQLDQRLFENYIELKADPIVGSLEPGIYAGCFDWKDCLPPTGVRNYLKEALVNIIAVHAEVFTVSKELVPRVLSRVVEAVSEELSRLMQCVSSFSKNGALQARLEVCALRDTVIIYLTPESKSSFKQALEVLPQLSSGADKKLLEELLNKFKSNMHLQLTCFQAASTMMKT	34558	106773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_+_34703_78816_78873_80703_80827_99883_99946_102096_102157_104430_104767_104811
915848	contig_9982_pilon	+	2023	4	Intergenic	novelGene_55772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	368.554835359227	28	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	88	1914	635612	641928	FALSE	30	GTCACATACAGTATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEKLVFAYESSVHSANVLLSLNDQRKKDVLCDVTVFVEGQRFRAHRAMLAACSSYFHARIVGQMDAELSITLPEEVTVKGFKPLIQFAYTAKLILSKDNVDDVCRCVDFLGVHNIEESCFQFLKFKFLDSTTDQQEGPRKECFLSHCQKTDLQLSPVDQKDLEIDEVEEFLESEHVPIPQCKLSRHQGDARASLALQDSTSQTSESMCSEKDTALTLPSLCPKYRKFQKAFGTDRVHSVDSSVKDSQVSPIQPNETPENECLGGVQDCADLQAILKCEETKTPVEHEETKKQDSASEHPAVKAEATPFAHSSAADPHGLYALSLLHTYDQYGDLNFASMQNTTVLTEKPLSGADGQEEHTLGGSQDLHLKSDPGPREDSSLASGDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDSPCQMQLSPAVARDVPEQMYSQKRFECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLKSVNCPFISTLSTEGCSGSLEIGNDDYVPEAQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESFSAREQECEVKLPFNEQRIISLSRNDFQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLVSVASFLLYRFH	608039	642037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_608063_635547_635846_638028_639376_641682
915849	contig_19735_pilon	-	1732	12	Intergenic	novelGene_167883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	66.6309684036877	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	742	1470	88775	66446	FALSE	70	AAAACAAAAACACAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQIYGECVDSYPYDFVALKRLQDTSSKLTEDHKEEQIENNSLTENLNKLVLLNEEANLGSEPATEDHKEKHFQMRDSGTPLFSNSENVAKDLLVDSLEGEDFEKEFSFLNNLLSPGSSSTSEFTQECQTAHGSPNTSLTSQEPSLGSEPLAHSSGFLPSQLFDLGLHAAGAFNSLARHRGSELPLPHMDNESVPSQSPKKLTSSPNNGNQDMSAWFSLFADLDPLSNPDAIGHSDDELLNA	112055	66183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19735_pilon_-_66562_75053_75144_77879_78138_83698_83774_85714_85759_87314_87401_88715_88815_90951_91123_93238_93438_100157_100231_101374_101544_111965
915850	contig_9463_pilon	-	3471	1	Intergenic	novelGene_83804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2806	3138	17925	17593	NA	20	GCAATCTGCCTCTTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRGWKSFKVPNSESLDCLEETVGRIMDVKGNSDEGSEGNEESYREILCGLREYIWCQQQNVVRNVNVKCASGEALKGNDGHVIGQWRRVVLFMQWQRICLNYVQMFDGR	20730	17259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_17300_20700
915852	contig_4508_pilon	-	4859	2	Intergenic	novelGene_177534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	882	junction_1	0	155	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	599	847	91454	91206	FALSE	20	TCTATTTTATTTTTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCTDSDVLEEDAEVYELRSRGKEKVRRSTSRDRLDDIIVLTKDIQEGDTLNAIALQYCCTVADIKRVNNLISDQDFFALRSIKIPVKKFSSLTETLYPPKGRQASRPSSVQFAPEQQEIVPANDSLSSSESAGSFLKEVDRDIEQIVKCTDTKRENLNEVVSALTAQQIRFEPDNKNTQRKDPYYGADWGIGWWTAVVIMLIVGIITPVFYLLYYEILAKVDVSHHSTVDSSHLHSGITPPSQQREMENGIAPTKGIHLGQQDDHKLYSQDSQAPAAQHKT	95398	87193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_91872_95217
915853	contig_4759_pilon	-	2955	1	Intergenic	novelGene_106348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATTCAAGTTAGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983409	980454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_980500_983400
915854	contig_13633_pilon	+	2266	13	Intergenic	novelGene_15319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	411.648380160652	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	234	1634	20259	49142	FALSE	65	TTAAAAAAAAATTTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5284	49774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5517_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
915855	contig_2161_pilon	+	558	3	Intergenic	novelGene_114955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	20.5	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGCACTTCTGGGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995892	1000862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_996086_996223_996314_1000587
915856	contig_8606_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_159389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1186	1518	21943	22324	FALSE	15	ACTCCCTCTACTTCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLYLIIKKTKVIKNFNLLGSTNQCPWKQQSRNQMTIALGKSAAKDLFAVFKSKDVTLRTKVRLTQAMVFSTASYACESWTMSKEDKEELMPLNYGVGKEY	20757	22777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_22003_22051
915857	contig_5039_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_64926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAAAAGGGCCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173425	1175559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1173400_1175600
915858	contig_15849_pilon	+	2570	6	Intergenic	novelGene_176060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	38.9389265388762	87	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1	885	89870	109280	TRUE	65	ATCTGGAAAAAAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCKTMATGVPSPAGPSSGQTCVLILIFTLLLQSLSVAVTYLYFTKELKQMQDKYSRSGVACFLKEDDSFGDPDDEDSMDNPCWQIKWQLRQLVRKMVMRIYEETTPTGQEKQQDSPYLGRERSLPRVAAHITGNSRRTSTFLPPSSGNEKALGQKIKTWESSRKGHSFLNNLHLRNGELVIHQTGFYYIYSQTYFRFQEKETVPTVSLEENRKKNKQMVQYIYKYTSYPDPILLMKSARNSCWSKDSEYGLYSIYQGGIFELKENDRIFVSVTNEQLIDMDQEASFFGAFLIG	89869	111267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_90020_97054_97193_100149_100193_106574_106680_108831_109312_109613
915859	scaffold_12124_pilon	+	2474	13	Intergenic	novelGene_22101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_12	194.687998260465	5	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1098	1463	879089	894124	TRUE	35	CAGACAGAGACTGGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRSRMTPVTHHSGIQLS	863026	895737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_863427_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_894078_894148_894465_894711_894994
915860	contig_15784_pilon	+	2972	3	Intergenic	novelGene_172486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	0	62	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGATATTGCTGAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94559	97748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15784_pilon_+_94714_94839_94930_95020
915861	contig_14661_pilon	-	2993	1	Intergenic	novelGene_47445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAGTGCTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68812	65819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_65800_68800
915862	contig_5917_pilon	+	4053	7	Intergenic	novelGene_122140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_5	20.0700163317212	105	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	534	1457	208205	278920	FALSE	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMILSASVIRVRDGLPLSASTDYEQNTGVQECRKYFKMLSRKLAQLPDRCTLKTGHYNINFISSLGVSYMMLCTENYPSVLAFSFLDELQKEFITTYNMMKTNTAVRPYSFIEFDNFIQRTKQRYNNPRSLSTKINLSDMQIEIKLRPPYQVPMCELGSANGVTSAFSVDYKGAGKISSGHQRLEPATLSGIVAFILSLLCGALNLIRGFHAIESLLQSDGEDFNYIIAFFLGTAACLYQCYLLVYYTGWRNVKSFLTFGLICLCNMYLYELRNLWQLFFHVTVGAFVTLQIWLRQAQGKAPDYDV	205315	281516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_205830_208185_208387_237352_237517_238545_238741_257010_257127_268315_268382_278719
915863	contig_17274_pilon	-	2649	11	Intergenic	novelGene_26579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	329.188228829647	22	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1567	2202	251759	232842	TRUE	35	ATTTTTTTTAAAGATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	259031	231550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739_252231_252363_252440_253139_254033_258905
915864	contig_5445_pilon	-	2771	5	Intergenic	novelGene_135440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	422	junction_3	265.707075555018	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTTAAAAAAGAGATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182318	169940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5445_pilon_-_170156_171151_173353_173435_173661_175154_175195_182228
915865	contig_2703_pilon	-	3224	10	Intergenic	novelGene_101834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGAGCAGCCTGCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1423313	1255942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1256132_1276409_1276610_1278881_1278970_1292398_1292632_1298441_1298512_1305351_1305422_1306568_1306676_1311286_1311457_1362117_1362249_1421347
915866	contig_2114_pilon	+	3369	1	Intergenic	novelGene_104274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGAGTAGAACTGCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591731	595100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_591700_595100
915867	contig_3382_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_124207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1431898	1434616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1431900_1434600
915868	contig_10437_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_38337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446567	448470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_446600_448500
915869	contig_12733_pilon	+	3755	3	Intergenic	novelGene_129609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	165	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATCCAAGCAGTCGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426140	430589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_+_427380_427509_429192_429755
915870	contig_2636_pilon	-	1171	1	Intergenic	novelGene_52038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTATGAATTATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7585	6414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_6400_7600
915871	contig_14666_pilon	+	1694	5	Intergenic	novelGene_39606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1833.65270703042	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	491	1393	484038	484940	FALSE	50	AAAAAAAAATGTCTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477259	485241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483866_483909_483946
915872	contig_14925_pilon	-	1576	7	Intergenic	novelGene_55313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	983.356567522122	9	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	100	513	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGRIRTYKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	130947	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112690_112809_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129483_130929
915873	contig_6208_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_52993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	242	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	814	1299	399696	399211	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSVSLNGICRNCGIGVFCCVYSQQQQNKCVHYIHNLDIFFDGLSVSTDIQERISNVASYRCALNGSLCWGFLSLGGCCLLVPFWPILPRVSQDCSALDLKLFLPCEYPTAALFPTVSSYFFKLQVAPYSLLEFSQGNDGNVSDFLSQMRTVLRWWLVGEI	400509	398500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_398500_400500
915874	contig_12638_pilon	-	1952	9	Intergenic	novelGene_33127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	1614	1952	172943	172605	FALSE	35	CCAGTGATAATGCATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPKNPRKSINNPPVQPKHFLFPYLFTWNYIHVKLRHKNLNIKIEQLFKSLSITKLHKNYQEFIQIGTTWSCYTLQNKCIIFKRFSAMFVLKFNYISYRSITANLQSLQFVT	191805	172604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_173560_178085_178277_180789_180867_180956_181002_182928_183048_183450_183603_185490_185617_191148_191356_191725
915875	contig_4305_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_136642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCGTCAACCCAAATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3127	5023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_3100_5000
915876	contig_12638_pilon	-	2349	4	Intergenic	novelGene_33066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAACTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453905	68823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_69404_257687_257697_442441_443168_452871
915877	contig_11720_pilon	+	2088	5	Intergenic	novelGene_43865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_3	3815.59224596916	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91857	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_93261_94959_95061_95383_95486_95901_96052_98299
915878	contig_9325_pilon	-	2499	2	Intergenic	novelGene_158812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	423	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTCTCTCAAATATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29027	15555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9325_pilon_-_15979_26951
915879	contig_8712_pilon	-	1705	2	Intergenic	novelGene_58843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTGGCCCCGCCATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585607	576278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_576371_583994
915880	contig_9363_pilon	-	2008	15	Intergenic	novelGene_6601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	621.14866027648	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	206	1147	759796	755663	TRUE	20	TCAGCCAGCATGAGCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQVTSTIHPTLKKDFLLTLTSWLRLRRPQL	761773	753967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756086_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687
915881	contig_10426_pilon	-	2771	1	Intergenic	novelGene_144661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1458	1766	48013	47705	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEAVKDFILLGSTINIHGSSSQEIESRIALVKSGAKDLFKELKSKDVTLKTKVHLTQAMVFSIASYACESWTMNKED	49470	46699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_46700_49500
915882	contig_7644_pilon	+	3618	2	Intergenic	novelGene_64249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACAGTTTTCTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168660	172870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_169575_170166
915883	contig_6576_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_42355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCAGGTGCCACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751908	750424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_750400_751900
915884	contig_11303_pilon	+	1500	2	Intergenic	novelGene_178964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	137	583	1604	2883	FALSE	60	GCAAGGAAAAAAAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQ	1467	3800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11303_pilon_+_2047_2879
915885	contig_15327_pilon	-	1315	5	Intergenic	novelGene_70643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2538.66582824522	19	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	77	487	901528	900904	TRUE	35	TTGAATGTATAGAGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902104	899720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899924_900278_901033_901126_901281_901400_901536_902035
915886	contig_6364_pilon	-	1418	1	Intergenic	novelGene_51813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAATGATAAATTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492266	1490848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1490800_1492300
915887	contig_9833_pilon	+	4328	2	Intergenic	novelGene_68504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1195	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3604	4116	216973	217485	FALSE	35	TCCACTATATACTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAAVSQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKRISPITSCFVSHWKLCEAAFSYPVCWSPIGVRDGGSALR	213059	217697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_216182_216491
915888	contig_2933_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_111374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037043	1038012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_1037000_1038000
915890	contig_14666_pilon	+	1235	3	Intergenic	novelGene_39588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1754.5	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	168	935	479860	484940	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASILQEVTTATRPCSWTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479911_484223
915891	contig_4845_pilon	-	3955	16	Intergenic	novelGene_53629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_15	77.1447124997343	195	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	229	1671	265176	228128	FALSE	20	TTTTTTTCTGTACTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METDLSSQDRKDLDKFIKFFALKTVQVIVQARLGEKICTRSSSSPTGSDWFNLAIKDIPEVTHEAKKALAGQLPAVGRSMCVEISLKTSEGDSMELEIWCLEMNEKCDKEIKVSYTVYNRLSLLLKSLLAITRVTPAYRLSRKQGHEYVILYRIYFGEVQLNGLGEGFQTVRVGTVGTPVGTITLSCAYRINLAFMSTRQFERTPPIMGIIIDHFVDRPYPSTSPMHPCNYRTAGEDTGLTYPSVEDSQEVCTTSFSTSPPTQLMVPGKEGGLPLAPNQPAHGAQADQERLATYTPSDGAHCAATPSSSEDTETVSNSSEGRASPNDVLETIFVRKVGAFVNKPINQVTLTSLDIPFAMFAPKNLELEDADPMVNPPDSPETGSPLQGSLHSEGSSGGSSGNTHDDFVMINFKPAFSKDDILPMDLGTFYREFQNPPQLSSLSIDIGAQSMAEDLDSLPEKLAVHEKNVREFDAFVETLQ	284097	225843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_228206_230043_230173_230552_230670_230890_230969_231554_231670_233978_234116_245973_246068_246923_247023_247373_247471_248206_248248_252334_252476_253656_253704_263479_263600_264064_264146_265107_265190_283882
915892	contig_4689_pilon	-	1862	4	Intergenic	novelGene_165404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	29.0287214094363	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCAAAATTGTCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091864	1084184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1084548_1084918_1085003_1085500_1086743_1091691
915893	contig_762_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_135950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260085	261345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_+_260100_261300
915894	contig_9363_pilon	-	1515	11	Intergenic	novelGene_6588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1035.11508538906	6	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	178	1248	786587	754063	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSVSGPSLDSALVGKNKEKHNRSSLK	787943	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754116_773871_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
915895	contig_9609_pilon	-	6811	16	Intergenic	novelGene_23018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	222	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATCACTACTTACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333322	318183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_318916_319040_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406_324476_325130_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330303_331386
915896	contig_5253_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_61568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACAACTACTTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216267	213762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_213800_216300
915897	contig_9653_pilon	-	3776	11	Intergenic	novelGene_48296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_6	723.140124733789	8	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	327	1451	1018271	1007791	FALSE	70	GCAAAAAAAAAAAAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEGIQCNFP	1021092	1005465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018025_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006
915898	contig_4232_pilon	-	2797	4	Intergenic	novelGene_63452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	100.915806492343	236	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTAGAATTGCTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546375	542772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_544131_544543_545270_545475_545650_545836
915899	contig_11594_pilon	-	2455	1	Intergenic	novelGene_80915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339426	336971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_337000_339400
915900	contig_4659_pilon	-	1806	8	Intergenic	novelGene_118243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	240.382348497946	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	10	429	860030	843259	TRUE	65	AAAAAAGAAAAAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGHLPSPL	860039	820198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_821200_836792_836944_838858_839042_843216_843280_843322_843360_847628_847730_853789_853937_859916
915901	contig_8027_pilon	-	2878	1	Intergenic	novelGene_158834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTAATTTTTCTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245193	242315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_242300_245200
915902	contig_7612_pilon	-	2282	4	Intergenic	novelGene_170354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	72.3985880770858	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	422	1987	57595	35290	FALSE	15	ATTTTTGTATGGTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVVFEDLAVDFTQEEWALLDFAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQQGNNERIILQFMKNDSWSSMLGEICEFHGIEDQHNNQRNPVRSHTIEIICESKEGNIKKTKENNQCGKPFSQIANLIRLKKTLARVYSSECHRCKETFVDHSLFNHHITYHTGCNTYQCKEYGVTCISSSYLRTHVETLTGEKLYKCKECGIVCSCSSSLITHTRTHSREKPYCKCKKFREDIGDVSALVKHKKTQSGKAFSSSFISKRLRTHSRERTCECKECGKVFSCSSSLRKHIRTHSGDRPYKCKECGKAFTRSSSLNTHTRTHSGERPYRCKECGKAFFYSSSFTTHMRIHSGEKPYECKQCGKSFCDISPLNRHIKTHSGERPYECKECGKAFNRSSHLTFHIRTHRGERPYECKECGKAFSWPSALTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSSSLTKHVRTHSGERPYECKECGKVFISSSSLTKHIRTHNGDGPYKCKECRKAFSWPSALTRHIRTHSGERPYEFKE	58016	34994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_36593_37087_37221_38230_38358_57592
915903	contig_11056_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_130376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGTTCCTAGCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349419	351696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_349400_351700
915904	contig_6276_pilon	-	6790	13	Intergenic	novelGene_174125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	3988	4368	236760	219126	TRUE	5	CCGCCTGCTATGCTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGSWFAIWAICLRTSFFVMMPRSLPLRVTRHCRSPSFRKMSTTVSMGVWSVTVKGLRFRMRRSFRGCGLLAGSSGGSSVKYMMELLTMPSCLCLAFFIARISSLLWANPMRRSESLETTTGKPL	240747	174403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_174661_176355_176619_197198_197355_198290_198397_202898_203081_207032_207156_211419_211627_211728_211810_213232_213778_217115_217302_218809_219212_225299_225516_236681
915905	contig_5643_pilon	+	1220	11	Intergenic	novelGene_38775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2935.91465134803	14	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	170	1012	236108	237983	FALSE	10	GCCACCTCTTTGTTGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAPAGCGWSLPFVQCQVAKGKRRFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233604	238191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233677_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236887_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
915906	contig_5380_pilon	-	2462	2	Intergenic	novelGene_178549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1941	2258	296755	296438	FALSE	55	GGAGAAACAATAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISRIEDKHTDTTLFQENSEKGTKKNEETLRVMWDTIESKNLGVIGVPEQGEKTENT	424210	296233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5380_pilon_-_297721_423235
915907	contig_18919_pilon	+	6339	1	Intergenic	novelGene_156031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2650	3015	128246	128611	NA	30	CATTACTAATCAAGGGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEETGWTVLKTGLPLRGYRFHHQAQLHLPHVSVQGACQETWWTRPARHRAEGTGNGVRGDERTEQPDPSLQWHTLLGALWSGFSHGIPWTASPPELLALGQQSSCSEKHSSSHTRKHWD	125596	131935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_125600_131900
915908	contig_8820_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_79320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	445	966	305702	305181	NA	15	TTCCTCTTTGGAACGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLEVLIAATKLHRVTFFYTSGIGVKSHHTDPGFVPVASGYYAAVYKRPDRHQVILSARHDVLAIWAPAHTEQAPEVALHGTVQLHRVKVKHPQKPVLAHARQELAIWGESKLVEGPLAHCPLEERVPRGFALARVHGEALSLLQELVVGGCGATSVLHIIQVHTPARVSY	306146	304547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_304500_306100
915910	contig_6635_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_127024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAGAGCTGACAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456328	458445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_456300_458400
915911	contig_4091_pilon	+	1079	2	Intergenic	novelGene_173025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	326	763	13212	13649	FALSE	70	AAACCTACAAAAACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	12228	13965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12255_12912
915912	scaffold_13505_pilon	-	1897	10	Intergenic	novelGene_111524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_5	416.309209632325	198	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	2	1156	603285	594258	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEVSSPQREHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603286	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
915913	contig_11338_pilon	+	3266	1	Intergenic	novelGene_6314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	2013	2411	247359	247757	NA	35	TCAGTGACATTAATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKKGIRERRKQNKETNKQKPQNNNNNKKQTNKQKNKRKEMPSGMSLCICAEKGSSIKLRGTAQLEGAPKPRKETENKQIRANKKALGVPPAWRHGPGSSFKVEQCFAAFQEEAKMAHRARYLRERRGRW	245346	248612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_245300_248600
915914	contig_7165_pilon	+	3407	2	Intergenic	novelGene_116893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1305	junction_1	0	111	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1663	2031	1045174	1045542	FALSE	30	TGAGATGGATTGACACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVALECRVAKLKGRNDEVKELNRRFQRATKEDKIKYIMKCAKTWTGVRKPKGKNMLSISQAERTEEKIQASSCNIEGFYKENIKQSRKYQKKMEGIHRVTVPKRIGQRSTISGGSI	1016798	1046918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1016870_1043582
915915	contig_5958_pilon	-	2085	8	Intergenic	novelGene_140087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCCGTCTCATCGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184301	151790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_-_151935_154864_154981_160820_160868_167905_167969_176701_176794_177736_177821_181665_181718_182814
915916	contig_10324_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_7772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAAGATTCCCCCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79309	80576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79300_80600
915917	contig_12644_pilon	-	2186	13	Intergenic	novelGene_44487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	499.929738118824	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	8	1786	1151228	1026304	FALSE	60	ACTTGTTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQELTFVFVSFPFPSITTPPSLPLLPQQFQMIKTSYTRLGFFRIPPRRCFSIS	1151235	1025903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026459_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
915918	scaffold_12124_pilon	+	2497	8	Intergenic	novelGene_22005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	155.064831734395	45	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	179	1066	799011	807554	TRUE	45	AGATACAAATGGATGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791857	810339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816
915919	contig_16647_pilon	-	5416	26	Intergenic	novelGene_170303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_25	139.155947052219	233	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	330	2414	343701	282666	TRUE	50	TAATTAAAAGCTATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATDHGSESDKHYRKGLLGELILLQQQIQEHEEEARRAAGQYNTSYTQQKRKVSDKEKIDQLQEELLHTQLKYQRILERLEKENKELRKLVLQKDDKGIHHRKLKKSLIDMYSEVLDVLSDYDASYNTQDHLPRVVVVGDQSAGKTSVLEMIAQARIFPRGSGEMMTRSPVKVTLSEGPHHVALFKDSSREFDLTKEEDLAALRHEIELRMRKNVKEGCTVSPETISLNVKGPGLQRMVLVDLPGVINTVTSGMAPDTKETIFSISKAYMQNPNAIILCIQDGSVDAERSIVTDLVSQMDPHGRRTIFVLTKVDLAEKNVASPSRIQQIIEGKLFPMKALGYFAVVTGKGNSSESIEAIREYEEEFFQNSQLLKTSMLKAHQVTTRNLSLAVSDCFWKMVRESVEQQADSFKATRFNLETEWKNNYPRLRELDRNELFEKAKNEILDEVISLSQVTPKHWEEILQQSLWERVSTHVIENIYLPAAQTMNSGTFNTTVDIKLKQWTDKQLPNKAVEVAWETLQEEFSRFMTEPKGKEHDDIFDKLKEAVKEESIKRHKWNDFAEDSLRVIQHNALEDRSISDKQQWDAAIYFMEEALQARLKDTESTIENMIGPDWKKRWLYWKNRTQEQCVHNETKNELEKMLKCNEEHPAYLASDEITTVRKNLESRGVEVDPSLIKDTWHQVYRRHFLRTALNHCNLCRRGFYYYQRHFIDSELECNDVVLFWRIQRMLAITANTLRQQLTNTEVRRLEKNVKEVLEDFAEDSQKKIKLLTGKRVQLAEDLKKVREIQEKLDAFIEALHQEK	364357	277047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_280040_282655_282731_304783_304895_305420_305515_307299_307417_309341_309483_313317_313398_316090_316200_317703_317857_318722_318889_322238_322316_323078_323144_323999_324116_324987_325061_325157_325231_327948_328080_328844_328945_329025_329098_329493_329569_329726_329808_342917_343032_343629_343717_345308_345414_347004_347059_352215_352327_364313
915920	contig_7720_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_155751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335147	333161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_333200_335100
915922	contig_10437_pilon	+	2720	4	Intergenic	novelGene_38146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	229.143817042679	1	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	353	715	160149	162086	FALSE	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFWHKLGCCVVEKPQPKKKRRRIDRTMIGEPMNFVHLTHIGSGEMGAGDGLAMPRRYAAPSRSLLEPVTPGPLFSLSNSASGLGGWTPSTPSGCSPSWRWDQGSRTDHVTTGWPEELS	156677	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_156768_159886_160203_160732_160844_161888
915923	contig_9706_pilon	-	3720	2	Intergenic	novelGene_20993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448930	445109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_445996_446096
915924	contig_9216_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_163516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	735	1130	646671	646276	NA	60	TTAAAAAAAAAACCTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPLLCLQPSLGLRWISKTCFTSAAEYSVPPGSKQLLRVAFQKLLGLLNCEEGMALAREAWDQPFDLPEPTPLPPSSLSASATVPKSAESALSSPSAGRGPWTIMCPAGHTLCSPKLHKTVGGSLLQGGW	647405	645032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_-_645000_647400
915925	contig_19098_pilon	+	2465	1	Intergenic	novelGene_65805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTTTGTGTGTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256766	259231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_256800_259200
915926	contig_10609_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_123904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCCCAGGAAATCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178429	176529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_176500_178400
915927	contig_2940_pilon	-	512	4	Intergenic	novelGene_81931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4233	junction_3	6336.9463203239	76204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	51	458	722201	717705	FALSE	15	TCTGGTATGTTTCACCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCLQRWRPSPIGTMAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE	723513	717650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720954_722105_722207_723468
915928	contig_5062_pilon	-	3445	2	Intergenic	novelGene_157843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	443	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTACAGCCTAGGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653895	627960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_628541_651030
915929	contig_10765_pilon	+	3793	27	Intergenic	novelGene_122949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	53	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3173	3556	406312	411938	TRUE	50	AATAAAATCAATGGCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAQKQLLLTDTQQAGHQGVQGRMLLSRRKFQRGIIEAFNKVSKAGDIHFIFNSSSNWDKNFNKKPSQGMLDVFVFDLEEIMCTFLHKLKRSLKVLHWIHLNPKEFHPHYQADNALNHIRALLFMP	327787	417393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_328253_328566_328666_340893_341047_343478_343591_345180_345343_347444_347621_348093_348190_350158_350214_354087_354212_354836_355031_355548_355808_360666_360754_363167_363354_365290_365550_380017_380123_384543_384677_386691_386867_395419_395508_398274_398382_399140_399245_406278_406382_409385_409480_409574_409668_411811_411982_416687_416765_416852_416937_417360
915930	contig_9121_pilon	+	3175	1	Intergenic	novelGene_134433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTCCTCAAGAGCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56589	59764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_56600_59800
915931	contig_16411_pilon	+	1245	2	Intergenic	novelGene_77304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTGTCAAATGTACCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99679	243566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_99778_242419
915932	contig_821_pilon	-	3883	3	Intergenic	novelGene_149421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1720	2175	415070	414615	TRUE	35	TAAGAACTAAGGTGCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLRSSSKRTFQIYPEIQRCQCYGNIHTPTRKNVNTTIIQIYTPTSNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDGNAKVGNEKEGLILGKYGLGDRNNVGDCMIDFCKTNDFIADTFLQQHKWQLYMWTSLDGKHRSEINYICGKRR	421430	347153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_348673_414425_415522_420162
915933	contig_5628_pilon	-	2490	16	Intergenic	novelGene_157575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	54.9047660347746	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	897	2030	427589	406035	FALSE	45	TTAAAAAAATATGGAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEKGSAAGSEQNLMCSFLQLLGDRWGRNGPRGWCVIPSDDPFVLYIYAAPQALPSKKLEAFLCHETRRTGWYQLLLLDILIKDES	434506	405574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_406140_411655_411803_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427629_427864_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266
915934	contig_12624_pilon	+	3419	2	Intergenic	novelGene_60990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	368	junction_1	0	35	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAACCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96186	99707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_98241_98342
915935	contig_3797_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_120092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349892	348702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_348700_349900
915936	contig_5799_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_50265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATCTATAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249772	247145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_247100_249800
915937	contig_4678_pilon	-	2352	2	Intergenic	novelGene_126046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCTTGATCCATTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561585	558940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_559987_560279
915938	contig_2161_pilon	+	2548	1	Intergenic	novelGene_114974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGAAGTTGGTGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062748	1065296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1062700_1065300
915939	contig_15327_pilon	-	1244	3	Intergenic	novelGene_70659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_2	1286	233	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901536_902035
915940	contig_1996_pilon	-	4403	1	Intergenic	novelGene_131874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	180	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1905	2339	135876	135442	NA	25	TTTTATACTTTGGGTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIPIYAPTTKAKDEETEDFYQLLQSEIDQKRNQDALIITGDWNAEAGNKEGLVAGIYGLGNRNDAGDHTTEFCKTSDFFIAVPFLNNKNGDYTCGPCQMEYAGIKLTTSVERDGGKAHYHQLEQGQGLTAELTINCSYASSI	137780	133377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_133400_137800
915941	contig_15327_pilon	-	6006	1	Intergenic	novelGene_70550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTTGGGAATTCCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556526	550520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_550500_556500
915942	contig_12964_pilon	+	3352	2	Intergenic	novelGene_131739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGCAGCTCAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652114	689297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_654373_688203
915943	contig_9415_pilon	+	634	1	Intergenic	novelGene_109951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2506242	2506876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_2506200_2506900
915944	contig_4071_pilon	+	1927	2	Intergenic	novelGene_151861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCAGAAGTATTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22488	25635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4071_pilon_+_24036_25255
915945	contig_7806_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_157552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGTGCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290913	293621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_290900_293600
915946	contig_6740_pilon	-	2723	1	Intergenic	novelGene_142654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTATTGTGATCCCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36790	34067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_34100_36800
915947	contig_14546_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_157443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCACCTAAAGCACAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516308	515270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_515300_516300
915948	contig_4531_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_47908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGCTGATGGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376383	375072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_375100_376400
915950	contig_3942_pilon	+	576	5	Intergenic	novelGene_128766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5889.65280704219	473	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAGTAACTGGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792277	795503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793680_793794_793882_795075_795179_795313
915951	contig_15353_pilon	-	2958	3	Intergenic	novelGene_151956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAATGAAGGTCCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271630	82573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_82874_83361_84056_269666
915952	contig_7695_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_41684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACTAACAAAATATAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1060354	1061339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1060400_1061300
915953	contig_4350_pilon	-	3556	1	Intergenic	novelGene_136367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	100	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2106	2435	44604	44275	NA	35	CGACTAAGTAGGATTCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTITVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISELDLTELYRTLHPTAAR	46709	43153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_43200_46700
915954	contig_9752_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_122035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTACAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191745	190904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_190900_191700
915955	contig_2830_pilon	-	3000	2	Intergenic	novelGene_165850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1781	2254	685720	685247	FALSE	35	ATGAGAGGCGGGACCAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLKIENQKARTLSAFLKLKELKKKFKPRVAIVKDSMEKILNNAGSIKRRLKEYTESLHQKELINVQPFQEVACDQEPMVLKEEVQAALKALVKNKSPGIDGIPTEMFQQMDAELEVLTRLCQEIWKTAIWTTNWKRSIFVPIPKQGDPTECRNY	702414	684500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_686719_701632
915956	contig_18990_pilon	+	3092	2	Intergenic	novelGene_177451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	12	junction_1	0	136	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2657	2995	5649	5987	TRUE	55	CAAGAAAAAAAATGTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAPEDYKYLLVFIDTFTNWVEAFPCRTEKATEVEKHLLNEIIPHFRLLVSTGSDNRPRFVTLVVQWVAPAQDINCKLHTAWRPQYSGKVEQAKQTLKRHVAKLCQETKLV	2992	20065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18990_pilon_+_5990_19970
915957	contig_3866_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_112408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACTGATAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192875	195017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_192900_195000
915958	contig_16126_pilon	-	2213	1	Intergenic	novelGene_141870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAAAAAAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26806	24593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_-_24600_26800
915959	contig_4486_pilon	+	2809	1	Intergenic	novelGene_38620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	368	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTGGAATACAGGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415183	417992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_415200_418000
915960	contig_5686_pilon	-	2169	2	Intergenic	novelGene_45490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCTTTTTGCTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242133	239863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_239932_240032
915961	contig_5031_pilon	+	2497	2	Intergenic	novelGene_133184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGATTCTTTGGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22623	25310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_24373_24562
915962	contig_6374_pilon	+	3061	1	Intergenic	novelGene_158433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAATGAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61204	64265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_61200_64300
915963	contig_8631_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_121958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCTGTGCATAGATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714873	712731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_712700_714900
915964	contig_202_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_127074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1005	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGAAGGTTTACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285389	287640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_285400_287600
915965	contig_6975_pilon	+	3086	1	Intergenic	novelGene_74294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	136	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431932	435018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_431900_435000
915966	contig_14441_pilon	+	2541	4	Intergenic	novelGene_100577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	5	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1960	2307	116876	117560	FALSE	15	GCCTACGAGTGTCTCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPTTSGERPGPSPSPRTSVPWSGATVASPRVSEPLSQPPMSVRWTVPGEPGGTGVELGARATCSQAAPRPVSYQRGVLSATVLYEVLLGKAALYAVLVSALVLMAMAKKKES	111198	117794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111381_115098_116957_117097_117344_117539
915967	contig_3862_pilon	-	2395	1	Intergenic	novelGene_137427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTCATATCAGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613102	610707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_610700_613100
915968	contig_15087_pilon	+	4203	1	Intergenic	novelGene_37226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGCGTTGCTGCGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129271	133474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_129300_133500
915969	contig_614_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_132606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1662	2258	214272	213676	NA	40	TCCAGAGGCAAGATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYFAKEDIQTANRHMRKCSRSLAIRDMQIKTTTRYHLTPTRLALVQKTQNNKYWRGCGETGTLIHCWWECKIVQPLWKSIWHFLIKLEIEVPHHPPIPLLGIYPRVIRAITQIDICTPMFTAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWINRLWCIHTMEYYTMIKNNNESVKHLLTWRNLEGIMLSEFSQSQNDKYCIRLLL	215933	212877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_212900_215900
915970	contig_19352_pilon	-	3351	1	Intergenic	novelGene_122347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGATAAACAACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91090	87739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_87700_91100
915971	contig_18189_pilon	-	8412	2	Intergenic	novelGene_170753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	245	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	222	1508	35584	34298	FALSE	35	CCTAAGATACATAGGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQELFPGEDLGNPFLQDKGLEHMAVIYKEIPLGEQGDECDDYGGNFSLCCSPIQRQNVRPTTRPQDDELFGQTFLQKPDLSVCQIVHGGEDSGKHDGKTVDWESVVLNYSHRMAQPAKPYACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQNSHLLRHQVIHTGEKPYECQECGKAFRQSSALMQHQKTHTGKRPYECRACGKDFSRSASLRKHERIHTGEKPYQCKECRKAFSQSSGLSQHRKIHTLKKPHECELCGKAFCHRSHLIRHQRIHSGKKPYKCEECEKAFSQSSNLIEHRKTHTGEKPYRCHKCGKAFSQSSSLIEHQRIHTGEKPYECGECGKAFCHSSALIQHQRIHTGKKPYACNECGKAFRHRSALIEHYKTHTREKPYECNTCGKSFRGSSHLIRHQKIHTGEKL	39985	27393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_35721_39900
915972	contig_9463_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_83848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGTAAAAACTGTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221982	219431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_219400_222000
915973	contig_8065_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_107332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTCATAGTCATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139079	137032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_137000_139100
915974	contig_7870_pilon	-	3753	2	Intergenic	novelGene_108929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTCTTTCATTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275105	270934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_272848_273265
915975	contig_3948_pilon	-	2833	13	Intergenic	novelGene_53286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_7	134.361116853881	10	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	23	796	1458393	1426958	TRUE	15	TTCCCCGGCAGATCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLSWSLLLLSLICETRAFYVPGVAPINFHQNDPVEIKAVKLTSSRTQLPYEYYSLPFCQPRKITYKAENLGEVLRGDRIVNTPFQVLMNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFETSKQMRRVHAPCLRGPTPHPKKLTLPRRISYSSPTPYTGRKVTSNGPRGGILT	1458415	1417071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429120_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1435012_1439634_1439749_1458390
915976	contig_13403_pilon	+	4869	1	Intergenic	novelGene_158098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	52	309	86794	87051	NA	35	TGAGGTCAATTTATAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVTIKIWDVGGQPRFRSMWERYCRGVYMIDATDREKIEASQNELPNLLDQPQLQGIPVLVLVNKTHLPNASDGKQLIEKMNLSAIQDREFDAIQFLAKKRII	86742	91611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13403_pilon_+_86700_91600
915977	contig_14744_pilon	-	2306	9	Intergenic	novelGene_66119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.291756500681	6	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	66	1001	1597041	1590918	TRUE	5	TTTCTCCTGTGAGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNCGRNVLVKDLKTHPEVCGREGEEKRDAVVLPPNADDEPWSQDGMWIASHLLRQIEALDPPMRLPRGHLRSFESDLIHSRTTNQRNMTTRFPIQNNLLEEQERQERNRSRQRPKEGGEESANLDFMLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQVLAVTLHVPYLRSVWAALPPKWWTTPMTSSRSFCSRLTS	1597106	1586133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1586987_1588659_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591675_1591755_1592980_1593188_1593928_1594335_1596803_1596858_1596969
915978	contig_3747_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_24974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAACCCCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237325	234961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_235000_237300
915979	contig_18108_pilon	-	3088	3	Intergenic	novelGene_33488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	337	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACAAAGATCCGTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254993	247183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_247267_250795_250999_252191
915980	contig_19957_pilon	-	1757	1	Intergenic	novelGene_57737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAGTTATATGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309144	307387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_307400_309100
915981	contig_7919_pilon	+	2110	1	Intergenic	novelGene_28071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTATGAAAGAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1066921	1069031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1066900_1069000
915982	contig_1948_pilon	+	2170	5	Intergenic	novelGene_31152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	264	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGGGAGGTGCCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404863	414261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_406721_406908_406977_409654_409713_411643_411724_414154
915983	contig_299_pilon	-	3067	1	Intergenic	novelGene_129443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTCATTTTCCCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925252	922185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_922200_925300
915984	contig_7412_pilon	-	2056	3	Intergenic	novelGene_76301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	9.5	96	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	347	1624	328722	326809	FALSE	20	GTTGGTGTGATTTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEEANDDKKPTTKFELERETELRFEVEASQSVQLELLAGMAEIFGTELTRNKKFTFDAGAKVAVFTWHGCSLQLSGRTEVAYVSKDTPMLLYLNTHTALEQMRRQAEKEEERGPRVMVVGPTDVGKSTVCRLLLNYAVRLGRRPTYVELDVGQGSVSIPGTMGALYIERPADVEEGFSIQAPLVYHFGSTTPGTNIKLYNKITSRLADVFNQRCEVNRRASVSGCVINTCGWVKGSGYHALVHAASAFEVDVVVVLDQERLYNELKRDLPHFVRTVLLPKSGGVVERSKDFRRECRDERIREYFYGFRGCFYPHAFNVKFSDVKIYKVGAPTIPDSCLPLGMSQEDNQLKLVPVTPGRDMVHHLLSVSTAEGTEENLSETSVAGFIVVTSVDLEHQVFTVLSPAPRPLPKNFLLIMDIRFMDLK	329536	326376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_327481_328116_328745_329212
915985	contig_8687_pilon	+	3018	4	Intergenic	novelGene_169679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	29.227080289044	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTGACACAAACCTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326397	340227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_328469_328570_328670_329958_330145_339565
915986	contig_11316_pilon	+	1011	2	Intergenic	novelGene_122610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACGATCATACAAAGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137036	138853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137866_138671
915987	contig_20058_pilon	+	3043	1	Intergenic	novelGene_109287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAACAATACAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36027	39070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_+_36000_39100
915988	contig_11316_pilon	+	1379	2	Intergenic	novelGene_122618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	403	1293	137674	138777	FALSE	45	CAAAGACGACCCACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKALLITLAATSITAVYSTRIVFFVLLGQPRYPILIQINENNPFLINAIKRLILGSIFAGFIISSSLTPTTVPHMTIPHHLKFAALAITLLGFALAIELSLFTYHLKFDFPLYTHKFSNILGYYPTIIHRSPPFHVLNTSQNLASTIIDLAWLEKAIPKGLASIQKFASTSISNQKGIIKLYFLSFLISLTLGLLLTI	137271	138863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137975_138187
915989	contig_13292_pilon	-	1498	2	Intergenic	novelGene_142940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAGCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232683	224123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_225567_232628
915990	scaffold_4438_pilon	+	1346	2	Intergenic	novelGene_174550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCACTTCCCAGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421167	422570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_422468_422524
915991	contig_7151_pilon	-	3537	4	Intergenic	novelGene_40793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	856.070609756513	12	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAATGTCTTTGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546320	528878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_531757_531982_532900_545852
915992	contig_10446_pilon	-	4277	11	Intergenic	novelGene_162487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	339	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGAAGGTGTGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	822729	771889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_772588_772854_773000_773311_773381_783896_783974_789574_789648_791476_791685_799864_799980_800944_801107_809339_809573_816514_816669_820386
915993	contig_1008_pilon	-	3593	5	Intergenic	novelGene_121618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_2	72.8607404573958	309	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	29	601	1126350	1116371	FALSE	10	TTTTTTGAGTGTGCCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGRGLLATTMAGDVGGRSCTDSELLLHPELLSQEFLLLTLEQKNIAVESDVRINKDGLTDLYVQHAIPLPQRDLPKNRWGKTMEERREHHEIERETKRNTAVDGVRKRPLIVFDGSSTSTTIKVKKTENGDNDRLKPPPQNHDLTHRKSPSDPVKLPPLSPGGTTSVKLKRAAPKEEAEAVNNLKPPEAKRKIQYVTWP	1126378	1113378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1116428_1118703_1118827_1118952_1119080_1123561_1123729_1126251
915994	SIRV6	+	913	8	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	553	450	337	44	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	15	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	93	584	1733	10736	TRUE	20	TAATTGGCATCGCGCGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
915995	contig_14683_pilon	-	2430	2	Intergenic	novelGene_166055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGTAGCCATCTTCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176338	173678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_174154_174383
915996	contig_7179_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_78119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGGGTCCAGTTAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757208	759708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_757200_759700
915997	contig_16211_pilon	-	3551	1	Intergenic	novelGene_150100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAATATTTAAATTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206044	202493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_202500_206000
915999	contig_3956_pilon	+	2358	10	Intergenic	novelGene_14881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1056.94854284503	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	458	1834	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283900_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
916000	contig_9345_pilon	+	1710	2	Intergenic	novelGene_24567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	881146	883249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_881254_881646
916001	contig_16625_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_171115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTATATGGGATCAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58083	60692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_58100_60700
916002	contig_5039_pilon	+	1190	1	Intergenic	novelGene_64802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTACTTTTCTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186986	188176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_187000_188200
916003	contig_11709_pilon	+	7202	13	Intergenic	novelGene_168203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	111.067421966219	1075	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	805	2418	71	2488	6373	65862	TRUE	65	GTGTATAAAAAAAAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGINANSQMHGQGPSQPCGAMPLGRMPSAGMQSRPFPGNMSSMTPSSPGMPQQGGPGMGPPMPTVNRKAQEAAAAVMQAAANSAQSRQGSFPSMNQSGLMASSSPYSQPMNNSSGLMNTQAPPYSMTPNMVNSSTASMGLADMMSPGESKLPLKTDGKEEGPPQPESKSKDSYSSQGISQPPTPGNLPVPSPMSPSSASISSFHGDESDSISSPGWPKTPSSPKSSSSTTTGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDTKKQPKLQPPSPANSGSLQGPQTPQSTGSNSMAEVPGDLKPPTPASTPHGQMTPMQGGRSSTISVHDPFSDVSDSSFPKRNSMTPNAPYQQGMSMPDMMGRMPYEPNKDPFGGMRKVPGSSEPFMTQGQMPNSSMQDMYNQSPSGAMSNLGMGQRQQFPYGASYDRRHEPYGQQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDVYNMQYGGQQQEMYSQYGSSYSGPDRRPLQGQYPYPYNRERMQGPGQMQAHGLPPQMMGGPMQAASGEGPQQNLWAARNDMPYPYQNRQGPGGPAQAPPYPGVSRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSHRQPYMPSSASMQPITRPPQSSYQTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPAVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPPGSVEASQPVLKQRRKIT	6302	73199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_6633_28057_28204_36568_36673_37401_37561_41883_42094_45057_45263_53217_53357_53610_53784_58108_58260_61212_61310_62950_63722_65859_65991_68613
916004	contig_10990_pilon	+	830	1	Intergenic	novelGene_7417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAGAAAAAGAAATACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597194	598024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_597200_598000
916005	contig_10494_pilon	-	4826	1	Intergenic	novelGene_102232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCCTCTTCTGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268179	1263353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1263400_1268200
916006	contig_3424_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_55497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGTAAAAACCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160362	157374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_157400_160400
916007	contig_3326_pilon	+	731	2	Intergenic	novelGene_170607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	258	503	382763	383008	FALSE	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRGRQREASEKTKKKQKKANTSSQQTRLPGERPPGRTESNHSAPPSQADLGHGKQGEPPAGAKRSGGGKKLNNCKVPRDPTDAAMRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPGAWNPSGLQL	381659	383236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_+_381870_382715
916008	contig_10793_pilon	-	2301	1	Intergenic	novelGene_83411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTGGAGGCGCAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133218	130917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_130900_133200
916009	contig_16594_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_53931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCTAGTATTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321682	324551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_321700_324600
916010	contig_8712_pilon	+	1965	4	Intergenic	novelGene_58767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	312.65565012575	176	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	61	486	314974	321793	FALSE	20	TGGTGTGAAGAAGGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AACAASSDLRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286960	323272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315134_318064_318222_321684
916011	contig_1516_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_49914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAGATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59455	61554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_59500_61600
916012	contig_8712_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_58731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	16625	16326	NA	40	TACATCAGCAATTCATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSKVLFNTLINERTSKSLSRASSAAPTEVPQVDGFNKEKFILSQSSGLQVQIQGLTSRGTLSLLALEEGPCHQSSLGLGASLHRNLKSKGCALLLALLS	16625	14646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_14600_16600
916013	contig_14322_pilon	+	2805	3	Intergenic	novelGene_116610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCCAGTTGGCTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679749	684724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_681372_683073_683491_683958
916014	contig_9049_pilon	+	2588	7	Intergenic	novelGene_83136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1160.53413229522	2	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	38	538	88356	111592	TRUE	35	GTAATATCATCAGAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEVAALF	88318	115009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111575_111612_112978
916015	scaffold_8345_pilon	+	486	7	Intergenic	novelGene_107016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	390.067800374357	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	35	484	583910	602684	FALSE	70	AGAAATGAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLKIFGFMWTNSLRLMYTFDYISEKPGSHHLFTYLFDSSIHGEKIEDIPKEVLMDCAHLVKANSIQGCKMNNVNVVYTPWSNLKKTADMDVGQIGFHRQKDVKIVTVEKKVNEILNRLEKTKMERFPDLAAEKECRDREERNEKKAQI	580108	602686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_580125_583891_583932_591070_591123_593092_593148_598125_598202_602217_602322_602543
916016	contig_11318_pilon	-	2276	17	Intergenic	novelGene_48138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_11	1076.79033873533	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	683	2275	36412	14241	FALSE	30	AAAGGAAACTGGTTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEKPENARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKKLEEEKGKKEKERQEIEKERRERERERERERERREREREREREREREKEKERERERERDRDRDRTKERDRDRDRERDRDRDRERSSDRNKDRSRSREKSRDREREREREREREREREREREREREREREREREREKDKKRDREEDEEDAYERRKLERKLREKEAAYQERLKNWEIRERKKTREYEKEAEREEERRREMAKEAKRLKEFLEDYDDDRDDPKYYRGSALQKRLRDREKEMEADERDRKREKEELEEIRQRLLAEGHPDPDAELQRMEQEAERRRQPQIKQEPESEEEEEEKQEKEEKREEPVEEEEEPEQKPCLKPTLRPISSAPSVSSASGNATPNTPGDESPCGIIIPHENSPDQQQPEEHRPKIGLSLKLGASNSPGQPNSVKRKKLPVDSVFNKFEDEDSDDVPR	58206	14239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_14348_14720_15046_17444_17596_18880_18955_21082_21173_21294_21512_27448_27736_31126_31211_32293_32348_33898_34085_36394_36474_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_58143
916017	contig_7707_pilon	-	3175	2	Intergenic	novelGene_72161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAACTGCCAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252419	249126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_249264_249381
916018	contig_14744_pilon	-	3273	11	Intergenic	novelGene_66134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_10	74.4264066041079	3	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1539	2492	1593104	1588029	FALSE	20	GTTCAGCTGAGCCTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALSLQNEGQDPHVAEQDLWRAIYEADRSRGGPSALSDIKGAAGETMLPCEFCEELYPEELLIDHQTSCNPSCALPPLSMGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604756	1587247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591755_1592980_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1601762_1601822_1604697
916019	contig_12151_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_54983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATAGTTACACTAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988759	989371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12151_pilon_+_988800_989400
916020	contig_15666_pilon	+	1748	7	Intergenic	novelGene_70139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	991	1437	107869	110018	TRUE	30	ACCTAGTAGGACAAGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPGLSRADVLNPWGPGCRLPWQGQAQGERGCSPLLFKPKFKDNQHDQCNCDSQTDQYQEYGVSILPSSRLLLLPPHPHHPHRLRMEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEAFKLKLAGKGLHFPGETMKVQLE	106764	110642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107635_107748_107963_108097_108200_108716_108859_109098_109137_109947_110246_110558
916021	contig_10581_pilon	-	3105	4	Intergenic	novelGene_41425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTATTTGGTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884386	646646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_648671_706749_706760_728144_728298_883468
916022	contig_19012_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_159497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGACAGTATTATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119018	117291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_117300_119000
916023	contig_12427_pilon	-	1046	3	Intergenic	novelGene_40473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2873	junction_2	1990.5	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGTGTGTTAATGTCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315969	313884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748
916024	contig_11142_pilon	+	1998	6	Intergenic	novelGene_176215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_4	98.3410392460848	26	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	16	834	7978	25818	FALSE	70	AAAAAAAAAATCTACATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKQRPPGHAGYPAPPAGFPVQHQPMTNQPGGPAGVPWMTAPPPPLDCPPGLEYLTQIDQILIHQQVELLEVLIGFETNNKYEIKNSFGQRIYVAVEDTDCCTRNCCGSDRPSTIKIIDNMGREVITLERPLRCSSCCCPCCLQELEIQAPPGVPVGYIVQTWHPCLPKFTVQNEKGEDVLKISGPCVVCSCCGDVDFEIKSLDEETVVGKISKHWSGVMKEVFTDVDNFGIQFPIDLDVKMKAVMLGACFLIVSLLSLILVTDVFSSIVLK	7962	26982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11142_pilon_+_7991_16256_16415_17813_17857_21241_21463_23177_23340_25596
916025	contig_12677_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_110713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCAGCTTCACATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1500
916026	contig_10078_pilon	-	735	1	Intergenic	novelGene_160013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	317	616	269143	268844	NA	70	TCTATTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTKTQHTKPLGHSKSSAQRSIYSNKHTHQKRRTKIKTLILQLEQLEIHVRDMLLRSIKYARSNGQYLPRNKEEKAGGDRKTGRIDTVNPGGKGEGEEC	269459	268724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_268700_269500
916027	contig_14513_pilon	-	1247	4	Intergenic	novelGene_70314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	1262.5702180693	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	187	702	18880	11833	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12108_13087_13136_14952_15001_18735
916028	contig_9653_pilon	+	4898	1	Intergenic	novelGene_48326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	118	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCCTTCGAGCTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029353	1034251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1029400_1034300
916029	contig_6191_pilon	-	6601	6	Intergenic	novelGene_107830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	304	831	306299	305772	TRUE	35	ACAGACATGAGTTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFCKTSDLFTANTFFQQHMWTLPYGIHRNQIDYICGKRQWRSSISSVRTRAGVNCGTEHQLLIHKFMLKLKKIKTSLQEPKYHLEDIPPEFEDHIKNRFDTLNTNDRTSDELWDDVKNIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKLALECRIAKANGRHDHEKELNRRFHRAA	306602	79710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_83794_101027_101352_175493_175706_260903_261050_267650_268413_305528
916030	contig_12414_pilon	+	784	2	Intergenic	novelGene_59663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCCCAATAAAACTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776521	777365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_776994_777053
916031	contig_8650_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_162623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTAATTTGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223067	223807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8650_pilon_+_223100_223800
916032	contig_5566_pilon	-	2316	1	Intergenic	novelGene_153668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCACTGCTTGCCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195408	193092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_193100_195400
916033	contig_8848_pilon	+	2152	4	Intergenic	novelGene_140463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.5979797464467	8	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	17	745	93887	95408	TRUE	50	CTAAATAATTAAAATGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVLAGMEAEDSEKEAAEQEPREEQEEPEEEQAECSGKKRVVPGIVYLGHIPPRFRPLHVRNLLSAAATGAKKRSKYSKDYTEGWVEFRDKRVAKRVAASLHNTPMGARRRSPFRYDLWNLKYLHRFTWSHLSEHLAFERQVRRQRLRAEVAQAKRETDFYLRSVERGNRFLAADGDPARPNGSWTFAQRPTEQELRARKAARPGGRERARLATAQDQARSNRGLLAKIFGAPQPSEGMEGPSVARNS	93870	98467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_94064_94714_94886_95027_96086_97737
916034	contig_7356_pilon	+	2624	3	Intergenic	novelGene_60416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477109	480524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_479138_479845_479948_480030
916035	contig_12635_pilon	+	2819	2	Intergenic	novelGene_60858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGACAGATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599653	603897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_600229_601653
916036	contig_5023_pilon	+	2947	16	Intergenic	novelGene_7337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	2052.73192491264	7	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	675	2028	3	2030	607312	647385	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYAPPPSQKVTPLWPTSAGHPCLWAFGASDKPVSLFESQEIWMVYKSSLITRNFPQNWGPKCHQFLCFPPGRSSLFLTVGFGLVLELTHL	607309	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646905_647122
916037	contig_8328_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_174039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	451	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45402	42680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_-_44251_45221
916039	contig_14287_pilon	+	3575	1	Intergenic	novelGene_24059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAGTTAATACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27910	31485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_27900_31500
916040	contig_5574_pilon	-	4672	1	Intergenic	novelGene_155844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2533	2916	110777	110394	NA	45	GGTAAAAGTAAAGTTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVCGQTIPPRLPTHLCWEPVVQQHPLFHPPTHAGAHRPVTPAPKPSHPSCVLQTGGICFSTWLPAPGAQGLAARHFCPANCTSGPRTCSSHSYAQPSAPGAHRPPVHVASPSQWHWKPMNRRPGA	113309	108637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_108600_113300
916041	contig_5084_pilon	+	2563	1	Intergenic	novelGene_64566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCCCCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566561	569124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_566600_569100
916042	contig_5031_pilon	+	1943	9	Intergenic	novelGene_133207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1333	1650	94110	94635	FALSE	30	TCAGCAATCCTAACTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSYVYPGLRTTVGNLTASCLVALTIGAQWRKGSHPPPVPPLPVHGGLQEEQAVARAKGEAARHPWSPLVTHLQHQSLRGLGPNLPYPLVRAPLNSAQGSRLDR	77745	94928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_77812_80340_80512_84575_84663_87129_87301_88118_88305_90740_90851_92326_92422_93663_94115_94322
916043	contig_2377_pilon	-	1391	1	Intergenic	novelGene_67902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214260	212869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_-_212900_214300
916044	contig_16362_pilon	-	1657	1	Intergenic	novelGene_161170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATGGGTTACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325889	324232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_-_324200_325900
916045	contig_12624_pilon	+	3786	1	Intergenic	novelGene_61151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	561	3225	3785	955316	955876	NA	5	CTCCACTTCCCTCTTCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQHREGAAGKASSRGQPLHAQPEESRAWEARREGQAADSGNLGSRSGSVRKGRASPSQNGGPQSDRFTAGRWAAIPRPSPRGARGPQTLQGGGVRGEGSGGEGANARILSQARVHLALVGPGLAVAPIFLVHELVLVVLIHVHLPEPGRRHRVLRHLRSPPVAKASSRCYLYQSNPCPAGTHRLS	952091	955877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_952100_955900
916046	contig_817_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_132457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGTGTGTCCTTTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567737	566138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_566100_567700
916047	contig_4213_pilon	-	3453	1	Intergenic	novelGene_124806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGGAAATTTATCGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37345	33892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_33900_37300
916048	contig_12427_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_40577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTCCACCTCCCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542470	543716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_542500_543700
916049	contig_13800_pilon	-	2615	3	Intergenic	novelGene_153743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTCTATAGCGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162896	153087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_154913_159543_159683_162245
916050	contig_2646_pilon	-	2441	21	Intergenic	novelGene_69649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	35.3208153926265	89	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	6	1913	2169681	2162768	TRUE	5	TCCCTGGCCTCATCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMATCAEILRSEFPEIDRQVFDYVTGVLHSGSADFESVDDLVEAVGELLQEVSGDSKDDAGIRAVCQRMYNTLRLTEPRSQGNSQMLLDAPIQLSKITGNYDCDTKLPGLLKREQSSTVNAKKLEKAEARLKAKQEKRSEKDTLKTSSPPVLEEASASQAGSRKESRLESSGKNKSYDVRIENFDVSFGDRVLLTGADVNLAWGRRYGLVGRNGLGKTTLLKMLATRSLRVPAHISLLHVEQEVAGDDTPALQSVLESDTMREDLLRQERELNAQIASGRAESSEAAQLVEIYARLEEIEADKAPARASVILAGLGFTPAMQQQPTREFSGGWRMRLALARALFARPDLLLLDEPTNMLDVRAILWLENYLQTWPSTILVVSHDRNFLNAVATDIIHLHSQRLDGYRGDFETFIRSKQERLLNQQREYEAQQQYRQHIQVFIDRFRYNANRASQVQSKLKMLEKLPELKPVDKESEVVMKFPDGFEKFSPPILQLDEVDFYYDPAHLIFSHLSISADLESRICVVGENGTGKSTMLKLLLGDLAPVRGIRHAHRNLKIGYFSQHHVEQLDLNVSAVELLARKFPGRPEEEYRHQLGRYGISGELAVRPRCQLVWGPEEPGGLCSDDHALPQLLYSG	2169686	2162154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2162619_2162703_2162792_2162908_2163043_2163231_2163324_2163439_2163529_2164693_2164827_2164904_2164950_2165983_2166061_2166241_2166443_2166556_2166613_2166722_2166746_2166857_2166915_2167008_2167069_2167161_2167243_2167533_2167801_2167953_2168077_2168175_2168274_2168483_2168531_2169027_2169108_2169244_2169393_2169608
916051	contig_17753_pilon	+	1895	4	Intergenic	novelGene_105065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_3	420.159757975728	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	764	1210	131420	133179	FALSE	35	TTTTGAAAGTGAGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLIPEAKWMEPRGAFWRERRLRPPALVPALLQRALPTPSIHAQPTKAQ	45657	133864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_130836_131726_133038
916052	contig_13607_pilon	+	2396	1	Intergenic	novelGene_170175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	863	1168	186491	186796	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHMSWSHFVLTYIYLTSGHKSFGNSIVVLSAHLEFVSKRGCNQVEGDLAWYSRLNLPVWWLTPEEFRYNDFVLCLNIPMIIKMALDHAAFCSVIHKVTMS	185628	188024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_185600_188000
916053	contig_16098_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_45859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGACATACCTCAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234351	233631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_233600_234400
916054	contig_10930_pilon	-	2353	7	Intergenic	novelGene_37029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1604.53139576638	2	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	713	1561	276835	268388	FALSE	15	ATGATTTTCCAGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279726_279832_280157
916055	contig_10732_pilon	-	2229	4	Intergenic	novelGene_114725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	21.6384431561566	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	795	1772	380281	362718	TRUE	10	GTACGTTCTCTCTGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGWPGRRIPWCGPPEAQGTVLPWPSDDVPQWRFHAPVELHVSGAGGRQPSPLCSPVPRLPPGDRAAYCEAANKRVMDVINSARTRQQLLHTQTFHSDSLLTQEDAAAAGDRRPAPDTWIYPLIQMKPFEIQIDEIITETLLTEAERGARIYLTTGYFNLTQAYMDLVLGTRAEYQILLASPEVNGFFGAKGVAGAIPAAYVHIERQFYREVCSLGQQERVQLQEYWRRGWTFHAKGLWLYLAGSSLPCLTLIGSPNFGYRSVHRDLEAQIAIVTENRALQQQLHQEQEQLYLRSGVVSSATFEQPSRKVKLWVKMVTPLIKNFF	381075	357726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_358176_362709_362838_368157_368307_379572
916056	scaffold_12124_pilon	+	2099	5	Intergenic	novelGene_22017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157.793179510396	67	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	95	541	807994	808440	TRUE	50	AAAGACAAAAGCTGTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPGQTVSGSGGERCPCAFGPPRQQFQTRWPQTPRIHSGRGGLVIESQRQRGEEGPLLCCPPGHPPPQTLHQLGNKERLLEEMCPPTPRLHPPQTPALRWMEGNQPFVNERWGGLTLTALIGRSGLGLVKNFLSGGKWTFCCVVFIGP	807700	812019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_807731_807929_808463_809816_809950_810456_810488_810647
916057	contig_7396_pilon	-	2933	16	Intergenic	novelGene_79543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3298.6662853678	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	209	1375	255163	247733	TRUE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRETTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYRVIIPMQGVVAHMVILVDLLLLHK	257477	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248178_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249857_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
916058	contig_10609_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_123916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273627	272785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_272800_273600
916059	contig_6975_pilon	+	4149	18	Intergenic	novelGene_74245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	32	junction_1	56.0397782597758	78	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	606	1821	77	1897	105710	155741	FALSE	25	TTTGAAAAATTTGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAADGAGGSLTRDRAAAAAAPAPAMATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIATILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYTEARRQLRDESQLRQDVENELTVQVSMKKEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIAQLEEKNNKITAAMRQLEQRLQQAEKAHMEAEAEDEKYLQECLSKSHSLQKQISQKEKQLVQLETDWKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRNETQQIIVLKKEFLSLQDENQQLKKVYHDQEQALQELGNKLSESKLKIEDIKEANKALQGLVWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHALLIQRCSSNLP	105633	157993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_105714_107753_107928_110462_110581_115500_115603_116834_116959_117156_117219_117809_117876_120694_120765_121734_121837_121969_122087_124445_124614_125288_125387_127794_127915_132039_132170_132484_132580_136745_136795_155424_155503_155597
916060	contig_15112_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_124765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAATTTCGAGATGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32138	29755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_29800_32100
916061	contig_6076_pilon	-	1670	1	Intergenic	novelGene_81770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	197	496	447128	446829	NA	20	ATCCATTGTCAACTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSNRDHSRGFWTELEKDVEHNFNPQKKDQIYWPKGDRRNLESMAPRHPFSSVVKLPPRFTVQRGSGQPRKTERD	447324	445654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_445700_447300
916062	contig_7182_pilon	-	1029	4	Intergenic	novelGene_117137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2351	junction_3	1797.04652756188	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	70	564	888957	887056	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEEDDDDE	889234	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887233_888169_888345_888814_888961_889168
916063	contig_10377_pilon	+	3504	12	Intergenic	novelGene_115377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	676.061161593296	4	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	242	700	219517	237533	TRUE	65	CACTTAAAAAAGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDSDEAKGDSPFQRLRIPRFLKFFPSGKPAALSC	209042	259335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_235978_236012_237469_237575_240234_240355_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868_258094_258300
916064	contig_18162_pilon	+	1780	3	Intergenic	novelGene_122320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	885	1460	10163	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7977	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_8782_10082_10810_16364
916065	contig_9696_pilon	+	4084	1	Intergenic	novelGene_68770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAATGTTCATTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140035	144119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_140000_144100
916066	contig_15407_pilon	-	6413	1	Intergenic	novelGene_123082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	195	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	261	626	469881	469516	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLGGIFGLRFKDYLRAIVSGVHPTFMAPGSLASIRIFNSVLIFPLLIRNSSTESLIKKCLVMVARHHPVLLVFWQRRQLFMEAIGHTFHFLLPFLTLLLPLFRSTVDELLCLGWLLAGF	470141	463728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_463700_470100
916067	contig_3975_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_54691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAACAAATTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079098	1079966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1079100_1080000
916068	contig_610_pilon	-	797	4	Intergenic	novelGene_76700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1256.39590363335	5	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	17	679	252557	200317	FALSE	50	GCAAAGTGTAAGGTAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVVLH	252573	200198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_200328_220517_220785_234998_235302_252475
916070	contig_262_pilon	+	2567	1	Intergenic	novelGene_140612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	64	333	21948	22217	NA	45	TATACACCAGCTAATAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLLSSLVSWSSSAAITEVPQVMALTKRNLFFHYLVGYKSKFRASAPGEGFRSLSALEEGLVIKLPLVKELLSTGTLGPKDTLFSWLLFLHGMRSPRLSAHFSFISQKRLI	21884	24451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_+_21900_24500
916071	contig_1150_pilon	-	616	3	Intergenic	novelGene_61403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	69	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311048	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
916072	contig_6902_pilon	+	2995	1	Intergenic	novelGene_135561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGCTCAAAGCTATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281952	284947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_282000_284900
916073	contig_13244_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_87010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAGGTCTTTTGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495614	497730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_495600_497700
916074	contig_12964_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_131722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAGTTAGTAATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602257	600327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_600300_602300
916075	contig_13051_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_140103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGCTTCCTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118976	118177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_118200_119000
916076	contig_18869_pilon	+	3699	19	Intergenic	novelGene_56437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	150.751174677568	10	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	798	2394	1305	3698	127729	160664	FALSE	25	CCAAGCTGAAAGCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLTKFSFQVDRSWKAQLSSLNETIKIPKPEVSHCTPWFQDYLHLESFESGNHGTNVLSWAFMPQDTCGQYSFPRKDGHAKTSDPERSWKIVHVSDEEEAAELECVSVTGFTALFTQATERKGCTIILWDLETQGMQCFSLGKIRIPIESDGDQQLCLVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDSLCHLNAWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVDFFLKSKENLLNPSSNSSALDQFDHFPSDLYLRNVEELTPALDLLCSAIRESDSETQSKHFSEQLLNLTLSFLNKQIKELFVHTEELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKQTDALDEYDVNENVPKVKESDIWEKLSFEEVIANAILNNKIPEAQTFLRINSHSAQRLEELIKIGLDLVFDSLKKNNIKEASELLKNMGFDVKDQLLKICFFTTDKNIRDFLVEILKEKNYISENEKRTIDFVHQVEKFYSGQFQENPQIQSFPRYWIKEQDFSKHKSVLDSVLKYHKDEFNKQDHRIVLNWAQWWDRLTQESVLLPRISTEDYRSYSAEALWRHLTARHDWLSISLWIREFQTQDSYASLQQNRWPPLTVDVIDQNTCCNSYMRNKILDKLARNGVFLASELGDFDLFLLRLSRIGGVMQNTLPVQNYRTKEGWDFHSHFILYCLEHNLQHLLYVYLDFYKLSPSNCPFLEKKELHEAHPWFEFLVQCRQVSSNLTDPKMIFQASLANAQILIPSNQASISSMLLEGHTLLALATTMYAPGGVSQVVQNEENENCLKKVDPQLLKMALTPY	116187	160665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116392_118630_118816_119693_120240_121626_121893_127625_127764_128533_128983_130281_130428_132150_132284_136509_136666_137079_137256_138333_138511_139404_139477_141302_141431_141771_141945_142672_142887_151307_151512_153836_153944_159332_159479_160586
916077	contig_11720_pilon	+	1194	10	Intergenic	novelGene_43788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2670.84097358357	51	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	191	910	86302	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67809	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78446_86295_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
916078	contig_16322_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_87558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTAAAAAAAAAAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140123	142579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_140100_142600
916079	contig_6898_pilon	-	3680	2	Intergenic	novelGene_35800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACGGGGCTAGAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141803	137996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_140320_140446
916080	contig_2480_pilon	-	3394	13	Intergenic	novelGene_63528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACCGCGACTCCCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278656	251381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_251561_254201_254354_261834_262003_263138_265134_265927_266059_268069_268202_270347_270428_271793_271872_274102_274184_274276_274407_277040_277110_277207_277281_278530
916081	contig_10403_pilon	-	6060	19	Intergenic	novelGene_175800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	79.3606395583548	347	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	2248	3513	83482	71308	FALSE	20	CCTCCGCCCAGCAATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLKQLIPGMEVSFYKILQDSRLVTPLAFALTSDNREQVQSGLGILLEAAPLPDFPALVLGESIAANNAYRQQETEHVPRRMHLQSLNHSFPASVKCLTPPLLKDNVPGLNIEELIEKLQSGMVVKDQINDVRISDIMDIYEMKLSTLASKESRLQDLLEAKALALAQADRLIAQYRCQRTQAETEARTLASMLREVERKNEELSVLLKSQQVESERAQSDIEHLFQHNRKLESVAEEHEILTKSYMELLQRNETAEKKNKDLQITCESLNKQIETVKKLNESLKQQNEKTIAQLKEKEEQRKEVHSLLVDRECKLANLQQKAVAQEETIETLQKERKDKEETIDLLRKELSRTEQIRKELSIKASSLEVQKAQLASRLEEKESLVKLQQEELNKHSHMIAMIHSLSGGKINPETVNLSI	102034	68760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_71479_72489_72630_73323_73407_73614_73729_75435_75633_78426_78538_78630_78706_79188_79385_81793_81913_83422_84711_86339_86500_87386_87606_93365_93431_96031_96164_96315_96439_98355_98442_99047_99170_100001_100067_101987
916082	contig_6589_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_25730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGGAAGAGTGCTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457655	455356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_455400_457700
916083	contig_6441_pilon	+	3022	2	Intergenic	novelGene_172886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCGAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284089	287578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_284703_285169
916084	scaffold_880_pilon	-	1768	14	Intergenic	novelGene_121399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	293.93768208031	21	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	47	784	311045	281431	TRUE	35	TTTCACATGATTAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQANGAEAEEEEQAEEDCPELVPIETKRREEEEKPGPGAKIPVTIISGYLGAGKTTLLNYILTEQHSKRIAVILNEFGEGSAVEKSLAVSQGGELYEEWLELGNGCLCCSVKDSGLRAIENLMQKKGKFDYILLETTGLADPGAVASMFWVDAELGSDIYLDGIVTVVDSKYGLKHLAEEKAGGLINEATRQVALADLIIINKTDLVPEEDLSQLRTAIRYRIMVNKWTRKNFRDTKIEVSRPF	311091	271358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_271881_272251_272382_275217_275456_277107_277160_281388_281446_286464_286513_289326_289427_291218_291266_297110_297149_298351_298412_303083_303176_305774_305872_307554_307642_310891
916085	contig_7398_pilon	+	429	1	Intergenic	novelGene_166151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATTTAAAAAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61201	61630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_61200_61600
916086	scaffold_13505_pilon	-	4124	7	Intergenic	novelGene_111514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_4	453.690943509149	18	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	1	990	602003	596651	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGKWLPGTSALGSGVGVSLVFLKKFWKKLFSHLCPQVTHKSQNLSLSPPSTSLETVPSSYSSYFSEQTLGPAWNVGRGPSQAQKAPWNGRGLQSGGGKKCPQGQVFSLY	602003	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_597232_597627_597907_601873
916087	contig_15491_pilon	+	2502	4	Intergenic	novelGene_75961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTCACAGCAATGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35399	45160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_37562_38890_39042_40180_40317_45107
916088	contig_5350_pilon	-	3502	1	Intergenic	novelGene_99364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1551	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAGAAAATAACAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214963	211461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_211500_215000
916089	contig_16322_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_87574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAATAAAAAAAAATTACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262530	264515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_262500_264500
916090	contig_14970_pilon	+	2129	10	Intergenic	novelGene_44969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1140	junction_5	5247.33635662001	7	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	133	1428	136145	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
916091	contig_2757_pilon	-	4307	1	Intergenic	novelGene_164603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACCTACCAGAAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498803	494496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_494500_498800
916092	contig_1982_pilon	+	5453	18	Intergenic	novelGene_151331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	63.5933229721769	188	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	241	3030	359020	418775	FALSE	45	AAGGAGTGGAAATAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESMLNKLKSTVTKVTADVTSAVMGNPVTREFDVGRHIASGGSGLAWKIFNGTKKSTKQEVAVFVFDKKLIDKYQKFEKDQIIDSLKRGVQQLTRLRHPRLLTVQHPLEESRDCLAFCTEPVFASLANVLGNWENLPSPISPDIKDYKLYDVETKYGLLQVSEGLSFLHSSVKMVHGNITPENIILNKSGAWKIMGFDFCVSSTNPSEQEPKFPCKEWDPNLPSLCLPNPEYLAPEYILSVSCETASDMYSLGTVMYAIFNKGKPIFEVNKQDIYKSFSRQLDQLSRLGSSSLTSIPEEVREHVKLLLNVTPAVRPDADQMTKIPFFDDVGAVTLQYFDTLFQRDNLQKSQFFKGLPKVLPKLPKRVIVQRILPCLTSEFVNPDMVPFVLPNVLLIAEECTKEEYVKLILPELGPVFKQQEPIQILLIFLQKMDLLLTKTPPDEIKNSVLPMVYRALEAPSIQIQELCLNIIPTFANLIEYPSMKNALIPRIKNACLQTSSLAVRVNSLVCLGKILEYLDKWFVLDDILPFLQQIPSKEPAVLMGILGIYKCTFTHKKLGITKEQLAGKVLPHLIPLSIENNLNLNQFNSFISVIKEMLHRLESEHKTKLEQLHIMQEQQKSLDIGNQVNASEETKVTNVGSQQIDKVFNSIGADLLTGGEPDSKDDGLHSKHKGASLTLEEKQKLAKEQEQAQKLKSQQPLKPQVHTPVAPVKQTKDLTDTLMDNMSSLTSLSVSTPKISAPSTFTSVPSMGLGMMFSTPVDNTKRNLTNGLNANMGFQTSGFNMPVNTNQNFFSSPSTPGVTKMTLGTPSSLPNFNAMSASPVGAKQTQQRPTDMSALNNLFGPQKPKVSMNQLSQQKPNQWLNQFVPPQGSPGMGSTVMGTQMNMIGQSAFGMQGNPFFNPQNFAQPPATMTNSSSASNDLKDLFG	334803	421198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_335016_358991_359197_373082_373241_378021_378167_383313_383464_384728_384951_386324_386442_387038_387165_390419_390597_394629_394753_399378_399493_402332_402466_404349_404469_413479_413581_415603_415671_415810_415907_416974_417095_418130
916093	contig_5628_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_157567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTAATTCTTATCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148031	146033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_146000_148000
916094	contig_2969_pilon	-	1454	2	Intergenic	novelGene_157081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGGCTGCGGGGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981494	976302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_977020_980757
916095	contig_14563_pilon	+	2886	1	Intergenic	novelGene_135035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	838	1152	62926	63240	NA	15	CTCTGCCTACTCAGCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLLWKLARSISHRLNLFNKRLCRHVLGEHSGTRVLSLYNKIFQIFKFCFHFAQFIFNSISFLLHFTISSKEKPHGPIKILLTNFSSQTSKFIIYKFYLPPNI	62088	64974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_62100_65000
916096	contig_1699_pilon	+	4245	1	Intergenic	novelGene_72801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGTTCTGACTGACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15713	19958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_15700_20000
916097	contig_10793_pilon	+	987	11	Intergenic	novelGene_83398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3434.32612895165	1	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	212	589	160548	163940	TRUE	35	TCAAATACAATTTTAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130875	167260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130886_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
916098	contig_6165_pilon	+	6747	4	Intergenic	novelGene_167400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	17.1723291631883	192	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	240	2816	404093	433578	FALSE	35	CTCATTAAAACCCAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEVSVAECKSVPGITSTPHSMDHPSPFYSPPHNGLLTDHESLDNDVAREIQYLDEVLEANCCDSAVDGTYNGTSSPEPGADILVDSLSPPAHTAIQPEPTERAAGRQAPPHIELSKSNSYTMAEGERANGHPPDQLRDTLGDSLQAPVSPSSSTSSRCSSRDGEFTLTTLKKEAKFELRAFQEDKKPSKLFEDDESEKEQYCVRKVRPSEEMLELEKERRELIRSQAVKKNPGIAAKWWNPPQEKTIEEQLDEEHLESHKRYKERKEKRAQQEQLLQQQQMQQQQQPPPQLCTAPAASREHSSMTENAKEDIVTEQIDFSAARKQFQLMENSRQTVAKGQSTPRLFSIKPFYRPLGSISSDKPVTISRPASVGAPPEDSAASTTKGQKVACALDSQSVGGGQGGAAPQGKEGPYSEPSKRGPLSKLWAEDREFTSVRAVLTVVKDDDHGILDQFSKSVNVSLTPEELDSGLDELSVRSQDTTVLETLSNDFSMDNISDSGASNETTSALQENSLADFSLPQTPQTDNLSEGRGEGVSKSFSDHGFYSPSSTLGDSPSVDDPLEYQAGLLVQNAIQQAIAEQVDKAVSKTSQDGAEQQRPEVTLEEAETGPSNSEKPQSMFEPPQVSSPVQEKRDVLPKILPAEDRALRERGPSQPLPAVQPSGPVNMEETRPEGGYFSKYSEAAELRSTASLLATQESDVMVGPFKLRSRKQRTLSMIEEEIRAAQEREEELKRQRQVLQITQSPRAKNAPSLPSRTTCYRTAPGKIEKVKPPPSPTTEGPSLQPDLAPEEAAGSQRPKNLMQTLMEDYETHKSKRRERMDDSSVLEATRVNRRKSALALRWEAGIYANQEEEDNE	317191	437509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_317320_403981_406392_422537_422717_433479
916099	contig_13765_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_165874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	114	704	25085	25675	NA	45	TAACTCAGCACAAGAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMASIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKLDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	24971	26491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_25000_26500
916100	contig_18272_pilon	-	9824	1	Intergenic	novelGene_7027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	8093	8416	213614	213291	NA	20	GCCCCACTCCAAAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNEAKTQGCISALESPVLQSLCWAFLCGASNKTKQKRRKSNSKYCFVLHFAFCFLIRVCMGCECRENLKRLCLLQISIKPDVYQHLSPANSLSGGFKDRGESLSLL	221706	211882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_211900_221700
916101	contig_16496_pilon	-	922	2	Intergenic	novelGene_5228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	75	TAAAAAAAAAGAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
916102	contig_998_pilon	+	2469	1	Intergenic	novelGene_153781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1659	2051	301862	302254	NA	50	TAAACAAATGATGGTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTNSKWIKDQNIKSKTIMIRDENIGSMLEVLIRGINRIQTITNNTQTLEHKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRIKREPTDWEKIWRYDKSDKGLICKLYRKIQHLYNKKTNNTIKNGQRI	300203	302672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_+_300200_302700
916103	contig_12790_pilon	+	3084	3	Intergenic	novelGene_35260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	514	junction_2	87	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1411	1734	309644	310194	FALSE	15	GTTTTTGCAGTAGTTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLPDIEEVKDQSRNKGSSAVRVYRMLPPLTKNQRKERKSKSSQDAKSKAKRKSCGDSSPDTFSDGLSSSTLPDDHSSYTAQGYLGQDLEVERALTPGEVCWVCLM	308233	311544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_309756_309873_309924_310032
916104	contig_13947_pilon	+	1373	2	Intergenic	novelGene_173099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4602	8584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13947_pilon_+_4642_7250
916105	contig_6217_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_109661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	378	725	747307	747654	NA	50	CCATACCAAAAAGAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTETMLETAGYNFVRPMTSSLQIPFFNNINGDYTHGPHWMEHTEIQLTTSVEKDDGKTQYHQSEQGRRLTAEQTINSSYKLKLNRKLEQVHESQRMTLSISHLNLETISRTDLMH	746929	748757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_746900_748800
916106	contig_11681_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_102969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122007	119988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_120000_122000
916107	contig_12080_pilon	-	5672	26	Intergenic	novelGene_128344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	539.936885200483	2162	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	809	2430	78	2507	120866	62705	TRUE	50	TAATAAAGCATTGAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSPDEVPAAGGDGGKSKKFLERFTSMRIKKEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLHTSKAGMSQKESSRSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLSKELEDAKKEMASLSAAAVAIVPPVPSSTNAPPAPPLPADSGTVIPSLPTHLPEEVSKPPPPPSLPEGYTIPPPPPPPPLPGSVCIPPPPPLPESASIPLPPSLPGSTAIPPPPPLPGDTGIPPPPPLPGVAGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGSTCILPPPPLPGDTGIPPPPPLPGGPGMPPLPPPLPGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLAPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164193	45152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_108591_109504_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117808_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
916108	contig_16999_pilon	-	3724	4	Intergenic	novelGene_84957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGACTTGATGGCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263215	45613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_48716_62845_62998_76354_76475_262865
916109	contig_16148_pilon	-	5175	1	Intergenic	novelGene_50381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	781	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAGGAAGTTTGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104338	99163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_99200_104300
916111	contig_11816_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_98509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGGCACCATACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975089	977320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_975100_977300
916112	contig_2069_pilon	+	3831	2	Intergenic	novelGene_23188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTTAAAACCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71703	91971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_74925_91361
916113	contig_1639_pilon	+	2663	24	Intergenic	novelGene_74878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	251.440996397141	1	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	193	2277	287049	331557	FALSE	25	GAAAACGTGGTGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLKVPDRDLLKGNTYLVEEDLYFKNFMTYILKNVKKSQRLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNVKKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAAVAILAASDGCGGGGGTKSSATSASPSRQPVRK	279676	331943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289018_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298131_307925_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_331456
916114	contig_8304_pilon	+	4371	1	Intergenic	novelGene_153161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	269	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGATGCCTTTTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16435	20806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_16400_20800
916115	contig_7963_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_58494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	2662	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCAGGCTTTGTGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136548	131780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_132508_134585
916116	contig_7057_pilon	+	921	7	Intergenic	novelGene_123346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	740.612453011395	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	478	921	943281	943724	FALSE	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLFVA	938910	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938962_939052_939118_941037_941070_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
916117	contig_14868_pilon	+	3096	1	Intergenic	novelGene_150428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAGCCCAAGAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71300	74396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_71300_74400
916118	contig_9345_pilon	+	2355	22	Intergenic	novelGene_24534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1509	2348	726473	729870	FALSE	10	CCGGTAGCCTTGTCGATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPCKVFRTQPGHHVIDGSEEVCFLLLRVGVIIAQKADPTVGLGITKVEIDSFSMSNVKDSIGLWWEPGTHLSPRDLQVLLQQIHGVWGGHIAWRLVIFTWLVELECLSPELLHQGQSLASSHTVLHHILCFPPVCCFWPSLHSHLGFLVQIRLRLGTQKVEDLHIHFVLDHFAISPLEYSPCLSHQQPHVEMVPFHQELGLVPIYGSLHSLFNLLWSHHDVHTTFLLKVHGVNGVQGVTSHILKGSAQLGLGVDLLIGDVAHEKGQTPGILESGGQAI	723450	729877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_723591_723975_724261_724352_724480_724616_724710_724887_724994_725133_725276_725366_725456_725542_725682_725809_725905_726000_726131_726228_726338_726419_726492_726591_726698_727129_727215_727390_727483_727603_727671_728011_728072_728208_728267_728797_728864_729087_729162_729313_729427_729770
916119	contig_16622_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_48410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13095	15093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_13100_15100
916120	contig_12042_pilon	+	1854	1	Intergenic	novelGene_170434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150440	152294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_+_150400_152300
916121	contig_9706_pilon	-	3350	1	Intergenic	novelGene_21010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524088	520738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_520700_524100
916122	contig_8254_pilon	+	4504	2	Intergenic	novelGene_48372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	57	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTAAAAAGGAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43754	48541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_45136_45418
916123	contig_13592_pilon	+	4658	3	Intergenic	novelGene_33726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1596	junction_1	138	281	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1536	1910	266585	267518	FALSE	50	TGTGAAAAAAAAATCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPDELVEKPMSPMQYARSGLGTAEMNGRLIAAGGYNREECLRTVECYDPRTDQWSFLAPMRTPRARFQMAVLMGQLYVVGGSNGHSDDLSCGEMYDPNIDDWTPVPELRTNRCNAGNNGFLLR	265049	270266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_266685_267159_267282_267365
916124	contig_6654_pilon	+	1867	3	Intergenic	novelGene_85770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	313	junction_2	12	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	1078	1866	628801	650183	FALSE	45	ATGAAGCTACTATTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYRVALLYDAHRPHFSIIAISAGDSTTQVSQEVPENCQEWIGGKMAQNGLDHYVYKVGIAFNTEIFGTFRQTIVFDFGLEPVLMQRVMIDAASTEDLEYLMHARQQLVTTAKRWDSSSKTIIDFEPNETTDLEKSLLIRYQIPLSADQLFTQSVLDKSLTKSNYQSRLHDLLYIEEIAQYKEVSKFNLKVQLQILASFMLTGVSGGAKYAQNGQLFGRFKLTKTLSEDTLAGRLVMTKVNAVYLLPVPKEKLVQTQGTKEKV	627723	650184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_629090_640126_640395_649951
916125	contig_13625_pilon	-	3378	8	Intergenic	novelGene_150158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	105.109272586549	96	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	60	1046	43661	29843	TRUE	30	AGCTTCAGTGAAACCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43720	25339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27253_28833_28998_29587_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
916126	contig_3975_pilon	-	429	1	Intergenic	novelGene_54743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAAAAGAAAAATAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1723555	1723126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1723100_1723600
916127	contig_9036_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_155463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTTTTAAAACCCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180493	179371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_179400_180500
916128	contig_14415_pilon	-	3411	1	Intergenic	novelGene_77594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	2878	3411	19037	18504	NA	35	CAGGCAGATATTAATTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRL	21914	18503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_18500_21900
916129	contig_3095_pilon	+	1260	5	Intergenic	novelGene_75170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1829.71191379955	7	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	35	748	220513	226800	FALSE	15	AGTCTTTTATTGCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220478	227312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226219_226272_226409_226645
916130	contig_17427_pilon	-	2507	13	Intergenic	novelGene_30372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	1022.54749957588	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	31	1455	188879	178046	FALSE	55	ACTTAAAGTTATACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204673	176993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
916131	contig_14575_pilon	-	1885	2	Intergenic	novelGene_101918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATATTTTTTAAAAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256541	248418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_250117_256354
916132	contig_7870_pilon	-	1168	7	Intergenic	novelGene_108965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	602.12420276514	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	149	580	600052	364867	FALSE	40	CACATTCACATAATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMGNLELFKIQRSSSTELLSHYDSEIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCERENSTVPQFVRQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQASQIE	848782	364278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_364884_370811_370890_402901_403001_441672_441796_496464_496569_600041_600086_848667
916133	contig_9815_pilon	+	2817	3	Intergenic	novelGene_164230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAACATCAGCTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	86993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_1355_39118_40482_86893
916134	contig_5041_pilon	+	3580	18	Intergenic	novelGene_27079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTCTGCAGACCGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525127	636080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_525654_526404_526496_532091_532937_554547_554623_565859_565985_569903_570009_570821_570918_572068_572203_572642_573005_576404_576605_580875_580969_581052_581199_594959_595122_598400_598586_605334_605437_616557_616729_620101_620175_635991
916135	contig_7428_pilon	-	3292	1	Intergenic	novelGene_77715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	858	1187	416230	415901	NA	30	AGTAGATTATTATTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKTPGIDRVPTEMFQQTDAALEVLTPRNLEYSYLANRLEEIHIYAYSQERCSNQMQKLSNIVNITCKENFAGDHSEVATAVYQQGTAINSGHI	417087	413795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_413800_417100
916136	contig_8866_pilon	-	2553	15	Intergenic	novelGene_77855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	157.176506137631	7	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	11	2005	769789	657073	FALSE	65	CCTTTAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSKMNNPSESSKPSMESGDSNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGHLHQVQLAGTNLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLDEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSALSSPSALNSPGLGIEGLNRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVNPVLPLTSAAVTNLSVTGTTDTPSNNTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPPRDQPGDGDIRVANSYPPRSCTVASKCQSCCHGCCCRTKPRPDGTLSVCSWRCLTQSQPRDPGRCSQPSSDEQQYTGNYSRRSPQHRDCPSVPEPSEPLSAHQQPS	769799	656524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_657152_660814_660904_661651_661987_676950_677057_684092_684273_685274_685421_686661_686804_690845_691020_695554_695650_708097_708225_710870_711060_713011_713132_715095_715150_726515_726617_769731
916137	contig_8260_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_163225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCATTTTACTTAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7588	9914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_7600_9900
916138	contig_12429_pilon	+	4837	1	Intergenic	novelGene_136207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGACAACAGAAAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134422	139259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_134400_139300
916139	contig_7182_pilon	+	3876	1	Intergenic	novelGene_117104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGATTCACGAGAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117685	121561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_117700_121600
916140	contig_12837_pilon	+	1743	4	Intergenic	novelGene_57369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	121.150961843295	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1175	1483	310953	330098	FALSE	30	GAGCATGAACTTAAGCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVTQAQCVKIETEFYRRSRSEIVNGEGHTMGALYWQLNDVWQAPSWSSLGKRSSVLCVSERAIRVGRGTEKHSV	301725	330358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_301865_301909_302867_310874_311040_329876
916141	contig_13680_pilon	+	2765	6	Intergenic	novelGene_149607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	32.2948912368505	304	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	221	628	430059	437960	TRUE	65	AAATTAAAAAAAATATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFREAYSNTCSAVGLAAREGNVKVLRKLLKKGRSVDVADNRGWMPIHEAAYHNSAECLRMLIHADSSENYIKTKTFEGFCALHLAASQGHWKIIQVLLEAGADPNATTLEETTPLFLAQVMPFWQEYPRSDMMS	428389	445944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_428597_430045_430255_435344_435504_437907_438005_440173_440640_444317
916142	contig_7870_pilon	+	2266	1	Intergenic	novelGene_108975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGATAGTAGCATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382476	384742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_382500_384700
916143	contig_990_pilon	+	2724	21	Intergenic	novelGene_76164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	167.946598655644	1	102	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	763	2292	228	2519	1901824	1932551	FALSE	40	TGAAGATAATTTATTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNNQIKVKTKADGSFRLENITTGTYTIHAQKEHLYFETITIKIAPNTPQLADIIATGFSVCGQISIKRFPDTVKQMSKYRVVLSSQDKDKSLVTVETDAHGSFCFKAKPGTYNVQVIVPEVETRAGLTLKPQMFPLTVTDRPVMDVGFVQFLASVSGKVSCLDTCGDLLVTLQSLSRQGEKRSLQLSGKVNSMTFMFDSVLPGKYKISIMHEDWCWKNKSLEVEVLEEDVSAIEFRQTGYMLRCSLSHAITLEFYQDGNGPENVGIYNLSKGVNRFCLSKPGVYKVTPRSCHRFEQAFYTYDTSSPSILTLTAIRHHVLGTITTDKMMDVTVTIKSSIDSEPALVLGPLKSVQELRREQQLAEIESRRQEREKSGKEEDGEGMTKPPVQEMVDELQGPFSYDFSYWARSGEKITVTPSSKELLFYPPSMEAVVNGENCPGKLIEIHGKAGLFLEGQIHPELEGVEIVIREKGASSPLITVFTDDKGAYSVGPLHSDLEYTVDSQKEGYVLTAVEGTIGDFKAYALAGVSFEIKAEDDQPLPGVLLSLSGGVFRSNLLTQDNGILTFSNLSPGQYYFKPMMKEFRFEPSSQMIEVQEGQNLKITITGYRTAYSCYGTVSSLNGEPEQGIAVEAVGQNDCSIYGEDTMTDEEGKFRLRGLLPGCVYHVQLKAEGNDHIERALPHHRVIEVGNNDIDDVNIIVFRQINQFDLSGNVITSSEYLPTLWNYVVLLDSTLPKSQYDYVLPQVSFTAVGYHKHITLIFNPTRKLPEQDIAQGSYIALPLTLLVLLAGYNHDKLIPLLLQLTSRLQGVRALGQTVSDNSGPEDAKRQAKKQKTRRT	1895774	1932756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1895796_1895977_1896129_1901768_1901944_1903810_1903953_1905047_1905180_1906166_1906304_1908048_1908137_1911080_1911145_1911719_1911816_1914619_1914839_1914940_1915024_1915861_1916022_1916170_1916298_1918041_1918156_1919670_1919799_1920674_1920817_1924248_1924333_1925991_1926103_1929769_1929890_1930456_1930550_1932419
916144	contig_533_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_174259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	26	445	131021	131440	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVPCWNWGWAAVSFGPHRGLSALLARKPGRAPRWLPGQYLKGRSRTRPLEHPKFRHFLSSAFLAPCSKMHFPFSQHPNYRHFQQRRTLLQVRDILQGCPPCWPFVLGALRSSCSLPASSALRAKWEILTCAFNAFG	130995	133211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_+_131000_133200
916145	contig_11370_pilon	+	1818	16	Intergenic	novelGene_98770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	20	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	124	378	222966	223421	TRUE	20	GGAGCCTGCAACCCGAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPVLLGLVLAKGEFCCLFILVLSSTFSGPSGFVGRINAPTIMVQGLPVPRQDLLLLLLLLLFLKLLLLLLLLLQGLEVGMLLLQLPLEPLRLPLLLQLLALVFLQQGLFLEQLLLKDLELSLLLL	222644	274732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_222721_222918_223155_223355_223439_223869_223883_225627_225835_226196_226263_226740_226915_227133_227215_227343_227399_227725_227860_228333_228420_228846_228961_231286_231416_231504_231562_233214_233278_274488
916146	contig_10674_pilon	-	2131	6	Intergenic	novelGene_6419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	49.5701523096308	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1443	687	2129	113201	98072	FALSE	60	AAGCAAAGAAAAATCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVKHALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLEQGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDPHYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQMQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISQEALDFLEQILTFSPMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPTDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHVYNWERYHDCQFSDHDWPIHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFDTNYSPEPCWQYPDHHENKYCDLECSHTCNYKTSSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDLSNWKE	134114	98069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_98448_100324_100527_104232_104398_110297_110443_112646_113835_134061
916147	contig_6050_pilon	-	2234	8	Intergenic	novelGene_123124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_5	71.0125024921956	12	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	321	1091	394250	389438	TRUE	15	CAGTGTTTCACACTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGAAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSGLIAQLEEKQQQPTRELLQVRHGALC	394570	377073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_377904_379934_379962_381537_381571_381701_381818_382659_382683_389323_389693_392504_392601_393830
916148	contig_2487_pilon	+	3475	1	Intergenic	novelGene_148447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3070	3381	101602	101913	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVYLSAPSFRVVIKVIMLAIKLEQIKKKKKSAFTCAANTCFRIISGVSFPKCFFEPLETRKCNCKDVCGPLCLLQHLKSEDSPDIMHLFCQGENKYFHENSK	98532	102007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2487_pilon_+_98500_102000
916149	contig_5947_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_101584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGAAGATGAGGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856717	859681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_856700_859700
916150	contig_15063_pilon	+	4118	6	Intergenic	novelGene_8525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	172	junction_1	3707.70306254425	133	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	252	1424	34808	36661	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYYYFNSWGQGKLVTISPESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	26344	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_39092_39506
916151	contig_4876_pilon	+	2556	1	Intergenic	novelGene_137897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1206	1565	365738	366097	NA	30	GTTCCATCAATATGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVQGLTNRFDTTEDRSSETEDKERCGIQSKGKISSDRSSRTRGEKGKHTKELLTENFPNIMKDEKVAIQEAPRPSYRIDTKRKSPRHIIIILSKTTKSLESSFRKPKLHIERKQQD	364532	367088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_364500_367100
916152	contig_5954_pilon	-	1460	8	Intergenic	novelGene_28550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	23	72	463	534	559387	559316	TRUE	10	CCCAGGGCCACTTTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQRGVAAASGEAHHVVFAIAHDGVGLVDGNVIRAHVKDHPHGALYNVQLQIVSQARGAVHPHQHSAPLVRAEAHGQAVHPRAGPVIGGPRVGDERTPLPKDVCGPGVIADRATVGSHGAVTGEAVPLLQADALVGTGLFGAGGAGASQPLSTCPMRCRASAMRSGRRPLRSTEARQP	578802	553682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_553831_555685_555814_556233_556616_557243_557434_559237_559413_559726_559847_573000_573186_578670
916153	scaffold_9100_pilon	-	2581	12	Intergenic	novelGene_83309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	33.8264896931189	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	520	1935	843636	800961	FALSE	15	TTCCTGGCTATGTAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFDCDSLRRLLGKYKFRDLTVEELKNVNMFYPHFRYSVDTYIFKDSSQKDLLNFTGTIPVMYQGNTYNIPIRLWILDSHPFAPPICFLKPTANMGISVGKHVDAQGRIYLPYLQNWSHPKSVIVGLIKEMIAKFQEELPLYSLSSSDEARQVDLLAYIAKITEGVSDINSRSWANHETKTVNKITVVGGGELGIACTLAILAKGIADRLVLLDLSEGTKGGTMDLEIFNLPNVEISKDLSASARSKVVILTVNSLGSSQSYLDVVQSNVDMFRALVPALGHYSQHGVLLVASQPVEIMTYVTWKLSAFPENRVIGIGCNLDSQRLQYIITNVLKAQTSGKEVWVIGEQGEDKVLTWGGQEEAMSHNSKVQLSNRAMELLRVKGQRSWSVGLSVADLVDSIVNNKKKVHSVSVLAKGYYAINSEVFLSLPCILGSNGVSEVIKTTVKEDTVTEKLQSSASSVHGVQQQLKL	844155	800314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_801129_802209_802334_803972_804037_810020_810195_812141_812313_825143_825247_829212_829332_830592_830729_835944_836109_839094_839161_841667_841753_843594
916154	contig_5600_pilon	-	1090	9	Intergenic	novelGene_174954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	67.5407284532822	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	957	133	1089	212951	196940	FALSE	35	CTTTCGAGGCCCAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIECPRGARNLPGLVQEGEPFSEEATLFTKELVLQREVEVEVESMDKAGNFIGWLHIEGANLSVLLVEHALSKVHFTAERSSYYKSLLSAEEAAKQKKEKVWAHYEEQPVEEVVPVLEEKERSASYKPVFVTEITDDLHFYVQDVETGTQLEKLMENMRNDIASHPPVEGSYAPRRGEFCIAKFVDGEWYRARVEKVESPAKVHVFYIDYGNREVLPSSRLGVLPPAFSTRVLPAQATEYAFAFIQVPQDEDARTDAVDSVVRDIQNTQCLLNVEHLSAGCPHVTLQFADSKGDVGLGLVKEGLVMVEVRKEKQFQKVITEYLNAQESAKSARVSYHLLMRPFSNANVSTSASSPALPHSVFK	296763	196938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_197016_197574_197634_199824_200029_201571_201686_202859_202930_203791_203916_206927_207070_212783_212973_296652
916156	contig_9668_pilon	-	4405	9	Intergenic	novelGene_58098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1327	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCACACGGCATGTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360047	182297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_184811_189901_190008_282639_282809_331981_332159_337928_338031_339302_339442_342685_342788_355525_355712_359136
916157	contig_13786_pilon	+	2920	8	Intergenic	novelGene_174567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_5	96.2102289949738	36	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	215	1078	53063	91169	FALSE	20	TGGTTTATAAGTTGTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCSPAAEGGGRWQRWRWEPARWLRETARCRQPPALLRTPPSARLAALSPPESGDVSHRPGVAAARARNRGAMSEAGGGPGCGSPVPQRAPWSLVAATAALCLVSATSVWTAGAAPMSREEKQKLGNQVLEMFDHAYGNYMEHAYPADELMPLTCRGRVRGQEPSRGDVDDALGKFSLTLIDSLDTLVVLNKTKEFEDAVKKVLRDVNLDNDVVVSVFETNIRVLGGLLGGHSLAIMLKEKGEYMQWYNDELLQMAKQLGYKLLPAFNTTSGLPYPRINLKFGIRKPEARTGTETDTCTACAGTLILEFAALSRFTGATIFEEYARKALDFLWEKRQRSSNLVGVTINIHTGDWVRKGM	52848	93011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_53224_63525_63572_75954_76056_76742_76783_81850_81964_83069_83224_88293_88429_91055
916158	contig_5910_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_168419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTCTATAAACATACTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129829	130749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_129800_130700
916159	contig_6738_pilon	+	2573	3	Intergenic	novelGene_166124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	191	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAGTAAATATATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32612	40636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_32717_36540_36701_38327
916160	contig_12427_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_40412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGGCACAGTGGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68304	67178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_67200_68300
916161	contig_5999_pilon	-	1871	11	Intergenic	novelGene_45628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	177.710326092774	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	141	1412	195005	163332	FALSE	15	TGTTCATCTTTCATCTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVQKKPTMYPPWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNARYFLEMSDTRDMSEFETEGFFALHHRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCQQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAVNSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEHICREGPVEIGLPRSMKEETKLPYLPTPGKREPQGISWESPMDGMDKTCHLPEPEMNIERPSLRIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKVWPLLGQPFPLPLTQ	200067	162872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_163554_167255_167417_168956_169075_169873_169984_175793_175924_180637_180724_180817_180850_182002_182166_191342_191404_194816_195019_199940
916162	contig_7357_pilon	-	2281	9	Intergenic	novelGene_36831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_8	1890.6231115693	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	225	1475	166824	136424	FALSE	30	GTTGTACACTTTAAGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167048	135617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
916163	contig_11902_pilon	-	1731	5	Intergenic	novelGene_176149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_2	23.9308900795603	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	504	908	10352	8797	FALSE	15	ATTGTCACTGCTTTCCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPPKGPPPAFQLPPGRPLSPLHREKHRESVSASGNKARASQSCPCFPGLRSRRDEDSLSGDRSDLKAPSTPGKRKKRRHRTVFTAHQLEELEKAFSEAHYPDVYARETLAVKTKLPEDRVQVHKGLLLPRDTSETTGLLSSSHTVWFQNRRAKWRKREKCWGGSSVMAEYGLYGAMVRHSLPLPESIVNSAKGGLAGSCMPWLLGMRKKSIAMTSKRRSEEKLTGLWGSDTPRGDSSPSQVGPQSSSGKVSPEQGLEDEVVDLSSSTRQETQREPRVAQVGASSDSTGLEGLRPGEAGVL	14764	7973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_9087_10237_10419_11385_11579_12057_12137_14599
916164	contig_10616_pilon	-	4061	12	Intergenic	novelGene_175606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_7	199.050639347864	156	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	737	1666	988931	977025	FALSE	5	GTTTTTGTTTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQSHGTSTSYRVGAVFRDLWNAAFFLSGSKKTKNSIDKSTETDNGYVSLDGKKTVKSSEVGVQNQEPRCETIRSEETTWNTGTLKNIPSKDTQRTITNVSDEVSSEEGPETGYPLRRHGDRTSESILRNRKSHHYKKHYPNEDAPKSGTSCSSRCSSSRQDSESTRPESETEDVLWEDLLHCAECRSSCTSETDVENPQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHNSHPGLEKISAIVWEGNDCKKADMSVLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAISLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASELYVIAFGSNEDVIVFSMVIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLTSARRARKSEVPHFRLKKVQNIKMWLSLRSYLKRRGPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCAQLLHVHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSILLTEQINLYLKMEKKPNKKEELTLVNNVLKLATKLLKELDSPFRLYGLTMNPLLYNITQVVILSAVSGVISDLLGFNLKLWKIKS	1016961	974629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_-_977046_977683_977810_978126_978223_980031_980188_984474_984562_986713_986846_987074_987348_988892_989022_995177_995397_1000190_1000347_1006005_1006193_1016877
916165	contig_12873_pilon	+	2337	3	Intergenic	novelGene_27203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1198.5	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1493	2224	17632	19334	FALSE	40	AGGAAACATTCTTCCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQTSPFCFYYFFMHSFHLSFLLFLSSNSQPPSPDPFEIQVGAGCELRSSETSTSFLRAAYKGSDLLSFQNNSWVPSPEGGSKAQNACMLLSQYQGIMEVVHWFISDFCPRFILRLLEEGKVDLQRKVKPEARLSSGTSLGPGRMLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWGKKELWHRLGMGVGGLQAECKNR	16020	19447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16817_16935_18014_18984
916166	contig_16999_pilon	-	5288	1	Intergenic	novelGene_84956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAGTTAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47604	42316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_42300_47600
916167	contig_10456_pilon	+	4740	5	Intergenic	novelGene_163462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_1	46.4670582240796	72	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2889	1562	4450	36382	49210	FALSE	70	GAAAAAGCAGAAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIKSCINHPEISKDLYFHQALFTCLFMSPVEDQLFQEHLLKTDCRSGIDIICNTEKEGKTMLALQLCESFLISQLQNGDMYYIWELIFIWSKLQLKSNPSKQVFVDQCYQLLRTATNVRVIFPFMKIIKDEVEEEGLQICVEICGCALQLDLHDDPKTKCLIYKTIAHFLPNDLEILRICALSIFFLERSLEAYHTVERLYKRPDEEYNEGTSSVQNRVRFELLPILKKGLFFDPEFWNFVMIKKNCVALLRDKSAVRFLNESTLENPTSDLKKTVKRQGLDEGLHSLTDQTTGEFNLDDISGVQSKGHANTKKNFTALNASKVDHNVPRHRCVLCNKEFLGGHIVRHAQAHQKKGSFSCVICGRKFRNKGLMQKHLKNHVKKIQRQQITVTQQEDQEIPALEEINCSDSSISFENGNSDENLEVEPLTASTDRNKEVIPEHVAEFIEIPVSVPEDVIENIIKNGSPDTPLNNVLEPLPECEDDDEEEEEEGDYEEDDYDLNQETSVLHKINGTVCHPKDIYATDQEGNFKCPALGCIRIFKKIGFLNKHARTVHPTDLNVRQTVMKWSKGKCKFCQRQFEDSQHFIDHLNRHSYPNVYFCLHFNCSESFKLPFQLAQHTKSHRIFQAQCSFPECHELFEDLPLLYEHEAQHYLSKTPESSTQPSESILWDVLTDSNPNHQEKDSSSNEKQTISLPVSASKSRKDYSEPKTCIESMERKTDNLVQNGNEHSDDAVSDTSLLDQKMPDVEPNSENNCTINDQLVNGHIEIEQTPLVSSDPALKIDTNRTRTENGSILPSVVPQDHSTLPVSQAPSKPNLTSEHTSYGLILTKPYVRPLPPSYLDERYLSMPKRRKFLTDRVDACSDQDNVCKKSVKRLRCGKCLTTYCNAEALEAHLAQKKCQTLFGFDSDDESKSSTFSVGISVEIENAIDKTVVDFYVVKKINICIAQIIKHCPKNYFL	32210	49500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_+_33686_36295_36499_37106_37247_42731_42874_46720
916168	contig_13014_pilon	-	2050	1	Intergenic	novelGene_169340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCCATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375157	373107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_373100_375200
916169	contig_9332_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_60743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTTTCCAAAGCTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603715	605652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_603700_605700
916170	contig_6898_pilon	+	2131	14	Intergenic	novelGene_35691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2436.72047768933	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	715	1851	116718	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112982_113067_114251_114527_115896_115981_116675_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125667_127441
916171	contig_6710_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_94017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	853	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	657523	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657523	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
916172	contig_5686_pilon	-	1233	3	Intergenic	novelGene_45409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAATTTAAAAGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189441	176046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_176720_182636_182787_189031
916173	contig_7165_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_116901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGAAATAATGCACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118905	1116735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1116700_1118900
916174	contig_6958_pilon	-	1693	2	Intergenic	novelGene_69920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCATCCCCTTTTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150382	148584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149127_149231
916175	contig_4093_pilon	-	1699	7	Intergenic	novelGene_27630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1838.02273743644	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	189	695	69014	41737	FALSE	20	CTTTTCAACTACTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72466	40732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69143_69227_69257_72435
916176	contig_15062_pilon	+	4231	18	Intergenic	novelGene_162294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	116.738758414945	132	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	1125	2879	60862	94568	FALSE	15	TGTTTTTGTGTGGACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSYVYVNTVSLDNRENHGIIYQARKELHKIVRKLLATSAKILRNPFADTFSTVDVEDHECTVWLLLRKSMSADKAARLQAVQEMSQAHHWQDYQYRIIAQACDLRTLIGLARSKESDLRFFLPPPPLPSLKEDSSVEEELRHLLASLPQTEVDECIQYFTSLALSESSQSLAAQKGGLWCFGGNGLPYAESFGKVPSATVEMFCLEAIVKHSEIPTHCDKIEANGGLQLLQRLYQLYKDCPKVQRNIMRVIGNMALNEHLHPAIVHSGWVSLMAEAMKSQQIMEASHAARTLANLDRETVQEKYQDGVYVLHPQCRTSQPIKADVLFIHGLMGAAFRTWRQQDLDEVLMEKASEDEDRYTTCWPKTWLARDCPALRIISVEYDTSLSDWRARCPMERKSIAFRSSELLRKLRAAGVGDRPMIWVSHSMGGLLVKKMLVEASKKPEMSTLINNTRGMIFYSVPHHGSHLAEYSVNYRYLLFPSLEVKELSKDSPALKALQNDFLEFAKDKNFQVLNFVETLPTCIGSMIKLHVVPVESADLGIGELIPVDVNHLNICKPKTKDAFLYQRTLQFIHETLAKDLEN	43624	95920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_43731_50982_51075_54399_55233_58670_58708_60805_60917_62269_62360_64132_64265_67946_68069_69500_69630_70302_70417_72429_72593_76491_76643_82641_82784_87562_87658_89740_89839_91256_91440_92398_92543_94431
916177	contig_11572_pilon	-	6657	1	Intergenic	novelGene_100054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	225	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGAGTTACAAAGGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261477	254820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_254800_261500
916178	contig_12842_pilon	+	4267	8	Intergenic	novelGene_168347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTCTTTTCCTTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166618	201830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12842_pilon_+_170038_171065_171251_172684_172828_173281_173362_175422_175575_176203_176321_182466_182566_201758
916179	contig_10437_pilon	+	2038	12	Intergenic	novelGene_38192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	620.603425361356	7	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	133	1380	229668	232823	FALSE	30	CAAGTGTCCGAGACTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPGSGHQGLPRGPAGYISPLTERPEWLEEPPFCLPSPGAFSPRMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKKMNAVTAKKRKAPRARRLQLGEEQRAGPWPTAIPFSTTTIIRMTPTGSLQALGRKEREESSLCCFVTRSPLNQILTNPVLT	225133	233481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225265_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232517_232650_232709
916180	contig_1925_pilon	-	5036	3	Intergenic	novelGene_162220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCTGGAGTAGATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325593	276672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_279390_279712_281963_325524
916181	contig_11316_pilon	+	2726	2	Intergenic	novelGene_122647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137700	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138599_138698
916182	contig_7612_pilon	-	1404	3	Intergenic	novelGene_170360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	57	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	579	1016	113642	113205	FALSE	15	TCATCCATTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFIREVTVATQAQEHSGYSSSIKTASSQPCSQAHLSLALSLCPKALSFLFPWARKSTTPTPAATSCYLQCYSSISWFRELLRAGIPGPKDMLASGCSSFVVVGSSLSCLCGSSFEAQWDGKTDCHGLNCVPPKYLSTLLGHDSQ	128621	112816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_114118_122523_122603_128597
916183	scaffold_13609_pilon	+	1979	9	Intergenic	novelGene_124419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	107.209782669307	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	241	1323	701875	706070	TRUE	10	TCATGTGTGTGTCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECLKELEESHDQHAVLVLQPAVEAFFLVHATERESKPPVRDTRESQLAHIKDEPPPLSPAPLTPATPSSLDPFFSREPSSMHISSSLPPDTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSHCNPNHLSYFKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLVYLLENDVSTLGYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLKPNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELLISGLPTIDIDDLKSNTEYHKYQSNSIQVSYCWHPSLYGLLTLSSANLYDPK	700879	707712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_700929_701683_701930_702286_702405_703031_703173_704215_704504_704633_704740_705380_705499_705813_706503_707488
916184	contig_11448_pilon	-	3810	1	Intergenic	novelGene_66423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTAGAATTTTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568363	564553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_564600_568400
916185	contig_7327_pilon	-	2454	21	Intergenic	novelGene_172118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_17	218.711568052538	6	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1383	1071	2453	151672	104483	FALSE	35	CTCAGCAAGACATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLAALESNKNQDLEKKEGRIDDLLRANCDLRRQIDEQQKLLEKYKERLNKCISMSKKLLIEKSTQEKLSSREKSMQDRLRLGHFTTVRHGASFTEQWTDGFAFQNLVKQQEWVNQQREDIERQRKLLAKRKPPTANNSQAPSTNSEPKQRKNKTVNGAENDPFVRPNLPQLLTLAEYHEQEEIFKLRLGQLKKEEAEIQAELERLERVRNLHIRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAFDLYEQRYAAVKIHQLNKSWRDEKKENYYKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVLEYCEGNDLDFYLKQHKLMSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLVDGTACGEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVWSVGVIFFQCLYGRKPFGHNQ	258351	104481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_-_104501_105464_105577_108514_108651_108909_109080_109401_109492_109571_109664_116207_116290_119065_119164_131696_131764_143596_143786_145398_145536_145643_145755_151591_151685_152705_152793_154310_154407_156070_156118_158972_159049_178762_178836_179909_179982_191072_191192_257863
916186	contig_4114_pilon	-	3026	1	Intergenic	novelGene_15610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	951	1295	357404	357060	NA	30	ACTTAACCATTGTGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIHRVSVPKRIGQHSAISGGSIYKELMVLKEEVQTALKVLVKNKTPGIEGMPIEIFQQTDAMLGALIHLCQEICKTVIWPSNWKRSISVTIPKKISNRMWKLSNNVIDITHK	358354	355328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_355300_358400
916187	contig_7285_pilon	+	4485	1	Intergenic	novelGene_143407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTGGGGTGAGTCATACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314759	319244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_314800_319200
916188	contig_9668_pilon	+	480	1	Intergenic	novelGene_58244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTTGACCACTGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590640	591120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_590600_591100
916189	contig_9074_pilon	-	2815	2	Intergenic	novelGene_156630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTAAGCCTTGTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100911	97255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9074_pilon_-_99521_100361
916190	contig_10331_pilon	+	2954	5	Intergenic	novelGene_54179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	244	junction_2	99.7922842708794	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	792	1202	589019	598981	FALSE	50	ATAAAAATTAAAAGTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDSDTEAAASPPHPSPEEAVAEEPLHTVAEEESCSPSAELEKPLSASVDSKPVEDKTVEVNDKKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEAGRQQSSVTVSETLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPTGFDASVSSSSSNHPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNSKKKGKGTNSSDSEELSAGESVTKTQPVKSVSTGMKSHSTKSPARMQSPGKCGKNGDKDSDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERITILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERESAATSSSSSSPSSSSITAAVMLTLAEPSMSSASQNGMSVECR	583217	600733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_583815_586578_586693_588938_589155_594919_595067_598853
916191	contig_11986_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_69255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTGTGCAATATTTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831532	833954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_831500_834000
916192	contig_19012_pilon	-	2972	14	Intergenic	novelGene_159468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1316	1618	72148	71247	TRUE	65	AGAGGAAGGGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLGAGCMGRSGGIRDCVNGLCIIDLDEMAVIAGDVPGSSEEGAPCGSAVLGNVCDGMEPLGGELASISSTGEVQTGLLEANSNAYCRTSTKGNRLGPEP	73463	5305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_5378_8424_8579_12570_12650_21347_21471_36884_37046_41925_42016_50662_50801_55914_55994_58185_58258_63389_63541_69243_69366_69757_69860_71235_71398_71996
916193	contig_5964_pilon	-	2346	4	Intergenic	novelGene_80358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_1	51.5816504841273	40	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	651	1943	42416	39546	FALSE	15	AAATTTGTCTTTTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNEYLRPGIDPQKEQLPGKISPKYDGLGTDDGACSRILQEPVIPGDAHHESDSHGPAKNAMSHEETNPYICKECGKVFNKRHLLTQHEQIHSGLKPFECTECGKTFSKSTTLLQHHIIHTGEKPYECTECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKPYECSECGRAFTHHSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPGFIRHYSIHTGGKPYECIECGKAFNHRSELTRHQRIHAEKKHYECVECGKAFNYRSHLAQHQRIHTGEKPYECSECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKPYECSECGKTFAHLSTFVLHKRSHTGEKPFECKECGKAFRDRPALFRHYSIHTGEKPYECSECGKAFNRKSHLTQHQRIHTGRSPISVTDVGRPFTSGQTSVNIQGLLLGMENLWPEETSYSASDHSCQRESSQMSSL	47441	39142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_39550_41127_42566_45794_45923_47068
916194	contig_8651_pilon	+	3674	14	Intergenic	novelGene_168165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_11	71.701468546439	187	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	499	1467	153207	169918	FALSE	30	TCCAGGTGCAACTACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIQRLSIDLQKVTAEAQEKEKLITHLQEKVASLEKRLEQNLSGEEHVQELLKEKTVAEQNLEDTRQQLLATRNIQATTIDILETRVKELEQTLQASEEKLKHSSEVVASQEAQIQALSSANEESRCAQQQAITVQQQCKERVHAVEAQIAALEKAQAADKTATKHKMRELEQENTALKESRNECERSLQHHQLELKKLKEEWNQREIVSVAMAQALEEVRKQREELQQQAANLTAVIDEKEQGLQEKTEMVFQKEQEILQLKKGHECALLQMHQLQSELEALRSLRAEEPGAAAAPEDLQRLPDQEQEPVTLKAMKAPVFQLSAAEGTPNGEVGTMDLGQLQKEKQDLEQQLIEKNKIIKQMQQRMLELKKTLQKELKIRPDELFEVREKPGPEMSNLAPSVTNNADLTDAREINFEYLKHVVLKFMSCRESEAFHLIKAVSVLLNFSQEEENMLKETLEYKMSWFGSKPAPKGSIRPSISNPRIPWS	130327	172125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_130361_134838_134965_137183_137280_150980_151077_153059_153210_154274_154371_161096_161187_162015_162119_162222_162360_162811_162956_167797_167858_168455_168624_169186_169274_169837
916195	contig_17074_pilon	+	2730	7	Intergenic	novelGene_145119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	215.983795688473	78	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	77	652	208015	223497	FALSE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAFPSPQWTGFLSSETWSTLA	207938	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_223433
916196	contig_12414_pilon	+	5854	13	Intergenic	novelGene_59651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.10554159678513	19	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTTTTTTGCCAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759116	792226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_759319_760668_760804_762804_762903_765742_765875_766736_766903_767635_767693_774262_774353_781926_782108_782791_782911_783428_783460_787131_788692_788768_790803_791177
916197	contig_6230_pilon	-	4081	14	Intergenic	novelGene_102082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_5	45.2643778851035	169	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	152	2374	102577	64829	FALSE	25	TAAATTTCTTTTTGTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADFFSQSEPLAPLELNRDFKKPALPVPPAVQVKVPVTNPSNPEEVKKERPTALLDTDSAEPDVSPAPPDSGETRGPQEEKLRPLTAASSPGGPSRAPAYQEPPWGGPATAPYSLEILKGGIILGTRSLKGASRCLFGRLSSCDVCLEHPSVSRYHAVLQHRVSGPDGECGGHGPGFYLYDLGSTHGSFLNKTRIPPRTYCRVHVGHVLRFGGSTRLFILQGPEEDREAESELTVTQLKELRKQKQMMLEKEMLGEDSDEEEEMDTTEGKRNTSSQDDEMGCTWGMGEDAVEDEAEENPIVLEFQQEREAFYIKDPKKALQGFFDREGEELEYEFDEQGHSTWLCRVRLPVDDSTGKQLVAEAIHSGKKKEALIQCSLEACRILDTLGLLRQEAVSRKRKAKNWEDEDFYDSDDDTFLDRTGLVEKKRLNRMKKAGKIDEKPETFESLVAKLNDAERELNEISERLKASSKGLSESPSQDSLDAFMSEMKSGSALDGVSRKKLHLRTFELRKEQQRLKGLIKIVKPAEIPELKKTENQTTDSENKAKKLTLPLFGAMKGGSKFKLKTGAVGKLPPKRPELPPALMRMKDEPEVEEEEEEEEEEEEVKKCEKKKMEDGSSGLQQEIEPEAAVQEMSPPTDFTCSKQTKDHESMSQLSQVAWNEDDQETSETAPSLQEPSALKNECEKSRDELKKKKAAGPSKRPPTLSSKYPEDDPDYCVWVPPEGQSGDGRTHLNDKYGY	102728	63121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_64879_66260_66331_67981_68050_68739_68827_70768_71004_74339_74452_78351_78539_78898_78969_79713_79875_86756_86897_87231_87293_96815_96939_98572_98769_101914
916198	contig_1535_pilon	-	2895	6	Intergenic	novelGene_127253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_5	354.938529889332	35	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	215	1099	134839	129144	FALSE	35	TGATTTTAACCAATTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVLTTDAQKLLHQLNALLEQESRCQPKVCGLRLIESAHDNGLRMSARLRDFEVKDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136102	127347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_134578_134840_135888
916199	contig_6102_pilon	-	1720	5	Intergenic	novelGene_32159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	609.663995574612	3	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3	332	867516	847043	TRUE	20	CTCTAAATCTTTGAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867518	838834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_844848_845001_846088_846136_847011_847094_867237
916200	contig_8377_pilon	-	1127	12	Intergenic	novelGene_35106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.72487872372821	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTATGAAAAACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180507	154966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_154992_161231_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
916201	contig_15407_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_123096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTTATAAGTAATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558940	527545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_529520_558922
916202	contig_4812_pilon	-	823	6	Intergenic	novelGene_103669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6972.1678522537	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	118	600	82334	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82803	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82335_82686
916204	contig_6954_pilon	+	774	1	Intergenic	novelGene_64432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGGATACGTTTTAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246213	246987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_246200_247000
916205	contig_6375_pilon	+	2974	1	Intergenic	novelGene_72988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAGTGGTTGATGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292966	295940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_293000_295900
916206	contig_16703_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_72798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAACAAAATAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45663	47879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_45700_47900
916207	contig_18110_pilon	-	3457	2	Intergenic	novelGene_178965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2095	3144	4465	3416	FALSE	70	ACCTACAAAAACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	125034	3102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18110_pilon_-_5074_123548
916208	contig_7035_pilon	+	1350	2	Intergenic	novelGene_83520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTTTAAACTTACTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272778	274173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_+_273977_274021
916210	contig_11846_pilon	+	2160	2	Intergenic	novelGene_105973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATGTTCAGCAAAGGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307930	320559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_308788_319256
916211	contig_1699_pilon	-	1834	2	Intergenic	novelGene_72824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAAAAAGTAGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87151	83608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_-_84467_86175
916212	contig_19459_pilon	-	698	5	Intergenic	novelGene_59836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4395.20775248452	993	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	100	426	16240	6939	FALSE	15	TCTTCTTGTATTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHDIIQ	19063	6666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6953_12625_12704_15503_15702_16203_16265_18988
916213	contig_8624_pilon	-	3712	2	Intergenic	novelGene_112572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1749	2066	1060350	1059545	FALSE	15	GCCAGGCCTATCTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLACWFFLKRLCPETARTLPSWRCPLAGPVSHRSWQKTKRDSSLLWCRRVDSDSQRPSGQQNEPPPGPAPSSQSLLCFSPLLEPLCQSILSRIFLFFADPLLYQA	1062098	1057898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8624_pilon_-_1059726_1060213
916214	contig_16724_pilon	+	4396	1	Intergenic	novelGene_105281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	3661	4179	516911	517429	NA	30	ATCTCCATAACTCAGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCTTERNTAWSCAILTIIAKFEPIVAVTVSIHLVEGLPLFRRPSTLPSMMSFSRNLSLLKTCPKYVRCSLTILASKEHSGCTYSEADLFILLAVHGIFNILLQHHSSKASILLWTSLVTVQLSHAYEMTEDTMAWVRCTLVFKVTSLLFNTLRRSSAADLPSAMCLLIS	513250	517646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_513200_517600
916215	contig_14176_pilon	-	2560	13	Intergenic	novelGene_74839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	165.517601447365	10	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	1508	2398	229012	224445	FALSE	60	GTATGAGGAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEIFFAGQS	232539	224282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_224469_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229257_229406_229638_229738_230314_231182_231369_231790_231966_232443
916216	contig_9373_pilon	-	2101	1	Intergenic	novelGene_162739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTACCTAATATTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402441	400340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_400300_402400
916217	contig_1836_pilon	+	1874	14	Intergenic	novelGene_71051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	371.679555945296	12	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	984	891	1874	845736	884324	FALSE	25	GTATGTGAATCCTCTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSAVALLNQALKTNDLVSVQNQLRSPTIGFNNLDEAYVERYANALLTIKLEALSQGQDSLSWNEIQNCIDMVNFQIQEENDRIVAVGYINEAIDEGNPLKTLDTLLLPTAKIRNVNPDYAQHYQDVLYQAKSQKLRDSESASNVLWLDEIQQAVDEANMDKDRAEKWVTLVIDVNQFLERRKPSDTLSVLTSSSLDANDIIPECANEYYDALLKAKEQKSQNVSGEGSWLKCTLQDQYEYYYNIDSKESSWKMPEDASLKQSWLLGKDIEDIISEITANYIREKIWSASEDLILRFKSTPSGHRLTEEFEARKSFLYDQEASVVKIQ	833374	884324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_833443_833754_833869_834579_834759_838179_838268_842084_842249_844018_844058_845143_845343_845696_845858_852946_853072_859240_859405_872898_872990_877333_877502_879519_879663_884153
916218	contig_5039_pilon	+	6720	1	Intergenic	novelGene_64869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	277	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	2548	3024	376016	376492	NA	40	TTAAAACATGAGCAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVSIPLTESVSCFRCPSALANMTSFSGARSFLVTGVSDSLNILPSKEQFGCVSSRQSTPIGVESLPTRSDPTGQSRTAPKGFQGTAGGFELPTFQLAAELLTTVPPGLQAEYKTKTKAIAFESILTHSNPVAWWLRIRTGQADSLSLKLEDYHILL	373468	380188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_373500_380200
916219	contig_10042_pilon	-	4673	1	Intergenic	novelGene_79253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	4081	4452	1204454	1204083	NA	25	CCGACTCATAGTCACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHPTAHPDACLDLLPPYLLHSLLPVTKSCLPVPYAQQKRAVPSPGSLLPLIASSFCTDPWVSKKLSSQLLDERLVVQTHLEVPWKTVLVICFGKVTALKTYGTVLFCTHGVTMSRNRLDSN	1208534	1203861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1203900_1208500
916220	contig_11574_pilon	-	2602	11	Intergenic	novelGene_64076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	296.053390455168	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	71	1819	456525	450354	TRUE	25	ATCTGATGAGCTGTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKARPTGGR	463697	449215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450372_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_462651_462686_463675
916221	contig_12299_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_29732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93925	92984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_93000_93900
916222	contig_9297_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_69898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954802	953858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_-_953900_954800
916223	contig_11807_pilon	-	3907	4	Intergenic	novelGene_178967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	7.40870359029762	164	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	95	703	61361	58239	FALSE	40	TACCTATAAAACGTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVVVEDVAVDFTQEEWALLDHSQRQLYRDVMMEIFRSLTSVASQNLIDGDKLSTENIIVRFMKNDTWSSMVGEICELPGTEDQNNNQKTHMRRYMLENLYESNEDNHCGQTFSQIPNLSVLKRTMELYPSECLECGKSLMNHSSLKHHIKSHSGCSAYQCKECGEACGCPSYLSTAMRTLTGQKSYECKKCGKAFSQSSHLNSHIRTHVVRRLMNVRNVGKPVVAPHSSLHM	61455	55034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11807_pilon_-_58313_59486_59837_60551_60703_61327
916224	contig_12270_pilon	-	879	2	Intergenic	novelGene_113544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	37	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	542	877	14409	13851	FALSE	10	TGCTGCTTATAGCTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYG	14950	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
916225	contig_7644_pilon	-	1870	1	Intergenic	novelGene_64261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGACTAGCTGCACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196971	195101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_195100_197000
916226	contig_6302_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_171704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGACCCAGAACTAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153965	155609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_154000_155600
916227	contig_10920_pilon	-	574	3	Intergenic	novelGene_178969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	1	34	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23647	21989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10920_pilon_-_22234_22847_23064_23533
916228	contig_7695_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_41587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	516	947	419379	418948	NA	30	TTATGAACAATGCCTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALPQLILEHFYHLRRKLHILKPSLQPHPPSPSQPLINLLSVSMIYLFRTFPLNGIYNVQSFVSGFFHLTMFSRLIRVVVCIRTSVLLMDEIIFRCMPWWCKRLSTRLLAQKLAVQTHPAAFQEKDLVISSRKVYSLENTMG	419894	417745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_417700_419900
916229	contig_13542_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_131529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAACCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504188	506310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_504200_506300
916230	contig_1472_pilon	-	1097	2	Intergenic	novelGene_86144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAGCAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756677	751223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_751867_756223
916231	contig_6137_pilon	-	1425	3	Intergenic	novelGene_59265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATATTACTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332676	1327576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1328334_1331694_1331859_1332172
916232	contig_5574_pilon	+	3893	2	Intergenic	novelGene_155843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTAATGGGTTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107787	112293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_111228_111840
916233	contig_7870_pilon	-	2592	3	Intergenic	novelGene_109004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTGATATGCAGATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557246	488721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_489580_489735_490470_556246
916234	contig_17144_pilon	-	2160	13	Intergenic	novelGene_29392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2033.86690232888	44	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	133	1869	179764	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183214	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172565_174895_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
916235	contig_6102_pilon	+	1990	1	Intergenic	novelGene_32184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATATTTTTGGAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867711	869701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_867700_869700
916237	contig_19076_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_74224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAGTACAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137431	139603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_137400_139600
916238	contig_1428_pilon	+	2956	2	Intergenic	novelGene_158411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAAAAGAAAAGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141633	151324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_142388_149122
916239	contig_5003_pilon	+	3896	20	Intergenic	novelGene_120227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	45.0028007746443	135	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	758	2277	189	2465	214040	266094	FALSE	15	TAACAGCTTTGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVLCSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPTYAGISELNQPAELLPQFSSIEYVVLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGCEAISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPVTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNLTDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGMVVGDELKTPIRSWHDIEKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEMKCCPNLTGYFNTSLFKQTFQRVFTKDIHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAIGPCVSLNSKGPCVSENEIGSGGTCQWKICGLSPTTTLAVYFEVVNQHNAPIPQGGRGAVQFVTQYQHPSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSPDESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPILYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQILIYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA	188934	267525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_189102_214018_214261_217375_217434_217679_217767_218770_219008_222541_222622_224113_224259_230409_230569_231638_231759_233675_233775_235377_235459_236469_236560_237704_237812_244405_244560_249337_249416_251927_252090_254043_254131_255595_255752_259118_259185_266004
916241	contig_8597_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_158703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGAGTTGCAGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33843	31481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_31500_33800
916242	contig_6710_pilon	-	549	2	Intergenic	novelGene_94389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	2097	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	657167	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657167	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
916243	contig_11281_pilon	+	1674	1	Intergenic	novelGene_125522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGTAATTTGCGGTGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003730	1005404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_1003700_1005400
916244	contig_12644_pilon	-	2044	14	Intergenic	novelGene_44490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	572.729693463808	1	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	466	1272	1068666	1034331	TRUE	25	CAGTTTTACTTTTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDISGTKCDFTVQVQLRYSVDYNIEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGEMLELHVGASGGFSPPVLKQK	1151235	1025950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027291_1030066_1030210_1034213_1034395_1035117_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063352_1068334_1068405_1068664_1068750_1123325_1123677_1151204
916245	contig_15777_pilon	-	1354	3	Intergenic	novelGene_75752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_2	63	43	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	65	574	259057	235198	FALSE	85	ACGAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTAVLYLPNIRHFLPERRHGSMCRPSPSPASPPSNSRTSLVQVKTKTSFSGHSSASSTSKPFKTPKDNLLTSSSKQHTVFSAKGSKDKQCIPVPVVSLEKIPNLVKADGANVKMNSATTTAVTSSSTSSSAVSSPPLFKPVLMSKQVPPSPEKILNGKGILSATIDKKQQNGTKSSNKPYRRLSGTCPCP	281666	234417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_235502_258851_259075_281619
916246	contig_10734_pilon	+	2581	13	Intergenic	novelGene_51279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_11	88.0903497678504	8	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	46	1638	1336726	1361573	TRUE	20	GGTAAATCTGTGTAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAHLSYGRVNLNVLREAVRRELREFLDKCAGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGNRLPAADVKNIIFFVRPRLELMDIIAENVLSEDRRGPARDFHILFVPRRSLLCEQRLKDLGVLGSFIHREEYSLDLIPFDGDLLSMESESAFKECYLESDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARQVANMMIRMKREFTGSQNSVFPVFDNLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVKLPPEKFAPKKQGDSGKDLPTEAKKLQLNSAEELYAEIRDKNFNAVGSVLSKKAKVISAAFEERHNAKTVGEIKQFVSQLPHMQAARGSLANHTSIAELIKDVTTSEDFFDKLTVEQEFMSGIDTDKVNSYVEDCIAQKHPLIKVLRLICLQSVCNSGLKQKVLDYYRREILQTYGYEHILTLYSLEKAGLLRPQAGGRNNYPTIRKTLRLWMDDVNEQANQMILEYPKGHGEVALRLCISRLSSFCYVTESHGHIICVQWLRPLSACG	1336680	1362887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336828_1339438_1339505_1339941_1340070_1341846_1342034_1346894_1347012_1347328_1347504_1352397_1352592_1354485_1354613_1355744_1355813_1356736_1356875_1359066_1359205_1361420_1361685_1362055
916248	contig_6958_pilon	+	1054	8	Intergenic	novelGene_70007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	279.98709882815	19	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	127	492	750213	753910	TRUE	15	TTCTAAATGTTCCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPELISDTYLALFLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFENHNSEVYEGKF	743807	769536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_743872_750150_750284_750917_751082_752856_752954_753876_753931_758481_758604_768406_768486_769195
916249	contig_4315_pilon	-	4016	14	Intergenic	novelGene_46758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2815	3333	270506	269011	TRUE	25	ACACTGGCCAGCAGCCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVESPLLGRNLAWETLLLWPLSKSSTGCRRTQSHTTTFRSSLPLASQVPRWLKCKVLTQPVWPSSPCCRRKRCTKTLAPQASYTKRALEPNSRSRRAGRACQRGRGRADVSEDTQSSRARSSSDESCSRLARLRCTRRRGCSSSSSSSSSSSSSSSSSEWSWTRFSSLIE	295085	250370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_250692_251440_251517_265848_265917_268792_269484_270460_270605_271711_271809_277695_277805_285723_285796_286274_286333_286845_286954_288341_288479_291957_292076_292465_292596_293198
916250	contig_13021_pilon	-	3049	4	Intergenic	novelGene_8255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	443.699848496205	26	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	112	543	236115	231362	TRUE	20	ACCCAGCCCTCCCATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDNNSQTASDKNSRSFLDTL	236226	215807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_218304_231351_231421_231599_231882_236024
916251	contig_18145_pilon	-	2037	12	Intergenic	novelGene_37358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	846	1274	98918	97184	TRUE	50	ATGAAAGTAAGCAGTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLQARWQISVRSAPEKPLVILARNSKSTSGNWGLAQIGLEDGNTGLLIRNWTSSWSSRLTSSRPPMSSQVTCGTSTTVSRSADGLLWLRAHRKSSIVTAREFMTSASMVSSSRSMRSIFLRMACRAASEHRAAKSAPTCP	101264	92690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_92820_93350_93475_94897_95010_95953_96087_96162_96299_96653_96766_97166_97334_97425_97550_98475_98539_98826_98982_100325_100480_100636
916252	contig_17989_pilon	+	3456	3	Intergenic	novelGene_150851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTGAAAAGGAGAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348766	352323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_349302_349349_349446_349498
916253	contig_17144_pilon	-	1045	6	Intergenic	novelGene_29379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1967.6793031386	5	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	497	964	166619	166152	FALSE	25	AAATTCTTGAGTGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183238	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166627_173305_173460_176155_176271_179700_179786_181794_181850_183158
916254	contig_6163_pilon	+	2354	1	Intergenic	novelGene_103789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAAAAACATAGTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14205	16559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_14200_16600
916255	contig_11574_pilon	+	2124	3	Intergenic	novelGene_64113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1592	1963	806856	807227	FALSE	30	AATGATCATTTTGGGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNTHYLCKGNPLLKAKLYSVASAFSSKNFMVSVCTFRSLIYFEFVFVYGVRHGICFIFLHVEIQFSQHRLLERVFFPHRIDLAPLSKSSWREMCGFISRLLVLFHWSVYLLLYQYQAVLINV	687655	807388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_688196_717278_717428_805953
916256	contig_4604_pilon	+	2581	4	Intergenic	novelGene_19173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1950	junction_3	936.958673344537	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCCAGCTAGGTCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371547	376482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372165_372787_372964_373590_373704_374807
916257	contig_2496_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_168516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAAAAAAAAAAAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133263	131948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_-_131900_133300
916258	contig_16103_pilon	+	2561	1	Intergenic	novelGene_118779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGCTCAAGTAGATATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530659	533220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_530700_533200
916259	contig_7457_pilon	+	2779	1	Intergenic	novelGene_31527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACAATTTTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706564	709343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_706600_709300
916260	contig_14868_pilon	+	2926	13	Intergenic	novelGene_150432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTCACCCACACGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90078	185393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_90793_92469_92596_96151_96301_109655_109954_110137_110301_115026_115504_123469_123606_124638_124802_124892_124948_130553_130638_139495_139586_154428_154574_185067
916262	contig_614_pilon	-	4258	1	Intergenic	novelGene_132642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGAAAAGAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	936139	931881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_931900_936100
916263	contig_7056_pilon	-	1532	8	Intergenic	novelGene_43635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1154.55753517996	7	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	63	917	730480	722516	FALSE	25	AAACTGCAATTTGTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGTEGGEGFVVKVRGLPWSCSAEEVQRFFSDCKIQNGAQGIRFIYTREGRPSGEAFVELESEDEVKLALKKDRETMGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRGKVRIEFIRMSSMSSMSGGWGM	731009	721900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722560_725637_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_730383_730513_730979
916264	contig_10940_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_49220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	527	907	875054	874674	NA	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSRVPHPYSNQTCAAIFVFWYALLFTVKEAAVPGALLVHFSLCKTTHISWPGPPRMCSRVPNPHPNQTFAVILVFCHALLFTVKEAAVSGGVLSTSAFVRTHMYPGLDLLECAPGSLTPTAVKVA	875580	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874000_875600
916265	contig_11572_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_100039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCACAACATCATATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141017	143361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_141000_143400
916266	contig_5686_pilon	+	2231	3	Intergenic	novelGene_45242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	502	843	94439	94780	TRUE	55	CATAATACTAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93788	96812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94000_94148_95482_96125
916267	contig_3307_pilon	+	4467	1	Intergenic	novelGene_86894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGAAAGTGATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152933	157400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3307_pilon_+_152900_157400
916268	contig_3601_pilon	-	3471	1	Intergenic	novelGene_132851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1659	1964	130167	129862	NA	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131825	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_128400_131800
916269	contig_4151_pilon	+	800	2	Intergenic	novelGene_65269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	99	416	620441	620758	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAACCAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEGMILVSLTGGPSSAEECGGRESWKMDGSFRVSRRYLVCSLRLRNRIGGGYTEPDTHLGLGSHQAAVQRGREEESDLAQPAH	620342	622726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620937_622520
916270	contig_6919_pilon	-	3625	2	Intergenic	novelGene_163998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	456	1301	127887	95914	FALSE	30	CTTTTAAGACCCCAGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMLILIDSPL	128342	93589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_95941_127068
916271	contig_6017_pilon	+	2288	4	Intergenic	novelGene_152554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	61.5521459143925	60	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	57	647	452107	457739	TRUE	30	TTAAGTAACTATTGCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEVSKERLGAGSSRSGGMKLHCEVEVISRYLPALGLRNRGKGVRAVLSLCQQTPGSRPRPRLRGEPGGPHSACLLISTLKDKRGTRYELKENIEQFFTKFVDEGKATVRLKEPLVDICLSKANSSSLKSFLSAVRLAHRGCDIETPLLTLTPVKTSEFEKFKTKMVITSKKDYPLSKNFPYSLEHLQASYCGLVRVDMRMLCLKKPSEIRLEP	452050	465556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6017_pilon_+_452320_455197_455297_457460_458185_464360
916272	contig_12886_pilon	-	1460	1	Intergenic	novelGene_135546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957594	956134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_956100_957600
916273	contig_610_pilon	+	2342	10	Intergenic	novelGene_76841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	206.045182627381	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	109	1947	350131	375649	FALSE	35	CATTGCAGTATTATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYEQLQKPRVTVKHTMSESTSCNLTLVCSVERAEKSVLYSWTWVDTHSFKSFESSTLTISWMPCDPDVAYTCTAKNPVSQSTSSPIHAQQFCADLRASRGRTVGETVVGTLGESVTLSLTVPVSRDIEKVVWMFNTSIISKDWREPAIAGPLMKSKEPGKDRVWVSDQDYTLKISQLKMEDTGPYNAYLCLNTPRLTSTQHFTLRVYRRLKKPEITWIPGPSDDSICRVTLMCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSEPTVSHSLYTMLPQGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350022	376044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_363029_363303_363794_364137_366326_366597_368139_368245_369603_369658_373393_373717_374082_374155_375583
916274	contig_1379_pilon	-	1151	2	Intergenic	novelGene_134600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	643	junction_1	0	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGAAAGCAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480260	476998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_-_477214_479324
916275	contig_8269_pilon	+	2850	11	Intergenic	novelGene_106239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	442	junction_2	320.569009731134	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	793	2385	324938	377795	FALSE	15	CGCCCCACCGCCCCCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAASADRRAAPSTAPTVAPPRASPGRSPSCDPGPPRPLDSHLAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIETELEKQKGVVRPSISQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASSEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH	324145	378260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_325330_339814_339977_342676_342800_344516_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488_369651_370571_370749_377781
916276	contig_1725_pilon	+	4613	3	Intergenic	novelGene_24323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	519.5	128	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	787	1203	251048	252853	FALSE	35	TAACCCAGATCAGCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMVSTLPRFIKETSLLWLIKTFVPFY	250261	256263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_251188_252129_252265_252711
916277	contig_7004_pilon	+	3458	13	Intergenic	novelGene_126445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	49.9271691789373	285	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1186	1710	274729	278336	TRUE	25	CTTATAATTGTTGCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLHRVPILATAIQEELEKGNPEPGPLNAVDDRHHSVLVSLLCAHLGLSSEDIVEMELCLADTQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYV	272424	282373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_272603_273020_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
916278	contig_5686_pilon	-	2930	2	Intergenic	novelGene_45486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2287	2625	238489	238151	FALSE	20	GCACTCTTAGATCTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPAGMVPSGRRFCSSHYDVNTCGKHVVTGFNVLEREALSLSLCQTTLLLLVWRQPLPAPKETSNSTLSLLTCIVKPLWIYRAETWEPETSPSLPGPLPKRFSLLKKPLPSS	241046	237845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_240507_240777
916279	contig_12464_pilon	-	8613	1	Intergenic	novelGene_68650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGTTGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111164	102551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_102600_111200
916280	contig_9852_pilon	+	1494	5	Intergenic	novelGene_138472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	26.8642420328585	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	72	374	322239	349949	TRUE	15	TCCACTTGTGATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLALEACPGCHQGHSHFLELPGSPSLQPPLPPVGAVTVISPLELIRTKMQSKKFSYQELHRFVSKKVSEDGWISLWRGWAPTVLRDVPFSVCSCCNFTI	322167	365582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_+_322339_342138_342313_349920_350003_353927_354009_364596
916281	contig_960_pilon	-	2729	2	Intergenic	novelGene_108229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTCAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434349	430981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_433673_434311
916282	contig_19352_pilon	+	2825	1	Intergenic	novelGene_122380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATGGAGCTTAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118674	121499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_118700_121500
916283	contig_18735_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_132678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCACCCAGAAAATCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66672	65126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_-_65100_66700
916284	contig_9981_pilon	-	5242	23	Intergenic	novelGene_121055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_22	100.733549197297	182	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1328	3987	53	4039	347273	258123	FALSE	45	AAAAGACTTTTAAAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHRPAGCPRCGGAAAAAMQQAQPYEFFSEENSPKWRGLLVSALRKVQEQVHPNLSANEESLYYIEDLIFQLLNKLCMAQPRTVQDVEERVQKTFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRRNPLLLPVDKIHPSLKEVLGYKVDYHVSLYIVAVLEYISADILKLAGNYVFNIRHYEISQQDIKVSMCADKVLMDMFDQDDIGLVSLCEDEPSSSGELNYYDLVRTEIAEERQYLRELNMIIKVFREAFLSDRKLFKPSDIEKIFSNISDIHELTVKLLGLIEDTVEMTDESSPHPLAGSCFEDLAEEQAFDPYETLSQDILSPKFNEHFSKLMARPAVALHFQSISDGFKEAVRYVLPRLMLVPVYHCWHYFELLKQLKACSEEQEDEECLNQAITALMNLQGSMDRIYKQYSPRRRPGDPVSPFYNRQLRSKHLAIKKMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGPLTRIGAKHERHIFLFDGLMISCKPNHGQSRLPGYNNAEYRLKEKFVMRKTQVCDKEDTCECKHAFELISKDENSIVFAAKSAEEKNNWMAALISLQYRSTLDRMLDSVLLKEENEQPLRLPSPEVYRFVVKDSEENIVFEDNLQSRSGIPIIKGGTVVKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLLIERFEIPEPEPTEADKLAIEKGEQPISADLKRFRKEYVQPVQLRILNVFRHWVEHHFYDFERDLELLERLESFISSVRGKAMKKWVESIAKIMKRKKQAQANGISHNITFESPPPPIEWHISRSGQSETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAVNSVSVYRLDHTFEALQERKRRILDEAVELSQDHFKKYLAKLKSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNPMGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNAGRHGSTSGTLRGHPTPLEREPCKISFSRIAETELESTMSAPTSPNTPCTPPVSASSELSVFLDVDLNSSCGSNSIFAPVLLPHSKSFFSSCGSLHKLSEEPLVPPPLPPRKKFDHDASNSKGNMKSDDDPPAIPPRQPPPPKVKPRVPVPIGAFDGPLHSPPPPPPRDPLPDTPPPVPLRPPEHFINCPFNLQPPPMGHLHRDVRDASTCPNSPNTPPSTPSPRVPRRCYVLSSSQNNLPHPPAPPVPPRQNSSPHLPKLPPKTYKRELLHPSLYRLPLLENAETPQ	347325	256919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_258624_259678_259789_264582_264625_265150_265413_269463_269581_273396_273570_274630_274749_278229_278393_278554_278675_284910_285134_286455_286560_294257_294381_295780_295863_296228_296885_297917_298046_301042_301142_306125_306237_307354_307499_311399_311604_314207_314373_315560_315693_319213_319340_347189
916285	contig_19094_pilon	+	5460	3	Intergenic	novelGene_177779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTAATTAGGCTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4282	9960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19094_pilon_+_5298_5470_8482_8526
916287	contig_1435_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_115526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592346	594178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_592300_594200
916288	contig_11720_pilon	-	1106	10	Intergenic	novelGene_43837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
916289	contig_5485_pilon	-	4435	5	Intergenic	novelGene_37754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_1	60.7453701939498	120	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	3523	4128	462889	459244	FALSE	10	ATGATTTTGCTTCTCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLCSNIQEMRARHRDAFLKKHNLKLGFMSAFVKASAYALQEQPVVNAVIDDTAKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNVEAMNFADIERTISELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAVGGKLEVRPMMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL	466411	458936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_459379_460469_460638_460843_460928_461234_461309_462744
916290	contig_9678_pilon	-	2707	7	Intergenic	novelGene_146361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_1	51.6228308664555	90	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	1205	2287	232365	213699	FALSE	45	CCAAACACAGTCTCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAECLPTTCFVPSHLVCFQTATGDTIVSSKSSALAAAHRAKREGEKKHGKNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSVAKQPELDHALKCLQREDPSLKVKLDPDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYGLETYLGPLQVAYRETILNTVRATDTLDRTLGDKRHLVTIELEASPTETSSVMPVIENAENVSEDRLKVFQEAIENGIHSACLQGPLLGSPVQDVAITLHSLIVLPGTSTTMISACVSRCVQKALKKADKQVLEPLMNLEVTVTREYLSPVLADLAQRRGNIQEIQTRQDNKVVVGFVPLAEIMGYSTVLRTITSGSATFALELSSYQAMNPQDQRTLLSQRSGFAKGF	233569	213278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9678_pilon_-_213837_214520_214704_219463_219580_222918_223099_225922_226062_227788_227866_232115
916291	contig_14094_pilon	+	2461	1	Intergenic	novelGene_145910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	1236	2222	264825	265811	NA	65	ATGACAACATTAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELQGPGDQANSHKQPIWAYQNKTRSSDTVSKHRINKYDNLLMAWRQQSISDHIKRQTMMASASSQNKESRNFLEEEYKRLIYRTLQEIRKEMMQNADQAIEELKKIREEHNDKFNRLQEAKERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAMEVRISEIEGKALDTNLFEEKSDKKILKNEETPRIRWDSIKRNNLQVIGVPKQRGITENTERIVEDLLAENFPHIVKDDKVSIQDGHRNLHKVDPKRQSPRHIRIKLTKTKDKERILRAHRDKQKVIYKGESIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCHPRIICPEKLSQI	263589	266050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_263600_266000
916292	contig_8541_pilon	-	4237	1	Intergenic	novelGene_105589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGGATTCTGAGGTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560153	555916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_555900_560200
916293	contig_12923_pilon	+	1038	1	Intergenic	novelGene_30161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTAAGTGCTCGGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288718	289756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_288700_289800
916294	contig_3153_pilon	+	2710	12	Intergenic	novelGene_104665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTGTTTCCGAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193038	247683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_194874_204933_204999_206342_206394_207413_207517_209572_209693_212233_212287_214493_214582_217132_217170_217855_217966_229042_229140_233950_234036_247617
916295	contig_17427_pilon	-	2281	12	Intergenic	novelGene_30349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1007.29416616502	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	30	671	188879	179740	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWPQTILCT	204690	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179767_182705_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
916296	contig_19744_pilon	+	3989	16	Intergenic	novelGene_120349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_7	115.423086464056	1525	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	20	2215	9142	84616	FALSE	35	GGGAATATAATTGTAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGVENMATAMDEDLEEELDEKDEKSMMCPPGMHKWKLEQCMVCTVCGDCTGYGASCVSSGRPDRVPGGICGCGSGESGCAVCGCCKACARELDGQEARQRGILDAVKEMIPLDLLLAVPVPGVNIEEHLQLRQEEKRQRVIRRHRLEEGRDGSGERGEKDASKITTYPPGSVRFDCELRAVQVSCGFHHSVVLMENGDVYTFGYGQHGQLGHGDVNSRGCPTLVQALPGPSTQVTAGSNHTAVLLMDGQVFTFGSFSKGQLGRPILDVPYWNAKPAPMPNIGSKYGRKATWIGASGDQTFLRIDEALINSHVLATSEIFASKHIIGLVPASISEPPPFKCLLINKVDGSCKTFNDSEQEDLQGFGVCLDPVYDVIWRFRPNTRELWCYNAVVADARLPSAADMQSRCSILSPELALPTGSRALTTRSHAALHILGCLDTLAAMQDLKMGVASTEEETQAVMKVYSKEDYSVVNRFESHGGGWGYSAHSVEAIRFSSDTDILLGGLGLFGGRGEYTAKIKLFELGPDGGDHETDGDLLAETDVLAYDCAAREKYAMMFDEPVLLQAGWWYVAWARVSGPSSDCGSHGQASITTDDGVVFQFKSSKKSNNGTDVNAGQIPQLLYRLPTSDGSASKGKQQTSEPVHILKRSFARTVSVECFESLLSILHWSWTTLVLGVEELRGLKGFQFTATLLDLERLRFVGTCCLRLLRVYTCEIYPVSGMMNFFKMTLERKYLRR	9122	86390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_9330_11793_11940_12240_12343_28546_28667_29612_29695_41638_41757_47388_47594_48605_48760_66015_66189_67270_67397_67483_67612_72996_73089_75259_75395_77724_77809_81254_81352_84370
916297	contig_9400_pilon	-	822	1	Intergenic	novelGene_146601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158630	157808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_157800_158600
916298	contig_6059_pilon	-	2741	14	Intergenic	novelGene_44831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4175.07318151502	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	563	2287	584299	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584861	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_571326_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
916299	contig_2924_pilon	+	2810	16	Intergenic	novelGene_140257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_8	411.14423530219	1498	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	16	1824	66050	303804	FALSE	25	CACCAGGGGGGGAAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIKKEMKKDPLTSKAPEKPMHEVSGGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESEDLSISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTIVTAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPPTSATQESSKTEVDSRTKTKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVALINKDCIDLGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPETLPNRTEEKEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSVSRPIAMPPRRPERPVGPLTHTRGDGPKIDLVGSAISSILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEDDKEEHVSLAHRGADASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGAMAAGGGPAPLSAAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKVEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK	66034	304790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_66159_125503_125608_135679_135810_147478_147685_185699_185776_199573_199669_221847_221956_236286_236339_239711_239793_242630_242782_259354_259441_287622_287733_293259_293389_297301_297568_302765_302830_303762
916300	contig_7758_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_163550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	140	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACTTAAGTTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195333	197785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_195300_197800
916301	contig_1443_pilon	+	4154	3	Intergenic	novelGene_28152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAACATGAGTCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255753	324409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_257161_318685_320421_323397
916302	contig_18364_pilon	+	1915	2	Intergenic	novelGene_102577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTCCTATGACGGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149297	151278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_150902_150967
916303	contig_11422_pilon	-	994	1	Intergenic	novelGene_99042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1738	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1700
916304	contig_7171_pilon	+	2903	3	Intergenic	novelGene_101431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCATACTGAATTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575889	1745879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1578366_1718944_1718955_1745462
916305	contig_9732_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_98357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTAAAACTTAGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261863	263809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9732_pilon_+_261900_263800
916306	contig_5779_pilon	-	1057	2	Intergenic	novelGene_106431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	141	473	94343	94011	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94483	93292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93733_93866
916307	contig_10930_pilon	-	4195	4	Intergenic	novelGene_36997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1810.3989124561	59	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	3338	4105	274400	267520	FALSE	30	GACTACTTTGTTAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNSDRKAGSDGFCCYFKKSCLPSAGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLY	277737	267429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_267526_268438_268580_272837_273009_273950
916308	contig_7179_pilon	+	2924	2	Intergenic	novelGene_78143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	255	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGTTGCTCAGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996712	1000251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_999617_1000231
916309	contig_6375_pilon	-	1782	5	Intergenic	novelGene_73017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	28.4550083465108	8	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1085	1780	397099	395248	FALSE	30	TCTGCAGCCAAGAATTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNVHNHITNDKRFNGSESIKSSWNISVVKFLLEKLKQELVTSPHNYTDKELKGACVAYFLTKRREYRNSLNPFKGLKEKEDKKLRSRRYRLFANRSSIMRHFGPEDQHLWKDVTEELMSDEEDSLNEPGVWVARPPRFRAQRLTELCYHLDANSKHGTKANRVYGPPSDRLPSAEVQLLPPELYNPNFQEEEDEGGDENGLVSPSFDQPHKTFCPDLNSFIEIKVEKDE	402584	395245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_395668_395950_396064_396709_396814_397040_397103_401503
916310	contig_17976_pilon	-	2579	4	Intergenic	novelGene_32468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGAGGTTTCTGCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48857	41586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41646_41811_41856_45522_45583_46441
916311	contig_6885_pilon	+	3788	1	Intergenic	novelGene_83639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGGGCTTTGACAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123341	127129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_123300_127100
916312	contig_13780_pilon	-	1985	13	Intergenic	novelGene_149078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_12	1187.74828983249	8	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	104	1852	699220	657588	FALSE	15	CGCCCGGGAGCGAGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKHIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	713236	657454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686641_688702_688760_694786_694858_699201_699268_713180
916313	SIRV6	+	990	8	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	163	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	46	5	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	101	442	1673	2560	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKTPLQNVYTLRSKTLPHHMLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDASTNLCSPFQLVQLLKCQLRFVLKQSVVSAVKS	1466	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2035_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
916314	contig_7201_pilon	-	3146	18	Intergenic	novelGene_152486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	379.268764661356	1	83	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	381	845	229608	171350	TRUE	20	GTTCAAAGACTGGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTVTPALQPTNLLSQWGPKDGGSQTPLLRATALRLCPWLRRRGYVCYFSTSTHHHTKFYSDPVEAIKDIPDGATILVGGFGLCGIPENLIGALLKTGVKGLTAVSNNAGVNNFGLGLLLHSRQIKRMVSSYVGENAEFERQYLAGELEVELTPQGTLAERIRAGGAGVPAFYTSTGYGTLIQEGGSPIRYNKDGSIAIASKPKEVREFNGQHFILEEAITGDFALIKAWKADRAGNVIFRKSARNFNLPMCKAAETTVVEILALLPQKTSIFLRFMYIAL	255860	66397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_67233_69432_70210_83641_83744_93179_93261_108085_108176_153032_153109_153715_153789_161664_161708_163997_164088_169479_169585_171320_171413_213983_214045_216545_216653_224245_224396_229524_229661_238453_238545_239711_239821_255732
916315	contig_8712_pilon	-	2120	9	Intergenic	novelGene_58871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_5	46.3782006981728	121	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1653	1952	881988	881689	FALSE	15	CAGGCAGGTCTGTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGQVPGGSCGPPRSPAGHPSHPWPGQSEGPRQQTPAFPGWCPLGRKHLSGLSPSRHPDRVSLELWKQQRAAWPANSPSPDRPGSAAAASCRWDSVLH	895090	881520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_882234_882757_882856_883618_883703_883869_883954_886898_886986_888549_888643_889205_889287_893149_893222_894282
916316	contig_7022_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_142150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTCAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182986	184947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_183000_184900
916318	contig_12327_pilon	-	3002	8	Intergenic	novelGene_140693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	188	junction_7	216.178308866754	50	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1230	2099	1151840	1145558	FALSE	60	GAAATAAGACAGAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMKNRQVNHARNIWDRAITTLPRVNQFWYKYTYMEEMLGNVAGARQVFERWMEWQPEEQAWHSYINFELRYKEVDRARTIYERFVLVHPDVKNWIKYARFEEKHAYFAHARKVYERAVEFFGDEHMDEHLYVAFAKFEENQKEFERVRVIYKYALDRISKQEAQELFKNYTIFEKKFGDRRGIEDIIVSKRRFQYEEEVKANPHNYDAWFDYLRLVESDAEAETVREVYERAIANVPPIQEKRHWKRYIYLWVNYALYEELEAKDPERTRQVYQASLKLIPHKKVCLF	1155112	1144654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1145633_1146314_1146507_1147457_1147629_1148715_1148895_1151136_1151304_1151754_1152768_1153599_1153753_1154963
916319	contig_10106_pilon	+	3163	1	Intergenic	novelGene_73905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAATAGCATGTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179986	183149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_180000_183100
916320	contig_7730_pilon	-	2754	2	Intergenic	novelGene_156269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	4	408	120951	120547	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAGAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMILYTENPKESTRKLLALIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEDITKSIPFTIAFKKIKYLGTNLTRDVRDPYKENYKTLLQETKKDLHKWKNTPCSWIGRLNIIKISIPPKVINRYNAKPNPNPNSIF	120954	100265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_101549_119483
916321	contig_10159_pilon	-	2775	8	Intergenic	novelGene_30783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	116.404291946962	16	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	363	1025	353226	349428	TRUE	25	TTAAAATTTTGTTTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKIGLSSH	419155	316532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_317411_317769_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_349371_349450_352585_353440_419006
916322	contig_7165_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_116877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	153	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	573	1958	2530	671232	670660	NA	30	AGCTGGCCATCCAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVVVQNKTPDESPVKENALQLPDREFKSLILRILRELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLAEFRKIKQEQNAKINSQLEIIQRQQVEIQKINNKVSEMDSVIEGLRSRFETVENRITGIEDKHLDTTLFQENSEKRIKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENRERIIEELLTENFPNIMKDE	673189	670658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_670700_673200
916323	contig_7840_pilon	+	2914	12	Intergenic	novelGene_68975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	449.079131240478	3	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	976	2079	299444	304775	FALSE	35	ACTAGGTTATAGTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQANGTDSAFHVLAAKPAHTALAPVAMPVRETNPWANAPDAANKEIAAIYSGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSVVPPLQPAFVPAQSYPVANGMPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	183030	305610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_269016_269050_292102_292178_295141_295283_298003_298201_299336_299535_301110_301261_303007_303155_304059
916324	contig_10259_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_177194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58536	56387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_56400_58500
916325	contig_2342_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_132778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGAAACTATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600379	602101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_600400_602100
916326	contig_7051_pilon	+	2237	12	Intergenic	novelGene_64347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	519.275035008878	2	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1767	471	2237	335902	347598	FALSE	65	CAGGATAAAAGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKERERE	321869	347598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_330091_330170_331803_331924_334316_334513_335893_336118_337641_337814_338679_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
916327	contig_5947_pilon	+	3456	6	Intergenic	novelGene_101594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	2721	3455	1220324	1300221	FALSE	30	TTTACTTGGATCCACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPETCDPMKCRNYQTIPLISHTSKIMLKIIQKRLQQYMDRKLLEIEAEVRRGCGTRDIIAAVRWILTESREYQKVVHLCFIDYAKAFNCVDHTKLWITFQRMGIPQHLILLMRYLYIDQEAVVLTEQGDTAWFKVRKGVCQGYILSLYLFNLYAERIMREAGLYEEEPGIKIGGRLIINLPYANDTTLLAESQEDLKHLLMKIEDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVRVS	884460	1300222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_884861_888541_890255_1089065_1089077_1156211_1156239_1219754_1220443_1299605
916328	contig_14341_pilon	-	2724	2	Intergenic	novelGene_111802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTTGACCCCATCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469909	441994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_442002_467192
916329	contig_14288_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_153840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAAAAAAAAGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471228	473375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_471200_473400
916330	contig_6272_pilon	+	2793	2	Intergenic	novelGene_160437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	469	junction_1	0	80	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	179	2269	122506	124596	FALSE	40	AACGGATGAGAAAGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIQQCVVANKLPRNRPYVCNICFKHFETPSKLARHYLIHTGQKPFECEVCHKTFRQLVHLERHQLTHNLPFKCSICQRHFKNLKTFVKHQQLHNETYQSDVKQVRRLEAKQEKPVYGVYRTFAPEERWTLHPCSKPDATYNPTKRRKTIHACTICGKMFPSQSKLDRHTLIHTGQRPFKCVLCSKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSKLLKHKQIHTRNKTFQTLSLKVKSPESCPLPSKLNAKQDGFENGDMGESEENSPLDVHSIYIVPFQCPECEECFESEQILNEHKCFPARGGKIPSRLKRSYNYKTTVKKILAKLKRAGGKKLDNFRSEKKVFKTSFLKNCDLTSGEQSSEQTQKTFMGSLGKYGTYKTVGNQKKKTLTLPFSWQKQFQTQNVGKNLKGVLTTESMLTMDSSVNNKDMSVYGSSGEEFFDNCEVLQCGFSVPSENIHTGHKTCPCDKCEKVFPSISKLQRHYLIHTGQRPFGCNVCGKSFRQSAHLKRHKLTHIEKIPYRRSLCQVEFENLNKLFNRPGDNVNCNAFQQYQALGFHKCEVSESDQMSEIKVKAESEDFLLGAHCGNRQPCLSGTRPESEQRCCRRGPSSGRPERNEGLLYRCSVCSKSFRSPSKLERHYLIHAGQKPFECSVCGKTFRQAPHWKRHQLTHWKERPQEEMVVLNSVM	117729	125120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_117828_122425
916331	contig_13778_pilon	+	1132	1	Intergenic	novelGene_70860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTATTTCGTGGTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309869	311001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_309900_311000
916332	contig_7022_pilon	-	1121	2	Intergenic	novelGene_142129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTTAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42135	40563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_41380_41830
916333	contig_14357_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_121666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATAGGGTTTCCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491736	493603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_491700_493600
916334	contig_6076_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_81712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACGACGCATTCCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4392	1686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_1700_4400
916335	contig_165_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_117072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1698	2009	76287	76598	NA	45	TAAAAAAAAGGAGCGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKDTGKDECKGLMDHNYHSLHQTESSTTRWCPATTTDCSDRDHNRGSRTELEKNVEQNSNSQKKTRLTGLTETGETPRVSPRTPFYLSNEVTSEVHPSAKD	74589	76818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_74600_76800
916336	contig_3956_pilon	+	1486	7	Intergenic	novelGene_14951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1400.88524591496	5	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	347	979	1286460	1290491	FALSE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282862_1286174_1286224_1286409_1286606_1287276_1287530_1289851_1289892_1290297
916337	contig_7207_pilon	-	1556	5	Intergenic	novelGene_72088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	265	junction_3	104.64075448887	12	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	957	1556	696514	675990	FALSE	30	CAGATACCTGTAGCTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVI	738568	675989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916
916338	contig_5967_pilon	+	5061	2	Intergenic	novelGene_44414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	4162	4524	449710	450468	FALSE	75	AGAAAATACATAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEHKRLIYRTLQEIRKEINQNTEHATEEIKNIREEHNDKFNRMQESIQRQQSEIQKINNKISELDNSTESHLQSRVRKNKLELLSRKHAGKKAMG	445548	451005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_449993_450388
916339	contig_12080_pilon	+	3757	2	Intergenic	novelGene_128355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	978	1403	65019	65444	FALSE	80	AGGTAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKIPDDFSVEEKAHQLPDREFKSLIFRDIQELKQKADKKEEKIDKFMEKADKIMANTDKTMEELRKIIQEQNIKINSQLEIIHKQQFESQKINNKISEMDTIIEGLRSRCETTEDGISKIEDKYLATSLFEEKS	63893	67798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_63950_64097
916340	contig_3956_pilon	+	2138	11	Intergenic	novelGene_15053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1526.18650564078	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	81	1970	1281682	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHLSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVGPRCRRSGHTQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1283815_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287567_1290434
916341	contig_2834_pilon	+	287	1	Intergenic	novelGene_27992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATTAAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252778	253065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_252800_253100
916342	contig_17127_pilon	+	4491	6	Intergenic	novelGene_168300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	346	666	49767	50087	TRUE	25	CCAGGTTCCTGGCAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFILAGSRAQLEMPMKPTFLWGAGSSSMQPSSSSGCRAFRGILGESSASPTSSNTTTETYCCRSLPCWKRAHCLKVPMIPWGVECGLHWNDTRWTCFRFRKRSE	49421	58052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_+_52113_53694_53852_54064_54269_55036_56194_57659_57823_57933
916343	contig_14441_pilon	+	1481	6	Intergenic	novelGene_100323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	374.658778090144	4666	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	334	1299	6011	117610	FALSE	15	CTGCCTACGAGTGTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLLLVGPGPVLGALVSQHPSRAICKSGASVKIQCRSTGIQAWTILWYHQPPRQSFTLIATSNQGSSVTYEQGFTKAKFPISHPNLTFSTLTVTSGQAEDSSLYFCGASDTVNYDLTFGPGSKLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	5677	117792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6042_6604_6913_112104_112154_116578_116963_117220_117344_117539
916344	contig_12798_pilon	-	1130	1	Intergenic	novelGene_178971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTACTCCAGTATAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2889	1759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12798_pilon_-_1800_2900
916345	contig_9921_pilon	-	3164	1	Intergenic	novelGene_23729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	678	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	650	994	128181	127837	NA	45	TTTAAAAAAGGTTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECSLEARMTRLRLTYFECAIKRDQSLEKDIVLGKAEGQRKRGRPSMRWTDTVAATMGSSITRIVRWHSTGQCFIRLYTGSLSVGTDSMAPDNNNQIQNAKYKV	128830	125666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_125700_128800
916346	contig_4087_pilon	+	2736	1	Intergenic	novelGene_156080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAATGATGTTCAAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135634	138370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_135600_138400
916347	contig_11224_pilon	-	2980	1	Intergenic	novelGene_124449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	804	1142	16439	16101	NA	30	TCCCTGAACTATACAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILEKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGTLITCKFLLLIVSHIILRVSSFFFILFSDFSSNRVVSKCSPSILLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLPFGFLIVVFV	17242	14262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_14300_17200
916348	contig_3960_pilon	+	2023	1	Intergenic	novelGene_138030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAGCACCCCATCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543752	545775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_543800_545800
916349	contig_9646_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_117444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATGAGTTTGTCTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215870	214810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_214800_215900
916350	contig_17074_pilon	+	2636	9	Intergenic	novelGene_145108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	200.403616172463	78	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	122	871	208015	223810	FALSE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGVFNSTFPPLFRRTDSATCTRQDLVFIS	207893	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216577_223726
916351	contig_5217_pilon	-	623	5	Intergenic	novelGene_135768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3911	junction_4	1932.08928365125	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1	576	559918	557689	FALSE	15	ATATCTTGTGTTTATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	559918	557641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558851_559273_559374_559858
916352	contig_10095_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_57237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTCCTAGTCTGTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236835	235601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_235600_236800
916353	contig_10103_pilon	-	1781	7	Intergenic	novelGene_86174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_5	71.2476120457537	13	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	150	1676	686830	672305	FALSE	25	TTTTATCTTAATATTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYLCLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVVERNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDGSSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESNMPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPTVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLNYIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM	694493	672199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_673256_683709_683874_684193_684353_685338_685526_686764_686857_690179_690226_694416
916354	contig_8377_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_34940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68095	69569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69600
916355	contig_4659_pilon	-	1078	7	Intergenic	novelGene_118241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	419	junction_5	80.6337742856897	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	10	993	860030	819799	FALSE	25	TAAACATTTCTTTTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	860039	819713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_853789_853937_859916
916356	contig_16826_pilon	+	3486	1	Intergenic	novelGene_176310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1281	1634	6874	7227	NA	20	TCCTTTATCTGTGGCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPWAFSIGIMLGCSHPPTISFRISTMSIRPEKVTLILLSSWPNDGMLVCLYCMVFSPLNPDPLMETVAEMFFKNEAMERQISAPREIPRSPMPGPFTWKKGREKSQESRTYTKMFF	5593	9079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16826_pilon_+_5600_9100
916357	contig_7630_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_133662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	633	995	539921	540283	NA	25	CACATTCCACTGGATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSRNWSFLITCPKYMRQSLAILISKEHSGCTSSKADLFILLAVRGISSILCQHHNSKASILLQFSLFTVQLSHAYEANENIVALVRCTLVLKMTSLLFNTLKRSFTADLPNAIHRLIS	539288	541129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_539300_541100
916358	contig_3584_pilon	-	436	2	Intergenic	novelGene_108157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387124	386457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_386746_386976
916359	contig_16098_pilon	-	1895	7	Intergenic	novelGene_46135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_5	1641.03944870994	13	131	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1293	1691	456927	456273	FALSE	5	GGGGGAGTCTGTTGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460260	456068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457719_457851_457907_458405_458838_460148
916360	contig_12622_pilon	+	3112	17	Intergenic	novelGene_5800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	175.701884861119	6	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	1469	2956	446467	463579	FALSE	30	CACTGAACAATTTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQQQNQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLGKAHLGGPSWGRFACRLGASGVRPRYEWSRSEANGVFL	349682	463735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_401825_401940_404556_404636_405785_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_455251_457156_457348_460455_460537_463384
916361	contig_10005_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_148914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAGTTAACAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130098	131440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_+_130100_131400
916362	contig_17074_pilon	-	2587	8	Intergenic	novelGene_145113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTGTGGGGCCCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225482	207920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_208027_212341_212490_213416_213551_214119_214223_215065_215107_215399_215473_216281_216333_223551
916363	contig_17198_pilon	+	1480	1	Intergenic	novelGene_62438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAGAGGGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1290857	1292337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1290900_1292300
916364	contig_12793_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_164127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTACGAGGGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256500	254264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_254300_256500
916365	contig_9345_pilon	-	1877	6	Intergenic	novelGene_24664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	1844	junction_5	1529.97403899543	8	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	235	816	955353	947957	FALSE	20	GCAGTTTTCTAAACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001309	946895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
916366	contig_14925_pilon	-	1677	5	Intergenic	novelGene_55298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
916367	contig_16098_pilon	+	5963	16	Intergenic	novelGene_45828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1241	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3678	3992	201660	202163	TRUE	5	CATCTTCTTCTTCCCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPLTSEVATIGTLLVVKDSLIILHQAAQLLSQLQRQVLLGSGLSAMHHHCLCWLVQGGHQLLINDHLANDGVHSGQVQLKHVRQCLHADGVIDTAVGEEVGPK	197982	227313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_201836_201935_202025_202113_202182_202273_202430_204666_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215519_215681_226248_226377_226745_226860_226987_227041_227220
916368	contig_3424_pilon	+	2016	2	Intergenic	novelGene_55537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTCTGATTTTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269956	278413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_270794_277234
916369	contig_6102_pilon	-	2574	10	Intergenic	novelGene_32079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	200	junction_9	94.2785471061389	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	45	2276	788684	784643	FALSE	70	CCCAAAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRAVSLGQDRYRRRYWVLPYLAGIFVEGTEGNLVPEDVKQETDSLKAAAHPAYNTALFVKKELADSSTSAGSPARARGRPRKTKPGSVRPRHLKSPVKSEDSEQSHAQPQPEAQLHPQFHPQPQAQSQLQSHPQSHSEFLEPEGSPLSLSQSQHDLSQSAFLSWLSQTQSCGSLLSSSVLTPDSSPGKLDPAPSQPLEEPEPDEAESSPDLQAPWLNFSAQMPCNAAPTPPPAVSEDQSTPSPQLPASSKPLIRPSAADSCSPVQLCSTPLPVVTPKRRAGDPGETPQSPTGLGQPKRRGRPPSKFFKQMEQRYLTQLTAQPVPPEMHSGWWWIRDPETLDATLKALHPRGIREKALHKHLSKHRNFLQEVCLRPPTDSIFEPSQLPTFQEGLTSWSLKEKTYETDLAVLQWVEELEQRVILSDLQIRGWTCPSPDSTREDLAYCEHLPDSQEDITWRGRGREGLAPQRKTTNPLDLAVMRLAALEQNVERRYLREPLWSPHEVVLEKALLSTPNGAPQCTTTEISYEITPRIRAWRQTLERCRSAAQVCLCLGQLERSIAWEKSVNKVTCLVCRKGDNDEFLLLCDGCDRGCHIYCHRPKMEAVPEGDWFCAVCLAQQVEGEFTQQPGFPKRGQKRKSGYVLNFPDGDGRQRRLLSRGRENLVVPQCSEEGLSPSKRRRLSMRNHHSDLTFCEIILMEMESHDAAWPFLEPVNPRLVSGYRRIIKNPMDFSTMRERLLRGG	788728	784344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_784791_784899_785127_785506_785654_785774_785908_786012_786303_786493_786646_786755_786912_787035_787259_787417_788071_788581
916370	contig_5643_pilon	+	932	9	Intergenic	novelGene_38834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1790.82646772377	215	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	65	523	233973	237605	TRUE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSRHQWVP	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_237583_237635_237720_237819_237913
916371	contig_18081_pilon	+	2793	1	Intergenic	novelGene_23790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGTAAAAGAACTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98057	100850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_98100_100800
916372	contig_7022_pilon	-	3559	1	Intergenic	novelGene_142143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACTTTTCAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130109	126550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_126600_130100
916373	contig_10324_pilon	-	2801	2	Intergenic	novelGene_7857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353183	349707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_352006_352680
916374	contig_4385_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_141493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAAGGCATCTTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291803	290709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_-_290700_291800
916375	contig_11752_pilon	+	7638	5	Intergenic	novelGene_37634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1804.04412016447	874	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	80	817	84194	88933	TRUE	30	AAAGGTCTGGTGAACTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84114	106922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_94430_105597
916376	contig_11396_pilon	-	2762	1	Intergenic	novelGene_71342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACATCAAAATGACAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489609	486847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_486800_489600
916377	contig_12938_pilon	-	1546	3	Intergenic	novelGene_99751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	268	297	84609	84580	TRUE	25	GAGTGCTTAACCACTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDQYPHIWLYETGTKPGKRREEDKSASPGGNHLGIHITSGFEFPETKQVSPIQGSCRSQPQDPAGFINLAVQGQRKGHPQHRITHTQIVMIPIYRKLV	85711	82228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_83462_84563_84633_85467
916378	contig_1428_pilon	+	3777	1	Intergenic	novelGene_158394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAATCAGTAGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65858	69635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_65900_69600
916379	contig_5419_pilon	-	1517	2	Intergenic	novelGene_15481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAATTCACCTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116123	113931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_114384_115058
916380	contig_4350_pilon	+	3071	3	Intergenic	novelGene_136360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1989	2300	8499	8810	FALSE	60	CAGGGAAAAAAAAACCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFWPFCSCIIFLNSSILWSVVSMNLSAFSMNLSVLSSFLSTFCFNSLIILSIRDLNSVSDISSAFSSTGKSSGVLFWTPTVTILFCFCKCFDIVCCLRGIQ	1834	9581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_3261_7833_8232_8334
916381	contig_4392_pilon	+	2135	9	Intergenic	novelGene_117292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_3	31.1525982062492	81	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	144	1265	74856	99256	FALSE	35	AAAAACAGCTCATTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACVGRTRECTIVPSNHYGPIPGIPVGSTWRFRVQVSEAGVHRPHVGGIHGRSNDGAYSLVLAGGFADEVDRGDEFTYTGSGGKNLAGNKRIGAPSADQTLTNMNRALALNCDAPLDDKIGAESRNWRAGKPVRVIRSFKGRKISKYAPEEGNRYDGIYKVVKYWPEISSSHGFLVWRYLLRRDDVEPAPWTSEGIERSRRLCLRLQYPAGYPSDKEGKKTKGQSKKQTSETSKRPNPDDECPSASKMVKRSDSAEAVEAFQLTPQQQHLIREDRHNQKLWDEVLAFLVEGPNFLKKLEQSFMCVCCQELVYQPVTTECLHNVCKDCLQRSFKAQVFSCPACRHDLGQNYIMTPNENLQTLLDLFFPGYSKGR	74712	100126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_74961_79382_79488_87126_87234_90532_90696_91385_91527_93213_93311_93615_93774_97390_97490_99109
916383	contig_13004_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_112710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	536	850	847663	847977	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGLEICCVDFSAPSFLPRHTAVIKMLIIIIPYLYTALSRARHCSQCLLIFIFATKRLLYLYLFIYLYRSASGTIVRHLPVNRKVSSSNPSAALQEKKPGNLLP	847127	848369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_847100_848400
916384	contig_15857_pilon	+	2327	1	Intergenic	novelGene_152067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGGGACAGAGAAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50849	53176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_50800_53200
916385	contig_5586_pilon	+	707	1	Intergenic	novelGene_143536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTATAAAGAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317819	318526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_317800_318500
916386	contig_9995_pilon	+	3032	1	Intergenic	novelGene_47814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGGCCTGAAATCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878493	881525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_878500_881500
916387	contig_4068_pilon	-	2752	23	Intergenic	novelGene_161701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_21	48.453799243785	148	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2244	509	2752	112702	29016	FALSE	40	GTTAGTGGACTACAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALHLACANGHPEVVTLLVERKCQLNVCDSENRTALIKAVQCQEEECATILLEHGADPNLMDVNGNTALHYAACGQNISIAAKLLSHNANIEARNKNDLTPLLLAVSENKQQMVEFLVKKEANIHAVDKAKSNRQLISEYKEEKRPKNSSQNNNPDIEIQESPRQISRRTESRKVDESSDEDSSSRLSKKPGVDDSWPTSDDEDLDLGIQNVAKPNLTKLITASQQSRKNIEEKPSIVRPEKRTLFEDSNSDSEDEDVVETLPKPSFTVQGFSHPAFPPSDPPLKPSLNFSAVPGVTKEGAAKPAVGKRENSIDIIESAPREQRNNDNLTYIDGAHKNNRSDMMSALGLGEEEDVESPWDSESVSESLAQKYVGHFSGATDEKGENIVNGQIEDSPEKYPHLKPIQPIIEMKDSTPDKAAERKDVQTSKSDFSDWDSTSLTHKLSRDLKVDDKCPFVSQSMTKSQSASTEFGEMTLIDKEKINIGAVFLLGNYPLHDLCESHLPENKESKEDLSAELDLEMTSEEERERLDERENNRPQVEEERKKFKSSELEVTENTYDPAIDNGANGFIKQGKSGKSDNQQFCIKENDDSDSSDPALHMKKVKKYDSKKWTSEESAITSVLQKANSLTGVLQVNDDSSLSEIDQDEGRPAKKTSDEESKVQKQINSMNDLDDLSQSSETASEDCALPNSNYKNSMLLIEQLGMDCKDSVSLLKIQDAILSYERLVELKKNHCELLTGKIKKMENK	113827	29015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_29132_34322_34465_34756_34791_37125_37294_42831_42996_61062_61146_63826_64070_78188_78271_78366_78396_80957_81052_83468_83531_83831_83962_85997_86201_86292_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102902_108099_108274_109188_109304_112700_112792_113408
916388	contig_13778_pilon	+	3873	1	Intergenic	novelGene_70849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3092	3418	253362	253688	NA	20	TCCCCATTTCCATCCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRNLFSHSPLGYKSKFRASAPRERFLCRLWRKVRGINLPLIWELRCAGTSGPKDALCSQHCFLGGMRFLCVSACCSLLYLRRDWLKTLSNLVYLISTTVANPSY	250270	254143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_+_250300_254100
916389	contig_4083_pilon	+	2874	1	Intergenic	novelGene_152323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCAGCCAATTACTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50192	53066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_50200_53100
916390	contig_5686_pilon	+	3329	3	Intergenic	novelGene_45223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	2	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	654	995	94439	94780	TRUE	70	TTTAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93785	99206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94918_96945_98146_98209
916391	contig_10494_pilon	+	6442	1	Intergenic	novelGene_102231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	362	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATGCCAGGACTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263134	1269576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1263100_1269600
916392	contig_2917_pilon	-	2075	6	Intergenic	novelGene_147573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	246.452104880441	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	411	992	109433	77876	FALSE	60	GTATCAAACTAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVNQSKRPHKGTHFTRWSQLL	124090	76792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_123985
916393	contig_10902_pilon	+	1505	9	Intergenic	novelGene_65683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	64	junction_8	315.584378574099	206	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1044	461	1504	189165	234701	FALSE	35	AGGATCAGCACAAAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYSFRPRPPASSTSELQRNELSKFMKGKN	160610	234702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452_218579_234622
916394	contig_3975_pilon	-	3182	2	Intergenic	novelGene_54812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2131	2574	2235496	2235053	TRUE	10	TTTATTGTATGTGTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDQSLLAVTRNRREEKRRVNSDGKVALIKGRVAQSVVVLAVSKLYIYKKLNWQKSCVRDNIYNNAKKKNWFLVWRFRVVVSWDISVNWSNNVFGAFVLPPSLLDSVWGLRSLQAAIQGSTIGLYSSRATQEEGETGIGRGYEMCG	2237626	2036059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2036216_2234600
916395	contig_1964_pilon	-	2390	15	Intergenic	novelGene_130902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_13	364.631159739621	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1980	411	2390	158795	116037	FALSE	35	ACCCCAGCTGAACGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYVLSSSPADKLDSRFRKGTFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDLKQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPPEVLGPLPNPTANKPLVEEFSNAETQNLDAMEQVGLDSLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQLFQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGVPWGVYPANLFQQQAAAAANNTASQQAASQAQPGQQQVLRAGASQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYYDQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTAGSLTGTTNGLFRPIGTQPPQQQQQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLSNSSQSTSLFSHGPGQPGSASLGFGSSGSLGAAIGSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRPSSSLAPIGQPFYNSLGFSSSPSPIGMPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKFRGASSTSSLFSSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIVEFSQDQHGSRFIQQKLERA	210237	116036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_116065_119210_119479_138056_138294_142615_142907_143025_143170_148382_148522_150074_150218_152871_152998_154587_154682_154853_155125_157972_158143_158726_158915_166164_166274_173681_173751_210124
916396	contig_14415_pilon	+	3677	1	Intergenic	novelGene_77582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGAGCTGGTGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8187	11864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_8200_11900
916397	contig_7446_pilon	-	1824	2	Intergenic	novelGene_101965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	255773	255375	TRUE	90	AAAAAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYSFFLLPFFFFFHFCFSPFLSLSSLHSTPVASSHSSLFCLCVCLWLLFLSSLSLIFPIPVLAPHITIYPLLPAYLHCALNITLTSSTGTAYWNLPCTGSRSALSALVHATNNPSQQLPFSWTCPAVPYLID	255773	253839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_254296_254405
916398	contig_12078_pilon	+	2258	1	Intergenic	novelGene_74117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTTTTATTTCCTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415464	417722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_415500_417700
916399	contig_8322_pilon	+	2746	6	Intergenic	novelGene_143243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	53	junction_4	461.248999998916	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	441	1370	292682	295697	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSIYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGRCTRNNLFSSNIVSL	290138	297073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294560_295076_295472
916400	contig_6412_pilon	+	5017	7	Intergenic	novelGene_149936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCCTTCTATGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60197	385994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_60857_87271_87844_102979_104328_139282_140214_228843_229290_229560_230387_385759
916401	contig_5003_pilon	-	3932	1	Intergenic	novelGene_120186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2704	3024	22503	22183	NA	25	GGAGGATGTTGAGACTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALFTIAKRWKQPRCPSADEWINKLWYVHTMEYYTTMTMNLKHLITWVNLEGIMLSEISQSQQDKYYMRPLLRELKKRFKHRRKHSLMVTRVRREGEGNSLTR	25206	21274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_21300_25200
916402	contig_11316_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_122621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	352	864	137674	138186	NA	40	GAACCCCTAATGACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137322	139366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137300_139400
916403	scaffold_12124_pilon	+	2097	12	Intergenic	novelGene_22284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	3200.05802116821	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1437	1940	1508902	1509405	FALSE	35	GAAATGTGTGGTAAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1509562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1492789_1492949_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508638_1508789
916404	contig_753_pilon	-	1538	4	Intergenic	novelGene_112912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCGTCCCCCAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302308	298102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_299379_300682_300851_301708_301765_302270
916405	contig_9706_pilon	+	2596	1	Intergenic	novelGene_20994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAGAAAACAATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445110	447706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_445100_447700
916406	contig_3948_pilon	+	2059	2	Intergenic	novelGene_53245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCAAATGTCTTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195544	1198315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1197281_1197992
916407	contig_2988_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_136538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTGAGAAACTATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36949	36014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_36000_36900
916408	contig_7247_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_176691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	976	1431	132676	132221	NA	30	AACTTGCTGTTGAACGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEFCKTNNLFIANTFFQQYRQQLYTWTSPDRIHRNQTDYICGKRQWRSLISSVRTRSGANCGTDHKLFLCKFKSKLRKIETSPREPKYDLEYVPPEFRDYLKKGFDALNTNDQRPDVLWDDVKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETL	133651	132219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_132200_133700
916409	contig_5575_pilon	-	6570	20	Intergenic	novelGene_122057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	44	junction_1	64.1415937151653	232	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1399	4200	23	4222	224707	136639	TRUE	20	TGTAATTCCTGTCATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLGDSSSDPANPDSHKRKGSPCDTLASSTEKRRREQENKYLEELAELLSANISDIDSLSVKPDKCKILKKTVDQIQLMKRMEQEKSTTDDDVQKSDISSSSQGVIEKESLGPLLLEALDGFFFVVNCEGRIVFVSENVTSYLGYNQEELMNTSVYSILHVGDHAEFVKNLLPKSLVNGVPWPQEATRRNSHTFNCRMLIHPPDEPGTENQEACQRYEVMQCFTVSQPKSIQEDGEDFQSCLICIARRLPRPPAITGVESFMTKQDTTGKIISIDTSSLRAAGRTGWEDLVRKCIYAFFQPQGREPSYARQLFQEVMTRGTASSPSYRFILNDGTMLSAHTKCKLCYPQTPDMQPFIMGIHIIDREHSGLSPQDDTNSGMSIPRVNPSVNPSISPAHTVVRSSTLPPSSSNMVSTRVNRQQSSDLHNSSHSNSSNSQGSFGCSPGNQIVASVALNQGQAGSQSSNPSLNLNNSSIEGTGITLAQFMSPRRQVSSGLATRPRRPNNSFSPNIPPLSSPVGMTNSACNNSNRSYSNIPVTSLQGMNEGPNNSVSFSASSPVLRQMSSQNSPSRLNIQPTKAESRDNKEITSILNEMIQSDNSSSDGKPLDSGLLHNNDRLSDGDNKYSQTSHKLVQLLTTTAEQQLRHADIDTSCKDVLSCTGTSSSASGNSSSGSCPSSHSSLTERHKILHRLLQEGSPSDITTLSVEPDKKDNASTSVSVTGQVQGNSSVKLELDTSKKKESKDHQLLRYLLDKDEKDLRSTPNLSLDDVKVKVEKKEQMDPCNTNPTPVTKPAPEEVKLESQSQFTADLDQFDQLLPTLEKAAQLPGLCETDRMDSAVTSVPIKSEILPTSLQSTTARPTTRLNRLPELELEAIDNQFGQQGTGDQIPWANNAVAAVNQNKPEDQCISSQLDELLCPPTTVEGRNDEKALLEQLVSFLSGKDETELAELDRALGIDKLVQGGGLDVLSERFPPQQATPPLMMEERPNLYSQPYSSPSPTANLPSPFQGMVRQKPSLGTVPVQVTPPRGAFSPGMGMQPRQTLNRPPAAPNQLRLQLQQRLQGQQQLIHQNRQAILNQFAAAAPVGINMRSGMQQQIAPQPPLNAQMLAQRQRELYSQQHRQRQLIQQQRAMLMRQQSFGNNLPPSSGLPVQMGNPRLPQGAPQQFPYPPNYGTNPGTPPASTSPFSQLAANPETSLANRSSMVNRGMTGNMGGQFGTGISPQMQQNVFQYPGSGMVSQGEANFAPSLSPGSSMVQMPIPPPQSSLLQQTPPTSGYQPPDMKAWQQGAMGNSNVFSQAVQNQPTPAQPGVYNNMSITVSMAGGNTNVQNMNPMMGQMQMSSLQMQGMNTICPEQMNDPALRHTGLYCNQLSSTDLLKTETDGTQDKKTEEFFSVVTTD	224729	134205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_-_136542_136626_136684_140380_140471_151566_151751_157546_157722_167134_167538_169852_169955_173394_173710_174858_175028_176688_176807_185356_185538_187907_189229_190504_190653_197995_198137_202517_202614_203838_204019_207723_207902_216141_216240_220144_220312_224618
916410	contig_6576_pilon	+	4120	3	Intergenic	novelGene_42314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	582	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1781	2338	532130	532687	TRUE	40	TGGACATAAAATGATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEKTVSLTSGAGVTGYPSAKKLKEDPYLTTCTKTNSKWTKDLNIKSKMIMIMEEKIETMLGALIYGINRIQNIINNVQTPEERLDNWELLKIKYLCSSKYFTKRVKRPPTDREKIFGYVKSDQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDIILTHNKKTRFTDLKETEETPRVWPPDTLLVQW	530207	585474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_531326_531467_534318_585322
916411	contig_13201_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_130867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGACCTTTCCTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20025	22288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_+_20000_22300
916412	contig_10023_pilon	+	4058	14	Intergenic	novelGene_123456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	14.2592231130235	115	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	135	1391	46607	51615	TRUE	35	AAAGCCAGGGTAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKIALGLGIPASVTVVYILYRRYRESREERLTFVGEDDIEVEMRVPQEAVKLIIGRQGANVKQLRKQTGARIDVDTEDVGDERVLLISGFPVQVCKAKAAIHQILTENAAVSEQLSVPQRSVGRIIGRGGETIRSICKASGAKITCDKESEGTLLLSRLIKISGTQKEVTTAKHLILEKVSEDEELRKRIAHSAETRVPRKQQISVRREDVTEPHGGGDPALWENATCGTEQAVPLVVPPHRGGGDMAAIGLPPEDGSGAKANGDGFEEESAAQASPEMSMFEIPSPDFSFHADEYLEVYVSASEHPNHFWIQIIGSRSLQLDKLISEMTQHYEHSPPEDLAVQVGDIVAAPLPANGSWYRARVLGTLENGNLDLYFVDFGDNGDSPLEDLRALRSDFLSLPFQAIECSLARIAPLR	30019	55080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_30092_46544_46692_47359_47467_48077_48268_48979_49120_49191_49523_50590_50752_50937_51111_51314_51381_51611_51764_51977_52080_52337_52435_52600_52693_52852
916413	contig_6445_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_77122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTGCTGGGCACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441080	1439194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_1439200_1441100
916414	contig_12464_pilon	-	2709	1	Intergenic	novelGene_68654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCACCTAAAACATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120621	117912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_117900_120600
916415	contig_15371_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_151473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	312	611	216466	216167	NA	40	ACACTACAGAACAGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIYLPGLSIMILTVIQRHLPVWSNSTGFQVAVVSGECGDEASMVDGAHRPLLLILGKVWPWKQQDIREGSAHQHLSLEGTIESIHQGGQRARDSRAAP	216777	214033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_214000_216800
916416	contig_91_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_127084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGATAGGATAATGACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188529	187586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_187600_188500
916417	contig_14925_pilon	+	2211	3	Intergenic	novelGene_55383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_2	28.5	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATTAGAGCTGTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150120	158522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_150186_153924_154028_156479
916418	scaffold_12124_pilon	+	2134	11	Intergenic	novelGene_22350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3172.38362119085	3	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	294	671	1490385	1508039	TRUE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483868	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508722_1508789
916419	contig_15063_pilon	+	4103	6	Intergenic	novelGene_10437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_5	3551.08261801947	67	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_39092_39506
916420	contig_6710_pilon	-	555	2	Intergenic	novelGene_94427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	GCACCTGTGGTTTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
916421	contig_18511_pilon	-	2786	2	Intergenic	novelGene_126884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATAATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39947	37029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_38207_38338
916422	contig_5217_pilon	-	615	5	Intergenic	novelGene_135758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2190.77554760865	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTGTTTATGTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560391	557638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558527_559275_559374_559858_559966_560368
916423	contig_5196_pilon	+	2122	11	Intergenic	novelGene_38696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	93.9235859622065	38	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	424	1398	302305	336267	FALSE	20	ACTGAAATCTGGTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGYLVAIFLSAIFLYYVLHCILWGTNVYWVPPVEMKRRNKIQPCLSKPAFASLLRYHQFHPFLCASDFKKIASLYGNDKFDLPYGTKTSAEYFRVALSKLQSCDLFDEFDNVPCKRCVVVGNGGVLKNKTLGEIIDSYDVIIRMNNGPVLGHEEEVGRRTTFRLFYPESVFSDPVHNDPNTTAILTTFKPLDLKWLWELLTGGKIKPASDLIYKPYQIRILDPFITRTAAYELLHFPRVFPKNQKPKHPTTGIIAITLAFHICHEVHIAGFKYNFSDLSSPLHYYGNATMSLMNKNAYHNVTAEQLFLKDIIDKNYVISLTQE	281093	336991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_281334_281606_281779_302293_302394_304819_304898_309130_309235_310808_310873_328015_328112_331045_331233_331362_331480_334900_335054_336180
916424	contig_7587_pilon	+	3728	3	Intergenic	novelGene_163719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	2594	3433	247605	248444	FALSE	55	AGTCTCAGCAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	230264	248739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_+_232129_246635_247335_247574
916425	contig_19737_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_158971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCTAGCATCTATATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40448	42971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_40400_43000
916426	contig_15867_pilon	-	4120	18	Intergenic	novelGene_170904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	77.1278541277595	552	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	88	1725	298984	266482	FALSE	25	TCAATGAGCTTAGATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIILQYNKLLEKSDLHSVLAHKLQAEKHDMPNRHEISPGHDGAWNDSQLQEMAQLRIKHQEELTELHKKRGELAQLVIDLNNQMQQKDKEIQTNEAKIAECLQTISDLEAECQELCGKLQDLERVNQTLKDEYDALQITFTALEEKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQEANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVLPDETSEQAEETSPVRAISRAATKRLSQPAGGLLDSITNIFGRRSVSSPPVPPDNMDSHPGSSKDVRVPATALYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEVFGDKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCIKTVFAGSICNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREMELLGKVTALDLNPERTELLSCSRDDLLKIIDLRKNVVRQSFSAPGFKCSSDWTRAVFSPDGSFVTAGSAEGSLYVWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVSVDKGSKAVLWSDY	302514	264086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_266576_267613_267716_268416_268465_268577_268728_269505_269612_269872_269994_276046_276119_277272_277344_279096_279203_281340_281444_282310_282368_282977_283065_286507_286574_292128_292381_293237_293312_294393_294500_298961_299056_302498
916427	contig_7730_pilon	+	2835	1	Intergenic	novelGene_156301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATGGTACTGAGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428545	431380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_428500_431400
916428	contig_10377_pilon	-	6020	6	Intergenic	novelGene_115405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	125	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATGGTCATGAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302257	231015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_234605_267573_267967_269074_269311_280182_280747_282853_282981_301146
916429	contig_17274_pilon	+	1126	1	Intergenic	novelGene_26481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTGTTGAGAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24372	25498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_24400_25500
916430	contig_1964_pilon	-	1372	4	Intergenic	novelGene_130925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.1434160364686	10	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	15	350	579155	566322	TRUE	15	TCCCTCCGGTGCAGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAVMQSPAVLVTSRRVQNVHTGLDLTVPQHQEVRGKMMSGHVEYQILVVTRLAVFKSAKHRPEDVVQFLAPGPQGRWISPAETSPSWMQTARQGMMGRLSISSGSRMEWRERVC	579169	550924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_551859_566233_566460_574982_575149_579123
916431	contig_6191_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_107841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCGAATTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141115	143448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_141100_143400
916433	contig_405_pilon	+	4457	6	Intergenic	novelGene_135305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.5472502950782	126	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	415	897	377197	413447	FALSE	35	ACATGTGAGATTTTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGSQPLDPRKTIFVGGVPRPLRAVELAMIMDRLYGGVCYAGIDTDPELKYPKGAGRVAFSNQQSYIAAISARFVQLQHNDIDKRVEVKPYVLDDQMCDECQGTRCGGKFAPFFCANVTCLQYYCEYCWASIHSRAGREFHKPLVKEGGDRPRHVPFRWS	329140	417007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_329309_330912_331003_359570_359694_377163_377270_388095_388278_413219
916434	contig_6497_pilon	+	2554	2	Intergenic	novelGene_35566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	230	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTACATAGTTATATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166332	169219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_166549_166881
916435	contig_610_pilon	-	6378	3	Intergenic	novelGene_76658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3794	4102	30688	30380	FALSE	20	GCAATGTCTGAGACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSNIISSMKLSLVSPVKIHHDSICTPFFPSPSITITHLIVSYSVYYYLFPSLLYKLLDGKIHDLFISLFTSASTPSNIVPCIQCVSNKFLLNRIKSDQPA	98362	28103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_31543_70497_70682_95607
916436	contig_2087_pilon	+	4201	2	Intergenic	novelGene_65546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2975	3457	7310	7792	TRUE	35	GCAACACCTGCAGCCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPARARGIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSHQRCSPDLEAAARPNVAPQPRRKGQRRCSESGTQAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKATPAAYKRHPESRPSGRAESKQPAALGQEPAAPGSRGANEQRPRDLTRAAAQTWKQPHTRT	4335	8831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_8264_8558
916438	contig_17198_pilon	-	4596	1	Intergenic	novelGene_62430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2903	3250	1209802	1209455	NA	75	GCTCAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYYLAIQRNDLSRYVKTCMNLKCILLSEGSQSENSELCDFNYMTFWKRQNFRENKKMSDCQRLWERGVDRIDEAQGISFSGSVLYDAVIVPDTVPLSDTFSFAAPVVNLNVCTF	1212704	1208108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1208100_1212700
916439	contig_5023_pilon	+	2509	11	Intergenic	novelGene_7189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2312.56893735084	44	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	133	1398	607279	647201	FALSE	20	TGTAGATGTTTCCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580796	648312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625835_647099
916440	contig_14030_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_62244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGCTCACAGGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361529	363290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_361500_363300
916441	contig_8377_pilon	+	1106	2	Intergenic	novelGene_34975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAAATTCCAAACCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68103	69328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68437_68555
916442	contig_10225_pilon	+	2609	14	Intergenic	novelGene_86828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	557.038651416217	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1184	1816	42707	46881	TRUE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYISRKPWSGSGSIRDSALTGLSARTFARQITRTCHPLMKRCLRSRCCRQEEGS	21307	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21601_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46526_46724_47325_47404
916443	contig_7695_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_41688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	549	384	932	1096312	1096860	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAARKNNNESVYHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	1095928	1098046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_1095900_1098000
916444	contig_18511_pilon	+	1682	10	Intergenic	novelGene_126880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	337.27996942863	4	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	129	1682	47371	59842	FALSE	50	GAAAAGAGCTATCAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQK	35443	59842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
916445	contig_8452_pilon	+	3168	2	Intergenic	novelGene_48119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059257	1076090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_1062297_1075961
916446	contig_6842_pilon	+	4192	1	Intergenic	novelGene_130812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	167	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	499	915	1685700	1686116	NA	25	TAAACAGTTCCTGTTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRGLFSICPVGYKSKFRASAPRERFLPEGGLSHQSSLGLGASQHRNLRSEGCTLLLALLSWWYEAPCVSACFFLLYLKRDWLKTLSNLVDLIGITATNLFCYIIVIEFTTHKEITSDYKMVHNHTILGIMTQPN	1685201	1689393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1685200_1689400
916447	contig_3281_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_128522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	807	1124	13834	14151	NA	35	GTTGGCTTTTTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFLKFLLDPFRKREKEDVDIPKYFSLFNPEDKSFLFSSAGDQCCMNAQQRVTSNIYRLCSTSGTDKVAIKSNVLFPPPRMSGATFVWHLRSLMLLQNHILESG	13027	14646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3281_pilon_+_13000_14600
916448	contig_4838_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_144797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAGAACAAAGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288778	290765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_+_288800_290800
916449	contig_8631_pilon	-	3047	16	Intergenic	novelGene_121972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	777	1121	845382	845038	TRUE	60	CTTAAAAGAAAAAGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKPKVSIKGDPPSRPIPLSELRHKTHAVEEEPSAVMVLGQRWVVSRALEKGGLALLLARLLGRFFGNGLAEVFAAAFTLPLTVVFTRLHSLFQAVLQKCGRTADSTFFFPCLI	846158	787692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_787842_790569_790640_792115_792228_794051_794146_798996_799133_799249_799385_807739_807892_809943_810069_810150_810286_811011_811078_820244_820333_821709_821809_832095_832188_832698_832797_843966_844095_844790
916450	contig_7657_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_30055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGCCATAGTTTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378706	380692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_378700_380700
916451	contig_1856_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_84872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATTGTACTAAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186100	183891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_183900_186100
916452	contig_2078_pilon	-	2467	13	Intergenic	novelGene_100174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	19	junction_6	60.4847891806049	20	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	73	1950	535379	505518	FALSE	10	TCTGAGGTGCATTTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSANSSRLHQEDKEPPVIYSELKKARPEDSPGQADSRDRDHEDATEYYENVPCTSSALDH	535451	505000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
916453	contig_20420_pilon	-	4173	1	Intergenic	novelGene_172484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52346	48173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_48200_52300
916454	contig_18096_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_58055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATACACATTGGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78861	77730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_-_77700_78900
916455	contig_1986_pilon	+	2484	7	Intergenic	novelGene_64131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	76.1221605929136	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	511	915	339967	348587	FALSE	30	AATTTTTATGTTAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGLAVIGVFLKLGKHHKELQKLVDVLPSVKHKNTVVEFGSFDPSCLMPTCPDYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQAIEVDDDQLEQFRTLLFTSEGEKEKRMVDNFRPLQPLMNRTVRSSFPHDYVLNIQV	328744	350156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_+_328881_330040_330239_338207_338327_339909_340006_341166_341230_342409_342566_348440
916456	contig_6847_pilon	-	1767	10	Intergenic	novelGene_143872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAGGGCCCCTCAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112358	77863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_77988_81026_81088_82018_82128_101146_101274_102053_102183_102631_102748_104093_104159_109787_109889_110422_110608_111608
916457	contig_8248_pilon	-	2379	12	Intergenic	novelGene_125026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	28.8552958600939	71	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	314	1600	158805	129579	FALSE	40	AAAGGTTGAGAAGTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSGLGKAATLDELLSTCIEMFDDNGELNNSYLPRIVLLMHRWYLSSTELAEKLLCIYQNASGESCNEFRLKICYFMRYWILKFPAEFNLDLGLIRITEEFREVASQLGYEKHISLIDISSIPSYDWMRRVTQRKKVSKKGKACLLFDHLEPIELAEHLTFLEHKSFRRISFTDYQSYVIHGCLENNPTLERSIALFNGISKWVQLMVLSKPTPQQRAEVITKFINVAKKLLQLKNFNTLMAVVGGLSHSSISRLKETHSHLSSEVTKNWNEMTELVSSNGNYCNYRKAFADCDGFKIPILGVHLKDLIAVHVIFPDWMEENKVNIVKMHQLSVTLSELVSLQNASHHLEPNMDLINLLTLSLDLYHTEDDIYKLSLVLEPRNSKSPTSPTMPNKPVVPLEWISGVMPKPDPTVINKHIRKLVEVSG	201906	128799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_129705_136163_136242_146568_146845_148727_148845_149217_149392_151124_151273_152671_152804_153329_153388_157642_157751_158735_158924_160569_160697_201838
916458	contig_7004_pilon	+	1758	13	Intergenic	novelGene_126449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_9	45.4449453245964	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	741	1259	274463	278336	TRUE	20	AAACTCATGCTGCTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLVPILATAIQEELEKGNPEPGPLNAVDDRHHSVLVSLLCAHLGLSSEDIVEMELCLADTQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAAPASLATEPHVRMVALYDNEEVGSESAQGAQSLLTELVLRRISASPHHLTAFEEAIPKSYMISADMAHAVHPNYV	273021	281124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274471_274742_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
916459	contig_7119_pilon	+	2404	3	Intergenic	novelGene_40940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	302	140	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	159	1253	137044	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127510	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707
916461	contig_8263_pilon	+	2784	1	Intergenic	novelGene_83071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	936	1280	31028	31372	NA	45	TGAATGAGAAATTAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKETVVHGDSLPHIPYPPPVPVSPSSSVTPGKWRPIVMPCMAAFKLLRSQALCNELEVRTEALNTFLGHLTGVSHETMTLNLQSREPNPIRCLVLHIQPQQLFFIFKNFLSLL	30092	32876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_30100_32900
916462	contig_15039_pilon	-	1895	4	Intergenic	novelGene_110153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_3	540.696669944331	43	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	158	535	200602	197500	FALSE	75	AATAATGAAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLINSGRRGRRRRGRSELGFGGLTCPHSPAATGGGGQRVRRREPPPGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGLCMN	260918	196139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_197618_198506_198613_200448_200620_260778
916463	contig_9321_pilon	+	2616	2	Intergenic	novelGene_174713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACCTTCGTCTAAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10735	14618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_12623_13889
916464	contig_9468_pilon	+	1693	9	Intergenic	novelGene_59454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	130.453954999456	66	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	190	591	172913	189634	TRUE	50	AGAAACAAAAGATTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFIDANFVFL	150458	190827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_150578_172515_172569_172895_172974_173055_173131_173543_173652_175888_175934_177207_177296_189609_189702_189792
916465	contig_4301_pilon	+	1760	2	Intergenic	novelGene_65132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	199	498	557908	558207	FALSE	70	CACACACAAAAAAATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHSSILTHMGSHESESTRQQLEPINVGKFLPPRSPQYPELPGLTGSVLQDLGLQSTLMKLSASTLETALGILTRPLGGQSGSYLSDVHSKACIQESIL	556330	559469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_556487_557865
916467	contig_6102_pilon	+	2051	2	Intergenic	novelGene_32229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902275	904376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_903261_903310
916468	contig_17059_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_166088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	435341	435658	NA	25	CAGGATAGGTGGATCGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIRVGGTPTVPPASPSRNPVQRRETPESASWFRCGTAGTQPLAVFSLTAFGPVSETAFDDIGVFFVSNCALHSVVYKTFKDFKNFRKHYIHIFSNIYCTESVLFF	435340	437647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_435300_437600
916469	contig_7775_pilon	-	2969	1	Intergenic	novelGene_37469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATCCCAGCCACATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100862	97893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_97900_100900
916470	contig_13863_pilon	+	2004	12	Intergenic	novelGene_42065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	376.227313914789	7	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	364	1713	474588	490279	FALSE	30	TCAGGTCCTTTGAGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455690	490570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_470925_471052_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
916471	contig_6691_pilon	+	1786	1	Intergenic	novelGene_60146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1020	1514	271245	271739	NA	40	GTCCAAGCCAGAGCAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLGRKGDDVLWETVRQPKSGDRHVDDTWEEVELNHFMESLSRPITSEERESVIKNLPTEECPGPDGFTREFYRTLREELTPILFKLFQKIEKEGILPNSFCEANIIPIPRPNKDTTRKENYRPISLMNIVAKTLNKILTNRIQQHIKRVIHHDQVGFILRMQK	270225	272011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_270200_272000
916472	contig_4125_pilon	+	3092	5	Intergenic	novelGene_25245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	406	738	2983870	2984202	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPRRLWPPAAWTAPQFHEMTSQSHQHTLTSGRLGGKIGRTVTSSGQRGLEVTSVTSQGPPRRPSLCLTKLAGQMLLQNTKIILCRSETMEQQKNGVIKTQVCHTEARA	2983464	2988661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_2985477_2985670_2985758_2986075_2986181_2986977_2987092_2987887
916473	contig_15365_pilon	-	2397	1	Intergenic	novelGene_111132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	558	1076	71381	70863	NA	40	CAAGGACAACATGATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTIQRKLTRWNTQESNQLYLWKETMEKLNIIRTRPGADCGTDHQLLIPKFKLKLKKIRTSPQDPKYDLQYILSEFGDHLKNRFDALNTNDRRPDELWKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKLAFECQVAKAKGRNGEVKELNRRFERATPEDRVRYYNDMCKTWR	71938	69541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_69500_71900
916474	contig_18081_pilon	+	2937	1	Intergenic	novelGene_23765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	273	599	41843	42169	NA	85	ACAATAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSRNRSVTMWLAGLKAVCPSHCQPQAKELKRKLSYVYRRQVDEFFSIVLKPHRPHRFTCHFKGVLIAQSEVRMGLLLFCCILLLKLLASVFCFPKEKNLGFSDFCF	41570	44507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_41600_44500
916475	contig_20090_pilon	+	2612	1	Intergenic	novelGene_178972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1716	2072	14465	14821	NA	55	ACAAAAAAAAAGTCCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLDATTNQLNVIDIHRTLHPMAAKYTFFSNAHGILSRIYYILDHKASLNRILSIKILQSIFSNHKTIKVGINNRKSKEKKLNTWKLNTLLKNYWVTEKIKKGIKKFKDPNKNKNTS	12749	15361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20090_pilon_+_12700_15400
916476	contig_3469_pilon	-	2267	1	Intergenic	novelGene_34206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	20	TTCATATATCCAGCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531300_533600
916477	contig_8568_pilon	+	3544	1	Intergenic	novelGene_156938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	759	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1262	1585	84905	85228	NA	35	GCTTATCAGATCAGCGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCHSENYLPNIILSLPLLPLARSWHTIFPFPPSTKHCTPTLLLSTGHTTFPWLESHRPALAWVPPTPTCQLLPCLFFFLLSSFSVFLPPSQVEQLYTLPPGHAVPP	83643	87187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_83600_87200
916479	contig_14744_pilon	-	2032	6	Intergenic	novelGene_65993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_4	404.756914703134	537	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	71	580	969897	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969967	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967450_967855_968630_969717
916480	contig_6898_pilon	+	3430	11	Intergenic	novelGene_35738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2446.83460004962	8	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	326	1486	115973	125646	FALSE	10	GTATTCAGGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRTGVCHAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	104574	127590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_104600_114302_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_123013_123145_124370_124464_124782_125008_125481
916481	contig_12250_pilon	+	2861	6	Intergenic	novelGene_80602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6.28012738724303	84	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	50	646	333287	334673	FALSE	40	CAAAATAGAATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHPIPVWRRSSRCFCMSRQGGFLPAGALPDTLWPWRKLRLGARSVRDPVMARLPKLSVFDLDYTLWPFWVDTHVDPPCHSSGDGTVRDSRGRTIRLYPDVPEILERLLGLGVPVAAASRTGEIEGANQLLELFDLVRYFVHREIYPGSKVTHFQRLQQKTGVPFSQMIFFDDEKRNIVDVSKLGVTCVHVQNGMNLQTLTQGLETFAKAQVGP	333237	336888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_333426_333541_333603_333675_333787_334118_334227_334322_334409_334581
916482	contig_18869_pilon	+	306	2	Intergenic	novelGene_55984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGATTGTGAGAGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59581	62375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_59681_62168
916483	contig_1225_pilon	+	2423	4	Intergenic	novelGene_44122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	4	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	239	556	250814	274411	TRUE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250575	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274994_275513
916484	contig_10734_pilon	-	3627	1	Intergenic	novelGene_51219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173219	1169592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1169600_1173200
916485	contig_9484_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_105603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATTAAACTTGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68906	71440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_68900_71400
916486	contig_10323_pilon	+	1788	2	Intergenic	novelGene_123539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACGCGTCCCACTGACGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243362	246701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_243565_245115
916487	contig_18822_pilon	-	1549	6	Intergenic	novelGene_111713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	89.5066477978033	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	198	515	112989	94921	TRUE	45	AATATATACAAGGTACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPDFFKAFYGCLAACEGSREIKDFKDFYLSIADHYIEVLECKIQCEENLTPVIGGYPVEKFVATMYHYLQFAYYKLNDLKNAAPCAVSYLLFDQNDKVMRQNLVYYQYHREKWDLSDEHFQPRPEAVQFFNVTTLQKELYDFAKENVTDDDEGEVVEYVDDLLEMDETS	115404	93825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_94581_94641_94975_106124_106209_109003_109150_112955_113085_115302
916488	contig_13863_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_42103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAATACATTTCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490717	487809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_487800_490700
916489	contig_15851_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_164094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTGTTTAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17844	16725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15851_pilon_-_16700_17800
916490	contig_17796_pilon	+	4332	1	Intergenic	novelGene_33828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	274	825	2223	3047	83907	84731	NA	40	CAGAAAGTTTACATGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQWFKIRKSINVIHHINKMKEKDHMIISIDAEKTFDKVQHPFLIKTLSKIGLARKLLNIIKGIYAKPTTHIIPSGKRLKAFPLRTNTRQGYPLSPLLFNIVLEVLARALRQEKEIRGVQIGKEEVKLSLLTDDVILYIKNPNDSTRKLLELVEGFSKVARYKISIQKSVAFLYSNKENFKKELRKTIPFTIAPYEVKYLGINLTKDIKDLYKENYKTLLQETKRELHKWKKIYHLMDSKNQHCENGHFYPKQSTDRIQSQSKFQQHSLLRWKN	81684	86016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_81700_86000
916491	contig_9646_pilon	-	2118	1	Intergenic	novelGene_117437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	672	971	184641	184342	NA	40	AAAAAATCCCATTGCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSLFLHSPVGYKSKFRALAPGEHFLHRLWRKVHVISLPLVWELLCTGTSGPKDALCSQHCFLDGMRFPCVSAHFSLLYLKRDCIKTMILSTSSV	185312	183194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_183200_185300
916492	contig_7229_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_39852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTTGAGAACCCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1259763	1257362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1257400_1259800
916493	contig_5063_pilon	-	1617	1	Intergenic	novelGene_109978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGAACTTTGTGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3922	2305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_-_2300_3900
916494	contig_5539_pilon	-	3288	1	Intergenic	novelGene_104753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1226	1552	56665	56339	NA	35	AATGCCAAGTATGTGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVAALFITAKRWKQPRCLSTDEWINKLWYIQTMECYATRNNEESAKHLTTWMNLENIMPSEISQSQKDKYCMRPPLYKLKKRFKHRRKHYLMVMRVGRAGEEKSLTR	57890	54602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_54600_57900
916495	contig_2755_pilon	-	6143	4	Intergenic	novelGene_158299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4999	5304	260419	241965	FALSE	20	TAATTTTTCTTCCATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERLRLSPGQVWQLLAASEPSLPPPATQSSSSTLPLMFRVPKAPYIIESLFFPSLCCKRVHQKHLTTLPSWPHPDFFFLHVNLFLSFDNSGLIKYLPFCD	267511	241125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_-_242041_260189_262979_264904_267277_267444
916496	contig_6199_pilon	-	4435	5	Intergenic	novelGene_126330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAACAAAAATAAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86260	50127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_50550_76979_79360_83935_84697_85256_85526_85657
916497	contig_709_pilon	+	1370	7	Intergenic	novelGene_57653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAAATAGGCGCCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3762199	3772543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3762538_3764721_3764952_3765205_3765385_3767118_3767287_3769814_3769959_3771705_3771773_3772299
916498	contig_15777_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_75733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGCATTGTTGATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15759	13312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_-_13300_15800
916500	contig_6189_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_164930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	205	837	20819	21451	NA	70	CAAACTTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDILPEDELLRLEGTQNTTREELPPQSRVNLTDVDRVKLSGTSFADVAQLKIGRNSCKHPLIIGTWNALSTNLGNLEVIKNEMECINIGVLGISELKWTGIGHSELANHMVCYAGNDKLKLYGVAFIVKENISRSILKYNAVSDRIIPIHLQGRRVNMTIIRIYAPTTKAKDEEIEDYYHLLQSEINQTCNQDALIITGDWNAKDGNKK	20614	22056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_20600_22100
916501	contig_935_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_45560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364841	366941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_+_364800_366900
916502	contig_3817_pilon	-	4216	6	Intergenic	novelGene_78349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	32.784142508231	141	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	48	695	554238	543886	FALSE	20	AGAAACTGGTCTCCCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIADLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHFRMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDILASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSSTCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS	554285	540364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_544078_545016_545110_548986_549099_549546_549730_552173_552233_554229
916503	contig_13794_pilon	+	3159	2	Intergenic	novelGene_168549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	248	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAACGAAACACTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4044	7720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_5257_5773
916504	contig_20332_pilon	-	702	2	Intergenic	novelGene_156178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACTGTGAGAGAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632776	630299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20332_pilon_-_630895_632669
916505	contig_5019_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_109175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78136	76419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_76400_78100
916506	contig_12119_pilon	+	1959	1	Intergenic	novelGene_88692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAATTGAGCTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410398	412357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_410400_412400
916507	contig_8204_pilon	+	925	3	Intergenic	novelGene_177002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	109	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	42	473	55640	63474	FALSE	50	AAACAAAAACTGACGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCWSFVFLCVTVYMVCPISAIFSEEKNTTEPAYKVKNAPSIPNTPEPTITQEPLVGSQKRKARKTKITHLVRTADGRVSPAGGTLDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRSEDNSAHP	55598	63926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_55857_57899_58087_63446
916508	contig_5125_pilon	+	2903	1	Intergenic	novelGene_43475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAGCAACACACAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75559	78462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_75600_78500
916509	contig_6710_pilon	-	2130	1	Intergenic	novelGene_89051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTCACCCTTCAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590674	588544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_588500_590700
916510	contig_9227_pilon	-	2630	4	Intergenic	novelGene_154307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	21.5148527508066	101	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	686	2061	241	2301	74216	47907	FALSE	30	TTTAGAATCTAACCACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVEFTQEEWALLDLAQRKLYKDVMIETFRNLASVVSQTLNDGKNLSSKYLIVEFMKNDTWSSMLGDICKLHDIEDQHKNQGRHKRRHIIKNLFESNEENQGGKTYRRIPNLAVFKRTPAIINSSECHECGKSFINHSSLKRHIRSHSDCNTYRYKTCKEACICPSDQSIPVRTLTEEKPYKCKVKTLTGEKPYECNKCGEDFCSFLSFQTHVRGCKRECKECWKTYPSSLLLCKKFHSGDKPYKCKEFGKGFSDSSSFTIHIGTHSGERQCKHCGKAFSNSSALATHQRTHSGERPYECKECGKVFSCSSHLTSHIKSHSGERPYKCKVCGKVFSFSSSLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQSATLTSHIRVHTGEKPYECKDCGKAFSQSSALTSHKRVHTGEKPYECKECGKVFTFSSSLTEHIRTHSGEKPYECKECGKTFSQSSHLTIHVRTHNGERPYPCKECRKAFSDYSSLTRHIRTHSGEKPYECKECGKAFSCSSSLTKHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTSHTKTHSGERPYECKECGKAFSDYSSLTKHTRTHSGERPYECKECGKAFRQSATLTSHIRVHTGEKPYECKECGKAFSQSSALTSHIRVHTGEKPYECKECGKVFSCSSSLTKHIRTHRSLTNVRYVGKSSVVPHPSLDT	74456	47577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_49687_50025_50177_51660_51788_74213
916511	contig_7171_pilon	-	1348	9	Intergenic	novelGene_101365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	24.4869225301997	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	213	746	1360418	1354255	TRUE	10	CCTGCTGACCTTGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLQVTSGPEHILHVQINWPEKRNAMNRAFWSEMVECFNKISEDASCRAVVEVEAVKPPSWWCGHRDMASVLLQPQGEDMVCISWYIHNLLSKHQETFSVIEKCPKPVIAAIHGGCIGAGVDLITACDIRYCAKDAFFQVKPGQRAGLHRPEADG	1360989	1353397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1353973_1354227_1354300_1356225_1356291_1356469_1356519_1356598_1356711_1357398_1357442_1360053_1360113_1360257_1360465_1360823
916512	contig_1335_pilon	+	3741	3	Intergenic	novelGene_166523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	172	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	747	1151	722439	722843	TRUE	20	TGCCTTACTTTTATATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASARSQNKEPRNFPEEEDFLELPEAEYKRLIYRTPQEIRKEIKQNAEYAIEEIRKIREEHNDKFNRLQQSIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAAEGRISEIEDKALDNNLYEEKSDKRFKKMKTP	721317	900374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_+_721734_722108_722939_897879
916513	contig_15407_pilon	+	4090	3	Intergenic	novelGene_123081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	706	junction_1	679.5	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATGGAATGAAATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463728	468048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_467602_467704_467850_467976
916515	contig_16103_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_118952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAAGAAAGGCCTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999238	1001568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_999200_1001600
916516	contig_8044_pilon	+	2648	2	Intergenic	novelGene_132374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGGGGTCGCAATGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372887	375875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_375400_375739
916517	contig_20819_pilon	+	2397	7	Intergenic	novelGene_55639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_6	510.920547204314	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	8	1345	29817	42557	FALSE	15	GCTTCCAACCGGGCCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVESTVRALSPAPC	29809	43609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41309_41400_42519
916518	contig_6710_pilon	-	557	2	Intergenic	novelGene_93814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	101	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
916519	contig_1452_pilon	-	1678	4	Intergenic	novelGene_115120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	72	383	257142	256831	TRUE	65	AGGTAAAAAATCAAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHLHISRRSGFLLSLDPAAACCPLISCSWDLSCQLICRTWDSSICTACEREPCSPTCRSWACQLLQLCNLGEASTLIHGLGTF	257213	86544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_86875_88089_88353_88698_89388_256817
916520	contig_10976_pilon	+	2722	4	Intergenic	novelGene_155581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	585	junction_3	107.50917273527	48	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	248	1048	93612	174420	FALSE	60	AGGTAAAAATCAACAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSIRKRWTICTISLLLIFYKTKEIARTEEHQETQLIGDGELCLSRSLVNSSDKIIRKAGSSIFQHSVEGWKINSSLVMEIRKNILRFLDAERDVSVVKSSFKPGDVIHYVLDRRRTLNISHDLHSLLPEVSPMKNRRFKTCAVVGNSGILLDSECGKEIDSHNFVIRCNLAPVVEFAADVGTKSDFITMNPSVVQRAFGGFRNESDREKFVHRLSMLNDSVLWIPAFMVKGGEKHVEWVNALILKNKLRVRTAYPSLRLIHAVRG	93364	176094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_93725_100551_100684_113737_113996_174122
916521	contig_14792_pilon	+	2940	1	Intergenic	novelGene_170489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	409	942	44388	44921	NA	65	AAAAAAAAAAAGCTACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETNIFMPANTTSILQPMDQVISTFKSYYLRNTFHKAIAAINSDSSDGSGQSKLKIFGKGFTILDAIKNIRNSWDEVKMSTLTGVWKKLIPTLMDDFEGFKTSVEEVTTDVVEIARELELKVEPEDVTELLKSHDKTLTDKELLLIDEQRKWFLEMESTPGEDAVNIVEMTIKHF	43979	46919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_44000_46900
916522	contig_11572_pilon	+	3157	17	Intergenic	novelGene_100029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCACTTCACTATCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133013	242774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_134182_143476_143600_152950_153125_153686_153773_156393_156572_157849_157995_158410_158548_170052_170118_174872_175044_178262_178335_189887_190072_212134_212268_213931_214027_219367_219480_233193_233263_235373_235479_242634
916523	contig_1076_pilon	-	2966	2	Intergenic	novelGene_101112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGCTACTAGGGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70713	67678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_-_70359_70427
916524	contig_10058_pilon	+	1841	11	Intergenic	novelGene_67720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	163.105763233553	3	20	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	70	888	72602	99369	TRUE	30	AGTTTGTTTAAATTCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72532	101646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_99565_100287_100718_101192
916525	contig_9389_pilon	-	6035	1	Intergenic	novelGene_84149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1848917	1842882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1842900_1848900
916526	contig_3956_pilon	+	1342	3	Intergenic	novelGene_14754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.5	53	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	23	787	794009	795834	FALSE	40	TTGAAGGAATCCATATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSGNRLQMLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQG	793986	796389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007_795738_795831
916528	contig_11548_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_66784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTATTTAATTCCTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114212	116646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_114200_116600
916529	contig_2069_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_23535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGACCGACAGGCAGCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508376	1509826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1508812_1508941_1509111_1509754
916530	contig_7182_pilon	+	3480	1	Intergenic	novelGene_117106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2151	2456	124226	124531	NA	65	TAAAAAAAAAAACCCTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLSALEEGPCHQSSFGLGASLCRNLTSKGRTLLPRHCFLGGMRFPCLSAHFSLLYLKRDWLKTLPNLADLISVTAANPSYHIIVIAFTTLRETHQMIKW	122075	125555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_122100_125600
916531	contig_7234_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_145956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTAAGCCTTCACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518007	519327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_518000_519300
916532	contig_6375_pilon	+	1783	4	Intergenic	novelGene_73078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	84.6417286107876	130	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	225	308	751294	757164	FALSE	55	ATAATGAATATAACTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSWARAHLGSLPGSRLGLGPEDFLRCVSAIVIFLVISIAAVTSRDGAAIAAFVFGIILVSVFAYDIFKIYQTEMAPRATEGIPGWREWLSTWLLTERLVV	748884	758639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_748953_750937_751031_751230_751316_757102
916533	contig_1213_pilon	+	2750	2	Intergenic	novelGene_76462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1944	2258	44693	45007	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGVWSDLVQICLHGFPVWSLSGSNSGYLLQLGSPEIHRQWPLALRGKPGQKEKVCNDLLNISLVNVGKIRKTNNDLRNTGNRGIILLTTLKLSNLHVILKEN	41885	45499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_+_43825_44688
916534	contig_5696_pilon	+	3771	1	Intergenic	novelGene_117565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	228	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1644	2201	701184	701741	NA	35	TCATGAAGCTCCATAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKFLNIIKGIYAKPTANIIFNGDRLKTSPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGVQIDNEEVKLYLFADDMILYIENTKDSTRKLLELIEKFSRVAEYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKAIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIHAHG	699540	703311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_699500_703300
916535	contig_10990_pilon	+	3121	20	Intergenic	novelGene_7465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_19	452.018789597937	9	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	682	2049	947	2995	729714	752026	FALSE	60	GTGCAAAAACTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVSCAVSNSFLLRSLTTRSIWPFLIPDGYKNSPTQLCFNRKAPALYGG	708578	752152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709396_714557_714612_715933_715994_722232_722433_723512_723633_727930_728102_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751885
916536	scaffold_13505_pilon	+	1532	2	Intergenic	novelGene_111615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	137	649	659510	660022	TRUE	20	AGCCATCCACTTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	659373	664526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_660267_663887
916537	contig_15067_pilon	+	2896	2	Intergenic	novelGene_154346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCTTCATCTAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236715	243763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_236858_241009
916538	contig_6502_pilon	-	1101	2	Intergenic	novelGene_178973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	59	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGACAGAGCTGGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339173	295932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6502_pilon_-_296310_338449
916539	contig_18194_pilon	+	2764	2	Intergenic	novelGene_55961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	899	1246	4994	5341	TRUE	50	ATAACAACAAAACATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDAWLQLSVVETSDGRTAFTACSQSPVDISLLALAFADDLAEWSTMLVETLVIAAATPSPTPVAHNGRLTPAVTGARAKPRMVRMPETVLVELATMWEMVQSLCILPTLSARA	4095	8393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_+_5503_7036
916540	scaffold_13505_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_111587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAGAAGACTCCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633069	634924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_633100_634900
916541	contig_6364_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_51803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGTAGAGCAGAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434805	1437018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_1434800_1437000
916542	contig_7753_pilon	+	4145	4	Intergenic	novelGene_41472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	201	515	928843	929157	TRUE	35	AGTGGCATTAATTATAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLAIFAFKEHSDCTSSKTDLFVLLAVHSILNVLHQHHNSKASVFLQSSLFIVQLSHTYDAIENIMAWVRRTLVFKVTSLLFHSLKRSFAADSPNAMHLLIS	928642	1254317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_930607_933351_933903_1111835_1112345_1253196
916544	contig_16382_pilon	+	3335	1	Intergenic	novelGene_160225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTGAGGGAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143195	146530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_143200_146500
916545	contig_1856_pilon	+	2921	2	Intergenic	novelGene_84890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407577	437406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_407917_434824
916546	contig_10882_pilon	-	1882	1	Intergenic	novelGene_172746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12595	10713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_-_10700_12600
916547	contig_3529_pilon	-	3399	4	Intergenic	novelGene_105355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1734	2072	530598	530260	FALSE	20	TTAGATAATTTGTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKVYSLQYGLHLNIKKTEILTTGPINNIMINGENIEVVKDFILFGSTTNVHGSSSQEIKRLIALGKSAAKGLFKVLKSKDITLRTKVCLTQAMVFSVNSYAYESWAVNKED	577231	528932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_531605_551590_551748_553495_553661_576826
916548	contig_15029_pilon	-	3185	4	Intergenic	novelGene_128220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGTACAATTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431116	398396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_398883_398923_399273_412028_412612_429349
916549	contig_5871_pilon	-	1699	2	Intergenic	novelGene_160181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	19	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACACACATAATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431924	400599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_402040_431665
916550	contig_12622_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_5816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	532	870	369418	369080	NA	35	TAAGAGAGTAGATGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHNGAHLRYSTGLTRLGARENEANKIQRKDKSKGLTDHTHHGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDRDHNRGSRTELEKNVEQNSHSKKKTRLTGLTETGETPRGWPLDTLLVQ	369949	368814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_368800_369900
916551	contig_14684_pilon	-	799	1	Intergenic	novelGene_99685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAACACGCTGGCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419623	418824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_418800_419600
916552	contig_10940_pilon	-	620	1	Intergenic	novelGene_49299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACACAGACAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041425	1040805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_1040800_1041400
916553	contig_7730_pilon	+	638	4	Intergenic	novelGene_156266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	20.8326666559997	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGGAAGGAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68796	149381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_68918_132372_132425_147807_147910_149018
916554	contig_19269_pilon	+	1242	2	Intergenic	novelGene_175629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10364	12663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_10486_11542
916555	contig_7513_pilon	-	2086	1	Intergenic	novelGene_89031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACATCCAGTTATGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697235	695149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_695100_697200
916556	contig_8049_pilon	+	1654	2	Intergenic	novelGene_166865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTACATGGAAACTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106612	163181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_+_107177_162091
916557	contig_4759_pilon	+	2149	2	Intergenic	novelGene_106342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	618	1214	596496	597092	TRUE	35	AAATTTTTGAAATGGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIRQMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLGKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	595878	598074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_597909_597955
916558	contig_9484_pilon	-	3000	2	Intergenic	novelGene_105595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	2573	2998	2181	1756	FALSE	15	CATTTCTCTCTTTATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERCFPKGVFLICVVGRTQVLIFRRGLLLICTQWPCRLAGCGYLLVQKTPPEQGSLPASPLTHELVRPEGLRLSAGQIWQLLAASKLSLPPPATQSSSSALRLMFRAPRLPYIMESLVFSGLFCKRDYQKGLTTSPSWPRL	112397	1753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_2345_109988
916559	contig_10063_pilon	-	2980	1	Intergenic	novelGene_127759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAATCTGAGGGTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691253	688273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_688300_691300
916560	contig_3747_pilon	-	2323	2	Intergenic	novelGene_24973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAACCCATTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237287	234926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_236508_236545
916561	contig_15666_pilon	-	1875	6	Intergenic	novelGene_70188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	649.994153819863	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	89	1249	110619	107816	FALSE	25	TCAGTCAATCCTGGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110707	107189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108850_109098_109378_109948_110246_110558
916563	contig_18800_pilon	+	2881	1	Intergenic	novelGene_110667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1855	2226	7151	7522	NA	20	CTATTAGATACTTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLLMGEIGGRERITGAKKVSRTHYISSQGLKIILCSLRPFRQWPCPLDSGSWSRSPDSGWSPLSPAFQLSLLGPLDWQLCSLTFGQPHSPNPFQWQPYPLDFCRPHSSAPWAWHPHPFSFG	5296	8177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18800_pilon_+_5300_8200
916564	contig_7119_pilon	+	2562	4	Intergenic	novelGene_40905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	387.026556654134	7	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	328	1413	138713	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138231_138291_138707
916566	contig_15304_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_30681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	8494	junction_3	909.175817246954	51	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	399	995	106308	105631	FALSE	20	CAAGACTGGCATGGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPGK	107225	105491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_105960_106040_106371_106480_106523_106931
916567	contig_3270_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_104455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGTCAAGAAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58805	57611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_57600_58800
916568	contig_7004_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_126497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAATTCTGTCATTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427058	427707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_427100_427700
916569	contig_1009_pilon	+	2323	1	Intergenic	novelGene_121732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAACTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135658	137981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_135700_138000
916570	contig_15114_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_121180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCTGCATTCGTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673413	676043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_673400_676000
916571	contig_5023_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_7381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	980	1546	647301	639192	FALSE	25	CTTCAAGGATATTCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYLCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGILP	648280	639095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_639206_643430_643537_646854
916572	contig_11328_pilon	+	4794	1	Intergenic	novelGene_88417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	3370	3780	647025	647435	NA	65	AAAAAAAAAAGATAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFFKNNESFQFLGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKVSLKRFEKKSSPALKLHLNPFMLTGISGDQVLFLPLEGFWEAATPLIVFAATRQGLYDNLKPKKQACAAN	643655	648449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643700_648400
916573	contig_2646_pilon	-	2505	7	Intergenic	novelGene_69717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	152.8234275234	92	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	207	2009	2623501	2595042	FALSE	25	TGATTAATTTTTGAAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLILGRRLNREDLGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGREFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGREFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFEDVSQHEEFLELGKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMSPRTRPRRSTGYSEVIVVVGGCERVGGFNLPYTECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILVSGGRINSRDVWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYDGQNRLSSVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDKVQSYDPETNSWLLRAAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGGLTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQENCGMSVCNGKIYILGGRRENGEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHRYNEKCFKL	2632990	2594545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2595243_2599698_2599888_2600887_2601077_2607808_2607928_2608692_2608878_2622581_2623563_2632845
916574	contig_3956_pilon	+	1822	9	Intergenic	novelGene_14820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1379.16242131774	6	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	407	1306	1286460	1290491	FALSE	15	TGACTGTGTGGAGCCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281597	1291007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282864_1286120_1286224_1286409_1286606_1287276_1287530_1289105_1289229_1289493_1289545_1289758_1289892_1290297
916575	contig_5321_pilon	-	2070	2	Intergenic	novelGene_153867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32953	30331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_31160_31711
916576	contig_6364_pilon	-	4063	1	Intergenic	novelGene_51788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCCAAGGACCATCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1230763	1226700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1226700_1230800
916577	contig_16535_pilon	+	1874	12	Intergenic	novelGene_167710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	41.4453737860387	41	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	19	1767	359858	364317	FALSE	25	AAACCATGTGTCTAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSRLPQQLFLQGVAAVFMFAFASLYMQIPGLYGAEGILPARRTLRPQGKGRWQQLWEMPTLLWEVPRLGLDTAQGLELLSLLGTLLALGALLLRPLRHRLTYLLLWAAYLSAYQVGQVFLYFQWDSLLLETGFLAVLVAPLRQTPLRKQAPQGGPTGATPHEDLPFWLVRWLLFRLMFASGVVKLTSRCPAWWGLTALTYHYETQCLPTPAAWFAHHLPVWLQRLSVAATFLIEIAVPPLFFAPLRRVRLAAFYSQVLLQVLIIITGNYNFFNLLTLVLCTSLLDDKHLGVERGRGRRTKMPTSWPKALLTMLAPLLELAVYGLLAYGTTHYFSLEMDWEQRAIHSRTNFTFHQFSQWLKAVTLPTMWLGGASLTWELLTALWRWTQVRGWLWKLWSAVQLSIFGMATVALFTVSLVPYSYMEPGTHGRLWTGAHRLFGAVEHLQLANSYGLFRRMTGLGGRPEVVLEGSYDGHHWTEIEFMYKPGNTSRPPPIVTPHQPRLDWQMWFAALGPHTHSPWFTGLVLLAALRTTCHPHASHVLPGLSDGPRAARGPAAPHHSPSPNRPCRRRAGAPSPRVPV	359839	364424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_359952_360405_360660_360756_360786_360907_361126_361205_361385_361813_361956_362081_362217_362301_362408_362482_362580_362668_362852_362938_363080_364146
916578	contig_10341_pilon	-	4400	5	Intergenic	novelGene_47240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGTGACCTCCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157292	136030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10341_pilon_-_139320_147426_147489_149231_149366_151626_151691_156441
916579	contig_5686_pilon	+	1085	5	Intergenic	novelGene_45251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_3	2044.94368809999	151	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	54	452	93843	172333	TRUE	75	TAGGAAGAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLELTGVLLFDHLDGIRCNC	93789	175915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172278_172587_175535
916580	contig_8712_pilon	+	4013	11	Intergenic	novelGene_58740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	157.589371469018	5	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2821	3492	90625	103433	TRUE	30	GATCAGTTGACTCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIERKKWMNIRPLPTKKQMPLQFDLCNHIASGKKCQYVGNCSFAHSPEEREVWTYMKENGIQDMEQFYELWLKSQKNEKSDDVASQSNKENGKQIHMPTDYAEVTVDFHCWMCRKNCNSEKQWQGHISSEKHKEKVFHTEDDQYCWQHRFPTGYFRTCDGFLNGTCTEGNSCKFAHGNAELQEWEERRDALKMKLNKARKDHLIAPNDNDFGKYSFLFKDLN	84407	104017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_86107_87288_87486_87972_88074_88547_88730_89380_89458_90060_90700_93512_93622_99333_99468_101391_101556_103243_103561_103623
916581	contig_11160_pilon	-	2992	5	Intergenic	novelGene_168808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.2735639524583	39	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCTTCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317964	310177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_312651_312743_312914_313920_314071_315639_315780_317905
916582	contig_6361_pilon	-	4782	8	Intergenic	novelGene_23934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5003.98977551607	94	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	35	CAAACACGGCACCAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436455	292044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_292774_326543_327027_379949_380969_409197_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
916583	contig_14666_pilon	-	480	3	Intergenic	novelGene_39663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	2500	junction_2	1295.5	118	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGCTGTTGGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492537	488763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488913_490404_490532_492333
916584	contig_7657_pilon	-	2165	13	Intergenic	novelGene_30043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAATAAATTTAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348721	268233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_-_268789_271568_271693_274533_274605_294981_295081_296344_296459_312105_312221_315213_315386_320376_320467_329525_329684_331094_331193_336473_336779_339852_339989_348593
916585	contig_6217_pilon	+	3479	3	Intergenic	novelGene_109664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	159	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTTGATTTTAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766595	808628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_769640_785132_785531_808591
916586	contig_12622_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_5889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTAGCCTTATATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515397	1513024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_1513000_1515400
916587	contig_8020_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_114450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1274	1621	373207	373554	NA	70	GCAAAAAAAAAAAAAGACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHQNGPSHKGATLVIYLLNKDSLGVHDHNCLGFRACICENMGGHSYCHWRFGQQIPDHRESCAKTDLPKLCQHDFCLSQAWHLSQESSGANPFRQNALVLRLSDPGFSFLHLSN	371933	374647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_371900_374600
916588	contig_1154_pilon	+	1945	1	Intergenic	novelGene_87142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAAATTCTTGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	827996	829941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_828000_829900
916589	contig_3018_pilon	-	1289	11	Intergenic	novelGene_78868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	453.668039429713	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1062	227	1288	583440	562941	FALSE	75	GAAGGAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDTQSSIAVASAFLLTDWVPSPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYET	625020	562939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572327_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583608_624961
916590	contig_7151_pilon	+	1323	8	Intergenic	novelGene_40732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_3	117.840951268726	30	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	822	1178	505515	507901	FALSE	40	ATAAATCATGATACCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502248	508046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503041_503212_503293_503438_504052_504143_505033_505169_505440_505593_506568_506685_507738
916591	contig_10734_pilon	-	5676	20	Intergenic	novelGene_50965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	65.4248421648778	203	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	99	2237	224178	193605	TRUE	5	CATGGGTGTTTTGCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPCFGLAARPQGKPEAQAAQGEPTGLEPPAAMGSLFRSESMCLAQLFLQAGTAYECLSALGERGLVQFRDLNQSVSSFQRKFVGEMKRCEELERILAYLVQEINKADIPLPEGETSPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRKNLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPPLENDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVTYAELDEPLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGYKVKKICDCYHCHIYPYPNTAEERKEIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVIQVRKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQELRRALEDGSRESGATIPSFMNTIPTKETPPTLIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFVMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFDGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNIFGSGWNVSAMYSSSHATKEHKKMVLWNDSVVRHNKVLQLDPSVPGVFQGPYPFGIDPIWNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVTLGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGYLIFMIVYKWLVYSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASETIGLYPGQVRARAETAAGRHGAVCPRPLPGQTSLPALAAQRAQLLWSQQEWLYTCEERQRGRGVFAGKPRYRRGT	224276	186032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_189142_189755_189928_192098_192217_193564_193685_194295_194416_196610_196826_197642_197762_199116_199208_199290_199479_200248_200386_200668_200820_204484_204698_205868_205963_207872_207956_211739_211867_213013_213103_213841_213980_216374_216473_218933_219013_224061
916592	contig_233_pilon	-	3545	1	Intergenic	novelGene_14693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1374	1679	121338	121033	NA	25	TTTTGCAGCATATATTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGLRGVRPLRCSDLANLRSRDLLLQKLLRRGSPGGVALAAAGSPRAHWLAGEQGYRLRPASLTTETFPSQGSRCRRAIGEQATRCHPALRLMSLHSRGRE	122711	119166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_119200_122700
916593	contig_12050_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_62601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299623	301271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_299600_301300
916594	contig_15518_pilon	-	3278	1	Intergenic	novelGene_127624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCCCAGAGACTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32737	29459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_-_29500_32700
916595	contig_13409_pilon	-	1894	2	Intergenic	novelGene_128438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTTCTTATAATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126118	4610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_-_5615_125228
916596	contig_12931_pilon	-	2276	1	Intergenic	novelGene_166775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1301	1870	125321	124752	NA	40	GAAATACTAAAGGGAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISSHIKRQSMMASARSQNKESINSLEEENFLELPETEYKRRICRTHLGIRKEIQQSAEIARQHTDTVVAELKKVMQEHNAKFNRLQEYTERQQSEIQKINNKISELDNSIESHKSRIEAVEVRISDIEDKALDGNLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPERGRNRKYRENC	126621	124345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_-_124300_126600
916597	contig_6215_pilon	-	2684	9	Intergenic	novelGene_21213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	770.120353824647	1	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	65	1192	243029	228234	FALSE	45	AATGAATTCAGACAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRQERRCLHFVGVRRCYEVVEMGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243093	226741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231724_233741_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
916598	contig_3426_pilon	-	3164	1	Intergenic	novelGene_57968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCACAGCCACTAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525360	522196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_522200_525400
916599	contig_2312_pilon	+	2006	6	Intergenic	novelGene_160746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	19.1666376811375	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1177	1602	260675	266448	FALSE	40	TACTAGAATGAAATACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSNQTSWRKANLTCKIAIDNLEKAELLQGGELLRQRKTTKESLAQTSSTITESLMGISRMMSQQVQQSEEAMQTLVNSSRTILDANEEFKSMSGTIQLGRKLITKYNRRELTDKLLIFLALALFLATVLYILKKRLFPFL	255217	266852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_255313_258066_259064_260590_260683_262104_262207_262984_263104_266251
916600	contig_10968_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_84275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCTCCATCCACATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88339	89666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10968_pilon_+_88300_89700
916601	contig_14341_pilon	-	3734	1	Intergenic	novelGene_111798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGACCCAGCATTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389917	386183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_-_386200_389900
916602	contig_8864_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_135961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTAGCAAGTGTAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33837	32372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_32400_33800
916603	contig_12644_pilon	-	1151	6	Intergenic	novelGene_44477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	503	junction_5	447.044337845811	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	44	907	1037159	1026128	FALSE	75	AAAAAAAAGGAAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1037202	1025883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082
916604	contig_13044_pilon	+	4617	2	Intergenic	novelGene_100001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	231	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTTCTATTTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219703	224446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_224062_224187
916605	contig_12250_pilon	-	1580	11	Intergenic	novelGene_80665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66.1786219258153	34	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	500	1503	57	1559	387634	381240	FALSE	5	CTTCTTAGTGGTCCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAPLPGSCGDPEKQRQDKMQEEGLQLVMMVREGEAAGACPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELPYVLEMVAELAGQRDPGLGAFSCQEARKAWLDRLGNLDEAVEECVRARRRKVKELQSLGFGPEEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDSGPEPTPSWDGPDKQSLVRRLLAVYALPSWGRAELALSLLQETPRNYELGDVVEAVRHSHDRAFLRRLLAQECAVCSWALPRNRMQALTSCECTICPDCFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDTQLLSYFSTLDIQLRESLEPDAYALFHKKLTEGVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQWEEQHRGRSCEDFQNWKRTNDPEYQAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYNAFYAKNKCPDPNCRVKKSLHGHHPRDCLFYLRDWTPLRLQKLLQVSALGTEYPPQEEVAEGSGPAEGPMARLPQEHLQHQ	387690	381218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_381347_382946_383065_383334_383454_383568_383684_384737_384828_384918_385018_385100_385275_386482_386690_386793_386980_387087_387337_387595
916606	contig_7380_pilon	+	3593	20	Intergenic	novelGene_157514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	70.4224687136356	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	102	2165	139473	268373	TRUE	35	ACTTTCAATAAAGTTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGGIPVSDAGGVDRHRETQLTGRTAGEVTGEVTMVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSRKDEQIRGITMKSSAISLHYTKDNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFAPQEAYSHLKNILEQINALTGALFTSKVLEERAERETESQGNSSSEQGEQVYDWSTGLENTDDSHLYFSPDQGNVVFTSAIDGWGFGIEHFAEIYSQKIGIKKEVLLKTLWGDYYINMKAKRIMKVDQAKGKKPLFVQLILENIWSLYDAVLKKDKEKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQISAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVEKLMCTGSQTFDSLPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQAEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSVLETNPKGEELRAGNEEQVESMTPKPVPQEESNQESFVAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPVEFLQRVPLGFSAPPDDLPPVPHMAYCTLENLYLLMGRELEDLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPHLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERVCEDSDQCV	138605	299971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_+_138690_139455_139564_142280_142349_143828_143914_155567_155702_157165_157304_159811_160027_167053_167178_168704_168782_169532_169670_170631_170755_173428_173529_177572_177725_177966_178137_193986_194126_255947_256080_259679_259829_268343_269327_280006_280192_299681
916607	contig_14142_pilon	-	6205	29	Intergenic	novelGene_120554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	216.469288367016	392	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1916	5751	14	5764	447028	432882	FALSE	20	GTATTGTGCATCAAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDTTRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNLGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN	447041	432440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_433183_433245_434039_434143_434294_434457_434572_434695_434883_435061_435266_435485_435669_435748_435854_436534_436636_436944_437192_437299_437525_440116_440323_440419_440526_440624_440797_441202_441387_441757_441981_442128_442333_442469_442565_442751_442921_443005_443216_443747_443959_444068_444194_444641_444775_445000_445222_445364_445527_445868_446151_446345_446520_446613_446751_446901
916608	contig_6208_pilon	-	3492	1	Intergenic	novelGene_53041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCACAGTTTGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522945	519453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_519500_522900
916609	contig_10082_pilon	+	644	2	Intergenic	novelGene_63888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	68	207	183	389	399444	399650	FALSE	95	AAAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQLHRHYSSLQPSRCHLEAACPGDSGNGGGGTEFSSPRERRHPGNQDTAGHATQTLEPRGMGDPGREHQHVSVHQLQAHFTLMVTAKHRSHPQPTAAIIVTDGNHITKRPQKTRLSLGDSELKIMVME	397677	399905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_397784_399367
916610	contig_1008_pilon	+	3392	6	Intergenic	novelGene_121608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4.83321838943783	114	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752538	787958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_752659_768733_768862_771060_771135_782684_782804_783455_783692_785243
916611	contig_1301_pilon	+	6635	1	Intergenic	novelGene_47418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	367	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	843019	843393	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIDAEKASDKIQHSRLLKTVSKIGIEEKFFDIINGIYKKRTANIILNGERLKALSLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLAKAIRQEREIQGIQIGKEEVKLSLFADDTILYIQNPRQLQESNWN	843018	849653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_843000_849700
916612	contig_7568_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_174011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATATCACAACATGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130975	128718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_128700_131000
916613	contig_7963_pilon	+	2301	9	Intergenic	novelGene_58465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGCCGCTGAGCTCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120280	126294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_120366_120488_120735_120938_121069_121583_121959_122054_122209_122351_122489_122993_123131_123745_124053_125564
916615	contig_3523_pilon	+	2655	1	Intergenic	novelGene_171495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1884	2270	461444	461830	NA	50	AAGGAAACTAACAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGAGGITENTERIVEDLLAENFPDIAKNHKISIQDARRTPHKVDPKRKSPRNIIIKLAKTKDKERILREARDKGKVIYKGESIRRSSDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEENLPAKNYISSKTVSQI	459560	462215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_+_459600_462200
916616	contig_11281_pilon	+	2899	1	Intergenic	novelGene_125499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACACAGCACAGTACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938694	941593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_938700_941600
916617	contig_15105_pilon	+	2841	2	Intergenic	novelGene_150963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	161	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAGTGGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560501	594774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_563218_594649
916618	contig_14326_pilon	+	4319	5	Intergenic	novelGene_120754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3189	3590	565180	606622	TRUE	5	TCTCCAGCCTCTCCCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLVPGNNDNEEGQSFNSSCSFSLEVVSVNPGSTKVKGSRETNVLVSETSPLVMILSTSGYSLHPAERRLLTLPCLCPSLLSILVSLTFIPCAFSMDFSRVSVVICTFPLLLRKSSGRSPHVSSFLDCIRSSS	561991	615764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_565504_582907_582981_606617_607143_610340_610473_615687
916619	contig_11160_pilon	+	1645	3	Intergenic	novelGene_168834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	132	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	257	985	318478	320483	FALSE	60	AAAAAAAAAACATTGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLACLAASCANNAFAFGPELSSLITPLAIQTHSFAAVAAAYYRSQQQQQGLATPSQPPAPPSAPLPASATAPPSPPFSFQLPRRLSESPVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318221	321143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319290_320059
916620	contig_13211_pilon	-	3599	3	Intergenic	novelGene_123143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	287	595	334263	333955	TRUE	35	TGCTGTCTACAAGAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPAGDRTTSNQQHTLSHPPTFFTPTQPPLLPTATVPWPGGTGFSPVPLGVHPTAWAGSLSAICLLLVLLLSASFGFFHTSHNFPHLSLKYLALCAICASS	334549	220886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_223641_271555_271766_333914
916621	contig_8375_pilon	-	1631	1	Intergenic	novelGene_141308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGGGCAGGAGGAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185878	184247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_184200_185900
916622	contig_5935_pilon	-	5004	1	Intergenic	novelGene_102774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGACTCTAAGGAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418921	1413917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1413900_1418900
916623	contig_500_pilon	+	1399	1	Intergenic	novelGene_30939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATAAAAGCTATTTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216894	1218293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1216900_1218300
916624	contig_5125_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_43476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAGTGGAGGGGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83967	86257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_84000_86300
916625	contig_3956_pilon	+	1984	12	Intergenic	novelGene_15213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1311.58708983234	7	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	306	1583	1286220	1290491	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282889	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283971_1284054_1284078_1286137_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289599_1289833_1289892_1290297_1290527_1290644
916626	contig_11594_pilon	-	1782	10	Intergenic	novelGene_80927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCGAAGGAGCGACACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568816	540400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_540564_543388_543491_548947_549016_560265_560432_560909_561096_563007_563102_563558_563647_566662_566776_567338_567455_568130
916627	contig_9895_pilon	+	3020	6	Intergenic	novelGene_144680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	276	junction_3	99.17943335188	7	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	225	701	96967	231985	FALSE	40	AGGGCCCAGTAAGCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSLGEKSRVEAGTRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEV	62175	234304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_62319_96885_96996_109898_110002_148541_148707_194344_194442_231902
916628	contig_20527_pilon	+	2910	4	Intergenic	novelGene_138612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	1440.95485317511	38	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	902	1249	23541	26270	TRUE	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVEFPEEIQRSF	22639	28894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_23740_24905_25023_26238_26346_27308
916629	contig_7963_pilon	-	2689	12	Intergenic	novelGene_58428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	654.344148336951	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	860	1855	123023	120628	TRUE	20	TCTTAATATTTTTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126207	102720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_102728_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123029_123840_124051_125563
916630	contig_17753_pilon	+	5604	9	Intergenic	novelGene_105044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	216	junction_5	236.610142164278	95	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	1119	2141	131420	143267	FALSE	55	AATATGGAAACCAGACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVKKMKLLTFLILLIFLTSFFLSYNQTMVITTWFPKQMVTGISENFQKLMKLPHRSCTCSHCIDELRVSRWFDERFNQTVQPLLTMRNSLLEEETYSWWLQLQQEKNPKNLNNTIKELFRVVRGDVDPMLENEFVGCRRCAVVGNSGNLKESQYGSQIDEHDFVLRMNKAPTVGFEADVGSKTTHHLVYPESFRELGENVNMVLVPFKTIDLQWVVSATTKGTISHTYVPVPTKIKVKKEKILIYHPAFIKYVFDNWLQGHGRYPSTGILSVIFSLHVCDEVDLYGFGADSKGNWHHYWENNPSAGAFRKTGVHDGDFESNVTAILASIHKIRIFKGR	45388	146730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96221_130836_131726_137748_137946_138965_139146_140838_140885_141749_141870_143093
916631	contig_2069_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_23205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	83	415	97901	97569	NA	20	TAGTCTTTGATCTTCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPKTKTLPEFSKDSSNVYSRFPAHKGHMRTKPNMWDPGESPAALLTLVLAPPLPTSSSSASLPLAVLLIPTGTPSCGPSLMDRPIWGGLRLKGPNFSSPQGAAEPWRERQVQLPTYYPPAAYKTTWGWKCSVWSSGS	97983	95799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_95800_98000
916632	contig_16098_pilon	-	682	4	Intergenic	novelGene_46001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1057.64402749171	6	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	4	501	352350	350466	TRUE	30	TACCAGACTCTGAAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGAVAGWWDEAGGLVR	352353	348289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348441_350435_350643_350765_350889_352152
916633	contig_2278_pilon	-	2351	2	Intergenic	novelGene_118122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	124	junction_1	0	57	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACTACCATTATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963999	960916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_963250_963981
916634	contig_17470_pilon	+	4806	12	Intergenic	novelGene_110496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	27.2232885231841	167	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	64	1266	229562	243438	FALSE	10	TTCTCTATCACGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLHKSRIADFQDVLKEPTIALEKLRELSFSGIPCEGGLRCLCWKILLNYLPLERASWTSILAKQRELYSQFLREMIIQPGIAKANMGVSREDVTFEDHPLNPNPDSRWNTYFKDNEVLLQIDKDVRRLCPDISFFQRGTEYPCLLILDPQNEFETLRKRVEQTTLKSQTVARNRSGVTNMSSPHKTTAPSSLNEYEVLPNGCEAHWEVVERILFIYAKLNPGIAYVQGMNEIVGPLYYTFATDPNSEWKEHAEADTFFCFTNLMAEIRDNFIKSLDDSQCGITYKMEKVYSTLKEKDVELYLKLQEQNIKPQFFAFRWLTLLLSQEFLLPDVIRIWDSLFADDNRFDFLLLVCCAMLILIREQLLEGDFTVNMRLLQDYPITDVCQILQKAKELQDSK	229498	246978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_+_229585_230718_230793_232362_232404_232992_233055_233201_233302_234313_234397_235483_235644_239899_240111_240667_240832_241963_242125_242405_242464_243372
916635	contig_6871_pilon	+	2065	3	Intergenic	novelGene_21540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	33	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	218	1165	134070	135017	TRUE	25	CACACAAGTTTTCCCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEPPARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	135982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_133940_135438_135502
916636	contig_10641_pilon	-	2763	4	Intergenic	novelGene_171405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	749	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2037	2336	242858	242559	FALSE	30	AAATCCAACACCCTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWYPAATTDCSDWDHNRGFWTELEKYAEQNSNTQKKDQIYWPERDWRNPESTAFRRPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQHHKTKWA	259638	242131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10641_pilon_-_244620_258281_258408_258608_258717_259597
916637	contig_15687_pilon	-	1679	2	Intergenic	novelGene_129135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAACAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139728	116769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_117548_138827
916638	contig_5056_pilon	+	3007	1	Intergenic	novelGene_171162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAATGTGTTTTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134285	137292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_+_134300_137300
916639	contig_14390_pilon	-	1388	5	Intergenic	novelGene_178887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGTTGAGAGAGAGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25084	6096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14390_pilon_-_6162_7503_7594_8682_8865_23030_23129_24131
916640	scaffold_880_pilon	-	3415	3	Intergenic	novelGene_121390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1552	1863	268671	268360	FALSE	25	ACAAACCCGTTGCTGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTNGPFLCERKERDSGYRVGDGCVSAEIEGRWGDGKGQLGDRAPPQLLSVPCELGNTLRVTLLLSLSVSQGDSETPLEITNSLSIESILTPNNPIGQSRTAP	394446	266807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_269132_279820_280033_393567
916641	contig_10525_pilon	-	2248	1	Intergenic	novelGene_178974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	958	1323	1291	926	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	2248	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10525_pilon_-_0_2200
916643	contig_546_pilon	-	1450	8	Intergenic	novelGene_117203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTATTCACTTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147621	103330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_103530_119793_119882_123931_124065_136648_136837_139865_140056_140262_140635_146630_146845_147555
916644	contig_5019_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_109194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	113	346	124151	124384	NA	70	TGCACTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLKKLEIEVPYDPAISLLGIYSREIRAITQIDICTPMFIPALVAITKRWKLPRCPSGDKWINQLWYIHTMEYYVMIKNNDKSAKHLITWMNLEGMLSEISQSQKDKYCMRPLL	124038	125346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_124000_125300
916645	contig_5084_pilon	-	1803	1	Intergenic	novelGene_64511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATCCCAGCAACCACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364503	362700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_362700_364500
916646	contig_16951_pilon	+	3866	4	Intergenic	novelGene_98627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_3	76.8779696806713	5	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	21	761	65762	91405	FALSE	35	GCTTCCAGCATCACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHVRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFPRGSSAFEKAQEKEDGRTESAKTVTTEECLVNPVGMNRYGVDPSTSAFNHRGSLYPSSSPYRKRQNSGDSRLGEALPPLLEVSAPTSCPLEALQHLG	65741	94510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_65874_68468_68670_74288_74484_91172
916647	contig_13707_pilon	-	4192	11	Intergenic	novelGene_43526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	290.163333314187	63	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTATGTTTTTAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154156	140267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_140306_140789_140859_140953_141045_141609_141648_143000_143070_143216_145253_146441_146477_150930_151000_151514_152162_152693_152763_153125
916648	contig_10973_pilon	-	1596	1	Intergenic	novelGene_150384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	408	920	2730	2218	NA	50	ACAAAGACGACCCACCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3137	1541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3100
916649	contig_7530_pilon	+	2143	3	Intergenic	novelGene_141829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCACAGGATTGATTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129598	135540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7530_pilon_+_131294_131933_132274_135432
916650	contig_6684_pilon	-	4301	1	Intergenic	novelGene_168585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGAGCATCCAGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26014	21713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6684_pilon_-_21700_26000
916651	contig_12239_pilon	+	2859	11	Intergenic	novelGene_170466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	69.9659917388441	87	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATTTTGTCAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22050	76260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_22111_24520_24810_44658_44813_45246_45344_47050_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_67985_68046_74519
916652	contig_10982_pilon	-	3051	1	Intergenic	novelGene_87857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	546	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGCTTGTTTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73136	70085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_70100_73100
916653	contig_16109_pilon	+	3334	1	Intergenic	novelGene_80325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1986	2285	221366	221665	NA	45	TAACAGTCCTACAAGTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLFGNIKTNKKLGHSKQTLNKYNNLLMVRRQQSVSNHIKRQSMMASASSQNKESRNFPEEENFLKLLEIEYKRLMYRTLQEIRKEIKQNTEQAIEEI	219380	222714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_+_219400_222700
916654	contig_3018_pilon	+	2658	16	Intergenic	novelGene_78843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2029	2430	600066	624867	FALSE	20	CTCGCTCTGGGAAAATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLMTFASGKFDYYGVLCIGIQNTGACQPQCSLQTSKCIHKSCFREGRSCQTNCRRHGLSAKKYGCEQLCGRYLHFTHEMSGKSEVQERINVFTKPAIQNRPVMFTQQTPEPPLFARPPGSLSTPPRSGDPR	561152	625095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_561580_562782_563042_566734_566838_567957_568081_569956_570088_570203_570434_572320_572360_576712_576887_577774_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600202_600813_600911_603366_603438_624769
916655	contig_8848_pilon	+	3724	3	Intergenic	novelGene_140465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	79.5	6	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	6	653	93887	95408	FALSE	25	AATGCTTATCTATCTATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMEAEDSEKEAAEQEPREEQEEPEEEQAECSGKKRVVPGIVYLGHIPPRFRPLHVRNLLSAYGEVGRVFFQPEDGFVRRKKKAAAAATGAYLHRFTWSHLSEHLAFERQVRRQRLRAEVAQAKRETDFYLRSVERGNRFLAADGDPARPNGSWTFAQRPTEQELRARKAARPGGRERARLATAQDQARSNRGLLAKIFGAPQPSEGMEGPSVARNS	93881	98479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_94104_94682_94733_95027
916656	contig_8291_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_99949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGCCTCTGATGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406449	405483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_405500_406400
916657	contig_4659_pilon	+	2610	4	Intergenic	novelGene_118221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATCCACCAGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741027	767459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_741418_764890_765242_765526_766293_766356
916658	contig_8063_pilon	+	3172	22	Intergenic	novelGene_152410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_17	73.9062960076417	123	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	17	2071	6663	52913	TRUE	25	GGAAAGCTCGGTGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYFDYMRSWIQMLQQLPQASHSLKNLLEEEWNFTKEITHYIRGGEAQAGKLFCDIAGMLLKSTGSFLESGLQESCAEFWTSADDSSASDEIRRSVIEISRALKELFHEARERASKALGFAKMLRKDLEIAAEFTLSAPIRDLLDVLKSKQYVKIQIPGLENVQVFVPDGLVEEKGIILQLLNAAAGKDCSKDSDDVLIDAYLLLTKHSDRDQDSDDGWGAWEGQPVKVVPQVETVDTLRNMQVDNLLLVVMQSAHLTIQRKAFQQSIDGLMTLRQEQTSSQPVIAKALQQLKNDALELCNRISDAIDQVDRMFVSEFDAEVDECESVTLQQYYREAMIQGYNFGFEYHKEVVRLMSGEFRQKIGDKYISFARKWMNYVLTKCESGRGTRPRWATQGFDFLQAIEPAFISALPEDDFLSLQALMNECIGHVIGKPHSPVTALHRNSPRPVKVPRCHSDPPNPHLIIPTPEGFRGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEPAYPKGDSSASTRRSWELRTLISQTKDTASKQGPIEAIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHRSTVTLPNYQEISMSYTISAFSLKLEEFFLK	6646	60984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_6806_10353_10471_15274_15375_15470_15555_23433_23701_28859_29010_31036_31199_31708_31843_33155_33235_33978_34046_39806_39904_44265_44367_45183_45265_49532_49725_50785_50857_51917_52035_52126_52218_52911_53072_55304_55428_56797_56905_58860_59041_60451
916659	contig_4769_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_117988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTGAGAAGTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846649	847501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_+_846600_847500
916660	contig_9738_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_169263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185239	182804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_182800_185200
916661	contig_13172_pilon	+	5750	2	Intergenic	novelGene_146326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	624	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATTTTTCTAATAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65515	71355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_67230_67319
916663	contig_2036_pilon	-	3203	2	Intergenic	novelGene_131814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATGACAAGCAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583591	580218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_580708_580877
916664	contig_5260_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_144398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAAGACCCGTTTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451043	448110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_448100_451000
916665	contig_18414_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_170023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	40	636	143239	142643	NA	50	AAAAAACCAAACCCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQSFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITQIDIFTSMFMAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMQLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	143278	140843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_-_140800_143300
916666	contig_19145_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_164142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCACCTAAGATACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142396	140823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_140800_142400
916667	contig_7119_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_40992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140339	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_140300_141000
916668	contig_5020_pilon	+	2720	9	Intergenic	novelGene_27889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	871.911943661744	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	324	1253	122915	125772	TRUE	40	CTCACATTAATCCTAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118501	127624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657_126438_126822
916669	contig_3382_pilon	+	1827	1	Intergenic	novelGene_124059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240103	241930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_240100_241900
916670	contig_12528_pilon	-	2686	10	Intergenic	novelGene_81316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	540.052215125286	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1398	1910	947253	933897	TRUE	15	TCGGTGCCTATGACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHTYRNKHIHTHTLICTRIHTVTHTDRSLAFPGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWNVCLYSW	968163	932716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_933742_933922_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947706_956052_956217_959917_960131_964909_964971_967656
916672	contig_15371_pilon	+	1289	2	Intergenic	novelGene_151432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCATTGACTGAGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23429	25573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_23571_24425
916673	contig_6608_pilon	+	3092	3	Intergenic	novelGene_162537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCTAGTGCTGCTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195232	205546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_+_197569_204616_205035_205208
916674	SIRV6	+	551	5	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	-4	81	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	16	3	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTGGCTCTTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1527_1640_1736_1845_2027_2470
916675	contig_6364_pilon	-	2420	10	Intergenic	novelGene_51858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	422	802	2235916	2235536	TRUE	25	ACGTGTACCTGAAATTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGRDGPQLLLRVQNHGYLVCGVHLEVLLECLQEEVAQLADGACIVGLGREELLQTDVGGQHQLQGGLALIAQLDDCLLHWCQDGGQVAEQVLVEALDEVHLLGPAIELADLLIALVHQQQRVRD	2236337	2197519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_2197609_2198789_2198876_2204538_2204597_2205139_2205240_2217264_2217496_2221244_2221332_2223566_2223613_2224627_2224704_2234021_2234124_2234792
916676	contig_7411_pilon	-	3470	6	Intergenic	novelGene_136972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	25	junction_5	58.7965985410721	118	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	740	2223	242	2464	119782	106725	FALSE	25	CCAGCATCTCTTTGGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLQESLSFEDLSVDFTQKEWQLLDPSQKDLYKDVMLENYSSLVSLGYEVMKPDVIFKLEQGEEPWIVDGEIASSDSPEEVWQVDGHMLWHQDNQDKLKNVKRVHGCDAFGKKFDLSMNFVPVRKSHSESDLDGIILKHHVDLLIPKADCEKMEPNDFNVFDKLFLHTKPEETDTWLKYYEYDKYDRISYKKSQIVIYHRTRLGEKLFECCECRKRFSKKSSLIKHQSRHIRELAYGCGKCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYDCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHSGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYECSECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLITHHRTHTGTKPYGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECSDCEKSFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSFCRKAFFEKSELVRHQRTHTGEKPYECSECKKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECHECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSVCKKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYQCSECPKAFSQKSQLINHQRTHTKKTC	127272	105718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_108710_115074_115171_115835_115963_119767_119887_121104_121202_127232
916677	contig_10163_pilon	+	1926	10	Intergenic	novelGene_82606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_9	53.6720724215554	7	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	234	1499	11226	31892	FALSE	40	GTGTATATTCTCAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEENMKLATVEDTVEYCLFLIPNEPRNPEKHKEILLKYIERIMTHFAPILVPYIWQNQPFNLKYKPEKGDVPAHMFGMTKFGDNIEDEWFIVYVMKQITEEFPELVARIEDNDGEFLLIEAADFLPKWLDPDNSTNRVFFHHGELCIIPAPRKPRAISWLPTTTPTIPQALNIISTHPEKILASESIRAAVNRRIREYPEKIQASLHRAHCFLPAGIAVVLKQRPRLVAAAVQAFYLRDPFDLRACRVFKTFLPDTRIMTSVTFTKCLYAQLAQQRFVPDRRSGYQLPPPSHPQYRAHELGMKLAHGFEILCSKSSPHFSDSKKSLVTTSPLWPGFLDSLKKNDYFKGLIEGSAQYQEKLEMAKNYFQVSVNQPERGRRRDRNRRRIWNVWLFACMNNCLLFHETRRTGWCPATITEHFDQ	6458	32319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_6679_11212_11431_13892_14011_22629_22718_22832_23012_23828_24022_24602_24732_26559_26689_29381_29468_31753
916678	contig_4538_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_153071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTGTAAGCAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63811	62846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_-_62800_63800
916679	contig_6079_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_160102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCAATCTAGTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451962	449874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_449900_452000
916680	contig_14970_pilon	+	1149	5	Intergenic	novelGene_45084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2928	junction_1	4009.92577861486	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	344	448	231446	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	213860	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
916681	contig_12786_pilon	-	1606	8	Intergenic	novelGene_103454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_2	60.0618728598149	16	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	102	905	674025	652481	FALSE	55	AATTATATACACTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLRPQPGKLHRLGAAGGTHGDPLGKRCLQTPVMRNTSKELHGATNRYAPCDWYYHLPVKRSEKAVDAPPASQIPGLSEVGDTQNGNTFGTRRYWIKETDSEYIKLAKQGGRPDLLKHFGPATQKGSPVTYSMPDWYLHHSKPPTANQREVPFTSMPDYMVHEEFNPNQANGNYESRRGPFDFDMKTVWQREAEELEKDKKKVRLPAITSKHPSKVGTPVTSKETSGNRISFPPINGYKDEWLQQRADSEKRTPQTSKTSTSSRSPENPEGQQDPEALPDPDVPEGSQRDEESSPPSECL	674524	651779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_652510_653179_653350_655354_655453_660804_660962_664259_664369_669384_669571_673970_674044_674441
916682	contig_2703_pilon	+	3886	7	Intergenic	novelGene_101780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	671.412110571609	26	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2452	3045	602068	610870	FALSE	15	GCCCAGGGGCCGCATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	599616	611711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
916683	contig_16098_pilon	-	2822	4	Intergenic	novelGene_46248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	90.0382634710871	9	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	107	1063	830479	828958	TRUE	55	CATTTAGAAAAATATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPQPHEELEQPGPSSVPLASTLQSCQLNWSQTRLMPVAIEMALLLLLLGGFWVQEVITESQTAMETLQTPTSLDNVSSIPVTLNLNSMTSDAMKISSTGDQPPSSTSSIANEKVTSFGTSTGVNTVPLALELTTFQEVSTKNLLMLTETSNATSDPVIPLKINSLESHTRSSRTITSSLETSSVTSGPPVTKATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGLPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSVTSGPPVTEATSSLETSSLKISTMITSETSKNTITLHPHPTSLPYILTQHPYPVSSPSILI	830994	826321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_827683_828559_829039_829603_830496_830904
916684	contig_3602_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_60690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATTATTTTTACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311193	1309612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_1309600_1311200
916685	contig_14666_pilon	+	1313	2	Intergenic	novelGene_39481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCATTTGGGGATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41367	43832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_42635_43786
916686	contig_3832_pilon	-	3440	2	Intergenic	novelGene_161481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACCAAAAATTGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446189	441934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_445252_446066
916687	contig_720_pilon	-	1493	2	Intergenic	novelGene_155169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAAAGAAAATTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208379	198681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_200069_208273
916688	contig_5628_pilon	-	3569	16	Intergenic	novelGene_157576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_15	46.7199695585898	140	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	891	2039	427589	410984	FALSE	70	GAAGGAAAAAACAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEKGSAAGSEQNLMCSFLQLLGDRWGRNGPRGWCVIPSDDPFVLYIYAAPQDMRAHTSIPLLGYQVTAGPQADPPGLPAAAVRPAVHVQG	434500	409453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_411104_411655_411803_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427629_427864_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266
916689	contig_13607_pilon	-	4217	1	Intergenic	novelGene_170183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	554	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1914	2354	223216	222776	NA	20	GTAGTCCTTGACAGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFVIPHNIAQLSWPISPPICCYLDPSNINQKTKPAAIELTMTHDTCHVCQRRTELHRVFSGGLFESRSTGLSSKVLLGGFKPPTFQLAAEHVNICPIQGLLSNIPKPNPLPLNQFQLVTTPQNRVELLHRVSKERLVDLNCRPFS	225129	220912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_220900_225100
916690	contig_1532_pilon	-	1812	7	Intergenic	novelGene_37413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1788	junction_4	745.997914801971	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	34	1068	32058	13113	FALSE	35	GGTAATAATGAGTATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLGTKGTTAAQMAQVLQLNQDQDIKSCPESEKKRKMEFNLGKIEEICSDFQTLISEINKPSNAYILKTANGLYGEESHPFHKKYLEDIKKHFGAEPQSVKFMKTPDQSRKKINSWIEKQTEGKILNLLPEDSVTSTTKMVLVNALYFKGTWEHPFSSENTTEKPFRINTTTSKPVQMMSMKQKLPVFHIEQPQAKGLQLDYESHDISLLILLPEDISGLEQLEKAITYEKLNEWTSEDMMELYEVQLYLPKFKLEESYDLKSTLSRMGISDAFNPSKADFSGMSAERYLYLSNVFHKSFVEINEKGTEAAGGSGSEVSVRILLPSMEFNTDHPFLFFIRHNKTKSILFYGRFCSP	32091	12368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1532_pilon_-_13518_15732_15889_17971_18115_27260_27379_28825_28964_29438_29505_32049
916691	contig_6001_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_128036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTTAAATCAATAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392778	394478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_392800_394500
916692	contig_12119_pilon	+	3163	1	Intergenic	novelGene_88650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATTTGGAAATAGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190798	193961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_190800_194000
916693	contig_7887_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_124881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1893	2195	233738	234040	NA	10	CATCCACGTGTGGTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRVGFCNTLTKVTSLIQSKGSFPKVWPAPPFNLQEIKGKGIRQNWGPQTTKKTVSGAECVLWAGGSCAEKLLVRGKTDDNKDLPPEPTETESLPLELTL	231845	234095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_231800_234100
916694	contig_9609_pilon	+	786	6	Intergenic	novelGene_23014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	219	junction_1	191.040309882496	11	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	266	784	318428	323321	FALSE	20	AACTATTGGGGTTGATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDG	318162	323323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261
916695	contig_6397_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_146280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTCTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561730	563407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_561700_563400
916696	SIRV3	+	462	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5832	14	3773	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGCATTTGCGTTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7776	8925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
916697	contig_16322_pilon	-	1332	6	Intergenic	novelGene_87507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	524.606747955075	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	212	589	37060	32956	TRUE	55	AAATAAAAAGTTTCAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIHRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57639	31701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36442_37026_37098_57465
916698	scaffold_13505_pilon	-	4253	10	Intergenic	novelGene_111525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	431.428233878654	7	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	1116	1133	596573	596556	TRUE	5	TCATTTTCTCTCCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGTYKSLNRLMCFPK	603236	588570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589363_589810_589843_590205_590259_594013_596600_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
916699	contig_9981_pilon	-	2599	1	Intergenic	novelGene_121065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAGAGATGCCTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344487	341888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_341900_344500
916700	contig_17274_pilon	-	4088	9	Intergenic	novelGene_26496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	427	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGACTTCCAGAACGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80309	70534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_71022_71180_73876_74917_74966_76378_76418_77044_77166_77891_78000_78278_78360_78575_78718_79942
916701	contig_10074_pilon	+	3491	1	Intergenic	novelGene_57129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1874	2182	346000	346308	NA	5	TGCCTCTCGTTCTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIFFPSNYAEAVLKAFPSPSQEHGPWGEKNPNQPQLFTAHFPTVSALKVPALGVLASFTVKTLSSCPAAVRPVPRRDLYTQCLGMRDPEPHTVKRLQRLEY	344126	347617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_344100_347600
916702	contig_6842_pilon	-	4237	1	Intergenic	novelGene_130740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	141	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGCTTACAGAGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257335	1253098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1253100_1257300
916703	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
916704	contig_16924_pilon	+	2174	2	Intergenic	novelGene_177215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	269	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCCTCCAGATCAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4	2525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16924_pilon_+_508_854
916705	contig_17074_pilon	+	2918	13	Intergenic	novelGene_145125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	227.373163666154	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	30	1163	208015	223655	TRUE	25	TGGTATACAACCTTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207985	225568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212465_213460_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452_224708_224865
916706	contig_15120_pilon	+	2855	17	Intergenic	novelGene_108015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	88	junction_1	76.2396509370288	96	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	43	1893	219611	249224	FALSE	30	GCAAATATACTTTGTGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATAVAAGSGPAEGTEVAEGPPGPAAALELWLNKATDPSVSEQDWLAIQNFCEQVNTDPKGSTHAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLETCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLGSWTTEKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPMDRILPPPSPWPKSSIFDADKEKSKLLTRLLKSSHPEDLQAANRLIKDLVKEEQEKSEKVSRRVSAVEEVRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQAVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNTVTSPVEDIPVSRVFQNPAGCMKNCPLIDLEVDSRSEQAGTLAPSLLHQDLAALGINDAAVTNEVARQNCCKERRNPTPSTLPDGGVQSPSAERNLLDLLSPQPSPGPLNYVPQKSIPKEVPPGTKSSPGWSWEASSLVSTPSSQNTPLAQVFVPLESVKPSSLPPIVVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTATQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFNPLTPPAMISQMLLLENPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDLAVLGAA	219568	250186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_219711_229926_230012_230843_230920_231828_231928_232647_232772_234612_234717_236088_236170_236671_236810_237009_237092_240432_240559_241361_241485_241794_241824_242740_242875_244531_244690_247280_247451_248501_248613_249113
916707	contig_2054_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_51683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAATTAAGTTGAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121546	119164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_119200_121500
916708	contig_10930_pilon	-	3979	6	Intergenic	novelGene_36978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	968.533200256966	36	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1803	2651	276835	268388	FALSE	90	AGAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_279832_280157
916709	contig_401_pilon	+	1706	10	Intergenic	novelGene_42826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1424.36544242699	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	57	1097	1711949	1715819	FALSE	40	TAATATCTTGAATGGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMAKGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRKQSLAGEESQRSDREATGYNRFVNSAKHSGGRA	1711892	1716428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713510_1713607_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715469_1715716
916710	contig_7412_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_76297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299467	298025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_298000_299500
916711	contig_6958_pilon	+	1816	10	Intergenic	novelGene_70014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	131.140674633044	2	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	810	1005	1814	797705	806338	FALSE	35	TTCATTACTGAGTCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFGDIISSQQEINRLSNEVSRLESEVGHWRHIAQKTTAQGADSSDQSEICKLQSTIKELKQNRSQDIDVHQHEMSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSDAENEIMKLKSLNQDSSLTEDNLKLEKHVQALEKE	782664	806340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_786733_786796_787588_787714_792713_792825_797530_797810_799938_800008_801481_801648_802350_802717_805686_805728_806275
916712	contig_1759_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_171336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAGTGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71745	68973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_69000_71700
916713	contig_3787_pilon	+	4365	3	Intergenic	novelGene_102406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	294	junction_1	19	123	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	4063	4365	546705	548637	FALSE	20	CAGTGCTCCAGCGGTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPSSQIPSWKDWAKPGPYDQPLVNTLQRRKEKREPEPGGGGPAPTAGAPAAAAEEAQRPRSMTVSAATRPGEEMQPCEELALALTRSLQLDTQRSSRDSL	542642	548637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_546738_548013_548191_548544
916714	contig_13004_pilon	-	2938	7	Intergenic	novelGene_112737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	7.25718035235908	77	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	303	1616	940855	930977	FALSE	20	GTATTTATGTGTTTCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKFKAARGAGNREKHAPLAEQILTADAVREGVREKRRGRGTREEEEEYVGPRLTRRILQQARQQQEELETEHGTGDRPKAPRERTTRLGPGVPQDGSDDEDEEWPTLEKAAIMTGVGHHAEVVVDAEDERAIELFMNKNPPARRTLADIIMEKLTEKQTEVETIMSEVSGFPMPQLDPRVLEVYRGVREVLSKYRSGKLPKAFKIIPALSNWEQILYITEPEAWTAAAMYQATRIFTSNLKERMAQRFFNLVLLPRVRDDIAEYKRLNFHLYMALKKALFKPGAWFKGILIPLCESGTCTLREAIIVGSIITKCSIPVLHSSAAMLKIAEMEYSGANSIFLRLLLDKKYALPYRVLDALVFHFLGFRTEKRELPVLWHQCLLTLVQRYKADLATDQKESLLELLRLQPHPQVSPEIRRELQSAVPRDVEDVPITTD	941157	929654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_931323_931858_931962_932147_932309_932920_933055_933417_933557_937151_937315_940587
916715	contig_17976_pilon	+	2094	4	Intergenic	novelGene_32494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	212	1228	41843	47385	TRUE	45	GAAGTAACAAAGAATTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41631	49760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47501_49009
916716	contig_20951_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_43144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347778	350188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_347800_350200
916717	contig_10042_pilon	-	2944	1	Intergenic	novelGene_79129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1403	1810	63546	63139	NA	70	AATGAAAAAAAAAAAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAALEVLTYLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPTPKKGDPTQCRNYQTISLISHTSKILLKIIQKRLQQYTDRDLPEIQGGFRRGHETKDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVHHNKLWITL	64948	62004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_62000_64900
916718	contig_10627_pilon	-	3235	7	Intergenic	novelGene_60029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_3	9.3704618645804	139	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	861	2586	37	2622	536316	525726	FALSE	75	AATCAGAAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDNGAATDHADKNGRTPLDLAAFYGDAEVVQFLVDHGAMIEHVDYSGMRPLDRAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIGPATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAAQRYQYALKKFPREGFGEDLKTFRELKVSLLLNLSRCRRKMNDFGMAEEFATKALELKPKSYEAYYARARAKRSSRQFAAALEDLNEAIKLCPNNREIQRLLMRVEEECRQMQQQQQQPQQQPQQQLPEETEPEPQHEDIYSVQDIFEEEYLEQDVENVSIGLQTEARPSQGLPVIQSPPSSPAHRDSAYISSSPLGSHQVFDFRSNSSVGSPTRQSYQSTSPALSPTHQNSHYRPSPPHTSPAHQGGSYRFSPPPVGGQSKEYPSPPPSPLRRGPQYRASPPAEGMSVYRSQSGSPIRYQQETNVSQLPGRPKSPLSKMAQRPYQMPQLPVAVPQQGLRLQPAKAQIVRSNQPSSAVHSSTVIPTGAYGQVAHSMASKYQSSQGDIGVSQSRLVYQGSIGGIVGDGRPVQHVQASLSAGAICQHGGLTKEDLPQRPSSAYRGGMRYSQTPQIGRSQSASYYPVCHSKLDLERSSSQLGSPDVSHLIRRPISVNPNEIKPHPPTPRPLLHSQSVGLRFSPSSNSISSTSNLTPTFRPSSSIQQMEIPLKPAYDRSCDELSPVSPTQGGYPSEPTRSRTTPFMGIIDKTARTQQYPHLHQQNRTWAVSSVDTVISPTSPGNLPQPESFSPPSSISNIAFYNKTNNAQNGHLLEDDYYSPHGMLANGSRGDLLERVSQASSYPDVKVARTLPVAQAYQDNLYRQLSRDARQGQTSPIKPKRPFVESNV	543068	525112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_527680_529329_529431_531892_532040_534207_534300_535718_535852_536157_536334_543049
916719	contig_14704_pilon	-	2617	1	Intergenic	novelGene_82684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1406	1744	31131	30793	NA	45	GAGAGAGTCAAGAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSTRRSCGVLFWTFSGAVLFCFFEYVLILSAVFGTFRDYFLHLLTVDLFVMSCCFVLFGYVCAHGVGILCCLLICGHDTSHHLVQVSRAGCSAVVQQGRSSGRGGTGVIP	32536	29919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_29900_32500
916720	contig_9363_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_6635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	314	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAACCATCCATTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875896	877155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_875900_877200
916721	contig_14450_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_48945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACTTCAGATTAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531878	533060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_531900_533100
916722	contig_4091_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_173045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1041	1427	57039	56653	NA	15	CAATACCTTTCCCCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFCISNCCFCIISSCGFILVFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNFSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSSSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCSGKCFDIVCCHCSIQ	58079	56536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_56500_58100
916723	contig_16578_pilon	-	2520	1	Intergenic	novelGene_148688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1261	1767	323419	322913	NA	25	GTCAGAGTACTCTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQGFISPIGIEGRSPSCTEGTGKNKAPGIDRIPIEMFQQTDAMLEVLTCLCQEIWKTATLLTDWKRSIFVATPKQGDPTEWGNHRTMSLISHPSKILLKIIQNGCSSTSIGNFQKFKSDLQEDVEPGISLLMSDRSWLKAENTGKMFTYVLLTMQRHSTVWVITNYG	324679	322159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_322200_324700
916724	contig_990_pilon	-	4052	23	Intergenic	novelGene_76076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	93	junction_1	108.018822969437	138	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	144	2483	1142804	1093771	FALSE	35	AAAGGTTCTTGAAATTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSLEKIVDPTLAEMGKNLKEAMKMLEDSQRRTEEENEKKLLSGDIPGPLQGSGQDMVSILQLVQNLMHGDEDEEPQSSRIQNIGEQGHMALLGHSLGAYISTLDKEKLRKLTTRILSDTTLWLCRIFRYENGCAYFHEDEREGLAKICRLAIHSRYEDFVVDGFNVLYNKKPVIYLSAAARPGLGQYLCNQLGLPFPCLCRVPCNTMFGSQHQMDVAFLEKLIKDDIERGRLPLLLVANAGTAAVGHTDKIGRLKELCEQYGMWLHVEGVNLATLALGYVSSSVLAATKCDSMMLTPGPWLGLPAVPAVTLYKHDDPALTLVAGLTSNKPADKLRALPLWLSLQYLGLDGIVERIKHACQLSQRLQESLKKVNHIKILVEDELSSPVVVFRFFQELPGSDSGPKAVPAPNMAPSAAGQEGHSCDALNRWLGEQLKQLVPASGLTVTDLEVEGVCVRFSPLMTAGVLGTQNEDVDQLVASIKSKLPVLTCTLQLREEFKQEVEGTAGLLHVDDPNWPGIGVVRYEHANDDKSSLKSDPEGEKIHAGLLKKLNELESDLTFKMGPEYRSMKSCIYIGMASDDIDVSELVETIAVTAREIEENSRLLENMTEVIRKGIQEAQVQLQKANEERLLEEGVLRQIPVVGSVLNWFSPLQPSQKGRTFNLTAGSLESTEHTYVSKVQGMGVTPPPTPSGTRTKQRLPGQKPFKKSLRGSDVMSETSSVSHIEDLEKMEHLSTGPEQDTPEAASPQEADQSEALQEEAQHPEDDCPQVEEPESLR	1142947	1092201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1094004_1094503_1094609_1095418_1095516_1095603_1095697_1096604_1096727_1097050_1097170_1097807_1097980_1099020_1099127_1100358_1100448_1101854_1101919_1108873_1108925_1111229_1111356_1112823_1112926_1113085_1113135_1114036_1114122_1118059_1118139_1118940_1119010_1120917_1121108_1123215_1123363_1125109_1125191_1128026_1128093_1128586_1128661_1142783
916725	contig_7229_pilon	-	2204	1	Intergenic	novelGene_39822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894473	892269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_892300_894500
916726	contig_7342_pilon	-	4556	19	Intergenic	novelGene_71121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	107.337373399926	11	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	2812	4506	81495	76155	FALSE	20	CCAAAGCTAGTTTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVRDKALEDVVVMNVDSNTLETPFDDVQALPPEVVSLLRLQLRKVALVPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEAFLAQKSGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEGRLEKLNSGDGFSDLFEQEITCSEASSGALRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGMQSLLMYKDGDSGLQRGGSLRTLPLVSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSKRLRQEEGPSESPGAPPLSSDDAGGSWAEEALDSSFLGSGELDLLSEILDSLSVGVKSTGSLRPSQSLDCCHRGDMDGGFSLLEVPGRPRWYPEDEKTPELQPLSLPTNLLSFQDPPTLDASGCSKNSNSQLPPEASQDIIPPSQPLTTSADPSSRGDSESSPLTEPNPLILHLSPPDKAVEESRVQESPCSWLSITPTQPNPPESPPSLPLSESSLDTACTSQPPGVSSGPSSPATPRAQPSQELLAEQAHLQPFKELGAPRHPAVPTSDWPEPKARSRPRVAELKKCFES	86202	76104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76788_76882_77088_77208_77271_77666_77775_77844_77890_78711_78784_79008_79050_79138_79230_80345_80451_80856_80983_81075_81178_81295_81342_81436_81538_82306_82557_82798_82880_83222_83642_83789_83834_83913_85681_85994
916727	contig_12964_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_131741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	759	1103	671504	671848	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGFLVWRFRVVVSWDIPVNWPNNVCSAPVLPPNLMLVPEVLKNCKLPSKIEQLVSIHREQQEEEGEPGRGRGYGISYLPPLTTSSFAMRPEDLDGAQLPLLNILIKDSIEES	670745	672861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_670700_672900
916728	contig_3900_pilon	-	2735	2	Intergenic	novelGene_84208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAATAAGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560628	556826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_559390_560456
916729	contig_7909_pilon	-	3589	3	Intergenic	novelGene_155927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	124	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2239	2589	1027260	995229	TRUE	50	AAAAAAGAATTATCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLPIITLNVNGLNAPIKRWRVTEWIKKQDLSIYCLQEKHLSTRTDICTPIFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYTTIKNNEESVKHLTIWVNPEGSLC	1029498	765615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_766331_994943_995308_1026988
916730	contig_10444_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_139462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGCTGTTTCCTCTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780922	783106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_780900_783100
916731	contig_4364_pilon	+	1943	6	Intergenic	novelGene_387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	40	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	20	GCTGCAGTGAACGGCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
916732	contig_3382_pilon	+	7271	1	Intergenic	novelGene_124094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTTTGAAATCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581073	588344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_581100_588300
916733	contig_13224_pilon	+	1814	8	Intergenic	novelGene_104107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	39.6803554954451	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	299	1300	291364	302188	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYRLLSIVRQQRVSPGWQNWPSARSSTSAAEAHSIALPAQAQVVICGGGIMGTSVAYHLSKLGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLCHQLEQETGIQTGYVRTGSISLAQTQDRLISLKRINSRLNVMGIPSEIISPKKVAELHPLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALALASAASQNGVQIYDRTTVLHVIVKKDQVTGVETDKGQIDCQYFVNCAGQWAYELGLSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLETPLQSNTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFEKNPKPIFTEGKNQLEIQNLQEDWDHFGV	282914	302702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_283151_291301_291588_293361_293496_299267_299350_299443_299608_300338_300461_301171_301290_302030
916734	contig_13145_pilon	-	3806	1	Intergenic	novelGene_116657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	175	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237912	234106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_-_234100_237900
916735	contig_7318_pilon	-	1919	1	Intergenic	novelGene_152238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCTTTAATGGCTCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351536	349617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_349600_351500
916736	contig_12837_pilon	-	3365	6	Intergenic	novelGene_57385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_3	189.280109890078	15	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	2695	3363	394673	382012	FALSE	20	AGGGTCCACCAGGCTGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQDENGDSVLHLAIIHLHAQLVRDLLEVTAGVISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITSQEDVVEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKILSILLKHKKAALLINQPNGEGLNAIHIAMMSNSMSCLRLLMAAGADIDAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTFDGTTPLHIAAG	398747	382009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_382075_382543_382714_383351_383554_390081_390197_394554_394697_396076
916737	contig_11466_pilon	-	935	1	Intergenic	novelGene_177692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64333	63398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11466_pilon_-_63400_64300
916738	contig_835_pilon	+	3588	7	Intergenic	novelGene_152129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	121.64657368331	43	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	135	932	70975	380598	TRUE	55	TAAGAAAATCTATACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKSTEILEYSSDSGKEDDSENVLFIDSESPHKCSVDFGTDARQYMERLVEPWTKSTETILYTPQKQKNKFPRTPEDSTKKKKLIRGGLAERLNELQNRERSAISFWRHQCVSYPKTLEGRKSGVLVVKILELHEECTMQVAICEQLEDLQASSPSPGVAPGPGACLKILFTKDTASNLKGRPQDIVHIYPPWQKLIIPDESCPVVLNTYFCQKSIAKEDSERMAVVHCRDSPLLRRSITLAQMFRLKCVKPEIQVTCGGMTTMGTDLTHEQEEAKQHFPAHTSPSDSLLDVVGSQGATAGIPSRTPHYI	70840	383443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_71097_88205_88307_164341_164562_320242_320430_321691_321829_380567_381512_381700
916739	contig_10126_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_105759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	149	454	165426	165731	NA	10	CCTTTTCTCACCCCCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRGR	165277	167959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_165300_168000
916740	contig_5797_pilon	-	2696	1	Intergenic	novelGene_56912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTCCTTACTTCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91962	89266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_89300_92000
916741	contig_7612_pilon	-	2587	3	Intergenic	novelGene_170372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1172	1612	269757	268827	FALSE	40	GCACTACAAAATGCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVFGSCSSLLSLIFPIPILAPHITIYPLIIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMENADKKIEEFKKIIQEKNDKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDRVIEVLRSRFEMMEGRISKIEDKHLDTTLRQNQKKEQIKMNKP	327584	267851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_269179_269668_270099_326754
916742	contig_15365_pilon	-	2712	9	Intergenic	novelGene_111126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	112.832840963968	5	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	574	1725	28	1752	48653	21917	FALSE	5	TTATTCTGTGGGGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIAVHEPSFMISQLKISDRSHRQKLQLKALDVVLFGPLTRPPHNWMKDFILTVSIVIGVGGCWFAYTQNKTSKEHVAKMMKDLESLQTAEQSLMDLQERLEKAQEENRNVAVEKQNLERKMMDEINYAKEEACRLRELREGAECELSRRQYAEQELEQVRMALKKAEKEFELRSSWSVPDALQKWLQLTHEVEVQYYNIKRQNAEMQLAIAKDEVAASYVIQAEKIKKKRSTVFGTLHVAHSSSLDEVDHKILEAKKALSELTTCLRERLFRWQQIEKICGFQIAHNSGLPSLTSSLYSDHSWVVMPRVSIPPYPIAGGVDDLDEDTPPIVSQFSGTMAKSAGSLARSSSLCRSRRSIVPSSPQSQRAQLPPHAPPHPRHPHHPQHTQHSLPSPDPDILSVSSCPALYRNEEEEEAIYFSAEKQWEVPDTASECDSLNSSIGRKQSPPSSLEIYQTLSPRKTSRDELSLEGSSRGDSPITVELSRGSPDCVGLTETKSMIFSPASKVYNGILEKSCSMNQLSSGIPVPKPRHTSCSSAGNDSKPVQETPSVARISSIPHDLCHSGEKSKKPSKIKSLFKKKSK	48680	20956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_22395_27743_28012_38227_38467_38706_38808_39228_39253_39524_39693_44611_44790_45255_45434_48562
916743	contig_8673_pilon	+	3435	4	Intergenic	novelGene_129916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	150	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1684	2214	483225	483755	TRUE	40	AGTTCCACAAGAATAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGVQNKTPDDTPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENMDKKLEECRKIMQEQNVKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLSEENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEPGGENRKHREDH	253508	485066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_+_253792_291595_291780_482008_484190_484279
916744	contig_6418_pilon	+	1950	1	Intergenic	novelGene_81265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTCATAAAACATGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1559177	1561127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1559200_1561100
916745	contig_14525_pilon	-	1271	1	Intergenic	novelGene_149795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307920	306649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_306600_307900
916746	contig_16883_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_161719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTGGCCGGGGACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155520	157450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_155500_157400
916747	contig_8377_pilon	+	4400	1	Intergenic	novelGene_35147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGATCTCAGCAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191683	196083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_191700_196100
916748	contig_7078_pilon	+	1518	2	Intergenic	novelGene_130191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	705	1028	960948	961271	FALSE	30	TGAGGCATATTGAGGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPSQPPVLIFIAGSNSVCWNTQGLCSGFSFLVSLNIILFNPLPSNTMTLKYLVMAYLWISRLENSGIYLTFPYGCLNSFQMKNGKNRNTYFLLESVHSSQSSSSH	873090	961761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_873660_960812
916749	contig_13547_pilon	-	1760	14	Intergenic	novelGene_104876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	386.195737844159	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	36	986	223705	98915	TRUE	55	AAGAGAAAAATTATTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEESILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVDINSYLSLPADLTKMHLTDSPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGEEKSVIQMEKLKISLWEIVLELLPLWISSTCMELSGLK	223740	84812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_84962_88970_89175_91157_91266_93759_93918_98156_98301_98903_99026_101109_101247_103067_103246_114702_114835_163206_163351_176603_176674_196798_196883_221449_221507_223667
916750	contig_6326_pilon	-	2432	2	Intergenic	novelGene_168540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTCCATTCCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655868	646017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_-_647001_654419
916751	contig_12008_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_24990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCAGTTCAAGTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7003	8882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_7000_8900
916752	contig_9609_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_22922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	101	463	18723	18361	NA	30	AATTTGTCATTCCCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQSALNPLCFPSHPQTEAACLVLRGTLLTSITLCPAVQSGPCLKSWPQKLFQFWGNRESRGHAFWGTSSLRPLSLVLLLEFEFCTPPFSCSIQESLLCFLSGLLLMVAGHRLVLLVSG	18823	16596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_16600_18800
916753	contig_13607_pilon	-	3220	1	Intergenic	novelGene_170203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGCCTGCACTGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318611	315391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_315400_318600
916754	contig_4232_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_63367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAGAAGATAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
916755	contig_11160_pilon	+	1798	3	Intergenic	novelGene_168819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	760.5	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	294	1145	318478	320483	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTLLSAFYDIDFLCKTEKSLANLNLNSMLDKKAVGTPVAAAPSSSFTPGFLRRHSASNLHALAHPAPSPSSCSPKFQGATNGGSCGGGAVASGPASYGTLKEPSGGGGTALLNKENKFRDRSFSENGERSQHLLHLQQQQQQKGSGGGSQINSTRYKTELCRPFEESGTCKYGEKCQFAHGFHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNADERRPAPSVFDAPPSPPDSLSDRDSYLSGSLSSGSLSGSESPSLDPGRRLPIFSRLSISDD	318184	321136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318529_319035_319673_320319
916756	contig_8242_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_80205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTAAGGTATGGGACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215694	216818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_215700_216800
916757	contig_8322_pilon	-	4215	2	Intergenic	novelGene_143223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	54	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCTCATCTTCTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185052	139079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_140016_181773
916758	contig_7333_pilon	-	2927	5	Intergenic	novelGene_142814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	50.6081762168921	9	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	640	2499	406076	394458	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407212	394029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_405092_405298_405761_406195_406691
916759	contig_7357_pilon	-	2303	3	Intergenic	novelGene_36872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	348	junction_2	176	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1	399	249394	240096	FALSE	60	TTAAAAAAAAAATACTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTNGLTKPASLAAAAAVTTKPGGGSGSKKLVIKNFRDRPKLPDNYTQDTWHKLHEAVKAIQSSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKVSPTLYKQLRQVCEDHVQAQILQFREYPFLAHEVSIHYLNLLKLNIDR	249394	238191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_240270_247801_247918_249285
916760	contig_7396_pilon	+	3057	2	Intergenic	novelGene_79658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGAAAAAAAAAAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277563	281559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_277701_278639
916761	contig_9706_pilon	+	8094	1	Intergenic	novelGene_21031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	234	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATGAAGTTTACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599008	607102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_599000_607100
916762	contig_4759_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_106349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAAGGATTCAAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982683	980459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_980500_982700
916763	contig_16098_pilon	-	1435	10	Intergenic	novelGene_45979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1461.46629396475	47	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	125	1282	352350	348441	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	354113	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348534_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
916764	contig_17144_pilon	-	2756	16	Intergenic	novelGene_29254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	1992.12920152172	16	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	335	2461	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183176	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176205_181799_181850_183158
916765	contig_3975_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_54725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1357	1812	1594064	1594519	NA	30	TAGTTCCTATTTAAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPILGFPNNHLDFSLFVHEVSGNALGVLTQKHGGLQQFVDYYSLQLDPVATGYPPSLHAVAATAKLVETTADVVLGNFLDVYVSHAMSALLNSVLTQHLLASRLTMYEVLLLAASNIRLHSVASLNPATLFPAVNEDSCPPHDYLDLLNSS	1592707	1594576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1592700_1594600
916766	contig_7080_pilon	-	2019	10	Intergenic	novelGene_100100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1321	1689	538463	529114	TRUE	0	GGCGGCGCGGCCCGGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPFVKMDSSHSLFDCSPDVISTLCVDNFLLGIRHAAGERHPALLTAVAGAAAVEVGIEVPVFRAVGTTALVSLLQGVDEVLQVDVVPVGSDVVLKELPEAVPHPVLEQEGQHRHGQLQEEN	542242	460848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_460862_488492_488593_525759_525810_527212_527362_529095_529267_534487_534612_536985_537028_538413_538544_540657_541374_541718
916767	contig_11678_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_160829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	25	456	108214	107783	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FADVAQLKMRRNSCKHPLIIGTWNVRSMNLRKLEVIKNEMECINISILGISELKRTSIGYSESDNHMVYYAGNDKMKRNGVTFIIKKNISRSILKYSAVSDRIISIHLQGRQANTAIFKFTDQPLMPKMRKSKIFTNFYSLKLIKHAIRMH	108238	106150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_106200_108200
916768	contig_14225_pilon	+	581	1	Intergenic	novelGene_52747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCATTTACACTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270313	270894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_270300_270900
916769	contig_5023_pilon	+	2552	12	Intergenic	novelGene_7194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2346.58211796724	16	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	118	1452	607279	647201	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLSPSPLCLPVTLLSTLPESHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580811	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629255_647084
916770	contig_15974_pilon	+	4312	2	Intergenic	novelGene_164809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	967	1320	139290	139643	FALSE	45	AAAAGTTGTCAAAGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWGTGPRKACFPNHHRPCLYKETGPQDSALKSTRQTSPGVCLECPAPPPPRHRWLQAYCKLLQKACAVESALIINTLPCLPMHPITQASETNRTDLLDSQLRSVCSLFWLALRTAD	125496	142635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_126064_138890
916771	contig_3975_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_54686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGCACTCAACCACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056801	1054758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1054800_1056800
916772	contig_4392_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_117334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAGGGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556432	558883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_556400_558900
916773	contig_6097_pilon	-	1048	1	Intergenic	novelGene_174444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGTCTAGAACTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170130	169082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6097_pilon_-_169100_170100
916774	contig_4732_pilon	-	3022	1	Intergenic	novelGene_75379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	319	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	902	1240	216590	216252	NA	55	TAACAACAACAACAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSIPGMYPPDASSIPSPSHHSQEYLQIWPSVPLGAESPAGFTTTLALALPLPHSQSCQIQILLETSSSLVFHEPHAPGFLPTLRQDVLCLSCQLLLLFPDFTQAFLWVLP	217491	214469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_214500_217500
916775	contig_15063_pilon	+	2928	3	Intergenic	novelGene_13009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	2955	33	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1820	2815	35557	36661	FALSE	65	AAATTAGAAATAAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHTQIYTHATQTYTPHVHAYTHTHIHRHDHRLPEPAKGSPSFSVGREFLPAGVPRVPLPQDSCSKVHHCALGKPHLPKLSLLLDIDLNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29446	36774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_36158_36266
916776	contig_19816_pilon	-	1820	6	Intergenic	novelGene_156469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	298.600468854287	23	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	138	542	124800	124293	TRUE	75	CAATTTAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	124937	116817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_122287_123631_123680_124001_124035_124227_124556_124658
916777	contig_6630_pilon	-	3212	3	Intergenic	novelGene_30711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1320	junction_2	18	27	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2661	2978	374404	372498	FALSE	45	GAGACGTTGCTGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSKEEEVVTKGPVSLRTFEVTATQTKDLEFGGVPGVCLLMLGLPVFLFLLLLMCKQQDPSLLSFPPSLPSLYELWETRVFGAYLLWFFLQALFYLLPVGKVSFC	377418	372263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_372710_374298_374492_374845
916778	contig_7775_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_37449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9648	13346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_9600_13300
916779	contig_5954_pilon	-	1857	10	Intergenic	novelGene_28551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	22	69	1126	1194	557368	557300	TRUE	35	CTACAGAATCAAAGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAVPQCWGAAPACGGRGHGGGGLHDGGGHVGQQGGGRGLRTEQHGRPLPHQAQVALGPHIGVALGGQCQHLEPIVVEAGHLALEGAALISAPNLDGSLAVEDGQLAAFVEQPLIYYSTKPVGDSLSSNRQAFVIKVSCWVSLVDRPAVHLQRGVAAASGEAHHVVFAIAHDGVGLVDGNVIRAHVKDHPHGALVNVQLQIVSQARGAVHPHQHSAPLVRAEAHGQAVHPRAGPVIGGPRVGDERTPLPKDVCGPGVIADRATVGSHGAVTGEAVPLLQADALVGTGLFGAGGAGAVTAPLHLPDAVQGVGDEVWEAPVEVHRGQAALKAVPGGHQLGQVAEHVLAQTANVQLSFEIEVSGAIGVLRDSAGVDLERMYVARVPGHHHVVPLVVIDWFV	586835	554973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_555074_555688_555814_556233_556616_557243_557434_559237_559413_559725_559847_573000_573183_578667_578838_582927_583018_586513
916780	contig_16883_pilon	+	3870	3	Intergenic	novelGene_161761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1465	1899	561808	656217	TRUE	70	AAAATTACAAGAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLARRGLKITKSLLNVKTQDLRSRGSLLKNKKLSAVTLVVQFNKDIKFKSIFAFNLINILTPKATQMQHRYYFLQKIIAQKKKKIIARRQGQDDGVVRRFQWTLLQQRPEKTSDLIIYGNLGASKAELRNQTEWQGEGEMVQKQ	560343	658360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_562074_656048_657676_657847
916781	contig_14047_pilon	+	3034	1	Intergenic	novelGene_176584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAATTTACATTCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47240	50274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_47200_50300
916782	contig_9571_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_136265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTATATTGAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377905	379295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_377900_379300
916783	contig_1339_pilon	-	803	5	Intergenic	novelGene_163126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	29.6310647800581	11	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCACCATCTGCACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353027	349534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_349686_351686_351783_352077_352146_352234_352295_352599
916784	contig_17993_pilon	+	2423	11	Intergenic	novelGene_61927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_10	95.7697760256335	16	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	138	1277	67188	81284	TRUE	90	TAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRKKSVKTCLINSEIPEETIPDETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVVDLCAGRWWEYMPSGFTDSSFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSHLELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTKPQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLHTIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQKCHPWFHLLNLICHT	55360	86269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_55437_67126_67316_68444_68579_72502_72667_72886_73053_76162_76301_77881_78020_79631_79726_80786_80918_81237_81395_85233
916785	contig_18794_pilon	-	5799	14	Intergenic	novelGene_54628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_2	38.9953722030504	287	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1899	406	2304	111149	71139	FALSE	45	GTTACAGTTTAAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYTTIKQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHANVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHGFFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSRPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSPIDIWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQCVPNNLKTLVPNAGSEAIQLMRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQIGHPLGSTTQNLQNSGKPQKDVLEKAGPPPHIKPVPPAQPPVKPHTRISSRQHQASQPPPHLVYPYKAEASRADHLSHLQEDKPSPLLFPSLHHKNPQSKILAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLVSRSTKDSDDWADLDDLDFSPALTRIDLKNKKRQSDETLCRFESVLDLKPSEHVGTGNSAPAQTSSQRRDTPTLRSAAKQHYLKHSRYLPGINIRNGILPNPGKDFIPSNPWSSSGLSGKSSGTVSVISKINSVGSSSTSSSGLTGNYIPSFLKKEIGSAVQRVHLAPISDPSPGYSSLKTVRPHPGRPFFHTQPRSTPGLMPRPPAAQPVHGRTDWASKYASRR	141610	67643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_71294_80352_80476_82706_82836_85119_85269_85386_85578_87447_87769_88475_88644_91978_92151_92842_92976_106599_106680_107859_107982_110325_110381_111048_111322_141377
916786	contig_17522_pilon	+	3190	4	Intergenic	novelGene_160810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	2188	2733	247675	248220	FALSE	35	GAGCTAAGATGGATATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFFPCSGTLITHRLLLLIAFHVILRVSSFFFVLFSDFSSNRVVSRCLSSISLILSSTVSNLLLSPSMTLSVSEILLFIFWISNCYFCMISSCEFILVFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWIVLNIRDLNSLSGSSNAFSSTA	81932	248677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_83310_156572_156660_246667_247046_247329
916787	contig_19378_pilon	-	1173	4	Intergenic	novelGene_73787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	62.6329696636595	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAATATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18283	16147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16747_16791_17040_17682_17788_18062
916788	contig_5260_pilon	-	2779	1	Intergenic	novelGene_144374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	509	901	298688	298296	NA	40	TAACCCAGATAGGGAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSSEELPDLTRRDPTPCRPDWLRYTVRQAVAFGTCCSRSGETEQHSLLRPPEPVKSSTGSAKDKCMRLACHMDQKTPHLGRTSLPFTCRLPALHWVPGQLQRLSHPLGRKYDRSCALCHFPSLGEETN	299196	296417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_296400_299200
916789	contig_854_pilon	+	4341	26	Intergenic	novelGene_36537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2832.6030855028	7	99	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	760	2283	1029	3311	1679334	1715375	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKPLSCQKAQDGESRRAGPWGWARVFSMNLVFFRLTEF	1612872	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677613_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701200_1715265
916790	contig_11825_pilon	-	3775	2	Intergenic	novelGene_155417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAAGACTCAGCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110360	106237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_107502_107849
916791	contig_15172_pilon	+	2671	8	Intergenic	novelGene_158748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_7	144.244548583017	40	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	58	681	243174	267627	FALSE	60	CCTTCAACAACAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243116	269617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534
916792	contig_3956_pilon	+	1218	5	Intergenic	novelGene_14882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1455.28940420797	46	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	84	650	1281682	1290447	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEEPAPARWWPRPASAKA	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284175_1290400
916793	contig_1225_pilon	+	3527	2	Intergenic	novelGene_44121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2738	3043	234351	234656	FALSE	40	TCCGAAAGTGAGAACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGCTCVSSQSKGVASKPHGTAWLEGAPKPRKKKRKQTNKSEQTNKQKSPRGPTSVAARARKQFHSQTVFHSLSGRSKDGTQSQVFEKKEGEAVRGKEEI	227480	235140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_228316_232448
916794	contig_10183_pilon	+	3639	3	Intergenic	novelGene_169501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	12.5	122	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTAAATTCCCAGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33743	72474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10183_pilon_+_33779_57081_59213_71001
916796	contig_7963_pilon	-	2263	9	Intergenic	novelGene_58483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	647.112516781278	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	707	2056	125592	120628	TRUE	75	AGAGAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPNNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126298	120297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123072_123773_124051_125563
916797	scaffold_13609_pilon	+	1937	7	Intergenic	novelGene_124416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	358	junction_1	83.5144698041403	43	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	44	1252	653970	662710	FALSE	30	AGTGTTTAACCGTTACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGQELEKTLEESKEMDIKRKENKASDTPLALESTNTEKETSLEETKVGEILIQGLTEDMVTVLIRACVSMLGVPVDPDTLHATLRLCLRLTRDHKYAMMFAELKSTRMILNLTQSSGFNGFTPLVTLLLRHIIEDPCTLRHTMEKVVRSAATSGAGSTTSGVVSGSLGSREINYILRVLGPAACRNPDIFTEVANCCIRIALPAPRGSGTASDDEFENLRIKGPNAVQLVKTTPLKPSPLPVIPDTIKEVIYDMLNALAAYHAPEEADKSDPKPGVMTQEVGQLLQDMGDDVYQQYRSLTRQGSDFDTQSGFSINSQVFAADGASAETSTSGTSQGEASTPEESRDGKKDKEGDRASEEGKQKGKGSKPLMPTSTILRLLAELVRSYVGIATLIANYSYTVGQSELIKEVIFSASA	653926	663395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_654004_654514_654874_657577_657774_659374_659543_660457_660604_661021_661089_662471
916798	contig_10323_pilon	-	1245	6	Intergenic	novelGene_123616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1007	junction_5	1492.14980481184	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	372	1244	473591	460646	FALSE	50	AGGAAGAATCTGCAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNE	474567	460644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_473477_473604_474208
916799	contig_6412_pilon	-	1854	4	Intergenic	novelGene_149962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	38.7843038125248	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	945	1469	252500	242178	FALSE	55	AAGAAAAAATTCAAGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGITENTEKIVEDLLTENFPDIMKDKKISIQDAHRTPHKNHTMPNYKLTYFNMRGRAEIIRYIFAYLDIKYEDYRIEPADWPDIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGKTELEQCQVDAIVDTLDDFMSHFPWAEEKQDVKVM	253444	241792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_242297_245458_245552_251634_251777_252329
916801	contig_9267_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_162005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGTATTGGCCATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201605	199650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_199600_201600
916802	contig_8544_pilon	+	1585	5	Intergenic	novelGene_55907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	35	junction_2	392.969066848779	28	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	343	819	19363	90726	FALSE	50	ACTGCTTAGTAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHMSQLKSTTAWVRHTLVFKDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQLVSIGNKSNDLLSLILYEISGISFSTYKFFNISI	18367	91492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_83417_83520_83788_83836_90458
916803	contig_7426_pilon	-	1310	2	Intergenic	novelGene_27483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	47	144	167	310	938433	938290	TRUE	15	ATGTTGTGGGGTTGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKNLYTHYYVTLVSLPILRQHTPPFHPGFPVSVQPAPDPLCLLILPLDRSCLFSLMYLLELRSTLLTIITVCPIVQSNLCLKSCPREWFQLWANRESGDHVF	938599	747712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_-_748438_938014
916804	contig_10482_pilon	+	4835	1	Intergenic	novelGene_152815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82452	87287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_82500_87300
916805	contig_17427_pilon	-	2668	12	Intergenic	novelGene_30371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_4	1053.2143715297	265	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	56	1354	188879	179167	TRUE	60	TTATACAGAAAATAGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVGESFSLSQAVLVLEPERARTISPTLFLKILKGYTVDLFPFFSQITVRNSVWCSMTWWALWR	204698	176985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
916806	contig_678_pilon	+	3398	1	Intergenic	novelGene_167780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	244	660	17233	17649	NA	40	AAAAAAGCCATGTGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVTLQIHHLKSLFRVQRKHITPPTPQEINFTRCQEALLRLYQSPLLRWRETREEPMTFIVTSLSHLHNRLTRLRKLSLLATPLSERIQFSSPSGFRGGPGIFNKTSFASWDLLTITSLSLTAVCIRLTLDWSLGGK	16989	20387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_17000_20400
916807	contig_6001_pilon	+	3849	9	Intergenic	novelGene_128048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAACAAAGAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723393	758876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6001_pilon_+_725546_725641_725807_728557_728667_729840_729903_730968_731051_755883_756836_757623_757700_757971_758122_758775
916808	contig_15182_pilon	-	3512	3	Intergenic	novelGene_136431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGAGAAAAATCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87789	84075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_85309_85434_87131_87206
916809	contig_1544_pilon	-	2153	4	Intergenic	novelGene_167934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.74165738677394	120	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	54	302	58109	56779	TRUE	30	AGTAATAAGGCTTTTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKYPDVVQLPEGAASSCMGIQSASQPGFELVIVWRIQIDDEGKVLPKLDLLTKIPQQALELDKKKVIESAPLSFRTLLGVLGIEAALESLIKLFFNTKE	58162	53896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_55251_56281_56907_57579_57672_58080
916810	contig_7151_pilon	+	2111	4	Intergenic	novelGene_40780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1499	1897	529141	551143	FALSE	15	CTGAGGTTTCCTTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFMPEYHVWVKWRPVQPLPLPFTVLICKSQEIGKLGIQKLNNKVLKQLAIKQALRSKMKTTAMVEGISLGCW	527642	551357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529337_530062_530181_549639_549723_551141
916811	contig_9406_pilon	-	1535	10	Intergenic	novelGene_136157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	457.908530409974	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	123	1370	49554	34784	FALSE	30	TGAACACTTATCTCCAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQKRENEVLEAWKALLDACEGRRVRLVDTGDKDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKSALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGVLNRKHEWETHNKKASSRSWHNVYCVINNQEMGFYKDAKTAASGIPYHSEVPVTLKEAVCEVAVDYKKKKHVFKLRLNDGNEYLFQAKDDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	51322	34618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_35003_35741_35785_37596_37771_38922_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51225
916812	contig_15047_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_52101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTGCAGAATTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1804	82	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_100_1800
916813	contig_9375_pilon	+	1186	1	Intergenic	novelGene_136052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGATAGAAATGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188443	189629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_188400_189600
916814	contig_10404_pilon	-	2246	2	Intergenic	novelGene_138731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1596	249	1844	1571917	1570322	FALSE	25	AAGTAGTGATGTTTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNNFKYRCQNLFSHEGGSRSENVGMNSSRCLSVKERNTSIGDPAPQQQSSPLRENVALHLGLSSSKNSSRRSQNCAAEIPQIVEISIEKENDPCVTTPGTRLARRDSYSRHAPWGGKKKHSCSTKTQSSLDTEKKFGRTRSGLQRRERRYGVSSVHDMDSVSSRTVGSRSLRQRLQDTVGLCFPMRTYSKQSKPLFSNKRKIHLSELMLEKCPFPAGSDLAQKWHLIKQHTAPVSPHSTFFDTFDPSLVSTEDEEDRLRERRRLSIEEGVDPPPNAQIHTFEATAQVNPLYKLGPKLAPGMTEISGDSSAVPQASCDSEEDTTTLCLQSRRQKQRQVSGDSHAHVSRQGAWKVHTQIDYIHCLVPDLLQITGNPCYWGVMDRYEAEALLEGKPEGTFLLRDSAQEDYLFSVSFRRYNRSLHARIEQWNHNFSFDAHDPCVFHSSTVTGLLEHYKDPSSCMFFEPLLTISLNRTFPFSLQYICRAVICRCTTYDGIDGLPLPSMLQDFLKEYHYKQKVRVRWLEREPVKAK	1627304	1569919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1571948_1627086
916815	contig_11594_pilon	+	2787	4	Intergenic	novelGene_80940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_3	260.051704260689	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATCTGAGAGCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561987	568810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_563104_563560_563658_566673_566778_567340
916817	contig_6589_pilon	-	2778	19	Intergenic	novelGene_26234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6.34428877022476	120	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	396	626	2167680	2166650	TRUE	25	GGGGGAAGAGAGCATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGSLLPQTARDYPVYLPHGSPTVPHRLLTLTLLPGLELCLLCGPRPLLSQLDPQLLERWWQPLLEPLRTCVPLGPRALPTGFPLHADILGLLLLHLELRRCLFTVELSEDKEPSLDQRRRLLRSFYTLVTSMHFPPEPGPPEKAEDVAQLPRACYVVSGPEEPDTGWRLVALQSGPRRLLLLLSPQSPTHGLRSLATHTLHTLSRLL	2168781	2159488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2159629_2160165_2160357_2160811_2160903_2161689_2161923_2162021_2162191_2162276_2162439_2163266_2163327_2163431_2163514_2163604_2163696_2164869_2164993_2165080_2165197_2165307_2165382_2165595_2165728_2166161_2166865_2167664_2167740_2167815_2167881_2167959_2168067_2168438_2168535_2168713
916818	contig_15952_pilon	-	814	1	Intergenic	novelGene_154059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGAGCCCTGGTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248803	247989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_248000_248800
916819	contig_6847_pilon	+	3684	14	Intergenic	novelGene_143862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	208	junction_1	479.409325915911	1359	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	332	1783	77788	110600	TRUE	65	GGAAAAAACAAACTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74255	113502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74316_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
916820	contig_9720_pilon	+	4135	7	Intergenic	novelGene_116798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	457	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACAAGAAATAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422255	444744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_425413_428096_428328_428860_428968_431984_432119_440772_440874_443303_443528_444563
916821	contig_5062_pilon	-	2985	1	Intergenic	novelGene_157870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	2090	2575	1035728	1035243	NA	70	AGGGAGAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLEPPARVRRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDLEAVARPNIAPQPRRKRPRRLSESGTRAKGGGRQRGASENPKEAEKKKRGEKKKATPAAYKRHPKSHPPGRAESKQLAALGPEPAAPGSRGANEQRPQILARAVAQTWKQPHTRT	1037817	1034832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_1034800_1037800
916822	contig_5574_pilon	-	7704	4	Intergenic	novelGene_155817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	664	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	600	1064	100360	99896	TRUE	15	TCTGGAAGTCCAGTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRSPLAFCFPQSWKLPRSPESQCLTQAHLLGTATSALCHTLLLSKGTFPDCLPDITPAPSPMPTHSHYLGLLSLSLIAPTTMSVLISSCLLLCPQLKTKPTAIELIPTHSDPIGHSRTVPWGFQGCNLYGSRLPHLSPLELLVGLNHQPFG	100959	9274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_9597_9690_9895_10065_12225_95940
916823	contig_13612_pilon	+	2323	7	Intergenic	novelGene_157292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	63.0361448341787	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	413	1279	51083	53792	FALSE	85	TTACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLGQHFQNVSLNQLHPGCLGSWFPGPHPLL	49649	54836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49913_50043_50127_51016_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441
916824	contig_1813_pilon	+	4298	6	Intergenic	novelGene_105502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGCCGCCGGGTAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339006	392322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_342414_343025_343150_362123_362289_364861_365014_387653_388004_392222
916825	contig_20452_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_167302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46096	48079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_+_46100_48100
916826	contig_5019_pilon	-	3585	2	Intergenic	novelGene_109228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	49	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGCATCACCAGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408919	357867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_361440_408906
916827	contig_4689_pilon	-	2838	2	Intergenic	novelGene_165399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	81	junction_1	0	153	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCCTCTGTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091962	1084175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1086743_1091691
916828	contig_14618_pilon	-	754	2	Intergenic	novelGene_136817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGAAGGCAGAAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680213	674604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_674989_679843
916829	contig_2733_pilon	+	782	1	Intergenic	novelGene_128584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813830	814612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_813800_814600
916830	contig_2069_pilon	+	2441	13	Intergenic	novelGene_23241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	314.560495859788	11	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	200	1600	333898	343975	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTITKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323987	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341107_341354_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
916831	contig_9708_pilon	-	3721	2	Intergenic	novelGene_67254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	105	308	40041	39838	TRUE	35	AGTCCTCCAGTTAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLPVWFLVAGWLPGCWCWDSLVSEVQCTFNLRLMRINLISSVRPQACLNFKSKGDPESLADTCFESRSVTAIEHNGEDNRPLIQTVQLRITANYELKQVT	40145	35693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_36377_37107
916832	contig_2476_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_157644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAGAGGAGGGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482166	484038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_482200_484000
916833	contig_9132_pilon	+	2121	2	Intergenic	novelGene_121379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1190	1498	116479	116787	FALSE	40	CCTGAGACCAGAAGAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFISFSCLTALARTSSTMLNKSDESRHPCLLLSRRGKALSLSPLSIMLAVKFFIDALYQVRSPDGTVVKSLAANQKVSSSNSPVTPWKPYGAVLLCPIGLL	115062	117410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_+_115840_116066
916834	contig_7627_pilon	+	996	2	Intergenic	novelGene_175564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	21	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCACCTGCTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164681	165825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_164895_165042
916835	contig_13158_pilon	-	1000	1	Intergenic	novelGene_107287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTAAGCCTCTTCTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103458	102458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_102500_103500
916836	contig_7753_pilon	-	2458	11	Intergenic	novelGene_41461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	141.605649604809	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	533	1174	562350	528009	TRUE	30	ATAATTTGGGTTGAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRIHFVVDPHGWCCMGLIVFVWLYNVVIIPKIVLFPHYEEGHIPGILIIIFYGISIFCLVALLRASITDPGRLPENPKIPHGEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRNLDLFVIRHELAIMRLAAFMGIIMLVGITGLFYTQLIGIITVRYNIY	572885	526179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_527437_527981_528026_535559_535681_550197_550337_553390_553503_560672_560772_562196_562398_564138_564197_564972_565139_567959_568101_572765
916837	contig_5686_pilon	-	2547	4	Intergenic	novelGene_45447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACAACCTAATGAGGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231121	218983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_219668_222752_222914_224040_225102_230480
916838	contig_20614_pilon	-	2180	2	Intergenic	novelGene_107570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	972	1706	237859	237125	TRUE	40	TCAACCTAGGAAATGAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIERLRSRFETMEDRISEIEDKHLATTLSEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPEQREKTENTERIIEELLTENFPDIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRADREKQKVTYRGETVRLSLDYLAKTLQARRQLDDIYKTLKEKNCQPRMIYPAKLSFKYDGEIRSFPEIRGLCKNQTKLTRIVKGSPLIREQTTSDHRLSIGHRIVLARYQLS	238830	234213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_234263_236699
916839	contig_12622_pilon	+	1313	1	Intergenic	novelGene_5789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACTAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177739	179052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_177700_179100
916840	contig_1452_pilon	+	2545	2	Intergenic	novelGene_115135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATACAAAAAAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697563	700690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_699952_700533
916841	contig_20610_pilon	-	2853	4	Intergenic	novelGene_67652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1933	2337	79093	78689	FALSE	70	AGGAACAATCAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPVTPTSPSHHPADPESSSKHPVLLVARYTPAPTHPASIREHSHYLVAHLTPAHYFVHSKWQRVLPHPRSHATHAHLLPCPPSKCQHALLHCWTDDKQWTAPAQPTLNYPAHLMNNNIHSPCPLLPRPPGNRG	111587	78172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_79696_97580_98059_110563_111256_111427
916842	contig_9919_pilon	-	3076	15	Intergenic	novelGene_137957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_14	175.605730114309	83	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	166	1872	591968	546439	FALSE	55	TTCTGAGAGAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGAPEVIASLCKPDTVPADFEKVLEKYTKEGFRVIALAHRKLESKLTWHKVQNVNRDTIENNMDFLGLIVMQNKLKQETPAVLAALHNADIRTVMVTGDNMLTALSVARDCGMILPQDKVIIAEALPPKDGKVAKINWHYADTVSQCSSSSAIDSEAIPVKLAHDSLEDLRVTRYHFAMNGKSFSVIQEHFQDLVPKLMLHGTVFARMAPDQKTQLVEALQNVDYYVGMCGDGANDCGALKRAHGGISLSELEASVASPFTSKTPSISCVPNLIREGRAALITSFCVFKFMALYSIIQYFSVTLLYSILSNLGDFQFLFIDLAIILVVVFTMSLNPAWKELVAQKPPSGLISGTLLCSVLSQIIICIGFQSLGFFWVRQQPWYEQWHPQSDACNTTGGLYWNSSHSDNVTEHDEHNIQNYENTTVFFISSFQYLIVAIAFSKGKPFRQPCYKNCLFVLSVIVLNVFVLCIMLYPIAPVDQALQIVCVPNQWRIIMLTIVAANALVSFLVEGSIDRWGGCCLSWVLGCRKKMPEAKYMYLAQELLVDPEWPPKPQTTTEAKTLCKENG	592133	545234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_546613_555959_556041_568214_568304_578847_579036_580713_580892_582979_583053_583935_584033_584332_584443_584535_584579_585204_585285_585362_585486_585998_586175_587892_588018_591702_591824_591919
916843	contig_7356_pilon	-	872	4	Intergenic	novelGene_60377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	742.9970838884	41	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTATTTACAATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457913	423445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_424012_435516_435623_437474_437529_457767
916844	contig_5286_pilon	-	4493	1	Intergenic	novelGene_157359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAGTAAGTTTTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550308	545815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_545800_550300
916845	contig_13958_pilon	+	4157	10	Intergenic	novelGene_129530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	325.050803246751	303	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	65	469	114673	124392	TRUE	15	TCTATATCCTTATTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WKPTFALGCGEQRPRSLCESAMADTAPNGPQGAGAVQFMMTNKLDTAMWLSRLFTVYCSALFVLPLLGLHEAASFYQRALLANALTSALRLHQRLPHFQLSRAFLAQALLEDSCHYLLYSLIFVNSYQSCYSLCSMLPHILKNSLMQRVQIVCLC	114434	146939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_114472_114645_114718_117494_117590_118080_118258_121711_121769_124361_124496_126638_126723_134555_137201_140713_140870_146239
916847	contig_1107_pilon	+	1713	1	Intergenic	novelGene_126530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43151	44864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_43200_44900
916848	contig_9161_pilon	+	2266	6	Intergenic	novelGene_160629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	464.760411394947	29	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1012	1701	52934	63414	FALSE	20	GTAGGCATTCTTGCCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQTPKNKATVFKLCSICLYLPQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	50758	63979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_51745_52908_53063_54664_54842_56680_56804_60940_61076_63288
916849	contig_16917_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_161938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTCCCTTTCCATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166108	168546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_+_166100_168500
916850	contig_12884_pilon	+	2031	2	Intergenic	novelGene_104982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	73	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGCTATGAGTCAGAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868494	873095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_868536_871105
916851	contig_6418_pilon	-	2593	4	Intergenic	novelGene_81180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTCATGTTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323899	1151830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1152301_1194641_1194676_1260795_1260985_1321999
916852	contig_10042_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_79183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813801	815833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_813800_815800
916853	contig_5063_pilon	+	4033	1	Intergenic	novelGene_110003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCCTTGCTCCCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41534	45567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_41500_45600
916854	contig_16205_pilon	-	2884	3	Intergenic	novelGene_156892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAATAAAAAAATTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120386	116901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_119271_119443_119701_120128
916856	contig_20951_pilon	-	885	2	Intergenic	novelGene_43050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	12	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27651	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
916857	contig_2036_pilon	-	860	6	Intergenic	novelGene_131829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_5	362.032374242967	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	403	738	636612	614437	FALSE	25	AATTTCAGTTAGTCTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINT	647926	614314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_614441_617077_617232_631747_631872_636558_636731_641848_642039_647832
916859	contig_14536_pilon	-	2425	13	Intergenic	novelGene_69281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_3	167.336902352377	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	108	1070	137680	58055	TRUE	30	TCCTTTTAAAATCTAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLGEDSPRAPVSSPPESWGACRPRSSWHSRRQQNMAPWTFWRCCQRSVGWVPVIFITFVVVWSYYAYVVELCVFTITGNGENGKAVVYLVAFHMFFVMFVWSYWMTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARRSKLQR	137787	53764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_57556_57673_58028_58074_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_87938_88043_95419_95447_137562
916860	contig_2770_pilon	-	2838	4	Intergenic	novelGene_107486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3383	junction_3	299.508857223882	20	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTTCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750778	743755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_744171_744572_746745_747765_747797_750558
916861	contig_9982_pilon	-	7038	30	Intergenic	novelGene_55715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_6	86.7065519977246	307	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1765	5298	62	5359	283987	224066	FALSE	35	AAGGGAAGAATGGTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPHQPGDCGGGGAAATEVVTMGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSKKDVTTKLKAMQEFGTMCAERDTEVVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKHLAPYLKSLMGYWLMAQCDTYTPAACAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEIASVLHDHLLKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFYRVITCSLLALKKLLCLLPDNELDSLEEKFKFLLSHNKFWKYGKHSIPQIRSAYFELVSALCQRIPWLMKDEASKVSPSVLLSIDDSDPVVCPALWEAVLYTLTTIEDCWTHVNAKKSVFPKLSAVVREGGRGLATVIYPYLLPFISKLPQSITDPKLDFFKNFLTSLVTGLSTERIKASFSECSAIVAAFFECLRFIMQQNLGEEEMEQMLVNDQLIPFVDAVLKEPRLQNGQLFHHLAETLSSWESKADMERGDKMAHNLEKVLLNFWERLSEVCMEKINEPEADSTSVLGVSSLLEVLQKPKSALKSNKKKVGKVRFADEISESNKKNEKGVSSEGENSEGSELVTEPLTQDLSDLISPLRKKPLEDLVCKLAKMSINYITEQTSEQHLKFLSTLLSTFSSSQVFKVLLGDEKQSIGKGKTLEIAKLAQKNPAVQFLYQKLLGWLNEDQKKDAGFLVDILYSALRCCDSNMERKDVLDDLTEVELKWDSLLQVIEKSCSSSDKHALVSLWLKGDILGEKLVNLADHLCNMGLESTVSSESYFSERWTLLSLVLSQHIENDYLIGEVYVERIIVKLHETLSKTKTLSEAENSRSSVSRVCDVACNYFSSAKGRLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKERTHLPDSLICKLKNTWLSGVNFLVHHVDSTYKQSSFLRLSAVWLKNQVQSSSLDVRSLQVLLSAVDDFLNKLLESKDTDLLGVCIGSVMPNDSEWGQMRQSLPMQWLHRPLLEGRLSLNHECFQTEYKEEDIKTLPSHLCTSALLSKMMLVALKKEVVLENNELVKIIAELLYSLQWCEELDNPPAFLTEFCEMLQRMNITYRHLCALGDTSGLLKLIFSRSKANGTLWSLIIIKLVFSGSITSEDVKHHYRNSEDSFFPLTEGNLHTIQSLCPFLLKEEKKKFIAECIPALLAWPKDDLYYIDGGFGYFAIFNSSLQTKSIDDEELLHGILEVIMSWKKNYEDIFLFSCNLSEASPETLGINIEIIRFLSLFLKYRSSPLEESEWDFIMCSMLAWLETTSESRALYFDPLVQLFACVSCDLACDLSVVFDSATLDTVCDLPQNLISEWKEFFSQGIHSLLLPLLMTVIESKDPSETSFQNALLRPMCETLTYISKDQLLSHKLLGRSVASQKTNFPEHLQTLLDTLAPLLLFRARPVQIAAYHMLYKLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAVLMSLLSTQEDLLENVLGGISVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTFGESVLEFSNKDPKTFFTEELRLSIRETAALPYQIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRIFNIVDRFTSKYVSNVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSITVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF	284048	222386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_224129_225560_225729_227785_227981_229295_229517_230416_230589_234798_234986_242354_242430_243304_243540_243967_244182_245109_245255_247446_247583_250606_250750_252711_252820_254345_254506_256139_256327_256739_256885_257943_258098_259263_259504_260345_260536_263220_263263_263761_264569_265798_265935_267153_267345_267916_268091_273611_273793_274569_274623_279418_279650_280180_280280_280776_280981_283945
916862	contig_3822_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_133328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTTCAGAGAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298225	300441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_298200_300400
916863	contig_610_pilon	-	1363	3	Intergenic	novelGene_76679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	255	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACCGGGAAGGAATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35546	31784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444
916864	contig_18039_pilon	+	1475	1	Intergenic	novelGene_171248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAACAAGGGTGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154621	156096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_+_154600_156100
916865	contig_17753_pilon	+	4808	1	Intergenic	novelGene_105094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGAGGGGGTTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99308	104116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_99300_104100
916866	contig_9668_pilon	-	1853	12	Intergenic	novelGene_58219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_11	912.494609969363	13	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	440	1624	605373	545572	FALSE	30	ATTTGATTTACAATTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKVCCKKSLI	669997	545342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_628280_628420_669866
916867	SIRV6	+	908	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	33	587	-4	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	311	12	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	225	716	1733	10736	TRUE	50	AAACGTAAATTTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1120	11238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
916869	contig_11258_pilon	-	2145	6	Intergenic	novelGene_67816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	135.897608514646	3	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	4	579	360591	328749	TRUE	50	AAGAATAATGATGAATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRTAP	360594	326101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327364_327431_327648_328660_328762_330514_330660_354741_355099_360530
916870	contig_6375_pilon	-	3567	1	Intergenic	novelGene_72918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACGGGCACTCAACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8671	5104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_5100_8700
916871	contig_2940_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_81984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1418	1822	1122358	1122762	NA	40	AAAAAAGCCCTGGCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLQNIFKKKTLTALKREIDSFTITVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNSTTGQLDLTNIYRTLHPTAAKYTFFSSAHGMFSREDPILGHRATHNKIQNAEVIQTFFSDHDAIKVEINRKIKEKNQFHGN	1120940	1123391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1120900_1123400
916873	contig_8284_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_125715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435199	433123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_433100_435200
916874	contig_10943_pilon	+	2464	1	Intergenic	novelGene_168266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTGTTCCATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41411	43875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_+_41400_43900
916875	contig_14925_pilon	+	1576	5	Intergenic	novelGene_55314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTGCCCATGCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112094	133820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_113276_114663_114781_115152_115207_115820_116029_133804
916876	contig_6509_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_145638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAACAACCCCACGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106620	107991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_106600_108000
916877	contig_13004_pilon	+	2635	1	Intergenic	novelGene_112657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCACTCGTGGACGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542107	544742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_542100_544700
916878	contig_4604_pilon	+	2006	12	Intergenic	novelGene_19139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1221.46827375976	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	418	1569	358980	379856	FALSE	20	CTGTTCATTATGCTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFDPNLLHNNGHNGYPNGTSAALRETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	339862	380293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_339894_348292_348679_358979_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364550_377384_377535_378442_378607_379336_379470_379808
916879	contig_5020_pilon	+	2918	1	Intergenic	novelGene_27961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAACAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219977	222895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_220000_222900
916880	contig_6102_pilon	+	1578	10	Intergenic	novelGene_31913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	483.86019815441	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	197	835	379418	394507	FALSE	30	TTATACTCAAACCAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	375289	395250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375312_375445_375533_379330_379487_379617_379711_393384_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
916881	contig_10016_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_117863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTAAAGCACAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352786	351791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_351800_352800
916882	contig_19692_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_174885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAAAGAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59467	57126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19692_pilon_-_57100_59500
916883	contig_6915_pilon	-	4076	3	Intergenic	novelGene_162405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3698	4027	175956	175627	FALSE	40	GACATCCAAGAAGCTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEIDDVIEGLRSRFQTVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVRWDTIKSKNLRVIGIPKRGENRKHREDH	180051	175577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_176620_176930_178647_178733
916884	contig_3068_pilon	-	2080	2	Intergenic	novelGene_137662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTGGCCTCCTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429080	426930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_427021_427090
916885	contig_14970_pilon	-	3893	8	Intergenic	novelGene_45073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAATAAAATTTCATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232242	205424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_207822_210761_210859_212611_212701_213683_213891_216611_216671_221180_221249_224291_224377_231351
916886	contig_12951_pilon	+	2181	10	Intergenic	novelGene_68126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	65.4700006694236	45	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	760	1140	108003	120246	FALSE	75	AAATTATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVSGWRTFLQALGYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCGECCLCVVSRGPAWP	61284	121287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_61367_63778_63958_74877_74959_86814_86874_91427_91512_95327_95430_102050_102195_107974_108114_109617_109724_120082
916887	contig_8386_pilon	-	4331	15	Intergenic	novelGene_82205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	230.51469695055	498	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	217	690	45992	34605	TRUE	10	GCCTTTGGGATCTTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTLYVGNLSRDVTEALILQLFSQIGPCKNCKMIMDTAGNDPYCFVEFYEHRHAAAALAAMNGRKIMGKEVKVNWATTPSSQKKDTSSSTVVSTQRSQVLVHLHMDSHKLNGVMSGQPKLLAFEKTVKYFNIKLLQCKIISMSLLVISVQKLQLKI	46208	16095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19900_20485_20595_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21779_22024_31346_31423_34573_34662_35173_35293_35899_35933_36104_36160_36681_36781_38376_38474_45978
916888	scaffold_19766_pilon	+	2435	15	Intergenic	novelGene_34415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	139.959268856248	610	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	115	2271	843870	851417	FALSE	15	TTCTAATCTGGGCCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKDYTLEKEKAKKFLQEFYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	843755	851581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
916889	contig_8377_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_35037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTCATTAATAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79751	77743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_77700_79800
916890	contig_10765_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_122978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431727	430274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_430300_431700
916891	contig_17_pilon	-	5293	4	Intergenic	novelGene_173976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4634	4948	352991	352677	FALSE	35	GGAGTCAGACAATGTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTWRPQPRDLGHGKQGSPSRG	716647	352331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_-_354492_536238_536555_537969_539584_715444
916892	contig_854_pilon	+	3063	16	Intergenic	novelGene_36592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3838.97445796255	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	147	2306	1700894	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1679526	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679550_1700770_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
916893	contig_1719_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_87261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1768	2160	146927	146535	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEEERNTEEERNNEKEEGEKLSKKFCSGRISWNFFLNQIGLQLLENMDANTDSFAKVDRQIREAVRCYCEIYEEKKRRIIQTSLINFLTRNAVPIPRVNPDDPEPSTSGIITTTDKMPVLFNSSSSLE	148694	146392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_146400_148700
916894	contig_17144_pilon	-	1026	2	Intergenic	novelGene_29350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	288	731	166806	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQLPSLAPSWEEGAACALGAREGRREAGQVLQSPAPGLSEAEPLTTGLGERTGQWLFSGTYPEEERRGETGRPGGCLAGSSSETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_183158
916895	contig_3601_pilon	-	6317	1	Intergenic	novelGene_132944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2166	2477	432953	432642	NA	65	ATAAAAAAAAAGAATGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYSSLSFPQLCRAPLGPLRTDSPRPPEDGPLSAPFQMGSSRPPFGRAPLGPLRTGSSRPPQDRLLSASSGQGSLGPLKTDSSRPLWTDSSWPPLGQAPLGPL	435118	428801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_428800_435100
916896	contig_17158_pilon	-	2414	14	Intergenic	novelGene_141158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCATATCTGTTTAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207464	182096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_182185_183115_183333_183878_184026_185767_185915_187916_188050_188244_188365_190785_190883_196195_196302_197532_197623_197749_197826_198976_199024_200424_200594_204566_205456_207376
916897	contig_3818_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_99275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACACAGTGAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574274	573723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_573700_574300
916899	contig_12619_pilon	+	2893	2	Intergenic	novelGene_73580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	428	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCAAGAGACAGAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897433	900567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_898154_898394
916900	contig_10263_pilon	+	2728	2	Intergenic	novelGene_135809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6798	10687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_6867_8027
916901	contig_3956_pilon	+	2134	11	Intergenic	novelGene_15054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1409.74022074991	1	128	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	81	1610	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGAIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKRCAVPQRDQGQRGGRLSVGHQGGEQAIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283950_1286542_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289107_1289162_1289240_1289586_1289677_1289758_1289892_1290297
916902	contig_1719_pilon	-	800	5	Intergenic	novelGene_87367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	522	junction_3	399.987812314325	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	70	615	803613	754873	FALSE	40	ACAAATAGCTTCAAAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNRAVSRLSRKRPPSDIHDRDGSSSSSHQNLKSTTKWAASLENLLEDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKMQDKKQMQEKAKEIYMTFLSSKASSQVNVEGQSRLTENILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKQAEEEEEDLPDTQTAAKRASRTYNT	803682	754687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_755020_773533_773678_786510_786598_787980_788100_803564
916903	contig_5200_pilon	-	4396	35	Intergenic	novelGene_140149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_1	52.4282422768043	114	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1393	4182	138	4319	180434	111855	FALSE	55	TAAGTCTAAGAAATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSLLGPATPAPTAAAAAALQEALENAGRLIDRQLQEDRMYPDLSELLMVPTPNNPTVSGMSDMDYPLQGPGLLSVPNLPEISSIRRVPLPPELVEQFGHMQCNCMMGVFPPISRAWLTIDSDIFMWNYEDGGDLAYFDGLSETILAVGLVKPKAGIFQPHVRHLLVLATPVDIVILGLSYANLQTGSGVLNDSMSGGMQLLPDPLYSLPTDNTYLLTITSTDSGRIFLAGKDGCLYEVAYQAEAGWFSQRCRKINHSKSALSFLVPSLLQFTFSEDDPIVQIAVDNSRNILYTRSEKGVIQVYDLGQDGQGMSRVASVSQNSIVSAAGNIARTIDRSVFKPIVQIAVIENSESLDCQLLAVTHAGVRFYFSTCPFRQPLARPNTLTLVHVRLPPGFSASSTVEKPSKVHKALYSKGILLMTASENEDNDILWCVNHDTFPFQKPLMETQMTTRVDGHSWALSAIDELKVDKIITPLNKDHIPITDSPVAVQQHMLPPKKFVLLSAQGSLMFHKLRPVDQLRHLLVSNVGGDGEEIERFFKLHQEDQACATCLILACSTAACDREISAWATRAFFRYGGEAQMRFPATLPPPSNVGPILGSPVYSSSPVPSSSPYPNPTFLGTPPQGLQPPAMSTPMYAVGNPATQATSMSCMTGPEIVYSGKHNGICIYFSRIMGNIWDASLVVERVFKSGNREITAIESSVPSQLLESVLLELKGLQEFLDRNSQFAGGPLGNPTTTAKVQQRLMGFMRPENGNTQQMQQELQRKFHEAQLSEKVSLQGIQQLVRKSYQALALWKLLCEHQFAVIVGELQKEFQEQLKITTFKDLVIRDKELTGALIASLINCYIRDNAAVDGISLHLQDICPLLYSTDDAICSKANELLQRSRQVQNKIEKERMLRESLKEYQKISNQVDLSSVCAQYRQVRFYEGVVELSLTAAEKKDPQGLGLHFYKHGEPEEDIVGLQAFQERLNSYKCITDTLQELVNQSKAAPQSPSVPKKPGPPVLSSDPNMLSNEEAGHHFEQMLKLAQRSKDELFSIALYNWLIQADLADKLLQITSPFLEPHLVRMAKIDQNKVHYMDLLWRYYEKNRSFSNAARVLSKLADMHSTEISLQQRLEYIARAILSAKSSTAISSIAADGEFLHELEEKMEVARIQLQIQETLQRQYSHHSSVQDAISQLDSELMDITKLYGEFADPFKLAECKLAIIHCAGYSDPILVQTLWQDIIEKELNDSVAMSSPDRMHALSLKIVLLGKIYAGTPRFFPLDFIVQFLEQQVCTLNWDVGFVIQTMNEIGVPLPRLLEVYDQLFKSRDPFWNRMKKPLHLLDCIHVLLTRYVENPSQVLNCERRRFTNLCLDAVCGYLVELQSMSSSVAVQAITGNFKSLQAKLERLH	180571	111777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_111994_112627_112735_113795_113933_117536_117648_118259_118381_119073_119188_120312_120443_123525_123681_124365_124471_124684_124839_125222_125359_126060_126200_126848_127041_129382_129514_132299_132398_138789_138906_140333_140401_141707_141856_142377_142441_142836_142926_143760_143856_144755_144867_146952_147124_148411_148513_151817_151971_152455_152554_153705_153798_154068_154143_155311_155418_165678_165846_166652_166746_170593_170665_175664_175762_177460_177599_180271
916904	contig_8773_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_74523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCAACTGCACAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38809	41025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_38800_41000
916906	contig_12970_pilon	-	1021	2	Intergenic	novelGene_50509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGTGCACCAGTAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31627	29963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_30577_31219
916907	contig_6445_pilon	-	1564	16	Intergenic	novelGene_76881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	81	junction_15	692.348646917786	4	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	56	1327	89674	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96322	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
916908	contig_3818_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_99233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	219	590	409561	409932	NA	75	TTAAAAAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQGALEAVSFTQLSSEENILTGNLSVRMTVTKAGIARGQAIPIQGRPEKTSAGEEVFSAPFTCLARPHTWLQESLHRCPPPQSDSHERSRGSRLERLAEKTWLQAQLAAHQPYGNKNVKPIG	409342	410937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_409300_410900
916909	contig_15172_pilon	+	1862	7	Intergenic	novelGene_158752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	199.457319299699	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	14	571	243174	267627	FALSE	25	AATGACTCTTCCCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243160	268918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_260340_260392_267534
916910	contig_6418_pilon	-	2638	14	Intergenic	novelGene_81250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	519.739010517062	2	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	465	2249	1476927	1449950	FALSE	25	ATACAATTCTGCTTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESKRNVSESALPSFQTPVNTVSSTSLITPPTVVSSQPKLQTPATSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVEFISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNSPAGAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSLPTVGPSGLYSPSNNRGPIQMKIPISAFSTSSPAEQSSTATPRVEADRQAFRLWHHWVGLNRQPLENQTNKTTDNSVNKKAADSTSQTGRATASDSGGVIDLTMDDEESATSQDPKKPNHTPVSTIGSSQPVTRPLQPIQPAPPLQQSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNSGLTLGSAGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGIVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQSTDVISSSQSS	1497713	1449560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1450370_1454063_1454177_1455959_1456143_1458960_1459117_1460538_1460618_1467819_1467885_1469633_1469697_1472220_1472860_1476860_1476950_1477830_1477905_1482694_1482761_1491132_1491203_1496150_1496297_1497627
916911	contig_6059_pilon	-	3031	6	Intergenic	novelGene_44845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2959.05265921376	86	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1438	1917	571639	569817	TRUE	30	CTTAAACCGTGCACATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVI	573284	567802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569957_570660_570746_571300_571456_571539_572958_573165
916912	contig_14220_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_159885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACAAACTATCTCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420705	423084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_420700_423100
916914	contig_18251_pilon	-	4191	1	Intergenic	novelGene_50148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	483	1452	342	1793	39442	37991	NA	45	AACTTTGTAAAGAATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIDIDMDMDKDIDMDIDIDIDMNIDIDIDMNIDMDMDMDIDIDMDIDMNMDIDIDMDMDIDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDMNVDIDMDIDMNIDIDIDMNIDMNVDTDIDMDIDIDIDMGIDMDINMDMDIDMDMGIDMNIDIDIDIDMNIDMDINMDMDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDMDIDMNVDIDIDMDMDKDIDMDIDIDIDIDMNIDIDIDMNIDIDIDMDIDIDMDIDMNIDIDMNIDIDMDIDMNVDIDIDIDMDIDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDIDIDMNIDIDMNMDIDMDMDMDIDIDMDIDMNVDIDIDMDIDIDMDIDIDMDIDIDMGIDMNIDIDIDMNIDMDINMDMDIDMDMGIDMNIDIDIDIDMNIDMDINMDMDIDMDIDMDIDIDIDMDIDIDTDIDI	39783	35592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_35600_39800
916915	contig_3424_pilon	-	3596	3	Intergenic	novelGene_55546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	2570	3100	304916	304386	FALSE	30	TCTCTCCCTTAAATGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDYSLQYGLYLNIKKTKILTTRPRSNIMIKGEKIEVVEDSILLGSTINTHGNRSQGIKQYIALGKCAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVCLTQTMIFSNASYACERWTMNKGDRRRIDVFELWCWRRILNTMDCQKNEHISPGRSTARVLRGSEDGKTSSHVLWTVIRRMTSCSVK	404468	303889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_306997_403931_404068_404115
916916	contig_15732_pilon	+	3955	6	Intergenic	novelGene_88828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	523	junction_1	136.384163303516	59	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	307	1332	53547	153994	FALSE	30	CCAATGTGCAGCCAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYEEAAEEWALYLREVFLHIVKREAILLYLLENISLLHLELLSLNSYRCKLLILSDSLLEDLNPEKCQFLEKVLHSPESVVTLLCGVESSDQLYKLLNISRGIFEISTDQEPEDYISVIKSVLFRGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKECEYFPSALVILYIITVCNSLINVLVRSTASCTADYMF	10991	156617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775
916917	contig_9577_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_178975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGACGGTTACATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40958	38318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9577_pilon_-_38300_41000
916918	contig_15236_pilon	-	5797	5	Intergenic	novelGene_141610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	142	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	4239	4550	593334	593023	TRUE	35	TGGGACACAGCAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKIHKFMEKADKFMENTDQKMEEFRKRQEQNVKINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEKDSVIEGLRNRFETMEDRISEIEDNHLNTTLRKNQKKEQRKMKKP	789488	591202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_592179_592751_596153_743024_743767_788613_788791_788987
916919	contig_7452_pilon	-	2271	1	Intergenic	novelGene_109162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGCACTGGGGGTCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193563	191292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_191300_193600
916920	contig_9370_pilon	-	2036	5	Intergenic	novelGene_177241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCCTGCCGTTTCAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76589	59846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_-_59935_71916_72160_72911_73403_75278_75390_75486
916921	contig_7321_pilon	-	2907	6	Intergenic	novelGene_53137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	152.718040846522	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	62	697	208319	169423	TRUE	10	TCTACTTGTGGCATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTEQTTEILLCLSPAEADNLKEGINFLQNKCTGKSYILYKNKSRLKACKNLCKHQGGLFIKDMEDLDGRSVRCTKHNWKLDVSTMKYINPPGSFCQDELGHRILNTVDCTRPNGGRLPKKAAFMMSDFAGGASGFPMTFSGGKFTEEWKAQFIKTERKKLLNYKARLVKDLQPRIYCPFAGYFVESHPSDKYGWTFCSTFLHITYCVLE	208380	165928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_167336_168619_169617_173563_173702_203985_204078_207655_207860_208311
916922	contig_6062_pilon	-	8878	3	Intergenic	novelGene_5255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_2	73.5	300	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	29	634	597983	560745	FALSE	45	CTCAGTGATAAACAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLRPGILREMAGGGDWSVMDTFHLLLLVAALPLVSRGATRDATAWTEEKNYHQPVILNSSSLRQVAEGTSISQMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMKRIQRLQADWVLEVDTFLSQTPYGYRSFSNIISTHNPTAKRHLVLACHYDSKYFPHWDNKVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKQLLTLKVSVFLLLIPGIRYIRSDSK	598011	552500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_561084_569595_569743_597863
916923	contig_1717_pilon	-	3825	2	Intergenic	novelGene_146119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGCGCACACCTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214452	206632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_-_206767_210761
916924	contig_5945_pilon	-	2640	7	Intergenic	novelGene_104576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	348.769941683945	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	23	673	249693	219523	TRUE	50	ATTATATTAACCAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249715	216801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_218756_219509_219591_224366_224478_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
916925	contig_6076_pilon	+	3991	3	Intergenic	novelGene_81755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3435	3749	454196	454510	FALSE	15	TCCTTGAGTCATTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGTRAKGGGGGETQGKNKKKRKKSNTSSQQMALREPPVWVCGILAAAVSRSRDCGCGKQRRPSRGEERWGVGKHISPITGCFVSDWKLREAAFLYPLFAGLR	238262	454752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_240678_431673_431683_453185
916926	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
916927	contig_753_pilon	-	2048	2	Intergenic	novelGene_113024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGTGTATTTTCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1388799	1385672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1387608_1388686
916928	contig_8269_pilon	-	2607	1	Intergenic	novelGene_106225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGAGGAAGTACAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273244	270637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_270600_273200
916929	contig_3723_pilon	-	3246	3	Intergenic	novelGene_178976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTCCTTGACATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202565	15660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3723_pilon_-_16721_17545_17698_200531
916930	contig_16666_pilon	+	1712	2	Intergenic	novelGene_61803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	931	1278	181466	181813	FALSE	20	TTTTCTGCATTTATACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSHICHSPKPEKPGSQLRLLPLHPFTSSGSPGSATASQISPLPSPPLRPHCCSLSSGLSTALPTSSDTPKLSTLPCNPAVASYRLHYKIHLHRRLFKPLLVQLLPLGIASSSA	179689	182247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_179787_180632
916931	contig_11309_pilon	-	1936	8	Intergenic	novelGene_149863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2302	junction_7	1690.83161521791	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	27	920	65730	56293	FALSE	35	GAGCCTCTTAGGGAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRSVFRRMGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65756	55276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
916932	contig_5889_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_133669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGATGCCTTGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10627	13218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_10600_13200
916934	contig_12948_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_126228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	651	1001	372558	372208	NA	75	CAAAAAAAAGAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIAHTSKILLKIIQKRLQQNINRELPEIQARIRGRSGTRDITADVRWIQAESREYQKDVYLCFIDYAKAFSCVDHNKLWITLQRMGIPKHLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQGHTV	373208	370746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_370700_373200
916935	contig_13021_pilon	+	2322	13	Intergenic	novelGene_8172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	2	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	169	2019	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
916936	contig_12010_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_160937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAACCAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53330	50334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12010_pilon_-_50300_53300
916937	contig_6031_pilon	-	2215	3	Intergenic	novelGene_56779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	66	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCCACAGCCCTCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560455	487005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_487373_488325_488394_558675
916938	contig_6440_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_161665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44005	46340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_44000_46300
916939	contig_10674_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_6457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAAGTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329889	330983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_329900_331000
916940	contig_9752_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_122025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTCCTACACATCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134289	137052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_135131_135490
916941	contig_1551_pilon	+	1711	3	Intergenic	novelGene_173421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.5	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1167	544	1710	394101	414072	FALSE	40	ATAAATTTATTATGCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAYGALPALSGQASEEQGKIIQVTVKEEDHIWDQGSCLQRNLSHIREFSRQRFRQFCYQETPGPREALSQLRKLCCQWLSPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHNPESGEEVVTLLEDLERELDEPRQQVPQGTHGQEVPMEEMTPLDIAKKSLGTQLHPMENRMECESPEPYLLQDNGSFSWLSMMPRSVGDDNLSNLDANEAEIDPQNMREKFFRSLAVLLENKSNNTKIFSKAKYCQLIREVKEAKAKAKKESVDYRRLARFDVILVQGNEKLIEAVNGETGKIRYYLHSEDLFDILHDTHLSIGHGGRTRMEKELQAKYKNITKEVIMLYLTLCKPCQQKNSKPKKILTSQPIKEVSSRCQVDLIDMQLNPDGE	393557	414073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1551_pilon_+_394521_410864_411013_413473
916942	contig_7963_pilon	-	2804	5	Intergenic	novelGene_58290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1464.63619629586	27	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACAGTTTCATTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48911	37162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_40232_43546_43819_48741
916944	contig_2768_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_57487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657965	659791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_658000_659800
916945	contig_5260_pilon	+	3009	1	Intergenic	novelGene_144402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2450	2755	465159	465464	NA	60	GGGAAAAAAAACCCCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNECYKFFQNGPLFHKSPYHPKINTCQFFTISANLPSLYKPMCYRRPQSANVMSLLSGFAAAVKCQVKMPWKIHTVPRQKKGQEMVKCVYLDMCELTSNCL	462709	465718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_462700_465700
916946	contig_16496_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_5121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1874	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1900
916947	contig_16703_pilon	+	3509	1	Intergenic	novelGene_72769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAAGTGGGAATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19344	22853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_19300_22900
916948	contig_10861_pilon	-	3823	3	Intergenic	novelGene_39187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2830	3171	285891	285187	FALSE	10	TGCTGTGGAGGGATGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGAKMGIRKRKERREKQGPKKKKSAKGACCWSGEKRRKKKKKTNKHRKQNRTDQNKCKKAPGIPPAWWCGPGSSSTVKQCFRAFQEEAKMAHRARCLRERRGEVVRGTKETK	386801	284534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_285414_285776_287073_385153
916949	contig_34_pilon	+	7904	17	Intergenic	novelGene_39964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_9	136.792483688798	189	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	694	2085	65	2149	12230	56098	FALSE	35	AGTTACTAAGAATTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGAALGLEIVFVFFLALFLLHRYGDFKKQHRLVIVGTLLAWYLCFLIVFILPLDVSTTIYNRCKHAAANSSPPENSNITGSYATAIPVPSQHPCFKPWSYIPDGIMPVFWRVVYWTSQFLTWILLPFMQSYARSGGFSITGKIKTALIENAIYYGTYLLIFGAFLIYVAVNPRLHLEWNQLQTIGIAAANTWGLFLLVLLLGYGLVEIPRSYWNGAKKGYLLMKTYFKAAKLMTEKADAEENLEDIMEEVHKVNESIKYNHPLRKCVDTILKKCPTEYQEKMGRNMDDYEDFDEKHNTYPSEKSLVKLHKQVIYSVQRHRRTQVQWQILLEQAFYLEDVAKNEASATRQFVHTFQSPEPENRFTQYFYNPTVEWYWECLLRPWFYRILAVVLSVFSVIVVWSECTFFSTRPVLSLFAVFIQLAEKTYNYIYIEIACFFSIFFLSICVYSTVFRIRVFNYYYLASHHQTDAYSLLFSGMLFCRLTPPLCLNFLGLTHMDSSISHQNTQPTAYTSIMGSMKVLSFIADGFYIYYPMLVVILCIATYFSLGTRCLNLLGFQQFMGDNDMTSDLVDEGKELIRREKRKRQRQEEGENRRREWKERYGHSREDSTRNRSVHTDPKESNFSDISTNRSSRYTRANNRTERDRIELLQDAEPLDFNAETFTDDPLESESGRYQPGGRYLSMSRSKIFDDV	12165	61853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_12404_12882_12981_17187_17284_19811_19980_20923_21135_33728_33804_35023_35138_35897_36082_38942_39125_39688_39823_42106_42213_42712_42811_46029_46134_47288_47336_50221_50328_55006_55134_56037
916950	contig_8284_pilon	+	3768	4	Intergenic	novelGene_125659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.65685424949238	337	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3328	3651	189579	189902	FALSE	20	TTAGCTCTGCCTCAACCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALKEHGQGESKQHGDGSSRLSTCGPPGSSRGQAGERRVEGGKAYLPGALSPAGSSVKLLSCTPCPPISSRSPRWQIRAALADKGPPLRISPHSLFSVSFLFHSVLS	183599	190019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_183649_184532_186289_187846_189076_189285
916951	contig_12050_pilon	-	5622	16	Intergenic	novelGene_62617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2458	2796	345226	344888	TRUE	25	CCACCCAACCACCGCCGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPMRPRPKNPILKQTETDECRAEWAGLGAHVLRVVPGRWACPQATRSTVQSADATFAEPDYAFLTVPLFTSVPKFNWAFLNLQLPQQEIGLVWFRASLPVLVSLLLSVMV	356347	321297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_321339_322362_322399_323512_323595_334038_334175_334707_334952_340477_340565_341362_341420_342202_342254_342344_343354_343804_345286_348909_349021_349697_349797_350554_350719_350994_351178_351507_351631_354629
916952	contig_9888_pilon	+	1291	1	Intergenic	novelGene_162254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTATGGCCACACCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23080	24371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_23100_24400
916953	contig_15498_pilon	-	1337	2	Intergenic	novelGene_42701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	75	374	884428	884129	FALSE	40	TGGATGCAAAAATTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTFHHEDVTIISMHPMTGLQNTLTAPKRGIDSSTIIVGVFNTPLSVKDRTSKKKLNKDTEDLMATVNQLDLIDICGTLYPTAARYSFPVHMEHSPE	1067097	883165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_884472_1067066
916954	contig_7629_pilon	+	1022	1	Intergenic	novelGene_153583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACAGGGTGGATTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343899	344921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_343900_344900
916955	contig_3103_pilon	-	5896	8	Intergenic	novelGene_146181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_2	284.795379462633	141	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	361	939	98616	32562	FALSE	20	TGTAATCTTTTATTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSVIDWNDVRKHKYGHLSESTSQYQEAADILELGHFTWDRYLKETCSVPAPVHCFKQSYTPPSNEFKISMKLEAQDPRNTTSTCIATVVGLTGARLRLRLDGSDNKNDFWRLVDSAEIQPIGNCEKNGGMLQPPLGFRLNASSWPMFLLKTLNGAEMAPIRIFHKVWCPSNITSSKLLKVKCLQSQLMSL	159904	27604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_32729_62285_62521_75292_75364_94341_94366_95012_95082_98603_98733_115721_115804_159742
916956	contig_9815_pilon	-	3267	4	Intergenic	novelGene_164231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	873	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	2285	3136	983	132	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGGGERQVRSQKKQKKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGSRGGRVWVKKGREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGARSEVLELKGGGGGERQGRNKKKRKKSNTSSQQMALREPPVRVCGIQAAAVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGWESVYHQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPVCWSPIGVQDGGSVLR	113800	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_1673_4412_5196_42825_43412_113574
916957	contig_1725_pilon	+	2711	19	Intergenic	novelGene_24281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	649.599983750684	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	980	2395	245314	255543	FALSE	20	CTACATTGGAGCACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201452	255859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236183_240047_240131_244924_245069_245297_245323_246599_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
916958	contig_14970_pilon	+	1832	9	Intergenic	novelGene_44993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4959.99072422268	7	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	119	484	136145	188829	TRUE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICALQQTKKTAHQSQTCPIPLKDQLP	136026	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182386_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
916959	contig_16098_pilon	-	2691	20	Intergenic	novelGene_45833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	531.190556394046	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	854	2565	39	2603	230275	201500	FALSE	30	ACAGTTCCTAATTATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRFFTTGSDSESESSLSGEELVTKPVGGNYGKQALLLSEDEEDTKRVVRSAKDKRFEELTNLIRTIRNAMKIRDVTKCLEEFELLGKAYGKAKSIVDKEGVPRFYIRILADLEDYLNELWEDKEGKKKMNKNNAKALSTLRQKIRKYNRDFESHITNYKQNPEQSADEDAEKNEEDSEGSSDEDEDEDGISAAAFLKKKSEAPSGDSRKFLKKMEDKAKKKHDRKSKRLDEEEEDNEGGEWERVRGGMPLVKEKPKMFAKGTEITHAVVIKKLNEILQARGKKGTDRAAQIELLQLLVQIASENNLGEGVTVKIKFSIIASLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNRTMVQLGICAFRQGLTKDAHNALLDIQSSGRAKELLGQGLLLRSLQERNQEQEKVERRRQVPFHLHINLELLECVYLVSAMLLEIPYMAAHESDARRRMISKQFHHQLRVGERQPLLGPPESMREHVVAASKAMKMGDWKTCHSFIINEKMNGKVWDLFPEADKVRTMLVRKIQEESLRTYLFTYSSVYDSISMETLSDMFELDLPTVHSIISKMIINEELMASLDQPTQTVVMHRTEPTAQQNLALQLAEKLGSLVENNERVFDHKQGTYGGYFRDQKDGYRKNEGYMRRGGYRQQQSQTAY	230461	201411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_201583_201673_201837_201936_202025_202113_202180_202271_202432_204668_205033_212685_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897_215040_215290_215395_215520_215632_226746_226857_226985_227041_227220_227347_228196_228387_228525_228592_230174_230286_230433
916960	contig_12119_pilon	-	5061	1	Intergenic	novelGene_88690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATTGCTTTAATAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415027	409966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_410000_415000
916961	contig_5260_pilon	+	2489	2	Intergenic	novelGene_144420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1218	1604	531900	532286	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEENKSLFHSLVNTSMTHQSSDRESAIDAEIKEYEVAIVLQRSPGGQTLQCSAAHQWVGSSTAGERPGDLLLRRLQPRKSYVAVLLCYMGSLGVQIDSTAWHVTTTIVLQIQKTGFQFASMVFPPHF	529938	533171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_530567_531310
916962	contig_11428_pilon	-	3170	3	Intergenic	novelGene_138499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1021	1350	216701	155983	FALSE	80	AAAAAAAAAGAAACCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYQYNAIPIQIPTIFFKEIEKLIINFIWRGKKPGISKALLKKKNKVRGFTLPDLRTYCTVMVVKTAQDWHNDSYIDQWNRTENPDVNPSTNATGDKGSKSIQ	219283	154162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_156011_216399_216742_218303
916963	contig_10958_pilon	-	1643	2	Intergenic	novelGene_5459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901524	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
916964	contig_2646_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_69603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1282	1662	1501495	1501875	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTRKILARRTKGPREPETHQPEPRRTRWCPATTTNRSDSDHNRVPDRAGEKCRTEFKFMKKDKITGLTETGGTPETMDLGHSANPELKPPPKPTFQTKIKQAYKTIIHVRNMLLSSIKYTR	1500213	1502082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1500200_1502100
916965	contig_15087_pilon	-	1911	1	Intergenic	novelGene_37230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146311	144400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_144400_146300
916966	contig_5623_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_154883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACATCCCAGACCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350022	348734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_348700_350000
916967	contig_7119_pilon	+	5019	12	Intergenic	novelGene_41014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	72.2072316151274	78	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	16	1590	198227	218460	FALSE	25	AATCTTTGCCATTGAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAAASSASEPEAEPKAGPKVGPKAEGEEDELKETRTRRKVLSQAVAAAPYKTVGPGWDPQEEGVSESDGDEEYAMASSAESSPGEYEWEYDEEEEKNQLEIERLEEQLSINVYDYNCHVDLIRLLRLEGELTKVRMARQKMSEIFPLTEELWLEWLHDEISMALDGLDREHVYELFEKAVKDYICPNIWLEYGQYSVGGIGQKGGLEKVRSVFERALSSVGLHMTKGLALWEAYREFESAIVEAARLEKVHSLFRRQLAIPLYDMEATFAEYEEWSEDPIPESVIQSYNKALQQLEKYKPYEEALLQAEAPRLAEYQAYIDFEMKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERFNESGDPSCVIMQNWARIEARLCNNMQKARELWDSIMTKGNAKYANMWLEYYNLER	198211	221889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_198554_203524_203652_204805_204911_207313_207499_208659_208712_209905_210031_214746_214903_215610_215750_216231_216340_217063_217142_217268_217328_218346
916968	contig_8523_pilon	-	4670	4	Intergenic	novelGene_178489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	1706	2506	341575	340775	TRUE	55	AAAAAAAAAGAGTTGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKEQNAKINSQLEILQRKQLEIQKINNKIAEMDDVIEGLRSRYETVEDRIRGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKTNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKDGKLAIQEAQRSPYRRDPKRTSPRHIIFTLAKTKDKERILRAAREKQEVTKRGKTIRLSSDYSAETMQARGQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFSDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLQSEDKQLQLTGRT	395922	212399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8523_pilon_-_213150_213652_214358_340065_342586_395227
916969	contig_2733_pilon	+	3294	1	Intergenic	novelGene_128556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTACATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566617	569911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_566600_569900
916970	contig_2798_pilon	-	6532	2	Intergenic	novelGene_120036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	839	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACCAGAATGAAAACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134258	127567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_133431_133589
916972	contig_11304_pilon	+	3613	7	Intergenic	novelGene_156677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_1	140.091240109992	105	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	655	1497	447600	458486	FALSE	75	GCAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRKERIARRLEGIENDTQPILLQSCTGLVTHRLLEEDTPRYTRATDPASPHIGRSNEDEETSDSSLEKQARWKQCTEPPGVHGDASYGSGTMDTQSLESKAERIARYKAERRRQLAEKYGLTLDSEADSEYSPRYTKSRKDPDAGEKRGGKSDKQEDLSKDLSSVYSRTETVGLRTCTAESKDYAFPASESVSDKEVLLNVENQRRVQELSATGQAHDLPPAVESSSSFSFPGRRESSFSEVPRSPKQTHRGPLSSPKQPASPSHSVAEPPSHTEIRSR	271268	460602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_271608_351744_351860_433617_433676_441235_441328_447549_447608_447721_447874_457803
916973	contig_7165_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_116831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGGAAATAGTAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252258	250402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_250400_252300
916974	contig_5434_pilon	-	3474	7	Intergenic	novelGene_74663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_6	112.37239676876	27	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	39	590	282075	275963	TRUE	50	ATGTTTGCAAGGACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAFAPTPQATSFPAEGRCGYYVEKKKRFCRMVVAAGKRFCGEHAGAAEEENARKRILCPLDPKHTVYEDQLAKHLKKCNSREKPKPDFFIQDINAGLKDETEIPEQLVPISFLSEEQLENLIKKLRKASVGLNSTLKDQIMSHPVLHDALNDPKNGDSATKHLKQQVCLGHSNSTKWPFIHL	282113	262222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_-_262893_273748_276121_276265_276336_276929_276993_279050_279118_279205_279253_281928
916977	contig_13037_pilon	+	1761	7	Intergenic	novelGene_155142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	37.8934910857612	20	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1473	289	1761	50267	54658	FALSE	10	GCTGCGGCCTGAGCGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAALLTAWSQMPVTFEDVALYLSREEWGRLDHAQQNFYREALQKRKGLSLGFPFRRPLRASPVQAKGEASSSGQQTGEEEDEEKTAVCTEAVEVGKEALAPATLEDVKPFRTMAGRDPGGSLQCEQPASSSQSSKQTYDDGPPQPLEQGQQKTAPPTTSLPETEEDNVPEKPSEEEECATEAAESREDGLAADEGLAAEGEGSKNTYKCEECGKGFGRSSHLIQHQIVHTGEKPYTCPSCWKNFSHHSTLIQHQRIHTGEKPYVCDRCDKRFTRRSDLLTHQGTHTGAKPHKCPVCSKCFTQSSALVTHQHIHTGVKPYPCSVCGKCFSDRSNLIAHNRIHTGERPYHCLECGKSFSHSSHLTAHLRTHRGIRPYSCPLCGKCFTRHSTLIQHQRIHTGEKPYECDRCAKCFTRRSDLVTHQSIHTGDKPHKCPDCSKSFTQRSALVTHQRTHNGDKPFPCPECGKCFSHRSIRSPGGGWRVPGHVNAEG	35148	54658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_+_35299_49732_49812_50207_50300_50959_51081_52711_52829_53109_54262_54608
916978	contig_14684_pilon	+	7344	1	Intergenic	novelGene_99686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTCCCAGCAGCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468070	475414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_468100_475400
916979	contig_15897_pilon	+	2671	16	Intergenic	novelGene_49585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_10	273.476547846835	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1743	928	2670	871468	888825	FALSE	35	TGAAGACAGCAAGCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSYMDPRITPTRTPVDFYPSALHPSGLMKPMMPQDSLNGTGCHSEEQNCVPPLQERKTTAIEPAPVWTPEGYMALQSKGYSLPHPKSNDTLAMDMHVRSPEEALPGGLGGCSSGSSHSPYTLERAGHANSDIPEASSKKAEKESKLTAQRAGEQGETMKQFDLNYGNTIIENCGSSPGEESEVGSMVGEGFIEVLTKKQRRLLEEEKRKKEQAVQVPVKGRGLSSRIPPRFAKKQNNLCLEQGDVTVPGNSLGTEIWESSNQALPVQASTSDSWSKAVTAFSSTESGSAEQGLKSSQGDSGVDLSAESRESSATSSQRSSPYGTLKPEEMNGPGLAEPKADSHKEQAQKQSEQKDSEQGSGQSKEHRPGPIGNERSLKNRKGSEGAERLQGAVVPPVNGVEIHVDSVLPVPPIEFGVSPKDSDFSLPPGSASGPAGNPVVKLQDALASNAGLTQSIPILRRDHHIQRAIGLSPMSFPTADLTLKMESARKAWENSPSLPEQSSPGGTGSGIQPPSSVGASNGVNYSAFGGVSMPPMPVASVAPSSIPGNHLPPLYLDGHVFASQPRLVPQTIPQQQSYQQ	860534	888826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_860628_862642_862836_866905_867224_868801_869008_871350_871547_876434_876652_880901_881108_881722_881869_882515_882658_884357_884441_885032_885225_885379_885578_886060_886148_887317_887423_887605_887796_888727
916980	contig_11855_pilon	+	2397	12	Intergenic	novelGene_67032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1911747	1935764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1911856_1912484_1912630_1914056_1914152_1915279_1915422_1915657_1915747_1917913_1918106_1919633_1919744_1922354_1922457_1927211_1927297_1931563_1931800_1933180_1933358_1934848
916981	contig_5765_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_141424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCAGGCCTTTCTTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925335	926889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_925300_926900
916982	contig_504_pilon	-	1229	5	Intergenic	novelGene_54399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	107.429919017004	47	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	127	1227	25825	17742	FALSE	10	ATTGACTGTGTCTCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQKKSKLCSRANVYTQVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKSFGVFFNDLIDSFDESNSKISWIVSICVFVLTFTAPLTTVLSNRFGHRLVVIVGGLLVTTGMVTASFSQAVYHMYITVGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFDKKRSVVTAVASTGECFAVFAFAPAITALKENVGWRNSLLFVGLLQLNIVVCGSLLRPIIIRAPGSPKTTTQENRKEVQYMLENEKTRTSIDSIDSGVDLPTSPKNVPSHTNMELEPKADIQQTLAKTSARQSDKEVALLDFSILKEKSFICYALFGLFATLGFFAPPLYIIPLGISLGIDQDRAAFLLSAMAIAEVFGRIAAGLVFNRQPIRKIYIELICVI	32634	17739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_18338_20971_21101_22506_22651_25593_25833_32515
916983	contig_10904_pilon	-	1979	7	Intergenic	novelGene_22721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	383.683318491812	53	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	244	1146	662171	651590	FALSE	10	TTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSEISSL	662724	650756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651607_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
916984	contig_21399_pilon	-	4467	3	Intergenic	novelGene_173671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	15.5	138	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTGTTAGTGTTAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152460	139199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21399_pilon_-_143350_147889_148122_152375
916985	contig_7718_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_129412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAGAACAAAAATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267455	268946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_267500_268900
916986	contig_4315_pilon	-	2634	1	Intergenic	novelGene_46853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAAAAGGTGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611229	608595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_608600_611200
916988	contig_18420_pilon	-	1566	1	Intergenic	novelGene_109373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	183	584	116561	116160	NA	40	TATTTTGTTTTAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRDWSLLITCPKYVRRSLAILASKEHYGYTSSKTDSFVLLAVRSIFSILHQHCNSKASILLQSSLFIVQLSHAYEAIENIMAWVMRTLSLQGDTFAFQHFKEVFCNRFAQCNVPFDFWTAASMGVDCGSK	116743	115177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_115200_116700
916989	contig_15047_pilon	-	2015	3	Intergenic	novelGene_52299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	8.5	1	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	822	1628	131962	129138	FALSE	20	TTCTGCTTCTATTTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCFQLLRIGGSDLYTFHPPTGAGCTYRLGRRADLCDVALRPQREPGLISGVHAELHAERQGDDWRVSLEDHSSQGTLVNNVRLPRGHRLELSDGDLLTFGPEGPPGTSPSEFYFMFQQVRVKPQDFAAITIPLSRGEAGGGGGFQPMLPSQGAPQRPLSTLSLAPKATLILNSIGSLSKLRPQPLTFSRGGNGPQSLPPPTPSGEVGTTPSAPPPAPRNRRKSAHRVLAELDDDERGPPESPSPVLVEPRKKQRGEKAPLTPSGRE	132783	128750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_129148_130052_130621_131733
916990	contig_12410_pilon	-	1713	2	Intergenic	novelGene_167268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97714	60833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_61269_96436
916991	contig_3700_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_138068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACGCACACACAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162751	160155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_160200_162800
916992	contig_15407_pilon	-	3160	4	Intergenic	novelGene_123044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGGTAATGTGAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336606	295228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_295524_333118_334997_335104_335203_335717
916993	contig_16516_pilon	+	1766	5	Intergenic	novelGene_173247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	6.26498204307083	106	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	8	337	13019	25763	TRUE	10	CCTTCAGTAGTGTTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIMGDTRIQCGPDEYPHNNLCCKNCASGEYLSKHCTRNHHAGKCEACEHETYMAHSSGLNDCLPCTQCREDQEVVTNCTRTRNRQCQCRTGFYCEQADCEMCRACLRYPRQ	13011	29719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_+_13095_15312_15442_19586_19698_25749_25994_28520
916994	contig_16411_pilon	+	1550	7	Intergenic	novelGene_77315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1596	junction_4	414.86450264581	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	159	1100	131665	148057	FALSE	20	TATGATGCTGAATCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLRVGGARSSYCVEGACPTQALQTGPAPTHDFLPRWTCTQSSISPQYNICEQMVQIRDDHIRFISELARYSNSEVVTGSGLDSQKSDEEYRELFDLALRGLQLLSKWSAHVMEVYSWKLVHPTDKFCNKDCPGTAEEYERATRYNYTSEEKFAFVEVIAMIKGLQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMME	131506	148507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_131731_134144_134265_135020_135147_142146_142314_143077_143226_146694_146849_147896
916995	contig_9594_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_73918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTGGGTAAGGGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145655	147529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_145700_147500
916996	contig_6302_pilon	-	2843	2	Intergenic	novelGene_171709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATTTCCACAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231366	227288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_228433_229667
916997	contig_4678_pilon	-	2424	1	Intergenic	novelGene_126006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181085	178661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_178700_181100
916998	contig_3380_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_60138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	311	610	619837	619538	NA	60	AAAAAAAAAACTCCATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLGQKRFTAGPFSWRSPLLPGTALHRQPLSSSVSMAVFSSELSSSSPRSPGFRVFISQSVYPLSLARWGSPARSALQGWVIHSENPLNCFLKNQRQR	620147	619150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_619200_620100
916999	contig_20670_pilon	+	4279	8	Intergenic	novelGene_144837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	3578	4264	62657	63343	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYHKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRYIRKCSGSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTENNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRGKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHFITWMKLEDIMLSEISQSQKDK	50212	63358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20670_pilon_+_50771_51028_51223_51978_53012_54341_54424_56699_56793_57515_57693_60652_60894_61457
917000	contig_12078_pilon	+	2896	2	Intergenic	novelGene_74120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	2274	2777	489105	489608	TRUE	60	CGTCAGCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKILEMDRVKEGLRCRSETAEDRSSGIEDKHLATTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDKVKSKNLKVIGVPEQADKTEDTERVPEELLTENFLNIMKDEKVAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITFTKTKDKES	486831	490310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_489621_490203
917001	contig_7151_pilon	-	5564	5	Intergenic	novelGene_40741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTTGCTCTGTGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510463	502269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_502453_503036_503212_503293_503385_504050_504141_505438
917002	contig_9833_pilon	+	2103	11	Intergenic	novelGene_68547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_6	145.685139942274	34	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	237	1130	246676	254740	TRUE	50	AGTGAAAGAAGCCAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAATHAVPAPNPQPEVLYNKIFINNEWHDAVSKKTFPTINPSTGEVICQVAEGDKDDVDRAVKAAQAAFQLGSPWRRMDASDRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYQVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHKDVDKVAFTGSTEVGHLIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDVYAEFLERSVAQAKARVVGNPFDSQTEQGPQVDETQFKKILGYIQSGKQEGGEAAVWWWGCC	230883	257698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_230949_244838_244944_246609_246751_248736_248817_249384_249497_250051_250181_251069_251184_251787_251891_252272_252458_254644_254811_256795
917003	contig_8377_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_35127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAATAGTATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175680	178062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_175700_178100
917005	contig_18168_pilon	+	5289	1	Intergenic	novelGene_122062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	57	365	1665	1973	NA	75	ATAGAAATGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASLPPLYFPESLSLSWALCPPKLSLGLFSWALLEEKSSPGNLMPESVLSQKTEVEGMMFPFWGWEHLCLEAPDRDSLMTCFGFVTHQLNVYPYPRQLEL	1608	6897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_+_1600_6900
917006	contig_7004_pilon	+	1853	14	Intergenic	novelGene_126448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_10	44.6014567119551	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	27	578	273029	274474	TRUE	20	CTCAAACTCATGCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCEGRVAMTGRARKEAVQAAARELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFCELKETDSWEIKPESKYFLTRNSSTIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRRSRRSQVGFHQVGVETYGGGIWSTWFDRDLTLAGRVIVKCPTSGRLEQRLVHVEQPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNLEMHL	272600	281121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_272621_273022_273117_273202_273292_273378_273493_274020_274147_274339_274819_274924_275033_275985_276064_277055_277140_278171_278377_278738_278779_278897_279000_280450_280619_280975
917007	contig_19012_pilon	-	2154	1	Intergenic	novelGene_159473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1286	1636	14785	14435	NA	70	TAAAAAAAAAAAAGATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTSLREINRYEYEVFSRRSEMRLPPLWLSFTLLQPQLCPYYSYSSLHQTTLQPKAVMHFPQISTRFTPALHSGFCANVTSSKSHVLITLSKIAYLIPSQQQHPHTLCPSNLLYWS	16070	13916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_13900_16100
917008	contig_8729_pilon	-	6272	4	Intergenic	novelGene_40133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	302	688	861387	861001	TRUE	70	TTTATTAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYESRKTGNRQNMKWNIYKHQYLGISKLRWTGTGHLKLDNHTVYYDRNDNLKRNGIAFIVKKNISRSTLKYNALSARTKSTGLQGRLVNITILFKFRYQPLRPKLKKLKIIINFCSLKLIKHAIRMH	861688	583643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_-_586617_710819_712120_717549_718672_860811
917009	contig_18283_pilon	+	5711	2	Intergenic	novelGene_170696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTAATGGTATTCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23450	29208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_29022_29068
917010	contig_11986_pilon	-	2891	1	Intergenic	novelGene_69123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	276	831	603	1433	127303	126473	NA	15	GATTGTGAGCCTGGTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFDCVDHKKLWITLQRIEIPEHLIVLMRNLYIDKEAVVRTEQRESAWFEIKKGVRKGCILLPYLFDLYAEQIIREAGLYDEECGIRISGRLINNLRYADDSDFLAERGLEALTDEDQRLQPSVWITPQHKENRNSHNWTNKQHHDKWRKVTRFQDFILLGSTINTHGSSSQEIKQHIALGKSAAKDLFQVLKSKDVSLRTKVFLTQAMVFSVASYACESWTMNKEDQRRINAFELWCWQRILNIQWTARRTNKSVLEEVQPKCFLEARMVRLHLK	127905	125014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_125000_127900
917012	contig_8138_pilon	+	2085	3	Intergenic	novelGene_52399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTGTACTGACTGTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123366	203762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_124331_182033_182343_202950
917013	contig_15114_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_121213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGTCCCTCCCTGCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947580	949130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_947600_949100
917014	contig_9177_pilon	+	2968	2	Intergenic	novelGene_32787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	438	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2034	2459	1447121	1447546	FALSE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGMWNVESMNLGKLEVIKNEMEHINVDILGISELKWIGIGHFESDNHVVYYAGNDEMKRNGVAFIVKKNVSRSVLKYRAVSGRIISIGLQRRPVNMTIIHIYTPTTNVKELKIFTNLCSLKLIKHAIKMH	1444579	1448055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1445030_1445537
917015	contig_10958_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_5471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCAGTTTTCAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901299	895296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
917016	contig_10857_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_160930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	928	1245	740216	740533	NA	15	GCCACTCTCCGTCTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPNIIVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	739288	740791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_739300_740800
917017	contig_2078_pilon	+	3034	2	Intergenic	novelGene_100146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2653	3021	301115	301483	FALSE	70	GTAGAAAGAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDWVDVVYLLIGFSGMGAFIASQQIGEDIKQGVLHAYFPQSSSWSSGGRRGEGPGVVAGLSTKDALAAVTYRESMGRGVSYGTSWGWEKEKKRERKKFKKGNLQVVAEWAWGPVGSEGGCV	287551	301496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_290121_301031
917018	contig_2646_pilon	+	2730	1	Intergenic	novelGene_69538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTTAGAATCCCTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576655	579385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_576700_579400
917019	contig_18184_pilon	+	3089	5	Intergenic	novelGene_123862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	68.1230504308197	30	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1200	1888	3087	96200	111547	FALSE	25	GTGTGGGAAGGGCTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFTESVTFKDVAVVFTEEELGLLNPAQKKLYQDVMVENFRNLMSVGGKNPRQVETVPQAGAQEDLSSLHIWQQIASDLTRWQDSMINKSQFYKQGDSPSSVPGGLFNIHTGETPHQCNECTETFSDVSSFDLHQRLHSEEKSLTCCECGKSFRYISRLRNHQRAHMGKNCYKHDECGKEFSQSSHPRSPLNVHAMAKLHKCEECGKCFRHRAALTVHCKGHKGVKSYKCKECGKAFIYLLHFQEHQRIHTGEKTFRCDTCGKNFRCRATFNTHCMAHMRGKPYKCEECGKGFRHAANLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKYFSSRTNLQTHGRIHTGEKSYSCEECGKGFRQAAHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFCQNSHLQAHQRVHNEEKPYKCE	89848	111549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_91675_96138_96215_104898_105026_109733_110451_111206
917020	contig_15952_pilon	-	2025	1	Intergenic	novelGene_154068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCACAGTTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293464	291439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_291400_293500
917021	contig_12142_pilon	+	1632	1	Intergenic	novelGene_147791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAATTAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19364	20996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_19400_21000
917022	contig_7035_pilon	-	2776	1	Intergenic	novelGene_83519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACTAAAAAAAGGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274187	271411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_271400_274200
917023	contig_17144_pilon	-	544	4	Intergenic	novelGene_29404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1930.7494802681	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	47	340	170784	166277	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFCLQERVWSVS	170830	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166308_168188_168310_168996_169099_170744
917025	contig_6279_pilon	-	1989	1	Intergenic	novelGene_164762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATTGTAAAGAAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59113	57124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_57100_59100
917026	contig_1435_pilon	+	1399	2	Intergenic	novelGene_115513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCATCCAACAGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566472	572172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_566989_571289
917027	contig_8377_pilon	+	2340	2	Intergenic	novelGene_35099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGAATCGACATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144633	147196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_144797_145019
917028	contig_5324_pilon	-	1845	2	Intergenic	novelGene_102054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_1	0	49	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAAATTGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393217	364871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_366100_392600
917029	contig_2867_pilon	+	534	1	Intergenic	novelGene_135193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGCAACCCCAAAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852358	852892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_852400_852900
917030	contig_3956_pilon	+	1956	11	Intergenic	novelGene_14891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1513.41332424424	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	83	1243	1281682	1286425	TRUE	10	TGGTGGTGACTGTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMEKL	1281599	1291001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286414_1286606_1287276_1287338_1290529
917031	contig_12644_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_44574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1184	1624	2032311	2032751	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWGKPQANNKQGLGLWRKPSAQVIIQSGRRGGGGGGGDGGRHTRERSQFPWGRQSRGWVKGQVLISPRARLEPSGGEGGRMLGVGGIPPGREGCSHTALRFRTETQLASTLLNRGPGRPRASRLLRSLKGKNGSHEGCGALAGYG	2031127	2034598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2031100_2034600
917032	contig_14326_pilon	-	2649	4	Intergenic	novelGene_120755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	81.3893249893512	80	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	833	2499	150	2648	607092	563553	FALSE	40	AATGTGAAAATGCATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSGVETQPVPLDSSMSAVVQELYSELPVSVSKELHADSEPSGIPDVNSGASRALISQSRTLPLEQQRTHVESCCEENSETLDDGGEPGRCGLVDSTAGGTVASGTLDREEKTKSMELKVFRDQGNQEEIVRDPCEGAKEDQSQHSTAAEGKMSPSQEELLIQSRKELTCGDLPEDFLRSKGNVQITTETLLKSIEKAQGMKVNETKMDNNEGHRHGNVSKRLSAGCSEYPEVDKIMTSGEVSETSTLVSLEPLTFVDPGLTETTSKEKEHEELKLCPSSLSLLPGTSDISKVDNGKEELCKLNLVSEADDNHQQILVHHNEKNSSACDSPMTTRSVVVVEPLEEDYKVSYFTSNLSNLESRTTSLEQCDLEGDGLMKGSTEKTDTSCFDQDDQSKNLTSREENEEQLLSPGSERGECSPFNSSQPEEYASGHHSGCSCEKETVGSLKENTLLDNRYIQGGIYTESFCSLMPNSFTETTEVMSKENNLRITSDTQGSFTNYEDRETFANINHSGNNYEENSISSLMQIEEPERTTTIDPSILSEKIYSKDSNSLVNIKRNLENNTQLNERLCSGFLFKRKSPLNILPEDQISPINEMSKLKYDTVQFPSSPELDYRPESEKTVWTSHDDIPHSDEQSIPCEVNELSYTDELVVNKVESECVLNQQVSLNSRDHVKLPADSLLNINKEMPRARSENFQQSHHPPFEDRADIIANTQTIPIKTRMKDICPPGDKTCSASSNSSTLNIKPGSLERKKQAADSGMEDLHSRLLSSKNEAAGFPQEVAVMECQNVQSQNKTSSHCVSKNASEEGICSASAAFESSKIILEVENSFVT	616034	563551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_565505_582908_582982_606618_607144_615936
917033	contig_233_pilon	-	2577	14	Intergenic	novelGene_14569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1413.20311818735	90	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	701	2137	104176	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104314_105461_105704_107300_107472_108401_108453_126894
917034	SIRV6	+	894	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	12	140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	35	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
917035	contig_9304_pilon	+	3572	2	Intergenic	novelGene_177837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCGTATTTCATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416	145743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_+_3065_143819
917036	contig_13425_pilon	+	4082	3	Intergenic	novelGene_170839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	372	1823	59848	62332	TRUE	35	CAGAGCTAGCAAATCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLPTPRAGLAVGSCSSSSPSPWLGQTTSSSGAEGVEEPSKKRGIEGKNNSAVEQDHAKTSAKTEYPLAKQENSSTCMGSSTKLESSGNSTRSSGISLNENSSTSEGDRSSSSQSSSSISSQVTTAGSGKVSESETSDKHGSAPFVSSLLKSSVNSHVTQSTDCRQQSGSPENNALECSSVSASQSSSEIQLPLLGSSGSSEVELPLLSSKPSSETASSGLTSKTSSEASVSSSVSKNSSSSGASLLTLKSSSSTNTSLLTSRSTSQVAASLLASKSSPQTSGSLVSKSSSLASVSQLASKSSSQTSTSQLPSKSTSQSSESSVKFSCCKLTNEDVKQKQPFFNRLYKTVAWKLVAVGGFSPNVNHGELLNAAVEALKATLDVFFVPLKELADLPQNKSSQESIVCELRCKSVYLGTGCGKSKENAKAVASREALKLFLKKKVVVKICKRKYRGSEIEDLVLLDEESRPVNLPPALKHPQELP	59476	64642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13425_pilon_+_59948_60980_62414_62464
917037	contig_7357_pilon	+	6136	18	Intergenic	novelGene_36903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	4439	4777	390591	398879	TRUE	15	GCTCACCTGCCTCCTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVDKLLAGTHPSLLVVRFLTYLEGSLVTLVHHFHHIPALCRKGLQASFLLINHHCVFTRSYQLPGPCSAIFLCVRRVNRLLRTRPTIVVFGGLQRMGRFAPTFALLWGLWQ	385797	417545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_390198_390552_390666_390744_390850_393033_393160_398846_398968_401227_401295_401472_401551_402847_402942_403229_403451_404239_404366_405486_405583_405689_405781_408548_408618_410567_410687_411737_411805_415800_415876_416198_416275_417453
917038	contig_9011_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_159351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756432	755187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_755200_756400
917039	contig_3018_pilon	-	1884	14	Intergenic	novelGene_78878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	444.771066701902	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	609	1276	1884	570362	562953	FALSE	40	GGTTATGAGACCAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINS	625103	562952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572380_576815_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
917040	contig_6048_pilon	-	2844	1	Intergenic	novelGene_73337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	443	784	2837320	2836979	NA	85	AAGAAGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDMQVANRHMKKCSQSLAIIEMQIKTTMRYHLTPTRLTLIQKTQNNKCWRGCGETGTLVHCWWECKMVGSLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAISLLGIYPGEVRAVI	2837762	2834918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2834900_2837800
917041	contig_151_pilon	+	2293	1	Intergenic	novelGene_132575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237277	239570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_237300_239600
917042	contig_7379_pilon	+	4329	5	Intergenic	novelGene_150024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGAATTCCTTTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536755	548704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_+_536865_537340_537477_540875_540961_542466_542521_544759
917043	contig_19851_pilon	+	2639	4	Intergenic	novelGene_29854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4222.70129445859	1	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTACTTAGAGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53470	56474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53485_53542_53703_53927_53980_54061
917044	contig_4223_pilon	+	1556	2	Intergenic	novelGene_117262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	40	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGTACAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120698	139551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_120773_138069
917045	contig_13888_pilon	-	2935	1	Intergenic	novelGene_151809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354353	351418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_351400_354400
917048	contig_20951_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_43069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGCAAGGAGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26998	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27000
917049	contig_253_pilon	-	5217	4	Intergenic	novelGene_129761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1556	2038	739636	739154	FALSE	35	CAATTCCCAGCAACCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKDSTGKILNDAGSNKRRWKEYRESLYQKELVNVHLFQEVAYDEGPVILKEAVQAALKALVKNKAPGIDGIPTEMFQQMSATLETLTCLCQEIWKTATWPTNWKRPIFVTVPKKGDPKEYRSYPTISLISHVSKVLMKINKNQLRQCVNRELLETQDGF	799913	735974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_740022_754776_754937_776072_776462_799292
917050	contig_299_pilon	-	2460	1	Intergenic	novelGene_129427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTCAAACCAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861885	859425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_859400_861900
917051	contig_13481_pilon	+	389	2	Intergenic	novelGene_119497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387604	1388214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1387782_1388002
917052	contig_6202_pilon	-	2677	1	Intergenic	novelGene_139824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTGAAGTACAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475587	472910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_472900_475600
917053	contig_8587_pilon	+	5971	6	Intergenic	novelGene_159102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	775	112	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAGTTACGCCAGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92480	186839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_92986_93419_98139_125282_125438_184295_184361_186089_186528_186750
917054	contig_16098_pilon	-	1861	8	Intergenic	novelGene_46047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1966	junction_1	1007.07503317726	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	366	1733	350768	348441	FALSE	35	AATAAAATGGCTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSVRGRCGTGESGWGNGAGQGLLLIWLVPHRREAGFWGSPNSPRWGSFWGSGWIILRPQKTGFRLTSLQLPCSNWLRQTSLSPGALGGGSADARISGAREELGLTQYWVPPGRRVPAGGGDEEAPGHSAGATEALG	351133	348312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765
917056	contig_20293_pilon	+	2204	6	Intergenic	novelGene_153526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTACTTCAATTAAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81649	107191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_82276_82614_82787_84365_84753_105913_106032_106093_106222_106418
917057	contig_6088_pilon	-	4965	40	Intergenic	novelGene_161266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.158061897512025	325	29	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	4563	4964	126009	113459	FALSE	25	GCGAGCGAGGAGGAGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCALAATRSSKLLRCSFPSQSKRRGISCSPSSPHLSGFVAGSGLQEPSDQVIQLGFDLGRGRRHPFPEGAWRLRSGGAGGGLAASIVVKPPCPGVPPLPPYSSSQFRSFPDSSHHVSTHRYPSPRAEEAEEEGE	249459	113457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_113699_113824_113904_114518_114581_125988_126139_127917_128018_169053_169216_170536_170757_175405_175504_176002_176076_176688_176792_178988_179028_179691_179799_181037_181192_194330_194467_195520_195647_196584_196770_199130_199298_205699_205882_208466_208563_210875_211025_216371_216449_217020_217194_218168_218280_226527_226637_228404_228531_229226_229309_230708_230822_231710_231773_231880_232036_232911_233036_234064_234189_234276_234355_238361_238420_239500_239644_240557_240631_242005_242160_243898_244060_244596_244698_245247_245410_249309
917058	contig_14811_pilon	-	1662	2	Intergenic	novelGene_74484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1013	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	29	808	375703	357434	FALSE	35	ACAACCCCAAAGTGTCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHQGSSTTNMSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	375731	356579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_357613_375102
917059	contig_14142_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_120436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72365	69573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_69600_72400
917060	contig_16098_pilon	+	2681	3	Intergenic	novelGene_45764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	393	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCAACGAGATGGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31089	34252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_31589_31682_31768_32155
917061	contig_11564_pilon	+	1797	2	Intergenic	novelGene_158568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGAAAAAAAAAAAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57179	59319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58706_59048
917062	contig_6191_pilon	+	2654	3	Intergenic	novelGene_107829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGCGACCGAGGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77301	80677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_77346_77451_79301_79916
917063	contig_14822_pilon	-	1911	7	Intergenic	novelGene_145436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	43.3384612350534	121	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	793	1665	358227	357077	FALSE	15	GACTAGCTTCATCTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPAGIYDTKYAVEFHARFVASYLEYAFRKCERENGKQQAAGSPHLTLEFCSYPSSMRAHIDYRCCTSPATHRPHPTSVCDNFSAYGWCPLGTQCPRSHNIDLIIDADEAAVEDKRRRRRRREKRRRALLSLSGTQTSGEAEDGPPVKQVCEDGLKVEEIEQEVAENDTANQPGCEEDHKNDLEKGVEAARPGGTDMATPEVPGSQASPNSVPGDGLHRAGFDAFMTGYVMAYVKVSRGPQPCRSGPWLPECHNKVYLSGKAVPLTVAKSQFSRSSKAHTQKMKLTWESS	360402	356830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_357698_357779_357940_358135_358396_358546_358706_358830_358928_359069_359111_360075
917064	contig_13295_pilon	-	3547	1	Intergenic	novelGene_31244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	389	1170	2044	3213	105019	103850	NA	25	TTGATATGTTGGAGCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGIPAEMFQQIDVALQVLTHLCQEIWKTATKDWKRSRFAPIPRKGDLTEFGNYRTITLIWQASKILLKIIQKWLQRYINRELPDIQGRFRGGCGTRDITADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCADHKKLWITLRRGIPEHLIVLMQSLYIDLQADVRKEQGDTAWFKIRKGEHQGCIFSPYLFNLYAERIIQEAGLYGEECGIKIGGRLINNLQYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDYSVQHGLHLNIKRTKILTTGPISNIMINGEKIDVVKDFILLGSVINAHGSSSQEIEQHIVLGKSAAKGLFKVLKSKHVTLKTKVRLTQAMIFSVALYACESWTTKKEDQRRIDTFELWCWQVY	107062	103515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_103500_107100
917065	contig_12948_pilon	+	4978	3	Intergenic	novelGene_126176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTACAGCCTTCAACATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167399	172547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_171522_171646_171942_171986
917066	contig_17274_pilon	+	3314	10	Intergenic	novelGene_26489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	685.769442593545	64	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	751	1122	33620	34765	TRUE	55	GAAATAAAGCCCCACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEHRVAKAKGRIHEVKDLNTRFQRAAQEDKVKYYNEMCKDLELENQKGRICSAFLKVKELKKKFKPQVAILKDSTGKILNDAESIKSRWKEYTELLYQKQWVNVQPCLLKVKRT	32869	113181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_33964_34737_36337_41218_41368_42655_42710_47229_47296_51703_51785_54321_54330_68310_68374_104417_104478_113041
917067	contig_6283_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_100225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGTTTAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	635899	633891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_633900_635900
917068	contig_5125_pilon	-	4601	1	Intergenic	novelGene_43446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCCAGATTCGTGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33997	29396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_29400_34000
917069	contig_2739_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_165833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAAAGCATAAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112604	113373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_112600_113400
917070	scaffold_12124_pilon	-	1554	7	Intergenic	novelGene_22119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	6.5	56	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	258	1307	917500	906841	FALSE	20	AAGCACTCTGCCCTCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQWRPRPPFPTELLGLIEGFKGSKVLFTACKLKVFDVLKDGTILTAEDIASKIDTSVCGTERLLDACATLGLLERSERGYSNTELARLYLVSEGEHSLHGFITLCNDYTWELFTHLESAIREGTNQFHEVSGRRADNLFKCPIPLQDSSRSKEAQLQFMHAMHDLTKLSAHAVATAFDLSRFTSACHLGGCTGALAHALVQEYPHLKVTVFDLPEVLELAPSFQPAREQAAQIHFMPGDFFQDRLPEAELYVLSRIIHEWPEDKVHQLLGRISERCKPGGGLLVAEAILDEERRNSRGAWVQSLSTLLQTQGRQRSGEEYQRLLRAQGFHDVRVVRTGALLDAVLATR	917757	906593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_907053_909100_909224_911827_911972_912554_912703_914892_915078_916784_916948_917425
917071	contig_826_pilon	+	4040	7	Intergenic	novelGene_154937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	143	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGGTTTAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221090	348016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_+_221359_235785_236021_299149_299341_341907_342566_342714_342841_343286_343522_345689
917072	contig_14516_pilon	-	3263	1	Intergenic	novelGene_153948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGATTACAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398895	395632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_-_395600_398900
917073	contig_8316_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_178730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	939	1283	184675	184331	NA	40	GTATGTACATTAGAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLHLMYFGHVIRKDRSLEKDIMLGKVEGQRKRGRLSMRWTDTMAATSSNRNNCEDGVGPDSVSCCALGPYESEPTQQHLTTLLSLFNFLIKSFLGGFHGVNTPIMAQFKLPT	185613	184241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8316_pilon_-_184200_185600
917074	contig_17144_pilon	-	2459	16	Intergenic	novelGene_29283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2089.16345193211	286	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	990	1736	172541	166965	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPTCVRHIRGALQM	183209	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_167003_167307_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_174661_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
917075	contig_160_pilon	+	3619	16	Intergenic	novelGene_156325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_9	49.0399383722651	79	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	19	1797	207052	254905	FALSE	15	TAACTTTTTCTTTTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPLLLRMAVPGFILGVFIHLLHISSVANYPNGKVAKSCHGMIPEHGHSPQSHPIHHISVNQTTFQPGDQLKVTLSGPPFKGFLLEARDAEDLSGPLIGSFTLIDSELSQILTCEDIQGSAVSHRNPSKKNDIEVYWHAPSSAPNHIQFLATVVEKYKIYWVKIPGSIISQPNALPFTTPKATTARLSTLPPDSHLTKPFSASACGNTKFCIRSPLNCDPEKERACVFLSFMRDDRSVMVEMSGPSKGYLSFALSHDRWMGDDDAYLCIRDDQTVHIQASHLTGRSHPVMDSEGSLEDMAWRLADGVIQCSFRRNISLPGFKNRFDLNTSYYIFIADGAADDGRIYKHAQQPLITYEKHNVMDFPKNIGGSHSLFLLKVHAALMFVAWMTTVSIGVLIARFFKPVWSKAFFFGEAAWFQVHRMLMITTSVLTCVAFVLPFMYRGGWSRHAGYHPYLGCVVMALAVLQPLLAAFRPPIHDPRRQMFNWTHWSMGTAARIIAVAAMFLGMDLPGLNLPELWKTYAMIGFVAWHVGTEIVLEIHAYRLTRKVEILDDTRIQILQSFTAAEAEGHTFKKAVLALYVWGNVTFLIMFLSAISQL	192868	256727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_192887_207051_207248_209616_209754_210984_211080_212797_212946_215749_215933_225271_225371_227529_227678_238098_238213_239853_239970_241683_241771_252192_252291_252536_252596_253399_253544_254671_254734_254812
917076	contig_1964_pilon	-	1799	6	Intergenic	novelGene_130908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	278	junction_3	189.791886022559	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	485	961	148389	142581	FALSE	50	AGAATTCAGGAAACATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGVPWGVYPANLFQQQAAAAANNTASQQAASQAQPGQQQVLRAGASQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYYDQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTAGSLTGTTNGLFRPIGTQPPQQQQQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLSNSSQSTSLFSHGPGQPGSASLGFGSSGSLGAAIGSALSGFGSSGKYAFKMSIHC	154670	141742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_142907_143025_143170_148382_148522_150074_150218_152871_152998_154587
917077	contig_4531_pilon	+	1949	7	Intergenic	novelGene_47940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	260.642582007537	23	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	751	1731	729029	738189	FALSE	55	AGCATAACAATAATAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTECTSLQFVSPFAFEAMQKVDVVRLASLSDPELRLLLPCLVRMALCAPADQSQSWAQDKKLILRLLSGVEAVNSIVALLSVDFHALEQDASKEQQLRHKLGGGSGESILVSQLQHGLTLEFEHSDSPRRLRLVLSELLAIMNKVSESNGEFFLKSSELFESPVYLEEAADVLCILQAELPSLLPIVDVAEALLHVRNGAWFLCLLVANVPDSFNEVCRGLIKNGERQDEESLGGRRRTDALRFLCKMNPSQALKVRGMVVEECHLPGLGVALTLDHTKNEAFEDGVSDLVCFVSGLLLGTNAKVRTWFGTFIRNGQQVRDKLISV	727763	738407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_728500_729014_729322_729945_730085_732799_732903_733741_733856_737433_737565_737988
917078	contig_990_pilon	+	1450	5	Intergenic	novelGene_76148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_4	86.8259753760359	16	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	96	668	1763058	1777881	FALSE	55	AAAGTTTTTTAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EILPSGDRTEIGEKGVNLSGGQKQRVSLARAMYCNSDIYLFDDPLSAVDANVGKHIFENVVGPKGMLKNKTRILVTHSISYLPQVDFIIVMSDGKISEMGSYQELLARDGAFAEFLRTYASVEQEQDAEDEGLMGSSGPGKEAKLMENGMLVTDTTGKQLQRQLSNSSSYSGDTHKHHNSTAELQKPGTQKEATWKLMEADKAQTGQVRSGSPGKDGGRCC	1761619	1778663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1761664_1763006_1763175_1765452_1765637_1774021_1774113_1777700
917079	contig_9098_pilon	-	1838	11	Intergenic	novelGene_75838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	155.588592126801	62	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	522	1391	345261	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	349005	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_348781
917080	contig_14441_pilon	+	979	4	Intergenic	novelGene_100507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	532.225724878291	38	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	395	943	125667	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	108116	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_125517_125902_126159_126283_126514
917081	contig_4686_pilon	-	2188	5	Intergenic	novelGene_118548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	149.279938370834	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	325	840	537789	530600	FALSE	80	ATTAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHLQQLIEGAHREIEDKPVATSNIQELQAQISRHEELAQKIKGYQEQIASLNSKCKMLTMKAKHATMLLTVTEVEGLAEGTEDLDGELLPAPSAHPSVVMMTAGRCHTLLSPVTEESGEEGTNSEISSPPACRSPSPVANADASVNQVPSLGMPPAVLSGGMQDSIFCPC	540009	529251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_530813_531879_532075_537681_537823_539161_539349_539905
917082	contig_7806_pilon	+	6293	1	Intergenic	novelGene_157530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTAAAAATGATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196691	202984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7806_pilon_+_196700_203000
917083	contig_20314_pilon	-	3137	1	Intergenic	novelGene_125620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3143	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_0_3100
917084	contig_5136_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_126621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225636	222894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_222900_225600
917085	SIRV7	+	2070	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	53	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTATTGTTCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	114911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
917086	contig_6363_pilon	+	4733	4	Intergenic	novelGene_178939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2746	3111	228828	229193	TRUE	50	GTAAACAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCRISGCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSSSSSAFSARGESSGVLFWLPTGTILSCFCKCFVIVCCLRDIQ	172425	242045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6363_pilon_+_173347_173860_175620_228762_229683_240912
917087	contig_14780_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_166384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCGGACTGAGTCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81843	80360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_80400_81800
917088	contig_2854_pilon	+	1604	2	Intergenic	novelGene_120841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAATCAAACGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267397	280050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_267925_278973
917089	contig_854_pilon	+	1357	7	Intergenic	novelGene_36218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	119	766	543600	563192	FALSE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSYAVPSLWCFLAAGCRAWLMSSSCWRLV	543481	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562389_563109
917090	contig_12540_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_148071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAGAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345718	344286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_344300_345700
917091	contig_12701_pilon	-	1340	6	Intergenic	novelGene_169546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	75.6005290986776	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	131	916	40561	24829	FALSE	45	TAATATAACATTGAGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNSKPKDNVVLFLGKVLFSLLETMVFSIIPKPRKNVAGEIVLITGAGSGIGRLLALQFARLGSVLVLWDINKDGNEQTCRMAQEAGATRVHAYSCDCSQREDVYRVADQTYKAFLPAMIANDHGHLVCISSSAGLIGVHGLADYCASKFAAAGFAESMFAETIAQNQKGIKTTIVYPFFIKTGMFDGCSTSFPNLLPILEPEYVVRKIVDAILQNQLYLCIPKSLYFLLFLKRLGFTLRHFSMDWGILSLCIPQCCVHF	52335	24404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_24911_29682_29809_30464_30610_33152_33253_40228_40576_52219
917092	contig_9366_pilon	+	1380	3	Intergenic	novelGene_166253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	211	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAGTTTCAATTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939863	1014592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_939872_955910_955942_1013251
917093	contig_6509_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_145653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAAACAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181913	184533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_181900_184500
917094	contig_6027_pilon	+	3731	1	Intergenic	novelGene_74425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCAGGATTGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204811	208542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_204800_208500
917095	contig_14483_pilon	+	788	2	Intergenic	novelGene_133755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGACAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56078	60831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14483_pilon_+_56315_60279
917096	contig_11846_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_106010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTATCTTCTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452151	453860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_452200_453900
917097	contig_5620_pilon	-	2000	1	Intergenic	novelGene_161365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	66	548	440090	439608	NA	45	AATTTCTTTACAGCAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRRFTKEDIQAANRHMRKSLAIREMQIKSTVTYHLTPALLAQIKNTGNKKCWRGCGEIRTLMHCWWECVMKQPFWKMIRCFLRKLEIQIPYDPTMPFLGIYSREIRAVTGIGICTLMFIAVLFTIAKRGKQPRCPSTDKWINKLWYIHTMEYSATIKEQ	440155	438155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_438200_440200
917098	contig_8978_pilon	+	2762	21	Intergenic	novelGene_49424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_9	62.4479583333194	110	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	909	2727	35	2761	445453	522730	FALSE	35	AATCGGCAGCAACATGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSLKNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAASGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQLPPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRDSFLDDVNLILANSVKYNGPDSQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLYDTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPTTTPEKQVTQEGEDGDGDLADEEEGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFSAIQLSESGSDSDVGSSGIRPKQPHMLQENTRMGMDNEESMMSYEGDGGEASHGLEDSNIR	445418	522731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_445480_446148_446230_467264_467415_467598_467719_467997_468174_468888_469068_470546_470761_471240_471407_472561_472774_476209_476319_476539_476639_477347_477526_503619_503688_504882_505006_505917_506011_506092_506178_516764_516833_517072_517190_520497_520624_521768_521926_522551
917099	contig_10456_pilon	-	6175	7	Intergenic	novelGene_163455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGAAAGAATAGATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52800	12072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_12153_33547_33682_36291_36497_37104_37244_42729_42872_46718_49063_49669
917100	contig_14536_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_69302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	224	526	123094	122792	NA	70	ATGCAAAAAAAAAATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKKQLSGHSNPSKAKREHKALFLDKEIKILDLLKSDMLLAGVGCEVDKNKSIIHTVKQKEAEIHGSVNAPPTMAKMVFLVPDKVFAKTEKALSVKCKH	123317	122516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_122500_123300
917101	contig_10765_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_122950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	202	309	331514	331407	NA	75	CAGGCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQYIDRELPEIQARFRGGPGTRDITADVRGILAESREYQKDVSLCFIDYAKAFDCVYHNKLWITLLRMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVRTEQGDTAWFKVR	331715	329374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_329400_331700
917102	contig_10734_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_51127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAAAAAAAAGATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746457	744677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_744700_746500
917103	contig_3382_pilon	+	3265	13	Intergenic	novelGene_124163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_12	212.44587546008	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2613	354	2966	951880	987641	FALSE	5	TCCCAGCTCCTGGTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRRALPSHRRDVGYRGRSKSRDRVFQGHQEFFPPANASCQRSCTSSPDVTSSRPPLDDDVIVEDLNHRLTHLGSQDSSPPSPVSPKATSFAGTGQMGANHRFSENNSQEGLYRNQGNIRPVSDSTPASNRKEPTSWVNGQGTGRESLFSQGPPTAFPRKSTSVLSSDCVDIKGESRYREIQHFSLFNSTVDGTATDPSSTRSSGYKTTASRQREESLQRKQDTGTFHGNRQVTGEIADADPGVGFVNDLTFPKTYQAARYVHNALNDSVKVMDETTDGEKTGAIGFSLRVAAKEDKDVFPSGSQSLRSQCFPTPGETMAPAEVSSPSTVSPSPSHRAAAYGIGSHSSAHISVTPATGFTTRRTQESALYTLSDVTSTASSKIDDGSEEICLDYLGNGCQLKKCGKVHFHLPYRWQILVANTWMDLQPMERIEEAYCDPNNCVISIGSHNINFQEMSCDFNPIRRLSTPSSRTKLVTSVFATKWIWYWRDKSGDWIQYGEKKDNQQISNINSSYIESLFLSCPRGIVQFKAGSEEYELSFQGMIQTNTASKTQKDVARRPQFVSSRGVEELLKGAGCEPAPSPSVTSNVPPLDHPSLPLNGYKLSIIGDQLPEYTTISESFKASMKNFKIEKIKKIHNPKLLDAFQRKKSKMKNPNERILFSAANRSHVDSICAYNFDWTLHGTHDTRYGRGNYFTKEAIYSHKNCLCDDKNIVMFVARVLVGDFTEGNMTYTHPPRRFCDPETRYDSCVDTRLNPSVFIIFQKDQMYPEYVIEYTETDKACVIS	931528	987940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958020_959116_959551_959648_962492_962617_965242_965418_967481_967603_971870_971974_978965_979048_981257_981389_981763_981898_987357
917104	contig_16322_pilon	-	1189	4	Intergenic	novelGene_87503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	644.680282517363	59	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCAATTTATTGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57689	31692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_57465
917105	contig_15244_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_118067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATACTACATTTTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706264	704342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_704300_706300
917106	contig_5696_pilon	-	1349	2	Intergenic	novelGene_117513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTATCATTCTCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345006	341350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_341696_344002
917107	contig_16098_pilon	-	933	6	Intergenic	novelGene_45947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1779.96871882626	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	470	808	349190	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	350276	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349493_349604_349647_349990_350076_350236
917108	contig_17796_pilon	-	2234	1	Intergenic	novelGene_33779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAAAGAATATTGACACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33260	31026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_31000_33300
917109	contig_1275_pilon	-	2629	18	Intergenic	novelGene_108763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	582.204455223129	2	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1485	1144	2628	464550	400578	FALSE	15	TGAATTCTGTTCTCGATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAE	546950	400576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870_456934_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464672_471140_471188_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
917110	contig_4125_pilon	-	2552	6	Intergenic	novelGene_25247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	115.044339278384	54	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCAGTGAGTCCTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2997322	2983464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2985474_2985667_2985758_2986075_2986179_2986975_2987092_2987887_2988043_2997243
917111	contig_1450_pilon	+	2088	2	Intergenic	novelGene_27415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1772	junction_1	0	2	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	141	1157	419840	423253	FALSE	25	ATTTCCTGTAGAAGTAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419699	424184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293
917112	contig_11328_pilon	-	3140	2	Intergenic	novelGene_88377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTAAAAAATGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586255	581861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_582145_583398
917113	contig_12923_pilon	-	2262	16	Intergenic	novelGene_30192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	59.3155029388514	3	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1254	1985	527836	511076	FALSE	30	ATTTCTACATGTACAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585703	510798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_533635_533746_535158_535254_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
917114	contig_3956_pilon	+	1742	8	Intergenic	novelGene_15031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1241.05838636518	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	81	845	1281682	1289629	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPGAASMPVC	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284808_1289599_1289677_1289758_1289892_1290297
917115	contig_20141_pilon	+	2225	10	Intergenic	novelGene_173468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	23	junction_9	19.3333333333333	74	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	405	1421	15621	39691	FALSE	35	CAAACCCATTGCCGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYLSEDPLGKILASIYLPKSLRERLHLNNLQTILFNFFGQTSLFKIKNFTKALTTYVVSASISDTSIQNLADPVVITLHHIEGSPNYGQVHCAFWDFGKNNGLGGWNSSGCKVNETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDTVNERILVLITYAGCGISSIFLGIAIVTYIVFHKLRKDYPSKILINLCTALLMLNMMFLVNSWSASFQKVGLCITAAVALHYFLLVSLTWMGLEAVHMYFALVKVFNIYIPNYILKFCLVGWGIPAVMVAIILSVKKDLYGTLSSGTPFCWIKDDSIFYISVVAYFCLIFITNLFMFCAVIVQLNSVKAHSQKTRRKMILHDLKGITSLTFLLGLTWGFAFFAWGPVRILFLYLFAIFNTLQGFLIFVFHCAMKENVREQWQIHLCCKWFRLDNSSDGFDEDPLSCEVVANCGRSILPVEIKMNSIHEQRFLQYFPAEIPSPLPDWGKF	6934	40495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20141_pilon_+_7072_12034_12155_13309_13356_15519_15624_18320_18443_22450_22720_26749_26829_29201_29483_35827_35930_39530
917116	contig_15327_pilon	+	987	2	Intergenic	novelGene_70665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGACAGAATCCCGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900429	901536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_901281_901400
917117	contig_12786_pilon	-	2455	2	Intergenic	novelGene_103385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCACAGATAAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590412	585847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_587215_589324
917118	contig_2341_pilon	-	3463	1	Intergenic	novelGene_84352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCTGAGGCAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56945	53482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_53500_56900
917119	SIRV7	-	1886	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-22	-87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGTTCCGGGAGAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	1092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2171_2292_2676_2993_3112_43028_43078_114680
917120	contig_10258_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_155045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2	409	71642	72049	NA	30	CCCAGCAATGATGGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWKQEGLVVRKYSLGDRNGAGDRIIEFCKTKDFFIADTFFQHRWRLCTWTLPDGIHRNQIDYICGKRQWKSTISSVRTRLEADCGTDHQLLICRFKLKLKKIRANPPEPKYDLEYIPPEFRDHLKNKFDTLNTND	71640	74107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_71600_74100
917121	contig_9955_pilon	-	2983	4	Intergenic	novelGene_21302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	768.801809455611	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	208	885	49317	46990	FALSE	25	TAAATTATTTTGGTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEKS	49837	44891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46999_47590_47737_48794_49380_49692
917122	contig_10500_pilon	-	3615	8	Intergenic	novelGene_41276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	6	101	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	189	1097	1640040	1629460	TRUE	85	CAAAAGAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640228	1626847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
917123	contig_7056_pilon	-	3302	5	Intergenic	novelGene_43654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1532	junction_3	827.757210781036	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1396	1707	725582	725118	TRUE	80	TAAGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	727057	722483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_725319_725471_725734_725813
917124	contig_19850_pilon	-	1690	11	Intergenic	novelGene_170850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	92.3144625722319	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	751	1689	32225	3450	FALSE	25	TAGGTTCTATACATTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKEVDTDCSALQEVEDLCRLHCLSIAFLLRLPLSQRAQTRVITSHWIQNIQTFLKMKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTSH	39577	3448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_32120_32463_37650_37836_38256_38447_39010_39081_39509
917125	contig_408_pilon	-	4722	1	Intergenic	novelGene_84924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCAAAAAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158482	153760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_153800_158500
917126	contig_17108_pilon	+	3142	1	Intergenic	novelGene_109556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAGAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445847	448989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_445800_449000
917127	contig_2036_pilon	-	2314	3	Intergenic	novelGene_131834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	691	junction_2	144.5	26	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1512	2057	636612	616864	FALSE	20	TTGTGTACTGTAAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINTYVFVGNQLIPQPLDSEEDEKMEEDNKQEEEKDHREAMKPEEPPQNLLREKIMKLPLPESLKAYLTYFREK	638123	616606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631747_631872_636558
917129	contig_9373_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_162726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258398	260170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_258400_260200
917130	contig_11338_pilon	-	1898	13	Intergenic	novelGene_6365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	281.924586054892	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	209	784	319426	306858	TRUE	20	CTAGAGTTGATTCAGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTSLSPDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFSSLRET	323314	294817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306879_315157_315304_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321473_323269
917131	contig_6589_pilon	+	425	3	Intergenic	novelGene_25680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	12	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	26	298	70965	72115	FALSE	10	GCTCCTCCCCCTGCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPRNSNTMAAAALAAPSLGFDRVIGVLVADLSLPNMHVVDVELSGPPGPTGRSFAVHTRRENPAEPGAVTGSATLTAFWRSLLGCCQLPSKPGIHLC	70939	72242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_71039_71113_71269_72071
917132	contig_10500_pilon	+	2326	2	Intergenic	novelGene_41191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCACCCAAAGAATCTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1371760	1374286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1372613_1372812
917133	scaffold_12510_pilon	-	1411	5	Intergenic	novelGene_151398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAAAGTATAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412237	408175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_409161_409887_410019_410602_410751_411613_411678_412154
917134	contig_10002_pilon	-	3900	1	Intergenic	novelGene_157656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	3098	3550	330827	330375	NA	65	ACAATAAAGTTAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLEARARAVKQDKEIKGIQVSKDEVKLSLFTDDTILYIENPKESPRKLLELIGDFSKVAGYKINIQKSVGFLFTNKDNFEKEIGRSIPIIKAFRKIKCLGINLTRDIKDLYKENYKTLLSETKRDLHKWKNIPKFNFTRKEQTYLSGSN	333924	330024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_-_330000_333900
917135	contig_11476_pilon	+	2485	1	Intergenic	novelGene_170497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCAGAAGAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986	3471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_+_1000_3500
917136	contig_10482_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_152851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTATTCTGGAAAACGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188947	187727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_187700_188900
917137	contig_2768_pilon	-	1844	1	Intergenic	novelGene_57497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2710	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACTCACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708795	706951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_707000_708800
917138	contig_2414_pilon	+	2742	1	Intergenic	novelGene_158459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	106	540	157643	158077	NA	65	TATCAGTGAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPIVPATVSVHLIEGLSLFCWPCTLPSVMSFARDGSLLTACPKYVRCSLAILASKEHSGCTSSKTDLFILLAVHGIFNILLQHHNSKVSVLLRSSLFIVQLSCAYEAIENTMAWVRRTVVFKVIFAFQPFKEVFCSRFAQFS	157537	160279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_157500_160300
917139	contig_5602_pilon	-	673	2	Intergenic	novelGene_132985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGCGACCGGGCGGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416	21	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_117_838
917140	contig_3004_pilon	+	5426	9	Intergenic	novelGene_127481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_7	203.059066222122	45	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	212	991	277854	281328	TRUE	15	TGTAGTTTTGGCTCGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSPNNTVTSNLATSVEIEDQSDNSESSGSSLFKTQRVPSSPKRREENPLRTFVHSPKSVQARDSSSDSYVEPRPLTLKAVFERFKERKRKKKRKYKPTGRPRGRPKGSKNTKSSQIDKKQFQVKGPGFLFLESENERNPLPWKKILTFEQAVARGFFNYIEKLKYEYHLKESLKQMNVGEDLEKEDLDSRRYKYLDDDGSISPVEESTAEDTTHLEHSDECDIRLVEDNYFIISCELPKKRKVNLDEENGEGTALFRK	275421	287263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_275551_277771_277919_278897_279283_279693_279870_280776_280832_281229_281610_282582_286451_286738_286875_287113
917141	contig_10129_pilon	-	5863	3	Intergenic	novelGene_128156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	28.5	678	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCATATTCATTTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514006	502770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_506713_511903_513572_513753
917142	contig_16126_pilon	+	4499	4	Intergenic	novelGene_141869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_3	133.687030867703	121	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	1325	3244	25914	38059	FALSE	25	AAGCACAGTACTCTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQLPICKLKELFEENKKLQQFSPLSDYEGQEEEMNGTKMKFRKRNNSRSEIITSGKQKSSHSLDYDKDRVKELINLIQCRKKNVSGDSDTEDMRSKTVLKRKLEDLPENMRKLAKTSGLSENCHLYEESPQPVGSLISALGHDADLRRQQQDPSNSGVADIHSLFNWLSETLANARHSDASLTDTVNKALGLSTDDAYEELRQKHEYELNSTQDKKEYEQPTCAKIENVHFKGTQSPLLEVDTSSLKYPVGASTSEGGTDLKLHLKEDPNLISVNNFEDCSLCPTVPIEHGFRRQQSKSNDVEETEIHWKLIPITGMKSPEEQLVCVPPQEAFPHDPRVISRQRSSDYQFPSSPFTDTLKGTTEDDVLTGQVVAEEQCVPAAEPPALSETTERTVLGEYNLFSRKIEEILKQKNVSYVTRIPTPIFSTQEKMKRLSEFIYSKTSKAGVQEFVDGLHEKLNTIIIKASAKGGNLPPVNPNDSGAKMASTAVGRHAVPVSSGDFSGNCLPESLCSDAFKDTNSHEPHSSSAVGLTDVEMSQPHHAAELMVTSDHTVPGDAAREPVEKETKSPSDVNMSAQPALSNFISQLEPEVFNSLVKIMKDVQKNTVKFYIHEEEENMLCKEIKVTTREGGSNAASA	24589	39314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_26299_30660_31080_32275_32421_37088
917143	contig_20641_pilon	+	1428	5	Intergenic	novelGene_52849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	1578.21027987401	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	523	1119	54874	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14548	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_45848_45965_54835_54968_56379
917144	contig_4654_pilon	-	3327	8	Intergenic	novelGene_103086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	829.989574559555	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	160	480	500418	499009	TRUE	20	ACTAGATTTGTGTATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDKSELVQKAKLAEQAERYDDMAAAMKAVTEQGHELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVISSIEQKTERNEKKQQMGRQYRERIEAELQDICNDVLVHLVFR	515949	492661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_493455_493523_494533_494873_494970_496408_497031_497816_497941_498805_499030_500118_500422_515793
917145	contig_312_pilon	+	716	8	Intergenic	novelGene_128322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_7	57.6353774577202	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	125	715	572892	588856	FALSE	30	TAAGCATACGTTGATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVSSLNEVKIYSLSCGKSLPEWLSDRKKRALQKKDVDVRRRIELIQDFEMPTVCTTIKVSKDGQYILATGTYKPRVRCYDTYQLSLKFERCLDSEVVTFEILSDDYSKIVFLHNDRYIEFHSQQGFYYKTRIPKFGRDFSYHYPSCDLYFVGASSEVYRLNLEQGRYLNPLQTDAAENNVCDINSVHGLFATGTVE	572767	588857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_312_pilon_+_572958_575400_575447_577846_577946_582291_582370_583777_583816_585377_585515_587220_587287_588795
917146	contig_15236_pilon	+	5203	3	Intergenic	novelGene_141657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	122	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	898	1320	711134	711556	TRUE	65	GTACAATTAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTESSTARWCLATTTNCSEKDHNRGSQIELEKNVELLTRKTNKQTNKKKNQTYWSDRDWRNPQSMAPGHPYSSVIKSLLRFTLQPKIRLNEIKWAHQPRGKDEKAVRDRKAGNGEPKVEKGREMTCHGVGN	710236	715829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_713941_714245_715246_715330
917147	contig_11986_pilon	+	3429	7	Intergenic	novelGene_69099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	502	864	50857	57408	TRUE	10	GCCCTGGGCACTCCCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGHPQPTLVHVHLLFQQSAHGLIEIHVVTLQGLFSWFSLEAHVGELFDEPRQDPGFILLAGRLHALWKSFFGGIAPGAAGGGAVLGSSVIPHVSFFIFPLTGAEVHFIPTAAPAFLHRF	48561	76112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_48972_50765_50915_51980_52044_53492_53569_57242_57411_58893_59110_73765
917148	contig_8576_pilon	+	939	2	Intergenic	novelGene_88825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	114	356	1018999	1019241	FALSE	20	AACAGATTTGGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLLLRSTLAVLLPRQTCSFFWQSKGASRRTVSSRARMSSKKLMWREEPAEGTGQPPPPVSGDFLLARCLQNPLGFRKTGLPSFFLEELFPSAASQQRYTDSSGFSLFLLCLVPVMG	1017085	1019824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_1017163_1018962
917151	contig_15434_pilon	-	4724	2	Intergenic	novelGene_56720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1597	1896	81099	80800	FALSE	45	TAAGCAACACTCAGGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRPPEHSCLPASPFTPELIRPEGLRLLSGQVWQLLAASERSLPPPATTSSSSTLPLMFRAPRLPYIIDSLVFSGLCYKSTHRRRLTTPPSWPCFLAS	82873	77971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_82437_82614
917152	contig_4783_pilon	-	4695	1	Intergenic	novelGene_108423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1000	1341	421388	421047	NA	25	AGTCCCAGCAATGTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDTEPNPSKGQNLGSNSTCSLKNLSLSDQQFPPQTSFQGPSTLVQLYYGGLMCAKGAVNGFHRICLARPPCGSPLGSGVSNILYLLPPLWTDGCIDSALGSLCPGCPSHPFC	422387	417692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_417700_422400
917153	contig_9706_pilon	+	2569	2	Intergenic	novelGene_20910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102635	105923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_104359_105077
917154	contig_5451_pilon	+	3500	2	Intergenic	novelGene_167163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	893	1591	199695	200393	TRUE	80	TTAAAAAAAAAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRFETMEDRISEIENKHLATTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIRVPKQREKTENTERITEELLTEYFPNIMKVEKLTIQEAQRTPYRIDHKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSLDYLAETMQARRQWDDTYKTLKEKNCQPKIIYPAKLSFIYDGEIRSFPDKQKLRDYVKTKPNLQDLLKGVLRSENKQQGTTG	198802	202420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_202055_202172
917155	contig_4364_pilon	+	988	5	Intergenic	novelGene_690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	10685.6461520818	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	927	61	987	1530895	1532285	FALSE	35	CCGACAGGATGCAGAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGI	1530464	1532286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160
917156	contig_205_pilon	-	1762	1	Intergenic	novelGene_144327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	919	1260	340356	340015	NA	30	AATCTAATGGGAGCAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICPHRPPSQSSNSFPLDKAPSPGQPQRVLQESNGGLMDHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELQKDVEQNSNSQKKTRFTGLKETGETPRVWPPDTLLTQ	341274	339512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_205_pilon_-_339500_341300
917157	contig_11986_pilon	-	1878	2	Intergenic	novelGene_69124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	514	1344	127303	126473	FALSE	50	AGACATGGAGTAGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFDCVDHKKLWITLQRIEIPEHLIVLMRNLYIDKEAVVRTEQRESAWFEIKKGVRKGCILLPYLFDLYAEQIIREAGLYDEECGIRISGRLINNLRYADDSDFLAERGLEALTDEDQRLQPSVWITPQHKENRNSHNWTNKQHHDKWRKVTRFQDFILLGSTINTHGSSSQEIKQHIALGKSAAKDLFQVLKSKDVSLRTKVFLTQAMVFSVASYACESWTMNKEDQRRINAFELWCWQRILNIQWTARRTNKSVLEEVQPKCFLEARMVRLHLK	169474	125938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_127590_169247
917158	contig_7359_pilon	+	4038	2	Intergenic	novelGene_139838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGTTTATATTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16118	21523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_19044_20410
917159	contig_6576_pilon	+	2823	1	Intergenic	novelGene_42342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2466	2807	686975	687316	NA	20	TTTGTTTCCTCTCAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYPYFLSYAIHSTQSAEWMVFRLLPWIVLHNFPLNVGVRQSSSLCAFFSHGTYCFFVILLIPMGSHLMYMPFTAILTSSGMIFLLGIILIVPTTSWHLQHLKVNTPKTEQTH	684509	687332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_684500_687300
917160	contig_15866_pilon	-	2384	10	Intergenic	novelGene_63613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403130	373357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_374534_376728_376863_378938_379033_381903_382089_382343_382429_386494_386613_386774_386841_388044_388170_389788_390016_402956
917162	contig_21412_pilon	+	2514	2	Intergenic	novelGene_142852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGGCAACAGTCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24950	27519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_+_25282_25336
917163	contig_6735_pilon	-	1463	9	Intergenic	novelGene_15697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	735.107135049035	63	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	80	568	564868	543218	TRUE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHPQDSGCPPSGGRADL	568277	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543266_551192_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
917164	contig_16622_pilon	-	2152	7	Intergenic	novelGene_48463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	19	junction_1	1436.8080846871	485	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	716	1150	115540	113120	TRUE	25	GGATTTCATGTCAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	121955	111850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112973_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_121330
917166	contig_14060_pilon	+	6651	1	Intergenic	novelGene_156048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCTAATGAAGCATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36364	43015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_+_36400_43000
917167	contig_12391_pilon	+	1134	1	Intergenic	novelGene_103610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAAAAACCTGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86717	87851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_86700_87900
917168	contig_10197_pilon	-	2978	9	Intergenic	novelGene_115314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	21	junction_2	73.0530629063559	158	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	65	1393	1663461	1531758	FALSE	20	CATACCGTACCCCTTGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCFSEECRSVIQEQAAALGLAMFSLLVQRCTYLLKESAKAQLSSPEDEDDQDDIKVSSFVPDLKELLPSVKVWSDWMLGYPDTWNPPPTSLDLPSQLAVDVWSTLADFCNILTAVNQSEVPLYKDPDDDLTLLILEEDRLLSGFVPLLVAPQDPCYVEKTSDKVIAADCKRVTVLKYFLEALCGQEEPLLAFKGGKYVSVAPVPDTMGKEVGSQEGKQLEDEEEDVVIEDFEEDSEAGGSGGEDDIRELRAKKLALARKIAEQQRRQEKIQAVLEDQSQMRQMELEIRPLFLVPDTNGFIDHLASLARLLESRKYILVVPLIVINELDGLAKGQETDHRAGGYARVVQEKARKSIEFLERRFESRDSCLRALTSRGNELESIAFRSEDITGQLGNNDDLILSCCLHYCKDKAKDFMPTNKEEPIRLLREVVLLTDDRNLRVKALTRNVPVRDIPAFLTWAQVG	1663525	1530172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1531889_1535155_1535238_1535547_1535760_1538734_1538889_1548101_1548249_1552068_1552246_1649819_1650022_1661607_1661777_1663406
917169	contig_11932_pilon	+	3554	2	Intergenic	novelGene_85430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	985	1377	470545	470937	FALSE	40	AATTTTTTAAAAACCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHILCIHSSVDGHLGYFYLLAVVNSAAVNIGVKVSFRASAFKSFGHIPRSGIAGSCGSSIFSFLKNHSTVFYSGCTILHSHQQWIRVPVSPHPHQHLFIFCPFFFFFILAILVGVKWYLISLMHLSDGY	469440	473114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_+_469901_470020
917170	contig_5585_pilon	-	2027	15	Intergenic	novelGene_143063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	44.0869386923758	15	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	31	1791	497822	364508	FALSE	15	ATCTGGTGTGTACTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLPVRAPNLTMQCTQIQINHHYVGLWFGHDFHPQFPSFAACSKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTLQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASFWKNKDVQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYSMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWVIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLILTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSNVPFYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQTKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFLELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSNLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPTQSHRMDLMIDCQPPAMSYHRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPIEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHVLQPPPRPTQPTSGKKRKRVSDDIPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKLSGEATSEVHRSAWEWTAP	497852	364271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_364568_392713_392852_394330_394430_402731_402900_405339_405465_408483_408656_413431_413493_418029_418211_420188_420301_432969_433105_434073_434195_457587_457675_459577_459718_462996_463060_497723
917171	contig_11932_pilon	-	3676	1	Intergenic	novelGene_85429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	841	1371	472274	471744	NA	25	TATTCCCACCACACTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHICSQCWKERKHTKKRQSFHEKSERETIPFTIAYKKIKYLGINITRDEEVLCNENYKTPLKEIKEDLNKWKDVPCSWTGRLNIIKMSILPKTIYRFNTMPIKIPTASFTETEKPILSFIWNVKGPQIAKAMLKEKNKGRGHTLSDFKTYYSIFTQIMCAFYVCLATVPYHCEVFS	473114	469438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11932_pilon_-_469400_473100
917172	contig_17470_pilon	-	2215	6	Intergenic	novelGene_110461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20641	13833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_15228_16240_16373_17294_17394_18886_18976_19689_19753_20203
917173	contig_1443_pilon	-	2557	2	Intergenic	novelGene_28160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATCTGAAAGAGGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319376	316729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_318345_318434
917174	contig_9099_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_149915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389080	391006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_389100_391000
917175	contig_12622_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_5843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCACTAGATGACTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463797	461506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_461500_463800
917176	contig_12312_pilon	+	2147	21	Intergenic	novelGene_63998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	81.0693992823433	3	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	1017	1934	506925	533697	TRUE	70	TAAGAAAAGAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKAAPLRTGNGSSMPEGRSSRDRTAPSAGMQPQPSLCSSAMRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476913	534353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_501256_502315_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506321_506800_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_529242_529357_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
917177	contig_14513_pilon	-	1981	4	Intergenic	novelGene_70318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	51	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	193	531	18880	12738	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSGTPFIPVTYVSNGWGKHGIKFFLNFFSAFSSW	19072	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12836_13087_13136_14952_15001_18735
917178	contig_13067_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_141348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAACAAAATTAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56569	57485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_+_56600_57500
917179	contig_11548_pilon	+	1637	5	Intergenic	novelGene_66767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1502.49581946174	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	242	799	112832	119638	FALSE	25	AACCATTACGCTGTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112590	120476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_119008_119121_119346_119402_119491
917180	contig_14208_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_129107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTATTTCTTACTGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298634	297252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_297300_298600
917181	contig_533_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_174257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCACCAGGCCTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130862	129450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_533_pilon_-_129400_130900
917182	contig_9653_pilon	-	3009	1	Intergenic	novelGene_48347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACAAAATCAACAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110147	1107138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1107100_1110100
917183	contig_15039_pilon	-	1934	1	Intergenic	novelGene_110188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATTCATGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363589	361655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_361700_363600
917184	contig_10482_pilon	+	2227	7	Intergenic	novelGene_152829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1283.77472928686	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	25	561	116203	123281	TRUE	40	GGTTATAAAAACCTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	116178	127578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_116251_117254_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942
917185	contig_9668_pilon	-	3098	5	Intergenic	novelGene_58083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAAGCCTATTTCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223803	110530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_110539_141861_142102_142282_142634_142813_143209_221699
917186	contig_10990_pilon	+	3408	3	Intergenic	novelGene_7425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	121	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCCAGGGAACACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670556	674868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_670770_671344_672584_672912
917187	contig_408_pilon	-	3146	2	Intergenic	novelGene_84926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161403	155605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_156909_159560
917188	contig_7426_pilon	+	3968	8	Intergenic	novelGene_27495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_4	26.8905567219484	492	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	755	1813	917183	929690	FALSE	15	GCAAGTGGCTTTTGGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYMNRGDRWIQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGSLKDFPVKQLLGPDFGYVTREPLFEPVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKVYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVCDFLQAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMTFVPIPGTKQFRMLMASTSACYRLFREKQKEGHGEAIMFKGLGGMSSKRITISKILSNESLMQENQYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEGHQARAFFPNMVNMIVLNKDLGIPKPFGPQVEDVCCLETHVRSLLEPLGLCCTFIDDISAYHRFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP	916428	931845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_917294_918331_918440_921076_921229_921896_922042_923041_923136_925202_925289_927695_927825_929456
917189	scaffold_880_pilon	+	4529	8	Intergenic	novelGene_121507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	679.861510507388	7	136	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	221	601	564006	569258	TRUE	75	GTAAAAAAAAAAAACCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGDLDEQEFVYKEPAITKLPEISHRLEGFYGQCFGAEFVEVIKDSTPVDKTRLDPNKAYIQITFVEPYFDEYEMKDRVTYFEKSFNLRRFMYTTPFTLEGRPRGELQEQHQRNTVLTTMHAFPYIKTRVTVIQKEEFVLTPIEVAIEDMKKKTLQLAVAINQEPPRPKDAADGAPRLRGSNCKPGTAGSGPSVPGRNSS	557527	579535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_557610_559501_559592_563957_564195_567763_567909_569211_569319_575187_575250_575292_575355_575791
917190	contig_6028_pilon	-	2054	3	Intergenic	novelGene_156579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	145	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTCCAGTATTTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314040	309393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427
917191	contig_5020_pilon	+	2821	7	Intergenic	novelGene_27838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	1016.8760030385	17	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	1191	2135	121762	124469	TRUE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGVYQAFPFPHLPPPSSIPCSHIGSPSYRDLSQCCS	118462	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124547_124909_125091_125657
917192	contig_1734_pilon	-	2643	2	Intergenic	novelGene_164370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGTTGTTTTGTCTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536200	448071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_-_449987_535472
917193	contig_2798_pilon	-	2123	4	Intergenic	novelGene_120026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	743.779985389945	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	223	876	116665	115914	FALSE	60	TTAAAATATGAAATAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDSLGLPGLHHRVDGAEDTPLLAISPGVLGPAEKPLFYRGHLYLLPSLSVL	170447	114666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116068_116165_116680_120452_120595_170381
917194	contig_12528_pilon	-	2527	6	Intergenic	novelGene_81344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_1	617.993980553209	64	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	544	1032	966228	955823	FALSE	65	TGAAGAAAAAGAACAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENVAIT	968154	954327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_955837_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
917195	contig_5690_pilon	+	1532	10	Intergenic	novelGene_119717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	466.289794912462	9	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	76	1050	1044729	1105490	FALSE	5	TTTCACGTGTTCGTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRRHLPAARSLPPPPPRHGPEPRRTMAAARHSTLDFTFGAKADGETILKGLQSIFQEQGMTESVHTWQDHGYLATYTNKNGSFANLRIYPHGLVLLDLQSYDNDVQGNKEIDSLVEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1044653	1105972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1044778_1073769_1073891_1077645_1077740_1086452_1086568_1087638_1087794_1088255_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
917197	contig_8355_pilon	-	2529	3	Intergenic	novelGene_177545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	161	343	37086	36904	TRUE	25	GCCTGTGAGCAGCCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQFVILWWLACYCDTGSFATGISNTKRVSLDGQTDWKEGPRSLLLKNLASENFMNSSGTLSDIVPEDEFRRLEGTQNTTGEDLPPQSRVNLNDVDGVKHSGPSFADVMCHDSK	37246	3752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8355_pilon_-_4836_5101_5262_35960
917198	contig_12021_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_172180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGCTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12447	10567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_10600_12400
917199	contig_11978_pilon	+	2272	2	Intergenic	novelGene_62850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	51	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	714	1400	569925	570611	FALSE	40	CATACACACAATGGAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLYTENPKESTRNLLELIERFSRVAGYKIKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYKYNAIPIQLPTTFLKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKEKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYDHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNK	564856	571483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_564923_569277
917200	contig_12402_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_133391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTCAGTGTGATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654074	652000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_652000_654100
917201	contig_7840_pilon	+	2846	11	Intergenic	novelGene_68993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	451.902478417634	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	17	1405	238014	304152	TRUE	30	AAGATTTGCTCACGAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVKIKMNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQANGTDSAFHVLAAKPAHTALAPVAMPVRETNPWANAPDAANKEIAAIYSESITGFGDMWTCPWEGRTLPPAMAGLQKGLSGVNLLVLPLQVCSRLVTDALPLRLTAG	237997	306104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_303007_303155_303412_303496_304059_304306_304816
917202	contig_19342_pilon	+	1476	7	Intergenic	novelGene_41060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13138237134266	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	29	889	3263	6183	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPVSDAGPGRRSRKAYLEGTCVEWLRRHLENWKEMLQGTEAIMRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3234	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3925_4285_4365_5061_5293_5413_5522_5960_5994_6139
917203	contig_2209_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_141010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAGTATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149844	148591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_148600_149800
917205	contig_4469_pilon	+	4400	22	Intergenic	novelGene_21896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	117.443246292723	37	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1057	3174	55	3228	400809	440976	FALSE	25	AGGTATGGGCAGCTCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKNREPRFLDYLSDLCVSMNKSIPVTQELICKAVLNPTNADILIETKLVLSRFEFEGVSTGENALEAGEDEEEVWLFWRDSNKEIRSKSVRELAQDAKEGQKEDRDVLSYYRYQLNLFARMCLDRQYLAINEISGQLDVDLILRCMSDENLPYDLRASFCRLMLHMHVDRDPQEQVTPVKYARLWSEIPSEIAIDDYDSSGTSKDEIKERFAQTMEFVEEYLRDVVCQRFPFSDKEKNKLTFEVVNLARNLIYFGFYNFSDLLRLTKILLAILDCVHVTTIFPISKMAKGEESKGSNVMRSIHGVGELMTQVVLRGGGFLPMAPMAAAPEGNVKQAEPEKEDIMVMDTKLKIIEILQFILNVRLDYRISCLLCIFKREFDESNSQTSETSSGSSSQEGPSNVPGALDFEHIEEQAEGIFGGSEENTPLDLDDHGGRTFLRVLLHLTMHDYPPLVSGALQLLFRHFSQRQEVLQAFKQVQLLVTSQDVDNYKQIKQDLDQLRSIVEKSELWVYKGQGPDEVMNGASGGNEHKKTEGNNKSQKHESTSSYNYRVVKEILIRLSKLCVQESASVRKSRKQQQRLLRNMGAHAVVLELLQIPYEKAEDTKMQEIMRLAHEFLQNFCAGNQQNQALLHKHINLFLNPGILEAVTMQHIFMNNFQLCSEINERVVQHFVHCIETHGRNVQYIKFLQTIVKAEGKFIKKCQDMVMAELVNSGEDVLVFYNDRASFQTLIQMMRSERDRMDENSPLMYHIHLVELLAVCTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHEDCIPEVKIAYINFLNHCYVDTEVEMKEIYTSNHMWKLFENFLVDICRACNNTSDRKHADSILEKYVTEIVMSIVTTFFSSPFSDQSTTLQTRQPVFVQLLQGVFRVYHCNWLMPSQKASVESCIRVLSDVAKSRAIAIPVDLDSQVNNLFLKSHNIVQKTAMNWRLSVRNAARRDSVLAASRDYRNIIERLQDIVSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENTDARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEENEEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGEKVLLFIFK	399341	442148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_399362_400774_400895_401959_402155_404826_405079_405898_406041_406849_407004_408863_409052_409966_410106_410774_410830_413608_413775_413850_414022_414727_414791_415614_415753_417867_417994_421055_421257_423552_423805_426386_426513_428316_428446_432995_433117_435295_435481_439771_439921_440840
917206	contig_5676_pilon	+	1477	2	Intergenic	novelGene_159095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1	357	737468	737824	TRUE	20	GGATGGCTCCAATAGGCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQVAWIPCTRVGGSLGAVCWLLVLLFLLLLVSHLPLAASPSFCSGAWLRAPSLPFPVELWGCVRVCGCFQVWAAARTRIQGLCSFAPLLPGAAGSGPGAAGCLDSVRPGGRLFGCRL	737467	738998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_738070_738123
917207	contig_16622_pilon	-	2417	13	Intergenic	novelGene_48462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	659	junction_6	934.955509933791	209	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	306	1583	128619	112684	FALSE	25	GATTTCATGTCAATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISPDPRPSLGLAQWAESYEAKCERRQETRESRRCRHNVTTCRQVGKTLRAQQRQQLKRARQQQFFRRRNLQVEEKGTAQSSQAREQGPSRRSQASDLNAPSSWAKRSSSPIQQVAGTSSEIITTQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	132419	111849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271_126420_128277_128679_132173
917208	contig_12402_pilon	-	2498	6	Intergenic	novelGene_133355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	24.8563875090489	26	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	318	887	500246	472119	FALSE	40	GGGGGATATAAATCAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVVEDVAVDLTQEEWALLDLAQRKLYIDVMLETFINLASVVSRNLNDGENLSSEYLIVQFTKNDSLFYKLEEISELHGIEDQHENQGRHMREHTEVNFCERNKGSKCGKTFSQTANLTVLKTTTPEVNTSEWHESGRTFMDHSTVEHHIRSRIGCDTYQSAVESVPSTATPCTTEQNTAWSCMFYV	502949	470507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_472202_477921_478128_479562_479714_483540_483668_500243_500494_502879
917209	contig_7612_pilon	-	2320	7	Intergenic	novelGene_170355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	79.9138424944153	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	546	1985	57595	35331	FALSE	20	AATTTTTGTATGGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVVFEDLAVDFTQEEWALLDFAQRKLYRDVMMETFRNLASIVSQQGNNERIILQFMKNDSWSSMLGEICEFHGIEDQHNNQRNPVRSHTIEIICESKEGNIKKTKENNQCGKPFSQIANLIRLKKTLARVYSSECHRCKETFVDHSLFNHHITYHTGCNTYQCKEYGVTCISSSYLRTHVETLTGEKLYKCKECGIVCSCSSSLITHTRTHSREKPYCKCKKFREDIGDVSALVKHKKTQSGKAFSSSFISKRLRTHSRERTCECKECGKVFSCSSSLRKHIRTHSGDRPYKCKECGKAFTRSSSLNTHTRTHSGERPYRCKECGKAFFYSSSFTTHMRIHSGEKPYECKQCGKSFCDISPLNRHIKTHSGERPYECKECGKAFNRSSHLTFHIRTHRGERPYECKECGKAFSWPSALTTHIRTHMGRGLMNVRNVGKSLFLLHPSLNIYELTMEMGLINVKNVGKPLVGPQPSLDI	61020	34995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_-_35489_35573_36593_37087_37221_38230_38358_57592_57823_57944_58028_60785
917210	contig_5084_pilon	-	3248	9	Intergenic	novelGene_64688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_8	41.6855790411984	102	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	344	1537	1838867	1822251	FALSE	5	CTTTTTGATGTGCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRGRDEPPESYPQRQDHELQALEAIYGADFQDLRPDACGRVKEPPEINLVLYPQGLAGEEVYVKVDLRVKCPPTYPDVVPDIELKNAKGLSNESVNLLKSRLEELAKKHCGEVMIFELAYHVQSFLSEHNKPPPKSFHEEMLERRAQEERQRLLEAKQKEEQEQREILHEIQRRKEEIKEEKKRKEMAKQERLEIASLSNQDHTPRKDPGGYRTAAILHAGSPDFVGNGKHRANSSGRSRRERQYSVCSSEDSPGSCEVLYFSGSSADQLVVHKGKRIGSDEQLGKSIYNALETTTGSFVLLYEWVLQWQKKMGPFLTSQEKEKIDKCKKQIQGAEAEFSSLVKLSHPNVVRYLAMNLREQDDSIMVDILVEHISGVSLATHLSHSGPVPTHQLRRYAAQLLAGLEYLHSNSVVHKVLSASSVLVDAQGTIKITDYSISKRLADICKEDVFEQTRVRFSDNALPYKTGKKGDVWRLGLLLLSLSQGQECEEYPVTIPRDLPADFQDFLKK	1873178	1820539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1822791_1823753_1823912_1827624_1827741_1834436_1834586_1836146_1836228_1838717_1838871_1849758_1849862_1852241_1852355_1873054
917211	contig_6361_pilon	+	2899	5	Intergenic	novelGene_23975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	179	523	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405181	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
917212	contig_7730_pilon	-	1634	11	Intergenic	novelGene_156263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGGAGCAGCTAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272195	68670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_68916_99552_99777_132370_132429_147811_147910_149018_149148_158222_158323_190132_190192_226508_226592_259243_259320_259575_259674_271731
917213	contig_15752_pilon	+	575	1	Intergenic	novelGene_148787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTACCTAACGCACCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363763	364338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_363800_364300
917214	contig_16860_pilon	+	1603	2	Intergenic	novelGene_155349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	0	97	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTTGTTAAAACCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146946	148868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16860_pilon_+_147021_147339
917215	contig_10766_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_151240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATATTAGCAGAAGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587288	585686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_585700_587300
917216	contig_1865_pilon	-	1786	2	Intergenic	novelGene_103240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCTCCTTCAGATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67479	59776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1865_pilon_-_59785_65701
917217	contig_14208_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_129097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGTAATTCACTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209315	211556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_209300_211600
917218	contig_8801_pilon	+	3944	3	Intergenic	novelGene_66266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	195	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1126	1482	384815	385171	FALSE	75	GACAAAGAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNVIVFTNRFNQVEERISRLEDRVVKITDGKEQQGPRLKKAEHSLMELWDSNKKPNTHILGIPEGDDREKGTEGIFEEIMTENFPNLTKDLNPQIQEAQRTPKLDKPKEIYTKTHYS	383159	387633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_383323_383518_383521_383854
917219	contig_11548_pilon	-	4129	6	Intergenic	novelGene_66789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_3	23.0390972045347	132	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	949	2850	198	3047	134265	123918	FALSE	25	ATCACTGAATGGTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVPAEEARQSQAISLCSLKLHDTQCEESNKASQIESVDLAITEKENSSVGPTHPVGQNNLTQVQQMQRYAEMPVVLNSHPGGKDRHLTLPGKVTEEIVQSENDKVLSSPENVQSCDAELNQPASAAKYRDDSKRSLEKLVKPGSPLQSVSIENRNLDLEHLMLETSEHSFSPRKIIENKPLADTLISTAASSGMSVSLEQPTSPKSIKKNLFSSDLKTNEGNYLQVKSLNSDTQACAHSDISKFGSSSDSATLTHCTRPINVETEFQTQEISVVKMANLLKNSETKAELHKETTDLGGTVFQSNTTYSQKGEQTIHMLQDMSTYETQDLLNGGFFPVYADSNQNTADTSENQEPSASFVPKSFDSSVCGVFKECMENKSTSKRLEAEDGSETLDRDVDVSVNSDIHYEPLSGDSDQDSCDCRNPKLDTEDSCTLSCSHTRKREDATKDDYESFMSVNSSDNEDWGYCNKVPGLETSIPPRNWSSGLKKEDKCVPCYIQIRDLHGIPRTYTNFTVTKEFKDTTRTLHSLRRHPSFTAKCGLISSWTSTWQIADDLTQNTLDLEYLRFAHKLKQLVKNGESQHSASSTNAFLTESPIQITVGAFPLTKISESPVVHPASRSRSPLLVTIVHSDPRQRSQHVRSHTPSYSDSSSFWKERCHSRYHLPNSEGNQTVSFHLNKLKYNSTLKESRNDISLILNEYAEFNKVMMNSNQVVFQDKELNVASGEATSQEMYSSFPRKPASYEDMITDLCANLHVKLESVMKEACKSTFLFYLVETEDKSFFVRTKNILRKGGHKEIEPQHFCQAFHRENDTLIVIIRNEDISSHLHQIPSLLKLKHFPSVIFAGIDSPEDVLDYTYQELFRTGGFVVSDDKILETLTLVQLKEIVKILEKLNGNGRWKWLLHYRENKKLKEDVRVDSVARKKNLIMKSFQSANIIELLHYHHCDSRSSTKAENLKCLLNLQIQHIDARFAVFLTDKPTVSREVFENSGILVTDVNNFIENIQKVAAPFRSSYW	134462	122835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_124037_124405_124588_127629_127736_128792_128947_129908_130035_132102
917220	contig_16964_pilon	-	2641	20	Intergenic	novelGene_143126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_18	15.7286547968175	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	823	2469	171	2639	208608	152918	FALSE	70	TATAAATGAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESNLNQDGAPRPSYVFSADPIERPSEINFDGIKLDLSHEFSLVASSAEVNSLESKDYLQVCLRIRPLTQLEKEHESEGCVCILDSQTVLLKDPQSIIGQSTEKSSGQMAQKFSFSKVFGPETTQKEFFQGCIEQLAKDLLKGQSRLIFTYGVTNSGKTYTIQGTEENIGILPRTLNVLFNSLREKLYTKMNLKPHRSREYLRLSPDQEKEEIACKNALLRQIKEVAMHNDSSDTLYGSLINSLNTPECEESVIDCEQASLNMDDNIKFSVWVSFFEIYNECIYDLFVPGSPKFQKRKMLRLSQDVKGYSFIKDLQWIQVSDSKEAYRLLKVGIKNQSVAFTKLNNASSRSHSIFTIRILQIEDSEMPRVLRVSELSLCDLAGSERSMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNSEKSKFQQHVPFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCCFAYDETLNVLKFSATAQRVFVPDTLNTSLGKSFAPVKSSQDTSLDINDLDNKTLNVKRTTISWESNLEDLAEDEDLTEDLEKAEENKNVGTEFTEEDLDQTLEEDKALISQEKRKLLDLIEDLKKKLINEKKEKLTLELKIREEVTQEFTQYLAQREADFKETLLQEREILEENAECRLAIFKDLVGKCNLQEEPTNEDPAMKVETEEAIACLELKFNQVKAELAKTKEELIKTQEKLKKRENESEINLNSLVQELENSNKDNTDASSLIIKNKLTCPEIVEVPEDSKTKTSSGRKRSNENELLQQDEPPAKKGPIYISSSISEYRKKSEDMQQSISKEKEDIRVLKKNNEELKTHLLIVENE	211821	152915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_153067_161815_161973_168859_168913_170403_170513_171620_171760_172030_172171_176809_177098_177656_177820_181125_181273_181354_181427_182336_182449_183426_183655_184133_184171_186622_186808_187732_187872_188347_188465_188560_188648_208461_208610_210743_210815_211723
917221	contig_13481_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_119300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACACTGAAATTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243495	246303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_243500_246300
917222	contig_11855_pilon	-	4792	2	Intergenic	novelGene_66916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1250	1600	811504	811154	TRUE	25	CCCTTGAATGAGCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEGVQNKTPDDLPVEEKALDLIDREFKSLIFRIIQGFKQKADKNEEKIDKFIEKADKFMEIQTINERIQENNTGTKCQNKFTSKKHTKTTIRNPKDKQQDFRNGQCHRRAKEQV	812753	807791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_809882_810051
917223	contig_211_pilon	-	1869	2	Intergenic	novelGene_129896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	268	831	588422	587859	TRUE	65	AAAAAAAAAAAGAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKNKYCMRPLL	588689	586674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_587113_587258
917224	contig_7748_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_101051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGATTGTGTCACCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150752	149908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_149900_150800
917225	contig_9386_pilon	-	3735	12	Intergenic	novelGene_175206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_3	30.7579190904856	147	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	18	2345	108639	85090	FALSE	20	TTTCCTTACTGTCAGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRFAMDLEQSRDLNNAIVHIDMDAFYAAVEMRDNPELRNKPIAVGSMSMLSTSNYHARRFGVRAAMPGFIAKRLCPQLIIVPPNFDKYRAVSKEVKEIFADYDPNFMAMSLDEAYLNVTKHLQERQNWPEDKRRYFIKTGNSAENDKPREEVNKLSERELSISPLLFEDSPPDLQPPGIPFQVNFEEQNNPQILQNSVVFGTSAEEVVKEIRFRIEQKTTLTASAGIAPNTMLAKVCSDKNKPNGQYQILPNRQAVMDFIKDLPIRKIPGIGKVTEKMLKALGIITCTDLYQQRALLSLLFSETSWHYFLHISLGLGSTHLERDGERKSMSVERTFSEISNAEEQYSLCRELCSELAQDLQKAGLKGRTVTIKLKNVNFEVKTRASTVSPVVSTAEEIFAVAKELLRTEIDADFPHPLRLRLMGVRISSFPNEEDKKHQQRSIIGFLQARNQALAATEHILEKTDKDQFTKPLEMSHKKSFFDKKRSEMKWKHQDTFKCETVNKQSLHTSQPFQVLKKKMDENLETSKNSDNCQIFTCPVCFREQESISLEAFNRHVDACLGGPSVSEDHAFSSEVNKEENVHHSLSFYEKQDSEAHQKNIEITSVDCVDLVETIGNLTKAESIDALSSKHSKEECSSLPSKAFNTECFHQNSSCTVPLENEDGISLSRQESPQPYLHEMITDQALVCPVCNLEQKTSDLSLFNMHVDVCLNKGVIQELRKDKVNPVSQPKESSGSTGSSGRVQKPVTKTRRPGLITKYSRSKKIKPNNSTHTLDLFFK	108656	83699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9386_pilon_-_85175_85399_85443_86007_86950_87990_88163_89461_89559_93451_93485_95788_95956_97044_97170_98397_98638_103188_103343_106560_106693_108501
917226	contig_10940_pilon	+	2547	1	Intergenic	novelGene_49184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCCAGCAGTTTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176741	179288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_176700_179300
917227	contig_8954_pilon	+	5594	1	Intergenic	novelGene_130265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAGAGAAAAAAATGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81513	87107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_81500_87100
917229	contig_5434_pilon	+	2579	1	Intergenic	novelGene_74696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAACCAATGTCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416353	418932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_416400_418900
917230	contig_10345_pilon	-	3028	1	Intergenic	novelGene_158386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACCCCTATGGAGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19593	16565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_16600_19600
917231	contig_16125_pilon	+	2012	1	Intergenic	novelGene_155284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTGATTTTCAGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172073	174085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_172100_174100
917232	contig_4469_pilon	-	1285	2	Intergenic	novelGene_21908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGTCTAGATTTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445077	443741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_444018_444068
917234	contig_9821_pilon	+	1455	3	Intergenic	novelGene_171906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCTGTCCATTCCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457234	627858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9821_pilon_+_457603_457749_458165_627186
917235	contig_5279_pilon	+	3828	13	Intergenic	novelGene_105571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	72.6052397099089	866	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	2323	3156	355236	391945	TRUE	30	CCATGGTTATGAAGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLKPLWCLRRRPRLGGFLAENLSSREVASGVSSPDSASPRALNIFDRDLKRKQKNWAAQQPEPMKYDYLKEEVGSRVADRVYDIARDFPLALDVGCGRGYIAQHLNKETVGKFFQADVAENALKNTIETEIPTLSVLADEEFLPFRENTFDLVVSSLSLHWVNDLPRALEQIHYVLKPDGVFIGAMFGGDTLYELRCALQLAETEREGGFSPHVSPFTAVSDLGHLLGRAGFNTLTVDTDEIQVNYPGMFELMEDLQEKKVQNVDLIFQNKLHIY	351694	395267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_353746_354964_355458_359419_359461_362129_362194_366354_366403_367738_367843_370230_370271_374032_374231_383262_383324_391889_391989_393733_393818_394395_394479_394805
917236	contig_7057_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_123389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCAGCTGCCTCCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204984	1206636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1205000_1206600
917237	contig_20646_pilon	+	2026	2	Intergenic	novelGene_145019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	257	793	27349	27885	TRUE	45	AAAAGATGACAGCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNITKSLNSKTLNCAHEEPVHRPRESFRQNKGILFFIRDHSLQYGLHLSIKNTKILTTGPVSNIMIKGEKIEVVKDFILLGSTINARGSSSQEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVYLTQAMVFSVASYVCESWTMNKEDRRRIDAFELWCRQRVLNIPWTARRMNKSVL	27092	29850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20646_pilon_+_28344_29075
917238	contig_4701_pilon	+	4260	4	Intergenic	novelGene_165430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCCCTGTGCATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30318	74806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4701_pilon_+_30730_62413_62666_63557_63678_71329
917239	contig_12599_pilon	+	2318	1	Intergenic	novelGene_176966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	1936	2316	54909	55289	NA	60	GTAAAGAAGAAATCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRERIKQNKETNKQKNPRKTVPPGMSLYVCTEQGSSSQATQYCLARRGSQAEKRKSKQTNKSKQKKSEQTNKKSPGGPTSVAVRAAKQFHSQVAFCVLSGRSKDGTRSLVFERKEEWGGD	52973	55291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12599_pilon_+_53000_55300
917240	contig_34_pilon	+	6902	5	Intergenic	novelGene_39983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	192	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	944	1312	212125	212493	TRUE	65	ATGAAATAGACAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	211181	317243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_216414_259518_259754_266840_267071_279361_279665_316341
917241	contig_9999_pilon	+	1874	1	Intergenic	novelGene_174670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATCTCCTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259212	261086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9999_pilon_+_259200_261100
917242	contig_18096_pilon	+	2313	14	Intergenic	novelGene_58041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	649.161288662706	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	54	1766	40382	76634	TRUE	5	TGAGCCCTCTCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40328	79123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_76835_78776
917243	contig_3960_pilon	+	932	1	Intergenic	novelGene_138035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAAGAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571728	572660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_571700_572700
917244	contig_12869_pilon	+	2200	8	Intergenic	novelGene_75325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	316.200143283087	14	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	518	1099	85646	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67330	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81663_81903_81994_85623_85694_94365_94433_96917
917245	contig_10734_pilon	+	3672	2	Intergenic	novelGene_51338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAAAAAAGGGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1650965	1687267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1652213_1684842
917246	contig_11378_pilon	+	5421	20	Intergenic	novelGene_112258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	3201	3797	404319	419734	TRUE	50	GAGAATCAAGATGGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLNRTGCTRSSMPLWISRGRESNSEPGRGIRTLNPSRFPVMTGSMSADELEVAWVTLKVTFLKSVIPRLMSSSIASSSPVGAQQALKLGQQPDGVQLPQEAVIMQAVPQLDDEATDDSRQLGLAEDNVAAVLQAQVHGYGGSAVLHEQEDHRFLGLVTQHGHTVCEGGQQRVKGLTPFTCDQVRMACGRGRGGGAW	378413	443063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_381220_390332_390488_395099_395211_401729_401838_404298_404433_404801_404931_406647_406774_407852_408023_419676_419935_421026_421247_423446_423628_429701_429819_430312_430416_432535_432668_435885_436035_436784_436876_438360_438471_440610_440693_440982_441099_442940
917247	contig_7843_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_152031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATGTAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265002	265900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_265000_265900
917248	contig_1406_pilon	+	2465	4	Intergenic	novelGene_25449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1346	1816	585492	585962	FALSE	15	GTTCCCTTGCAGCACGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLERRAVLEIEQLAALVQVRKGTLQPVLGQTRLQAQARGVPPAQPKPLCLRWLEVQFLQHLPGSRQYSVQVGEDFPVLSDGEQLVPQALQLAGVPATNRQHGGRGSAAGGGAGTENGPCVAEGSCRKRHSRLRGGSRSAARSPGPEPRPPPGPGG	484562	586611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_484847_498645_498776_568220_568331_584670
917249	contig_4114_pilon	+	2802	2	Intergenic	novelGene_15609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321703	324670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_321806_321970
917250	contig_6589_pilon	+	2147	6	Intergenic	novelGene_26039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	953.57915245668	8	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1134	2117	1726632	1730817	FALSE	20	CACTTGCTCCAGACCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTETHRRGTETQRQGDRDPETGGQRPRERRIQIQRGEDRDSERGGTETQRQGAQGPRNRTQDAASYLGGRVSGGKGGWESCTPDSPSLPPTSLGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSLKGNESEESRVPCSCYNSSSTNDSATGSSPAPGLSADGGGGRGGMLSSSGRNSSLWGGWGMGGACPNWGDKAPQGKLPMALGPWPLWDQDEEQRETGSVGAEVEAEGEADEPLE	1725392	1730847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729125_1730549
917251	contig_3103_pilon	-	3056	1	Intergenic	novelGene_146209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTGGGACTCTATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144765	141709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_141700_144800
917252	contig_15236_pilon	-	6161	5	Intergenic	novelGene_141565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1089	1409	444064	443744	TRUE	25	AGACCACAAGTGGTTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSYPLLGLLLATRHAVSKKTNSAVILRPTAPGISLLLLSLKHASAAIEVRVTGVIAWSQTLGRETGPVCLSFPEGETEGERELPGPHLLPPTFRRVKMGAKGSVQ	445152	418983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_419280_425595_426336_428008_428137_437905_437963_440212
917253	contig_7088_pilon	-	2395	7	Intergenic	novelGene_159801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	116	junction_6	62.634965385868	6	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	20	982	749060	721258	FALSE	30	TAGAATATCTTTTTAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEGDRQDPARNMGNHLQLLPADSEEEDETEMEVEDQDSKEAKKPNVINFDTSLPTSHTYLGADMEEFHGRTLHDDDSCQVIPVLPQVMMILIPGQTLPLQLFRPQEVSMVRNLIQKDRTFAVLAYSNVQEREAQFGTTAEIYAYREEQDFGIEIVKVKAIGRQRFKVLELRTQSDGIQQAKVQILPECVLPSTMSAVQLESLNKCQIFPSKPVSLEDQYSCKWWQKYQKRKFHCANLTSWPHWLYSLYDAETLMDRIKKQLREWDENLKDDSLPSNPIGIESHFLSCGPYLAKRNYLMCFLFNKTKYFRLFKTDEYFN	749079	719844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_-_721465_722785_722849_734068_734229_741620_741771_742561_742765_743346_743460_748993
917254	contig_10042_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_79144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	391	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTATGCCTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94015	91316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_91300_94000
917255	contig_6440_pilon	+	5427	3	Intergenic	novelGene_161648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	289	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	4315	5364	120905	121954	FALSE	60	CAAAAGAAATACAACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTITKHLQKQDKMVPVGIQNKTPDNAPLEENALELPDREFKSLILRILQEQRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRNIFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIRSKDLRVIGIPEQGQKTENTERIIEQLLTENFPNIMKDEKLANQEAQRTLYRIDPKRKSPRHIIFTLTKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNFQELLKRVLQSEDKQLQLTDRT	1878	122017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_4552_119000_119429_119691
917256	SIRV6	+	810	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	337	223	164	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	20	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	160	651	1733	10736	TRUE	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1467	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
917257	contig_6929_pilon	+	629	2	Intergenic	novelGene_139419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8749	junction_1	0	90	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130709	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_130971_131948
917258	contig_14094_pilon	+	3422	2	Intergenic	novelGene_145909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1237	2223	264825	265811	TRUE	70	AGCAAGAAAAAAAATCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLELQGPGDQANSHKQPIWAYQNKTRSSDTVSKHRINKYDNLLMAWRQQSISDHIKRQTMMASASSQNKESRNFLEEEYKRLIYRTLQEIRKEMMQNADQAIEELKKIREEHNDKFNRLQEAKERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAMEVRISEIEGKALDTNLFEEKSDKKILKNEETPRIRWDSIKRNNLQVIGVPKQRGITENTERIVEDLLAENFPHIVKDDKVSIQDGHRNLHKVDPKRQSPRHIRIKLTKTKDKERILRAHRDKQKVIYKGESIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCHPRIICPEKLSQI	263588	267066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_266118_266173
917259	contig_13428_pilon	-	3511	2	Intergenic	novelGene_143425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCGAGGTGACTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41723	37809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13428_pilon_-_40906_41308
917260	contig_9386_pilon	-	2062	9	Intergenic	novelGene_175207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_1	26.8604611836804	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	18	1301	108639	87965	FALSE	35	TAATCATGCCAACTCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDRFAMDLEQSRDLNNAIVHIDMDAFYAAVEMRDNPELRNKPIAVGSMSMLSTSNYHARRFGVRAAMPGFIAKRLCPQLIIVPPNFDKYRAVSKEVKEIFADYDPNFMAMSLDEAYLNVTKHLQERQNWPEDKRRYFIKTGNSAENDKPREEVNKLSERELSISPLLFEDSPPDLQPPGIPFQVNFEEQNNPQILQNSVVFGTSAEEVVKEIRFRIEQKTTLTASAGIAPNTMLAKVCSDKNKPNGQYQILPNRQAVMDFIKDLPIRKIPGIGKVTEKMLKALGIITCTDLYQQRALLSLLFSETSWHYFLHISLGLGSTHLERDGERKSMSVERTFSEISNAEEQYSLCRELCSELAQDLQKAGLKGRTVTIKLKNVNFEVKTRASTVSPVVSTAEEIFAVAKELLRTEIDADFPHPLRLRLMGITFLLFP	108656	87203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9386_pilon_-_88163_89461_89559_93451_93485_95788_95956_97044_97170_98397_98638_103188_103343_106560_106693_108501
917261	contig_9375_pilon	+	2414	1	Intergenic	novelGene_136079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACAATGAAAAAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614557	616971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_614600_617000
917262	contig_6418_pilon	-	2581	7	Intergenic	novelGene_81122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	332.533540497129	60	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	56	511	106563	78202	TRUE	25	TTGACCAGGATGCCCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIWGRSQLSAPGPASFEMSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKESE	118003	75108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_76215_77237_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
917264	contig_9177_pilon	-	3373	3	Intergenic	novelGene_32762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2555	2920	1448201	1447836	TRUE	45	TTGTAAAAAGAGTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLVFWSRPLKSSVQLFYFVISSFTLASLFSTASIRVYSDIHFGLFFLSCLFSDLLLSSCMMSLMSLHNSCGLLSLVFNASNLFLRWSLNSGGIQSRSYFGSHGLALIFFSFDLNLHMSN	1525011	1310550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1310695_1447526_1448526_1522781
917265	contig_5935_pilon	-	2257	2	Intergenic	novelGene_102760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAGAATATAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386447	1379935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1380942_1385196
917266	contig_10904_pilon	+	2709	3	Intergenic	novelGene_22476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	919.5	10	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	354	1322	149100	150068	TRUE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	145874	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_146226_149097_150468_150596
917267	contig_6175_pilon	+	1916	15	Intergenic	novelGene_16348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	955	1332	1708048	1719513	TRUE	10	GCAGGCCTTGAGCTCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFSSFNHFNTSCLGCGGSIHVRSLSSKSMIAEVPMCFMIRSTKSRFFFRKSTICSGFLLIRILSTLLKKLASSGFKGDSFRRKLYNFISKDSSSPSLSFIWETSEVSNSQDIFGYLYLIFSSMS	1683795	1793705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1683842_1685586_1685701_1688441_1688508_1689437_1689587_1691806_1691961_1693918_1694049_1700125_1700239_1705470_1705603_1707997_1708073_1710416_1710553_1713810_1713994_1719479_1719717_1746007_1746160_1770752_1770886_1793609
917268	contig_10581_pilon	+	5017	2	Intergenic	novelGene_41380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	0	92	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1579	1902	537940	538263	TRUE	55	ACAAAATTTTAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPKYLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQRNTAWFKVKKGVRQGYILSPYSLNLYAEQIIREAGLYEEERGIRITGRLINNLRYADDTTLLAESEEDSKHLLKRSSQLDQ	536361	550222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_540238_549081
917269	contig_4103_pilon	-	838	1	Intergenic	novelGene_52017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTGCACAATACTGTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509522	508684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_508700_509500
917270	contig_16098_pilon	-	974	4	Intergenic	novelGene_45935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1070.85832655658	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	62	523	349429	348413	FALSE	25	TAGCACTTATTTGGTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349490	347961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346
917271	contig_9809_pilon	+	2423	10	Intergenic	novelGene_176760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	226.141057258026	3	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	841	1878	114919	117674	FALSE	15	TAGTTTGTGTACCATTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSLELREKQAEKEERQKTKKIETSAEKLRKLLKEEKRLKKKKRKSTSSSSSISSADESVSSSSSSSSSHKRRKKRKRNRSESSRSSKRHSSKASSSQIDQNRQDEYYPLPVNTSASFLNQKQEVEKLLEKQDRLPYQKTQVKDKDRYPLSSSSVEIPDDSGGRSEDPRDFYNSCKTQASSSKTEKPYKSERHFSNRRDSADSFCRSSEDKIKNYGYRRVDRDVEGRKEQSRRWEPGSGRYSASPASSEYSWKSLEKYKKCTYSGSRDFSKHEQRYQLNTNQGEYEREDSCGEDAKTEVPEEDGLSSKEQSESRVKKNLPQNLLNIFNQIAEFEKEKGNKPKNL	109188	118219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112484_112519_114811_114925_115880_115991_116752
917272	contig_3601_pilon	+	4035	3	Intergenic	novelGene_132859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	140	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2980	3420	160627	161067	FALSE	15	CAGAACTCTCTCGCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHFCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPAWQPKLGSSSTLKRSSATPQEEAKMAHGARYLSKGGRRWRETSKKSKEAGKKKSNTSSQQMALREPARAGWCFWTRNCVRGKQRGPSVGEEG	129857	161682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_131331_131721_131896_159294
917273	contig_16071_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_165991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25290	27297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16071_pilon_+_25300_27300
917274	contig_15084_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_116710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGCATGAACCTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248314	246817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_246800_248300
917275	contig_17993_pilon	+	2441	8	Intergenic	novelGene_61934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	119.963940160264	2	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	779	1294	76195	81284	TRUE	95	AAAAAAAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRHLYMKWVRLTKPQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLHTIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQKCHPWFHLLNLICHT	72087	86270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_72667_72886_73049_76157_76301_77881_78020_79631_79726_80786_80918_81237_81395_85233
917277	contig_17687_pilon	+	2049	1	Intergenic	novelGene_177976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCAAATAGTAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19882	21931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_+_19900_21900
917278	contig_2854_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_120906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	650	985	1306244	1306579	NA	40	CCACCAATTAATTCTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCGSPKRRNERGRDKRKFDEIMAVNVPNLMKGMNIHIREAQHTPRRINAKRSTLRHIIVKLWELKDKEKILKTAREKLMFPYKGSSIRLKLISAQNPWRSESSEMTYLKC	1305594	1307980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1305600_1308000
917279	contig_12249_pilon	+	3137	1	Intergenic	novelGene_121007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1762	2076	100942	101256	NA	50	AAGAAATACCATCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERFFPKGGVFDPRGRPDASTYLLPDGGLLLTGSGWPCRLSGAGSLPVWKMRLLSIAACLPHHSPPSCSGLNGSGSRQVRSGNSLLLLNSLSIPLPLRPQLCL	99180	102317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_+_99200_102300
917280	contig_5424_pilon	-	7049	18	Intergenic	novelGene_172805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	294.963219805559	972	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	2842	3720	123722	117849	TRUE	10	CGCCCCGCGGCAGCATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFLSTHLPSVLIKGLKQLHENQKNNPPLLENKSGSGIPNSNSNSSVQHVQIRVARLEENTALSPSPMTALQIPVQITHVSSTDSPAATVDSETITLNSGTLQTFEILPSFHLQPTGTPGTYLLQTGSSQGLPLTLTASPTVTLTAAAPASPEQIIVHALSPEHLLNTSDNVTVQCHTPRVIIQTVATEDITSSISQAELTVDSDIQSADFPEPPDALEADTFPDEIHQPKMTVEPSFNDAHISKFSDQNSTELMNSVMVRTEEEISDTDLKQEEESPSDLASTYGTEVSCT	168311	96051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_-_96447_112509_112562_113586_113694_115073_118245_118789_118946_120473_120560_123481_125111_126344_126574_128702_128985_129702_129736_131066_131225_135062_135140_139134_139250_144247_144343_152897_153021_155822_155940_156654_156778_168210
917281	contig_6048_pilon	-	2531	3	Intergenic	novelGene_73192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCAGGGTCTGAGCGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1458434	1450035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1451808_1456955_1457047_1457766
917282	contig_7171_pilon	-	2467	1	Intergenic	novelGene_101201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTTCAGATCAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39910	37443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_37400_39900
917283	contig_5600_pilon	-	1729	13	Intergenic	novelGene_174953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.8180663714023	1	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	784	1398	203895	197234	FALSE	15	AGCCCTCATTGGTCATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENMRNDIASHPPVEGSYAPRRGEFCIAKFVDGEWYRARVEKVESPAKVHVFYIDYGNREVLPSSRLGVLPPAFSTRVLPAQATEYAFAFIQVPQDEDARTDAVDSVVRDIQNTQCLLNVEHLSAGCPHVTLQFADSKGDVGLGLVKEGLVMVEVRKEKQFQKVITEYLNAQESAKSARLNLWRYGDFRADDADEFGYSPCPPG	412072	196902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_-_197254_197444_197503_197588_197634_199824_200029_201571_201686_202859_202930_203791_203916_206927_207070_212787_212973_296652_296763_356450_356593_394481_394555_411961
917284	contig_6497_pilon	+	1940	3	Intergenic	novelGene_35632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728257	739748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_728482_729767_730123_738387
917285	contig_5999_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_45625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153493	154668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_153500_154700
917286	contig_14300_pilon	-	1861	8	Intergenic	novelGene_133105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGCGCGGATCCAGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257278	218504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_218597_243460_243578_243771_243862_246860_247018_248954_249106_250297_250452_255399_255560_256338
917287	contig_11056_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_130372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGACTTCTAAAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333023	334979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_333000_335000
917288	contig_10892_pilon	+	7831	5	Intergenic	novelGene_116754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	45.2789962344573	289	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	589	1770	579	2348	178258	202884	FALSE	25	GTGAGTCGGAACCAACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSVVFEDVAVDFTQEEWALLDFSQRELYRDVMMETFRNLDSVFQQDNNEQKLSMKNDSWFSMLGEICVFHGIECQHNNQGKHVGIYTVQNRHESKESREENHCEETFGWFGNLASLQRAHTRVNPSEFLECGKAIMDHSSFEHHIGSHPGYKPYRCNKCGDDCSCPSYLKPFVRENLCKCKDDGKPCSCSSPLAEHIRTLSRERPYECKECGKAFSSSSSFTKHVRTHSGERPYECKECGKAFSQVSDLTRHIRAHSGEKPYECKECGKAFSYLSNLTRHIRTHSGERPYECKECGKAFSRSSFLATHIRTHSGERPYECKECGKAFSSSSSFRNHIRTHSGERPYECKECGKAFSQVSYLTRHVTAHSGEKPYECKECGKAFSQCSQLTRHKRAHSGHRPYECKVCGKAFSQSSHLTSHIRTHSGDRPYECKECGKSFSQCSQLTRHERAHSGDRPYECKVCGKSFIQSSHLTSHIRTHSGDRPYECKECGKTFSQSSHLTSHIRTHSGDRPYECKECGKSFSDYSSITRHIRTHSGERPYECRECAKAFRSSSSLRKHVRTHNGDRLYDRNVGKPLVSRRPSLTID	168322	208367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_168661_178017_178261_199598_199723_200871_200999_201368
917289	contig_15020_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_87398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	153	308	62441	62596	NA	15	CCTGCCCTGCACTGATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSTSFDFFLTSHHLPLLCSNTGLFAPSFFLLEGLQSSVRVWNCFPVWTAMLVGSWGFCLFVCFELFVCFLFLELGARCGQVVLHGLEPTPTACAEVQKDP	62288	63163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15020_pilon_+_62300_63200
917290	contig_3326_pilon	+	3845	1	Intergenic	novelGene_170606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCACCACAGATCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351978	355823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3326_pilon_+_352000_355800
917291	contig_12605_pilon	+	972	5	Intergenic	novelGene_64183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2967.48853199132	6	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	382	972	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3870	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_5960_6133
917292	contig_9852_pilon	-	3199	2	Intergenic	novelGene_138463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTAGTGCTCTTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44928	39232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_41034_43530
917293	contig_11316_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_122609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	660	1172	137674	138186	NA	40	TGGCCTCAATACAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137014	138661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138700
917294	contig_14415_pilon	+	675	4	Intergenic	novelGene_77624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	211.189225314382	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	116	313	35981	37984	FALSE	10	TTGTATTGGTTTTGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAQRHQGGCGVAEDQDGGQKAESQKQRNPKQQRPSQSHMSLKNPQDHQMLRQGSLRKPALILERSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33362	38346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33435_35937_35993_36102_36166_37861
917295	contig_8852_pilon	+	1228	4	Intergenic	novelGene_159837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_3	48.2101879504968	14	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	70	459	16985	57146	FALSE	55	CTAAAAAAACTGTACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KERVRYFHDDDNLSLNDLVKNEKMGTARDQNKLFMKMASKFMGKTDGDYYTLDDMFVSKAAERESLGEEEENQRKKAIAEHQSLAAQMEKCLYCFDSSQFPKHLIVAIGVKVYLCLPNFRSLTEGHCLIVPLQHHKAATLLDEDIWEEIQGK	16915	57915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8852_pilon_+_17036_38984_39198_51615_51733_57137
917296	contig_10460_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_157461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATCATGTAAAATGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45616	43028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_-_43000_45600
917297	contig_19737_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_158986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGGAGCACTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108738	110910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_108700_110900
917298	contig_5816_pilon	-	3770	11	Intergenic	novelGene_158245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	28.8242953079516	282	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	478	1782	273693	210202	FALSE	10	CTTGAAGTGGTCTGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNAFQWIQYGSINNIFMNFYGVSAFAIDWLSMCYMLTYIPLLLPVAWLLEKFGLRTIALTGSALNCLGAWVKLGSLQPHLFPVTVLGQVICSVAQVFILGMPSRIASVWFGANEVSTACSLAVFGNQLGIAIGFLVPPVLVPNIEDRDELAYHISIMFYLIGGVATLLFILVMIVFKEKPKYPPSRAQSLSYALSSPDASYLSSIVRLFKNLNFVLLVITYGLNAGAFYALSTLLNRMVILHYPGEEVNAGRIGLTIILAGMLGAMISGIWLDKSKTYKETTLVVYIMALVGMVVYTLTLNLGHLWVVFITAGTLGFFMTGYLPLGFEFAVELTYPESEGISSGLLNVSAQVFGIIFTISQGQIIDNYGTIPGNIFLCVFLMLGVALTAFIRADLRRQKANKETPEIKPQEEEEEEEESNTSKVPATVSEERL	274444	208213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_210283_216552_216609_217187_217300_217423_217530_218822_218934_222453_222558_224102_224171_233195_233337_237302_237445_273309_273794_274067
917300	contig_10437_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_38499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	35	415	1280137	1280517	NA	20	CTCACTATTGTGTCATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDPAKSAPAPKKGSKKAVTKVQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	1280102	1280662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_1280100_1280700
917301	contig_4519_pilon	+	4376	6	Intergenic	novelGene_123674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	99.2862528248498	52	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAGAAAAAAGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69965	154822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_70919_77856_78014_78794_78937_79733_81078_109640_110365_153766
917302	contig_6477_pilon	-	1511	1	Intergenic	novelGene_154193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACCAGAATGAACTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779794	778283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_778300_779800
917303	contig_854_pilon	-	1806	1	Intergenic	novelGene_36735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716253	1714447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1714400_1716300
917304	contig_3948_pilon	+	2035	1	Intergenic	novelGene_53246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	93	332	1196371	1196610	NA	45	ACAAACCAAATGTCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWPPQDIGSACRPHPLGGFPPREAPPRALAMSESGASCCVETGFHSLVQSGNLFCFAFVVKMQPLPSPRLGEHRQAGSAEARLLTVVPPSLQKLPSPTGSFQSPVPQPF	1196278	1198313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1196300_1198300
917305	contig_17753_pilon	-	4322	1	Intergenic	novelGene_105074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3362	3724	57888	57526	NA	10	GTTGACCAGGTCCCCTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQAMPHSLNSSWAGLESRHPTRHVSWLNLLGKLPHSSTVPTAADYPIGQVSTGLTLLTRSSVVNSFTFFHHIRDSASRSGWLQSLSQPHSTFLQNQSLFSNLQSLTRTEHPKSKVRRG	61249	56927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_56900_61200
917306	contig_593_pilon	+	2112	10	Intergenic	novelGene_102009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_9	127.769564953455	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	285	1256	383582	481427	FALSE	25	GTTCTGTAAACCTTAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSARDLEESINKIREILSDDKHDWEQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLG	383297	482283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016_479091_480193_480287_481277
917307	contig_8598_pilon	+	2898	1	Intergenic	novelGene_22868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	453	782	3506	3835	NA	85	AAAAATAAAAAAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVCEFCVANVMIIKPSRKVESAVGGTVGVRIGKMVERGGLSGLHLMRVSLALLILVLLPPCGVGGGQHCPHAIFRTSIATTREMQVKMTMRYYFTPTKVAIINTIYF	3053	5951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_3100_6000
917308	contig_12689_pilon	-	990	1	Intergenic	novelGene_145070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCTAAAAGTCTGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597439	596449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_596400_597400
917309	contig_5153_pilon	-	2785	4	Intergenic	novelGene_74381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	206	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044506	971134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_971674_993172_994954_1031616_1031970_1044394
917310	contig_18869_pilon	-	1846	5	Intergenic	novelGene_56442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAATAGCCTAAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129039	117591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_118816_119693_119919_121690_121891_127623_127762_128980
917311	contig_4336_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_152368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375176	373454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_-_373500_375200
917312	contig_13245_pilon	-	1117	4	Intergenic	novelGene_148806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_2	5280.10759570506	26	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGGTGGCATGGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26868	24751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13245_pilon_-_25637_25998_26073_26417_26457_26749
917313	contig_10159_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_30825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGCCACTCACAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513947	515242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_513900_515200
917314	contig_6048_pilon	-	681	3	Intergenic	novelGene_73345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_2	46	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAGAAGCAGGAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2934084	2924543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2924599_2929499_2929592_2933550
917315	contig_10354_pilon	-	4473	1	Intergenic	novelGene_50865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	198	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAAAATCCTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443327	438854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_438900_443300
917316	contig_2054_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_51692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAACACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144451	147595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_144500_147600
917317	contig_18208_pilon	-	2497	1	Intergenic	novelGene_176173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145202	142705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_142700_145200
917318	contig_9319_pilon	+	4496	1	Intergenic	novelGene_154642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	405	4092	4496	77031	77435	NA	50	CATAAGTGGAAAAACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFITTLIQCGTEVLARAIKYEKEIEGIQKVRKVKLSLLPDDMLLYAENTKKSTRKLLDIIEVFSKVVGYKINVQKSIGFVYINKENFKKETSKSMPFTRAPRKIKYLGINLTRNIKELYKENYRILLHETEKDL	72939	77435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_72900_77400
917320	contig_15371_pilon	-	1343	2	Intergenic	novelGene_151478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTTCCAATTTCCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224108	222705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_223143_223202
917321	contig_4426_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_15461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCCTTAATTTTCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926931	927435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_926900_927400
917322	contig_12701_pilon	-	2278	1	Intergenic	novelGene_169543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATAGTGTGTGTCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25275	22997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12701_pilon_-_23000_25300
917323	contig_10627_pilon	-	1554	1	Intergenic	novelGene_60030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538910	537356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_537400_538900
917324	contig_11742_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_166539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATGGGGAAGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89634	90062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_89600_90100
917325	contig_12689_pilon	+	3792	2	Intergenic	novelGene_145040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	420	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1	393	71951	72343	TRUE	25	GTAGAGCATGTGTGTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRGKQGGKARSKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK	71950	78961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_+_72513_75731
917326	contig_5429_pilon	-	3707	2	Intergenic	novelGene_127783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	55	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1209	1511	130307	130005	TRUE	40	TATTACAACAACTTCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHRKINILGYSEMKWTGVGHFESDNHMVYSAGSDKWKTNGIAFIDKENISRSILKYNTISDRLISICLQERPVNTTIIQIYTANTNAKDEEIEDFYQLL	131515	127621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_128030_128216
917327	contig_6862_pilon	+	2371	14	Intergenic	novelGene_63750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	156.52630835454	104	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2307	63	2369	49393	110587	FALSE	35	TGAAAAGTAAGCTCTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLKKPRNTPRLPLALNPLKSKDVLAVLAERNHAVVPIGAWVEPASPDSSEMPAYTSACVIEEELKEQLRRKQEALKHFQTQVKHRVNQRVRLRKKQQLQRSYEAAEKKGSIAMQSSDPAHLTPRRRTSVFPNSLNAAVGSSRLPPSPEDEENKNELFQQQAQALSQTMKQVRHQLASFKTMGKKKATVFPDGKRKSVPTQEKALSRKPASIRINIETREGFPLKVHQSLSATVHYHNFMQSEKLDSGESSSIMTDEKWRKNLLWRDQQDLLSEIKNKPFNRVQKVQFKNPLFDVMEEEELKQLHLQDILPRAQDYLPEAQSDLSETQGDLPGIHSVEPEAQNVELDTQAIELEVQAREPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQAGEPEAQAGEPETQAGETETQGGTLEAHSIEPEDGSIVLEALDFLPQNQGFLPKDQDFLPKDQNFLSKEEDFLLRDQSVLLKDQSSLPKDQNILPKCQEQNFLPKDQEIYFRQPSPALTAERWKKKWPTSAQQCLSSMFQGQPSTRDQLDQLEERDEQEKANLKQSASILIGRGEREMFPLDVHQDLLHRRQDQASIRYKKVRFKEPYSDMTDERRREDFALAGYRHLPPKLQAHTCVRDPVEQDKKEGKKQEINSMQLNMSVKQPSSFLREERVRQELPQENPQYVAPKIQDRASLREQVSDAYQPGLNPEFQAPLALQSGVDQEEDKKVRQKQYLRYKRLFMDMEREQVKEQQRQKEHKKK	49025	110589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_49076_49380_49561_55247_55398_55962_56140_75087_75202_78741_78865_82880_83004_83262_83947_84170_84327_85673_85797_86046_86224_86840_86964_109124_109218_110491
917328	contig_7230_pilon	-	3128	1	Intergenic	novelGene_52533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1863	2210	62410	62063	NA	25	GCTTCACTGTATAACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNAKINSQLTIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVKDRISGIEDKHLDTTLFEENSQKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	64272	61144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_61100_64300
917330	contig_14925_pilon	-	5190	1	Intergenic	novelGene_55232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCTTTCTTAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52259	47069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_47100_52300
917331	contig_15185_pilon	-	3534	1	Intergenic	novelGene_99391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTCCTGATAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108509	104975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_-_105000_108500
917333	contig_9290_pilon	-	2719	1	Intergenic	novelGene_77524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTAAATTCACTCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213804	211085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_211100_213800
917334	contig_5419_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_15483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207575	210147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_207600_210100
917335	contig_6299_pilon	+	4367	5	Intergenic	novelGene_172932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3822	4139	440592	449461	TRUE	10	GCAACTGTGGCTCCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRKLGTPFFAPLLAIALNRQALLVLLHPDHTRFLGKLRHGSALGQDHIDLLPFHLQLLPLPEVDIISVGHGKRVLHFPVDHSLSIAFFFIDFFNILVPLFSVV	436770	470501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_440621_443871_444044_446077_446158_449424_449543_470354
917336	contig_3900_pilon	-	2459	13	Intergenic	novelGene_84205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	77	junction_12	205.172877647661	29	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	137	1987	561497	543648	FALSE	50	AAGATAAGATAGGAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLWTRVVQAAFIFLTTESIGVLLDPCGHISPESPVVQLGSNFTAVCVLKEKCMDNFAVNADNIFWKTNHAIVPKEQYTVINRTASSVTFRDVSSLNTQLTCNIYAFGQIEQNVYGITIISGLPPEKPKNLNCIVNEEKNMMCQWDPGRKTYLETNYTLKSEWATEKFADCKAQRDTPNSCTLDYSPVYFVNIEVWVEAENALGNITSDHINFDPIDKVKPNPPHNLSVRSSEELSSILKLAWINPSIKSFLRLKYSIQYRTKDASTWSQIPPEDTSSTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGFWSDWSEEASGITYEARPSKEPSFWYKIDPSHTHGYRPVKLIWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHFQNYRVNDTKLTVNLTNDRYIATLTARNLVGRSDASVLTIPACDFRAAHPVMDLKAFPKDNKLWVEWTAPTESVNKYILEWCVLSDKSPCIPDWQQEDGTVHLTYLRGNLMESKCYLITVTPVYADGPGSPESVRAYLKQAAPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTILYKTAFGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGMYGPDFTFTTPKFGKE	575810	543175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_543800_544127_544275_544465_544568_547045_547229_547795_548007_548729_548813_550976_551137_552489_552645_553164_553332_556398_556520_557421_557728_561433_561513_575689
917337	contig_12841_pilon	+	4345	1	Intergenic	novelGene_55862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1759	2193	328692	329126	NA	40	GCAGAGCGTTAAGGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGWAEEAMLSDHRLRASVVGQKRGVICPVSWCRWLGGKVSTAVPWVPGASGWLEKQTRPVCGSPARVGAQKGGCHSSVGPWLRGQGGGGCCQTMIMCGGMAGCISEGTTDLQSSSMGGWRGRVGEVSSLNLCRVGSTPAWLWT	326933	331278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_326900_331300
917338	contig_9481_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_149686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGATATTATTTGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467190	469145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_467200_469100
917339	contig_16625_pilon	+	763	1	Intergenic	novelGene_171113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCTTCACCTAAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53210	53973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_+_53200_54000
917340	contig_14405_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_85680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCTGTGGGGAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	964911	963095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_963100_964900
917341	contig_5961_pilon	+	2475	4	Intergenic	novelGene_144139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	566	junction_2	753.705955042593	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	1982	2473	197721	202099	FALSE	70	AGAGAAGGAACAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEI	174482	202101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_175796_194230_194394_197215_197889_201775
917342	contig_16098_pilon	-	596	4	Intergenic	novelGene_46201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	391.518695452578	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	100	594	708827	706896	FALSE	15	GGCTGACCGCATCCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGAGGGAAAVAAGGVVTTTASGKRIRKNHACEMCGKAFRDVYHLNRHKLSHSDEKPYQCPVCQQRFKRKDRMSYHVRSHDGAVHKPYNCSHCGKSFSRPDHLNSHVRQVHSTERPFKCEKCEAAFATKDRLRAHTVRHEEKVPCHVCGKMLSSAYISDHMKVHSQGPHHVCELCNKGFTTAAYLRIHAVKDHGLQAP	708926	706893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_706958_707721_707894_708172_708237_708630
917343	contig_12951_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_68131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACTCCTAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68773	67975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_-_68000_68800
917344	contig_7630_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_133659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGCATATTCACAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533395	534787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_533400_534800
917345	contig_14405_pilon	-	2131	14	Intergenic	novelGene_85668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	179.559124774935	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1122	1008	2129	827854	740524	FALSE	70	GCATAAAAAATAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPRDWLSVFSPPIVPPSQQPTEQRLESSGSLSAQGGNMKNA	996191	740521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_740639_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827975_844997_845136_866566_866724_885904_886020_979091_979165_989814_989909_995881
917346	contig_11754_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_176972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTATCAAAGGTACAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42258	47512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_+_43103_46992
917347	contig_8228_pilon	+	6706	32	Intergenic	novelGene_81779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_23	53.1049458690471	143	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1503	4512	146	4657	51193	180876	FALSE	35	GACTCCAACACATAGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIFRILAGILHLGNVGFTSRDSDSCTVPPKHEPLTIFCDLMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFTWIVDHVNQALHSAIKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIESKMGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEKPRLSNKAFIVQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAISPTSATSSGRTLLTRMPAKLNKGRPGQAAKEHKKTVGHQFRNSLHLLMDTLNATTPHYVRCIKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMKQKDVLSDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRGWLLRKKYLRMRKAAITVQRYVRGYQAWCYATFLRRTKAATIVQKYWHRYVVHRRYEITRAATVVLQSHLRGYLARNRYRKILREHKAVIVQKWVRGWLARTHYKRSMHAIIYLQCCFRRMMAKRELKKLKIEARSVEHYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLVEKLAHLEAIYNTETEKLRSDLERLHLSEEEAKVATKRVLNLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKSIEESADRYRQETEQLVSNLKEENTLLKQEKETLNHLIVEQAKKMTETMEKKLIEETKQLELDLNDERLRYQNLLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMVNVPKPGHKRTDSTHSSNESEYTFSSEFAETEDTPWRTEEPSEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQVLQDELDRKEEQVLRSKAKEEEGPPIRGAELEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKGAPEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELDVRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKNTMTDSIILLEDVQKMKDKGEIAQAYIGLKETNRLLESQLQSQKRSHDSEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENLDLMEQLEKQDKTVRKLKKQLKVFAKKIGELEVGQMESISPGQIIDEPIRPVNIPRKEKDFQGMLEYKKEDEQKLVKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQKVRSLLTSTINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHCLKQYSGEEGFMKHNTSRQNEHCLTNFDLAEYRQVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQGMSGVKPTGLRKRTSSIADEGAYTLDSIIQQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIVGAVTLNNLLLRKDVCSWSKGMQIRYNVSQLEEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDEDAEAICSMCNALTTLQIVKVLFLYTPVHEFEERVSASFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHTFPVTFPFNPSSLALETIQIPASLGLGFISRV	49212	182925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_49338_51172_51280_61647_61914_63297_63380_69531_69673_71359_71486_72784_72869_82261_82424_83363_83462_87108_87196_88070_88180_91154_91367_92647_92805_96891_97132_99790_100040_102701_102796_108304_108454_124907_125022_128920_129065_129297_129352_135586_135815_141727_141829_144736_144936_148882_148977_157147_157295_163118_163274_167117_167208_172483_172635_176154_176438_178085_178261_180335_180417_180723
917348	contig_3956_pilon	+	1646	9	Intergenic	novelGene_14892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1423.26315205587	4	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	83	757	1281682	1289629	TRUE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANITRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKASMPVC	1281599	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282752_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284829_1289608_1289677_1289758_1289892_1290297
917349	contig_3463_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_62021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATTAAAAAGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613902	612083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_612100_613900
917350	contig_11285_pilon	-	3128	6	Intergenic	novelGene_5719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_3	38.2800208986359	83	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	7	642	910546	824608	FALSE	80	TATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADRFSRFNEDRDFQGNHFDQYEEGHLEIEQASLDKPIESDNIGHRLLQKHGWKLGQGLGKSLQGRTDPIPIVVKYDVMGMGRMEMELDYAEDATERRRVLEVEKEDTEELRQKYKDYVDKEKAIAKALEDLRANFYCELCDKQYQKHQEFDNHINSYDHAHKQVRNSYLLTKKQILLRVKTIEFYECTQKNLVNIVSFVCWFLSEVVWRI	910552	822121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_824896_845502_845590_846255_846324_868989_869063_877365_877441_910501
917351	contig_14914_pilon	-	2551	2	Intergenic	novelGene_178979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	178	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGATTTAAAAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41418	1776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14914_pilon_-_4259_41349
917352	contig_11656_pilon	+	3207	21	Intergenic	novelGene_54021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	145.966742787527	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	173	1849	468970	528014	TRUE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPRVSIRPETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRGKPAN	468797	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_468997_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527897_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
917353	contig_753_pilon	-	4643	32	Intergenic	novelGene_112921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	25	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	3524	3940	522608	487751	TRUE	20	CGCTGCCCAGGAGCGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFTAAIPLLAIRTFSITLFPPKRVTNSAGEATVKSRCESIFFRSRPCFTRCMPDMLDLICKAKPSCRLEIPKSESVSELTEAGDREPSFSSSRSNFTRLLISSSELSSDTEPIMNRECWFSSRGLAKGEGSSIIPSK	593168	404749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_405349_407206_407298_487737_487992_521425_521559_522565_522704_527746_527860_529193_529275_530243_530343_531717_531820_534587_534703_541158_541369_545057_545225_546629_546796_547153_547320_550546_550695_551510_551616_553506_553589_554533_554680_556357_556509_557801_557940_558301_558451_558801_558989_559628_559730_560445_560543_565068_565189_572357_572467_573701_573815_576900_576992_579098_579225_591153_591301_592074_592174_593068
917354	contig_8330_pilon	-	1487	2	Intergenic	novelGene_71726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAACAAAGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165262	162875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_163361_164260
917356	SIRV7	-	1992	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	1	-4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	39	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCGTAATTAGTGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147917	1009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2232_3008_3112_43028_43079_114680_114989_147608
917357	contig_1867_pilon	-	2788	1	Intergenic	novelGene_54553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424662	421874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_421900_424700
917358	contig_16125_pilon	-	3871	4	Intergenic	novelGene_155218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3046	3366	82782	82462	FALSE	75	AAGAAAACAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRILMFVCSISFLTISNFPRFILLTFHVPIISGCLQLFLLILSHATSAKEGPESLTPSMSFIKVDSTLRRQPFPSHLLSGFQPEGLIFRHYIRQRSAAVHKVFTG	189138	81956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_84796_96069_96500_180041_180249_188743
917359	contig_10299_pilon	+	1988	16	Intergenic	novelGene_79745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	62.0234364306483	3	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	808	1398	502326	516149	TRUE	20	ATCGTGAAATCCCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVTNTRENKSRQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCRGSSRLSGSAEQR	463096	517578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_463167_463367_463505_484139_484234_488618_488710_489793_489871_493160_493198_497085_497184_498369_498483_500805_500863_502292_502387_502702_502780_503290_503426_511683_511810_511888_512041_516109_516437_517275
917360	contig_3132_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_127446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACAACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304666	305420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_304700_305400
917361	contig_3747_pilon	+	2530	8	Intergenic	novelGene_24912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3983.31691340936	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	90	971	201481	203529	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEEGFLSIFSLFSSSLLYGYHS	201391	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203467_203651_203768
917362	contig_6227_pilon	-	3680	9	Intergenic	novelGene_49796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	82.5695729370087	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	588	1292	1291269	1260481	TRUE	15	TCCTACCCCACCACGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVLGRCFLTVVQVHFQFLTQALQKVQPVAHSCFAEVVMPEKKSSSSGSGLPGMSHTPELEEAVRSWRGGC	1331851	1249856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1250469_1252830_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1290774_1291552_1291831_1292061_1308695_1308751_1331830
917363	contig_15420_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_175297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAGTACAATTAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154968	153526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_-_153500_155000
917364	contig_8942_pilon	-	692	1	Intergenic	novelGene_143192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCACCTAAAGCAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279859	279167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_-_279200_279900
917365	contig_14508_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_79035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCCTGCTGTGTCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15390	16631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_15400_16600
917366	contig_13800_pilon	+	1637	2	Intergenic	novelGene_153747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	442	795	172862	173280	FALSE	35	AACCTTCCTTGAGACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKHLNTFKPCSFHECNKVVFCSEVRVVRKYELSVSQTSCYSGTDCTPKMVAQSTPSQLPQAALSYASRQEAALRGTPRNQDTDRPGVLSHWTASVYPEGSVQARALEVQKPVIYI	172420	174122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_172926_172990
917367	contig_4114_pilon	+	3523	9	Intergenic	novelGene_15603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	273	638	311684	313047	TRUE	0	GGTTCCCTGCTGTTGTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGYRFSLGQWVYWFLLDGSGVAVGALGKRRGVPGHWVDLGDLGKQILLGAWISRLLVVRSGVVGVRGNSLARQLGKLSTTVGRAQAVVQSMEVWLLLKTATAATVPPGARAQELRGEDRVAGWKAIVAKRWKSVLGVEPVDRGQAGLCIVGVVGVHAVHAVRVGGPAVAQHRVALHHRVAAVLEGAEVALRLHLEGRLQALLGQSTLQRQA	311411	370385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_312045_313042_313379_314897_315040_315545_315633_318006_318159_321261_321467_327931_328028_336847_336945_368610
917368	contig_12951_pilon	+	3408	2	Intergenic	novelGene_68210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1445	1789	796605	796949	FALSE	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	766930	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_766962_795191
917369	contig_12677_pilon	-	1565	1	Intergenic	novelGene_110741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1575	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
917370	contig_11277_pilon	+	3023	8	Intergenic	novelGene_80310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_6	119.429425834264	228	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	371	1138	255962	267180	TRUE	25	GGAAAATATGTGGGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGKPLHFDTQFSVHNVLKPSEMLSYPNGGNSLRVILKDCLKAMCHFDWILLFCVMTIFTNDKPLLLVFPNTSKTG	248278	270871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248376_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_267610_269415
917371	contig_6677_pilon	+	3596	1	Intergenic	novelGene_114225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAATTAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688211	691807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_688200_691800
917373	contig_14322_pilon	-	2934	2	Intergenic	novelGene_116611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	84	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	418	744	684070	683276	FALSE	45	CAAGTAAAATGAAATCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLDQTESNTTRWCPATTTDCSDRDHNRGSRTEGWRYATSRVCILHFIKRQQMWLQTCGQIQPFEAFLCLISSLAGGCALKMFGFCFLPLFSSCFAQKTPKAF	684487	681085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_-_683489_683956
917375	contig_11518_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_109132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	218	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGCTGTTAAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303410	301772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_301800_303400
917376	contig_14034_pilon	+	4861	37	Intergenic	novelGene_72628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	43	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3016	3465	126125	132298	TRUE	25	ACACGGACGTGCGACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNERLPAGRTVAYGQENIFLNPGKKAKLQWVYFLIFIILKLNFVSLFQVRYAKGNLKSISTHSSQFHRRVCTWTVTTFINRNLVNGIQDSEVVTLLRVCREHDLIHRLWEQQLVGAQGRWNHGLPEDCHQYPLTSIDDSHICQVTRIVS	86196	152228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_86867_89958_90035_93391_93545_94009_94137_95472_95590_96076_96189_97067_97124_98108_98174_99931_99994_113664_113870_115488_115587_116414_116538_118187_118347_118672_118738_118851_118998_120496_120576_120668_120752_121434_121508_121714_121831_122658_122763_122856_122912_124515_124621_124945_125053_126065_126252_127568_127667_130956_131128_132244_132481_135094_135192_136778_136900_138033_138125_138858_138957_141147_141233_145162_145243_145951_146036_147942_148094_148313_148515_152022
917377	contig_1812_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_174516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	825	1349	15414	15938	NA	55	AAAGTTAACAAAATACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVAIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILGIFQELRQKGDKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEITQKQQLEIQKINNKISETDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEQTLRVMWDTIKSKNL	14589	16714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_+_14600_16700
917378	contig_3077_pilon	+	3299	5	Intergenic	novelGene_26797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	778.719461680521	59	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	230	850	473998	477634	FALSE	10	ATCTTTATTTGTGTCGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSK	467381	480083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443
917379	contig_14566_pilon	+	4757	3	Intergenic	novelGene_148845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	83	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTTTCTAAACATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98279	103661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_101816_102238_102505_102706
917380	contig_10074_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_57161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	369	677	524332	524024	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRPSASTWSTSKTSARSRSTGRLLFCPTPPKMRYSSNTKMMTSQETCFEYSFPGRPQEEFILIHLHFLPCIPSGATVYDLEVDCQGTVKQSGPAALIPSK	524700	522931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_522900_524700
917381	contig_15673_pilon	+	4576	3	Intergenic	novelGene_169833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	2442	2975	110271	110804	FALSE	45	GTAACAATGCACATACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTSYQNLWDTAKAVLRGQLIAINVHIQKEEKAIIKTLTLQLKQVEREQQKKPSGARQNEIIRIRAELNEIENRKTIERVNKSKRWFFEKINKIDKPLAKLTKEKQERKQITHIGNEIGDITRDPTEIKRIITEYYENLYSDKFENLEEMDTLLETHYLPNLTQSEVNKPITKEDI	7490	112405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15673_pilon_+_9262_41277_41565_109887
917382	contig_10867_pilon	-	322	4	Intergenic	novelGene_159465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3857	junction_3	1120.17984667146	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATACCCACTTTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91457	87686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_87840_88193_88256_88603_88683_91429
917383	contig_37_pilon	+	3881	3	Intergenic	novelGene_178981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	3063	3881	159342	160160	FALSE	10	CATGAGTCTCTCCTCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSLARKGSPLKKRKRKQTNNSKQTNEPELRDPTSTADQTGKQLHTRTELRNPSGRSKDGAQSQVLERREGGGGEKQVRNQKKQKKKKATLAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSAGIRGGRVWVKKSREWESVFHKLPEHCSPSERSKDGARKEVLERKEGEVGRSNEEIRRSGKKATPAANNWHSESHLFGCVESKQPLFPGQETVAVGSRGGRVGVKKGGGWESVYRQLPVVLSPAGSSVRLLSHTPCLLVSNKSPRWWICAALAGRGPL	41272	160160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_37_pilon_+_42233_154578_155932_158592
917384	contig_4151_pilon	+	1423	1	Intergenic	novelGene_65210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149599	151022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_149600_151000
917385	contig_9871_pilon	+	3236	1	Intergenic	novelGene_75642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2086	2409	372700	373023	NA	80	ATCAAAATAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLAKRSLFSHSPVGYKSKFRVSAPGEGYLSLSALEKGPRDASVFPSFWELLCAETSGPKDTLCSRHCFLGDMRLLCVSARFSLLYLKRDCIKTLSNLINLISLTSS	370614	373850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_370600_373800
917386	contig_10765_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_122882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	724	1026	43592	43894	NA	55	AGAAAAAATTCAAGCCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWKTQIDILGVSELKWTGIGRFESVSDMICYAENDKTKRKGIAFVVRRNISRSILKYSAVSDRITSIHLQGRPVNMTILQIYAQPLRPKMKKLKIFTNF	42868	44658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_42900_44700
917387	contig_9363_pilon	-	2626	18	Intergenic	novelGene_6594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	525.614157167149	6	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	439	1113	773929	758771	TRUE	40	AGAAGTGCAAGAGTATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGSLGPPMKGLGP	777072	753798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758807_765812_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977
917388	contig_9995_pilon	+	4201	1	Intergenic	novelGene_47802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTCTTGCCTGGCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817816	822017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_817800_822000
917389	contig_1867_pilon	-	3772	1	Intergenic	novelGene_54576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGCCTGTGTCAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457372	453600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_453600_457400
917390	contig_15092_pilon	-	9891	1	Intergenic	novelGene_57815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	354	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	252	759	2716	3474	332837	332079	NA	30	TGCAACTACCTCCCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKNSCKHTSVIGIWNARSMNQGKLDVVKNEIECIKIAIAGNSELKWTGIGHFELDNHIVYYVDNDKLKRNDTAFIVKKNITLKYNTVSDRIIPVHLQGRPVNTIIIQIYAPTTNAKEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDAFIITGDWNAKVRNEEGSVVRKYGLGDRNDTRDHMIELCKTDDLFIGNTFFQQHKQRLYTWTSPDEIHRNQIDCICGKRPWRSSISLVRTKARGQLQNRLSIAYMQVQVEAEDN	335552	325661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_325700_335600
917391	contig_6589_pilon	+	1685	13	Intergenic	novelGene_25724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	71.0293366621614	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	86	1261	460735	485809	FALSE	75	CAACAAAAATAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCVCPTKNQSSLLSVVGLGGWPETV	451705	486233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_467000_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_485738
917392	contig_5467_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_111962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAATTGAACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113217	112540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_-_112500_113200
917393	contig_13924_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_147770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAAAGATTAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5960	2689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_2700_6000
917394	contig_615_pilon	-	2711	3	Intergenic	novelGene_80031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAAATTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26014	8771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_10898_22343_22407_25492
917395	contig_6137_pilon	-	3957	3	Intergenic	novelGene_59146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	11	119	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	319	1014	1126385	1026331	FALSE	25	GCCCCAGCAGTTTCATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLELREASILIHGLGTFQPLQSTMASQEATPSSQLEESNALDLPSACDIRDYVLQKPCQEANSEDFSSLEAFSFPCSSEVDPDTSNLNTEQNDCWTSENFWLDPSMKSQPETQEEDDGLRKSLDRFYETFGHSQLASRNPLSVSVSQRLSQKITELKGQESQKYALRSFQMAQVILNRDGCSILRRRSRDISFYPLGEGSMSLDDEKPTPGLSKDIIHFLLQQKVMKDP	1126703	1023387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1026774_1121976_1122159_1126314
917396	contig_9981_pilon	+	1832	10	Intergenic	novelGene_121056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTTTTTACTCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264889	295947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_265413_269463_269581_273396_273573_274632_274748_278228_278391_278552_278677_284912_285133_286454_286562_294259_294379_295778
917397	contig_5718_pilon	-	3452	2	Intergenic	novelGene_110412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGCTGCGTTAGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1568420	1439823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1443191_1568335
917398	contig_1372_pilon	-	4944	6	Intergenic	novelGene_140503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	413	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAATGTCCCCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204862	534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_2074_138033_139087_139186_139703_144477_145230_145667_146183_204293
917399	contig_6278_pilon	+	6005	10	Intergenic	novelGene_119819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_7	78.3951686594002	144	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	923	2545	479348	547401	FALSE	15	TGCTGAGTTGGTACTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMLDLDEDDDREESLMMNRLANVRKCTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPHPDPLQIPHLILPPVPPRLDLIQKGIVRSPCSSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRDPPPPPPERPPPIPPDNRLSRHFHHVESVPSRDQPMPLEAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGDGSPKPGITASSNVNGRHSRMGPDPVILRKHRCHDLPLEGTKVFSNGHLGDEEYDVPPRLSPPPPAATLLPSVKCTGPLASSVSEKARDLVEEDDNEYKVPSSHPVSLNSQPSHCHNVKPPVRSCDNGHCTLNGTHGTPSEMKKSNIPELGIYLKGDVFDSASDPVPLPPARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIHPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFILPSDPFFDPASGQIPLPPARRVPGENVKSNRTSQDYDQLPPCPDGSQAPARPPKPRPRRTAPEIHHRKPHGPEAALEDVDAKIAKLMGEGYAFEEVKRALEIAQNNVEVARSILREFAFPPPVSPRLNL	478425	550861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_+_479426_493772_493959_495547_495914_509370_509466_520733_520881_524001_524100_524215_524348_528952_529094_539905_540026_547141
917400	contig_18208_pilon	-	607	1	Intergenic	novelGene_176170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAATAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35327	34720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_-_34700_35300
917401	contig_18184_pilon	+	4305	2	Intergenic	novelGene_123884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	66	344	553827	554105	TRUE	30	ATCATGCAGACACTGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTANIILSGERVRAFSLKTGMRKRCPLSPLLFSIVLEVLARAVRQEREIKRIQIGKKEVKLSLFTNDMIPYLENPKNSIRKLLDLTRIQQRCRVKDRHTKISWVPLHSQGET	553761	558318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_554220_554471
917402	contig_9180_pilon	-	2916	4	Intergenic	novelGene_109103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAATTCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476750	234661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_-_236947_397274_397331_413851_414132_476455
917403	contig_20662_pilon	+	661	6	Intergenic	novelGene_177646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGAGTGTGGAACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55433	72938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_+_55543_57088_57150_57533_57702_63603_63755_68470_68562_72857
917404	contig_4783_pilon	-	2467	3	Intergenic	novelGene_108339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	37	384	32076	31729	TRUE	45	GCTTAACTAGTAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKIEVEGKFLSMILGMYEKPTANVILNGERLRAFLLKSGTKQKCPFSPLLFNVLEVLARVIRQEKEIKAMQIRKEEVKLLLFTDDILCIENPRESTRKLLELIEEFSKVAGYRVNKQVSWVSIHKQ	32112	29385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_29610_29653_30523_30738
917405	contig_16846_pilon	-	2435	9	Intergenic	novelGene_82935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	182.726186889017	45	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	511	1368	599134	575489	TRUE	5	CCTGAGGGTGGGGGTGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRRDTDSDTQDANDSSCKSSERSLPDCTPHPNSISIDAGPRQAPKIAQIKRNLSYGDNSDPALEASSLPPPDPWLETTSSSPAEPAQPGACRRDGYWFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCEQNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKPPPPVPKKPAKSKPAVSRDKASDAGDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYVPEAQTRL	648129	518579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_518858_520464_520572_574806_575708_576521_576678_577456_577549_598743_599157_599687_599777_602407_602772_648094
917406	contig_11656_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_54034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAAAAAAAGAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510195	512351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_510200_512400
917407	contig_20356_pilon	+	2124	2	Intergenic	novelGene_159546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	34	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTGGGAAGATAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121889	124611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_122552_123149
917408	contig_6937_pilon	+	757	1	Intergenic	novelGene_175014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194454	195211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6937_pilon_+_194500_195200
917409	contig_6227_pilon	-	3078	1	Intergenic	novelGene_49806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTATATTTTTATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285416	1282338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1282300_1285400
917410	contig_17989_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_150843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273888	272076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_272100_273900
917411	contig_1759_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_171334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAGTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52718	50105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_50100_52700
917412	contig_13854_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_154123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAACAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296873	298768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_296900_298800
917413	contig_3151_pilon	-	2840	7	Intergenic	novelGene_139173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	97.1895341873576	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	901	2703	137	2839	21520	10067	FALSE	45	GTAAGTCAGCATTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLMPASSELNNGQNFLTQWMTNPSRAGVILNRGFPVLEAEGQNQAAVNLSTSFPIKATHFSNSFGFINEEDLLHEEQKLETNSSYKLQSDKSKTHTVFSVTKKKPQIVAHKDVPGYWEDNKNDFILDLASEFKEVAYKDPLFNKLEQLKEVQQKKQEQLKRQQLEQLQRLMEEQEKLLTMVSEQHTFPASTLLPDGQSQEYRAPCTSATVDKTTPFLPSFIHQNQTQEKVYTSSILLDEQNNFCRTANQDFVLTSKSSASPSLFCAAQCQEAPVKENDLKEENHRHPSGEGILSCWEKMTKQILEENDTNLKQIGDSSEMVNIEERPIKAAIREKKQTFEDYLEEQIRLEEQELKQKQLREAEGSLLIKAKPKRPFLKRGEGLARFTNAKSKFQIVKESKLVTNQSISEDQHQFKVDRQQFQRKTAVINKGPCTENSTVKKNSKVRTKSGSITLNQKPKLLKSNNRKSLSPLGLKIQAGKKCDGQFRDQINSELKVESNNKENVLEGTKPGDTGCKVWSKEKHPLLTGLVNCMASKSLIGKTVKESESSFDISLQKKLESWEQEKEKENLELDEFLFLEQAADEMSFSSNSSFVLKILERDQQIGKGHQMYSTPVKALQQEKTNTVDPISQWNQNEDLDHIEHKNKSECEVPPKQNDSVSSPTGLMEQSYKISRRAFQMNTSENQTRWNANDDEGVRNSDSSADSEEQLDITIKPSTEDKERCLSSSADSAEVSDGKELFRDTETQEKDKSRDIDLDLSDKDYSSGESIIIESMKNKVSESSRKTSSISMSRVDFDDERTWSDLEENSCKHDVILGNEAVYGTLQTSCPNSEICVLDKTVKRKIALVKKGEDLSKSSRSIGPPPTSDLMIKFFPSLKPKPKSDSRLGNEPQLTISEDQLP	25981	10065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_11687_12004_12108_12955_13068_14911_15212_20233_20358_21076_21587_25911
917414	contig_7411_pilon	-	6406	1	Intergenic	novelGene_136986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	260	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATGAGGTAATAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178981	172575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_172600_179000
917415	contig_15376_pilon	-	3542	21	Intergenic	novelGene_154686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_10	23.2453758842485	226	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	36	2489	273007	163980	FALSE	10	CTCCTGGGAAGTGGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGILYFVDSNEMYGTPSVFLTEEGHLHIQMHLVKGEDLAVKTKFTIPLKEWFRLDISFNGGQIVVTTSIGQDLKSYHNQTISFREDFHYNDTAGYFIIGGSRYVAGIQGFFGPLKYYRLRTLDPAQIFNPLLEKQLAEQIKLYYERCAEIQEIVSVYTSTVQQGGERQEACDLWNSYLALKHRYGSPSMCKAFPWEKELKDKHPSLFQALLEMDLLTVPRNSNEFILEIGGRIFEKAIKRLSSVDGLHQISSVVPFLMDSSCCGYHKASYYLTVFYETGLNVLQDQLQGMLYSLVGGQGSERLSSMNLGYKHYQGVDNYPLDWELSYAYYSNIAMKTPLDQHTLQGDQAYVETIRLKDDEILKVQTKEDGDVFMWLKHEATRGSAAAQQRLAQMLFWGQQGVAKNPEAAIEWYAKGALETEDPALIYDYAIVLFKGQGVKKNRRLALELMKKAASKGLHQAVNGLGWYYHQFKKNYAKAAKYWLKAEEMGNPDASYNLGVLYLDGIFPGVPGRNQTLAGEYFHKAAQGGHIEGTLWCSLYYITGNLETFPRDPEKAVVWAKHVAEKNGYLGHVIRKGLNAYLEGSWHEALLYYVLAAETGIEVSQTNLAHICEERPDLARRYLGVNCVWRYYNFSVFQIDAPSFAYLKMGDLYYYGHQNQSQDLELSVQMYAQAALDGDSQGFFNLALLIEEGAIIPHHILDFLEIDSTIYSSNFSILRELYERCWSHSNEESFSPCSLAWLYLHLRLVWGALLHSALIYFLGTFLLSVLIAWTVQYFQSVSASHSSPTPARTSPDPDASTSSPAATPAADALDQGQPTVTNNPEPRG	273042	162926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_-_164120_175490_175564_175645_175749_176941_177070_181960_182071_183360_183446_183578_183670_192061_192146_195070_195199_197666_197844_201459_201523_209024_209166_212047_212168_232016_232197_234063_234276_255754_255896_258286_258420_261381_261515_268796_268856_272526_272643_272970
917416	contig_6847_pilon	+	1953	6	Intergenic	novelGene_143880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	727.854820688851	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	655	1161	102585	110600	TRUE	65	TTTAAAAAAAAAAAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVFVFLSHACFSCVQLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	101150	112348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_101275_102054_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110653_111608
917417	contig_6445_pilon	-	1546	14	Intergenic	novelGene_76897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	809.938758733899	9	21	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	68	781	96360	64923	TRUE	10	CATTAGCCTTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAAGPAPPPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKISTQRPRTQPKPPTALTSLRSSSRKGSLCR	96427	42872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68081_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
917418	contig_16211_pilon	+	2683	6	Intergenic	novelGene_150062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79846	92362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_80000_80383_80504_85310_85427_86272_87790_87917_88078_91745
917419	contig_7057_pilon	-	969	4	Intergenic	novelGene_123352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	523	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACTTGAACTCCTCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943717	941080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_941105_941206_941285_941402_941523_942970
917420	contig_7093_pilon	+	4654	1	Intergenic	novelGene_157962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	119	352	36241	36474	NA	80	GAATGAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPHLPLLTSVRTLARFQPLPKLLRSPFRDPNNRSRCSRMVIRVYIASSSGSTAVRRVESPPLLFSYTSVPSCPRTVKLRKFVWQLLLRKTEASLAPPPLLLFLPFVASVSFFLVV	36122	40776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_36100_40800
917421	contig_4496_pilon	-	3136	1	Intergenic	novelGene_66688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	747	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCTCTTTAAAATGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931037	927901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_927900_931000
917422	contig_6102_pilon	-	2181	2	Intergenic	novelGene_32182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	1640	2179	868153	867614	FALSE	35	AGATATCTCTAGAAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTTAPPGLFLFQSRGKSRPKWQAVPLTQRPRISADPGHGLFPSEKWRGGCRPSILVSPFPQVYHHHHHQQRLFTSLLAVKYFLSGLVTPSRVTNFSFHFSRLPILCVPPPQPSSHGHRSRFSEKSPKARGQAVRRPTVFYREEGEREERRERVQQGERTKGGAGAGKKREELGDSAFS	869867	867611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_869699_869773
917423	contig_14732_pilon	-	2350	1	Intergenic	novelGene_169707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCAATACCAGTTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69445	67095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_67100_69400
917424	contig_1008_pilon	-	3480	1	Intergenic	novelGene_121629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	191	628	1181145	1180708	NA	40	GTACAAGTACCTGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDIVPKDEPLRLGVTQKTTGEELPPQSRVDLKDVDGVKFLGPSFADMARLKMRRNSCKHPLIIRTWNVQSINLGKLEIVKNEMECIKIDILDISEMKLTGIGHFESDNQMVYYAGNDNLNRKGIAFIIKKNISRSILK	1181335	1177855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_1177900_1181300
917425	contig_3151_pilon	+	1613	1	Intergenic	novelGene_139183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAACAAAAAAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109851	111464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_109900_111500
917426	contig_8681_pilon	-	1272	1	Intergenic	novelGene_157204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGGCCCAGCCAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177984	176712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_176700_178000
917427	contig_5988_pilon	-	6409	16	Intergenic	novelGene_15900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	472.847854318208	115	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2084	6252	156	6407	574449	563688	FALSE	35	CCAGCACAGCTACACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPSSVDVNSRQLVGGSQAFYQRPPYPGPLPLQQQQLWQQQQQQQATAATSMRLAMSTRFPSTPGPELGRQALGSPMTGIPTRLPGPGEAVPGPAGPAQFIELRHNVQKGLGPGGPPFPGQGPPQRPRFYALSEDPHRLAPEGLRSLTVSGLLPQKPSAPPATELNSSLHPTPHTKGPNLAAGLELVSRPPSSTELSRPPPLALEAGKLPCEDSELDDDFDAHKALEDDEELAHLGLGVDVAKGDDELGTLENLETNDPHLDDLLNGDEFDLLAYTDPELDTGDKKDIFNEHLRLVESANEKAEREALLRGVEPGPLGPEERPAPAPAPAPASAPDASEPRLAPVLPEVKTKVEEGGSHPSPCQFTITTPKVEPAPATTSLGLGLKPGQSVIGNRDTRMGTGPFSSSGHTGEKGPFGATGGPPAHLLAPSPLSGPGGSSLLEKFELESGTLALPSGHTASGDELDKMESSLVASELPLLIEDLLEHEKKELQKKQQLSAQLQPAQQQQQQHSLLSTPGSAQAMPLPHEGSSSLAGPQQQLSLGLGGTRQPGLAHPLIPTQPPAHALQQRLAPSMAMVSNQGHMLSGQHGGQAGLVPQQSPQPVLTQKPMGTVPPSMCMKPQQLAMQQQLANSFFPDTDLDKFAAEDIIDPIAKAKMVALKGIKKVMAQGSIGVAPGMNRQQVSLLAQRLSGGPGNDLQNHVAPGSGQERSAADPSQPRPNPPTFAQGVINEADQRQYEEWLFHTQQLLQMQLKVLEEQIGVHRKSRKALCAKQRTAKKAGREFPEADAEKLKLVTEQQSKIQKQLDQVRKQQKEHTNLMAEYRNKQQQQQQQQQQQQQHSAVLALSPSQSPRLLTKLPGQLLPGHGLQPPQGPLGGQAGNLRLPPGGMALPGQPGGPFLNTARAQQQQQQHSGGAGALTGPSGSFFPGNLALRGLGPDSRLLQERQLQQQRMQLAQKLQQQQQQQQQQQHLLGQVAIQQQQQQGPGVQANQALGPKPQGLLPPNSHQGLLVQQLSPQPSQGPQGMLGPAQVAVLQQQHQQQQHPGALGPQGPHRQVLLTQPRVLSSPQLAQQGQGLMAHRLVTSQQQQQQQQHQQQGSMAGLSHLQQGLMPHSGQPKLNAQPMGSLQQQQLQQHQFQQQQQQLQQQQQLQQQQQQLQQQQQLQQQQVQQQQLQQQQLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQFQQQQQMGLLNQSRTLLSPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVTLGPGMPAKPLQHFSSPGALGPTLLLTGKEQGIVETALPPEVTEGPSTHQGGPLAVGTTPESTAAEPGEVKPSVSGDSQLLLVQPQAQPQPNSLQLQPPLRLPGQQQQVNLLHTAGGGSHGQLGSGSSSEASSVPHLLSQPSVSLGEQPGPMSQNLMGPQHPLGLERPMQSNVGPQPPKPGPVPQSGQGLPGAGVMPTVGQLRAQLQGVLAKTPQLRHLSPQQQQQLQALLMQRQLQQSQTVRQTPPFQEPGTQPSPLQGLLGRQPQLGSFPGSQTGPLQELGAGPRPQGPSRLPAPQGALSTGPVLGPVHPTPPPSSPQEPKRPSPKLPSPSSQLHSEVQLTPTQPGTPKPREPSGRVSPAAAQLADTFFGKGLGPWDPPDNLAEAQKPDPGHLEQVNGQAVPEPPHVSIKQEPREEPCALGAQAVKRETNGEPLGTPGTSNHLLLAGHRSEAGHLLLQKLLRAKNVQLSTGRGPEGLRAEVNGHLDSKLTGLEQKLQGTPSNKEDAAARKPLTPKPKRVQKASDRLVSSRKKLRKEDGVRASEALLKQLKQELSLLPLTEPTITANFSLFAPFGSGCSISGQSQLRGAFGSGALPTGPDYYSQLLTKNNLSNPPTPPSSLPPTPPPSVQQKMVNGVTPSEELGEHPKDAASARETEGALRNASEVKSLDLLAALPTPPHNQTEDVRMESDEDSDSPDSIVPASSPESILGEEAPRFPQLGSCRWEQDDRALSPVIPIIPRASIPVFPDTKPYGALDLEVPGKLPATTWEKGKGSEVSVMLTVSAAAAKNLNGVMVAVAELLSMKIPNSYEVLFSESPAQAGTEPKKREAEGPGGKEKGLGGKSPEAGPDWLKQFDAVLPGYTLKSQLDILSLLKQESPAPEPP	574831	563685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_563712_563900_564029_564106_564240_564915_565047_565135_565312_565486_565563_566229_566390_566542_566711_566833_566975_567110_569958_570057_570291_570402_570470_570574_570660_570818_570943_572690_574571_574797
917428	contig_15720_pilon	-	2385	2	Intergenic	novelGene_41960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1088	1543	307437	306982	TRUE	35	TGTTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	308524	305307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305799_306630
917430	contig_9649_pilon	-	2149	1	Intergenic	novelGene_160686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTAAAGCACAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19889	17740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_-_17700_19900
917431	contig_9646_pilon	-	3122	1	Intergenic	novelGene_117475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	4	15	320	334	404037	404023	NA	10	TCTGTTTCTTTATTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLFEETILYPLSGLGIFVFQQLTICLDLCLNSQLCPIGLHVYPYTSTTFFDYYIFTVCFEIRKCEFSYSVLFQDCFGILEPSAIPYELEDGLFNLSKKAVGILIGIMLNL	404356	401234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_401200_404400
917432	contig_5341_pilon	-	1204	2	Intergenic	novelGene_168019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340896	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338767_340654
917433	contig_9706_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_20923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACTAGACTGACAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171409	173280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_171400_173300
917434	contig_4232_pilon	+	612	1	Intergenic	novelGene_63388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTAGCCTCCATCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467251	467863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467300_467900
917435	contig_7396_pilon	-	2380	14	Intergenic	novelGene_79583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3262.12360317123	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	124	1398	255163	246442	FALSE	35	TAGACTTACAATGTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNNTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257477	245459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
917436	contig_16535_pilon	-	2577	2	Intergenic	novelGene_167714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1681	2058	396321	395944	FALSE	40	CAGACCCTAAGCCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDTVLRSGHPVSHASRQASLSAPQPFGPRPGLCLAQANVTKLFSNPTSAWRHLLFQQAYCLKVLCSRSGRMGREAHCTVLNWSPGLVLLLRFLCCRFSLSPVLLLSVCLLSLGGFQPRDPVMD	438783	395424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_397725_438506
917437	contig_6842_pilon	+	1522	10	Intergenic	novelGene_130679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	361	junction_6	161.572672178997	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	349	1521	347570	398321	FALSE	55	AAGAAAAGCAAGAGCGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPK	345998	398322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_346346_347568_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291
917438	contig_3469_pilon	-	1701	10	Intergenic	novelGene_34167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_9	80.801540139337	19	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	97	1059	413507	392502	FALSE	80	AAGAAAAAAAAAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSILTCTFKNLPSTSEWALRFSMRPLSCSSQLRAAPAAQTKSKKTLAKPNMRNIVVVDGVRIPFLLSGTFYKDLMPHDLARAALTGLLHRTSLPKEVVDYLIFGTVIQEVKTSNVAREAALGAGFSDRTPAHTVTMACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLVTVNAVCV	427532	391859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_392651_393186_393368_393720_393909_395429_395518_403815_403916_408080_408126_408540_408641_413288_413334_413440_413516_427444
917439	contig_12479_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_56846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	621	926	174708	174403	NA	15	CTCTGGGGACCATGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVTVGVQNKTLDDLSVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFVENTDKKMEEFKKTIQEKNAKINS	175328	172610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_172600_175300
917440	contig_9049_pilon	+	4068	1	Intergenic	novelGene_83154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	2346	2915	93180	93749	NA	40	GCACAAGTAACACTCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTCLAFLKLKELKKTFTPRVAILKDSTRKILNDTGSINRRWREYAESLGQKELLDAQPFQEVAYDQEPMVMKEEFQAALKALVKNKPPGIDGIPIEMFQQTDAGLQVLTRLCQEIWKTATWPTSWKKSIFVPIPKKGDPIECGNYQTISLISQTTKILLKIIQKQLQLYIDRELPEV	90834	94902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_90800_94900
917441	contig_8075_pilon	+	2920	2	Intergenic	novelGene_42495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAACATTTGACTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677767	685528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_680666_685506
917442	contig_10225_pilon	-	1940	10	Intergenic	novelGene_86787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	42	323	47709	47428	TRUE	5	GCTCGGCTCAGCCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47750	20679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39911_40139_40305_40967_41051_41435_41455_46278_46878_47356
917443	contig_16492_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_100296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTTAACACTCACATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151099	151960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_151100_152000
917444	contig_8045_pilon	+	957	4	Intergenic	novelGene_35405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_2	583.850627776965	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	396	491	118627	118722	FALSE	20	GTGTTAAAGTTCTTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	117281	119188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_117349_117450_117513_118075_118243_118527
917445	contig_12437_pilon	+	4441	1	Intergenic	novelGene_169079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTATTCAGACCAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92576	97017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_92600_97000
917446	contig_7629_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_153581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAGGAGCACAAAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336136	336947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_336100_336900
917447	contig_7549_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_164533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCTGAGAAGAGCAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708189	705995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_706000_708200
917448	contig_18869_pilon	+	1391	3	Intergenic	novelGene_56436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_1	87	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	17	736	116204	120040	FALSE	30	ATATCATGTTCCGTACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRVLSVLLVPIPAEATGRLGPRAQLHREQEVLGSLTAAGSLQVLSLAPGGGGNCSLEGPFRQFVWENSPNRSTPTDKPKLLILSKKYELFIYEFNLKDGRCDSTILFSCNGETLQKLIEDQSMSISLSSLRILSFHNNTSLLFINKHIVLHVLFPEGDAEIRVLNSFTLDLAAPAVGGIVDTQLCRGILFVLNSLGWICILGSKDVDMQGKRIRRKVSLFRLLVLEVREWGEWLVCFR	116187	120695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116392_118630_118816_119693
917449	contig_6533_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_114658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCTCTGTTTGTGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251698	253351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_251700_253400
917450	contig_2940_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_81974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTAGACAAAATCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1087179	1088329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1087200_1088300
917452	contig_1154_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_87128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTAAAAGCTTGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452400	454594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_452400_454600
917453	contig_8303_pilon	-	2218	6	Intergenic	novelGene_154915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	447	junction_4	98.6217014657525	16	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	225	872	51496	29167	FALSE	15	GCAAGTATTGTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGATRPNGPNTGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEFQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIFMAIAKKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	54804	27820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29283_33988_34083_35771_35895_36176_36329_51333_51593_54676
917454	contig_7457_pilon	-	2111	17	Intergenic	novelGene_31474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_16	201.481388718661	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2004	108	2111	549396	516989	FALSE	5	GTGGGTGTATTTCTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNVRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVRPMFVSNWTEETLRGNPVLQLDPAVPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIFHMMFGVTLSLFNHTYFRKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSEKAPSLLIHFINMFLFSYSDTGNAVLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKPLVLRHQYLRRKHL	551371	516988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_517097_517489_517707_518245_518365_520402_520494_520938_521094_521407_521548_522385_522537_525700_525914_528051_528146_528943_529027_530848_530976_531312_531396_537254_537384_537938_538037_539131_539211_549279_549443_551310
917455	contig_12277_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_139666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	1933	2268	31665	31330	NA	25	CGGAAGCAGAGACCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTDTSTQSKQALIQRHIWLLKKDRCLAPLNSTKDLLSSRFSLIQAYVQDVDSTGSCLPGEHFGQPIKIHQSGTCPLLRNGPRAWRQQAWKVPGTNTRLSPLTGRGHCTRQ	33597	31329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_31300_33600
917456	contig_7428_pilon	+	3259	3	Intergenic	novelGene_77708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	8	807	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	33	347	322115	322832	FALSE	25	TCTCCCCTTGGACAGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQQQQQQQQQLRNLRDFLLVYNRMTELCFQRCVPSLHHRALDAEEEACLHSCAGKLIHSNHRLMATYVQLMPALVQRRIADYEAASAVPGVAAEQPGASPSGS	322082	325744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_322157_322350_322447_322655
917457	contig_4426_pilon	+	3710	1	Intergenic	novelGene_15374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGCACACCAATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162427	166137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_162400_166100
917458	contig_5031_pilon	+	3707	1	Intergenic	novelGene_133202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTATCTCTTTATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63157	66864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_63200_66900
917459	contig_3956_pilon	+	1896	6	Intergenic	novelGene_14984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1516.60853221917	7	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	389	961	1288971	1290075	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQRAALRGGGGWGCSCEGGA	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282907_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289834_1290018
917460	contig_14566_pilon	-	2655	3	Intergenic	novelGene_148831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1688	2071	68972	68589	TRUE	45	TATTCCAACATACCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLYLNIKKTRILTIGLISNIIINRENVKVLKDFTLLAFTTKAHGSSSQEIRQCVTLGKSAAKELFKVLKNKDVTSRTKVRLTQAMMFSIAFYECESWTKLTTNKGDQRRIDAFELRC	82565	62017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_-_62067_68053_70196_82101
917461	SIRV7	-	1996	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-9	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTAATTAGTGTTAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114925	1007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1446_1529_2676_2993_3112_43028_43078_114680
917462	contig_5084_pilon	-	5356	2	Intergenic	novelGene_64584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783499	772864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_774605_779883
917463	contig_17059_pilon	+	2197	1	Intergenic	novelGene_166098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAACCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529558	531755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_529600_531800
917464	contig_13265_pilon	+	1238	2	Intergenic	novelGene_145994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	215	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	540	878	18804	19142	FALSE	20	CTCGAGAGTATGGCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSIPDCTSKCRSLQHALDILSVITKGSEGQIKAFLSSYCYNATTIKDAFGRNALHLVSSCGKKGVLDWLIEKGVDPLVKDKESGWTALHRSIFYGHIDCVWSLLKVSSFF	8628	19502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_8798_18433
917465	contig_9683_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_151270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCAGAGTAAAGTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126661	128368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_126700_128400
917466	contig_11780_pilon	+	3654	1	Intergenic	novelGene_134306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTTTCTCTTTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93720	97374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_93700_97400
917467	scaffold_12510_pilon	+	2606	3	Intergenic	novelGene_151419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTGCTAAACATCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650226	653884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_651936_652541_653041_653486
917468	contig_6710_pilon	-	389	2	Intergenic	novelGene_98282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	10	GGCATCCATGTCTGGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
917469	contig_12250_pilon	+	2723	5	Intergenic	novelGene_80601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	6.04152298679729	107	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAACAATCTATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333233	336673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_333426_333541_333787_334118_334227_334322_334409_334581
917470	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
917471	contig_18162_pilon	+	2238	3	Intergenic	novelGene_122292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1344	1919	10163	10738	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSINYLGSVYPSRAVITTMKERHVGRSVFVSSRARQLGLFGFTAYSSSKFALRGLAEALQMEVKPYNIYVAVAYPPDTDTPGLAEENKTKPLETRLISETTSVCRPEQVAKQIVKDAIQGNFNSSIGSDGYVLSSLTCGMAPVTSVTEGLQQVVTMGLFRTIPLFYLGSFDSIVCRCMMQRAKSDVADKAA	7518	16613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_+_8782_10082_10809_16364
917472	contig_3751_pilon	-	3568	24	Intergenic	novelGene_158624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	194.864346204097	36	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	683	1597	127436	76346	TRUE	30	AAATTTTTCTTGATGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFHGMSADFTSENFSAAWYLIENHSNTSFEQLKTAVNNLKKQANKKNEGSLAYVKGGLSTFFEAQDALSAIHQKLEADGTEKVEGSMTQKLENVLNRASNTADTLFQEVLGRKDKADSTRNALNVLQRFKFLFNLPLNIERNIQKGDYDVVINDYEKAKSLFGKTEVQVFKKYYAEVETRIEALRELLLDKLLETPSTLHDQKRYIRYLSDLHAPGDPAWQCIGAQHKWILQLMHSCKEGYVKDLKVAQVCTAPCWILIMMCAPQCWVILVRQHHSRGAAAFSLVEMTHGDTKLPTGWRLLKN	171786	22535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_23635_25813_25931_29596_29664_41665_41728_42822_42883_43356_43438_61755_61818_62967_63090_64455_64614_64774_64841_76268_76394_86109_86236_101456_101575_102973_103077_103866_103949_104086_104233_112860_112942_125272_125398_127350_127465_130121_130235_131796_131872_150782_150910_153409_153587_171624
917473	contig_12969_pilon	-	2862	1	Intergenic	novelGene_61651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAACCAAAGTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14781	11919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_11900_14800
917474	scaffold_12124_pilon	+	2382	3	Intergenic	novelGene_22110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	1.5	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1	519	893568	894086	TRUE	25	GTGTGTCCGGAAACACGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCPSPAWAPDPACPLCPQGCSEDPISTTQWRACLRGETAPDACWCCGGALEAAELPSAWLPTSTADEQGTHLCERPPHCTIYLGSSADPGAARKEPSGTQAPAFTCVWVSISPAGWPPSPSSPLRTPYHNPQWRPCLGREDPLAGPLCPRQNPRERREAHCSKSCFYCRAAE	893567	896551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_894148_894465_894711_894994
917475	contig_253_pilon	+	5752	18	Intergenic	novelGene_129751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1614	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3468	3908	707538	709869	TRUE	50	CTGTAACCACAGGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSLGTMDVPWSSLVGLCSVTVRYDPRILAFSTSDSSFFPLGLFSFSRTMVRSVACSRSNCRRLKRSSRLALWWSLGPAPGDDRVTIPRGETGSWMSCSMEVGECGGGVRGSSQLRRGRRTLACTASSSLSSIFRFWAFSELSSW	700785	750727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_703412_703699_703912_704488_704649_705221_705389_707235_707948_709838_709939_711529_711652_712423_712694_714364_714449_726341_726739_728456_728582_732484_732602_733586_733744_734838_734926_735280_735390_744951_745132_750016_750064_750647
917476	contig_8357_pilon	-	4364	1	Intergenic	novelGene_39785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCTTGCTGCTCACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	988424	984060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_984100_988400
917477	contig_992_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_164302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAAAAATAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380150	377553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_377600_380200
917478	contig_8552_pilon	+	1498	10	Intergenic	novelGene_80089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	116.469144962926	15	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	751	1311	512672	517971	TRUE	20	GATTTGGAATGGCTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSTNSNLKFLFKGKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFGEAIGMGFPVKVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	510660	518959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_510700_511085_511204_512078_512793_513301_513386_513742_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912_517986_518786
917479	contig_2332_pilon	+	2871	3	Intergenic	novelGene_58675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6257	junction_2	293.5	20	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTGCGTCTTTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331253	334836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_333928_334162_334280_334756
917480	contig_7131_pilon	-	1730	1	Intergenic	novelGene_175337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATGTAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136233	134503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7131_pilon_-_134500_136200
917481	contig_11318_pilon	+	1236	1	Intergenic	novelGene_48151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23804	25040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_23800_25000
917482	contig_12923_pilon	-	4664	16	Intergenic	novelGene_30078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	326.172347080497	57	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	2114	3646	68307	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPTHTFFQIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101260	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45982_46055_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
917483	contig_5732_pilon	-	2464	6	Intergenic	novelGene_119571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGGGGCCACCAGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132592	94495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_94725_107353_107437_127216_127385_129360_129454_130287_130391_130804
917484	contig_8050_pilon	+	4356	1	Intergenic	novelGene_114863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGAATCTTTAGGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396986	401342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_397000_401300
917485	contig_13226_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_175346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	2	535	231060	230527	NA	10	TGTCTTTTTTTGCATTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQEREKKKQKKTKQHQQPTNGTQRAARGIQAAGSPRSRDRGRGKQRNKRTKASGSHLSGSRDLEAATCPNVAPQPRRKGQRRRSEPGTRAKGGGGSERQARNQKKQKKKKKKQHQQPTNGTQRAARPGAQNPSSRCPPAKRLWPREAGEHELGRRGLGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	231061	228963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_-_229000_231100
917486	contig_2312_pilon	+	1104	2	Intergenic	novelGene_160744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAAAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248350	249498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_+_248992_249035
917487	contig_3018_pilon	-	2639	10	Intergenic	novelGene_78853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	750	junction_3	229.496066294053	58	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1062	1576	2637	577034	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEGGKKCVVYSERWRSNPISQSNHVECYFILLFEIGYYLCSNFSFAFEDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	585528	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_577834_580093_580175_583417_583648_585063
917488	contig_3751_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_158627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	212	607	56108	56503	NA	65	ATTAAAAAAAAAAACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHKRVTKTYHNHVCQNQRQRKNPDSSLRKTRSHLQGETVRLSSDYLTEKMQARRQWDNMYKTLKEKNCQPRIIYPAKLFLKYDGEIRTLPDKQKLWDFVKTKPNLQEILKGRLRLEDQHHSLGHRTALVR	55896	58239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_55900_58200
917490	contig_19606_pilon	+	2388	1	Intergenic	novelGene_148271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGTTAAAATTAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46403	48791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_46400_48800
917491	contig_5145_pilon	+	2616	11	Intergenic	novelGene_131353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	31.2264311121204	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	39	1130	36550	60791	TRUE	15	CTGAGTGGCGACCTCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEVHVQRTQPALQPGLPGVGGTRPPLLRLRNRAWGRIRLRGAGLRAEGGKMADSSGRGGGKPSAAGSNTPSGAKPKGKRVQGGRMVEPRYLQYEKKTTKKVPAADALKASGKMPEVGKKPNLLQKSRGTSDLSGVGKSDLQSTMLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLGRRWCLALYFFFIVVKIHMSSPHLKMYSSYDEPHLRLYCFFCTSYC	36511	114071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514_52606_57458_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509_61335_83195_83734_113666
917492	contig_12644_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_44554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAGAAAAAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1612974	1611563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1611600_1613000
917493	contig_7695_pilon	-	1646	3	Intergenic	novelGene_41569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	114.5	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	407	982	390227	388811	FALSE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNAQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	390633	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_388909_388974_389019_389793
917494	contig_7056_pilon	+	1277	1	Intergenic	novelGene_43731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073154	1074431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1073200_1074400
917495	contig_5945_pilon	-	4491	1	Intergenic	novelGene_104599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	703	149	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATATATTTAACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373209	368718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_368700_373200
917496	contig_16496_pilon	-	1262	3	Intergenic	novelGene_5186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1982	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	311	427	1225	836	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKKKPFAVESIPTHSEDSLGGCNCHHETHQKYSIPR	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_939_1211_1354_3413
917497	contig_15093_pilon	+	4157	24	Intergenic	novelGene_143288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	271.333617428932	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2649	1508	4156	54057	91835	FALSE	30	ATTCTTTGCTAGACAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEETMLSVLRPSQKTTDRAVCSPSASSRPPIDPSELPPDKLHVEMELSPDSQITLYGPLLNAFLCIKENYFGEDDMYMDFEEVISSPVLSLSTSSSSGWTAVGMENDKKENESSAKSIHPLSLRPWDITVLVNLYKVHGRLPVHGTTDGPECPTAFLERLCFEMKKGFRETMLQLVLSPLNVFVSDNYQQRPSVDEVLREGHISLSGLQLRAHAMFSAEGLPLGSDSLEYAWLIDVQAGSLTAKVTAPQLASLLEWGQTFVFHVVCREYELERPKSVIICQHGIDRRFCESKLSCVSGPCPTSDDLKYTMTRLAVDGGDIYVVEHGCATNIKMGAIRVANCNLHNQSVGEGISAAIQDFQVRQYIEQLNNCRVGLQPVVLRRAYWLEAGSANLGLITVDIALAADHHSKHEAQRHFLEIHDARTKRLWFLWPDDTLKNKRCRNKCGCLGGCRFFGGTITGLDFFRLEELTPSSSSAFSSTSAESDMCYGQSLLQPGEWIITKEIPKIIDGHVNGMKKKEWENKSVGIEAERKTQHLSLQVPLRSHSSSSSSEENSSCSAVQPLLASEKESPSSVADDHLVQKEFLHGTKRDDGQGSIPTEVSGNSPVSPNPQDKSVGQSPLRSPLKRQASVCSTRLGSTKSLTAAFYGDKQPVTVGVQFSSDVSRSDENVLDSPKQRRSFGSFPYTPSADSNSFHQYRSMDSSMSMADSEAYFSAAEEFEPISSDEGPGTYPGRKKKKKQTQQIDYSRGSIYHSVEGPLTGHGESSQDSRTLPFKTHPSQASFVSALGGEDDIIEHLYVVEGEKTVESEQITSQQPMMSCYQTYLTQFQVINWSVKHPTNKRTSKSSLHRPLDLDTPTSEESSSSCEQLAVPTFKVIKQGLTA	4665	91836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_4784_5836_5916_7075_7141_25205_25393_31334_31417_31809_32004_34183_34264_36388_36540_40094_40252_40854_40934_43500_43593_44994_45113_52495_52593_54048_54258_66948_67177_67987_68126_74119_74300_77046_77176_77914_78035_78744_79026_83963_84215_87050_87310_88498_89337_91811
917498	contig_6842_pilon	-	2644	1	Intergenic	novelGene_130800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGCCAACTCTTCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1661582	1658938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1658900_1661600
917499	contig_7568_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_174006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAAAAATACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98487	99577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_+_98500_99600
917500	contig_10569_pilon	-	3101	1	Intergenic	novelGene_44050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	841	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1529	2578	2469	1420	NA	30	CAGGATCCATCAATATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTLDNSPVEENTLEVPDRELKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQKLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	3997	896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_900_4000
917501	contig_14047_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_176583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGCCGAGAAGGAAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30877	33153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14047_pilon_+_30900_33200
917502	contig_34_pilon	-	5582	1	Intergenic	novelGene_39982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	4200	4715	212564	212049	NA	35	TCCGCAGAAGGTGAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	216763	211181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_211200_216800
917503	contig_10016_pilon	-	6271	46	Intergenic	novelGene_117847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_7	126.621024915364	143	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1681	5046	48	5093	379493	261403	FALSE	15	TGCCCAGCTTGCTGACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPDETSTVALFKAHEMASKRIEEKIQEEKSVLQNLDLRSQSIFSAVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDRSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAVFTDLSSNDLIRPRISLVCQIVRVGHMELKEGKKHTFGLRRPFGVAVMDITDIIHGKVDDEEKQHFIPFQHIAMETYIRQRQIIMSPLITSHVIGENEPLTSILNKVIATKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHLVDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVYDEDGKLLEKAVHPGAGYEGISEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVSIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNPDGTTLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKFYLTLPGTKVEMEEKELQASKNLASFTPAKDSTKDSFQIATLICSTKLTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVEGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSENETYDFLVFDALVFIISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSAPLAYVKLSKVLNFYVANADDSSKTELLFAALKALKYLFRFIIQSRVLYLRFYGQSEDGDEFNNSIRKLFLSFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPIELSVLFCKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESNIFRQSECRDVLLPLLTDQLSGQLDDSSSKPDHEASSQLLSSILEVLDRKDVGPTTMHIQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHVGSFVACMIAILRQMDDSHYSHYISTFKTKQDIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQSRVFLRAINQFAEVLTRFFMDQASFELQLWNNYFHLAVAFLTHESLQLETFSQAKRNKILKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVELRKATIPIFFDMMQCEFNFSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGKGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLSSSGEVFALLVSSLLENLLDYRTIVMHDESKENRMSCTVNVLNFYKEKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEAAYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIIAYFDRGKMWEKAIKLSKELAETYESKVFDYEGLGNLLKKRASFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLTQFPSAEKMTSTTPPGDDIKSSPKQYMQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFKYSRPFRKGEKDPDNEFATMWIERTTYTTAYTFPGILKWFEVKQITTEEISPLENAIETMEVTNERISNCVQQHAWDRSLSVHPLSMLLNGIVDPAVMGGYSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQMPLLTEGIRIHGEKLTEQLKPLHERLSSCFQELKEKVERLYGVITLPPNLTERKQGRTGSLVLPYIMSSTLRRLSITSVTSSVVSTSSTSSDNAPSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPVREDGENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPEDDLMSPSKKAQRPKSLQLVDSRLTPFHGSSPPQSTPLSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLMTSTLPPPPPPKSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRREAKAPPPPPPKARKSVIPSSEPGSQ	379540	260224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_261508_262159_262264_263498_263638_264301_264471_272045_272213_274374_274513_275187_275272_279818_279996_281376_281464_281908_281994_282579_282662_283979_284122_289575_289681_292458_292549_294264_294385_296529_296621_297237_297279_298321_298482_300562_300649_301512_301668_302035_302095_305619_305721_306641_306721_308028_308124_311463_311563_325153_325250_329825_329963_331794_331902_332723_332795_333494_333607_339198_339334_341401_341503_343124_343215_343454_343553_349938_350123_351138_351243_353982_354056_355764_355864_357368_357494_362222_362349_367041_367185_370255_370329_373125_373256_376460_376543_378205_378364_379451
917504	contig_10475_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_148748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTCTTTATTCCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268296	267012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_267000_268300
917505	contig_5936_pilon	+	3176	1	Intergenic	novelGene_53540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGGAAAAAAAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42493	45669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_42500_45700
917506	contig_8377_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_35089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTGGTTAGCAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141672	139713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_139700_141700
917507	contig_14208_pilon	+	1063	2	Intergenic	novelGene_129078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109702	110800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_110131_110165
917508	contig_6434_pilon	-	3786	1	Intergenic	novelGene_61885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCCTGAATTGTTGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892027	888241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_888200_892000
917509	contig_10627_pilon	-	1727	3	Intergenic	novelGene_59995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	66	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	7	318	286902	285479	TRUE	25	TTTGATGGTTTTTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGMRSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLVY	286908	284018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_284257_284307_285708_286819
917510	contig_5280_pilon	+	2162	2	Intergenic	novelGene_52571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	108	725	52218	52835	FALSE	15	GCTGTAGTCATCTAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKNEVVKISFFLDPQSMLMKAAVKKSKFVLDKSAAKDLFKALESKDVTLRTKVGLTQAMVCSISSYTCESWTMNKEDRRRIDTFELWCWQRILNIPWNVRGMNKSVLEEVQPECSLDVTMVRLCLMYFARVIGRNHSLEKDIMLGKVEDQRKRGRPSMRWIDTVAATVGSNITFVRMAQDRAVLRSVVHRVALSQNRLDGT	23915	54272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_23975_52169
917511	contig_14811_pilon	-	1531	3	Intergenic	novelGene_74486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	506.5	1	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	24	803	375703	357434	TRUE	30	GACAACCCCAAAGTGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKYKLIMLRHGEGAWNKENRFCSWVDQKLNSEGMEEAQNCGKQLKELNFEFDLVFTSVLNRSIHTAWLILEELGQEWVPVESSWRLNERHYGALIGLNREQMALNHGEEQVRLWRRSYNVTPPPIEESHPYYQEIYSDRRYKVCDVPIDQLPRSESLKDVLERLLPYWNERIAPEVLRGKTILISAHGNSSRALLKHLEGISDEDIINITLPTGVPILLELDENLHAVGPHQFLGDQEVIQAAIKKVEDQGKVKRAGK	375726	356580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_-_356879_357003_357613_375102
917512	contig_6272_pilon	-	2117	5	Intergenic	novelGene_160455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190391	169495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_170130_175029_175132_178309_178433_186636_186778_189274
917513	contig_12312_pilon	-	2560	4	Intergenic	novelGene_63950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_3	455.299413085011	11	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	52	561	223896	215838	FALSE	35	TAATGCTTTAAATGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	223947	213838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218881_223842
917514	contig_4136_pilon	+	4993	28	Intergenic	novelGene_161247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	111.760767426689	306	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	1504	4170	161421	238026	FALSE	10	TCATGCTGCTGTTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTFGVNEYRHWIKEELDKIVAYELKTGGVLLHPIFGGGKEKDNPASHLHFSIKHPHTLSWEYYTMFQCKAHLVMRLIENRISMEFMLQVFNKLLSLASTASSQKFQSHMWSQMLVSTSGFLKSISNVSGKDIQPLIKQWVDQSGVVKFYGSFAFNRKRNVLELEIKQDYTSPGTQKYVGPLKVTVQELDGSFNHTLQIEENSLKHDIPCHSKSRRNKKKKIPLMNGEEVDMDLSAMDADSPLLWIRIDPDMSVLRKVEFEQADFMWQYQLRYERDVVAQQESILALEKFPTPASRLALTDILDQEQCFYRVRMSACFCLAKIANSMVSTWTGPPAMKSLFTRMFCCKTCPNIVKTNNFLSFQSYFLQKTMPVAMALLRDVHNLCPKEVLTFILDLIKYNDNRKNKFSDNYYRAEMIDALANSVTPAVSVNNEVRTLDNLNPDVRLILEEITRFLNMEKLLPSYRHTITVSCLRAIRVLQKNGHVPSDPALFKSYAEYGHFVDIRIAALEAVVDYTKVDRSYEELQWLLNMIQTDPVPYVRHKILNMLTKNPPFTKNMESPLCNEALVDQLWKLMNSGTSHDWRLRCGAVDLYFTLFGLSRPSCLPLPELGLVLNLKEKKAVLNPTIIPEAVAGNQEVASNPSSHPQLVGFQNTEDDHLAKEASCNISAHQQGVKRKADTPLGSPLEPGQILEKNEDSSKVKLKIRFSNSQDEEEIDMDTVHDSQAFISHHLNMLERPSTPGLSKYRPASSRSALVPQHSSGCDGTPTTKPPWSMELARKGTGKEQSPLEMSMHPAVAPPLSVFSKESTSSKHSDTHTHTHTHTHTHTDTQTHTHTHRHTHTHTHIHIHSKLLVICLTGTGSRIHGLLSMCCGAKLCLKQKHLPNLW	135088	238849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_135454_135850_135904_143102_143264_153424_153544_154975_155096_156358_156591_158779_158965_160081_160196_161266_161469_163776_163863_168190_168327_169366_169522_170189_170305_170868_170979_180099_180166_181557_181811_183196_183338_186001_186113_188673_188868_189729_189870_195449_195520_196514_196625_211649_211880_214972_215129_215622_215729_226529_226653_237274_237371_237805
917515	contig_9995_pilon	-	3557	1	Intergenic	novelGene_47709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGAGAGAAGACTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335526	331969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_332000_335500
917516	contig_16977_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_169604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGAAAAAAAAAAACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68046	70268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_+_68000_70300
917517	contig_10904_pilon	-	2755	2	Intergenic	novelGene_22635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	685	junction_1	0	13	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1623	2093	505089	499813	FALSE	40	ATAAAGTGTTGCACAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	506711	499150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_500201_505006
917518	contig_990_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_76139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1673486	1672157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1672200_1673500
917519	contig_6823_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_131239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCACTAGCCATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419707	418992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_419000_419700
917520	contig_1146_pilon	+	10591	55	Intergenic	novelGene_84823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_40	231.338720422089	300	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	3269	9810	251	10060	841846	921040	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAATTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VASLSSASLLPRRSRLLVLLCGLRRNPERPSASPALRRLLLHLLLLGFLLSPGPERSVGGGRFGRRLALLRAAALGHVVSGKVMSRRAPGSRLSSGGGGGGTKYPRSWNDWQPRTDSASADPDNLKYSSSRDRGGSYGLQSSNSAVVSRQRHDDTRVHADIQNDEKGGYSVNGGSGENTYGRKSLGQELRVNNVTSPEFTSVQHGSRALANKDMRKSQERSMSYSDESRLSNLLRRITREDDRDRRLATVKQLKEFIQQPENKLVLVKQLDNILAAIHDVLNESSKLLQELRQEGACCLGLLCASLSYEAEKIFKWIFSKFSSSAKDEVKLLYLCATYKALETVGEKKAFSSVMQLVMTSLQSILENVDTPELLCKCVKCILLVARCYPHIFSTNFRDTVDILVGWHIDHTQKPSLTQQVSGWLQSLEPFWVADLAFSTTLLGQFLEDMEAYAEDLSHVASGESVDEDVPPPSVSLPKLAALLRVFSTVVRSIGERFSPIRGPPITEAYVTDVLYRVMRCVTAANQVFFSEAVLTAANECVGVLLGSLDPSMTVHCDMVITYGLDQLENCQTCGTDYIISVLNLLTLIVEQINTKLPSSFVEKLFIPSSKLLFLRYHKEKEVVAVAHAVYQAVLSLKNIPVLETAYKLILGEMTCALNNLLHSLQLPDACSEIKHEAFKNHVFNVDNAKFVVIFDLSALTTIGNAKNSLIGMWALSPTVFALLSKNLMIVHGDLAVHFPAIQYAVLYTLYSHCTRHDHFISSSLSSSSPSLFDGAVISTVTTATKKHFSIILNLLGILLKKDNLNQDTRKLLMTWALEVAVLMKKSETYAPLFSLPCFHKFCKGLLANTLVEDVNICLQACSSLHALSSSLPDDLLHRCVDVCRVQLVHSGTRIRQAFGKLLKSIPLDVVLSNNNHTEIQEISLALRSHMSKAPSNTFHPQDFSDVISFILYGNSHRTGKDNWLERLFYSCQRLDKRDQSTIPRNLLKTDAVLWQWAIWEAAQFTVLSKLRTPLGRAQDTFQTIEGIIRSLAAHTLNPDQDVSQWTAADNDEGHSSNQLRLVLLLQYLENLEKLMYNAYEGCANALTSPPKVIRTFFYTNRQTCQDWLTRIRLSIMRVGLLAGQPAVTVRHGFDLLTEMKTNNLSQGNELEVTIMMVVEALCELHCPEAIQGIAVWSSSIVGKNLLWINSVAQQAEGRFEKASVEYQEHLCALTGVDCCISGFDKSVLSLANSGRNSVSPKHSLNGESRKTVLSKPTDSSPEVINYLGNKACECYISIADWAAVQDWQNAIHDLKKSTSSTSLNLKADFNYIKSLSSFESGEFVECTEQLELLPGENINLLAVGSKEKIDMKKLLPNMLSPDPRELQKSIEVQLLRSSVCLATALNHIEQDQKWQSITENMVKYLKQTSRIAIGPLRLSTLTVSQSLPVLSTLQLYCSSALENTVSNRLSTEDCLIPLFSEALRSCKQHDVRPWMQALRYTMYQSQLLEKIKEQTVPIRSHLMELGLTAAKFARKRGNVSLATRLLAQCSEVQLGKTTTAQDLVQHFKKLSAQGRVDEKWGPELDIEKTKLLYTAGQSAHAMEMLSSCAISFCKSAKAEYAVAKSILTLAKWIQAEWKEISGQLKQVYRAQQQQNFTGLSTLSKNILALIELPTVNTVDVNTMEEVYPRIESESTVHIGVGEPDFILGLLYHLSSVQAPEVAKSWAALASWAYRWGRKVVDNASQGEGVRLLPREKSEVQNLLPDTITDEEKERIYGILGQAVCRPAGIQDEDITLQITESEDNEEDDMVDVIWRQLISSCPWLSELDESATEGVIKVWRKVVDRIFSLYKLSCSAYFTFLKLNAGQVPLDEDDPRLHLSNRAEQSTDDVIVMATLRLLRLLVKHAGELRQYLERGLEKTPTAPWRGIIPQLFSRLNHPEVYVRQSICNLLCRVAQDSPHLILYPAIVGTISLSSESQASGNKFSSAIPTLLGNIQGEELLVSECEGGSPPASQDSNKDEPKSGLNEDQAMMQDCYSKIVDKLSSANPTMVLQVQMLVAELRRVTVLWDELWLGVLLQQHMYVLRRIQQLEDEVKRVQNNNTLRKEEKMAIMREKHTALMKPIVFALEHVRSITAAPAETPHEKWFQDNYGDAIENALEKLKTPSNPAKPGSSWIPFKEIMLSLQQRAQKRASYILRLEEISPWLAAMTNTEIALPGEVSARDTVTIHSVGGTITILPTKTKPKKLLFLGSDGKSYPYLFIGLEDLHLDERIMQFLSIVNTMFATINRQETPRFHARHYSVTPLGTRSGLIQWVDGATPLFGLYKRWQQREAALQAQKAQDSYQTPQNPGIVPRPSELYYSKIGPALKAVGLSLDVSRRDWPLHVMKAVLEELMEATPPNLLAKELWSSCTTPDEWWRVTQSYARSTAVMSMVGYIIGLGDRHLDNVLIDMTTGEVVHIDYNVCFEKGKSLRVPEKVPFRMTQNIETALGVTGVEGVFRLSCEQVLHIMRRGRETLLTLLEAFVYDPLVDWTAGGEAGFAGAVYGGGGQQAESKQSKREMEREITRSLFSSRVAEIKVNWFKNRDEMLVVLPKLDSSLDEYLSLQEQLTDVEKLQGKLLEEIEFLEGAEEVDHPSHTLQHRYSEHTQLQTQQRAVQEAIQVKLNEFEQWITHYQAAFNNLEATQLASLLQEISTQMDLGPPSYVPATAFLQNAGQAHLISQCEQLEGEVGNLLQQRRSVLRGCLEQLHHYATVALQYPKAIFQKHRIEQWKTWMEELICNTTVERCQELYRKYEMQYAPQPPPTVCQFITATEMTLQRYAADINSRLIRQVERLKQEAVTVPVCEDQLKEIERCIKVFLHENGEEGSLSLASVIISALCTLTRRNLMMEGAASSAGEQLVDLTSRDGAWFLEELCSMSGNVTCLVQLLKQCRLAPQDLDIPNPAEASEAVHLANGVYTSLQELNSNFRQIIFPEALRCLMKGEYTLESMLHELDTLIEQTTDGVSLQTLVESLQAYLRNAAMGLEEETHAHYIDVARMLHAQYGELIQPRNGSVDETPKMSAGQMLLVAFDGMFAQVETAFGLLVEKLNKMEIPIAWRKIDIIREARSTQVNFFDDDNHRQVLEEIFFLKRLQTIKEFFRLCGTFSKTLSGSSSLEDQNTVNGPVQIVNVKTLFRNSCFSEDQMAKPIKAFTADFVRQLLIGLPNQALGLTLCSFISALGVDIIAQVEAKDFGAESKVSVDDLCKKAVEHNIQVGKFSQLVMNRATVLASSYDTAWKKHDLVRRLETSISSCKTSLQRVQLHIAMFQWQHEDLLINRPQAMSVTPPPRSAILTSMKKKLHTLSQIETSIATVQVCFVRSSSLRILVLEIKYT	841595	921571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_865015_865174_865680_865837_868288_868426_869381_869441_870489_870704_871488_871615_872212_872286_873176_873275_874891_875066_876788_877014_879121_879224_879762_880033_881587_881719_881880_882043_882473_882593_886933_887022_887109_887212_887696_887838_888386_888587_889038_889236_889420_889586_890329_890485_892192_892336_892487_892690_894775_894886_895701_895850_896203_896364_897121_897243_900249_900499_900833_901134_902640_902786_902902_903042_904053_904285_904387_904566_905118_905281_905840_906059_906356_906512_906921_907145_908830_909069_909508_909748_910900_911150_911588_911728_911814_911925_912046_912266_912884_913076_913799_913973_914118_914399_914863_915137_915359_915595_915933_916161_917817_917969_918062_918253_918625_919096_920842
917521	contig_7057_pilon	+	577	2	Intergenic	novelGene_123358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	760	junction_1	0	152	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	134	577	943281	943724	FALSE	5	TCTGCCTCCCGCTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTPCPKGQPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLFVA	942970	943724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_943030_943206
917522	contig_1694_pilon	+	5660	6	Intergenic	novelGene_144977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	144	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	2699	3664	1712834	1724086	FALSE	30	TGACATTCCATGCGATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSLVEENALELPHREFKSLILGILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIMQSQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTEKIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAARKKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMHSIDSPLEITFRLSLAALKIVSLSLVLTSLIIICLCDFLLRSTLCGVQ	1611870	1726082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1611952_1612238_1613188_1710679_1711079_1711352_1711832_1712043_1713655_1723941
917523	contig_8304_pilon	+	3693	5	Intergenic	novelGene_153157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	154	junction_1	52.5999049428799	1689	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	17	598	3798	17711	FALSE	10	TTTTGATGCCTTTTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALILSMAVPTIIGFSLWKEFFPKLMTELSELQEFYDPDTVELMTWIKRQAPVAAVFAGSPQLMGAIKLCTGWMVTSLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDIYKILTSYKANYLIVEDAICNEVGTMRGCRVKDLLDIANGHVVCEEGDKLTYSKYGRFCHEVKINYSPYVNYFTRVYWNRSYFVYKINTVISFQS	3781	20806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_3840_4542_4626_6549_6683_14759_14919_17546
917524	contig_7056_pilon	-	4495	4	Intergenic	novelGene_43730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTTTCTTGCCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094604	1039285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1039993_1040211_1040696_1049667_1050027_1091659
917525	contig_16541_pilon	-	2606	1	Intergenic	novelGene_126722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1277	1594	211247	210930	NA	80	AATAAAAAAGAAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIQSINKENNTLILGNSRQYQNIKKQNKMAPASDQNKESDNLLVEEKSLEIPNMEFKTLIFRALQEIRKDIKENTDKTNENIANMKKTQTNRKIIQEQNIKINT	212523	209917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_209900_212500
917526	contig_1090_pilon	+	1113	5	Intergenic	novelGene_131094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_4	11.6726175299288	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	64	693	73167	107219	FALSE	35	TAAACCTTCACCTACAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDATRNAAYTVDCEDYVHVVEFNPFESGDLGNLIAYGGNNYVVIGTCTFQEEEADVEGIQYKTLRTFHHGVRVDGIAWSPETRLDTLPPVIKFCTSAADMRIRLFTSDLQDKNEYKVLEGHSDFINGLVFDPKEGQEIASVSDDHTCRIWDLEGVQTAHFALRSPGMSVCWHPEETYKVNIYNLDFFYHAEKTCTDVIHTHLQEKSE	73103	107639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_73323_79416_79542_85454_85528_87485_87581_107038
917527	contig_2854_pilon	-	987	8	Intergenic	novelGene_120878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	354.241414281048	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	74	691	1130219	1075372	FALSE	55	GTACAATAAAAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSPDAVIFPPAFLRSGSVYEPLKSIDLPRPDDETLWAKLDHHYRIVKSTLLRYQSPTTGLFPTKTCGDNPKAKIQDSLYCAAGAWALALAYRRIDDDKGRTHELEHSAIKCMRGILYCYMRQADKVQQFKQDPRPTTCLHSVFSLHTGDEYLSYEEYGHLQINAVSLYLLYLVEMISSGLQIIYNTDENYLCEIRLTAATQKV	1133102	1075075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1075420_1076127_1076209_1079306_1079415_1085646_1085747_1096002_1096142_1098387_1098478_1130167_1130278_1133087
917528	contig_8452_pilon	+	1716	2	Intergenic	novelGene_48058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACAAAAAAAAGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457915	459751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_458769_458888
917529	contig_405_pilon	-	2206	3	Intergenic	novelGene_135292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242356	139752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_141826_183921_183988_242289
917530	contig_18544_pilon	-	3291	13	Intergenic	novelGene_152738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	582.085761149793	3	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	374	1321	64924	49264	TRUE	20	GTTGAATTCTAGGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQGGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSLITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAGRKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVKYCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGIDLSGLTLQSNAPPSMLVKDEYVHDFEGQPSLSTEGHSIQTIQHPPSNRASAETYSTPALLASSESNATSTTNFPNIPVASTSQPASILAGSHSEGLLQIASGPQPGQQQNGFTGQPATYHHNSTTTWTGSRTAPYTPNLPHHQNGQFTMSLHSSLPFPIILLLSIGVPSLTLKWMFR	125182	37156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184_40324_47686_47856_49130_49315_53228_53280_54734_54803_54895_55016_58025_58239_62799_62830_63285_63461_64684_65064_121105_121271_125113
917531	contig_3948_pilon	-	3009	2	Intergenic	novelGene_53405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	137	319	1859957	1859775	TRUE	75	AAAAAAAATAAAAAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTWKLQKSLELSLRVLGSHWTPAFPLLGKERERKGTWLNLQRGVRMVGTFSLRLLLPLEGAWEGGLMGGKHRAEETAMQDWEAVTLGSVRPWPHPRGPDSGPRRR	1860093	1856362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1858739_1859460
917532	contig_5780_pilon	+	4073	6	Intergenic	novelGene_29776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	203.160626106537	2	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	281	763	107519	110295	TRUE	40	AGCAATAAAGCATTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRLKPLRKWEKLQMSSSERRKIMCSVTFHVIAITCVVWSLYVLIDRTAEEIKQGQATGALEWPFWTKLVVVAIGFTGGLLFMYVQCKVYVQLWKRLKAYNRVIYVQNCPETSKKNIFEKSALTEPNFENRDGPGACHSDTNSSCCTEPEDTGATIVEV	73990	113701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_74045_104880_104955_107366_107549_109432_109581_109990_112072_112167
917533	contig_8552_pilon	-	3882	9	Intergenic	novelGene_80090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTTCTGTTTCAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520492	510675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_510699_511018_511203_512078_512791_513299_513384_513740_513926_515339_515370_516525_516566_517364_517407_517910
917534	contig_5059_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_140759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCCCAGAAAAACCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502732	501238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_501200_502700
917535	contig_17440_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_7538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	432	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGATACCCGCTCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2977	500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_500_3000
917536	contig_18888_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_168244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18888_pilon_+_0_1300
917537	contig_10176_pilon	-	1726	10	Intergenic	novelGene_72732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	15	CTTTCCAACTGTCTGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
917538	contig_6439_pilon	+	4032	1	Intergenic	novelGene_154254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATACATTTGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397133	401165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_397100_401200
917539	contig_4538_pilon	+	3314	1	Intergenic	novelGene_153072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2357	2659	70234	70536	NA	20	CCATCACAGCAGTTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYLHFTRVGLEKSLLVLPSSSTKPCCFQFMNEVFITFMSVLSLTALSKATFPHPPMGLKKRYFSLLPLKFHNPSLLTRVRTPRGQETYLHNLCDPRNS	67877	71191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_67900_71200
917540	contig_15517_pilon	-	3464	4	Intergenic	novelGene_176405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	148	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	355	1149	121861	121067	TRUE	65	CAGCAAAAAAGAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIEPPTRARRIQAAGGLGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQHFSPGLEAVACPNVAPQPCSKGQRWLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGEKKKQHLQPTNGTQGAARPVARNLSSRQPWVQSLRPREVEEQTNKGPSFSPARQTRPGRSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASKKPKEAEKATPASNKQPLESRPPGHAESKQPAPPQPRDLGHGKQGSPSRGEEGWGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	122215	8047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_-_9006_9968_10805_11698_11989_120835
917541	contig_4213_pilon	+	3104	5	Intergenic	novelGene_124794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	131.482650946807	7	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	142	555	12984	42900	TRUE	25	GTGTTATGAGATGCTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDTKNMEKDIEPTQMLANPGYISSKKNSNKATLNRVLSFSLLMCQIMEFLLRYKGPSDHWIGLKRKQSQPWKWKNGTELPTRLHSRGEGECAYLTDNGVSSARSYTERKWICSKPDTYAQMKQQSPNLSSKAVTPY	12842	45489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19277_40541_40646_42734_44851_44890
917542	contig_3986_pilon	-	6803	11	Intergenic	novelGene_52676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.145567976962	13	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	5005	5886	55958	34990	FALSE	20	TATTTTCAATGTCTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKGAFSLSVKDVTTQGEVIKHYKILMLDEGGYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARGCLLDFLKTDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILNDGL	153862	34072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35005_41425_41498_44833_44911_46118_46299_47666_47820_48252_48400_52848_52953_54769_54869_55923_60655_108396_108527_153684
917543	contig_10005_pilon	-	2483	2	Intergenic	novelGene_148912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1875	2195	123707	123387	FALSE	40	GACAGAAGACTTCCCCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRVVPVGIQNKMPDDLPVEEKALDLTNREFRSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFMAKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLKII	125727	123098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_125253_125398
917544	contig_4232_pilon	+	829	1	Intergenic	novelGene_63377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCTTATCTGCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467234	468063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467200_468100
917545	scaffold_13505_pilon	-	528	6	Intergenic	novelGene_111484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5932.72361061932	52	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	36	395	547805	541845	TRUE	0	TCTTGGTCTGGGCCTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	548330	540191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540258_541297_541353_541832_542033_547363_547465_547734_547806_548295
917546	contig_15456_pilon	+	2924	2	Intergenic	novelGene_139512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	231	533	146014	146316	TRUE	25	GACAATGTATTGCATTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIIFCFIDLSKLCLKSGLREWFQFWVSRASRGHNFGVLPVSVRPVSLVFFHEFEFCSTFFSHSVWDSVVIPVRVVVGGSQMPSSSSGLRLVESLVRVVL	145783	148823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15456_pilon_+_148146_148261
917547	contig_6199_pilon	-	4022	3	Intergenic	novelGene_126340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAGTAAAATCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96364	84538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_84596_90064_90839_93173
917550	contig_12148_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_140329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70672	67517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_67500_70700
917551	contig_11417_pilon	-	1892	1	Intergenic	novelGene_103305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCATGATAGCCTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537248	535356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_535400_537200
917552	contig_8365_pilon	+	1725	1	Intergenic	novelGene_150922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAGCCTCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151295	153020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_+_151300_153000
917554	contig_177_pilon	+	2280	3	Intergenic	novelGene_41828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	73	1149	417672	418748	TRUE	10	TTTTAGTTGGGTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415658	420205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419289_419614
917555	contig_5832_pilon	+	3606	1	Intergenic	novelGene_134155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTAATAATGCACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439398	443004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_439400_443000
917556	contig_5586_pilon	+	2352	1	Intergenic	novelGene_143494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1542	1928	132573	132959	NA	50	CAGATTACACAATCATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFETEAARLLVSLVCSASASCGLLAVGPHAHICPAGASVPKLGSSTDKCPEAPHSARKPPAHRYSALLLCGLAPALSGAGLLVLLLPVLCCFCFSAAAGSLLLLVLCHCHSSIHSQFQSHFHILGIC	131031	133383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_131000_133400
917557	contig_12884_pilon	+	1968	1	Intergenic	novelGene_105022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1508	1915	1237619	1238026	NA	10	CCCAGTGAGCTGGTCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATQPLPRSSIRTASTSERSLTDVLPSWSCSNCALLRTLASRSSLAGTGARRPLKVSFSCRLISVSSMMVMRILMIFSTVTLPVRYCRSSSRLCSSVKYSELISSQTLTVRPLKPPTGTSTVAFSKVSRACVSE	1236111	1238079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1236100_1238100
917558	contig_3130_pilon	+	2429	1	Intergenic	novelGene_103579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	896	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1422	1721	156786	157085	NA	25	GAGACGTCATGGCCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCCDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPERDWRNPKSRAPRYSFSSVVKSLPRFTIQLGSGQFHKTTWD	155364	157793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_155400_157800
917559	contig_4068_pilon	-	1735	17	Intergenic	novelGene_161706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	51.3661792914365	44	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	999	736	1734	102853	61102	FALSE	40	GAGAAAGACTTGATGAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFLVKKEANIHAVDKAKSNRQLISEYKEEKRPKNSSQNNNPDIEIQESPRQISRRTESRKVDESSDEDSSSRLSKKPGVDDSWPTSDDEDLDLGIQNVAKPNLTKLITASQQSRKNIEEKPSIVRPEKRTLFEDSNSDSEDEDVVETLPKPSFTVQGFSHPAFPPSDPPLKPSLNFSAVPGVTKEGAAKPAVGKRENSIDIIESAPREQRNNDNLTYIDGAHKNNRSDMMSALGLGEEEDVESPWDSESVSESLAQKYVGHFSGATDEKGENIVNGQIEDSPEKYPHLKPIQPIIEMKDSTPDKAAERKDVQTSKSDLSAELDLEMTSEEE	113755	61100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_61146_78188_78271_78366_78396_80957_81052_83468_83531_83831_83962_85997_86201_86292_86354_87764_87838_94687_94722_96362_96420_98713_98785_102794_102889_108126_108274_109188_109304_112700_112792_113408
917560	contig_1406_pilon	-	4400	3	Intergenic	novelGene_25500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	7	324	1435966	1435649	TRUE	40	TCAGAGAAAATAGTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKMWSILKNIPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRPSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSAVKSLCILEPCHWVYRCLLWLCLHDGSSP	1435972	1412613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1415700_1415954_1416490_1435193
917561	contig_16775_pilon	+	2283	14	Intergenic	novelGene_107751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	307.716191380743	5	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	264	1508	130489	174136	FALSE	30	TAACAGCTTTGACCTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAGQDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKSDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130225	174911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152263_156930_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_172805_172867_173984
917562	contig_17796_pilon	-	2555	2	Intergenic	novelGene_33833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTCTGTCCCAACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111373	98228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_99646_110235
917563	contig_1146_pilon	-	2312	7	Intergenic	novelGene_84802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	76.663224560411	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	833	1966	266831	265659	TRUE	45	AATAATTCTGGTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSINACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQHLLEKKIP	279822	261730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_261899_262442_262571_265608_266333_266371_267237_270976_271102_274550_274707_279676
917564	contig_12605_pilon	+	938	5	Intergenic	novelGene_64182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_3	1790.83519272433	17	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	382	936	4816	6234	FALSE	15	TAGAGAGGGGTGTGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSS	3870	6236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5815_6005_6124
917565	contig_3077_pilon	-	1532	9	Intergenic	novelGene_26686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	6	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGGCAGCAGAGCAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	9672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9682_11323_11476_12010_12069_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
917566	contig_10549_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_110652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAACTAGGGTCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585680	586250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_585700_586200
917567	contig_6902_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_135590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGGCAGCACATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453048	451339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_451300_453000
917568	contig_3382_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_123989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	892	1218	52556	52230	NA	20	CTGTGATGCTGAACAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPAFSLAEGHLWDPEGQGSWPCQRDQLGWACCFAEPFPPGSALQSFTAIKETCISLHLLLAFHRSPSPFRQPCRYTQMIKILYFDNYTFLIHSKIYIQYHKHVVYR	53447	51579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_51600_53400
917569	contig_3787_pilon	+	3343	2	Intergenic	novelGene_102377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	90	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCTGTCCAGTGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404242	408956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_406917_408287
917570	contig_7022_pilon	+	1893	1	Intergenic	novelGene_142139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103718	105611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_103700_105600
917571	contig_6102_pilon	+	3814	29	Intergenic	novelGene_31885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	509.996988786629	9	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	26	1990	372917	380445	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RATCLGSPMTVSLSSQIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVRKETGGGWSG	371175	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372908_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
917572	contig_5997_pilon	-	3262	1	Intergenic	novelGene_168623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAGACAACGTCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352386	349124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_349100_352400
917573	contig_5718_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_110453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCACATCATTACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626803	1624413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1624400_1626800
917574	contig_1146_pilon	+	4648	26	Intergenic	novelGene_84825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	223.836783393615	16	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	850	2553	381	2933	861773	887841	TRUE	60	AAGCACAACAATTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRTDSASADPDNLKYSSSRDRGGSYGLQSSNSAVVSRQRHDDTRVHADIQNDEKGGYSVNGGSGENTYGRKSLGQELRVNNVTSPEFTSVQHGSRALANKDMRKSQERSMSYSDESRLSNLLRRITREDDRDRRLATVKQLKEFIQQPENKLVLVKQLDNILAAIHDVLNESSKLLQELRQEGACCLGLLCASLSYEAEKIFKWIFSKFSSSAKDEVKLLYLCATYKALETVGEKKAFSSVMQLVMTSLQSILENVDTPELLCKCVKCILLVARCYPHIFSTNFRDTVDILVGWHIDHTQKPSLTQQVSGWLQSLEPFWVADLAFSTTLLGQFLEDMEAYAEDLSHVASGESVDEDVPPPSVSLPKLAALLRVFSTVVRSIGERFSPIRGPPITEAYVTDVLYRVMRCVTAANQVFFSEAVLTAANECVGVLLGSLDPSMTVHCDMVITYGLDQLENCQTCGTDYIISVLNLLTLIVEQINTKLPSSFVEKLFIPSSKLLFLRYHKEKEVVAVAHAVYQAVLSLKNIPVLETAYKLILGEMTCALNNLLHSLQLPDACSEIKHEAFKNHVFNVDNAKFVVIFDLSALTTIGNAKNSLIGMWALSPTVFALLSKNLMIVHGDLAVHFPAIQYAVLYTLYSHCTRHDHFISSSLSSSSPSLFDGAVISTVTTATKKHFSIILNLLGILLKKDNLNQDTRKLLMTWALEVAVLMKKSETYAPLFSLPCFHKFCKGLLANTLVEDVNICLQACSSLHALSSSLPDDLLHRCVDVCRVQLVHSGTRIRQAFGKLLKSIPLDVVLSNNNHTEIQEISLALRSHMSKAPSNTFHPQDFSDVISFILYGNSHRTG	841601	892922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_861728_861787_865015_865174_865680_865837_868288_868426_869381_869441_870489_870704_871488_871615_872212_872286_873176_873275_874891_875066_876788_877014_879121_879224_879762_880033_881587_881719_881880_882043_882473_882593_886933_887022_887109_887212_887696_888180_888304_888587_889038_889236_889420_889586_890329_890485_892192_892336_892487
917575	contig_13004_pilon	-	3339	10	Intergenic	novelGene_112629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_3	98.4919624470275	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	126	1127	242710	220414	FALSE	85	ATTAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGFCDCGDTEAWKEGPYCQKHELNTSEIKEEEDPLVHLSEDMIARTYNIFAIMFRYAVEILTWEKEGELPADLELTDKSDTYYCMLFNDEVHTYEQVIYTLQKAVNCTQKEAIGFATTVDRDGRRSVRYGDFQYCEQAKSVIVRNTSRQTKPLKVQVMHSSIVAHQNFGLKLLSWLGNIIGYSDGLRRILCQVGLQEGPDGENYSLVDRLMLSDSKLWKGARSVYHQLFMSSLLMDLKYKKLFAIRFAKNYERLQCDYVTDDHDREFSIADLSVQIFTVPSLARMLITEENLMTIIIKTFMDHLRHRDAQGRFQFERYTALQAFKFRRVQSLILDLKYVLISKPTEWSDELRQKFLEGFDAFLELLKCMQVCIN	248925	218201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_220529_220613_220778_231459_231559_232550_232640_233423_233532_237726_237848_239301_239365_239992_240132_242606_242738_248827
917576	contig_7157_pilon	-	2962	3	Intergenic	novelGene_131298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGTTAATACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914528	902800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_904681_904824_905885_914506
917577	contig_10143_pilon	+	3413	2	Intergenic	novelGene_163325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	577	918	20197	20538	TRUE	10	TCCTTTTGCTTTCTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTLIARREKSMPSFKASKDRRTLLLGANAAGDFKLKPMLIYHSENSRALKNYAKSTLPVLYKWNNKAWMTADLFTTWNILSPLLRPTAQKKRFLSEYYCSWTTHLVTPEL	19620	24585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_20747_22298
917578	contig_10674_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_6445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	54	383	233911	233582	NA	35	AAAAGGTACATGTGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRHLGCFHLFHILNNAAMNTSVHMSIHITALISLGYIPRSRIAGSYGISISSFLRKCHTIFQNGCTILHFHQQGIRVPSSLQPLQHLFFLIRASNGGVRWYLTVVLICISLMSSDCEHFLMCLLAA	233964	231480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_-_231500_234000
917579	contig_11117_pilon	-	1778	2	Intergenic	novelGene_148603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139645	114348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_115625_139143
917580	contig_9177_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_32813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1186	1626	1640885	1640445	NA	5	TCCGCTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METPKMFPEGLISTWTTLMTVQTLQPFMESWCIRLFRQPLGLSDGETEAREGQELIQDHKVGFGPLWLSSPSGLGVCHGLNCVPQKYVSTWLGHHSHHCVVVLHFVIFLCVINHNLCLCLKRIGVGCNTLAQVTSLFQCKESFPGV	1642070	1640197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1640200_1642100
917581	contig_9098_pilon	-	1964	11	Intergenic	novelGene_75841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_7	167.694245578076	237	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	186	1517	350397	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350582	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330
917582	contig_10404_pilon	+	1027	6	Intergenic	novelGene_138661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2915.08918559964	48	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	68	415	1085448	1099868	FALSE	20	CCAACTGTTGCTCGGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	1085380	1100480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1085451_1091654_1091686_1097965_1098008_1098197_1098305_1098722_1098859_1099839
917583	contig_6364_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_51861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	347	1044	230	1273	2235272	2236315	NA	15	TACGACCCTGGTGCATGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVKVKVTCALGSNACLGIGVTCHSQSVGPDSCYILTAYQAEGNHIKSYVLGVKGADIRDSGDLVHHWVQNVLSEFVMSEIRTVYVTDCRVSTSAFSKAGMCLRCSACALNSVVQSVLSKRTLQARSMHEVIELLNVCEDLAGSTGLAKETFGSLEETSPPPCWNSVTDSLLLVHERYEQICEFYSRAKKMNLIQSLNKHLLSNLAAILTPVKQAVIELSNESQPTLQLVLPTYVRLEKLFTAKANDAGTVSKLCHLFLEALKENFKVHPAHKVAMILDPQQKLRPVPPYQHEEIIGKVCELINEVKESWTEEADFEPATKKPRSATGENPTAQEDDRLGKNEVYDYLQEPLFQATPDLFQYWSCVTQKHTKLAKLAFWLLAVPAVGARSECVNMCEQALLIKRRRLLSPEDMNKLMFLKSNML	2235042	2236580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_2235000_2236600
917584	contig_4151_pilon	-	1971	3	Intergenic	novelGene_65303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	204	569	1473343	1472978	TRUE	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHGSAILDSYQRPANRGYEKAASWSFQQETEQPVTGDIYFPTPTLLHPHSASSASPHHSLLAGKHWLLGFHPPALADSLSAICWLLVLLFSASFDFFLISHHLPLLLLKYLAQCTIFASS	1473546	1314682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_-_1314885_1315003_1315927_1472700
917585	contig_10609_pilon	+	2332	15	Intergenic	novelGene_123923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	499.242814425107	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1223	1726	420445	486656	FALSE	25	TGTATAAACCAGTTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRNKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASGRSCQGSG	361235	487262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374985_386436_386639_386996_387085_389596_389740_390915_391129_400432_400512_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314_420456_422067_422149_426657_426770_477871_477944_486428
917586	contig_17144_pilon	+	2499	14	Intergenic	novelGene_29223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	311	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	20	GGCTGTTGCCCCAGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	176009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975
917587	contig_11855_pilon	-	2198	12	Intergenic	novelGene_67153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	276.709502475666	3	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	29	982	2723908	2713545	TRUE	40	TTGATAATTTTAAATAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLQLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTAQLRPIKKTE	2731317	2709200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2711716_2711876_2713483_2713574_2716006_2716098_2716379_2716503_2717121_2717192_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
917588	contig_19892_pilon	-	3181	1	Intergenic	novelGene_158947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAAAGATGTCACCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5882	2701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19892_pilon_-_2700_5900
917589	contig_5481_pilon	+	3558	4	Intergenic	novelGene_144570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCTGGGCAGGAGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287785	311915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_+_291004_308010_308142_310429_310553_311829
917590	contig_3103_pilon	-	2388	1	Intergenic	novelGene_146193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	725	1051	73737	73411	NA	60	CAACAATTAAAAATCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVNREYKKAASWSFQQETEQPVTSDICFPTPHPSSSPLWPVSWLGSTTFTPVSLGFHPPALAGSLSAICWLLVLLFSDSLDLFLISHHLTLLSLKYLALCAIFASS	74461	72073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_72100_74500
917591	contig_13924_pilon	-	2735	1	Intergenic	novelGene_147773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACTTGAGCTGTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14588	11853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_11900_14600
917592	contig_15188_pilon	+	4977	1	Intergenic	novelGene_163083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTATTATCCCAAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169785	174762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_169800_174800
917593	contig_9227_pilon	-	1794	3	Intergenic	novelGene_154306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	7.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	174	1124	50210	48248	FALSE	30	TTTAGAATCTAACCACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRTSTSIIGTVSQTLNDGKNLSSKYLIVEFMKNDTWSSMLGDICKLHDIEDQHKNQGRHKRRHIIKNLFESNEENQGGKTYRRIPNLAVFKRTPAIINSSECHECGKSFINHSSLKRHIRSHSDCNTYRYKTCKEACICPSDQSIPVRTLTEEKPYKCKVKTLTGEKPYECNKCGEDFCSFLSFQTHVRGCKRECKECWKTYPSSLLLCKKFHSGDKPYKCKEFGKGFSDSSSFTIHIGTHSGERQCKHCGKAFSNSSALATHQRTHSGERPYECKECGKVFSCSSHLTSHIKSHMERDLMNVRNVGKPLAITHP	50383	47577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9227_pilon_-_48310_48982_49687_50025
917594	scaffold_9205_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_161104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCCAGCCAGACCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273647	272452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_272500_273600
917595	contig_5023_pilon	+	2678	12	Intergenic	novelGene_7227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2346.58211796724	170	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	88	1296	607279	646928	FALSE	10	TCTGTAGATGTTTCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRK	580841	648310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629239_646921
917596	contig_5189_pilon	+	2194	1	Intergenic	novelGene_34876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGGGAAAGCCAACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205169	207363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_205200_207400
917597	contig_17198_pilon	-	1751	3	Intergenic	novelGene_62416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	398	junction_2	57.5	73	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	1312	1749	1125078	1119096	FALSE	20	TCTGCAGTGATATTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGTDSEVRCLGGRSPKSQDSYPVSPRPFSSPSVSPSHGMNIHNLASGKGSTAHFSGFESCSNGVISNKAHQSYCHSKHQSSNLNVPELNSINMSRSQQVNNFTSNDVDMETDHYSNGVGETSSNGFLNGSSKHDHEMEDCDTEM	1126389	1119093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1119217_1122034_1122180_1124906
917598	contig_18869_pilon	+	2255	13	Intergenic	novelGene_56438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	166.957309080961	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1173	1082	2254	128685	141317	FALSE	50	AGAAAAATTACATTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQDTCGQYSFPRKDGHAKTSDPERSWKIVHVSDEEEAAELECVSVTGFTALFTQATERKGCTIILWDLETQGMQCFSLGKIRIPIESDGDQQLCLVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDSLCHLNAWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVDFFLKSKENLLNPSSNSSALDQFDHFPSDLYLRNVEELTPALDLLCSAIRESDSETQSKHFSEQLLNLTLSFLNKQIKELFVHTEELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKQTDALDEYDVNENVPKVKESDIWEKLSFEEVIANAILNNKIPEAQTFLRINSHSAQRLEELIKIGLDLVFDSLKKNNIKEASELLKNMGFDVKDQLLKICFFTTDKNIRDFLVEILK	116237	141318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_116392_118630_118816_119693_119919_121690_121893_127625_127764_128507_128983_130281_130428_132150_132284_136509_136666_137079_137256_138333_138511_139404_139477_141302
917599	contig_11816_pilon	+	3124	1	Intergenic	novelGene_98521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	2134	2739	988219	988824	NA	30	AACAATTTTGTTACCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGVISIFKSYYLRNTCKVIAAIDSASSDGSGQSKPKIFWKGFTILDAIKNIHGSSEEVKISTFTGVWNKLIPTLMDDFEGFKTSVEKVTADVVETARDLKAEVEPKDVTELLQSPDKTLIDEEMLLMDEQRKWFLEMESTPGENAVNIVEMTRKHTAYYINLVDKAAAGFEMTDSNFERSSIVGKMLSNGIAYYREIFS	986085	989209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_986100_989200
917600	contig_5643_pilon	+	1111	9	Intergenic	novelGene_38863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1908.57587205094	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	99	680	236108	237581	TRUE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGPNTMTSKRW	236009	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237550_237635_237720_237819_237913
917602	contig_14744_pilon	-	2762	11	Intergenic	novelGene_65976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	52.3961830670899	71	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	716	2151	28	2178	923855	901646	FALSE	30	CGCTTTGTCCCAAATAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRTSSQQGAMGSWWSKENSSPGKDLRVFIQNSLWPFEDCWIQIEHAVNTICDVLQNPQEFPLVQEVAKGGSYGRGTVLRGKSDGTLVVLLSGFKQSGDEKISQREIILDKIWKRVEDLKHSMALEYNLQTQRSQGRLILQLSTKWQSIIFEVLPAFNTLGFSTKPSPQIYRELKKFSHSTAAYPGEFLVCFTKLQQKFFNNCPRNLKDLILLVKYWYQKCVKEMDKSSQLPQYALELLTVYAWEQGCGQDQFDIAEGIRTVLGLIKQYEHLCVYWTVYYNFEDVTVRKILHSQLWAQRPVILDPTNPKNNVSQDKNECWAQLNLKAHEWLSSLCLDDKSPGPSWNILPTTLYATPGHRLDKFIHKFLQPSQNFLDQTSKAIDIICKFLREKCFQRSEDQKIKIQDIIRGGSTAKGTALKSGSDADLIVLPESLKSFPSQKHNRFRIIKEIHKELEACQQEKKFKVKFEISKQKAPGVLSFSLKSIEFDAELEERVKFDVLFAFNVLGQWDSVSPPSPSVYAELIQLYESSDYVEGEFSSCFTGLQRDFIISRPTKLKSLICLVKHWYKQCERKLKGKGSLPPKYALELLTVYAWEKGSEAPDFHTAEGFQAVLELVTKYRQLCVFWLVNYNFEDVTVGKFLLAQIQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAQEAKAWLLSSLCFKDGRRCPVNSWDVPTSQTLESYGAKLHHDLAEMLSSGS	923882	901061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_901721_903287_903445_904372_904612_906959_907148_909683_909979_912431_912615_915820_915969_916638_916875_917698_917878_920649_920924_923678
917603	contig_20175_pilon	-	2993	1	Intergenic	novelGene_142458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2184	2549	27217	26852	NA	45	GGCAAAAAGTATATGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNCTATLGDSLEISYKVKDTLFIQATNSTPRYLLKGTKNHTAGWCPTTTTDCSDQDHRAGFWTGLEKDGEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNAESMALRHPFSSVVKVISDVHCSAWEWTGP	29400	26407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20175_pilon_-_26400_29400
917604	contig_7057_pilon	+	640	6	Intergenic	novelGene_123347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	885.169904594592	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	19	639	938931	943721	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEPQHTHLTPPPKASRSPCVKPSAWVAATPPGPSQFWRNLSCPCTLSRLFQLPPRQPYSPVHVPRAQCLCSCSAFSPPGPGRNKSTPLLLFV	938912	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938962_939052_939118_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943451
917605	contig_10904_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_22494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304646	301616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_301600_304600
917606	scaffold_12124_pilon	+	1253	2	Intergenic	novelGene_22385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	303	1082	1508626	1509405	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497094	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497102_1508330
917607	contig_4232_pilon	-	270	1	Intergenic	novelGene_63408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGCGGAAGAAAGACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467660	467390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467400_467700
917608	contig_17769_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_124257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGGAAATGACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94478	92674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_92700_94500
917609	contig_15084_pilon	-	2510	3	Intergenic	novelGene_116665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	26	11	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCCCAGCTACCTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20253	11792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_-_12691_18369_18482_18753
917610	contig_1154_pilon	-	6801	4	Intergenic	novelGene_87121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	3499	4044	467958	467413	TRUE	40	TTTAAAAGGCCATTAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVSTLGLTLVSALGLTFVSTPGLMLILTPGMMLVWASGPRLVWGSGVTLLSAPGLMLVSTPRLKLVSAPGLMFVSALGLTFVSTPGLTLPSIPGPTIVWASGMTFVWASGVTTVSALGLMLVSVPGLTLFSTPGLMLVWAAGLTLVWALGQILVSDSELILSLSSAFPRLTGGSKSTEGL	471456	434372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_434973_439214_439503_442408_442504_465638
917611	contig_21208_pilon	+	3627	3	Intergenic	novelGene_175771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	122	521	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	905	1231	22803	23129	FALSE	70	CGCAGAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGGWFMTMNFGVHAVMYTYYTLKAARVNSPRMLSMLITSLQILQMFVGAMVSILTYIWRHEQGCDTTTMEQFFLSSILYSSYFILFAHFFRQAYIIPKVKNKTKSQ	20377	25525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_+_20637_21501_21634_22289
917612	contig_8418_pilon	+	5199	8	Intergenic	novelGene_166073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	119	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	3304	4200	1583613	1584509	FALSE	55	TAAATAAATAAAGGATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERIGTTLGALIHGINTIRTISNNAQAPEERLDTWELLKIKHLCSSKDFPKRVKRQPTDWEKFFGYDKSDQRLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDINRHFIKEDIQMANRHLKKCSRSLTIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIKKTQNNKCWRGCGETGTLLHCWWECNMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYPRETRAVTQIDICTPMFITALFTIAKRWKQPRCPSMDEWINKLWYIHTMEYYATIKNKDEAVKHHITWWKLELIMLSEFSQSQKSKYCIRPLL	1273077	1585508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_+_1273530_1273588_1274866_1308760_1308878_1478887_1479189_1543007_1543372_1549199_1549222_1575907_1575913_1582847
917614	contig_7356_pilon	+	1271	1	Intergenic	novelGene_60369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401717	402988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_401700_403000
917615	contig_5551_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_134295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTAGTTTCATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825409	826747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_825400_826700
917616	contig_5375_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_169230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139018	142601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_139000_142600
917617	contig_17106_pilon	+	3642	4	Intergenic	novelGene_127668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_3	52.3598658855765	79	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	58	804	74438	79353	FALSE	30	AGCCCAGAATGTCAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKCQVCHKAFTQTSHLKRHMLLHSEVKPYSCHFCSRGFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFSTLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHHLKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTHMIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVKHGVMDIGLDSQDAETKGQRT	74380	82191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_74789_78123_78316_78832_79008_79324
917619	contig_11115_pilon	+	1899	7	Intergenic	novelGene_102806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	502.906441486773	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	289	1899	165608	173214	FALSE	10	GGGCTGGCGGGGGAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPD	165319	173214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
917620	contig_5145_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_131359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACACCACAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232545	230910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_230900_232500
917621	contig_9185_pilon	+	3068	2	Intergenic	novelGene_166877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1480	1971	51099	51590	TRUE	35	TTCAAAGACCTAGCCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALAKNKAPGTDRIPTEMFQQTDVALEVLTCLCQEIWKTATWPTDWMRSIFMPIPKKGDPTKCGNYQTISLMSHTSKILLKIIQKPLQQNINRELPEIQARFRRVLGTRDIVADVRWITSESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWIAL	49619	53287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_52610_53209
917622	contig_1301_pilon	-	3446	15	Intergenic	novelGene_47302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	711.724766224376	30	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	81	1457	322831	278293	TRUE	45	GTAAGAAGACCAAATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSR	322911	268649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_274190_274263_276836_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
917623	contig_11427_pilon	+	2299	2	Intergenic	novelGene_78986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGCAGCGCCTCAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470726	473096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_472073_472143
917624	contig_1443_pilon	-	1985	5	Intergenic	novelGene_28258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	64.0209926508485	49	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATTAAAAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562605	557661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_559362_559576_559691_560831_560913_561588_561649_562575
917626	contig_10877_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_166213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTACCAGTGTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50334	51362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_+_50300_51400
917627	contig_3948_pilon	+	2785	1	Intergenic	novelGene_53338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGACACTGAGAACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1475280	1478065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1475300_1478100
917628	contig_10943_pilon	-	2135	2	Intergenic	novelGene_168264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGGTCATGGAAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41432	39167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_39220_39349
917629	contig_10225_pilon	+	2684	14	Intergenic	novelGene_86814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	81	1082	20776	42680	TRUE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20695	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46577_46754
917630	contig_10583_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_167916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	366	1682	2047	191482	191847	NA	20	TGGCGCATGGAGCCAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIRETRKLNKEMKKKKNPNKQNQNKIKKRKNKCPQGCPCVSVQSKGLASKLRGTAWLEGAPKLRKEKENKQKNQKRTNQSKQTNKKAPGVPPVWRHGPGSSLTVKRCFVAFQEEAK	189800	191848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_189800_191800
917631	contig_12938_pilon	+	2062	7	Intergenic	novelGene_99730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	601.437098401265	84	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	59	421	78117	80832	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	52004	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_81459_83391_83470_84550_84635_85468
917632	contig_12951_pilon	+	1120	3	Intergenic	novelGene_68129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	246	683	64695	69055	FALSE	50	AAAGAAAAGATTCTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRLAPDPLCLLILPLDRSCPFSLMYLPELRSTLFRVSFYVPYSSLIFVRKVGLGNGFRFGLTESSEAMSFGVPPVSIKLLSLIFLLEFEFDFFIPLSLAPSGTLLFCSLSGRSLVVARRTRWCPATTSERPDREHNRGSLMVQ	64278	69492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_64342_64512_65054_68976
917633	contig_20822_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_170639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGCCGCAACTCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68234	67103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_-_67100_68200
917635	contig_12450_pilon	+	3323	25	Intergenic	novelGene_162317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	128	junction_7	159.231465867216	20	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1105	3315	8	3322	343168	422359	FALSE	20	GCCCCCAGCCTCAGTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARGRRLPLLLLLALSALQPLGPAAAASKLNIPKVLLPFTRATRVNFTLEASEGCYRWSSTRPEVASIEPLGLDEQQCSQKAVVQARLSQPTRLTSIIFAEDITTGQVLRCDAIVDLIHGIQIVSTTRELYLEDSPLELKIQAMDSEGNTFSTLAGLVFDWTIVKDTEADGFSDSHNALRILTFLESTYIPPSYISEMEKVAKQGDTILVSGMKTGSSKLKARIQEGVYKNVRPAEVRLLILENILLNPAYDVYLMVGTSIRYKVQKIRQGKITELTMPSDQYELQLQNNILGAEGDPAWPVAVLAQETSTVTALQLGQSNLVLGHRSIRMQGASRLPNSTIYVVEPGYLGFTIHPGDRWVLETGRLYEVTIDVFDKSSNKVYLSENIRIETVLPPEFFEVLSSSQNGSYHHVRAIKRGQTTINAALTSVVDQDGGVHMLRVPVWNQQEVEILIPITLFPSILTFPWQPKTGAYQYTIQAHGGSGNFSWSSSSSVVATVTVKGVMTTGSDTGLSVIQARDVQNPLHFGEMKVYVIEPSNMEFAPCQVEARVGQTLELPLRISGLMPGGANEVVTLSDCSHFDLVVEVESQGVFQPLPGRLQPGSEHCSGVRVRAETQGYTTLLVSYKHGHIHLSARITIAAYLPLKAVDPSSVALVTLGSSKEMLFEGGPRPWVLEPSKFFRNVTSEDMDSIILALFGPPASRNYQQHWILVTCRALGEQVIALSVGNKVSITNPFPAVEPAVVKFVCAPPSRLTLMPVYASPQLDLSCPLLQQNKQVVPVSNHRSPLLDLAAYDQQGRRFDNFSSLSIQWESTRPLLASIELNLPMQLVSQDDGSGQKKLHGLQAISVHEASGTTAISATATGYQQSHLSAARVKQPYDPLVPVSASIELILVEDVRVSPEEVTIYNHPGVQVELHIREGSGYFFLNTSVADIVRVTYQEARGIATVHPLLPGTLTVMIHDLCLAFPAPAKAEISISDIQELYVRVVDKVEIGKMVKAYVRVLDFYKKPFLAKYFTFMDLKLRAASQIVTLVALDEALDHYTATFLVHGVAIGQTSLTAAVTDKAGQRINSAPQQIEVFPPFRLIPRKVTLIIGATMQITSEG	343160	422360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12450_pilon_+_343344_360181_360319_361669_361802_366962_367060_370248_370400_374275_374409_379298_379458_379886_379956_381292_381400_382313_382455_383388_383527_384595_384752_386664_386864_391800_391947_396875_397098_398050_398225_402682_402876_403404_403512_404628_404734_404817_404920_418964_419094_420031_420160_420273_420410_422056_422120_422344
917636	contig_7426_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_27494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCAGTGAGCCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909086	911461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_909100_911500
917637	contig_18189_pilon	-	6915	3	Intergenic	novelGene_170752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.5	204	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	189	1475	35584	34298	TRUE	20	TACATAGGCTATCCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQELFPGEDLGNPFLQDKGLEHMAVIYKEIPLGEQGDECDDYGGNFSLCCSPIQRQNVRPTTRPQDDELFGQTFLQKPDLSVCQIVHGGEDSGKHDGKTVDWESVVLNYSHRMAQPAKPYACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQNSHLLRHQVIHTGEKPYECQECGKAFRQSSALMQHQKTHTGKRPYECRACGKDFSRSASLRKHERIHTGEKPYQCKECRKAFSQSSGLSQHRKIHTLKKPHECELCGKAFCHRSHLIRHQRIHSGKKPYKCEECEKAFSQSSNLIEHRKTHTGEKPYRCHKCGKAFSQSSSLIEHQRIHTGEKPYECGECGKAFCHSSALIQHQRIHTGKKPYACNECGKAFRHRSALIEHYKTHTREKPYECNTCGKSFRGSSHLIRHQKIHTGEKL	42554	27386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_30309_31779_35721_42502
917638	contig_4832_pilon	+	1955	14	Intergenic	novelGene_163413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_6	57.2116386553745	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	357	1868	497716	509953	FALSE	35	AAATTGTAGATTCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGMYVINLHKALASLATATLESVVQERFGSRCARIFRLVLQKKHLEQKQVEDFAMIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQEIPKTPDHAPSRTFYLYTVNILSAARMLLHRCYKSIANLIERRQFETKESKRLLEKSQRVEAIIASMQATGAEEEQLQEIEEMITAPERQQLETLKRNVNKLDASEIQVDETIFLLESYIESTMKRP	495935	510040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502388_503917_503999_504248_504301_504658_504720_505180_505332_506088_506191_506558_506609_507026_507177_509871
917639	contig_4213_pilon	+	2210	2	Intergenic	novelGene_124801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1701	2066	28237	28602	FALSE	25	TTACAAAGCATCTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLKGWKKMFPANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEAHYIMIKGSIHQEDISVINIYISNDSAPKYIKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNVPLSVKDRTSRKKLNKDIEELNATIN	26310	28746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_27124_27349
917640	contig_5020_pilon	-	2949	5	Intergenic	novelGene_27952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_4	14.3069039278245	38	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	8	427	198340	185458	FALSE	60	AGACAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKMAAPLRIQSDWVQTLRKDEGEAWLSCHPPGKPTLYGSLTCQGISLDGIPEVTASEDFIVNEINKKSIHISCLKENSSSKFLAPYTSFSRIHTKSITCLDISSGGGLGVSSSTDGSMKIWQASNGELRVMALDTPLGSYA	198347	182935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_185596_187799_187890_190949_191054_196551_196593_198293
917641	contig_5286_pilon	+	958	2	Intergenic	novelGene_157394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	88	435	676051	679789	FALSE	20	TGTTCAAGTCATCCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCAKKTKIPRTGPISNIMINGEKTEVVKDFSLLGSTINTHGSSSEEIQRSIALGRFAAKDLFKVLESKDVTLMTEVHLIQAMVFTIASYAYESWTMSKEDRRRIFFTNTITNLK	675963	680312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_676362_679752
917642	contig_7898_pilon	-	1074	8	Intergenic	novelGene_47524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3185.20866583305	32	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	71	814	285587	282680	TRUE	15	AGCCCTCTGCACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHQRCQCMSADWLPNCCLSTPFYHQWVQAGPGFVCGD	286096	282047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282788_283691_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
917643	contig_20293_pilon	-	2287	2	Intergenic	novelGene_153512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	703	junction_1	0	40	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1275	1658	28634	27694	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDNCVHDLQAHNKEIYTIKWSPTGPGTNNPNANLMLASASFDSTVRLWDVDRGICIHTLTKHQEPVYSVAFSPDGRYLASGSFDKCVHIWNTQVCLCCLNGQLLYLVGNICLFSFWFPIPLVPII	29908	27064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_27959_28515
917645	contig_10711_pilon	-	7123	1	Intergenic	novelGene_118467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	87	446	897614	897255	NA	30	CCCCAGCTAGAGTATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPVPPVVHLTLRQAGDDFSRRYRRDFAEMSSQLHLTPFTARGRFATVVEELFRDGVNWGRIVAFFEFGGVMCVESVNREMSPLVDNIALWMTEYLNRHLHTWIQDNGGWVGACVVEWESVLEVCVPRCSGWRMGGLRGQREAVEPVK	897700	890577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_890600_897700
917646	contig_12802_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_114250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACAGTGAAGGGCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139560	137976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_138000_139600
917647	contig_7993_pilon	-	4173	13	Intergenic	novelGene_170971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	34	junction_1	13.3174384423832	85	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	14	1594	362973	319366	TRUE	50	TTATATTACACATGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKEKMKEQSWNILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMATNPGYYAEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGALVDQAVFEELIRDHLPQLTEHMTDMTFFSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKAILQLGLAILDYNLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSSVQQGSNMSDEKSSHIRVDITDLIRESNEKYGNIRYEDIYSMRCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVKLSLHELDELYVIFKKELFLSCYWCLSCPVLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRILYHFLSPWAHSANRDSLALWTFRLLDENSDCLINFKEFSSVIDVMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTDVKSQDLSKGDELSKEELLYFSQLHVSRPANENEAESVKNSPEKGKGKVDIQTYLNQWQEEIFKKRRKH	362986	315208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_-_317766_319343_319443_328542_328600_329814_329899_331457_331524_332247_332489_332662_332732_348327_348427_349354_349485_350442_350729_352104_352223_361885_362101_362834
917648	contig_3380_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_60143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	114	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTACTGGAAGCATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1286134	1288794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_1286100_1288800
917649	contig_3122_pilon	-	4331	21	Intergenic	novelGene_64380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	143.636381185269	265	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	541	1689	276393	260981	TRUE	0	TTTCTGTGTTTGTGGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVLGGRKGILEVSPSLFQT	277521	249591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_250676_250928_251031_251697_251839_251993_252120_252992_253206_255696_255847_256427_256451_257996_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_260947_261038_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277007
917650	contig_10749_pilon	-	943	4	Intergenic	novelGene_133472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	365.223523643018	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	60	479	168321	164389	FALSE	15	TCTGTTCACCTGTGCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPLPAVTLTEYRPWTLPSSLTSSALPSSFRCHVVLREINPCTSRLNLTCRSALTG	169047	163924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164552_167156_167395_168302_168346_169012
917651	contig_1275_pilon	-	1704	10	Intergenic	novelGene_108745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	509	junction_3	119.968926017851	41	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1380	324	1703	444565	388468	FALSE	35	CTCTAATCCCATCATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPP	456935	388466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_388554_395563_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870
917652	contig_10734_pilon	+	3556	21	Intergenic	novelGene_51089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	97.4638907493437	87	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	138	1412	557899	571073	TRUE	40	GTAATGATAGACTAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDVGSGSGGQRIQEEIKNLVKLQTSNASWAPYDSSSSKQISSESPMGFFYENSERNESVLSLPKSKEPEMQQESSPSQPDCNVDSSSVSSGYGTFCISELNACKSKDPKEFMEDTEVSKEQYVAPVVQTDSLLGGVKNKSFYIQTAEEFSASLKDDISVFPGEFEHNFLGENKISEVYSGKTNSKSITSWAQKLKQNQPKRAHIEEGRSKSMQGSEQAKKSLSEKPDFTAATQSHAFYLSKPDESPDSWISDSGTGLTYWKLEEKDMYHSLPEALEKTLVPSSSTDMSPSQSNTSNEMKLPSLKDIYHKKQRENKQLPERNLTFASTPNHPPEVLTLDPTLHRKPNQQISGIQPHDFVNILDDRISFSPESVLEPSMSSHSDIDSFSQASNIASQLSGFPNYPSNTKTSPVDCWKNHAFQNESRSSSTFPSVYTVSSNNISVNTIDEENTVMVTPASVSQSQLPGLGRT	540647	596814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_540680_557793_558315_559408_559533_563827_563919_566009_566117_569961_570088_570252_570647_571056_571213_573658_573747_575343_575560_578094_578143_579087_579153_580585_580688_588583_588716_589208_589385_590256_590404_591227_591349_592187_592266_592944_593193_593511_593581_596299
917653	contig_14775_pilon	-	3731	2	Intergenic	novelGene_178918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	533	967	24601	24167	TRUE	65	AAAAAAAAAAAGCAGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEELRGDRNTYALLVGMQMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIAFDPAIPLPGIYPRQIRVVTRIDISTPTFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESENHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	25133	20924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14775_pilon_-_23470_23947
917654	contig_12802_pilon	-	581	1	Intergenic	novelGene_114237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCTTTTAAGACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36556	35975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_36000_36600
917655	contig_7201_pilon	-	3231	2	Intergenic	novelGene_152522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1875	2177	330341	329326	FALSE	80	CAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITLTGNTTESLMEQEKDWVQNSNSGKKTRLNGLTATGGTPESMATWTDCTVPQVLQGDLDHPTPCTSQSGKGLALSPPCNPPCLMIQEHRVYAIYHTQP	332215	328271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_329495_330207
917656	contig_10861_pilon	+	2866	2	Intergenic	novelGene_39424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	978	1382	2217946	2219548	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDFILVYIYLRAKDLSKYCHISSILIFICMYVHPHVLQNCFQLNQRNFEKFWLSSTYSLSIGFIKWAFLLDLGQFHIYLFADHSHGIPSKTCYYHGSKISYIVSFAKCSNSSTHTILFFRIKWPKLSILFQP	2216968	2221032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_2218217_2219414
917657	contig_15893_pilon	-	2648	1	Intergenic	novelGene_128512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTATAGGACCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82782	80134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15893_pilon_-_80100_82800
917658	contig_13244_pilon	+	2290	5	Intergenic	novelGene_86925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	98	junction_1	524.491360748678	140	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	20	556	239761	252668	FALSE	30	AACTCAATAGTGTTCTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETAAGKMADGKAGEEKPENPQRAGAAGGPEEEAEKPVKTKTVSSSNGGESSSRSAEKRSAEEEAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSSKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRDTPTSAGPNSFNKGKHGFSDNQKLWERNIKSHLGNVHDQDN	239741	254402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245131_245347_247045_247121_250878_250935_252541
917659	contig_6270_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_99848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	193	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATACAATTAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421621	419463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_419500_421600
917660	contig_8377_pilon	+	4160	27	Intergenic	novelGene_34961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3279.85941956819	1	88	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	655	1968	1393	3360	176610	197939	FALSE	45	ACAAATATTATTTATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68097	198739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164503_164590_169245_169307_172896_173026_176583_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185748_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
917661	contig_7945_pilon	+	8245	1	Intergenic	novelGene_161594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATGTAAGGAAAGGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367726	375971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_367700_376000
917662	contig_16492_pilon	+	1687	7	Intergenic	novelGene_100313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	56	junction_5	215.447596103244	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	205	1686	172164	193608	FALSE	35	ACCAAATTCTGGGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSGEPMAFCCQSGSGNMCQAPHS	171553	193609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_192228_193409
917663	contig_11316_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_122634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1830	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137400_138900
917665	contig_6076_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_81725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTCAATACCCAGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20819	23031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_20800_23000
917666	contig_19342_pilon	-	3359	1	Intergenic	novelGene_41046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3359	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_0_3400
917667	contig_12250_pilon	+	2199	16	Intergenic	novelGene_80730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.748331477354788	57	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1094	1420	413260	414614	TRUE	25	ACTTTGTTACGCCAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIRPAGVKKVVPIRGEGHIQDAPAYIPGLDAPEFMEAAIPAVIQSDCLVLASRHEDLTIFAVDATESLLRVGVSEGQIIGQEVRHHSRLFSKGEASPVAEAPFSLV	408849	418699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_409168_409264_409371_410568_410723_411495_411645_412087_412275_412371_412429_412786_412856_413206_413265_413474_413624_413857_413957_414264_414330_414605_414736_414992_415120_416368_416549_417144_417396_418599
917668	scaffold_19766_pilon	+	2212	13	Intergenic	novelGene_34441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_8	137.192889352506	1	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	212	2050	845891	851417	FALSE	15	CCTTCTAATCTGGGCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	845496	851579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
917669	contig_6299_pilon	+	3988	7	Intergenic	novelGene_172942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_6	85.6843366990464	293	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	1114	2952	961482	968048	FALSE	20	CAAATCTTGATGTTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTDTPGARGGFQYHSLEEIHIFVLCNILRRPIIVISDKMLRSLESGSNFAPLKVGGIYLPLHWPAQECYRYPIVLGYDSQHFVPLVTLKDSGPEIRAVPLVNRDRGRFEDLKVHFLTDPENEMKEKLLKEYLMVIEIPVQGWDLGTTHLINAAKLDEANLPKEINLVDDYFELVQHEYKKWQENNQQGRREMHVQNPLEPSMPQLSLMDVKCETPNCPFFMSVNTQPLCHECSERWQKNKNKPPKLNCKLGPEAPPGMALGASRGEACEPLVWTPEEPAGGPHSAPPTAPSLFLFSETTAMKCRSPGCPFTLNVQHNGFCERCHNAQQLNTSRNVDPKRHLDAGKCRACLQDATRTFNGICSTCFKRTTTEPSSSLGPSALPSCHQRSKSDPSQLTQSLSPHSCHRAGGEAPSGCLSQAARTPEDRTGTSKCRKAGCMYFGTPENKGFCTLCFIEYSENKHFVAASGKANPTASRFQNTVPCLGRECGTLGSTMFEGYCQKCFIEAQNQRFHEAKRTEEQLRSSQRRDVARTTQSSSRPKCARASCKNILACRNEELCMECQHLSQRVAPAPLRGEPAPEEPPQAALPGPCLRALRQHQVQRLLQRVLSV	956609	969084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_+_956846_960604_961597_961938_962110_963194_963376_964792_965713_966637_966820_967778
917670	contig_20199_pilon	-	610	4	Intergenic	novelGene_82568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	75.7935793234933	484	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44221	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_40967_41934_42078_43906_43951_44118
917671	contig_8447_pilon	+	2247	12	Intergenic	novelGene_69381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_11	591.255884250768	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	52	1152	5825	44901	TRUE	25	TTAACCCTGTAAGGCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELDKGLTEPQIQVICRQMLEALDFLHGKKIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAKNLKTLQKRDSFIGTPYWMAPEVVMCETMKDTPYDYKADIWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKVALDKNPETRPSAAQLLEHPFVSSITSNKALRELVAEAKAEVMEEIEDGRDEGEEEDSGDVTSPLGNHTQDSSEVSQLSLNADKPLKESSSTLPTPSQPQDSVNGPCSQPSGDRSLQTTSPPDVAPGNENGLAVPAPLRKSRPVSMDARIQIAEEKQVTDWGDLGPVANRSQKASQSRPNSSALETLGDEKLANGSLEPPPRWLQAHPRATQTLAASPSPRAWTTAPPSLLTCP	5773	66481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_61158_61252_65556_65687_66073
917672	contig_12677_pilon	-	570	1	Intergenic	novelGene_110755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCCCAACTCATCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610	40	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_600
917673	contig_13536_pilon	+	4718	3	Intergenic	novelGene_177677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	845	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	2612	3256	211464	212108	FALSE	45	ATGAGACTAATGGGACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTQPKAIYKYNAIPIQIPTTLFKEMEKLITNFIQKRNKPQISKALFKKTKVEGLTLPDLRTYYTATVVRTDWYWYNDSYIDQWNRIENPDVNPSTHGHLIFDKCPKSIKWGTDNLLNKWCWQNWMSMCKKLKQDSYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIESMLEALIHNINRIETITNNTRTPEDKPDNWDLLTIKLLCYSKDFTKR	174669	213570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13536_pilon_+_175810_207085_208013_210919
917674	contig_5125_pilon	+	481	1	Intergenic	novelGene_43481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141536	142017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_141500_142000
917675	contig_8375_pilon	+	2398	4	Intergenic	novelGene_141259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	163.628305076543	76	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	159	854	24694	29167	FALSE	40	GTGTGAAAAGAGGCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLPGWTVRNGQNLTLQCIVDISTTSHVKPHHLVLFYKDDVMFYNVSSRENTESYFIPQARVYDSGKYKCTVILNNKEKTTPEYQVSVRGVPNPRVVLDKKEVIEGGVVTVNCSVEEEKAPIYFKIEKVSLESKTIKQSREKTSQNQNFVMVEFPIEEQDHILIFRCQAMILSGLQMETSDLTRSDLVTVRCQSCCSFHHSCGLLVWYRGTEPRIRNRLGPSSWATVLRT	18685	30711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_18794_20025_20053_24670_24965_28742
917676	contig_8671_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_126268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	244	558	527148	527462	NA	45	AAAAGAAGTTAAGTGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCSLAILASKEHSGCTSSKTDLFLLLAVRGIFNILLQHHNSKVSVFLQSSLFIVQLSHAYEAIENTMARVRCTLVFKVTSLLFNTLKRYFAADLPNAMRLLIS	526904	529079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_526900_529100
917677	contig_8594_pilon	+	4102	4	Intergenic	novelGene_140026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	18.3847763108502	147	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	323	640	313139	313577	FALSE	25	TTAATGTTTGTGATGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYIRAHTGAVLTQWSLGNGTPVTSKGGDYFVFYSHGLQASAWQFWIEVQVSEEQPEGMVTVAMAAHYFSGEDKRSPQLDALKEKFPGWTFPSAWVCTYDLFVF	309747	317039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_309943_310396_310513_313127_313292_313412
917678	contig_5816_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_158251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267596	268515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_267600_268500
917679	contig_15991_pilon	-	658	5	Intergenic	novelGene_70932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3028.94382376102	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	77	409	105108	102194	TRUE	25	CTCTACTTCTACAGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQVSGGAEVCCCYWSHSHCRALHSWNLH	106358	101186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_101289_102046_102271_103579_103703_104975_105142_106315
917680	contig_13021_pilon	-	3050	2	Intergenic	novelGene_8248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1751	2140	207762	207373	FALSE	25	ATTCTCTCAGCAATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIKSEKHLSIGFHLSLAEGCPNPKTKPIAVELIPTHTVTLYDRAELSHRVSKAVNLIQKQTVTSFSRGVASGFKPPSLWLAAEHLTTVPPELGGLPQEVSILPTRLGFHWAFPAGFHWCFTSWHFTLP	210617	206462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_208241_209345
917681	scaffold_13505_pilon	-	1975	1	Intergenic	novelGene_111402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTACCCCACCCCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221828	219853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_219900_221800
917682	contig_6101_pilon	+	723	1	Intergenic	novelGene_114274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169202	169925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_169200_169900
917683	contig_5539_pilon	+	3052	14	Intergenic	novelGene_104749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	114	junction_1	252.655295263828	60	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	802	2043	79372	145233	FALSE	70	TCAAAAGAAAAAATACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTYQDSMENQESSKLIVASRNSPLSELSGKLMKSIEQDAVSTFTKYISPDAAKPIPITEAMRNDIIAKICGEDGQVDPNCFILAQSIVFSAMEQEHFSEFLRSHHFCKYQIEVLTSGTVYLADILFCESALFYFSEYMEKEDAVNILQFWLAADNFQSQLAAKKGQYDGQEAQNDAMILYDKYFSLQATHPLGFDDIVRLEIESNICREGGPLPNCFTTPLCQAWMTMEKVFLPGFLSSNLYYKYLNDLIHSVRGDEFLGGNISLTAYGSVGPPHESHPGVSSSSSSQSSVKKTSVKILKNFDEAIIVDAASLDPESLYQRSYAGKMTFGRVSDLGKFIRESEPEPDVKKSKGSMFSQAMKKWVQGSTDEAQEELAWKIAKMIVSDVMQQAQYHQPLEKSTKVRITYVLT	40870	146242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_41006_63825_63874_68044_68228_78936_79481_89038_89138_99952_100038_101372_101497_102939_103077_106298_106444_108546_108721_131108_131219_134842_134926_144442_144496_145110
917684	contig_11677_pilon	-	638	5	Intergenic	novelGene_85922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7721.44393879798	10	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTTCTTGTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598058	594881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_594942_595166_595349_595714_595892_597208_597397_598027
917685	contig_19402_pilon	-	2041	11	Intergenic	novelGene_80787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	4	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTCTTTAGCTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98372	23785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643
917686	contig_6710_pilon	+	541	2	Intergenic	novelGene_97122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATATACACAGTGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653372	657824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_653882_657792
917687	contig_13612_pilon	-	2805	9	Intergenic	novelGene_157291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	1922	2743	53628	50082	TRUE	10	CCAGCCCTGCCTCCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPAPPVPCLGHSSAQGRPLAAACPGFPQTSPGWRARSSRSPGYHCSYARGCRYQPAGCSPPWGEGPPHKLASCRRRQWGGLWHSEQQPSWAMEPTVGPLQTGGVTAVQLQHVHLPLGKGLRVLDHPVQCGARITHAGEVAHVCIDAQFQAQGVNLVGQVGHATGEALGIGHQVAAVVSSANPAVINVEVRVAQVPPPILCQPVSHLHEEPLADAVLRVLFTVDVAAEAFPGQPAHGWRPQEARSPAPAPGSLGPARALSSAALLRTPRPRN	56986	49385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_49407_50040_50124_51013_51152_51611_51784_52247_52441_52781_52871_53440_55304_56240_56380_56879
917688	contig_14341_pilon	+	1119	2	Intergenic	novelGene_111863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5029	junction_1	0	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	17	307	550058	550553	FALSE	5	GTGTGGCTTCCACTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQVGLGRETWGRAGAATRNGQRPV	550041	551365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_550151_550355
917689	contig_7078_pilon	+	2982	1	Intergenic	novelGene_130227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1791	2297	978946	979452	NA	20	TATTATTTTTCGTTTTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSMSKILNDARSVRRIWKEYTELPYQKELVHVQPFLEVAYDQDPMILKEEVKAALKALAKNKSPGTHRLPTEMFEQMNSALEVLSCPCQEIWKIITWPTDWKRCIFLPIPKKGDPTECRNYPTISSISHASKILLKIIQKWLQQYINRIQAGFRRGCGMRDIIADVR	977155	980137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_977200_980100
917690	contig_3862_pilon	+	2814	1	Intergenic	novelGene_137401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCTGTGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447701	450515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_447700_450500
917691	contig_19974_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_130475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225529	223894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_223900_225500
917692	contig_10642_pilon	-	1886	1	Intergenic	novelGene_78748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCCATGGGTACCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329881	1327995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1328000_1329900
917693	contig_3818_pilon	-	4609	2	Intergenic	novelGene_99254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	488	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	2848	3912	476704	474884	FALSE	25	GCTCAAGTCAGTTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRATALFPTAIRPPRKTSTHVTSSPKTKVQRTPRSGWPGSGALREGAGWPAQNDGRGRNTDLLKPAWRAQPPFPGAPLTLLSGTVHRQQSPRSSSPKDMVHEGRKLYDHPWLVVTTEREGEESAGGETLHHIKSMHPRFQEQAVSPGGGREKMLGVLPVRPGGKGSPLGVNGAAVGGRAEEEPQQLALGCVGRGRLELVDDLVLHRVGLVLLHLRQQLQRLLLLLRRVVAQQVGCCGQDGGPTSSCHQVEANGKGDVDLGAVELLVLLLLGQDELGSPVGKADDSGTLQDCEDVGKGIATGDLQGWMLGPKDIQKERRQATEDAQEAEGGNDSQEQHRLGIHAEVCGGENQIH	479551	474186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_475074_475829
917694	contig_5686_pilon	+	1646	4	Intergenic	novelGene_45219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2724	junction_2	1381.25410004419	55	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	131	478	93843	171803	TRUE	70	AGAAAAAAAAAAAATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAEAALPECLGNVGKGNRLGRPVAFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLE	93712	175920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_172587_175535
917695	contig_5539_pilon	-	2611	9	Intergenic	novelGene_104758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTCAGTACTTCAATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168119	101434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_101504_102942_103075_106296_106442_108544_108719_131106_131218_134841_134923_144439_144494_145108_145205_166370
917696	contig_2093_pilon	-	3416	1	Intergenic	novelGene_152940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCACCCTTTTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961180	957764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_957800_961200
917697	contig_7909_pilon	-	2202	1	Intergenic	novelGene_155888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	422	1269	36	1304	370914	369646	NA	15	GTCGAGGTATATTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYIVSSGFSSKMKVVASRLLEKYPQAIYTLCSSCALNMWLAKSVPVMGVSVALGTIEEVCSFFHRSPQLLLELDSVISVLFQNNEERGNELKEICHSQWTGRHDAFEILVDLLQALVLCLDGINNDTNIRWNNCIAGGAFVLCSAVTDFDFIVTIVVLKNVLSFTRAFGKNLQGQTSDVFFAASSLTAVLHSLNEVMENIEVYHEFWFEEATNLATKLDIQMKLPGKFRRAQQGNVDSQLTSESYYKETLSVPTVEHIIQELKDIFSEQHLKALKCLSLVPSVMGQLKFNTSEEHHADMYRSDLPNPDTLSAELHCWRIKWKHRGKDIELPSTIYEALHLPDIKFFPNVYALLKVLCILPVMKVANERYENGRKRLRAYLRNTLTDQRSSNLALLNINFDIKHDLDLMVDTYIKLYTTKSELPTGNSETTENT	370949	368747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_368700_370900
917698	contig_16125_pilon	+	3015	11	Intergenic	novelGene_155232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTAAAAAAAAAAAATTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115563	153053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_117615_118857_118892_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138993_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016
917699	contig_13481_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_119403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATGCAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618451	616166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_616200_618500
917700	contig_10225_pilon	+	2258	13	Intergenic	novelGene_86770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	44	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	1154	2020	42707	47511	FALSE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFDPTRAISPGAPRSPPMGLQKWRKRKKSRTRGSLPSSSLLRTWRT	20650	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46784_47378
917701	contig_1964_pilon	+	2475	1	Intergenic	novelGene_130932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682769	685244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_682800_685200
917702	contig_12464_pilon	+	2965	7	Intergenic	novelGene_68707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCGGTCCAGTCCCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342800	382175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_344618_345550_345708_346256_346561_357035_357116_357347_357832_381083_381147_382115
917703	contig_16541_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_126740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAAACCCTCCACTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353354	355853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_353400_355900
917704	contig_5062_pilon	-	1899	3	Intergenic	novelGene_157864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAAAATAAAGTCAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744081	739107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_739692_741720_741861_742906
917705	contig_11121_pilon	-	4831	2	Intergenic	novelGene_167048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	3471	3866	47814	9717	FALSE	30	GATTAGTCCCTGGAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILTTQETSKEDGRNTRSLYEKELVDIQPFQEVAYDQELMVLKEEAQATLKSLVKNKASGIDRIPVEIFEQTDAALECSLIYANKFGRQLPGQLTGRDLYLCPFQRKVIQQNVEITEQCHYYHTQIKFC	51284	8751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_9877_47578
917706	contig_15611_pilon	+	2613	2	Intergenic	novelGene_178383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAGATTTTAGAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5276	22944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15611_pilon_+_6898_21952
917707	contig_7870_pilon	+	3228	2	Intergenic	novelGene_109064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCATCAGCACTATACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688012	722648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_690143_721550
917708	contig_9415_pilon	+	1228	3	Intergenic	novelGene_109858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	778	junction_2	41	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	83	409	1993493	2000181	FALSE	40	AATGCTATACATACATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGQQSLHSDRAFLLAFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSALSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRNKRSKNQENGPVCSLRGKDTFMF	1993410	2001000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1993609_1999791_1999899_2000077
917709	contig_6159_pilon	-	3065	1	Intergenic	novelGene_128257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAATAAAATATTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236573	233508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_233500_236600
917711	contig_9646_pilon	-	7506	4	Intergenic	novelGene_117412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTTTTTGTGTGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111497	8945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_9220_15700_15886_71486_71847_104810
917712	contig_4426_pilon	-	5937	2	Intergenic	novelGene_15446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	260	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAACTCAGCAAATACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915990	850704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_854439_913787
917713	contig_16029_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_163760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCCCCAGAACATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42808	43898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16029_pilon_+_42800_43900
917714	contig_16328_pilon	-	5188	1	Intergenic	novelGene_178156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1547	1897	70417	70067	NA	30	GAGTCTGGAATCGAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFSTSGLGEQLLTAPSRIDIGLSLLREEYNFVQNWMTSEAVLKLRFSLQFHKELIFSFKDILSFTTLYLLHKLLSSWNQAFPFSVHFSKASTTLPWLSGVICRAPSSVPTSLFH	71963	66775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16328_pilon_-_66800_72000
917715	contig_14219_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_54347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCTATGTTAAACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841564	839631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_839600_841600
917716	scaffold_9100_pilon	+	1009	6	Intergenic	novelGene_83278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	681.144918501195	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	94	528	647136	654304	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644861	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650525_654231_654617_654681
917717	contig_6710_pilon	-	552	2	Intergenic	novelGene_96195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	105	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	5	TGCCTTGCACCTGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
917718	contig_4091_pilon	+	6763	7	Intergenic	novelGene_172992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	138.953729309036	34	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1571	1942	27470	28511	TRUE	45	AAGAAAGAAACTGCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSLNNIINITCNGVLSGNCQKFSRFQKRTWTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDRNKLWMTLQKNGNSKTFNCAHEETYIDQEAVFRTEQGDTAWFKIRKGVCQDCIL	10679	263453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_28180_30334_221578_222590_261465
917719	contig_3789_pilon	+	1310	3	Intergenic	novelGene_79870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTTCTACTTTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510452	586860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_511704_528816_528824_586808
917720	contig_4305_pilon	-	479	3	Intergenic	novelGene_136683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_2	564.5	69	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTGAGCGCCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514683	512962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_-_513298_513934_514044_514648
917721	contig_8576_pilon	-	1545	1	Intergenic	novelGene_88806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTCATCTTTTATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906303	904758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_904800_906300
917722	contig_11602_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_166601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAAGGGTATAGTTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230693	232223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_+_230700_232200
917723	contig_13224_pilon	+	2485	1	Intergenic	novelGene_104114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1706	2071	301923	302288	NA	85	AAAAAAAAAAAAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVFVRFFSVHLESWLASKPSFFSSAPHYLIISFPQLLWMLMGGFIFGTGRVASCLGALRRTRNQFSLRARTSWRFRIYRKTGITSVCELDYNNNALYLCKISYFQSILKNRWLQWTFCSG	300217	302702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_300200_302700
917724	scaffold_12124_pilon	-	2374	2	Intergenic	novelGene_22399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCTCTGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510597	1508146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1509157_1509233
917725	contig_3095_pilon	+	1206	6	Intergenic	novelGene_74981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2979.94225447407	53	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	317	790	149859	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149742_149784_149896_150413_150696_150996_151163_151848
917726	contig_1069_pilon	-	3549	1	Intergenic	novelGene_172296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	178	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3247	3549	10485	10183	NA	50	CTACAAACTTGAACAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNAGTIKSISSDHNAIKADINNGKTKEKKSTTWKLNNTLLTHLWVTEEIRDGIKNFPESNENENTSYQNLWDTAKAVVRGQFIATDAHIKKEEREKSKH	13731	10182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1069_pilon_-_10200_13700
917727	contig_12946_pilon	+	1508	2	Intergenic	novelGene_178982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	44	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	178	693	24021	24536	FALSE	30	ACAAGATCCCCAGGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSWGQMESWGQTEHWVHLKASLTIGSRFHGPPRGATVTGSSSCSFLHSGWLFTQPHSSACSFVAPAKHSCYCKYPAQSPPCYLKPTAISPYHLAHSPWLALKQPSFLFMAFGSSLLRVVGWGLALAGEALGRRGPGLSLPLGKHQPRPVLLMRHVRTKKPEFLGYLHHPP	9922	25351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12946_pilon_+_10053_23973
917728	contig_18162_pilon	-	2502	2	Intergenic	novelGene_122270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9791	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_7446_7491
917729	contig_14341_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_111765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259311	261398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_259300_261400
917731	contig_5302_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_81515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTACTTTCATATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385736	1386796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1385700_1386800
917732	contig_10399_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_114484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTAAATAAATAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258394	259310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_258400_259300
917733	contig_18976_pilon	-	5825	1	Intergenic	novelGene_174892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1359	1682	12337	12014	NA	25	GGGGGTTTCAAAATTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRREPGTRAKGGRGDERQGRNQKKRQEATPAANKWHPGSWPVRAGKIQAAGASRLRDRGCGKQRRPSGGDEGWGVGKRISLVTSYSVSCWKLHEAAFLYPLYTGL	13695	7870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_-_7900_13700
917734	contig_6946_pilon	+	1473	6	Intergenic	novelGene_59746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	41.6432467514242	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	855	617	1471	45050	45904	FALSE	40	GAGTGTAATAGTTGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYLYEKLATG	1708	45906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_28232_28288_35894_35984_38507_38647_44954
917735	contig_16322_pilon	+	2551	2	Intergenic	novelGene_87549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91150	94091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_91557_91946
917736	contig_11560_pilon	-	2460	10	Intergenic	novelGene_117914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	12	junction_1	84.2009647755642	74	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	138	1082	165836	128499	FALSE	10	TTGGTCTGTGATGCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSRLQEIRERQKLRRQLLAQQLGAESADSIGAVLNSKDEQREIAETRETCRASYDTSAPNAKRKYLDEGETDEDKMEDYKDELEMQQEEENLPYEEEIYKDSSTFLKGTQSLNPHNDYCQHFVDTGHRPQNFIRDVGLADRFEEYPKLRELIRLKDELIAKSNTPPMYLQADIEAFDIRELTPKFDVILLEPPLEEYYRETGITANEKCWTWDDIMKLEIDEIAAPRSFIFLWCGSGEGLDLGRVCLRKWGYRRCEDICWIKTNKNNPGKTKTLDPKAVFQRTKAGLQLDRLLRIATTMQKHMHPTSAPLIPT	165973	127120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_-_128589_145639_145757_148488_148582_152403_152546_153573_153665_158049_158138_158739_158821_159950_160039_160753_160843_165770
917737	contig_11335_pilon	+	2824	1	Intergenic	novelGene_104908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317595	320419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_+_317600_320400
917738	contig_151_pilon	-	2142	2	Intergenic	novelGene_132561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1791	2114	163982	163659	FALSE	30	CCTTGAACAGGTATTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVHISIHVMTLTSLGYIPRSGIAGSYGASISSFLRKRQIDFQSGCAVLHSQQQCISVPVSAQPLQHLLFWVFWINASLAGVRWYLIVVLICISLMTNDHKHSSCIC	165859	163630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_-_164844_164930
917739	contig_10367_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_169455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATATTAGCATATAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132710	130582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10367_pilon_-_130600_132700
917740	scaffold_13553_pilon	-	1681	2	Intergenic	novelGene_73753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3893	junction_1	0	70	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACATGAGCGATGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41851	37812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_37901_40258
917741	contig_3700_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_138080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAGGAAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248975	250389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_249000_250400
917742	contig_11277_pilon	+	1402	9	Intergenic	novelGene_80306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	160.971222195149	1	51	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	193	1200	250372	269500	FALSE	20	CACATTTCCACTTCTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAARFACLRILPSRTFHPAFTKASPLVKNSITKNQWLLTPSREYAIKTRIGIRRGKTGQELKEAALEPSVEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCFYGLGMSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	248219	269702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_248376_250335_250501_254697_254798_255953_256066_256493_256636_260595_260705_266767_266957_267467_267610_269415
917743	contig_18859_pilon	+	6221	6	Intergenic	novelGene_150536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	282.395750676245	742	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	38	1402	67388	90831	TRUE	50	CACAACAACAACATACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANQDPDKVAKAIMDAIEDRIQKGSVHSVKQVKVVILLPQVLNVFYANMKNREGSQTSPRQSMITKLKAFFNSSWQAPKKQASLVLEKKIESAIFQVCGEDEKHVGSTISWIQHLIEKEQSTYTSEDECIRNFDEKEYQELNKLQKSSNIKISLDPKKPLIEVSGISKDVMKATSAIEEMIKRVRVCKEQESQADCISEFIEWQYNDKNSFYPFDRITNLQLENARKAKQRTIDIKINNQSYTVDLHTNTATDARGYSLPVQRVMKSEVEIPANWSDMKQQSSCLVELQPTHPEYNTVAGKFNQTCSNFKILKIERVQNPDLWNCYQAKKKTMDAKNNQINNEKLLFHGTDGSSVPYVNQNGFNRSYAGKNAVAYGKGTYFAVNASYSASDTYSRPDSNGKKHMYYVRVLTGIYTHGNSSLIVPPSKNSQDPTDLYDTVTDNTQNPQLFVVFYDYQAYPEYLITFSR	67350	124525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_67554_67635_68236_69517_69652_90033_90209_90541_93962_122836
917744	contig_17144_pilon	-	2350	14	Intergenic	novelGene_29560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1675.27574697492	37	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	593	1782	125	1906	179764	166562	FALSE	10	TGCTTCCTGTAATTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFWAGVGEPHKPRARALPPL	183206	166117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166618_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
917745	contig_8304_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_153162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAAAAGCTCAGTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26034	27719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_26000_27700
917746	contig_8386_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_82229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	229	543	57535	57221	NA	75	ACCACATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTRTLLAQIKKTENNTCWRGCGEIGTPMHCWWECKMVQPFWKMIWRFLKKPETEISHDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFTVALFTVAKR	57763	55570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_55600_57800
917748	contig_8453_pilon	-	6018	1	Intergenic	novelGene_125130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAGAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219522	213504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_213500_219500
917749	contig_13699_pilon	+	6336	5	Intergenic	novelGene_158312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	457	junction_3	532.615011053951	363	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1804	5415	115	5529	31433	41889	FALSE	10	GTCCTAGGGGCTCCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGIIDTATGRRLTINEAVSNDLVAAKIALVILESLWSFMGLLWPESGEILPITDALEQGIVSTELAHKILSGRQHIMALFLPATAEVWSWKKAIENGILDKDLANNLKSICIPDVMPHMQLADASEQSKLSINPGAAALPCSKGQTEGIASHREKLLFQLMTHSYINVRDGQRLLLLDKELIETLTPRDGSQTSPPEVFGIGHQRLETPEELQESVNVKSTEAFFDGLTLRPQEFQVSFQNKEYTEGTETIVETEGSYVENPGKDLFVGEQKVRNPNVNTLKVINKVKSELQRQLLGTQTEHRTEVSMRKNVSSGLTVPHQEAEGLCLVVDKDHFPVETPAEEWQAFRKTSFTCQKEQANTLETERIPGETGRTLIKPQDKKSQFQVEKTLDLESEVKSENDVSIQSLDKKKVVNKMLLDRDDYKQSQEGENIAGGSSRMMLEKRDEEDNGSETSLSCSRPSELLEETTLNILSAQLLDGGIFHEQTGQKLLLNEAIAQGIVPSHIAVKLMGKFQMFRGFFDSQTCESLTTEEVIDEGLMDEKLLHNVLMSDKAISGVLDPRTHTLCTVKDAVATGLLDKQTATRILEGQVVTGGIIDMKRGKKVSVTLASNLGLVDSADQAELVSLEKASKGRDCEKTIRERLITLQMETTGIMDPDTKAPLTVVHAIDRGLLERQEAIQLLTKQVVDGGIIHHVSGMRLSVDNAFKHGLIDEDLSRQLKKVENLNLHQFFHPETKETISFPEAMKLDLITPDLKREIQEIQSLTGSFVDLISGQRLTLAEAKKEGPLTNKALLSSGMMHGIVDPENYRIVPYSELVKKCKIDIESGQRYLEVIPFSDIKDGVSGKAVTLSEATQLGKVDFASTWRVLEAQANTGGIIDTATGKRLTLASALEQKLVDENMVRIIASHQVSNGGIIDIFNDQRVNLKEAIEKKLISHELAAVIQVDTLEPSDHKAQIEKHDEIEVCELKNEFLRKEMLIACNQAAEMSCDKEETERLFQIESPSAEETTKLRLPDGEQAKKTRKISLRESQYKDHDKRRASPDAKGSVSILISGNLTGKFLDQIAVEHPHSEVCNFKLKELVQVNMGNNTNGEQEKIVTQVEIISPVKQSTSGLESKEIRENQREMISEVQESNCGTSGKLLSEQATREPMNIKVKSKREKREMILDASVKTCKPAILSEEEWNQETGITDEHDSSIKSQPTEITIPERGKEAEREQGFSIICKAKDSSYQMVSKGISIGNQDASTFFNSKQANEGEVNNLSICLTLKPEENLIQEITDGPQSEPSPSMTPRLEGLHYQESVGQALDADTSQISKAYKSLQGTTRQETNYYRDSCVTFKSKETKDVISRSNECKEKSYQEVTFDLTKALKLEDITVSRVDPKEVSYLEFSDRKDLNHQDSRSDREVCGISKSNIVTTQETTGEKFLEMANSKVTDSEAGSLEGIVTQEGPTVLVSLLPEKLLQDLSWKEITGQQDAITSPTIPETSAEKTVPLISCSTKKMDEMTPQEELRESPSSEQTPFMTVPGGKENEGVNLEPFKATKNVYNRQLCLEHDEKLVSYLSLLRDIEMRMKQIQPLELNLTELEDLLCQAKVLDRELKDLSTMVSQELECVNQIIISQPQEVPAQLLKALEKDAKNLQKSLSSVSDMWSSRLHCLQNVVEVKKTKMLNQQVQLEGKLEDLKAWVVNTNLTLNSKEYNNETDADSLNHCLQQYEDLEQPMAERKSQLDALAFDIQFFISEHAQDLSPKQNRQMLRLLNELQRSFQDLAEQTAAQMDVLQGHLQQLEQAAQVKVRQNQQLDSVCLLGCLLPLGFLARLHLSRFKEPGFTNFGILCHSGQYVF	31318	42696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_35948_36489_36640_38903_39120_39207_39358_41505
917750	contig_12050_pilon	+	2011	16	Intergenic	novelGene_62620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	370.512413947075	2	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	126	1643	334091	354706	TRUE	20	TAACAGTTGTGTGGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPKDLKKPRGKKCFFVKFFGTEDHAWIKVEQLKPYHAHKEEMIKINKGKRFQQAVDAVEEFLRRAKGKDQTSSHNSADDKNRRNSSEERSRPNSGDEKRKLSLSEGKVKKNMGEGKKRVSSGSSERGSKSPLKRAQEQSPRKRGRPPKDEKDLTVPESSTVKGMMAGPMAAFKWQPTASEPVKDADPHFHHFLLSQTDKPAVCYQAITKKLKICEEETGSTSIQAADSTAVNGSITPTDKKIGFLGLGLMGSGIVSNLLKMGHTVTVWNRTAEKEPNNRHLFCAYCEVEHRSMHQCDLFIQEGARLGRTPAEVVSTCDITFACVSDPKAAKDLVLGPSGVLQGIRPGKCYVDMSTVDADTVTELAQVIVSRGGRFLEAPVSGNQQLSNDGMLVILAAGDRGLYEDCSSCFQAMGKTSFFLGEVGNAAKMMLIVNMVQGSFMATIAEGLTLAQVTGQSQQTLLDILNQGQLASIFLDQKCQNILQGNFKPDFYLKYIQKDLRLAIALGDAVNHPTPMAAAANEVYKRAKALDQSDNDMSAVYRAYIH	323521	356765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_323595_334038_334178_334710_334954_340479_340567_341364_341422_342204_342256_342346_342421_345187_345288_348643_348707_348911_349023_349699_349802_350559_350723_350997_351178_351507_351633_354631_354708_356398
917751	contig_12312_pilon	+	5293	21	Intergenic	novelGene_63958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4303	4647	245987	257978	TRUE	20	GCGACTCGCAAGCCAGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSPASPGEALGSRSQPLAWFSLESMEANALFIASVSLLAQASSSQEVSCNTRMISLISALIFSTVKLRFFKASSIPWFFEFLVVTKIFIAEMRTGSNSLTVFIEFTSITRCS	213841	326158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_215984_218222_218326_218673_218880_223841_224029_225333_225458_226679_226979_228082_228196_229392_229543_233702_233833_234965_235165_237713_237906_241325_241503_242253_242408_245860_246008_246881_246973_256293_256456_257907_258034_259774_259880_260265_260421_278131_278200_325895
917752	contig_10857_pilon	+	2952	6	Intergenic	novelGene_160920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	133.69128617827	2	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	264	581	467726	468931	TRUE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCRCSRPSALRDA	463712	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_470317_470471
917753	contig_5623_pilon	+	2643	2	Intergenic	novelGene_154862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCTAAAACATTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247148	250045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_249651_249904
917754	contig_15273_pilon	-	4264	3	Intergenic	novelGene_140427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2690	3037	64996	64649	FALSE	50	CACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKWYFTKEDIQAANRYVRKCSRSLGISEMQIKTTMRYYLTLARIIIIKKTQNCKCWRGCEETGTLIHCWWECKMVQPLWKLIWHFFKKLEIEVPYDPAIPLFGIYPREIRAVHK	156395	63421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_65477_85220_86055_155020
917755	contig_18328_pilon	-	3527	1	Intergenic	novelGene_132554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	3060	3521	45476	45015	NA	40	CCTAAGAATTATGTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSVSNHKEADHDGFSKPSKQRIKKPSGGRDLGINRGRIQKINIQTSSRDQEGDEAKTEQTKEHTNKARDELKKVIQEHNDKLNRMQESIERQQTEIQKIKNKISELDNSIESHRSRIEAMEVRISEIEDKTLDANLFEEKSDKRIKKN	48535	45008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_-_45000_48500
917756	contig_17108_pilon	+	5341	1	Intergenic	novelGene_109527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCCCAAGAATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74594	79935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_74600_79900
917757	contig_9471_pilon	+	3228	1	Intergenic	novelGene_21690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTACTTTGTCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54220	57448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_54200_57400
917758	contig_9332_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_60742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGCAAAAAGAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602396	604082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_602400_604100
917759	contig_2704_pilon	+	3019	4	Intergenic	novelGene_75307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.0506967012082	5	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	96	428	217418	321113	TRUE	40	TTGTTTAAACTTTTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGDFLSYLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMAYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNLLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGYRMSAPQHCPEDVFKIMLKCWDYKPENRPKFTDLQKELTAIKKKMS	217322	324286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_217453_315106_315262_320970_321604_322185
917760	contig_6735_pilon	-	1325	12	Intergenic	novelGene_15779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	919.639059631549	12	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	82	1140	564868	542177	FALSE	30	CACCCTTATGCTGAGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKSVVGHDVSVSVETQGDDWDTDPDFVNDISEKEQRWGAKTVEGSGRTEHIDIHQLRNQVSEEHGVLKKKEMESGPKASHGYGGRFGVERDRMDKSAVGHEYVAEVEKHSSQTDATRGFGGKYGVERDRADKSAVGFDYKGEVEKHASQKDYSRGFGGRYGVEKDKRDKVALGYDYKGETEKHESQRDYAKGFGGQYGIQKDRVDKSAVGFNEMEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEWTLILWSCLILHECFL	568279	541991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542228_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546577_546634_547243_547355_551179_551235_552840_552952_554243_554374_564157_564232_564784_564869_568198
917761	contig_7426_pilon	+	4822	1	Intergenic	novelGene_27499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	41	529	931888	932376	NA	20	ATATATATGTGTGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGFWCDVLCCFIDMRWGDTDLTRALCWSCSPCCSGLRIRALSKVYLKGSKSPCTLNRHIIHDPRWHKWLSAWLLTKRLVVRTQQEVSQEKDLEICFQKATAMKTLSMEHSSTLQHMGLPQVTINSTATGLFFGFGFGFITWPAPKVKTNVHNKVWLCVSGGLPPKEDLEMRSGSK	931847	936669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_931800_936700
917762	contig_10851_pilon	+	5159	7	Intergenic	novelGene_178983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	187	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGCATGGTATGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8361	273199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10851_pilon_+_8545_133552_133768_139584_140779_144973_145612_242657_243228_270712_272107_272234
917763	contig_2100_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_50637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTTGAAACATCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	942600	944123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_942600_944100
917764	contig_567_pilon	-	2529	1	Intergenic	novelGene_34008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621792	619263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_619300_621800
917765	contig_9706_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_20965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGGTGGTAGCTGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316811	314283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_314300_316800
917766	contig_7775_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_37513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTGCTCTGTAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339379	338078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_338100_339400
917767	contig_5854_pilon	+	3507	1	Intergenic	novelGene_68862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAACAAGAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349910	353417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5854_pilon_+_349900_353400
917768	contig_14621_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_105875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448890	450270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_448900_450300
917769	contig_5686_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_45301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	285	626	94439	94780	TRUE	30	TTATCTCATTTAACTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	94154	96486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94926_95893
917770	contig_15327_pilon	-	931	1	Intergenic	novelGene_70499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAATTCTAACCACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427012	426081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_426100_427000
917771	contig_6513_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_117753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86736	89174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_86700_89200
917772	contig_6446_pilon	-	3606	2	Intergenic	novelGene_149197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAATACCAGATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255263	251117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_251226_251765
917773	contig_6102_pilon	+	3597	29	Intergenic	novelGene_31837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	511.737985013935	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	89	1522	370803	378892	TRUE	30	TACTGTGAGAAGGCAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLPARPSKPGALCAGEG	370714	394909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_376251_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
917774	contig_12923_pilon	-	2505	16	Intergenic	novelGene_30198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	36.2396958535189	55	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	591	2231	539189	511076	FALSE	35	ACAATTTCTACATGTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGIEQFQLQKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIGLTFFMFTVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVVSGTIGLKKKIYLSKPVFLTFKHTQAVGTETKHLCVYWEASKEGGSWSTEGCSHMGSNNSHTTCQCFHLSSFAVLVGLTPKADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585694	510801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_531948_532117_533560_533746_535905_536038_538385_538522_539156_539317_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
917775	contig_7992_pilon	-	2968	1	Intergenic	novelGene_115547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	639	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAAATATTAGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613678	610710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_-_610700_613700
917776	contig_6320_pilon	+	3382	10	Intergenic	novelGene_158080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	189.442912994787	184	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	27	1301	33191	145533	FALSE	20	ACCCACTTGTGATATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALADQFEDMTTSVLERLKIFYCCQVPPHWAIQRQLAGLLFELGCTGSALQIYEKLEMWEDVVICYERAGQHGKAEEILRQELEKKETPSLYCLLGDVLRDHSYYDKAWELSRHRSARAQRSKGLLHLRNREFKDCVECFERSLKINPIQLGVWFSLGCAYLALEDYGGSAKAFQRCVTLEPDNAEAWNNLSTSYIRLKQKVKAFRTLQEALKCNYEHWQIWENYILTSTDVGEFSEAIKAYHRLLDFQDKYKDVQVLKILVRAVIDGVTDRSGDVATSHRGKLQELFGRITSRVTNDGEIWRLYAQVYGNGQSEKPDENEKAFQYLSKAYKCDTQSSGWEKDMTSFKEVVQRALGLAHVAIKCSKNKSSPQEAVQVLSSIRLNLRGLLSKAKQLFTDVASGEISSELADEIAAMDTLVTELQDLSNLFRNQY	33164	147614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6320_pilon_+_33263_36803_36927_55137_55366_69588_69688_82049_82103_94330_94497_133033_133232_134530_134643_139607_139709_145410
917777	contig_6919_pilon	-	3662	1	Intergenic	novelGene_163975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTCGGCATTTCTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28297	24635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_24600_28300
917778	contig_3822_pilon	+	1689	4	Intergenic	novelGene_133322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTATGGGATAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290839	297225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_290879_292752_292805_293547_293643_295722
917779	contig_16431_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_87619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCAGAGCCAGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252214	253883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_252200_253900
917780	contig_5605_pilon	+	679	3	Intergenic	novelGene_143954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	7	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466217	485551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_466402_472975_473133_485213
917781	contig_20699_pilon	+	2589	1	Intergenic	novelGene_178984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAGCTATATTTTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33082	35671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20699_pilon_+_33100_35700
917782	contig_4315_pilon	+	2151	10	Intergenic	novelGene_46796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1697	2116	338064	343517	FALSE	10	GCTGGAGACGTGCCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSAPPGSADNLSVDLLPYWEPQVIEESAGRSRALVGQLEADAGCIGLRWEGRCRLSSNRRRSRDTSSCSSRMAWSRPVLVRRKLGVVSAGPWVRGAAAGAGVGGELSALLGRSCSEIRFRTLNSEEGTISAVNARSR	327077	343552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_327548_327642_328246_333530_333732_333994_334108_335677_335774_337184_337333_337998_338115_338964_339142_340931_341092_343485
917783	contig_16532_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_110051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCTTCATCTAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204172	204990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_204200_205000
917784	contig_1719_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_87259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134220	136042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_134200_136000
917785	contig_17603_pilon	-	1336	5	Intergenic	novelGene_152770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	35.947009611371	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	398	751	42514	1537	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLHGLRDDIPLDFQKLEKEMDSVVFEDVAMDFSQEEWALLDLAERKLYRDVMIETFRNLAAIGKNELFFFPSVNNNILLIDFAPVFGLRNENKLLNEGGTVPWSVELTDPDILPSP	47122	5	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_151_1096_1715_28907_29021_42451_42697_46907
917786	contig_10404_pilon	+	2862	3	Intergenic	novelGene_138633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417464	425607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_417727_422515_422676_423167
917787	contig_9684_pilon	-	3506	4	Intergenic	novelGene_178248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	153	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1898	2482	4738	4034	FALSE	35	TTCTCCAGAATAGACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	75951	3009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9684_pilon_-_4321_4440_5758_55513_55724_75283
917788	contig_6137_pilon	+	1962	15	Intergenic	novelGene_59231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1258.95354382527	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	875	1405	1331821	1345157	TRUE	15	TTCTGTAGTTCACCCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLSFRVFARRCRV	1313230	1348372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341632_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119
917789	contig_5814_pilon	+	637	1	Intergenic	novelGene_143048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCTGGGCCCCAGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151478	152115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5814_pilon_+_151500_152100
917790	contig_10437_pilon	+	1623	8	Intergenic	novelGene_38283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	76	1098	431167	451175	FALSE	30	AATTTCTATCATTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431091	451700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
917791	contig_5260_pilon	-	1603	3	Intergenic	novelGene_144421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCACATAGAATTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533182	530160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_530575_531317_532026_532701
917792	contig_6823_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_131198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAGCATAGAGAACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18279	17076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_17100_18300
917793	contig_5711_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_80269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAAAAAAAAGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60759	61267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_60800_61300
917794	contig_14243_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_57436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTCCACTTGTGTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672821	675049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_672800_675000
917795	contig_10302_pilon	-	2828	2	Intergenic	novelGene_175202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	0	86	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCAATTCTTCATACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47142	42401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_-_45007_46919
917796	contig_2768_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_57496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAATTGTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701222	699536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_699500_701200
917797	contig_10877_pilon	-	4635	1	Intergenic	novelGene_166218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	226	525	111869	111570	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHSLHQTESSIARWCLATTTDCSDRDHNRGSWTELENNVEQNSNSQKKRTRFTGLTDWRNPESMAPKYRFSSMVKSLPKFNVQLGIGQSHKTKQD	112094	107459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_-_107500_112100
917798	contig_13490_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_129119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATAGTCTTTTCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24453	22317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13490_pilon_-_22300_24500
917799	contig_16722_pilon	-	6514	3	Intergenic	novelGene_118301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	684	junction_1	101	239	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	471	6044	6514	165227	155993	FALSE	75	GTTAAAAAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNINNYFKLGQEGKYRVYHNQYSTNSFALNKHQHREDHDKRRHLAHKFCLTPAGEFKWNGSVHGSKVLTISTLRLTITQLENNIPSSFLHPNWASHRANWIKAVQMCSKPREFALALAILECAVKPVVMLPIWRESLGHTRLHRMTSIEREEKEK	171270	155992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_156036_164408_164541_164931
917800	contig_11548_pilon	+	1515	6	Intergenic	novelGene_66762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2256	junction_1	638.817344786442	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	86	676	112832	119638	FALSE	20	ACCATTACGCTGTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	102517	120477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
917801	contig_10013_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_125047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	112	426	215770	215456	NA	20	ACCTCTGTGCCACCAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRRTLFNIVPEDAPLRLEGTQNMTGEVLPPQRRVDLNDVEGVKLPGPTLAHVAQLKMRRNSCKHPLIIGMWNVRSMNLGKLEVVKNELKHFKIDILAISELK	215881	213341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_213300_215900
917802	contig_8616_pilon	-	3119	25	Intergenic	novelGene_72526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1604	2476	376105	373643	TRUE	10	CGGGTTTGCTCTTTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPVPRVHLDVGVHNGHQLPPLGGQPLEHGEGLGEAAGVPGEIPLAISMFNVQPDDIAGQVVVIKALIHFQHISLVPVVPAALVVAEGEERGQCLGPCKTSVLPEDVHDRGPEQQEHINDATLRHPADICLRSLPRALQIVQHLPKQRLPCGIGGDVNPGLGGIEPEDAQVPLRVVRQEHRHRPIQGHGIVQLVLEHIQIVEAIWLPTLSDLQPQTVRMLWEPIHMLHSWQRKVQTHRRRPIRLAVRVSFECFLPGSWLIFLCLLLGLLWLVAISRCFLGLGSIALSWVF	380458	362636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_362681_366430_366537_366692_366800_367051_367181_372150_372332_372784_372847_373628_373704_373874_373964_374050_374149_374406_374586_375364_375518_375720_375958_376049_376175_376278_376361_376613_376759_376886_376987_377266_377369_377546_377790_378683_378750_378931_379008_379121_379199_379373_379483_379605_379720_379884_379988_380141
917803	contig_17989_pilon	-	3371	2	Intergenic	novelGene_150850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2509	3096	347195	346608	FALSE	55	GAGGGAATGCAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTWGNVLQEAVYALNKCPIYGAVLLRTRIHGSRNQGVEMGVVSLTINPSDPLTRLLLPIPMTLLCSSGLEVLISKAGMFPQGDTSMIPLNWKLRMPPGHFELLLSLDQQAKKEVTILAGVIDPDYQEEIGLILHKGSKEEYVWNARDPLERLLVLPCPVIKVNGKLQQPNSDMTTNGPDPSGMKVWVTPSGKEL	349865	346332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_349611_349772
917804	contig_17795_pilon	+	1709	1	Intergenic	novelGene_175791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGACTAACTTGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5491	7200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17795_pilon_+_5500_7200
917805	contig_835_pilon	-	2851	3	Intergenic	novelGene_152173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383439	369762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_-_371594_381943_382405_382880
917806	contig_4105_pilon	-	3798	14	Intergenic	novelGene_21496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	743.696850818369	1	101	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	736	1827	109032	100151	FALSE	30	CTTTAAAGTTCATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	137460	98179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_116940_117103_119337_119547_121847_121986_137434
917807	contig_12886_pilon	+	2470	2	Intergenic	novelGene_135477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCACATCCTTAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314537	327317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_314545_324854
917808	contig_233_pilon	+	2806	16	Intergenic	novelGene_14654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2482	2805	108497	126984	FALSE	30	TCACTTCTGGGAAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLAGQPFISSCCLVLQRTESGSPSPVKFIFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRPEEEQSHQSEQQGMLAWHDLHSCPRTLVLRVLGGLGQVKLRSCPGWFT	78173	126985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107465_108395_108583_108724_108818_109917_109978_126899
917809	contig_4125_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_25181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAGGAAATAGACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1256679	1254203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1254200_1256700
917810	contig_3426_pilon	-	4078	2	Intergenic	novelGene_57922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	3302	3604	152324	152022	FALSE	50	ATATGAAAAGTGAAGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHELKAMHKQMIQGYGRLDPSEAPIRKEKKTWQVPKAQASGHLLAEGMGTKQTSPVARAGIADIGLLRHQNLEPIMQHFAGSFLGISPFRTFRTLDTEV	157343	151547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_153888_155605
917811	contig_3817_pilon	+	3783	9	Intergenic	novelGene_78348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_3	3.30718913883074	107	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	16	723	515981	528492	FALSE	20	AATTGTTGGTGACCCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVWSWGGRLGLRRYLGAGRILCLRFQSRGPQGVENGDRSQCSSKTPKIPKIYTKTGDKGFSSTFTGERRPKDDQVFEAVGTTDELSSAIGFAMELITEKGHTFAEELQKIQCTLQDVGSALATPRSSAREAHLKHTAFSEGPILELEQWIDKYSSQLPPLTAFILPSGGKSSSMLHLCRAVCRRAERRVVPLVQMGETDANVAKFLNRLSDYLFTLARYTAMKEGNQEKMYKKP	515965	531552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_516097_518239_518302_520135_520230_522032_522091_522851_522925_523181_523280_523561_523627_526985_527046_528410
917812	contig_5958_pilon	+	2027	9	Intergenic	novelGene_140085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_4	76.3982166022218	19	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATGGTTCTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151778	184149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5958_pilon_+_151932_154862_154983_160822_160870_162680_162769_167909_167961_176696_176798_177740_177821_181665_181718_182814
917813	contig_1443_pilon	+	6706	3	Intergenic	novelGene_28331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAATCCTCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760741	776693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_766826_767440_767556_776186
917814	contig_19957_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_57683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42948	45209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_42900_45200
917815	contig_19850_pilon	-	1547	10	Intergenic	novelGene_170854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	79.1201617794099	1	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1437	111	1547	39513	3453	FALSE	25	CATGTAGGTTCTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLRQHTVFLKKMTQFILQEMPKARYSSLLNDFVESNYFVIDGDSLLVTCLGDKSFKRGQDLHFFYLVECYLVDLMRNGAQFGIIFFEDAECAYFPFPELLPLRTALILHLQHNTNIDVQTEISGCLSLEWELFLEERHPYFLIVSDEGLNDLQTHLFNFLIIHSWGMGVHVVLSSGQESDSLKLYAYIMQSTKRNQKFSKEVDTDCSALQEVEDLCRLHCLSIAFLLRLPLSQRAQTRVITSHWIQNIQTFLKMKKWCEYFILRNISKFGSWNLNLKHLSDLNDEHLLKNIAFFYETENVQEIYLNLGDFIKRDYEHLWNSVSHLVKEFNVGKPFPLRTTAGYFLGKTSSPIQEISSENMSNLGFIPMTSAIIDMFLGDTLKDLPFLKSDDPVVTSLDKPKKSVVRFRLRTHTTLSDDYDMTKCHFDEKSTDSHYVNHQQKKMAYQRFYGKSLESVSAKVIVTQTSHPEEESSRKKTS	39623	3452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19850_pilon_-_3605_6173_6290_6957_7064_18842_18999_19934_20077_22703_22863_32120_32463_38256_38447_39010_39081_39509
917816	contig_8552_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_80097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	681	1103	535448	535870	TRUE	65	GGTACAAAAAAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLRVRGADRLALGHKAGSGSFWIMKGVPFYGLSCPTQTTPSRGLPPEGGVAQVTTRPPQKLNKVPPPGPTVGVHVPGEMAGPVREGGLPALRRDLRVPRECLRQRAGLHPSSVLWGGEPPRWWLRCSGVGGPVEPAIP	534767	631652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_536174_631278
917817	contig_9538_pilon	-	484	1	Intergenic	novelGene_176449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGTCGGTCGGGCTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28489	28005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28000_28500
917818	contig_8377_pilon	-	3594	20	Intergenic	novelGene_34914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.33978126961662	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3193	3519	128928	68133	FALSE	20	GAGGTGGTGATGTCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTLVLLEVSRNTWVGILPGVRGGVVSEESCPLSEMFAGENAVVPAGKGSLGDTALGLSVVVSPVILTGAVTSTPMSRKTKPNAKSLSHKYMVISGNQPYETACVLS	180509	68057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68139_68219_68328_128715_128932_131428_131565_135047_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
917819	contig_11631_pilon	-	4088	8	Intergenic	novelGene_104181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCAGGGCCCCGTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93153	77868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_-_80639_81512_81672_82818_82950_86021_86152_87078_87215_87294_87436_88997_89070_92604
917820	contig_9668_pilon	-	2336	3	Intergenic	novelGene_58147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACGGTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360553	347767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_348503_355527_355712_359136
917821	contig_18039_pilon	-	3098	1	Intergenic	novelGene_171254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	432	761	210155	209826	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDVHENNLFIRNAFFPTIKSIAYTRGPHQMYYTRIKSSASVERHDERSSILSVRNKSDTNCGTDHKFKLKPKKIRATAREPKHDFEYITHDFRDHLKNRFDTVNTNDQ	210586	207488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_-_207500_210600
917823	contig_5023_pilon	+	3554	1	Intergenic	novelGene_7112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	19	342	84342	84665	NA	15	GCGTATGACTATCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQLGLMSLSHGRNVFESKNYTFSSSNSDSLLCNELIVNIIKNSVTALKRTAPHNKIYNEVWPWNEVRFPDVQMSYGNSKLVSYVTIQIQQDFLSHCHLFRGQNVLILPCDIQ	84323	87877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_84300_87900
917825	contig_11933_pilon	-	2053	1	Intergenic	novelGene_107268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTTAACTGAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195011	192958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_193000_195000
917826	contig_9921_pilon	+	2788	1	Intergenic	novelGene_23715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAGAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50268	53056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_50300_53100
917827	contig_614_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_132662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	843	1142	1137835	1138134	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDAAVARQEAGQRELVSFLCLCFTGRTWNICKGGSTEGRTNHWFLEIWEKRVKSHPDGGLASYRRWVPTSMALEGRMETDCGRFAGWLRGGSPSLRPL	1136992	1139608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_1137000_1139600
917828	contig_9011_pilon	-	2952	1	Intergenic	novelGene_159281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	59	328	178137	177868	NA	85	AAAAATGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTM	178195	175243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_175200_178200
917829	contig_1107_pilon	-	2154	4	Intergenic	novelGene_126595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	177.994381933813	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	200	718	869021	857675	FALSE	65	CAGAAAAAAAAAAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIILCLTVGNGSSWKNLEMILNSTINFLRQPWLNSSTRIMQILSTFPQTCPLLTGQILERIATEFNQLQFHAVQSKGMPLLDKVRPRIAGITAMLQQSLEGLLLEGLQTSNVDIIRHCLRTYATIDKTRDAEALVGQVLVKPYIDEVCAPQSLHSANIYRAYTMSKTFYWV	885462	856238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_857933_858472_858582_868869_869032_885273
917830	contig_7568_pilon	-	1009	3	Intergenic	novelGene_174012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGAGTCAATCCAGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151674	132463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_132471_149515_149712_150868
917831	contig_5903_pilon	+	5321	23	Intergenic	novelGene_173223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	38.2502903354184	114	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	1053	2774	487901	534211	FALSE	15	GACTACTTGCCTTAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCAKLKKQGGGKTQHYDCKWYIPLTDLSFQTVDESEATPNLPLVPDEELDAMKIKISQIKNDIQREKRANKGSKAIERLKKKLSEQESLLLLMSPNMAFRVHNRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFKSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHNIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKITKEDGENTDRIMGKGQVQLEPQALQDKDWQRTVIAMNGIEAKLSVKFTSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKETVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPATPGQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV	372320	536758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_+_372557_455319_455502_463447_463553_464264_464452_480662_480771_485648_485710_486829_486883_487780_487922_493396_493519_495431_495601_497253_497374_499220_499297_500748_500854_501783_501859_504808_504907_506643_506776_527963_528024_529093_529204_530784_530925_531973_532109_533014_533121_533546_533710_534121
917832	contig_18473_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_169633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	597	1409	2005	16574	17170	NA	15	ACAGCCTCTCACTGGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILTSLGRHVVVQVRCCVHVTTAFSYHYATRGLGSATGPPWASSHRWEDPCTGCPKPLLPGPSKPLLPAPAMLPGPEELSCRHATWVPAAQGGRHADPVQGTLRPLLLCTSITALLALLASILPRSIQLCPAVRRSLHRILHGNTSTGHTQDSALYGQVFQLSLSSAGKCPEAYHSTSKPPDERQSGLSRSLGWQAHC	15165	17171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_+_15200_17200
917833	contig_19825_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_59697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATACAATATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112959	112033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19825_pilon_-_112000_113000
917834	contig_12970_pilon	+	4468	1	Intergenic	novelGene_50556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTGAAGATAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602446	606914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_+_602400_606900
917835	contig_854_pilon	+	5586	31	Intergenic	novelGene_36484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3565.42544897832	14	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1360	4083	493	4575	1687025	1714980	FALSE	30	CCCCCTTGTCATAAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612770	1715991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649679_1685180_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704617_1705297_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
917836	contig_4232_pilon	+	2979	6	Intergenic	novelGene_63154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_5	31.2857795172184	110	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	319	831	18294	20654	FALSE	15	TACGTGGATCTCTTTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQATKRKHVVKEVLGEHMVPSDQQQIVRVLRTPGNNLHEVETAQGQRFLVSMPSKYRKNIWIKRGDFLIVDPIEEGEKVKAEISFVLCKDHVRSLQKEGLWPEAFSEVAEKHNSRNRRTQPELPAEPQSSGDGSSSEDDSDLFVNTNRRQDRESEEESEEEESEEEAAA	17453	22802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_17656_18177_18381_18506_18616_18713_18823_18993_19042_20494
917837	contig_1275_pilon	-	1932	9	Intergenic	novelGene_108792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	680.921055905161	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	143	1000	513735	468101	FALSE	40	ACTTCAGAGAATATTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQRVRSYPC	546849	467168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_505931_513627_513806_546777
917838	contig_9183_pilon	-	2269	6	Intergenic	novelGene_40299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	460.825086122707	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	748	1185	322898	318417	TRUE	25	TATGAAATCCATGTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	323645	311846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314946_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743
917839	contig_12588_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_173088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAATGTTTTTGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58608	60171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12588_pilon_+_58600_60200
917840	contig_11574_pilon	-	1645	3	Intergenic	novelGene_64089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_2	139.5	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	468	1166	451360	449890	FALSE	40	ATTAATATAACTATTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	451827	449410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808
917841	contig_938_pilon	+	1267	3	Intergenic	novelGene_143918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	178	junction_1	5.5	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2	475	95251	97944	FALSE	80	TAAAAAAAAAAAAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHIVFVDFDNWSNFFGHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIFNYLNRIGCFFLHPRCSKRKDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHILNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKGMQLPSQCKPPKRRRFHC	95249	98736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_+_95351_96634_96766_97701
917842	contig_10958_pilon	+	715	1	Intergenic	novelGene_5326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCTGGCCAGGCAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98443	99158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_98400_99200
917843	contig_9389_pilon	+	931	4	Intergenic	novelGene_83990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	932.784481479451	24	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTGCTCTGACCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382013	385518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_382076_383391_383428_384317_384382_384749
917844	contig_2438_pilon	+	1660	4	Intergenic	novelGene_112020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	403.209622901041	53	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	83	544	310588	312412	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	305083	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305
917845	contig_13787_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_40610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1243	1719	154578	155054	NA	65	ACACAATAAACCAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNMVSGLKKDSLTTCDMQMTQSCLLKVKHLLIKIKDHNLQHRLHLNIKKTKILTVGAISKIIINGEKIEFAKDFMLLESTINTHGSSSQEAKGHIAMGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTVVRLTQAMVFSIASYACKSWMTNKEDQRRIDAFELWCW	153335	155399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_+_153300_155400
917846	contig_9815_pilon	+	5260	3	Intergenic	novelGene_164236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	145	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	2288	3871	5142	6725	TRUE	55	AAATAAATAAATATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQGKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVARYKINIQTSVGFLYTSKENDEKEIRKSTPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKVIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPMSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTRNINTQNPTDKLDNWDVLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKISGHYKSDKGLISIINKKIQYLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKDDIQASNRHMRRSSRSPAIREMQIKTTMRYHLTPALLA	114	115495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_1674_4413_6731_114111
917847	contig_14467_pilon	+	4473	1	Intergenic	novelGene_138286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2674	2994	385796	386116	NA	85	AAAAAAAAAAAAGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQKALYNSPFKVYSMIFSIVTELYKYHSTNNFRTFSSTQKGTPHLLAVTSPSPQPLKPSQPLICFLSLDLPILDIAFKWNGTIWSFLTGMFYLACFQGSSVLQYV	383122	387595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_383100_387600
917848	contig_14441_pilon	+	1218	5	Intergenic	novelGene_100727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	476.158783915618	1674	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	378	1178	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120473	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120687_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
917849	contig_14686_pilon	-	1571	1	Intergenic	novelGene_88060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAGTACACATATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18461	16890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_16900_18500
917850	contig_12427_pilon	-	2432	4	Intergenic	novelGene_40456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2507	junction_3	1968.60712179957	58	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	939	1472	316061	314393	FALSE	30	GACTGAAAGCTGACAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	316999	313432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315565_315748_315842_315937
917851	contig_7342_pilon	+	4081	13	Intergenic	novelGene_71116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTGTGTGGCTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76099	86805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_76438_80854_80965_81109_81170_81292_81345_81439_81538_82306_82418_82502_82560_82801_82884_83062_83131_83224_83343_83591_83647_83793_83834_83913
917852	contig_14528_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_111258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGGACAGAGCAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79799	81386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14528_pilon_+_79800_81400
917854	contig_12852_pilon	-	2660	3	Intergenic	novelGene_141442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATGTGCTTTGTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507081	422476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_-_422527_482444_485039_507065
917855	contig_383_pilon	-	3498	13	Intergenic	novelGene_126117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2697	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCACTCTGCTTTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169455	135461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_136795_141854_142032_143970_144207_145078_145290_148650_148831_150745_150862_153253_153324_154229_154335_155145_155307_157139_157282_159219_159372_164400_164584_169023
917856	contig_10988_pilon	+	4552	7	Intergenic	novelGene_104726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3159	3485	365392	365718	TRUE	45	GCAAATCAAATGATGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEESLKLAIEHRVDKVNGKNDEVKKLNRKFQRVAREDKVKYYNEMCKDLKLENQKGITHLAFLKLKELKKKFMLRFAMLKDSMGKILNNAGSIKRRWKEYTESLYQK	74996	378024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_76788_133603_134101_245172_245183_265189_265304_289396_289896_365144_365767_377005
917857	contig_9579_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_150585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAACAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795499	793820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9579_pilon_-_793800_795500
917858	contig_4519_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_123712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCAACTGGAAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650673	652869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_650700_652900
917859	contig_9389_pilon	-	3779	7	Intergenic	novelGene_84088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.4728523206022	191	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	1632	3371	1246348	1243616	FALSE	20	TATTCGGTTTAAGAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRFMKNNTWSSVLGEISELHGNKHQQKNQRRHLRSRVVENLCESNEGNQCGKTFSRIPNLTVLKRNSPEVNLFACSECGKAFVDHSSYKHHTRSHTGCNARQCKECGEACSCPSHLTTPMRTHNGKKPHKCKSYGKDFICFSTLKNSVTSVTGEKRYECNECKKHFCTFSSFCTHVRDHKRERKEYCKTYSRPSSFILHKKFHNTGMPYQCKECGKAFSKASSLTTHTRTHSGERPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIRTHNGQRPYECKECGKAFTCSSHLTTHIRTHIGERPCECKECGKVFSDSSNLSTHMRTHCRDRSYECKECGKAFMQVSHLTKHVRTHSGEGSDECTECEEVFRFTRSSLLTNHKRTHSGERPYECKECGKAFTQHSALTTHTRTHSGERPYECKECGKAFRQHSVLTIHIRTHSGERPYECKECGKAFRQLSALTAHARTHSGERPYECRECGKHFRQRSALTTHTRTHSGERPYECNDCGKAFRSSSILTSHLRTHSEERPYECKECGKHFRQLSALTTHIRTHSRERPYECMECGKAFGQLSALTTHTRTHSGERPCECN	1264804	1243207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1244276_1244689_1245666_1246244_1247424_1256302_1256525_1256674_1256715_1260828_1261050_1264731
917860	contig_4091_pilon	+	2214	5	Intergenic	novelGene_172999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	147.922910666333	35	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10727	33929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27500_33267
917861	contig_14687_pilon	-	4173	5	Intergenic	novelGene_107908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	915	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATCTAAAATACAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646582	431816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_432270_470165_470713_539405_539740_547372_547567_643937
917862	contig_8269_pilon	-	1990	12	Intergenic	novelGene_106241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1210	1566	362733	342702	TRUE	10	TGCCTGTTGGCTGAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGLQLPLADPLVDPNEHLPGNVLTIILTSEVLDKVLQLHLTLGLDVGAVHVRVEQDDGEGQDEYGVWVPELPHYPGVADAVPLAEGLDEPLHFLRLPLDADVSLEFPEGFIQLHG	378291	325092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_325330_339814_339977_342676_342797_344513_344689_362646_362781_363318_363353_365128_365255_366861_366964_369488_369651_370571_370748_376429_376480_377779
917863	contig_14780_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_166388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTTTTCAACAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106998	105039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_105000_107000
917864	contig_4131_pilon	+	533	1	Intergenic	novelGene_127899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	41	421	381082	381462	NA	45	TGATGAGAATTACTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	381041	381574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_+_381000_381600
917865	contig_9272_pilon	+	6774	1	Intergenic	novelGene_125970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	292	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	5590	6165	637700	638275	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTASMFDLSMKDKSRNPFGKLKDKIKRKNKDSASDSASAIVPSVTPSADSDDESSTKDKRKKSKIKTLFSKSNLQKTPVSQSMSVLPTSKSDRVLLRPGDLPSRWEDDDNEDDSSSASDSEFLSSLTWFFFLNLAYFALREKKQTLRVCMCVRVRTHKHTKTHFEKKILIQLLVTKMMRIRMKTMGYLNLG	632110	638884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_632100_638900
917866	contig_4232_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_63350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTTATCTGCGAGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467034	468066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
917867	contig_7629_pilon	+	3430	1	Intergenic	novelGene_153558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	273	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235221	238651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_235200_238700
917868	contig_11564_pilon	+	1821	2	Intergenic	novelGene_158565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAACTACATCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57177	59286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58706_58993
917869	contig_6127_pilon	-	2792	1	Intergenic	novelGene_157049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16626	13834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6127_pilon_-_13800_16600
917870	contig_7119_pilon	+	3078	3	Intergenic	novelGene_40946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	11	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	141	1295	137033	139798	FALSE	30	TAAAGTTTGGGGTTAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127517	141581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
917871	contig_13762_pilon	-	1896	2	Intergenic	novelGene_156670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	37	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTTAATTTTGCTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42341	39242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13762_pilon_-_41076_42278
917872	contig_9843_pilon	+	2238	2	Intergenic	novelGene_114301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTCTAAAAGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2309	6037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_2820_4309
917873	contig_10930_pilon	+	6653	7	Intergenic	novelGene_36975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	119	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	3181	3666	276899	279879	TRUE	15	TTAGTTTTAGCTGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALFKVSQIKTIPPCTA	267058	331223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_272833_274320_276721_277013_278443_278637_279700_281665_303189_303983_330814
917874	contig_7571_pilon	+	2714	1	Intergenic	novelGene_106403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	117	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAAAAGCCTCGGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226895	229609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7571_pilon_+_226900_229600
917876	contig_4402_pilon	-	1125	3	Intergenic	novelGene_140853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	102.5	14	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	353	1123	596783	595209	FALSE	65	AGGAAATAAACATAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDG	597288	595206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_596736_596839_596991
917877	contig_12492_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_77504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322597	321854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_-_321900_322600
917878	contig_10779_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_165523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCACTCTAGGCTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73788	71775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_71800_73800
917879	contig_14666_pilon	-	1083	1	Intergenic	novelGene_39638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATGGACAGGACGGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485236	484153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_484200_485200
917881	contig_12312_pilon	+	3535	14	Intergenic	novelGene_64015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	62.2941105805176	7	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	889	2670	370	3039	539838	544786	FALSE	10	CATCCTTATTTTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLWKVVRPARQLELHRLILLLIAFSLGSMGFLAYYVSTSPKAKEPLPLPLGDCSSGGAAGPGPARPPVPPRPPRPPETARTEPVVLVFVESAYSQLGQEIVAILESSRFRYSTELAPGRGDMPTLTDHTHGRYVLVIYENLLKYVNLDAWSRELLDRYCVEYGVGIIGFFRAHEHSLLSAQLKGFPLFLYSNLGLRDYQVNPSAPLLHLTRPSRLEPGPLPGDDWTIFQSNHSTYEPVLLASLRPAELPVPGPVPRRTRLPTVVQDLGLHDGIQRVLFGHGLSFWLHKLVFVDAVAYLTGKRLCLDLDRYILVDIDDIFVGKEGTRMKVADVEALLNTQNKLRTLVPNFTFNLGFSGKFYHTGTEEEDAGDDMLLKHRKEFWWFPHMWSHMQPHLFHNRSVLADQMRLNKQFALEHGIPTDLGYAVAPHHSGVYPIHMQLYEAWKSVWGIQVTSTEEYPHLRPARYRRGFIHNGIMVLPRQTCGLFTHTIFYNEYPGGSHELDRSIRGGELFLTVLLNPISIFMTHLSNYGNDRLGLYTFESLVRFLQCWTRLRLQTLPPVPLAQKYFELFPQERSPLWQNPCDDKRHKDIWSKEKTCDRLPKFLIVGPQKTGTTAIHFFLSLHPAVTSSFPSPSTFEEIQFFNGPNYHKGIDWYMDFFPVPSNASTDFLFEKSATYFDSEVVPRRGAALLPRAKIITVLTNPADRAYSWYQHQRAHGDPVALNYTFYQVISASSQAPLALRSLQNRCLIPGHYSTHLQRWLTYYPSGQLLIVDGQDLRTNPAASMESIQKFLGITPFLNYTRTLSLFLMSRFDEDKGFWCQGLEGGKTRCLGKSKGRRYPDMDSESRLFLTDFFRNHNLELSKLLSRLGQPVPSWLREELQHSSLG	539387	545282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_539416_539496_540843_541043_541132_541459_541615_541800_541987_542249_542379_542512_542696_542788_542886_543248_543373_543511_543687_543883_544055_544151_544262_544442_544564_544660
917882	contig_7457_pilon	+	2152	8	Intergenic	novelGene_31650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_4	101.978589189404	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	196	483	1007252	1012281	TRUE	70	TAATAAAATTAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKDCDQRWCLCP	1005911	1016695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014498_1015382
917883	contig_16686_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_162111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGGCAGTTTGAATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247346	249580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_+_247300_249600
917884	contig_401_pilon	+	2582	21	Intergenic	novelGene_42909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	466.346234036472	1	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	18	2258	1929703	1972939	FALSE	40	GCAGAGATGATCAATCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTSAYEHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKKTCSDPKSKPPFLLEKSMESSLKYINKKFPNIDIRNSTQHLGPVHREKSEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDVCQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVVLLLSRIEDRRVLIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFCPHTKAVSGALLSFAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRTFHLNRVPASTH	1929685	1973263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1929805_1931105_1931217_1931938_1932032_1938754_1938812_1939252_1939396_1940369_1940461_1940552_1940579_1948433_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1972807
917885	contig_9833_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_68518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAGTTAATGAACCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222582	224929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_222600_224900
917886	contig_1009_pilon	+	1945	4	Intergenic	novelGene_121766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	170	junction_1	91.4913474961795	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1229	1702	298547	299568	FALSE	20	CCTAGAATGTCATTTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGGLPEEVLCGNLDLLPPPGKSAKPSAAPMEHKGLVSHNGSLINVGNLLQRAEQQDSGRLYLENKIHTLELKLEESHNRFSATEVTNKTLAAEMQELRNRLAEAEETARTAERQKNQLQRLLQDFRRRLTPLQLEMQRMVEKADSWVEKEEPAPTN	297318	299811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_298581_298681_298871_299020_299227_299523
917887	contig_8552_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_80059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATACTCTCGGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316955	316298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_316300_317000
917888	contig_1867_pilon	-	4251	1	Intergenic	novelGene_54557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	651	3600	4250	439059	438409	NA	70	AAGAAAGGAAATAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGLQNTQNKLLTALKRETDNSTITIGVFNTPLSVKDRTNKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIHRTLHPTAAKYTFFSNAHRTFSRTDHILGHRAILNKIQNVEIIQSSFSDHNVFKVEINNRKSEEKKISYIETENTLLTHHWVIEEIRDEIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQLIAIDAHIKKEERDKIKTLTTQLKQIEDSKKSPQPP	442658	438407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_438400_442700
917889	contig_6975_pilon	+	1962	4	Intergenic	novelGene_74240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	148.818308312146	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAATCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27822	42384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_+_29495_29744_29812_41045_41115_42230
917890	contig_6199_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_126350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGTCGCTGGGATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90320	91875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_90300_91900
917891	contig_14666_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_39651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTGAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485962	486994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_486000_487000
917892	contig_9099_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_149905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATGTTTTAAGCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316118	316735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_316100_316700
917893	contig_4604_pilon	+	5986	1	Intergenic	novelGene_19147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	4936	5355	360182	360601	NA	25	GGCTCGCAGAAGTCATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFILDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQVSDFNALCFLRALHLHIFHISKGRFSPSPQFARKRAIVYKNYYFKILSEALAFLDRRYKYGQDSIWVFTYNPKSMLTVNLCTVSLKLGSMTSSCGSY	355246	361232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_355200_361200
917894	contig_4180_pilon	-	3042	2	Intergenic	novelGene_8313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTACTTCTTTTCCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762291	750643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_751237_759842
917895	contig_5020_pilon	+	2121	9	Intergenic	novelGene_27850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_2	1010.74019133257	125	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	274	1509	121762	125772	FALSE	25	CCTTTGCTGTAACAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121748_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
917896	contig_16594_pilon	+	5578	11	Intergenic	novelGene_53823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	91	480	115812	116201	TRUE	10	TGTGGCGTGGAGCCGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFRQIWPNGVFVSHEILGGWHIFPAEKILANYKLSTKSKATCLKGYGVLTLCHFCKQFCSVCHFISLNKTPCNYRLFIQNKILLLYRFLSLTIYRSAKSQLSLQTLQHAKLQHNQPSRVCTHAIILVT	115721	306538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135509_149147_149351_165477_165648_239220_239785_272662_273672_306352
917897	contig_3602_pilon	+	2490	3	Intergenic	novelGene_60612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	90	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	30	956	902032	913188	FALSE	35	AAGCTTTTAAGACCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	902002	914722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_912283_912411
917898	contig_5959_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_150208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGCTACAAAGAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411758	413876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_411800_413900
917899	contig_10554_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_166959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCCTCAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11317	13595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10554_pilon_+_11300_13600
917900	contig_16211_pilon	+	1669	1	Intergenic	novelGene_150058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTATTTCTCTGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78028	79697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_78000_79700
917901	contig_7056_pilon	-	2185	10	Intergenic	novelGene_43656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_9	1076.63943320677	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	760	1278	725925	725118	TRUE	80	TAAGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMRKCVSVFWWASKGSCVWARCV	731015	722483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_729063_730383_730539_730979
917902	contig_3181_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_136941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGATTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392664	391985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_392000_392700
917903	contig_4678_pilon	+	2539	1	Intergenic	novelGene_125996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	286	861	4	864	4715	5575	NA	45	TACAATGAAATGCTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKLKSIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHVYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTQALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWESKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKRPRCPSTDEWINKLWYIYTMEY	4711	7250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_4700_7200
917904	contig_14357_pilon	-	2790	1	Intergenic	novelGene_121697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAATTTATAATCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679992	677202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_677200_680000
917905	contig_5346_pilon	-	1262	1	Intergenic	novelGene_161858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGGAGGAGAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179462	178200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_178200_179500
917906	contig_12050_pilon	+	1115	1	Intergenic	novelGene_62642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	453	920	359783	360250	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNSQLLHFAFREDKQWKLQQVTRLLPAAAQAAGAGRGRPGASMERDWLWGFVATASLGRCFLAAKPAWAVPGAPPGTTGASYPTAAGVITHGIPQQVISLPRASLRGLLIARRSKPMCLDSMAPGRCINSVLKSFLRFILESKIRQAHKTRRD	359330	360445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_359300_360400
917907	contig_2799_pilon	-	2698	2	Intergenic	novelGene_85585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1748	2050	781803	781501	TRUE	35	CATTACTATTTTTATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHLEKCKPRIKKKFGKN	783550	779898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780451_781404
917908	contig_10003_pilon	+	5174	1	Intergenic	novelGene_88246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	253	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3996	4307	693407	693718	NA	50	ATTTCAGAACACAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTNHHEDLTIINIYAPNDWAPKYIKQTLTALKRETNSFTIIVGHFNTPLSSKDRTSRKKLNKDTEELKGTISQLDLTDIYTTLHPTGAKYTFISNATSPE	689411	694585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_689400_694600
917909	contig_12464_pilon	+	5275	2	Intergenic	novelGene_68651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	181	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1043	1372	105818	106147	TRUE	35	AGTATACTGTACCTATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIKDYSLQYGLHFNIKKTKLLTTGPISNIMINGEKIRIVRDFILLGSTINTHERSSQEIRQCIALGKSATKDLFEVLKSKDVTLKNKMCLTHAMVFQWPHTRAKAGQ	104775	122792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_+_109810_122551
917910	contig_10982_pilon	+	3114	7	Intergenic	novelGene_87884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	179	junction_4	192.878775976576	14	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	820	1752	145192	201769	FALSE	35	GTTTGCTGAATATAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPHKSNTSETAPQPSSTVQGAHISHIAQQMSLRGSAPVTIVPLPGEQVQVQGVIQTAQSSVIHPPHVQTASSLSESEESQDSSDSIGPSQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRSRKGDGENPGVSTVTSMSVPTPIYQTSTGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQYAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPVTLTSQAAKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKTLKDLYSHKSV	144372	203131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_145285_168725_168846_171072_171174_182221_182353_190709_190893_190980_191141_201624
917911	contig_5686_pilon	-	871	1	Intergenic	novelGene_45480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCCTGTTCTGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229473	228602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_228600_229500
917912	contig_3077_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_26894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGAAAGCACCTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502065	1504646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1502100_1504600
917913	contig_5968_pilon	-	1493	2	Intergenic	novelGene_112176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605772	603523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5968_pilon_-_604657_605412
917914	contig_5523_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_169101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	628	960	406393	406061	NA	60	AAAAAAAAATCATGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPFLAAHGPAFHKGYKHSTINSVDIYPMMCHILGLKPRPNNGTFSNTRCLLVDQWCINLPETIGIVIGVLLVLTTLTCLIIIMKNRLSVPHSFSRLQLQDDDDDDPLIG	407020	405153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5523_pilon_-_405200_407000
917915	contig_7416_pilon	-	2595	8	Intergenic	novelGene_134313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_6	114.267498548318	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2154	9	2162	104771	37359	FALSE	45	TGGGGGAAAAAATACAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAAASALQQLSDEELFSQLRRYGLSPGPVTESTRPVYLKKLKKLREEEQQQQHRSGSRGNKTRNTNNNNTAATTVAAAGPAAAAVGMGVRPVSGDLSYLRTPGGLGRISVSGPESPSGGPGVASAAPAAGSKVLLGFSSDESDVEASPRDQAGGGRKDRASLQYRGLKPPPAPVAASEVTNSNSAERRKPHSWWGARRPGAPELQTPSGKDGAAEEEEREDGEERDLEAHEPLWPSRTVNGSRLLPYSYRENYSDSEEEDEDDVASTRQVLKDDSLSRHRPRRSHSKPLSPLTAKSAGSRLESSVQGGGGIAMNDRAAAAGSLDRSRNLEEAAAAAEQQPGGGCDPLDASPIPRYRVNAKKLTPLLPPSLTDMDSTLDSSTGSLRKTNNHIGGGAFSVDSPSIYSNSLSPSAAVATSGSLRINHSNHTGSKHTYLKNTYNKPKLSEPEEELLQQFKREEVSPTGGFSAHYLSMFLLTAACLFFLILGLTYLGMRGTGVSEDGGLSIKNPFDGTFGEIQESKKNLMMNTLYKLHDRLAQLAGDHECGSSSQRTLSVQEAAAYLKELGPEYGDIFNISLLWILENGKDVGIRCVGYDPDEELTNITHVQFLQSTRPQMSFWCRFRRAFITVTHRLLLLCLGVVMVCVVLRYMKYRWTKEEEETRQMYDMVVKIIDVLRSHNEACQENKDLQPYMPIPHVRDSLIQPHDRCVKNFLS	104779	36925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_-_37487_37588_37691_38658_38805_38892_38973_54783_54852_57196_57264_62577_62616_103246
917916	contig_7396_pilon	-	2760	16	Intergenic	novelGene_79548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3204.91832865259	9	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	97	1485	255163	246442	TRUE	25	ATTATTTATGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246139_246199_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
917917	contig_7457_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_31559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	886	1194	856218	855910	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFIFTHLEQNRKKETQDSEKEPVYRTIYMNRGLLYPETRRTRWCPATTTLHSDQDHNTWIQIEMERNVEQNFKFKKNADLLDPLSQDEFLRLLPSDIFKP	857103	855122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_855100_857100
917918	contig_5286_pilon	-	3510	6	Intergenic	novelGene_157354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	524	junction_1	418.757686496618	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1137	2372	3508	564457	537067	FALSE	40	TGATGAACTGAAACGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHLNEATQGKEHSEMSNNVSDPKGPPAKIARLEQNGSPLGRGRLGSTGAKMQGVPLKHSGHLMKTNLRKGTMLPVFCVVEHYENAIEYDCKEEHAEFVLVRKDMLFNQLIEMALLSLGYSHSSAAQAKGLIQVGKWNPVPLSYVTDAPDATVADMLQDVYHVVTLKIQLHSCPKLEDLPPEQWSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNSTYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKTKDMMVEMDSLSELSQQGANHVNFGQQPVPGNTAEQPPSPAQLSHGSQPSVRTPLPNLHPGLVSTPISPQLVNQQLVMAQLLNQQYAVNRLLAQQSLNQQYLNHPPPVSRSMNKPLEQQVSTNTEVSSEIYQWV	566828	537064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_537453_539784_539897_558628_558753_559504_559632_560396_560574_564246
917919	contig_6451_pilon	+	3850	1	Intergenic	novelGene_173701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	162	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAATAAATGAAATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95500	99350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_95500_99400
917921	contig_12299_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_29760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644033	645413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_644000_645400
917922	contig_16098_pilon	+	2307	3	Intergenic	novelGene_46209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	533	7	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	843	1469	766291	767278	FALSE	40	TAAAAGGAATCTTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPSAPSAPYAPPSALVSQVFYFWISIPLDLEGGQVGCGQGLGGRGSIKVPLLSCSGLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	764795	768116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290_766711_767071
917923	contig_18888_pilon	-	3410	1	Intergenic	novelGene_168246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16946	13536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18888_pilon_-_13500_16900
917924	contig_20602_pilon	+	1103	5	Intergenic	novelGene_133734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTCAACTTGGTAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22875	28928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_+_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26554_28880
917925	contig_13481_pilon	-	4669	2	Intergenic	novelGene_119294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACCAGCTGGGCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195669	190778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_194672_194893
917926	contig_13800_pilon	-	4621	1	Intergenic	novelGene_153738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGATGCTCAATTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152879	148258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_-_148300_152900
917927	contig_5918_pilon	+	4354	4	Intergenic	novelGene_99548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	199	junction_3	77.4180570381068	64	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	1771	3276	753390	765115	FALSE	70	CTTGAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVGTASQSGKPAPPAAGTGFGDKFKPAAGAWDCDTCLVQNKPEAVKCIACETPKPGTGVKRALTLPAASESAVTVTASSSSCTVTTGTLGFGDKFRRPLGSWDCPVCCVSDNAGDDKCVSCMSEKPGISVPTSSSSTPPVSLSSGGSLGLDKFKKPEGSWDCEVCLVQNKPESARCVACESAKPGTKSEFKGFGTSSSSSNPAASSFKFGIQPSSSGPSQTSTNTGNCKFGDKGGFTAGVASDSESANPMSGGFTFSKPTGDFKFGVSSDPKPEEDKKDSKNDNNFKFGLPSGLSNPAPLAPFQFGVSNLGQQEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINPAPAATNTTVTSETKSSFSFGTIETKSVSVSPFTCQTAEASKEEKPAARVGFTFGSVEQASLPSTSAFVLGRTEEKQPEPVTSTSLVFGRKADGEEPKCQPVFAFGSSEPTKDESASKSTFSFSMAKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSATAGKYYSFFTRCYLIS	749254	766193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_750789_753153_753772_760679_760875_764186
917928	contig_7182_pilon	-	2153	1	Intergenic	novelGene_117105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	129	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACACTTGCCCTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119867	117714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_117700_119900
917929	contig_14953_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_137271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGATTTTCCATCACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73242	71760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_71800_73200
917930	contig_14687_pilon	+	1585	2	Intergenic	novelGene_107949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	22	399	573025	573402	TRUE	45	AAAAATCCAGCTATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTCESWTMNKEDRRRIDAFELWCWRRMMNIPWPSRRTNKSVLEEIQPECFLEGRMVRLHLTHFGHVIRKDQSLEKDIMLGEVEDQRKRRGPSMRWTDTVAATMGSNIATIVRMSRAQQCFILLRKLTHPAVW	573003	574654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_574012_574077
917931	contig_13456_pilon	+	3421	1	Intergenic	novelGene_153261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1957	2340	17866	18249	NA	20	AACACGGTGTGGTCAGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAAPKALVKNKASGIDRTSIEMFQQMDAVLRVLTCLCQEIWKPATWPTNWKRSIFVPIPEKGDPASCGDYQTMSLISHASKILLKIIQKRLQQFIGRELSEIKAGFRRGRGTRDIIADVR	15909	19330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_15900_19300
917932	contig_5959_pilon	-	2274	1	Intergenic	novelGene_150222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAATTTTGAAATATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465702	463428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_463400_465700
917933	contig_8729_pilon	+	4761	2	Intergenic	novelGene_40162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGCTGACTTAATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765007	770662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_765718_766611
917934	contig_9345_pilon	-	2419	3	Intergenic	novelGene_24730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	156	614	1104561	1104103	TRUE	45	CACCTCAAAAAGTCACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGAAVAVPKSKSQLLHQGNPLVDVIHHWCWVAHKFGTEPRRSPVPLRAFVDMDLEGIHSREAPFVCGVHEILMLAHVAAVRQAVHELAVAVELYPGPLTHQLLLPQLQGQLQLVSGGVLLVVECVWRDFHLKVGTNPGIYPVNMVLELWRLVGLSSPGHPTGSGTDASGWGGCFQSGDGSFGGDPGHWSGCPWLLGRPASCGG	1104716	1073578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1073942_1087293_1087696_1103062
917936	contig_854_pilon	+	2196	19	Intergenic	novelGene_36555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	3278.74372772542	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	92	2038	1656112	1706879	TRUE	20	AGGAGCGTGACCGGGCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQSWRRRRRPSRTWRSRSPPCTPRCERHEEEDRGWSGMPGDYRRSQEKAPEGPGGTEPAFRGEGGRL	1649830	1709162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1705375_1705441_1706748_1706998_1709122
917937	contig_5744_pilon	+	1612	2	Intergenic	novelGene_149352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGCCCAGCTGAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734219	737873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_735664_737705
917938	contig_4151_pilon	+	755	1	Intergenic	novelGene_65223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGCACTTGTATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469456	470211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_469500_470200
917939	contig_9895_pilon	-	2760	2	Intergenic	novelGene_144694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	467	784	164844	164527	TRUE	35	CCTCCTAAGATTGAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLNWFLSLVSHKHVDDSASSSKEVTASPWSEVAIQIRKISPPVDQVLVKGGAKGEHMCDIFLQLCQNEKYKEAGWFVLLSLDKLMKKKRCAQGFRVKAQVPHT	165310	158136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_159915_164328
917941	contig_16369_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_98693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	217	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATTTATTTTATTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16016	10614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16369_pilon_-_11430_14500
917942	contig_6102_pilon	+	2714	18	Intergenic	novelGene_32358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	83.7663995202212	6	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1338	2222	1711393	1714324	TRUE	30	TACAAAGCTGAGACCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQVRKLKTILFLTQQQPQCHLLSVSK	1699255	1714920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714599_1714702
917943	contig_9468_pilon	-	946	5	Intergenic	novelGene_59474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCAAAAACAAAAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206329	200355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_200589_201375_201503_203172_203264_205638_205777_205972
917944	contig_17413_pilon	-	3255	1	Intergenic	novelGene_177198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	418	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCACCTCTAATTAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24017	20762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17413_pilon_-_20800_24000
917945	contig_2793_pilon	-	1385	8	Intergenic	novelGene_142868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	569.072284781224	9	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	121	516	118367	82062	TRUE	25	CAATATCCTAGACTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVKGGTKCIKYLLFGFNFIFWLAGIAVLAIGLWLRFDSQTKSIFEQESNNSSFYTGVYILIGAGALMMLVGFLGCCGAVQESQCMLGLFFCFLLVIFAIEIAAAIWGYSNKDKGGATEALRRNKWLQSSQ	118487	79165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2793_pilon_-_79632_80792_80877_81588_81679_81832_82116_84252_84328_85118_85217_92111_92215_118301
917946	contig_1146_pilon	-	4724	24	Intergenic	novelGene_84821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3052	3366	876925	874888	TRUE	10	TCTCTTCCAGACCCGTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQCTVMLGSKLPSKTPTHSLAAVNTASEKNTWFAAVTHLITLYRTSVTYASVIGGPRIGLKRSPMLLTTVLNTRRSAASFGNDTDGGGTSSSTDSPEATWLRS	892924	841595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_841936_865013_865171_865678_865835_868286_868425_869380_869439_870487_870702_871486_871614_872211_872283_873172_873270_874887_875066_876788_877013_879120_879222_879760_880032_881586_881722_881884_882047_882476_882593_886933_887020_887107_887210_887694_888585_889036_889232_889417_889581_890324_890483_892190_892335_892483
917947	contig_9036_pilon	+	2628	1	Intergenic	novelGene_155437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAACTAGCCAAGAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24193	26821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_24200_26800
917948	contig_19132_pilon	+	849	5	Intergenic	novelGene_169992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACAAAGTCCAAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333503	410063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_334054_334822_334869_344629_344726_389414_389487_409978
917949	contig_7327_pilon	+	2637	11	Intergenic	novelGene_172127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTAAGACGGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142058	191192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_143788_145399_145537_145646_145754_151590_151685_152705_152791_154308_154407_156070_156117_158972_159049_178762_178838_179911_179981_191071
917950	contig_15105_pilon	+	3658	2	Intergenic	novelGene_150977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623079	626829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_624998_625089
917951	contig_13525_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_145087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64155	65990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_64200_66000
917952	contig_401_pilon	-	2324	1	Intergenic	novelGene_42794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATAAGGTCTAGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1122271	1119947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1119900_1122300
917953	contig_11145_pilon	+	3901	4	Intergenic	novelGene_160525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1306	1845	141193	141732	TRUE	45	ATTCCCACAAAGAAAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRSRSETMGDRISETEDKHLDTTLFDEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIRVPEQAEKTENTEKITEELLIENVPNIMKDEKLTIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQKVTYRGETKRLSSDYLAKTMQAKRQWNDIHKTLKEKISRQE	139887	243065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_142765_142807_143451_158882_158885_242686
917954	contig_9099_pilon	+	2139	3	Intergenic	novelGene_149916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAATAGAATAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390416	502026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_392043_400159_400462_501815
917955	contig_8260_pilon	+	1786	2	Intergenic	novelGene_163252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCTGGAGCTACTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177101	183480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_177762_182354
917956	contig_4152_pilon	-	1367	2	Intergenic	novelGene_177307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	1055	1366	421059	419870	FALSE	40	GGAGGCGGCAAGAAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKWRKTERGRGRKEKNEQIKIRKVKEPQSSQRAARLGVWNPSSWRLLVKRPWPREAEEQTNKSPRIPPAQQPRPRSSYTLGWSPAAPQEEAKMALGARHSSKRG	422113	419868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4152_pilon_-_420089_420966
917957	contig_3233_pilon	-	1333	1	Intergenic	novelGene_56520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTACTGGAACCATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232118	230785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_230800_232100
917958	contig_16204_pilon	+	1168	1	Intergenic	novelGene_154494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	540	908	251852	252220	NA	40	TGAAAACCCTATGGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPESLDSMRIRNSFLHFSPFDQDTSTVSLIKTFSNGRQPPSSSSGLMAKETVSHLEGFLRTDRFKSGCLSHHGPAPRGLPCSCPARQDQEQRQSPAGGSIQSHLFITCLVPGPVLALRYAI	251312	252480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_251300_252500
917959	contig_3004_pilon	-	2115	7	Intergenic	novelGene_127555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCCCAAAGTTTTGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855488	818015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_818622_820751_820838_827930_828158_833488_833588_837197_837367_850863_851036_854732
917960	contig_7207_pilon	-	1154	8	Intergenic	novelGene_72067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	205.107537747437	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1020	135	1154	696456	665432	FALSE	50	ATGATATGTAGAAGATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEDGGDSDEKDKKKANLPKKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAG	696590	665431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_665596_666571_666611_671649_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696410_696453
917961	contig_7151_pilon	+	2737	1	Intergenic	novelGene_40702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAGAGAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48540	51277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_48500_51300
917962	contig_8273_pilon	+	2318	2	Intergenic	novelGene_113097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	486	833	729371	729718	FALSE	30	TGGAACGTTCTCCAGAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIIHDRNAKINSQLEIIQKHQLQIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLFEGKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIRGPERGQNRKHREDH	470740	731203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_471212_729356
917963	contig_11259_pilon	-	2472	1	Intergenic	novelGene_144521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAAAATCAGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127251	124779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_124800_127300
917964	contig_7066_pilon	-	1845	2	Intergenic	novelGene_42136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAAAGTGCCTAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731248	726515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_727271_730158
917965	contig_3285_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_153391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGAGGGAGACAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240012	240911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_+_240000_240900
917966	contig_18272_pilon	+	4706	1	Intergenic	novelGene_7059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2894	3355	488034	488495	NA	10	CCCCTCAACTCTGTCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKVYASITNGRNWRERRNNEHQASPKPSRTIYISCHGSKLILFSETIWAVVLPSRLWELAMPSGFWVWVPWVLGFSSAFQVHWDGNSAPSALGGPILLDHLSGKPTPLALAVLILLPLRQDCLLSFGQQPHPLAHFNGSPTLQIGVGEDPNL	485140	489846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_485100_489800
917967	contig_2770_pilon	+	1059	2	Intergenic	novelGene_107458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTGAACAATCAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742937	744169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034
917969	contig_6434_pilon	+	4253	1	Intergenic	novelGene_61861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTTACATTCGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815834	820087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_815800_820100
917970	contig_3948_pilon	-	2249	6	Intergenic	novelGene_53200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	315.171699237098	2	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	274	585	856627	840803	FALSE	20	GTGTCATGTCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSRTLKYCKQVLREWNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869636	839138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_847933_856576_856712_866355_866480_869571
917971	contig_12142_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_147826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGGAGAAAGATGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144194	141638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_141600_144200
917972	contig_9389_pilon	+	3472	1	Intergenic	novelGene_84131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGAAAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607094	1610566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1607100_1610600
917974	contig_6101_pilon	-	3695	1	Intergenic	novelGene_114292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351695	348000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_-_348000_351700
917975	contig_8050_pilon	-	5896	28	Intergenic	novelGene_114848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	340	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	2118	2756	438618	429310	TRUE	25	CCCGATGTCATTCCGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSLENEKIFVPHPPHIMFFSVEFMDSLKHISGVLTFPIFSIFKGATPLHLTALSSKIAKFPSAVPTKRKFFCLLCLENELQYKQVTESVIFSSVCLLFPSSVLMTRRLPDCVPDTIQLSFSTGRYTKAKHNILLSVTSSEVCASVFKSRKESCPLSLCPQPSQMLAFLLLGFVATMHSTAKFLGNKIYLIRQTNSAEFKMSKTLAEVGLS	448500	364986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_365111_365389_365538_368095_368193_370881_371060_372242_372428_374718_374951_375387_375522_376841_377054_380919_381124_382190_382282_387021_387211_388115_388271_389340_389488_389631_389824_390689_390843_394918_395016_403317_403507_409794_409955_427668_427844_429231_429333_434549_434745_436251_436446_437188_437261_438463_438650_442581_442739_443737_443945_445953_446026_446850
917976	contig_12786_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_103380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAAGCCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582041	580988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_581000_582000
917977	contig_12790_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_35194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276060	273165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_273200_276100
917978	contig_10864_pilon	-	2044	3	Intergenic	novelGene_107042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	189.5	10	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	50	1633	704692	703109	TRUE	90	AAAAAAAGAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGRGSRVKRVEGKFGMLTPNKGEASTEKTHLCFIRLLESCVDQFYMYRNPENYKRLFFRFMNVLVKRCKEPLIPSIANTVALLELQYIHCGAVLARLCKNTILCLPKSYISLLHYWEFLCSKKDKEPVDVFAIIQEFKPKDVTRAIQHFRFHLSYLAEVLCGHENVNFNVLLDAFDDIDCVVSGEAERTLVLCLVMLVNAKGILKPHCKRLLCSHFQEIEKQLQRMRENFPACVPERLLRVVRRVLVAVDVKSVAEALQDLLSDRDKEYLVDCRWCWDSVHAKGSVVRGLYHEEVKLNRLLCVGSLDGAAEPESEFDQDETGEPASEDRDHLLTAILSQRQRKASSRRKLRRVCLLVSLCISWRRWASAQAERGKEEAREPSAGNFKKADVDRTQCDLCGVKFIRGPENDFSPREVLEEVTFEAAALSGAEPERKEGLERNSESYEQHICLEGHQRQQAAYQKYSAFFREQVDPAVDEGKLVVQDMEQSVWIGSRLGWKEHSHVLQRKVQENIKKVLDTVEEVYRRKAWDSGKGPRNGPKCS	704741	698067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_698271_701748_701848_702999
917979	contig_4232_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_63366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTCTTTTTAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467206	468042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467200_468000
917980	contig_3095_pilon	-	4243	3	Intergenic	novelGene_75018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152239	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_149895_150412_150695_150995
917981	contig_12119_pilon	+	1146	2	Intergenic	novelGene_88673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGAACACTTCCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338056	339817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_338131_338745
917982	contig_12775_pilon	-	1350	2	Intergenic	novelGene_172291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	23	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	181	546	119718	119353	TRUE	70	AAAATGAACAAACGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLNSLSGTSSAFSSTGELSGVLIWMPTGAILSCFCKCFDIVCCFWGIQ	119898	118414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12775_pilon_-_118683_118816
917983	contig_3509_pilon	+	3080	1	Intergenic	novelGene_160700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	1644	2174	17098	17628	NA	20	CAATGTTTTGCCACTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELCSLLGRRKDGAWSQVFEGKEGEMVRGKEEFKRRRKKHHQQPTNGTQGISLCSQVESTQPVLPSQETVAAGRRGGQVVVKKGGRWKSVYLCLPVVLSPAGSSVKLLSHIPFSLVSNRCPRWRIHAALADRGPLHESLLALHSLSVSHSIWCFAEFFISSFDVLGFQDCCFFCLV	15454	18534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3509_pilon_+_15500_18500
917984	contig_1836_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_71059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATAATAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	898337	900001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_898300_9e+05
917985	contig_5549_pilon	-	364	1	Intergenic	novelGene_81709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGTAAAGCAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905757	905393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_905400_905800
917986	contig_3380_pilon	-	2577	2	Intergenic	novelGene_60094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	139	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGACAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381538	372514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_374921_381367
917987	contig_4496_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_66650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGGAAAAGATCTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729939	728610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_728600_729900
917988	contig_14744_pilon	+	3037	16	Intergenic	novelGene_66147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	318.910116211798	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1824	2894	1675440	1689166	FALSE	35	TTTTAGGTATTAATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLDLLLEANISTSLAESIKSMNLRPEEDDIPWEDLRDNRDLNVFFSWDPKDRDVSEEHKKLSLEEETMWLRIRSLTLRLISGLPSLNHPVEPKNSEKTTENGVSSRIDTVRLLLQHLEVALDTGKRFIEKQIQYPFLGPVPTRMAGFFNSGCSQCQTSSFHLVSDIYELDTNGLEDTTEIQERIENSLKSLLEQLKDVFSKCKGDLLEVKDGSLKTHPTLLENLVFFVETISIILWVSSYCESVLRPYKLNLQKKKKKKKETSIIMPPVFTSFQDYVTGLQTLISNVVDHIKGLETHLIAFKLEELILEDTSFSPEERKFSKTVQGKVQNSYLHSLLEIGELLKKRLETTKKIKI	1650140	1689309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1651023_1653022_1653136_1659978_1660187_1661020_1661111_1669265_1669447_1670156_1670257_1674120_1674250_1675319_1675472_1676016_1676143_1677965_1678210_1678616_1678741_1679043_1679110_1680473_1680572_1681695_1681807_1685324_1685472_1689043
917989	contig_8330_pilon	-	2207	12	Intergenic	novelGene_71787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGAAGAAAGGCGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857793	837477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837681_852602_852685_853008_853124_853232_853347_853836_854058_854993_855088_855432_855535_855624_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
917990	contig_10431_pilon	-	3052	1	Intergenic	novelGene_117399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAACATGCAAGCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231148	228096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_228100_231100
917991	contig_7963_pilon	-	3108	12	Intergenic	novelGene_58452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_11	450.849171238688	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	707	2143	125592	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126298	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
917992	contig_7963_pilon	-	2424	5	Intergenic	novelGene_58485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	587.801624700034	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	145	648	123938	122315	TRUE	55	CAAGCGGAAGAGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYHIQFRFLHRLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAGRISGNFANGE	124082	120309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120356_120488_121959_122054_122489_122993_123132_123746
917993	contig_3018_pilon	+	1223	9	Intergenic	novelGene_78828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAAAGGCAAAAGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550952	576888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_551009_561477_561580_562782_563044_566733_566846_567964_568081_569956_570088_570203_570434_572320_572360_576712
917995	contig_16211_pilon	+	2237	4	Intergenic	novelGene_150070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCGCTGCCTTCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93162	121256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_94948_97474_97610_115116_115260_121082
917996	contig_1847_pilon	+	1789	1	Intergenic	novelGene_171724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	620	943	48273	48596	NA	15	CAGTTAAGTGCTCGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSQVSGSHLFPISALTLTSDTSRGLQLSWRCNSATLTVRLCVWFLAISALLLQEIRLSFKAQVEALKSCMQHLSLDSEALGASLSFISLSSESRTNQPAPLYFSF	47653	49442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_+_47700_49400
917997	contig_13593_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_156114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	46	324	22045	22323	NA	40	GAAGGCAAGGCGATACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFVFLHFSVSCLSTPMASSLSTFFFASISLSSLLFYTQPSSTHHNCPIPLPPAYLHCVLNITLLSSTGTTYWNLPWNDHWLTLLVPVCAANNPSQQLSFSWTCPAAP	21999	23704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13593_pilon_+_22000_23700
917999	contig_2067_pilon	+	2083	2	Intergenic	novelGene_158928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1386	1751	597923	598288	FALSE	70	AACAAGAAAAATATAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDEKISNQDAHRTPHEVDPRKKTPRHTIIKLDKTKDKGRILRVARDKQKVIYQGESIRISSDYSAESVQARRQWDDIYKALKEKNCQQNCLTNMMAKLGHFQINRSLRNLQKLNQNYKKH	596079	598620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_+_596585_597042
918000	contig_13004_pilon	+	1956	5	Intergenic	novelGene_112735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	217.276897069155	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	69	935	922526	928299	FALSE	10	CTTGGATTGGATGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALYFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	922457	929320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926980_927531_927669_928134
918001	contig_10734_pilon	-	2136	1	Intergenic	novelGene_51532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1658	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTTTGTGTGTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2293010	2290874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2290900_2293000
918002	contig_3602_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_60567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAATAGCAGCGCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518471	519734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_518500_519700
918003	contig_5947_pilon	+	2169	3	Intergenic	novelGene_101567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	19	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785607	789345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_787475_787929_788055_789168
918004	contig_4857_pilon	+	5442	3	Intergenic	novelGene_48880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	161	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	274	678	1389919	1390323	TRUE	45	TTGGACACCAGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCSFQNRPTNTRSPVRVTEKGQAAWVGTSSLTQCGIAKDLPAGGLVPWPTDLLTPSAFSNQDQMEKPQPPTTLVITFCLDAASNQSRFPVGPKSAWVMGFRVSNESLISLSKSLVCAKKICKNQNKQPFFLI	1389645	1564469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1392700_1561986_1563271_1563365
918005	contig_5961_pilon	+	9309	1	Intergenic	novelGene_144106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	154	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTTGGAGAGAGTTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113711	123020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113700_123000
918006	contig_8330_pilon	+	3465	3	Intergenic	novelGene_71881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_2	62	53	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACTGTGAGAGAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1059825	1116792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1060050_1060925_1061055_1113680
918007	contig_14618_pilon	-	3548	20	Intergenic	novelGene_136824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	80.0311573675183	93	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	748	2988	1104391	1083906	FALSE	30	GTTGCTGCAAATATAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSPFTASSSTLLLAAQLADSPRCLIMIQVCATHFGDICHAVGQEATEKFLIPKFFELCSDNVWGMRKACAECFMAVSCTTSPEVRRAKLSPLFIRLISDPCRWVRQAAFQSLGPFISTFANPSWAGLYIREDGTLSIRPPAPDRDSRSPHPGNCANSLSARSRKPVQTEPDVPLEGTSMESSHSLHVGHSAGPTQHPAEGSAVAGDGLARLCPGPSAFSKVPGVDDRLTNGHSGPDSSAHPGSPQDGFGNFLYWRTPLPDISKDLELLLGKAGQQEDVRCSSEMAHNSCVPSSEIQRVLDSLQEHMVNDPDVQAQVQVLSAALRAAQLDSVSASQSKPAGDLNEVSAADPRSASGSQMELSASCSLDALGTARILQSTGPDGDCDGSSDPVQAELRRDPTPHEENKSKLQDIIPQPLLDQYVSMTDPARAQTVDTDIAKHCAYSLPGVALTLGRQNWHCLKDTYETLASDVQWTVRRTLAFSIHELAVILGDQLTAADLVPIFNGFLKDLDEVRIGVLKHLYDFLKLLHTDKRREYLYQLQEFVVTDNSRNWRFRYELAEQLILILELYSPHDVYDYLVHIALKLCADQVSEVRWISFKLAVAILRKFYSNSESALGLNFISELIIRFRHCPKWVGRQAFAFICQAVVSAECIPVDQFVEHLLPSLLSLASDPVPNVRVLLAKALRQTLLEKAYFRNAGNPHLEVVEETVSALQSDRDQDVSFFATLEPKRLNIMDTAVLEKRD	1186968	1083345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1084064_1084655_1084798_1087552_1087688_1088496_1088618_1090569_1090671_1091539_1091702_1091953_1092140_1093022_1093119_1096280_1096475_1098679_1099138_1100186_1100360_1101299_1101459_1103911_1103978_1104301_1104454_1105518_1105628_1115195_1115343_1126056_1126200_1127697_1127805_1149595_1149729_1186922
918008	contig_5041_pilon	-	4098	1	Intergenic	novelGene_27051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGATGGAGGGAGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519716	515618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_515600_519700
918009	contig_14450_pilon	-	3098	2	Intergenic	novelGene_49019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGTGCAGGACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191355	1188044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1190876_1191088
918010	contig_12250_pilon	-	1681	1	Intergenic	novelGene_80607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGAGTCTCTGTGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347735	346054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_346100_347700
918011	contig_8600_pilon	-	1863	1	Intergenic	novelGene_125741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATAATTGCAAGCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118717	116854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_-_116900_118700
918012	contig_6873_pilon	+	3930	5	Intergenic	novelGene_129837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	3323	3928	696271	696876	FALSE	15	ACGGGGGGGTGCATCTAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDSLFSSSWLFFRTGTGEVWICFLSFPIFSPLVLLWPLSLLSAGSAAWPARRPCSSPTHRLSTSYCSGLLCSNRCFGYGGGGQRISGLPYSMSSGYALVPPKGRGCSSLGSRPSTAELGAGIQAGWEGPTAVWGSGLSTLTLFTGCRMWADVTAVMVLGEGMEGSALLGAPALMGTTTCCWWLLKELVLLGTGPLGRKGTC	681464	696878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_683791_686371_686482_692911_693095_694034_694619_696151
918013	contig_3077_pilon	+	1237	6	Intergenic	novelGene_26766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_4	2203.5803956289	65	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	56	739	13867	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13118	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
918014	contig_13224_pilon	-	2713	1	Intergenic	novelGene_104134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401118	398405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_-_398400_401100
918015	contig_10446_pilon	+	5647	11	Intergenic	novelGene_162502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	106.758793548822	150	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	2035	3255	974817	1054546	FALSE	75	AAAAAAAAAACAACTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRANLEELRSQHENKVEENSVLQQRLEESEGELRKNLEELFQVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDSAKQSEDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIAKEEQEDLLKKRERELTALKGALKEEVSSHDQEMDKLKEQYDAELQALRESVEEATKNVEVLASRSNTSEQNQVGAEERVKALKEENERLRGRVGDLERHVVQLQRQIHDLEGEEAKARETLRKHEEEKRQLEEALVHARKEEKEALTARRSLEGELEDAQRNLSRATQEQKQLSEKLKDETEQKEQLRRLKNEMENERWHLDKTIEKLQKEMADIVEASRTSTLQLQNQLDEYKEKNRRELAEVQRQLKEKTLEAEKSRLTAMKVQDEVMPGRISTCVYCLFQVSFEIALKLFFERLGGSFQDSFCA	963360	1056938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_965055_966024_966124_967932_968039_974163_974266_974783_974933_976361_976498_988704_988918_1045180_1045388_1046278_1046384_1053178_1053332_1054255
918016	contig_14450_pilon	+	2571	8	Intergenic	novelGene_48935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_1	70.3559463277516	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	77	1123	512549	523347	TRUE	50	AAACCCCAGCAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAEWSRRRAPGKRSAVSAEPAARGAMEIGTEISRKIRSAIKGKLQELGAYVDEELPDYIMVMVANKKSQDQMTEDLSLFLGNNTVRFTVWLHGVLDKLRSVTTEPSSVKSSDSSIFDSNVPFNKGSFSRGDERRHEAAVPPLAVSSTRSEKRDTRVSTSSQEQKSTSVRQTYDDGAATRLMSTVKPLREPAPSEDVIDIKPEPDDLIDEDLNFVQENALSQKKPTVTLTYASSRPSIEIYRPPASRNADSGAHLNRLQFQQQQNSVQAAKQVDTQNSRVYDAGRLCEPEVLNSLDKTYSPFFRNNSEKMSSEEENFRKRKLPVVSSVIKVKKFSHDGEEEEEDDDYGSRTGSVSSSVSVPAKPERRYLNMSVN	512472	526680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_512585_513049_513093_518602_518718_520939_520981_521524_521721_522078_522509_523161_523844_525728
918017	contig_12312_pilon	+	5167	22	Intergenic	novelGene_63953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	119	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	3363	3917	233805	242257	TRUE	20	TCGGAGCAGTGAGGCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCIWAFRSLKTLFTNENVGQLGRQLVHSVTLCKKILAIRPHHDISQTMPFGHKPPDGSLTYSPVIHCGIINPPLGLLNLALKMDSCFGGSAVGHSPIGFGLQVLQGRGHLFGQRPGLWSISLPCLRRSANLEVRADISPSERRMSSLSLGSSHNSAIFRASAKAPRICSSPSGPPFGSASQF	213838	326145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_214747_214810_215984_218222_218326_218673_218880_223841_224032_225339_225458_226678_226983_228087_228196_229392_229543_233702_233862_235038_235165_237713_237905_241325_241503_242253_242408_245860_246008_246881_246973_256293_256456_257907_258034_259775_259884_260268_260421_278131_278189_325888
918018	contig_10324_pilon	-	1685	3	Intergenic	novelGene_7916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	2	62	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGTAAGCCTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892309	883640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_885118_891918_892059_892241
918019	contig_16625_pilon	-	1390	8	Intergenic	novelGene_171107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	19.3675512343798	39	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	958	1389	21835	6950	FALSE	20	TAAGAGTAGTTTGTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDQGEVIALDKVSNKVEKIRQNALLLGLNSIRAFCFDGTKALKLEMVEDTEGEPPFLPESFDRILLDAPCSGMGQRPNMACSWTLKEVTSYQPLQRKLFSVAVQLLKPGGVLVYSTCTITLAENEEQVAWALRTFPCVQLQYQ	66254	6948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_7076_10665_10815_17612_17758_21823_21944_34818_34929_54768_54849_63713_63870_65751
918020	contig_7088_pilon	+	3115	1	Intergenic	novelGene_159792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGCCAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706578	709693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_706600_709700
918021	contig_10861_pilon	+	863	2	Intergenic	novelGene_39203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGACCCGCCTCCGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375099	376284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_375450_375771
918022	contig_16999_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_84952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTACTCCACTGAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23778	25551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_23800_25600
918023	contig_4364_pilon	+	2463	1	Intergenic	novelGene_150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	194	373	1216815	1216994	NA	20	AGAGACTGTCAGGTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPGGSPPVPARATTSTLGLPPLSVHGPAALSSGPFFRFPLESVSSRDWLLSFQRHFPHSRAHHPMLATGQAADPPALAQTAPRRVCRGSSRHGPRCCSSVSGHRGLVFSGVTGQCLQGPREQR	1216621	1219084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1216600_1219100
918024	contig_6361_pilon	+	3512	4	Intergenic	novelGene_23866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGATAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54679	65288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_55271_56667_56740_60093_60214_62559
918025	contig_14814_pilon	-	2830	4	Intergenic	novelGene_137740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.8957200593122	4	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	14	553	397875	395214	FALSE	15	TTGTGCCTGTGAATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQGMRLKKKKVVPSSLDLCNLYDPSNPKTTILKKRKKVKEMLHSVEHNGVLEAKAKQVPVLGNGGTFSPLKKKLRAENDFVKFDTSFLPKPSFFRKAKSTACASFLSPTVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNTTAGPSRVAFNPEQRPLHGVLKTPTSSPSNTPLAPKKVLATPPKRRPTAMDFF	397888	392936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_395366_396348_396413_397413_397564_397701
918026	contig_14680_pilon	+	2106	2	Intergenic	novelGene_132736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGAGCGAGAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4259	6401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14680_pilon_+_6019_6054
918028	contig_14575_pilon	+	796	3	Intergenic	novelGene_101905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_1	105	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	346	795	74809	80758	FALSE	55	AGAGAAAGAAGAAAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSGTPSVIPSVKSETVTSGSKNKGSSHSSGPFAVPEHLRKDIEEFEAYYKKRQQRNNEYDSQNKKMGEANPKQKCSTLYDYFSQYLEDNGPLDIRHRVFNEYRFYPEETRQIVQKAGGLRQFLLRCPRFVVIDNCIALRKVSTRIKR	74463	80759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_74886_76192_76364_80556
918029	contig_14158_pilon	+	2034	2	Intergenic	novelGene_136135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAATGTAAAGCCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44968	49389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_45947_48333
918030	contig_5084_pilon	+	6032	35	Intergenic	novelGene_64577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_34	80.0891155899861	183	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1558	4677	46	4722	721455	821524	FALSE	25	TATGTACATTGGAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASELGARDDGSCSELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDNNPLLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGASNSGMLNTYSLNGVLQSESKSDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDNDEDEEEELHLSREELHDMLRLHRYRKLHQNKCSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPRKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEESPRRHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASAHNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSAQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFMYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGVNEESCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGEPEGESQQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCTAVSGYSDQVIHQRRAAASLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAARQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASMTGSVSDTVNGLSVQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLAEFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGTPKSLHMTSSLTTDSLVRKQGKGSNPSGGR	721409	822834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_721598_721848_722019_722109_722178_725373_725539_728620_728742_729874_730087_735359_735414_736239_736444_739963_740160_741039_741108_741927_742138_742612_742694_743552_743649_748499_748560_748971_749115_750341_750427_751024_751143_752493_752580_755581_755750_756010_756145_757487_757556_758584_758679_759470_759643_774468_774607_779888_780115_784216_784345_793684_793780_803992_804066_811500_811660_813277_813381_814342_814432_817615_817772_818347_818508_819236_819453_821306
918031	contig_3601_pilon	-	2351	1	Intergenic	novelGene_132922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGATTCATCGTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346343	343992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_344000_346300
918032	contig_5423_pilon	-	4000	1	Intergenic	novelGene_85207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319647	315647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_315600_319600
918033	contig_4232_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_63284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466563	468053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466600_468100
918035	contig_11493_pilon	-	2665	14	Intergenic	novelGene_143657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_2	228.145858047826	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	502	1914	184849	113409	FALSE	45	TCACAGACTGAGAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTINISEVVCLAIHKEDFYLSTGPIFTFEIYLPSECVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPFVAENLTEADYDLVGQLYYKDCHALDQWRKGWFAMDKSTLRFCLQMQEAQEDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTIWRTAIEKAAGTDGNALEDQQLSKNDVPIIVNSCVAFVTQYGLGSKYIYQKNGDPLHVSELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTGVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGTFIRSLPVVNRATLAAVIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLAMAFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDTQVSQAGDLLVEVYVERKEPECSIIIPISPIMEAEELTNNILAIKNIIPEKGDLWATFEVIENEELERPLHYTENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKQFLTIDTIRHYSERSALESIKDGVLKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGYLFLFKDLKVFIYEVFEFVYIFISWVLAFLFYTALSPLAWKS	197083	112657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_113651_126283_126413_135824_135943_139148_139224_141334_141404_143264_143413_146901_147008_150637_150851_156774_156939_183434_183499_184764_184964_185815_185919_188014_188160_196944
918036	contig_13224_pilon	+	3185	5	Intergenic	novelGene_104067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	33.7222107816199	41	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2411	2719	38456	39246	FALSE	45	ACAACACAATAGATTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMTQTLLAESEEDLNHFLMKIKDYILQYGLYINIKKTKLLTTEPISNIMIHGEKKLSSISFYLDPQSMPMEAAVKKSNDVLHWANVLQKTSLKCSKSKMSH	30452	39712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_30626_34383_34456_34884_35069_36474_38556_39037
918037	contig_3588_pilon	+	2285	16	Intergenic	novelGene_72870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	635.341049271089	3	129	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	631	1077	120067	131459	TRUE	30	CTTTTGGGCTTCTAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALPPPPAVHPPPPASRNLTPLLPPQPNHEEPSRSRNPQAPQRLPAPLIDRSKKPPLDRSLAPFDREPFTLGRTLCFSRSFSELRRPLGEHLPKIQKPPLPPATERHERSPLPGKKPPVPKHGWGPDRRENVSTCIKDLCPSQHCPP	84497	141558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_84655_90123_90187_96173_96211_111722_111793_116876_117124_120010_120130_122109_122180_122283_122368_125563_125712_127433_127474_131417_131548_134071_134120_136015_136117_137170_137249_138772_138929_140821
918038	contig_13101_pilon	-	1783	6	Intergenic	novelGene_172788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	81.869652497125	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAATGCAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244311	236894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240729_241643_241883_244093
918039	contig_11594_pilon	+	2645	11	Intergenic	novelGene_80913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	47.621528744886	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	1316	2179	347434	365784	FALSE	10	TACCGTTGATGTGTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKLLRRNTDKKGKPEIACENTHCTAVPLMQPTVHIADKDPIPEEQELEAYVDEIDMDSDFRKDDFYYLSQEDKERQKREHEESKRVLQELKSVLGFKASEAERQKWKQLLFSDHAVLKSLSPVDPVEPISKSESSMNSDMGKVGKNDTEEENSKPSTTDSEISRTENLCENPLGSKNKDISANEVFLQGAEERVCYQYKSEDESQQAEVGDLATAHPTPKDPVQPSIKQRLARLQLSPDFTFTSGLAAEVAARSFSFTTMQEQTFGDEEEEEEQITQEIKNGIEEK	318314	366250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_318332_326126_326217_330580_330757_332491_332768_335649_335800_341481_341630_343220_343522_347276_347471_352803_352905_361775_361984_365266
918040	contig_610_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_76858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCTGGCATTTCCTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392428	394192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_392400_394200
918041	contig_10377_pilon	-	4561	3	Intergenic	novelGene_115413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	205	549	259131	258787	TRUE	0	CCTTGTTGTTGCTTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTEENHSVGFTQLNILNSFSLSYSVKTVYFTQPYASLSLLIAVDSNAPQPHVCRGELGSVGFFNVNNRIFELRPSEQRKSNPCGFVQRSQELGMGRGGAGGKINGARCRLRGR	259335	252867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_255167_256866_258105_258311
918042	contig_13093_pilon	-	3517	1	Intergenic	novelGene_105214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	793	1107	53478	53164	NA	40	AAGATCCCAGGCACCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSSKHCRYNVEADKFFPSHNSCYNLICQLNKIHMECGKLVRIRPSTFPQPLLHRKQTAFSFISFTIFSGLHTMHNLGARKAAVTLGRPPNNGYRLQCNGPPHA	54270	50753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_50800_54300
918043	contig_17432_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_159011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACATAAAGAAAAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90002	92611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_90000_92600
918045	contig_14142_pilon	+	2619	6	Intergenic	novelGene_120534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAGAGGTTCATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349041	353577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_349684_349796_349877_350131_350223_350384_350748_351178_351806_352761
918046	contig_19865_pilon	-	5519	2	Intergenic	novelGene_170163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	219	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	4557	4931	73594	73220	FALSE	55	TTAGTTAAACAAAGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPFCLCSTLLSMHLIVDIILYSHICSLPSVHASIRPSIHLHPSLSLHPSHPSRPSRPSHPSSILIKHPLTGATVEKHDLDLTAGRSVNWHTFLEKQVGNAVVLENLNGVPLPNPVILFLEFFL	78669	72631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_-_77275_77793
918047	contig_7230_pilon	+	4978	1	Intergenic	novelGene_52526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2498	2809	36695	37006	NA	70	AAAAACATTTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHQNISRCSGFLLSLDPAAASCRLISSSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSPTCPSWACQFLRLCDLEEASTLVHRLGSF	34197	39175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_34200_39200
918048	contig_8955_pilon	+	4612	5	Intergenic	novelGene_175086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	91.420388863754	180	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	732	2168	278191	281421	TRUE	35	TTCTTACAAAATCGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPDEKEFTGGQSGGPQQNTGVLDGPQKKPEGPIQAMMAQSQSLGKGPGPRTDMGAPFGPQGHRDVPFSPDEMVPPSMNSQSGPIGPDHLDHMTPEQIAWLKLQQEFYEEKRRKQEQVVVQQCSLQEMMVHQHGPRGVVRGPPPPYQMTPSEGWGPGGAEPFSDGINMPHSLPPRGMAPHPNMPGSQMRLPGFAGMISSEMEGPNVPNPASRPGLSGVSWPDDVPKIPDGRNFPPGQGIFSGPGRGERFPNPQGLSEEIFQQQLAEKQLGLPAGMSMEGIRPSMEINRMIPGSQRHMEPGNNPIFPRIPVEGPLSPSRGDFPKGMPPQMGSGRELEFGMVPSGMKGDVSLNVSMGSNSQMIPQKMREAGAGPEEMMKLRPGGSEMLPAQQKMVPLPFGEHPQQEYGMGPRPFVPMSQGPGSNSGLRNLREPIGPDQRTNSRLSHMPPLPPDPFPEPTLYYDVSNVQVCNAQLYPLIP	272816	285359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_272994_273920_274021_277736_279542_281335_281505_282998
918049	contig_709_pilon	-	2106	6	Intergenic	novelGene_57670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	47.0914004888366	88	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	409	1488	3936133	3930683	FALSE	25	GGTTATGGCGGAACCCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEEEARGTDSEGPRKLGLCVLCGLPAAGKSTFARALGHQLRQQQGWAIGIVAYDDVMPDAFLDGASARPLPSQWKLLRQELLKYLDCFLMAAVNGCQMSAPPNRTEAMWEDFITCLKDQDLVSSAALEAQSCYLLSKTAVSRSLFLVLDDNFYYQSMRYEVYQLARKYSLGFCQLFLDCPLETCLQRNDQRPRALPAETIHLMGRKIEKPNPEKNAWEHNSLTIQSPACSSEVSLEVTDLLLTALENPVKNVEDNWEQKETDRIICSASTLHQADQMLRRILSQTMKEAKDEQVLPYNLKLLAEELNKLKAEFLEDLRQGSNKKYLCFQQTIGISDVISFFHYEKDNIVQKYFSKQH	3936541	3930064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3930886_3931179_3931274_3932351_3932428_3934756_3934956_3935201_3935494_3935917
918050	contig_500_pilon	+	1327	10	Intergenic	novelGene_31038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	897.499296743079	18	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	55	765	1492663	1496733	TRUE	15	GTTTGGAAGGAGGGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMA	1485759	1499600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496734_1496821_1496871_1497978_1498078_1498882_1498974_1499277
918051	contig_15354_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_65706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGTGCAAACTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171047	169971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_170000_171000
918052	contig_8365_pilon	-	4497	6	Intergenic	novelGene_150924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2603	2944	194143	193802	TRUE	50	TTTTAAAAAATGATAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRISKIQDQHLDTALFEENSEKRTKKNEQNLRIMWDTIKSKNVQVIGVPERGENRKHRIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPKKKSPRHIRIQLTKTKDKES	198054	191468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8365_pilon_-_191715_191841_192112_192569_193473_193667_194570_194667_195836_197046
918053	contig_3410_pilon	+	3266	9	Intergenic	novelGene_58945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	350	874	228599	230970	TRUE	50	TTTTAGGAAGGAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRESMMRRTASAICLARTVCCSNLVFTADWEMHSQIVSQNSETQTSSLESLLQEHPSFWHALGFLDPGIEHLFGRHEKDAVPSLGSIHHTQFIYQEAGTTFHVLPPHLLHVLGLRGRCVPAVVQDEDVWAGEALAHLVEELLPSASGWTLSWPPAQTHQHPGKTCQSNCPALW	228249	244071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_228702_228843_228910_229141_229295_230653_230761_230874_230985_231840_233766_235392_235530_238597_238777_243934
918054	contig_14718_pilon	+	2186	2	Intergenic	novelGene_177932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	84	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	34	579	33671	44038	FALSE	35	ATAGTATTCTAATTGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIFGALRTGAYMVYILMTKGLKQSVCDQSFYNGPVSKFWAYAFVLSKAPELGDTIFIILRKQKLIFLHWYHHITVLLYSWYSYKDMVAGGGWFMTMNYGVHAVMYSYYALRAAGFRVSRKFAMFITLSQITQMVMGCVINYLVFSWMQQDQCHSHFENIFWSSLMYLSYFVLFCHFFFEAYIGKMRKTMKAE	33637	45645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14718_pilon_+_33792_43613
918055	contig_709_pilon	+	2348	6	Intergenic	novelGene_57672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	8.73155198117723	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	88	1425	3944240	3957791	FALSE	40	TGGAAACTACTTAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCFLTSTLHWWKLRHWKRRSRLAWAGGGGMEAGTEDPGLTRRPTLASSWDAPCGALTQSLFLSRGGLGAGEFDWEELLEPPAPGQDLVILKRSPNSQDENACFLYLNFDPTGGEEIASIGILSSARNMEVYLREEYCGTSRGKNVCTLLDNSKYEKIILFKKYLKLESSTHACKIKLLSFGEKQCIFISKVVVHMRAVSANSSPSSSALGSRIDLYRVQTIMESTGSQLLPGAQQLMDMVRFQQRNCVPFGEQLQSVSGNTGYKHMIGLQLSSTSGALDKSSSMPFPFRTGLTSGKVTEDLKACIDKNLQPCGEGNTSNLNTCASVPQSHTVLEDDLKNLESSFLPKKASDTSNIPNSELLPFLQNLCGQVNHLRVRNNREWQEKVAKPGEGIVGVVVEEQPVCSCLEKLLSKNVELMEKNFMDYIDQRICKLQEHTDNKIVLLMDLLQNSNSSSPGMPLRHFVSGERLSTGDR	3944152	3958714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3944404_3945761_3945966_3946938_3947012_3949977_3950185_3953919_3954375_3957556
918056	contig_9363_pilon	+	3005	4	Intergenic	novelGene_6510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	19.2527054375915	60	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	1669	2985	523482	524798	FALSE	40	ATGAAAACACAATTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGIKRKSYTADFKLKVVARAEETSNRASAREFEVAESSIREWRKEKKELEKMNPQKRARRGPKAKWPELEHDLKEWIISQREQNQAVSTVAIQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRNGLSLRIRTTVGQQLPGDWEQKMVSFQKFIAKEISELGISAVDIINMDEVPMSFDILATSTVAASGTKTAAITTTGHERACFTVVLGCTASGVKLKPMVIFKRVTMPREKLPTSVVVHFNKKGWMDCDVMKVWIDKCYRARQGGFFSKKSLLIFDTMAAHKEKHVQNYINSTGAHIAVIPGGLTCKLQPLDIAVNHLFKTLVRREWDEWMQSGIHEFTPSGRLKRVTFTEVCNWVASAWGKITPETIRNGFRKAGIVYQQNTDDEDEDAEGSDDDDISSEVTEERLQAALRYFNDDSDEGSDFEGFRESDDDDDNK	512363	524818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_513696_513819_513988_518588_518728_523452
918057	contig_18419_pilon	-	1216	2	Intergenic	novelGene_141464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGAAAGTGTCCTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30660	28641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_29503_30305
918058	contig_3627_pilon	-	8343	20	Intergenic	novelGene_78453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	357	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1858	2178	316019	314150	TRUE	55	CAAATTATATGCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGNFFSFTIILLFFMPVLHQPPCVHPEASRPAAACILGRGFPTLSGWEGNAKHPGKIKPLSPHELELYAPCGSPQGDGSESLQNVTIVCTHLDQCLSEPYNNE	332721	295954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304726_309358_309490_309604_309769_312559_312785_313377_314209_314945_315156_315967_316054_318593_318774_320223_320416_323437_323678_326343_326456_329122_329208_329564_329710_330614_330737_330838_331027_331548_331755_332368
918059	contig_9113_pilon	+	2324	5	Intergenic	novelGene_68584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCCTGGTTCCAAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346512	364458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_+_348569_352032_352087_354152_354276_364040_364105_364431
918060	contig_10058_pilon	+	2719	11	Intergenic	novelGene_67726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	163.105763233553	9	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	67	885	72602	99369	TRUE	25	GTTTGTTTAAATTCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72535	101647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532_100163_100335_100502_100646
918061	contig_16594_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_53880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTATAAATTCTTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186654	184795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_184800_186700
918062	contig_13823_pilon	-	1427	6	Intergenic	novelGene_145262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	238	junction_4	28.2488937836511	4	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	126	746	252433	245376	FALSE	60	CAGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGEIFVRVYNEVPTFQLEVPKAFAASLLDYIGSQAQYLHTFMAITHAAKVESEQHGDRLPRVEMALEALRNVIKYNPGSESECTGHFKLIFSLLRVHGAGQVQQLALEVVNIVTSNQDCVNNIAESVVLSNLLALLHSLPSSRQLVLETLYALASSTKIIKEAMAKGALIYLLDMFCNSTHPQVRAQTAELFAKMTADKLIGPKVRTRQVLGRKSLTLCYFDTNFMKFTKVRYGEDKKMICFEIILF	253685	244694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_245621_246031_246107_248110_248211_250428_250521_252324_252503_253629
918063	contig_5965_pilon	-	2988	5	Intergenic	novelGene_154677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4.32290411644765	63	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	265	1710	261346	244990	FALSE	25	GAATTACTTTTAGTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPVPRRERSLSCRGAVAPGAGPEKAAALPSQDSALLQERNQEEDSSALKILKVTSLGSVLFRDVAIVFSQEEWEQLAPAQRDLYRDVMLETYSNLVSLGLAISKPNVISFLEQGKEPWMPERVVIGGLGPGLESRPDTKVSPLRQNVYEVESLQWELMESLTSYKLECFQDDWEHRERFDRQQGNADGHFSQMIISHEEMPSFGHQTSVTFYQKIHAGEKPYGYNECRKELWQEEFLINHQGIHTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFTQHQRVHTGEKPYKCKDCAKAFSRSSQLIEHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTIHTGKKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPYLCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFTHCSQLIHHQAIHTEEKPYEYKECGRTLSHDSTTVQHQRMCNGETHVNIINIEKPSISTYPLLIIRELMLASNHINGSNGKSSLA	265683	243711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_246306_260637_260734_261312_261440_263284_263374_265601
918064	contig_11417_pilon	-	1273	8	Intergenic	novelGene_103312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCAGGGCCAGGCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560884	556441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_556741_557385_557471_557567_557642_557739_557818_558186_558382_559104_559260_559487_559658_560667
918065	contig_8059_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_111107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTTCATCTAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224670	223194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_223200_224700
918066	contig_13481_pilon	-	3752	7	Intergenic	novelGene_119524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	546	junction_6	357.40581509912	109	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	238	1284	1462670	1444323	FALSE	65	TGGAAAAAAAAACTTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKVAKPKEPITDVSVIIKSLGEEVPQDYVCIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCEIIQSTPYGRPANISGNTSSQRIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFCKVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPMGATIECWPPNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEDNLTEKQRLLLGLASPTDGKPDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEK	1501690	1441854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1444569_1445295_1445466_1447629_1447700_1459726_1459977_1462359_1462693_1473241_1473321_1501554
918067	contig_13481_pilon	-	1245	1	Intergenic	novelGene_119332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGCTGAGAACTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334778	333533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_333500_334800
918068	contig_6740_pilon	-	3934	1	Intergenic	novelGene_142659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGAAATGGTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66776	62842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_62800_66800
918069	contig_13592_pilon	-	2370	1	Intergenic	novelGene_33738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGAAAAAAAAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282837	280467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_280500_282800
918070	contig_6102_pilon	-	1450	4	Intergenic	novelGene_32047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.6562492732896	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCGAACAGGTGAGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556551	554193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_555032_555144_555529_555692_555806_556436
918071	contig_17768_pilon	+	1884	2	Intergenic	novelGene_140384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAACACACGGCCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20771	22779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_22586_22709
918072	contig_13074_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_153413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCAAACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160979	161848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_161000_161800
918073	contig_10494_pilon	+	1453	10	Intergenic	novelGene_102154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_3	19.3677853951119	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	653	1336	889190	892457	FALSE	75	AAAAGGAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWKDPWRRSKSPKKKLGVSVSPSRARRRRKTSASSASASNSSRSSSRSSSYSGSGSSRSRSRSSSYSSYSSRSSRHSSFSGSQSRSRSFSSSPSPSPTPSPHRSSIRTKGELAPPPGKAGEKSVKKPALPPVLPQSAKTTAPAPEPTKPGDPRETRRKERQARTPPRRRTLSGSGSGSGSSSSGSSSRSRSLSVSSVSSVSSATSSSSSVHSVDSEDMYADLASPVSSASSRSPTPAQTKKEKGKSKKEDGIKEEKRKRDSSTQPPKSSKPSAGSRSSQQPSTPQQAPSGQPPQAAFVAHKEIKLTLLNKATDKASRKRYELSDKDRQSSPPAKRANLSPDRGSRDRKSGGRLSSPKPERQRGQNPKAPATQPDRKRQLSPQSKGSSKVTSVPGKATDASATSAAPSTKSGKASTLSRREELLKQLKAVEDAIARKRAKIPGKV	878145	892574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_878275_880261_880388_885873_885979_887089_887234_887602_887669_889107_889269_889526_889727_890465_890563_891359_891457_892246
918074	contig_4114_pilon	+	2479	4	Intergenic	novelGene_15577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	7.36357401145817	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	18	407	169955	177929	FALSE	20	TACCTACTTACCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIFPVMILGLIIVRRLLDLIFSQHDLAWIDNILPEKEKKETDKKKKRKGAHEDSDEEEKDLPVGVTHSDSSFSDSELDRSITLHFKISCPASPAFNYSRSPVFMMPQVKIEMESDYDFTDVDKYRREADGETTL	169937	180001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_169958_172613_172767_175517_175586_177763
918075	contig_10331_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_54078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGGGATCATTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96342	95679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_95700_96300
918077	contig_10489_pilon	-	1755	2	Intergenic	novelGene_165638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	306	974	551488	550820	TRUE	45	CAACATGAGATGAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALAKNQAPGVDGISIEMFQQMDAELEVLTHLCQEFWKTATWLTDWKRSIFMPIPKKGDPTECGNYRTISLISHASKILWKIFQKWLKQYINRELPEIQAGFRRGRGTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNSVDHNKLWITLQRMGIPEHLIVPMRNLYIDQEVVVWTEQGDTVWFKVRKGVCQGCILSPYLFSLYAEQII	551793	549984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_550471_550524
918078	contig_7272_pilon	-	709	1	Intergenic	novelGene_25415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATTCAAGAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873327	872618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_872600_873300
918079	contig_405_pilon	+	3069	1	Intergenic	novelGene_135294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTGCTGCAGTGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142535	145604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_142500_145600
918080	contig_854_pilon	+	1736	1	Intergenic	novelGene_36351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCCCGAGGGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974685	976421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
918082	contig_7234_pilon	+	3673	1	Intergenic	novelGene_145967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGATTAAATCAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575971	579644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_+_576000_579600
918083	contig_4486_pilon	+	2514	5	Intergenic	novelGene_38553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTCGTGGGTGCAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142192	177670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304
918084	contig_9809_pilon	+	2589	10	Intergenic	novelGene_176754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_7	126.684599120497	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	115	1080	108357	111861	TRUE	65	AGTAAAAAAAAAAAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKWYEDFVFQQLHHLV	108242	116063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111871_112241_112362_112466_112590_114806
918085	contig_4202_pilon	-	2558	3	Intergenic	novelGene_147079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAAAGAAGTTGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295322	276446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4202_pilon_-_276455_292611_293708_293868
918086	contig_10494_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_102144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	398	736	426551	426889	NA	30	CCACAATGAGGTACCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSKDYSLQYELHLNIKQKPSTTGPISNIIINGEKIEVVKDFIFLGSTINAHGNSSLEIKRRIALGNSAAKDLCKVLKSKHGTLRTEVRLTQAMIFSVAPNACKSWEMNKED	426153	428459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_426200_428500
918087	contig_4402_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_140791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	1705	2184	199409	199888	NA	40	ATGCTCCTGCCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGMPASGSHPSESDPVCRLCPHCAFSFSCPASALPALLVFPKFLSFSLFSPSHSLGYLLCSHDFYLVCLYQGLLSHFQPSTKPPPLAVCFSVHNQFFLLYSVLNSIHPIMQARNCGTVFYSLLFYPPPSHSCLISKPRDSVCAYCLNSSPPLHLHHLD	197704	200028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_197700_2e+05
918088	contig_1337_pilon	+	1491	1	Intergenic	novelGene_84229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAAAAACATAAAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112320	113811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_112300_113800
918089	contig_8228_pilon	+	893	1	Intergenic	novelGene_81781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	74	391	53776	54093	NA	55	AACCCTTAACAAAATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAVKKSNDKEEKRKVSVNTKSTKTKEKKTKSTDKRNLAQESKRNKENISTKKKKHYKMTAINSHLSIITLNINGLNVPIKRQRVTEWVKKTGPINMLSTRDMP	53702	54595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_53700_54600
918090	contig_9575_pilon	-	2721	15	Intergenic	novelGene_169715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	5.07947048501744	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	30	1994	142259	53153	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSRRRPRGMACLMAAFSVGTAMNASSYSAEMTEPTSVCVSVDEVVSSSMDATEKDLLNGHLKKVDNSFMEAQRFSSLPRRAAVNIEFKDLSYSVPEGPWWRKKGYKTLLKGISGKFNSGELVAIMGPSGAGKSTLMNILAGYRETGMKGAVLINGMPRDLRCFRKVSCYIMQDDMLLPHLTVQEAMMVSAHLKLQEKDEGRREMVKEILMALGLLSCVNTRTGSLSSGQRKRLAIALELVNNPPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKGLAQGGRSIICTIHQPSAKLFELFDQLYVLSQGQCVYRGKVSNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYGDQNSRLVRAVREGMCDADYKRDLGGDAEDSTSMEGCHSFSASCLTQFCILFKRTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYLAKTMADVPFQIMFPVAYCSIVYWMTSQPCDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFDTIPTYLQWMSYISYVRYGFEGVILSIYGLDREDLHCDIDETCHFQKSEAILRELDVENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLKYKIRAER	142288	52425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_53382_55929_56049_59434_59594_59842_59944_61202_61372_62303_62406_62616_62730_66366_66482_67734_67859_69401_69548_77666_77718_81504_81638_83716_83835_135916_136161_142217
918091	contig_13787_pilon	-	2852	3	Intergenic	novelGene_40631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1485	junction_1	255	23	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1792	2127	182586	182251	FALSE	35	GAACTGTAGATGAGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRKQNSLIADMEKVLVVWIGAQTSHNIPLSQSLIQSKALTLFNSMRTERGKEAAKEKFEASRGWFMRFKERNCLHNIKVQDEAASSDIKATASYPEDLAKITGEDNYTKQ	205397	181525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13787_pilon_-_183890_189120_189184_204972
918092	contig_1244_pilon	-	3062	2	Intergenic	novelGene_37894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	0	103	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	41	1057	111238	101635	FALSE	15	TTCAGCAATGGTCTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATHVSGEKISIYTGETAKAADRDSFGNDCPGQDRSSQRSWRQKCASYVLALRPWSFSASLTPVALGSALAYRFQGDLDPRLLVGCAVAVLAVHGAGNLVNTYYDFSKGIDHKKSDDRTLVDRILEPQVVVRFGVFLYTLGCVCAACLYYLSPLKLEHLALIYFGGLSGSFLYTGGIGFKYVALGDLVILITFGPLAVMFAYAVQVGSLAVFPLVYAIPLALSTEAILHSNNTRDMESDQEAGIVTLAILIGPTLSYVLYTTLLFLPYLIFSILATRCSISLALPLLTIPMAFSLERQFRSQAFNKLPQRTAKLNLLLGLFYVFGIILAPAGSLPKL	111278	99629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_102123_110709
918093	contig_2867_pilon	-	767	6	Intergenic	novelGene_135210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_1	66.7514793843552	32	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	199	765	979252	972505	FALSE	35	GCAGGACTCATCAGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALNENSLESYLRLFQENLGLLHKYYVRNALVCSHDHLTLFLTLVSGLEFIRFDLDLDAPYLDLAPYMPDYYKPQYLLDFEDRLPSSVHGSDSLSINSFNSITSTNLEWDDSAIAPSSEDYDFGDVFPAVPSVPSTDWEDGDLTDTVSGPHSTASDLTSSKASTKSPTQRHNPFNEDHSEGMSSSDTTPVHTTSLEKEESQALDLLEACAELEVIRVTKKKKTGKKKKTKSDEEASPLHPASTQQKCARHGDGPGH	980929	972502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_972626_973788_974018_977440_977501_979095_979283_980195_980284_980849
918094	contig_13014_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_169379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTTTGTCTCTCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591486	592563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_591500_592600
918095	contig_1406_pilon	-	1992	1	Intergenic	novelGene_25664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAAAAGGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2808300	2806308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2806300_2808300
918096	contig_4857_pilon	+	4555	1	Intergenic	novelGene_48893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1218	1529	1436195	1436506	NA	30	GGTATTAGCTCATTATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFEEFKTLVEEVTADVVEIARELELEVEPEDVTELLKSHDKTLMNEELLLMDEQRKWFLEMETTPGEDAVNVVEMTTKDLEYYINLVDKAAAGFERIRLQF	1434977	1439532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1435000_1439500
918097	contig_14575_pilon	+	5061	29	Intergenic	novelGene_101866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	124.138952757935	47	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	146	691	17236	26356	TRUE	60	GATAAAGAGGAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17090	80748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39519_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50577_51064_51146_54377_54491_59252_59376_59882_59985_61543_61637_63867_64005_68967_69220_70559_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556
918098	contig_19647_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_144022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGCCTCACAACCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107976	109351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_108000_109400
918099	contig_1210_pilon	+	620	2	Intergenic	novelGene_171513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	22	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTTTTTACTTACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231564	232369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_231776_231960
918100	contig_1443_pilon	+	4532	4	Intergenic	novelGene_28161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAAGGAGACGCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316762	333804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_320990_327009_327123_331883_331947_333675
918101	contig_10042_pilon	+	954	3	Intergenic	novelGene_79083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	398	junction_1	89.5	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	10	498	6321	26890	FALSE	25	TAGTCCGTAAGGTTTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRYSVLPGNVPSLPSPLVCLGERNSFPS	6311	27346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600
918102	contig_11171_pilon	+	5045	4	Intergenic	novelGene_48627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_3	22.3755819291179	95	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1612	4839	108	4946	399325	446199	FALSE	40	ACACCCAAACCGGGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQQQQQQQQQQGQQQQQQQGQQQGQQQQQQHPQHVMQYSNTTPKLPLQSQVGQYSQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQSGENLQCGQSSVPMGSRNRILQLMPQLSPTPSMMPSPNSHAAGFKGFGLEGMPEKRLTDPGLSSLSALSTQVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSKRPSSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAESLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGTSEKASSSPAQGTQNEPPRLSASPAAREEAASPGAKDTPLSSEGTPKVNEKTVGVIVSREAMASRVEKTGGQDKGSPEDDPVATQSPPSTGGAKETSHTTLPQPEPPGGGGKGNKNGDSSSNHNGEGNGQSGHSAVGPSFTGRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAMPRNVSGFPQYPPGQEKGDFTGHGERKGRNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGGLEGSSRPNVLVSQTNELASRGLLNKSIGSLLENPHWGPWERKSSSTAPEMKQINLADYPIPRKFEIEPQSSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIVRDPGAHSLGHMGADTRMGRSERLNPSLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSGDHCHPTSIKHESYRGNASPGAAVHDSISDYGPQQESRPTPMRRVPGRVSGREGMRGRSHSQYHDFSEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHMTFSERGNRSSLHAPFSPNSESLASAYHTNARAHAYGDPNTGLNSQLHYKRQMYQQQQEEYKDWSSTSAQGVIAAAQHRQEGLRKSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPMGTYHDPSSQEAGRCLLSSDGLPNKGMELKHGSQKLQQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSNQKRYGPPHETDGHGLAESTQSSKPSNVMLRLPGQEDHSPQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKNSNTEDKGRLLPPSKEGADKAFNSYAHLPHSQDIKGIPKRESSKDLTSLDNRNCPAVTLTSPAKTKILPPRKGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSTEAGGDTVTLDDILSLKSGPPEGGSVAVQEGEMEKRKGEVVSDLVNPTNQELNIEKPLPRSSEEWRGSGDDKVKTETHPETVAAGKELPGAMASATSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVSPVGILAPEANPKTEEKENDTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKKKGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPAHIPEGSADGEPKPKKQRQRRERRKPGAQPRKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQPLDKADAKNKSFFPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSITESKALPASSFMLQGPVVTESSVMGHLVCCLCGKWASYRNMGDLFGPFYPQDYAATLPKNPPPKRAAEMQSKVKVRHKSASNGSKTDTEEEEEQQQQQKEQRSLAAHPRFKRRHRSEDCGGGPRSLSRGLPCKKATIESSNEKTALDSKPCVPTTSEGGPELELQIPELPLDSNEFWVHEGCILWANGIYLVCGRLYGLQEALEIAREMKCSHCQEAGATLGCYNKGCSFRYHYPCAIDADCLLHEENFSLRCPKHKGRLWR	399217	446298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_404002_433675_433770_441319_441370_446181
918103	contig_11416_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_145361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTATTGTGAACAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384855	386583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_+_384900_386600
918104	contig_6159_pilon	-	3103	1	Intergenic	novelGene_128250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2088	2531	216816	216373	NA	75	ATAAAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHRSRIQAVEVRISETEDKALETNLFEETSDKTVLKNEETLRIMWESIKRNNLRVIGVPEQSGITENTERIVEDFFAENFPDTVKDDKIPIQGSHQTPRKVDPKRKSPRHFIIKLTKTKDKERILRAARDKRKVIYKAELRINSD	218903	215800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_215800_218900
918105	contig_11846_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_105994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATTTTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392026	394465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_392000_394500
918106	contig_8316_pilon	+	409	1	Intergenic	novelGene_178729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACATATATTTCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183101	183510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8316_pilon_+_183100_183500
918107	contig_13108_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_135874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	275	574	204712	204413	NA	70	AAAAAACCAAAACAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGSWTELEKDVEHNSNSQKIDQIYWPNGDWRNPESMAPRHSFRSVVKLSPRFTVQPGSGQPRKTKWD	204986	203079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_-_203100_205000
918108	contig_9945_pilon	+	2625	1	Intergenic	novelGene_104808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51389	54014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_+_51400_54000
918109	contig_10197_pilon	-	4793	29	Intergenic	novelGene_115281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	437.808694301658	7	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1522	4569	63	4631	1197388	1167782	FALSE	50	ACAATAAATTTTGTATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA	1197640	1167619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1167899_1175424_1175539_1175647_1175784_1175985_1176166_1176281_1176530_1186804_1186922_1187111_1187323_1187480_1187628_1187804_1188044_1188181_1188370_1188646_1188840_1188960_1189088_1189239_1189404_1189522_1189730_1189856_1190054_1190437_1190568_1190903_1191039_1191152_1191273_1191416_1191607_1191693_1191814_1191979_1192171_1193341_1193448_1193543_1193670_1193759_1193973_1194097_1194317_1194408_1194574_1196589_1196759_1197288_1197400_1197589
918110	contig_4923_pilon	-	996	1	Intergenic	novelGene_109327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCCTTCACCTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387941	386945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4923_pilon_-_386900_387900
918111	contig_6980_pilon	+	3152	1	Intergenic	novelGene_36072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGGCCTCATTCTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366978	370130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_367000_370100
918112	contig_854_pilon	+	3594	20	Intergenic	novelGene_36507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2932.91715558951	3	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	888	2667	337	3003	1689375	1715383	FALSE	20	AAGGGGTTTTCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612773	1715974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649609_1689305_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
918113	contig_863_pilon	-	1260	3	Intergenic	novelGene_176618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATAAAAAAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113510	97345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_863_pilon_-_98479_99326_99380_113436
918114	contig_11825_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_155403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2202	2528	38780	39106	NA	60	TAAAAAAATTCACAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSLRQKDITIINIYAPNDRAPKYIKQTDSTEKRDRQLHSNSRRLQHTTFSERQNIRKKLSKDTEDLNATVNRLDLIDIYRTLHPTAASILSFPMHMQHSPEKATY	36578	39290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_36600_39300
918115	contig_9673_pilon	+	4702	1	Intergenic	novelGene_119161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAACAATGGCAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69047	73749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_69000_73700
918116	contig_15629_pilon	+	5160	1	Intergenic	novelGene_122447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	148	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1115	1426	97982	98293	NA	40	TTAATTTACTGATTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQATRGTLSTENFKTVVKLSKSPCAFYSRHTQTMLRDASDEVLLPTSADGLLPRLPGYAPASSTTTESNFTSISFLRTCTCPHLHFVSPCKASCLLDEALYPV	96867	102027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_96900_102000
918117	contig_7870_pilon	+	4345	1	Intergenic	novelGene_109091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCCCAGAACATGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817109	821454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_817100_821500
918118	contig_960_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_108310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTGAAAATTTTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045674	1046798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1045700_1046800
918119	contig_13702_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_102642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	953	1252	211071	211370	NA	55	AAATATTATATCCAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210118	211384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210100_211400
918120	contig_8027_pilon	+	5108	1	Intergenic	novelGene_158835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACCTTCAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242315	247423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_+_242300_247400
918121	contig_15991_pilon	-	3264	2	Intergenic	novelGene_70953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACATCTGGGCCTGGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172216	168538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_170823_171236
918122	contig_5423_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_85197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGTAATCTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246943	248458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_246900_248500
918123	contig_13021_pilon	-	4393	6	Intergenic	novelGene_8272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	61	junction_2	554.299197185058	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	9	728	270415	258084	TRUE	40	AGCATAGTACCTCGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKKSFLVFLFSLSIQNAVLDDDRTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSQTIMYYFYQGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSVYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGSLPINYTFFEKNAAISPAISKDVRQPAEFNFTKKSTQGDEEYRCEAKNRLLNNAKYSQYSPIPLTGMTSLWEMCLVMTLGLCGLTS	270423	247616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_251152_252257_252369_258064_258149_259754_260040_265837_266120_270327
918124	contig_8174_pilon	-	3813	2	Intergenic	novelGene_160053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	97	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCCTCTTTTGACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254023	249689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_253354_253874
918125	contig_7446_pilon	-	773	2	Intergenic	novelGene_101962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAAAAATCCACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254953	253828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_254512_254863
918126	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
918127	contig_9183_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_40343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	2255	2623	318415	318047	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCAHTHTHTHTHTHTFLFFLLQQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVSGPATGAGQSQGLWPEEGTLARKRPCAEEQKMQDTKPHENCDTKPLGKLSGPIFFKKNVLLSPP	320669	317935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_317900_320700
918128	contig_8978_pilon	-	1465	1	Intergenic	novelGene_49487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1756958	1755493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1755500_1757000
918129	contig_11160_pilon	-	1303	5	Intergenic	novelGene_168811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	11.1214882097676	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATTTTCATATGCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318479	311888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_312622_312743_312914_313920_314071_315639_315780_318369
918130	contig_10236_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_169120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGTACAATAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113859	112124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10236_pilon_-_112100_113900
918131	scaffold_17542_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_139242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	88	330	462077	462319	NA	35	AAGGCTGAGAAGTTACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLFLFPSEFIHETRNLLPPQSTFFHPTAMGYFLISSLQYSLVDFAAIPCAAPREKNKPTSPSQVLLIIILSPVPRCCVWSALPWCPHPLLYSSSLFIFIATPLVQAVS	461989	463018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_462000_463000
918132	contig_9752_pilon	+	1872	2	Intergenic	novelGene_122043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1440	1766	206507	206833	FALSE	20	GTGGTGTAGGTGTAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSHIQRGNNKTARITWQKPCRQEGNGVTYKTLKERNCQPRIIYPAKLLFKYDGEIRAFPYKQKLREYIKTKPNLQEILKGVLQFENRQHQKRQPGSRTQDHTSHIPA	204824	206939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_205328_205570
918133	contig_11171_pilon	+	572	6	Intergenic	novelGene_48536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1799.1444188836	104	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	2	529	31058	65921	FALSE	5	GCTGTGTGTGGTCTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQLSTLGHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDFEQCLLSERRTNTRWPPRCLQTTAVLASCISAFQSHL	31056	65964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_31079_41754_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51151_65805
918134	contig_7657_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_30058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAGAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393214	394937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_393200_394900
918135	contig_5954_pilon	+	2499	2	Intergenic	novelGene_28575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCTGCCTGATGGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894262	896821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_896506_896565
918136	contig_5019_pilon	+	3011	1	Intergenic	novelGene_109226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTGGCTTCAGCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340846	343857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_340800_343900
918137	contig_4924_pilon	-	2642	7	Intergenic	novelGene_84722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_3	1273.53453907706	15	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	19	825	252576	114572	FALSE	35	AGAATATTAACTTAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPW	252594	112754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
918138	contig_5780_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_29807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATTAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171256	170089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_170100_171300
918139	contig_6208_pilon	+	4494	1	Intergenic	novelGene_52997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2147	2452	413902	414207	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYEIISSANRETLTFSLPIWMPFISFSSLTALASTSSTVLNNSGDRGHPCLIPVLMGNAFKVSPFRMMLAVGFV	411755	416249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_411800_416200
918140	contig_2438_pilon	+	2423	2	Intergenic	novelGene_112061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	0	44	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	980	1318	311851	312412	FALSE	10	TTTTGGATGGACTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	310871	313517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305
918141	contig_14023_pilon	-	2096	11	Intergenic	novelGene_165380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1581	1913	277748	264127	TRUE	25	AATCCATTGGGATTCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATRVSGSSLTTPLATPSYTIPNDPCPSSRLMVIFSRATSHSSGTYTSAALKYSGFTEAYSTPFPSLLLFLFLWKTYSIITSPPTINKAATGTEMIRWMKFSYGLTLVGT	301517	263237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_263276_263981_264142_270999_271106_271588_271661_277608_277839_278171_278282_282118_282279_285036_285166_290646_290786_299730_300159_300993
918142	contig_7025_pilon	-	2085	18	Intergenic	novelGene_104385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	677	junction_15	709.068964098522	1	79	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1680	404	2083	85393	49287	FALSE	50	CAGCAAAGAGAAGTTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSAKSCRVLGGSWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNT	91003	49284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90763_90883_90969
918143	contig_14537_pilon	-	2969	3	Intergenic	novelGene_158652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	155	712	163057	162500	TRUE	75	ACGAAAGAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWGFSLGIYPIWCLLCFLDGQVFIFHDIGEVFCQQFFNDPLFFPCSGTPITLKFLLLIVFHIILWVTSFFFVLFSDFSSNRVVAKCLSSIYLILSSTVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILTFCSCIISLNSSILFVCIFHVCVCLFHEFVYFFLIFVCFLLQLLDSSE	163795	52823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_54493_161911_163130_163713
918144	contig_8866_pilon	-	1863	1	Intergenic	novelGene_77847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643709	641846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_641800_643700
918145	contig_3132_pilon	-	2249	5	Intergenic	novelGene_127432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_4	121.371331046504	5	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	132	683	229252	224837	FALSE	70	TCGGAAAAGAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKVREEQDK	229383	223270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
918146	contig_7151_pilon	+	5066	5	Intergenic	novelGene_40794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	410	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	4568	4963	541458	541853	TRUE	35	TTTAAGAGTGGCAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWKIQTKNGRNKEINTGTEQPEIIQKQQSEIEKINKISEMDSVIEGLRSKFEMMEYRISETEDKHLDTTLRKNQKKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLPVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKS	528878	562759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529337_530062_532472_539557_539774_539973_541890_562692
918147	contig_3700_pilon	+	1114	1	Intergenic	novelGene_138090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAGAAAAAAAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288634	289748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_288600_289700
918148	contig_2867_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_135233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	230	409	1223214	1223035	NA	5	TTCTTCTGCAGTGCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFFFAFCFSSSSSFPHPLSSTYHIFPPHSCLSALCTDHHAPKQHRYSLPEPTLKCSLALPCRPQFLLQTTNPSPTPMLDLPCCTIAKQMALPIEQGGGKYCAHRQANNKERQAHLLRHNQIKQKSRKKQKSTINK	1223443	1220665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_1220700_1223400
918149	contig_13863_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_42005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAATGATTCCCAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71888	71267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_71300_71900
918150	contig_12938_pilon	+	2316	2	Intergenic	novelGene_99745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78182	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_79657_85476
918151	contig_12545_pilon	-	2132	2	Intergenic	novelGene_178137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTACCAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46677	44371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12545_pilon_-_44874_45047
918152	contig_6954_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_64447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAAAAAACCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529003	527898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_527900_529000
918153	SIRV1	+	650	3	NIC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-62	-55	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCGGAAAGGGGTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10649	11551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV1_+_10792_10882_11243_11403
918154	contig_6227_pilon	-	2876	1	Intergenic	novelGene_49828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1405431	1402555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1402600_1405400
918155	contig_7663_pilon	-	3832	1	Intergenic	novelGene_178926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	802	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	2839	3594	123904	123149	NA	35	TACAGGTGCCAGAAGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLNAPIKRRRVADWIKKHDPSICYLQEMHLRLKDTNRLKLKGWKKIYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYASNNSAPKYIKQTLTALKTEIGSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQNIKILQSIFSDHKAIKVEINNTKSKEKNQTHGN	126742	122910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7663_pilon_-_122900_126700
918156	contig_19559_pilon	-	4771	14	Intergenic	novelGene_163432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_8	24.6221144646446	191	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	242	1849	94417	79836	FALSE	20	ATGTGTTTCCTGGAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTLPQKESRAPTTCPGPATTQDLGSSCDNGPERECSRKPDQKLYGVGDPTATFSSGSSYLSSRGSIIKWFWDSAEEGYRTYHLDEYDEDKNPSGIVNLGTSENKLCFDLLSWRLSQSDMLRVEPSLLQYPDWRGHLFLREEVARFLSFYCKSPVPLKPENVVVLNGCASLFSALATVLCEVGEAFLIPTPYYGAITQHVYLYGNVRLVYVYLDSEVTGTDTRPFQLTVEKLEMALQGAHSEGVKVKGLILINPQNPLGDIYLPGELQEYLGFAERHKLHVIVDEVYMLSVFEESAAYSSVLGLERLPDPQRTHVMWATSKDFGMSGLRFGTLYTENQDVAIAVASLCRYHGLSGLVQYQMAQLLQDRDWINQVYLPENHARLKAAHTYVSEELRALRIPFLSRGAGFFIWADLRQVMQVKLRGSSKPSSNRWEAEVGQSLPQSQLRPEILPSPQYLSEGTFEEEMLLWRRFLDNKVLLSSGKAFGCKEPGWFRFVFSDKAHRLCLGMQRVRQVLEGKSQVAEDPPSSQTQEPSS	96037	76913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_79925_80050_80465_81870_82013_82126_82173_83811_83902_84589_84691_85656_85735_86258_86357_88369_88437_88896_88967_90108_90180_91357_91418_94135_94418_95796
918157	contig_3832_pilon	-	3946	1	Intergenic	novelGene_161480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAACCAAAAATTGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445880	441934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_441900_445900
918158	contig_10500_pilon	-	1064	4	Intergenic	novelGene_41294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	825.429315905096	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGACAGTGTGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640185	1633135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1633231_1635076_1635617_1636943_1637059_1639871
918159	contig_401_pilon	+	4453	19	Intergenic	novelGene_42921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	497.723136881996	334	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	943	3033	1946658	1973007	TRUE	15	TTTCTTTCCCACCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLKFASILLVVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSQMLDSVEKMLVETSDLSIFCFHLRIFEKMFAMTLEEPTMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLDICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTMKQRQIPRKGEPERDKPGAESHRKNRSVVTTMDKLHLILTELALTMNHVRSFSVFEHTVFPSEYLSSHLEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFVQSLAQFLGADASRVIRSALLQQTQPLDSSGEQTITTLYTNWYLESLLRQASNGAIILAPAMQAFISLPREGEQNFSAEEFSDISEMQALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLMGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIEGLKEFVTPDTDIKVTLSVFELASAAGVSCEIDPALVAAVANLKADTLSPEEEYKVACLLLIFTAVSLPLLATDPASFYNIEKGGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTVYNKNIETHLKEFLVVASVSLLHLGQETDKLKTRNRESISLLMRLVCGGGVILPDPGHAGVLFPLCPASKCLSGGFPHLPPEPGACQYTLKALWAYRNPCHSGSCGHFLKGQ	1944918	1975740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1945598_1946394_1946751_1946936_1947083_1948361_1948495_1948789_1948910_1952093_1952240_1952522_1952655_1955788_1956008_1957517_1957649_1960857_1960956_1961068_1961163_1961320_1961404_1961682_1961764_1964452_1964547_1965467_1965585_1966094_1966205_1968753_1968848_1972807_1973757_1975069
918160	contig_6356_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_126429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTCTTTTGTTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55594	54159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_-_54200_55600
918161	contig_9180_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_109123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAAAGCTAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488523	490016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_488500_490000
918162	contig_9070_pilon	-	2311	13	Intergenic	novelGene_171949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_7	30.8837425768892	57	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	16	1224	192474	125813	FALSE	15	CACACTCCTGTGGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDEEQMKYKLEGKCFSVLGFCRSSQVQRKFFMGNQVLKVFAAKDDEAAAVALSSLIHALDELNMVAIVRYAYDKRANLQVGVAFPHIKDAYECLVYIQLPFMEDLRQYMFSSLKNNKKYTPTEVQLNAVDALIDSMSLVKKDEEEDTIEDLFPTTKIPNPEFQRFFQCLLHRALYPQEPLPPIQQHILNMLDPPTEVTAKSQIALSEIKTLFPLTEAIKKKDQITAQDIFQDNHEEGPDSKKRKTEEGDIHFSISSMTEGSVTSVGSVNPAENFRVLVRQKNASFEEVSHQLISRIEQFLDTNETLYFMKSMDCIKAFREEAIQFSEEQRFNSFLKALQEKVKMKQLNHFWEIVVQDGITLISKDEASGSSVTAEEAKKFLALEEKPDEEAAIYEEGGDVDDLLDMI	192489	124725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9070_pilon_-_125828_126588_126661_136752_136821_138562_138660_140716_140827_164934_165005_166989_167084_175326_175524_179635_179770_182146_182238_183166_183305_188282_188346_192414
918163	contig_7333_pilon	-	1731	3	Intergenic	novelGene_142812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	47	1303	402719	394458	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKSGHPPETCLFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEEAASHSGLVGSDAKTEEPGQEGWQPHGEAEEAMAEKSDSDDMGPEATRVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSCFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	402765	394029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_398208_398401_402523
918164	contig_546_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_117227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145574	143612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_143600_145600
918165	contig_2480_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_63507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGTGGGTAAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125406	123153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_123200_125400
918166	contig_3818_pilon	-	6729	21	Intergenic	novelGene_99213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	4138	4962	237170	229780	TRUE	10	ACCCCAGCGCGCGTGCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGTFKPDAWLEIWARPGRLLANLARPPLVSSWWMAVGFPPGVAPKEERVGATGMVRTIVPAPVVMAPRLCMGVGNFILAACGAGPGEGFAGRPEVLLLMSCKLKLRPWRRLLADVAPGGEVPGEVATKRLWSVCKALGAGLLETAEEAGLPESPPSEEALDLAVVRSPVSSLAPDACPKVMVMGFPPDTSAAPPWEGAHGPPPVSPWERRDTLIFGRLEALLPGRGLEGWCRFSCTLRSSFSASSVCSDEMGTWACLWVSTASVRCMCLLSN	246030	198893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_198921_200370_200641_203416_203588_214702_214795_214927_215113_222298_222433_223287_223403_223643_223746_223853_223928_225283_225360_225537_225695_228732_228796_229273_229476_229680_229840_233547_233740_234191_234276_235040_235168_235978_236094_236607_236831_237146_237281_242003
918167	contig_3394_pilon	-	6443	2	Intergenic	novelGene_152692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGCCGTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468531	461782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_466321_466626
918168	contig_1150_pilon	-	626	3	Intergenic	novelGene_61421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	174158	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311058	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
918169	contig_8259_pilon	-	2888	1	Intergenic	novelGene_148870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	132	446	162537	162223	NA	75	AAAAAAAAAAGAGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNIIADVKWILAESREYEKDVYLCFINYAKAFNCVDHGKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLYRDQEAVVLTEQGDVMWFNVKKGVCQGCVLSPYLVSLYAEQIV	162668	159780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_159800_162700
918170	contig_19098_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_65779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACCAACCAGGCACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44952	46725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_45000_46700
918171	contig_10003_pilon	-	1908	15	Intergenic	novelGene_88156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	993.078474815992	2	63	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1890	17	1906	626149	380687	FALSE	15	AGCCGTGTGAGTACTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQESGTETKSNGSALQNGSSSGNHLLECGGLREGRSNGETPAVDVGAADLAHIQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAGKQPKEVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPIAQGMIPTELQQLWKEVTSAHSAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIINPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFPSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKTAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTTPITPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPITSDIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKISGNPSLIKNMQSSHSYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPM	626165	380684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_380846_385999_386070_387779_387902_391285_391388_391978_392056_392162_392365_402817_402902_416834_416923_430739_430845_460909_461115_466538_466684_472049_472140_473195_473334_531527_531657_625975
918172	contig_3601_pilon	-	3263	1	Intergenic	novelGene_132879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTCTTCTTCCTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167158	163895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_163900_167200
918173	contig_610_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_76676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1297	1602	32436	32131	NA	40	ACAAGCGAATGGCTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTSPHSSLSTLGKGILSLGQRQPHTRKTGLASRMGTACQPSISLCPGTFVLNQPNHTRWHGCKSCGSQSCRHTLQMRKSLSVRIRLPGHFSSGSSSEAK	33732	31535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_31500_33700
918174	contig_15021_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_26936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAGAAAAATATAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201133	202796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_+_201100_202800
918175	contig_12644_pilon	+	5438	7	Intergenic	novelGene_44505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	145	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2311	2613	1079022	1079324	TRUE	55	CTTTCACCTAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIILIVVMVSHLSKIIKLNKTRVPTLTTSIQCCIRSPRQSNKTRKRQGIQIGKEVKLSPFTDDLILCTENSKRVHKKTSRANREIQQSCRAQGQQTKIS	1076711	1169050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1080017_1098936_1099068_1106637_1107428_1107999_1108171_1113355_1114000_1125134_1125300_1168818
918176	contig_9538_pilon	-	399	2	Intergenic	novelGene_176450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGGATTGGCTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28565	28027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28172_28310
918177	contig_8674_pilon	-	1276	1	Intergenic	novelGene_102903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCCAAGTGGATAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168625	167349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_167300_168600
918178	scaffold_9100_pilon	+	3719	1	Intergenic	novelGene_83300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATAAATTTTTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748579	752298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_748600_752300
918179	contig_14687_pilon	+	2706	1	Intergenic	novelGene_107937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATCAGCCAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506725	509431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_506700_509400
918180	contig_8866_pilon	-	2002	2	Intergenic	novelGene_77830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGCTGTAATCTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579546	577476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_577884_577951
918181	contig_11816_pilon	-	2941	2	Intergenic	novelGene_98525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_1	0	29	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTAAATTCCCAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002541	998541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_999335_1000393
918182	contig_3956_pilon	+	2470	14	Intergenic	novelGene_14849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1351.36292367346	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	464	1951	1284120	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYPKHVGHTRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282769_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287518_1289637_1289677_1289758_1289892_1290297
918183	contig_10600_pilon	-	2691	4	Intergenic	novelGene_169874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.381533094402	180	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	328	654	304796	278096	FALSE	50	ACATGGAAAAAACACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAATDPWHLDHLESASADFPYNPGQGQAIRNGVNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTETIEESKREWLI	337964	276058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_-_278296_280312_280394_304750_304991_337831
918184	contig_11816_pilon	+	2896	2	Intergenic	novelGene_98499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATAACCTAGTCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559319	578832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_561716_578332
918185	contig_5715_pilon	-	2173	1	Intergenic	novelGene_127979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625118	622945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_622900_625100
918186	contig_6496_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_103522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGTACTTTACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892938	891134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_891100_892900
918187	contig_6871_pilon	+	2073	4	Intergenic	novelGene_21541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	79	1215	121971	135017	TRUE	55	GCTTTAAAAGAGAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135661_135796
918188	contig_10732_pilon	+	5236	1	Intergenic	novelGene_114707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCCAGCAATGTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119022	124258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_119000_124300
918189	contig_16385_pilon	+	2904	4	Intergenic	novelGene_86201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	219.27760183536	133	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	857	1282	32552	32977	TRUE	10	GTGATTGGGTTTCTTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTFIAREKAIPGLKASKDRLTLLLGANTAGDFKLKPVLIYHSENPRALENCAKSTLPVLYKWNNKAWMTAHLFTTWFTEYFKPPVETNCSEKKIPFKILLLTDSAPGHPRALMEMYKEINVVFMPANTTSILQPMDQE	31600	36830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16385_pilon_+_32189_32283_34324_35622_35680_36611
918190	contig_10377_pilon	-	2756	5	Intergenic	novelGene_115341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_4	13.7386316640341	97	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	26	2353	86758	70985	FALSE	20	TATGTTGTATATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERRGPWICMKNAGLRCGAGRTSPVHTAEDLGRPSCTSVNHREGFQLLWLVCGPNIRSSASKLPQCSASLPFLFLKWLLGLRDDIPFNFQKLEKEMDSVMAEDVAVVFSQEEWALLDVAQRKLYRDVMMETFRNLASVVSLKFNDEEKLSSEHIVVQLMKNNTWSSMLGEVCDQLHGNKDQHKSQGRHMRSPTVENLCESNEDNQCGKSCQTPNLTVMKRNPAEENPFECCECGKVFKDHSSHNYQTRPHTRCNPCQCKEHGKVCSCPSHLRTPLRTLIRKKPHKRKVCEKDVISVSTLKNPVTTLTGEKRYECKECGKDLYRFSSFWTHVRSNQESRECCKTYSRPSSVILHKKSHDRGKPYECKECGKAFSDATSLTQHVRTHCEERAYECKDCGKAFSRTSDFTKHIRTHTGERPYACKECGKAFSSSSYLTTHTRTHSGERPYECKECGKAFSQSSHLTTHRKTHNGQRPYECKECGKAFSFSSSLTQHIRTHSGEKPYKCKQCEKAFTCSSHLTQHIRTHSGERPYECKECGRVFRYSSALAAHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSRSSSLIVHIRTHSGEKPYECKECGKFFRQASDLRTHRRIHSGERPYKCKVCGKAFSQSPHLTIHIKTHNGQKPYECKECGKAFSCSSSLTLHTRTHSGIRPYKCKECGKSFRYSSNLASHIKSHSGEKPYACKECGKVFSYSSGLTTHKRTHSGEMPFECKNCGKVFRQVSHLTSHMRIHSGERPYECMECGKTFRHSSHLTIHRRTHSGEALRV	86783	70581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_72771_73919_74074_75000_75128_86352_86601_86745
918191	contig_9183_pilon	+	3642	8	Intergenic	novelGene_40288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1673	2110	312219	315445	TRUE	0	CCTGCTGCGTCTTCCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFQASSRVMPCMAELASCRISSPGWTVSLCSEAVPLNILLMVRGLSPWSEPFPPSRLKPSPAEVFSRVTVQTSAVESTEASLATEIEAEESVEEFRSGVSSKAGFLVTITACRGSRAWRRMARASVCVAPLRDFPLMDRTSLPF	310546	325966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_+_312324_314769_314891_315233_315491_318242_318533_320559_320727_322743_323226_323383_323834_325868
918192	contig_17829_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_157040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAGAAGGAAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53156	52095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17829_pilon_-_52100_53200
918193	contig_10904_pilon	-	4175	2	Intergenic	novelGene_22750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2429	2749	653700	653380	FALSE	15	TCTCTACTGTTGTTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNIVINGEKIEVVKNFILLRSTIKAHGSSGQEIKRPIVLSKSAAKHLFKVLKNKYVTLTTKVLLTLGMVFSIASYACESWTMNKEDRRRIDAFELWCWRRISNIS	656206	651953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_655092_655169
918194	contig_5300_pilon	-	3762	1	Intergenic	novelGene_144241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTGAAAAAAAAAATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36598	32836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5300_pilon_-_32800_36600
918195	contig_15787_pilon	-	2223	1	Intergenic	novelGene_144000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACAGATACTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119520	117297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_117300_119500
918196	contig_5696_pilon	-	3494	1	Intergenic	novelGene_117542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTCTGTACGGGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650076	646582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_646600_650100
918197	contig_4232_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_63384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAGAAGATAGACGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468139	467243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
918198	contig_13702_pilon	-	3581	2	Intergenic	novelGene_102606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	85	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	565	903	141751	141413	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLRVKVAQLVNVIDVNRLYTCKNTVTYIYNNEQLLRLLMCDQYLMGFGFLVWRFRIMVSWDIIPVNWPIMVFSASVLPSSLLCTAWGLKACKWPSKVQLVFIHLEQQRKEI	149835	138734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_-_142132_149651
918199	contig_10855_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_124339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	509	871	546557	546195	NA	30	GAACTCTTGCAGCTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRDWSFLITCPKYVRRSLTIFASKEHSGCTSSKTDLLVLLAVHGVFNNLRQLHSSKASILLQSSLFIAQLSRAYEAIENTMAWVRHTLVFKVTSLLLNTLNRSFAADLPNAIRCLIS	547065	545686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_545700_547100
918200	contig_4426_pilon	-	1882	7	Intergenic	novelGene_15434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	345	junction_6	672.092007590231	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1794	87	1880	904546	820922	FALSE	65	TAAAGAAAGGGAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTDSDPGHTSENWGERLISSYRTYSEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLK	904632	820919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_895571_895641_904482
918201	contig_11121_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_167056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAGAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73617	71327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_-_71300_73600
918202	contig_15720_pilon	-	4144	1	Intergenic	novelGene_41937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	282	849	633	1481	297062	296214	NA	10	CCTGCCACCCAGCTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCATTNPMQTLQKEAVCAICLDYFKDPVSIGCGHNFCRGCVTQLWGGEDEDRDKEEDEWEEEEEDEAVGATGGWDNSIREVLYRGNANEDFQDQEDEPWVGDGGVRNWDNMNCVWDQEEDEEDRDYYLEGLRHDLRIDVYPEEQERLEEYDDDEELYPDTHLPLPSTPQRQFTCPQCRKNFTRRNFRPNLQLANMVQIIRQMCPTPYRGSQGNDQGTCSKHQEALKLFCEVDKEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVLEYKVRGIRREYWGRWVGGSGE	297694	293550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_293600_297700
918203	contig_6654_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_85775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCACTACAATTACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661721	660292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_660300_661700
918205	contig_3018_pilon	+	3193	1	Intergenic	novelGene_78947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350589	1353782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1350600_1353800
918206	contig_10734_pilon	+	2259	11	Intergenic	novelGene_51181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	424.626059021346	14	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1354	1962	1134427	1142903	FALSE	0	GGTTTTTTGTGTCCGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123688	1143200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127682_1127745_1127956_1128605_1129370_1129449_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662_1140893_1141326_1141417_1142723
918207	contig_7933_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_164658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1084	1395	64955	64644	NA	40	CAGAGAAGTAGAGAGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSVERESPWGCGLHLYISRCSGFFLSLDLAAASCHPISRSWDLSCQLICRTWDSSICTASEWEPCSPTFQSWACQLLQLCDLGEASTLIHGLGTF	66038	63897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_63900_66000
918208	contig_19849_pilon	+	1794	1	Intergenic	novelGene_175459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	200	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	167	568	174	575	NA	15	CCTGGGTATGTTCACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPKYPSTDEWINKLWYVHTIEYYAMRKNNDESVDHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	7	1801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19849_pilon_+_0_1800
918209	contig_15236_pilon	+	2401	1	Intergenic	novelGene_141585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTATTTCTGTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439334	441735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_439300_441700
918211	contig_17144_pilon	-	1518	11	Intergenic	novelGene_29256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	5	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	106	1434	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183187	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
918212	contig_12327_pilon	-	2095	10	Intergenic	novelGene_140655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	312	1783	2094	598918	517603	FALSE	55	AAAGAGAGGAGAGAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMLNTAEPTMVPTPTSPFVMKTPMTDVKSSGAELPAAMNVAPATSSLRCRRYTDLLQRGHEEVITHNGQCVEHVHGTEHMEDHCPLSSVLVTEDVPGELVQG	790156	517601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_517681_594115_594188_598485_598573_598843_598948_708769_708871_732503_732560_738986_739119_740952_741120_741848_741908_788918
918213	SIRV1	-	1570	4	FSM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	-270	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	261	69	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGAATCGATGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10636	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7815_10282
918214	contig_6958_pilon	+	6488	21	Intergenic	novelGene_70015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	94.1973858448312	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1980	5943	393	6335	783058	851948	FALSE	30	GACATTGCAGATGTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWLGGLGSGLGQSLGQVGGSLASLTGQISNFTKDMLMDGTEEVEELPNTRRKEIEAIHAILRSENERLKKVCTDLEEKHEASELQIKQQSTSYRNQLQQKEVEISHLKARQIALQEQLLKLQSATQSVPSGAVQGPSTTALPSFGYGVSHHASAFRDDDMDFGDIISSQQEINRLSNEVSRLESEVGHWRHIAQKTTAQGADSSDQSEICKLQSTIKELKQNRSQDIDVHQHEMSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSDAENEIMKLKSLNQDSSLTEDNLKLEKHVQALEKENSLLSQEKEELHISLLKLNSEYEVIKSTATRDMTLDSELNDLRLNLEAKEQELNQSITENKILVAELEELDKQNQEATKHMILMKDQLSKQQNEGDNMISKLKQDIHDEKKRVHQLEDDKMNITKELGVQREKLIQSELALNDLHLTKQKLEDKIEDLVDQLNKLQKNNLNIQKENFELKEHIRQNEEELSSVRNELTQSLGQDSNSNLKDDLLKEREAEVRNLKQDLSEMEQINETLEKVAFDLKMENEKLVLACEDVRHQLEESLADKSQISLEKDTIVEALKLEKGQLEAELCQAEKRLLEKANKYEQTIEELTNARNLNSSALQLEHEHLIKLSQEKDFEISELKKNIEQVNADHQVSKEVLSSSLEEQKQLTQLIKEKEMFIEKLQGRSSELQDELDKYTQALRKSEISRQTIEEKDRSLASMKEENNHLKEELERLREQQSRATPVAEPKSLDVITELESEVSRLNIIKGDLEEEIKHYQKITEDQNQSEMQLLQSVQEQKKEMDEFKYQHEQMNVTHTQLFLEKDEEIKSLQKTVEQIKTQLHEERQDIQTENSDIFQETKVQSLNIENGSEKHDLSKAETERLVKGIKERELEIKLLNEKNISLTKQIDQLSKDEVGKLTQIIQQKDLEIQALHARISSASYTQDVVYLQQQLQTYAMEREQVLAVLSEKTRENSHLKTEYHKMMDIVAAKEAALIKLQDENKKLSARFESSSQDMFRETVQNLSRIIREKDIEIDALSQKCQTLLTVLQTSSTENAVGSVNSNQFEELLQERDKLKQQVKKMEEWKQQVMTTVQNMQHESAQLQEELHQLQAQVSVDSDNNSKLQVDYTGLIQSYEQNETKLKNFGQELAQVQHSIGQLCNTKDLLLGKLDVISPQLSSGSSLSSPSAEPLRASKSDQLSESSKLLQQEIEELRKSLQEKDATIRTLQENNHRLSDSIAATSELGRREHEQTDSEIKQIKEKQDVLQKLLKEKDLLIKAKSDQLLSLNENFTNKANENELLRQAVTNLKERILILEMDICKLKEENEKIIDASRGKETEYQALQETNMKFSMMLREKEFENHTMKEKALAFEQLLKEKEQGNTGELNQLLNAVKSMQEKTVLFQQERDQVMLALKQKQMENSALQNEVQHLRDKELRLNQELERLRNHLLESEDSYTREALAAEDREAKLRKKVTALEEKLVSSSNAMENASHQASVQVESLQEQLNVVSRQRDETALQLSVSQEQVKQYALSLANLQMVLEHFQQEEKAMYSAELEKQKQLVAEWKKKAENVEGKLISLQERLDEANAALDSASRLTEQLDLKEEQIEELKKHNELQKEMLDDIQKKLMNLVNSTEGRVDKVLMRNLFVGHFHTPKSQRHEVLRLMGSILGIKREEMEQLLNEDQGGVTRWMTGWLGGGSKSVPNTPLRPNQPSVFNSSFSELFVKFLETESHPSVPPPKLSVHDMKPLDSPGMRKLATNEPESFKEATGSRTSRRTDVNPFLAPRSAAVPLVNPAGLGTGGSGHLLLKPISDVLPTFTPLPVSPDNSAGVVLKDLLKQ	782665	852101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_786736_786796_792713_792825_797530_797810_799938_800008_801481_801648_802350_802717_805686_805728_806275_806363_808034_808248_808852_811883_814160_814302_814837_815032_817770_817935_820207_820312_832175_832276_846518_846601_847331_847447_847888_848006_849084_849230_851727
918215	contig_10134_pilon	-	2167	4	Intergenic	novelGene_16194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	693.05892005418	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTCTAAAATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39342	32180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33125_33546_33731_34922_35178_38558
918216	contig_11071_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_131038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181537	180681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_-_180700_181500
918217	contig_8594_pilon	-	3317	8	Intergenic	novelGene_140003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	970	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	183	488	188273	187968	TRUE	5	TGCCCGGCCCGGACGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGEAMGWGNVAVETAFLGFPASFWLVLTGGVNKLLMEVIGDKGCGLALLAFDNDAIVLLKTGLGSWAETVPVELTRTDVKEEFTFAVCGRDEQSCSVPFC	188455	82789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_82801_106424_106625_124863_126283_136958_137034_175833_175947_180553_180682_184914_185098_187267
918218	contig_2636_pilon	-	3192	2	Intergenic	novelGene_52085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	150	junction_1	0	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	123	299	85555	62451	FALSE	35	ATGGTCAAGAAGTCATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPKEKTSPYQRNPGFPKQLLASLLILLLLLAISFFIAFMRKGWGCCPENWIVSNTSCYFISFKFSNWTNSEKNCIGMGAHLLVINTKEEQVLSNRP	85677	59557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_62624_85551
918219	contig_753_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_112890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	127	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243585	241150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_241200_243600
918220	contig_17344_pilon	-	4369	1	Intergenic	novelGene_169586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2024	2353	54272	53943	NA	35	TATTTGAAATAGCAGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYSLVLSERLPLGLCTGSAHAQLSVLELPFFAMLSIICYDPHSQMPCIVNKTQVNIFLVFPAFSQDPSDTSSSESGLNFWQFPVDVLLQAFLNYLQQILLACDINDIV	56295	51926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_-_51900_56300
918221	contig_11396_pilon	-	2541	19	Intergenic	novelGene_71260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	194.315679586937	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	822	2469	6	2474	147912	121478	FALSE	10	GATGGGGAGGTTCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREHWIQDAEECDKAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHSALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENNEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVLGNLAAAQELCEEALKHYEDFPKLWMMKGQIEEQEELVEKAREAYSQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKVGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAVFLEARPQRKTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSERKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCENAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGEVLVLVAARIKNTF	147917	121410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121631_122169_122297_124392_124508_125485_125578_126107_126242_127268_127446_127615_127736_128716_128856_130392_130515_133875_133999_137866_138086_138974_139094_142751_142915_143648_143806_144196_144268_146250_146407_146608_146786_147254_147334_147886
918222	contig_5231_pilon	-	3013	2	Intergenic	novelGene_65881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCAGTTATCCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118068	114766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_-_115259_115547
918223	contig_2054_pilon	-	3409	1	Intergenic	novelGene_51681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1050	1349	104840	104541	NA	60	AAAGTAGAAAGATAGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCIATKSVAHRILETNRCVPLKASSPVSCIRLLKLFRRRDFGRTFGERHYWLNCGEQHTLKAAQSATIFKLGTAVCFLLESEFYGQQPLFTTAITELF	105889	102480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_102500_105900
918224	contig_10749_pilon	-	1307	6	Intergenic	novelGene_133464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1060.5197593633	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	162	821	151884	145071	FALSE	60	TGATTAAAAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGMDTSVCVSVRCSARQRPAPRSQVDFCLKQTSLPSILLV	152045	144584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150788_151767
918225	contig_1244_pilon	+	3043	2	Intergenic	novelGene_38085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTCAGTTGGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565854	1569154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1566446_1566702
918226	contig_18162_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_122337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTCCAAATTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13553	11205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_11200_13600
918227	contig_7088_pilon	+	6666	1	Intergenic	novelGene_159802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	203	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720050	726716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_720000_726700
918228	contig_16067_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_169852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAATTAAACAGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87931	86146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_-_86100_87900
918229	contig_6479_pilon	+	3418	10	Intergenic	novelGene_160598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	271.676686931769	79	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	186	1181	61059	99234	FALSE	20	TTTGCTATCATTTTGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCIKVNGKLFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAVTCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQEDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVANEASKKKVDVIDLTIESSSDEEEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSPHESITHVSSSSSRSETGVITSSGSNIPDIISLD	48107	101471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_48149_58805_58941_61049_61156_62614_62689_69188_69350_76384_76519_77983_78156_87951_88092_96306_96345_99054
918230	contig_3602_pilon	+	1903	2	Intergenic	novelGene_60527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1401	1703	181470	181772	TRUE	15	CTGCAAGTCTCCGCGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQAKKRRGLPGTTRSWKRPGRILPWSLQRERGGPAAPGFWTPSLQNCETINFCCLKPPWEINTSGVCTPHPFICWSSKSPSPEPVPTLSTFYKPCRVS	180069	182849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_181938_182814
918231	contig_14142_pilon	-	1967	10	Intergenic	novelGene_120470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	22.6655773158711	116	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	301	1134	259646	248094	TRUE	25	ACGATACTAGAGTCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYSGASVSVSLSAWPAAAGRTRFTSGMHSLGSSGLPFAPTTTWMN	259946	246247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_246759_246903_247008_247199_247410_247970_248104_248210_248334_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
918232	contig_19342_pilon	-	2374	4	Intergenic	novelGene_41135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	174	524	10622	10272	TRUE	25	GATGGTGGACTCTGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYWKTTSYNSIRQGIKNGTVRQQTSSSNFTKERRENQDQLQPKADSCEVGVKYTSVLQLFTNSDTSHPSHGTVYFSPGFINSLQWPQNSRTILMIMQFIKEVKGYTQSGSGSGSI	10795	5424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_5541_6135_6184_6351_6466_8699
918233	contig_15888_pilon	+	4044	1	Intergenic	novelGene_84463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	3289	3762	592906	593379	NA	25	CACAAATAGCTTCTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGEPPAWVCGIQAAGASRSRDRGRRKQRNKRTKAPGSHQHGSPDQEAAAHWNGDPQEEAKMALGARHSSKRSGRQREASEKSKEAGKKKSNTSSQQMAPREPPAWVCGIQAAGASQSRDCGRGKQRSPSRGEEGWGGGKAHTANYRLFCLPLDTL	589617	593661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15888_pilon_+_589600_593700
918234	contig_9982_pilon	+	2094	5	Intergenic	novelGene_55751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	174	junction_4	70.5704435298518	21	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	426	1610	327980	338154	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQGKTSWKIPAS	327554	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965
918235	contig_9609_pilon	-	3047	7	Intergenic	novelGene_23026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGCTTTTTCTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326364	320966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321038_321844_321907_322283_322351_322601_324070_324250_324327_324406_324476_325130
918236	contig_16125_pilon	-	4217	5	Intergenic	novelGene_155264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	996.321829280078	3	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	54	1493	236934	152973	TRUE	25	TCCAGGTCACTCATCACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKTCMSYIFYQDMFLLR	236987	147462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_148943_151728_153054_155553_155618_179440_179598_235796
918237	contig_11505_pilon	-	1941	1	Intergenic	novelGene_140919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCATGTGAGGAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51259	49318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_49300_51300
918238	contig_14711_pilon	+	2420	11	Intergenic	novelGene_68901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	366.323299832266	5	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	631	2037	86227	90430	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQVKIFCLLPLWAGFYLLPMVRSLSCSLLPYPTPCPDSSHLGHAHLGLSFLCTSTLTSLPHPSVNFSQLLGSCSSSRLAS	70428	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_70468_84788_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032
918239	contig_7322_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_164910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197322	198667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_197300_198700
918241	contig_15353_pilon	-	3680	1	Intergenic	novelGene_151992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAATCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537923	534243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_-_534200_537900
918242	contig_5643_pilon	+	1172	12	Intergenic	novelGene_38830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	2515.80120816575	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	65	1000	233973	237822	FALSE	15	ACCTCTTTGTTGATTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233610	238194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237823_238022
918243	contig_8552_pilon	+	4229	1	Intergenic	novelGene_80071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGTTAAGAATAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440285	444514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_440300_444500
918244	contig_5999_pilon	-	1713	10	Intergenic	novelGene_45627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	181.710392291323	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	83	1093	182154	163332	FALSE	25	GAGTAGGGAGACGAGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFETEGFFALHHRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCQQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAVNSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEHICREGPVEIGLPRSMKEETKLPYLPTPGKREPQGISWESPMDGMDKTCHLPEPEMNIERPSLRIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKVWPLLGQPFPLPLTQ	191382	162711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_163554_167255_167417_168956_169075_169873_169984_175793_175924_180637_180724_180817_180850_182002_182166_188158_188190_191342
918245	contig_14357_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_121663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479832	482147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_479800_482100
918247	contig_3465_pilon	+	3568	3	Intergenic	novelGene_173388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACTAATTACTAATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426813	699143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_428468_697155_697242_697315
918248	contig_4105_pilon	-	2220	4	Intergenic	novelGene_21450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTACATCACTTTGGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16935	3230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_3670_5577_5999_15521_16772_16825
918249	contig_2365_pilon	-	2847	2	Intergenic	novelGene_103766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	262	678	294709	294293	TRUE	65	CTAAAAACAAAACCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQLQGASSKRQNNSNQQYTLSYPPTFFTPTWPPLLPVATVSWPGSTKFTPVPAGFHPPTLASSLSAICWLQALLFSAFLGFFPTSHHLFFLSLKYLAPNAIFASSWKAVKHCSTVELLLELCHHADGIPRAFVCLF	294970	291983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_-_293918_294057
918250	contig_854_pilon	+	4359	25	Intergenic	novelGene_36480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	3211.66153752185	27	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1189	3570	179	3748	1649514	1715383	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612767	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680863_1701227_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
918252	contig_5947_pilon	-	2302	13	Intergenic	novelGene_101555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	29.4901113369663	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	458	1624	625417	615871	FALSE	35	AAAAAATGTAGTGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTCNHALYAICDVFTQFYEALNEVLLSDVFAQLQWCVKQDNEQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPGVWDETCSCMLDIFKTTIPHILLTWRPVGMEEDSSEKHLDMDLDRQSSSSIDKNASERGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQKLFASLLIKCVVQLELIQAIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDAEIHIETEDQGMYKYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCLRILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKINDEKFKAHASMYYPYLCEMMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWTPEEPSQLPGTLSAVW	631719	615192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_616048_616415_616534_618097_618237_619910_620080_621279_621411_622981_623097_624139_624195_624301_624441_625293_625430_628127_628254_628401_628533_630200_630362_631692
918253	contig_2703_pilon	+	2411	9	Intergenic	novelGene_101835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_3	51.6343817141253	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	78	467	1256056	1298468	TRUE	30	AAAATCCATCTGTTTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AARLLPVARFARISRSVPPGAGAPAMTASPAAMRVFLEVRRRLQSALLILGEPKEGDMPVDISVMPSSLQMRTPGSCTELWFPAEVRLVPSSCRGLQYVAGDGLHLRLQTQAELSTKPLSLFTQSPQVQECCTFYCQSCGEVIIRDRNQRQIPK	1255978	1422773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1256133_1276412_1276610_1278881_1278973_1298443_1298514_1305353_1305424_1306570_1306680_1311292_1311457_1362117_1362257_1421356
918254	contig_16125_pilon	-	297	1	Intergenic	novelGene_155286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGCAACGCTGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177837	177540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_177500_177800
918255	contig_6361_pilon	-	5946	13	Intergenic	novelGene_23906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4577.09068805357	36711	192	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	4533	4913	163962	163582	FALSE	40	GAGTTAGAATACTGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDRFQQSFQTKTDWEEGPGDLCLKKLASENLINSSETLSDIDPEDEPLRLESTQKTTSQSRVNLNDMDRAKLSGPSFADVVQFRMRRNSCKHPLIIGTWNVRSMSLGKLEVVRNEMECLKTDPRH	496323	162548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_164062_233696_233907_250118_250300_255041_255486_255564_255837_283438_283804_380557_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
918256	contig_17274_pilon	-	3539	4	Intergenic	novelGene_26465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1245	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTGCTCTCCTCAGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33214	6977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_7084_26182_26360_27831_28000_30126
918257	contig_5350_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_99351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	557	1012	173658	174113	NA	50	ATTTATAAAGATAACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIMGCTGEVTRYNSSSGTLRVQFFHQNSLFPAVLAGTLLWPSASALLGHVLQSSFSSVSKCPKAFYSASKPPAQVHSAFLLCGPEGPPRSLLSSFLCHHFLSSLSLSLSFSPGSRSFSAQESQFQRTCSPLLAVLLWWWWDPLSALELALF	173101	174821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_173100_174800
918258	contig_19342_pilon	+	1298	6	Intergenic	novelGene_41080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.57681974534502	4	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	22	606	3263	5037	TRUE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRAQIPQRHM	3241	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4365_5016_5059_5960_5994_6139
918259	contig_16594_pilon	-	3955	9	Intergenic	novelGene_53806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3108.64793509574	2	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	196	717	135431	121101	TRUE	30	CCTAATAAAACTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	149290	115146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115991_116096_117401_117478_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135551_149214
918260	contig_4659_pilon	+	619	3	Intergenic	novelGene_118200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	1	85	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187667	190445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_187964_188123_188199_190197
918261	contig_17964_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_33887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGACCCTGTCTGTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162571	160605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_160600_162600
918262	contig_13612_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_157303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCATGTTCTGCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72302	71543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_71500_72300
918263	contig_10722_pilon	-	2837	9	Intergenic	novelGene_70981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_5	240.176985523176	2	155	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	2386	2835	6730	5733	FALSE	15	GTGCGTGTACACAGCTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYN	17343	5730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_5843_6185_6328_6423_6529_6637_8562_9665_9787_14372_14446_16247_16358_16853_16929_17168
918264	contig_10861_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_39209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTTTTATTTGAGACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439618	438338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_438300_439600
918265	contig_3900_pilon	+	6327	3	Intergenic	novelGene_84198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531987	540329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_534948_536103_537306_538164
918266	contig_15105_pilon	-	4347	3	Intergenic	novelGene_151004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	977.5	316	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	37	516	839916	836135	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRGQSVNALFQYIPFCSDL	839952	827912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_830670_835060_836548_839849
918268	contig_817_pilon	-	2394	1	Intergenic	novelGene_132471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	805	1131	677459	677133	NA	65	AAAAAAAAACTGACACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQKNKQICLGRSTARVLLRSENEETDTRLTHCGRVIRSDQSLEMDIMLGKVDGQRKRGRPSVRWIDTVAATTSSSITIIVRMAQHWAVFCSIARKVTMRWDHFDSP	678263	675869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_675900_678300
918269	contig_13224_pilon	+	1645	7	Intergenic	novelGene_104108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_6	40.9539036261774	15	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	248	1231	291364	302288	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYRLLSIVRQQRVSPGWQNWPSARSSTSAAEAHSIALPAQAQVVICGGGIMGTSVAYHLSKLGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLCHQLEQETGIQTGYVRTGSISLAQTQDRLISLKRINSRLNVMGIPSEIISPKKVAELHPLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALALASAASQNGVQIYDRTTVLHVIVKKDQVTGVETDKGQIDCQYFVNCAGQLLWMLMGGFIFGTGRVASCLGALRRTRNQFSLRARTSWRFRIYRKTGITSVCELDYNNNALYLCKISYFQSILKNRWLQWTFCSG	283430	302702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_283616_291301_291588_293361_293496_299267_299350_299443_299608_300338_300461_302030
918270	contig_2069_pilon	+	614	1	Intergenic	novelGene_23361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGTCAAGATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950448	951062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_950400_951100
918271	contig_1759_pilon	+	7034	3	Intergenic	novelGene_171328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	146	499	36966	37531	TRUE	25	TGCCCTAGAGGAGCTAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLHIKSKTIRIMEEKIGTTLGALIHGRNTIQTISNDAQAPEERLDKCKLLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYNKSDQHLVSQIYKILQNLNSKKTNNPIKKWAKDMNRHFGNQFGASLKSGK	36820	93822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_37281_37492_37717_87472
918272	contig_7340_pilon	-	2785	2	Intergenic	novelGene_159886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1483	1857	61424	61050	TRUE	15	TGCGCAGACAGCCGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFSPTNYLVPVIFGVQQPDGSHRNREECIHVVQRFPYFLVLKKDSMDCNVRLYRANLDRRREDAVFTSTLMLITVVSDRGPLKSMFMFLMYFLYLMFLALCLLASYSKRGAQEWLLSFFFCQK	62906	11467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_-_11524_60177
918273	contig_5917_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_122170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAACAGGGAGAGGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722695	725404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_722700_725400
918274	contig_11316_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_122595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAGAGCCATAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138727	136895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_136900_138700
918275	contig_9235_pilon	+	2658	3	Intergenic	novelGene_156223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	355	1503	45805	46953	TRUE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45052	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_47082_47294
918276	contig_11574_pilon	-	2810	10	Intergenic	novelGene_64075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_9	224.605552738546	207	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	705	2132	454111	449890	FALSE	25	GATGAGCTGTTTTAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463700	449211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454889_456384_456540_462651_462686_463675
918277	contig_2988_pilon	+	1655	13	Intergenic	novelGene_136535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_8	65.2569706791713	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	12	1115	22702	170354	FALSE	40	TTTTCATTTCCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVLMPFAFFFLESEGFAGLKKGLRARILETLVMLILLALLILGIVWVASALIDNDAASMESLYDLWEFYLPYLYSCISLMGCLLLLLCTPVGLSRMFTVMGQLLVKPTILEDLDEQIYIITLEEEALQRRLNGLSSSVEYNIMKLERELENVKTLKTKLERRKKASAWERNLVYPAVMVLLLIETSISVLLVACNILCLLVDETAMPKGTRGPGIGNASLSTFGFVGAALEIILIFYLMVSSVVGFYSLRVFGNFTPKKDDTTMTKIIGNCVSILVLSSALPVMSRTLGITRFDLLGDFGRFNWLGNFYIVLSYNLLFAIVTTLCLVRKFTSAVREELFKALGLHKLHLSNTPRDSETTKPSANGHQKTL	22690	170894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_+_22756_72320_72448_73194_73264_74216_74282_77024_77098_111693_111775_116385_116463_117111_117190_120549_120624_120865_120957_122408_122476_167987_168150_170268
918278	contig_9976_pilon	-	1632	2	Intergenic	novelGene_147909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATCAAAATATTACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115474	94966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_-_96171_115046
918279	contig_2043_pilon	-	3675	1	Intergenic	novelGene_169927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGACCATGGACTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811423	807748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_807700_811400
918280	contig_6048_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_73338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	211	624	2841369	2840956	NA	45	AGGGGTAAATATTAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKISIQDVHQTPQKADPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILRVARDKRKVIYKGKSIRLGSGYSAETMQARRQWEDIYKALKEKNFQPRIIYPAKLSLKYDGKIRAFPDKQKFKEFEKNQRKLQEILKGVLQLENQ	2841579	2840710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2840700_2841600
918281	contig_16622_pilon	-	4568	12	Intergenic	novelGene_48409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_6	37.1590283569115	160	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2265	63	2327	36525	10351	FALSE	25	CCGTATGAGACTGTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNNFLVWHRTFRVGKPDVSAMGKRGSRSQSQLLNTLTKKQKKHLRDFGEEHPFYDRVSRKETKPQICQLSESSDTSDSESEADSEPEQVSGYCKLLATLKDISEEEEDDEEEEEEIIDEEPEMSGEDGDGDVGVEEEMAAESADMQENMALYTDCQEKGREGPPGKSQQASPEEFTDAKHESLFSLETNFLQEESGGSCSLKVSQDPFLQHVNKELKDKDVQAVGTNPKTTHQLKWPTLGQLVFSSKFQKLETFKPSKDIDLKSLHLQKPLESTWTKTNSQFLSGPQKSSSPFTPLQKELFLIMNSYRDLFYSERTALKNGEEIRHVYCLHALNHVLKANARVLGNNSRRRSQKLGVGDDDDFRDQGLTRPKVLIVLPFREAALRVVQLFISLLEGDSKKKIIVSNKKRFKGEYGSDPEERPPNLKRPEDYEAVFVGNIDDHFRIGVAILQRSIRLYAPFYSSDILIASPLGLRTIIGGEGEKKRDFDFLSSIELLIIDQADIYLMQNWEHVLHLMSHMNLLPLDSHGVDFSRVRMWSLNNWSKYYRQTLLFGALQDAQINSLFNKHCINLQGQVAVRNVPMTGSISHVLVQLPHVFQRMEAENVASVIDARFNFFVNKILPQYRDAVMSHTLIYVPSYFDFVRLRNYFKKEELNFTHICEYTKKSGVSRARQFFLQGEKQFLLLTERFHFYKRYTIKGIRNLIFYELPTYPHFYSEICNMLKATNRGEEATWTCTVLYSKYDAQRLAAVVGVERAAQMLQSKKNVHLFITGEK	36587	8109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_10595_20458_20705_21421_21535_21626_21810_23051_23255_24982_25203_26916_27328_29219_29309_30446_30621_34653_34889_35617_35658_36418
918282	contig_10286_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_98394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAGCATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377191	375849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_375800_377200
918283	contig_2703_pilon	+	2179	16	Intergenic	novelGene_101734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1127.52007915109	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	606	1361	584486	610870	TRUE	30	AAAGTTTGGTGTCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526213	611747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564194_578015_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756_611293_611351
918284	contig_10225_pilon	+	2101	15	Intergenic	novelGene_86781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	555.123207504608	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	105	1106	20776	42680	TRUE	25	GACTTGACTTTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20671	47757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46546_46754_46812_47395
918285	contig_3155_pilon	+	1623	5	Intergenic	novelGene_26379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	64	570	258156	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258092	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261565_261832
918286	contig_20293_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_153542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCAGCACCATTTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	141301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_141300_143700
918287	contig_3147_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_142272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCATGTGTCTCTGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70909	72864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_70900_72900
918288	contig_7396_pilon	-	2015	9	Intergenic	novelGene_79549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4358.1330220061	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	425	736	248211	246385	FALSE	25	ATTATTTATGTATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257083	245105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248283_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
918289	contig_13348_pilon	-	3377	9	Intergenic	novelGene_162679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_4	92.5485514473349	61	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	1630	3078	106149	41552	FALSE	15	CCATTTACAGTGTTGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDELVHDLASALEQTSEQNKLGELWEEMALSPRQQRRQLRKRRGRKRRSDFTHLAEHTCCYSEASESSLDEAIKDCREVAPVTNFSDSDDTMVARRHPALNTIVKSKQHSWHESDSFTENAPCRPLRRRRKVKRVTSEVAASLQQKLKVSDWSYERGCRFKSAKKQRLSRWKENTPWTSSGHGLCESAENRTFLSKTGRKERMECEADEQKQGSDENMSECETSSVCSSSDPGLFTNDEGRQGDDEQSDWFYEGECVTGFTVPNLLPKWAPDHCSEVERMDSGLDKLSDSTFLLPSRPAQRGYHARLNRLPGAAARCLRKGRRRLIGKETSISTLGTERIGHIISDPRQKEKNKALASAFPHISTCAHEFNPLSPFYSLDVLADASHRRCSPAHCSARQASIHLGPPCSRDVKRKRKPVATASLSSPNAVHTDTMEPATPASQVQKSPNSEWLIRTSAAEKATDSTTATFFKMPQEKSPGYG	107778	41252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_41713_58224_58320_71496_71583_74021_74077_81903_81972_84730_84811_86601_86779_92543_92609_105487
918290	contig_3472_pilon	+	2935	1	Intergenic	novelGene_166953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992386	995321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_992400_995300
918291	contig_14925_pilon	-	3411	1	Intergenic	novelGene_55230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATTTTCATGAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46559	43148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_43100_46600
918293	contig_8106_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_139734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	350	661	77412	77101	NA	40	TAGACCTATAACTAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLNWFSSLASLKGADASASCSKEGTADPWCEGAIEICNISLLIDQVLVRGEALGDCMFDTFLQFCQNEKYEEASWLVLLLLDKVEKETCSGFRVKAQALHK	77761	75595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_75600_77800
918294	contig_3241_pilon	-	1781	2	Intergenic	novelGene_146387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTCTCAATAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753366	751430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_751844_751998
918295	contig_9895_pilon	+	3031	1	Intergenic	novelGene_144685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	720	1043	113474	113797	NA	80	AAAAAATGAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEGGEEAADRKFEASRHQFVRFKERNCLYNIKVQGEAARADEEAAASYPEDLAKVIDEGGYTKEKIFSVDETALYLKILPPRSFIAREEMSVPSFRDSKDRLTLV	112754	115785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_112800_115800
918296	contig_10569_pilon	-	4854	1	Intergenic	novelGene_44083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCTGCCTCCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349943	345089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_345100_349900
918297	contig_4803_pilon	-	1089	1	Intergenic	novelGene_150731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84130	83041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_83000_84100
918298	contig_16525_pilon	-	2018	3	Intergenic	novelGene_133809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGCAAGAACTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93784	91498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_92306_92507_92862_92927
918299	contig_15135_pilon	-	2241	2	Intergenic	novelGene_119864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAATCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50323	47944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_48614_48751
918300	contig_7411_pilon	-	2536	1	Intergenic	novelGene_136970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTATGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103637	101101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_101100_103600
918301	contig_1694_pilon	+	3853	2	Intergenic	novelGene_144974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	110	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATGCCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600877	1609625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1604661_1609555
918302	contig_10451_pilon	-	2335	16	Intergenic	novelGene_138340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	39.7533506624145	163	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	23	2002	641834	595576	FALSE	50	TACTTAAATAAAATCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLTQNEMVFKRLHLGTVSYGTDTMDEIQNHVITSYSQTQSQASGNNASSTPPRKAQSSAPKVRRSVSSRIHEAVKAIALCHNVTPVYESRAAGAGETEYAEVDQDFSDENRTYQASSPDEVALVQWTESVGLTLVSRDLTSMQLKTPSGQILTYHVLQVFPFTSENKRMGIVVRDESTAEITFYMKGADVAMSTIVQYNDWLEEECGNMAREGLRTLVVAKKSLTEEQYQDFESRYSQAKLSLHDRALKVAAVVESLEREMELLCLTGVEDQLQADVRPTLEMLRNAGIKIWMLTGDKLETATCIAKSSHLVSRTQDIHVFRPVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVIAGDSLEVCLKYYEHEFVELACQCPAVVCCRCSPTQKAHIVKLLQQHTGRRTCAVGDGGNDVSMIQAADCGIGIDGKEGKQASLAADFSITQFKHIGRLLMVHGRNSYKRSAALGQFVMHRGLIISTMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLMVGYATIYTMFPVFSLVLDQDVKPETALLYPELYKDLTKGRSLSFKTFLIWVLISIYQGGILMYGALVLFESEFVHVVAISFTALILTELLMVALTIRTWHWLMVVAEFLSLGCYLASLAFLNEYFDVAFITTVTFLWKVSAITVVSCLPLYILKYLKRKLSPPSYSKLTS	641856	595242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_595713_597936_598141_598859_598918_599337_599447_602968_603034_603399_603556_604606_604672_605240_605386_615769_615860_617641_617741_618573_618745_619004_619089_623335_623429_624399_624562_637520_637770_641741
918303	contig_10345_pilon	-	3225	5	Intergenic	novelGene_158382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2596	3003	14228	12955	FALSE	20	TGCTTCATCATCAGTGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRSSSASNWAGVFNRAKATSSRWPLRAFFRASSRGFPFSWRYAALICWRCALFLLVKMSMMVASSTPGNKKQKAISRIWCIMVACMCCYDAGSYVQGISKPAGVSHGDRFQQGFQTKIDWEERSADPLAKVSQ	19593	12732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_13251_14116_14231_14652_14745_16895_16975_17171
918304	contig_5461_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_156835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAACAGACTCAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804736	804171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_804200_804700
918305	contig_2703_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_101673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTATGTTGTTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167935	166874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_166900_167900
918306	contig_12543_pilon	+	1648	1	Intergenic	novelGene_168391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTTGTAGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403677	405325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_403700_405300
918307	contig_2798_pilon	+	6804	1	Intergenic	novelGene_120037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	799	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	5399	5776	132966	133343	NA	45	TTCAACTGAAATTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPYSGRRLCRTFTAREKSMRGFKTSKSRLTFLLGANAAGEFQLKSMLIKHSESSRALKNYAKSTLPMLYKWNSKAWMIAYLFTTWLTEYFKPVVENYCSGKKKKRFLQKYYCSLTKHLVTQEL	127567	134371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_127600_134400
918308	contig_10451_pilon	-	2390	17	Intergenic	novelGene_138339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_6	39.0311874499099	173	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	670	2013	23	2035	641834	595576	FALSE	30	GTACGTCCAACATCTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLTQNEMVFKRLHLGTVSYGTDTMDEIQNHVITSYSQTQSQASGNNASSTPPRKAQSSAPKVRRSVSSRIHEAVKAIALCHNVTPVYESRAAGAGETEYAEVDQDFSDENRTYQASSPDEVALVQWTESVGLTLVSRDLTSMQLKTPSGQILTYHVLQVFPFTSENKRMGIVVRDESTAEITFYMKGADVAMSTIVQYNDWLEEECGNMAREGLRTLVVAKKSLTEEQYQDFESRYSQAKLSLHDRALKVAAVVESLEREMELLCLTGVEDQLQADVRPTLEMLRNAGIKIWMLTGDKLETATCIAKSSHLVSRTQDIHVFRPVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVIAGDSLEVCLKYYEHEFVELACQCPAVVCCRCSPTQKAHIVKLLQQHTGRRTCAVGDGGNDVSMIQAADCGIGIDGKEGKQASLAADFSITQFKHIGRLLMVHGRNSYKRSAALGQFVMHRGLIISTMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLMVGYATIYTMFPVFSLVLDQDVKPETALLYPELYKDLTKGRSLSFKTFLIWVLISIYQGGILMYGALVLFESEFVHVVAISFTALILTELLMVALTIRTWHWLMVVAEFLSLGCYLASLAFLNEYFGIGRVSFGAFLDVAFITTVTFLWKVSAITVVSCLPLYILKYLKRKLSPPSYSKLTS	641856	595220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_595713_596809_596843_597936_598141_598859_598918_599337_599447_602968_603034_603399_603556_604606_604672_605240_605386_615769_615860_617641_617741_618573_618745_619004_619089_623335_623429_624399_624562_637520_637770_641741
918309	contig_8691_pilon	+	1905	1	Intergenic	novelGene_72693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150319	152224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_150300_152200
918310	contig_5338_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_114566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGTTCAGGCCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353139	352101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5338_pilon_-_352100_353100
918311	contig_6635_pilon	+	1964	7	Intergenic	novelGene_127021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_6	23.8607068908977	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	70	1134	454257	494250	FALSE	70	AAAAAAAAATTTAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGKLKVKIVAGRHLPVMDRASDLTDAFVEVKFGNTTFKTDVYHKSLNPQWNSEWFKFEVDDEDLQDEPLQITVLDHDTYSANDAIGKVYIDIDPLLYSEAATVISGWFPIYDTIHGIRGEINVVVKVDLFNDLNRFRQSSCGVKFFCTTSIPKCYKAVIIHGFVEELVVNEDPEYQWIDRIRTPRASNEARQRLISLMSGELQRKIGLKVLEMRGNAVVGYLQCFDLEGESGLVVRAIGTACTLDKLSSPAAFLPACNSPSKEMKEIPFSEDPNPNTHSSGPSTPLKNQTYSFSPSKSYSRQSSSSDTDLSLTPKTGKALPSTLFIYFFFFQICFCFLLAFHPSLSSCFWHLS	454187	495080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_454347_464448_464536_467028_467201_470250_470347_471537_471694_488730_488930_493985
918313	contig_18231_pilon	+	4459	1	Intergenic	novelGene_105896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	2605	2931	303229	303555	NA	25	CCCCCCACAAAGTGCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSYCLCRLEIAGSEVRLFFHFLNKNKGINKQKKPNPLLLSRIRLSDPIGQSRTAPWIFQRAPGGFELPTFWLATTALNHYATRVSKQRTRFSQSHVLRHTSRNVKIP	300624	305083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_+_300600_305100
918314	contig_2069_pilon	-	3800	13	Intergenic	novelGene_23574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_5	44.2652986736413	120	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	28	1743	2355156	2322408	FALSE	20	CCAACCTTTCGGTTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRESNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVISRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKVYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATVTRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFSEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLLKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV	2355183	2320350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2322570_2323290_2323468_2323821_2323936_2327485_2327579_2331938_2332146_2334824_2335011_2338434_2338624_2339359_2339510_2345269_2345354_2346426_2346529_2349531_2349643_2349812_2349908_2355110
918315	contig_16999_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_84995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	747	1121	159770	159396	NA	35	AAATGACAGATTTTGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFIIAKRWKQHRCPSTDEWINRLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKDCMRPLL	160516	158210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_158200_160500
918316	contig_3789_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_79860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAAAAAAAAAAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462048	463348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_462000_463300
918317	contig_6506_pilon	-	3135	2	Intergenic	novelGene_153483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAAAGAGAGGTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108194	104167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6506_pilon_-_107032_107923
918319	contig_7753_pilon	+	7124	24	Intergenic	novelGene_41497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	26.1012279802962	1037	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	409	582	1212662	1214539	TRUE	15	GCGGAGCCGGGCAGCGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEGSRGGPTCSGVDGRQDLSPNSRGCNFPEYELPELNTRAFHVGAFGELWRGRLRGADDLSLKEPPAPALPGLRGGDDSAREDAAVARDLGCSLEAAAELRTVCGLDKLKCLEEGEDPEVIPEDTDLVTLGVRKRLMEHREETITIDRVCRQETFAYEMESHAIGKRPENPADLVEEGGAYPISEYLVPCYIS	1200587	1266781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1200902_1202990_1203069_1212645_1212731_1214434_1214541_1216129_1216280_1219540_1219624_1220010_1220176_1223526_1223635_1225071_1225689_1226403_1230229_1231005_1231117_1232452_1232669_1233234_1233336_1233553_1233626_1234220_1234276_1236888_1237011_1237957_1238184_1240519_1240597_1241690_1241787_1243638_1243702_1244401_1244510_1248048_1248186_1263202_1263277_1266646
918320	contig_13800_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_153733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	950	1351	143980	144381	NA	45	TTAAATCTACGATCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSPYQLLHHGSTILDSYRRSANREYEKAASRSFQQETEQPVTSNIRFPTPHSSSPPLGLLCFLCPQSLGREAPASPWCCLDSTHPCWPALSAVCWLLVLLFSASLDFFLTSHHLPRVSLKYLALCAIFASS	143030	145193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_143000_145200
918321	contig_4213_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_124778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAATACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_0_2100
918322	SIRV1	-	1553	4	FSM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	-270	17	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	144	85	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGACGTAGAGGCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10636	1023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7815_10282
918323	contig_11337_pilon	-	3183	1	Intergenic	novelGene_107208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGGTTATATTAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371552	368369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_368400_371600
918324	contig_17144_pilon	-	1900	2	Intergenic	novelGene_29142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAATTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75657	71873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_72241_74124
918325	contig_1274_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_137770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATGTAGAACAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25668	27603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_25700_27600
918326	contig_6313_pilon	+	3906	1	Intergenic	novelGene_149321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	786	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAATGTGCAACAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20031	23937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6313_pilon_+_20000_23900
918327	contig_6599_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_175969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCATACCCGGCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261648	260737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260700_261600
918328	contig_10861_pilon	-	3395	4	Intergenic	novelGene_39217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	317	junction_3	484.306606282517	7	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	748	1371	590918	588381	TRUE	10	TCGTTTGCCACTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTQRINYNSFWFSGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRSPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYSPPIQRRYSPSPPPKRRTASPPPPPKRRASPSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVTKRRSPSLSSKHRKGSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQSTSSPPPVRRGASSSPQRRQSPSPSTRPIRRVSRTPEPKKTKK	591665	582608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_583682_585565_585767_587630_588850_590763
918329	contig_11564_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_158532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAGAAAGAAGTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37812	35227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_35200_37800
918330	contig_19427_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_178985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAAAAGAAAGAGGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6146	4523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19427_pilon_-_4500_6100
918331	contig_2504_pilon	+	3120	2	Intergenic	novelGene_166856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGCAAAAAGCCAGAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399663	406016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_402559_405791
918332	contig_3424_pilon	-	2215	13	Intergenic	novelGene_55582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	20.9408890292015	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	12	1589	1138079	1128729	FALSE	5	TTCTTTGCAGCTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVLAVRRLLRGSGSWGRSRLRSGPPTYRPFSSGSAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILINSGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTARFGSKDEILLALEKHGGICDCQTSRDTTMYAVSADAKGLDTVVGLLADVVLQPRLTDEEVERTRLAVQFELEDLNMRPDPEPLLTEMIHEAAYRGNTVGLHRFCPPENITKIDRQVLHAYLRNYYTPDRMVLAGVGVEHEHLVQSARKHLLGTRPAWGDQKAVDIDRSVAQYTGGIVKLERDMSSASLGPTPIPELTHVMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFTRLYLNVLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGAVDVVELERAKTQLMSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRCRKLPHELCALISNVTAEDIKRVASKMLRRKPAVAALGDLSDLPTYEHIQAALSSRDGRLPRAYRLFR	1138090	1128102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1128899_1129047_1129193_1131124_1131188_1131436_1131528_1131649_1131769_1131852_1131946_1132268_1132533_1133189_1133291_1134086_1134182_1135433_1135517_1135956_1136037_1136559_1136763_1138008
918333	contig_7704_pilon	+	1723	1	Intergenic	novelGene_154629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402826	404549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_402800_404500
918334	contig_8637_pilon	+	2274	1	Intergenic	novelGene_175181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGGTGGCTGAAAATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330549	332823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8637_pilon_+_330500_332800
918335	contig_11316_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_122653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAAGTGGGGCTGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137900_138900
918336	contig_8377_pilon	+	4813	28	Intergenic	novelGene_34957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2772.7278363231	2	100	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	898	2697	814	3510	154883	197939	FALSE	10	TTGGTGGATTCTGCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMFPFSSICRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68096	199242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140966_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194464_196058_196218_197663
918337	contig_11850_pilon	+	2875	2	Intergenic	novelGene_125204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	46	375	275643	275972	TRUE	45	AAAAAAAGTCTTTATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSHPVLLQQKYHKWMALTKRNLFLHSEVCQKSKFRASAPGKVFLSLSAFSSMFPGLGASLRRKPGPKDMLCSWHCFLDGMRSPCLTAHFSPISQEIASGHSPILYTESCLTNTTAAHPPLLTS	275597	279934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_+_277989_279450
918338	contig_4213_pilon	+	989	1	Intergenic	novelGene_124804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCCCACAGCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32588	33577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_32600_33600
918339	contig_11816_pilon	-	2676	2	Intergenic	novelGene_98494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552709	548227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_550298_552103
918340	scaffold_13609_pilon	+	2204	7	Intergenic	novelGene_124422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	60.7273048599685	43	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	28	660	779035	794586	TRUE	25	ACTATCATTTCCTAAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACEEALRKMAAACRSVKGLVAVITGGASGLGLATAERLVGQGASAVLLDLPSSDGEAQAKKLGKNCAFAPVDVTSEKDVQAALTLTKEKFGRVDVAVNCAGIAVAIKTYNLKRSQAHTLEDFQRVLNVNLIGTFNVIRLVAGEMGQNERDQGGQRGVIINTASVAAFEGQVGQAAYSASKGGIVGMTLPIARDLAPIGIRVMTIAPDVVDLIPVFSIW	779007	796263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_779062_779416_779582_780271_780437_780559_780689_780768_780878_794548_794627_794759
918341	contig_6576_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_42360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTTTTAAAAATCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	807550	806891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_806900_807600
918342	contig_15044_pilon	-	4240	2	Intergenic	novelGene_174965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	183	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1594	1980	99133	98747	TRUE	55	ACAATTTTAAAAAAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQQTISKHMQKQERMVPVGIQNKTLDDFPVEENALELPDREFRSLILRANQEFKQKADKNEEKIDKFMEKADKLMENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKIIRFQKWTLSQKG	100726	93008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15044_pilon_-_94188_97665
918343	contig_7839_pilon	-	2782	2	Intergenic	novelGene_45710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	98	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1608	2021	806845	806432	FALSE	80	CAAAAGAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKQIHGKGRQIHGKYKNVEEFKKTIQEENAKINSQLEIIQKQQLEIQNVDNKISEMDSVIEGLRSRFEVIEDRISQIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNETLRIYVGYNQEQKSASDWSSRTGRKWKTQRGSLKNC	945593	805670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_807648_944788
918344	contig_5023_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_7142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAAGATGTGGCAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328119	326405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_326400_328100
918345	contig_1898_pilon	+	1486	4	Intergenic	novelGene_177341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTTCAGCAAAATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233115	241155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1898_pilon_+_233466_233558_234071_240463_240891_240958
918346	contig_12050_pilon	+	1634	3	Intergenic	novelGene_62598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	3	311	298493	298801	TRUE	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRACVKDFHLGAGHWRCRLGAVGCPWQAVLLCFGLVCFLQALAEGSLARQLFVARTLWFFLLRGLPQCQSLFSQKIEGRLQRARGWWSGRAGFRKVPFVVRT	298490	301267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_299128_300174_300221_300316
918347	contig_18195_pilon	+	2043	1	Intergenic	novelGene_138444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGACAGACCCACTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2784	4827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18195_pilon_+_2800_4800
918348	contig_6137_pilon	-	5112	6	Intergenic	novelGene_59236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCAATCTTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332676	1315555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331859_1332172
918349	SIRV6	+	941	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	576	11	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
918350	contig_11316_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_122608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	670	1182	137674	138186	NA	50	ATACAAAGACGACCCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137004	138860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138900
918351	contig_10103_pilon	+	2385	4	Intergenic	novelGene_86175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAAACTCCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	681881	719616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_682560_682684_682838_711169_711259_718151
918352	contig_3900_pilon	-	1334	2	Intergenic	novelGene_84203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	0	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAATAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544533	543008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_544275_544465
918353	contig_776_pilon	+	4418	3	Intergenic	novelGene_139914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	149	499	758882	759232	TRUE	80	ATGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWFLLITCPKYVRQSLTILSSKEDSGYTSSKTDLFVLLAVHGIFNILCQHHNSKASILPSSLLIVQLSYAYDAIENTTAWVRRTLVFKVTALLFNTLKGSFAADLLNAMRL	758733	842127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_760127_760640_760843_839304
918354	contig_8476_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_121350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTATCTATGTGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181562	179423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_179400_181600
918355	contig_6117_pilon	-	2469	7	Intergenic	novelGene_167305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	31.9826341768293	112	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	12	1151	137284	114783	FALSE	45	AGACCAATAAATATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRMFPVLKISVAGLDPNAMYSLLLDFVPTDGHRWKYVNGEWVPAGKPEVSNHSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGGSHRMVMNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLKDVPEAISESKHVTYSHLGGWIFSNPDGVCTAGNTNYQYATPLSLPAPHSHHGCEHYPGLRGCWQSPYPSAYVHRNHSPTVNLIESSSDNLQVFSGPESWTSLSSTPHASILSVPHTNGPINPGPSPYQCLWTISNSGGGPAGPGPEVHASSPGTFLLGNPAVTSPPSVLSTQAPTSAGVEVLGEPSLTSIAVSTWTAVASHPFPGWGGPGGGGRHSPSSLDS	137295	113464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_115078_120954_121091_123763_123953_127703_127766_129892_129955_135295_135431_137023
918356	contig_13519_pilon	+	1501	12	Intergenic	novelGene_124626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	377.050230119354	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1182	318	1499	67718	115603	FALSE	45	TTTGCTGAAAGAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLA	57024	115605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66283_67639_67796_72486_72670_79401_79476_82120_82256_95191_95295_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513
918357	contig_5071_pilon	+	2566	1	Intergenic	novelGene_171282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACTTTGCAAATGAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205621	208187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5071_pilon_+_205600_208200
918358	contig_7323_pilon	-	4150	2	Intergenic	novelGene_173212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3269	3568	49666	49367	FALSE	45	AAGCACAATTACTTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGIRERRKQNKETNKNQKEKKNARKKKCPQECPCASVQSKGVASKPCGTARLERAPKLRKEKENKQTNQDRTNQTKKQKSDTGWESVSQLSGVL	53243	48784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_52544_52852
918359	contig_16578_pilon	-	4274	3	Intergenic	novelGene_148693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	715	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1	312	365521	360092	TRUE	35	AATATTTACGGGAGCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCNQVFELAQLVLVLRVVPDILLSEEGLLVLGKPSHDSRVHNPIQQHGERVNGEALVILVLVYHHQDLLVGRGHGLDGVLQGANCGLLKIRSPRRKGLSRLP	365521	352155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_354974_358947_360318_365435
918360	contig_14970_pilon	+	3701	9	Intergenic	novelGene_45045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	256	junction_2	6684.79997363421	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	75	228	341	568	207723	210890	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATRKDGDSQPLY	188764	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_188830_191970_192205_207681_207823_210762_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
918361	contig_2444_pilon	-	6855	1	Intergenic	novelGene_83793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1937	2245	272302	271994	NA	30	CCCCAGAATGTGTGTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIGVGCNTLTQVTALIQYKGSFPGVWPASPLILQEIKGERSEQGDRGPHSTKKEAPEWSASFGPGDPCIEKLLDHGKIDDKDLPQELTERESLPWEVGP	274238	267383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_267400_274200
918362	contig_4884_pilon	-	2628	1	Intergenic	novelGene_63775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTACCTACATCCAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65786	63158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_63200_65800
918363	contig_12050_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_62679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCCCTGCCGCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463046	461738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_461700_463000
918364	contig_13565_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_162377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1600	1953	132155	132508	NA	85	TAGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDSRSLAVPSPGNIIPIMQTEKCLIILTAFKKESSGDGLALPGNLITSTTSLLFPDPLVTRLACHPQLRGKRHFLLPGSFFANSPLSVHKPECPLKQPLYSGHPPRGFFPSGCTL	130555	133240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_130600_133200
918365	contig_11227_pilon	+	2360	2	Intergenic	novelGene_163176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125350	127968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_125480_125737
918366	contig_12090_pilon	-	3264	2	Intergenic	novelGene_80494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2716	3159	165733	165290	FALSE	20	CGCCATGGTATTTTCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARTGKQFHTQTELHKRSGKKQHQQPTNGTRGVGHCEHMESKQPVLPGQETVAVGSRGGRVGVKKGGRWEDVYCCLLVVLSPAGTSMKLLSRTPYLLVSDRSPRWWIHAALADRGPLHVCLLALCSLFVSYFIWCLAEFFISSFDV	349749	165184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_166321_347621
918367	contig_11986_pilon	+	2200	1	Intergenic	novelGene_69250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTGTGACCAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808312	810512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_808300_810500
918368	contig_10205_pilon	-	1563	6	Intergenic	novelGene_143117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	72.0277724214764	14	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	174	599	233986	224395	FALSE	80	GCAATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNGAPGFINLCDALNAWQLVKELREALGIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEDEAKVCMVYDLYKTLTPISTAYARARGADRMSSFGDFIALSDVCDVPTAKIISREVSDGIIAPGYEEEALKILSKKKSGNYCVLQMDQSYKPDENEVRTLFGLHLSQKRNNGVIDSCQSLLSETSSSPPLLSSTLSLILCAMPRTVR	235037	223430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_224492_229409_229502_231373_231464_232780_232867_233925_234034_234911
918369	contig_2251_pilon	+	1612	1	Intergenic	novelGene_128476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAGAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122467	124079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_+_122500_124100
918370	contig_15361_pilon	+	5031	16	Intergenic	novelGene_167859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	800	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAGAAAAAGGGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420114	514062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_+_422940_425239_425351_435933_436126_444304_444438_446968_447113_449710_449844_468678_468795_471892_472015_472762_472983_474553_474716_487646_487775_498792_498861_500378_500493_504689_504874_508500_508701_513883
918373	contig_3103_pilon	-	2748	2	Intergenic	novelGene_146184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAAGGCTAGAATTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49496	46280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_48944_49411
918374	contig_3449_pilon	+	4843	2	Intergenic	novelGene_73730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	871	junction_1	0	115	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGACTCAGATAACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493432	501390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888
918375	contig_19402_pilon	-	3617	5	Intergenic	novelGene_80751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58054	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277
918376	contig_2768_pilon	-	3744	1	Intergenic	novelGene_57507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	517	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGTAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	772764	769020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_769000_772800
918377	contig_14914_pilon	+	714	1	Intergenic	novelGene_178980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTCATCTTTCATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26781	27495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14914_pilon_+_26800_27500
918378	contig_13481_pilon	+	3182	2	Intergenic	novelGene_119293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190768	194068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_191057_191174
918379	contig_7720_pilon	-	3142	2	Intergenic	novelGene_155742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	0	115	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	84	746	255678	254481	FALSE	20	GGTTCATGTCTAGATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSPANSTAGTIDSDGWDASFPDIASSMPLPVSDRCFSHLQPTLLQRAKPSNFLLDRKKTDKLKKKKKRKRRDSDVPVKEGYMGSLLKLEAADPYVETPTSPTLQDIPQAPSDPSSGWDSDTPSSGSCATVSPDQVKEIKTEGKRTIIRQGKQVVFRDEDSTGNDEDIMVDSDDDSWDLVTCFCMKPFAGRPMIECNECHTWIHLSCAKIRKSNVPEVFVCQKCRDSKFDIRRSNRSRMGSRKLFLD	255761	252084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_254708_255242
918380	contig_15095_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_177390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1142	1501	124618	124977	NA	45	TACATATACATGTATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSQVSGSHLFPINALTLTSDTSQGLQLSWRCNSATLTIRLWVWFSAILALLLQEIRLSFKAQVEALRSCMRHLSLDSEALSASLSFISLSREVGQTNQLPYTSHSDKAVERYHTCSP	123476	125666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15095_pilon_+_123500_125700
918381	contig_3956_pilon	+	3083	16	Intergenic	novelGene_15135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1245.66534831792	7	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	831	2496	69	2564	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281613	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282730_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287320_1287367_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
918382	contig_10958_pilon	+	1911	4	Intergenic	novelGene_5412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	11	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCGCTTGATTGCACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888221	901583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889005_895279_895855_900457
918383	contig_1939_pilon	+	5346	3	Intergenic	novelGene_144870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1515	2051	302534	303070	TRUE	40	AAAAGACTTATAGTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTFMEKADKFMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQVEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISKIEDKHLDTKLFKEKSERRTKKNEEILRIMWDTIKSKNLRAISVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPSIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDHKRNSPRHIISTFAKTKDRES	300736	309898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_301575_301857_303800_307332
918384	contig_11449_pilon	+	1483	10	Intergenic	novelGene_170548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	153.501357214413	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	9	1397	38285	236497	FALSE	20	TAAGGTGATTTGAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEAAGGKYRSTVSKSKDPSGLLISVIRTLSASDDVEDRENEKGRLEEAYEKCDRDLDELIVQHYTELTTAIRTYQSITERITNSRNKIKQVKENLLSCKMLLHCKRDELRKLWIEGIEHKHVLNLLDEIENIKQVPQKLEQCMASKHYLSATDMLVSAVESLEGPLLQVEGLSDLRLELHSKKMNLHLVLIDELHRHLYIKSTGRVVQRNKEKGRWSSLVKDASPGPLIDVTNLPTPRKFLDTSQYSTPGSSGVREINLQEIKEDLELDPEENSTLFMGILIKGLAKLKKIPETVKAIKERLEQELKQIVKRSTTQVADSGYQRGENLTGENQPRPASLPFCWTGAHSFIQQRLLLELLELLFDKFNAVAAAHSVVLGYLQQTVGTSLTQQEEIKLYDMADVWVKIQDVLQMLLTEYLDMKNTRTASEPSAPLSYASTGREFAAFFAKKKPQRPKNSLFK	38276	241762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11449_pilon_+_38371_59403_59594_74822_75018_98471_98657_105618_105729_127560_127805_140413_140466_145447_145625_236347_236498_241676
918385	contig_11720_pilon	+	7486	8	Intergenic	novelGene_43771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2648.5819925818	857	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	526	840	86302	87271	TRUE	20	TCTTTCTATCGTACTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQVWSAHHGGRGHHGMVINTFAQKHTVRQSGELAAFL	67773	98753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78478_86244_86415_87069_93261_94959_95061_95383_95486_98299
918386	contig_11304_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_156703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCCCTACAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368315	366633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_366600_368300
918387	contig_14441_pilon	+	1007	5	Intergenic	novelGene_100609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	3	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	392	820	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111205	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113152_113209_116578_116963_117220_117344_117539
918388	contig_7396_pilon	-	2727	16	Intergenic	novelGene_79570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2341.58477579229	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	243	1544	254680	246385	FALSE	15	GCTAGATATGGTGCGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257083	245201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254608_254697_255105_255191_255295_255381_257027
918389	contig_2069_pilon	-	2177	2	Intergenic	novelGene_23575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	134	466	2323995	2323663	TRUE	30	AACTGACTTTTAAACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRDEYASKGCLNFVVFNLQFPTAFEFSEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKEVKDGPCPPIPIIVNHVMNVCVQVFVWTFSIYLGIIHSSGNAGSYGNSALTTF	2324128	2321230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2322570_2323290
918390	contig_6946_pilon	+	1544	7	Intergenic	novelGene_59742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	48.4424056655599	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1083	461	1543	35925	45883	FALSE	35	ATGAGAAGCTGGCAACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAYANVIPVGTTMDKVTEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTAHLDSEEEDDDLFDDPPPVPLRHKVPNQETLHPEVFSMTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYL	1705	45884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_13907_14042_28232_28288_35894_35984_38551_38647_44954
918391	contig_14924_pilon	+	2825	2	Intergenic	novelGene_104140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	148	549	5682	6169	FALSE	20	ATTTGTTCTGTAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPRFVAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLVTWMKLENIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	5534	8445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14924_pilon_+_5833_5918
918392	contig_13571_pilon	+	1375	1	Intergenic	novelGene_128137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	606	769	1374	441451	442056	NA	60	ATAGAAAAACACCAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCCVYSQQQNIKKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIEVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFVAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIE	440682	442057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_440700_442100
918393	contig_9609_pilon	-	1518	3	Intergenic	novelGene_23095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	410	1123	483579	482384	FALSE	25	TAAACTCACTTCTTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFGVRLPLKALGITANRGQRFQGQNITIFYKNRLGLYPYFGPRGTGHHGGIPQLVPLGRHLAQAAFQIRHSLGPGFAGLAVLDWEEWSPLWAGNWGRRRVYRAASRAWARQVFPHLDHREQLHEARAGFEQAARTLMEDTLQLGQALQPHGLWGFYRYPACGNGWHSMASNYTGRCHAATLARNTRLHWLWAASSALFPSIYLPPRLPPAHHQAFVRHRLEEAFRVAHAGHLHPLPVLAYARLTHRRSGRFLSQDDLVQTMGVSVALGATGVVLWGDLSFSSSEEECWRLHDYLVGTLGPYVINVTRAAMACSHQRCHGRGRCARRDPGQLEAFLHLRPDGIPGDWEPFSCHCYRGWAGPTCQKPRPGPKEAA	483988	481988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_482654_482771_482862_483225
918394	contig_11978_pilon	-	1865	2	Intergenic	novelGene_63119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	515	junction_1	0	26	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	782	1132	1890320	1889970	FALSE	25	TTGTATGAGTTCTTTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDCSLLITCPKYMRHSLTILTSKENSGCTLKTELFILLTVHGIFDILCQHHNSETLILLWSSLFIVQLWHAYEAIENTMAWVRHILVLKVTSWLFYTLKRSFASDSVPLLFV	1891991	1889236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1891066_1891955
918395	contig_17882_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_175835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAACTTAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78154	79697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17882_pilon_+_78200_79700
918396	contig_8376_pilon	-	3806	5	Intergenic	novelGene_153769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	186	junction_1	85.7536442374317	432	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	327	884	138966	128830	FALSE	40	TTTAATAAAGCAATGGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEQVAQKSSELEQYLQRVRELEDMYVKLQEALEDERQARQDEETVRRLQARLLEEESSKRAELEKWHVEQQQAILTTEAEKQELENERVVKERALQEAMAQLEQLELERKQALEQYEGVKKKLEMATSKTKSWKDKVAQHEGLIRLIEPGSKNPHLITNWGPAAFTEAELEEREKSWKEKKTTE	141132	125907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_128937_129307_129405_131134_131334_138811_138979_140818
918397	contig_17274_pilon	-	5100	2	Intergenic	novelGene_26541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCTTATCTCTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146509	141239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_141867_142036
918398	contig_11493_pilon	+	2811	2	Intergenic	novelGene_143717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTCTAAATGCTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291617	294886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_292550_293007
918399	contig_3270_pilon	-	2812	1	Intergenic	novelGene_104465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATAATGCAGAAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104739	101927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_101900_104700
918400	contig_13800_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_153734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	590	991	143980	144381	NA	40	GACAGAAAACTTCTCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRSPYQLLHHGSTILDSYRRSANREYEKAASRSFQQETEQPVTSNIRFPTPHSSSPPLGLLCFLCPQSLGREAPASPWCCLDSTHPCWPALSAVCWLLVLLFSASLDFFLTSHHLPRVSLKYLALCAIFASS	143390	145833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_143400_145800
918401	contig_6544_pilon	-	3348	1	Intergenic	novelGene_142066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCGCCTACTAGATTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22006	18658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_18700_22000
918402	contig_6477_pilon	+	4331	21	Intergenic	novelGene_154190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_10	93.2126064435493	78	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	278	1927	776734	810493	FALSE	20	TCACTGCCATCTCCCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFRKRKPSEEARKRLEYQMCLAKEAGADDILDISKCELSEIPFGAFATCKVLQKKVLIVHTNHLTSLLPKSCSLLSLTTIKVLDLHDNQLTGLPDDIGQLTALQVLNMERNQLTYLPRSIGDLIQLQTLNVKDNKLKELPDTLGEIRSLRTLDISENEIQRLPQMLAHVRTLETLSLDALSMVYPPREVCSAGTEAIQQFLCKESGLEYYPPSQYLLPVLEQDGAENSRDSPDGPTDRLSKEELEWQNRFSDYEKRKEQKMLEKLEFERRLELGQREHAQLLQQSNSQKDEILQTVKEEQSRLEQGLSEHQRYLDAERQRLHKQLKQTEQNISHRIQKLLEENQRQKKSSEILKSLENERIRMEQLMSVTQEETENLRRREIASAMQQMLTESCKNRLIQMAYESQRQNLVQQACSSMAEMDERFQQILSWQQMDQNKAISQILQESAMQKAAFEALQVKKDLMHRQIRNQIKLIETELLQLTQLELKRKSLDTETLQEMISEQRWALSSLLQQLLKEKKQREEELREILVVFGFCVQHHTWVCFP	773330	812897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_773356_773675_773896_776701_776806_777237_777295_777831_777877_778918_778997_780210_780280_782029_782115_783189_783312_784959_785051_786302_786434_789847_789878_790327_790451_790805_790946_791893_791939_794159_794231_795889_795990_805714_805803_806787_806863_808597_808679_810346
918403	contig_3787_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_102457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAAATTGAGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154897	1157566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_1154900_1157600
918404	contig_4832_pilon	-	2861	14	Intergenic	novelGene_163427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	35.0573494645458	1	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	113	1969	521546	515860	FALSE	20	CTGTGTCACGGAGATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKELYRRRFPRKTLGPSDLSLISLPPGTPPVGSPGPLAPIPPALLAPGTMLVPKREVDMHPSLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSRELLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCTHLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILNSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDGLQYSPVQEGNPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCPVTSAASPALPGSKGVLTSSHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHDYPPAFPLGADMQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPLGSSHRSSPPAPPPGRVSSIVAPGGTLREGHGGPQPSGPSLTGCRSDIISLD	524699	514967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_516124_516588_516627_516812_516947_517131_517301_517380_517515_518264_518426_518546_518621_519179_519286_519510_519646_520274_520366_520609_520661_520887_520973_521131_521550_524590
918405	contig_6634_pilon	-	3180	2	Intergenic	novelGene_171139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAAATGATTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350158	165853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_167382_348506
918406	contig_11285_pilon	-	1763	15	Intergenic	novelGene_5656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	450.159404873339	11	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	26	1570	794466	784252	FALSE	5	CGCCAGCGTGCTGCCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMGLTAPLPSQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	794632	784058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787194_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607
918407	contig_20731_pilon	+	5104	1	Intergenic	novelGene_151592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCTCAGCAGTTTGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10151	15255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20731_pilon_+_10200_15300
918408	contig_4857_pilon	-	1428	2	Intergenic	novelGene_48862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGCACTACAAAATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354890	1351814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1352399_1354046
918409	contig_12327_pilon	-	2480	2	Intergenic	novelGene_140653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2110	2460	359130	254874	FALSE	55	GGGGAGAAAAAGACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRRLFSHSPVGYKSKFRASAPWERFLHRLRRKVHVLNLPLVWELLCKGTSGPKDTLCSRHCFLGSMRFPCVSACFSLAQCSSCCFGVLHLRKSKCHSPALTSSQASTLCLPL	361239	254853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_254983_358888
918410	contig_10949_pilon	+	2438	18	Intergenic	novelGene_146681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_17	222.034443538941	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	89	2287	14717	116402	FALSE	25	CTCGCCCTCAAGACTCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSVMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFIRELRSRTFDSSDEVILKPTGSQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPSVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFKFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGTCLNDSDDDSPDLDLDGNESPLALLMSNGSTKRMKSLSKSRRAKIAKKADKARLVTEQVMEDEFDLDSEDELQIDERLGKEKTTLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGTGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRHKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLAQQVGADTPGNEPC	14628	116553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_14718_15101_15211_17517_17679_18636_18779_20305_20493_22139_22303_30671_30760_31127_31235_32517_32610_39743_39834_42753_42858_58890_59070_59582_59669_60157_60292_60907_61222_90797_90894_112694_112830_116391
918411	contig_18610_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_168062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31466	34501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_+_31500_34500
918412	contig_14048_pilon	+	2476	1	Intergenic	novelGene_146338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584266	586742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_584300_586700
918413	contig_3463_pilon	+	2445	1	Intergenic	novelGene_62013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCCATATTGTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547586	550031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_547600_550000
918414	contig_12624_pilon	+	2544	12	Intergenic	novelGene_60939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	358.347538958601	19	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	90	539	11640	38981	TRUE	50	ATATTCAGAATCTAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELVCMRIHLGETAQEASIFMQKLKSAAFLLRAGCCPGENKMWDLREQCLEAGTEP	6012	55570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43073_43149_44521_44632_46682_46768_50396_50437_54975
918415	contig_8461_pilon	+	2165	1	Intergenic	novelGene_163923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTCTCAACAACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374996	377161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_375000_377200
918416	contig_10740_pilon	+	2100	2	Intergenic	novelGene_152244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34547	37039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_+_34731_35122
918417	contig_233_pilon	-	3101	13	Intergenic	novelGene_14508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1095	junction_12	1086.59314679721	21	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	31	1767	108727	92135	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYV	108757	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724
918418	contig_12793_pilon	-	1982	1	Intergenic	novelGene_164136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	782	1147	312234	311869	NA	15	GATCCCTCTGCACATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFMFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSVFCLSSWRILSIRDLHSLSGSSSAFSSTGESSGVLFLTTTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	313015	311033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_311000_313000
918419	contig_8464_pilon	-	899	1	Intergenic	novelGene_125366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCTAGCAATATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775166	774267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_774300_775200
918420	contig_11493_pilon	-	4827	3	Intergenic	novelGene_143645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	254	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3962	4327	74404	68830	FALSE	45	CATTCAATCCATAACAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRNHAASLRSCLEISSAKYLSCNHLKVLTSTKHLNIIQTNSLSLHKKYCSSSIVQSHVYYFLFYSLTRSTFNVHISRNILFLTIEILSQLSILPEPSLELPLISIILPTNFSRQTRALL	78365	68329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_69125_69648_69719_74403
918421	contig_8259_pilon	-	3724	2	Intergenic	novelGene_148848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGTCACCTATCAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8544	4653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_5070_5236
918422	contig_5095_pilon	+	767	3	Intergenic	novelGene_74933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	86.5	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	105	419	103037	252060	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFRQENVEDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELPEWPWTQPI	102932	252408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_103099_225547_225770_252029
918423	contig_16098_pilon	+	2364	2	Intergenic	novelGene_45790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	218	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31101	33559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_31589_31682
918424	contig_4538_pilon	+	2868	1	Intergenic	novelGene_153081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATAAACATCAATATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131029	133897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_131000_133900
918425	contig_13244_pilon	-	2302	2	Intergenic	novelGene_86937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTATTTGGAGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254313	251946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_253160_253224
918426	contig_11338_pilon	-	1932	11	Intergenic	novelGene_6355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	237.82337984311	53	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	299	1393	319426	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVN	323314	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
918427	contig_8487_pilon	+	4122	2	Intergenic	novelGene_111904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCAGTCCTGTGCTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27039	35800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_27730_32368
918428	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	132	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
918429	contig_15327_pilon	-	971	3	Intergenic	novelGene_70656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	65	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	339	389	900954	900904	FALSE	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901506	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
918430	contig_7411_pilon	+	3505	7	Intergenic	novelGene_137018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	47.747309406453	123	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	501	1487	348085	352611	FALSE	20	TGCCTTAACTTCTCAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNKYGKTPEDVICERSKSKSLELKERIREYLQGHYYVPLLRAEDTSSPVIGELWSSDQTAEAPHAGRFGGSPRDPVLTLRAFAGPLSPSKAEEFRKLWKTPPREKAGFFHNVRKSDPERGVERVGRELAHELGYPWGEYWDFLGCFVDLSSQEGLQKLEEYLIQQEMGKKTQQEPGENKACLQDKASGGGKKCSNSISVRAFLDEDEDMSLEEIKNWQNAARSASQPPAGAFGDTGCDILPVGQDTYLTDSLDASGTCDGRNGFCSPLSQARPRRGKRPMPHCREGSLLSPVSNLTVEFDKLNLQTLGSSFCKTSNNIETKDKIIVTSRMNSVGSDLLEPASAAEKTESNQVRTENQISAETAEVSLDPDSPGHEAPRSCDPELQSAPACPASSELTTRLFLLGGEPSKLDRDVLAALEHADIDPHQYPAVLRWKGAVLAYSPSDRQRYGRPSKLWDGQRVSSSPWQIKVSQATLAEPLRQAQGSPMAWGCGRP	339518	354629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_+_339551_341196_341264_345706_345880_346963_347071_347963_348149_350123_350773_352337
918431	contig_16185_pilon	-	1935	10	Intergenic	novelGene_144741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	92.0037573038443	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	116	1273	127403	82379	FALSE	20	ACGTTGGTATCAATCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPVISASDEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPLEKKSSQSGDDT	134378	81716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111496_127346_127464_134323
918432	contig_6578_pilon	-	734	2	Intergenic	novelGene_162237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGAAAAAGGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148150	147278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_147658_147795
918433	contig_14822_pilon	+	3066	11	Intergenic	novelGene_145430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_10	24.5399674001413	134	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	411	2132	229220	355987	FALSE	10	GTGCTGTTCAGCCGCCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRSKRNSIAGFPPRVERLEDFEGGGGGDGNVTQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFTCEKIGSGFFSEVFKVRHRTSGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLSWTVRVKLAYDIAVGVSYLHFKGIFHRDLTSKNCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSKGREKLAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKADVFSYGIILCEIIARIQADPDYLPRTENFGLDYDAFQHMVGDCPPDFLQLTFNCCNMDPKLRPSFVEIGRTLEEILSRLQEKELEHDRKVQHTAKGLMEKGPGVKRLSTLDDKIPPKSPCLRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPQRGAAARTHKVNPFSARQDLKGGKIKFFDLPSKSVISLVFDLDAPGPGTMPLADWQEPLAPPARRWRSLPGSPEFLHQEACPFMGREESLSDGPPPRLSSLKYRVREIPPFQASALPAAPAHEAMDCSSAQEENGFGPRIQVASPGPPGVSEEMEVEEERPICVAPVPFSSSGTGQQSQGEQDG	203686	356921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_204007_229129_229442_272630_272753_316971_317021_342968_343116_353092_353176_353404_353490_353744_353829_354037_354125_354838_354957_355262
918434	contig_5686_pilon	+	4990	1	Intergenic	novelGene_45203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGGGTTTCCAAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67686	72676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_67700_72700
918435	contig_11678_pilon	-	2441	2	Intergenic	novelGene_160859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTCCCAGCATAGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324662	322132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_323409_323497
918436	contig_17768_pilon	+	3487	7	Intergenic	novelGene_140405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	209	junction_5	58.3742713492473	81	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	313	1029	104029	113083	FALSE	10	TAATTGGTTTTGTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISFPSGIIKVFTSNPSPAVLCFRVKNISRLEQILPNAQLVFSDPSQCDSNTKDFWMNMQAVTVYLKKLSEQNPAASYYNIDVLKYQVSSNGIQSTPLNLATYWKCSAGTTDLRVDYKYNPEAMVAPSVLSNIQVVVPVDGGVTNMQSLPPAIWNAEQMKAFWKLSGISEKSENGGSGSLRAKFDLSEGPSKPTTLAVQFLSEGSTLSGVDIELVGTGYRLSLVKKRFATGRYLADC	101792	115541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_102080_104003_104160_104521_104655_108219_108420_109173_109239_112576_112742_113060
918437	contig_3747_pilon	+	2479	7	Intergenic	novelGene_24785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_6	1549.56054702257	5	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	1019	1684	202676	203804	FALSE	20	CACTTTAGTTTGTCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	204599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
918438	contig_19899_pilon	+	3259	22	Intergenic	novelGene_102527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	31.4667156692804	120	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1006	3021	132	3152	157305	192992	FALSE	30	AGCCATACAATTTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKPEGLSQDELRKRLYQTFKDRGILDTLKTQLRNQLIHELMHPVLSGELKPQSIPVEGSALLIGASNSLVADHLQRCGYEYSLSVFFPESGLAKEKVLTMQDLLQLIKINPASSLYKSLVSGFEQENQKGFLMQFLKELAEYHQAKESCDTETQTSPTFPSKDSLAEKLRLIDDQFADAYSHRPKLESLERKLNEYKREVEQQLRAEMVQKLKYFKDTEIAKIKMEEKRKYEKELAEFRNEFDRVCQAKSEALISREKNTLERIQKHQEIETKEIYAQRQVLLKDIDLLRSREAELKQRIEAFELSQRLQEEKNKSVDDALKRRELNIKTLEETYDQKLKTELLKYQLDLKDEYITRTNRLIEDERKNKEKAMHLQEELTVINSKKQELSQSVNRVKELELELESLKAQSLAMSKQNHLLSEKVKGLSDYSRLKEEKLELQAQTKLLKQQLEESRSENVLLLNRIAQPSPELVIFQKELKKAENAIALGHKEFETHKQALEKRLQSEIEHSAQLKAQLIDYDATVKRLTTQIADLKLQLKQTQTALQNEVYRNPKPSLMDRSITGFRSGRMVPHDGDISGDFLKNPVEQEKALAVAVTPRVTSPPDAGMESISPDSDLEFVANTKARVKELEQEAERLEKAFRNYHRRVTQNPGTSPPPAKSPLPLYLLGTLKNVTSRSPERGLFAEDRIVSEQPQVDILREEKSDALEVLTGSAASRRRRGSSPRRLSSTPLPKAKRSLDSEMYLEGLARSLVASPSACPDRTSQPSPAESRPTPSSASPRSLPEQKASLYQKQAELQDRSEFSNLDKLTSKDNEELDSSFEYAGDMPRSFEVDGLLPAGDMPHVDTVSAAVPARPVSLQYTNIDQRQIGEPEEEENIWEQRTKERRQTEERRQSERQEALEKERRELEKLDQERRMIEESLKIEMEKELEVSAQEIKDKSVCGENPLEKYMKIIQEGRDQNSADKSSKKIIIREGSPLDTLPSSDKDESFTGLSHEEPDDSW	157173	193099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_157398_158206_158408_160356_160426_160511_160543_166337_166446_169485_169623_169954_170129_172515_172623_175474_175595_176730_176805_178048_178141_179084_179275_180099_180231_180753_180866_183414_184024_184477_184605_185738_185840_187521_187642_190832_190991_191892_192046_192590_192662_192949
918439	SIRV6	+	924	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	18	586	18	-31	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	87	13	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	240	731	1733	10736	TRUE	45	AACGTAAATTTACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1105	11239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
918440	contig_5317_pilon	+	1014	4	Intergenic	novelGene_76528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	87	497	35282	43326	FALSE	10	ACCTGTTTTTGGTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33702	43843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
918441	contig_1263_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_170378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGCCGCTTGCAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50924	49572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_49600_50900
918442	contig_5153_pilon	-	2266	3	Intergenic	novelGene_74396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	209	301	994439	994347	TRUE	80	AACGATAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSSPSSYQGLHRTESSRARWCPATTADCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNLKSMAPKHPFSSVVKLPPRFTVQPGSGQPRKTK	999904	991465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_993091_994006_994632_999888
918443	contig_10437_pilon	+	2266	6	Intergenic	novelGene_38297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	1115.30623597288	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	150	848	439767	447058	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNR	431118	448476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951
918444	contig_16752_pilon	+	3001	1	Intergenic	novelGene_177681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	2208	2630	84945	85367	NA	10	GTGCAGGCTCCAGTGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVCGSRRGVSLARSSAWPERAPNSRKGKENRQTIQNEEKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGKSKDGARSQALERKEGEVARGKQEIKRSRKKKKQHQQPTNGTQRASQCGLVFLDKRLCPWEAEEAECG	82737	85738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16752_pilon_+_82700_85700
918445	contig_11338_pilon	+	3060	1	Intergenic	novelGene_6382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305151	308211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_305200_308200
918446	contig_10642_pilon	+	3597	5	Intergenic	novelGene_78743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCATCCTTAGCAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285533	1297609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1288657_1290369_1290608_1292136_1292211_1296482_1296626_1297590
918447	contig_9189_pilon	-	1915	2	Intergenic	novelGene_165104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAGATTAGAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252920	241286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_243005_252723
918448	contig_8822_pilon	+	764	6	Intergenic	novelGene_117926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	66	201	207	407	51569	60831	TRUE	65	TTTATATAGAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTKRNLFSHSPVGYKSKFRVSAPRECFLCWLWRKVHAINLPLVWELLCAGNSGPNDALCSWHCILVGMRFSCVSVHFIAIMVDMFFLQDITSCFLRPLSLTEITGLSSWRNPTPSLHSSSPCSSWEITSDLQR	51362	77173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_51598_57093_57178_60743_60838_61527_61656_62416_62501_77034
918449	contig_7876_pilon	-	7575	7	Intergenic	novelGene_144840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	289	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	5257	7413	17331	1450	FALSE	40	GCATAACATGGATGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRASLE	169191	1287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_-_3603_17327_18856_47112_47876_62299_62398_85439_85697_152865_153734_167445
918450	contig_4083_pilon	+	3826	2	Intergenic	novelGene_152319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	30	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGGGTCACTACGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29039	62361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_32636_62131
918451	contig_5057_pilon	+	3000	1	Intergenic	novelGene_151527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTCTTAGGGGCTATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525932	528932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_525900_528900
918452	contig_8702_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_157724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	30.3380134769631	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	270	1226	20151	24256	TRUE	15	GTGTCATTCACTGTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPSADGRLLGRGASDPRLHPRAHPALPPPFLPTPPSPLPALYPPGPREELVYLPCIYRNTGIEAPDYLATVDVDPKSPQYSQVIHRLPMPNLKDELHHSGWNTCSSCFGDSTKSRTKLVLPALMSSRIYIVDVASEPRAPKLHKVVEPKDIYAKCDLGYLHTSHCLASGELMISSLGDPKGNAKGGFVLLDGETFEVKGNWEKPGAAAPMGYDFWYQPRHNVMISTEWAAPNVLRDGFNPADVEAGLYGTHLHVWDWQRHEIVQTLTLQDGLIPLEIRFLHNPDAAQGFVGCALSSNIHRFYKNEAGTWSVEKVIQVAPKKVKGWMLPEMPGLITDILVSLDDRFLYFSNWAQGDLRQYDISDPKRPRLTGQVFLGGSIVKGGPVQVLEWFSQGEARGWRSSDDPA	19663	24891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_19915_20132_20319_21099_21221_22364_22548_22793_22973_23424_23504_23594_23717_23958_24010_24202_24335_24556
918453	contig_7909_pilon	-	2991	19	Intergenic	novelGene_155907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2112	2600	496311	454778	TRUE	15	TTTGCAGTGCCTCTGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGTKVELGDVVTIITFCVVVFVVCVEGLVKVILTGDICGGKELAMLCMMLLILGLPLTGTVIVFETGTTAFGTSFRTTGEELEEFVRLRFLGFSSSSEQLTPSLLPVSAGTGRDALCWIAALATALAVTVKAVWGTSRGISGTNRRPSMDHSEELLGPDIL	544717	443002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7909_pilon_-_443070_444939_445052_451520_451617_453105_453186_454741_454782_458391_458568_462223_462484_496262_496540_511059_511321_516143_516291_517732_517902_524094_524237_526672_526845_528519_528719_536898_537063_538878_539035_540062_540104_542361_542516_544439
918454	contig_17108_pilon	-	4682	2	Intergenic	novelGene_109515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	3517	4068	70851	70300	TRUE	10	CCCTGGTGGTGTAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQESIKRRKKEYMESLYQKELVDIQPFQKVAYYQKLMVLKEEVQTALKRMAKIKAPGTDGIPIEMFQLMDAVLEVLTRLCQEICKTATWPTGWERSIFVPIPKRGDPTECGNYQTKSLISHTSKILLKVIQICSSTSTGNRQKFKPDSEEDVKQEMSLLMSDGSWLKAENTRKMFTCVLLTM	74367	46077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_46193_69800
918455	contig_4754_pilon	-	3063	6	Intergenic	novelGene_35974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	118.530333670331	121	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	751	2256	505	2760	482542	455656	FALSE	30	ATAAATCAAGGGTTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLGGRRKKEASSMALPQGLLTFKDVAIEFSQEEWECLDPAQRALYRDVMLENYRNLVSLGISSSAINIISILKKGTEPWTVENKMKIAKNPDVSPARVIRKLSPEEIINKGEFHKTVMLERHESYGIENFDFKKVRENIDEFESHWAGDERNDKGVTMTHNKNLIFRREPHNRRDEGNKYMTCVENKIGPSLQSHLAELQRFQTGEKMYECNQVEKSINNGSSVSPLQRIPPRVKTNICNKYGEVFMHPSLLTLYQKTHITQKMYNCNECGVDFSQRSMFANLQIIHSVQELYKSNECTKAFKCGSIITNTREKPYKCKVCGKFFCQNSNLANHLRIHTGEKPYKCNECGKTFRWRSVLTKHHRIHTGEKPHKCGVCGKAFIHRSNLVEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINNSSRVEHQRIHTGEKPYKCTDCGKAFKCSSNLTSHQRTHNGEKLFKCDVCGKVFSKNSSLLTHYTSHTGEKSYKCNECGKAFLHNSSLVEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRWRSVLTKHHRIHTGEKPHTCSVCGKAFIQRANLVKHHRIHTGEKPYKCNECGKAFINNSNLAEHQRIHTGEKPYKCTDCGKAFKCSSNLTSHQRIHNGEKPYKCNVCGKVFNHRSSLTTHHRIHTREKPHKCDECGQTFVQIASFVEHQRIHIREKPHKCNECGKEFTMCSYQLVHEEIPTGEKTYKCSECWEALNMGDPSLNIRESITDRNYINVKYMAEPLGSADG	510536	455352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_457635_480081_480178_481410_481538_482488_482575_484831_485252_510484
918456	contig_12638_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_33300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1188968	1187454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1187500_1189000
918458	contig_15897_pilon	+	1130	2	Intergenic	novelGene_49516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	63	junction_1	0	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	303	826	1128	158355	158657	FALSE	20	TGTTTCTCTTCACACGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLNSSFLNDGLTFIPGSRKGVFRIKKFMTTREERSGHSDVLWVIPALSQPSGTLRDGKDGYVGARDVGEGGDMRAGSQSCCFFLHHPGQAEVQAVFSDG	156470	158659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_156994_158052
918459	contig_2438_pilon	+	6571	2	Intergenic	novelGene_111989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	513	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGATTTTCTGGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159581	175710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_159599_169156
918460	contig_15165_pilon	+	425	2	Intergenic	novelGene_145298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGGATTGGCTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439	1003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_720_858
918461	contig_10078_pilon	-	2725	2	Intergenic	novelGene_160010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	348	764	250714	250298	TRUE	20	CTGAGGCTGCTTATGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNRILANRIQQHIKRVIHHDQVGFTPGTQGWFNIRKSINVIHHINRTKEKNHTIISMDTEKASDKIQHPFLMKTLKKTGIDGKFRNIIQGIYEKPTANIILNEEKLGAFPLKLEARQGSCSPHFYSVLQKS	251061	248200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_249553_249688
918462	contig_15172_pilon	-	2675	8	Intergenic	novelGene_158749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	682	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	2289	2675	258367	243117	FALSE	15	CCGTCCATCAGCGCCGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGLNVPDPVPDIVKRLLVRDVVDQHDALCAPVVGRGDRPEPLLASCVPYLQFDSLAIKLYSSDFKVNSYGGDEGGVEGVLGEAEQDTGLPHPRVPDQQQLEQVIVGLRHITLSPRREVRPAPRHWTPA	269618	243116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_-_243296_248917_248980_252813_252874_256834_256913_258359_258453_258972_259039_260338_260391_267533
918463	contig_1090_pilon	-	455	1	Intergenic	novelGene_131157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGCCAGGACAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884063	883608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_883600_884100
918464	contig_8377_pilon	+	3409	14	Intergenic	novelGene_34998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4111.91762229551	3	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	626	1885	135175	173009	FALSE	55	AAAGAAAAATTTTCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSR	68125	174533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128903_131460_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896
918465	contig_17440_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_7526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGTAAAAGGAACTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242	2199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_200_2200
918466	contig_2730_pilon	-	3380	1	Intergenic	novelGene_135370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	22	69	236	304	295346	295278	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVRCCRVSSNSQRPFVPQNEILPGPASSSQSLLCLSPLLQLLCQYGIINTLHQHYNSNASVLLRSSLFIGQLSLVYEMTENIIAWIRRTLVPQSDIFAF	295581	292201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_292200_295600
918467	contig_5013_pilon	-	2219	2	Intergenic	novelGene_110098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	534	932	220994	220596	TRUE	40	TTTTTGTATGGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNISGIADFRTYYTVTVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDINSSTYEQLILDKGPKSVNWGKDSLFNKRRWYNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLKIENDKDHGRKNRDNARSPNTWHKHNTNHK	221527	218905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_219174_219576
918468	contig_6137_pilon	+	3901	5	Intergenic	novelGene_59260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2036	junction_2	583.958206980602	18	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2094	2555	1328176	1332311	FALSE	40	GAAGGTTTACAGAGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQ	1319603	1333657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174
918469	contig_11579_pilon	+	2839	3	Intergenic	novelGene_171938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.5	109	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54820	61616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_55138_58447_60468_61114
918470	contig_10225_pilon	+	913	3	Intergenic	novelGene_86871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	17	655	46329	47494	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDPLRGEAEAVGTVRPGLYLQELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	46130	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_46138_46319_46819_47345
918471	contig_7123_pilon	+	3580	1	Intergenic	novelGene_170590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGTCTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603053	606633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_603100_606600
918472	contig_593_pilon	-	3156	11	Intergenic	novelGene_101997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAATTTAAATAACCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482319	300140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_300534_383570_383643_385614_385717_386469_386568_388564_388637_398706_398813_420093_420159_471622_471775_479014_479089_480191_482084_482189
918473	contig_5947_pilon	+	6201	2	Intergenic	novelGene_101457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	159	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTGGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16055	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_21956_44627
918474	contig_709_pilon	-	4148	1	Intergenic	novelGene_57590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCTGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2240146	2235998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_2236000_2240100
918475	contig_19459_pilon	-	1146	7	Intergenic	novelGene_59808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6037.35383535977	5	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	23	808	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16262	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203
918476	contig_6102_pilon	+	1976	15	Intergenic	novelGene_32360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	95.236547606473	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	860	1909	1711393	1714849	FALSE	40	TATATACAAAGCTGAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLLELKKQLALAEGKPLDPPKGKKKK	1701290	1714916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703542_1710782_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714505_1714599_1714702
918477	contig_12123_pilon	-	2968	1	Intergenic	novelGene_144613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157291	154323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_154300_157300
918478	contig_17274_pilon	-	2963	4	Intergenic	novelGene_26581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	415	junction_2	312.350586503193	170	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTATACTTAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242505	231565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084
918479	contig_854_pilon	+	3995	26	Intergenic	novelGene_36554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_15	2684.62538287933	3	92	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	772	2319	45	2363	1649736	1709563	TRUE	15	AGGGGTTTTCTACCCACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVWRR	1649691	1715975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692785_1702657_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1709550_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711756_1711879_1712278_1712488_1715212
918480	contig_16045_pilon	-	376	1	Intergenic	novelGene_130866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGGAGTATGGTTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365537	365161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_365200_365500
918481	contig_4832_pilon	+	1937	15	Intergenic	novelGene_163416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	56.5441853594088	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	280	1857	497716	509953	FALSE	40	AGTAGATAAATTGTAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIQTSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGMYVINLHKALASLATATLESVVQERFGSRCARIFRLVLQKKHLEQKQVEDFAMIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQEIPKTPDHAPSRTFYLYTVNILSAARMLLHRCYKSIANLIERRQFETKESKRLLEKSQRVEAIIASMQATGAEEEQLQEIEEMITAPERQQLETLKRNVNKLDASEIQVDETIFLLESYIESTMKRP	496012	510033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502358_502514_502611_503917_503999_504248_504301_504658_504720_505180_505332_506088_506191_506558_506609_507026_507177_509871
918482	contig_6208_pilon	-	2731	1	Intergenic	novelGene_53000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	286	861	1852	2712	414398	413538	NA	40	GAAGAACAAAGTGGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNISKTINVIHHINKTKDKNHMIPSIDAEKAFNKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLSVIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPMRTGIRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAVRLEKEIKGIQIGREKVKVSLFADDMISYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENSKTLLQETKRDLRKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPAAFFNEMEKQITNFIWKGKRPQ	416249	413518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_413500_416200
918483	contig_5718_pilon	-	825	1	Intergenic	novelGene_110352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	316	627	673234	672923	NA	30	AACTTGCTTGTAAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLYDPKTRRTRWYLATTAYCSDWDYNRGSQTGWEKKVEQMIEFTNKTRLIGLTKTGGTTEAMAPGHPSDSDMKPLSKFIFQPKIRQAYQTNNNTCEECAS	673549	672724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_672700_673500
918484	contig_7285_pilon	+	2941	3	Intergenic	novelGene_143379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATCAAAAGATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167633	265684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_168105_262262_264327_265278
918485	contig_19269_pilon	+	2257	2	Intergenic	novelGene_175632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTGTTGTTAGATGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13139	19391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_+_13213_17207
918486	scaffold_19766_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_34350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	733	1062	608948	609277	NA	80	AAACAAAAAAAAACATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTSLARPVLCLILENTLKNPLPGPFLQPSGSMLVRQTDFTQPFSGLSVCFNNDLYVFSLGRSFSFQKSNCYFYSKKNPRDSINLRPEELDGARLPPMTTLTGNTADSP	608215	610293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_608200_610300
918487	contig_10246_pilon	-	2282	1	Intergenic	novelGene_46917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGTCAGGTCTTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183939	181657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_181700_183900
918488	scaffold_12124_pilon	+	2251	10	Intergenic	novelGene_22230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	2863.30768323785	14	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	336	713	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490225_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
918489	contig_19974_pilon	-	5415	34	Intergenic	novelGene_130468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_21	122.65324366611	106	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1690	5073	217	5289	345834	155913	FALSE	35	GACATTGAACTTAGGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRGPCTLETLLNPSPNVADAKIYPEEITPLLPAISGEKIAEDQTCFFLQILLKYMVIQAASLEWKNKENQDTGFKFLFTLFRKYYLPHLFPSFTKLTNIYKPVLDIPHLRPKPVYVTVTRDNENAYSTKIPYMAARVVFIKWIVTFFLEKKYLTTTQNTKNGVDVLPKIIQTVGGGVVPERGPELDGGVPAEQDRNHSNSSTLSDRRFSNASLCSIEEEHRTVYEMVQQILLSTRDYVNFVNEVFRQAFLLPSCDIAVTRKVVQVYRKWILQEKPVFMEEPDKKDIAQEDAEKLGFSETASKEACSESSGHKRSSSWGRTYSFTSAVSRGCVLEEESNVKAGAQVMLQVFLTNAANVFLLEPCAEVPMLLKEQVDACKAVLIIFRRMIMELTMNQKTWEQMLQILLRITEAVMQKPKDKQIKDLFAQSLSGLLFRTLIVAWIRANLCVYISRELWDDFLGVLSSLTEWEELINEWANIMDSLTAVLARTVYGVEMTNLPLDKLSEQKEKKQRGKGCVLDSQKGTAVGRSFSLSWRSHPDATEPMRFRSATTSGAPGVEKARNVVRQKATVPTEVEECHQSESAPGVDTGHLVVEQLQQHIPRSSSTSDITERLYSDVSQGQKIEDAQNLSFSDCKPVQDNKGHVKKEHEGITILVQRSSSPAELDLKDDLRQTQGKRRERQKSESVSSDTPLGYNREAELSMSAWQSCEEDPELNTPADAVADSDARHWLQLSPTDASNFTDSSECLADDCSIIAGGNLTGWHPDSAAVLWRRVLGILGDVNNIQSPQIHAKVFGYLYELWYKLAKIRDNLGISLDNQSSSSPPVLIPPLRIFASWLFKATTLPNEYKEGKLQAYRLICAMMTRRQDVLPNSDFLVHFYLVMHLGLTSEDQDILNTIVRHCPPRFFSLGLPGFSMLIGDFITAAARVLSTDMLVAPRLEALTILGSLVCFPNTYQEIPLLQSVPEVNKVVTGTEDIKHYLITILLKNATVEPDECARCLAICSLGVWICEELAQRTSHPQVKEAINVIGVTLKFPNKIVAQVACDVLQLLVSYWEKLQMFETSLPRKIAEILVATIAFLLPSAEYSSVETDKKFIVSLLLCLLDWCMALPVAALLHPVSTALLEEQHTARAPLLDYIYRVLHCCVCGSSTYTQQSHYILTLADLSSTDYDPFLPLANVKNSEPVQYHSSAELGNLLTVEAEKKRRSLELIPLTARMVMAHLVNHLGHYPLSGGPAMLHSLVSENHDNAHVDSSELSSEVFRSPNLQLFVFNDSTLISYLQIPTERPAGGPPVGALSDVRVIVRDISGKYSWDGKILYGPLEGCFTPSGRNSSSLISGWHHQTLGPQKVFSQIEEGEDVLDKLLENIGHTSPECLRPSQLNLNEPSPPPRGMSYDQEKEITEVILRQDTQEDEYVQRSNSASVVKVARQGQPMPAEPRGPFYFCRLLLNDLGMNSWDRRKNFHLLKKNSKLLRELKNLDSRQCRETHKIAVFYIAEGQEDKCSILSNERGSQAYEDFVAGLGWEVDLSTHCGFMGGLQRNGSTGQTAPYYATSTVEVIFHVSTRMPSDSDDSLTKKLRHLGNDEVHIVWSEHSRDYRRGIIPTAFGDVSIIIYPMKNHMFLIAITKKPEVPFFGPLFDGAIVSGKLLPSLICATCINASRAVKGLIPLYQSLYLFALTLGLKLATPEPR	358336	155786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_156096_178316_178476_184989_185146_186827_186952_194169_194242_195006_195779_201091_201276_206675_206814_206937_207007_208288_208400_213386_213496_216832_216892_220007_220137_228220_228350_266293_266450_266677_266777_268090_268285_289877_290055_292021_292113_297454_297553_299089_299240_313088_313254_316226_316465_321473_321586_325864_326014_330464_330600_331611_331780_333993_334222_340659_340860_342737_342877_344752_344869_345770_345949_348350_348395_358278
918490	contig_15691_pilon	+	3312	1	Intergenic	novelGene_60778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGCACAAATTGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101548	104860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_101500_104900
918491	contig_7815_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_134359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146536	143818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_143800_146500
918492	contig_3426_pilon	+	2404	2	Intergenic	novelGene_57909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	207	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAGTAGATTAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145061	148488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_145375_146397
918493	contig_12871_pilon	-	2610	4	Intergenic	novelGene_140379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	207	425	53788	53570	TRUE	55	AATGTCAGAAACCAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTKRSLLSHSLVGSKSKFRASAPVEGFLCRPWRKVLVISLPSFWEHLCTGASGPKDVLCSWCCFLGGMRFPCVSARFSLSYLKRDWLKTLSNLVNLISITPTNPSYYIIVIEFTTHKEITSDDTMVDSHTRLGITNQPN	53994	37042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_37126_42067_42114_43603_43733_51642
918494	contig_12312_pilon	-	803	1	Intergenic	novelGene_63923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGCTCCAATGTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60850	60047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_60000_60800
918495	contig_9839_pilon	+	5125	6	Intergenic	novelGene_88515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1688.67751805962	9	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAAAATCACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45378	61483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_49724_54122_57651_57850_59824_59927_61264
918496	contig_15741_pilon	-	2376	1	Intergenic	novelGene_159681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTTCCAAATCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78605	76229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15741_pilon_-_76200_78600
918497	contig_5047_pilon	-	608	4	Intergenic	novelGene_157994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	32.0970749792286	1	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	99	509	1132158	1085911	FALSE	30	GAATAAACTTCGCTTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRPQPWAQAPPVPGGDPWLVKSVSESHTPRPTESGSEAGPLQRSQSLPHSSTVALSGGVSDHSALGSSALSEREASRLDKFKQLLAGPNTDLEERSELRHMGTSHHQESSAGSRARPLDLRVLCYDAPRPRKD	1132256	1085811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1086036_1091793_1091974_1095665_1095760_1132146
918498	contig_13863_pilon	-	3797	1	Intergenic	novelGene_42105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTATTGTATGTTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496761	492964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_493000_496800
918499	contig_15551_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_176331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCTAGCTAGAGCAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138285	136211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15551_pilon_-_136200_138300
918500	contig_9332_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_60696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	607	948	36650	36309	NA	55	TTTTTAAAAAAATCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSSMLSSNFLNNVFALSMCIFLFCILCAKFYLFTSKLFIFSLFQSSRERDIGIYCKDLWRRKEAQESVPAAAFAGFVENLNIFFCLSEYYKKIIVTTEHLPHGRDCPKYFI	37256	34858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_-_34900_37300
918501	contig_3956_pilon	+	1849	11	Intergenic	novelGene_15010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1516.81267465696	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	81	797	1281682	1284841	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEIEPGKWRT	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284765_1284816_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286143_1289853_1289892_1290297
918502	contig_12250_pilon	-	2126	13	Intergenic	novelGene_80733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_12	130.476903022038	43	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1467	243	1709	416521	410501	FALSE	55	GAATGACACAAAAAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRNSSSAGSGSGDPSEGLPRRGAGRRLSEEEEEEDEDVDLAQVLAYLLRRGQVRLVQGGGAGNLQLIQALSDSEEEHDSAWDGRLGDRYNPPVDATPDTRELECNEIKTQVELATGRLGLRQAAQEHSFPRMLHQRERGLCHRGSFSLGEQSRVMSHFLPNDLAFTDTYSQKAFCGIYSKDGQIFMSACQDQTIRLYDCRYGRFHKFRSIKARDVGWSVLDVAFTPDGNHFLYSSWSDYIHICNIYGEGDTHTALDLRPDERRFAVFSIAVSSDGREVLGGANDGCLYVFDREQNRRTLQLESHEDDVNAVAFADVSSQILFSGGDDAICKVWDRRTMREDDPKPVGALAGHQDGITFIDSKGDARYLISNSKDQTIKLWDIRRFSSREGMEASRQAATQQNWDYRWQQVPKKAWRKLKLPGDSSLMTYRGHGVLHTLIRCRFSPTHSTGQQFIYSGCSTGKVVGKDCVRKGGLRKGMDVSPAFHL	417359	410083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_410722_411491_411646_412088_412275_412371_412430_412787_412857_413209_413265_413474_413622_413855_413957_414264_414330_414605_414734_414989_415118_416366_416547_417142
918503	contig_17144_pilon	-	1669	10	Intergenic	novelGene_29292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2329.68097217168	148	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	135	722	179764	167672	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQKYRPHPDDLGPG	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_167953_174695_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
918504	contig_7396_pilon	-	2573	14	Intergenic	novelGene_79575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3372.6174601553	10	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	99	1415	255163	246442	FALSE	10	CTTGTGGATGTTCTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257085	245283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
918505	contig_4180_pilon	-	4346	14	Intergenic	novelGene_8425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2785	3324	1152834	1136605	TRUE	40	GAAGGGGGTGGAAATAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGAILQDNLPLADDHQRGATALHAFKDVVLERAVVRLGRDGLNAVWIPDDQVSIRSHSDAAFPRVKVEDFGCIGAGHSHKLILIHLPSDHSLIPDDGHPLLGAIGALRNQGEVILSYSFLGSVESTMGTASDLEISADSKEFRKSGVVGSGLRGGEVTKAAALAQFLLHTHPFSGPGR	1157739	1072461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_1072733_1076122_1076213_1078057_1078243_1125305_1125470_1127665_1127729_1128284_1128367_1128938_1129003_1136501_1136636_1145010_1145106_1145579_1145723_1147772_1147945_1152735_1152915_1153721_1153886_1155199
918506	SIRV6	+	731	7	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	339	513	166	3	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	27	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469	10818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
918507	contig_7362_pilon	+	2892	3	Intergenic	novelGene_147550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	43	113	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	33	470	373689	410965	FALSE	40	GTCCTCTTGAACATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFGSALKGTRMAAVFLVTLYEYSPLFYIAVVFTCFVVTTGLVLGWFGWDVPVILRNSEETQFSTRVFKKQMKQVKNPFGLEITNPSSASITTGITLTTDCLEDSLLTCYWGCSVQKLYEALQKHVSCFRISTPQALEDALYSEYLYQEQYLYPFI	373656	413387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_373793_401898_402039_410771
918508	contig_4339_pilon	+	3398	2	Intergenic	novelGene_146103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	59	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	1947	2795	1217980	1218828	TRUE	35	CTGGAGGACATTATACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAQLFTTWFSEYFKPTVETYCSEKKIPFKILLLIDNTPSHPRVLMEMCEEIYVFMPANSTSILQPLDQGVISTFKSYYLRNTFHKAIAAIDSDSSDGSGQSKLKTFWKGFTILDAIKNIHDSWEEVKISTLTGVWKKLIPNLMDDFEGFKTSVEEVTADVVEIARELELKVEPENVTELLQSHDQTLTEKKLFLLGEQSKWFPDMESTREDAVNTAEMTTKDLEYYTNLVDKAAEAFARIDSNSERSYTVGKTLSNSIACYREIFRERKSIDVANSVVVLL	1216033	1255562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_+_1218927_1255057
918509	contig_990_pilon	-	3311	16	Intergenic	novelGene_76096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	133	junction_10	296.680269351068	132	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1084	3252	59	3310	1376800	1357108	FALSE	20	CTGTAGGGAACCCCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEGNGTENPCSRTLGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPLSPQTKDYMENKKVAVELKDVPSPLHAGSKLFPAVPLPDIHSLQQPKIQLSTVPKVSCCAHCTNESSTSPMHFGGGGGGGGGTGSLIHTGALLDSQSTRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLHQFPALQGCPSAAGYFPCSDFTSGAPGPMEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQTAPVAIPLCNGCGTKGTGKETTLLLATGLGKAASKFGSPEVAVAGQMLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFEEFISDLPPRLPLKMPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCATKSPSAIADKVKSPKKLKNLKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNANVKSLQELCHMESKTGNRNSEPQQGNMSLAAPPHSNSSAAVPTYKNSGMAESVYKGNQKKENLSARSVPSSPVERKDKEESMFQVSYPSAFSKLIVSRQVGPLLTSQSWSSRASPLAFNIANSSSGADCPDPFANGADIQISNIDYRLSRKELQQLMQEAFSRHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMETLQEAISAVNSLHRYKIGGKKILVSLATGATNKSLSLLSAETMSILQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGHKLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSHARQSPLGSSQSHEGSSVNCSPVIFEELEYHEPVCRQHCSNKEFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYAAEFGALEVMQENRGGVPLEHLITCVPGVNIATAQNGVKVLKWIHNKPPPPNADPWLLRSKS	1376858	1357106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1357134_1357400_1357577_1358317_1358438_1358566_1358804_1361123_1361205_1362663_1362843_1363758_1363922_1365431_1365591_1365679_1365838_1366036_1366463_1369415_1369589_1370161_1370280_1371538_1371766_1372672_1372848_1373529_1374220_1376656
918510	contig_1146_pilon	+	2275	11	Intergenic	novelGene_84831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	269.537845209165	18	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1448	2044	889493	892693	FALSE	60	GCACAACAATTTAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVGLLAGQPAVTVRHGFDLLTEMKTNNLSQGNELEVTIMMVVEALCELHCPEAIQGIAVWSSSIVGKNLLWINSVAQQAEGRFEKASVEYQEHLCALTGVDCCISGFDKSVLSLANSGRNSVSPKHSLNGESRKTVLSKPTDSSPEVINYLGNKACECYISIADWAAVQDWQNAIHDLKKSTSSTSLNLKADFNYIK	881938	892924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_882043_882473_882593_886933_887022_887109_887212_887696_888180_888304_888587_889038_889236_889420_889586_890329_890485_892192_892336_892487
918511	contig_7513_pilon	-	3043	1	Intergenic	novelGene_89000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1973	2332	613144	612785	NA	15	TGGCACCTTTGGTGTCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCIASPRKYIEVPTPVSVNVTLFGNRAFEDVISNMRSSFHLSGILQRWRRDTETGRQRKDAVRHCSCQSRNAWSCQKLRERPGWRRVSLRAPEGTNMADTLVSDSQPPELGDGTLLLI	615116	612073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_612100_615100
918512	contig_17560_pilon	+	2783	9	Intergenic	novelGene_167579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_5	98.9289517785365	82	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	915	2745	38	2782	58310	153941	FALSE	30	GTACAACTCAGTTTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCKCITKRQPRMKKASRSVGPVPKVSGISKTQAVEKIKPESSSSASTGGKLTKSGTATSLSKTKSSDDLLAGMAGGATVTNGVKGKKSTCPSAAASAPAPAMNTVENKAKISTGTSSSSKRSTSTGNKESSSTRERLRERTRLNQNKKLPSASQGANDVVLAKRPRSRTAAECDIRMSKSKSDNQISDKAALEAKVKDLLTLAKTKDVEILHLRNELRDMRAQLGINEDPSEGDEKSEEKETIIAHQPTDVESTLLQLQQQNTAIREELNQLKNENRMLKDRLNALGFSLEQRLDNSEKIFGYQSLSPEITPGNQSDGGGTLTSSVEGSAPGSVEDLLSQDENTLMDHQHSNSMDNLDSECSEVYQPLTSSDDALDAPSSSESEGIPSIERSRKGSSGNASEVSVACLTERIHQMEENQHSTSEELQATLQELADLQQITQELNSENERLGEEKVILMESLCQQSDKLEHFSRQIEYFRSLLDEHHISYVIDEDVKSGRYMELEQRYMDLAENARFEREQLLGVQQHLSNTLKMAEQDNKEAQEMIGALKERNHHMERIIESEQKGKVALAATLEEYKATVASDQIEMNRLKAQLENEKQKVAELYSIHNSGDKSDIQDLLESVRLDKEKAEALAGSLQEDLAHTQNEANRLQDTIAKVEDEYRVFQDEAKKQIEDLNMTLEKLRSELEEKETERSDMKETIFELEDEVEQHRAVKLHDNLIISDLENTVKKLQDQKHDMEREIKTLHRRLREESAEWRQFQADLQTAVVIANDIKSEAQEEIGDLKRRLHETQEKNEKLTKELEEIKSRKQEEERGRVYNYMNAVERDLAALRQGMGLSRRSSTSSEPTPTVKTLIKSFDSASQVPNPTAAAIPRTPLSPSPMKTPPAAAVSPMQRHSISGPISTSKPLTTLTDKRPNYGEIPVQ	58272	153942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_58463_67125_67280_83542_85177_86421_86630_102771_102846_103948_104125_107089_107254_139639_139732_153851
918513	contig_20641_pilon	+	1654	7	Intergenic	novelGene_52861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	10	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	27	1358	14659	56882	FALSE	20	GATCTCTGTGAAAGCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14632	57178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
918514	contig_13592_pilon	-	4019	2	Intergenic	novelGene_33723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	86	junction_1	0	1052	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270266	264237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_264461_266470
918515	contig_9121_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_134465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGCAAGGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227747	230432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_227700_230400
918517	contig_13612_pilon	-	1244	4	Intergenic	novelGene_157271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	872	1243	55230	25999	FALSE	35	AAGAAACTACCTCTCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSLAEMVRRSVDMNRGAASTVHRAIWDWASSKLRPKFPMSSYGDLSSAREQSEARRLRPWAAAFGDPSDPLPLTSVRHLPIPGTVELAHPPLGLVHVPAEDGFHGGTGRHSSPANTARRHLA	57537	25997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_-_26241_55100_55304_56239_56380_56879
918518	contig_11117_pilon	-	3213	1	Intergenic	novelGene_148598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2645	2977	94537	94205	NA	50	TCATTTAAACTACAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDTSISPRDRKSYINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRPDREHNREYQMEQEKGGVQNSNSIKKTRLNGLTETGGTLESMAPGFSISPELKQLPRPTLQTGIGLDCGT	97181	93968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_94000_97200
918520	contig_13456_pilon	+	5418	5	Intergenic	novelGene_153275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1418	1792	327220	327594	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEAQAALKAPGIDGIRTEMFSANGCSTGDTHLSMQEIWKTASWPTDWKRSIFVPILRKGDPTECRHCRTILLISHTSKTLLKIIQKWLQQCISRELPEIQAGFRRGCRMRDIIADQMDLG	135981	331269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_136129_207137_207642_278980_279446_326918_327719_327767
918521	contig_6272_pilon	-	3133	11	Intergenic	novelGene_160450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191228	153690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_153925_154949_155051_162090_162165_164419_164487_165670_165784_167188_167309_170025_170130_175029_175132_178309_178433_186636_186778_189274
918522	contig_10106_pilon	+	2940	11	Intergenic	novelGene_73881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	517.486270349272	3	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	143	1123	151101	172575	FALSE	45	GCACAGAATTAGGCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGEKQKLKNTDYPLIARILQGPCEQVSKVFLMEKDQVEEVTYDVAQYIKFEMPVLKSFIQKLQEEEDREVKKLMRKYTVLRLMIRQRLEEIAEPPETM	132900	174392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_133011_151068_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169340_169463_170993_171092_172505
918523	contig_3382_pilon	-	2434	2	Intergenic	novelGene_124013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCACCAGGCAAATGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135400	129898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_130000_133067
918524	contig_10263_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_135812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	293	610	17661	17344	NA	55	AAAAAAGCACAACGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPKSVDYRIGKSGKMDKYAARAMSVQVQRILQNRQEWKNGQACCHSQVCPSPRKYYRTDKSGKMNKHAATAMSAGVRRPLQSHQYVLTLQMGKTIESFAFSQTG	17953	15619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_15600_18000
918525	contig_10158_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_150769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTAAAGTAACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43296	44241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10158_pilon_+_43300_44200
918526	contig_6050_pilon	-	2715	9	Intergenic	novelGene_123111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_7	53.3291665038935	97	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	23	1111	359870	323202	FALSE	50	CAAAAGTTTCACTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKETEPMETAQESPYLKLPLANQLKNESSQSNHPLQDNELSMQNSEGASESAASVALHPSMAVPAPVAQPIPASSQQVLVQAAGFATRGAQMELISFPRVQQVPQQVQSMQHVCRAQVQYVEEGDTVYTNGAVRTAYAYNPKPQKYASSSATAYFEAPGSAQETVAASSPPVVPSHSMVGITMDVAGTPITSSASAYLIHGGIDITRHSLAHTSRWSPATLQWLLDNYETAEGVSLPKSSLYNHYLRHCQEHELDPVNAASFGKLIRSVFTGLRTRRLGTRGNSKCHYYGIRLKPDSLLSQLQEDTQCMAMQQQPVHQKPRYQPAQKTDSLGDSGSNSSLHSTPEQAIAAQSQHHQRYIV	359892	321597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_323207_323676_323793_328068_328189_329320_329503_339993_340256_340902_340983_344449_344540_346833_346947_359749
918527	contig_5628_pilon	-	3591	17	Intergenic	novelGene_157578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	57.3947065830116	125	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	913	2061	427589	410984	FALSE	70	GAAGGAAAAAACAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEKGSAAGSEQNLMCSFLQLLGDRWGRNGPRGWCVIPSDDPFVLYIYAAPQDMRAHTSIPLLGYQVTAGPQADPPGLPAAAVRPAVHVQG	434809	409453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_411104_411655_411803_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427627_427864_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431731_434266_434416_434700
918528	contig_8377_pilon	+	2211	7	Intergenic	novelGene_35144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3063.33132480892	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	128	1042	191158	197939	FALSE	35	TTAAAATATTTGTAGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	189182	199108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_189272_191119_191254_192216_192340_194008_194117_194346_194523_196081_196218_197663
918529	contig_14814_pilon	+	4889	3	Intergenic	novelGene_137726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1230	1712	311855	312337	TRUE	15	CCCAGGCCCTCAGACCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQLTISKHLQKQDRVVTVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKPLIFRTIQELNQKADKNEEKIDKFMENTDQKMEEFKKIIQEQNAKKNSQLEIIEQQQLEIQKINKKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISEIEDKHLDIILRKNQKKEQRKMKRP	310432	315559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_311265_311457_315207_315251
918531	contig_6299_pilon	-	4468	6	Intergenic	novelGene_172933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	12.3028451993838	138	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	470495	440555	FALSE	10	TTCACCCAGCTTTGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLSKQRSHSCGRMEPAAGGFSEEQFREACAELQQPALAGADWQLLVETLGISIYRLLDQQTGLYEYKVFGILEDCPPALLADVYLDLDYRKQWDQYVKEVYEKECNGETVVYWEVKYPFPMSNRDYVYLRQRQELEMEGQKIYVILAQSTSMPQFAEKPGVIRVKQYKQSLAIESDGKKGSKVFMYYFDNPGGQIPSWLINWAAKNGVPNFLKDMAKACHRYLKKT	470534	436770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_440621_442400_442469_443871_444044_446077_446158_449424_449543_470354
918532	SIRV7	-	2094	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	287	81	282	-79	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	40	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAGAGAACTATTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147636	1084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
918533	contig_2689_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_100842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	837	1202	266967	267332	NA	15	TCGCTGGGTCATATGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYFGCLLDPSCPVFSFQYVLILSAVFGTFSSYHLHCFILLFCFIWLCLSRHAVRSLLICGHDTVHFFVQWEGPVAQLWCSRAGPAEGEGLGWVVCGIYWGHQGGSGISAGQVPAGSACAA	266130	268524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_266100_268500
918534	contig_5686_pilon	-	6036	12	Intergenic	novelGene_45420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	2398	3069	208699	203000	TRUE	50	CAGCAAAACATACACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	231121	186577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_212480_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222915_224017_225102_230480
918535	contig_17198_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_62340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1027	1344	576190	576507	NA	40	AAAAGATTTACAGCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLSRPLYCILRSPGGTVVKRSAANQKVGGLKPPASSREKDVAVCFPKDLQPSTDCISLRPEELDGAQLPPMTTLTGNTTESPCQSRREVGCRTQILVKRPDLMV	575163	576884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_575200_576900
918536	contig_12644_pilon	-	1522	2	Intergenic	novelGene_44481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	0	16	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1028241	1025891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249
918537	contig_6199_pilon	-	2282	3	Intergenic	novelGene_126336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1031	1417	81610	81169	TRUE	30	ACTGGAAGACATTGTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSQAVFQHLGTTSPDLVAAPVGSLEALLFFFLSSFYLFILFFFLLLFVFLHFIVSHLSSLLSPIPILAPHVTISPLHPAYLRRGLNITPPSSTGMAYQNLPCTDYRRALVVVVGATNNPSQQFLFS	82640	79577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_79955_80680_81376_81430
918538	contig_8978_pilon	-	3497	10	Intergenic	novelGene_49443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_9	20.0154261496131	78	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	1112	2236	1522314	1486799	FALSE	10	CTATTGATCGTTTTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTPEGNLDEPDDLETEVLQELTGIDKDGSLPCAVTDVWGEEEETEETESEDRIIVQQNEVSGDEILRNVDQLSEVHIEPEVGGSSRSKCDVDQSLQPEPFFHKVVQSEDFRIASQVQSVQCSPEESFPLRSRSDSPPKTKSKNSLLIGLSTGLFDANNPKMLRTCSLPDLSKLFRTLMDVPIVGDVRQDNLEIVEIEDEHIKEGPSDSEDIVFEETDRDLQELQASMEQLLREQPGEEYSEEEESVFKTSDAEQMANGTDLADEDDNPSSESALNEEWHSDTSDGEIASECEYDSVFNHLEELRLHLEQEMGFEKFFEVYEKVKAIHEDEDENIEICSTIVQNILGSEHQHLYAKILHLVMADGAYQEDNDE	1531457	1485537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1486813_1493772_1493906_1494791_1494923_1495916_1496126_1500711_1500864_1513372_1513621_1514451_1514541_1519893_1520012_1522283_1522464_1530495
918539	contig_17560_pilon	-	2592	1	Intergenic	novelGene_167571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGGAAAGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5199	2607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_2600_5200
918540	contig_9468_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_59462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATGAATGATTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153417	154328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_153400_154300
918541	contig_11512_pilon	-	2231	11	Intergenic	novelGene_43345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1166.8139526077	4	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	18	764	581687	556654	TRUE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	581704	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556130_556357_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645
918542	contig_9924_pilon	+	2064	6	Intergenic	novelGene_175921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	207.582850929454	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1950	114	2063	116907	128991	FALSE	55	AGACTCAAACAGAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLKPSVVTKYVESDDEKPLDETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDNEKSNKVYDHTPRFSPKKNSSNCNGEEKKLDDPCSGSITYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEITSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHVALEEDLNSEIRALDAVNKEKNTKEHKVIDAKSETKVRKGEKSCALERKDISKSEGKLSRKQTDSEYMDQSVPTEEQRANKSTSGEHKKCGRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQGSADYQGDSNSGTEQELESSVKLNISSKDNRGGIKSKTSAKVTKELYVKLTPVSLSNSPVKGADCQEVSQDKDGYKSSDLNPKSENCGPVQESSDNEHLVENEGPLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRQTELNPATSNSDEESSETVKEKQKLSVPLRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSEIVDQNSDFDEMLAILKEVSRMSHSSSSESDINEAHTNHEKTLFDL	15757	128992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_15765_116800_116926_119585_119700_123901_124012_126980_127049_127352
918543	contig_19816_pilon	-	1626	9	Intergenic	novelGene_156473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	301.131200641846	34	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	24	1151	126795	122240	TRUE	45	GTGGTAAAAAGCAAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKVDWKIWPISPGFVPF	126818	117427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_117799_122135_122287_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126435_126731
918544	contig_15371_pilon	-	3493	2	Intergenic	novelGene_151444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	58	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1461	1793	148263	147931	FALSE	45	CTTTCAACTAAAGCATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGLRALSQPALVELFHLDFKMKLCKFTGEEKRLAKVIESEQRWKYIKAVFKTCKWLKDAGESPLSGKKTSRTFPSCFKQMVGKGTKLMESKEVVKPNRWQLTTTRRKW	166327	146230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_148859_165462
918545	contig_14575_pilon	+	4920	4	Intergenic	novelGene_101909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	4.92160768674447	222	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATAGCAGCTTACTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109595	117762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_109822_111287_111566_113159_113278_113464
918546	contig_12790_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_35283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1159	1599	447474	447034	NA	40	GACACCTAACTACAACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMNFLNWFSSLVTLKDVDDSASSSKEGTANSWHEVAIQIPKISPQIDQVLVKGGALSDCMCDIFLQFCHNEEYKQAGWLVLLLLDKLVKERDELRASESKLVLHKGPQSFHLCPKRKPIPCSNRADIAKNQTQSLIVRVAELQR	448632	446083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_446100_448600
918548	contig_14643_pilon	-	1044	1	Intergenic	novelGene_99142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTGGAGCCCTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156049	155005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_155000_156000
918549	contig_11422_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_98983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGAGGTATAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
918550	contig_12532_pilon	-	3578	5	Intergenic	novelGene_111161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAATGAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249860	174901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_175569_214435_214858_246108_246806_247776_248980_249271
918551	contig_11309_pilon	-	2584	7	Intergenic	novelGene_149856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4230	junction_6	1053.49545165922	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	115	858	64259	56293	FALSE	25	CTTCACGAATTTCACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	64464	54566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427
918552	contig_4125_pilon	-	4461	20	Intergenic	novelGene_25252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	202.063797829675	175	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	710	2133	339	2471	3031212	3008064	FALSE	25	AAATGTTTTGTCATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRLGYVSLCDNAKTGCKARELKSVYVDAVGQFLKLIFHQNHVNKYNIYNQVALVAINIIGDPADFNDENNVTSREKLIDHYLGHNAEDPALDGTYTGKPDYISPLDDLAFDMYQDPEVAQIIRKLDERKHDAVQKERYDYAKKLKQAIADLQKVGERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAKVYQQLELHNLMDAELMRRPFDLPLQPLVHPGSPRHQKPKPSLPQQEERLTEKRAMEPLLQEQPSSRSRSVPPQHAAVGQVEMLPYDERPLPAIRKQQGETHMEYELSDPDVSEAQKGGISGEPEPLTEKALREASSAIDVLGETLVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRFSVSALAHRVYEVRETAVRIILDMYKQHRAFILEYLPPDDNNTRKNILYKTIFEGFAKIDGKPTEAEIRAQKKAATEEVERQKKEEIKVLQGQLAALKEIQVEVQEKESDAMKLKNQDTQGRKADPPNAPETPDNHYLDHLCIFCGERNESFTEEGLDLHYWKHCLMLTRCDYCKQVVEIASLTEHLLTECDRKDGFGKCYRCSEAVLKEELPRHIKTKDCNPSKSEKLANRCPLCHENFSPGEEAWKAHLMGPAGCTMNLRKTHVLHKVQAPPPGKGSAMTRAGTSGLKAGSKIPTPKRGLSKSSSRTYTKR	3036467	3006073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3013497_3013607_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760_3017869_3018214_3018422_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3026849_3027048_3029023_3029216_3030519_3030676_3031086_3031256_3034948_3035026_3035495_3035559_3035743_3035883_3036451
918553	contig_4678_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_126014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	585	896	273650	273339	NA	15	AAATTCTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDHPDKKHNRESLTEQEKSRVQNSNSSKKTRLNGLIETRGTPEDMASGLSVNPELKPFLKPILQAKIRLDYGTK	274234	273086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_273100_274200
918554	contig_1867_pilon	-	2091	2	Intergenic	novelGene_54618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTACCACAGAGGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559763	554781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_555435_558325
918555	contig_2577_pilon	-	3805	1	Intergenic	novelGene_172075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2601	3089	268496	268008	NA	15	TCGTGCAGTATTTCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLLNNIINITRKSNIAEDNSKTVAAVHRQGIARNSSWIQKSIWNDRIIADTRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLQRMGISEHLIVLMWKLHRPRSSHLNRTKDTARFKNRKGVHQGCIFSPYLFNLYAKQTIREAGVCDKEWRKTH	271096	267291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_267300_271100
918556	contig_7565_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_172908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131951	131415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7565_pilon_-_131400_132000
918557	contig_6217_pilon	+	3344	1	Intergenic	novelGene_109706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAATAAAAGTCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1101141	1104485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_1101100_1104500
918558	contig_6477_pilon	+	1516	2	Intergenic	novelGene_154197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	370	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTGGCAGAAGCCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808464	811648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_808679_810346
918559	contig_9548_pilon	-	3850	5	Intergenic	novelGene_141071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATACCTGGGATAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222205	168481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_171148_174744_174897_175157_175530_175709_176139_221974
918560	scaffold_12124_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_22395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	599	1378	1508626	1509405	NA	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508027	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508000_1510600
918561	contig_16098_pilon	-	1376	11	Intergenic	novelGene_45941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1547.88812257217	15	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1014	363	1376	350768	348286	FALSE	30	AGACTCTGAAGACTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFSGT	354097	348285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348411_348919_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352216_352352_353990
918562	contig_6137_pilon	-	3925	2	Intergenic	novelGene_59276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTATGGCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345577	1341504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1344069_1344216
918563	contig_7840_pilon	+	2813	2	Intergenic	novelGene_68973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	985	1533	158677	159225	FALSE	35	ATGGGGTAGAGGGAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKIIKKRLQQYIDRELLEIQAGFRRGCETRNIIADARQILAECREYQKNVYLCFMTMQRDLTVDHNKLWIALQRMGILEHLIVLMWNLYIDQEAVVQGMDAASFKIRKGVHQGFFSPYLFCLYAEQIILKTALYEEEQGIRIRGRLINNLGYADNTTLLAENEEDLKRLLMKIKNYSLWCG	156973	160505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_157159_157877
918564	contig_17144_pilon	-	2339	18	Intergenic	novelGene_29313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2063.26699149691	69	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1983	148	2130	179764	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPRGLGCLQERVWSVS	183229	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166320_166525_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172574_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
918565	contig_9505_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_121875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	158	358	664912	665112	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAELGGTLGLFDKGLQNAVWIFRAQQPVSPGAVYELQRAGTQLVQREHWSEEMGRQRLASGAAGSRSLSSAAQGTCVLHVVGADTTVGLTPSLCPSRILWEERDGSCISLGLLLDSQL	664754	666795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_664800_666800
918566	SIRV6	+	716	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	63	4	63	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGGGGAAAGAGCAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10300	11326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
918567	contig_960_pilon	-	2855	13	Intergenic	novelGene_108235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	417.344848083958	23	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	347	1693	487192	443706	TRUE	30	CCAAGTAGATGTACTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPEVIACDENPDATYDYRSDLWSCGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFFSFIEGCLVKNYMQRPSTEQLLKHPFIRDQPNERQVRIQLKDHIDRTRKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEEVPEQEGEPSSIVNVPGESTLRRDFLRLQQENKERSEALRRQQLLQEQQLREQEEYKRQLLAERQKRIEQQKEQRRRLEEQQRREREARRQQEREQRKREQEEKRRLEDLERRRADEEKRRVEREQEYIRRQLEEEQRHLEMLQQQLLQEQAMLLHDHRRPLPQPHPHPQPQPPQPPQERSKPSYHAPEPKPHYEPADRAREVPVRTTSRSPVLSRRDSPLQGSGQQNSQAGQRNSTSSIEPRLLWERVEKLVPRPGSGSSSGSSNSGSQPGSHPGSQSGSGERFRVRCRVAFFFPLPLSNIGLDQCIGSL	490030	441671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_442106_442977_443929_445281_445389_450484_450626_451322_451410_454132_454271_473573_473785_475883_475957_478717_478894_483087_483167_484616_484672_487135_487267_489758
918568	contig_6189_pilon	-	4289	1	Intergenic	novelGene_164967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGTGTGTGTCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220010	215721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_215700_220000
918569	contig_11316_pilon	-	1187	1	Intergenic	novelGene_122684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGAATTTGAATGATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140702	139515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139500_140700
918570	contig_10734_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_51339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1667149	1668968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1667100_1669000
918571	contig_4000_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_176085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1000	1356	290214	290570	NA	40	GTAATGAACTCTCAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPFEIPEVLAIPFETETVRLLVFLVSSASASCGLSALKPHARTYPTGASVPKFCSSTNKCLGHPTLLGSLLCTGTQFSYSVGQLQCCLALVSLFCCCCLSSIHSQFQNCFHVLDIC	289214	291653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_+_289200_291700
918574	contig_7707_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_72217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	770802	772530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_770800_772500
918575	contig_16067_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_169850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTTTCTCCTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74816	74232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16067_pilon_-_74200_74800
918576	contig_1301_pilon	-	653	5	Intergenic	novelGene_47293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1141.99242007117	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	223	534	268752	259065	FALSE	40	ACTTTAAAAAGGTACTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEEKKESETSREDEYKQKYSRTYDETYQRYRPASTSGSATPSSSLSTMSSSLYASSQLNRPNSLVGITSAYSRGLTKENEREGEKREEEKEGEDKSQTKSIRERRRPREKRRSTGVSFWTQDSDENEQEQQSDTEEGSNKRETQTHLLKI	269219	258945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_259086_264256_264323_266537_266660_268649_268819_269063
918577	contig_7452_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_109166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGTTTGATGCCTCTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382468	384242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_382500_384200
918578	contig_13863_pilon	+	2389	9	Intergenic	novelGene_42094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	314	junction_8	299.593787485655	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1009	2076	478688	490279	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	476887	490592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
918579	contig_7839_pilon	+	3577	1	Intergenic	novelGene_45754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGGAAAAAGAATCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1121303	1124880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_1121300_1124900
918580	contig_1443_pilon	-	1736	7	Intergenic	novelGene_28362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	91.0158716317593	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1572	165	1736	945539	939290	FALSE	20	CCAGCTACTACCACCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREQVLCHPLLEDRLSLCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNYQTGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDVPVEKPPEETAAQIPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVNSSDTAPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTADRSHSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEEGEQMTPELLMLQERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRNQEMVTGGILGLGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGVDEKEFTVQIKDEEGGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVEGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAEFNCLGVEPVQTANSRNGKKGHHAETVFNRVLPGPVAPESSKKRSRRMQPDLSKMMALMQGGGPGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMGGAASSPHVDSSTMLHHHHPHPHPHHHHHHHPGLRATGYPSS	945703	939289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_939665_942217_942335_942738_942778_943113_943231_944102_944406_944696_944849_945070
918581	contig_7179_pilon	-	4110	5	Intergenic	novelGene_78210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_4	38.3690956369837	126	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	111	2018	1698267	1684759	FALSE	20	GAATGGGAGTCAGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSASPLRPLSGPGAAEADLENPSAVPVPEWGPDLAGMAPRPPKAVLQESVTFKDVAVDFTQEEWHHMDPAQRILYRDVMLENYSHLVSLGYQVSKPEVIFKLEQGEEPWISEEEIQRPFCPDWETPEAKSSKPQQGISTISCNTDDLSHATLEDSWDVRSQLERQQENWRRPLRPDAYTQKKIIVPEESFEQNKFGENSGLSTDLVTQLNIPSRIRPSECNTLGSNLGHNSDLLNQNNILTKKKPYKCNKCRKAFIHRSSLTKHEKTHKGEAAFPSGTDQGIYPGKKHHECTDCGKTFLWKTQLTEHQRIHTGEKPFECNVCGKAFRHSSSLGQHENAHTGEKPYQCSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPYRCNLCGRSFRHGTSLTQHEVTHSGEKPFQCKECGKAFSRCSSLVQHERTHTGEKPFECSICGRAFGQSPSLYKHMRIHKRGKPYQSNNYSIDFKQSSSLIQEESTLTEVKSYHCNDCGEDFSHITHLADHQRIHTGESPYDCEQAFSQQPNSHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSFIEHHRIHTGEKPYECNECGEAFSRRSSLTQHERTHTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQHERTHTGEKPYECNECGRAFRKKTNLHDHQRIHTGEKPYVCKECGKNFSRSSALTKHQRIHARNKV	1698773	1682666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1686411_1689722_1689819_1690160_1690288_1698234_1698303_1698698
918582	contig_12180_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_160345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	168	539	11920	11549	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINVGEVAERLEHLHTAGGNVKWYNHFGNQFGASFKKKARNRSTSNDPAIPLLGIYPREIRATTRTDICKLMFTAALFTIAKRWKQPRCPSMDEWINKLWYIHPMEYYTMIKNNDEFMKHLIT	12087	9922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_9900_12100
918583	contig_13528_pilon	-	2975	1	Intergenic	novelGene_66857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTTACTTTCAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26226	23251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_23300_26200
918584	contig_9668_pilon	-	4833	1	Intergenic	novelGene_58225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAAAATCTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559351	554518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_554500_559400
918585	contig_3252_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_61495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299070	300495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_299100_300500
918587	contig_1084_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_152382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506254	504221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_504200_506300
918588	contig_16360_pilon	-	5114	20	Intergenic	novelGene_170072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	155	junction_8	87.6904338475164	229	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	896	2691	341	3031	93797	60579	FALSE	40	TTTAAAAAAAGTTTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTGFSSPNPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLNSSSSSSSNSSNEREDFDSTSSTSSTPPLQPRDSASPSTSSFSCLGVSVAASSHVPIQKKLRFEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSSPTAATSQQQQLKHKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDKCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDVCFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA	94137	58495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_60675_62928_63082_64785_64959_66015_66122_66850_66965_67812_67921_69026_69113_69545_69657_70139_70245_71270_71464_73796_73916_74877_74946_78935_79019_79317_79408_79553_79717_80613_80688_81738_81809_82437_82542_90999_91116_93238
918589	contig_10732_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_114726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAATCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379471	381074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_379500_381100
918590	contig_4392_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_117322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCCATAAAACAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434423	432351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_432400_434400
918591	contig_9345_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_24733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTAGATGACTAAGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1074833	1075432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1074800_1075400
918592	contig_14666_pilon	+	1144	2	Intergenic	novelGene_39571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	94	834	477340	484940	FALSE	10	TGTCTTGGGTATTCAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKVRRKRWLTWAGFTMIIGFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477246	485250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477446_484305
918593	contig_5153_pilon	-	2833	1	Intergenic	novelGene_74379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	2065	2538	967665	967192	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSFEQNKGIPRGLESRKECVSVASFHHTYSICMLSKIIREAGLYEGERGIRIGRRLIKNLCYSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQNHNRGFRTELEKNVEHNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSHRFTVQPGSGQPRKTK	969729	966896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_966900_969700
918594	contig_7945_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_161604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425562	426681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_425600_426700
918595	contig_3252_pilon	+	1791	1	Intergenic	novelGene_61489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	632	1147	252361	252876	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIRTLKRCWWECKMIQPFWKRIWCFLRKLEIELPYDPAIPLLGIYPREIRSHHLNRHMHTYVHGSIVHKTAKSWKQRRCPTTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYGMRPLL	251729	253520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_251700_253500
918596	contig_16666_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_61713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	330	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAGTGTGAGGTATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4008	703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_700_4000
918597	contig_4876_pilon	+	3630	1	Intergenic	novelGene_137883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTCTCTCTAGGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191524	195154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_191500_195200
918598	contig_8978_pilon	+	4088	28	Intergenic	novelGene_49423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_15	62.9522648863485	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1266	3801	116	3916	437503	525637	FALSE	10	CTGGGGCAGTGTCACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGTLSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSLKNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAASGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQLPPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRDSFLDDVNLILANSVKYNGPDSQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLYDTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPTTTPEKQVTQEGEDGDGDLADEEEGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFSAIQLSESGSDSDVGSSGIRPKQPHMLQENTRMGMDNEESMMSYEGDGGEASHGLEDSNISYGSYEEPDPKSNTQDTSFSSIGGYEVSEEEEDEEEEEQRSGPSVLSQVHLSEDEEDSEDFHSIAGDSDLDSDD	437267	525809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_437335_437454_437629_441939_442114_442338_442444_444381_444583_444739_444882_445348_445480_446148_446230_467264_467415_467598_467719_467997_468174_468888_469068_470546_470761_471240_471407_472561_472774_476209_476319_476539_476639_477347_477526_503619_503688_504882_505006_505917_506011_506092_506178_516764_516833_517072_517190_520497_520624_521768_521926_522551_522730_525414
918599	contig_19094_pilon	+	3728	1	Intergenic	novelGene_177781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGTATCTTCCCTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6610	10338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19094_pilon_+_6600_10300
918600	contig_3147_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_142291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2229	2546	327205	326888	NA	20	CCCTGATCCCAGCAGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWALEGLAEGVGAGPGQDSWSSSSCGNATRLPGPGHAWSARPRKSLWEAHNLEVVLRHSWIPVTASDPSPLCPLQTLDFCLIEALFIPTFSQLCIKRPQASEACR	329433	326543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_326500_329400
918601	contig_18283_pilon	+	3601	1	Intergenic	novelGene_170705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCCTATGATGAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111262	114863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_111300_114900
918602	contig_7744_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_62462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATTCAGGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425421	423704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_423700_425400
918603	contig_16231_pilon	+	514	2	Intergenic	novelGene_176706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	3	323	8783	9103	TRUE	15	TGGGTGAGTACACTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGQRADGSRGHSGGSGSQALPRLSAWRPCRRGTTGLVAAARSPRCLWSRFLPPSGVVSRGGVGRSRYGKLPPSHAGAWLCGPVAREPFPLLPPAGIVTWKGSGAS	8780	25506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_9122_25333
918605	contig_9888_pilon	-	1708	2	Intergenic	novelGene_162260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43690	38139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_39439_43281
918606	contig_15172_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_158741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAAAAAAAAAAGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220438	221860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_220400_221900
918607	contig_2770_pilon	-	2238	2	Intergenic	novelGene_107489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746049	743765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_745095_745140
918608	contig_10857_pilon	-	2728	1	Intergenic	novelGene_160907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	79	240	98	337	449110	448871	NA	20	TTTGTTAAAGCTGTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRNHSQTGVQASQDWPCRLTGAGPSKTRPLTMPLYVPAAAGAWHLLCAVLICQGEPPAPFTKLHLPAGKRKRHLGAQVLLGRLSASPRQPGCWCCPSGRQHWCSRARGGA	449207	446479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_446500_449200
918609	contig_11505_pilon	-	1517	2	Intergenic	novelGene_140918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGAAAATCTGAACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90691	41805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_43004_90372
918610	contig_10958_pilon	+	1364	4	Intergenic	novelGene_5432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	32	307	888255	895837	TRUE	45	CACAAGGACGCAGAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNISCKLSCILCKCSRDPFCIWLTLSCIPP	888223	901497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889019_895752_895855_900457
918611	contig_8818_pilon	-	2708	6	Intergenic	novelGene_178233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	431	799	58087	57010	TRUE	70	GGAAAAAAAAAAAGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCLCIISSCEFILAFCSYIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFFSCLSAFCVSSWKIRSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWMPTGTILSCFCKCFDIVCCFGGIQI	66538	1155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8818_pilon_-_1679_43145_43265_44625_45769_56885_57017_57725_58434_66454
918612	contig_34_pilon	+	1615	4	Intergenic	novelGene_40028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTACTTGTCGCAGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216045	380404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_216966_217370_217637_378517_378622_380079
918613	contig_5023_pilon	-	2396	11	Intergenic	novelGene_7353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGAGAAAGGATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648302	614401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643544_647172
918615	contig_11175_pilon	-	862	1	Intergenic	novelGene_61176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTCTTTTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249803	248941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_-_248900_249800
918616	contig_7962_pilon	-	1256	1	Intergenic	novelGene_149301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227231	225975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_226000_227200
918617	contig_10581_pilon	+	3942	8	Intergenic	novelGene_41415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACAGCGTCTTCCGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616257	649698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_619082_619574_619758_620242_620396_627358_627549_628814_629036_632023_632160_633201_633383_649644
918619	contig_8866_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_77911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGACAAAAAGGGAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167119	1169070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1167100_1169100
918620	contig_17214_pilon	-	2512	1	Intergenic	novelGene_153470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81777	79265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_-_79300_81800
918621	contig_10627_pilon	+	2732	21	Intergenic	novelGene_59953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	99.0709215663204	1	136	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	786	2361	54	2414	172734	179015	FALSE	30	AAGCATGGCTGAAATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKKGKVGKSRRDKFYHLAKETGYRSRSAFKLIQLNRRFQFLQKARALLDLCAAPGGWLQVAAKFMPVSSLIVGVDLVPIKPLPNVVTLQEDITTERCRQALRKELKTWKVDVVLNDGAPNVGASWVHDAYSQAHLTLMALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFLSKTSEISLDDEELAQHPATTEDVRACCQDIKVLGRKELRSLLNWRTKLRRHVAKKLKEQAKALDISLSSGEEEEEGNEEESTAGTRRQPSKEEEEEEQLNQTLAEMKAQEVAEKKKKLLREQRKQRERVELKMDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTSLDSDLDLEEGAGGGGHQGLKDQQRVQFAEVEDDKEEEEEENPLLVPLEEKAVLQEEQANLWFSKDGFAGIEDDADEALEIGQAQLLYESRRKGQEQPQPQPPSSLKTERKSPQCQDEAPKGTETPKGTEAAPDPEGKDKDDSSDSDSSSSEDEEREPHRGKKRSRGPKSDDDGFEVVPIEDPVKHRILDPEGLALGAVIASSKKAKRDLIDNSFSRYTFNEDEGELPEWFVQEEKQYRIRQLPIDKKEVEHYRKRWREINARPIKKVAEAKARKKRRMLKKLEQTKKKAEAVVNTVDISEREKMAQLSTRRLGLARRSAKSPML	172566	179333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172594_172707_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174348_174431_174627_174709_174826_174941_175047_175129_175231_175460_175542_175633_175775_175918_176055_177073_177256_177416_177538_177622_177895_178138_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178872_178959
918622	contig_16647_pilon	+	3419	1	Intergenic	novelGene_170316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAGCAAGCATGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358000	361419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_+_358000_361400
918623	contig_12864_pilon	+	2924	1	Intergenic	novelGene_76346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAGGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83732	86656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_83700_86700
918624	contig_16578_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_148686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACAACTGTTGTGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320148	321815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_320100_321800
918625	contig_16999_pilon	+	5442	1	Intergenic	novelGene_84955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTCCAGACTAAGACAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42314	47756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_42300_47800
918627	contig_5571_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_75531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAAATGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235729	234991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_235000_235700
918628	contig_13365_pilon	+	3929	3	Intergenic	novelGene_168079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	226	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2317	2913	26953	27549	FALSE	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRDCGEIGTPMHCWWERKIIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICPPLFMAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTTEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKHCMRPLL	20232	28565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_20824_21364_21830_25692
918629	contig_6445_pilon	+	2474	2	Intergenic	novelGene_76995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	205	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	103	339	448414	492790	FALSE	60	AAGATCAACAAAATCGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLEIEVPHDPARPLLGIYPREIKAITRIDICTPMFIAALFTIAKRWNQPRYPSKDEWINKLWYIHTTEYYATIKNDDDAVKHLITWRKLQVIMLSEFSQAQKDKYCIRPLL	448311	494925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_448598_492737
918630	contig_8412_pilon	+	1456	2	Intergenic	novelGene_118388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	109	junction_1	0	13	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTGGTTTAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684916	687995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711
918631	contig_9177_pilon	-	5842	36	Intergenic	novelGene_32596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1583.57552187112	18	136	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	3799	5406	15057	2152	FALSE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITLFPSFLCLPGIAARDVAGGLRALAQAARGVAALTSDPAVQAVVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPASPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	28420	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_13322_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
918632	contig_5260_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_144408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAACTGAAACAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481701	481038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_481000_481700
918633	contig_9706_pilon	+	2188	17	Intergenic	novelGene_20902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	623.142590022541	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	121	1401	231608	555590	TRUE	20	ACCCTTGCTTTTAATGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRLVRPATTSTRCSSPMTDPLRSFSASVSSS	91318	698586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_555500_555638_688565_688730_698010
918634	contig_5059_pilon	+	956	1	Intergenic	novelGene_140741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279499	280455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_279500_280500
918635	contig_7275_pilon	-	2334	14	Intergenic	novelGene_111231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_11	55.3186573061372	3	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	67	1392	190578	167273	TRUE	60	AAAGACAGAGAAAGTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQTLQQEFSLINVQIRNVNVEMDAADRSCTVSVHCSNHRVKMLVKFPAQYPNNAAPSFQFINPTTITSTMKAKLLKILKDTSLQKVKRNQSCLEPCLRQLVSCLESFNQEDSASSNPFALPNAVTPPLPTFARVTTAYGSYQDANIPFPRTSGARFCGAGYLVYFTRPMTMHRAVSPTEPTPRSLSALSAYHTGLIAPMKIRTEAPGNLRLYSGSPTRSEKEQVSISSFYYKERKSRRWKSKREGSDSGNRPIKAAGKVIIQDIACLLPVHKSLGELYILNVNDIQETCQKNAASALLVGRKDLVQVWSLATVATDLCLGPKSDPDLETPWARHPFGRQLLESLLAHYCQLRDVQTLAMLCSVFEAQSRPQGVPNLFGPFPSRSSNLVVCHSRYPSFTSSGSCSSMSDPGLNTGGWNIAGREAEHLSSPWGESSPEEIRFGSLTYSDPRERERDQHDKNKRN	193308	158888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_159664_167105_167280_167398_167526_168466_168540_168639_168791_170151_170265_173033_173116_174208_174343_183433_183588_187174_187245_187781_187939_188095_188189_190413_190579_193242
918636	contig_3386_pilon	+	2074	4	Intergenic	novelGene_34520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACAGTCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404156	408430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_404940_405102_405196_406371_406844_407704
918637	contig_6445_pilon	+	2925	1	Intergenic	novelGene_77047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	329	655	629525	629851	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQSSQTILAIMGFIREVTGYNSGSGTLKIQFFHQDSLPGPRPLPGPRPLPKGTQLSLSVGQKAQHHLLLLGLCCWVFPATASHRLSHSLSHQVCQWLTGDDCNIVM	629196	632121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_629200_632100
918638	contig_3956_pilon	+	1408	8	Intergenic	novelGene_15211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1917.96340753755	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	173	712	1284132	1290310	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1282875	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282897_1283903_1283978_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285739_1289810_1289892_1290297
918639	contig_15236_pilon	-	2176	7	Intergenic	novelGene_141627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	321	junction_3	431.656660115678	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1157	1708	637863	618893	FALSE	35	ACTGTGTTTAATATCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMFFVFIQLLSSGSAWFGIIVMVVTCLFLDIVKKVFERQLHPTSTEKAQLTETNSGIKCLDSVCCFSGGEAACTSVGRMLERVTGRCGPAPVSRSWSGSEPFCTNDRSFLTLSTMDSSTC	646580	618424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_618975_623267_623402_635486_635653_637192_637297_637797_637864_644160_644300_645563
918640	contig_10973_pilon	+	2083	1	Intergenic	novelGene_150340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATAGTGAGAACTCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	3120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1000_3100
918641	contig_7840_pilon	-	3073	2	Intergenic	novelGene_68947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAAGGTCACGCTGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32055	12622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_12870_29229
918642	contig_6418_pilon	+	2264	3	Intergenic	novelGene_81170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATGCAGCAATTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543003	609986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_544583_592692_593191_609799
918643	contig_5136_pilon	-	7191	1	Intergenic	novelGene_126618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	4753	5370	214827	214210	NA	45	TATATATATATATATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKKPQISKALLKKKNKVEGLTLPDFRTYYTVTVVKTAWYWYNDRYIDQWNRTENPDVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTPQAFMHGINRIQTITIKAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFIKRVKREPTDWEKKFLDSTSQTKFKSP	219579	212388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_212400_219600
918644	contig_10082_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_63881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGATTTTCTGTGACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283248	285966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_283200_286000
918645	contig_15518_pilon	+	1933	5	Intergenic	novelGene_127588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	224.188536727461	2	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	513	731	15096	37386	TRUE	50	ATCATAAAAATGACCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11270_11338_11415_14882_15202_37273_37389_38035
918646	contig_17796_pilon	+	2758	6	Intergenic	novelGene_33794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	969	junction_2	54.50357786421	97	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	149	1075	53527	96579	FALSE	85	ACCAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKGTKIVYFFLVPFFKLYIFDLKYQ	53378	98262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325
918647	contig_15629_pilon	+	3663	1	Intergenic	novelGene_122456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATATTCATTATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115169	118832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_115200_118800
918648	contig_17936_pilon	-	2781	1	Intergenic	novelGene_29948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59376	56595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_56600_59400
918649	contig_5816_pilon	+	3249	29	Intergenic	novelGene_158233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2942	3247	184760	194497	FALSE	25	ACAAGCAACCGCCCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDPLGLPPPHPLRMMLFPPGPGPSLLAFPLGFVMQSADRGLRDLSLQVHWITQFGWHRFLAHLPMARGGQAGIALCAYLPPPSPAGLTAAADGCFPGYYNN	13547	194499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_13701_39629_39821_48895_48980_53765_53894_56603_56707_57815_57963_60945_61068_65382_65683_66644_66806_72323_72362_75576_75645_83306_83401_83681_83796_92765_92808_95040_95135_96293_96357_98093_98178_125890_126001_126760_126850_138054_138155_148740_148828_149500_149571_160522_160606_164159_164292_171048_171152_172616_172702_184663_184770_192933_193103_194370
918650	contig_1037_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_84590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	350	850	147468	147968	NA	5	CTCCACGGTCCCGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGLRGLQGQLCGEEGPLAQSCGICPVLWVGKAGGHVCPHAPSSKHTPRVLRQGVVDLQIVVLGHNGGTTLALARHLVLEQHAGLPLQARGGGGVSGCDSSPASGAGAQLAPGALLPCSSLWSVSRGAVGRLARGRSSSLKSLTSLWFRLRDSCPEVTYATPELW	147118	149461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_147100_149500
918651	contig_7870_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_109011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAATTTCATTTGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517197	516325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_516300_517200
918652	contig_15114_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_121195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAAAAAATGGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750835	752341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_750800_752300
918654	contig_8796_pilon	+	3367	4	Intergenic	novelGene_178986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1773	2567	22107	88600	FALSE	50	TAAATCACCACTAACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELRSLILRILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMVSLTDSPL	19882	89400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8796_pilon_+_20379_20696_21192_21325_22875_88573
918655	contig_7895_pilon	+	855	3	Intergenic	novelGene_154452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	108.5	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAAAAGTAACTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725155	730716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7895_pilon_+_725356_728162_728235_730133
918656	contig_6740_pilon	+	3632	1	Intergenic	novelGene_142674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGACCATGGTCCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599487	603119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_599500_603100
918657	contig_15413_pilon	+	2382	1	Intergenic	novelGene_176953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47480	49862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15413_pilon_+_47500_49900
918658	contig_8683_pilon	-	2894	2	Intergenic	novelGene_150275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1642	1968	724695	724369	TRUE	75	GCTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKQAVYIHVKKYHSAIKRNKLQIHRTTWMNWKCIMLSERPDLKGYILYDSIYMTLLQRQNYRDRKHISGHHGLGLGKKVDYKGYEEILERGEFTQLYVSQNSYISIK	726336	722523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_722998_723916
918659	contig_9389_pilon	-	3940	2	Intergenic	novelGene_84148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1846870	1842878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1844804_1844855
918660	contig_13519_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_124642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTTGGATTTTCATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107206	105291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_105300_107200
918661	contig_10958_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_5337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGTTGCTGTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551298	549845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_549800_551300
918662	contig_18272_pilon	-	2222	2	Intergenic	novelGene_7020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGCCATAAATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192805	187433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_187880_191029
918663	contig_10599_pilon	-	1283	2	Intergenic	novelGene_49901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAATTAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319689	312842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_313449_319012
918664	SIRV7	-	629	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	5	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1349_114707
918665	contig_4103_pilon	-	2971	2	Intergenic	novelGene_51992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	687	1088	206382	205981	FALSE	30	GTTCAGCATTGTTCAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVASLTITPSDPLARFFLPVPATLCSAGLEVLVPKGGMLPPGDTSLIPLNWKLRIPPGHFVVFMPLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQEEIGLILHKGGKEEYVWNAGDPLGHLLGLPCPVIKSMENYSNLILT	207133	204097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_206752_206816
918666	contig_7357_pilon	-	3761	1	Intergenic	novelGene_36925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1480	1809	622839	622510	NA	65	AAAGTCAAAGAAAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPTPPGLEGPRRGQLGSTPISSILLHTQRLGHLVPTRQAPHHRRAFVPAAPSSRNVHMFSPPRLCRDHSSPSLRYLHGEFLLGGLFLTRPFSPHQAPCPYPALAPSEL	624318	620557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_620600_624300
918667	contig_12113_pilon	+	5082	4	Intergenic	novelGene_134757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	90.2748888426652	268	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	392	1735	348781	354183	FALSE	30	CAATTGTGGGTAGAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYFVMDYIPGGDMMSLLIRLGIFPENLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSNCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQVKVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHSFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDGNEEENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQHTGSEIKNPDLVYV	348389	357530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_349325_351458_351642_351855_351963_353673
918668	contig_20596_pilon	-	3704	2	Intergenic	novelGene_157236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1150	1554	94206	93802	FALSE	30	GATCCTGAAGCTGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVQLGLLPSVPSVLDHMLPPEIIECQTIHFGTVTLYFFHLLLMLPVSFSILPIEFLRIATRGLIFFFSSFSLRNVEHVLCFWFSNFRSLHISLYYFYFVFSSHPLISSVQLFIIFPFCFSSSTFKSKFQSLF	95675	91651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_-_94308_94627
918669	contig_9195_pilon	+	2318	7	Intergenic	novelGene_155681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	35	junction_4	66.5173327453496	141	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	665	1504	291971	298773	TRUE	45	AGCAAAAAATCCTATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSGVSHSSAAPTVGFSQASNVGLFSGLEHTSTFVTASGPSSSSVPGNSGFSFKSATNLGVFPSTSHFGPEAGERASSGFGKTEFNFKPLENAVFKPILGAESEPEKTQSQVASGFFTFSHPVSSGPGGLATFSFPQVTSSSPTNSSFTFSKPVNSNNSSSTFAPALSTQNVEEEKRAPKSLFGSSNSSFASFPVSSAGSLGDPLAGGRTGARQGCEEAASQMDPLPRLTKGLKRKEDQDRSPRRHDRDMAEDSDPLSRGDHPPDKRPVRLNRPRGGTLFDRTLQDVLKSNKEIGRLGNKEPKKEIGSVKSEDSDHTAVPGGCQSVLALSRLPGVNKEEETEGREKKEDSLRGTPVRQSKRSESTDSLGGLSLAEFTAIQCKNIPDYLNDRITLEKHFSKIAEVKRVSTRRSKKMAVVYFFDHASAALARKKGKDLHKDVALFWHKKKISPNKKPFTLKEKQLGDSEVNPGPEDVSSQHSPLRKSVGRVTAGGGLLSKSSP	291306	302392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_292350_292561_292786_296228_296308_296541_296690_298763_298954_300979_301120_301898
918671	contig_14687_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_107930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATTGGTATTTGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471740	473949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_471700_473900
918672	contig_10023_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_123463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	507	887	45794	45414	NA	10	TGACTGTCTTTTCCCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVPQFIHSSVDGHLVCFHLFAIVNNAAMNMGVHMSVRVTALISLGYTSKSGIAGLYGISISSFLRKYHIVSQNGCTILRFHQHKRVPSSPQALQYLLFSVFLIHASIVRDEIVSHCSFDLHFSNG	46300	44893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_44900_46300
918673	contig_12969_pilon	+	5757	5	Intergenic	novelGene_61666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	159	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	3792	4271	298238	298717	TRUE	20	CCTACGGAGGCTGACGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIEMALFSEAFSAFIAYIGLLSSVSSLMSNQSDLCWEGFSAFIAHIRFLSCMSSLMYNQTALHSEAFSTITAYIWFLCSMSTLMYDEIALHGEAFSTFTAYVGFLSCMCSLMSDKWTFQGKAFSTFIAYIGFLSSMSSLMYNETVLHGKAFSTFIACI	294446	311907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_299686_300206_300294_300630_300761_304449_304658_311814
918674	scaffold_13609_pilon	-	2627	22	Intergenic	novelGene_124401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	687	1004	607800	604917	TRUE	25	AGGGGCGGAGCCAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLRKFNIDLRSAARCGIHWTPGRGPGPEEILVLLLELDALNSTSRRCSIETDEPGLLSIVISATKSISVSISSPSCIVLGLWIFGLITNGHSFRHKSTSCSSL	619358	515990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_-_516219_564621_564692_572408_572506_573271_573479_574893_575047_597824_597888_599964_600044_600932_600980_601064_601134_601745_601846_603360_603463_603748_603900_604030_604158_604786_604928_605126_605233_607152_607284_607730_607835_608313_608392_616961_617073_617323_617501_618473_618565_619163
918675	contig_3155_pilon	-	1757	4	Intergenic	novelGene_26332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	31.4783876475414	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	63	326	61964	61106	TRUE	80	CAAAAAAAAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAALYIWAVGILAAGQSSTMTGTYSGQFVMEGFLNLRWSRFARVILTRSIAIVPTLLVAIFQDVQHLTGMNDFLNVLQSLQLPFALIPILTLTSLRPVMSDFANGM	62026	59632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_59726_59767_61184_61623_61774_61928
918676	contig_10050_pilon	-	1313	2	Intergenic	novelGene_119633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAACCAATGTCATAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426572	249907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_250603_425954
918677	contig_12886_pilon	-	2545	4	Intergenic	novelGene_135544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1560	2000	895729	895289	FALSE	70	CACAGCAGAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALFHLIFVWFIHNLLFHNISPTLIFLYSQLFYLVEDFFLIYAASQFFANSLQTPSRLIDLQVRFLCSFDNSETSFLLSSSSRKGLLPPNIFWFYRTILLLVVQFLADIFNILCTISDSRRISIIDHFILEFLNPRGFLDFRFVP	901939	894743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_896959_897505_897700_898158_898272_901916
918678	contig_1380_pilon	-	1203	1	Intergenic	novelGene_138859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1206	3	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_0_1200
918679	contig_13958_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_129536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	65	364	144004	144303	NA	85	CAATAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKKIVLHIDLNQIFCFFCLEVILQTLVEPKTKKKVVFESVLTHGDPMYVRIELCFVEFSMAEFSEVARPFFDLNLRTFQLASKHINCLHHPGTPSRT	143939	145845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_143900_145800
918680	contig_10861_pilon	+	3275	5	Intergenic	novelGene_39392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	330	junction_1	303.596257387999	94	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	258	680	1910254	1924759	FALSE	75	CCAAAAAAAAAAAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTYRQREKQGSKVQESTKGPDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLYEDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLVREYLRKKPQYENVLS	1903767	1927354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1903879_1909485_1909605_1910226_1910335_1913305_1913420_1924531
918681	contig_2798_pilon	-	2833	1	Intergenic	novelGene_120033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGAAAAAAAGAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125967	123134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_123100_126000
918682	contig_7057_pilon	+	2537	5	Intergenic	novelGene_123395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	6	junction_1	25.2438111227287	72	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	190	1827	1221279	1239048	FALSE	30	TTCCTCTAAATATCTACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANASFAGQQVCGAPHTVMPEVELTDQLFTVLPVDHELVTFRDVVISFSQEEWEYLDSSQKDLYWDVMMENYSNLASLDFESAHETKSLGIGKDIINNSDSQWDIMESSKSTGLENFIFRNDWQSKSNIEVQGSEVGYFSKRKIISEKVPSYKNHKYLTLLHQSIHHNEKPYEYKEYGKVFTCDSNIDEYERICTGEKTYECNECWNSFGVDDLYPIQLNIHTSMKPCKCFEYGNIFNFHEDLSEHQKIHNNEKNYKYKEYRRTFKVVGEMTSLQKIHAGEKPYECMVCGKSFRVHAQLTRHQKIHTDDKPYKCLECGKDFRFHSQLTEHQRIHTGEKPYKCMECEKVFRISSQLTEHQRIHTGEKPYACKECGKAFGVCRELARHQRIHTGKKPYECKACGKVFRNSSSLTRHQRIHTGEKPYKCKECGKAFGVGSELTRHQRIHSGQKPYECKECGKFFRLTSALIQHQRIHSGEKPYECKACGKAFRHSSALTEHQRIHTGEKPYECKACGKAFRHSSSFTKHQRIHTGETLYECKECGKAF	1220551	1239758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1220694_1221231_1221293_1224824_1224919_1226133_1226261_1237645
918683	contig_3601_pilon	+	3089	2	Intergenic	novelGene_132849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2687	3001	131041	131396	FALSE	25	CCGGTGCTTTCCAACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKKKPSKKENKNLREKECPQGSLCASAQAEGVGPKPHSTVRPEQAPNLRKRKQTIQNKQTKSPGIPPAWQHGPGRVPHSNGAPQPLRKKQRWHMESGI	128354	131484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_131065_131105
918684	contig_9345_pilon	-	2570	2	Intergenic	novelGene_24706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGAAGAAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972915	968322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_969183_971205
918685	contig_10581_pilon	+	3835	8	Intergenic	novelGene_41375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_4	34.3736966357732	6	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	578	1708	475832	485194	FALSE	5	TGTGGTTTGTTTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSITKDMDIYSYRLPLGVCAGIAPFNFPAMIPLWMFPMAMVCGNTFLMKPSERVPGATMLLAKLFQDSGAPDGTLNIIHGQHEAVNYICDHPDIKAISFVGSNQAGEYIFERGSRHGKRVQANMGAKNHGVVMPDANKENTLNQLVGAAFGAAGQRCMALSTAILVGEAKKWLPELVERAKNLRVNAGDQPGADLGPLITPQAKERVCNLIDSGTREGASILLDGRKIKVKGYENGNFVGPTIISNVKPNMTCYKEEIFGPVLVVLETDTLDEAIKIVNDNPYGNGTAIFTTNGATARKYSHLVDVGQVGVNVPIPVPLPMFSFTGSRASFRGDTNFYGKQGIQFYTQVKTITSQWKEEDATLSSPSVVMPTMGR	475005	487321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_475033_475281_476085_477421_477544_478888_479079_479280_479463_480930_481111_481387_481487_485089
918687	contig_2069_pilon	+	2690	17	Intergenic	novelGene_23338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	43	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGGACCCAGGCGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606151	670877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_606289_607876_608195_609280_609472_610321_610499_611899_612135_615191_615369_616157_616269_616879_616955_618581_618698_619110_619211_620026_620209_621870_622062_624904_625009_625436_625490_650657_650735_652121_652268_670577
918688	contig_4315_pilon	-	2005	7	Intergenic	novelGene_46803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_5	116.206353813665	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	89	892	339053	328205	FALSE	65	AAAAAAGAAAGAAAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	339141	327091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
918689	contig_15965_pilon	-	4031	3	Intergenic	novelGene_178987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	714	1223	34413	33904	TRUE	55	ACATAAAGACTCATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTRYHLTQTRLVLIQKTQNNKCWRGCGETETLIHCWWESKMVQPLWKLIWRLLRKLEIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAVTRVDICTTMFTAALFTTAKRWKQPRCPSTDEWINIFWYIHTTEYYAMIKNNDEAVKYGITWWKLELILQSEFSQPQKDKYCIKPLL	35126	29098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15965_pilon_-_29506_30026_31437_32912
918690	contig_5499_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_57024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	823066	823419	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTRCGAHDPRRPLRLLTAQPILSEHTACYFLRIGPVRDSILLTSSRVRGAVHFYLDCVESIICSFQNALSHFRRWSPTLPLSARAASPPPRSAVLEKPPDPRLQLADTAEVKRHGRS	823065	824709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_823100_824700
918691	contig_11507_pilon	+	2255	1	Intergenic	novelGene_103362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	478	804	115206	115532	NA	25	CAGTCTCTCTTCTGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGHHLVLVSWQRRQLFMEAISRTFHFFLLLRTGRRLINNLCYADDTTLLAESEEDLKHLLMKTKDHSLRYGLHFNIKKTKILTTGPISNIKINGEKTEVVKDFILL	114728	116983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_+_114700_117000
918692	contig_3077_pilon	+	2318	9	Intergenic	novelGene_26873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	76.9622472385	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	158	1042	1337784	1346705	FALSE	40	TAAAACTGAAGCTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPCGGRSRAQPPTVYLGAAMTQPLPDKAPAKKHVRLQERRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYAGHRTKIMETTSMPTTSEAMTGRRRSTLQPRAPCPTRWRTSGRWCGKKKCPSLSCSLSSEKAKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336996	1347981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337103_1337732_1337906_1338432_1338533_1340785_1340839_1342061_1342195_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
918693	contig_15500_pilon	-	2042	1	Intergenic	novelGene_129002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTCACACATACTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271878	269836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_269800_271900
918694	contig_19606_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_148267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAAGGAACAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36358	38648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_36400_38600
918695	contig_15062_pilon	-	2301	12	Intergenic	novelGene_162298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1099	1398	91369	87569	TRUE	15	TTTTATGAAGTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVMGDTVENHPSGVVDKSTHFWLLRGFHQHLFDKKTPHAVRHPDHGPVPDTSRSELPEEFAASECNGLSFHGASCSPVTEAGVVFHRYNAESRTVSC	95315	62305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_62357_64129_64262_67941_68069_69500_69628_72427_72590_76488_76640_82638_82782_87558_87656_89738_89838_91255_91438_92396_92540_94428
918696	contig_13612_pilon	+	3049	7	Intergenic	novelGene_157289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	82.9151172384546	9	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	1140	2006	51083	53792	FALSE	80	GTTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWLAWERFRCNINCKEDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLGQHFQNVSLNQLHPGCLGSWFPGPHPLL	49373	54835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_49848_49913_50043_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53441
918697	contig_5566_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_153683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1269	1571	272868	272566	NA	30	TGAAGATGTTGTCACTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPNTRADQQGTHPVNPGQPSTESGWKQRCIPCSCGITRDEISIRLDHALSFAYAPILAFIIGPVGCLSPHRDHALIIFGFHVKVTCIGCLITVIVNSQV	274136	272453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_272500_274100
918698	contig_9274_pilon	-	3830	1	Intergenic	novelGene_151156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACTTAAGTTTGCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508436	504606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_-_504600_508400
918699	contig_9995_pilon	-	3137	2	Intergenic	novelGene_47656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	366	2408	110096	108054	TRUE	40	TTCTGAGTGAAATAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEIKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIQFSTAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	110461	80942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_81627_108008
918700	contig_10904_pilon	-	5341	7	Intergenic	novelGene_22554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	280.81810047708	8	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	30	743	662714	658096	TRUE	30	TAACATTCAAGTCTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSDSYFIHSML	662743	391148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_393389_475053_475321_656004_658125_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665
918701	contig_4392_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_117340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAAAAACCCCTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605092	602817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_602800_605100
918703	contig_12120_pilon	+	2538	2	Intergenic	novelGene_21427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	534	2005	2538	89310	89843	FALSE	35	ATTAGGTCATTTCCAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRISGIEDKHLATTLFQENSEKRTKKNQETLRVMWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTKNKERIIEEPLTENFPNIMKDEKLAIQEAQGTPYRRDPKRKSPRHIILILSKTKDKQRILRAACGKQEVTYRGERLSSDYSAETMQARRQCDDIYKTFQEKNCQPRIIYPAKLYFRLDGE	87025	89843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_87547_87826
918704	contig_7293_pilon	+	392	4	Intergenic	novelGene_54252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4979.55607124437	140	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAAGCTGCAGTATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335643	336570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335654_335758_335804_336110_336241_336363
918705	contig_1719_pilon	+	1995	12	Intergenic	novelGene_87282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1193	1498	371781	375269	TRUE	15	CGAACTCCGTAGTGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNILHSFECFLPQFHADSTVQLNKPGFQMHGLAFWIVKIDCRTLVMVALNLRQVHSQIVTQLTELSLTSVLEAEFESLLGDIMVETLYSRIVSKKVQTLPV	363228	382068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_363310_363712_364065_364686_364871_365091_365209_366800_366906_370006_370183_371603_371810_373440_373642_375193_375360_375732_375866_376033_376227_381987
918706	contig_2069_pilon	+	2183	11	Intergenic	novelGene_23266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	303.675813985902	5	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	116	958	333898	341321	TRUE	15	GCCTCCGACTCTCAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324052	344360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_333841_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519
918707	contig_11338_pilon	-	1800	7	Intergenic	novelGene_6374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_3	91.2988073428247	57	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	817	1665	307395	295354	FALSE	30	ATGGAGGACACGTCTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	308211	295218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230
918708	contig_18108_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_33452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCTTCTCTCTCCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86726	89341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_86700_89300
918709	contig_13214_pilon	-	4423	1	Intergenic	novelGene_175709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3447	3752	3418	3113	NA	30	TTTGCCCAGTAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGTFNYGLPLRVIRSASGMKNIPSGTKLLKFSRSICRPIISFKSLGTSHSCNGLGKVTTGMSRTFPRKGCSIKKSRTCIYGYMEIFKFPKGRIVCYIHLP	6864	2441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_2400_6900
918710	contig_6634_pilon	+	2637	1	Intergenic	novelGene_171150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTCCAGCTTCTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353656	356293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_353700_356300
918711	contig_11493_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_143653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGACACTACTCACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107743	108564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_107700_108600
918712	contig_9239_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_137178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTAAAGGACAGAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175562	176755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_+_175600_176800
918713	contig_14829_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_163811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1839	2282	46115	46558	NA	50	CAACGACACCTAACAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLKWSRIFILLGSTINTYGSSSQEIKQHVALGKSAAKDLFKALKSKDVTFKTKVPLTQATVFSIASYVCKSWTMNKTEEELMPLNYGISEEYRIYHGLPKNERICLGRSTARMLLRSKDGETSSHILWTCYQEGSVPGEGHHAW	44276	46716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_44300_46700
918714	contig_11026_pilon	-	880	1	Intergenic	novelGene_167650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	154	453	83269	82970	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESITARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHTKDQIYWPERDWRNPNSMAPRHPFSSVVKSLPRFTIQMGTGQPHKTKRY	83422	82542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_82500_83400
918715	contig_4884_pilon	+	3357	1	Intergenic	novelGene_63791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATAAACATCATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196615	199972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_196600_2e+05
918716	contig_15952_pilon	-	3801	1	Intergenic	novelGene_154098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATAAAAGACTGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738025	734224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_734200_738000
918717	contig_5549_pilon	-	3496	1	Intergenic	novelGene_81662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTCAGCTATTTTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468568	465072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_465100_468600
918719	contig_21208_pilon	-	2903	2	Intergenic	novelGene_175780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTATCCAGGATTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77601	73318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_73570_74949
918720	contig_10642_pilon	-	2650	1	Intergenic	novelGene_78714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGTCGAAAGGACTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	907222	904572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_904600_907200
918721	contig_13377_pilon	-	685	4	Intergenic	novelGene_162525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.9470120998333	105	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	61	477	10902	232	FALSE	25	GCACTGGTGTGGATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTVSVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRALALTSLLSLQRAGAIKADHVSTYAIFIQTHSPSGEYMFEFDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGQAFFFDAQAGPTYIASLKTLLNYMIQLSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVQLGQPNTLICHVTRFM	10962	23	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13377_pilon_-_250_4256_4328_4646_4893_10820
918722	contig_9698_pilon	-	5929	10	Intergenic	novelGene_82501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	675	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAACCTATAACATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273105	235572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_239205_254499_254666_257696_257807_257918_258162_262139_262194_264718_264768_266734_266794_268646_268783_270842_270913_271695
918723	contig_6513_pilon	-	3020	1	Intergenic	novelGene_117738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTTCAGGTTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47371	44351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_44400_47400
918724	contig_13901_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_146650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCTTCTAAATTCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215946	214033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_214000_215900
918725	contig_11012_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_163686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAAATAAGTTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417889	420184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11012_pilon_+_417900_420200
918726	contig_3153_pilon	-	6358	1	Intergenic	novelGene_104708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCCTCCAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486411	480053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_480100_486400
918727	contig_15491_pilon	-	5097	1	Intergenic	novelGene_75964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	42	299	46982	46725	NA	50	TCAAGAAATCAAACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGNFSFFLQYFQHHHLKHLSEENLRLVICRTFINMLFNVRFSEVTEDHSNTS	47023	41926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_41900_47000
918728	contig_1452_pilon	-	446	2	Intergenic	novelGene_115169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715442	710737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_710974_715232
918729	contig_11986_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_69093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACAGGGGGGTGCTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29349	30313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_29300_30300
918731	contig_7457_pilon	-	2141	4	Intergenic	novelGene_31479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_3	83.1745153277132	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1197	1697	549396	537177	FALSE	40	CTCACATAAACCCAGCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEVRLLFLLVFEQLIFHPHKGAIFLFQ	550592	536732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_537384_537938_538037_539131_539211_549279
918732	contig_4754_pilon	+	2204	2	Intergenic	novelGene_35912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1491	1796	180150	180455	FALSE	40	TGAAGTAACCAAGCCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCQMMSGSDRLESIYLSRQPKGDAESAALRRNELEQQLCAASAKCLYVSPHVFKFFTKKKNRYDKTIFTLPCPALFHLSYLWSPVGHTVSHIIFIKIHQT	178487	180863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_178937_179108
918733	contig_7119_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_41033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1334	1642	392853	392545	NA	10	ATGTCCCTACGTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICTFIHSFKKLLLGTFYVPHSSPDAVRVTYPCPCPYVEEAAAGTDHDTVSALRCHIKPGFAANWPHWACITDREGSPHSPPLPIVALSLLRVSAVAEIRAI	394186	392471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_392500_394200
918734	contig_12677_pilon	-	1154	2	Intergenic	novelGene_110750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	127	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574	16	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_135_538
918736	contig_19459_pilon	-	922	6	Intergenic	novelGene_59807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	456	junction_5	8583.26608232554	4	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	243	584	11335	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SADWGYDGKNVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16236	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_16203
918737	contig_10708_pilon	-	1380	7	Intergenic	novelGene_174358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	344.158878039392	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	23	487	505554	476043	FALSE	55	AAAATCATGTTTTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASRGDFMFSADRLIRLVVEEGLNQLPYKECMVTTPTGYKYEGVKFEKGNCGVSIMRSGEAMEQGLRDCCRSIRIGKILIQSDEETQRAKVYYAKFPPDIYRRKVLLMYPILSTGNTVIEAVKVLIEHGVQPSVIILLSLFSTPHGAKSIIQEFPEITILN	505576	475149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_-_476048_476104_476150_492343_492443_496251_496414_501466_501530_502589_502660_505533
918738	contig_8775_pilon	+	5433	8	Intergenic	novelGene_166820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	124	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3904	4359	180169	223892	TRUE	45	AGAGCAATTAGAGTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDILLSEISQSQKDKYCIRPLLSQSSSAAPTEIPQVDGFTKRNLFSHSPVGYKSKFRASAPGERFLHWLWRKVCVISLPLVWELLCAGTSGPKDMLCSRHCFLDGMRFLPRCSLLSFMSQKTLTQATT	2703	252793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_3081_77617_77909_159248_160200_160315_162448_180016_180303_192595_192858_223832_224080_251906
918739	contig_4232_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_63326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGAGCGTAGTATACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467500	466946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_467500
918740	contig_9235_pilon	+	2670	3	Intergenic	novelGene_156230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	4	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	199	1347	45805	46953	TRUE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45208	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_47922_47968
918741	contig_17427_pilon	-	1968	10	Intergenic	novelGene_30357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	946.014211779553	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	50	415	188879	179683	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEPETSCKERATST	204710	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179721_184575_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
918742	contig_17144_pilon	-	1770	9	Intergenic	novelGene_29359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_2	1540.49194658719	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	37	1476	172736	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173161	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
918743	contig_13968_pilon	-	2346	1	Intergenic	novelGene_106866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	741	1145	25347	24943	NA	80	GAAAAAAACAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLLKYTDSYLLQKFSILKELENNKNRPVVKFYCTQKNLVAYSFPPPDFFLCFSLGSLEEQTSEIYICMCIYICIYLLQGNGSHSCRGWQSLKSMGPAAGLQGCRGWQIQNLQVRWQAGDFCTLTSQEPEVKR	26087	23741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_23700_26100
918744	contig_7189_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_117655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTATCTCACACAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508714	509615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_508700_509600
918745	contig_6629_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_173771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTTTTCTTTATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169522	167114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6629_pilon_-_167100_169500
918746	contig_3277_pilon	-	5213	3	Intergenic	novelGene_74739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	747	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGCTTGGTAGTATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283139	270574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_272567_278432_278563_280048
918747	contig_1516_pilon	-	6548	1	Intergenic	novelGene_49934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGCTCAGGCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152777	146229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_146200_152800
918748	contig_8687_pilon	+	2633	1	Intergenic	novelGene_169681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	574	876	347130	347432	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDAGSIKRRWKEYTGSLYQKELIDIQPFQKVTYDQEPVVLKEEVQATLKALAKNKAPGTDRISVEMFQQTDSALEVLTYLCQEIWKTASWPTNWK	346556	349189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_346600_349200
918749	contig_8020_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_114420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228422	226829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_226800_228400
918750	scaffold_12510_pilon	-	5779	20	Intergenic	novelGene_151361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_7	398.99328301263	238	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	656	2269	253602	191536	FALSE	40	ACATAAGTAAAGCATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGLAAVATAAEYPGQEASGGNLSGVNCGPSSGAGPGPGPGSWSRSLDRALEEAAVTGVLSLNGRKLREFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLTELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVRLPEELAELPLMRLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQMITLDNNPLQSPPAQICIKGKIHIFKYLNIQACKIAPDLPDYDRRPLGFGSCHEELYSGRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFSDLPLRVAEITKEQRLRRESQYQENRSSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCAAEEEEDEVRQPKGLDSDSLSSQFMAYIEHRRISHEGSPIKPLPIREFQKAEDMRRFIHQSRVPVDPSSLLSVSPSHNQLSHTDLELHRRREQLLERTRREAQRAALQYEEEKLRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQAPLDGESLSGLNNQVGCATTLPHSSAFTPLKSDDRSNASSSSPTAETVHHSPAYSFPAAAIQRNQPQRPESFLFRAAVRVETNKGHGSPLLSSSAPATDSTDSITRQDSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPAVPKLTMAKCRRNVENFLEACRKIGVPQEQLCLPLHILEEKGLSQVAVTVQALLELAPPKPQQHQFSAI	300571	188025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_191662_199365_199444_206082_206221_206837_206957_208017_208129_208631_208681_212532_212608_219764_219813_221543_221694_222107_222160_236702_236780_240038_240188_243066_243188_244011_244106_252203_252314_253485_253623_256441_256548_262905_263033_264951_265097_300314
918751	contig_10003_pilon	-	2385	1	Intergenic	novelGene_88174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGCGCTTCTTCCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423868	421483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_421500_423900
918752	scaffold_13505_pilon	-	6154	5	Intergenic	novelGene_111594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	121.243556529821	2	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACACTTCCCCGGCTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661912	652843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_653140_653683_653874_654866_656126_656804_657265_657963
918753	contig_9809_pilon	+	1703	6	Intergenic	novelGene_176764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	153.98233664937	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTAAAAGCCCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112242	118056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_112362_112466_112590_114811_114925_115897_115984_116752_117407_117448
918754	contig_10196_pilon	-	1487	2	Intergenic	novelGene_132214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307691	1305726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1307062_1307539
918755	contig_1275_pilon	+	927	2	Intergenic	novelGene_108824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4342	junction_1	0	45812	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	90	779	747279	747968	FALSE	15	TTGTGTCTGTCGTCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC	746547	748116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272
918757	contig_1694_pilon	+	2242	1	Intergenic	novelGene_144988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	930	1322	1670028	1670420	NA	85	GAACAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHHSLHQTDSSTTRWRPATTTNCSDRDHTRGSWTELEENVEQNSNSKKDETYWSDRDWRNPESTAPGHRFNSVQNCLLRFTLQPKIRQAHKTNNNTRSSTICMRLNGHTNPGASMRRQEVTGRLDE	1669098	1671340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1669100_1671300
918758	contig_7912_pilon	-	2934	4	Intergenic	novelGene_129575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	9.10433352249844	102	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	222	1922	309394	301283	FALSE	60	AAAATTAAAAAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAPKDLAQVPVTGKALMEPTQGSVNFEDVAVYFSQEEWGLLDEAQKLLFCDVMLENFAIIASLGSWHGTEDEETSSKQNVSVEIQVRTSNAGSSTQNTHPWEMGVPFLEDILHMTKQATHPGQNSCLGGACVRCFWMRASLHQHQNCHSGVNPFKKDMDGASFRKRCRFHVSGMPLSCEEIGKDLPATLSLLQYQSTLKSENPPSNLECGEAFHSGKTLCKWNKCGKSPSHKHTLVHHESVCTGEGLYEDSKCEKDFSCRYRLVQHQGVHTGQRPYECSECGKSFRYKCLLIYHQRVHTGERPYKCEECGKSFRDSSTLIQHQKIHTGERPYECSECGKCFNRRSDLNKHQRSHTGERPYECSECGKFFGRHSLLHKHKRIHSTATPYECSKCGKFFSYCSYLNNHRRIHAGTELYECCECGKSFSQGSSLIQHQKIHIRAMAYECGECGKSFSRKSLLIYHQRVHTGERPYQCVECEKSFRHRSAFIRHWKIHTGERPYECIECGKLFSRSSHLNKHKRIHTGEKALSVAKVGNPFSTNTASFDSRVHIGTKAYECGEWEIL	309615	300270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_302785_305911_306039_308681_308721_309361
918759	contig_10042_pilon	+	2622	1	Intergenic	novelGene_79175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	264	620	787282	787638	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIPWAARRMNKSVLEEAQPECSLETRMARLCLTYFGHVIWRYQSLEKDITLDKAEGQQKRGRPLMRWTDTEAATMDSSITMIVRMARTGQCFILLYIGSLRVGMDSRAPNSSNIYL	787018	789640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_787000_789600
918760	contig_9945_pilon	-	2159	3	Intergenic	novelGene_104805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCACAGTTCCCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74618	42204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_42840_45614_45820_73299
918761	contig_11281_pilon	+	2497	1	Intergenic	novelGene_125498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	964	1290	933856	934182	NA	20	GTTGCTATGAGTTGGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAASKEDGRNTQSHCTKKNYSMFSLFRRQHMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDGILTEMFQQMDATLEALTRLQEIWKTTTWPTDWKRSIFMLISKKGNSTECRNY	932892	935389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_932900_935400
918762	contig_14970_pilon	+	2113	3	Intergenic	novelGene_45086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11938	junction_1	336	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCTGATTGTATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216257	225920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_216674_221180_221253_224295
918764	contig_14665_pilon	+	2032	1	Intergenic	novelGene_171049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61743	63775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_61700_63800
918765	contig_15666_pilon	-	3179	4	Intergenic	novelGene_70205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	82.6357469057228	565	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	690	1628	132068	129963	FALSE	20	CTGCCAAGTGAATGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYPFEIQGIAGCELLSGENTVSFLRGALGGLDFLSVKNYSCAPAPEGGSRAERFCALVSQYQGILDTIEKLLYKSCPRFLLSVLNAGKADLQRQEKPETWLSGGPSPGSDRLLLVCHISGFYPKPVWVMWMRGEQEQLGTQRSDVLPNSDGTWYLRATLDVVAGRAAGLSCRVKHSSLGGQDIILYWGKKVRKNWCPPNMEGDVP	132757	128411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_130298_130515_130795_131446_131711_132007
918766	contig_3627_pilon	+	2365	3	Intergenic	novelGene_78421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	27	junction_1	17	47	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	681	2043	323	2365	145411	212946	FALSE	55	GAAGATGACAGGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVRSLLTRAGAARMNLERTEVLFQNPESLTCNGFTMALRSTSLSRRLSQPPVVIAKPKKVPPCKNLEKQHECEYKALTDVGVRHSENQSDPMQDPPIPPDIENLIVVQNSSLIKGESQKTAQSWSQRVEDAKINIPNHSGPAAEIHSKSLEGTHGEGLFSEKILNDIKDYTRMFAQDTECAPLPQRAISKVTSERSPSVQLEDLGSRVESLKLSDSHLDPIKNEHDCYPTSSFNKVVPELDLRNCLSIGGSVYPTSLIKLLLAGSEQETLGANSDHQGALKATLDQQEVSGATPNQQKIPDTSRVLGEAFSATPPQWEVPGANPVRREALGETSSLPEVSGAIPVRGEVFGAIVDRQETLGVSGGAVPDPPIFFAAPPDPVITYHVPREWPEPQSTVSSGLEAQGAIQILPFGYSGHAPQLSSNSEKSSVPPAMAISHKENEKQVHISFLPVYPQRFTLVPEKELYQASLSVVPLSQPGPSKSIGGNSQVHMTSTVNVVNPTLVSTSVSLASTSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQKTNCGECTYCKNRKNSHQICKKRKCEELKKKPSVVIPLEVIKENKRPQREKKPKVLKAGFDNKPVNGPKSESMEYGRCGHGEEQRLELNPHPLKNVTRNEESMTGIEIEKWTQNKKSHLTDHVKGAFSATVTEAEKVKNS	145088	212946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_147151_172054_172109_212697
918767	contig_13481_pilon	-	720	1	Intergenic	novelGene_119369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGAGGTCTGTGTCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470086	469366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_469400_470100
918768	contig_12964_pilon	+	1693	2	Intergenic	novelGene_131677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	51	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCGCTACCTCACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211142	213244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_211249_211657
918769	contig_12884_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_105012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	835	1149	968156	968470	NA	60	CTAATAAAAAGGAGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQHQDLFWFVLGICGIREGLLPGAYVQTPAGPQTGVQWGGPWRAVSGHLARRTAGDAAAICCRDFHLSDSGLGGRDVWVKSEARGPGVAHRTGRFPPPLSFQH	967321	969349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_967300_969300
918770	contig_16496_pilon	-	2228	4	Intergenic	novelGene_5198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3926	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_212_275_787_840_1676_3255
918771	contig_18272_pilon	+	1856	2	Intergenic	novelGene_7088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTTTTTTTTTAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539570	541470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539659_539702
918772	contig_9177_pilon	+	2286	17	Intergenic	novelGene_32556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAGGCCCCTTCATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710	28451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2036_20251_20479_20695_20809_20907_21027_21214_21390_21607_21689_21866_21972_22740_22896_23250_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25003_25335_25480_25583_25714_25970_26070_26312_26474_28365
918773	contig_9363_pilon	-	2328	13	Intergenic	novelGene_6746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	452.326209720374	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	148	1254	1544440	1508282	TRUE	5	GTTGTTGTGATGTGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGIGKHFQTKGSQEALHKFASKPINEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYDIEGTSKQNLTSFNMELSSSGISADLSGDHVVVGSVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFVGNEPLTQEAKEGYLGYTLTWLSSLGNTSLLAAGAPRYKHVGRVLLFQERNGKELWSQIQEIDGAQIGSYFGGELCGIDVDQDGETELLLIGAPLPPLCSGSAAPSPSPSTAASTSTSMAAVPPWPRSSQKLMLYMRRKCSMSTC	1544741	1505320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505371_1505748_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1530850_1530937_1532246_1532399_1535530_1535664_1535775_1535850_1538731_1538883_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647
918774	contig_9011_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_159295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	382038	381703	NA	75	TGTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLSSAAIIEIPPVDGFNKEKFVLSQSCRLEVRIQGASSKGRLSLSVGSKRRSLSSIFPSRRASQGRDLRSKGRAILLALVSWWYEIPHVSLLASLFCISKETDLRHNLIL	382040	379760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_379800_382000
918775	contig_8801_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_66285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTCTACCCAGTAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448633	450882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_448600_450900
918776	contig_14546_pilon	-	3075	2	Intergenic	novelGene_157409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1024	1401	26291	25914	TRUE	35	CAATAATCATTGCCATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMENLYTDQEAVVLIGQRDTAWFKVRKGVHRGCILSAYLFSLYAEQIIQEAGLCEEEWGIRTGGRLINNLRYADDTTLLAVSEEDLKHLLMKIKDRSLQYGLHLNIKETKILTNDQ	27314	24194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_25613_25657
918777	contig_753_pilon	-	2861	20	Intergenic	novelGene_112925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2071	2487	522608	487751	TRUE	55	AAAAAAAAAACCGTACCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFTAAIPLLAIRTFSITLFPPKRVTNSAGEATVKSRCESIFFRSRPCFTRCMPDMLDLICKAKPSCRLEIPKSESVSELTEAGDREPSFSSSRSNFTRLLISSSELSSDTEPIMNRECWFSSRGLAKGEGSSIIPSK	557924	405035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_405349_484600_484650_487738_487992_521425_521559_522565_522704_527746_527860_529193_529275_530243_530343_531717_531820_534587_534703_541158_541369_545057_545225_546629_546796_547153_547320_550546_550695_551510_551617_553506_553589_554533_554680_556357_556509_557801
918778	contig_11337_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_107209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGGAAAGATTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371113	369426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_369400_371100
918779	contig_7840_pilon	+	2754	2	Intergenic	novelGene_69002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	128	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATGAAAATACATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277661	280625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_279646_279855
918780	contig_6164_pilon	+	3980	2	Intergenic	novelGene_121289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAGCGTTGTACTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575428	614362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_577533_612486
918781	contig_10892_pilon	+	1522	1	Intergenic	novelGene_116760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTTGAAATGAAAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175960	177482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_176000_177500
918782	contig_2969_pilon	+	4605	5	Intergenic	novelGene_157055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2106	2618	4236	287097	TRUE	50	TAGACCCCAAAGGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPAWVCGIQAAGTSRSRDCGRGKQRNKRTKAQGSHQRGSPDREAAAHSNGAPQPLRKKQRWHTEPGTEAKGGVGSERQARNQKKQEKKKKATPAANKWHSESQLVRAGVSGQETVSVGSRGGQVWVKKGGKTNIFSASFDFFLASGHLPLISLKYLAPCAIFASS	1616	399365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_2339_2852_4641_203395_203406_286999_287104_397384
918783	contig_3601_pilon	+	3445	7	Intergenic	novelGene_132831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAGTTTTCAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11679	351772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_12158_13434_13700_32192_32379_160590_160617_289902_290163_342818_344267_350990
918784	contig_20365_pilon	-	4398	2	Intergenic	novelGene_85323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	109	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGTGGGAGGTAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34152	29682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20365_pilon_-_29818_29889
918785	contig_10500_pilon	-	4093	4	Intergenic	novelGene_41290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1751	junction_3	205.511286524339	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	3368	3823	1635143	1629460	FALSE	35	TATAAATCATGTGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1638510	1629189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076
918786	contig_755_pilon	-	1505	4	Intergenic	novelGene_119773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	246.621166974775	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	178	588	87736	83959	FALSE	50	AACTGGTATAGAATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNETDLAGPMVFCLAFGATLLLAGKIQFGYVYGISAIGCLGMFCLLNLMSMTGVSFGCVASVLGYCLLPMILLSSFAVIFSLQGMVGIILTAGIIGWCSFSASKIFISALAMEGQQLLVAYPCALLYGVFALISVF	89049	83041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_84122_85521_85704_87670_87741_88876
918787	contig_2646_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_69596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAACAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457964	1458903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1458000_1458900
918788	contig_5590_pilon	+	671	5	Intergenic	novelGene_162993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_4	76.946003794869	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	336	671	181869	183347	FALSE	25	CGGGACCTCTGCAAGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPQHQVRLREGCEDVFENIVHSYDWFPAELGTVFSGWREACKARGSEALGSRLVCASLFLRLLCPAILSPSLFGLAPEHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEDRGPAMAHFLDQVATVDVDAAPSSYQGGSDLAHQLAVLHAQLCTIFAELDQATRDSLEPLPTILQAIEEGRPVPVSVPMRLPPPRAQVHTSFSAGEKPGFLAP	180320	183347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_180397_181504_181742_181846_182049_182152_182272_183310
918789	contig_8801_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_66308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAACTTCACCTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574662	572417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_572400_574700
918790	contig_4745_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_175175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTTTCTCTGTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203363	202613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_-_202600_203400
918791	contig_11267_pilon	+	4579	4	Intergenic	novelGene_175378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	140	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAAAAACTCCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59880	139968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_+_61783_81858_82287_88751_89447_138414
918792	contig_8585_pilon	-	700	2	Intergenic	novelGene_178988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2687	747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8585_pilon_-_1014_2253
918793	contig_11708_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_138957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGGTGTACAAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242845	240790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_-_240800_242800
918794	contig_10734_pilon	-	2722	11	Intergenic	novelGene_51151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	43.9140068770774	57	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	140	2155	946522	917927	FALSE	35	GTATGTATCTCTAACAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLWAPLVRSTARGAGLAPAASGGRAYGVFKVTLPTPTFPGAGETPMNLSATFLAGCQNLGSEVEISTIEKQRKELQLLIGELKDRDKELNDMVAVHQRQLLSWEEDRQKVLTLEERCSKLEGELHKRSEIIRSLIKKIKTLESNQNECQMALQKTQQQLQEMAQKAAHASLLSEDLEARNQNLSNTLVDLSAQVGQLQAREQALTTMIKLKDKDIIEAVNHIADCSGKFKVLEHALRDAKMVETSIVKEKQDYKQKLKALKVEVSKLKEELNEKTTENNDQREEIIRLKQERSYLHDELVFTVEREKRKDDLLDIAKSKQERTNTELHNLRQIYVKQQRDLQFLHVNVENSQELIQLYDSKAEEPKALESGRDMCLSDLENSHSKDDVKREKDQKLLVKDQKFETMLVQQNRSDKSCYDVCKEKRLQVNTSFGEKSVTAVSSLFTKDSVEKQKSWSLGGKIQIEPENKSTLCKIHAKSAKDTEIGILNREKQLSESSLADEKQWHNFNVYLGLANSSGSKPPEKLNVECQDQKDRPEISYCQNNEACLSESDICDESRCCHPSNLVIEAPGHMSDVQWMSIFKPCKVGRIVRHKPTCTCSESVSGAKYNSSASEPVVSIHHPACLGSSSSTLRGEEKIIETDSSADRKSSSKTLLIDQDAALPSEKDDFSPTSKLQRLLAESRQMVSDLELSTLLPLSSENLNSGDQNVCAYGSLD	946661	917359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_918080_922702_922863_925178_925905_927718_927835_928205_928295_934893_934996_937941_938114_940494_940597_942037_942205_943852_944046_946486
918795	contig_16951_pilon	+	1872	5	Intergenic	novelGene_98628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	307.015777281885	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	21	407	65762	69761	TRUE	20	AATTGATGTTCTACCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSVRDLPRCLNSKGQTGTLSGHASGT	65741	107957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_65874_68468_68670_69687_69816_103952_104099_106692
918796	contig_1472_pilon	-	4676	4	Intergenic	novelGene_86116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1945	2550	265543	119132	FALSE	45	AATAAAATGAAGACTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKIMENTDKKLEELRKILQEQNGKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEIDSVIEGLRKTFETTEDRISNIKDKHLDTNLFEEKSEERTKKNDETLRITWDTIKSKKKINTCTTKRQIIQLKMGRENEQTLHQRRNSSGQQTHEEMLVITSH	267487	117005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_119271_120857_121033_128805_128833_265278
918797	contig_2703_pilon	+	103	1	Intergenic	novelGene_101654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGCGGTGGGGCGCGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1369	1472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1400_1500
918798	contig_602_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_134956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	794	1129	493995	494330	NA	35	AAAATCCCCTAAAGTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFYLLVQGVVPGVLKACKWPSKLQQLVSIHLKQQKKEAVRNRRRKWNVWLIASENSCLLCHENRTGWCLAIITEHFDPRFCRRILIKKGKMQNRISNSHGSQSFWSHGG	493201	495308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_493200_495300
918799	contig_4315_pilon	-	2477	2	Intergenic	novelGene_46821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	649	junction_1	0	3	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGAGATGAGAAGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351851	348872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_350258_350759
918800	contig_14665_pilon	+	2677	4	Intergenic	novelGene_171038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	570	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1392	1748	38848	39204	FALSE	20	TTATTCTGTAATATTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLSVFKGKVHICTLTSEMQESFQIPLKEFPKALWRDFSASLFEQSILNQTKMVFYYPLYLEGVLQYTSYIYIKITFLNNQYGVKLLKGMVHLKNIKIIAPSKQSCKNKHKHFPKPS	32102	40133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_32752_33684_33896_34681_34804_38438
918802	contig_2770_pilon	-	1193	5	Intergenic	novelGene_107467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1975.11687945296	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	218	550	750561	743582	FALSE	30	TAAAGTCGTGTTAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDKKKICMYWLVVVSPKDRATPQFYNINTCTIP	750778	742938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743677_744619_744680_746600_746745_747765_747797_750558
918803	contig_854_pilon	+	2900	14	Intergenic	novelGene_36697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	3857.54203097128	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	165	2048	1705343	1714980	TRUE	30	ACCCCCTTGTCATAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704891	1715990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715038_1715195
918804	contig_3132_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_127409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTTTAAGGATAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11975	10470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_10500_12000
918805	contig_5777_pilon	-	3728	1	Intergenic	novelGene_173318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	207	539	43469	43137	NA	35	GGTCCTAATTTTAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPEYIRQSLTILASKEHSGYTSSKTNLFVLLAVHGIYNVLCQHRNSKASILLQPSLFIVQFSHAYEAIENTMAWVRRTLVLKGTSLLFNTFKRSFAAYLPSAVCRLIF	43675	39947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_39900_43700
918806	contig_990_pilon	+	2365	14	Intergenic	novelGene_76095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGGATAGCGACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357106	1372757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1357134_1357400_1357577_1358317_1358438_1358566_1358802_1361121_1361207_1362665_1362841_1363756_1363950_1365426_1365591_1365679_1365837_1366035_1366466_1369415_1369589_1370161_1370278_1371536_1371765_1372671
918807	contig_16098_pilon	-	1839	9	Intergenic	novelGene_45989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1358.60792725495	6	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	100	1098	352350	349467	TRUE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKVVPSGRGWGRGGQERLGKDHGWRHLLVLILPLDLLPAGRQLYPVL	354088	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349064_349172_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
918808	contig_5711_pilon	-	2732	1	Intergenic	novelGene_80272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71908	69176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_-_69200_71900
918809	contig_2365_pilon	+	3371	1	Intergenic	novelGene_103764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1895	2251	265809	266165	NA	60	CTAAGAAAAGAAGAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGRCPQPDLAASPFHCPPPTGTGTLAAGRSRRPVLLPSAQGQEASQGLAREGLLDRLDHCCGPCLEPPCCDLHRAVGWDSARRSPEVSAAGAAWAACHIVAPRPHRSRCSHNIRII	263914	267285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_263900_267300
918810	contig_9705_pilon	+	5487	37	Intergenic	novelGene_41747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	262.879019432941	6	112	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1242	3729	25	3753	450139	539299	TRUE	25	CAATATCCTTTTCGTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAATVVVPAEWIKNWEKSGRGEFLHLCRILSENKSHDSSTYRDFQQALYELSYHVIKGNLKHEQASNVLNDISEFREDMPSILADVFCILDIETNCLEEKNKRDYFTQLVLACLYLVSDTVLKERLDPETLESLGLIKQSQQFNQKSVKIKTKLFYKQQKFNLLREENEGYAKLIAELGQDLSGNITSDLILENIKSLIGCFNLDPNRVLDVILEVFECRPEHDDFFISLLESYMSMCEPQTLCHILGFKFKFYQEPSGETPSSLYRVAAVLLQFNLIDLDDLYVHLLPADNCIMDEHRREIVEAKQIVRKLTMVVLSSEKMDEREKEKEKEEEKVEKPPDNQKLGLLEALLKIGDWQHAQNIMDQMPPYYAASHKLIALAICKLIHITIEPLYRRVGVPKGAKGSPVTALQNKRAPKQAENFEDLRRDVFHMFCYLGPHLSHDPILFAKVVRIGKSFMKEFQSDGSKQEDKEKTEVILSCLLSITDQVLLPSLSLMDCNACMSEELWGMFKTFPYQHRYRLYGQWKNETYNSHPLLVKVKAQTIDRAKYIMKRLTKENVKPSGRQIGKLSHSNPTILFDYILSQIQKYDNLITPVVDSLKYLTSLNYDVLAYCIIEALANPEKERMKHDDTTISSWLQSLASFCGAVFRKYPIDLAGLLQYVANQLKAGKSFDLLILKEVVQKMAGIEITEEMTMEQLEAMTGGEQLKAEGGYFGQIRNTKKSSQRLKDALLDHDLALPLCLLMAQQRNGVIFQEGGEKHLKLVGKLYDQCHDTLVQFGGFLASNLSTEDYIKRVPSIDVLCNEFHTPHDAAFFLSRPMYAHHISSKYDELKKSEKGSKQQHKVHKYITSCEMVMAPVHEAVVSLHISKVWDDISPQFYATFWSLTMYDLAVPQTSYEREVNKLKIQMKAIDDNQEMPPNKKKKEKERCTALQDKLLEEEKKQMEHVQRVLQRLKLEKDNWLLAKSTKNETITKFLQLCIFPRCIFSAIDAVYCARFVELVHQQKTPNFSTLLCYDRVFSDIIYTVASCTENEASRYGRFLCCMLETVTRWHSDRATYEKECGNYPGFLTILRATGFDGGNKADQLDYENFRHVVHKWHYKLTKASVHCLETGEYTHIRNILIVLTKILPWYPKVLNLGQALERRVHKIYQEEKEKRPDLYALAMGYSGQLKSRKSYMIPENEFHHKDPPPRNAVASVQNGPGGGPSSSSIGSASKSDESSTEETVPLFQINQGRDLSVV	450114	550770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_450210_462681_462741_466106_466199_468452_468505_473562_473634_474500_474623_475171_475306_492028_492196_503872_503966_505982_506139_506704_506878_508318_508515_517191_517234_517896_518028_518132_518235_521263_521349_522202_522297_522913_522995_524563_524661_528230_528349_529093_529274_530040_530206_534461_534738_535760_535903_536361_536520_537441_537571_537911_538044_538146_538332_538840_539020_539252_539370_540598_541034_541234_541987_542780_542817_547853_547992_548330_548401_548483_548642_550695
918811	contig_7045_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_77457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361502	359555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_359600_361500
918812	contig_16496_pilon	-	1349	3	Intergenic	novelGene_5187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	3594	980	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTVVLKFCYWAVVKILNALHDLIF	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1050_1235_1354_3413
918813	contig_9858_pilon	-	4228	4	Intergenic	novelGene_140538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_3	513.831576383633	249	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	3169	3954	263923	257701	FALSE	20	AAGCCTTAACTTCTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDSDTGMTLPAQKCVLDTFRSNGDSKILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRAKGSKCFLVTSNADVIEKEKINIYKEKLMNDSILSLQELDEAVFTKKLRIIQNQEKFIRDNEGKAKPEPDKKKKKLLCRKCKAFACYTVDVRVIEESQFAVVGDAFRECFVSKPHPKPKSYGSFEKRAKIYCARQDCSHDWGIYVKYKTFEIPVIKIESFVVEDVATGTQTLYARWKDFHFEKIPFDAAEMAK	267091	257426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_257998_260294_260439_262472_262625_263730
918814	contig_19094_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_177780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTTATGGCCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4300	6189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19094_pilon_+_4300_6200
918815	contig_10737_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_133895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATGAAAAGAAAATACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280043	280705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10737_pilon_+_280000_280700
918816	contig_6873_pilon	-	3474	6	Intergenic	novelGene_129817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	79.5326348111264	712	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	92	619	386693	379890	TRUE	40	GACAGCTGCTAACCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDSNDDDIPQLSSHTLAALQEFYAGQKQQTDPGGDNKYSIGIIEENWQLSQFWYSQETAFRLAEEVIAVAGEGGRIACVSAPSVYQKLRELHREDFSICIFEYDKRFAIYGEEFIFYNYNNPLDLPEKIAAHSFDVVIADPPYLSEECLRKMSETIKYLTQGKILLCTGMPWYL	431621	375587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_378360_379806_379910_380399_380681_385638_385722_386549_386709_431545
918817	contig_5903_pilon	+	4667	19	Intergenic	novelGene_173229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_7	41.1069066919147	106	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	945	2120	500787	534211	FALSE	15	GACTACTTGCCTTAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTNSCVKLQTVHNIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKITKEDGENTDRIMGKGQVQLEPQALQDKDWQRTVIAMNGIEAKLSVKFTSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKETVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPATPGQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV	480661	536758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_+_480771_485648_485710_486829_486883_487780_487922_493396_493519_495431_495601_497253_497374_499165_499297_500748_500854_501783_501859_504808_504907_506643_506776_527963_528024_529093_529204_530784_530925_531973_532109_533014_533121_533546_533710_534121
918818	contig_8955_pilon	+	3607	4	Intergenic	novelGene_175087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	45.9782557302906	165	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	790	2373	80	2452	279016	284215	FALSE	10	TCGAACTGCCTTTTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPNPQGLSEEIFQQQLAEKQLGLPAGMSMEGIRPSMEINRMIPGSQRHMEPGNNPIFPRIPVEGPLSPSRGDFPKGMPPQMGSGRELEFGMVPSGMKGDVSLNVSMGSNSQMIPQKMREAGAGPEEMMKLRPGGSEMLPAQQKMVPLPFGEHPQQEYGMGPRPFVPMSQGPGSNSGLRNLREPIGPDQRTNSRLSHMPPLPLNPSNNPTSLNTAPPVQRGLGRKPLDIAVAGSQVHSPGINPLKSPTMRQVQSPMLGSPSGNLKSPQTPSQLAGMLAGPAAAASIKSPPVLGSAAASPVHLKSPSVPAPSPGWTSSPKPPLQSPGIPPNHKAPLTMASPAMLGSVESGGPPPPAASQSASVNIPGSLPSSTPYTMPPEPTLSQNPLSIMMSRMSKFAMPSSTPLYHDAIKTVASSDDDSPPARSPNLPSMNNMPGMGINTQNPRISGPNPVVPMPTLSPMGMTQPLSHSNQMPSPNAMGPNIPPHGVPMGPGLMSHNPMMGHGSQEPPMVPQGRIGFPQGFPPVQSPPQQAPFPHNGPSGGQGNFPGGIGFPGEGPLGRPSNLPQNSADAALCKPGGPGGPDSFTVLGNSMPSVFTDPDLQEVIRPGATGIPEFDLSRIIPSEKPSQTLQYFPRGEVPGRKQPQGPGPGFSHMQGMMGDQGPRIGLALPGMGGPGPVGTPDIPLGTAPSLPGHSPLRPPPFLQQGMMGPHHRMMSPAQSAMPGQPTLMSNPAAAVGMIPGKDRGPAGLYTHPGPVGSPGMMMSMQGMMGPQQNIMIPPQMRPREAAKIGCADACQDEIPGPESCFEGVPGVPLVMQ	278936	285370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8955_pilon_+_279980_281243_281505_282998_284046_284114
918819	contig_6361_pilon	+	3728	7	Intergenic	novelGene_23950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1008	1352	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	379398	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_379770_380029_380523_405216_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
918820	contig_1275_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_108812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACAAAGTGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652745	650301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_650300_652700
918822	contig_17144_pilon	-	1727	10	Intergenic	novelGene_29535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1859.27369995868	295	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	77	1453	179764	166363	FALSE	20	GTTTTTTTCTTTCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181849	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172508_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
918823	contig_8330_pilon	-	3589	1	Intergenic	novelGene_71897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2280	2642	1088935	1088573	NA	35	AATATGTTAGTGTATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASWNSTDRKQAKGATYVVLQEKKRTIPGAAQRSAELLEGAQEARPSCFQRVWPWCPGSQRVGPQSPRFPRVGSLSTQFQSVGLALRCARWIGLPPKTEGVWLPCPRGRVGGVTTKRD	1091214	1087625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1087600_1091200
918824	contig_4469_pilon	-	2817	13	Intergenic	novelGene_21915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1320	1670	519792	511052	TRUE	75	CAAATGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGYAVLVLMARSLAVLGQTLQGLIDQCYILFIYIQSEKTKASSCASTNTVQKLQGLTYQVIVGLVILATKEVLQVSVMVFAQELQEAEDGLHDGDDSAHLQVILSLVRGGLGALP	547501	462060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_462718_465138_465323_507703_507886_510927_511178_518038_518243_519771_519884_522734_522830_525561_525686_527063_527169_529296_529493_536316_536440_542766_542945_547094
918825	contig_9809_pilon	+	2487	11	Intergenic	novelGene_176753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	196.326793892225	1	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	152	1390	108394	114954	FALSE	50	ATGCTGAGGTAAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRCSPCSGTSSRTIRTSGASWGRRLSLPGARRPSYRAEEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLASGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVILYFLLEN	108242	116051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108905_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110694_110729_110783_111181_111338_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806
918826	contig_5461_pilon	+	1875	1	Intergenic	novelGene_156831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGTCCTTCAGACTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798090	799965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_798100_8e+05
918827	contig_4103_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_51934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGTAAGTTCCTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90310	88753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_88800_90300
918828	contig_11316_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_122681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCAAGATTTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	139423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139400_140500
918829	contig_6847_pilon	-	4220	4	Intergenic	novelGene_143850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	852	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACCCCCTCCCTCGCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85640	74041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_74106_77514_77988_81026_81090_82020
918830	scaffold_12124_pilon	+	3729	10	Intergenic	novelGene_22338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3283.60537320086	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1760	2539	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483577	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497333_1506629_1506687_1508010
918831	contig_11855_pilon	+	1460	5	Intergenic	novelGene_67128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2654160	2663451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2654351_2656329_2656425_2657314_2657425_2659634_2659745_2662496
918832	contig_20165_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_54487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAAAAGTGTGTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126480	126878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_+_126500_126900
918833	contig_14481_pilon	+	2769	6	Intergenic	novelGene_153849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.5909067418368	92	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	179	1294	108970	122917	FALSE	40	TATGTATTGAAGACAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKQWWRGQLAADIHQALRYKELKLPSYKGQSPQLSLRRYFADLIAIVSNRFTLCPSARHLAVYLLDLFMDRYDISIQQLHLVALSCLLLASKFEEKEDSVPKLEQLNSLGCMTNMNLVLTKQNLLHMELLLLETFQWNLCLPTAAHFIEYYLSEAVHETDLHDGWPMICLEKTKLYMAKYADYFLEVSLQAAACVASSRIILRLSPTWPTRLHRLTAYSWDFLVQCIERLLIAHDNDVKEANKQRGQAGPQSAQLSVFQTTSQPSRPVHFQQPQYLHQTHQTSLQYRHPVSEQPSCQQIVSTTHTSSYTLQTCPAGFQTSVQGLGHVQTGVGMSLAIPVEVKPCLSVSYNRSYQINEHYPCITPCFER	108120	124392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_108258_108928_109039_113719_113931_121338_121639_121758_121883_122505
918834	contig_9706_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_20911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103434	105922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_103400_105900
918835	contig_8683_pilon	-	1002	6	Intergenic	novelGene_150273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTCACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729046	722509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_722802_722907_722998_723916_724064_726502_726635_727779_728051_728976
918836	contig_9274_pilon	+	3051	1	Intergenic	novelGene_151157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508877	511928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_508900_511900
918837	contig_16411_pilon	-	2886	3	Intergenic	novelGene_77350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2217	2621	241559	240328	TRUE	30	ACTTCGAACATGGACAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMSWESMHRPTLGSGGDGLGEALVWFQSIPLAVQLDTTVGWLWCSLSGFSSSSRSKACRAIRLAGGGQGLVDGWLEAAHMLHGGTVRLYRLHVLVQDGKHLIVQDLVLPDAVCHLLQGHILNDFILPVLPLYF	243775	238170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_238336_240227_240375_241201
918838	contig_9471_pilon	-	4666	2	Intergenic	novelGene_21691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1572	1919	57315	56968	FALSE	25	ATCCCAGCACCAGCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNTGSIKRRWKEYTELLYQKELVDVQPFQEVVSNQEPMVLKEEVQAALKALGKNKAPGTAGIPIEMFQQTDAVLEVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGDPTKCGNY	59412	54220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_58201_58726
918839	contig_19687_pilon	+	4345	1	Intergenic	novelGene_170767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1635	2045	73773	74183	NA	65	CCAGAAGAAAGGAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKGNNKISEMDSVIEGLRSKFETMEDRIKTNTWIQLWLRKNRKKITKINEETLRMVSDTIKRKNLQVIGVPEQGEKTENTDRIIELLLTENFPNIMKHEKLTIQEVR	72138	76483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19687_pilon_+_72100_76500
918840	contig_10324_pilon	+	2543	1	Intergenic	novelGene_7816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCAAAAGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223739	226282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_223700_226300
918841	contig_7870_pilon	-	2746	1	Intergenic	novelGene_109024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554819	552073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_552100_554800
918842	contig_6446_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_149164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	153	329	88449	88273	NA	10	ATGTCATTTCTTTTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRSSSWVTPGSVSAQTANLLGISLPGPRIRNTLPVPPGDGLLLGVLNYCEMSLPAPSNDEERVSWSESAPFHPYWCPEPRAHTLCLVRESSFLGADRFGREGRISDIN	88601	87057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_87100_88600
918843	contig_3382_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_124084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGATGGGTCCCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493339	495697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_493300_495700
918844	contig_20928_pilon	-	1117	1	Intergenic	novelGene_178857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	407	829	20721	20299	NA	50	AATAGGTTGATAGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNISSKQQLKKTGVAMLISDKIDFKVKSTTKGKERHYIMIKRSVHLEDITIINIYAPNDRDPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLLVKDRTSRKKLNKGTGALKATTNQPDLTDIYQTLHPTEDKYTFFSNAH	21127	20010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20928_pilon_-_20000_21100
918845	contig_5020_pilon	+	1467	8	Intergenic	novelGene_27804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	920.257949641051	150	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	368	808	122915	124498	TRUE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKALWMPTRPLPGRKGFRDSGKGPLPMLLVMPLSTVLSW	118457	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123355_124303_124363_124444_124547_124909_125091_125657
918846	contig_4816_pilon	+	5164	5	Intergenic	novelGene_115603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	151	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3976	4359	292712	293095	FALSE	25	TCGCGAGTAAAATTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKGGKRKQNKLKKKKKKKKKGPQRNRKKKKIQRKKKCPHGSLCISVEAEGESPCHSAQPGQKGLPTQEKEKKTNKQFKTNKRTKALGSHQHGSPNQEAAPHSNGAPQPLRKKQRWCTEAGT	87098	293900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_87495_156403_157393_178732_179656_181993_182413_291463
918847	contig_5788_pilon	+	5860	5	Intergenic	novelGene_178559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	151	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	1081	2145	3256	56399	TRUE	40	CGAAAGGGTACAATCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREFPAKWRSRQKHHAVPPQQRSEKLTQTENTTILKP	1390	76006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_+_1702_2486_4216_56294_57319_57408_59857_75658
918848	contig_17427_pilon	-	1917	8	Intergenic	novelGene_30320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	943.635587739769	18	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	224	820	179819	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204681	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181412_188858_188890_204653
918849	contig_3956_pilon	+	2261	7	Intergenic	novelGene_14985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1235.74871591634	3	140	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	569	1207	1288971	1289956	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283884_1287992_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
918850	contig_11117_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_148589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTATTACCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80671	79304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_79300_80700
918851	contig_9363_pilon	-	2525	1	Intergenic	novelGene_6497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402785	400260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_400300_402800
918852	contig_610_pilon	+	2525	2	Intergenic	novelGene_76780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATGGTCAATGAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242227	244879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_242752_242878
918853	contig_4783_pilon	-	4975	1	Intergenic	novelGene_108333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGCTTCACTGCTTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17927	12952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_13000_17900
918854	contig_401_pilon	-	2131	11	Intergenic	novelGene_42817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.093714958035	1184	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTAAGCTAACGAACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1728755	1711888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1711962_1712504_1712623_1712855_1713341_1713437_1713529_1713608_1713702_1714019_1714096_1715076_1715232_1715417_1715484_1715714_1716278_1724174_1724346_1728515
918855	contig_10003_pilon	+	2103	1	Intergenic	novelGene_88302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAACACGATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929796	931899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_929800_931900
918856	contig_20527_pilon	+	2488	5	Intergenic	novelGene_138615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1209.9168101568	26	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	610	1086	24977	27453	TRUE	50	AAAAATAATGACCATGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	24367	28943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27851_27938
918857	scaffold_12124_pilon	+	2266	10	Intergenic	novelGene_21990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	167.01792614663	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	227	1366	800112	811108	FALSE	80	ATTAAAAAAAAAAAGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKGHKDGSGHKPIPIPGNLGNKHSFSINPTARYTVRIRTANSRILHWGPWSEPVEFGFEEGEASPKYVYVLVVLGTLLGALLIGFLFKRVENRYKRIENRYMGTKVHGSTIHNRQKVETTKCQPTDEWIHTMGSIHTTQYASAVKTEPGGAVLKSSAANQKVGSWNSSAAPWNPAGQFCSVL	791833	812008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_807432_808432_808463_809816_809950_810647_810745_810825
918858	contig_10951_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_61645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTAAAAAAAAAAATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314380	313132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_313100_314400
918859	contig_6740_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_142724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTTGAGTATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	730470	732705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_730500_732700
918860	contig_6283_pilon	-	4158	1	Intergenic	novelGene_100222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2170	2490	622100	621780	NA	10	TCGCTAAGTCTCTCCGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPQPHSCSCHAALAGLCLCSRHPAHGACCMWPTVCVWGTCDAGAPHRLLSCHGSRSLRTSYSLSELVCSVLRCHPAFLLSLAVLLALIRVQALPSRDQARPPSH	624269	620111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_620100_624300
918861	contig_8330_pilon	+	2197	12	Intergenic	novelGene_71793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	100	junction_7	566.548313681664	6	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	236	1339	852673	856687	FALSE	40	AAGAAGTACGAATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837515	857545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667
918862	contig_13258_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_146926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGCCAAAAGTCCAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48595	46817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13258_pilon_-_46800_48600
918863	contig_11574_pilon	-	2158	3	Intergenic	novelGene_64059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	413	811	451360	449708	TRUE	10	TAGTTGTCGCGTGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVSLVPFLPHFEPVKRNKSSNYKLLCKK	451772	448318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_448578_448619_449791_451044
918864	contig_15039_pilon	-	2301	7	Intergenic	novelGene_110151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	507.131365843429	2	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	498	938	202841	197500	FALSE	80	AATGAAAACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKATNPALNLNSCTGVQQRNMAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGLCMN	260909	196136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_197618_198506_198613_200448_200620_202795_202923_208401_208526_222093_222255_260778
918865	contig_2726_pilon	+	3716	8	Intergenic	novelGene_165890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	263.547230790124	167	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	3160	3714	176473	187134	FALSE	30	ATATGGCATTTTGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAPSFERGVYELTHNNRTVSLKTINAVQQMSLYPELIASVLYQATGGIEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQVAALTGYLKSNLNTYTERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDSFSLEQSDK	163944	187136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_166829_173744_173870_174716_174804_176409_176501_176771_176894_177010_177157_186427_186552_186999
918866	contig_15286_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_124439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAAGCCAGCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31038	32031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_31000_32000
918867	contig_10225_pilon	+	2229	13	Intergenic	novelGene_86765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	150	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1160	2113	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20644	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46775_47407
918868	contig_14575_pilon	-	7668	1	Intergenic	novelGene_101925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	680	982	396439	396137	NA	15	TAACGTTGCCTTTTCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYNLQYRLYINIKKTQILTTGPIGNIMIKGENIEVVKDFILPGSTINAHGSSSQEIKQLIALGKSAAKDLFKVLKSKDVILRTKVRLTQAMVFSIT	397118	389450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_389400_397100
918869	contig_19930_pilon	-	3963	1	Intergenic	novelGene_178991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAGTAAAAAGGGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26869	22906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19930_pilon_-_22900_26900
918870	contig_3081_pilon	+	1015	4	Intergenic	novelGene_133937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_3	59.6340693079235	8	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	10	738	224783	236211	FALSE	30	TACGACAAACCTTTGAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLCMINFYHGGLKGVAHLWQEFVLEMRFRWENNFLIPGLASGPPDLRCCLLHQKLQMLNCCIERKKARDDGKKTSTSDNMTNTYPGNAGKARDQLGSDNPKDTDKEKGEVGKSWDSWSDSEEEFFECLSDTEELKGNGQESGKKGGPKEMVNLKPEGRLLQHGKLTLLHNGEPLYIPVTQEPAPMTEDLLEEQSEVLAKLGTSAEGAHLRARMQSACLLSDMESFKVGHTFRAPCSILSCSGMEL	224773	236488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_224887_225584_225640_225871_226244_236013
918871	contig_13718_pilon	+	3422	1	Intergenic	novelGene_142912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2068	2379	271429	271740	NA	45	AAGCCTCATACCACTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLNWFSSLVSLKDYVDDSASSRKEGTASPWREVAIQIRKISPPVDQVLVKGKAQGEHTCDTFLQLCQNEKYKEAGWFVLLSLDKLVKEMRSGLQSQSSSAA	269361	272783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_269400_272800
918872	contig_9575_pilon	-	3964	1	Intergenic	novelGene_169721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	747	2914	3660	485750	485004	NA	5	CTCTTGATGGCTTGTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRLTSWAVRLQGLDLGQRGRRWQRRRGGRVGWCRACFGFFRHQFLGGLRHVGLEVTPEPEIGAESFVANVADERFHGTQKLLVPLQLLVHCEHFPTLLTGPQAGVFAGTCFFGGCAALWHLFLGLFRRLLFDVDFQLLRKTEVFREAGGVLRIEVDLFRRIAERIVVFCCEHVVDFGWLWLRLGPGRAGDFAIVVENGQSQVFRRYHGVLVVDLHLVPPDAEGGLEGAHALETGQLLVLTPALVLVL	488663	484699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_484700_488700
918873	contig_7457_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_31531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTATTCCCTGTTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	716540	715175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_715200_716500
918874	contig_10642_pilon	-	2223	2	Intergenic	novelGene_78722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	0	27	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTGTTGAATTGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921277	918815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_920866_921104
918875	contig_854_pilon	+	2833	17	Intergenic	novelGene_36591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	2107.93428854975	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2241	3	2243	1679349	1715383	FALSE	25	AAAGGGGTTTTCTACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHDGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1679346	1715973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700890_1715253
918876	contig_6497_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_35658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGTTTTTCTTCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880520	882498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_880500_882500
918877	contig_4305_pilon	+	3059	1	Intergenic	novelGene_136696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGAAATCACCTTGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554159	557218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_554200_557200
918878	contig_753_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_113027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAGAAAGTGATTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392459	1389511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1389500_1392500
918879	contig_11413_pilon	-	3500	16	Intergenic	novelGene_103174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	38.2978966640322	107	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	834	2505	530	3034	434408	427725	TRUE	10	GTGAGCATCGCTCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDDSAIRALTQFPLPKNLLAKVIQIATSSSTAKNLMQFHTVGTKTKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAALACKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPVLRKIETFLNHYPVDSSWISPEPRLQSDDVLPLGKDSGPLSDPITGKPYMPLSEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILGAIELHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGAHCNVIITQPRRISAVSVAQRVGHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPARGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYPHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPLGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMAPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPDIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGEVQAQQCHIQDQIRQHPAAQVDH	435426	427089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_427413_427504_427645_427721_427827_427921_428080_428181_428342_428463_428658_428726_428809_428897_429105_429330_429507_429762_429868_429951_430028_430275_431113_431470_431624_433440_433591_434303_434426_434914
918880	contig_709_pilon	-	1099	3	Intergenic	novelGene_57677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_2	12.5	18	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	11	463	3993535	3989267	FALSE	40	TATTTCATAAAGGATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGMEAGTEDPGLTRRPTLASSWDAPCGALTQSLFLSQDGLGAGEFDWEELLEPPAPGQDLVILKRSPNSQDENACFLYLNFDPTGSEEIASIGILSSARNMEVYLREEYCGTSRGRNVCALLDNSEHEIILYKKYLKLESSTHACKVKVSHH	3993545	3988630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3989352_3990455_3990660_3993371
918881	contig_16204_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_154473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAGTCACTTAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77012	79021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_77000_79000
918882	contig_13021_pilon	-	2316	2	Intergenic	novelGene_8093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	165	653	44956	44468	TRUE	45	TGATATCCATATGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSGIVPEDETLRLEDTQNTTGGKLPPQSRVDLNDVDGVKLPETSFAHMAQLKMKRNSCKHPLIIRTWNVQSMNLGKLELVKNVMHCTKINILGISELKWTGIGHSESDNHMVYYATNDKLKQNGITFIIKKNISRSILKYNYVNDRIISTCLRKTS	45120	36915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_37213_43101
918883	contig_11548_pilon	+	3473	14	Intergenic	novelGene_66793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTAACATGTCGACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139327	202177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_139454_141461_142340_145160_145409_148402_149117_152187_152250_152349_152424_155650_155758_156511_156611_164947_165063_165251_165372_165502_165640_170613_170705_173682_173757_201549
918884	contig_16103_pilon	-	1600	10	Intergenic	novelGene_118818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4402.98396292535	25	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	292	654	735970	733331	TRUE	40	GGAGCCAAATGCAAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	742945	721413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_721451_722882_723680_732167_732247_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_742792
918885	contig_6028_pilon	-	1765	12	Intergenic	novelGene_156587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	193.938773673251	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	655	1287	323759	316454	TRUE	10	GAAGTGTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLCQSNLQDQTTVTWRM	353993	309525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316502_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_323940_324003_326490_326709_332025_332108_353771
918886	contig_4783_pilon	-	3191	1	Intergenic	novelGene_108343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1333	1845	52372	51860	NA	50	TCGCTAACAACAACAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEKPPAQPMNLGLPTLYNCVSHFSYINLSIYIYTLHWFCFSREPSLRQYYNEMCKDLELKNQRGRTCLSFLKLKEQKKKFKPLVAILMDSMGKILNNAGSIRRRWKEYTESLYQKELDNIQPFQEVAYDQEPMVVKEEVQAALKALAKNSLQELTVYQLRYFSKRMQH	53704	50513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_50500_53700
918887	contig_19816_pilon	+	2735	2	Intergenic	novelGene_156459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	576	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2261	2719	37494	37952	FALSE	20	ATAGGGAACGGGGTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHHRISDHEVTLRCWALGFYPVEITLTWQWDREDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEHRYTSSVQHEGLPELLTVRWGKEGDEGRASSQGKQGPFWAQQQGWGPSPSLPFPESCSQSPTLIMGIIAGLVLLVVIGAVVAGAVI	34590	37968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_36834_37476
918888	contig_10182_pilon	-	2314	2	Intergenic	novelGene_134613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATATCTTTCATATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414770	133814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_134130_412771
918889	contig_9049_pilon	+	1312	7	Intergenic	novelGene_83141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	1711.85585614625	2	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	19	480	88356	107948	TRUE	45	AATTTAGTCAATTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSGSQSVFAGSIASSSPGTCYKCKFSDST	88337	112127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_107863_108105_108616_108724_111558
918890	contig_5881_pilon	-	3423	1	Intergenic	novelGene_129047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGGTAGTTAATGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409344	405921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_405900_409300
918891	contig_8552_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_80070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	18	533	422607	422092	NA	80	AGGAAAAAAAAAAAACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDQEPMVLKEEVQAALKALSKNKAPGTDRIPTEMFQQMEAVLEVLTSLCQEIWKTTTWPTKWKRSLFMPVPKKGDPTECGNHQPISLISHASKILLKVIQMWLQQFIDREMPEIQAGFRRGRGTRDITADVRWILAESREYQKNVYLCFIDYAKAFNCVDHNKLWITLQRMGFQNT	422624	420392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_420400_422600
918893	contig_3123_pilon	+	2128	8	Intergenic	novelGene_162969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	82	junction_7	14.0900891496434	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	8	919	56398	108998	FALSE	10	TTTTATAGTTGGTTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSMDLNSASTIVLRVLTQATSQDTAVLKPAEEQLKQWETQPGFYSVLLNIFTNHALDINVRWLAVLYFKNGIDRYWRRVAPHALSEEEKSTLRAGLITNFNEPINQIATQIAVLIAKVARLDCPRQWPELIPTLIESVKVQDDLRQHRALLTFYHVTKTLASKRLAADRKLFYDLASGIYNFACSLWNHHTDTFLQQVSSGNEAAVQSSLERTLLSLKVLRKLTVNGFVEPHKNMEVMGFLLGIFERLKQFLDCSRSIGTDNICRDRLEKTIILFTKVVSSLFTLSRFSQIWCVYSYLVRKMTFL	56390	110207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_+_56536_63441_63543_74251_74325_76048_76253_91422_91556_102088_102148_107470_107520_108843
918894	contig_2036_pilon	-	2891	5	Intergenic	novelGene_131831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	608	junction_3	138.087834366392	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	112	1185	661441	616864	FALSE	35	TAAGAAATGTCCCATCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILGPFGINHGIELHSDVVEYAKEKLESFIRNSDSFDKFEFCEPAFVVGNCLQIASDSHQYDRIYCGAGVQKDHENYMKILLKVGGILVMPIEDQLTQIMRTGQNTWESKNILAVSFAPLVQPSKNDNGKPHSVGLPPCAVRNLQDLARIYIRRTLRNFINDEMQAKGLPTRAPPKRKRKRVKQRINTYVFVGNQLIPQPLDSEEDEKMEEDNKQEEEKDHREAMKPEEPPQNLLREKIMKLPLPESLKAYLTYFREK	661552	615157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631747_631872_636558_636731_647832_647936_661134
918895	contig_6086_pilon	-	3379	1	Intergenic	novelGene_171457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2518	2859	27154	26813	NA	65	GAAAAAGATGAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGGIRENTERIVEDLLAENFPHILKDEKISVQEAHQTTHKVDPKRKSPRHIIIIIAKTKDKERILRVTRDIRKVVYKGESMRISSDYSAGKKAMG	29671	26292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_26300_29700
918896	contig_15838_pilon	+	2112	2	Intergenic	novelGene_174346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	333	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAATGAAAAAGATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303173	305792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_303901_304407
918898	contig_6302_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_171708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	486	953	227247	227714	NA	50	AAATACACAGCTCCACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHGSRSSFVCGNPIIPASFIKETILSPLDRFSTLVKGQFNITVWFYFRTLNSIPLVCLYLVYIFPCSKPVSDCFDYCSFVVCFQIGKCESSYFVLLFQDSFGYFGSLAIPCKIDIGFSISTKKAVGILMGIAFNLYTTYITSYMTFKEIKSSNP	226761	228881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_226800_228900
918899	contig_15498_pilon	+	4809	4	Intergenic	novelGene_42645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	203	junction_1	137.177095593818	14	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	4244	4768	684456	686124	FALSE	15	ATCTGTGTCATGATGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHPLLSEQVSTACPGPRAVIDYSKADTWAVGAIAYEIFGLSNPFYGQGQAHLESRSYQEAQLPVLPESVPLDARHLVRSLLQREASKRPSARVAANVLHLSLWGEHILALKNLKLDKVVGWLLQQSAAALLADRFTEKSCVETKMKMLFLANLECEALCQAAFLLQSWRAAP	677772	686165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_679550_681329_681431_682090_684723_685866
918900	contig_3601_pilon	-	1429	3	Intergenic	novelGene_132884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGGCAAGCAGAGGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349864	176708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_177743_198911_198935_349492
918901	scaffold_16539_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_68418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	943411	941009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_941000_943400
918902	contig_6241_pilon	-	2400	3	Intergenic	novelGene_156405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	193	junction_2	113.5	6	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1151	1567	189992	182242	FALSE	85	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQATTAPKMIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPASAAAAAAAAAAAAIIPTGSTPPPFQGRPITPVYTVAPNIQRIPTAGIYGASYVPFAAAPATATIATLQKNTAATAAVYGGYAGYIPQAFPAAAIQVPIHDVYQTY	194213	181408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_-_182485_189818_190025_193095
918903	contig_5799_pilon	+	6408	2	Intergenic	novelGene_50257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	157	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTAAGTATGCAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208127	216819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_213233_215516
918904	contig_17144_pilon	-	3066	14	Intergenic	novelGene_29442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1960.41985902731	25	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	401	1969	174965	167578	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPR	181849	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176280_181790
918905	contig_17993_pilon	-	2037	5	Intergenic	novelGene_61923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1.08972473588517	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACATAACAATGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55196	37227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_38857_39109_39221_42083_42218_42458_42548_55122
918906	contig_1150_pilon	-	1934	3	Intergenic	novelGene_61463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1205	1564	360272	359657	FALSE	20	AATTATTCTTCACTCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSLSGEVTSEVHGSARYWTASKNKKGLMRHSSPGTRTRGRRGHESW	472448	359286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_359792_360047_360396_471367
918907	contig_7027_pilon	-	4031	1	Intergenic	novelGene_164330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	3387	3719	48154	47822	NA	45	AGACTGGGGAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAVYKHNSATLIQILTAFFKEMKKLIIIWKGKRPWISKALLKKNKVGGLALPDLRTYYIATVLKTACYWYNDRHIDQWNRTENPDVNPSTYGHLIFNKDPKRQSF	51540	47509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_-_47500_51500
918908	contig_7230_pilon	-	2449	7	Intergenic	novelGene_52542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	437.839645938505	5	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	115	690	177508	134555	FALSE	20	TGAAGATTGACTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QCVIWWSQHLGKYLRFTFPAFRALPPPSRVGVPGRRCEMSTMFADTLLIVFISVCTALLAEGEKKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSMMVEWWQSFPSPPSPTSKGCLIETCWEMTPQTVPSSSCIFSVPCRFDRTSRRFWALPLHELPPSRQVDFLALHLLLGSSPEIKQNPLIAVILFRYIRLVTVL	177622	132795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151056_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_176952_177432
918909	contig_1719_pilon	-	3067	1	Intergenic	novelGene_87313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTTTTGAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438806	435739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_435700_438800
918910	contig_7452_pilon	+	4389	1	Intergenic	novelGene_109149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTGCCTCTGACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128943	133332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_128900_133300
918911	contig_12638_pilon	-	658	4	Intergenic	novelGene_33320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_2	1201.88916109413	12222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTGCCGTGCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310671	1298308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1298672_1302911_1302969_1303534_1303703_1310601
918912	contig_5816_pilon	+	659	2	Intergenic	novelGene_158265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACTTAAAAAAAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357920	359072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_358239_358731
918913	contig_5031_pilon	-	1679	1	Intergenic	novelGene_133198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATTATATATCCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51824	50145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_50100_51800
918914	contig_5747_pilon	+	6325	4	Intergenic	novelGene_178992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	5491	6195	164172	165192	FALSE	15	TCCTCTAGTTTTCTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPKEAEKRKKGKKKKKKKKKQHLQPTNGTQGAARPARGIQAACSFEPRARGPGKQMSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALRARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYSRLLVSDRSPRWWIRAALAGRGPLHESLLALCSLSVFLLRLVFG	128149	165322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5747_pilon_+_131479_158907_159781_162883_164214_164529
918915	contig_19061_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_173514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	371	901	60615	60085	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIRTWNVQSMKLGKLEVVKNEMECIKIDILGISELKWTGISHFESENHMACYARNDRLKRNDVTFIIKKNIPGSVWKHNAVSDRIISIHLQGRLVNMTIIQIYTPITNARDEKIENFYQLLQSEIDETCSQDALIIIGDWNVKVGNKEGLIVGEYGLGYRNNVEIP	60985	58731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_58700_61000
918916	contig_15498_pilon	-	1530	12	Intergenic	novelGene_42665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	159.419867691816	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	511	1278	691001	688241	FALSE	20	AAACTTCCATCTGGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697609	687988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_695347_695405_697262_697374_697554
918917	contig_8554_pilon	+	4242	2	Intergenic	novelGene_160272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	311	junction_1	0	71	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAATGGGACCAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39955	44335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_40036_40173
918918	contig_5092_pilon	-	2965	1	Intergenic	novelGene_62253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTAAGCTAAATATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160370	157405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_157400_160400
918919	contig_1725_pilon	+	2846	20	Intergenic	novelGene_24283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	650.877026055684	4	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	23	1522	201480	248367	TRUE	30	TGATTTAACTACATTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDVSLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKNT	201457	255851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246694_247056_247187_247639_247755_248355_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
918920	contig_10225_pilon	+	1424	6	Intergenic	novelGene_86856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	397.965626656373	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	91	1308	42629	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	41451	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46808_47308
918921	contig_13481_pilon	+	3447	1	Intergenic	novelGene_119466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGATTTGTCTCATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1248315	1251762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1248300_1251800
918922	contig_11281_pilon	+	7221	2	Intergenic	novelGene_125418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	6701	7090	48115	48504	FALSE	20	ATGACATCTTTTCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNILDEECMKASKKLVQAYLNNLNTDLYGEVQQFHSYIKTKFTDSGMTELTHEGMCDSVIEDKIERVFPNVEIALRIFLTLMITNCTMEHSFLSLKRLRNPPRTTVIQERLNSLSLLCMEVDIRQLNCD	41301	48635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_46491_46603
918923	contig_7612_pilon	+	2516	6	Intergenic	novelGene_170374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	18.5083764820148	133	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	994	1689	337618	374632	FALSE	35	TATTCCTCATACCCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVTVDFTQEEWALLDFSQRKLYRDVMMETFRNLALVVSQQVGNGQMMSSEHLIMRFMKSNSWYSRLGETCEFCGIEEQHNNQGRHVRRHTVEILCESKEGKVRKRKDNNQCGKPVIKTEYLTKRDPVRENPSESHECGKAFLNYSSFKHHVISHAGCNICQYKECRGVCSCFCHLSTHVETLTGKKIYKCKECGITCSASSLITHIRTHSGERPSEYKELWKSL	334180	375459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7612_pilon_+_334934_337377_337621_370615_370743_371707_371859_372202_372601_374615
918924	contig_15453_pilon	-	4676	2	Intergenic	novelGene_112485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17332	11876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15453_pilon_-_16323_17102
918925	contig_1516_pilon	-	1494	1	Intergenic	novelGene_49956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGACCCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329209	327715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_327700_329200
918926	contig_14445_pilon	-	2212	4	Intergenic	novelGene_137384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.16024689946929	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTCCCTTTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498209	365253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_366918_367965_368150_397246_397399_497997
918927	contig_12786_pilon	-	1946	2	Intergenic	novelGene_103448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1011	junction_1	0	27	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2	391	629483	628728	FALSE	25	CTTTCCCTTCACCTAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPEGRRPSRAQPFFARPVREPSESCHFLSPWVFVAGVAARIWRSGSKRSPRSVLQIRTDLLVSLLRPLQPAAHSPLRPRVRIRSGGGSEEGGQGRRSSAPRESSPVPLEGVWRALWNVPGAHGRAGKNW	629484	627172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_628938_629303
918928	contig_10526_pilon	+	1606	10	Intergenic	novelGene_142571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	91.7508704167008	28	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	251	757	277075	307731	TRUE	35	GGAAGATGTGACTGACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLLPIYTAPPLQSKYVEEQPGHLQMGFASIRTTTGRYIGWFKGVYVFVKNGIMDTVQFGKDAYVYLKNPPGDFLPKIGVITVSGLAGLVSARKGSRFKKIAYPLGLATLGATVCYPVQSVIIAKVTGKKAYATSQQIYEAVKSWTKSNKKETLPEPKEKTKVEKLC	223349	310741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_+_223385_273809_273912_276961_277087_279949_280070_283141_283197_284658_284758_291360_291453_307400_307517_307718_307833_309993
918929	contig_15135_pilon	+	2703	1	Intergenic	novelGene_119863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAGCTAGATAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45262	47965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_45300_48000
918930	contig_5075_pilon	+	876	2	Intergenic	novelGene_174082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGGCTTGCAGAGACGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579672	580709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5075_pilon_+_580301_580461
918931	contig_6050_pilon	-	2842	6	Intergenic	novelGene_123115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	17.8392824967822	102	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	270	1031	360564	357753	FALSE	25	AAACGATCTCATCCTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPREAAELSLQVTQEPVGLQIVKVEEDEHIWRQESSFQRKETHTREIFRQRFRHFCYQETPGPREALSQLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPRELQSWVREQHPESGEEAVTVLEDLERELDEPGEQVPVSSQEMPLKETEPMETAQESPYLKLPLANQLKNESSQSNHPLQDNGAVASLISCQLLSCNLPGLLFLFLSCAIHSQAPLIACTCCGIPDQLSVVVLQSSRTALLVSELNGEEI	361534	355941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_357772_357986_358099_358175_358251_359749_359892_360150_360691_361391
918932	contig_3789_pilon	+	2910	1	Intergenic	novelGene_79898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCTACTGAACAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628223	631133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_628200_631100
918933	contig_13718_pilon	-	5257	4	Intergenic	novelGene_142905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1440	1751	260700	260305	TRUE	30	GTTAAAATGCTTAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTAKLQTQGTRRCCTYMEVRNRRSSGLSLFFKAEPSDNGVRSPTCKTAIGMGRTENSPESRHKHSMILAPINTPGVEVIRPLLVFGYMDSLRGGHFGIHFN	262139	254719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_255203_256434_256518_257364_260501_260584
918934	contig_18869_pilon	+	3435	1	Intergenic	novelGene_56489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	112	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	375	716	361357	361698	NA	30	GGAGTGACTCTTGGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWRFLKKLETEISYDPAIPLLGIYPREIRAMTRIDICTPMFIAALFTIGKRWKQPKMPINGWVNKLWYIHTMEYYAAIKNNDESVKHLTTWMNLEDIMLNEISQS	360982	364417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_361000_364400
918935	contig_7753_pilon	-	4236	2	Intergenic	novelGene_41504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	0	17	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1229564	1224223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1224401_1225505
918936	contig_13528_pilon	-	2783	10	Intergenic	novelGene_66854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2219	2686	22062	12473	FALSE	50	ACAAGGAAGGGGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYCDAEVPCKETRVCFLPRWPCCVHSANELSLSRSGLASSAESSFASERSCSPPTRSAYFLQRAASFSSGVERVFRACINNKTSFPNVFSLFLLHSESCCPSGGSVRASCPGVSSLDSCVQYAGLTKFLLFVIKALPSSSSSECLLLVTSQLES	38962	12375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_-_12680_13898_13995_21897_22065_25267_25464_27585_27655_28827_29290_32282_32376_34945_35042_36012_36874_38523
918937	contig_3948_pilon	+	4462	5	Intergenic	novelGene_53254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	743	152	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAACACAAGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257573	1324118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1261006_1306617_1306773_1310204_1310240_1322688_1323343_1323932
918938	contig_8538_pilon	+	1935	2	Intergenic	novelGene_4636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8832	junction_1	0	4000	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	67	1896	841232	843061	FALSE	25	TTTCTTTCAATAAAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRGRCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840311	843100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228
918939	contig_13211_pilon	-	3277	2	Intergenic	novelGene_123131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	66	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2770	3075	34141	33836	FALSE	55	TTTTATTGAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTQSSTTRWCLATTTDCSDRDHNRGSWMELEKNVEQNSNSHTQKKDQTYWCDRDWRNPETMAPGHPFSSVMKSLLRFTLQPKIRQAHKTKRD	37531	33633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_-_36805_37425
918940	contig_16594_pilon	+	4575	11	Intergenic	novelGene_53810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAAGAACTCTGTTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115146	335646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115995_116098_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135507_149146_149351_165477_165647_293663_293888_335583
918941	contig_10838_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_129171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTCTAGAAATCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94013	95342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_94000_95300
918942	contig_3948_pilon	-	2422	7	Intergenic	novelGene_53205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	295.102618686374	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	101	760	856685	840803	FALSE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869607	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565_856701_866430_866480_869571
918944	contig_10489_pilon	-	464	1	Intergenic	novelGene_165633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462883	462419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_462400_462900
918946	contig_5961_pilon	-	2824	3	Intergenic	novelGene_144182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAACACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350272	292617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_293128_293300_294495_349152
918947	contig_15047_pilon	+	1587	6	Intergenic	novelGene_52148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	39	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	27	380	2194	3329	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRWGPTGASSAGTVSGPMMAPTTSP	2167	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2780_3257_3498_4158_4434_4552_4687_21013
918948	contig_15365_pilon	-	1978	2	Intergenic	novelGene_111124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19754	13992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_14481_18264
918949	contig_5727_pilon	+	3900	23	Intergenic	novelGene_7953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1183.95133796164	9	119	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	1943	3199	176222	179323	FALSE	15	GTCATGTTCATGCCCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKGMLLRFFVHFYDMEIIEEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	168165	180024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168384_168578_168822_169825_169948_170283_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174972_175109_175492_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176978_177214_177545_177751_177921_178134_178221_178344_179257
918950	contig_8330_pilon	-	2546	2	Intergenic	novelGene_71891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTCTGATCCACAACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216961	1068582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1068668_1214500
918951	contig_16578_pilon	-	4499	1	Intergenic	novelGene_148669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2302	2610	229104	228796	NA	60	AGAGATCATTAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDRPQKKVTKTYHNQNCQNKRQRKNPDSSLGKTQNQLQRGTNKTSSDYSAETMQAITQQKPCRQEGNGMTYIKLLKKKIANQELHIQKNCLSDIMVKSGHF	231405	226906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_226900_231400
918952	contig_11171_pilon	+	2491	1	Intergenic	novelGene_48628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	742	2229	45	2273	401866	404094	NA	25	CGTGTGACAGTAGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELKHGSQKLQQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSNQKRYGPPHETDGHGLAESTQSSKPSNVMLRLPGQEDHSPQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKNSNTEDKGRLLPPSKEGADKAFNSYAHLPHSQDIKGIPKRESSKDLTSLDNRNCPAVTLTSPAKTKILPPRKGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSTEAGGDTVTLDDILSLKSGPPEGGSVAVQEGEMEKRKGEVVSDLVNPTNQELNIEKPLPRSSEEWRGSGDDKVKTETHPETVAAGKELPGAMASATSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVSPVGILAPEANPKTEEKENDTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKKKGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPAHIPEGSADGEPKPKKQRQRRERRKPGAQPRKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQPLDKADAKNKSFFPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSITESKALPASSFMLQGPVVTESSVMGHLVCCLCGKWASYRNMGDLFGPFYPQDYAATLPKNPPPKRAAEMQSKVKVRHKSASNGSKTDTEEEEEQQQQQKEQRSLAAHPRFKRRHRSEDCGGGPRSLSRGLPCKKATIESSNEKTALDSKPCVPTTSEGGPELELQIPELPLDSNEFWVHEGCILWANGIYLVCGRLYGLQEALEIAREMVSTRIPYSLFALLHSLLHFGSISSSFTCYR	401821	404312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_401800_404300
918953	contig_9443_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_167121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACAAAAAAAAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6624	4959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_-_5000_6600
918954	contig_7379_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_150038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTCTGAGGGCCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561186	560171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_560200_561200
918955	contig_8651_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_168158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95478	93273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_-_93300_95500
918956	contig_9197_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_154377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTGTAGTATCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111796	113278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_111800_113300
918957	contig_8712_pilon	+	2279	3	Intergenic	novelGene_58777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	227.5	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	37	339	314974	315276	TRUE	20	CCTGAGCCAAATCCCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANASKYGCPRPPQPPLSPLPWPWGLLESQERD	286984	317872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315834_316489
918958	contig_4496_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_66622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGTATAAATTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597315	599710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_597300_599700
918959	contig_8317_pilon	+	798	1	Intergenic	novelGene_20049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGGAAAAATAAAGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16421	17219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
918960	contig_15897_pilon	-	3230	2	Intergenic	novelGene_49572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1235	2005	819785	819015	TRUE	45	GACTTGGGAAGATTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKNSSKDFTKRVKREPTDWEKNFGQYESDKGLISIIYEKIKHLHNKKTNNPIKKWAEEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSCSLAIRETQIKTTMRYHLTLALLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMMQPFWKMILHFLRKLEIEIQYDPAIPLLGTYPREIRAVTRIDICTPMFKAALFTIAKRWKQPRSPSADERINKLCYIQTTEYYATIKNNDESVKHLIA	821019	817746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_818739_818781
918962	contig_10082_pilon	+	2448	1	Intergenic	novelGene_63885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2081	2428	319789	320136	NA	65	AACAAAAAAAAAACCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPRTEKQLKELTRPKDGSLKRSTKFDKPLAKLTKGKQERKQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKMYSNKFEKLEEMNKFLETHYLPKLTQTEEEYLNKSKTKEEIEKVI	317708	320156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_317700_320200
918963	contig_709_pilon	-	2552	5	Intergenic	novelGene_57536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGTTCAGCTGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510798	1498430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_1498611_1506108_1506202_1506402_1506486_1508379_1508477_1508699
918964	contig_11328_pilon	+	1820	3	Intergenic	novelGene_88419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1983	junction_2	2384	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	667	1092	644338	645398	FALSE	50	AAAATGCAAGTGGCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGRRDYAA	643671	646126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_644383_644805_645017_645228
918965	contig_13542_pilon	+	1354	7	Intergenic	novelGene_131537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_1	82.768754168869	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	78	1091	535605	544291	FALSE	25	ACCCAGGAAATCGTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLLSQTASGALARPATVLGAMEMGRRIDAPTSAAAVRAFLERGHTELDTAFVYSDGQSESILGGLGLGLGGSDCKVKIATKANPWDGNSLKPDSLRSQLETSLKRLQCTQVDLFYLHAPDHSTPVEETLRACHQLHQEGKFVELGLSNYASWEVAEICTLCKNHGWILPTVYQGMYNATTRQVETELFPCLRHFGLRFYAYNPLAGGLLTGKYKYEDKDGKQPLGRFFGNNWAEIYRNRFWKEHHFKAIALVEKALQAAYGPSAPSMTSAALRWMYHHSQLQGARGDAVILGMSSLEQLEQNLAASEEGSLEPAIVDAFNQAWHLVAHECPNYFR	535527	544554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_535837_540319_540508_540702_540808_541724_541822_542065_542166_542720_542851_544129
918966	contig_12031_pilon	-	2526	1	Intergenic	novelGene_137559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATGTCTTTAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269435	266909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_266900_269400
918967	contig_17344_pilon	+	4167	1	Intergenic	novelGene_169593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74906	79073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_74900_79100
918968	contig_3818_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_99269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	599	928	550873	550544	NA	20	GCACAGTTCTACTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNKPTKSLSSWLLRSNGVRRGKQRRNKHRVHQVSAEQINREAGLYEEERRIKIGGRYISNLRYADDTTSLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKPKSSQLNQ	551471	548283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_548300_551500
918969	contig_11825_pilon	-	2209	2	Intergenic	novelGene_155420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	32	junction_1	0	45	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTTGTTGTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120678	118395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_119186_119259
918970	contig_2215_pilon	+	3509	2	Intergenic	novelGene_163848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1128	3384	125	3508	209593	212976	FALSE	30	CTCAATATGATTTCCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDRTNHVEGNRLSAFLIPSPSAICQTEPLAIKLQNGSPLTERPHSEVNGDTKWQSFKSYYGIPPMKGSQKSRVSPDFIQECRGYSKNLQNGGIKRTVSEPSLSGLHQNKKLKQDQKANGERKNFGESQQRNPGESSSQPNVSDLSDEREPESPIAQENAVKNLASFSTHNCSGSENPGLQILNEQVEKNVNYRDKNIVLLLKNKTVLMPNGATVSASSMENTHGELLEKTLSQYYPDCVSIAVQKTTSHINAINSPATDELLCEITHPSHTSGQINSPQTSNSERPPAPVAVVTEACDADNASKPPAMLGTCPFQKPEQLQPQKSVFEICPSPAENSNIQGTKQLESGEEFCSGSSSNLQAPGGSSERYLKQNEINGAYFKQYSVFTKDSFSATTTPPPSQLLLSTPPPHPQISQLPSEGKSTLDDGVLEEHHQYPNQSNTALLGEVKIQNHPEAPQSRSPNPSTYASSPSLVLPKRPQNNCVNRNDIRTPGTMAVPLCSEKTRQISEHLKHNSPILGSSADLQGHCQQLMGHKEQEILKGQHKEQAQDHELSTQSYLKPGWIELKAPHFHQAESNPKYKEASLRSILLYKSNPSNQMTSKQYTGYSNVREGLPGQAYVQKIMQLEQRSQRYQAEINQGQSQGTVDQHLQFQKPSPQVHFSKTDPSPEAHMQSVCAPSLHFQSRPDPQTQKLMPTSLKHHLSQQASETEPFSNSHLLQYKPHKQAVQTQPSHNSHLPQNQQQQQTLQMRSKEQIPQTFSHPQSNGEQKREGSFFSQIKVEEYFHAENQSVKSREFQTPNTQVGLEQRQNMNSRNSPYGQILKSNASNVQLSCGNNTHLVPEKKEQTINTELFTGNKTQNLHHMQYFPNNVTPKQDVFHRCFQEQEQKSQQASVLQGYKSRNQDTSSQQAAQLAQQRYLMQNQANAYPVPDQGGRHIQTPPHKDVQKHAALRWHLLQRQEQQQTQQLQTETGHNQMHRPIKVEPGSKPHACMRPTSAQAENKMWKKITKQEIPPQSCDNVQQKSIIETMEQHLKQFQVKSLFDHKAPPLRSQKQVKVEMSGPVTVLTRPTTAAELDSHTPALEQQATPSSEKTPTKRTAGSVLNNFLESPSKLLDTPIKNLLDTPVK	147860	212977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_147939_209546
918971	contig_804_pilon	+	5269	1	Intergenic	novelGene_138786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCATGGTTGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158619	163888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_+_158600_163900
918972	contig_5084_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_64542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCATACTCTCGGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509676	510946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_509700_510900
918973	contig_1443_pilon	+	4662	1	Intergenic	novelGene_28392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	2522	2917	1052114	1052509	NA	20	TCAATTGTGGTATTTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEAGKKWRFGEGPRPGNCLLLQGSLPTSPAGHWPGQPCASPKCPESCFRLRCNLSLSESSCFLWAWIELHVSDILVSRRGRVSNQARWTNTSQPSFQEIPSSNADTPKLTGKGSRELCKKKKPFPVSRSL	1049592	1054254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_1049600_1054300
918974	contig_13366_pilon	+	639	4	Intergenic	novelGene_99796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.16024689946929	25	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGGCATTTCCAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177047	185492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13366_pilon_+_177139_177947_178046_178269_178383_185155
918975	contig_14522_pilon	-	1437	2	Intergenic	novelGene_147310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTATGTCTCATAAAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66490	64984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_-_66001_66069
918976	contig_19559_pilon	-	2154	9	Intergenic	novelGene_163429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	27.6541136180497	57	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	443	1384	48610	43631	FALSE	40	TGAATAAAATCCAGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDVLCVVRDVVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLVNNSTLEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKEKVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSYDLKRKMILQQF	51666	42860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_-_43742_44227_44384_44592_44776_45985_46238_47283_47397_48483_48611_48766_49018_50224_50319_51569
918977	contig_10042_pilon	+	2951	1	Intergenic	novelGene_79191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTCCCCTTAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925625	928576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_925600_928600
918978	contig_5092_pilon	+	1431	4	Intergenic	novelGene_62280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTGTATCTTTGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239336	251421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_240036_247333_247408_248482_248543_250823
918979	contig_8702_pilon	+	3715	10	Intergenic	novelGene_157729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	47.8325267708486	187	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	71	1909	47137	50874	FALSE	30	AACATTCTTGAACGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDEPDAKSPKTGARAPPGHAETGEPTTLLQRLRGSISKAVQNKVEGILQDVQKLSDNDKLYLYLQLPSGPSTGDKSSEPSTLSNEEYMYAYRWIRNHLEEHADTCLPKQSVYDAYRKYCESLACCRPLSTANFGKIIREIFPDIKARRLGGRGQSKYCYSGIRRKTLVSMPPLPGLDLKGSESPEMGPEVTPAPRDELVEAACALTCDWAERILKRSFSSIVEVARFLLQQHLISARSAHAHVLKAVGLAEEDEHAPRERSSKSKNGVENLEAGAQKKPEKPTQPPKELEPRAGAGASVRGERKKNVVETPAPAASNPQVNALVARLPLLLPRTPRSHLQPIRVSPPILAPRLPSGPLKVATLPLPSRGGGPPAAVPIINMILPTVPALPGPGRAPPVGLTQPQCTDNKEVGIGGDPGPQDKGVKRTAEVAVSEASGQDPPAKAAKQDIEDTGADAKRKRGRPRKKSGGSKERNSTPEKSAAALDSAQPSRLTLETWGSGRESNSAGGSERPGLMGEARKGTVLAQGREDGAISKGVRGSSSRHTKEAEDKILLVAPKVSVIKGSRSQKEALRLVKGEEETAAQGNKDLKGHVLQSCLPHECKDPKATPP	46658	52680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8702_pilon_+_46716_47123_47253_47471_47506_47909_47993_48254_48375_48555_48676_48797_48880_49182_49385_49628_49730_49893
918980	contig_8443_pilon	+	2510	1	Intergenic	novelGene_150615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1540	2118	787946	788524	NA	80	AATAAAAAAGAAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNLIEGYRRRIELLEDSETEDKYLDTDLFEKKSETRMKKSEESLRIMWDTIKRKNLHMIRIPEKEETMENTEKIVKDLPKENFPLIMKDEKITIQEAQRTSYRIDHKRKSPRHIIIKFAKTKDKGRILRVTQEKRKVTYKGEPIRLRSDYSAETMQARRQWDNIYKTLKRKKLPTKNYISSKIVSQIHWQN	786406	788916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_786400_788900
918981	contig_3956_pilon	-	2438	11	Intergenic	novelGene_15244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	CAGCCGTGGAGGCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
918982	contig_8898_pilon	-	2965	4	Intergenic	novelGene_137251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	36.6090456338624	150	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	368	586	334756	333074	FALSE	75	AAACAAAAACAGAAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLTDPSYGIPREQQKPALQELTRAHVESFNYAVREGLSLAVQAIPPFEFAFKDERISLTIVDAVISSPTVPKGSICKELKVYPAECRGRKSTYRGKLTADISWAVNGISKGIIKQFLGYVPIMVKSKVCNLHSLPPKALIEHHEEAEEMGGYFIINGIEKVIRMLIMPRRNFPIAMIRPKWKSRGPGYTQYGKF	339755	330694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_333218_334681_334829_335585_335754_339628
918983	contig_9091_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_32427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1302	1613	20463	20152	NA	15	GGCCAGGTTCCAGTACGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQWLFSSFIDCRFVCFILLFCFIWLCLSSGLRIVCCLLVCGQDTFHLLLQWAGSVTEVWYSRAGPAEGELLGWVVHGVYQG	21764	20127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_-_20100_21800
918984	contig_9345_pilon	-	2350	7	Intergenic	novelGene_24572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_6	154.854411912896	32	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	20	859	922013	906189	FALSE	30	CCCTAGGAAGACTGATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAADEMAEGGGCRERPDAETQKSELGALLRTTLQRGAQWYLIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPAEAWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSIAPSRNFTTSPKSSASSYSSVSASPIANGDSTNTSGMHGSGVSRG	922032	904697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_906334_913553_913616_913745_913892_914487_914615_916080_916212_919782_919911_921912
918985	contig_5571_pilon	+	2064	3	Intergenic	novelGene_75525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGAATTATATCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207209	229798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_208474_216721_217460_229736
918986	contig_4857_pilon	+	2954	2	Intergenic	novelGene_48857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	102	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCTGAATGAGAAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340478	1362833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1340582_1359982
918987	contig_4083_pilon	-	3873	1	Intergenic	novelGene_152318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTCTAATTTACAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32912	29039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_-_29000_32900
918988	contig_9363_pilon	-	1610	16	Intergenic	novelGene_6591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.850118991745	8	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	395	1453	759301	753955	FALSE	35	GAAGTGCAAGAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVEKPLVEPGAGQPA	773626	753797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754000_755027_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_765976_766002_766093_766235_773175_773319_773610
918989	contig_6898_pilon	+	2970	11	Intergenic	novelGene_35716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	2496.31464563264	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	117	1409	59668	125646	TRUE	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59551	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116811_123024_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126520_127008
918990	contig_10011_pilon	+	2792	11	Intergenic	novelGene_68093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	90.0204976658094	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	669	2010	60	2069	322928	333031	TRUE	25	GGTCATAATTGCATTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTGEHGGRSGADQGSSSNSCSGTCS	322868	334219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332481_332994_333045_333190_333402_333720
918991	contig_5502_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_154958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAAAAAAAAAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308603	309185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_308600_309200
918992	contig_9471_pilon	-	3117	13	Intergenic	novelGene_21852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1080.86877351303	7	128	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	113	823	445281	437746	TRUE	30	ATCCAGTTTATGACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNQKQQKPTLSGQRFKTRKRDEKERFDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAKFLDASGAKLDYRRYAETLFDILVAGGMLAPGGTLADDMMRTDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNKLIRRYKYLEKGFEDEVKKLLLFLKGFSESERNKLAMLTGVLLANGTLNASILNSLYNENLVKEGVSAAFAVKLFKSWINEKDINAVAASLRKVSMDNRLMVFLPISKVLNTSQSISPRQA	446596	432816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_433658_433706_434647_435103_435227_436329_436469_437020_437168_437641_437805_437958_438073_438968_439105_439752_439819_440615_440711_442736_442914_445217_445292_446494
918993	contig_10988_pilon	+	3768	6	Intergenic	novelGene_104727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2335	2724	134149	366208	TRUE	25	TAGTTTGGATGGCACCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFTGIKSTIFVERVDRKTQYHQSLKRWERKKRQKWMSEETQIQAGFRRGCGMRYITADVRWILGESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVKDVYLCFID	74996	378551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_+_76765_133582_134217_134438_134495_193002_193239_366178_367193_378491
918994	contig_2917_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_147584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAATATTTTCATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95627	92769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_92800_95600
918995	contig_610_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_76673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCCCTTCCATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32067	30599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_30600_32100
918996	contig_2069_pilon	-	1974	3	Intergenic	novelGene_23290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1393	1749	344113	343644	TRUE	20	AGGTCACGGTGGATGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTECPICSDVLGLCRILSLGALGRESWGLTRASGHAQRGAQCPSRLCLIPGLVLGFCGGEVVLQEGLQVLKGRPLIRVQTPGLLHGLIQGHRAAWGAWHVVAMLHLFHYFPVTHACR	345505	342627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_342734_343524_343647_343759
918997	SIRV6	+	919	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	37	572	0	-17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	14	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	221	712	1733	10736	TRUE	35	CATATGACACGAACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1124	11253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
918998	contig_16125_pilon	-	4103	16	Intergenic	novelGene_155234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	940.529174927014	359	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	636	2090	236037	117592	FALSE	65	ACTTCATCAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	236672	115578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
918999	contig_14618_pilon	-	5221	1	Intergenic	novelGene_136862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	2841	3476	1344204	1343569	NA	40	GGAACATACGGTACTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATLKQLICSKALVEAHTELSSLKHNPARRKASCGPACTVPHGPEQALIFSLYFSHLILNRRYFSGVGGYNGISEETQAWRGFTKLPEVTARRSQDSNPGHAQGHHGALSPGPLTTQVLSFPIGTASSPSPAGHSSLSSCLTVAPQGSPGVSPQSSHSIAPGSKGQVPSDHPREEKSRVQQSEGHNVRTQHWSRRVGFSSCSSHPPAHTL	1347044	1341823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1341800_1347000
919000	contig_5667_pilon	+	3354	1	Intergenic	novelGene_178993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2690	3076	3654	4040	NA	10	GTCTTGGCTTTTAACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	964	4318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5667_pilon_+_1000_4300
919001	contig_753_pilon	+	2813	1	Intergenic	novelGene_113028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGACCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394680	1397493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1394700_1397500
919002	contig_3081_pilon	+	3135	3	Intergenic	novelGene_133917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	103.5	3	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCCCACTCCTAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163722	198332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_163785_193875_194009_195392
919003	contig_5643_pilon	+	1118	12	Intergenic	novelGene_38835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2515.80120816575	7	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	65	943	233973	238020	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDPQQQH	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237748_238002
919004	contig_1348_pilon	-	4166	1	Intergenic	novelGene_174374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1113	1481	611164	610796	NA	50	AGAAAGAAAAAAGCCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSVGKENGTGSIKRKWKEYTESLYQKELVDVLPFQKVVYDQEPMVLKEEVQAALKVLAKNKSPGIDRIPTEMFQQKDATLETLISAKKFERQLLGQPTGRDPYLRPFQRKMIQRNAEVIK	612276	608110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_608100_612300
919005	contig_4736_pilon	+	2784	1	Intergenic	novelGene_168642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGCCCGCGCCGAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399271	402055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_399300_402100
919006	contig_9484_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_105601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68666	66873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_66900_68700
919007	contig_1596_pilon	+	1906	2	Intergenic	novelGene_131603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1293	1622	152496	152825	FALSE	40	AAAAAAATCCTCCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSCHVVLASFMTMASGQKRRQHRASGCPLWVPNSHVAQGPASQNCCGVGREERKRHQRRCLEEMHASLKTSQSELNWVWSFCLGGARCAARSPALSREALVTCQAWRV	132302	153109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_133164_152064
919008	contig_9177_pilon	-	1725	3	Intergenic	novelGene_32788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTTCCAGACAAAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491316	1456568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1457608_1458346_1458530_1490813
919009	contig_19412_pilon	-	3703	3	Intergenic	novelGene_178698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	295	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2825	3283	1193	482	FALSE	10	GTGGAGGGACGGCGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKRTRKAPKKTEKKKQRKKKCSQGSLCTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGRSKDGAWSQALERKEGRRREASKKSKEAEKKKKAKKKKQH	4070	61	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_502_754_2514_2566
919010	contig_13097_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_107675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	206	298	63617	63709	NA	15	AGTTGTCCCATTTGGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTKRSLFSHSPVGYKSKFRVSAPGEGFHCWLWRKVLVISLPLVWELLCAGTSGPKDALCSRHCFLGSMRFPCVSAHFSLLYLRRDTNLVSLINITSS	63411	65505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_63400_65500
919011	contig_7179_pilon	-	2923	2	Intergenic	novelGene_78144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000251	996712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_999626_1000241
919012	contig_16122_pilon	-	1709	3	Intergenic	novelGene_134483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATATATATATGAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92845	90500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_-_91018_91605_91617_91664
919013	contig_21315_pilon	+	4004	2	Intergenic	novelGene_151567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGCCAATAGAATGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33875	37985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_35399_35504
919014	contig_9389_pilon	-	3168	9	Intergenic	novelGene_84129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	6.2836593637784	46	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2063	2482	1618177	1605443	TRUE	20	TCATCCACTTGTGGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVRDGCPRSPVLPAPHLRPVSAPRDTGPHLLGLRKAAAAAGPGSRRKRRRRLPGWRESGGSGGGETRIARGAGAAPSDPGQEPAGHPLMGPSDRGPRQTTLTPELVGDGPPLATRGRTRPVPVAWKLGAAGKGFRART	1638990	1602658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1602909_1605006_1605802_1618116_1618348_1633299_1633426_1634371_1634523_1635503_1636158_1636241_1636591_1637091_1637266_1638552
919015	contig_16766_pilon	+	2243	5	Intergenic	novelGene_153359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1005	1340	152279	152614	FALSE	20	GCCTGGGTTCTCAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGVYFWTLNSIPLVYVSTVYQSQAILINVAVYYVFEEPSWHSGKRTQLLMRRSAVGTHQPLHGRKMWQSASIKIYSLGNPMGQFYSVQQVAISQNRLDGSGFFLAVYTMF	128281	153517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_128373_141334_141346_143948_144131_144808_145165_151914
919016	contig_2758_pilon	+	2339	2	Intergenic	novelGene_166428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGGAAAGGAGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11240	14056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2758_pilon_+_11504_11980
919017	contig_12677_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_110852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACACACCAGACACATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3778	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2900_3800
919018	contig_12000_pilon	+	3454	8	Intergenic	novelGene_43154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	519.933472981429	22	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	276	827	488478	669327	FALSE	40	TCAGAAGGTATTAAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFCLVRVRLLPPGCVLRKPVVKNPPILLGATLRVSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPLTAKNK	416848	671954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_558472_558606_669224
919019	contig_3285_pilon	-	2951	1	Intergenic	novelGene_153380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCACCCATATTTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67001	64050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3285_pilon_-_64000_67000
919020	contig_10286_pilon	+	493	1	Intergenic	novelGene_98425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCACACCAGCCGCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440268	440761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_440300_440800
919021	contig_13744_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_77214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCCTGGCAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1119758	1121803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_1119800_1121800
919022	contig_10930_pilon	-	2059	1	Intergenic	novelGene_37016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269650	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_267600_269600
919023	contig_6556_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_168496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAATGGCCCCGTAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322399	320277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_320300_322400
919024	contig_15185_pilon	+	3390	10	Intergenic	novelGene_99424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_7	6.69991708074726	77	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	888	1940	254196	257645	FALSE	30	TTCATAAATATGTCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLSAIIAVTMCGLGCKKYVEANISHKSRTAVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSSKWAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALVILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIIQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHTFDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDAISFVDQGGHVLSSTGLTLPSMPSRNSVAETSVTNLLRESGSGACLDLQVIDTVRSGRDREDAVMHHLLCGGLYKPRRRVRAGINQKTKPTAVESIPTHSNPRGQSRTAP	252239	259095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_252426_253315_253480_253658_254222_254730_254952_255164_255368_255592_255683_255779_255851_256595_256726_257190_257280_257422
919025	contig_3572_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_175287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACCCACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14321	15930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3572_pilon_+_14300_15900
919026	contig_14220_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_159873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	588	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGTTTTGAGTGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368457	370093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_368500_370100
919027	contig_10159_pilon	-	1409	9	Intergenic	novelGene_30796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	125.00074999775	18	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	709	1233	338223	317967	FALSE	55	GTTGGACAACAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642161	317790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_431825_431937_456756_456901_597817_597913_606778_606838_641956
919028	contig_11026_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_167670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAATAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170718	173175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_170700_173200
919030	contig_7707_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_72184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGGTGTGAAGTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554578	556911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_554600_556900
919031	contig_401_pilon	-	2345	15	Intergenic	novelGene_42923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGATGATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1973313	1944930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1945310_1945464_1945593_1946389_1946475_1946689_1946759_1946944_1947080_1948358_1948492_1948787_1948908_1952091_1952240_1952522_1952651_1955784_1955923_1964489_1964544_1965464_1965583_1966090_1966203_1968751_1968843_1972806
919032	contig_13778_pilon	-	6882	3	Intergenic	novelGene_70847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	135	junction_2	10.5	97	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	181	2592	258733	218251	FALSE	10	TTGAGACCTGTCCCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVTEFRQFSEQQPAFRVLKPWWDVFTDYLSVAMLMIGVFGCTLQVMQDKIICLPKRVQPSQNHSSVSNVSQAVASTTPLPPPKPSATNPATVEMKGLKTDLDLQQYSFINQICYERALHWYAKYFPYLVLIHTLVFMLCSNFWFKFPGSSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEVSGEDSEEKDNRKNNMSRSNTIQSGPEGSLVNSQSLKSIPEKFVVDKSTAGALDKKEGEQAKALFEKVKKFRLHVEEGDILYAMYVRQTVLKVIKFLIIIAYNSALVSKVQFTVDCNVDIQDMTGYKNFSCNHTMAHLFSKLSFCYLCFVSIYGLTCLYTLYWLFYRSLREYSFEYVRQETGIDDIPDVKNDFAFMLHMIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLKQLNLNNEWTPDKLRQKLQTNAHNRLELPLIMLSGLPDTVFEITELQSLKLEIIKNVMIPATIAQLDNLQELSLHQCSVKIHSAALSFLKENLKVLSVKFDDMRELPLWMYGLRNLEELYLVGSLSHDISKNVTLESLRDLKSLKILSIKSNVSKIPQAVVDVSSHLQKMCVHNDGTKLVMLNNLKKMVNLTELELVHCDLERIPHAVFSLLSLQELDLKENNLKSIEEIVSFQHLRKLTVLKLWHNSITYIPEHIKKLTSLERLSFSHNKIEVLPSHLFLCNKIRYLDLSYNDIRFIPPEIGVLQSLQYFSITCNKVESLPDELYFCKKLKTLKIGKNSLSVLSPKIGNLLFLSYLDVKGNHFELLPPELGDCRALKRAGLVVEDALFETLPSDVREQMKTE	320451	213960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13778_pilon_-_220525_258595_258738_320275
919033	contig_12425_pilon	-	2743	9	Intergenic	novelGene_46664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	633.983388977976	2	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	24	1046	211174	204225	FALSE	30	AAAACCTGGTGAACGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	211197	202527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048
919034	contig_641_pilon	+	1539	10	Intergenic	novelGene_170130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	33.8493393994296	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	22	1302	1977	45324	FALSE	30	TTTAGTAGAAATCTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKISCTAMKLFLKILCASFILHVCKALRELYNVNCSAEDVFNLDSSTDEKFSRHLIFQLHDVAFKDNIHVGNFVRKILQPALKLIASEDDDKTPETTGCRFSHFSEASIQQGTSFNTMSMEKDTRESWTLNSEKLKRLGSAKQSSPDLSFLVVKNNIGEKHLFVDLGVYTRNRNFRLYKSSKIGKHVALEVAEDNKFFPMQSKNISEENHYFLSSLVSNVRFSDTLQILTCDTSQNKQKQVEYFNHSNTSVETIEGFQCSPYPEIDRFVLSLVNKNGIKGGIRRWNYFFPEELLVYDICRYRWCENIGRAHKSNNIMILVDLKNDVWYQKCHDPVCKAENFKSDCFPLPPEVCLLRLFKDEEEFTREDETVETKNNETKNPHKPSSIKLSKGVPSNDDWDNGTDDAYFLEAIEDAELAEAAENSLLSYSSISG	1955	45561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_641_pilon_+_2019_15100_15249_18584_18873_20901_21065_23028_23118_33200_33291_33367_33477_39359_39443_39526_39574_45102
919035	contig_6137_pilon	-	3262	22	Intergenic	novelGene_59169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	2813	3241	1300361	1239072	FALSE	45	CAAGCCAGAAACAGGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERCLVKRTSCRAYCLIPFYQKKYLDFTDLESSNKEPTTDCDPRSTCSEFLSLRNTQFPRLLQSTTTGNINQIFSSLQSWRLACPKVCGSGIGCRRLLTHVLQGLMNPEPTGQMAVCWLTGLWSWQIPKLAGQLTSYWLKS	1354471	1239050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1239268_1240379_1240549_1268907_1268969_1300358_1300429_1305870_1305968_1313652_1313739_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
919036	SIRV3	+	420	3	NNC	SIRV3A	novel	2467	5	NA	NA	3833	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7836	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_8002_8137_8208_8755
919037	contig_9668_pilon	-	3098	5	Intergenic	novelGene_58169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	35	349	675392	675078	TRUE	60	ATTACTATAATAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQKFKADSEEDMERGISLLMSDGSWLKAENTRKMFTHVLLTMQRHSTMWINTNYGHRCKEWEFHLNVLMRNLYIGQEAVIQTEEGDTSWFKIRKGMCQSYILLPYLFNLYAEQII	675426	487646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_489638_548639_548739_644352_644483_674022_674508_675033
919038	contig_2770_pilon	-	3616	1	Intergenic	novelGene_107402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAAATTTATCCCAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84216	80600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_80600_84200
919040	contig_5623_pilon	-	1612	8	Intergenic	novelGene_154843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	405.245403101249	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	136	687	211298	209309	TRUE	40	TCCTCAAGATGTGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKPFQAAPSNLPFSGQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGGGPGPSHRGVHPFLCWLLCGHLCAGHRRSAQ	211433	206965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207584_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210040_210210_210728_210808_211004_211118_211203
919041	contig_9274_pilon	+	2780	9	Intergenic	novelGene_151158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	597	2183	2779	559041	642111	FALSE	30	AAAGAGAGGGAGCTTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLHQFSGELISEELFFLLIIYCKGFFLLLQSLDFLEQSVTDEFFFLLGPGLDGHAGFAQVAVLLLQRLALEFVGLQLDLQHLVLLLQRGQAVGELLQAERRDDNAPGFPTAAAAAAAAARGRRAGRLHGGRAAAVAPRPVRVALAGAVRHGRGRRRKRSREAAAEKAGLRMSGRRASTGERRAGRLAPGRRLGAAAR	509114	642112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_510530_516630_516758_523141_523236_526297_526459_532253_532415_534476_534581_558920_559050_583760_583911_641673
919042	contig_5696_pilon	-	4075	2	Intergenic	novelGene_117568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAATTTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704417	700211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_702679_702809
919043	scaffold_17542_pilon	-	3130	1	Intergenic	novelGene_139248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAATTTGTTCCCAGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517572	514442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_514400_517600
919044	contig_7914_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_165026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAAAAAATTGGAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122166	119990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_120000_122200
919045	contig_10904_pilon	-	1397	11	Intergenic	novelGene_22596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGATGGCGGCGGCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472646	461575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_461798_467351_467434_467544_467609_467865_467943_468090_468179_468377_468508_468611_468709_469848_470069_470157_470293_470821_470878_472420
919046	contig_6048_pilon	+	4583	23	Intergenic	novelGene_73334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	23.8131500583707	162	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	952	2859	98	2956	2843720	2879980	FALSE	25	GTGCATGTGATGTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSRLHMYTPPQCVPENTGYTYALSSSYSSEALDFETEHRLDPVFDSPRMSRRSLRLVTPVFTAGDGPDTKGRTCARNTASVKDRESRTVKQRRSTSKPAFSINHMSRKVTSSAVSQSSCHSLRGNMALQPPVLDASLIREQTKVDHFWGLDDDSDLKGGNKAAVQGNGDLAAAADTAAVNGYTCSDCSLLSERKDVLTAHPPALGPTSRVYSRDRSQKSGASFCVNRILWLAKCTSSSFSSFLVQLFQVVLMKLSYESENYKSKSYESKDCESKSFKSKSHESKAHSGYGGRTEVNELLREDARLGVNGEPLCEDCKGKKERLETNASPHLQLSQSHRVTRAAWHIVSYAGHMLVQVLRRTAAVGWFVSSAVWSVLWLAITAPGKAASRVFWWLGFGWYQFVTLMSWLNVFLLTRCLQNICKFLVLLIPLLLLLGAGLAFWGQGDFLSFLPVLNWTNGYKAQRADDPKNIFTPDAAHLRLPLEGDGKEAFQWHWLSDIERQVTALSGRCQLHEEKLRELTLLLQRLQAHTDKADSDQDGVLSLLRNLQARADQADGDREGMLMLVHQLVEQRVKETHSEGVQGTETDFMTFHQEHELRISNLEDMTGKLTEKSEVIQKELEQTKLRTTSRTAEEQHLLSTVRQLELQLEHLKSELANWRNLKTSCEKVDTIHEKVDTQVRETIRLMFSDDQQDGSLEWLLQKFSSQFVSKDDLQILLQDLELQILKNITHHISVTKQAPTSEAVVSAVHEAGVSGITEAQARIIVNNALKLYSQDKTGMVDFALESGGGSILSTRCSETYETKTALISLFGIPLWYFSQSPRVVIQPDIYPGNCWAFKGSQGYLVVRLSMTIFPTTFTLEHIPKTLSPTGNITSAPKDFAVYGLESEYQEEGLLLGQFTYDQDGESLQMFHALKRPEKAFQIVELRIFSNWGHLEYTCLYRFRVHGDPIK	2822863	2881607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2822941_2843699_2843797_2851291_2851481_2853736_2853922_2855032_2855060_2855164_2855348_2858542_2858741_2859297_2859382_2859672_2859787_2861032_2861132_2861651_2861746_2862609_2862669_2862791_2862938_2863429_2863736_2865012_2865100_2865756_2865801_2866888_2867025_2868512_2868768_2869527_2869613_2873770_2873887_2877436_2877605_2879360_2879454_2879866
919047	contig_7963_pilon	-	1002	1	Intergenic	novelGene_58569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCACTGTGCTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252187	251185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_251200_252200
919048	contig_1406_pilon	-	2864	1	Intergenic	novelGene_25623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2609697	2606833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2606800_2609700
919049	contig_20641_pilon	+	1704	8	Intergenic	novelGene_52813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1226.78038884267	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	64	1098	14599	56568	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEWGRTAFVTTPLITTMWEVSMGAAMKL	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379_56445_56487
919051	contig_6210_pilon	+	2385	2	Intergenic	novelGene_171889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	1983	2384	107652	108053	FALSE	55	GTGAAAAACAAGAAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAA	105580	108054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_106637_106725
919052	contig_12969_pilon	-	1743	1	Intergenic	novelGene_61690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	218	676	507377	506919	NA	25	CCCTCTATCATAATGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKTSQTILIVKWFIKEVMVQLRIRINRLQLRIRKHVGKVSLLQCRTALSSSLSHAGLLVGTSLFSGPSRQASLGLAVCHHSLYHRGPSGPVATGCAAGPHLCLLLFSVSQPLTCVTALLGGSLPSLSLLLLSSASSCCFSSCFCLSLKPL	507594	505851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_505900_507600
919053	contig_14441_pilon	+	1006	6	Intergenic	novelGene_100389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.906497713021	19	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47264	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47566_112110_112154_116578_116712_116760_116944_117247_117344_117539
919054	contig_7411_pilon	-	1812	1	Intergenic	novelGene_137011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGGTGCCGTTTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317191	315379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_315400_317200
919055	contig_16098_pilon	-	1626	11	Intergenic	novelGene_45968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_9	1210.30002891845	37	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	116	1501	352350	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354104	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
919056	contig_8712_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_58764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGACTTATTGCATTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282080	280932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_280900_282100
919057	scaffold_12124_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_22207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTTCCAGCCCCTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366220	1367014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1366200_1367000
919058	contig_10466_pilon	-	3096	4	Intergenic	novelGene_173620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1831	2181	74679	70429	FALSE	30	GGTTGAGAAGTTAGAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHVPSQQFHLHHWKFVHNHHPLHLLHPLHLLPLHPPLPPQGYCLLYDDRPHPHLPPPLHPHHLHHHLLLPAVPLLLLLHQNTDLPGEQNSDQEKWAQSNLLYEEHPLPCHLTLKN	80702	69513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_70712_74611_75753_78888_79382_80438
919059	contig_14647_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_167383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	167	667	160260	160760	NA	60	TATTAGAAAATTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTENNKCWRDCGETGTLIHCLWECKMVQPLWKSLWRFLKELEIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAITQIDICTPMFIVALFTIAKRRKQPRCPSTDEQRWINKLWYSHTMEYYTMIKNNIESTKRLITWMNLEGILLSDISPKRTNIV	160093	161934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_160100_161900
919060	contig_11896_pilon	+	7133	1	Intergenic	novelGene_87990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	428	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3841	4197	29832	30188	NA	50	AGTAGAAATAACTTAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKNCQQNNKKPRTRWLYWGVLPNTQRRVDANPTESLQKSRRGRNTTKLYEASVTLIPKPGKDITEKENYRPISLMNIDVKTFNKILADRLQQHVKKKNHTQWSSRIHTRIASVVQY	25991	33124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_26000_33100
919061	scaffold_16539_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_68329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGACCCTGCCCTAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304910	303675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_303700_304900
919062	contig_20429_pilon	-	2567	2	Intergenic	novelGene_169247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACACATCAAAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125440	122485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_123033_123420
919063	contig_13633_pilon	+	3753	3	Intergenic	novelGene_15336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	496.5	114	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	147	533	38237	38623	TRUE	55	CCTAACCCACAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSQTILMIMGFIRGVTGYNSGSGTLKDTVFPSGRPLPSCARRHASPWHWASAQRHSVFSLWAGKPTTPSPAAGSLLPPLLSVFRVIACSLSPGSRSFSAQGSQVQRMCLTPGCSSLVVMGTSLSHL	38090	109214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_39433_49019_51301_109084
919064	contig_4426_pilon	-	1066	1	Intergenic	novelGene_15457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCATCGAGTTGATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903757	902691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_902700_903800
919065	contig_4924_pilon	+	2909	1	Intergenic	novelGene_84781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTGGATGGCCCATGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447136	450045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_447100_450000
919066	contig_19727_pilon	-	3867	2	Intergenic	novelGene_168992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	1636	2556	15805	14885	FALSE	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSVSNSSMILSVFSVFSPCSGTLITCRFLLLMVSHVVLRVSSFFFVLFLDFFSNRVVSKCLSSVSLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCKFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLDSLSVRSSAFSSTGRSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGILWLFSSFIDCRCFFFCPAFLFYLVMSEQAGCAFFVVCSSVGRMPFTYFSNGQGQSLMYGTAGQVQLKGSCWDGLFVACTRADSADWESMQGRFQ	56776	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_15874_55209
919067	contig_16948_pilon	-	1849	2	Intergenic	novelGene_166407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGAGGCCTGCCCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271402	269512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_-_271103_271143
919068	contig_12125_pilon	+	1321	2	Intergenic	novelGene_76204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCTTTAACATCTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116269	119516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_117535_119460
919069	contig_1233_pilon	+	3610	2	Intergenic	novelGene_178862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1136	1813	138675	139352	TRUE	30	GGTTGTTAACCAATGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVGFISGMQGWFNVRKSINVIHHINKRKEKNHTIISIDAEKAFEKVQHPFLIKTHNQIGIEGKFLNIIKGIYAKSTANIILNGERLKIFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLTRAIKQEKEIRGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSMRNLLELIESFSRVAGYKINFQKSVGFLYTSKENDEKEINTIFNSP	137539	141959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1233_pilon_+_140161_140970
919070	contig_8386_pilon	-	3315	2	Intergenic	novelGene_82199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCCCAGATGGCTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15033	53	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_1601_13265
919071	scaffold_880_pilon	+	4421	5	Intergenic	novelGene_121391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTTTGGGGGGCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266807	394925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_269245_279219_279805_307762_307928_393342_394461_394809
919072	contig_4486_pilon	+	2411	14	Intergenic	novelGene_38575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1048.05170611866	5	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	291	1082	343083	399436	TRUE	30	TAGAGTGTGAGGTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTK	311765	413477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_341227_341376_342989_343093_360586_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399437_407559_407696_411177_411318_412424
919073	contig_10749_pilon	-	1199	6	Intergenic	novelGene_133515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	36.3560173836464	4	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	133	750	311325	305793	TRUE	40	CCAATAAAACGTCTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLPEYQDAEIVRTRDPEKLASCDIVVDVGSEYDPQRHRYDHHQRSFTETMSSLSPGKPWQTKLSSAGLIYLHFGRKLLAQLLGTSEEDSMVGTLYDKMYENFVEEVDAVDNGISQWEEGEPRYALTTHLSARVARLNPTWNQPNQDTEAGFQHAMALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVQVWAKVLWVGGQ	311457	305203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305396_305535_305958_306076_306230_308321_308482_310998_311112_311298
919074	contig_2069_pilon	+	3034	10	Intergenic	novelGene_23186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	261.764855368655	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	20	63	273	335	76142	76204	TRUE	20	CTACTTCCATCCCTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDVSSCF	70295	100578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70403_75853_75950_76072_76238_81602_81709_87422_87523_87707_87803_89407_89567_89952_90998_92048_92192_99560
919075	contig_3747_pilon	+	2994	6	Intergenic	novelGene_24890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1662.57720422241	16	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	939	1592	202819	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTILSSNKSSSFLLLGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201131	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202458_202636_203128_203228_203386_203498_203651_203768
919076	contig_9363_pilon	+	1437	1	Intergenic	novelGene_6523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAACCTGCTTTGTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558644	560081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_558600_560100
919077	contig_13014_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_169380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTTAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599145	597198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_597200_599100
919078	scaffold_19766_pilon	+	2691	15	Intergenic	novelGene_34426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_1	145.025332058836	73	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	686	2521	845894	851417	FALSE	10	TCTGGGCCCATCTTCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844397	851587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844793_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
919079	contig_14970_pilon	+	1602	8	Intergenic	novelGene_45077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	5591.99755846491	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	29	901	207759	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATQQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	207730	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_207823_210762_210859_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
919080	contig_5569_pilon	-	4070	1	Intergenic	novelGene_86712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTTAATCAATATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20415	16345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_16300_20400
919081	contig_11160_pilon	-	4181	3	Intergenic	novelGene_168806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	12.5	104	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1544	1909	312801	312436	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAAGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLSTQQHTCGGHARPSQACKCYILRAQDTPALPPAALRCPNYLTRALCTDHEVVILAQQPSQQDGESRGQLVPLLEQVTQHSHGQSQSDGGVHLAEGKLCRDSREASKEWATQRQPGEAL	318503	310163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_314071_315639_315780_318369
919082	contig_10811_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_165787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGAAGTTCCTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163002	160973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_161000_163000
919083	contig_3956_pilon	+	1804	8	Intergenic	novelGene_14986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	20	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	81	659	1281682	1286416	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284175_1286171_1286224_1286409_1286606_1287276_1287558_1290335
919084	contig_9274_pilon	+	3833	1	Intergenic	novelGene_151155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3124	3462	507724	508062	NA	30	ATACCATGTTTCTCCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRQRKGQENQTNGNGELRVVMGRVLTHYRIATNVMEHFVYKLLNGKLICPVNFQTKQTNKLSQTKRDGKFTGKNECHEAGQARSTGLAYSKRSTNVSGSYCFRKKKKHETS	504600	508433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_504600_508400
919085	contig_9843_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_114305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCCACCCCTGCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5241	4517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_-_4500_5200
919086	contig_5041_pilon	-	5069	1	Intergenic	novelGene_27110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTAAGAAAATGTTTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600833	595764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_595800_600800
919087	contig_14397_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_134657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCACACCAAGTGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121529	120016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_-_120000_121500
919088	contig_15087_pilon	-	4648	4	Intergenic	novelGene_37224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	430.634673734271	100	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1532	1918	132342	131956	TRUE	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYVYSASWQPHQKGFLLSRGSSRSPRISPVDLTWVTCPVTRGVRGVSQRKWRKQDGSGRKTIPVKICILVPSLSLTHCVKLVHFLRLFKPVCLHLWYGNSHPCPSDRGSSSRVTDIKCTVNSKDLTP	135866	129163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_129489_129550_132724_133432_133528_134811
919089	contig_5084_pilon	-	2111	2	Intergenic	novelGene_64654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1638	1964	1459965	1459639	TRUE	25	CTCCAATCATATCCATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALINRNLFSHSLGGWKSEFRVPAPGEGFLSPLVLGERPCHQSVSDLRASQSRDPRSKGSTLLSALLSWWYEVPFLCSLLSPFTSRKIKGDAGHTPGKLTVHQIRYVT	1461602	1459439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1459548_1459599
919090	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_92118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3	356	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657507	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
919091	contig_8773_pilon	+	3929	2	Intergenic	novelGene_74504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGATGCTCCAATTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2651	6665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_+_3680_3764
919092	contig_15538_pilon	+	2632	19	Intergenic	novelGene_152638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_14	29.5048123298096	63	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	56	1630	59790	132045	FALSE	30	TATCTGGATATATGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSPGKPAAVARRSEADFMAAARKAVLGPLVGAVDQGTSSTRFLVFNSKTAELLSHHQVEIKQEFPREGWVEQDPKEILQSVYECIEKTCEKLRELNIDISNIKAIGVSNQRETTVVWDKFTGEPLYNAVVWLDLRTQSTVENLSKRIPGNNNFVKSKTGLPLSTYFSAVKLRWILDNVRKVQKAVEEGRALFGTIDSWLIWSLTGGAKGGVHCTDVTNASRTMLFNIHSLEWDKELCDFFEIPMAILPNVRSSSEIYGLMKAGALEGVPISGCLGDQSAALVGQMCFQDGQAKNTYGTGCFLLCNTGHKCVFSEHGLLTTVAYKLGRDKPVYYALEGSVAIAGAVIRWLRDNLGIISTSEEIEKLAKEAGTSYGCYFVPAFSGLYAPYWEPSARGIICGLTQFTNKCHIAFAALEAVCFQTREILDAMNRDCGIPLSHLQVDGGMTSNKILMQLQADILYIPVVKPSMPETTALGAAMAAGAAEGVGVWSLEPEDLSAVTMERFEPQINAEESEIRYSTWKKAVMKSVGWVTTQAPESGIP	59734	133047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_+_59868_70596_70671_73805_73913_80614_80693_92214_92292_94717_94856_97019_97130_97481_97549_100666_100703_101105_101174_107424_107468_108144_108226_121343_121423_122182_122280_122779_122865_123291_123413_123523_123668_125677_125759_132034
919093	contig_7396_pilon	+	4369	1	Intergenic	novelGene_79657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCGAAAAAAAAAAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277190	281559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_277200_281600
919094	contig_2069_pilon	-	3375	5	Intergenic	novelGene_23557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	118	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	455	766	2279794	2279483	TRUE	20	CAGGAGGGGGAGGTGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLCSSKHFIKTEPTGWEKNFGNDISDKDLMSKTYGKLQQLKNKKTNNPIKKPVKDMNRHLTKEDIQVANKHMKRCSISLVIKDANQNRNEIPSHPCKNGID	2291100	2094585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_2094983_2095180_2097187_2100691_2100748_2279332_2279884_2290735
919095	contig_20951_pilon	-	1596	6	Intergenic	novelGene_43056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	12926.6373106079	47	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	84	1199	29171	26952	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKVSVRLWLYLFFFFFFFYVFGFFFLALDSGFKNWNGEGDSSRLE	30017	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27069_27489_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
919096	contig_14441_pilon	-	1497	5	Intergenic	novelGene_100543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGCTGGCTGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117773	111196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111384_112104_112675_116580_116961_117218_117343_117537
919097	contig_18303_pilon	+	511	1	Intergenic	novelGene_146805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTTCTCAAAACACTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47994	48505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18303_pilon_+_48000_48500
919098	contig_16594_pilon	-	3296	8	Intergenic	novelGene_53836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	130	junction_3	2618.92081684383	48	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	186	1019	165546	121101	TRUE	25	ATCCCTGAATATCAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335666	116291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_335583
919099	contig_3956_pilon	-	2144	1	Intergenic	novelGene_14704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTTAAAGTGGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34142	31998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_32000_34100
919100	contig_5023_pilon	+	2113	13	Intergenic	novelGene_7290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2119.55686537435	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	66	1019	607279	631429	TRUE	25	TTGGAAGCAATCCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEAREL	580863	647582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622586_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
919101	contig_11321_pilon	+	2925	1	Intergenic	novelGene_86660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	2404	2871	183853	184320	NA	80	GGGAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIWVPVLFEMRDCDFPFGFMCLEGRWGTCPWAAQLWLTAGPAYTQQAAMRGRADGHLPGPAQGRAVHLTRDAATAPALALADRNSAPPLARQQKHCSQRSCELLGQVYPPFFTVRLCLCKTCLEQRETVTHDSALWAGASSLLSMGFLVDRWPQ	181449	184374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_181400_184400
919103	contig_610_pilon	-	1392	5	Intergenic	novelGene_76742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1326.68277576066	7	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	57	596	252557	220550	TRUE	25	TATTGTCAAAGTGGATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDLQSQQPSKQPE	252613	213498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220586_220665_220785_234998_235302_252475
919104	contig_12915_pilon	+	6787	3	Intergenic	novelGene_148329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAATGGTAGATGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19336	139568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_+_20023_130600_136615_139481
919105	contig_10801_pilon	-	1663	1	Intergenic	novelGene_74073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAGCACAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473396	471733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_-_471700_473400
919106	contig_19974_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_130470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACCAATAAGCAGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191407	190184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_190200_191400
919107	contig_12951_pilon	+	3350	1	Intergenic	novelGene_68218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1387	1731	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
919108	contig_2480_pilon	-	3090	1	Intergenic	novelGene_63514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1516	1962	127614	127168	NA	40	GGAATATTAGTCATCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLVAAVLDSAVLTAWQQLPRPQRVLPVVSVYSSPRVCTGPLSHQEPTQVWLPCFCAGVCNRCVHRFDHHCIWVNNCIGAWNTRYFLIYLLTLTASVATLASVSAAFLAQVVFFSDFYLKTYIDNHGHSQVVDTVFLVQVIMLWGERF	129129	126039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_126000_129100
919109	contig_2107_pilon	+	1700	3	Intergenic	novelGene_178994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCAGGGAGTTTGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314143	325677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2107_pilon_+_314401_314688_315037_324582
919110	contig_12257_pilon	+	2000	2	Intergenic	novelGene_152091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGTTGAAGTATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116421	118520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12257_pilon_+_117290_117388
919111	contig_4442_pilon	-	3630	3	Intergenic	novelGene_127924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1345	1869	44622	44098	TRUE	20	CTTTATAGTTTTAGGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGFQNKTPDDSPLEENALELPDTEFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFKENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSSFEMMEDRIRGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	46023	2153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_3082_43264_45410_45466
919112	contig_5428_pilon	+	2572	11	Intergenic	novelGene_160418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	67	junction_1	241.320637327188	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	136	1092	177032	225328	TRUE	80	ATAGTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTAELFEEPFVADEYIERLVWRTPGGGSRGGAEAFDPKRLLEEFINHIQELQIMDERIQRKVEKLEQQCQKEAKEFAKKVQELQKSNQVAFQHFQELDEHISYVATKVCHLGDQLEGVNTPRQRAVEAQKLMKYFNEFLDGELKSDVFTNSEKIKEAADIIQKLHLIAQELPFDRFSEVKSKIASKYHDLECQLIQEFTSAQRRGEISRMREVAAVLLHFKGYSHCVDVYIKQCQEGAYLRNDIFEDAAILCQRVNKQVGDIFSNPETVLAKLIQNVFEIKLQNFVKDQLEECRKFDAEQYLKNLYDLYTRYIFNY	176896	228362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_177059_199551_199647_200448_200597_204094_204290_218513_218579_221479_221509_222581_222692_223937_223983_224084_224226_225226_226551_228104
919113	contig_12474_pilon	+	877	1	Intergenic	novelGene_172211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAAAAACTTCCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3196	4073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12474_pilon_+_3200_4100
919114	contig_6552_pilon	-	2716	2	Intergenic	novelGene_163604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	779	1339	145246	144686	TRUE	30	GCACTTACTGGTGAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSGRTLSDIVLEDEPPGLEGTQKTTREELPPQSRVDLNDIDGVKLSGPSFTDVALLKMRRNSCKHPLIIETWNVQSMNLGKLEIVKNAMECINIDILGISELKWTGIGHFESDNHMVYYAGNDNLKRNGIAFTVEKNISRSILKYNAVSDRVIAIHLQGRPVNTTIIQIYTPTTKAKDEEIKDFY	146024	142965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_143478_143820
919115	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	65	829	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147176	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
919116	contig_9121_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_134434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAATAAAAAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57658	56619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_56600_57700
919117	contig_11413_pilon	-	2827	10	Intergenic	novelGene_103168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	359	868	407288	406046	TRUE	65	AAGAGATGAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVEPTLERTFFKSGEEALVPRRLRLRVEELGLAGTGFLSLEGVTEGRGDTGMGLTRVGATPAGGAAPVEVVLFFTEVVEVLFGRLKSAGADFAATFLTSASFPSVLMEVGLLGRGMGGGSYCLAQLQQEWQSLGLSEQSGCSWSWVWWPGQRPAWVVRLASQESLPL	423815	388814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_390451_401250_401348_402176_402396_406038_406228_406836_406895_407018_407313_408830_408946_419493_419573_421704_421819_423789
919118	contig_6270_pilon	+	1206	7	Intergenic	novelGene_99803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	427.161041710917	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	73	861	27433	47331	FALSE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISANKTIALSC	27360	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37492_37536_37666_39225_39481_40398_40558_47302
919119	contig_7704_pilon	+	2216	2	Intergenic	novelGene_154612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233125	235759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_234646_235063
919120	contig_15062_pilon	-	2771	2	Intergenic	novelGene_162289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	26	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACTAAATGTAAACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28187	25367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_27939_27987
919121	contig_16594_pilon	+	1705	3	Intergenic	novelGene_53867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147509	272923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_148445_165139_165648_272661
919122	contig_7004_pilon	+	2931	10	Intergenic	novelGene_126484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	32.0901507908233	9	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1747	2157	405275	406398	TRUE	25	ACCAGCTCCACACACCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKIFTQLRKYEPHGPLVNSEYYTGWLDYWGQNHSTRSIPAVTKGLENMLKLGASVNMYMFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKVPYHFIKLQSSRKFPWDHYLPPAPR	403437	408323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_404913_405003_405326_405432_405555_405663_405705_405918_406067_406349_406425_406542_406635_406774_406889_407161_407294_407913
919123	contig_12923_pilon	-	2241	15	Intergenic	novelGene_30195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	48.1821056630203	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	630	1893	74	1966	577741	511076	FALSE	30	CAATTTCTACATGTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATRLGEKPGLFIVVGGGRPGLGTMGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLVSLTMSFSCSNTTLVPMTFGIEQFQLQKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585698	510800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_533635_533746_535905_536014_538385_538522_539156_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577768_585651
919124	contig_8284_pilon	-	1466	2	Intergenic	novelGene_125690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	888	1271	451611	451228	TRUE	10	CTTCTGAGTCACCTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSIFFTNTIIQRHQFFFSLPYSSSLFIVQVSHAYEVIENTTAWARHSLILKVTSLLFSTLKGSFADLPNATCGLISWLLIPWALIVDSSKMKSLTTSIFSPFIMMLLIGPVVRIFVAFMLRCNPY	452498	424390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_424450_451091
919125	contig_16622_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_48506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	369	761	150267	149875	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEVQRRIDAFELWCLRGILNIPWTARRMNNSVLEEVQPECSLEVRMARHHLTYFRHVIKMDQSLEKDIMLRKVQGHQKRERPSTRWIDTVAATMGSSITMTVRMVEDWAVFGSLVHRVDMRQNRLDGT	150635	149647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_149600_150600
919126	contig_3900_pilon	+	1973	2	Intergenic	novelGene_84209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557778	560624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_559393_560265
919127	contig_4093_pilon	-	2698	6	Intergenic	novelGene_27624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2011.76016463196	3	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	110	742	69245	41737	FALSE	20	ATGGGAGGCAGTGAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72533	39780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45770_46391_46425_68951_69257_72435
919128	contig_11815_pilon	+	4572	4	Intergenic	novelGene_50942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	569	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1270	1707	471445	471882	TRUE	10	CCCCATTTTTCTCCATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDATLEALTRLYREIRKTATWPTDWKRSIYVPIPKKGDPAKCRNYQTISLVSHASKIMLKIIKKWLQQYIDRKLPEIQARFRRGCGMRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFYCVDCNKLWITLRRMRILEHLIGTCT	364674	474927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_365064_367920_368760_471403_474343_474522
919129	contig_11978_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_63021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTACAAAGGACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591847	1597012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592065_1592187_1592303_1595888_1595987_1596303_1596391_1596971
919130	contig_4426_pilon	-	2634	2	Intergenic	novelGene_15445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAAAAAGATGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853382	850675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_851468_851540
919132	contig_854_pilon	+	8103	33	Intergenic	novelGene_36574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3252.04970085574	6	150	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1536	4611	2294	6904	1683971	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1678778	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1680904_1681768_1681892_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715315_1715538
919133	contig_2892_pilon	-	2524	1	Intergenic	novelGene_118981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	180	578	16691	16293	NA	30	TTGTGAGGTGCAAAGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQTGEAVPKLCSTYWQEGVEMTHSTRYSGDRKRRYVETRNREMKKNKKDKRERKQTTQKRKKKAARDPTSMTAQTREAVTQPSSASQPVRKKQRWHMESSVREKGGGGSEKRGRNQKRTRKSTPTTKKWQ	16870	14346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_14300_16900
919134	contig_11978_pilon	-	563	5	Intergenic	novelGene_63024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	3759	junction_1	3737.87934529728	696	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	6	428	1596982	1591984	FALSE	10	AGTGCTTGCCTTCCGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAVVIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA	1596987	1591848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1592067_1592189_1592304_1595890_1596020_1596304_1596389_1596969
919135	contig_7057_pilon	-	3226	1	Intergenic	novelGene_123181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	2591	3001	236279	235869	NA	20	AGACATCACCGCCCGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAMGPLAATFMAFLMSEYVAGRARRQVRSTTDTSGVGTRNAIPVSFLETHVKDGSQNPASSPSTPLALGCGQAPAFPSTNAPSSWGMPSTLAAALCPPALIPFELWDDFAYGLGSPRGGRDDVLVGAPPIPPGLL	238869	235643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_235600_238900
919136	contig_7933_pilon	-	4342	2	Intergenic	novelGene_164669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	530	997	151953	151486	TRUE	40	GTTAAAAGATTACCACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYTENLNESTRKLLELIDFRKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLNNENYKTLLQETKRDLRKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPKAFFKGMEKQITNFIWKGRKPWINTA	152482	116454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_118715_150400
919137	contig_15732_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_88853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1942	2349	26188	25781	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKSETHSTQKSLRDSELQTKNVEQNSNSYKKTRLNGLTKSGGTPKTMAPRCSVNPELKPFPKPTLQTKIRRDYKTKNNTSEDCTSLSYQIYETKWAAPVQKQDEKAGRDRNGMNGLREPGVKRGSVLSQCGDCN	28129	25685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_25700_28100
919138	contig_12479_pilon	+	3536	3	Intergenic	novelGene_56880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522656	526801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_523542_524042_524135_524242
919139	contig_5125_pilon	+	2429	8	Intergenic	novelGene_43409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1567.97152202377	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	270	1337	35654	58893	FALSE	20	CTTAATGTTTGTATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25623	59985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_25850_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_58657_58722
919140	contig_20170_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_166657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGGTGCCTAGCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72570	70471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20170_pilon_-_70500_72600
919141	contig_17198_pilon	-	4135	1	Intergenic	novelGene_62424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAAGCAAACTTCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1174591	1170456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_1170500_1174600
919142	contig_14525_pilon	+	1505	8	Intergenic	novelGene_149780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_1	41.675128392491	38	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1365	139	1503	235549	256934	FALSE	20	TGTTGAGCTTGTGCAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQELVHQAASLYSDRIAVCFDECNSQHPIYYTYKTLVNDASKLSNFLQLHCDFQGIQEIGLYCRPGINLPSWILGILQVPAAYVPIDPDSPPPLSTYVMKKCNLKYILVEKKQVDKFRSSHDTLLNYDTFTVEHNDLLLFRLHWKNVEVKLMLSDGKEKSEKEKLKNSRGSGNSNEGNSEEYIDLRLKHCLAYVLHTSGTTGIPKIVRVPHACIVPNIQHFRMLFEITQEDVLFLASPLTFDPSVVEIFVALSSGASLLVVPTSVKVLPSKLAAVLFSHHRVTVLQATPTLLKRFGSQLIKSTVLSASTSLRVLALGGEAFPSLTVLKNWRGEGNKTQIFNIYGITEVSSWATVYRIPEEILNSTVKCELPVQLGFPLLGTVVEVRDTNGFTIQEGNGQVFLGGRNRVCFLDDEMTVPLGTMRATGDFVTVKDGEMFFLGRKDSQIKRHGKRL	234606	256936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_234709_235512_235779_237244_237366_240415_240736_244876_245070_255509_255752_256129_256237_256782
919143	contig_14441_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_100767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	41	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	193	741	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPTFGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121828	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
919144	contig_3862_pilon	-	742	1	Intergenic	novelGene_137424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCACCGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602913	602171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_602200_602900
919145	contig_5574_pilon	+	3599	1	Intergenic	novelGene_155858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	2666	3136	182515	182985	NA	50	AGCCTAAACTACCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYMLQLRGREFQNGLKKHDPTICCLQKTHLKSKNTNRLKLKGWKKIFHVDKNQKRVGVAILLSDKVAFKTKSVRRDKDGHYIVIKASIHREDLTIINIYAPKYIKQVLIELKKEIDSTTIIVGDFNTQLSIFDRTSRKIINKETEDLNDTINQLD	179849	183448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_179800_183400
919146	contig_20748_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_138182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCTGTAAGCCTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191196	192731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_191200_192700
919147	contig_10569_pilon	-	1409	2	Intergenic	novelGene_44073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAAGCGTAACTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271902	267923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_-_268637_271206
919148	contig_4832_pilon	+	2223	14	Intergenic	novelGene_163419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	48.4085180044237	9	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	170	1261	497716	504383	TRUE	35	TGTAGATTCTTATACTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQTSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGMYVISILTSYFLTVWQPELERRVITYQKKIW	496122	510044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502388_502517_502611_503917_503999_504248_504720_505180_505332_506088_506191_506558_506609_507026_507177_509871
919149	contig_9053_pilon	-	1326	1	Intergenic	novelGene_87953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	7	546	304889	304350	NA	85	AAAAGAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRMVPVGIQNKTPDDPPLEENALELPEREFKSLLLRILQELRQKADKHDEKIDKFMENTDKKLEEFKKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRFSGIEDKHLDTTLFQENLEKRTKKNEETLRVMWDTFKSKNLQVIGIPERGRKQKTQRGSLKNC	304895	303569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_303600_304900
919150	contig_8263_pilon	-	2227	8	Intergenic	novelGene_83105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTGAAAGAAATCCAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193185	155767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_156462_162211_162419_179978_180105_184209_184297_187959_188095_188936_189003_189256_189384_192400
919151	contig_10078_pilon	+	1285	1	Intergenic	novelGene_160012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACATGCTGTCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261538	262823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_+_261500_262800
919152	contig_17427_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_30393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213566	215242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_213600_215200
919153	contig_5039_pilon	-	2012	2	Intergenic	novelGene_65017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	767	1084	1738026	1737709	TRUE	35	GGACAGGCTTGTAAATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVLGCFIFEFIFFFHIFSFILSGICFFYHTGKHVPISFFNPYKCCRISCIRAAVWMVLLGKLTKRFSDIIRRAFFIQIQQPIILTDLLFGFMGRHHSVPNDTKI	1738792	1735805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1736614_1737588
919154	SIRV7	-	2023	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	150	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	31	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147768	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2245_2526_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
919155	contig_12677_pilon	-	1348	2	Intergenic	novelGene_110710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_223_322
919156	contig_2799_pilon	-	2344	3	Intergenic	novelGene_85593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTCGCTAACCCGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783892	780395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780434_781540_781791_781836
919157	contig_11338_pilon	+	3107	9	Intergenic	novelGene_6198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	562	junction_3	416.278077131141	31	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	387	1628	8000	11749	FALSE	25	CTGTGAGGCAGCAGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	7613	13228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
919158	contig_20223_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_177231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGAATCCATAGAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60751	59870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_-_59900_60800
919159	contig_12479_pilon	-	4607	2	Intergenic	novelGene_56845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1272	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1644	1949	174708	174403	TRUE	75	TATAAAAAAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVTVGVQNKTLDDLSVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFVENTDKKMEEFKKTIQEKNAKINS	176351	171677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_173368_173434
919160	contig_6707_pilon	+	418	1	Intergenic	novelGene_167039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCATGCTTTCCAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140133	140551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_+_140100_140600
919161	contig_5125_pilon	+	3001	1	Intergenic	novelGene_43445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1321	1701	30240	30620	NA	25	ATTAATGAAGTTGGGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMPVSKKGDPTECGNYQTTSLILHASKILKIIQKRVAAVHQQGTARDSSQIQKRRWNKGISLLMSDGCWLKAENTRKMFTCVLLTMQQLSTVDPNKLRITLQRMGIPEDLIVLMRNMYIDQEAVI	28919	31920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_28900_31900
919162	contig_15991_pilon	+	3875	2	Intergenic	novelGene_70954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1808	2131	170981	171304	TRUE	30	TCCCTCGGGCACCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIASISSQNKESRNLLEKENFLELLAVEYKRLIYRTLQEIRQNAEQAKEHTDKVIEEPKKIREEHNDIFNRLQESIERQQSEIHKIKNKISELDNSVESHRNRIEAM	169173	173286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_171755_171992
919163	contig_11293_pilon	+	2689	25	Intergenic	novelGene_134676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	301.949841194233	1	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	769	2310	46	2355	101298	155605	TRUE	35	CAGGTACGTGGAAAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYVKIKDIVKGKLLILMEARLSALYKVENDYEILERFPGAYLKGRKYRPLFDYFLKYKENGAFTVLVDNYVREEEGTGVVHQAPYFGADDYRVCVDFNIIQKDSLPVCPVDASGCFTAEVTDFMGQYVKDADKNIIRTLKEQGRLLVASTVTHSYPFCWRSDTPLIYKAVPSWFVRVEHMVDRLMSNNDLCYWVPEFVREKRFGNWLKDARDWAISRNRYWGTPIPLWVSDDFQEVVCIGSVAELEELSGAKISDLHRESLDHLTIPSRCGKGSLHRISEVFDCWFESGSMPYAQVHYPFENKKEFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPAFKNVIVNGLVLASDGQKMSKRKKNYPDPVSIIHKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFFIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTAKASTNITDCWVLSCMQSLIEFFKTEMSAYRLYSVVPRLVKFVDILTNWYVRMNRRRLKGENGTEDCIMALETLFSVLFSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKRLIDPVSVQDEDTVSIHYLMLPHVREELLDKKTESAVSRMQSVIELGRVIRDRKTIPIKYPLKEIVVIHQDLGALKDIKSLEKYITEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMVLGKRLKGAFKAVMTSIKQLSDEELELFQKNGTIVVEGHQLHKEDIRLMYTFDQATRGTAQFEAHSDAQALVLLDVTPDQSMVDEGLAREVINRIQKLRKKVPCGFRKIIC	101252	173636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_101320_103926_104015_104267_104329_111938_112035_114871_114995_115569_115662_120160_120260_121604_121732_123275_123350_124056_124252_126278_126366_128797_128882_130093_130239_139020_139142_142765_142858_144621_144700_145509_145632_146022_146126_146376_146461_148135_148311_150627_150741_155222_155320_155573_155640_156316_156494_173513
919164	contig_11316_pilon	+	1343	2	Intergenic	novelGene_122606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136994	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_138136_138667
919165	contig_19606_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_148276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52481	54519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19606_pilon_+_52500_54500
919166	contig_13780_pilon	-	5472	3	Intergenic	novelGene_149120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	685	junction_1	122.5	22	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	2452	2958	824289	822800	FALSE	75	AAAAAAAAAAAGCTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFLIENSDSGTGKKEKEKKNRKGKDKENGSVSSSETPPPPPPNEISPPPHAVEEEEDDDWGEDTTEEAQRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRVSKLCLGL	826740	820285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_822989_823722_823882_824130
919167	contig_4402_pilon	-	4950	2	Intergenic	novelGene_140825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTTTATATCCGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462278	454848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_458582_461061
919168	contig_15354_pilon	+	2841	12	Intergenic	novelGene_65768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_9	60.1381330049605	27	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	123	1634	663143	676641	FALSE	45	GAAAAATATATTTGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLEELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYHNGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGIKGLWPLRSDPNRETDDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQVVAETGAGTVYWNWTWSAAWLHQTFKCSLYLWL	663020	677848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_663204_664557_664707_665958_666076_666467_666690_669379_669495_670617_670716_671430_671590_672205_672290_672860_672978_673521_673625_676259_676336_676430
919169	contig_1146_pilon	+	2643	3	Intergenic	novelGene_84834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	746	junction_2	27	44	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2088	2471	904108	904594	FALSE	75	CATTTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVIWRQLISSCPWLSELDESATEGVIKVWRKVVDRIFSLYKLSCSAYFTFLKLNAGQVPLDEDDPRLHLSNRAEQSTDDVIVMATLRLLRLLVKHAGELRQYLERGLEKTPTAPWRGQSLNQMFQ	901008	904766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_903042_904053_904285_904387
919170	contig_1379_pilon	+	3730	1	Intergenic	novelGene_134598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	179	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1372	1689	456019	456336	NA	55	AAAAAAAAACTGCTCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSYDFLSNLYQGYTATNLVYSLACFSTTSDNGFDSPFLRKFKSPNLNCFSFDSFHLNIHCSLPIFFSSCPSSSLTPIPGTSYCIVSRILNPLLFPQPLHLYPYK	454647	458377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1379_pilon_+_454600_458400
919171	contig_11285_pilon	-	1299	13	Intergenic	novelGene_5714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_5	349.142630437603	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	89	1252	789442	784252	FALSE	15	TGCCCTTTACTCTCCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	789948	784204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926
919172	contig_12120_pilon	-	3578	6	Intergenic	novelGene_21413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	163	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGACTAACTTGAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98785	33820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_34642_37653_37883_40189_40882_70914_71592_94863_95326_98088
919173	contig_6025_pilon	+	4949	1	Intergenic	novelGene_178032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	274	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143899	148848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6025_pilon_+_143900_148800
919174	contig_2703_pilon	-	1183	2	Intergenic	novelGene_101646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3351	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1766_2586
919175	contig_19352_pilon	-	3413	1	Intergenic	novelGene_122424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCAGACGACCTCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409434	406021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_406000_409400
919176	contig_16999_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_84958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	775	801	49146	49120	NA	70	GACAAGAAAAAGAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAPLAGRPGSLCPRLAALLRARELGCGGRPAADFAERLLAQPQPSLQHRLCLLFPHLLPDPDQAVPRAGPDRRRRLLVAASAARLLLPGGLLGVAVVVFVVGGRRRRGSRASAHAPGSALAPGPVGQVVLGAELCGFADARAPGEAPAQHPGTALLQLRVVGLLHQPRIAASTPQAAAVLSGGERWLPAGPRVGSLLSNQGSSSSSSVVQYRGRKSACDQTPEEVQLRVVRRDFSQLLWQLQNVQETFVALYFQRTGMLPERKVC	49920	47493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_47500_49900
919178	contig_6497_pilon	+	1796	1	Intergenic	novelGene_35599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCCTAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449618	451414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_449600_451400
919179	contig_20493_pilon	-	2859	3	Intergenic	novelGene_86401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	22	113	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	2033	2794	38628	37388	FALSE	10	TGCCTGAGCCTCCCTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFDQSGVYFVIGSEGQREVVKKCHQVGGTWRVFAVRLIVGGRFLRDDLVQLPFLTMCIKESLRLHPSVISISRCCTQDIVFPDGRVIPKGVICLISIFGTHHNPSVWPNPEVPPSPTILIHCRNMRGGGPEWGIRHHIWHYMHVCLSKVVCLGIPHPAALSPHPQVYDPFRFNLENTQKRSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMTEMKVVLALTLLRFRVLPDDTEPRRKPELILRAEGGLWLRLEQLGARPQ	40660	37322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_37566_37953_38264_38354
919180	contig_9901_pilon	-	6501	13	Intergenic	novelGene_126916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	160.713750880944	1036	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	308	781	207348	185991	TRUE	20	GTCTTGGATTCTTGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAADGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	249460	79662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_79767_79854_80829_173905_177916_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_207324_207492_245846_245927_249376
919181	scaffold_16735_pilon	-	4477	13	Intergenic	novelGene_160359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	71.6121885963246	1837	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	150	2021	405618	365642	FALSE	5	TCCGGACGGTCCTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSALWTRKRKPRIANSDESGGSMYRTLHLSTEQVATFCRSLHEMHSPDQSSSPQDSSGPQLAAMRQLTDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKARTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLKELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPSSLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGAHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSSPESRKEFLRAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARPAMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSAGSPEREPPQPPRGGDTDRWVEEQFDLAQYEEQDDIKETDILSDDDEFCESAKGASVDRELREQLQAASISQRDRGRKALDSHASRMTQLKKQAALSGINGGLASSGEEVIWVRREDFAPARKVNTEI	405767	363185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16735_pilon_-_366112_369584_369758_372785_372874_376138_376242_376749_376809_382011_382121_385895_386015_386104_386285_390415_390525_396416_396543_396836_396906_398571_398752_405531
919182	contig_4678_pilon	+	4759	15	Intergenic	novelGene_126015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	73.9349203622996	7	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1196	3591	283	3873	287603	332416	FALSE	20	CCGATTCTCCTTTTACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHRTAASPKEAIEEGVEHDHGMPVSKRMQGERGGGAALKENVCQNCEKLGELLLCEAQCCGAFHLECLGLTEMPRGKFICNECRTGIHTCFVCKQSGEDVKRCLLPLCGKFYHEECVQKYPPTVMQNKGFRCSLHICITCHAANPASVTASKGRLMRCVRCPVAYHANDFCLAAGSKILASNSIICPNHFTPRRGCRNHEHVNVSWCFVCSEGGSLLCCDSCPAAFHRECLNIDIPEGNWYCNDCKAGKKPHYREIVWVKVGRYRWWPAEICHPRAVPSNIDKMRHDVGEFPVLFFGSNDYLWTHQARVFPYMEGDVSSKDKMGKGVDGTYKKALQEAAARFEELKAQKELRQLQEDRKNDKKPPPYKHIKVNRPIGRVQIFTADLSEIPRCNCKATDENPCGIDSECINRMLLYECHPTVCPAGGRCQNQCFTKRQYPEVEIFRTLQRGWGLRTKTDIKKGEFVNEYVGELIDEEECRARIRYAQEHDITNFYMLTLDKDRIIDAGPKGNYARFMNHCCQPNCETQKWSVNGDTRVGLFALSDIKAGTELTFNYNLECLGNGKTVCKCGAPNCSGFLGVRPKNQPIATEEKSKKFKKKQQGKRRTQGEVTKEREDECFSCGDAGQLVSCKKPGCPKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFISKLDGRLSCTEHDPCGPNPLEPGEIREYVPPPVPLPPGPSSHPAEQSSGMATQGPKMSEKPPADTNQTLSLSKKALAGTCQRPPLPERPLERTDCRPQPLDRVRDLAGPGTKPQSLGSSQRPLDRPPATAGPRPQLSDKPSPVTSPSSPSLIRSQPLERPLGMAGSRLDKSIGAASPRHQPLEKAPVPTGLRLPPPERLLITSGPKPQASDRPPDKSHASLSQRLPPPEKVLSAVVQTLVAKEKALRPVDQNTQSKNRAALVMDLIDLTPRQKERAPSPHEGTPQADEKMPVLESSSWPPSKGLGQMPRAGERGSVSDPVILPPGKAAAPSEHPWQAVKSLTQTRLLSQPPAKAFLYEPATQASGRPPAEAEQTLGLPSQAPGLVKQMAGGQQLPGLAAKGTTLSGQSFRPLGNAPASLPTEKKTLATTEQSPWVLGKASLGPGLWPMVAGQTLTPPCWSSGSTQTLAQTCWSLGRGQDPKPEQNTVPALNQAPSSHKCAESEQK	286544	333302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_286666_287339_287492_287593_287738_290373_290498_295480_295682_297295_297476_309451_309609_311072_311279_315735_315849_319538_319809_322312_322430_323150_323293_326685_326793_329053_329259_330782
919183	contig_5623_pilon	-	2256	13	Intergenic	novelGene_154846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	377.973351132943	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	78	1388	212514	208454	TRUE	25	ACCTCCATGGCTAGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTIRPA	212591	207022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207857_208419_208467_208519_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424
919184	contig_14537_pilon	+	2882	1	Intergenic	novelGene_158654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1417	1755	55142	55480	NA	25	TCCCTGCAAAATATGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAIPLQSAQAEGVGPKPCSTAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQKPQVPTTVAAQTGKQFHTRTELCSPPGRSKDGAWSQVFEQKEGEVVRGKEEIKISRKKQHQQPTNGT	53725	56607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_53700_56600
919185	contig_18843_pilon	+	5120	1	Intergenic	novelGene_165624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATTAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49617	54737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18843_pilon_+_49600_54700
919186	contig_5153_pilon	-	4156	1	Intergenic	novelGene_74345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGGCTCTTGGGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763708	759552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_759600_763700
919188	contig_9389_pilon	-	1782	3	Intergenic	novelGene_84090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_2	12	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	1264856	1260830	TRUE	25	GTGCATTGCATTGGGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFCAAAAALSPPPLPARPRPRGRSCFPEAEEVGTCVSRGAHSAPLRSPRSAPASRAKTSLSQRKVTNVHWEKRTAPVSWRQSQEPGNAGPICDCQNLLPKAGPARCSFSSIKTH	1264858	1255280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1256715_1260828_1261050_1264731
919189	contig_10103_pilon	-	3106	6	Intergenic	novelGene_86169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	267	junction_5	210.216650149316	54	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	664	1092	654769	653406	FALSE	30	AGTTGAACGTATTCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAETLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHVIKKLGGSLTDSYLDEGMYVCRVWENKL	656993	651391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_-_653647_654456_654570_654694_655244_655980_656047_656148_656224_656945
919190	contig_9653_pilon	-	2753	9	Intergenic	novelGene_48294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1192.96143457155	1	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	264	1313	1016667	1006903	FALSE	65	AAAAAAAAAAAAAGTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1025402	1005462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925_1018001_1025325
919191	contig_12671_pilon	+	2171	1	Intergenic	novelGene_19197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTTGAGCTTGTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86986	89157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_87000_89200
919192	contig_17144_pilon	-	1239	7	Intergenic	novelGene_29551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1841.41799226092	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	35	1186	174965	166152	FALSE	15	CTCTTAAACTGTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174999	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166473_172589_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
919193	contig_3386_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_34576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGAGGACAAACAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478778	476167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_476200_478800
919194	contig_11294_pilon	+	1687	16	Intergenic	novelGene_50055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	159.742654152094	1	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	419	1348	306332	348804	FALSE	30	TCTAATATTTGAGGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVARTQRDGFHIFIVSIKTEKTDSSWNLNVSLSMKGPHGYISASDWPLMIFYMVMCIIYILYGVLWLMWSACYWKDILRIQFWIAAVIFLGMLEKAVFYSEYQNINSTGLSTQGLLIFAELISAVKRTLARLLVIIVSLGYGIVKHFTNTLIFAVLASVVFMVWTTKTFRIAKCQSDWMERWVDDAFWSFLFSLILVVIMFLWRPSANNQRYAFMPLIDDSDDEIEEFMVTSENLTEGIKFRVSKTISNGAAKPATSDNFDEDLKWVEENIPSSFTDVALPVLVDSDEEIMTRSEMAEKMFSSEKIM	251371	349143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_+_251543_256913_256975_290307_290443_306280_306335_309927_310019_311568_311631_311866_312051_319137_319238_332581_332617_333604_333664_334971_335076_337381_337456_338120_338195_340644_340698_347019_347051_348744
919195	contig_9839_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_88574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331163	265538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_266826_331020
919196	contig_2703_pilon	+	2302	15	Intergenic	novelGene_101705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	929.273803042143	13	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	300	1433	559489	610870	FALSE	55	AAAAAAAAAAAGTTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYSPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHDAAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526167	611739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599674_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
919197	contig_9054_pilon	+	4086	9	Intergenic	novelGene_160674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_8	44.8915359505553	66	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	213	1730	426380	499089	FALSE	80	AAGAAAAAAAAGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFYPAVEGTLCLTGHHLILSSRQDNTEELWLLHSNIDAIDKRFVGSLGTIIIKCKDFRIIQLDIPGMEECLNIASSIEALSTLDSITLMYPFFYRPMFEVVEDGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYINKEFAVCLSYPPIVIVPNSIDDEAVRKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDEKLINATLRAGKRGYIIDTRSLNVAQQARAKGGGFEQEAHYPQWRRIHKSIERYHILQESLIKLVEACNDQTHSMDRWLSKLETSNWLTHIKEILTTACLAAQCIDREAASVLIHGTEGTDSTLQVTSLAQIILEPRSRTIHGFEALIEREWLQAGHPFQQRCAQSAYCNSKQKWESPVFLLFLDCVWQILRQFPCSFEFNEHFLITLFEHVYASQFGTFLGNNESERCKLKLQQKTMSLWSWVNQPSELSKFTNPLFEANNFVIWPSVAPQSLQLWEGKLHHFQTIY	426167	501445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_426562_441717_441827_461791_461918_470405_470580_473074_473293_474378_474541_479481_479624_490039_490261_498905
919198	contig_15859_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_50188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGCTGGTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323488	322330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15859_pilon_-_322300_323500
919199	contig_15732_pilon	-	3692	1	Intergenic	novelGene_88856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAGGATTTTGAGAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47465	43773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_43800_47500
919200	contig_14711_pilon	+	3861	5	Intergenic	novelGene_68910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_3	228.59831036121	24	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	1	771	84075	85937	TRUE	25	AGTCTTATCTCAGACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFVSPAFTPLLIPATPPLLPWLPAPSFTLLPGDHPAVFPRSSSSLCPTAAQTGNLCHLILSPLFIPCQASRAPSADGTLFPGFPGLRAPCVFGGTYGTHLVPNSPPPSRITPLWVR	84074	90799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_84100_84807_85050_85433_86242_87717_90194_90489
919201	contig_14191_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_153758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGACAAGGGTAATCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7142	8706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_+_7100_8700
919202	contig_6192_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_170345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGAAGAACCCAGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	831720	832979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_831700_833000
919203	contig_3386_pilon	+	1858	4	Intergenic	novelGene_34585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	651	junction_3	410.061242038579	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	328	345	508345	508362	FALSE	55	AGAAAAAAGAATGGTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPESDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK	506097	509875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_506121_506538_506635_507645_507741_508231
919204	contig_1544_pilon	-	4016	2	Intergenic	novelGene_167929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1523	1996	7146	6673	FALSE	35	ATTGGAAGAGCGTAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGVQNKTPDDFPVEGKVLEPPDREFKSLILRIIHELKQKADKNEEKIHKFMEKADKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQIIQKQQLEIQKIKQDFRNRQLIEGLRSRFEMVEDRISAIEDKHLDTTLFEENSEKKNEEK	126615	4652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1544_pilon_-_7719_125665
919205	contig_6418_pilon	-	1900	7	Intergenic	novelGene_81123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	359	junction_6	209.40292102388	32	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	62	868	106563	76729	FALSE	60	TAGCACTGTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVHEILCKLSLEGDHSTPPSAYGSVKAYTNFDAERDALNIDTAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNAQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEIKTVYKEMYKTDLEKDIVSDTSGDFRKLMVVLAKVGFSVSSPLLRLKASYTPCFISGSELTKSPVPASEIQLHLRQWVCTVTADWSFLCNRISYSAKPHGQVDFGARKGTGGSQVLAGVWAAALTA	118009	75696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_77088_78209_78301_81713_81828_85894_85990_103028_103129_106515_106575_117959
919206	contig_3956_pilon	+	1836	7	Intergenic	novelGene_15011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1516.93770471961	3	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	81	875	1281682	1284867	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDR	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1285173_1285712_1285810_1290452
919207	contig_4845_pilon	+	2765	1	Intergenic	novelGene_53691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860846	863611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_860800_863600
919208	contig_5023_pilon	+	4007	17	Intergenic	novelGene_7232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1821.21146150028	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	87	1862	607279	646990	TRUE	35	TCAATGCTCTAAGAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580842	649301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607319_608019_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_648261_648426
919209	contig_233_pilon	-	4090	15	Intergenic	novelGene_14536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	1284.17623281961	27	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	1545	3647	108522	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127029	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_109764_109803_109976_126898
919210	contig_8259_pilon	+	768	1	Intergenic	novelGene_148891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGGTAATAACATTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297175	297943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_297200_297900
919211	contig_8820_pilon	-	3107	7	Intergenic	novelGene_79294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	701	junction_1	413.196785240802	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1465	2460	168430	166441	FALSE	50	TAAATTACAAAGAAATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	170434	165793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168814_169016_169799_170135
919212	contig_50_pilon	+	5088	1	Intergenic	novelGene_122221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTGGGCAAGACATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68041	73129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_50_pilon_+_68000_73100
919213	contig_4426_pilon	-	2350	2	Intergenic	novelGene_15447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAATAAAGAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853379	850726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_851427_851729
919214	contig_5424_pilon	+	4429	4	Intergenic	novelGene_172800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	309	junction_1	18.0554700852678	979	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	320	676	96371	115196	FALSE	75	AGGAGAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDFSTRTYGTSGLDNRPLFGETSAKDRIIHLVVGSLTSLLILVTLISAFVFPQLPPKPLNIFFAVCISLSSITACILIYWYRQGDLEPKFRNLIYYILFSIIMLCICANLYFHDVGK	96051	118949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5424_pilon_+_96449_112511_112563_113588_113694_115073
919215	contig_9011_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_159280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAATGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178072	175243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_175200_178100
919216	contig_3081_pilon	+	3971	5	Intergenic	novelGene_133984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	2112	2789	2971957	2972634	TRUE	45	ATCAATTACATGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEPNAKINSQLEIIHRQQLEIQKINNKISEIDGVIEGVRSRFETVEDRISGIEEKHLDTPVFEENTEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRATREKQEVQYRGETIRQSSDYSAETMQARRQWDDIHKISKEKQIASQE	2841281	2973953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2842025_2911286_2911502_2913443_2913582_2970941_2972721_2972857
919217	contig_6102_pilon	+	2485	21	Intergenic	novelGene_32351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	88.7244470256084	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	797	2391	93	2483	1699217	1714777	FALSE	30	GCTAAAGAAGCAGTTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSISRCALQRPLNSEVGNRFRLHQRGVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEDSYTLVSHLIATEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDMLLKNNSELLNNLGNFINRAAMFVSKFFGGCVPEMVLMLDDQRLVAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISRHGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQDQLQLPPPACSILPKNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGGQGELTLVLLQAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQMLMDEVTKQGNIVRELKAQNADNHQVAAEVAKLL	1699124	1714779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703497_1704759_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711493_1711873_1712088_1712873_1713006_1713109_1713215_1713305_1713493_1714177_1714250_1714478_1714599_1714702
919218	SIRV3	-	416	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	922	combination_of_known_splicesites	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCTGTTAAATGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	7837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
919221	contig_10711_pilon	-	3336	1	Intergenic	novelGene_118418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	957	1322	214526	214161	NA	35	TATCATAATCACACTTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRRSAILDSYWRPANGVRESSYTELPAEDKTTGNLRYMPPHPPSFFNPDSASSASRGHNLLFGKHQLLGFHLPERAGSLSAICWLLVLLFSASFDFFLTSHHLPLLLLKYLVPCTIFASF	215482	212146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_212100_215500
919222	contig_12249_pilon	+	2477	7	Intergenic	novelGene_121010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_6	32.0884195102636	41	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	70	822	162628	182920	FALSE	30	TATCTTTTAGCTCAGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGVIPPKKFITRLRKENELFDNYMQQDAHEFLNYLLNTIADILQEERKQEKQNGRLPNGNIDSENNNSTPDPTWVHEIFQGTLTNETRCLTCETISSKDEDFLDLSVDVEQNTSITHCLRGFSNTETLCSEYKYYCEECRSKQEAHKRMKVKKLPMILALHLKRFKYMDQLHRYTKLSYRVVFPLELRLFNTSGDATNPDRMYDLVAVVVHCGSGPNRGHYIAIVKSHDFWLLFDDDIVEKIDAQAIEEFYGLTSDISKNSESGYILFYQSRD	152375	184575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_+_152428_162610_162841_168393_168471_168590_168675_177489_177688_181475_181555_182818
919223	contig_821_pilon	-	1484	3	Intergenic	novelGene_149383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	35.5	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	388	858	171190	68751	FALSE	55	GAAGACATCATGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWARNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRVKLLIGPVQEIPAGQDQPPSGLMHQAFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQVPTGHGTQEQDVYQVPPSVQRSIGGTNGPHLSKKVSD	190728	68124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_69210_171178_171366_190516
919224	contig_18859_pilon	+	1767	1	Intergenic	novelGene_150549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATACTGAGAGACAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132932	134699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_+_132900_134700
919225	contig_7720_pilon	+	5117	3	Intergenic	novelGene_155752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_1	8	139	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	545	952	342389	345203	FALSE	35	AAATTCAACTTCTGTGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAVNASWVGLCKIQDDVRGYVNGPILLAQTPLCDCVGFGICRGIDMEKRLYHILTPVPPEELRDVNCLLIGAVSIPQCVFKSQRGLEGTIPYVTTDYNFSLPGARDKIGARDSEQNYEEKRYLTPKLYRKINRY	341844	349368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_342507_343817_343952_345047
919226	contig_17560_pilon	+	3010	2	Intergenic	novelGene_167584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGTGATCAGAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107913	137292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_108254_134622
919227	contig_12969_pilon	+	2212	1	Intergenic	novelGene_61647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATCTTTGTTTATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6151	8363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_6200_8400
919228	contig_13982_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_163480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACTGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349286	347254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_347300_349300
919229	contig_6373_pilon	-	2036	1	Intergenic	novelGene_178104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAGACCAAACAGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4604	2568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6373_pilon_-_2600_4600
919230	contig_7009_pilon	-	2975	1	Intergenic	novelGene_23675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540191	537216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_537200_540200
919231	contig_19352_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_122420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360685	361521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_360700_361500
919232	contig_16846_pilon	-	1475	1	Intergenic	novelGene_82852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTGGACAAACCGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85205	83730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_83700_85200
919233	contig_14445_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_137373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATTCCAAAAGACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332459	331838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_331800_332500
919234	contig_1516_pilon	+	6375	2	Intergenic	novelGene_49953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATACATCTTTCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309636	316176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_314725_314889
919235	contig_11055_pilon	-	891	6	Intergenic	novelGene_142171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_4	125.646488211967	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	184	891	151472	132880	FALSE	60	GAAATAAATCAACTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIKTLREGIVINGNRLGTLVETYVDTINSGAVPCLEDTVTTLAQCENSVAVQKAADHYSKQMAQCMRFPTDTLQELLDVHAACEREAIALFMEHSFKDDKREFQKNLMETIEKKKEDFMIQNEEASEKYCQVELKKISEPLMASISRGTFSVPGGHSLYLEAKKKFEQNYARVPRKGVKANEVLQSFLQCQAPIEEAILQSDRALSDSEKAKAAMQAKKEAAEKKQELLKIKNQEQQKKMKAQERSFKENMEQLKQKIEREIENSLRDKEKMLEHKQKVQKELLNEGFEKKSEMLNK	152578	132879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_132937_133843_134038_134375_134479_139218_139432_151331_151613_152535
919236	contig_5935_pilon	-	2477	1	Intergenic	novelGene_102764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	940	1281	1381475	1381134	NA	70	AAAGAAAAGAATATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDDSLQYGLHINIKKTKILTTGPISNITINGENTEVVKDFILLGSTVNTHGNSSQEIKKHITLGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQTIVFSVPSFACESWTINKKD	1382414	1379937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1379900_1382400
919237	contig_10609_pilon	+	2344	2	Intergenic	novelGene_123909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTACTCTAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238155	333993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_238163_331656
919238	contig_755_pilon	+	4691	18	Intergenic	novelGene_119776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	162.083493371563	3	118	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	1448	2941	556655	581811	FALSE	30	ATAAACGTGTTGTACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKDFLTDEKFQEGITHYIRKFSYRNAKNDDLWGSLSNSCLEGDFISGGFCYSNSKMTSNTLSFLQKNVEINEMMNTWTLQKGIPLVVVKQEGRSLRLHQELFLKGVFREDPEWGTLQERYLWQIPLTYSTSSSNMIHRHVLKSKRDTLELPEKTSWLKFNVDSNGYYIVHYEGHGWDHLITQLNQNHTLLRPKDRVGLIHDAFQLVSAGRLTLDKALDLTRYLQHETSSPALLKGLGHLELLYHMMDGRNISDVTENLKHYILRYFKAMIDKQSWSDEGSIFDRLLRSALLKLACDLNHPPCTQKAAELFSRWMESSGKLNIPADVLKIVYSVGAQTTGGWNYLLEQYGLSMSGAEKNKILYALSTSKHQENLVKLIKLGMEGKVIKTQDFAPLLHAIARNPKGQHLAWNFVRENWTHLLKKFDLGSFAMRVIISGTTSHFSSKDELQEVKLFFQSLKAQGSHLDIFQIVLETITNNIKWLEKNLNTLKTWLLVNV	525104	583561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_525220_527447_528122_542025_542165_546317_546453_547672_547794_555200_555315_556298_556434_556640_556769_561629_561699_562743_562920_565805_565886_568431_568616_572607_572765_573243_573429_576498_576661_577371_577513_580844_580927_581667
919239	contig_10446_pilon	+	3591	2	Intergenic	novelGene_162512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1991	2317	1083726	1084052	TRUE	60	CTAAAGTACAATTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQVHSLHFTGNPSYFSADGAHADHSGCPHIHSLPCSEHLAADPNRPPGSLCWVQAVGAASNLSIPSPIASSFVPRIQQWFWSGRRLRGLGSWDTWVTFPPVLCLQV	1081735	1086553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1084508_1085734
919240	contig_4385_pilon	+	1861	3	Intergenic	novelGene_141516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	6.5	13	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	100	738	448820	452350	FALSE	15	TTATATGCTTTATGGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVEIGAHWIHGPSQGNPVFQLAAEYGLLGEKEMSEENQLVELGVHLGLPSVSYASSGQSVSLELVADTANLFYTLLDQTREFLHVAETPVPSVGEYLKQEISRHMANWTEDKETKKLKLAVLNTHFNLECCVSGTHSLDLLALGPFGEYTMLPGLDCTFREGYEGLTSCIVASLPKDILVFNKPVKTIHWGGSFQEETLPGETFPVSVECEDGDRFPAHHVILTVPLGFLKEHLDTFFQPPLPP	448720	453473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_449206_450019_450220_452297
919241	contig_6356_pilon	+	4970	2	Intergenic	novelGene_126428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATAAAAAAACAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48125	53187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6356_pilon_+_48381_48472
919242	contig_7157_pilon	-	4347	5	Intergenic	novelGene_131299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGTTAATACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963136	902800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_904681_904824_905861_946993_947396_961816_962371_962661
919243	contig_14569_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_165419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTTCAATAAAACCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351531	350042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14569_pilon_-_350000_351500
919244	contig_6239_pilon	+	5328	6	Intergenic	novelGene_178349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	426	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1900	2424	145782	146306	TRUE	45	TTACAGCTAAGAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKYLQKQERMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILTILQDLRHKADKHEEKKDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQQEIIQRQQIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRPEKNEDTLRIMWDTIKSKNL	166	242676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_1360_145075_146820_205539_206259_208956_209598_209935_210264_241973
919245	contig_6929_pilon	+	572	3	Intergenic	novelGene_139414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6083	junction_1	1333	2	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	54	317	127755	130939	TRUE	25	TAAGGGTTTTTAAATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127701	132172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127787_130707_130971_131948
919246	contig_10345_pilon	-	1147	13	Intergenic	novelGene_158346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAGTGGAGTCTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24284	4366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_4425_11655_11736_11829_11938_13154_13209_14185_14231_14652_14745_16895_16975_17171_17231_18808_18901_20418_20515_21586_21646_23044_23167_24081
919247	contig_3747_pilon	-	1436	7	Intergenic	novelGene_24902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATTGGGCTGGCTTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205188	201313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203277_204631
919248	contig_11548_pilon	+	1903	2	Intergenic	novelGene_66799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167748	169923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_168433_168704
919249	contig_8820_pilon	-	1358	8	Intergenic	novelGene_79269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	133	471	103655	102607	TRUE	30	GAAGCCCTGGGAGTACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKSGWLALYCATLRQAWCSMEKSEPRQRSRVRSMMCSSLNACSKALVTRPLDVKYGCMMVAASLWICSIGDAASSPSSSLPLRLRCASSSPSSRGDAAQPGQEVVEDHVRA	104116	99150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_99195_99342_99523_99854_100030_100863_101105_101242_101400_102516_102744_103453_103685_104013
919250	contig_2550_pilon	+	3556	1	Intergenic	novelGene_135630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCGATTCAGAAGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410465	414021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_410500_414000
919251	contig_7171_pilon	+	2704	3	Intergenic	novelGene_101408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1420012	1578374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1420060_1464211_1464328_1575833
919252	contig_8377_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_34927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAACTACATAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68091	69583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69600
919253	scaffold_21177_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_145492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	120	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAGATGTTTTAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209375	206847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_206800_209400
919255	contig_9955_pilon	+	1457	1	Intergenic	novelGene_21396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCACCTTGTACATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741722	743179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_741700_743200
919256	contig_4114_pilon	-	2268	1	Intergenic	novelGene_15614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	584	1755	83	1837	370303	368549	NA	40	ATAGTATCTAAATGATTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPGPEGCSTGSEDLDTLQTALALARHGMKPPNCNCDGPECPDYLEWLEGKIKSVVVEGGEERSRLPGTLPPSEAGLPAPSTRPLLSAEVPQIPPPEGLPLSQSALSIAKEKNISLQTAIAIEALTQLSSALPQPSHSTSQAACPLPEALSPPAPFRSPQSYLRATSWPVAPVEEHPPFAPDSPAFPPATPRTEFPESWGTDTPPATPRSPWPMPRPSPDPMTELEQLLGSASDYIQSVFKRPEALPTKPKIKIEAPASSPAQSLSPILQREAPPPSSEPDTHQKAQAALQQHLHHKRSLFLEQAHDATFPAPTEPPASGWWAPASSLAPRPPDKPPKEKKKKPLAPSGGPMGTEKAAPGIKPTVRKPIHIKKSKLRDTQPLFLPLRQIILEGLRSPAPEEVQAHPPAPLPTSQGSAVPLPPEPSLALFAPSPSGDSLLPPTQETRSPSPIATLQTGSTGPLPPADDKLEELIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQPTCLPAPESPFATHSPKQIKIESSGAVTVLSTTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDTPAKRAQAEFPTCDCVGKSVWVSGKGRELWPGLGF	370385	368117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_368100_370400
919257	contig_18889_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_167120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTGAACTTGTCATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259150	257679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_257700_259200
919258	contig_2204_pilon	-	2175	1	Intergenic	novelGene_71673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15759	13584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_13600_15800
919259	contig_8050_pilon	-	5333	8	Intergenic	novelGene_114850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTGTAGAAAAACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388623	368389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_371067_372246_372428_374718_374951_375387_375522_376841_377054_380919_381124_382190_382282_387021
919260	contig_3095_pilon	+	1257	5	Intergenic	novelGene_74969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	79	843	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147162	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
919261	contig_9415_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_109916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAGCAACCAGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2146842	2145124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2145100_2146800
919262	contig_15518_pilon	+	702	4	Intergenic	novelGene_127612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	293.647180586953	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	8	27	325	351	15833	15859	FALSE	30	CTGAAATAGTCACTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARWPTVPYRALFVGQPNCLRSSEFRPPWRLPMSPLKGTK	11225	16210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_14927_15137_15202_15808
919263	contig_19330_pilon	+	3547	6	Intergenic	novelGene_163693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	29.0585615610959	111	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	13	1146	33108	48192	TRUE	20	CAGTGGCGGAAGACCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMEVVKCPEHGTFCFLKTGVRDGPNKGKSFYVCPADACEFVQATNIPVSYCLLHEDFVVDLQGLLLPQGKNEYRVFFRCTGSKAKGKPWCGSIPCQDPNSKEHSVTSKVQDAPEPFHHLSSQQRNPFKVLDKNQEPSLWKQLIRGEGEEKMVDKKQREKGDQIFNQKKEQKPESKCWMEKALSSGMVVKKKQSAVQEKKQGERREFQCEAKETEGSHKRNVSEVKPKQCPGNELRKPSASSQEKSNGESGDVQNESEPLREKETKLLPLNVHSQNSVSKPQKGGHLSRDHPKNWEARETKAKDDSSTQTVQKRLPHGNFQTQSETPDVPALQGPATQSAPAAAGLSRGEGRKADTSSDGSEEEGVIFVSFKPGNPPT	33095	50944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_33139_33218_33322_35893_35981_45283_45351_47346_48769_49119
919264	contig_10159_pilon	+	3286	1	Intergenic	novelGene_30842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	331	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	327	984	856	1839	613600	614583	NA	75	CAGAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTAKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVEREPTDWENIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQMKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLGTDIPLNPAIPLLGIYPRAIRVVTRIDICTPMFMAALFTITKRWKQPRCPSTEEWINKLWYIHTMEYYGKRKNNESVSHLITLMKLKDIMLSEISQSQKDKYCTRPLL	612744	616030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_612700_616000
919265	contig_5799_pilon	-	2968	4	Intergenic	novelGene_50317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2086	2439	618277	617669	TRUE	25	TGGAAGACGCTAGGGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSVNAERAFDKVQHPFLLKTLSKIGREGKFFNIIKGIYTKPTANIILNGGRLKALPFRMGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARVIRQEKENKFNQGHKRPIQRKLQNTTTRNQKRPT	642263	617085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_617273_617326_617754_618008_618284_640184
919266	contig_8138_pilon	+	1971	4	Intergenic	novelGene_52452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1062	junction_1	35.2262528363278	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	193	648	280295	306552	FALSE	20	GTCTTGCAAGTTAAGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280102	307875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364
919267	contig_2770_pilon	+	1490	5	Intergenic	novelGene_107477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACCACTGCCGAAGCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742985	750766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_743862_744034_744173_744574_744674_746594_746760_750554
919268	contig_12841_pilon	+	3952	8	Intergenic	novelGene_55871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	74.0432857406079	208	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	486	1010	433787	445524	FALSE	30	AAAATAGGTGTTATTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCPICLHQASFPVETNCGHLFCGTCIIAYWRYGSWLGAISCPICRQTVTLLLTVFGDDDQSQDVVRLLQDINDYNRRFSGQPRSIMERIMDLPTLLRHAFREMFSVGGLFWMFRIRIILCLMGAFFYLISPLDFVPEALFGILGFLDDFFVIFLLLIYISIMYREVITQRLNR	419556	448466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_+_419769_424843_424920_426342_426425_430795_430872_433747_433857_438408_438483_441591_441703_445254
919269	contig_4385_pilon	+	2481	6	Intergenic	novelGene_141518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7.88923316932641	96	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	50	472	449036	452350	TRUE	5	TGTCAGGGTTGCTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPSVGEYLKQEISRHMANWTEDKETKKLKLAVLNTHFNLECCVSGTHSLDLLALGPFGEYTMLPGLDCTFREGYEGLTSCIVASLPKDILVFNKPVKTIHWGGSFQEETLPGETFPVSVECEDGDRFPAHHVILTVPLGFLKEHLDTFFQPPLPP	448986	459331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4385_pilon_+_449206_450019_450220_452297_453528_455117_455398_455928_456087_458937
919270	contig_5031_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_133166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCACAAAAAGACAAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13836	11548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_11500_13800
919271	contig_4783_pilon	-	992	1	Intergenic	novelGene_108356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	187	681	116924	116430	NA	35	CCACCCAACAGCAGCCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKSRRYKEIKDWYKLRKIGVNIKVTTKQTNNPTSQNDKLEKYKDSANTKSTTRKKMKRKYIKKNNSAQKIKWNKENSEQHTKIDIKMTALNSYLLIITLNVNGLNAPIKRQRVADWIKKPRSSLQETHRRLKDTNRLNLKRWKKNISSKQHSKKSRSGNINL	117110	116118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_116100_117100
919272	contig_15273_pilon	-	2642	1	Intergenic	novelGene_140424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1630	1977	48096	47749	NA	70	CGCAGATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTITQIYAPTSKAKDEEIEDFYQLLRSEIDRTCSQDALIITGDWNAKDGSKKGSVVGKYGLGDRNDARDHMIKFCKTNDFFIANTFFHHHKRRLYMWTLPDGIHRNQINYICGKK	49725	47083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_47100_49700
919273	contig_12677_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_110851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3800
919274	contig_11186_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_98867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGGTAAAATTCATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224905	223232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_-_223200_224900
919275	contig_17768_pilon	-	2416	1	Intergenic	novelGene_140409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACAGTTTGTTACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120068	117652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_-_117700_120100
919276	contig_10904_pilon	-	875	8	Intergenic	novelGene_22598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGGGAGATTGGGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470274	467351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_467434_467544_467609_467865_467943_468090_468179_468377_468508_468611_468709_469848_470069_470157
919277	contig_5765_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_141384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCATCTAAAGTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619943	619123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_619100_619900
919278	contig_9363_pilon	+	3843	2	Intergenic	novelGene_6723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	0	117	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTTCACTAAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1435148	1440793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1435376_1437177
919279	contig_9609_pilon	-	1637	3	Intergenic	novelGene_22920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATGTAGCACTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254176	7786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_8407_200727_200877_253308
919280	contig_3170_pilon	+	2563	13	Intergenic	novelGene_178866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34.5984906542981	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	583	2091	25207	41640	FALSE	30	TTATCAGTCTTACTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYNHLQEIPVIALRNRLLLLHHISELFCPCIPMFDLDGCLHETGLGPSVGFDTLRGILISQGKEAAFRKVVQATMVRDRQHGPVVELNRIQVKRSRSKGGLAGPDGTKSVFGQMCAKMSAFSPDSLLLPHRVWKVKFVGESVDDCGGGYSESIAEICEELQNGLTPLLIVTPNGRDESGANRDCYLLSPAARAPVHTSMFRFLGVLVGIAIRTGSPLSLSLAEPVWKQLAGMSLTIADLSEVDKDFIPGLMYIRDNEATSEEFEAMSLPFTVPSASGQDIQLSSKHTHITLDNRAEYVRLAINYRLHEFDEQVAAVREGMARVVPVPLLSLFTGYELETMVCGSPDIPLHLLKSVATYKGIEPSAPLIQWFWEVMESFSNTERSLFLRFVWGRTRLPRTIADFRGRDFVIQVLDKYNPPDHFLPESYTCFFLLKLPKYSCKQVLEEKLKYAIHFCKSIDTDDYARIALTGEPAANDSSDDSDNEDVDSFASDSTQDYLTGH	20016	42112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3170_pilon_+_20180_22345_22431_22645_22786_24412_24601_25200_25399_32176_32261_36289_36432_36576_36772_38045_38159_38723_38915_39463_39570_39985_40199_41367
919281	contig_1699_pilon	+	3010	3	Intergenic	novelGene_72800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1962	2558	5985	13408	FALSE	45	CAGTCACCTAATGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPVGIQIKTPDDSPVEENSLEVPDREFESLILGIFQELRQNADKHEGKINKFMENTDKKLEEFSKMMQEQNAKINSQLEIIHKQQLEIQKINNRISEMDDVIEGLRSRFETVEDRITGTEDKHLDTTLFQESSIKRRTKNEETLTVTWDTIKSKNLRVISIPEQGEKTENTERLIEELLTENLPNIMKDKKLTVLVI	3905	13860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_5413_5530_6562_13388
919282	contig_5039_pilon	+	6051	2	Intergenic	novelGene_64870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCTCAAATAACCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381016	387571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_385271_385774
919283	contig_12455_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_178995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTAAAGTACAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27635	29113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12455_pilon_+_27600_29100
919284	contig_14661_pilon	-	2029	1	Intergenic	novelGene_47444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGTGCTATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67847	65818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14661_pilon_-_65800_67800
919285	contig_7887_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_124942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGGCAGTTCCAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773163	771921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_771900_773200
919286	contig_3948_pilon	+	964	1	Intergenic	novelGene_53233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAGAATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	934914	935878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_934900_935900
919287	contig_10748_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_150745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAGATATAAAAGAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150516	148329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_-_148300_150500
919288	contig_9721_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_155994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAAAAAAAAAAGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436561	435749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9721_pilon_-_435700_436600
919289	contig_2414_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_158509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAAAAATAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471244	473297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_471200_473300
919290	contig_13506_pilon	-	1485	1	Intergenic	novelGene_178632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTGAAATTCTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813803	812318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13506_pilon_-_812300_813800
919291	contig_14467_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_138229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	1452	1865	146612	146199	NA	40	AGTCCCAGCTAGAGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQHHILKKKIHPDQVGFIPGIQGWFNIRKSISILNHMNKRKEKNHAIISIDVEKAFNNVQHSFLIKTPYKIGIEGKFLNIVKVIYAKPTANIILNGERLKTFPLRTGTRQGCSLSPLLFNIVL	148063	146196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_146200_148100
919292	contig_8284_pilon	+	2780	1	Intergenic	novelGene_125724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTAAAGGAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453359	456139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_453400_456100
919293	contig_17500_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_157914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTGACTTATTAATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222200	224191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_+_222200_224200
919294	contig_11258_pilon	-	1241	5	Intergenic	novelGene_67822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	149.396075919015	1	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	58	621	360591	328766	TRUE	10	ATGTTTCTGTGGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVSTTHSPSSQENSNQSQSP	360648	327107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328685_328767_353000_353146_354741_355099_360530
919295	contig_17936_pilon	-	1265	5	Intergenic	novelGene_29903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGAGCTGCTCCGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95816	50582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_50675_68274_68390_79102_79298_90971_91159_95140
919296	contig_2577_pilon	-	2112	2	Intergenic	novelGene_172069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATTAAAAAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214563	211491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_211542_212501
919297	contig_11986_pilon	+	919	1	Intergenic	novelGene_69232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATGTCTCAGAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775161	776080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_775200_776100
919298	contig_13722_pilon	+	3483	1	Intergenic	novelGene_174632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14146	17629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_+_14100_17600
919299	contig_2689_pilon	+	1342	1	Intergenic	novelGene_100844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTCAGATGTGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283443	284785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_283400_284800
919300	contig_15970_pilon	-	2868	7	Intergenic	novelGene_144045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_3	39.0242090104193	74	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	840	2028	2867	167457	147712	FALSE	30	TAGTCAGTCACTGGCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKTYRRYSDFHDFHMRITEQFENLSSILKLPGKKTFNNMDRDFLEKRKKDLNAYLQLLLTPEMMKASPALAHCVYDFLENKAYSKGKGDFARKMDTFVNPLRNSMRNVSNAVKSLPDSLAEGMTKMSDNMGKMSERLGQDIKQSFFKVPPLLPKTDSDPEHCRVSAQLDDNVDDNIPLRVMLLLMDEVFDLKERNQWLRRNIKNLLQQLIRATYGDTINRKIVDYVDWMTSPEQVADSVKRFRYILRHSHFFQVVQSLALLSLINFHCFFVSSLSIKFA	169484	147710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_147890_148142_148289_150990_151063_152505_152668_160545_160657_162284_162393_167394
919301	contig_7534_pilon	+	742	1	Intergenic	novelGene_162122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAAACTGGGCTGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65015	65757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7534_pilon_+_65000_65800
919302	contig_500_pilon	-	2820	6	Intergenic	novelGene_30961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGGGAGACGCTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1468254	1446840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1446940_1452268_1452366_1454482_1454585_1461319_1461548_1464028_1464133_1466064
919303	contig_17796_pilon	+	1722	11	Intergenic	novelGene_33822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	400.480823510939	3	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	48	1007	72492	110627	TRUE	40	AAAAACTGTGTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGERRIKINSPRLIPTRQRPDKPPLSAIIIVTSCPSHSTFSWVQ	72444	111399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237_110283_110496_110855_110911
919304	contig_15264_pilon	+	520	1	Intergenic	novelGene_158871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTATGTATATTTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97821	98341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_+_97800_98300
919305	contig_7004_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_126522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	128	475	593799	594146	NA	0	CCGCTCCCCGGGGCCGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVSGWRLLLTHVVAGADKPKIGRSDSRLLAHRATGAGKSPNVQVRRQAAGSHPKNWRSEDDESDAGSREGELCRNIHIYWMQATPPRKLLFQAIDCSPQITSWMMITSYLANH	593671	595722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_593700_595700
919306	contig_6199_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_126343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	52	324	86900	86628	NA	35	ATAAAGAGACAGTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTGNNKCWRGCGEIGTLMHCRWECKMIQPFWKVIWYFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYTGEIRAVTRIDVCTPIFIATLFTIAKRWKQPRCPSTDELMNKLLYIHKLE	86951	84718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_84700_87000
919307	contig_14683_pilon	-	3683	3	Intergenic	novelGene_166042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2908	3273	154185	139618	TRUE	25	TCGGAGGAGACTGGCAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREEDKGMLGDGSGDAGLANAAARGQVETVRQLLEAGADANRVNCFGRRPIQVPGAPGPGRQGARERGAQPPWFGGWDRHLHRRRRVQEPFLGGVEPRRKAGFLTAKIPEATGQTGLAICF	157092	138674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_139014_139546_139659_153860
919308	contig_3382_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_124191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1687	2019	990742	991074	NA	50	GTATACAAGTAAATGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIERRTEDITALDGRSKLGKKYLGQAGEKRQFKCNYRHTAVLCHIFVMKRSRHTLIYLEVYFRADSVQVDSSLCVTKSCQVWCREATSWSSCPFGLFVQLWQRRYLSST	989055	991301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_989100_991300
919309	contig_7056_pilon	+	1688	2	Intergenic	novelGene_43645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCTCTCCAGTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722467	725244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723720
919310	contig_13021_pilon	+	1167	1	Intergenic	novelGene_8269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241311	242478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_241300_242500
919311	contig_7138_pilon	+	2547	2	Intergenic	novelGene_120998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATATTAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303491	306181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_304715_304857
919312	contig_20527_pilon	-	2251	7	Intergenic	novelGene_138559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGATTCTGCTTAGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37343	12814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308_27471_36171_36243_36519
919313	contig_5945_pilon	+	3111	1	Intergenic	novelGene_104537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	70	381	42827	43138	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAAASCRLISCSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSPTFQSWACQLLQLCDLGEASTLIHGLGTF	42757	45868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_42800_45900
919314	contig_13740_pilon	-	2383	2	Intergenic	novelGene_34743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	291	611	301074	300520	FALSE	70	GACAAAAAAAAAAAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAALLTTARSWEQSKCPSTDEWVNKLWCIHIMEYYATIKNNEEFAKHNMDESGGHYAEPNKSITKGQIFYGTTFIKSQEQVYTQKAMFFDGYLRWEVEGRGITF	301364	298747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_300639_300872
919315	contig_15236_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_141612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1698	2021	594693	594370	NA	10	CTGGTGAGATCCCTGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYHPTPCLPLLDLSHFLAGQSAAFRWANSQLPRELIHHSPAGRDQGMGGTSSVLCEFTPPTPAGFFSAISLLLVLLFLASFGFFPASHLLPLLSLERLTPCVFASS	596390	594094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_594100_596400
919316	contig_10225_pilon	-	2367	7	Intergenic	novelGene_86778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	44	325	47709	47428	TRUE	10	GCTTTCGGGCCGCGCCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNQDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47752	20658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39895_45218_45256_46107
919317	contig_2940_pilon	+	2606	1	Intergenic	novelGene_81987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	541	864	1124798	1125121	NA	25	AAGCTTCCTAACATCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKLKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTVKFIEEKIGSALETLIHGINRIQTITNNTQTQEDKLDNWDRLKIKHLCSSKDFTKRVKRETTDREKIFGHYKSD	1124257	1126863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1124300_1126900
919318	contig_18859_pilon	-	4219	15	Intergenic	novelGene_150526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1454	1828	48035	47661	TRUE	15	CTCCTCCAGGCAGGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTHRCKGKPKTPELIAGMAMDRYLCFSAKQRLSSTTFLNRYTHLGGSSAFHWGPTAWITWRYGRFPAFEMMALPGAILPFLFTIWSQSDWSSGPAAFERAAARPPLCLRLSFDAFTTTSTGN	67687	28857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_29055_33256_33390_34320_34355_39736_39988_42499_42737_46057_46640_46703_48309_50959_51196_51816_52036_54985_55068_57385_57536_63023_63089_63427_63598_67347_67552_67633
919319	contig_19402_pilon	-	3302	18	Intergenic	novelGene_80768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146726	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144321_146344
919320	contig_11335_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_104918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGATCAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338866	337382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_337400_338900
919321	contig_11978_pilon	-	4100	1	Intergenic	novelGene_63124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	181	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2207	2506	1908977	1908678	NA	75	AAAAAGAAAAGAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKTLAKNKALRIHRIPTEMFQETDAALEVLIRVCQEIWKTATWSADWKRSIFVPIPKKGDPTECRDYRTISLIPHASIILLKIIKKWLH	1911183	1907083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1907100_1911200
919322	contig_7286_pilon	+	1925	3	Intergenic	novelGene_108665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	223	588	178960	179364	TRUE	20	TGTGTGGTGAATACACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQSLAILTSKDHSSCISSKTDLCILLAVHGIFNILHQHHNSKASVLLWSFIFTVQLSHTYEAVENTMAWVRCTLVLKVTYLPNAICRLISQLLLPWALLVDPSKKKSLTTSIFPPFIMMF	178737	280871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_179201_179239_179368_279537
919323	contig_16110_pilon	+	2722	1	Intergenic	novelGene_126803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	623	937	116595	116909	NA	45	TCTAATGGAGACTTAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHFNIKKTKILTTGPITSIMKNRENVEVVKDFILLRSTVNVHGSSSQETKRLALNISAAKDLFKVSKSKDVTLRTKVHLTEAMCYGLSCVPQK	115972	118694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_116000_118700
919324	contig_10051_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_175602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGGAAAAATCAATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443858	445677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_+_443900_445700
919325	contig_5686_pilon	-	1975	2	Intergenic	novelGene_45303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCACACATGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96825	94171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_95443_96121
919326	contig_7446_pilon	-	1937	2	Intergenic	novelGene_101961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251875	249713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_251600_251824
919327	contig_18898_pilon	-	2993	15	Intergenic	novelGene_77638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTTAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71241	53323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18898_pilon_-_53387_53470_53559_56519_56757_56849_56935_59830_59963_61113_61333_62140_62300_62386_62496_63947_64010_64578_64699_64915_65060_66091_66242_67302_67482_68457_68539_70076
919328	contig_16125_pilon	+	3098	8	Intergenic	novelGene_155252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2162	2485	236051	236374	FALSE	35	CTGAGAGACAGAAGTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAASIFLSSFFPSAFLERLGDPLLAAGFRTTPGKGELDVLPPWSLFSGSSLAGFKGPGLDLAPRGAGGPFCGDTFLVRLSSSWEASVLRDGFWPKAGLGKRGLGS	138930	236987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_138972_144608_144705_148087_148240_148782_148808_151681_153054_155553_155618_179440_179596_235794
919329	contig_5419_pilon	-	2725	3	Intergenic	novelGene_15480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	35	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	187	378	118172	116032	FALSE	30	GACATGAAGTATAGTCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRQAEQKNWSLDQHHIANLCDSLNHFLTQTGHVPPQGGSHRPPASARIADSCALTSGKQESAMMNSYGHPQAPHLYPGPSPMYPIPTQESAGYNRPAHHMVPRPPVPPPGANEEIPDDFDWDLIT	118358	113684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_116121_117460_117560_118168
919331	contig_17989_pilon	+	2420	1	Intergenic	novelGene_150845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	982	1317	279238	279573	NA	15	AGGTTTTTGGTATTATGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKADPEWLIFKNAAWGIIANCLARLALPTMPASALSHCSSKDGQPCVQLAGWNHLLLLGSMSLNMLLPLPAMLSITSHLLQRLFLACFYPGSLYSQLSTNSVPFNVISITG	278256	280676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_278300_280700
919332	contig_2689_pilon	+	4858	1	Intergenic	novelGene_100828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTAGTCCTGCTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151470	156328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_151500_156300
919333	contig_5047_pilon	-	4240	4	Intergenic	novelGene_157998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3200	3592	1198445	1198053	FALSE	80	AACAAACATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMDGVIEGLRSRSEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEA	1355647	1197404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1200379_1200530_1201349_1353513_1353757_1355442
919335	contig_20314_pilon	+	2360	1	Intergenic	novelGene_125634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAGAGAAGACTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5744	8104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_5700_8100
919336	contig_5093_pilon	+	3431	1	Intergenic	novelGene_135073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTCAGAAACATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451646	455077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_451600_455100
919337	contig_15108_pilon	+	2581	1	Intergenic	novelGene_131175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	977	1399	67212	67634	NA	30	TATAAGGACCTCTAGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSDWSFLTTCPKSANRSLANLVSIDISKGSTQLGNKNNDTDVVQPCPFKTQKKERALCHVSQQVTDKVPAGLGWGLPAPHPFQIQQRPPPHLGAAERRMEAEEGETLSWDKVSISIIQGTLTLITTDNQNLAGCTML	66235	68816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_66200_68800
919338	scaffold_16539_pilon	-	3867	6	Intergenic	novelGene_68320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCCAGGACGTCCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152584	144723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_146267_148146_148217_148692_148816_149147_149281_149373_149445_150657
919339	contig_14666_pilon	+	2578	10	Intergenic	novelGene_39524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_6	85.1495416572776	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1559	2230	446586	448893	FALSE	35	AGATTAGTGAATTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFQNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN	442044	449241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_442067_443650_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446741_447493_447609_447970_448067_448153_448295_448638_448769_448858
919340	contig_12139_pilon	+	1321	3	Intergenic	novelGene_146459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	366	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	2	763	69610	172686	FALSE	10	CTCCTTCCCAGTTCACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTEAVRVLRVLQQEPRAGEGLLACCANVAGRLVLPTCNVLLLGADAFRGREQVVVFVRGDLDPNLHWLGHFPELGACGGWRAALIQAPVIANTQAAATLLLLVLYENQDVPQGEVHLTLSTGEQVRIGATHHQPQATGLLYLQTLIFLEDGGLHVVSLWGDELPLGQVLRVALFAAGHCPGIYSGISPESCSDDEPGRGSSRRRRRRRRAAAAAAAPPPRPGVVWFFFFFFFSPSPLALSSSSSSSSLFCSFF	69608	173244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_69710_158489_158866_172400
919341	contig_1309_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_73981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	134	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263861	261273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_-_261300_263900
919342	contig_11709_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_168219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55030	56185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_55000_56200
919343	contig_6137_pilon	-	3680	17	Intergenic	novelGene_59248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACTGAGTCGATTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354909	1318942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102_1328334_1331694_1331859_1332172_1332310_1333465_1333519_1336698_1336792_1337701_1337774_1339032_1339076_1341575_1341636_1345121_1345188_1346614_1346749_1347420_1347554_1347637_1347747_1348117_1348277_1353508
919344	contig_5728_pilon	-	3452	2	Intergenic	novelGene_126705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGGAATAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366724	359785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5728_pilon_-_362880_366366
919345	contig_2867_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_135267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCCCTGGACGGATGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1300477	1301148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_1300500_1301100
919346	contig_17274_pilon	+	4382	6	Intergenic	novelGene_26525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	357.203247465641	124	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	83	586	163818	173411	TRUE	85	TAAAAAAAGAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLGSHTGRRLRAGPAPTPSSARADNDRMSIVNQDRDRRLVYETVFSHYRKHKVDMANAIKKPFPFLEGLRDRDFISNKMYQDSEESCRNLVPIQRVVYNVLDKLEKTFDLALLEALFSEVNMKEYPELICICRSFKNAIEEISNPQEQEEKEKLNSQPRLEQGTGENFHRSLPWLRAGPSSHIGLFFLTLFYDS	131640	178075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_131722_163816_163980_165066_165236_166823_166899_173313_174554_175421
919347	contig_8412_pilon	-	7079	9	Intergenic	novelGene_118387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	709	1062	704532	704179	TRUE	5	TTCCGGTTCTTCGAGGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRCLSLKATVLNSSGVIDSFKNLIKTKDPVSQKMHVQIFTINPRVFRDDFCGLLVESSAVGCFLHALSPRSQGDAQPSHCEGIQQNGHLTAQFPFMPEMAYAGEARSQAWDEHYSF	705240	684910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_685087_686709_686794_687496_687611_689263_689439_690469_690664_692511_692618_694542_697854_701198_701318_702440
919348	contig_15114_pilon	-	2106	1	Intergenic	novelGene_121160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGATTCACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157424	155318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_155300_157400
919349	contig_2798_pilon	-	4008	2	Intergenic	novelGene_119990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3136	3441	138503	50797	FALSE	30	TTGATATAATGTGATCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMAPLNITLSDPLTKFLLPVPLTLCSASLEVLVPKGGMHPFGDASLIPLKWRLRMPPGHFGLLMPQDQQAKKGVTILAAVIDPDYQEEIRLIFHNGCKEE	141638	50229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_50811_138211
919350	contig_3956_pilon	+	2074	8	Intergenic	novelGene_14840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1406.98045473276	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	541	1179	1288971	1289956	TRUE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281598	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283850_1287989_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1290081_1290237
919351	contig_6954_pilon	-	1595	3	Intergenic	novelGene_64406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	60	junction_2	2.5	4	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	424	1275	22	1296	14647	10769	FALSE	65	AGAAAAATTAAAGAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLKQSIMADESLASLPRVGKEADEATEKECTSCHNSVFKSVDELEKSSKNVDGSRLANEDQNSVIQTQVPDIYEFLKDASGKVGDSHEVADECFKLHQVWEPKVPESVEELPPMEEMPQSVEDHLPNAYIDLTKDPVTETKNLGEFLEVTVLNIDQLGCSGGNLNQNAQILDSSLQLDTVGAFIDLTQDASSESKNEANHSAVADGGLGCQVICIEEENCKEEKVPVADRPLECIVEEACIDLTTESPSPCEVKRDDLKSAQKSNSVSSELPGALDNAHKKRKNLSDLSHSSQKKQRKEIDLTSRKKAKKITQDSGENDEARQRKANKKRFPAVNKDPSALKASPGMQDSSAAPATSPTSLSAKNVIKKKGEIIVSWTRNDDREILLECQKRGPSVKTFTSLAAKLNKNPNQVSERFQQLMKLFEKLKCR	14668	10469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_10826_12377_12478_13529
919352	contig_20786_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_159698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATTTAAAGATTCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30842	28942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20786_pilon_-_28900_30800
919353	contig_6497_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_35662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	1889	2446	895268	894711	NA	35	CCATGAATTCCAAGATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLNSQTILTIMGFIREVTVTIQAQEQSGYSSSIRTTSSQLCLQAHLSLALGLCPKALSFLSPWAGKPTTPSPATGSLLQGLPCHHFSPSSLAVVGFPFPTSRVAYFKPSGMAKLTKPLGEIQLPYLHSPTQSPGWELTRPRQERPHKSNPLHHTLQFLIPGIVDHMIFQFKVANTSPFQLTHA	897156	893885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_893900_897200
919354	contig_8377_pilon	-	3504	16	Intergenic	novelGene_35087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.49666295470958	8	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1173	1508	164142	163807	TRUE	25	TTCTATGGTATAATTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLEKRQKEGRKEQNGRERKGTERKGKRSKGKERRGGKRRERGRGEGRGGKGRKGKGRGGKGGEGREGRVGKGREGKGREGKGREGMIAGKPLRVDKETIKETEKPQTDR	180509	136039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161950_163485_164589_169245_169304_172899_173004_173644_173685_176607_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381
919355	contig_19816_pilon	-	1871	7	Intergenic	novelGene_156497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	240.028065488647	20	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	11	526	126795	125483	TRUE	15	TTCCAGAATCCTGTGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRLTAGAGLTAGAGPGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRAGTRGRGSWCLLQLTLSWDCVPFWPLKRRGGK	126805	123035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123362_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_125893_126392_126435_126731
919356	contig_3627_pilon	+	2114	14	Intergenic	novelGene_78558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	114.806294283461	1	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	37	1380	1299272	1307800	FALSE	20	TACAGATGGTGTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRKPTCELRAATMLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQAEAPEEKPEEDDLRNEVLQFNTNCPECNAPAQTNMKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299235	1308534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299407_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301554_1301912_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
919357	contig_9011_pilon	+	3420	1	Intergenic	novelGene_159338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGAAAGACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662352	665772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_662400_665800
919358	contig_1699_pilon	+	1920	4	Intergenic	novelGene_72825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	173	junction_1	71.2881476824865	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	550	1029	94670	95707	FALSE	45	TTAAACTAGGCCCAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETTGKIVPSTNGITNAENSVSPLIPRSTDSTLRGLETVKKVGKVGTNGQNAAGPSAESVTENKIGSPPKTPVSNIAVTSAGPPNVGTELNSVPPKSSPFVTRVPIYPQHSENIQYFQDPRTQIPFEVPQYAQTGYYPPPPTVPAGVAPCVPRFVRSNNVPESSLPPASVPYADHYSTFSPRDRMNSSPYQPPPPQPYGPVPPVPSGMYAPVYDSRRIWRPPMYQRDDIIRSNSLPPMDVMHSSVYQTPLRERYNSLDGYYSVACQPPSEPRTTVPLPREPCGHLKTSYEEQIRRKPEQWAQYHTQKAPLVSSALPVATQSPTPPSPLFAVDFRTDVRKILIT	89364	96598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_89550_93132_93348_94520_94955_95512
919359	contig_7748_pilon	-	2450	2	Intergenic	novelGene_101058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	350	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	261	902	181029	180388	TRUE	60	TCTCGAACTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILKNAGNIKRRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEVAYDQELMILKEEVQVARKALVKNKAPEIDGIPIEMFQQMDATLEALARLCQEVWETATWPTDWERSIFVPIPNTGDPTECRNYPTRSLISHTSKILLKIIQKQLQQYISRKLPEVQARFQRGRGTRDIIADVTWILAESREHQKDVYLCLIDCLEAFDCVDHNKLWITLQRWELMNS	181289	177156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_178415_180097
919360	contig_12540_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_148120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCCAAGACCGGAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222552	1223204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1222600_1223200
919361	scaffold_12510_pilon	-	2166	5	Intergenic	novelGene_151363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_1	121.677853366995	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGGACTCTCGGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208761	190574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_191662_199365_199444_206082_206221_206837_206957_208017
919363	contig_5346_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_161860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	143	520	371743	371366	NA	35	CCCTCTCAGTAACAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPNPLCLPISPPDRSCPYSLLYLLELRGTLLTNITLCPTVQSNPCLKSGLCLSSGLIENPGAMLSGVPPVSVRPSSLVFLLEFEFCTPSFSCSIRDSLFCSLSRRSLVVARHYLVLLVLG	371885	370431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_370400_371900
919364	contig_7119_pilon	+	2040	3	Intergenic	novelGene_40976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	3	1157	137033	139798	TRUE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137030	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707_139866_140133
919365	contig_3463_pilon	+	2680	1	Intergenic	novelGene_62018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTACAATCTGGCAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593504	596184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_593500_596200
919366	contig_8063_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_152417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	46019	46333	NA	60	AAAAAAAAAGTAAGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNTMDCQKNEQVCLGRSTARLLLGSKGGATSSHVLWTRCQEGPVLEKGIMLGKVEGQRKRGRPAMRWTDTVAATMGSSITTIVRMVQDRAVFLLLYTGSL	46016	48409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_46000_48400
919367	contig_15236_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_141641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGGTCTTTAGCGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674598	672189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_672200_674600
919368	contig_6272_pilon	+	4592	35	Intergenic	novelGene_160444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	125	junction_26	163.294427550986	1	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1482	4446	145	4590	133604	248370	FALSE	25	GGCTCACGCCCCTCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPAQPKKIVAPTVSQINAEFVTQLACKYWAPHIKKKSPFDIKVIEDIYEKEIVKSRFAIRKIMLLEFSQYLENYLWMNYSPEVSSKAYLMSICCMVNEKFRENVPAWETFKKKPDHFPFFFKCILKAALAETDGEFSLHEQTVLLLFLDHCFNSLEVDLIRSQVQQLISLPMWMGLQPARLELELKKTPKLRKFWNLIKKNDEKMDPEAREQAYQERRFLSQLIQKFISVLKSIPLSEPVTVDKVHYCERFIELTIDLEALLPTRRWFNTILDDSHLLVHCSLSCLVRREEDGHLFSQLLDVLKFYTGFEINDQTGNALTENEMTTIHYDRITSLQRAAFAHFPELYDFALSNVAEVDTRESLVKCFGPLSSNTLHQVASYLCLLPALPKNEDTAFDKEFLLELLVSRHERRISQIQQLNQMPLYPTEKIIWDENIVPTEYYSGEGCLALPKLNLQFLTLHDYLLRNFNLFRLESTYEIRQDIEDSVSRMKPWQSEYGGVVFGGWARMAQPIVAFTVVEVAKPNIGENWPTRVRADITINLNVRDHIKDEWEGLRKHDVCFLITVRPTKPYGTKFDRRRPFIEQVGLVYVRGCEIQGMLDDKGRVIEDGPEPRPNLRGESRTFRVFLDPNQYQQDMTNTIQSGAEDVYETFNIIMRRKPKENNFKAVLETIRHLMNTDCVVPDWLHDIILGYGDPSSAHYSKMPNQIATLDFNDTFLSVEHLKASFPGHNVKVTVDDPALQIPPFRITFPVRSGKGKKRKDADGEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMVVGPPGTGKTDVAVQIISNIYHNFPEQRTLIVTHSNQALNQLFEKIMALDIDERHLLRLGHGEEELETEKDFSRYGRVNYVLARRIELLEEVKRLQKSLGVPGDASYTCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGNPLPDVAEIATFFPFHEYFANAPQPIFKGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRSKYLLVKEAKVIAMTCTHAALKRHDLVKLGFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPPVIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRVGVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRYKNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALFMYMCLLGYPADKISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGSNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQNDYILLSLVRTRAVGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYVFARVSLFQNCFELTPAFSQLTARPLHLHIIPTEPFPATRKNGERPSHEVQMIKNMPQMANFVYNMYMHLIQTTHHYHQTFLQLPPAMVEEGEGVQSQETELETEEETTPVHGDILPGSADASSSQEMSASETETTPDLAETIPGPAEATSNHTASSDPEATHPQAETTAAVAASVTAPT	133459	248372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_133679_136037_136095_139069_139111_146394_146431_150176_150298_152348_152490_153855_153925_154949_155051_162090_162168_164423_164489_165672_165790_167196_167311_170027_170132_175031_175135_178313_178435_186638_186781_189277_189457_192577_192746_195368_195539_199591_199834_201721_201869_202642_202713_206226_206338_208819_208930_211281_211418_214324_214535_216555_216694_219214_219287_220337_220526_220854_221027_227478_227650_239229_239316_242789_242965_245320_245435_248067
919369	contig_9098_pilon	-	3019	17	Intergenic	novelGene_75825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	173.036383005858	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	858	1727	345261	335775	TRUE	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	383857	322915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_323682_327581_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_375715_375837_378117_378205_383589_383727_383818
919370	contig_6445_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_77092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCACTTGTGGTATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001106	1002260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1001100_1002300
919371	contig_16295_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_178996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13796	15497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16295_pilon_+_13800_15500
919372	contig_9580_pilon	+	2512	1	Intergenic	novelGene_167728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	426	752	748551	748877	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVTKNEMERLKIDTLGISELKWTGIGHVESDSHMVYYAGNDKLKTNGIASVIKKNISRSVLKYNAASDRIISTCLQGRPVNTTVIQIYTPTTNAKDEETEDF	748125	750637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_748100_750600
919373	contig_9995_pilon	+	1184	1	Intergenic	novelGene_47690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAATGTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280811	281995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_280800_282000
919374	contig_6227_pilon	-	2068	19	Intergenic	novelGene_49750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	346.338466436134	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	17	889	1224979	1208732	TRUE	15	GAGGTTATGGCTTCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALTRDPQFQKLQQWHREHGSELNLRRLFDSDKERFSRFSLTLNTNHGQILMDYSKNLVTEDVMQMLVELAKSRGVEAARERMFSGEKLNFTENRAVLHVALRNRSNTPILVDGKDVMVEVNRVLDKMKSFCQSVRGGDWKGYTGKTITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPRVWFVSNIDGTHIAKTLASLNPESSLFIIASKTFTTQETITNAETAKEWFLMSAKNPSAVAKHFVALSTNTTKVKEFGIDPQNMFEFWDVEVPEAQGGHCLALLGSPKCDD	1224995	1202621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1203044_1203147_1203215_1203300_1203377_1203570_1203700_1204139_1204217_1204370_1204501_1205857_1206011_1206142_1206187_1206579_1206641_1208711_1208801_1211210_1211265_1212591_1212637_1213149_1213222_1214096_1214244_1214340_1214425_1222004_1222125_1223376_1223446_1223746_1223838_1224857
919375	contig_2312_pilon	-	2115	5	Intergenic	novelGene_160729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	59.7594134844043	31	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	929	1801	201935	191966	FALSE	55	AAAATAAAGATTTTATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMEISQLTRELHQRDITIASTKGSSSDMEKRLKAEIQKAEEKAVEHKETLDQLESLKLENRHLSETVMKLELGFREAKEISLADLQENYIEALNKLVSENQQLQKELMDTKSKLEVSTQMCPPKTDRIFKAAHSRATEFKNTEFKPPHCQHRQGGIKTEHYKAGFRSPPRGQASDSLEPVSRTLSPLSPQTSPCSSTISLPSNFLCKTLPSVLDANDANFSDTVSESMNDQDEFISLCPLPVSPLGSIATRFLEEEELRSHHILERLDAHIEELKRESEKTVKQFTALK	202863	191651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2312_pilon_-_192125_193859_194137_195006_195213_199524_199612_201791
919376	contig_6914_pilon	-	4038	2	Intergenic	novelGene_151719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTAACTCTTTCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73486	69360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_72701_72788
919377	contig_10711_pilon	+	4420	1	Intergenic	novelGene_118429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	4096	4419	750859	751182	NA	20	CTATACTTCTTTCTCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWSPPPHCPVEGLKEFLCQLPSEIVQERQAGLRIYPEPPPPQPRIWRSLPPNTLQSKELLGLVTPSSHLTHWAHSAHGRLQCFKKLAACSPPSTPSSMCKHTALASR	746763	751183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_746800_751200
919378	contig_10973_pilon	-	1507	2	Intergenic	novelGene_150386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	677	1189	2730	2218	TRUE	40	TCATACAAAGACGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3406	1545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1732_2085
919379	contig_18889_pilon	+	2333	1	Intergenic	novelGene_167116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTTTGTCAACTCGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174674	177007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_+_174700_177000
919380	contig_11056_pilon	-	1094	6	Intergenic	novelGene_130399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	218.12565186149	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	747	347	1093	679018	645293	FALSE	55	TTAAAAAAAAAAGATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVIPKNPYPASDVNTEKPSIHSSTKTILEHQPGQKGRKPGKKRGRTPKTLIPHPISTPSKSAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPTSPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPSSAMQAPTVCIYLNKNGNTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTVFSFLKQGHGGEVISAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFTQTHLSLTATEYSHSHDRYLPGDTFVLGNSLSRSLEPHSDPMDSALPLSPTLALRSPVFISQVWPASLQESGLGAFQVMGKEPTLGPWKTGPGIGSGAQSPHHLLGLVWHPIAPQLLPSPTSSLDSKMMVQTST	684610	645291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_645561_655695_655766_667867_668060_670511_670713_679002_679130_684375
919381	contig_13765_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_165873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	268	609	19682	20023	NA	25	ACATTCATTTATGAGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLCKGVWQFLKKLNIELPYDPTIPLLGIYPKEFKAVTQIDTCTPMFFSELFAIAKRWKQPKCPSTDEWMNKTWYVRTMECYPAIRRNEVLIHATICINLENIMLCEISQT	19414	20874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_19400_20900
919382	contig_16776_pilon	-	3610	3	Intergenic	novelGene_130518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	516	1	148	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGTTATTGACTGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47762	34758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_35274_37057_40060_47669
919383	contig_19604_pilon	+	2050	4	Intergenic	novelGene_77252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.545092761196	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	38	397	273206	273988	TRUE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	273168	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484_273577_273833_274814_274991
919384	contig_34_pilon	-	1386	9	Intergenic	novelGene_40019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	856.439103205826	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	180	1295	230337	212049	FALSE	45	ACAAAATTAACCCACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247081	211957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230352_243246_243346_246970_247016_247060
919385	contig_5794_pilon	-	5759	2	Intergenic	novelGene_69767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	4243	4854	704317	703706	FALSE	15	CTGTTCTGTTGTACACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNVQPFQKVAYDQEPMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDGISTEMFRQMDATLEALTRLCQEIWKTATWPTKWKTSIFVPIPKKGDPTECGNYRTLSLIPHASKILLKIIQKWLQQCINRELPEIQGRVRRGHGTRDITADVRWNLAESREYQKDVYLCFTDNAKAFNSVHHNILWITLRTMGIPEHLTVLMWNLYIDQEAVI	714461	702800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_707496_713397
919386	contig_3789_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_79816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126047	127543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_126000_127500
919387	contig_8248_pilon	-	3662	6	Intergenic	novelGene_125021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1309	1671	106858	106496	FALSE	65	ACAGTAAAACTAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPPKLIYRCSAISIQIPTALFNKREKLITSFIGKGKKSQISKTLLKKKNKVGGLTLPDLRNFYTAMVVKTAWYWYNDRHTDQWNRIKNPDVNLSTYGQLIFDKGPKSIKWGKDSLFNK	126897	104504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_106978_108339_108575_124685_124946_125006_125347_125998_126007_126551
919388	contig_14536_pilon	-	1945	11	Intergenic	novelGene_69282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_9	188.347020151634	7	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	237	1067	95431	54970	FALSE	55	GTTAAAAAAAAAATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKMFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARSIGSNPPFPIKPLSESKNRLLDSESQWTETGSEEGIVRSGL	137783	54091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_57556_57673_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_95419_95447_137562
919389	contig_12414_pilon	-	3518	1	Intergenic	novelGene_59621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATCAATAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562084	558566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_558600_562100
919390	contig_19145_pilon	-	3501	1	Intergenic	novelGene_164149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAGTCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222934	219433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19145_pilon_-_219400_222900
919391	contig_3975_pilon	-	3378	3	Intergenic	novelGene_54830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	445	junction_1	21	98	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2062637	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2060205_2060294
919392	contig_9955_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_21355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	130	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAAGTCCTTCAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149178	146972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_147000_149200
919393	contig_3181_pilon	-	1011	2	Intergenic	novelGene_136940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	16	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTGAACTACAGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385198	382023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_382953_385116
919394	contig_12622_pilon	+	3065	3	Intergenic	novelGene_6020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	101	316	1659303	1660619	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAACCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INQRLHQPETRRTRWCLATTNDQPYREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTPESMFPGLSVNPELKQFPRPALQTKIGLDYTQDKMGSSCLEVR	1659202	1671507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_1659475_1660575_1660798_1668936
919395	contig_15108_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_131190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTGAACATCTTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154681	157189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15108_pilon_+_154700_157200
919396	contig_3862_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_137425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCATTTACGATAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607267	604393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_604400_607300
919397	contig_10299_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_79804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGTACACAATAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810439	807491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_807500_810400
919398	contig_6958_pilon	+	2861	8	Intergenic	novelGene_69978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAATCGGACCATGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685018	863160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_685272_685648_685782_686963_687264_688391_688622_689379_689533_693317_693518_693875_694972_862664
919399	contig_14353_pilon	+	4371	1	Intergenic	novelGene_82126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1770	2168	186401	186799	NA	20	GACAGGTTTCAGTGGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAHHSALKIMVIISEGLFLSFSNIPFYMKAAVNTMCQSAGHPAEQRSHAHKPQGQALGRNEASRNKTSSVYLVMEIQVLEILLFPLYWQTRTLIAVRTVLIRNSASALTQSWGRQGRLWEGVQNFWLFEN	184631	189002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_184600_189000
919400	contig_7457_pilon	+	892	1	Intergenic	novelGene_31304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGATGAAGCTGATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167813	168705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_167800_168700
919401	contig_3380_pilon	-	2791	7	Intergenic	novelGene_60089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.5645706579217	60	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTCTTGTGGGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374875	365749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_367305_369070_369117_369635_369718_369831_370657_370961_371111_371942_371997_374795
919402	contig_7704_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_154613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233461	235764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_+_233500_235800
919403	scaffold_21177_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_145491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	1248	1862	208069	208683	NA	35	ACGGAGCTCATTCCAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPTTIAMIKRKRKIISVGEDVEKLEPSSTAGENEKWYSHCGNSLAVLQKAAQNPAIPVSVLYPKELKVGTQTETCTPMFTEVLFTITKRWKQPKCPSTDEWINKRWYIHTMEYYSAIQRNEVLRHATTWTNLENIMLSEVSQSQKDKHCMISLIQNKQIYRNQSLLLVTQGSREGKGGSYCLGGTEFMLMVVE	206821	209147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_206800_209100
919404	contig_9535_pilon	+	3284	2	Intergenic	novelGene_124488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	109	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	705	1352	374783	375430	FALSE	30	CTGAACAGAGTATGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRNPSPDPLSESESEEEENANYLNESSGEEWDSSEEDPVVPNLTPLESLAWQVKCLLKYSTTWKPLNPNSWLYHAKLLDLSTPVHILREIGLRLSHCSHCVPKLEPIPEWPPLASCGVPPFQKPLISPSRLSRDHATLNGALQFATKQLSRTLSRATPIPEYLKQIPNSCVSGCCCGWLTKTVKETTRSEPINTTYSYTDFQKAVNKLLTASL	373854	377362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_373931_374154
919405	contig_16740_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_116997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1495	1818	56212	55889	NA	65	CAAGGAAAAAAGAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRILIFMCSISYVTTSNFPRFILHMFPVPVINGCLELFLLILSSATSANEDPGSFTPSTSSRLSLLDKSALPHRIWSAFQPEGLIFHHYIRQCSTVVRKVFIVRFF	57706	55289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16740_pilon_-_55300_57700
919406	contig_5669_pilon	-	4101	1	Intergenic	novelGene_86037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGTGTGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18068	13967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_14000_18100
919407	SIRV6	+	478	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	123	279	123	83	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	11	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACAAAACGTCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10360	11051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
919408	contig_14196_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_169969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGAGTCAGAACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95184	92628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14196_pilon_-_92600_95200
919409	contig_5415_pilon	+	2903	1	Intergenic	novelGene_146148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1620	1967	307754	308101	NA	30	TGTGGACTGCTAGAAGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHQRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQEVACDQELMVLKEEVQAALKALVKNKASGIDRIPTEMFQKIDAALQVHTRLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGDPTECGNYRTVS	306134	309037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_306100_309000
919410	contig_5222_pilon	+	1535	5	Intergenic	novelGene_58974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	50.236316544906	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTCGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35324	39978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_35552_36304_36392_37536_37620_37933_38052_38958
919411	contig_4797_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_6944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTGTGTGCATTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657894	656354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_656400_657900
919412	contig_6885_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_83654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGATATGGAGATGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160840	158535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_158500_160800
919413	contig_4232_pilon	-	656	1	Intergenic	novelGene_63414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAAAGCAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467500_468100
919414	contig_9706_pilon	+	856	1	Intergenic	novelGene_20822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1880	2736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1900_2700
919415	contig_14796_pilon	+	7195	29	Intergenic	novelGene_159364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_1	136.827110483505	453	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1379	4140	217	4356	88016	237486	FALSE	40	TACCCCAGCTAGAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGEENQLVPKEGFLPLEHLWDPGDAVVKSSAAVQKIENAAEEPRVLCIIQDTTNSKTVNERITLNLPASTPLRKLFEDVANKVGYVNGTFDLVWGNGINTADMTPLDHTSDKSLLDASFEPGRKNFLHLTDRDGEQPQILLEDSSAVDDNVHDRFIGPLPRECSVGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTPEFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRSFGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQMSNDFSNDDGVDEGICLESNSGNEKISKPGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAAGGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRITQEDIKKTHGGSSGSRGYYSSAFASSTNAYMLIYRLKDPVRNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQREIERNTCKIKLFCLHPVKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMYLEDILPLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEEDTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETRKPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPVTVRAYLNQTITEFKQLISKAIHLPAETMRIVLERCYNDLRLLSVPSKTLKAEGFFRSNKVFVESSETLDYQMAFTDSHLWKLLDRHANTIRLFVLLPEQSPGSYSKRTAYQKAGGDSGNVDDDCERVKGPVRSLKSVEAILEESTEKLKSLSLQQQQDGDNGDSSKSTETSDFENIESPLNERDSSASVDNRELEPHIQTSDPENFQSEERSDSDVNNDRSTSSVDSDILSSSHSSDTLCNADNAQIPLANGLDSHSITSSRRTKANEGKKETWDTAEEDSGTDSEYDESGKSRGETQYMYFKAEPYAADEGSGEGHKWLMVHVDKRITLAAFKQHLEPFVGVLSSHFKVFRVYASNQEFESVRLNETLSSFSDDNKITIRLGRALKKGEYRVKVYQLLVNEQEPCKFLLDAVFAKGMTVRQSKEELIPQLREQCGLELSIDRFRLRKKTWKNPGTVFLDYHIYEEDINISSNWEVFLEVLDGVEKMKSMSQLAVLSRRWRPSEMRLDPFQEVVLESSSVDELREKLSEISGIPLEDIEFAKGRGTFPCDISVLDIHQDLDWNPKVSTLNVWPLYICDDGAVIFYRDKTEELMELTDEQRNELMKKESSRLQKTGHRVTYSPRKEKALKIYLDGAPNKDLTQD	87799	240325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_88055_92248_92321_133685_133890_135131_135246_144040_144180_147454_147552_153677_153824_154317_154398_156873_157024_173550_173647_173726_173880_175674_175843_183008_183141_183610_183688_184310_184367_190606_190720_191657_191763_194637_194846_212694_212811_214863_214984_216879_217658_221587_221764_222095_222177_223640_223757_232385_232505_234237_234369_235852_235901_236002_236134_237311
919416	contig_7078_pilon	-	6269	2	Intergenic	novelGene_130226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	246	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	5722	6267	970917	970372	FALSE	40	ATCTCTGACAAAATAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTLKKMEGLKNVDIDFSYGEEVKAIKRKKKTSKLREIGVNIKVTTKETNNTTHRNKRLEKYKDSANTKSMTMKKMKRKYIKKNDSAQKIKWNKETVNNTHKKRHQNDSTKLLSINNSSECKWTKCTDKETENDRLDKKHDLSICCLQEIHLRLKNTSKLKLKQWKKYIKQTTLKKEQEWQY	976974	970369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_972132_972467
919417	contig_12021_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_172203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAGTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179524	181188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_179500_181200
919418	contig_10904_pilon	-	1366	6	Intergenic	novelGene_22725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	411.362613760658	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	215	613	661760	660357	TRUE	20	AGCCATTCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGQLHHEPCELSPCGDLQVLQLTQHISLPVVTTQ	662743	650761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660458_661462_661763_662310_662445_662665
919419	contig_11512_pilon	-	686	1	Intergenic	novelGene_43268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAAAAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363780	363094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_363100_363800
919420	contig_5236_pilon	-	2279	10	Intergenic	novelGene_100958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	213.645084713462	72	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	102	932	1011714	1007759	TRUE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKERHISRRGRGTAAHAHPAPECPTPTGESQWPHYGAAV	1011815	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007869_1009587_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
919421	contig_18168_pilon	-	1380	8	Intergenic	novelGene_122071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	153.979060330969	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	21	1139	27110	23694	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCSTRVMAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDHCGGALWRGAEIYVSCAARGAAQASLPEMEVPFSVHCPHHGDHCCPGSLCHCGCGGWSCDLEEEELRWKQRELCSGCNMRLLPCVALSDTKFVHHHHPPPLDFVTSRKPDFVFCSWCLNVSVFLSA	27130	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25126_25190_25315_25964_26241_26483_26754_27040
919422	contig_10864_pilon	-	5238	15	Intergenic	novelGene_107051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	214.377456551642	70	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1325	3978	1200	5177	748764	731244	FALSE	70	CAATAAAAAAGAAGAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGNRSLRKHFPKQDTVQRFLCLLSSLQEIPPDRVCNINRDCANVFIKFLLGKQKWPEVLLLLTGKASGEPPFRDCLIKDCSLSDLDLCAIIPHLSGWDQRKTQLLGCLIDSGASPEGLQENKESPLTLCLKFKDFELAFLLLTKGAAPHGVSFAEGDTPLHAALHIFLDVNADIGFSFLSHLLDLFLSNPTKYDYLNPNVQDGNGNTLMHILFQKGMLKRMKKLIDLLVKFNINFNLRNKEGKDARHRIKKNDPLLLAWNKALTESRRKSRQDSAAHLGKLPRPATPGRTSQPKSQGSFKSLPCDVTANPQPEGAGVADSWEIVPDAQVARQEPEDFRPCYLRDRLVQDITILIQRVELNTFLPEDCPQCAEPLVAGAGTEVEKDEFQQSPDTRSSDHTGSNPVPAEAEEGHAQAGLGATQLIPVVNRGTEDSKDQEDWSMQDIETCLQDFDNMTWEIECTSEMLKKLSSKAMTKVMKKKIILAIQHLGNGEWTQGLQKRLKHLKGKIRLFEAKLDKGARMLWELAIDFSPRCSESPEKIITTEQNVQSVDKSGQVYTEIIRIWDIVLDHGKLSDSIRAICSAYNRGLSCILRKKLKGIDKGQMSANMKIQKRIPRCYMEDTEAEKGRECMDPEYFPPASAVETEYNIMKFHSFSTSMAFNILNDMKAKVEYPFRVGELEYAVINLNPKPLEPIILIGRSGTGKTTCCLYRLWKKFHVYWEKAEQAGSPLLAKQTWLKRRLEVEPGKEGPGWEEEEEEEEDEEEEGSVEAETVDSIDEEQEGDTGVEGPDTELAGDGQAEELCVPDHAHQLEHLHQIFVTKNRVLCQEVQRNFTELSKSTKATSHYKPLEPNVHKLQDLKDENFPLFVTSKQLLLLLDASLPEPFFPRNEDGSLKRTIVGWSTQEEMTILHWQEDEEEVEVDRDSDEEDKTAEARTSDSDPRAYLTFEVFTNEIWPKMTKGKTSYNPALIWKEIKSFLKGSFEALSCPHGRLTEEAYKKLGKKRSPNFKEDRSEIYSLFCLYQQIRFQKGYFDEEDVLYNLSRRLSKLKVLPWSIHELYGDEIQDFTQAELALLMKCINDPNAMFLTGDTAQSIMRGVAFRFSDLRSLFHYASRNNTNKQCTVRKPERIHQLYQNYRSHSGILNLASGVVDLLQFYFPESFDPLPRGSGLFDGPKPTVLESCSVSDLAILLRGNKRKSQPIEFGAHQVILVANEMAKEKIPEELGLALVLTVYEAKGLEFDDVLLYNFFTDSEAYKEWKIISSFTSPSPDSREESQPLIDVPLEKLSSSKGRSLTLNPEMYKVIFSHFPTQFHLFNHFIIFQR	780854	731182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_731457_736516_736655_736959_737160_741987_744895_745545_745723_747814_748070_748676_748839_756674_756847_762928_763062_765415_765555_765780_765865_770058_770178_773908_774060_777018_777146_780654
919423	contig_12123_pilon	-	2226	1	Intergenic	novelGene_144611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCACAAAGAGATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152110	149884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_-_149900_152100
919424	contig_9177_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_32797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1275	1751	1528186	1528662	NA	35	ATGAATATGCATTACTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIIKKTKILTTGPISNSMINGEKIEVVKDFILLGSVVNTHGNSRQEIKRCIALGRSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQAIVFSVASYACKSRWTMNKEDRRIIDTFELWCWQRILNILWTAKRMNKSVLEEVQNRILLRSKDGETTCYILWTCCR	1526911	1528884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1526900_1528900
919425	contig_10324_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_7785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATTAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118329	116957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_117000_118300
919427	contig_1262_pilon	+	1624	2	Intergenic	novelGene_133543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTATGGTTAAGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127261	162846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_+_128764_162724
919428	contig_10058_pilon	-	2701	11	Intergenic	novelGene_67718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCACTAAACTCCAGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101642	72528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_72663_97060_97132_97297_97404_97628_97777_98057_98259_98434_98538_98695_98813_99355_99405_99530_100097_100370_100572_100637
919429	contig_16098_pilon	-	1369	10	Intergenic	novelGene_46018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1631.85068761412	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	118	1131	352350	349015	TRUE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQPLSLPTVRPVPGRSVSAYCRA	354106	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348422_348907_349080_349404_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
919430	contig_6958_pilon	+	1854	11	Intergenic	novelGene_70018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	115.014303458309	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1476	379	1854	783058	808942	FALSE	50	AAAAAGAGAGTTCATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWLGGLGSGLGQSLGQVGGSLASLTGQISNFTKDMLMDGTEEVEAELPNTRRKEIEAIHAILRSENERLKKVCTDLEEKHEASELQIKQQSTSYRNQLQQKEVKSAFRDDDMDFGDIISSQQEINRLSNEVSRLESEVGHWRHIAQKTTAQGADSSDQSEICKLQSTIKELKQNRSQDIDVHQHEMSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSDAENEIMKLKSLNQDSSLTEDNLKLEKHVQALEKENSLLSQEKEELHISLLKLNSEYEVIKSTATRDMTLDSELNDLRLNLEAKEQELNQSITENKILVAELEELDKQNQEATKHMILMKDQLSKQQNEGDNMISKLKQDIHDE	782679	808942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_783197_786733_786796_792713_792831_797683_797810_799938_800008_801481_801648_802350_802717_805686_805728_806275_806363_808034_808248_808852
919431	contig_501_pilon	-	6867	1	Intergenic	novelGene_134901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1146	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTATAGTTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767317	760450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_760400_767300
919432	contig_12279_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_50132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATGCTCCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74785	76793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_+_74800_76800
919433	contig_11832_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_106944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	712	1269	85189	84632	NA	25	TTAATAGGCATGAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTAQPVQYSPGLVGGCGSAQHPAEAPRVGRGTGQWVLPNSPPRLQSEGGCQQGGAGNPGVLQGQGEAGGVSRRVSVVGDGWDCTGSLWCCASVLFMPALPLPRDVSVELPFVLMHPKPHDHIITLPRPQSGRHTTPSRRREGTRGPVEKCWNFQHPPTHLLSSPPAAPETDVPVDTNLIEFDTK	85900	83807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11832_pilon_-_83800_85900
919434	contig_6898_pilon	+	3943	13	Intergenic	novelGene_35692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	2240.82352638241	108	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	1422	2558	116718	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126736_127405
919435	contig_7356_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_60432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	31	96	241	336	516767	516672	NA	45	GCCATAGCAGTAAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWSPEQRSGLAPEVRWLHPSPPQYRGPGSSCAGEEWAVGLESALSLCVRAYRGSRRYLDRGTGLQPPGRSGGTPEPHQGGMSLPAFSFLAVVSWPGVWERLLFLRLRPRRV	517007	515765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_515800_517000
919436	contig_299_pilon	-	2478	14	Intergenic	novelGene_129455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCACCTATACAAAGCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	992920	965978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_966074_970898_971071_971911_972145_973395_973562_974105_974264_980748_980852_981043_981157_982235_982307_984208_984360_985538_985619_988262_988383_989173_989269_991474_991639_992163
919437	contig_18272_pilon	-	3908	3	Intergenic	novelGene_7055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	7	351	488787	488443	TRUE	40	CCTCAGCTGAAAAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPMTDGSNQLPQQIPHQLRLKGTEKEQKEGTLYCLLEFYRQGTGQRSYICCPPRKEMDLEQHRDQQHCWKEHWKQDLFSFKGWGYGLLNPKGWAHSLLGFKDLDLHQLQSGVWGCH	488793	473551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_473965_474187_477289_488399
919438	contig_13300_pilon	+	1243	2	Intergenic	novelGene_125769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGGAGAAGGGAGGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45441	46928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_46503_46746
919439	contig_5686_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_45492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCACCAATAATTGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249859	247149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_247100_249900
919440	contig_1301_pilon	-	3108	2	Intergenic	novelGene_47429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAACGAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986301	982318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_984297_985171
919441	contig_5961_pilon	+	3181	7	Intergenic	novelGene_144144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	108	junction_3	720.344689868831	11	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	1516	2907	197721	209789	FALSE	45	AGGTAAGAGGCAAATAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKKEDKETSGKRGKEITGVKRQSRSEHETTDAKKSMEDRGKRCPTPEVPKKSTGDVPQIEDSGSGKPVKIKGQPESGILKTGTFRENTEDTERNKAQREPLTRARSEEMGRIVPGLPSGWAKFLDPVTGTFRYYHSPTNTVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQVPAERDREPSKLKRSYSSPDITQAVQEEEKRKPAVTPAVNRENKPICYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLCNAPHLADYFNRNCYQNDINR	193383	210063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_194394_197215_197889_201775_202352_204380_204468_206906_206988_207371_207635_209572
919442	contig_5928_pilon	-	2731	2	Intergenic	novelGene_40349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	22	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAACAAAGAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156639	65576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_66712_155043
919443	contig_10042_pilon	+	6438	4	Intergenic	novelGene_79134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	3964	4425	261906	262367	FALSE	30	TCTTAATGGAAGCAGATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSKRPANTNIIQIYSPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIGKTCNQDALIITGDWNAKVGNKEEGTVVGKYDLGDRHNARYHMIEFCKTNSLFIGNTFFNSINGNYTHGPRQMEYTGIKSTVSVQRDDGEAQYHRSEQGQGPAVEQTINCSYASSR	76512	264380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_77195_77701_80774_81228_81253_261720
919444	contig_1154_pilon	+	470	1	Intergenic	novelGene_87196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAGACAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1065118	1065588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_1065100_1065600
919445	contig_4336_pilon	+	1653	1	Intergenic	novelGene_152367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGGTCTGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371163	372816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4336_pilon_+_371200_372800
919446	contig_17144_pilon	-	2253	13	Intergenic	novelGene_29293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2238.56152969317	96	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	135	1958	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168010_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
919447	contig_1443_pilon	+	2338	4	Intergenic	novelGene_28219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	82	junction_2	64.389440128021	10	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	273	728	536254	538096	FALSE	30	GACTGCACTGAAGTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQVDNKSDFLEKKPHRQHPGILQLPHVRLPQALANAAQLLLLESSVSNVEKQVQALTNYLWSRHLPVEPEELQRRAMHLEKKFLENPDRAQAEEKLHGAVLSALRRTTYHWQELRYNEKLSLVYMAARLDGGFAAVSRAFHEVKVPQIPT	535981	539706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536384_536468_536604_537644_537727_537987
919448	contig_7151_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_40759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511311	512840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_511300_512800
919449	contig_9982_pilon	-	1771	16	Intergenic	novelGene_55766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	239.21919283833	2	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	892	1641	345176	339852	FALSE	30	TTACTATCAGAGCCTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353587	339721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345224_345278_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347551_348004_348155_349531_349612_350163_350255_353478
919450	scaffold_9100_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_83321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCTATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856834	854689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_854700_856800
919451	contig_14618_pilon	-	1870	2	Intergenic	novelGene_136837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTTTGGTGATATGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193357	1170430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1170731_1191787
919452	contig_2770_pilon	-	1073	6	Intergenic	novelGene_107482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	19	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	218	667	750561	743833	FALSE	20	TCCAATGGGTTCTAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750778	743426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
919453	contig_4759_pilon	+	1886	7	Intergenic	novelGene_106318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	326.190980187306	16	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	102	734	464361	493475	TRUE	10	TTTTCCCTTGGTATTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNIKIFSGSSHQDLSQKIADRLGLELGKVVTKKFSNQETCVEIGESVRGEDVYIVQSGCGEINDNLMELLIMINACKIASASRVTAVIPCFPYARQDKKDKSRAPISAKLVANMLSVAGADHIITMDLHASQIQGFFDIPVDNLYAEPAVLKWIRENISEWKNCTIVSPDAGGAKSRKFQAWCPGTVHTDGGCFAAITEGSVMRAWALE	464259	499833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_464483_473999_474184_475323_475423_485950_486076_493372_494326_498625_498786_499691
919454	contig_6418_pilon	+	1240	1	Intergenic	novelGene_81238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATATGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1439353	1440593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1439400_1440600
919455	contig_2703_pilon	-	1085	2	Intergenic	novelGene_101644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3253	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1766_2586
919456	contig_7869_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_150000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTAAAATATTGTGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98212	100128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_98200_100100
919457	contig_11321_pilon	+	2433	2	Intergenic	novelGene_86649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	117	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAAACTTTTTCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69347	86841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_+_70998_86058
919458	contig_3018_pilon	-	2073	2	Intergenic	novelGene_78933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTTCTTCCAAGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649748	647633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_648620_648661
919459	contig_17144_pilon	-	763	5	Intergenic	novelGene_29200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1728.83935054707	31	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	71	679	172541	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	172611	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166340_168192_168310_168996_169099_170744_170934_172528
919460	contig_8045_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_35435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACCCTAATCAAGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419069	416186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_416587_416779
919462	contig_16185_pilon	-	3418	3	Intergenic	novelGene_144762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	73.5	141	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2929	3237	124600	123763	FALSE	30	TTCTTACAACTGGACCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDTIADVRWILAESGEYQKDVYLGFIDYAKAFDYVDHNKLWITLQRIGIPGHLIVLMRNLYIDQEAVFRTEQGILCGLKSGKVCFRAASFDHTYSFCMLSR	134388	123581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_123786_124314_127464_134323
919463	contig_9345_pilon	+	1937	2	Intergenic	novelGene_24726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTCTTTGTAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041987	1089162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_1042059_1087296
919464	contig_11160_pilon	-	2698	4	Intergenic	novelGene_168810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_3	10.4243305140746	60	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	482	847	312801	312436	FALSE	45	AGCAGATGCTCAAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLSTQQHTCGGHARPSQACKCYILRAQDTPALPPAALRCPNYLTRALCTDHEVVILAQQPSQQDGESRGQLVPLLEQVTQHSHGQSQSDGGVHLAEGKLCRDSREASKEWATQRQPGEAL	318448	310584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_312914_313920_314071_315639_315780_318369
919465	contig_3081_pilon	+	1893	2	Intergenic	novelGene_133948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	487	855	338848	439689	FALSE	35	AAAGTTACAAGCAGCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRHTENLKDSTRKLLELIERFSRVAGYKISIQKSIGFLYTNKENDEKEIRKTIPFTIAPKKIKHLGINPTREVKDLYKENYKNYCKKPKGSTDTFKLPEGLNCWAEGCGDHGLKEHRDQLA	338361	440727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_339120_439592
919466	contig_7840_pilon	+	2657	13	Intergenic	novelGene_68959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	419.496349805335	25	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	311	1552	238014	304152	TRUE	45	CAATTACATAATCATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQESITGFGDMWTCPWEGRTLPPAMAGLQKGLSGVNLLVLPLQVCSRLVTDALPLRLTAG	130617	305768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_303412_303496_304059_304306_304816
919467	contig_9333_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_120313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	643	1137	94484	93990	NA	35	GAGAAAAGCCCCAGGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILREFSLSSSSVILSVFSVFSPRSGTLITRKFLLLIVSHIIRRFSSFFFILFSEFSSNRVVSKCLSSVSLILSSTVSDLLLSPSMTLCISEILFIFWISNCCFCMISSCEFILTFSSCIIFLSSSIFFVFSMNLSAFSMNLVFFPHFCLLFALTLG	95126	92874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_92900_95100
919468	contig_10541_pilon	-	5437	1	Intergenic	novelGene_144623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	241	726	1610	2335	57745	57020	NA	25	TAAGGTTATCCGTGTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISRTLSDIASEDELPRLEGTQKMTGEELPPQSRVNLNDVDGVKLSGPSFADVAPLKMRRNSCKYPLIIGTWNVRSMNLGKLEIIKNEINIDILGINELKWNGIVYFELDNHMVYYAGNDNLKRNGVAFIVRKNISRSILKYNAVSDKIISGCLQGRPVNATVIQIYAPNTKVKDEEIKDFYQLLQSEIDQTSSQDALIITGDYNVKVGNEGSVVGKYDLGDRNDARDRKGMHDRILQDK	59354	53917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_53900_59400
919469	SIRV5	+	1980	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	15	34	-4	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
919470	contig_5686_pilon	+	5421	1	Intergenic	novelGene_45413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	579	887	179519	179827	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIFSLLMFPSRLSITDIYVEKAIMENYTTLRGVGAWVAQAVCTRLLTQKLAVQTPPLTLWKKDLANCFHKDYSQDNPMEQFYSVTHGVTVSQGPTQYGSS	178940	184361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_178900_184400
919471	contig_4103_pilon	-	2721	11	Intergenic	novelGene_51885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	31.0916387474189	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	146	1015	53593	49718	TRUE	30	TGTAGTAGTTTGAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLGLLPRKAWVALLSQILRPPHAACPRAVRFHSQVAEAVLTSQLKPNQEKSNFIIKTPKGTRDLSPQQMVVREKILDTVVSCFKRHGAKGLDTPAFELKETLTEKYGEESVLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKCYHVGKVWRRESPTIAQGRYREFCQCDFDIAGEFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGKNQGFQSIVIEPG	53738	46917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_49235_49674_49856_50128_50228_50474_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53485
919472	contig_1867_pilon	+	2546	1	Intergenic	novelGene_54522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	341	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGTATCATTTAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204279	206825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_204300_206800
919473	contig_7066_pilon	-	2536	5	Intergenic	novelGene_42201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	45.5377590577314	14	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	126	914	1035369	1031317	FALSE	55	ACATTTTAAAAAATTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDAIGSLMGHRTLSSAPALWASIPCPRSELRLDLVLASGQSFRWREQSPAHWSGVLADQVWTLTQTEEQLYCTVYRGNKGQVGKPTQEELQAIRSYFQLDVSLAQLYYHWGSVDPHFQEVAQKFQGVRLLRQDPIECLFSFICSSNNNITRITGMVERLCQAFGPRLVQLDDITYHGFPSLQALAGPEVEAHLRKLGLGYRARYVSASARAILEEQGGPSWLQQLREAPYEHAHKALCTLPGVGTKVMLQGVRAALTTDTE	1035494	1029694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1031547_1033225_1033406_1034370_1034619_1034927_1035036_1035346
919474	contig_11056_pilon	-	3069	1	Intergenic	novelGene_130403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	45	629	663030	662446	NA	15	CTCGGTATTTATCACCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEDEPPRLEDTQSMTGEELPPQSRVNLNDMDGVKFSGPSFADVARLKMRRNSCKHPLIIRMWNVQSMNLGKLEVVKNEMEHLEIDILGISRLKWTDTGHFELDNHVGYYAGNDNLKRSGVALIVKKNISISIPKYSAVSDRIISICLQGKPVNTTVIRIYAPTTKAKDEEIEDFYQLLQYEIDQLCNQDALRITGDWIQKLETKKDQ	663074	660005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_-_660000_663100
919475	contig_7051_pilon	-	2745	4	Intergenic	novelGene_64363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2033	2404	343665	343020	TRUE	50	AAAAAACTTCTGTGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITNLCSSWSFNMVSTNLTFPRVKTCKKRIFKRLIIIQQGQQKSPIATKTKTPHKTKTKKPTIYLSLLSGVHLWLRNKFLHLSHPEEFQSEAFLSATSFGTLSLLQSSLVHFGLLEELEMDFL	347027	338581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_338865_342961_343099_343372_345536_346865
919476	contig_21007_pilon	+	437	2	Intergenic	novelGene_161513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	390	48	437	589	978	FALSE	40	CAATACAATAATTGCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIAL	256	978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
919477	contig_15666_pilon	+	4131	2	Intergenic	novelGene_70114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTGAGGATGCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97266	101888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_101189_101679
919478	contig_7129_pilon	+	3881	2	Intergenic	novelGene_169306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAGATAAAAAAGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904669	1011953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_908185_1011587
919479	contig_5463_pilon	-	3047	2	Intergenic	novelGene_144776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGACATAACCCACACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42682	38073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_40159_41720
919480	contig_12624_pilon	+	2319	10	Intergenic	novelGene_60955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	310.462379184482	1	85	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	126	446	11640	39792	TRUE	40	CTAATAATTTTAAATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELVCQTCSRNRS	6081	56519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38824_39763_39840_41857_41951_42823_42973_50396_50437_54975
919481	contig_12677_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_110886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGCATCTAATCGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3509	3118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3100_3500
919482	contig_10239_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_175247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGACAATGATCCCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41829	43322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_41800_43300
919483	contig_16883_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_161744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361832	360272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_360300_361800
919484	contig_12019_pilon	+	757	3	Intergenic	novelGene_87670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	255	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	109	408	5225	8336	FALSE	25	GTGATGTTATGGATTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKGILS	5116	8685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8322
919486	contig_14694_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_152479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166327	167584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_166300_167600
919487	contig_12029_pilon	+	2177	1	Intergenic	novelGene_177353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	185	559	37116	37490	NA	30	ACTTATCTATCTTAATTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIAEHLIALMRNLYIDQEAIIHTEQGDIAWFEVRKGVHQDCILSPYLFYLYAEQIIGEAGLYEEEWGIRIGGRLVKNLPYADDTTLLAESEEDLKHLLRKIKDHNLQYGLHLNIKQKSSQLDQ	36931	39108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12029_pilon_+_36900_39100
919488	contig_7410_pilon	-	6412	8	Intergenic	novelGene_106054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCCAGTAACTACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138620	98137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_98848_107336_107456_123305_123478_123675_123793_125038_125304_131165_131211_132873_132993_133755
919489	contig_10302_pilon	+	3069	2	Intergenic	novelGene_175204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGTTCTGAGCTACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46223	51841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_+_49083_51631
919490	contig_7333_pilon	-	2091	2	Intergenic	novelGene_142792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1744	2046	227218	226668	FALSE	60	GCACAATTAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPNGQHVPKSKDKKAGRDRKMGQMDMGKRWRVLTHCGDCNQCHKTIYQVYKTKQATPAQKQDEKAGRDWSSGHREPGVKSGRMLSYCGDSNQCHKTTCV	228961	226622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_226829_227076
919491	contig_10904_pilon	-	4685	9	Intergenic	novelGene_22489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	255.965207596658	127	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	9	731	662714	657826	TRUE	55	TATATTAAAAACCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTMGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEVDRQLLLPSLS	662722	278902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_279565_279788_280076_392471_393389_475053_475321_656004_657864_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665
919492	contig_987_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_72320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1205	1531	1030689	1031015	NA	25	CATTCAGTGAGAATTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLFYFSLNQRSANYDLAEPNFVSKILLEHIRAHFFFLIYCVYGCFGTTMAEMSRCDRDHISHKPETFTICPLKKKFSVLWSNSASITSSVATICWLRINKKKKKEV	1029484	1031031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_1029500_1031000
919494	contig_14450_pilon	-	4061	1	Intergenic	novelGene_49057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGAAATTTCACCTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421402	1417341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1417300_1421400
919495	contig_5549_pilon	+	2649	5	Intergenic	novelGene_81699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	308.604115332249	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	219	785	831635	844446	TRUE	20	TCTTTGTACTGGGGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEILRDSEKGQSSLLVGCQNSSEISDDSFGDVSARQTNKPPLQLILDPSNTEISAPRPSSPGGLTEEDSVLFNKLTYLGCMKVSSPRNELEALRAMATMKSSSQYPFPVTLYVPNVPEGSVRIIDQSSNVEIASFPIYKVLFCARGHDGTTESDCFAFTESSHGSEEFQIHVFSCEIKEAVSIMYCT	829984	848047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_830171_831602_831792_842368_842580_844247_846006_847742
919496	contig_4924_pilon	-	1621	11	Intergenic	novelGene_84691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	1150.46707471357	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	15	1334	252576	65524	FALSE	15	TTTTAATATTTGTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252590	65236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82359_82480_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
919497	contig_5062_pilon	+	2883	9	Intergenic	novelGene_157852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	204	junction_1	157.312139947939	1	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	149	1045	676221	741875	TRUE	80	ACAAAAAAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWIKRKFGERPQPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQVSS	676072	744070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_676238_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_743066_743422
919498	contig_1719_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_87287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGCTTTACAGCAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373206	370960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_371000_373200
919499	contig_7457_pilon	+	3011	18	Intergenic	novelGene_31555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_1	32.1396175661914	80	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	1057	2490	851177	858158	FALSE	0	CCCCTGCGTGTGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEIYGANSPIWESGFTMPPSEGTQLVPRPATVSAAVVPSAPIFSPTMGGGSNSSLSLDSGGAEPMPAGEKRKLPENLTLEDAKRLRVMGDIPMELVNEVMLTITDPAAMLGPETSLLSANAARDETARLEERRGIIEFHVIGNSLTPKANRRVLLWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYIARLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPTQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHNILYFLTYADEYAIGYFKKQGFSKDIKVPKSRYLGYIKDYEGATLMECELNPRIPYTELSHIIKKQKEIIKKLIERKQAQIRKVYPGLSCFKEGVRQIPVESVPGIRETGWKPLGKEKGKELKDPDQLYTTLKNLLAQIKSHPSAWPFMEPVKKSEAPDYYEVIRFPIDLKTMTERLRSRYYVTRKLFVADLQRVIANCREYNPPDSEYCRCASALEKFFYFKLKEGGLIDK	848244	858679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_848556_848692_848817_849165_849312_849418_849509_849787_849970_850067_850261_851166_851274_851461_851573_851658_851799_851894_852104_852312_852440_853335_853447_853897_854042_854365_854481_854586_854624_854702_854767_854900_854986_857964
919500	contig_7253_pilon	-	2323	1	Intergenic	novelGene_140193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	607	966	151562	151203	NA	30	TTCTGCAAACCTTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALLTVAKGWKQPKCPSADKWINKMWYRHTVEYYSASRRNEVLLHATIWMDLEDNMLIEISQSQKDKYCMTSLTYIKKIRQMYRDQSLFVVTGGRKGECHGLNYVPPRCLSTWLVI	152168	149845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_149800_152200
919501	contig_11720_pilon	+	778	6	Intergenic	novelGene_43860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_5	1586.12251733591	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	24	743	86302	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	86278	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
919502	contig_13300_pilon	-	901	4	Intergenic	novelGene_125818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	25.4689353265241	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1	300	250812	247377	TRUE	40	GGAAAGGAAAAGAGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGRLGLGGVLDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQVVLWTHADIFKRQSKNGNTN	250812	244184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_247440_250575
919503	contig_15857_pilon	-	3516	5	Intergenic	novelGene_152079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	624	1238	213886	213272	TRUE	50	AAGCAAAGAAATCACTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEIQAALKTLVKNKVSGTDEIPIEMFQQMGAVLEALTHLCQEICKIATWPTNWKRSIIVPIPKEGDPTETKNDRTISLISHTSKNLLKIIQKRLQQYIDRELPEIKARFRRECGMRDITDGVRWILAESKEYQKNVYLCFTDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVFMGNLYLDKKAVIGTEQWDTAWFKVRKCVC	215568	129681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_129889_130102_131894_134115_134177_213052_214171_215229
919504	contig_2703_pilon	-	4337	1	Intergenic	novelGene_101751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	301	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATGTATATTTTCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562075	557738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_557700_562100
919505	contig_9235_pilon	+	2795	2	Intergenic	novelGene_156205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	524	junction_1	0	1	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	283	1431	45805	46953	FALSE	35	GAAAGATCCCTTTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43918	48317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643
919506	contig_7467_pilon	+	2148	2	Intergenic	novelGene_69485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	258	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGCGGGGCAAGATCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112069	114342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_114188_114312
919507	contig_13542_pilon	-	1473	7	Intergenic	novelGene_131536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	504	1028	546565	540439	TRUE	10	GCGCCTGCGCACAGGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLFPTHLQLGVVVHPPQGGRGHAGGTGAVSSLQGLLHQGNGLEVVLLPEAIPVDLSPVIPKEAAQRLLPVLVLVFVLASQQAPCQRVVGVEPQSKVPETGEEFCFHLPGGGVVHALIHRRQDPAVVLAEGTDLGHLPGGIVGEAKLHKLALLVQLVAGAQCLFHRGAVVRCM	547068	535510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_535834_540316_540506_540700_540805_541721_541819_542062_542165_542719_542846_546536
919508	contig_12884_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_105023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	705	1112	1237619	1238026	NA	0	TGGTGTCGTCGCTGGGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPATQPLPRSSIRTASTSERSLTDVLPSWSCSNCALLRTLASRSSLAGTGARRPLKVSFSCRLISVSSMMVMRILMIFSTVTLPVRYCRSSSRLCSSVKYSELISSQTLTVRPLKPPTGTSTVAFSKVSRACVSE	1236914	1239146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_+_1236900_1239100
919509	contig_9252_pilon	+	2879	2	Intergenic	novelGene_178997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTGTTTTAGCTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12284	136993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9252_pilon_+_13539_135368
919510	contig_12920_pilon	+	3368	1	Intergenic	novelGene_166326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATTTCTGGGCCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69714	73082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_69700_73100
919511	scaffold_15568_pilon	+	4005	2	Intergenic	novelGene_122571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCAGTTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25520	31006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_26031_27511
919512	contig_2733_pilon	-	2821	1	Intergenic	novelGene_128553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557849	555028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_555000_557800
919513	contig_10549_pilon	-	3295	1	Intergenic	novelGene_110578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2223	2531	14125	13817	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSISMYLFTNLSMDHRGGCSLQNKLCSTVALVIVIHGQSARLSPQLWKAKVIQSDCLEQWNGHRTRSQEVWAGVLVLLKNSCISHVTFFKKPYSYHELACN	16347	13052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_13100_16300
919514	contig_3018_pilon	-	1783	13	Intergenic	novelGene_78866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	375.672831582068	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	320	1783	600079	562938	FALSE	75	AGGAAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625141	562937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624936
919515	contig_2684_pilon	+	1754	13	Intergenic	novelGene_172698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	225.186342589618	74	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	444	1496	149561	162173	TRUE	20	TTTACTTTACGGAACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPDGLAVTPTPVPVVGSQMTRQARRLYVGNIPFGITEEAMMDFFNAQMRLGGLTQAPGNPVLAVQINQDKNFAFLEFRSVDETTQAMAFDGIIFQGQSLKIRRPHDYQPLPGMSENPSVYVPGVVSTVVPDSAHKLFIGGLPNYLNDDQVKELLTSFGPLKAFNLVKDSATGLSKGYAFCEYVDINVTDQAIAGLNGMQLGDKKLLVQRASVGAKNATLVSLPTINQTPVTLQVPGLMSSQVQMGGHPTEVLCLMNMVLPEELLDDEEYEEIVEDVRDECSKYGLVKSIEIPRPVDGVEVPGCGKIFVEFTSVFDCQKAMQGLTGRKFANRVVVTKYCDPDSYHRRDFW	143224	162771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_143346_147763_147900_148633_148679_148965_149069_149522_149675_150976_151094_151940_152080_157600_157681_157763_157887_158211_158310_158538_158786_162038_162358_162697
919516	contig_7993_pilon	+	2409	3	Intergenic	novelGene_170961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	115	junction_1	94.5	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	35	721	16712	33022	FALSE	50	TGATTATAAAAGATAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDPQKKNKGDPMNNLENFYQEMIMKKRLEEFQLMRGEPFASHSLVSATSVGDSGTAENPSLLQDKGKQAAQGKGPSLHVAKVIDFSPQQCWTGPKKLTQPIEFIPEDEIQRNRLSEEEIRKIPMFSSYNPGEPNKVLYLKNLSPRVTERDLISLFARFQERKGPPIQFRMMTGRMRGQAFITFPNKEIAWQALHLVNGYKLRGKILVIEFGKNKTQLSDLQADSLISCATDNTAEISGS	16677	34710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_17084_31084_31233_32855
919517	contig_17964_pilon	-	2721	7	Intergenic	novelGene_33902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	237.678821568566	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	2039	2719	373501	359083	FALSE	30	GGAATTTTCCCAAGACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAASGLAGTTNGPFRPLGSQQPQPQPQQQPNNSLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRANSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHI	386649	359080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_359316_370784_371082_371986_372131_373494_373634_380107_380260_384030_384136_385000
919518	contig_13865_pilon	+	2072	2	Intergenic	novelGene_122738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	630	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	20	574	616	1293	FALSE	85	AAATTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDILFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKWYLG	596	2791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13865_pilon_+_1151_1273
919520	contig_10135_pilon	-	2262	1	Intergenic	novelGene_106679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACCAGGCACTCCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275559	273297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_-_273300_275600
919521	contig_12790_pilon	-	1980	5	Intergenic	novelGene_35288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	141.310827610626	7	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTTTGTGATACCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460374	453988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_455168_455548_455685_455784_456169_456711_456895_460276
919522	contig_4364_pilon	+	1406	12	Intergenic	novelGene_5	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_11	13.9639441253963	21	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	42	983	144301	276039	TRUE	50	AAATCAGTTTATAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLRSVLHQDFEGIMELSIFNDASKDKSGTIIEKWKVKLEASGILVVIGGHDSPSPRGVGYSKNQAIAQSSGAYLCFLDSDDVMTPQRVRLQLEAAAQHPTSIIGCQVRRDPPDSTERYTRWINQMSADQLLTQVFTSNGPTVIMPTWFCSRAWFSHVGWFDEGGQGVPEDLLFFQEHLRRGGRVVRVDRSLLLYRYHPQAASLSVLEGTIWTLRVRFLEERVLPYWATFTIWNAGKQGRRLYRSLEAANRQKVVAFCDVDERKIKKGFYCYEDSQERPKPRVPILHFRAAQPPFIICVKLDLTGGAFEDNLRSLHLQEGQDFFHFS	144259	283005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_144334_144434_144535_157577_157643_180872_180939_207801_207898_256295_256392_265103_265229_270554_270691_271046_271116_272201_272277_275958_276064_282606
919523	contig_7919_pilon	-	820	7	Intergenic	novelGene_28031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	25.5435358206773	16	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	234	347	186678	186565	TRUE	30	GCAGCAACATAGTCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEDRPPTVVSSKGNERPQDPRGCHKRKHQKSTEDFTSCPTQSKHQEKKKQDKRLKSPAEVTKQSRCVPARPIARRTKMTSRPTSGQEPTSDSVAYPLAFLPSSSLFLWTKQCWK	348733	168158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_168217_173062_173247_173956_174159_186535_186686_307718_307808_312840_312939_348694
919524	contig_5686_pilon	+	3186	3	Intergenic	novelGene_45489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	699	1253	239068	239622	TRUE	30	TGCTAAGTGATATGTCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPTYKSKMIKIMEEKIGTTLGALIHGINRIRTISNNTEIPEEKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDKSNQRLISKICKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDINMHFAKEDIQAANRYMRKCSQSLAIKRNANQNYSEIPSHPTKASINKKTKTTVRYHFTPTRLALIKNTK	238369	274064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_241047_273371_273476_273659
919525	contig_11338_pilon	+	3597	15	Intergenic	novelGene_6163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	577.089888835282	7	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	446	1864	6086	11749	TRUE	45	ATCAAAAGCTGAATTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRVGDVPGQGCRNGRCPQRQLRPHWLLPLQALRPSESSM	745	13603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8887_10639_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_13170_13290
919526	contig_5649_pilon	+	4608	4	Intergenic	novelGene_82309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	276	junction_3	102.294781011654	97	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	1431	2246	183075	187256	FALSE	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEILPFSRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSMENGLNYMAVAFAMQLVKILLVDERSAAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRGNAPEGLPQLMEVVRSNYEAMIDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLREKAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQVELLERKMHQQGILKTDDLITRFFRLCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTIIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHSGEATNTVTKINLLNKV	181644	189618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_183213_183315_183486_184370_184624_187001
919527	contig_11548_pilon	+	2705	14	Intergenic	novelGene_66794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1	408	145189	148587	TRUE	30	CTCACAGACGGTCGCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILIAFYYIYSLFLQRFLHRWLSLWNSFDWRFLSFPCPFSIHCHWNIFTNRSFFVFPIQFGCLYKLCSQHFTLTSFSFLRKLPFCQFKSCCRVQTIVCSSSSSFGKRATQVHPFTLYHEWCTCLPLRLNSQICCWT	145188	202196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_145397_148387_149117_152187_152250_152349_152424_155650_155758_156511_156611_164947_165063_165251_165372_165502_165640_170613_170705_173682_173757_174851_174951_178076_178223_201552
919528	contig_14441_pilon	+	1049	6	Intergenic	novelGene_100454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.986403956887	79	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	434	862	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	82333	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82368_112113_112154_112454_112665_116578_116963_117220_117344_117539
919529	contig_12079_pilon	-	1471	9	Intergenic	novelGene_67461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1201.09187304719	4	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	523	1143	600692	580918	FALSE	10	TCCGTGCCATACTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYRPSLETTTKRYTSLGTSAPSAWSPKGEQRHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQVGCDGFWESLSDT	638845	580589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580964_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599535_600596_600885_601782_601879_609189_609274_638695
919530	contig_2646_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_69565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGAATAAAAGTAGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876221	874311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_874300_876200
919531	contig_8045_pilon	-	4984	1	Intergenic	novelGene_35468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCCACCAGCTGGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534599	529615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_529600_534600
919532	contig_5718_pilon	+	2165	8	Intergenic	novelGene_110438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	88.3785919225017	20	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	16	999	1617860	1625636	FALSE	25	GAAGCCTGTGAGCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMVFCSTCNNTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQTKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKVSPAAD	1617844	1626802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624746_1624894_1625477
919533	contig_938_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_143917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAGAGGTTACCAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92743	91463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_938_pilon_-_91500_92700
919534	contig_15039_pilon	+	633	1	Intergenic	novelGene_110109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148497	149130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_+_148500_149100
919535	contig_299_pilon	+	3368	2	Intergenic	novelGene_129450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGGTGGCTGGAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935307	941284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_935688_938296
919536	contig_16999_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_84994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1405	1770	132626	132991	NA	35	CGCTTCCTTAAAAAGCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIERLCQKRTYRLGKNFGYNISDKDLISKSYKILQHLNNKKTNNPIKKWANDMNRHFTKEDIRAGKRHMKKCSQSLAVRKMQIKTTMRCHLTPARLALIQKTQNSKCWKGCGDIGTVMHC	131221	133033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_131200_133000
919538	contig_6397_pilon	-	2715	2	Intergenic	novelGene_146282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATTGACACAGCGGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570228	567451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_567605_567666
919539	contig_12624_pilon	-	3685	1	Intergenic	novelGene_61008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAACTAGTTCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782281	778596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_778600_782300
919540	contig_14353_pilon	+	2500	1	Intergenic	novelGene_82134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGACGCGTAATGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298480	300980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_298500_301000
919541	contig_5020_pilon	+	1412	8	Intergenic	novelGene_27801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	920.257949641051	138	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	368	1099	122915	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTHTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118457	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123200_124201_124363_124444_124547_124909_125091_125657
919542	contig_13283_pilon	+	956	4	Intergenic	novelGene_154024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_3	70.0047617428034	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	7	414	114754	121948	FALSE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLMEGDKLQSLTMQAHEGFELTGPSGPVKPAPGLPQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQSKRCPLHAAAEAGHVDVCHMLIQSFPKGSTTFYDTDCSLRRRK	114747	122490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_114909_116848_116932_118050_118158_121885
919543	contig_7376_pilon	-	2634	1	Intergenic	novelGene_108091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	65	379	125283	124969	NA	55	CAAAGAAAACATCAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCTARSSVHTAKPEGSLGSFFFFLSFLSLPPFLSFLLDTWHYVPSLLLLDGLCCATQLGSPFPGLYHHAGGIPGGIFFSLLFSTFLPYPSPEHLVLCAISTPS	125347	122713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_122700_125300
919544	scaffold_12510_pilon	+	3226	20	Intergenic	novelGene_151362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGACAACTCTCCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190505	300581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_191661_199364_199444_206082_206221_206837_206955_208015_208129_208631_208683_212534_212608_219764_219815_221545_221694_222107_222159_236701_236779_240121_240190_243068_243188_244011_244109_252206_252314_253485_253625_256443_256547_262904_263035_264952_265097_300314
919545	contig_7049_pilon	+	1718	3	Intergenic	novelGene_171447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	30.5	35	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182096	186461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7049_pilon_+_182243_184645_184830_185073
919547	contig_8673_pilon	-	2401	4	Intergenic	novelGene_129935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_1	54.4813933579366	23	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	91	582	338208	335374	FALSE	35	AAAAGATTACAGTTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLAWRALRTSETFLRVKRLLLEDYCPEEKMFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSKKNWNHVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHSKFGVETLLLKNNYLVLIFGWCLLEETYGMCGSFFPWFIVIIFIS	352720	333554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_335638_336673_336774_338080_338229_352650
919548	contig_6842_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_130805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTTTTGGCCTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1785736	1678384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1680122_1785679
919549	contig_18364_pilon	+	2540	1	Intergenic	novelGene_102592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGTATTTGAGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225878	228418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_225900_228400
919550	contig_11720_pilon	+	1639	9	Intergenic	novelGene_43777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2331.25373994338	4	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	460	1356	78465	98482	FALSE	20	ACTTGAGAATTTGGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67786	98765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_78356_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
919553	contig_11493_pilon	-	5359	7	Intergenic	novelGene_143690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	511	junction_5	215.772578321611	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	73	1029	215291	196847	FALSE	35	AACATGATTTTGTTAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGNSVRLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAESEKEKQEWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAQDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPNDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIPSEGGLSHEFVQSTFLCDFLYQAPSAASKLYSEKKLLEGIFSGTFRFCYLIKLYSIISTILNFDFFPLRC	232852	192516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_197080_197522_197698_201062_201246_201922_202009_212093_212294_215211_215328_232816
919554	contig_9815_pilon	+	5062	2	Intergenic	novelGene_164234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	164	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	2288	3871	5142	6725	FALSE	40	GACTAATGAAGCACAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQGKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVARYKINIQTSVGFLYTSKENDEKEIRKSTPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKVIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPMSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTRNINTQNPTDKLDNWDVLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKISGHYKSDKGLISIINKKIQYLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKDDIQASNRHMRRSSRSPAIREMQIKTTMRYHLTPALLA	114	7916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_1674_4413
919555	contig_1210_pilon	-	2635	1	Intergenic	novelGene_171519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAAAATTGAGAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275360	272725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_272700_275400
919556	contig_20875_pilon	+	1596	1	Intergenic	novelGene_153093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCAACAACGTGTATGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12935	14531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_+_12900_14500
919557	contig_6583_pilon	-	1858	2	Intergenic	novelGene_174585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAATAAAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18425	16499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_17807_17874
919558	contig_6027_pilon	+	4798	2	Intergenic	novelGene_74422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	122	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAGACAGAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125612	138954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_127048_135591
919559	contig_7775_pilon	+	2769	1	Intergenic	novelGene_37510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACATCACTCAGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327742	330511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_327700_330500
919560	contig_10930_pilon	-	2633	1	Intergenic	novelGene_36984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAAGGAGTTCCGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269778	267145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_267100_269800
919561	contig_2069_pilon	-	1289	2	Intergenic	novelGene_23173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTACTGGCCATGTGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34726	30790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_31124_33770
919562	contig_14467_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_138287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGATAAGAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391259	389423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_389400_391300
919564	contig_7362_pilon	+	1007	1	Intergenic	novelGene_147540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTTTTAAAAAAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304377	305384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_304400_305400
919565	contig_5588_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_172843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTAAAGAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1056500	1055835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1055800_1056500
919566	contig_8100_pilon	+	2986	12	Intergenic	novelGene_176003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_7	10.0494644403167	76	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	40	1467	378286	401123	FALSE	25	CTTGTGTAACCACTCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQSVVVQVGQCGNQIGCCFWDLALREHAAVNQKGIYDEAISSFFRNVDTRVIGDGGSISKGKIRSLKARAVLIDMEEGVVNEILQGPLRDVFDSKQLITDVSGSGNNWAVGHNVFGSLYQEQILEKLRKSAEQCDCLQCFFIIHSMGGGTGSGLGTFLLKVLKDEFPEVYRFVTSVYPSGEDDVITSPYNSILAMKELNEHADCVLPIDNQSLFDIISKIDVIVNSGKLGKTVKPKSLVTSSARALKNRQEKPFDAMNNIVANLLLNLTSSARFEGSLNMDLNEISMNLVPFPQLHYLVSSLTPLYTLADVNIPPRRLDQMFSDAFSKDHQLIQADPKHSLYLACALMVRGNVQISDLRRNIERLKPSLQFVSWNQEGWKTSLCSVPPVGHSHSLLALANNTCVKPTFVELRERFMRLYKKKAHLHHYLQVEGMEESSFTEAVSSLSALIQEYNQLDATKSMPVQDFPRLSIAM	378246	402642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_+_378311_378400_378475_379585_379639_382491_382550_391559_391676_393556_393679_394232_394421_394645_394822_396061_396203_399843_399985_400661_400837_400964
919567	contig_18391_pilon	-	3939	2	Intergenic	novelGene_174095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	151	582	81144	80713	TRUE	60	GAAAAAAAAGAGTATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDETLKLALEHRVAKANGRNDEVKQLNRRSQEATREDRVKYYNEMCKDLELENKNGTTNLAFLKLKELKKNFKPRVAVLKDSVDKILNDAERIKRRWKEYTESLYQKELVSVQPFQEVAYDQEPMDGIEGKTPGYTEGISEK	81294	76831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18391_pilon_-_79309_79832
919568	contig_9901_pilon	-	5497	10	Intergenic	novelGene_126936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_8	141.932517437594	325	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	115	747	207348	185991	TRUE	20	GTTGGTATTCTCATCAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVFAWGYNNCGQVGSGSTANQPTPRKVTNCLHIKKVVGIACGQTSSMAVLDNGEVYGWGYNGNGQLGLGNNGNQLTPVRVAALHSVCVNQIVCGYAHTLALTDEGLLYAWGANTYGQLGTGNKNNLLSPTHIMVEKERVVEIAACHSAHISAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPRHVAPAVCRA	207462	173797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_177916_178113_178343_184551_184683_185232_185385_185870_185998_197326_197519_198646_198790_199187_199296_204141_204301_207324
919569	contig_17704_pilon	+	1714	1	Intergenic	novelGene_177183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAAAGGCTGATTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254684	256398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17704_pilon_+_254700_256400
919570	contig_240_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_173811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAAAAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791070	793379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_791100_793400
919571	contig_12638_pilon	+	1736	15	Intergenic	novelGene_33161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	202.202679184495	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	112	1542	269238	274265	FALSE	20	AGACCACTGCTTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235649	274459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235676_241232_241318_269237_269367_269457_269602_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
919572	contig_4232_pilon	+	2487	1	Intergenic	novelGene_63429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	931	1242	499726	500037	NA	30	ACAACAGTGTTCTGTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHQDWRRLVNSLQYADAVQWIAFIWPFSPWSYNSHQKIGWDYANKVLVAHQGMDSLLLMQIRYMEHLWGWDHANKLYGILMRGLVSIAILLGLKGDMGREEL	498795	501282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_498800_501300
919573	contig_7467_pilon	-	2253	2	Intergenic	novelGene_69489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAAAGCATAGAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132426	129324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_130835_131683
919574	contig_4125_pilon	-	3326	12	Intergenic	novelGene_25133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	338.666221990554	2	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	73	453	822728	815518	TRUE	30	AATTCTTAGTATTTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGQVGGTRHPCFSARHPRPLAVAMEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKETLLS	845425	809064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812139_812627_812775_812911_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815533_815919_816029_820537_820622_822555_822775_845399
919575	contig_17936_pilon	+	2488	12	Intergenic	novelGene_29921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	871.53077071181	14	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	528	1637	79133	121021	TRUE	25	TACTATTACCAGCCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	50591	126576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_69033_69333_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
919577	contig_13945_pilon	+	903	2	Intergenic	novelGene_173455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGACTTCTTAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69391	70511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_69733_69949
919578	contig_5602_pilon	-	2581	2	Intergenic	novelGene_133042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAAACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747120	655485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_657619_746672
919579	contig_12724_pilon	-	8258	1	Intergenic	novelGene_146859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGCCTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167608	159350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12724_pilon_-_159400_167600
919580	contig_1596_pilon	+	2457	1	Intergenic	novelGene_131602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGACAAAACAATACCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131200	133657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_131200_133700
919581	contig_7963_pilon	+	2011	1	Intergenic	novelGene_58497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGCCAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139417	141428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_139400_141400
919582	contig_854_pilon	+	4833	27	Intergenic	novelGene_36634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3787.59349153266	7	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1222	3669	14	3682	1694500	1714980	TRUE	25	GAGTACCATGTGCTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1694486	1716390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698988_1699029_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715341_1715599
919583	contig_4232_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_63319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468106	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
919584	contig_9363_pilon	-	2260	12	Intergenic	novelGene_6771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	495.339803227196	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	86	1030	1548961	1538785	TRUE	45	ACCTAATAAATGTGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSCIILMRLLLFGPFLFAPASSYNLDVLHAQSFSFQDSGRHFGYRVLQFGNRVVIGAPGEGNNTGNLYQCQPATGRCLPVRLSGSNYTSTYLGMTLATDPTNGRLLACDPGLSRVCDQNIHLSGQCYLFRQNLQSPVHQGRPGYQECIKGNVDLVFLFDGSRSMQRDEFQKIVDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTTYKTEFSFLDYVRQKDPDVLLAKVEHMALLTNTIGAINYVATEVFRQDMGARPDATKVLIIITDGEASDTGSIDVAKDIIRYIIGEAFSDKRKSGGTPQICLKTHQRVRKDSGHI	1549046	1505346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506390_1535603_1535664_1535775_1535850_1538731_1538878_1539039_1539173_1543519_1543666_1544362_1544494_1544647_1544766_1546033_1546102_1546214_1546310_1547626_1547730_1548903
919585	contig_2100_pilon	-	1364	12	Intergenic	novelGene_50678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	966.329145027162	38	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	84	1100	1182812	1170268	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185494	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170132_1170216_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173297_1175575_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
919586	contig_5434_pilon	+	766	1	Intergenic	novelGene_74701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTCAAAAAAAAAAAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458478	459244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_458500_459200
919587	contig_14158_pilon	+	2772	1	Intergenic	novelGene_136134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGTTCAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43119	45891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14158_pilon_+_43100_45900
919588	contig_8156_pilon	-	1858	1	Intergenic	novelGene_98903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	32	343	64593	64282	NA	35	CCTGGACAGAGCTGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCGGLCVAVMLKDMPRVFQTLAGSPRVDRFQQSFQTNTDWEEGPGNLLLKKLASENLMDSSRTLSDIALKDEPLGLEGTQNTTGEDLPPQSRFDLNDMDGVKLSGPSFADVT	64624	62766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_62800_64600
919589	contig_10324_pilon	-	2615	2	Intergenic	novelGene_7856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAACAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352973	349701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_351975_352631
919590	contig_366_pilon	+	2903	3	Intergenic	novelGene_51609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCAGCTTTAGTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055883	1328350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_1056278_1216099_1216466_1326207
919592	contig_17127_pilon	-	1625	7	Intergenic	novelGene_168309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_1	262.43094329747	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	137	1498	92657	84539	FALSE	25	CCAAACCCATTGCCGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPEDRKKPEESGRARAKAVKNAKEQRNQDACACEVESTLSPGEGIMVYFHAIVSKDFSFNPNQHRVLIRGGEEFGKPPWNRNVCEMSYTKDLGEYGSLLEGFAFISKQNLDKPIPYKYVIAYTKDSEEYEFIYKRQQKEGEYVNRCLCIRSSLLGSGDWHQYDDIICMKPPGKIQRFWDHVTDGTRKSLVRGKQIAARVMLDSIFSILQTWNAINLKKFFTQFKQFYSVVREPTVYEGGPQTWSSFLKYGETEVKKDLWHYLKEKMDLFLQRNSEEHPPEHWPVRSGLRMGLIVLFAMEEFALPMSDADLSSLCYLLCVSASSPDPLHRDLQPVFETSRSWRRYLVNLCGRCMYPSKDCWVLTLPVLHHCMGLAPQGKDIPPEDTWAALEGLSFSQFREERSDQNQLLQLMESNQHLLNVDGCLFRSWFSLLPLRDLADYMRTLVPYLAASPAHFLDCFLGVYYRLRGLYKISHRNLEVCYLQRATAPLLSKTENQTF	93789	84411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_84825_85441_85634_87090_87351_88022_88310_91964_92168_92523_92683_93678
919593	contig_16951_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_98612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	151	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTACATATTACGAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10468	13050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_10500_13000
919594	contig_5317_pilon	+	876	4	Intergenic	novelGene_76507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3454.92373287747	5	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTAAATGGTGTTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33677	43685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35263_35410_36684_36851_43209
919595	contig_6048_pilon	+	1548	1	Intergenic	novelGene_73294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	316	624	1987975	1988283	NA	50	CTGTAAAAAATTATAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVNSYLSIITLTVNGLNVPLKRQRMAEQIKKHDPSIYCLQERHVRHKDIKRLKTKGWKKIYQAHSNQKRAGVAVLISDKIDFKSNFIIKDKKGHYIMIKG	1987659	1989207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1987700_1989200
919596	contig_7933_pilon	+	617	3	Intergenic	novelGene_164683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6634	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGAGACGAGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	197937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_186078_189402_189558_197893
919597	contig_16620_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_156003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCTTATCTATTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26051	27616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16620_pilon_+_26100_27600
919598	contig_7707_pilon	-	2695	1	Intergenic	novelGene_72190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTCCTACTTCGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617182	614487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_614500_617200
919599	contig_5954_pilon	+	2678	1	Intergenic	novelGene_28491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	384	689	368041	368346	NA	25	AAAAATTTTCTCCCGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLKAVSPMVDRFQQTCQTKARKKGLAIYFPKVDNKNPTDHNRIPSDTVLENDVGGHSKYTAAGTMDLSIPTIVDVGDWAELCSVVRGVTMSQSQLSGNYQ	367657	370335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_367700_370300
919600	contig_6027_pilon	+	573	1	Intergenic	novelGene_74456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334802	335375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_+_334800_335400
919601	contig_10058_pilon	+	2076	10	Intergenic	novelGene_67710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	136.495828182077	489	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	81	935	72602	98946	TRUE	10	GATTCTTGTTGTGGGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFENTVPMCSRVFLQEHHLPL	72521	100516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98806_98890_99055_99357_99407_99532
919602	contig_500_pilon	+	1689	11	Intergenic	novelGene_31057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	990.306018359982	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	299	1276	1492663	1498065	TRUE	15	CATGTTTGACTGTGTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1486433	1499587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1486585_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
919603	contig_15929_pilon	-	1169	6	Intergenic	novelGene_172467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	191	676	92109	84434	TRUE	25	TGGAGGCCCAAGTGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFLHSPVGYKSKFRVSAPGEYFLCWLCRKVHVINLPLVWELLCEGTSGPKDALCSRHCFLGGMRFPCVSARFSLLYLFNIISIRRKTWLERSEGFVGQGRSFSGLLGKLEDVYAGASAPRVEHDPVEDLVTMPCCPSGAVGLLAPACPCSRLSDAEEGLGGRGPVPLDVGDINEQAHKQPQGVSHLQVPIIRYFSHFFLCRRLSHSNNSEDGTGPGNVSFCYI	92299	82390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_-_82701_83361_83510_84398_84488_87309_87621_89764_89842_92065
919604	contig_7254_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_145836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161243	159836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_159800_161200
919605	contig_500_pilon	+	1259	1	Intergenic	novelGene_31115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCCCTCTTTTATTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1659990	1661249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1660000_1661200
919606	contig_10902_pilon	-	9379	1	Intergenic	novelGene_65662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	278	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	4795	5145	83716	83366	NA	15	GGGAGGCGAGGCGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREFLGWGHWLSCFLFLQVFPLYPMPVFCNPFLSRPGSLSFFSHHPDPCAFYLPYRPHKSLTHNLGHQSCSANCMLGWSSWKQQFVPETSRYKVGLGQDLVQFYSITWRRYESKAT	88510	79131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_-_79100_88500
919607	contig_15518_pilon	+	3307	1	Intergenic	novelGene_127627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAATAGTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36283	39590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_36300_39600
919608	contig_8075_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_42494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674122	673134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_673100_674100
919609	contig_5419_pilon	+	3099	1	Intergenic	novelGene_15525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAATAAAAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268612	271711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_268600_271700
919610	contig_1107_pilon	+	1490	1	Intergenic	novelGene_126551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTAGTTGATTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205713	207203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_205700_207200
919611	contig_9468_pilon	-	1780	3	Intergenic	novelGene_59524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1360	1686	680400	515155	FALSE	35	AGCCAATTCCAACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNYLFCKPSPEVQLKKKSTIAEMKNSLEGLNSRFELAEGRISEPQYSSIEIIQSEVRNIECTGRKYRKSILHDHTTAIYPDPDLYYRPIIAASSKPCFSGIIHNLAH	683137	515060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_515446_680364_680942_682319
919612	contig_20662_pilon	-	3693	1	Intergenic	novelGene_177645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	7	315	53540	53232	NA	55	ACCTAAAAAATTAACAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWMSEETLKLAREHRLPKANGRNDEVKQLKRRFQSAAPEDKVKFYNEMYKDLELEKPKGKNILGVSEAERTEEKVQALVATLKDIEQCRKHQKKMEGIHSHCTK	53546	49853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_49900_53500
919613	scaffold_12124_pilon	+	1558	4	Intergenic	novelGene_22382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1935.24313717941	23	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	742	1386	1508643	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497069	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506687_1508010_1508646_1508763
919614	contig_12402_pilon	-	2884	5	Intergenic	novelGene_133346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	6.10327780786685	104	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	697	2094	507	2600	250345	239541	FALSE	50	TGCATACAATAAAATACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVIFSQEEWALLDLTQRKLYRDVMLETFRNLASVVSRNLDGERLSSEHIMVQFMKNNTWSYVLGKISKSYGSKNQHKNQKKHLRSHTVQNFCESNKGRQPGKTFSQIPDQTVLKRNPPEGNPFECCECGKAFMDHSSHNHHARSHSGCNTCQSKECGESCSCPHLTIPIRALTGKKLHKCKVCGKGLICISTLKNPVTTFTGEKRYECSKCGKGFCSLLSFWTHVRGHRHECKECCKAISHPSSLISHKKICNRDKLYECKECGKAFSQASSLTQHVRIHSGERPYECIECGKAFSQSAHLTQHIRTHNGQRPFECKQCGKTFIQASSLTQHIRTHNGQRPYECKECGKAFSRASFLSIHIRTHIGVRPYKCKQCEKAFRQSSHLTKHMRTHSGERPYECKQCGKMFSCSYYLSEHIRTHSGEKPYKCKQCGKAFRRSSHLTTHIKIHSGERPYECKECGKAYRQVSHLIKHTRTTHSGERPYECKECGKAFSDSSNLPRHVRTHSVERPYECKECGKTFTHSSYLSEHIRTHSGERPFECKECGKAFSYSSHLTKHMTTHSGERPYECKECGKTFTHSSYLSDHIRTHSGERPFECKECGKAFSYSSHLARHITTHSGERPYECKECGKAFCHSSHLTRHIKSHSGERPYECKECGKTFSHSSYLSGHIRTHSGKSSQKWGVSSLLL	257596	239256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_241357_241933_242082_243053_243181_250342_250591_257335
919615	contig_12239_pilon	+	2295	8	Intergenic	novelGene_170470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_7	56.9733199284847	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	180	890	24698	74567	FALSE	30	GTTTTAGAAATCTGACGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQRKHLVKDFNPYITCYICKGYLIKPTTVTECLHTFCKTCIVQHFEDSNDCPRCGNQVHETNPLEMLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQELERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENSYPMVLQYRPRIDFG	24518	75972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_24810_45246_45344_47054_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_74519
919616	contig_709_pilon	+	379	3	Intergenic	novelGene_57665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_1	45.5	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGCTTATCGAGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3911266	3924360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_3911317_3921891_3922071_3924210
919617	contig_8673_pilon	-	3481	2	Intergenic	novelGene_129910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	903	1241	150970	150632	FALSE	70	TACAATAAAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLQIPFFQQRKQWLYLWTLPDGIHRNQFDYICGKRRWKSSISSVRTRPGANCGADHQLLICTFELQLKKIRTSLQEPKYDLEYIPPEYRDHLKNRFDALNTNDRRPDEL	200187	148391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_151828_200142
919618	contig_16999_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_84985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAGGTAGAGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107451	108755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_107500_108800
919619	contig_7057_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_123390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAGAGAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1205078	1207102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1205100_1207100
919620	contig_9609_pilon	-	909	1	Intergenic	novelGene_23160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATACAAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	808467	807558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_807600_808500
919621	contig_15518_pilon	+	2526	5	Intergenic	novelGene_127592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	264.647288858208	3	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	585	704	15096	15988	TRUE	60	GGGAAATGAAAAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGPIT	11046	39584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15974_16139_37265_37389_38035
919622	contig_12586_pilon	+	2969	3	Intergenic	novelGene_121811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1024	2010	178153	188675	TRUE	20	GTCGATGTCACTGAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLMPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKEEPTDWEKIFGWYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKRAKEMNRHFTREDIQAANRRMRKCSRSLAIKEMQIKTTMRYHLTSALLAQIKNTGNSKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICPPMFMAALFIIAKKWKQSRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIVLSEISQSQKDKYCMRPLL	177129	190130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_+_178211_187746_188767_189262
919623	contig_2480_pilon	-	1009	1	Intergenic	novelGene_63502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTCATTATTTTGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33003	31994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_32000_33000
919624	contig_3409_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_172301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	325	624	16091	15792	NA	45	AAGCATACATGCATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDGSDWEHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPESMTPRHPFSSVVNSLPRFTIQPGSGQPHKTKWD	16415	14257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_14300_16400
919625	contig_9463_pilon	-	3681	1	Intergenic	novelGene_83805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	3267	3605	27088	26750	NA	10	GGACTTTGTCTCTTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPCLLLVSFIIQRSWYLLLPEHISSTLPLATLLQPYLLLLLECTKLISTSGHFHLLFPGLLLNSFLVLFKCLLKWNLCREAFGDHPISNILPTSIPALSRIFPFRALTVT	30354	26673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_26700_30400
919626	contig_13481_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_119301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAGTGGAGGCATTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246278	243577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_243600_246300
919627	contig_6885_pilon	-	3873	2	Intergenic	novelGene_83701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2813	3409	283773	283177	TRUE	20	TGGACTGACACAGTGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKLLYSIITITSKILLKIINKQLQQYVDEELPEIQARFRRGRGTRDIIADVRWILAESRKYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDHKKLWITLQRMGIPEHLTVLMKNLYIDQEAVVRTEQRDTVWFKVRKGVHQGCILSPYLFNLYAEQIIGEAGLYEEELGIRIGGRLINSLCYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSL	286585	282622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_282740_282829
919628	contig_11171_pilon	+	1562	7	Intergenic	novelGene_48546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1694.37426175237	1679	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	261	563	51117	64959	FALSE	5	CCTGCAGCTGTGTGTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDPPPMIQYACLPNLDCVGHPKERCFAF	41851	65958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52109_64877
919629	contig_5649_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_82340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATTCCATTTTCGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564998	565787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_565000_565800
919630	contig_7057_pilon	-	851	8	Intergenic	novelGene_123222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_7	37.0548407699965	682	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	31	693	539698	537131	FALSE	5	GCCTGTGGGCTGGAGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRLHNKPTFSQTIVLLNLYRNPQNTAQTADGSHCHVSDVEVQEHYDNFFEEVFTELQEKYGEIEEMNVCDNLGDHLVGNVYVKFRREEDAERAVTELNNRWFNGQAVHAELSPVTDFRESCCRQYEMGECTRGGFCNFMHLRPISRNLRRQLYGRGPRRRSPPRSHTGHRPRERNRRRSPDHRHGRF	539728	536972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_537216_537519_537616_537717_537852_538028_538128_538201_538252_538336_538404_539420_539509_539654
919631	contig_6048_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_73151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCATATCCTTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1052367	1053840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1052400_1053800
919632	contig_14925_pilon	-	1127	3	Intergenic	novelGene_55342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336	26	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	77	523	116065	112704	FALSE	5	GTGCACTTGCCTTTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGSMRKISPGRKRVHVLLPKHEMFCPTQHHICPKLTFLSPHLVHVPPTTLELVMGGGIVPNFQPFWFS	129477	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112903_115817_116101_129436
919633	contig_1154_pilon	+	3406	8	Intergenic	novelGene_87086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_1	199.127689522813	10	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	961	2883	522	3404	439267	468190	FALSE	35	AGGAAGTGATGTCAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRMIQQFAAEYTSKNSSTQDPSQPNSTKNQSLPKASPVTTSPTAATTQNPVLSKLLMADQDSPLDLTVRKSQSEPSEQDGVLDLSTKKSPCAGSTSLSHSPGCSSTQGNGENSTEAIAVDSNNQSKSPLEKFMVKLCTHHQKQFIRVLNDLYTEAQPGTEDLLRSDSATMEASTCSAGCAQLSSKHKEKDAMCLDMKSPTSADLFIDPSGSHSSLHLTEQTLKEPPPETNSVDGRENALTIVQKDSSELPTTKPNTGSSMDSSTLGYLTASNSSSLNFHHISKNMEGQTTGQEQDISAKVCEDGKDRMQSSALAESLIAVKVASENSEEGNSCIVPQRNSVKALSEEAWDSRFVGDLPSTADKENALQCSSKTPLCQDLEANEQDARPKQENHLHSLGRNKVGYHLYPSDKGQYDHSKDGWLAPSAMPAVHKASNGHSRTKTISTSIKTARKSKRASGLRINDYDNQCDVVYISQPITECHFENQRSIFSSRKTARKSTRGYFFNGDCCELPTVRTLARNLHSQEKASCSTLASEAVVTPKPTLTISAPRPTVDVHLPREDSPKEPSKEMTSLKEGGRNTSSEKGSQEPEVCSIMDKLNQSSSPRSKEMIVSSLVWPFSVHLPEEGTPEGSSTISALTASRVSSHEQDQQPVELLDTEEMSAPQDCHLVPSTESISEGSRTEVRSSPKTVNREESPLCSENQSPSVDLEPPVSLGKAEDNERISSESETRICPKAQTSVSPAAQTSISPGVEKSVSPGTETSISPSAETVVTPEAQTNVIPEAQTIVGPGIEGSVSPGVETNVSPKAETNISPGAETSFSLGVETSISPGAERSVTPEPQTSLGPEAQTSIIPGVKISISPGVETNVSPKAETSVSPRVETSISPRVETSVDPETQTSVSPGVETNVSPKAETSVSPEPKIEDAQELSTHLLLRENSVFTNENPSEVEESEAAGDTGKLE	330755	468192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_330874_331888_331963_389032_389099_389755_389836_434841_434975_439216_439505_442410_442505_465639
919634	contig_13004_pilon	+	3163	17	Intergenic	novelGene_112623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGTGATGAGCATTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194125	220755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_194243_194584_194666_194779_194890_198643_198745_200057_200215_200710_200759_201713_201817_206282_206336_208515_208641_209953_210021_210138_210260_213211_213278_213965_214079_214259_214319_217494_217680_219013_220529_220613
919635	contig_10446_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_162469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTAAACTTTCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644411	643167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_643200_644400
919637	contig_13158_pilon	-	487	1	Intergenic	novelGene_107283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAGTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91796	91309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_-_91300_91800
919638	contig_753_pilon	+	1764	8	Intergenic	novelGene_113010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACTCAATTACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1348414	1363514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1348452_1354812_1355025_1356199_1356312_1358352_1358507_1359927_1360100_1360849_1361025_1362329_1362435_1362717
919639	contig_4900_pilon	-	1870	7	Intergenic	novelGene_159075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	135	662	1188120	1181643	TRUE	65	ATCTGCAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188254	1180002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181189_1181620_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
919640	contig_8228_pilon	+	3226	23	Intergenic	novelGene_81777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	45.6436068138267	33	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	952	2856	370	3225	29053	108393	FALSE	30	AGTTCAGTCGCCTGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYCLDPKTKELPHLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYGEDIINAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSTSEANVEEKVLASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMRTYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKSPEFKMLQLGDANFFHYTKQGGSPVIEGVDDAKEMAHTRQACTLLGISESYQMGIFRILAGILHLGNVGFTSRDSDSCTVPPKHEPLTIFCDLMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFTWIVDHVNQALHSAIKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIESKMGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEKPRLSNKAFIVQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAISPTSATSSGRTLLTRMPAKLNKGRPGQAAKEHKKTVGHQFRNSLHLLMDTLNATTPHYVRCIKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMKQKDVLSDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRGWLLRKKYLRMRKAAITVQRYVRGYQAWCYATFLRRTKAATIVQKYWHRYVVHRRYEITRAATVVLQSHLRGYLARNRYRKILREHKAVIVQKWVRGWLARTHYKRSMHAIIYLQCCFRRMMAKRELKKLKIEARSVEHYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLVEKLAHLEAIYNTETEKLRSDLERLHLSEEEAKVATKRVLNLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKSIEESADRYRQETEQLVSNLKEENTLLKQEKETLNHLIVEQAKKMTETMEKKLIEETKQLELDLNDERLRYQNLLN	14004	108394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_14119_26733_26906_28969_29115_41936_42094_47547_47692_48441_48524_49137_49246_51172_51280_61647_61914_63297_63380_69531_69673_71359_71486_72784_72869_82261_82424_83363_83462_87108_87196_88070_88180_91154_91367_92647_92805_96891_97132_99790_100040_102701_102796_108304
919641	contig_16724_pilon	-	5919	3	Intergenic	novelGene_105284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	1274	2005	615349	517165	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPGHLIVLMRNLYVDQDAVVGTEQRDIVWFKVRKGVCLGYILSPYLFSLYAEQIIQEAGVFEEEQGMRIGGRLINNLCYADDTTLFAESQEDLKHLLMKIKDHSLQCGLHLNIKKTNILTTGPISNIMINGKKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRHIALGKSAAEDLLKVLKSKDVTLKTKVHLTQAMVSSVISYAWESWTVTKEVQRRIDAFELWCWRRILNMPWTAKRMNKSASE	617140	513250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_517477_614929_615597_616114
919643	contig_11335_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_104914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGCAAATTCACAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331232	329004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_329000_331200
919644	contig_5698_pilon	+	2071	6	Intergenic	novelGene_55006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	951.046076696603	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	20	631	4103	19370	FALSE	25	GTCATTCATACTATCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVKNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8030_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
919645	contig_12948_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_126208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250330	247893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_247900_250300
919646	contig_1867_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_54568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	196	303	449733	449626	NA	25	TATACATTCCATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RESQSHNTAGNCGKRLSSASANTLRNSVGTFKRHFCSPPSGIHCRNTKKENLTQKEQEANENKLGMLKSLKLCTGKQSKIDNFNLNIPELKETLILEHLP	449928	448000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_448000_449900
919647	contig_8571_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_169161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	227	684	553	1236	371369	370686	NA	15	GAGGAGGCCAGGCTCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRLLCLHNHLGSVTSQSLELQVPWREARPKRPCPQGATASDTQHEGGSWGGALTSACEARAGGFCTHRPHRHSPGCKGQPEGWGGGSWSPTVRHRPIWAQPGDTQRSLWGLKAVGKAGPILRRGVERCSSLTPPQKAGGLEGWGRQPLFTPKQRQACAGFWPLTMACSIRVSQPLTGPLPTGISGERPPHHLDPPGHTSSPPLQTARQGRDRGRASSQASPQHQP	371921	369070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_369100_371900
919648	contig_7657_pilon	+	6153	5	Intergenic	novelGene_30042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	208.147183502444	8	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1105	1683	268689	296533	FALSE	50	TTAAAGAACACACTCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMYSRVKRRRKSLRRNTYGIQNHHEVSTEGEEESQEEDGDIEVEEAEGEENDRPYNLRQRKTVDRYQAPPIVPAHQKKRENTLFDIHRSPARRSHIRRKKHAIHSSDTTSSDEERFERRKSKSMARARNRCLPMNFRAEDLASGILRERVKVGTSLADVDPMNIDKSVSFQNVFLDIAFFKTFFLVPKTKK	267584	301003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_268789_271571_271689_274530_274607_294983_295083_296346
919649	contig_6551_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_155552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2	349	341081	341428	NA	65	AAAAAGAAAAAAGAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGEPCREGECLPPGGGPVPGWQTDQIGGPGVFVESREGVLTLCIHSCIHLASQTASQQIFECLRSAGLCLEAWANKTNVVPSLVPKAPQVNYNVLSIVTRKFGVVRKDSHVPRAV	341079	343247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_+_341100_343200
919650	contig_6740_pilon	+	2144	2	Intergenic	novelGene_142658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAATACAGTACCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62327	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_62804_63169
919651	contig_4884_pilon	-	3909	1	Intergenic	novelGene_63786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAATAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170497	166588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_166600_170500
919652	contig_20722_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_178109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAAAAATAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10898	12664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20722_pilon_+_10900_12700
919653	contig_15093_pilon	+	2086	12	Intergenic	novelGene_143290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	135	junction_11	117.634607265236	6	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	147	1610	40201	68134	FALSE	45	ACATATATATTTACCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDFNYGPWADRQRDCLWKFFFPPDYQVLKVSEIAQPGRPRQILAFELRMNIIADATIDLLFTKNRETNAVHVNVGAGSYLEINIPMTVAENGYTPAIKGQLLHVDATTSMQYRTLLEAEMLAFHINASYPRIWNMPQTWQCELEVYKATYHFIFAQKNFFTDLIQDWSSDSAPDIFSFVPYTWNFKIMFHQFEMIWAANQHNWIDCSTKQQENVYLAACGETLNIDFSLPFTDFVPATCNTKFSLKGEDVDLHLFLPDCHPSKYSLFMLVKNCHSSKMTHDTGIPAECQSGQKTVKPKWRNITQEKAGWVECWTVPSVLLTIDYTWHPVYPQKADEQLKQSLSEMEETMLSVLRPSQKTTDRAVCSPSASSRPPIDPSELPPDKLHVEMELSPDSQITLYGPLLNAFLCIKENYFGEDDMYMDFEEVISSPVLSLSTSSSSGWTAVGMENDKKENESSAKSIHPLSLRPWDITVLVNLYKVHGRLPVHGTTDGPECPTAFLERLCFEMKKGFRETMLQLVLSPLNVFVSDNYQVM	36499	68610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_36540_40094_40252_40854_40934_43500_43593_44994_45113_49898_50055_50314_50413_52151_52331_52485_52593_54048_54258_66948_67177_67987
919654	contig_6433_pilon	-	4420	5	Intergenic	novelGene_162760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1963	2277	186347	186033	FALSE	70	AAAAACAGAAGAAATGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSLLPVATVSWLGNTLVSLGFHLPTLAGSLSAFCWLLLLFSTSLDFFLIAHHLRLLSLKYLALCTIFASSGKAAKHCWTVKLLPGLCCHAGRTPRAFLFVCLL	374689	183889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_-_187003_237173_237813_316486_316562_344908_345187_374374
919655	contig_15327_pilon	-	2057	2	Intergenic	novelGene_70584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACACCTTAACACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817020	814670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_815090_815382
919657	contig_8377_pilon	+	2432	2	Intergenic	novelGene_35096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTTCCTAGGGGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144592	147360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_144684_145019
919658	contig_15866_pilon	+	5671	1	Intergenic	novelGene_63657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCATTTAAACTAAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561623	567294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_561600_567300
919659	contig_15047_pilon	+	1368	6	Intergenic	novelGene_52241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3077.58024428284	6	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	276	740	3242	4413	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGHTEVLGSGLLPSGYHPDLAAGRGGPDPGRGACGDQACGGWDLPEVGSHCGALWRGAKIHMSCAARGAD	2570	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4204_4434_4552_4687_21013_21062_21232
919661	contig_8843_pilon	-	2287	2	Intergenic	novelGene_156637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGGGTTTGGTTTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12811	7549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_7571_10545
919662	contig_4604_pilon	-	1199	1	Intergenic	novelGene_19196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCACTTCTCCAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538127	536928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_536900_538100
919663	contig_4232_pilon	+	237	1	Intergenic	novelGene_63426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACCTTATCTGCGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467826	468063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467800_468100
919664	contig_6102_pilon	-	3772	3	Intergenic	novelGene_31741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1040	1435	214659	214264	FALSE	20	ACATCAGCGGCCTGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQMRKLELREAGDFQKQVISGGAQAPAQVPHGRALTCLSGFLLFHFFLHTLPYNLTGLLSVPQARQVLPCLRAMRFTVLSAWNPLPHVWQVQLLVSAEMSAPLRDFPDHAIHCTFFCFLHRTNHNGKLSC	216247	211926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_215424_215524_215706_216153
919665	contig_4732_pilon	-	2092	2	Intergenic	novelGene_75466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698690	696232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_697277_697642
919666	contig_8663_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_58015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGATGTCCAGGTCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306352	304461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_304500_306400
919667	contig_14513_pilon	-	1267	3	Intergenic	novelGene_70234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	62	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	198	566	18880	11982	FALSE	10	GCTTTTGTCCATGTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19077	11280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
919668	contig_11677_pilon	-	2172	7	Intergenic	novelGene_85903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	15.9730676104776	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1063	1677	486107	484850	FALSE	10	TTCTGGTTCTCACTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKVDCLKQKSVLLNLTAALTEGVVNGKKLKMKQAFRSHTPSTHRPSPEAKGSDTQPVGGSQRTGWPHFQEIFMLSALSQEDVKTLKQYLLAQARPGPWEFHSGVLTTQTPEEICANIIREKLLQYLPQEVPYNVQQRTEVWEEGPSGQLVIVQKLLVSKESHVGILIGQKGQLIAQIAQEAGRDLMDIFLCDVQLHLSVKLLK	488593	484354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_484973_485082_485164_485284_485435_485755_486008_486098_486638_487052_487131_488139
919669	contig_10904_pilon	-	1256	6	Intergenic	novelGene_22728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	408.447107958913	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	24	509	662714	660357	TRUE	25	TGCTAAAGCCATTCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAPPRTMGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGQLHHEPCELSPCGDLQVLQLTQHISLPVVTTQ	662737	650767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660458_661462_661763_662408_662445_662665
919670	contig_17144_pilon	-	1508	9	Intergenic	novelGene_29399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2058.14139076376	17	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	289	1428	174965	166152	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183398	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166430_172558_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174985_181820_181850_183158
919671	contig_3787_pilon	+	1992	2	Intergenic	novelGene_102447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGATTGTTGCAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734680	737473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_736619_737419
919673	contig_14326_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_120710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328776	327617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_327600_328800
919674	contig_1596_pilon	+	2115	1	Intergenic	novelGene_131584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGGATTGTTAGGGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81254	83369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_+_81300_83400
919675	contig_2069_pilon	+	2257	11	Intergenic	novelGene_23244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	297.027422976398	3	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	706	1422	341330	343975	FALSE	15	TGACTACTGATGTGGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323990	344810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_333963_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
919676	contig_17171_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_147350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAATACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47098	47883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_47100_47900
919677	contig_6137_pilon	+	4283	16	Intergenic	novelGene_59217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_12	1115.55438335485	2	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	626	1881	1531	3411	1313581	1353702	FALSE	35	AAAAAGCCTGTTTGTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYEVFMHFNLKLMLLLLIFFPPHSMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1312050	1354574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
919678	contig_6710_pilon	-	346	2	Intergenic	novelGene_98301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	1	345	657520	653586	FALSE	20	GCTTCATCAGGGACGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVE	657520	653584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
919679	contig_15732_pilon	+	4458	1	Intergenic	novelGene_88849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTACACTTACCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12904	17362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_12900_17400
919680	contig_10371_pilon	+	2583	10	Intergenic	novelGene_175463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_9	20.1463779178759	88	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	450	971	27180	58222	FALSE	25	CTATAAGTGTATGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPGEVSKKSSDGSFKDSKAELETESSTRASRSLTTKTSKRRSRNSVEGDSPPSDAEGDIGPTGQEKSEVSDNSEIPNELSSSLRRLPRPGSARPAPPRVKRQENAEVLTVDRTGSGKAVSNVIVDSQNSDNEEDDQFVVEAAPQLSEMSEIEMVPAVELEEEEKHGGLVKKILETKKDYEKLQPSAKPGEKEKSLVYESAWKKEKDIVSKEIEKLRMSIQTLCKSALPLGKIMDYIQEDVDAMRNELQLWRSESRQHAEALHKEQSITDCAVEPLKAELAELEHLIKDQQDKICAVKANILRNEGRIQKMVYSTSLSSRR	10062	59834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_10137_11172_11249_24885_24910_25842_25928_26581_26666_27073_27198_27418_27456_28901_28979_54507_54732_58056
919681	contig_20373_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_178998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	210	542	18657	18989	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKSNTCSPQTAPKEPPAPARGIQAACSSEPRARGPGKQRSKRTKAPGCNQCSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGT	18447	19057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20373_pilon_+_18400_19100
919682	contig_11285_pilon	-	2888	2	Intergenic	novelGene_5727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	816	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGTCTAACTCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859337	854662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_857144_858930
919683	contig_10953_pilon	+	2297	1	Intergenic	novelGene_42601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGCAACTCAACCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461262	463559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_461300_463600
919684	contig_15039_pilon	-	2049	6	Intergenic	novelGene_110152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_4	443.539130179063	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	252	689	200602	197500	FALSE	75	AATAATGAAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQETNHSQVPMLCSTGCGFYGNPRTNGMCSVCYKEHLQRQNSSNGRISPPDKVLDCPEYRITNMKCGTLTATSVSSLSESLPVQCTDGSVPEAQSLDFTCSSMQPSPVSNQSLLSESVASSQVDSTSLDKAIPETEDLQGLCMN	208514	196139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_197618_198506_198673_200448_200620_201176_201237_202795_202857_208401
919685	contig_15613_pilon	-	2658	8	Intergenic	novelGene_147199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_4	61.9209502642898	46	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	537	2012	111581	84124	FALSE	30	TATTCTAAGTGTAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHVIARDYGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVIFNCSCRDVIGWTSGLMSIKVFYERGECILLSAVDNCAEDVREIVQRLGIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHDDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPAAVQPLSRASPVPGTPDRLQCQQLLQQAQAAIPRSTSFDRKLPDGTRSSPSNQSSSSDPGPGAGGGHWRQQVAYDGCQSPLLLDHQGSGPLECEGAREREDIMEGSRHPETKWHGPPSKVLSSYKERALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSNTSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTTPCMPTSILGPLHLTGSRSMIHSRAEQWADSGDISGPDGEQVKMYAVHNYASAISVSNTAEGSMGDLSEVSSHSR	117885	83477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_84517_86299_86404_86790_86892_88386_88474_90800_91062_107156_107432_111326_111904_117671
919686	contig_14182_pilon	-	3519	7	Intergenic	novelGene_76180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	478.285276331559	110	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	128	1048	69537	57708	FALSE	15	CGACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIAFNTPTALQKEEARQDVEALVSRTVRAQILTGKELRVATQEKESSSGRCMLTLLGLSFILAGLIVGGACIYKYFMPKSTIYRGEMCFFDSEDPANALPGGEPYFLPVTEEADIREDDNIAIIDVPVPSFSDSDPAAIIHDFEKGMTAYLDLLLGNCYLMPLNTSIVMPPKNLVELFGKLASGKYLPHTYVIREDLVALEEIRDVSNLGIFIYQLCNNRKAFRLRRRDLLLGFNKRAVDKCWKIRHFPNEFVVETKICQEYYINYSFRRIPRGAVVKPWLLSKGRQFEPTSSSTGERCGSLLQ	69664	55236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_57841_59086_59172_59320_59472_64721_64833_65076_65275_65549_65682_69426
919687	contig_15152_pilon	+	2249	1	Intergenic	novelGene_126959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103803	106052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_+_103800_106100
919688	contig_16775_pilon	+	2269	16	Intergenic	novelGene_107781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	221.708056286239	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	132	1538	134135	174136	FALSE	40	TTAGAAAATGAGGATCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130802	174867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130872_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
919689	contig_1996_pilon	-	2170	1	Intergenic	novelGene_131861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1619	2008	58038	57649	NA	45	AAACTCATTTAATTCAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQRLYQPEPERTRWCLATTIDSSDRYHNRESRTEREKNVEQISNSQKKTRLTGLTETGGTPETMAPGQPANSELKPFPKSTFQPKIRQTYKTITHMRNVLLLSSIKYMRSNGQHLPKDEKAGRDRKTG	59656	57486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_-_57500_59700
919690	contig_3866_pilon	-	3274	1	Intergenic	novelGene_112386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2754	3245	141287	140796	NA	50	GGAAATAATGAGAATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLNATINQLDLMDIYRTLYPIAAKYNFFSSAHGTLSRIDHILGHKASLNKMQSIEILQSIFSDPKAIKVEINKRKSKEKESNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGIKKFIESNENENTSYQNLWDTAKALLRGQFLAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEHVERE	144040	140766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_140800_144000
919691	contig_2799_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_85499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATATTTTTGCCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582465	585420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_582500_585400
919692	contig_10023_pilon	+	3840	15	Intergenic	novelGene_123459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	14.6700096684859	97	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	331	1587	46607	51615	TRUE	5	GGTGTGCATGTCTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKIALGLGIPASVTVVYILYRRYRESREERLTFVGEDDIEVEMRVPQEAVKLIIGRQGANVKQLRKQTGARIDVDTEDVGDERVLLISGFPVQVCKAKAAIHQILTENAAVSEQLSVPQRSVGRIIGRGGETIRSICKASGAKITCDKESEGTLLLSRLIKISGTQKEVTTAKHLILEKVSEDEELRKRIAHSAETRVPRKQQISVRREDVTEPHGGGDPALWENATCGTEQAVPLVVPPHRGGGDMAAIGLPPEDGSGAKANGDGFEEESAAQASPEMSMFEIPSPDFSFHADEYLEVYVSASEHPNHFWIQIIGSRSLQLDKLISEMTQHYEHSPPEDLAVQVGDIVAAPLPANGSWYRARVLGTLENGNLDLYFVDFGDNGDSPLEDLRALRSDFLSLPFQAIECSLARIAPLR	30038	54666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_30092_39926_40142_46544_46692_47359_47467_48077_48268_48979_49120_49191_49523_50590_50752_50937_51111_51314_51381_51611_51764_51977_52080_52337_52435_52600_52693_52852
919693	contig_9345_pilon	-	2349	1	Intergenic	novelGene_24452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATGGGCAAGAATGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	439998	437649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_437600_440000
919694	contig_11989_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_68468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218277	216070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_216100_218300
919695	contig_6446_pilon	-	2662	1	Intergenic	novelGene_149198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGGCAGGGAGAATCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255263	252601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_252600_255300
919696	contig_1723_pilon	+	4786	1	Intergenic	novelGene_165525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3958	4281	14837	15160	NA	70	AAAGAAAAAAAAAAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMRMCRSRIGGHVWAPLNCCLDSPTLWLNEQGEMFSTSCLQRDINVAGQVSGASQGAPATARHSGSSARREPSPAKKNILGSFEDVKPFWVITFYLPKFRQTTKLQ	10879	15665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1723_pilon_+_10900_15700
919697	contig_8241_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_157483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	477	384	860	146153	145677	NA	65	AAAAAAAAATAATTCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEKMHKFLETHYLPKLTQTEVEQLNKPMTKEEIEKVILKLPTKKGLGPDGFTGEFYQTFTEELTPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEASITLIPKPGKDTTKKENYRSISLINIDTKILNKILANRIQQHI	146536	145676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_145700_146500
919698	contig_11816_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_98606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATTAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1476777	1477960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1476800_1478000
919699	contig_10225_pilon	+	2007	14	Intergenic	novelGene_86816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	2	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	1107	1892	42707	47636	FALSE	20	ATCCTAGACTTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20700	47751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42606_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46550_47404
919700	contig_10225_pilon	+	2075	13	Intergenic	novelGene_86820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	519.760274603163	3	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	1023	1817	42707	47494	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERLQELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	20736	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38566_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46745_47394
919701	contig_2940_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_81964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGCAATGCAGACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035950	1033860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_1033900_1036000
919702	contig_16632_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_154147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	712	1110	198154	197756	NA	30	TAATTTCAGTTCTTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGTRGKGGGGGERQARNPKKQGEKKKSNTSSQQVAPREPPAWVCGIQAAEASRSRDRGHRKQRRLSRGEEGCFVSRWTLREAAFLYPRLLVSDRSPRWWIRVALAGRGPLHESLLTLHSLSVFSLHLVLG	198865	196359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_196400_198900
919703	contig_12837_pilon	-	3245	1	Intergenic	novelGene_57398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTAGACTAGATGTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435176	431931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_431900_435200
919704	contig_8552_pilon	+	4581	1	Intergenic	novelGene_80073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	807	1229	447011	447433	NA	50	AAGGTAATTAAAAAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIKRKSYTADFKLKVVARAEETSNRVAASEFDVGESSIREWRKEKKELEKMNPRKRARRGPKAKWPELENDLKEWIISRREQNQAVSTVAIQIKAKLLANERGIPDFKAGFAWISKFMKRNGLSLRVRTTVGPQLPDD	446204	450785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_446200_450800
919705	contig_10466_pilon	-	3001	2	Intergenic	novelGene_173631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	674	991	308270	307953	TRUE	5	CTTTTTTTTTTGTTGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRVALLPKMWSILENIPCALEKNVYFASVGWSALYMSVSSSWLIVAFRSSASLLSFFLDVLSLTKSDVLKSPTIIVELSISLFGAVKVCFMYFGTLSLGA	308943	196632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_198129_307438
919706	contig_4091_pilon	-	4527	3	Intergenic	novelGene_173008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	596	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2471	2773	56589	56287	TRUE	20	GCTCTTAACCACTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	61883	10820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11291_55002_57252_60075
919708	contig_13945_pilon	+	1342	2	Intergenic	novelGene_173448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCAGTTTGGCTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662	122715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_1039_121749
919709	contig_12677_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_110726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
919710	contig_9836_pilon	+	1422	1	Intergenic	novelGene_176153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCATTGTTTGTGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7770	9192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_7800_9200
919711	contig_12923_pilon	-	4284	3	Intergenic	novelGene_30176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2872	3189	324752	324435	TRUE	35	TCTACTCATATCTACACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFRTFIAREKSMPGFKTSTDRLTLLLGANAASDFKLKPKLIYHSENPRALKNHAKSTPPVLSKCNNKAWMTAHLFTTWFTEYFKVTVKTYCSEKKDSFQNITSY	327623	319679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_319803_321672_321980_323769
919712	contig_10581_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_41391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTACATTTATCTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594890	596825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_594900_596800
919713	contig_7816_pilon	-	489	1	Intergenic	novelGene_66477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTGGGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157905	157416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_157400_157900
919714	contig_8587_pilon	+	5588	3	Intergenic	novelGene_159137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCAGTTGTGAATCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457577	486856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_457765_481294_483991_484151
919715	contig_13780_pilon	+	2833	11	Intergenic	novelGene_149089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1651	2100	727457	775105	FALSE	20	CATGAGTATTGTCTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCQLHFCKVPLADCFQQSVVSDVRLFICTGSYRVSTASSGAPSSRGNFLTPISVGCVQFWRAGVQILYHWAKTKCGGTVLSPGSRGESPFSCWWLSGCRHSLVRGCVTPEASVVTVPFPLLSVCPSNPPLPPSEKESCKGALRWIPFT	675899	775838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685834_686093_686214_686409_686640_694785_694856_699199_699267_702164_702217_727438_727631_774829
919716	contig_4364_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCGACTGGCTCCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532776	1533314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
919717	contig_10451_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_138337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCACAGCAATAACAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522460	521269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_521300_522500
919718	contig_11825_pilon	-	1188	4	Intergenic	novelGene_155399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCCATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21941	18406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_18699_20047_20254_20394_20492_21348
919719	contig_3956_pilon	+	2033	12	Intergenic	novelGene_15012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1470.10966589301	10	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	81	1028	1281682	1287503	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFEPRTPPTCPSWWRA	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285721_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289536_1290542
919720	contig_9099_pilon	+	4361	3	Intergenic	novelGene_149907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	201	junction_2	7.5	55	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1002	3358	4359	326318	327319	FALSE	55	CGGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIKKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVMDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTTHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGRFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTT	317531	327321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_317612_319277_319357_323119
919721	contig_6710_pilon	-	500	1	Intergenic	novelGene_97400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	70	AAAGAATAAAAATGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
919722	contig_504_pilon	-	4535	2	Intergenic	novelGene_54440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTGAAAAAAAAAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237110	231715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_231950_232809
919723	contig_3602_pilon	+	841	2	Intergenic	novelGene_60518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAAGGGAGGGGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169550	170924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_170158_170690
919724	contig_9609_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_22967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAACCAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257676	259214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_257700_259200
919725	contig_12312_pilon	+	2605	12	Intergenic	novelGene_63954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	327	2278	2604	278138	326161	FALSE	15	CTCGCAAGCCAGGGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVACLSSKSDPRWFEQSLFQPDEIADGRLHRGHRRGEVRDGFAVHLALLVHDHQVRDLLRHRLQDALDRARMKHRHRGGWRGGEPRATENWDRRRGEREQTQTRSSEA	213838	326162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_214545_214601_215197_241473_241503_242253_242408_245860_246012_246884_246973_256293_256456_257907_258034_259774_259880_260265_260421_278131_278204_325900
919726	contig_1084_pilon	-	1524	2	Intergenic	novelGene_152383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGGCCCTTAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506278	504304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1084_pilon_-_505744_506193
919727	contig_9609_pilon	-	4288	10	Intergenic	novelGene_23029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1909	2346	325405	324968	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIWIKLLYYLSNTTRHIEKEGWNVCIIQSWLIGQERIILVQQNKVSPTVTSSVLRTTGLPESQADWRFDYTAGDSGTQQLLRWSSLLCLMRNTGIRESQGTDLQVKHLYLSLYMSVLNNLISTNPLNLQHFHFLIILLEFDIQS	333334	323025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330301_331386_331487_331563_331692_332692
919728	contig_20889_pilon	+	665	2	Intergenic	novelGene_127647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAACAAAAGAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43965	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_44063_44318
919729	contig_6946_pilon	+	1608	7	Intergenic	novelGene_59743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	50.8573713656361	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	858	751	1608	45050	45907	FALSE	45	AGTGTAATAGTTGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAISQNHEVFSMTAVSQNHEVFSMTAVSQNQPENLRQSTGCFKEESMPTSLLANFVDCQESNSESEEESGIPASLQGGMDPVALHQQKSDVDVPQWEVFFKRNDEITDDGLENFPSSAEAGASQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHISEQGSQGWDSQADTILLPSQERNCNDTTSLNKGGYRPRIKGNIPASQLEQNVLCPKDTYSDSRSRAQDVNIVPGVGEPTTISSGKNKPEEKWLLNPGTKADSQSSSDFEIPSTPDAELPKQEHLQYLYEKLATGE	1705	45907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_1810_12187_12325_13907_14042_28232_28288_35894_35984_38510_38647_44954
919730	contig_13244_pilon	+	1971	5	Intergenic	novelGene_86918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	642.061912902486	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	36	473	239761	252630	FALSE	55	AGAATAAGTCCCAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAAGETAAGKMADGKAGEEKPENPQRAGAAGGPEEEAEKPVKTKTVSSSNGGESSSRSAEKRSAEEEAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSSKPKETVPTLAPKTLSVAAAFNEDEDSEPEEMPPEAKMRMKNIGRTRSYGSEI	239725	254128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245131_245347_247045_247121_250878_250935_252602
919731	contig_16121_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_6868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAGAAAAAAATTACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34401	37073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_34400_37100
919732	contig_16703_pilon	+	8867	15	Intergenic	novelGene_72755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1570.00874331375	1	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	376	1653	15466	40668	FALSE	80	CAAAATAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	6830	47882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_6877_9183_9297_9928_10038_11233_11287_15411_15469_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_32938_32985_33016_38544_38758_40600
919733	contig_18415_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_118312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1799	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAGAAAAATAGAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10161	12935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_+_10200_12900
919734	contig_3270_pilon	+	2398	10	Intergenic	novelGene_104501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCCCCAATTTCGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356409	376995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_357763_359607_359770_360190_360333_362563_362731_365981_366145_367848_367890_369380_369479_370452_370584_375430_375548_376971
919735	contig_3747_pilon	-	3108	2	Intergenic	novelGene_24981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCACCCCCAGCCTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266259	262224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_262998_263924
919736	scaffold_19766_pilon	-	4111	2	Intergenic	novelGene_34460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1937	2326	902282	901893	TRUE	40	AACGGGACATCAGGATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALTGNTTESLLEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTEPGGTPESMAPRFSVNPALKPFLRPTLQRLDWTIGHKMILMKSVLQVDNMRLNGQLLSGGEMRRQGQELVEWTREIGWKAGMCCHSIGRAIRVT	904218	899929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_900810_900987
919737	contig_13547_pilon	-	1727	4	Intergenic	novelGene_104893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	128	junction_3	90.0925450115972	25	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	36	341	223705	176547	FALSE	65	GAAATAGAGAATAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNAIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQILFCSETIARCWYILLSGSVLMKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVRTLKNAELFYDILQFQL	223740	175160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_176674_196798_196883_221449_221507_223667
919738	contig_10299_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_79744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCATGAGAAACTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457420	458331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_457400_458300
919739	contig_7919_pilon	+	4093	1	Intergenic	novelGene_28083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	3364	3690	1103086	1103412	NA	60	AAACAAAAAGTCATCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSHHIKRQTMMASASSQNKEARNFLEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKELRQNTEQAKEHTDKAIEELKVIQEHNGKFNRLQESVDNKQKSRRLTIKFQN	1099722	1103815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1099700_1103800
919740	contig_11505_pilon	-	755	1	Intergenic	novelGene_140922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAATGTACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79335	78580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_78600_79300
919741	contig_18919_pilon	+	1862	1	Intergenic	novelGene_156034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAAAAAAAAAAAAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146879	148741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_146900_148700
919742	contig_4232_pilon	-	213	1	Intergenic	novelGene_63368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAATAGAAGATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467439	467226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_467400
919743	contig_5200_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_140163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCAGCATATTTAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341033	343341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_341000_343300
919744	contig_13718_pilon	-	5133	4	Intergenic	novelGene_142904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	201	434	261731	261498	TRUE	30	GTTAAAATGCTTAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVSGGLPKPALAGLFSQARDHAVSCPIQIYRESEVQKPLYSIGFPVPRPLLYCRDASITGTEFYVMEHVQGRKFCDFTIPRVSPTERLAIYVARIETLALLHSLMYSHCSWRDMVEKLGTTKDKYQPGQSNIKPQLIRTSLP	262033	254719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_255203_256434_256518_257364_261843_261944
919745	contig_21208_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_175782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAATTAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89692	88221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_88200_89700
919746	contig_1225_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_44209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAGCTCCAGGGACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276798	275552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_275600_276800
919747	contig_11055_pilon	+	6681	3	Intergenic	novelGene_142168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	140	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2713	3018	115514	115819	TRUE	50	CCAAAACTATATATATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPPTLLNLSISSSRFLTESLGFSMYSIISSANRDSLTSALPIWMHFISFSFLIALARTSSTMLNKCGDKGHSCLFPVLKGIVFSLSPLGMILAVGFA	112734	172705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_+_114426_114492_116188_169410
919748	contig_9099_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_149884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTGAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182721	184603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_182700_184600
919749	contig_10749_pilon	-	1284	11	Intergenic	novelGene_133462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	192	junction_1	944.614609245485	42	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	24	1217	154244	139545	FALSE	45	GAGAACCAAACAATTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVSLENAKPSSQAASVTIPDHLSINLSQPSTPSSSSSSTTTPSLATAGTSDAPSSLPNPLPTAPCVSSLLGMKPIPLLALNVVSAAKGTGASATTTTTSAVPCVTNKLKGEKQRYSPY	154267	139477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_139894_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_149595_149671_150658_150788_151767_151900_153558_153676_154232
919750	contig_709_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_57559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGACAATCCGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1570629	1573288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_1570600_1573300
919751	contig_12920_pilon	+	2021	1	Intergenic	novelGene_166352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCAAAAAAAACACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233250	235271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_+_233200_235300
919752	contig_4469_pilon	+	5027	1	Intergenic	novelGene_21911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	46	306	454450	454710	NA	30	GAGGTGAAATTTGTGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLSSGQSHQPYPLMQRQDVQQEDAEESTDPQEKTSFGPQGLPNFASPHSHLWRGMHLRPCCHPALLSPLPDLSMCPIAFPFSVDQQNTDVRWFFPGPLS	454404	459431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_454400_459400
919753	contig_20527_pilon	+	2684	5	Intergenic	novelGene_138575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	45	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	565	1191	13527	27453	FALSE	35	AATAATGACCATGCTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12962	28946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
919754	contig_11292_pilon	+	2340	2	Intergenic	novelGene_109430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	408	713	259894	260199	TRUE	15	ATCTTTGGCTATGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTERFRSEFFTSFITVGNLNCISSVRKPELCPVLACSSQNCLFILTLPPPFFITMQGMGSMKAIPNLFGIFGKKSNSLVKEFRRKKSAKKTRVVVVEVPK	259486	319556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_261395_319124
919755	contig_11422_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_99051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2092	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_2100
919756	scaffold_13609_pilon	+	2485	23	Intergenic	novelGene_124404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_21	201.607301783024	31	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	755	2265	219	2483	564647	619252	FALSE	15	TCCTCCTCCGAGGTCTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVDRTKLKKTPTEAPADCRALIDKLKVCNDEQLLLELQQIKTWNIGKCELYHWVDLLDRFDGILADAGQTVENMSWMLVCDRPEREQLKMLLLAVLNFTALLIEYSFSRHLYSSIEHLTTLLASSDMQVVLAVLNLLYVFSKRSNYITRLGSDKRTPLLTRLQHLAESWGGKENGFGLAECCRDLHMMKYPPSATTLHFEFYADPGAEVKIEKRTTSNTLHYIHIEQLDKISESPSEIMESLTKMYSIPKDKQMLLFTHIRLAHGFSNHRKRLQAVQARLHAISILVYSNALQESANSILYNGLIEELVDVLQITDKQLMEIKAASLRTLTSIVHLERTPKLSSIIDCTGTASYHGFLPVLVRNCIQAMIDPSMDPYPHQFATALFSFLYHLASYDAGGEALVSCGMMEALLKVIKFLGDEQDQITFVTRAVRVVDLITNLDMAAFQSHSGLSIFIYRLEHEVDLCRKECPFVIKPKIQRPSTIQEGEEMETDMDVADITMESSPGSSVSMEHRLDVELRASSSSSSTSISSGPGPRPGVQCIPQRAALLKSMLNFLKKAIQDPAFSDGIRHVMDGSLPTSLKHIISNAEYYGPSLFLLATEVVTVFVFQEPSLLSSLQDNGLTDVMLNALLIKDVPATREVLGSLPNVFSALCLNARGLQSFVQCQPFERLFKVLLSPDYLPAMRRRRSSDPLGDTASNLGSAVDELMRHQPTLKTDATTAIIKLLEEICNLGRDPKYICQKPSIQKADGTAT	516345	619254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_516410_519634_519765_564622_564692_572408_572508_573273_573481_574895_575049_597826_597890_599966_600045_600933_600982_601066_601136_601747_601848_603362_603464_603749_603901_604031_604160_604788_604930_605128_605235_607157_607287_607733_607836_608314_608396_616965_617073_617323_617502_618474_618567_619165
919757	contig_6873_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_129807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	387	1424	1810	65229	65615	NA	20	CCCAGCCAAGTGGCACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWTGEGPPQLSGAVQPVRKEQRWHTMPGIWKKGKRGRWREIRNRETEEKMPLWSPLSWQHRLGKGLLSLAALHNLSRRSGDSTGLQVCRKTERKEGRKRQEIEKREKKLKILEGAHQLDSVDLGKWF	63805	65615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_63800_65600
919758	contig_12324_pilon	-	2527	1	Intergenic	novelGene_166646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAGTACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100570	98043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_98000_100600
919759	contig_4125_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_25076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	57	174	327	500	468286	468459	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQEAVIRTEQGDTLRFKVTKVVHQACILSPYFFNLYAEQIIQEAGLHEEGRGIRIGGRLSNNLRYSDDTTLLAESEEDLKRFPKIRDYSLQYGLHLNIKKTKILTSGPMSNIMINRQNVEVVKDFILLGSTINTHVSSSQEIKQRTALGKSAAKHLFKVLKSKSL	467959	468973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_468000_469000
919760	contig_3081_pilon	-	3303	6	Intergenic	novelGene_133943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	20.9380037252838	255	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTGTAATTTAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269884	239352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_240121_246413_246505_246601_246708_246840_248673_252485_252591_269483
919761	contig_19032_pilon	-	2819	13	Intergenic	novelGene_172538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1022.13350875618	3	124	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	212	1774	162634	157217	FALSE	10	TACTCTTGTTTTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGLLGIVVAIIGGAICHSEVVAVAEVVESAIHTLGALFSPAEVVFQTEGTTTEVECPTEGTTTRTSEDEETIVATKINLRATTSGSRVNSGVRSHGVSIITKDIIEYPNKTN	164915	156171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158695_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837
919762	contig_15449_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_33680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	162	494	194962	195294	NA	75	AATTAAAAAAAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVTLARAPTLPDHPPSTVSYLEAQEDVHCLQEAQEGKCPSEGQVSHIWEAEVEIAGQQQQGSTADGAAHAGSHSPPVAALVPAGDSQAPDPSPAQSEKFKEGQGEGSRE	194800	196898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_194800_196900
919763	contig_9440_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_59087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAAAATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680170	1682078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1680200_1682100
919764	contig_10904_pilon	-	1342	1	Intergenic	novelGene_22702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGGAATTAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631971	630629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_630600_632000
919765	contig_18110_pilon	+	2923	2	Intergenic	novelGene_178966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1607	2656	123707	124756	FALSE	60	CTCATAAAAATAAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQMLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	3645	125023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18110_pilon_+_5204_123658
919766	contig_10331_pilon	+	2110	2	Intergenic	novelGene_54080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTTTACCAAGCATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96993	99889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_97112_97897
919767	contig_5945_pilon	-	1348	6	Intergenic	novelGene_104566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	299.323236652285	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	39	446	249708	224481	TRUE	15	ATATGACTGTGCCTTCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRVCCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAENKGRGTSLHFIPMKKDYPI	249746	215591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219606_224405_224541_226464_226536_235617_235755_249568
919768	contig_9415_pilon	+	2458	5	Intergenic	novelGene_109797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_3	66.8482423104751	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	54	704	1712832	1737702	FALSE	25	ACATATGTCTGGTTATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAAVFFGCAFIAFGPAFALYIFTIATEPLRIIFLIAGAFFWLVSLLLSSLVWFVAGTTVGHKDGPVQKYLLIFGVLVSVLIQEAFRLAYYKLLKKANEGLKAINPEETAPSMRLLAYAFMTLVIILLHIFWGIVFFDGCEKKRWHTLLVVLLTHLLVSALTFISPHYGINLASAYTAMVLMGVWAFFVAGGSCRTLKLCLLCQDKDFLLFSQRSR	1712778	1739456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_1712945_1714635_1714807_1720758_1720830_1733129_1733258_1737534
919769	contig_9011_pilon	-	1407	10	Intergenic	novelGene_159266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCAAGATGGGCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172418	82760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_82896_89343_89467_90305_90431_95139_95254_111441_111555_114691_114778_133015_133130_134389_134442_161902_162039_172009
919771	contig_9955_pilon	-	2192	6	Intergenic	novelGene_21395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	44.0109077388776	52	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	771	1442	742411	733269	FALSE	30	GGTGAGAGTACAAATTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVNQSVGFPPVTGPHLVGCGDVMEGQSLQGSFFRLFYPCQEAEETMEQPLWIPRYEYCSGLASYLQFNKHWGGLLFNLAVGSCRLPVSWNGPFKSKDSGYPLIIFSHGLGAFRTLYSAFCMELASRGFVVAVAEHRDQSAATTYFCKKAPEKNQTINESLEEEWIPYRQLGEGETEFHVRNPQAHQRVNECVRVLRILQDVTAGRTVLNILPGGLDLMTFKV	743181	732518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_733389_735074_735217_735593_735663_740268_740366_741190_741345_742321
919772	contig_2854_pilon	+	4671	1	Intergenic	novelGene_120793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47460	52131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_47500_52100
919773	contig_20420_pilon	-	3112	1	Intergenic	novelGene_172483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51285	48173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_48200_51300
919774	contig_8276_pilon	+	2544	1	Intergenic	novelGene_174474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGAGATAGAGCAGCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128494	131038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_128500_131000
919775	contig_12410_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_167256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1785	2084	11567	11268	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSEVSTQTETYNNETRHKKEDRSRINSLSLQLEELEREEETKPKPTRRKEITKIRIEIKEIKIRKTTEKITKTRNWFFEKINKINKPSARLTKRKNA	13351	11054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_11100_13400
919776	contig_12583_pilon	+	2454	2	Intergenic	novelGene_175079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1398	1850	6975	7427	TRUE	50	CACAAAATTAACGACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESINSLEEENFLELTEAYYERLIYRTLQEITKEISQNAEKAKEHTEKAIVELKKVIQEHNGKSNMLQEGIERQQSKIQKIKNKISELYNSIESHRSRIEAVEVRIALKIKHLTTTYLRKNQIKELKRRRNSKSYVGLFQEK	5577	8258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_+_7975_8201
919777	scaffold_12124_pilon	+	4801	7	Intergenic	novelGene_22088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	196.720119854466	89	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGATCACATTACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860013	884628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642
919778	contig_11681_pilon	+	3343	1	Intergenic	novelGene_102971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	2046	2522	139506	139982	NA	50	TAGAAAAAAAATACTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIIADVKWILAEIKEYQKDVYLCFIDCAKALYCVVHNELWITLQTMGIPEHLIVLMRNLYLDQEVVIQTEQGDTAWFKVRKGVRQGCILSPYLFNLYAEQIVRESGLCEEERGIRIGGKLINDLQYADDTTLLAESEEDLKHLLMKIKFSIGYTST	137460	140803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_137500_140800
919779	contig_16632_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_154128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79916	81180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_79900_81200
919780	contig_6975_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_74291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAGCTTTCTACTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418204	415486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_415500_418200
919781	contig_8712_pilon	+	4513	1	Intergenic	novelGene_58787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	549	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	3540	4064	292224	292748	NA	55	ATTCTCAACAACAACAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGRGKRGINSDGKIALIRGRVVQLIIVIAVNKLYTCKKLNWQKLCDRYIYNSDQKKRVAAEAAFVQPNISWDLVPWFGGLGSWFHGTSQLIGLRTCLVLLFYLLIHCLVPGVLKACKWPSKAQQLAFIHLEQQRKKESQEWEEDMERVADCFHEQLPPLPCDEKNWMVPGYHY	288684	293197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_288700_293200
919782	contig_14322_pilon	+	2342	1	Intergenic	novelGene_115621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTAAAAAAAAAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169707	172049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_169700_172000
919783	contig_3797_pilon	+	2593	2	Intergenic	novelGene_120118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1981	2448	868650	869117	FALSE	45	TGGAATACTACACAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHLRSLRDFTKRVKRQPTDREKNFGYDKSDQRLISKIFKILQNLNNKKTSNPIKKWAEDMDRHVTKEDIQAANRHLKKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLAFIQKTQNNKCWRGCGETGTLTHCWRECKMAQQPLWKSIWHFLKKLEIEVP	860282	869262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_862047_868433
919784	contig_15666_pilon	-	2133	5	Intergenic	novelGene_70173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_3	671.540393423955	11	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	156	881	110619	108530	TRUE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110774	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108859_109098_109138_109948_110246_110558
919785	contig_17796_pilon	-	1038	6	Intergenic	novelGene_33756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAGCAAAGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17088	8152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_8243_11783_12178_13652_13830_13905_13974_15231_15320_16867
919786	contig_3821_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_178999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTCCATATGGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14072	16339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3821_pilon_+_14100_16300
919787	contig_19098_pilon	+	4010	9	Intergenic	novelGene_65802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	205.218176582875	97	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	392	1513	264832	288978	FALSE	15	CATGCAGATTGTGGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELQRIKNEKKQKQNERKQKISENRKHLASVRVVQKNLVFVVGLSQRLADPEVLKRPEYFGKFGKIHKVVINNSTSYAGSQGPSASAYVTYIRSEDALRAIQCVNNVVVDGRTLKASLGTTKYCSYFLKNMQCPKPDCMYLHELGDEAASFTKEEMQAGKHQEYEQKLLQELYKLNPNFLQLSTGSVDKNKNKVTPLQRYDTPIDKSSDSLSIGNGDNSQQISNRDTPSPPPGLCKSNPVIPISSSNHSARSPFEGAVTESQSLFSDNFRHPNPIPSGLPPFPSSPQTSSDWPTAPEPQSLFTSETIPVSSSTDWQAAFGFGSSKQPEDDLGFDPFDVTRKALADLIEKELSVQDQPSLSPTSLQNTSSHTTAAKSPGSGFLHPAAPANANSLNSTFSVLPQRFPQFQQHRAVYNSFSFPGQAARYPWMAFPRNSIMHLNHTANPTSNSNFLDLNLPPQHNTGLGGIPIAGEEEVKVSTMPLSTSSHSLQQGQQPPSLHTTVA	250495	291475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_250653_263214_263302_264076_264179_264786_264913_267841_267976_279915_279974_282009_282260_283414_283913_288877
919788	contig_10023_pilon	-	2939	5	Intergenic	novelGene_123500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6.10327780786685	57	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCTTATGAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381865	374254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_376544_377981_378149_379872_380086_381017_381200_381777
919789	contig_7080_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_100110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAAAGAATGGTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496006	494142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_-_494100_496000
919790	contig_15327_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_70828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633684	1631493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1631500_1633700
919791	contig_15236_pilon	+	1451	9	Intergenic	novelGene_141635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGGACAAGCTGCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650213	664026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_650631_654829_654987_656272_656472_657770_657957_660984_661087_661160_661233_662587_662661_663175_663354_663959
919792	contig_3817_pilon	-	4122	10	Intergenic	novelGene_78309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	31.8855979718852	10	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	2939	3841	159727	151911	FALSE	40	TAAGGTTCTAAATCAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERMKAEKERRQLEEKLQAEVLLQQMEELKVKEMEATKLKKEQENLLKQRWELERLEEDRKRMAALRQKAELGRFLRHQYNVQLNRRTQQIQEELEADKRILQALLEKEDENQRIHLARREQALADVAWMKQVIEEQLQLEREREAEQQMLLRDEAKEMWEKREAEWARERSARDRLMNEVLTGRQQQIQEKIEQNRRAQEESLKHREQLIRHLEEARESARREKEESEELKSAWKQELEAQVVERQLQAQEEDQQEEEEEEEARQAEQLTDALLQQEAKMMAEQGYWPKTYRHPKIAWN	166554	151629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_151944_153063_153208_153723_153910_156354_156437_157226_157400_158371_158439_158628_158742_159622_162359_164940_165129_166435
919793	contig_5916_pilon	-	856	1	Intergenic	novelGene_158071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGCTCATCAGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771768	770912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_770900_771800
919794	contig_5264_pilon	+	2328	1	Intergenic	novelGene_165051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAACCCAACTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36189	38517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_36200_38500
919795	contig_2403_pilon	-	4906	1	Intergenic	novelGene_71009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	103	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1255	1566	145231	144920	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSLQQPESRKTRRCPATTTNCSGRDHNRKSWTEWEKNIEQNSNSQKKTRFTGLTEAEGSPKTMAPGHPSNSELKPLAKFTFQPKIRQAYKIHNNTHEERVS	146485	141579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_-_141600_146500
919796	contig_1725_pilon	+	5233	2	Intergenic	novelGene_24322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	857	junction_1	0	150	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	4157	4513	255187	255543	FALSE	35	TAACCCAGATCAGCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKYESVLPSSQLCNEYIYDSPQFIPVTFPMKCAWPDVCHKAHWAVRPWTVYIYMCCLQNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	250088	256263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_251188_252129
919797	contig_1812_pilon	-	5506	4	Intergenic	novelGene_174513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	1510	2046	166351	14021	TRUE	15	CCTGGGTCCTTATTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRGGSVQATQHHLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPQDPTSAVAQTGKQLHTRMELHSPSGKSKDGAWSQTLERKAGEVARGKQEIQRSREKKKKATPAANKWHSESQLVQAGVSRQETVSVGSRGGRVWVKKRREWESVYHKLPTLWSPSGRSKDGARSQVLE	167860	5146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1812_pilon_-_6684_6747_7122_12471_14481_166274
919798	contig_10241_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_142834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGACCCAACAATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100848	102413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_+_100800_102400
919799	contig_2463_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_42996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAAAATAAGAAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11470	13624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_11500_13600
919800	contig_11512_pilon	-	2180	6	Intergenic	novelGene_43366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	842.418898173587	2	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	140	586	609650	556556	FALSE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQHHWGQYRAQVHGGVLLGSLAASVPGLGSVAAPSLPALSLPLPAMPHIT	622340	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556703_586541_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
919801	contig_6898_pilon	-	3356	2	Intergenic	novelGene_35736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGCAAGGGTAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100217	96745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_99606_99721
919802	contig_6439_pilon	+	1459	2	Intergenic	novelGene_154244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAAAAACCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373343	400430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_373416_399043
919803	contig_3382_pilon	-	1564	1	Intergenic	novelGene_123987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTGAGCAGCCATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49374	47810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_47800_49400
919804	contig_8453_pilon	+	2792	1	Intergenic	novelGene_125126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	811	2436	63	2498	198157	200592	NA	50	GACACTACTTATAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVNNPTTCQPSPFSTLFFFVKIYTAVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLHKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	198094	200886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_+_198100_200900
919805	contig_6760_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_150789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTACGCCACCCAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162027	159583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_159600_162000
919806	contig_17427_pilon	-	2396	13	Intergenic	novelGene_30375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1185.90618188043	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	79	1020	188879	179445	TRUE	20	TGCAACTTTTTTGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHVAPNHSLHLNQESAPPRNQLQRKSHLYLNCRARSGEWKIKRMFPTW	204721	177073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179767_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188137_188767_188890_204653
919807	contig_12239_pilon	+	1443	11	Intergenic	novelGene_170465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	76.0934294141091	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	516	1085	45336	74567	FALSE	15	GTGGTGTTGCAGTTTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQELERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENFRCLNCSASQVCPQDGPLYQSYPMVLQYRPRIDFG	22050	74925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_22111_24520_24810_41218_41296_45246_45344_47054_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_67985_68046_74519
919808	contig_6047_pilon	+	2299	15	Intergenic	novelGene_24213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	654.362132935891	4	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	948	1352	2299	119315	123077	FALSE	65	GAAGAAGAACAAGAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTD	105237	123077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105286_106266_106370_107152_107293_107809_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118167_119278_119549_119762_120009_120539_120677_122420_122500_122584_122741_122981
919810	contig_7066_pilon	-	1977	3	Intergenic	novelGene_42152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	5.5	8	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGCTATATGCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757865	748127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749885_750340_750424_757728
919811	contig_4531_pilon	-	2703	7	Intergenic	novelGene_47859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGGACTTGACCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172455	159814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_159838_160319_160441_160731_160870_161118_161281_161403_161586_163100_163266_170543
919812	contig_13740_pilon	-	3299	10	Intergenic	novelGene_34655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	4722.99850090027	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	166	1173	165243	158260	FALSE	30	TTCAGGTGCTTAACATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTLETVPLERKKREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNL	165408	156133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161922_162031_162127_162164_165237
919813	contig_17074_pilon	+	2998	1	Intergenic	novelGene_145154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274453	277451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_274500_277500
919814	contig_13301_pilon	-	1465	9	Intergenic	novelGene_153127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	211	744	174296	171961	TRUE	20	CTGTGCTACCGCCAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METVGLGSWGMELYRGAGGHGWGWVHKEACRGPRYSTLTMSLSAAALDIVAVPDILLLPDTPLSIEFAALAVPRTCLLPWDFLTADKLHVPAGAGGPLPPGLPLSIHWQGTATLQMWVRVESPAQKGPPCWGRGLSHVRRSRVWPKPQVTEQGLTELHGPHPPATGQGDRPVQPRCS	174506	169209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_-_169280_169366_169518_170820_170996_171497_171670_171807_172000_172201_172375_172629_172824_172975_173084_174276
919816	contig_11307_pilon	+	2437	1	Intergenic	novelGene_105260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTATTGGTTCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212722	215159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_212700_215200
919817	contig_4891_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_124506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTACTTACACTCTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6172	8187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_6200_8200
919818	contig_19589_pilon	+	2501	3	Intergenic	novelGene_179000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATAGAAATCACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123416	242434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19589_pilon_+_124670_241139_241691_241737
919819	contig_5961_pilon	+	1597	7	Intergenic	novelGene_144104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	680.282151430975	6	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	1101	1595	197721	202102	FALSE	70	GAAGGAACAAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEIT	113700	202104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_170363_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197889_201775
919820	contig_7129_pilon	+	3366	1	Intergenic	novelGene_169302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACCCAAAAGACTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904669	908035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_904700_908000
919821	contig_14711_pilon	+	2324	5	Intergenic	novelGene_68925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_2	158.296201786398	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	37	840	86227	89329	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHR	86190	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105
919822	contig_15732_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_88877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAATAAAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180184	182027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_180200_182000
919823	contig_16535_pilon	+	1484	11	Intergenic	novelGene_167712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_10	38.4849321163491	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1425	58	1482	361065	363824	FALSE	10	CCTGCTGGCCCCGAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPHEDLPFWLVRWLLFRLMFASGVVKLTSRCPAWWGLTALTYHYETQCLPTPAAWFAHHLPVWLQRLSVAATFLIEIAVPPLFFAPLRRVRLAAFYSQVLLQVLIIITGNYNFFNLLTLVLCTSLLDDKHLGVERGRGRRTKMPTSWPKALLTMLAPLLELAVYGLLAYGTTHYFSLEMDWEQRAIHSRTNFTFHQFSQWLKAVTLPTMWLGGASLTWELLTALWRWTQVRGWLWKLWSAVQLSIFGMATVALFTVSLVPYSYMEPGTHGRLWTGAHRLFGAVEHLQLANSYGLFRRMTGLGGRPEVVLEGSYDGHHWTEIEFMYKPGNTSRPPPIVTPHQPRLDWQMWFAALGPHTHSPWFTGLVLRLLQGQESVIRLIQNDLTRYPFHKQPPTYVRAQRYKYWFSPPGEQHQWWHRQWAEQFFPPVALGDPTLETLLAQFGLQDKSPPRPRSTSSLLPQALHWVRTQLSPLKAPTLLWGLLAAVGAIRVVQ	361007	363826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_361126_361205_361385_361813_361956_362081_362217_362301_362408_362482_362580_362668_362852_362938_363108_363324_363437_363504_363602_363680
919824	contig_2798_pilon	+	1508	2	Intergenic	novelGene_120004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAAAAAAAAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102647	104627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_103767_104238
919825	contig_2438_pilon	+	1177	4	Intergenic	novelGene_112058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2852.23986056962	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGGATGGACTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310651	313516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_310797_311935_312083_312310_312409_312729
919827	contig_6069_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_8012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCCATCCACTTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83295	83888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_83300_83900
919828	contig_6576_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_42363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1	303	1005786	1006088	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDRTSKKKLSKDTEELNTTINQLDLIDIYRTLHPTAAKYNSFSIAHGTFSRIDHILGHKASLNKIQSIEILQSIFSNHKAIKVEINNRKSKEKYQTNGN	1005785	1006905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1005800_1006900
919829	contig_12277_pilon	-	1731	1	Intergenic	novelGene_139721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAATAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434960	433229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_433200_435000
919830	contig_7119_pilon	-	3099	3	Intergenic	novelGene_40952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1309	2055	139626	138880	TRUE	30	AGACCTAGCCCATGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140934	127531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137230_138158
919831	contig_11363_pilon	+	3291	1	Intergenic	novelGene_160492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAATTTTATTAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166943	170234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_166900_170200
919832	contig_10197_pilon	-	5056	1	Intergenic	novelGene_115202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	2109	2480	899342	898971	NA	15	TCCATGTTTTGAATGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVLIYTLLNTQVGPSVYLWVFPLCAPLFSLIHFPINSNCPGLSTLVSVLSSQVRESASLYLSLFSASWPRNFLKAVNRDSCRNYLVFTGIIVLCCLMSSVFTCILSSVFGHFRQENTIFLCK	901450	896394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_896400_901400
919833	contig_8415_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_141684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCTACTTTACCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66071	65457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8415_pilon_-_65500_66100
919834	contig_854_pilon	+	1326	7	Intergenic	novelGene_36261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2673.63871904938	18	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	324	884	556203	562402	TRUE	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHPLLAVQPLLSLRAEVERTSLLCPDPTPPASTWAAVPLRGCPDVRRAQAGRLPASPHRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543503	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556241_556832_557065_557591_557752_562271_562420_563372
919835	contig_14474_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_144210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCAGGGCAGATGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63468	65641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_+_63500_65600
919836	contig_6446_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_149228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAATTAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426354	424561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_424600_426400
919837	contig_12528_pilon	-	1939	2	Intergenic	novelGene_81327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	247	690	934933	934490	TRUE	35	ATGTCGAAAAGGTTTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHRSSGNERGSFPQTWRRMGCVGRAGFLEKPIADVHRLYHLQLSEYLPQCLLFSAELFACARLKKLHQDSSVSKRCHLQPHLWNKGPSWIICLHLLTYPFLILSPFSPVPFLPSLICTQDPGKQALLTSFLYPSQCLENSYAISIH	935179	932861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_933717
919838	contig_5302_pilon	-	2238	8	Intergenic	novelGene_81452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	722.518187046004	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	321	869	185066	177220	FALSE	15	TTAATGTTACTGTTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209559	175850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209410
919839	contig_6117_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_167312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTTAGAAATACATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165146	167197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_+_165100_167200
919840	contig_6954_pilon	+	2864	20	Intergenic	novelGene_64418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	58.1922975169799	79	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	905	2715	148	2862	70910	144155	FALSE	55	AGAAGAATTGGAAAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHLLLEVAAAPLRIIAAKNEKSRSELGRFLAKQVWTPQDRQCILSTLAQLLLDKDCTVLVGRQLRPLLLDLLERNAEAIKAGGQVNHDLHERLCVSMSKLIGNHPDVLPFALRYFKDTSPVFQRLFLESSDANLVRYGRRRMKLRDLMEAAYKFLQQEQSVFRELWDWSVCVPLLRSHDTLVRWYTANCLALVTCMNEEHKLSFLKKIFNSEELIHFRLRLLEDAQLQDLEKALVLANPESSLWRKDKELQYVQGHLVSADLSSRVTAVCGVVLPGQPLAPEEQASNRSSSCEQELALRSYVLVESVCKNLQTLAMAVASQNAVLLEGPIGCGKTSLVEHLAAMTGRRKSPRLLKVQLGDQTDSKMLLGMYRCTDVPGEFVWQPGTLTQAATKGHWILLEDIDYAPLDVVSVLIPLLENGELLIPGRGDSLKVAPGFQFFATRRLLSYGGSWYRPLNSHATLLDKYWTRIHLDNMDKTELHEVLQSRYPSLSAATDHLLEIYIQLTGEKHHCQSDSHVECGQAPEDVSEARRENKRPSLEGRELSLRDLLNWCNRIAHSFDSSSSASLNIFREALDCFTAMLSKQTSKLKMAEVIGSKLNISKKKAEYFCQLYKPEIVINELDVQVGRVRLLRKQSEAVYIQREKLTFAATRPSSVLIEQLAVCVSRGEPVLLVGETGTGKTSTVQYLAHVTGHRLRVVNMNQQSDTADLLGGYKPVDHKLIWLPLREGFEELFAQTFSKKQNFTFLGHIQTCYRQKRWHDLLRLMQHVHKSAVNKDGKESETGLLLKEKWEAFGLRLSQAQQQMKMTENALLFAFVEGTLAQAVKKGEWILLDEINLAAPETLECLSGLLEGSSGSLVLLDRGDTEPLVRHPDFRLFACMNPATDVGKRNLPPGIRNRFTELY	70762	144157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_71012_97354_97582_107378_107604_107987_108096_108175_108369_118168_118412_118622_118755_120411_120516_122217_122333_125072_125267_125922_126002_129909_130006_131314_131428_132808_132958_133647_133709_139491_139704_140521_140626_142274_142420_142939_143037_144139
919841	contig_3103_pilon	+	3476	4	Intergenic	novelGene_146185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATCGAACCCAGCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55645	154516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_56859_90985_91384_136348_136489_152791
919842	contig_14970_pilon	-	3256	2	Intergenic	novelGene_45150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_1	0	111	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAGAAAAAACAAGCGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315779	308958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_312047_315611
919843	contig_6163_pilon	-	670	5	Intergenic	novelGene_103808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_2	366.02458933793	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	14	505	93933	76115	FALSE	45	AAAAACAAACCCATGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAMKLTDSVLRSFRVAKVFRENSDKINCFDFSPNGETVISSSDDDSIVLYDCQEGKPKRTLYSKKYGVDLIRYTHAANTVVYSSNKIDDTIRYLSLHDNKYIRYFPGHSKRFRGWQDPRLEWRKWYQSSCAGWKTHRPHHLFAVQPQVHDLCQCMFQHGLLVAYH	93946	75949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_86907_86975_89577_89676_93772
919844	contig_11071_pilon	+	2836	2	Intergenic	novelGene_131037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2117	2437	181233	185149	FALSE	60	CTAAGAAAAAAAAAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGYLFSSVMKSLLRFTLHPKFRQAESVKGAVRHIVINFLATLVQTGIRRENKTSYPGLDVNVVSIPKNQDAMIYQNKNEMKNADAQQFHFPISTLDKHVCVKEE	179116	185548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_181308_184903
919845	contig_15043_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_175504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192747	191041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_191000_192700
919846	contig_8616_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_72585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCTTGGTTAGGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425787	428280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_425800_428300
919847	contig_18364_pilon	-	4567	1	Intergenic	novelGene_102567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCAACCTAAAAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122821	118254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_118300_122800
919848	contig_12951_pilon	+	3350	1	Intergenic	novelGene_68219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1387	1731	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
919849	contig_9708_pilon	-	2096	1	Intergenic	novelGene_67239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGAACAAAGAAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14764	12668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_12700_14800
919850	contig_3380_pilon	-	1700	7	Intergenic	novelGene_60091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5937728636157	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACATAAAATGGCGTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374879	366639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_367800_368448_368570_369070_369117_369635_369718_370961_371111_371938_371997_374795
919851	contig_8538_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_4615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGGTGCCCTGCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	702726	703526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_702700_703500
919852	contig_10958_pilon	-	1704	2	Intergenic	novelGene_5463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901585	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
919853	contig_13528_pilon	+	1260	6	Intergenic	novelGene_66850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	429.568900177841	41	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	18	938	12393	28917	FALSE	55	GAGGCACAAATACGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEAGICGLGVKADMLCNSQANDILQHQDSNCDVTSNKHSLEEDEGSAFITNNRNLVSPAYCTQESREETPGQEARTDPPDGQQDSECNRNKEKTLGKEVLLLMQALNTLSTPEEKLAALCKKYADLLEESRNVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQSEHSKAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQVQLEQHDVHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKFQPPHLASYGVESLLNHLDNVQIPSYVFC	12375	29239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_12682_13900_13993_21896_22068_25270_25466_27587_27672_28827
919854	contig_13868_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_172646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCACTAGAAGATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58117	60217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_+_58100_60200
919855	contig_9011_pilon	-	2155	6	Intergenic	novelGene_159259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAGAAGGAAAAGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41263	16712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_16906_17159_17288_22859_23012_23216_23322_25060_25129_39754
919856	contig_16228_pilon	+	3970	6	Intergenic	novelGene_147923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	125	junction_4	216.441585653035	44	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	63	1052	47816	71852	FALSE	30	GAGAATAAATTTCTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCSEDPHLYWVSWLLGFFILLGVWSTGAKGSGTKDSEAFVSLKEIQGSSVLFHVIMEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQKFHLMVYETIPLPQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGPRLQEDCRDNDGDLYYTMVSQQESLRGKK	47753	75060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_59843_60222_69477_69790_71434_71573_71760_71853_72142
919857	contig_9206_pilon	+	3907	6	Intergenic	novelGene_137483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1045	1425	117062	117442	TRUE	15	CGTCTGTACACTGCGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRPGVRKPKGKNTLGISQAERTEEKIQALSYNTKGFYGQNTERCRKYQKKMEGIHRVTVPNRELTEIQAQFRRGYGTVDIIAEVRWILAESREYQKDVCLCFTMQRHLDHNKLWVTLQKWKFLSI	116017	132925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_+_119543_123352_123448_124322_124450_127425_127520_130938_130977_132897
919858	contig_10734_pilon	-	2157	12	Intergenic	novelGene_51501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_4	536.589443993225	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	64	972	2305085	2270478	TRUE	45	AATAGAATTCAGTATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFREENSTLSS	2305148	2265169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
919859	contig_2069_pilon	-	2939	8	Intergenic	novelGene_23283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1449	1817	344113	343745	TRUE	20	AGCCTCCCACCAGTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTECPICSDVLGLCRILSLGALGRESWGLTRASGHAQRGAQCPSRLCLIPGLVLGFCGGEVVLQEGLQVLKGRPLIRVQTPGLLHGLIQGHRAAWGAWHVVAMLHLFHYFPVTHACRVGLC	345561	335629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_335707_339002_339105_339556_339708_341057_341218_341298_341474_341998_342074_342571_342734_343524
919860	contig_8589_pilon	+	1270	1	Intergenic	novelGene_107364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAACGTAAAAAGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214464	215734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_+_214500_215700
919861	contig_6445_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_76982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGAAACCTAATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402672	402004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_402000_402700
919862	contig_2716_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_173562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGGTCTCTGCTGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	876745	874874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_874900_876700
919863	contig_12019_pilon	+	3151	9	Intergenic	novelGene_87759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	36.4054855069947	44	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	300	1625	713694	727571	TRUE	15	GATGACTGGATCCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQPREEAAEVREEEEKEEVAEAEGAPELNGGPEHSLPSSSYSDLSQSSSPPSLLDQLQMGCDGASGGSLNMECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRRTIRMKLEYEKCERSCKIQKKNRNKCQYCRFQKCLALGMSHNAIRFGRMPEAEKRKLVAGLTASEGSRHNSQVADLKAFSKHIYNAYLKNFNMTKKKARGILTGKASHMAPFVIHDIETLWQAEKGLVWKQLVNSLPPYKEISVHVFYRCQCTTVETVRELIEFAKSIPSFGNLFLNDQVTLLKYGVHEAIFAMLASIVNKDGLLVANGSGFVTREFLRSLRKPFSDIIEPKFEFAVKFNALELDDSDLALFIAAIILCGDRPGLMNVSQVEAIQDTILRALEFHLQANHPDAQYLFPKLLQKMADLRQLVTEHAQMMQCIKKTETETSLHPLLQEIYKDMY	648150	729808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_648265_652598_652683_713592_713824_723006_723162_723984_724124_725715_725919_726100_726552_727323_728934_729644
919864	contig_2419_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_137130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTCCAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139998	141365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_140000_141400
919865	contig_120_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_165247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTAATGCACCCAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52703	51644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_51600_52700
919866	contig_3866_pilon	-	2433	1	Intergenic	novelGene_112393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGACCTCTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164929	162496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_162500_164900
919867	contig_8816_pilon	-	2145	5	Intergenic	novelGene_179001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATTATATAGTGGATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128533	30622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8816_pilon_-_31297_31346_31907_70717_70809_127531_127562_127743
919868	contig_15407_pilon	-	5248	4	Intergenic	novelGene_123045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	4823	5173	330912	330562	FALSE	25	ATTTTAAAGTCTATTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISMLWILLRFALWPNMWSILENVPRTFEKKVYLAAVGWSVRYMSMRSSWLTVAFSASVSLFSFFLDVLSFTESGVLKSPTTVVELSLFSAVRVCLIYFGALSLGT	336606	330486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_332819_333067_334997_335104_335203_335717
919869	contig_14220_pilon	+	1537	1	Intergenic	novelGene_159859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAAAAGTGGCAAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314264	315801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_314300_315800
919870	contig_15405_pilon	+	1231	2	Intergenic	novelGene_112101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAGATCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93058	118669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_93486_117865
919871	contig_7022_pilon	+	2098	1	Intergenic	novelGene_142130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGGCCATGACCTCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43963	46061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_44000_46100
919872	contig_6870_pilon	-	3766	4	Intergenic	novelGene_103971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACCTATTTTGAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1499872	1430777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1433856_1476193_1476537_1499124_1499307_1499709
919873	contig_10446_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_162508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029819	1031660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_1029800_1031700
919874	contig_5041_pilon	-	2303	15	Intergenic	novelGene_27093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	625.686414904398	52	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	126	1997	620136	554530	FALSE	15	ATTGTTGTGTTTATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSLSIIIDRYTMTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKVLGNVL	636080	554223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_620101_620169_635987
919875	contig_15371_pilon	-	954	2	Intergenic	novelGene_151430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	37	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAACACCACCTTTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37582	22569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_-_23186_37244
919876	contig_7045_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_77441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCTGTAAAAAGTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297599	295826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_295800_297600
919877	contig_3426_pilon	-	3430	2	Intergenic	novelGene_57971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCATTTAGTACATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539366	535777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_538512_538670
919878	contig_15570_pilon	-	1894	4	Intergenic	novelGene_137827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	23.1708629293104	63	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	753	1580	391492	383689	FALSE	30	TATAAAGGAGTGTGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNNEIVKPAKYFSELEKSILLALVEKYKYVLECKKSDARTIALKQRTWQALAHEYNSQPGVSLRDFKQLKKCWENIKARTKKIMAHERREKVKRSVSPLLSTHVLGKEKIANMLPEQLYFLQSPPEEEPEYHPDAAAQESFAVSNRELCDDEKELIHFPVCEGTSQPEPSCSAVRITANKNYRSKTSQEGALKKMHEEEHHQQMSILQLQLIQMNEVHVAKIQQIERECEMAEEEHRIKMEVLNKKKMYWERKLQTFTKEWPVSSFNRPFPNSP	409381	383374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_384099_391074_391526_396482_397132_409311
919879	contig_10068_pilon	+	2911	9	Intergenic	novelGene_148706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1804	2307	47750	56384	TRUE	0	CCCGCCGCCGCCGGCTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAALIRTAVYQKACRSDLSPACWADRCTGPGAHPSRSCSGKVFWHTAHQGPSRGPRPFPGGSAVSLCFSSGHCPLDRGKELGPGCWHRRCAHGRSCSLQGLRWSTLSPGFPGSTSKCGAGNLRAPRLRQTLCLALWGFQGPGTQVGHKHKRFLLPGNLFSQVGPCQ	43055	59850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_+_44096_44150_44811_47646_47762_51231_51586_54327_54438_56356_56500_57189_57275_58179_58368_59634
919880	contig_8570_pilon	+	2338	3	Intergenic	novelGene_120132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGTCAGCTTTTTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2431	225206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_4232_159466_159472_224673
919881	contig_8268_pilon	+	2660	2	Intergenic	novelGene_147000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	131	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	342	2317	2658	75918	76259	FALSE	15	GCCGAGTGGGAAGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEKSERLKNHKVPKDPTGAAMRSGEVALRCCSTAWLEGVEVYNARYSGNRKRRKIQRDEKLSNEESQKGKKMEKETKQIEITNKQERPPKKQKKNKTTKKRNALRDSSVRLC	73340	76261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8268_pilon_+_73810_74070
919882	contig_16722_pilon	-	2823	3	Intergenic	novelGene_118290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	260	junction_1	93.5	93	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	213	377	132864	132700	FALSE	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVIIETWVAEEELELWEIRAFAERVEKEKAQAVEQQAKKRLEQQKPTVIAASTTSPTNSTTSTVSPAQKVMVAPISGSVAPGAKMVLTTKVGSPATVTFQQNKNFHQTFATWVKQGQSNSGTQL	136682	130253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_132961_136189_136233_136609
919883	contig_1213_pilon	-	2391	7	Intergenic	novelGene_76464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.9274217186902	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	17	1063	65725	43395	FALSE	15	TCATTAGATTTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPGSEMGKMAAVVGSAATIAAEPGEDAFRKLFRFYRQSRPGTADLGGVIDFSAAHTGRGAGPSAHKVVRSQLSVSSVNEHDAHRAGLQPVSKWRAYGLEGYPGFIFIPNPFLPGYQWHWVKQCLKLYSQKPNVCNLDKHMTKEETQDLWEQSKEFLRHKEVNKRRPRSLLEKLRWVTLGYHYNWDTKKYSADHYTPFPSDLAFLSEQVATACGFQGFQAEAGILNYYHLDSTLGIHVDKSELDHSKPLLSFSFGQSAIFLLGGLKRDEAPTAMFMHSGDIMVMSGFSRLLNHAVPRVLPNPKAESLPRCLETPLPAVLPRDAVEKKRDITTEGFSHLDDKNSQVKRARLNPDS	65741	42066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_43488_43610_43825_44688_44883_48984_49076_56204_56368_62454_62564_65542
919884	contig_7078_pilon	-	3250	3	Intergenic	novelGene_130204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	40	408	968176	967808	TRUE	15	TGTAATCCCCCTGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPYSWIGRLNIVKMSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	968215	951295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_951555_963631_963733_965325
919885	contig_17144_pilon	-	2920	17	Intergenic	novelGene_29456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1940.65794255453	3	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	932	2632	174597	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183249	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
919886	contig_6302_pilon	+	2827	1	Intergenic	novelGene_171692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100688	103515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_100700_103500
919887	contig_10976_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_155584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110879	103325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_104286_110409
919888	contig_5549_pilon	+	3518	1	Intergenic	novelGene_81695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	563	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	2379	2792	766374	766787	NA	10	TGCCTTTTAGGTCTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALISLGYIPRSGIAGSNDISISSFLRKRHIIFQNSCIIMHPHQQCIRVQISPQPLQHFLFPVFLIHASNAGMRWYLIVVLICISLMASDRSISSCVCWPLECLLWRSVCSFPLPIFKLDYLSFCCRGVGFSCRFGD	763995	767513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_764000_767500
919889	contig_10982_pilon	+	2242	2	Intergenic	novelGene_87888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173844	177850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_173893_175656
919890	contig_5590_pilon	+	3354	1	Intergenic	novelGene_163036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	320	963	2316	3278	358449	359411	NA	65	AAAGAAGAAGGAGAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAQVHAPEQIHLLLPPALLASVPEALPHVSMGGQDPGVLSEPITKNFIECLCGAMCTWTCPQGVSAQPLQEQLPIHSKLQERLPVSVTLGMVMLGRGPHMHSSFHPQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSSTDDSEEERAQRLAELQEQVRLHRAPGQGNLPSALHFHPLCGLAPLQWVGAVLTSYMGTPLAGGPSLSGRETSGSPQPLKGGSGARVSVYPEASCLPSCSAPLGPSSWARAGFGLDVLSTPLEPGVWVGASTWGWALSQGPPLYPLSMSCAPHPCPGCQRS	356133	359487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_356100_359500
919891	contig_1472_pilon	+	3241	1	Intergenic	novelGene_86143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	223	333	751446	751556	NA	55	GTGGGGAAAAAATAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISSLKSEPNLYSGSGHLFLVWEEFCILINVFKCLLSLYTLVLNSQCKIPEKVFTADVFLKVYIETYSGNSNPFGMPLKSLPIKGFLAMFCEVRGFAHLFSTRKLSEIIFV	751223	754464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_751200_754500
919892	contig_12391_pilon	-	4282	2	Intergenic	novelGene_103614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAATTTCCTGGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93651	88408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_92289_93249
919893	scaffold_12124_pilon	-	3275	9	Intergenic	novelGene_22331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1949	2284	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510352	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
919894	contig_5574_pilon	+	5004	1	Intergenic	novelGene_155840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	3687	4130	111141	111584	NA	35	ACTTACAGTGACTGACTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEVSAFNFHRAGSTPAWLLTWVQSHSCLAAPGDGGFCWEHRLLCLNIAMLCGFSWQGTGDRNSVSAVSVQSLLPLGTQFNSSVLTLMFRVPKLSSISDSLVFSGLCCKTDVKRCLTTPPSWTNNFFFCKYTFQTIVIYRQITAPHT	107454	112458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_107500_112500
919895	contig_11068_pilon	-	2475	1	Intergenic	novelGene_130548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	249	750	1608	2357	225791	225042	NA	40	AATTTGTAATATTGAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIPNYTATINAKDEEIEYFYEFLQSEIDQTCNQDALIITSDWNAEVGSKEGSVAEKYGLGDRNNVGDRMIEFARPTIYSLQIPFFNNINGNYTHGLSQMEHTSNRQHLWKEAMEKLNIISWNKARADYVTHHQFLICKFKLKLKKIRTSPREPKYDLEYIPLEFRDHSRTDLTHSTLMTEDQTSYSNDIKDIIHEESKSLLKRQERKKRPRWMSEETLKLAFEHRVAKANGRNDEVKELNRRFRRAA	227398	224923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_-_224900_227400
919896	contig_848_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_83344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGAAGCATTTGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558539	560194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_558500_560200
919897	contig_5241_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_174395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGTCCAGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66252	64190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5241_pilon_-_64200_66300
919898	contig_3095_pilon	+	775	4	Intergenic	novelGene_75191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1300.49913494781	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	46	444	226165	226800	TRUE	20	TGAAGTCTTTTATTGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220523	227309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220531_226126_226409_226645_226824_227001
919899	contig_11978_pilon	+	2953	1	Intergenic	novelGene_62821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424003	426956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_424000_427000
919900	contig_5765_pilon	-	2690	1	Intergenic	novelGene_141430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCCCTCCAGCTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	950672	947982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_948000_950700
919901	contig_299_pilon	-	2493	1	Intergenic	novelGene_129454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	965922	963429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_963400_965900
919902	contig_5062_pilon	-	2525	11	Intergenic	novelGene_157829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTCGGAAGACCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744070	621641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_622505_676053_676264_716400_716497_723731_723898_733902_734080_739284_739421_739578_739691_741720_741861_742906_743064_743426_743525_743700
919903	contig_18916_pilon	+	4978	2	Intergenic	novelGene_136883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAAAAAACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74303	80953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_75433_77104
919904	contig_7440_pilon	-	3101	3	Intergenic	novelGene_61173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2048	2347	79166	78867	FALSE	20	TGTGTTCAAGTCCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPVWVCGIQAAGVSQSRDCGRGKQRRPSRSEEGWGVGKRILQITCCFVSRWTLLSRTTCLLVSDRSLRWQIRAALAGRGALHESLLALHSLSVF	82010	78112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_-_79182_79443_80904_81438
919905	contig_12915_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_148343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACTATACCAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69282	68733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_68700_69300
919906	contig_20561_pilon	-	845	1	Intergenic	novelGene_166363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40902	40057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_-_40100_40900
919907	contig_15236_pilon	-	4330	3	Intergenic	novelGene_141601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	3344	4330	532143	531157	FALSE	40	AAGCCCAGAGCCACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIKKQDPPICCLKETHLRKKDVNFIKNQRLEKIYLTNNYQKRARVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKRMIHHEDITIINIYAPNDKAPKYIRQTLTAPKRETDSSIIIVGDFNTPLSIKDRTSKKKLNKDTEDLKATIRQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHIVGHRAILNKIQNAEIIQSIFSEHNTIKVEINNRKSKEKKSVTWKLNNNLLTNHWLIEEIRDGIKKFLESNKNENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELEQIENGKK	595000	531156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_532566_533288_534016_592806
919908	contig_3077_pilon	-	1569	3	Intergenic	novelGene_26823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	825	1208	481557	479480	FALSE	20	TGCATATTCTCCAGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNLMRLEPYVKLPRKEALRNSSSIQASSGDVHHSHKEEPAHLAHCGGLDKALSDSKVHGGHNTTQAKSQEHSCSCLPVLRSGKPVPLCHDDGRNAQDTDDGEVDEPWLWGAVEGVIEPGDKAPHNQ	482381	479118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_479643_481020_481217_481532
919910	contig_5686_pilon	-	2685	3	Intergenic	novelGene_45456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGCTGTCCAATCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241675	220468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222914_224040_224201_241595
919911	contig_7009_pilon	+	4423	1	Intergenic	novelGene_23646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	2099	2524	456941	457366	NA	70	ACAGATTAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNSSSRLARQLSSKFLGIHERVLPTLHLFVETSQLVFHQFLEPSFSLMPSVQLGLLPSIPSVLDHMLPPEMVDCEPILFGTVTLCIPSVSFDASSCIIQYFARRIHQYCLKIFFSSFSLRNAKRVLPFWFSNFRSLHISL	454842	459265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_454800_459300
919912	contig_2917_pilon	-	5887	2	Intergenic	novelGene_147596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	359	junction_1	0	171	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1167	1478	113935	113624	TRUE	30	AACAGTTGCTGTCAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLSIVSGCCSAPVVYCSLDIKLPLLDGYWPSLPAVASHGFCPHIRIASGLLPCSVCSANDRCPGHSFHLLFVGIRSFFVFPLTVDQYDLGRKYSCQPPVFV	115101	105923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_109739_113029
919913	contig_9653_pilon	+	5489	1	Intergenic	novelGene_48320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	311	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCATGCTTAAGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022118	1027607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1022100_1027600
919914	contig_854_pilon	+	1886	7	Intergenic	novelGene_36294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	113	547	556108	563353	FALSE	30	ATATGACCTCATCGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLIYPFTLVPPSA	543619	564692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562354_563316
919915	SIRV6	+	888	9	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	166	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	110	333	315	647	2002	10736	TRUE	30	CTAATTGTTGGTAACAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1469	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1724_1835_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
919916	contig_5057_pilon	+	390	1	Intergenic	novelGene_151496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAAAAAAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357347	357737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_+_357300_357700
919917	contig_1331_pilon	-	1226	4	Intergenic	novelGene_37833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3563.14505271209	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	14	45	422	466	160053	160009	FALSE	30	TATACCTGTGTGAAATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELYCACTGILSLSEVCPAQDEDEKTVLVDNKCKCVRISSRIIPSKEDPSQDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTEFVYHLSDVCKKCDPVEVELDNQVVTASQSNLCNEDSETCYTYDRNKCYTNTVPLTYRGEIKMVTTALTPDSCYPD	194010	159248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_193957
919918	contig_987_pilon	-	2420	7	Intergenic	novelGene_72293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_4	202.569329695621	31	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCTACAGAGGAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935182	920144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_920170_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198
919919	contig_8597_pilon	-	3788	3	Intergenic	novelGene_158721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGAAAAGAAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284080	120599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_122766_250287_250992_283162
919920	contig_10253_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_76874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTATGACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87520	88594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10253_pilon_+_87500_88600
919921	contig_5917_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_122145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	73	450	229693	229316	NA	85	AAAAAAAAAAAAACCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQNSKCWRCCGETGTLIHRWWEYKMVQPLWKSIWLFLKKLEIEVRYNPAILLLGIYPREIRAITRRDICTPTFTAALFTIVKRWKQPRCPSMDEWINKVWYIHTMEYYTMIKNNDEAVKHLLTWRNLEGIMLSEFSQSQKDKYCIRPLL	229765	227520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_-_227500_229800
919923	contig_5145_pilon	-	2225	13	Intergenic	novelGene_131440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_7	146.262511335688	3	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	712	1386	925621	916397	FALSE	5	CGATTCCGTCCTGCCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	947068	915557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_934779_934816_936149_936299_937358_937490_939095_939164_941152_941310_946949
919924	contig_12464_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_68733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACAACCCATCCCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390147	388479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_388500_390100
919925	contig_4093_pilon	-	1858	6	Intergenic	novelGene_27635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1780.11129989111	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	129	818	69245	45436	TRUE	30	TGAATGGACTTTTCAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTVST	72552	40740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41766_45420_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
919926	contig_7644_pilon	-	1377	2	Intergenic	novelGene_64236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACTACCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166153	133418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_134695_166052
919927	contig_14807_pilon	-	787	7	Intergenic	novelGene_124679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	6949.40440493524	29	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	40	690	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCCSYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38893_39750_39796_39900
919928	contig_4413_pilon	-	1474	1	Intergenic	novelGene_116988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACATGCATATGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133504	132030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4413_pilon_-_132000_133500
919930	contig_13760_pilon	-	2081	10	Intergenic	novelGene_61301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	205.111412061895	2	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1183	1713	165384	161870	TRUE	5	TCTTTCTTCTGTCTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSFAAVMGALDMAQITRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEGPPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPAEGPEPWDNTEHGVEVVLAHLEAARMVAHHGGLYHTNAEVKLQGEPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPAVRSSEL	175990	161436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161588_161652_162033_163253_163465_164411_164524_165339_165389_167181_167602_169072_169199_170851_171307_172482_172612_175942
919931	contig_15135_pilon	-	1614	3	Intergenic	novelGene_119891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	884	junction_2	239.5	27	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACCATCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121354	119072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_119981_120097_120182_120732
919932	contig_6326_pilon	+	2009	7	Intergenic	novelGene_168537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	41.3820277683709	8	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1094	1417	284987	290096	TRUE	10	TGCAATGTTTTGCCTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKQHLAWP	283723	291687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_284391_284560_285143_286930_287015_289403_289467_290075_290241_291119_291203_291322
919933	contig_15047_pilon	-	4525	1	Intergenic	novelGene_52274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	811	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3331	3630	6719	6420	NA	30	GTAATGGGGAACCCAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	10049	5524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_5500_10000
919934	contig_10042_pilon	-	2389	1	Intergenic	novelGene_79178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTTGTCTCGGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789640	787251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_787300_789600
919935	contig_13216_pilon	+	2591	2	Intergenic	novelGene_47501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCACCATGTTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251826	255221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13216_pilon_+_254084_254887
919936	contig_13542_pilon	+	5910	1	Intergenic	novelGene_131508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	63	359	358465	358761	NA	5	TGTGGAGGGGCTGGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGIGLSLKKIPVFKGCCESKMQVVMITLRRDPDFWASRVLALGPLFSAGPCTRAYRIYHARGRAWASPCPLGPIDTSSVSIIGALVISSFCRCGNGGSVRLKGVLCEVTQLVRSRSGL	358402	364312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_358400_364300
919937	contig_14687_pilon	-	3473	1	Intergenic	novelGene_107943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	457	765	543572	543264	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREVIADVRWVLAESREYQKDVYLCFVDFAEAFDCVDPNKLWITLGRMGIPENLTVLMQSLCIDQEAVIRTEQKILCGLKSGKVCVRVVSFHHTYSVCMLSK	544028	540555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_540600_544000
919938	contig_5084_pilon	+	4904	2	Intergenic	novelGene_64472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3033	3437	60995	61399	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRRGGEDTLSGSVGRLDVFFPPSLAFLWETRESFISGSMTILSTSVSEAASASCFSLSERSSSSKCKRRGLMGSLPPCTSGDSFKPVPKWSTWKVPLFPGGSLLIKARRASPGNSVPTGLGSSAMPTESSFSC	57962	64021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_61983_63137
919939	contig_10642_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_78732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	407	844	1272635	1273072	NA	10	TGGTCCTGCATCTCTTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDSRVGASSLRTPADYTGDYLQMCYRLGWLLLCRTLRPAGAGKSSAFPTAQSSKPKKKGTRTKLWHAGGPPSLPGSREADRDSGHPHRSVHTSSCISFSPNDAFLPHPQGRADRQCAGRTAAFLSLKAIRDSVSLKNRCLSPH	1272228	1274833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1272200_1274800
919940	contig_10159_pilon	+	4033	1	Intergenic	novelGene_30878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972298	976331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_972300_976300
919941	contig_10263_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_135826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTTCACAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588203	590449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_588200_590400
919942	contig_13780_pilon	-	2723	17	Intergenic	novelGene_149070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_10	1559.32361012516	569	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	760	2169	686159	657588	FALSE	20	CTCTCATTGTCTCCTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	761499	657033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_660148_660194_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684765_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686561_688702_688760_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_761434
919943	contig_10019_pilon	+	1790	1	Intergenic	novelGene_86708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCTATGTATATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500363	502153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_500400_502200
919944	contig_5928_pilon	-	2831	1	Intergenic	novelGene_40361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGCAGGTGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176374	173543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_173500_176400
919945	contig_17130_pilon	-	3126	2	Intergenic	novelGene_176550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1559	1915	22641	22285	FALSE	45	AAACAAACAAATCTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVAFECSVAKVKGRNDEVKELNRRFQRVAEKDKVKYYNDTCKDLELENQKGRTHSTFLKLKEPKKKFKPRAAILKDSMGKIPNKRRKHQKKTEGIQSHCTKKNWSTFSHFRR	24294	21073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_-_24129_24223
919946	contig_9293_pilon	-	3450	1	Intergenic	novelGene_175197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1304	1642	99225	98887	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCIRISNVDPISSSMIFTVFGFIFRSLIHFKFVLLYGARYGSYFIFFADEHPVLPALFVKKTVFSPFDGLWGLVKDQVTIGGWIYIWVLNSVPLLNMSLYQYQAVLTTIAV	100528	97078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_97100_100500
919947	contig_2215_pilon	+	2204	2	Intergenic	novelGene_163862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAACAATAATATAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229154	235260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_230442_234343
919948	contig_6137_pilon	-	1632	10	Intergenic	novelGene_59136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	17.3233589535084	13	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	41	1414	936436	914015	FALSE	40	TCTTATCTAAATGATATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKTSESGSKHGTLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLTLALFGGSQKYADDKNRMPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFTLEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEDHDHLLSEHVIAIRAGKQRAVSSATVARYSQDSNTSVLDVVSDKPLSERLKVAPGETTDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTDAAQVLQDFYLELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTEARARLELREQATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYSDEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNIAERTYNNLFQFHQLRQIAKELNIQVVDFENFVGSLNDQGYLLKKGPKVYQLQTT	936476	913796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_914108_914827_915018_917441_917519_918808_919019_919305_919523_921675_921872_928492_928635_930458_930600_931359_931391_936359
919949	contig_10013_pilon	-	2391	1	Intergenic	novelGene_125036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1243	1587	27819	27475	NA	10	ACTGCCCCGTAGGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNNNDRVRVRQAGLSCVWDQLVGWLVAGRSSAASLNMYGSCCWLSAGMPWFPSLWLPVLQEASLGLDHMMASRFQKQPEVNPQCTSTFQVSICIMFADVLLAKASHMSRPTY	29061	26670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_-_26700_29100
919950	contig_2703_pilon	+	2874	2	Intergenic	novelGene_101712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1718	junction_1	0	27	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAATGGTTCCTTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526179	562075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434
919951	contig_7004_pilon	+	2059	12	Intergenic	novelGene_126481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.1402989825669	3	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	866	1903	405668	408168	FALSE	20	CCAGCTCCACACACCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHGGTNFGYWNGADEKGYFLPITTSYDYDAPLSEAGDPTPKLFALRNVISKFQEIPLGPLPAPSPKMMLGPLTLHLDGSLLAFLDFLCPQGPIRSILPMTFEAVKQDHGFMLYRTHLVNTFTEPTSFWVPNNGLHDRAYVMVNGVFQGVLERNIKHRLFLTGKMGDKLDVLVENMGRLSFGSNSSDFKGLLEPPLMGHVVLTQWLMFPLKIDNLVKWWFPIQLPKRSQPSTPSGPTFYSATFPILGLVGDTFLYLPGWSKGQVWINGFNLGRYWTKRGPQQTLYVPKPLLFPRGTFNKITLLELENVPPRPQIQFLDRPILNSTLYRTYLYSLSAGEQMELSGH	402952	408324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_403104_403286_403349_404817_404913_405003_405326_405432_405705_405918_406038_406349_406425_406542_406633_406774_406889_407161_407294_407525_407742_407913
919952	contig_9161_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_160639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCACCACAGAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62171	59890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_59900_62200
919953	contig_7563_pilon	-	2323	2	Intergenic	novelGene_145550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAACAAAAAAATAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49399	46900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7563_pilon_-_46956_47131
919954	contig_835_pilon	+	5580	1	Intergenic	novelGene_152171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	3530	3898	352488	352856	NA	65	AAGACACACAAATAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAGLIQTPTEGFIQWSQEVDHLSGDCSPSHHRVTGALKPTRQITWRYFYRVPAPPPPPERMESLPVLPLNASSDISSPHRGGKETLGKIRGQHPALKETLMSVGFPTKNVISETEKGWEY	348958	354538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_349000_354500
919955	contig_10731_pilon	-	3033	3	Intergenic	novelGene_177547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAATACATAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435747	432187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10731_pilon_-_432805_433195_433322_433457
919956	contig_4742_pilon	-	3554	1	Intergenic	novelGene_130993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGCAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208104	204550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_204600_208100
919957	contig_9481_pilon	+	3415	1	Intergenic	novelGene_149622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGAGACTGACTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54220	57635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_54200_57600
919958	contig_10658_pilon	-	2418	1	Intergenic	novelGene_130096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	976	1296	437546	437226	NA	20	TACACAAGGTTGCCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNILWTAKRTNESVLEEVQPECSLQARIVRLCLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSMRWIDTVAASMSSGIEVIVRMVEDSAVFHSVVYRFAVSQN	438521	436103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_436100_438500
919959	contig_826_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_154945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGGGAAAATAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340946	338327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_826_pilon_-_338300_340900
919960	contig_15123_pilon	+	3100	5	Intergenic	novelGene_110930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	893	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1562	1894	307568	307900	TRUE	15	CAAGTTCCGCAGCCCCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFADSSSGAPKSTGLAPMPAHCSPAVRNSTEPEAGPPTVTASPDSSLSSFDTVPITGERTSIIFLLPKLRLAQAKCHLGTLSPYLLDSSLMALEDAPPSPASEAGVARIK	306006	313756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_308551_308861_308991_309338_309421_309663_309807_313554
919961	contig_3861_pilon	+	5361	4	Intergenic	novelGene_57901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	422.378450628764	96	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156700	167445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_157646_159322_162144_164705_165623_166767
919962	contig_8058_pilon	-	2206	2	Intergenic	novelGene_149511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_1	0	1	115	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	138	1124	62418	61432	FALSE	65	TGGATGAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSNSTSNAETGCISLNVTFQYSLYATTYILIFIPGLLANSVALWVLCRFISKKNKAIIFMINLSVADLAHVLSLPLRIYYYISHHWPFQRALCLLCFYLKYLNMYASICFLTCISLQRCFFLLKPFKARDWKRRYDVGISAAIWIVVGTACLPFPILRNSGLANKTESCFADLGYKQMNAVALVGMITVAELTGFVIPVVIIAWCTWKTTTSLRQPPKAFQGVSERQKALRMVFMCAAVFFICFTPYHINFIFYTMVKESIISSCLIVRSTLYFHPFSLCLASLCCLLDPILYYFMASEFRDQLSRHSSSVTRSRLMSRESGSSMIS	75177	60349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8058_pilon_-_62468_75089
919963	contig_11855_pilon	+	1473	1	Intergenic	novelGene_66919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGTCAACAGGCACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814657	816130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_814700_816100
919964	contig_1143_pilon	+	3562	2	Intergenic	novelGene_86619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	2364	3083	918948	919667	FALSE	85	TAAAAAAATAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPYNNNRLIFLVTIDTKILNEILVNRIQQHIKKIICRDQVGFIPGMQGWFNIRKPINTIYHTNKTKEKDHMIISIDAEKAFDKIQHRFLIKTFTKIGLEGKFLNIIKGIYIKPIANVILSGQRPKALPLRTGTRQGCLLSPLLFKIVLKVLGRAVRQEREIKDIQIGKEEVKLSLFADDVILYIENPRDTTRKLLELIEKFSKVAEYKINIQKSVGFLYTNNENSEKEIRKTIAGHDY	914275	920146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_914942_917250
919965	contig_10748_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_150748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162333	164949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_162300_164900
919966	contig_4783_pilon	+	860	1	Intergenic	novelGene_108373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCCAATTAATAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170228	171088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_170200_171100
919967	contig_7057_pilon	-	4349	6	Intergenic	novelGene_123420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	113	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	4052	4348	1537091	1526459	FALSE	15	CAGCGTCCAACCTGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSLNIINPLDTACRSSACILPSSSGHLTWRRVELQAFPGRTCRDEPLPRAPIAHLTNLTVPPGVTPIPAKGQLEDSHRQMAFGLSAPGRSLPPLLHL	1558139	1526457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1526648_1527491_1527569_1537060_1537190_1537493_1537586_1554220_1555332_1555389
919968	contig_10159_pilon	+	2466	1	Intergenic	novelGene_30832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATTGGTTAACAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554756	557222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_554800_557200
919969	contig_19558_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_164754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCTGATTAAGTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173335	171330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_-_171300_173300
919970	contig_14563_pilon	-	2931	1	Intergenic	novelGene_135034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAAAGGGGTAATGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64974	62043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_62000_65000
919971	contig_18794_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_54666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCAGTGAGGGGCACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342699	345121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_342700_345100
919972	contig_6117_pilon	-	1653	5	Intergenic	novelGene_167307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	35.5624450790437	43	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	280	1005	137284	123747	FALSE	75	TGAAAAAAAAAAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVLKISVAGLDPNAMYSLLLDFVPTDGHRWKYVNGEWVPAGKPEVSNHSCVYIHPDSPNFGAHWMKAPISFSKVKLTNKLNGGGQIMLNSLHKYEPQVHIVRVGGSHRMVMNCSFPETQFIAVTAYQNEEITALKIKYNPFAKAFLDAKERNHLKDVPEAISESKHVTYSHLGGWIFSNPDGVCTAGNTNYQYATPLSLPAPHSHHGCEHYPGLRGCWQSPYPSAYVHRNHSPTGLRFC	137563	123098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6117_pilon_-_123953_127703_127766_129892_129955_135295_135431_137023
919973	contig_7594_pilon	+	6906	1	Intergenic	novelGene_55393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	296	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	4640	5029	365597	365986	NA	45	AGTTTAAACATAAAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAEMVNGYLLSPALLSLWSGQILSWWIGCFCLFAILWFRVFWLSVLVIEVAMVLTLKSLLTLGLISLIFLILFITVLSKLSLSRRNPVKLWSINPIHILSHWSTLSSCTLVVSTLHHFSQHRRVGIPW	360957	367863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_361000_367900
919974	contig_2940_pilon	-	3292	1	Intergenic	novelGene_81873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATTACTACAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320541	317249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_317200_320500
919975	contig_5640_pilon	-	849	6	Intergenic	novelGene_27236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	303.095100587258	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	87	713	63466	24907	TRUE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMAGSLGHLQA	138283	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_24851_24933_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206
919976	contig_5910_pilon	-	6796	2	Intergenic	novelGene_168411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	6337	6672	68688	68353	FALSE	25	GGGGAGACTATGTCGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIETTKILTTGPISNIMINREKIEVVKDFILLISTINTHGSCSQEIKRCSALGKSAAKDLFKALKSKDITLKTKVHLTQTMVFSTDSYACKIWTMNK	179601	68228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_70303_174879
919977	contig_16724_pilon	+	2655	3	Intergenic	novelGene_105310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTTTTCAAGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541152	549633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_542008_543918_543998_547912
919978	contig_6278_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_119825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGAAAAAAGGGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532915	530619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_530600_532900
919979	contig_8377_pilon	+	1895	17	Intergenic	novelGene_34905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3932.29957322605	1	73	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	1388	1894	176629	180509	FALSE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFCWKLIKERLLMKEDSFWLNFRAYHGCSANFLSRTLESLLTRTKTVMLTSFPVNDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68043	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136404_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173672_176586_176703_177253_177349_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
919980	contig_1380_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_138864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTCCAGACACTATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14716	13375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_13400_14700
919981	contig_19006_pilon	-	1429	1	Intergenic	novelGene_145588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71892	70463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_-_70500_71900
919982	contig_4519_pilon	-	2625	2	Intergenic	novelGene_123696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGTCTCTCTCCAGACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532359	529561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_531660_531832
919983	contig_2798_pilon	-	2359	4	Intergenic	novelGene_120027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	772.877020546535	12	116	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	615	1547	116665	115733	FALSE	35	CTGTTGTCTGAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193562	114920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120452_120648_170381_170519_193294
919984	contig_12837_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_57359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAGCAAATAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271855	273834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_271900_273800
919985	contig_9243_pilon	-	5624	1	Intergenic	novelGene_60329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41324	35700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_-_35700_41300
919986	contig_12250_pilon	-	4079	2	Intergenic	novelGene_80515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3346	3681	10935	10600	FALSE	35	AAACTTGCTCTTGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLKRNGVAFIFKKNISRSILKYIAVSDRIISILLQGRPVNTTIIQISSAAEIDQTCNQNVLIFTGDWNTKQRRHIGSWKIGLGDNNDTRDHMMEFFKTNDSFIANIFFQ	72340	10201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_11551_69610
919987	contig_13740_pilon	-	3256	7	Intergenic	novelGene_34638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2953.78348713796	9	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	170	763	165243	158322	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDVAILEVALVMEEEEEDMVVEDLDMATRVGATEVVMTTMEEEIMEVEVTMILEIITSNLLTTVQ	165412	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_161131_161270_161574_161722_161919_162031_165237
919988	contig_14441_pilon	-	3885	2	Intergenic	novelGene_100806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162636	155701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_159263_162312
919989	contig_5758_pilon	+	1658	1	Intergenic	novelGene_119077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115748	117406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_115700_117400
919990	contig_12969_pilon	-	2330	4	Intergenic	novelGene_61667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13.6381816969859	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	180	2258	300665	297716	FALSE	20	GACAATGTGGTAGTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYNNLVSVAGKPDALSKLEQGEELWTTEDEIHCRICPEIRKVDDHLQRHLQKQRIQKCAEQCYEHNAFGNIFNQRKSNFPLKQHHMFDLHRKTLKSYLTLENQNTSGDLIMLNKFNGYGQSFLHDKHEQLYTDNKFQESVKLNSYNSQVIKHQRTAKLEKAHVCSECGKVFIKKSQFIDHQKVHTGEKPHGCSMCGKAFSRKSRLIEHRRTHAGLKHYECTECDKTFLKKSQLNIHQKTHVGEKPYACNECGRAFSKKCRLIYHQRTHTGEKPYGCNLCGKAFSTKFSLSTHQKTHTGEKPYTCSECGKGFFEKRRLIAHYRTHTGEKPFICSECGKGFTLKNSLITHQQTHTKEKSYTCNECGKGFSMKHCLIVHQRTHTGEKPYICNECGKGFPLKSPLIRHQRTHTGEKPYVCSECGKGFTMKSDLIVHQRTHTAEKPYVCSDCGKGFTVKSRLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKAFPAKIRLVGHQRTHTGEKPYVCNECGKGFTEKSHLNVHRRTHTGEKPYICNECGKGLTGKSMLIAHQRTHTGEKPYKCNECGKGFTMKSTLGIHERTHTGEEPYKCNECGKAFRKKTCLIQHQRFHTGKTFFACTECGKFSLRKYDLITHQRIHTGEKPYECGVCGKAFTTKSGLNVHHRKHTGERPYECNDCGKSFAHLSILVKHRRMHT	311895	297643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_299674_300198_300286_300631_300759_311809
919991	contig_5033_pilon	-	2220	15	Intergenic	novelGene_28992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3690.33054282487	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	27	1448	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566813	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531165_531533_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542159_542738_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
919992	contig_6589_pilon	+	2076	14	Intergenic	novelGene_25725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	63.7481175032416	1	74	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	803	1459	479605	507033	FALSE	45	TACATAAATATACTATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451705	507650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457290_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884
919993	contig_8328_pilon	-	2188	3	Intergenic	novelGene_174044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	40	junction_1	15.5	134	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	290	343	81902	81849	FALSE	45	CCATAGGTATACCAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDSGTLDTVGAVVVDQEGNVAAAVSSGGLALKHPGRVGQAALYGCGCWAENTGAHNPYSTAVSTSGCGEHLVRTILARECSHALQAEDAHQALLETMQNKFISKYNIKKVISF	167045	80003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_-_81995_161272_161352_166927
919994	contig_5669_pilon	-	2953	1	Intergenic	novelGene_86109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2405	2740	482212	481877	NA	70	GAAAAAAATTTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTRHKESISPTERKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRPDREHSRESQTEQEKGGVQKSNSSEKTRLNGLTETGGTPESMAPGFSIGPEIKQFPRPTLHTGIGLDCGT	484616	481663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_481700_484600
919995	contig_15732_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_88875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	285	821	161952	162488	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDNPNYQGIWKPRKIPNPDLFEDLEPFKMTSFGAIGLELWSMTSDIFFDNFIVSGDRRAVDGWASDGWDLKKAADGAAEPGVMDQMIEAAEEYPWLWVFYILTVALPMFLVILFCYSGKKQLSAMKYKKTDAPQTDVKEEEEEKEKEKDKGDEEEEGEEKLEEKQKSDPEEDGGTAS	161667	162893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_161700_162900
919996	contig_7327_pilon	+	1683	2	Intergenic	novelGene_172122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118132	132348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_119163_131695
919997	contig_12901_pilon	-	3281	1	Intergenic	novelGene_142986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	168	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAAGTAGAGAGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150442	147161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_-_147200_150400
919998	contig_8712_pilon	-	3462	7	Intergenic	novelGene_58729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	773	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGCAAAATACACGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13065	960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_1098_2102_2254_2342_2442_5369_5465_5545_5674_8141_8436_10507
919999	contig_9727_pilon	+	2520	6	Intergenic	novelGene_86341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	174	junction_1	199.309207012621	1	136	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	113	772	425838	430935	FALSE	55	AAGCATGAAGGTAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLREWRQTKWEIGPGCGLPVPTGGFSLGQPRIPPRTMDSGTRPVGSGCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKSSVWKRLKSPFRKKKESVT	425249	432683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_425321_425796_425944_426077_426135_428941_429016_429240_429433_430704
920000	contig_1225_pilon	-	1984	4	Intergenic	novelGene_44149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCCCACAAAGAGCCGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276795	250592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_250837_253413_253517_274219_274478_275416
920001	contig_5062_pilon	+	1331	5	Intergenic	novelGene_157865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_4	61.8359725402617	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	355	786	739675	743539	FALSE	60	GGAAAGAGAAAAAGTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRYLI	739163	744084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743422
920002	contig_11316_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_122682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCAAGATTTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	139423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139400_140500
920003	contig_12000_pilon	-	2813	1	Intergenic	novelGene_43179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502830	500017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_5e+05_502800
920004	contig_15449_pilon	+	2879	3	Intergenic	novelGene_33590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_1	731.5	86	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	236	1204	37166	43282	FALSE	25	CCTGCTATAGCAAGCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEM	28085	44957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_28142_36986_38069_43216
920005	contig_7843_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_152018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACGGTCAGCAGTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180914	179524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_179500_180900
920006	contig_3193_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_126317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGGGAAATGACAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107202	109344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3193_pilon_+_107200_109300
920007	contig_20165_pilon	-	5688	1	Intergenic	novelGene_54475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	263	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1919	2218	64567	64268	NA	45	AGGAAACAATTCCATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRTEINEIENRKTVERINKSRNWFLKKINEIYKPIARLTKKQREKMQITKTRNVSRDITTDPTEVKRIITENYELYFNKIDNFDEMNKFLETHNLPN	66485	60797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_60800_66500
920008	contig_3077_pilon	+	1485	9	Intergenic	novelGene_26679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3315.48389190779	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	39	869	9676	17462	FALSE	25	ATTAACAGTGTGCGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQSTAGLSSSRCLHFCGPTALTGWTWPGSTLDGETRSISPPWSRHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTSAKPQSTDSLASRSPTPPRATSGWGTMTRKVSKARCST	9637	18078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13047_13171_15137_15262_16144_16296_16947_17054_17449
920009	contig_4364_pilon	-	958	6	Intergenic	novelGene_134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_5	73.0824192265144	51	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	53	631	1116749	1113176	FALSE	45	TGTATTTTATACAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSSARGRARRRPAPVPMQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDGKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASFENVRAKWYPEVRHHCPHTPILLVGTKLDLRDDKDTIERLRDKKLAPITYPQGLAMAREIGSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPPPVKKPGKKCTVF	1116801	1112848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1113307_1114806_1114967_1115484_1115548_1115798_1115917_1116009_1116082_1116714
920010	contig_5415_pilon	+	3579	5	Intergenic	novelGene_146126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	87	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1582	1938	259116	308101	FALSE	90	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEASKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQEVACDQELMVLKEEVQAALKALVKNKASGIDRIPTEMFQKIDAALQVHTRLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGDPTECGNYRTVS	91418	309742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_91907_92433_93000_112954_113428_259061_259135_307763
920011	contig_5623_pilon	-	1737	12	Intergenic	novelGene_154828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	391.804408110572	10	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	251	1531	212514	207141	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCSVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHTRLLSSWELPGCRGVGSSSHLVPTVQRGTPVLSPPPATSVLPSPARPPLTVICGGHLQGRPVP	213740	206934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207332_209312_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211121_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619
920012	contig_11922_pilon	+	2234	1	Intergenic	novelGene_176475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAGAAGTCCCCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5982	8216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11922_pilon_+_6000_8200
920013	contig_10074_pilon	-	2493	5	Intergenic	novelGene_57176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	488	junction_1	51.2072992843794	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	1018	2010	561932	558945	FALSE	45	GGAAAAATAAATTCCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFHKLWQDCGGNFPEGPRPGPLGSTTEGRFIKKEPNLFSPGAVATETPRPSSQAEPYYSPPVSVSRALPHHGSAASSMMSSPSSSWPSVARPSSQSVSTNPPNSFSTATLSSNSQAIPPFLGIPLASDLNASSACVYSNSNDIGRMEASSMSPADLYGISDASMLSDCSVDMMASCNESMRETDNHRLVSMHLDSPTCTSVLDPRNLRQLCPMASSGGSGASSTAAAFVSQPDAFEGSSFGCASNGLIHESGAADSTNPGSHGFVQSGQYSGISTMPNEQLGDSFAYEFFQV	563056	558461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_559724_560818_560891_561019_561089_561859_562073_562179
920014	contig_10793_pilon	+	1409	15	Intergenic	novelGene_83412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2837.28569000985	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	75	1001	146975	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130927	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
920015	contig_9484_pilon	+	3422	3	Intergenic	novelGene_105694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_2	3.5	74	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	190	432	263613	264101	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILPLFYPCQYYLLKNEQFLSHLLLFLHLDSGIPQGVTQQVTHKVAQHLTGASHGDNVKLLNSMIQAHISVSTQLNEVGPIAVLEFWVQALISQHLWYREQPILFLMDHLCKTAFQLMQEDCVQKLLYQQHKVSLLEKLSFSH	258447	267091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_258501_263476_263622_263867
920017	contig_2892_pilon	+	3056	1	Intergenic	novelGene_119022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	442	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCTTGTACGAGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273197	276253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_273200_276300
920018	contig_12540_pilon	+	2549	15	Intergenic	novelGene_148085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	364	junction_11	114.523703098654	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	134	1225	947894	965234	TRUE	40	ATAAGAAGTATAGTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRKPTGLFYLLDEESSFPHATSQTLLAKFKQQYEDNKYFLGTPVMEPAFIIQHFAGRVKYQIKDFREKNMDYMRPDIVALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAVHAMAVLREAGRLRAERAEKAAGTDGSGIRNHPGEPQRTASTASEKLYRDLHDQIIRTIKGLPWQGEDPRRLLQSLSRLQKPPAFILKSKGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIISMTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLEALGKAEPFFIRCIRSNAEKKELCFDEELVLQQLRYTGMLETVRIRRSGYSAKYTFQDFTEQFQVLLPKNALPCREVISTLLEKMAVDKKNYQIGKTKVFLKELERQALQETLHREVMRKILLLQSWFRMVLERRHFLQMKRAAVTIQVP	944629	975033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_944678_947808_947951_948990_949196_950806_950886_953923_954038_957543_957584_958647_958771_960893_960975_961437_961549_963670_963794_965075_965474_966214_967070_968471_968539_968690_968816_974995
920019	contig_14895_pilon	-	1622	1	Intergenic	novelGene_106703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	892	1191	295422	295123	NA	25	CCTTTCTGGAGAACATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWHSIASGDEYRTSFSGCLKAQPESGGVFPQAEFSRTLSDQAALAPEWQVFPDRSQRISGFRPGAFLSFFPSSSYSSLLWGILFLLNNINTKPSCWDC	296313	294691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14895_pilon_-_294700_296300
920021	contig_19775_pilon	-	1525	1	Intergenic	novelGene_147750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208782	207257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_-_207300_208800
920022	contig_11171_pilon	+	1058	9	Intergenic	novelGene_48541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1593.89604722987	40	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	48	833	41803	65739	FALSE	5	GCTGTGTGTGGTCTGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHVVLSPVWFLYSLFMKLFQRSTPAITLESPDIKYPLRLIDKEIINHDTRRFRFALPSPQHILGLPIGQHIYVSARIDGNLVVRPYTPVSSDDDKGFVDLVIKVYFKDTHPKFPAGGKMSQYLENMKIGDTIEFRGPNGLLVYQGKGKFAIYPDKKSDPVIKTVKSVGMIAGGTGITPMLQVIRAILKDPDDHTVCHLLFANQTEKDILLRSELEELRNEHSTRFKLWFTVDRAPEAWDYSQGFVNEEMIRDHLPPPLDCFRCLASQPGPPARWWG	41755	65964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_41887_48681_48755_49127_49235_51071_51202_51762_51847_52056_52143_60501_60602_64785_64848_65679
920023	contig_8210_pilon	-	5459	1	Intergenic	novelGene_30218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19038	13579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_13600_19000
920024	contig_6898_pilon	+	3719	14	Intergenic	novelGene_35667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	185	1918	59668	125646	TRUE	5	TTTTTTTTTTATTTTGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59483	127604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126168_126324
920025	contig_9415_pilon	-	2821	5	Intergenic	novelGene_109924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTACCAGTACCAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463558	2201221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2202029_2256697_2256724_2275991_2276310_2276368_2276707_2462226
920026	contig_5758_pilon	+	2408	1	Intergenic	novelGene_119058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGTTTAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53216	55624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_53200_55600
920027	contig_6109_pilon	-	4674	1	Intergenic	novelGene_160391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	128	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCGATATAAATCTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640865	636191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_636200_640900
920028	contig_1150_pilon	+	240	1	Intergenic	novelGene_61439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCGCCGCCTTGGATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308933	309173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_308900_309200
920029	contig_7775_pilon	+	1764	1	Intergenic	novelGene_37497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAGGAGATTATTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252892	254656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_252900_254700
920030	contig_7057_pilon	+	4144	4	Intergenic	novelGene_123411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	11.7851130197758	176	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	71	1669	1391215	1410470	FALSE	60	AGAATAAAACCAACACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGSVTFRDVAVDFSQEEWECLDPAQRDLYRDVMWETYSNFISLGPSISKPDGITLLEEGKEPWMAVREGAGKHGRDLESTYRTNNLSPEKDIYEIYSFQWEIMERIKSYSFPGCIYGNDWECQNKIEGQKEPQEGYFRQVKITPEKITTYKKHSFLTEYQRIHNGEKLYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKACGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLHECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYACKECGKAFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPYECEECRKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNAI	1391144	1412945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1391224_1397566_1397694_1398881_1398978_1409103
920031	contig_10930_pilon	-	2505	4	Intergenic	novelGene_37030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1577.5798623912	25	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	871	1368	276835	272993	TRUE	15	CTATGATTTTCCAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQAQC	277705	267597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273005_273950_274325_276723
920032	contig_3153_pilon	-	4044	3	Intergenic	novelGene_104639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	223	522	170281	169982	TRUE	60	GTACAATGAAGAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKVGGLILPDFRVYYTAMVVKRARYLYKNRYIDQWNRIENPEVNSSTYEQLIFDKGPKSINCGKISLLNKWCWHNWISICIKMKQDPYLTPSTKTNSK	170503	71274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_71569_71634_74419_169537
920033	contig_3832_pilon	+	4689	3	Intergenic	novelGene_161451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	136	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1380	1769	346235	346624	TRUE	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLQLENLKGRTHSAFLKLKELKKKFKSRVAILKDSIGKKLNDTGSIKRRRQEYKESMYQKELVDVQPFQEIVCDQELMILKEEVQAALTALAGKKRHQELMEYQLRCFNKQMQLWKCSLVYVKKFR	311450	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_311862_345266_346905_484255
920034	contig_4429_pilon	-	3009	1	Intergenic	novelGene_50819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1990	2328	202948	202610	NA	20	GGGTCAAGTGCATCTTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFLDYIDYTRRKKIFGNDEINLSYFHTMLYLVVCLVCHFDAKFSVSLPTVPPYATQLHISMPLYLHNLCFKCPSPSSLVQQSIDHTFKTQQSTTSQLFGGEGEQLCSIKF	204937	201928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_201900_204900
920035	contig_3747_pilon	+	2336	5	Intergenic	novelGene_24941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5170.10275526512	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	54	662	202422	203441	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGEPDLMPFLPHSACCLGL	202368	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_204117_204207
920036	contig_17560_pilon	-	2999	7	Intergenic	novelGene_167580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	952	1251	85029	84730	FALSE	50	TAAAAGGTGTTACACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVQLCHFLLFILQLGLQAVHFNLVTGHCGLILFQCGGQGHLPLLLRLNNPFHVVVSFFECPYHFLSFLIVLFCHLQSIAQMLLDTKKLLSFKASILS	153942	82981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_85172_86417_86630_102771_102844_103946_104125_107089_107252_139637_139729_153848
920037	contig_10252_pilon	-	3302	1	Intergenic	novelGene_162909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73040	69738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_69700_73000
920038	contig_5758_pilon	+	1859	3	Intergenic	novelGene_119118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGCTGCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404773	412800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_404898_406662_406788_411190
920039	contig_5686_pilon	-	2989	1	Intergenic	novelGene_45460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTGGTGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223772	220783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_220800_223800
920040	contig_10431_pilon	-	3138	1	Intergenic	novelGene_117386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	238	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	963	1418	6573	6118	NA	35	AAAAAGCTAGGTTTCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPLILMPCSSSYIQLLELFVQHTDRISIVKGYNPMHTFPDFKPHSIPCSLQTTASCSMYRFCINTVRCSGIPLLRNVIRNDPQCLCIVNKIQVNIFLVFSAFSQDSSDISNDIPCSMSSSESGLNFWQFPVNVLLQPLLNYLQQNFACV	7535	4397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_-_4400_7500
920041	contig_8866_pilon	-	3070	1	Intergenic	novelGene_77826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGCAACAGTCAAGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574169	571099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_571100_574200
920042	contig_16064_pilon	+	2234	5	Intergenic	novelGene_179003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	750	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGGTAAACGCTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8282	23159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16064_pilon_+_10144_10785_10909_16450_16505_17470_17581_23073
920043	contig_13097_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_107678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	374	829	77418	76963	NA	50	CGATAAAGATCATGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKTVNVIHHINKTKDKNHMILSVLAEKAFDKVQHAFMIKPLNKIGIEGKFLNIIKGIYIKPTANIILNGETLKAFPLRTDTRQGCRLSPLLFNIVLEVLARAVSLEKEIKGIQIGREEVKVSLCADDMIVYTENPKESTRKHWN	77791	76209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_76200_77800
920044	contig_11815_pilon	-	3082	2	Intergenic	novelGene_50957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	393	1163	500284	499166	FALSE	25	GTGCCCATCACTGGATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKTEGGRERKEKNEQIKIRKVKELQSSQGSHRCRYEVWGSRSQVSQHSLVRRRRGIQCLVFRNQKEKEETERRDQRKQKKKKGKKKKRKNNTCSPQTAPKEPPARSRGIQTAGSPGPRSRSPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNVAPQPRRKGQRRRSEPGTRAKGGRGSEGQARNQKKQKKQHQHPTNGTQRAARPGARNPSNRCPPAKRPWPREAGEPQPGQRGVGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	500676	497246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_499707_500054
920045	contig_3916_pilon	-	2295	1	Intergenic	novelGene_141857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42939	40644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3916_pilon_-_40600_42900
920046	contig_15063_pilon	-	1734	7	Intergenic	novelGene_9495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.94427190999916	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	980	1303	35891	35108	TRUE	20	GTCACATTGCCATGTGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34925_35033_35380_35839_36156_36264_36597_38972_39090_39504
920047	contig_6496_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_103520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	753	1097	888056	887712	NA	15	ACTGCCACATCTTTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSITSYACESWTINKEERRRTDAFELWCWRRILTISWTARRTNKSVLEDVQPECSLETRMATLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIILGKAEGQQKRRRPSTRWTDALAAKNRLKH	888808	887592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_887600_888800
920048	contig_9995_pilon	+	2637	2	Intergenic	novelGene_47738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534148	562027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_534182_559423
920049	contig_14441_pilon	+	1900	4	Intergenic	novelGene_100460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	29.5108266385218	80	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	24	401	85423	87540	TRUE	15	TGCCGTTTTTTATTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRPGDPAMRALPLACALLCLLQPGLMGAQVIQTPRYSVRRSEKRVLLECTRQNVLVSTRPSFGAAADPCSYDVDSTEKGDALDGYSVSRKTKGGFSLTLGLASPNQSSVYLCASSESTARCSHIFSEQKAEG	85399	93648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_85472_87050_87372_87532_87795_92403
920050	contig_6361_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_23887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACACAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101510	99694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_99700_101500
920051	contig_12079_pilon	+	4063	12	Intergenic	novelGene_67426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	1379	2011	581102	584370	TRUE	35	AGCGCTAGGAAGCCGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWVLLLSSLAWDNSLVKVCSLPLHALILLGLGDPLLLIAVVHDALTGELGAVACVLGALLLQVVLDVVIHRLIHGGRGRRGRCHHQVQLLPGLHQVVLRLFGPVLPFLHLVLLAPPRLFQQGNLGCVLSELRGLLLLALYLIHSLSLQLLLGPQRGPHGQPPSALPPPGHASSPPPAAGLSGSARKVLEDTGQRCLSTQLLKDPGALA	579723	638789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582169_583661_583759_584145_585378_585891_586056_591616_591713_598002_598155_599466_599548_600607_600887_601783_601877_609187_609274_638695
920052	contig_6175_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_16360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1765	2082	1742913	1743230	NA	65	TCAATAAAAAAAAAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLVPTHLEQRKIKNTKDTRKIISPRDRKGHINQRLHQHKTSRTRWCLATTDDRPDREHNRESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNSLRLEGPQKTWPPDALLAQN	1741148	1743558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1741100_1743600
920053	contig_12119_pilon	-	2617	1	Intergenic	novelGene_88693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTAGATCATTTCTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414074	411457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_411500_414100
920054	contig_5744_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_149344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGAATGTTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644013	642682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_642700_644000
920055	SIRV6	+	956	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-22	154	-16	-93	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	237	728	1733	10736	TRUE	35	AAGAACCTGACATCTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1108	11177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
920056	contig_3153_pilon	+	3486	2	Intergenic	novelGene_104693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	25	297	350837	351109	TRUE	50	GGACGAAACAAATCTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLFPSPKNMALCAISTPRWTVQDHSAGEPLPWSTPTSQSAPSWLFPSFFFARYLVFLYRLPFFSPEHLALFIISAPSRRDVKCCSAREPHTQSMLPSQ	350812	354499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_354078_354278
920057	contig_11417_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_103272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	331	726	293110	292715	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLKIDISFDPAMPLLGLYAREIRVITQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDERINYDTYTQWSTMQQERTMMNL	293440	291566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_291600_293400
920058	contig_11160_pilon	+	3170	2	Intergenic	novelGene_168829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2728	3039	322577	322888	FALSE	50	GTTATTTATGCAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFISGPCSWKKVIIWTVKGISWLFPLVIRCIPVLAGWLVAGRPGGVWRACESLSGSRGRRGSQGSAFSLGHPRNNCSEWEGPLPACGRQPVRAELEVGESHC	318198	323019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_319012_320662
920059	contig_10765_pilon	+	2066	2	Intergenic	novelGene_122947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCCAAAAAAAAAAAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306518	473066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_308523_473004
920060	contig_14683_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_166047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCTCACAGTGACTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159285	157263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_157300_159300
920061	contig_16098_pilon	-	2016	2	Intergenic	novelGene_46166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	0	47	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1133	1492	463853	463494	FALSE	35	GCTGGCTGAGAAAATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEHCPSPEPQVISDLTSHLTLHPENLSCSKGHFPIPGLAWSLTELCNCHCHQLCPWPQGASLLSHSHPGHVLLQPLGLMPRHAQSSHRSSLSPGRRGVGWCRAVLSVSKNMLFLFPKR	466279	462969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_464885_466178
920063	contig_11338_pilon	-	3969	19	Intergenic	novelGene_6199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	110.793044752061	33	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	791	1540	13877	12549	TRUE	25	AGGGGAGAGGAGCCGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYSKWAGWGQGAGVAGPFPVLTWPPLCLPVEQSR	21396	7613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_8187_8741_8921_9811_10004_10505_10736_10853_10918_11045_11140_11263_11434_11537_11635_11718_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14105_14167_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
920064	contig_15248_pilon	+	523	3	Intergenic	novelGene_149153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAGACTAAATGGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136383	153936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_136460_144936_145251_153803
920065	contig_14925_pilon	-	1523	5	Intergenic	novelGene_55347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	895.406716246868	23	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	83	502	116065	113125	FALSE	5	TTGTGTGCACTTGCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAITYLKWLPLKPVFF	129483	112103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113166_114700_114779_115150_115208_115821_116101_129436
920066	contig_990_pilon	-	4430	22	Intergenic	novelGene_76075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	107.181157175666	126	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	7	2238	1142804	1094379	FALSE	15	TGTTACCCGTGAGTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTSLEKIVDPTLAEMGKNLKEAMKMLEDSQRRTEEENEKKLLSGDIPGPLQGSGQDMVSILQLVQNLMHGDEDEEPQSSRIQNIGEQGHMALLGHSLGAYISTLDKEKLRKLTTRILSDTTLWLCRIFRYENGCAYFHEDEREGLAKICRLAIHSRYEDFVVDGFNVLYNKKPVIYLSAAARPGLGQYLCNQLGLPFPCLCRVPCNTMFGSQHQMDVAFLEKLIKDDIERGRLPLLLVANAGTAAVGHTDKIGRLKELCEQYGMWLHVEGVNLATLALGYVSSSVLAATKCDSMMLTPGPWLGLPAVPAVTLYKHDDPALTLVAGLTSNKPADKLRALPLWLSLQYLGLDGIVERIKHACQLSQRLQESLKKVNHIKILVEDELSSPVVVFRFFQELPGSDSGPKAVPAPNMAPSAAGQEGHSCDALNRWLGEQLKQLVPASGLTVTDLEVEGVCVRFSPLMTAGVLGTQNEDVDQLVASIKSKLPVLTCTLQLREEFKQEVEGTAGLLHVDDPNWPGIGVVRYEHANDDKSSLKSDPEGEKIHAGLLKKLNELESDLTFKMGPEYRSMKSCIYIGMASDDIDVSELVETIAVTAREIEENSRLLENMTEVIRKGIQEAQVQLQKANEERLLEEGVLRQIPVVGSVLNWFSPLQPSQKGRTFNLTAGSLESTEHTYVSKVQGMGVTPPPTPSGTRTKQRLPGMLINIGKNQLDFSWENKPLHHVTVFPQVCCYLDSFIFLVP	1142810	1092186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1094609_1095418_1095516_1095603_1095697_1096604_1096727_1097050_1097170_1097807_1097980_1099020_1099127_1100358_1100448_1101854_1101919_1108873_1108925_1111229_1111356_1112823_1112926_1113085_1113135_1114036_1114122_1118059_1118139_1118940_1119010_1120917_1121108_1123215_1123363_1125109_1125191_1128026_1128093_1128586_1128661_1142783
920067	contig_16999_pilon	+	1317	1	Intergenic	novelGene_84986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCATAAAAATAATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114425	115742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_114400_115700
920068	contig_5033_pilon	-	2270	2	Intergenic	novelGene_28948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1611	1946	451758	451423	FALSE	85	AAAAAAAAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	454134	451098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_452151_452916
920070	scaffold_13505_pilon	+	3256	2	Intergenic	novelGene_111548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	68	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2152	2502	601239	601589	FALSE	25	GTGTACTTCCCAAGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTFLWGLLNSPGQSGNGLEHIATCGLQIESQVKDSAVQNSSWGAALAGDSCRSSRTPAVSKLFLPVRPVLEAKIQLWLQAPQVPLESGGLGQGLGKELPGADLLCEDTRGPQVRV	597406	602343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_597531_599211
920071	contig_6871_pilon	-	1270	1	Intergenic	novelGene_21650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741038	739768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_739800_741000
920072	contig_2215_pilon	+	873	1	Intergenic	novelGene_163866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	259	507	245717	245965	NA	35	TAATATCAAGTTTGCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVASASEDNDEVWSDSEQSFLDPDIGGVAVAPSHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSLNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKIHGKKVKREPPEPHESSEPTYLRFIKSLTERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNRYI	245458	246331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_245500_246300
920073	contig_610_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_76821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337967	335324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_335300_338000
920074	contig_14525_pilon	+	2630	11	Intergenic	novelGene_149788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	48.6979465686183	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	54	2519	240706	277363	FALSE	30	TGTTTATTTTATTGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSTKYPAFPATPTLLKRFGSQLIKSTVLSASTSLRVLALGGEAFPSLTVLKNWRGEGNKTQIFNIYGITEVSSWATVYRIPEEILNSTVKCELPVQLGFPLLGTVVEVRDTNGFTIQEGNGQVFLGGRNRVCFLDDEMTVPLGTMRATGDFVTVKDGEMFFLGRKDSQIKRHGKRLNVELVQQVAEELQQVESCAVTWYNQEKLILFIVSREDLVKDYIFKELQEHLPSYAIPDELVLIDALPFTSHGKIDVSELNKIYLNYMNLKSDCKLNGKEELWGKLQHLWKSVLSLSEDPSMIPKESLFLPSGGDSLKSIRLLSEIENLVGVSVPGLLEIILSSSILEIYSHILQTVFADEDLPLSKSYATKRKFSDINQEEADGKSSHQKCGMPLNCDNAINAFIALNRGSQILSLNTTRFLTKSGHCPSACSSDLTSQINIQNVKSINPPPIIEKSEKPSFVAKVSEEEKPVIGAEKLELRVRWRSDTGKCVDASPLVVVPAIDKSSATVYIGSHSHRMKAVDLYSGKVKWEQILGDRIESSACVSNCGNFIVVGCYNGLIYVLRSNSGEKHWVFTTQDAVKSSATMDPTTGLLYIGSHDQHAYALDIYEKTCVWKLKCGGTVFSSPCLSLIPHHIYFATLGGLLLAINPATGDRVWKHFCGKPLFSSPHCCLQYICIGCVDGNLLCFTHFGEQVWQFSTNGPIFSSPCTSASEQEIFFGSHDCFIYCCNMKGHLQWKFEATSRVYATPFAFQNHNYSDETLLAAASTDGKLWILESKSGQLQSVYELPGEVFSSPVVWESILIIGCRNNYVYCLDLLGGNKK	240652	277474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_240736_255509_255752_256129_256237_256782_256956_257389_257583_258438_258555_260123_260920_272787_272952_274254_274378_275133_275266_276973
920075	contig_6047_pilon	+	5609	15	Intergenic	novelGene_24233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_1	107.978833904745	137	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	1	2382	222023	261205	FALSE	45	ATGTAAAATAAAGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPSLLNWRRVSSFTGPVPRARHGHRAVAIRELMIIFGGGNEGIADELHVYNTVTNQWFLPAVRGDIPPGCAAHGFVCDGTRILVFGGMVEYGRYSNELYELQASRWLWKKVRPQPPSSGLPPCPRLGHSFSLYGNKCYLFGGLANESEDSNNNVPRYLNDFYELELQHGSGVVGWSIPVTKGIVPSPRESHTAVIYCKKDSGSPKMYVFGGMCGARLDDLWQLELETMAWSKPEAKGTVPLPRSLHTANVIGNKMYIFGGWVPHKGENIETSPHDCEWRCTSSFSYLNLDTAEWTTLVSDSLEDKKNSRPRPRAGHCAVAIGTRLYFWSGRDGYKKALNSQVCCKDLWYLDTEKPPAPSQVQLIKATTNSFHVKWDEVPTVEGYLLQLNTDLPYQAASSDSSAAPNIQGIMMDPHRQGSNSIVPNSIDGTVNSAKTERIAVKGTSVKNNPDIKASTDSNAILLSSLATNASNHNSCMVDILRKNEGPHTSANVGVLSSCLDLRTVIPETSVSSTVSSSQTMVTQQSIKTESSSTNGAVVKDETSLTTFSTKSEVDETCALPATKISRVETHAAATIPFSKETPSNPVATMKAGEQQWCDVGIFKNNTALVSQFYLLPKGKQSIAKVGNADVPDYSLLKKQDLVPGTGYRFRVAAINGCGIGPFSKISEFKTCIPGFPGAPSAVRISKNVEGIHLSWEPPTSPSGNILEYSAYLAIRTAQIQDNPSQLVFMRIYCGLKTSCIVTSGQLANAHIDYTSRPAIVFRISAKNEKGYGPATQVRWLQGNSKKAPLS	222022	264432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_222186_223694_223844_225076_225238_231193_231403_232349_232435_234956_235064_235173_235363_240292_240461_240949_241003_248720_248899_253393_253598_254125_254203_256168_256307_258525_258712_260890
920076	contig_5988_pilon	-	2314	1	Intergenic	novelGene_15987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATATGTCAAAATCCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670543	668229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_668200_670500
920077	contig_7083_pilon	+	2869	1	Intergenic	novelGene_125162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCAGCATAATGTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157997	160866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_+_158000_160900
920078	contig_4900_pilon	-	2488	1	Intergenic	novelGene_159053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1892	2194	726134	725832	NA	40	TACAGAGAATCAATGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCAKDPELENQKGRTASAFLKLKELKKKFRAAVLKESMDKILNDAGSVKRRWKESDMEREKGGVQNANSSKKTRLNGLTETGGTPESMVPALSISPELK	728025	725537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_725500_728000
920079	contig_9363_pilon	+	3389	3	Intergenic	novelGene_6491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	243	554	387040	387351	TRUE	25	GAATGATTTGTGCACCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQGPHATKNEEPGGECILWTHGPCTEKLLDQGKIDDKDLPPEPTQRGSLLLELEPRIWTSSLLNCERINFSLLKPSTCGISVIGPLDKIEFGTRRAGYCSDT	386625	390357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_386757_386928_387411_387581
920080	contig_5794_pilon	-	1258	1	Intergenic	novelGene_69733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCATTTACTGATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390649	389391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_389400_390600
920081	contig_12148_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_140340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111789	113745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_111800_113700
920082	contig_14556_pilon	-	1145	1	Intergenic	novelGene_138513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTATTCCAACTCATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78886	77741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_-_77700_78900
920083	contig_8269_pilon	+	1806	2	Intergenic	novelGene_106264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	243	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAATGGTGAATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397259	399224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_398858_399016
920084	contig_3252_pilon	+	2097	6	Intergenic	novelGene_61481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_1	86.6773326770038	36	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	277	1203	194324	210363	FALSE	65	CTAAAGCACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQDGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLSPQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAWKRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVTNGMSQLPSVNPSASSGNETTFSGGGGTAVVTTPESDHVPKADGTDVRPEEPLKADSSASSSSSEPKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKGEINTSLCLACGLLWDSSTHTLPSTFMKHATCFLWLIT	189387	211257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_189591_194250_194466_195484_195638_207153_207262_208547_208676_209967
920085	contig_10904_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_22643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAACTCTATCCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510549	511172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_510500_511200
920086	contig_7410_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_106036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAATGCATACTTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14845	12277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_12300_14800
920087	scaffold_12124_pilon	-	3025	4	Intergenic	novelGene_22016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1116	1424	810895	810587	TRUE	30	CTGTAAGAGTCCAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSAAMNLGAHVSVFNSLVSVFNPTPRSEIARHMVVLGLTLKSPTLLAVLPFKKKPNEQGAEEGPQDHQYIDVLGAGFSFFKACRESVKRKAHIYDQVSTHG	812010	804060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_804234_807297_808462_809815_809949_810455
920088	SIRV7	-	697	4	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	149	-14841	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCGATAAATAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147769	70878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680_114980_147602
920089	scaffold_12124_pilon	-	5285	5	Intergenic	novelGene_22012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	90	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1117	1425	810895	810587	TRUE	35	CTGAAAACAAATGGCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSAAMNLGAHVSVFNSLVSVFNPTPRSEIARHMVVLGLTLKSPTLLAVLPFKKKPNEQGAEEGPQDHQYIDVLGAGFSFFKACRESVKRKAHIYDQVSTHG	812011	800004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_800146_802988_803111_803837_803971_804058_804234_807297
920090	contig_1372_pilon	+	2651	13	Intergenic	novelGene_140517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_12	38.5789234340894	11	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	1310	2473	457535	484809	TRUE	40	TACATTACTTGAAGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGDLKRSLRNLEQVLRSLNYPQEVDCVGLIKGDTAASLPIISYSLTSYSPYIAELLMKSNVELIAKNDLRFIDTLYKLLRDQFNYKPVLTKKQFLQCGFAEWKIQIICDILNFVMKKHKELSGFEKTPSQQRKKISFGKSEPLGSEKTSTEPVSIDVTGRFMTSGKKKAVVIRHLYDEDSANVPEDTLSTGTDVHEGFDVSDIKPAEIKTPEIKVPEIKSEQQGMKFDPEITVLQTMLAECQEKLKKLSWLESRVECLEEKMKGKVMVNEKTWTNLLSRVTLLETEMLLLKKNDEYIELNEMREDSASSRHMDHLSSDRTSKEERPASLPLSSGYSTSSSESAPRTLTINYCGLRDDSEETTIQKMERMKKMFEETAELLKCPAH	451713	487438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_+_452033_453613_454554_457484_457624_465653_465802_467188_467336_467692_467813_469559_469731_470835_471043_471793_471870_483575_483701_483958_483997_484766_484853_487303
920091	contig_13014_pilon	-	2655	14	Intergenic	novelGene_169324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_2	201.617072161517	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	195	1253	306937	282922	FALSE	75	AAATTGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILLPFRFRFSGWGTIIFSCFVCIGQVVFALGGIFNAFWLMEFGRFIFGTGGESLAVAQNTYAVSWFKGKELNLVFGLQLSMARIGSTVNMNLMGWLYSKVEASLGSAGHTTLGVTLMIGGITCILSLICALALAYLDRRAERILHKEQGKTGEVIKLSDVKDFSLPLWLVFVICVGYYVAVFPFIGLGKVFFMEKFKFSSQAASAINSVVYVISAPMAPVFGFLVDKTGKNIVWVLCAVATTLVSHMMLAFTLWNPWIAMCLMGVSYSLLACALWPMVAYVVPEHQLGTAYGFMQSIQNLGLAIVSIIAGVILDTRGYLFLEVFFIACVSGGNLNYSAKQREEIKLSHTE	308865	281519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_282926_285401_285460_288244_288358_290339_290438_291850_292008_292340_292398_293457_293570_295240_295340_297483_297587_301155_301265_303161_303230_303537_303581_306899_306953_308686
920092	contig_14077_pilon	-	3159	1	Intergenic	novelGene_174865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTATCAATCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47528	44369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_-_44400_47500
920093	contig_14687_pilon	-	2550	1	Intergenic	novelGene_107950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577788	575238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_575200_577800
920094	scaffold_12510_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_151397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410003	408167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_408200_410000
920096	contig_18735_pilon	+	2412	1	Intergenic	novelGene_132689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1890	2195	95841	96146	NA	60	AAAAGCACATAGAGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKYYSLHQTEYSTTRWCPATPTYCSDRDNRGSQTELEKNVEQNSNSPKKKKKKKDQTYWSDRDWTNPKSMVPGHPLNSVMKSFLRFTLQPKIRQAHKTK	93951	96363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_94000_96400
920097	contig_20842_pilon	-	1303	8	Intergenic	novelGene_160969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	87.2746076637251	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	147867	89919	TRUE	65	ATTAAAAAAAAAAAGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVGKSQTLKYPRSNSSICSLPFLAKICQEIKSAIKKSVPFKDSDSDKYSVFPTLRGYHWRGRDCNDHSKTAYPGRRPDNWDAHQDSNCNGIWVHSPGESFCWETQLGLISTSLPNGSQRCRYL	147868	59172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_60012_89827_89920_124655_124751_130216_130266_131009_131081_132234_132296_141520_141592_147843
920098	contig_8310_pilon	-	4844	5	Intergenic	novelGene_75596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327569	314987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316341_316402_316755_317712_317884_320574_320710_324736
920099	contig_11590_pilon	+	5085	14	Intergenic	novelGene_125605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1579	1974	859000	859395	TRUE	45	TTAGGTTAAATAAATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMSCSSAGAGFATWRVGGDDSQVVVYTRELDGIDRVFTMVLNFGESTSIVNLAEMISGLPPTVSVRISTNSAYDGSAVETSAITLGKGEGHILEYSTKNPLHRQTALRDRCFVSSRACYSSVLHILHSLC	857421	891988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_860237_860601_860674_861522_861649_862060_862210_865287_865505_866856_867033_869799_869999_873983_874172_874791_875004_878196_878336_879305_879513_880035_880101_881602_881727_891592
920100	contig_12265_pilon	-	1380	1	Intergenic	novelGene_149441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTTATCAATGAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31963	30583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_-_30600_32000
920101	contig_15047_pilon	+	1482	6	Intergenic	novelGene_52189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3070.07324994046	6	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	20	319	2194	3255	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAVSHFPEDVWL	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2764_3221_3452_4241_4434_4552_4687_21013
920102	contig_11364_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_65184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216705	214745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_-_214700_216700
920103	contig_14871_pilon	+	1809	3	Intergenic	novelGene_63743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	23	859	393918	416038	FALSE	40	TACGTAACTGAACGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSAAGPAMGNCAGRTDFEWVYTDQPHTQRRKEMLAKYPAIKNLMRPDPNLKWTVMAMVLAQLVACYLARGLTWRWLLFWAYTFGGCVNHSLTLAIHDISHNTAFGTGRAAYNRWFAVFANLPVGVPYAASFKKYHVDHHRYLGGDGLDVDVPTRFEGWLFCTPARKLLWLALQPFFYSLRPLCVHPKAVTRMEVFNALVQLAVTPPSLPSGGSSPWPTCWPAPCWAWACIPSRATSWPSTTCSSRATRPILTTGPSIGSPSTWATTWSTMTSPASPAATYPWCGR	393895	416988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_394000_413522_414265_416025
920104	contig_10345_pilon	+	3241	4	Intergenic	novelGene_158384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3664	junction_3	404.648818936453	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGATGATATGTTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13208	19219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_14233_14654_14746_16896_16977_17173
920105	contig_9345_pilon	+	990	3	Intergenic	novelGene_24691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	564	953	947931	952498	FALSE	30	CTGTGTCCCACAAAGCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVLAARFHKTRHPDFFFPRLACRAALVAISKTSLTPSLVFAEHSMYPKAPILFAMSLPSSGFTGSCFILASSRLVCSSFRRSFLFPTRMMGTLGQKCLTSGVHFSGMFSKLSGLSMEKHISITSVSG	947367	952535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_948130_949474_949607_952439
920106	contig_18506_pilon	+	1094	1	Intergenic	novelGene_67943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTAAACTTTCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7897	8991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_7900_9000
920107	contig_5954_pilon	-	1727	2	Intergenic	novelGene_28771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392753	1390872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392492_1392645
920108	contig_5832_pilon	+	2488	6	Intergenic	novelGene_134159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	62.1694458717464	25	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1369	2040	443568	447866	TRUE	15	CTGTATTGTACCATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDADDRVVVEYHEELPAVKPARERSASRRSSASSSDSDEMDYDLELKMISTPSPKKSMKMTMYADEVESQLKNIRNSMRADSISTSNIKNRIGNKLPSEKFADVRHLLDEKRQHTHPRPPVSNTKSDIRQRLGKRPYSPEKAFSSNPVIRREPFSDVHSRLGIPRQDIKGLYSDTREKKSGSLWTRLGSAPKTKEKNTKKVEHRAPATEEDDSELQRAWGGSD	442199	449483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_443792_445145_445301_446712_446875_447735_447900_448370_448534_449231
920109	contig_8801_pilon	-	2476	5	Intergenic	novelGene_66252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	47.4150556258242	61	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	204	659	199038	193594	TRUE	30	CATCTAGGGTCACACATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCESSGDSADDPLSRGLRRKGQPRVVVIGAGLAGLAATKALLEQGFTDVTVLEASSRVGGRVQSVKLGHATFELGATWIHGSHGNPIYHLAEANGLLEETTDGERSVGRISLYSKNGVACYLTNRGRRIPKDVVEEFSDLYNEWCCELH	218809	191309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_193118_193584_193615_194487_194715_198830_199065_218632
920110	contig_16970_pilon	+	2857	4	Intergenic	novelGene_157594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	148.492424049175	36	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1601	1996	162175	166536	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSAPSSRFISIYRGPSHTYKVQRLTEFTCYSFRIQAASDAGEGPFSETYTFSTTKSIPPTIKAPRVTQLEGNACEILWETVPPMKGDPVNYILQVLVGRESEYKQVRASVHADVWLPRVCWLHASVHCHE	27153	167397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_27171_27416_27772_160946_162365_166330
920111	contig_15047_pilon	+	1070	6	Intergenic	novelGene_52178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3070.07324994046	5	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	20	484	2194	4413	TRUE	45	ATACTCAAAATTTGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGPDPGRGACGDQACGGWDLPEVGSHCGALWRGAKIHMSCAARGAD	2174	21611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_4276_4434_4552_4676_20997_21062_21232
920112	contig_5569_pilon	+	2998	1	Intergenic	novelGene_86725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTAACCTGTTACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172158	175156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_172200_175200
920113	contig_2757_pilon	-	1561	12	Intergenic	novelGene_164605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAATTCCTCTAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536123	509045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_509525_514566_514835_514941_515018_515928_515972_516805_516877_517820_517886_531406_531452_532774_532817_533640_533706_534398_534519_534651_534758_535942
920114	contig_6740_pilon	-	1588	2	Intergenic	novelGene_142665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGAAGGAGTGAGACCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585580	535373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_535855_584473
920115	contig_6272_pilon	+	2893	1	Intergenic	novelGene_160458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCTCCAGTATCTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183449	186342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_183400_186300
920116	contig_3081_pilon	+	4898	10	Intergenic	novelGene_133900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_6	306.493711292301	221	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	27	2027	14555	53642	FALSE	40	CATCCTAAAAGAGAGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGGGSVMASGRGASSRWFFTREQLENTPSRRCGVEADKELSYRQQAANLIQDMGQRLNVSQLTINTAIVYMHRFYMHHSFTKFNRNIISPTALFLAAKVEEQARKLEHVIKVAHACLHPLEPLLDTKCDAYLQQTQELVILETIMLQTLGFEITIEHPHTDVVKCTQLVRASKDLAQTSYFMATNSLHLTTFCLQYKPTVIACVCIHLACKWSNWEIPVSTDGKHWWEYVDPTVTLELLDELTHEFLQILEKTPSRLKRIRNWRANQAAKKPKVDGQVSETPLLGSSLVQNSILVDSVTGVPTNPSFQKPSTSAFPAPVPLNAGNISVQDSHTSDSLSLLAAGMPGTSYSLSSHQGWPQDQESARTEQIYSQKQETSLSGSQYNISFQQGPSVSLHSGLHHRSEKISDHSSVKQEYTHKAGSSKHHGPISATPGVIPQKMSLDKYREKRKLETLDLDVRDHYMAAQVEQQHKHMQPQAVSSSSVTSPIKMKIPITNPEKPEKYVTDKKEKSGSLKLRIPIPPTDKNASKEELKMKIKVSSSERHSSSDEGSGKSKHSSPHISRDHKDKHKEHPSNRHHTSSHKHAHSHGGSSSGGSKHSADGIPPTVLRSPVGLSSDGISSSSSSSRKKLHVNDASHNHHSKMSKSSKSSGGLRTSQHPRETGQEASGDQRS	14528	56513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_14713_15539_15622_37254_37384_38990_39052_42959_43023_46520_46567_48246_48411_51719_51791_52314_53474_53574
920117	contig_8284_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_125729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACCAGCAGCAGTTTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482115	483705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_482100_483700
920118	contig_7357_pilon	+	1944	2	Intergenic	novelGene_36780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAATGACATCAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119244	121589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_120826_121226
920119	contig_3252_pilon	-	4808	1	Intergenic	novelGene_61477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAATCAAAGGAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162320	157512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_157500_162300
920120	contig_11656_pilon	+	4028	1	Intergenic	novelGene_53952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1260	1559	133169	133468	NA	15	TTTTTATCCTCCTTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCIKWTYSVYCKNRLGICFLSVKLYYNFNFCFCFFLKLGLTTLHLFPSSPEILALPSSGTGPPLLVKYHYIISCNSMVYYYLTREIKVQMSFPDVPCC	131909	135937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_131900_135900
920122	contig_6743_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_33555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTGTGTTGCTAAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232054	230144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_230100_232100
920123	contig_16896_pilon	-	3204	1	Intergenic	novelGene_174910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	2014	2496	95238	94756	NA	30	CGTAACCCCTTATATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKNREYQEDVYLCFIDYAKVFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVIMKNLYLDQEAVVRTEQGDSEWFKIRKDVRQGCSLSPYLLNLYAEQIIQEAGVYEEERGVRIGGRLINNLQYADDTTFLAKSKEDLKHLLMKVKYHSLQYGLLLNIKEKSSQLNQ	97251	94047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16896_pilon_-_94000_97300
920124	contig_10163_pilon	-	712	2	Intergenic	novelGene_82665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403208	329936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_330315_402874
920125	contig_7398_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_166168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATATTTGGCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172227	171055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_171100_172200
920126	contig_8015_pilon	+	501	3	Intergenic	novelGene_176681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	31	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121527	123232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8015_pilon_+_121556_121914_122195_123039
920127	scaffold_12124_pilon	-	1310	2	Intergenic	novelGene_22186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	168	551	1231935	1231552	TRUE	40	TTGTGTGGGAAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQVQQTPYRIDPKRKSPRHIIITFAKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGEAIRLSSDYLAETMQARRQWDDVYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRTFPDKQKLREYVKTKPNLQELL	1232102	1230748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1230852_1230895
920128	contig_14970_pilon	-	1472	7	Intergenic	novelGene_45037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGTGCCCTTCTATGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232189	182350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_182457_188755_188830_191970_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
920129	contig_10297_pilon	+	3149	1	Intergenic	novelGene_112566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATTTTTACATATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760292	763441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_760300_763400
920130	contig_9575_pilon	-	1915	8	Intergenic	novelGene_169714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	3.09047252182628	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	122	1183	62727	53153	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAGAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLYVLSQGQCVYRGKVSNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYGDQNSRLVRAVREGMCDADYKRDLGGDAEVNPFLWHRPSEEVKQAKRLKGLRKDSTSMEGCHSFSASCLTQFCILFKRTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYLAKTMADVPFQIMFPVAYCSIVYWMTSQPCDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFDTIPTYLQWMSYISYVRYGFEGVILSIYGLDREDLHCDIDETCHFQKSEAILRELDVENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLKYKIRAER	66485	52420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_53382_55929_56049_59434_59594_59842_59944_61202_61372_62303_62406_62544_62730_66366
920131	contig_9682_pilon	-	4649	4	Intergenic	novelGene_125295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3197	3700	23903	23400	FALSE	15	TTCTTGCTTTGGCCAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTWSLPKHSLGNNTITHVLISGLKDGRSWPHFTEVKPPESKGTCPGHTVTGGREPGRRFSASHLRLQALLALRCGLTIWPHAASLGPAAGPRRPRSQGRPEGLCRPHFPSIKQRILPSPFSQPSLLMPTVHPTTPALITWVKPTLFMLGLSEQVLRVCLRDSRTEC	30210	22450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_-_24225_24853_24948_27083_28006_28351
920132	contig_14326_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_120753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAGAAGAATTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553137	551320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_551300_553100
920133	contig_9161_pilon	+	2604	7	Intergenic	novelGene_160631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	523.719920907689	10	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	898	1587	52934	63414	TRUE	40	ACAGAACTTGAAGTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPNSRKKQALNRLRAQLRKKKESLADQFDFKMYIAFVFKEKKKKSALFEVSEVIPVMTNNYEENILKGVRDSSYSLESSIELLQKDVVQLHAPRYQSMRRDVIGCTQEMDFILWPRNDIEKIVCLLFSRWKESDEPFRPVQAKFEFHHGDYEKQFLHVLSRKDKTGIVVNNPNQSVFLFIDRQHLQTPKNKATVFKLCSICLYLPQEQLTHWAVGTIEDHLRPYMPE	51331	64658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_+_51411_52115_53063_54664_54842_56680_56804_60940_61076_63288_63829_64055
920134	contig_12793_pilon	-	2155	2	Intergenic	novelGene_164128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTACGAGGGAATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256500	254264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_255769_255849
920135	contig_4103_pilon	-	2967	11	Intergenic	novelGene_51884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	26	junction_10	27.544327909753	226	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1011	1568	50200	48971	TRUE	30	TGTAGTAGTTTGAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGGVSLVEQLFQDPRLSQNKQVLEGLGDLKLLFEYLTLFGIAEKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPNQAGKDSLSMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRMKVGPRYG	53696	46917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_49235_49326_49455_49761_49856_50128_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53485
920136	contig_2730_pilon	+	3131	1	Intergenic	novelGene_135384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1627	2169	331980	332522	NA	50	AACAGGAAGAACGTAATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQICIGVSRKDYHRPGLEKGLLSYLFPGFLIPILKKVKDTNKPSTYPLHHLGSFQISNKKQSQEDHSLKKERENCQNSSSSKKPMEQMKLPQRTRESSSSELQITKNGRMSMEYKRALRCRALQLCSSAASEMGDASVTCREELPSHLSRAKSPLPAFSDNSLQHLDVVNSPFKVPAEIS	330353	333484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_330400_333500
920137	contig_17144_pilon	-	1757	10	Intergenic	novelGene_29423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2239.92315234141	50	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	749	1468	167982	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183213	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168208_174866_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
920138	contig_17074_pilon	+	3366	13	Intergenic	novelGene_145186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	298.736354872021	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	394	1326	636689	657014	TRUE	15	CGACACGTGTGGATTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKHREIFIALVCCASYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECVTIAWVYGADNFYNGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVVTPVLCVGCFIFSLVKYQPLTYNKVYVYPDWAIGLGWGLALSSMVCIPLVFLISLCQARGPLSVRFKYLLTPREPNRWAVEHEGALPYNSSSTVNGVLMKPTHIIVETMM	616455	661306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_616517_625262_625403_635238_635374_636631_636736_636871_636997_640911_641025_646890_647023_648257_648361_648912_649014_651584_651756_656873_657061_658529_659935_660717
920139	contig_5084_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_64541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAGGATCCCAAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508531	507353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_507400_508500
920140	contig_2933_pilon	-	2140	1	Intergenic	novelGene_111297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213977	211837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_211800_214000
920141	contig_678_pilon	+	485	1	Intergenic	novelGene_167831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCAAAACTACAATGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160443	160928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_160400_160900
920142	contig_6137_pilon	-	3504	1	Intergenic	novelGene_59186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAACAAAATGAGTTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291966	1288462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1288500_1292000
920143	contig_3252_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_61508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1338	1658	576120	575800	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEERYSFQQMILKQLNIRKQKKEFKNRNKGHNRESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTPESMAPGLSVNPKLKPFPRPTLQTKIGLDYGTLDDTCEESAS	577457	575548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_575500_577500
920144	scaffold_12124_pilon	+	2577	3	Intergenic	novelGene_22107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9	5	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	555	1487	893154	894086	TRUE	35	CAGACAGAGACTGGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPNTQCSVTNVEHVKRKPRDRGRLFCLRVAGTLGQVYAASAVGFLQVSTGQRWVSGCKPAGTLLGDPLVMRDPLRVVLRGYYWLEWWKSTAEEDIPDGRLGRTCVKAQAPGIHLGSPTEPGAASRTSQAEDWHQPGLCPSPAWAPDPACPLCPQGCSEDPISTTQWRACLRGETAPDACWCCGGALEAAELPSAWLPTSTADEQGTHLCERPPHCTIYLGSSADPGAARKEPSGTQAPAFTCVWVSISPAGWPPSPSSPLRTPYHNPQWRPCLGREDPLAGPLCPRQNPRERREAHCSKSCFYCRAAE	892599	895737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_894163_894439_894711_894994
920145	contig_9995_pilon	-	6335	2	Intergenic	novelGene_47805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	450	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAGAAGAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	839728	828820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_833618_838190
920146	contig_10930_pilon	-	2823	8	Intergenic	novelGene_36981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1986.17726360186	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	18	1556	280370	268388	TRUE	80	TAACAGAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280387	267063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268018_268074_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276989_278443_278637_279700_279832_280157
920147	contig_6871_pilon	+	2181	4	Intergenic	novelGene_21547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	79	1215	121971	135017	TRUE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135160_135231
920148	contig_12119_pilon	+	551	1	Intergenic	novelGene_88643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTTAACAACCCCATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125225	125776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_125200_125800
920149	contig_4103_pilon	+	3021	4	Intergenic	novelGene_51953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125943	213732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_126018_152040_152305_204406_205105_211747
920150	contig_7056_pilon	-	2288	6	Intergenic	novelGene_43649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1281.11507679833	1	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	49	525	726042	725281	TRUE	75	AAAAGGAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFFSLPILLLHEQCFRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNVIFFTTQPCESTY	726090	722478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_725319_725467_725606_725661_725734_725813
920151	contig_4103_pilon	-	3374	24	Intergenic	novelGene_51989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_23	285.426487511508	17	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1010	3030	344	3373	289125	203534	FALSE	75	GAAAAGAAAAGAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLAAAVLRAGGEGGASGSDEDEVSEVESFILDQEDLDNPVLKTSEIFLSSTAEGADLRTVDPETQARLEALLEAAGIGKLSTADGKAFADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLDEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTALTYACAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLAAGADQEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLINRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHFDVVQLLVQAGADVDAIDNRKITPLMSAFRKGHVKVVQYLVKEVSQFPSDIECMRYIATITDKELLKKCHQCVETIVKAKDQQAAEANKNASILLKELDLEKSREESRKQALAAKREK	352451	203532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_203582_215896_216014_216555_216652_218862_219026_219250_219427_220914_221129_221559_221703_222231_222378_222871_222984_223150_223297_238934_239038_239972_240117_240287_240416_243058_243147_264115_264226_269082_269275_269525_269764_276615_276711_282406_282641_286814_286963_287688_287837_289084_289242_300390_300542_352375
920152	contig_34_pilon	-	1653	8	Intergenic	novelGene_40002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1516.09690875442	4	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	61	1386	247052	212049	FALSE	80	GAATGAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEIWTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIGKKLYPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247112	211781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224807_230214_230324_243214_243354_246970
920153	contig_12948_pilon	+	3936	2	Intergenic	novelGene_126216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGACAGTGCTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273378	277358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_277009_277052
920154	contig_19006_pilon	+	3547	1	Intergenic	novelGene_145584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	474	3073	3546	48877	49350	NA	25	TCTCCCAGCTTATTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDWAAFCSVVHEVTMSWGLTQRQLTTTLPSSNPSRLSSKPSSSVNAFHGYQRISLGLSYNYILCAYQIYFTIFYTIRLVEACCNNSSNTDSIKEKVVFSLPSTLKPNSLRKRQNHSKSIKSVYVSDVVINRVALGHLLDFCFDLFFQPFLSNFISF	45804	49351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_45800_49400
920155	contig_20875_pilon	-	7189	2	Intergenic	novelGene_153097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	0	408	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	6396	6752	24970	24614	FALSE	70	AAAAAAAGGGAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGQSPRNNLGRAAGSLARVQGMSVLPGKWGVPPLQGKLSWCLGGSSCPVRLVLGVPAAWGRVHFLSSRSPCLLAPPSRLKCKTQSSHLRFPSHTSTGQEGAGCSLQPLPCGAFQQTL	34476	24176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_31296_34406
920157	contig_11666_pilon	-	3054	2	Intergenic	novelGene_179005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1586	2074	95805	90681	FALSE	50	GAAAAAAGAACATTTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRISGIEDKHLDTILFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIKKDEKLAIQEAQRTPYMRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILTAAREKQEVTYREETIRLSSDYSAETVQARRQSQLVQGKVMEAP	97390	89700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11666_pilon_-_90719_95354
920158	contig_5623_pilon	-	3749	16	Intergenic	novelGene_154819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	398.119613516675	29	101	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	15	1850	214765	207845	FALSE	10	GCCTTGTTATGTCTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKEGI	214779	205945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207857_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210743_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681
920159	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
920160	contig_5316_pilon	+	4658	1	Intergenic	novelGene_61250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1424	1792	489040	489408	NA	25	TGTATACGTTCCCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRNDEVKEPNRKFQRAAQENKVKYYNEMCKNLELENQKERIHLAFLKLKELKKKIKPRVAILKDSVGQKLNDARSIKRRWKEYTESLYQKELVHVHPFQEAAYDQEPIVLREEVQAALKV	487616	492274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_487600_492300
920161	contig_6738_pilon	+	2929	1	Intergenic	novelGene_166140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65730	68659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_65700_68700
920163	contig_15092_pilon	+	1442	3	Intergenic	novelGene_57797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	116	682	325159	351165	FALSE	25	GTTGATATTAGACATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325043	351925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
920164	contig_2892_pilon	-	4884	1	Intergenic	novelGene_119027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	147	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291511	286627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_286600_291500
920165	contig_15327_pilon	-	1897	11	Intergenic	novelGene_70772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	78.2946358315817	8	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	10	1359	1169101	1130258	FALSE	45	ATTAAAAGGCAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRHPPKSRTISLWLNGLRHSAWTLLSSPSKPASCTSRRDSSPSLASLCSLTWPSTMWLSHPSRTSWSRRPRVASPDISRASLDSGANQALPWGGGRA	1169110	1129719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131040_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
920166	SIRV6	+	919	10	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-1	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	14	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	110	333	373	705	2002	10736	TRUE	25	CACGAACTTTGAGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1129	11260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1847_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
920167	scaffold_8345_pilon	-	569	4	Intergenic	novelGene_107017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACCAGGAGCCCATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619858	581249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_581310_602512_602744_612489_612537_619627
920168	contig_3700_pilon	-	1813	2	Intergenic	novelGene_138095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	396	1417	1812	344272	343877	FALSE	35	TGGCCATCCAAGCTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVKKIIQEQNAKINSQLEIIQKLQLEIQKINNKISETDSVVEGLRSRFEMMEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKSNEETLRIMWDTIKRKNLRVIRVAEQGEKTENTERIIEELLTEKFPNIMKDGK	345775	343875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_-_344917_345003
920169	contig_9528_pilon	+	2192	1	Intergenic	novelGene_172339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCCAACTAAATTAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178787	180979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_+_178800_181000
920170	contig_11427_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_79022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAGAGTCATTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809392	807316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_-_807300_809400
920171	contig_7057_pilon	+	2299	5	Intergenic	novelGene_123387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	23.7526314331697	69	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	358	1794	1226227	1239048	FALSE	25	TTCTTGTAAAGATGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMENYSNLASLDFESAHETKSLGIGKDIINNSDSQWDIMESSKSTGLENFIFRNDWQSKSNIEVQGSEVGYFSKRKIISEKVPSYKNHKYLTLLHQSIHHNEKPYEYKEYGKVFTCDSNIDEYERICTGEKTYECNECWNSFGVDDLYPIQLNIHTSMKPCKCFEYGNIFNFHEDLSEHQKIHNNEKNYKYKEYRRTFKVVGEMTSLQKIHAGEKPYECMVCGKSFRVHAQLTRHQKIHTDDKPYKCLECGKDFRFHSQLTEHQRIHTGEKPYKCMECEKVFRISSQLTEHQRIHTGEKPYACKECGKAFGVCRELARHQRIHTGKKPYECKACGKVFRNSSSLTRHQRIHTGEKPYKCKECGKAFGVGSELTRHQRIHSGQKPYECKECGKFFRLTSALIQHQRIHSGEKPYECKACGKAFRHSSALTEHQRIHTGEKPYECKACGKAFRHSSSFTKHQRIHTGETLYECKECGKAF	1197191	1239553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1197288_1224824_1224919_1225210_1225285_1226133_1226261_1237645
920172	contig_4315_pilon	+	1906	1	Intergenic	novelGene_46757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1318	1716	249846	250244	NA	25	CTGCTGGCATAAGGATGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAIKPAVRTPSLKMGKWRRSGGSGPQWYRNHLKKQGFHKKSGETYWGSKTGQEWRSPRKLPANLFEMFISTTTFGKSLTRICLGHHKRSKPFITAHKNNFAFLVVRTRPSLCFPLALSPAPAASFEKGWEP	248528	250434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_248500_250400
920173	contig_14970_pilon	-	1326	5	Intergenic	novelGene_45125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	148.130010463781	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	281	775	285706	268709	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315693	268157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291001_315579
920174	contig_7066_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_42119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586616	587624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_586600_587600
920175	contig_6975_pilon	-	4710	17	Intergenic	novelGene_74247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	150	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCAAGCAGAAACAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157993	107113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_107926_110460_110581_115500_115601_116832_116959_117156_117217_117807_117876_120694_120763_121732_121835_121967_122084_124442_124612_125286_125384_127791_127915_132039_132168_132481_132580_136745_136792_155421_155500_155594
920176	contig_6102_pilon	-	2517	8	Intergenic	novelGene_31897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATCACCTACATAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377313	373420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373476_373632_373725_373902_373962_374388_374502_374585_374771_374894_375730_375966_376037_376205
920177	contig_8594_pilon	+	4258	5	Intergenic	novelGene_140024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	7.96868872525461	155	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	236	796	309563	313577	FALSE	25	TTAATGTTTGTGATGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIYLAKSTKKTLVALTLVCGITFLLVCSGTFFPYSSDPASPKPKRVFLQHITRTFHDLDGNVVKRDSGIWINGFDYTGMSHVTPHIPEINDTIRAHCEETAPLCGFPWYLPVHFLIKKNWYLPASEVSPRNRAHFRLISKEQTPWDSVRLTFEATGPSHMSLYIRAHTGAVLTQWSLGNGTPVTSKGGDYFVFYSHGLQASAWQFWIEVQVSEEQPEGMVTVAMAAHYFSGEDKRSPQLDALKEKFPGWTFPSAWVCTYDLFVF	307258	317039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_307407_309475_309679_310396_310513_313127_313292_313412
920178	contig_19076_pilon	-	1853	1	Intergenic	novelGene_74223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136955	135102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_135100_137000
920180	contig_2078_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_100150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGTATTCACTCAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324305	322122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_322100_324300
920183	contig_17440_pilon	+	1701	1	Intergenic	novelGene_7540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTCTAGCATATTAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551	2252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_600_2300
920184	contig_6740_pilon	+	2642	1	Intergenic	novelGene_142711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1572	1892	688186	688506	NA	25	GGAGGGACAAGTCCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRILMFMHSTSFLMISSFPRFILHTFHVPIINGCLQLFLLILSCTTSANEGPESLTSSTYLFKVDSTWRRQLFHNHLLSAFQPGGLIFWHYIRQCFAAIHKVLTG	686614	689256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_686600_689300
920185	contig_13952_pilon	+	3473	2	Intergenic	novelGene_133265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	143	junction_1	0	53	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	258	590	236050	236382	FALSE	20	CCCTAGTTGCAATCCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPEVPVGSLIDFGTEPPASPPLEALPPQLQDGDSSLGDGGSESETTESADSENDMGESPSHPSWDQYHRSSSNDSFSSSQSAASARDEEGLELREFMCSYVEKVFSGG	202025	239265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_202103_235869
920186	contig_13760_pilon	-	1467	4	Intergenic	novelGene_61308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.9481032602883	35	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	133	903	172514	167445	FALSE	75	TTAAAAAAGCAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGTMAAFPLQVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVIVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLSQGSGKAASPASPSGPKGSHMKRRSITMTDGLTADKLTRGDGCPTSASLPHPRESIRNCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPRLQHRDPCPCHPCGPLCHSAACLSCHPPFQRAPAVPWKCPKAYWGVGQGPSCQPLP	172646	166880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_167602_169072_169199_170851_171313_172487
920187	contig_1143_pilon	-	2817	1	Intergenic	novelGene_86610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAGAGTAAGTTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234356	231539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_231500_234400
920188	contig_19744_pilon	-	1194	5	Intergenic	novelGene_120361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	760	1068	100560	96214	FALSE	65	CTAAAACAAAACAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVFSSSDNSAHHRESSATVFIFFIGFTQKLGLQISIKFTPIVQYLWNLSSGLVCAITTQAARAECKCDTIRALNCGHSSIPIGCTASIVPQAHSIFNIFL	103579	96087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_96215_97723_97906_100434_100579_101976_102076_102937
920189	contig_4151_pilon	+	3266	2	Intergenic	novelGene_65222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	829	1197	462797	463396	FALSE	50	CCTCTCCCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKILKLSGISFYLDPQSTSVEAAVKKSNDVLHWGNLLQKISSRVARLSLTYFGHVIRRDQFLEKDIMLGKVEGQRKRGRPSMRWTDTVDTTMGSNMAMIVRMAQDLGVGSCTSRCYEMEQT	461968	465465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_462924_463154
920190	contig_10937_pilon	+	2407	2	Intergenic	novelGene_67315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTCTTTTTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86776	92829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_87037_90682
920191	contig_10892_pilon	-	1755	1	Intergenic	novelGene_116745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	190	522	136088	135756	NA	35	CATTCCCCACTGCAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSTEERCGSLLLLRLYSLGPQKTWPPDSVNPELKPFQKPTLQRLDWTIKHKMILMKSVLLSSTRCTRLSGQLQSRWDKKAKTDRSWLNGHGKPRVERGSVQSHYRDCN	136277	134522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_134500_136300
920192	contig_15491_pilon	+	2167	6	Intergenic	novelGene_75937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	89	424	30833	31209	TRUE	25	TCTTCTTTTCTAAGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIPTGNKNSTNGKIKREKQIAAIKEIPQMVTFKTEVIFSQFRRLEVPTQDAGSRGRFALCWLWRKILVSLSFCSCAITWLGICLPLSLLLDCLFNLFCISKEIDSKHTLH	30744	47026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_30895_30935_32434_37438_37562_38890_39042_45108_45206_46878
920193	contig_17144_pilon	-	1697	2	Intergenic	novelGene_29156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGTATTTTCATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131497	129667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_131259_131391
920194	contig_10861_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_39213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGAGATGCCCTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527009	525709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_525700_527000
920195	contig_3584_pilon	-	1612	2	Intergenic	novelGene_108112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTTTTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184699	182975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_183836_183947
920196	contig_7733_pilon	+	2643	4	Intergenic	novelGene_147155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_2	37.9326889224701	30	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	271	711	236322	238314	TRUE	25	ACCATGATGTATTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEEPIYKTSCALTIHAIGRYSPDVLKNHAKEVLPLAFLGMHEIADEEKSEKEECNLWTEVWQENVPGSFGGIRLYLQELITITQKALQSQSWKMKAQGAIAMASIAKQTSSLVPPYLGMILTALLQGLAGRTWAGKVKEPFMPS	236051	241636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_236335_237020_237213_238078_239443_240832
920197	contig_12677_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_110759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAAAGCCTCACACCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_100_1500
920198	contig_10953_pilon	+	624	3	Intergenic	novelGene_42599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	21624	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460353	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_460404_461127_461201_463962
920199	contig_8330_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_71948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	52	300	1424567	1424319	NA	50	TTCACCTAAGTACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LATTNDCPDREHNRESLMEQEKSVVQNSNTYKRPDLVSACMALLNTAISEMKFIYIYMCVCIYIYMHTHTHTHKYLFHCRLLEISFIYIYEIIRPVRPF	1424618	1423145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1423100_1424600
920200	contig_12086_pilon	-	4207	1	Intergenic	novelGene_74710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	192	527	15563	15228	NA	65	TACCACAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHSPGYGGRSSGKSFPDRPRAWLGAFLRFGGVGNRRESRSLRSSLPPPLSCQGAEAALPAWMNDSDASSLSSPPGRLPKCLICAVHLPPGASDLPNLFLACPTSSHPLRY	15754	11547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12086_pilon_-_11500_15800
920201	contig_5033_pilon	-	3618	2	Intergenic	novelGene_28966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2857	junction_1	0	308	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	239	298	464919	464860	TRUE	30	CCTGAAATCAGCCGAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVGSSADTSRAYGWGVAEGVPGPTSLEPQAPKGSFQLCGHWERCWLRQVTELFLSKQVWWQPSRSPHRILCTCALRGRMSPSLAGSWALCPGALCTT	465157	460022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_463031_464547
920203	contig_8597_pilon	+	4329	3	Intergenic	novelGene_158689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9205	69185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_10100_65315_65834_66268
920204	contig_12819_pilon	-	3390	3	Intergenic	novelGene_179006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	368	982	44962	44348	TRUE	35	AAGATAACTTTAGTTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKRDRIAPIGVQIKTPDNSPLEENALEVPDRELKSLILGIFRELRQKADKYEEKIDKLMENTDKKLEEFKKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPIS	45752	6049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12819_pilon_-_7226_43115_45013_45435
920205	contig_15236_pilon	-	1335	1	Intergenic	novelGene_141613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACAAATGGTGCTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603128	601793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_601800_603100
920206	contig_14744_pilon	-	2629	5	Intergenic	novelGene_66018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_3	449.325258025854	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	72	581	969897	968300	TRUE	80	CTCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969968	961413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_962609_964176_964410_967273_967450_967855_968630_969717
920207	contig_854_pilon	-	1569	3	Intergenic	novelGene_36688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	736	1281	1707003	1704861	FALSE	15	CCTTGCCCTGCATCAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLHRGGRDTGP	1707738	1704572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704997_1705283_1705434_1706743
920208	contig_18850_pilon	-	2528	10	Intergenic	novelGene_142409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCATCCACTCTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182130	163395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_163405_175385_175508_176353_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513
920209	contig_8377_pilon	-	1700	5	Intergenic	novelGene_35007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAGAACTAAATGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144525	68159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68335_136279_136399_140773_140974_142255_142386_143449
920210	contig_7396_pilon	-	1956	14	Intergenic	novelGene_79563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3303.55270300603	3	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	395	1188	119	1306	255163	245848	FALSE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTITKH	257472	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245860_247727_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
920211	contig_10599_pilon	+	2605	4	Intergenic	novelGene_49870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1011	junction_1	187.054953303984	42	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	223	816	123528	151084	FALSE	25	GCACTTAACTAGATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGELNVDSLITRLLEVRGCRPGKIVQMTEAEVRGLCIKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPEANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGRLVNLLCGFFLLLVHYLESICNN	123305	152873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123580_146885_147018_148809_149041_150905
920212	contig_9363_pilon	+	4369	3	Intergenic	novelGene_6736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	6	200	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	245	814	1489029	1490538	FALSE	15	CTACTTTGAGTGCTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPLAPLPAGEPNGARPKCRKAEPVSFAEVAVYFSPEEWACLRPAQRALYRDVMRETYGHLGALGFRGTKPALISWVEEEAELWSPDAQDPEAGKDLIADTADSRNKEKGQREETEALEKILLMAAQPPALKAVKPPPAVFPYGLEQPSRVPHRGRPPTLCPPPLYPEQTSVMAAMCVGRVLPGAPPW	1488784	1494093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1489225_1489388_1489500_1490275
920213	contig_3817_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_78378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893452	895228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_893500_895200
920214	contig_11978_pilon	+	1993	2	Intergenic	novelGene_62900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	4	15	591	605	784117	784131	FALSE	30	AAGGTCGAGAAGGGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLDKDSLHLTRRRADVDLSRRLLSRLDLKVLGGLLGDGGEGGGCRLHHPQGLLGNLHHLLLLDLGGHHLDLLDHGRLAPTRALDDQQVVSCLDDVVCSGLNQHRLHLLRHGHWGLGGRKALLPCFLVSLGQWGWGAFSEELRRGSSIAGVYEVVDRQSECHIATPTSQLHHIGPTLHGGGGCTRLLDGGWFDGDRFMAGW	772802	785519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_772854_783577
920215	scaffold_12124_pilon	+	3381	11	Intergenic	novelGene_22006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	178.582305954425	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	175	1062	799011	807554	TRUE	45	CTGTAAACCTTTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLLSELLIPTGLLAQEHQDLSTQEPVRTLHMTFDPRKMILAWDCRQDATVVECLMIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791861	811996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_798927_799072_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808331_808432_808463_809816_809950_810456_810488_810647
920216	contig_7457_pilon	-	1119	1	Intergenic	novelGene_31396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2	346	462507	462163	NA	80	AAAAAAAAAGGGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EANRVGLVSFPPPFTDGYDLYWPENSPPSLHYTTCDVRTQGFKENSSAALAVVVPLRLLCNLIHSSENRTDRGISIPSHSLGKLSRNSQIPYQLRSKVPHLQSLLLEVFGPWKD	462508	461389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_461400_462500
920217	contig_16303_pilon	-	1901	2	Intergenic	novelGene_34099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35206	33136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33372_33540
920218	contig_10023_pilon	+	2165	2	Intergenic	novelGene_123487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	39	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	43	306	206928	207191	TRUE	50	ACAATGAAATACATCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSCLFNDLLLSSHMMPLMSSYNLSGLWSLVFNASNLFLRWSLNSDGIYLRSYFGSHGLIFIFFSFNLNLHMSSCWSTPQLAPGLVLTDDTELLHCLFPQM	206885	209615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_208417_208981
920219	contig_7905_pilon	+	3344	4	Intergenic	novelGene_179007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1910	2506	686619	687215	TRUE	25	AGTCCCTTATGGAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTRALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDTPFDPAIPLLGIYPREVRAVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKLEDIMMSEISQSQKDKYCMRPLL	681090	741815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7905_pilon_+_682252_685870_687493_740097_740343_741499
920220	contig_14508_pilon	-	2506	1	Intergenic	novelGene_79055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACAACCCTATAGGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76722	74216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_74200_76700
920221	contig_1516_pilon	+	1842	15	Intergenic	novelGene_49950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_12	52.9468832791845	5	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	65	1156	300567	325067	TRUE	60	ATTAAACAATAAAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFQPSNKEGFGLGLQLKKILGMFTSQQWKHLSNDFLKTQQEKRHSWFKASGTIKKFRAGLSIFSPIPKSPSFPIIQDSMLKGKLGVPELRVGRLMNRSISCTMKNPKVEVFGYPPSPQVSGHCKNIPTLEYGFLVQIMKYAEQRIPTLNEYCVVCDEQHVFQNGSMLKPAVCTRELCVFSFYTLGVMSGAAEEVATGAEVVDLLVAMCRAALESPRKSIIFEPYPSVVDPTDPKTLAFNPKKKNYERLQKALDSVMSIREMTQGSYLEIKKQMDKLDPLAHPLLQWIISSNRSHIVKLPLSRLKFMHTSHQFLLLSSPPAKEARFRTAKKLYGSTFAFHGSHIENWHSILRNGLVNASYTKLQEWEKDSTGCPPRMSWSRDITG	297553	326485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_297608_300556_300707_301707_301859_302435_302490_304171_304268_304858_304952_305754_305881_306835_306902_307828_307897_309115_309165_309414_309525_310249_310323_325001_325082_325478_325811_326145
920222	contig_2209_pilon	+	3985	1	Intergenic	novelGene_141021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1189	1554	226790	227155	NA	30	TCACATGACTAAGTTAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASTIQFFWFHDKGSHGSWRQLAQTKTCTQIFTGTVFKTAKRWKQFKCPSTDEWTNKMWHMHTVEYYSASRINEVLIHATIWMELEDIMLSEISQSQKDKHCTTSLILKRKGKCIETEVY	225601	229586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_225600_229600
920223	contig_6842_pilon	+	2177	14	Intergenic	novelGene_130670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	231.927758595431	3	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	22	2142	347594	415814	FALSE	55	ACAAAAAAAATTCAGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNDSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLSREMDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKDHVFIRDEAGHGDPRPEPRPTLSVQSRALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQKQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKKFQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHTQAEEEAHLLSQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRHDESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNLKAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQYEQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLEQRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKYLLERQEREIETFDVESLRMGFGNLVTLDFPKEDYR	287090	415849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_287098_347579_347661_362302_362397_363416_363499_371855_372024_373103_373311_383703_383839_392827_393065_394642_394772_398291_398496_406346_406587_408043_408257_414417_414601_415652
920224	contig_6795_pilon	-	4281	6	Intergenic	novelGene_27673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	88.2074826757912	105	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	131	460	119175	110792	TRUE	25	CTCACTTAGTATAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKR	119305	50176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_50906_62586_62992_63665_63725_108163_110852_117641_117758_119021
920225	contig_12079_pilon	+	3807	6	Intergenic	novelGene_67467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1151	1555	590955	591359	TRUE	0	CGGGCCGCCCCGCGCGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQSKDPLKGTGRPEQGRGRNLGNRCARHRWRAGDQQRGGLKSDFPSSGEASRTALEGEIWPLGLAVCIVHGAEGAPRRGCWGPTPGTHLQAGWCSRELEPFTSPGAPCQKCTILGKVSHFAKGSDSALPFSS	589804	638846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_591709_598000_598155_599466_600883_601780_601877_609187_609274_638695
920227	contig_10990_pilon	+	3271	15	Intergenic	novelGene_7496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	345.694900578117	8	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	979	3159	723621	752040	FALSE	60	GTGCAAAAACTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDRCCLQLIPPQIPHHQKYLALPHPRRLQKLADSALLQQESPRSLWRMILRN	722642	752152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751889
920228	contig_6270_pilon	-	2370	6	Intergenic	novelGene_99809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACAGTGGGCACAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48794	27396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_27547_37389_37665_39224_39479_40396_40556_46894_46933_47300
920229	contig_6795_pilon	-	2825	2	Intergenic	novelGene_27752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGAGAAGATTATCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367699	364707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_364853_365019
920230	contig_15047_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_52218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	10	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	15	638	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2179	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4755_20026_20400_21013
920231	contig_4156_pilon	-	594	1	Intergenic	novelGene_88127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAACAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549580	548986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_549000_549600
920232	contig_17195_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_168975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1921	2259	103171	103509	NA	20	AGATCCGTGGTTGCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLLWKTVWQFLKKLNIDLPCDPAIPLLGIYPRELKTCPPKNLYTSVHRSIILNRPKVETTQCLSSDDWINKMWYIPKMEYYLAIKRNKALMHATIWMNLKNIMLSERSKT	101250	103579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_+_101200_103600
920233	contig_9054_pilon	+	3962	1	Intergenic	novelGene_160679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAAAAAGTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497483	501445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_+_497500_501400
920234	contig_5698_pilon	-	2032	8	Intergenic	novelGene_55007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTTTTTTAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20810	4083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_4146_7815_8025_11129_11207_11790_11869_17145_17219_18788_18851_19227_19293_19404
920235	contig_5136_pilon	+	762	2	Intergenic	novelGene_126645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATCCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317268	324796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_317335_324100
920236	contig_14441_pilon	+	818	5	Intergenic	novelGene_100455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	83	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	232	780	125667	126705	FALSE	5	TGGCCGTGTGTCCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VYLCASSSEAVGTDPQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	82333	126743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_121627_121691_125517_125902_126159_126283_126514
920237	contig_11719_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_154772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGGGGTGAATAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129153	128426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_128400_129200
920238	contig_6199_pilon	-	2272	1	Intergenic	novelGene_126374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTTACTCCCCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233735	231463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_231500_233700
920239	contig_10930_pilon	-	2321	7	Intergenic	novelGene_37025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	6	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	677	1525	276835	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276945_278437_278637_279700_279832_280157
920240	contig_9995_pilon	+	5523	2	Intergenic	novelGene_47806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	419	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2230	2541	832300	832611	TRUE	35	CAGAAGAAAGGCCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERTCFQHVKAKQGVAQGRTPQLFNRRGWEAGCQLRLKTKKPVAIKATLNHSDPMCVRENCAPQGFQWLFLAVDHQVFLSRHLGSISGYAPTSNLSVSSRVL	830070	840050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_833599_838055
920241	contig_10904_pilon	-	2156	1	Intergenic	novelGene_22446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	219	557	96368	96030	NA	50	AAGTTTTTTTAATATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAECVLHLLVAYLEELEAVDLKKFKLYLGTKAELGEDKIPWGRMETAGPLEMAQLLTAHHGSGEAWLLALSIFERINRKDLWERGQREDLVKGKDRGRMVKAGTHQFPSPSW	96586	94430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_94400_96600
920242	contig_1725_pilon	+	2330	15	Intergenic	novelGene_24269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	837.811044889464	3	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	76	624	201480	236005	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAERLRPHVRIAALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQLCSFCR	201404	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_235984_236169_240033_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248341_248425_252129_252265_252711_252779_255366
920243	contig_12214_pilon	-	3324	3	Intergenic	novelGene_177329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1458	2036	234194	196174	TRUE	40	ACTGAATGCCCCAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQLTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTQGDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMESTDKKLEEFQKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINKISEMDSVIEGLRSRSETMEDRLSKIEDKHLDTTLFEEKSEKRKKKNEETPRIMWDTINSKNLRVIGVAFCWLLVLLFFPLL	235651	15098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12214_pilon_-_15375_195161_196220_233661
920244	scaffold_12124_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_22400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCAGCCTCTGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509449	1508149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1508100_1509400
920245	contig_8542_pilon	-	2190	1	Intergenic	novelGene_179008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAGAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50866	48676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8542_pilon_-_48700_50900
920247	contig_7457_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_31469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	269	370	500717	500616	NA	85	AAAAAAGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSHVPHPTPLSWTLFSRRELGPGTDGNLPGPERLWDLGPAPVECGVGREAACPYSDTNSAFPLGVELAALPPSVLSQHPGTEGAAEDLLMPLVDRQSRSMGPGPLPTTFNSCFLGLDCGSPS	500985	499292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_499300_501000
920248	contig_9609_pilon	+	6478	17	Intergenic	novelGene_23011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	271.595510076566	1	170	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	4739	5968	325779	332820	FALSE	20	ATGATACTGTGTCTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSPFVGARGTLGDARERRALRPTASRSLRIESKASFLPGMTVCGIIFAAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	317556	333330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323350_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331394_331487_331563_331694_332694
920249	contig_11176_pilon	-	3610	2	Intergenic	novelGene_123452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4874	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAACAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145875	137321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_138884_143827
920250	contig_1847_pilon	-	5686	2	Intergenic	novelGene_171730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	120	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAACAGTCTTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105623	98433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_103231_104734
920251	contig_6795_pilon	+	2071	9	Intergenic	novelGene_27683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATATTTTACTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70922	129331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_72052_74612_74764_110794_110854_117643_117756_119019_119198_122975_123155_124203_124275_128914_129061_129285
920252	contig_15029_pilon	-	2965	6	Intergenic	novelGene_128188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1305.93941666526	2	158	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	20	370	172327	165496	TRUE	30	CTACATGTTTATTGACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEDAMSGLSFPLLCVATCLAARCVLSASPNTTLPYNVTSEPTKITPTNSTTPAPNTTATPETCESHHDCVSCANTSCFWIECKEAKKSHCSHNSTASDCHAVNNTELCAHCHSIANQFYS	172346	160728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_163271_165442_165500_166430_166467_168149_168220_169581_169654_172158
920253	contig_12841_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_55850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGGGGGAAATGCCCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259465	256731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_256700_259500
920254	contig_7707_pilon	+	3265	3	Intergenic	novelGene_72236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1790	2215	1181963	1182388	TRUE	35	GAATTATCTATGTGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNIEVVKDFILLGSTINAHRSSSQEIKQCISLCKSAAKDLFKVFKSTDVTLRIKVCLTQAVVFSIASYACKSWTMNKEVGRRIDVFELWCWQRILNIPWAARRTNKSVLKEVQPECFLKQEFWTCYQERSVPGEGHHDC	1180173	1230502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_1182679_1183547_1184238_1230432
920255	contig_5549_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_81680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACTATATTACACCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574483	571955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_572000_574500
920256	contig_10044_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_156373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGAAAAAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3950	5544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_4000_5500
920257	contig_5921_pilon	+	2798	1	Intergenic	novelGene_142246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	214	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGGCACAGGAACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207509	210307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_207500_210300
920258	contig_5039_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_64838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	832	1149	300492	300175	NA	15	TTTTTTTCCTTTTCTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKDGIRISTISLIQNYPSSVGSVRNDILKRIISISSEIHFKKSGKTRGCILLAVLHQIDAVGINGINVTRKNIFNEEQHFNVCTNNLQYTLSTFEHWNLINFFL	301323	298870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_298900_301300
920259	contig_14142_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_120508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGATCCATCTTAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343579	341762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_341800_343600
920260	contig_10581_pilon	+	2670	1	Intergenic	novelGene_41431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	744	1079	724951	725286	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTPLHFSFSLKHPFVKPFSLFFPVHMTQGKYFLTFCLKWHLNHRALSKPRIKDCSIISLKMPVCPSHPSAQKPSAAPRCLHGQDQTPRLAVRAFHMGVWPPLLFCLDPQL	724207	726877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_724200_726900
920261	contig_13148_pilon	+	1815	2	Intergenic	novelGene_162931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGGGTGGGCTCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130431	154839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13148_pilon_+_132217_154809
920262	contig_6445_pilon	-	2537	2	Intergenic	novelGene_76994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCCAGTCTCTCCACAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494925	448244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_448716_492859
920263	contig_8059_pilon	-	1990	1	Intergenic	novelGene_111096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCCTGCTCTGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151235	149245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_149200_151200
920264	contig_6635_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_127014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTATCATGAGTAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357823	355754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_355800_357800
920265	contig_10074_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_57177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAAAAGGTCGGCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558584	561216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_558600_561200
920266	contig_19330_pilon	+	2768	4	Intergenic	novelGene_163694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_1	18.9795211273157	55	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	378	1061	47509	48192	FALSE	65	GGAAAAAGGAGAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGKSFYVCPADACEFVQATNIPVSYCLLHEDFVVDLQGLLLPQGKNEYRVFFRCTGSKAKGKPWCGSIPCQDPNSKEHSVTSKVQDAPEPFHHLSSQQRNPFKVLDKNQEPSLWKQLIRGEGEEKMVDKKQREKGDQIFNQKKEQKPESKCWMEKALSSGMVVKKKQSAVQEKKQGERREFQCEAKETEGSHKRNVSEVKPKQCPGNELRKPSASSQEKSNGESGDVQNESEPLREKETKLLPLNVHSQNSVSKPQKGGHLSRDHPKNWEARETKAKDDSSTQTVQKRLPHGNFQTQSETPDVPALQGPATQSAPAAAGLSRGEGRKADTSSDGSEEEGVIFVSFKPGNPPT	33260	49899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_+_33322_35893_35981_45283_45351_47346
920267	contig_9981_pilon	+	2009	3	Intergenic	novelGene_121017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.5	15	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	976	1281	62399	62704	FALSE	65	GAAATGAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRSETVEDRISGIEDKHLDTTQFEVNSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENVPKIMKDEKMAIQEAQ	10071	63432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_10174_61373_62073_62224
920268	contig_14397_pilon	+	1520	1	Intergenic	novelGene_134656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGGTGATGAGATCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120009	121529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14397_pilon_+_120000_121500
920269	contig_4114_pilon	+	2564	1	Intergenic	novelGene_15611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2	364	355803	356165	NA	25	GCCTTGTACTTCAGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLGLDAIESVPTHSNLMHNRMKHCPILCHPHNLCHVSAHCYSCCVNPSHGGSFSFSLTLYFTKHDVLLQGLVLPDNMSKVKTKSHHLCFQGTFWLYFFPDRFVLSSGSPWYIQYSLPTP	355801	358365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_355800_358400
920270	contig_4769_pilon	-	3339	2	Intergenic	novelGene_117998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_1	0	79	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	449	1354	896707	893203	FALSE	90	TAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIPSFQNMLFVEIPEYRNKHIRASVKVNFYVINGKRKRSQPQHFTYHPVPAIKTEPNDEYDPTLICSPAHGGLGSQPYYPQHPMVAESPSCLVATMAPCQQFRSGLSSPDACCQQQNPAAVLYQRSKSLSPSLLGYQQPALMAAPMSIADAHRSVLVHAGSQGQSSALLHPSPANQQASPVIHYSPTNQQLRCGSRQEFQHIMCCENFAPGTTRPSQPPVSQGQRLSPGSYPTVIQQQNATSQRAAKNGPPVSDQKEVLPAGVTIKQEQNLDQTYLDDGKILIFLSARRMVRQVPPNPES	897155	891217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_893961_896559
920271	contig_13074_pilon	-	2673	3	Intergenic	novelGene_153406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1101	1865	115971	93025	TRUE	50	GGACTATATGAAGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECIKIDILGISELKWTGIGHFESENHMVYAGNDKLKRMVLCSLLIIIKKNISGSILKYKVVSDRIILVHLQERPVNMTVIQIYSPTTQAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTHNQDALIITGDWNAKVGNKEGLEVEKHGLGDRNDAEDRMIEFCKTTDFITNTFLQQHKWQLYTWTSLNGIHRNQINYICEQRRWKSSISLVRTRSGADCGTDYQLLVCKFKLKLKKIRTSPREPKYDLEYIPLEFRDRLKNRFTH	117071	47088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_47266_92393_93033_115214
920272	scaffold_12124_pilon	+	2792	7	Intergenic	novelGene_22371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2171.50644714677	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	891	1454	1508626	1509259	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQFSPASPWVPCG	1491956	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509223
920273	contig_12630_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_173065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52795	51552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_51600_52800
920275	contig_3122_pilon	-	2496	15	Intergenic	novelGene_64389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.209064901369	3	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	733	1701	270409	260981	TRUE	50	TGATGGAAGGAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVLGGRKGILEVSPSLFQT	277563	258005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258329_258447_258571_258896_259033_260012_260193_260947_261038_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_273623_273699_276264_276420_277112
920276	contig_6488_pilon	+	3026	1	Intergenic	novelGene_44744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	928	1230	92556	92858	NA	25	TCCCTCAGCAAGTCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSYQGLYQTESSTARWCPSTTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHTKKDQIYWPDRDWKNPESMAPGHSFSSVVKSLPRFTVQRGIGQPHKTKWN	91628	94654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_91600_94700
920277	contig_11258_pilon	+	3756	4	Intergenic	novelGene_67823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1343	1654	330208	330519	TRUE	25	GGAAGCAGGAGGCTAGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQVGCHHLSLNVIPSTPIQTSPWPEPSLEVQCRSSVASATQAGIQSLGRPTWPGTEGAERFQLQGCECHPHLGHVWMTIDHRGGSPDREGPPPGHGNWGTLP	328865	361918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_330663_336874_337092_354744_355098_360529
920278	contig_1276_pilon	-	2798	1	Intergenic	novelGene_159767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCTGTCCTATAGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161672	158874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_158900_161700
920279	contig_15118_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_74556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCAGTCAGACATCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152672	153510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_152700_153500
920280	SIRV6	+	1464	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	56	8	-55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	53	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	20	TTTAGTCGATTATTGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
920281	contig_7179_pilon	-	5156	3	Intergenic	novelGene_78120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTAGGTCTCTAATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762900	757259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_759377_759731_761532_761661
920282	contig_6445_pilon	+	2593	1	Intergenic	novelGene_76999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATTCGCAAGTGGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483060	485653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_483100_485700
920283	contig_14790_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_127921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282526	280814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_-_280800_282500
920284	contig_14647_pilon	-	2684	1	Intergenic	novelGene_167378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1432	1809	137064	136687	NA	35	CAATCCCACTCCTAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLKIVQKQQLEIQKINNKISEMDSVREGLRSRFEMMEDRISEIEDKHLATTLFEEKSEKRRKKNEETLRIMRATVKSKNLRVIGVPEQGEKTENTGSLKNC	138495	135811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_-_135800_138500
920285	contig_10976_pilon	+	599	1	Intergenic	novelGene_155597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAGAAAAAGATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204107	204706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_+_204100_204700
920286	contig_13707_pilon	-	1775	8	Intergenic	novelGene_43553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	839.286164133618	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	11	796	275441	270672	FALSE	30	TATTTACAAAAGTGGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSRMRGMVAILIAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPEFMNANPSPPPSPSQQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEAFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYSPQLHRQVPRQHPHHSQRQGGCRSFPGLLIRTSHGLFSLNSPRLLLKDFMCVFKCFS	275451	269692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13707_pilon_-_270844_273327_273441_273706_273839_273955_274040_274147_274253_274510_274587_275197_275274_275413
920287	contig_16776_pilon	-	1628	2	Intergenic	novelGene_130532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGGTGTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57801	56129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_56211_56254
920288	contig_10990_pilon	+	3077	15	Intergenic	novelGene_7497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	447.283341691933	8	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	471	1319	729714	743916	TRUE	80	ACTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATVKLGRSM	723375	752160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_723633_727930_728102_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743893_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751520_751885
920289	contig_8284_pilon	+	2949	1	Intergenic	novelGene_125666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1510	1827	214735	215052	NA	40	ATAAAGCAAGATGTTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQEDWDKTEIYQTKQMRISCRPRQENVHRRVGRRTASKAQPREVEEAWAPTTASCQHCLLPAPKHPVHLLETHKNILQSRFLTGHGKASQVQWPRGNSARCFEV	213225	216174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_213200_216200
920290	contig_5928_pilon	+	2859	1	Intergenic	novelGene_40386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2141	2488	302128	302475	NA	50	GAAAAAAAAGAGTAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIKTTRYHFTPGRMAKIRKKENNRCQQGCGEIGTLIHCCWKCKMVQPLWKTVWQFLRKLKIELAYDLAMPFLGIYPKDLKVETQTDPCTPVFIAALVTVAKRWKHLNVRQLISE	299987	302846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_3e+05_302800
920291	contig_5643_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_38953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485495	487366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_485500_487400
920292	scaffold_12124_pilon	+	2377	7	Intergenic	novelGene_21989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_1	144.280302035848	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	227	946	800112	807554	TRUE	45	AGATACAAATGGATGGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHKEEGQISMEPMEKQCNCTFELRSLHGGVLLMVKANTSQGLFEEKLKYHNPGGNGTAAENFSCFMYDEDFMNCTWAKGRAAPGDVQYFFYIRDSEGETERECPHYLEHSGTHVGCHVKDISGLTFYSYFLVNGSSRGTGIQFFDSILSKNDMKRYSPPINITVNCNHSHCLLKWQRPKAQQHMSARELKYEVDIQRKVMGAEYQLDLQQWVMGAEYQMDPPGMGNGSCTTSWTSRNG	791833	810339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_791953_800004_800148_802990_803115_803841_803972_804060_804234_807297_808463_809816
920293	contig_9455_pilon	+	1898	1	Intergenic	novelGene_161836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGAGTTCTGGCTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276727	278625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9455_pilon_+_276700_278600
920294	contig_7359_pilon	-	2633	1	Intergenic	novelGene_139837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTCAAAATAAAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16226	13593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_-_13600_16200
920295	contig_2704_pilon	+	4147	4	Intergenic	novelGene_75293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1826	2272	29210	29656	TRUE	20	TGAGAAAGGTTTTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRISETEEKHLDTTRLEKKSEKRMKKNEETLGIMWDTIKSKNFRVTGGLQQVEKTENTDRITEELLTENLLNIMKDEKLTIQAAQRTPYRTDTKRKSPRHIIITLTKIKDKQRLLRAALEKQKVTYTVETIRLSSDYSAETMQARR	27230	315521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_27931_28084_29739_212926_213227_314028
920296	contig_11396_pilon	-	2168	2	Intergenic	novelGene_71363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTGTGATCTAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805888	801926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_804019_805812
920297	contig_18869_pilon	-	5757	10	Intergenic	novelGene_56476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	62	junction_8	296.32918798917	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	125	874	248629	227662	FALSE	15	TTGATGTTGATCTTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EETVNRDIPPLTGKSTRIINGRFILIHGKDLRINLPLTYHFMLIALPSVTRLMNAPVTPDSGYSSAHAEATYEEDWEVFDPYYFIKHVPPLTEEQLNRKPALPLKTRSTPEFSLVLDLDETLVHCSLNELEDAALTFPVLFQDVIYQVYVRLRPFFREFLERMSQMYEIILFTASKKVYADKLLNILDPKKQLVRHRLFREHCVCVQGNYIKDLNILGRDLSKTIIIDNSPQAFAYQLSNGIPIESWFMDKNDNELLKLIPFLEKLVELNEDVRPHIRDRFRLHDLLPPD	249736	222778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_227728_228304_228401_229658_229786_232922_233003_233106_233170_242948_243036_245313_245426_245715_245795_248589_248716_249698
920298	contig_5279_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_105545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAACTTTTGTATTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110571	111720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_110600_111700
920299	contig_3627_pilon	+	3718	25	Intergenic	novelGene_78448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	277.404109433432	34	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	1889	3427	316044	332430	FALSE	40	CAGTAGTATTTAATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSKKDERKDKKEERDDETDEPKPKRRKSGDDKDKKEDRDERKKEDKRKDDSKDDDETEEDNNQDEYDPMEAEEAEDEEDDRDEEEMNKRDDKRDVNRYCKERPSKDKEKEKTQMITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTVKQESKDVEENVGLIVYNGAMVDVGSLLQKLEKSEKVRAEVEQKLQLLEEKTDEDEKTILNLENSNKSLTGELREVKKDLSQLQENLKISENMNLQFENQLNKTIRNLSTVMDEIHSVLKKDNVKNEDKDQKSKENGASV	292824	332721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298442_299042_299094_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842_331029_331550_331757_332370
920300	contig_5686_pilon	-	4952	13	Intergenic	novelGene_45422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGCAAAACATACACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250747	186577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208414_212625_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222914_224040_224201_241595_241801_250017
920302	contig_762_pilon	-	2863	3	Intergenic	novelGene_135949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_2	30	29	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	78	407	266669	259662	FALSE	15	CTCTGAGTTGGATTGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDVSQRRVPVKAQEALQKEDLP	266746	257205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_259837_263903_264056_266666
920303	contig_9945_pilon	-	2385	1	Intergenic	novelGene_104809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCAGAACTTTCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53916	51531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_51500_53900
920304	contig_11281_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_125495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTATAATGACATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925935	923962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_924000_925900
920305	contig_3409_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_172314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAAGACGAAAGAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201452	202738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_+_201500_202700
920306	contig_6795_pilon	+	2068	2	Intergenic	novelGene_27727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGATTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288292	298979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_288495_297113
920307	contig_10749_pilon	-	1287	6	Intergenic	novelGene_133513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	33.7140920091288	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	172	933	311325	305532	FALSE	5	GTCCTTGCCCCATCCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLPEYQDAEIVRTRDPEKLASCDIVVDVGSEYDPQRHRYDHHQRSFTETMSSLSPGKPWQTKLSSAGLIYLHFGRKLLAQLLGTSEEDSMVGTLYDKMYENFVEEVDAVDNGISQWEEGEPRYALTTHLSARVARLNPTWNQPNQDTEAGFQHAMALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVDSSGEILELAKGGCPWKDHLYSLESELAPPVAIAFVIYTDQAGQWRVQCVPKEPHSFQSR	311496	305177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305718_305834_305958_306076_306230_308321_308482_310998_311112_311298
920308	contig_19559_pilon	+	4655	13	Intergenic	novelGene_163431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2704	3246	79617	80285	TRUE	20	TCCACAGCCGGGCATCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGAGQFKHSLRSLTQPQKKAGNSSSSSGVRPSQVSSWQMAHPQSVSRSLGTPRPVVATRSSGHKLTTSLPVLAAGLLGLRGGGVFCHLGFALKHLPDPLHTQAKPVGFVREDEAKPAWLFTPKGLARGQQHLVVQKAAPQQHFLLKGALRQVLGGWKDLGTKLRLGQALAHLCLPPVG	76913	95541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_+_79923_80048_80467_81872_82012_82125_82172_83810_83901_84588_84697_85661_85730_86248_86357_88369_88434_88893_88967_90108_90180_94135_94418_95362
920310	contig_14744_pilon	-	4713	22	Intergenic	novelGene_65964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	85	junction_1	64.0561332630747	301	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	408	2234	715361	694609	FALSE	15	TAAATCTGGCTGCTGCCGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLLVSPPRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSTNPSDPYFNTLENSIISLFVLLTTANFPDVMMPSYSRSPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYHLLISRRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSAGERYLTFKALNQSNTPQLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTAFLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGIWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYIVFLTIYGVELFLKVAGLGPIEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALAFNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKKRYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGILYPNCCNTSTVADAYRWVNHTIGNKTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKSQDSEVDSGITLEKELSKEELVTILELYREVRGATSDITRLLKTLSQMERYEQNSVVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHARKQEEQQRQLGGSGGVPSTQQPPGSRQHSQTIT	715768	692129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_694732_695156_695238_695434_695575_696895_696981_697163_697233_697849_697897_699217_699334_701102_701193_701643_701716_702819_702928_704154_704228_705006_705061_705149_705207_707711_707757_708810_708875_709350_709400_710548_710674_710890_711008_712801_712902_713164_713224_713712_713748_715243
920311	contig_9375_pilon	+	3790	2	Intergenic	novelGene_136078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3320	3652	612559	612891	TRUE	25	TTGCTACGATTCGGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQETSKEDGRNTESYRKELVDVHLFHEVAYDQELMVLKEEVQAALKALAKNKDPGIDGISIEMFQQTDAVLEVHTHLCQEIWKRATWPTDWKRSIFVPKKGDPTKFRNY	609239	614131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_612946_614047
920313	contig_9011_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_159291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	412	759	349370	349717	NA	55	AAAATAAAGTGGGAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLYKIYQGLFSFTHQSNCSGLQGHVRTTLLSAISPIFLPSSAVLLFPLAHWLQPHWPPCCSSNPPEMLLPQTSRNALLQISTCFLASFMSLLKCRLLSEASLNMQLYKLQLHST	348958	351308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_349000_351300
920314	contig_14925_pilon	-	928	6	Intergenic	novelGene_55330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	6	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	77	490	116065	114666	TRUE	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129477	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112285_113025_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
920315	contig_2646_pilon	+	1066	1	Intergenic	novelGene_69597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1459215	1460281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1459200_1460300
920316	contig_10861_pilon	+	1886	2	Intergenic	novelGene_39306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACAATAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1441880	1447145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1443428_1446806
920317	contig_3846_pilon	-	3167	2	Intergenic	novelGene_137144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAAACACTGCGGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175983	160446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3846_pilon_-_160662_173031
920318	contig_12638_pilon	+	1711	11	Intergenic	novelGene_33367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	109.991136006498	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	134	1432	1515842	1538931	TRUE	25	CTGAAAGGATTTTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGLPSDGPFKADYYRY	1515708	1539674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535060_1538799_1538985_1539448
920319	contig_10748_pilon	+	2458	3	Intergenic	novelGene_150743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	269	junction_1	53	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	1	645	145529	159145	FALSE	60	AATAGAATAGAAGAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRLGGPGALPKGLTQSPLCRSLQVLNLSGNCFQEVPASLLELRALQTLSLGGNQLQSIPAEIENLQSLECLYLGGNFIKEIPPELGNLPSLNYLVLCDNKIQSVPPQLSQLHSLRSLSLHNNLLTYLPREILNLIQLEELSLRGNPLVVRFVRDLTYHPPTLLELAARTIKTRNISYTPCDLPGNLVRYLGLASNCPNPKCGGKLIHCPYFALT	145528	160958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_145729_157209_157339_158829
920320	contig_16210_pilon	+	4717	1	Intergenic	novelGene_147678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	4323	4712	69500	69889	NA	45	ACAAAACTCTGATACTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDQRRIDAFELWCRQRILTIPWTAKRTNQSVLEVQPECSLEARMGRLCLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKAEGQRKRVRLSTRWTDTVAATMGSRITRTVRMVQDQAEFRSAVHMVTMNQNQLHST	65177	69894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_+_65200_69900
920321	contig_11428_pilon	-	2618	2	Intergenic	novelGene_138491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACCACTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87193	67511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_-_69630_86693
920322	contig_8848_pilon	-	2088	1	Intergenic	novelGene_140473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATAAACTTTATAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356526	354438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_-_354400_356500
920323	contig_7942_pilon	-	3614	2	Intergenic	novelGene_155326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_1	0	61	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	34	1731	29347	26765	FALSE	70	AGTACTTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALSQESSKYLYMEYHSPDDNRMNRNRLLHINLGIHSPSSYHPGDGAQLNGGRTLVHSSSDGHIDPQHTAGKQLICLVQEPHSAPAVVAATPNYNPFFMNEQNRSAATPPSQPPQQPSSMQTGMNPSAMQGPSPPPPPPPSYMHIPRYSTNPITVTVSQNLPSGQTVPRALQILPQVPSNLYGSPGSIYIRQTSQSSSGRQTPQSTPWQSSPQGPVPHYSQRPLPVYPHQQNYQPSQYSPKQQQIPQSAYHSPPPSQCPSPFSSPQHQVQPSQLGHPSSHIFMPPSPSTTPPHPYQQGPPSYQKQGSHSVAYLPYTASSLPKGSMKKIEITVEPSQRPGTAINRSPSPISNQPSPRNQHSLYTATTPPSSSPSRGISSQPKPPFSVNPVYITYTQPTGPSCAPSPSPRVIPNPTTVFKITVGRAATENLLNLVDQEERSAAPEPIQPISVIPGSGGEKGSHKYQRSCSSGSDDYAYTQALLLHQRARMERLAKQLKLEKEELERLKAEVNSMEHDLMQRRLRRVSCNTAIPTVSDLLGCVEREMWGDWLSRPFDFLFYFVSCRGFFFFFKVIMDEGL	29380	24881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_-_27064_27948
920324	contig_16103_pilon	-	1883	10	Intergenic	novelGene_118877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4706.40528074949	5	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	193	531	735970	733351	TRUE	25	TAGTGCAACTGTTTTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKERPAR	742252	722348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722782_722892_723680_732167_732247_733297_733366_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737499_737630_742194
920325	contig_4232_pilon	+	650	1	Intergenic	novelGene_63409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1985	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467407	468057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467400_468100
920326	contig_3948_pilon	-	5650	17	Intergenic	novelGene_53274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_15	128.503343828089	482	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	23	1570	1458393	1417019	TRUE	5	TCTCCCTGCTTTGACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWLSWSLLLLSLICETRAFYVPGVAPINFHQNDPVEIKVLAEFQITTRHAHWGHQAVKLTSSRTQLPYEYYSLPFCQPRKITYKAENLGEVLRGDRIVNTPFQVLMNSEKKCEVLCSQSNKPMTLTVEQSRLVAERITEDYYVHLIADNLPVATRLELYSNRDSDDKKKEKDVQFEHGYRLGFTDVNKIYLHNHLSFILYYHREDVEEDQEHTYRVVRFEVIPQSIRLEDIKTDEKSSCTLPEGTNSSPQEIDPTKENQLFFTYSVHWEESDIKWASRWDTYLTMSDVQIHWFSIINSVVVVFFLSGILSMIIIRTLRKDIANYNKEDDIEDTMEESGWKLVHGDVFRPPQYPMILSSLLGSGIQLFCMILIVIFVAMLGMLSPSSRGALMTTACFLFMFMGVFGGFSAGRLYRTLKGHRWKKGAFCTATLYPGVVFGICFVLNCFIWGKHSSGAVPFPTMVALLCMWFGISLPLIYLGYYFGFRKQPYDNPVRTNQIPRQIPEQRWYMNRFVG	1458415	1409045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1411182_1414304_1414396_1415165_1417199_1419325_1419410_1422641_1422718_1422798_1422881_1423774_1423908_1425302_1425374_1426888_1427001_1427090_1427210_1429092_1429217_1430585_1430716_1430816_1430986_1434911_1435012_1437833_1437885_1439634_1439749_1458390
920327	contig_10494_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_102128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAAGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281808	283246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_281800_283200
920328	contig_8330_pilon	+	2632	1	Intergenic	novelGene_71931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	738	1037	1316216	1316515	NA	55	AAAAAAGAGGATAACGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRLKYLLCMDVSFKRILPIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVAKRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTRALLARIKDTGNNKC	1315478	1318110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1315500_1318100
920329	contig_12307_pilon	-	2690	1	Intergenic	novelGene_178690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	435	1308	12	1319	18532	17225	NA	55	AAAACATAGAATACAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKAGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGDLIFDNGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTLKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSLSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIRRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNEAVNHRITWMKLENIMLSEISRSQKDKYCMRPLL	18543	15853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12307_pilon_-_15900_18500
920330	contig_3004_pilon	-	3593	12	Intergenic	novelGene_127480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGATCACCACCAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287163	275421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_275549_277769_277917_278895_279281_279691_279868_280774_280831_281228_281606_282578_284153_284373_284413_285295_285747_286375_286449_286736_286873_287111
920331	scaffold_13553_pilon	-	5231	1	Intergenic	novelGene_73752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	52	159	148	306	42665	42507	NA	75	TAAAAAAAAAAAACACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDQNGCEKRRKLAIESRVAKANGRNDEVKELNRRFQRVAREGKANYCNEMCKDLKLENQKGGTHSAFLKLKELKKRFKPQVAMLKDSTGKILNDTGSIKRR	42812	37581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_37600_42800
920332	contig_15666_pilon	+	4403	2	Intergenic	novelGene_70115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGGCAGAAGAGTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97266	102160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_101189_101679
920333	contig_3745_pilon	+	2326	2	Intergenic	novelGene_85081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTCGGAAGTGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384521	406105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_385771_405028
920334	contig_18189_pilon	-	4265	3	Intergenic	novelGene_170754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.5	14	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	189	1475	35584	34298	TRUE	35	TTAATATTTTAATGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQELFPGEDLGNPFLQDKGLEHMAVIYKEIPLGEQGDECDDYGGNFSLCCSPIQRQNVRPTTRPQDDELFGQTFLQKPDLSVCQIVHGGEDSGKHDGKTVDWESVVLNYSHRMAQPAKPYACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQNSHLLRHQVIHTGEKPYECQECGKAFRQSSALMQHQKTHTGKRPYECRACGKDFSRSASLRKHERIHTGEKPYQCKECRKAFSQSSGLSQHRKIHTLKKPHECELCGKAFCHRSHLIRHQRIHSGKKPYKCEECEKAFSQSSNLIEHRKTHTGEKPYRCHKCGKAFSQSSSLIEHQRIHTGEKPYECGECGKAFCHSSALIQHQRIHTGKKPYACNECGKAFRHRSALIEHYKTHTREKPYECNTCGKSFRGSSHLIRHQKIHTGEKL	42554	30036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_-_30309_31779_35721_42502
920335	contig_10958_pilon	-	2655	1	Intergenic	novelGene_5385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTGGTGGCATAACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864431	861776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_861800_864400
920336	contig_7887_pilon	+	4024	1	Intergenic	novelGene_124860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCATCACTTGTGTTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130360	134384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_130400_134400
920337	contig_1925_pilon	+	3799	2	Intergenic	novelGene_162221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	183	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAATGACCAAGACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278223	402830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_+_281582_402389
920339	contig_12178_pilon	+	2128	2	Intergenic	novelGene_156551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTACAAGAAATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559584	561882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_+_561205_561374
920340	contig_13145_pilon	+	1703	8	Intergenic	novelGene_116629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1381	junction_1	669.25477897709	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	473	844	43606	57392	FALSE	40	GTTAGTCTACAGACAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLLLLFPATLVLRGGPGGSLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35339	58251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48800_48895_57324
920341	contig_9571_pilon	+	1171	2	Intergenic	novelGene_136333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAATTAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773201	776478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_+_773720_775825
920342	contig_6102_pilon	-	2080	7	Intergenic	novelGene_32155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_6	345.472020092318	45	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	867537	847043	TRUE	25	AATCTTTGAGCCGTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCVTSRRPASPPLASTHARSFSVLAPLFLHFPPLSDPRSRSLRAVHSGDPGRACCCRRLKEARRGHDRGENPGVATGEESNPQQLPPERPVHPSPCPVHNAACFCKVVRSKGLCLY	867537	838829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_847094_867237
920343	contig_9375_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_136075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGGAGTGTGGTCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589395	586800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_586800_589400
920344	scaffold_21177_pilon	-	2367	4	Intergenic	novelGene_145483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_3	93.4142506378027	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	64	879	221483	183033	FALSE	60	ACCAAAGAAAAGGAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDGLELQPQGPDSFFDATGADATHMDGDQIVVEVQETVFVSDVVDSDITVHNFVPDDPDSVVIQDVIEDVVIEDVQCPDIMEEADVSETVIIPEQVLDSDVTEEVSLAHCTVPDDVLASDITSASMSVPEHVLTSESIHVPDVGHVEHVVHDNVVEAEIVTDPLTTDVVSEEVLVADCASEAVIDAIGIPVDQQDDDKSNCEDYLMISLDDAGKIEHDGSSGMTMDAESEIDPCKVDGTCPEVIKVYIFKADPGEDDLGKRKPSAYYTS	254641	181544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_183218_217716_218287_221422_221512_254606
920345	contig_10354_pilon	-	4163	2	Intergenic	novelGene_50864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAAAATCCTTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443080	438854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10354_pilon_-_441516_441578
920346	contig_5965_pilon	-	2963	5	Intergenic	novelGene_154679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	2.06155281280883	33	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1641	328	1968	265389	244990	FALSE	10	GTGTTGGTCAGTGGGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPLALPSQDSALLQERNQEEDSSALKILKVTSLGSVLFRDVAIVFSQEEWEQLAPAQRDLYRDVMLETYSNLVSLGLAISKPNVISFLEQGKEPWMPERVVIGGLGPGLESRPDTKVSPLRQNVYEVESLQWELMESLTSYKLECFQDDWEHRERFDRQQGNADGHFSQMIISHEEMPSFGHQTSVTFYQKIHAGEKPYGYNECRKELWQEEFLINHQGIHTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFTQHQRVHTGEKPYKCKDCAKAFSRSSQLIEHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTIHTGKKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPYLCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFTHCSQLIHHQAIHTEEKPYEYKECGRTLSHDSTTVQHQRMCNGETHVNIINIEKPSISTYPLLIIRELMLASNHINGSNGKSSLA	265716	243994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_246306_260637_260734_261312_261440_263284_263374_265376
920347	contig_11574_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_64102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATTAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468305	465604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_465600_468300
920348	contig_3018_pilon	-	1949	6	Intergenic	novelGene_78893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	121	junction_5	455.489802300776	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	394	978	600079	577746	FALSE	65	TAATGATAAAAGAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSGRLKRSVLN	625051	576774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
920349	contig_6589_pilon	+	1487	9	Intergenic	novelGene_26045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	975.45511813717	6	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	350	844	1726977	1730190	FALSE	10	CCATTGCGGCTCTGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSIANTFLSCPLCWSLPPLGEDVGSGQLPQPRQVLPLRFQPLLLRLRQPHLLLRHLDSHRQGQLRVLCGTSYVSVLVLGPIRSSHKPSPLLRFREGLSFISLQIWSKALAISGILTMGLALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRTLLERKVQEMVLETIQNYRANPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWNSPQDWLQVLSRLGPLVRPRRNTDFCVIPANSHIYGEGCKRSLQKWLRNNLISIVGICLGVGLLEVIWLRPHSLLAP	1725417	1730833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1725552_1725657_1725731_1725983_1726064_1726914_1727040_1727175_1727251_1728198_1728304_1728996_1729042_1729149_1729234_1730067
920350	contig_10855_pilon	-	2450	5	Intergenic	novelGene_124396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	34.658151999205	58	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	41	1270	1056527	1020026	FALSE	25	CATATGCATCTGTAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTESSGSCWEIPESSFNFLWIESNPQCRLLHLSSCIHKVYVLGESVVFEDVAVDFTLEEWALLDPVQRKLYRDVMLETFRNLASVDDETPFKANESVSQRDTHEKKISKEDKILKFTRNDSWSSILGKISEGLSIEDQPKDQGLLLRDCMVLRLCESNEGHQWGETFSQIPNLNLYKKTTTRNNPFECTECGKVFMYPSSFKRHIASHAGHKPYQCPECGKGFGFPSELRRHVRIHSGERPYACELCWKTFIHLRSYRRHEKVHSKEKLYECKQCGSTFSFLDSYQRHERTHNKEKFNECKECGKAFKWPSSLTRHMTTHTGEKPYVCKQCGKGFNQLSYLRRHVKMHSGEKPYECKQCGKAFKCPSSLPKHMRTHTGEKPYECKQCGKAFVSSSALRYHVRTHSRVEH	1056567	1018845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_1020304_1021143_1021656_1022082_1022267_1022718_1022846_1056398
920351	contig_9437_pilon	+	2694	7	Intergenic	novelGene_141723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	18.1291661878495	93	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	1996	2601	221595	225386	TRUE	10	CCCTGTATTCTTGCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAIAASEAGQPPPYSNMWTLYCLADMNQQSRPSPPPAPGPLPQATLYLSNSKDPQFLQHPPKVTSPTYVMMDDTKKTSAPPFILVGSNVQEAQDWKPLPGHAVVSQSDTLKRYAAVQVPIAVPADQKFQKHTPNSQNASPPTSGQDVPRPQSPVFLSVAFPVEDVAKKSSGSGDKRTPFGSYGIAGEITVTTAHVRRAET	198741	227041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_200271_204200_204376_204494_204549_221253_221410_221513_221602_224787_225392_226953
920353	contig_10904_pilon	+	2513	1	Intergenic	novelGene_22771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTAAAACAAAGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	706997	709510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_707000_709500
920354	contig_8310_pilon	+	4332	1	Intergenic	novelGene_75553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAGTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215090	219422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215100_219400
920355	contig_9429_pilon	+	3943	2	Intergenic	novelGene_155086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGCTGTGAGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1553	6036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_2779_3318
920356	contig_935_pilon	-	2658	11	Intergenic	novelGene_45546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	357	junction_5	239.351122830038	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	35	1579	370806	345477	FALSE	10	ATTTCTGACTTCTGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSGSQQH	377414	344397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637_370822_377395
920357	contig_8377_pilon	+	2284	22	Intergenic	novelGene_34904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3210.3988647438	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	717	2151	133	2283	68257	180494	FALSE	40	TGAACATTACAAACGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGQDSNSAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQK	68043	180495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_124720_124739_128717_128936_131522_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
920358	contig_15276_pilon	-	2807	1	Intergenic	novelGene_176893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAATGGAGAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18467	15660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15276_pilon_-_15700_18500
920359	contig_6583_pilon	-	3538	2	Intergenic	novelGene_174587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	729	1169	25469	25029	TRUE	75	TCAAAACAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLRKPGIEGKSLQCHYGHVCKTNSQHSTQRRKAESLPFENGNETRMPVITTLINIVLEVLARKIRHERDIRGIQMGKEEVKLSLLADDMILYKENPKGSTGKLLKLIEFSKVAGFRINTKKSIWFLCPNKDHFEKENNKIPRD	26197	22283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_22909_23284
920360	contig_16685_pilon	+	3926	5	Intergenic	novelGene_115050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGCGAGTAAAGAAGGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462930	494481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16685_pilon_+_466449_467511_467642_473175_473249_476278_476396_494393
920361	contig_18607_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_175115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCCAAGGACAAGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299221	297063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_-_297100_299200
920363	contig_7009_pilon	-	4353	7	Intergenic	novelGene_23623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	170	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2852	3253	537017	536616	TRUE	15	TCCCGCACCCCTGATGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAGDVRRELIPVLAVVATHVALKRIAEAVATHVDGVHDVVQEKHPAVFALVHLHLLAAGADHAEGVLGVLGGRPQHVVGPVLLLDGQAVPGVGVDVVGQVDEAAALLLVIALGVCGVLAAVAWGSISLGRD	539868	431144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_431273_435029_435243_444939_444992_453478_453601_512646_512815_517990_518115_536322
920364	contig_3380_pilon	+	2879	1	Intergenic	novelGene_60100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1827	2219	391622	392014	NA	40	TGGGGGGAGATAACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLMPYTKTTSKWIKDLNIKPKPIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISKIYRKIQHSTTKRQIIVLKNGQRK	389795	392674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_+_389800_392700
920365	contig_18163_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_35306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGCAGAGGGTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9954	8747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_8700_10000
920366	contig_10446_pilon	+	3610	1	Intergenic	novelGene_162437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3057	3380	170072	170395	NA	35	AATACTCTCACTGACACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTTFPHWISKRYLKLKHVPNQSPHLPFPNLLLPPFPSQLMPMPSFQLLRLITVDSSSTSSFSHTSHANHQQIQTICKIKPFNHLHCQYPNLSSYHLLLGLLQQSPN	167015	170625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_167000_170600
920367	contig_1090_pilon	-	5510	41	Intergenic	novelGene_131168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	45.3049666151516	111	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1325	3978	171	4148	1031633	952595	TRUE	55	AGAATAAGGAAGAATTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKPVSHKTENTYRFLTFAERLGNVNIDIIHRIDRTSSYDEEVETYFFEGLLKWRELNLTEHFGKFYKEVIDKCQSFNQLVYHQNEIVQSLKTHLQIKNSFAYQPLLDLVVQLARDLQTDFYPHFQDFFLTITSILETQDTELLEWAFTSLSYLYKYLWRLMVKDMSSIYSMYSTLLAHNKLHIRNFAAESFTFLMRKVSDKNALFNLMFLDLDKHPEKVEGVGQLLFEMCKGVRNMFHSCTGKAVKLILQKLGPVTETETQLPWILVGETLKNMVKSTAFYIHKEHFGTFFECLQESLLDLHTKVTKTNCCESSEQIKRLLETYLILVKHGSGSKITNPVDVCKVLSQTLQVASLSTSCREALLDVISALILGENVTLPETLIKETIEKTFESGFERRLILDFSEVMFPMEQFEQLFLPSFLSYIENSFLIDDVTVKDDALAILAKLILNKAPPPTAGSMAIEKYPVVFSEQTVGSYLKQKKTRSKGEKEQSPVLDHLLFIIQLPPNKDATYLSHSWAALVVLPHIRPLEKEKVIPLVTCLIESLFTTVDRGSFGKGNLFVLCQAVNTLLSLEESSNLLHLVPVERVKNLILTFPLEPSVLLLADLYYQRLSLCGCKEPLSQEALMELYSKLQANISTGVSKIRLLTIRILNHFEVQLPELMEDDGLSERQSAFAIIRQAELVPATVSDYREKLLHLRKLRRDVVQTAVPDGPLQEVPLRYLLGMLYVNFSPLWDPVIELISSHAHEMENKQFWKVYYEHLEKAATRAEKELQNEERDEEKSIGDESWEQTQEGDVGTLYHKQLALKTDCWERLDHTNFRFLLWRALAKFPERVEPRSRELSPLFLRFINNEYYPADLQVAPTQDLQRKGKRVVAEETEEDPAARDGEELEEEEVPQDEPTQKKKTRRAAAKQLIAHLQVFSKFSNPQALYLESKLYELYLQLLLHQDQMVQKITLDCIMTYKHPHILPYRENLQRLLEDRSFKEEIVHFSISEDNTAVKTAHRADLFPILMRILYGRMKNKTGTKTQGKSASGTRMSIVLRFLAGTQPEEIQIFLDLLFEPVKHFKNGECHSAVIQATEDLDLSKVLPLGRQHGILNSLEIVLKNISHLISAYLPKILQILLCMTATVSHILDQREKIQLRFINPLKNLRRLGIKMITDIFLDWESYQFRTEEIDAVFHGAVWPQISRLGSESQYSPTPLLKLISIWSRNARYFPFLAKQKPGNPECDILTNVFAILSAKNLSEATASIVMEIADDLLTLPDFEPTETVLSLPVTGCEYTDVAENADVYHDRRKINSTSCTCNSSVSQKNYNKCRKGEKEKK	1031803	938708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_938937_942733_942817_943095_943236_947349_947488_947949_948091_948451_948608_949785_949939_950039_950091_950255_950400_951232_951321_952554_952702_953203_953431_957967_958048_959449_959594_965521_965731_979531_979699_981171_981298_982694_982781_984502_984594_987747_987934_993041_993286_993528_993609_995111_995189_1004678_1004838_1005615_1005679_1006328_1006480_1010873_1010980_1013317_1013407_1013528_1013685_1017665_1017845_1019783_1019862_1021650_1021786_1021862_1022010_1022576_1022733_1023185_1023324_1024192_1024275_1028160_1028350_1029530_1029664_1029782_1029850_1030520_1030602_1031588
920368	contig_12142_pilon	-	3345	6	Intergenic	novelGene_147784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTGCGCAGGAGAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13985	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_4690_6015_6085_9947_10001_11932_12002_13026_13091_13482
920369	contig_13510_pilon	-	2568	2	Intergenic	novelGene_164198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	66	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	507	2060	2566	60496	59990	FALSE	45	GAGGCTTTAAAAAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGQLDIYLTITTTHTHTHLLLLNTIDSVLTHNNPMYNRMKHCKTNDFIANTFFQQHNQGLYKWTSPDGIHRDQIDYICGKTQWKSSISSVGTRPEADCGTNHQLLICKFKLKVKKMRTSPGEPKYDLEYIPPEFRDHLENTFGTLNTNDCRPDELWNDIKDIIHEES	81243	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13510_pilon_-_62283_80970
920370	contig_3424_pilon	-	2157	13	Intergenic	novelGene_55583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	24.1004840891907	2	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	18	1556	1138079	1128729	FALSE	50	AAAACAAAATCATCCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATVLAVRRLLRGSGSWGRSRLRSGPPTYRPFSSGSAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILINSGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTARFGSKDEILLALEKHGGICDCQTSRDTTMYAVSADAKGLDTVVGLLADVVLQPRLTDEEVERTRLAVQFELEDLNMRPDPEPLLTEMIHEAAYRGNTVGLHRFCPPENITKIDRQVLHAYLRNYYTPDRMVLAGVGVEHEHLVQSARKHLLGTRPAWGDQKAVDIDRSVAQYTGGIVKLERDMSSASLGPTPIPELTHVMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFTRLYLNVLNSYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGAVDVVELERAKTQLMSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRCRKLPHELCALISNVTAEDIKRVASKMLRRKPAVAALGDLSDLPTYEHIQAALSSRDGRLPRAYRLFR	1138096	1128127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1128899_1129047_1129193_1131124_1131188_1131436_1131489_1131649_1131769_1131852_1131946_1132268_1132533_1133189_1133291_1134086_1134182_1135433_1135517_1135956_1136037_1136559_1136763_1138008
920373	contig_6980_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_35996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCCAGCAATTCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256240	257962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_256200_258000
920374	contig_4689_pilon	-	943	5	Intergenic	novelGene_165402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	33.4617318738884	68	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCCTCTGTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091966	1084175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4689_pilon_-_1084548_1084918_1085003_1085500_1085603_1086632_1086743_1091691
920375	contig_6503_pilon	-	1274	1	Intergenic	novelGene_145772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCACTCCTAAGATTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188121	186847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_186800_188100
920376	contig_7056_pilon	+	1897	7	Intergenic	novelGene_43708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	216.255057744322	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	49	831	928641	935916	TRUE	30	AGCAAATCTGTTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPNRWSPITVQEEMMTGLICPQKK	928592	937933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935542_935846_936043_936993
920377	contig_8978_pilon	-	1879	2	Intergenic	novelGene_49488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1760468	1755493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1756521_1759616
920378	contig_6191_pilon	-	2724	1	Intergenic	novelGene_107834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAAAACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116599	113875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_113900_116600
920379	contig_8386_pilon	-	3280	12	Intergenic	novelGene_82210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_8	192.664741142065	2	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	175	1290	45992	18699	FALSE	65	AAAAAAAAAATCAGGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTLYVGNLSRDVTEALILQLFSQIGPCKNCKMIMDTAGNDPYCFVEFYEHRHAAAALAAMNGRKIMGKEVKVNWATTPSSQKKDTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIKAAFAPFGRISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSTAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPAGYRVAGYETQ	46166	16708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_34662_36104_36160_36681_36781_38376_38474_45978
920380	contig_401_pilon	-	2281	8	Intergenic	novelGene_42925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTTCTACAAGATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1957705	1944940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1945593_1946389_1947080_1948358_1948492_1948787_1948908_1952091_1952240_1952522_1952651_1955784_1956011_1957521
920381	contig_10482_pilon	+	1970	8	Intergenic	novelGene_152802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	666	junction_1	1025.37069454149	116	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	154	708	116203	123281	TRUE	25	GGGCTTGCATTATAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	77215	127174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117315_118597_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942
920382	contig_5881_pilon	-	2212	3	Intergenic	novelGene_129051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	579	1634	2212	483205	482627	FALSE	60	GAAAACACATCATACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQNMLTFVLKNNPYMICHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVRDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQRDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTCSRIDYILGHRAILNKIQNVEGIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIGDGIKKFLESNEN	490274	482626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_483900_488563_488682_489453
920383	contig_7870_pilon	-	2505	1	Intergenic	novelGene_109073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGGTGGAGATGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731289	728784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_728800_731300
920384	contig_8254_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_48392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATGGTCACTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101212	99998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_1e+05_101200
920385	contig_960_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_108313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGCTGAAAGCCGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047713	1050328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1047700_1050300
920386	contig_10225_pilon	-	2296	13	Intergenic	novelGene_86812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	42	323	47709	47428	TRUE	20	AAAGTCCCGACTCCGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47750	20693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39911_40139_40308_40967_41051_41435_41524_42607_42723_44014_44071_45214_45256_46107_46788_47351
920387	contig_10345_pilon	-	1430	2	Intergenic	novelGene_158387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGACAGGCCTGGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18232	16605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_16975_17171
920388	contig_2757_pilon	+	1337	8	Intergenic	novelGene_164606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_7	30.2013650184821	27	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509339	533356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_509538_514579_514838_514944_515021_515929_515974_516807_516879_517822_517888_531408_531454_532776
920389	contig_3382_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_124015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCAGAATAATTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135400	132911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_132900_135400
920390	contig_12969_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_61699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGCGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598251	597253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_597300_598300
920391	contig_1443_pilon	-	2219	4	Intergenic	novelGene_28259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_3	37.8505834389203	34	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATATTAAAAAAATAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562624	557661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_559691_560831_560913_561588_561649_562575
920393	contig_13004_pilon	+	2918	1	Intergenic	novelGene_112622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191480	194398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_191500_194400
920394	contig_9815_pilon	+	3455	4	Intergenic	novelGene_164238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	287	877	1819	2409	TRUE	25	CATCACATTTGTCCTATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQKTQRGSLRNC	1532	46705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_2480_3016_3291_6724_7132_44878
920395	contig_10904_pilon	-	1472	8	Intergenic	novelGene_22727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	379.882849825886	37	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	284	1264	662171	650974	FALSE	25	CTAAAGCCATTCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLKEKREGKQAES	662764	650765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651008_651379_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
920396	contig_9614_pilon	-	3087	5	Intergenic	novelGene_104412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTGGATTGTCAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143610	64593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_-_64662_74548_75126_94133_94311_97514_97877_141707
920397	contig_5921_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_142242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	286	798	163646	163134	NA	45	GACAGGAAAACTGGACGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTVRYHLTLILVVLIKKTENNKCWRGCGETGTLMHCWWECEMIQPLWKMIGHVLKKLEIEVPYGPAIPLLEIYPREMRAVTRIDICTPMFTAALFTIAERRKQPKRPSIEEWINKLQYILTMEYYATIEYNDESVKRLTTWMNLEGIMLSKISQSQKDKHCMRPLL	163931	162312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_162300_163900
920398	contig_19990_pilon	+	422	4	Intergenic	novelGene_30772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3256	junction_1	340.544661779724	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	28	420	139243	143886	FALSE	40	GTGAGTATATTACGTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVKNLDSTLNKRALDPTPKHECHVSKNANRVTSLLAYRAYELTQYYFYEYGFDELRRRPRHVCPYAVVSFNYKDDTQTLKFPSSRSNSFNADRNTDKFSYTLWKGQLLNKGKLLCYISLRSATRAFLPIK	139215	143888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_+_139378_141321_141444_143020_143053_143782
920399	contig_4654_pilon	-	867	1	Intergenic	novelGene_103108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGAATATCAGACGGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515577	514710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_514700_515600
920400	contig_5821_pilon	+	2987	2	Intergenic	novelGene_179010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2046	2351	253516	253821	FALSE	30	TTGGAATATAGTTTTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIIPSANRESLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNIFSLSPLRMMLAIGFA	250733	254457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5821_pilon_+_251779_252515
920401	contig_12624_pilon	-	2342	1	Intergenic	novelGene_60970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23749	21407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_21400_23700
920402	contig_13800_pilon	+	3974	2	Intergenic	novelGene_153735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2100	2501	148200	148601	FALSE	45	CGGTAGAGAAATAAGAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDANILNKILANRIEHHIKKIIHHDQVGFITGMQGWFSIGKLISAIHHVNKRKEKNHMIISVDSEKAFDKVQRPFLIRTLNTIGVEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLENRNKTRMPFITTPI	143788	150074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_145397_147708
920403	contig_16724_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_105270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGTCTTCAAAATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331907	334039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_+_331900_334000
920404	contig_6069_pilon	-	753	2	Intergenic	novelGene_8033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGAATATTGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224994	222930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_223659_224969
920405	contig_8354_pilon	+	2905	2	Intergenic	novelGene_24087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCAGACTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160391	163432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_162677_162812
920406	contig_9195_pilon	-	1637	9	Intergenic	novelGene_155677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	9.13441295322255	32	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	143	1075	131178	113241	FALSE	20	TGCCTGTTGTTTAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLCAAGLLTSFIHQTVNRTINDWTPSNEKSVASLLRTLEELKSDLSMSTSTQKNTAAQLQTQLVDVLLKDNDSLTKVLSTVTQEKAELCKAVSKLEKTLKHHLHKGCTLSKPGRAAWKHERMAPQGSPRHADPRLCMLAGNEEAATCSVKMEKLYLHYLRAESFRKALIYQKKYLLLLIGGFQDSEQETLSMIAHLGVFPSKPDKKATASRPFTKFRTAVRVVVAILRLRFLVKKWQEVDRKGTLLRGTALRPEAPMSQRQPPLPETTGSPPTRDASPGLVRDPACGTRPTPTASPRRKDRSTPSPNSRSERPLDAAQDPEHSLTEYIHHLELIQQRLGGLPSDSTSKKSCRQKIK	131522	112678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_-_113282_113739_113868_115674_115817_117235_117313_122231_122465_123249_123370_129998_130173_131160_131264_131465
920407	contig_9807_pilon	+	4846	1	Intergenic	novelGene_32925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCCGGCTGGGCTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147365	152211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_147400_152200
920408	contig_9727_pilon	+	2698	10	Intergenic	novelGene_86370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAACGCTCAAATTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577567	622869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_579490_581731_581823_582360_582420_583892_584028_584739_584833_584956_585087_590127_590172_591626_591752_598023_598078_622824
920409	contig_6870_pilon	-	2985	20	Intergenic	novelGene_103993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCATGGTTTTGGATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607505	1488059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1488089_1493504_1493613_1502316_1502445_1504246_1504494_1521424_1521615_1523632_1523705_1524852_1524941_1525067_1525164_1530737_1530856_1532495_1532660_1533388_1533488_1539712_1539973_1547903_1548096_1561566_1561717_1564394_1564538_1567435_1567563_1593445_1593536_1594459_1594546_1601693_1601850_1607063
920410	contig_17436_pilon	-	2004	2	Intergenic	novelGene_164181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTAGCTTCTCGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91562	86341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17436_pilon_-_86389_89605
920411	contig_18511_pilon	+	1801	10	Intergenic	novelGene_126861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_1	342.204544997994	16	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1542	258	1799	47371	59830	FALSE	55	GGAACAGAAAGAAAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQM	35381	59832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753
920412	contig_8063_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_152450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1319	1696	910148	910525	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQWGPNTPVVKKNEEHRRYKESISPTDRKGPINQRLHQPETRRTRWCLATTNDHPNREHNRESRMEQEKSGVQNSNSSKNTRLNGMTENEGIPESIAPRLSVNPDLKPFLRPTLQTKIRLDYGA	908829	910786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_908800_910800
920413	contig_3818_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_99222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAACCGATGCTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251176	252483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_+_251200_252500
920414	contig_7976_pilon	-	2070	2	Intergenic	novelGene_169403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	239	379	708030	707890	TRUE	55	ACTCAGCAAATACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRLSGRGGRDTLEAVRSCQTLPGKSLSPSGLSSSWVSGEAGKQQCSGGAFSAPGETQQQRVYTATQNHYEASLDQQKVSMCLRPTTQIKNTPPQGKTSLPFTSLLPALHWVLDRLQQLQSPLGWK	708268	705736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_707320_707781
920415	contig_854_pilon	+	1333	8	Intergenic	novelGene_36248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2608.86268128392	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	108	686	543600	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543492	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563630_563738
920416	contig_6740_pilon	-	3484	2	Intergenic	novelGene_142683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628526	620030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_621173_626184
920417	contig_14522_pilon	+	3692	1	Intergenic	novelGene_147325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCCAGAAATAAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106327	110019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14522_pilon_+_106300_110000
920418	contig_7904_pilon	+	3768	1	Intergenic	novelGene_160034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	170	403	535582	535815	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLELGAGVVKGCLLKHRLQGCRVSLPQRQTSYLAGLNGPLGGLKARLGSTGAGSAAMNSPVDPGARQALKKKPPERTPEVRSVDPGARPAVQQIVSFCRSEALGDCPGVRTSHLLLGYLFFKSRSSVPGRSGV	535412	539180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_535400_539200
920419	contig_9313_pilon	+	927	3	Intergenic	novelGene_86480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	404.5	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	29	322	387329	462015	FALSE	30	GTACAATTTAAATTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGVNASVDQTHFSKLPGLHPYS	387300	462620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432587_461956
920420	contig_610_pilon	+	1518	7	Intergenic	novelGene_76833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_2	196.467483880214	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	7	969	350011	373785	TRUE	25	TATTCATTGCAGTATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIMANPKRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKVTPFDQHIFPPPPTSRTIQYPA	350004	376040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360752_361083_368139_368245_369603_369658_373435_373806_374082_374155_375583
920421	contig_11056_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_130388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	75	443	638388	638756	NA	25	ACTGCCTTTCACTGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDILPPSATSLQATPLSWPAAQSKAPSSPLVANPRLPSHWWAQLPLGWVRKHRAGSRAPLAPGPSLCPGQRLLSRRPLRNRSSIAVSFEGQGCHLLLDRDQVMGDTQALINAGIFLGMTL	638313	640089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_638300_640100
920422	scaffold_6394_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_110976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTCGACTCCTCAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371265	370879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_370900_371300
920423	contig_5463_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_144777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACTCAGCATCTCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39239	40358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_+_39200_40400
920424	contig_13201_pilon	-	2754	1	Intergenic	novelGene_130877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACCCAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133199	130445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_130400_133200
920425	contig_7976_pilon	+	2057	1	Intergenic	novelGene_169424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGCGGGCTCATTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906637	908694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_906600_908700
920426	scaffold_16539_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_68340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAATTATGAAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464878	463700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_-_463700_464900
920427	contig_15327_pilon	-	1930	1	Intergenic	novelGene_70532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	57	174	153	326	509828	509655	NA	30	ACTTTTGTTTACAATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICNSWEGTQGPSLCEAWHLLRFLFHWWRLAGCSIGIAPVCFVGFRVLLLLMTISRGRGVAWRAPFLSSLSHSRSAGTPPLALGPSSACTTQELVTGSSSAGSWRSQY	509980	508050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_508000_510000
920428	contig_5084_pilon	-	1726	1	Intergenic	novelGene_64561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAAAGAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537465	535739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_535700_537500
920429	contig_10765_pilon	-	3003	2	Intergenic	novelGene_122962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGGTGTAGGTGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375551	372363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_373761_373945
920430	contig_9988_pilon	+	2584	1	Intergenic	novelGene_113050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCATCTAAACTACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55532	58116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_55500_58100
920431	contig_6720_pilon	+	3003	1	Intergenic	novelGene_178043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1816	2124	277872	278180	NA	65	TGAAAAAAAAATCCACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDKCIENTDKNMEGFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKVSEMDSVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTVFEENSEKRTKKNEETLKVM	276056	279059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6720_pilon_+_276100_279100
920432	contig_18933_pilon	-	4239	2	Intergenic	novelGene_177290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGAAGTAAAAACGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15989	11019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18933_pilon_-_12482_13212
920433	contig_16148_pilon	+	684	1	Intergenic	novelGene_50372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAAGGATAGCCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74356	75040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_74400_75000
920434	contig_17769_pilon	+	1232	8	Intergenic	novelGene_124272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_5	102.009803450453	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	61	1155	111972	116765	FALSE	30	GCATATAGCATGTCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTNVVVLAGTNRPDILDPALMRPGRFDRQIYIGPPDIKGRSSIFKVHLRPLKLDESLSKDALARKLAALTPGFTGADISNVCNEAALIAARHLSPSVREKHFEQAIERVLGGLEKKTQVLQPSEKTTVAYHEAGHAVVGWFLEHTDPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPREQYLYTREQLFDRMCMMLGGRVAEQLFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQVRAGVTGAGRHHRCRHRHRCGQASQVQASQIVQFGMSEKLGQVSFDLPRQGEALVEKPYSEATAQLIDEEVRCLISAAYARTLELLTCSREQVEKVGQRLLEKEVLEKADMIELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLEEDTSLPEGLKGWNQERTEEQVEGQVQESPA	111911	116842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_+_112009_112757_112884_113496_113608_114697_114814_115333_115535_115879_115970_116111_116307_116546
920435	contig_6589_pilon	+	1371	11	Intergenic	novelGene_25723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_6	69.6109905115564	9	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	86	673	460735	475020	TRUE	25	CACTGTGAGTTGGAATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEGCQGWAFVQ	451705	484219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843
920436	contig_8631_pilon	-	3035	3	Intergenic	novelGene_121993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCCAACGTGCGCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187124	1025907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_1025991_1169009_1169534_1184696
920437	contig_17144_pilon	-	2362	13	Intergenic	novelGene_29336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1783.07924007569	78	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	328	2067	173640	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183391	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173685_181799_181850_183158
920438	contig_13868_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_172647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCAGGTAAAATATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64437	62620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_62600_64400
920439	contig_16622_pilon	-	1932	10	Intergenic	novelGene_48481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	659	junction_5	1035.23872120229	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	274	909	125335	112952	FALSE	70	AAAAAAAACAAAAAACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TQHHPPSGGRRDLADHLSSQAGDLPSHNSPIKKPPKHHRGTQTKAEDAQTTIKNDASQQTNCGVAVLDKEIIQLSEYLKEALQRELVLKQKMVILQDLLSHLIRASDSSWKGQLNEDKLKGKLRSLENQLYTCTQKYSPWGMKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	126389	111928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118884_125275_125372_125464_125495_125765_125791_126056_126121_126271
920440	contig_15838_pilon	-	1141	1	Intergenic	novelGene_174349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATCAAAAAGAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355092	353951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_354000_355100
920441	contig_8354_pilon	+	4862	4	Intergenic	novelGene_24147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAATAAAGATTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534832	541455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_537379_538000_538147_539084_540522_540722
920442	contig_835_pilon	+	3198	2	Intergenic	novelGene_152168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1332	1853	347116	347637	FALSE	55	GCAATTAAAGGAAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLYTDQEAVVRTEQGDTAWFKVRKGVCQGSILSPYLFNLYTEQIIQEAGLYEEECGIRIGGRLINNLRYADDTTLLAESQEDLKDLLMKTKNYTLQYGLHLNIKKTKILTSGPISNIMINGEDLSCQGFHFTCIHSQCPWKQQLRNQTTYCTGQICCKRPL	337892	348982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_338043_345934
920443	contig_7202_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_19112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1153	1482	170410	170739	NA	35	AAACCACTGCCTAGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIRASSVDPIFSSMNFIVFGFIFRSLIRFELVFVYGVRYGSYFIFFADGHPVLPAPFVTKTVFSPFDALWSFVEDQVIVGGWMYIWVLSSVPLVSVFVVVPVPGCFD	169257	171460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_169300_171500
920444	contig_6276_pilon	+	2616	4	Intergenic	novelGene_174126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	23.4710223230453	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTATCTTTGGTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174569	238951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_174664_176358_176473_225377_225517_236682
920445	contig_1734_pilon	+	2226	1	Intergenic	novelGene_164375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1612	2061	556464	556913	NA	35	TAGTGATTGGAATGTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSTGTLCDTVPEDEPFRLEGTQNTTREELPPQSRVNLNDVDGLKLLGPSFADKAQHKIRRNSGKHPLIIGMGNIRSINVGKLEVVTNEMECIKINIVGISELKWTGIGHSESDNHMVYYAGKNKLKRNGIALIVKKNISISILKYGNC	554852	557078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_554900_557100
920446	contig_3382_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_124190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	902	1591	990400	989711	NA	20	TGGATTGAATGGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQMSSGMTSRTSYMKKAEGHYKEERKKRPKWMSEETPKLALERRVAKANGRNDEVKEMNRRFKGQLEKTTSLLKCYNEMCKDLEIQNQKRRTHLAFLKMKELKKKFKPQVAILTDSMILNKTGSIKRRWQENTEFLYQKELVNIQPLQEIVYDQEPRGLKEEIHAALKALGKNKAPELTEYQLRCFNKRMQHRKCSLIYAKKFGRHLPGQLTGRDPYLCPFQRKVI	991301	988406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_988400_991300
920447	contig_14173_pilon	-	1709	1	Intergenic	novelGene_144572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGAGAGTAAGTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2765	1056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14173_pilon_-_1100_2800
920448	contig_3627_pilon	+	2983	12	Intergenic	novelGene_78563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	103.974726744786	8	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	29	820	1299272	1301640	TRUE	20	TACAGATGGTGTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGALEPGTPAAPAAPSPARVRAPASGNLFRPISAEDEEQQPTEIESLCMNCYRNGVTRLLLTKIPFFREIIVSSFSCEHCGWNNTEIQSAGRIQDQGVRYTLTVRAQEDMNREVVKTESATTRIPELDFEIPAFSQKGALTTVEGLINRAISGLEQDQPMRRASEETIAERIDEFIVKLQELKQVASPFTLIIDDPSGNSFVENPFAPQKDEALVITHYNRTSKQEEMLGLQVSGWKEPEHPEMISHPGLLGVSGNLFCC	1299243	1308534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
920449	contig_1996_pilon	+	324	1	Intergenic	novelGene_131862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCTTCATCTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73449	73773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_73400_73800
920450	contig_8260_pilon	-	1887	1	Intergenic	novelGene_163262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	524	823	307644	307345	NA	55	AAAAAAAAAAAGTCTCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFVLLLRNLCQFQGDKNILLFSSESIIVLAFTFSTVTFKTIFCSPESTTNLCIEWLTCLATNQMVGVSGLPRNISQERPGDLLPTNQLLKTPRSTVLL	308167	306280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_306300_308200
920451	contig_10599_pilon	-	1978	3	Intergenic	novelGene_49886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATGTTTTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165612	161246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_161482_163804_164445_164509
920452	contig_11096_pilon	-	1812	2	Intergenic	novelGene_143485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGACCCTCGACAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293069	277930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_278294_291620
920453	contig_2438_pilon	+	3015	2	Intergenic	novelGene_112012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4923	junction_1	0	192	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	83	436	310588	310941	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAAAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVRAGPTVGWKCQRAGLGVGAWRLLNLKKRKLRAHRFQLLPKPGHHYWAKTHSSLPAH	305083	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559
920454	contig_4508_pilon	+	1108	3	Intergenic	novelGene_177529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	17	6	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCTGATTATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24056	41773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_+_24300_38555_38706_41058
920455	contig_10323_pilon	-	3043	1	Intergenic	novelGene_123538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGACCCAGCAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246400	243357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_243400_246400
920456	contig_10982_pilon	-	2389	8	Intergenic	novelGene_87882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGGAGAAGAAAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203131	142513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_142594_145180_145283_168723_168845_171071_171172_182219_182353_190709_190892_190978_191140_201621
920457	contig_4091_pilon	+	1297	5	Intergenic	novelGene_173022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_4	122.273003970623	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTTTTATGACAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11131	27584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_25756_25821_26751
920458	contig_7045_pilon	-	3563	1	Intergenic	novelGene_77462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGCTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376489	372926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_372900_376500
920459	contig_9706_pilon	+	1336	13	Intergenic	novelGene_20936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	719.105675281611	2	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	552	1256	337165	442130	FALSE	10	GTGGGTGTGACCGCTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRLT	231538	442210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313534_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_442121
920461	contig_10225_pilon	+	2276	12	Intergenic	novelGene_86773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	563.634193544209	1	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1099	1815	42707	47280	FALSE	20	CTTGATTCTGATCCTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFRDLKA	20657	47741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46754_47267
920462	contig_1082_pilon	-	2854	1	Intergenic	novelGene_170421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAACAACAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21967	19113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_-_19100_22000
920463	contig_3956_pilon	+	1977	10	Intergenic	novelGene_14850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1319.39875008596	120	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	84	1277	1281682	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKHSPALPLCQCADRPAPPHGAYLPCGDPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285782_1289594_1289677_1289758_1289892_1290297
920465	contig_3077_pilon	+	2468	2	Intergenic	novelGene_26821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1848	junction_1	0	12	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACACAAAAGGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476012	479019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_476905_477443
920466	contig_11216_pilon	-	2074	3	Intergenic	novelGene_173597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5	46	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	151412	135880	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVIWVILSVEVGGLLGVTQQLSSFETEFNTQPHRKVEGNFNPFASPQKNRQSDENNLKDPGGSGFDSISKNTWAPAPDQTEQDQNRLSQNSVNLSPSSHSNNLSVVTYSKGLHGPYPFGQS	151413	132677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11216_pilon_-_132734_134228_135916_151082
920467	contig_15835_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_157153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCACTTGCTAGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15404	12950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15835_pilon_-_13000_15400
920468	contig_10930_pilon	-	3188	7	Intergenic	novelGene_36969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1421.48826547703	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	142	915	279066	274012	TRUE	25	TTGATGTCCAGAATTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSQERFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKRGK	279207	266538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274028_274065_274325_276723_277013_278443_278637_279049
920469	contig_2834_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_27997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTGCTCCTGTAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273845	275949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_273800_275900
920471	contig_9997_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_169472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGCTGGCAGGTGGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75979	73611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9997_pilon_-_73600_76000
920472	contig_6137_pilon	+	2306	19	Intergenic	novelGene_59202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1047.05405811605	4	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	63	1892	1313656	1353702	FALSE	55	TGGAAAAAAAAAAGTACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNWNPQNAVTLFRENETGEGMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1305908	1354116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331774_1331815_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
920473	contig_5640_pilon	-	3389	1	Intergenic	novelGene_27260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171086	167697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_167700_171100
920474	contig_4869_pilon	+	3185	5	Intergenic	novelGene_179011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	2366	3184	617330	618148	FALSE	35	AGGCAAGAAGGCAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKRRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETM	581038	618149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4869_pilon_+_581721_586620_587037_587309_587784_588007_588312_616840
920475	contig_854_pilon	+	1151	8	Intergenic	novelGene_36235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2608.86268128392	20	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	113	691	543600	562402	TRUE	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543487	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563223_563532
920476	contig_5084_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_64563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATATAGTCTGTGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539550	541056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_539600_541100
920477	contig_5020_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_27869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_4	394.752841098776	14	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	629	1399	123186	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118467	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
920478	contig_14142_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_120437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	144	524	70919	71299	NA	50	AAGGACATTGTACATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNEKKQLRTSINNQNVECMKYECRKLEVVKNEMEYLKIDILGISELKWTGVGHFESDNPIVYYAGNEKSKKNGITFIVKKSISRSTLKYNSVSDRVISIHLQRKQINMNIQIYTPTINAKDEEI	70775	71807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_70800_71800
920479	contig_5643_pilon	+	1993	15	Intergenic	novelGene_39066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	749.27216724782	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	353	1687	631988	641123	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSSTSSTRSTAPTPPARGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQTQGGYV	631222	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631884_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641102_641244_641412
920480	contig_18081_pilon	-	2509	1	Intergenic	novelGene_23793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	726	1187	112611	112150	NA	40	ATAACGACTGTATAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYRNNWPLPPKKTTFEASFNRYKEKLKTKRLWSPRELTHGPRVVQTAVCLPSRSPNEVVSTITQILQERLCTRAQASRRVTTLCNVCPQSLSVQWFREGLCPGGHLWFSQLGLLVFSMEHDGEVQQKHQTCQKPKHLREKTRERGYLNNCGR	113336	110827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_110800_113300
920481	contig_10324_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_7918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAGAGCTTCCGGGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890389	892309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_890400_892300
920482	contig_10263_pilon	-	2333	3	Intergenic	novelGene_135828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCAGGGATCCCGCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897463	807262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_-_807291_839853_840684_895988
920483	contig_2689_pilon	-	3295	1	Intergenic	novelGene_100831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	1913	2428	185777	185262	NA	65	CAAAAAGAAGAAAGGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMGFIREVAVTVQAQEHSGYSSSIKTASSQLCLQVCLSLALGLCPEALSFLTPWARNPTTPSPADGSLLPPLLIVFMVTAHTLLVSCFQELLSTGTLGPKDALSTPGCFSLVVIGSSSLFWNSLSFNAKPINPLGGPQLPITQSCQVTWVGVTRPWLERPHKRDQLHHIV	187689	184394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_184400_187700
920484	contig_6159_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_128268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACTGCTTTACTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314709	312306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_312300_314700
920485	contig_7410_pilon	-	2503	4	Intergenic	novelGene_106134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGTGAATGTGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938538	933214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_933295_934103_935406_936328_936401_937489
920486	contig_11117_pilon	+	2302	2	Intergenic	novelGene_148577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTGAGTTCTTGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34521	193131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_36273_192580
920487	contig_6710_pilon	-	573	2	Intergenic	novelGene_92452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2135	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	657517	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657517	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
920488	contig_6217_pilon	-	1184	1	Intergenic	novelGene_109686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAACACATTAAAAATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892810	891626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_891600_892800
920489	contig_12411_pilon	-	4289	5	Intergenic	novelGene_145667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1871	2245	31227	30853	TRUE	25	CAGAGTGCTCCTTAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLKVVKNEMEHLKIDILGISELNWTGIGHFESDSHMVCYTRNSKLKRKGIAFIVKKNISRSILKYNSVSDRIISIRLQERPVNTTIIQIYVPTTNAKDEKLKIFTNFCSLKLIRHAIKMH	120722	28736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_-_30551_30622_31380_59581_59805_78531_78584_119279
920490	contig_8823_pilon	-	1804	1	Intergenic	novelGene_53062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATCCAGCCCATGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64655	62851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8823_pilon_-_62900_64700
920491	contig_5791_pilon	+	2834	1	Intergenic	novelGene_35831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGAGAAACTAATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1019608	1022442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1019600_1022400
920492	contig_5999_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_45595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5449	7757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_+_5400_7800
920493	contig_16907_pilon	+	3004	2	Intergenic	novelGene_87492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTCTCTTTTTTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658218	662242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_+_660942_661961
920494	contig_9888_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_162261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTATCTATTGCCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40686	39519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_-_39500_40700
920495	contig_13067_pilon	-	2134	1	Intergenic	novelGene_141337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44089	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44100
920497	contig_10311_pilon	+	2477	8	Intergenic	novelGene_50466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	444	866	65659	66409	TRUE	25	CCTGACTGAGCTTGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIETRFRNSQRKQHNARCDLAYSTTASTAFGTISSQELNKVSHVHGHLLHCSIVESLNVTKNPLVFFSNKVYSHTFSPKSTPSANSVCGEKKHIRHQNVTSALCELLHMTIHLLTISCCLLIKGYLFSKTYKFFPVGKH	65215	69916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_66032_66359_67260_67490_67585_67826_67961_68263_68407_68641_68754_68868_69038_69807
920498	contig_11855_pilon	-	1090	1	Intergenic	novelGene_66968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGACTTGATTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1078380	1077290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077300_1078400
920499	contig_10722_pilon	-	1698	10	Intergenic	novelGene_70963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_6	273.686537826862	57	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	103	1218	14395	4150	FALSE	30	TAGTACAATGGCTGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSSWQQTPSPLILDQNYINTKNQVIKAERRVLKELGFCVHVKHPHKIIVMYLQVLECERNQTLVQTAWNYMNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	16299	3669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637_6738_8496_8562_9665_9787_14372_14446_16247
920500	contig_10857_pilon	+	981	11	Intergenic	novelGene_160888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1504.57416234628	10	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1	489	21918	58861	TRUE	5	TCCCATGCGCTGCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPGPGEQEELLVDEATGLTTQRSVEDEEEAARERRRRERDRQLQAEDEDLGHQAPEPEQDKLLHLKPSEAPELDEDEGFSDWSQKPGPQGQLAVDGGEAPQGDSPQEQEHEENRPQGHEQEDSDGPGQAEVPLEGLACNVSSPGHPAPWPWRGLPNTARLP	21917	66893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_21971_54430_54566_56404_56561_58201_58268_58782_58876_59617_59662_59830_59913_61366_61502_61883_61962_62094_62125_66784
920501	contig_5988_pilon	+	1985	9	Intergenic	novelGene_15840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGAGAGCATGGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241615	259855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_242384_243167_243288_249400_249658_251800_251901_253930_254024_254688_254861_255239_255404_258764_258939_259718
920502	contig_20719_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_140572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGGAAAAAAATAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62652	59818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_59800_62700
920503	contig_6795_pilon	-	2704	1	Intergenic	novelGene_27729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1794	2111	312729	312412	NA	35	AAAAAAGGCTTGGTGATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRVLGWCKWLSAQLLARRLAVQIHPRGASDRLGVVSGHLRYSTGLIPSGARENEGNRIQGKDQSEATKASSGLSPVQLDGAWLPPLTALTRITTEGSAQSWIRM	314522	311818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_311800_314500
920504	contig_13456_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_153264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGAAGAAAGGCCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25460	24090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_24100_25500
920505	contig_10953_pilon	+	844	4	Intergenic	novelGene_42600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	9180	junction_3	15384.8654852748	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461173	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_461224_461550_461639_463465_463529_463817
920506	contig_19362_pilon	+	3911	2	Intergenic	novelGene_157803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	41	493	78660	79112	TRUE	25	GTGACCTGGAAGTGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWSFCPSGVCPVRMVLDPRRPRGEWLWGLQMGRGGPGHADVCEELRFLGRRTLELPWGFRNCPGGMGVQFGGEGREAGSKCCATAGRGNLPSGDPAPARLLEAAAARAGGIWLRQAAAALSLPAPHLLRARSPWRQLQTDKGSKCSAQVQDRKGRTGREQKKS	78619	83382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_82385_83236
920507	contig_1594_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_138827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGTTCTGTAAGACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583321	582438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_582400_583300
920508	contig_11026_pilon	-	3563	1	Intergenic	novelGene_167660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	155	475	133278	132958	NA	10	CCTGGCCCACTGCCTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKNNSGECSGRSENCNTGDSTDGERQQQRNGSSGTRRSAHNSAGADPQRESLVPLHGRLPGGVGCFWALIGGARPADPQSKRAECLLAEVYWWSGVPPSTYQWN	133432	129869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_129900_133400
920509	contig_16625_pilon	-	1585	10	Intergenic	novelGene_171106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_8	21.4476105895272	53	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1164	421	1584	65826	6950	FALSE	20	TAAGAGTAGTTTGTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVFPKISLRPEVENYLKEGFMNKEVVTSLGKQEAERKFQTLLNHLSHPPSFTTVRVNTRLASVQHVKNLLLDELQKHPDLQDVLLIPVIGPRKNIKKQQCEAIVGAQCGNAVLRGAHVYVPGIVSASKFMKAGDVISVYSDIKGKCKKGAKEFDETKIFLGNGISELSRKELFSGLPELKGIGIRMTEPVYLSPSFDNVLPGYLFLQNLPSAVVAHVLNPQPGEKILDLCAAPGGKTTHIAALMHDQGEVIALDKVSNKVEKIRQNALLLGLNSIRAFCFDGTKALKLEMVEDTEGEPPFLPESFDRILLDAPCSGMGQRPNMACSWTLKEVTSYQPLQRKLFSVAVQLLKPGGVLVYSTCTITLAENEEQVAWALRTFPCVQLQYQ	66246	6948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_7076_10665_10815_17612_17758_21823_21944_28976_29059_32842_32997_34818_34929_54768_54816_63713_63870_65751
920510	scaffold_12124_pilon	+	2619	6	Intergenic	novelGene_22074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445.841855370265	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	67	204	337	540	846895	852375	TRUE	20	AATGTTTGAGTTGGATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QHQLHELQLGAWPSSTCRCPVPPRCLDLFVSAVPLGGSKVVSPRPFAKSSSYRLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	846558	859616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
920511	contig_9177_pilon	+	2441	15	Intergenic	novelGene_32579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	798	1268	4573	7001	TRUE	25	TGTCCCTGCAGACACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSWRQELPAATALAVAMVIPLVMRMKSSGVEVLAGGSGEQKIASSCRMCSVVASRARVPFVASSSTAFTVFSNDVTLVTITLAEFLSCHTAGSSPTLPAAAFVALIRSPRALATSFTALIKTTWVSGSSAPRLAAPSLTTSARRVMVDTEDWAA	1713	9856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2729_4535_4704_6472_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7424_7599_7741_8489_8611_8687_8789_8903_9056_9149_9315_9403_9509_9727
920512	contig_7963_pilon	+	718	3	Intergenic	novelGene_58417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_2	416.5	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2	385	57335	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	57333	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_57564_57782_57934_63003
920513	contig_8452_pilon	-	1671	2	Intergenic	novelGene_48059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAAAAATGAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460428	458668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_459188_459276
920514	contig_14727_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_56653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAGCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312505	310254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_310300_312500
920515	contig_17144_pilon	-	4371	1	Intergenic	novelGene_29147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1861	2193	90590	90258	NA	20	GTCCTCCCAGCCCTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLEPHCRHLPSWRARVLLLFAVGMELLQYADDTTLLPESKEDLKHLLMKIKDYRLQYGLHLNIKKTQILTTRPISNFMINGEKIKVVKDFILLGSTISTHGSSSQEIK	92450	88079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_88100_92400
920516	contig_12635_pilon	-	1719	6	Intergenic	novelGene_60867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	367	junction_5	539.11690754418	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	41	126	307	432	637505	633112	TRUE	45	CTGAGGAATTGATAGAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKYLVKLSDFDREHFSEVFVDLKWFESKVGNKYLNEAAGAAAEEAKNYEEKKKSKGEENVCWAALDKNESEAATSKDNLEDETEDDDLFETEFRQYKRTYYMTKMGVDVVSDDFLADQAACYVQAIQWILHYYYHGVQSWSW	640354	630333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_630856_632346_633206_637473_637580_637793_637858_639632_639771_640324
920517	contig_5954_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_28474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGTCTACTTGCGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187501	188790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_187500_188800
920518	contig_9434_pilon	-	3257	1	Intergenic	novelGene_150510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAACCTGTCTGCCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380854	377597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_377600_380900
920519	contig_14481_pilon	+	2584	2	Intergenic	novelGene_153850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	0	4	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121028	124235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_121883_122505
920520	contig_3018_pilon	-	2146	2	Intergenic	novelGene_78888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	852	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1234	1551	570362	569929	FALSE	30	AGATTGTTAACCATTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRYIPLFSCS	571595	569333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_570088_570203
920521	contig_5889_pilon	+	3236	1	Intergenic	novelGene_133693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	2469	2909	282187	282627	NA	65	GGAAACAAAATCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSHQITQSYNTGNHDLAKLLPTFSGGNNSIHDRHIIIKLAKTKDKERILRVARDRRKVIYKGESKRISLDYSAETMQARRQWNDIYKALKEKNCQPRIKYPAKLSLKYDGEIMTFPDNQKFREFAKTKPKLQEILKGVLQLENQ	279718	282954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_279700_283000
920522	contig_3130_pilon	+	3242	1	Intergenic	novelGene_103587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182941	186183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_182900_186200
920523	contig_14621_pilon	+	3005	8	Intergenic	novelGene_105874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCGACCAGGTCCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425307	463796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_427442_428924_429101_431642_431781_432844_432926_437112_437284_437850_437947_460397_460590_463779
920524	contig_10766_pilon	-	3179	3	Intergenic	novelGene_151205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4	10	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGTCATGCGCCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183930	141207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_141270_141771_142524_181565
920525	contig_7376_pilon	-	859	1	Intergenic	novelGene_108090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACCGCCCCATAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115123	114264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7376_pilon_-_114300_115100
920526	contig_13349_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_161135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321206	323057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_321200_323100
920527	contig_12142_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_147840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTATTTTTCTGTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227216	228511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_227200_228500
920528	contig_5910_pilon	-	2986	3	Intergenic	novelGene_168422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1501	1887	153864	153478	TRUE	30	CAAGTGTGGGTGAAGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISVCCLCIISSCEFILAFCFCIIFLNSSNFLSLFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWLTLNIRDFNSLSGSSSSYSSTRKSSGFLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	155535	152209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_152770_152938_154039_154209
920529	contig_6397_pilon	+	4815	1	Intergenic	novelGene_146242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	166	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAACCTTTAAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432133	436948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_432100_436900
920530	contig_9440_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_59113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1651	1950	1714609	1714310	NA	80	AAAAAAAAAAAAACACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHIVLFRLLPNKKPERERRGMLGEMFSLPGPCPFLESFRQFFNKENSKRCLGRWLGIVIDLLYLRSKDLFSTNICKWIGFFPQDQSQKKGIILYFKNTT	1716259	1713142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1713100_1716300
920531	contig_5023_pilon	+	2121	7	Intergenic	novelGene_7371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1190.609146147	7	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	138	563	629246	643427	TRUE	10	TTGGTGTCTGTAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISTGPKD	625742	648304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639189_643410_643539_646857
920532	contig_1694_pilon	-	1740	4	Intergenic	novelGene_144959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	53.5184288093571	40	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	8	541	1677956	1539630	FALSE	0	TGCTCCCCTTTTCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRGLSPRQSKSDSDDDDLPNVTLDSVNETGSTALSIARAVQEVHQSPVSRVRGNRMNNQKFACSISPFSIESTRRQRRSESPDSRKRRIHRCDFEGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV	1677963	1538430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1539812_1560249_1560408_1616429_1616493_1677825
920533	SIRV6	+	676	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	106	1	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTATATGCGGTAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
920534	contig_2100_pilon	-	1071	9	Intergenic	novelGene_50754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	907.10341713335	16	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	94	396	1182812	1173272	TRUE	25	TGTAGCCCATAAGAGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMISQ	1185504	1169930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173287_1176787_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
920536	contig_11548_pilon	-	2141	1	Intergenic	novelGene_66763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAGATGTCCATCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107163	105022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_105000_107200
920537	contig_9673_pilon	+	2959	1	Intergenic	novelGene_119163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	75	305	86247	86477	NA	55	TGAAAAATCTTGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSHVNAHQRVALAEEDFNSQLDRKMCSVGTNHPLSPATPVISQWAHEQSGHGGRDGGYAWNQPYELLLTKADLAIATSECPILPVAETSSQCPIWHHSSR	86172	89131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_86200_89100
920538	contig_8045_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_35318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCTCCCCTGCTGTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47193	45522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_45500_47200
920539	contig_14618_pilon	-	4269	19	Intergenic	novelGene_136826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	77.7797618794548	89	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	2067	3899	1099217	1083906	FALSE	30	TAAAGTCCTTCACAGACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWIPSFSQDIPSRLHSAQSLPLPIQPSSRKPVQTEPDVPLEGTSMESSHSLHVGHSAGPTQHPAEGSAVAGDGLARLCPGPSAFSKVPGVDDRLTNGHSGPDSSAHPGSPQDGFGNFLYWRTPLPDISKDLELLLGKAGQQEDVRCSSEMAHNSCVPSSEIQRVLDSLQEHMVNDPDVQAQVQVLSAALRAAQLDSVSASQSKPAGDLNEVSAADPRSASGSQMELSASCSLDALGTARILQSTGPDGDCDGSSDPVQAELRRDPTPHEENKSKLQDIIPQPLLDQYVSMTDPARAQTVDTDIAKHCAYSLPGVALTLGRQNWHCLKDTYETLASDVQWTVRRTLAFSIHELAVILGDQLTAADLVPIFNGFLKDLDEVRIGVLKHLYDFLKLLHTDKRREYLYQLQEFVVTDNSRNWRFRYELAEQLILILELYSPHDVYDYLVHIALKLCADQVSEVRWISFKLAVAILRKFYSNSESALGLNFISELIIRFRHCPKWVGRQAFAFICQAVVSAECIPVDQFVEHLLPSLLSLASDPVPNVRVLLAKALRQTLLEKAYFRNAGNPHLEVVEETVSALQSDRDQDVSFFATLEPKRLNIMDTAVLEKRD	1187131	1083535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1084064_1084655_1084798_1087552_1087688_1088496_1088618_1090569_1090671_1091539_1091702_1091953_1092140_1093022_1093119_1096280_1096475_1098679_1100360_1101299_1101459_1103911_1103974_1105518_1105628_1115195_1115343_1126056_1126200_1127697_1127805_1149595_1149729_1186922_1186968_1187112
920540	contig_5039_pilon	-	4096	3	Intergenic	novelGene_65006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1712642	1703011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1706339_1710620_1710830_1712082
920541	contig_5280_pilon	+	1798	2	Intergenic	novelGene_52638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCACGTAGTATTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77305	79152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_78889_78937
920542	contig_9809_pilon	-	1407	2	Intergenic	novelGene_176762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112686	111174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_-_112362_112466
920543	contig_4364_pilon	+	648	4	Intergenic	novelGene_233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24775.4876888876	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	495	154	648	1530895	1531750	FALSE	15	TACGAGGGCTATGCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPQAAVPAAPGLCAPQWASSCAPATPPGHLTPNPPQTPACGASASHTLIAMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPI	1527813	1531750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1527961_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
920544	contig_10312_pilon	-	2510	2	Intergenic	novelGene_159024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	65	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	1167	1808	197449	196808	FALSE	40	CTGAGCAGTGAAGGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSLMILSVFSVFSPCSGIPITRKCLLLIVSHIILRVSSFFFVLFSEFSSNIVVFKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCLFIISSCEFTLAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSLFSSRLSAFCLSSWRILSLRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	198860	196105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_198160_198404
920545	contig_6291_pilon	-	1787	2	Intergenic	novelGene_164800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386332	383396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_-_384479_385627
920546	contig_10323_pilon	-	1064	8	Intergenic	novelGene_123615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	1889.08340801802	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	948	117	1064	473591	460643	FALSE	50	GAAGAATCTGCAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGYLNSGSRASSRASSARASPVVEERPEKDFTEKGSRNMPSLSAATLASLGGTSSRRGSGDTSISIDTEASIREIKELNELKDQIQDVEGRYMQGLKEMKDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEK	478680	460642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_467386_467480_468607_468779_471164_471237_473477_473604_474208_474245_478612
920547	contig_8907_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_85785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAATCCACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42911	43467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_42900_43500
920548	contig_5419_pilon	-	3255	1	Intergenic	novelGene_15548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACTCTGAGCATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452593	449338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_449300_452600
920549	contig_10104_pilon	+	4300	4	Intergenic	novelGene_160134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2642	3133	415926	416417	TRUE	50	GTCTATAGGACAAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFLWKGKKPEISKALLKKKNKVGGLALPDLRTYYIATIVRTAWYWNNDRYTDQWNRIENLDVNPSTYSHPIFDKGPKSIKWETDSLFNKWCWQNWKSICKKMKQNPYLKPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKIIEEKTRSTLETLIHGINRIQTITNNI	413284	597163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_416495_558234_559003_560704_560930_597066
920550	contig_13042_pilon	-	2752	3	Intergenic	novelGene_179016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTCGTGCCAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10525	3401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13042_pilon_-_4089_4529_5058_8988
920551	contig_6446_pilon	-	2190	2	Intergenic	novelGene_149205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAACATATATAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302858	280252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_281232_301647
920552	contig_11338_pilon	-	4485	1	Intergenic	novelGene_6286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTACTTCTGGCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194833	190348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_190300_194800
920553	contig_9335_pilon	+	1609	1	Intergenic	novelGene_147454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	520727	521101	NA	65	AAAAAAAAAAAGATTTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDFPNLCTDVEFSPSQWVRHWRDGLHIWKREVSDGKSSHHAPIILECQSVILTWIRSRSRRGAGSNQGHIVSQRQRLELWTTSDLPHSRATGIAIAYYQQKAKIFQQVWLLKAIVESKTTVLEF	520726	522335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_+_520700_522300
920554	contig_9727_pilon	-	2668	2	Intergenic	novelGene_86273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCCCAAAAGAAAGTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131083	128241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_128454_128627
920555	contig_10082_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_63909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	485	1458	3	1460	534955	536412	NA	35	AAAGTCATTTAGACTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFQNGNKPYECKECGKGFNCASALTTHIRTHSGERPYECKECGKTFSQSSHLNTHTRTHNGQRPYKCKECGKAFSQTSSLTLHVRTHSGVRPYKCKECGRAFSYASGLTTHVRTHSGERPYECKECGKAFSSSSHLTQHTRTHSGERPYECKECGKTFSRSSHLISHIRTHSGEKGYECKECGKAFSHASALTTHIRIHSGEKPYICKECGKAFSDSSHLTTHRRTHSGEKPYKCKECGKAFSQTSSLNLHKRTHSGVKPYECKECGKAFSRSSYLTEHIRTHSGEKPYKCKECGKSFSCATSRIAHLRTHSGEKPYECKECGKAFSQSSHLTTHIRTHSGERSYECKECGKAFCDSSGLNQHVRTHSGEKPYECKQCGKAFSHASALTTHIRTHSGERPYECKECGKAFICSSNLTTHIRTHSGEKPYKCKECGKVFSESSNLTTHIRTHTGERPYECKKCGKAFKVFSHLTSHIKTHSGERPY	534952	537224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_535000_537200
920556	contig_7119_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_41044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518306	519038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_518300_519000
920557	contig_6654_pilon	-	4121	3	Intergenic	novelGene_85701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	33.5	103	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	33	491	165289	146445	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGWRDSHQPIMCSYKLVTVKFEVWGLQTRVEQFVHKVVRDILLIGHRQAFAWVDEWYDMTMDEVREFERATQEATNQKIGVFPPAISISSIPLLPSSVRSAPSSAPSTPLSTDAPEFLSVPRDRPRKKSAPETLTLPDPEKKATLNLPGMHSSDKPCRPKSE	165321	142814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_146762_161384_161449_165211
920558	contig_10438_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_161685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACTAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151417	153252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_+_151400_153300
920559	contig_563_pilon	-	1088	8	Intergenic	novelGene_169750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.8266529660215	5	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	83	658	124347	121355	TRUE	15	GCCTGTCTCTGGATAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VILTLFGFKLLYPGHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGITLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSVSKRGVSCQFGPDVTKTFLEENHLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLRGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYANTLLQLGMM	126665	120841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_121178_121260_121418_121606_121689_122781_122961_123071_123113_124010_124099_124224_124368_126603
920560	contig_13625_pilon	-	1995	8	Intergenic	novelGene_150162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	123.227349203968	4	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	21	1007	43661	29843	TRUE	40	ATTTATAACAGTCTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGWSAMDEAGGCASGGGFRPGVNSLDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43681	26645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27215_28833_28998_29587_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
920562	contig_7410_pilon	+	2697	1	Intergenic	novelGene_106101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAGGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408844	411541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_408800_411500
920563	contig_8269_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_106220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGGTTTGTGGTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262674	260895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_260900_262700
920564	contig_19402_pilon	+	5175	17	Intergenic	novelGene_80785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	1547.53479236938	2	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	618	2288	29462	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23470	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_142957_143063_143802_144315_144352
920566	contig_5317_pilon	+	787	3	Intergenic	novelGene_76548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	15	425	35282	43326	FALSE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSTMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35267	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
920567	contig_4305_pilon	+	4381	19	Intergenic	novelGene_136689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	8.81164353162309	291	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	760	1170	525453	526749	TRUE	10	GCGCGTCTGGCCCACCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRLEDSPSIQTDSESPSPEEVPDYLLQYRAIHSAEQHHAYEQDFEADYAEYRILHARVAAASQRFIELGAEIKRVQRGTPEHKVLEDKIVKEYKKFRKRYPGYREEKRRCEYLHQKLSHIKGLILEFEEKNRGS	523982	549962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_524000_524333_524447_524555_524758_524847_525140_525317_525493_525571_525615_525757_525930_526512_526558_526638_528686_529940_529981_531018_531129_532179_532366_532964_533089_533404_533520_536850_536979_538237_538356_541827_541941_543484_543564_549700
920568	contig_11872_pilon	+	2464	9	Intergenic	novelGene_143146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	104.169033306449	22	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	48	1109	42170	71294	FALSE	20	GAGTGGAATTGCTGGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSLLLEEVGGGSCIMSEADGLRQRRPLRPQVVTDDGQAPEAKDGSTFSGRVFRVTFLMLAVSLTVPLLGAMVLLESPIDPQPLSFKEPPFLLGVLNPNTKLQQAKRLYENQLIGPESIAHIGDAMFTGTADGRVVKLENGEVETIARFGAGPCKTRDDEPACGRPLGVRAGPNGTLFVADAYKGLFEVNPWKREVKMLLSSETPIEGKKISFVNDLTITRDGRKIYFTDSSSKWQRRDYLLLIMEGTDDGRLLEYDTVTKEVKVLMDQLRFPNGVQLSPAEDFVLVAETTMARIRRFYVSGLMKGGADMFVENLPGFPDNIRPSSSGGYWVGMATIRSNPGCSMLDFLSERPWIKKIIFKVTQYPQW	42122	72649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_+_42262_52013_52131_60111_60228_62392_62486_64364_64482_68492_68668_70194_70330_70717_70911_71270
920569	contig_7151_pilon	-	2388	7	Intergenic	novelGene_40776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	810.661338387095	8	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	115	753	551180	529189	TRUE	40	AAAATACTAAGTGTTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPFNPDMVFWHKGEPNNHQEERCAVIVNEKDKWGWNNIPCQFETNRICKKPATAFN	551294	527492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_528382_528442_529337_530062_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
920570	contig_4955_pilon	-	2361	2	Intergenic	novelGene_178211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	86	325	349148	348909	TRUE	65	AGAAGAGGAAAAAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNCCKFILEFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFYSTGKSSGVLFWMPTGTILSYFCKCFDIVCCLRGIQ	349233	327499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4955_pilon_-_329152_348524
920571	contig_10135_pilon	+	2090	13	Intergenic	novelGene_106598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	1	junction_1	26.5717059210649	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	780	1343	73574	76530	TRUE	40	TTAAGAAAAAGTGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANNAAPSPPRRGGGLLEEAELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQA	71965	78065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_72124_72952_73577_74379_74440_74618_74740_74963_75076_75266_75423_75918_75984_76239_76285_76528_76616_76887_76967_77185_77294_77378_77494_77705
920573	contig_9053_pilon	+	4324	4	Intergenic	novelGene_87938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	3830	4210	245434	245814	FALSE	35	CAGCACAATTGGAAGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSCQGFYQTESSTARWCLATTSHCSEQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIFWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFLRFTFSRGVDSPIKPNGTNEVQQSWEKGQKAEGDRKAGDRERKVE	148309	245928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_149919_181869_182661_223306_224149_244846
920574	contig_854_pilon	+	1140	6	Intergenic	novelGene_36279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1554.85014068881	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAGGAGAAAATAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543547	563757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_546004_556103_556169_557711_557752_562271_562405_563029
920575	contig_10500_pilon	-	3741	1	Intergenic	novelGene_41199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2964	3281	1395961	1395644	NA	25	GTCACTTTGAGGACTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISLISRASKIMLKIMQKQLQQYIDRELLEIQAGFRRGCGMRDVIADVRWMVAESREYQKDVYLCFINYARAFDCVNHNKLQITLQRMGILEHVIVLMQNQEAVV	1398924	1395183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1395200_1398900
920576	contig_6059_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_44803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	129	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	46	375	407403	407074	NA	50	AAAAAAAAAATGTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRSLFPHSQSRLKVQIQGVSSRGRFFPLCRPSSLRCSPRLGASLHRDPGPKDTLCSRHCFLDGVRSPGLTAHFCPSYLKRLPQDTIQSCRSGPALLTQLPSILPH	407448	404781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_404800_407400
920577	contig_4103_pilon	+	5512	3	Intergenic	novelGene_51955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	1027	1848	148506	149327	TRUE	55	AATTACAAATTAGGATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERAVFCPYWNRHSGYRFAFPVCNASAKTTIHGLTECLIHCHGIPHSSASNQGTHFTANDVKQWAHAHGIYWSYHVPHHSEVAGLMEQWYGLLKTQLRHQLVGNTLQRWGNVLQEAVYALNRCPIYGAVSPISRIHGSRKQGVAMGVAPLTITPSYLLARFLLPVPVTLCSAGLEVLVPKGGKLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHFGLLMPLAQQAKKGVTILAGVIDPDYQEEIGLILHKGGKEEYVWNAGDPLGRLLVLPCPVIKVSRKILT	147479	217902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_149765_214134_216019_216559
920578	contig_5171_pilon	+	2156	2	Intergenic	novelGene_161228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1343	1669	32713	33039	TRUE	45	CAAGACCAAAAAGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWGQQSISNHIKRQSMMASASSQNKESRNVPEEENFLELPEAEYKRLVYRTLQELRKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLQETIEREQSDIQKISNKISELDN	31370	62428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_33047_61948
920579	contig_13501_pilon	+	3296	6	Intergenic	novelGene_169055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	46.9919141980831	50	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	58	177	177	353	13496	16876	TRUE	20	TACAAGATTGCCCTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRKESHPGELRFPPGGSAALALNSRSPGLTRGAPGPPGRWGRWCRWRHNCRAFLRRWCMFMDTREDEKTKLISCLGAFRQFWAGLSQESHEQCIQWILEFVHGQHSPKRISFCMTA	12801	38590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_12977_13494_13583_16786_16916_19959_20059_22997_24763_37550
920580	contig_9471_pilon	-	2833	3	Intergenic	novelGene_21692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	110	304	115219	57242	TRUE	25	ATCCCAGCACCAGCCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LECQVAKANGRNDDVKELNRRFQRVAREDRVKTQNEMCKDLELENQRKNTLSIFQGEGTKEKIQALSCNTEGFYGQNVEHRKHQKKMEGIHRVTIPKRTG	115328	54220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_56585_57076_57406_115188
920581	contig_7870_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_109061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGTCATGCCATACCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674935	672545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_672500_674900
920582	contig_5023_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_7394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTTTTGGTGTCTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647419	648297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_647400_648300
920583	contig_9580_pilon	-	5846	4	Intergenic	novelGene_167738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	52	372	874332	842568	TRUE	20	AGTTCCCAAGGCTCGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFTKHDVFLQGLIPPDNMSNSLVILASKEHPGCTSSKTDLFLLLAVHGIFNILCQHHNSKASILLWSSLFIVQISYASEATENKVRRTLVLKVTTLLFNTLKRSFTADLFNSMRLLISGLLLP	874383	831785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_831838_831924_836284_841504_842846_874289
920584	contig_17144_pilon	+	1732	8	Intergenic	novelGene_29435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	894	1211	167621	168283	TRUE	20	GGCATTGGCTGTGGTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166074	172731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170925_172518
920586	contig_16884_pilon	-	1676	1	Intergenic	novelGene_161819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTAAGTATTTTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46199	44523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_44500_46200
920587	contig_5777_pilon	+	2967	1	Intergenic	novelGene_173322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATAATCTCCTTTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43284	46251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_43300_46300
920589	contig_776_pilon	-	2957	1	Intergenic	novelGene_139919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	794908	791951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_792000_794900
920590	contig_12864_pilon	-	5017	7	Intergenic	novelGene_76422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	545.506416094256	105	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCTGCCCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252184	242232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242508_242682_242888_243778_243826_244598_244767_245704_249843_251887_251999_252111
920592	contig_593_pilon	+	3256	26	Intergenic	novelGene_101995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	208.418041445552	8	64	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2646	285	2930	300334	539509	TRUE	35	ACGTGAGAAAGGTATGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRMESCLAQVLQKDVGKRLQVGQELIDYFSDKQKSADLEHDQTMLDKLVDGLATSWVNSSNYKVVLLGMDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSARDLEESINKIREILSDDKHDWEQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLGHLSSVLGNKFDHGAEAIMPTIFNLIPNSAKIMATSGVVAVRLIIRHIPRLIPVITSNCTSKSVAVRRRCFEFLDLLLQEWQTHSLERHISVLAETIKKGIHDADSEARIEARKCYWGFHSHFSREAEHLYHTLESSYQKALQSHLKNSDSIVSLPQSDRSSSSSQESLNRPLTAKRSPTGSTTSRASTVSTKSVSTTGSLQRSRSDIDVNAAASAKSKVSSSGVTPFSSAAALPPGSYASLGRIRTRRQSSGSATSVASTPSDSRGRSRAKVVSQSQPGSRSSSPGKLLGSGYSGLSGGSSRGPPVTPSSEKRSKIPRSQGCSRETSPNRIGLERFGLGQPGRVPGSVNALRVLSTSTDLEAAVADALKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSERSYGSRNGGIPHYLRQTEDVAEVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHSKVSFQYVSGDSGGFYNNS	300049	546242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_300529_383566_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016_479091_480193_480287_481277_481424_482673_482810_483992_484058_487513_487574_489405_489484_492996_493165_493984_494035_494817_494986_506912_507021_513193_513362_527459_527564_530930_531176_536869_536938_539459_539624_544644_544724_546109
920593	contig_5039_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_64979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	1098	1427	1679067	1679396	NA	20	AACTCTACTGCCGCTGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNSSAVVATGCPGNSSTIVASGCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPG	1677969	1679396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1678000_1679400
920594	contig_14314_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_176840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCAATATCCATCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145047	146881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14314_pilon_+_145000_146900
920595	contig_4783_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_108346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCACTGGTTTTGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53667	52264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_52300_53700
920596	contig_1301_pilon	-	1721	13	Intergenic	novelGene_47328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	552.401493229537	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	546	1638	83	1720	322831	269193	FALSE	70	AAGAAAATGAAGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSSTSNRLWAEDSTEKEKDNVPTTVTIPVAPTVVNAAASTTTLTTTTAGTVSSTSEVRERRRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTRE	322913	269191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_277728_277906_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_305264_305410_309751_309912_322794
920597	contig_10990_pilon	-	2274	6	Intergenic	novelGene_7481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTATTTTTAGTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731581	714354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722280_722432_723510_723631_729669_729803_731226_731421_731544
920599	scaffold_880_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_121452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTTTTAACATTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445819	447571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_445800_447600
920600	contig_3449_pilon	+	3242	1	Intergenic	novelGene_73740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAATGTAATCGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509896	513138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_509900_513100
920601	contig_9363_pilon	-	1905	1	Intergenic	novelGene_6713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATACTTCCAATTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1302368	1300463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1300500_1302400
920602	contig_8373_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_176376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGTTCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15636	13848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_13800_15600
920603	contig_8795_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_146893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198853	196898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8795_pilon_-_196900_198900
920604	contig_9727_pilon	+	557	3	Intergenic	novelGene_86288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	21	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACCCTGTCTCAGAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167528	176470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_167556_169388_169597_176148
920605	contig_12923_pilon	-	1802	4	Intergenic	novelGene_30125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.571954892067	23	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCACAGTTAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101245	82832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_83558_85805_86681_93602_93733_101173
920606	contig_9995_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_47765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAGAAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699447	700909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_699400_700900
920607	contig_6217_pilon	-	3783	2	Intergenic	novelGene_109648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCCTGTGGTGTAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723974	720017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_723296_723469
920608	contig_1008_pilon	+	3465	6	Intergenic	novelGene_121607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	77.4508876643774	121	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTTTGTGAGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750830	787958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_751029_768733_768862_771065_771135_782684_782804_783455_783692_785243
920609	contig_6576_pilon	+	3253	1	Intergenic	novelGene_42302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2522	2887	465935	466300	NA	15	TTTGGTCAAGTTGTGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHVTPFHPRFPVSICPVFLSHPAFSSLLLGRCCPFGFVYLIELRSTFLTCVTVCFIGLSNLWLKGGLREWLHFSVSRVPRGLRLRSSSSHRRTSKSHLFFCEFELCYAFFSRSVQDPLL	463413	466666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_463400_466700
920610	contig_5758_pilon	-	2296	1	Intergenic	novelGene_119129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1635	1970	576631	576296	NA	60	AAAAAAAAAAGGGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHTESKIFTWILHLPTDSFLISYYKILFMIKISKNGPITTYTRDSISLRPEELDDARQPPMTTLTENTTESLMEQEKSVVQNSNSHKKTRLNGLTETGGTLRSHGPWTLC	578265	575969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_576000_578300
920611	contig_17796_pilon	+	2605	5	Intergenic	novelGene_33772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_1	187.255173493284	4	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1676	2272	16960	34984	FALSE	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDPDPDRGMNFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVVCPPPSKIHNGHHTGGHASSYSPGMIVNYTCDPGYLLVGQAFIFCTHQGTWSQSDHYCKEVQCSLPRFMNGIQKEMNYKKVYHYGDSVTLECEDGYILEGSPQSQCQEDDRWDPPLAMCTSSTRDALIVGTFFGMFFFILYILVPCWIFLMRKKW	15284	35317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_17090_18022_18200_20417_20604_31843_31868_34904
920612	contig_6738_pilon	-	1520	2	Intergenic	novelGene_166132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAATATGCTGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40654	38893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_38906_39146
920613	contig_6102_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_32309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAATCTTTAGCTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1553701	1554917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1553700_1554900
920614	contig_14474_pilon	-	1850	2	Intergenic	novelGene_144209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	388	813	65242	64817	TRUE	75	CAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTKRSLFSHSPVGYKSKCRVSAPGKCFLFWLWRKVCVINLPLVWELLCAGTSGPKDVLCSRHCLLGGISFPCVSAHCSLLYLKIDWLKTLCNLVDLISIAATDPFYYIIVTEFTTHKEIISDYKMVHNHKILAIMTQPS	65629	63457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14474_pilon_-_64304_64625
920615	contig_9146_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_79483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	704	1006	127128	126826	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKCCLYDINEEGLEAVMSMRQNSIYKIRLCLESISFEIEKRAERPGVLITTKQEEPGACILWTQGPCTEKLLYQGKIDDKDLPSGPTERESLPQELAT	127831	126770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9146_pilon_-_126800_127800
920616	contig_5690_pilon	-	4523	4	Intergenic	novelGene_119679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_1	15.6276108929747	72	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	642	1929	362	2290	296379	293196	FALSE	20	TATTTGTATGTATATGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDGLRQKVLPLLKTAIKDCPIGKDWKLNCRPCPPRLLFLFQLNGALKVEPPRSQDPAHPDKPKKHSPKRRLQHALEDQIYRIFRKSRVLTNQSINCLFTVPANQAFVYIVPGSQEEDPVGMLLDQLRSHCTVKDSESLLVTTPLSGSRRYQVMRQHSRQQLSFHIDSSSSSSSGQLVDFTLREFLWQHVELVLSKKGFDDSVGRNPQPSHFELPTYQKWISAASKLYEVAIDGKEEELGSPTGELTSKILSSIKVLEGFLDIDTKFSENRCQKALPMAHSAYQSNLPHNYTMTVHKNQLAQALRVYSQHARGPAFHKYAMQLHEDCYKFWSNGHQLCEERSLTDQHCVHKFHSLPKSGEKPEADRNPPVLYHNSRARSTGACNCGRKQAPRDDPFDIKAANYDFYQLLEEKCCGKLDHINFPVFEPSTPDPAPAKNESSPAPPDADADKLKEKEPQTQGESTSLSLALSLGQSTDSLGTYPADPQAGGDNPEVHGQGEVKTEKRPNLVDRQASTVEYLPGMLHSNCPKGLLPKFSSWSLVKLGTAKSYNFHTGLDQQGFIPGTNYLMPWDIVIRTRAEDEGDLDTNSWPAPNKAIPGKRSAVVMGRGRRRDDIARAFVGFEYEDSRGRRFMCSGPDKVMKVMGSGPKESALKALNSDMPLYILSSSQGRGLKPHYAQLMRLFVVVPDAPLQIILMPQVQPGPPPCPVFYPEKQEITLPPDGLWVLRFPYAYVTERGPCFPPKENVQLMSYKVLRGVLKAVTQ	296740	290962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_293394_293814_294688_294935_295082_295667
920617	contig_1964_pilon	-	6048	2	Intergenic	novelGene_130909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	472	junction_1	0	102	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	4842	5213	143071	142581	FALSE	45	CAGAGAATTCAGGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTAGSLTGTTNGLFRPIGTQPPQQQQQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLSNSSQSTSLFSHGPGQPGSASLGFGSSGSLGAAIGSALSGFGSSGKYAFKMSIHC	147912	141745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_142907_143025
920618	contig_9127_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_103009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTAAAAAAAAAACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169638	166955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_167000_169600
920619	contig_10583_pilon	-	2937	3	Intergenic	novelGene_167923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATGAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225820	222692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_225146_225209_225448_225574
920620	contig_16211_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_150106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	63	299	236845	237081	NA	25	CACTTCTGTGAATTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAELQEEEHGIRIGGRLINIMQYADDTTLLAESKEDLKHLLMKIKDYSLQDGLYLNLKKTKILTTGPINNIMINRENTEVVKDFILFGSTINAYGNNN	236782	237643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_236800_237600
920621	contig_12624_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_60993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACTTGTAGGCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110824	112625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_110800_112600
920622	contig_8587_pilon	+	2568	1	Intergenic	novelGene_159113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAGCAGCAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131298	133866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_131300_133900
920623	contig_12479_pilon	-	3269	2	Intergenic	novelGene_56883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_1	0	74	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAGAAATGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594024	545832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_549020_593942
920624	contig_15219_pilon	-	1780	3	Intergenic	novelGene_40842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_1	3	27	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	1414	1779	39153	35226	FALSE	25	ACTGCATGAATTCCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMRLDEEAPYFPRCRSVDGLLSARKRNAQVPLWNYTVLRGQIFIVYFIAGVKKLDADWVEGYSMDSLSRHWLFSPFKLVLSEEMTSLLVVHWCGLLLDLSAGFLLFFDASRPAGLFFVSYF	40566	35224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_-_35359_38457_38565_39027
920625	contig_1535_pilon	+	2583	5	Intergenic	novelGene_127230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	6.86931583201704	60	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAAAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53209	107537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_53709_98843_99032_102092_102166_102496_102864_106081
920626	contig_14666_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_39669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAACATGCCTGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490799	488821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_488800_490800
920627	SIRV6	-	1086	8	Genic_Genomic	SIRV6B_SIRV6C	novel	189	1	NA	NA	-9038	-138	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	7	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTTCATTGGGGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11585	1682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Genic_Genomic_SIRV6_-_1735_1844_2030_2470_2619_2738_2828_3105_3164_10723_10825_11035_11109_11205
920628	contig_9006_pilon	-	4582	2	Intergenic	novelGene_177474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	784	1086	81591	81289	TRUE	5	GAGGCTCTGGGCGCCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWAVFMHLLMLCPLPRMSCLLSVPLENIYSSFESHYMVSVIMAFCNPLKTNPFFLRAFKQPYTDVNCRKSCPFHVSSIIAMSFEERVHVSFIFLSPTST	82374	70908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9006_pilon_-_71764_78647
920630	contig_2463_pilon	-	861	1	Intergenic	novelGene_43002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231766	230905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_-_230900_231800
920631	contig_11566_pilon	+	5747	18	Intergenic	novelGene_166687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	717	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2557	2907	159950	164386	TRUE	60	TGATTTAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTVQDPQSLYLMFGLFSHGLITFIHVINSVFSSHRKQDDVCIPCGPALRALPRTLTGRGLPAWSQDKNQDAPYRLVSSQAGSFMFFKTFLTSFSRSLRALCSSSKDFFIFLLSLS	157393	255971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_160293_164378_164432_164760_164860_177026_177121_183372_183466_186195_186422_188862_189166_189367_189447_191618_191705_194817_194968_195696_195757_197639_197781_203217_203340_223962_224059_224288_224383_234701_234794_245832_246034_255112
920632	contig_12090_pilon	-	2423	1	Intergenic	novelGene_80492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	935	1273	143898	143560	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPCETPEVTAIPFETDSARLPVFLVSSASVSLASRPLGPLARICPAGASVPKLCSSTDKCLVAPHTSSKLQLEGTQYWEPHPNQVDTYFEGAQFNPLQAALHTQMSVLSS	144832	142409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_142400_144800
920633	contig_12761_pilon	+	894	1	Intergenic	novelGene_164054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	197	508	221553	221864	NA	30	TTTGTATGAGAGACTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELYPLLELGTLRSLGEMAAWSPLRTALDQLVWRPGRRRGPGDLMLRDECGTPRGCWARESHVVWLLGPRWLLPSSVSRSLHTFCLKPHPSEGTALRNTTDSP	221356	222250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_221400_222200
920634	contig_18607_pilon	+	2208	4	Intergenic	novelGene_175112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1.24721912892465	28	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	227	1861	134184	157573	FALSE	15	TTTGGTTTAAGAGTGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLFIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKFYRDVMIETFRNLASLVSQKLNDGEKLSSDHIMVQFMKNNAWSSMLGELSELHGSKDQHKNPGRYLRSHAVENLCECNKGNQCGKTFIWIPNLTLLKRNPSEVNCFECCQCGKAFMDHTSHKHHTTSHTGCNACQCKECGEACSCPSHLTTPMRTLTGKKPHKCKVCGKDLICISTLKNPVTALTGEKLYECSKCWKNFCSLLSFWMHLRSHRHECKECCKTISHSSSLILHKKNHRDKHYECKECGKAFSEASTLTQHIRTHSGERPYECMECGKAFSQSSHLTTHIRTHNGQRPHECKECGKAFIQASSLTQHIRTHSGERPYECKECGKAFSQASSLSQHIRTHIGVRPYKCKECGKAFRCSSHLTKHIRTHSGERPYECKECGKTFSRSCYLSEHIRTHSGEKPYKCKQCGKAFSQSSHLTAHVRIHSGERPHECKECGKAFSRAAHLATHIRTHSGERPFECKECGKAFSDSSALTTHIRTHSGERPYECKECGKTCSRSSHLTSHKRTHHG	133957	157920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_+_134187_154615_154743_155696_155848_156219
920635	contig_7695_pilon	-	1581	1	Intergenic	novelGene_41646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	655	1083	773678	773250	NA	70	AAGCAATAATAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDITMKIIKAYDNGKKVSEMAHEEGLSHSAILTIIKDKNRILETVKGAIGIKSTILTKKRQGPVHEMEKLLMIWIEDQIQKRIPMSLLMIQTTACGLFETLKEQQGEDYRYYFHASKGWFHRFKHRFSLYNMSITGEAGSRC	774332	772751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_772800_774300
920636	contig_2892_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_119001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACCAACAATTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143371	142618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_142600_143400
920637	contig_10581_pilon	-	2039	1	Intergenic	novelGene_41392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	496	861	603056	602691	NA	45	ATACAAGAGACTAAACGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCCPAPGVEAMCIPVQTENFSNPLRSPDDRRGGSAARCFPAFRPRSEHFESAVWPDHSPDCRLPLPGGVCDVHREGVGREGSKATQRTTPWQGSGRWGVLEDMKAGIGGMAYVISFCLS	603551	601512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_601500_603600
920638	contig_13421_pilon	-	5367	18	Intergenic	novelGene_166802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_16	160.687170558221	308	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	50	1132	193239	162874	TRUE	30	ACTCCCAGCATTAGGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAVMNAVEENQGSGESQKVEEASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGADAGDKNATKAADDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPACHDNDESDTAKAVEVQNKQMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTTEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFIGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGA	193288	146687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13421_pilon_-_149960_150952_151072_152113_152184_157257_157344_158425_158575_158764_158856_159814_159961_162093_162179_162447_162632_162840_162955_163596_163677_164455_164501_164609_164760_165078_165236_165566_165675_166104_166264_166528_166745_193152
920639	contig_4674_pilon	-	3936	3	Intergenic	novelGene_174142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2094	2492	258195	257716	FALSE	50	GGAAATAATTAGAGCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGITENTERIVEDLLAENFPDMKDDKISIQDAHRTPYKVDPKRKSPRHIIIKLNKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIHAFPDKQKFRESAKTKPKSQEILKGVLQLENQ	260430	256271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_257812_257892_259863_260004
920640	contig_9995_pilon	-	3665	5	Intergenic	novelGene_47696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	728.636054556731	1246	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	102	1775	322474	297529	FALSE	15	TAATTTGCCTTTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAVLSQESTRYLYGEGDLNFSDDSGISGLRNHMTSLNLDLQSQNVYHHGREGNRMNGSRTLTHSISDGQLQGGQSNNELFQQEPQTAPAQVPQGFNVFGMSSASGASNSAPHLGFHLGSKGTSNLSQQTPRFNPIMVTLAPNIQTGRNTPTSLHIHGVPPPVLNSPQGNSIYIRPYITTPSGTARQTQQHSGWVSQFNPMNPQQVYQPSQPGPWTTYPTSNPLSHTSAQQPNQQGHQTSHVYMPISSPTTPQPPTIHSSGSSQSSAHSQYNIQNISTGPRKNQIEIKLEPPQRNNSSKLRSSGSRTSSSSSSVNSQTLNRNQPTVYIAASPPNTDEVMSRGQPKVYISANATAGEEQVMRNQPTLFISTNSGASAASRNMSGQVSMGPAFIHHHPPKSRAIGNNSATSPRVVVTQPNTKYTFKITVSPNKPPALAHVDRISEARKLSMGSDDAAYTQALLVHQKARMERLQRELEIQKKKLDKLKSEVNEMENNLTRRRLKRSNSISQIPSLEEMQQLRSCNRQLQIDIDCLTKEIDLFQARDQRSTIKTPKNQDTEDDEGAQWNCTACTFLNHPALIRCEQCEMPRHF	322575	295638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_297672_300994_301089_301628_301790_321093_321167_321271
920641	contig_12437_pilon	-	757	6	Intergenic	novelGene_169082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	273.295151804784	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	235	642	136889	103979	FALSE	5	CCCTGCTACTCTCTCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRGFPPSLPTEFHKMGSFRRPRPRFMSSPVLSDLPRFQAARQALQLGSNSAWNSVQTAVINVFKGGGLQSNELYALNENIRRLLKSELGSFITDYFQNQLLSKGLFFVEEKIKLCEGGSTSIGCSHGSQSQDRV	166400	103863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_104035_104172_104231_115539_115589_134563_134645_136725_137020_166296
920642	contig_9345_pilon	+	3152	4	Intergenic	novelGene_24434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	190	534	336788	337132	TRUE	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSDWSLLITCPNYVRCSLTIFAPKGHSGCTSSKTDLFVLLAVHGIFSILRQHHNSKALILLRSSLFIVQLLHAYEAIENTMTWVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFGLKSNPI	336598	561345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_337352_405992_406504_559282_560664_560838
920643	contig_11850_pilon	-	2148	7	Intergenic	novelGene_125230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1367	junction_6	533.675853554071	1	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	97	1002	286397	282879	FALSE	30	AGTTGCACAGATCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHFKSGSIQRSAAATAATRSARQHPPADNSATMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY	286493	281732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11850_pilon_-_282950_283292_283464_283935_284051_284202_284335_285098_285261_285361_285531_286311
920644	contig_6589_pilon	-	4403	2	Intergenic	novelGene_25837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	9	344	926496	926161	TRUE	15	AGTGCACTGTGCGCTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IWMPFISPSCLIALARTFSTILNKSGDKIHSCLVSVLKQKAISFSPLRRMLAISFVYMPLNMLRNFPSIPILLRGLFFFLKSRMGVDFIKYLFCINRDDHVILCFIYVLNYID	926504	909633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_912390_924857
920645	contig_5253_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_61560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAACAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192407	191406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_191400_192400
920646	contig_2739_pilon	+	664	3	Intergenic	novelGene_165844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAGAGAGACGAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248650	291360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_+_249057_280052_280275_291324
920647	contig_11629_pilon	+	496	1	Intergenic	novelGene_161189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	453	44	496	164934	165386	NA	25	GAACCAGGGTACACTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKR	164890	165386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_164900_165400
920648	contig_8377_pilon	+	2056	17	Intergenic	novelGene_35004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3163.27285022965	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1956	101	2056	68257	180503	FALSE	30	ACAAACGTGAGTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTAPVNITGLTTTDKPKAVSPSDPLPAGTTAFSPANISERGHDSSETTPPLTPGNIPTQVFLDTSNNTSVPDMTGYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNI	68156	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_128717_128936_140803_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
920649	contig_13571_pilon	+	2164	1	Intergenic	novelGene_128123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTCTGGCCTATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247789	249953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_247800_250000
920650	contig_14684_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_99683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCACCACCATCATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414338	413122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_-_413100_414300
920651	contig_19816_pilon	+	2061	4	Intergenic	novelGene_156463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	38.9386982604994	45	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	35935	36578	TRUE	70	ACCAAGAAAAAAAAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRRAGRWDGGLSRFSPPGSHSLRYFETAVSRPGGGEPRLISVGYVDDTQFVRFDSDRDSANRRKQPQAPWIQQERPDYWDRNTRVYEHTAQTFRVGLRILRGYYNQSDAGLLPSR	35932	54141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_36266_36558_36834_38399_38433_52721
920652	contig_2278_pilon	+	3246	1	Intergenic	novelGene_118138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	194	585	528	1112	1151084	1151668	NA	55	TTATTCCTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSISSSSVILSVFSVFSPCSGTLIACIFLLLIVSHIILSICSFFFILFSNFSSNRCIQVFVFNFADPVFHCSHLLLSPSMTLPISEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILAFCFFIIFLNSSMFLFVLSMNLSAFSMNLAVFSSFLSAFCFNSWIALSIRDLNSLSDSSSAFSSTGKSSGVLF	1150556	1153802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1150600_1153800
920653	contig_4845_pilon	-	2760	3	Intergenic	novelGene_53684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	279	593	827571	827257	FALSE	65	AAAAATCAAACAAACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGENAEVVKDSFYLDPQSTAMEAAVKKLNNALHWANLWQKDLFKVLKSKDVTLWATACLTQAMVFSIASYACESWITNKEGRRRIDGFELWCWQRILNLPEE	1015941	825089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_827755_970356_970370_1015859
920654	contig_1605_pilon	+	3005	4	Intergenic	novelGene_179017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAGAATGTAGAACATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250682	338711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1605_pilon_+_250714_252819_253106_253223_254909_337708
920655	contig_7111_pilon	-	1546	1	Intergenic	novelGene_175940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82188	80642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_-_80600_82200
920656	contig_7398_pilon	+	5337	12	Intergenic	novelGene_166159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	191	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3808	4125	151011	213204	TRUE	35	GATGTAAGTTCAAGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLQGIRYLRTSCNITSSQCKPMRVLNNARDTTQSRNGVLIRLVRVSNMWTFSCWCNRMKRRKISSSAGSETLRRKRSRYAVVVMTSSTVTLWRAGAKTGTKNPL	124184	337067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_126354_133730_133876_134183_134360_142361_143511_150842_151033_166914_166997_175663_175834_213160_213244_215233_215397_229166_229795_249012_249246_336918
920657	contig_854_pilon	+	1483	7	Intergenic	novelGene_36257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	9	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543501	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557555_557752_562271_562405_563029
920658	contig_546_pilon	-	4401	4	Intergenic	novelGene_117221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGATATGCCAAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147637	133140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_136835_140223_140635_146630_146845_147555
920659	contig_8195_pilon	+	3986	4	Intergenic	novelGene_170064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGTATATGAGAGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461281	476121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_461392_462365_464893_472626_472847_474992
920660	contig_14219_pilon	-	1097	1	Intergenic	novelGene_54308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGAAATTTACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660314	659217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_659200_660300
920661	contig_10005_pilon	-	4479	1	Intergenic	novelGene_148908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	835	1140	107846	107541	NA	30	TAGTAGCCCAGCACTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHLVRNTGPALKSSCYLGCSAFVGLVVSFLRQMGGSAIVWRHCTGQEATDMKITLLYSCVMALVSDVLRNTVSFIHMLTSYLIDGFLNNHLYPLILLFT	108680	104201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_104200_108700
920662	contig_15084_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_116667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCATCAATTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18558	20609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_18600_20600
920663	contig_10324_pilon	-	2475	1	Intergenic	novelGene_7815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1834	2202	224380	224012	NA	15	CCTCGACTGTTGTCAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGKKIEAVKDFISLGSTIKPMEAAVDALHWANLLQKTSLKYAKDPFKVFKSKDVTLRTKVCLTQAILFSIASYTCKCWTMKKEDRRRIDASELRCWQRILNIPWTARRTNKSVLEVQPEC	226213	223738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_223700_226200
920664	contig_3948_pilon	+	550	1	Intergenic	novelGene_53348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCACCTAAAGCACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1508097	1508647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1508100_1508600
920665	contig_12021_pilon	-	1036	1	Intergenic	novelGene_172191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTACACCAGGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39808	38772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_-_38800_39800
920666	contig_6795_pilon	-	2269	10	Intergenic	novelGene_27686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	102.537195900853	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	729	1355	119175	71902	FALSE	40	AAAAATGCTATGGATTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLIMVYACKTSCAKSITGVIPYFPYSKQCKMRKRGSIVSKLLASMMCKAGLTHLITMDLHQKEIQGFFNIPVDNLRASPFLLQYIQEEIPDYRNAVIVAKSPASAKRAQSFAERLRLGIAVIHGEAQDAESDLVDGRHSPPMVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVVCQPIIITLLVFAVIVLLISWLPVCL	129404	70987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_72054_74615_74765_110795_110852_117641_117758_119021_119195_122838_123159_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286
920667	contig_6871_pilon	-	1816	4	Intergenic	novelGene_21615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_2	12.2565175405668	40	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	502	1287	497327	493893	FALSE	45	TGGAAACCAAGCAAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRSLQQRPEPTPEEWDLIHVATEAHRSTNAQGSHWKQRRKFLPDDIGQSPIVSMPDGDKVDLEAFSEFTKIITPAITRVVDFAKKLPMFSELPCEDQIILLKGCCMEIMSLRAAVRYDPESDTLTLSGEMAVKREQLKNGGLGVVSDAIFELGKSLSAFNLDDTEVALLQAVLLMSTDRSGLLCVDKIEKSQEAYLLAFEHYVNHRKHNIPHFWPKLLMKVTDLRMIGACHASRFLHMKVECPTELFPPLFLEVFEDQEV	497828	493363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_494144_495002_495262_496054_496202_497198
920668	contig_15952_pilon	-	2957	2	Intergenic	novelGene_154099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737617	734485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_734994_735168
920669	contig_7840_pilon	-	1857	2	Intergenic	novelGene_69007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGTAGATAGCCACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281263	279101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_279640_279944
920670	scaffold_12124_pilon	+	753	2	Intergenic	novelGene_22140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACATGGAACCTTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946834	966379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_946906_965697
920671	contig_11378_pilon	+	2029	3	Intergenic	novelGene_112264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	659	1132	395239	395712	TRUE	70	AAAAAAAAAAGATGTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAVPDTTPRPEPRSAAAAREPHNGWFVAEAEILCDFRRRGVSRDWTQPTRPISFAAILVISSKGNHFIALQLFWGAGELRPHYPGNILKILMPPLSHSRVGGRGRYIWFSDPPPVRRAAQAADLCCRGAWKPMEKSGKCSPLTVDTGPRLKQHSSE	389968	409785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_390488_395099_396182_409357
920672	contig_7527_pilon	+	2420	8	Intergenic	novelGene_139563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	844.879607411854	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	537	1127	85507	96168	FALSE	10	TTTTTTTTTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRFVDPPL	80078	97461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80392_84488_84642_85436_85578_85690_85781_86443_86519_89859_90038_94415_94572_96147
920673	contig_6412_pilon	-	3051	2	Intergenic	novelGene_149946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1412	1915	142387	141884	FALSE	45	GGATAAACAAACTATGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRIVPANIQNKTSDDLPVEEKALDLTDREFRSLIFRIIQELKQKADKNKEKIDKYMKKAGKFMKNTDKKLEEFKKIIQEQNAKINSQVEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEEMKSRFETMEDRISETEDKHLDTTLRKNQKKEQRKMKKP	232411	140747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_142623_231235
920674	contig_15188_pilon	+	3035	5	Intergenic	novelGene_163073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.4570902500961	11	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	665	1998	638	2635	110021	125134	FALSE	25	CACCATTATCTTCCTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPAPKLEETALSSQDPASPFKENPEDKVGHGLLEARCGESVTFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYRNLLALGPPVCKPDVISHLERGEAPWCSQRGGHAAACPEWEPPPPMREERMYKEEPTREATLEKLKKPSRHSCVWGDAWGWKEQADALSGSEGVLWKPAPATCEDVSREQDSSPGLGESEGGSPFRSALFVQQSIPAEAGFHDNIHVTSFRSIEAVTQHQRTCAGRNAFRSIDHGKYCRAGKLRGTGPGDGLFACGECGKAFRQSSSLALHRRWHTREKAYKCHECGKAFTWSTNLMEHQRIHTGEKPFFCSECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCTACEKAFSCSSLLNMHLRVHTGEKPYQCAECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYKCSACGKAFTCHSSLTVHETIHNGEKPFKCSECEKAFNNRSRLTLHQRIHTGEKPFKCSDCGKGFSCHSYLIVHQRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHSYLIVHQRVHTGEKPFDCSRCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCAECGKAFSQNHCLIKHQKIHTGEKSLKCNECGEMFSWSSHLIEHQRLHSPEKPFAVQFSKHLLSTYYVPGSLLHAGGPGLGDVDAVSAMDVAELLCAVQPSPSRTFPLGNKPGN	109383	125534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_110055_110466_110553_117665_117793_118407_118504_123479
920675	contig_11677_pilon	-	2212	12	Intergenic	novelGene_85882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	800	1627	262562	258375	TRUE	20	GCCCAGCCCTCAGCCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSSASSETTFWVNPAMSMSFSSICCFRLNASASSMSFSRCSFSRCSFSRWASSCACESSLSNLLCFFSSSWLRTCWPSRCSLVSCSSAVSRWHFFLSCCRARWLSSLSACRSPSRLSSCLLFCCSTSSLSSNSCWSRFLVKSTSLIARSYFRRHSPPASSSTSPLISAARMRRASITSISITSICFFSASYWVCSSFISFSARSLSAVSASSSWEADSPVLRSSVSSDVSSEIRVSNRSLLSRSSFRSFSTFSSLLRSCWISSSLFRICSSDS	263361	247307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_247473_250482_250594_254105_254171_257415_257545_258259_258409_258827_258917_259059_259175_259412_259526_259911_260041_260343_260498_262279_262404_262492
920676	contig_11816_pilon	+	1309	4	Intergenic	novelGene_98583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	38.5947607267561	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCATGTATTGTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346876	1356896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1347153_1347783_1348103_1350748_1350908_1356341
920677	contig_2768_pilon	-	3634	3	Intergenic	novelGene_57476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1263	1817	821643	821089	TRUE	40	CTTTAGATAAAAATTGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLRILWDSIKRNNLRVTGVPEQGGGITENTDRIVEDLSAENFPDSVKNEKISIQEAHRTAHRIDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERILRAARDKRKVIYKGDSVRLSSDNSAETMQVRSQWDDIYKALKEKNCQPRIMYPAKRPLKYEGKIRALLDKQKLREFVKTKPKLQEILTGVLWIENQ	822905	640940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_640948_644497_645122_819902
920678	contig_15420_pilon	+	474	2	Intergenic	novelGene_175302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTGTGGACATATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172536	187466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15420_pilon_+_172568_187023
920679	contig_11304_pilon	+	1983	1	Intergenic	novelGene_156713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAATAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405685	407668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_405700_407700
920680	contig_7119_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_40863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGCCGTCAAGGCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37630	35203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_35200_37600
920681	contig_10581_pilon	-	2164	2	Intergenic	novelGene_41424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTATTTGGTGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691510	646646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_648671_691370
920683	contig_10689_pilon	+	1063	4	Intergenic	novelGene_118632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3510	junction_3	133.639648142142	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	62	580	57608	61101	FALSE	20	GCTTTCTTGTTTAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLGGRCSALILPAAQDLTTTMSSKRAKTKTTKKRPQRATSNVFAMFDQSQIQEFKEAFNMIDQNRDGFIDKEDLHDMLASLGKNPTDEYLDAMMNEAPGPINFTMFLTMFGEKLNGTDPEDVIRNAFACFDEEATGTIQEDYLRELLTTMGDRFTDEEVDELYREAPIDKKGNFNYIEFTRILKHGAKDKDD	51300	61584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10689_pilon_+_51347_57592_57792_58211_58374_60928
920684	contig_14871_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_63739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCATCCAGATCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311760	308909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_308900_311800
920685	contig_17936_pilon	+	1968	3	Intergenic	novelGene_29894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	141	11	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	86	430	50646	79303	FALSE	70	CCAAAAATAAAAAAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCRSSSAVSCAVAPVAAAPVAALADAGAMAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDR	50560	80841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_50676_68275_68391_79103
920686	contig_15248_pilon	-	3160	1	Intergenic	novelGene_149147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAACAATAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12749	9589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_9600_12700
920687	contig_6898_pilon	-	2769	5	Intergenic	novelGene_35766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTGCTTCAGCCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127706	122715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_122741_122981_123142_124329_124462_124780_125006_125479
920688	contig_3747_pilon	+	1186	6	Intergenic	novelGene_24830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4644.22791861037	91	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	329	967	201313	204963	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISMSIRRPRCSQPLSLYP	200984	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_202886_204913
920689	contig_17344_pilon	+	4167	1	Intergenic	novelGene_169594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74906	79073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17344_pilon_+_74900_79100
920690	contig_854_pilon	+	3222	16	Intergenic	novelGene_36599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2204.68331815101	8	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	70	1515	1685144	1702631	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELRLLRRRPRPMRPRSRR	1685074	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698920_1702579_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1715226
920691	contig_366_pilon	+	3148	2	Intergenic	novelGene_51595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTGGAGAATTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758058	761574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_759704_760071
920692	contig_1472_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_86139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGGAGCACAGTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627000	625668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_625700_627000
920693	contig_987_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_72261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGCAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417115	415024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_415000_417100
920694	contig_5419_pilon	+	2323	7	Intergenic	novelGene_15557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	42.0343774652235	10	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAAACCAGTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539484	589563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539733_540053_540147_541812_541927_550898_551051_551753_551870_586830_586980_588112
920695	contig_18272_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_7053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTCTAAAATTTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471336	474219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_471300_474200
920696	contig_6654_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_85702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	657	971	146759	146445	NA	15	ACGCTGGCCCCGTGAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMDEVREFERATQEATNQKIGVFPPAISISSIPLLPSSVRSAPSSAPSTPLSTDAPEFLSVPRDRPRKKSAPETLTLPDPEKKATLNLPGMHSSDKPCRPKSE	147415	144857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_144900_147400
920697	contig_15273_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_140436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	113	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCAAGATGGCGCACGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117918	120626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_117900_120600
920698	contig_14037_pilon	-	2467	1	Intergenic	novelGene_173642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1414	1779	4435	4070	NA	20	TGTACTTCAGGTGAAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFKITMITMVKVLMEKIREREIIRKNQDTVVSISQGCNQGVSQAVVLMWSSKFSFRLIQILGRIQFLVVVGLRPSAPRGQLQVLATCAPLEIVPTQLFALFLYPTEESLCCFELFTLLRQ	5848	3381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14037_pilon_-_3400_5800
920699	contig_10801_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_74040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	901	1239	268730	269068	NA	30	AAAAAGCTTTACTGCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLVLLFYLLVCCSVWGLKSLQLAIQGTTVGLYSPGKNRGRRVRNRRIWNVWLIASMLNCLLCHETKSGWCLATITEHFDQRFHRRILMKRGKMQNRITKSHGLQIYWNHEG	267829	269590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_267800_269600
920700	contig_10974_pilon	+	1838	2	Intergenic	novelGene_179018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGCAAAAAGCTGACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47612	52978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10974_pilon_+_48508_52035
920701	contig_8647_pilon	+	2913	2	Intergenic	novelGene_178121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	191	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	461	1048	986955	987542	TRUE	45	TTTTTTTTTCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTSDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQQLKQKADKKEEKIDKFTEKVDKLMENTDKKLEEFRKITQEQNAKINSQLEIIQKQQLETQKINNKISEMDSVTEGLRRRFETVEDRISRIEDKYLDTTLFQENSEKRTKKNGTTLRVIKSKNWQVTAVPERGENRKHREDL	986494	989833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_988909_989334
920702	contig_11338_pilon	-	1582	10	Intergenic	novelGene_6219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_9	84.8384084925899	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	82	1446	17283	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYSKWAGWGQGAGVAGPFPVLTWPPLCLPVEQSR	21363	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
920703	contig_253_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_129775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATGCTTACTTTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817283	819569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_817300_819600
920704	contig_19352_pilon	+	3798	1	Intergenic	novelGene_122345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	239	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGAGACCCCGCCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87292	91090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_87300_91100
920705	contig_9680_pilon	-	801	1	Intergenic	novelGene_178401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCAAACATCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99153	98352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9680_pilon_-_98400_99200
920706	contig_19990_pilon	-	3461	1	Intergenic	novelGene_30763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATTATTTAAGCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63784	60323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_60300_63800
920707	contig_6361_pilon	-	3603	8	Intergenic	novelGene_23926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	5003.98977551607	67	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	20	TCAGTTCTTGATCATATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	496323	255594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_255732_380016_380549_408814_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
920709	contig_5988_pilon	-	3003	10	Intergenic	novelGene_16084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2056	2427	1224879	1222038	TRUE	15	CTTCTAACTCTCCCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFIITEHATCNVCKEEMRGGGRSHQTEKGWMAISLLLFFLVLLIHSQDHHEFSEQSNKIQEEVNTMPDIILISIFSLFNNKLSIKKDKATHDHQPHIQVCLEKPNGSKEKVAQGGQDHQAHG	1226934	1209868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1209911_1218346_1218437_1218870_1218975_1219913_1220035_1221371_1221423_1221658_1221814_1222024_1222105_1222577_1222678_1223381_1223459_1224751
920710	contig_8106_pilon	+	2383	1	Intergenic	novelGene_139739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1281	1682	122757	123158	NA	70	CCTAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSGHLRYSTGLIPLGARENEENRIQGKDQSEGLIVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHKRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKLSLRCTFQPGSGQPRKTK	121476	123859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_121500_123900
920711	contig_17560_pilon	+	3551	2	Intergenic	novelGene_167572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2844	3386	131404	131946	FALSE	30	TGTCATAATCACACTCGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISNHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKFLILRIIQELKRKADKNVEKIDKFMEKADKFMENTHIKNGRIQENNAGTKCQNKFTTRNYTKITIRNPKDNKISEMGTVIEGLRSRFEMVEDRISGIENKHLDTTRFEEKSEKRMKKNEETLRIRWDTIKSKKL	12342	132111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_12395_128612
920713	contig_7840_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_68946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	12625	12948	NA	15	GTCTATTTAGTGTTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQPAHHDVHRLVPAPAAFGHQDHNGRHPGLELLPSGSRAGRRERASRLGQAFPGAERGGWLSCPRRGFVSSDQWAPVPGLVLGKRNQAPSPVLCLVSNLPPRKLRP	12622	14382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_12600_14400
920714	contig_12479_pilon	-	2830	19	Intergenic	novelGene_56864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	122.383038141286	9	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	741	2345	531614	451285	FALSE	0	GTGTTTTTTGTTTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKIIETENMMDRIVTGLSESSVKVRLAAVRCLHSLSRSVQQLRTSFQDHAVWKPLMKVLQNAPDEILVVASSMLCNLLLEFSPSKEPILESGAVELLCGLTQSENPALRVNGIWALMNMAFQAEQKIKADILRSLSTEQLFRLLSDSDLNVLMKTLGLLRNLLSTRPHIDKIMSTHGKQIMQAVTLILEGEHNIEVKEQTLCILANIADGTTAKELIMTNDDILQKIKYYMGHSHVKLQLAAMFCISNLIWNEEEGSQERQDKLRDMGIVDILHKLSQSPDSNLCDNSLEPSVSSPTSCMTRQNLHGSRRK	538144	450799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_451361_454082_454177_455597_455671_461707_461804_474329_474426_475590_475741_479005_479099_482062_482150_486699_486782_487092_487176_507869_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535934_537773
920715	contig_12790_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_35281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1	324	432446	432123	NA	65	ATATGAAAGAAAAGAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCFLPPTNPCKPPPTLPTGPQIRAAPPVGYPFFSFPFLFSFCLAPYTTSLPTSPRRVPWLEHPWIRPITAVGLHCSSPSTTQPAAERRESKPVPLPIRQPRLSDEGL	432446	430500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_430500_432400
920716	contig_15114_pilon	-	1597	2	Intergenic	novelGene_121088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	420	758	30383	27932	FALSE	75	AAGAAAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRIYQIPTLGAALSPPVELPLNLRSSPRSCKVCVVLMQQSQTSSCRTLQSHKLCPAPGRCRNMFNFDQEFPQNCMISLLPLKNKSQPWFWGTSSSIGITQFIKAMFYILPW	30802	27092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_28222_30334
920717	contig_2162_pilon	-	3328	2	Intergenic	novelGene_179019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4905	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1671	2165	191829	191335	FALSE	50	TAAAAAAAGAATGATGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPALLARIKNTANNQYWRGCGEIGTLMHCWWEGKMIQPFWKMIWFFLRKLEINIPFDPTIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPTFMAALFTIEKRRKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCVRPLL	327691	190171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2162_pilon_-_192129_326320
920718	contig_5539_pilon	-	3780	1	Intergenic	novelGene_104789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	3326	3637	296562	296251	NA	30	TGTCCGGTAAATGCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSSCWLWGRGGEGGAGGSRGTFTQLLYRHLLLGKGREEGTAGGCLLHHAASVTGRQRQEGVAGGYAHTHSSSTLCWVTGRRKRPQEHCAHSCSSSGPHWVG	299887	296107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_296100_299900
920719	contig_2403_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_70998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCCAGCCTGGACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68177	70424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2403_pilon_+_68200_70400
920720	contig_6028_pilon	+	2552	2	Intergenic	novelGene_156589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAGCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318146	322879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_319630_321810
920721	contig_8682_pilon	+	1523	1	Intergenic	novelGene_165277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	21	362	108427	108768	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCLTQVMVFSIASYACESWTTNKEDQRRIDAFELWCWQRILNIPRTATKMNKSVLKEVQPECSLEARMARFHLTYFRHVIKRDQSLEKDIMLGKVKGQQKEEDPQRDGLTQWLQRWAQT	108406	109929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_108400_109900
920722	contig_11338_pilon	-	4737	7	Intergenic	novelGene_6267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	313.540888703354	7	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	299	742	319426	315511	TRUE	40	TGGGAAAATCTGCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSGNAEVGEGKAT	323314	124778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_125621_312357_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
920723	contig_6208_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_53042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAGGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522856	520898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_520900_522900
920724	contig_19012_pilon	+	3982	15	Intergenic	novelGene_159475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_1	169.35887508905	69	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	1329	3023	50686	86127	FALSE	80	CTTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRELRYLFALLVGTKRKYVDPSRAVEILKDAFKSNDSQQQDVSEFTHKLLDWLEDAFQMKAEEETDEEKPKNPMVELFYGRFLAVGVLEGKKFENTEMFGQYPLQVNGFKDLHECLEAAMIEGEIESLHSENSGKSGQEHWFTELPPVLTFELSRFEFNQALGRPEKIHNKLEFPQVLYLDRYMHRNREITRIKREEIKRLKDYLTVLQQRLERYLSYGSGPKRFPLVDVLQYALEFASSKPVCTSPVDDIDASSPPSGSIPSQTLPSTAEPQGAPSSELPGTSPAITAISSRSIIHKPFTQSRIPPDLPMHPAPRHITEEELSVLEGCLHRWRTEIENDTRDLQESIARIHRTVDLMYSDKSMIQVPYRLHAVLVHEGQANAGHYWAYIFDHRENRWMKYNDIAVTKSSWEELVRDSFGGYRNASAYCLMYINDKAQFLIQEECNKETGQALVGIETLPPDLRDFVEEDNQRFEKELEEWDAQLAQKALQEKLLASQKLRESESSVTTAQAGEPEYLEQPSRSDFSKHLKEETIRIITKASHEHEDKSPETVLQSVRTFLLAL	20415	87086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_21473_36887_37051_41930_42018_50664_50803_55916_55994_58185_58260_63391_63541_69245_69374_69765_69862_71237_71400_71998_72223_75379_75451_76138_76368_77785_77987_85960
920725	contig_5047_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_157993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047932	1047119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1047100_1047900
920726	contig_57_pilon	+	3002	24	Intergenic	novelGene_44881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_8	221.229909749708	1	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	632	1896	1106	3001	100667	129542	FALSE	60	CAGAAAAAGAAAAAGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVDKAYDYLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPEDTENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKAGQSAAKRQGKFKKDVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKD	66738	129543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_100637_100738_102984_103134_104960_105077_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_122503_122543_129464
920727	contig_13481_pilon	+	3778	1	Intergenic	novelGene_119362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	51	365	452109	452423	NA	30	GAATTCATTTTGCTAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFMKRSLFPQSQSRLKVISSRGRLFLSLGPSHQCSTGLGASRCRDPGPKDALCSWHCFLDAIRSPCLTAHFCLLYLKRLPQDTIQSCRSGPALITQLPPILPH	452058	455836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_452100_455800
920728	contig_6278_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_119823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTCCAAGAAAGTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513983	511135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_511100_514000
920729	contig_2504_pilon	-	7446	3	Intergenic	novelGene_166839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	6116	6511	369814	274497	FALSE	55	AAATCTTTTTGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQESVSNHIKRQSMMASASSQNKESKNFPEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHAIEEIKKIRDEHNDKFNRLQESIERQQSEIQNVNNKISELDNTIESHRSRTEAMEVRISEIEGKALHTNLFEEK	378389	273561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_274794_369715_373980_376439
920730	contig_6028_pilon	+	1077	1	Intergenic	novelGene_156597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337848	338925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_+_337800_338900
920731	contig_10793_pilon	-	3575	10	Intergenic	novelGene_83433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	621	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCAAGTCTTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168751	152936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_152968_159123_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161477_162546_162689_163140_163288_163929_164078_165049_165375_166399
920732	contig_14414_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_166504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	107	424	103528	103845	NA	15	GGTTAAGCTGTCTACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFPKVHPMHNIPNRSHPPPPQTRVPSLSEWHHYPPVKPGARVSSLTPPSCPPDLCHYGTLKVEIILDLQKSCKNSTEFLYTLYAAYLKVNILYYHNIMTKLSP	103421	105230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_+_103400_105200
920733	contig_8571_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_169172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTCCATTTGGCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390135	392862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_390100_392900
920734	contig_10864_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_107072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACTACAACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	883253	884519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_883300_884500
920735	contig_11855_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_66913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTATTTATGAGCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796151	797527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_796200_797500
920736	contig_614_pilon	-	4173	1	Intergenic	novelGene_132614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCAGAGAAGTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395169	390996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_391000_395200
920737	contig_10446_pilon	+	3444	4	Intergenic	novelGene_162451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCCTGCCATCTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339327	438182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_340612_434848_435976_437099_438081_438130
920738	contig_19899_pilon	+	3519	23	Intergenic	novelGene_102526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	31.6705992918374	134	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1050	3153	260	3412	157000	192992	FALSE	30	AGCCATACAATTTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGSEGRDAPRDPGLQPGMGLELGLRRAGGAAAGGSTHLMAQSPMPPKPEGLSQDELRKRLYQTFKDRGILDTLKTQLRNQLIHELMHPVLSGELKPQSIPVEGSALLIGASNSLVADHLQRCGYEYSLSVFFPESGLAKEKVLTMQDLLQLIKINPASSLYKSLVSGFEQENQKGFLMQFLKELAEYHQAKESCDTETQTSPTFPSKDSLAEKLRLIDDQFADAYSHRPKLESLERKLNEYKREVEQQLRAEMVQKLKYFKDTEIAKIKMEEKRKYEKELAEFRNEFDRVCQAKSEALISREKNTLERIQKHQEIETKEIYAQRQVLLKDIDLLRSREAELKQRIEAFELSQRLQEEKNKSVDDALKRRELNIKTLEETYDQKLKTELLKYQLDLKDEYITRTNRLIEDERKNKEKAMHLQEELTVINSKKQELSQSVNRVKELELELESLKAQSLAMSKQNHLLSEKVKGLSDYSRLKEEKLELQAQTKLLKQQLEESRSENVLLLNRIAQPSPELVIFQKELKKAENAIALGHKEFETHKQALEKRLQSEIEHSAQLKAQLIDYDATVKRLTTQIADLKLQLKQTQTALQNEVYRNPKPSLMDRSITGFRSGRMVPHDGDISGDFLKNPVEQEKALAVAVTPRVTSPPDAGMESISPDSDLEFVANTKARVKELEQEAERLEKAFRNYHRRVTQNPGTSPPPAKSPLPLYLLGTLKNVTSRSPERGLFAEDRIVSEQPQVDILREEKSDALEVLTGSAASRRRRGSSPRRLSSTPLPKAKRSLDSEMYLEGLARSLVASPSACPDRTSQPSPAESRPTPSSASPRSLPEQKASLYQKQAELQDRSEFSNLDKLTSKDNEELDSSFEYAGDMPRSFEVDGLLPAGDMPHVDTVSAAVPARPVSLQYTNIDQRQIGEPEEEENIWEQRTKERRQTEERRQSERQEALEKERRELEKLDQERRMIEESLKIEMEKELEVSAQEIKDKSVCGENPLEKYMKIIQEGRDQNSADKSSKKIIIREGSPLDTLPSSDKDESFTGLSHEEPDDSW	156740	193099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_157126_157298_157398_158206_158408_160356_160426_160511_160543_166337_166446_169485_169623_169954_170129_172515_172623_175474_175595_176730_176805_178048_178141_179084_179275_180099_180231_180753_180866_183414_184024_184477_184605_185738_185840_187521_187642_190832_190991_191892_192046_192590_192662_192949
920739	contig_11281_pilon	-	6383	1	Intergenic	novelGene_125484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCAGCCAGCAGGGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	892248	885865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_885900_892200
920740	contig_9738_pilon	-	2547	2	Intergenic	novelGene_169262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATTCCACAGCCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183360	180699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9738_pilon_-_182776_182889
920741	contig_8017_pilon	+	2980	2	Intergenic	novelGene_65358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	160	459	973037	973336	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKIIQKRLQQYNDRELPEIQAGFRRGGGMRDIIADVRWILAKSREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDLNKLWITLRRMGIAEHLIVLMQNLYVDQEAVI	937042	975857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_937116_972950
920742	contig_211_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_129870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAAAAAAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230217	231719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_230200_231700
920743	contig_15031_pilon	-	3995	1	Intergenic	novelGene_138406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTAAATATCATAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91765	87770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_87800_91800
920744	contig_16632_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_154139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGTTAATTCTACCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98574	101012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_98600_101000
920745	scaffold_19766_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_34451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCTTAGACAATTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873157	872615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_872600_873200
920746	contig_10549_pilon	+	2879	1	Intergenic	novelGene_110608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCTAAAGCACAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169530	172409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_169500_172400
920747	contig_9414_pilon	-	1792	4	Intergenic	novelGene_131088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.87400787401181	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAATAAAGAATCAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538406	534390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_535678_536009_536242_536363_536452_538221
920748	contig_5461_pilon	+	3488	1	Intergenic	novelGene_156812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTTTATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209387	212875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_209400_212900
920749	contig_7093_pilon	+	4110	2	Intergenic	novelGene_157961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	119	352	36241	36474	TRUE	75	CAAAAGAGAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPHLPLLTSVRTLARFQPLPKLLRSPFRDPNNRSRCSRMVIRVYIASSSGSTAVRRVESPPLLFSYTSVPSCPRTVKLRKFVWQLLLRKTEASLAPPPLLLFLPFVASVSFFLVV	36122	40769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_38600_39136
920750	contig_11512_pilon	+	1780	2	Intergenic	novelGene_43391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556814	563054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556866_561325
920751	contig_9705_pilon	+	1983	2	Intergenic	novelGene_41728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCAAGTAGTGGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209813	216934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_211723_216860
920752	contig_11986_pilon	+	2645	2	Intergenic	novelGene_69176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	95	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1981	2532	552576	553127	FALSE	65	AAAAAAAAAACCAAATCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVKAPDSNCAHWENEAVNPQQRRTPTCFPRTLLACSSISRNQGMWFPRNLLAHTHTPERTHRPFTRSPSACTVLLPSPGQALQVVGRKLSLLPAPSTSPQAMPHMGRSRCLQSDAKENILPSPLWPAVGSPRWGAGGWEGYNCRDVGTRDTQIHPAPGLHVGRPWKGAGSSRVLGWEGWEDP	549822	553240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_550472_551244
920753	contig_3382_pilon	+	3546	1	Intergenic	novelGene_124109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	314	945	2288	3232	680425	681369	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKEHRNFPEEENLLELPEAGYKRLIYRTLQEIRKEIKQNTEHTIEEIKKIREEDNDKFNRLQESTERQQSEIQKINNKISKLDNSIESHRSRIETMEVRISETEDKALDTNLYEENSDKRIKKNEETLRIMWDSIKRINLRVIGVPEQGGITENTERIVVDLLAENLLDIEKDDKISIQDAHRTPRKVDSKRKSPRHIIIKLVKTKDKERILRVTRDKRKVIYKGESVRINWDYSAETTQARRQRDDIYKALKEKNCQPRIIYPAKLSLNYDGEIRAFPDKKKFREFAKTKPKLQEILNGHVQLQNQ	678137	681683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_678100_681700
920754	contig_19402_pilon	-	4941	19	Intergenic	novelGene_80770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	92	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTAAAAACAAGACGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	23449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97798_107509_107692_109783_109831_130466_130595_138557_138661_139813_139896_142954_143078_143814_144315_144739
920755	contig_11338_pilon	-	1864	6	Intergenic	novelGene_6383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	276.586767579362	14	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	299	892	319426	306671	FALSE	20	ATTCTTTCATTCTCCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPVNADSTCAYPLQLDHSHY	323314	305698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
920756	contig_6375_pilon	-	2206	9	Intergenic	novelGene_73031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_8	87.7872962050888	8	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGAAACTAAGGCAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471310	465129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_465166_465385_465494_465627_465736_466164_466311_466665_466808_467364_467518_467614_467749_468662_468706_469974
920757	contig_12125_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_76208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134066	135903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_134100_135900
920758	contig_9333_pilon	+	2421	1	Intergenic	novelGene_120344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	154	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTCACTGAATTGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561506	563927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_561500_563900
920759	contig_10074_pilon	-	4914	1	Intergenic	novelGene_57166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCAGAATAGGGCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543295	538381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_538400_543300
920760	contig_13295_pilon	-	3566	2	Intergenic	novelGene_31200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	320	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAATTTAGGTATTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10247	6515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_6784_6949
920761	contig_2704_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_75302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	215	754	143612	144151	NA	30	TAAGCCTTCACCTGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGAKRLKGEDMNVCVCSINKSPWEHTAERASQAGGQAAAETRPGERRRRGASTCGARHLTCKNEGEHWTPEKGDTMGTHAPHFCPRAEAPGLRSWWHSRYPSRFCICEIRPSGAETRIMWEAVCHVSCYCCPKCCQHPRKPKSFSPNPPAWQLQPGLRCTGQLWNRTLVRTPLPPAMQ	143397	145844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_143400_145800
920762	contig_12951_pilon	+	2454	3	Intergenic	novelGene_68136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	16.5	26	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1039	1419	108003	120246	FALSE	70	ACAAAAAAATTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVSGWRTFLQALGYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCGECCLCVVSRGPAWP	106964	121281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_108114_109617_109724_120082
920763	contig_10722_pilon	-	306	1	Intergenic	novelGene_70959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACAAATGTTGCCATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3325	3019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_3000_3300
920764	contig_11281_pilon	-	3115	1	Intergenic	novelGene_125475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	302	909	892	1800	865211	864303	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKIMEEKIGTILGALIHGINTLLTISNNAQAPEERPDNWELLKIKYFHSSKDFTKRVKRQPTDWEKFFGYNKSNQRLIAKIYKRLPNLNNKKTNDPIKKWAKDMNRHFTKEDIQVANRHMKKCSPSLAIREMQIKTTRRYHLTPTRLALIQKSQNNKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQSLWKSIWHFLKKLEIEVPSDPAIPLLGIYPREIRTITQIDIRTTVFIAAMFTIGKRWKQPRCPSKEEWINKLWYIHTMEYYAMIKNNDEAVKHLITWRKLEVIMLSEFSQSQKDKYCIRPLL	866102	862987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_863000_866100
920765	contig_6446_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_149208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTGTCTCCTTCTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295237	296821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_295200_296800
920766	contig_3270_pilon	-	5947	10	Intergenic	novelGene_104500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	252.039728398834	9	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	3991	4722	362718	357511	FALSE	10	CTCTTCCCAGCTGTTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVVELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNEDEEEEGKAVVAPVEKSKPEDDFPDSYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSSGGFKFTFSHSASAANGTNSTNSKSVVAQTSPASSNGSSSKTTNLAASVTATKVCETALQTSFALFYL	385799	356285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_357762_359605_359791_360190_360331_362562_362733_365983_369479_370452_370585_375431_375549_376972_377090_380092_380162_385753
920767	contig_7110_pilon	+	2098	20	Intergenic	novelGene_176016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	37.436927567662	48	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2028	71	2098	75736	259473	FALSE	10	GTTGGTCTTCCATTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEEEKWEKLDAEFDHFVVDMKPFVLKLPHRSERQRCALWIRKLCEPSGTGTGIMGRKNRNLYAKLLLHMLKRGVLEGPFTHRPEPGTLKTLPSYMSIYFDEPSSVRVKGPSPERLPDWVMSELGTSDHKLNESWKLSSEDNTLVQSPTDVHRRMETNWSTLDGRSQAFKTSREQYSGQLRMRSHSVSPAYREDGEDVTPKIAEDHLKKSALSLDDSDIEARLNSWNLGIENPRYLRQKPVPVSLTTPKFSLRKSSSFHDDHLLSRMHEKELDMKTKIVEAKFHEEKLKLQQKHDADVQKILDRKNHELEELKTLYKRKQNETEETIRKLEKKVQTLIRDCQVIRETKENQITELKKICEQSAESLNNDWEKKLHTAVAEMEKEKFDLQKKHTENIQELLEDTNIRLNKMEGEYVAQTQATNQMVKELEARVQQLTGEAENSNLQRQKLIQEKMELERCYQITCNELQEVKARRNTLHKEKDHLVNDYEQNMKLLQTKFDADINLLKQEHALSASKASGLIEELEQTVCLLKEQLQESEHQRMQQLKDQENKFQMEKSHLKRTYEKKVHDLQNELDKEKEDAQKKIHKFEEALKEKEEQLTRVTEVQRLQAQQADAALEEFKRQVELNSEKVYAEMKEQMEKVEADLTRSKSLREKQSKDFLWQLEDVKKRYEQQ	68978	259473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7110_pilon_+_69035_75721_75836_78376_78568_79958_80129_100917_100975_104642_104737_106978_107057_128748_128797_129058_129137_147342_147430_159359_159460_162641_162761_166500_166645_189385_189541_194721_194852_199788_199882_200617_200678_207905_207986_246500_246637_259365
920768	contig_4232_pilon	+	1937	3	Intergenic	novelGene_63464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1172	1480	557402	557710	TRUE	15	CACTCATCAGTTCGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAEGMWGRVTKVQGKDQRHRPDLQVPSPILGHLSPEMPPGETAGDTVHIERGTKEVSEWKGWLGPESRGRREAIQGAEGRLTCWLCRPQYRPRPRSPCSMV	556072	560802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_556460_556617_557979_560613
920769	contig_6102_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_32230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCCAAAACGGGACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902285	904302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_902300_904300
920770	contig_12079_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_67570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAAAGAAAGAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872188	870547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_870500_872200
920771	contig_1982_pilon	+	5353	18	Intergenic	novelGene_151333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_1	70.9663402838782	175	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2790	141	2930	359020	418775	FALSE	45	AAGGAGTGGAAATAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESMLNKLKSTVTKVTADVTSAVMGNPVTREFDVGRHIASGGSGLAWKIFNGTKKSTKQEVAVFVFDKKLIDKYQKFEKDQIIDSLKRGVQQLTRLRHPRLLTVQHPLEESRDCLAFCTEPVFASLANVLGNWENLPSPISPDIKDYKLYDVETKYGLLQVSEGLSFLHSSVKMVHGNITPENIILNKSGAWKIMGFDFCVSSTNPSEQEPKFPCKEWDPNLPSLCLPNPEYLAPEYILSVSCETASDMYSLGTVMYAIFNKGKPIFEVNKQDIYKSFSRQLDQLSRLGSSSLTSIPEEVREHVKLLLNVTPAVRPDADQMTKIPFFDDVGAVTLQYFDTLFQRDNLQKSQFFKGLPKVLPKLPKRVIVQRILPCLTSEFVNPDMVPFVLPNVLLIAEECTKEEYVKLILPELGPVFKQQEPIQILLIFLQKMDLLLTKTPPDEIKNSVLPMVYRALEAPSIQIQELCLNIIPTFANLIEYPSMKNALIPRIKNACLQTSSLAVRVNSLVCLGKILEYLDKWFVLDDILPFLQQIPSKEPAVLMGILGIYKCTFTHKKLGITKEQLAGKVLPHLIPLSIENNLNLNQFNSFISVIKEMLHRLESEHKTKLEQLHIMQEQQKSLDIGNQVNASEETKVTNVGSQQIDKVFNSIGADLLTGGEPDSKDDGLHSKHKGASLTLEEKQKLAKEQEQAQKLKSQQPLKPQVHTPVAPVKQTKDLTDTLMDNMSSLTSLSVSTPKISAPSTFTSVPSMGLGMMFSTPVDNTKRNLTNGLNANMGFQTSGFNMPVNTNQNFFSSPSTPGVTKMTLGTPSSLPNFNAMSASPVGAKQTQQRPTDMSALNNLFGPQKPKVSMNQLSQQKPNQWLNQFVPPQGSPGMGSTVMGTQMNMIGQSAFGMQGNPFFNPQNFAQPPATMTNSSSASNDLKDLFG	335008	421198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_335121_358991_359197_373082_373241_378021_378167_383313_383464_384728_384951_386324_386442_387038_387165_390419_390597_394629_394753_399378_399493_402332_402466_404349_404469_413479_413581_415603_415671_415810_415907_416974_417095_418130
920772	contig_11096_pilon	-	2504	3	Intergenic	novelGene_143462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	2073	2504	204622	198721	FALSE	15	ACAGGGCCCGCGAGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGLPANPRQMAHTMLDFPVPLAPIIIFKLGPGDTSQISYVRKFSIAMRTIEPSTKGPDDCSGGGSSGVGGSVDGAELFLLLGTSDEGSLGRTLLEAWELGVDVLLLGVAILAPSPPRSRFRSHRPAAPTPRPPAPARTVRRA	208067	198720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_-_199027_204496_204639_206011
920773	contig_7730_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_156272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTGAGATAAGGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167391	169235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_167400_169200
920774	contig_16496_pilon	-	1533	2	Intergenic	novelGene_5143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	8	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	309	326	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3593	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
920775	contig_11548_pilon	+	2193	11	Intergenic	novelGene_66727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	726.118723074953	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	210	1547	63836	119638	FALSE	65	AGAGAAAAGGAGAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63626	120284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
920776	contig_18342_pilon	-	1837	1	Intergenic	novelGene_154565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	392	757	53546	53181	NA	35	ACCGGTGACTGGAATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIPKVIYRYNAIPTQFPTIFFKEKEKLITSFIWKGKRNQISKALLKKNKVGGLILPNLRTYYIATVVKTAWYWYNSTRIDHWNRMEILEVNPSTCGQLIFNKKLECIKWGRDSLFNKWF	53937	52100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18342_pilon_-_52100_53900
920777	contig_5084_pilon	-	1341	2	Intergenic	novelGene_64613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCTTGTTCCAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1044018	1042577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1043736_1043835
920778	contig_3150_pilon	-	5664	10	Intergenic	novelGene_171911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	11.9111940295621	166	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	265	870	275943	265671	TRUE	5	GTGTGTCTGGTGGCCGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDEFLKKALAESPASEAARGRSAGSVVLTHQCFCLYSHLDDARGRHQKKIQSRTQNYLNVYAVEGLRTLCIARRVLSKEEYACWLQRHMEAESALDNREELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETIAKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDQDEEVITFNAESQEACAALLDQCLRYVQSKGPGSAQEKTSKDISVAFSPLSPPSVSTASGRSPSLVIDGRSLAYALEKSLEDKFLFLAKQCGSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGK	276287	251096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_-_252342_252480_252670_253376_253482_253556_253638_255156_255358_259175_259302_262823_266007_269270_269456_275858_275986_276065
920779	contig_6710_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_98343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGATAAAAAATAATCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657175	655832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655800_657200
920780	contig_6513_pilon	+	3171	8	Intergenic	novelGene_117762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	401.697774503191	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	754	2262	908	3169	152061	171596	FALSE	40	TTTTAAGTCACCAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHSSSYPTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSDDYLHMVHRLSSDDGDSSAMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSDGTPKGSRPPLILQSQPLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKDQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTLRLSRIRSSDMDQQEDMLSGMENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSIATKQPQTSVVQNQQQVSQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGRVDSQASLTQDSDTIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDITGSLKSTPENHPDTPKKKSDPELSKSEIKQNESRLAESKPNENRLVETKSIENKLEAKTEIQTEEPKQNESRMTESKHNESTIAEPKQNENRLSDPKPNDNKQSNGRAETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKHRHENRKDSGKPSAEKKPEVSKHKQDIKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDSKQKSDGRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSSRNEHGIKSDGSKTDKIERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDSNKSRPDKS	150778	171598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_151684_152058_152159_152690_152843_158569_158728_159728_159826_163882_164510_170367_171036_171134
920781	contig_8276_pilon	+	2543	1	Intergenic	novelGene_174467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCCGTCCAGATTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97028	99571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_97000_99600
920782	contig_10159_pilon	+	2858	5	Intergenic	novelGene_30854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_4	52.7369652141645	86	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	379	1416	748193	799002	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAALAAALLSSLARCSLLESGDPVASALSPYFGTKTRYEDVNPGLLPNPEAPWRDPELLEGTCTPVQLVAVIRHGTRYPTAKQIRKLRQLHELLQARGPWGGRASATSGRDVGAVLADRPLWYADWMDGQLVEKGRQDMRQLALRLASLFPTLFCRENFGRLRLVTSSKHRCVDSGVAFLQGLWQHYNPGLTPPDVADMECGPPRINDKLMRFFDNCKKFLTEVERNATALYHVEAFKTGPEMQDILKKVAATLQVPINDLNADLIQVAFFTCSFDLAIKGIKSPWCDVFDIDDAKVLEYLNDLKQYWKRGYGYTINSRSSCILFEDIFQHLDKAVEQKQRSQPISSPVILQFGHAETLLPLLSLMGYFKDREPLTAYNYKEQMHRKFRSGHIVPYASNLIFLLYHCENAKTPKEEFQVQMLLNEKVLPFAHSQETVSLYEDLKNHYKGVLQSCHAIDECKLLKVNSSDEL	747814	800444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_748407_751627_751826_758416_758515_765027_765162_798608
920783	contig_15697_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_173302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1822	2127	41779	41474	NA	55	ATATGGATAAAAACAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCQKNKHICLGRSTARILLRSEDGEALSHVLWTCYQAGPVPGEGHHAYEVEGQRKRGSPSTGWIVTVAATVGSNIATFVRMARDQAVFPSVVHRVAMSWS	43600	41450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15697_pilon_-_41400_43600
920784	contig_11117_pilon	+	785	2	Intergenic	novelGene_148581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	266	junction_1	0	7	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAATCCTGAAACCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68531	74604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_68607_73894
920785	contig_11574_pilon	-	2732	1	Intergenic	novelGene_64101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCCTATGGGGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468305	465573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_465600_468300
920786	contig_1813_pilon	-	4286	6	Intergenic	novelGene_105501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	12.9243955371228	82	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	142	1155	387950	342138	FALSE	30	ACCCCAGGCAAGACCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALVLRGVRELEKRVEFLTAPRRHRHKKKWAATEPKFPATRLALQNFDMTYSVQFGDLWPSIRVSLLSEQKYGALVNNFTAWDHVIAELEHLGARDFVNEAFSHWELEHESGQPAAPAPAPASWACSPNLRCFTFAKGDVSCFPRARLGSLGVLDYYLMDAASLLPVLALGLQPGDTVLDLCAAPGGKTLALLQTGCCCNLAANDLSTSRTSRLQKVLHSYVPQDIRDGTRVRVTSWDGRKWGELEGDTYDRVLVDAPCTTDRHSLHEEENNIFQRSRKKERQTLPLLQVQLLAAGLLATKPGGYAVYSTCSLSHLQNEYVVQGTIELLANQYSIEVQVEDLTHFRKLFMGTFFFFPSCQVGELVIPNLMANFGPMYFCKLRRLT	392310	339006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_342415_343026_343152_362125_362287_364859_365015_387654_388005_392223
920788	contig_9183_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_40279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1100	1465	303027	302662	NA	30	TGATGTCAAGTGCACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEIPLFIFWISNFCLCIISSCEFVLAFCSCIIFLNFSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRHLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWMPTGTVLSCFCKCFDIVCCLRGFQ	304126	302355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_302400_304100
920789	contig_11291_pilon	+	3333	2	Intergenic	novelGene_179020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51077	55640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11291_pilon_+_53402_54631
920790	contig_9304_pilon	+	2447	3	Intergenic	novelGene_177836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	12.5	22	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1000	1311	15430	15741	FALSE	75	AAAACACAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMKKLGQSLYYVCFATGERRLQRPHLLTWSPCLRSPLLTPNLLTFDDSVQQSWHRKPSMCRRAGPCHYDVRKWSGYVGSLSLDIKSLMAVVVARCHQVCSNS	1416	16877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9304_pilon_+_1646_13632_13747_14773
920791	contig_11386_pilon	-	2056	9	Intergenic	novelGene_82826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	100.087149524802	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	177	1115	222850	205805	FALSE	50	AAAGAGACTAGTATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEAAAVVAAAAAGASDWVSGSGTGANQRGQRTGGARHGVQLEVLWHLQSKAHCGRDSNMEQYTANSNSSTEQIVVQAGQIQQQVQGQPLMVQVSGGQLITSTGQPIMVQAVPGGQGQTIMQVPVSGTQGLQQIQLVPPGQIQIQGGQAVQVQGQQGQTQQIIIQQPQTAVTAGQTQTQQQIAVQGQQVAQTAEGQTIVYQPVNADGTILQQGMITIPAASLAGAQIVQTGANTNTTSSGQGTVTVTLPVAGNVVNSGGMVMMVPGAGSVPAIQRIPLPGAEMLEEEPLYVNAKQYHRILKRRQARAKLEAEGKIPKERRKYLHESRHRHAMARKRGEGGRFFSPKEKDSPHMQDPNQADEEGMTQIIRVS	230152	204863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_205859_208633_208736_209555_209730_211238_211388_212975_213082_213501_213634_217969_218117_222775_222913_230038
920792	contig_2703_pilon	+	5662	9	Intergenic	novelGene_101769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	640.881022011886	5	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	4203	4796	602068	610870	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	593949	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_594674_596351_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
920793	contig_13868_pilon	-	3795	1	Intergenic	novelGene_172658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAATTAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98437	94642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13868_pilon_-_94600_98400
920794	contig_8866_pilon	-	2310	2	Intergenic	novelGene_77827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574707	572161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_573027_573262
920795	contig_10109_pilon	+	3701	9	Intergenic	novelGene_131333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	75	junction_2	104.002403818373	82	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	214	792	210095	279594	FALSE	70	CAATGAAAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLYNHPVPKANTPINLSVNQEIFIASEQVLKDQPSLAPHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIIITSRKLSTLTACLHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFNDLSNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPISFCEESFVKHRSSLMKQFLEMAVNLQLFKQVRVDLHVFLL	200834	282503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_200892_204051_204112_207386_207441_210052_210164_233816_233918_243396_243443_248935_249038_262336_262463_279459
920797	contig_11681_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_102976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171587	172565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_171600_172600
920798	contig_5023_pilon	+	1617	11	Intergenic	novelGene_7282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	2428.21257100774	2	39	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	472	1230	611764	647201	FALSE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPAQSHPSVAHLCWPSLSLGLWSI	580858	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609729_611724_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625800_647136
920799	contig_2033_pilon	-	3958	2	Intergenic	novelGene_71549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACCAGGAGAGAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447742	413344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_-_413723_444162
920800	contig_3018_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_78805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508029	505996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_506000_508000
920801	contig_9653_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_48327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACAGTCTAATCTTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031083	1029369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1029400_1031100
920802	contig_7057_pilon	+	2298	6	Intergenic	novelGene_123388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	22.4641937313584	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	357	1793	1226227	1239048	FALSE	25	TTCTTGTAAAGATGTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMENYSNLASLDFESAHETKSLGIGKDIINNSDSQWDIMESSKSTGLENFIFRNDWQSKSNIEVQGSEVGYFSKRKIISEKVPSYKNHKYLTLLHQSIHHNEKPYEYKEYGKVFTCDSNIDEYERICTGEKTYECNECWNSFGVDDLYPIQLNIHTSMKPCKCFEYGNIFNFHEDLSEHQKIHNNEKNYKYKEYRRTFKVVGEMTSLQKIHAGEKPYECMVCGKSFRVHAQLTRHQKIHTDDKPYKCLECGKDFRFHSQLTEHQRIHTGEKPYKCMECEKVFRISSQLTEHQRIHTGEKPYACKECGKAFGVCRELARHQRIHTGKKPYECKACGKVFRNSSSLTRHQRIHTGEKPYKCKECGKAFGVGSELTRHQRIHSGQKPYECKECGKFFRLTSALIQHQRIHSGEKPYECKACGKAFRHSSALTEHQRIHTGEKPYECKACGKAFRHSSSFTKHQRIHTGETLYECKECGKAF	1197253	1239553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1197288_1221231_1221293_1224824_1224919_1225210_1225285_1226133_1226261_1237645
920803	contig_17796_pilon	-	2386	7	Intergenic	novelGene_33769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACTCCAAACTCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32143	11977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_12178_13652_13830_13905_14010_15232_15320_16867_18198_20415_20604_31843
920804	scaffold_9100_pilon	+	1120	6	Intergenic	novelGene_83253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	687.353300712232	98	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	99	347	647136	649118	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKG	644841	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649314_650406_650581_651029_651162_654578
920805	contig_10159_pilon	-	1796	1	Intergenic	novelGene_30802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAAAAATAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371196	369400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_369400_371200
920806	contig_10225_pilon	+	4973	11	Intergenic	novelGene_86772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	524.098502192097	92	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	3181	4710	42629	47494	FALSE	25	GACTTGACTTTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	20653	47757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_47355_47401
920807	contig_13295_pilon	-	1782	11	Intergenic	novelGene_31218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_10	188.605938400677	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1698	84	1781	85663	61032	FALSE	20	CCCCAGCCCCTCCAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPGATTCTEDRIQHALERCLHGLSLSRRSTSWSAGLCLNCWSLQELVSRDPGHFLILLEQILKKTREVQEKGTYDLFAPLALLFYSTVLCTPHFPPDSDLLLKAARTYHRFLTWPHPYCSICQELLTFIDAELKAPGISYQRLVRAEQGLPTRRHRSSTVTVLLLNPVEVQAEFLAVADKLSTPRHSPHSAYITLLLHAFQATFGAHCDLPGLHHRLQSKTLEELEDIFMETTDAQELASRTRDAAEARQWLRTKLQEVGEQAGFPGILDTANPGKLHTIPIPVARCHTYSWSQDSFDILQEILLKEQELLQPGVLGDDEEEQEEEDLDTDGHCAERDSLLSTSLSALRDSALSLASSQASGPAFSSQLLTSFVSGLSDGVDSGYLEDSEESSPEWPRKPGSQERRGHRRPGRKFNRIYKLFKSTSQLMLRRDSRSLEGGAAEVLPLRRAESLSSPLDCLALLPTRAQRSRSLPQSKLRAQVPRWLLAPASRHQPRRPFLSGDEDPKASTLRVVVFGSDRISGKVARAYSNLRRLENNCPLLTRFFKLQFFYVPVKRRHGTGSSA	134756	61030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_61129_61226_61933_62195_62280_63514_63669_64246_64422_67420_67491_79381_79521_80246_80316_83126_83228_85560_85677_134686
920808	contig_3525_pilon	+	3513	1	Intergenic	novelGene_135123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2882	3214	52910	53242	NA	30	AGTGGTGGCAGTGAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPWGAPLSPKSELNSKTVATLPPHLLLHPFPTPAQLTWWENVKVTGELRFCVSLLLRKAEMMSERRMGETPHSKPLCVLCRATPASSLPIPGVETRPTTEGPGGQGQG	50028	53541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_50000_53500
920809	contig_9609_pilon	+	3055	3	Intergenic	novelGene_23031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	614	junction_1	27	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAATTAGAAAGAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323032	326348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_324073_324253_324332_324411
920810	contig_7357_pilon	-	2074	8	Intergenic	novelGene_36787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1434	junction_2	1842.08258362592	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	2	1192	160025	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	160026	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911
920811	contig_233_pilon	+	2451	13	Intergenic	novelGene_14622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	123	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	334	846	78477	91651	TRUE	10	TGGGGACAGCTGCTTGCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78143	108429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91472_91677_92138_92359_93764_94016_94731_94914_98310_98454_99781_99872_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107300_107469_108396
920812	contig_6915_pilon	+	3239	2	Intergenic	novelGene_162418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2412	2816	237227	237631	FALSE	55	AAAAAAAATGGCTCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNNCKHCQANKKYGSTRENEENRIQGKDESDGLIVHSYQGLHRTESSTARRCPATTTDWSDQDHNRGLWTELEKDVEHNSNSQKKKDQIYWPKGDWRNPESTAPRHPFSSVVKTLLRFTVQPETGQPHKTKRD	234645	238054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_235025_235194
920813	contig_9345_pilon	-	2072	4	Intergenic	novelGene_24729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	63	521	1104561	1104103	TRUE	5	CCACCGCCTCCGCCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHKFGTEPRRSPVPLRAFVDMDLEGIHSREAPFVCGVHEILMLAHVAAVRQAVHELAVAVELYPGPLTHQLLLPQLQGQLQLVSGGVLLVVECVWRDFHLKVGTNPGIYPVNMVLELWRLVGLSSPGHPTGSGTDASGWGGCFQSGDGSFGGDPGHWSGCPWLLGRPASCGG	1104623	1042009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1042058_1048103_1048166_1087294_1087696_1103062
920814	contig_11304_pilon	-	3940	2	Intergenic	novelGene_156731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGGAGAGTAAGAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501657	496998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_497607_498325
920815	contig_11316_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_122671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCCTCGTAGTATAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139383	140525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
920816	contig_5059_pilon	-	3825	15	Intergenic	novelGene_140745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCGATGGGAGGAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507115	408659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_408856_414311_414694_420161_420940_431283_431445_443418_443618_459478_459630_465490_465594_472835_472922_486532_486648_493603_493712_495904_496023_500138_500324_502767_502972_503478_503754_506351
920817	contig_5317_pilon	-	754	3	Intergenic	novelGene_76552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	200	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCTTTGTACGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43688	35301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_35408_36682_36839_43196
920818	contig_5649_pilon	-	3732	14	Intergenic	novelGene_82353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	23.5997191839676	110	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1242	2144	888054	881419	FALSE	45	CTAGCAAACCACCGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSSVEVDTVHKHYLTFLSYVGCVFSALACVLTITAYLCSRRKPRDYTIKVHMNLLLAIFLLDVSFLLSEPTALTGSQAGCHASAMLLHFSLLACLTWMGLEGYNLYRLVVEVFGTYVPGYMLKLSLVGWGFPIFLVTLVAVVDVNNYGPIILAVHKTPERVIYPSMCWIRDSLVSHITNLGLFCLVFLFNMTMLGTMVVQILRLRPHAQKWPHVLTLLGLSLVLGLPWALVFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGLLIFLWYWSMRLQARGGVSSSLKSSSDSARLPISSGSTSSGRI	925329	879830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_881553_882514_882784_883727_883837_884921_885191_887087_887207_888051_888156_888366_888413_888588_888706_889053_889186_889811_889960_890671_890806_892293_892717_893244_893341_925285
920819	contig_10225_pilon	-	4011	4	Intergenic	novelGene_86843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGGGGCCATTCTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41811	34791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_35784_37030_37144_38520_41051_41435
920821	contig_1435_pilon	-	3954	2	Intergenic	novelGene_115490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	57	junction_1	0	123	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAAGCGCCAGACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	491588	487440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_488944_489137
920822	contig_14687_pilon	-	2604	1	Intergenic	novelGene_107956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAGAATTCAAATTTACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604226	601622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_601600_604200
920823	contig_12810_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_145694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTAATATTTGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265674	263377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12810_pilon_-_263400_265700
920824	contig_12619_pilon	+	2776	1	Intergenic	novelGene_73577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	406	867	880690	881151	NA	70	AAAAGAGAAAGATATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILSKAIYRYNATPIQIPMSFFKKMKEQITNFMWKGKRPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYDTATVVKTTSYSYDNRYIHQWNRIENPDVNSPTYEQLVFDKGPNSVNCGKDKLFNKWCWHNQISICKKLKQDLYLIHHAQKLTQNASKT	880284	883060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_880300_883100
920825	contig_16578_pilon	-	1333	2	Intergenic	novelGene_148648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAATCAACGGTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174514	173083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_173511_173608
920826	contig_13481_pilon	-	2786	1	Intergenic	novelGene_119537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471531	1468745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468700_1471500
920827	contig_12485_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_147284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCTAAAGGTTGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123843	126372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_123800_126400
920828	contig_10711_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_118463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTAGTCTTTGAGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882327	881180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_-_881200_882300
920829	contig_14925_pilon	-	1495	6	Intergenic	novelGene_55297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	4	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	80	493	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129480	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113037_113217_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
920830	contig_12277_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_139686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228762	228179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_228200_228800
920831	contig_8167_pilon	-	2882	8	Intergenic	novelGene_155655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	15.507733422985	22	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	458	1021	148855	143912	TRUE	20	ACTCACGTCACAGCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLITSMAVLPLLFGCVGIFSLFKLLQRMRMKAYLQDAVVVITGATSGLGKECAKVFHAAGAKLVLCGRNREALEELTRELAAPRATKWPLPGPVTQKMSLVSAVFDQVKTHKPYMVTFDLADPGAIVAATAEILQCFGHVDILVNNAGISYRGTITDTTVDVDKRVMETNYFGPVALTKGNDLVLK	180440	136361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_137452_139852_140006_143293_144212_144937_145048_148701_148881_157058_157231_166300_166379_180258
920832	contig_8060_pilon	+	2615	1	Intergenic	novelGene_104832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGATTACAGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196996	199611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_197000_199600
920833	contig_11948_pilon	-	5597	1	Intergenic	novelGene_174382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCATTATAATTTTAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136991	131394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_131400_137000
920834	contig_18869_pilon	-	2106	2	Intergenic	novelGene_55980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	438	923	52984	52499	FALSE	15	TGTTCTTTACTTGATCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	59520	51315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_53330_59428
920835	contig_7345_pilon	+	1851	1	Intergenic	novelGene_159172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTCATGACACATTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110361	112212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_110400_112200
920836	contig_6576_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_42248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302419	303665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_302400_303700
920837	contig_10892_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_116737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAATAAAAAACTAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71231	72939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_71200_72900
920838	contig_20641_pilon	-	1931	6	Intergenic	novelGene_52826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGAAGAGGTCCGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86663	14536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14644_14717_14770_16768_16914_45846_45962_54832_54966_85284
920839	contig_14441_pilon	+	1025	6	Intergenic	novelGene_100569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	445.837190014472	561	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	248	985	125164	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREGKDVTGSQDRDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111387_121192_121239_125152_125204_125517_125902_126159_126283_126514
920840	contig_6374_pilon	+	12055	17	Intergenic	novelGene_158435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	605	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	10784	11251	149028	175495	TRUE	65	AAAGGAAAAGAAAGCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFMVALVLFSSSSLLHSMAVRLSFSSLSPASSFSHRERSSARLGYRSRPSTPSISSTVLIAKSQCSLAVVSCSMCLSTSATERLQLLFFLPQTTLSNPVKTLCSSEFRSLQLSHVSSDHGGLVFGDGDRGLVLVHASRVLIDLVLALAELRPQF	61286	395014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_70559_72251_72373_89993_90094_95008_95216_100574_100811_114733_114917_118202_118308_122126_122268_127618_127770_129276_129366_130350_130496_148994_149204_151228_151395_175369_175511_190197_190342_207634_207751_394485
920841	contig_14450_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_48988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCGGGTTTACGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048181	1050365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1048200_1050400
920842	contig_20779_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_112369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAAACAATAAGCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106097	109568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20779_pilon_+_106100_109600
920843	contig_13625_pilon	-	2228	3	Intergenic	novelGene_150161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	5	43	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1185	1613	29659	27060	FALSE	65	ATTAAAAAAAAAAACCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQMVAAQLASMVWNNPSQQQFLQFGGSSGSQLPQIQTDVVLPSCKKKAPPETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAITTLHGKILNGVRLKVMLADSPREESNKRQRTY	30843	26444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27253_28833_28998_29587
920844	contig_7359_pilon	+	2703	9	Intergenic	novelGene_139876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.0204990580962	8	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	60	1034	414164	423877	TRUE	5	CTGTGTGGTTTCTATCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAKSQPSAPKTKSPGSVSNGTAASQGQWGRAWEVDWFSLASVVFLLLFAPFIVYYFIMACDQYSCSLMAPVVDIVTGRAHLSDIWAKTPPVTKKAAQLYSVWVTFQVVLYSLLPDFCHKFLPGYVGGVQEGAVTPAGVVNKYEINGLQAWLITHLLWFANAHFLFWFSPTIIFDNWIPLMWCANILGYAVSVFIMVKAYLFPTNAKDCKFTGNFFYNYMMGIEFNPRIGKWFDFKLFFNGRPGIVAWTLINLSFAAKQQELYGRVTNSMVLVNILQAIYVVDYFWNETWYLKTIDICHDHFGWYLGWGDCVWLPYLYTLQFCC	402218	425668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7359_pilon_+_402272_414157_414262_415308_415532_416422_416514_417644_417859_421711_421917_423580_423713_423865_424070_424191
920845	contig_6048_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_73244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATTTCTCAGCATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1905985	1904012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1904000_1906000
920846	contig_18850_pilon	-	1723	7	Intergenic	novelGene_142440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	181466	181095	TRUE	60	GGAAAAGATAAAAAGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LERDLPRLAGVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181468	177027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178390_178649_178946_179146_180513
920847	contig_6102_pilon	+	1800	15	Intergenic	novelGene_32356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	69.0997873531091	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1785	16	1800	1699217	1714574	FALSE	40	CTGATGGATGAAGTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVRGEMRLFVSEGAPGTLSVLAAARRARERAELLISTVGPEECVVPFLTGPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEAMELQPALSAALYYLVIQGKKGEDVLGPVRRALTHIDHSLNHQSCPFLTGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALRSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGALALRPYLQKQPQPRPPEGRSVSNEPEEEELTTLSEEEIAMVVTAWEKGLGSLPPLQPQKNPVLPVAGEKNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAMEEGLTPKEICDKYHAIHADIYRWFNISFDVFGRTTTPQQTKITQAIFQQLLARGFVLQDTVEQLRCEHCSRFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKKPQCKVCRSCPVVKSSQHLFLDMPKLENRLEEWLGKTLAGSNWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVWFDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCTALGTEAKTSPKPAVVETVTAAGPQQIQM	1699201	1714574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1699326_1700335_1700427_1700614_1700694_1700771_1700907_1701241_1701318_1701572_1701746_1701907_1702015_1703144_1703262_1703407_1703612_1704607_1704810_1706545_1706621_1710798_1710970_1711137_1711234_1711374_1711456_1714505
920848	scaffold_13505_pilon	+	3255	3	Intergenic	novelGene_111549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	13.5	56	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2152	2502	601239	601589	TRUE	10	ACCTCTGTGGCTGAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTFLWGLLNSPGQSGNGLEHIATCGLQIESQVKDSAVQNSSWGAALAGDSCRSSRTPAVSKLFLPVRPVLEAKIQLWLQAPQVPLESGGLGQGLGKELPGADLLCEDTRGPQVRV	597406	603277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_597531_599211_602237_603171
920849	contig_7915_pilon	+	3205	13	Intergenic	novelGene_42972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	96	junction_12	162.408157806873	81	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	650	1953	793	2745	121126	137758	TRUE	15	CTTGGGTCTATCATCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCFCLLELKNILDMLQLENNELQGLKLQHDQKVSELEKMQVEVLEEKLELENLQQTAQRQKGEIEWQKQLLEKDKREIERMTAETRALQVCMASLSKEKEDLEEKCDSWEKKLAQTKRVLAATEENSKMEQSNLEKLELSVRKLQQELDQLNRDKLSLHKDILVMQQQLQEKREEVNTLQEELAHVQDHLNLAEQDLLHTAKHRDIQLSEQTRLQKDISEQKKKFEDCQKEGETKQKQLQVLQNEIEENRLKLVQQEMMFQKLQKERESEEEKLEASKMTLKEQQQQLEKELTDQKSELEQVLTKVSVAEEHVKTLQEEKRWNETLEKTLSQTKQQLSEREQELMEKSSELLALQKEMDSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQIATLKEALKTQRSQLEKNLLEQKQENSCMQKEMATIEQVAQDNHERARRLMKELIQMQHEYMELQKQMANQKDLERRQMEISEAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQCLPELPAELEGIFERNENLEGELESLKENFPFTMNERPSPFEEKLNFSQVHIMDEQWRGEALREKLRHHEDRLKAQLRHCMSKQAEVFIKGKQQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSIDSTSLSPSLSQLESSLADDFQHGQSQSSFHQVLPSPSESDICLH	120333	138425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_121264_121345_121564_123136_123295_124358_124433_125539_125729_126153_126380_128202_128409_129868_130010_133645_133919_134106_134170_135458_135669_137701_137785_137991
920850	contig_7164_pilon	-	1439	1	Intergenic	novelGene_172137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGCCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459949	458510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_458500_459900
920851	scaffold_12124_pilon	-	2566	6	Intergenic	novelGene_22425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	23.2465051136725	40	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	386	1021	1649803	1644956	FALSE	40	CATAAATGTCTCTACTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETFRNLDSIVSGTLNDGERLSTEPTMMQLMKNNTWSSMLVEISESHGNKDQYKNQGRYLRSHTKENLCESEGSQCGKAFSWIPNLTGLKRNPLECRECGKAFMDHSACNHHTRSFTGCNACQYKECGEACSSLSHLTTTMRTLNGKKPHKCQVFSIIVDHMHLLHILISENHWIRDMIIFMTSERRIESTLRMKRWKNYMTVGFNLIME	1663903	1643410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1645130_1647117_1647395_1648064_1648216_1649769_1649897_1659676_1659908_1663842
920852	contig_10937_pilon	+	3219	1	Intergenic	novelGene_67325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCGAAGTACAATATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136495	139714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10937_pilon_+_136500_139700
920853	contig_9373_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_162740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	262	576	400794	401108	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPMEAAVKRCIALGKYAAKDFFQVLESKDVTLRTKVHLTQAMVFSITSHAYKSWTMNKEDRKRINGFELRCWQRILTPPWTARRMNKSVLEEVQPECSLEGRIV	400532	402741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_+_400500_402700
920854	contig_17075_pilon	+	1928	3	Intergenic	novelGene_131761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	709	1038	121926	122255	TRUE	30	GCAGAGGGGAAGAGAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLAQIKKAGNNKCWRGCGEIGILMPCWWECKMIQPFWKMTWRFLRKLEIEILYDPAIPFLGIYPRERRVITSGQPGTDTATDT	99821	124220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_99888_121283_122623_123697
920855	contig_15092_pilon	-	2360	1	Intergenic	novelGene_57779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATACTACTCAGCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308933	306573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_306600_308900
920856	contig_10042_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_79254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	134	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	119	643	1211084	1210560	NA	10	TTCTTTTTTTATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGSKWSVKYLGLRDGLDTEGEGAGAVKDSGLYNWTDSWMGPFNIWCLKVRKNQWGFGHADFEVPVIHLWSPGGTVVKSSAANQKVGSWNPPAAPWKPYGGSSALSYRVTMSRNRLDGSGSTGDSSKRQAGGAQRRGLSWRYAFAVLPNNRQTLPGQAKIERHPKDALTFMCNLAFVNKLKVVCRFDSGPSGTSPFNFSRHKRRWARLQKQNQ	1211202	1208997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1209000_1211200
920857	contig_3123_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_162979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186277	184042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_184000_186300
920858	contig_5935_pilon	-	2313	1	Intergenic	novelGene_102775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAATAAAAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1419382	1417069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1417100_1419400
920859	contig_8879_pilon	-	3124	2	Intergenic	novelGene_158999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACTATACATATATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422205	418651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8879_pilon_-_421698_422127
920860	contig_3153_pilon	+	3634	3	Intergenic	novelGene_104707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_1	41	63	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	474152	474463	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPGLGAAATAGARARAFWTSVKPPRAPSSGARGVCGDCCCQGCGPGCHLLLLLGRLLLFLLLLGRAVPPPRSRLLLGRAAVSRPLAELLQPPPPLLIHPRAP	474149	539630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_474542_520569_520652_536470
920861	contig_5944_pilon	+	4019	2	Intergenic	novelGene_178304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	2702	3184	192691	193173	FALSE	25	AGCCCCAGCCGGGGCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVACPNVAPQPRRKGPRRLSESGSRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKREKKKATPAAYKRHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRILACAAAQTWKQPHTRT	189747	194008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5944_pilon_+_190069_190310
920862	contig_3414_pilon	+	3402	7	Intergenic	novelGene_80963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1737	2051	67134	70789	TRUE	45	TCCACTATCTGAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLKTRRKEVTVLIFKATECILHIFKKLCVVSLDLCLAIFHWILEFHGGKFIEDLPHVLTDNGPCDFIVTLGSGFNSSTGHIIKRNHVGQHSYCLVEWAEPRS	64958	79224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_65411_65849_67265_69035_69214_70783_70875_71146_71442_76899_77097_78450
920863	contig_19185_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_163666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCAGCAGCAATGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168038	169702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_+_168000_169700
920864	contig_15146_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_116958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTATAAAAGTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557229	554523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_554500_557200
920865	contig_7398_pilon	-	1939	1	Intergenic	novelGene_166175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAATCATGAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266229	264290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_264300_266200
920866	contig_6048_pilon	+	2867	1	Intergenic	novelGene_73320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGAAATATTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2113182	2116049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2113200_2116000
920867	contig_7720_pilon	+	3130	17	Intergenic	novelGene_155729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	66.7696600260927	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	34	1716	164847	238168	TRUE	50	AAAAAAACAAGTCTCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATALSEEELDNEDYYSLLNVRREASYEELKAAYRRLCMLYHPDKHRDPELKLQAERLFNLVHQAYEVLSDPQTRAIYDIYGKKGLEMEGWEVVERRRTPAEIREEFERLQREREERRLQQRTNPKGTISVGVDATDLFDRYEEEYEDVSGSGFPQIEINKMHISQSIEAPLTATDTAILSGNLSTQNGNGGGSINFALRRVTSAKGWGELEFGAGDLQGPLFGLKLFRNLTPRCFVTTNCALQFSSRGIRPGLTTVLARNLDKNTVGYLQWRWGIQSAMNTSIVRDTKTSHFTMALQLGIPHSFALISYQHKFQDDDQTRVKGSLKAGFFGTVVEYGAERKISRHSVLGAAVSVGVPQGVSLKVKLNRASQTYFFPIHLTDQLLPSAVFYATVGPLVVYFAMHRLIIKPYLRAQKEKRELEKQRESTATDILQKKQEAEAAVRLMQESVRRIIEAEESRMGLIILNAWYGKFVNDKSRKNEKVKVIDVTVPLQCLVKDSKLILTEASKSGLPGFYDPCVGEEKNLKVLYQFRGVLHQVMALDSEALRIPKQSHRIDTDG	164813	239643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_164919_188254_188385_190684_190759_196990_197093_215025_215155_216144_216268_217282_217357_220310_220501_221166_221253_221648_221766_231415_231572_232812_232886_233778_233837_233960_234104_234824_234955_238142_238793_238853
920868	contig_9484_pilon	+	2303	10	Intergenic	novelGene_105613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	481.331127521364	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	130	1380	97159	103702	TRUE	5	CTTGGTGGTGGTTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPVSPEAAAVQLLSEERLQRCCPCALLRPWPAPFLGEPGWSPEMLLGHPSLLQGTSMPLTLVFRRLGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYCELCFIWSSSYCMLRSGNTT	95788	105097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_104412_104883
920869	contig_11378_pilon	-	1695	2	Intergenic	novelGene_112260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAAACCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385821	384046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_384422_384501
920870	contig_960_pilon	-	1999	2	Intergenic	novelGene_108238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	11	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444608	441737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_442106_442977
920871	contig_6677_pilon	-	3009	6	Intergenic	novelGene_114226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.63033476111609	48	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	466	1785	702261	690102	FALSE	30	GAGACAGTTTTTAACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGITHTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGDWDINNPLASSVIYDEQSPFPPSSHSASIFEESHVPVTEESLTRVQICEKAEELKDIVPEKKSTLNENLSEIKHQCVVQKNVNKRDPPNSHEHSGKKNLLKVENGVTRRGRSASPKKSANRYSEEHLEKIPGPLKNDPKRRPRERSLSPRKGENRSCQVSTREGSGQDHCRRGRGRSSSPRKQQKSEGSKDQPNADARLLEGEIRRAGGRASDNAEQIQDGKEKSGVIRKDIKQSQSGKNRTGSPEKKSKRLDEKSLPSKKANNTISRVVSENEKGKKATLGEISSSKDKIGENVKISEKKLKQEPEERTILNKIEDHKGKELEAADKNKEDGGLKPESSSPVKKTPITPGPWKVPSANRVTGTGVAEKRL	716624	688877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_691220_693030_693170_702198_702344_702952_703077_703868_703972_716468
920872	contig_5041_pilon	+	4395	2	Intergenic	novelGene_27111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTAAAATTGGTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595851	600290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_597378_597421
920873	contig_3956_pilon	+	1391	7	Intergenic	novelGene_14883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1473.82129928368	1	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	84	632	1281682	1286425	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284198_1286419_1286606_1287276_1287368_1290527
920874	contig_9345_pilon	+	1858	2	Intergenic	novelGene_24526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGGTTGCTATGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694195	703842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_695405_703193
920875	contig_7452_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_109158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAATAATAAGAATTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178198	180517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_+_178200_180500
920876	contig_5696_pilon	+	2397	1	Intergenic	novelGene_117588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTCTTACAACTTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747909	750306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_747900_750300
920877	contig_11505_pilon	-	3749	3	Intergenic	novelGene_140912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	33	329	67837	67541	TRUE	65	GAAAGGAAATAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPSDWKRSIFMPIPKKGDPAEYGNYQTISLISHASKIFLKIIQKRSQQCMDRELAEIQSGFRRGHETRDIVADVRCILAESREYQKDVYLYFFDYARAFDLWIITNYG	67869	3701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_4358_5122_7524_67177
920878	contig_10074_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_57119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313345	315355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_313300_315400
920879	contig_5817_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_169577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTCTGTAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33924	31523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_31500_33900
920880	contig_8563_pilon	-	4342	3	Intergenic	novelGene_178613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1975	3024	4464	3415	FALSE	40	TTTATAGCAATAGATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	197995	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8563_pilon_-_4514_4608_5098_196559
920881	contig_10779_pilon	-	3108	4	Intergenic	novelGene_165510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCCACGGGGAGTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11466	4496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_-_4518_4754_4914_8317_8521_8741
920882	contig_854_pilon	+	1261	8	Intergenic	novelGene_36246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2370.13886616332	4	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	427	783	557096	562402	TRUE	30	ATCTGCCCAGCCAATCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAGGPEGGTSDFSPAPGHAQWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543492	563585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557155_557584_557752_562271_562405_563029_563257_563336
920883	contig_11304_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_156726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	906	1310	466145	466549	NA	65	TTTTATTAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGSRGLSSKGRNTSTWRYNMDSIALEVKNATRPSWAPHASGSTGKEGVIVLAGVIDRDYQGEIGLVLLNGGNEEYIWNTGSPSGCLLLPPYSVIKVNGKLQQPNSDRSTIGPDPSGMKIWVTLPPRQRTTTS	465239	467607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_465200_467600
920884	contig_2726_pilon	+	3716	8	Intergenic	novelGene_165891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_3	263.547230790124	96	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	555	3160	3714	176473	187134	FALSE	30	ATATGGCATTTTGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAPSFERGVYELTHNNRTVSLKTINAVQQMSLYPELIASVLYQATGGIEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQVAALTGYLKSNLNTYTERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDSFSLEQSDK	163944	187136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_166829_173744_173870_174716_174804_176409_176501_176771_176894_177010_177157_186427_186552_186999
920885	contig_10163_pilon	-	2419	2	Intergenic	novelGene_82668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359648	356640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_358603_359191
920886	contig_2830_pilon	-	1496	1	Intergenic	novelGene_165858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTTTTTTAAATTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710710	709214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_709200_710700
920887	contig_7009_pilon	-	2916	2	Intergenic	novelGene_23599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAGCACATATTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422210	419160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_421870_422003
920888	contig_9653_pilon	-	3982	26	Intergenic	novelGene_48218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	5	94	junction_25	490.829638876871	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1115	3348	126	3473	544351	509213	FALSE	10	CTTGTTACTTTCAGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVKYFTFSFPQSITIEE	544476	508703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_509456_509787_510001_510109_510358_510931_511041_511526_511635_512397_512557_513575_513728_516115_516269_519305_519457_522053_522196_522561_522723_523155_523256_523437_523542_527409_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_530278_530455_531409_531528_533720_533800_534075_534156_534527_534600_536416_536485_536837_536877_543009_543086_544336
920889	contig_9177_pilon	+	3304	25	Intergenic	novelGene_32618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	153.058398214175	6	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2088	2441	20739	21379	TRUE	20	AAGGTCCCTGTCACCTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTWEWISCFDSSILFLRQALDAASWPRGGRVSKSSRVAWAACTACMLELMVPVSACWAEVKGGMCPRCIWPLVICCWAGGMLPIWKFSGPEAPERMMAGRATEPCSTFPMRLYCC	14032	25404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_14089_14296_14417_14810_15020_15162_15267_15424_15553_15704_15844_16051_16170_16268_16379_16549_16678_17437_17611_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20483_20705_20809_20907_21023_21210_21390_21607_21689_21866_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696_24824_24930_25075_25327
920890	contig_20819_pilon	+	3498	3	Intergenic	novelGene_55649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	389	77	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	67	534	36841	40553	TRUE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDPVQSRQRGVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYRECRGRGPHG	36774	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_36878_40122_41210_41309
920891	contig_16260_pilon	-	1932	1	Intergenic	novelGene_177141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGTTGAAGCTAAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3679	1747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16260_pilon_-_1700_3700
920892	contig_6410_pilon	-	2909	5	Intergenic	novelGene_108628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTCACTCTGCCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309411	299814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_299909_300669_300772_301579_301637_306342_306394_306806
920893	contig_7870_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_109089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTCATAGTGAGGCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	810809	812665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_810800_812700
920894	contig_9325_pilon	-	3127	1	Intergenic	novelGene_158813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAATGGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29027	25900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9325_pilon_-_25900_29000
920895	contig_7942_pilon	-	1642	6	Intergenic	novelGene_155323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	441	junction_3	63.3390874579039	44	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	460	1512	28411	3882	FALSE	15	TGTATCCACTTGTGCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKIEITVEPSQRPGTAINRSPSPISNQPSPRNQHSLYTATTPPSSSPSRGISSQPKPPFSVNPVYITYTQPTGPSCAPSPSPRVIPNPTTVFKITVGRAATENLLNLVDQEERSAAPEPIQPISVIPGSGGEKGSHKYQRSCSSGSDDYAYTQALLLHQRARMERLAKQLKLEKEELERLKAEVNSMEHDLMQRRLRRVSCNTAIPTPEEMTRLRSMNRQLQINVDCTLKEVDLLQSRGNFDPKAMNNFYDNIEPGPVVPPKPSKKDSSDPCTIERKARRISVTSKVQADVHDTQATAADEHLTGSKPSPRTQPRDEDYEGAPWNCDSCTFLNHPALNRCEQCEMPRYT	28870	3751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_-_4031_9267_9370_17724_17809_21041_21136_26902_27064_27948
920897	contig_5196_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_38688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGACGCCACTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235297	236692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_+_235300_236700
920898	contig_18194_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_55960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	242	729	428	1156	5370	4642	NA	75	AAAATAAAAATTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	5797	4095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_4100_5800
920899	contig_7396_pilon	-	1894	17	Intergenic	novelGene_79605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3207.71838451804	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	119	958	255163	248600	TRUE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYEVVLTGCLLVGVDVPCLLLLEEVAGVVAELGIFLFLHHHRLEEEI	257472	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_248832_248882_248934_249003_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
920900	contig_1154_pilon	+	2237	2	Intergenic	novelGene_87109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	717	1037	394827	395147	TRUE	50	AAACAAGAAGCTAGGACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDISQAERPEKKNSSLKLAVLKYSMGKILNNTGSIKRRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEVAYDQEPMVLKALAKNKPPGINRIPIEMFQQTDATLEAPTRLCQEN	394110	404984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_396233_404869
920901	contig_12050_pilon	+	1853	1	Intergenic	novelGene_62780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	299	661	945203	945565	NA	40	TAGGGTGCCAAAAATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTAISHWSPGSSHLVCCHWLLCYSFLCLLNLGGFQCGDPGSKGCAPLLAPLFLIVVRSSLPASGMAHFKPSRMAILANPLVRVSSTPTRVPCTSFTLRWATSTSFAQPNPVIWWELQR	944904	946757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_944900_946800
920902	contig_12543_pilon	+	6514	5	Intergenic	novelGene_168388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_3	38.4472040595932	68	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	594	1785	217	2001	391336	399020	FALSE	25	GCTACTATATTATGTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTFKESMTFKDVAVVFTEEELGLLDSDQRKLYQDVMLENFRNLVSVGGQIQSEMETAPDARPCDALSCWQIWQQSTSDLTRCQGPVINNSHFYKQNDLACQIRAGPSIIHTGEKAYQCNECTETFSDVSSFDLHQRLHSGEKSHTCNECGKSFRYSSVLHIHQKVHVGEKCCKCDECKKEFSQSSHLQTHQKVHTVAKPHKYEACGKGFHSRFALNVRCKVHTGQKPYNCEECGRAFVYASHLREHQRIHTGEKPFKCDECGENFRRRSTLNIHYMLHTGEKPYKCAECGKDFRQSAGLRTHQRIHSGEKPFICEVCGKNFIQRSHLRSHLGVHTTERPYKCVLCGKSFMMKYNYEFHLVVHTGDKPYKCEVCGKRFSRRGDYNIHCRIHTGVKPYNCEECGKDFSRRSALKVHCRVHTGEKPYNCEECGKCFIRRSELNVHCKVHKGEKPYNCEECGRAFIQASRFREHQRIHTGEKPFKCDTCGKNFHLKSTLYNHCKIHTGEQPYKCEECGKGFNFPSKLYVHKSVHTGEKPYNCAECGKHFSRGSYLRKHQRVHSGEKPLKWEEWKEIWSEFSPSVPSEGSHWRKAIQI	386619	403533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_386718_387512_387585_391289_391351_393838_393966_397377
920903	contig_34_pilon	-	2635	2	Intergenic	novelGene_40049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4888	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATGCCAATTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247104	240852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_243354_246970
920904	contig_1107_pilon	+	718	1	Intergenic	novelGene_126608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACAGACTTGCTGAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1182315	1183033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_+_1182300_1183000
920905	contig_6227_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_49809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	232	543	1306880	1306569	NA	45	CCTAAGGTCAGAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCANEVAVAYYADDVSVAYQEGIAQFMAPGGKGPALKLTRSCVYMQPTPQRFFRQKRQEEKQKEERRENEEARKLLKQLKHGSRAVTLKTARDPEGALRQSW	1307111	1305645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1305600_1307100
920906	contig_12605_pilon	+	532	4	Intergenic	novelGene_64175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1894.37312997085	71	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	504	29	532	3897	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIERDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3868	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4422_5835_6005_6124
920907	contig_5718_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_110387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTACATTATAAACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1219108	1217774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1217800_1219100
920908	contig_8248_pilon	-	2475	1	Intergenic	novelGene_125028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175160	172685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_172700_175200
920909	contig_5928_pilon	-	5391	6	Intergenic	novelGene_40351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	169	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	4273	4704	262730	262299	TRUE	35	ATGGATTGACACAGTAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDAALEALTCLCQEIWTTATWPINWKRSIVVPIPQKGDPTKCRNYRTISLISHTSKILLKIIQKRLQQYINREVSEIQARFRRERGTREIIIDVRRILAKSREYQKDVDLCFIDYAKALDSVTHNKLWITLQRMGISEY	350389	139044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_139696_262262_262936_263040_263572_290480_291240_347535_349941_350017
920910	contig_9871_pilon	-	523	3	Intergenic	novelGene_75654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	27	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGGATGTAGAGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398910	397330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_397683_398508_398627_398857
920911	contig_10904_pilon	-	3843	6	Intergenic	novelGene_22759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	286.17966384773	91	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	383	1246	662171	658096	TRUE	25	TGGCATTTTTCAAGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSDSYFIHSML	662774	654743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_655261_656015_658125_660333_660634_661462_661763_661936_662445_662665
920912	contig_4426_pilon	-	5623	2	Intergenic	novelGene_15355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	553	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3748	4080	40117	39785	TRUE	40	GCTGAAAGAGAAAAGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVKLSGPSFADVAQLKMRRNSYKHPLIIRTWNVQSMNLGKLEVVKNEMERLKIDILDNSELKWAGIGHFESGNHMVSSAGNDKLKRNVITFIIKKNILGICPEVQRCQ	43864	37955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_38850_39135
920913	contig_7019_pilon	+	2206	2	Intergenic	novelGene_149447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAAGTTCATAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	479512	481812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_479714_479807
920914	contig_8636_pilon	-	774	1	Intergenic	novelGene_141906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGCTGTGTATATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300018	299244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_299200_3e+05
920915	contig_15939_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_160259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTCTAAGACGGGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102571	101331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_-_101300_102600
920916	contig_9839_pilon	-	1853	2	Intergenic	novelGene_88534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAACATAAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64650	62381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_63354_63769
920917	contig_7051_pilon	+	2474	6	Intergenic	novelGene_64362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	994	junction_3	120.751977209485	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1338	1135	2472	338727	347604	FALSE	80	AAGAAAAGAGAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKGEAKEQERKKERSRSIDRDRKKKDKEREREQD	337592	347606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
920918	contig_1443_pilon	+	2844	1	Intergenic	novelGene_28369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATCTCTGTATTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	973847	976691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_973800_976700
920920	contig_3095_pilon	+	1259	5	Intergenic	novelGene_74970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	79	843	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147162	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
920921	contig_18415_pilon	-	3962	2	Intergenic	novelGene_118314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1758	2078	29203	28883	TRUE	55	CTTAAAGCATTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPPAAFFNETEKQITNFIWKGKRPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTTTVVKTTWYWYNNRHTDQCNRIENPHVNSSTHEQVVFDEGPKSINWGKDSLFNK	30960	26908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_-_27788_27877
920922	contig_3866_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_112420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCAATATCAAAATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225390	227917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_225400_227900
920923	contig_5279_pilon	-	1375	8	Intergenic	novelGene_105564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	410	junction_5	251.974893469122	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1227	147	1373	353138	322496	FALSE	65	TAAGAATTAAAAACTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKTSFKSKKLDSEIRPKKDSKEFAQKGTKEKEDIVQRSTDDFPKGKLKMVSLDITEVKSPKVKCSETRRKIQSGDGYENSTGGKMFDEDSLEEHSENASEMEDDEESEDEITGVGRASDDDDDDHESEGDEDEEDKDEDGEDDESDSGPDLARGKGNIETSSEDEEDEDFLPEESGFEHAWRELDKDAPQTNEITRRLAVCNMDWDRLKAKDLLALFNSFKPKGGVIFSVKIYPSEFGKERMKEEQVQGPVELLSIPEDAPEKDWASREKLRDYQFKRLKYYYAVADCDSPETASKIYEDCDGLEFESSCSFIDLRFIPDDITFDDEPKDVASEVDLTAYKPKYFTSAAMGTSTVEITWDETDHERITTLNRKFKKEELLDMDFQAYLASSSEDEEKIEEELQGDDGINAEEDGKTKKSQKDDEEQIAKYRQLLQVIQEKEKKGKENDMEMEIKWVP	353284	322493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_-_322657_330139_330288_332950_333066_335222_335376_336363_336465_339168_339283_339885_340245_353062
920924	scaffold_12124_pilon	+	2643	2	Intergenic	novelGene_22389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4737	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	674	1453	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1506628	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1506687_1508010
920925	contig_5062_pilon	-	4678	3	Intergenic	novelGene_157854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2844	3152	696646	696338	FALSE	35	AGGCAGGAGGGAACGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPATIKTEMQKERDGMVKSVLESILPWKDSPDRACKQLKKACLGLNIFHGKSTKQSWKTGLYIQDEVTYFSSLYSPSCFSPPRRIMSCKDFFLSTIFLPRC	857115	694811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_697346_777672_778170_855468
920926	contig_13496_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_107661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTCTAACTCACTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472729	471399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_471400_472700
920927	contig_4783_pilon	+	3724	1	Intergenic	novelGene_108374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATACTGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172345	176069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_172300_176100
920928	contig_11744_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_176852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112461	110438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_-_110400_112500
920929	contig_3077_pilon	+	1736	8	Intergenic	novelGene_26684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1792.01159343917	214	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	562	1245	13867	17590	FALSE	20	AACAGTGTGCGGCACTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9672	18081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11760_13846_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
920930	contig_8964_pilon	+	3556	1	Intergenic	novelGene_168697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTCTGTAATCTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538297	541853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_538300_541900
920931	contig_5039_pilon	+	3548	4	Intergenic	novelGene_64957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2065	2376	1655337	1657739	FALSE	20	AGTTCATTTCCTGCATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRATIMDQEKFRWLPPSLITDFHQGRHRMFACRSFIAAEKFPDLFCALSPTATRPFRSVLKSTRIGSLLPSLFFPNPSPSLQPIFLIKTAPIPPVTGAALKN	1652791	1658911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1654832_1655312_1655438_1655545_1655609_1657591
920932	contig_15236_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_141676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAGAAATGAAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763747	765955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_763700_766000
920933	contig_10930_pilon	+	2649	8	Intergenic	novelGene_37008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1863	2204	276899	279337	TRUE	50	GCAGAAGTTGGAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSSSWKHFIWLP	267439	280341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_272833_273013_273952_274324_276722_277013_278443_278637_279302_279470_279702_279834_280159
920934	contig_401_pilon	-	5093	30	Intergenic	novelGene_42908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	375	35	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACAATGCGTGATCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1975740	1929673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1929803_1931103_1931216_1931937_1932031_1938753_1938812_1939252_1939395_1940367_1940460_1940550_1940690_1941957_1942009_1942104_1942270_1944523_1944622_1945190_1945310_1945464_1945593_1946397_1946749_1946934_1947080_1948360_1948493_1948787_1948908_1952091_1952240_1952522_1952651_1955784_1956011_1957521_1957646_1960854_1960950_1961062_1961162_1961319_1961402_1961680_1961761_1964449_1964544_1965464_1965583_1966090_1966203_1968751_1968846_1972806_1973760_1975074
920935	contig_1725_pilon	+	3292	1	Intergenic	novelGene_24254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	92	427	201480	201815	NA	15	TTCAGTTTTCAGAGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKVLGGAGRGGAGGVSSPAPAEPPLPWGPEGP	201388	204680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201400_204700
920937	contig_3015_pilon	+	3625	2	Intergenic	novelGene_163307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTAATCTCTGCAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44458	48133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_44508_44557
920938	contig_6360_pilon	-	1033	1	Intergenic	novelGene_165875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	5	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_0_1000
920939	contig_755_pilon	-	1634	1	Intergenic	novelGene_119770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84661	83027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_83000_84700
920940	contig_5935_pilon	+	5400	1	Intergenic	novelGene_102704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGATTCCTCCCCACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955491	960891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_955500_960900
920941	contig_19604_pilon	+	2661	5	Intergenic	novelGene_77240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	300.653454994284	33	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	360	764	273206	273921	FALSE	15	ACAGCAGGTCTCCTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEIRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGKFSPALTRGDTVCPSLGLMGRASGYQPLLTEAMDAASCPSEAADPHQVQGDEEGVPQHPAVHHCL	269898	275818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273689_273833
920942	contig_8980_pilon	+	2881	17	Intergenic	novelGene_73992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	41.6379015291357	74	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	29	1492	2011	70763	TRUE	50	AAATAGTTGTGAAGAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEEVYWSEMEASIILPILKKKLAFLSGGKDRRSGLILTIPLCLEQTNMDELSVTLDYLLSIPSEKCKARGFTVIVDGRKSQWNVVKTVVLMLQNVVPAEVSLVCVVKPDEFWDKKVTHFCFWKEKDRLGFEVILVSANKLTRYIEPCQLTEDFGGSLTYDHMDWLNKRLVFEKFTKESTSLLDELALINNGSDKGNQQEKERSVDLNFLPSVDPETVLQTGHELLSELQQRRFNGSDGGVSWSPMDDELLAQPQVMKLLDSLREQYTRYQEVCRQRSKRTQLEEIQQKVMQVVNWLEGPGSEQLRAQWGIGDSIRASQALQQKHEEIESQHSEWFAVYVELNHQIAALLNAGDEEDLVELKSLQQQLSDVCYRQASQLEFRQNLLQAALEFHGVAQDLSQQLDGLLGMLCVDVAPADGASIQQTLKLLEEKLKSVDVGLQGLREKGQGLLDQISNQASWAYGKDVTIENKENVDHIQGVMEDMQLRKQRQNVKTW	1982	78473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_2066_4851_4961_16480_16572_23406_23521_35876_35991_38102_38201_39811_39868_44402_44615_59360_59484_64510_64706_65231_65347_67149_67315_70746_70829_71556_71680_72672_72865_75129_75252_77586
920943	contig_9580_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_167743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACAACCAGACCAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1108782	1109954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_+_1108800_1110000
920944	contig_8377_pilon	+	4150	16	Intergenic	novelGene_35125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_6	1758.37256828264	2	151	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	1293	3356	176583	197939	FALSE	60	AAAGAAACAAATATTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	175290	198733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
920945	contig_11316_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_122635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	413	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_137400_138900
920946	contig_12948_pilon	+	2376	3	Intergenic	novelGene_126161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	28	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1424	1738	62090	62404	FALSE	50	AGCACAATTTATTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQEYGARLGTPNPCRGIFCGTPVLGHYFPTEGQFLCPLQDILRFWFKNPWGPLRAFQGICKVLPFSIPYLREFGFSSYLSTTTCHIRLNAETVMRTQLSSIN	32668	63042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_33443_61023_61637_62053
920947	contig_13592_pilon	-	3211	1	Intergenic	novelGene_33717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGGAAGAAAGAAAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259797	256586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_256600_259800
920948	contig_6589_pilon	+	1950	17	Intergenic	novelGene_25726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	63.5638212743696	438	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	930	1586	479605	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451705	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_464582_464635_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
920949	contig_9185_pilon	+	1351	1	Intergenic	novelGene_166900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303461	304812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_303500_304800
920950	contig_5961_pilon	-	2204	2	Intergenic	novelGene_144154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAAGGCTGTATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214874	212538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_213927_214058
920951	contig_8631_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_121984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAGGAACTCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837187	839125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_+_837200_839100
920952	contig_602_pilon	-	2251	3	Intergenic	novelGene_134965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1254	1592	557455	557117	FALSE	20	AGGGAGTGTTGTACTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIPVTTRTSLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLICGSNAGVRWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	599476	556457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_557850_582744_582802_598674
920953	contig_4874_pilon	+	3982	22	Intergenic	novelGene_78622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	16	junction_21	16.641613823713	87	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1058	3177	192	3368	42796	95464	FALSE	20	CTATTCCTTCCTTAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQPNSSAKKKEEKGKNIQVVVRCRPFNLAERKANAHSVVECDQVRKEISIRTAGLADKSSRKTYTFDMVFGASTKQIDVYRSVVCPILDEVIMGYNCTIFAYGQTGTGKTFTMEGERSPNEEYTWEEDPLAGIIPRTLHQIFEKLSDNGTEFSVKVSLLEIYNEELFDLLNPSTDVSERLQMFDDPRNKRGVIIKGLEEVTVHNKDEVYQILEKGAAKRTTAATLMNAYSSRSHSVFSVTIHMKETTIDGEELVKIGKLNLVDLAGSENIGRSGAVDKRAREAGNINQSLLTLGRVITALVERTPHVPYRESKLTRILQDSLGGRTRTSIIATISPASISLEETLSTLEYAHRAKNILNKPEVNQKLTKKALIKEYTEEIERLKRDLAAAREKNGVYISEENFRAMNGKLTIQEEQIVELIEKIGAIEEELSRVTELFMDNKNELDQCKCDLQNKTQELETTQKNLQETKLQLVKEEYITSALESTEEKLHDAASQLLNTVEETTKDVSGLHSKLDRKKAIDQHNAKAHDIFGKNMNNLFNNMEELIKDGSLKQKTVLEVHKTLFGNLLSSSASALDTITTTALGSLTSIPENVSTRVSQISNMILEEQSLAAESKTVLQKLISVLKTDLLNSLETILSPTVMSILKINSQIKHIFKTSLTVADKIEDQKKEMDDFLSTLCSNLHELQESTVSSLAESQKLCENLTEDLKTIKQTHSQELCQLINIWAERFCALEEKCDNIQKPLDSVQENIEQKSKDLINKTTSRGTKFCADSDGLSQELKQFNQEGTKLVEESVKHCDKLNSNLEIISQETEQKCEALNTSTLCFSEQWVSCLNKRQEELQNLFEVINQGCEASSSEITEKLSGYKAATENQRNTFLDQITTDEERLMSQSLELNETIKIGLTKLKCFLQSDLKLDIPTGTTPQRKNYLYPSTLVRTEPREQLIDQLKRKQPELLMMLNYSENNKEETSQDLDEEKAVLEHTVTVEEPLSQEPSIDAGVNCSSGGGVPFFQHKKPHGKDKENRGINPVERSKVEETTEHSVTKSRLPLRAQINL	42604	96078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_+_42873_51534_51668_51926_52025_52106_52186_53219_53406_53513_53639_56096_56188_56424_56668_57848_57945_60895_60985_64689_64778_65313_65503_66154_66363_67318_67492_73744_73871_73946_74106_76474_76582_87005_87286_91368_91592_93094_93247_93908_94032_95332
920954	contig_9481_pilon	+	843	4	Intergenic	novelGene_149681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTCGCCACGCACGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452240	481964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_452868_454514_454597_477026_477093_481896
920955	contig_10446_pilon	+	5021	13	Intergenic	novelGene_162496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	127.202676203503	118	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	1409	2629	974817	1054546	FALSE	75	AAAAAAAAAACAACTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRANLEELRSQHENKVEENSVLQQRLEESEGELRKNLEELFQVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDSAKQSEDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIAKEEQEDLLKKRERELTALKGALKEEVSSHDQEMDKLKEQYDAELQALRESVEEATKNVEVLASRSNTSEQNQVGAEERVKALKEENERLRGRVGDLERHVVQLQRQIHDLEGEEAKARETLRKHEEEKRQLEEALVHARKEEKEALTARRSLEGELEDAQRNLSRATQEQKQLSEKLKDETEQKEQLRRLKNEMENERWHLDKTIEKLQKEMADIVEASRTSTLQLQNQLDEYKEKNRRELAEVQRQLKEKTLEAEKSRLTAMKVQDEVMPGRISTCVYCLFQVSFEIALKLFFERLGGSFQDSFCA	901799	1056938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_901849_963428_964334_964940_965055_966024_966124_967932_968039_974163_974266_974783_974933_976361_976498_988704_988918_1045180_1045388_1046278_1046384_1053178_1053332_1054255
920956	contig_4091_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_173002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	645	1091	11776	11330	NA	70	TAAGAAAAAAAGAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASQRGSLFATQHRLAKKGSQLKKRKRKQTINSKETNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTQTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVIGKEEIKTSRKKSNTSSQQIALREPASVGWWNPSSWCFSDKRLCPWEAEEAEWG	12420	10760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_10800_12400
920957	contig_6360_pilon	-	4399	1	Intergenic	novelGene_165884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCAAGTAATAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88422	84023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6360_pilon_-_84000_88400
920958	contig_18162_pilon	-	3617	3	Intergenic	novelGene_122283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	113	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
920959	contig_12547_pilon	+	2493	2	Intergenic	novelGene_179022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	1940	2491	49586	50137	FALSE	55	CAATATCATGAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPLEQNALELPDREFKSLILRILQERRQKADKHEEKIDKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRKQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRTSGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEDTLRVMWDTIKSKNPRVIGIPEQGEKTENTDRIMEEPLTENF	4553	50139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12547_pilon_+_5671_48763
920960	contig_18511_pilon	+	2029	11	Intergenic	novelGene_126867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	324.783758830395	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	178	1953	47371	61308	FALSE	45	AGACAATTCACACTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35394	61384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
920961	contig_4091_pilon	+	2023	2	Intergenic	novelGene_173003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGGAAAACTCAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10760	13040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12001_12257
920962	contig_11538_pilon	+	4943	1	Intergenic	novelGene_152305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	33	503	247738	248208	NA	75	TGGTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQIPLAFFNEMEKQITNFIWKGKRPQISKALLKKKNKVEGLTLPDFRTYYTATVIKTAWYWYNNRYLDQWNRIENPDINSANYEPLIFDKGPKYINWGKGSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKSNSKWIKDLNIKSKTIKILEEKIGTTLGARINGINRI	247705	252648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_247700_252600
920963	contig_14514_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_137469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	176	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	255	768	174	941	42228	42995	NA	30	TAAAAAACTGTGTGCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLAGLLPSEGNSLVSVDPAAADEQQPEAVSVPPLQGCLRSPNPPFSPVPFTIWDCVQSLSPCNRCGGGYIFTYSKTCKSRSLCKAETCQRRKTQNSCHQNKRQESGKTASCQRRRTCETRKAKAAPSSSISQRFLCIFTFEAGKSFLLPPFLTASGERRSPWRGPECQKSLAPVYVYGTKPVIHNLRPAAEYACPPQLSCWAAGDNGQAWQTPTAMFPFVCFYYPHHFIFILSPQSPPIPITATSRPLRNRFY	42054	44699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_42100_44700
920964	contig_13021_pilon	+	2512	14	Intergenic	novelGene_8148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3096.12766926345	13	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	489	1457	176597	179572	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLAAVVRSWQDEQCGQNFELLMSV	174506	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176065_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179504_179690_179985_180211_180440
920965	contig_5321_pilon	+	2616	1	Intergenic	novelGene_153868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCATGATCCTTCCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31468	34084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_31500_34100
920966	contig_8541_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_105592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGTTTGTTCTATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569603	568155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8541_pilon_-_568200_569600
920967	contig_10487_pilon	+	1696	1	Intergenic	novelGene_159414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAATGGTGAGCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212255	213951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10487_pilon_+_212300_214000
920968	contig_16884_pilon	+	3166	1	Intergenic	novelGene_161828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	379	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAGACATACTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109218	112384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_+_109200_112400
920969	contig_14792_pilon	+	4301	3	Intergenic	novelGene_170486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	156.5	29	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3774	4091	72915	73708	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEFSQDRKRHINQRLHQPESRRTRWCPPTTNGCPDRENNTESLMEQEKGGMQNSNSGKKTRLNGLTETGGNPESMDPGFSISPELKQFPRPTHQTGIGLDCGI	38961	73918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_39129_69308_72935_73410
920970	contig_3095_pilon	+	3603	1	Intergenic	novelGene_75154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154492	158095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_154500_158100
920971	contig_11248_pilon	-	3777	1	Intergenic	novelGene_142551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACGGAAGTCACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268298	264521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_264500_268300
920972	contig_5549_pilon	+	5074	7	Intergenic	novelGene_81689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.957557879392	46	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	224	1039	831635	854538	FALSE	25	AATCCCTGCAATGTGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEILRDSEKGQSSLLVGCQNSSEISDDSFGDVSARQTNKPPLQLILDPSNTEISAPRPSSPGGLTEEDSVLFNKLTYLGCMKVSSPRNELEALRAMATMKSSSQYPFPVTLYVPNVPEGSVRIIDQSSNVEIASFPIYKVLFCARGHDGTTESDCFAFTESSHGSEEFQIHVFSCEIKEAVSRILYSFCTAFKRSSRQVSDVKDSVIPTPDSDVFTFSVSLEVKEDDGKGNFSPVPKDRDKFYFKLKQGIEKKVVITVQQLSNKELAIER	752456	858573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_752561_829986_830060_831588_831792_842368_842580_844247_844423_852661_852820_854423
920973	contig_16123_pilon	-	2519	4	Intergenic	novelGene_164285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	460	948	229518	229030	TRUE	20	TCTCCCACAGCATTGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFFLIFVCFLLQLLNNSVRDLNSLSVRSSAFSSTGRSSGVLFWTPIGTILSCFSKCFDIVCCLRGIQWLFSSFTDCRFVCFILLFYLVMSEQAGCAFFVIWSSVGMILFTSFSNGQGQSLRYGTAGQAQLKGSCWDGLFVAHTRADSADRESVQGRFQ	232038	227264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16123_pilon_-_228703_228896_229651_230371_230686_232025
920974	contig_13244_pilon	-	3752	2	Intergenic	novelGene_86976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	25	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513328	332016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_334959_512518
920975	contig_10734_pilon	+	6085	27	Intergenic	novelGene_51225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	473.953542089487	404	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1216	3651	295	3945	1243300	1321486	TRUE	25	TTGCCAGTGGTACTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKKTQGIRDSVLHLKSLAGIMAGRREICAQ	1198704	1334964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1240226_1240306_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1275042_1275148_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1310195_1310254_1321457_1321506_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
920976	contig_17074_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_145157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAAAGACAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294728	297047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_294700_297000
920977	contig_13244_pilon	-	2044	1	Intergenic	novelGene_87009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGGAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497654	495610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_495600_497700
920978	contig_5302_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_81538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAATTACCAGAGATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601544	1599165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1599200_1601500
920979	contig_9036_pilon	-	2931	1	Intergenic	novelGene_155467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAATATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199399	196468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_196500_199400
920980	contig_7057_pilon	+	3095	1	Intergenic	novelGene_123385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTCATTTCCTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1197181	1200276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1197200_1200300
920981	contig_7870_pilon	-	1481	1	Intergenic	novelGene_109036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAAGAAAATACCAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606262	604781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_604800_606300
920982	contig_10920_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_178970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	550	1086	23077	22541	NA	25	TTAAAGCCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLRRRRRADSDLNRRGVASCRGWGRNSSLLRDVSAPLATGGFPFPDGDQCSRRVAGQRRDRRPGRRSFQAPLEARCVESSPQIPGEPEETLLREGSEGADNLLGPLPGGGCVPRCCPKGGERGWDPSDNPPKVYGVLMGRLSIWISDPLPCPGLSGTFRDREALGGKTGMGGGQEK	23626	21996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10920_pilon_-_22000_23600
920983	contig_3153_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_104711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGCAACTACAGTATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539585	537385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_537400_539600
920984	contig_15518_pilon	+	1436	3	Intergenic	novelGene_127580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	342.5	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	918	1391	15096	16176	FALSE	15	ACTCATGCTTGTTGTCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGEASIPLHLALF	10517	16221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_15082_15202_15808
920985	contig_15732_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_88873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAGAAGAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152985	155347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_153000_155300
920986	SIRV5	+	1764	3	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-187	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGTGACCGACCATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10946	13597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_10992_11311_12821_13387
920987	contig_8263_pilon	+	2126	6	Intergenic	novelGene_83097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	158	junction_1	131.438807054842	20	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1648	2073	192474	192899	FALSE	85	ACGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTNDEDELSIGLPVELKRKKEQLDGGHRPSKENQSAAGLTLPLNSDQAFHLMSNLAGDVITAAVTAAIKDQLEGVQQALSQAAPSLGEDTDAEEGDDFELLDQAELDQIESELGLTQDQKAEAQQSKKSSGFLSNLLGGH	139975	192952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_140168_179979_180107_184211_184297_187959_189005_189258_189386_192402
920988	contig_6365_pilon	-	3706	2	Intergenic	novelGene_133991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2859	3188	967	638	FALSE	35	CATGAATGAACATCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPREPPTWMCGIQAASASQSRDHGRGKQRSLSRGKEGWGIGKCTPQITGCFVSRWKLCKAAFSYPRLLVCDRSPRWWIRAVLAGRGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	67366	119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_1996_65536
920989	contig_13348_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_162672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGTTCTTTTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26758	29532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_26800_29500
920990	contig_7976_pilon	-	4117	5	Intergenic	novelGene_169400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	37.3388202813104	100	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	248	535	696197	687029	FALSE	40	GGAATCAAAACATTTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQKKLEKATKQLIKQEELKRLHKAQAIQRQLEEVEERQRAFEIQGVRLEKALRGEAADSGTQDEAQLLQEWFKLALEKNKLMRYESELLIMARELELEDHQSRLEQKLRKKMLKEESQKDENDLNEEQQILTKMMQVIEQRDKLVDSLEEQRIREKAEDQHFESFIFSRGCQQSRT	720017	683446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_687214_691692_691767_696168_696272_717483_717578_719938
920991	contig_12998_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_168963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	274	675	19319	18918	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPTSLPDHLYWGPVNWQHPLFCPLNHARGSRSVCPLLCPAVCTRGLWVGCIPCSTHPSMPGAHGLSSGSPSSTQPPVLGACRWAMPVPKPSHLSQGLQTGSVCFSAWLPGTWGPVACPLPPSQLRQGPEDQ	19592	16981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12998_pilon_-_17000_19600
920992	contig_16882_pilon	-	3667	5	Intergenic	novelGene_148219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAACACACGTATTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214089	203087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_203558_206618_208887_210589_210738_212310_212435_213432
920993	contig_11253_pilon	-	3116	1	Intergenic	novelGene_126838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2332	2676	188807	188463	NA	15	ATTGGTCAGTGTATCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHRIFQNDCILLHSYQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLSCASNARVRCYLIVVLICISPMASDREHFLMSVGRLNVFFGEVSVHFLCPFFNWMMCLFLVEVLDFLVDYTDLTFI	191138	188022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_188000_191100
920994	contig_10500_pilon	-	1956	3	Intergenic	novelGene_41203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	185	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCTAACAAAATTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1539419	1438634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1439883_1448130_1448475_1539055
920995	contig_6215_pilon	-	4857	8	Intergenic	novelGene_21209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	827.604411071189	36	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	2566	3459	233835	228234	TRUE	45	AATGAATTCAGACAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	237444	226741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_227148_227241_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_234147_235190
920996	contig_14333_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_49117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAAACAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390661	392908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_390700_392900
920997	contig_1301_pilon	-	2647	2	Intergenic	novelGene_47430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCAAAGCCATTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986301	983469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_984987_985171
920998	contig_13633_pilon	+	2435	13	Intergenic	novelGene_15318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	453.603993956549	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	380	1336	28347	49142	FALSE	25	TTCCAGCTCATAGACCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5037	50241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21999_22177_22774_22808_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
920999	contig_4812_pilon	+	2700	2	Intergenic	novelGene_103653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22194	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGTTAAGGAAAAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78778	81740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_81286_81547
921000	contig_4686_pilon	-	1388	4	Intergenic	novelGene_118532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	268	junction_2	133.352498622594	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	847	1386	470447	465047	FALSE	20	GTCCCAGCAATCTGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILTETLFRKIISFAVLKETQFHEEVMAQASAVLKRAHKRGVELEYILETWSQLDEDHQELSRQLEVVESSIPSVGLVEEGEDRLIDRITLYQHLKSSLNEYQPKLYQVLDDGKRLLISISCSDLESQLNHLGEHWLTNTSKVAKELHRLETILKHWTRYQSESAALIHWLQSAKDRLEF	471293	465044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_465111_465975_466173_466705_466838_470300
921001	contig_5428_pilon	+	2077	2	Intergenic	novelGene_160414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCACACTGCCCTCTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168540	176333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_170567_176282
921002	contig_361_pilon	+	4543	2	Intergenic	novelGene_166616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3328	3663	1043520	1043855	FALSE	25	GCCACCAATGACTGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWEKNFGYDKSDQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFAKEDILAAKRHMKKCSQSLAIREMHIKTTMRYHLTPTRLTLIQKPQNKNCWRGCAETYTVLVGM	1002463	1044735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_1004890_1042618
921003	contig_6434_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_61842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1147	1497	754713	754363	NA	30	GTGAGTCAGAACTGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEKTLKLALEYRVAKAKGRNDEVKQLNRRFQRVPQEDEVKYYKEICKDLELENQKGRTHSTFLKLKELKRKFKPPVAILKDFMGKKWNIMGSIKRRWKECIQSLYQKELVSVQPL	755859	752873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_752900_755900
921004	contig_17796_pilon	+	3405	3	Intergenic	novelGene_33825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	987	junction_2	14	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1313	1714	75600	96579	FALSE	65	AAAAAAAAACAAACCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKGTKIVYFFLVPFFKLYIFDLKYQ	73401	98270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_74664_75549_75748_96325
921005	contig_10299_pilon	+	1741	1	Intergenic	novelGene_79768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAAAACTCCTTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590776	592517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_590800_592500
921006	contig_14744_pilon	-	1898	6	Intergenic	novelGene_66001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	415.554280449618	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	72	581	969897	968300	TRUE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969968	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967382_967919_968630_969717
921007	contig_10196_pilon	+	2651	2	Intergenic	novelGene_132350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	104	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACATGGATTTCGATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2477287	2481206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_2479266_2480533
921008	contig_5423_pilon	-	2333	8	Intergenic	novelGene_85273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	218.488966704107	5	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	138	914	573204	558996	FALSE	30	GCCTCATTGTAAAATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYACSFKAMEGDCSSLGRVSTKVFFTVFALLGLFICFFGHRFWKTELFFIGFIFMGFFFYILITRLTPIKYDVRLILTAIAGSVGGIFLVATWWRFGILMLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRITLLFWQYGGCWQ	574278	557576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569080_569259_573063_573236_574172
921009	contig_15021_pilon	-	2129	1	Intergenic	novelGene_26925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	38	400	94415	94053	NA	35	CTAATGAACCTATTTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDPPPRERPEDTSLTTTVRNKCVRAPASLKSAVINLFCRSDTTVGTATTGLTMGVTESQDGRGHVAAEIPKDKMGMVPIMDSRVKAAIRIQVYLGEVVGLVPEHCNKVSHTKFLVFLCI	94452	92323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_92300_94500
921010	contig_10803_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_170124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93831	95747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10803_pilon_+_93800_95700
921011	contig_11106_pilon	+	3777	1	Intergenic	novelGene_167444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCATAAGGACTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566	5343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_1600_5300
921012	contig_2527_pilon	-	3492	2	Intergenic	novelGene_179024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAATGTCCCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261211	119170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2527_pilon_-_121305_259853
921013	contig_4125_pilon	-	3382	13	Intergenic	novelGene_25255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	55.6744006603474	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	86	1294	3030585	3010848	TRUE	35	GAACTGAATTTGAATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAKVYQQLELHNLMDAELMRRPFDLPLQPLVHPGSPRHQKPKPSLPQQEERLTEKRAMEPLLQEQPSSRSRSVPPQHAAVGQVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRFSVSALAHRVYEVRETAVRIILDMYKQHRAFILEYLPPDDNNTRKNILYKTIFEGFAKIDGKPTEAEIRAQKKAATEEVERQKKEEIKVLQGQLAALKEIQVEVQEKESDAMKLKNQDTQGRKADPPNAPETPDNHYLDQWWR	3030670	3006376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760_3017869_3018214_3018422_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3029023_3029216_3030519
921014	contig_7593_pilon	-	3079	1	Intergenic	novelGene_127350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGGACTAGCAGATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643462	640383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_640400_643500
921015	contig_17432_pilon	-	1364	2	Intergenic	novelGene_159002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAACGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10058	8470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_9547_9770
921017	contig_2854_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_120852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTAGTTGATGTCACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301415	299747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_299700_301400
921018	contig_2917_pilon	+	2911	2	Intergenic	novelGene_147599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	36	482	107022	107468	TRUE	50	TAATTACATAGTGGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPVKVFQQTDAMLEMPTHLCQEIWKTATWPTNWQRPIFVSIPKKGDPKECENYRSISLISHTSKILLKIIQITIVAVHGLAQADSEKEMERGLITADVVWVLAESREYQEDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLQRIGIPEHLIVLMRYLYTDQQAVA	106986	113412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_109092_112606
921019	contig_12923_pilon	-	2886	10	Intergenic	novelGene_30096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_6	323.720386891047	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	269	1801	68307	48997	TRUE	20	ATTTTTATGAGGTTCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPTHTFFQIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	68575	45346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196
921020	contig_10129_pilon	+	3055	1	Intergenic	novelGene_128171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAGGAAAAAAAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626933	629988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_+_626900_630000
921021	contig_9415_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_109712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACTTGGGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436285	438506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_436300_438500
921022	contig_16125_pilon	-	281	2	Intergenic	novelGene_155268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1848	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGTAAATCTCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151849	148782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_148943_151728
921023	contig_2646_pilon	-	1386	8	Intergenic	novelGene_69707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	69.4979077647196	23	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	117	416	2558650	2555936	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGCEGRRSLPRLPRALSRRWAARASAGDAEKGEELNVIMSGVKRTIKETDPDYEDISVALPNKRHKAIENSARDAAVQKIETIIKEQFALEMKNKEHEIEVIDQRLIEARRMMDKLRACIVANYYASAGLVKVSEDM	2576695	2535851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2536315_2551698_2551861_2554094_2554211_2555706_2555945_2557271_2557365_2557636_2557735_2558550_2558670_2576598
921025	contig_10734_pilon	+	767	1	Intergenic	novelGene_51348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711989	1712756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1712000_1712800
921026	contig_19816_pilon	-	873	5	Intergenic	novelGene_156506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336.644099903741	17	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	194	718	126303	123193	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITPSLL	126793	123037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123207_124838_124935_125577_125854_126164_126435_126731
921027	contig_614_pilon	-	2443	12	Intergenic	novelGene_132645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	223	junction_1	79.255732123173	41	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	168	1568	1040560	943435	FALSE	70	TATGAAGAAGAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALYSSLNKVILYCLSKAQQSLSECLSLLSILSYLQEHWDIIFATYNSNAGFLLCLMHCLLQLNARSYPEGFGLEPKPRMTPYHQVFLSPNEEVRGKRGENVPSLSDVQHNIQRMVRTLWQQLVAQRRQALEDAFKIDLSVKPGESEVKIEEVTPLWEETMLKAWQHYLVSEKKMLASRSNVTHHSKVTSWSGSLSSAMRLMPSRLAKDPECKAEDFVPCIENYRRKGQELYASLYKDHVQRQRCGSIKAASAWARIKEQLFGELGLWGQTVGAAPCSQWELDRREGPARMRRRIRRLSPLEAQSQAAHEESQDRNDISQTNAGNKDELTPKEVEIERDEVAMDCTKLTFFPALHESLHSEDFLELCRERQVILQELHDQEKVSLKYSLVIVQGHLVSEGVLLFGQQHFYICENFTLSPVGDVYCTRHCLSNISDPFIFNMCSKDRSCDHYACQRHRYTDIREIRQTHFLLQDIALEIFFQNGCSTFLVFHNNDRSKAFKSFCSFQPGLKGKGITEDSLNLR	1040727	942559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_943502_945012_945099_948469_948591_966341_966491_982381_982549_983323_983373_985593_985801_993541_993620_1027597_1027735_1028986_1029173_1030633_1030756_1040528
921028	contig_15114_pilon	-	2181	2	Intergenic	novelGene_121161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACATTCTGAAGGATTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158618	155330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_156856_157962
921029	contig_12424_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_174270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAGATGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67775	66043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12424_pilon_-_66000_67800
921030	contig_9272_pilon	+	2020	1	Intergenic	novelGene_125892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244832	246852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_244800_246900
921031	contig_6583_pilon	-	2360	2	Intergenic	novelGene_174586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	119	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCATACACAAAAACTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43224	16993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_18422_42292
921032	contig_6823_pilon	+	2789	1	Intergenic	novelGene_131212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCTACAAGGTTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198601	201390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_198600_201400
921033	contig_299_pilon	-	5414	10	Intergenic	novelGene_129439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTCAGTCCGCACTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	956305	920408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_920480_921467_921590_930100_930279_931296_931510_939521_939631_947654_947868_948406_948528_951183_951355_951452_951569_952205
921034	contig_678_pilon	+	989	2	Intergenic	novelGene_167813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117287	118314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_117866_117903
921035	contig_8362_pilon	-	1100	1	Intergenic	novelGene_150682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGAACCCTTTCCAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96366	95266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_95300_96400
921036	contig_8386_pilon	-	4261	12	Intergenic	novelGene_82213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	99	junction_1	194.515885603377	30	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	217	1242	45992	19750	FALSE	50	TTAAGTGAAATACTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTLYVGNLSRDVTEALILQLFSQIGPCKNCKMIMDTAGNDPYCFVEFYEHRHAAAALAAMNGRKIMGKEVKVNWATTPSSQKKDTSSSTVVSTQRSQDHFHVFVGDLSPEITTEDIKAAFAPFGRISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFK	46208	16730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_34662_35899_35933_36104_36160_36681_36781_38376_38474_45978
921037	contig_9415_pilon	+	3498	1	Intergenic	novelGene_109747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	613	972	593363	593722	NA	50	AAAAAGATTGTCAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKKISVFSLDQAFLTDTLSLVILRVRADLYIAGCSAVSLASPIRCQWQPLKHIQTLPKSPGGKKSPQLKSNALDYSNTPVKKYLLSLPFVSKEEQDQLCEIYINSSISQDLKIQLEKN	592750	596248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_592800_596200
921038	contig_10864_pilon	+	2916	1	Intergenic	novelGene_107100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAAGTCCCTTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985721	988637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_985700_988600
921039	contig_15897_pilon	-	2085	2	Intergenic	novelGene_49567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812094	809943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_810535_810600
921040	contig_10225_pilon	+	1286	2	Intergenic	novelGene_86874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	13	1176	46329	47636	FALSE	20	TTCTGATCCTAGACTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	46316	47746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_47226_47369
921041	contig_8386_pilon	-	3696	1	Intergenic	novelGene_82211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAGTGAAATACTCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20426	16730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_16700_20400
921042	contig_11318_pilon	+	2668	1	Intergenic	novelGene_48157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCTGATGCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44865	47533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_44900_47500
921043	contig_14796_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_159374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAATAAAACTCTTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165684	167744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_165700_167700
921044	contig_854_pilon	+	3895	21	Intergenic	novelGene_36513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3011.11456897608	7	68	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	1121	2797	1679334	1715249	FALSE	20	GTAAGCTGGTTTACAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1612774	1716347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678194_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687073_1700878_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704990_1715174
921045	contig_3382_pilon	-	2591	1	Intergenic	novelGene_123988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	892	1218	52556	52230	NA	55	AGGATAATGACTAGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARPAFSLAEGHLWDPEGQGSWPCQRDQLGWACCFAEPFPPGSALQSFTAIKETCISLHLLLAFHRSPSPFRQPCRYTQMIKILYFDNYTFLIHSKIYIQYHKHVVYR	53447	50856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_50900_53400
921046	contig_13674_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_140310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	1390	2031	13849	13208	NA	15	GGTGGTGCACGGAGCCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSLFSPCSGTPMTRKFLLFIVSHITLRVSSFFFVLFPEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTRSVSEILLFIFWISDCYFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWMPTGTILSRICKCFVIICCLRGIQ	15238	12150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_12200_15200
921047	contig_16255_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_176094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACAAATCCAGACAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483	3396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_+_500_3400
921048	contig_12605_pilon	+	907	4	Intergenic	novelGene_64163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	160	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	426	905	4816	5952	FALSE	20	ATGCCGTGTGCAGCACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRY	3826	5954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
921049	contig_9073_pilon	-	3747	6	Intergenic	novelGene_177396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	888	1301	118355	117942	TRUE	20	ATTCTGATAGCTTTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYDPAIPLTGIYPREIRVVTRVDICTPMFMAALFTIEKRRKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCLRPLL	376826	55153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_-_55487_56381_58466_117912_118356_127830_128172_318359_318608_376528
921050	contig_3132_pilon	+	3162	4	Intergenic	novelGene_127431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2534	3034	225801	229258	FALSE	15	CAGCGCAGCTCGTGGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYVHKSKEIDLHNNIVTLILDSSLSQLLYVAMNESHIGCLEAILFHVIFDVIFGHFYLTLCHVYSSDMSLLTNQLTECIAISTTSTTQVQNPAVFQTLRDDQTTAIIPQGHLLMYILQGFPDVLGGRPGCSDTGIGLEVRRFLQYLPVVGLHILPDLSVTRGGHC	223267	229386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_225973_227104_227255_228797_228929_229210
921051	contig_11720_pilon	+	1489	10	Intergenic	novelGene_43824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	10	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	144	1205	68064	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67920	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
921052	contig_19640_pilon	+	3274	1	Intergenic	novelGene_134855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2131	2478	36701	37048	NA	40	TCAATGACTAGGATAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKAAALRPAHGKTLIEEGKNRSAQWAKLHAVFLAMMEELGNGESLYVWIFTDSWAVANGLAIWSGKWEVADWTIKATPVWSTDLCKALWDFRGCIRVGHIGAHQKNLLPGLKGD	34570	37844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_+_34600_37800
921054	contig_5816_pilon	+	1552	14	Intergenic	novelGene_158235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTTGATGCCCGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48190	95095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_48288_48894_48980_53765_53894_56603_56707_57815_57963_60945_61068_65382_65683_66644_66806_72323_72366_75582_75645_83306_83401_83681_83796_92765_92808_95040
921055	contig_10011_pilon	+	3612	2	Intergenic	novelGene_68115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	0	4	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2457	2900	333300	333743	FALSE	40	CAGGGATTGTAACAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSCILVVGSPTFLSGRQDWEVEVGGKTGWVLGVCKASTSRKGSVALSPENGYWVVMTTMRNEYQASAFPPTHLWSKEPPWRVGIFLDYEAGDISFYNVTAKSHIYTFTCCSSSGPLQPVFSPGTQDGRKNTDPLIICPVCVQGPH	330658	334455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_332229_332413
921056	contig_2703_pilon	+	3136	4	Intergenic	novelGene_101845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1749	2297	1430352	1431010	TRUE	65	CAAACAAACTAAAACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRASASSQNKESRNFPEEEYFLELPEVEYKRLIYRTLQGIRKEIKQNTEHAIEEIKKITEEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKNNNKISELDNSIESHMSRNEAMEVRMREIEDKALDTNLFEEKSDKRIVEDLSAENFPDIVKDDKISIRDAHQTPHKVDPKRKSPRHIIIKLAKTKIQTEF	1329870	1431894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1330804_1429536_1430733_1430842_1431136_1431180
921057	contig_14829_pilon	+	2129	1	Intergenic	novelGene_163828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234816	236945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_+_234800_236900
921058	contig_5084_pilon	-	5446	10	Intergenic	novelGene_64641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_1	53.8229837545905	632	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	3818	4549	1337412	1330743	TRUE	20	TCCCAGCACCTAGAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLEVVWNRFYKEVYFLPVNIRFLSMFQFNLCCCFLSPVPPPPPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSASKKLDKLGMRGSNTSELIFEDCKVPADNILGHLSKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLG	1344219	1328281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1328438_1329071_1329145_1329244_1329350_1330179_1330841_1333776_1333874_1335200_1335338_1335727_1335822_1337106_1340983_1341204_1341295_1344062
921059	contig_15560_pilon	-	1997	2	Intergenic	novelGene_179025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	90	677	149375	116893	FALSE	65	TTATAGATAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRASFRISSDNFCLFFLSCLFNDLLLSSRMISLMSFLNSCGLWLLEFSASNQFLRWSLNSGSIYSRSYFGSRGLFLIVFTFNLTSYLFNLYAEQIIREAGLYEDRDIRIGGRLINNLQYADDTTLLAESEKDLKHLLTKIKDHSLQYILHCNIKKTKILTTGPISNIVINREKTDIVMDFILLGSTINTHGSRSQEVKRLIALGKSTAKDLFKVLKNQRCHFKD	149464	115572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15560_pilon_-_117315_149209
921060	contig_10642_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_78746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGGTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299155	1300036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_1299200_1300000
921062	contig_12935_pilon	-	655	1	Intergenic	novelGene_165718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAACTTTCACCAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155602	154947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_-_154900_155600
921063	contig_16204_pilon	+	3094	1	Intergenic	novelGene_154501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAATTAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276361	279455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_+_276400_279500
921064	contig_1594_pilon	-	2680	5	Intergenic	novelGene_138857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_3	25.8493230085432	75	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	35	625	777962	768433	FALSE	30	CAGTTAGTAAGCATGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPEVERRRQQIMAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEYSAFDMSAPTPAHCCPAVGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFAVSKCTFCCIETSEIPWLNPVYQHHSLFSLKLLTCGFQVTAVRAMVILLVARCRCLFPMQN	810135	766377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_768694_771341_771460_777250_777306_777805_777976_810114
921065	contig_15361_pilon	-	2369	2	Intergenic	novelGene_167869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTTATCTCCTGCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480909	478360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15361_pilon_-_478823_479002
921066	contig_14220_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_159860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTTTTCAAACTGTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314438	316453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_315256_315314
921067	contig_10331_pilon	-	1086	8	Intergenic	novelGene_54061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTTTGTTGCTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67396	52309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_52352_53537_53724_55921_56072_56159_56257_59467_59531_60913_60971_64318_64470_67056
921068	contig_5718_pilon	-	1871	1	Intergenic	novelGene_110382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	221	562	1188514	1188173	NA	65	GAAACTGGGCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSYHVLHHPEAAALTGRWNGLLKTQLWHQLGGNTLQYWGNVLQEAVYVLNQHPVYDAVSPTAKNHGSRNEEVEMRVAPLTITPSDPLAKFLLPVPTTLCSAGLEALILKRGMLPPGDTAWIPLTWKLRMPLGHFGLLMPLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQGEIRLKLYHGGKKRVFKKYRIFFRVS	1188734	1186863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1186900_1188700
921069	contig_5321_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_153870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAACTACATGCATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46820	44472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_44500_46800
921070	contig_18934_pilon	-	4524	5	Intergenic	novelGene_175881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	56.2427773140694	125	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	103	759	134098	52388	FALSE	5	CTCTTTCGCTTCCCCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRLSGCPGQELARGLWLASPLLARQPATEPTLERMRASCVLLTALVALAAYYVYIPLPNSVADPWKLMLLDATFRGAQQVSNLIHYVGLSHHLLALNFIIVSFGKKSAWSSAQVKVTDTDFDGVEVRVFEGSPKPEEPLRRSVLYIHGGGWALASAKISYYDELCTAMAKELNAVIVSIEYRLVPKVYFPEQIHDVVRATKHFLQPEVLQKYSVDPGRIGISGDSAVQSRCQSKKQVQTASFNLSSSSSFRF	134200	48622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_-_52468_54321_54462_75188_75259_77167_77397_133960
921071	contig_10082_pilon	-	1363	2	Intergenic	novelGene_63891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	747	1052	404162	403857	FALSE	5	TTTGCCTGTTGTGTTCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDSSVRLTVTAGIRVHCRFEGEHCWQASARRHCGMRCVYMGPFWTLATPRKTESESRLEWLAHPVIPGMGVLVTARLEGLHCHSHLTLVHCFEFLFKTH	408319	403545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_404824_408234
921072	contig_11512_pilon	-	2725	4	Intergenic	novelGene_43279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	473.560508864026	62	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	253	879	374806	367967	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGGLWLKPQRCHVQASPFCPSAERNHLVSCSSSGRARGALPTCSLLPSGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	375058	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_366625_366732_368181_368470_368604_374526
921073	contig_10074_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_57131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	124	573	358468	358019	NA	35	GTGACAAGGGTCAGAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQAKKSGLNACGHWTHSRYKLKSQTTLFLLIIPSRVIQHLSSQTRLPKLPLDSRKARHLLIILPSNLSILLLYGSVLLCLHVLPVVQGRVHHFLTPSLNKNAGPCRRVHAHDLHEDGPGKSINGVLKNPCILVATITQKWPSLSGNI	358591	357522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_357500_358600
921074	contig_5260_pilon	+	3298	2	Intergenic	novelGene_144391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421762	464385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_424017_463341
921075	contig_11427_pilon	+	2374	1	Intergenic	novelGene_78989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	246	809	586225	586788	NA	25	CCCTGTGACACAGTAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGISIETFQQTDAALEGLTRLCQEIWKTTTWPTYWKRSIFMPIPKKGDPIECGSYRTISLLSHTSKILLKITQKWLQQYINTELTEIQAGFKRGCGTRDIITDVSWILAESREYQKDVYLCLIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLTVLMRNLYTDQEAVI	585979	588353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_586000_588400
921077	contig_7839_pilon	+	1876	1	Intergenic	novelGene_45693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTTGGTGCATTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185651	187527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_185700_187500
921078	contig_854_pilon	+	4969	27	Intergenic	novelGene_36523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	2715.92084621393	5	81	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1128	3387	158	3544	1649514	1714980	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGILEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1612788	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693185_1709537_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712449_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
921079	contig_7333_pilon	+	2488	2	Intergenic	novelGene_142796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1585	1911	248950	249276	TRUE	55	CTCAGCAAATACAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQFISNHIEADHDGFSKLPKRRNLPEEENYLELLEIEYKRLIYRTLQEIKQNAEQAKEHTDKTIEEFKKIREEHNDKFNRLQESVERQQSEIQKINNKISELTQ	247365	250243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_249280_249669
921080	contig_15760_pilon	+	3030	4	Intergenic	novelGene_131058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAATTATCTATGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385253	455721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_385562_411057_411501_449898_450980_454523
921081	contig_9921_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_23724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAGGAAATGATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108295	109657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_108300_109700
921082	contig_5954_pilon	-	1756	2	Intergenic	novelGene_28761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACAATAATGGTGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392766	1390858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1391087_1391238
921083	contig_11681_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_102990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAGGTGAGGCACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244227	244854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_244200_244900
921084	contig_7963_pilon	+	912	6	Intergenic	novelGene_58403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	858.926446210617	9	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	67	318	56777	57459	TRUE	5	GCTGGGTGACTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTSDHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNRL	51426	63342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51434_56717_56964_57281_57335_57447_57564_57782_57934_63003
921085	contig_12709_pilon	-	2997	1	Intergenic	novelGene_147409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCCCAGGAGGCCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46538	43541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_43500_46500
921086	contig_3601_pilon	+	3497	4	Intergenic	novelGene_132857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	292	927	129120	130354	TRUE	10	CGCTTCTCTCTTTTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGRTISVEKDIILGNAEGQQKRGRPPMRWIDMVAATMGSNTANIVRMAQDRVVSKCLTSILLILSSTISNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFLLAFCSCIIFLNSSLFLSVVSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFISWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVYFGCLLEPSYPVSVNVLILSAVFGAFSSYFSR	128828	161693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_129276_129874_130819_159210_160560_160936
921087	contig_7933_pilon	-	1804	2	Intergenic	novelGene_164671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTATTTACTCAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131690	117093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_-_117704_130496
921088	contig_2854_pilon	-	1824	3	Intergenic	novelGene_120851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	323	junction_2	40	4	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306478	299677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_300590_303933_304061_305693
921089	contig_9668_pilon	+	3501	1	Intergenic	novelGene_58134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGATGAATAACCCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286893	290394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_286900_290400
921090	contig_3986_pilon	-	2895	7	Intergenic	novelGene_52707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	105.695579640568	62	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	180	644	60653	52406	FALSE	25	GAATAAATTTCTCTTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVSSKKQVKEKDKGQWSPVKVSTQSKAPPPLPPLVVFNHLAPPPEDKHPEQEEHFVVALYDYNAVNDRDLQMLKGEKLQILKETGDWWLAKSLITGREGYVPSNFVARVETLEVEKWFFRSIGRKDAERQLLAPINKVGSFLIRQSDTNKAL	153862	50154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_52414_52848_52953_54769_54869_55923_56018_57911_57964_60545_60655_153684
921091	contig_13625_pilon	+	2153	5	Intergenic	novelGene_150159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGAGGGAGAGGTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25832	35125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_+_27240_28836_28943_29635_29975_34069_34249_35003
921092	contig_12139_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_146461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACCACTCGGAACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71773	73596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_71800_73600
921093	contig_6635_pilon	-	3600	6	Intergenic	novelGene_127023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2746	3084	488995	471620	TRUE	5	CTTCCCGGGCATCGTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTSRSKIKCSFHKDNPLIHTYSFISLDGELHAGRNAAGLLSLSRVHAVPMARTTNPDSPSRSKHCKYPTTAFPLISSTFRPIFLCSSPDIKEISLCLASFDALGVRILSIH	491740	454268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_454345_464446_464530_467022_467200_470249_470346_471535_471692_488728
921094	contig_6098_pilon	+	2212	2	Intergenic	novelGene_145463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20389	22756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_22403_22557
921095	contig_10296_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_168887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGAAGACCTCAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903798	904485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_903800_904500
921096	contig_2798_pilon	+	3828	1	Intergenic	novelGene_120044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2917	3273	158933	159289	NA	25	CATTTTCATTGGACGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYLFEEEMKCLDPHKINLGGLLELVSQFDPFLAGHISKYGNTEKGNPSSTSKTTCEELINLISDKVRSTILNEISKARYFSLSVDSAPKLSHTDQLSIVLRYMSPIDGKPVELFSIY	156016	159844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_156000_159800
921097	contig_11338_pilon	-	2450	5	Intergenic	novelGene_6386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	174.864769178929	72	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	892	1485	319426	306671	FALSE	20	GTATCATATTCTTTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPVNADSTCAYPLQLDHSHY	324054	305705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
921098	contig_12479_pilon	-	4754	13	Intergenic	novelGene_56877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	160.126165534833	8	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	426	1559	548994	507804	FALSE	65	AAAAAAAAGTTAATAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGYLTLIPRKFYKVSCKDMKNAVIGNNKQKANLIVLGAVPRLLYLLQQEASSTELKAECAVVLGSLAMGTENNVKSLLDCHIIPSLLQGLLSPDLKFIEACLRCLRTVFTSPVTPEELLYTDATVIPHLMVLLSRSRYTQEYICQIFSHCCKGPDHQTILFNHGAVQNIAHLLTSVSYKVRMQALKCFSVLAFENPQVSMTLVNVLVDGELLPQIFVKMLQRDKPIEMQLTSAKCLTYMCRAGAIRTDDSCIVLKTLPCLVRMCSKERLLEERVEGAETLAYLIEPDVELQRIASITDHLIAMLADYFKYPSSVSAITDIKRLDHDLKHAHELRQAAFKLYASLGANDEDIRKKVSLGEGRPPVLTANRQGVTSA	594244	504608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_507966_512516_512718_514761_514823_516362_516454_516544_516621_518254_518336_531545_531639_535588_535687_535790_535934_537773_537846_548938_549020_593516_593611_593938
921099	contig_10159_pilon	-	2047	8	Intergenic	novelGene_30795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	124.583223556933	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	598	1857	353226	317967	FALSE	50	AAGAAAATTTAACCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQVRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSIVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPLPWPVVPLGRQVKYSRLVNDT	642114	317776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_352585_353440_431854_431937_456756_456901_641956
921100	contig_7945_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_161595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGCCCAGCACCACACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372428	371109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_371100_372400
921101	contig_9133_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_109313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACAATTTTCAAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868086	865196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_-_865200_868100
921102	contig_7870_pilon	+	3792	1	Intergenic	novelGene_108926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	3344	3751	267015	267422	NA	25	GGATATTCTATTGTACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACENWTMNKEARRRTDAFELWCWQGILNIPWTAKRTNKSVLEEVQSECSLEARMVKFCLTYFGHVIRRDQSLEKNIMFGKVEGQRKRRRPSTRQSDTVAATMGSSITMTVRMVQDGVVFRFVVHRLL	263671	267463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_263700_267500
921103	contig_19362_pilon	+	2649	2	Intergenic	novelGene_157802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	94	546	78660	79112	TRUE	65	ATTATAAAGTAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRLRRRFPIDGYRPRRRRRWSFCPSGVCPVRMVLDPRRPRGEWLWGLQMGRGGPGHADVCEELRFLGRRTLELPWGFRNCPGGMGVQFGGEGREAGSKCCATAGRGNLPSGDPAPARLLEAAAARAGGIWLRQAAAALSLPAPHLLRARSPWRQLQTDKGSKCSAQVQDRKGRTGREQKKS	78566	82376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_79353_80513
921104	contig_3132_pilon	+	1456	8	Intergenic	novelGene_127429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGCGCAGCTCGTGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220779	229385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_221340_221632_221774_222115_222248_223788_223873_224860_224931_225837_225981_227108_227260_229210
921105	contig_19957_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_57742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAACTAAATATCCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371174	372087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_371200_372100
921106	contig_14768_pilon	-	3030	14	Intergenic	novelGene_115085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	54	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2439	2873	249058	241012	FALSE	20	TGGTAGCATACTCCTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSCCQVQVQLLWAGSHLANELLMGEDAVSSEPAVVLNALAPSRQLRTVSSAKVDSLSKVVALVEATVVSTGKGDDKFSCTLVCADNRHTMGHEGVGIHEGDKLVQEVRLAIKQLRCQLLHHLFQMFSCKRGYSIPGLWLYQWR	260446	240854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14768_pilon_-_241027_241125_241284_248692_248810_248913_249117_254071_254255_254342_254742_255361_255469_256181_256539_257158_257304_257843_258018_258362_258505_258720_259320_260035_260103_260239
921107	contig_3463_pilon	+	2415	1	Intergenic	novelGene_62022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1951	2328	626231	626608	NA	80	AAAAAAAAACCAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPLTTRIEHRVLNIGSTGSSSKRSKTRKGNKLIRIRKEKIELSLFTDNMIVYVENPKEPTKKLLELISNYKMVAECNINIQESTAFLYISNEQLEFEIKNSTPLTFTTPKIKYLGINLTKYVQD	624280	626695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_+_624300_626700
921108	contig_2703_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_101812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTGTTACATTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1095975	1097821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1096000_1097800
921109	contig_19743_pilon	-	2800	13	Intergenic	novelGene_173155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	47	junction_2	62.7568057398293	109	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	718	2157	33	2189	360363	231213	FALSE	30	TTCTACTATGTCTTAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECEEEAVCVIMCASVKYNIRGPALIPRMKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSDDWGVEKRSVHDVPVVRLPADSPIPERGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYSLKKYVDDFGVPVSNTISREYNELLTAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNTLRIKETAQALAQLSRWDRGTNHLLFNMLPGSPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSIPVYSPLSAEVDLPEKGPGPRRYFLLSSQMVLHPEYREDLDALQAKYGDSVLVLDKCTNLSEGVLSVRKRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLRGARLGQAVLSDVLQAGCVPVVIADSYVLPFSEVLDWKRASVVVPEEKVSDMYSILQSIPQRQIEEMQRQAQWFWEAYFQSVKAIALATLQIINDRIYPYAAISYEEWNDPPAVKWSSVSNPLFLPLIPPQSQGFTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVWNNQNKNPPEESLWPKIRVPLKVVKTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDELQFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYTYKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTHMVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFPEKLKSFPNIGSL	360395	230601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_-_231352_238341_238425_240794_240924_244789_244934_269271_269439_283779_283970_308858_308991_338665_338760_341305_341446_344249_344446_353257_353375_358782_358873_359827
921110	contig_6707_pilon	-	3579	1	Intergenic	novelGene_167045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGTGAAAACAAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202582	199003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6707_pilon_-_199000_202600
921111	contig_20346_pilon	-	2620	3	Intergenic	novelGene_179026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1911	2273	74583	74221	TRUE	35	CGATATTACATTATTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKSNTCSPQTAPKEPPARRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	76532	73321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20346_pilon_-_73635_74186_75350_75388
921112	contig_19957_pilon	-	3927	1	Intergenic	novelGene_57731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGCTCAAGCATAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279628	275701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_275700_279600
921113	contig_13021_pilon	-	3663	11	Intergenic	novelGene_8149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCGGCCGCCTCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181153	174506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_180209_180438
921114	contig_2716_pilon	-	2791	9	Intergenic	novelGene_173563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_8	29.97681395679	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	147	1409	897282	877493	FALSE	30	ATACTTGTGCCTAACATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYGKGKLPPGPTPLPIIGNSLQLDVKNISKSRSNFSKAYGPVFTLYFGMKPTVVLHGYEAIKEALIDLGEEFSGRGHFPVAERTNKEFGVVFSNGKIWKETRRFSLMTLRDFGMGKRSLENRVQEEACCLVEELRKTNASPCDPTFILACAPCNVICSIIFQNRFDYTDENFLNLIGILSENTQILSTPWMQICSTFPMLLDYFPGIHNKLFNNAIFLKSYILGKVKDHQETLDINNPRDFIDCFLIRMEQEKHNQQSDFIVENLLATISDLFGAGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVAAKVQEEIDRVVGRHRSPCMQDRGSMPYTDAVIHEILRYIDLIPMGLPHAVTRDIKFRDYIIPKGTTIMTSLSSVLYDSKEFPNPEMFDPGHFLDESGNFKKSDYFMAFSAGKRICLGEGLARMEVFLYLTTILQKFTLKSLVDPKHIDTTPVVNGFASLPPSYQLCFIPV	914112	876110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_877675_879325_879468_885312_885501_888599_888742_892561_892739_893873_894035_896838_896989_897161_897325_914008
921115	contig_15236_pilon	+	926	3	Intergenic	novelGene_141590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGGAGAAGTGTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450696	452542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_451165_451306_451469_452246
921116	contig_5253_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_61606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGCAAGATACCTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389899	390821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_389900_390800
921117	contig_20507_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_164209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAACCACAGGTAATCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126001	127620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20507_pilon_+_126000_127600
921118	contig_12624_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_61093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895172	897529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_895200_897500
921119	contig_15248_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_149151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3	317	89605	89291	NA	60	AAAGAACATCACTAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWTGIGHFESDSHIGSYARNDKLKKNDVAFFIKKNISRSILKYNTVSDRIISICLQGRPVNTTIIQIYAPTTKAKDEEIKDFYQLLQYQIDQACNQDALIITGN	89607	87187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_87200_89600
921120	contig_2940_pilon	-	2818	1	Intergenic	novelGene_81917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCTTTCTTTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545532	542714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_542700_545500
921121	contig_3900_pilon	+	2696	2	Intergenic	novelGene_84214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGAGCTGAAAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680876	687711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_681337_685475
921122	contig_6233_pilon	-	1196	8	Intergenic	novelGene_74768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTCTTCTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131660	118025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_118155_119649_119754_123346_123483_125127_125229_125886_126038_127998_128056_130492_130581_131230
921123	contig_10019_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_86667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTACATGCAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208848	209771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_+_208800_209800
921124	contig_12050_pilon	+	2083	1	Intergenic	novelGene_62685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGCAGCATCTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497490	499573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_497500_499600
921125	contig_5935_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_102761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACAGTCAAACGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1379937	1381801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1379900_1381800
921126	contig_17144_pilon	-	1560	9	Intergenic	novelGene_29351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2058.14139076376	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	300	1265	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174985_181820_181850_183158
921127	contig_15570_pilon	-	3777	3	Intergenic	novelGene_137869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGAAAAAAATTCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880723	776485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_-_779143_791245_792318_880675
921128	contig_10541_pilon	-	3469	5	Intergenic	novelGene_144636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGCACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403673	166941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_167640_167685_169084_325634_326128_326235_326468_403025
921129	contig_7025_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_104396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2382	2735	80480	80833	NA	40	AAGTAATTTCCCCAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTQNSGQWFCVRRRQEDRTRAGYTGCCSSVSNNLGGKLVGGHMGLCFIIRPQNSHMYIYSFVYTKYFITKMIKEYLAIKKKVPGHASQNICILAHAPLTTSPNFESDQSLSSLIK	78098	81019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_78100_81000
921130	contig_9653_pilon	-	2920	1	Intergenic	novelGene_48318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATCCCAGCAACTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018887	1015967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1016000_1018900
921131	contig_15047_pilon	+	1663	6	Intergenic	novelGene_52228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3018.18760185645	18	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	6	371	2194	3255	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMASQILLLLLSGALALTRAGELPLPAVFLHRRVPARPRGAPLHLRRLRGRHAVRAVRQRRRESERGAAGAVDRAGGAGVLGRADTESPGRRRDFPSEPADRAPLLQPERRRVSHFPEDVWL	2188	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
921132	contig_10324_pilon	+	2560	21	Intergenic	novelGene_7711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	1187.35748618518	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	763	2328	69577	76715	FALSE	45	TTAATCAGATAAAAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILVWAFGMGGDPGRRRYWDLLDLLDWTDVDGGQRWWIDYLFCPQTFFEHLESLAGANVNTLSC	51796	76947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_51870_57251_57429_66121_66171_67844_67919_68040_68126_68713_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440
921133	contig_6726_pilon	+	2156	2	Intergenic	novelGene_86216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCATCGGGTTTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70184	74718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6726_pilon_+_71560_73937
921134	contig_7644_pilon	+	4986	1	Intergenic	novelGene_64248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	128	478	168012	168362	NA	10	CTGACAGTTTTCTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLHTPCRQTGEFSGPPYILFRPQSITDGANEQESLTREPEVLMLSQSSLWLQSGFTCTCALIAVSHWLMLPRSGEAAQESKHSHFALAPLTACPARVLYKQLSPGLRFLAQCLGHEISVNAKCMSESLKSSNYCLLKYLRTADDSHTLGGMRDFIGSE	167884	172870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_167900_172900
921135	contig_8357_pilon	-	2784	5	Intergenic	novelGene_39756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	371	junction_4	367.118083864034	33	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCTCTTAATAATTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804558	790826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_790841_793348_793440_795882_796038_800632_800734_802135
921136	contig_12689_pilon	-	3141	1	Intergenic	novelGene_145045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAAAGTGCGAGGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164090	160949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_160900_164100
921137	contig_20293_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_153525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATCTTGCGAGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81880	81242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_81200_81900
921138	contig_5084_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_64510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTATGTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358755	357132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_357100_358800
921139	contig_15498_pilon	-	1463	11	Intergenic	novelGene_42673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	133.898805073085	1	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	468	1028	691001	688532	TRUE	35	GAGAAACGTTGCCCTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKVQRPVQVARCVWCVPV	697623	688004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688582_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
921140	contig_4156_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_88093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCACATAAATAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255504	254785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_254800_255500
921141	contig_7031_pilon	-	2659	2	Intergenic	novelGene_132781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1710	2078	111267	110899	FALSE	60	CTACATCAAAACAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENKDKKLEEFRKIMQEKNAEINSQLEIIQRQQLEIQKIKNKISEMDSVIEGLKSRFEAVEDRISGIEDKHSDTILFQENSEKRTKKNEETLKVMWDTTKIKNFRVIGIPERRENRKHREDH	308627	110317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_112174_307824
921142	contig_14357_pilon	+	1846	2	Intergenic	novelGene_121698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTCTACAATAACTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689135	700433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_689325_698776
921143	contig_8308_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_173472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATATATAACTTCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38812	36325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8308_pilon_-_38226_38332
921144	contig_1274_pilon	-	4262	3	Intergenic	novelGene_137823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	2446	3066	688425	687805	FALSE	20	ACCGTGTTGCCCAGAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCELILAFCSCIILLNSSIFLSVFSVYLSAFSINLSIFSPFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSFRSSAFSSTEKSSGVLFWTHTGTILSCVSKCFDIVGCLWGIQWLFCSFMDCRFVCFILLFCFIWLCLSRRAVCSLLFARLWARYFSPPSAMGRVGQVWYSRAGPAEGELLGWVVCGMYQG	869110	686608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_-_688664_713489_714138_867551
921145	contig_10734_pilon	+	3212	8	Intergenic	novelGene_51448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	198	869	2216472	2217143	TRUE	30	ACTCGAACAGGAAGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWSTGPVCLQRAGDRSFRGKPAQEARSRPQPMSTEALGLSTAALRLRARACPSDPTPGRRDSRGPSDPTQGRRDSRGPSHPTPGHGDSRGPSDPTPGCRDNRGNLAKYQTRGLLCRMGKQILHPKCRSCWEALKSLCSGVRIQIALWGDPGSFSSSFMVPWGGRQGARVCGRHHWSVSLMRSCREGKQTNVHPHVLSPGKVGPPGAGQRTAMSLETSRSHHS	2216274	2234423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2218548_2222648_2222790_2222880_2223192_2225527_2225646_2226109_2226169_2226275_2226347_2229765_2229914_2234332
921146	contig_9720_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_116775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300634	299839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_299800_300600
921147	contig_6215_pilon	-	3775	1	Intergenic	novelGene_21247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGACATAGCTACGCTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596966	593191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_593200_597000
921148	contig_6445_pilon	+	2769	5	Intergenic	novelGene_77100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTGGATTAGGGTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1141516	1351203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1143787_1224781_1225064_1264671_1264676_1321983_1321999_1351005
921149	contig_6278_pilon	-	875	1	Intergenic	novelGene_119829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTTGAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566394	565519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_565500_566400
921150	contig_2917_pilon	-	1894	8	Intergenic	novelGene_147575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	229.561960867978	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	18	1067	124032	93080	TRUE	60	TAATAATAACAACACAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEEETMDSADPSERSGWLTGWLPTWCPTSTSHLKEAEEKILKCVPCTYKKESVCISNGNKIWTLKLSYSLPNKTPLVLLHGFGGGLGLWALNFEDLCTNRPVYAFDLLGFGRSSRPRFDSDAEEVENQFVESIEEWRCALGLEKMILLGHNLGGFLAAAYSLKYPSRVSHLILVEPWGFPERPDLADQDRPIPVWIRALGAVLTPFNPLAGLRIAGPFGLSLVQSLRPDFKRKYSSMFQDDTVTEYIYHCNVQTPSGESAFKNMTIPYGWAKRPMLQRIGKMDADIPVSVIYGARSCIDGNSGTSIQSLRPHSYVKTVAILGAGHYVYADQPEEFNQKVKEICDTID	124049	77136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_-_77936_93051_93170_93782_93970_96189_96302_98762_98918_109365_109739_113029_113116_123985
921151	contig_7057_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_123428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCCACAGAAACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1615869	1661249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1615883_1659455
921152	contig_9705_pilon	+	2570	2	Intergenic	novelGene_41729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATAACAGTTAACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221444	225978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_223453_225416
921153	contig_9127_pilon	+	2591	1	Intergenic	novelGene_103008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCCAGCAATTCAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166955	169546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_167000_169500
921154	contig_4180_pilon	+	2345	10	Intergenic	novelGene_8296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	167.038548075616	1	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	761	1627	811833	821915	FALSE	10	GAATCTGGTTTTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733027	822633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802649_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
921155	contig_5628_pilon	-	2693	16	Intergenic	novelGene_157579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_15	49.5417220352929	8	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	930	2078	427589	410984	FALSE	0	CTGTGCTGGGTGTTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEPVQRIPRYELLLKEYVQKLPAQAPDRDDAQKALDMIFSAAQHSNAAITEMERLQDLWEVYQRLGLEDDIVDPSNTLLREGPVLKISFRRSDPMERYLFLFNNMLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEKGSAAGSEQNLMCSFLQLLGDRWGRNGPRGWCVIPSDDPFVLYIYAAPQDMRAHTSIPLLGYQVTAGPQADPPGLPAAAVRPAVHVQG	434506	410368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_411104_411655_411803_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_425756_426473_426621_426878_426938_427489_427629_427864_428023_429228_429378_430097_430176_431498_431764_434266
921156	contig_9538_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_176458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCATACCCGGCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29731	28820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28800_29700
921157	contig_9976_pilon	+	2917	12	Intergenic	novelGene_147905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	37	junction_9	38.075175748307	8	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	38	1174	15748	40235	TRUE	65	GAGAGAAAGAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDVDTRKIIKAMLSYVWPEDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFMFKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRIAKNVFLHLHNLDLGFHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIMFEVTLVSGVLYYKCGAQFALVTLGTLGAYTAFTVAITRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNEKYEAQRYDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSIGLTAIMVLASQGIVAGTLTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTRIKVSNLYSTFSKVREHHPINKIILGKYSYITMFVNQFLSYRNWVYLVY	15710	57381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9976_pilon_+_15832_35332_35466_36345_36615_37643_37733_37824_37913_38811_38987_39936_40839_40996_41127_45612_45785_48336_48441_53683_53792_56755
921158	contig_1341_pilon	-	2369	3	Intergenic	novelGene_179027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	1637	2368	1903	1172	FALSE	25	TCCTGAGAGCAGCTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQR	41292	1170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1341_pilon_-_2610_40077_40523_40807
921159	contig_8376_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_153775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAATAAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170235	169088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8376_pilon_-_169100_170200
921160	contig_20614_pilon	-	2237	1	Intergenic	novelGene_107531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68905	66668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_66700_68900
921161	contig_16103_pilon	-	2069	8	Intergenic	novelGene_118927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATCTTTGCCTATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792430	783592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_784418_785514_785688_788394_788594_789048_789327_789467_789641_790825_791015_791766_791823_792254
921164	contig_15062_pilon	+	2800	2	Intergenic	novelGene_162300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATCTATACAATGAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77618	137303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_80367_137251
921165	contig_11986_pilon	+	5569	2	Intergenic	novelGene_69132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	113	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3721	4050	199300	199629	FALSE	40	GGATCGCAAAGCACTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAVVEAGTSQVRGSGWRLLLIHVAAGAGEPKIDKSESRALAHRLQRPSNPKTGRQMAGKLLGQVPRTGGQTNRSQLQDAEQAKAHKPCQKVHPYWMQATPTRNLPFH	182484	201148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_182602_195696
921166	contig_6488_pilon	-	3126	2	Intergenic	novelGene_44707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	496	junction_1	0	249	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2685	2984	634	335	FALSE	40	GTTAAATGAGAAACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCLAATTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQLGSGQPHKTKWN	6683	192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_3218_6582
921167	contig_8691_pilon	+	2668	4	Intergenic	novelGene_72689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_1	153.267377118841	66	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	148	960	91704	105008	FALSE	75	TAAAAAAAAAAAAAACTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFALCSGWGCGGLRLCQLRGWIGEAVERGTCRAYHGRRYGSGGCDRRPGSESEVTSPDPTRRALKEWTLLVSPFGRLRARLPCDLTVRPLDPFTYPDADRVLVAVSSVEGGAQGLDSLQVRYDEARKEMAIVSETIDPQASVEVDAPLKFDLNIKSSGSGCVKVQKIECDNCKIETELGTSILQSFKSQKLHVQTKGGKVICLGTVYGNVDIHASEKSTVTIDKLQGSSVTISTEDGFLKAKYLYTESSFLSSAAGDITLGSVHGKMTKA	91556	106716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_+_92155_97002_97113_103833_103927_104849
921168	contig_10074_pilon	-	3984	1	Intergenic	novelGene_57155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	3348	3716	485220	484852	NA	15	GGGTTCTCTATTACCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRGWSLLITRPKYMRGSLAILTPKEHSDSGCTSSKTDLFVLLTVHGIFDIFEQHHNSKASILLWSSLFIAQLSYAYEMTENTKASVRHTLVLKVTSLLFNILKRSLETDLPKAIQLLIS	488567	484583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_484600_488600
921169	contig_10140_pilon	-	1705	3	Intergenic	novelGene_148402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267964	210187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_-_210744_213072_214202_267944
921170	contig_10074_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_57106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235459	233670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_233700_235500
921171	contig_7362_pilon	+	2332	3	Intergenic	novelGene_147554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	0.5	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	38	439	401975	411266	FALSE	60	GCGGAAGAAAATGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETQFSTRVFKKQMKQVKNPFGLEITNPSSASITTGITLTTDCLEDSLLTCYWGCSVQKLYEALQKHVSCFRISTPQALEDALYSEYLYQEQYFIKKDSKEEIYCQLPSDTKIEDFGTVPRSRYPLIALLTLADEDDREIYDIVSN	401937	413159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_+_402039_410771_410950_411106
921172	contig_18937_pilon	-	357	1	Intergenic	novelGene_179028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTGTTACATGAGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435	78	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18937_pilon_-_100_400
921173	contig_19132_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_169982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277434	278801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19132_pilon_+_277400_278800
921174	contig_792_pilon	+	1925	2	Intergenic	novelGene_179029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAAACAATGGAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55953	180859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_792_pilon_+_56534_179514
921175	contig_2377_pilon	+	3023	2	Intergenic	novelGene_67871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTATACCCTGTACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570	4025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_1235_1666
921176	contig_14516_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_153942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAAAAAAATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352427	353437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14516_pilon_+_352400_353400
921177	contig_12297_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_161382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACGAGTTAGAGAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747861	746216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_746200_747900
921178	contig_9981_pilon	+	2107	2	Intergenic	novelGene_121042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAATTTTCGCTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196407	198616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_198209_198310
921179	contig_14441_pilon	+	1167	5	Intergenic	novelGene_100582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	13	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	553	981	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111198	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111551_111988_112040_116578_116963_117220_117344_117539
921180	contig_8822_pilon	+	3151	2	Intergenic	novelGene_117938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATGTAGAACATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166974	230026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_169841_229741
921181	contig_15245_pilon	-	2556	1	Intergenic	novelGene_145222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACACCATGTATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70705	68149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_-_68100_70700
921182	contig_5590_pilon	+	2689	3	Intergenic	novelGene_162983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	155	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1302	1784	65139	67555	FALSE	40	TCTCCATAAAATAGGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRQQTISKHLKKDLKGTISQLDLIDISRTLHPIATKYTFFSNTHGTFSRRDHILGHRATLNKIQNTEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNNLLTNHWVIEEIRDGIKKFLDSNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIATDAHIKKKKKG	63784	68460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_+_64203_64255_65184_67117
921183	contig_6972_pilon	+	594	1	Intergenic	novelGene_179030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTTAGAATTATGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59126	59720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6972_pilon_+_59100_59700
921184	contig_15047_pilon	+	1440	7	Intergenic	novelGene_52131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	52	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	30	650	2194	4256	TRUE	15	ATCTGCATCTTTGCTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKELWASTQRISP	2164	21663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3481_4222_4434_4552_4687_21013_21062_21232
921185	contig_7057_pilon	+	788	10	Intergenic	novelGene_123331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	266	junction_1	661.517242200379	11	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	154	624	938907	943233	FALSE	20	CGTACCATGCCCGAGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	937163	943397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
921186	contig_4751_pilon	-	2032	1	Intergenic	novelGene_173734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	285	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCCTTGGATACAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391098	389066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_-_389100_391100
921187	contig_18919_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_156037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAACTGGGCTAGGGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147586	148258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18919_pilon_+_147600_148300
921188	contig_8284_pilon	+	3194	4	Intergenic	novelGene_125716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1144	junction_3	120.809307956336	128	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2051	2365	450767	451081	FALSE	30	GAACCAACTTGATGGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIIADVRWTLAESREYQKDVYLCFIDYANEFNCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLLRNLNIDQEAVVGTEQGDTAWFKVRKGVHQGCILSPYLFSLYAEKII	436258	451910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_436487_438444_438503_441534_441606_449073
921189	contig_7894_pilon	+	3208	2	Intergenic	novelGene_170775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATATAGAGAGACGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104859	134121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_106773_132826
921190	contig_7019_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_149475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAGAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334923	1333250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1333200_1334900
921191	contig_12000_pilon	+	2207	1	Intergenic	novelGene_43195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1187	1549	595206	595568	NA	75	TGAATAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLSDGLHLNIKKTKILTTGPINNMINREKIDVVKDFILLGSTVNAHESSSQEIRQHSALGKSAAKDLFKMLKSKDVTLETKVCLTQAMVVSVTPYAYESWTMNKEDRRIVAFEL	594019	596226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_594000_596200
921192	contig_10042_pilon	-	3164	3	Intergenic	novelGene_79161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2064	2417	787577	748017	TRUE	25	TTGGGACCAATTGATGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNRMKHCPSCAILTIVVMLESIVAATVSIHLLRVFLFLLTLYFSKNGVLLQGLVPPDSMSKVHERSLTILAYEEHFGTISSKTDLFVLLAVHGIFNIHCQHRNSKVSILQSFLFTV	789640	710995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_711607_747880_748344_787550
921193	contig_9815_pilon	+	2112	2	Intergenic	novelGene_164233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	561	1551	2111	1819	2379	FALSE	35	CACAGAGAGGATCATTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGRKQK	3	2380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_+_362_626
921194	contig_7129_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_169293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	1640	2458	93398	94216	FALSE	35	AGGCAAGAAGGCAGTGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSSDYSAETM	55989	94217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7129_pilon_+_56928_92696
921195	contig_17602_pilon	+	4177	10	Intergenic	novelGene_174497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3595	3909	95396	95710	FALSE	20	TATCTCATTCTCCCTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRPELLSAQRAAALSAQLWYSWRSTAPHLTLLGPTGMHSMGVWSGSGQVREESPEATLGRCPSGTVLQPSPSLPASPPRDWEQTGRGSLVAEGSPWVLARKR	34014	95978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_+_34463_35259_36746_43092_43287_43663_43810_55016_55132_56260_56389_61351_61446_65225_65410_89621_89883_94857
921196	contig_12540_pilon	+	1948	5	Intergenic	novelGene_148127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	603.622139670175	373	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1146	1745	1250092	1252921	FALSE	5	GTCTCATCTGTCTTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGLSTRSRLAESSGSFVGPPEQRVGDGCDFVPLSVQAQLLSRLPIPEGQVITINPSLSVEEAAEDYAKKLREAFQGDSIPVFDLLILGIGPDGHTCSLFPDHPLLQEKEKIVAPISDSPKPPPQRVTLTLPVLNAARTVIFVATGEGKAAVLKRILEDHEENPLPAALVQPHTGKLCWFLDEAAARLLTVPFEKHSTL	1248847	1253124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_1249765_1249863_1250311_1251168_1251271_1251605_1251747_1252783
921197	contig_17432_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_159009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTGATACTGATCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86078	84001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_-_84000_86100
921198	contig_2036_pilon	+	6797	1	Intergenic	novelGene_131843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	224	675	12	686	625913	626587	NA	30	CAAGCATGATGTCCTCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLKMRTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRLEKEIKGIQIGREEVKVPLFADDMILYTENLKKSTRKLLEVLKDFSKVSIYKINIQKSAGFLYPNKENFEDEITKSISFTIAPKKIKYLGINLTRDIKDLYNENYKTLLQETKRDLGKRKNIPCSWIGRLNIVKMSILRKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNFICKRKRPQISKALLKKKSKVGGLTLPDFRTY	625901	632698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_625900_632700
921199	contig_2799_pilon	-	2850	12	Intergenic	novelGene_85505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGATACTCAGAACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	729364	602384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_603760_607922_608056_681360_681435_687150_687272_696526_696898_699189_699244_702702_702769_704623_704817_707591_707703_718651_718698_721092_721224_729189
921200	contig_8978_pilon	+	1805	4	Intergenic	novelGene_49490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	119	junction_3	91.5459811606532	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	866	1732	1758895	1772309	FALSE	10	GGGAGTCGCCTACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1758029	1772382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
921201	contig_18869_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_56484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	236	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1239	1577	318234	317896	NA	55	GAAGAAAGAAAAAATGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	319472	316265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_316300_319500
921202	contig_8377_pilon	+	1859	16	Intergenic	novelGene_35022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3750.06740324609	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	26	1183	68257	164610	TRUE	45	AATTGAACATTACAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVRLCFL	68231	180492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164631_172896_173006_176567_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
921203	contig_19402_pilon	-	5197	16	Intergenic	novelGene_80766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	348	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146721	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97800_102161_102225_107509_107688_130466_130595_138557_138661_142957_143058_143796
921204	contig_5419_pilon	-	2991	1	Intergenic	novelGene_15516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2111	2446	249956	249621	NA	10	GCTTCAATCTTTTCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKESSSSIQKTVLGYILMRSLPHSGRGFLFHVWREVGKRHDLDIGGGLLLRLDAVHLNGVLPRSTHLLRLPFKGPCNIFKSPATGLRNFEEGEDQEDNKEGSKDDKNVGP	252066	249075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_249100_252100
921205	contig_2419_pilon	-	4642	2	Intergenic	novelGene_137123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	4195	4641	169733	115801	FALSE	20	CCACAGAAGCCCTCCCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLVQSGESVHIGVIDVGAAVQQLEDLVRVAAGASSQEDGAIVELHLGLLALHHRRLEVRLGADPALQLLVPLLLRVRHLHPLSCRRVFLSRGAKGEAEREKRGGRGCVTASLSAGQRRAGNREETLETSSIPQSTGAARPGERTSLP	173927	115799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_116241_169726
921206	contig_10734_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_51544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCCTTGCAAAAGAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2437594	2438781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2437600_2438800
921208	contig_7051_pilon	+	3566	2	Intergenic	novelGene_64319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	143	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1800	2411	223379	223990	TRUE	20	ATATAGTATTTGTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTLYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEQKIGPTLQALIHGINRIQTIIINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQSKPLEITNVGGAAGRSELLCTAGGNAK	221579	326793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_224864_326511
921209	contig_10323_pilon	-	3376	5	Intergenic	novelGene_123598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	358	junction_3	1982.53579728085	180	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	864	3029	468796	459350	FALSE	20	GTGCCTTAGGCTGATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFLQDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEALERQKEFFDSIRSERDDLRDEVAMLKQELKKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELAFQNPDLSEVKEEAQAKLTDKKPAGEAQNEVTEDAGEKTVSGSTENVERPEGPKIELDGKLDQEDDDVKTKVGKGIADKDSVKFEDDTIQSSGTSTSDQGLGGSVTQGNARKEAAQSSPLELEDEDAHSRPSEEVSDTSQTESAERCVGSEHPSQTVEKVLENVSLENSDSSALAGELGDFQSEYKEGPQDGNEKSRGKEDCTMC	469659	459002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460999_463310_463453_465065_465159_467386_467480_468607
921210	contig_2093_pilon	-	2846	2	Intergenic	novelGene_152960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	137	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	102	389	1072672	1072385	FALSE	55	CAGTAAGAACAAAACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THHSVPPQQRSEKLSQTEKTGILKLHGEVPYQLMQHGSAILDSYQRPADRGYEKVASRSFQQETEQPVNSDIRFPTTNTSSPLLGLLCFLWPQSLGWEALAAWSPPAHTGRLPECHLLAAVVAFFCFF	1072852	1069927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_1072699_1072777
921211	contig_12528_pilon	-	1627	8	Intergenic	novelGene_81326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_6	439.334515291629	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	761	1162	959940	933323	FALSE	30	CGAAAAGGTTTATATTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968144	932857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956217_959917_960131_966191_966274_967656
921212	scaffold_12124_pilon	-	1923	4	Intergenic	novelGene_22076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	220	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1226	1573	857198	852247	FALSE	5	TGTCTGGAGCTGGTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWNRKWVCWEWWYGTYCVPQNVHQLG	858981	851896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_852461_854702_854801_857162_857231_857788
921213	contig_7915_pilon	-	1992	2	Intergenic	novelGene_42971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGAGAAAGCCCGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119306	110956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_-_111299_117656
921214	contig_3948_pilon	-	2160	4	Intergenic	novelGene_53377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	168	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	647	1096	1861398	1860949	TRUE	5	CCGCTCCGCAGCCTCGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQADLPVGCEAADTINSSGAPVLGPAGPSVMVMGARGEEGTGVVLNCKGHPSFGRGASCSNSPPSWVGLASSRRPLEDPGWDWRALARPEVGRRSWSLPLCKQPESLISHKWPLSGSRRWRWKEGKPRSRREWEMINSEATNIKTKAI	1862044	1813323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1813534_1814129_1814435_1814486_1814516_1860428
921215	contig_17130_pilon	-	1908	2	Intergenic	novelGene_176551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	1559	1906	22641	22294	FALSE	40	GAGGTAGCATATGATCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVAFECSVAKVKGRNDEVKELNRRFQRVAEKDKVKYYNDTCKDLELENQKGRTHSTFLKLKEPKKKFKPRAAILKDSMGKIPNKRRKHQKKTEGIQSHCTKKNWSTFSHF	24294	22291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_-_24129_24223
921216	contig_7943_pilon	-	3017	1	Intergenic	novelGene_173149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	125	433	223306	222998	NA	25	ATTTCCCCCAGCTCACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWIRHTLVLKVTSLLFNTLKMSFQKKKPNPLPSSPSQLSGPIEQSGTAPQGFQGCKSSRKQADASFSHGVAGGFQPLTFWLAAGRFNHCATRAPFKEVFRE	223430	220413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_-_220400_223400
921217	contig_12920_pilon	-	2481	1	Intergenic	novelGene_166327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACATAGTATGATCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74798	72317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_72300_74800
921218	contig_17066_pilon	+	3101	1	Intergenic	novelGene_130961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	879	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317741	320842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_317700_320800
921219	contig_13607_pilon	-	1845	2	Intergenic	novelGene_170205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTATTCTTTAAAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318649	316697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_318147_318253
921220	contig_5889_pilon	-	502	1	Intergenic	novelGene_133686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163479	162977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_-_163000_163500
921221	contig_10324_pilon	+	2523	2	Intergenic	novelGene_7858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTCCTCTGTCCCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349714	352845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_352080_352687
921222	contig_6505_pilon	-	4066	1	Intergenic	novelGene_175698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172852	168786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_-_168800_172900
921223	contig_8317_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_19556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACATAAAGAATTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
921224	contig_3588_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_72900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGTAGTATGATATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142292	144900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_+_142300_144900
921225	contig_7840_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_68981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192775	190442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_190400_192800
921226	contig_7629_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_153579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGGCTGGTGGATTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325238	327172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_325200_327200
921227	contig_14441_pilon	+	1192	5	Intergenic	novelGene_100401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	419.432578014632	62	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	606	1007	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	67220	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67327_67434_67737_116530_116963_117247_117344_117539
921228	contig_3153_pilon	-	3356	7	Intergenic	novelGene_104682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	97.0274875142778	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	166	339	311083	307187	TRUE	25	TATTTTGCCTTTAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVARELQPSIIFIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQTAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLKNLLCKQGSPLTQKELAQLAR	311703	291663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_294617_302677_302742_307186_307271_308828_308872_311036_311117_311333_311426_311663
921229	contig_17603_pilon	-	1382	1	Intergenic	novelGene_152771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	992	1300	18541	18233	NA	15	TGTGCCCAGCAGTTCCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIYTDDSVMVFGLGQTWLWQHACPFSRSCLFCNILWTRADMVVAACLSVFPLLSVLFPWLGQTWLWQHACLFPHVCLFCDISLNLDRHGSGSMAVHFLLPF	19532	18150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17603_pilon_-_18200_19500
921230	contig_8317_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_19406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATAAAGAATTCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16383	17061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
921231	contig_10323_pilon	+	919	2	Intergenic	novelGene_123610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCATTGGTAGCTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460186	463409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_461040_463343
921232	contig_8822_pilon	+	4254	2	Intergenic	novelGene_117932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	176	298	80269	80391	TRUE	50	AGAGGAAATCATAAGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLGHVSPCPERLGGRGCTSLQTLVEVVLDPGKLSARGTITAEKCLFLLTHPLTPLCSNMSLAIFNNCHAHLCWNAGVSASKPVSYRKLRTQGSHCPFD	80093	87115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_+_82651_85418
921233	contig_9538_pilon	+	171	1	Intergenic	novelGene_176461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGACCTCTAATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28953	29124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_29000_29100
921234	contig_11525_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_171071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	380	766	21389	21775	NA	35	TTAGCAAATTGATCATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEPCLPESKEYYRTGKNGKTDKHAAIAMFARVQRPLQNHQYISALQMGKTIEGLAFSDWLETVILYFELSFLTIVGTGFSNVRRVFIGPTNFYSLNANRKRVESFLCSVCLALCESFPKRYFPRAS	21009	21997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_+_21000_22000
921235	contig_5643_pilon	+	4523	1	Intergenic	novelGene_39158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1300	1605	685090	685395	NA	30	ATCATATTTGAGACAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLADSLGFSVYKIISSANRDTMTSSLPVWMPFISFSSLTALARTSSTMLNKSGEKRHPCLLPVLKGNTFKISAFRMMLDVGFV	683790	688313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_683800_688300
921236	contig_15236_pilon	+	4055	1	Intergenic	novelGene_141596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGGCAGAAAAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475618	479673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_475600_479700
921237	contig_5799_pilon	+	3808	2	Intergenic	novelGene_50263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231001	235013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_231834_232037
921238	contig_7057_pilon	-	2393	4	Intergenic	novelGene_123439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.63299316185545	33	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	50	1354	1682309	1663001	FALSE	35	GTAAAGCTGCTATGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALPSEGSALPWEEKEMPKLQKLVTFKDVAVDFTQEEWECLDSSQRHLHREVMLENFENLVSLGHLLSKPEMIFHFERLDDVWMEEEMPRSSCSGVRDEKDGTLPWQVSPGEKPYSCPHCGQDFCQHRNLLIHQQTHTGEKPSPYNRCGKAFSERTTDLNLPVLLPGEKPYQCVKCSRVFTSVSALGRHKKGHVGKKPHTCEECGKDFSCSSNLSIHQRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHRRVHTGEKPFRCGTCGKDFSRSSNLSIHQRIHTGEKPFRCCDCGKDFSRKAALQIHQSVHTGRKPHARKACDQGFTSRSALARHQQDHAGSNAYVCDTCGRGFGHRANLYLHQRVHSGERPFRCEACGKCFSWRKDLGIHQRVHTGERPYRCGACGRDFRHRSSLKRHERVHTGEKPYTCAVCGKGFSQRVHLQTHQRLHSKEKL	1682358	1661961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1664071_1664462_1664556_1665668_1665796_1682294
921239	contig_3797_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_120110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTCTTCCAGTTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531273	529113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_-_529100_531300
921240	contig_9843_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_114304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	224	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTTCTAAAAGTTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3990	6037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_4000_6000
921241	contig_2596_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_53526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGGCACAGTGGTTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072528	1074449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_1072500_1074400
921242	contig_3956_pilon	+	2260	10	Intergenic	novelGene_14987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1071.9867789861	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	761	1741	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1287458_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
921243	contig_7056_pilon	+	1716	7	Intergenic	novelGene_43697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	246.451764494033	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	34	588	926284	930595	TRUE	50	AATAAAGAAGGGCTGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSERIPVSTS	926250	937716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_930571_930638_935330_935498_935846_936043_936993
921244	contig_11631_pilon	+	3926	4	Intergenic	novelGene_104182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	277	junction_1	139.544497084861	45	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	562	1119	80252	82955	FALSE	65	AGGGAAAAGTAAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPTIRDMVVRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTRVFEKHFPATIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNVAPEDRVWVRGWFPVLFELSCVINRCKLDVRTR	79690	85762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_80341_80465_80639_81512_81674_82820
921245	contig_17440_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_7537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAATTATCTTACCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499	1249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_500_1200
921246	contig_18108_pilon	+	2536	1	Intergenic	novelGene_33457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCCCAGCAAGTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104808	107344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_+_104800_107300
921247	contig_18869_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_56441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTATCTGTTGAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117481	119074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_117500_119100
921248	contig_10674_pilon	+	4612	9	Intergenic	novelGene_6414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_4	36.0310196219868	203	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	58	813	22839	41305	FALSE	25	AATCTGCATTTCTCTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAIACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALWDVESGQLLQSFHGHVADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHESDINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFAGYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHILRVWA	19915	45104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_19958_22823_22901_26995_27129_28782_28927_29834_29927_33911_33961_35891_35989_39644_39812_41293
921249	contig_361_pilon	+	4543	2	Intergenic	novelGene_166607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGATGCCAGGTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	981823	986722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_985249_985604
921250	contig_17144_pilon	-	1816	10	Intergenic	novelGene_29304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2213.55952659462	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	535	1521	169039	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183224	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169046_174903_175001_175973_176280_181790_181850_183158
921251	contig_16098_pilon	+	1394	3	Intergenic	novelGene_46229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	533	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	113	553	766291	767278	FALSE	35	AAGGAATCTTTATTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HQLSLHLSGNCPVPSWHEQGRATLNGERGALELTNSEMPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLWLRELGVGVYDSGPEPASLPSKLRTQDTR	765525	768119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_765638_766290_766640_767186
921252	contig_14970_pilon	+	1581	8	Intergenic	novelGene_44942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4670.90491167157	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	133	987	136145	231550	FALSE	15	CCTGGAGGTCCTTTGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITIRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
921253	contig_9011_pilon	-	2166	2	Intergenic	novelGene_159318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGGTTGAGTAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511409	508772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_508880_509350
921254	contig_7051_pilon	-	1910	1	Intergenic	novelGene_64367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	249	716	343665	343198	NA	60	AAAAGTTAACGAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITNLCSSWSFNMVSTNLTFPRVKTCKKRIFKRLIIIQQGQQKSPIATKTKTPHKTKTKKPTIYLSLLSGVHLWLRNKFLHLSHPEEFQSEAFLSATSKEGYFINCFYLIIIVSNTTWVLENGLNNCFTACGFLSDTWISQTLFAQQIYILLNIL	343913	342003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_342000_343900
921255	contig_16046_pilon	+	2018	1	Intergenic	novelGene_145513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTCTTTAAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134388	136406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16046_pilon_+_134400_136400
921256	contig_15029_pilon	+	1938	6	Intergenic	novelGene_128194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAGCTCCGACAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161752	172340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_163273_165444_165503_166431_166467_168147_168218_169580_169654_172158
921257	contig_19402_pilon	+	1538	2	Intergenic	novelGene_80791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTGCTAGCTTTTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30761	155937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_31817_155454
921258	contig_15952_pilon	-	5017	5	Intergenic	novelGene_154051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1986	2384	270088	269690	TRUE	25	TGCATGTGATCCATAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGPTSCPGYSAITEVARDPVQSEEGAGKLGRGFSQRGCFFDLCDRSDAHTYLLLTERHFSLLLEAQADSLSLGLSQCGKRLPSANALLTKHTSQSGMKGASSRWIRSGNSSLLSNCLSLHPPFSPIPQLCL	272253	121032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_121423_122093_123079_200721_201434_269143_271668_271847
921260	contig_18162_pilon	-	3008	3	Intergenic	novelGene_122313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
921261	contig_7350_pilon	-	3726	2	Intergenic	novelGene_179031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	114	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3034	3420	186116	185730	FALSE	20	TCACCTCCCTATAGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPHKSLQGERHSKSVDPLCLCLRKGAVPILNSWLRGAGRLLFPHLLICSLSKARRTAQGAGWVLLLAQGTQQLLKLVPDPVQIREQAGKWERGFSLRGVFLILTVGQMQVLIFHRSRAASHWCWMAE	189192	185423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7350_pilon_-_186504_186546
921262	contig_5826_pilon	+	4553	2	Intergenic	novelGene_71528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	4079	4438	227395	227754	FALSE	35	TAGAGTTTAAATTTCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWNRLKGTQQQLGVRSPWEAQTVKSLTTNQKVGSSNRPKGTLVERPGDLLLKGHSYENPMEYSFILKHVELPRVRIDLMATVFLFFQLVTRYRQVHPLLSTSYHLLDNGNSIYVTVLS	223257	227869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5826_pilon_+_223951_224009
921263	contig_5039_pilon	-	1231	1	Intergenic	novelGene_64789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTAATTTTATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154184	152953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_153000_154200
921264	contig_14450_pilon	+	5760	9	Intergenic	novelGene_48970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	3997	4815	1042789	1169744	TRUE	10	ACCCCGGCTCCAGCGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSSKQIGDLFLIFWGFLLLFLPLCRPIGDVIQTGPDPRQVQERPRRLLHLLVVALRRLFRASLLEGQRVAGDLPRLGQVLPLPVLGRVAAVSQGILGLLLAVFPVVLLRVAVALMALEAPLAAFAALLAALGGELVVVVGRGGGDGVAGWGGAPGIGGFGTAVVVILLGVAADHWGAARRLALSPHPAAGDAVPHGCCHSNGSDWQRPDAGKHPSAQNPCSILDHSWRKTCLYLRGSIQKHHGSGSINVRILQKGSVSLKEGAARPDGWT	1038722	1502393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1039828_1039897_1043374_1065852_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689_1311248_1379343_1379461_1502264
921265	contig_1639_pilon	-	2384	23	Intergenic	novelGene_74882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACGGCGCCGCCGGCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328984	279703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_279732_283495_283594_286377_286414_287045_287105_287385_287453_289008_289136_290190_290295_293136_293254_293369_293423_296203_296346_297968_298127_298223_298276_307919_307994_309145_309320_311114_311154_311928_312049_312577_312679_312825_312987_314717_315024_315535_315687_321335_321392_324204_324321_328939
921266	contig_6364_pilon	-	2198	7	Intergenic	novelGene_51825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	9.65084912786895	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1121	1519	1588512	1587638	TRUE	20	CTGGGCACTGGGGATACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGKQARVGFFDLCLGD	1590116	1586316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1586772_1587413_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588934_1589040_1589381_1589757
921267	contig_593_pilon	-	2541	2	Intergenic	novelGene_102023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	33	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1257	1586	491357	473820	FALSE	25	ATCCTCAAGGTCATATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNNFHIRWITFLWNRHKYGSLPVGWPGSFFQTSRHRRGSTPSVACVCWNISAGVPSVPGAVLFTSAFLQLGLLLSLPSVLDHMLPPEIDECLSILFGTATLCSPSIFF	492613	472864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_473945_491152
921268	contig_11338_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_6265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	435	869	123021	122587	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLRGDQNSSALLGECKMIQPFWKMIWRFLRKLETEIPYNPAIPLLGIYPREIRVFTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRNNNDESVKHLITCLKLEDIMLSEISQSQKDKHCIRPLL	123455	121086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_121100_123500
921270	contig_5428_pilon	+	4375	1	Intergenic	novelGene_160424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224539	228914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5428_pilon_+_224500_228900
921271	contig_10074_pilon	+	2967	1	Intergenic	novelGene_57193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTCGAAGAATATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582029	584996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_582000_585000
921272	contig_4678_pilon	+	2109	1	Intergenic	novelGene_126007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGATTCATCCACGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198779	200888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_+_198800_200900
921273	contig_13823_pilon	+	641	3	Intergenic	novelGene_145246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	17.5	19	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87962	89615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_88168_88469_88671_89380
921274	contig_9484_pilon	+	2067	2	Intergenic	novelGene_105665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCTTCAAAGCCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129937	142683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_130801_141479
921275	contig_20420_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_172473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	849	1163	14174	13860	NA	45	CTCAGCAAAATGGGAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKAESGRIKKPDPSFCCLQETHLRHKDTNRLKIKGWRKIFHATSKQKRARVAILISDKRDFKSKSVTRDKGYDMIKGSIQQEDITIINTYAPNSNAPKYVKQI	15022	13331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20420_pilon_-_13300_15000
921276	contig_7840_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_69012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294920	293079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_293100_294900
921277	contig_8161_pilon	-	1425	2	Intergenic	novelGene_156784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580276	560610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_561855_580095
921278	contig_10074_pilon	+	4701	1	Intergenic	novelGene_57154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	498	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGCACGTGCTTACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483866	488567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_483900_488600
921279	contig_3956_pilon	+	2630	12	Intergenic	novelGene_15055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	730	2106	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284184_1286153_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
921280	contig_5423_pilon	-	1185	1	Intergenic	novelGene_85195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAGAAAAAAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212360	211175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_211200_212400
921282	contig_6445_pilon	+	5088	1	Intergenic	novelGene_77106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGCTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170550	1175638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1170600_1175600
921283	contig_4845_pilon	-	4099	3	Intergenic	novelGene_53685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1690	2004	827571	827257	TRUE	40	GATTTCACTCCAGATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGENAEVVKDSFYLDPQSTAMEAAVKKLNNALHWANLWQKDLFKVLKSKDVTLWATACLTQAMVFSIASYACESWITNKEGRRRIDGFELWCWQRILNLPEE	907144	825116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_825342_825386_827777_905660
921284	contig_16411_pilon	+	1545	9	Intergenic	novelGene_77321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	1596	junction_1	893.435923835616	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	14	1213	142180	167340	FALSE	20	CTCAGGAAGGCCTCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQVLMGRMESVFNQAIRNTIYAALQDFAQVTLREPLRQAVRKKKNVLISVLQAIRKTICDWEGGREPPNDPCLRGEKDPKGGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSLDGPIVLAIEDFHKQSFFFTHLLNISEALQQCCDLSQLWFREFFLELTMGRRIQFPIEMSMPWILTDHILETKEPSMMEYVLYPLDLYNDSAYYALTKFKKQFLYDEIEAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKAMAGSVLLDKRFRAECKNYGVIIPYPPSNRYETLLKQRHVQLLGRSIDLNRLITQRISAAMYKSLDQAISRFESEDLTSIVELEWLLEINRLTHRLLCKHMTLDSFDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNFDFLPNYCYNGSTNR	142166	167672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_142314_143077_143226_146694_146849_147896_148054_148956_149054_152592_152670_157185_157295_160871_160992_167136
921285	contig_11259_pilon	-	3401	4	Intergenic	novelGene_144539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	79	junction_3	159.596017772653	19	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	6	374	159043	147722	FALSE	75	AGTACAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMLQQDSNDDTEDVSLFDAEEETTNRPTKSKIRHPVASFFHLFFRVSAIVVYLLCELLSSSFIACMVTIILLLSCDFWAVKNVTGRLMVGLRWWNHIDEDGKSHWVFESRKVNCPPFFKNRVI	159048	144694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_147851_153631_153777_155716_155800_159031
921286	contig_9335_pilon	-	4199	6	Intergenic	novelGene_147474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	806	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	3534	3956	1330599	1329909	FALSE	45	AACAGAACCATTTTTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSPGIPHQRGRPSRKQRHTRTELRSPSGRSKDGARSEVLKRKEGEVGRGKEEIKRSGKKATSAANKGHSQSHPFGCVKSKQPLFPGQETVAAGSRGGRVRLKKGGGWESINCQLPVVLSPAGSSVRLLSHTPLFAGLR	1469930	1329665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_1330219_1330486_1331937_1345772_1346025_1466678_1466967_1468132_1469342_1469483
921287	contig_7870_pilon	-	2582	1	Intergenic	novelGene_109072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAATGAAAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731289	728707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_728700_731300
921288	contig_12951_pilon	+	2951	1	Intergenic	novelGene_68234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	988	1332	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795617	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795600_798600
921289	scaffold_880_pilon	+	668	1	Intergenic	novelGene_121453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTGTCAAATGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446829	447497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_446800_447500
921291	contig_16228_pilon	-	3231	1	Intergenic	novelGene_147951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACACAGCAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89387	86156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_86200_89400
921292	contig_7707_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_72142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGAATTCCCATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127734	126620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_126600_127700
921294	contig_7022_pilon	+	3055	17	Intergenic	novelGene_142121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	159.165094614837	117	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	918	2754	300	3053	92865	145395	FALSE	30	GGTTAGTTTAGATGAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSPPVFGLHSASSGHSEFGGLGTLGTPTALAAHPQLASFPGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSESDSNSESDTEGSEEEDDDDDKDQDESDSDTEGEKTSMKLNKTASSVKSPSMSLSAHSTPRNLHIAKAPGSAPAALCSESQSPAFLGTPSSTLTSSPHSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKYLSRNGIMDISRDNFSFSAKIRVGDFYEARDGPQGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILEAKKKKKEEAANAKLLEAEKRI	34266	145397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_57926_58013_92799_92989_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_119394_119692_120709_120771_121540_121650_121894_121997_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552_143619_145332
921295	contig_9653_pilon	-	1150	1	Intergenic	novelGene_48355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGATCTCCCTCATGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1144709	1143559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1143600_1144700
921296	contig_10307_pilon	-	2939	1	Intergenic	novelGene_170301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAATAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655360	652421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_-_652400_655400
921297	contig_10307_pilon	+	1211	3	Intergenic	novelGene_170273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	162	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	192	665	389628	392020	FALSE	20	TCTTAAGTTGTGAGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLTCCGNAENS	387671	392566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387851_389615_390071_391989
921298	contig_3095_pilon	+	1240	5	Intergenic	novelGene_75076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	100	825	147280	151151	TRUE	25	AGTTTTCAGTGTCTGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147180	152252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
921299	contig_2969_pilon	-	3676	12	Intergenic	novelGene_157069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	84	junction_10	64.2841059748966	45	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	74	1423	956248	862737	FALSE	45	CAATAGTTTAATCAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVKVAVRVRPMNRREKELEAKFIIQMEKSKTTITNLKIPEGGTGDTGRERTKTFTYDFSFYSADTKSPDYITQEMVFKTLGTDVVKSAFEGYNACVFAYGQTGSGKSYTMMGNSGDSGLIPRICEGLFSQINETTRWDEASFRTEVSYLEIYNERVRDLLRRKSSKTFNLRVREHPKEGPYVEDLSKHLVQNYGDVEELMDAGNINRTTAATGMNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATGATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANPLAKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLKMLLAQGNQIALLDSPTALSMEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKVRTVKDVLVLLWWLK	956321	860483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_-_862845_866552_866619_873646_873823_875530_875663_875845_876015_877462_877606_880937_881048_881786_881885_884195_884313_890627_890742_892781_892852_956201
921300	contig_3832_pilon	+	2403	1	Intergenic	novelGene_161496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484492	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484500_486900
921301	contig_10246_pilon	+	2020	5	Intergenic	novelGene_46913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	383	junction_1	96.7506459926754	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	1164	1928	169683	183855	FALSE	80	CATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANYDLPASINFILSKTGQEQLYYVGHSQGTTIGFIAFSRIPELAKRIKMFFALAPVVSLNFVTSPLAKLAHMPDLIYKDLFGAKDFLPENAIVKWLGTHVCSQVILRKLCENIMFVLCGFNEKNLNMSRVDVYITHSPAGTSVQNMIHWSQAVKSPNFQAFDWGSTARNYFHYNQVKSSELRRFLKTHQGSQPVIGILEGLWEVFGRVDWVGFVFLRSIPEQLKLHGWGCRLSLLSLSSSWLQIRVDIVIRYS	168519	183947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_169783_171155_171293_175054_175202_176294_176367_183546
921302	contig_10377_pilon	+	4490	1	Intergenic	novelGene_115350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	310	156	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAGAAAGTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120158	124648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_120200_124600
921303	contig_12951_pilon	+	1699	2	Intergenic	novelGene_68217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	933	1277	796605	796949	FALSE	30	CTTCCAAGGTTGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	797371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795851_796304
921304	contig_11248_pilon	-	2437	3	Intergenic	novelGene_142549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	530	979	313184	260898	TRUE	45	CCTTCATCTAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICRKMKQDPYFTPYTKTNSKWIKDLNTKPKTIKIMEEKIGTMLGALIHGINTIRTISNNAQAPEERLDNWVHVKVKHLCSSKDFTKRVKRQHTDLEKNFGYDKSDQCLISKVYKILQNLNNKRTNNPIKKWAKDMNRHFAKEDNLSG	313713	258919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_259835_260354_261250_313086
921305	contig_6326_pilon	+	2574	5	Intergenic	novelGene_168535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_3	39.5126562002607	159	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1822	2127	284987	291122	TRUE	15	CAATGTTTTGCCTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFSSPHAQATSREESELRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRSQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEK	283165	291689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_285143_286930_287015_289403_289467_291119_291203_291322
921306	contig_9609_pilon	+	503	1	Intergenic	novelGene_23038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAGAACTTCACAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334054	334557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_334100_334600
921307	contig_5020_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_27953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAGCTTAACTCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192418	191512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_191500_192400
921308	contig_7457_pilon	+	2248	1	Intergenic	novelGene_31509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGAGCGTGGCACCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669745	671993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_669700_672000
921309	contig_14679_pilon	-	3189	3	Intergenic	novelGene_174184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTACTACTGCTAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234165	96029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_98766_203391_203548_233868
921310	contig_7733_pilon	+	738	4	Intergenic	novelGene_147127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	57.3120115391762	22	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	255	590	88179	107305	FALSE	40	GTATTATTAGCAACAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHAKSWTLKKHFEGYPTNSNFELKITELPPLKNGGPPPEIIIFLELRMEGFIVTRWQGDVRQKALKDLLKWVSEGKIQYHEHIKEGFENMPAAFMGMLKGENLGKTIVKA	86546	107453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_+_86791_88168_88285_106056_106176_107194
921311	contig_19402_pilon	-	3132	6	Intergenic	novelGene_80792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTGGTATTAACTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58046	32587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_33115_33362_33973_35722_37075_47344_47387_55277_55354_57521
921312	contig_17888_pilon	-	4306	4	Intergenic	novelGene_179032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2999	3472	52904	52431	TRUE	40	TGTAATGGCCCATAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENALELTDSECNSLILRILQKLRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKRNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISRIEDKHLDTTLIEENSEKRTKKNEETLRVMRDTIKSKNF	221151	37044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17888_pilon_-_37055_51606_54771_113644_113727_220101
921313	contig_10074_pilon	-	3933	1	Intergenic	novelGene_57103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	174	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	42	129	178	306	217066	216938	NA	35	CTATCACCCCAATCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNKSWVFLRINQGKGEAAASSRASEPFRCVYSPGELCCSAGLRQSQRLCISNKLTSDGHMLACGAHFEQQESRAFYKLHRYLLLPSSHLTGSTFKLKISAS	217243	213310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_213300_217200
921314	contig_12485_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_147285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCTTTTCTCTCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124190	125628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_+_124200_125600
921315	contig_15897_pilon	-	2278	12	Intergenic	novelGene_49536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1	552	626498	625947	TRUE	50	GGAAAATATAATAGTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPRSEGVDATTSLLPGFSGRADDVTSSVFLPEDTGWVVVDAELRRLPSDNVGNDVGRAVAVVADDGTDVVTALLVCWLPNEKLALPPLREVPPKLITPEEPALVSGRLPKTPVEELLVLVLAAAGGATVVEVREEVTGGSTCFPSTGGPVKLNPEDTVEVLVDCALVRLVDEALLADFVESSA	626498	589702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_589922_593342_593530_594236_594319_594423_594509_605090_605357_606194_606355_611555_611657_616492_616568_617942_618018_620908_621005_623329_623393_625629
921316	contig_7420_pilon	-	2221	4	Intergenic	novelGene_85866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGACTTCAAATATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402309	330433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_-_330441_360124_360205_376780_377651_401045
921317	contig_10182_pilon	-	4125	3	Intergenic	novelGene_134631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1780	2367	385722	385135	FALSE	50	TCCAAAAAGAAGAAAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGNFLELLEVEYKRLIYRTLQDIRKEFMQNAEQAKEHTDKAIEELKKIRKEHNHKCNRLQESIERQQSEIQKINNKTSELDNSIGSHRSRIEVMEVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEETLRIMWDWSTRTGEVTENTERILEDLLAENFPDIMKDEKIPIQDAHRTLHKVDPKRQSPRHNQTCQNER	417301	383376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_386802_387346_387753_417007
921318	contig_678_pilon	+	4212	1	Intergenic	novelGene_167807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCATTTAAGTCTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92154	96366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_92200_96400
921319	contig_19604_pilon	+	2003	4	Intergenic	novelGene_77249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.545092761196	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	44	403	273206	273988	TRUE	20	GAATTCCCTGCTTTGGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	273162	275800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484_273577_273833_275317_275528
921320	contig_3469_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_34202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	25	TTTGTCGATAGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531100_533600
921321	contig_17074_pilon	+	2264	4	Intergenic	novelGene_145151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253391	260870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_254426_257409_257788_258269_258430_260178
921322	contig_10225_pilon	+	2438	13	Intergenic	novelGene_86801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	188	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	1120	2322	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20684	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46827_47210
921323	contig_21007_pilon	+	836	1	Intergenic	novelGene_161537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	25	447	589	1011	NA	15	AGAGTATTGCTTGCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	564	1400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1400
921324	contig_10904_pilon	-	4305	10	Intergenic	novelGene_22434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	20.0610180311081	88	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	920	2763	353	3115	87583	61644	FALSE	5	CCCGTCCTGCGCTGTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRNARLGECVNLSHRYTRLLLVKEHSNPMRAQEKLSAMGRRHAGTVAHQASPIRVETLFEPDEERPEPPHTVVLQGAAGMGKSMLAHKMMLDWAEGRLFQGRFDFLFYINCREMNQKAKRSLQDLISSCWPEQSVLLPELVRVPERLLFIIDGFDELKPSSHNPQGPWCFHWQEKWPTELLLGSLIRKKLLPELSLLITTRPKALEKLHHLLEHPRHVEILGFSEAERKEYVYKYFHNVEQAGQVFNFVRDNEPLFTMCFVPMVCWVVCTCLKQQLEGGGLVRQTSRTTTAVYMLYLLSLMQPKPGTPTHQTPPNQKGLCSLAADGLWNQKVLFEEQDLQKHGLDGADVSAFLNINIFQKDINCEKFYSFIHLSFQEFFAAMYYILDGEESGLGPEKNVSRLLADYGSSDRSFLAPTVRFVFGLLNKETRSYLEKNLCWKVSPHIKMELLKWIQSKAQSEGSTLQQGSLEFLSSLYEIQEEEFIQQALSHFQAITVSHIATKMEHMVSSFCVKHCRSVLVVHLYGAAFSADDDGVKWTSGSQTLLAQSPEKNLLPNAYSENLAAALCTNPNLIELVLYRNALGSRGVKLLCQGLRHPNCKLQNLRLKMCQVPSSACQDLAAALMVNRNLLRMDLSSNCLGLPGMKLLCEGLRHPKCRLQMIQLRKCQLEAGACQEISSVLSNNQHLMELDLTGNALEDLGLRLLCQGLKHPTCHLQTLWLKICHLTAVACEDLTSALSVNQSLRELDLSLNDLGDPGVLLLCEGLSHPNCKLRTLRLGICRLGSAACKGLSAVLQANHHLQELDLSFNDLGDWGMRLLCEGLRHPTCRLQKLWLDSCGLTAKACEDLSSMLGVNQTLTELYLTNNTLTDTGVRLLCKRLSHPSCKLRVLWLFGMDLSKMTHGALAALRVKKPYLDIGC	96520	60453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_61732_63514_63686_71079_71251_73007_73179_75004_75176_78005_78177_82594_82766_85934_87631_93272_93341_96283
921325	contig_12079_pilon	+	3790	1	Intergenic	novelGene_67470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	2728	3207	597383	597862	NA	90	AAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGGEGGPALPHPTQHDFTLLHGQASIHTVKIIHVVHPSSEGLAEVFVHEGCCLQNLEVPGLAELVQASSPEGLDLCRSHVPIGTGTWASLGGKGASSHSCSPHSASCTCVRLYAAPDAFTLWGPWLLLPTRLHDLLNRLWGQKTNAHLGPTSQRAPP	594655	598445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_594700_598400
921326	contig_6479_pilon	+	2439	2	Intergenic	novelGene_160621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGCCCACAAAGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621989	630275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_624404_630250
921327	contig_10299_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_79800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTACAAAAAAAAAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796003	797709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_+_796000_797700
921328	contig_9415_pilon	-	3278	1	Intergenic	novelGene_109859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2001015	1997737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1997700_2001000
921329	contig_5769_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_138765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTATGAAAAAAAGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200755	198674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_-_198700_200800
921330	contig_12837_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_57361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTAGCAAATAAATGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271883	273834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_271900_273800
921331	contig_17144_pilon	-	1067	5	Intergenic	novelGene_29354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2550.30003136886	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	293	772	173384	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WALQLPSLAPSWEEGAACALGAREGRREAGQVLQSPAPGLSEAEPLTTGLGERTGQWLFSGTYPEEERRGETGRPGGCLAGSSSVSRGSPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183411	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166473_172528_172740_173128_173209_173305_173405_183139
921332	contig_6241_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_156397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGGAAGCAGATTTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164846	167059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_164800_167100
921333	contig_6842_pilon	-	1658	3	Intergenic	novelGene_130702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCATGTGTGCAGAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398341	391585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_393063_394640_394770_398289
921334	contig_1244_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_37955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATTACTGTTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884344	885604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_884300_885600
921335	contig_6397_pilon	+	4966	1	Intergenic	novelGene_146286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTTCATCACAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590909	595875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_590900_595900
921336	contig_14882_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_115040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAAAGAGATTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512421	514876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_512400_514900
921337	contig_4797_pilon	+	2774	2	Intergenic	novelGene_6891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGCTTCATTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218766	279645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_219200_277304
921338	contig_12402_pilon	+	3149	4	Intergenic	novelGene_133357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAATGGAAAAAGGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475523	500493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_478130_479564_479732_483540_483665_500241
921339	contig_6710_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_94043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1	375	657526	653562	FALSE	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657526	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
921340	contig_253_pilon	+	3862	3	Intergenic	novelGene_129774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGAAAGCATCTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814732	824565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_815284_815755_818618_824116
921341	contig_8484_pilon	+	2606	4	Intergenic	novelGene_178377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	180	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGTATTGGGAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42225	46960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_+_42949_43019_44638_45969_46083_46808
921342	contig_12118_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_168902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	387	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	692	1069	21732	22109	NA	70	TTCTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMLMAALFTRAKRWKQPRCPATNERINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSKISQSQKDKYCMRPLL	21040	23574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12118_pilon_+_21000_23600
921343	contig_15498_pilon	-	3164	12	Intergenic	novelGene_42689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	298	junction_8	171.93180466262	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	553	1662	567	2228	829154	785428	FALSE	10	CATCTGTGGATTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDTSQGELVHPKALPLIVGAQLIHADKLGEKVEDSTMPIRRAVNSTRETPPKRKLADGEEEKPEPDVSSEESASTVEEQENETPPATSSETEQPKGEPENEEKGESKSSEEAKKDEKDQSKEKEKKVKKTIPSWATLSASQLARAQKQTPMASSPRPKMDAILTEAIKACFQKSGASVVAIRKYIIHKYPSLELERRGYLLKQALKRELNRGVIKQVKGKGASGSFVVVQKSRRTPQKSSNRKKKTPAVDPEPQVKLEDILPLAFTRLCEPKEASYSLIRKYVSQYYPKLRVDIRPQLLKNALQRAVERGQLEQITGKGASGTFQLKKSGEKPLLGGSLMEYAILSAIAAMNEPKTCSTTALKKYVLENHPGTNSNYQMHLLKKTLQKCEKNGWMEQISGKGFSGTFQLSFPYYPSPGVLFPKKEPEDSRGEDEDEDDSSEEDSEDEEPPPKRRLQKKTPAKSPGKTASMKQRGSKPTVKVPAAQRGKARLLPKKAPPKAKTPAKKARPTPLVIKKPSGSSSKKPAATVRKEVKLPGKGKSTMKKSFKAKK	829720	784491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_785723_786209_786324_795559_795672_797091_797252_803537_803629_813229_813385_814785_814867_820918_821063_823751_823912_825236_825391_828513_828614_829058
921344	contig_7830_pilon	-	2872	3	Intergenic	novelGene_177915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGCACTCTCCTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217623	208975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7830_pilon_-_209917_215613_217060_217138
921345	contig_2414_pilon	+	4238	1	Intergenic	novelGene_158466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186185	190423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_186200_190400
921346	contig_19939_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_179033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACATCCATTTGTGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10695	12784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19939_pilon_+_10700_12800
921347	contig_9858_pilon	-	3223	1	Intergenic	novelGene_140535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTCTGTTTGCAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255195	251972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9858_pilon_-_252000_255200
921348	contig_6192_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_170329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCATTTACTTAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129652	129143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_129100_129700
921349	contig_9528_pilon	+	4380	2	Intergenic	novelGene_172341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3060	3494	204621	205055	FALSE	65	GAAACAGATGAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISNHIKRQSMMASANSQNKESRNFPEEKNFFELLEAEYKRLIYGTLPEIRKEINQNAEHTIEEIKKIREEHNDKFDRPQESIERQKSEIRKINNKIAGLDNSIESHRSRIEAMEVRIKIEDKALDINLYEKKSDKRI	196419	205941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_+_196849_201990
921350	contig_3018_pilon	-	3631	2	Intergenic	novelGene_78783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAGCAAAATTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410047	406241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_406738_406912
921351	contig_3223_pilon	-	2238	1	Intergenic	novelGene_151835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTCTAACTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	986265	984027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3223_pilon_-_984000_986300
921352	contig_6270_pilon	+	1355	8	Intergenic	novelGene_99808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	157.946387184037	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	542	937	39429	45668	TRUE	10	TTGCTGGGTTACTGAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27380	47676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_37391_37676_39335_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_47302
921354	contig_5585_pilon	+	4836	2	Intergenic	novelGene_143083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	130	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3587	3904	619778	620095	FALSE	40	GGATTTAAATAATAGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFHNSSGLWSLMFNASNLFLRCLQIQLGYTQSRGLLIFFSFNLNLHMSNWWSVPQSAPGLVLTDDIEFSIISFHRCSQFDSCVFHLARSTNIVATYVVVKRYLQ	488827	621027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_491376_618739
921355	contig_6673_pilon	+	2120	1	Intergenic	novelGene_164028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTTGTTCCCTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148439	150559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_+_148400_150600
921356	contig_6137_pilon	+	1175	1	Intergenic	novelGene_59129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875443	876618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_875400_876600
921357	contig_13456_pilon	+	3849	14	Intergenic	novelGene_153287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_11	443.323115363258	753	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	12	2237	305013	354546	FALSE	15	CTCTAAGCCATTTCCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDPQAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSMILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMSLGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITARVSSEQEHFLIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDVVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCIVHIHTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILRNHGLVSVGETVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLDPGKYKAKSRSPESPAGEGSTGSPPRWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVPGYSFASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDDASEEGQNGSSPKSKTKWTREDGHRVSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQNLQDIKTAGPQSQVLSGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFNTLTDRELEEYRREVERKHRGSEENVDETREQKDKSPPDPPAAPQTPPSTPIKLEEDLPQEQTVRDDSDAAALKPTLPDLSPDEPSEALGFPTLDEEEEEGLGEAPDPQSPPKSPLAASPEPAPAQVAEEAASPAAEEGAAVDPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS	305001	356158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_305208_307142_307306_319232_319385_330938_331020_332828_332979_334116_334261_334364_334464_335179_335360_338916_339169_341967_342070_342732_342823_349424_349582_352158_352258_354184
921358	contig_10861_pilon	-	1767	1	Intergenic	novelGene_39448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCATCTTTCTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2585749	2583982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2584000_2585700
921359	contig_15047_pilon	+	1654	6	Intergenic	novelGene_52229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	4	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	342	617	3242	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2200	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
921360	contig_5586_pilon	+	2765	1	Intergenic	novelGene_143621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	835671	838436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_835700_838400
921361	contig_13453_pilon	-	5322	2	Intergenic	novelGene_146708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	341	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	675	1031	84532	84176	TRUE	25	CTGGAAGTCTGACCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISEFWIMLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAGVECSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFIESGVLKSPTVIIELSVCLFSAVRVCFMYFGALSFGA	85206	78194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_79349_81038
921362	contig_91_pilon	-	2966	1	Intergenic	novelGene_127098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	35	108	233	340	314593	314486	NA	45	TAGAATTATTGGAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPFLYLTFSGHSQSLPLKGGELPKRLHRRCLAEWCCGPHIVLPLKFGTPWFGSPRTPCCSSCLCSQLKEKSQACGGNMGSIEELRGAIYLAEEACPGISDTMVAQLVQRLQR	314825	311859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_311900_314800
921363	contig_8980_pilon	+	1502	13	Intergenic	novelGene_73991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	46.0503951002474	20	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	29	1477	2011	70752	FALSE	30	AAGATGCTTCAGATGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSEEVYWSEMEASIILPILKKKLAFLSGGKDRRSGLILTIPLCLEQTNMDELSVTLDYLLSIPSEKCKARGFTVIVDGRKSQWNVVKTVVLMLQNVVPAEVSLVCVVKPDEFWDKKVTHFCFWKEKDRLGFEVILVSANKLTRYIEPCQLTEDFGGSLTYDHMDWLNKRLVFEKFTKESTSLLDELALINNGSDKGNQQEKERSVDLNFLPSVDPETVLQTGHELLSELQQRRFNGSDGGVSWSPMDDELLAQPQVMKLLDSLREQYTRYQEVCRQRSKRTQLEEIQQKVMQVVNWLEGPGSEQLRAQWGIGDSIRASQALQQKHEEIESQHSEWFAVYVELNHQIAALLNAGDEEDLVELKSLQQQLSDVCYRQASQLEFRQNLLQAALEFHGVAQDLSQQLDGLLGMLCVDVAPADGASIQQTLKLLEEKLKSVDVGLQGLREKGQGLLDQISNQASWAYGKDVTIENKENVDHIQGVMEDMQLRKQRM	1982	70777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_2066_4851_4961_16480_16572_23406_23521_35876_35991_38102_38201_39811_39868_44402_44615_59360_59484_64510_64706_65231_65347_67149_67311_70746
921364	contig_17753_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_105114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCTCATATACCCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146014	145043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_145000_146000
921365	contig_7730_pilon	+	2151	13	Intergenic	novelGene_156264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_10	42.2895935452473	44	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	112	1554	68782	307284	FALSE	25	CCCACCCAGAGTTGCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSWSPLLILRSLVQRRLRRCVGCGDWAAALVPSAAAPGKPLWKAYTVQTSESVPLAAATEAYLKALAVCHGPLDHYDFLIKAHELKDDEHQRRVMQRLQKLHEDLKGYSIGTEGLFSKLFSRKKPPRGLYVYGDVGTGKTMVMDMFYAYVEVKRKKRVHFHGFMLDVHKRIHRLKQSLPKRKPGFMAKSYDPIAPIAEEISEETCLLCFDEFQVTDIADAMILKQLFENLFKNGVVVVATSNRPPEDLYKNGLQRANFVPFIAVLKEYCNTVQLDSGIDYRKRTLPAAGKLYYLTSEADVEAVMDKLFDELAQKQNDLTRPRILKVQGRELRLNKACGTVADCTFEELCERPLGASDYLELSRNFDTVFLRNIPQFTLAKRTQARRFITLIDTFYNFKVRMICSALTPLSSLFLHQHHDSELEQSRILMDDLGLSQDAAEGLSMFTGEEEIFAFQRTISRLTEMQTEQYWNEGDRNKK	68670	307881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_68918_99554_99779_132372_132425_147807_147910_149018_149150_158224_158325_190134_190194_226510_226594_259248_259320_259575_259677_300042_300184_303770_303885_307155
921366	contig_14450_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_49013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCACCTTAAGTACAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1173701	1175153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1173700_1175200
921367	contig_12079_pilon	+	1815	9	Intergenic	novelGene_67506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCTGACTGTCCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860594	871674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_861538_863504_863581_864501_864700_866538_866649_867246_867409_868245_868420_871110_871170_871499_871562_871643
921368	contig_12427_pilon	-	2763	1	Intergenic	novelGene_40479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCTGCATTTAACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316999	314236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314200_317000
921369	contig_2438_pilon	+	1958	2	Intergenic	novelGene_112067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	512	850	311851	312412	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	311339	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305
921370	contig_2703_pilon	-	5399	14	Intergenic	novelGene_101805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	4767	5228	767885	761371	FALSE	20	ACTCAACTCACTTGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPYSAANRYFSAISSFLTAEALGIWDALVSLGHALGRQAAHLLDDPEPLLSLVFALQAQHDHVGVHRRDLQLVLLLPHLLLLVDDAAAQQVHVQLRAVVLGGFVALESGVLDDTELLGPLPQPLLAPQEGADAGITHQLDAGLGRGPLVGG	781863	761199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_761509_762747_762930_766148_766239_767833_767919_768659_768769_771102_771313_773181_773330_774063_774175_774799_775039_775122_775295_775578_775738_777251_777447_777562_777683_778593
921371	contig_2093_pilon	+	3413	1	Intergenic	novelGene_152938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	877	1488	958641	959252	NA	25	AAAGTCCCTCTCAACCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRKEPPTSKILLKKKNKVLYYLILPSLRIYYTAMVVKTAWYWYNRHTDQWNRIENPEINPSIYGHLIFDKRSKSIKQGKDSLFNKQFWQNWITICRKMKQDPYLTLNTKTNLNSIKDLNVKPKTIKPMKENTGTVLGTLVYSINRISNITKNAQTPEDKLDNWDLLKIKYLWLIQRLFQDSKKRTFRLGKKKSLATTYLIKV	957764	961177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_957800_961200
921372	contig_2161_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_114975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093520	1094176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_1093500_1094200
921373	contig_1624_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_138366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31883	31250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_31200_31900
921374	contig_10023_pilon	+	1635	2	Intergenic	novelGene_123478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGCTAAACCTGAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134066	136558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_134247_135103
921375	contig_10496_pilon	+	1153	1	Intergenic	novelGene_59435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGTCCTCCAAGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172613	173766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_172600_173800
921376	contig_4924_pilon	-	2124	7	Intergenic	novelGene_84703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	1239.49057636147	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	20	766	252576	82377	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252595	81018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
921377	contig_13021_pilon	-	1561	2	Intergenic	novelGene_8092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	728	1051	80302	79979	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLVLERKVAKVNGRNEEVKELKRFPRVNQEDKVKYYNEMCKDMELENQKRRTCLAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSRGKILKDSGSIKRRWKEYTESLYPK	81029	36899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_37106_79674
921378	contig_2054_pilon	-	2705	2	Intergenic	novelGene_51653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	151	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAATAAGAATCAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19424	10271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_-_10441_16888
921379	contig_5261_pilon	+	2917	1	Intergenic	novelGene_102475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAATTATTTCCCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655715	658632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_655700_658600
921380	contig_5696_pilon	-	1946	5	Intergenic	novelGene_117597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	513.886843089021	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAAGGAAATGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773015	763552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_764684_764836_765050_765887_766008_767338_767784_772978
921382	contig_7151_pilon	-	823	5	Intergenic	novelGene_40789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	972.766929947765	586	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGTCTTTGTCATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551203	528875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_536388_536494_549638_549729_551152
921383	contig_4180_pilon	+	1176	7	Intergenic	novelGene_8354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1707.08881497777	54	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	41	598	865772	888134	FALSE	10	AGCTTTGGAGCCGCCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865731	888712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875219_875317_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
921384	contig_19514_pilon	+	2377	2	Intergenic	novelGene_166313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAACAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19510	21934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_+_19635_19681
921385	contig_17427_pilon	-	2438	12	Intergenic	novelGene_30364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1065.98141642586	1	107	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	139	747	186489	179824	TRUE	20	AAACTTGCTTCGTTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHGDPETCI	188798	176955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181266_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
921386	contig_6164_pilon	-	4286	1	Intergenic	novelGene_121302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	3706	4227	718845	718324	NA	40	TCAACTCAGATAGAGAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVTGVPEEVRITENTETIVKDMLTENFPHIMKDETISIQDADQTPDKVDPKRKSPRYIIIKLGKTKDKDRILRAAKDTRKVIYKGESISISSDYSAETMQARRQGDDIYKALKKKNCQLRVIYPAKLSLKYDGKIRAFPGKQKFREFAKTKPKLQEILRESFS	722550	718264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_718300_722600
921387	contig_1939_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_144868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTCCTATGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295234	297390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_295200_297400
921388	contig_4091_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_173028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	69	506	13212	13649	NA	55	AAATTAACACTAGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	13143	14786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_13100_14800
921389	contig_15857_pilon	+	2152	4	Intergenic	novelGene_152074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	272	junction_3	79.0330451281122	17	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	192	512	98584	100874	FALSE	65	AAGGTAAAAGCAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFVDKEEKDAIEELVKYQLEKTQRFLKERHIDAVEDKIDEEVRHFRESRQRNTNEEDDEVREAMNRARAHRSQLEDFASAFSADDFMSVDLTEEMADDSDDSISAAASKGRGRGRGGRGQNSTSRGGSQRGRGTGLVTSSRGRGSKAAASTSFRNMSIIDGEYRLLVII	89328	102514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_+_89454_94923_94987_98580_98792_100761
921390	contig_7912_pilon	-	2916	1	Intergenic	novelGene_129581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAACTACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345939	343023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_343000_345900
921391	contig_14829_pilon	-	4059	1	Intergenic	novelGene_163825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCAGATGGGGAGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180689	176630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14829_pilon_-_176600_180700
921392	contig_5928_pilon	-	2336	1	Intergenic	novelGene_40357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	827	1339	165086	164574	NA	65	GTCAAAGACATAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKILSLLLRPTTQKKRFLSKYYCSLTMHLVTQEMEMYKEINIVFMPANTTSILQPMDQGVISTFKSCYIRNRFPKAIAAIDSDSSDGSEQSKLKTFWIGFTILDAIKNIRDSWEEVRILTLTGVWKKLIPTLMDDFEGFKTSVEEVTADIVERARKLELEVEPEDVTELL	165912	163576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_163600_165900
921393	contig_10239_pilon	+	3774	1	Intergenic	novelGene_175249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTGGGCTCAGTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49441	53215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10239_pilon_+_49400_53200
921394	contig_14405_pilon	-	2433	15	Intergenic	novelGene_85659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	187.359321375058	49	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	371	2056	885922	725517	FALSE	40	AATGAAAAATTATTGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKRKIWCNLCIDLVAFTGEIFKGAVFQSLDGIIVSANCKLRKIFTLKSKPQDTTDKDDEPTDIIPRSCQLTTDVPQVTQLLNMTKLRQTEIQFGGHPLRSAESDQFIHRGGSVRNNKSQDVCHIAFGSKVLGPPPLSGRRNNMRLSSETVRSIGSKNHRSCLQSTVEKCVSSTDVSALLVSESEEQGDKENIRQIKQPVPVHAGLHIMHPHPPQEPLADKKNNSRRLRVQSTGRDRTETPGGSSSGNNRSEDKATPVLTSVSQQREETVKPSTLGPQAPDPADEWIFPENYDRIPHLESSRRSLLLDDDSFSASHLWPEVSQEHDHSRQAEETQIVAKDIFTFSSRPRSAPRGKTQSTSPEECALVWDLKESNSGPNGGAQLEDDSSEEEYDCRNYQPSQMSESELQMLASLRRQQNEELEEAGALHGLSASQVDNCNVSISTSSDDTTTWNSCLPPPVNQGRHYQKEMNPPSPSNPRDWLSVFSPPIVPPSQQPTEQRLESSGSLSAQEYSWMIFTYSDSQKRMHCELVRLYGHMLLALVPLFPFHYSLSRVCQRSQHR	995970	725139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_725672_740543_740639_782994_783057_793361_793566_821212_821533_823860_823984_825531_825649_826980_827144_827836_827971_844997_845136_866566_866724_885904_886020_989814_989909_993288_993379_995881
921395	contig_8330_pilon	+	3788	1	Intergenic	novelGene_71898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2705	3052	1096827	1097174	NA	65	ACAAGAAAAACATAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQTLMASASAQNKESRNLLEEENFLELPEVEFKRLIYRTLRDIRKEIRQRNKPRNTQTKQQRNLRRLEKSIMTNLTGCRNPKRDSKQKSRRLTIKFQNQTIQ	1094122	1097910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1094100_1097900
921396	contig_854_pilon	+	3995	24	Intergenic	novelGene_36581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	3283.94962246277	10	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1063	3192	84	3275	1679334	1715249	FALSE	35	ATAAAAAGGGGTTTTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEARERPRPGKE	1679250	1715969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697741_1698938_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709199_1715226
921397	contig_15666_pilon	-	1608	4	Intergenic	novelGene_70190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	799	junction_3	502.617813718004	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	595	1026	108757	107816	FALSE	25	GGTCCCATGAATTATGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	109591	107233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098
921398	contig_5321_pilon	+	3642	2	Intergenic	novelGene_153865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGATAGTTTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17538	21697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_+_18730_19246
921399	contig_13021_pilon	-	3274	3	Intergenic	novelGene_8280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_1	258.5	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2083	2484	253082	252681	TRUE	15	TGAGACTCCTTCCTTTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKSNHIALGKSAAKDLFKMLKGKDVTLITKVRLTQAMVFSITSYVCESWKMNKEDGRRIDAFELWCWRRILSIPWTDKTTNKSILEVVHPEGSLEAKMARVHLMYFGHVIRRDQPLEKDIMLWKVEGQ	255164	249616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_249915_251082_251152_252257
921400	SIRV6	+	619	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	196	-270	9	90	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	16	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	69	210	88	297	2569	10736	FALSE	40	AAACGTCACATATTTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	2481	11058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
921401	contig_8065_pilon	-	2957	1	Intergenic	novelGene_107342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTCATCACTTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245648	242691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8065_pilon_-_242700_245600
921402	contig_17212_pilon	-	4189	1	Intergenic	novelGene_88610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	206	621	418	1038	85957	85337	NA	10	TCTTCCCAGCACGTCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSAVPKNLFLLPKKKVSHSSKKGGHSSPASSDKNSNGNHRRRTADAEIKMQSTPAPLGKTRARSSGPAPVPLPSSSFRSKQNVKFGTSVKSKKPNSSLRNSSPIRMAKITHVEGKKPKAMAKNHPAQLASKASRNLHVRVQKSKAVLQSKATLASKRRTDRFNMKSRERSGGPITRSLQLAAATDVGENRREDSSAKQELKDFR	86374	82185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_82200_86400
921404	contig_12250_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_80736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAATGGAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417306	414898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_414900_417300
921405	contig_8204_pilon	+	1948	6	Intergenic	novelGene_176991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_4	112.054629533991	18	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	3	1634	18967	63532	FALSE	15	TCATCCAGCGTCTCTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLASEGVKIEESKQIKTKESDGGRIKELEKGKEEREIKVEKTDEGNLQKEAEFEKSAKENVRDSKDLRNFEELQVDNIMAIKMEDPKEIKKEELEEDQKCSLFPDFSYSASSKIIISDVPSRKDHMCHPHGIMIIEDPTALNKPEKLKKKKKKSKMDRHGNDKSTPKKTCKKRQSSESDIESVIYTIEAVAKGDWGIEKLGEAPRRKVRTSSSGKGSLLDAKPPKKKVKSREKKMSKEKLSDTTKESKLPDFISLSASKSISGEVPEGIKAEPLTPMEDALPPSLSGQAKPEDSDCHRKTETCGSRKSERSCKGALYKTLVSEGMLTSLRANVDRGKRSSGKGNSSDHEGCWNEESWTFNQSGTSGSKKFKKTKTKEDSLLGSTKLDEEFEKKSNSLPQYSPVTFDRKYVPVPRKKKKTGNMSSEPAKTSKGSGDKWSNRQLFLDAIHPTEDDKPKEQLQRSLPKTAETDCNDECLHHSEAAGTRSSTPDMPAVSAFFSLAALAEVAAMENVHRGQRTTPLTHDGQPKEMPQAPVLISCADQ	18964	63846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8204_pilon_+_19976_20988_21128_25972_26122_45005_45066_57899_58087_63444
921406	contig_8452_pilon	-	2107	7	Intergenic	novelGene_48018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	232.542947048975	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	460	927	380814	316088	FALSE	15	ACTTTTCAGTATGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYNSRVLKIHQVLCIPSWMAKLFSWTLEPIFSSSEPTSEARIGMGATVDIQRQQRMELLDRQLTLSQFAHARRQRQRQGGMINWNRLFPPLRQQRSVNYQDDRPSEQQASPPLEASEEQVARLMEMGFSRGDALEALKASNNDLNVATNFLLQH	509720	314907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_316196_332026_332150_380577_380824_412328_412377_416565_416690_504933_505091_509599
921407	contig_3832_pilon	-	2797	1	Intergenic	novelGene_161458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGCAGCAACTCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347296	344499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_344500_347300
921408	contig_7979_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_125550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCTGTGTCTTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1104425	1106672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7979_pilon_+_1104400_1106700
921409	contig_11908_pilon	+	1267	1	Intergenic	novelGene_133223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATGAAAAACTGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616411	617678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_+_616400_617700
921410	contig_6217_pilon	-	1901	2	Intergenic	novelGene_109619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAAAAAAATTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433941	431972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_433128_433195
921411	contig_2770_pilon	-	1480	1	Intergenic	novelGene_107404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCATAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113472	111992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_112000_113500
921412	contig_17171_pilon	+	1450	5	Intergenic	novelGene_147378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.20565096031518	60	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTGTTGATTCTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318437	327169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_318671_320563_320761_322300_322371_323711_323849_326356
921413	contig_8377_pilon	+	4686	5	Intergenic	novelGene_35159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	4171	4677	453226	453813	FALSE	15	ATGGCAGATCCGTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKRVRERRKLKSKDLASKPRGTAWLEGAPKPRKEKENKQIKAEQIRANKKAPGGPTSMAVIERREGEVVRRKEEIERSRKKQHQQPTYDTQGAGQCGRVESKWHWGEACASQPIDCGCRKQRRPSGGEERWRVGKPISWVTVCSVSCWKLREASFSYLLFADLQ	292587	453822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_292954_293390_295178_298594_299329_451942_453415_453495
921414	contig_5419_pilon	+	1561	1	Intergenic	novelGene_15542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCCACAGCCCTACGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428088	429649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_428100_429600
921415	contig_233_pilon	+	1923	10	Intergenic	novelGene_14549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	339	848	78477	91651	TRUE	15	CCAGCTTCCCATCCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78138	104223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91676_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151
921416	contig_5988_pilon	-	1497	1	Intergenic	novelGene_15908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAATATATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627669	626172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_626200_627700
921417	contig_1037_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_84607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTTTATCCCAGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369930	367795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_367800_369900
921418	contig_6302_pilon	+	3559	2	Intergenic	novelGene_171683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTTTTTGTAAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38711	103376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_40225_101330
921419	contig_960_pilon	-	2031	2	Intergenic	novelGene_108199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	112	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGATTTACATCTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90538	3345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_5012_90173
921420	contig_4392_pilon	-	3591	2	Intergenic	novelGene_117288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3177	3542	40693	40328	FALSE	20	AAACCCTGGTGGCGTAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIILSLAALYLRINLEMFFLMVNAMSFLFVTPSIADHLLSDSKCPIPVHFSSLMPMIAIFIYSISFLTTSNFPRFVLHTVHVPIINGCLQLFFLIFSCATSTNEGPESLTPFTSLRLTLL	46815	40278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_43013_45958
921422	contig_9415_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_109928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	186	545	2251743	2251384	NA	15	CCATCCACTTGGGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQPLQYTPEQGRQRNGSKGQQAQKGTEVLSGFNRRGGEKKHGGEALAAAGLESEQGRKTRPETYLQFGLGLREMPSPCPHTYFLSLAFSLSSPAAAAKGGARATSLASKPGFALQLRG	2251928	2250163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2250200_2251900
921423	contig_405_pilon	+	3361	19	Intergenic	novelGene_135319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTCTGCACCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473923	529309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_474616_476069_476261_477391_477818_484513_484719_486188_486363_488802_488947_489233_489383_492270_492378_504766_504888_507635_507757_510115_510263_512961_513135_513232_513333_513983_514073_515226_515296_515995_516129_519314_519452_522877_523036_529284
921424	contig_6958_pilon	-	1665	4	Intergenic	novelGene_69941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	218.769792755358	3	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	59	646	183238	149618	FALSE	25	AGCCCTTTTGTAAACGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	183296	148598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149861_154506_154590_160928_161061_183108
921425	contig_10962_pilon	-	1794	2	Intergenic	novelGene_103893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	84	455	290952	290581	TRUE	15	TTCGCCACATCTATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLQRESLYQKESVNVQPFQEAAHDQEPMVLKEEVQVTLEALAKSKAPGIDRIPTEMFQQMDTALEVLTRLCQKIWNTATWPTNGKRSIFTPISKKGDPTECGNYQTILYASKILPKIIQKQLQQYIDRELSEIQAGFRRKRGTRDIITDV	291035	288905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_290088_290423
921426	contig_5033_pilon	-	710	2	Intergenic	novelGene_28938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	3	443	465025	450093	FALSE	25	GATGCATTGTCCAAACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAQAGDRALSLQAGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLPASSVIGAFPTLPTNNLS	465027	449825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450150_464641
921427	contig_546_pilon	-	1140	1	Intergenic	novelGene_117169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATCCAAATTCTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48491	47351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_47400_48500
921428	contig_10732_pilon	-	3183	1	Intergenic	novelGene_114698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAAGGTTCGAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101114	97931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_97900_101100
921429	contig_12864_pilon	-	2512	4	Intergenic	novelGene_76392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	464.23581172599	2	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGGCCATTCAGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219010	215276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_216564_216622_217255_217823_217908_218501
921430	contig_17144_pilon	-	2425	12	Intergenic	novelGene_29218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1610.86143475579	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	35	2341	174965	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRADILKCTILSTHVLMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174999	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166894_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
921431	contig_2365_pilon	+	2274	1	Intergenic	novelGene_103763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	21	66	233	298	263333	263398	NA	65	CAAAATAAAGAAGAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKSSRDLDIRRAERETVPRDKATHQWWSPDHWGGRHTRRNRSVEYQQEVPHTTGLRTAPSLHLVGAKTQLLVAANGMCSGILAQCQSSIHPLPPPSW	263100	265374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2365_pilon_+_263100_265400
921432	contig_9981_pilon	+	4197	16	Intergenic	novelGene_121054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	287	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1511	2032	258430	265326	TRUE	20	TGTCCTGTGATAATGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCSGGRRGTGGGVSGRGSLGGGGGGLCRGPSNAPIGTGTLGFTFGGGGCLGGIAGGSSSDFIFPLEFEASWSNFFRGGRGGGTSGSSLSLCKLPHELKKDFECGKRTGAKMLLLPQELLRSTSKNTLSSEEADTGGVHGVFGEVGADIVDSSSVSAMRLKLILHGSLSNGVG	256919	306196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_258623_259677_259789_264582_264624_265149_265413_269463_269581_273396_273573_274632_274748_278228_278391_278552_278677_284912_285133_286454_286562_294259_294379_295778_295863_296228_296884_297916_298046_306125
921433	contig_6583_pilon	-	3342	2	Intergenic	novelGene_174589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1750	2058	36619	35316	FALSE	25	AGTTCTGACACCAACCGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMGERREGKEASRRSRKKQHQQPTNGTQRAGPFRWVESKQPVLPGEEIVAAGCRGGQVGVKKGGGWESVYRKLPVVQSPAGSSVKLLSRTPSLLVSDRSPR	38368	34031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6583_pilon_-_35600_36594
921434	contig_5623_pilon	-	4265	12	Intergenic	novelGene_154809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_11	341.301907020071	21	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	132	962	212514	210725	TRUE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLR	212718	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665
921435	contig_10904_pilon	-	1657	5	Intergenic	novelGene_22760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	271.49159747587	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	319	1191	662171	657826	FALSE	65	CATTAAAAAGACAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEVDRQLLLPSLS	662710	657359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_657864_660333_660634_661462_661763_661936_662445_662665
921436	contig_10749_pilon	-	1110	4	Intergenic	novelGene_133479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	725.730130435703	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	76	354	168308	167122	TRUE	10	TCTCTGTTCACCTGTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLLLERSPLNLRFGEETPAQCGNPMPGSRGQIHVLLTLGTLEVPTLSIHSLPILPVIQAPFPLPQEFPTGIQCSPHVDPLNLCHNQGIQDAHPQDPTHLLAPTLLHAHHLPLECLL	168815	163926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164573_167011_167395_168302_168346_168777
921437	contig_15449_pilon	+	4689	13	Intergenic	novelGene_33601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	660.583259745171	5	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	2057	3520	44312	51815	TRUE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTKIQVKMQMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	42255	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51179_51221_51330_51809_51932_54570
921438	contig_5715_pilon	-	3707	1	Intergenic	novelGene_127968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588634	584927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_584900_588600
921439	contig_3980_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_172333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTTAAAAAAAATTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174551	173679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3980_pilon_-_173700_174600
921440	contig_12277_pilon	+	3076	7	Intergenic	novelGene_139708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	236.272030130996	23	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	1460	2467	378343	408875	FALSE	50	GTAATACCAAAGGCAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSQLQLPLQYEWAPLKWYLHLDCIAICLLIDIYTCLASQRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRPPSKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVASFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACAADSRSSGSKLSTRNSSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNASGAESLVIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPESIIRTVKLCLWGWQTFILFGGVFSPCGCCAHRCQIREIGSQLLKAQNGSITCLCF	376883	409484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_378632_389514_389612_392066_392181_403868_404075_404651_404784_405792_405907_408819
921441	contig_10311_pilon	-	3261	8	Intergenic	novelGene_50416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	270	junction_7	1063.98922044563	215	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	775	1209	68387	67177	FALSE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68754_68868_69038_70224_70358_70446_70493_71497
921442	contig_13501_pilon	+	2939	1	Intergenic	novelGene_169060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23143	26082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13501_pilon_+_23100_26100
921443	contig_15063_pilon	+	1945	7	Intergenic	novelGene_12277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	223	1695	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27941	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
921445	contig_13612_pilon	+	2378	7	Intergenic	novelGene_157288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	72.5383040576188	56	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	748	1332	52289	53792	FALSE	85	ACAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRVDYTLLADTCNLWRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMVPVGQGIPWACHPSRTCPHCRVFPSFLDAHCQVLGQHFQNVSLNQLHPGCLGSWFPGPHPLL	49364	54838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_49410_50043_50127_51016_51154_51613_52057_52249_52428_52776_52872_53441
921446	contig_10074_pilon	+	3262	1	Intergenic	novelGene_57098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGCATAAGTTGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187352	190614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_187400_190600
921447	contig_16686_pilon	-	4447	4	Intergenic	novelGene_162109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	97.4690834173699	4958	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	66	761	246051	241401	FALSE	50	CCAAAAGACTTCACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNERIPHPGQTQEQDCLQSQYVGDDEEMAVKQENGVPAAGVEESLPSCSSDNGLSASAEGCALGVPRRGPALLQIDRHQIQAVEQSAQALELQGLGVDVYDQDVLEQGVLQQVDDAIHEARRVAQLADTEKEYQSVLDDLTSCTTSLRQINKIIEQLSPQAPTNRDINRKLDSVKRQKYNKEQQLKKITAKQKRLQAILGGAEVKVEIDSASLEEDAGEDSVNHFSVFLN	251024	237714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16686_pilon_-_241551_243877_243999_245626_246064_250971
921448	contig_383_pilon	-	3071	6	Intergenic	novelGene_126118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGAAGAAAGGTCATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153812	136074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_136795_141854_142032_143970_145290_148650_148831_150745_150862_153253
921449	contig_10722_pilon	+	2018	2	Intergenic	novelGene_70989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1584	1955	32043	32414	FALSE	55	GCAAATCATAAAAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIQDAINDVYSGVSENRISAASYIDIDKEVTTEMDDINLQEIVDSQSKDDDDEDDEDLPLEEPEPLSQTQVFNYIKALKEFGKVKGDQEFFDKATDLEICFNNFIKKTKQTKQLTLDVFIKK	30284	32477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_31754_31928
921450	contig_14160_pilon	+	2174	4	Intergenic	novelGene_171542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	402	992	3962	7528	TRUE	25	AATTCTGAGATGATGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSFTASGSGTWADDQSNCVPRKVSGSESGSEWEGEAPLGGLREVLRLVWVLDIHPLILLLRPALMQGLLHPVQPVFSFVLRRGTQGQLLAREDQIKAPIAVGWPHRLTAQQGAVLHTGAFLIAQVEAELQWGKLAEEFFPDAHGTPPFQRAQLHEAPEWVGQPHLPPVHHAEVLMLLHGGCLGFPASWGRHTSSV	3560	27169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14160_pilon_+_4452_7427_7697_14682_15090_26562
921451	contig_5959_pilon	+	1253	1	Intergenic	novelGene_150218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACATTGACAAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444895	446148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_444900_446100
921452	contig_10902_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_65680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	338.220688863056	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	633	1598	189165	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	160602	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_160843_165571_165736_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
921453	contig_12327_pilon	-	2281	3	Intergenic	novelGene_140652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1883	2233	359130	254874	TRUE	5	TGCCTGAGGGCTTCCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRRLFSHSPVGYKSKFRASAPWERFLHRLRRKVHVLNLPLVWELLCKGTSGPKDTLCSRHCFLGSMRFPCVSACFSLAQCSSCCFGVLHLRKSKCHSPALTSSQASTLCLPL	361012	254716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_254746_254854_254983_358888
921454	contig_11512_pilon	-	2709	11	Intergenic	novelGene_43364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1263.73684365061	1	117	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	110	715	609650	573378	TRUE	5	GCAGTGGCCTGTGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKVRRNA	622310	554961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_573287_573392_576891_576953_580068_580156_581645_581707_582722_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
921455	contig_10225_pilon	+	2539	13	Intergenic	novelGene_86780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	1134	2426	42707	47636	FALSE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20670	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46884_47177
921456	contig_13744_pilon	+	1712	14	Intergenic	novelGene_77146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_1	43.2882180562472	26	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1485	226	1710	116284	166524	FALSE	20	TGGCTTGTGCAGCCCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRQRKGIKATELSEDRPAQDENVKVENKLPSGCTSGGVWRILSFAVGGTVALCSGLLTSVYLATLHENDLWFSNIKEVEREISFRTECGLYYSYYKQMLQAPTLKQGLHGLIYDNKTESMRTINLLERMNIYQEVFLSILYKVLPIQKYLEPVYFYIYTLFGLQAIYVAALYVTSWLLSGTWLSGLLAAFWYVTNRIDTTRVEFTIPLRENWALPFFAIQIAAITYFLRPNLQPLSERLTLLAIFVSTFLFSLTWQFNQFMMLMQALVLFVLDSLDMLPAVKVTWLYGIQITSLFLVCILQFFNSMILGSLLISFNLSVLISRKLQKNLKTGSFFHRLGKLLLHLFMVLCLTLFLNNIIKKILNLKSDEHIFKFLKAKFGFGATRDFDANLYLCEEAFGLLPFNTFERLSSTLLFYAYVFVLSVTVIAAIAVAFHNLSDSTNQQSTGKMGKWTVELKPETAYNLIHTILFGFLALSTMRMKYLWTSHMCVFAS	113648	166526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_113835_116244_116384_121070_121205_140241_140333_144434_144557_145170_145317_146734_146859_147392_147528_157667_157800_159533_159636_162017_162092_162266_162426_165964_166088_166481
921457	contig_11248_pilon	+	2942	1	Intergenic	novelGene_142544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	345	2597	2941	190901	191245	NA	30	AGGGAGGGAGACGTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGVSAPSRRASTEHPSNVPGLVVLSAPGGEPEAAGARARTAGHRPATAQVSSSLASGASVRRPLSKLVLEARDTLPTFPEGHRGGGRGRKVLSRAVVALTAVLALSLQAALDT	188304	191246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_+_188300_191200
921458	contig_18291_pilon	+	4016	3	Intergenic	novelGene_173328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAGAGAGAAAGGTTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14112	20199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18291_pilon_+_14742_14778_14885_16918
921459	contig_14792_pilon	-	1634	2	Intergenic	novelGene_170485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGAAATACAAGACAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70775	38961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_39129_69308
921460	contig_12520_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_161087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	895	1317	587621	588043	NA	35	CTAGAAACCTGTAGCCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPSAHLCKPRGKSPCHAALPGQKGLPAQEKEKKTNNSKETNKQKPRDPTSAAAQTGKQLHTRTEIHSPSGRSKDGARSQVFEQKEGEVVRGKEQIKRSGKKQHQQPTNSTQRAGPCGWVESKQPVFPSQEIVAAGSRGG	586726	588928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_586700_588900
921461	contig_17074_pilon	-	1014	1	Intergenic	novelGene_145162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAAAGCCGTCTACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552056	551042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_551000_552100
921462	scaffold_21177_pilon	-	1629	1	Intergenic	novelGene_145485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTGGCTAAACAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183188	181559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_181600_183200
921463	contig_5084_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_64589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	105	527	913252	913674	NA	20	TACCTCACACCCAGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTKRSIFSHSPVGCKPNSGSAPRERFLCQLRRKVRVISLPLVWELLCAGTSGPKDAFCFRHCFLGGMRFPCVSAHFSLLYPKRDWLKTIFNLVDLISITAANPSYYIILIEFTTHKEITSDYKMVHNHTILGIMTQSK	913147	914586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_913100_914600
921464	contig_6871_pilon	+	2249	3	Intergenic	novelGene_21554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	833	junction_1	150	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	75	1211	121971	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121896	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940
921465	contig_4350_pilon	-	3423	1	Intergenic	novelGene_136386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	185	558	2586	3143	260890	260333	NA	30	CAGGGATAAGCCCAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPHPVIVTSGLLAFCSSPRVGKGLQSRSPTRPPHPMTPSCPPAQPLPTTLLLSAPLSPGSWWGMIHNLQPGHETGHWSPPPQPRRWRPWPGHPEAQVSRLPSISVCHLPPGSLSSQNSIPGSSQGRGGADSTPLSWILPRHLAASALVLAFGTLPPQPLPSLGCGEQLPAVPGRLRYWTPSDP	263475	260052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_-_260100_263500
921466	contig_19459_pilon	-	1350	8	Intergenic	novelGene_59820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	192	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	227	1012	16240	7003	FALSE	15	TTCTTGTATTTATTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19190	6664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
921467	contig_16211_pilon	+	2137	6	Intergenic	novelGene_150102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTAGTAAGCTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202724	223633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_204404_205330_205454_211934_212035_221218_221291_222658_222772_223583
921468	contig_6743_pilon	-	2595	1	Intergenic	novelGene_33541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192032	189437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_-_189400_192000
921469	contig_6361_pilon	+	2295	2	Intergenic	novelGene_23875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTATATCTCAGATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59184	63825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_60214_62559
921470	contig_12644_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_44530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTGTGGGGTTGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417030	1418806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1417000_1418800
921471	contig_14322_pilon	+	4692	6	Intergenic	novelGene_115649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	88	324	424007	449328	TRUE	30	CTCCTGCAACCACCATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVYAILASKKHSSCFSSKTDLLVLLTVCGMVSILHQHHNSKASILPSSLFFVQLLHAYEAIENTVAWVRRTSVFRVTSLLFNTLKRSFAADLPKATHYLISFLFVYC	417737	456679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14322_pilon_+_417747_423928_424242_449326_449763_450511_450864_450910_453379_455565
921472	contig_14068_pilon	-	4300	1	Intergenic	novelGene_165959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGGAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31902	27602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_27600_31900
921473	contig_16411_pilon	-	2552	1	Intergenic	novelGene_77371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATGAAAAGAAAATACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312406	309854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_309900_312400
921474	contig_3627_pilon	+	1934	14	Intergenic	novelGene_78437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_13	244.014768201828	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	818	1138	304403	309452	TRUE	30	CTTTGAAAGTGATAGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTKNSDTTKSESISNPTFTEDSSCCTSANCTTDYIWCSGSAPAPVTAAGTDFSSFYYTATADSATAFITAATAESWFIAAPCPYSFTATTSTKVRSTVQILRKE	292732	316053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_315965
921475	contig_10323_pilon	+	3355	1	Intergenic	novelGene_123546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCCCGGGCCAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263611	266966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_263600_267000
921476	contig_5020_pilon	-	2804	9	Intergenic	novelGene_27890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1831	2178	124926	123330	TRUE	20	TCGCAGTCCTCGATCCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	127649	118501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118564_119436_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656_126018_126343
921477	contig_15114_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_121114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	961	1530	90863	112607	FALSE	15	GGTCCATGTTTCAGGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRADSTADGCGGWQVPNPWVRRQAGDFSFLMWLQGLMNPKSAGQTAGYWLTGLQELANPKICKSELFQVLWKRIPRGEGVLCLLVNVPHQGQATEEQEEDHENRSDEDDGNNPGGCRFVIGCLLTDWLTPFPSFVQIRKKSLNLNTVSCPQLQISEDLKIIRSGNLKLFIGAIFPVLHIINPQGIKILH	89902	112607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_90888_92430_92604_106815_106974_109493_109642_112541
921478	contig_13453_pilon	+	3924	2	Intergenic	novelGene_146729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1904	2203	180257	180556	TRUE	70	ACTGTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVVLDVIPQLVWYLVISVQYVKSVLEMAFKFRWDMLQVVIWLSWTCSNFLQLQLELAWEQLKACSTVSPWPCSADDIELFHHLFSTDVVDLIPVYSMW	178353	182600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_+_180751_181073
921479	contig_9121_pilon	-	3415	1	Intergenic	novelGene_134426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATCTAAAATGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43275	39860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_39900_43300
921480	contig_9269_pilon	-	2606	4	Intergenic	novelGene_177817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAACAACATTTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359780	79905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9269_pilon_-_80022_80247_81731_208535_209126_359363
921481	contig_14450_pilon	-	3845	1	Intergenic	novelGene_48944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2889	3248	528401	528042	NA	35	TGGAAGAATTAACGCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRNLEDSYLANQLEEIQICAHSKGDPTECRMYRTLSLISHASKILLKIIQKRLQQYINRELPDIQAGFRRGHGTRDITGDVGWTLAECRQYQKDVYLCFTDYAKTFNSVGPSKLRITL	531289	527444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_527400_531300
921482	contig_5961_pilon	-	2958	2	Intergenic	novelGene_144166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTCACTCTGAAAAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266447	243872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_244122_263738
921483	contig_3822_pilon	-	2551	2	Intergenic	novelGene_133329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATGCTATAGAATAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300875	298258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_298709_298774
921484	contig_11780_pilon	+	3618	1	Intergenic	novelGene_134303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCCAGAAGAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45682	49300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_45700_49300
921485	contig_17993_pilon	-	5593	7	Intergenic	novelGene_61928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCACCGCCGCCACGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80298	55367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_-_55434_67120_67321_68448_72674_72894_73053_76161_76298_77878_78017_79628
921486	contig_9363_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_6733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATACATGAGACTAAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1487579	1485143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1485100_1487600
921487	contig_5260_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_144409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAATCTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483033	481458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_481500_483000
921488	contig_5711_pilon	+	2869	3	Intergenic	novelGene_80268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTTTTTTAATTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58620	135773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5711_pilon_+_60605_61037_61264_135114
921489	contig_6062_pilon	+	641	1	Intergenic	novelGene_5307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTCTCAAAGGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796833	797474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_796800_797500
921490	scaffold_12510_pilon	+	2778	2	Intergenic	novelGene_151417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCATTTTATCATCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629157	632353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_629332_629749
921491	contig_6397_pilon	+	3077	1	Intergenic	novelGene_146275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAGTCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526337	529414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_526300_529400
921492	contig_11825_pilon	+	2217	2	Intergenic	novelGene_155421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	32	junction_1	0	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAATCACCCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118395	120686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_119186_119259
921493	contig_14405_pilon	+	1681	4	Intergenic	novelGene_85617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_3	12.684198393627	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2	379	312699	325709	FALSE	35	GAAGGCAGGAAGGGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLCSYVRFKVPQQILQGLVDVRIPHNDFYRKLFFEIVSERSRHSLHQNMDKIKVPTQIIWGKQDQVLDVAGADMLAKSIANCQVELLENCGHSVVMERPRKTAKLIIDFLASVHNTDNNKKLD	312697	327011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_312744_317667_317723_318167_318269_325532
921494	contig_5961_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_144184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTAAACCTTCATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319732	317839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_317800_319700
921495	contig_13958_pilon	+	2810	1	Intergenic	novelGene_129537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACTGACAGAAAACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177646	180456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_177600_180500
921496	contig_8354_pilon	+	3388	2	Intergenic	novelGene_24121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	33	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	201	1199	465032	466030	FALSE	30	GACAGCTTGACTTACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPLNCSFNDVDELMKVLQLAVHIPTFILGLVLNLLAIRGFSTILKKRWPDYAATCIYMINLAVFDLLLVLSLPFRMVLSRTQVPFLSFCTMVECLYFISMYGSIFTICFISLDRFLAIRYPLLVSHLRSPGKIFIICCSIWVLVWAGSIPVYSFHGETEEYKCFHNMSDGTWRAETFFPLEVFGFLLPLGIIGFCSSKSIHILIGRRAHTQDWVQQKASIWTIGASLAVFVVSFLPVHLGFFLQFLVRNGFILECRAKQNISLFLQLSLCFSNINCCLDVFCYYFVIKEFRMDIIVHRPSTASLVLQDTMITRTEGREALSEEENPSPEFQ	448323	468219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_448378_464885
921497	contig_6027_pilon	-	3912	1	Intergenic	novelGene_74426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	3083	3427	208187	207843	NA	20	TAAGTTCTACTCTGTCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMILFNNFRILLDHLSFQQAQIWISSSQLARQLSSKFLGIDKWALPVSHPFAETSQLVFCQFLEPCFSPMPSAQFGLLPSLPSVLYHIPPPEMAEHQLTLFDTVTLCIPSIFF	211269	207357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_207400_211300
921498	contig_6199_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_126365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAGCTGGAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173917	172890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_172900_173900
921499	contig_6137_pilon	-	2843	1	Intergenic	novelGene_59268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCTGCAAGCTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332676	1329833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1329800_1332700
921500	contig_11855_pilon	-	1151	1	Intergenic	novelGene_67126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGGCTTCTCTGGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2651974	2650823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2650800_2652000
921501	contig_12250_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_80738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	510	1028	425799	426317	NA	70	TGTAGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKRNGVAVLVKKNVSRSVLKHSAVSDRIISICQQGKPVNLTAVHIYAPTTNAKDTEDFYELLQSDTDHTCNQDALINTGDWNMKVGNKEEGSVVGKYCLGDRNNAGDHMIEFPSLKLVNFSPCGGLSGALVAQWLKHSAANQKVGGSNLPATLQEKDVAVCFHKDYSLETL	425289	427606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_425300_427600
921502	contig_9113_pilon	-	2182	5	Intergenic	novelGene_68581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	688.770054154505	12	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	283	843	348512	347822	FALSE	30	TGTGACTGGAAATGGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERILALSNKQALTG	363765	346482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_347858_347987_348568_352030_352088_354153_354278_363719
921503	contig_10475_pilon	-	5619	2	Intergenic	novelGene_148743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCTCAGATTCACCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258674	242950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_-_246871_256975
921504	contig_10953_pilon	+	1992	2	Intergenic	novelGene_42602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACGTCTGGCTCTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461630	464464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_462976_463817
921505	contig_7467_pilon	-	1424	1	Intergenic	novelGene_69474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTAAAAACAAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71702	70278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_-_70300_71700
921506	contig_6102_pilon	+	3514	31	Intergenic	novelGene_31881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	486.509979342665	3	81	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	52	2196	371166	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRQGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRNVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	371114	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374587_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_395003_395096
921507	contig_16934_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_132531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCTTCAGCTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185784	184561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_184600_185800
921508	contig_6929_pilon	+	2709	1	Intergenic	novelGene_139399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1108	1512	120634	121038	NA	35	ATTTTATACATACAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSSSCNIKGFYGQKIEQHRKHKKKMKGIQSLYQKESVDIQPFQEVEYDQEPMVLREEVQAALKALAGNKPPGIDGILMEMFQQRDAALEALIHLCQEMKFEDSCLASRLEEIHICAYSKERLILWNVEITEQ	119526	122235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_119500_122200
921509	contig_6842_pilon	+	4015	1	Intergenic	novelGene_130836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTAATTCAGCAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1823786	1827801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1823800_1827800
921510	contig_3132_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_127445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTACAATAAAATATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302282	303860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_302300_303900
921511	contig_5961_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_144179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGGTTTAGTCCAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286696	289057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_286700_289100
921513	contig_3018_pilon	-	2252	9	Intergenic	novelGene_78869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	466.008700964907	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	1631	2251	570362	562941	FALSE	75	GAAGGAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYET	625099	562939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570428_576676_577834_580093_580175_583417_583608_624962
921514	contig_7009_pilon	+	3951	1	Intergenic	novelGene_23668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAACTACAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521398	525349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_521400_525300
921515	contig_1759_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_171340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGATGCTCATCGAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80042	78082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_78100_80000
921516	scaffold_880_pilon	-	3340	4	Intergenic	novelGene_121496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1167	1610	544325	539140	FALSE	20	TGGAACGCCTGGGGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLIKVWCFAHQGCQRHGHLHLYSCKVTDGSEAEPHEQVEGGAGLAPGDIYAAAAVMQHALAEVCTLLHLLLKQQVSELGNEGSERGEAVRQVRGALITAQRIHQDPQDTSQQAVFTVQSRAWMIFSCMSKMIKFASVARLPLIKAS	545491	537409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_539220_541596_541725_542995_543151_544244
921517	contig_11016_pilon	+	3962	1	Intergenic	novelGene_163300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACCAAGGAGGTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219224	223186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11016_pilon_+_219200_223200
921518	contig_19816_pilon	-	1334	6	Intergenic	novelGene_156503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	271.030182821028	23	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	223	777	125593	124293	TRUE	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRSATTTRATPHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGIGVGPEFSCPTAEFQVPGRSLPAFCLYCEAPSSHLCIPSLGTCVLTLT	126200	123036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124210_124556_124658_124935_125577_125780_126164
921519	contig_16535_pilon	-	3029	2	Intergenic	novelGene_167716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2186	2563	396321	395944	FALSE	25	TTAAAGCCATCCACTCGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQDTVLRSGHPVSHASRQASLSAPQPFGPRPGLCLAQANVTKLFSNPTSAWRHLLFQQAYCLKVLCSRSGRMGREAHCTVLNWSPGLVLLLRFLCCRFSLSPVLLLSVCLLSLGGFQPRDPVMD	439310	395477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_-_397730_438533
921520	contig_7398_pilon	+	3952	1	Intergenic	novelGene_166189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACACCCAGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404879	408831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_404900_408800
921521	contig_18794_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_54635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGGTCCTCAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110376	112069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_110400_112100
921522	contig_13481_pilon	-	2534	17	Intergenic	novelGene_119512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	473.295952437531	2	87	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	771	2313	222	2534	1462670	1411861	FALSE	20	TGTCTCCCAGCTTATGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKVAKPKEPITDVSVIIKSLGEEVPQDYVCIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCEIIQSTPYGRPANISGNTSSQRIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFCKVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPMGATIECWPPNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEDNLTEKQRLLLGLASPTDGKPDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHKVPFPSPQRPRILVQLSPHDSLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTEHKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYFDLYDPPPDVSCIDLDTNTISQTGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKCKDDGLMDLAMNDYDFHSGKRLHMIDLEIQEAFLCFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDATSLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKVDMDKSGEVRLIELDESFKSEHTVFVTPPEIPHLPNGEEPPLQYSYNGFPVLRNNLFERPEGFLQTRRSKLPSKSSSPNSPSPMFRRTKQEIKSAHKIAKKYSSIPQMWSRCLLRHCYGLWFI	1501646	1411860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1411960_1412476_1412613_1415047_1415182_1426239_1426386_1427713_1427917_1430766_1430872_1437121_1437298_1437583_1437729_1439916_1439976_1441289_1441357_1444326_1444569_1445295_1445466_1447629_1447700_1459726_1459977_1462359_1462721_1473241_1473321_1501554
921523	contig_18977_pilon	+	3683	16	Intergenic	novelGene_178870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_5	37.4806616803919	173	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	900	2703	38	2740	752	29523	FALSE	50	AATAGTAAAAATCTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLQQSLRNKSLQMNDYKIALLCNAYSTNSECFTLPMGALVETIYGNGIMRIPLPGTSCVASGSITPLPMNLLDSLTVHAKMSLIHSIATRVIKLAHAKSSVALAPALVETYSRLLVYMEIESLGIKGFISQLLPTVFKSHAWGILHTLLEMFSYRMHHIQPHYRVQLLSHLHTLAAVAQTNQNQLHLCVESTALRLITALGSSEVQPQFTRFLSDPKTVLSAESEELNRALILTLARATHVTDFFTGSDSIQGTWCKDILQTIMSFTPHNWASHTLSCFPGPLQAFFKQNNVPQESRFNLKKNVEEEYRKWKSMSNENDIITHFSKQGSSPLFLCLLWKMLLETDHINQIGYRVLERIGARALVAHVRTFADFLVYEFSTSAGGQQLNKCIEILNDMVWKYNIVTLDRLILCLAMRSHEGNEAQVCYFIIQLLLLKPNDFRNRVSDFVKENSPEHWLQNDWHTKHMNYHKKYPEKLYFEGLAEQVDPPVQIQSPYLPIYFGNVCLRFLPVFDIVIHRFLELLPVSKSLETLLDHLGGLYKFHDRPVTYLYNTLHYYEMHLRERPTLKRKLVHAIIGSLKDNRPQGWCLSDTYLKSAMNAREDNPWIPDDSYYCRLIGRLVDTMAGKSPGPFPNCDWRFNEFPNPAAHALHVTCVELMALAVSGKDVGNALLNVVLKSQPLVPRENITAWMNAIGLIITALPEPYWIVLHDRIVRVISSPSLTSETEWVGYPFRLFDFTACHQSYSEMSCSYTLALAHAVWHHSSIGQLSLIPKFLTEVLLPIVKTEFQLLYVYHLVGPFLQRFQQERTRCMIEIGVAFYDMLLNVDQCSAHLNYMDPICDFLYHMKYMFTGDSVKEQVEKIICNLKPALKLRLRFITHITKMEPAVGPPQAMNSGSPAPQPNQVPVSLPVTQ	714	30466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18977_pilon_+_961_2342_2486_3468_3644_4313_4478_8514_8640_11781_11988_12077_12259_13204_13376_13749_13967_18807_19045_23401_23568_24583_24657_25865_26081_26740_26862_27542_27675_29355
921525	scaffold_880_pilon	+	2874	1	Intergenic	novelGene_121389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGAGACCAACTTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266807	269681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_266800_269700
921526	contig_7254_pilon	+	2338	1	Intergenic	novelGene_145840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAACCATCAAATGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174491	176829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_174500_176800
921527	contig_2988_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_136531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGATCACCGTTCTTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15982	13516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2988_pilon_-_13500_16000
921528	contig_12583_pilon	+	3281	1	Intergenic	novelGene_175078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	2035	2487	6975	7427	NA	75	AAAATTAAAAACTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESINSLEEENFLELTEAYYERLIYRTLQEITKEISQNAEKAKEHTEKAIVELKKVIQEHNGKSNMLQEGIERQQSKIQKIKNKISELYNSIESHRSRIEAVEVRIALKIKHLTTTYLRKNQIKELKRRRNSKSYVGLFQEK	4940	8221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12583_pilon_+_4900_8200
921529	contig_9036_pilon	-	2577	4	Intergenic	novelGene_155458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTCTCCCCTCCATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210221	148320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_150177_169590_169708_184315_184419_209720
921530	contig_20718_pilon	-	3068	1	Intergenic	novelGene_169149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAAGGTTATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71310	68242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20718_pilon_-_68200_71300
921531	contig_854_pilon	-	1970	2	Intergenic	novelGene_36193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	308	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	143	529	497521	497135	FALSE	75	AAGTAAAATAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTHHCQAIPSSSWVSGQLEHWLQNGPVPPRSSGTEQWGDGGATADQMAPEAASGGHPGTGTCTRSHSHTHAHIYTHAHTHIRADTLSDHTGSEAFIHTQPPPHSLLAQPRACGSVLPPRNGKNNTIVEVPGDSPLLGSAVGSRAPEQARRARRGKGGAPIKVLCTYLAFTHFIT	509275	495693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_497571_509182
921532	contig_11370_pilon	+	713	2	Intergenic	novelGene_98701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTCTTAATTTTAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33696	57426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_+_33843_56859
921533	contig_17989_pilon	+	3737	5	Intergenic	novelGene_150802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2682	3254	314862	315434	FALSE	30	CTTACCAGATATATGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPCFAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGFHLNIKKTKILTIGPISNIMINGEKIEVVKDFILLRFTINTHGSSSQEIKRHIMLCKSAAKDLFKVLKSKVCLTQAIVFSVTSHAYENWTMNKKTEEELMPLNYDVGENIEYTMDCQKNEQICLRRSTARMLLRSKDGKTLCHVLWTYYQEGPIPGEGHHAW	32686	315917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_32796_32843_33212_212224_212904_313132_314658_314861
921534	contig_2093_pilon	+	3828	1	Intergenic	novelGene_153013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACAGCGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457200	1461028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1457200_1461000
921535	contig_10793_pilon	+	794	9	Intergenic	novelGene_83441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3257.93445874836	7	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	9	386	160548	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	160539	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
921536	contig_9389_pilon	-	3973	3	Intergenic	novelGene_84152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCCAAATTGAGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2002743	1849870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1850420_1998959_2000323_2000682
921537	contig_5686_pilon	+	5223	2	Intergenic	novelGene_45245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	746	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93788	100408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94164_95560
921538	contig_21006_pilon	-	2729	2	Intergenic	novelGene_177720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	0	69	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17273	8847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_11128_16824
921539	contig_7229_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_39846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTAAAGCCAACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1190308	1189263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1189300_1190300
921540	contig_1534_pilon	+	2928	2	Intergenic	novelGene_176124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	31	1224	34	1227	TRUE	40	AACCTCAACTCTCATAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWIDRLNIVKMSILPKAIYKYNTIPIQMPTTFFKEIEKLIINFIWKGKKPRINKALLKKKNKAGGLTLPDFRTYYTATVVKTARYWYNDRYIDQWNRIENLDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKCCWQNWISICRKMKQDPYLIPYIKTPSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKTGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLYSSEDVTKTVKREPTDWEKSFRHYKSDKGLISIIYKTIQHLYNKKTNNPIKKWVNETNRHFTKEDIQMANKHMRKCSRSLAIREMQIQTTMRYHLTPALLGRIKNTGNNKRWRGCGKMGTLMHCWWECKMIKPFWKMIWRFLRKLEIDIPFNPAIPLLGIYPREMRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQ	3	3407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1534_pilon_+_1640_2115
921541	contig_8866_pilon	+	4043	1	Intergenic	novelGene_77841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	1061	1516	620965	621420	NA	30	GGCATCATACCCAGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQAKDCRSHQKLGRRKGGSSPRAFRESRPWQHLDFALLTSRTVRQCFKPRSWYSVTRDVVHLPSPCSTVRSFTSTFIALCSTGLSLNNSGHHGVLRPYYVSGILLRCLPCDMPPPHNKSEVRSYGGCFWRRKLELGGQYVLMSDERAKG	619904	623947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_619900_623900
921542	contig_5951_pilon	+	4686	3	Intergenic	novelGene_153235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	112	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATGCCAATGGTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150095	155106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_+_150335_150460_153406_153604
921543	contig_18364_pilon	-	2271	3	Intergenic	novelGene_102566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATGCCAAATAAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152682	118088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_118453_119228_120849_152395
921544	contig_7342_pilon	+	2205	3	Intergenic	novelGene_71216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	941	1360	695287	695706	FALSE	20	CTCGTTCATGGCAAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVKKVLFLRELSVWPHATCFLCKWLLQLGTFFFSWLRFTSFPQNVEYFLIFYGFNRNRMAQGLMTREIKQSQMRNWHGCHTNMKRRANYTEIGKPEGTKSYLLRLPARQPTTALSLYATGKRQASQRFNPQNLLADS	693319	696551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_693415_694216_694354_694578
921545	contig_17144_pilon	-	1521	10	Intergenic	novelGene_29534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.24071260092	7	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	698	1333	172736	166277	FALSE	20	GTTTTTTTCTTTCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTMRVWSVS	174991	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166299_168194_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173447_173580_173751_174572_174761_174876
921546	contig_7396_pilon	-	2869	14	Intergenic	novelGene_79615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3120.89274323757	42	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1220	2362	251531	246442	FALSE	5	ATTTTTGGTGGTCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
921547	contig_6445_pilon	-	847	7	Intergenic	novelGene_76903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	772.271271423887	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	297	617	77856	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNTESPSRSPPRTRGAWTNSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	85459	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49883_73997_74051_77848_77924_80504_80562_85287
921548	contig_4271_pilon	+	1364	2	Intergenic	novelGene_171874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGGAGTTTATTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586614	588343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_586726_587090
921549	contig_4426_pilon	-	4474	6	Intergenic	novelGene_15413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	517.606414179732	2234	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1462	4386	87	4472	904546	818261	FALSE	25	TGTCCCAGCAGATGTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDKIASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTEKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSFREEKKDLKEEREHVSADRETESSSLGISAKEEPIGLHSVEKEIDIEKHIKESKEKSEKRFQTKEKDLEKTDRKNSEKEKKIKHDYKSEKDKLDVSECADRVKEKDKLCSHHTEKCHKEGEKIKNSTTIKKTDDREKSREKIDRKHDKEKPEKERHPAESKEKHLMEKKNKQSDNNEYIKSEKGKNKEKDREVDKRERSRDKESANVTNSKHLQEEKKSSVADGSKAQHEKSFSLKDKTKDEPLKTPDGKEKDKKDIDRYKERDKHKDKIQLNSLLKLKSEADKPKPKSLPAPKDSRPKEKRLVNDDLMQTSFERMLSLKDLEIEQWHKKHKEKIKQKEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENT	904632	818258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890139_904482
921550	contig_5602_pilon	+	1140	1	Intergenic	novelGene_133040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATCCTAAGAGCAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621094	622234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_621100_622200
921551	contig_12677_pilon	-	798	1	Intergenic	novelGene_110766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTATACACTGTTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1737	939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_900_1700
921552	contig_14441_pilon	+	726	3	Intergenic	novelGene_100783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	154	702	125667	126705	FALSE	15	AATGGTGTGCAGCCTGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125513	126729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
921553	contig_19402_pilon	+	2270	14	Intergenic	novelGene_80778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1798.38207036378	3	74	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	624	2057	29462	146500	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGVSTLSVNEGAL	23464	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37071_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107706_146481
921554	contig_1867_pilon	-	2383	2	Intergenic	novelGene_54615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	459	junction_1	0	23	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	650	964	533714	533400	TRUE	75	CTTAAAAAACAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFHFFANGYPVLPAPIVRETFSSPFNGLRPFVEEQLSIGGWIYFWVLNSVPLVYVSIIVPVPSCVDYCGCIGSSEIGDCEASYFVLQRFYKNQVYCCVIYVP	534363	531128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_531643_532494
921555	contig_5965_pilon	-	2929	4	Intergenic	novelGene_154678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.96655480858378	59	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	416	1651	246225	244990	FALSE	25	GAATTACTTTTAGTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLTSYKLECFQDDWEHRERFDRQQGNADGHFSQMIISHEEMPSFGHQTSVTFYQKIHAGEKPYGYNECRKELWQEEFLINHQGIHTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFTQHQRVHTGEKPYKCKDCAKAFSRSSQLIEHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTIHTGKKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPYLCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFTHCSQLIHHQAIHTEEKPYEYKECGRTLSHDSTTVQHQRMCNGETHVNIINIEKPSISTYPLLIIRELMLASNHINGSNGKSSLA	265713	243711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_-_246306_260637_260734_261312_261440_265601
921556	contig_9099_pilon	+	3194	1	Intergenic	novelGene_149922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1714	2037	411385	411708	NA	35	CTTAACAGCATTTCACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFLTVLMSLSGLLLGFWESCIPQGHGEMPCLSCIKWEEGHYGRGPWKPRAFFGEELLKSACGVKWGPCIPWLKTAPRDPPGLLSMLLTLALQCLCIFALNLVGILP	409671	412865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_409700_412900
921557	contig_13074_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_153459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTCACCAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649645	650724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_649600_650700
921558	contig_5023_pilon	+	1253	2	Intergenic	novelGene_7121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	91	396	137341	137646	TRUE	30	CAAAACTTTCTGTAGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRIRVGCNTLAQVTSLIQCNGSFPSMWPAPPFILREIKGKGSEQSGGPHTTKKAVLGAELVLWTQCSCAEKLLVQGKIDEKDLPPEPTQRESLPLEMTP	137250	138728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_138189_138413
921559	contig_11720_pilon	+	2897	1	Intergenic	novelGene_43993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1818	2171	264777	265130	NA	10	GCTGGGAGCTGGGCCGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAFSCKLVGRTVGTREGVLPRNQEAAILLGSGPRASFTAELLEATTATTAEMATNVAAAIASTTAGNTTRASEKWFLPAFQSPIKCLLQNLAGSSWQGCFANVVCSLLAQQCSVEC	262959	265856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_263000_265900
921560	contig_18274_pilon	+	2666	2	Intergenic	novelGene_164040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTGGTGTGGCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53255	56528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_+_55078_55684
921561	contig_20493_pilon	-	3978	11	Intergenic	novelGene_86417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	108.166723163827	126	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	580	1434	49056	42450	FALSE	45	GCAAAATGCTGGATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTPAFHFNILKPYMKIFNESTNIMHAKWKCLASDGSTRLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSKYIAAILELSALVVKRHQQIFLHFDFLYHLTPDGRRFRRACRLVHDFTDAAIQQRRCTLSEQGVDDFLKAKTKAKTLDFIDVLLLSKDEDGKELSDEEIRAEANTFMFGGHDSTASGISWVLYNLAKHPEYQERCRQEVQELLKDRRPEEIEWNTCIILHPVLTQQTLLHCAQLNLHAQRCAQFHSVLQSQEGAISRSRVPGAPSLVWEQSQLT	55235	39905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20493_pilon_-_42637_43050_43181_43377_43445_45931_46203_46996_47119_48978_49107_49197_49252_50362_50420_51335_51523_54457_54665_55211
921562	scaffold_12510_pilon	-	3130	19	Intergenic	novelGene_151420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_8	69.3623514773622	19	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	98	2419	669700	651695	FALSE	20	TGCCCCAGCCCCATAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDQARSAISNLFGGESLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAADEEENADNNLGSHPASVTKPRRFNSSICYAAIAVIIFFLMGFMIGYLGYCKRAEAKAGCRGPQETMSTETEDTETSEADEVPETPSHLFWGDLKNIFSQKLNTVDFSSIKRLSENPYIPREAGSQKDENLAFFIENQFREFQLSKVWRDEHYIKTQVKGSSAQNSVSIVPVNGTTVSVVERPQGYVAYSKTATVTGKLVHANFGTKADFESLNNLNSPVDGSLVIVRAGKITFAEKVANAENFNATGVLIYMDYADFPIVEAELPVFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRSAAEQLFDPKNMEQDCPPTWKADPSCKMQSLQGRNVKLTVNNVLKETRILNVFGVIKGFEEPDRYVVVGAQRDAWGTGAAKSSVGTALLLELARIFSDMVLKDGFKPSRSIVFASWSAGEFGAVGATEWLEGYLSTLHLKAFTYINLDKAVLGTKNFKVSASPLLYLLIEKTMQDVRHPVTGLSLYRDSNWANKAEKLSIDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDNDYPYLGTPKDTYEALMEKIPQLTRMARTAAEVAGQLVIRLTLDLELNLDYERYNDKILSFVKDMTQFRADIKEMGLNLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFRNAEKANRFIMREMNDRIMKVEYHFLSPYVSPKDSPFRHIFWGSGPHTLSALLENLELRRKNRDAFNETLLRNQLALATWTLQGAANALTGDIWDIDNEF	675149	650983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_651938_652543_652685_653947_654170_655752_655835_656026_656086_657112_657181_658136_658201_658422_658509_660161_660282_661000_661165_662541_662682_663014_663114_663711_663835_666531_666638_666845_666996_668193_668402_668913_669125_669664_669724_675075
921564	contig_13158_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_107294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCAGCTGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162980	165262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13158_pilon_+_163000_165300
921565	contig_1450_pilon	+	2798	20	Intergenic	novelGene_27350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	566.023236898576	1	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	1518	2618	347091	355748	FALSE	45	ACAAAATTATTTTCTGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	243350	355928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_243479_244348_244531_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341115_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354176_354330_355589
921566	contig_7272_pilon	-	2230	1	Intergenic	novelGene_25379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATGCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	686502	684272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_684300_686500
921567	contig_6885_pilon	-	4030	2	Intergenic	novelGene_83698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1028	1468	284288	283848	TRUE	10	TTCTGCTCGGAAGCGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRFQRATREDKVKYYKDMFKELEIENQKGKTLSAFLKLKELKKKIKSRVAIVQDSMGKILNDAESIKRRWKEYTESLYQKELVDVQLFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKALVKKEAPGIDRIPIEMLQQTDAVLDVLTHLCQEI	285315	279590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_281654_283348
921568	contig_10103_pilon	+	3562	2	Intergenic	novelGene_86165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATTAAAAAAAACCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645379	649177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_647915_648150
921569	contig_5832_pilon	-	6013	3	Intergenic	novelGene_134122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	653	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1874	2245	128329	127958	FALSE	45	CGACTGTGAAGACAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNFTSFYYKELLQKMQIPVLEKYVPLHGLQRNNADKRHGPIRCHHPTLSTNSERFGSQGDQPKRVPAQFLPSSCLPTGIPACPTRYVVVTASSTHQPAQEVIEPQQYATSRLPGCRKPCCQV	135881	124189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_129967_130886_130992_135750
921570	contig_17427_pilon	-	2094	8	Intergenic	novelGene_30331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1046.67069846271	4	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	401	997	179819	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204697	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_188727_188890_204660
921571	contig_16846_pilon	+	1756	2	Intergenic	novelGene_82880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGGGAGGAGGCAGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235428	237374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_+_235576_235765
921572	contig_14273_pilon	-	2679	8	Intergenic	novelGene_21156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGTAGTTTGCTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152259	128798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_128845_135359_135519_137933_138052_139057_139183_147780_148027_148889_149548_150872_151982_152041
921573	contig_10629_pilon	-	2474	2	Intergenic	novelGene_52943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACCACATTGCAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428470	390775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_-_392520_427740
921574	contig_15867_pilon	+	5961	14	Intergenic	novelGene_170876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	22	junction_13	39.4987828439541	89	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	12	1847	9646	42862	TRUE	30	CCCTAGAGGAAAGTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGDLFEEDSPRVSNNQYEKGKKLKTKALEPSAPREFTNLSGIRNQGGTCYLNSLLQTLHFTPEFREALFSLGPEELGSLEDKDKPEAKVRIIPLQLQRLFAQLLLLDQEAASTADLTDSFGWTSNEEMRQHDVQELNRILFSALETSLVGTSGHDLIKSLYHGTVVNQIVCKDCKNISEKQEDFLDLTVTVKNVSGLEEALWNMYVEEEVFDCDNLYHCGTCDRLVKAVKLAKLHKLPPFLTVSLLRFNFDFVKCERYKETSRYTFPLRINLKPFCEQSELDDSEYIYDLFSVIIHKGGCYGGHYHVYIKDVDHLGNWQFQEEVNKPDVHLKDLPNGEEIDDPLMVLHAILSEEESNLLPVDQLGQKLLKKIGLSWNKKYRKQYGPLRKFLQLHSQIFLLSSDESTVSLSKNCSLQPKSDFQRNAHRICKPPTSESPRLNDSTSCPHWFDINDSKVQPIKEKDIEQQFQGKESAYMLFYRKSLLQRPPEARANPRYKVPCHLLSEMDAANIELQTERAECDSANNNFELHLHLGPHYHFLNGALHPVVSQTESVWDLTFDKRKTLGDLRQSIFQLLEFWEGDMVLSVAKLVPAGLHIYQKLDGKINMETQ	9634	48620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_+_9845_12879_12948_14132_14247_16894_17060_18764_18912_22201_22346_24989_25119_29363_29460_31123_31232_34173_34475_37180_37263_38985_39158_42751_45912_47555
921575	contig_6898_pilon	+	3574	11	Intergenic	novelGene_35739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2179.33673625716	16	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	326	1516	115973	125646	FALSE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRTGVCHAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	104574	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_104600_114302_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
921576	contig_6175_pilon	+	4858	23	Intergenic	novelGene_16338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	465	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1989	2576	1647485	1656176	TRUE	0	GCTCCCCCGCCCTCCCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYNVLESRVERLLVLIPCRVSAAVTGSAGSVEPSGSPWVVAVCGPQSAAAAITHHTGPLTDVSPGTLGWSLPLLWATAGELGGRGLHLRHLGALLHHIFTSSILRGRQFSVLAFEDCSFCLGIYSEAECFLHAAIHHCLSYLVCALGIFLPVRAGLHGHTARHFRLCCEGSHTGGQRVQGLSAGLHLHGRITP	1645496	1793716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1647701_1650556_1650684_1654371_1654523_1656082_1656190_1657674_1657829_1661563_1661686_1669608_1669739_1670847_1670904_1672947_1673046_1677385_1677472_1683751_1683840_1685585_1685701_1688441_1688507_1689435_1689587_1691806_1691961_1693918_1694049_1700125_1700242_1705471_1705585_1708004_1708073_1710416_1710553_1719483_1719717_1746007_1746155_1793609
921577	contig_5797_pilon	-	1850	4	Intergenic	novelGene_56941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_1	30.2691628926573	53	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	41	319	318960	316403	FALSE	70	CAATTTAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSCRLRKGPPWLRMVRSGKNGDLHLKQIAYYKRTGEYHPTTLPSERSGIRRAAKKFVFKGEEVWGEISSKYNHRKKAVLCWKRQKTKSFGNCFRRGKKESPERMP	322421	314871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_-_316500_317723_317767_318821_318968_322388
921578	contig_1594_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_138850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGTGCTAATTTTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	720305	722171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_720300_722200
921579	contig_14300_pilon	-	2483	2	Intergenic	novelGene_133136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAAAAACTGGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420390	406168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_406240_417978
921580	contig_6557_pilon	+	1868	2	Intergenic	novelGene_33020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1040	1375	623200	623535	TRUE	20	TTCTCGAACGCGCTGGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVAWTRVGEVAMRFWMYFRAEPTRLTKGLDMGCYKERSQEQLQGFWPEQLGRQSGHSLRLGTLWGGTGFLEGERSRLTGRMKVELTSGWYRNSSAARPHASPSLVCSSLQ	622160	627080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_623617_626668
921581	contig_12793_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_164133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1550	1849	266183	265884	NA	55	AGAGAAAATAACAAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAVYKCNAILIQIPTTFFKEMEKLIINFIRKGKRPQISKVLLKQKNKVGGLVLPDFRTYYAAMEVETAWYWYNDRHIDQWNRIENPDVNPHMVT	267732	265274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_265300_267700
921582	contig_11413_pilon	-	2357	2	Intergenic	novelGene_103166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387738	385240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_387197_387337
921583	contig_7079_pilon	+	786	3	Intergenic	novelGene_129245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	411.5	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1	462	347955	348688	TRUE	15	TCTGAGTTTGCTTATATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPDPLLWGVTRVVLAHCPLYLWGVLRPPPTPRGPPPPGRGGPPPPPPPATGRSGPLPPPPPGAGGPPLPPPPPPPPPLPSSGDGPVAPPPLPALGSGGGLASGGGRGALLDQIRQGIQLNKTPGGPRELNAAATTTELRGAGGGPDARDAEEK	347954	349826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7079_pilon_+_348318_348589_348706_349519
921584	contig_9609_pilon	-	4107	11	Intergenic	novelGene_23030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1909	2346	325405	324968	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIWIKLLYYLSNTTRHIEKEGWNVCIIQSWLIGQERIILVQQNKVSPTVTSSVLRTTGLPESQADWRFDYTAGDSGTQQLLRWSSLLCLMRNTGIRESQGTDLQVKHLYLSLYMSVLNNLISTNPLNLQHFHFLIILLEFDIQS	333334	323025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_324070_324250_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330301_331386_331487_331563_331692_332692
921585	contig_10973_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_150356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_3000
921586	contig_12638_pilon	+	2539	2	Intergenic	novelGene_33256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAGGCTTCCCCATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812312	823136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_812340_820624
921587	contig_12778_pilon	-	2547	1	Intergenic	novelGene_173491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125704	123157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12778_pilon_-_123200_125700
921588	contig_11316_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_122617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	403	915	137674	138186	NA	40	CATTCAACCTGATATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137271	138821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137300_138800
921589	scaffold_4438_pilon	-	3458	6	Intergenic	novelGene_174526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1328	1636	114151	113843	TRUE	5	TTCTTCCCTTTCATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENEKGRTHLAFLKLKELKKKFKPRAAILKDSMGKILNDIGSIKRRWKKYTESLYQKELVEVQPFQEIAYDQKLIVLKEEAQVALKGMAKKQDSRN	411304	38599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_38886_72387_73121_113039_114155_162801_163302_305544_305615_410550
921590	contig_17768_pilon	+	4866	1	Intergenic	novelGene_140391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	338	175	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATACCCAGCAAAGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46158	51024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17768_pilon_+_46200_51000
921591	contig_7357_pilon	-	1900	6	Intergenic	novelGene_36801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_5	1007.56208741695	19	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	266	1018	166824	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167089	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_166772
921592	contig_11493_pilon	+	2013	2	Intergenic	novelGene_143716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	247	840	289796	290389	TRUE	30	GACCTCTGTTGTAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQHTISKHLQKQDRMVPEGIQNKTPDDLPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKEKADKNEEKIDKFMENTNKKLQAFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQLLEIQKIKKKKISEMDCVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKQLDTTLFEEKSEKRTKKNEEILRVMWDTIKRKNLQVIGVQNRERKQKTQRGSLKNC	289549	291608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_291435_291480
921593	contig_18869_pilon	+	735	1	Intergenic	novelGene_56223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATAACAGGAGATTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73348	74083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_+_73300_74100
921594	contig_14970_pilon	+	1899	9	Intergenic	novelGene_44992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	5	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	120	1208	136145	231550	FALSE	15	GCCACCTTAACTCTTTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136025	232241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
921595	contig_9614_pilon	+	1588	2	Intergenic	novelGene_104424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGAATTATTCCCTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133619	135384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9614_pilon_+_135102_135278
921596	contig_6873_pilon	-	3555	5	Intergenic	novelGene_129834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	116	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCTCTCTTGAATGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814761	573471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_574559_574601_575181_640656_641051_714884_714932_813313
921597	contig_12837_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_57393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATGAGAAACTAATTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404854	403399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_403400_404900
921598	contig_5964_pilon	+	2221	2	Intergenic	novelGene_80343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGTTCAAATCCACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673	3065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_+_1174_1344
921599	contig_10750_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_172609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACAAGGCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103626	101699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_101700_103600
921600	contig_8447_pilon	+	2548	4	Intergenic	novelGene_69418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	495.479117174029	10	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	60	371	70881	82214	TRUE	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	70821	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_70938_71848_71963_82073_83636_83735
921601	contig_4803_pilon	-	5910	20	Intergenic	novelGene_150701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	359.869836425582	5	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	1942	3465	48135	15989	TRUE	20	AAATTTTGGCTGTGTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFQDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDEAKAKEEKVKKCGEDEETIPPKFRLKPATDKEGKPLLPEPEEKSEPMSESELTDELLEDFDQSKSKEKPSKPTEKVEKGVVPHDAVEALADSLGKKEADPEDGKPVVDKVKEKAKEEDHEKLGEKEETIPPDYRLEEAKDKDGKPLPPKEPKEQFPPMSEDLLLEALSEDFSGPRPADTSSLKFEDAKLSAVISEVVSQTPASTTHSAGPPPKALESDNKELDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKATAEHKDKLGERDDTIPPKYIHLLDDDDQGKPEAPSTKKPKESKKPADDQDPIDALSGDLDSCPSTTETSQKAAKDKDKKTDSSTKAPKNGGKSKASAKAKEEASKPKADERNTS	50076	12592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_15023_15973_16040_17580_17653_19570_19664_20125_20171_21585_21679_23598_23707_27341_27441_30768_30847_31014_31066_33244_33329_33807_33910_39339_39436_40570_40619_41849_41934_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039
921602	contig_4884_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_63823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGATATATCAGTGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570401	571897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_570400_571900
921603	contig_8554_pilon	+	3334	1	Intergenic	novelGene_160283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAATAGAAAAATGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70973	74307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_71000_74300
921604	contig_1090_pilon	-	2603	1	Intergenic	novelGene_131131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	177	299	450399	450277	NA	95	AAAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPCTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYNENYKTILQETNRDLRKWKNIPCSWIGRLNVVKMSILPKAIYKYNAILIQIPTAFFNEMEKQTTNFIWKGKRP	450575	447972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_448000_450600
921605	contig_14300_pilon	-	2607	1	Intergenic	novelGene_133149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1264	1608	515709	515365	NA	20	CTACAGGGTCTTCGGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLRTHAALNFAPWASRFPHSRPALVALWGSQYIKVNPFLTHVHTGPPSGLLHCVPCHFMWTERCSKGFRCICSFGPYSNPRRPVPPPCPCHRWETKLQGCESPAQDHTAREKM	516972	514365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_514400_517000
921606	contig_12938_pilon	+	3560	7	Intergenic	novelGene_99718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	828.70831552617	60	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1575	1967	80440	80832	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNMYCVHGALIAQWIGKNNVRRQLICPLEAWSLVVGKEYIFLMKQEKAYKGLSRQEQKPPAHVWTSLVVSRVKWEWEENLNLCCEHVSALPQFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	51950	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_81459_83391_83470_84550_84635_85468_85609_85656
921607	contig_10766_pilon	-	3356	1	Intergenic	novelGene_151209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGCTGTTTTGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164704	161348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_161300_164700
921608	contig_5954_pilon	-	1376	1	Intergenic	novelGene_28764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACACACAATAATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1392238	1390862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1390900_1392200
921609	contig_6047_pilon	-	2688	1	Intergenic	novelGene_24239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCGTGCTAACTGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264432	261744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_261700_264400
921610	contig_9008_pilon	+	3814	1	Intergenic	novelGene_58624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1767	2090	150299	150622	NA	80	CAACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKINISVNYNNKNSGGASCNRFPFHGIMIDSGPEGWGEPSMKKHRTQKLGSHHIPVHACCPGLIIDSTPSPSKCPGLHNNSMVTVLRVWLWSTFDLNSNPSLASC	148532	152346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9008_pilon_+_148500_152300
921611	contig_9653_pilon	+	1761	1	Intergenic	novelGene_48352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1127432	1129193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1127400_1129200
921612	contig_10609_pilon	-	3345	2	Intergenic	novelGene_123917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	198	554	352267	351911	TRUE	40	TTGAATAGGGGCACAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKMKQDSYLTPDTKTNSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSMLEALILDINRIQTITNNTQTPEDKLDNWDLLKTKHLCSSKDFTKRVKRAPRDWDKIFSYYKSDKGLISKIYKEI	352464	348667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_351411_351862
921613	contig_7157_pilon	-	2658	1	Intergenic	novelGene_131295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891464	888806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_-_888800_891500
921614	contig_8317_pilon	+	663	1	Intergenic	novelGene_19954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16409	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
921615	contig_10135_pilon	+	1987	12	Intergenic	novelGene_106600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	7	junction_3	30.5238018493575	124	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	607	1206	73574	76322	TRUE	20	GTGATGTCCTAATTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDFCLRRDFRQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSGYSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANNAAPSPPRRGGGLLEEAELSDDDRANLMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKSCLKCQACGYRSTTFEVFL	72967	78075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_73577_74379_74440_74618_74740_74963_75076_75266_75423_75918_75984_76239_76345_76528_76616_76887_76967_77185_77294_77378_77494_77705
921616	contig_8050_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_114827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAAATAAGTCAATCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300019	301512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_+_3e+05_301500
921617	contig_11574_pilon	-	2128	9	Intergenic	novelGene_64094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	262.491428431482	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	553	1980	454111	449890	FALSE	40	GTCATCAAATTATAAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	456526	449741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454646_454889_456384
921618	contig_13074_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_153414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	452	844	202609	202217	NA	5	CTGTAGCTGGCTCCTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYGFRGLSSKGRNAPTWRHTLIPLNWKLRMPPGHFGLLMPLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQEEMGLILHNGGKEEYVWNAGDPLGHFLVLPCPVIKVNGKLQQPNSDMTTNGTDPSGRKMWVTTPSEEP	203060	201660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_201700_203100
921619	contig_1734_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_164374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGGAAAATATAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527769	530060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_527800_530100
921620	contig_10734_pilon	+	2016	8	Intergenic	novelGene_51503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	220	579	2265456	2265815	TRUE	45	CTAAGTGAAATAAGCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265236	2281395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266070_2267082_2267194_2269291_2269431_2270438_2270505_2270955_2271050_2274374_2274509_2277108_2277191_2280838
921621	SIRV6	+	988	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	12	528	12	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	246	737	1733	10736	TRUE	45	GTAACAATGTAATGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1099	11297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
921622	contig_5788_pilon	-	2109	2	Intergenic	novelGene_178558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTGGCAACAGTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191558	1389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5788_pilon_-_3169_191228
921624	contig_18055_pilon	+	1091	10	Intergenic	novelGene_117802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	244.269027968532	1	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	640	1089	77213	80712	FALSE	45	TACTTGGAATACAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKT	40633	80714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663
921625	contig_817_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_132486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCCCCATGGTTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752737	751472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_-_751500_752700
921626	contig_854_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_36347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGGGGACAAAATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974685	976369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
921627	contig_13456_pilon	+	2609	15	Intergenic	novelGene_153319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	42.6538631405917	28	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	660	1980	630	2609	613892	646380	FALSE	20	GTAAGTCTTCATCCTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVCVQQLLKTLFGTNLASQFDGLSSNPSKSQGRAQRLGSSSVRPGLYHYCFMAPYTHFTQALADASLRNMVQAEQEPDASGWFDVLQKVSSQLKTNLTGVTKNRADKNAIHNHIRLFEPLVIKALKQYTTTTSVQLQKQVLDLLAQLVQLRVNYCLLDSDQVFIGFVLKQFEYIEVGQFRQSEAIIPNIFFFLVLLSYERYHSKQIVGIPKIIQLCDGIMASGRKAVTHAIPALQPIVHDLFVLRGTNKADAGKELETQKEVVVSMLLRLIQYHQVLEMFILVLQQCHKENEDKWKRLSRQIADVILPMLAKQQMHIDSHEALGVLNTLFEILAPSSLRPVDMLLRSMFVTPSTMASVSTVQLWISGILAILRVLISQSTEDIVLSRIQELSFSPYLISCPVINRLREGGSNSTPEEHSEGRETKNLPEETFSRFLLQLVGILLEDIVTKQLKVEMSEQQHTFYCQELGTLLMCLIHIFKSGMFRRITAAATRLLTSDSSDGSFYALEGLNSHVRAMIPTHPSLVLLWCQLLLLANYTDYRWWAEVQQTPKRCSLSSTKLLSPQTLGEEDDSDLASKLGMCNREIVRRGALILFCDYVCQNLHDSEHLTWLIVNHIQDLISLSQEPPVQDFISAVHRNSAASGLFIQAIQSRCENLST	603641	646380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_604217_613837_613916_614487_614712_616412_616492_616647_616810_619513_619570_620493_620643_622203_622341_624626_624744_628012_628136_628469_628706_629889_630033_638087_638296_644450_644593_646200
921628	contig_16496_pilon	-	1333	2	Intergenic	novelGene_5221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAAATGTAGCAGGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3501	105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1319_3381
921629	contig_6014_pilon	+	4044	1	Intergenic	novelGene_176274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAGTAAATACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105738	109782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_105700_109800
921630	contig_21207_pilon	+	4180	3	Intergenic	novelGene_175731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3098	3403	18232	18537	FALSE	30	CCTCAATGAGATGGACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLISHASKILLMIIQKQLQQYNNRELPEIQAGFRRRCGTKAIIADVRWILVESRGYQKDVYLCCVDYAKAFNCVDHNKLWVTLQTMGIPEHLIVLMRTCT	139	19314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21207_pilon_+_2586_4531_4840_17888
921631	contig_10003_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_88180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATTGAAAGAGGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437382	436295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_436300_437400
921632	contig_5605_pilon	-	2444	6	Intergenic	novelGene_143929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	285	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCCCACAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573459	143908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_144974_214818_214826_262751_262814_368342_368580_379149_379278_572514
921633	contig_3956_pilon	-	1978	10	Intergenic	novelGene_15172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	1214	1978	1289011	1281669	FALSE	25	AGTGGATTCTCCCAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSARPSGKGRAFMYRRLCLFGDLERQSTFDSSLTVSRYETTGSDFLMGIQAWSSSRSFRQISRCSSPAPAMMCSPDSSMMHCTMGSDLARRFRPSTSLGLIRSAMAWRRTVSVCTHTRHAVHHHQGTISDTEGSCHLRGEVNVAGRVNEIDEEAGAVLTLLDEVQVVLRKLVEEGDGGGLDGDTALLLILPSVSEAGLPSPGGGNDAGLADQGVGQRGLAVVHVGNDRHVSDIGLLVHDGPDLVYCEVHLAADG	1291015	1281668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281679_1282692_1282913_1283793_1283976_1284056_1284110_1287480_1287533_1287965_1288075_1288872_1289192_1289494_1289675_1289756_1289891_1290296
921634	contig_2646_pilon	+	1094	3	Intergenic	novelGene_69681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	130.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTTTACTAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2309545	2314247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2309649_2313144_2313329_2313440
921635	contig_13700_pilon	-	3651	1	Intergenic	novelGene_68298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	252	759	689	1447	351333	350575	NA	55	TGATAAAAACTCTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQRQQVEIQKINSRFETMEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQREKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIPKAQQTPYRKDPKRTSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEATYREETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFQFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVL	352021	348370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_348400_352000
921636	contig_12000_pilon	+	1508	1	Intergenic	novelGene_43188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTAAATTTCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559193	560701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_559200_560700
921637	contig_11566_pilon	+	3743	1	Intergenic	novelGene_166695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAGTAATAAAGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168135	171878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_168100_171900
921638	contig_18294_pilon	+	1773	3	Intergenic	novelGene_179034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1	5	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1037	1546	36729	37551	FALSE	65	GAGAACAGAAAAACAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKKSEMESKNS	33400	37778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18294_pilon_+_33708_35999_37206_37518
921639	contig_614_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_132643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGCTGGAAGATGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933288	934440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_933300_934400
921640	contig_8775_pilon	+	776	1	Intergenic	novelGene_166833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGGCTTTAACAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222835	223611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_+_222800_223600
921642	contig_240_pilon	+	3863	3	Intergenic	novelGene_173798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1032	2832	3863	806766	807797	FALSE	60	GCAGAAATAAATGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRQRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTKKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTRRKEIVKIR	572303	807797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_573028_636427_636975_805205
921643	contig_14575_pilon	-	3031	1	Intergenic	novelGene_101901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTACGACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55411	52380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_52400_55400
921644	contig_12677_pilon	+	785	1	Intergenic	novelGene_110786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGTGTTGTCATGTAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2161	2946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_2900
921645	contig_10241_pilon	-	3953	3	Intergenic	novelGene_142837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGTATCTGTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122431	117185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10241_pilon_-_118203_118376_120953_122071
921646	contig_14142_pilon	-	2013	9	Intergenic	novelGene_120466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	23.8628895987054	110	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	198	1031	259646	248094	TRUE	15	TACTAGAGTCTGTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTPEAQPLAPDCLPSVHAPAPASLSPQASPMDKNTASELMPPPPDGDDPPRISPDPVTVSAVSQELGEKGPASLSTLLETGFGTPSELSPRIEEQEPENASLSAEETNGPELGPGEAMEGVSEEPALEDEGNAAWNYNFSQLPRFLSGSWSEFSAQSENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYSEEEQLEYAEMAPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSTQPDTSYSGASVSVSLSAWPAAAGRTRFTSGMHSLGSSGLPFAPTTTWMN	259843	246243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_246506_246620_247008_247199_247410_247970_248104_248210_248334_248491_248581_258456_258569_259008_259108_259245
921647	contig_2646_pilon	-	3842	1	Intergenic	novelGene_69571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGATACATTTGTACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1111646	1107804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1107800_1111600
921648	contig_10982_pilon	-	1332	1	Intergenic	novelGene_87901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTTTCATGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295607	294275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_294300_295600
921649	contig_19954_pilon	-	1606	3	Intergenic	novelGene_173745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGACTGAACTGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123733	5682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_-_6152_121437_121727_122885
921650	contig_9373_pilon	-	1997	1	Intergenic	novelGene_162727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATGGCTTGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279279	277282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_277300_279300
921651	contig_5686_pilon	+	2425	18	Intergenic	novelGene_45278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1488.66066927131	1	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	24	1058	93843	208233	TRUE	30	CCCAGCAAACTTCCAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITW	93819	241665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_208232_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597
921652	contig_8322_pilon	+	2123	1	Intergenic	novelGene_143226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCTAAAAAGAAAATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181757	183880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_181800_183900
921653	contig_9389_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_84162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	551	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	246	329	1993791	1993874	NA	5	TCCACTTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAAITEVPQVYGFNKQICSHTVYRLEIQIQGASSRGRLSLSQLWGKVLVISLPQLRSFSAQVTQVQRALTLFFWLLFLSGMRSPRPSAHFFYISKEIDFKTQPHLVN	1993545	1995448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1993500_1995400
921654	contig_16382_pilon	+	1262	1	Intergenic	novelGene_160224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTTTGGCTACGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111546	112808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_111500_112800
921655	contig_14666_pilon	+	1530	4	Intergenic	novelGene_39584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1629.52392502296	5	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	580	1239	484281	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483861_484184_484274
921656	contig_6885_pilon	-	3065	2	Intergenic	novelGene_83708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAAAGGTTTATTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416198	412374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_414729_415487
921657	contig_5623_pilon	-	2742	1	Intergenic	novelGene_154860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1965	2366	247926	247525	NA	15	AGGCTCAGCTCTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLWRWVSPSAENAPSKHHRLPASLLTPELIWPEGLRLSPGQVCQLLTASEPSLPPLATHSSSSTLPFMFRAPRLPYIINSLVFSGLCCKRGHWKCLTTPPSWPRLLCSINFSILLDHLCLEWAQIWVSSSQ	249890	247148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_247100_249900
921658	contig_9708_pilon	+	4758	2	Intergenic	novelGene_67264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAGCAGCCAGGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61397	66283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_+_62195_62322
921659	contig_4232_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_63231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACACTTCTCCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158821	159908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_158800_159900
921660	contig_8462_pilon	-	2744	3	Intergenic	novelGene_159428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	971.5	64	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	17	337	232394	231503	FALSE	25	TGCATATTCTGATTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTTTRGAVVDVLRVDSVEDLVPETTDKVAVPAVLALVAVVRAAAVVVEAVTEAAEDLVEVAMEAFTTVMDMEEIITPKGLTGGVTEPALQQVTLPNKLIWKPHVT	232410	229095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_231644_231853_231991_232351
921661	contig_2846_pilon	-	1925	2	Intergenic	novelGene_177013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	278	766	607002	606514	TRUE	60	AATCCACAAACAAAAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQANNNQKRTGVAILISNKIDFKLKSTTKDKEEHYIMIKGSIHQEDIPIINIYVLIDRAPKYIKRTATALKREIDSSTIIVGDVNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEDLNVTINQSDLIDIHRTLHPTADKRTVLSHPHGTFSRLDHILDYKASLNRIQTIEIL	607279	551995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2846_pilon_-_553074_606432
921662	contig_8100_pilon	+	3301	2	Intergenic	novelGene_176006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTAAATATTTAGACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384728	388132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8100_pilon_+_387757_387859
921663	contig_12793_pilon	-	1885	1	Intergenic	novelGene_164114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176879	174994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_175000_176900
921664	contig_9713_pilon	-	3043	22	Intergenic	novelGene_170253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_18	82.0856805838637	67	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1710	1332	3041	305498	279068	FALSE	25	TCTTTCCCAGGAAGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADPEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGVSGNMERITSPVLVGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQSLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVFTPSKPLCDTLTVSEVEADTGDGLDRIASSSGDGSRPSSDNADSPRSGLRERIYLEESPDKSEVIQDADTQLLIGSPSTRITPHIIGAEDDDFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKQTNSKETRRVFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEIATDLDKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRVTLEKERACAEQIVAKIEEVLMTAQAIEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDREGEEKGKRRGFTSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQKQRHPKHLSTLSSVSPEPQDSAKLRQSGIANEGTDIGYLPANPTSSVAAGT	406735	279065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9713_pilon_-_279244_280341_280448_281957_282073_282402_282436_282941_283080_283737_283844_284133_284177_287040_287140_287437_287549_289675_289769_291681_291757_296557_296699_297708_297829_299148_299227_300536_300716_303438_303497_305459_305510_306179_306279_325055_325123_326753_326843_328100_328125_405694
921665	contig_9696_pilon	+	2897	2	Intergenic	novelGene_68814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTTTTCTACTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391606	395564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_392347_393407
921666	contig_10920_pilon	-	1023	2	Intergenic	novelGene_178968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23626	21989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10920_pilon_-_22234_22847
921667	contig_5485_pilon	+	2343	4	Intergenic	novelGene_37787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_2	19.131126469709	43	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	543	881	688882	691262	FALSE	50	AAAATGACTATAACATGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQIPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELEVSS	688339	692724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_688894_689066_689193_690974_691105_691191
921668	contig_11933_pilon	-	3139	14	Intergenic	novelGene_107252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.0634604476509	10	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	170	1801	269902	108172	FALSE	90	AAAAAAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNLSDTLKKLKITAVDRTEDSLEGCLDCLLQALAQNNMETSENIQGSGTLQLFANLLTPQSSCTAKVANIIAEVAKNEFMRIPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGRALGNICYDSHEGRSAVDQAGGAQIVVDHLRSLCGRTDPANEKLLTVFCGMLMNYSNENDSLQAQLINMGVIPTLVKLLGIHCQNAALTEMCLVAFGNLAELESSKEQFASTNIAEELVKLFKKQIEHDKREMIFEVLAPLAENDAIKLQLVEAGLVECLLEIVEQKVDSEKEDDIAELKTASDLMVLLLLGDESMQKLFEGGKGNVFQKVLSWLPSNNHQLQLAGALAIANFARNDGNCIHMVDSGIVEKLMDLLDRHVEDGNVTVQHAALSALRNLAIPVINKAKMLSAGVTDAVLKFLKSEMPPVQFKLLGTLRMLIDAQAEAAEQLGKNVKLVERLVEWCEAKDHAGVMGESNRLLSALIRHSKSKVSTAEKDLESAKLVQILHRLLADERSAPEIKYNSMVLICAVMGSGERLNIQRTSDSCSVADK	270071	106833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_108228_121189_121319_135959_136104_137831_137958_138876_139012_140355_140488_141126_141271_158358_158485_162881_163011_176518_176666_207803_207930_214256_214380_245558_245670_269898
921669	contig_11815_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_50954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCAATAAAAGAACCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484356	482397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_482400_484400
921670	contig_3747_pilon	+	1496	2	Intergenic	novelGene_24838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200984	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201194_203919
921671	contig_14684_pilon	+	2730	2	Intergenic	novelGene_99687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	493	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	89	343	472175	473027	FALSE	30	ACATTCCCAGCAGCAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIASVVPNRYPRWFTLSHIESQQCELASTMLTAAKGDVRRLETVLESIQKNIHSSSHIFKLAQDAFKIATLMDSLPDITLLKVSLELGLQVCDWWSRERFEDLVFPRALRTAN	472086	475414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_472194_472791
921672	contig_7398_pilon	-	2479	4	Intergenic	novelGene_166160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	34.2150064542836	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	145	621	142471	126302	FALSE	15	TTTGCCCAGCTGTGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQNFPTPDPLLLTKEGERKGEESKEEEEEEEEEGKKGLDEDEDDFDSFMAETPTAETVPSPFGARDETAFASHQVRTQSAPFTGPFISVVLSKLENMLENSLHVNLLLIGIITQLASYPQPLLRSFLLNTNVVFQPSVRSLYQVLASVKNKIEQFASVERDFPGLLIQAQQYLLFRVDMSDTDPESLTKDPIQNASWTDTGRNLFG	142615	124443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_-_126355_133734_133874_134181_134361_142365
921673	contig_11106_pilon	+	2138	1	Intergenic	novelGene_167443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGATAAAATGTCCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1566	3704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_1600_3700
921674	contig_17427_pilon	+	2144	10	Intergenic	novelGene_30290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	238.215795933223	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	7	801	147949	175469	TRUE	10	ATCCTTGGTGTCATTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIPLQKTAWG	147942	176877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173650_175453_176147_176211
921675	contig_10734_pilon	-	2239	11	Intergenic	novelGene_51496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	684.029940865164	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	715	1767	2274500	2265543	FALSE	55	GTAATACACCACATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKERPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305180	2265070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267095_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282592_2282950_2305140
921676	contig_16948_pilon	+	2082	10	Intergenic	novelGene_166418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	111.152658898683	154	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	414	1160	390013	410355	FALSE	0	CTTTGTTTGTGGCCTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISGVFHPNGLEVIINTEIWDLRTFHLLHTVPALDQCRVVFNHTGTVMYGAMLQADDEDDLMEERMKSPFGSSFRTFNATDYKPIATIDVKRNIFDLCTDTKDCYLAVIENQGSMDSLNMDTVCRLYEVGRQRLAEDEDEEEDQEEEEQEEEDDDEDDDDTDDLDELDTDQLLEAELEEDDNNENAGEDGDNDFSPSDEELANLLEEGEDGEEEDSDADEEVELILGDTDSSDNSDLEDDIILSLNE	384926	411277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16948_pilon_+_385047_386717_386801_387339_387425_389887_390073_390728_390823_391220_391326_391539_391614_392145_392248_405439_405693_410296
921677	contig_10331_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_54082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCTTTTATTAGAAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102587	99715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_99700_102600
921678	contig_13481_pilon	+	3623	1	Intergenic	novelGene_119356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGATTTAGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431289	434912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_431300_434900
921679	contig_7119_pilon	+	3163	3	Intergenic	novelGene_40889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	195	1280	138713	139798	TRUE	35	GACAAGGAGACAGTGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WPCLRNRILASFFHRRWGLAGADATAGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127412	141906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_140971_141195
921680	contig_2114_pilon	+	1459	2	Intergenic	novelGene_104231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	493	junction_1	0	2	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCATGGTTGTCCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137560	139933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_138492_139405
921682	contig_19061_pilon	-	3825	1	Intergenic	novelGene_173515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	1942	2472	60615	60085	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIRTWNVQSMKLGKLEVVKNEMECIKIDILGISELKWTGISHFESENHMACYARNDRLKRNDVTFIIKKNIPGSVWKHNAVSDRIISIHLQGRLVNMTIIQIYTPITNARDEKIENFYQLLQSEIDETCSQDALIIIGDWNVKVGNKEGLIVGEYGLGYRNNVEIP	62556	58731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19061_pilon_-_58700_62600
921683	contig_2703_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_101818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	926	1282	1123450	1123094	NA	60	AATATGAAACAAAATTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMESAEWYRWGQGLWRLTTPSAFISPFTGYFLPARLAKVFCLFRTQQLFLVIYLRFLGCELAAYLSILGFINLHNLHASVLLTRPAKSWVHQPLQLCESEETLWSCLLILKFADHHSL	1124375	1121931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1121900_1124400
921684	contig_11316_pilon	-	1012	2	Intergenic	novelGene_122622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2499	junction_1	0	639	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACTTGAAGAACCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138869	137326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138135_138665
921685	contig_8309_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_176437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAGACAAGGACCCATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28440	30061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8309_pilon_+_28400_30100
921686	contig_1867_pilon	-	3154	3	Intergenic	novelGene_54545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423683	380909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_383567_423096_423552_423641
921688	contig_2757_pilon	-	1913	4	Intergenic	novelGene_164584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTACAGCACCTCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226164	203155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_203222_213894_213956_223155_223345_224567
921689	contig_4857_pilon	-	4154	2	Intergenic	novelGene_48726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	433	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2447	2842	1193569	1193174	FALSE	45	ACAAATACCCAGATCTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKGKKEKENKTNLKKKQKGPQRSRKKKNNIKRNAFRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKETIQNKQMNKSPGIPPAQQPKPGSSSTLEWSSAAPQEEAKMAHGARYSSERKGRWGEARKK	1196082	1191861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1195037_1195103
921690	contig_13283_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_154015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45081	43841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_43800_45100
921691	contig_6847_pilon	+	2496	14	Intergenic	novelGene_143863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	566.188314168168	1	107	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	330	1235	77788	102143	TRUE	50	AAATCCCAAGTAAAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSEGSNPVLRICN	74257	112360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74316_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102101_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110421_110608_111608
921692	contig_11978_pilon	-	649	1	Intergenic	novelGene_62844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGAATAATTTGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509682	509033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_509000_509700
921693	contig_9895_pilon	+	1872	1	Intergenic	novelGene_144683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CGAAAAAAAAAAAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90515	92387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_90500_92400
921694	contig_10855_pilon	-	3147	4	Intergenic	novelGene_124397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	31	junction_3	18.7082869338697	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	647	1944	46	1989	1039659	1020026	FALSE	25	ACCATACAGATGGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVPAERTPGGLREPEMESVVFEDVAVDFTLEEWALLDPVQRKLYRDVMLETFRNLASVDDETPFKANESVSQRDTHEKKISKEDKILKFTRNDSWSSILGKISEGLSIEDQPKDQGLLLRDCMVLRLCESNEGHQWGETFSQIPNLNLYKKTTTRNNPFECTECGKVFMYPSSFKRHIASHAGHKPYQCPECGKGFGFPSELRRHVRIHSGERPYACELCWKTFIHLRSYRRHEKVHSKEKLYECKQCGSTFSFLDSYQRHERTHNKEKFNECKECGKAFKWPSSLTRHMRTHSREKPYECKQCGKAFKWPISLQTHMRTHTEEKSYKCKRCGKAFIWPISLRTHRRSHCGEKSYECKQCGKAFSWPICLQRHMRVHTVEELYECNQCGKTFRWHFSLRRHLITHSGAKPYECKDCGKAFSWLISLREHMTKHSGKIFYECKECGKAFYYLQSLRRHERSHSEEKLYKCRQCGKGFNQLFYLRRHVRMHTGEKLYECKECGKTLKWASSLTIHMRMHTGKKPYECKQCGKAFNWSISLRAHMRMHSGEKPYECKQCGKAFYWSISLRAHMTTHTGEKPYVCKQCGKGFNQLSYLRRHVKMHSGEKPYECKQCGKAFKCPSSLPKHMRTHTGEKPYECKQCGKAFVSSSALRYHVRTHSRVEH	1039704	1018867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_1021656_1022082_1022267_1022718_1022846_1039656
921695	contig_14333_pilon	+	327	1	Intergenic	novelGene_49089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTTTGGCTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282859	283186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_282900_283200
921696	contig_5095_pilon	-	2095	17	Intergenic	novelGene_74932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	345	1750	2094	225725	102932	FALSE	60	TCCTTAAAAACAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGDDVGVLDLLQDADLPLNVLAAHAPPAGFCPPFLDKFGGILETGAFLPTFLHDCKLSAAKFLAGIVVILHVFLPEHGHDKLSRLTKDQRTSALLPKPSPPLLRRRGPLMHQSP	299758	102930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_103096_225544_225768_260643_260785_262583_262716_262866_262930_263517_263685_264030_264075_265362_265455_267551_267642_270247_270372_271256_271357_272174_272274_273984_274081_275079_275283_277338_277537_285773_285873_299699
921697	contig_16934_pilon	-	3039	1	Intergenic	novelGene_132526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTAGTGCTGCCATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171834	168795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_168800_171800
921698	contig_9833_pilon	+	3766	2	Intergenic	novelGene_68497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	74	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3042	3554	216973	217485	FALSE	35	TCCACTATATACTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAAVSQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKRISPITSCFVSHWKLCEAAFSYPVCWSPIGVRDGGSALR	212431	217697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_213475_214974
921699	contig_6059_pilon	-	2004	11	Intergenic	novelGene_44869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2487.15524445098	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	675	1919	576622	569146	TRUE	65	GGAAAAAAAACATTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	577296	568160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550
921700	contig_8520_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_85449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAGGGAAGATAGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246760	245900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_245900_246800
921701	contig_5093_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_135109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCATTGAAGAATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897079	898142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_897100_898100
921702	contig_13894_pilon	-	4825	7	Intergenic	novelGene_62070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	33	junction_3	42.2597786185504	171	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1036	2031	296344	294812	FALSE	20	GCTCATGTTTGGTAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQEKLLTYYRNRAAIPAGEQARAKQAAVDICAELRGFLRAKLPDMPLRDMYLSGSLYDDLQVVTADHIQLIVPLVLEQNLWSCIPGEDTIMNVPGFFLVRRENPEYFPRGSSYWDRCVVGGYLSPKTVADTFEKVVAGSINWPAIGSLLDYVIRPAPPPEALTLEVQYEHDKHLVIDFLPSVTLGDTVLVARPHRLAQYDNLWRLSLRPAETARLRALDQADSGCRSLCLKILKAICKSTPALGHLTASQLTNVILHLAQEEADWSPDVLADRFLEALRGLISYLEAGVLPSVLNPKVNLFTELTPEEIDELGYTLYCSLSEPEVLLQM	308788	292017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_295619_296155_296419_296627_296807_300214_300366_301643_301813_306248_306605_308682
921703	contig_5084_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_64605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGACTCCAGGTTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	985967	985487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_985500_986000
921704	contig_11378_pilon	-	2683	2	Intergenic	novelGene_112300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGAGCCCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1039196	1036377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_1036815_1036950
921705	contig_11372_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_176662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAAGGATGAGACCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672858	673647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_+_672900_673600
921707	contig_7695_pilon	-	1115	1	Intergenic	novelGene_41659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTCTGTCATCTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869658	868543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_868500_869700
921708	contig_9646_pilon	-	1879	1	Intergenic	novelGene_117439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGTTGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190197	188318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_-_188300_190200
921709	contig_4103_pilon	-	3703	4	Intergenic	novelGene_51980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	373	junction_3	23.8374122383748	29	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	644	1935	91	2025	200670	188639	FALSE	50	TATGAAAATAGAATCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRGQKREEGWKEVVRRSKKLSVPASVVSRIMGRGGCNITAIQDVTGAHIDVDKQKDKNGERMITIRGGTESTRYAVQLINALIQDPAKELEDLIPKNHIRTPASTKSIHANFSSGVGTTAASSKNAFPLGAPTLVTSQATTLSTFQPTNKLNKNVPTNVRSSFPVSLPLAYSHPHFALLAAQTMQQIRHPRLPMAQFGGTFSPSPNTWGPFPVRPVNPGNTSNSPKHNNTSRLPNQNGAVLSSESPGLTTASCPITVSSVVAASQQLCVTSTRTPSSVRKQLFACVPKTSPPATVISSVTSTCSSLPSVSSAPITGGQVPTTFLPASTPQAQLSSQKMESFPAMPAPKEKVSTQDQPMANLCTPSSTANNCSSSASNTPGAPETHSSSSPTPPSSNTQEEAQPSIVSDLSPMSMPFASNSEPAPLTLASPRLVAADNQDTNNLPQLAVPAPRVSHRMQPRGSFYSVVPNATIHQDPQSIFVTNSVPLTPPQGPPAAVQLSSAMNIMNGSQMHINPANKSLPPTFGPATLFNHFSSLFDSSQVPANQGWGDGPLSSRVAADASFTVQSAFLGNSVLGHLENVHPDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSMDPSGSSPSSSSTPLTSFSSIPGTRVFLQGPAPVGTPSFNRQHFSPHPWTSASNSCRNPGGTLPKES	201376	186960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_188854_195525_197139_200563_200714_201329
921710	contig_3018_pilon	-	1921	13	Intergenic	novelGene_78858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	375.874498854191	3	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1470	450	1919	600079	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	625113	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600188_624772
921712	contig_5894_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_83034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTCTCACCCCGTACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366130	367696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_366100_367700
921713	contig_8576_pilon	+	2188	1	Intergenic	novelGene_88761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTGTTTTTGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732241	734429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_732200_734400
921714	contig_15952_pilon	+	1690	4	Intergenic	novelGene_154056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_3	33.2097709851918	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGGTTTGCACTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233537	238372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_233638_234781_234862_235137_235307_237031
921715	contig_8291_pilon	+	5237	2	Intergenic	novelGene_99966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4513	4812	769837	770136	FALSE	65	TACTCTAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCLATTIDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESTAPRHPFSSVVKSSPRFTVQPGSGQPHKTKWD	764730	770561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_765107_765700
921716	contig_11512_pilon	-	1800	5	Intergenic	novelGene_43307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_3	394.108091137444	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	193	699	396169	374504	FALSE	20	GCACTCTCTGAAGTGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSGKQQPAR	396361	373402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
921717	contig_12622_pilon	+	5236	6	Intergenic	novelGene_5815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_2	188.308682752549	75	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	27	356	358539	398502	TRUE	70	GATAGAAGAAAAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEVSS	358512	410014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_358564_388907_389057_398346_401940_404556_404650_405789_405878_408752
921718	contig_5062_pilon	+	3062	2	Intergenic	novelGene_157863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	588	junction_1	0	37	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2708	3010	743716	744018	FALSE	80	ACAAAAAAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQVPPNESNTNSEGSYTNVSTNSTSVTSSTATVVS	738978	744070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_739693_741722
921719	contig_8138_pilon	-	2386	1	Intergenic	novelGene_52485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCATTTGAGAACAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307923	305537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_305500_307900
921720	contig_4392_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_117342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	123	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	302	946	624513	623869	NA	45	AAAAGAATTATCTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRREQTISNHLQKQDRMVPVSVQNKTPDDLPVEENALDLTEREFKSLIFRIIQELNQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKLEEFKKIIWEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISETDSVIEGLRSRFEMMEDRISKIEDKHLDTTLFEEKSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIRVPEQGGENRRRREDHRRIADRKLPQYHER	624814	621784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_621800_624800
921721	contig_5479_pilon	-	1137	1	Intergenic	novelGene_133599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGAAGATCTTTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286982	285845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_285800_287000
921722	contig_10339_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_125276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCATAAGAAATGAGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334419	336655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_+_334400_336700
921723	contig_6930_pilon	-	2973	3	Intergenic	novelGene_178891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1661	2107	527836	527390	FALSE	65	CTACAAAAACAAAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQTKTPDDSPVEENALEVPDREFKSVLLGIFQELRQKAEKHEEKIDKFMENIDKKLKEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDNVIKGLRSRFETMEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEQTLRVM	569273	526523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6930_pilon_-_528270_528566_529458_568937
921724	contig_6929_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_139426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	112	312	139133	138933	NA	85	ATAAAAAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPSGKLFVKPSLQVKATNTWLYDPAPTSHVDETVLSLMTLEAFIPQRRSLLCLCCCLLIQQQEMQWRNSTTMSHFGVEMTRWCQPFLLTRSPKDRNPAMGIRT	139244	137011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_137000_139200
921725	contig_5718_pilon	-	1234	1	Intergenic	novelGene_110348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATCTGGTACTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630196	628962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_629000_630200
921726	contig_19960_pilon	+	2540	1	Intergenic	novelGene_164185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1545	1919	8112	8486	NA	40	CATCAATATGTAGATGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNKKGKRGKRKQNLKKNNSPPKKQEKKTTKKKCSEGALCTSAQAEGVCPKPCSTARPEQAHNSRKGKKTNNPKQTNKSPGIPPAWQPRTGRSSTLKWSSTAPEEEAKMVHRARYLSERRGRW	6567	9107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_+_6600_9100
921727	contig_14687_pilon	-	1997	2	Intergenic	novelGene_107966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAACTTACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688536	685046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_686530_688022
921728	contig_10864_pilon	+	1897	3	Intergenic	novelGene_107054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	368	712	744173	744517	TRUE	50	TACGTAAGAAATTAGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLCLSGDRIAPSMVRAPGIWALLELIFLYFRACSCHQRLGTLRTIFWEERIQFNPLNQNRDVLHETVSQIAWPEVFRLLPCHLGIRDDLPTVSDPSSFWLGVGSDVTWQRLK	743805	748445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_744895_745545_745723_747814
921729	contig_6898_pilon	+	1152	2	Intergenic	novelGene_35790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125514	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125807_126841
921731	contig_5551_pilon	+	2290	1	Intergenic	novelGene_134239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	360	1930	2289	417934	418293	NA	35	CCTCACTTATATAAGTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTIWQLLKKLKIELPHDPAIPLLGIYPKDLKAETQKETCTPMFIAALFTIAKRWKQPKCPSVDEWVNKMWYTHTIEYYSTRRRNEVLIHATIWMNLEDTMLMERSQSQKDKYYM	416004	418294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_416000_418300
921732	contig_9272_pilon	+	686	2	Intergenic	novelGene_125930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363132	400716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_363206_400103
921733	contig_2036_pilon	-	829	4	Intergenic	novelGene_131836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_3	378.762018511184	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	112	468	661441	636681	TRUE	70	GAAAAGAAAAAGAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILDLSSVNLHLWLAIASR	661552	617116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617232_631747_631872_636558_636731_661134
921734	contig_5959_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_150235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGAAAACACAATGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622570	621192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_-_621200_622600
921735	contig_177_pilon	+	2345	2	Intergenic	novelGene_41847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	179	691	417873	418497	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRIPS	417694	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_418374_418485
921736	contig_7416_pilon	+	2270	1	Intergenic	novelGene_134333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864411	866681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_864400_866700
921737	contig_3077_pilon	+	1183	4	Intergenic	novelGene_26770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1070.34231284513	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	279	704	15160	17590	FALSE	50	ATACAAAAGATTAACAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13861	18069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_14112_15131_15262_16144_16328_17449
921738	SIRV6	+	308	4	NNC	SIRV6A	novel	531	4	NA	NA	-88	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2384	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2506_2749_2815_3106_3165_10724
921739	contig_8362_pilon	-	3322	3	Intergenic	novelGene_150673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2340	2774	29982	29548	FALSE	35	AGAGCTGGAGAAGGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLRGDRNTYALLVGMQNDTTIWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIHICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHIMEYYAMRKNNNESVNHLITWIKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	233787	28999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_31775_87018_87024_233245
921740	contig_9415_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_109721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAAAAAAAAATCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452105	450068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_450100_452100
921741	contig_12528_pilon	-	2152	11	Intergenic	novelGene_81314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_8	458.715696265127	1485	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	959	1546	959940	933323	FALSE	15	TCGGTGCCTATGACTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	968139	932716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947151_956052_956217_959917_960131_963878_964021_964909_964971_966191_966274_967656
921742	contig_14441_pilon	+	1196	5	Intergenic	novelGene_100575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	6	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	356	1156	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111197	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111372_120954_121239_125517_125902_126159_126283_126514
921743	contig_7410_pilon	-	2450	1	Intergenic	novelGene_106066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1253	1600	318499	318152	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEHNAEINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSITEGLRRRFEMMEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKRNEETLRIMWATIKSKNFRVIGVPERGENRKHREDH	319751	317301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_317300_319800
921744	contig_9578_pilon	+	1142	1	Intergenic	novelGene_67997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGTTAAATTTGTCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1245332	1246474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_+_1245300_1246500
921745	contig_20527_pilon	+	2824	5	Intergenic	novelGene_138591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	1041.95090455357	5	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	21	509	13527	26633	FALSE	35	TAATGACCATGCTAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPLRGKMSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSM	13506	28948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_26626
921746	contig_14333_pilon	-	3779	1	Intergenic	novelGene_49128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	2950	3252	411880	411578	NA	30	TAAGTCGCCCAACTGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRTECLERFLFGFHVSQTTISSPKLSPKLLTSRVSCAFDKYLFSTTNVSGTVYPIFPWMSPKCYKLRTTHANLTSPPNSSSSPALTAVTGAISHAEAQA	414829	411050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_411000_414800
921747	contig_6102_pilon	+	1613	4	Intergenic	novelGene_31910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_3	17.5562587763516	15	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375196	377319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375533_375636_375730_375966_376039_376207
921748	contig_6302_pilon	-	2557	2	Intergenic	novelGene_171693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAGGGACTTAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104205	100861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_102168_102954
921749	contig_15784_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_172485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGGCTTCCGGGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96105	94517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15784_pilon_-_94500_96100
921750	contig_11363_pilon	+	2800	1	Intergenic	novelGene_160498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCAGCGATTCTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182152	184952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_182200_185000
921751	contig_2940_pilon	+	4760	1	Intergenic	novelGene_81967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	3804	4211	1059549	1059956	NA	65	AAAAAAAAAAGTTTTACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQANKHMKKCLRSLAIREMQIKTTRYHLTLTLPSLIKKTENNKCWRGCGEIGTLIHCWWECKMVQPLWKMTWHLLKKLEIKISYDPAIPLLGIHHKEISALTRIDICTPMFIAALFTIAKRWKQSK	1055745	1060505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_1055700_1060500
921752	contig_12277_pilon	+	784	8	Intergenic	novelGene_139683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_3	164.904920038976	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	510	275	784	345203	389564	FALSE	35	GATATGAATAATGCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEYVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVVRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRPPSKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGF	205275	389564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_205415_327600_327658_345124_345206_365884_365975_366373_366491_376158_376242_378464_378632_389514
921753	contig_5260_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_144386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATTAAATAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402298	403051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_+_402300_403100
921754	contig_16411_pilon	-	3576	4	Intergenic	novelGene_77266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1153	1599	12508	12062	FALSE	65	AAAAAAAAAAATTTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLYIDQEAVIQTEQGNIMWFKIREGVHQGCILSLYIFNLFAEQIIREAGLYEEEWGIRIGGRLINNLQYADDTTLLAKSEEDLMHLLMNIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMIEKTEVVKDLILLGSTINTYGSSSQEIK	203254	10084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_13216_68765_68892_201537_201662_203059
921755	contig_5947_pilon	-	1374	1	Intergenic	novelGene_101483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAACAATATGTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370620	369246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_369200_370600
921757	contig_4091_pilon	-	3914	3	Intergenic	novelGene_173009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1858	2160	56589	56287	TRUE	20	GCTCTTAACCACTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	121175	10820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11291_55002_57380_120108
921758	contig_9468_pilon	+	2894	2	Intergenic	novelGene_59520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	199	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472643	476039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_474307_474808
921759	contig_2341_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_84349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TGAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42041	40464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_40500_42000
921760	contig_17144_pilon	-	1940	11	Intergenic	novelGene_29340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	543	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	317	1645	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183398	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166510_172634_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
921761	contig_5891_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_151586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGAATTTAATAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153851	152983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_-_153000_153900
921762	contig_10324_pilon	+	2725	14	Intergenic	novelGene_7743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1199.42745216947	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	1007	2395	69971	79380	TRUE	20	TGTACAGACTCCAGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	68964	80758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_79542_80589
921763	contig_9177_pilon	+	3127	24	Intergenic	novelGene_32621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.203931119992323	3	110	12	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATATACCCTTTTTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15204	26015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_15261_15419_15553_15705_15844_16051_16170_16268_16379_16549_16676_17437_17611_18199_18494_18836_19005_20027_20127_20274_20479_20695_20807_20910_21023_21210_21390_21607_21689_21864_21972_22740_22896_23251_23356_23963_24025_24696_24856_24960_25075_25327_25480_25583_25712_25970
921764	contig_8660_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_136483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGGGGGTATGGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71934	70185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_70200_71900
921765	contig_10225_pilon	+	2265	13	Intergenic	novelGene_86833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	615.480181782214	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	1112	2011	42707	47494	FALSE	20	CTGATCCTAGACTTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSESEWPDPGGRQRPPHTLRGEAEAVGTVRPGLYLQELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	21364	47748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21630_35637_35785_37050_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46338_46409_46825_47297
921766	contig_16204_pilon	-	481	1	Intergenic	novelGene_154477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATTTAAAAAAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154941	154460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16204_pilon_-_154500_154900
921767	contig_1694_pilon	+	1644	4	Intergenic	novelGene_144961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAAAAAAGGCATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1538527	1677963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_+_1539811_1560248_1560408_1616429_1616495_1677826
921768	contig_10958_pilon	+	2221	6	Intergenic	novelGene_5427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5309.5640499009	2	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	33	434	888255	894000	TRUE	30	TATGTTGAGAAATTACCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888222	901570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894144_895250_895855_900457_901397_901469
921769	contig_5238_pilon	+	5469	22	Intergenic	novelGene_176255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	219.449434772042	654	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1036	3111	227	3337	66240	119678	FALSE	30	TAATATGGCTAATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSVGNVADSTGLAELAHREYQAGDFEAAERHCMQLWRQEPDNTGVLLLLSSIHFQCRRLDRSAHFSTLAIKQNPLLAEAYSNLGNVYKERGQLQEAIEHYRHALRLKPDFIDGYINLAAALVAAGDMEGAVQAYVSALQYNPDLYCVRSDLGNLLKALGRLEEAKACYLKAIETQPNFAVAWSNLGCVFNAQGEIWLAIHHFEKAVTLDPNFLDAYINLGNVLKEARIFDRAVAAYLRALSLSPNHAVVHGNLACVYYEQGLIDLAIDTYRRAIELQPHFPDAYCNLANALKEKGSVAEAEDCYNTALRLCPTHADSLNNLANIKREQGNIEEAVRLYRKALEVFPEFAAAHSNLASVLQQQGKLQEALMHYKEAIRISPTFADAYSNMGNTLKEMQDVQGALQCYTRAIQINPAFADAHSNLASIHKDSGNIPEAIASYRTALKLKPDFPDAYCNLAHCLQIVCDWTDYDERMKKLVSIVADQLEKNRLPSVHPHHSMLYPLSHGFRKAIAERHGNLCLDKINVLHKPPYEHPKDLKLSDGRLRVGYVSSDFGNHPTSHLMQSIPGMHNPDKFEVFCYALSPDDGTNFRVKVMAEANHFIDLSQIPCNGKAADRIHQDGIHILVNMNGYTKGARNELFALRPAPIQAMWLGYPGTSGALFMDYIITDQETSPAEVAEQYSEKLAYMPHTFFIGDHANMFPHLKKKAVIDFKSNGHIYDNRIVLNGIDLKAFLDSLPDVKIVKMKCPDGGDNADSSNTALNMPVIPMNTIAEAVIEMINRGQIQITINGFSISNGLATTQINNKAATGEEVPRTIIVTTRSQYGLPEDAIVYCNFNQLYKIDPSTLQMWANILKRVPNSVLWLLRFPAVGEPNIQQYAQNMGLPQNRIIFSPVAPKEEHVRRGQLADVCLDTPLCNGHTTGMDVLWAGTPMVTMPGETLASRVAASQLTCLGCLELIAKNRQEYEDIAVKLGTDLEYLKKIRGKVWKQRISSPLFNTKQYTVELERLYLQMWEHYAAGNKPDHMIKPVEVTESA	66013	121810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_+_66277_69286_69438_70848_71093_99889_99959_103219_103337_105711_105792_106330_106527_106801_106943_107562_107664_107829_107984_108068_108171_108355_108536_109181_109341_109745_109836_111187_111314_111692_111864_111973_112091_112186_112358_113499_113653_115778_116032_116253_116378_119503
921770	contig_13697_pilon	-	2227	1	Intergenic	novelGene_165911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACTCCATGGCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121447	119220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_119200_121400
921771	contig_11855_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_67036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTATGAGTTGGAATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1936647	1934442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1934400_1936600
921772	contig_9995_pilon	+	442	1	Intergenic	novelGene_47666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCATGGTGGTTTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166859	167301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_166900_167300
921773	contig_9177_pilon	-	3852	2	Intergenic	novelGene_32744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCCCATTGCTTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1128831	1123470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1123562_1125070
921774	contig_610_pilon	+	2394	5	Intergenic	novelGene_76849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	46	junction_3	210.774761297457	1	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1471	1926	366398	375609	FALSE	40	ATAACCTAAATGTCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSVEDSGDDVTYRWTFLQKGAVASQEGSLLNVSWRSSEYHPNFTCTAMNPISNSSWQFLSGNICPGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGQDASSSEERQFIHSVLLCTETPTGGTTTATE	364927	376077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_366597_368139_368245_369603_369658_374082_374155_375583
921775	contig_6418_pilon	-	1471	1	Intergenic	novelGene_81259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAGCAAAAAGAAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1495768	1494297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1494300_1495800
921776	contig_11720_pilon	+	2328	4	Intergenic	novelGene_43864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3591	junction_3	1927.78445083699	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91602	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_93261_94959_95061_95383_95486_98299
921777	contig_10749_pilon	+	7842	1	Intergenic	novelGene_133500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	120	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTTACAAAAGAACCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231802	239644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_+_231800_239600
921778	contig_9833_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_68516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	1752	2066	216973	217287	NA	25	TTTCCCAGTCAAGAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAA	215221	217288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_215200_217300
921779	contig_17790_pilon	+	5064	1	Intergenic	novelGene_128485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86153	91217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_86200_91200
921780	contig_14288_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_153842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	260	784	480576	481100	NA	45	TGTGAATTTATTAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDTMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKQLETTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	480316	482197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_480300_482200
921781	contig_5031_pilon	+	3167	2	Intergenic	novelGene_133182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	703	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2540	2845	25252	25557	FALSE	10	TTGTGGTGTCTTTACCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILCPDTLLKSSISSSSVLVDSLGFSVYKIMSSANRDTLTSSLPIWMPFISFFGLTALARTSSAVLNKSGDKGHPCLVPILRENAFKVSPFRMMLAFGFV	22598	25879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_23506_23619
921782	contig_6870_pilon	-	2916	19	Intergenic	novelGene_103995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCCTTTAATTCAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1607505	1493530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1493611_1502310_1502439_1504240_1504494_1521424_1521469_1523688_1523855_1524819_1524941_1525067_1525164_1530737_1530856_1532495_1532660_1533388_1533488_1539712_1539971_1547900_1548096_1561566_1561717_1564394_1564538_1567435_1567563_1593445_1593536_1594459_1594546_1601693_1601850_1607063
921783	contig_13014_pilon	+	2728	1	Intergenic	novelGene_169318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	115	309	31987	32181	NA	10	ACAGGTCTGGTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIGIEGKFLNIIKFIYRKPTADIIVNEERLKAFPLKTGMRQGCLLSPLLFNILLEVLAKAIRQEKEITDIQIGKEEVKLPLFTYDMILYMKIPNIPQESYWN	31872	34600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_31900_34600
921784	contig_8462_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_159427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTGAACTGCACAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231132	229069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_-_229100_231100
921785	contig_8383_pilon	-	2760	1	Intergenic	novelGene_172763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAGTAGATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322127	319367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8383_pilon_-_319400_322100
921786	contig_5620_pilon	+	1972	1	Intergenic	novelGene_161366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGATTCCTCCGGTGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443324	445296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_443300_445300
921787	contig_11338_pilon	-	1587	8	Intergenic	novelGene_6404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	210.348496062887	5	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	152	991	319426	311103	FALSE	30	AGGTTGAGAAGTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEQGRMKRTGYKEKISPKD	323314	310506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_311160_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
921788	contig_6287_pilon	+	6843	1	Intergenic	novelGene_160429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	402	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAAATGGCCACCCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149892	156735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6287_pilon_+_149900_156700
921789	contig_4125_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_25163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTCACAGCATGCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	912506	910856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_910900_912500
921790	contig_20058_pilon	-	1861	9	Intergenic	novelGene_109285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	385.875222708067	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	99	1712	49654	30516	FALSE	50	GAAAAATGGCAGGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAEYGGHDQIDLYDDVISPSANNGDAPEDRDYMDTLPPTVGDDVGKGAAPNVVYTYTGKRIALYIGNLTWWTTDEDLTEAVHSLGVNDILEIKFFENRANGQSKGFALVGVGSEASSKKLMDLLPKRELHGQNPVVTPCNKQFLSQFEMQSRKTTQSGQMSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPGNLIKHLVKGTRPLFLETRIPWHMGHSIEEIPIFGLKAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	49752	30366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_30706_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40135_40247_40376_40551_41458_41605_45576_45681_49540
921791	contig_16632_pilon	+	5101	3	Intergenic	novelGene_154140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	108	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGAATTTTGATCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100177	105902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_+_102429_102966_105697_105782
921792	contig_7521_pilon	-	4387	1	Intergenic	novelGene_160556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGGAGTATCCACAACGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335112	330725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_330700_335100
921793	contig_6497_pilon	+	4608	1	Intergenic	novelGene_35590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCTACCAAAATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346770	351378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_346800_351400
921794	contig_10904_pilon	+	1175	3	Intergenic	novelGene_22658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1936	junction_2	602.5	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	803	1114	533790	535124	FALSE	30	CGGATCAGAACTTTGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFSLRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED	530612	535185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_531362_533736_533924_534946
921795	contig_2027_pilon	-	2748	4	Intergenic	novelGene_39938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTGGAACAAAGAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429055	413874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2027_pilon_-_414031_414076_414493_414895_415858_427841
921796	contig_12677_pilon	+	1128	1	Intergenic	novelGene_110824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	190	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTCATAGGGGGATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2167	3295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2200_3300
921797	contig_8045_pilon	+	6265	1	Intergenic	novelGene_35339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAATTTATTAATCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99230	105495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_99200_105500
921798	contig_8829_pilon	+	3133	1	Intergenic	novelGene_140953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1873	2172	135618	135917	NA	65	GCAACAACAACAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGQKDWAFFVACLSLGPILLTTCPGGQGWSFSYVVAQCVQQVEWGWVVCGTNWGRQGSARGSAGQGPGDRVSATRRRGTWCMVQIGRRERIGMLCRVN	133745	136878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_133700_136900
921799	contig_11378_pilon	+	2683	15	Intergenic	novelGene_112318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	20	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCAGGCCGGAAGCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1151980	1179421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1152691_1153988_1154101_1154188_1154329_1154419_1154628_1158180_1158396_1158960_1159152_1160476_1160528_1160748_1160797_1160871_1160967_1161065_1161197_1168493_1168655_1169474_1169921_1176176_1176247_1179107_1179172_1179380
921800	contig_3386_pilon	+	1360	10	Intergenic	novelGene_34543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_5	607.813567908231	2	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	693	1292	494399	506163	FALSE	25	CCCTCCCCCTGCTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRYRSENTPDPGFLT	470010	506231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476271_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996
921801	contig_19930_pilon	+	4266	1	Intergenic	novelGene_178990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	2870	3289	25697	26116	NA	45	TGTGAAGAATATCGAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTHLAFLKLKELKTKFKPQVAVLKDSTGKIVNDAGSIKRRWKEYAESLYQKELVHVQPFQQVAYDQELMVLKEEVQAALKALAKKKKKKAPGIDGIPTEMFQQMDAALEVLTCLCEEIWKTATWPTD	22827	27093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19930_pilon_+_22800_27100
921802	contig_960_pilon	+	2979	2	Intergenic	novelGene_108274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1441	1989	960037	960585	TRUE	25	TGGTCGTTGTGGAAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKRHLIKSQHLFLTKTLKKIGIERKFFNMIQVIYEKSTANIILNGKRLRAFPLKSGTRQGCPLSSLLFNIVLEVLARAVRQEKEVKGIQVGKEEVKLSLFTEDMIPYIENPNESARKLLELIGKFRKVAGYKTNKQKSVEFLYTSNEKSERETRELIPITIVSKRIKHLTKPSQRYEGLIQ	958596	961697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_961470_961591
921803	contig_12157_pilon	-	3032	1	Intergenic	novelGene_135885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTCAGCAAATGCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68482	65450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_-_65400_68500
921804	contig_11855_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_67052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAAAAGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1997533	1999763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_1997500_1999800
921805	contig_854_pilon	+	1667	7	Intergenic	novelGene_36241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2351.07715857127	11983	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	339	899	556203	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPHPLLAVQPLLSLRAEVERTSLLCPDPTPPASTWAAVPLRGCPDVRRAQAGRLPASPHRIHCPLCPQDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543488	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556241_556832_557065_557591_557752_562271_562405_563029
921806	contig_8060_pilon	+	3530	1	Intergenic	novelGene_104837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGAGAAGGAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230480	234010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_230500_234000
921807	contig_5451_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_167192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	2	448	820039	820485	NA	30	TCTGATACCTGAATACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASFGFSLATRCLPPLLLGCLTPSTIFALFCRAVGLHLGVWLLPGLGCGTGEIPGPLFVCSSASRGHSLFTQGRRLLGFRAPLRAALWVLFLGCWCCFFCFLWFLACLSLPPPPFTRVPGSERCLFPFLRGCGDTFGRAAAPRSGLLRW	820037	820998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_+_820000_821000
921808	contig_9653_pilon	-	2521	3	Intergenic	novelGene_48313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2050	junction_2	254	10	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	83	571	1016667	1014088	FALSE	40	TTCCCCAGAATATGAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKVRRGLVWPGNTF	1016749	1012137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1014247_1015777_1016036_1016595
921809	contig_6048_pilon	-	1867	1	Intergenic	novelGene_73307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTCTTCATACCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2032111	2030244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2030200_2032100
921810	contig_4783_pilon	-	1430	17	Intergenic	novelGene_108370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	441.229372747327	1	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	85	972	335593	220176	TRUE	30	TCATGAACCACTTGGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSAKRKFADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERILMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFSDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVTLKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPAPLLMD	335677	155427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_155515_157883_157943_159655_159744_173638_173714_178145_178212_203798_203836_220129_220197_272584_272664_292845_292941_300778_300880_302093_302224_303697_303803_313098_313210_322707_322810_330045_330118_333871_333934_335583
921811	contig_7513_pilon	-	4155	15	Intergenic	novelGene_89008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	40	CACTTCCCTACCAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	647448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_647536_654246_654351_656302_656506_661839_662363_669619_669878_671628_671800_673123_673256_673407_673561_677525_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
921812	contig_7513_pilon	-	3393	10	Intergenic	novelGene_89012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	121	597	692216	691740	TRUE	35	TGGTTTTGTAAGAAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGTHTHTHPHPKVQTPGQGQATNPSLPHIPRPSQEASSNPTPRLEGKYRSVICIFRNARVLWTKVFLLQTLQTRLLKPGLFQGLTASSALGARVEHPAAAPRRPSVSAGRPATCPHSMLTGHGAAPGLSSEDSSGTSLNIITKVCRGCLLRGSFSV	692336	669617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_669878_671628_671802_673124_673561_677525_677628_680392_680534_682650_682807_685345_685493_690079_690193_690276_690412_690606
921813	contig_11026_pilon	+	1248	1	Intergenic	novelGene_167671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGATTAGTGGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171725	172973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_171700_173000
921814	contig_5979_pilon	-	3395	5	Intergenic	novelGene_178441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2383	2808	425693	425268	TRUE	20	GGTCTGTGTCATGGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRSGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPFAGLR	554420	279507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5979_pilon_-_279775_328650_328798_425094_425847_426167_427082_553105
921815	contig_3525_pilon	-	3521	1	Intergenic	novelGene_135122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	53472	53239	NA	80	AAAAAAACAGAAAATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TELSLEVHERGAGDITLGQNNTRMLLNWDTAQEEPSDSSNAEVQERKATETWQWDKTARDVMHREFKIKVKCPVDGTKRGGGGDEEVLLRKGVLVGTPGS	53541	50020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_50000_53500
921816	contig_3153_pilon	+	1544	4	Intergenic	novelGene_104620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGCACTGTTTATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13765	108819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_14056_71509_71835_72927_73310_108272
921817	contig_10263_pilon	+	2441	1	Intergenic	novelGene_135863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAATGTGGGAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989625	992066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_989600_992100
921818	contig_6137_pilon	-	4265	5	Intergenic	novelGene_59165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	3806	4234	1300361	1239072	FALSE	45	ACAGGATCCAGATCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERCLVKRTSCRAYCLIPFYQKKYLDFTDLESSNKEPTTDCDPRSTCSEFLSLRNTQFPRLLQSTTTGNINQIFSSLQSWRLACPKVCGSGIGCRRLLTHVLQGLMNPEPTGQMAVCWLTGLWSWQIPKLAGQLTSYWLKS	1309608	1239040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1239268_1240379_1240549_1268907_1268969_1300358_1300429_1305870
921819	contig_7396_pilon	-	1033	7	Intergenic	novelGene_79626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4587.10901755004	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	97	585	255163	246385	FALSE	5	CTATTTTTGGTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257083	245936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_253927_253977_254602_254701_255105_255191_257014
921820	contig_6210_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_171885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78509	80074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_+_78500_80100
921821	contig_4857_pilon	+	3740	1	Intergenic	novelGene_48697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	121	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAAGCAGAGAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145736	1149476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1145700_1149500
921822	contig_8563_pilon	+	3706	5	Intergenic	novelGene_178614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	129	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2777	3196	63457	63876	TRUE	25	AAGAGGCTGAGTGGGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQGSLCTSVEAEGEFLAMQLRLARKGFQFKKRKRKETNNSKRTNEQKPRDPTSVVAQTGRQLHTRMQCRSPSGRSKDGARSQALERKDGEAARGKQEIKRSRKKKKATPAANKWHSDSQLVRAGASGQETVSAGSRGG	4214	180874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8563_pilon_+_6334_51416_51581_62963_63879_111914_112306_180757
921823	contig_17171_pilon	+	1421	4	Intergenic	novelGene_147379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_2	3.29983164553722	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	288	689	320702	326562	FALSE	25	CCTTTTCAAAGGGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHPATWRQPQPTTSILSHRDFPVAGHAVADFTSEVKVPFEWTWTQRSETPRAAGDGRPSDIWCQGPKDEKNRTSRRGSRKPESRVWPASNQLVACFKLPWQEIKSRKERIASGTLITLRSWPSTGPQNSRCS	318521	327294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_+_318671_320563_320761_323711_323849_326356
921824	contig_7176_pilon	-	3443	4	Intergenic	novelGene_107880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATTTCTCCTTGCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864056	851158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7176_pilon_-_851281_851895_853945_862042_862659_863400
921825	contig_10126_pilon	+	1342	4	Intergenic	novelGene_105753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	858.427632360469	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAATTTTGATCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162188	185167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_162302_169472_169569_181522_181563_184074
921826	contig_14508_pilon	+	1488	3	Intergenic	novelGene_79038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35678	54541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_37085_49687_49733_54504
921827	contig_17194_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_155371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTCATGGGGCATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220405	219341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_219300_220400
921828	contig_13565_pilon	+	3871	1	Intergenic	novelGene_162379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGAAAGTTCAGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134485	138356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_+_134500_138400
921829	contig_13702_pilon	+	1108	2	Intergenic	novelGene_102650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	783	1082	211071	211370	FALSE	85	CAAGAACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210129	211396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210584_210742
921830	contig_15021_pilon	-	3373	9	Intergenic	novelGene_26967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1068	junction_3	262.061508762733	172	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	2410	2994	261049	243699	FALSE	60	TGATTAATAAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQRQAGDGDGSAHGHHA	265401	243319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_243801_248098_248157_249299_249384_251250_251397_251961_252064_260956_261075_261238_261374_262373_262498_263276
921831	contig_2054_pilon	+	8971	9	Intergenic	novelGene_51669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	276	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAAAGTAAAGTGTGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48987	97607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_56541_58135_58353_65651_65763_66043_66127_66712_66853_72068_72165_74194_74576_77020_77117_97313
921832	contig_6062_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_5276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAACTGGTAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701326	703207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_701300_703200
921833	contig_9345_pilon	+	3154	4	Intergenic	novelGene_24433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	192	536	336788	337132	TRUE	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSDWSLLITCPNYVRCSLTIFAPKGHSGCTSSKTDLFVLLAVHGIFSILRQHHNSKALILLRSSLFIVQLLHAYEAIENTMTWVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFGLKSNPI	336596	561345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_337352_405992_406504_559282_560664_560838
921834	contig_7286_pilon	-	825	6	Intergenic	novelGene_108699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3662.83472736622	14	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	24	761	292049	286948	FALSE	10	TTAATTGCCTTGTGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292072	286883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022
921835	contig_15135_pilon	-	1476	1	Intergenic	novelGene_119845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACTTACATACCAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14388	12912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_12900_14400
921836	contig_13749_pilon	+	6881	24	Intergenic	novelGene_156336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	28	junction_5	57.8217716598411	233	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1220	3663	474	4136	88031	226416	FALSE	20	GAGTGAATGTTGTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFHAGRMWSYHWKWKPGPQLFLFVLCIACVPHSAWGCANCRVDLSNPSGTFTSPCYPNDYPNSQACMWTLRAPTGYIIQITFNDFDIEEAPNCIYDSLSLDNGESQTKFCGATAKGLSFNSSANEMHVSFSSDFSIQKKGFNASYTRVAVSLRNQKVILPQTLDAYQVSVAKSVSIPELSAFSLCFEATKIGNEANDWTAFSYSDASFTQLLSFGKDQSGYFLTISGLRCFLNSVLPDKENEDVFTESFEQLCIVWNNSLGSVGVYFKRNYEMVPCDSTINRVIPGSGKLLLGSNQNEIASLKGDIYNFRLWNFTMNSKILSNLSCNVKGNVVDWQNDFWNIPTLALKAENNLSCGSYLIPLPAAELANCADLGTLCQDGIVYRISIVIENVLHHPEVKVQSKVAEWLNSTFQNWNYTVYVVNISLHLSTEEDKIKVKRSIEDDSRLVIWALLVYNATNNVSLEGKTIQQKLLRNNESLGEGLRLYTVNVRQLDTCPASEDPKGYVWPAIQPSEYSLPCNGKPGFYASRTCHRNLTNASLAYWGVPDVSNCSNDLNNVNTILNLTGEGQNLTSANITSIVEYVKRIVNNEENIDITLGSTLMTIFSNILTSSDSDLLESSSEALKTIDELAFKIDLTSTSRVNITTRNLALGVSSLSPGTNAVSNFSIGLPSNNESYFQMDFESGQVNPLASVILPPNLLENLSKEDSALVKRAQFTFFNKTGLFQDVGTQRDNLVSYVMACSIGNITIQDLKDPVRIIIKHTRTQTVHHPICAFWDLNKNSFGGWNTSGCVAYRGSDESETVCLCNHLTHFGVLMDLQGTASQMDARNTKVLTFITYIGCGISAIFSAATLLTYVAFEKLRRDYPSKILMNLSTALLFLNLIFLLDGWITSFDVDGLCTAVAALLHFFLLATFTWMGLEAIHMYIALVKVFNTYIRRYILKFCIIGWGLPALVVSVVLASRNQNEVYGKESYGKEQGDEFCWIQDPVIFYVTCAGYFGVMFFLNVAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGMTWGFAFFAWGPLNVPFMYLFSIFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRRHLCCGRFRLADNSDWSKTATNIIKKSSDNLGKSLSSSSIGSNSTYLTSKSKSSSTTYFKRNSHTDSASMEKSTSKLTHADGEQTSIIPVHHVIDKVKDYCSAHSDNFYKNIIMSDTFSHSTKF	87557	229161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_+_88033_99600_99702_156041_156384_158152_158777_165592_165662_174648_174735_177848_177902_178892_178956_183436_183580_184291_184404_186001_186067_186667_186876_188130_188303_190933_191075_193793_193914_195425_195472_196905_197010_201397_201526_202713_202983_204201_204299_206649_206934_220653_220756_221640_221794_226237
921837	contig_19688_pilon	-	1388	1	Intergenic	novelGene_173057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAAGAAGAATTAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54210	52822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19688_pilon_-_52800_54200
921838	contig_11363_pilon	+	3493	1	Intergenic	novelGene_160497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGAACCACTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180814	184307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_180800_184300
921839	contig_14617_pilon	-	3282	4	Intergenic	novelGene_178880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1755	2120	1528	1163	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	31585	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14617_pilon_-_1782_12518_12711_29079_29376_30572
921840	contig_5136_pilon	-	2324	13	Intergenic	novelGene_126623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	183	junction_3	234.749097738179	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	150	1706	249014	227929	FALSE	65	TCAGGCCAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWIVDPERSLLTEADAGHMEFTDEVYQNESRYPGGEWKSAEDTYTDANGDKSASPSELTCPPGWKWEDDAWVYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNRPKSWVAAEKMYHTHRRRRMIRKRNKDLTQSASSTARAMQELEDQEGWEYASLIGWKFHWKPRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGTDTTEDGDEKRGEKQNHSTTTVFGANTPIVSCNFDRVYLYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEIEIYGEPQTVLQNPPKVIIELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPLVKLNSEIDITPKLLWHPVMCGDKACGDILVTAELILRDKDGSNLPILPSQRAPHLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASITSPSLIVECGGERIESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIEHRPFGQKPVVGQCTINHLDRFRCDPYVTKEDIVPQLKASLMAAPPCRDVVIEVEDTKPLLASKVGF	251505	227310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_228018_232929_233096_235181_235344_237070_237170_237292_237452_237697_237880_240029_240108_241526_241636_242519_242694_245287_245434_247228_247335_248927_249043_251384
921841	contig_7410_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_106109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	36	111	194	304	446595	446485	NA	90	ACAACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRKQGQHSHCIATKSLAHQILSRVRNSGGPPKDGSPPYCIECVSLPTVLPVNPISHIRLLKGLTMPLPSLPFQGFDRYFFPFGSPKLQKFQFVPILLRWS	446788	445615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_445600_446800
921842	contig_2311_pilon	+	562	1	Intergenic	novelGene_169822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAAGTCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473221	473783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_+_473200_473800
921843	contig_9828_pilon	+	2816	1	Intergenic	novelGene_172247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1889	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80645	83461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_80600_83500
921844	contig_1435_pilon	+	803	1	Intergenic	novelGene_115479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCTAAAGAAATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350698	351501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_350700_351500
921845	contig_14970_pilon	-	4234	2	Intergenic	novelGene_45054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCACGGTTAACAATAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214780	191988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_192205_210762
921846	contig_5894_pilon	-	1273	2	Intergenic	novelGene_83035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	827	1273	377190	376703	FALSE	40	AAAGAATCCTGAGAGCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNTKINSQLEIIQKQQLEIQKISNKISEMDSVIEGLRDRFETMENRISEIEDKHLDTTLRKNQKKRTKKNEEILRIMWDKIKGENLPVIGVPEQEETTENTETIIEELLTENFPNIMKDEKSQKKITKHIIITHAKTKN	378016	376702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_376758_376798
921847	contig_13863_pilon	+	2593	11	Intergenic	novelGene_42075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	394.274029071152	4	111	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	185	739	474588	482003	TRUE	30	CGACTAGCATATTATTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVPVAREEVVVRGNTLVAIQLTKLEVCWREGPASKNNPCSRILATLLLTSRDRLTLCSKEMVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPAVMA	455717	491339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455878_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481469_481988_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
921848	contig_177_pilon	+	2456	3	Intergenic	novelGene_41823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	73	1074	417672	418748	FALSE	25	TAAATTTCTGTTGTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLILFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415658	420130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418132_418206
921849	contig_5302_pilon	-	3197	2	Intergenic	novelGene_81523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGGGCCCCTTCCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1501193	1485559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1485592_1498028
921850	contig_10494_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_102123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230031	229024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_229000_230000
921851	contig_12644_pilon	+	2294	1	Intergenic	novelGene_44582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	475	1857	2078675	2080057	NA	35	ATTGTCCACAGCTACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVTPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIKEKIGQTLQAFIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWVLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWKKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSGSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFNPAIPLLGVYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDVMLSEISQSQKDKYCMRPLL	2078200	2080494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2078200_2080500
921852	contig_10437_pilon	+	4578	6	Intergenic	novelGene_38254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_5	162.276800560031	61	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3554	4000	401482	407700	FALSE	30	TTAACATATATTTGGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQDENCMYSPTGKAAKCRGYREIPVGDEKALKRAVARVGPISVAIDASLTSFQFYSRGVYYDERCNSDNLNHAVLAVGYGTQKGNKHWIVKNSWGEYWGNKGYILMARNKNSACGIANLASFPRM	396440	408278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_397230_398632_398756_398840_401557_405379_405546_405816_405923_407600
921853	contig_6361_pilon	-	2550	1	Intergenic	novelGene_24033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCTGTTAGAGTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667029	664479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_664500_667000
921854	contig_12479_pilon	+	2969	1	Intergenic	novelGene_56885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAGAAAGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557528	560497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_557500_560500
921855	contig_9995_pilon	+	4478	2	Intergenic	novelGene_47829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	139	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCTGGGCACCCTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944280	948909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_944949_945099
921856	contig_12923_pilon	-	3099	17	Intergenic	novelGene_30075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	349.453121856137	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	62	2182	93727	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHEADLGATAADPEASPECLGYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101229	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45944_46118_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69713_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
921857	contig_17274_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_26500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	679	978	79012	78713	NA	25	CCAGATCCCTGTATCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGSRMSSAVPYGLQSPLQSRRSSQKAGLRVAVKLAGSLSLCHNELRPDLKKPFTSGILAYVGLLQHKGSCEVPRCQKRGAEWLHTKERKWKQGKPPTL	79690	77297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_77300_79700
921858	contig_5569_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_86733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGGTGAGATTAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226933	224965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_225000_226900
921859	contig_17427_pilon	-	2321	12	Intergenic	novelGene_30353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1247.97453751308	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	37	693	188879	181330	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWTSPSSPHQFRLR	204697	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181368_182701_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
921860	contig_405_pilon	+	5148	24	Intergenic	novelGene_135278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_6	42.6743504817111	1	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	978	2937	29	2965	37111	112153	FALSE	15	CCTCTGGAGTTTACAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNPAIKRIGNHITKSPEDKREYRGVELANGIKVLLISDPTTDKSSAALDVHIGSLSDPPNIAGLSHFCEHMLFLGTKKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLEGALDRFAQFFLCPLFDASCKDREVNAVDSEHEKNVMNDAWRLFQLEKATGNPKHPFSKFGTGNKYTLETRPNQEGIDVRQELLKFHSTYYSSNLMAICVLGRESLDDLTNLVVKLFSEVENKNVPLPEFPEHPFQQEHLKQLYKIVPIKDIRNLYVTFPIPDLQKYYKSNPGHYLGHLIGHEGPGSLLSELKSKGWVNTLVGGQKEGARGFMFFIINVDLTEEGLLHVEDIILHMFQYVQKLRAEGPQEWVFQECKDLNAVGFRFKDKERPRGYTSKIAGILHYYPLEEVLTAEYLLEEFRPDLIEMVLDKLRPENVRVAVVSKSFEGKTDRTEEWYGTQYKQEAIPDEVIEKWQNADLNGKFKLPTKNEFIPTNFEILSLEKEATPYPALIKDTAMSKLWFKQDDKFFLPKACLNFEFFSPFAYVDPLHCNMAYLYLELLKDSLNEYAYAAELAGLSYDLQNTIYGMYLSVKGYNDKQPILLKKIIEKMATFEIDEKRFEIIKEAYMRSLNNFRAEQPHQHAMYYLRLLMTEVAWTKEELKEALDDVTLPRLKAFIPQLLSRLHIEALLHGNIAKQAALGIMQMVEDTLIEHAHTKPLLPSQLVRYREVQLPDRGWFVYQQRNEIHNNCGIEIYYQTDMQSTSENMFLELFCQIISEPCFNTLRTKEQLGYIVFSGPRRANGIQGLRFIIQSEKPPHYLESRVEAFLVTMEKSIEDMTEEAFQKHIQALAIRRLDKPKKLAAECAKYWGEIISQQYNFDRDNIEVAYLKTLTKEDIIKFYQEMLAVDAPRRHKVSVHVLAREMDSCPAVGEFPCQNDVNLPQAPALPQPEVIQNMTEFKRGLPLFPLVKPHINFMAAKL	37082	114336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_37271_38534_38743_41049_41220_55539_55663_62678_62792_64280_64444_65314_65408_65853_65946_66993_67075_68672_68777_78522_78626_81880_82004_83875_83959_87343_87489_90305_90417_91359_91481_97358_97451_99954_100067_102952_103121_105272_105546_106631_106694_110546_110620_111299_111368_112057
921861	contig_12886_pilon	-	4073	1	Intergenic	novelGene_135478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	182	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTACTGTCTCACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323828	319755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_319800_323800
921862	contig_11338_pilon	-	1427	8	Intergenic	novelGene_6368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	297.825452236709	42	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	300	908	319426	295358	FALSE	45	GAAATAAAGTGATACTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLC	323315	294838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
921863	contig_13440_pilon	+	1578	1	Intergenic	novelGene_170515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	279	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	1201	1578	77135	77512	NA	30	CTCCATTCCACACCACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAYRLLRPQTLLTKVECRTFFFINYVMPIELDIPQDHGPHSPPPSNSVPQEVWMCLWRFRNLALDKLCWLPQQHCKSLWKQTATSFSGKVAGGFEPPTFWLAAEHLTTVQPGLQKKLAHSFSHPQ	75934	77512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13440_pilon_+_75900_77500
921864	contig_10740_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_152243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTCTTGTCAGGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22397	20479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_20500_22400
921865	contig_11709_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_168201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	71	436	6373	6738	NA	10	CAGCCAGTCTGGGGCTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNYSRPPTYSGVPSASYSGPGPGMGINANSQMHGQGPSQPCGAMPLGRMPSAGMQSRPFPGNMSSMTPSSPGMPQQGGPGMGPPMPTVNRKAQEAAAAVMQAAANSAQSRYGSQDQCQGRHSGYPHVSEHTPGRAATHLGGRRE	6302	8430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_6300_8400
921866	contig_5586_pilon	+	2886	1	Intergenic	novelGene_143593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAGTCCCAAGAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530973	533859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_531000_533900
921867	contig_10019_pilon	-	2272	1	Intergenic	novelGene_86666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTAAAAAAAAAAAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209771	207499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_207500_209800
921868	contig_12841_pilon	-	2990	4	Intergenic	novelGene_55843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	51	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	514	1224	219236	218526	FALSE	75	ATTTAAAAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDFLHGLQMLKSLQGKHVVTLLGYCEDDNTILTEYHPLGSLSNLEATLNLSKYQHVNTWQNRLQLAMDYVGIINYLHSSPLGTLVMCDSNDLPKTLSQYLLTSNFSIVANDLDALPLVNHSSRTFVKCGHRELHGDFVAPEQLWPYGEDLPFHDDLMPSYDEKIDIWRIPDVTSFLLGHVVGSDMVRFHLFDIHKACKSKTPAERPTAQDVLDVYQKVLNSLRDTVTTQTREML	238670	216759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_219297_226392_226700_233027_233121_238617
921869	contig_2969_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_157088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTACAATTAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1193726	1194971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_1193700_1195000
921870	contig_2444_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_83784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAACTGAAGAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249336	248524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_-_248500_249300
921871	contig_11258_pilon	-	2483	2	Intergenic	novelGene_67833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCAACTGAATAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347136	341268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_342405_345789
921872	contig_9609_pilon	-	1562	1	Intergenic	novelGene_23013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCCCTAAAAACAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319713	318151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_318200_319700
921873	contig_11370_pilon	-	1320	1	Intergenic	novelGene_98779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTAGTGTTTTGTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295933	294613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_294600_295900
921874	contig_3956_pilon	+	2598	12	Intergenic	novelGene_15117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1142.53255012677	93	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	193	2079	1284763	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281722_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
921875	contig_3960_pilon	-	1189	1	Intergenic	novelGene_138013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378948	377759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_-_377800_378900
921876	contig_5686_pilon	+	4632	6	Intergenic	novelGene_45476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2229	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2949	3260	300482	304732	TRUE	20	GGGACTTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETGGHYVIYRYSAILIQIPMAFFNEMEKQITNFIWKGNRPRIKKALLKKKNKVGGLTLPDFRAYYIAMVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDTNYLRAGDI	226791	330217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_227116_227198_228791_270220_271198_300426_300507_304445_305159_329271
921877	contig_14142_pilon	+	4092	1	Intergenic	novelGene_120439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	56	319	72223	72486	NA	20	TGTCCCATAGCATTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELVDVQPFQEVAYDQEPMVLKDEVQAAVKALAKNKAPGIEGKPIEMFQQMDAMLEALTRLCQEICKIHIWIQKFVRSKFVRDPYSSPFQRKVIQQNVEIIEQYH	72167	76259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_72200_76300
921878	contig_12622_pilon	-	2360	2	Intergenic	novelGene_5787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGAAATTTCCAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279725	176441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_178663_279586
921879	contig_8059_pilon	+	4431	2	Intergenic	novelGene_111092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	14	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACAAAACGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119593	311049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_121068_308092
921880	contig_8616_pilon	+	7659	3	Intergenic	novelGene_72611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	234	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2024	6075	247	6321	462972	469046	TRUE	15	AGTTCAGCATGCCCGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQAPQLEVSAPSTSIEGFVGKLKGPQITGPSLEGDIGLKGAKPQGSIGVDISAPKVEGSITGPSVEVQAPDVNVHGAGGKLNMPKMKVPKFSLSGSKGEGAGIDVTLPEGEVTLPGVSGDVSLPEVALGGLEGKVKGTKVKTPEMIIQKPKISMQDVDLSLKSPELKGDIKISAPGIQGDVKGPQVAVKGPQVDIEAPSLEGAKLSGPSGKTGTCRISMADVDLNVAAPKVKGGVDVTLPKVEGKVKVPGVDVTGPKVDVSAPDVEVHGPEWNLNMPKMKMPKFRAPGVKGEGPELDVNLPKENVSIAGPKVSVEAPNVNIEGLGGRLEGSDIKLPEVSVKTSKISVPDLDLHVKGTKVKGEYDVTVPKLEGELKGPKVDIDAPDVDVHGRDWHLKMPKMKMPKFSVPGFKAEGPEVDVNLPKASVDISGPKVDVGAPNVSTEGPEGKLKGPKFKMPEMNIKASKISMPDVDLHLKGPKIRGEYDVTVPKVEGEVKVPDVELKSARVDIDAPDVNVQGPDWHLKMPKVKTPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADVDVSASKVNVEVPDVNIEGPEGKLKGPKFKMPVMNIKAPEISIPDVDLHMKGPKVKGEYDVTVPKLEGELKEPNVDISAPDVEIHGPDWNLKMPKMKMPKFSMPSLKGEGPEVDVNLPKADVDISGPKLDISAPDVSFEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKMSLPGVDPDLKGPKMKGNLDVSAPKVEGEMKVPDVDIKGPKVDIKAPDVDVQGPDWSLKMPKMKMPKFSMPSFKAEGPELDVNLPKADIDVSVPKVDIDAPDVSLEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDADLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGEMKVPDVDIKGPKVDINAPDVDVQGPDWNLKMPKIKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIEAPDVSLECPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDMDMKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKAEGPEVDVNLPKANIDVSGPQVDVSAPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPEMNIKPQKISTPDVGLHLKGPKMKGDYDVTVPKLEGEIKAPDVGIKGPKVDMNAPDVEVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPSFKGEAPEVDVNLPKADIDVSGPKVDIDVPDVNIEGPDAKLKGPKFKMPSMNIQTHKISMPDVGLNLKSPKLKSDVDVSLPKVEGDLKGPEIDVKAPKMDVDVGDIDIECPEGKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPEVDLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGQMKVPDVDIKGPKVDIDAPDVDVHGPDWHLKMPKVKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADINISSPKVDIDAPDLDIEGPEGKLKGSKFKMPKLNIKAPKISMPYVDLNLKGPKLKGGIDASVPELEGDLRGPQVDIKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLHLKGPKVKGDVDISVPKLEGDLKGPNVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKTPKISMSDVDLNLKGPRVKGDVDISVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDISAPDVDVHGPDWHLKMPKIKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLPKADIDISGPKVDIQSPDVGLECPEGKLKGPKFKMSDMHFKTPKISMPDVDLHLKGPQVKGDVDISVPKLEGELKGPSVDVEVPDVDLECPDAKLKGPKFKMPDMHFKAPKISMPDVDLNLKGSEVKGDVDVSVPKLEGEMKVPDVDIKGPKVDIGAPDVDVHGPDWHLKMPKMKMPKFSMPGFKGEGPEVDVNLRKPDVDISGPKVDIEPPDVSIEGPEGKLKGPKFKMPEIHAPKISMPDIDFNLKGPNIKGHVDVSAPKLERELKGPELDVRGPKLDVDMPDVAVEGPDGKWKSPKFKMPDMHFKAPKLSMPEVDLHLKAPK	462725	473660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_470105_470266_470526_473639
921882	contig_13226_pilon	+	4887	1	Intergenic	novelGene_175342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160553	165440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_+_160600_165400
921884	contig_12746_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_152184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487792	486219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_486200_487800
921885	contig_17393_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_179035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGACTCAGGGCCGCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2231	1728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17393_pilon_-_1700_2200
921886	contig_2438_pilon	-	1960	2	Intergenic	novelGene_112068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGTGAACCTATTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313520	311339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_312084_312304
921887	contig_15135_pilon	+	4426	25	Intergenic	novelGene_119872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGGTACAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64618	122822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_66375_68578_68624_70361_70459_75996_76081_81370_81518_85338_85411_88099_88214_92180_92250_94676_94799_95331_95422_95824_95913_96510_96633_96821_96947_98617_98715_101001_101065_101587_101777_103604_103687_105122_105244_110796_110880_113400_113528_113711_113932_119824_119981_120097_120182_120732_120819_122635
921888	contig_11318_pilon	+	3277	2	Intergenic	novelGene_48129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGTGCTAGAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8522	14492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_9456_12148
921889	contig_6674_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_148007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167966	166931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_166900_168000
921890	contig_5499_pilon	-	3256	29	Intergenic	novelGene_56971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	37	junction_18	163.627828704443	63	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	922	2769	177	2945	232334	33574	FALSE	50	AATGACAATGAATGGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKLAGVPGLSAEVCVYSASKQEGRRHDQAREPGVPEVDFQQHQLHHTLPGRIDGLFFMSSEENYTDPYVKLSLYVADENRELALVQTKTIKKTLNPKWNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDPTMERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPTEGGDVPEPWETISEEVNLTGDSLSLTLPPPPASPVSRTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLLQREPSSRLRSCSVTDAVAEQAHLPPPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIVQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPIRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKASLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD	232510	33262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_33677_36443_36517_37631_37729_39127_39236_40792_40853_42775_42837_45308_45383_50573_50670_52721_52793_55288_55411_56923_57154_59109_59176_69984_70044_76524_76580_78168_78247_84280_84479_85566_85687_86425_86558_93496_93572_95835_96013_97211_97345_104538_104706_106563_106667_107104_107167_115229_115281_183294_183349_186417_186457_189031_189114_232311
921891	contig_16643_pilon	+	4883	4	Intergenic	novelGene_158121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	459	818	231311	237630	FALSE	20	CTGAGTATCAGGGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSPTNTEQFFFCRLFGVLIIFSFIICFSLPLFTFPAFFLLFIFILILIFFIIINFSIRAKFFFLPTDFVFIFFPFYIFIFIFLIFFIKILLTILILLILLIFSFFILLFFVYTVHLSI	230852	241695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_231435_232653_232721_234525_234649_237584
921892	SIRV7	+	1156	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAAACGTCGATTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	2284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1329_1451
921893	contig_12340_pilon	-	1365	3	Intergenic	novelGene_122104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	145	junction_2	11	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	37	489	42866	26692	FALSE	20	TCGCAGAATGGGGTGAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPESPPTVQSGKMAGAPEGLVFVSPPDEEMATGADDPASVPAAPREDFRVLCTSKRAVTEVLELCGRFVQQLGDALPEKIREPALRDAQWTFESAVQENVSINGGAWQEASENCSMDSDIKVLEDQFDEIIVDIAMKRKQYPRKILECVIKTIKAKQEILVR	42902	25815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_26832_32416_32496_42632
921894	contig_5698_pilon	+	2010	7	Intergenic	novelGene_54998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	899.928515679625	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	20	577	4103	19243	FALSE	45	CAAAAAAGAAGGATGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQVRR	4083	20676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18862_19240
921895	contig_11337_pilon	-	3103	3	Intergenic	novelGene_107178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCCCTGGCCTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164841	159296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_159448_160748_160887_162027
921896	contig_11378_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_112249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATAGGGTTTCCAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352901	356252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_352900_356300
921897	contig_615_pilon	+	1634	1	Intergenic	novelGene_80048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	346	663	52476	52793	NA	50	AGGAAAAAAAAGAGGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNASSGLEADSVTTSDTLDESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPLNHIMINGERIEVVKDLILLGSTINAHGSSSQEIKRHCVRQICCKRHL	52130	53764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_52100_53800
921898	contig_9437_pilon	-	3241	1	Intergenic	novelGene_141717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGAAAATTTCTCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132174	128933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_128900_132200
921900	contig_18414_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_170021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGGAAGTGCCATATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140837	142979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18414_pilon_+_140800_143000
921901	contig_12079_pilon	-	2274	7	Intergenic	novelGene_67522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	385.438566945355	33	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	550	1509	867345	861365	FALSE	35	ACAAACGTTAACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862313_867333_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
921902	contig_7202_pilon	+	301	1	Intergenic	novelGene_18679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGCTGCTGGTTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29810	30111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_29800_30100
921903	contig_14537_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_158664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107439	106979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_107000_107400
921904	contig_16594_pilon	-	1714	9	Intergenic	novelGene_53847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1020	junction_8	2072.26331579749	99	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	95	1240	272836	121101	TRUE	30	TGCCATTATAGATGAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	272930	118094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
921905	contig_2444_pilon	+	2294	2	Intergenic	novelGene_83794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTCTTCTGGCAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269603	274238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_269913_272253
921906	contig_14617_pilon	+	3683	3	Intergenic	novelGene_178881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1169	1693	1170	1694	TRUE	65	GTAAATAAATAAAATAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	1	7641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14617_pilon_+_2128_5845_6321_6559
921907	contig_12729_pilon	+	2807	13	Intergenic	novelGene_149931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_11	49.0611862881443	54	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	48	1760	33989	77151	FALSE	35	GCATTATGAAACACTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPKTKEQIENLLRNGMNKELRDRLCCRMTFGTAGLRSAMGAGFCYINDLTVIQSTQGMYKYLERCFSDFKQRGFVVGYDTRGQVTSSCSSQRLAKLTAAVLLAKDVPVYLFSRYVPTPFVPYAVQELKAVAGVMITASHNRKEDNGYKVYWETGAQITSPHDKEILKCIEECVEPWNGSWNDNLVDTSPLKKDPLQDICKRYMEDLKKICFHREINSKTTLKFVHTSFHGVGHDYVQLAFQVFGFKPPIPVPEQKDPDPDFSTVKCPNPEEGESVLELSLRLAEKENARVVLATDPDADRLAVAELQENGHWKVFTGNELAALFGWWMFDCWKKNKSRNADVKNVYMLATTVSSKILKAIAFKEGFHFEETLPGFKWIGSRIKDLLENGKEVLFAFEESIGFLCGTSVLDKDGVSAAVVVAEMASYLETMNITLRQQLIKVYEKYGYHISKTSYFLCYDPPTIKSIFERLRNFDSPKEYPKFCGAFAILHIRDITTGYDSSQPNKKSVLPVSKNSQMITFTFQNGCVATLRTSGTEPKIKYYAEMCASPDQSNTALLEEELKKLIEALIENFLEPSKNGLIWRSV	33941	78198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12729_pilon_+_34112_36802_36910_37802_37888_42802_42887_51946_52141_58807_58998_59337_59436_60146_60328_62030_62125_62454_62585_62817_63008_73566_73701_77048
921908	contig_13379_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_175868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	73	393	101097	100777	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPGSPRDPRTPAPGSPRDPRTRAPSSPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAPVTHERQLQAAP	101169	98538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_-_98500_101200
921909	contig_10734_pilon	-	2978	19	Intergenic	novelGene_51329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	41.0980835214466	71	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	837	2514	332	2845	1690199	1592706	FALSE	25	TTCACAAAGTTGGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQKKQSGGGSEHLLEPEGSEVVELSPSEIPNLDQNGSEEQQPSDELVEKTDQTPEREVGPEKGGWRKGKRVSCYLNPEGKAAAPKESLVSTSTEDALFRKDDSARVFPLTMTWAFGWNSSLPVFSIRDENQRVLLYVCAHTVVIYDVFRNSQHHLQGHANVISCLCISEDRRWIATADKGPDCLIIIWDSFTGIPVHTIFDSCPEGNGIRAIAITHDAKYLATISDGKDQKICIWKWTLAVETPACTLDLNKEYGFQNYLIFNPTNNKELVSNSKTRAIYYSWYEEKNTLAHSAPLLTEKTFNKLVGKFSQSVFHLNLTQILSATMEGKLVVWDIRRPPPSAITFLGFPYIKPCKLVHLQKEGITVLTTIDRNFVIATSDATVYHLTADGTKLEKLFVEPKDAICTVACHPYQPLLAVGSLCGMIKVWDYESKTYLFSRVFEKGIGVQSLTYNPEAILGVGFTEGTVYILDAMSLENEIAEPFKYSRSGVTHISFSHDSHYMATADENYTVALYQVVVKHGQRVWEYLARLRSHHRSIQSLLFGVNLDSNEPRLLSLGRDRLLIEYNLLKTCKDHLEVLDIHRTDQGCYPTCMVWYPPLTKELFLLICNSGYKVKLFNSTTKMCRKTLLGPTYGSPIEQIQLLPVKTTSELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHKTSAIICHPNGVAGMTLSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWEINLSALEAAVSLGGEDLTPFYGLVAGGREGQFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETREVSEHICLSEVPYVMRAIGFYPSEEKINDMFNEIKFGEYVDTGKIVDKINLPDFLKVYINHRPPFGNTMTGIQHSFKVLGYTNSEGKTVIQREDFLRLLLTKGEHMTQEEMLDCLATLFGMNPEGWKSEPATTSVKGSEICLEEALPDEITAEVFTTEILGLTISEDSGQDHMVSDV	1696963	1592572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1592831_1594270_1594373_1595610_1595840_1616124_1616269_1616476_1616568_1623239_1623404_1624479_1624595_1642310_1642496_1643488_1643663_1653400_1653550_1654008_1654260_1659065_1659281_1661411_1661463_1662299_1662378_1667393_1667475_1667691_1667804_1687297_1687408_1690061_1690203_1696635
921910	contig_10732_pilon	+	1794	12	Intergenic	novelGene_114664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	21.5946886644007	41	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1581	212	1792	7573	28934	FALSE	10	GGTAATGGTGTTTGGTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRQTQATTLVHQIFGGYLRSRVKCSVCKSVSDTYDPYLDIALEIRQAANIVRALELFVKPDILSGENAYMCAKCKKKVPASKRFSIHRASSVLTLSLKRFANFSGGKITKDVGYPEFLNIRPYMSQSNGEPVMYGLYAVLVHSGYSCHAGHYYCYVKASNGQWYQMNDSLVHLSNVKVVLNQQAYVLFYLRIPGSKKSPEGSISRAASTLSSRPSILPDHLKKNISNGVASSPLTGKRQDPVTTKLHPTEELGVPVSRNGSDCLYRAVPPAPTPSSRPRPPFSPHSTCPSFPVSSQTLGRAEPQSCSSVPVPRPQVNGDSASPPCQLQEASKVPQSIPKKRKKHRARETREQGSEPCSSQHGGDTAAVPRVKKRRKKRKHAEDDGVSALQERPAWAQNQRHGVGKQCRVEPPADRLQEGGGQQVGCMTDIHHVGSKKKKRKRVEGLHGEQDHRRDPAMHSRCSPSADTQPDAAAESPRKKRKKKQRKHESQQEVEENEHQNGQRWDRQNDPPVPELSSHLPTVNGQTHGPLGSWDTERQSDVVQELLRYSSDKAYGRKVLTWDGEMSAVSRDAIEDSRLARTETVIDDWDEDFDRG	6191	28936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_6260_6738_6810_7500_7584_9263_9376_11396_11538_12090_12192_14638_14778_20282_20355_24076_24673_25273_25468_28070_28173_28821
921911	SIRV7	-	912	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	36	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114685_114961_147608
921912	contig_11656_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_53966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCCCTGCACCAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152525	154854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_152500_154900
921913	contig_5039_pilon	+	4120	1	Intergenic	novelGene_64814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	815	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	3421	3876	225247	225702	NA	70	CAGAAAAAGGAAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHEDIAIIDIYIPNDRAPKYIKQTLTALKREIDNSTIIVGDFNTPLLVKDRKSRKKLIKDTEDLKATVSQLELVGIYRTLHPTASKYTFFSNAHETFSRIDHILGHGSTLNKIQNIEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKGKKINYMETK	221826	225946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_221800_225900
921914	contig_563_pilon	+	752	1	Intergenic	novelGene_169773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAACTAGTCCGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713731	714483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_+_713700_714500
921915	contig_854_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_36738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCAGCTGTCACCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714876	1716326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1714900_1716300
921916	contig_9895_pilon	-	2847	3	Intergenic	novelGene_144689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	151	474	134822	134499	TRUE	60	AAAATATATCAAGCAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYETNREQRARIDTYRGPLLANAARICHLGILSEISKHRLQESSFTELPAGDKTTGRERYELSQHPSFFTTTRPTLLPSDTFLARKHQLHHGVAWIPLARNSLSAI	134972	131732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_132704_132809_134070_134356
921917	contig_15720_pilon	-	2788	2	Intergenic	novelGene_41942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1088	1543	307437	306982	TRUE	50	GTCAGACAAAAGGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	308524	305237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305862_306360
921918	contig_4783_pilon	-	2867	2	Intergenic	novelGene_108360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	856	1353	147198	146701	TRUE	35	GTATTTGAGAGAAAGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEEDFLKLLEAEYKRLIYRTLQDIKKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNGKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRTEAMKVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEDTLRIMWDCIKRNNVRVIGVPERRGNRKYRENC	148053	125535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_127048_146698
921919	contig_6589_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_25746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTCCAAAGGAGATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486259	484167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_484200_486300
921920	contig_10904_pilon	+	2250	2	Intergenic	novelGene_22474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	270	734	149604	150068	FALSE	10	CTTGTGTGTTCTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGLRWVKSPSAPALACGARPCTLFSKCRPRHFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	145857	151584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_145956_149432
921921	contig_612_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_155634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	3	389	288334	288720	NA	45	AGGCAGAAGGGGACAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHININTLGISELKWTGTGHFESHNHMVYYAGDDKLKTNGIAFIIKRNILRYILRYNAVSDRLIPYAYKEDWLIQLLFELIHQPLRPKMKKLKIFTNLLQSETDQTCNQNTFVLLVTGMRKLERKNG	288331	289716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_288300_289700
921922	contig_1452_pilon	-	3752	2	Intergenic	novelGene_115118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	96	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	852	1259	86246	85839	FALSE	20	GTTGAAGAGTCTGTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQHKSSRVKRSTYCSHNQSAGRAVYSEMIRSKDLSTARTLRISPSLLFDCCAIHSDHITLRLVRYVAYGKSQSQTTCFSTMNGVNLFLWSQIKTSPSDWSFPLVGEGKQDSITASAWILCSLTKLKKGTRAH	257040	83345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_86875_256817
921923	contig_9121_pilon	-	3181	4	Intergenic	novelGene_134475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2246	2614	271248	270880	FALSE	30	ATCACTTTGAGGACTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLWKLSFVCARKSGRPTNWKRSIFVPNPKKGDAAECKNYRTVSLILQASKILLMIQKELQQYIYRELPEIQARFRKEHGTRDITTDVRGILAESREYQKDVSCVLLTMQRHLTVWIITNYR	288958	270312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_272526_272743_272911_287819_288078_288415
921925	contig_10159_pilon	-	2187	9	Intergenic	novelGene_30794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	144.223567768933	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	644	1306	353226	349428	TRUE	25	TCATGCACTGTACACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSASTMKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCESLEHFTGRDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHMEAHKNGHANGHLSIGTDFPTLDSSFNIKVKPNGMPNGYRKEMIKIPMPEPERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKIGLSSH	642160	317760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_318147_318829_318997_319501_319656_338199_338318_349371_349450_352585_353440_431854_431937_456756_456901_641956
921926	contig_7119_pilon	+	2432	2	Intergenic	novelGene_40880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_1	0	125	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	196	1281	138713	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWPCLRNRILASFFHRRWGLAGADATAGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127411	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707
921927	contig_6842_pilon	-	733	2	Intergenic	novelGene_130661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTTGTACAATCCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255998	249489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_249599_255374
921928	contig_5698_pilon	-	2636	5	Intergenic	novelGene_55042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAGAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19579	9137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_11209_11790_11869_17145_17219_18788_18851_19227
921929	contig_15047_pilon	+	1762	6	Intergenic	novelGene_52105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	12	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	81	704	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2113	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20984
921931	contig_12080_pilon	+	5789	26	Intergenic	novelGene_128338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1633	44	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3065	3514	107843	108292	TRUE	5	CCCCCGCCGGGGGGCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	45131	164231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45892_46201_47139_54876_54963_56918_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118606_120731_120885_164134
921932	contig_753_pilon	-	1467	1	Intergenic	novelGene_113031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAGTAAAAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1421607	1420140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1420100_1421600
921933	contig_16496_pilon	-	1236	3	Intergenic	novelGene_5124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3468	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_501_672_1354_3413
921934	contig_12635_pilon	-	2272	2	Intergenic	novelGene_60799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTAACCAATGTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187859	169263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_169375_185698
921935	contig_16703_pilon	+	9218	16	Intergenic	novelGene_72747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1248.99745751899	68	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	868	2004	20022	40668	FALSE	80	CAAAATAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	47882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15437_16997_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
921936	contig_2100_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_50605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCAGTGTTGTTTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726968	724988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_725000_727000
921938	contig_7840_pilon	-	2092	2	Intergenic	novelGene_69005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGATTGTTCTAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380842	277686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_279435_380498
921939	contig_14068_pilon	-	3157	1	Intergenic	novelGene_165957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	117	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTGTTAGAATTTATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18669	15512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_15500_18700
921940	contig_2596_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_53451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCCGCCCAGCAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56026	58481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_56000_58500
921941	contig_4812_pilon	-	520	4	Intergenic	novelGene_103674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	14454	junction_3	1886.0394128084	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	113	346	81555	79235	FALSE	40	AAAAAACATGTCTTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	81667	79060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547
921942	contig_3386_pilon	+	2720	1	Intergenic	novelGene_34542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAAGCCCTATGGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466425	469145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_466400_469100
921943	contig_2715_pilon	-	2205	1	Intergenic	novelGene_173176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATATTCACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130584	128379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_-_128400_130600
921944	contig_9363_pilon	+	2239	2	Intergenic	novelGene_6665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	43	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	220	414	1014185	1014379	TRUE	30	GAACGGTAAAGGGGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIVRAVISLPGPGSLAPLSCCCSRPTKPTGFRVFPSWPSATLPCLEDQIHPVCPPPTLLSRLLTCLSSWVLSRMAARAPSPPAPEPRGLQGFKFGTPFPTHTLTLPSLTLRTPTPPRAARGSVPCTVHSQWEGASLG	1013965	1021624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1014907_1020326
921945	contig_7840_pilon	+	2858	12	Intergenic	novelGene_68970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	413.739767295002	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	241	1620	238014	304882	FALSE	0	GGGCTGTTCTTTCCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKVETDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSGWEWRSKAQRGLCFPDKYTFQ	130687	306120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299240_299535_301110_301261_304059_304308_304816
921946	contig_1276_pilon	-	991	1	Intergenic	novelGene_159769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTTTAGAAAAAAATAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173304	172313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_172300_173300
921947	contig_6589_pilon	-	2058	2	Intergenic	novelGene_25977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_1	0	13	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	4	387	1309190	1306951	FALSE	80	AAAATAAATAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMNKMLDKEDFTMMKRAIFATQRQSFPPVCTHNMLDDSSDPILTTIRRIGLFNSSADRVKVRALARGGLGTAGGRGIPGLKLPTPLVYQRPYHVSKRTLAQGTTIGLCLPGAAEEGESGTGGGCGVCG	1309193	1305279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1307272_1309127
921948	contig_821_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_149382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGCTTAGCATGGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64695	63752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_63800_64700
921949	contig_5928_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_40384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACACAGCAAAAGATGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298111	298872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_298100_298900
921950	contig_4531_pilon	+	4755	9	Intergenic	novelGene_47946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_5	26.5188612123522	150	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	1542	2933	761121	773874	FALSE	30	ACATTCATATTCTTTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLTNNAKNHSPKQLQEAFSAVPVSHIQVMQILEHLTLLSASELIPYAEVLTSNMNQLLNSGVPRRILQTVNKLWMVLNTVMPRRLWVMTVNALQPSIKFVRQQKYTQNDLMIDPLIVLRCDQRVHRCPPLMDITLHMLNGYLLASKAYLSAHLKETAEQDRPSQNNTIGLVGQTDAPEVTREELKNALLAAQDSAAVQILLEICLPTEEEKAKGVNPDSLLRNVQSVITASTPNKEVEEGEDNLLCNLREVQCLICCLLHQMYIADPNIAKLVHFQGYPCELLPLTVAGIPSMHICLDFIPELIAQPELEKQIFAIQLLSHLCIQYALPKSLSVARLAVNVMGTLLTVLTQAKRYAFFMPTLPSLVSFCRAFPPLYEDIMSLLIQIGQVCASDVATQTRDIDPIITRLQQIKEKPSGWSGLCKDPSYKNGSREARSMDPDVQLCHCIESTIIEIINMSVSGI	759579	775696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_761173_762183_762386_764958_765085_769749_769949_771220_771473_771814_771923_772078_772185_773403_773581_773704
921951	contig_953_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_130017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563024	561259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_561300_563000
921952	contig_776_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_139952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATACACAGGAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1083651	1085958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_1083700_1086000
921953	contig_7457_pilon	-	1781	7	Intergenic	novelGene_31431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	161.779342178028	81	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	26	451	473193	470916	TRUE	45	CATAACAATAAATATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEPLTISSFCTRRRKSRRRRCPRYARTSRP	473218	468268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471138_471292_471559_471667_472730_472768_473151
921954	contig_5779_pilon	-	3613	1	Intergenic	novelGene_106468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCAATGTGGTTTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124311	120698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_120700_124300
921955	contig_8020_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_114447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGAGTCCAGCAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345836	343624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_343600_345800
921956	contig_15029_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_128222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTTCTGCTTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431110	429352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_429400_431100
921957	contig_10801_pilon	+	3296	1	Intergenic	novelGene_74054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	194	571	342348	342725	NA	65	AATAAAATACATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELFRCIISPYLVNLYAEHIIQEAGLYEEERGIRTGGRLINNLRYADDTTLLAENKEDLKHLVMKIKDYSLQYGLHLNIKRTKITTTGPMSNIMINGEKNEIVKDFVLLASTINTHGSSSQEIQ	342154	345450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_342200_345400
921958	contig_854_pilon	+	3715	10	Intergenic	novelGene_36630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3737.40109080899	83	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	1344	2561	1696571	1715249	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1693973	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702642_1715188
921959	contig_16869_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_137592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTAGAGGAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57501	56406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_56400_57500
921960	contig_3241_pilon	-	2848	1	Intergenic	novelGene_146421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGAAGGGCAGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946651	943803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_943800_946700
921961	contig_5020_pilon	+	1081	6	Intergenic	novelGene_27791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1209.36981936875	17	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	465	767	124540	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	91862	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_91876_123171_123333_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
921962	contig_9696_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_68846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1115	1450	621957	621622	NA	40	GTGAGAATGACAGCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYQLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKTIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCP	623071	620509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_620500_623100
921964	contig_14925_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_55231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATATTTTCATGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44966	43150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_44227_44280
921965	contig_6199_pilon	+	2650	1	Intergenic	novelGene_126370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTATTAAAAGGAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219467	222117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_219500_222100
921966	contig_5894_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_83036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCTCAGCAACTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379053	377641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_377600_379100
921967	contig_177_pilon	+	2552	2	Intergenic	novelGene_41827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	890	junction_1	0	2	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	73	1149	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415658	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647
921970	contig_11364_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_65161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAGAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79680	80688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_79700_80700
921971	contig_7323_pilon	-	4189	1	Intergenic	novelGene_173209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	96	341	43731	43486	NA	25	CTTTAAGCTTGGGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRRWKEYTESLYQKELVSIQPFQDVAHDQELMVLKEDVQAGAKTLEKNKAPGIEEYQLKCFSKWMQHWRCTLIYTMKFGRQLPGQLTERRPYLCPFQGKVIRQNAQIIKQCH	43826	39637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_39600_43800
921972	contig_8674_pilon	-	2698	3	Intergenic	novelGene_102887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	12	39	299	337	189236	189198	TRUE	50	AAGACAAAGAAGGAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPEGGRDASPAAGQSAPGSVSPPLSPPPLRTASAPPSPNPALRSFPSPPSSHLPASNEDVLVFLFLGSWFVVSQLRTVEQSGLLDRLDAFVLCPGRYQMGVGTPVRPDSS	189534	80673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_81845_176867_177630_188769
921973	contig_5643_pilon	+	866	9	Intergenic	novelGene_38838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1982.54485683805	197	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	64	807	233973	238136	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTEEERGPLSCWGVLAPTPSNTLRIFHPLHSFHPYPLKKG	233611	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237238_238020
921974	contig_6028_pilon	-	2206	2	Intergenic	novelGene_156561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCATAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247633	225187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_227228_247467
921975	contig_16690_pilon	+	1643	2	Intergenic	novelGene_179036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1248	1556	3595	4270	FALSE	70	AAAAGGTGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSAWCRLAVCSGEMVMWKKREKKPTTNKKKKSNTCSQRMALREPPAWARGIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPGLEAVARPNVAPQPCRKG	2347	4357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16690_pilon_+_3647_4013
921977	contig_8386_pilon	+	697	1	Intergenic	novelGene_82239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTAAAGCCACCCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79262	79959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_79300_80000
921978	contig_1210_pilon	+	956	3	Intergenic	novelGene_171514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	17	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTAAACTGTTGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231631	256986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_231776_231960_232313_256526
921979	contig_17144_pilon	-	3283	10	Intergenic	novelGene_29439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2302.13731610915	40	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	18	698	179764	174565	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLGG	179781	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166142_167618_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_172191_173939_174761_174876_175001_175973_176271_179700
921981	contig_20165_pilon	-	2075	1	Intergenic	novelGene_54489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265300	263225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_263200_265300
921982	contig_12793_pilon	-	1583	3	Intergenic	novelGene_164130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	13.5	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACTAAGGGAATACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299768	254929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_255772_255849_256501_299678
921983	contig_11754_pilon	-	2831	2	Intergenic	novelGene_176975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATGAGATACAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49865	42259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_-_42983_47757
921984	contig_13172_pilon	-	3617	1	Intergenic	novelGene_146324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	325	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACGCCCTCAGGGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50580	46963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_47000_50600
921985	contig_15434_pilon	-	1454	6	Intergenic	novelGene_56717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTTGTTGGTCCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76217	68272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_68393_68536_68890_72150_72327_72462_72657_73316_73514_75803
921986	contig_19469_pilon	-	1960	12	Intergenic	novelGene_135010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_2	41.9423059069645	72	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	63	1490	520725	442580	FALSE	20	TAATTGCTTAATCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVVQAISALCQKYPRKHGVMMTFLSNMLRDDGGFEYKRAIVDCIISIVEENPESKESGLAHLCEFIEDCEHTVLATKILHLLGKEGPRTPVPSKYIRFIFNRVVLENEAVRAAAVSALAKFGAQNENLLPSILVLLQRCMMDTDDEVRDRATFYLNVLQQRQMALNATYIFNGLTVSVPGMEKALHQYTLEPSEKPFDMKSIPLAMAPVFEQKAEISLVANKPEKLAPSRQDIFQEQLAAIPEFMNLGPLFKSSEPVQLTEAETEYFVRCIKHMFANHIVFQFDCTNTLNDQLLEKVTVQMEPSDAYEVLCYIPAPSLTYNQPGICYTLVRLPDDDPTAVACTFSCTMKFTVRDCDPNTGVPDEDGYDDEYVLEDLEVTVSDHIQKVLKPNFAAAWEEVGDTFEKEETFALSSAKTLEEAVNNIITFLGMQPCERSDKVPENKNSHSLYLAGVFRGGYDLLVRSRLALADGVTMQVTVRSKEGTPVDVILASVG	520787	442109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_442711_443204_443304_443571_443711_444463_444562_513598_513771_514594_514735_515252_515316_516340_516467_517050_517155_518057_518134_520127_520372_520689
921987	contig_401_pilon	-	3300	10	Intergenic	novelGene_42945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	140.773085951808	13	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	872	1987	2238781	2232134	TRUE	35	ATAAAATGACTGTTCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGTNKTSSSISEILDKVQEDAEDVLFSLGFGHEDHKDTSRIPARFFTTPSKAKGIDFQLFLKAQVQRIEMEDPCLMLASRFKQVQTLAVTADAFFCLYSYVSKTPVQKFTPSNMFWNYNPTDVPFIRIMAPDPEPHSPRERLRKAISKMCLYTCPKDRLSPPHNSPRRNSLDQVVWEVMDRVRGEKLVLQEDPEFGPGPQKEPVPFIRDTKLPTVLTASQTLDSNLEASCYTHSLPRAYLEWSRDPEQVRKELWGLQTTNEEVHSAKDETFWKRKNKARKSLFQKNLMVRDDRKVKSLDLSIIQQKWRQSPDTPDLHRSLTQQLQDSFDLEEVQSNNEEEESHWPSRPRYPHLYQISAGKDSRSKWDPL	2262034	2227413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_2228478_2231884_2232248_2233390_2234152_2236352_2236562_2238749_2239156_2239859_2239914_2240742_2240793_2247444_2247488_2248391_2248600_2261892
921988	contig_2067_pilon	-	2933	2	Intergenic	novelGene_158927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGCTTGGGCCTCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598268	595161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_597608_597781
921989	contig_9177_pilon	-	2141	13	Intergenic	novelGene_32602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	782.568935550657	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	18	1700	9494	2159	FALSE	10	CCTGTAACCTCTGCCGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALHTQMLTAVQEISHLIEPLASAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGTEEAGSDSAATVQVPAFRASR	9511	1717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2227_4327_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903_9054_9147_9319_9407
921990	contig_10599_pilon	+	3121	2	Intergenic	novelGene_49883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1375	junction_1	0	33	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTAACTAGATGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147887	152873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_149041_150905
921991	contig_13786_pilon	+	2152	2	Intergenic	novelGene_174573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGTACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124355	126599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_125046_125137
921992	contig_9737_pilon	+	3924	3	Intergenic	novelGene_165254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	18.5	8	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	741	1091	7471	11310	FALSE	35	AAAAATGCACCTTTCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHSWALSHLLFSPSTGRYTLKVLFVCFRFLLMYSTVLCCYYNSALTTAVVGAIKNVSIAYIGMLVGGDYLFSVLNFVGLNICMAGGLRYSFLTLRSQSKPKQLVDEESIPLDLKS	6730	14143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9737_pilon_+_7636_10009_10093_11207
921993	contig_8978_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_49450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCACAATTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639967	1637669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1637700_1640000
921994	contig_854_pilon	+	2737	12	Intergenic	novelGene_36595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1900.30248135952	2	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	36	1583	1683971	1715249	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1683935	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698361_1715198
921995	contig_10003_pilon	+	2395	1	Intergenic	novelGene_88300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTACCCAGAATTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924553	926948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_924600_926900
921996	contig_4103_pilon	-	1387	2	Intergenic	novelGene_51993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTATAAAGAGACACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213732	212105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_212304_212543
921997	contig_6227_pilon	-	1889	2	Intergenic	novelGene_49808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	29	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	515	1036	1291269	1290748	FALSE	70	TTGAAGGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCCSAQDSKMDYKRRFLLGGSKQKVQQHQQYPLPELGRALSAPLASTATTTPLGSLTAAGSCHHAMPHSTPIADIQQGISKYLDALNVFCRASTFLTDLFSTVFRNSHYSKAAMQLKDVQEHVMEAASRLTSAIKPEIAKMLMELSTGAANFTDQKEFSVQDIEVEYLLCLT	1292063	1289894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1291552_1291831
921998	contig_2504_pilon	-	3571	3	Intergenic	novelGene_166862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCAGTACTCACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436254	419846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_-_419899_420128_420303_432909
921999	contig_91_pilon	-	2972	1	Intergenic	novelGene_127112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATTAAATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418736	415764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_415800_418700
922000	contig_10414_pilon	-	1958	1	Intergenic	novelGene_146939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	101	553	155028	154576	NA	20	TGGTGGTGACAGGCCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNIHNTFCEIGRYVIWMLCEHLGPQGLLCGTWLRKLPLQTSQVNFQLGPTQYVAPQPYQGHSGEALGSKAAFSVNWCHCPGQAPWCLPTLGTQEQDRVPTLPGQGHLFPWVGGGWTGSLPSRAVGIPRRARSGPWTYIQLNVAQTDVI	155128	153170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_-_153200_155100
922001	contig_14775_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_178917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTGCATCCTAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20884	19587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14775_pilon_-_19600_20900
922002	contig_6445_pilon	-	1846	13	Intergenic	novelGene_76907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	801.236995040932	8	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	973	1509	77905	44574	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTA	96335	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85315_91012_91854_96306
922003	contig_5684_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_80986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38888	41089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_38900_41100
922004	contig_10319_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_147249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCTGAAACCTCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134634	136385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_+_134600_136400
922005	contig_10581_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_41341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAAATGTGCATATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68815	66893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_66900_68800
922006	contig_8942_pilon	+	2444	1	Intergenic	novelGene_143208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTCTGTTTTGGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508145	510589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8942_pilon_+_508100_510600
922007	contig_15248_pilon	-	3300	1	Intergenic	novelGene_149148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAACAATAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12889	9589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_-_9600_12900
922008	contig_4812_pilon	-	1220	4	Intergenic	novelGene_103717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_2	856.827870695159	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	69	207	1012	1218	944244	944038	FALSE	60	AGGACAGAAAAAGAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNYHESWETRSSYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDREREREREREREREREKERELERERAREREREREKERDRERERDRDHERERERDRERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARERDKERERQREWEDKDKGRDDRREKREDIREERNLRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVLPQETRSLSPSHLTDDRQGRWKEEDRKPERKESSRRYEEQDIKEKISSVDKQRELTEIMESSRTRAQDILGHHQSEDRDISDRVHEENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGHAEIISEDGQVFSPK	952197	944035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944451_944834_944939_946403_946960_952052
922009	contig_4966_pilon	+	3531	1	Intergenic	novelGene_179037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	685	1062	209491	209868	NA	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIDNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSMRNLLELIERFSRIAGYKINIQKSVGFLYARKENDEKEIRK	208806	212337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4966_pilon_+_208800_212300
922010	contig_17274_pilon	-	1547	9	Intergenic	novelGene_26576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_8	325.663937211353	2	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	70	789	251759	232842	TRUE	45	CTCCTTTAAAAAGAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLGSLFFSHSVCCWFCCCCLLSMESISSWMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	251828	231239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874_247035_251739
922011	contig_14443_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_126680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACCTGAAAAATGGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49813	48222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14443_pilon_-_48200_49800
922012	contig_6842_pilon	-	2757	1	Intergenic	novelGene_130737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTTTCACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235318	1232561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1232600_1235300
922013	contig_10746_pilon	-	610	1	Intergenic	novelGene_176814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59917	59307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10746_pilon_-_59300_59900
922014	contig_6445_pilon	-	1429	14	Intergenic	novelGene_76944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	632.503385401516	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	405	1205	77905	43105	FALSE	40	AAAAGATACATTAGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88568	42880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88170_88216_88473
922015	contig_10106_pilon	-	3519	9	Intergenic	novelGene_73890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2444	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCGCATCTGAGATCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176660	159345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_159370_166020_166153_166903_166950_167025_167128_168796_168850_169339_169463_170993_171096_172509_174025_175238
922016	contig_19342_pilon	+	848	2	Intergenic	novelGene_41106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	24	75	232	306	6164	6238	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAATVPRALMCLSQPKGEILNGLHGGGVEAEGT	3618	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3826_6139
922017	contig_15970_pilon	-	2561	1	Intergenic	novelGene_144050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATTTAACCTTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169484	166923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_166900_169500
922018	contig_17162_pilon	-	713	1	Intergenic	novelGene_171529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATTTTAAGGATTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8544	7831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17162_pilon_-_7800_8500
922019	contig_5569_pilon	-	1019	6	Intergenic	novelGene_86739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	92	junction_4	21.0104735786702	18	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	201	563	448704	446213	FALSE	45	AACCTTCATCTAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKNFSKKIQQIHVVSQFKILVSLLENNIYVHDLLTFQQITTVSKAKGASLFTCDLQHTDTGEEVLRMCVAVKKKLQLYFWKDREFHELQGDFSVPDVPKSMAWCENSICVGFKRDYYLIRVDGKGSIKELFPTGKQLEPLVAPLADGKVAVGQDDLTVVLNEEGICTQKCALNWTDIPVAMGEDQQ	452324	445756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_-_446414_448106_448200_448635_448735_450577_450673_451932_451976_452292
922020	contig_3095_pilon	+	2096	5	Intergenic	novelGene_75160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1823.67655780843	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	45	347	220513	226298	TRUE	30	CTTCCCAGGATATATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHQLPSQG	220468	245837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225660_226275_226409_226645_226824_244376
922021	contig_5947_pilon	-	1871	2	Intergenic	novelGene_101581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAACAAACAAACACGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	832176	830090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_830235_830449
922022	contig_11720_pilon	+	597	2	Intergenic	novelGene_43912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_1	0	22	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGCAACATTAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172073	173059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_172173_172561
922023	contig_11338_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_6407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_3	149.052473981481	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	152	775	319426	315122	FALSE	10	GTTTCCCAGCATTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHVSPGGI	323314	314061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
922024	contig_12837_pilon	+	4317	17	Intergenic	novelGene_57347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	101.838643819525	429	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	879	2640	42	2681	213153	352504	FALSE	45	TTAAGATAAATAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLHLFLLLALCQAGHIARACSYSLRGSWQIRNANGSLELPGTVPGCVHSALFQQGLIQDPYYRFNDLHYRWISLDNWTYSKEFKIPFNHSKWQKVNLIFEGIDTVTKILLNNVTVGKTDNMFSRYSFDITTMVRDVNFIELRFQSAVLYAAQQSEAHTGYQVPPNCPPLVQKGECHVNFIRKEQCSFSWDWGPSFPTQGIWKDVRIEAYNICHLNYFTFSPIYDNSAQEWNIEIESSFDVVSSKPVGGQVVVAIPKLQTQQTYSIELQPGERIVELLVKINKNISVENWWPHGHGNQAGYNMTVLFKLDEDLNIEKSAKVYFRTVELIEEPIEGSSGLSFYFKINGFPIFLKGSNWIPADSFQDRVTSDLLRLLLQSAVDANMNALRVWGGGIYEQDEFYELCDQLGIMIWQDFMFACALYPTDRSFMDSVSAEVAYQIRRLKSHPSIIIWSGNNENEAALMTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVTQAQCVKIETEFYRRSRSEIVNGEGHTMGALYWQLNDVWQAPSWSSLEYGGKWKMLHYFAQHFFAALLPVGFEDHDVFYVYGVSDLHSECRVTLTVRVHTWSSLEPLCSHVTGHFVINSGEAILIYKEPVPSLLRRCWNCTRQSCVVSFYLSADSKPLGPTNYHFLSSPKEAVGLQKAHITALISQQGDTFAFDLETSAVAPFVWLDVGSIPGRFSDNGFLMTEKTRTILFYPWEPTSKSKLEQSFHVTSLTNIY	213111	354140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_213330_232120_232216_234965_235072_237989_238161_241002_241127_255572_255749_256651_256763_282716_282869_285252_285371_286821_286909_289906_290075_302652_302872_310874_311040_329876_330022_338912_339056_339886_340145_352279
922025	contig_16125_pilon	+	2961	11	Intergenic	novelGene_155257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2599	2910	236512	236823	FALSE	20	GGGTCGACTGTTGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRWLIPRRPGKHRFRIFFGQVDRLGAYRFQNSHFRLRVSVRRVCQRPKSLVDSRSRLWKWGFGLLVRLFLRRRFHSQRWLWGPKFRHVAGSCRRAGVALVVE	143461	236874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_144693_146071_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153054_153471_153486_155566_155618_179440_179596_235794_236053_236109
922026	contig_1867_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_54616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2222	2536	533714	533400	NA	30	CATCACCCCTCAAAGATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFHFFANGYPVLPAPIVRETFSSPFNGLRPFVEEQLSIGGWIYFWVLNSVPLVYVSIIVPVPSCVDYCGCIGSSEIGDCEASYFVLQRFYKNQVYCCVIYVP	535935	533308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_533300_535900
922027	contig_17144_pilon	-	1857	11	Intergenic	novelGene_29531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1836.66263641421	15	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	225	1790	174965	166152	FALSE	25	TTTTCTTTCTTAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	227610	166084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166427_168201_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_227421
922028	contig_5280_pilon	+	1577	1	Intergenic	novelGene_52654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAGAGGAACTAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277275	278852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_277300_278900
922029	contig_3787_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_102446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTAGCCTTGAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737220	734680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_734700_737200
922030	contig_3942_pilon	+	1289	12	Intergenic	novelGene_128881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	11.2683275871609	16	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	131	874	1534857	1549972	TRUE	25	AGAATGGGGTCTGAGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRLAAHCSFARWLLCNGSLFRYVHPSEEELRALAGKQRPRGKRERWASEEKPLSVPRDAPFQLETCPLTAVDALVLRFFLEYQWFVDFAVYTGGVYLFTEAYYYATCPAREANIAVCWCLLAVAFSIKVFLTVTRLYFSAEEGGERSVCLTFAFFFLLLAMLVQVVREETLELGLEPGLASMTGNLEPLLKKQGWDWALPLVKLTVRVGLAVVGAMLGAFLTFPGLRLAQTHCDALMMAEDRPGLQ	1531855	1551323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1531888_1534080_1534131_1534808_1534913_1535409_1535491_1535826_1535916_1536004_1536162_1536941_1537094_1549644_1549706_1549824_1549974_1550064_1550179_1550283_1550339_1551078
922031	contig_3956_pilon	+	3040	15	Intergenic	novelGene_15119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1121.15850251207	68	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1144	2520	1286460	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285762_1286150_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
922032	contig_1230_pilon	-	2156	8	Intergenic	novelGene_28873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAAAAATACCGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408972	405233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_405448_405712_405912_406124_406277_406373_406930_407146_407348_407584_407794_408013_408234_408567
922033	contig_7009_pilon	+	2050	6	Intergenic	novelGene_23632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	561.440789398134	1	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	205	1065	444955	518263	FALSE	50	ACCTAGTGCACAATAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	435057	519248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_435248_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991
922034	contig_366_pilon	+	2823	5	Intergenic	novelGene_51597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAGGTTTGACATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763039	771595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_764347_765319_765429_768020_768099_769051_769129_770343
922035	contig_20314_pilon	+	2487	1	Intergenic	novelGene_125646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTGCGATCAAATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5805	8292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_5800_8300
922036	contig_8310_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_75562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAAGTAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218149	219422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_218100_219400
922037	contig_4000_pilon	-	1246	2	Intergenic	novelGene_176078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATTGTTGCTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63710	34999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_-_35805_63269
922038	contig_5727_pilon	-	4299	19	Intergenic	novelGene_7960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2490	2855	177001	176468	TRUE	5	CCCTACTTCCTCCTCCGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSLGHWSNTFRKACMKLSLVAIPSCFSKLIKELAFSLSSSLLSSDRMITLLNISGRKCLGALISLTPLTASFAFPLFRYSNYMKPTVNLSSSSFDGGGFLLVLAGFSWISGGLVLRPS	180078	170312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_170348_171185_171328_171890_171992_172571_172710_172797_172864_173289_173443_173717_173827_174028_174113_174200_174300_174718_174862_174958_175120_175472_175587_176189_176286_176464_176585_176666_176867_176952_177207_177538_177747_177914_178132_178219
922039	contig_753_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_113023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGTTCAAAATGGTAGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1380223	1378792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1378800_1380200
922040	contig_9505_pilon	+	3560	14	Intergenic	novelGene_121872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	200.26842933169	9	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	49	744	652560	665112	TRUE	20	CCACCCAGAGGTGTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFFSLPGGSSRGSKEKMEPESLYNLLQPVKAVEPPAEEDLPNREKRKHLPATSRKDTKFEELQKVLVEWVNTMLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQKLTSLQLEVEEIALTAASQRCKLAVVLEAMNQSLQVETHQVPWSVETIFNKDLLATLHLLVALARRFQPSLPLPANVQVEVITIESTKSGLKSEKSVEQLTECNTDKDQSPSADTTVGLTPSLCPSRILWEERDGSCISLGLLLDSQL	650745	677410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_650779_652544_652639_654124_654190_654611_654715_656279_656421_657761_657878_659017_659074_663426_663450_664999_665356_665478_666244_666444_666514_669223_669326_675220_675294_675846
922041	scaffold_14325_pilon	-	1680	2	Intergenic	novelGene_162659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCAGGCCTGGGTGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94371	89293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14325_pilon_-_90934_94331
922042	contig_1719_pilon	-	2908	1	Intergenic	novelGene_87352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCCAAGAAGGAGCCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691463	688555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_688600_691500
922043	contig_5954_pilon	-	2495	9	Intergenic	novelGene_28820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	31.0802891717564	75	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	335	1279	1668374	1656714	FALSE	15	TTTGTTCAATCCATCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPEEKLDPLPDSFILQPPVFHPVIPYVTTIFGGLHAGKMVMLQGVVPQHGHRFQVDFQCGCSLQPRPDIAIHFNPRFHTTKPHVICNTLYGGCWQAEARWPGLPLQRGASFLILFLFGNEAVKVSVNGHHFLHYPYRLPLSRVDTLGIFGDILVKAIGFLNINPFMEGGREYPVGHPFLLKSSRLEVPCSRALPQGLWPEQVIIVRGLVLQELEDFTLSLRDKSGHIPVTLRASFTDRTLAWIYPWRRKKLILAPFLFYPQRFFEVLLLCHKGGLKLALNGQGLGATSLDQQALERLRELRISGSIKLYCVHY	1668708	1655497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1656861_1657362_1657514_1662614_1662704_1663343_1663371_1664400_1664440_1664981_1665102_1666072_1666287_1666427_1666517_1668305
922044	contig_7963_pilon	+	1585	8	Intergenic	novelGene_58488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAACGAAATTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120332	124054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_120366_120488_120735_120938_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122992_123131_123745
922045	contig_8676_pilon	+	5385	2	Intergenic	novelGene_142202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_1	0	6	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGACCATTTTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236157	244715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_+_237359_240531
922046	contig_987_pilon	+	3352	1	Intergenic	novelGene_72255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	171	545	383018	383392	NA	25	CACCTATGTTCACTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMGKLIITFIWKGKTPQINKALLKKNKVGGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWHNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGTDSLFNIWCWQN	382847	386199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_382800_386200
922047	contig_12402_pilon	-	2543	1	Intergenic	novelGene_133388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1545	2114	651160	650591	NA	50	AAAAAAGACCAGATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHLRYSTGLTPLGARKNGENKLQGKDKSKGLTDHSYHGLHQTECSTARWFPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSHKKRPDFEGLMDHSYLGLLQTESSTASWFSATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNSQKKDEIYWPKGDWRNPESMAPRYPFSSVVKSSLRFTVQPGSGQPHKTK	652704	650161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_650200_652700
922048	contig_10225_pilon	+	1990	13	Intergenic	novelGene_86819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	4	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	62	1063	20776	42680	TRUE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20714	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46425_47226
922049	contig_17158_pilon	-	1019	2	Intergenic	novelGene_141156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169998	167540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_168209_169647
922050	contig_4732_pilon	+	1550	1	Intergenic	novelGene_75479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATAAAGTATTATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708493	710043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_708500_710000
922051	contig_4180_pilon	-	4180	4	Intergenic	novelGene_8289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	2738	3130	467880	467488	FALSE	15	TCGGTTGGATTCCTCTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEHTLLKNYWVTEEIKDGIKKFTGSNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIVINAHIQKEERAKIKTLTLQLKQVEREQQKMPLGTRRKEIIRIRAELNEIENRKTIERVNKTKNWFFEKINKIDKPLTK	764930	466437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_468136_530043_530330_581761_582439_763411
922052	contig_5982_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_169156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAAGGGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79555	80618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5982_pilon_+_79600_80600
922053	contig_19342_pilon	+	1372	6	Intergenic	novelGene_41061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.2	3	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	43	132	375	506	4154	4285	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHQIPVTGSWRPRPSSCCSRGPPLPARRLPLPEVFPHRRVPARPRGAPLHRRRLRGRHAVRAVRQRRRESEVGAAGAVGGAGGAGVSGRADTIAKGAAQTLRVDLPTLRGCYNQSDAGSRTFQGMFGCEVGPNGRLLCGYYQSAYDGFDYIALEEDLRTWMAAERTA	3234	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3303_3605_3892_4133_4365_5020_5293_6087_6186_6353
922054	contig_8259_pilon	-	1599	1	Intergenic	novelGene_148889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1050	1373	282923	282600	NA	60	AAAGGAGAAGAAGAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVCTDCYGNNKTPGRGNQTWNGRGLQREIGGEGQGSISKGVEMLPEARILIRLTKKDLTYWSDRDWRNPKSMAPGHPFNSALKLLLSFTFQPKIRQAHKTNSSTRN	283972	282373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_282400_284000
922055	contig_8829_pilon	+	1858	1	Intergenic	novelGene_140954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGGTGAGGGCGGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163964	165822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_+_164000_165800
922056	contig_1443_pilon	-	2746	1	Intergenic	novelGene_28162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGTGCTGATGATGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319533	316787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_316800_319500
922057	contig_16775_pilon	+	2733	15	Intergenic	novelGene_107763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	228	junction_3	188.912084076705	9	90	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	135	1367	130489	172874	TRUE	45	AATAGAGGGAATAACAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAAIAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADGK	130354	174900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_173325_173984
922058	contig_1639_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_74903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	954	1274	299859	300179	NA	50	AGGACGGAATAAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRHYPGEQLCLLGLFNDKSDSNNNEKDKKKNDLAQKIKWNKETFSNTENRYQNDTTKPIPINNHAGCKWTKCTNKEKVAEWIQNTIRLYAASRRHTLDLKTQDTN	298905	300791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_298900_300800
922059	contig_3151_pilon	-	2685	6	Intergenic	novelGene_139172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	105	junction_4	68.8098830110908	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	881	2643	42	2684	21460	10067	FALSE	45	GTAAGTCAGCATTATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELNNGQNFLTQWMTNPSRAGVILNRGFPVLEAEGQNQAAVNLSTSFPIKATHFSNSFGFINEEDLLHEEQKLETNSSYKLQSDKSKTHTVFSVTKKKPQIVAHKDVPGYWEDNKNDFILDLASEFKEVAYKDPLFNKLEQLKEVQQKKQEQLKRQQLEQLQRLMEEQEKLLTMVSEQHTFPASTLLPDGQSQEYRAPCTSATVDKTTPFLPSFIHQNQTQEKVYTSSILLDEQNNFCRTANQDFVLTSKSSASPSLFCAAQCQEAPVKENDLKEENHRHPSGEGILSCWEKMTKQILEENDTNLKQIGDSSEMVNIEERPIKAAIREKKQTFEDYLEEQIRLEEQELKQKQLREAEGSLLIKAKPKRPFLKRGEGLARFTNAKSKFQIVKESKLVTNQSISEDQHQFKVDRQQFQRKTAVINKGPCTENSTVKKNSKVRTKSGSITLNQKPKLLKSNNRKSLSPLGLKIQAGKKCDGQFRDQINSELKVESNNKENVLEGTKPGDTGCKVWSKEKHPLLTGLVNCMASKSLIGKTVKESESSFDISLQKKLESWEQEKEKENLELDEFLFLEQAADEMSFSSNSSFVLKILERDQQIGKGHQMYSTPVKALQQEKTNTVDPISQWNQNEDLDHIEHKNKSECEVPPKQNDSVSSPTGLMEQSYKISRRAFQMNTSENQTRWNANDDEGVRNSDSSADSEEQLDITIKPSTEDKERCLSSSADSAEVSDGKELFRDTETQEKDKSRDIDLDLSDKDYSSGESIIIESMKNKVSESSRKTSSISMSRVDFDDERTWSDLEENSCKHDVILGNEAVYGTLQTSCPNSEICVLDKTVKRKIALVKKGEDLSKSSRSIGPPPTSDLMIKFFPSLKPKPKSDSRLGNEPQLTISEDQLP	21501	10065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_11687_12004_12108_12955_13068_14911_15212_20233_20358_21076
922060	contig_15114_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_121206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACGTAAAGTACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788600	787365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_787400_788600
922061	contig_15407_pilon	+	1892	2	Intergenic	novelGene_123089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	202	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTCTACTAGCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504590	508751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_505286_507554
922062	contig_1472_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_86142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1012	1356	752208	751864	NA	70	TAAAAAAAAAAAGCAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIIKKKKIKPIAVELIPTLTDPIGQSRTAPKGQEVAGGFELPTFWLADELLATASQGLLYFPVSVQYNQCTSCTATTHLSVEACMLLNRFQWSFQTKTDQEERPGDLLPKISQ	753219	751223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_751200_753200
922064	contig_8598_pilon	-	1375	1	Intergenic	novelGene_22877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAGAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35183	33808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_33800_35200
922065	contig_8377_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_35098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTACGTCCCTGGTTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144610	147318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_144600_147300
922066	contig_5918_pilon	-	738	1	Intergenic	novelGene_99596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAATATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2058026	2057288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_2057300_2058000
922067	contig_9272_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_125956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	329	649	479230	478910	NA	35	CCAAGGAGCCATTACAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKDHSLQYALHLSIKKTKILTTGPISNIMINREKTEVVKDFILLGSTINTHGSSTQEIKRRIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLIQAMVFSIASYACES	479558	478006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_478000_479600
922068	contig_16103_pilon	+	2180	1	Intergenic	novelGene_118768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTCACTGAAATATACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471204	473384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_471200_473400
922069	contig_4024_pilon	-	4066	1	Intergenic	novelGene_177897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCATTTAAAAAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168413	164347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_164300_168400
922070	contig_9345_pilon	-	1529	4	Intergenic	novelGene_24616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2016	junction_1	1570.35247281904	87	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	117	455	952473	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	955226	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197
922071	contig_8801_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_66262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTACAATAAAAAATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375538	376717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_+_375500_376700
922072	contig_2230_pilon	+	2664	5	Intergenic	novelGene_179038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAAATAACTAGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126984	228891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2230_pilon_+_127604_129072_129421_137335_137498_138476_139647_228526
922073	contig_5423_pilon	-	4800	13	Intergenic	novelGene_85176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	343	junction_10	226.459878099607	83	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	1099	3156	206665	127198	FALSE	85	GAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLDRQYLAINQISTQLSVDLILRCVSDESLPFDLRASFCRLMLHMHVDRDPQESVVPVRYARLWTEIPTKITIHEYDSITDSSRNDMKRKFALTMEFVEEYLKEVVNQPFPFGDKEKNKLTFEVVHLARNLIYFGFYSFSELLRLTRTLLAILDIVQVPMSSYFERLSKFQDGGNNVMRTIHGVGEMMTQMVLSRGSIFPMSVPDVQPSIHPSKQGGPSEHEDITVMDTKLKIIEILQFILSVRLDYRISYMLSIYKKEFGENNENAEMSASGSPDTLLPSAIVPDIDEIAAQAETMFAGRKEKNPVQLDDEGGRTFLRVLIHLIMLDYPPLLSGALQLLFKHFSQRAEVLQAFKQVQLLVSNQDVDNYKQIKADLDQLRLTVEKSELWVEKSSSYENGEMGENQVKGGEEPIEESNILSPVQDGTKKPQIDSNKSNNYRIVKEILIRLSKLCVQNKKCRNQHQRLLKNMGAHSVVLDLLQIPYEKNDEKMNEVMNLAHTFLQNFCRGNPQNQILLHKHLNLFLTPGLLEAETMRHIFMNNYHLCNEISERVVQHFVHCIETHGRHVEYLRFLQTIVKADGKYVKKCQDMVMTELINGGEDVLIFYNDRASFPILLNMMCSERDRGDESGPLAYHITLVELLAACTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHDDCVPEVSLGKA	207763	125553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_127471_129556_129758_130382_130506_134494_134621_134740_134831_165179_165354_166556_166723_168773_168832_171428_171559_178065_178260_204308_204460_205821_205967_206438
922074	contig_11061_pilon	+	2882	1	Intergenic	novelGene_173342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	5	340	19734	20069	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMDRVKIDILGISELKWTDTGHLESDNHMGYYAGNDKLKRNGITFAVKKNTSKSILKYNTVSDTIIFICLRGRPVNTIFQMYTSITKAKMKKLKIFTNLCILKSIKHAIKMH	19729	22611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_+_19700_22600
922075	contig_3737_pilon	-	3546	4	Intergenic	novelGene_178341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	2789	3334	320980	320115	FALSE	0	CGCTCTGCTGCTTTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPARARGIQATDGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPGLEAVTSPNVAPQPCRKGQRRLSESGTRAKGGGRQREASEKPKEAEKATPASNKRPPESRPPRRAESKQPAPPSQETLDTGSRGAPAEAKRGGGWESAHRKLPAVLSPSGCSVRLLSRTPICWSPIGVQDGGSALH	390253	319902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3737_pilon_-_320418_320737_321943_380237_381206_389395
922077	contig_15731_pilon	-	4414	15	Intergenic	novelGene_171964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	105	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAAACTGCAAGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39350	11525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_-_11689_15121_15368_15885_16013_17410_17523_17793_17995_18352_19951_20591_20804_21773_21877_22169_22357_23504_23610_24621_24817_26460_26659_33744_34468_35453_35586_39238
922078	contig_3147_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_142286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	240	542	239008	238706	NA	75	ATGAAAGAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSASVLPPSSLRSAWSLKRLQAAVQDTAIVLFTWSNRGRRVRNRRKMWNVWLIASVNNCPLCHETRRTGLCLATITEHFDQTFYRKILIKRGENVEQNF	239247	238304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_238300_239200
922079	contig_5643_pilon	+	819	8	Intergenic	novelGene_38807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1912.96235707654	63	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	68	433	233973	237627	TRUE	15	ACCTCTTTGTTGATTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGVSISGSPKGHPWLH	233607	238194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236514_237586_237635_237720_237819_237913
922080	contig_18162_pilon	-	2880	3	Intergenic	novelGene_122321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
922081	contig_8461_pilon	-	3101	7	Intergenic	novelGene_163931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	96.8549889726331	7	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	874	2931	560351	441187	FALSE	50	CATAATAAATACAAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRKQEQPKRLPSHVSRQEEVEGELSEGEHWYGNSSETPSEASYGEVQENYKLSLEDRIQEQSTSPDTSLGSATPSSHTLELVALDGEVLRDSLQCQDHLSPGVSSFCEDDPPGSNKPLSSNLRRLLEAGSLKLDATATANGRVESPVNTGSNLSFSPPSHHAQQLSVLARKLAEKQEQNDQYTPNNRFIWNQGKWLPNSTTTCGLSPDSAILKLKAAANAVLQDKSLTRTEETMRFESFSSPFSSQSASSTLAALSKKVSERSLTPGQEHPPPASSFLSLASMTSSAALLKEVAARAAGSLLAEKSSLVPEDPLPPPPSEKKQEKVTPPPAPPPPPPPPPPQSLELLLLPVPKGRVSKPSNSASEEESGKPFQCPICGLVIKRKSYWKRHMVIHTGLKSHQCPLCPFRCARKDNLKSHMKVHQHQDRGETFQCQLCPFTSSRHFSLKLHMRCHQHFLRTEAKVKEEIPDTDVKGSPHLSDSACLGQQREGGGTELVGTMMTSNTPERTSQGGAGVSPLLVKEEPKEDNGLSTSFTLNAADRPTNHTKLKDPSEYVANSASALFSQDISVKMASDFLMKLSAESYKETPMVKIKEEPMEVDIQDPHVSISPSQNVGYSTLIGREKTEPLQKMPEGRVPPERNLFSQDISVKMASELLFQLSEKVSKEHNHTKENTIRTTTRFTR	561224	441016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_-_441200_447170_447229_449561_449802_498110_498592_505170_505344_518726_519777_560308
922082	contig_9706_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_20953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287962	289977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_288000_290000
922083	contig_9571_pilon	-	4853	4	Intergenic	novelGene_136321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	371	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGTACAACAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738969	654163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_654244_654288_654799_674517_674675_734863
922084	contig_15498_pilon	+	1706	1	Intergenic	novelGene_42716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCTGCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002697	1004403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_1002700_1004400
922085	contig_6915_pilon	-	2409	3	Intergenic	novelGene_162410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1245	1544	181393	181094	FALSE	50	TTAAAGTGTTGAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRELPEIQARFKRRCGTRDIISDVRWILAESREHQKDVYLCFIDYAETLHCGDDNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNQEAVVGTEQWDTAWFKIRKDVH	240659	180228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_-_182129_236622_237021_240548
922086	contig_7253_pilon	+	1812	3	Intergenic	novelGene_140201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGGACTTGGGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176895	179297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_178300_178449_178512_178951
922088	contig_18822_pilon	-	1078	2	Intergenic	novelGene_111736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACAGTTTGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215119	213624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_214414_214830
922089	contig_14666_pilon	+	897	4	Intergenic	novelGene_39589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1654.15846345573	41	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	274	801	484281	485144	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSLGSSADM	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479904_484218_484783_485118
922090	contig_2940_pilon	+	3510	6	Intergenic	novelGene_81871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	61.8242670801684	71	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	19	981	316098	350613	FALSE	75	AAAAAAAAAAAACAGGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVFRAPKRKRKVYEHYESPFPIPFGQDHIPKKEFQVYHAEMMDNNVIVRNAEAIEQLYGKGYFGKGILSRSRPNFTISDPKLVAKWKDMRTSMPIITSKKYQRSVEWAAELLCRQGQEESAVHSILQDYTKPLEHSCFQRNKETHLQGELNSEVDPNLEGPVGREKLSVMNGDSGESDEVENLSNQSAYPQEGSRQDAVTANGSDGLMVEGAAPLPHVPCGHHDDLILQRGSQPEDSRRTGLLSARESRSAHEYVLVEEVVSDVSTGKDAPSEERLICRRNPYRIFEYLQLSLEEAFFLVYALGCLSIYYEEVRCFI	316079	353142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_316287_317944_318027_329214_329252_333005_333529_334888_334952_350544
922091	contig_5033_pilon	-	1759	6	Intergenic	novelGene_28912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	1221.19836226552	98	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	273	515	453103	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLQPKGVELHPAGWYEGLVLSSLELPQLGTSASTGHFYRVWLRALDKDITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	456941	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_456698_456758_456856
922092	contig_14219_pilon	+	4138	1	Intergenic	novelGene_54357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTTACCCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864338	868476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_864300_868500
922093	contig_6059_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_44783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTTTGCTCTGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123275	124673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_123300_124700
922094	contig_20561_pilon	+	1183	1	Intergenic	novelGene_166375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATAGTTTCTCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95837	97020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_95800_97000
922095	contig_14472_pilon	-	3663	4	Intergenic	novelGene_111175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	933	1241	465708	325130	FALSE	35	AAAGACCAGATTTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFAKEDLQVANRHMKKCSRSLTIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIKKTQNKCWRGCGETGTLTHCWWECKMVQPPWKSIWRFLKKLEDTNHNQQHTNSRR	637649	322707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_325172_465441_465883_524403_524783_637270
922096	contig_5945_pilon	+	2753	1	Intergenic	novelGene_104596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAACCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346646	349399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_346600_349400
922097	contig_4486_pilon	+	2320	13	Intergenic	novelGene_38565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1254.17054262967	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	156	1310	343083	412464	FALSE	30	TAATAGAGTGTGAGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311714	413474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_343027_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
922098	contig_10106_pilon	+	3831	11	Intergenic	novelGene_73887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	615.052428659541	520	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	33	734	151101	169404	TRUE	10	GTCCCTCTGGATGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSSQTALVPCGQDKYISKNELLLHLKTYNLYYEGQNLQLRHREEEDEFIVEGLLNISWGLRRPIRLQMQDDNERIRPPPSSSSWHSGCNLGAQGTILKPLTIPNIQISDADEPPESDQTLSPTEARGLKPLQEDTPQLMRTRSDVGVRRRGNVRTPSDQRRIRRHRFSINGHFYNHKTSVFTPAYGSVTNVRINSTMTTPQVLKLLLNKFKIENSPEEFALYVVHTSGGPV	151068	176660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_151160_153289_153366_155380_155533_159293_159383_165993_166155_167027_167130_168798_168851_169393_169463_170993_171092_172505_174026_175239
922099	contig_4538_pilon	+	1882	2	Intergenic	novelGene_153082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1022	1414	133856	167186	FALSE	55	GCAAAAGGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIIKNEMEDININILGISELTWTGIGHFELDNHMVYYAGNDNLKRNGITFIVKKNISKSILKYKAVSDRIIPICLQGRPVNTTIIQICTPTTKANDEEIEDFYQILKSEIDEICNKNTLIITGD	132834	167654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_134038_166975
922100	contig_5461_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_156839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGTATCCACCCTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833426	831117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_831100_833400
922101	contig_11338_pilon	-	1914	1	Intergenic	novelGene_6284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGCAACTCTCTGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186416	184502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_184500_186400
922102	contig_7254_pilon	-	1113	1	Intergenic	novelGene_145857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245356	244243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_244200_245400
922103	contig_19744_pilon	-	672	1	Intergenic	novelGene_120413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGGCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264386	263714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_-_263700_264400
922104	contig_4350_pilon	+	2574	1	Intergenic	novelGene_136396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATTTAGAAATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376642	379216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_376600_379200
922105	contig_8273_pilon	-	2333	2	Intergenic	novelGene_113098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCAGTGTATGAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481406	477409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_-_477694_479357
922106	contig_17274_pilon	-	971	7	Intergenic	novelGene_26583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	352.898199044553	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	243051	232842	TRUE	35	TATTTTTATACTTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	246310	231566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141
922107	contig_16666_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_61785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111237	109834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_109800_111200
922108	contig_2062_pilon	+	2860	2	Intergenic	novelGene_139033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCACATGAAATCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1176230	1179138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1177068_1177115
922109	contig_15952_pilon	+	4867	6	Intergenic	novelGene_154053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	37.7518211481248	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	728	1783	186975	189315	FALSE	30	AATGGTGATATGTAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFSSNGKYLATCADDRTVRIWSTKDFLQREHRSMRANVELDHATLVRFSPDCRAFIVWLANADTLRIFKMTKREDGGYTFTATPEDFPKKHKAPIINVGIADTGKFIMTASSDTTVLIWNLKGRVLSTINTNQMNNTHAAISPCSRFVASCGFTPDVKVWEVCFGKKGDFQEVVRAFELKGHSAAVHFFAFSNDSRRMASVSKDGTWKLWDTDVEYKKQQDPYLLRTGRFEEAGTVLCRLALSPDGQVLALASGRSIHLYNTRRGEEEECFEQVHGECITDLSFDITGRFLASCGDRAVRLFHNAPGHRAVMEEMQGLLKRASNDSTRQRLQQQLTQAQDALKHLGALKK	184545	192399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_184682_186383_187136_187605_187758_188008_188136_188482_188636_188852
922110	contig_7378_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_120239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAACAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179879	177692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_177700_179900
922111	contig_13464_pilon	+	3403	21	Intergenic	novelGene_125244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_20	257.071507561612	42	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	301	2826	440611	527104	FALSE	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQALLRQLFQSVKEKITGAPSLECAEEILLHLEETDENFHNYEFVKYLRQYVCNTLGSMIEEEMEKCISDQNQSEDSGYDTVVQHVTKRTQESKEYKEMMHSLKNIMIVVVESMINKFEDDEIRIQERQKKLQNEKSNSYCTDNCSDSDSSFNQSYKFCQGKLQLILDQLDPGQPKEVRYEALQTLCSAPPSDVLNCENWATLCEKLTVSLADPDLVFSDRILKFYAQTFTLSPLHMTKEIYTSLAKHLELYFLSRENRIPTLSTGVDITNANVIRLLKKVRLLNEYQKEVPSFWIRHPEKYMEEIVESTLSLLSVKYDQSHLVSQKILDPIYFLALVDAKAVWFKKWMHAYYSRTALLRLLEKKYKSLITAAVQQCVQYFELCETMKADEILRHSKLCGNKQKNFYYSGQELQYIYFIHSLCLLGRLLIYTQGRKLFPMKLKNRKDLVSLTDLLVLFTQLIYYSPGCPKTTSAAHSENYSPASMVTEVLWILCDQKECAIECLYNNTVIEALLQPIHNLMKGTEAASHCSETALIHVADILAKIASAEEGLILLLYGENVNSSEEENPTGAHVIAQFSKKLLDEDSPIFSGSEMLPVVKGAFISVCRQIYSTCEGLQVLIPYSLHESIAKAWKKTSLLSERVPTPVEGSDFVSSVSQQSQNIMVWEDNLLDDLLNFAATPKGLLLLQRTGAINECVTLMFNRYAKKLQICRHKKFGYGVVVTQVASTAAGAIALQSSGFINALITDLWANLECGRDDVRVAHPRSTPVDPIDRSCQKSFLALVNLLSYPAVYELVGNQELPNKAEYSLREVPTCVTVSHHFLLIFLFYKCYYLRLVVKM	440310	527681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_+_440736_460269_460432_472016_472195_480736_480806_483023_483150_486001_486081_486227_486332_486429_486492_487258_487404_489849_489910_496632_496724_500020_500162_500627_500721_502933_503077_506774_506903_510219_510422_511000_511084_513198_513338_516242_516331_520634_520754_526915
922112	contig_9437_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_141731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTACAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239888	240827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_239900_240800
922113	scaffold_880_pilon	-	2498	5	Intergenic	novelGene_121445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	3	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTCTCTACAGCTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441691	428763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_429708_432672_433596_437560_437774_439123_439212_441361
922114	contig_17427_pilon	-	2130	11	Intergenic	novelGene_30317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	990.865803224634	12	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	13	633	188879	179441	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLRTAGQEVESGKSRECFQLGD	188891	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179685_182761_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
922115	contig_12605_pilon	+	783	5	Intergenic	novelGene_64200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	23	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	23	391	3897	4829	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5967_6005_6124
922116	contig_6375_pilon	-	1686	1	Intergenic	novelGene_73000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGCACAGTGGTAAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323778	322092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_322100_323800
922117	contig_3975_pilon	+	1029	1	Intergenic	novelGene_54709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATACATATTAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399001	1400030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1399000_1400000
922118	contig_6885_pilon	-	4519	1	Intergenic	novelGene_83674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	3453	3755	210312	210010	NA	40	ACACAGAGTCACTATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDNLKRNGVAFIIKKNISRSIPEYNAVGDRIISICLQGRPVNMTIIQIYAAITKGKNEKIEDFYQLLQSEIDRTCNQDALLVIGMQKLEMKKHW	213764	209245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_209200_213800
922119	contig_15043_pilon	-	3910	1	Intergenic	novelGene_175511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	142	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279369	275459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_275500_279400
922121	contig_12528_pilon	-	3285	1	Intergenic	novelGene_81284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGAAGGAATTTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265762	262477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_262500_265800
922122	contig_5189_pilon	+	4711	1	Intergenic	novelGene_34881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAGGTTACACAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217313	222024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_217300_222000
922123	contig_7816_pilon	+	3475	1	Intergenic	novelGene_66463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATGCTTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120362	123837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_+_120400_123800
922124	contig_233_pilon	-	2346	14	Intergenic	novelGene_14525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1541.21063610788	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	467	1903	104176	78579	FALSE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104324_105476_105606_108779_108814_109914_109976_126898
922125	contig_18857_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_179039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	991	1356	1831	2196	NA	25	AGATGGTTATGTGTGAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCLRKSFDIVCCFRGIQ	840	2552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18857_pilon_+_800_2600
922126	contig_12019_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_87763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGGTTCCCAATAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	669600	667859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_667900_669600
922127	contig_6418_pilon	-	2714	1	Intergenic	novelGene_81230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCAAAGGGTGGAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401615	1398901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1398900_1401600
922128	contig_8044_pilon	-	2375	1	Intergenic	novelGene_132358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	859	1200	225790	225449	NA	60	AAAAAAAAGCAAGAGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNFPRFILHTFHIPIINGCLQLFSSHFESCHISKRRSQKLDSIDIIKVNSTLRSQLFPSHNLSAFQPERLIFQHHIIQCSAAIHKVFTGQFFFRSRLPGPSSQSVLVWKRH	226648	224273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_224300_226600
922129	contig_5236_pilon	+	2078	15	Intergenic	novelGene_100883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	148.682873723827	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	14	1903	60644	84085	FALSE	35	TGAGCAGGTTACCAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASERMADGAEWIPEERRPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60630	84260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
922130	contig_10345_pilon	-	1229	11	Intergenic	novelGene_158349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAAGTGGAGTCTTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24282	4367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_4425_11655_11736_11829_11939_13155_13251_14116_14305_16894_16966_18749_18901_20418_20515_21586_21646_23044_23167_24081
922131	contig_11816_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_98561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTAATTCAACAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1182815	1185134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1182800_1185100
922132	contig_3942_pilon	+	926	6	Intergenic	novelGene_128686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	506.162977705798	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	58	759	426591	429999	FALSE	25	GATGTTATGAGTCATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQVHGHWGNQGMREGGIQACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426533	430166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428204_428489_428587_429453_429607_429804_429853_429936
922133	contig_8447_pilon	-	4002	17	Intergenic	novelGene_69389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1355	2107	83037	69701	TRUE	40	TGGAAAGAGAGGAGGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRDLSLNRGSCVGAKMMLECSPCLLCASGAKAHHSPYQLLLPIRSVAQAQAANVFQPPASHNPRWLLRSIRRAVGEELGGLVWGGRAQALGFLTQFEEHLLLPLLLVQLFFQSLFAWPKLVPPFLQGLVMALVQGLQLLGFVFYQEVTFFITCSCCNSFVFLSHWITMSRIWFSCFCCCCSRSDFCLFSSCWENCLIFSRCSEALPPPLMWRLFLYMAMRVLPSLLWILGSRAFSCCCRTFSCSIMRWL	84491	5773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_5924_21257_21329_22347_22545_23214_23296_40690_40826_44381_44929_48348_48477_53956_54088_54547_54726_65554_65685_67606_67732_69678_69866_70807_70941_71849_71961_82071_82237_82858_84083_84182
922134	contig_9389_pilon	+	1456	2	Intergenic	novelGene_84128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	17	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	61	186	227	412	1514429	1534151	FALSE	25	GGAGATATTTGAGGTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSQVWCRENWGPRATILHIHKPQVRISTALTGVWSKHSSASKLPSALLPLPCLYLTWLLGLRDDILLDFWRLEKEMDSVFVEDVAVVFSQEEWTLLDLAQRKLYRDVMMENFRNLASVGKNGILFFFNPSVKKNTY	1514202	1535195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1514432_1533968
922135	contig_6102_pilon	-	2392	1	Intergenic	novelGene_32254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCAGGCATGCACTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307733	1305341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1305300_1307700
922136	contig_14215_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_59352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTACAGAGAGTTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31016	32033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14215_pilon_+_31000_32000
922137	contig_16156_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_137097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCCTGGAAGGAGTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711830	710055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_710100_711800
922138	contig_9206_pilon	-	5108	1	Intergenic	novelGene_137481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	54	165	190	354	117055	116891	NA	25	TTTGAGGTGTCTTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WYSDSVYSFHLLLIFPASFSILPIESFGIVTQGLNFFFSSFSLRNAKRVLPFWFSNSRSAHFIMIFYFVFSSCPLKSSIQLFYFIISSFHFSYLKFESKFQSLFCSPFWSCLSFLSF	117244	112136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_112100_117200
922140	contig_10734_pilon	-	470	1	Intergenic	novelGene_51347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTATTGAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711590	1711120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1711100_1711600
922141	contig_5059_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_140765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCCTGGATATAATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556830	555894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_555900_556800
922142	contig_4924_pilon	-	3576	10	Intergenic	novelGene_84659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1289.21119533335	2	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	326	1276	252772	65182	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALVVPLYSPLFCDLNLLLLFFFFNICFVLYFAFFKEKYT	253097	62881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65295_114593_114711_127720_127785_132966_133072_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398_252596_252764
922143	contig_6952_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_173648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTATATTTCATTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326194	327468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_+_326200_327500
922144	contig_11780_pilon	+	2432	1	Intergenic	novelGene_134307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTCTTTGTGTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94945	97377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11780_pilon_+_94900_97400
922146	contig_9737_pilon	+	703	3	Intergenic	novelGene_165255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	18.5	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTCCCAGCCAAAGCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7555	11747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9737_pilon_+_7636_10009_10093_11207
922147	contig_4874_pilon	-	2084	2	Intergenic	novelGene_78624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1188	1529	69469	69128	FALSE	75	AAAAAATTAAAGTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRTRDKEKISPKDYWTTATMASTRLSPVQLDGARLPPLTALTGITIVSWTELEKDVEQNSNSKKKKTRSTGLTDWRNPKSMAPGHPFSSVVKSLPKFIVQLGIGQPHKTKRD	90621	68572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_69840_89804
922148	contig_6544_pilon	+	1907	2	Intergenic	novelGene_142107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTAATAAAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143500	150998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_145387_150977
922149	contig_11505_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_140913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCAACAATGACAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7420	4796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_4800_7400
922150	contig_1867_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_54578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTGCTTCAAAAAAACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466657	465100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_465100_466700
922151	contig_5832_pilon	-	1853	3	Intergenic	novelGene_134158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGATGCCCTGTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446818	442199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_-_443790_445143_445298_446709
922152	contig_17432_pilon	+	1871	1	Intergenic	novelGene_159005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49698	51569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_49700_51600
922153	contig_6084_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_127035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGAACCCAGGTGTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267416	268133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6084_pilon_+_267400_268100
922154	contig_13901_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_146627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCTTCACCTGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28241	27509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_27500_28200
922155	contig_15062_pilon	+	2597	16	Intergenic	novelGene_162295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	38.0085370527318	63	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1446	1150	2595	60862	91411	FALSE	35	CTTGGAAGTCAAAGAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSYVYVNTVSLDNRENHGIIYQARKELHKIVRKLLATSAKILRNPFADTFSTVDVEDHECTVWLLLRKSMSADKAARLQAVQEMSQAHHWQDYQYRIIAQACDLRTLIGLARSKESDLRFFLPPPPLPSLKEDSSVEEELRHLLASLPQTEVDECIQYFTSLALSESSQSLAAQKGGLWCFGGNGLPYAESFGKVPSATVEMFCLEAIVKHSEIPTHCDKIEANGGLQLLQRLYQLYKDCPKVQRNIMRVIGNMALNEHLHPAIVHSGWVSLMAEAMKSQQIMEASHAARTLANLDRETVQEKYQDGVYVLHPQCRTSQPIKADVLFIHGLMGAAFRTWRQQDLDEVLMEKASEDEDRYTTCWPKTWLARDCPALRIISVEYDTSLSDWRARCPMERKSIAFRSSELLRKLRAAGVGDRPMIWVSHSMGGLLVKKMLVEASKKPEMSTLINNTRGMIFYSVPHHGSHLAEYSVNYRYLLFP	43625	91413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_+_43731_50982_51075_54399_55233_58670_58708_60779_60917_62269_62360_64132_64265_67946_68069_69500_69630_70302_70417_72429_72593_76491_76643_82641_82784_87562_87658_89740_89839_91256
922156	contig_8587_pilon	-	4102	27	Intergenic	novelGene_159140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	8	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1476	1988	531765	529731	TRUE	50	TTCAACAAAATACACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACLATPKDTTHTANRKRKKKTSFIIRFTMIILGPSVLLTVKMCISRRQNMMKSRDRMIRPGYSVAGMSLAGQPCYEEQDGSDVQLIPEVAEVQGGHLQQPEPVGVVEELPRLLAHQREEPAVDDALPPGGRGLEVHHQHVGEQPEEGEVRENVEVEDDHRRAEEGPDAG	571555	479694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_-_479716_493000_493170_493434_493615_497236_497406_499567_499748_502136_502201_506792_506989_511370_511475_512842_512964_513192_513548_522243_522380_524682_524817_525496_525641_526657_526771_529702_529915_530339_530455_531103_531243_531690_531863_545023_545209_548953_549132_549511_549652_559815_559901_561791_561879_562531_562692_563562_563640_564504_564609_571193
922157	contig_1443_pilon	+	4356	5	Intergenic	novelGene_28235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	76	junction_1	41.9553333915964	29	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	2960	3373	538954	540857	FALSE	40	AGAATGGAAATGAATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPVSILPVPACKDLNSGKQRE	535994	541840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746
922158	contig_11709_pilon	+	3874	1	Intergenic	novelGene_168237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCCAATTTAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615073	618947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11709_pilon_+_615100_618900
922159	contig_13740_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_34782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGTATTGCCTTGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819873	821740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_819900_821700
922160	contig_10103_pilon	+	2036	5	Intergenic	novelGene_86171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACACGCACTACCGCAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653239	657032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10103_pilon_+_653647_654456_654569_654693_656052_656151_656223_656944
922161	contig_6568_pilon	+	2053	2	Intergenic	novelGene_152864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	56	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	381	1673	2053	157577	160522	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFFLAGSNLVVRETGMEVGKGCDLNTSGHSKTDGSSPVSSPRKPTHPVMDFFSSHLLDDSSSPSNSSHAADVPEVVVNDFLISDENLHKMENVLDLWSSSLKVLRTGVHQLCNSSTLKATVVSFN	155904	160522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6568_pilon_+_157683_160247
922162	contig_8075_pilon	+	2050	5	Intergenic	novelGene_42478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCCACGTGGTCTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574904	620500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_576357_612911_613033_616664_616837_619302_619457_620349
922163	contig_3004_pilon	+	1427	1	Intergenic	novelGene_127516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319769	321196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_319800_321200
922164	contig_9609_pilon	+	2655	22	Intergenic	novelGene_22996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	263.615606913962	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	2098	2655	328876	331481	FALSE	15	ACTGTGTATGTGTTGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAG	309973	331481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_310540_311500_311591_313099_313180_314274_314431_317882_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388
922165	contig_12391_pilon	+	2051	13	Intergenic	novelGene_103604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	314.493596472523	2	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	9	1346	56813	107379	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQNSDFLCQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIKCGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56804	108084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82550_82755_82834_94095_94222_96528_96640_96773_96852_98719_98892_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
922166	contig_8354_pilon	+	1340	1	Intergenic	novelGene_24112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAAGTGTTAGCTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232332	233672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_232300_233700
922167	contig_20550_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_142621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	560	1042	14366	13884	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPISKKGDTIECRNYQTISLTSHTSKIFLKIIQKQLQQYITRKLPEILAGFKTGCGRKHIITDVRWVSAESREYQKDVYLCFTDYAKAFDRVDHNKLWLTLHRMGIPEHLIVLMRNLNIDQKVVVQTGQEDTTWFKVRKGVHQGCILSFYLFNMYAEQKI	14925	12803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_12800_14900
922168	contig_12520_pilon	+	1428	1	Intergenic	novelGene_161051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTCCTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51596	53024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_51600_53000
922169	contig_16766_pilon	+	2856	1	Intergenic	novelGene_153361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2243	2548	137371	137676	NA	45	AAGGATTTAATATCCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCHSESSIFIRKLEYMAYLPNRGTVINKISDTKTLLTRIIVIKSRLRKYHPTHLKSHCCIPVCRVTVTLKCHIQNPYIFGQVIFDKGVKSIQWGNSLFNK	135128	137984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_+_135100_138000
922170	contig_8464_pilon	+	2916	2	Intergenic	novelGene_125407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCAGATATTCTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913277	916243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_+_913426_913475
922171	contig_7356_pilon	-	1661	10	Intergenic	novelGene_60363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	625.252028197776	37	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	52	381	457848	432998	TRUE	20	ATATATGCTTCATTGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSASLVRATVRAVSKRKLQPTRAALTLTPSAVHKIKQLLKDKPEHVGVKVGVRTRGCNGLSYTLEYTKTKGDSDEEVVQDGVRVFIEKKAQLTLLGTEMDYVEDKLSKL	457899	329293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_329714_336710_336787_340697_340863_342323_342830_343906_343999_432976_433006_433991_434073_435516_435623_437474_437529_457767
922172	contig_7963_pilon	-	2603	6	Intergenic	novelGene_58277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	3693	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTCATTGTCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48950	36857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
922173	contig_6199_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_126367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	421	780	202603	202244	NA	40	AGCCAATCTCAAAAGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYAGNNKLKRNGVAFINKKNISKSILKYNSVSDRIIPILLQGRPVNTTIIQIYTPTANAKDEEIDDFYQFLQAEIDQTCNQDALIITGDWNMKVANKHGLGDRNDAGDYMIRILQNQ	203023	200151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_200200_203000
922174	contig_10526_pilon	-	1320	7	Intergenic	novelGene_142576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCTAAGCATAAAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310765	283144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10526_pilon_-_283195_284656_284757_291360_291451_301332_301417_307405_307510_307712_307831_309991
922175	contig_8866_pilon	+	2100	3	Intergenic	novelGene_77913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGAAACCAAACCGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168192	1206102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1170005_1182622_1182684_1205875
922176	contig_12841_pilon	-	3781	3	Intergenic	novelGene_55866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGGAAGAAACTTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413346	370139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_372669_411082_411646_412657
922177	contig_6635_pilon	-	3087	23	Intergenic	novelGene_127022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACGGGGGAGGGGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	555258	454187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_-_454345_464446_464530_467022_467200_470249_470349_471535_471692_488728_488930_493985_494137_498869_498956_504574_504684_516862_516980_519813_519909_521782_521975_525901_526090_528932_529101_533073_533213_535388_535453_535844_535907_536113_536215_536707_536798_537287_537380_538637_538722_549365_549557_554973
922178	contig_10581_pilon	-	804	1	Intergenic	novelGene_41439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCACGAGGAAGAAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771776	770972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_771000_771800
922179	contig_12000_pilon	+	3666	11	Intergenic	novelGene_43160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	606.059073028364	86	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	96	929	417192	583476	TRUE	75	TAAAAAAAAAAAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELDHPEGDRWKLLLTGWQTELGNLDLTGQKQVFKAENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYPVWNQNSLQNCPWF	416858	588451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_416951_417188_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573_490689_494931_494989_558472_558606_583430_585374_587611
922180	contig_20527_pilon	+	2112	5	Intergenic	novelGene_138577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1245.84840570593	27	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	76	462	13527	26333	TRUE	35	AATAATGACCATGCTAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEVDRWH	13451	28946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25602_26309_26346_27308
922181	contig_8241_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_157479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	143	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATAAAAATGAAAACAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82211	81260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_-_81300_82200
922182	contig_14389_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_178731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATTGGGGCATTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14389_pilon_+_0_2600
922183	contig_6217_pilon	+	1615	1	Intergenic	novelGene_109662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCAACTATGAAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758149	759764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_758100_759800
922184	contig_9571_pilon	-	4298	3	Intergenic	novelGene_136324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTCAGACAGAACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738969	709041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_709529_710045_710906_736018
922185	contig_13048_pilon	+	2336	1	Intergenic	novelGene_138930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTTGAAATAATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469637	471973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_469600_472000
922187	contig_12964_pilon	-	1493	3	Intergenic	novelGene_131678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCATCCGGAAGGTCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213132	211158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_211248_211378_211512_211861
922188	contig_12620_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_98807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAACACTGCCCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246943	244978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_245000_246900
922189	contig_5452_pilon	+	3597	2	Intergenic	novelGene_101026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	155	550	527818	528213	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDREKAFDKIQHPFQIKTLSKIGIEGKFLNIIKSIYAKPIANTILSRERLTAFPLRMRMRQGCPLLPLLVNIVLEVLARAIRQERETTGIHTGKEEVKLSLFADDMVLYIEDPQRFYKKTAGTNRRI	527663	532642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_529067_530448
922190	contig_4271_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_171871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACCATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558132	559608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4271_pilon_+_558100_559600
922191	contig_3270_pilon	+	12661	16	Intergenic	novelGene_104471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	160	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	12276	12614	209849	210539	FALSE	20	AACACGGCCGCCACCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVHFRKGGKSHRGGEKSSPSSKNTQEGKEPKSRAVASTAATSGSLSWQCLYRARRGREKASEGGGRERGPECVSLTPQLPKPRQPFQFASGKLRHKITAALQPPPSLEERE	123142	210586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_133667_135020_135157_135708_135896_138789_138934_139533_139681_141822_141983_144391_144473_153842_154017_159819_159954_161442_161535_168757_168820_171135_171205_184909_185019_209494_209592_209689_210054_210405
922192	contig_2636_pilon	-	2288	1	Intergenic	novelGene_52050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAGTGTGATTGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48975	46687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_46700_49000
922193	contig_9482_pilon	+	1157	5	Intergenic	novelGene_44331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	264.573595621332	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	10	600	1253592	1275321	FALSE	15	AGATTTAGCTCTGTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGGAPREAPQGESRSPCVPPTSFEADPLKKRRWGLFLTGVVGGTLAAVYAVATPFLMPALRRVCLPFVPATPSQVENVVKILRCGRGPLVDIGSGDGRVVIAAAKAGFPAVGYELNPWLVYYSRYRAWREGVRDSARFYVSDLWKVTFSQYTNVVIFGVPQMLKCGGTRDTDTLPAGRAQSLSVFPEVRGDPGH	1253582	1275878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1253605_1259498_1259789_1262354_1262493_1264833_1264885_1275222
922194	contig_12622_pilon	+	1559	7	Intergenic	novelGene_5838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	268.203540037951	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	134	1366	455010	475619	FALSE	70	CTTATAAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQQQNQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTIPGVASPVAGAAARRSGGQHVPSTTPAPRVSSRKSLGWTPSGTRDKPREAIQNKTQQTPEQNRKQKSSVRHENNPLQT	454876	475812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_455251_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_475379
922195	contig_11754_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_176971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCATCACTATCATACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36883	34728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_-_34700_36900
922196	contig_5967_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_44417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	106	375	470631	470362	NA	15	TGCCCATGGGGGCAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNLSCLVHTQSLAISQLPFNYSYWQFVFLVSYDFMCLCLQPLWGGGLACNPNSMMDLKRLGNFQVFFFPCCEDGSDDFQTVHVGLEPKVSCNGFLVDSLGLSLCKTVPSANRDTFTSSFLIWI	470736	468525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_468500_470700
922197	contig_9177_pilon	-	1480	4	Intergenic	novelGene_32685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTGGAAGCTGCAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416874	405453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_405553_405912_406015_407996_408031_415629
922199	contig_953_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_129998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	760	1080	262457	262137	NA	55	AGGCAATAATAATGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMRTLGWKGRECSHIAGLETNVTKQFVYKFLNEKLMRTVNFHLKHNLKKRCESGVSTSQYNSCDSAYGSRRNHHFQGILPTDYVCLGNSCNRWRYGNIMRFLEEL	263216	260878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_260900_263200
922200	contig_3832_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_161469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAAGAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380869	379798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_379800_380900
922201	contig_12002_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_179040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	208	627	248	874	9458	10084	NA	65	AATCTACAACAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRDNLQVTGVPEQGVITENTEKIVEDLLTENFPDIMKDEKISIQDAHRTPYKVDPKRKSPRHIIKLTKTKDKERILREARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETRQARSQWDDIFKTLKDNNCQPRIIYPAKLSLKYDGESRAFPDKQKFREFTKKQTKITRKSKGCPTIKESITPDNNARLEHRTDQPDRDSDTDIENTSKLKY	9210	10321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12002_pilon_+_9200_10300
922202	contig_17108_pilon	-	3305	2	Intergenic	novelGene_109529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTCTCTGCTTGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79935	76344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_77077_77362
922203	contig_16103_pilon	-	2122	8	Intergenic	novelGene_118833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	2	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	59	691	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743686	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
922204	contig_12123_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_144581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGAAGGGGTGACTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58805	59653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_58800_59700
922205	contig_5899_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_146963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAGGAGTACCTGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48915	50591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_48900_50600
922206	contig_4065_pilon	-	2113	2	Intergenic	novelGene_133413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	407	919	852582	852070	TRUE	20	TAGGTGCCATTATTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNINESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	852988	850440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_851400_851834
922207	contig_18251_pilon	-	2374	1	Intergenic	novelGene_50167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAACCACTGTGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52781	50407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_50400_52800
922208	contig_8045_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_35330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	359	679	84781	84461	NA	35	AAAATCAAGAGTTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNMNKTKILVTGPIINIMINGENIEVVKDFILLVSTINAHGSSSQEIKQLIAWGKSAAKDLFKVLKSKGATLRTKVCLTQAMVFSVASYACES	85139	82563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_82600_85100
922209	contig_8773_pilon	-	3994	1	Intergenic	novelGene_74507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTAACAGCTCCTGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14677	10683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_10700_14700
922210	contig_15034_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_143636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1585	1896	38572	38883	NA	35	ACCTTCTTCTATAGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKYCRLHQTESSTTRWCPTTTIDCSDRDHNRGSRTELEKNVEQNSNLQKKIRLTGSDRDYRNPESMAPGHSFNSVMKSLLRFTLQPKIRQAHKTNETKGAH	36987	39024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_37000_39000
922211	contig_7707_pilon	+	2362	2	Intergenic	novelGene_72117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAGAACAAGCAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24845	27727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_26478_26997
922212	contig_18162_pilon	-	3617	3	Intergenic	novelGene_122284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	123	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTCCGGCAAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9689_9886_10809_16363
922213	contig_6503_pilon	-	3363	3	Intergenic	novelGene_145785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGAAATGTTACTAGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613354	609296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_611612_611682_612248_612871
922214	contig_5880_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_151128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	157	456	319218	318919	NA	60	AAAGAAAACATCAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKAHKMREKIDKMLEKTDKQMGEFRKIIQEQNVKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMHSVTEGLRNRFQTMEDRISEIEDKPLDTICWRKNQRKE	319374	317960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_318000_319400
922215	contig_9953_pilon	-	806	1	Intergenic	novelGene_179041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGGATGCCAATCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11041	10235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9953_pilon_-_10200_11000
922216	contig_14445_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_137390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTGACCAGTCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432358	431381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_431400_432400
922217	contig_11720_pilon	+	1228	8	Intergenic	novelGene_44012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	5	junction_3	179.76810459192	25	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	317	1084	271336	280503	FALSE	20	GTCAGGTGAAGTGTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGDQKSTASQKPRGRGILHSLFCCVCRDDVEALPPHSGAPLLVEENGAVPKQTPVQYLLPEAKAQDSDKICVVIDLDETLVHSSFKPVNNADFIIPVEIDGVVHQVYVLKRPHVDEFLQRMGELFECVLFTASLAKYADPVADLLDKWGAFRARLFRESCVFHRGNYVKDLSRLGRDLRRVLILDNSPASYVFHPDNAVSASRWAKTKERGQAGPCPGPGAFSSPPSSQPSVSRVVHSLCPPALAACSLCDSSV	270053	280647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_270153_270549_270700_271268_271343_278462_278612_279036_279142_279264_279322_279968_280062_280146
922218	contig_11422_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_98963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
922219	contig_7410_pilon	-	2740	2	Intergenic	novelGene_106112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAAAAAAAGAAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492754	489482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_491680_492211
922220	contig_10958_pilon	-	2118	3	Intergenic	novelGene_5338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	372	junction_2	57.5	31	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553135	549901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_550620_551157_551306_551883
922221	contig_6599_pilon	-	2434	2	Intergenic	novelGene_175962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	319	747	259384	258915	FALSE	60	AAATAAAAAAATTGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTPPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFHKGPKSIRWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLENWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKHSNGQQTHEEMLMMTSH	259702	257227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_258970_259010
922222	contig_6496_pilon	-	1240	1	Intergenic	novelGene_103507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAATTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689843	688603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_-_688600_689800
922223	contig_8317_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_19759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCTCGAACAGCAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17092	16402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_17100
922224	contig_7272_pilon	-	4012	2	Intergenic	novelGene_25308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1960	2268	445267	444959	FALSE	30	TCTGCAGTGAACAATGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGIVFFVKKNISGLILKYSAVSDRLISICLQGRLVNMTIMQTYTPITNAKDEEIEAFYQLLHSEIEQTCSQDALITTGDWNAKVGNKEGLVVGKYGFGEKK	459729	443214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_446379_458881
922225	contig_10857_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_160892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	34	342	33239	33547	NA	60	GGAAGGAAAATAATAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILATGPISNIMIKGEKIEVVKDFILLGSTVNTHGSSSQEIKQLIASGKSAAKDFFKVLRSKNVTLRTKVYLTQAMVFSITSYVCESLTMNKEDRRRIDGFKLWCWQRMLNIP	33205	34578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_33200_34600
922226	contig_7229_pilon	-	598	3	Intergenic	novelGene_39810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3961	junction_1	46.5	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	44	135	411	545	875788	875654	FALSE	25	TCTACTTAAAAGTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877452	875600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350
922227	contig_14970_pilon	+	1133	5	Intergenic	novelGene_45063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_1	2534.39040994082	2	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	328	432	231446	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192188	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
922228	contig_14441_pilon	+	1539	4	Intergenic	novelGene_100649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGCTGCCTACGAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111852	117787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111969_112341_113247_115141_115572_117699
922229	contig_6418_pilon	+	4159	2	Intergenic	novelGene_81216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	3084	3398	1354242	1354556	FALSE	75	CTCAAAAAAAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQKTKLQCYSLKGTRTSVHEELKRSNLVERRSREPILKIKEQVYCFHLDSRCFFGKASWNLFARRFGEVIALLSFMLLGDPPNAGTQFHTTLLSLLLSCSGGK	1347426	1355317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1350060_1353791
922230	contig_16187_pilon	+	998	1	Intergenic	novelGene_101079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCACTTGTGGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69744	70742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16187_pilon_+_69700_70700
922231	contig_7963_pilon	+	1181	5	Intergenic	novelGene_58375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	84	848	51450	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51366	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
922232	contig_12837_pilon	-	2906	1	Intergenic	novelGene_57342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2463	2870	205124	204717	NA	60	ACTCAAACAAATAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQSTNLISQTYTNPTASKYTFFSNAHGTFSRIDHILDHKASVNRIQSIEILQSVFYDNKAIRVEINNRKSKEKKSNTWKLNNNLVKNYWVIEEIKVGINKFTESHENEHILPEPLGHSKGSAQRSIYSNKCTHP	207586	204680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_204700_207600
922233	contig_5954_pilon	-	2619	13	Intergenic	novelGene_28507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	421	53	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	755	1252	443672	441390	TRUE	35	GGCGGGAGACGCACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPACSDSVHKNYSGCFAEPSCPPGALLRLSAWKGHQWARKVLTLMARAIAAAGRDLCCHGKGVLEAILLLGGGGGGGCCCCCCHGGRGPEGGGGGCPLGGGGGGGIMPIGGGGIIPFSLMQAIDPRAHRRTSQVLILEGHGAQVGGGPDSSVVVAAASKGVGVH	444426	430433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_430605_432407_432536_435588_435666_438684_438839_439035_439128_439446_439627_439714_439825_439935_440047_440759_440940_441225_441474_441736_441801_441924_442106_443503
922234	contig_18506_pilon	-	4359	1	Intergenic	novelGene_67953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	122	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18824	14465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_-_14500_18800
922235	contig_1213_pilon	-	2709	2	Intergenic	novelGene_76465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGTGGTGGTATTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45139	42310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1213_pilon_-_43485_43604
922237	scaffold_19766_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_34354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATGAACAGGAAAGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619770	617423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_617400_619800
922238	contig_1596_pilon	-	3086	1	Intergenic	novelGene_131587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAACCCACTCAGTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87873	84787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1596_pilon_-_84800_87900
922239	SIRV6	+	464	1	ISM	SIRV6A	SIRV604	1537	10	10281	5	1131	-5	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGTATACTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11368	11832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_11400_11800
922240	contig_13968_pilon	-	2745	3	Intergenic	novelGene_106865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	601	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1069	1386	20991	20674	TRUE	60	ATTATAAAAAAACAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRLHLTYFGHVIRRHQSLEKDIMLGKVEGQQKRRPSMRCIDTVVATIGSNIEMIVTMAQDQAVFHSVVHGVSMSRNQLNGIYQQRHINNVHCRIIHNSKKMKTA	22059	8586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_8796_9315_9386_19593
922241	contig_7688_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_160395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTCCTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73210	71119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7688_pilon_-_71100_73200
922242	contig_11044_pilon	+	2099	1	Intergenic	novelGene_176592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTTCTGGACAGAGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52256	54355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11044_pilon_+_52300_54400
922243	contig_12595_pilon	-	1923	2	Intergenic	novelGene_179042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	789	1088	67354	67055	FALSE	55	AGTCTCAGCAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNRRDPESYVGHN	68382	66219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12595_pilon_-_67381_67620
922244	contig_15732_pilon	+	1565	3	Intergenic	novelGene_88874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	874	1179	162136	162488	FALSE	40	AATAGAACTTTGCCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGPGVMDQMIEAAEEYPWLWVFYILTVALPMFLVILFCYSGKKQLSAMKYKKTDAPQTDVKEEEEEKEKEKDKGDEEEEGEEKLEEKQKSDPEEDGGTAS	161188	162874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_161400_161473_162148_162194
922245	contig_2214_pilon	+	2906	2	Intergenic	novelGene_144269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	636	junction_1	0	28	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAAATTAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329392	332430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_330560_330691
922246	contig_17144_pilon	-	2952	17	Intergenic	novelGene_29294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1761.80323882769	5	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	135	2657	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
922247	contig_19816_pilon	-	1503	8	Intergenic	novelGene_156510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	273.546474057678	9	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	201	1091	126303	123459	FALSE	35	ACTTGATAACCTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWKSRSQSTVLIMGIIAALVLLVVIAAVVVGAVIWRKKSSGGKGGNYAQAASSDSSLGSDVSFMASKA	126804	123046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124441_124556_124658_124935_125577_125854_126164_126425_126725
922248	contig_6576_pilon	-	1840	4	Intergenic	novelGene_42323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCGCCTCTATTGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606625	599319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_599378_600398_600863_604573_604724_605457
922249	contig_7171_pilon	-	2184	1	Intergenic	novelGene_101280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATTAATAAAGAAGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1017589	1015405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1015400_1017600
922250	contig_12948_pilon	-	2878	6	Intergenic	novelGene_126198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1016	junction_2	185.115747574322	10	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	643	1932	198	2129	236337	231090	FALSE	15	AGCTCTCTGCTTTATTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESNNWQELLGRLCLIDRLLLEFPAEFYPHIVSTDVSQAEPVEVRYKKLLSLLTFALQSIDNSHSMVGKLSRRIYLSSARMVTAVPHVFSKLLEMLSVSSSTHFTRMRRRLMAIADEVEIAEAVQLGIEDTLDGRRDSFLQASTPNNYPETTENSSLERTVHLGKTGKGLCPAKLSASSEDISDRLASILVGLPSSATTTEQPKPMVQTKGRPHSQCLNSSPLSHHSQLMFPALSTPSSSAPSVPAGTVTDVSKHRPQGFVPCNIPSASPQTQRKFSLQFQRNCSESKDSDKLSPIFTQSRPLPSSNIHRPKPSRPTLGSISKQGDTSKNSMTLDLNNSSKCDDSFGSSSNSNNAVIPSDETVFTPVEEKCRLDVNTELNSSIEDLLEASMPSSDTTVTFKSEVAVLSPEKAENDDTYKDDVNHNQKCKEKMEAEEEEALAIAMAMSASQDALPIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQDVGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATCEKSNYNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLIDSTGQRLRIADFGAAARLASKGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVRSCFEFDRRKYFRVLRDSIIPNRFALVFIMCLSIRSP	237013	230340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_231350_232224_232357_233724_233888_234585_234739_235113_236399_236877
922253	contig_12635_pilon	-	1348	10	Intergenic	novelGene_60810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_9	388.671653611358	8	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	87	1331	252849	180251	FALSE	10	CCTTTTGTTATTTGATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNLKFSAFVSNISFVAFPAPNTNSPTKILPKTLGPINVNVGPQMIISTPQRLTSSGSVLIGSPYTPAPAMVTQTHIAEATGWVPGKRSKKGDKNGKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTSYNEVADELVSEFTNSNNHLAAESQAYDQKNIRRRVYDALNVLMAMNIISKEKKEIKWIGLPTNSAQECQNLEIEKQRRIERIKQKRAQLQELLLQQIAFKNLVQRNRQNEQQNQGPPALNSTIQLPFIIINTSRKTVIDCSISSDKFEYLFNFDNTFEIHDDIEVLKRMGMSFGLESGACSLEDLKLAKSLVPKALEGYITDISTGPSWLNQGLLLNPTQSVSNLDLTTGATVTQSSVNQGLCLDAEVALATGQLLAPNSHQSSSAASHCSESRGETPCSFNDEDEDDEEEDSSSPE	252935	180233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_-_180435_180644_180751_189585_189753_192587_192740_197104_197174_201014_201162_206834_206998_219680_219803_227341_227446_252818
922254	contig_5686_pilon	+	2782	1	Intergenic	novelGene_45200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	2209	2739	43474	44004	NA	20	TTGTATGATTCCATTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNQGSSSQEIKGCIALGKSAAKDLFQVLQNKDVTLRTKVGLNQAMVFSVASYACESWTMNKEDGRRISAFELWCWQRILNIPWAARRMNKSILEEVQSECSLEARMARLHFMYFGQVIRRDHSLEKDIMPGKVEGQQKRGRCSTSWIDTVAAAMGSNRNDFKDDTGLGSVSFCCT	41265	44047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_41300_44000
922255	contig_5744_pilon	+	3949	2	Intergenic	novelGene_149348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	760	1203	676080	676523	TRUE	65	AGCAAGGAAAAGAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCAFCTGRDPATESLHVHPEPVRSSPRSSERYVIAYGLPCGSKTPPLREKPLSHLPPRSLFCPGSWTGFSNCRVPWAGSRIHHTPGAILPALDSEQINRGKNKLLAPLSQEPRVGTAPLPRHGHKGSTDFECLSPCIDLCGPISAA	675320	679313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_+_677933_677976
922256	contig_4180_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_8364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	196	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGAGGTGTTTTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868171	870881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_868200_870900
922257	contig_9389_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_84151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATCAGTCGATGATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1847515	1849262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1847500_1849300
922258	contig_1406_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_25482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTCACAAACTTTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313494	1310166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1310200_1313500
922259	contig_12746_pilon	-	2217	2	Intergenic	novelGene_152188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	316	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTTTAGTTTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592487	557452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_557460_590277
922260	contig_9668_pilon	-	5052	14	Intergenic	novelGene_58085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	177.391987304284	321	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	1585	3129	184257	121609	FALSE	40	ATGAGAAATGATATGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLSFHAGSWESWCCCCLIPPDIPWNPGRRWQLEMADTRSVHETRFEAAVKVIQSLPKNGSFQPTNEMMLKFYSFYKQATEGPCKNSRPGFWDPIGRYKWDAWSSLGDMTKEEAMVAYVEEMKKILETMPMTEKVEELLHVISPFYEIVEDKKSGRSSDFTSDLGNVLTTPNAKTMNGKAESSDSGAESEEEEAREEVKGAEQSDNDKKMMKKSADHNNLEIIVTNGYDKDSFVQDIQNDFHASSSLNGESTEEVKPVEQNFEQTGKTTVCIHEDVSGIQHLTSDSDGEVYCDSMEQFGQEESLDSFSSNSGPFQYYLNGDPNQRLENSGFPEDVQVSPANGSIGDMQGVAVEGKGEVKRGGEDGRSNSGTPPNEKRGGENLEFCNVRRGRGHRMQPLGEGAKGRQVGSGGDGERWGSDRGSRGSLNEQIAIVLMRLQEDMQNVLQRLHKLETLTASQAKSSTLQTSSQPSSLRPSWWPFEMSPAVLTFAIMWPFIAQWLVHIYYQRRRRKLN	190932	119685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_121622_123176_123287_123619_123665_129339_129540_134528_134797_145066_145150_145973_146178_147289_147422_164932_165048_174462_174536_176722_176844_183890_184057_184242_184811_189901
922261	contig_8330_pilon	-	2448	9	Intergenic	novelGene_71842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	224.967636561351	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	105	1061	916108	896249	FALSE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	916212	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904339_904412_904827_904897_916051
922262	contig_5799_pilon	-	2391	2	Intergenic	novelGene_50226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4052	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_557_2217
922263	contig_14182_pilon	-	3413	6	Intergenic	novelGene_76181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	514.085751601812	88	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	133	942	69537	57708	FALSE	15	CGACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKIAFNTPTALQKEEARQDVEALVSRTVRAQILTGKELRVATQEKESSSGRCMLTLLGLSFILAGLIVGGACIYKYFMPKSTIYRGEMCFFDSEDPANALPGGEPYFLPVTEEADIREDDNIAIIDVPVPSFSDSDPAAIIHDFEKSGKYLPHTYVIREDLVALEEIRDVSNLGIFIYQLCNNRKAFRLRRRDLLLGFNKRAVDKCWKIRHFPNEFVVETKICQEYYINYSFRRIPRGAVVKPWLLSKGRQFEPTSSSTGERCGSLLQ	69669	55236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_57841_59086_59172_59320_59472_65076_65275_65549_65682_69426
922264	contig_18272_pilon	-	5013	1	Intergenic	novelGene_7023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205079	200066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_200100_205100
922265	contig_8820_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_79317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTTCACCGTTCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278760	277995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_278000_278800
922266	contig_5031_pilon	+	2111	2	Intergenic	novelGene_133180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	501	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTCTAAAGTCAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22598	24823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_23506_23619
922268	contig_10838_pilon	-	5052	4	Intergenic	novelGene_129166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCATAGCATTCGTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85469	76046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_76920_77354_77562_81321_81406_81581
922269	contig_4418_pilon	-	4288	16	Intergenic	novelGene_98384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	216	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACCTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	909477	835517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_836755_840079_840233_849055_849240_851944_852453_867701_867790_870491_870640_871274_871431_877335_877478_879764_879823_880147_880296_887087_887276_890610_890707_891011_891138_901271_901411_904303_904445_908701
922270	contig_7179_pilon	-	4175	5	Intergenic	novelGene_78209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_4	36.155048056945	126	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1409	2083	1685433	1684759	FALSE	20	GAATGGGAGTCAGTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIHKRGKPYQSNNYSIDFKQSSSLIQEESTLTEVKSYHCNDCGEDFSHITHLADHQRIHTGESPYDCEQAFSQQPNSHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSFIEHHRIHTGEKPYECNECGEAFSRRSSLTQHERTHTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQHERTHTGEKPYECNECGRAFRKKTNLHDHQRIHTGEKPYVCKECGKNFSRSSALTKHQRIHARNKV	1698744	1682666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1686411_1689722_1689913_1690160_1690288_1698234_1698303_1698698
922271	contig_14450_pilon	-	3330	4	Intergenic	novelGene_48972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.787613557254	41	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	312	1001	1065993	1042825	TRUE	20	ATCCTATTGCAGATGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCFFPFFVCSVPPGVIQNGARVLSRGMFPGVRPLPITPIGMTAAMRNGITSCRMRTESEPSCGSPVVSGDPKEDHNYSSAKSSNARSSSPASDSISSSSADDHYEFATKGSQEGSEGSEGSFQSHESHSDTEEDDRKHSQKEAKDALGDSGYASQHRKRQHLAKARKVASDTLPLKKRRTEKPPESDDEEVKEAAGSLLHLAGIRSCLNNITNRTAKGQKEQKETPKN	1066304	1038791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039698_1041027_1042081_1042454_1043375_1065853
922272	contig_903_pilon	+	2478	1	Intergenic	novelGene_178825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCTTTTTTGTGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46280	48758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_903_pilon_+_46300_48800
922273	contig_854_pilon	+	4037	24	Intergenic	novelGene_36582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_23	2476.01174295049	2	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1112	3339	84	3422	1679334	1715383	FALSE	40	GTCATAAATGATAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1679250	1715998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706866_1715305
922274	contig_20716_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_176141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACAGACGTGATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153591	151812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20716_pilon_-_151800_153600
922275	contig_14017_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_165693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGAAAGAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71133	72647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14017_pilon_+_71100_72600
922276	contig_8209_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_179043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTCATAAAACAACATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38847	39786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8209_pilon_+_38800_39800
922277	scaffold_13505_pilon	-	2035	9	Intergenic	novelGene_111519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_8	432.627437872357	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	1190	1444	594063	589159	FALSE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHRAGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEVSVDHECAGPTGPWKTRTCPTPCLAII	603262	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
922278	contig_3787_pilon	+	3171	2	Intergenic	novelGene_102403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGCAAAACTGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522195	557283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_522204_554120
922279	contig_6163_pilon	-	2197	8	Intergenic	novelGene_103818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	326.557742495372	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	482	1054	79431	78086	TRUE	15	GATGTACTGTTGTATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPVDDTFISGSLDKTIRLWDLRSPNCQGLMHLQGKPVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVKLYDLRSFDKGPFATFKMQYDRTCEWTGLKFSNDGKLILISTNGSFIRLIDAFKGVVMHTFGVSWQPLSMAISMLIPPGLRVVLAGWWRPALARDSLVRVWACVLFLRMNSFPLDSEAVEHIIFHPVTQVWTS	93882	75985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_78458_78698_78816_79347_79448_86079_86279_86907_86975_89577_89667_93772
922280	contig_14694_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_152468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCACCAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89421	91512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_89400_91500
922281	contig_854_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_36736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	467	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714545	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1714500_1716400
922282	contig_17427_pilon	-	1437	2	Intergenic	novelGene_30265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	0	52	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTAATTTATACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15246	6644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_6788_13952
922283	contig_16804_pilon	+	4163	8	Intergenic	novelGene_167289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGGAAGGATCACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40954	58122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_+_44004_46462_46550_51455_51616_52337_52546_53274_53474_55242_55357_56447_56624_57952
922284	contig_7707_pilon	+	3913	1	Intergenic	novelGene_72115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTAAAGTATAGAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9414	13327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_9400_13300
922285	contig_8160_pilon	+	2639	1	Intergenic	novelGene_136401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32336	34975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8160_pilon_+_32300_35000
922286	contig_10949_pilon	-	1443	11	Intergenic	novelGene_146683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	291	806	59664	32549	TRUE	45	ATATTTCACAAAATCACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSTSPGSRTRLGSEQGFARGNFRGNFGLIIRVVFSFPNLSSICSSSSESKSNSSSITCSVTSLALSAFFAILARRDLDKLFILLVLPLDINRASGLSFPSRSKSGESSSESFKQVPVMLNSTRRISLARSLMSCTVRTVSGISSSWSGRASFLVQALKAKFRALPPWTR	60441	18716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_-_18777_20303_20491_22137_22297_30666_30760_31127_31233_32515_32608_39741_39834_42753_42856_58888_59070_59582_59669_60155
922288	contig_12008_pilon	+	3573	1	Intergenic	novelGene_25011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCAACTTCACTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61847	65420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_61800_65400
922289	contig_4426_pilon	+	2745	2	Intergenic	novelGene_15399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAAAAACAGGTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789736	839914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_790075_837507
922290	contig_7151_pilon	-	578	2	Intergenic	novelGene_40792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1816	junction_1	0	9	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAATGTCTTTGTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530181	528877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062
922291	contig_12409_pilon	-	2027	3	Intergenic	novelGene_169441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCGTCCGCGGGCGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144630	137740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12409_pilon_-_138008_139890_140011_142990
922292	SIRV5	+	885	4	FSM	SIRV5A	SIRV509	885	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3107	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8315	11866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11311
922293	contig_3832_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_161472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACGTCCTTTTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391371	393155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_391400_393200
922295	contig_4013_pilon	+	4698	2	Intergenic	novelGene_178555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	718	1095	907	1284	TRUE	25	GCTTATTTAATTCCAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEVGVHQESPWKKGLVIYFQTLSNQKLCGTQFYSDTHGVSMSQGQLMETGSGGGGSIQKRPKSTVIRRTVVSRGTFSPIFHSNGYFYFPENNSMKIQTSGDIWRNGSRARAWKQLVSLTMSFSY	189	5055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4013_pilon_+_3993_4160
922296	contig_2924_pilon	+	1850	3	Intergenic	novelGene_140292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGGTATGTCTGCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448022	451778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_449729_450388_450499_451744
922297	contig_3956_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_14794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTTTGGTCTCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1178157	1180537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1178200_1180500
922298	contig_15047_pilon	+	1624	6	Intergenic	novelGene_52214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3059.86722587762	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	16	1065	2194	21099	FALSE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSGDSAQGSDVSLTASKGETLEGLMWRTG	2178	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4158_4434_4552_4676_21013
922299	contig_14441_pilon	+	2951	3	Intergenic	novelGene_100799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	15	68	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	706	1014	137283	137591	TRUE	30	GTTCTTCCTCCATAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRAQSEGSGSLELGLRQVCLSAVTHPRPGDSPASGIISPAIALCWCPRVETSPVNRRLLSGAPERPPGASADMGELVLAVMRGIGSLKLGAGSGLPLGAEG	136577	140998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_137853_139208_140590_140703
922300	contig_1516_pilon	-	4581	12	Intergenic	novelGene_49909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	203.123990143707	414	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	738	1334	53917	37391	FALSE	50	CTAATAAAATAAACTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCRNQNCKAEFCWVCLGPWEPHGSAWYNCNRYNEDDAKAARDAQERSRAALQRYLFYCNRYMNHMQSLRFEHKLYAQVKQKMEEMQQHNMSWIEVQFLKKAVDVLCQCRATLMYTYVFAFYLKKNNQSIIFENNQADLENATEVLSGYLERDISQDSLQDIKQKVQDKYRYCESRRRVLLQHVHEGYEKDLWEYIED	84330	34143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_37476_38498_38612_41324_41586_50506_50565_53837_53969_57307_57380_57900_57944_62432_62542_63896_63964_74472_74529_75065_75159_84084
922301	contig_15327_pilon	+	3078	1	Intergenic	novelGene_70544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	522	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1520	1831	528577	528888	NA	15	CGTTCAGTTCATCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMSSDPEHFLVSVGHLNVFFGEVSVHFLCPFFNRIICLFVVEVLDFLVDYGD	527057	530135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_527100_530100
922302	contig_19243_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_177406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCAGGTTTTGGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38290	40429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19243_pilon_+_38300_40400
922303	contig_10855_pilon	+	3022	1	Intergenic	novelGene_124296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1914	2285	278437	278808	NA	25	GCTGGTTCCAGCCAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRTLSDTLPEDEPLRLEGTQNTTGEELPLQSGVDLNDVDGVKLSGPSFADAAQLRMRKHSCKHPLITGMWKVQSMNLGKFKSSEMEHTNIDVLGISGLTWLVLAILNQTTIWSTMRGMTT	276523	279545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_276500_279500
922304	contig_14068_pilon	-	2833	2	Intergenic	novelGene_165968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1236	1826	246505	245915	TRUE	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	247740	240111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14068_pilon_-_240922_245717
922305	contig_5718_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_110420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAGAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448556	1451190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1448600_1451200
922306	contig_2438_pilon	+	2126	2	Intergenic	novelGene_112066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	0	13	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	680	1018	311851	312412	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	311171	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305
922307	contig_3721_pilon	+	2756	1	Intergenic	novelGene_123814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGGAGTGTTGGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139616	142372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_139600_142400
922308	contig_9242_pilon	-	2458	1	Intergenic	novelGene_155067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCATGAATTTCCAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615328	612870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9242_pilon_-_612900_615300
922309	contig_11427_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_78985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGATTAACTGCTCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468812	470892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11427_pilon_+_468800_470900
922310	contig_11338_pilon	-	1836	1	Intergenic	novelGene_6264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	100	336	122823	122587	NA	60	TTAAAAAAAAAAAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLETEIPYNPAIPLLGIYPREIRVFTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRNNNDESVKHLITCLKLEDIMLSEISQSQKDKHCIRPLL	122922	121086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_121100_122900
922311	contig_8254_pilon	+	3392	1	Intergenic	novelGene_48357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	138	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	2482	2967	3212	3697	NA	55	AAAAAAAGCAACACCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRQLSESGSRGKGVGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKATPTAYKRHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRILAHASAQTWKEPHTRT	730	4122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_700_4100
922312	contig_1225_pilon	+	2878	4	Intergenic	novelGene_44141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	805	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	223	540	250814	274411	TRUE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250591	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_275154_275201
922313	contig_4797_pilon	-	2721	4	Intergenic	novelGene_6892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGTCTCAGCCGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296685	225487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_225562_266129_267271_285183_286184_296179
922314	contig_253_pilon	-	1620	1	Intergenic	novelGene_129656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTTAAAGTACAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316746	315126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_315100_316700
922315	contig_8354_pilon	+	4860	4	Intergenic	novelGene_24148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534832	541472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_537379_538000_538147_539084_540369_540588
922316	contig_14441_pilon	+	1243	6	Intergenic	novelGene_100605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	1603	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	403	1203	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111203	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112001_112040_120959_121239_125517_125902_126159_126283_126514
922317	contig_2069_pilon	+	2238	14	Intergenic	novelGene_23263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	339.498917219038	15	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	267	1109	333898	341321	TRUE	20	CAACTTCTGTCTTAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	324033	345502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332216_332333_332932_332996_333888_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_344889
922318	contig_5602_pilon	-	3094	4	Intergenic	novelGene_133028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	188	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	338	682	648702	648358	TRUE	25	AGTGAGTGTTCTTGAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFESIVGAVVSVHLIEGFPHFCSPSTLPNMMSFSSDWSFLMMCPKKISQGLAILISRENSGCIFSKTDLFVFLAVHNIFSILHHCHSLNTVILGRWAFTSLLFEIHQGQWKANR	649039	541350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_542454_636601_637161_643981_644580_648205
922319	contig_13542_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_131556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1504	1845	621452	621111	NA	80	TCATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDLSRQLSSVHCLLPWSSESNQVSKVSSSSMLQIELCLSKIHVDDRVFWTELEKDAEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPKSMAPRHRFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPHETKWD	622955	620698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_-_620700_623000
922320	contig_11898_pilon	-	1162	1	Intergenic	novelGene_144275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201300	200138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11898_pilon_-_200100_201300
922321	contig_16411_pilon	-	2150	8	Intergenic	novelGene_77364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	174	junction_5	193.851826435154	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	387	1007	320829	302599	FALSE	35	CCTAGGAACCCCAGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVLMLMYYCCKQNNKLGQLKPSALPSKLRQHFSCPFRMSQNSGTGHANPTFKLQTPQSKRKVTNTPETPRKPSQPPPRPPPDYLHKGSSPASLPAHLSRAVRNAPGAKSQVERKESSRRPPPSRPVPPAPNYILTQDFSRPRPPQKALPANPVPGRKTLPRQGGPSTLLPSAAGPQHSRPLVAPVPKFPEYRSQRAGGMTSSKI	323490	301455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_302653_303441_303595_318787_319013_319328_319414_320725_320871_322118_322230_322354_322433_323334
922322	contig_3018_pilon	+	1129	4	Intergenic	novelGene_78891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTAAAGATATTTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576713	584233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_576887_577774_577838_580097_580175_583417
922323	contig_15104_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_163355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596272	597679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_596300_597700
922324	contig_2377_pilon	+	910	2	Intergenic	novelGene_67925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAGAAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277537	279578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_277768_278898
922325	contig_2940_pilon	-	966	1	Intergenic	novelGene_81876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343675	342709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_342700_343700
922326	contig_10331_pilon	+	2885	7	Intergenic	novelGene_54168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	385.467969558504	60	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	297	2588	2884	538112	544974	FALSE	40	GTGCTTATAAAAAGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKKKRRIIAVKKRQEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVK	526324	544975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538157_541971_542045_543768_543864_544890
922327	contig_15498_pilon	-	1482	9	Intergenic	novelGene_42666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	145.722124263957	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTCCATCTGGCCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697711	687988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689537_690926_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262
922328	contig_6634_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_171129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCAGATTTACTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38502	36338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_-_36300_38500
922329	contig_5686_pilon	+	3415	12	Intergenic	novelGene_45399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_11	1586.13200705416	14	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	1492	2364	202891	211355	FALSE	20	AAATCAGGTGTCGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	170242	212406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_200560_202871_203002_208031_208722_211283
922330	contig_12292_pilon	+	1555	1	Intergenic	novelGene_167003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1055	1363	270487	270795	NA	15	TTTGCTCTGTAATTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHCLHNPETELDGTWLLLLMALTGITTEGPGQSGRKIIKQKIKLARKMRLTGLTETGGTLETMALRHLSELEMKPFSETTFQPNHRQVHKINNNTQEEQAP	269432	270987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_269400_271000
922331	contig_7057_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_123410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	202	522	1385507	1385827	NA	40	ATCTCTTGTAAGATAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVPTHSDPVYDRTKHCQSCAILTTVILLELIVVATVSVHLVKDSLLLILCFTKHDVFLQGLVPPDNMSKLYETSIAILAFKECSSKTDLLVLLAVHGILSILHQHHNSKGSILLWSSLFIVQLLHTYGTIENTMAWVRRTLVLKVTSFFFFFNAPKRSFTADLPNAMHHLIS	1385305	1387890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1385300_1387900
922332	contig_610_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_76764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	26	358	227586	227254	NA	55	TGGAAGAAAGGAAATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHKKKHYKMTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDIP	227611	226583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_226600_227600
922333	SIRV6	+	655	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	224	1	138	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	22	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTCTTGTAATTATGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
922334	contig_4305_pilon	+	2500	2	Intergenic	novelGene_136644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	168	503	7752	8087	TRUE	25	GATTGCATGTTTGATCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSWHCFLGGMRSACLSAHFCLLYLKRLPQNTIQSCRLSPPLLIQLPPILPLNIIEAGFTTYKKITQYQESWPSQIDTHIFQSMTEAFFFSKIMEKLNIYKDFRTYLIRM	7584	10612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_9439_9966
922335	contig_7378_pilon	+	1177	1	Intergenic	novelGene_120285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTACTATTACTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589898	591075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_589900_591100
922336	contig_8386_pilon	-	2726	9	Intergenic	novelGene_82215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	44	junction_8	115.176766320296	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	235	1092	35180	18699	FALSE	35	AACACCCAGCATTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDHFHVFVGDLSPEITTEDIKAAFAPFGRISDARVVKDMATGKSKGYGFVSFFNKWDAENAIQQMGGQWLGGRQIRTNWATRKPPAPKSTYESNTKQLSYDEVVNQSSPSNCTVYCGGVTSGLTEQLMRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSTAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPAGYRVAGYETQ	35414	17064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19900_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21914_22024_31346_31423_34573_34662_35173
922337	contig_12793_pilon	-	1872	2	Intergenic	novelGene_164129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAGCACATGTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299768	254718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12793_pilon_-_256501_299678
922338	contig_4659_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_118203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTGGACTATGAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188980	190405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_189000_190400
922339	contig_3525_pilon	-	866	1	Intergenic	novelGene_135126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	53472	53239	NA	15	TCAGCAGCTTTGCAGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TELSLEVHERGAGDITLGQNNTRMLLNWDTAQEEPSDSSNAEVQERKATETWQWDKTARDVMHREFKIKVKCPVDGTKRGGGGDEEVLLRKGVLVGTPGS	53541	52675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_52700_53500
922340	contig_5415_pilon	+	1799	1	Intergenic	novelGene_146143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTAATCTCCAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223932	225731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_223900_225700
922341	contig_3832_pilon	+	2638	1	Intergenic	novelGene_161488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484257	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484300_486900
922342	contig_17926_pilon	-	2156	2	Intergenic	novelGene_179044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGGGGGGGGAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115769	113332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17926_pilon_-_113533_113813
922343	contig_3469_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_34204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	10	CCTGACCCACTCCTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531300_533600
922344	contig_6710_pilon	-	565	2	Intergenic	novelGene_94203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	222	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	657511	653562	FALSE	5	CACCTGTGGTTTTGCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657511	653356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
922345	contig_5136_pilon	-	1739	3	Intergenic	novelGene_126620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	413	junction_1	141.5	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	513	827	224642	220806	FALSE	45	AAAAAAATGAGGCCCGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREQLTEKEEEIVDWWSKFYASTGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYDCELEKVTEFEGLTDFSETFKLHRGKSDENDDPSVVGEFKVSKMCCLSCLRFTFIFFMYLG	225154	219893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_-_220998_223324_223424_224618
922347	contig_10196_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_132023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	395	793	307351	306953	NA	60	AAAGAAAAAAAGGAGAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPEVLTVGHAGPEEVAACYWEFLFLLNANAAAPALAQQAGGCSHPADGGAWFRVEVRILWPTRLFSHIKFYWSVATPTPVQLLLLWEGSVEKSHRMPVQPTAFAMWPLPEHACRPRVRGAWWRSGWPRAV	307745	306108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_306100_307700
922348	contig_10399_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_114482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTTGGTGATAGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220295	218039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_-_218000_220300
922349	contig_3095_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_75092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3276.68262118869	920	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	58	822	147241	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147183	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151167_151848
922350	contig_14536_pilon	+	4028	3	Intergenic	novelGene_69270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2294	2602	23635	23943	FALSE	35	TAATGAGATAATCCTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTALLRRSRIPGRQWIGKHRRPRTVSFHAKQNMIRRLEIEAENHYWLSMPYLTAEQEYGHAAIRRAETFAAIKASSTSKFPPHRFVVDQLNHLNVTKKWS	15921	25369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_17599_17710_17773_23080
922351	contig_4093_pilon	-	1689	5	Intergenic	novelGene_27633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1603.19727419928	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	65	652	69245	41771	FALSE	20	ACTTTTCAACTACTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTV	72488	40733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41773_45615_45784_46300_46425_68951_69257_72435
922352	contig_17440_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_7548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_900_3000
922353	contig_4418_pilon	+	3374	1	Intergenic	novelGene_98377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1934	2362	802677	803105	NA	15	GCTAGCAAGCGTGCCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASTYEQLILDEGPKSVSWGKDSFFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCIKTNSKWIKDLNIKLKTIKIIEEKIGTMLGALIHGINTIRTISNNAQTPKEKLDNWEFLKIKHAHQKTSPKESKDNLQTGKKFLAMTNSISV	800743	804117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_800700_804100
922354	contig_12414_pilon	-	3971	3	Intergenic	novelGene_59657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	590.5	53	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	48	353	794812	794507	TRUE	70	GACAAAAAAGAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLSHSRGSAPTPRCMAGPHLVAFPREAVQTPNSQLLQAPGAPGCLTLVLRASPRRFGPSRAWAWPPSSPSLVSKERCAGPPSLSAGAGEATPGSRRPALLLAAEPLPEELVRADS	794859	764938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_765876_766737_769074_794161
922355	contig_5018_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_46963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	400	852	342963	342511	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGLCLSLGCAQLCLWQAGTPLAGAGRTEEPRCQLTGQAEVRCGLPQGRHAGMRGRGGQAGRAMVQAFPPSRAEAQLALVPPCKGLVLHITVASQRPSAWGQTHPTGTLVLSFNSQTWDITNPPLGLSFPICHLGMMRYPLHRAAVKIQ	343362	340511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_340500_343400
922356	contig_20753_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_168258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGATCTACTGAAATTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68401	69848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20753_pilon_+_68400_69800
922357	contig_8310_pilon	-	1605	4	Intergenic	novelGene_75587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGTAGTACTCCAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314395	308751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_308855_309223_309319_310953_311031_313065
922358	contig_6576_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_42285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTCTATAAAAAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333135	331406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_331400_333100
922359	contig_11751_pilon	+	2895	2	Intergenic	novelGene_150303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGAGGCGTGGTGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159685	162695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_162332_162446
922360	contig_2414_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_158456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGAGCCTTTTTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149228	152811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_149200_152800
922361	contig_15047_pilon	+	1883	6	Intergenic	novelGene_52162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3061.42317231708	46	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	27	842	2194	4178	TRUE	15	CTGCATCTTTGCTATGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPREHPQRQM	2167	21665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3690_4158_4434_4552_4687_21013
922362	contig_20429_pilon	-	2196	2	Intergenic	novelGene_169239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TATATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75076	70950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_73037_74966
922363	contig_7963_pilon	+	648	1	Intergenic	novelGene_58495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGGAATATGAACCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133300	133948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_133300_133900
922364	scaffold_13553_pilon	+	2027	2	Intergenic	novelGene_73757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAGATTGACTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50864	211587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_+_52288_210983
922365	scaffold_12124_pilon	-	2296	12	Intergenic	novelGene_22091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1055	1402	885431	879139	TRUE	20	TTGTGAAACCTCGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIIGQAPRLLSLSHSLGCPATRLRQLSQTLKGGVALFAQGSNTLAFLHPPSHTSARPLHPKTPGWAPAAPRLPKVAQVVLASDPCRVRPGIHKLVGVFVYHSVLLWQAFTLYI	895497	860102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_860363_867258_867353_872360_872476_877122_877264_877339_877520_879034_879169_883674_883808_884852_884987_885380_885481_894076_894146_894277_894710_894993
922366	contig_10302_pilon	-	2865	3	Intergenic	novelGene_175203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.5	88	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	98	373	51744	44894	FALSE	30	CAATCAATTCTTCATACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FDKYNLHKEGNSQYSQQLSKKLRTSNSWADFSMEPITPALAETYRCCGFHSHSPYEWSAPSPPVELMVTGTPTCTCLSPTETSTKTGPSSKRTRGGYLCPVEPLDPHTEKSHTNFPESQVLIT	51841	42401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10302_pilon_-_45007_49032_49084_51632
922367	contig_5047_pilon	+	1256	5	Intergenic	novelGene_158006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	8.13557004763649	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1	570	1488757	1530212	FALSE	55	GAAAAGAAAACCGTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPGFTGDYCETEIDLCYSSPCGAHGRCRSREGGYTCECLEDYTGEHCEVNVRSGRCANGVCKNGGTCVNLLIGGFHCVCPPGEYEKPYCEVTTRSFPPQSFVTFRGLRQRFHFTISLTFATQERNALLLYNGRFNEKHDFIALEIVGEQVQLTFSAGETTTTVAPQVPGGVSDGRWHSVQVQYHNKFVA	1488756	1530898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1488887_1517841_1518065_1524884_1525001_1527507_1527597_1530200
922368	contig_14666_pilon	+	708	4	Intergenic	novelGene_39618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	59	502	477340	485014	FALSE	40	GCTCCCTTTATTAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVRVPTDSRCQGGSGGRRRGRGVGGGRARRPATLTGEKLQGRCHQLEGGHSHFRKSFS	477281	485220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483310_484840
922369	contig_5718_pilon	+	2160	9	Intergenic	novelGene_110447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	86.7337881105167	10	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1	759	1617860	1624817	TRUE	25	GAAGCCTGTGAGCAGCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASEEHNSPTEAPQPAVEDEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIVIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTVEKLQQYYLFIPSKFKHL	1617859	1626802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1617947_1618678_1618773_1622481_1622671_1622890_1622963_1623157_1623277_1623868_1623941_1624078_1624196_1624808_1624894_1625477
922371	contig_12624_pilon	-	3852	13	Intergenic	novelGene_61015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850487	822675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_824825_832954_833128_834319_834392_835163_835314_835984_836121_840053_840219_840544_840701_842126_842199_843401_843462_846472_846593_847461_847751_849706_849852_850322
922372	contig_5023_pilon	+	2614	15	Intergenic	novelGene_7326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1584.36212620057	4	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	238	1698	611764	647385	FALSE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFRTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGASDKPVSLFESQEIWMVYKSSLITRNFPQNWGPKCHQFLCFPPGRSSLFLTVGFGLVLELTHL	607252	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607323_609638_609725_611682_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625784_629227_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_646890_647194
922373	contig_5602_pilon	+	10371	58	Intergenic	novelGene_133023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	565	79	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2306	2716	532460	536876	TRUE	10	CTCGGTGCCCGGCAGCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIFSTIDQNQRLNCKSFSAFSPDSSLKEVKLISICTLTSPQPFTKSLKSSAVKSSNEFFGSTSSRPFLIACNGCSATTNILCSAYFRTYSYTFWGVTGIFTPLGMSSTCPPPSSLHKSIANAKSIAEKTASASEL	527497	690038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_529782_532438_532526_533904_534050_535766_535880_536789_536942_538826_539008_541140_541202_544244_544376_545525_545672_546195_546307_548650_548899_551218_551316_551403_551527_553167_553385_554336_554453_554548_554720_555886_555960_556440_556676_557873_558086_558257_558522_559101_559365_559844_559977_561092_561204_561804_561933_564613_564852_564972_565134_569654_569785_569872_570000_570080_570199_570297_570446_571872_571964_572456_572607_573601_573699_576730_576858_577227_577322_577772_577925_581949_582077_583029_583243_586025_586221_586472_586627_586888_587001_587097_587242_588587_588726_591624_591738_594331_594514_597780_597900_598783_598938_600294_600408_600487_600604_610158_610375_612157_612306_612901_613061_613245_613437_620308_620427_622160_622245_622711_622791_623148_623192_690019
922374	contig_7138_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_120975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTACCACATGCTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100047	96443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_96400_1e+05
922375	contig_10734_pilon	-	3896	1	Intergenic	novelGene_51536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	345	701	2304848	2304492	NA	30	CCCCAAGCAGTCAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFSWPAGLEEVAPDSCRKKPWRRVKERGLRVTSLLYSRPARGAEQGMPKEDGKTQGNTLDSWGGGWEFRACLMRMLVSESLPLRGRESDQLVNGNCRSSMSGRFVSGGFLFVCFVLF	2305192	2301296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2301300_2305200
922376	contig_10904_pilon	-	1979	1	Intergenic	novelGene_22700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	1084	1443	620456	620097	NA	30	TCTGGACAGAGCTGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNMFYQSRKKLIPKSDKKTIKHENLSHKLRCMFLKNVHTPMFMAALFTIAIRWKQPRSPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNDESVNHLITWTKPEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	621539	619560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_619600_621500
922378	contig_5316_pilon	-	1980	9	Intergenic	novelGene_61241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1216	1566	540920	511588	TRUE	25	AAATTATGTATTTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGGDFACIFLFKLPGETSRPGEFRGLPYPFPALVPAPDARSPPIRPPVLPALGGRCVTPGDILFLCREGWASGKRLGFPSELTGLLYTKLLWLDTGMETGISKLGGGTAYTIFAC	551008	453885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_453969_474049_474255_511461_511608_521314_521502_523561_523610_540824_540999_543404_543535_544131_544215_550084
922379	contig_18173_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_160762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTGACCCAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30570	32507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_30600_32500
922380	contig_2033_pilon	+	2375	1	Intergenic	novelGene_71534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCATTGTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130665	133040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_130700_133000
922381	contig_8312_pilon	-	3461	2	Intergenic	novelGene_152891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTTCCTGAAGCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277263	273628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_275047_275220
922382	contig_8167_pilon	+	2476	2	Intergenic	novelGene_155641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	115	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAGATTATACAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47612	68468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_+_49321_67700
922383	contig_4486_pilon	-	443	1	Intergenic	novelGene_38609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363355	362912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_362900_363400
922384	contig_13941_pilon	-	5576	7	Intergenic	novelGene_174660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	30.0444115713167	99	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	477	1769	80616	71896	TRUE	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEAVLLDLFGLKLNSQKNCHQMLLKALNAVRYHHTANAKFFCIMCCSNISSETDGECGNCELEINNGLSALLRKFETVSNSSMVASLYTIKQKIDEKNLSSIKVIVPVYRKTLMKAFIDQLFTDVYSFEFEDLQMTLQGGLLKQSNEINMITAQELEEIQNEVETYLRSLPPLKGELTIITSPSIPDIFIHGFTTRTGGISYLPTLSSLNLFSSSKRRDPKAVVQENLRRLANAAGFNAEKFYRIKTDHANDVWIMGRKEPESYDGITTNQRGVTIAALGADCIPIVFADPVKKACGVAHSGWKGTLLGVAMATVNAMIAEYGCSLEDIIVVLGPSVGPCCFTLPKESATAFHNLDPKCVRLFDSPDPSIDIRKATRVLLERGGILPQNIQDQDQDLSLCTSCHPNKFFSHVRDGLSFGTQIGFISIRE	81854	58593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13941_pilon_-_62400_71894_72056_73176_73403_75441_75608_76586_76766_80054_80671_81432
922385	contig_5649_pilon	-	3193	15	Intergenic	novelGene_82291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2493	2846	153515	149907	TRUE	30	CCTTCTGCCCAAAGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGIVSKTEDLWIYKGMLNEGELAFCVFPRSIYEVYREHFHSQTSLNTINHIMKSFTVTNLKSRMVQFISYFLEIQTWVQFFENINQDFYIPCMCLCSITFIFPITPDATSRSRDTL	169621	147639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_147695_148625_148795_149783_149911_150059_150172_152883_153052_153445_153577_154086_154327_156609_156730_157503_157628_157819_157970_164096_164248_165469_165672_166772_166922_168032_168156_168449
922386	contig_8674_pilon	+	2644	1	Intergenic	novelGene_102904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	298	651	173785	174138	NA	5	TTTCGGCATTTTGTTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISVFWILLRVALWPKMWSVLENVPWALEKNVYFAAVGYSVLYMSMRLSWLIVSFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTITVELSISLSVLLELFMYFGALSLGV	173487	176131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_173500_176100
922387	contig_3077_pilon	+	1501	9	Intergenic	novelGene_26752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3606.00975586243	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	376	1008	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTPGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	11314	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16233_16283_16328_16936_17054_17449
922388	contig_8044_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_132370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTACTGTGCATATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358185	357028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_357000_358200
922389	contig_10437_pilon	+	1453	9	Intergenic	novelGene_38292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	898.046621493005	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	51	1178	431167	451431	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPYPGGVVVKSSAANQKVGSLNPPGTPWKPCWAVLLCPVGSL	431116	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075_451159_451309
922390	contig_4469_pilon	+	3459	23	Intergenic	novelGene_21897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	97.0199029593822	46	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1149	3447	11	3457	405954	518167	FALSE	45	AAAGAATGTAGCACTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQTMEFVEEYLRDVVCQRFPFSDKEKNKLTFEVVNLARNLIYFGFYNFSDLLRLTKILLAILDCVHVTTIFPISKMAKGEESKGSNVMRSIHGVGELMTQVVLRGGGFLPMAPMAAAPEGNVKQAEPEKEDIMVMDTKLKIIEILQFILNVRLDYRISCLLCIFKREFDESNSQTSETSSGSSSQEGPSNVPGALDFEHIEEQAEGIFGGSEENTPLDLDDHGGRTFLRVLLHLTMHDYPPLVSGALQLLFRHFSQRQEVLQAFKQVQLLVTSQDVDNYKQIKQDLDQLRSIVEKSELWVYKGQGPDEVMNGASGGNEHKKTEQGNNKSQKHESTSSYNYRVVKEILIRLSKLCVQESASVRKSRKQQQRLLRNMGAHAVVLELLQIPYEKAEDTKMQEIMRLAHEFLQNFCAGNQQNQALLHKHINLFLNPGILEAVTMQHIFMNNFQLCSEINERVVQHFVHCIETHGRNVQYIKFLQTIVKAEGKFIKKCQDMVMAELVNSGEDVLVFYNDRASFQTLIQMMRSERDRMDENSPLMYHIHLVELLAVCTEGKNVYTEIKCNSLLPLDDIVRVVTHEDCIPEVKIAYINFLNHCYVDTEVEMKEIYTSNHMWKLFENFLVDICRACNNTSDRKHADSILEKYVTEIVMSIVTTFFSSPFSDQSTTLQTRQPVFVQLLQGVFRVYHCNWLMPSQKASVESCIRVLSDVAKSRAIAIPVDLDSQVNNLFLKSHNIVQKTAMNWRLSVRNAARRDSVLAASRDYRNIIERLQDIVSALEDRLRPLVQAELSVLVDVLHRPELLFPENTDARRKCESGGFICKLIKHTKQLLEENEEKLCIKVLQTLREMMTKDRGYGEKGEALRQILVNRYYGNVRPSGRRESLTSFGNGPLSPGGPSKPGGGGGGSGSGSVSRGEMSLAEVQCHLDKEGASNLVIDLIMNASSDRVFHESILLAIALLEGGNTTIQHSFFCRLTEDKKSEKFFKVFYDRMKVAQQEIKATVTVNTSDLGNKKKDDETDRDAPSRKKAKEPSTQITEEVRDQLLEASAATRKAFTTFRREADPDDHYQSGEGTQATTDKTKDDLEMSAVITIMQPILRFLQLLCENHNRDLQNFLRCQNNKTNYNLVCETLQFLDCICGSTTGGLGLLGLYIN	405943	518169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_406041_406849_407004_408863_409052_409966_410106_410774_410830_413608_413775_413850_414022_414724_414791_415614_415753_417867_417994_421055_421257_423552_423805_426386_426513_428316_428446_432995_433117_435295_435481_439771_439921_440840_440953_462579_462713_465134_465326_507706_507888_510929_511184_518044
922391	contig_10948_pilon	+	2565	1	Intergenic	novelGene_124959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAATGAAAAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22408	24973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_22400_25000
922392	contig_1275_pilon	+	8513	17	Intergenic	novelGene_108731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGATTTCTTTCCTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333546	371464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_338262_339757_339941_342543_342757_343259_343317_350095_350240_351961_352100_355195_355421_355599_355761_356170_356298_359071_359568_359777_359944_363605_363713_364055_364216_364698_364910_367967_368193_369970_370327_370635
922393	contig_10904_pilon	-	1434	5	Intergenic	novelGene_22761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	304.349613931084	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	164	1027	662171	658096	FALSE	45	CAGGAATACACAGACACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSDSYFIHSML	662423	657688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_658125_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310
922394	contig_34_pilon	-	5328	7	Intergenic	novelGene_39989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	531.392405750109	72	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	3941	5056	230337	212049	FALSE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247105	211776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214
922395	contig_9895_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_144715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1798	2220	518846	518424	NA	65	AGAAACAGAAGCCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLGDFLLVCILYGNGQLFVFHDIREVFCQQFFRDPLCVFLGIFRNYILCLLIVDLFMSSCFFFFWLCLGMPAGHSLLCVSTIFLTTLSRWAGLVAQLWCSKAGPAEREGKDGLFAATQFYAESYREVSSGLHLCRSGL	520643	518344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_518300_520600
922396	contig_8447_pilon	+	917	6	Intergenic	novelGene_69454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	243	junction_1	25.3881862290318	8	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	2	541	236181	243137	TRUE	20	TGCACCTTGGTCTCATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR	236179	266722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_236250_238722_238842_240840_240952_241861_241941_242975_243163_266371
922397	contig_1348_pilon	-	3134	1	Intergenic	novelGene_174376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1507	1875	611164	610796	NA	35	CATTTGGTAAGAGTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSVGKENGTGSIKRKWKEYTESLYQKELVDVLPFQKVVYDQEPMVLKEEVQAALKVLAKNKSPGIDRIPTEMFQQKDATLETLISAKKFERQLLGQPTGRDPYLRPFQRKMIQRNAEVIK	612670	609536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_609500_612700
922398	contig_8260_pilon	+	3361	1	Intergenic	novelGene_163238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGACATGTCCCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110580	113941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_110600_113900
922399	contig_3394_pilon	-	4201	1	Intergenic	novelGene_152665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATAGACTTCCACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359735	355534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_-_355500_359700
922400	contig_5791_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_35832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTTCATGTGAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020105	1022467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1021978_1022367
922401	contig_4783_pilon	+	508	1	Intergenic	novelGene_108398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259931	260439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_259900_260400
922402	contig_17936_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_29962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	261	786	941	1726	83451	84236	NA	40	GCAACAACAAGTCAGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTGNKSTTSVERDNGESQSSVRTRPGADCGTDHQLLICKFKLKLKKINTSPREPKYDLEYIPSEFRDHLKNRFDALNTNNQQRPDELCDGIKDIILEDCKRSLKRQERKKRQKWMSEETLKLALERRVAKVNGRNDEVKELNRRFERAAQEDKLKYYNDICKDLEVENQKNMLGISQAERTEEKIQALSCNMEDSAGKILNYARSIKRRWKEYTESLYQRELVNIPPFQEIAYDQEPMVLKEEVQVALKALAKKQGFRN	82510	85654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_82500_85700
922403	contig_11363_pilon	+	1763	2	Intergenic	novelGene_160483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	429	1073	139185	139829	TRUE	70	AAAAAAGAAGAAAGGGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQETDREQRVRSDTCRGPLSATAARSRHLGLLSEISEQGVRESSLTELPAGDKTTGYQQYTLSQPPHFFTSTRPPLLPAATVFLAGKHRLHPGFNWIPLACTGRLPKCHLLAAGVAFFCFFRFIPYLSPPPPHFSQIPGSMHHLCFFLKACETQFKCKTASRPVLPHWWDPGLFLFVLNCLFICFLFLFSNWEPILAGKYCVAWDLLPQVAQT	138756	142827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11363_pilon_+_140426_142733
922404	contig_10300_pilon	+	2727	1	Intergenic	novelGene_152924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGTATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61746	64473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10300_pilon_+_61700_64500
922406	contig_9415_pilon	-	1729	1	Intergenic	novelGene_109789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1672251	1670522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_1670500_1672300
922407	contig_11548_pilon	+	1661	5	Intergenic	novelGene_66773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	227	817	112832	119638	FALSE	10	TACGCTGTTCATTGGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112605	120482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
922408	contig_11816_pilon	-	2267	2	Intergenic	novelGene_98547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTTAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1085709	1083085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1083772_1084128
922410	contig_15866_pilon	-	1750	1	Intergenic	novelGene_63654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACTAAGACAGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539721	537971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_538000_539700
922411	contig_6270_pilon	-	2715	1	Intergenic	novelGene_99849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427472	424757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_424800_427500
922412	contig_10451_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_138318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATATTTTCAAGTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263999	262014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_262000_264000
922413	contig_5260_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_144348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAACCCACCCTCCCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76563	74944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_74900_76600
922414	contig_11285_pilon	-	2626	1	Intergenic	novelGene_5721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTCAGCAGCTCAGCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841435	838809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_838800_841400
922415	contig_9127_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_102991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGAGATTTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752	2785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_+_800_2800
922416	contig_498_pilon	-	1720	1	Intergenic	novelGene_148547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	527	1584	110	1693	4446	2863	NA	55	GAAAAACTATATTCCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSRGLSKTKRNTTGNQKSQSMDDNNIKTMKEGINGIGKARLYQVRVDCFKLRKIRVKFMVTTKKVNKPTHKNKDENHEVSAKTKPTKTKEMITKSTNKSNSAQESKKNKENFSTTKKKHYKMTAINSHLSIITLNVNGLNAPIKRWRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYRKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNTEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENETTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLMTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNETGDITTDPT	4555	2835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_498_pilon_-_2800_4600
922417	contig_7870_pilon	+	5967	1	Intergenic	novelGene_109066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCCCCTTTATAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693802	699769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_693800_699800
922418	contig_10892_pilon	+	1145	1	Intergenic	novelGene_116757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATCTCACCCCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172172	173317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_172200_173300
922419	contig_3601_pilon	-	4805	1	Intergenic	novelGene_132975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGAACGTAGCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1156605	1151800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1151800_1156600
922420	contig_5238_pilon	-	3751	6	Intergenic	novelGene_176260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5667	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	590	913	91268	90945	TRUE	50	TCAAGAAAGTTGCGCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNFPRPHSHTGGIPGSFAFLFLIFIHLFLLLFAFLHFIVSDLSTPVASSPTTLFGLYVFGSHSSLLSPIPILPHTSVSPLHPAYLHHALSITSPSSPGMAYRNLP	218835	74240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5238_pilon_-_76339_84853_85398_90748_91423_218117_218346_218577_218669_218719
922421	contig_10962_pilon	-	6432	42	Intergenic	novelGene_103888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.77663404307467	107	63	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	5236	5883	359078	332119	TRUE	5	CCCACCCCCCCCGGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPATELEAAAPWGVSSVRAAEELTVSWLLSGSAIFSCRRASAAPLLPRPEPRRLVLAQEPVVFWRVLRLKLGSSAGGDSLRFLVDFLKLANLACNPEGPGFDVSDLEDLCSFSLLLLLGLGLDAERERLALFWSFPCFTLAPGGTVEEAEATAEDEEEVDAAEESVMVLHPALAEAADFEASLVGFADLSSAPVDSDTEPLFIQELSVLFLF	412724	274043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_274104_311716_311865_331777_332433_332519_332580_349883_349988_353010_353148_359045_359130_360525_360624_363978_364126_367075_367114_367199_367294_368181_368276_368468_368640_370203_370267_370355_370533_373251_373371_373497_373654_375751_375905_377158_377388_377697_377815_380487_380702_383698_383799_384041_384217_385566_385708_386639_386835_388074_388225_390865_391039_391446_391520_391600_391803_392234_392363_393690_393842_394534_394677_396322_396482_397805_397903_401833_401949_402635_402792_403810_403972_407187_407358_408898_409013_410807_410900_411423_411529_412209
922422	contig_9673_pilon	+	2742	1	Intergenic	novelGene_119180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTGTTTGTAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171959	174701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9673_pilon_+_172000_174700
922423	contig_9656_pilon	+	1732	2	Intergenic	novelGene_121934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440008	441906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9656_pilon_+_441016_441181
922424	contig_3956_pilon	+	2946	14	Intergenic	novelGene_14897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1349.887994477	6	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1051	2427	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1284089_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286228_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
922425	contig_2323_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_151848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTCTTAGAGTCAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100789	98591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_98600_100800
922426	contig_19640_pilon	-	2623	1	Intergenic	novelGene_134857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACCTTAAATTTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46586	43963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_44000_46600
922427	contig_21006_pilon	-	1668	1	Intergenic	novelGene_177723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26066	24398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_24400_26100
922428	contig_9415_pilon	-	4880	24	Intergenic	novelGene_109896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_18	335.333431672083	847	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1319	3957	923	4879	2117718	2080489	FALSE	15	ACCGCACAGGTGTGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGAGSGVRTDDPPPQSQQERRLSTELPEGQDVYTAACNSVIHRCALLILGVSPVIHELQKRREEGQMQQPSTSASEGGGLMARSESLTAESRLVHASPNYRLVKSRSESDLSQPESDEEGYALSGRRNVDLDLASTHRKRGPMHSQLESLSDSWARLKHSRDWLCSSYSFESDFDLTKSLGVHTLTENVVSFVSGDVGNAPGFKEPEESMSTSPQASIIAMEQQQLRAELRLEALHQILVLLSGMEEKGSVSQAGSRSSSGFQSSALLTSVRLQFLAGCFGLGTVGHAGASGESGRLHHYQDGIRAAKRNIQIEIQVAVHKIYQQLSATLERALQANKHHIEAQQRLLLVTVFALSVHYQPVDVSLAISTGLLNVLSQLCGTDTMLGQPLQLLPKTGVSQLSTALKVASTRLLQILAITTGTYADKLSPKVVQSLLDLLCSQLKNLLSQAGVLLMASFGEEEGEEGEEEEKKVDSSGETEKRDFRAALRKQHAAELRLGDFLVFLRRVVSSKAIQSKMASPKWTEVLLNIASQKCSSGTPLVGNLRTRLLALHVLEAVLPACESGVEDDQMAQVVERLFSLLSDCMWETPIAQAKHAIQIKEKEQDIKLQQGELEEEDENLPIQEVSFDPEKAQCCLVENGQILTHGSGGKGYGLASTGVTSGCYQWKFYIVKENRGNEGTCVGVSRWPVHDFNHRTTSDMWLYRAYSGNLYHNGEQTLTLSSFTQGDFITCVLDMEARTISFGKNGEEPKLAFEDVDAAELYPCVMFYSSNPGEKVKICDMQMRGTPRDLLPGDPICSPVAAVLAEATIQLIRILHRTDRWTYCINKKMMERLHKIKICIKESGQKLKKSRSVQSREENEMREEKEGKEEEKGKHSRHGLADLSEPQLRTLCIEVWPVLAVIGGVDAGLRVGGRCVHKQTGRHATLLGVVKEGSTSAKVQWDEAEITISDTPLYNLEPCEPLPFDVARFRGLTASVLLDLTYLTGIHEDMGKQSTKRHEKKHRHESEEKGEVEQKTESDSALDARTGLMSDDVKSQGTTSSKSENEVSSCSLDPTLSGVEPQHQITEGKRKNHEHMSKNHDIAQSEIRAVQLSYLYLGAMKSLSALLGCSKYAELLLIPKVLAENGHNSDCASSPVVHEDVEMRAALQFLMRHMVKRAVMRSPIKRALGLADLERAQAVVYKLVVHGLLEDQFGGKIKQEIDQQAEEGDQAQQAQTPVTTSPSASSTTSFMSSSLEDTTTATTPVTDTETVPASESPGVMPLSLLRQMFSSYPTTTVLPTRRAQTPPISSLPTSPSDEVGRRQSLTSPDSQSARPA	2130599	2080487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2080640_2082731_2082931_2084479_2085232_2087133_2087655_2088413_2088498_2088871_2089112_2090092_2090267_2095490_2095602_2096123_2096231_2097574_2097731_2100494_2100689_2100838_2101077_2101310_2101432_2102071_2102288_2104060_2104327_2111369_2111422_2116865_2116987_2117464_2117778_2120478_2120601_2122307_2122429_2122516_2122632_2125823_2125998_2127864_2128087_2130490
922429	contig_8241_pilon	+	1492	1	Intergenic	novelGene_157497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAATGTGCTTTGCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607326	608818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8241_pilon_+_607300_608800
922430	contig_6446_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_149236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCACTTGTCATACTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495571	497744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_495600_497700
922431	contig_7293_pilon	+	257	3	Intergenic	novelGene_54264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATCAGGAAGCTTTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335737	336424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
922432	contig_15045_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_130061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCCATGATGCACTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155233	153070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15045_pilon_-_153100_155200
922433	contig_1472_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_86145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	1175	1573	755852	755454	NA	25	AGGTCGGCAGTTTGAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWLACKGQGKFRAKKDMSWKDTVLLMITLAPKAPRLSPIQSHVYRELCCRYPPHHSPLPPPKQEVMEKIISIPWPLLCSPVGRNIVTDTMCDLVPATGRWLFNFPDQRAEWSCSLIEGNGLTQWLQQWAQT	757026	755304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_755300_757000
922434	contig_7568_pilon	-	4721	2	Intergenic	novelGene_174005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	204	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTTGACTACCATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88422	74785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_77880_86795
922435	contig_8628_pilon	-	1243	1	Intergenic	novelGene_164442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	864	1235	661413	661042	NA	55	CACGAAATATATGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLLSYMNTLQAFDQDNVMEEISGKMIHTARTLNLEVDIANVEQLIDHKEGELTDQDFRDSEEERNAEEERNNEEEEKLSKNFTVKGLGGVFPKLISGFSYLKTQSQTQITLLKLKGRFGKQ	662276	661033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_661000_662300
922436	contig_14467_pilon	-	3297	1	Intergenic	novelGene_138228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	77	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137784	134487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_-_134500_137800
922437	contig_5419_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_15506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCAAATAACTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241044	242432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_241000_242400
922438	contig_10734_pilon	-	824	1	Intergenic	novelGene_51426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGAATTTCTTTTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2132638	2131814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2131800_2132600
922439	contig_762_pilon	-	1810	1	Intergenic	novelGene_135951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTCTACCATACAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263742	261932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_-_261900_263700
922440	contig_14501_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_172026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACAATTAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81138	83087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_81100_83100
922441	contig_1847_pilon	-	5918	5	Intergenic	novelGene_171731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_4	14.7139389695622	128	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	228	1325	120877	103027	FALSE	40	ATCAACAGTCTTTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIIETAKLEEHMENQTNDPTSTYTRPAEPVEEENKNGNGKPKSLSNGLRKGTKKYPDYIQIAMPTESRNKFPLEWWKTGIAFVYALFNLVLTTVMITVVHERVPPKELSPPLPDKFFDYIDRVKWAFSVSEINGIILVGLWITQWLFLRYKSIVGRRFFFIIGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFQCAPKLNGNSQAKVERILRLISGGGLSITGSHILCGDFLFSGHTVVLTLTYLFIKEYSPRHFWWYHLICWLLSAAGIICILVAHEHYTVDVIIAYYITTRLFWWYHSMANEKNLKVSSQTNFLSRAWWFPIFYFFEKNVQGSIPCCFSWPLSWPPGCFKSSCKKYSRVQKMGEDNEKST	121104	98433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_103231_104734_104902_110653_110808_115738_115857_120422
922442	contig_4426_pilon	-	2815	1	Intergenic	novelGene_15426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	388	1164	1650	2813	821767	820604	NA	65	GGAAGAAAAAAAAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKLKHKEREKEKHRKEMEGEKEKYKNKDGAKELQRNVEFDREFWKENFFKSDETEDLFLSMEHETLTFEKKLKLEKNIKDDKSTKEKHISKERTFKEEREKIKKESEKSF	823416	820601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_820600_823400
922443	contig_16098_pilon	-	2926	2	Intergenic	novelGene_45917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGCCCTGGTGGCACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301818	298763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_301503_301631
922444	contig_10377_pilon	+	2567	4	Intergenic	novelGene_115339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.3525935187666	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	81	1715	19325	22862	FALSE	30	TGATACACGTTGTAACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDVAVVFSQEEWALLNLTQRKLYRDVMIQTFRNLASVVSQNLKDGEKLSSEVIMVQYMKNNTWSSALGEISQSHGNKDHHKNQERHLRSHTVENICETNEGNQCEKTFSQVPNLTVLKGNHTEVNPFECSECGKVFTDPSSHNCHTRYHNGCNTCQFIACGEACSCTTPMRTLNGTKPHNCGVCGNDLVCISTIKNPVTILTGEKHYNCNEYGKDFYSFSSFWTHVRGHKSECKECCKTYSHSLSLILHNRDKPYEYWECGKAFSEASSLTQHVTTHRGERPYKCKRCGKTFSQSSHLSNHIKTHNKHRPYECKECGKAVSQASTLTRHITTHTGERPYECKECGKAFSWPSRLTAHMRTHSGEKPYECKECGRAFRWPSQLATHMRTHSEERPYECKECGKAFRQSSHLINHVRTHNGQRPYECKECGKAFSQASTLTTHVTTHSGERPYQCKECGKAFRYFASSLTTHIRTHNGERPYECKQCGKAFSQASSLTKHIRTHSGGRPYECKECGKASSCCSELTSLRGTRSGERPYECKERVKAFRHSHLTSHVRSHSGETAVSKEIFHP	19244	23714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_19359_20190_20342_21163_22290_22538
922445	contig_11548_pilon	+	1626	5	Intergenic	novelGene_66777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	197	787	112832	119638	FALSE	20	ACCATTACGCTGTTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112635	120477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
922446	contig_13021_pilon	-	3469	11	Intergenic	novelGene_8140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCGGCCGCCTCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180959	174506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_180209_180438
922447	contig_4470_pilon	-	2605	2	Intergenic	novelGene_171772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTTAAAGAGGTCTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240332	224273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_-_224303_237756
922448	contig_12427_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_40413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTTATTAAAGCCGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206921	208044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_206900_208000
922449	contig_5779_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_106512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATGGAAGCATACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249398	247266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_247300_249400
922450	contig_15031_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_138397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71533	69830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_-_69800_71500
922451	contig_6228_pilon	-	2962	2	Intergenic	novelGene_164519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	133	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570243	566324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_568485_569441
922452	contig_7188_pilon	-	2850	1	Intergenic	novelGene_108522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	334	633	55280	54981	NA	65	GTTAGAATGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAYAVEMGPHGERHSKSVDPLCLCLGKGPVPTLGSWLRGASSLFFPFVNLFTLQGRENGSRRVTDPTSSPEELAIAEANLGPSAEQGAVEVNGREVFP	55613	52763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_52800_55600
922453	contig_13226_pilon	+	2653	1	Intergenic	novelGene_175340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149955	152608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13226_pilon_+_150000_152600
922454	contig_11961_pilon	-	3718	2	Intergenic	novelGene_153689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACAAGAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96473	92626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_96156_96284
922455	contig_14933_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_165046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACTGTAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42025	40654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14933_pilon_-_40700_42000
922456	contig_6847_pilon	-	1500	8	Intergenic	novelGene_143854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTCGACTCCCCTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101586	74054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_74106_77514_77988_81026_81090_82020_82125_96728_96859_98608_98756_99886_99982_101149
922457	contig_17144_pilon	-	1845	11	Intergenic	novelGene_29553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2353.06022234876	18	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	145	825	179764	174565	TRUE	15	CTCTTAAACTGTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLGG	183226	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166306_166425_166823_168190_168310_168996_169099_170744_170934_174558_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
922458	contig_9653_pilon	-	3196	5	Intergenic	novelGene_48224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_4	294.95974301589	36	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	108	629	529435	527395	FALSE	75	GCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNVRIL	531441	524827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_527624_528640_528763_529027_529193_529429_529511_531409
922459	contig_3956_pilon	+	2517	12	Intergenic	novelGene_14909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1168.00275953484	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	83	730	1281682	1286416	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281599	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284224_1286151_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288032_1288986_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
922460	contig_4079_pilon	-	4620	1	Intergenic	novelGene_167471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	92	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	2529	3038	118008	117499	NA	10	ACCCTCTTTATGCTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVEDSKAKLFQRGLSQLRENENNNYSNLILDFYIWALTLAIRPKDLQYSVSSGDLSALFPTLQRQSTALYPIISNAQVLFLFIYLFSGVYEVGGYAPRSWHYVEGRRCSWQNALTKLSNYRVDFLYLGTLDSVQGTRGIGFHSLFGHAGRFLFLFFLREDLVFWHIT	120536	115916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4079_pilon_-_115900_120500
922461	contig_19604_pilon	-	1964	3	Intergenic	novelGene_77255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	516	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1651	1953	274123	273562	FALSE	20	GTCTGGAAGTCACATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLWGRHVQESRGKWSRDSPAVPGGGKGSGAQQTHACTPRVPGQCSGQGQGLGQADPKPGLGTGIGVVTDSDEPQDAGELLLHRLVLDGDQPLLMGLDRG	275816	273550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_273577_273835_274841_274883
922462	contig_12709_pilon	-	3072	2	Intergenic	novelGene_147414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1360	1677	126763	126446	TRUE	10	TTCCCCAGTATTCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMCSISFLTTSNFPRFILCTFHFLIINGYLQLFLLILSRATSANEGPESLTPSMSLRSTLTLRRQLFPSHILSAFPPEDLIFWHYIRQCSVAIHNIFIGQFFQR	128122	53388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_-_54626_126287
922463	contig_13565_pilon	-	3482	2	Intergenic	novelGene_162375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	97	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCTTTCCCTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105979	102442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13565_pilon_-_103631_103685
922464	contig_10793_pilon	-	1445	1	Intergenic	novelGene_83418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTACCTCTTCAACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133395	131950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_132000_133400
922465	contig_14536_pilon	-	2092	12	Intergenic	novelGene_69283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	191.926811119359	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	279	1166	87977	56449	TRUE	55	GTTAAAAAAAAAATTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIFTSPASPSKEFYLSNSEKERYEKEFSQERQQEILRRAARDLPIYTTSASRTIRYCERCQLIKPDRAHHCSACDICILKMDHHCPWVNNCVGFSNYKFFLLFLLYSLLYCLFVATTVLQYFIKFWTNELSDTRAKFHVLFLFFVSAMFFISVLSLFSYHCWLVGKNRTTIESFRAPAFSYGPDGNGFSLGYSKNWREVFGDEKKYWLLPVFSSLGDGCSFPTRLVGMDPEQASVTSQNEYARSIGSNPPFPIKPLSESKNRLLDSESQWTETGSEEGIVRSGTNNHVTVTIEN	137783	54091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_54978_56408_56487_57556_57673_59109_59200_67398_67526_71128_71262_81219_81341_81777_81811_83271_83342_83964_84086_87938_88043_137570
922466	contig_9484_pilon	+	1942	1	Intergenic	novelGene_105676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164857	166799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_164900_166800
922468	contig_11175_pilon	+	4318	39	Intergenic	novelGene_61180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	32	junction_1	47.1992886936402	80	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1332	3996	321	4316	307110	371481	FALSE	35	CACTGGTCTAATAGAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKAVLKQEKNNYNAWVFIGVAAAELEQPDQAQGAYKKAAELEPDQLLAWQGLASLYEKCNHINAKDDLPGVYQKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHVEVARTWHKLIKTRQEEGADNQELHQLWRKLTQLLAESTEDQNNETQQLLLTAFENALGLSDKIPSEDHQVLYRQFIQCLFKFPHETARLKKACEGMINIYPSVQYPLEVLCLHLIESGSFTDEAQQYCCRLVEMDSRSGPGLIGLGIKALQDKNYEDALKNLTEGLKESPLCTTGWYHLAEAQLKMHRPKEAILSCSQALKNIDNLGVSGGSLHQKNLCLHLKAEALIKLSDYESSEEAIHTLDQVSDANNIPGLLVLRSLACLNKGLLDEATKIMEDLLSSYPDLAEAHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQKALEKDNEVAEYHYQLGLTYWSMGEETRKDKTKAFTHFLKAARLDTYMGKVFCHLGHYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEEMDTALAILTTVTQKASAGTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNCWESLGEAYLSRGGYTTALKSFIKATELNPESTHSVFKVAAIQQILGKYKEAVAQYQLIIKKNEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYVEKALEYFTWALQHRADVSCLWKLVGDACTSLYAVSPSKVNVHVVGVLPGQKEGKQVLKKNELLHLGGRCYGRALKLMSTSNTWCDLGINYYRQAQHLAETGSNMNDLKELLEKSLHCLKKAVRLDSNNHLYWNALGVVACYSGVGNYALAQHCFIKSIQSEQINAVAWTNLGVLYLTNENIEQAHEAFKMAQSLDPSYLMCWIGQALIAETVGSYDTMDLFRHTTELSMHTEGAIGYAYWVCTTLQDKSNRETELYRYNILQMNAIPAAQVVLSKYVERIQDYAPAFTMLGYLNEHLLLKKEAADAYRRAILLLQTSEDQDTYNVTVRNYGRLLCSIGEYDKAIQAFKSTPLEELEDIIGLALALFLKGLYKESSKTYERALSIVESEQDKAHILTALAITEYKQGKMDTAKTLLFKCSILKEPTAESLQALCALGLAMQDVTLSKAALNELLKHIKQKDNGYQRYLLTAAIYALQGHSVAVQRQASKAVHSNPADPALWSLLSRVVAQYTQRNAKGGAVAGNVAHILDSNHGKKALLYTAVNQVAMGSSSAEDEKNIAVKTIQKAALLSPGDPAVWAVLMAACYADDKLALVNNTQPKKMDIYLALLSAISASIKDKEFPENYNQSLEKWSLSQT	297142	371483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_297174_301402_301475_304875_305022_306416_306487_307108_307200_310629_310774_311643_311736_312841_312918_313454_313596_315441_315541_315655_315765_321987_322129_325266_325369_327112_327253_329538_329626_329714_329819_330298_330426_331026_331207_331391_331517_332861_333116_334293_334397_336803_336981_337067_337213_337424_337504_337594_337657_337783_337841_339202_339272_341723_341799_342461_342604_345070_345165_347580_347659_350305_350431_351243_351368_360826_361049_361977_362051_365287_365342_365523_365636_369369_369499_371416
922469	contig_6533_pilon	+	1934	2	Intergenic	novelGene_114635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	758	1123	99127	99492	TRUE	25	TAAGGGGTTAGGTTCCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSVSEILLFIFWISNCCFCIISICEFLLAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSPAGSSSAFSSTGKSSGVVFWMPTGTILSCFCKCFDIVSCLRGIQ	98369	100361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_100202_100259
922470	contig_18889_pilon	-	1035	2	Intergenic	novelGene_167111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	606	920	84903	84589	FALSE	70	CGAAAAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNDTAWLWTDVQFHKCGKEARRTVAAVGWSLLWAVQLATEAQLAAEAHIKSFAERVIVRDVWESCVATTDVLSSRAREPDEQLETLACRFVKMGDPRVRGTIP	85670	84473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18889_pilon_-_85349_85510
922471	contig_6410_pilon	-	4021	5	Intergenic	novelGene_108629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTCACTCTGCCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310523	299814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_299909_300669_300772_301579_301637_306342_306394_306806
922472	contig_5083_pilon	+	2411	2	Intergenic	novelGene_151640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCATGGAAAAAAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206233	234343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_206249_231947
922474	contig_2733_pilon	+	9256	1	Intergenic	novelGene_128562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	315	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578416	587672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_578400_587700
922475	contig_5429_pilon	-	5887	1	Intergenic	novelGene_127781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	1737	2270	119221	118688	NA	60	AAAAAAAAAAACGTTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVQNPHSVIKHLLSPFLFQKMNNLSFSELCCLFCCPPCPGKIASKLAFLPPDPTYTLMCDESGSRWTLHLSERADWQYSSREKDAIECFMTRTSKGNRIACMFVRCSPSAKYTLLFSHGNAVDLGQMSSFYIGLGSRINCNIFSYDYSGYGASSGKPTEKNLYADIEAAWLALRTR	120957	115070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_115100_121000
922476	contig_11096_pilon	+	3670	2	Intergenic	novelGene_143464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_1	0	30	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	83	442	198818	204647	FALSE	45	TCCAAAAGGAGGCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAGAGGRGVGAAGRWERKRLRGGEGARMATPSRRTSTPSSQASKRVLPRDPSSEVPSKRKSSAPSTLPPTPLLPPPLQSSGPFVEGSIVRIAMENFLTYDICEVSPGPNLNMIIGANGTGKSSIVCAICLGLAGKPAFMGRADKVS	198735	207875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_199027_204496
922477	contig_20527_pilon	+	2198	6	Intergenic	novelGene_138568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1158.2056121432	6	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	674	1300	13527	27453	TRUE	45	GAGAATAATAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12853	28713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27607_27968
922478	contig_7025_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_104397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2269	2622	80480	80833	NA	40	AAGTAATTTCCCCAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKTQNSGQWFCVRRRQEDRTRAGYTGCCSSVSNNLGGKLVGGHMGLCFIIRPQNSHMYIYSFVYTKYFITKMIKEYLAIKKKVPGHASQNICILAHAPLTTSPNFESDQSLSSLIK	78211	81019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_+_78200_81000
922479	contig_5947_pilon	+	3124	1	Intergenic	novelGene_101523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAACAAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489961	493085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_490000_493100
922480	contig_12327_pilon	+	3417	15	Intergenic	novelGene_140656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_13	39.1489176747205	32	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	81	1673	594119	788412	FALSE	5	CTGTTCTGTATTCTTCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHEFPRDIFSNEDRRQGAVVLHVLCAMYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVVALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLINSRTYANGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAQDRSVNGTRRDDVIAEAGHESENENEDNENNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDPPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTVIGFTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIHLNSRGLIYSVGLLLASVFFTVFGVHLNKWQLDRKLGCVCLFLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH	517603	790156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_+_517681_594115_594191_598489_598575_598845_598950_708771_708847_723976_724003_732505_732560_738986_739121_740954_741116_741844_742116_759841_760009_763555_763671_764725_764839_784739_784806_788262
922481	contig_4884_pilon	+	2553	14	Intergenic	novelGene_63810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	578.925243766259	29	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	448	1473	576025	585192	TRUE	25	GCTTGTAGAGACCACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTEEGVEGIIKEVEVDIIEVAIDLSGIEDTLGVLDEVGHVLEVQKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEDDKNSERITVKKETQSPEQVKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKMAPVPLDDSNRPASLTKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSYQKATEEHSTRQKSPEIHRRIDISPSALRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRKERSKERGDSKGSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKNVFVFYTANGG	563268	593614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_563390_570115_570221_575041_575156_575917_576158_578251_578568_578703_578874_581256_581363_582400_582486_584843_585020_585152_585316_586137_586319_587339_587487_592827_593041_593198
922482	contig_6270_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_99847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413481	410953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_411000_413500
922483	contig_5585_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_143082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGGCCTTAGTAGAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488827	491389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_+_488800_491400
922484	contig_2757_pilon	-	1862	1	Intergenic	novelGene_164592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGCTACCACCGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256775	254913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_-_254900_256800
922485	scaffold_13505_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_111410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTCCAGCAGCTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316951	317959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_317000_318000
922486	contig_9375_pilon	+	1497	1	Intergenic	novelGene_136063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344703	346200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_344700_346200
922487	contig_7331_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_67231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1979	2278	120567	120268	NA	70	GATATGAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTGIKSPTSVERDDGEAQYHQSEEGRTDHQLLICKFKYKLKKIKTSPREPKYDLEYIPPEFGEHLKNRFDSLNINNQRPDKVWNDIRISYMKKAKGH	122545	120264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7331_pilon_-_120300_122500
922488	contig_14686_pilon	-	2416	3	Intergenic	novelGene_88062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98745	35431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_37042_89876_89960_98022
922489	contig_15092_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_57766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	1035	1688	279671	280324	NA	85	GAAAACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHITGEAESDNAEASKKLKNGLDKVVQYEEYLPEQIFNTDKTGLFWKRMPEWIYFNKEAKLMPGFKAFKGRFTLLLGGKAAGFKLKHFLVYHSEKPQAFTNTDKNKLPVYYRSNLKAWWIVLFKDWFLSCFIPEVHTYCLENSISFKILLPLDNAPGHPPHIDDLNQDVKVVLSTSQYDSCDSAYGSRCKHHLQGILPMDYVCPGNSFNRRRYSNIM	278636	281090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_278600_281100
922490	contig_16703_pilon	+	946	7	Intergenic	novelGene_72742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1530.00015432098	4	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	207	662	6490	11236	TRUE	5	TGCCTCAGCCTGCTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVSCGD	5730	15659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10038_11222_11258_15396
922491	contig_12837_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_57370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303184	301893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_301900_303200
922492	contig_9375_pilon	-	1603	1	Intergenic	novelGene_136089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	313	630	754659	754342	NA	45	AAAGAATCTAAAACCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRVALWSKMWFILENVPSELEKNGYFAAVGWSLLYMSMRSSWLIVVFRSFVPLLSFFLDVLSFTNSGVLKSPSINVELSVSLSSAVRVCFMYFGTLSLGA	754971	753368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_753400_755000
922493	contig_3956_pilon	+	1552	7	Intergenic	novelGene_14817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1336.32215011534	742	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	86	1033	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281596	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284769_1289833_1289892_1290297
922494	contig_854_pilon	-	4676	2	Intergenic	novelGene_36573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	4008	4316	1679447	1679139	FALSE	20	GCGGATAGCACGGGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLLPPAPHPQEDQPCTHLLIFRDAHDPHGLHGLLEHVLILLPRNGDVPVGQEAVFVVWLQQEVSCKGYRACVGQQGVKTRGHRQHCDLKGLGDREKGPMP	1684597	1678778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1682325_1683467
922495	contig_4232_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_63365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11780	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGGCAAAATGAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
922496	contig_13952_pilon	-	1838	1	Intergenic	novelGene_133252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1147	1458	65387	65076	NA	70	AAAAAAAAAAAAACAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHAWHTLVLATLSFSFCLPPIPLLSPSFCRRYRVSTGGLLTPDVSKNKDGAQRLASEKLEAHPSSTTYLLPVTCFNPQASISSVSSGDYHSNIFQHWPYRTLF	66533	64695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_-_64700_66500
922497	contig_2062_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_139046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATCATCTTTACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1218966	1220718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1219000_1220700
922498	contig_3410_pilon	-	3013	10	Intergenic	novelGene_58911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	13	junction_9	496.912566519938	5	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	25	1290	57649	15414	FALSE	15	ACACGTTGAGCCTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAALWAALAVGLQLWTAVLAQAAHPTYAPESGNGTQCQPRQYYDKRAQMYCSMCPPGHFVQSFCTKTSDTVCAPCEDSTYTQLCNWVSKCLSCSSRCSSDQEEVQSCTREQNRICTCRSGWYCMLRRQEGCQLCVPLRKCLPSFGVAKQGTATSNVVCTPCAPGTFSNTTSSKDPCRPHRNCSSVAIPGNASMDTVCGSLAPALTVALGPAPNNIALPIGLIVGVTALGLVIIVLVSCVIMTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSKEECPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	57673	13690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29831_30355_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57580
922499	contig_13674_pilon	-	310	1	Intergenic	novelGene_140312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGCCAGGTATTCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12864	12554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_12600_12900
922500	contig_9389_pilon	-	2318	2	Intergenic	novelGene_84126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGAAAATCACATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471519	1469117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1470115_1470198
922501	contig_15608_pilon	+	2758	2	Intergenic	novelGene_179045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	116	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1434	2483	19470	20519	FALSE	70	AAAAGAGGAAAAACATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDSIIEGIRSRFETVEDRIRRIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	17754	20794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15608_pilon_+_17963_18244
922502	contig_4392_pilon	+	3858	3	Intergenic	novelGene_117287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1782	2156	41728	42102	TRUE	45	TATCAGAATAAGAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALQALVKNKSPGIDGIPIEMFQQIGAMLEVLICLCQDIWKTATWPADWNRSIFLPIPKKGDPAECGNYRTISLISHTSKNFIEDRSKQLQQYIEEGTARNSSQIQKRTWNRGYHC	39902	46757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_40275_40318_43015_45967
922503	contig_4213_pilon	+	1121	5	Intergenic	novelGene_124792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	120.437483783081	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	158	523	12984	24364	TRUE	10	GGTGTGGGTTTATTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHDTKNMEKDIEPTQMLANPGYISSKKNSNKATLNRVLSFSLLMCQIMVFGTIIGLVVTTAKFHQKLSGCLETACPDSCIGFQKKCFYFSHDTRNWTSSQRFCDTQGADLVQVETQEELVR	12826	43081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_13045_19193_19305_24170_24492_40521_40646_42734
922504	contig_504_pilon	+	2666	6	Intergenic	novelGene_54455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484702	497010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_+_485140_485273_485338_486794_486884_490993_491085_491825_491988_495187
922505	contig_2219_pilon	+	3164	3	Intergenic	novelGene_67159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTTCTTTTTTTTTGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48899	417903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_+_50090_298291_299019_416656
922506	contig_6958_pilon	+	875	6	Intergenic	novelGene_70008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	306.735325647373	4	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	12	389	750213	758531	TRUE	15	GTTTTCTAAATGTTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLKDQRIQKTDLERVLEANDGPGMLDEDEDLQKALALSRHEIDMEDEEADLRRAIQLSMQGSSRNVSQDTPQTSGTNLSSEELRKRREAYFENSNSNSNSSSSGSSR	750201	769533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_750284_750917_751082_752856_752954_758485_758604_768409_768486_769195
922507	contig_6278_pilon	-	1960	1	Intergenic	novelGene_119805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCCCGCCTCCCTGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336396	334436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_334400_336400
922508	contig_848_pilon	-	3018	2	Intergenic	novelGene_83354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2559	2888	847394	847065	FALSE	10	CCTGTTTTCCATTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRQPPVRVCGIQAAAVSWSRDCGHGKQRRPSWGEEGWGMESVYHQLPVVLSPAGRSVRLLSHTPCLLVSNRSPRWRIRAALEGRGPLHESLLALHSLSVFSLHLVLG	850181	846934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_-_847762_847990
922509	contig_14357_pilon	+	3463	2	Intergenic	novelGene_121667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	338	736	497017	497415	TRUE	35	AGTCTATGGCAGAACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVLPKAIYKYNTIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKLQISKALLKKKYKVGGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYTDQWNRIKNLHVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWGRLSFQQMVLAKLDVHLQKK	496679	500572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_497796_498225
922510	contig_7091_pilon	+	2605	1	Intergenic	novelGene_131785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	448	906	401055	401513	NA	60	TCTAACTTTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKWFLNYVIGRGWKSFKVPNSKSLGCLEETVGRIVDIKGTSSEGSEGSEESYRGSLYHLREYIWCQQQNFRNLDIKCASGEALKENGEHVIGQWRKGDTFYAVAKNLSELCSNIWWKVELVSNEHRYLADEISKQDLKGVLWFLVATSSKM	400607	403212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_+_400600_403200
922511	contig_8964_pilon	+	2383	1	Intergenic	novelGene_168715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCATGAAATATACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560132	562515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_+_560100_562500
922512	contig_4531_pilon	-	4258	25	Intergenic	novelGene_47944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2482	2868	740009	737517	TRUE	40	ACCGCACAGAACCAGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFFQSRIHRHIGLHLHISFFHNAGTSYCGENAHQLQKKLPSHLPKDRTAVLSFSLLSISDKSSKPSPDFCICSKKQTTNKTNQVTHSIFKSFIFSMIQCQSHSKTGQVTFFYHHASNFEGLRRIHFT	773879	727860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_728499_729013_729317_729937_730088_732802_732906_733742_733854_737431_737564_737987_738161_739842_740072_741751_741876_745247_745320_745406_745522_747219_747288_748457_748596_749941_750118_750881_750990_758279_758385_761005_761171_762181_762384_764956_765082_769746_769947_771218_771475_771815_771920_772075_772183_773401_773581_773704
922513	contig_15974_pilon	+	2285	1	Intergenic	novelGene_164812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAAATAAGAATTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143678	145963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15974_pilon_+_143700_146000
922514	contig_10299_pilon	-	4373	1	Intergenic	novelGene_79793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725981	721608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_721600_726000
922515	contig_3161_pilon	-	5968	5	Intergenic	novelGene_84499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	3904	4935	114024	100136	FALSE	35	GAAGTCCCATAGACACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTFPLRKGIRQRCPLSPLLFNMVLEILARIIRQEKEIKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELTERFSSVAGYKINIQKSVGFLYTSKENNEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRIYLTATVVKTAWYWYKDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQTWIPICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQT	360746	99102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_-_101050_113906_114202_208922_209098_357071_359279_359402
922516	contig_299_pilon	-	4079	2	Intergenic	novelGene_129477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	2672	3862	1372666	1371373	FALSE	35	TCAGTGCGCCCATAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEESTLEVPDKELKSLQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQNSRGLSKTKRNTTGNQKSQSMDDNNIKTMKEGINGIGIEPSNGEEGKAIPSKGRLLQTYKDKGKIHGNHKES	1375337	1371155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1371593_1371695
922517	contig_6110_pilon	-	3079	16	Intergenic	novelGene_163276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	138.576092214109	60	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	31	2052	430722	380167	FALSE	15	TCCCAGCTAGTCTGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEILDLSFLSDMERDLILNVLQRDEELRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSDRTCARCQESLGRLTPKTNTCRGCNHLVCRDCCVQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFYDQKVNRFDYRTGSEIIRMSLRHKPAVNKRETVGQSLLHQSQIGDIWPGRKFAQERQKEYSAPFEVPKLKSGKSMLEAESESLDSYTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKETQPGGQNVVSVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVGHASGSLGDRSKSVPGLSVDMEEEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMRSGSSMSTIGSVMSIYSEAGDFGNVSVTGKIAFSLKYEKQTQTLVIHVKECYQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTINPLYDEILRYEIPESLLTQKTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEVHMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESLTGLPSHKGELVVSLKYIPASKLPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKSGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNDVRLEDLQHMCLELTVWDREPLSSNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL	430752	379139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_380316_382066_382276_383033_383134_384977_385087_388865_389028_389561_389665_389957_390137_391212_391312_391834_391939_392053_392145_392670_392747_393245_393348_429547_429651_429894_430005_430139_430356_430612
922518	contig_7057_pilon	-	1635	2	Intergenic	novelGene_123403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATGGACAGGTTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298095	1292485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1292852_1296826
922519	contig_6807_pilon	+	4586	2	Intergenic	novelGene_84557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	259	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCTGTCTTAGTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79312	84205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6807_pilon_+_83000_83306
922520	contig_6277_pilon	-	2078	1	Intergenic	novelGene_80404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAAGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544261	542183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_542200_544300
922521	contig_5153_pilon	-	2874	3	Intergenic	novelGene_74380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2168	2641	967665	967192	FALSE	35	CTGAACTGTGCATGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSFEQNKGIPRGLESRKECVSVASFHHTYSICMLSKIIREAGLYEGERGIRIGRRLIKNLCYSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDQNHNRGFRTELEKNVEHNSNSQKKDQIYWPKRDWRNPKSMAPRHPFSSVVKLSHRFTVQPGSGQPRKTK	1001630	966958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_969421_971559_971807_1001465
922522	contig_15029_pilon	-	3624	1	Intergenic	novelGene_128229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	127	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	744	2879	3622	534084	533341	NA	40	ATGGAAACTGAGTAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLSTITLNVNGLNACIKRRRVTEWIKKQDPSICCLQWTHLRNKDINILKIKGWKKIYQANSYQKRAGVAILISDKTDFKTKSTIKHKEEHYIMYKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKRETHSTTVIVGVFNTLLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQPDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNAYGTFSRIDHILGRRTILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSI	536962	533338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_533300_537000
922523	contig_11816_pilon	-	4070	3	Intergenic	novelGene_98560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1424	1819	1178075	1177680	FALSE	50	TACTTATGACCAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLTLEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQRAVQEDRVKHHNDMCKELEIENRKGRTRSAFLKLKKLKKKFKLQVAIVKDSMEKILNDTESIKRRWKEYTESLYQKILHWSHPRLEQGRMKKTKDTRED	1294220	1175428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1179288_1271346_1271477_1294139
922524	contig_11370_pilon	-	2095	16	Intergenic	novelGene_98769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_3	109.478440292548	60	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1908	187	2094	274546	222068	FALSE	15	CCCGAGGAGCTGTCATCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPAPARSLDDIDLSALRDPAGIFELVEVVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVTEDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKSPPGNDDQLWLVMEFCGAGSVTDLVKNTKGNALKEDCIAYICREILRGLAHLHAHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDYRSDIWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRLKSKKWSKKFIDFIDTCLIKTYLSRPPTEQLLKFPFIRDQPTERQVRIQLKDHIDRSRKKRGEKEETEYEYSGSEEEDDSHGEEGEPSSIMNVPGESTLRREFLRLQQENKSNSEALKQQQQAQQQQQRDPEAHIKHLLHQRQRRIEEQKEERRRVEEQQRREREQRKLQEKEQQRRLEDMQALRREEERRQAEREQEYKRKQLEEQRQSERLQRQLQQEHAYLKSLQQQQQQQQQLQKQQQQQQQQQILPGDRKPLYHYGRGVNPADKPAWAREVEERTRMNKQQNSPLAKTKPSSTGPEPPISQASPGPPGPLSQTPPMQRPVEPQEGPHKSLVAHRVPLKPYAAPVPRSQSLQDQPTRNLAAFPASHDPDPATPTPTATPS	274732	222066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11370_pilon_-_222221_222544_222719_222917_223152_223870_223988_225619_225831_226192_226263_226740_226917_227135_227215_227343_227399_227725_227857_228329_228421_228847_228959_231285_231412_231502_231560_233212_233279_274489
922525	contig_3601_pilon	-	3490	2	Intergenic	novelGene_132852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1678	1983	130167	129862	FALSE	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	131895	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_131089_131139
922526	contig_15407_pilon	-	712	3	Intergenic	novelGene_123043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	35	12	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATCTGTTTGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387195	290406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_290842_341609_341686_386994
922527	contig_19052_pilon	-	401	1	Intergenic	novelGene_178931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATGGCGGTAGCTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113915	113514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19052_pilon_-_113500_113900
922528	contig_1244_pilon	-	3450	1	Intergenic	novelGene_38034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGGCAAGATTGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929774	926324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_926300_929800
922529	contig_6630_pilon	-	3038	11	Intergenic	novelGene_30700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	773.944087127746	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	660	1109	364162	358583	TRUE	40	ATAAAAAGATGTTGCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAEMKFQNRAAPSLAMVLVNSFQLLYVVDALWNEEAVLTTMDIIHDGFGFMLAFGDLVWVPFIYSLQAFYLVRHPNEISWPVASVIIALKLFGYIIFRCANSQKNAFRKNPTDPRLARKFKNHSYFNGKKSSSFWMVGLCSPPQLPG	374429	355884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_357779_358547_358671_358774_358860_360550_360720_364054_364181_366330_366435_367651_367844_370546_370602_372512_372555_372594_372710_374296
922530	contig_12677_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_110871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATGACACACCAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3574	2949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3245_3341
922531	contig_15678_pilon	+	709	2	Intergenic	novelGene_179046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATTAAAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112070	120666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15678_pilon_+_112368_120254
922532	contig_6102_pilon	-	2044	2	Intergenic	novelGene_32078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	284	junction_1	0	18	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	145	501	786149	785688	FALSE	90	AAAAAAAAGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSPDSTREDLAYCEHLPDSQEDITWRGRGREGLAPQRKTTNPLDLAVMRLAALEQNVERRYLREPLWSPHEVVLEKALLSTPNGAPQCTTTEISYEITPRIRAWRQTLERCRSAAQVCLCLGQLERSIAWEKSVNKVVSGRKSLGRLRSQPARGGGGWSHWQAEA	786293	784144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_785908_786012
922533	contig_9389_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_84127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	419	1260	176	1435	1469906	1471165	NA	15	ATCTTGTATTTAGTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVTTLIGEKRYQCKECGKHFCSFSSFWTHLRGLKCECKEGCKTYSHSSILHKKFHNGDMLYECKECGKAFSQPSHLSEHIRIHSGERSYEYKECIKAFSDSSAVTKHIRTQGEERPYKYRECTKAFSDFSALTKHIRTRSGERLYECKECGKAFSRSSSLTIHIRNHSGEKPYKCKECGKAFTRSSLLSSHIRIHSGERPYKCKECGKAFSQVSHLTKHIRTHSGERPYECKECGKAFSCSSHLTSHKKTHNRERPYECKQCGKAFSQSSYLTTHIITHKGQRPYECKECGKAFSLASSLTRHTRTHSRVMPYECKHCGKAFSQSSHLTTHIRIHSGERPYECKECGKAFRHASSLTTHIRTHSGVRPYKCRECGNSFSCYSHLTSHTKTHSGERPYECKECGKTFSQTSSLTKHIRTHSGEKPYKCKECGKAFSCSSSLTTHKRTHSGEKPYECKECGKAFSQASHLTSHIRIHSG	1469730	1471513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1469700_1471500
922534	contig_709_pilon	-	2542	1	Intergenic	novelGene_57661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATTAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3858056	3855514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_-_3855500_3858100
922535	contig_18634_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_174237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACTTGCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22237	19347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18634_pilon_-_19300_22200
922536	contig_10951_pilon	-	764	4	Intergenic	novelGene_61644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	210.771598339688	21	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCTGCTCCTAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317283	313124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_-_313678_314510_314540_315819_315885_317166
922537	contig_20875_pilon	-	795	1	Intergenic	novelGene_153094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCCACTGGCCGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17903	17108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20875_pilon_-_17100_17900
922538	contig_3132_pilon	+	2580	3	Intergenic	novelGene_127406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	148	junction_2	3.5	39	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1789	2097	12986	13294	FALSE	30	AGACCCAGCCATTACCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHCQPERWDSSSSSMQALTSHTAPVLASVLQPCLEGTTSDWLLLGMKTPAEVLIVTTEWEVCVVIICLSRITLKPPNSFHSSYPGAIQGWQLVSLPGTRLD	6294	13777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_+_7589_8405_8502_12587
922539	contig_9784_pilon	+	1317	2	Intergenic	novelGene_165698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAACTGTGTCAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24084	50383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_24841_49822
922540	scaffold_13505_pilon	+	3505	1	Intergenic	novelGene_111580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2236	2544	626656	626964	NA	65	AATAAATACAATACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKILLKIIQKRLQQYIDRERPEIQARFRRGHGTRDIIADVRWILVESREYQKDVYLCFTDYAKAFDCVDFNKLWITLQRMGIPEHLIVLMRNLCIDQEAVV	624420	627925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_624400_627900
922541	contig_6795_pilon	+	5507	5	Intergenic	novelGene_27665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	190	197	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGACAAGTGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45566	112963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_46979_48976_50493_62776_64965_104076_104173_112668
922542	contig_16322_pilon	+	2504	14	Intergenic	novelGene_87531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	484	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTTTTAAAACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77570	106603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_77956_78553_78622_79821_79948_81563_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89957_90094_90171_91475_91557_91946_92049_93066_93186_96006_96081_103786_103858_106148
922543	contig_9177_pilon	-	867	7	Intergenic	novelGene_32538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	989.856330765003	3	10	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	277	669	2838	1909	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERCLPLPRVLTLQEYYY	3455	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1957_2238_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374
922544	contig_9099_pilon	-	3711	1	Intergenic	novelGene_149910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTTATGGTGTGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326244	322533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_322500_326200
922545	contig_17144_pilon	-	2248	13	Intergenic	novelGene_29269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1783.07924007569	2	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	103	1953	181791	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183202	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_181790_181850_183158
922546	contig_7182_pilon	-	1188	6	Intergenic	novelGene_117145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1421.03970387882	16	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	127	594	889318	887235	TRUE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCVWLPLSQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKENF	891386	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_887094_887143_887242_888179_888345_888814_888961_889168_889333_891274
922547	contig_8447_pilon	+	4400	16	Intergenic	novelGene_69382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	563.946057310055	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1299	2441	48468	82214	TRUE	40	AACAAGGCGAGAAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRRQELRELRLLQKEEHRNQTQLSSKHELQLEQMHKRFEQEINTKKKYFDTELENLERQQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	5773	84477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5925_21258_21332_22350_22546_23215_23298_40692_40828_44385_44931_48350_48482_53963_54088_54547_54728_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82702_83005
922548	contig_12570_pilon	+	5887	1	Intergenic	novelGene_79390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCACCTATTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281839	287726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_281800_287700
922549	contig_19006_pilon	+	4536	17	Intergenic	novelGene_145580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	417.987720363888	2599	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	151	1365	41925	83378	TRUE	10	AGGGTCATGTGTCTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPTVDPCQDFFSYACGGWIKANPVPDGHSRWGTFSNLWEHNQAIIKHLLENSTASVSEAERKAQVYYHACMNETRIEELKAKPLMELIEKLGGWNITGPWDKDNFQDTLQVVTAHYRTSPFFSVYVSADSKNSNSNVIQVDQSGLGLPSRDYYLNKTENEKVLTGYLNYMVQLGKLLGGGDEDRIRPQMQQILDFETALANITIPQEKRRDEELIYHKVTAAELQTLAPAINWLPFLNTIFYPVEINESEPIVVYDKEYLEQVSTLINNTDKCLLNNYMIWNLVRKTSSFLDQRFQDADEKFMEVMYGTKKTCLPRWKFCVSDTENNLGFALGPMFVKATFAEDSKNIASEIILEIKKAFEESLSTLKWMDEDTRKSAKEKADAIYNMIGYPNFIHCGPGPLL	22245	94321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19006_pilon_+_22334_41862_42076_55695_55818_56975_57123_58689_58756_59858_60051_67900_68044_69354_69470_76103_76215_79838_79938_80455_80496_83349_83454_86755_86867_87598_87667_88471_88663_90921_91018_91691
922550	contig_678_pilon	-	4985	1	Intergenic	novelGene_167799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	401	1206	323	1528	54007	52802	NA	10	TTTTTTTAATGGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDNRREQTYGQKILRETDIKILINNDNGKEQTYGQKILRETDIKILINNDNGREQTYGQKILRETDIKILINSDHGREQTYGQKILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETDIKILISNDNRREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINDDHGREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINDDHGREQTYGQMILRETDIKILINNDNGGEQTYGQMILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILISNDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQKILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETDIKILINDDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETEIKILIKIVTT	54329	49344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_49300_54300
922551	contig_9321_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_174717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCGCACATTGCACATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30888	31559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_30900_31600
922552	contig_17976_pilon	-	1882	3	Intergenic	novelGene_32519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCACTGGGACAGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48073	41666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41857_45522_45583_46441
922553	contig_5031_pilon	+	3252	1	Intergenic	novelGene_133162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	854	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAACAAAAATGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5243	8495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_5200_8500
922554	contig_5200_pilon	-	4011	32	Intergenic	novelGene_140148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_31	56.200010739109	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1291	3876	59	3934	180434	111855	FALSE	55	TAAGTCTAAGAAATTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVFHTLVSQTVSAVSLILEMPSSLLGPATPAPTAAAAAALQEALENAGRLIDRQLQEDRMYPDLSELLMVPTPSIFQPHVRHLLVLATPVDIVILGLSYANLQTGSGVLNDSMSGGMQLLPDPLYSLPTDNTYLLTITSTDSGRIFLAGKDGCLYEVAYQAEAGWFSQRCRKINHSKSALSFLVPSLLQFTFSEDDPIVQIAVDNSRNILYTRSEKGVIQVYDLGQDGQGMSRVASVSQNSIVSAAGNIARTIDRSVFKPIVQIAVIENSESLDCQLLAVTHAGVRFYFSTCPFRQPLARPNTLTLVHVRLPPGFSASSTVEKPSKVHKALYSKGILLMTASENEDNDILWCVNHDTFPFQKPLMETQMTTRVDGHSWALSAIDELKVDKIITPLNKDHIPITDSPVAVQQHMLPPKKFVLLSAQGSLMFHKLRPVDQLRHLLVSNVGGDGEEIERFFKLHQEDQACATCLILACSTAACDREISAWATRAFFRYGGEAQMRFPATLPPPSNVGPILGSPVYSSSPVPSSSPYPNPTFLGTPPQGLQPPAMSTPMYAVGNPATQATSMSCMTGPEIVYSGKHNGICIYFSRIMGNIWDASLVVERVFKSGNREITAIESSVPSQLLESVLLELKGLQEFLDRNSQFAGGPLGNPTTTAKVQQRLMGFMRPENGNTQQMQQELQRKFHEAQLSEKVSLQGIQQLVRKSYQALALWKLLCEHQFAVIVGELQKEFQEQLKITTFKDLVIRDKELTGALIASLINCYIRDNAAVDGISLHLQDICPLLYSTDDAICSKANELLQRSRQVQNKIEKERMLRESLKEYQKISNQVDLSSVCAQYRQVRFYEGVVELSLTAAEKKDPQGLGLHFYKHGEPEEDIVGLQAFQERLNSYKCITDTLQELVNQSKAAPQSPSVPKKPGPPVLSSDPNMLSNEEAGHHFEQMLKLAQRSKDELFSIALYNWLIQADLADKLLQITSPFLEPHLVRMAKIDQNKVHYMDLLWRYYEKNRSFSNAARVLSKLADMHSTEISLQQRLEYIARAILSAKSSTAISSIAADGEFLHELEEKMEVARIQLQIQETLQRQYSHHSSVQDAISQLDSELMDITKLYGEFADPFKLAECKLAIIHCAGYSDPILVQTLWQDIIEKELNDSVAMSSPDRMHALSLKIVLLGKIYAGTPRFFPLDFIVQFLEQQVCTLNWDVGFVIQTMNEIGVPLPRLLEVYDQLFKSRDPFWNRMKKPLHLLDCIHVLLTRYVENPSQVLNCERRRFTNLCLDAVCGYLVELQSMSSSVAVQAITGNFKSLQAKLERLH	180492	111777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_111994_112627_112735_113795_113933_117536_117648_118259_118381_119073_119188_120312_120443_123525_123681_124365_124471_124684_124839_125222_125359_126060_126200_126848_127041_129382_129514_132299_132398_138789_138906_140333_140401_141707_141856_142377_142441_142836_142926_143760_143856_144755_144867_146952_147124_148411_148513_151817_151971_152455_152554_153705_153798_154068_154143_155311_155418_165678_165846_166652_166746_180271
922555	contig_7378_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_120275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCGACATAACGGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532647	534764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_532600_534800
922556	contig_20641_pilon	+	1579	7	Intergenic	novelGene_52807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1323.86891974495	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	64	978	14599	56560	FALSE	85	AAAATAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGKCLWGLQ	14535	57161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54977_56543
922557	contig_10857_pilon	+	2611	9	Intergenic	novelGene_160918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	214.771390087227	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	72	764	454304	469527	TRUE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAGLLTLGAVLCAAATVREAAGLMAGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTFQCCGKWSPFGLLGDAEAGLCPGELATREDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSFCDQQRSSEVLAL	454232	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_454313_457543_457619_463693_463796_464688_464776_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484_470519_470601
922558	contig_8660_pilon	+	2497	2	Intergenic	novelGene_136486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	94	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	70	306	237873	238478	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNLQHADDTILFAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLHIRTWSFHLVTNREKIDIVKDYILLGSIINTHGSIGQEIKRYNCTGQICCKRTSLKCSKTKMSL	237803	240669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_+_237919_238287
922559	contig_9609_pilon	+	2564	1	Intergenic	novelGene_22927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	115	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	84	255	108	362	47390	47644	NA	70	AATGGAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYNEISSDPKKASLNLKKHKIINAGEVVERLEHLHMVGECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYPRETRVITQIDICTPTFTAAKRWKQPTCASADEWINKLWYIHTMEY	47282	49846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_47300_49800
922560	contig_3747_pilon	+	3005	5	Intergenic	novelGene_24919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10018	junction_1	1068.16252859759	5	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	820	1491	202676	203692	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVKIVICPKPSIGC	201752	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498
922561	contig_1301_pilon	-	1443	12	Intergenic	novelGene_47323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	905	junction_3	346.056055269128	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	222	1442	305285	269187	FALSE	65	ATGAAGAAAAAGAGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQE	309848	269185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751
922562	contig_7720_pilon	+	4511	5	Intergenic	novelGene_155760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	6.04152298679729	14	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	74	928	669409	675801	FALSE	35	CTATGAACAATAGTGTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGCMARAPPGSEARLSLATFLLGASVLALPLLTRAGLQGRTGLALYVAGLNALLLLLYRPPRYQIAIRACFLGFVFGCGMLLSFSQSSWNHFGWYMCSLSLFHYSEYLVTAVNNPKSLSLDSFLLNHSLEYTVAALSSWIEFTLENIFWPELKQITWLSATGLLMVVFGECLRKAAMFTAGSNFNHVVQNEKSDTHTLVTSGVYAWFRHPSYVGWFYWSIGTQVMLCNPICGVAYALTVWRFFRDRTEEEEISLIHFFGEEYLEYKKRVPTGLPFIKGVKVEL	669335	679384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_669604_670362_670452_671353_671524_672872_673091_675618
922563	contig_10904_pilon	+	475	2	Intergenic	novelGene_22432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCCGCTTTCACTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5780	8478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_5817_8039
922564	contig_7379_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_150042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTTAATGACAGAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590265	587904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_587900_590300
922565	contig_7009_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_23598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACACGCTGCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417257	419066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_417300_419100
922566	contig_8377_pilon	+	4778	30	Intergenic	novelGene_34997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	3043.36415802239	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1161	3486	136	3621	68257	197939	TRUE	15	GTGGATTCTGCTTCAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68121	199245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172947_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_198120_198268
922567	contig_16110_pilon	-	2737	2	Intergenic	novelGene_126793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAACATAGTTCTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122694	88434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_88892_120414
922568	contig_11281_pilon	+	3383	1	Intergenic	novelGene_125417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTCATGTCTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41301	44684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_41300_44700
922569	contig_11176_pilon	-	1305	1	Intergenic	novelGene_123445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	620	964	70174	69830	NA	55	CTGGACAATGAAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMKNTKDTRKSISPRNRKGHINQRLHQPETGRTRWCPATTKDYPDREHNRESLMEQEKCGVQNLNSSKKTRLNGLTETGATPESMAPGFSISPELKQFPRPTLQTTTGLDCGT	70793	69488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11176_pilon_-_69500_70800
922570	contig_1535_pilon	+	2640	1	Intergenic	novelGene_127233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGGAATCCAACGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64847	67487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_64800_67500
922571	contig_2969_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_157077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAACACTGTTACACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946507	947776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_946500_947800
922572	contig_5350_pilon	-	2579	1	Intergenic	novelGene_99363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	1144	1611	211718	211251	NA	65	AAAAAAAAAACCCGAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGYDIAANSLISKIYRILQHLNNKKKNNPIKKWAKDRNTHFTKEDIQAANRHRRKCSQSPAIREMQIKTTTRYHLTPTQLARIKKKQKITNVGEVVGRLELLSTVNVSVKWYNIYGKRYGVSLKKLEIEIPYNSAIPLLEIHPREIRAITRTDI	212861	210282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_210300_212900
922573	contig_5484_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_151100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267457	265262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_265300_267500
922574	contig_8866_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_77887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAGAAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1021245	1020138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1020100_1021200
922575	contig_9177_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_32725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTGCCACCAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617482	615192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_615200_617500
922576	contig_7707_pilon	-	3926	10	Intergenic	novelGene_72214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1927	2430	766746	763025	FALSE	70	GGAAAAAAAAAAAACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVNLSKVIGGLVLSDPILYQVFHAAHQRFKSSSSSLTMGGSELLYLPSLSPMESVLINGLLRLGPDMGPIRTGTGTLTAGGVSGFSESLTGDTICKISWKLFRAARDTSLFLLRAADCMWSRRTSHALEKSPKGCSKYLLVLKILATPANVNTHVSAHCFSAVSLE	800051	761528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_763129_766346_766977_773779_773924_774879_775009_778973_779165_782236_782298_783469_783594_786401_786610_792639_792723_799295
922577	contig_14744_pilon	-	1287	4	Intergenic	novelGene_66005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	499.371827621685	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	151	660	969897	968300	TRUE	20	TACCATTTATTGGGTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	970047	960500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961216_968195_968630_969717
922578	contig_9901_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_126939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCCAGCCTACGTCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202181	200448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_200400_202200
922579	contig_19994_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_178169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	133	432	21233	21532	NA	50	GAGGTGTAGAAAGATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKMPDFLKCSNQLLSETAPYQHLDFVRRRHNQRYLQKRSFSCWGISKRWHIIKRGKDPGFFQMPWLISILSLRKIRKRKKIEYVCIYLKRGYRVGKRD	21100	23373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19994_pilon_+_21100_23400
922580	contig_4924_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_84762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	608	1042	213482	213916	NA	45	ACAAAAAAAAGCCCTGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDCVVSSQSDEREFPWGCGLNPNTSRHSGFLLTLDPVAASCCLSSSSWDLSCQRTCQTWDSSIFTACERSPALWPANLGFACPCSYMNQEKPCGLACPSWNSSTFTACEWEPCSLTCRSWGRQLLWLHELGEASILIHRLGTF	212874	215139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_212900_215100
922581	contig_14954_pilon	-	1028	1	Intergenic	novelGene_165183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAGAAATCTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139034	138006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_-_138000_139000
922582	contig_3068_pilon	+	2447	1	Intergenic	novelGene_137656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411211	413658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_+_411200_413700
922583	contig_6674_pilon	+	2295	1	Intergenic	novelGene_147992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTATAAAAATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99141	101436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_+_99100_101400
922584	contig_11564_pilon	+	4007	4	Intergenic	novelGene_158560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCGAGTTAGTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57050	68819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_59336_59417_60848_62470_62607_68663
922586	contig_6871_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_21578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCAGGACCACCCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135982	134735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_134700_136000
922587	contig_2377_pilon	+	1871	2	Intergenic	novelGene_67922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAACAATAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276726	279571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_277930_278903
922588	contig_3269_pilon	+	638	1	Intergenic	novelGene_117031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAGGTTTAACTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178308	178946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_178300_178900
922589	contig_9955_pilon	-	4207	2	Intergenic	novelGene_21269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2020	junction_1	0	5	121	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	542	1234	49296	47546	FALSE	25	TCTGAGATTTAATTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794
922590	contig_6163_pilon	-	1400	1	Intergenic	novelGene_103788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTAAAACACCCTCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15597	14197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_14200_15600
922591	contig_9981_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_121058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGGGAATAATGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279442	281078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_+_279400_281100
922592	contig_10466_pilon	+	2717	6	Intergenic	novelGene_173622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_2	181.48101829117	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	126	2633	74739	91767	FALSE	30	AAAGTAAGTTTTATGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDGYEQISSDEDGIADLERETFKYPNFDVEYTAEDLASVPPMTYDPYDRELVPLLYFSCPYKTTFEIEVSRMKDQGPDKENSGAIEASVKLTELLDLYREDRGAKWVTALEEIPSLIIKGLSYLQLKNTKQDSLVQLIDWTMQALNLQVALRQPIALNVRQLKAGTKLVSSLAECGTQGVMGLLQAGVISGLFELLFADHVSSSLKLNAFKALDSVISMTEGMEAFLRGRQNEKSGYQKLLELILLDQTVRVVTAGSAILQKCHFYEILSEIKRLGDHLAEKTSSVPNHSEPDHDTDAGLERTNPEYENEVEASMDMDLLESSNISEGEIEKLINLLEEVFHLMETAPHTMVQPPVKSFPTMARITGPPERDDPYPVLFRYLHSHHFLELVTLLLSIPVTSAHPGVLQATKDVLKFLAQSQKGLLFFMSEYEATNLLIRALCHLYDQDEDEGLQSDGVIDDAFALWLQDSTQTLQCITELFSHFQRCTASEETDHSDLLGTLHNLYLITFNPVGRSAVGHVFSLEKNLQSLITLMEYYSKEALGDSKSKKSVAYNYACILILVVVQSSSDVQMLEQHAASLLKLCKADENNAKLQELGKWLEPLKNLRFEINCIPTLIEYVKQNIDNLMTPEGVGLTTALRVLCNVACPPPPVEGQQKDLKWNLAVIQLFSAEGMDTFIRVLQKLNSILTQPWRLHVNMGTTLHRVTTISMARCTLTLLKTMLTELLRGGSFEFKDMRVPSALVTLHMLLCSIPLSGRLDSDEQKIQNDIIDILLTFTQGVNEKLTISEETLANNTWSLMLKEVLSSILKVPEGFFSGLILLSELLPLPLPMQTTQVSLPYNVHLINDCGNIKKKPVVLLKTKPKQKPSFLPSKKT	74613	91851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_+_75755_78890_79383_80439_80595_88556_88640_90875_90970_91099
922593	contig_11507_pilon	-	2442	1	Intergenic	novelGene_103363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAGAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117173	114731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11507_pilon_-_114700_117200
922594	contig_20527_pilon	+	2249	7	Intergenic	novelGene_138560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_2	1199.84022084424	1	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12814	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25436_25614_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36519
922595	contig_11171_pilon	+	1185	1	Intergenic	novelGene_48521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGACCGGACTCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9928	11113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_9900_11100
922596	contig_5623_pilon	-	2182	12	Intergenic	novelGene_154842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	361	junction_8	276.87700524431	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	481	1446	70	1515	212265	207631	FALSE	40	CTCAAGATGTGTTAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	212493	206963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424
922597	contig_6654_pilon	-	2180	3	Intergenic	novelGene_85731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	39	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATAAAGATACTGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416433	410450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_412367_412988_413125_416305
922598	contig_6275_pilon	+	1903	1	Intergenic	novelGene_142468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATAATATTAAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146384	148287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6275_pilon_+_146400_148300
922599	contig_15498_pilon	-	3564	3	Intergenic	novelGene_42696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2105	2422	834242	833925	TRUE	30	TTGAGAGGTGACATTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEALKEDGRNTESLYQKELVDVQLFQEVTYDSELMVLKEEVQAALNALAKNKAPGNDGIPIEMFQQTDAVLKVPTCLCQEIWKTATRPVNWKYPCLCPFQRRSN	836346	831814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_831823_832389_832734_833134
922600	contig_14450_pilon	-	6240	19	Intergenic	novelGene_48929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	6	junction_18	33.6466753993927	130	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1183	3552	290	3841	491700	416132	FALSE	50	AAATAAATCTACATTACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPFGLKLKRTRRYTVSSKSCLVARIQLLNNEFVEFTLSVESTGQESLEAVAQRLELREITYFSLWYYNKQNQRRWVDLEKPLKKQLDKYALEPTVYFGVVFYVPSVSQLQQEITRYQYYLQLKKDILEGNIPCTLEQAIQLAGLAVQADFGDFDQYESQDFLQKFALFPVGWLQDEKVLEEATQKVASLHQKHRGLTAPDAEMLYMQEVERMDGYGEESYPAKDSQGSDISVGACLEGIFVKHKNGRPPVIFRWYDIANMSHNKSFFALELANKEETIQFQTEDMETAKYVWRLCVARHKFYRLNQCSLQTQTVTVNPIRRRSSSRMSLPKPQPYGMPPPHQLHYNGQYTEPYTSSQDNLFVNNQNGYYCHSQTSLDRAQVDLSGRIRNGSVYSAHSTNSLNNPQPYLQPSPMSSNPSITGSDVMRPDYVPSHRHSALIPPSYRPTPDYETVMKQLNRGMMHAERQSHSLRNLNIGNSYAYSRPDALVYSQPEIREHAHFTSPQSAHCPFNLNYSFHSQSPYPYPAERRPVVGAVSVPELTNVQLQAQDYPAPNIMKTQVYRPPPPYQYPRPANSTPDLSRHLYISSSNPDLITRRVHHSVQTFQEDSLPVAHSLQEVSEPLTSARHAQLQKRNSIEIAGLTHSFEGMRLKERTMSASAADVAPRAISAGSQPNVFIERTKAEETDEQESLRYGHKKSLSDATMLIHSSEEEEDFEEENKTCATLSPCAHEPRQLPAAVGSYSQEPQLSYSCSSVTPFAGPLHILEPKSHVTETEKRVRDISPVHMTAEAQRPRRDGPLMPSMSESDLTTSGRYRARRDSLKERPVSDLLSGKKNIVEGLPPLGGMKKSQGGAKKIGPLKLAALNGLSLSRLPLPDEGKEVPTRATNDERCKILEQRLEQGMVFTEYERILKRRLVNGECSTAQLPENAERNRFQDVLPYDDARVELVPTKENNTGYINASHIKVSVSGIEWDYIATQGPLQNTCQDFWQMVWEQGIAIIAMVTVEEEGGREKSFRYWPRLGSRHNTVTYGRFKITIRFRTDSGCYATTGLKMKHLLTGQERTVWHLQYTDWPEHGCPEDLKGFLSYLEEIQSVRRHTNSTSEPKSPNPPLLVHCSAGVGRTGVVILSEIMIACLEHNEVLDIPRVLGMLRQQRMMMVQTLCQYTFVYRVLIQFLKSSRLI	492863	413732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_416261_417102_417264_417714_417950_418079_418209_420181_420404_422379_422518_427536_428997_433991_434077_434798_434860_449063_449144_450004_450093_454268_454358_454752_454841_457196_457268_458080_458149_460906_461005_465814_465985_491520_491900_492773
922601	contig_14467_pilon	+	2233	10	Intergenic	novelGene_138277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	269.20284701226	7	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	428	1384	369732	378027	FALSE	25	TTCAAGCCTAGGGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKSFGTPFGGGTGGFGTTSTFGQNTGFGTTTGGAFGTSAFGSSNNTGGLFGNSQTKPGGLFGTNSFSQPATSTSTGFGFGTSTGTSNSLFGTASTGTGLFSSQNNAFAQNKPSGFGNFGTSTSSGGLFGTTNTTSNPFGSTSGSLFGPSSFTAAPTGTTIKFNPPTGTDTMVKAGVSTNISTKHQCITAMKEYECKSLEELRLEDYQANRKGPQNQVGAGTTTGLFGSSSATSSATGLFSSSTTNSGFAYQNKTAFGTSTTGFGTNPGGLFGQQNQQTTSLFSKPFAQPTTTQNTGFSFGNTSTLGQPSTNTMVRK	352180	378876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_352319_354734_354961_367941_367977_369703_369808_371154_371257_371363_371541_373147_373288_374527_374636_375783_375962_377851
922602	contig_12050_pilon	+	5327	1	Intergenic	novelGene_62778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGTGTCCATTTTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	933264	938591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_933300_938600
922603	contig_3723_pilon	+	2523	2	Intergenic	novelGene_178977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	31	1413	200049	298198	FALSE	55	AAAAAAAGCCATAAGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKHTMLMDRQTQHCENGNSTQSNLQIQCSPDPIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKAPLKRKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIEQLNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGKDSLFNKRCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKELNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNQDLLKIKHLCSSKDFIKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKSLISIICKKIQHLYNKKTHNPIKKWAKEMNRHLTKEDIQMASRHMRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARINNTGNNKCWRGCGEIRTLTHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIGIPFDPAIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNKESVNHLITWMKLEDIKIKRKNIKTQ	200018	299308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3723_pilon_+_201398_298164
922604	contig_10892_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_116749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTTTTTTCATATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156383	158659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_156400_158700
922605	scaffold_19766_pilon	+	2793	10	Intergenic	novelGene_34443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	957	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2022	2438	853208	854307	TRUE	0	CCTTGGCCCCGCCCCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKGDLSRFRGLDVLQDELDAAVQHLDGAVLCYQVFSHCRVLSAACGCHSGHMVYTDAFSFLCGQSVGQLSKQHCGLSIDYINDRFKNADGKLCMLGHRVQLKKEGTLNYLTHLLMDVDVGGVRRPPLWYTNPETPAP	851063	855783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_853004_853126_853227_853325_853423_853511_853623_853706_853758_854065_854125_854227_854320_854681_854814_855356_855483_855698
922606	contig_7993_pilon	+	2325	4	Intergenic	novelGene_170972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1047	1382	344417	379875	TRUE	35	ATTTACAGAAGCAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVEYLCTVNKTQVNIFLQLQQCIDRELSEIQARFRRECGKRDIIANVRWILVESREYQKDVYMCFVDYSKAFDCVDNNELWITLQRMGMPKHLTVLMRYLYINQEVVI	342887	404804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7993_pilon_+_343006_343488_344477_379599_380153_404138
922607	scaffold_13505_pilon	-	315	4	Intergenic	novelGene_111502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6160	junction_1	3957.90696651091	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	282	32	313	547805	541923	FALSE	15	CTCCAAGAGCGTGGCCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGWQRRGRTMPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSR	548326	541920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_542033_547363_547465_547734_547806_548295
922608	contig_14513_pilon	-	1259	2	Intergenic	novelGene_70239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	10	TGCTTTTGTCCATGTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12166_18691
922609	contig_7342_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_71165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	82	486	468252	467848	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPEHLTVLMRNLYIDQEAVVQTEQGDTAWFKVRKDVCQGCILSPYLFNLYTEQIVREAGLYEEECVIGIGGRLINKLGYADDTTSLAQSEEDLKHLLMEIKDYSLRYGLHLNIKKTKILTDGPISNTVTVME	468333	465971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_466000_468300
922610	contig_7963_pilon	-	2950	13	Intergenic	novelGene_58450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	630.441489927671	2	156	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	915	1985	123098	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126237	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123108_123742_123879_123955_124051_125563
922611	contig_10855_pilon	+	2601	1	Intergenic	novelGene_124388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1090	1542	841856	842308	NA	10	ATGCCTGGACTGTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKELEIENQKERTRLVFLKLKELKKKFKPRVAIVKDSLGKTLNNTGSIKRRWKAYTESLYQKELVYVQPFQEAAYDQEPMVLKEEVRAALKALAKNKAPGIDGISIEMFQQTDAALKVLTCLCQEIWKTATRPTDWKRSIFMPIPKKGD	840766	843367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_840800_843400
922612	contig_5041_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_27040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	289	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTCAGGTTCAGGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410715	408314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_408300_410700
922613	contig_8558_pilon	-	2772	1	Intergenic	novelGene_123163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGTCAAATGAGAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535580	532808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_532800_535600
922614	contig_6079_pilon	-	1091	1	Intergenic	novelGene_160091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	74	382	422184	421876	NA	50	AAAAATCACACTTTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVGQNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFTVQPGVDSPIKPNGTNEV	422257	421166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_421200_422300
922615	contig_15172_pilon	+	1716	6	Intergenic	novelGene_158756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	204.995999960975	247	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	12	452	243174	258481	TRUE	15	TGACTCTTCCCATCCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECNMAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKVGLVAGWV	243162	268920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258982_268156
922616	contig_6199_pilon	-	1763	1	Intergenic	novelGene_126354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATTAAAAAAAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107764	106001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_106000_107800
922617	contig_9848_pilon	-	2091	1	Intergenic	novelGene_79997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	751	1338	198811	198224	NA	65	GAAATGAAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQTQDRMVPVGAQNKTPDDPPVEENALELPDRKFKSLILRILQELRQKTDKHEEKIDKFMENTGKKLEEFRKIIQEQNAKINSQLELIQRKQLEIQKINKISEMDGVIEGLRNRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMSDSIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLKNC	199561	197470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_197500_199600
922618	contig_18162_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_122299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
922619	contig_13300_pilon	-	3312	6	Intergenic	novelGene_125831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	87	junction_1	42.7859790118211	67	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	146	1036	1126112	1116784	FALSE	30	ATAGTCCGTGACAAAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGIDVSIRGEVWPFLLRYYSPESTSEEREALRVQKRKQYLEIQQKRLSMTPEEHREFWRNVQFTVDKDVVRTDRSNQFFRGEGNPNVESMRRILLNYAVYNPAIGYSQGMSDLVAPILAEVLDESDTFWCFIGLMQNTIFVSSPRDEDMEKQLLYLRELLRLTHLRFYQHLVSLGEDALQMLFCHRWLLLCFKREFPEAEALRIWEACWAHYQTDYFHLFICVAIVVIYGDDVIEQRLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRLLPRIPCSLHDLCKLCGPGMWDSGYIPAVECSGHHVGSDSCPYGGTVETSSPKLPRESKKGVKTPREGLVFRR	1127415	1114507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1117033_1118322_1118470_1122650_1122831_1124738_1124926_1125984_1126120_1127277
922620	contig_10511_pilon	-	5199	1	Intergenic	novelGene_126914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	95	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1797	2096	636187	635888	NA	55	ATATCTGAAATGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKSQKENKTKKKKHKKRNALRDLSTRLRVKSQAAQHCPARTGSQLKNRKNKQFKTNKQKARDPTSVAAWTRKQFHTVMELHSPSGRSKDGALSQVFE	637983	632784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_632800_638000
922621	contig_9181_pilon	-	1972	3	Intergenic	novelGene_177098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	830	1300	76553	76083	FALSE	75	AAAAAAATCCACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLQEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIKKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRIRGIEDKHMDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGVGEQGEKTENTERITEELSTENFPSIMKDEKLAIHIGETPKENHQGIS	77481	75410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9181_pilon_-_76958_77003_77300_77352
922622	contig_2924_pilon	-	2546	1	Intergenic	novelGene_140240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTGCATGTAGAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14303	11757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_11800_14300
922624	contig_4508_pilon	-	1797	1	Intergenic	novelGene_177532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGTGGGTGGAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46004	44207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_-_44200_46000
922625	contig_10793_pilon	+	2393	12	Intergenic	novelGene_83429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3138.54888562183	68	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1182	1985	152887	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	151705	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
922627	contig_4857_pilon	-	2397	3	Intergenic	novelGene_48694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1835	2239	1135132	1134728	FALSE	55	TATATTTTGACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELENNILTHTKKDQIYWPERDWRNPESMAPRHPFSSVVKSLLRFTVQPGIRTAPQNKMGLMRHSSPGTRTRRQKKTRKLVIGNPRLSKDSVDMQWGC	1140249	1134569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1136236_1137331_1137784_1139970
922628	contig_9955_pilon	-	3569	3	Intergenic	novelGene_21304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	972	junction_2	524	1	116	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	207	920	49317	47546	FALSE	25	ATTGTTAAATTATTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49836	44896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_48794_49380_49692
922629	SIRV5	+	587	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-363	981	-249	-104	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCACTACTCCGAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7952	10885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
922630	contig_6098_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_145469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGTCTTCTTTAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43988	46296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6098_pilon_+_44000_46300
922631	contig_11855_pilon	-	3027	8	Intergenic	novelGene_66943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2553.98029493941	26	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	2038	2985	1085897	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1087934	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837
922632	contig_12479_pilon	-	3539	1	Intergenic	novelGene_56827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCACCAGCAGAGCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79944	76405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_76400_79900
922633	contig_1719_pilon	-	1808	1	Intergenic	novelGene_87279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1007	1306	361081	360782	NA	80	AAAAAAAAAAAAGATAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKPPALTSSCYKGRRSVIKPHVYHMVRSLDDTNDLCLTANLKVGGSNPPSGTAEEKTWRLQSVIPTHLEQRRMKTTKDTRKILAQETKGPHKPETPSA	362087	360279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_360300_362100
922634	contig_11304_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_156719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	1320	1787	439984	439517	NA	25	TAACACAGGTTGTTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDWSLLIKCPKYMRCSLTILASKEHSGCTSSESDLFVLLAVHGILNILHQHRNSNVAILLGSSLFIVQLSHAYEVIENSMAWVRRTLVLKVPSLLFNTSKKSFATDLPNAVKPKPNPTRPYRTEYNCPIGFPRSSWWIQTADLLFSSHSS	441303	439243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_439200_441300
922635	contig_16532_pilon	+	3809	1	Intergenic	novelGene_110053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCAGCTTGAGCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216774	220583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_+_216800_220600
922638	contig_7396_pilon	-	2559	17	Intergenic	novelGene_79577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3463.30339900993	8	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	160	1158	255163	248560	TRUE	40	ATGAAAAAAGTTCTTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGSNGLRQKRATWRPL	257061	245295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246210_246282_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248606_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
922639	SIRV7	-	896	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-10	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	35	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTAACATGAAAAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147611
922640	contig_8682_pilon	+	2452	1	Intergenic	novelGene_165284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTAGAAATTTGTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206761	209213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_+_206800_209200
922641	contig_3095_pilon	+	1565	3	Intergenic	novelGene_75137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6759	junction_2	704.5	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	96	785	149574	150781	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLSKLTPSVPHSSISLGPIPLPLHHLLPTCMCLTSWVLLHLSLLIPTLTPFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWGMNHPSISFVAWFPQMMHASGPLGPRVP	149478	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_151163_151848
922642	contig_3270_pilon	+	678	1	Intergenic	novelGene_104496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCATCTAGTTCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342802	343480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_342800_343500
922643	contig_6871_pilon	+	2009	4	Intergenic	novelGene_21559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	72	1208	121971	135017	TRUE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121899	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_135110_135346
922645	contig_19727_pilon	+	3600	2	Intergenic	novelGene_168991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	225	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	1649	2401	15222	55071	FALSE	40	ATCATAATCACACTCGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDRESKSLIFRIIQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINLQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISETEDKHLDTTLFEKKSRKRTKKNEETLRTTWDTIKSKNLQVIRVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQEAQQTPYRIDPEEITKAFLFSFSCFVFFCLFVSLFHFLLSFISFFSFFISSFLI	13573	56270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_+_15858_54954
922646	contig_12977_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_122793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCCTTTCTGAGGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19059	20647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_19100_20600
922647	contig_9668_pilon	+	3365	3	Intergenic	novelGene_58125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAAGCTATTGAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231356	261885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_231859_232035_232619_259605
922648	contig_13093_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_105201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCACTCAGCATAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12430	11388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_11400_12400
922649	contig_10042_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_79151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCTCGGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131964	134235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_132000_134200
922650	contig_8628_pilon	-	2519	2	Intergenic	novelGene_164437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	134	493	651980	650477	FALSE	60	TATAGAAACAAATATCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIGGAIPGKTPVLVVATVFTYGQLTICIIATPVKWISKHMLESCHCMSATTGIQGNNLPLQFRMLLPMKKTKNGVKFLFVDILWEVVPNPMILILNYSINYLFIKPAMTTFEGVSGD	652113	648450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_-_650799_651942
922651	contig_3602_pilon	+	1997	3	Intergenic	novelGene_60558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	61	junction_1	9	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1644	354	1997	478415	552684	FALSE	25	GACAGGGGGAGCTCAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGESLHSLIQQGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDMADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLELFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEACSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPPPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGNDGLSFFMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSTWLPLDGFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKGDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPVFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQGKALGPGVWSWSQSQQTPHRT	478061	552684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_479774_495921_496067_552544
922652	contig_8864_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_135960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1841	2206	26836	26471	NA	60	AAAAATCTGACTCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDSRSISLRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRADREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGTPESIAPGFSISPELKPFPRPTLQTKIGLDCGTQNDTHEECAS	28676	25994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_26000_28700
922653	contig_17976_pilon	+	1600	3	Intergenic	novelGene_32502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2230	junction_1	302	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	183	1199	41843	47385	FALSE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41660	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443
922654	contig_19378_pilon	+	3195	2	Intergenic	novelGene_73793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	753	1109	34820	35176	TRUE	30	GTATTGATAATATATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAIETTTGDCCIEFCKTNLLDGNTFFQQQTVTIHVDHAGWNTKESNRPRLWKETREKLNTIGQNKAGADCETDPQLLICKCKLSLRKLKHVHKSQSTTVSISHLNSETISRIDLTH	34067	37346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_35735_35818
922655	contig_678_pilon	+	1797	9	Intergenic	novelGene_167785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAGCCAGAAATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29888	40059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_30276_31115_31176_31453_31887_32707_32918_35732_35976_36687_36816_37326_37387_38800_38951_39933
922656	contig_12677_pilon	+	572	1	Intergenic	novelGene_110841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGATTCGGGGAAGGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3500
922657	contig_348_pilon	+	3311	3	Intergenic	novelGene_67583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2103	2573	330995	331465	FALSE	50	GGGATATAAAAGAGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIILSLTALCFRIDLEMFFLMMMQRHSSSSCHSCHSRPSDYLISECPVPVHFSSLMPRISMFMCSISFLTISNSPRFKLRTFHVPIINGCLQLFPLILSRATSAKLDSILIIKVNSTLRRQLFPRHLLSAFQPGGLIFWHSIKQCSAAIHKIFTG	197379	332203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_197876_213829_214088_329646
922658	contig_9053_pilon	-	2950	1	Intergenic	novelGene_87919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	2573	2917	61588	61244	NA	70	AGACATCACAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYKKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIDNLNRPITGEEIEKAIKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIHRRACTSSTQATSEHRKGSNTSKFIL	64160	61210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_61200_64200
922659	contig_5916_pilon	+	2242	7	Intergenic	novelGene_158016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	115	junction_1	59.6566565159888	39	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	228	1289	212460	247683	FALSE	20	AGTTCTTTAATCTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETSEEVAVLVQRVVKDITNAFRRNPHIDEIGLIPCPEARYNRSPIVLVENKLGVESWCVKFLLPYVHNKLLLYRMRKQWLNKDELIDVTCTLLLLNPDFTTAWNVRKELILSGTLNPIKDLHLGKLALTKFPKSPETWIHRRWVLQQLIQETSLPSFVTKGNLGTIPAERTQRLIQEEMEVCGEAAGRYPSNYNAWSHRIWVLQHLAKLDVKILLDELSSTKHWASMHVSDHSGFHYRQFLIKSLISQTVIDISVLEQNPLRSEPALVLPKGEEAAASTEEPRINLPHLLEEEVEFTTDLIDTYPGHETLWCHRRHVFYLQHHLNGRFSHSMTQLSPTDSPGGTLSDLHLIPAGPCTSQAMEVDGLNDSSKQGYSQETKRLKRTPAPDSLGLEMEHRFIDQVLSTCRNVEQARFANAYRKWLVTLSQ	195763	248636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_195849_212317_212488_223801_223869_230862_230968_233235_233450_245018_245324_247340
922660	contig_8687_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_169680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	1154	1534	335307	335687	NA	80	CCAAAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITADPTEIKRIITEYYEEFYSNKFENLEEMDKFLETHYLPNLTQTEVEQLNKPITKEEIGKVILKLRTKKSPGLDGFTGELYQTFGEELTPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEASITLIPKPGKG	334153	335688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_+_334200_335700
922661	contig_614_pilon	-	2657	12	Intergenic	novelGene_132659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	177	junction_5	105.793108557135	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	838	2514	143	2656	1224447	1116112	FALSE	30	AAGATCACCCCCAGGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAEDTPEAGDRVRDPGSGNDSQPESVQSPGPDALWELLEGKFLEHKQEAFRTPDERRKSLLSLLPLFLKAWEHSVGIICFPSIPILAEDVSHQFAQEIQEALAGKPAEQARAVAWQLLRRKGDADQGGYLLLKSVYVLTGKDSETLGRVAESGLPALLLQCLYLFFVFPPEKDELLESNLQVQRMFVQMLLNICSESQGLEGLVSGTELQSLLIATTCLREHSCCFWKEPTFCVLRAISKTQNLSIIQYLQAMDCIKISLQNLSKLADMFPAPEVSEAVGLVLGFVKDSYPISSALLLEFENGGGYPLLLKVLLRYDGLSQSETDPHVEELFRLVMWLTTCGRSELKVFDSITYPQREGFKFHHEASGATVKNLQAFQVLQNVFHKANDLLLCSQVLSAIKTMWTWNAHNFFLLEWTLQPISQFVELLHLKPVPVQMQFFQLLEALVFELYYVPHEILRKVQRLIKENPESPCTLVALQSIHRITGGDLLFTDIFRDSGLLGLLLAQLRKRAKIMRKSGNKESAPGIQDPERELTCLMLRTVATLLEGSVRNAAVLKDHGMVPFIKIFLDDECYRAASLSILEQLSVINAEEYMSIVVGALCSSTQGELPLKLDLLKSLIRILETPKGHAAFRVSSGFNGLLSLLSDLEGSLQEPPLQMWGLVSPSQTLDLVFHTLCAMSAALHLDPVNSDFFQKNGLFEKLAEDICLLGCFGVLEEEGALLQSSASAKPRPFADLQSAAFSSTSPFPSRLQNCLQILSFLDSMASSTLHLRRDLTVSLSAGLEPVVDAQKGEAGSNPKSSFQQWPDLEERTEEGDAAIMHPGMVCVMVRLLPRVYH	1224589	1116110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_-_1116191_1157200_1157782_1176740_1176932_1178352_1178458_1182623_1183077_1187938_1188097_1190467_1190658_1192334_1192525_1196186_1196322_1198471_1198579_1199498_1199614_1224237
922662	contig_1725_pilon	+	2879	20	Intergenic	novelGene_24272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	551.550717437497	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	734	2566	239689	255543	FALSE	30	TAACTACATTGGAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201411	255856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236107_239656_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
922663	contig_5189_pilon	-	2482	2	Intergenic	novelGene_34877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2180	junction_1	0	1	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAACAATAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220372	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_205790_218496
922664	contig_5758_pilon	+	3854	6	Intergenic	novelGene_119116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCGGACAGAGCTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390310	491682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_392774_416101_416110_417658_418154_433249_433358_440949_441432_491384
922665	contig_16125_pilon	+	6242	2	Intergenic	novelGene_155279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	139	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162762	169179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_163267_163441
922666	contig_2969_pilon	+	1579	1	Intergenic	novelGene_157076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAACGTTGCCCAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913880	915459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2969_pilon_+_913900_915500
922667	contig_2264_pilon	+	2762	1	Intergenic	novelGene_177844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1155	1460	38929	39234	NA	35	CCCTCACAGAAACCCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKCHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPFQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDHQHFLMCLLAI	37774	40536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2264_pilon_+_37800_40500
922668	contig_7066_pilon	-	1164	5	Intergenic	novelGene_42211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_2	45.2071620431984	26	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	701	1018	1118753	1110612	FALSE	30	ACAACCCTGAAGGTAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCRGRFVCPVILFKGKHICRSATLAGWGELYGRTGYNYIFSGGADDAWADAEDVTEEDCALRSADTHLFDKVRGHDIKLLRYLSVKYICDLMVENKKVKFGMK	1127003	1110465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_1110739_1112265_1112327_1112639_1112716_1118699_1118809_1126358
922669	contig_15326_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_157704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	964	1461	36558	36061	NA	50	ATGGCACCTAACAATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKLLNNINITHKVLLKIIQKQLQPYINRELSEMQARYSRGRGTRDITADVRWILAESREYQKDVYVCFIDYAKAFDYVDRNKSWKTLQRMGIPEHLIVLMRNLYTDQEAVVRTEQGDTPWFKIRKGVRQGCILSPYLFSLYAEQIIQETGLYEEQDIRIGGRLI	37521	35310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_-_35300_37500
922670	contig_4832_pilon	+	2645	11	Intergenic	novelGene_163415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_8	56.9283760527208	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	347	1324	497716	505201	TRUE	30	AAAAGATCTGGGGAGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQTSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPIWVSLC	495945	509974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502388_502517_502611_503917_503999_505180_505332_506088_507177_509871
922671	contig_6833_pilon	-	3266	12	Intergenic	novelGene_175128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCCCTGTGGGAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168170	146116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6833_pilon_-_146185_146624_146778_147269_147379_149717_149852_151065_151266_153679_153778_155445_155584_157115_157244_157533_157640_161163_161284_164481_164644_166320
922672	contig_10753_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_105141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATACTATGTTGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305318	307550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_305300_307600
922673	contig_6898_pilon	+	3505	7	Intergenic	novelGene_35706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	687.868204430665	37	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	131	850	59668	116840	TRUE	20	CCCCTTGCTACTCAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRYNSDLS	59537	120180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_118774_119458
922674	contig_9189_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_165109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCAAAGAGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273222	275015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_273200_275000
922675	contig_12938_pilon	+	10219	3	Intergenic	novelGene_99737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1772	junction_2	324	14	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	6253	6645	80440	80832	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNMYCVHGALIAQWIGKNNVRRQLICPLEAWSLVVGKEYIFLMKQEKAYKGLSRQEQKPPAHVWTSLVVSRVKWEWEENLNLCCEHVSALPQFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKVCYKEHNSLSY	74187	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_83470_84550_84635_85468
922676	contig_12638_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_33359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTCCTTTTCATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1435804	1433841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1433800_1435800
922677	contig_2550_pilon	-	2761	3	Intergenic	novelGene_135663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	564	1214	1169694	1169044	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGSYKNSININIQKSVGFLYISKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGRNMTRDVKDLYKENYKTLLHETQKDLQKWKNISCTWIGRLNTVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCW	1177203	1167455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1168605_1168645_1169871_1176816
922678	contig_6710_pilon	-	561	2	Intergenic	novelGene_91693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	3	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1	354	657176	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657176	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
922679	contig_15821_pilon	+	3072	2	Intergenic	novelGene_25031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1407	1835	181049	181477	TRUE	75	TAAAAATTAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASASSQNKESSNRLEEENFLEFPEVEFKRLIYRTLQDIRKEIMQNAEQAKEHTDGAIEELKKIIQEHNDKFNRLQVSIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIQAMEVRIGEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEET	179642	205106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_181576_203967
922680	contig_11267_pilon	+	517	1	Intergenic	novelGene_175384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTCTCCTATATATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217041	217558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11267_pilon_+_217000_217600
922681	contig_14744_pilon	-	2224	8	Intergenic	novelGene_66013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_5	460.276935271427	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	68	577	969897	968300	TRUE	65	ATAAAAATAATAGCAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969964	960517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_965701_965811_967273_967450_967855_968630_969717
922682	contig_6086_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_171460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGCCTGGGAGTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29848	28049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_28000_29800
922683	contig_6767_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_174619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTGGAATAGAACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33598	35559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_33600_35600
922684	contig_21422_pilon	+	2663	1	Intergenic	novelGene_79081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCTCTGTAAACTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27046	29709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_27000_29700
922685	contig_19558_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_164753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATACTGTGTTTTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171328	173243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_171300_173200
922686	contig_17074_pilon	+	3159	12	Intergenic	novelGene_145111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	204.077120408879	6	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	548	1390	214186	223655	FALSE	40	ATACGGATTTTGAATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLVDWFPVFRDLVNIGLKAFAFCVATSLTLLTVAAGWLFYRPLWALFIGCLALVPIIIARTRVPAKKLE	207919	225424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212584_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_223452
922687	contig_12948_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_126168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTCAAAAAACCTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106384	105645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_105600_106400
922688	contig_6227_pilon	-	3394	1	Intergenic	novelGene_49640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	3077	3391	373595	373281	NA	20	GAGTCCTCCAACTTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIVLGFIFRSLIHLEVVFVYGMRYGSCFIFLQMDIQFCQHHLLKTVFSPFDGLWTLVEDQVTVGGWIYIYVLSSVPLVNVCVVVPVPGCFDYCSCTVGSEVR	376671	373277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_373300_376700
922689	contig_5484_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_151093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218575	220805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_+_218600_220800
922690	contig_7207_pilon	+	3089	1	Intergenic	novelGene_72095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710670	713759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_710700_713800
922691	contig_11629_pilon	+	553	4	Intergenic	novelGene_161191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_3	90.033327162779	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	468	86	553	165444	412378	FALSE	15	ACCTGTGTGATGTGCCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCF	165358	412378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_165525_251949_252077_311582_311753_412288
922692	contig_16103_pilon	+	454	3	Intergenic	novelGene_118702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGCGGGGCCGGCCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198304	199900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_198548_199035_199195_199848
922693	contig_14472_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_111166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	923	1282	228849	229208	NA	35	GGTCAGAACCAACTTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLSIISHGSKILLKIIQKRLQQYIDREVPEIQAEFRRECGTRDIIVDVRRILTESREYRKGVYLCFIDYEKASDCVDHNKLSITLQRMGIPEYLIVLRRNLYIDQEAVVQTQQGDTV	227926	230098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_227900_230100
922695	contig_18214_pilon	-	2576	2	Intergenic	novelGene_166019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAACTCACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204197	192059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_-_194569_204130
922696	contig_2715_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_173171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	16	435	103307	103726	NA	70	AGAAAAGGAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNRNTMSGCFSKEKFILSQSSRLQVQIWASAPGEHFLRWLWRKVRVINLPLVWELLSTGTSGPKDVLCPRHCFLGGVSFPYVSAHFSLLYLKRDWLKTLSNLVDLISITAAYPSYYYIIVIEFQHIRKSHQITKWYTMIRYWKS	103291	105185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2715_pilon_+_103300_105200
922697	contig_10940_pilon	-	3154	2	Intergenic	novelGene_49183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTTCATTATATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178215	174612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_177089_177537
922698	contig_15787_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_143979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATGGTTACAGAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70493	68046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15787_pilon_-_68000_70500
922699	contig_19098_pilon	-	2531	1	Intergenic	novelGene_65856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCCAGTGCCCCGGCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481325	478794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_478800_481300
922700	contig_8673_pilon	-	804	5	Intergenic	novelGene_129930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	176.669182372025	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	338208	330949	TRUE	45	AAGTGTACATAATATTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGFHKPKMYRSIEGCCICRAKSSSSRFTDSKRYEKDFQSCFGLHETRSGDICNACVLLVKRWKKLPAGSVVDARAGPSLKTTLKPKKVKTLSGNRIKSNQISKLQKEFKRHSNSVSLLQ	338210	324127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8673_pilon_-_324477_330858_330971_335506_335638_336691_336774_338080
922701	contig_13021_pilon	+	2590	7	Intergenic	novelGene_8212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	72	junction_5	3194.33335507322	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	67	627	177472	178956	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLGAVFVARPRHDNRRTRGGWRTSDRLAASSRLER	177405	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_178855_180211_180440
922702	contig_9528_pilon	-	2388	1	Intergenic	novelGene_172344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248846	246458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_-_246500_248800
922703	contig_11594_pilon	-	4652	5	Intergenic	novelGene_80874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	315	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCACTTCCTTTTCTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259270	3982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_5621_160918_161130_162230_163606_200463_201808_259186
922704	contig_10549_pilon	-	2787	8	Intergenic	novelGene_110624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	95	328	454696	454463	TRUE	10	GGCGGGTGCAGCCTCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSLASCSSTSGFFQGDSPLAAPGGNLIFSASMETFRMLFPLLLLLSAFMLSFKLGSLTTAEELKFTSDFPLFFPWTQSLDSSSFMMPTSVMWHGTWSSVLDPLRALYE	454790	371092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_371179_414194_414667_426013_426165_428713_428851_440131_440214_441149_441266_442842_443645_453849
922705	contig_6102_pilon	+	1883	10	Intergenic	novelGene_31928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_4	234.612683184672	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	2	400	380335	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	380333	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_394036_394221_394272_394467
922706	contig_4832_pilon	+	1158	4	Intergenic	novelGene_163418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	64.1162139313363	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	170	772	497716	498947	FALSE	30	GTAAGCATTTTTGGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKEF	496122	499333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747
922707	contig_4678_pilon	-	1608	1	Intergenic	novelGene_126011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAACAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247165	245557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_245600_247200
922708	contig_9415_pilon	+	1320	1	Intergenic	novelGene_109743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAATCCTAATAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583874	585194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_583900_585200
922709	contig_7963_pilon	-	3408	11	Intergenic	novelGene_58439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	478.22693357861	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1757	2809	120716	118203	FALSE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	124026	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121863_121916_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746
922710	contig_20165_pilon	-	2203	2	Intergenic	novelGene_54491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGACTTTTTTTTTTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309223	271053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_273114_309080
922711	contig_7066_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_42170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	77	544	916129	915662	NA	60	AATAGTGCAGGATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRHPIYGAFSPIARIHGSRNRGVEMGVAPLSTTFSDPLTKFLLPIPMTLCSAGLEILVPKRGMLPPGDTTLIPLHWKLRMPPGHYGLLMPLDQQAKKGVTVLAGVVNPVYQGEIGLILHNGDKEEYVWNTGDPLGCLLVLPCPVIKVNGKLQQSNSDMTTKGPDHSGMKVWVTPPCTES	916205	914613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_914600_916200
922712	contig_9653_pilon	+	6300	1	Intergenic	novelGene_48208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	951	1268	194038	194355	NA	20	TCTCCCGTGTGTTACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQPFFGSPLPFPDLDRLSNNFPFGLVGTVTPLLRDSLPLSLTESPLPESRDEFFRSLLFALALILASLMEDAEIQFPFISFFISSVSTFSSSPEKKESLKLSGS	193087	199387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_193100_199400
922713	contig_19459_pilon	-	817	6	Intergenic	novelGene_59894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6441.90786646316	1	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	409	750	11335	7003	FALSE	55	AATAATTTTTTAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	15702	6935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
922714	contig_7457_pilon	-	2323	6	Intergenic	novelGene_31407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_5	155.817072235362	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473218	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471292_471559_472039_472730_472768_473151
922715	contig_10811_pilon	+	2542	2	Intergenic	novelGene_165782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	13	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	81	323	10534	10776	TRUE	15	CTCCTCTTCAAGTTGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AACGCRAAHCRCLSSHPPAHELGLLQMVLDLLLAELLSDVEAEGHGAFLLLAVFGVIAAESDELLAAAAAAIGLALAALGVLHHPLHLLAGWQQAVGVATLAGVHQ	10453	71791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_12349_71144
922716	contig_1939_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_144865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	325	777	283130	283582	NA	65	GAAGAAAGGAACAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIYAPNDRAAKYIQKTLTALKREINSSTMIVGDFNTPLSVKDRTSKKKLNKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTRHPIAAKYMFFSNAHGMFSRIDHILGHRAILNKIQHVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKNQLYGN	282805	283749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_282800_283700
922717	contig_6557_pilon	-	2566	5	Intergenic	novelGene_33031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	286	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1945	2361	639254	637621	FALSE	0	GCCTCCTTCCCGCCCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCPSFLWALSLHSHQEGDHKGFFFSPKTVTNNAISVTAGRALQKTKMYQYVVHSQLSNMKKDRATDALQCAPMAWMRLWVLLNMETPEKKPANSTAKRPRVTERAATSWISCFSYSSGVNVRGRQAWMLLSYPGPE	641198	637415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_637643_637824_637890_637991_638091_638838_638939_639123
922718	contig_9177_pilon	+	3981	1	Intergenic	novelGene_32764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323844	1327825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1323800_1327800
922719	contig_6165_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_167404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	884	1243	416801	416442	NA	80	ACAAAACAAACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSIVVGRIMVPLKCPSLTSETCEGYLTCQKGLTDIIKMGRLFWIIWILSPRWAQYNYMGPYKREADVSERLEDASLLALKMEEGIMNQGVWVVSRTWKRERNGLSPRASRRSSTVLIP	417684	416172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_416200_417700
922720	contig_1575_pilon	-	3783	1	Intergenic	novelGene_45165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1643	2086	70659	70216	NA	25	TTTTAACCCTGGAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPFSMNLYIFSSFLSVFCFNSWIILNIGDSNSLSVRSSAFSSTGWSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQYLFSSFIDCRFVCFVLVFLFYLVMSEQAGCAFFVCSSVGTILFTSFSNGQCQSLRYGTAGQVQLKGSY	72301	68518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_68500_72300
922721	contig_17144_pilon	-	1076	3	Intergenic	novelGene_29344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	941.5	268	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	338	781	166806	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183404	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_181794_181850_183158
922722	contig_8611_pilon	+	2361	1	Intergenic	novelGene_166558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	432	1929	2360	6401	6832	NA	65	AGGAAAAAAAATCAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGRINHEDITIVNIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQMDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKMENVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKS	4472	6833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_4500_6800
922723	contig_4876_pilon	+	1925	1	Intergenic	novelGene_137909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTTATCAAAATGACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615144	617069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_615100_617100
922724	contig_8538_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_4650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	609	1830	5	1834	841232	843061	NA	25	CAAATAGTGTTGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	841227	843127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841200_843100
922725	contig_615_pilon	+	1151	1	Intergenic	novelGene_80050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAATAAAATTCTATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54335	55486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_54300_55500
922726	SIRV6	+	1024	9	ISM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	386	400	170	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	265	10	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	154	645	1733	10736	TRUE	25	AGAGACCTATTCGTGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1473	11425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
922727	contig_7945_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_161616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAATTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707601	707076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_-_707100_707600
922728	contig_12402_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_133348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTGCCCAGCAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257394	255311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_255300_257400
922729	contig_13954_pilon	+	2700	1	Intergenic	novelGene_130052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1377	1805	43541	43969	NA	55	AGAACATAAAGACTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQHSISNHIKRQTMMASASSQNKESRNLLEEENCLELLEVEYKRLIYRTLQEIRKEIRQNTEQAKEHTDKAIEELKKIREEHNDKFNRLQESIERQQTDIQKFNNKISKLDNSIESHRSRTEAMEVRISEIEDKALDTN	42164	44864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_42200_44900
922730	contig_2043_pilon	+	1951	1	Intergenic	novelGene_169923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAATACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766275	768226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_+_766300_768200
922731	contig_6724_pilon	+	1316	2	Intergenic	novelGene_167960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATACATAAAAATGTCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191461	367524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_192272_367018
922732	contig_5686_pilon	+	2462	17	Intergenic	novelGene_45287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1619.9653111641	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	1060	1899	202891	215344	TRUE	25	ACTTGATCCAGCTGGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKLQVSTSGSQGAS	93829	224178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200417_200560_202871_203002_208031_208722_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043
922733	contig_13558_pilon	+	2256	2	Intergenic	novelGene_123016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	873	1832	40701	41660	FALSE	80	TAAAAGAAAAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNSSFSCTVYKNLEPFTYFFYLVFLVGIIGSCFAAWAFLQKNTNHRCVSIYLINLLTADFLLTLALPLKIVVDLGVAPWKMRIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFISIDRYLQLIHSYKIYRIQEPGFAKMLSTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKENPNVGCMDFKTNFGKNWHLLTNFLCVAIFLNFSAIILIPNCLVIRQLYRNKDNESYPNVKRALINILLVTTGYIVCFVPYHAVRIPYTLSQVEVIFDCSTRNLLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHLSRAFRLKVTETFTSQKETRTQTEKPRCENNA	36825	42084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_+_37429_40431
922734	contig_21065_pilon	+	1493	1	Intergenic	novelGene_176865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTTCAGTCGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12566	14059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21065_pilon_+_12600_14100
922735	contig_3469_pilon	+	4770	2	Intergenic	novelGene_34235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1084	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1941	2459	631870	632388	TRUE	55	TAATAATAATAGAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFIENTDKKLEEVRKIMQEQNAKINSQLGQKQLEIQKINNKISEIDDVIEGLRSRFETVEDRISGIENKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRATWDTIKSKNFRVIGIPERGEKRKHREDH	629929	634830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_633212_633342
922736	contig_20527_pilon	+	2749	5	Intergenic	novelGene_138555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	2	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	720	1346	13527	27453	FALSE	55	ACCAATGTCATAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12807	28856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
922737	contig_12229_pilon	-	1772	4	Intergenic	novelGene_169386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30.2103734943259	17	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1440	333	1772	98340	77524	FALSE	20	CCAGCCAGTGTCACCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSSSDLEKVSQGSAESLSPSFRGVHVSFTTGSTDSLASDSRTCSDGGPSYEPAHSPTNSGKKLFAPVPFPSGSTEDVSPSSPLQPPPLPQKKIVSRAASSPDSFFWTQGSPKPRAASPKLNVSHSETSVCIHEDSPFSYSLSTGNRHHHVFSASEPLEKTCKGNSHWAPAAGLAGSKSGRGSPSLQGKGAPSASSSQLSVSSQASTASSQLHSLLSSISSKEGTYAKMGGLFTQSLLRLVAKCEDLFMGGQKKELHFNENNWSLFKLTCNKPCCDSGDAIYYCATCSEDAGSTYAVKICKTPEPKAASYCSPSVPVHFNIQQDCGHFVASVPSSMLVSPDGPKDPLPALPSHPPAQEQDCVVVITREVPHQTAADFVRDSATSHRAEPEVYERRVCFLLLQLCNGLEHLKEHGIIHRDLCLENLLLVHCTPQASQPATSGKPTAAPTPSSSAATSNAPPITTASAPAATPSTCSSTTL	122763	77523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12229_pilon_-_78067_85374_86127_98195_98354_122444
922739	contig_11281_pilon	+	3215	1	Intergenic	novelGene_125516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGGATTTCAGGGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966660	969875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_966700_969900
922740	contig_5023_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_7143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTATTATTTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334230	332698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_332700_334200
922741	scaffold_880_pilon	-	1506	8	Intergenic	novelGene_121506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTCCGGAAGTCTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576367	556616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_556672_557483_557604_559497_559590_563955_564193_567761_567906_569208_569319_575183_575360_575795
922742	contig_3277_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_74740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1604	1933	274712	274383	NA	65	TGAAATAAAAACTGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYIQLWGIVTEVLKAYRQPAKIHPPTGAKENEENQRHRERLIQRTKGQLMDHNYHNPRKTESRTTNNCSGSDRNRRVPDRAGEKCGTKFKFTKEKKKEKDQACWSHRD	276315	273632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3277_pilon_-_273600_276300
922743	contig_14514_pilon	+	3717	9	Intergenic	novelGene_137478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_6	5.45435605731786	61	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	620	1863	1151	3013	80353	95644	FALSE	25	ATTTTATGTTCGTATGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSCPWRRCRPGRAVHWPLLLLAVLILLFSLPFFIEEPNTKPSRYQGTENIKQRSLELPQKANSQAPTVGRRTTACVKSARENSMLGKQLESRAHAAEESRTAEPREDPAVKASPGEQVRAPSTAKMGSQKSQEKQQTVAEILSPGCQDKRTATGRTGTPSLQSQDMKIAREVGSQHKQPTTPRTVPMKDKGTATAKRLTLGGQGMTPTTSAGVRGGRLSTRNRKAGVTPAIIQKKSTSVSIRTQPKATPKVKLKGLPSEERAASQGPTAQRAQRLKATNFKSEPRWDFEENYSLEVAALQTSCPDSVKVKASQSQWLQHLFLPNLTLFLDSKRFTQSEWDRLEHFAPPFGFMELNYSLVQRVVSRFAPVPQQQLLLASLPPGEPQCIRCAVVGNGGILNNSQVGREIDSHDYVFRLSGAVIKGYEQDVGTRTSFYGFTAFSLVQSIFLLGRQGFQHVPLGKNVRYLHFLEGTRDYEWLEALLLNQTLMGNNFHWFRRRPQEAFGEALPLDRYLLPHPDLLRYMKNRFLRSKTLDTVHWRIYRPTTGALLLLTALQLCDQVSAYGFITKGHERFSDHYYDKTWKKLVFYANHDFKLEQVLWKRLHDEGIIWLYQRPELPK	79202	96348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_80484_91973_92749_93553_93723_93866_94039_94269_94409_94623_94728_94903_94994_95075_95176_95461
922744	scaffold_13505_pilon	-	3711	6	Intergenic	novelGene_111542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	502.010916215972	7	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	43	1020	603235	594258	TRUE	30	CATGTTCAATCAGTTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603277	591459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_592551_592657_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
922745	contig_3862_pilon	-	4007	3	Intergenic	novelGene_137418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1948	2280	587162	586830	TRUE	25	GGGGGATGCAAGTTTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECVKINILGISELKWTGTGHFELDNHMVFYARNDKLKRNGITFIDKKNISRSIAKYSPVSDRIISVRLRPVNMTIIQIYAPTSNAKDEEIEDFYQLLQSEIDRHEIRMH	589109	580460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_581400_585351_585703_586392
922746	contig_11386_pilon	+	3106	8	Intergenic	novelGene_82753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	451.852829571573	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	790	1452	17940	34094	FALSE	65	ACAAGTGAAAAAATAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRV	7876	35748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_7965_11061_11261_11370_11585_13558_13752_17844_18037_19625_19980_20816_21022_34087
922747	contig_1406_pilon	-	4534	1	Intergenic	novelGene_25481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	141	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAAACAGTAGTAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1313494	1308960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1309000_1313500
922748	contig_16622_pilon	+	5045	3	Intergenic	novelGene_48501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	3684	4181	126378	128793	FALSE	15	CGAGGACCGTTTGCATGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLGCNDLRAGPCYLASPGGTLLPSLGTLCRAFLLHLQVPSPEELLLSSSLQLLSLLGPQCLPHLTASGHVMAAAAALTGLLPALTLGFVALSPLGQAKGGPGVWADHDDLLSTCCAGLPVPGIAAWICQMVRGRRRGGVRRWAKKLLSPWTRGTEIVQRSIDVG	122543	129657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_126120_126270_126422_128339
922749	contig_3077_pilon	+	1993	10	Intergenic	novelGene_26874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	83.902647878286	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	209	1183	1337887	1346705	FALSE	75	AAAGAAGTAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCRRGSNIALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREATLHYLRTAGHPLSRWALQHQPPSPRQLEEEFMKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337048	1347515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337103_1337732_1337906_1338437_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
922750	contig_15327_pilon	-	749	4	Intergenic	novelGene_70672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	70	junction_1	2538.47176247617	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	132	431	901528	900755	FALSE	85	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQDECEK	902159	900436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900773_901126_901281_901400_901536_902035
922751	contig_6589_pilon	+	428	1	Intergenic	novelGene_26278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2251144	2251572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2251100_2251600
922752	contig_8354_pilon	+	1155	1	Intergenic	novelGene_24084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTCATCGTAATGGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146764	147919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_+_146800_147900
922753	contig_3956_pilon	+	1264	6	Intergenic	novelGene_15095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1579.64839125674	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	78	1070	1281682	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281604	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282713_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284753_1290491
922754	contig_10793_pilon	+	1320	13	Intergenic	novelGene_83403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3414.57084500462	1	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	112	909	152890	163295	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEGK	130878	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130955_152854_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163303_163944_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
922755	contig_4091_pilon	-	2912	4	Intergenic	novelGene_173015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	658	960	56589	56287	TRUE	20	GCTAGTGGATTCGAACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	57246	10861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_55003
922756	contig_5062_pilon	+	3187	1	Intergenic	novelGene_157844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627961	631148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_628000_631100
922757	contig_8138_pilon	+	3223	9	Intergenic	novelGene_52493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTCCAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346451	467532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_347388_347713_347803_351791_351875_351977_352125_360254_360349_362854_362925_373949_374019_408726_409654_466724
922758	contig_18850_pilon	-	2759	7	Intergenic	novelGene_142419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	384	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	181466	181095	TRUE	10	CTGCGCCACTCGTACCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LERDLPRLAGVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181468	171870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_172057_176353_176463_176669_177108_177568_177654_177998_178052_178212_179146_180513
922759	contig_13744_pilon	+	1027	8	Intergenic	novelGene_77147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	50.4599255016558	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	189	1025	116284	147512	FALSE	25	CCCAGCAGTGAAGGTAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRQRKGIKATELSEDRPAQDENVKVENKLPSGCTSGGVWRILSFAVGGTVALCSGLLTSVYLATLHENDLWFSNIKEVEREISFRTECGLYYSYYKQMLQAPTLKQGLHGLIYDNKTESMRTINLLERMNIYQEVFLSILYKVLPIQKYLEPVYFYIYTLFGLQAIYVAALYVTSWLLSGTWLSGLLAAFWYVTNRIDTTRVEFTIPLRENWALPFFAIQIAAITYFLRPNLQPLSERLTLLAIFVSTFLFSLTWQFNQFMMLMQALVLFVLDSLDM	113669	147514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_113835_116260_116384_121070_121205_140241_140333_144434_144557_145170_145317_146734_146859_147392
922761	contig_5643_pilon	-	4455	2	Intergenic	novelGene_38955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGCCATTGATTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493192	488479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_492095_492352
922762	contig_11338_pilon	-	1942	4	Intergenic	novelGene_6144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6837	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_893_2631_2779_4517_4665_6081
922763	contig_10482_pilon	+	1431	3	Intergenic	novelGene_152850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_1	75.5	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGTAAGTTTTGTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171909	177960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_173167_176056_176185_177914
922765	contig_19076_pilon	-	969	1	Intergenic	novelGene_74201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGCAACAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90349	89380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_-_89400_90300
922766	contig_12179_pilon	-	2523	2	Intergenic	novelGene_127995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	977	1417	490662	490222	TRUE	55	TGTGCACTTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLFETPEVMAIPFETEAAQLLAFFASSASASCGLLALRPHTRICPAGASVPKLSSSTNKCLEAPHSTRKPCATHRHSALLLRGQAPVPSCTGLLVLLLLVLCHSRSSATAGSLPLLLLCCCRFSASATALSIQFQNHFHILGIF	491638	489007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_-_489921_490028
922767	contig_9666_pilon	-	1688	2	Intergenic	novelGene_178153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1017	1451	109209	108775	FALSE	25	GACTGCTCTGACCAGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCIHHSSIMQNKFTALKILSASLSHPSPPWLEHLATTDLFTVCTVLLFLECHIVVSIHYVAFSDWLLSLRNMRLSLLQLWGLESLKSMWQTSGLKTQALLRQNSSFSKGHGSPIDTSKLPEGLNCWAQGCGDHGLREHLAQLA	110698	108537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9666_pilon_-_109298_109770
922768	contig_13295_pilon	-	1942	1	Intergenic	novelGene_31233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	171	542	91755	91384	NA	20	TGACGGCAACAGGTCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWAEGRVKTQFAQFSPCSRLGDALGPPASRVPTQVSPERAAWSISSLRHPLLGTLISLEEKGRWWADGIDGHGGFKIPSNLESTSCCRATPTHGDPMCVRVELCSIGFSVVDLLEVDHQAFF	91925	89983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_-_90000_91900
922769	contig_7411_pilon	-	2697	1	Intergenic	novelGene_136992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	288	593	221797	221492	NA	60	TAGTAAAAAAGAAAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYSGLDFACGCRCSKLQMELKILQDQRICLSLQSTGLIRIKTHCRGVDSDSQDRVELPHSVSNTWWIRTAIAFNHYTTRVSLIRMGNLNIGYLKWREIKA	222084	219387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_219400_222100
922770	contig_5918_pilon	-	3926	1	Intergenic	novelGene_99546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATAACTTGCTCAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747622	743696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_743700_747600
922771	contig_11126_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_138126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTACAACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299059	300405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_+_299100_300400
922772	contig_6102_pilon	-	2681	9	Intergenic	novelGene_32003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	96.6135989392798	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	412	1017	455625	450744	TRUE	80	AAGGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYDVTRFQGDVDEDLICPICSGVLEEPVQAPHCEHAFCNACITQWFSQQQTCPVDRSVVTVAHLRPVPRIMRNMLSKLQIACDNAVFGCSAVVRLDNLMSHLSDCEHNPKRPVTCEQGCGLEMPKDELPNHNCVKHLRSVVQQQQTRIAELEKTSAEHKHQLAEQKRDIQLLKAYMRAIRSVNPNLQNLEETIEYNEILE	473516	448615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_449892_450263_450405_450496_450852_451251_451388_452090_452363_455535_455649_470683_470869_472780_472890_473422
922773	contig_7291_pilon	-	2107	2	Intergenic	novelGene_106312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	153	452	204167	203578	FALSE	40	TGGGAAGATACAGGGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPNPLCLPISPPDRSCPFGLLYLLELRGTLLLGITLCPTVQSNPCLKSWPRKLFCSGVTERPGAMLSGAPPVLLRPLSLVFFLEHFLNKLCYAS	204319	201922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7291_pilon_-_203613_203902
922774	contig_7179_pilon	-	3114	1	Intergenic	novelGene_78141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACACCACATCTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990880	987766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_987800_990900
922775	contig_12624_pilon	-	1774	2	Intergenic	novelGene_60971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61342	21407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_22743_60903
922776	contig_7045_pilon	-	2011	6	Intergenic	novelGene_77488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	162	junction_3	50.6343756750293	10	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	211	927	572142	552552	FALSE	40	AGAAATTTTTGAAATGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEKNAFISCIWKLNQRYLRKKIDFVNVSSQLLEESVPSGENQSVAGGDEEAVDEYQELNAREEQDIEIMMEGCEYAISNAEAFAEKLSRELQVLDGANIQSIMASEKQVNILMKLLDEALKEVDQIELKLSSYEEMLQSVKEQMDQISESNHLIHLSNTNNLKLLSEIEFLVNHMDLAKGHIKALQEGDLASSRGIEACTNAADAILQCMNVALRPGHDMLLAVKQQQQRFSDLREHFARRLASHLNNVFVQQGHDQSSTLAQHSVELTLPNHHPFHRDLLRYAKLMEWLKSTDYGKYEGLTKVWI	577310	551467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_552714_568441_568552_569434_569568_569765_569994_572058_572247_577204
922777	contig_5434_pilon	+	3148	1	Intergenic	novelGene_74687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCATCTTTGGCTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370236	373384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_370200_373400
922778	contig_12379_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_148925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57848	56507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_56500_57800
922779	contig_9653_pilon	-	2509	4	Intergenic	novelGene_48267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_1	942.595471144553	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	202	615	1009606	1006903	FALSE	15	TGGATTTGATGTGGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1014237	1005008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126
922780	contig_7840_pilon	-	2360	2	Intergenic	novelGene_68965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGCCGCCAGTAGCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185351	130667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_130707_183030
922781	contig_18081_pilon	+	4275	1	Intergenic	novelGene_23806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	584	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATGACAACAACATCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143676	147951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_143700_148000
922782	contig_10855_pilon	-	1527	2	Intergenic	novelGene_124330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAGCAAATCGCCAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545611	516891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_516928_544120
922783	contig_6546_pilon	-	505	4	Intergenic	novelGene_140966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	55	420	599635	597660	FALSE	15	AGTCCGCACGCTTGCGCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSDSSDSSFFASTFFSSAGAAAVEGAGPPAGAAPAAGAGPPAPTLQMRLPMLTLARAFANKPGQKGSTFTPAALMRALILSSVTVTSSSCRIRAEYMQASSETEAMARECWAGGCRARC	599689	597574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6546_pilon_-_597774_598337_598412_599244_599363_599575
922784	contig_9389_pilon	-	3138	4	Intergenic	novelGene_84092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	10.6144555520604	45	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2535	33	2567	1291468	1286098	FALSE	20	ATCTTGTTTTTGGTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSWGPSVTILHIRKSQGGISTALTGVRSKRYSSAFKLPSALLPLPSLFLKCLLVHRVDVLLDFQKLEKEMDSVVIEDVAVVFSQEEWALLGLAQRKLYRDVMMETFRNLASIGEISKSHGNKDHHKNQRRYLRSHTVYNFCESNEGNQCGKTISRILNLTLLKRNAPEVNPFECCECGKTFMDHSSYKHHTRTHTGCDACQCKECGEACSCPSHLTTPMRTLKRMKRHKCKTCGKDFVCISALKNPVTTLNGEKRYECNECGKYFCSFSSFWTQVRDHKHECKERCKTSTRPSSLLLHKKFCNRLKPYERKKCGKAFTETSSVTPHINTHSAESPYKAKQCGGAFSQLSHLTTNIRAHDTQRPYECKEYGKPFSDSSALITHIKTHTGDRPYECKQCEKSFTCSSALTTHTRSHNGERPYKCKECGKTFIDCSAFTTHTRTHSGERPYECKECGKAFRSSSHLTAHIRTHSGERPYECKECGKAFRQLSALTIHTRTHSGERPYECKECGKPFSDSSALTTHIRTHTGERPFECKSCGKAFSDSRALIKHTRTHTGERPYECKECGKAFRQVSHLTNHLRTHSGERPYLCKECGKAFRRASNLSIHIRNHSGEKPYECKECGKSFIRSSLLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRQLSALTTHIRIHSGERPYECRQCGKSFTCSSALTIHMRTHSGERPYKCKECGKAFIDFSALTTHIRTHSGERPYECMECGKAFRSSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRQLSALTTHTRTHSGARPYKCKECGKTFRSSSHLTTHRRIHTGETPYECKECGKSFRKASNLTTHTRIHSRKRHYKL	1291500	1285526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1288229_1288834_1288896_1289866_1289994_1291252
922785	contig_1450_pilon	-	3386	1	Intergenic	novelGene_27381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTAGAGGAAGTTCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253820	250434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_250400_253800
922786	contig_12786_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_103442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCCCAAAATCCATTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623962	625979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_624000_626000
922787	contig_17144_pilon	-	2329	12	Intergenic	novelGene_29297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2202.12389589972	11	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	136	1023	179764	173536	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	183217	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167631_172649_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
922788	contig_6227_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_49679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATTGGCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	862088	864257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_862100_864300
922789	contig_10023_pilon	+	542	1	Intergenic	novelGene_123495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTGAGAAGGGAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221395	221937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_221400_221900
922790	contig_4125_pilon	-	2248	8	Intergenic	novelGene_25240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_2	30.2600969824579	78	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	97	636	2803242	2799229	TRUE	30	TAAAATCATTGATGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITVWSLCTKSISYIKYPKACQQGITFTRDGRYMALAERRDCKDYISIFVCSDWQLLRHFETDTQDLVGIEWAPNGCVLAVWDTCLEYKILLYSLDGRLLSTYCAYEWSLGIKSVAWSPSSQFLAVGSYDGKVRILNHVTWKMITEFEHPVTINNPKIIVYREAEKSPKLGLGGPSLPTPESSGQASLHHGDEIMGTIEDLPQRDAGGPNGF	2806594	2797183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_2798069_2798501_2799287_2799703_2799811_2801538_2801617_2801731_2801867_2802243_2802331_2803167_2803272_2806527
922791	contig_12740_pilon	-	3146	2	Intergenic	novelGene_159208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2603	2941	50249	49700	FALSE	40	CAATTGCAGCTTTAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQTSCGRTLENHKGRTNLAFLKLKELREKIQASRCNIEGFLGKILNDSGCNQRRWKEYTESLYLKELVKVQPFQEVAYDQEPTILKEEVQAVLMTLVKNKAPGADWNTS	52851	49494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_50006_50216
922792	contig_7976_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_169422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CATTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878721	879716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_+_878700_879700
922793	contig_15666_pilon	-	1959	7	Intergenic	novelGene_70176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	593.714694856788	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	864	1295	108757	107816	FALSE	20	AAGTGATGTTGCTTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110832	107151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110047_110134_110246_110558
922794	contig_13982_pilon	-	1464	1	Intergenic	novelGene_163478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	114	461	346397	346050	NA	20	AGGAGCCCAGGTGGCACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIKSIFLIKVLGVYFAHSLTVLKFFCTSPAPPRHIYFPKGEERSGFYLNLALRMTSAAKKTGDNWESGLTERRRSCRVMWENRSTSEKKLWQVRSGPGSEIEPKTQTSSSRTLS	346510	345046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13982_pilon_-_345000_346500
922795	contig_12948_pilon	+	2354	3	Intergenic	novelGene_126163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1	85	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1375	1689	62090	62404	FALSE	45	TTTAAAAAACTTTTAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAQEYGARLGTPNPCRGIFCGTPVLGHYFPTEGQFLCPLQDILRFWFKNPWGPLRAFQGICKVLPFSIPYLREFGFSSYLSTTTCHIRLNAETVMRTQLSSIN	32670	63069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_33385_61012_61637_62053
922796	contig_7408_pilon	-	2355	7	Intergenic	novelGene_168735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_6	231.823687793595	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	692	1513	36909	12597	FALSE	35	GAATCAAAGTTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVGWTAINAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48275	11754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47877_48040_48129
922797	contig_5031_pilon	+	6876	37	Intergenic	novelGene_133164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	602	79	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	737	1198	6435	7304	TRUE	20	CAGCCCCACTGGGTGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQAGCVFFVVCSSEGTILFTSSSKGQGQSLRYGTAGQLQLKGSCWDGWLVARTRADSVDLESVQGRLAMPVLLGKGAPKQRKEKENKQIKTEQMTAKKQNPGGPSSMVARAGKQFHSRVVFHSLSGRSKDSAQSQVFDRKEGKVVRGKEEI	5602	107457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_5825_5920_6664_7071_7808_25230_26554_28336_28510_29747_29942_31417_31482_32666_32782_34524_34574_35154_35233_35919_36047_36696_36795_41693_41776_42564_42708_42900_43097_70817_70902_72097_72188_72790_72926_73683_73806_75202_75304_75988_76117_77691_77812_80340_80512_84575_84663_87129_87301_88118_88305_90740_90851_92326_92422_93663_93813_94578_94674_97341_97488_98638_98725_99041_99111_102698_102764_103674_103799_105905_106016_107368
922798	contig_14773_pilon	+	3840	14	Intergenic	novelGene_174763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGACCACTGAGCTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60612	104716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_+_62685_63416_63573_66002_66086_67005_67094_70607_70717_73608_73755_81794_81899_82196_82302_84428_84518_87118_87195_88192_88336_100167_100260_103736_103840_104242
922799	contig_10163_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_82613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11368	9915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_9900_11400
922800	contig_1516_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_49912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47415	45361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_45400_47400
922801	contig_34_pilon	-	373	1	Intergenic	novelGene_39986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCTAAGTTGCCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211881	211508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_211500_211900
922802	contig_8729_pilon	+	3548	1	Intergenic	novelGene_40129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	324	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	611	1078	568620	569087	NA	45	CATTGAACCACATAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARERACSLLHPPRLARGGGDETVSVPLCHPILPPHTWCEVEAVPLYPHPPSVTPSIYLPSEGQRSCNCMCIPSEAVSSLALPSARWKWSEYMHICPLHLPSFPRPMTGGCDVTEKTHLPFLPPSLYLRGSKGRATADTSACYPTTTHTPSTGNK	568009	571557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_568000_571600
922803	contig_10500_pilon	-	3417	7	Intergenic	novelGene_41264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1009.50763576442	76	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	991	1443	1635143	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1637831	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635145_1635518_1635617_1636940
922804	contig_15135_pilon	-	2344	4	Intergenic	novelGene_119888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	884	junction_3	210.365290757662	3	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1399	1944	120151	113596	FALSE	45	TAAAGTTTTAAGCCTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDILEPESVIKPFEEKAAKRIMVICKALNLNLQGCVTENENDPVTNIEPFFLSVALYDLRDSRKISADFHADLNHTAVRQMISGLPMALENGNIDTVTPRQSDEPYIKGFPEEWLKFPKQVTHLIYYRMENACSVVLNNRSYKMGNFPKKYSLKAVL	122100	113195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_-_113932_119824_119981_120097_120182_120732
922805	contig_6862_pilon	+	2349	1	Intergenic	novelGene_63751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	1965	2348	72777	73160	NA	55	GAAAAAAGCAACACCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSERRGRWREASEKSEEAGKKSNTSCQQMAPREPPAWVCGIQAAGASWSRDCGRGKQRNKRTKAPGSHQRSSPDREAASHSNGPPQPLRKKQRWHTEPGTRANGGGGEKRQARNPKKQEKK	70812	73161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_70800_73200
922806	SIRV7	-	901	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	6	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAATCCTAAGAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147951	56039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
922808	contig_15970_pilon	-	598	1	Intergenic	novelGene_144055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTGACATCAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180821	180223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_180200_180800
922809	contig_4093_pilon	-	2148	7	Intergenic	novelGene_27632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	2226.85932923978	7	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	407	1144	69245	41737	FALSE	20	CTTTTCAACTACTTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	73872	40732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_73342_73642_73776
922810	contig_6418_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_81124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCAAATATATATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77508	78531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_77500_78500
922811	contig_11763_pilon	-	3783	1	Intergenic	novelGene_179047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	205	618	2099	2716	13454	12837	NA	40	CAAGAACTCTCAAGGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTGIKLTTSVERDNGKAQYHQSDTRPGANCRINHQFLTCKFKLKVKKIKSSPQETKYDLELIPPEFGDHLKNRIVAFNTNDQRPDELWDDIKDIIDEESKRSLKRQERKKRTKWMSEETKKFALERRVAKANGRTDKVKDLNRRFQRATQEEKVKYYNDTCKDLELEKQKRRTRSAFLKLKELKKKIQALSCNIEGFYGQNIE	15552	11769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11763_pilon_-_11800_15600
922812	contig_15970_pilon	-	2666	1	Intergenic	novelGene_144061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGCAAACACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201113	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_198400_201100
922813	contig_12019_pilon	+	842	1	Intergenic	novelGene_87758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATAGGTATTCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641855	642697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_641900_642700
922814	contig_3956_pilon	+	2837	15	Intergenic	novelGene_15013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1302.30281910662	14	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	81	1727	1281682	1289148	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLCIIEESGEHIIAGAGELHLEICPSLTAWQRTSTRVRCRPARSSSRGPVTWQRSTSGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287347_1287968_1288033_1288981_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
922815	contig_7459_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_174777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAGCAGTATAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121352	122262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7459_pilon_+_121400_122300
922817	contig_11337_pilon	+	1883	10	Intergenic	novelGene_107170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	113	junction_1	178.238985080339	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	58	1551	127468	172617	FALSE	30	CTGTGAAGCAATACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGRGRRWVSLAVSEDLSKAMSQDGASQFQEVIRQELELSVKKELEKILTTAPSHEFEHTKKDLDGFRKLFHRFLQEKGPSVDWGKIQRPPEDSIQPYEKIKARGLPDNISSVLNKLVVVKLNGGLGTSMGCKGPKSLIGVRNENTFLDLTVQQIEHLNKTYNTDVPLVLMNSFNTDEDTKKILQKYSHCRVKIYTFNQSRYPRINKESLLPVAKDVSYSGENTEAWYPPGHGDIYASFYNSGLLDTLIGEGKEYIFVSNIDNLGATVDLYILNHLMNPPNGKRCEFVMEVTNKTRADVKGGTLTQYEGKLRLVEIAQVPKAHVDEFKSVSKFKIFNTNNLWISLAAVKRLQEQNAIDMEIIVNPKTLDGGLNVIQLETAVGAAVKSFENSLGINVPRSRFLPVKTTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEKREFPTVPLVKLGSSFTKVQDYLRRFESIPDMLELDHLTVSGDVTFGKNVSLKGTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENKIVSGNLRILDH	102719	172949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_102763_127453_127582_128443_128552_159261_159448_160748_160883_162023_162322_168693_168892_169430_169674_171277_171383_172509
922818	contig_8447_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_69399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	584	889	23603	23908	NA	85	AAAAAATAAAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNKYRLNKWMAAKHRNSFNPVQPKGRIWKIPRGILQQHISASPVGAEAGTGWTFGTCLLTSEWKVSREQRSCYLSLHSPQLLGLHKSLRPGLVRQREAKN	23019	25662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_23000_25700
922819	contig_14664_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_169537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148606	149233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14664_pilon_+_148600_149200
922820	contig_10225_pilon	+	2247	13	Intergenic	novelGene_86823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	1055	2131	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20749	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46751_47260
922821	contig_10864_pilon	-	3108	1	Intergenic	novelGene_107081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	684	1019	897201	896866	NA	35	AGATGGAGCTGACCAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLCLFQPFGHKALCPAFPFLAVTHEPFFPFQIRKLKLQLEEERQKGPRSDSAVGDLAGLQNGTDLQLIEMQSRYWGRQFQSAQAVSGVGSLAGSEPVDIFLKRSQVTKKG	897884	894776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_894800_897900
922822	contig_16411_pilon	+	2094	1	Intergenic	novelGene_77264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTTTAATGAGAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6899	8993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_6900_9000
922824	contig_5916_pilon	+	2159	1	Intergenic	novelGene_158048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGGATCTTTGCATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384459	386618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_384500_386600
922825	contig_5171_pilon	-	1301	1	Intergenic	novelGene_161231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153245	151944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_-_151900_153200
922826	contig_18055_pilon	+	1583	13	Intergenic	novelGene_117803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	354.227200709124	3	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1563	20	1582	40653	85630	FALSE	70	AAGAAGAAGAAGAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLLVGMCSGSGRRRSSLSPTMRPGTGAERGGLMMGHPGMHYAPMGMHPMGQRANMPPVPHGMMPQMMPPMGGPPMGQKSMWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEK	40633	85631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
922827	contig_6102_pilon	+	2249	17	Intergenic	novelGene_31921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	448.411009670537	6	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	46	942	379014	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	378968	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394661_394765
922828	contig_9785_pilon	+	3423	1	Intergenic	novelGene_157902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1001	1300	502437	502736	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFETEAARLLVSLVSSASVSCGLSALGPHACIFPAGASVPKFCSSTGKCLEAPHSARKPHAHRHSALSLWGSAPVLSRTGVLVLLL	501436	504859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_+_501400_504900
922829	contig_3465_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_173403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAACCACTGGACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817958	820466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3465_pilon_+_818000_820500
922830	contig_13968_pilon	-	3036	2	Intergenic	novelGene_106869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	375	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	1369	2058	45600	30850	FALSE	25	GGACATAAGGTTGCTATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVKNEVEYIKIDILGISELKWIGMGHFELDNHMVYYAGNDILKSNGIAFMVKKNISRSILKYKAVSDRIIVICLQGRPVNMTTIQIYAPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNAKVGNKEGSVVGKYGLGDRNDGGDCNLLKIIKNLLQHTSTGNCHKFKPDSEEDMEPGISLLMSDGPWLKAETIRKMFTCGVFVFFFLLCKSIQLCGS	46968	29871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_31034_45094
922831	contig_19013_pilon	+	2403	2	Intergenic	novelGene_162083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	173	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTATTCCCAACAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25203	48626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_25282_46301
922832	contig_3529_pilon	-	6681	2	Intergenic	novelGene_105370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTATTAGCCCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610896	603125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_605053_606142
922833	contig_6674_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_148037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAGGGGCGCCGGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446894	445686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6674_pilon_-_445700_446900
922834	contig_366_pilon	+	3974	1	Intergenic	novelGene_51602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	780398	784372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_+_780400_784400
922835	contig_1813_pilon	-	2060	5	Intergenic	novelGene_105503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	12.9301005409857	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	138	821	364980	342138	FALSE	15	CACTTGCGGATACTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAASLLPVLALGLQPGDTVLDLCAAPGGKTLALLQTGCCCNLAANDLSTSRTSRLQKVLHSYVPQDIRDGTRVRVTSWDGRKWGELEGDTYDRVLVDAPCTTDRHSLHEEENNIFQRSRKKERQTLPLLQVQLLAAGLLATKPGGYAVYSTCSLSHLQNEYVVQGTIELLANQYSIEVQVEDLTHFRKLFMGTFFFFPSCQVGELVIPNLMANFGPMYFCKLRRLT	392326	340898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_-_342415_343026_343152_362125_362287_364859_365015_392223
922836	contig_15498_pilon	-	3007	1	Intergenic	novelGene_42702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	863	1192	886204	885875	NA	40	GTGATCACAACACTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTNLQSINKENNSRISRRQQTISKHTEKRDNMAPVSNQNKTPDDLTVKEDGLELLDREFKNLIFKAVQQVRKEMKENTDKTKEKIDKIMENTKSGKTLTKQWKNSGK	887066	884059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_884100_887100
922837	contig_3103_pilon	-	2271	1	Intergenic	novelGene_146190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	191	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	305	697	69174	68782	NA	45	GAAAATTTACCATGAGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEIVGKEGITGTKQFRRTHYISPQGLKIVLCSPRPFRQWPFPPDSGCWPHSLDFGWSPLGPGLQLHLLGPLECNFSPSHLGSPILLVHLSGNLTPSALAGSILLPLGQWIWPHPIGTSERQPHTLELSW	69478	67207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_67200_69500
922838	contig_11633_pilon	-	2583	2	Intergenic	novelGene_179049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	987	1597	2583	1850	864	FALSE	35	GAATTATTAAAGGGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQ	3612	863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11633_pilon_-_3329_3494
922839	contig_11986_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_69185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589358	588041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_588000_589400
922840	contig_6058_pilon	-	1502	6	Intergenic	novelGene_172410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	165	junction_5	353.172139331516	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	679	1335	390928	385415	FALSE	30	TCAAGAAACTGTATTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKKCKLFYKKYNEFKEKGVGTLHLKPTGNQKTQLLVRADTNLGNILLNVLIPPNMPCTRMGKNNVLIVCVPNPPIDEKNATTPVTMLIRVKTSEDAEELHKILLERKDA	395740	385247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387923_390675_391339_392479_392667_395659
922841	contig_3747_pilon	+	2475	8	Intergenic	novelGene_24910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	90	1097	201481	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201391	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
922842	contig_11026_pilon	-	2877	1	Intergenic	novelGene_167669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGATACAGTAGCCCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170099	167222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_167200_170100
922843	SIRV7	-	878	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-31	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	30	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTACAAAAATGTATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
922845	contig_6445_pilon	+	1207	11	Intergenic	novelGene_76880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGGTCCTCATACAATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42867	85391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_43153_44514_44579_49734_49890_55478_55611_64137_64207_64855_64940_68004_68099_73962_74051_77848_77922_80502_80561_85286
922846	contig_3397_pilon	+	1321	5	Intergenic	novelGene_154578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	161	junction_4	33.7888665095472	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	12	728	126240	180571	FALSE	25	TGTGGGAGAATGTGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATFMNELKNLQAEGLTTLGQSLRTAFDLLNLNRLVTGIDNYGQGRNPFFLEPAIIITITDGSKLTTTSGVQDELHLPLNSPLPGSELTKEPFRWDQRLFALVLRLPGTMSVESEQLTGVPLDDSAITPMCEVTGGRSYSVCSPRMLNQCLESLVQKVQSGVVINFEKAGPDPSPVEDGQPDVSRPFGSQPWHSCHKLIYVRPNPKTGVPIGHWPVPESFWPDQNSPTLVSTRETMTVIVTI	126228	181164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3397_pilon_+_126360_142138_142229_172322_172507_178078_178205_180374
922847	contig_9653_pilon	-	2178	12	Intergenic	novelGene_48189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	761.563029521447	3	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	143	1048	196924	182641	TRUE	25	ATTTGGAGTACATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVENEQVLDVNPTDPDNLSDSFFSGDEENVETEEIKNEINGNWISASSINEARINAKAKRRLRKNSSRDSGRGDSVSDNGSESLRSGVTVPTSPKGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPGQVYDVEEVDVKDPNYDDNCVYETVVLPLDERAFEKTLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQASCSGQGYCAPEYV	200976	175248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178210_178906_179022_179275_179384_182567_182681_184264_184363_186002_186225_188843_188955_192150_192240_194047_194351_196881_196987_200896
922848	contig_3817_pilon	+	1795	1	Intergenic	novelGene_78347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1407	1718	511276	511587	NA	30	CTGTTACAGTACAGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPATTDDRPNREHNRESLTEWEKSRVQNSNSRKKTRLDGLTETGGTLEDMAPGLSVTPKLKPLQRPTLRQRLDWTMEHKMILVRSMLLGSSRYMRLNGQLLF	509869	511664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_509900_511700
922849	contig_3181_pilon	+	6317	5	Intergenic	novelGene_136920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	159	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	4603	5076	209699	210172	FALSE	30	CAGAACTGATGAGGGGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCARHQVRKPEGKNKLGIPQAERTEEKIKPRVAIVKDSMGRILNYPGSSKRRWEEYTVTVPKKLVDIQPFQEAAYDQEPMVLKEEVQAPLKTLGKNKAPGIDGISTEMFQQTNAVLEVLTNLCQEIWKTVTWPADSKRCIFMPLPKKGDPTECRNY	141443	211413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_+_143870_181398_181554_189293_189895_207936_208172_208513
922850	contig_7202_pilon	-	1077	3	Intergenic	novelGene_17540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	46	318	29911	28475	TRUE	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKVNE	29956	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
922851	contig_9988_pilon	-	671	1	Intergenic	novelGene_113048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTCTTCTTTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42749	42078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_42100_42700
922852	contig_14792_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_170493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGTGAGTGAATGAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75793	77222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_+_75800_77200
922853	contig_15449_pilon	+	1445	2	Intergenic	novelGene_33679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTCGTGGTACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191471	201032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_191506_199621
922854	contig_10990_pilon	-	4593	19	Intergenic	novelGene_7411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	130	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2596	2997	613532	606426	TRUE	25	CAGACCCTAGCTCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTVIADMIKPAFPIWTAKRVSLPCSTDFSFLGIFAAFFSFSSLSVPSWLLSGWISRATPSWVFAGLLRFSGTPCFLPFFFFSSPSPSLAPKRVKMIPVWELIPTAVTTIRPEPSMTWVPESSMGSLSKDFLT	631622	541714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_542102_590664_591332_604786_604988_605603_605860_606340_606468_606929_607056_608235_608272_609813_609978_613498_613715_614038_614283_614812_615056_615955_616186_617090_617280_617982_618062_618969_619078_627791_627982_628470_628685_629797_630011_630919
922855	contig_7919_pilon	+	2474	1	Intergenic	novelGene_28132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1500	1865	1548677	1549042	NA	30	ATCCACCAGATACACCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFNSGGGFYFILQDPKYPPFASFSFTIQSPKGISPSFSFTSLPETMFLKSHTLLSPRPVVSILIHQDSFTCKAGFLFLIVILITILVSFTVFLNCPFSIQRLVARERSLLKLRVYFSIYR	1547177	1549651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1547200_1549700
922856	contig_13051_pilon	-	1181	1	Intergenic	novelGene_140099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGTTCTGTAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81363	80182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_80200_81400
922857	contig_9548_pilon	-	2464	14	Intergenic	novelGene_141050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_12	75.34473042202	39	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	774	2322	142	2463	125993	94039	FALSE	45	AATCTTACTTACAAATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRQRTLFQTWGSSVVRSVDASGRSSGTERPQSPGSSKSRFPAPAEAAEAQPESDDDVLLVAVYEAERQLSPKDGGFCKSAGAVWIYPTNCPVRDYQLHIARTALFCNTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPSGKVVFMAPTKPLVAQQIEACYRVMGIPQSHMAEMTGSTQAFTRKEIWHNRRVLFLTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVVDEAHKALGNYAYCQVVRELVKYTNHFRILALSATPGSDIKAVQQVITNLLIGKIELRSEDSPDVLPYSYERRVEKVVVPLGEELAAIQKAYIQILEAFATSLIQRNVLMRRDIPNLTKYQLILARDQFRKNPSPNIVGLQQGIIEGEFAICISLFHGYELLQQMGMRSLYLFLCGIMDGTKGMTRTKNELVRNEDFMKLYNHLECMFADTCSASASGVSALRKGDKDKKFFYSHPKLKKLEEVIVEHFKSWNDQNTSEKKCDETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLFQHQPVIKVMTFVGHSSGKTMKGFTHKEQVEVVKRFRDGGYNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDAQKSPVRLVQRMGRTGRKRQGRIVVILAEGREERTYNQSQSNKRSIYKAISGNRQVLHFYQGSPRMVPDGITPELHKMFITHGVYEPEKPSRSLQRMRQSHSKKDWSLSEEEFRLWNRLYRLRDSDEIKEITLPQVHFPSLQNEELRSTQEPNIGIHQLSLSEWRVWQDHPLPTHQVDHSGRCHHFISIMQMIEGMRHEEEECSYELEI	126134	94037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_94066_96584_96741_97769_97928_100238_100423_102076_102284_108812_108998_111841_111929_112451_112578_112917_113051_115298_115431_117823_117983_121546_121625_124706_124880_125476
922858	contig_9333_pilon	-	4345	3	Intergenic	novelGene_120343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGAGTCAATCCTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564775	552489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_553791_561503_563909_564136
922859	contig_9883_pilon	-	1562	4	Intergenic	novelGene_87579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCAGCCACCCAGCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81272	65816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_66074_68002_68098_71274_71497_80284
922860	contig_2550_pilon	-	2039	16	Intergenic	novelGene_135701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_12	117.620973186474	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1200	838	2037	1771485	1671988	FALSE	40	ATTATTAAAGGTACACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLDLESMGKSSDGKSYVITGSWNPKSPHFQVVNEETPKDKVLFMTTAVDLVITEVQEPVRFLLETKVRVCSPNERLFWPFSKRSTTENFFLKLKQIKQKERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSIRLPQSGSQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLSVRPKQLSSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDHLVEKYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVAL	1801382	1671985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1672018_1673856_1674001_1674585_1674712_1677962_1678038_1682020_1682135_1743881_1744033_1748640_1748735_1752722_1752898_1769461_1769632_1770656_1770760_1771467_1771535_1772085_1772197_1777053_1777229_1777997_1778203_1779819_1780055_1801320
922861	contig_15188_pilon	+	3544	6	Intergenic	novelGene_163074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.8095211115606	17	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	620	2239	110021	124868	FALSE	40	TTTATAAAGTGCTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPAPKLEETGTAWFALSSQDPASPFKENPEDKESVTFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYRNLLALGPPVCKPDVISHLERGEAPWCSQRGGHAAACPEWEPPPPMREERMYKEEPTREATLEKLKKPSRHSCVWGDAWGWKEQADALSGSEGVLWKPAPATCEDVSREQDSSPGLGESEGGSPFRSALFVQQSIPAEAGFHDNIHVTSFRSIEAVTQHQRTCAGRNAFRSIDHGKYCRAGKLRGTGPGDGLFACGECGKAFRQSSSLALHRRWHTREKAYKCHECGKAFTWSTNLMEHQRIHTGEKPFFCSECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCTACEKAFSCSSLLNMHLRVHTGEKPYQCAECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYKCSACGKAFTCHSSLTVHETIHNGEKPFKCSECEKAFNNRSRLTLHQRIHTGEKPFKCSDCGKGFSCHSYLIVHQRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHSYLIVHQRVHTGEKPFDCSRPSVRTTVSSNIRRSTLERSH	109401	126173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15188_pilon_+_110070_110466_110520_117665_117793_118407_118504_123479_124711_124804
922862	contig_17976_pilon	+	2143	5	Intergenic	novelGene_32509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1283.883951142	9	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	182	1051	41843	47778	FALSE	55	AATAATAATTAAAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQLVPVPSSQQVLVKVG	41661	48870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46564_46647_47275_47730
922863	contig_8269_pilon	+	1470	9	Intergenic	novelGene_106240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	442	junction_2	350.791872055212	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1290	179	1468	324938	369538	FALSE	40	AGTGTTAATAAACTTCAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAASADRRAAPSTAPTVAPPRASPGRSPSCDPGPPRPLDSHLAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPREMLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADI	324759	369540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_325330_339814_339977_342676_342800_344516_344684_362641_362782_363322_363353_365130_365257_366863_366964_369488
922864	contig_5429_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_127784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAAAAGGTCAGCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128300	129126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_128300_129100
922865	contig_17144_pilon	-	1859	11	Intergenic	novelGene_29327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2169.32174884225	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	159	1775	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183266	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166510_172557_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
922866	contig_14575_pilon	-	4264	30	Intergenic	novelGene_101877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1225	1542	76249	69216	TRUE	15	CACCATCCTCTACTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRRCSGTAKGPEECELPLFLLPEVTVSLLTLGITEGVPDPTNIGCRSFGFFFLPLCFAFGVTYIESLLSCFLSTVQLLSQLQTDGNKVRLPGSVPPSSHGAES	83215	17223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_17272_19960_20119_20521_20561_20879_21036_21521_21609_26340_26426_27682_27778_28956_29020_30471_30761_33860_33916_39339_39503_40650_40700_41531_41650_42755_42849_44947_45004_47300_47374_59250_59374_59880_59983_61541_61637_62293_62355_63864_64004_65122_65448_68965_69218_70557_70631_72113_72162_73354_73410_74802_74884_76190_76364_80556_81603_83151
922867	contig_10106_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_73860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCCTGTCTTCTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115397	113782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_113800_115400
922869	contig_8682_pilon	-	1528	1	Intergenic	novelGene_165282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	55	387	144099	143767	NA	25	TGTCAGGATGGCACAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSIFREIVYDQEPTVLKEKSPSCTEGIGEKTRLQELTKYQSRCFNKWLQCWKRSPVYAKKFGRQLLGQSTGRVPYLCLFQRKMSIPKKDDFYWPSSLPNICPFLAIGHS	144153	142625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_142600_144200
922871	contig_10263_pilon	+	3171	2	Intergenic	novelGene_135820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATAATTTAGCTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350733	354602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_353563_354260
922872	contig_6276_pilon	+	1855	1	Intergenic	novelGene_174116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCTATGTATATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35690	37545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_35700_37500
922873	contig_2100_pilon	-	2442	9	Intergenic	novelGene_50662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	710.058228246107	19	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	56	1138	1180382	1173168	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVSGRGTWADALTVFLNQYYFFLSSLFQLPGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQA	1180437	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189
922874	contig_6954_pilon	+	1179	1	Intergenic	novelGene_64416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTCGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28769	29948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_28800_29900
922875	contig_6191_pilon	+	3099	1	Intergenic	novelGene_107835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117689	120788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_117700_120800
922876	contig_8138_pilon	-	1815	4	Intergenic	novelGene_52471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGAAGGGGAGGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307861	280244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280331_288507_288614_304971_305096_306362
922877	contig_16951_pilon	+	1898	5	Intergenic	novelGene_98625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	287.029941817923	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	60	818	46585	106818	FALSE	35	TTGAGTTTAATTCAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLLPVSDLSPHSVRLAPAEMQSQRIPGRKRGRPPLHSTPLKMAVPNLYSSSPGCLPAVKTPKKRGRKPGYKLKSQVLMTPLALSPPRSTPEPDLSNIPQDAATVPSLAVPQALTVCLYINKQANAGPFLEQRKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLVFSLVKQGYGGEMVSASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	46525	107898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_46741_65743_65874_68468_68670_103952_104099_106692
922878	contig_3252_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_61497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGATAACTGGAGAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312249	310168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_-_310200_312200
922879	contig_10217_pilon	-	1648	10	Intergenic	novelGene_87409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	20	CATTCTGTTTGGTTTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	108884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
922880	contig_10042_pilon	+	2609	1	Intergenic	novelGene_79176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	251	607	787282	787638	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIPWAARRMNKSVLEEAQPECSLETRMARLCLTYFGHVIWRYQSLEKDITLDKAEGQQKRGRPLMRWTDTEAATMDSSITMIVRMARTGQCFILLYIGSLRVGMDSRAPNSSNIYL	787031	789640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_787000_789600
922881	contig_5217_pilon	-	763	5	Intergenic	novelGene_135762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2162.60715052457	7	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	559903	558552	TRUE	10	TATCTTGTGTTTATGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIIDVVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLVSEERDESL	559905	557640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558574_558666_558851_559273_559374_559858
922882	contig_3380_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_60085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCTTCTCAGAATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113280	111495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_111500_113300
922883	contig_18162_pilon	-	2364	3	Intergenic	novelGene_122300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16364
922884	contig_5019_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_109186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAATTCATTATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105660	107353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_105700_107400
922886	contig_7963_pilon	-	3925	13	Intergenic	novelGene_58455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_12	544.435098417515	11	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	1524	2960	125592	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	127515	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126910_127309
922887	contig_13753_pilon	+	3192	2	Intergenic	novelGene_136518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	2115	2462	323046	323393	FALSE	50	CCTACTCATCAAAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFKKIIQEQNAKINSQAEIIQKQELETQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRINETEDKHLDTTLFEKKSEKRMKKNEETENYVGYNQKQNSASDRSSRTGGENRKHREGH	264298	324123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_265286_321918
922888	contig_15092_pilon	+	2464	3	Intergenic	novelGene_57791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	5	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	462	1028	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324697	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
922889	contig_18799_pilon	+	3557	1	Intergenic	novelGene_171418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1511	2107	26716	27312	NA	20	AATCTTTGATGCTAGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTPTTKAKDEEIEDYHQILQSEIDHSCNQDALIITGDWNAKVGNKEGSVVGKYDLGDRNDARDRVIEFCKTNGFFIADAFFHQHKQQLYTWTSPDGMHRNQVNYVCGKRGWKSSTSSVITRPGANCGTDHQLLICKFKLKLKKIRTSPSEPKYDLEYIPPEFRDHLKNRFDVLNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKR	25205	28762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_25200_28800
922890	contig_6325_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_143376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTCAAGAAGGGAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546859	545724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_545700_546900
922891	contig_18859_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_150556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCCAATCACTGGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188113	186669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_186700_188100
922892	contig_6847_pilon	+	3460	13	Intergenic	novelGene_143868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_12	489.204534309412	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	1230	2681	77788	110600	TRUE	60	AAAAATCCCAAGTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	76558	112358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110630_111608
922893	contig_13924_pilon	-	4318	1	Intergenic	novelGene_147782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	1449	2045	58003	57407	NA	70	TTATAATATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCALELENQKGSPRSALLKLKEVKKKAKPQVAILKDSMEKILNAGSIKRRWKGYTESLYQKELVNIEQFQLVAYDQEPMILKEEVQAALKALAKNKAPGIDGIPIEMFQQTDTALKVLTRLCEEIWKTVSWPTDWKRSIFMLIPKKGDLTECGNYQTISLISHTNKILLKIIQKWLHQYIDRELPEVQARFRRGRGC	59451	55133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13924_pilon_-_55100_59500
922894	SIRV1	+	499	2	ISM	SIRV1B	SIRV109	464	3	-64	406	-64	-369	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5299	17	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCCTGAACGCAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10647	11237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV1_+_10792_10882
922895	contig_15236_pilon	-	3308	3	Intergenic	novelGene_141559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	154	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAGGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536250	339733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_342376_514545_514940_535978
922896	contig_18163_pilon	-	1444	3	Intergenic	novelGene_35315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	7	3	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCTGCAGAGGGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11207	8749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18163_pilon_-_9721_10413_10635_10955
922897	contig_1856_pilon	-	3551	16	Intergenic	novelGene_84893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_2	12.8034717513997	52	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	10	1818	493965	453671	TRUE	25	GTGAGTACAGTGTCATCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTGLIRKLGHQLTEIRERALRNILCKIEHHLICYADLIQERLLFLHLLEWFNFPSVPMKEEVLNLLNSLVKYPSAVQHLVDLGAVEFLSKLRSNVEPNLQAAIDGILDGLFILPSEVPTLHSTSSQANPTDFSQEPEILTGYFPQDKSNFQQTEVPPRPVVNWTVKCLKFSAFPWLPLTTTDRHVLSSNESSLRSNNHTLIWNTCELLKDVIMQDFPAEIFLQRPKIVQGLLSLLKLAFGGDGKHRLALQSMSCLQQLCTNLRNRLNFHRDPGFFSSKQDTVSQNSSLSYCHEARGTHHSQNASPGSSSPRPSVVGRTGQRPRGDGQDWDAVSSSGSSSHAHVNSRMSVPSPLDVGHVDLPELGAEDTLGLQLQQLSLPQFCVSVLESAVPLLRTGSRQMIIRVLELLAEDMILIGDAVSADIWDDSSLFAIDMKEKLLTVFESLGETMSHHKSSASWEQPEAMLVHHRMAFVSISLFTVRLLQTLLPVEKASQFLPEPMSAALFLLSLDVPFSLEYPNIHEAVVAYLEQLNSENYSIYKRTAETVYSVECTCNFMFDVGKEGEKNLLELLELADQALRSFSFHQHFPLIKEIICICSKM	493974	447629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_447770_449297_449415_450962_451089_452320_453788_455207_455421_466419_466591_474892_475009_478430_478613_481399_481566_483809_483961_484876_484992_486733_486825_487623_487714_490000_490179_493409_493598_493934
922898	contig_6063_pilon	-	4167	1	Intergenic	novelGene_27596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	3431	3838	39796	39389	NA	25	CCTTCCTCACTAAGCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNILKGIFFLSSRSQHWLKIFSKPCCKQMCCHPGFVDPFIEHRQSRFSIILKGTSIFEWSMSIGFNLKSPAVLAPNKRVSLSFEALKPGIDYFFLAVKVLDGIFFQYKAVSSTLKICCLMQPASSVISSRSSG	43226	39059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_39100_43200
922899	contig_8616_pilon	-	4903	4	Intergenic	novelGene_72462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	65.7621978545932	28	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	844	1359	301626	294382	TRUE	60	CGGAGAAAAAATAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRLQEAQLYKEEGNQRYREGKYRDAVSRYHRALLQLRGLDPDLPSPIPNLGPQGPALTPEQENVLHTTQRDCYNNLAACLLQMEPVNYERVKEYSQKVLERQPDNAKALYRAGVAFFHLQDYDRARHYLLAAVNRQPKDANVQRYLQMTQSELKSYHRKEKQLYLGMFG	302469	290741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_293031_293126_294477_297044_297228_301388
922900	contig_10235_pilon	+	2204	14	Intergenic	novelGene_46342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	171.946083471831	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	1638	2204	120344	121479	FALSE	15	CACCAGCAGGGCTCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEERRAACAEKLKRLDEKFGAPDKRLKAEPAVPPAAPPAPAPPPAVPKESSMPPAAPPAPAPAPEKEPEEPAQAPPAQSTPTLGVAPAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLLSKEGPESPEEVPSPATPPASKAEPKGDGVGPTRQPPSQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQQQWQQ	114046	121479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_+_114184_116075_116251_116918_117097_117423_117524_117609_117683_118005_118150_118311_118464_118665_118746_118890_119038_119360_119452_119563_119783_120202_120678_121119_121311_121437
922901	contig_14467_pilon	+	1226	1	Intergenic	novelGene_138263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	74	649	318578	319153	NA	5	CAGTGGCCCTGGCTCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	318504	319730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_318500_319700
922902	contig_6023_pilon	-	1053	1	Intergenic	novelGene_179050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATAAATTAAAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28294	27241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6023_pilon_-_27200_28300
922903	contig_15449_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_33639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGCTTCAAAGGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88481	87189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_87200_88500
922904	contig_8864_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_136002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAGCAAAGGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719507	717530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_717500_719500
922905	contig_5020_pilon	+	940	6	Intergenic	novelGene_27886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1203.17689472496	13	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	324	626	124540	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118492	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119475_119576_124307_124363_124444_124547_124909_125091_125657
922906	contig_13481_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_119274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTTGTACCTCAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106869	109396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_106900_109400
922907	contig_5039_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_65061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAAGCCGTCCACTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1830781	1832926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1830800_1832900
922908	contig_13888_pilon	+	3943	3	Intergenic	novelGene_151787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	805	189	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	106	597	337589	338879	TRUE	70	AAATGAAAAAGATGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVSICPIISLNYHFKGKEKTGILC	337483	345533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_339363_342670
922909	contig_7009_pilon	-	3044	1	Intergenic	novelGene_23689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	105	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	221	666	1411	2076	838349	837684	NA	50	AGTCAGGAAATCAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLSIISQNKAEANCGIDHQLLICKFKLKLKKIRAIPRAPKYDLEYIPPEFRDHLKKRFDVLHTNDQRPGELWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMPEETLKVALECRVAKVKGRNDEVKELNRRLQRVTREDKVKYYNEMCKDLEMENRKGRTHSAFLKLKELKKKFKPRVAILKDFTGKILKDAGSIKRRWKEYTESLYQKRVGQRSTISGGSI	839759	836715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_836700_839800
922910	contig_6102_pilon	+	1961	2	Intergenic	novelGene_31730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATACCTGGTATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169032	189341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_169604_187951
922911	contig_7410_pilon	-	4309	1	Intergenic	novelGene_106044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCAATTTTAACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50513	46204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_46200_50500
922912	contig_11512_pilon	+	3000	2	Intergenic	novelGene_43315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAAGACGAGATTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392464	396337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_393294_394166
922913	contig_6163_pilon	-	1503	7	Intergenic	novelGene_103825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	34	junction_1	44.8664685483491	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	97	1176	235495	232811	FALSE	20	AGAGACGTCTATTTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGSSLNGVPPNPTPIVQRLPAFLDNHNYAKSPMQEEEDLAAGVGRSRVPVRPPQQYSDDDDAYEDDEEDDAQNPDSAIRYKRKGPGKPGPLSGSADGQLSVLQPNTINVLAEKLKESQKDLSIPLSIKTSSGAGSPAVAVPTHSQPSPTPSNESTDTASEIGSAFNSPLRSPIRSANPTRPSSPVTSHISKVLFGEDDSLLRVDCIRYNRAVRDLGPVISTGLLHLAEDGVLSPLALTEGGKGSSPSVRPSQSSQGSSSPEEKEVEEAAESREKTGLIRPGEPLSGEKYSPKELLALLKCVEAEIANYEACLKEEVEKRKKFKIDDQRRTHNYDEFICTFISMLAQEGMLANLVEQNISVRRRQGVSIGRLHKQRKPDRRKRSRPYKAKRQ	235591	232483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_232945_233085_233159_233288_233382_233621_233783_233895_234375_234900_235035_235489
922914	contig_9415_pilon	+	6688	43	Intergenic	novelGene_109730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	4077	4445	524081	529298	TRUE	20	GCGCGCGAGGGAGGAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLGTSAAFFSSDPFTLLPACESPSSASKYSSSDSDSTPSSNSEVPTRSFVPSEIIGIEDICLSGDCAGDFCGKGILLIKHSISFIFWSEILTCIRGSPPDTLNLTILMSFSTIALANST	499808	598852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_+_500084_501281_501450_501880_501985_503312_504968_505654_505715_506401_506490_507959_508112_510271_510408_511756_511864_512562_512717_513974_514278_514951_515116_515334_515439_516333_516452_517197_517358_518564_518627_520554_520635_522578_522732_524047_524190_524852_524932_526457_526592_529251_529366_530763_530888_532767_532904_533628_533747_534852_535043_537181_537326_540958_541054_541866_541995_550106_550171_551525_551697_552259_552369_553463_553592_555373_555431_556366_556449_557255_557316_561643_561702_565215_565328_573909_574008_575910_576007_580078_580126_583012_583053_598733
922915	contig_15236_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_141534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74137	74856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_74100_74900
922916	contig_8712_pilon	+	1868	3	Intergenic	novelGene_58803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	73	423	314974	321821	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANASAWRAAASSPSAWTPCRMWTTTVPTAKLSWAPTSVCRTRPTWRRP	311677	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311744_314967_315188_321684
922917	contig_4857_pilon	-	4482	8	Intergenic	novelGene_48767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1457	junction_1	1718.3681390274	5	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1152	1874	1226315	1212207	FALSE	25	ATTTTAAGCTGATTTTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1227554	1209598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
922918	contig_1143_pilon	+	1107	1	Intergenic	novelGene_86635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAAACCCAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1315519	1316626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_1315500_1316600
922919	contig_21259_pilon	+	2987	1	Intergenic	novelGene_177447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	110	319	6560	6769	NA	15	TGTTCCTCGAGACCATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPCARRGYRGDRGVFPPVSSVGRSLGTHVRVLTVSDMTVERRGIRTPSTLSLPTEPPSRILGDRKGIQEARFEHKAALHLTRSTGTGVAIEVQDEERKIFFLHFS	6450	9437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21259_pilon_+_6400_9400
922920	contig_12605_pilon	+	1331	2	Intergenic	novelGene_64220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4099	junction_1	0	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	838	1329	5632	6243	FALSE	5	GTGTGGGGTCTGAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLMSAWSCEPCFYGPWDKVQSFCIFLPFSSDPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSGRE	4794	6245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_6005_6124
922921	contig_17005_pilon	-	2619	1	Intergenic	novelGene_129903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	237	714	1800	2513	28075	27362	NA	55	AGCGAGAAACCAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVHGKQRRPSVSEEGWRVGKHISQIAGALGPLRKEQRWRTEPGTRVKGGGGGERQARNQKKQKKKKSTTSSQQTAPREPPTRARGIQAAGAPWPRDRGCGKQRNKRTKAPGSHQRGSPDWEAAAHSNGAPQPRRKEQRWRSEPGTRAKGGGGGERQARNQKKQRKKKSNTSSQQMAPREPPTQVRRIQTAGAPCQETAAAGSRGTNEQKPRDPTSVAAQT	29874	27255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17005_pilon_-_27300_29900
922922	contig_1339_pilon	+	2409	1	Intergenic	novelGene_163153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1279	1578	631132	631431	NA	85	ACTAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGQPAVGPLSTKPGTRGRVDGQRSILSSWAILLPPLHRLKGGISPGPRVGVRTQGSVTGAKVPVGRTHVEPGNQMPRSIKEAARRMADGVLGTGMCQG	629853	632262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_629900_632300
922923	contig_19032_pilon	+	2432	10	Intergenic	novelGene_172548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1058	1375	159629	160674	TRUE	40	CAAATCCAAAGCTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFRFLRAAISINFPRHCGALCNSVFSFPVSAICFLKPATIILSIMVFVPRMLYLPGFSAACLVTQVVFPAPGKPIIITTSQSFFSSGPFGPLTRSSKGTFWIKV	156928	163312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_157295_157737_157810_158174_158360_158692_158949_159222_159391_159618_159746_160163_160284_160593_160862_161306_161416_162551
922924	contig_2069_pilon	+	3286	10	Intergenic	novelGene_23182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	220.166659657386	2	122	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	83	895	70041	89492	TRUE	25	AACCTTTGTTGCATTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTALRQQQGAEVPGGPTRSEPEAVTTNMWNSEFESYGSSTYSGAGGYTQSPGGFGSPAPAKAERKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69958	91980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_70051_70295_70403_75847_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407_90502_90598
922925	contig_2496_pilon	+	1718	2	Intergenic	novelGene_168515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGCAGAAATATAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95160	128336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_+_96861_128318
922926	contig_4232_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_63282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTAGACCGGCGGGCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468015	466563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466600_468000
922927	contig_8354_pilon	-	2605	3	Intergenic	novelGene_24063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGAATTTTTCCTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25004	21214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_23630_23979_24047_24881
922928	contig_7321_pilon	+	1296	1	Intergenic	novelGene_53133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCCTAGGTGAGCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162523	163819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_+_162500_163800
922929	contig_18822_pilon	-	2187	1	Intergenic	novelGene_111737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	45	138	172	309	215665	215528	NA	55	TTCACCCAAACCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCSSKDFTKRAKRQPTDWENNFAYDKSDQHLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAAYRHMKKCSRSLAIREMQIKTAMRYHLTPTRLA	215836	213649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_213600_215800
922930	contig_8377_pilon	-	3552	21	Intergenic	novelGene_35114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.48193472919817	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCACCTCCACCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199250	164517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_164588_169243_169307_172947_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182893_183046_183256_183403_185670_185814_189177_189270_191115_191253_192215_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660_198069_198111
922931	contig_9955_pilon	+	5457	7	Intergenic	novelGene_21327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	347	junction_1	280.144456783758	32	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1164	1637	69965	84621	FALSE	30	AGGGAGATAGGGGATCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGFLEGLRCSECVDWGEKRNTIASITAGVLFFTGWWIIIDAAVIYPTMEEFNHSYHACGVIATIAFLMINAVSNGQVRGDSYSEGCLGQTGARIWLFIGFMLAFGSLIASMWILFGGYVVKEKPTVYPGIAVFFQNAFIFFGGLVFKFGRTEDLWQ	66706	88441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_67858_69952_70058_71904_72018_73577_73646_75469_75563_78450_78512_84575
922932	contig_16594_pilon	-	3845	10	Intergenic	novelGene_53824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2575.04217872683	3	122	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	177	998	165546	121101	TRUE	70	TCAAAAAAGAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335657	115721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149197_149244_149351_165477_165649_335583
922933	contig_10774_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_158672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCTAGCAGTGCAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10974	12030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10774_pilon_+_11000_12000
922934	contig_15248_pilon	+	3587	4	Intergenic	novelGene_149157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187434	253128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_187594_222492_222796_243148_243521_250375
922935	contig_19459_pilon	-	1094	8	Intergenic	novelGene_59890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	83	868	16240	7003	FALSE	25	GTGGAATTCTTCATAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19046	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
922937	contig_14822_pilon	-	2838	1	Intergenic	novelGene_145387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTGAAGTCTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7057	4219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_4200_7100
922938	contig_11253_pilon	+	2288	1	Intergenic	novelGene_126820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACTGAAAAGGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99827	102115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_99800_102100
922939	contig_17274_pilon	+	1922	15	Intergenic	novelGene_26507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	146.245966279625	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	505	1620	100360	124457	FALSE	35	TCTCATAATAAATCACTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIRKKDSLSGQNDALRTRETTECAPEPEQADTVDNGNNSTLGRQKWKRRRKRGRPRKHLTQRNKAPLKRGRPRGSRKHADETVDFHSPFLPVTCGKVKGTLCKKKLEQGVSEKCIQHEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNFKEVFALQETNEKSSLV	87696	124759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_87866_95017_95181_96227_96397_100356_100454_104417_104472_113142_113218_114494_114600_118530_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
922940	contig_16185_pilon	-	2757	2	Intergenic	novelGene_144761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	985	1350	116287	115922	FALSE	30	ATAATATTCTTTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSISEILLFIFWISNCCLCIISSWEFIFAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFYSSLSAFCLSSWRILSIGDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLWGIQ	117452	114514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_116993_117173
922941	contig_11720_pilon	-	1546	10	Intergenic	novelGene_43811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGACACCCACCCACCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98766	67864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68133_76920_76959_78406_78514_82236_82289_86232_86416_87064_87162_93131_93256_94952_95059_95381_95486_98299
922942	contig_4874_pilon	-	2320	1	Intergenic	novelGene_78631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTGATAAACCACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324293	321973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_322000_324300
922944	contig_19604_pilon	+	2716	6	Intergenic	novelGene_77237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	310.086052572508	2	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	93	899	269805	273854	TRUE	35	GGTTTACAGTAAAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVRRRLSLFLNVQSLVAADWTTLAEELGFEYLEIRHLEAYPNPTGRLLDAWEGRPDASVGRLLELLAKLGRHDALEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGKFSPALTRGDTVCPSLGLMGRASGYQPLLTEAMDAASPCALQVPIRSG	269712	275787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273689_273817_274879_274994
922945	contig_14795_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_176896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTTATTTTTTAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26769	28335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14795_pilon_+_26800_28300
922946	contig_7056_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_43584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGCAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31124	29595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_29600_31100
922948	contig_6102_pilon	+	3555	25	Intergenic	novelGene_31836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_18	478.146246804608	12	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	900	2703	96	2798	370803	394507	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370707	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379722_393069_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
922950	contig_7254_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_145831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTATTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5917	7624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_+_5900_7600
922951	contig_7593_pilon	+	2113	1	Intergenic	novelGene_127281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAGCACAAAAGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61332	63445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_61300_63400
922952	contig_21127_pilon	-	2993	2	Intergenic	novelGene_179051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	365	1147	52879	52097	TRUE	85	TATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKP	53243	49673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21127_pilon_-_50027_50603
922953	contig_17274_pilon	+	3831	13	Intergenic	novelGene_26551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	15	junction_12	205.586086321251	5	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1541	2212	203643	213531	TRUE	25	AAATAGGGCTTATTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIEEDKMKTCSLSGPTFPRDKNMNFQSPKLPVTCGKVKGILHKDMLKQGSWIKCIQSEDGRWFTPREFEIAGNYEKAKNWKTSLRCGGETLSWLLKRGFLPNPPTARKKRRVESPNSDLTDAYPENSNRCEVCQDGGKLFCCDTCPKSFHEDCHIQPVEAERDPWSCIFCRIKAIQQRSLESQPCHQETEILRRQMLPEEKLKCEFLLLKVCCWTKSPFFCL	179127	216904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_179192_181182_181243_182427_182470_195741_195817_202343_203791_205828_205972_208197_208237_209285_209328_211491_211608_213058_213180_213468_213542_213702_213847_215439
922954	contig_14970_pilon	+	1958	9	Intergenic	novelGene_44932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	175	1263	136145	231550	FALSE	10	CCTTAACTCTTTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135970	232245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
922955	contig_5758_pilon	+	3175	3	Intergenic	novelGene_119087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	879	1220	164174	164515	TRUE	25	CCCGTTATACACAGGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQGRGLSQVTQLRKLASPRSAGRRAGLLLTGCADQRIPGLADKLTVQVPRMGDEMTGSSPRIQREQKARTSAYIQIQATPPRRLPFIGLATHSIFNHGSDYIKTPRIMAQPS	163295	170523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_165280_168572_169285_170044
922956	contig_11986_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_69106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAGTAGCTGCTGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65875	67882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_65900_67900
922957	contig_4754_pilon	+	2510	2	Intergenic	novelGene_35906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGTGAATCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148832	151473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_149348_149478
922958	contig_15570_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_137870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791531	793472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15570_pilon_+_791500_793500
922959	contig_14666_pilon	+	1171	4	Intergenic	novelGene_39609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	311	868	484383	484940	FALSE	40	AAAAAAATGTCTTGGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477264	485243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479509_479631_479834_479875_484365
922960	contig_5200_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_140164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTTTCACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343337	341048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_341000_343300
922961	contig_8628_pilon	+	2797	2	Intergenic	novelGene_164418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCAACGTGCATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401601	404554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8628_pilon_+_403916_404071
922962	contig_7171_pilon	-	3473	5	Intergenic	novelGene_101343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	88	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGGATCGACTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1310591	1301680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1301737_1302172_1302376_1302521_1302610_1307260_1309355_1309559
922963	contig_7707_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_72209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGGGAAGGGAGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727866	729812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_727900_729800
922964	contig_12622_pilon	+	4068	1	Intergenic	novelGene_5821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395799	399867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_395800_399900
922965	contig_9415_pilon	-	2160	1	Intergenic	novelGene_109939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAAACAACCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2463119	2460959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2461000_2463100
922966	contig_11590_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_125593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTTTCCTGAATCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699290	701875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_699300_701900
922968	contig_8394_pilon	+	2956	1	Intergenic	novelGene_27323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2249	2602	84953	85306	NA	55	CAAAAAGAAAATAGAGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLMLLFYLLVHCIIPGVLKACKQPSKAHQLVSIFLDQQRKRVRNKRRKWNVWLIASMNNCFLCHETRTGWCPATVTEYFDQRFHRRILIKKGEIQNRIANFHGTQIFWSHGGWMNP	82704	85660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_82700_85700
922969	contig_18850_pilon	-	1903	1	Intergenic	novelGene_142408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTACATGAAGTATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161238	159335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_159300_161200
922970	contig_12917_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_162888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	283	606	28530	28853	NA	45	AAAAAAGGAGCTCTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLWVWFLAISALLLQEIRLSFRAQLATFRSFMWRLSCDSEALSSSLSPLCLAKAGPTNQLSYTSPSDKTVEKYQTCDHPELCFSPILDLLVVKFCILILPPHAMD	28247	30590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12917_pilon_+_28200_30600
922971	contig_4832_pilon	-	2158	14	Intergenic	novelGene_163421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	28	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCGCAAAACGACCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510058	496150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_496256_497680_497859_498384_498643_498745_498932_499967_500057_502280_502388_502516_502609_503915_503998_504246_504718_505178_505330_506086_506189_506556_506609_507078_507177_509871
922972	contig_5715_pilon	-	3765	2	Intergenic	novelGene_127962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	114	392	549835	549557	TRUE	35	GAGATGGCCAAACTGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFLALCVNFYLDGIVVREDTLNYLSVLDLVEIALWPKMWSFLENIPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMGSSWLIVLFKSSVSLLSFFLVVLSFIESGVLKSPTIIMELSVSLFSTVRVYFMYFVALSLGA	549948	546053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_548845_548974
922973	contig_2219_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_67217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393460	391464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_391500_393500
922974	contig_7396_pilon	-	2297	13	Intergenic	novelGene_79582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3249.69386058133	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	118	1011	255163	247765	TRUE	20	TTGTATGTTGGATTATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRLFLCRGSWLIW	257471	245345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248849_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
922975	contig_10861_pilon	-	2275	3	Intergenic	novelGene_39314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1520	1873	1470772	1470419	FALSE	35	TTAACCTTCACCTAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISEKHAKNQRKSPLKPPRHSYQGLHQTESSTARWCLATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTQKTDQIYWSERGWRNPESMAPRHPFSSVVNSLPRFTIQLGIGQPHKTKWD	1473662	1470016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1471909_1472609_1472710_1473379
922976	contig_12201_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_159987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAGGAACTTAAATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147498	148376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12201_pilon_+_147500_148400
922977	contig_10042_pilon	-	2773	4	Intergenic	novelGene_79171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	83	junction_3	21.7613316585993	12	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	1605	2531	767013	766087	FALSE	25	ATAGAGGCCTTCATCTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDCSGSRPLLMESEEEDESCKPPQGKLGGAIPFTQPEVSTEPTKAVQDGRKNQFQALTQPTTDGLSEPDVFTTAPFRSSRVPADDVDIFSKAPFVSKGSVASPQPEEADVFLRAPFTKKKSTEELIVAQSTSQELPTQASLLSQTGDVPTGISPLLSSLDRAVYPCVRAQYSMASFVQHPNLPSHSVQAADHLESISPRGFSLEPGGHPNDRNKGPQPQKEAVSGPVAGKPFLPPSLSKYSRHYSPEDEPNPEAQPIAAYKIVSQTNKQSIAGSVSITSLSSRTTELLAADPFALAPFPSKSGKQKP	803201	765844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_767232_798122_798228_800612_800771_802078
922978	contig_4486_pilon	-	1966	8	Intergenic	novelGene_38534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	247.031932167087	1	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	667	1098	143917	131479	TRUE	15	CTGTCTTATGGGATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFNTKLDGFLLGKKQVSRRLPTIMRKLTMMGKMLTI	177543	130122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130977_131464_131583_132322_132604_143870_143994_156237_156397_159433_159548_162084_162163_177304
922979	contig_12951_pilon	+	1598	9	Intergenic	novelGene_68200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_2	325.379009771681	4	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	309	1325	820027	837330	FALSE	10	GGTGCGTCCCAGCAGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLASQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSLEHGPIVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMESSSQDTEVRRRIVGESQRGVPVAVPAKGEPSPPEEEEEQALTHWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSST	755139	837603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_755321_813282_813374_819990_820090_827840_827979_832246_832457_832891_833054_833431_833656_835934_836131_837306
922980	contig_10225_pilon	+	1879	1	Intergenic	novelGene_86876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGTGCAACTGGAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59781	61660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_59800_61700
922981	contig_15094_pilon	+	2247	2	Intergenic	novelGene_179052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	469	1065	62173	62769	FALSE	70	TATAAATTTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCLLSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	11708	63951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15094_pilon_+_11893_61888
922982	contig_5093_pilon	+	3576	1	Intergenic	novelGene_135095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621852	625428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_621900_625400
922983	contig_3975_pilon	+	2496	2	Intergenic	novelGene_54676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTATACTTCAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	929973	1109192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_930548_1107270
922984	contig_12677_pilon	-	321	1	Intergenic	novelGene_110683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_300
922985	contig_8552_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_80109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	381	695	568955	568641	NA	55	AAACTGTCAACAACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEWQIRDRFCPLSRVFTYPHQGPDDWWLHPRHLATHDRGPRLSGASQSLQPTELGAHSPAAKPTHLHALGNRDTLSSQTLRMRSAPCLAQHVTPYCSQIPVPT	569335	566980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_567000_569300
922986	contig_2100_pilon	-	982	1	Intergenic	novelGene_50619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	242	580	820800	820462	NA	35	AATCTGTTACAACAGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHINSLGKNLALVCSQQCQQHAGKIVDSSSFAMVTLVGHSFLNSAHSLDVYSITLLVDSHVCGQRNKKGLENIQRVPLLFPFVFIILADYCKMAVPAQRPPPLFFKELILTL	821041	820059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_820100_821000
922987	contig_10042_pilon	-	3935	17	Intergenic	novelGene_79172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_4	201.564467044665	153	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1139	3420	382	3801	944185	766087	FALSE	35	CAGTTAACAAACTCAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKFFDSRREQGGSGLGSGSSGGGGSTSGLGSGYIGRVFGIGRQQVTVDEVLAEGGFAIVFLVRTSNGVKCALKRMFVNNEHDLQVCKREIQIMRDLSGHKNIVGYIDSSINNVSSGDVWEVLILMDFCRGGQVVNLMNQRLQTGFTENEVLQIFCDTCEAVARLHQCKTPIIHRDLKVENILLHDRGHYVLCDFGSATNKFQNPQTEGVNAVEDEIKKYTTLSYRAPEMVNLYSGKIITTKADIWALGCLLYKLCYFTLPFGESQVAICDGNFTIPDNSRYSQDMHCLIRYMLEPDPDKRPDIYQVSYFSFKLVKKECPIPNVQNSPIPAKLPEPVKASEAAAKKTQPKARLTDPIPTTETSIAPRQRPKAGQTQPNPGILPIQPALTPRKRAMVQPPPQAAGPSGQPVLLASVPQPKTQPQPSQPLPQSQPKQPQAPPTPQQTPSTQAQGLPTQAQATPQHQQQLFLKQQQQQPQQQQQPPQQPAGSFYQQQQQQQPQQAQAQQFQAVHPASQQPAIAQFPVVAQGGSQQQLIQNFYQQQQQQQQQQLATALHQQQLMTQQAALQQKTAVTAVQQPQAQPVAPQPVPAQEPAIQAPIRQQPKVQTTPPPAIQGQKIGSLTPPSSPKTQRAGHRRILSDVTHSAVFGVPASKSTQLLQAAAAEASLNKSKSATTTPSGSPRTSQQNVYNPSEGSTWNPFDDDNFSKLTAEELLNKDFAKLGEGKHPEKLGGSAESLIPGFQSTQGDAFVTSSFSAGTGLQREPNPCPGITVEHFKESTGVKGLPLYPDPSRAPGTKTQNNLESDFLARDGPSSNSSFHSSEEEGTDLEGDMLDCSGSRPLLMESEEEDESCKPPQGKLGGAIPFTQPEVSTEPTKAVQDGRKNQFQALTQPTTDGLSEPDVFTTAPFRSSRVPADDVDIFSKAPFVSKGSVASPQPEEADVFLRAPFTKKKSTEELIVAQSTSQELPTQASLLSQTGDVPTGISPLLSSLDRAVYPCVRAQYSMASFVQHPNLPSHSVQAADHLESISPRGFSLEPGGHPNDRNKGPQPQKEAVSGPVAGKPFLPPSLSKYSRHYSPEDEPNPEAQPIAAYKIVSQTNKQSIAGSVSITSLSSRTTELLAADPFALAPFPSKSGKQKP	944848	765952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_767232_798122_798228_800612_800771_802078_802309_807096_807361_810795_811104_812063_812219_817366_817447_819357_819462_824641_824775_825254_825337_827005_827128_849627_849771_851270_851380_864221_864341_944022_944415_944696
922988	scaffold_12124_pilon	+	662	1	Intergenic	novelGene_22206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGCTCCTTGGAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1366220	1366882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1366200_1366900
922989	contig_12624_pilon	+	2243	11	Intergenic	novelGene_60951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_10	302.59438197032	13	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	139	837	11640	53324	TRUE	20	GTTCAGCTTCTAGTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNGGGSTVSRVSAARDGAAVDRRTQTDRLPGEFGQIDAGDANPDRTMASSKKKLEGLVAATITPMTENGLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLVYYSKRMQSRTSQRERHIRQGLRGSQT	6064	56362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6196_11632_11708_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_53241_53344_54975
922990	contig_6102_pilon	-	2264	15	Intergenic	novelGene_32348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTGTCGATCAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714926	1698759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1699323_1700330_1700421_1700606_1700692_1700769_1700905_1701240_1701315_1701570_1701744_1701905_1702014_1703141_1703258_1703403_1703612_1704607_1704808_1706543_1706619_1710796_1710966_1711133_1711234_1711374_1711431_1714814
922991	contig_1008_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_121560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAGGGCCAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564468	564085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_564100_564500
922992	contig_11375_pilon	+	1349	4	Intergenic	novelGene_152651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	603	971	108246	121146	TRUE	40	CAGATAGAGGCAGCAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPISAPKSPISMYHSLHKECCLSFVSSQPISSKRLVSSTLCHRLGSLEAGTHRVESWVQDVEKSTPVYPYKRNSFPEVAWMCLWFLQPERAERRLPTSLFVQSSQVFVCFLFPVDRRVEDA	107643	133346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_108447_120978_121171_132528_132679_133142
922993	contig_7070_pilon	+	927	1	Intergenic	novelGene_104042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATTATATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92851	93778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_92900_93800
922994	contig_6048_pilon	+	2306	1	Intergenic	novelGene_73323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGCCCTCATGCAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2259548	2261854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2259500_2261900
922995	contig_11493_pilon	+	5304	1	Intergenic	novelGene_143655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	203	574	110513	110884	NA	35	TTTCCAATCAAAAGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIGRRLISNLHYAHDTTLLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHFYIKKMKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFVLFGSTINTHGSSSQEIKRCIALGKSAAKDLFKMLESKDVTLKTKVHLT	110310	115614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_110300_115600
922996	contig_6873_pilon	+	2163	2	Intergenic	novelGene_129814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	309	1855	2163	310741	311049	FALSE	45	GACTCTATCAAGAGGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNVKRAKEHRDKAIEELKKIREEHNDKFNRMQEYMERQQSEIQKINNKISGLDNSIESHKSRIKAMEVRISETEDKALDTNLFEEKSDKRFLKNEKILRIMW	214483	311049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_215747_310149
922998	scaffold_880_pilon	-	3097	3	Intergenic	novelGene_121514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGTAATTAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577652	567383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_567906_569208_569318_575186
922999	contig_821_pilon	+	1141	1	Intergenic	novelGene_149387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACTCAGAGCCATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107272	108413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_107300_108400
923000	contig_15327_pilon	-	2357	17	Intergenic	novelGene_70779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	97.1919613123946	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	496	1818	1157860	1130292	FALSE	35	GTTGTACTCAGAAATGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSDILQNLVELLQLPGLGEDRAFHREIGLKTLVYKAYRCFFIAQSYVLVKKWSEALVLYDRVLKYADEVNSDDNHEAFENSLKDLPDVQELIAQVRSEKCSLQAAAILDASDSHQTETSSQVKDNKPLVERFETFCLDPSLVTKQASLVHFPPGFQPIPCKPLFFDLALNHVAFPPLEDKLEQKTKSGLTGYIKGIFGFRS	1169058	1129752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134153_1135053_1135149_1135692_1135703_1138516_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1167551_1167640_1168525_1168734_1168978
923001	contig_14034_pilon	-	1696	2	Intergenic	novelGene_72673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGCTCAACCATACAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393917	391942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_392939_393217
923002	contig_4732_pilon	+	2619	6	Intergenic	novelGene_75467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	461	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGCAGTTGTCTTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696232	942364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_697276_697641_698666_787198_787308_858382_858398_901232_901350_942053
923003	contig_3747_pilon	+	2849	9	Intergenic	novelGene_24792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3826.39692628718	15	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	330	1241	201313	203344	TRUE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKIRSEQPDIQHGQPNQF	200983	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203259_203293_203386_203498_203651_203768
923004	contig_5765_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_141415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATACGTGGACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873237	874989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_873200_875000
923006	contig_11849_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_171756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCAAAAAAAGAAGAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158841	159770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11849_pilon_+_158800_159800
923007	contig_8907_pilon	+	2732	10	Intergenic	novelGene_85854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	23.165001272407	49	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	470	1138	783659	796913	FALSE	45	TCCAAGGACAAGCAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIIVFLPGNIVGKYGTRICPAFLLSIPYTCLPVWAGFRIYNQPSENYNYPSKVIQEAQAKDLLRRPFDLMLVACLLLATAFCLFRGLIALDCPAELCRLYTQFQEPYLKDPAAYPKIQMLAYMFYSVPYFVIALYGLVVPGCSWMPDVTLIHAGGLAQAQFSHIGASLHARTAYVYRVPEEAKIIFLVLNIAYGILPQLLAYRCIYKPEFFIKTKAGEKIE	764015	798507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_764116_772866_772971_777382_777481_781523_781645_783612_783696_784742_784865_786147_786253_788425_788519_788712_788833_796721
923008	contig_15559_pilon	-	2682	1	Intergenic	novelGene_141892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	279	821	146837	146295	NA	35	TTTTACCAGCAGAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSSSGRSSVSSGGRRCVCPLVGGAVCPLVGGDVCVLWWEELCVLWWEEMCVSSGGRRCVSSGGRSCVCPLVGGDVCVLWWEELCVSSGGRSGVCPLVGGAVCVLWWEERRVSSGGRSGVCPLVGGAVCPLVGGAACPLVGGVECVLWWEELCVSSEESQAPWRSGRGTLYERWRLTCH	147115	144433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15559_pilon_-_144400_147100
923009	contig_18850_pilon	-	3396	9	Intergenic	novelGene_142427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATAAGATTACCCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182130	174507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_175507_176353_176459_176665_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178052_178212_178306_178947_179146_180513
923010	contig_383_pilon	-	2269	12	Intergenic	novelGene_126094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAAAGCCTGGGGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134870	86230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_86425_89956_90078_116748_116962_118128_118272_123643_123867_125162_125330_126209_126390_127892_127991_128774_128997_130292_130445_132655_132835_134493
923011	contig_5827_pilon	-	2192	1	Intergenic	novelGene_129802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCCAATTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468058	465866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_-_465900_468100
923012	contig_6954_pilon	-	3646	3	Intergenic	novelGene_64467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1579	1989	897310	896900	FALSE	40	CACACTGTGTAAAATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYKGLHQTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGSWTELETDVEQNSNSYKKDQTYWPERLEKPQEYGPWTPFQLTGEVTPEVHRSAGDWTASLNQMGLMRHSSPGTRTRRQDGTGKLVIGNSRMRRDSVDMSWGC	900958	895242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_897565_899265_899367_899735
923013	contig_5628_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_157558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAAAAAATTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36545	34338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_34300_36500
923014	contig_4213_pilon	+	1885	1	Intergenic	novelGene_124783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACGAGATACCATTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	10162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_8300_10200
923015	contig_6182_pilon	+	2754	1	Intergenic	novelGene_171649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCAGTGTTTCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69832	72586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_69800_72600
923016	contig_20951_pilon	-	1793	6	Intergenic	novelGene_43058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	13106.9997238117	49	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	72	1199	29171	27149	FALSE	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29192_29972
923017	contig_8978_pilon	+	3064	2	Intergenic	novelGene_49313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	456	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146106	273669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_147088_271586
923018	contig_14773_pilon	-	912	1	Intergenic	novelGene_174766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196996	196084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14773_pilon_-_196100_197000
923019	contig_13888_pilon	+	2453	4	Intergenic	novelGene_151799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGACAACTCAGTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338484	481895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_339351_342666_343641_427930_428135_481486
923020	contig_6031_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_56777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGCTTCTTCTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466762	468935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_466800_468900
923021	contig_1759_pilon	-	4261	3	Intergenic	novelGene_171321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	224	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATGTAAAAGATGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82072	7566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_8121_8565_9568_79367
923022	contig_17212_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_88608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76656	74043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17212_pilon_-_74000_76700
923023	contig_4392_pilon	+	5919	19	Intergenic	novelGene_117314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	145.671455129364	25	131	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	732	2199	1035	3233	378985	649057	FALSE	25	TTGGTGGAAGATATTTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVKKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPESTPEVKAWLQRRRKVRKVPKSFQRTRSHPKRPKTEEDEEASAVADGDEFPTPELATDQLKVSEKPEAAVKLGNIGAASEEETFADRMQPDQNLLHNINLSGNSCSSTSIMEEMKTEEDEACATVAPSNPEEADGAVTLSSGCVKSEEADPAKLSWPRSPESCSSVADTNGVWTEGEESDLESCGSGLEPGEVPEVPSGERNGFKVPHRIEAETKTAKSWRHPLSKPPARSPMTLVKQQAASDEELPEVPSTEEEVEETESWAKPLVHIWQTKSPNFVAEQEYNAAVARMAPHCAICTLLMPYYKPDSSNEENESRWETKLDEVITSGEKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEVCDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTQNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCMFCRHRIKKVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKAIAVGQTVITKHRNTRYYSCRVIAVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCVKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYLGSNIAHMYQVLNLKMDPR	306991	651743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_307491_308176_308353_313024_313140_343418_343613_378934_379039_384173_384312_464336_464531_468579_468819_471078_471399_474144_474254_488930_489113_490691_490906_492144_492222_516721_516778_518997_519107_581318_581505_601911_602083_645308_645438_649036
923024	contig_17936_pilon	-	4068	1	Intergenic	novelGene_29943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTCGACCCCCACGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55235	51167	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_-_51200_55200
923025	contig_2854_pilon	-	1540	1	Intergenic	novelGene_120905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTTGAGTATTATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1306647	1305107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_1305100_1306600
923026	contig_9389_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_83888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCTGCCTTATAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69768	68854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_68900_69800
923027	contig_5083_pilon	-	2067	12	Intergenic	novelGene_151663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCCAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674790	461727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_-_461969_462227_462295_462499_462624_546404_546514_648601_648746_651097_651203_653249_653334_658040_658171_658766_658926_659474_659580_666159_666213_674044
923028	contig_8310_pilon	-	1303	1	Intergenic	novelGene_75618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366092	364789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_364800_366100
923029	contig_7919_pilon	+	1967	1	Intergenic	novelGene_28044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTGAATGTTAGGTTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355542	357509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_355500_357500
923030	contig_15410_pilon	+	980	4	Intergenic	novelGene_130623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_1	967.455769876157	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	262	636	146836	148205	FALSE	35	TGTGGATAAATTTCAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICFSTGPSSEAYYSSLPVFEMIMAAVFFVIYMCDLHTKIPFINWPWSDFFRALIAAILFLIISIVVLASPGKASKVIAGTLQMARCRRTLLISLCNLQIMPPSNNSSTPPQQHSQPTHSPLLR	145506	148549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_+_145750_146817_146980_147081_147178_148070
923031	contig_8663_pilon	-	2148	1	Intergenic	novelGene_58000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCTGAAGAGAAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64663	62515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_62500_64700
923032	contig_10437_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_38463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	252	785	1105086	1104553	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPGRRKEKKHRKRKATKKSEKEDEEEEIRGPKELIPEKLAKVETLLEEAIKFLTPLKNLVKNKTETHLFASEIHFREEKFLLMLQSVKMASAMDSNHPWRNEHMIRLFSPAVYESKDLPDSYNNIKTRNESSFGAMNPKNFNETFLKRNSDSLPHRLSAAKIVYYLDPSSQKGATELARTLDASFSNGHLQTWTAVSEALCDSSLGDCKEAAEAHRPYCPKLFLYALASVHPGYEENRRSQLMETVLQKLKTWPVKSEH	1105337	1103641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1103600_1105300
923033	contig_6557_pilon	+	2559	5	Intergenic	novelGene_33032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	81.3956387038028	225	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	134	556	637549	639195	FALSE	10	GTTGTGACCCTGTGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVSGLVPSRFLTLLAHLVVVITLFWSRDSNIQACLPLTFTPEEYEKQDIQLVAALSVTLGLFAVELAGFFSGVSMFNSTQSLISIGAHCSASVALSFFIFESWECTTYWYIFVFCSALPAVTEMALFVTVFGLKKKPL	637415	641198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_637636_637821_637890_637991_638093_638843_638941_639125
923034	contig_15384_pilon	+	3380	6	Intergenic	novelGene_85118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	126.699013413681	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	209	877	75617	79055	TRUE	10	GGCGAGTCTGCAGTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVCFEGDSDGYINLVAYPYVESETVEQDDTPEREQPRRKHSRRSLHRSGSGSDHKEEKASSQEAKSPKMELHSHSDVPFQMLDGNSGLSSEKISHNPWSLRCHKQQLSRMRSESKDRKLYKFLLLENVVHHFKYPCVLDLKMGTRQHGDDASAEKAARQMRKCEQSTSATLGVRVCGMQVYQLDTGHYLCRNKYYGRGLSIEGFRNALYQYLHNGLDLRRDLFEPILSKLRGLKAVLERQASYRFYSSSLLVIYDGKECRAEPYLDRWSEMLPAPAPRQAPPLHPRWMSA	72014	82074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_+_72198_75591_75774_77964_78141_78670_78948_78996_80889_81404
923035	contig_14666_pilon	+	2568	2	Intergenic	novelGene_39501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_1	0	50	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTACCTCTTGTCAGTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314072	316727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_315379_315465
923037	contig_6589_pilon	-	3521	3	Intergenic	novelGene_25742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTCACAATACAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476816	465576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_467194_470062_470139_474988
923038	contig_13171_pilon	-	2642	4	Intergenic	novelGene_177956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCCCCATTCTTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126490	11432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13171_pilon_-_11637_109547_109751_114203_114213_124264
923039	contig_3956_pilon	+	2420	12	Intergenic	novelGene_14957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1229.36136077717	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	81	1907	1281682	1290491	FALSE	15	TGGTGACTGTGTGGAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287431_1289758_1289892_1290297
923040	contig_1725_pilon	+	1983	13	Intergenic	novelGene_24278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	619.408650560265	20	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	42	1007	201480	249088	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDYHKVNHLSSRCGEQ	201438	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_244989_249041_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
923041	contig_10196_pilon	+	1114	9	Intergenic	novelGene_132146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	394.987796488702	4	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	9	614	1034566	1046442	TRUE	10	GTAACCCCTGCCTGTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIGALTNKVTHLSTLQVGSLNIKCLSTPCHTSGHICYFVSKPGSSEPPAQVTHCSWLAVGSSMKGLQTRCTRP	1034557	1050792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043937_1044831_1044931_1046367_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
923042	SIRV6	+	817	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	525	2	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	38	4	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAGAAAGTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
923043	contig_14970_pilon	+	2058	11	Intergenic	novelGene_45005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_7	6366.4471913305	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	35	1360	136145	231550	FALSE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLTLSPVCPDTMNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136110	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_210762_210859_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
923044	contig_10581_pilon	+	1092	1	Intergenic	novelGene_41342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGAGAGGAATTTCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68865	69957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_68900_70000
923045	contig_12410_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_167273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	640	996	91263	90907	NA	55	AAGCACTAAAAAACGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVCLRHLVLLQHKYHKWMVFQEKFILSQSSRLQVQIQVISSRGMLSPSALEESPCPQSSFGLGASLHRNLRSKGRVLLPALLSWWYEVPMCLCSLLSDLKRDCIRNLIMSTSSV	91902	89353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_89400_91900
923046	contig_11422_pilon	-	1149	3	Intergenic	novelGene_99100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGAAGGAATCGAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2184	816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_1196_1371_1873_1915
923047	contig_6102_pilon	+	1499	2	Intergenic	novelGene_32301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	532	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATACTACTCAACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515967	1525658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1516021_1524212
923048	contig_10864_pilon	+	2772	2	Intergenic	novelGene_107070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855119	858065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_855625_855798
923049	contig_6439_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_154249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTAGTACTTACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393678	391267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_391300_393700
923050	contig_12638_pilon	+	1813	15	Intergenic	novelGene_33173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	178.022714097651	3	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	421	1611	269990	274265	FALSE	5	GCTTGCCACTGCTCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235651	274467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269581_269963_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
923051	contig_5083_pilon	+	3778	1	Intergenic	novelGene_151653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	79	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2866	3186	332733	333053	NA	15	GGCTTACTTTGACTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHALCSMQHLSAPPTQGQMVLQEWWHGRGQPIAMSQVQPGLEPRSVPSLTTVSDNGDGRCSWIWRVSSLHFNPLQTSHMTTYHPWNAPTAQQKMCSESPVQFPET	329867	333645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5083_pilon_+_329900_333600
923052	contig_5981_pilon	+	2982	1	Intergenic	novelGene_35521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157755	160737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_157800_160700
923053	contig_14969_pilon	-	2546	2	Intergenic	novelGene_179054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACCGCCATCTTGCCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7548	2502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14969_pilon_-_4308_6807
923054	contig_10734_pilon	-	2780	13	Intergenic	novelGene_51495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	49	junction_10	476.504692759916	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	903	2297	2282483	2265543	FALSE	70	CATAAATAAAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305224	2265059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282884_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
923055	contig_12765_pilon	-	4311	5	Intergenic	novelGene_106560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3005	3346	180976	180635	TRUE	50	TATATATACACATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKDNGRNTESDYLSKRTGCHSTISGGSIRSRTDGTEGRSLSSTEGIGENKAPGIDGIPIEIFQQSDATLEVLTRLCQEIWKTAGWQTNWKRSIFMPIPKKGDPTERINY	183980	118832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_118998_153017_153351_173629_173670_177350_177362_180218
923057	contig_20822_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_170636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAGTATAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7725	9445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20822_pilon_+_7700_9400
923058	contig_14744_pilon	-	2066	6	Intergenic	novelGene_66010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	489.308655145196	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	152	661	969897	968300	TRUE	30	CAAATACCATTTATTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	970048	960504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960911_962457_962609_964176_964410_967273_967445_967855_968630_969717
923059	contig_13744_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_77168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGAGGGAACCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364583	362122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_-_362100_364600
923060	contig_2726_pilon	-	3601	7	Intergenic	novelGene_165892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1894	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATCTCACTGCCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187136	163944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_-_166827_173742_173846_176406_176497_176768_176897_177019_177154_186424_186550_186997
923061	contig_1143_pilon	-	5070	3	Intergenic	novelGene_86633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2974	3291	1336668	1336351	TRUE	35	CTCTGAGTCCTAAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFRAFCILCGRLWNFEKLLDCEADPNVRFTSCFRAEFFGNVVGCCLLNGLVLTISTGSSRISLFLLSSPRGLPNESIHDDECRYSMCFFKILLAEVVKGHILHM	1339825	1288514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1288585_1334641_1337677_1337860
923062	contig_4180_pilon	+	2182	10	Intergenic	novelGene_8292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	184.340934810784	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	757	1623	811833	821915	FALSE	50	CGAAAGCACACAAAATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	733022	822474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_733329_735140_735216_790791_790890_802493_802660_810973_811081_811828_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
923063	contig_9313_pilon	+	1636	5	Intergenic	novelGene_86467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1214.3727547586	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	3	353	387172	432400	TRUE	30	TACAATTTAAATTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLRTRREGARSPRSSPAGVLCRAVAAPRRVLPLRPHQPEASGGRGSSWARRKDGHPRVHRLLLRLRGERSKDGAWSQVFEQKEREEVVRGKEEIKRSGKKQHQQPANGTQRAGLFV	387169	462621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_427877_428023_432396_432583_457278_457360_461601
923064	contig_16917_pilon	-	3041	3	Intergenic	novelGene_161930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298560	117754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_119983_296886_297030_297890
923065	contig_18272_pilon	-	1147	1	Intergenic	novelGene_7034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTGGGGTCCCCTGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234270	233123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_233100_234300
923066	contig_9668_pilon	-	2512	14	Intergenic	novelGene_58185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_9	808.979648078935	12	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	637	1914	280	2193	605373	503609	FALSE	20	TTTTTCCTGAAAGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669976	503289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866
923067	contig_14536_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_69322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	393	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGCTTGCAGTTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275971	274360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_274400_276000
923068	contig_6740_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_142705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAGAAAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657555	655203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_655200_657600
923069	contig_5502_pilon	+	1773	7	Intergenic	novelGene_154964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_1	358.624068102271	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	85	1086	357713	398610	FALSE	25	TCTTGGTTGTCTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	357628	399297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_398436
923070	contig_1146_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_84837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGATTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905498	903189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_903200_905500
923071	contig_19098_pilon	-	460	1	Intergenic	novelGene_65795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTCTGTTCTTTATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118965	118505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_118500_119000
923072	contig_4426_pilon	+	4687	6	Intergenic	novelGene_15377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGGTCCCGTTTGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277455	792588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_278023_294905_295217_412864_413325_486594_488521_678061_678508_791611
923073	contig_6740_pilon	+	1492	2	Intergenic	novelGene_142651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAACAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26391	28704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_27342_28162
923074	contig_5145_pilon	-	1779	8	Intergenic	novelGene_131445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	33	junction_7	149.742363779273	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	647	1396	927097	916397	FALSE	20	TGGTTGCTATGTTATAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASHGLNVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ	927743	916013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923898_923971_924431_924575_925545_925673_927073
923075	contig_7357_pilon	+	3069	2	Intergenic	novelGene_36841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCTGTAGAAATTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152269	155384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_153339_153384
923076	contig_12117_pilon	-	2648	5	Intergenic	novelGene_178846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	351	962	224732	103649	TRUE	75	ATTAAAAAAAAAAAAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQKEKRRNACKYPLITGTWNVRSMNLRKLEVIKNEMECLKIAILGISALKWTAAIGHFELDNHMVFYAWNDNLKRNGIAFIVKNNITKSILKYNAVSDRIISIYLQGRLVNTTIIEIYAPTTKAKDEETEDFYQLLQCEIDQTYNQNALIIIGDWNAEVGNKEGSIVGKYGLGDRSDAEDCMIGFCKINDFIANTFFQQHKW	225082	98236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12117_pilon_-_99576_102789_102841_103352_104101_188774_188825_224622
923077	contig_17144_pilon	-	1434	11	Intergenic	novelGene_29275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2248.42947187587	13	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	125	979	179764	173344	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQNHSLHPADALHPLAPARPLE	183206	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166345_172679_172740_173128_173209_173305_173405_173629_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
923078	contig_9668_pilon	+	3565	1	Intergenic	novelGene_58216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	668	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	741	1109	541342	541710	NA	15	CCAGGCTGCCTGTGTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKGSVSSSSMIFSVFSVFSSCSGTLIARKFLLLIVSHIIPTVSSFLFFLFSEFSSNRVVSKFLSSISLILSSTVSDLLLSPSMTLSISEILFIFWISNCRFCMISSCEFILAFCSSVFS	540601	544166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_540600_544200
923079	contig_8597_pilon	-	2166	2	Intergenic	novelGene_158723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAGTGTAAGAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123373	121118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_123214_123302
923080	contig_16883_pilon	-	3178	2	Intergenic	novelGene_161716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAAAACATTACTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197702	129098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_130291_195716
923081	contig_7887_pilon	+	4048	4	Intergenic	novelGene_124852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1081	1383	75346	75648	TRUE	50	CAACAAACTGACAGACACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRDWSLLITYPKYVRQSLTTLTSKKHSGCCSPKTDLFILLTVRGICNMLHQHHNSKVSVFLRSSLCVVQLSHTYEAIENNHGLGPAHRSLQRDIFTF	74265	190026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_77046_121431_121440_153446_153768_189087
923082	contig_14780_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_166387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACAACGTTTTTCGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104085	106998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_+_104100_107000
923083	contig_15245_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_145219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGTCATAACATTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53740	54718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_53700_54700
923084	contig_6589_pilon	+	1618	13	Intergenic	novelGene_25739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	59.4004185357496	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	25	1263	460735	507033	TRUE	20	TTGATTTGATCTGGAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	457332	509750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_457356_460733_460874_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
923085	contig_16594_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_53920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	166	531	290239	289874	NA	75	GAAAAATAAAAATAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAPCRLLLLVLFSVLTHIPAFPLCILQSAMSSLSILFVSAQSKKTFPSKPIFDVFLFSKPPMACLSFNSPSFIAISAAVCFSFSIVCHSYLCVSLWHRLSSKFPRAEPMFSSCVQTTYSG	290404	288696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_288700_290400
923086	contig_20693_pilon	+	2340	6	Intergenic	novelGene_60263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1258	junction_5	183.521551867894	2	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1087	1755	27342	34261	FALSE	40	TTTTAAAATATCCATCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFSQIYNTIDIQVALVGMEIWSDGDKIKVVPNTGVTFNNFMIWHRSNLAKKKIHDHAQLLSGISFNNRRVGMAASNSLCSASSVAVIEAKRMNNVALVGVMAHELGHVLGMPDVPYDTKCPSGSCVMNQYLSSKFPKDFSTTSRSHFERYLLSRKPKCLLQAPIPKNIITTPVCGNHLLEVGEDCDCGSPKDCTNSCCEARTCKLKPGTDCRGDTVNQITK	26255	34846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20693_pilon_+_27527_27888_27971_28866_28998_29789_29968_32928_33015_34254
923087	contig_16255_pilon	-	1938	2	Intergenic	novelGene_176099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	59	319	33474	30015	FALSE	45	GTCAGACTTTTTAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFRCCISKQLWRLQCSFWMEEGYDVKGVPTLLLDAYSFNDILAITGFNTCLGIAFSTGSTIFNVLRGILEVVIGVAAGSLLGVFIQYFPSSDQVREITCGKVML	33532	28395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16255_pilon_-_30158_33356
923088	contig_10446_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_162478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTGGAATGTGGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741583	742752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_741600_742800
923089	contig_12790_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_35192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191360	194034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_191400_194000
923090	contig_4232_pilon	-	1111	1	Intergenic	novelGene_63327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAAAATACAGGAGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468065	466954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
923091	contig_9363_pilon	-	2475	1	Intergenic	novelGene_6726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATATTGCAGTAGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1443934	1441459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1441500_1443900
923093	contig_12079_pilon	-	2046	10	Intergenic	novelGene_67534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	431.95064304234	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	167	790	871668	861925	TRUE	45	GAAAGTACAAACGTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLK	872424	860605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861628_861690_861928_864657_864701_866539_866650_867256_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
923094	contig_16724_pilon	-	1414	5	Intergenic	novelGene_105308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	844.248926561355	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	420	689	560992	541872	FALSE	35	ACCAAAGCAATGTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLPVLGIVSHCNLSHSSRVFSLCNIYSDLLPTQTGFLFYCVLIIICRYSGYQLFLSNIHVISWSFHHHNGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	568139	541146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_567926
923095	contig_6137_pilon	-	1915	2	Intergenic	novelGene_59154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTAGGGTATATTCCTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1175902	1173815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1173952_1174123
923096	contig_6503_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_145795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	923317	924422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_923300_924400
923097	contig_11026_pilon	-	1995	1	Intergenic	novelGene_167661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	155	475	133278	132958	NA	35	GCCTGCCAAACAGAGATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKNNSGECSGRSENCNTGDSTDGERQQQRNGSSGTRRSAHNSAGADPQRESLVPLHGRLPGGVGCFWALIGGARPADPQSKRAECLLAEVYWWSGVPPSTYQWN	133432	131437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_-_131400_133400
923098	contig_3817_pilon	-	4409	10	Intergenic	novelGene_78308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	34.8966728754731	10	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	3226	4128	159727	151911	FALSE	40	TAAGGTTCTAAATCAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERMKAEKERRQLEEKLQAEVLLQQMEELKVKEMEATKLKKEQENLLKQRWELERLEEDRKRMAALRQKAELGRFLRHQYNVQLNRRTQQIQEELEADKRILQALLEKEDENQRIHLARREQALADVAWMKQVIEEQLQLEREREAEQQMLLRDEAKEMWEKREAEWARERSARDRLMNEVLTGRQQQIQEKIEQNRRAQEESLKHREQLIRHLEEARESARREKEESEELKSAWKQELEAQVVERQLQAQEEDQQEEEEEEEARQAEQLTDALLQQEAKMMAEQGYWPKTYRHPKIAWN	166502	151629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_151944_153063_153208_153723_153910_156354_156437_157226_157400_158371_158439_158628_158742_159622_162359_164940_165129_166096
923101	contig_1725_pilon	+	2329	16	Intergenic	novelGene_24276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	591.460752901004	4	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	750	2021	247068	255543	FALSE	30	TGATTTAACTACATTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201428	255851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236052_246614_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
923102	contig_18108_pilon	-	2055	1	Intergenic	novelGene_33443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	257	571	59357	59043	NA	35	CTGAAGGATTCAATTTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRLFTIVSRPSGNFYITECYCTLFLTPQVGNVKSVNVGKFTPWKLANATYQGFCFSKSQLLNIYQHTAASSSNLGLLWLRKSECFYGKVWWCSLTLGMWVVG	59613	57558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_57600_59600
923103	contig_5797_pilon	+	3759	2	Intergenic	novelGene_56915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACTCAACAGCACCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173620	177513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_176766_176899
923104	contig_5226_pilon	+	4601	1	Intergenic	novelGene_140502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	222	669	1121	1789	24283	24951	NA	65	ACGGTAAGTACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQWFNIRKTVNVIHHINKTKDKNHMILSIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIEIEGKFFNIIKGIYIKPTANIILNAETWKAFPLRTGQIRMPFITTLIQHCAGGPSQSNEARKIKRIQIGKEEVKVSLFADGMILYTEKPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLKEETTRSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYNENYKKPRDLPK	23162	27763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5226_pilon_+_23200_27800
923106	contig_1154_pilon	+	2890	2	Intergenic	novelGene_87073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTATAAAGATTACAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209323	212452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_209638_209876
923107	contig_17274_pilon	-	1686	8	Intergenic	novelGene_26570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_4	343.224089350098	3	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	137	709	247024	232842	TRUE	30	ATTGAATTGTGTCCCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKGAVMK	259031	231020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_237118_237212_240084_240145_243020_243105_246141_246311_246874_247035_258905
923108	contig_14745_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_147854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATGGTATAGAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67698	68757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14745_pilon_+_67700_68800
923109	contig_9696_pilon	-	3639	4	Intergenic	novelGene_68819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	317	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCATTAAAATTAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460720	396460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_397766_398277_398561_437256_438169_459581
923110	contig_2078_pilon	-	3633	1	Intergenic	novelGene_100142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAAAAAATTAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273805	270172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_270200_273800
923111	contig_15897_pilon	-	2852	1	Intergenic	novelGene_49537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594287	591435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_591400_594300
923112	contig_11594_pilon	-	2375	1	Intergenic	novelGene_80917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCAGCACAACTGGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339439	337064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_337100_339400
923113	contig_10311_pilon	+	3977	9	Intergenic	novelGene_50417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACAGCGGGCTCGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65124	71557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65601_65836_67260_67490_67585_67826_67961_68263_68407_68641_68754_68868_70360_70448_70493_71497
923114	scaffold_12124_pilon	+	3710	11	Intergenic	novelGene_22317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3282.13159547267	6	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1741	2520	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483544	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1492789_1492949_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
923115	contig_9366_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_166249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTACTATCCACCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914512	916553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_914500_916600
923116	contig_2550_pilon	-	693	1	Intergenic	novelGene_135665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTTGTGCTGGACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183333	1182640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1182600_1183300
923117	contig_804_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_138791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	95.3406523996978	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	114	782	204639	172825	TRUE	20	AATTGTACTGTGTCAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCARENCKYLHPPAHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQFMLQNAQMPSLNSFPVTPSVAANPAMPFNPYLPHPGMGLFPAELLPNAPVLISGNPPLALPGAAGPKPMRSDKLEVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDVSMIEVSDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKLKAAHHQMNHSAATAMALQPGALQLIPKRPALEKTNGATPIFNPSVFHCQQAMANLQLPQPAFIPADSSMVSYCKCP	204752	169051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_804_pilon_-_169528_172738_172860_178352_178504_183049_183287_184285_184478_204585
923118	contig_19352_pilon	-	2593	2	Intergenic	novelGene_122343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGGGACAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91083	85707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_87827_90609
923119	contig_1836_pilon	+	3726	1	Intergenic	novelGene_71047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAATTGTAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744118	747844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_744100_747800
923120	contig_3525_pilon	-	3513	1	Intergenic	novelGene_135124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	77	234	70	303	53472	53239	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TELSLEVHERGAGDITLGQNNTRMLLNWDTAQEEPSDSSNAEVQERKATETWQWDKTARDVMHREFKIKVKCPVDGTKRGGGGDEEVLLRKGVLVGTPGS	53541	50028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_50000_53500
923121	contig_14969_pilon	-	2168	1	Intergenic	novelGene_179053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTCTCCCCCCAGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4654	2486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14969_pilon_-_2500_4700
923122	contig_3077_pilon	+	1402	6	Intergenic	novelGene_26749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1129.98276093045	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	379	837	15160	17511	FALSE	30	AGATTAACAGTGTGCGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSAVPEEQAAGRCHGVGPGLG	11280	18076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_11514_13047_13171_15137_15262_16144_16328_16936_17049_17449
923123	contig_6616_pilon	-	2037	3	Intergenic	novelGene_141764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCCTACTCTGTTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355365	351653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_353524_354058_354117_355256
923124	contig_13021_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_8216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_4	2922.00740074354	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	106	570	178184	180230	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGKTNLG	177699	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985
923125	contig_16098_pilon	-	1288	9	Intergenic	novelGene_46019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1526.83045882639	27	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	300	1166	350353	348413	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354106	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350413_352227_352352_353990
923126	contig_15029_pilon	+	1803	2	Intergenic	novelGene_128230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCCTAACCCTCTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534409	537259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_535309_536355
923127	contig_13004_pilon	-	2046	1	Intergenic	novelGene_112600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCCCTAGCACAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105318	103272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_103300_105300
923128	contig_17753_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_105091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGTGTATCTGTCGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93596	96271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_93600_96300
923129	contig_18869_pilon	-	1235	3	Intergenic	novelGene_55967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	8.5	8	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	7	855	34934	30616	FALSE	75	GAAAACTTAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGSYVEINDTITQIPSKVQIQDITKELHCPLCHDWFRDPLMLSCGHNFCQVCIQNFWKQQAKETFCPECKMLCQYSNCTFNIVVEKLVEKIKKLPLLKGHPQCPEHGENLKLFSKLDGKLICFQCKDARLPVGQSKEFLQISDAVRLFTEELTVRQGQLEATLKELQSLRNVQKDAIAANKENKLHLQQHISLEFLKLHQFLHSKEKEVLNELREEGKALNEEMEQNLNQLQEQCLLTKEMLVSIQARMEQQNAFEFLKVRSSSSMTMGILKWKRGLERM	34940	30235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_30916_33538_33635_34481
923130	contig_8259_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_148887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTCTCTGAATGGGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272070	272901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_272100_272900
923131	contig_1274_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_137826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798957	800393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_799000_800400
923132	contig_16360_pilon	-	4671	1	Intergenic	novelGene_170082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1673	1975	145224	144922	NA	25	CACATTTTAGCCCCTATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPHAFFQTSAFRSKQELLYELFCRYFTNDSKTCHSRNSTGLPCFSGSHKFSTFDRVQSYLFSIDYSSGKYLRFPSLTDSGFRRFYCINVLPWKHQISAI	146896	142225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_-_142200_146900
923133	contig_12638_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_33353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAAGGCGCTACATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1396409	1395014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1395000_1396400
923134	contig_987_pilon	-	2376	15	Intergenic	novelGene_72278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	317.229235341105	39	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	693	1592	941148	920155	TRUE	30	ACAATTCTACCAGTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSESHQRQLLLASENPQQFMDYFSEEFRNDFLELLRRRFGTKRVHNNIVYNEYISHREHIHMNATQWETLTDFTKWLGREGLCKVDETPKGWYIQYIDRDPETIRRQLELEKKKKQDLDDEEKTAKFIEEQVRRGLEGKEQEAPVFTELSRENDEEKVTFNLNKGACSSGGATSSKSSSLGPSALKTIGPAGSVKRKESSHSSAQSKEKKKKKSALDEIMEIEEEKKRTARTDYWLQPEIIVKIITKKLGEKYHKKKGIVKEVIDKYTAVVKMIDSGDKLKLDQTHLETVIPAPEEKEF	991058	907132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_907831_920068_920172_921710_921811_922616_922686_927659_927711_929229_929360_932293_932355_933198_933248_936245_936428_937203_937327_937410_937455_941074_941170_965205_965279_981662_981792_990589
923135	contig_7887_pilon	-	1393	1	Intergenic	novelGene_124945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAGGCCTGCAATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823891	822498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_822500_823900
923136	contig_6710_pilon	-	551	2	Intergenic	novelGene_97298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1	369	657516	653562	FALSE	60	AGAATAAAAATGAAAATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQKPVSAEGPKWTSNVRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657516	653379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657467
923137	contig_4315_pilon	+	2287	1	Intergenic	novelGene_46755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAGCAAACATACAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233946	236233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_233900_236200
923138	contig_11293_pilon	-	4121	1	Intergenic	novelGene_134682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	289	600	140998	140687	NA	10	GGTTGTACTTTGACCCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCLWLEPKDGRGPGATIPTTVSSPLTVHKERKVDRSRVQASRGGHGAPPALPLPVPRVCPPLPCMTTLFHIHSHGFLSFQQLLKSRAAACFHYLTIILTVI	141286	137165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_137200_141300
923139	contig_3269_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_117008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAGGAAAAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53831	53154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_53200_53800
923140	contig_1309_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_73983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATGTTGAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297772	299819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_297800_299800
923141	contig_5423_pilon	+	3147	1	Intergenic	novelGene_85218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACTGTCTCTCAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395491	398638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_395500_398600
923142	contig_12139_pilon	-	2694	1	Intergenic	novelGene_146460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTCTTACAGGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73396	70702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_-_70700_73400
923143	contig_2933_pilon	+	2603	20	Intergenic	novelGene_111311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	126.888416965895	2	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	855	2568	30	2597	301913	336954	FALSE	25	ACCACTTTGTTTAACAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKMEEECKLERNQSLKLKNDIENRPKREQVLELERENEMLKTKIQELQSVIQAGKRSLPDSDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEMYRHRMNTVMLQLDEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIEKVRREACIVNLESKLRRLSKDSGTLDQSLPRNLPVTIISQSFGDGSPRTNGQEADDSSTSEESPEDSKYFLPYHPPKRRMNLKGIQLQRAKSPISLKQASDLQAGRGHEEDDPDASPSSSNSLPTNSAFAKMQPHRNRNSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRSTVEEDNDSGGFDALDLDDDSHERYSFGPPSIHSSSSSHQSEGLDAYDLEQVNLMFRKFSLERPFRPSVTSGGHLRGPGPAVQHATLSGDSLIAQLTVVGGNARGSFIHSVKPGSLAEKAGLREGHQLLLLEGCIRGERQSVPLETCTKEEARWTIQRCSGPITLHYKVNHEGYRKLLKDMEEGLITSGDSFYIRLNLNISSQLDACSMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLCARVDPFTDHDLDMGTIPSYSRAQQLLLVKLQRLMHKGGREEVDGAHHTLRALRNTLQPEEPLSTSDPRVSPRLSRASFLFGQLLQFVSRSENKYKRMNSHERVRIISGGQPGSLGRASLDVTKLLSEKQEELEPESELSRNLSLIPYSLVRSFSCKRRRPVLFSPSMLAKTLVQKLLNSGGAMEFTMCKPDIVTREEFLRKQKTETIIYSREKNPNTFECIVPTNIEASRPGQVLGVGAVCCAIVFLALNIHIP	301883	336960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_301949_307613_307794_308707_308861_309617_309744_310407_310606_311512_311690_315832_315885_317716_317803_318830_318932_320205_320259_323290_323424_324000_324203_324808_324936_327620_327862_329145_329243_330116_330213_331268_331405_332891_333072_333395_333509_336873
923144	contig_6823_pilon	+	2157	3	Intergenic	novelGene_131237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	412	741	337336	419057	TRUE	30	AGACGCTGCCCAGACGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSLKRTRALYSPLSEGIGVRGSTVSLVSLRSPLTRDTICGSSSHGAPSVAAEMVIGTAKTVTNCTTLTEKWGQEGHSEESTPTSVPGVYFIVNTASSEANNRTMGFG	336924	421617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_337603_418994_419294_420437
923145	contig_4091_pilon	+	7064	8	Intergenic	novelGene_172993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	133.063587684035	379	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	6154	6468	311552	311866	FALSE	45	TACAACAGGGAATCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQELEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEHKHLVTRLFEENSEKRTKKNEETLRVMGDTIKSKNL	10679	312462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_28180_30352_221594_222666_309698_310017_310569
923146	contig_15666_pilon	-	2292	5	Intergenic	novelGene_70157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.352480108622	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	73	1023	110619	108530	TRUE	40	GATCAGATAGCATGTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTAGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110691	106774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107039_107524_108859_109098_109378_109948_110231_110558
923147	contig_11413_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_103229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAGAGAGAGAGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	878976	881169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_879000_881200
923148	contig_11505_pilon	+	1740	1	Intergenic	novelGene_140930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATCCAAAATAAAACACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168801	170541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_168800_170500
923149	contig_6846_pilon	-	3000	1	Intergenic	novelGene_107312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	12	323	330507	330196	NA	40	TAAAAAGTTTTTGCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTEFGTERLGCCTNRYLKCGSSFKTVNGWTCGSDRGPAAAEKQQQQRTNSSRTRTPVKDGTGADPRSERAECLFARGFLAEWGASEHLLVELGLPTMEQGS	330518	327518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6846_pilon_-_327500_330500
923150	contig_13786_pilon	+	2703	1	Intergenic	novelGene_174572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	299	646	105449	105796	NA	30	AGTGAATCCTGAGTCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIVLGFIFRSLIHFELVFVYGVRYGSGFIFLQLDIQFCQHHLLKTVFSPFDGLWALVEDQVTVGGWIYIWVLSSVPLVSVSVVVPVPGCFDYCSCIVVSEVRWCESSNFILLL	105150	107853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_105200_107900
923151	contig_4180_pilon	+	1422	7	Intergenic	novelGene_8334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1959.16831135618	11	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	351	932	870689	888134	FALSE	75	GAAAATAAAAACAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLLAVHGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865691	888624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_870518_870714_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
923152	contig_9512_pilon	-	2369	3	Intergenic	novelGene_178002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	126	2042	810155	713562	TRUE	40	AGTAACTGTTAAATGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNRIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERQKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADGMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRIAGYKISIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKEDYKTLLQETQRDLSKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIWKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNERYIDQWNRIENPDVNPSIYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQYPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIEPTLQALIHGINRIQTTTINAQNPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRAKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNQKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQMKTTMRYHLPPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	810280	712682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9512_pilon_-_712779_713330_713976_808652
923153	contig_4024_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_177896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGATTGCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121706	119365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_119400_121700
923154	contig_5571_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_75527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219978	222253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_+_220000_222300
923155	scaffold_21177_pilon	+	1705	2	Intergenic	novelGene_145488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTATGAGTCAGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189053	240108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_190191_239540
923156	contig_11448_pilon	+	4598	1	Intergenic	novelGene_66352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAATGAAAAAGATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173475	178073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_173500_178100
923157	contig_12622_pilon	+	3528	6	Intergenic	novelGene_5804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_5	80.1288961611228	8	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	42	584	349741	403121	FALSE	10	TGGTTTGTACTTCTCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLTIEQLSYLLKFAIQKMKQPGTKLYLLKTVYKKKRFM	349699	406065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398346_398491_401825_401940_403070
923158	contig_17144_pilon	-	828	6	Intergenic	novelGene_29268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1589.2709523552	191	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	219	533	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183200	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_179737_179786_181794_181850_183158
923159	contig_9235_pilon	+	2057	3	Intergenic	novelGene_156195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	262	7	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43463	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_45991_47187
923160	contig_10734_pilon	-	2118	14	Intergenic	novelGene_51497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	521.172846659028	2	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	99	1646	2305085	2265543	FALSE	55	GTAATACACCACATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305183	2265070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265750_2266013_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
923161	contig_12402_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_133382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTATATGTACCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640364	641819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_640400_641800
923162	contig_6513_pilon	+	2456	1	Intergenic	novelGene_117760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTCTACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148283	150739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_148300_150700
923163	contig_12239_pilon	+	3494	8	Intergenic	novelGene_170471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_7	56.9733199284847	63	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	180	890	24698	74567	FALSE	45	TAAATAAAACTAATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQRKHLVKDFNPYITCYICKGYLIKPTTVTECLHTFCKTCIVQHFEDSNDCPRCGNQVHETNPLEMLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQELERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENSYPMVLQYRPRIDFG	24518	77171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_24810_45246_45344_47054_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_74519
923164	contig_11816_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_98587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1887	2225	1356283	1356621	NA	20	CATGCTGCTCCCACATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIRYMEPNEGIGQSCHPTRLKMSHPRGEERISPSPRKNSQEQSVSFRPRMPALRSFWNQETRRGRAVTLKTARSGGRKTVAGETVRRQCSGLPSLWSEKAECFWSGGLLVE	1354396	1357108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1354400_1357100
923165	contig_18487_pilon	-	2122	1	Intergenic	novelGene_172678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTACATCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219802	217680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_-_217700_219800
923166	contig_6165_pilon	+	3384	3	Intergenic	novelGene_167420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGAGCTTGAGCCAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500217	507870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_503410_503875_503980_507782
923167	contig_6443_pilon	+	5477	6	Intergenic	novelGene_175144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	803	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	982	1323	27926	28362	TRUE	50	AAACTACAGACCAATATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFETEAAWLLVSFVSSASASVSCGLLALEPHAHICPAGASVPKLCSSTGISARRHPTPPGSLLHTGTQLSRSVGQLQHHLALVSWFCCCWFSAAAASQLL	26944	347716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6443_pilon_+_28143_28237_28513_92601_92825_135424_135608_206968_210408_347557
923168	contig_4659_pilon	-	1111	8	Intergenic	novelGene_118242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	256.322262085868	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	632	1033	838964	819799	FALSE	25	TATTTTCTAAACATTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	884093	819720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847714_853783_853906_859916_860035_884007
923169	contig_3822_pilon	-	813	9	Intergenic	novelGene_133308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1415	junction_5	703.634315536131	13	17	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	80	811	292774	277222	FALSE	75	GAAAGAGAAAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDS	293596	277219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281136_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547
923170	contig_6165_pilon	+	6570	3	Intergenic	novelGene_167399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	49	junction_1	15	184	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	768	2307	242	2548	404093	433487	FALSE	35	CTCATTAAAACCCAATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIEVSVAECKSVPGITSTPHSMDHPSPFYSPPHNGLLTDHESLDNDVAREIQYLDEVLEANCCDSAVDGTYNGTSSPEPGADILVDSLSPPAHTAIQPEPTERAAGRQAPPHIELSKSNSYTMAEGERANGHPPDQLRDTLGDSLQAPVSPSSSTSSRCSSRDGEFTLTTLKKEAKFELRAFQEDKKPSKLFEDDESEKEQYCVRKVRPSEEMLELEKERRELIRSQAVKKNPGIAAKWWNPPQEKTIEEQLDEEHLESHKRYKERKEKRAQQEQLLQQQQMQQQQQPPPQLCTAPAASREHSSMTENAKEDIVTEQIDFSAARKQFQLMENSRQTVAKGQSTPRLFSIKPFYRPLGSISSDKPVTISRPASVGAPPEDSAASTTKGQKVACALDSQSVGGGQGGAAPQGKEGPYSEPSKRGPLSKLWAEDREFTSVRAVLTVVKDDDHGILDQFSKSVNVSLTPEELDSGLDELSVRSQDTTVLETLSNDFSMDNISDSGASNETTSALQENSLADFSLPQTPQTDNLSEGRGEGVSKSFSDHGFYSPSSTLGDSPSVDDPLEYQAGLLVQNAIQQAIAEQVDKAVSKTSQDGAEQQRPEVTLEEAETGPSNSEKPQSMFEPPQVSSPVQEKRDVLPKILPAEDRALRERGPSQPLPAVQPSGPVNMEETRPEGGYFSKYSEAAELRSTASLLATQESDVMVGPFKLRSRKQRTLSMIEEEIRAAQEREEELKRQRQVLQITQSPRAKNAPSLPSRTTCYRTAPGP	317189	437509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_317320_403981_406392_433479
923172	contig_10500_pilon	-	3704	7	Intergenic	novelGene_41253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	46	junction_6	960.94860540105	2	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	611	1066	1635143	1629460	FALSE	30	CCTTCAATAATTCTGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640219	1626821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635145_1635518_1635617_1636940_1637067_1639834
923173	contig_1244_pilon	-	1722	5	Intergenic	novelGene_38022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1056	junction_3	371.981518358103	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	876	1310	924306	923211	FALSE	25	CTACATCATATTTATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGSVSSSSYNA	925416	922798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583
923174	contig_4131_pilon	-	2700	1	Intergenic	novelGene_127857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	52	432	152917	152537	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTGGESVKEVVTFSGEIMPEPSKSAPAPKKGSKKAITKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK	152968	150268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4131_pilon_-_150300_153000
923175	contig_9515_pilon	-	1265	10	Intergenic	novelGene_73800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	167	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1	807	72653	66703	TRUE	20	AGGAATGGCTTGTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEWKRARVGHLGQVHLSSGIRDLIQSRGLGVCLVSRKVFLGVALLQRWLGAQDLDHLGRLLPISDNLHLGLALPLTVPNGQGQVPCLVALQDVGLATTPGKDGLTQVQDEAVPSVEAVPAQRSLRGSDVLLPLHVVEFLDGSWGGPWGGLVEC	72653	30326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_30346_65806_65901_66072_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68347_68727_68822_69341_69476_71787_71873_72459
923176	contig_7285_pilon	+	2547	12	Intergenic	novelGene_143385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_11	236.185912204701	6	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	11	1006	220216	324708	TRUE	60	TTTGACAAAATGAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGVARQAQTSQESYHDKAREHPDEGKHPDGGLYNKGPSYSGYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSPPIPRTSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFYPLSPGGVGQITPPLGWQGQPVYPITGGFRQPYPSSLSVDTSMSRFSHHMIPGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEHPHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNAFMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKREKLQESTSGTGPRMTAAYI	220205	335128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7285_pilon_+_220225_221382_221450_222879_223014_301406_301540_308340_308432_310159_310244_312550_312674_313781_313945_320306_320415_323968_324018_324673_324715_333593
923177	contig_5894_pilon	+	4596	2	Intergenic	novelGene_83032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	135	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	3649	4230	437733	438314	FALSE	35	GCGCGGCTTAAAATCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEYRVAKAKGRNDEVKELNRRFQRAAPEDKVKYYNDTSKDLEIENQKRRTCLAFVKLKKLKKKFKPRVAILKDSMGKILINAGSIKRRWKEYTESLYQKELVDIQPFQEVAYDQETLVLKEEVQAALKALAKNKTLGTDGIPVEMFQQMDTTMEALTSLCQEIWKTATSPTNWKRSIFVPIQRK	357299	438680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_360064_436848
923178	contig_9527_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_134038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284653	286096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_+_284700_286100
923179	contig_14925_pilon	+	1678	5	Intergenic	novelGene_55299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACAGCACTCAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112094	129481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_+_113276_114663_114781_115152_115207_115820_116101_129435
923180	contig_3095_pilon	+	1056	4	Intergenic	novelGene_75145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3565.0399093917	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	37	627	149709	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKSASPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	149672	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150688_151002_151163_151848
923181	contig_10196_pilon	+	2994	1	Intergenic	novelGene_132250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTCTCCGCACAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1802984	1805978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1803000_1806000
923182	contig_18794_pilon	-	1976	12	Intergenic	novelGene_54632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	40	junction_11	38.611007722609	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1605	372	1976	111149	82723	FALSE	50	AGCAAAATAAATTCAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRYTTIKQLGDGTYGSVLLGRSIESGELIAIKKMKRKFYSWEECMNLREVKSLKKLNHANVVKLKEVIRENDHLYFIFEYMKENLYQLIKERNKLFPESAIRNIMYQILQGLAFIHKHGFFHRDLKPENLLCMGPELVKIADFGLAREIRSRPPYTDYVSTRWYRAPEVLLRSTNYSSPIDIWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEIDTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFRWPQCVPNNLKTLVPNAGSEAIQLMRDMLQWDPKKRPTASQALRYPYFQIGHPLGSTTQNLQNSGKPQKDVLEKAGPPPHIKPVPPAQPPVKPHTRISSRQHQASQPPPHLVYPYKAEASRADHLSHLQEDKPSPLLFPSLHHKNPQSKILAGLEHKNGEIKPKSRRRWGLVSRSTKDSDDWADLDDLDFSPALTRIDLKNKKRQSDETLCRFESVLDLKPSEHVGTGNSAPAQTSSQRRDTPTLRSAAKQHYLKHSRYLPGINIRNGILPNPGKDFIPSNPWSSSGLSGKSSGTVSVI	141576	82722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_-_82836_85119_85269_85386_85578_87447_87769_88475_88644_91978_92151_92842_92976_106599_106680_107859_107982_110325_110381_111048_111322_141377
923183	contig_3900_pilon	+	2067	1	Intergenic	novelGene_84188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCATTGCTCACCTAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235335	237402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_235300_237400
923184	contig_10134_pilon	-	1709	4	Intergenic	novelGene_16249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	693.05892005418	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	398	628	34974	33552	TRUE	25	ATGTCTGCTCTATTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTLKCHGAHTPGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSDWLLLQTPHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQGPANSPFFLFWYQITFILVMGLLFTVDTGLYLSLQRDLQSLMGNRNNYNVTWSKSPQDK	38752	32242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_32799_33026_33731_34922_35178_38558
923185	contig_6710_pilon	-	523	2	Intergenic	novelGene_97937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	657523	653562	FALSE	40	TTTAACTTTAATCATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSTAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657525	653412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
923186	contig_20889_pilon	-	2898	2	Intergenic	novelGene_127645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2311	2625	42540	42226	FALSE	0	GCTTGGTGCCTCTGCCGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAWTGKQFHTRTELHSPSGRSKDGAQSLVFEQKEEEVVIGKEEIQRSGKKQHQQPTNGTQGVGQCGWMESKQPMLPGQETGAMGSRGGRAGVKKGGGWESVYR	44955	41952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_-_43079_43183
923187	contig_11572_pilon	-	2135	2	Intergenic	novelGene_100036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCACGAGCCACTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142785	138997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_140974_142626
923188	contig_4857_pilon	+	3786	1	Intergenic	novelGene_48746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	252	759	341	1099	1198189	1198947	NA	45	AAAAAAAATTTAGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAVYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTTWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYSHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWIAICKKMKQDPYLMPYIKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKTEPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKSKKRTYRLGKNFWTVQVRQRSNLHNLQENPTPLQQKDK	1197848	1201634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1197800_1201600
923189	contig_11417_pilon	-	479	1	Intergenic	novelGene_103281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGAGTTCCATTCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391200	390721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_390700_391200
923190	contig_19640_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_134858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46479	44102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19640_pilon_-_44100_46500
923191	contig_5302_pilon	-	1957	2	Intergenic	novelGene_81450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1456	1830	176322	175948	FALSE	30	ACTGTACATAGCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	177969	175820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176495_176686
923192	contig_5623_pilon	-	1713	12	Intergenic	novelGene_154823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.410759770668	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	2	1501	214867	207141	FALSE	65	AAAAAAAAAAAGAGTTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCKMVSSSEVSVCSGPVWNQRLEFDINICDLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLRGVGSSSHLVPTVQRGTPVLSPPPATSVLPSPARPPLTVICGGHLQGRPVP	214868	206928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207298_210755_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681
923194	contig_9901_pilon	-	2562	6	Intergenic	novelGene_126941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_5	75.5629538861471	402	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	216	977	216214	203983	FALSE	35	CCATTGTGGAAAACAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDVGKWPIFTLLSPQEIASIRKACVFGTSGNEALYVTDNDEVFVFGMNYSNCLGTGDNQSTLVPKKLEALCGKKIKSLSYGSAPHVLLSTEDGVVYAWGHNGYSQLGNGTTNQGIAPIQVCTNLLIKQVVEVACGSHHSMALAADGEVFAWGYNNCGQVGSGSTANQPTPRKVTNCLHIKKVVGIACGQTSSMAVLDNGEVSPLSIPVPLPPPLSVKCPCLHEICGLVSGRKIDGFDLVASLVASWLLTAEG	249465	202397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_-_204301_207324_207492_215524_215676_216088_216261_245846_245927_249376
923195	contig_4228_pilon	-	2297	2	Intergenic	novelGene_151172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	615	1076	465118	464657	TRUE	40	TGGGAAACAGCAAAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELSDREFKSLIFRAIQELKQKADTNEEKIDKFMEKADKLMENTNKKMEEFREIMQEQNAKINLQLEIIQTQQLEIQKINNKISEMDGVTEALRSRYEMVEIGSANLKTNTWIQICLRKNQKKRMKKKKMKKP	465732	462851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_-_463803_464386
923196	contig_8377_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_35024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACAGCATGCGTCCTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69275	68235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68200_69300
923197	contig_10904_pilon	+	4136	1	Intergenic	novelGene_22701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	260	783	2099	2881	625870	626652	NA	20	TCTGTGTGCTGACATTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISHLNSETISRIDFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKLTLERGVSKADGRNGEVKELIRRFGRVAQDDKVKYYNDKCKDLELENQKGRTCLAEGTKQKIQASTFNIEGFYGENIKLCRTYQKKMEGIQSHCTKKELIGVQPFQETAYDQEPMVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGILIEMFQQMDAALVVLTCLCQEIWKTATWPTDWKRFMFIPIPNKGDPNECGNYRTKS	623771	627907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_623800_627900
923198	contig_10837_pilon	+	3059	2	Intergenic	novelGene_160654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	79	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAAGCTGCACTGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	119880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_+_2023_118843
923199	contig_8317_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_19558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
923200	contig_6929_pilon	+	2465	2	Intergenic	novelGene_139431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1	426	194270	196752	FALSE	65	GATGGAAAAAAATAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSEGRSSSWLLLQPRRALRESLKIRRFSRRQVRKGCGSGVRRGKEVLTERLIPWASREAKGGSSLPVFLGVYRRKLGGAHPDPRRLGPGEPLPHPPGRGPLRPRGARRAGAEGSFVYKTGFTPTTLRKIYHKATADLKLH	194269	198791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_194610_196666
923201	contig_11548_pilon	+	1702	5	Intergenic	novelGene_66776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1189.67905335851	7	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	315	866	117651	119638	FALSE	30	GAAACCATTACGCTGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTVFFNVLLQIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112635	120474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117604_117856_118975_119121_119346_119402_119491
923202	contig_11448_pilon	-	3532	6	Intergenic	novelGene_66351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_1	68.973618144911	328	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	447	2450	186389	165976	FALSE	85	TAAAAAAAAAACAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERIHSINLHNFSNSVLETLNEQRNRGHFCDVTVRIHGSMLRAHRCVLAAGSPFFQDKLLLGYSDIEIPSVVSVQSVQKLIDFMYSGVLRVSQSEALQILTAASILQIKTVIDECTRIVSQNVGDVFPGIQDSGQDTPRGTPESGTSGQSSDTESGYLQSHSQHSVDRIYSALYACSMQNGSGERSFYSGAVVSHHETALGLPRDHHMEDPSWITRIHERSQQMERYLSTTPETTHCRKQPRPVRIQTLVGNIHIKQEMEDDYDYYGQQRVQILERNESEECTEDTDQAEGTESEPKGESFDSGVSSSIGTEPDSVEQQFAGVARDSQAEPAQPEQATEAPVEGGPPPHPLETGASTPERSNEVEMDNTVITVSNSSDKSVLQQPSVNTSIGQPLPSTQLYLRQTETLTSNLRMPLTLTSNTQVIGTAGNTYLPALFTTQPAGSGPKPFLFSLPQPLTGQQTQFVTVSQPGLSTFTAQLPAPQPLAPSAGHSTASGQGEKKPYECTLCNKTFTAKQNYVKHMFVHTGEKPHQCSICWRSFSLKDYLIKHMVTHTGVRAYQCSICNKRFTQKSSLNVHMRLHRGEKSYECYICKKKFSHKTLLERHVALHSASNGTPPAGTPPAAHAGPPGVVACTEGTTYVCSVCPAKFDQIEQFNDHMRMHVSDG	436787	164893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_166398_184807_186410_216685_216874_225366_225468_349238_349276_436687
923203	contig_513_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_80125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGTCAGAAAAGAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298299	295851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_513_pilon_-_295900_298300
923204	contig_11338_pilon	-	1593	10	Intergenic	novelGene_6344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_5	244.177278242421	13	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	299	676	319426	300344	TRUE	35	TTCAGGGGCCAAAAAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTAVGFTQERDLYGASLDQSVPSSLSI	323314	294807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
923205	contig_7748_pilon	-	2389	15	Intergenic	novelGene_101055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	280.217371892258	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	219	2054	164891	154585	TRUE	25	ATATCGCCAGGATGGTACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTTQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFQPCPSPLPQYKK	191003	152271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_-_152319_153771_153894_153980_154140_154577_154624_154785_154900_157063_157223_157503_157843_157919_158024_161602_161748_163126_163329_163412_163652_163773_164028_164219_164448_164878_164940_190833
923206	contig_34_pilon	-	1609	9	Intergenic	novelGene_39987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1517.24915554434	8	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	599	1450	224662	212049	TRUE	65	AAAGAAAGAATGAGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247110	211768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_211779_211899_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224813_230228_230408_243224_243354_246970
923207	contig_8354_pilon	-	1328	1	Intergenic	novelGene_24093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATACTATTTAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183505	182177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_182200_183500
923208	contig_5718_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_110340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1245	1559	584588	584902	NA	85	AAAAATAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGRRTGWCPATTNDCRDREHNRESRMEQEKGGVQNSNSSKKSRLDGLTETGGTPESMAPGFSISPELKQFLRPTLQTGIRLDCGTWSDTREACASWLRLGTGD	583343	585064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_583300_585100
923209	contig_14666_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_39500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAGACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313971	316221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_314000_316200
923210	contig_12312_pilon	+	3042	20	Intergenic	novelGene_63996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_15	73.472553150697	29	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	1907	2824	506925	533697	TRUE	60	AAAGAAAAAAAGATTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKGSTESCNTTTEDEDLKAAPLRTGNGSSMPEGRSSRDRTAPSAGMQPQPSLCSSAMRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHKFYFENLLSKNSKPIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWLNVHYHCSGAPAAPLQ	476911	534358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_477070_478478_478574_490349_490410_501200_502382_504846_504920_505070_505174_505612_505697_506120_506216_506867_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526473_527906_527956_529242_529357_531362_531439_531800_531896_533464_533710_534152
923211	contig_5718_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_110389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	18.5	32	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235198	1229648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1230783_1233337_1233571_1234999
923212	contig_7838_pilon	+	272	1	Intergenic	novelGene_179055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAGCAAAGTTCCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637455	637727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7838_pilon_+_637500_637700
923213	contig_6630_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_30705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	88	267	47	313	364948	365214	NA	70	AAAAAAAAAAAAACATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFSRDWSLLITCPKYMRQSLAILTSKEHSGYTSSKRDLFVLLAAHGIFNTLHQDFKSKALILWSSLFTHQLPRAYEVTENTMTCVMVKIVCQLGWAMILSVYM	364901	366544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_+_364900_366500
923214	contig_4103_pilon	-	2281	2	Intergenic	novelGene_51999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	476	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTTTGAATGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223089	220314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_222378_222871
923215	contig_14208_pilon	+	2584	3	Intergenic	novelGene_129068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	34	378	81404	81748	TRUE	55	CAAAATGACAGACAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCTISVFWILLRIALWTKMWSILENVPHALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSVFLDVLFFTESGVLKSPTVIVPLFSAVRVCFIYFGALSLGA	81370	247503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_81896_243057_244870_247256
923216	contig_7642_pilon	-	3392	3	Intergenic	novelGene_178842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	2393	3013	357297	356382	FALSE	50	GAACACCAGCATCCAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKKSNTSSQRMALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPSRKGPRRLSESGSRAKGRGRQRVASENPKEAEKEKRGKKKNNTCSLQMAPKEPPARSRGIQAAGSPGSRACGPGKQRSKRTKAPGSNQCSSPDLEAVARPNAAPQPRRKGPRRLSESGT	443966	356002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7642_pilon_-_356496_356790_358629_442905
923217	contig_17059_pilon	+	2513	4	Intergenic	novelGene_166077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	27.8128667266709	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	64	1167	386926	428371	FALSE	45	AGACAACAGTATTGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFSQEEWALLDLAQKTLYRDVMMETFRNLASVVSGNLKNGEKLSSEHIMVRLLKNETWSSMLGEISDQSHGNKDKHENQGRHVSYPVENHCESNEGNQCGETYSQIPNLTVLKRNPPEANPFEGCECGKASMDHSSHKNQTRSHTGCSTCQCKECGKAFSCLSHLPTPMRTLNGKKPHKRKVCEDFISIATLKTPVTTLSGEKCCERNKCGKAFCSFSSFRTSMTGHNHESIESKTYSCPSSVILHIRSHDRDKPYEYKECGKAFSEATSLTHVRSHCGERPYECKKCGKAFSRPSDLTKHVRTHNGERPYGCKKCGKAFSCSSALTTHMRTHSGERPYECKECGNVFRQSSHLTTHIKTHNGQRPYGCKECGKAFSCSFDILELTVE	386862	429717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_+_386960_388080_388235_390191_391079_428342
923218	contig_7410_pilon	-	2049	1	Intergenic	novelGene_106046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAACCTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52669	50620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_50600_52700
923219	contig_16496_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_5189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
923220	contig_4924_pilon	-	2125	9	Intergenic	novelGene_84661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	515.875893505405	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	47	880	252536	65524	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLRCLSDLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252582	62882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133006_252512
923221	contig_5171_pilon	+	2187	2	Intergenic	novelGene_161227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1374	1700	32713	33039	TRUE	45	CAAGACCAAAAAGGGGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWGQQSISNHIKRQSMMASASSQNKESRNVPEEENFLELPEAEYKRLVYRTLQELRKEIKQNAEHAIEEIKKIREEHNDKFNRLQETIEREQSDIQKISNKISELDN	31339	62428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5171_pilon_+_33047_61948
923222	contig_405_pilon	+	1937	5	Intergenic	novelGene_135276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	114	junction_3	40.024992192379	14	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	29	850	37111	62839	FALSE	55	GCCACCAAAAAAAATCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFQKKTYSKMNNPAIKRIGNHITKSPEDKREYRGVELANGIKVLLISDPTTDKSSAALDVHIGSLSDPPNIAGLSHFCEHMLFLGTKKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLEGALDRFAQFFLCPLFDASCKDREVNAVDSEHEKNVMNDAWRLFQLEKATGNPKHPFSKFGTGNKYTLETRPNQEGIDVRQELLKFHSTYYSSNLMAICVLGRESLDDLTNLVVKLFSEVENKNVPLPEFPEHPFQQEHLKVSACVFGILVVVKCY	37082	63926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_37271_38534_38743_41049_41220_55539_55663_62678
923223	contig_6304_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_122257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAGAAGTAAAAAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158496	160090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_158500_160100
923224	contig_7697_pilon	-	2918	1	Intergenic	novelGene_128281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	1440	2045	191665	191060	NA	20	ATGTCAACACTCTCCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGKVNLKTFWKGFTILDAIKHIRDSREEIKISILTGVWENLIPILIDDFEGFKTLVKEVTADVAETPRELELEVEPEDVTELLQSHDKTLTDEELLLMGEQRRWFLEMECTPGEDTVNTVEMTTKDLEYYINAFDKAAARFVRTDSNFERSSTVGKTLSNSITRYREIFCERINRRGKPHCCLILRNCHSHPNLQQPPP	193104	190186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_190200_193100
923225	contig_8330_pilon	+	2927	7	Intergenic	novelGene_71920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1694	1996	1284267	1287055	TRUE	15	TTCCAATATCTGTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLMSPEQGSPPIHVVLRLDHIHHLVGIQLESTLQLIQAIHILHGLLTVSFLSFLFLLFSTTLALPDAPQIPWEKHWFLCQMLTELKRGSIGIHVTFHIV	1282573	1298155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1284273_1286210_1286418_1286965_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295232_1297669
923226	contig_8394_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_27325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAACTCTATTGAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104108	102401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_102400_104100
923227	scaffold_12124_pilon	-	2471	1	Intergenic	novelGene_22166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	230	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	20	481	1027804	1027343	NA	60	CAGACAAATGGATAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIREMEIQTTMRYNLTLNKASINQKKHKHNKCWRGYGETRTLIHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKMLEIEVPYHPAIPLPGIYPREIRAMTQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPRCPSTDKWINKLWYIHTMGYYATIKNNDEVVKHNMEEAGGHYAE	1027823	1025352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1025400_1027800
923228	contig_8138_pilon	+	1756	4	Intergenic	novelGene_52479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	522.582688831793	58	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	250	786	280633	306552	FALSE	5	CCTTTCTTTCCGTGTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCARDPIVRILGKGTVPRTCPVGLRSPIPVTRGSCGVKADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280383	307522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280750_288507_288616_304973_305098_306364
923229	contig_9809_pilon	+	2232	8	Intergenic	novelGene_176748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	145.994548402553	1	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	155	727	108394	111861	TRUE	70	GTAAAGTAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRCSPCSGTSSRTIRTSGASWGRRLSLPGARRPSYRAEKRRELTTLKYRNSFPKKQISFLRFRGSQMRLQFLTLTRTVKALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKWYEDFVFQQLHHLV	108239	116059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_110410_110496_110652_110783_111746_111871_112241_112362_112466_112590_114806
923230	contig_15063_pilon	+	1825	7	Intergenic	novelGene_12284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	103	1575	28164	39515	FALSE	10	CCTTATACTGCGTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	28061	39765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
923231	contig_2062_pilon	-	4387	1	Intergenic	novelGene_139043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	176	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	2362	2745	1207090	1206707	NA	30	CCCCAGGCACTATGCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKIEKLEMIKTKRKKREENKTKKQNKTPKKEKKKKTRRKKCPQGCHYASVQSKGVAPKPCGTAQLEGAPKLRKRKQTKQNKPEQTNKKKPRVSHQCGGTGREAVSQSSGVLQPFREKQRWHTEQGI	1209451	1205064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1205100_1209500
923232	contig_6842_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_130666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAAAGTCAAAATGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272849	272074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_272100_272800
923233	contig_9406_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_136186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGCAGTTTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441650	442969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_+_441600_443000
923235	contig_10404_pilon	+	2129	2	Intergenic	novelGene_138711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAATAAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1236533	1238721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1238110_1238168
923236	contig_5084_pilon	-	4842	5	Intergenic	novelGene_64646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	44.4880601959672	679	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	3818	4516	1337412	1335039	FALSE	50	AAATTTTTCGATATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLEVVWNRFYKEVYFLPVNIRFLSMFQFNLCCCFLSPVPPPPPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRACGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGSEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKDDHYILNGTKCWITNGPDADVLIVYAKTDPAAVPASRGITAFIVEKVSLGGSVWEGVLLTVVPEMVPFHLPQARSMLRALPALSGVGVGVRRRGPFEGA	1344219	1334712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_1335338_1335727_1335822_1337106_1340983_1341204_1341295_1344062
923237	contig_3747_pilon	+	2838	8	Intergenic	novelGene_24747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4081.07126792434	4	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	530	1444	202144	203804	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200977	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201496_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
923238	contig_854_pilon	-	1553	2	Intergenic	novelGene_36361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTATGTGTTGGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976418	974688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_975990_976166
923239	contig_5799_pilon	-	3388	1	Intergenic	novelGene_50228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGATGAAAGCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123906	120518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_120500_123900
923240	contig_9873_pilon	+	796	2	Intergenic	novelGene_176782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCCTTCTGTTTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528460	529578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9873_pilon_+_528746_529067
923241	contig_17144_pilon	-	2538	16	Intergenic	novelGene_29257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2288.64668794076	3	80	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	597	2306	173659	166363	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAKPSHIPHQVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183187	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166076_166138_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173478_173644_173751_174876_175001_175973_176271_181794_181850_183158
923242	contig_8843_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_156664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1396	1854	127289	127747	NA	70	TCCTTAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKRLKLLRFHFTRIHNQRPWKQQSRNQCIALGKCAAKDLFKVLKNKDVTLRTKVNLTQAMIFSITSCAWESWTMNKEDQRRIDASKLWYWQRILNIPWTTRRTNEFVVEKVQPEYSLEGRMVRLLLTYFGHVVRRDQFLEKDITLGKVEGQ	125893	128126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_125900_128100
923243	contig_11338_pilon	-	1873	9	Intergenic	novelGene_6398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	271.546928494874	26	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	299	1138	319426	311103	FALSE	55	TAATAAAAAAAAGACCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEQGRMKRTGYKEKISPKD	323314	310367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_311160_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
923244	contig_8671_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_126255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAAAACAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478780	480080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_478800_480100
923245	contig_8330_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_71893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAATAAAATGAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070381	1071883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1070400_1071900
923246	contig_10734_pilon	+	568	2	Intergenic	novelGene_51040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTCTCAAAATGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388068	392193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_388122_391678
923247	contig_8020_pilon	-	949	1	Intergenic	novelGene_114448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTTTTTTTTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352731	351782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_351800_352700
923248	contig_8254_pilon	+	800	6	Intergenic	novelGene_48362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	324.159466929473	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	129	641	72814	86688	TRUE	35	GAAATATGTTTCAACATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILWDWDLKQWYKPHYQNSGGGNGVDLSVLYEARNMVSDLLCDPALPPRVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLHKGLNSRSSLPTPQLRRSSGTSGLPPIEQSSSRWERNNGKRPHQEFGISRCCILRDSCEFSQSWTSVCWFSN	14887	87405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_15016_72813_72865_74714_74964_77451_77595_86618_86830_87387
923249	contig_3018_pilon	-	1961	14	Intergenic	novelGene_78844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	574.086833421297	7	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	638	1261	583440	570068	TRUE	35	GTAAGTTGGGAAATCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVEPYTKE	625099	561477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_561574_562778_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570086_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583592_600107_600194_603367_603441_624772
923250	contig_15517_pilon	-	2890	1	Intergenic	novelGene_176408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	22948	22604	NA	75	GTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKKKVLLGTYSKGQKGEADKHAVRAYVCLNPRKYHRTDKSGKTGKPAARAIFVQVQRQNRQEWENGQACYHSHVCPSPQSRQEWENRQACCHSPACLSRRNVIESSVYLHITNG	22948	20058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_-_20100_22900
923251	contig_14341_pilon	+	745	6	Intergenic	novelGene_111827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1194	junction_1	1924.72360613154	17	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	80	694	548758	551737	FALSE	5	TACCTGTGTCTGTTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR	547736	551788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_547808_548749_548866_549940_550151_550355_550485_551481_551581_551668
923252	contig_15353_pilon	+	2776	2	Intergenic	novelGene_151955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69621	271630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_69682_268914
923253	contig_5302_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_81542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACCAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624488	1626449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1624500_1626400
923254	contig_16103_pilon	+	1364	3	Intergenic	novelGene_118836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1013	1363	723294	743691	FALSE	10	TCTCACTCCCACTTCCGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTSQQASKALIGSFLRLLQLLQGSGQTLLSTVQLLFNQLDPAVQGGHLSLSLLPGPPFPLHFPLEALGPLLGIIGLLLQNLDLALHRLDGGDPGHGAHPAFAHATVLASSAPRSSR	722281	743692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723322_737501_737629_743495
923255	contig_13831_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_160995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCAAAAATATCTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124433	122310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13831_pilon_-_122300_124400
923256	contig_12864_pilon	-	2787	9	Intergenic	novelGene_76347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_1	134.534382222538	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2757	30	2786	91151	84182	FALSE	55	TTCCAAAAAGAAATGGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTSLHPPTPPILNTDRSREDSPELNPPPGIEDNRQCALCLTYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIVECRPPVVEPDINSTVEHDENRTIAHSPTSFTEISSKESQNTAEIVSPPSPDRPPHSQTSSSCFYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGSPTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPQRSKLRIMSPMRTGNSYSRNSVSSVSTTGTATDLETSAKAVDHVLGSLNSSTNLGQNPPTSSNLQRTVVTVGTKTSHLDGSSSSEMKHTSASDLGSKSSSLKGEKTKMLSSKSSEGSGNNVAYPGIPKLAPQVHNTTSGEINISKIGTFVEPSSVPYSKEALSFPSLHLRGQRSDRDQHTDTTQSANPSPEADTDVKTLKLSGVSNRSSIINEYVGSSSRDRRQKGKKSCKETFKEKHSTKSFLEPGQVTTGEEGNVKPEFVDEVLAPELIGQQPCNNVSSDKIGDKVLSIPGVPKTSSMQVEGSAKELQTPRKRTVKVTLTPLKMESENQSKNTLKESSPASPLQGESASPAEPVSASESPGDGPVAQPSPNDTSSQDSQNNSYQNLPVQDRNLMLPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSSSTGKKRGKRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSSGEERLASNNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATTRKSSQ	91180	84180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_85900_86305_86492_87059_87221_87917_87997_88117_88236_88497_88657_89649_89788_90597_90705_91060
923257	contig_4114_pilon	+	2618	5	Intergenic	novelGene_15575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.6301458127346	72	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	72	347	169955	175552	TRUE	20	TACCTACTTACCCCAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQIFCLAVLWILKSTVAAIIFPVMILGLIIVRRLLDLIFSQHDLAWIDNILPEKEKKETDKKKKRKGAHEDSDEEPQFPPPSIIKIPMESVQSDPQNGIHCIARKRSSSWSYSL	169883	180001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_169958_172613_172767_174362_174448_175517_175586_177763
923258	contig_7730_pilon	+	1008	5	Intergenic	novelGene_156270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	18	junction_3	8.78564169540279	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	34	429	147891	226597	FALSE	65	CCTGAAAAGGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRKKRVHFHGFMLDVHKRIHRLKQSLPKRKPGFMAKSYDPIAPIAEEISEETCLLCFDEFQVTDIADAMILKQLFENLFKNGVVVVATSNRPPEDLYKNGLQRANFVPFIAVLKEYCNTVQLDSGIDYRKRTLPAAGKLYYL	147857	227176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_147910_149018_149150_158224_158325_190134_190194_226510
923259	contig_401_pilon	-	2144	1	Intergenic	novelGene_42761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATATACACTTTAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	990345	988201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_988200_990300
923260	contig_7165_pilon	-	3506	4	Intergenic	novelGene_116910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1157	1510	1218607	1218254	TRUE	15	AGCGTGTCGAGTCGCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVTDQGSNLHFTVTCCGTLGQGPQFPTYKMEKNKTGMSWWCLLASGLYSYMERLNYVSLKDLSRSHIFLQKGKEGRHKDLGRASETTHSRGPTHYNLAGVKGAVGLEILKCQKRF	1219763	1198239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1198466_1210504_1210596_1211674_1211769_1216668
923261	contig_19701_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_147900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAACTTCTTGTTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245358	244070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_-_244100_245400
923262	contig_14682_pilon	+	2086	2	Intergenic	novelGene_139102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	128	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGGCTCCCAAGTCAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89453	91834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_91482_91776
923263	contig_6946_pilon	+	2729	1	Intergenic	novelGene_59786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTTTGGTTAAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442004	444733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_+_442000_444700
923264	contig_6028_pilon	-	1916	12	Intergenic	novelGene_156586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	189.499253144039	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	439	1389	332055	316454	TRUE	40	GTTACAAAGTTGTTAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQPFTVNSLKKLAAMPDHTDVSLSPEERVRALSKLGCNITVNEDITPRRYFRSGVEMERMASVYLEEGNLENAFVLYNKFITLFVEKLPSHRDYQQCAVPEKQDIMKKLKEIAFPRTDELKKDLLKKYNIEYQEYLQSKNKYKAEILKKLEHQRLIEAERKRIAQMRQQQLESEQFLFFEDQLKRQELARGQMRSRETPALSEQIDGSALSCFSTHQNNSLLNVLVEQPNKSDAASYTSHSPPVNRALKPAATLSAVQNLVVEGLRCVVLPRDLCHKFLLLAESNTVRGIETCGILCGKLCQSNLQDQTTVTWRM	353985	309476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6028_pilon_-_309735_310936_311037_312427_312541_316397_316502_317309_317435_319271_319630_321810_321907_323753_323830_326490_326709_332025_332108_344627_344800_353771
923265	contig_4900_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_159054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1905	2207	726134	725832	NA	55	CATAAAAATGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKCAKDPELENQKGRTASAFLKLKELKKKFRAAVLKESMDKILNDAGSVKRRWKESDMEREKGGVQNANSSKKTRLNGLTETGGTPESMVPALSISPELK	728038	725603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_725600_728000
923266	contig_3504_pilon	+	954	2	Intergenic	novelGene_179056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCAAAAAAATGGCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37815	67539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3504_pilon_+_38130_66899
923267	contig_16431_pilon	+	6373	2	Intergenic	novelGene_87610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGCTGTTTGCTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191658	247538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_195296_244802
923268	contig_16098_pilon	-	2235	1	Intergenic	novelGene_46180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	658	996	622228	621890	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFQTKPIAVKSILTYSDPTGQSRAAPYGFQGVAGGFELLTFWLTAKCLTTVSPGLSFYQKKKKKLLPIQFPGAAGGFEPLTFWLVAKLLTTAPPGPSCTKRGCKFRFFKCS	622885	620650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_620600_622900
923269	contig_1719_pilon	-	2288	14	Intergenic	novelGene_87280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	533.70209761072	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	133	1560	382036	364862	TRUE	60	AAGAAGAAGAAAGAGTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAYFQRPENALKRANEFLEVGKKQPALDVLYDVMKSKKHRTWQKIHEPIMLKYLELCVDLRKSHLAKEGLYQYKNICQQVNIKSLEDVVRAYLKLAEEKTEAAKEESQQMVLDIEDLDNIQTPESVLLSAVSGEDTQDRTDRLLLTPWVKFLWESYRQCLDLLRNNSRVERLYHDIAQQAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQEAFKAVEDIHGLFSLSKKPPKPQLMANYYNKVSTVFWKSGNALFHASTLHRLYHLSREMRKNLTQEEMQRMSTRVLLATLSIPITPERTDIARLLDMDGIIVEKQRRLATLLGLQAPPTRIGLINDMVRFNVLQYVVPEVKDLYNWLEVEFNPLKLCERVTKVLNWVREQPEKEPELQQYVPQLQNNTILRLLQQSIEFSRLTSLVPFVDAFQLERAIVDAARHCDLQ	382168	362004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_362105_363207_363313_363716_364065_364686_364865_365093_365193_366305_366405_366802_366908_370008_370181_371601_371811_373441_373642_375193_375358_375730_375868_376035_376227_381987
923270	contig_6557_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_32956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGCTTTCTGGGGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353018	351345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_351300_353000
923271	contig_11846_pilon	-	2662	1	Intergenic	novelGene_106023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1542	1847	587571	587266	NA	25	CCTCAGCATCATGGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGHDLHILPGSPAPALSSAQLSSTLIVMLSEGFTLFRFQLPQGSLSCSHLAGSNLSFSPLNPHHMHLLRHLSSFTLCFSYFAQMSYQSDWINLLKLGIVV	589112	586450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_586400_589100
923272	contig_10609_pilon	-	1966	1	Intergenic	novelGene_123937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	624	256	879	397224	396601	NA	50	TCAAAAGAATAATACTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYARNNKLKRNGVTFIIKKNISGSILKYIVASDRIISIHLQGRPVIMTIIQIYAPSTNAKDEKIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNEKVANKEGTVVGKLVVRKGVHQGCILSQYLFNLYAEQIIREAGLYEEEGSIRIGGRLINNLQHADDTTLLAEREEDLKHLLMKIKDYLLHYGLHLNKNPHNWTNKQHHDKRRKY	397479	395513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_-_395500_397500
923273	contig_11902_pilon	-	3625	4	Intergenic	novelGene_176146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	26.6958174002346	59	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1252	1815	10511	8797	FALSE	50	GTCCCCAAATAAAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIFRRTPCHGTPSCCLFLCILSVSPPASHQVWFQNRRAKWRKREKCWGGSSVMAEYGLYGAMVRHSLPLPESIVNSAKGGLAGSCMPWLLGMRKKSIAMTSKRRSEEKLTGLWGSDTPRGDSSPSQVGPQSSSGKVSPEQGLEDEVVDLSSSTRQETQREPRVAQVGASSDSTGLEGLRPGEAGVL	14764	6986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11902_pilon_-_9087_10237_11579_12057_12137_14659
923275	contig_8597_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_158722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAATAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123621	121000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_121000_123600
923276	contig_11338_pilon	+	3834	16	Intergenic	novelGene_6177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	547.613789291525	2	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	299	1336	6086	10578	TRUE	30	ATTTAACCTCTAGTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCPRAPRCTCTSAYASSWAPLSSWPASRTRAARWGCAAAWWPDCCTTSSWLSSAG	745	13615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9870_9915_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11544_13223_13280
923277	contig_7019_pilon	-	1593	2	Intergenic	novelGene_149476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATTAAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334923	1333253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1333855_1333931
923278	contig_13172_pilon	+	1877	2	Intergenic	novelGene_146327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGTTATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66083	80218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_67237_79494
923279	contig_10734_pilon	-	1566	3	Intergenic	novelGene_51516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1147	junction_1	86.5	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	771	1565	2269689	2265780	FALSE	10	ACCTGCAGTTCCTCCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRVLPVSVKPLSLVFLLEFEFCTPVFFCSVRNSLLYSKRAIFFVIYIYFTTMKFFLKRSLKTYLIKKKKQQQFHECGASAGFPQATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQ	2270459	2265778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290
923280	contig_383_pilon	+	2261	1	Intergenic	novelGene_126138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATCACTCCTATTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163432	165693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_163400_165700
923281	contig_11338_pilon	-	2503	15	Intergenic	novelGene_6348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	187.315024403669	1	139	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	299	1963	319426	295354	FALSE	35	AGTTGATTCAGGGGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEEDPVLTVITYMGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230_307429_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
923282	contig_1275_pilon	-	903	2	Intergenic	novelGene_108850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2262	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	401	811	747710	747300	TRUE	15	CTCCAAGTCGCCTCTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGFHLQGDGLSR	748110	746566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_746634_747274
923283	contig_11338_pilon	-	3361	16	Intergenic	novelGene_6333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	228.410118476004	4	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	296	1822	319426	298788	TRUE	55	AAATCAATATCACTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEEDPVLTVITYMGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLCHGLSLHHHQQPAGCLHLSGVLPPQPAGPGAIQEMVHRD	323311	293896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_298989_299044_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230_307429_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
923284	contig_10044_pilon	+	2153	3	Intergenic	novelGene_156389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	45	41	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGAGTATTGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142835	153664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_+_142891_148808_149008_151765
923285	contig_6059_pilon	-	2001	14	Intergenic	novelGene_44839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5077.30547044756	3	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	176	979	580626	572909	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAILHTILLAKLLN	581012	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570739_571306_571456_571539_571618_572866_572944_573170_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921
923286	contig_5429_pilon	+	2422	1	Intergenic	novelGene_127789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAACTCTAGCAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149735	152157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_149700_152200
923287	contig_9014_pilon	+	2991	1	Intergenic	novelGene_106800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAAGATCTGTGTACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150635	153626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_150600_153600
923288	contig_9037_pilon	+	1138	2	Intergenic	novelGene_179057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGGGACGGCGTGGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002821	1004775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9037_pilon_+_1003833_1004648
923289	contig_10973_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_150334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1876	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	173	685	2730	2218	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	2902	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2900
923290	contig_6871_pilon	-	2580	1	Intergenic	novelGene_21606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGGTTTACATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438748	436168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_436200_438700
923291	scaffold_12124_pilon	+	1273	4	Intergenic	novelGene_22384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1189.35360595577	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	430	1107	1508211	1509405	FALSE	35	GGTAAACTTGACTGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSACCPAGSMMFTNKEFSSQRGLGPLLQGPRGFPVGCDKQTVIKSQSSKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497073	1509571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497122_1506629_1506829_1508028_1508353_1508869
923292	contig_5928_pilon	-	1281	1	Intergenic	novelGene_40372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAAAGTACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224561	223280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_-_223300_224600
923293	contig_16633_pilon	-	1530	2	Intergenic	novelGene_165073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTGCTTGGGGGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86585	84889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_85744_85909
923294	contig_3155_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_26349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTCACCAAAGAGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196183	197214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_196200_197200
923295	contig_1380_pilon	+	3540	1	Intergenic	novelGene_138862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTTGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5266	8806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_+_5300_8800
923296	contig_5684_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_81035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	543	941	446641	447039	FALSE	25	TGAATTTCTCTTTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIPFQSIHFITYEFLQEQVNPHREYNPQSHIISGGLAGAIAAAATTPLDVCKTLLNTQEHVALSLANVSGRLSGMANAFRTVYQLNGLPGYFKGVQARVIYQMPSTAISWSVYEFFKYFLTKHKLENRTPY	403544	447689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441837_446603
923297	contig_9406_pilon	-	1576	5	Intergenic	novelGene_136168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	394	junction_2	264.655908681442	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1473	104	1576	87564	81904	FALSE	50	AAGGAAATCAAAGCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEKAEHERELALRNELIRQEKLEQLARRFDRKAAMRETWLSENQRLVSQDNFGFDLPAVEAATKKHEAIETDIAAYEERVQAVVAVARELEAENYHDIKRITARKDNVIRLWEYLLELLRARRQRLEMNLGLQKIFQEMLYIMDWMDEMKVLLLSQDYGKHLLGVEDLLQKHALVEADISIQAERVRGVNASAQKFATDGDGYKPCDPQVIRDRVAHMEFCYQELCQLAAERRARLEESRRLWKFFWEMAEEEGWIREKEKILSSDDYGKDLTSVVRLLSKHRAFEDEMSGRSGHFEQAIKEGEAMIAEEHFGSEKIRERIQYIREQWANLEQLSDIRKKRLEEASLLHQFQADADDIDAWMLDILKIVSSNDVGHDEYSTQSLVKKHKDVAEEITNYRPTIDTLHEQAGALPQEHAESLDVRGRLSGIEERYKEVAELTRLRKQALQDTLALYKMFSEADACELWIDEKEQWLNNMQIPEKLEDLEVIQHRFESLEPEMNNQASRVAVVNQIARQLMHSGHPSE	87667	81903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_82004_82096_82968_83738_83893_86062_86366_87519
923298	contig_5457_pilon	+	4016	3	Intergenic	novelGene_138999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	2542	2976	195233	277897	FALSE	20	GGGCGGTGGAGAGGGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWNGKRPQISKALLKKNKVGGLTLPDFKTSYTATLIKTTWYWSNDRHIDQWNRIENPAINPNIYGQLIFDQGNQIHSMGKELSLQEMVLAKLDFHMQKNETRSIPHTIHKK	60950	278937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_63083_194823_195401_277630
923299	contig_8045_pilon	+	3670	5	Intergenic	novelGene_35452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCAAACCGCGGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447364	485419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_448620_476717_478794_480122_480297_481441_481506_485318
923300	scaffold_880_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_121388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCTGATCCATGGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266807	269199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_266800_269200
923301	contig_9720_pilon	+	2973	2	Intergenic	novelGene_116766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	157	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTTACATATTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193964	197162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_+_194539_194763
923302	contig_9235_pilon	+	2020	3	Intergenic	novelGene_156215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	12	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	428	892	45805	47193	FALSE	25	GATCCCTTTGTGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLLEL	44979	48321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46255_47178
923303	contig_5988_pilon	-	2276	2	Intergenic	novelGene_16162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAGTACAATAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2064487	1999048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1999898_2063060
923304	contig_5092_pilon	-	4959	17	Intergenic	novelGene_62285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_13	52.3281413294988	65	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1000	3003	501	3503	435443	379703	FALSE	50	CACTTAGAATGTAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELCEGVDLPRGQARDSGENEPKELEGPLPRGQESLGAKPDAVWSQNYQLPRKYGENSNSKHRDRIRVSEEVMMVVQEMKKYFPSERHSKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILSQNGAPQADVTMYSLEKLTTIASEHTSKNTDTFAAVFSFLSGRLVHISEQATSILNCRKDFLESSHFVELLAPQDVRVFYAHTAHAQLPSWNNWTQRAASRYEFAPVKSFFCRIRGGEGGEQENYCPFRIIPYLIHVHSPTQPGAEPCYLMLVEKIHSGYEAPRIPVDKRIFTTTHTPGCVFLEVDERAVPLLGYLPQDMIGTSMLMYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGQPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKVSFIIGRHKVRTSPLNEDVFATRIKRANSNDKDITELQEQIHKLLLQPVHVGDSSGYGSLGSSGSQEHYISIASSSESSGHCVEEIQKEPMTLQQVYVSVNKIKNRGQQLYIESMTKSPDKPAMGTCTEPLGDEQKAFSSFQTLKNDSMHTESCKDLRRDQHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPALKRKCISCTDTNSSSSEDDKQIHKADAVTQIPVIAKSEMTTAGQSTDAEEGVPRTLSTKALSLVSGVSQCSYSSTIVPVPPPDPAELTAAEEATLAFEPWTLNPQTTFLTSEEFKHVGLTKAVLSAHTQKEEQDYVDKFREKILSSPCSSYLQQESRSKVKYSYVQGDSTSKQTRSAGCKKGKHKRKKLPVPSDSNRSADHVCPHFRDGVQDTQPWCPPRASAPHAPVLSFPSTLVMPSQAPSLMPACPLPALASLGGACSASGTALPCLPRPLPPGSLTSVPALPAPYLDTFLTVFLHAPPACPLLPPSFSPYPFLGAEASPETPPSTSPVTPGLEPPSSVTNQRRVEERWETHGEEHPFISSRSSSPLQLDLLQEEMPRSSESPDQMKRDVCSEAECVRDADFQCVSERANMGPLVTAEARPLGGTLCLSG	435943	378246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_380506_381273_381520_403381_403556_404000_404108_405182_405316_408592_408720_409314_409444_411681_411788_416261_416419_416671_416779_420447_420527_422416_422557_423914_423967_432141_432344_433559_433676_434499_434646_435264
923305	contig_4364_pilon	+	2116	14	Intergenic	novelGene_230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	70	junction_13	72.9715029082339	61	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	121	1467	1453807	1486732	FALSE	25	CGAGGACCCACCGTCAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YRSRDPQLCRHGPLGKCVHCVPLEPFDEDYLNHLEPPVKHMSFHAYIRKLTGGADKGKFVALENISCKIKSGCEGHLPWPNGICTKCQPSAITLNRQKYRHVDNIMFENHTVADRFLDFWRKTGNQHFGYLYGRYTEHRDIPLGIRAEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIAAKLGLRKVGWIFTDLVSEDTRKGTVRYSRNKDTYFLSSEECITAGDFQNKHPNICQLSPDGHFGSKFVTTVATGGPDNQVHFEGYQVSNQCMALVRDECLLPCKDAPELGYAKESSSEQYVPDVFYKDIDKFGNEITQLARPLPVEYLIIDITTTFPKDPVHTFSISQNPFPIENRDVLGETQDFHSLATYLSQNTSSVFLDIISDFHLLLFLVTNEVMPLQDSISLLLEAVRTRNEELAQTWKKSEQWATIEQLCSTVGVQLPGLQEFGAVGGSVHAAASAAMWACQHCTFMNPPGTGHCEMCSLPRT	1451142	1487381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1451166_1453008_1453058_1453758_1453854_1455237_1455362_1456150_1456331_1459581_1459669_1461800_1461873_1462235_1462363_1468024_1468186_1479215_1479288_1481502_1481599_1482630_1482748_1483961_1484065_1486571
923306	contig_21299_pilon	-	2970	1	Intergenic	novelGene_175750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2465	2824	864	505	NA	60	GGCACAATAAAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRPEELDGAWLPLSTTLDWDHHRVDRVGDKCGTKIKFIKQTRLTGVTETEETPKTMALRYPSELEPKPFLKTTFQPNHRQAHKINNNTQEECAPQNNQLYEIKRATFAQKQREEGRKG	3328	358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21299_pilon_-_400_3300
923307	contig_4315_pilon	+	4259	9	Intergenic	novelGene_46854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	170.431804543636	170	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	951	1679	615820	626094	TRUE	35	GCAGGGAGGGTAAGAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLAFAVVFYVVVWANIYSTSQMFALGNHWVGVLLVTLAAVTLTLTLVLIFERHQRKANANTDLRLAAANGALLRHRVLLGVTDTVKGCQSVIQLWFVYFDLENCVQFLSDHVQEMKTSQESLLRSRLSQLCVVMETGVSPRTAEGPEDQVEEAPLLPSSPRPMERPLMQTELCQLVPEAEPEEMARQLLAVFGGYYIRLLVTSQLPQAAGTRHTDSTRAPCPCQLIEAHILGTGCCPFLAR	608968	629543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_609718_613099_613214_615732_615841_616859_617010_620921_621033_622082_622164_623158_623345_625914_628362_629230
923308	contig_8050_pilon	-	1375	2	Intergenic	novelGene_114861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAAGCTTCAGGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391657	389416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8050_pilon_-_389824_390689
923309	contig_3956_pilon	+	2061	11	Intergenic	novelGene_14988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1336.00247380011	5	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	431	1318	1286460	1289861	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACISKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDAMSSRSPRWPAPPCLS	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283833_1286180_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288066_1288935_1289229_1289493_1289536_1289810_1289892_1290297
923310	contig_12080_pilon	-	2004	4	Intergenic	novelGene_128365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	107	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAACAATGTATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264968	103836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_104208_104255_104418_123599_124961_264858
923311	contig_6914_pilon	-	4571	5	Intergenic	novelGene_151716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	379	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGCTACCTGTGAGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73486	45481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_45540_46585_46735_48745_49028_69316_72701_72788
923313	contig_2046_pilon	+	1519	1	Intergenic	novelGene_151555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTCCCCCCACCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12058	13577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2046_pilon_+_12100_13600
923314	contig_3469_pilon	-	2108	4	Intergenic	novelGene_34166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	228	junction_1	66.834788014094	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	912	1466	395466	392502	FALSE	80	AAGAAAAAAAAAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACISANQAMTTGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKDTVTKDNGIRPSSLEQMAKLKPAFIKPYGTVTAANSSFLVTVNAVCV	396377	391859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_392651_393186_393368_393720_393909_395429
923315	contig_5023_pilon	+	2212	13	Intergenic	novelGene_7319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1739.91897959519	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	256	1002	611764	630211	TRUE	25	TTTGGAAGCAATCCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGN	607252	647581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607356_609649_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625852_630210_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
923316	contig_2480_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_63537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254130	253621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_253600_254100
923317	contig_16205_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_156886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCAGCCTGTTATGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99784	101940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_99800_101900
923318	contig_5167_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_164103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATCACATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380786	381368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5167_pilon_+_380800_381400
923319	contig_7446_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_101949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACACGTGCAGAGACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180141	177539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_177500_180100
923320	contig_12644_pilon	+	1342	11	Intergenic	novelGene_44620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4674.2918608063	15575	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	53	859	2675526	2679914	TRUE	30	GTGAGAAATATGTGTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPVWHLAESRLPQEQLQPSHAQDDEYRP	2675473	2680625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679559_2679620_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
923321	contig_11281_pilon	-	1030	1	Intergenic	novelGene_125463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAGCTGTAGCAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836409	835379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_835400_836400
923322	contig_12074_pilon	-	2520	10	Intergenic	novelGene_53733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	6.86375342732467	48	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	364	1602	24193	12198	TRUE	20	AGCAACTCTGTTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNADEIAQLCYTHYGTKLPKQGKPEPNREWTLLAAVVKIQSAANWDFDSPDKRVQVTKEVVSMGTGTKCIGQSKMRKSGDILNDSHAEIIARRSFQRYLLHQLRLAAALKEDSIFIPGTQRGLWKLRPDLFFVFFSSHTPCGDASIIPMLEFEDQPCCPVSRDWVNSPSVVVSGNLEAPKNEGKCEDSDSPVTKKMKLEPEAPAREVASDVTHRQSFDKQESGQISPTVSSSNFTAEGLATVTITAPSGAKVVDVYRTGAKCVPGEAGDSGKPGPEYHQVGLLRVKPGRGDRTCSMSCSDKLARWNVVGCQGALLMHFLEEPIYLSALVIGKCPYSQEVMQRALIGRCRNVSALPKGFGVQELKIQQSDLLFEQSRCAVQAKRTDSPGRFVPCGADHESAKWTSLDHSRNC	26161	9623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_10505_12160_12248_15381_15528_16968_17588_21330_21462_21886_21942_23356_23426_24024_24216_25185_25329_25963
923323	contig_6489_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_128919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104442	102366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_102400_104400
923325	contig_14711_pilon	-	2097	12	Intergenic	novelGene_68907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	707	1108	89227	88226	TRUE	10	GTCCACCGGGTAGCCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTAEASIRTDTAVHGPAALTGSARAVGMTVTHSTLAAAKVPPQRMPSCRSQLASSHSHRRPELCPLQLQRPHWHRPFPLHRGPVPLGARHPDSRSGEDSSASEHSQSLPRRPGAQLHTPHCRCPWPSLQWGA	90813	83984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_-_84099_84806_85046_85429_85593_85912_86005_86147_86240_87715_87864_88084_88278_88637_88868_89107_89323_89460_89666_90111_90191_90486
923326	contig_610_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_76683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	93	566	42753	42280	NA	85	AAAAAGAAGAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANGRNDEVKELNGRFQRAATEDKVKYYNEMCKELELENQKEIAHSAFLKLKELKKKFKPQVAILEDSMGKIVNDAGSIKRRWKEYTESLFQKELVDIQPLQEVAYDQEPMVFKEEVQAALKPLTKNKAPGIDRIPIEIFPQTDATLEVLTHLCQEIWKTVTWPTNWKKSIIVPIRKKGDPTECRNY	42845	40511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_40500_42800
923327	contig_4832_pilon	+	2489	13	Intergenic	novelGene_163420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	64.5718269319781	6	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	161	1399	497716	505451	TRUE	40	GCATTCATTATAGTAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTITSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGIFGSRCARIFRLVLQKKHLEQKQVEDFAMIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQVTNGIITTNLQSWPRVRETLETNILNSQANSRSSSQIEE	496131	510022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502358_502517_502611_503917_503999_504248_504290_505180_506191_506558_506609_507026_507177_509871
923328	contig_7119_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_40989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	443	883	140491	140051	NA	15	CCATGGACAGGGCTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGRWRGSLCAEAAELEEEVCFQVLLGRRGLAAHSPRMGLPVQLLRRPPAPGGSKKARPVEEKSGVWVAPSGRQRDVAGQVLLLDAQGYGRKLCKVWSSASRDSPGSGFGSWVLALGRPPLAAAGLGPSPPSGSRDEMQTISEGE	140933	139650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_139600_140900
923330	contig_19469_pilon	-	1960	12	Intergenic	novelGene_135011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	58	junction_2	41.9423059069645	67	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	63	1490	520725	442580	FALSE	20	TAATTGCTTAATCTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVVVQAISALCQKYPRKHGVMMTFLSNMLRDDGGFEYKRAIVDCIISIVEENPESKESGLAHLCEFIEDCEHTVLATKILHLLGKEGPRTPVPSKYIRFIFNRVVLENEAVRAAAVSALAKFGAQNENLLPSILVLLQRCMMDTDDEVRDRATFYLNVLQQRQMALNATYIFNGLTVSVPGMEKALHQYTLEPSEKPFDMKSIPLAMAPVFEQKAEISLVANKPEKLAPSRQDIFQEQLAAIPEFMNLGPLFKSSEPVQLTEAETEYFVRCIKHMFANHIVFQFDCTNTLNDQLLEKVTVQMEPSDAYEVLCYIPAPSLTYNQPGICYTLVRLPDDDPTAVACTFSCTMKFTVRDCDPNTGVPDEDGYDDEYVLEDLEVTVSDHIQKVLKPNFAAAWEEVGDTFEKEETFALSSAKTLEEAVNNIITFLGMQPCERSDKVPENKNSHSLYLAGVFRGGYDLLVRSRLALADGVTMQVTVRSKEGTPVDVILASVG	520787	442109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_442711_443204_443304_443571_443711_444463_444562_513598_513771_514594_514735_515252_515316_516340_516467_517050_517155_518057_518134_520127_520372_520689
923331	contig_11989_pilon	-	2577	1	Intergenic	novelGene_68461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAATCTTCTATTCAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118668	116091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_-_116100_118700
923332	contig_3601_pilon	+	2919	1	Intergenic	novelGene_132984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAATGAAAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194679	1197598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1194700_1197600
923333	contig_16525_pilon	-	1994	2	Intergenic	novelGene_133787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGAGGGACCACAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93159	90548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_92417_93033
923335	contig_6504_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_158786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	580	915	246935	247270	NA	20	CTGAACTTCGTACCTAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYRLDLNIKKTKILSTGPISNIMINGENIDIKDFILVGSTINTHGSSSQEIKRRIALGKSAAKDLFKALKSKDVTLRTRVCPTQAMVISFISCTWSWTMNKEN	246355	248699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_246400_248700
923336	contig_2940_pilon	-	4806	3	Intergenic	novelGene_81880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	133	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	311	643	371731	371399	TRUE	65	GCACTGTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVNNLTTHQQYPYSTLGSLSPASLSPSAFWPLSLDHCTSLVAFGFTGLWKWVSFRGSGYPTHYLSVTFLYCGGLHVSVMLEAMPPLFPIPAGSSIVDGFQQSFQTKTD	372041	365354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_366183_367603_367692_368151
923337	contig_10765_pilon	-	1608	6	Intergenic	novelGene_122935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_4	36.7183877641707	16	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	474	1382	242646	222119	FALSE	55	GAATATAAAACCAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSPSEEAHHMESLTMACDTMPADPHAFTTGMVGFDASLPDMNNLQVSEGSKAEAVQEEEDTTVHEDDLSSSINELPATFECSDSFSLGMTEAEEKGDRALDQFTLASFGEGDRGVSPPPSPFFSAILAAFQPTACDDAEEAWRSHINQLMCDSDGSCAVYTFHVFSSLFKNIQKRFCFLTCDAASYLGDNLRGIGSKFVSSSQMLTSCSECPTLFVDAETLLSCGLLDKLKFSVLELQEYLDTYNNRKEATLSWLANCKATFAGGSRDGVITCQPGDSEEKVIKVCENLSLLCSGIVCWF	243119	221892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236243_239034_239202_242487
923338	contig_13456_pilon	-	4255	1	Intergenic	novelGene_153293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	295	681	328670	328284	NA	30	TGATTGCACATTTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCTKERNTARSCAILTIVVIIEPLVAVTVSIHLKEDESSSLSLTFYFTRHDVLLQGLVPPITCPKYVRQSLAILASKEHSGYTSSKTDLFVLLAVHSILNILHQHHNSSSVFLIHCPAFTCIRGN	328964	324709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_324700_329000
923339	contig_755_pilon	-	2012	1	Intergenic	novelGene_119796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	299	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	124	435	630935	630624	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRHHRTPALLAGIKNTGNNKCWRGCGENGTLMHCWRECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAK	631058	629046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_629000_631100
923340	contig_10182_pilon	-	2184	2	Intergenic	novelGene_134615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAGGGAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250500	246911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_247363_248767
923341	contig_2069_pilon	+	2735	5	Intergenic	novelGene_23190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_4	169.505899602344	50	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1466	1792	75827	81061	TRUE	65	AAAAAACAAAACAACTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTFSFQRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQVKSE	74361	87895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_75950_76072_76187_80971_81709_87422_87531_87707
923342	contig_5961_pilon	-	4039	3	Intergenic	novelGene_144181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAACACTAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297009	292617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_293128_293300_295894_296073
923343	contig_2703_pilon	+	4135	15	Intergenic	novelGene_101732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	986.746736730849	7	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	2676	3269	602068	610870	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAAGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526208	611736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_596351_596400_597823_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
923344	contig_9073_pilon	+	3227	3	Intergenic	novelGene_177398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	4	junction_1	0.5	38	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	100	1701	185782	217705	FALSE	70	ATCAAAAAAAGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLENYRKLVSLAGHQLSKPNVISQLEQEELSWGEKELLGCLSPDWETRLETKESTPKPNITEDFSHEVIMEREGLWHSTLGETWKPDNWLKGPPKNQDRHLGQVAVTHKETLSERRVCGSSEFERYSSQGSLLDTQHSIPMGKKPHNWNFYGEDAKQNSELIKSQRMFVVKKLYECNECGKAFSQSSSLLKHQRIHTGEKPHKCNVCGKHFIESSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIIHQRSHTGEKPYECGECGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNQCGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECIVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLIVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHRRTHT	185682	219231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_+_185816_192747_192844_216233
923345	contig_5502_pilon	+	2287	1	Intergenic	novelGene_155001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	86	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1454	1873	439251	439670	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTFFNLYNFQTKKKWRTLQSISTYCHHPCKPNLKKLPILLMDHSYQGLHQTESSTATWCSAATTDGSDRDHNRGFWTELEKDVEQNPNTQNKDQIYWPKGDWRNTKSMAPRHPFSSVKSVPSFTVQLGIGQPHKTKWD	437797	440084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_437800_440100
923346	contig_8284_pilon	+	837	2	Intergenic	novelGene_125670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGCTGGGTGTGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244085	249709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_244094_248880
923347	contig_2730_pilon	-	2229	2	Intergenic	novelGene_135374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTCAGTGACATTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311896	308976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_309997_310687
923348	contig_10765_pilon	+	3481	1	Intergenic	novelGene_122884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAAGATTTAGTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46804	50285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_46800_50300
923349	contig_10235_pilon	-	2039	13	Intergenic	novelGene_46341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	12	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	244	753	120501	119573	TRUE	20	CGACTAACGGCCCATCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVAGEGTSSGDSGPSFESNWGSTGLASKLPLLVLLVLPPPLTRVGAGATPRVGVDWAGGACAGSSGSFSGAGAGAGGAAGGMEDSLGTAGGGAGAGGAAGGTAGSALSRLSGAPNFSSSRLSFSAQAALRSSCMRRSSSSRRRRARSTAREISDDDCFRLWRHASSSSSGAGGLQGGPPRSWVVPRGGPSSQWGPCEVGVGEALGQEVPALSLEAEKSLPRPSWEGAVRCRGELPFLPSASGGRSSPAAD	121186	114044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_114182_116073_116248_116915_117095_117421_117528_117614_117681_118003_118148_118309_118464_118665_118744_118886_119031_119357_119451_119561_119782_120200_120675_121116
923350	contig_12624_pilon	-	2136	7	Intergenic	novelGene_61072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1377.32886615926	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1096	1938	875571	862389	FALSE	15	AGGATGGGGTAGTCTCGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKAKRRIPCLIPCRALEGEAHRVRFQFVPETPEELQVMPGNIVFVLKKGNDNWATVMFNGQKGLVPCNYLEPIELRIHPLQSLTSLLLPVPVLQENPSCHQEIKLSVPMPYTLKVHYKYTVVMETQLGLPYSQVLDNVSKKLKLLPEHTRLSYRPRDSNELVPLSEGSMKAAWDQVKDHCLTLWCENTVGDQGFPDESRETEKSHANNQTTKPQLKEGSQVVALFSYEATQPEDLNFLEGDVILVLSEVNEEWLEGECKGKTGIFPKAFIEECATPREV	876666	862190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_862484_863770_863949_867656_867769_867898_868051_874056_874122_875130_875186_875385
923351	contig_11386_pilon	+	3337	6	Intergenic	novelGene_82786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	517.805214342227	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	107	811	17940	27749	TRUE	10	CTCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASRQRVQKLDRMGATGLWRWSRLLLLLLYVSGFQAVSIMEKKVCLIEGNNLTEICPYNIMKYASSLKAWQRVRSQGPPETLVRTKTRNTDINQAQAGRYLLEDFPTEAVVKVTVTGLQRQDKGLYQCVIDLSPRDPVILHDRIRLVHCDDSSGTTVLNKNPIQTLVETTTLPLTTATMTPRTPLLRPRTVTKPLSTSTAIFSSPGLRNNFTNVGDVTRLLSCKVTVEPLREDD	17833	32456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_18037_19625_19980_20816_21022_27700_28773_30765_32187_32374
923353	contig_12566_pilon	-	1330	1	Intergenic	novelGene_86024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATAAAAGACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208434	207104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_207100_208400
923354	contig_6059_pilon	-	4126	1	Intergenic	novelGene_44797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTACTTTTAATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391417	387291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_387300_391400
923355	contig_6489_pilon	+	848	1	Intergenic	novelGene_128948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	179	540	47	586	298421	298960	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVGKQVLLGRKVVVMRCEGINICGNFYRNKLTYLAFLHKRMNTNPSRGPYHFRAPRCIFWWTVRGMLPHKTKRAQAALDHLKVFNRIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTHKSAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLDEKRKEKAKLHYRKKQQLMRSNC	298374	299222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_298400_299200
923356	contig_10740_pilon	-	1619	1	Intergenic	novelGene_152247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	214	585	108499	108128	NA	15	TCTTTCTACAATTGCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGEKSLVLEFLLLESSRDCVKFKFKARAGAAERMVPLPQSGKLRCLSVLNLLPSLHPLCRTLAPPPSPLRNDYDAPSLDSCISLSLSPTRSPHLGKLPMRSWQAALTVLFPCLKPLCDSLFC	108712	107093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_107100_108700
923357	contig_5039_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_64788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACATACACGCTGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150021	152034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_150000_152000
923358	contig_9706_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_20916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGACACAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128224	129103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_128200_129100
923359	contig_6446_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_149190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	186	506	245575	245255	NA	55	GAAAACATAAACCATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTESSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFSDRDHNRGFWTELQKDVEHNSNSQKKDQLYWPKGDWRNLESMAPRHPFSSVVKLSPRFTLQPGSGQPRKTK	245760	243676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_243700_245800
923360	contig_12630_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_173067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	1532	1990	60293	60751	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLLRNLYVDQEAVIQTEQGDTAWFKIRKVCVRFVSFHDTYSICMLRNAHDTTLLAESEDNLKHLLMKIKNYSLQLHQPETRRSGWCPAATSDCPDREHSRESLMEAGKGGMQNSNSSKKTSLNGLTETGGTPEGMAPGSLSTQN	58761	61082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_58800_61100
923361	contig_8689_pilon	+	7313	3	Intergenic	novelGene_170033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	93	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	3488	3922	151428	151862	TRUE	50	ATGTAAAAGATGACAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYFAPAMKPHLEQQLQLESPPGLVYDNPLSFFKIHLIFHTGQIGKLNGDVMGITTPASFKSLMVAVISAVPPGMQYCFWFTIFLDRGSSSGFFLAFPTITALTPLVRDPMWGFYQLLSISIPIMHSVTGEITRGWVWGSLDAL	147375	213244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_+_149023_149587_153961_211951
923362	contig_8558_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_123175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	551	865	1319660	1319346	NA	10	TCCACTTGTGATGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGTYWWSYRALEHLPQQGRCRREARELRGQENRKQKLKRQGTQEAELPQSQKVWPGPLGFQRVEPWPLVFLRVELPLRWTRRMVRLKPREQSCRPSGPGRWS	1320210	1317788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8558_pilon_-_1317800_1320200
923363	contig_17976_pilon	+	1578	4	Intergenic	novelGene_32475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	4	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	247	1263	41843	47385	TRUE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41596	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_47432_47517
923365	contig_13348_pilon	-	1602	1	Intergenic	novelGene_162677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGCTTTGAGCAAATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38251	36649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_36600_38300
923366	contig_12948_pilon	-	1906	3	Intergenic	novelGene_126210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	620	1	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTTCCCCTTTCTGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250466	247926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_248636_248748_248825_249345
923367	contig_9771_pilon	-	3476	7	Intergenic	novelGene_156921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	104.620610886298	124	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2577	3050	346973	339000	TRUE	65	GTGAAAAAGGAAAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLPLVLHWFFIEWYSGKKSSSALFQHITALFECSMAAIITLLVSDPIGVLHIRSCRVLMLSDWYTMLYNPSPDYITTVHCTHEAVYPLYTIVFIYYAFCLVLMMLLRPLLVKKIACGLGKSDRFKSIYAALYFFPILTVLQAVGGGLLLSVQTEL	350142	332575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9771_pilon_-_332831_334728_334806_338905_339023_339573_339756_341990_342198_346911_347067_347659
923368	contig_10159_pilon	+	2481	6	Intergenic	novelGene_30855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	82.5992736045542	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	377	925	748193	759027	TRUE	15	CTACCAGGTCTTTTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALAAALLSSLARCSLLESGDPVASALSPYFGTKTRYEDVNPGLLPNPEAPWRDPELLEGTCTPVQLVAVIRHGTRYPTAKQIRKLRQLHELLQARGPWGGRASATSGRDVGAVLADRPLWYADWMDGQLVEKGRQDMRQLALRLASLFPTLFCRENFGRLRLVTSSKHRCVDSGVAFLQGLWQHYNPGLTPPDVADMECGPPRINDKLMRFFDNCKKFLTEVERNATALYHVEAFKTGPEMQDILKKVAATLQVPINDLNADLIQVAFFTCSFDLAIKGIKSPWCDVFDIDDAKIPERERQSRQGL	747816	800024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_748407_751627_751826_758416_758515_758988_759034_765027_765162_798608
923369	contig_6770_pilon	+	1692	2	Intergenic	novelGene_178132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	293	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	71	466	74	469	TRUE	25	GTCTGGAATCCAACTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAEFSSNRVVSKCLSSVPLILSSMVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCICIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMSLSIFSSCLSAFCLSSWQIPSIRDLNSLSGTSSAFSSTGESSGVLIWMPTGTILSCICKCFGILCCFRGIQ	3	2362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6770_pilon_+_1384_2050
923371	contig_11720_pilon	-	4105	2	Intergenic	novelGene_43858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAACCATTTTCCTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84722	80567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_80966_81015
923372	contig_10466_pilon	-	2576	1	Intergenic	novelGene_173621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTGAGAATAACAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72202	69626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_69600_72200
923373	contig_15043_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_175507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249360	247330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_-_247300_249400
923374	contig_2854_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_120884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1114879	1116410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_1114900_1116400
923375	contig_12672_pilon	-	2198	2	Intergenic	novelGene_141484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	92	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAATGACACAGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145813	123402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12672_pilon_-_123415_143627
923376	contig_1309_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_73966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160272	161871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_160300_161900
923377	contig_1982_pilon	+	3703	1	Intergenic	novelGene_151320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180479	184182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_180500_184200
923378	contig_5331_pilon	-	1049	1	Intergenic	novelGene_112787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	232	558	274488	274162	NA	85	ACAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQSGVYTEKSSSLPRQLLIQEYSLFVTYCPLLTVSNRNYFPCAHVCSGADWKHMMFMEQSVLVIGTLFLMTCWLSRNWVQPGSTLQICHVAPQIWCSKAGSGNVVTQ	274719	273670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_273700_274700
923379	contig_15498_pilon	-	3671	2	Intergenic	novelGene_42698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	233	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2105	2422	834242	833925	TRUE	25	GTCACTATGAGTCGGAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEALKEDGRNTESLYQKELVDVQLFQEVTYDSELMVLKEEVQAALNALAKNKAPGNDGIPIEMFQQTDAVLKVPTCLCQEIWKTATRPVNWKYPCLCPFQRRSN	836346	832277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_832734_833131
923380	contig_14034_pilon	-	2241	1	Intergenic	novelGene_72647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263821	261580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_261600_263800
923381	contig_9653_pilon	+	2137	5	Intergenic	novelGene_48314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	107	415	1012244	1012552	TRUE	45	AATATAATGAAAAGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRHSGCNNGLKIPMITRMAQDGTMFCSVVHRVAMSQNQLDSTQQQQQQCTSEGRIKTFSDCYLLSVLLRELLEDVFHDKGVSQESKDMQCKKQDVAQACLG	1012137	1017955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1013684_1014126_1014247_1015777_1016035_1016594_1016781_1017927
923382	contig_15327_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_70437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGGTCTGTACCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70429	70938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_70400_70900
923383	contig_11744_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_176857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTTAACACAAGGGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132067	133040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11744_pilon_+_132100_133000
923384	contig_9363_pilon	+	2409	2	Intergenic	novelGene_6664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	34	450	1013803	1014219	TRUE	60	AAAAATTATCTCAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRVTARAKGDMGVLQDRTALHVLQPCPLANLGRDPSPLPSGRTRRPGSPAGPGPAAQPARSAPCLHRPSCHLPARAGVIGTTFLLLLSPHETYWLPGLSFLAISHPSLPRGPDPPSLPAPNPAVPTSHLPQLVGPVPHGGPSSLSPRA	1013769	1021605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_1014900_1020326
923385	contig_15185_pilon	+	2479	10	Intergenic	novelGene_99425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	7.43863786814047	42	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	496	1491	71	1561	255236	266397	FALSE	35	TACATTAAACATCTCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVLQTWVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALVILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVIIQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHTFDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQFDKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDAISFVDQGGHVLSSTGLTLPSMPSRNSVAETSVTNLLRESGSGACLDLQVIDTVRSGRDREDAVMHHLLCGGLYKPRRRYKASCSRHFISEDAQERQDKEVFQQNMKRRLESFKSTKHNICFTKNKPRLRKPGHKKKDGVANTETTNGKPPRDLGFQDTAAVIVTLESEEEEEESDSSETEKEDDEGIIFVARATSEVLQEGKVSGNLEVCPSPRVIPPSPTCAEKQLPWKSGQGDLAVYVSSETTKIVPVDMQTGWNQSISSLESLASPPCTQAPTMTHLPPRPLAAEEPQAPLALPSDPLLSFAFPPSLAKAGRSRSESSADIPQQQELQPLMGQKDHTHLSPRAANPRWCIQFNKGGQL	255165	267315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15185_pilon_+_255368_255592_255683_255779_255851_256595_256726_257190_257280_257422_257550_261076_261248_261755_261826_262569_262708_265924
923386	contig_1301_pilon	+	2010	5	Intergenic	novelGene_47426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	987.904853718211	7	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	24	338	983738	990327	TRUE	25	TACCAATTTTCTTTCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGCKSGAMPKSKELVSSSSSGSDSDSEVDKKLKRKKQVAPEKPVKKQKTGETSRALSSSKQSSSSRDDNMFQIGKMRYVSVRDFKGKVLIDIREYWMDQEGEMKPGRKGEI	981517	993668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_981540_983736_983810_986236_986360_990207_990376_992044
923387	contig_7182_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_117125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCCATCTCTCCCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714711	717244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_+_714700_717200
923388	contig_7189_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_117669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAAGACACGCCCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1042646	1043820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_1042600_1043800
923389	contig_12528_pilon	+	2387	2	Intergenic	novelGene_81280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTCAGATTATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254178	260914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_255530_259878
923390	contig_6612_pilon	+	2513	3	Intergenic	novelGene_148170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTTTCCTGTTCTGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44665	62084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_46877_50106_50275_61950
923391	contig_695_pilon	-	1203	6	Intergenic	novelGene_177162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAGAAACACAGGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44213	17566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_695_pilon_-_17610_19782_19852_25388_25432_28498_29156_42860_43142_44103
923392	contig_4103_pilon	+	1780	13	Intergenic	novelGene_51900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	58.3082684245268	1	101	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	502	1473	62257	65973	FALSE	35	GAAACCACTGAAGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPDAECLKIMCEILSSLQLGNFLVKDRRILDGMFAICGVPDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLHDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFQYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPVRAGEEPLGMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKVRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVASREEVDVRREDLVEEIKKRTSQPLCIC	53967	66280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_54003_54284_54375_58096_58217_60671_60768_61422_61553_62226_62335_62484_62578_62800_62895_63077_63206_63312_63556_65063_65181_65381_65529_65901
923393	contig_19457_pilon	+	2699	1	Intergenic	novelGene_179059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	1729	2433	14829	15533	NA	70	AAAAATAAAGACGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIERLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	13100	15799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19457_pilon_+_13100_15800
923394	contig_5039_pilon	-	4300	3	Intergenic	novelGene_64773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	7	16	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2594	2950	129139	128044	FALSE	35	GCCCACAGCCACTGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTMSKHLQKQDRMVPVSVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLLLRILQELKQKANKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIRKQQLEIQKIVPARYQSRK	132935	126693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_128078_128816_129547_130749
923395	contig_14687_pilon	+	4114	2	Intergenic	novelGene_107885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	203	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATTGGTATTTGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349814	473949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_351724_471744
923396	contig_8317_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_19559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
923397	contig_15327_pilon	-	1655	4	Intergenic	novelGene_70649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2568.09592240373	17	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAAATTGAATGTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902104	899727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901025_901126_901281_901400_901536_902035
923398	contig_12605_pilon	+	2016	3	Intergenic	novelGene_64204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	83	185	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1455	1961	5632	6258	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLMSAWSCEPCFYGPWDKVQSFCIFLPFSSDPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSGREGCGV	3874	6313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_6005_6124
923399	contig_3469_pilon	+	3419	1	Intergenic	novelGene_34218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGCAAGGATCTAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557728	561147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_557700_561100
923400	contig_15788_pilon	+	4627	4	Intergenic	novelGene_179060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	975	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	1800	2846	412974	420826	FALSE	65	GAAAAAAAAATGAGATAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKINYYSLQYGLDLNTKKTKILTTGPISNIMINGENTEVVKDFILLGSTINTHGSSSQKIKRQNYKTLLHETQRDLHKWKNIPRSWIGRPNIVKMTILPKEIYKHNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKEKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGSNSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEGKIGPTLQALILGINRIQTITINTQNPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTHWEKNFWTVQVRQRSNPHNLHENPTPLQQKDK	298048	422607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15788_pilon_+_298953_301495_301954_412536_413164_419969
923401	contig_13074_pilon	+	2038	2	Intergenic	novelGene_153407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAAGAAACCTTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95745	102647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_97589_102452
923402	contig_5316_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_61265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTACCTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559664	561782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_559700_561800
923403	contig_6164_pilon	-	3256	1	Intergenic	novelGene_121271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	1171	1824	402720	402067	NA	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRSSGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDENLAIQEAQRTPYRRDPKRKSSRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRAETIRLFAETMQARRQWGDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDEQLQLTSRI	403890	400634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_400600_403900
923404	contig_3745_pilon	-	4263	4	Intergenic	novelGene_85067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3689	4015	364530	364204	FALSE	85	ACAAAAATACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAPCAGAVGSLRTSSASALGTLSAQTHCPPRPRVMPRSAHRGRLLGVSSGTHSALNHHLLQIFAYVGKHRPLVWFLLPALQHQTVPEGRADRGLSKAHLAMAPSHGP	472006	363955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_-_366715_446588_447828_466924_467169_471985
923405	contig_5419_pilon	+	3664	9	Intergenic	novelGene_15503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	528.45693710557	1	145	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	FALSE	30	TGACATCACAGACTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
923406	contig_500_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_31128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGGTCAACAATTACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1741880	1743182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1741900_1743200
923407	contig_15123_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_110892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	8	364	20160	20516	NA	25	TCCTGGGACTGAAGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGMRLFCLLQVHFGFPLQLRRGSCCIPPVALRAQSRVAAAQARRPSRLGCHHPGRLRLEALGRREWALRSGRDWGSRTRPALRLPHAPAQSALHLRPFPSLNRRHHPFGGCHLTRLQSYN	20152	21944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_+_20200_21900
923408	contig_20211_pilon	-	3006	2	Intergenic	novelGene_147669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1255	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	2398	2886	40784	40296	FALSE	35	TACTGTAAAGAAGACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTSLSVLCQFLISFGAWLSSLSLHLMLRVSGFPFSLFGLVFQIFAVKGWCGASAYSTMLPGSPLDSFEETRMTHILGLSSVSSCSVSGHAFLAGMSQKWCCALSTSHQELTSSTCPTTDDIYLDHLVMLVPAHFLHGKDPMFPSVVDKYLVQRFSNIIPH	43646	40175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20211_pilon_-_42552_43016
923409	contig_7119_pilon	+	2028	4	Intergenic	novelGene_41021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	270	junction_3	0.471404520791032	8	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1421	1972	214801	217266	FALSE	25	TTGAGGTAAATGTTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGDPARIQLIFERALVENCLVPDLWIRYSQYLDRQLKVKDLVLSVHNRAVRNCPWTVALWSRYLLAMERYEVDHQKISATFEKALNAGFIQATDYVEIWQAYLDYLRRRVDFQQDSSKELEELRSTFTRALEYLKQEVEERKCGSQTLLVPGCASYYWLIYFLCQGRFVSKSLPTLTNSVL	213380	217322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_214903_215610_215750_216231_216340_217063
923410	contig_10013_pilon	+	2773	20	Intergenic	novelGene_125066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	61.5893378548278	77	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	813	2442	125	2566	368788	382233	FALSE	10	CTCTTGGAAGTGGCCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLNSRVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDKAEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPLIFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQKILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAVLPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGPGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYDKVFSRRADRHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRAREWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAIDVGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRLNPWADKVKVPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFKTMDFGKFDQIYDVGYQYGKTVFGAWSRGDIIEKMLTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTSYVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDCSRDEGGSPEGASPSVASEMEEEKSILRHRHGMPQDPPSSTADA	364009	382440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_364083_368736_368943_369174_369307_369380_369505_369786_369901_370021_370098_372715_372860_373335_373400_373646_373816_373983_374167_374412_374532_374687_374845_375208_375326_375412_375483_375908_376026_378892_379195_380271_380389_380876_380974_381086_381197_382158
923411	contig_6710_pilon	-	546	2	Intergenic	novelGene_97554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3	371	657520	653562	FALSE	65	TGGAAAAAGAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAEASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657522	653386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
923412	contig_7733_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_147144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	215	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAATTTTTATTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111856	109689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_109700_111900
923413	contig_4024_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_177899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAAAGGAATCAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182056	180202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_180200_182100
923414	contig_12540_pilon	-	2801	2	Intergenic	novelGene_148092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1890	2228	961653	960852	FALSE	55	CCAAAAAAAAAAAGTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAYVRACLRLSINVCTSARVPVCVHLPVHTCVQYLEGVLGAVARPPDAHSLQHARVAQLLQHQLLVEAQLLLLSVRADAADEEGLCLAQCFQELVKGCLGKDREGSVLSWA	963542	960278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_960973_961435
923415	contig_12019_pilon	+	2083	10	Intergenic	novelGene_87733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	152.389850930653	16	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	17	832	623205	637915	TRUE	10	TTATTGGCTCAGGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGASAMALMALRKELLKSIWYAFTALDVEKSGKVSKSQLKVLSHNLYTVLHIPHDPVALEEHFRDDDDGPVSSQGYMPYLNKYILDKVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVLPDREGKRCMFCVKTASRTYEMSASDTRQRQEWTTAIQTAIRLQAEGEDIVAQGPETEAA	623188	642653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_623310_633066_633208_635731_635969_636053_636201_637576_637686_637838_638139_639665_639833_639942_640142_641782_641874_642082
923416	contig_15087_pilon	-	1922	14	Intergenic	novelGene_37156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	417.970483938504	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	24	1301	66602	38999	TRUE	35	CAAGTTGAAGATCAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFTHLGRMALEFNRLASKVHKNEQRTSILQTLCEQLRKENEVLKAKLDKGLEQRDQATERLREENMELKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTAGQQQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQVRIFEEDFQRERSDREHMNEEKEKLKKQVEKLQAQVTLSNAQIKAFKDEEKAKEALKQQKRKAKSSGERYHVEPHPEHLCGAYPDAYPPMPAMVPHHGYEDWSQICYPPPPMAMEHPPPLPNSRFFHLPEYAWRSPRGECGIRAPK	66625	33341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33551_33741_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41837_42914_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54569_58875_59000_60952_61048_66533
923417	contig_7968_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_179061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACAATTTTGAGGCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468001	470240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7968_pilon_+_468000_470200
923418	contig_21422_pilon	+	2716	2	Intergenic	novelGene_79080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	220	junction_1	0	53	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1152	1562	27043	28591	FALSE	70	AAAAAGAAAAAAAGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISHELINLEISSPNVPDLTLIDLPGIARVAVGNQPADIGRQIKSLIKQYIHKQETINLVVVPSNVDIATTEALSMAQEVDPTGDRTIGKKRGEPKDYGWFQNGKASPESSWVFLGTHFEWWTYIRHLRIAKVAE	25891	29745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21422_pilon_+_27172_28309
923419	contig_753_pilon	-	3724	1	Intergenic	novelGene_113039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	114	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2488	2853	1451298	1450933	NA	25	CTGGCCAGAAAGGGCTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCFYIIFLNSSNFLSVFSMNLSVSFSCLSAFCLSSWRILSIKDLNSLSGSSSAFSSRGQLSGVLFWMPTGTILSCFCKCFVIVCCLRGIQ	1453785	1450061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1450100_1453800
923420	contig_6418_pilon	-	2748	1	Intergenic	novelGene_81228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTATGACACCACTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1401615	1398867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_1398900_1401600
923421	contig_19722_pilon	-	3472	2	Intergenic	novelGene_171897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAGTCATCTTAAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82276	78612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19722_pilon_-_79942_80133
923422	contig_4392_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_117343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAATCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649405	651769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_649400_651800
923423	contig_14970_pilon	+	1965	9	Intergenic	novelGene_44930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	179	1267	136145	231550	FALSE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	135966	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
923424	contig_6929_pilon	-	1733	3	Intergenic	novelGene_139443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAGAAATGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345030	318211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_319781_331495_331644_345014
923425	contig_854_pilon	+	2206	10	Intergenic	novelGene_36625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2403.17611341715	14	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	20	1174	1692728	1715375	FALSE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSRRAGPWGWARVFSMNLVFFRLTEF	1692708	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700861_1715297
923426	contig_8140_pilon	+	2335	1	Intergenic	novelGene_86430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178601	180936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_178600_180900
923427	contig_5669_pilon	+	5252	8	Intergenic	novelGene_86054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	177.625149901558	246	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	96	785	182940	189257	TRUE	20	CTCCCACATCTTCCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRSLGERSSGGRRARARRASRSAPHTDTFAMNQPAPGAPPAPRRVRLKPWLVAQVNSCQYPGLQWVNGDRKFFYIPWRHATRHGPGQEGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEGPWPMHPVGMQ	178247	193954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187247_187418_189221_191683_191912
923428	contig_11253_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_126832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162903	164661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_162900_164700
923429	contig_6361_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_23884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAATTACTCAATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92840	90139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_90100_92800
923430	contig_8760_pilon	-	1512	1	Intergenic	novelGene_175044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGCACAATTAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84197	82685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8760_pilon_-_82700_84200
923431	contig_6434_pilon	+	3411	16	Intergenic	novelGene_61887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1336.64527663683	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1136	2131	924065	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	894359	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_894642_896167_896326_900033_900192_902412_902550_918953_919000_919663_919800_921533_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
923432	contig_8712_pilon	+	6796	8	Intergenic	novelGene_58735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_1	104.8152894284	221	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	110	586	73618	78256	TRUE	70	AAAAAAAAAAAATGTAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPRPLPPPAHFCTVARPPRGLPYRLPIKKVDVQGNMSNVSEERRKRQQNIKEGLQFIQSPLSYPGTQEQYAVYLHALVRNLFNEGNDVYRECDWNGSISQYTEALNIADYAKSEEIVIPKEIIEKLHINRIACYSNMGFHDKVLEDCDTVLSLNASNCKALYRKSKSLSDLGRYKEAYDAVAKCSLAVPQVWN	63515	89628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_63591_73583_73686_74519_74560_76374_76573_78085_80146_83638_86107_87288_87486_87972
923433	contig_16121_pilon	-	1604	5	Intergenic	novelGene_6867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.73205080756888	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGCGGCTGCTGGGCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63815	33673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_33706_57740_58202_60690_60854_62563_62732_63035
923434	contig_11269_pilon	+	2118	1	Intergenic	novelGene_145829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCACCACCCAGGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343513	345631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_+_343500_345600
923435	contig_3627_pilon	+	9195	20	Intergenic	novelGene_78454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	250.78829734081	5	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	7282	8904	315811	332430	FALSE	40	CAGTAGTATTTAATTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSKKDERKDKKEERDDETDEPKPKRRKSGDDKDKKEDRDERKKEDKRKDDSKDDDETEEDNNQDEYDPMEAEEAEDEEDDRDEEEMNKRDDKRDVNRYCKERPSKDKEKEKTQMITVNRDLLMAFVYFDQSHCGYLLEKDLEEILYTLGLHLSRAQVKKLLNKVVLRESCFYRKLTDTSKDEENHEESEALQEDMLGNRLLLPTPTVKQESKDVEENVGLIVYNGAMVDVGSLLQKLEKSEKVRAEVEQKLQLLEEKTDEDEKTILNLENSNKSLTGELREVKKDLSQLQENLKISENMNLQFENQLNKTIRNLSTVMDEIHSVLKKDNVKNEDKDQKSKENGASV	295954	332721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_315817_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439_323680_326345_326458_329124_329208_329564_329712_330619_330741_330842_331029_331550_331757_332370
923436	contig_5481_pilon	-	2825	1	Intergenic	novelGene_144565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1591	1908	74579	74262	NA	40	GTAAACCTTTACCTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLQGLMNPNQQVRPQAAGSKVCRSWQIRSGDRLAHGTVEAGESQNPQVRWQASGLSPKNWRLDDHKVDVGPRCRGERALPGHSHIYSGCRPYPREGRNLSKGGT	76169	73344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_-_73300_76200
923437	contig_9815_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_164240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGAGATGCTTCACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46705	44709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_44700_46700
923438	contig_4654_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_103096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTGAAATTTGCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493662	494573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_493700_494600
923439	contig_15970_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_144063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGCAAACACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201114	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_198400_201100
923440	contig_8263_pilon	-	4203	2	Intergenic	novelGene_83078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	737	1144	111309	110902	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKNQTICGMTSRTSYMKKAKRLLKRQERKKRPKRMSEETLKLALECTAAKANGRNDEVKEVNRRFQRAAREDKVKYYNEMCKDLELENQKGRTSSAFLKLKGLKKKFKYRLAVLKNSMGKILNDTGSIKRRCKE	112105	107842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_111880_111939
923441	contig_11752_pilon	+	3756	2	Intergenic	novelGene_37652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_1	0	1	157	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	2085	2732	87165	88933	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	85080	89957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_87547_88667
923442	contig_7229_pilon	-	709	4	Intergenic	novelGene_39809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2656	junction_3	638.233499590863	511	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	38	652	877522	875654	FALSE	20	CTTAAAAGTGTTCTTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878215	875596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877535_878190
923443	scaffold_15568_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_122584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGAATAGTTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86336	88416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_86300_88400
923444	contig_5023_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_7154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	184	306	365270	365148	NA	60	AAAAAAAAAAACCTCTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIRLPGIYPREIRAITRIHICTPIFIAALFTIAKTWKQPRCPSTDEWINKLWCVHTIEYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEVMMLSKRSQSQKDKYCMRLLL	365453	363354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_363400_365500
923445	contig_12915_pilon	-	3017	2	Intergenic	novelGene_148353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	72	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGACCATGGTCCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200742	120588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_122746_199882
923446	contig_12622_pilon	-	3408	1	Intergenic	novelGene_5822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2672	2989	402613	402296	NA	20	CATAGTCATGGCTTTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMMWLQPCSGGTAVRCTTCQQNAAALIHIWILRGIRCTQGLISKLKAQSKFSPYLGSSLLEFYLQVLSSDHGYKDIGLCSAFLQMEFYQLPWEGTQSSLLPNGI	405284	401876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_401900_405300
923447	contig_10437_pilon	+	3184	2	Intergenic	novelGene_38239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAATTCTAGATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343777	347048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_344332_344418
923448	contig_5947_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_101563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	222	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTAAGCCAGCTGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779308	776926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_776900_779300
923449	contig_13894_pilon	+	1684	1	Intergenic	novelGene_62186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	734317	736001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_734300_736000
923451	contig_1639_pilon	+	5064	2	Intergenic	novelGene_74875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	199	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1453	1878	306652	307077	FALSE	65	ACCTATATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGIIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIYYAKAVDCVDQNKFMDNIANNGNSRTVVFMRNLYLDQEAVIRIEQGDSTWYKVREGVRQGCIFSPYLFSLCAEQIIREAGPYEEECGIRIGRRLTNNLQYADDTILLKMKKT	274908	310263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_275771_306061
923452	contig_12119_pilon	+	3126	1	Intergenic	novelGene_88678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	881	1306	365426	365851	NA	50	AAGAAAGAATGATATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLYWLTCCARHQFLRKHRLWKERLVFLDSLLVFKCVCLRFGFLLIKGTMHATQLPDVARDQHVEICSRGSGLLVSCRLLETSLNVDGAGACTRRWFPVLCFSCGSLPEKHIFLQGSRRLFPFLTDCPKSRKGLSSSPVVK	364545	367671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_364500_367700
923453	contig_11498_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_65539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAAAAAAAAAAAAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301794	303479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_+_301800_303500
923454	contig_19098_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_65876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1	327	591057	590731	NA	80	CACCAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLACYNPTVVLPSVSGFGGLARERLLPARNGHLAWPEDSGRSQGAGQGGRLRCPEGRRGAGAAPRERESGLARARGERRLPGKCAPPGTAGPRRGREREEPLPARVVA	591057	588812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_588800_591100
923455	contig_2380_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_117907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTTAGTGATTTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532639	530631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2380_pilon_-_530600_532600
923456	contig_11903_pilon	-	968	1	Intergenic	novelGene_164735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89624	88656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11903_pilon_-_88700_89600
923457	contig_10734_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_51251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACACAATAAAATATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1263806	1265550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1263800_1265600
923458	contig_10667_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_137311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1999	2328	56950	56621	NA	70	AAAGAAAATAAGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYHLRFQGRSAPYLSRAFRYEYGKTTGYLTVLQPCPEFPVLLCAQSKACGLELASEADQLSAWGCYGSNCPHVAINILVCVLTWHVLPVMKVVTPLCLLMKSSSFSVN	58948	56403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_56400_58900
923459	contig_14687_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_107970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGACAATGATTAGACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745328	746828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_745300_746800
923460	contig_2770_pilon	-	1733	5	Intergenic	novelGene_107445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3383	junction_4	732.353867676003	36	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	213	653	750561	744015	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEGKTLHS	750773	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
923461	contig_5779_pilon	-	4935	36	Intergenic	novelGene_106462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	358.271002204209	31	33	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1071	3216	523	3738	226591	129303	TRUE	15	TCTAGGCACTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTSFRIIFLPTEEGSIESSLFINTSSYGVLSYHVSGIGTRRISTEESAKPLPNAYFLLPQVQSIQLSQTQAETANTSLLQVQLECSLHNKVCQQLKSCYLESDDVLRLQMSIIVTMDSSSKEFEENTQDLLDHLAIVYVAIDNSETSDDSAVNMYILHSGNSLIWIQDVHHFSQRDALSLKFEPVLLPTSTTNFTKIASFTCKATLCDSGMNYMEVVRKTKSTPTLKACLSSPVVPGYFRMDSAAAQFHIETHENTSGVWSMWYLNHFDRSIVLNDIFVSKKTKHILKILNFTGPLFLPPGCWNIFSLKLAVKDIAINIFTNVYLTTNIGAIFAVPLQIYSALTKEGSLGFEVIAHCDMHYFMGKSRAEIPNWQRSLSLDRSTWDVDSELANKLYERWKKLKNGDVCKRNVLGMTRFSHLKKSKESESFVFFLPRLIAEPGLVLNFSATALRSSVVKYFVVQNPSSLPISLQLLPVSSYPKPEAAMRLLHKWFGTDMQMINFTTGEFQLTQACPYQGVNSEESRFGILHLHLQPLEMRRVGVVFTPADYGKVTSLILIRNNLTVIDMIGVEGFGARELLKVGGRLPGMGGSLRFKVPESTLMDCRRQLKDSKQILSITKNFKVENIGPLPVTVSSLKISGYNCQGYGFEVLDCHQFSLDPNTSRDISIVFTPDFTSSWVIRELTLVTAADLEFHFTLNVTLPHHLLPLCADVVPGPSWEESFWWLTVFFVSLSLLGVILIAIQQAQYILTEFMKTRQRQNSSSSLQQNNSPVDVIGSHSHKSNCKNFLDAYGPSDKGRGRNCLPVNAPQSRIQNAAKRSPATYGHSQKKHKCSVYYSKHKAGTSLASSASTTTEEKQTLALGSSLSVLKEDLCPDVMGENWINLKYASGVNVNLQKSLTFPKNLLNKEENTLKNTFVVNNTSSECHMKEEIQICMFPKETDIKTSETMAELKDCELYPLKASKKLPENHLPRNSPQYQSDLPEISRKNNGSNQQVPVKSEADNCETLKKQGDTKSSSEKKSHKASKEDICPEKRDVPPAEQEDPYRKKKLQEKKEGNLQNLNWNKMTWM	358736	107404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113291_125880_125961_126872_126952_127357_127544_129215_129317_132147_132224_156804_156957_163902_164529_164893_165044_165624_165811_166004_166192_168165_168309_171097_171226_177330_177404_178739_178850_181059_181202_183540_183659_184755_184826_186322_186494_192963_193118_193832_193933_195520_195630_195919_195979_197650_197805_197995_198074_225516_225628_226486_226604_227922_228047_232247_232317_238064_238139_349588_349633_357795_357867_358608
923462	contig_6509_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_145662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACAATTTAAAAAAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222125	224188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_222100_224200
923463	contig_7914_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_165029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAACAATGCATCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146603	144830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_-_144800_146600
923464	contig_3825_pilon	+	1487	7	Intergenic	novelGene_77940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_2	1235.22476587147	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAGTGACTCCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12758	15915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13105_13621_13772_13904_14198_14390_14471_14780_14912_15231_15302_15498
923465	contig_6272_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_160440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	351	1053	23	1075	122983	124035	NA	40	GACAGTCAGCTCATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTICGKMFPSQSKLDRHTLIHTGQRPFKCVLCSKSFRQSTHLKIHQLTHSEERPFQCCFCQKGFKIQSKLLKHKQIHTRNKTFQTLSLKVKSPESCPLPSKLNAKQDGFENGDMGESEENSPLDVHSIYIVPFQCPECEECFESEQILNEHKCFPARGGKIPSRLKRSYNYKTTVKKILAKLKRAGGKKLDNFRSEKKVFKTSFLKNCDLTSGEQSSEQTQKTFMGSLGKYGTYKTVGNQKKKTLTLPFSWQKQFQTQNVGKNLKGVLTTESMLTMDSSVNNKDMSVYGSSGEEFFDNCEVLQCGFSVPSENIHTGHKTCPCDKCEKVFPSISKLQRHYLIHTGQRPFGCNVCGKSF	122960	124036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_+_123000_124000
923466	contig_12464_pilon	-	5235	1	Intergenic	novelGene_68714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	226	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCCACCTGAATTTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367699	362464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_362500_367700
923467	contig_1008_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_121580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGTAATACAGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673348	674715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_+_673300_674700
923468	contig_4803_pilon	+	1829	1	Intergenic	novelGene_150732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAATTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89105	90934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_89100_90900
923469	contig_4087_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_156078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTGTAGACAACTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120943	121778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_+_120900_121800
923470	contig_15062_pilon	-	2551	1	Intergenic	novelGene_162281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1802	2239	1199	762	NA	70	AACCTACAAAAACAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFIFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLQSEDKQLQPSGRT	3000	449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_400_3000
923472	contig_4857_pilon	+	2561	3	Intergenic	novelGene_48734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	214	132	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1168	1746	1194283	1194861	TRUE	70	AAAAAAAAAACCCACAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	1192725	1196734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1192991_1193380_1195374_1196431
923473	contig_7775_pilon	-	1717	1	Intergenic	novelGene_37483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175408	173691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_173700_175400
923474	contig_1472_pilon	-	2620	1	Intergenic	novelGene_86123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGCAAACCAAACCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314964	312344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_312300_315000
923475	contig_17427_pilon	+	1098	7	Intergenic	novelGene_30266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGGCCCAGCAGCGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6644	86274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_6787_13951_14090_41900_42104_50642_50775_52621_52704_54097_54254_86029
923476	contig_6272_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_160462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAAAAAACCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205484	204201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6272_pilon_-_204200_205500
923477	contig_8210_pilon	-	2473	4	Intergenic	novelGene_30227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	792.098619000325	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	15	551	21509	15712	FALSE	45	AGAGGTATTATACCCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDIFRNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	21523	13789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144_18331_19804_19851_21487
923478	contig_5429_pilon	+	2187	12	Intergenic	novelGene_127806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_3	175.608175791899	15	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	1498	2187	467314	495651	FALSE	40	AACCCCAAAGCATCAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNDSVPEYKETTEESIRETNRFVSKMLQRNYLRVKPIVMPRFSLSCSESLMSELGNIAKTHDLHIQSHISENPDEVEAVKNLYPNYKNYTDVYDKNNLLTNKTVMAHGCYLSAEELNVFSERGASISHCPNSNLSLSSGFLNVQEVLKHDVKLGLGTDVAGGYSSSMLDAIRRAVMVSSVLLINKVNEKSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDSEIGNFEVGKEFDALLI	427893	495651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_+_428022_457958_458048_460504_460677_462742_463813_467275_467382_470446_470475_472132_472241_474440_474549_476956_477055_479553_479622_491576_491724_495586
923479	contig_5095_pilon	+	925	2	Intergenic	novelGene_74931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	173	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGATCTTCCTTGTCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102926	226300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_103099_225547
923480	contig_2770_pilon	-	1567	5	Intergenic	novelGene_107457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1985.46203690728	6	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	218	670	750561	743833	FALSE	20	AGTCGTGTTAAATGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFILKGKLLFSEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750778	742935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746779_750558
923481	contig_5189_pilon	+	1916	10	Intergenic	novelGene_34868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTTGGTCACCCACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198432	244247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205790_218496_218670_220257_220402_228135_228244_230387_230485_235736_235852_244171
923482	contig_15056_pilon	+	1445	3	Intergenic	novelGene_179062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	170	706	693	1965	TRUE	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTSGILGEGSDSTQYRETNTTCTRKGHGGPMDRSKLPEGLSCWTEGSGDHGLGEHLAQLA	523	26059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15056_pilon_+_1050_1785_2436_25790
923483	contig_7357_pilon	+	1168	2	Intergenic	novelGene_36924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTGGATTGACTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609709	611361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_609717_610200
923484	contig_4013_pilon	+	2494	2	Intergenic	novelGene_178557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	0	209	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGGTTCCCACCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1220	4411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4013_pilon_+_1255_1951
923485	contig_5649_pilon	-	3149	1	Intergenic	novelGene_82441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATATAGTATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492064	1488915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1488900_1492100
923486	contig_4087_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_156073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96624	94198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4087_pilon_-_94200_96600
923487	contig_9440_pilon	-	1524	2	Intergenic	novelGene_59020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCTTCATCTAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225775	223789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_224881_225342
923488	contig_10863_pilon	+	3014	2	Intergenic	novelGene_59327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	212	junction_1	0	43	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAAGAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63702	66819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10863_pilon_+_64193_64295
923489	contig_12008_pilon	+	1324	8	Intergenic	novelGene_24993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	561.939099031566	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	552	1028	34143	39456	FALSE	30	CATCTTGAAAATATTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNLLQCGVLRPDFFAVSWDSCKHERDQGMAAACRILAFFSTTFCIRELLIDTK	23637	39752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28108_30062_30219_34014_34146_34559_34714_39002_39167_39300
923490	contig_1443_pilon	-	3594	2	Intergenic	novelGene_28163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	167	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCATCTGAAGTACAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324139	317547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_320413_323410
923491	contig_5880_pilon	-	3337	3	Intergenic	novelGene_151126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2576	3016	209298	208858	FALSE	35	CAAGCAGAATGCTCGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNKQTTLKKRAGVAILISDKIDFQLKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYAPNDRAPKYINSNSTEKRDRQLHNSSRRIQHTTFSEGQNTRKKLNKDTEELNATIRQLNLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNSHGTFSRIDHI	212296	208536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5880_pilon_-_209426_209732_210703_210818
923492	contig_13206_pilon	+	3308	2	Intergenic	novelGene_161910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1338	1844	203815	204321	TRUE	35	GTTCGAATGGAACAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPPGWKALKRQLVKSCLLKEELTLMTWMESSFWDLFADVAQLKMRRDGCKHPLIIRMWNVRSINLGKLEIIKNEMEHINIDILGISELKWTGIGHFESDNHMVYCAGNDSLKRNGIAFIVQKNISRSILKYNAVSDRIISIHLQGIPVNTTITEIYAPTTKVKDEEI	202477	205842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_205687_205743
923493	contig_6266_pilon	-	1538	1	Intergenic	novelGene_171014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAAAACAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901323	899785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_899800_901300
923494	contig_5799_pilon	+	3064	1	Intergenic	novelGene_50339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	941	1240	710521	710820	NA	65	TTTAAAAAGAAAAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPWKHSLIYAKKFGRQLPGQLTGRDPIECGNYRTISLISRASKILLKIIQKWLQQYIHRELPEIQARFRRGCGTRDIIADVRWILAESREYHKDVVMD	709580	712644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_709600_712600
923495	contig_8242_pilon	-	1202	1	Intergenic	novelGene_80195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAGTGACAATAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175638	174436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_-_174400_175600
923496	contig_20889_pilon	+	7181	5	Intergenic	novelGene_127634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	34.0468427317424	597	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTATATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20027	46069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_21105_21686_39283_41155_41265_45863_45984
923497	contig_12786_pilon	+	2455	1	Intergenic	novelGene_103443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAACCTAATTTAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623962	626417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_624000_626400
923498	contig_13097_pilon	+	1643	1	Intergenic	novelGene_107680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGACGACCGCCCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79277	80920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_79300_80900
923499	contig_11986_pilon	+	1268	10	Intergenic	novelGene_69156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	704	1081	517945	523699	TRUE	10	AGCCTGGCGCCCCCGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLRLMLISSCRYFSYWSLMNFMMGCQLFSLLMWSPKPGVSITVSFIRTPFSSISCVMDLISMVFGMRSSEVGCTDFRLIWDLKRVLIRVDFPKPLCPTTMMLNSKPCFMAFLRICSRIESMPT	507202	535532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_507488_508544_508598_514823_514920_515234_515332_516431_516550_517890_518032_518497_518577_519051_519180_523615_523811_535456
923500	contig_10962_pilon	-	2828	3	Intergenic	novelGene_103917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCACTGGCTGGGAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401589	395749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_396482_397805_398659_400346
923501	contig_13283_pilon	-	2532	2	Intergenic	novelGene_154020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTTACCTCCTTAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73860	61439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_62860_72748
923502	contig_12543_pilon	+	2317	2	Intergenic	novelGene_168390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTAAAAAATTGTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398939	407608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_400202_406553
923503	contig_8552_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_80115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACACAAAATAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611328	609884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_609900_611300
923504	contig_3111_pilon	+	2586	1	Intergenic	novelGene_129950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGATTCCAACTCATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11190	13776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_+_11200_13800
923505	contig_546_pilon	+	4455	9	Intergenic	novelGene_117213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1078.52485338772	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	291	1343	136835	152874	TRUE	60	GACAAAAAAAAATCTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPEEADHQFCHQEEDPHLQNLFHPQVAQGGFQCLLQATEVVPQSLRGTVCLLQGLTWAQSPIMFPPQYLIRQDPFNQACTTAAPHQCLGHPGSPALGLPLPLSLEAEVLPLEEAPCASHPQAPPHPSPTGLPFQNNKPPVPSTPRPSSSSQAAPPPPPPNRPGPPPLPPGSSGNDEIPRLPQRNLSLTSSTPPLPAPGRSGPLPPPPSERPPPPVRDPPGRSGPLPPPPPISRNGSTSRALPATPQLPSRSGLDNPRSGPRPPLPPDRPGAGAPPPPPPSTSIRNGFQDSSCEDEWESRFYFHPISDLPPPEPYVPTTKSYPSKLARNESRSGSSRRERGAPPLPPIPR	119791	156170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_119885_123934_124054_136756_136838_139866_140266_140369_140638_146633_146847_147557_147672_152818_153966_154149
923506	contig_6418_pilon	+	4745	1	Intergenic	novelGene_81231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAACACACAATTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1402788	1407533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1402800_1407500
923507	contig_7850_pilon	+	3448	4	Intergenic	novelGene_178482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	274	624	74779	75129	TRUE	40	GAGAATAATGCCTGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASRRRSFQGTRHHLARTGSQLKKRKRKQANNSKQTKEQKPRDPTSTAAQTRKQLHTRMELCSPSGRSKDGSWSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSGKRATPAANKWHS	74505	185174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7850_pilon_+_75265_146184_146265_146532_146932_182964
923508	contig_5056_pilon	-	2089	2	Intergenic	novelGene_171158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATATATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113101	110181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5056_pilon_-_110698_111528
923509	contig_1735_pilon	+	4489	6	Intergenic	novelGene_106881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	830	junction_1	433.588283974556	53	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	107	1783	126256	137067	FALSE	10	TGCAACCTGTCCGGCTCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPPSATPHRRRVHWLGSLLTVSLLIFWSPSITAQLTIESVPFSAAEGNDVLLLLLNPPTDTLIYIWYKGESRDNNNKIASYGTGAPQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEVLAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINNQSLPDRARLELSTDNRTLTIHNVTRNDTGPYECETRNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNAISNPPAQYSWLINGNYLQSAQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVHSNATGLSRTTVKTITVSESVTKPSIQASNTTVREHEGPVILTCLTNHTGISIQWVFHGQILRLTDRMTLSQDNSSLTIGTVKREDAGVYLCKVYNLVSSSTSDPLNLTVKYYDPAPESSGLSGGAIAGIMAGALAGVALTAALVYFLCIRNTGGYDAFPRILLPPRLTAMLRKGKNSSPSLSLCLGLLFLLPKFLLLSTNVCGSLLPWSSRSLYPTVSWTWIFPSPSAFRGGTLNYVLLFPSQGSHSPKGKQMRK	126149	139773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_126320_127269_127633_131561_131841_132234_132490_134146_134426_136630
923511	contig_4486_pilon	+	3409	2	Intergenic	novelGene_38592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	839	1288	318537	395980	FALSE	40	ATGTCACCTATATATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLFFSWRTTDIAPLACFLPLESQEVDSILSFPSFSVYFSLSKLLGFLLWYLVRSISYRLNFFNKRLCSHILGKHSRTRLLSLVCTTEFSKSLSFVFILLSSFLSPSLSSSFYCKQQGETTCPFKILLRNVVSQIYMSIIYKFCLSPNI	317698	398101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_318772_395765
923512	contig_4364_pilon	+	672	4	Intergenic	novelGene_704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	4	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	59	670	1530895	1531867	FALSE	20	GCGTGAGATCGTGCGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTA	1530466	1531869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
923513	contig_17144_pilon	-	2050	10	Intergenic	novelGene_29305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2364.37803791459	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	658	1755	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183227	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_173156_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176387_179700_179786_181794_181850_183158
923514	contig_7357_pilon	-	4954	3	Intergenic	novelGene_36902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_2	7	198	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTCCTAGCAACAACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391189	385797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_390198_390552_390657_390739
923515	contig_9895_pilon	-	2982	1	Intergenic	novelGene_144690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2216	2524	132744	132436	NA	55	ATACACAAGCAAAAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIKEAPRTPYRINPKRNSTRHTIITFTKTKDNQRILTAAQEKQEVIYRRQTIRLSLDYLAETMQARRQWDNKYKTLKQNRSPTKNNISCKTLIQIC	134959	131977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_132000_135000
923516	contig_3747_pilon	+	1810	6	Intergenic	novelGene_24782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4955.43382561002	9	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201213_203009_203128_203228_203386_203498_203651_203768_203854_204139
923517	contig_7110_pilon	+	2251	21	Intergenic	novelGene_176015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	39.7490565925784	39	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	676	2028	224	2251	75736	259473	FALSE	10	GTTGGTCTTCCATTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSEEEKWEKLDAEFDHFVVDMKPFVLKLPHRSERQRCALWIRKLCEPSGTGTGIMGRKNRNLYAKLLLHMLKRGVLEGPFTHRPEPGTLKTLPSYMSIYFDEPSSVRVKGPSPERLPDWVMSELGTSDHKLNESWKLSSEDNTLVQSPTDVHRRMETNWSTLDGRSQAFKTSREQYSGQLRMRSHSVSPAYREDGEDVTPKIAEDHLKKSALSLDDSDIEARLNSWNLGIENPRYLRQKPVPVSLTTPKFSLRKSSSFHDDHLLSRMHEKELDMKTKIVEAKFHEEKLKLQQKHDADVQKILDRKNHELEELKTLYKRKQNETEETIRKLEKKVQTLIRDCQVIRETKENQITELKKICEQSAESLNNDWEKKLHTAVAEMEKEKFDLQKKHTENIQELLEDTNIRLNKMEGEYVAQTQATNQMVKELEARVQQLTGEAENSNLQRQKLIQEKMELERCYQITCNELQEVKARRNTLHKEKDHLVNDYEQNMKLLQTKFDADINLLKQEHALSASKASGLIEELEQTVCLLKEQLQESEHQRMQQLKDQENKFQMEKSHLKRTYEKKVHDLQNELDKEKEDAQKKIHKFEEALKEKEEQLTRVTEVQRLQAQQADAALEEFKRQVELNSEKVYAEMKEQMEKVEADLTRSKSLREKQSKDFLWQLEDVKKRYEQQ	68953	259473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7110_pilon_+_69048_73996_74112_75721_75836_78376_78568_79958_80129_100917_100975_104642_104737_106978_107057_128748_128797_129058_129137_147342_147430_159359_159460_162641_162761_166500_166645_189385_189541_194721_194852_199788_199882_200617_200678_207905_207986_246500_246637_259365
923518	contig_7963_pilon	+	2261	2	Intergenic	novelGene_58288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTGGATAGAAATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37162	40137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38571_39284
923519	contig_21027_pilon	+	2798	2	Intergenic	novelGene_127576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	49	300	13208	13459	TRUE	50	AAATATCTGGTAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPSILWVLATLSRFWMEASQPCISAPPSWSTGMTTLLPHIWAASFSSPSEWQPYPLGPGRPHPSAPWAWQSCLLSFGQWIWCHPTGTCGRQPHTPEPS	13159	16793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21027_pilon_+_15800_16635
923520	contig_5020_pilon	+	2580	4	Intergenic	novelGene_27790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAATAAAAAAAATAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44502	300792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_44511_46560_46951_114092_115127_299644
923521	contig_10793_pilon	+	1387	13	Intergenic	novelGene_83364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3448.15448525246	3	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	132	698	146975	161325	TRUE	15	TGTCTCGAGTTGTGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQGS	130870	165142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161316_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165054
923522	contig_5041_pilon	+	2037	1	Intergenic	novelGene_27085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCACTACATGCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539504	541541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_539500_541500
923523	contig_3410_pilon	-	1044	6	Intergenic	novelGene_58941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.93907194296653	17	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	270	809	202760	200042	FALSE	55	TATAATAAAATTCCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMETEDLVQLRRLNLELLRQLWAGQDAVRRSVAEAASESNLDASSSHNAEMLSSRETTSTASSPPSAPQDGPCDLAWPGRTSSLAVSLPPPKCQRQKSLGQLRPYSAPLPLTSDLNDPELSAGLDSLGPQEALRSVLTPRQSKPSKPRVTFSKEPGVPEWNWRLRPYLGYDWIAGFACV	205143	199806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_200059_201574_201660_202081_202406_202646_202833_204786_204950_205109
923524	contig_14725_pilon	+	2614	4	Intergenic	novelGene_173606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1707	2063	451314	451670	FALSE	35	GGACTGTGGAACAGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSKDWSLLTTCPKYVRHANLASKEHSGCTSSKTDLFVLLAVHGIFNILCQHHNSKTSTLLLSSLFAVQLSHAYEATENTMARVRCTLVFKVTSLLFNISKRSLAAVLTHAMCHLIS	436484	452221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14725_pilon_+_436542_440332_440388_448417_448507_449808
923525	contig_6556_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_168494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAATAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314959	313005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6556_pilon_-_313000_315000
923526	contig_14744_pilon	+	2745	1	Intergenic	novelGene_65921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119903	122648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_119900_122600
923527	contig_2867_pilon	+	2510	2	Intergenic	novelGene_135211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	844	1215	974568	974939	FALSE	55	TAGAATCAGAGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQRGKEQGEEQNQGQRGESEMTGQRRQNEMQRGDERGTEWLPPTDALWALRRLLFSLTSHQHPPRGAGASALLRQLLKTQSYSILSLSPGPLWATPSPWLHPQEKAGETVWEKLPVQRGAS	972561	976234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_972625_973787
923528	contig_7963_pilon	+	839	5	Intergenic	novelGene_58382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1313.42957557686	131	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51374	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56773_57424_57564_57782_57934_63003
923529	contig_16303_pilon	-	3608	5	Intergenic	novelGene_34066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	454	junction_4	597.181086438611	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	138	818	38799	35759	FALSE	25	CTATATATGCATCACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGTTDGEALRVHPVFTDTAWSWVGWVGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	38936	32968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579
923530	contig_6862_pilon	+	2456	14	Intergenic	novelGene_63748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_1	153.955768642246	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	743	2232	90	2321	49393	113646	FALSE	20	AGGTATGTCTGACTTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPLKKPRNTPRLPLALNPLKSKDVLAVLAERNHAVVPIGAWVEPASPDSSEMPAYTSACVIEEELKEQLRRKQEALKHFQTQVKHRVNQRVRLRKKQQLQRSYEAAEKKGSIAMQSSDPAHLTPRRRTSVFPNSLNAAVGSSRLPPSPEDEENKNELFQQQAQALSQTMKQVRHQLASFKTMGKKKATVFPDGKRKSVPTQEKALSRKPASIRINIETREGFPLKVHQSLSATVHYHNFMQSEKLDSGESSSIMTDEKWRKNLLWRDQQDLLSEIKNKPFNRVQKVQFKNPLFDVMEEEELKQLHLQDILPRAQDYLPEAQSDLSETQGDLPGIHSVEPEAQNVELDTQAIELEVQAREPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQASEPESQPCEPESQPCEPEAQAGEPEAQAGEPETQAGETETQGGTLEAHSIEPEDGSIVLEALDFLPQNQGFLPKDQDFLPKDQNFLSKEEDFLLRDQSVLLKDQSSLPKDQNILPKCQEQNFLPKDQEIYFRQPSPALTAERWKKKWPTSAQQCLSSMFQGQPSTRDQLDQLEERDEQEKANLKQSASILIGRGEREMFPLDVHQDLLHRRQDQASIRYKKVRFKEPYSDMTDERRREDFALAGYRHLPPKLQAHTCVRDPVEQDKKEGKKQEINSMQLVSDAYQPGLNPEFQAPLALQSGVDQEEDKKVRQKQYLRYKRLFMDMEREQVKEQQRQKEHKKKIEKLILIPTCGLLLP	48998	113781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_+_49076_49380_49561_55247_55398_55962_56140_75087_75202_78741_78865_82880_83004_83262_83947_84170_84327_85673_85797_86046_86224_109124_109218_110491_110596_113606
923531	contig_16210_pilon	-	4720	1	Intergenic	novelGene_147679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	204	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAGAACTGCCCCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69897	65177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_65200_69900
923533	contig_567_pilon	+	3138	1	Intergenic	novelGene_33995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAATACCTAATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447706	450844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_+_447700_450800
923534	contig_20429_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_169250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAATGACTGCCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138444	136316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_-_136300_138400
923535	contig_6958_pilon	+	3204	2	Intergenic	novelGene_70021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	352	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1653	2186	801530	802766	FALSE	40	ATTAAAGTTGGGTTCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLQNAHQQKLAEITRRHREELSDYEERIEELENLLQQGGSGTGITDHSKIHEMQKTIQILQTEKVESTKKMEELENRVKDISKKLSSVENDREVLRREQELLNVEKRQIIEECESLKLECSKLQSDAVKQRDTVTEEERILPQSTSVEEEVFRLQQALSGIKCLELISDWCFIAY	799877	803784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_801648_802350
923536	contig_11720_pilon	+	1492	11	Intergenic	novelGene_43781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2297.89230382975	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	149	1210	68064	98482	FALSE	20	TACTTGAGAATTTGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRRLGRRVQASGARSVGWVGVSTVSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67794	98764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67870_67990_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
923537	contig_3424_pilon	+	2267	2	Intergenic	novelGene_55462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAAAAGAACAAATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140680	149010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_142846_148908
923538	contig_8153_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_34815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1635	2057	158518	158940	NA	65	TCTTTACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQFVEETSYKCDFIQKIAKTLPDANIDFYSECKQERIKEYEMLFLVSNEEIHKQILMTIGLENLCENPYFSNLRQNMKDLILLLATVASSVPSFKHFGFYCSNPGQNNEIHNQSLPQEIVRHCMVQARLLAYRTGELYS	156883	159442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_+_156900_159400
923539	contig_7095_pilon	+	1997	1	Intergenic	novelGene_166460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTACCCTTCTCCCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473550	475547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_+_473600_475500
923540	contig_854_pilon	+	3596	13	Intergenic	novelGene_36628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3495.1456206748	4	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	551	2035	1694500	1714457	TRUE	10	GCTACATGCGTGTGTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERA	1693949	1716401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704531_1714452_1714480_1714862
923541	contig_10958_pilon	+	2074	5	Intergenic	novelGene_5421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	8	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	34	744	888255	895766	TRUE	40	TCATATCTAAAACTAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRGQIWALLIKSVIEVRPWMFLAGHLLPDASFLSVPGFKHGLPQEGKLTSRRGRPHVSLRNNYFPRRAFELFCSFLLFFIFFLKMYNHDRNLILCCFSVKEKYTHKAVTPPVKFCCCLVLAN	888221	901699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893946_895402_895855_900457
923542	contig_12841_pilon	-	2917	4	Intergenic	novelGene_55844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	52	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	87	1277	233087	218526	FALSE	45	CAAGATAGAGATAGATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWKREQKWETTWETVAEAQEIVKDTIMEKKSQESKKGPTHREVPPAVVLLLAMALMNALLYLCLDRFFISRLHSTVDPSHCPFGSFRMGQMKNCSPWLSCEELRTEVRQLKRVGEGAVKRVSQCFVLHHRQHARGLAFQVFLSEWKERKVALSRLTGLEMKDDFLHGLQMLKSLQGKHVVTLLGYCEDDNTILTEYHPLGSLSNLEATLNLSKYQHVNTWQNRLQLAMDYVGIINYLHSSPLGTLVMCDSNDLPKTLSQYLLTSNFSIVANDLDALPLVNHSSRTFVKCGHRELHGDFVAPEQLWPYGEDLPFHDDLMPSYDEKIDIWRIPDVTSFLLGHVVGSDMVRFHLFDIHKACKSKTPAERPTAQDVLDVYQKVLNSLRDTVTTQTREML	238670	216885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12841_pilon_-_219297_226339_226700_233027_233121_238617
923543	contig_9727_pilon	-	2749	2	Intergenic	novelGene_86286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAAAATTTTTTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148976	145290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_147234_148170
923544	contig_6873_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_129836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1494	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	124	372	586906	587154	NA	50	AAAAAAACCCACTGCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWEKFFGYYKSNKGLISKIYRKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKDIQAANRHMRKCPRSLAIREMQIKTTTRYHLTSALLVRNLKKKKKKQKIINVGEAVGRLECKMITTILENDMMLP	586782	588555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_586800_588600
923545	contig_5686_pilon	-	1028	2	Intergenic	novelGene_45346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTATCCATTTATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120530	119445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_119550_119606
923546	contig_6325_pilon	-	3257	3	Intergenic	novelGene_143346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	232	junction_1	30.5	43	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1808	2245	125756	116356	FALSE	20	TAGTTTATATTGCCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAGVFSLVTLLLLEVKRNSYFYSVTRQLNKTPFIHLIMK	127563	115343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_116635_118233_118341_125704
923547	scaffold_880_pilon	+	2549	2	Intergenic	novelGene_121426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	236	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2060	2464	404140	404544	FALSE	85	CATAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVPVCLHLCPHLLLSIFLATAILMGGKWYLIVVLIYVSLMANRILPFYPHIFLLFLELNKDNTAGDEGAQLMLAAITFSRASRFVALHCKGPPRAGLCSRCSLPFLCPFTHHPESWEGEMIVLLGSGAHPFGP	401880	404629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_402177_402376
923548	contig_20452_pilon	-	2832	2	Intergenic	novelGene_167300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATAGTAATAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47765	44887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20452_pilon_-_47104_47149
923551	contig_13901_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_146670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCAGTCCTCTCTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278277	280119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_+_278300_280100
923552	contig_17572_pilon	+	3083	1	Intergenic	novelGene_178425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	134	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATTAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12279	15362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17572_pilon_+_12300_15400
923553	contig_4531_pilon	+	5392	22	Intergenic	novelGene_47942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	151.452843218016	17	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	1989	3152	737526	750148	TRUE	30	GATGTGGCCACTCAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSQALKVRGMVVEECHLPGLGVALTLDHTKNEAFEDGVSDLVCFVSGLLLGTNAKVRTWFGTFIRNGQQRKRENSSSVLWQMRRQLLLELMGILPTVRSTRIVEEADVEMEPNVSVYSGLKEEHVVKASALLRLYCALMGIAGLKPTEEEAEQLLQLMTSRPPATPAGVRFVSLSFCMLLAFSTLVSTPEQEQLMVVWLSWMIKEEAYFESTSGVSASFGEMLLLVAMYFHSNQLSAIIDLVCSTLGMKIVIKPSSLSRMKTIFTQEIFTEQVVTAHAVRVPVTSNLSANITGFLPIHCIYQLLRSRSFTKHKVSIKDWIYRQLCETSTPLHPQLLPLIDVYINSVLTPASKSNPEATNQPVTEQEILNVFQGVIGVKLVVLYIF	727767	773537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_729322_729945_730085_732806_732903_733741_733856_737440_737565_737988_738163_739844_740072_741751_741878_745249_745322_745408_745524_747221_747291_748460_748596_749941_750992_758281_758387_761007_761173_762183_762386_764958_765085_769749_769949_771220_771473_771814_771923_772078_772185_773403
923554	scaffold_13505_pilon	+	1267	4	Intergenic	novelGene_111559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	79.4774601171091	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAACAAACAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608567	634281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608977_609105_609537_610121_634040
923555	contig_3956_pilon	+	2606	3	Intergenic	novelGene_14703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	437	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGCAATTCAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31997	47415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_32258_32381_33172_45859
923556	contig_7056_pilon	-	2144	10	Intergenic	novelGene_43658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	740	junction_4	951.861152858434	2	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1403	2002	725838	723226	TRUE	45	ACATTTTTTTAAGAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	730010	722492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_728561_728706_728906
923558	contig_13894_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_62077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAGAAAGAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421397	419887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_419900_421400
923559	contig_12479_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_56833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	142	474	120527	120195	NA	40	GAAACATCATGACACGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPRSEKENILQPPGDEQSGVESVSFGPRILALRSSWTQETESRNTDDSGMQWQTNSIRRDQERLERLARDGAVGFPSHRARKLSVFGLRLTGGAECLWALIGRAKRVF	120668	119240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_119200_120700
923560	contig_17144_pilon	-	2964	18	Intergenic	novelGene_29465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.25036233754	17	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	328	2676	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
923561	contig_610_pilon	+	2032	7	Intergenic	novelGene_76842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_2	215.989968902879	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	109	1053	350131	375649	FALSE	20	ATGTGTGTATATTACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRYTDDCALGPFSTKSQKTLSYIFSPTLWTPLLFLLMAAPPSPSSVSAELRTSGEEAVPTEVIGTLGGFMTLPLNISVGTEIEHVAWNGPQKTLALASPAGAVIILDKSYQSRLSISSQSYSLNISKLTPKDEGLYRAQINRKNSNITIEERFVLHIYGPSRSMKHWIILFLITVVLLCFGFSGWCIWKQKRQCSAPAFNSSQVEAPADLSGCKKLDTPPKTARQWPRTRSNNSSDSNLTTEEDKETTEMQEPVSGRDMVYDLGLQEDTASNGQAEYDLVTPNNTVPESVAEVNTVYAQVFFNSKGKTPVPQKKDSSYTVYCSVQKPQLEGPPPQQNDESPEISPYENFS	350022	376628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_350135_360719_361083_368139_368245_369603_369658_373435_373717_374082_374155_375583
923562	contig_2894_pilon	-	1279	1	Intergenic	novelGene_86538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221816	220537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_220500_221800
923563	contig_935_pilon	-	2260	4	Intergenic	novelGene_45587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_3	175.583471760743	1	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2217	44	2260	630665	623410	FALSE	45	GAGATGTTACAAAAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQNDEPPVVLRADNFRRRRRMKPRSTAASLSSMELIPIEFVLPTSHRNSKTPETALLHVAGHGNVEQMKAQVWLRALETSVAADFYHRFGPDHFLLLYQKKGQWYEIYDRYQVVQTLDCLRYWKVLRRSPGQIHVVQRHAPSEETLAFQRQLTALIGYDVTDISNVHDDELEFTRRRLVTPRMAEVAGRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLSKKIANNCIFLVIHRSTTSQTIKVSADDTPDTILQSFFTKMAKKKSLMDIPESQSEQDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHLVLDTPPDPALDEVRKEEWPLVDDCTGVTGYHEQLTIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFGIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSGKASAETPSSESKGKLQLLYYVNLLLIDHRFLLRHGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNYCHPIALPKHRPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKYPKAYPKLFSSVKWGQQETVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVI	632998	623409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_623566_623677_623744_628670_630678_632967
923564	contig_10511_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_126913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAAAAAAAAAAACAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630377	627943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_627900_630400
923565	contig_6109_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_160390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCTGGACAGAGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628920	626797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_-_626800_628900
923566	contig_8377_pilon	-	3556	3	Intergenic	novelGene_35148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCAGTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198242	191683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_194521_196079_196217_197660
923567	contig_2294_pilon	+	1989	2	Intergenic	novelGene_179064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	943	1320	3329	3706	TRUE	25	AGGTTTTCAATGGCTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLVPNPLAVTENKEHQRHKESTGPRERMGHINQRLLQSYTRRTRWCPATSNERPDMEHNRGSLIEQYNDGMQNSNSSKKTRLNGLTKTGGTPESMAPGLSITPELKQFLRSTLQTGIGLDCGT	2386	18188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2294_pilon_+_4325_18137
923569	contig_9828_pilon	+	2912	19	Intergenic	novelGene_172253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	7.14769236696988	51	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	399	1700	187821	202758	TRUE	20	CTATTTATCGCTATTGTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITNIPETELLQSPTTKVKLECNPTAHVYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKIKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLHEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGGGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPGWPEDPRQRARLTGAQVGDLVHSELPGDAHDQEQSRDSGPEGGSAEGLLPLLVQCQQLRQRGGGDGGCGRR	183155	206046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_183194_183843_184030_187419_187524_187750_187830_188282_188337_189477_189562_189789_189891_190022_190153_191117_191274_192169_192242_192833_192921_193609_193748_195921_196054_199517_199628_200728_200844_202644_202769_203713_203817_204268_204373_205051
923570	SIRV6	+	753	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	30	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44445	4	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10267	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
923571	contig_15866_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_63666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGCCCCCAGACACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598636	596640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_-_596600_598600
923572	contig_12605_pilon	+	1197	5	Intergenic	novelGene_64194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	483	713	1195	5632	6234	FALSE	15	TAGAGAGGGGTGTGGGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCLMSAWSCEPCFYGPWDKVQSFCIFLPFSSDPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSS	3874	6236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5552_6005_6124
923573	contig_16125_pilon	-	1218	9	Intergenic	novelGene_155251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1052.4469033519	2	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	266	301	155583	151876	TRUE	30	GTAATTAGAATGTTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKIY	235870	138906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151440_151883_155554_155618_179440_179598_235796
923574	contig_17572_pilon	+	2078	2	Intergenic	novelGene_178422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	891	1328	9511	9948	FALSE	10	TTGTTGGTATTTGGTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLFIHSSVDGHLGCFQSFATVNNAAVNNAAMNIDVHMSIRVMTLIFLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKHHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQALQHLLFPEFLILASNARVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLFAI	8219	10698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17572_pilon_+_8984_9384
923575	contig_12008_pilon	+	1387	8	Intergenic	novelGene_25002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	529.504735867511	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	34	474	23677	34028	TRUE	35	GTAAACTATGCACATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKM	23643	39723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34021_34146_34559_34721_39002_39215_39300
923576	contig_1637_pilon	+	4020	1	Intergenic	novelGene_142395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTGAAGACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744536	748556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1637_pilon_+_744500_748600
923577	contig_6270_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_99878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	833	1147	1055962	1056276	NA	30	CATCACTTTAACAGTCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTEFSTARWCPATTTDCSDQDHNTGFLIELEKDVEHNSNSQKKKTRFTGLKETGEAPRVCPPRHPFSSVVKLSPRFTVQPGSGQPLKPNGTNEVQ	1055129	1056709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1055100_1056700
923578	contig_6914_pilon	+	3608	2	Intergenic	novelGene_151720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	180	767	69975	70562	TRUE	10	AACCTTTTGGCCTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIKKTISAIHHINKTEDKNHMILSVNAEKAFDKVQHSFMIKTLNKIGIEGKFLSIIKGIYTKPTANIIVNGETLKTFPLRVGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAVRLEKERKGIQIGREEVKVPLFADDTILYTENPKESTRKLLELIDFCKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENLEEEITKSVLFTIPPKR	69795	73486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_+_72696_72778
923579	contig_5279_pilon	+	1057	5	Intergenic	novelGene_105555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAATGTTTCCTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292808	335763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_292898_322492_322654_330136_330285_332947_333071_335227
923580	contig_4832_pilon	+	2353	15	Intergenic	novelGene_163414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	10	junction_13	54.1119399099342	5	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	357	1766	497716	507115	TRUE	70	AGAGAGGAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQTSSEIVRTMLRISEITTPSSAPFTQPLSSNEIFRSLPVGYNVSKQVLDQYLTLLADDPLEFVGKSGDSGGGMYVINLHKALASLATATLESVVQERFGSRCARIFRLVLQKKHLEQKQVEDFAMIPAKEAKDMLYKMLSENFISLQEIPKTPDHAPSRTFYLYTVNILSAARMLLHRCYKSIANLIERRQFETKESKLPVQKRNSYKK	495935	510397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282_502388_502517_502611_503917_503999_504248_504301_504658_504720_505180_505332_506088_506191_506558_506609_507078_507177_509871
923582	contig_5779_pilon	+	2859	2	Intergenic	novelGene_106418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCTTAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55258	156547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_56989_155418
923583	contig_13021_pilon	+	2213	13	Intergenic	novelGene_8181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	2564.14754624005	36	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	166	1527	174676	180467	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQA	174510	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180126_180461
923584	contig_9363_pilon	-	2355	1	Intergenic	novelGene_6498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCCTTATCCATTGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405637	403282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_403300_405600
923585	contig_4232_pilon	-	706	2	Intergenic	novelGene_63373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACGGGGAAAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467398_467592
923586	contig_9633_pilon	+	3261	8	Intergenic	novelGene_139614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	675	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGGGAAGCTCCGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	640018	658803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_642094_643582_643715_644257_644380_646135_646202_646567_646720_649759_649879_654540_654816_658483
923587	contig_4232_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_63363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGCAGGAGGAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
923589	contig_10549_pilon	-	2474	1	Intergenic	novelGene_110601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGCATACAACGGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148541	146067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_146100_148500
923590	contig_3525_pilon	-	3276	1	Intergenic	novelGene_135147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	2276	2665	638283	637894	NA	65	ATGGGGAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPRCSDISLSVLLPHSATVLRNRQLNSTVLGSVLRERGCPQGLLTTCRSCGLDSRATVLDEDWWRFLSHTRKHLAPDHRNPQLGEERDVTALLPSAGTQRPRPPLFTDPFSALARQLLCTLSYAAPGT	640558	637282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_-_637300_640600
923591	contig_8712_pilon	+	1821	3	Intergenic	novelGene_58817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	761	junction_2	326.5	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	81	401	315133	321793	FALSE	40	TTTCTGCTTTTAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	315052	323213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684
923592	contig_15732_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_88884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCATTAACATGTCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204086	206406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_204100_206400
923593	contig_8027_pilon	-	3130	3	Intergenic	novelGene_158856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	42	62	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500742	489878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_490670_491734_493887_500555
923594	contig_5967_pilon	+	3304	1	Intergenic	novelGene_44416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCTCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467432	470736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_467400_470700
923595	contig_3601_pilon	-	3336	2	Intergenic	novelGene_132974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCGAACGTAGCTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155181	1151800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_1154269_1154313
923596	contig_5816_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_158247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCCCTTTCCAGAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212258	213926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_+_212300_213900
923597	contig_678_pilon	-	2188	1	Intergenic	novelGene_167806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	187	564	853	1416	88628	88065	NA	65	TACACAGATGATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAPLTITCSDSLEKFLLPVPVTLCSAGLEVIVLKAEMLPPGDTILIPLNSKLRMPPSHFGLFMPLDQQAKKGVTVLAHVIDPDCEGEIGLILHNRGKEEYVLNTGDPIGRLFLLPCPVIKVIGKLQQPNSDMTATGPDPSGMKVWVTPTGKEPRPAEMLFEGKGNTEWVMEECGSKYKLHHCDQL	89480	87292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_87300_89500
923598	contig_10377_pilon	+	1428	7	Intergenic	novelGene_115390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	52.0269695019377	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAGAACTTAAAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209112	257236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_220708_220952_227487_227752_252484_252616_255017_255169_256866
923599	contig_7396_pilon	-	2119	16	Intergenic	novelGene_79588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3391.27004069108	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	100	1416	255163	246452	FALSE	30	GAAAGTCCATTGTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNRSCEAVCRC	257086	245748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247182_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_248932_248997_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
923600	contig_2264_pilon	-	590	1	Intergenic	novelGene_177843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24428	23838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2264_pilon_-_23800_24400
923601	contig_19098_pilon	+	3779	2	Intergenic	novelGene_65842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGTAGACTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405705	409693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_406954_407162
923602	contig_7894_pilon	-	987	2	Intergenic	novelGene_170782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	233	616	245920	193438	FALSE	45	GTTTACTATGGTGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDRRRIDAFELWCWQRILNIPIHYCYKKEQICLGRSTARMLLRSKDGERLHLTYFGYVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKTGRPSMRRTDTEAAKMDSSTAMIMRIVQDQAVFHSVVHRVAMHWN	246152	193066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_193766_245864
923603	contig_11906_pilon	-	2569	7	Intergenic	novelGene_178674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	38.5634397958596	5	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	170	508	160192	144448	TRUE	35	TGAGACTTATTAAAGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAEARPAQEAQGVKSPRDQGTKKQKQKRQGAWKASCLSLKERCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCTTIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKS	190504	84145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11906_pilon_-_85256_100065_100175_143605_144453_153703_153890_158514_158641_160170_160239_190381
923605	contig_16776_pilon	+	2629	3	Intergenic	novelGene_130495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	969	2066	37116	38213	TRUE	20	TGAAGAGTGTGCCTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSREKWKQVLFQRKPGFNRGVRQRQRQSQQCKEEWGREIQSPQKRKKEKQIERGRWERGPQKIARIEDFSKVSVYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTITPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIMKMSILPKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNLIWKGKRPRINKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTVTVVKTAWYWYNNRHIDQWNRMENPDISSSTYEQLIFDKGPKSINCGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKLKMVKIMEEKIGITLGALIHGINTIPTISKNAQAPEETLGKCELLKIKH	34363	39725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35273_37056_38427_39375
923606	contig_10962_pilon	-	6570	42	Intergenic	novelGene_103885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	288	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	5134	5868	359078	332119	TRUE	15	AGCTCCTCGGTCCCTTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPATELEAAAPWGVSSVRAAEELTVSWLLSGSAIFSCRRASAAPLLPRPEPRRLVLAQEPVVFWRVLRLKLGSSAGGDSLRFLVDFLKLANLACNPEGPGFDVSDLEDPGRDSFVLGRLTLGLKRAAQSNFEEPPVLLCSFSLLLLLGLGLDAERERLALFWSFPCFTLAPGGTVEEAEATAEDEEEVDAAEESVMVLHPALAEAADFEASLVGFADLSSAPVDSDTEPLFIQELSVLFLF	412724	274016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_274104_311716_311865_330863_330990_331777_332580_349883_349988_353010_353148_359045_359130_360525_360624_363978_364126_367075_367114_367199_367294_368181_368276_368468_368630_370198_370268_370357_370524_373251_373371_373497_373654_375832_375907_377158_377388_377697_377819_380496_380702_383698_383799_384041_384217_385569_385708_386639_386835_388074_388225_390865_391039_391446_391520_391600_391803_392234_392363_393690_393842_394534_394677_396322_396482_397805_397903_401833_401949_402635_402792_403810_403972_407187_407358_408898_409013_410807_410900_411423_411529_412209
923607	contig_7744_pilon	-	4482	15	Intergenic	novelGene_62482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_10	19.2789670736938	45	118	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	102	2012	666802	660291	FALSE	25	TTCTTAAACTGATTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDMNAAVSTSAPFLPTSGTSMVTSTFSSVDYVIFVLLLALSLAIGLYHAFRGWGRHTIGQLLMADRKMGCFPVALSLLATFQSAVALLGVPSEIYRFGTQYWFLGCSYFLGLLIPAHIFIPVFYRLHLTSAYEYLELRFNKAVRVCGTVTFILQMVIYMGIVLYAPSLALNAVTGFDLWLSVLTLGIVCAVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGHVWEVASQHGRISGIELDPDPFMRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYAVFPCQQVTLCMGCLIGLVMFTYYQEYPMSTQQTQAAPDQFVLYFVMDVLKGLPGLPGLFIACLFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEYSEAWATRLSKIIAFGYGLLCLGMAYISSQMGPVLQAAFSIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAIVGLVAGLIMAFWIGIGSIVSSMGSSVASSPSNGSSFSLPSNLTAVTMTTLMPLTTLSKPTGLLRLYSLSYMWYSAHNSTTVIVVGLIVSLLTGGMRGRTLNPRTIYPVLPKLLALLPLSWQKQLPCKSYSQDLPTDTAVFSEKTSNGILWGSGDKKEEDRSSHKGSSPTFTLQETSL	666903	657820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_660432_660854_660971_661211_661316_661492_661675_661829_661917_662285_662354_662710_662824_663262_663352_663903_664034_664219_664361_664732_664888_665228_665297_665701_665754_666089_666156_666403
923608	contig_15047_pilon	+	1417	6	Intergenic	novelGene_52127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	7	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	656	778	4573	21020	FALSE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRQAPTPCGISTPPCPGPAAGSPASSPSATWTTRSSCGSTATPRIRERSRGRRGSSGRGRSIGTSRHGESRGHVCGVAPQVPGERERDAAARRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRFFRW	2164	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2551_2761_3433_3498_4158_4434_4552_4681_21005
923609	contig_1309_pilon	+	1494	2	Intergenic	novelGene_73980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	618	932	261954	262268	FALSE	40	TAAAATGTCAATTCTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIIAAFWILLRIALWPKMWSVLENVPCALEKNVYFAVVGWSVLYMSMRSNWLTVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTEGGVLKSPTIIVELSVSLFSGC	261260	262830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_261808_261883
923610	contig_6102_pilon	+	4379	7	Intergenic	novelGene_32212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	136	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGTTTAAAAAAACCGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	894898	904342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_895017_895470_895591_895808_895940_896211_896363_896629_896706_896888_896974_900644
923611	contig_8964_pilon	-	2204	2	Intergenic	novelGene_168700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	22	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541853	539473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_540278_540453
923612	contig_12915_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_148354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTTTTCAGTGACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136996	135637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12915_pilon_-_135600_137000
923613	contig_17935_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_170595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGCTAAATAATGGATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43554	44488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_+_43600_44500
923615	contig_15286_pilon	-	1115	3	Intergenic	novelGene_124437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTACCTGTGTGTCATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15455	10012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_-_10933_11417_11528_15370
923616	contig_17144_pilon	-	1600	10	Intergenic	novelGene_29205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1654.09004487156	35	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	46	1386	172736	166282	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSQ	173170	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166287_166466_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
923617	contig_9415_pilon	-	2339	2	Intergenic	novelGene_109909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTCTAGTACTCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2113891	2111498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2112306_2112359
923618	contig_854_pilon	+	2396	9	Intergenic	novelGene_36673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3022.22115907738	3	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	18	971	1710001	1714980	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNEKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1699278	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712338_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
923619	contig_20614_pilon	+	2232	4	Intergenic	novelGene_107604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	518	junction_3	77.5986826921408	30	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	86	1021	451169	482946	FALSE	40	AATAAAATTGCTTGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDASGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPAGGGSSNGSSGSSSGGGSGSGAVDHSMQRSFSQVPLPSFSPSAASPQAPALQVKVPPTTVPTPPRATPVLQPRPQPQPQPQAQLQQQTVMITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSSQVQPVAIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPVRAACPPASSRLLSRGARPWEGHRVSVC	451083	484157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_451257_480201_480634_481636_481819_482712
923620	contig_14526_pilon	+	1586	4	Intergenic	novelGene_111205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	20.4178571081514	22	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	48	368	228114	280793	FALSE	15	GAGTTGTGGCATGGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGANCAAPALRPLPAMAACRSALLVGLAFSLATLLQRGFGDTGDFRLEDALQETSSVKQRQLTPSHLLQMKMNKTIKPRSAVIRCLYSLKISHCQQKSAFLAWTIRYQLHKQETGKIKTSS	228066	282011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14526_pilon_+_228181_269734_269798_278896_278966_280671
923621	contig_8063_pilon	-	2396	2	Intergenic	novelGene_152448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1270	1599	993205	992876	TRUE	60	AAGAAAAGGAAAATCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKIHNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISGTEDKLLDTTLFQENSEKRTNKNEETLRVTWDTIKSKNLRVIGIPERGENRKHREDH	994474	861847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_861967_992197
923622	contig_953_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_130023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610221	608707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_-_608700_610200
923623	contig_16667_pilon	-	2439	1	Intergenic	novelGene_153255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	933	1238	73657	73352	NA	30	GCCTTCACCTGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHTSLVFKQGTFNPGGHPHCPPPPGPRHREGDVMKVNSSSGEPLNRASQLVLSPRHPVSQSLHLPPFSLILKQKGSPGCCLQFLSTGTLLTNKPSQFVY	74589	72150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_-_72200_74600
923624	contig_10122_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_177145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGTGATTGTTTCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34622	36759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10122_pilon_+_34600_36800
923625	contig_3727_pilon	-	3376	2	Intergenic	novelGene_146760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCTGAAAAAAATCCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410796	406779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3727_pilon_-_410041_410681
923626	contig_16125_pilon	-	1335	5	Intergenic	novelGene_155275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1184.15378540965	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	498	836	1333	236037	153018	FALSE	25	TATGAGTTACATTTTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGKEGKMRNRRVKEKPMKT	236982	153015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_153054_155553_155618_179440_179598_235796_236652_236761
923628	contig_9269_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_177816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCTAGCTGTACTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	983	282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9269_pilon_-_300_1000
923629	contig_7272_pilon	+	3245	10	Intergenic	novelGene_25276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	6.14636297152859	30	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	261	1757	118596	276172	FALSE	60	AAAAAAAAAAAGTACTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPLRVSVFFVLCIWIQSSAHGQSLGPEPSLRSSQDVETKETVQETKTRFLLFDEAGKACQIRLHHPNTLRECHFNASLPLVMVIHGWSVDGVLETWIRQLVAALKSGLSQPVNVGLVDWITLAHQHYVIAVRNTRLVGREVATLLQWLEVSVRFSRSNVHLIGYSLGAHVSGFAGSYIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGTPPSDRLSPDDANFVDAIHTFTRQHMGLSMGIKEPVAHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYKHIAKYGLNAITQTIKCAHERSVHLFIDSLLHSRLQNTAYLCRDMDVFSQGLCLRCKKGRCNTLGYHIRQDPQTKSRKLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQFINQIEKPIEPTFSMSLLGAKEEMQNIPITLGGGITSNKTYSFLITLDLDIGELIMINFKWENSAVWANIWNMVQIIIPWGTEPRYSGLLLKTIKVKAGETQQRMTFCSENTEDLLLHPTREKIFVRCKVNSKKLKQKIR	118126	277660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_118340_118548_118681_244721_244907_248037_248221_248753_248872_252077_252312_256007_256251_270874_270993_273514_273734_276060
923630	contig_854_pilon	+	2313	7	Intergenic	novelGene_36258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2727.65049488057	13	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	99	677	543600	562402	TRUE	30	TATGACCTCATCGCTGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543501	564693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563059
923631	contig_10159_pilon	+	2519	6	Intergenic	novelGene_30853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	86.2173996360363	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	390	1058	748193	791979	TRUE	15	CTACCAGGTCTTTTATGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPAAALAAALLSSLARCSLLESGDPVASALSPYFGTKTRYEDVNPGLLPNPEAPWRDPELLEGTCTPVQLVAVIRHGTRYPTAKQIRKLRQLHELLQARGPWGGRASATSGRDVGAVLADRPLWYADWMDGQLVEKGRQDMRQLALRLASLFPTLFCRENFGRLRLVTSSKHRCVDSGVAFLQGLWQHYNPGLTPPDVADMECGPPRINDKLMRFFDNCKKFLTEVERNATALYHVEAFKTGPEMQDILKKVAATLQVPINDLNADLIQVAFFTCSFDLAIKGIKSPWCDVFDIDDAKVLEYLNDLKQYWKRGYGYTINSRSSCILFEDIFQHLDKAVEQKQRGETSGVS	747803	800024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_748407_751627_751826_758416_758515_765027_765162_791954_792025_798608
923632	contig_5499_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_57037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGAATTATCAGTACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586481	1583932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1583900_1586500
923633	contig_14225_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_52758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1110	1538	418680	418252	NA	50	AGCAGAGGTAGAACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLSKDMEDLNATVNQLDLIDIHRTLHPTTAKYSFFSKERGTFSRIDHILGHKASLNRIQNIEILQSIFSDHKAIKVQMNNIKSKEKKIKYVETEQHQAQKLRGYRRN	419789	417727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_417700_419800
923635	contig_8710_pilon	-	2903	3	Intergenic	novelGene_73524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGCAGCAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553271	388473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_-_390678_550536_550601_552636
923636	contig_3335_pilon	+	4305	1	Intergenic	novelGene_165005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	237	714	355	1068	395629	396342	NA	35	GCACCCAGCAACAGCGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRSFSQKIHLSAHQRTHTGEKPYKCNECGRSFSQKKHLSTHQRIHTGEKPYECKECGKTFSQKTHLIIHQRVHTGEKPYECKGCGKTFADNSSLRVHQRIHKGERPYECNECGKTFYMKGNLITHMRLHTGEKPYECKECGKSFSRKDHFTAHQRIHTGEKPYKCNECGRSFSSETYLSNHHRIHTGEKPYECNECGKSFSHRANLSTHQRIHTGEKPYECNECGKAFARNDSLIAHQRIHTGEKPYECNECGRAFSVKSYLISHQRIHTGEKPYECNVCGKAFAQNSNLRVHQRIHTGEKSYECNECGKTFCQKPGLRIHQRIHTWEKPYECNGCGKTSDNSTLRNHWQIHMG	395274	399579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3335_pilon_+_395300_399600
923637	contig_18055_pilon	-	2342	3	Intergenic	novelGene_117832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTGAAAAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85628	81335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_-_83468_84603_84757_85571
923638	contig_6871_pilon	+	1899	1	Intergenic	novelGene_21595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGACCAGATTTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353247	355146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_353200_355100
923640	SIRV5	+	1993	16	FSM	SIRV5A	SIRV505	2029	16	2	34	2	-32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAGACCTCAGTGGTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002	10957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV5_+_1150_1987_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
923641	contig_5935_pilon	-	3101	5	Intergenic	novelGene_102674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	6.75925291729789	34	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	846	2541	16	2556	639483	628753	FALSE	15	GCCATCCACTTGGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKLYTFSTSSGSQDREALSREIMFLITQVKDHLQVQSFPNLDGKSYVPESFKSSLDKLLLHEQVDFQKILETFSQHHTSVCEVFENTCGNNKNKPKDTGICITALKTETKNTDTVSTTEDKPHFQKGMAMPSSQMARNGQEKLRGTGRKNWIHSDAFHVSQDEDTETETEPPGPSNGRGAVLNTSLNDSQSSSSWSKLSGFSSSTSWEEVNYVDDWSDGKESNKEYLVDTQCSTALSDELGNNGENSAVHSLSSDIHDLSFQVSRFGNAESSQRPQHKHMPLTTFTPHNTTGTFSTSGAEPLEGAPVDIQEVRNIGPRNASAHSRPSCHSAFSSSSDCPLAQVEKTFEKITETNCSAENRHGEEKREEINKRGTGPIFKNSSSWIDPEGETAESTEDVPLNSPVVMDDSLDNGSMMAGSSFTPCWPGQNHDLRNGDGSTKEQDIDPDAPTEDEEGQLLDSTDVHSTSRHGSHRPCALRPSLGQGAKTPNSSVSSNIPFPVPSKDCTTTEEGNEPGNILNCSQNSSSSSVWWSRSSVFSSGSSEGDSPWSYLNSSGSSFVSLPGKTRQEVLEARTLEPDDFEKLLAGVRHDWLFQRLENTGVFKPSQLHRAYNALLLKYSKKSELWTAQETAVYFGDYLNVKKKGKQRKAFWVHYLHQEETLGRYVGKDYKEQKGLWHHFTDVERQMTAQHYVTEFNKRLYEQKIPTQIFYIPSVILLILEDKTIKGCVSVEPYMLGEFVKLSNNTRVVKTEYKATEYGLAYGHFSYEFSKHRDVVVDLQGWVTGDGKGLIYLTDPQIHSVDQKDATTNFGKRGIFYFFNHQHVECNEICHRLSLTRPSIEKLSKS	639498	628207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_628953_630092_630280_631455_631619_634881_635036_637646
923642	contig_9333_pilon	+	2627	2	Intergenic	novelGene_120345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTAAAAGTGAGGATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561691	587826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_563877_587384
923643	contig_15434_pilon	+	3288	2	Intergenic	novelGene_56716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	68222	68768	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEGAGGEALGPSGTNKDAKGSQRPPKSHRLPSGCSYGLSEEVTAGVAFFPLSPGAGSSGAWPEVLASLRSSSPEVRLPLTAASPRRFARPVNTSAQRSGLVCLPAFRPEPDSWRISSRFQRLRIREHGIYIIW	68219	71652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_68398_68542
923644	contig_602_pilon	-	2637	1	Intergenic	novelGene_134944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGTTCGAGAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334713	332076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_-_332100_334700
923645	contig_2636_pilon	-	3750	1	Intergenic	novelGene_52046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAACGGTTAAGCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39166	35416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_35400_39200
923646	contig_8487_pilon	+	4634	4	Intergenic	novelGene_111921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACACTCATATGCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284536	295038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_+_288610_292249_292348_293644_293770_294700
923647	contig_16951_pilon	-	3487	1	Intergenic	novelGene_98665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	156	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120081	116594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_116600_120100
923649	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
923650	contig_6842_pilon	+	1132	3	Intergenic	novelGene_130690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	11	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369298	370996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_369488_370015_370591_370628
923651	contig_9389_pilon	-	2389	2	Intergenic	novelGene_84015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	21	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1039	1401	549611	549249	FALSE	20	TATAGGTTCGCTATGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYKRQSLVILISKGHSGCTSSKTDLFILLAVQGVFNILLRHHNSKVSILLRSSLFIVQLSDAYEAIQNTMAWVKPTFVLKVTSLLFNSLKGSFAAHLPNAICHLIS	551820	548260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_550479_551649
923652	contig_14925_pilon	-	7280	4	Intergenic	novelGene_55283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1014.14178276785	310	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	5070	5426	116065	115709	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGRWYLVSRNWGLSGGKGSWRCKLWTSVSIWYHAGNKT	123547	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_118879_121291
923653	contig_13206_pilon	+	2371	2	Intergenic	novelGene_161893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97675	106615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_99070_105638
923654	contig_6630_pilon	-	667	1	Intergenic	novelGene_30738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACATGTAAGGTGCTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809423	808756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6630_pilon_-_808800_809400
923655	contig_7446_pilon	-	2496	1	Intergenic	novelGene_101951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAAAAAAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197672	195176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_195200_197700
923656	contig_12586_pilon	-	1192	1	Intergenic	novelGene_121810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGCGCCGTCGCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71418	70226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12586_pilon_-_70200_71400
923657	contig_6059_pilon	-	1506	12	Intergenic	novelGene_44842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5648.5928387388	4	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	85	1086	576110	569638	TRUE	25	CGTGCACATGATGTTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKLYGGLTPFI	576194	567795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_567966_568173_568245_569144_569239_569552_569668_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080
923658	contig_17274_pilon	+	2523	1	Intergenic	novelGene_26521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAACTCTATATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125222	127745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_125200_127700
923659	contig_4782_pilon	-	2284	1	Intergenic	novelGene_73616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161586	159302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161600
923660	contig_13206_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_161916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTAGCTATATAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243250	245214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_243200_245200
923662	contig_9233_pilon	-	2142	1	Intergenic	novelGene_78262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738036	735894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_735900_738000
923663	contig_1443_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_28338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785287	787601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_785300_787600
923664	contig_2892_pilon	+	3276	2	Intergenic	novelGene_119023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8903	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTGACCTTGGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273197	289264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_276262_289052
923665	contig_5779_pilon	+	5438	4	Intergenic	novelGene_106480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	181	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	3638	4234	308674	309270	TRUE	30	GTCGATGGAATGGAATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRHFTKEDVQAANRHMRKCLRSLHIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKYTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIEPFWKMIWRFLRKPEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRAITQIDICIPILMAALFTIAKRWKQPRCPSVDEWINQLWYLHTKEYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEDVMLSEISQSQKDKYCIRPLL	150848	310602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_152245_278101_279263_307593_310189_310316
923666	contig_15838_pilon	-	2657	5	Intergenic	novelGene_174348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	7.79422863405995	36	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	11	343	365651	357367	TRUE	40	CTTCAAGATACAAATGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVWMGKIPVVLQARGTLTLQVSGMMQGELVQSAGDLQLPSCTSENHKGFNCSAWCVDQTIRLPPDCLAALLPILLIEVASWAQGGHSFRLPEAGAMTCQDPCDHSEAARSCQT	365661	336902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_336912_354927_355079_355212_357416_360702_360936_365600
923667	contig_14643_pilon	-	4480	8	Intergenic	novelGene_99115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	499	junction_3	115.714991179507	603	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	2160	3020	34696	27111	FALSE	10	GAACTTTTTGTCCTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIQQNVADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETVKLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ	42934	25650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_27249_28761_28858_29238_29452_29640_29798_34352_34442_34528_35409_40986_41117_41617
923668	contig_11512_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_43393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	540	1377	1916	589655	590194	NA	5	GTGAGGGTGTGCGGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTLNFQPKSIPAVVKVFIGLIYSGFLYATALSGERSTHACRHFTQAIAIMGCPQALKTDNGPAYTSAKFQQFCATWNILHSTGIPYNPQGQAIIERAHHTLKQLLNKQKGGDDWSRVCDQNERLAKDLFIFNFLSVAKDGRTAAERHFIPSDTRPHPQVLYKDPQNPSVWQGPAELLTW	588278	590196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_588300_590200
923669	contig_11855_pilon	+	3657	19	Intergenic	novelGene_66882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	85.2144172871014	352	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2392	2910	676574	682543	FALSE	75	GCACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDGYDSCSEDTSSSSSSEESEEEVAPLPSNLPIIKNNGQVYTYPDGKSGMATCEMCGMVGVRDAFYSKTKRFCSVSCSRSYSSNSKKASILARLQGKPPTKKAKVLQKQPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSMEGFSWGNYINSNSFIAAPVTCFKHVSIEFLTFLF	603174	683290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_603314_604753_604793_606127_606269_614545_614723_625359_625483_629834_629927_630147_630247_634456_634632_634731_634860_636450_636533_639783_639857_641062_641162_642782_642905_644540_645331_646208_646273_676525_676728_679840_679975_681245_681361_682427
923670	contig_15849_pilon	-	2368	5	Intergenic	novelGene_176061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	435	1932	2366	108882	89879	FALSE	25	AGGTCATGAGTGACTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRSLFFGPKLFHSRSLEVRTCWFSDCFQLCELLLSEDFFLFLGKDYLVAFLLTSWRSCHLICQQGLSILSSSSGSPKLSSSFKKQATPLLEYLSCIWLQLFGEVQVSHGHTQGLQQQCKDQDEHAGLPRAGARGARDSRGHSL	111255	89876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_-_90017_97050_97190_106572_106680_108831_109197_109638
923671	contig_6929_pilon	+	1181	7	Intergenic	novelGene_139392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_5	4216.04002260679	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	403	783	127176	130939	TRUE	5	TGCCTTTGTGTATCTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPRRRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRRPYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	102626	132315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_102668_123375_123410_126552_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
923672	contig_11117_pilon	+	3006	1	Intergenic	novelGene_148595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	167	478	88797	89108	NA	20	GTGAGGATGGCTTAACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTKGLIDHNFHETEFNTTKWCQATTTDCSDSDHNRRSQTELEKNVEQNPNSQKMTSLTGLTDTGENSKSISPEHPFSSVMEPLLRFTLQPKIRQDHKTKQD	88630	91636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_88600_91600
923673	contig_7748_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_101059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCATCGAGTCGATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179398	181359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7748_pilon_+_179400_181400
923674	contig_9180_pilon	+	4886	6	Intergenic	novelGene_109126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	110	junction_5	18.3521115951271	86	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	955	2868	145	3012	497512	504167	FALSE	20	TGATCGATTATTACCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKDVISVQLEDTTSSKNFCSQSCLSSYEEKRKSFVTICSNNKILTKCSMCQKTTVIQYEVKYQNVKHSLCSNTCFLKFHSANNLVMNCCENCGIYCYTSCSSFHILQMEGQSQYFNRLKSVTAYKQKPARVLPSVIFKSVKPSDEIIETTNDFGKTELFCSINCFSAYSKAKMESSTVNVPMVQEASTELPSPKKDTTPVISNIVSLADPHSDLSIVNSDVLQGTASPVTRNVIADISKSSPSESSSDVANRSVEEPSLLPSSSVVSQHTIGCDMEVQKDKVSSQDPAYNMKINDDGLCHPKFTSKVQKVKGKSQSIKKSWCSNPYLEHSAKKDVTFCYSCQLFCQKILSCGGESFTTQGISNWKKTLEKFRKHEKSEMHLKSLKFWREYQFCDEAINDNLSIHSKKIEENKNYLKFIIENILFLGKQCLPFRGNDQSVSSINKGNFLELLEIRAKDKGEGIFRQMNSQVDFYNSSKIQTEIIEIIKTEMLQDIVNEINVSSAFSVICDETTDSATKEQLSVCVRYPQKTSKAILIKERFLGFIDTEGITGTNLHGIIKTYLEQIGVDLKKIRGQAYDSTVNLRGKFNKIAAEFKKEEPRALYIHCYAHFLDLAVIRFCKEVKELRSTLSILSTLFNTVHTSEEMLADFQNICKLSQNKTCKKHSSQSCWTVHDRALLSVIEGLPEIIETLEVISSHSSNINLTDELSNLLTLVSKFEFIFCIKFLYRVLSVTGILSEELQSETMDIFSLTSKIETIFECLSSERNDVCFKTVWDGAEEICKKITCKGFEVEKPSLQKRRKIQKIIDHSNSDSMFFPTSTEEQYKINIYYQGLDTILQNLKLYFSEFDYCKIKQISELLFKWNEPLNEATARHVQEFYKLDADIIPELRFYRHYAKLNFVMDYDSVNFINLGYLFIQHGLHSNIPGISQLLHIALSWPVSSASANSSFSVLPRLKTYLCHTMGQERCSDMALMAIEQELVNKLMEPERLSGIVEKFINQMKEI	497367	506041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_497533_497622_497836_499540_499695_501002_501141_501311_501350_501863
923675	contig_3900_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_84169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCAATAAAGTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150954	149606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_149600_151000
923676	contig_10196_pilon	+	2840	19	Intergenic	novelGene_132253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	19.3452230362172	94	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	561	1686	458	2143	1889615	1895745	FALSE	10	TTTCTAGTCCCCACGTTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIDADLRRGGEHLLLFTQELAAAYTRYLKGETPPSSQACCACRLRPNVGRCYICRRRRRNKEPVYRYSEIFNLVSSFISQAEKETPKTSAIMLLGAVREIALHKDPALRWENMGTTESLKLAVPLLMARMTQLLQRTLVLGDLPQPLCQKFTRFFQAVPLPPYCFGFTNCLNVAPWDHRLLTTVLRGQNITGPRRRSGKKEFLWEVFAVVRARVERLEGLGQYRELVRYLKAVKCEDSVGLRDLRDKVPFYLCKCGDFTGAAYALLSPVNTLACCTACRLTPAHFESYLKMLWTGGVPAGNDIQDTGHWTVSVGVAVKPWILMKQALRMLFGNQALYQNARCWSALLALWGSSPVLEQSGLLTMLTLQAPSFSFQKKVLRASDAILQELRLHGNATLPADLFFGPLGLEACLLLCTQAAREMLVTEFPWLTSLLDIVLAFGKNLWALKVFLEGVSKTPAIYEVIGMISRDLSYQKYTLLRLWQILGPDYVGELLCLLLGFRSIDLQTVGVLLTRLMVENLSQCPWAKSLDLHRLKALQTPHLDPTHLLQLGALVSALENV	1885190	1896442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1885317_1886096_1886214_1888788_1888883_1889494_1889646_1889722_1889892_1890714_1890841_1890953_1891017_1891650_1891774_1892187_1892344_1892786_1892841_1892983_1893205_1893465_1893543_1893679_1893791_1894286_1894374_1894657_1894766_1894868_1894988_1895234_1895358_1895511_1895552_1895667
923677	contig_15087_pilon	-	1799	11	Intergenic	novelGene_37125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	477.244130398688	3	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	16	588	58968	41778	TRUE	10	TTCCATGACTGGTGCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKKLLMSSSNKEGASRQPDSPKMEGTGKKVTQATVIAGKLPEVGVLGAAEKKVKMLEQQRTELLEVNKQWDQHFRSMKQQYEQKITELRQKLTDLQKQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPHE	58983	33324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41789_42982_43047_49137_49267_52532_52665_52917_52984_54478_54572_58890
923678	contig_9516_pilon	-	2327	10	Intergenic	novelGene_106184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_8	116.688992572797	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	278	1150	898344	883534	FALSE	60	AAAAAAAACTTATCTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPPLSKELWFSDDPNVTKTLRFRQWNGKERSIYFQPPSFYVSAQDLPHIENGGVAVLTGKKVVQLDVRGNMVKLNDGSQITYEKCLIATGGTPRSLSAIDRAGAEVKNRTTLFRKIGDFRTLEKISREVKSITIIGGGFLGSELACALGRKAQAFGTEVIQLFPEKGNMGKILPEYLSNWTMEKVRREGVKVMPNAIVQSVGVSGGKLLIKLKDGRKVETDHIVAAVGLEPNVELAKTGGLEIDSDFGGFRVNAELQARSNIWVVSVNKSAQWCAKAYPQLNQIGEKCL	913225	882356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_883753_884205_884295_884626_884735_888747_888857_889790_889868_890736_890822_896966_897058_898249_898381_899602_899703_913084
923679	contig_3602_pilon	-	2290	1	Intergenic	novelGene_60544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	3	404	276264	275863	NA	40	GTGCTTTTTATATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRLQPPGLGPFPPGLCHLVGLTPPRPPVVGRNAAGKDGKERLGGSVLEQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKVSLCPEDTPLPAPGPSGTDSNRAALCCLSGLIVSPFQSPCLLYSHAPTSRTFRGA	276266	273976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_274000_276300
923680	contig_2093_pilon	-	3414	1	Intergenic	novelGene_152939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCACCCTTTTCATCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	961178	957764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_957800_961200
923681	contig_3900_pilon	+	2257	2	Intergenic	novelGene_84175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1858	2175	192348	192665	FALSE	50	ACATAGGGAATAAGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKNTEYIMDCQKKEQIYLGKSTARMLIRRMTRLCLTYSGHVIRRDQFLEKDIMLGKVEGQRKPGRPSKRWTDTVAATMGSSIPTIVRMVQDWAAVLLYIGSL	189212	192747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_190823_192100
923682	contig_10371_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_175487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTCTTTACCAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774603	776859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_774600_776900
923683	contig_15955_pilon	-	2424	3	Intergenic	novelGene_179065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	43	573	116559	115911	TRUE	45	TTTTAAAGAGATGGAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIHLQKMKQGPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKLGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTEWEKSFGQYKSAKGLMSIIYKKVQHLYKKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRAAGRSEHLCTAGGNAK	116601	113494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15955_pilon_-_113802_114366_115964_116081
923684	contig_10958_pilon	+	1635	5	Intergenic	novelGene_5396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	5	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	95	490	888255	895837	TRUE	20	CCGCTTGATTGCACTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLRVVGRQPLKLTLGLGTCASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRRDPFCIWLTLSCIPP	888160	901585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_893946_895788_895855_900457
923685	contig_16064_pilon	-	2590	5	Intergenic	novelGene_179002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_1	19.2142525225417	52	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	94	570	17575	9949	FALSE	20	CCCCGCAGCCCCTCCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDLPDASAFSTKLKNTLIQYHSIEDDKWRVAKKTKDVTVWRKPSEEFSGYLYKAQGVIDDIVNSVIDHIRPGPCRLDWDSLMTSLDILEHFEENCCVMRYTTAGQLWNIISPREFVDFSYTVGYKEGLLSCGKNLKTLYFLVWFKYLSFLGSMFLST	23159	7928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16064_pilon_-_10144_10785_10913_16454_16505_17470_17584_23074
923686	contig_710_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_162944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGTGAACCATAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267964	266575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_710_pilon_-_266600_268000
923687	contig_7548_pilon	-	2051	5	Intergenic	novelGene_117630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1615	1989	198428	192843	FALSE	40	AAGAAGCGCGAAGATATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGQEFLLLWSLDFLRVEEVGVLGAVHQDLGPVPVLGTPRAVPPGRLMATLPLQRGALTACVAHGGVCGDTGEAGRALTPGKGTGTGDSQNERVTRTLGNGFRRSGYHTPSARVRGRKPTRTR	207776	192780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_-_193180_198390_198556_203275_203320_206056_206109_206385
923688	contig_9177_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_32794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAGAAGAAGTAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497340	1499639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1497300_1499600
923689	contig_19032_pilon	+	2095	8	Intergenic	novelGene_172539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1649	2032	159243	160649	FALSE	50	AAAATTAAATTCAACTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKVFSFYFCFLLCSLLIVFIFWANYNSFSLEACKQAHFLNKLPKTLWGSLQQCVQFSSICHLLLKTCHHHFIHNGVRPKNVVFTRIFCCVFSNPGSFSGSWQANHHYNFTIFLLFRPLWSSDSIL	156177	160712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159362_159656_159746_160163_160284_160593
923690	contig_15146_pilon	-	539	1	Intergenic	novelGene_116946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGGTTAGCAGTCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396960	396421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_396400_397000
923691	contig_4876_pilon	-	2014	1	Intergenic	novelGene_137876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTCCCAAAAAACAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10673	8659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_8700_10700
923692	contig_7843_pilon	-	2339	2	Intergenic	novelGene_152005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGATCATATGAAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262228	146536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_146544_259896
923693	contig_6191_pilon	+	1603	1	Intergenic	novelGene_107832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGATGGTGAAATTAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103759	105362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_+_103800_105400
923694	contig_15720_pilon	-	2511	2	Intergenic	novelGene_41964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1088	1543	307437	306982	TRUE	45	AAAAGAATTATCTATGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	308524	305610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305947_306349
923695	contig_9011_pilon	-	5213	1	Intergenic	novelGene_159302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGCCATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445955	440742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_440700_446000
923696	contig_17500_pilon	-	1265	1	Intergenic	novelGene_157912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGCCATCCGCTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69261	67996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_68000_69300
923697	contig_3787_pilon	-	3831	3	Intergenic	novelGene_102407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2677	2979	544333	544031	FALSE	30	AGTATAGCCCCCAGACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISGSSPIGLNKSKASPLTCLTAFPRKCSHIQFNCQRGQTHASVHPFHPQKKGSCKGTELQHPHPTWARTKKTLNAWCSVQPKQGEATRLTSQLHPELS	548637	543178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_546736_548009_548190_548543
923698	contig_6031_pilon	-	1395	6	Intergenic	novelGene_56760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	826.744797383086	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	19	894	257660	254965	FALSE	15	GAGTTGCCCTGATGACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQVMDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257678	254463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255619_255774_255868_256163_256375_256704_256814_257469
923699	contig_21006_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_177724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGTGAGAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33152	30469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_30500_33200
923700	contig_1575_pilon	+	1651	17	Intergenic	novelGene_45170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	349.171245370735	1	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1521	130	1650	130657	190544	FALSE	30	GTAATGCCATTTCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREQAAALRRRPASRSSPEASGALPRAPRVARFQKLPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVTSILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWRKYISQFKNPLIMLLLASAVISVIMHQFDDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVICGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGQHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLR	82149	190545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_82237_130614_130726_132061_132179_143827_143918_146198_146235_149575_149638_150137_150247_166978_167135_167818_167888_169082_169159_171861_171929_180348_180474_181358_181457_183390_183487_183574_183665_185018_185124_190388
923701	contig_3155_pilon	+	1888	4	Intergenic	novelGene_26404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1054.77401476441	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	247	573	259780	261211	FALSE	45	AATAAAGTGATGAAGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258120	262526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258200_259209_259329_259731_259978_261082
923702	contig_10861_pilon	+	1415	1	Intergenic	novelGene_39237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603083	604498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603100_604500
923703	contig_12080_pilon	+	5460	27	Intergenic	novelGene_128340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1323	71	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	3055	3504	107843	108292	TRUE	5	CCCCGCGCCTACGCCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	45131	164276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_45892_46201_47139_54876_54963_56918_57058_57181_57346_57913_58044_58758_58891_58991_59217_59435_59539_59881_59977_62609_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109686_110390_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113013_113191_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118140_118502_118606_120731_120885_164134
923704	contig_9649_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_160683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTGATTTCACTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_+_500_2200
923705	contig_19579_pilon	-	1608	2	Intergenic	novelGene_59402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATTAAATATTTTTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13304	7773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_12012
923706	contig_9843_pilon	+	3379	5	Intergenic	novelGene_114308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1922	2500	9508	10086	TRUE	15	ACCAGGGCTTCATGCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFILLGSIINAQRSSSQEIKRIIFGTCAAKDLFKVKKKNKDITLRTKVQLTQAMVFLIASYACESCTMSKEDGRRINASELSCWRRILNMPWTARRTKKSVVEEVPERSLETRMVRLCLTYFGHVNKREQSLEKGIMLGRVESQRKRGSLSVRWIDTVAATTGSNIATIVRMVQDWAVFRSVVHGVAMSRN	7586	195062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_10108_71917_72670_125896_125906_148993_149056_195027
923707	contig_13300_pilon	-	3023	9	Intergenic	novelGene_125799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24.7130405858931	42	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1448	2035	240127	239060	FALSE	30	CAAAAACTTGGTTCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFGKVEDQPKERDLAWDKTVKRREAKNLPHPTTSPACPGYRTVAENGSPGAESGPSLGFFPGPANKEAVWVAKHGACRGTCQPSLRATALSVEMKISLSRGVSLAHLSAGSAQASGCPAPRTGEREEDLAACATGPLCRWPGSLPFSQHPRGLTCPKTEGGKEPGNPRSVPHPTPALYTQDKRLCLAFPAWTAS	248482	238071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_239615_240094_240268_241234_241338_242243_242458_244230_244442_246913_247029_247267_247440_247837_247919_248071
923708	contig_14508_pilon	+	4242	3	Intergenic	novelGene_79067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	240	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	850	1728	154069	159230	FALSE	25	CAATTAAGACCTTCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSTRNLLELIERVSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTIPISIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPHTKTNSKWIKDLNIKPKTIKFIEENIGSTLEALIHGINRI	146306	161744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_+_146914_153826_154824_159106
923709	contig_7230_pilon	+	2798	1	Intergenic	novelGene_52561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159573	162371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_159600_162400
923710	contig_9195_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_155664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	291	593	4588	4890	NA	10	CTCCTCGGTGTCCACTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGGQREPTEAPWPALAHARLLSQEGLPPPLRVLVARDALTGPMKPSSPVLVNGLSETGAPPAVSGTVCTEQGGGVRLRAGPHACTMCFRWPVSTWGLI	4297	5387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_4300_5400
923711	contig_6102_pilon	-	2081	1	Intergenic	novelGene_31911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1518	1826	375796	375488	NA	40	AAGGGAGAGAGTTGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWECCGYAQGSPFTHPQNSNSQADPGPDPDRQLRWQPLGALVERRLPDSTVEPREVVVAARPWSPQSPTLPSTSFPHRQLPVSHVGYLLQFFCIWQKRQPF	377313	375232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_375200_377300
923712	contig_610_pilon	-	2119	1	Intergenic	novelGene_76775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	277	768	232794	232303	NA	50	TCAGCCAATAGGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKSTRKLLELMGEFSTVAGYKVNKQKSTGFLYTSNEESEREIREITPFTIASKRIKYLGTNLTRDVKDLYNENYKTLLKENKENLKKWKDVSCSRTGRLNIVKMSMQPKPIYRDNTITIKILTDFLTEMEKQIINFIWNGKRPQIAKAMLKEKERSRRTCIS	233070	230951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_231000_233100
923713	contig_177_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_41776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	34	105	232	336	272860	272756	NA	45	ACCCAGCAGAGAAGTAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRDWSLLITCPKYVRRSLTILTSKEHFGCTSSKTDLFVLLAVHGIFNILHQHHNSKASTLLWSFLFIVQLSHTRENTMAWVRSSLVLKVTSLLFNTLKRSFAVDLPMQYVI	273091	271142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_271100_273100
923714	contig_7635_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_171355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAACAAGAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353	637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_+_400_600
923715	contig_14686_pilon	-	3859	2	Intergenic	novelGene_88057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	666	1019	14174	13821	TRUE	30	TTTTACTTACTCAGGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICLGDFLLRSILYGVCGASVSFSSFMILGKFSVGSSSMILSVFSVFSSCSGTLILCKFLLLIVSHIILRVSSFFLILFSDFSSNRVVSKCLSSISLILSSTVFRPASQPFRDTVHF	14839	10913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14686_pilon_-_13748_13814
923716	contig_17274_pilon	+	2875	6	Intergenic	novelGene_26587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAATACAACAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240138	259035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_240178_243020_243105_246141_246310_246873_247034_251738_254032_258904
923717	contig_678_pilon	-	2821	1	Intergenic	novelGene_167810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACAGCCCTCAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115695	112874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_112900_115700
923718	contig_567_pilon	-	3570	2	Intergenic	novelGene_33949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGGGGATAATTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277474	273537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_274073_274439
923719	contig_1335_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_166516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCAGTTCCACTCTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467784	467142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_467100_467800
923721	contig_21412_pilon	-	1120	1	Intergenic	novelGene_142856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43998	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_42900_44000
923722	contig_17796_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_33778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCATCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31069	29332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_29300_31100
923723	contig_11948_pilon	-	1544	2	Intergenic	novelGene_174383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141590	134311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11948_pilon_-_134641_140375
923724	contig_998_pilon	-	2398	1	Intergenic	novelGene_153794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATGGAAAAAAAAAAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332830	330432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_998_pilon_-_330400_332800
923725	contig_13571_pilon	+	2416	2	Intergenic	novelGene_128099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAAATTGTACTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5485	7943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_5952_5993
923726	contig_11825_pilon	-	1191	1	Intergenic	novelGene_155400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTAAGAGCAAGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25589	24398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_24400_25600
923727	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
923728	SIRV7	-	1801	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	11	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	45	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAAGCGTAATTAGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114727	1012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3036_43028_43078_114680
923729	contig_610_pilon	-	3243	2	Intergenic	novelGene_76777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3076	junction_1	0	764	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	74	466	252557	234991	FALSE	45	ATCCAGAAGTAAACCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRPGLLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGE	252630	232213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_235302_252475
923730	contig_13201_pilon	-	2702	2	Intergenic	novelGene_130871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATAAGTGGTAACTTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47567	43510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13201_pilon_-_43988_45342
923731	contig_15929_pilon	+	2334	3	Intergenic	novelGene_172468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	67	44	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTATTTAGGGGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82739	86768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15929_pilon_+_83764_84212_84489_85734
923732	contig_13021_pilon	-	3706	11	Intergenic	novelGene_8162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	143	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2626	3042	178197	177223	TRUE	0	GGTGCCGGCCGCCTCCCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSIRRISFHPSPHHDTHPQSEECCGLHSVLVHQCLYECNLSGSLQQAVLLLLAKLHSTSEFAYQVLSDPQFSLFGVQSPYQAFYLLHQGQGRLFFSGWFSHTLKNLLVFQVLRYRFPHLSPNHVFAVLWELHHRCK	181149	174507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174720_175989_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177791_178170_178281_178521_178584_178669
923733	contig_10446_pilon	+	4881	19	Intergenic	novelGene_162433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGAATTATCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143885	233784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_146526_148887_148949_157703_157751_172873_172914_173063_173182_181197_181260_187599_187739_188326_188642_190513_190651_198634_198780_199734_199838_200515_200672_204439_204666_213505_213612_213757_213931_218318_218393_228941_229082_229181_229246_233649
923734	contig_6509_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_145655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGCCACCTGCTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187233	189553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_187200_189600
923735	contig_9839_pilon	+	1797	2	Intergenic	novelGene_88577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGCCGGAACCCAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292025	331160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_293683_331020
923736	contig_14814_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_137756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1363	1692	412760	413089	NA	15	TGGCTGGTGGGGTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSEATEDLYCMRLEFWALVVLAELLHVLSPLSGILCRGGGGDSGLGKLTSGGGEAYPWQRDWFRNGPMIPPMDEDGFAQTFESLSSLTRLEGKMKGTESQLSPDWKGR	411397	413747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_411400_413700
923737	contig_12677_pilon	-	797	1	Intergenic	novelGene_110678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801	4	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_800
923738	contig_3956_pilon	+	2158	10	Intergenic	novelGene_14989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1071.9867789861	116	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	659	1639	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284182_1287475_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
923739	contig_8671_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_126254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAACAATACAAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	476642	478199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_476600_478200
923740	contig_16775_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_107808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	30	93	210	302	243261	243169	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIVHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDWSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKEDWRNPESMAPRHPFSSEVKLPPRFTVQPGSGQPRKTK	243470	241735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_241700_243500
923741	contig_7744_pilon	-	2685	15	Intergenic	novelGene_62483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_10	19.2789670736938	45	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	2	1852	666742	660291	FALSE	10	TCTGGGCTCCTATACTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTSTFSSVDYVIFVLLLALSLAIGLYHAFRGWGRHTIGQLLMADRKMGCFPVALSLLATFQSAVALLGVPSEIYRFGTQYWFLGCSYFLGLLIPAHIFIPVFYRLHLTSAYEYLELRFNKAVRVCGTVTFILQMVIYMGIVLYAPSLALNAVTGFDLWLSVLTLGIVCAVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGHVWEVASQHGRISGIELDPDPFMRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYAVFPCQQVTLCMGCLIGLVMFTYYQEYPMSTQQTQAAPDQFVLYFVMDVLKGLPGLPGLFIACLFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEYSEAWATRLSKIIAFGYGLLCLGMAYISSQMGPVLQAAFSIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAIVGLVAGLIMAFWIGIGSIVSSMGSSVASSPSNGSSFSLPSNLTAVTMTTLMPLTTLSKPTGLLRLYSLSYMWYSAHNSTTVIVVGLIVSLLTGGMRGRTLNPRTIYPVLPKLLALLPLSWQKQLPCKSYSQDLPTDTAVFSEKTSNGILWGSGDKKEEDRSSHKGSSPTFTLQETSL	666743	659457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_-_660432_660854_660971_661211_661316_661492_661675_661829_661917_662285_662354_662710_662824_663262_663352_663903_664034_664219_664361_664732_664888_665228_665297_665701_665754_666089_666156_666403
923742	contig_935_pilon	-	4077	1	Intergenic	novelGene_45569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTCACCAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602139	598062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_598100_602100
923743	contig_4418_pilon	-	4006	1	Intergenic	novelGene_98378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCAGCTAAGAAGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813534	809528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_809500_813500
923745	contig_12000_pilon	+	1157	1	Intergenic	novelGene_43176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGCCTTGAGCAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467476	468633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_467500_468600
923746	contig_20641_pilon	+	1247	7	Intergenic	novelGene_52827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1323.65881807461	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	591	1247	41548	56717	FALSE	15	GTCGGCTATGGCACTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLL	14537	56717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38649_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
923747	contig_4315_pilon	-	2106	8	Intergenic	novelGene_46794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	261.442544513384	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	177	1037	339053	328146	FALSE	25	CTCCCAAAACATCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCTMCPQDLPQPKQLLSGPPKPPPSQLRRTGTPSS	341019	327076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333536_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964_339142_340931
923748	contig_11855_pilon	-	2066	12	Intergenic	novelGene_66969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2064.55676310901	29	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	514	1428	1087425	1079453	TRUE	20	ACAGACTTGATTGTCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKG	1102128	1077290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1077736_1079259_1079454_1082881_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736_1091804_1101936
923749	contig_17299_pilon	-	1079	4	Intergenic	novelGene_177179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.471404520791032	22	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	95	643	32119	27133	FALSE	20	TTTATGAGGTATTTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVAVEEVAVNFTQEEWALLDLSQRQLYRDVMMEIFRSLASVASQNLIDGDKLSTENTILRFMKNDTWSSIVGEIFELLVTEDQDNNQKTHVSMLPVFNRRRMLENLCESNEDNHCGQTFSQIPDLSLLKTPMEAYPSECLECGKSLVNHSSLKQHIKSHSGCSAYQCKEYGEARSCPFYLSTAVRTLTGEKSYEYLFNPCHTEHSPACPVKC	32213	26696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17299_pilon_-_27189_28507_28816_30793_30945_32085
923751	contig_6479_pilon	+	2115	2	Intergenic	novelGene_160618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCAGATTTACTGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614582	628177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_614689_626168
923752	contig_20527_pilon	+	3374	5	Intergenic	novelGene_138611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1209.9168101568	27	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1350	1883	23734	27453	FALSE	45	AAAATAATGACCATGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	22384	28944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_23740_24925_25023_25434_25614_26238_26346_27308
923753	contig_13097_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_107683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAACAAAAACAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103335	101752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_101800_103300
923754	contig_2730_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_135397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTCTCTACTGATATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430991	433395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_431000_433400
923755	contig_4782_pilon	-	3256	3	Intergenic	novelGene_73590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161821	616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_1319_123516_123547_159297
923756	contig_16205_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_156887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATAAAATTAGCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104474	105906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_104500_105900
923757	contig_5569_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_86724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTCAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162688	164405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_162700_164400
923758	contig_3956_pilon	+	1681	10	Intergenic	novelGene_15159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1531.40420513533	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	116	1162	1284838	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281652	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282751_1284807_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287491_1289833_1289892_1290297
923759	contig_6946_pilon	-	1142	2	Intergenic	novelGene_59769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398494	391724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_392088_397715
923760	contig_854_pilon	+	2181	15	Intergenic	novelGene_36675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4155.50574293814	10	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	165	1994	1705343	1714919	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSLQAWGPALCRAPPNGPERCR	1699278	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1704899_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714855_1714974_1716274
923761	contig_9653_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_48324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCATTCCACCCAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030860	1028220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1028200_1030900
923762	contig_11493_pilon	+	6317	3	Intergenic	novelGene_143689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	403	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGAGTGCCACTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192516	199600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_197080_197522_199105_199428
923763	contig_13021_pilon	+	2707	1	Intergenic	novelGene_8103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATTAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102820	105527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_102800_105500
923764	contig_6879_pilon	+	2939	4	Intergenic	novelGene_178595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	468	866	274549	275549	TRUE	25	TGAGCGACTGACCCTGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVLLFLLLLVSRLPLAASPSFCSGAWLQAPSLPFPAGLWGYVRVCGSFRVWSAARTRDWGLCSFAPLLPGAAGSGPRAAGCLESARRGGRLLGCRLWAAGVAFFFSFFFSPFFLFLLLLDSHLPLTASPLL	274081	312717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6879_pilon_+_274868_275469_275843_291567_292914_312283
923765	contig_5916_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_158070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTGGAGAGGAGTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768676	769690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_+_768700_769700
923766	contig_2069_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_23571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGCTGAAGAAAAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2280274	2281440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2280300_2281400
923767	contig_10753_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_105146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATTATGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326128	324750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_324800_326100
923768	contig_7070_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_104052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196436	199018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_196400_199000
923769	contig_5084_pilon	+	2724	23	Intergenic	novelGene_64655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	194.393552634302	38	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	687	2064	203	2266	1470689	1485961	TRUE	10	GAGGTCTGTGTTGCCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSQGGRRLIYKADRFLAEAFSPAPSRAILRTIRAPQTSAPAPVPSFLPSSWPPCLLKPHQRGTFGAMSLLNPVLLPPKVKAYLSQGERFIKWDDETTVASPVILRVDPKGYYLYWTYQSKEMEFLDITSIRDTRFGKFAKIPKSQKLRDVFNMDFPDNNFLLKTLTVVSGPDMVDLTFHNFVSYKENVGKDWAEDVLALVKHPLMTNAPRSTFLDKILVKLKMQLNPEGKIPVKNFFQLFPADRKRVESALSACHLPKGKNDAINPEDFPESVYKSFLMSLCPRPEIDEIFTSYHAKAKPYMTKEHLTKFINQKQRDPRLNSLLFPPAQPDQVQGLIDKYEPSGINVQRGQLSPEGMVWFLCGPENSVLAQDKLLLHQDMTQPLNHYFINSSHNTYLTGSQFSGLSSAEMYRQVLLSGCRCVELDCWKGKPPDEEPIITHGFTMTTDIFFKEAIEAIAESAFKTSPYPVILSFENHVDSPRQQAKMAEYCRTMFGDTLLTEPLEKFPLKPGTPLPSPEDLRGKILIKNKKNQFSGPICPSKEPGEAEGSCPPKVSLGSKDTVWTGEEGAELEDEEVGEEEEEESGSLDEEEIKKMQSDEGTAGLEVTAYEEMSSLVNYIQPTKFISFEFASQKNRSYVISSFTELKAYDLLSKAAVQFVDYNKRQMSRIYPKGTRVDSSNYMPQMFWNVGCQMVALNFQTMDLPMQQNMALFEFNGQSGYLLKHEFMRLPDKQFNPFSVDRLDVVVATTLSIT	1470486	1487642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1470773_1474040_1474119_1474778_1474848_1475446_1475588_1475709_1475790_1475874_1475929_1476035_1476112_1480066_1480168_1480326_1480494_1480580_1480728_1480909_1481068_1481337_1481421_1481689_1481775_1482386_1482550_1482687_1482801_1482927_1483025_1484420_1484506_1484645_1484771_1485289_1485444_1485957_1486123_1486660_1486761_1487249_1487355_1487550
923770	contig_10930_pilon	-	3928	8	Intergenic	novelGene_36973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1846.20061040981	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	809	1327	276835	273918	TRUE	90	GAAAAGAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVISAQVKSLV	280341	267058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_274325_276723_277013_278443_278637_279302_279366_279406_279467_279700_279832_280157
923771	contig_5019_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_109171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTAGAACAAACTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29367	27268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_27300_29400
923772	contig_5586_pilon	-	3232	1	Intergenic	novelGene_143532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGCACCATTCAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305635	302403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_302400_305600
923773	contig_13093_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_105228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTAGCTATATGGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66292	63989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_-_64000_66300
923774	contig_7323_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_173207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAACAAAATAAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31913	33347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_+_31900_33300
923776	contig_15754_pilon	-	3501	4	Intergenic	novelGene_179066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	157	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	1315	2199	276213	275329	TRUE	65	GAGCAAGGAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKIVSQE	330995	235223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15754_pilon_-_235741_274543_276811_303145_303245_330377
923777	contig_1575_pilon	-	3586	1	Intergenic	novelGene_45164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	1446	1889	70659	70216	NA	25	TTTTAACCCTGGAAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSPFSMNLYIFSSFLSVFCFNSWIILNIGDSNSLSVRSSAFSSTGWSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQYLFSSFIDCRFVCFVLVFLFYLVMSEQAGCAFFVCSSVGTILFTSFSNGQCQSLRYGTAGQVQLKGSY	72104	68518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_68500_72100
923778	contig_1146_pilon	+	5588	34	Intergenic	novelGene_84826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	247	junction_31	211.417881602189	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1772	5319	114	5432	841846	904311	FALSE	20	AACGCTCCGATTGCTCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFLLSPGPERSVGGGRFGRRLALLRAAALGHVVSGKVMSRRAPGSRLSSGGGGGGTKYPRSWNDWQPRTDSASADPDNLKYSSSRDRGGSYGLQSSNSAVVSRQRHDDTRVHADIQNDEKGGYSVNGGSGENTYGRKSLGQELRVNNVTSPEFTSVQHGSRALANKDMRKSQERSMSYSDESRLSNLLRRITREDDRDRRLATVKQLKEFIQQPENKLVLVKQLDNILAAIHDVLNESSKLLQELRQEGACCLGLLCASLSYEAEKIFKWIFSKFSSSAKDEVKLLYLCATYKALETVGEKKAFSSVMQLVMTSLQSILENVDTPELLCKCVKCILLVARCYPHIFSTNFRDTVDILVGWHIDHTQKPSLTQQVSGWLQSLEPFWVADLAFSTTLLGQFLEDMEAYAEDLSHVASGESVDEDVPPPSVSLPKLAALLRVFSTVVRSIGERFSPIRGPPITEAYVTDVLYRVMRCVTAANQVFFSEAVLTAANECVGVLLGSLDPSMTVHCDMVITYGLDQLENCQTCGTDYIISVLNLLTLIVEQINTKLPSSFVEKLFIPSSKLLFLRYHKEKEVVAVAHAVYQAVLSLKNIPVLETAYKLILGEMTCALNNLLHSLQLPDACSEIKHEAFKNHVFNVDNAKFVVIFDLSALTTIGNAKNSLIGMWALSPTVFALLSKNLMIVHGDLAVHFPAIQYAVLYTLYSHCTRHDHFISSSLSSSSPSLFDGAVISTVTTATKKHFSIILNLLGILLKKDNLNQDTRKLLMTWALEVAVLMKKSETYAPLFSLPCFHKFCKGLLANTLVEDVNICLQACSSLHALSSSLPDDLLHRCVDVCRVQLVHSGTRIRQAFGKLLKSIPLDVVLSNNNHTEIQEISLALRSHMSKAPSNTFHPQDFSDVISFILYGNSHRTGKDNWLERLFYSCQRLDKRDQSTIPRNLLKTDAVLWQWAIWEAAQFTVLSKLRTPLGRAQDTFQTIEGIIRSLAAHTLNPDQDVSQWTAADNDEGHSSNQLRLVLLLQYLENLEKLMYNAYEGCANALTSPPKVIRTFFYTNRQTCQDWLTRIRLSIMRVGLLAGQPAVTVRHGFDLLTEMKTNNLSQGNELEVTIMMVVEALCELHCPEAIQGIAVWSSSIVGKNLLWINSVAQQAEGRFEKASVEYQEHLCALTGVDCCISGFDKSVLSLANSGRNSVSPKHSLNGESRKTVLSKPTDSSPEVINYLGNKACECYISIADWAAVQDWQNAIHDLKKSTSSTSLNLKADFNYIKSLSSFESGEFVECTEQLELLPGENINLLAVGSKEKIDMKKLLPNMLSPDPRELQKSIEVQLLRSSVCLATALNHIEQDQKWQSITENMVKYLKQTSRIAIGPLRLSTLTVSQSLPVLSTLQLYCSSALENTVSNRLSTEDCLIPLFSEALRSCKQHDVRPWMQALRYTMYQSQLLEKIKEQTVPIRSHLMELGLTAAKFARKRGNVSLATRLLAQCSEVQLGKTTTAQDLVQHFKKLSAQGRVDEKWGPELDIEKTKLLYTAGQSAHAMEMLSSCAISFCKSAKAEYAVAKSILTLAKWIQAEWKEISGQLKQVYRAQQQQNFTGLSTLSKNILALIELPTVNTVDVNTMEEVYPRIESESTVHIGVGEPDFILGLLYHLSSVQAPEVAKSWAALASWAYRWGRKVVDNASQGEGVRLLPREKSEVQNLLPDTITDEEKERIYGILGQAVCRPAGIQDEDITLQITESEDNEEDDMVDVIWRQLISSCPWLSELDESATEGVIKVWRKVVDRIFSLYKLSCSAYFTFLKLNAGQVGIAHCAV	841732	904467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_841938_865015_865174_865680_865837_868288_868426_869381_869441_870489_870704_871488_871615_872212_872286_873176_873275_874891_875066_876788_877014_879121_879224_879762_880033_881587_881719_881880_882043_882473_882593_886933_887022_887109_887212_887696_887838_888386_888587_889038_889236_889420_889586_890329_890485_892192_892336_892487_892690_894775_894886_895701_895850_896203_896364_897121_897243_900249_900499_900833_901134_902640_902786_902902_903042_904053
923779	contig_9706_pilon	+	965	1	Intergenic	novelGene_20881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTTCTCCCCTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2956	3921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_3900
923780	contig_10766_pilon	+	2938	2	Intergenic	novelGene_151182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	404	769	179965	180330	FALSE	35	GTGAAGTATGATATCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDTGSIKSRWKENIESLYRKELFDVQPFQEVTYDQEPMILKEEVQAVLKALVKNKAPGIEWIPIEIFQQTDAVLEVLTHLCQEIWKTAGRDQPTGSDPYLCPFQREVIQQNAEIIE	107682	182499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_107843_179721
923781	contig_1443_pilon	-	3291	1	Intergenic	novelGene_28376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTCAAGATTGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1023333	1020042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1020000_1023300
923782	contig_854_pilon	+	1606	4	Intergenic	novelGene_36725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3003.7370427889	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	318	584	1712393	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1711576	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
923783	contig_6227_pilon	-	3164	11	Intergenic	novelGene_49626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	292.545056358845	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	143	1420	395173	343524	TRUE	55	TACTCAATGTCAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTDGIYQGKQLFQCEEDCGVFVALDKLEIIEVDDTGLESDYAGPVDTMQVELPPLEINSRVSLKVGETLESGTVIFCDVLPGKESLGYFVGVDMDNPIGNWDGKFNGIQLCSFASVESTLLLHINDIIPVAEDPAKSLTELSPEFGHSSPPLQPPPMNSLSNENRFHSLPFSLTKMPNTNGSMGHSPLSLSVQSVMGELNNTPVQESPPVATSSGNSHGLEVGSLAEVKENPPFYGVIRWIGQPPGLNEVLAGLELEDECAGCTDGTFRGTRYFTCALKKALFVKLKSCRPDSRFASLQPVSNQIERCNSLAFGGYLSEVVEENTPPKMEKEGLEIMIGKKKGIQGHYNSCYLDSTLFCLFAFSSVLDTVLLRPKEKNDVEYYSETQGLLRTEIVNPLRIYGYVCATKIMKLRKILEKVEAASGFTSEEKDPEEFLNILFHHILRVEPLLKISPQAVPDMWRTCNVRMQRVL	395315	340081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_341551_342965_343183_343465_343585_349057_349125_349959_350052_352948_353072_354366_354509_355147_355314_356184_356565_392432_392539_395032
923784	contig_12871_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_140372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCAGATGCCTCCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21743	19676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12871_pilon_-_19700_21700
923785	contig_14807_pilon	+	572	4	Intergenic	novelGene_124691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	167	484	37320	38373	TRUE	25	CGTCAGACACCATGTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFSATMSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLSAPAQDNILLMRMTWKGWSRTRM	37153	38656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37648_38297_38438_38632
923786	contig_13014_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_169355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTATTACAAAGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416183	413729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_413700_416200
923787	contig_6433_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_162759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGCCATACTCTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181242	182836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_181200_182800
923788	contig_14472_pilon	-	4595	4	Intergenic	novelGene_111169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	125	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCCTGCACTGATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356824	308274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_309052_340542_341106_352218_352434_353784
923789	contig_6896_pilon	-	1336	3	Intergenic	novelGene_174225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	323	649	728562	728236	TRUE	10	CCCACTTCCCACTCTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEETIEQVQGAEKELEQVPIELWAKTSTDVGKVLSVEPIQVQIDTSKSLPRIAQYPLKPEAIAGLKHIIQDFLQQVLIIPCTSPCNTPIFPVKKKQIIEGGDLYKI	728884	530663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_530780_592305_592526_727884
923790	contig_6599_pilon	-	1095	2	Intergenic	novelGene_175974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAACTCACCTGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
923791	contig_13004_pilon	-	3062	1	Intergenic	novelGene_112751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATCTTTGGCTATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995842	992780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_992800_995800
923792	contig_5758_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_119089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCCTGGTCAGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167459	166823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_166800_167500
923793	contig_13528_pilon	+	1861	9	Intergenic	novelGene_66855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.105721313163	12	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	205	816	13921	28917	TRUE	20	CAAGTCATTTTTGAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQALNTLSTPEEKLAALCKKYADLLEESRNVQKQMKILQKKQAQIVKEKVHLQSEHSKAILARSKLESLCRELQRHNKTLKEENMQQAREEEERRKEATAHFQITLNEIQVQLEQHDVHNAKLRQENIELGEKLKKLIEQYALREEHIDKVFKHKELQQQLVDAKLQQTTQLIKFQPPHLASYGVESLLNHLDNVQIPSYVFC	12376	36496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13528_pilon_+_12561_13900_13993_21896_22068_25270_25466_27587_27672_28827_29292_32284_32378_34947_35044_36014
923794	contig_6217_pilon	-	1993	1	Intergenic	novelGene_109644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700768	698775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_698800_700800
923795	contig_4982_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_172236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGTACACCTGTAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77426	75553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4982_pilon_-_75600_77400
923796	contig_12074_pilon	+	2616	11	Intergenic	novelGene_53734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCCCTCCCACCTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9627	26161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_10509_12165_12250_14784_14883_15381_15525_16965_17586_21328_21458_21882_21944_23357_23422_24020_24215_25184_25328_25962
923797	contig_21007_pilon	+	819	1	Intergenic	novelGene_161542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	114	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	18	440	589	1011	NA	35	CTAGTAAGCAAGAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	571	1390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1400
923798	contig_17796_pilon	+	1411	10	Intergenic	novelGene_33818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	354.996713599812	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	210	1154	72417	110323	FALSE	15	TTGTCACCAGCTGTCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPPILSHSVSTAPVSTLANTVSPISNPSAVPTTPSSIPGYSPSTKQPPISGVLGLVIILVINNPAL	53885	110580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_54063_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96877_96987_97048_99617_99648_110237
923800	contig_3942_pilon	+	620	5	Intergenic	novelGene_128635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1766	junction_2	511.531279590994	13	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGGGCCCAAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176950	180119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179825_179974
923801	contig_7207_pilon	+	2148	4	Intergenic	novelGene_72056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628518	644909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_628782_637111_637293_639627_639721_643298
923802	contig_12977_pilon	-	3864	2	Intergenic	novelGene_122795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	408	767	29297	28938	TRUE	50	CAGAGTAAGAAACATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWYRSLEKLDIWDIFNLCLIGTSFVLILIKEIVHLLSFSLPRVCQLWIAHPKMCLNSLDELGNNIMPFHIHSLACRCMVFTLVYYPQANLSRREPPGPHQDVTSRAHREGTFYPLLLP	29704	21317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_-_21415_25937
923803	contig_13749_pilon	+	1602	1	Intergenic	novelGene_156338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACGCACACACCAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131461	133063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13749_pilon_+_131500_133100
923804	contig_5574_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_155852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCAAAGTGATGCTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160294	158941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_158900_160300
923805	contig_13542_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_131524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGATGGAACGATAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477728	478878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_477700_478900
923806	contig_9415_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_109736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAACATAGGGCGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556437	553824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_553800_556400
923807	contig_5586_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_143596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCCAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602412	598371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_599302_601569
923808	contig_7593_pilon	-	2440	1	Intergenic	novelGene_127351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644054	641614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_-_641600_644100
923809	contig_3270_pilon	-	12669	16	Intergenic	novelGene_104470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	216.679384242146	1344	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	914	2745	481	3225	209754	132578	FALSE	80	AGAAGAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMHQINPKLESQRVNKKVNNDASLRIHNLSILVRQIKLYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDVEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKAMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLAKTVEELRSTVDSVEGNASKILKIEKENQRLNKKVEILENEVIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKTEFEKRQIRKELEHYKEKGERSEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKMAQLQLENRELEGEKEQLKKGLELMKASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDATLEENNVKIGNLEKENKTLFKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREVNIFS	210586	123133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_133667_135020_135159_135710_135896_138789_138935_139534_139682_141823_141983_144391_144474_153843_154017_159819_159961_161450_161535_168757_168817_171132_171203_184907_185017_209492_209594_209691_210059_210410
923810	contig_11574_pilon	-	2054	2	Intergenic	novelGene_64111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	213	623	612950	612540	TRUE	30	ATCCAATCTATTATTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKLLVLNLPKEKLTPHLHHEIFLTYIHFLKIFYGTLDEGLQNSFSLNSEYTYCFMTLVNNPKTCQHSPFSTLEELFLVKIYVAKVTPFQNFLHVQLSDINYILLVVLLFSLSFSKSFHHHYLQNTATQASHQTL	613162	611050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_611616_611673
923811	contig_854_pilon	+	2775	16	Intergenic	novelGene_36557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2198.59784003856	8	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	73	1791	1656112	1715383	FALSE	25	TTTCCACTGAGCGTCACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1656039	1716367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685150_1704553_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706810_1715165
923812	contig_13021_pilon	+	3691	9	Intergenic	novelGene_8249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	327	635	206789	207097	TRUE	25	CTATATTTTGAGCAGCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLQCSGKRTVTSVSSVEQLDIRRGKEKKHNPNFTSHTETFVGGCRPKYECKLKSVLQDNNIGQYFMTSVKRFLDLGTENINQKGKDRQIKFSKILFIKRYH	206462	231625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_208237_209344_210559_211873_211936_212063_212127_213079_213169_215158_215269_218018_218302_231349_231424_231603
923813	contig_12340_pilon	+	1883	1	Intergenic	novelGene_122103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTCCTATGTTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25699	27582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_+_25700_27600
923814	contig_16594_pilon	+	3595	8	Intergenic	novelGene_53835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116291	272912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_132997_133151_135250_135593_149099_149351_165477_165649_272663
923815	contig_16541_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_126765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGCAGGCTGGGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484156	485356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_+_484200_485400
923816	contig_11356_pilon	-	1985	7	Intergenic	novelGene_175263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	9.26762584963856	14	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	364	690	328617	196785	FALSE	20	CACGTGCAAGTCTGCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLKYCLLILNQPLDDCFRRLWSKAVLKACADGGANRLYDVTEGERKRFLPEFINGDFDSIRPEVRDFYTAKGCELISTPDQDSTDFTKCLQVLQRRIEENGLQVDVIVTLGGLAGRFDQIMASVSTLFQATRITPLPVIIIQEESLVYLLQPGKHRLHVDTGMEGDWCGLIPVGQPCSQVTTTGLKWNLTNDLLGFGTLVSTSNTYDGSGVVTVDTDQPLLWTMAVRL	434426	195489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_196904_287662_287775_328521_328669_344171_344268_364499_364573_385794_385865_434353
923817	contig_6241_pilon	+	1502	1	Intergenic	novelGene_156395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGTGTATCTTTGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16313	17815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_16300_17800
923818	contig_7744_pilon	+	1594	15	Intergenic	novelGene_62525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_14	70.8574308749907	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	122	1534	825487	830740	FALSE	15	CCTGTGCACCCCCAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQAPPKWRGRLRVRAEQRRRACRASAALTVWNSAGPAARNMHFSIPETESRSGDSGGSAYVAYNIHVNGVLHCRVRYSQLLGLHEQLRKEYGANVLPAFPPKKLFSLTPAEVEQRREQLEKYMQAVRQDPLLGSSETFNSFLRRAQQETQQVPTEEVSLEVLLSNGQKVLVNVLTSDQTEDVLEAVAAKLDLPDDLIGYFSLFLVREKEDGAFSFVRKLQEFELPYVSVTSLRSQEYKIVLRKSYWDSAYDDDVMENRVGLNLLYAQTVSDIERGWILVTKEQHRQLKSLQEKVSKKEFLRLAQTLRHYGYLRFDACVADFPEKDCPVVVSAGNSELSLQLRLPGQQLREGSFRVTRMRCWRVTSSVPLPSGGTSSPGRGRGEVRLELAFEYLMSKDRLQWVTITSPQAIMMSICLQSMVDELMVKKSGGSIRKMLRRRVGGTLRHSDSQQAVKSPPLLESPDASRESIAKLSSKLSAVSLRGIGSPSADASASDVHGNFAFEGIGDEDL	825365	830800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_825550_826011_826087_827076_827195_827679_827745_828148_828260_828369_828461_828608_828697_828936_829007_829274_829368_829471_829676_829810_829937_830097_830176_830326_830402_830494_830537_830626
923819	contig_3153_pilon	+	1620	1	Intergenic	novelGene_104622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTGCTCTGTGGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53015	54635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_53000_54600
923820	scaffold_12124_pilon	+	2477	13	Intergenic	novelGene_22085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_11	199.638771006257	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	914	1279	879089	894124	TRUE	35	CAGACAGAGACTGGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRSRMTPVTHHSGIQLS	859945	895737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_894078_894148_894278_894711_894994
923821	contig_15104_pilon	+	1841	5	Intergenic	novelGene_163351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	79.7543102283507	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	255	902	587189	619519	FALSE	30	AATACTGTTTAAACTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVIHGRSCCCRELEGDDLLSDNFCSNEIHTPLQTPARPTASEDRYQELRESLQQCRLPWGADREYGGIIPISLPEEHRPKCEPPRVMGKGHQHYGFGGETWHREICCPYPVEHPYNTHISRCAMFPTFTSPKELYTGIKARSQQPFPPTVPTKAYDKTVLKTRGNPYRYELVDFPSDSKKKALTWPGQGVYYDVSIFLNVCLKQSKKYFYPIIL	586233	620458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_+_586463_587163_587323_595072_595250_616639_616822_619364
923822	contig_3602_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_60550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAGCAGCACTAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319149	319850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_319100_319800
923823	contig_11026_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_167690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	653	961	300140	300448	NA	20	CTATTAAGGTTATGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVFVAINCLLSTAFAVSQNFWYDVFSFSFDSSRNILIPSLRSSWLSVACRSSVSLLSFFSDVLSFTEGGVLKSPTIMELCLFPVLLRVCFIYFRALSLVCRY	299487	300448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11026_pilon_+_299500_300400
923824	contig_12566_pilon	+	2831	2	Intergenic	novelGene_85992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	1747	2211	16579	216349	FALSE	70	AGAAAGAAAAGATGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEDEPLRLEGTQKMTREELPPQNRVDLNDVDGVKLSGPSFADVARLRMRRNSCKYPLILGTWNVRSMNLGKLEVVKNEMEHLKIDILGISELKWTDIGHFELKNYMVYSAGNDKFKRNSIVFLVKKNISRSILKYNAVSDRIISCTYKEDQLI	14832	216969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_16767_216072
923825	contig_12520_pilon	-	3440	1	Intergenic	novelGene_161077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	136	552	535657	535241	NA	75	TAGATTAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETLGIFHPGAKSLFISEPVNSRIQIICFQSTVVKQTQSRHFHYKWKILEGKTGHQTSPKRSRTNYVNSQGLKIILCSLGPSGQWPCPPDSGCQPYPLDSEWRPLGSGLQLCLSGPLGWPLCSLCFGRFHSLSPSKW	535792	532352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_532400_535800
923826	contig_14441_pilon	+	1201	6	Intergenic	novelGene_100415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	451.823682424903	275	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	613	1161	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	81827	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_81936_82064_82375_121193_121239_125517_125902_126159_126283_126514
923827	contig_13101_pilon	-	2649	9	Intergenic	novelGene_172784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_6	107.319616100692	52	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1427	2479	237115	233529	FALSE	35	TTTTGATATGAATACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWLKSATKQPSILSKFCSLGKITTNQGSKGQLKENEYDLEEDAEKCENDNTLKVNGCGLDSPGNNVKPINVNEDKAINKGVEQIGFELVEKLFQGQLVLRTRCLECESLTERRENFQDISVPVQEDELSKVEESSEISPEPKTEMKTLRWAISQFASVERIVGEDKYFCENCHHYTEAERSLLFDKMPEVITIHLKCFAASGLE	244457	233358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_233735_234695_234867_236439_237129_238237_238399_238989_239095_239902_240024_240305_240729_241643_241883_244093
923828	contig_12624_pilon	+	2175	8	Intergenic	novelGene_60967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	376.862016647787	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1053	1751	39740	55160	FALSE	25	GGAAAACTCTTCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	11633	55584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_11708_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
923829	contig_10182_pilon	-	1124	4	Intergenic	novelGene_134633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.440145745087	20	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	49	354	429480	399725	TRUE	40	AACAATTGTATATTATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNGNRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDNVLVRIISAKNSPPTIVQDKVLALIQVGWPLVQFVGTE	429528	398482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_399219_399690_399914_404440_404520_429442
923830	contig_7408_pilon	-	2397	7	Intergenic	novelGene_168732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	269.661773750419	3	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	850	1554	24356	12597	FALSE	35	AATCAAAGTTCTGAGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48329	11753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24441_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47226_47360_48065
923831	contig_6102_pilon	-	2714	15	Intergenic	novelGene_31856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGGCCAGCTCCCCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377320	370745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371192_372704_372746_372938_373074_373198_373272_373402_373476_373632_373725_373902_373955_374378_374502_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375730_375966_376037_376205
923832	contig_10500_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_41214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAGAAGCAAAATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1569850	1572001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1570107_1570182
923833	contig_12414_pilon	-	2106	6	Intergenic	novelGene_59669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	237	junction_2	83.0556439984665	7	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	9	965	890468	835764	FALSE	20	CAGGCCTCTAAGCCGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQSTVVLQSPQQSGYIVTAAPPPHPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTVSYSASGHPVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCTPGHYHSSQPQYRPVPSVHYSSHLNQPLPQPAQQTGYQVMPNQQQNYQGIVGVQQPQSQSLVSSHPNNIGNQIQGVVIPYPSVPSYQVSLPQGSQGIAHQTYQQPVVFPNQSNQGAMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCTSQQLQSHQCTAVPPPPPVGGMVMMQLNVPNNPQPRAHSPPWKQNKYYCDHQRGPKCVEFSNVDNIVQVRCIFCSLSF	890476	834622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_835967_838083_838188_868323_868476_871631_871787_886849_886974_890249
923835	contig_7342_pilon	-	1493	2	Intergenic	novelGene_71132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	163	852	89523	88627	FALSE	5	TGTCCTGTCACGTTTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEGEFEEEAEEEVA	89685	87985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_88866_89072
923837	contig_12300_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_176510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTACTTCTGTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97919	96846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12300_pilon_-_96800_97900
923838	contig_20527_pilon	+	2354	2	Intergenic	novelGene_138619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3193	junction_1	0	45	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAATGAGAAACTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25571	28888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_26346_27308
923839	contig_2872_pilon	+	2808	2	Intergenic	novelGene_178544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1987	2376	3293	3682	TRUE	65	AAAGAAGCACAAAAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKSNTCSPQTAPKEPPARRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQDVINAAAQT	1306	23395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2872_pilon_+_3827_23107
923840	contig_6228_pilon	-	2761	4	Intergenic	novelGene_164494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAAAAAAAAGCCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207299	196944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_197958_198403_198412_198997_199593_206154
923841	contig_5039_pilon	+	4791	1	Intergenic	novelGene_64771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	107	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGCTACTCTGATTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120704	125495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_120700_125500
923842	contig_5727_pilon	+	2955	19	Intergenic	novelGene_7959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	693	junction_11	791.389347139214	7	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	549	2096	173359	177260	TRUE	55	AGAAGAAGAATCAGAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APQHYPKTTGNSEFLGKTPGQNAQKWIPARSTRRDDNSAANNSANEKERHDAIFRKVRGILNKLTPEKFDKLCLELLNVGVESKLILKGVILLIVDKALEEPKYSSLYAQLCLRLAEDAPNFDGPAAEGQPGQKQSTTFRRLLISKLQDEFENRTRNVDVYDKRENPLLPEEEEQRAIAKIKMLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTVGPRLDHERAKSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHNQSQGLLSQLQGQSKDMPPRFSKKGQLNADEISLRPAQSFLMNKNQVPKLQPQITMIPPSAQPPRTQTPPLGQTPQLGLKTNPPLIQEKPAKTSKKPPPSKEELLKLTETVVTEYLNSGNANEAVNGVREMRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPGKRMLGFFVSEFLMP	170312	179292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_170350_171187_171329_171891_171995_172577_172710_172797_172865_173290_173443_173717_173829_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474_175589_176191_176318_176462_176568_176652_176869_176954_177751_177921_178134_178221_178344_179257
923843	contig_13800_pilon	+	2262	16	Intergenic	novelGene_153711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	308.342061137735	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	239	1939	98364	162575	FALSE	75	GAAAAAAAAAAGAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIRCLCLIGLQTVCGLFSCQITREKVTHASKWLKNSNSTERDKRKKASSPWLFFIAILLKYSLPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	94540	162898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_94603_95566_95668_95759_95829_98357_98435_105635_105734_114262_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
923844	contig_934_pilon	-	1765	1	Intergenic	novelGene_129008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGACATCGTTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43049	41284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_934_pilon_-_41300_43000
923845	contig_8597_pilon	+	3602	1	Intergenic	novelGene_158719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	2578	3114	111367	111903	NA	35	AAAATATTTGAGTGTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSAKNENSRTLNCAHAKPIHRQTEQGDTRWFKVRKSVHKGCILSPYLLSLYAEQIIQEVELYEEECGIRIGGRLVTNPRYSDDTTLLAESEEALKHLLMKIKDYSLQYGLHFNIKKTKILTTGPITYIMINGENTEVVKDFILLGFTINAHESSSQETKRRFALGKSAAKKNSLKC	108789	112391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_108800_112400
923846	contig_3018_pilon	+	2136	2	Intergenic	novelGene_78905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	87	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCCTCATCCACTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611877	615647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_613042_614675
923847	contig_8464_pilon	-	4279	1	Intergenic	novelGene_125406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2408	2842	908203	907769	NA	15	TACAGAGCTGCTTCTTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLPFADLAPLFTGSGGPSRLSAGGSLLMWKMLPECHCLLYCARQLIWPEGCRLPPGQVWKLLTASELSLPPPATQSNSSTLPLMFRAPRLLYIIDSLVFSGLCCKRDHRKHLTTPPLWPRLLFYNCCVRLINFQITTPQKHEN	910610	906331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_906300_910600
923848	contig_7031_pilon	-	2666	1	Intergenic	novelGene_132798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	939	1244	332312	332007	NA	65	AGAGTTTAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTELNKDLENSVVQTKDMCPRMFTKDLLTQSFVKEIKPVTDGSNQLPLQKTHQLRLKGTETGQKEWKLSAPWNSTRKRAKGIITAVFQEKKKTVPGVVRR	333250	330584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_330600_333200
923849	contig_5020_pilon	+	2119	1	Intergenic	novelGene_27948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAGAACTGTCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175687	177806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_175700_177800
923850	contig_15063_pilon	+	2171	7	Intergenic	novelGene_12265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	444	1916	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27720	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
923851	contig_253_pilon	-	4457	1	Intergenic	novelGene_129769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAATCTCTTGTTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	788924	784467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_784500_788900
923852	contig_5033_pilon	+	2292	6	Intergenic	novelGene_28923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCGCAGAGCGACCGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449428	477314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_451736_456485_456604_462973_463033_464549_464981_477111
923853	contig_15327_pilon	+	3028	1	Intergenic	novelGene_70750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1048575	1051603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1048600_1051600
923854	contig_6898_pilon	+	2909	10	Intergenic	novelGene_35742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2177.78528910269	1	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	1030	2166	116718	125646	TRUE	30	AGTTTAGGAATACTTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	114318	127689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_114527_115896_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126103_127402
923855	contig_16103_pilon	-	1894	9	Intergenic	novelGene_118869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3996.209983769	16	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	266	628	735970	733331	TRUE	35	CAAGTGTCTTTTTGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	742919	722318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723380_723507_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_742792
923856	contig_9335_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_147432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTACACAGGCCTACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115894	113878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_113900_115900
923857	contig_5686_pilon	+	1666	5	Intergenic	novelGene_45230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1390.80936418332	65	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	185	628	170282	211355	FALSE	30	GCATTTGCATCTCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLEVSPSRVSVAFRRGDPGVTHSLKIPLLSRSLKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93785	212393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171685_208451_208722_211283
923858	contig_13702_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_102634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1861	2160	211071	211370	NA	15	TGGTATGAGCAGCGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	209210	211604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_209200_211600
923859	SIRV7	-	1031	4	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-22	-1070	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAAAAGATAGAAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	2075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2682_2993_3112_43028_43078_114680
923860	contig_12528_pilon	-	2912	7	Intergenic	novelGene_81331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	571.191566425447	17	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	1885	2382	966228	937599	TRUE	50	CAATATCAACTTGAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENDGFREEC	968112	932908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191
923861	contig_1009_pilon	+	3574	1	Intergenic	novelGene_121727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2022	2321	119912	120211	NA	65	GTTGAAAAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFIKEVIGYNSESGTTQDTVLPLLSVFSAVPPGGPVSGPQPLGSSAHQPFGLLAPWPGSALLQQVLQSSLAPPISAWGHPHSTRKPWPEGAQLSCSVG	117890	121464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_+_117900_121500
923862	contig_960_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_108293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCTGTTGTACAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1034969	1036807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1035000_1036800
923863	contig_2209_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_141022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1150	1515	226790	227155	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVASTIQFFWFHDKGSHGSWRQLAQTKTCTQIFTGTVFKTAKRWKQFKCPSTDEWTNKMWHMHTVEYYSASRINEVLIHATIWMELEDIMLSEISQSQKDKHCTTSLILKRKGKCIETEVY	225640	227875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_225600_227900
923864	contig_11978_pilon	+	558	5	Intergenic	novelGene_63022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTACAAAGGACCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1591847	1597012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1592065_1592187_1592303_1595888_1595987_1596303_1596391_1596971
923865	contig_2799_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_85473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTTATGTGACCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429542	431515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_429500_431500
923866	contig_6980_pilon	+	502	1	Intergenic	novelGene_36087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTTCCTACGGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404171	404673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_404200_404700
923867	contig_9366_pilon	-	2252	3	Intergenic	novelGene_166220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_2	3.5	51	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATGAAATACTACCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146613	140815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_141672_144077_144162_145301
923868	contig_2323_pilon	+	2657	1	Intergenic	novelGene_151842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	383	751	60146	60514	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLRYGLHRNIKETKILTTGQISNIMINGEKTDVVKDFIVLGSTINTHGTSSQETNRRITLGKSPAKDLLKVLKSKDVTLKTKVHLTQAMVFSTVSYACESWTMNKEDRRRTDAFEL	59763	62420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_59800_62400
923870	contig_11656_pilon	-	2721	1	Intergenic	novelGene_54032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAATGATGTATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499598	496877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_496900_499600
923871	contig_7151_pilon	+	2846	7	Intergenic	novelGene_40736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	131	junction_4	124.903184729436	2	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	592	948	505515	507901	FALSE	35	AGAGAATAAACTTTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWALSLKNCSAMGAHLVVINTQEEQEFLFYTKPKRKEFYIGLTDQVVEGQWKWVDGTPFKESLSFWDIGEPNNIVTVEDCATIRDSSNPRKNWNDVPCFFNMFWICEMPQRNILKNL	502257	509799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502457_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440_505593_506568_506685_507738
923872	contig_13224_pilon	+	2834	1	Intergenic	novelGene_104106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGACAAAACACAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277842	280676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_277800_280700
923873	contig_12000_pilon	+	2949	3	Intergenic	novelGene_43193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2.5	18	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1433	1795	595206	595568	TRUE	70	CAATGACAAAAAAAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLSDGLHLNIKKTKILTTGPINNMINREKIDVVKDFILLGSTVNAHESSSQEIRQHSALGKSAAKDLFKMLKSKDVTLETKVCLTQAMVVSVTPYAYESWTMNKEDRRIVAFEL	592272	634760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_592712_594212_596239_634276
923874	contig_7171_pilon	+	2843	5	Intergenic	novelGene_101342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	72.5499827705011	7	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	4	507	1301684	1307418	TRUE	45	ATCAAAGACCAAAGCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSDPSGKEESFQFFILWGLACCCDAGSYATDIQMPAGSPMVDRFQLSFQTKTD	1301680	1309960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1307263_1309344_1309549
923875	contig_665_pilon	+	4551	4	Intergenic	novelGene_158181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	526	825	97357	97656	TRUE	45	GAAAGATGGTCCAACAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSCAGNDKMKMNDIAFIVKKNISRSVLKSKTVSDRIIYICLQGRPFNTTIIQIYTLTTNAKGEEIEDFCQLLQSEIDQTCNQSRCIDSYHWLGCRNWE	19302	240425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_19583_97111_99819_159040_159058_238878
923876	contig_14621_pilon	+	3511	16	Intergenic	novelGene_105865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	845	1144	408764	425955	TRUE	20	CAGGTCCCACCAGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRSEFSASVHIYQLEEQGEVLVAVCNECALGFSWVGHPGGFRCNALILIHSGEIDICDANFSGDLDSELYRIRNITVVTFNFDREIIITTRKFDIHEV	396074	463803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_+_396371_402017_402122_403708_403783_405154_405252_407261_407343_408571_408766_411139_411252_413461_413555_425862_427442_428924_429101_431642_431781_432844_432926_437112_437286_437849_437947_460397_460590_463779
923877	contig_17560_pilon	+	3258	4	Intergenic	novelGene_167578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	250	junction_1	88.0946460726568	25	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	38	2251	58310	86694	FALSE	30	CTTTTTGATTAAAATACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCKCITKRQPRMKKASRSVGPVPKVSGISKTQAVEKIKPESSSSASTGGKLTKSGTATSLSKTKSSDDLLAGMAGGATVTNGVKGKKSTCPSAAASAPAPAMNTVENKAKISTGTSSSSKRSTSTGNKESSSTRERLRERTRLNQNKKLPSASQGANDVVLAKRPRSRTAAECDIRMSKSKSDNQISDKAALEAKVKDLLTLAKTKDVEILHLRNELRDMRAQLGINEDPSEGDEKSEEKETIIAHQPTDVESTLLQLQQQNTAIREELNQLKNENRMLKDRLNALGFSLEQRLDNSEKIFGYQSLSPEITPGNQSDGGGTLTSSVEGSAPGSVEDLLSQDENTLMDHQHSNSMDNLDSECSEVYQPLTSSDDALDAPSSSESEGIPSIERSRKGSSGNASEVSVACLTERIHQMEENQHSTSEELQATLQELADLQQITQELNSENERLGEEKVILMESLCQQSDKLEHFSRQIEYFRSLLDEHHISYVIDEDVKSGRYMELEQRYMDLAENARFEREQLLGVQQHLSNTLKMAEQDNKEAQEMIGALKERNHHMERIIESEQKGKVALAATLEEYKATVASDQIEMNRLKAQLENEKQKVAELYSIHNSGDKSDIQDLLESVRLDKEKAEALAGSLQEDLAHTQNEANRLQDTIAKVEDEYRVFQDEAKKQIEDLNMTLEKLRSELEEKETERSDMKETIFELEDEVEQHRAVKLHDNLIISDLESKSWENFSCLFCLILFICGVV	58272	87701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_58463_67125_67280_83542_85177_86421
923878	contig_15720_pilon	-	3772	10	Intergenic	novelGene_41961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	188.356045828107	8	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	12	1232	327739	309844	TRUE	35	TGTTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGGPQSPRSAHTRPPLLLLLLFGLMRERAAESPWGLPVVADGPASFAKEVMAELASQELGKKPWPGGTHSLHYHYLALSEPGQGLPQFLAVGYVDDQPFIRYDSRVGRAQPQALWMAAVDAQYWERETQKLRVWEKVQQVEMWTVMGYHNHSSGKHSAQRMFGCEIQEDGRSSSFWQFGFNGQDHLSLDLDTLSWVSAHPVALRTKRWWETERCYAEYDKAYLQGLCLTSLRRYLELGGQSLIRTEPPKVQVTRHTGQDGRTTLRCWALGFYPRDISLSWWLSGEELALETEHVETRPSGDGTYQKWAAVQVPAGEEAWYSCHVQHRGLNHALTVTWESPPHPRITATMVIFAILVTVSLVAGVVIWIKMQLPARDKESYQQAPGEEDLHKSQSPSRAVSAQHLC	327750	305307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305799_306630_308520_309683_309909_310220_310254_310619_310728_310843_311120_314402_314679_316351_316613_321157_321266_327645
923879	contig_9036_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_155449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90699	92142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_90700_92100
923880	contig_6842_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_130834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGCAGAAAGAGCAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1861334	1817910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1817964_1859367
923881	contig_6544_pilon	+	3373	1	Intergenic	novelGene_142065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGAATGGGTGAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18555	21928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_18600_21900
923882	contig_3956_pilon	+	2026	9	Intergenic	novelGene_15056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1120.1747003816	83	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	81	1502	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283872_1287381_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
923883	contig_11338_pilon	+	1694	4	Intergenic	novelGene_6338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1218	1613	295240	306936	TRUE	35	TGTCAAAGAAGCGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINFLEKHTTKSFISYFMAQRMAFPIFHGTKDVVQKSFLINREDGTDWSKEAPYKSLSWVKPPGRCSIKMRSGCCRNCHDQGWDSVAHREHELLHASSHAGVVDHCQVSRSEEKVEALQQHPGEGSQVEVV	294022	319241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_295361_300823_300888_306725_306963_319186
923884	contig_3900_pilon	+	2696	2	Intergenic	novelGene_84215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAGAGCTGAAAATACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680876	687711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_+_681337_685475
923885	scaffold_880_pilon	+	821	1	Intergenic	novelGene_121457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACAATTAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454202	455023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_454200_455000
923886	contig_5499_pilon	-	1412	1	Intergenic	novelGene_57029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGCTAATATTCATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1387966	1386554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_1386600_1388000
923887	contig_4156_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_88110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAACAGGGAAAGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356650	358965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_356600_359000
923888	contig_10331_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_54125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTTGAGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407954	407189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_407200_408000
923889	contig_15092_pilon	+	2423	3	Intergenic	novelGene_57790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	462	1028	325159	351165	FALSE	40	TACGCTTACCCAAATACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324697	352560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
923890	contig_5649_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_82299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGTCTGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162303	159629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_159600_162300
923891	contig_11551_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_168480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571817	573165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_571800_573200
923892	contig_5965_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_154650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGCATGGGGAGGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39531	41341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_39500_41300
923893	contig_9429_pilon	+	2393	2	Intergenic	novelGene_155096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	908	1627	48489	49208	TRUE	35	CTCAGAAAGTGTAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKNDVEFIIKKNISRSVLKYNAVNNKIIPIHLQGRPVNTTVTQIYAPTTNAKDEETEDFYQHLQSKIDQTCSQDVLIITGDWNEKVRNKEGSVVGKYGLGDRNDPRDQMIEFCNTNNLFIANTFLNNINGNCTLRPQQIEDTRIKSTTSVERLSIISQNKAGDNYRTGCQLLICKFKLKLKKIRTSSHEPKYNLEYIPPEFGDHLKNRFDALNTDDQRSDELWNDIRGIIHEESESH	47581	60229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_+_49960_60214
923894	contig_5321_pilon	-	3014	1	Intergenic	novelGene_153862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCATATACAATTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16491	13477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5321_pilon_-_13500_16500
923895	contig_16804_pilon	-	971	5	Intergenic	novelGene_167290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	116	junction_2	51.5866988670529	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	768	204	971	53399	43812	FALSE	55	TTGGAAAACTCTCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKTRRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLLPELKNADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAADKAFEGAPARELEVSLPDIDYVEIPADWWDAEADKSLLIGVFKHGVYSEYFPFWISPHRKDEFRHSLTKVGMF	53602	43811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16804_pilon_-_44002_46460_46551_51456_51617_52338_52539_53271
923896	contig_4402_pilon	-	4921	3	Intergenic	novelGene_140847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	251	7	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1107	3813	4919	594443	592901	FALSE	50	CTCAAGTGAAGAGACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPDIEKMDRTPEKDKNSSTAPAKKIKLNRETGKKIASAENISNTKELSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPISNVGKPASVIKNVSTKPSNTVKYNEKESEPSDKVQKLTKEVSHEIVTHEVKSSKNSTSSEKGKTKDRDHSVLEKENPEKRKSSTQPEKDSNLDRLSEQGSFRSLSQSSKETRTSDKHDSVRGSSNKDFTPSRDKKPDYDNRDYSSSKRRDERNESTRRKDSPPRNKDSASGQKNKPRDERDLAKKGTGDSKKSNLSPSRDRKPHDHKATYDTK	598540	592898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_593748_594183_594884_595168
923897	contig_7342_pilon	-	3990	12	Intergenic	novelGene_71106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	122.080314980693	116	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	2754	3524	84052	81177	TRUE	5	GTTTTCTCCTGGCGAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCRHIPTHRSKSLDPLSPFLFHRGSPPAMFDWFFEAACPASLQEDPLILMQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVESEHPSSAVQHFTFTLTDLAGNRRFGFCRLRAQARSCLCILSHLPWFEVFYKLLNNVGDLLAQGQVSEAEELLLNLLQQPLPSPQALLGLELLSCFVAPDSDRLPSIPENRNLTELVVALTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPHLLDYC	86805	76095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_76378_80899_80983_81075_81178_81436_81538_82306_82418_82502_82557_82798_82880_83058_83129_83222_83343_83591_83642_83789_83834_83913
923898	contig_8934_pilon	+	3653	2	Intergenic	novelGene_167236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2441	2821	675657	676037	FALSE	15	GGTTGCACATTTAGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKLIISLLHASKIMLMIIQKLLQQHIDSEVPEIQTRFRRGQEMRDVITDIRWILAESREYQKIVHLCFIDYAKAFDCVDCNISKNGNLEHLIVLMWNLYIYQEAVIQTDQGDTMWFKIRTGMCSI	588411	676869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_588786_673590
923899	contig_7919_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_28142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAAAAAAAAGGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1614839	1616624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1614800_1616600
923900	contig_10541_pilon	-	2708	2	Intergenic	novelGene_144628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1516	1848	135743	112669	FALSE	45	TGTGCATGTACACAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVIPLPTCASRGVSLQAMEHLLARKRAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPRIPPARQPKLGSSSTLEWSSTAPQEEVKVAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKQH	137258	111808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_112923_135664
923901	contig_5093_pilon	+	3003	2	Intergenic	novelGene_135096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCATATATTCTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622232	625404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_622942_623110
923902	contig_3861_pilon	+	6138	3	Intergenic	novelGene_57902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTCCCTGAAGCCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157035	167412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_+_157646_159322_162144_164705
923903	contig_13780_pilon	+	5026	2	Intergenic	novelGene_149065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	187	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCCTCCTGGTATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	654423	684085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_+_655099_679734
923904	contig_2377_pilon	+	3694	5	Intergenic	novelGene_67924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2818	3303	333101	334320	FALSE	20	TTAGTTATCTGTATGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTHSAFLKLKELKKKFKPRVAILKDSMGKILNDPGSIKRRWKEYTELLYQKELVHVQPFQEAAYDQELMVLKEEVQAALKALVRNKAPGTDGIPTECFNKRMQLWKHSLVYAKKFGRQLPGQSIGRDPYLYPFQRKEMQQNVEIIKQYH	277524	334711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_277980_278923_280176_300685_301410_332714_333216_333949
923905	contig_5871_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_160183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTACATTCTTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413178	411847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_411800_413200
923906	contig_1939_pilon	-	3103	1	Intergenic	novelGene_144894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1768	2124	1008925	1008569	NA	20	AGTTGCTCTTGAGTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSLSYCGSLYVAVMLEALPPVFQIPEGSLLVDRFQWSFQTETDWEEGTGSLLLKKLASENLMNNNGTLSNIVPEDEPLRVEGTKNVNGEELPSQSGVDFNNVDRVKLSGPSYADVA	1010692	1007589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_1007600_1010700
923907	contig_7444_pilon	+	4503	21	Intergenic	novelGene_174929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_18	74.5898619116566	68	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1053	3162	471	3632	156122	283746	FALSE	35	ACAAACATTTTATTGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQLFFIVLLSVVFPFSFVSLSALQHWNCPTGPPAGNGDPTCVGPAPFLIFSHGNGIFRIDPEGTNHEQLVADAGVSVFMDFHYNQERIYWVDVKRQLLQRVFLNGTRQERVGNIEKSVSGMAINWINEEIIWSNQQEGVITVTDMKGNNSRVLLSSLNYPANVAVDPVERVIFWSSEVGSSLHRADLNGADMKILLETSEKITAMSLDVLNKRLFWIQYNKEGGDSYIGSCDYDGGSFHLSKHLTQHNLLAISLFGDRIFYSTLKKKAIWIANKHTGKDMVKINLNASFAPPGEIKVVHPLVQPKAKGDAGESGQKLCKSKKGMCRDSVCRQEPKYHVCTCAEGYTLSQDRKYCEDVNECALWNHGCALGCENTPGSYYCTCPVGFILLPDGKRCHQLDSCPSNASECSHDCVLTSDGPVCFCPEGSALEADGKTCSGCLLSDNGGCSQLCVPLSPLSWECGCFPGYELQLDKKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYEILLSQQMGMVFALDHDPVENKIYFADTALKCIQRVNLDGSKRERLIEDAVDVPEGLAIDWINRKLYWTDRGKSLIERSDLNGTQREIIINKDISQPRGIAVHPMAKRLFWTDMGINPRIESSSLQGSDRRVIATSDLVSPSGITIDYLTDKLYWCDAKQSVIEMAHLDGSERQRLAQNDVGHLFSVAVFEDHVWFSDWASPSVIRVNKRTGQNRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGSEADLSNQVTPLDTLSTSQAFEDNITEGLQSQYTLVAEIMVSDQDDCAPVRCGPHARCVSEGDNATCQCLRGFTDNGKLCSDIDECEKDITVCAVASSQCINTEGGYVCKCLEGYRVDGIHCIDTTPPSHLGKDDLHPVRHIYPGCPPSHDGYCLNGGLCMYIEQVDEYACKNQKLLSKNPKNPYEESSKDMSSSRPTDSEMGLSSCPQPWFVVLKEHQDLKCGSQPVALKDVQAADVGQLSSLEPGSIQTTSYRKEPQVHGMDAEQSCWIPSSSNKTSGSQGIEKNLHLPFYVARPIAVGVEQPHSSPVS	155651	284617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_156252_189607_189808_192851_193034_194885_195114_195809_196013_210696_210823_212547_212671_216188_216312_217132_217259_218569_218707_221501_221651_228312_228418_229600_229825_236421_236590_241345_241475_246793_246911_247763_247890_253976_254122_263125_263244_278978_279085_283549
923908	contig_6871_pilon	-	1771	8	Intergenic	novelGene_21616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	22	junction_7	15.2382440468924	50	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	10	1242	503607	493893	FALSE	45	TGGAAACCAAGCAAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKPSKLECGSDPEENSARSPDGKRKRKNGQCSLKTSMSGYIPSYLDKDEQCVVCGDKATGYHYRCITCEGCKGFFRRTIQKNLHPTYSCKYDSCCVIDKITRNQCQLCRFKKCIAVGMAMDLVLDDSKRVAKRKLIEQNRERRRKEEMIRSLQQRPEPTPEEWDLIHVATEAHRSTNAQGSHWKQRRKFLPDDIGQSPIVSMPDGDKVDLEAFSEFTKIITPAITRVVDFAKKLPMFSELPCEDQIILLKGCCMEIMSLRAAVRYDPESDTLTLSGEMAVKREQLKNGGLGVVSDAIFELGKSLSAFNLDDTEVALLQAVLLMSTDRSGLLCVDKIEKSQEAYLLAFEHYVNHRKHNIPHFWPKLLMKVTDLRMIGACHASRFLHMKVECPTELFPPLFLEVFEDQEV	503616	493363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_494144_495002_495262_496054_496202_497198_497405_498100_498249_500297_500399_501041_501110_503554
923909	contig_6710_pilon	+	1462	1	Intergenic	novelGene_98347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCGGAGGAAAGAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	656657	658119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_+_656700_658100
923910	contig_7396_pilon	+	2630	14	Intergenic	novelGene_79580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	98	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	1530	2078	248280	250301	TRUE	5	AGGCCCCCGTCGCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEINSTIKINLHDISLTSRRWWWRKRKIPSSATTPATSSRRRRRRSSTWAHVVVISSRWRHGTSTPTRRHPVKTTSSPHGKSHGTSTSVIKHHCKTTIIVSFIVKVGIIRLCTSFDGRLYKIKNDLYALYNPIRLSSNKNDSVSRMRTAFLEKLDCCLSAFTSRSSLILAPLTPIIPPARL	245309	257083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246476_247186_247357_247718_247825_248192_248332_248756_249064_249741_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251523_252398_252442_253919_253979_254604_254699_255103_255191_257014
923911	contig_5408_pilon	+	3005	1	Intergenic	novelGene_173965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTTGTTTTAGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54543	57548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5408_pilon_+_54500_57500
923912	contig_7963_pilon	+	1808	9	Intergenic	novelGene_58558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	151.899586487258	5	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	96	1277	247365	252992	FALSE	5	GTTTCTAGTGTGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFFTGRLADWVLQDGAAPAFTRNITFMSLLTIASAVLEFLGDGIYGSTMGHMHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEPPSVLSVCASHHSASKLGAAG	246786	253523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_246877_247359_247475_247606_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250250_250407_250597_251106_251260_252926
923913	contig_3975_pilon	-	1874	12	Intergenic	novelGene_54823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	228.43900753875	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	110	1408	2066301	2056837	FALSE	15	TACATCTCTCTGCTCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079250	2056370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060364_2064154_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
923914	contig_5484_pilon	-	1373	1	Intergenic	novelGene_151101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCTATATTTAGGACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276711	275338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_275300_276700
923916	contig_6898_pilon	-	2565	6	Intergenic	novelGene_35707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCTCAGCTTCCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127664	59537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104633_112966_113061_114245_114525_115894_115917_125716
923917	contig_3095_pilon	+	1156	6	Intergenic	novelGene_75084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2979.94225447407	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	273	746	149859	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149705_149781_149896_150413_150696_150996_151163_151848
923918	contig_4364_pilon	+	514	4	Intergenic	novelGene_381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	81	512	1530895	1531687	FALSE	15	TGGCCGTACCACCGGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYA	1530444	1531689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
923919	contig_1330_pilon	+	977	1	Intergenic	novelGene_179067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	128	493	178998	179363	NA	55	AAACAGAAAGGGGAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGSSSAFSSTRESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCFQGIQ	178870	179847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1330_pilon_+_178900_179800
923920	contig_13607_pilon	-	3546	1	Intergenic	novelGene_170177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1643	2005	191549	191187	NA	10	ATTCCTTCCATCTGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSMDWSLLITYPRYLRQSLAILTSKEHSGCTSSKRDLFVLLVVHDIFNILCQHHNSKASILLLSSLFTVQLSLAYEATEKIKAWIKHTLVLKVTYLLFNTLERSFAAGWPNAVCHLIS	193191	189645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_-_189600_193200
923921	contig_11307_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_105244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	949	1455	83075	82569	NA	60	CATTAAAAAGACAGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECINTNILCISELKWTGIGHFESYNHMVYYAGNDNLKRRNGIAYIVKKNISRSILKYNTVSDRTISICLQGRPVNTTIVQIYTPTTKAKDEKIEDFYKLLQSEIDRTCNQDALIITGDWNVKAGNEEGSVVGKYGLCDRNDAGDRAIEFCKTNDSFIANTFFHQHKR	84023	82245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_-_82200_84000
923922	contig_7657_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_30031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGGGAGACTAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195137	197361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_195100_197400
923923	contig_14718_pilon	+	1957	1	Intergenic	novelGene_177933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	107	430	43715	44038	NA	65	TGCAAGCCAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGDTIFIILRKQKLIFLHWYHHITVLLYSWYSYKDMVAGGGWFMTMNYGVHAVMYSYYALRAAGFRVSRKFAMFITLSQITQMVMGCVINYLVFSWMQQDQCHSHFENIFWSSLMYLSYFVLFCHFFFEAYIGKMRKTMKAE	43608	45565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14718_pilon_+_43600_45600
923924	contig_19518_pilon	-	235	3	Intergenic	novelGene_170732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5162.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTTATGCTTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49274	45417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_45522_47647_47728_49223
923925	contig_5315_pilon	+	1541	2	Intergenic	novelGene_175348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGCTCGCCACTCCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18713	43345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_18725_41815
923926	contig_17144_pilon	-	2622	15	Intergenic	novelGene_29545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1751.20573186194	3	56	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	617	2356	173640	166363	FALSE	15	CTTAAACTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179751	166096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174885_176011_176271_179700
923927	contig_4426_pilon	+	4058	2	Intergenic	novelGene_15373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	116	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTCAAACTGCCAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154630	159170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_154847_155328
923928	contig_8520_pilon	-	2945	1	Intergenic	novelGene_85451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2409	2771	259729	259367	NA	40	ACATAGCCAACAAGGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALERQVSKVKGRNDEVKELNRRFQRVARADKVKYYNDMCKDLEIENQKGRTCSAFLKLIERKKKSKPRVAILKDSTGKILNDAGSIKKRWKEYTESLYQKELVDIQLFQEQC	262137	259192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_259200_262100
923929	contig_8161_pilon	-	791	3	Intergenic	novelGene_156754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_1	39	26	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	116	337	232317	230026	FALSE	20	AGCCATCCATTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTLQRTEPPLVRVNRQETSPGITTLFCRAHGFYPPEISMIWMRDGEEIIQEIDYGDILPSGDGTYQTWISVEMDSQSSNIYSCHVQHCDRHMVLQVPEEQDGIFYLPTPNQ	235330	229571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_230067_232136_232413_235310
923930	SIRV6	+	981	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	8	539	8	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	250	741	1733	10736	TRUE	30	CCTAATTGTTGGTAACAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1095	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
923931	contig_7870_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_108986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAAAAAAGCTTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431931	431045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_431000_431900
923932	contig_4783_pilon	-	4418	2	Intergenic	novelGene_108359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGATGAAAAGAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121572	116756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_117373_117770
923933	contig_7272_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_25390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATTAAACCACTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750537	749169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_749200_750500
923934	contig_9133_pilon	+	871	1	Intergenic	novelGene_109314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTACAATAAAAATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872698	873569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9133_pilon_+_872700_873600
923935	contig_7513_pilon	+	1485	4	Intergenic	novelGene_89018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	187.170154315977	69	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCAGCCGGACTCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	673542	682813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_674528_677431_677630_680394_680535_682651
923936	contig_1154_pilon	+	2579	1	Intergenic	novelGene_87078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATTAATTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229824	232403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_229800_232400
923937	contig_11338_pilon	-	3767	2	Intergenic	novelGene_6403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1398	1838	313440	313000	TRUE	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	314837	310505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310934_311498
923938	scaffold_15027_pilon	+	3069	1	Intergenic	novelGene_163571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGATTGATCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81359	84428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_81400_84400
923939	contig_10904_pilon	+	1737	2	Intergenic	novelGene_22485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACTTGTGTGTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149796	151580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_150652_150698
923940	contig_13456_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_153305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTGAGAAGTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527359	528659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_527400_528700
923942	contig_15867_pilon	-	5168	6	Intergenic	novelGene_170880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAGAAGAAACACTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48620	30839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15867_pilon_-_31230_34171_34469_37178_37259_38981_39153_42746_45910_47553
923943	contig_6434_pilon	-	2379	3	Intergenic	novelGene_61833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCGGGTCTGGCCACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700762	697919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_-_699384_699460_699793_700179
923944	contig_4782_pilon	-	1005	6	Intergenic	novelGene_73651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	89.1470694975443	13	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	264	743	499691	471286	TRUE	35	CAAGCTGAACCACTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASGVEKSSKKKTEKKLAAREEAKLLAGFMGVMNNMRKQKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLAAASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQYQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGKESHIRVSRLS	499954	467825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_467949_471146_471308_476967_477109_477443_477538_478827_478931_499571
923945	contig_6710_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_97146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	45	AAAATGAAAATGCCTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
923946	contig_3270_pilon	+	7101	6	Intergenic	novelGene_104504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	145	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGAAAGAAAATTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362859	385799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_+_369479_370452_370584_375430_375548_376971_377092_380093_380162_385753
923947	contig_19673_pilon	+	1400	2	Intergenic	novelGene_179068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACGAAACAAACAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3436	58500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19673_pilon_+_4397_58060
923949	contig_8597_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_158700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAGTCAGTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28004	26765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_-_26800_28000
923950	contig_5918_pilon	-	3445	4	Intergenic	novelGene_99545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1696	2097	745305	738179	FALSE	60	AAAAAGGAACTAGAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPVLLGEVVCTLFVSNCEGLTGDGEEAVISEELKLKVGSEELVIGREIFGNTGTSISSSSAGLEATKRVLSRLILPPPRPAPGDNPLAAGILKFGYEKPLAKTKKMKTTEILLRSITCYKTKYCKTRAANK	747780	736830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_738403_744474_744619_745271_745365_746144
923951	contig_8576_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_88762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732377	734466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_732400_734500
923952	contig_6505_pilon	+	2097	1	Intergenic	novelGene_175694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1635	1946	98882	99193	NA	40	TAAACGCTCATCTAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLRQTESSTARWCPAATTNCSDRNHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKKDQTYWPDRDWRNLESMVPGHPFSSVMKSLPRFTLHQRLDRPIKQNETKGAH	97247	99344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_+_97200_99300
923953	contig_12173_pilon	-	1563	1	Intergenic	novelGene_172961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCCCCTGGACACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87463	85900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12173_pilon_-_85900_87500
923954	contig_8248_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_125033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACCAACCTCCTCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199566	198300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8248_pilon_-_198300_199600
923955	contig_13420_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_179070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	365	682	38944	39261	NA	15	CCTTCTCCAACTGGCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTINVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	38579	41226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13420_pilon_+_38600_41200
923956	contig_11338_pilon	-	1695	5	Intergenic	novelGene_6387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	240.103493310697	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	152	745	319426	306671	FALSE	30	ACTGAAACACCTCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPVNADSTCAYPLQLDHSHY	321460	305720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311
923957	contig_17144_pilon	-	2278	16	Intergenic	novelGene_29319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1966.25808637173	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	157	2064	179764	166282	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLWSGQ	183238	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166296_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174742_174893_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
923958	scaffold_10332_pilon	-	3449	4	Intergenic	novelGene_179071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACAAGTATTTGAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246346	43518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_10332_pilon_-_44119_184082_184709_198316_198978_244784
923959	contig_720_pilon	+	3214	2	Intergenic	novelGene_155170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAGAGACTGGAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212244	232838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_214369_231748
923960	contig_6445_pilon	-	1153	12	Intergenic	novelGene_76949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	614.15489203047	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	420	824	77905	44574	TRUE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRA	88559	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473
923961	contig_12964_pilon	-	2734	1	Intergenic	novelGene_131684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTATAACAAATATAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407367	404633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_404600_407400
923962	contig_4604_pilon	-	1996	1	Intergenic	novelGene_19194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGTATCACGGGTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529858	527862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_527900_529900
923963	contig_6102_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_32410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACCAGACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1842790	1840501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1840500_1842800
923964	contig_17440_pilon	-	423	1	Intergenic	novelGene_7571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATACTTTTAATAGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1914	1491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1500_1900
923965	contig_15118_pilon	-	3034	12	Intergenic	novelGene_74591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGATTTGGGGTATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399344	376971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_377591_377789_377833_378490_378633_379670_379781_379883_380032_380162_380261_391806_392086_392167_392551_392641_392926_393223_393276_393416_393630_398681
923966	contig_5317_pilon	+	2939	1	Intergenic	novelGene_76494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAATCCTTTTCCAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29665	32604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_29700_32600
923967	contig_7753_pilon	-	1163	1	Intergenic	novelGene_41495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCTCACATGGCACATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195982	1194819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1194800_1196000
923968	SIRV5	+	727	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-397	875	-283	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	205	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7918	10991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
923969	contig_4315_pilon	-	1261	7	Intergenic	novelGene_46811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_5	116.206353813665	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	249	761	337246	328205	FALSE	45	ATTTTATATACAAATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	339010	327704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
923970	contig_12427_pilon	-	2052	3	Intergenic	novelGene_40459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3427	8	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGTTTGTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316515	313504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315834_315937
923971	contig_4232_pilon	-	780	2	Intergenic	novelGene_63398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACAGCTATTGGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467879_467967
923972	scaffold_12124_pilon	+	2733	3	Intergenic	novelGene_22106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.5	3	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	806	1738	893154	894086	TRUE	55	CGAAAAACAGACAGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAPNTQCSVTNVEHVKRKPRDRGRLFCLRVAGTLGQVYAASAVGFLQVSTGQRWVSGCKPAGTLLGDPLVMRDPLRVVLRGYYWLEWWKSTAEEDIPDGRLGRTCVKAQAPGIHLGSPTEPGAASRTSQAEDWHQPGLCPSPAWAPDPACPLCPQGCSEDPISTTQWRACLRGETAPDACWCCGGALEAAELPSAWLPTSTADEQGTHLCERPPHCTIYLGSSADPGAARKEPSGTQAPAFTCVWVSISPAGWPPSPSSPLRTPYHNPQWRPCLGREDPLAGPLCPRQNPRERREAHCSKSCFYCRAAE	892348	895496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_894148_894278_894711_894994
923973	contig_8616_pilon	+	3360	7	Intergenic	novelGene_72582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1837	junction_1	600.441342310434	46	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	2337	3290	428108	436516	FALSE	15	TTGAACCTTTTCATGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHNKQATENAKEEVRRILGLLDAHMKTRTFLVGERVTLADITVVCTLLWLYKQVLEPSFRQAFPNTNRWFLTCINQPQFRAVLGEVKLCEKMAQFDAKKFAESQPKKDTPRKEKGPREEKQKPQAERKEEKKAAAPAPEEEMDECEQALAAEPKAKDPFAHLPKSTFVLDEFKRKYSNEDTLSVALPYFWEHFDKDGWSLWYSEYRFPEELTQTFMSCNLITGMFQRLDKLRKNAFASVILFGTNNSSSISGVWVFRGQELAFPLSPDWQVDYESYTWRKLDPGSEETQTLVREYFSWEGAFQHVGRAFNQGKIFK	425771	436586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_428126_428649_428794_430491_430622_431032_431238_435726_435900_435993_436119_436357
923974	contig_10549_pilon	-	2336	8	Intergenic	novelGene_110623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGGTGCAGCCTCACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454420	371092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_-_371179_414194_414667_426013_426165_428794_428851_440131_440214_441149_441266_442842_443645_453849
923975	contig_12624_pilon	-	2252	9	Intergenic	novelGene_60943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCGCCGCCTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55579	6017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_6094_11631_11707_32959_33049_38761_39838_41855_41950_42821_42971_43099_43147_50394_50433_54971
923976	contig_9098_pilon	-	1905	11	Intergenic	novelGene_75827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	181.190093548185	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	220	1377	350397	335775	TRUE	40	AATACCTTAAAAATTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350616	327579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_327709_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_347761_347832_348546_348660_350328
923977	contig_7689_pilon	-	3369	2	Intergenic	novelGene_179072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCTGGGCCAGGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27667	24080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7689_pilon_-_26198_26415
923979	contig_4501_pilon	+	2183	1	Intergenic	novelGene_168984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	233	619	176397	176783	NA	25	TACAGTCACTATGAGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKKKRWRSSVSSVRTRLGANCRTDHKLPICNFKLKLKKISTSPQEPKYDPEYIPCEFRDYFKNRFDTLNTNNRRPNESWDDIKDIIHKESKRSLIRQERKKRPKWMSEETLKPVLECRVAKEEEMMK	176164	178347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4501_pilon_+_176200_178300
923980	contig_13283_pilon	+	1971	14	Intergenic	novelGene_154023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_13	63.4078560828053	26	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	63	1622	114754	161305	FALSE	45	AGGAACAAATTAGTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAEGRADTTTGSGAGTHLMEGDKLQSLTMQAHEGFELTGPSGPVKPAPGLPQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQSKRCPLHAAAEAGHVDVCHMLIQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLDAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYDVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCMEIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYECVVLFLSWDSDITLKNKEGETPLQCASLNSQVWTALQMSKALRDSAPDQPAPKERMVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQYCICIDDCSSSNCMCGQLSMRCWYDKDGRLLPEFNMAEPPLIFECNHACACWRNCRNRVVQNGLRTRLQLYRTHNMGWGVRALQDIPLGTFVCEYVGELISDSEADVREEDSYLFDLDNKVQCSGWGIKADYVRPENV	112950	161654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_112994_114734_114909_116848_116932_118050_118158_127527_127651_142738_142841_143641_143747_153852_154008_155084_155253_155476_155622_156797_156876_158135_158252_159865_159953_161169
923981	contig_11748_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_177354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACATAACAACTTACACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197299	196609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11748_pilon_-_196600_197300
923982	contig_11175_pilon	+	2503	21	Intergenic	novelGene_61178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	32	junction_1	49.900801596768	60	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	746	2238	265	2502	307110	336927	FALSE	55	AAGAAGGAAAACAAGTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKAVLKQEKNNYNAWVFIGVAAAELEQPDQAQGAYKKAAELEPDQLLAWQGLASLYEKCNHINAKDDLPGVYQKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHVEVARTWHKLIKTRQEEGADNQELHQLWRKLTQLLAESTEDQNNETQQLLLTAFENALGLSDKIPSEDHQVLYRQFIQCLFKFPHETARLKKACEGMINIYPSVQYPLEVLCLHLIESGSFTDEAQQYCCRLVEMDSRSGPGLIGLGIKALQDKNYEDALKNLTEGLKESPLCTTGWYHLAEAQLKMHRPKEAILSCSQALKNIDNLGVSGGSLHQKNLCLHLKAEALIKLSDYESSEEAIHTLDQVSDANNIPGLLVLRSLACLNKGLLDEATKIMEDLLSSYPDLAEAHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQKALEKDNEVAEYHYQLGLTYWSMGEETRKDKTKAFTHFLKAARLDTYMGKVFCHLGHYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEEMDTALAILTTVTQKASAGTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNCWESLGEAYLSRGGYTTALKSFIKATELNPESTHSVFKVAAIQQILGKYKEAVAQYQLIIKKNEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYVEKALEYFTWALQHRADVSCLWKLVGDACTSLYAVSPSKVNVHVVGVLPGQ	297128	336928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_297174_301402_301475_304875_305022_307108_307200_310629_310774_311643_311736_312841_312918_313454_313596_315441_315541_315655_315765_321987_322129_325266_325369_327112_327253_329538_329626_329714_329819_330298_330426_331026_331207_331391_331517_332861_333116_334293_334397_336803
923983	contig_8447_pilon	-	2333	1	Intergenic	novelGene_69404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCAGACAGGGATTGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39927	37594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_37600_39900
923984	contig_7428_pilon	-	1625	10	Intergenic	novelGene_77695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	82.7929143506053	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1560	66	1625	243098	234022	FALSE	20	TTCCAAGTCTATTACCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLSRLRHLGLGPRRAGSSKAMSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLHATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQNQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEPSQEPEMAPLGPKGLMHLYSELELSAHNAANRGLRGRGLIISTQEQGPDEGEEKAAGEAEEDYEEEDDEEEEDLSSPPGLPEPLQSVEVPPGPQALADGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDSSWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRTSPSQGSSPREESQDEPSEEAPMELGLKDPEEGTLPFQAQSLSPEPLPQEEEKLLPRNANPGIKCFAVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHAQPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDHSKLVDVPFQVEFPAPKNELVQK	250455	234021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_234060_234343_234429_234576_234692_235090_235219_235599_235750_236179_236244_236361_236448_236681_236858_242380_243113_250404
923985	contig_10143_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_163345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269886	272303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_269900_272300
923986	contig_1443_pilon	-	2805	1	Intergenic	novelGene_28366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GACAAAGAAGAAATACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967035	964230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_964200_967000
923987	contig_1428_pilon	+	1861	7	Intergenic	novelGene_158398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	58	junction_5	30.408332191468	9	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	145	1530	120025	155810	FALSE	80	AAAAAAAAAAAAAAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRKESETQCQTESKYDSVSGDTNDSSWNDIKNSGYISRYLTDFEPIQCMGRGGFGVVFEARNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLEAPPEKWQEKMDEIWLKDESTDWPLSSPSPMDAPSVKIRRMDPFSTKERIEIIAPSPVRSRSFSVGISCGQTSSSLSPFSPLEFSGADHRDVSGSVDPVCNLQDSCLTDCEGEDGTMDGNDEGHSFELCPSEASSVRSRERTSSSIVFEDSGCDNASSKEDLKTNRLHIGNHYANKLTGCKHASSKSSSEPTLSVSPPRPTTLSLDLTKTTAEKLQPSSPKVYLYIQMQLCRKENLKDWLNGRCAIEERERTVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKIGDFGLVTAMDQDEEEQTVLTPMPAYARHTGQVGTKLYMSPEQIHGNNYSHKVDIFSLGLILFELLYPFSTQMERVRTLSDVRNLNFPPLFTQKYPREVCIILTFDSF	117018	156141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_+_117132_119993_120117_125569_125720_127694_128473_132955_133124_140936_141039_155714
923988	contig_14273_pilon	+	2942	6	Intergenic	novelGene_21159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	566.924827468334	6	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	563	1927	138031	151187	TRUE	65	AAAAGAAAAGAAACAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHGWVLTSCYILIITIANIANLASTATTITIQRDWIVVVAGEDRSKLADMNATIRRIDQLTNILAPMAVGQIMTFGSPVIGCGFISAWNLMSMCVEYFLLWKVYQKTPALAVKAAFKVEEAELKQLNVHKDTEPKPLEGTRLMGDKDPDILELEHKQEPSCASQIAEPFRTFRDGWVSYYNQPIFLAGLGLAFLYMTVLGFDCITTGYAYTQGLSGSILSILMGASAITGITGTVAFTCLRRKCGLVRTGLISGFAQLSCLILCVISVFMPGSPLDLSVSPFEDIRSRFIQIEPLPTTTTTKIPGTFSTTEMHVSNGSSPANIAIETSPKSVPIISVSLLFAGVIAARIGLWSFDLTVTQLLQENVIESERGIINGVQNSMNYLLDLLHFIMVILAPNPEAFGLLVLISVSFVAMGHTMYFRFAQKTLGSRLFACGPDGKEVTNENQTNTSVV	137468	152259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_138052_139057_139185_147782_148029_148891_149549_150873_151989_152045
923989	contig_7080_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_100113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTGGGTTTTAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515399	518029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_515400_518000
923990	contig_10324_pilon	+	2566	6	Intergenic	novelGene_7876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.661477160101	810	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	204	710	549502	568878	FALSE	30	CCTGACTTCAGCACACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVSPTSGFATEAPSARTALMSSRRHACLSPASLGNSAVGDGSTAAFLSSGDVMAKWTARMAPTSKTVVSVIPGPYQALGNIAGRGTEEKPGRVGALSIVLPIVLLVLLCFGAFLLWKNWRLKSINSINFDNPVYQKTTEDEVHICRSQDGYTYPARQMVSLEDDVA	538643	570734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_538808_549462_549586_550276_550426_567233_567314_567956_568115_568842
923991	contig_1262_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_133558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294251	292041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_292000_294300
923992	contig_4232_pilon	+	391	1	Intergenic	novelGene_63376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTTTTCTACGCCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467234	467625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467200_467600
923993	contig_6412_pilon	+	2306	2	Intergenic	novelGene_149943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTACATGAGTTTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138266	229201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_140061_228689
923994	SIRV7	-	2458	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	116	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147922	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114685_114989_147608
923995	contig_7728_pilon	-	3181	3	Intergenic	novelGene_64747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906006	888817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_889414_903232_905183_905371
923996	contig_10749_pilon	-	874	4	Intergenic	novelGene_133484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	365.223523643018	59	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	77	514	168321	164291	FALSE	5	CTGGTCTCTGTTCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPEIGKKNESSPGGGVKVWGGNTGTMWKSNAGQPGPNPCPPYIGYPGGANPVHPQPTNPACHPGPFPPPPGVPHGNPVFPPCGPPQPVPQPGYPGCPPPGPYPPPGPHPPPCPPLAPGMPPLNYLPLEPHLPLSPNWLGKVGKGLPWACKDLLASWIEFLADEFSRGVVF	169064	163930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_164435_167119_167395_168302_168346_169012
923997	contig_5033_pilon	+	1908	1	Intergenic	novelGene_29107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAATAAGGTAAATATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842313	844221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_842300_844200
923998	contig_7839_pilon	-	960	1	Intergenic	novelGene_45691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCCTTGGTCAGTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182706	181746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_181700_182700
923999	contig_9919_pilon	-	3859	2	Intergenic	novelGene_137975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1956	2291	606793	606458	TRUE	50	ACAACAACAATACAGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLLVERRVAEANGRNDEVKEPNRRFQRAAREDKVKYYNEMCKDLELENQKRRTHSVFLKLKELKKKIQASSCNIEGFYGQNTEDARSIKKKMEGIHRVTIPKRIGQQ	608748	604384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_604610_605114
924000	scaffold_9100_pilon	-	2895	1	Intergenic	novelGene_83312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	242	607	836256	835891	NA	35	TTTTATATTTTTCATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKWSLVYINTLCVSLTRLHMFLQMTPGYTISIMYMLHYCLSLFILSQIGNTYNIPIRLWILDSHPFAPPICFLKPTANMGISVGKHVDAQGRIYLPYLQNWSHVRSVWVLKKFIFLHMYL	836497	833602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_833600_836500
924001	contig_3747_pilon	+	1715	3	Intergenic	novelGene_24957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5799.5	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	95	313	203322	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTE	203227	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203386_203498_203651_203801
924003	contig_3095_pilon	+	1226	5	Intergenic	novelGene_75093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	57	821	147241	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147184	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
924004	contig_8418_pilon	-	3328	1	Intergenic	novelGene_166062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	2787	3311	1085565	1085041	NA	60	ACAGGGGGAAAAAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTTTKHLQKQDRTVPVGVQNKTTDDSPLEENALELPDREFKSLIFRILQELMQKANKHEEKIDKSMEHTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFQTVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSKKRTKKNEETLRVMWDTVKSKNL	1088351	1085023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1085000_1088400
924005	contig_9484_pilon	+	2658	16	Intergenic	novelGene_105658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	561.976685953746	29	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	70	945	126829	206895	TRUE	20	TTTGGGATTTATTTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGLPGGPACYTDSHCSDCPSPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEKGYGTWTYRGKERTSPSSSKCTRRP	126759	213233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202577_202788_202823_204859_204895_206885_206944_211513_212353_212407
924006	contig_11292_pilon	+	1557	3	Intergenic	novelGene_109391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	148	junction_2	20	16	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	556	1125	41802	46916	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWRIFTGSLLVEEKSSALLHDLREIEAWIYRLLRSPVPISGQKRVDIEVLPQELHPALTFALPDPSRFNLVDFPLHLPLELLGVDACLQVLTCILLEHKVVLQSRDYNALSMSVMAFVAMIYPLEYMFPVIPLLPTCMASAEQLLLAPTPYIIGVPASFFLYKLDFKMPDDVWLVDLDSSRVRFLAEAW	41246	47348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_42099_46190_46323_46775
924007	contig_602_pilon	+	1873	4	Intergenic	novelGene_134934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_1	47.3028070578856	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	93	677	296691	305175	FALSE	55	GAAAGGAAGAAACGAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEHAVTQTEHMATIEAHAVAQQVQQVHVATYTEHSMLSADEDSPSSPEDTSYDDSDILNSTAADEVTAHLAAAGPVGMAAAAAVATGKKRKRPHVFESNPSIRKRQQTRLLRKLRATLDEYTTRVGQQAIVLCISPSKPNPVFKVFGAAPLENVVSRNELCSQIPFVFCRLWFTCFSSSVWHNSYHSTRSSSK	233725	306371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_233812_296684_296914_302845_302961_304928
924008	contig_12520_pilon	+	1001	1	Intergenic	novelGene_161068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430927	431928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_430900_431900
924009	contig_15838_pilon	+	6307	10	Intergenic	novelGene_174328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	139	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	892	1218	68437	68763	TRUE	25	TTGTGGGGATTGTAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFCKTNKLFIANTFFHQLERQLYTWTLPDGIHRNPIDYICGKRQWKTSISSVRTRPGADCRKNHQLFICKFKLKLKKIRTSPREPNYNLIISHLNSETISRRDLTR	67545	261615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_68853_84946_85606_110169_110910_216652_217172_235345_235569_242796_243788_243914_244154_250031_251202_251296_251396_261255
924010	contig_7009_pilon	+	1743	9	Intergenic	novelGene_23615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_8	591.223255209062	15	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	200	1219	444955	528034	FALSE	45	GTATATTCTCAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVVTYGADGFRDFHAIIPKSFSPSNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVAPYIVPGVLKACKSLSKAQQLVSICLEEQRKKERQE	431093	528558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_496799_496860_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_523002_527924
924011	contig_14727_pilon	+	1112	1	Intergenic	novelGene_56681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	390	689	382645	382944	NA	50	TAAATAACAGCCAACATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQNHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRYPFSSVVKSFPRFTVQPGSGQPHKTKWD	382255	383367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_382300_383400
924012	contig_9957_pilon	-	3732	2	Intergenic	novelGene_173839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1524	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	118	471	308248	307895	TRUE	30	CAGGTGAGAATCCTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIEKYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQIIRVKRYERVPMILVGNKVDLEGEREVSYGEGKALAEEWSCPFMETSAKNKASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEGCCSACVIL	308365	304286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_307514_307860
924013	contig_5031_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_133169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCTGTTGAGAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19202	16517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_16500_19200
924014	contig_17753_pilon	-	2354	1	Intergenic	novelGene_105075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1579	1941	57888	57526	NA	15	TAGGGTTTTCATGGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQAMPHSLNSSWAGLESRHPTRHVSWLNLLGKLPHSSTVPTAADYPIGQVSTGLTLLTRSSVVNSFTFFHHIRDSASRSGWLQSLSQPHSTFLQNQSLFSNLQSLTRTEHPKSKVRRG	59466	57112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_57100_59500
924015	contig_9979_pilon	-	2558	2	Intergenic	novelGene_179073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	142	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTAGCAATTAGACAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116451	4375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9979_pilon_-_6567_116084
924016	contig_1516_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_49951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAAAGTACAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300612	298318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_-_298300_300600
924017	contig_3155_pilon	+	1602	3	Intergenic	novelGene_26369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	622.5	108	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258080	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_261137
924018	contig_6735_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_15805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	1389	1838	545229	544780	NA	40	AAAGTAAACTTCGTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFHQYFSTYRPPSSPLPSSLLLDISLIPIAPSSLSLSPPSPKTTLILFAVSEASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKVSAASPGSTPRIPCPDRSLWCLN	546617	543995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_544000_546600
924019	contig_7898_pilon	-	1532	7	Intergenic	novelGene_47526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5680	junction_5	1651.6703329929	6	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	508	1464	285587	282118	FALSE	25	AAAGCCCTCTGCACTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286094	282049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533
924020	contig_13093_pilon	+	2218	6	Intergenic	novelGene_105217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTGGAGAAGCAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55772	80574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13093_pilon_+_56394_59701_60773_77589_77713_79446_79522_80070_80122_80297
924022	contig_14220_pilon	+	2093	1	Intergenic	novelGene_159884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCCCATTAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414518	416611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_+_414500_416600
924023	contig_8176_pilon	+	2875	3	Intergenic	novelGene_179074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1176	1697	33821	34342	TRUE	60	TTTTCACCGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHSQKKDRMVPVGVQNKTPHDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIHRFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKISEMDDVIEGLRSRSETVQDRISGIKDKHLDTTLFQENLEKRTNKNEETLRVMWDTIKSKNL	32645	40135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8176_pilon_+_34602_36729_36759_39245
924024	contig_5780_pilon	-	1962	1	Intergenic	novelGene_29769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	193	525	56601	56269	NA	45	CTAGACTGACCAAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKDYNLQYRLHLNIKKTKILTTRPISNIMINTDKIKVVKDYILLGSTINAHGSSSQEIKRHSISLGKFAAKDHFKVLKSKDVTLRTKVCLTSHRIFNCPICTRKLDNE	56793	54831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_-_54800_56800
924025	contig_4470_pilon	+	4767	1	Intergenic	novelGene_171776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTAATGTCTGAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241912	246679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_+_241900_246700
924026	contig_5881_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_129043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGGAAAGAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356565	354894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_354900_356600
924028	contig_12128_pilon	-	3006	1	Intergenic	novelGene_131979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	944	1246	272807	272505	NA	45	TGTTGAATATAAAGATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWPFLITCPKYVRRSLAFLASKEHSGCTSSKTDLFVLLTVRGIFSILSQHHNSKTSILLQSSLFFVQLSHAYQVIENTMAWIKCTLVLKVTSLLF	273750	270744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_270700_273800
924030	contig_10902_pilon	+	1324	9	Intergenic	novelGene_65691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	337.91268750226	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	359	1324	189165	218579	FALSE	35	TATGCAAACCTGAAATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCYR	168505	218579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_168587_170547_170597_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209783_218452
924031	contig_5779_pilon	-	2917	1	Intergenic	novelGene_106486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1619	1945	164092	163766	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEIQICMFPKETDIKTSETMAELKDCELYPLKASKKLPENHLPRNSPQYQSDLPEISRKNNGNLFILPFLPQPLFHGICSCLWLLVFAVDAECFSSRKRLQQRYKC	165710	162793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_162800_165700
924032	contig_18111_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_176732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	295	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	1947	2300	38944	38591	NA	45	TACAATTCAGCAACATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHYLPKLTELEKLNKPIIKEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEVYQTFREELTALLLKEFQSIDKDVILPNSFHEASITLTPKPGKDTTKKEHYRPLSLMNIDAKTLNKILA	40890	38588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18111_pilon_-_38600_40900
924033	contig_13042_pilon	+	2593	3	Intergenic	novelGene_179015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	10	504	3361	3855	TRUE	35	AAAAGTTTTTGAAATGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	3351	10319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13042_pilon_+_4086_4528_5057_8988
924034	contig_7457_pilon	-	1991	8	Intergenic	novelGene_31410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	169.618780246307	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTGCTCCAAGTCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473202	468235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470777_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473120
924035	contig_7184_pilon	-	1669	1	Intergenic	novelGene_130027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAACAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65649	63980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7184_pilon_-_64000_65600
924036	contig_11564_pilon	-	4081	3	Intergenic	novelGene_158559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	638	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGGTTGAACATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61263	57050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_59334_59417_60577_60624
924037	contig_233_pilon	-	2462	14	Intergenic	novelGene_14661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1095	junction_13	1055.42132701343	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	721	2166	73	2238	108727	78579	FALSE	30	CATTCACGATTTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	108799	78354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724
924038	contig_15323_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_148532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCACGTACTTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140102	141846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_140100_141800
924039	contig_15146_pilon	+	4358	1	Intergenic	novelGene_116960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCCTCAGGCTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556847	561205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_556800_561200
924040	contig_11816_pilon	-	2591	1	Intergenic	novelGene_98579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATAAACCAATAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336056	1333465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1333500_1336100
924041	contig_854_pilon	+	2848	12	Intergenic	novelGene_36652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	4238.76346385114	34	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	20	1774	1698397	1715249	FALSE	20	TGAGTTGCAGCTGTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKK	1698377	1716323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709334_1715244
924042	contig_17144_pilon	-	2943	9	Intergenic	novelGene_29544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1612.06381212873	29	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	1762	2763	170784	166277	FALSE	15	CTTAAACTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGCLQERVWSVS	174314	166096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166311_166480_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_172179_173947
924043	contig_8880_pilon	-	843	2	Intergenic	novelGene_165755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	125	junction_1	0	13	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	819	24	842	51626	34379	FALSE	60	AACTTGAAGAAGAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDVSPISMSPISQSQFIPLGEILCLAISAMNSARKPVTQEALMEHLTTCFPGVPTPSQEILRHTLNTLVRERKIYPTPDGYFIVTPQTYFITPSLIRTNSKWYHLDERIHDRSQCTSPQPGTITPSASGCVRERTLPRNHCDSCHCCREDMHSMHASTLQRKPTKDCKDPYCPPSLCQVPPTEKSKSTVNFSYKTDTLSKPKDGEKQSKKFGLKLFRLSFKKDKTKQLANFSAQFPPEEWPLRDEDMPTTIPREVEMEIIRRINPDLTVENVMRHTALMK	51649	34377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8880_pilon_-_35065_51493
924044	contig_13519_pilon	+	1735	13	Intergenic	novelGene_124629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	354.996674475817	1	92	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	128	1012	66179	100045	TRUE	25	ATCCAAGACTTGTACTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINKISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKLLTGKILQPHQS	57028	120662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57145_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_95191_95295_98559_98676_100005_100153_100536_100631_102213_102373_115522_115625_116672_116756_120484
924045	contig_10765_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_122941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCCCCCGGGATAACTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257304	256076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_256100_257300
924046	contig_14704_pilon	-	3356	2	Intergenic	novelGene_82708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATAATAGCGAAGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124952	86702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_-_89125_124018
924047	contig_4496_pilon	+	1869	1	Intergenic	novelGene_66644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	227	550	679554	679877	NA	55	AGCGTACAAAACCAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKVREKKSCHPRFQGALWLYFFQDRLVHSSGCHGTFSIHCQRHNSKASVLLQSSLLVVQLSHAYEAIENTITWVRALVLKVTSLLFNTLKRSFAAHLPSVVHHLIS	679327	681196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_679300_681200
924048	contig_4989_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_160777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTATCTTTGGCTAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24870	23224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_23200_24900
924049	contig_4686_pilon	+	2657	1	Intergenic	novelGene_118495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGACTACAGCTTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362631	365288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_362600_365300
924050	contig_5050_pilon	-	2549	2	Intergenic	novelGene_110264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1182	1649	330057	329590	FALSE	30	CACAACTGGTTAGTGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLGLTAPSIPGSSPGPVGQPPAQGGRGRGYQGDGDGAEQFFWMINHMRSFLCLVRPWVVGFPRQIQGQWVVGIIMRAEIQGPWTGGHSSCKRHPPLQAPGPSALAPQATSPRDCAFPRSFLNSTPYFVNSPLINPLTQMEGAVSDRTSADTES	365421	328689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_331047_365229
924051	contig_10930_pilon	-	2590	7	Intergenic	novelGene_36986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	6	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	16	1578	280370	268388	FALSE	15	TCACTTACTGTGCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280385	267375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
924052	contig_14868_pilon	-	2278	2	Intergenic	novelGene_150450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_1	0	22	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGTTTGGCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185249	152477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_154575_185068
924053	contig_4782_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_73673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	216	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	845	1153	597122	596814	NA	50	TGACTTCCTTAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVEAEGESPCHAAPPGQKGLPTQEKEKKTHKQFKTNERTKALGSHQHGSPDREAAPHSNGAPQPLRKKQRWRTKPGTRAKGVGGGKRQGRNQKEQEKKKQH	597966	595840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_595800_598000
924054	contig_4492_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_166113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAAAAAAAAAAACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169329	168849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4492_pilon_-_168800_169300
924055	contig_12528_pilon	-	2268	4	Intergenic	novelGene_81336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	577	junction_3	72.9977168592735	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1643	2134	947253	937394	FALSE	35	TCTGTTACTGATAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTHTYRNKHIHTHTLICTRIHTVTHTDRSLAFPGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPKTSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAW	948895	937259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_937459_937559_937622_943700_943777_946964
924056	contig_10861_pilon	-	2202	2	Intergenic	novelGene_39270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGGCAACCGCCTCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1340057	1337599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1337806_1338061
924057	contig_5258_pilon	+	2810	2	Intergenic	novelGene_100235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1274	1609	134364	134699	FALSE	55	CCTGAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWQFLKKLKIELPNNPAIPFLGLYPKDLKADIQKETCTQMFVAALFTIAKRWKQPKCPSTNEWINKMWYIHTMDYYPARRKNKVLIHATVWMELDDIMLSKIS	133032	135900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_133334_133391
924058	contig_9828_pilon	+	2704	18	Intergenic	novelGene_172254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	7.35835095111148	64	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	132	1433	187821	202758	TRUE	10	ACCCAGTGTTGGGCCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKIKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLHEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGGGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPGWPEDPRQRARLTGAQVGDLVHSELPGDAHDQEQSRDSGPEGGSAEGLLPLLVQCQQLRQRGGGDGGCGRR	187462	206063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_187524_187750_187830_188282_188337_189477_189562_189789_189891_190022_190153_191117_191274_192169_192242_192833_192921_193609_193748_195921_196054_199517_199628_200728_200844_202644_202769_203713_203817_204268_204373_204634_204677_205051
924059	contig_2730_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_135372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTCTAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301090	303000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_301100_303000
924060	contig_17074_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_145152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGGATGGGTAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260890	259403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_259400_260900
924061	contig_10074_pilon	+	3455	1	Intergenic	novelGene_57104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTAATGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213793	217248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_213800_217200
924062	contig_3601_pilon	+	2367	2	Intergenic	novelGene_132905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	11	481	224345	226218	FALSE	55	AATGAAACAAATACATTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINSKISEMDSVIEGLRSRFETTEDRIREIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGDPEQGKKTENTERIIEELLTENFPNIMKGTSSSTGITQFIKTIFYIPP	224334	228104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_224753_226155
924063	contig_5690_pilon	-	2328	2	Intergenic	novelGene_119705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1570	2082	936255	935743	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGWKIFKMPNGKSLEETAGRIMDVKSNSGEGSEGSEESNRESFCRLREYILCQQQNVARNVDVKRASGEALKENVEHVIGQWKKGNAFYAVAKNLSECPDREHNRDSLTEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLIETAGTPEDMAPGLCVSPKLKPFLRPTLQTKIRLDCGT	940739	935496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_937782_940696
924064	contig_4686_pilon	-	2165	1	Intergenic	novelGene_118553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAGAAAAAAAAGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547881	545716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_545700_547900
924066	contig_7527_pilon	+	1359	8	Intergenic	novelGene_139568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	151	junction_4	1191.38316117641	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	402	1091	85507	96119	FALSE	20	GAATACTTTTGTATTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGGPGAKSAAQAAAQTNSNAAGKQLRKESQKDRKNPLPPSVGVVDKKEETQPPVTLKKEGIRRVGRRPDQQLQGEGKIIDRRPERRPPRERRFEKPLEEKGEGGEFSVDRPIIDRPIRGRGGLGRGRGGRGRGMGRGDGFDSRGKREFDRHSGSDRSSFSHYSGLKHEDKRGGSGSHNWGTVKDELTEGPRYIQKQMSYNCSDLDQSNVTEETPEGEEHPVADTENKENEVEEVKEEGPKEMTLDEWKAIQNKDRAKVEFNIRKPNEGADGQWKKGFVLHKSKSEEAHAEDSVMDHHFRKPANDITSQLEINFGDLGRPGRGGRGGRGGRGRGGRPNRGSRTDKSSASAPDVDDPEAFPALA	80306	96387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7527_pilon_+_80487_84490_84642_85436_85578_85690_85781_86398_86519_89859_90038_94415_94590_96062
924067	contig_2940_pilon	-	848	1	Intergenic	novelGene_81888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	96	368	441781	441509	NA	20	GCTAGGCCATGATTCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPYKNLYIHCYVTLVLSPYCDSTLLLSTRLPMSIQPAPNPLCLPISPPDRSCPFSLLYLLELRGTVLMRITLCPTVQSNPCLKSWPRKLFYFWADRESRGYAFWGTSSLSQTIKSGLLTRI	441876	441028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_441000_441900
924068	contig_11548_pilon	+	1985	12	Intergenic	novelGene_66723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	982.710385861134	2	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	265	1554	63836	119638	FALSE	30	TATTCCATAATTTGGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGKKVLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPASMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTRYLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63571	120069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102178_102442_102575_112803_112904_117683_117771_117818_117856_118975_119121_119346_119402_119491
924070	contig_11071_pilon	+	3745	1	Intergenic	novelGene_131040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	3028	3384	192891	193247	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFELVVQSKRMLGPPGQERQEDPRVRGSCCSLGVSFSESFRELLPSRQVCCAQVRLSGSWGPHWWTVCPESKVDVSTPQRSGSVRHQITIGTDSPLPSIRLTAKEKARVSSSPSNKF	189863	193608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_189900_193600
924071	contig_3081_pilon	+	2778	2	Intergenic	novelGene_133988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	919	1596	2971957	2972634	TRUE	45	ATCAATTACATGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEPNAKINSQLEIIHRQQLEIQKINNKISEIDGVIEGVRSRFETVEDRISGIEEKHLDTPVFEENTEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRATREKQEVQYRGETIRQSSDYSAETMQARRQWDDIHKISKEKQIASQE	2971038	2973953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2972721_2972857
924072	contig_3018_pilon	-	1853	13	Intergenic	novelGene_78864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	418.730248290392	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	783	1853	583440	562938	FALSE	75	AGGAAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625103	562937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585123_600008_600194_624772
924073	contig_13110_pilon	+	2616	3	Intergenic	novelGene_138739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1419	1904	220722	222363	FALSE	25	GGTTGAGAAGGGACAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTKKMEEFKKIIQAQNAKINSQLEIIQKQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMMEDRISKIEDKHLDTILFMEKSEKRMKKNEETLRIMCDTIKSKNLRHLITWMKREDNILSEISQSQKDKYCMRPLLYNSCKSLHTKRNSLCWLQGMGGVRRELNR	219220	223075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13110_pilon_+_219544_219626_221028_222183
924074	contig_8044_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_132365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTACTGCCTTACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313226	315846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_+_313200_315800
924075	contig_16775_pilon	+	2050	15	Intergenic	novelGene_107762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	274.51058490428	2	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	156	1442	134135	174136	FALSE	25	CATTTGATTATACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAAIAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVDMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130354	174744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130448_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159424_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
924076	contig_10323_pilon	+	1359	5	Intergenic	novelGene_123608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTCCCTCTCCGGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460100	473526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_461001_463314_463452_467386_467477_468602_468774_473465
924077	contig_4105_pilon	-	3781	14	Intergenic	novelGene_21495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	737.239589969062	1	93	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	719	1810	109032	100151	FALSE	30	CTTTAAAGTTCATTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYGGRDRYDDRGSRDYDRGYDSRIGSGRRAFGSGYRRDDDYRGGGDRYEDRYDRRDDRSWGSRDDYTRDDYRRDDRGPPQRPKLNLKPRSTPKEDDSSASTSQSSRAASIFGGAKPVDTAAREREVEERLQKEQEKLQRQLDEPKLERRPRERHPSWRSEETQERERSRTGSESSQTGTSAASGRNARRRESEKSLENETFSKEEDCHSPTSKPPKPDQPLKVMPAPPPKENAWVKRSSNPPARSQSSDTEQQSPTSVGGKVALAQPSEEGPSRKDENKVDGVSVPKGQSGNSSRGPGDGGNKDHWKESDRKDGKKDQDSRSAPEPKKSEENPASKFSSASKYAALSVDGEDENEGEDYAE	121988	98179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_101403_101510_102097_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106017_108693_108868_108971_109098_114244_114380_115284_115340_116989_117103_119337_119547_121847
924078	contig_14450_pilon	+	3474	8	Intergenic	novelGene_48969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	2830	3300	1043137	1169744	TRUE	40	CTTATTCAATGACAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEAPLAAFAALLAALGGELVVVVGRGGGDGVAGWGGAPGIGGFGTAVVVILLGVAADHWGAARRLALSPHPAAGDAVPHGCCHSNGSDWQRPDAGKHPSAQNPCSILDHSWRKTCLYLRGSIQKHHGSGSINVRILQKGSVSLKEGAARPDGWT	1038721	1310722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1040062_1040631_1042082_1043097_1043374_1065852_1065960_1077390_1077457_1169683_1169749_1238939_1239077_1310689
924079	contig_15327_pilon	-	964	1	Intergenic	novelGene_70739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAGTATTGTCTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997764	996800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_996800_997800
924080	contig_5686_pilon	+	2145	10	Intergenic	novelGene_45356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1973.23902427293	5	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	157	996	170242	199935	FALSE	0	GTTTTTTGTTTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHINELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVEYYHCLVVFPGAMAG	129862	201084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_129993_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176717_182642_182789_189033_189098_198550_198595_199758
924081	contig_16775_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_107794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTTTTCCTCAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195081	192292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_192300_195100
924082	contig_5222_pilon	+	2298	4	Intergenic	novelGene_58995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	320.154129548045	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	1004	1612	185407	188217	TRUE	25	TTTCCACCATTTTTAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPAPTHMTPSPRQSEDGTYTGFIKVHLKLRRPVTVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSEVIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSVADCPLYLRLLAGPDTDVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYDKFRQKLEEALRESQGKPG	184403	188952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_185747_186224_186341_188064_188493_188541
924083	contig_19013_pilon	+	2311	2	Intergenic	novelGene_162090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAGGTAATTAAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43338	50275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19013_pilon_+_45444_50069
924084	contig_15498_pilon	-	1586	11	Intergenic	novelGene_42654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	258	junction_9	74.9965999229298	2	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	439	1320	12	1331	697708	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQHTLIVADTENLLKAPTIVGKSPLNPILFRGVGMVADPDNPLVLDILTGSSTSYSFFPDKPITQYPHAVGKNTLLIAGLQARNNARVIFSGSLDFFSDAFFNSAVQKATPGSQRYSQTGNYELAEALSRWVFKEEGVLRVGPVSHHRVGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697719	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_689495_689644_690473_690623_690908_691003_691276_691372_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
924085	contig_233_pilon	+	2433	14	Intergenic	novelGene_14582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	255	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	2133	2432	105585	127005	FALSE	5	GGCCCTGATGCTTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVIFWHQAQPGPNSTHSRQVLTLYWVHSWGRTRPEEEQSHQSEQQGMLAWHDLHSCPRTLVLRVLGGLGQVKLRSCPGWFTVTSGKRY	78138	127006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151_104308_105460_105626_108724_108818_109917_109978_126899
924086	contig_15105_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_150991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727028	728354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_727000_728400
924087	contig_4114_pilon	+	2756	2	Intergenic	novelGene_15608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321634	324523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_323678_323810
924088	contig_11270_pilon	+	1100	1	Intergenic	novelGene_179075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4597	5697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11270_pilon_+_4600_5700
924089	contig_12545_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_178136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAATACATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46667	43966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12545_pilon_-_44000_46700
924090	contig_9345_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_24707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATTTATACACATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	968777	970560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_968800_970600
924091	contig_7963_pilon	+	881	5	Intergenic	novelGene_58357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1296.79740129289	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	109	633	51450	57909	TRUE	25	GCAGCACTGGTGTGTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQVYNFRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGGHRCWHCPHHKGSAFQ	51341	63227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57426_57856_57934_63003
924092	contig_7933_pilon	+	617	3	Intergenic	novelGene_164684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6837	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGAGACGAGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	197937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_186078_189402_189558_197893
924093	contig_8198_pilon	-	3734	1	Intergenic	novelGene_178070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	60	521	76453	75992	NA	40	TTTAAAGTAACAGAAGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNRRLQRAAQEDKVKYCNEMCKDLELENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSTGKILNDTRSIKRRWKEYTGYQKALVDVQPFHEVAYDQELIILKEEVQAALKALAKNKPPGIDGILIEMFQRTHATLAALTHLCQDFWKTATWLTNWKRFIYVPIPKNRNYCKYH	76512	72778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8198_pilon_-_72800_76500
924094	contig_18283_pilon	+	4337	8	Intergenic	novelGene_170694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	73.792870625163	79	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	56	1321	53897	111846	FALSE	40	GTAGCCTATGATGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPFRPLCRVGSRDLQRRMWCHRLFHLQSRLQNLLKGGVTSWALQQPNFKRLFPLAIHGHHTASKSLNCAWQQHEDHFELQYANTVMRFDYVWLRDHCRSASCYNSKTHQRSLDTASVDLCIKPKTIRLDETTVFFTWPDGHVTRYDLEWLVKNSYEGQKQKIIQPRILWNAEIYQQAQVSPVDFQSFLETNEGLKKFLQNFLLYGIAFVENVPPTQEHTEKLAKRISLIRETIYGRMWYFTSDFSRGDTAYTKLALDRHTDTTYFQEPCGIQVFHCLKHEGTGGRTLLVDGFYAAEQVLQKSPEEFELLSKVPLKHEYIENVGECHNHMIGVGPVLNIYPWNKELYLIRYNNYDRAVINTIPYDVVHRWYTAHRALTIELRRPENELWVKLKPGRVLFIDNWRVLHGRESFTGYRQLCGCYLTRDDVLNTARFLGLQA	17072	114862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_17127_53895_54078_73948_74126_84641_84922_92554_92675_94690_94928_110824_110964_111714
924097	contig_9843_pilon	+	3490	3	Intergenic	novelGene_114299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1768	2262	1873	2367	TRUE	35	TTTTTTTTTTTAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLPGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNEAVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	105	128166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_2443_49409_50112_127715
924098	contig_17769_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_124256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91535	89862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_89900_91500
924099	contig_5686_pilon	+	1895	3	Intergenic	novelGene_45263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	298	639	94439	94780	TRUE	65	TTAAAAAAAAAAAAAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGTGGTISLLSALSAAIAFSLFGFFSLSLYLTLTSSPDSPFPCLFPLPDWNAEAVVASDTHWHCLVIHSFAYCSSIRRPTYGVGFDCRITILNDQSSHQQMSCPNTAYEIGL	93798	96825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93806_94148_95340_96128
924100	contig_14986_pilon	-	2089	2	Intergenic	novelGene_59732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	723	1163	151636	151196	FALSE	35	GGAGAAGAAAGCGCTACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLPVPRHSWRGDIKALIFCLFCFIFSNYFPTSTDSFCICTQQPLHFLFHIWRFNILLLRCLPEPSLSDIFQRQSNSVVPDKLFLFVLILFLACFGISSSNWLFHRRIEITINCGYKHLTDISCLVKSFFINSFQAFHNAGQIYQL	152454	150269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_-_151866_151961
924102	contig_8729_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_40124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGCGGGAATTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519055	521062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_519100_521100
924103	contig_9177_pilon	+	3236	2	Intergenic	novelGene_32722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATTTTTTTAAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612161	658930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_614914_658446
924104	contig_17440_pilon	-	2439	3	Intergenic	novelGene_7570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	564	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCGGGTCGGGCTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4004	1432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1440_1517_2728_2782
924105	contig_12119_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_88679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACATCAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365645	367651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_365600_367700
924106	contig_1694_pilon	-	3796	1	Intergenic	novelGene_144989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATGCATTAACTAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1677160	1673364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1673400_1677200
924107	contig_14184_pilon	-	3256	2	Intergenic	novelGene_66580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGGACAGTGAATAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31683	27664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_-_28451_29213
924108	contig_6898_pilon	+	1469	3	Intergenic	novelGene_35793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125694	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125908_126088_126520_126876
924109	contig_5062_pilon	+	2305	11	Intergenic	novelGene_157840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	199.77750123575	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	6	887	622718	742938	TRUE	25	TGGCCATTTAGTCATTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAPVVTGKFGERPQPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERTK	622712	744889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741848_742928_743066_743422_743527_743702
924110	contig_8138_pilon	+	1586	5	Intergenic	novelGene_52416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.121028852338	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	165	620	280295	306552	FALSE	0	TCTTCCTTTCTTTCCGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280181_280234_280331_288507_288616_304973_305098_306364
924111	contig_14441_pilon	+	665	3	Intergenic	novelGene_100772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	113	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	183	626	125667	126705	FALSE	5	GGCCGTGTGTCCGGGGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRADSAFSSGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121838	126744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126496
924112	contig_11883_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_163765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	212	636	620	1255	39547	38912	NA	55	AGAGAAAAAGAAATCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSETASKSSSIPSNPDYGVGDFSRQEKSSESQTVTELPKVVVHPVSVSPLRTDSPEVTESLPELSAQKRRDLPVTKVLSNSACVSSRETDEKSPQKRDVGHSEGKQEPHVGTVHAQLQRQQATDYSQEQQGKLLVSPRSLGSTDSGYFSRSESAEQTVSPPTPFARTLATTEQDSNKNSRACASRISTLAPSALLTGEKALLLPGQMRPPLATKTLEERISKLISDNEALVDDKQLDSVKPRRTSLSRRGSIDSPKSYIFKDSFQFDLKPMGRRTSSSSDIPKSPFTPTEKSKQVFLLSVPSLDCLPITRSNSMPTTGYSAVPANIIPPPHPLRGSQSFDDKIGSFYDDVFVSGPNTSVPQCGHPRTLVRQAAIEDSSTNENHVSLGTGQSVDESYQGCNASSETVSARNKSLAQASN	40166	38909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11883_pilon_-_38900_40200
924113	contig_6724_pilon	-	7572	2	Intergenic	novelGene_167980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	174	144	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCCCAGCCAAGTACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428600	369317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_373740_425450
924114	contig_13021_pilon	+	2221	14	Intergenic	novelGene_8154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2490.34436914317	3	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	76	1926	174676	180850	FALSE	45	AGACTGAATTAAGTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174572_174664_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
924115	contig_4425_pilon	-	2693	2	Intergenic	novelGene_178173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166423	163550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4425_pilon_-_164047_164226
924116	contig_1847_pilon	-	3442	1	Intergenic	novelGene_171727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	163	306	66685	66542	NA	20	TTCTAAGTCTTTTTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIQASSCNFEGFYGKILNSTGSKKRKWKEYTESLYQKELVNIQPLQEVEYDQEPMVLKEEFKAALKALAKHKAPGIDRIPIEMFQQTDAALVVLTGLCQEI	66847	63405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1847_pilon_-_63400_66800
924117	contig_10023_pilon	-	2029	2	Intergenic	novelGene_123488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	12	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGAAAGAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209488	206894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_208716_209280
924118	scaffold_12124_pilon	+	3163	10	Intergenic	novelGene_22301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3415.53405617465	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1194	1973	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473585	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1501971_1502076_1508010
924119	contig_9036_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_155454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAACAAAGAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134499	136829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_134500_136800
924120	contig_6795_pilon	-	329	1	Intergenic	novelGene_27751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	3	329	363507	363181	NA	75	AGAAAAAGCAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKRERDSSTIIAGDFNTQLSVKDRTSRKKLSKDTKHLNATVSQLDLVDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTVSRVDHTLGHKASLNRIQSIEILQSIFSDHKAVKVEISN	363509	363180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_363200_363500
924121	contig_9177_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_32778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTTTGAAGCTGTCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385257	1387286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1385300_1387300
924122	contig_4845_pilon	-	1439	2	Intergenic	novelGene_53633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTTGTAAATCGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241719	239988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_240971_241262
924123	contig_1143_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_86580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACCAGAAGAGCCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109261	107110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_107100_109300
924124	contig_20550_pilon	+	5359	18	Intergenic	novelGene_142619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	80	junction_2	235.432503422573	632	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1716	917	2632	12976	37779	FALSE	50	AAATAAATATTTCAGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQQQRSVMTEEYKVPDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQQGQTQDYSKAWEEYYKKQGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYYRQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQV	11599	40506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_12493_12952_12993_15553_15604_15692_15765_15896_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30891_30967_37487_37548_37627
924125	contig_16125_pilon	-	3353	2	Intergenic	novelGene_155278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166290	162762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_163267_163441
924126	contig_15118_pilon	+	2754	2	Intergenic	novelGene_74554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAGTCCAAGCTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139191	143909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_140128_142091
924127	contig_15491_pilon	-	2318	6	Intergenic	novelGene_75947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	240	junction_3	325.056671981979	9	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	107	772	46982	32303	FALSE	25	GCTTATCAAAGAGTCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47088	30756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_40256_40317_45107_45207_46879
924128	contig_7568_pilon	-	2774	2	Intergenic	novelGene_174001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	138	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGCTGAAAATTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78025	37587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_38110_75773
924129	contig_11293_pilon	-	2672	1	Intergenic	novelGene_134664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	630	2041	2670	26637	26008	NA	10	TGAATTTTCTTTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGVKLPAFWLIAELLTTVSPGTLIITILHKNNSYKKLELGWAMIIVESSFRTIKRVLKRKSVRKKRKIGVDIMVSTETMEDATQKSQPLKKVNLGPDGSLPTMLLWKTQLCLSFNFSICKRVENSAYLSCKCSLKIIKDYPCCFKKTGKKQPVFAMTSMVLWSQVLVPGLSKATRGRLTLCPGTSVPGTAFICKSTTSIFFNKSVLPG	28677	26005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_26000_28700
924130	contig_14618_pilon	-	1796	2	Intergenic	novelGene_136829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	0	20	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTACGTGAAGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1115280	1103916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_1105628_1115195
924131	contig_13004_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_112650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCTCATGTGTAAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443685	442665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_442700_443700
924132	contig_5033_pilon	+	5242	6	Intergenic	novelGene_28904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCAGCCCGTGGCGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446707	464698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_452152_452815_453121_456492_456604_462973_463033_464549
924133	contig_5361_pilon	-	640	1	Intergenic	novelGene_167207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426446	425806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5361_pilon_-_425800_426400
924134	contig_17144_pilon	-	1691	10	Intergenic	novelGene_29315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2295.08530194629	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	431	1396	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QELTLKRRGEERQGGLVGAWLAAPAIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183233	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179724_183158
924135	contig_11564_pilon	+	2013	2	Intergenic	novelGene_158566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTGTTGACTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57177	59300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58660_58769
924136	contig_755_pilon	-	4114	15	Intergenic	novelGene_119781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	847	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAATAAACACCCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583562	542023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_542174_546333_546451_547670_547790_555193_555315_556298_556760_561617_561699_562736_562918_565809_565889_568435_568614_572602_572763_573241_573427_576496_576661_577371_577513_580844_580925_581665
924137	contig_9527_pilon	-	3298	3	Intergenic	novelGene_134030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAGGGAAAAAAAGAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177861	174081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_174853_174914_175572_175991
924138	contig_18081_pilon	+	4297	1	Intergenic	novelGene_23807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	450	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAGAAAGGTAGATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143676	147973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_143700_148000
924139	contig_18647_pilon	-	2893	1	Intergenic	novelGene_162842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACTGTCATGTAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80289	77396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_-_77400_80300
924140	contig_7333_pilon	-	2385	20	Intergenic	novelGene_142752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	70.513392374464	1	95	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	141	2324	170084	94787	FALSE	35	CAGTGCCATTGCCAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADEEEGGAERMEVSTELPQGPQQLASWWDQQADFYTAFMHRLAQLVPEIYFSEMDPDLEKQEESVQMSIFTPLEWYLFGEDPDVCLEKLKHSGAFQLCGKVFKSGETTYSCRDCAIDPTCVLCMDCFQNSAHKNHRYKMHTSTGGGFCDCGDTEAWKTGPFCVSHEPGRADTTKENSRCPLNEEVIVQARKIFPSVIKYIVEMTIWEEEKELPPELQIREKSERYYCVLFNDEHHSYDHVIYSLQRALDCELSEAQLHTTAIDKEGRRAVKAGAYAACQEAKEDIKSHSENVSQHPLHVEVLHSEVMAHQKFALRLGSWMNKIMSYSSDFRQIFCQACLREEPGSQNPCLISRLMLWDAKLYKGARKILHELIFSSFFMEMEYKKLFTMEFVKARHLIEEQNVISVITETLLEVLPEYLDRNNKFNFQGYSQDKLGRVYAVICDLKYVLISKPTAWTERLRVQFLEGFRSFLRILTCMQGMEEIRRQVGQHIEVDPDWEAAIAIQMQLKNILLMFQEWCACDEELLLVAYKECHKAVMRCSTNFLSGSKTVVQLCGHTLATKSYRVSEDLVSIHLPLSRTLAGLHVRLSRLGAVSRLHEFVPFEDFQVEVLVEYPLRCLVLVAQVVAEMWRRNGLSLISQVFYYQDVKCREEMYDKDIIMLQIGASLMDPNMFLLLVLQRYELVDAFNKSISTKDQDLIKQYNTLIEEMLQVLIYIESGMYLEWEM	170224	94725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_94820_100051_100112_101606_101709_101975_102042_103024_103136_108095_108158_109748_109930_113624_113754_116956_117057_121505_121664_124171_124261_125089_125198_125537_125662_125898_125962_132524_132664_135310_135442_149685_149797_151937_152017_156508_156766_170003
924141	contig_4402_pilon	+	582	2	Intergenic	novelGene_140797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217748	222976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_217902_222547
924143	contig_11845_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_148148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84056	82337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_-_82300_84100
924144	contig_6270_pilon	+	2699	8	Intergenic	novelGene_99800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	398.950664434916	11	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	81	1013	27433	45668	TRUE	30	ATAACTTTGGTGAAAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVKLRKQPVPTVLIVSCWRSLLQQVMGIASFLPFLVGESDRIDRTFSCRLGHMVLWTVLLFLVPVAGTSADLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	27352	236362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_27545_35849_35871_37407_37666_39225_39481_40398_40558_45418_45457_45578_46787_235794
924145	contig_12277_pilon	+	3187	4	Intergenic	novelGene_139703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTTCCATCTCGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323936	451378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_325728_369745_370114_381506_382419_451262
924146	contig_15952_pilon	+	4191	2	Intergenic	novelGene_154063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGGCATTTCCAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267609	271859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_268361_268419
924148	contig_4732_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_75507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAGACAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1093258	1095235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_1093300_1095200
924149	contig_3382_pilon	+	1653	2	Intergenic	novelGene_124014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAACACCATTGCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132911	134682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_133884_134001
924150	contig_13042_pilon	+	3402	3	Intergenic	novelGene_179013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	7	639	2549	3181	TRUE	35	AAAAGTTTTTGAAATGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKFLDSTNQTKV	2542	10319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13042_pilon_+_4086_4528_5057_8988
924151	contig_14666_pilon	-	885	1	Intergenic	novelGene_39640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCATGTTCACCGCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485243	484358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_484400_485200
924152	contig_4519_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_123753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_4	113.049767801619	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	355	672	1400439	1406169	FALSE	25	ATTTGATTTCTGAGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDSEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVAHGAEVTCKDKKSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDVGIQIEQYKIMDRFYIFVSTLLAEVISG	1368012	1407031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_1368095_1391753_1391825_1398829_1399031_1400438_1400527_1405939
924153	contig_9921_pilon	+	2079	1	Intergenic	novelGene_23720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGCAAAACTTTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100274	102353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_100300_102400
924154	contig_5210_pilon	+	2235	9	Intergenic	novelGene_65405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	18.8215302247187	29	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	839	1996	387196	429457	FALSE	30	CTATACTTTTTCTGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLMDFVSPQHYPPREIVAHIIQKILLSDSETVDVLKEAYVLLMKIQQLHPANAKTVEWDWKLLTYIMEEEGQNLPGRVLFLRYVVQTLEDDFQQILRRQRQHLQQSIASTVLSCDKQPHNVRDVIKWLVKVVTEDELTQPPNGNQTSSETGILKASSSQPSPQADLTKNTNQLIVCQLQRMLSIAVEVDRTPTCSSNKIAEMMFGFVLDIPERSQREMFFTTMESHLLRCKVLEIIFLHSCETPTRLPLSLAQALYFLNNSTSLLKCQSDKTQWQTWDELIEHLQFLLSSYQHVLREHLRSSVIDRKDLIIKRIKPKPQQGDDITAVDVEKQIEAFRCRLIQMLGEPLVPQLQDKVHLLKLLLFYAADLNPDDEPSPNTWSGP	383435	429696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_384187_387108_387342_388160_388231_394462_394618_407432_407586_409217_409347_418739_418897_419074_419160_429194
924155	contig_3004_pilon	+	2158	2	Intergenic	novelGene_127538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCTTCACCTAAAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523362	526277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_523940_524696
924156	contig_8174_pilon	-	3100	1	Intergenic	novelGene_160054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGAAGACAAAATATCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254915	251815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_251800_254900
924157	contig_19345_pilon	+	2224	4	Intergenic	novelGene_179076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	59	619	7003	10333	TRUE	30	CTCTTGATAAAAACTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRNLIDGEKLSTENTIVRFMKNDTWSSMVGEICELHGTEDQDNNQKTHVSMLPIFNRGHLLENLCESNEDNHCGQTFSYIPNLSVLKRTMKAYPSECLECGKSLMNHSSLKHHMKYLSVCSAYQCKEYGEACSPSYLSAAVGTFTGEKSYECKECGKAFSYFSFLNEYVRYHPGEKHFEYMEHGKFCCDCSNLTNHKNSWLKEAL	6944	12048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19345_pilon_+_7095_9048_9348_10163_11592_11701
924158	contig_9440_pilon	+	6209	19	Intergenic	novelGene_59123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	140	junction_12	211.636889127359	5	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	726	2181	560	2740	1984413	2004320	FALSE	20	CAGTTTTAGCTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYHILTRKRIRYRFRRFIQQFSQCKATARNLKLKYLINLEALQSAFYTEQFEVKEPGRGPSGEEIFATIIITGNGGIQWSRGKHKESETLTEQDLQIYCDFPDIIDVSIKQANQEGSNESRVVTIHKQDGKNLEIELSSLREALSFVSVIDGYYRLTADAHHYLCKEVAPPRVLENIQSNCHGPISMDFAISKLKKAGNQTGLYVLRCSPKDFNKYFLTFAVERDNVIEYKHCLITKNENGEYNLSGTKKNFNNLKDLLNCYQMETVRSDSIIFQFTKCCPPKPKDKSNLLVFRTNGVSDVPTSPTLQRHNNVNQMVFHKIRNEDLIFNESLGQGTFTKIFKGIRREVGDYGQLHETEVLLKVLDKAHRNYSESFFEAASMMSQLSHKHLVLNYGVCVCGEENILVQEFVKYGSLDTYLKKNKNSINILWKLEVAKQLAWAMHFLEEKTLIHGNVCAKNILLIREEDRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQERIPWAPPECIENPRNLSLATDKWSFGTTLWEICSGGDKPLSALDSQRKLQFYEDRHQLPAPKWTELANLINNCMDYGPDFRPSFRAIIRDLNSLFTPDYELLTENDMLPNMRIGALGFSGAFEDRDPTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLRLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHKKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEYYKVKEPGESPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIELLKNNGRLPRPEGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDRIRDNMA	1978451	2007789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_1978732_1979536_1979657_1982196_1982355_1984411_1984524_1986423_1986611_1987264_1987393_1989463_1989599_1991298_1991387_1992099_1992228_1992979_1993119_1994745_1994898_1995050_1995202_1995952_1996090_1998684_1998875_2000141_2000267_2000642_2000816_2002220_2002339_2003854_2003969_2004215
924159	contig_12250_pilon	-	2977	6	Intergenic	novelGene_80580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1529	1888	314188	313725	TRUE	25	AAACGCCGCCACTCTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRDRDGTGARRGQVFTEGGDQGVKLRLLIVSQRLLQRRQQGDPITILTHFLSPPYSGACGFLSLVLSIPFSIFLLHPTHLPFPLAILFIIRVQNQVPYGNDGAAQRWRTSWLPGSRRR	315716	311792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_312170_312300_312406_312504_312603_313126_313596_313684_313750_313853
924160	contig_4701_pilon	-	2459	2	Intergenic	novelGene_165432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCATTAATATCACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74788	72219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4701_pilon_-_73405_73514
924161	contig_21065_pilon	-	1963	1	Intergenic	novelGene_176862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCATGAGAGCTCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2066	103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21065_pilon_-_100_2100
924162	contig_11292_pilon	-	2394	1	Intergenic	novelGene_109429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAGAAGTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258164	255770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_255800_258200
924163	contig_18487_pilon	+	2361	2	Intergenic	novelGene_172679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCACAGTAGCTGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217680	220125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18487_pilon_+_219804_219887
924164	contig_990_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_76022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGTAATAATAAAAACGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629493	630073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_629500_630100
924165	contig_6397_pilon	-	2186	1	Intergenic	novelGene_146237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATTAAGCTGGAAAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301466	299280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_299300_301500
924166	contig_8658_pilon	-	895	8	Intergenic	novelGene_55829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1361.93197109017	2	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	352	753	30206	6222	TRUE	15	GTCCCCCAGCCTTTGCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFTASPASSSTPRVITNQYNNPAGLYSSENISNFNHALESKTAASGVETNGSPLEYSQLPSGLVINKESEVYKMLQEKQELNEPPKQSTSFLVLQEILESEEKGDPNKPSGFRSVKAPVTKVAASIGNEACL	55662	5916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8658_pilon_-_6000_6162_6236_6743_6819_13112_13265_30045_30246_34540_34575_36529_36674_55528
924167	contig_17198_pilon	-	613	1	Intergenic	novelGene_62366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCTGGCTGATTCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811026	810413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_810400_811000
924168	contig_9345_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_24571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAGGAAGACTGATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	906420	904697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_904700_906400
924169	contig_17194_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_155383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCTGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302083	299710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_299700_302100
924170	contig_5623_pilon	-	4014	24	Intergenic	novelGene_154826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	355.446432464312	7	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	926	2781	222	3002	220970	209000	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLVIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPAARGWGTGTLRVPNRVLLVNVKFEGSEESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQPLVERPEDYALQVNGKYEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPTPQVQKLRTKPPPIPVKKPSSASLWSLEQPFCIELIQGSKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKMVSSSEVSVCSGPVWNQRLEFDINICDLPRMARLCLALYAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGEQCLYMWPFVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTESAAALVICLPEVAPHPVYYPALEKILELGRHGEHGRFTEEEQLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRGISRPSLESTVNESHSSSPMTLSM	276397	206929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209077_209294_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212593_212665_212717_213619_213751_213846_213944_214681_214904_216280_216371_216833_216984_217330_217511_217909_218140_218220_218450_220829_221000_239340_239459_276323
924171	contig_15327_pilon	-	3182	1	Intergenic	novelGene_70784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAGGGAGATAAAATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145652	1142470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1142500_1145700
924173	contig_6505_pilon	-	5474	1	Intergenic	novelGene_175699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTCTTTTTGAAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177024	171550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6505_pilon_-_171600_177000
924174	contig_5935_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_102763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	929	1270	1381475	1381134	NA	70	AAAGAAAAGAATATAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDDSLQYGLHINIKKTKILTTGPISNITINGENTEVVKDFILLGSTVNTHGNSSQEIKKHITLGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQTIVFSVPSFACESWTINKKD	1382403	1379937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1379900_1382400
924175	contig_11720_pilon	+	1609	3	Intergenic	novelGene_43868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3591	junction_2	2187	33	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	173	472	94193	94492	TRUE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRVGSEMERIPKSQREGGACRSAQGPKGTTWVFTWLVPWDGLFSAPSQSSSSSLPALIKAWKVWVFRPLVLGSQSKNIGCSLEPSFSECLLCISAPAT	94020	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_95061_95383_95486_98299
924176	contig_17144_pilon	-	1243	7	Intergenic	novelGene_29366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2627.24719155917	22	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	124	1035	179764	166277	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183205	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_166413_166774_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
924177	contig_4486_pilon	-	925	1	Intergenic	novelGene_38623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632505	631580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_631600_632500
924178	contig_3132_pilon	-	2363	4	Intergenic	novelGene_127405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTCAAACTGATTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13682	6294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_7590_8401_8501_12586_12677_12803
924179	contig_13968_pilon	-	2931	1	Intergenic	novelGene_106873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	1369	2067	45600	44902	NA	15	AGGACCGTGCAGTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVKNEVEYIKIDILGISELKWIGMGHFELDNHMVYYAGNDILKSNGIAFMVKKNISRSILKYKAVSDRIIVICLQGRPVNMTTIQIYAPTTNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNAKVGNKEGSVVGKYGLGDRNDGGDCNLLKIIKNLLQQYINKELPEIQARFGRGRVKKDIIADVRWILAESKEYWKDVYLCFIDYAKAFHCVDHNKLWIIL	46968	44037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_44000_47000
924180	contig_2768_pilon	+	2358	1	Intergenic	novelGene_57509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACTTACTGGCCTGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771113	773471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_771100_773500
924181	contig_3747_pilon	+	2641	9	Intergenic	novelGene_24763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4762.08219788099	30	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	242	1120	201481	203567	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAIWISFLKITGWRAPPPLC	200980	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201145_201403_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203508_203651_203768
924182	contig_14142_pilon	-	1948	10	Intergenic	novelGene_120517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	350.327501096747	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	243	962	353594	350546	TRUE	5	TGTTTGGGCTTCTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREVGPSTGGGPGNKLLGIAPD	355509	349028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_353901_354071_355472
924183	contig_9161_pilon	-	6687	1	Intergenic	novelGene_160646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGGAGAGGAAGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93967	87280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_87300_94000
924184	contig_9609_pilon	+	3219	18	Intergenic	novelGene_23021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_17	211.034673023162	197	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1901	2719	328876	332820	FALSE	40	ACCTTGAAAAATGATACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREMKYRDRAAERREKYGIPEPPEPKRKKQFDAGTVNYEQPTKDGIDHSNIGNKMLQAMGWREGSGLGRKCQGITAPIEAQVRLKGAGLGAKGSAYGLSGADSYKDAVRKAMFARFTEME	320116	333320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330305_331388_331487_331563_331694_332694
924185	contig_8075_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_42508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTTTATAAAGACAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731097	733225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_+_731100_733200
924186	contig_15047_pilon	+	1076	6	Intergenic	novelGene_52190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	66.7101191724314	71	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	20	589	2194	4667	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRNGCLWTAVCWSCGGCSCDLEEEELR	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3388_4591_4676_21004_21062_21232
924187	contig_10722_pilon	+	1630	2	Intergenic	novelGene_70966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	402	713	4077	4388	TRUE	50	ATCTCAATTCTGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDYESIHHTADRQNQEGMLAWRRVSACAGRVLSGWRHGACLCGTSQRSETFPACPCDVPFHACVSWQHLSDPETCSEIENEIFSFCVHVYLNFSNHLWCAWP	3675	6160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_4754_5608
924188	contig_8330_pilon	+	3568	5	Intergenic	novelGene_71879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	69.6455310841981	38	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	46	552	1047979	1113776	FALSE	40	GGACTGTGAGAGAATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEARIGGLPGLEATGCHMEPRASCQAAASLVEGKFHVLVGVTGSVAALKLPLLVSGLLDIPGLEVAVVTTERAKHFYSPQDVPVTLYSDADEWEMWKCRSDPVLHIDLRRWADLMLVAPLDANTLGKVASGICDNLLVILYLSGLEEDSLTTCNMQMTQPCLLKVKRT	1043232	1116792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1043255_1047955_1048165_1059953_1060050_1060925_1061055_1113680
924189	contig_4315_pilon	-	2672	2	Intergenic	novelGene_46873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTTAGAATCTAAATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	872510	869547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_870193_870483
924191	contig_8576_pilon	-	4360	4	Intergenic	novelGene_88721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	944	1744	627439	626639	TRUE	30	CTTTTAGCCAAAGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKGQNQNINYRTQTNEIEQQKKPTATGRKEIVKIRAEINEIENIKTIERINKTKSWFFERINKINKPLARLTKEKQERMQITQIRNAMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLQQSDGENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFSEELVPVLLKLFQSTEKEATLPNSFYEASVSLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDVRILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGM	631231	523330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_523954_524143_524911_625412_628263_631111
924192	contig_14575_pilon	-	7668	1	Intergenic	novelGene_101926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	192	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	680	982	396439	396137	NA	15	TAACGTTGCCTTTTCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYNLQYRLYINIKKTQILTTGPIGNIMIKGENIEVVKDFILPGSTINAHGSSSQEIKQLIALGKSAAKDLFKVLKSKDVILRTKVRLTQAMVFSIT	397118	389450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_389400_397100
924193	contig_13780_pilon	-	4099	2	Intergenic	novelGene_149139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2357	2998	938420	937779	TRUE	30	CATTGTATGTATAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQITNFIWKGTRPQISKALLKKKNKVRGLTLPDFRTCYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDLNSSTCEHLIFDKGPKSVNWGKDSLFNKWCWHNWISICRKLKQDRTSHHTQKLNSKWIKDLNIKSKEIKILEEKIGAMLGALIHGINTIRTVSNNAQAPEERLDSWELLKIKQLRSSKDFTKRVERQPTDWENIFWLQQIRSASNV	940776	936203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_936683_937156
924194	contig_9653_pilon	-	3242	12	Intergenic	novelGene_48293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	978.824535386389	1	127	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	11	1798	1025386	1006903	FALSE	45	AAAAAAAAAGTGTGTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEQMKKGHNPAGLLALQQIADYIMANSFSGFTSSPLSLGMVTPINDLPGTDASSYVKGEKLTRCKLASLYRLADLFGWAHLANTYISVRISKEQDHIIIIPKGLSFSEATASNLVKVNIIGEVVDQGSTNLKIDHTGFSPHAAIYSTRPDVKCVIHIHTLATAAVSSMKCGILPISQESLILGDVAYCDYQGSLDEQEERIQLQKVLGPSCKVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1025396	1005458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1018136_1018281_1018772_1018923_1019949_1020031_1021006_1021159_1025286
924195	contig_2733_pilon	-	2602	13	Intergenic	novelGene_128593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAATGCAAACATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915932	903090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_903290_903648_903811_907488_907577_907985_908090_909419_909550_909954_910030_910186_910239_910935_911173_911426_911635_911754_912426_913576_913738_915166_915395_915645
924196	contig_10732_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_114733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442553	444412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_442600_444400
924197	contig_6496_pilon	+	2449	2	Intergenic	novelGene_103491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	202	junction_1	0	29	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCGCTCTGTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451961	455261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_452686_453536
924198	contig_14133_pilon	-	1860	1	Intergenic	novelGene_119986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCCTCCTGAACATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299676	297816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_297800_299700
924199	contig_16633_pilon	+	2863	1	Intergenic	novelGene_165071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGACTTACAAAAGCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83455	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_83500_86300
924200	contig_3151_pilon	+	3946	1	Intergenic	novelGene_139193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTAAGTTGGATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218255	222201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_+_218300_222200
924201	contig_12624_pilon	-	3759	1	Intergenic	novelGene_60987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATAATAATTGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90071	86312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_86300_90100
924202	contig_18607_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_175111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	887	1357	115263	114793	NA	50	AATAACAACAGATCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPKVFKHFILLGSTINAHGSSIKKSNDALHWANLLQKILKSKDVTFRTKLHLTKAMTFSIASYACKSWTLYKEHQRKIDDFVLWYWRRILTIPWTAKRMNKSVPEEVNPECSLKTRMAICLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRLSSR	116149	114663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_-_114700_116100
924203	contig_12837_pilon	-	4544	1	Intergenic	novelGene_57394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	123	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2779	3156	418000	417623	NA	75	TAAAAAAAAAAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKDLIHLPEQRPPSLAAYPASLASCIQWIQLLGFVRQAPVRFYYNTLYRNLTTGCMGIACIEYGVCIMSKSHNVLFLRMYHGFWSPGGVVVKSSAAYQKASSSHLPAALWKPFRAVLLCPVGSL	420778	416234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_416200_420800
924204	contig_12837_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_57329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGTTACAGAATGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148208	149648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_148200_149600
924205	contig_1146_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_84805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	383	1149	1227	2375	266831	265683	NA	45	GTTGGAAAAAAAGATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSRPSSACHILINNPVNACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQH	268057	265680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_265700_268100
924206	contig_18214_pilon	+	2946	1	Intergenic	novelGene_166020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTCTCCCAGCATCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193247	196193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18214_pilon_+_193200_196200
924207	contig_4125_pilon	-	2219	10	Intergenic	novelGene_25172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	2.3094010767585	11	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	303	1340	1016914	992557	FALSE	50	ACAGAGCTAGGAGATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSVSENLFEANESPPMETGKTESKEPEEGCHAESEGVTMTTIMEMPQGEDEAEIQLGEVTEGEIGPFSSIKVPIIFTPIIPGEVQTKFKVVFKNPQYPTLYFRVIGIAIDVPVWVPKPNVDLKICMYDRLYQDSVLVHTRSKAALRLRFEVCKELRAHMELLPETGYIQALSSYSVQLKFLPRHSLSEDAGKYFDKESRVLEAPMTIWVADQIRPVEFTVHAIVTTSDLEISPSEVDFGYCTIYEAIKTSVTLHNHALLPQEFGFVGLPKFVDIQPNDGFGTILPLESLHLDVIFQPTKAKEYSFELVCKSEINRLPCSQMDYSPTYPYTPPSIILNTTSTADL	1017615	991677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_992648_995014_995149_996882_997057_998012_998101_998826_998956_1003663_1003786_1004667_1004791_1005277_1005355_1016814_1016963_1017361
924208	contig_6915_pilon	+	1672	1	Intergenic	novelGene_162421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCGTCATTTTATTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263247	264919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_263200_264900
924209	contig_10951_pilon	+	1599	1	Intergenic	novelGene_61631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTTTGTTATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175937	177536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_175900_177500
924210	contig_5317_pilon	+	1841	3	Intergenic	novelGene_76539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	43	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	913	1323	35282	43326	FALSE	10	CCTGTTTTTGGTCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	34369	43844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
924211	contig_11815_pilon	+	2450	3	Intergenic	novelGene_50877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACCCTTCTAACTCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9615	12685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_10038_10550_10652_10758
924212	contig_7697_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_128278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAAAAAAAGCACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177267	176225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7697_pilon_-_176200_177300
924213	contig_3068_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_137653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1735	2043	407717	407409	NA	40	CACTTAAATGCTACCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKERTQWSKFKKCSYIKSELTTEAPFNCFLFLSKAGLLVPHSLKLTLGFSSFSLWFSNYGPQNLQSLLNNLMIRDIFPTEYCPHLQLLTQKHESENQADSP	409451	407037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3068_pilon_-_407000_409500
924214	contig_12180_pilon	-	1842	12	Intergenic	novelGene_160346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAGCACCAATAGACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97129	73512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_73593_75521_75691_75795_75923_77522_77634_77752_77891_86763_86954_87631_87739_87821_87916_91461_91636_94534_94644_96480_96561_96666
924215	contig_15518_pilon	+	2934	4	Intergenic	novelGene_127598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	239.473496561844	124	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	21	66	416	481	15096	38209	FALSE	35	TCAGTAATCTGGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICGQSLHHCF	11046	40662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11055_11223_11422_14886_15136_38183
924216	contig_14807_pilon	+	3767	22	Intergenic	novelGene_124718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.63887656499994	198	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	387	581	45594	46098	TRUE	25	AGGGAGGTTGGCACGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKQNFIPLGGVENQGVVVQDPPPLTGPKKTGRTPNGSLVSFFQVKAARPQVGEAGESSAGWAGGWLGVGAGTAGGSGHCDAVGAARDVLISPLDHQRVLPLVLEQVGDAVEPAAHVLHQDLLAGRPRAMNTHQQHVVACFAAVHCEAALLACIGLAQPQALGHHLAGICWAWAWGPVLGGTGCLGQGVHEYR	45207	55190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_45622_45931_46139_46221_46438_46549_46728_47474_47607_48157_48272_48431_48573_48678_48948_49095_49218_49293_49443_49523_49728_49832_49993_50086_50263_50499_50629_50800_50941_51032_51142_51267_51363_51469_51720_53815_54026_54397_54558_54646_54768_55119
924217	contig_9785_pilon	-	543	1	Intergenic	novelGene_157909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTGTTGTAATGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	575461	574918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9785_pilon_-_574900_575500
924218	contig_3942_pilon	+	495	1	Intergenic	novelGene_128831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCAGTGTTAAAGTCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1234423	1234918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_1234400_1234900
924219	contig_7587_pilon	-	2678	2	Intergenic	novelGene_163711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	116	451	156016	155681	TRUE	70	CATCAAAATAAAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGTRGFLRAKQEFHRLTGWQWPVTHSFTFNIFQQNAQLSGFTDNLGITMTLYNKMESDHENILYYTEASWYFHRILTRVVELKINVTFFSQPKKLLNLLADFKVKCVSSK	156131	135266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_135750_153936
924220	contig_6902_pilon	-	3584	1	Intergenic	novelGene_135606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	128	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAGCAAAAGCAGTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510847	507263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_507300_510800
924221	contig_2161_pilon	-	3061	2	Intergenic	novelGene_114945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCACTTACTATTTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944085	940955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_943285_943353
924222	contig_18794_pilon	+	3140	1	Intergenic	novelGene_54650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1139	1462	175816	176139	NA	30	AATGTCTCTTAATTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHFESDNRVVYCAGNDSLKRNGIVFIVKKNISRFILKYNVFGDRIISICLQGRTVNTTIIQIYAPTTRAKDEEIEDFYQLLPSEIDQTCNQDALIFTSLLKKKKMH	174677	177817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_174700_177800
924223	contig_2703_pilon	+	1449	7	Intergenic	novelGene_101781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	724.589768995763	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	47	433	603453	609348	TRUE	25	GCCGCATCACTCTTGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRGEASLARPLTAAGCIFPSWLRSMRGYVITSRPSRMATCLECGWTEECPCPTCWNQRSFHTKCSW	599689	611719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_599697_603413_603520_605155_605221_606091_606240_607652_607732_609320_609402_610756
924224	contig_19023_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_179077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGGGCCATACTCTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37433	37818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19023_pilon_+_37400_37800
924225	contig_593_pilon	+	3249	10	Intergenic	novelGene_101996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_7	117.239545849987	33	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	194	1237	300334	480298	FALSE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRMESCLAQVLQKDVGKRLQVGQELIDYFSDKQKSADLEHDQTMLDKLVDGLATSWVNSSNYKVVLLGMDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVRDAAINSLVEIYRHVGERVRADLSKKGLPQSRLNVIFTKFDEVQKSGNMIQSANDKNFDDEDSVDGNRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRIGSSTLGSKSSAAKEGAGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSARDLEESINKIREILSDDKHDWEQRVNAVSH	300140	482310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_300529_383566_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_398710_398809_420091_420160_471623_471777_479016_479091_480193
924226	contig_15775_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_148376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	104	403	19685	19386	NA	20	TTTCACTATGTGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHHPLIQEQGLIQQHFSSLPEKFTWERQISQQKIMTHCSGSLHHSQGHFFPLNNVDGTQIHCQKNAIPQENPCPVDEEIFTFRVRVLAPFLARFSPSAQEQAKKSRKADCSLYNISTWLFFTLAHAGGLRINK	19788	18486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_18500_19800
924227	contig_13904_pilon	-	953	1	Intergenic	novelGene_165478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAAATTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40492	39539	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_-_39500_40500
924228	contig_20199_pilon	-	1001	4	Intergenic	novelGene_82515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1236.83502897067	179	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	128	463	43987	41055	TRUE	25	GGGACATCCCAGTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQDLAHSPTKWWLELHESDRRQELHALLKEIRAIRQELSEIWQELVSSSWSADLSEPKKCCTCRIL	44114	27557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_27692_40650_41250_42110_42171_43906
924230	contig_2550_pilon	-	1306	1	Intergenic	novelGene_135708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAGAAATTAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734987	1733681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1733700_1735000
924231	contig_9319_pilon	+	4609	3	Intergenic	novelGene_154646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	140	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	3959	4465	92654	93160	FALSE	15	GTAGTTATTTTTCTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILEKFSVRNSAMILSVSSVFSPCSRTPITHRFLLLIVSHIILRVSSFLFIIFSEFSPNTVVSNCLSSILLILSSTISNLLLSPSMTLSISEILLFVFWISNYCFCIISSCEFILAFCSCIIFLSSSLSVFFMNLSAFPMNLSIFPHFCLLLLQLLDNSEC	88107	93304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_88390_88492_88691_89175
924232	contig_11855_pilon	+	4652	2	Intergenic	novelGene_66914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	274	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCCCTCGTTTCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	806054	811140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_809641_810074
924233	contig_6743_pilon	+	1220	1	Intergenic	novelGene_33544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCCTGTGCTTTAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200394	201614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6743_pilon_+_200400_201600
924234	contig_3233_pilon	-	1476	2	Intergenic	novelGene_56590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTAAAAAAAAAAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760650	758789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_-_759138_759522
924235	contig_1948_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_31150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	756	1220	283002	283466	NA	60	AGAAAAACAGTACCACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYAGNDKLKMNGVACIIRKNVSSSILKYHAVSDGIISIRLQGRPVNRTIIQIYTPTTNAKDKEIEDFYQLLQHEIYQTCNQDALIITGDWNVKVQNKEGGSVVGKYGSGDRKDIGDHMIEFCKTNDLFTANTFFRAKNKAVKKSKTIPTTFL	282246	283550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_282200_283600
924236	contig_1594_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_138851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATTCAAAAAAAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723056	725124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_+_723100_725100
924237	contig_10765_pilon	-	1390	4	Intergenic	novelGene_122910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_2	29.4882274061286	10	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	41	1006	157570	151109	FALSE	80	AGTACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQNARDRQDKRIKMKQQQRVCPQPGSLYLAKTSTGPRLSLKTAVGGRVPATRSREQLYMCGVPKHCVKINSKNAESFQFHVRDYFGKEALRAGKGIQLADGGWLIPSNDGMAGKEEFYRALCDTPGVDPKLISRDWVYNHYRWIIWKLAAMEFSFPKEFANRCLSPERVLFQLKYRYDMEIGRSSRSAIKKIMERDDSPAKALVLCVSAIVASSLDVHEPSSSKTSSVDIRNAAVLELTDGWYAVRAQLDAPLSALLKMGRLTVGQKIITHGAELVGAQDACTPLEAPESLVLKVNQINLHSWQKSAPIQLNPRRLLHLKLSIHLCMFQGCYIS	157610	150724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_151587_152085_152257_154655_154844_157441
924238	contig_11978_pilon	-	4151	2	Intergenic	novelGene_62943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	468	junction_1	0	25	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGCAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	999038	991915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_995180_998151
924239	contig_4626_pilon	+	2972	2	Intergenic	novelGene_158818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAGAGCAGAACTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19680	23005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4626_pilon_+_19875_20227
924240	contig_6137_pilon	-	4442	4	Intergenic	novelGene_59235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATCAATCTTATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1328332	1315555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319602_1321457_1321503_1323816_1323938_1328102
924241	contig_6299_pilon	-	2124	1	Intergenic	novelGene_172949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAGAAAACTTCCCCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975723	973599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_973600_975700
924242	contig_10838_pilon	+	985	1	Intergenic	novelGene_129157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14778	15763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_14800_15800
924243	contig_6048_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_73370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAACAATCAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3132015	3130762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_3130800_3132000
924244	contig_1154_pilon	+	347	1	Intergenic	novelGene_87039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTATTTTGCTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42157	42504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_42200_42500
924245	contig_16594_pilon	-	4512	11	Intergenic	novelGene_53795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2665.07883560693	105	166	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	83	1228	272836	121101	TRUE	20	TATTCGTGTATCTGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	272918	115119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_116900_116975_118379_118467_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
924246	contig_7357_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_36847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCAATGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161279	163261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_161300_163300
924247	contig_7357_pilon	-	2217	9	Intergenic	novelGene_36821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1745.44148695251	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	585	1346	154622	136424	FALSE	5	CTTTCTTTGTTTTTCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167037	135552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154682_154940_155079_159911_160034_166772
924248	contig_9011_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_159282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAAAAAAAAAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186308	184981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_185000_186300
924249	contig_3745_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_85093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATACACGTTTAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	418852	420932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3745_pilon_+_418900_420900
924250	contig_12019_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_87779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAGTACAACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724403	725547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_724400_725500
924251	contig_8978_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_49304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTAGTCTCTATACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98198	96908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_96900_98200
924252	contig_19362_pilon	+	3086	1	Intergenic	novelGene_157788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	80	301	27141	27362	NA	40	CTCATTAAACAGTTAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDRRRIDAFELWCWRRILNTPWTAKRMNRSVLEQVQSECCLEARMVRLHLTHFGHIFRRDQSLEKDITLGKVQSQRKRGRPSTRRIDAVWLQQWTQAWQ	27061	30147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19362_pilon_+_27100_30100
924253	contig_11574_pilon	-	869	1	Intergenic	novelGene_64114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	424	771	794291	793944	NA	10	GCCAACTGTGCCCTCCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTLSRFLKKLKIELPHDPAIPLLGIYSKDLKAETRISMFTAALFTIAKRWKQPKCPLTNEWINKMWYIHTVEYYSASRRNEVLIHATVCMELEDIMLSEIRQSQRTNTV	794714	793845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_793800_794700
924254	contig_9121_pilon	+	3163	2	Intergenic	novelGene_134474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCATGGTAGACCATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267973	272457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_268775_270095
924255	contig_14643_pilon	-	2984	9	Intergenic	novelGene_99125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	501	junction_4	108.88382570428	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	662	1989	44	2032	53817	35191	FALSE	80	ACAATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFDYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLERDNVNPESQLIQQNEQSESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMHNRMQYSLEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEIAMISIQLAARFLFTTGFHTKKIVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGKIKYFFSLQ	53860	34238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_35409_40986_41117_41617_41844_42998_43123_43496_44251_45619_45762_48091_48266_52009_52201_53787
924256	contig_5686_pilon	-	3856	1	Intergenic	novelGene_45414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAATTGAAGCAATGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184365	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_180500_184400
924257	contig_266_pilon	-	1541	1	Intergenic	novelGene_166298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGTTCAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602917	601376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_601400_602900
924258	contig_6102_pilon	+	2603	21	Intergenic	novelGene_31842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	594.994409637603	2	9	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	75	1220	370803	379959	TRUE	30	GCAGGTAGGGTAAACGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQ	370728	394921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374749_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394645
924259	contig_776_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_139937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAATAAGCAACATTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	871454	838331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_840572_871314
924260	contig_4426_pilon	+	712	3	Intergenic	novelGene_15395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGCAGTAGATGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	565430	747673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_565716_747077_747165_747333
924261	contig_1813_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_105491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATTCAAATTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115617	118027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_115600_118000
924262	contig_10044_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_156381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115346	112880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_-_112900_115300
924263	contig_9185_pilon	+	2424	1	Intergenic	novelGene_166894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAGGAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267543	269967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_267500_270000
924264	contig_18714_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_179078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAATAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6963	5655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18714_pilon_-_5700_7000
924265	contig_3866_pilon	-	2153	3	Intergenic	novelGene_112412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	610	junction_2	34.5	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGGAGTAGAACAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210380	205147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_206037_209029_209125_209211
924266	contig_2161_pilon	-	4556	4	Intergenic	novelGene_114942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	553	912	956354	955995	TRUE	15	GAGGTGGAGTTACCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQQQRTYSSRTRRPVRDGAGADPRSERAECVCNGGFLAEWGASTHLLVELGLLTHGAREVSACVQEASCQSGVPPGIYTGGDTELWNTCPSRADVGLRAEGLEAIGSRS	956906	938131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_938197_941023_941368_951468_951831_953121
924267	contig_8712_pilon	+	1696	4	Intergenic	novelGene_58816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	577.82407934134	24	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	84	404	315133	321793	TRUE	25	CTCATGGTGTGAAGAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	315049	323268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318064_318222_321684_321926_322108
924268	contig_3060_pilon	-	3709	7	Intergenic	novelGene_178027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	8.06225774829855	51	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	73	1185	589887	310625	FALSE	40	ATAAATATTGCTTTTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRCPSRERNPAFSWSDAVPRSLIPMHRLILVYILVCVNFCGYRHTSATPQSASIKALRNANVRRDESNHLTDLYRRDETIQVTGNGHVQSPRFPNSYPRNLLLTWRLRSQEKTRIQLAFDNQFGLEEAENDICRYDFVEVEDISETSTVIRGRWCGHKEVPPRITSRTNQIKITFKSDDYFVAKPGFKIYYSFVEDFQPAAASETNWESVTSSISGVSYHSQSVTDPTLTADALDKTVAEFDTVEDLLKHFNPESWQEDLENLYLDTPHYRGRSYHDRKSKVDLDRLNDDVKRYSCTPRNYSVNLREELKLTNVVFFPRCLLVQRCGGNCGCGTVNWKSCTCSSGKTVKKYHEVLKFEPGHFKRRGRAKNMALVDIQLDHHERCDCICSSRPPR	589959	308100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3060_pilon_-_310751_325044_325260_340968_341168_346133_346197_393794_393976_398640_398846_589763
924270	contig_10095_pilon	-	2005	4	Intergenic	novelGene_57239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	67.9231591988738	29	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTTCACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257052	238855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_240622_249005_249156_253394_253444_257012
924271	contig_5881_pilon	-	1656	1	Intergenic	novelGene_129044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTCATTTAAAAGATAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356565	354909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_354900_356600
924272	contig_11720_pilon	+	780	4	Intergenic	novelGene_43954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	65	junction_3	207.094717996916	15	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	9	557	262271	264283	FALSE	35	AATCCAACATCTTATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLMHREGAQAQKQPSTSPTHRVFLRPAILMTGDRGPQRLSKPSYGSISSPSSPGPQQVPPRQTYLSEKISIPDAEPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKGGLHGWSSREKALSSRWARKGSPGRPCRGWGVCVGGGLLAPSLHPLPRNVLIRQYHRLGLPKTGPSG	262262	264506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263052_263872_263996_264079
924273	contig_9871_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_75670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTTTTGAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438044	436926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_436900_438000
924274	contig_9177_pilon	+	1595	1	Intergenic	novelGene_32754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCAACCCCGCGGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239558	1241153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1239600_1241200
924277	contig_8570_pilon	+	2654	12	Intergenic	novelGene_120134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	18.0874825443838	51	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1809	131	1939	209908	247146	FALSE	30	AATGATTATAGTCTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADIIADLRSKLKEVEEERLKAAQYGLQLVESQNELQNQLDKCRNEMMTMTENYEQEKYTLQREVELKSRMLESLTSECEAVKQQQKMHLEKLEEQLSRRHGQEVNELKDKLEKMKAELDEARLNEKQLKHKVEHQKELLSCKSEEMRIMSERVHESMSSEMLGLQIELTEMENMKTALKEQVNELQYRQEQLELLSNNLLRQVDRLKEEKQEREKEALSYCNALEKARAANQDLQVQLDQALQQALDPSSKGNSLFAEVEDRRAAMERQLISMKVKYQSLKKQNAFNREQMQRMKLQIATLLQMKGSQTEFEQQERLFAMLEQKNGEIKHLLGEIRNLEKFKSLYESMESKPSANSGVLEDNTYYTDLLQIKLDNLNKENESTKGELSLQRMKALFESQRALDIERKLFANERFLQLSQSENMKLRAKLDELRLKYEPEEKVEVPVLKKRREVLPVDVTTPKDVCANSAVEEVYRLPAQEEEPQSCPNNTKDNLELEKTVPVNTPVVSLSPHRNLPLNMQPTKEKKRVKLIGVAVDSEALNERSGNTLNSPRLTAESRLQTEVKEGKETASKLEKETCKKSHPILYVSSKSTPETQCPQQ	206012	247861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_+_206120_209884_210067_214818_214996_217387_217583_218176_218327_218420_218520_218595_218707_235465_235607_241394_241499_242107_242296_244244_244582_246998
924278	contig_8576_pilon	+	2846	2	Intergenic	novelGene_88748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	289	junction_1	0	19	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	188	505	690680	694989	FALSE	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFMKSSRSANQERSVSTLFREKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLE	690492	697330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_690845_694836
924279	contig_12416_pilon	-	1766	2	Intergenic	novelGene_179079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	82	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	25	555	81332	80802	TRUE	80	AAAAGAAAAAAGAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTSLGKKRYVCPGKHTAGKVGIESVSGALRDPNSSFCHGSLCPLRAPSSYLLAMQLPSDCLTLNPLKHYPTADPLSPHSGSPGYQQLQTHILTIPRLMEGKEFSPSRIQFEKSQGRTLIGVLWVTCPLLELVPDGEGVIRGGRFLRRMAEGEGRQSIRCPSCILHLEGTRLTSAL	81356	77841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12416_pilon_-_78869_80617
924280	contig_13740_pilon	-	3605	8	Intergenic	novelGene_34632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_2	3490.77189288605	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	165	653	165243	161045	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165407	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919_162031_165237
924281	contig_15092_pilon	-	5060	2	Intergenic	novelGene_57817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	565	912	331618	331271	FALSE	40	CTTCTTTATGAAGAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEDRRITQSQSTQKKWSTLSQGVAYDQELRVLKEKVQAALKALAKNKAPGIDGIPTEMFQQTDATLKHLFVYAKKSGRQLPGQLTGKDPYTCPFQRKVIQQNAEIIEQHH	495781	327122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_332057_495655
924282	contig_6102_pilon	+	1095	5	Intergenic	novelGene_31938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.906371583389	3023	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	219	338	394006	394507	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQWSRAGAPESTARAYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	393103	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393149_393758_393856_393929_394036_394221_394272_394467
924283	contig_10958_pilon	+	2011	4	Intergenic	novelGene_5447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	5	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAACTAGGGATAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888244	901705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889031_895304_895855_900457
924284	contig_8616_pilon	-	10514	8	Intergenic	novelGene_72615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	129	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	1090	1815	475107	474382	TRUE	15	CGGAGATCTTTGATGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSGPFRSPSTLGRGTSISPFTFGPFRLKSTSGMAILGALRCRSGILNLGPFSFASGPSIFTSGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFRCQSGPWTSTSGTSTSTLAASISTSGAFKSPSTLGRETSTSPFTLGPFRCKSKSGMEILGALMFISGILNLGPFSFASGPSTFTSGTSMSTLGPETSMSALGRFTSTFGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFKCQSGP	476625	463764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_464158_464904_465371_465531_466896_467117_472024_472610_473189_473389_475546_475706_475992_476259
924285	contig_16666_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_61804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183145	184363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_183100_184400
924286	contig_6497_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_35607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCACTGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503867	505877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_503900_505900
924287	contig_7254_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_145856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTCTTCATTACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241977	239556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_239600_242000
924288	contig_5623_pilon	+	1840	2	Intergenic	novelGene_154872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	0	19	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGCAAATGTATAGAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276203	285798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_276285_284039
924289	contig_14970_pilon	+	1709	8	Intergenic	novelGene_45030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5233.07345990238	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177328	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177433_182324_182437_192033_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
924290	contig_9931_pilon	+	2279	1	Intergenic	novelGene_134835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331671	333950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9931_pilon_+_331700_334000
924291	contig_4469_pilon	+	3645	1	Intergenic	novelGene_21968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAATTAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901858	905503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_+_901900_905500
924292	contig_6286_pilon	+	3088	4	Intergenic	novelGene_165651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	6.64997911442	543	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	132	935	136401	137800	TRUE	50	TATGTAATCACATATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPSAAFEALMNGVTSWNVPKDPVPCELFLIGEAAFPVMVNDKGQVLIAASSYGQGRLVVVSHEGYLVDSGLAPFLLNAVCWLCPTPGAPVGVHPSLAALVSILQESAVQAQAREEPGEPTGVYCISAYNDTMVERLVQFVKRGGGLLIGGQAWYWASQHGCDKVLSKFPGNQVTSVAGVYFTDIYGDKDQLKVSKKVPKIPLLVSIFHQHHSSNALSSSGSHRFHCIDNFLGMLFWVSAGTQSLQIQVSFSLPLQKIEEPWWCRG	134612	326892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_134705_136361_137021_137616_139271_326209
924293	contig_7962_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_149280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAAAAGCTGGCCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2139	337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_-_300_2100
924294	contig_9415_pilon	-	5335	3	Intergenic	novelGene_109893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	84	292	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1252	1728	2073967	2071831	FALSE	30	GACCCAGCAATCTACTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRNHPGCGRSANRQGYRSNGSYVDGWFGGECGSGNPYYLLCGTCREKYLALKTKSKTSSSERYKGQAPDLIGKQDSVYEEDWDMLDIDEDEKLTGEEEFELLAGPLGLNDRRIVPEPVQFPDSDPLGASVAMVTATNSMEETLMQIGKLKRCFTLIL	2075218	2068223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9415_pilon_-_2072067_2072758_2072812_2073779
924295	contig_8291_pilon	-	2609	1	Intergenic	novelGene_99961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1303	1656	586705	586352	NA	75	AAAAAAAAAAAGATAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLPPVAIAASSMQETQDYSFSGVFYQHPSGKMLCTSVSLPAPQWVASCMPAPAHGIPENFIGLPAMASCEPIPVYDTTANPSTIQEAAAMLSPMRTAFQPGWGAPFHDCSFLRYSP	588007	585398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_585400_588000
924296	contig_9609_pilon	+	2454	1	Intergenic	novelGene_22928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGGAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47392	49846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_47400_49800
924297	contig_10765_pilon	-	5697	26	Intergenic	novelGene_122943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	267.445468086487	49	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1159	3480	201	3680	360739	271828	FALSE	20	CTGTTCCGCGTAACCTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPNGSSHRTQSERGPHCSVLHAVEGFALVLLCSFQVATRKLSVLILKEIRALFIALGQPEDDDRPMIDVMDQLSSSILESFIHVAVSDSATLPLTHSVDLQWLVEWNAVLVNSHYDVKSPSHVWIFAQSVKDPWVLCLFSFLRQENLPKHCPTALSYAWPYAFTRLQSVMPLVDPNSPINAKKTSSAASSADSYVTLWRNYLILGFGVAKPSVMSPGHLRASTPEIMATTPDGTVSYDNKAIGTPSVGVLLKQLVPLMRLESIEITESLVLGFGRTNSLVFRELVEELHPLMKEALERRPENKKRRERRDLLRLQLLRIFELLADAGVISDSTNGALERDTLALGALFLEYVDLTRMLLEAENDKEVEILKDIRAHFSAMVANLIQCVPVHHRRFLFPQQSLRHHLFILFSQWAGPFSIMFTPLDRYSDRNHQITRYQYCALKAMSAVLCCGPVFDNVGLSPDGYLYKWLDNILACQDLRVHQLGCEVVVLLLELNPDQVNLFNWAIDRCYTGSYQLASGCFKAIATVCGSRNYPFDIVTLLNLVLFKASDTNREIYEISMQLMQILEAKLFVYSKKVAEQRPGSILYGTHGPLPPLYRVSLALLSCELARMYPELTLPLFSEVSQRFPTTHPNGRQVMLTYLLPWLHNIELVDSRLLLPGSSPSSPEDDTKDREGEVTACHGLKGSGWGSPEATSLVLNNLMYMTAKYGDEVPGPEMENAWNALANNEKWSNNLRITLQFLISLCGVSSDTVLLPYIKKVAIYLCRNNTMQTMEELLFELQQTEPVNPIVQHCDNPPFYRFAASSKASAAASGTASSSNTVVAGQDSFPDADEGKILKESDERFSHVIRTHTRLESRYSNSSGGSYDEDKTDPVSPYASWLLTITETKQPQPLPMPCTGGCWAPLVDYLPETITPRGPLHRCNIAVIFMTEMVVDHSVREDWALHLPLLLHAVFLGLDHYRPEVFEHSKKLLLHLLIALSGNSSFHAIASVLLQTREMSEAKTLTVQPGYQPEYLYTGGFDFLREDQSSPLPDSGLSSSSTSSSISLGGSSGNLPQMTQEAEDVDAAAETDEKANKLIEFLTTRAFGPLWCHEDITPKNQNSKSAEQLTNFLRHVVSVFKDSKSGFHLEQHLSEVALQTALASSSRHYAGRAFQIFRALKQPLSAHALSDLLSRLVEVIGEHGDEIQGYVMEALLTLESAVDNLSDCLKNSDLLALIITGFKL	363353	269810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_271855_273459_273544_275375_275564_285164_285287_286900_287100_290655_290842_291590_291695_292445_292597_299034_299118_309707_309799_316325_316495_319396_319544_320490_320748_328080_328253_328566_328667_340893_341049_343480_343592_345181_345343_347447_347621_348093_348186_350155_350214_354087_354213_354837_355031_355548_355809_360667_360755_363168
924299	contig_7056_pilon	+	1984	2	Intergenic	novelGene_43673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TATTAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790008	792109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_790378_790494
924300	contig_4783_pilon	+	2325	1	Intergenic	novelGene_108334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATATCTGAAATCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14571	16896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_14600_16900
924301	contig_10197_pilon	+	2201	1	Intergenic	novelGene_115319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1592421	1594622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1592400_1594600
924302	contig_16231_pilon	-	3261	3	Intergenic	novelGene_176705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACGCGCCGCGACGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15144	8684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_8745_11903_14430_14469
924303	contig_6364_pilon	-	550	1	Intergenic	novelGene_51751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTCATCACTGTATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602412	601862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_601900_602400
924304	contig_2219_pilon	-	1753	1	Intergenic	novelGene_67187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTACACTAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143562	141809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_141800_143600
924305	contig_3015_pilon	+	3582	1	Intergenic	novelGene_163309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTCCAGAAAAATGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58744	62326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_+_58700_62300
924306	contig_16156_pilon	-	1613	1	Intergenic	novelGene_137076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCCCATAATCATGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148237	146624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_146600_148200
924307	contig_20641_pilon	+	1748	7	Intergenic	novelGene_52815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	64	1455	14599	56882	FALSE	35	AAAGATCTCTGTGAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
924308	contig_10734_pilon	-	1940	10	Intergenic	novelGene_51510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	117	junction_9	575.949843495267	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	606	1715	2274500	2265543	FALSE	50	AGAAAAGGAAGCAACACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2282880	2265317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282592
924309	contig_4759_pilon	+	3174	1	Intergenic	novelGene_106323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATGAATTATCATCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	490533	493707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_+_490500_493700
924310	contig_10159_pilon	-	2382	1	Intergenic	novelGene_30826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAAAGAGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	519657	517275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_517300_519700
924311	contig_17366_pilon	+	1694	8	Intergenic	novelGene_161116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	21.4333328043503	11	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCTTGTAAAGAGAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7583	26846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17366_pilon_+_7859_7969_8137_11653_11912_12735_12806_23145_23215_24213_24305_25553_25696_26224
924312	contig_15775_pilon	+	2263	1	Intergenic	novelGene_148370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1148	1447	2644	2943	NA	15	TCCCCCTCCCACGGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGPPPIVVSRPEILELSTLIPLICAVLLLLLVAASLLAWRLVKRQKEGERTWLRLGWGWGSRKCVGPMAGAVIEDHLAPRLQRLAPGGPRAWGEAWSL	1496	3759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_1500_3800
924313	contig_2278_pilon	+	3114	1	Intergenic	novelGene_118098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	140	400	694355	694615	NA	50	CAAATTACCAAAACCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRHWAGICLGPGPFAAWSSCQLAASGQSWTGIARSRTAQWATPTWMYQGSAGRPLSTSDKGPCATSEPLALSWDFCCSLKHVTVLSSILSDHSAVTSLLSTHRLLLLVSAGIFSWLCLLLGLSRVSGASPF	694215	697329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_694200_697300
924314	contig_7342_pilon	+	3149	17	Intergenic	novelGene_71156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_16	91.9584654885019	170	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	135	1754	381744	420551	FALSE	5	CCCTGGCCTCCTGCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLPLLRLSLCFRRIKDTSPLQSKKICRIRERSLGGRLRPPHHGMGHPESAGEHALEPPAPASAPASAPPRPAPEAQLLPFPRELAGRSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSVSKNNVFMPSTFCESSAGNSDSEPEEKSSGFRLKPPTLIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKASSQTVPSTGTNGVSIPTDCTGPVTSTLPNNPARRSPSESADEARALEEKEPQKNESSSTSEEENCERKEQAAQQAFVFGQNLRDRVKLINENTDVADVENAGHPSSETPTATNYFLQYISSSLENSTNSADSSSNKFVFGQNMSARVLSPPKLNEVSSDANRENTAAESRSESSSQEATPEKESLAESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQIQCKLFVFDKASQSWVERGRGLLRLNDMASADDGTLQSRLVMRTQGSLRLILNTKLWAQMQIDKASEKSVRVTATDTEDQGVKVFLISASSKDTGQLYAALHHRILALRSRVEQEQEARVPAPEPGVAPSNEEDDSDDDVLAPSGATGGGAGDEGDGPTAGST	374953	421946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_375012_381667_381873_389060_389098_389178_389266_391607_391680_401006_401073_401988_402082_403298_403427_409403_409524_411476_411581_412888_412968_414068_414172_414733_414844_416559_416681_419315_419459_420116_420301_420507
924315	contig_10958_pilon	+	3351	1	Intergenic	novelGene_5384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAAAAAGAGGAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857761	861112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_857800_861100
924316	contig_3862_pilon	-	1953	1	Intergenic	novelGene_137432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAGCCTTCACTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627765	625812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_625800_627800
924317	contig_5018_pilon	+	716	4	Intergenic	novelGene_46923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.942809041582063	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTATAAAGACCAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11622	21618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_11800_15637_15712_16546_16707_21313
924318	contig_4151_pilon	+	2051	1	Intergenic	novelGene_65251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAGTAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561267	563318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_561300_563300
924319	contig_8138_pilon	+	1110	5	Intergenic	novelGene_52458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	554.521415276272	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGTGTCAGCCCTGCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280115	307241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280189_288512_288616_304973_305098_306364_306690_306756
924320	contig_4857_pilon	-	2428	1	Intergenic	novelGene_48874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373182	1370754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1370800_1373200
924321	contig_9319_pilon	+	2883	1	Intergenic	novelGene_154637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAAAAAATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41963	44846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_42000_44800
924322	contig_2646_pilon	-	2359	17	Intergenic	novelGene_69703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_2	62.2429714907635	35	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2295	63	2357	2558650	2513898	FALSE	45	CCCTTCAGGAAAAGGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWAARASAGDAEKGEELNVIMSGVKRTIKETDPDYEDISVALPNKRHKAIENSARDAAVQKIETIIKEQFALEMKNKEHEIEVIDQRLIEARRMMDKLRACIVANYYASAGLVKVSEGSKTCDAMVFNHPAIKKFFESPSRSSSPANQRSETPSANHSESDSLSQHNDFLSDKDNNSNMDIEERLSNNMEQRQSRNTGRDTSSTTGSCKTDQRNADFTGDETSRLFVKKTIVVGNVSKYIPPDKREENDQSTHKWMVYVRGSRREPSINHFVKKVWFFLHPSYKPNDLVEVREPPFHLTRRGWGEFPVRVQVHFKDSQNKRIDIIHNLKLDRTYTGLQTLGAETVVDVELHRHSLGEDCVHPQCSESDGSDAPPSSPLTIPAPVKASSPIRQSHEPVPDTSVEKGFPTNTEAERHTTFYSLPSSLERTPTKITSQKVTFCSHGNSAFQPIASSCKIVPQSQAPNPESPGKSFQPITMSCKIVSGSPISTPSPSPLPRTPTSTPVHVKQGTAGSVISNPYVIMDKPGQVIGATTPSTGSPTSKLSTASQASQGTGSPIPKIHGSSFVSSAVKQEDSLFASMPPLCPIGSHPKVQSPKPITGGLGAFTKVIIKQEPGEAPHVPTSGAASQSPLPQYVTVKGGHMIAVSPQKQVITAGEGSAQSPKIQPSKVVGVPVGTTLPSAVKQAVAISGGQILVAKASSSVAKAVGPKQVVTQGVAKAIVSGGGGTIVAQPVQALAKAQVTAAGPPKSGSQGSVMATLQLPATNLANLANLPPGTKLYLTTNSK	2576641	2513895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2513990_2516232_2516492_2522149_2522333_2522953_2523062_2524588_2524693_2526376_2526536_2528562_2528800_2530591_2530773_2531269_2531315_2536202_2536315_2551698_2551861_2554094_2554211_2555706_2555953_2557271_2557365_2557636_2557735_2558550_2558670_2576598
924323	scaffold_12124_pilon	+	2309	11	Intergenic	novelGene_22340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3172.38362119085	4	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	522	899	1490385	1508039	FALSE	20	CCTCATTTAGGGTCACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483584	1509449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483949_1484004_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
924324	contig_10722_pilon	-	3748	11	Intergenic	novelGene_70978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	171	junction_7	239.938512956966	1	183	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	2439	3338	6730	4150	FALSE	30	ATACAAATCTTGTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDSLRTNVFVRFQPETIACACIYLAARALQIPLPTRPHWFLLFGTTEEEIQEICVETLRLYTRKKPNYEMLEKEVEKRKVALQEAKLKAKGLNPDGTPALSTLGGFSPASKPSSPREVKAEEKSPVSVSVKTVKKEPEDRQQASKSPYNGVRKDSKRSRNSRSASRSRSRTRSRSRSHTPRRHYNNRRSRSGTYSSRSRSRSRSHSESPRRHHNHGSPHLKAKHTRDDLKSSNRHGHKRKKSRSRSQSKSRDHSDAAKKHRHERGHHRDRRERSRSFERSHKGKHHGASRSGHGRHRR	17396	3739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_-_4499_5545_5645_5730_5843_6185_6328_6423_6529_6637_8562_9665_9787_14372_14446_16247_16358_16853_16929_17168
924325	contig_7695_pilon	+	3280	22	Intergenic	novelGene_41672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	295	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGCGGCTGTGGGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979563	1201704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_979677_983512_983666_984015_984090_984182_984247_985916_986124_986757_986866_988045_988173_995503_996283_1001188_1001586_1003279_1003376_1004545_1004680_1005239_1005461_1005600_1005697_1018532_1018661_1021196_1021293_1032285_1032321_1036370_1036428_1052098_1052219_1059646_1059709_1094936_1094985_1107038_1107147_1201647
924326	contig_7396_pilon	-	1943	14	Intergenic	novelGene_79602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3327.86065401549	1698	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	770	1435	248983	246442	FALSE	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257077	245933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
924327	contig_9481_pilon	+	2925	1	Intergenic	novelGene_149643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2530	2844	135462	135776	NA	20	AGAGTGTGGTTCTTAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHQLVPIHLEQRRMKNTKDTKKILAQETKGPYINQKLHQPETRRTRWCPATTNDFPDREHNRESLTEQEKSVVQNSNSRKKTRLNGLIETGGIPKEHGPWTLC	132932	135857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_132900_135900
924328	contig_6076_pilon	-	2621	1	Intergenic	novelGene_81748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAAACCATCTAAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96035	93414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_93400_96000
924329	contig_1146_pilon	-	2508	2	Intergenic	novelGene_84806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1149	1358	2506	266831	265683	FALSE	45	GTTGGAAAAAAAGATACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLQNLMKKSKEYLEREQSKRSLRSSAKNSFNESHSDKENDAVKVTDCVKEKAQLTDKHCGSVIPDKPSLNKSNVLLQGASTQASSMNTSVLGSFSKVDIPIRTGHPTVLDSDFKVISTLVPENNVIRSLTGSYAKLPSPEPSMSPKMHRRRSRPSSACHILINNPVNACELSPKGKEKAVDLIVQDTDEKTNIPETVPKLPVDLAGGSSRNTPEAIEEMALGKSNQVCQSSGNQLENKIIHGLAPGEGQVISDRRGPHKMDNTCTVVPRLQEPYGTSQCIASQSFGTMSGLKSASVLEKNSCSLQMELNKSYDVKNPSPLLMQNQNNRQQMDTPTVSCGNEQFLENSFEKVKRRLDLDIDSLQKENYPYVITTGIAEQERQH	351128	265680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_268057_350996
924330	contig_678_pilon	-	4279	1	Intergenic	novelGene_167800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	106	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	59	832	53575	52802	NA	35	AGGCATAAATTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILINDDHGREQTYGQMILRETDIKILINNDNGGEQTYGQMILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQMILRETDIKILISNDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNRREQTYGQKILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETDIKILINDDNGREQTYGQMILRETDIKILINNDNGREQTYGQMILRETEIKILIKIVTT	53633	49354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_49400_53600
924331	contig_12090_pilon	+	922	1	Intergenic	novelGene_80504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGAAAAAAAAAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254126	255048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_254100_255000
924332	contig_4180_pilon	+	1182	5	Intergenic	novelGene_8380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	1591.36189708689	8	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTTTGGAGCCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874285	888710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_886082_886187_886317_886468_888085
924333	contig_4884_pilon	+	2567	10	Intergenic	novelGene_63798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	87.783825389419	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	435	1868	245874	295554	FALSE	40	TAATACATTCTAAAGGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQVGMFKVHPEIPESMSAEAKAFILKCFEPDPDKRACANDLLMNEFLKVSSKKKKTQPKLSEYLRSISLPVPVLVEDTSSSSEYGSVSPDNELKVDPFSFKTRPKSCGEKDVKGIRTLFLGIPDENFEDHSAPPSPEEKDSGFFLLRKDSERRATLHRILTEDQDKIVRNLMESLAQGAEEPKLKWEHITTLIASLREFVRSTDRKIIATTLSKLKLELDFDSHGISQVQVVLFGFQDAVNKVLRNHNIKPHWMFALDSIIRKAVQTAITILVPELRPHFSLASESDTADQEDLDVEDDHEEQPSNQTVRRPHAVIEDAVATSGVSTLSSTVSHDSQSAHRSLNVQLGRMKIETNRLLEELVRKEKELQALLHQAIEEKDQEIKHLKLKSQPIDIPGLPVCHLNSPGINTEDPELTDWLRENGADEDTISRFLAEDYTLVDVLYYVTRDDLKCLRLRGGMLCTLWKAIADFRDKQP	245439	296253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_246061_258177_258356_258452_258622_265734_265921_271590_271697_284653_284898_290877_290991_292122_292236_294757_294835_295493
924334	contig_7840_pilon	-	1605	1	Intergenic	novelGene_69023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTCAAAGAATAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352605	351000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_351000_352600
924335	contig_4232_pilon	-	840	1	Intergenic	novelGene_63402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAATAAGCTAGGACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468115	467275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
924336	contig_4426_pilon	-	2516	1	Intergenic	novelGene_15459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTAGATTTTGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908416	905900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_905900_908400
924337	contig_1836_pilon	-	5935	1	Intergenic	novelGene_71053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	169	1239	865426	864356	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDADNLAGPTLPIKTFRGDPQNFFEEFPFSAIEGWTGATITVKTKCPEEGVSNLHVNNATMGYLRSSLSTRLIPTIYILVFMVGVPANAVTLWMLIFRTRSISTAIFYTNLAIADFLFCITLPFKIAYHLSGNNWVFGEVMCRATTVIFYGNMYCSILLLACISISRYLAIVYPFTYRGLPKRTYALLTCGLVWAMVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDSTTCHDVHNTCESSSPFQIYYFISLAFFGFLIPFVVIIFCYTAIIRTLNAHDHRWLRSVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHTNYYYNSTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKITDHSTAYPTMVKSS	865594	859659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_-_859700_865600
924338	contig_7919_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_28107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTGGAGTTCCATTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1389829	1387491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1387500_1389800
924339	contig_17144_pilon	-	1092	4	Intergenic	novelGene_29189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	96.3512094140782	66	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	78	797	167982	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168059	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918
924340	contig_5846_pilon	-	3687	2	Intergenic	novelGene_178904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCCGTTCAATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	630973	603044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5846_pilon_-_604924_629165
924341	contig_383_pilon	+	3304	2	Intergenic	novelGene_126123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTCATCTTCTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138670	142032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_140779_140836
924342	contig_854_pilon	+	3147	15	Intergenic	novelGene_36603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	4157.62965056106	2	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	789	2370	18	2387	1685144	1715249	FALSE	30	TAGAATTCCAAGTCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAAVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDACQSPRLPLLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1685126	1716009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1700797_1700913_1701175_1701339_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709609_1715130
924343	contig_10940_pilon	+	2764	2	Intergenic	novelGene_49280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCCATTCTGCTGCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887741	892049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_888898_890441
924344	contig_6738_pilon	-	3765	3	Intergenic	novelGene_166127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTTATCACCTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40614	32659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_-_32755_36539_36701_37105
924346	contig_15105_pilon	+	4119	4	Intergenic	novelGene_151005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	880	1236	828792	829148	TRUE	20	AATGAGAGTTGGCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVLLPHCNIRGNNFRPDLILPLKSVLAPSLPPISLPPSSSLSFPSFRPSTQLSPIVPLLPQPIKTILPLRIEARVVTLNLLQDNGYHMPHMLKNIGYVIKIEVFEDVRLRFFPSKL	827912	839952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_831513_832201_832309_836187_836497_839849
924347	contig_5041_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_27033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	832	1164	336572	336240	NA	15	CCATTGCTATGCCTTCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDVPASILSDKIQRKYLRVFPMKLNLKDLRICIRKFMEDCTTLPQTYFIRDLLRKSSYLNFSALHNFHVLKYSFQKHSIAALPLTAFPDKNFLNFQTKNAEDTTSSRSS	337403	335320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_335300_337400
924348	contig_5569_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_86761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTATAAAATAAACACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506556	507046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_506600_507000
924349	contig_1276_pilon	-	1981	1	Intergenic	novelGene_159762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGGAAAAAAAAAAGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121169	119188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_-_119200_121200
924350	contig_20199_pilon	-	989	3	Intergenic	novelGene_82573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	440	2	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	160	318	43987	42004	TRUE	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQVSQVSPPPCSPQFEWTGWLHGDGTT	44146	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_41934_42078_43902
924351	contig_9321_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_174724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCAGTGCTTGTTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48613	50439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9321_pilon_+_48600_50400
924352	contig_8330_pilon	+	928	2	Intergenic	novelGene_71780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAAGTCTCCCCATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	833006	836533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_833887_836485
924353	contig_5718_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_110347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTCTAGCCTCCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610564	609175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_609200_610600
924354	contig_13494_pilon	-	3286	10	Intergenic	novelGene_167510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	331.938563406759	4	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	219	803	84021	29429	TRUE	30	TAATTCTTAATGGCAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDVKLEFPSLPQCKDDAELPILQKHGITHIICIRQNIEANFIKPNFQQLFRYLVLDIADNPVENIIRFFPMTKEFIDGSLQTGGKVLVHGNAGISRSAAFVIAYIMETFGMKYRDAFAYVQERRFCINPNAGFVHQLQEYEAIYLAKLTIQMMSPLQIERSLSVHSGTTGSLKRTHEEEEEFGSMQVATAQNG	84239	26903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_-_27733_27774_29503_32996_33091_41549_41623_45170_45222_45317_45358_48686_48724_49145_49207_51817_51916_83964
924355	contig_7919_pilon	-	876	1	Intergenic	novelGene_28119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432070	1431194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1431200_1432100
924356	contig_7380_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_157519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150083	148844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_148800_150100
924357	contig_4782_pilon	+	4321	1	Intergenic	novelGene_73648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTACTTCTGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449686	454007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_449700_454000
924358	contig_19098_pilon	-	3201	1	Intergenic	novelGene_65858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCACCCACTTGTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482103	478902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_478900_482100
924359	contig_8286_pilon	+	5101	5	Intergenic	novelGene_139812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_4	303.10971610953	298	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1045	1503	203610	220100	FALSE	35	TAATAACCTGATGTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDPSRWGLTLQTYVQLTMLDQHTRPQTSPVRLMERSIHSARYVFVENLYRSGKMPEVDYVVLSEWFDWIVRNIDVSVDLIVYLRTTPETCYQRLKMRCREEEKVIPLEYLDAIHQLYEEWFLKGSPFPVAAPVLVSQSPLQGGGLFQKEE	202565	223698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8286_pilon_+_203694_205644_205719_217005_217095_217604_217685_219968
924360	contig_14855_pilon	+	1025	1	Intergenic	novelGene_146031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCCTCCCTTAGAGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584129	585154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14855_pilon_+_584100_585200
924361	contig_7164_pilon	+	5375	21	Intergenic	novelGene_172140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	24.4488752297524	98	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	259	2940	494298	558129	FALSE	45	TGAAAGAATTCTCTGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDVIVVRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMESQLKRNSVDRIRCLDSTMSPQVSPPSETPSSGSLVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDTMNTSEDEDMFPIEMSSDEDKEPLDSSRTLPDDLSSFQDDIPKENLSTDTTYPQSASYPNSDREWSPNPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSVDRTMQKNNPEMLWLWGELPQAAKSSLHKVKESSPLISRKISDKVHFRAIQSESSDTFSDPSPTLAGDTPEQPLLDQNKPPTEMQFVNEDVEALGAAAPPLPTSEEHKPPSASLAQTASKTDSPSRKKDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDVGARSANQSPQSVGSSGIDSGVESTSDGMRDLPSIAISLCGGLSDNREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGNKYYNWMTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLATKGHSTGEQPSQLSMATRIKHESSSSDEEHAAAKPSNASHLPLLSNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDVHSASA	465435	560564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_+_465509_486749_486926_494288_494490_495766_495863_499167_499476_501031_501158_507714_507845_510866_511180_512322_512417_513084_513276_515780_515875_516717_516788_522110_522204_526221_526302_532064_532192_533610_533760_534310_534398_544290_544444_552295_552411_554415_554520_557969
924362	contig_7594_pilon	-	3814	2	Intergenic	novelGene_55441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTTGACTTTTGCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554559	549395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_-_552998_554347
924363	contig_4180_pilon	+	2318	3	Intergenic	novelGene_8406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_2	293	16	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	260	586	881883	882209	TRUE	10	CAGCTTTGGAGCCGCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSGGHIEGRRMGGGKACIPDYWELCLLLGAPWSCPPELPVCSLWWLKSKMANLGSSELVSLWLSDSGPLASGRGLVQEEGCEMGKHVSLVTRRSVSCWELRKVAFL	881623	888711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_882931_886082_886468_888085
924364	contig_13481_pilon	-	2365	2	Intergenic	novelGene_119292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCTGCAAAAGCCCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193288	190768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_191004_191158
924365	contig_10581_pilon	+	2314	8	Intergenic	novelGene_41416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1365	1748	620221	628834	TRUE	25	GACCACACACAGCGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFQICSPMSFEVVLEVSWPHKCPVTAFHCTFELLLHLRKWPRLFGLPITRTKVDIFPFAAGFCILCQLCTSSSNQTVMGQLLNPKEPWNATVCTLTGERNHSLNPLPHLVQILGAQLKSPDLLLLG	618018	649692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_619082_619574_619758_620102_620396_627359_627549_628814_629036_632023_632160_633201_633383_649644
924366	contig_12605_pilon	+	961	6	Intergenic	novelGene_64181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2654.62030429966	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	382	834	4816	5984	TRUE	20	TCAGGTAGAGAGGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDLPEVGSHRGALWRGAKIHMPCAARGAD	3870	6231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_5835_5893_6005_6124
924367	contig_7022_pilon	+	3259	2	Intergenic	novelGene_142151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	30	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	2745	3257	194637	195149	FALSE	30	GTTCCTGGAGAAGGACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKINNSNLHYGLYLNIKKTKILTTGPIINIMINREKIEVVKDFILLGCTVNIHGSTRQEIKRHIALGRSAAKDFFQVLKSKNVTLRTKVRLTQTMVFSVASYTCESWTMNKEDQRRIDVFELWCWQRILNTPWTSRRMNKSVLEEVQPECFLDVRMARLHLTYFGHVIRRN	188513	195151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_188666_192044
924368	contig_8850_pilon	+	2124	2	Intergenic	novelGene_172437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1283	1648	287645	288010	FALSE	35	GCACAGAATCTTCGACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCARKQLEIIQFQMTLLDTHLQIHHSALCVLLNPSFCPVPPCLAQHSCCWKSNGVVSPSAPAADNSATIFICKALDTFPSLWVVQTVKHSTTSGKAGSSNPPRAISGDKPVDTQKGSKQD	178684	288486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8850_pilon_+_178754_286431
924369	contig_17144_pilon	-	2457	14	Intergenic	novelGene_29281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1880.9966198863	9	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	127	1653	179764	167278	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITPVAA	183208	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167293_169063_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
924370	contig_1452_pilon	+	2307	2	Intergenic	novelGene_115168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	965	1285	709980	710300	FALSE	35	TGCATGCAAGAAGGCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKRLQKQDRIVPVGIHNKIPDDLPVEEKELELPDRGFKYLILRIIQELKQKADENEEKIDKFLEKADKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEII	708810	711322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_709010_709214
924371	contig_8576_pilon	-	3009	2	Intergenic	novelGene_88733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	944	1744	627439	626639	FALSE	50	GGATACAAAACATAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKGQNQNINYRTQTNEIEQQKKPTATGRKEIVKIRAEINEIENIKTIERINKTKSWFFERINKINKPLARLTKEKQERMQITQIRNAMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLQQSDGENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFSEELVPVLLKLFQSTEKEATLPNSFYEASVSLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDVRILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGM	631231	625373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_628263_631111
924372	contig_19352_pilon	+	2089	3	Intergenic	novelGene_122346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCATTAGAATGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87527	89752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_87776_87842_88471_88539
924373	contig_11719_pilon	+	1394	1	Intergenic	novelGene_154768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATTAAAAAAAAAAGATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118685	120079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_+_118700_120100
924374	contig_7138_pilon	-	2198	1	Intergenic	novelGene_120977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTGAGGGAAACAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102298	100100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_100100_102300
924375	contig_11068_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_130550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAAAAAAAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244922	246899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11068_pilon_+_244900_246900
924376	contig_2550_pilon	-	2625	19	Intergenic	novelGene_135697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_17	135.043705773856	7	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1359	1267	2625	1771485	1660605	FALSE	75	AAAAAATATGAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLLDLESMGKSSDGKSYVITGSWNPKSPHFQVVNEETPKDKVLFMTTAVDLVITEVQEPVRFLLETKVRVCSPNERLFWPFSKRSTTENFFLKLKQIKQKERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSIRLPQSGSQSSMIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLSVRPKQLSSLVRSGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDHLVEKYRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENAKKLMELACSMKIGQKKL	1801515	1660604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1660623_1671583_1671713_1671975_1672018_1673856_1674001_1674585_1674712_1677962_1678038_1682020_1682135_1743881_1744033_1748640_1748735_1752722_1752898_1769461_1769632_1770656_1770760_1771467_1771535_1772085_1772197_1777053_1777229_1777997_1778203_1778366_1778663_1779819_1780055_1801320
924377	contig_11292_pilon	+	1975	6	Intergenic	novelGene_109390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	21	junction_1	60.0433176964764	23	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	316	1551	39733	46916	FALSE	80	CAATAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKKKFCPRLLDYLVIVGARHPSSDSVAQTPELLRRYPLEDHAEFPLPPDVVFFCQPEGCLSVRQRRMSLRDDTSFVFTLTDKDTGVTRYGICVNFYRSFQKRMPKEKGEVGTGSRGKEVTRATCVSEEVGTESSESGTSLQPPSADSTPDVNQSPWSKRRAKGGGRSRNSTLTSLCVLSHYPFFSTFRECLYTLKRLVDCCSERLLGKKLGIPRGIQRDTMWRIFTGSLLVEEKSSALLHDLREIEAWIYRLLRSPVPISGQKRVDIEVLPQELHPALTFALPDPSRFNLVDFPLHLPLELLGVDACLQVLTCILLEHKVVLQSRDYNALSMSVMAFVAMIYPLEYMFPVIPLLPTCMASAEQLLLAPTPYIIGVPASFFLYKLDFKMPDDVWLVDLDSSRVRFLAEAW	35881	47340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_+_36116_39651_39795_40407_41005_41794_42099_46190_46323_46775
924378	contig_4232_pilon	+	1172	1	Intergenic	novelGene_63314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAAGCAGTCCCCTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466912	468084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_466900_468100
924380	contig_9121_pilon	+	3155	1	Intergenic	novelGene_134429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	504	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCGTGTAAACTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45941	49096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_45900_49100
924381	scaffold_4805_pilon	-	2455	2	Intergenic	novelGene_161032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTATAGACCGAGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628554	529446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_531441_628093
924382	contig_18162_pilon	-	3416	3	Intergenic	novelGene_122293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	146	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAACAATTACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9148_9271_10809_16363
924383	contig_8310_pilon	-	1773	3	Intergenic	novelGene_75604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	3	332	317883	316591	TRUE	35	GACTGCAGAGTGTAATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVHGDGVVARLLLLLLHGRDEVDHALALCGDPHLGPAVEVELAHHAALVLLPTQWLQGDQEVSHADGLRQGVALELDGYFSVGNGALCWPVLVAFFLGGKITILSPVVK	317885	315104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_-_316167_316211_316750_317712
924384	contig_4686_pilon	-	3758	6	Intergenic	novelGene_118513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	231.610535166257	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	126	569	437474	425769	TRUE	15	ATTGCCTCCTTCCCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDEFNLKLTLLSNQWQGVIRRAQQRRGIIDSQIRQWQRYREMAEKLRKWLVEVSYLPVSGLGSVPVPLQQARTLFDEVQFKEKVFLRQQGSYILTVEAGKQLLLSADSGAEAALQAELTEIQEKWKSASMRLEEQKKQLDFLLKDWEKCEKGIADSLEKLRSFKKKLSQPLPDHHEELHSEQMRCKRN	437599	410374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_413256_417837_417997_425619_425778_430258_430385_434749_434945_437360
924385	contig_4783_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_108396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	695	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259400	260576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_259400_260600
924386	contig_9197_pilon	+	2677	1	Intergenic	novelGene_154376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACATAAGACTTTATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91094	93771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_91100_93800
924387	contig_15918_pilon	-	3518	5	Intergenic	novelGene_132714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.3923048454133	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1575	1943	3517	42108	37225	FALSE	40	ACCAGGCAAACATGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKGSDMPPWDASLLENEFFRVLDDLDSTLAQEQSPSSVNTRTPVNYESRTQFSRFYSSGNRPGNTAGRHKNRYNETSSMSIYDILRPGAPRESSNTFFPRTRTIYDMYTTRKPRVFQEGYVQKNTFGSSSLCFHSIQRSASPATRHFTARSLHFPATAQNNTGFIPQSHQQSPKRTRLSSIIWNRSDSSRDGQNQEEFLRAPSPMETDPADQYMYPRCFQNSIYEFYHSQSVYQSVGLNAPIDNRMSPDPFENSENMPFYHQDNPFSRSFFSNTFGRGREQRFGRSPFWGQQEDHSSWSDFYQNRKPFTSSDRDFEMLSTVANSASDARGRSVPFQHQGSFSPGNGPDVSRDQEEPCPWQVDFQTSTLESMELSQDNGNQLTPNFSTPNACPMTDSSYHTKSGGLECQQDSSREVHLNKESYSFGISQPLASSFKTSFPQISDDKGNPQSSSFQNPTVTLQEIIPNKPVCFPIRSHTEVIVSNSDSTDSPPLAESQPSISVTEGNNEKDLNNSILEKYEQLNKM	202755	37223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_-_38736_42044_42958_173693_174105_185734_186035_202373
924388	contig_6589_pilon	-	1260	5	Intergenic	novelGene_25753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.56224173112709	18	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	690	1259	650045	643810	FALSE	20	CACCATTGTCTCCAGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEAIASARAGEEAERSLREQQRTVLQRRVDEVHAEASDLDAHFQELRQLLEKLKAELQQLFTQARCDSTIIDDLLGVKPQMRDRDIGLFLGLIEKRVVELLTVQAFLDSRSYTSSSLSRAALMVLGQSPDDLRKKLAPPQLPDNLYGSPPVGWPGNRLPNFLASESEHFQHCICLLKHLSWYSVLEPCF	650981	643808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_643943_645231_645336_645422_645587_649876_650046_650292
924389	contig_755_pilon	+	1524	4	Intergenic	novelGene_119771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	831	1208	83861	85669	TRUE	25	ATAGCCACCATACTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRCCSSLLVRFKSSRSFLCIWPTDVHIRDNSVQKTEIRAKTPYNKAQGYATRSCCPSMANAEIKILEAEKLHHPIIPAKILLQSWKVVSWEEDNIQGHLPHNQMKHPSYSLGLINKTFRDIQLH	83030	89033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_84098_85528_85710_87673_87780_88863
924390	scaffold_12124_pilon	+	1958	11	Intergenic	novelGene_22222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3151.72616830841	3	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	38	529	1473608	1508039	TRUE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491942_1494282_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508120_1508221
924392	contig_6654_pilon	+	2700	1	Intergenic	novelGene_85732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAGCTAAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411480	414180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_411500_414200
924393	contig_15255_pilon	+	861	1	Intergenic	novelGene_173916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTAAATTTTAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396018	396879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15255_pilon_+_396000_396900
924394	contig_14637_pilon	+	2684	2	Intergenic	novelGene_114560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	128	490	383085	383447	TRUE	20	CTTAAATATCTGTTGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISFSRDWFLLITRSKYVRRSLAILTSKEHSGCTSSKTDLFILLAAHGIFDILHQHHNSKASILLWSSLFTVQLARTYEATENTMAWVRRTFVLKVTRLLFNTLKRSFADVPNVILHLIS	382957	385805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_+_383566_383729
924395	contig_7009_pilon	+	1714	9	Intergenic	novelGene_23614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_8	591.223255209062	22	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	200	1219	444955	528034	FALSE	30	AACTATTGAATTGGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVVTYGADGFRDFHAIIPKSFSPSNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPVIKEETNHSEMAEDLCKIGSERSLVLDRLASNVAKRKSSMPQKFVAPYIVPGVLKACKSLSKAQQLVSICLEEQRKKERQE	431093	528529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_431279_444940_444995_453481_453602_496799_496860_506372_506634_512647_512816_517991_518118_522866_523002_527924
924396	contig_6079_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_160090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCTCACTAGCTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419999	419347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_-_419300_420000
924397	contig_7457_pilon	+	2544	13	Intergenic	novelGene_31556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	36.1442903128865	64	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	38	1306	849939	854137	TRUE	0	TTTTTTCCCCTGCGTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLPNSGRGPRLRMWPPTKSITPDGSVTATYLRAAIASPRYETTHVFGRSLLRSIFTVTRRQLLEKFRVEKDKLVPEKRTLILTHFPKFLSMLEEEIYGANSPIWESGFTMPPSEGTQLVPRPATVSAAVVPSAPIFSPTMGGGSNSSLSLDSGGAEPMPAGEKRKLPENLTLEDAKRLRVMGDIPMELVNEVMLTITDPAAMLGPETSLLSANAARDETARLEERRGIIEFHVIGNSLTPKANRRVLLWLVGLQNVFSHQLPRMPKEYIARLVFDPKHKTLALIKDGRVIGGICFRMFPTQGFTEIVFCAVTSNEQVKGYGTHLMNHLKEYHIKHNILYFLTYADEYAIGYFKKQGFSKDIKVPKSRYLGYIKDYEGATLMECELNPRIPYTELSHIIKKQKEVVCVCACMRACVRARTHVHMSKVFCECACGR	849901	858673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_849970_850067_850261_851166_851274_851461_851573_851658_851799_851894_852104_852312_852440_853335_853447_853897_854481_854586_854624_854702_854767_854900_854986_857964
924398	contig_12624_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_61016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGACATGAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	823827	822689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_822700_823800
924399	contig_5457_pilon	+	2933	1	Intergenic	novelGene_139007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGGGGCTCCCAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237220	240153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_+_237200_240200
924400	contig_16411_pilon	-	1399	1	Intergenic	novelGene_77284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGCTGTTTCCTCGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40844	39445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_39400_40800
924401	contig_3095_pilon	+	2216	4	Intergenic	novelGene_75135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_2	1046.09570414098	6	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1145	1903	149574	151151	TRUE	30	CTGAACATTCCACAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLTSWVLLHLSLLIPTLTPFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	148429	152150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149896_150413_150696_150996_151163_151848
924402	contig_20951_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_43059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26996	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27000
924403	contig_12437_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_169080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94415	92917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_92900_94400
924404	contig_1639_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_74911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318258	320608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_318300_320600
924405	contig_16125_pilon	+	1365	1	Intergenic	novelGene_155215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAATTTTAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62662	64027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_62700_64000
924406	contig_6048_pilon	+	1162	1	Intergenic	novelGene_73174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAATACCTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1227223	1228385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1227200_1228400
924407	contig_17432_pilon	+	3146	1	Intergenic	novelGene_159010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACATAAAGAAAAATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89465	92611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17432_pilon_+_89500_92600
924408	contig_9919_pilon	+	3180	2	Intergenic	novelGene_137969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACATACAGTAAAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583331	587024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_585488_586000
924409	contig_7188_pilon	-	4207	1	Intergenic	novelGene_108531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	114	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	529	831	114767	114465	NA	35	TAATGACACCTGCATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLTMSVFSPFIMMLLIGPVVRIFVFFMLKCGRLWPLILISKCFKSSSLSVSMVVSSAYCRLLMSLPPILMPHSSSYSPASRIMCSAYRLNRYGERIQA	115295	111088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7188_pilon_-_111100_115300
924410	contig_11816_pilon	-	851	1	Intergenic	novelGene_98595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGCATAAACTACAACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410382	1409531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1409500_1410400
924411	contig_1146_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_84812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGGCGTATGTTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500299	499057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_-_499100_500300
924412	contig_6208_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_52989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGAGATCAAATGGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389387	387270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_387300_389400
924413	contig_3601_pilon	+	3005	2	Intergenic	novelGene_132976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	983	1327	1152850	1153194	TRUE	20	CCCCCTAAGGTTCCTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGKGPEGTSWGAGNVLYTDRSHDTWYHTRIILGHNCMANICAFECLYILAQVQRTAMITTITEVGRAAGGGLDAPRTAERCDNQQLKLGEGYAALHYRLCFLCVCWDFSITKS	1151867	1154917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1154268_1154312
924414	contig_6885_pilon	+	2944	3	Intergenic	novelGene_83707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	20	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAGATGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397041	415076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_397120_409341_409408_412276
924415	contig_5954_pilon	-	5340	10	Intergenic	novelGene_28514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	673	112	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	227	562	444202	443867	TRUE	15	GTAGGAATGTTCTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRIKIKFKGNPSRKERNKWNLRPQWSGRQERMLGWLAGKPEVAALPIAGRGAGINVDPGTLENSPLLHFTRPCTRVAKIKNPKLIKTSMGWHWHPEKLRTKRAPSLLGGH	444428	436251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_438840_439035_439126_439443_439627_439714_439829_439938_440040_440755_440942_441204_441474_441736_441800_441929_442106_442858
924416	contig_2596_pilon	-	3156	3	Intergenic	novelGene_53481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCCCTCCTAGAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703634	687861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_-_688169_688714_690280_702350
924417	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
924418	contig_3155_pilon	+	1951	5	Intergenic	novelGene_26390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	55	561	258156	261211	TRUE	20	TTCATGAGTTCGAGTCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258101	262710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261245_261353
924419	contig_5145_pilon	+	1795	9	Intergenic	novelGene_131351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_1	20.84428878614	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	39	1130	36550	60791	FALSE	30	CAGCTCGATGGTATCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEVHVQRTQPALQPGLPGVGGTRPPLLRLRNRAWGRIRLRGAGLRAEGGKMADSSGRGGGKPSAAGSNTPSGAKPKGKRVQGGRMVEPRYLQYEKKTTKKVPAADALKASGKMPEVGKKPNLLQKSRGTSDLSGVGKSDLQSTMLEGHGTAPPDLDLSAINDKSMIKKTPQLEKTMSQKNDSSSFSSSRKKSPDLSESMDMMESQTLLLTLLTIKMENSLARLEDKAENNLLTMCREQEKLQKKVQELRRRWLLGQRTRELVGTLDAQAELLSPFEAVAGSFKEQYKTFATALDSTRHELPVTAIHLEGGSQRFLGRRWCLALYFFFIVVKIHMSSPHLKMYSSYDEPHLRLYCFFCTSYC	36511	61456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_36735_42796_42862_43837_43894_52514_52606_57458_57552_57660_57756_59129_59196_59297_59457_60509
924420	contig_11378_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_112284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAACAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507069	506564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_-_506600_507100
924421	contig_18081_pilon	-	3150	4	Intergenic	novelGene_23851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTAACTTCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462766	444520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_444529_459203_460136_460495_462422_462482
924422	contig_6871_pilon	+	2147	4	Intergenic	novelGene_21548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	479.302502485527	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	654	1109	134562	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_133940_134283_134388
924423	contig_1008_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_121579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTGCTAGTGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674715	673287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_673300_674700
924424	SIRV6	+	652	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	222	6	140	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	23	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAATTATGGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_10819_11031
924425	contig_9180_pilon	+	2377	1	Intergenic	novelGene_109114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1021	1389	396266	396634	NA	25	TGAAATGGTGTATCTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIETSYFRLEHKKNKAKCYFNLTKVCYSLDHISQKMIQRNPASVSPGVLDKGKDFWAPTESYCIRISDGKGAGILKSFGLLKKKNYTYHFLPHPCHPACYSLPSETEGHASSRKCNQRYYG	395245	397622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9180_pilon_+_395200_397600
924426	contig_8284_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_125656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	38	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	263	433	192176	192346	FALSE	20	GTATTGTTTGATATAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRKQLALEENSAASIITCHPRTLHPEALKSRSCCSTTYPKNVKQRLVHGKPSVNTSPCLNYPSVSKPRETKLKLGWGRENARVPLEMKRMRLRNVGVKAAADDRHKPKAWQQQPAGATRRRKTGDRRGGYICASLREPPSAV	183565	194085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_183649_191996
924427	contig_6507_pilon	+	3655	2	Intergenic	novelGene_179080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATAAGGTTTTCACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9843	93776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6507_pilon_+_11643_91920
924428	contig_1275_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_108767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGTTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407622	409195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_407600_409200
924429	contig_6488_pilon	-	2508	1	Intergenic	novelGene_44740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAATTGTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67347	64839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_64800_67300
924430	contig_3975_pilon	-	1430	6	Intergenic	novelGene_54831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	197.101598167037	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	424	969	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDRWCNPGEPEQKGRGSGRASLEAILPSCILSFIYPFIRSGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2064842	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2056978_2060060_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568
924431	contig_17186_pilon	+	1280	2	Intergenic	novelGene_179081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAGCAGTCAGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8121	10071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17186_pilon_+_9243_9912
924433	contig_854_pilon	-	1630	1	Intergenic	novelGene_36388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGCCCAAGATGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976420	974790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974800_976400
924434	contig_2730_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_135373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACATGTAGAAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307465	308974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_307500_309000
924435	contig_11964_pilon	+	1950	13	Intergenic	novelGene_164716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	475.43228136788	4	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	128	1474	180279	234930	FALSE	40	TTTAAATTACTGTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKWYLMPVVVLIGLTVRWTVSLNSYSGAGKPPMFGDYEAQRHWQEITFNLPVKQWYFNTSDNNLQYWGLDYPPLTAYHSLLCAYMAKFINPDWIALHTSRGYESQAHKLFMRTTVFIADLLIYIPALILYCCCLKETSTKRKITNALCILLYPGLILIDYGHFQYPLFVLLIKLACTVVASFIVCWLPFFAEREQTLQVLRRLFPVDRGLFEDKVANIWCSFNVFLKIKDILPRHIQVIISFCFTFLSLLPACIKLTLQPSPKGFRFTLVSCALSFFLFSFQVHEKSILLVSLPVCLVLNEIPFISTWFLLVSTFSMLPLLLKDELLMPSVVTTMAFFIACATSFSIFEKTSEEELQLKSFSISVRKCLPYFTFLPRIIQHLFLISVIAMVLLTLMTVTLDPPQKLPDLFSVVVCFVSCLHFLFFLVYFNIIIMWDFRNGRNQKKIN	180151	235406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_180361_195807_195893_212355_212446_213716_213806_215470_215554_216225_216300_218143_218280_220528_220615_222042_222128_225061_225133_231783_231853_231976_232176_234732
924436	contig_10958_pilon	+	2015	4	Intergenic	novelGene_5397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	47	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTTGTGAATCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888160	901686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_888945_895279_895855_900457
924437	contig_14546_pilon	-	1846	3	Intergenic	novelGene_157401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	645	983	173544	173206	TRUE	25	GTTCAGGTTGCTCAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKTHKTNHITSLYTHIVCKCIHRVWKLTVQLDKVIAERRRLGLRMWYSRGTWIMCILMSMYLRTEVLGWYKQLTCSAANCKAGSSSPPRGALKERAGDLLPKKSATRGKNT	174188	10866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_10897_140351_140925_172945
924438	contig_16977_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_169602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGTACAGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56574	59469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16977_pilon_+_56600_59500
924439	contig_12293_pilon	+	3039	1	Intergenic	novelGene_165588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1223	1801	13694	14272	NA	25	GCACCCAATGACAGGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTLDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEAKIDKFMENTDEKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIVQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTALFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGENRKHREDH	12471	15510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_+_12500_15500
924440	contig_17753_pilon	+	2885	1	Intergenic	novelGene_105112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1517	1903	146485	146871	NA	20	ACTGCTCAGCCTTCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	144968	147853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_145000_147900
924441	contig_3410_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_58956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCTAAAAACCAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383417	385383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_383400_385400
924442	contig_14635_pilon	-	4572	1	Intergenic	novelGene_84380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	3200	3583	622925	622542	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEDRTAKVNIRNVELKEYGLYFSVKKTKILTTGPVSNIMINGGKNCSCQGFHFTLQSAPMESAVNQTTCCIWQICCKRPLSSVKKQRCHFEDLGTPDSSHGIFSHLICKQKLAMNKED	626124	621552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_621600_626100
924444	contig_10011_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_68025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCAGTTGTGATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48510	46737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_46700_48500
924445	contig_12021_pilon	+	2272	3	Intergenic	novelGene_172190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	345	junction_1	60	35	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	768	1076	39446	42702	FALSE	15	TGGCACTTTTGCCCCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHWFHRNPLKATAPVSFNFFGVVTGPAASKICNDLRSSRARLLELFTDLSCNPEMMKNAADSYFSLLQGFINSLDESSQESKLRYIQNFKWTDTLQGQIPR	38678	43898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12021_pilon_+_39547_42150_42258_42601
924446	contig_11720_pilon	-	2271	2	Intergenic	novelGene_44024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAAAGAAAGAAATGACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426902	345903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_348028_426755
924447	contig_2863_pilon	+	3786	2	Intergenic	novelGene_174062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	15	junction_1	0	57	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	496	798	30181	30483	TRUE	20	CTGTTTGTTAAAGCCATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEFSTQPCLGDFPSQVQCLPAAFPIVSVTVARGVISYQAYSWWSLRGPMSDLLLDTCWDDVIGLFLYNVCIASTAIRAPYTFFLMSNIVLPGWKTWLAS	29685	34288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_32358_33174
924448	contig_13863_pilon	+	4052	1	Intergenic	novelGene_42106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	132	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	6	647	498940	499581	NA	65	TAGAGAATAGAAAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNTAENGNSRTLNGAMRNLYIDQEAVIRTEQGDTACLKVRKGVRQGCILSPYLFNLYAEQIIQEAELYEKEQGIRIGGRLINNLHYADDTTLLAESEEDLKLLTDEDQRPQPSVWITPQHKENKSPHNWTNKQHHEINGENIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQIKGHIALGKSAAKDLFKVLKSKDVILRTKARLTKAMVFQSPHMHAKAGQ	498934	502986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_498900_503000
924449	contig_17796_pilon	-	3080	1	Intergenic	novelGene_33845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181944	178864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_178900_181900
924450	scaffold_13505_pilon	+	2909	1	Intergenic	novelGene_111592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGAGAATTAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648248	651157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_648200_651200
924451	contig_6677_pilon	+	2425	2	Intergenic	novelGene_114195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_1	0	32	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564198	566895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_565820_566091
924452	contig_5279_pilon	+	4020	12	Intergenic	novelGene_105570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	43.7228309972401	33	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	2323	3156	355236	391945	TRUE	70	GGAAAAAAACACAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLKPLWCLRRRPRLGGFLAENLSSREVASGVSSPDSASPRALNIFDRDLKRKQKNWAAQQPEPMKYDYLKEEVGSRVADRVYDIARDFPLALDVGCGRGYIAQHLNKETVGKFFQADVAENALKNTIETEIPTLSVLADEEFLPFRENTFDLVVSSLSLHWVNDLPRALEQIHYVLKPDGVFIGAMFGGDTLYELRCALQLAETEREGGFSPHVSPFTAVSDLGHLLGRAGFNTLTVDTDEIQVNYPGMFELMEDLQEKKVQNVDLIFQNKLHIY	351694	394881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5279_pilon_+_353746_354964_355458_359419_359461_362129_362194_366354_366403_367738_367843_370230_370271_374032_374231_383262_383324_391889_391989_393733_394479_394805
924453	contig_10437_pilon	+	1202	6	Intergenic	novelGene_38293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1132.28017734128	10	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	51	671	431167	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431116	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432136_443797_443977_445309_445476_446951_447055_451075
924454	contig_11548_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_66803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGAGAGTTACAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194427	192576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_192600_194400
924455	contig_10023_pilon	-	2214	2	Intergenic	novelGene_123508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTGGATTTTGAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429946	427616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_429619_429734
924456	contig_9833_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_68474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTTGCCATATAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73987	76480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_74000_76500
924457	contig_4364_pilon	+	498	1	Intergenic	novelGene_812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACGGCGACTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532811	1533309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532800_1533300
924458	contig_665_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_158230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	1832	2338	951951	952457	NA	35	AGTATGGATTACACCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALESRVAKAKGKNEVKELNRRFQRVAREDKVMYYNDMCKYLEIENRKGRTCLACLKLKELKKKFRPRVAIVKDSMGKILNDAGSIKRRWKEYAESLYQKELVNIQPFQEAAYDQEPMVLKEEVQAALKTLVKNKPPGVDGISTGMFQQMHAEPEVLTHLC	950119	953138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_950100_953100
924459	contig_5451_pilon	-	1017	1	Intergenic	novelGene_167186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAAAGTAATATGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	699613	698596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_698600_699600
924460	contig_12157_pilon	+	969	1	Intergenic	novelGene_135895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATTCTGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107478	108447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_107500_108400
924461	contig_5671_pilon	+	3569	6	Intergenic	novelGene_79411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_5	728.393684761201	779	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	130	552	370430	531238	FALSE	60	AAACAGCTGCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	368795	534255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_368900_370404_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
924462	contig_1244_pilon	-	2172	1	Intergenic	novelGene_37959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACACAGGGGGCTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	889933	887761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_887800_889900
924463	contig_9484_pilon	+	2585	12	Intergenic	novelGene_105678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	728.934476530216	2	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	163	375	187875	198283	TRUE	50	ATGAAGTCAAATAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKQTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNSRAGCPQECQPCELEATRKAFCETGDIEDCSRGF	175483	213206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_175546_182686_182722_187809_187917_193422_193489_196702_196761_197343_197390_198282_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202815_206853_206944_211513
924464	contig_1301_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_47368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCCATGATTCCCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589475	591033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_589500_591000
924465	contig_5125_pilon	+	2711	7	Intergenic	novelGene_43437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	149	junction_1	1316.31885701502	2	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	484	1617	35654	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	26061	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
924466	contig_7342_pilon	-	2219	2	Intergenic	novelGene_71159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1034	1555	403461	401723	FALSE	10	TGGCCGTGGATGAGCGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTELSLLQDRQTSRARASSADSEGLLRAGLLGNVDVTGPVQSVGMLTPLVPVLGTVWDDALGCGACSTAGRRTLRCCSLGFWLGRPGGRRQVPGASDPWVAPMEMRHPLLSGGEGNSTPSSLLKDPPMPDFAGMRLSFRFFFFFYLKSNIFSLELAPQMQVPVIATCIDRRHT	404494	401058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_402080_403296
924467	contig_7744_pilon	+	2940	1	Intergenic	novelGene_62481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1395	1700	654875	655180	NA	75	CAACATAAAGAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAGIKSTTFVERDDGEAQHHQSTRPGADCRTDHQWLICKFKLKKIKTSPQEPEYDLEYIPPEFRDHLKNRFDGWNTNDRRPDELWDDVKDTINEESKKS	653480	656420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_653500_656400
924468	contig_17066_pilon	+	3126	1	Intergenic	novelGene_130960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317716	320842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_317700_320800
924469	contig_5084_pilon	-	5906	9	Intergenic	novelGene_64476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_5	94.4206015655482	38	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1437	4469	5905	88586	64707	FALSE	50	AGGCACTAGAGGCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLLLHQPEVLSTTVKGKLLPGIKAARPYTPKPNPVIREEDKDPVYLYFESMMTCARVRVYERKKEDRRQPSPSPSPSPLFQQQSSCHSSPENRSAKEPDSEQQPLKQVTCDPENDSDKSQEKSWKSSCNEGESSSTSYVHQRSPGGPTKLIEIISDCNWEEDRNKILSILSQHINSNMPQSLKVGSFIIELASQRKSRGEKNPPVYSSRVKISMPSCQDQDDMAEKSESETPDGPLSLGKMDDLTSMQTDALDSVRERLHGGKGLPFYAGLSPAGKLVAYKRKPSSSTSGLIQNHCVDYLEDDEEQVDIETVEDFSEEIIVHMKTAAARLLSSKQPCHTHVSADEKAAERSRKAPPIPLKLKPDYWNEKLQKEAEAFAYYRRTHTANERRRRGEMRDLFEKLKITLGLLHSSKVSKSLILTRAFSEIQGLTDQADKLIGQKNLLTRKRNILIRKVSSLSGKTEEVVLKKLEYIYAKQ	93054	64705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_64760_65538_65651_66438_66646_68942_68995_71746_71875_84603_85122_86662_86736_87211_87395_88475
924470	contig_13863_pilon	+	1453	5	Intergenic	novelGene_42007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	546	junction_2	406.840877985485	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	905	1372	75897	81541	FALSE	30	AGTCCAGAAGCACTGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	73927	81622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
924471	contig_15043_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_175512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CACAATTTTAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279531	281468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15043_pilon_+_279500_281500
924472	scaffold_9100_pilon	-	2814	1	Intergenic	novelGene_83230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTCACCAAAAGGTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467629	464815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_464800_467600
924473	contig_19816_pilon	-	1388	7	Intergenic	novelGene_156489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	290.259318923996	17	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	32	988	126795	123431	FALSE	10	GAATCCTGTGTTTGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVTRNRSIRVMAPGTLLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRARWMEREGPEYWDEQTRLAKDNAQISRESLRTALGYYNQSDTGSHTIQWMYGCEVGPDGRLLRGYNQHAYNGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEEDRVTENVKAYVEGRCVESLRRYLENGKEMLQRADVPRTQVTHHPVSEHEVTLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVEKEGTMLRLQAATVPWALMCLLWLLKRETAALCGTE	126826	123030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_123464_123631_123680_124001_124035_124701_124935_125577_125854_126164_126435_126731
924474	contig_15323_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_148504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTACAATAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29790	30817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_29800_30800
924475	contig_8447_pilon	+	2555	5	Intergenic	novelGene_69417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	438.12462553479	13	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	133	444	70881	82214	TRUE	25	GAGAAACTTTTTTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	69806	84485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82512_82671
924476	contig_720_pilon	+	2062	1	Intergenic	novelGene_155174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACATGGTGTATCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231154	233216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_231200_233200
924477	contig_7045_pilon	-	1983	2	Intergenic	novelGene_77454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAGGGCTAAGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	337161	334619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_336485_337043
924478	contig_12019_pilon	+	1358	2	Intergenic	novelGene_87653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAACATGAAGTGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5116	8655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_6348_8528
924479	contig_17274_pilon	+	2304	2	Intergenic	novelGene_26539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1831	2193	140141	140503	TRUE	40	GAGAGAGAGGAACAGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSSFMILEKFSVSSSSVILSVFSVFSPCSGTLITRKFLLLIASHIILRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCIIPNCEFI	138310	141155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_140510_141050
924480	contig_5260_pilon	-	2260	1	Intergenic	novelGene_144373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCCAGGAATGTACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289987	287727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_287700_290000
924482	contig_7056_pilon	+	2310	1	Intergenic	novelGene_43600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATCCAGCTGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697922	700232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_697900_700200
924483	contig_8330_pilon	+	1972	13	Intergenic	novelGene_71803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	611.472193198968	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	137	715	852673	855206	TRUE	35	AGAAGTACGAATCTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDDSGDLQGSPHT	837614	857546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855079_855172_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856266_856362_856560_856675_856755_856968
924484	contig_6870_pilon	+	3397	22	Intergenic	novelGene_103989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	12	junction_2	248.258368815786	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	897	2694	303	2996	1493590	1607140	FALSE	20	ACTGCACTTTATTGTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVGKDVSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEVVLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGLDSLVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN	1481079	1607541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1481158_1488030_1488091_1488699_1488781_1493506_1493613_1502310_1502447_1504248_1504495_1521425_1521617_1523634_1523857_1524821_1524943_1525069_1525166_1530739_1530856_1532495_1532662_1533390_1533490_1539714_1539975_1547905_1548099_1561569_1561717_1564394_1564541_1567438_1567569_1593452_1593538_1594461_1594549_1601696_1601852_1607065
924485	contig_17127_pilon	-	3209	7	Intergenic	novelGene_168307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	212	junction_4	86.825015596505	79	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1599	1611	3209	88565	76031	FALSE	15	GTGAGCCTTGCCGGAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRPSVLNTAVLLHKVRLSEDGQLARVSSECLQSNTVFWLSFLSPLPLRTPCVSASQDQCSRVECRVSMQMGFDYLKYNFFFSLLDWHQYDDIICMKPPGKIQRFWDHVTDGTRKSLVRGKQIAARVMLDSIFSILQTWNAINLKKFFTQFKQFYSVVREPTVYEGGPQTWSSFLKYGETEVKKDLWHYLKEKMDLFLQRNSEEHPPEHWPVRSGLRMGLIVLFAMEEFALPMSDADLSSLCYLLCVSASSPDPLHRDLQPVFETSRSWRRYLVNLCGRCMYPSKDCWVLTLPVLHHCMGLAPQGKDIPPEDTWAALEGLSFSQFREERSDQNQLLQLMESNQHLLNVDGCLFRSWFSLLPLRDLADYMRTLVPYLAASPAHFLDCFLGVYYRLRGLYKISHRNLENIEKALKMLLHLLEADLNTVPVEPFLQSYLTVCLNLHETICKITKNPKFSEMPALSAEIVCRIVSLQPVVDWAEMHGSEIGKKDSVKMVFQGALTATRSWLQRIFANKMFQSSHPSGVSFRYPEEVE	90175	76030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_76202_81044_81199_83646_83703_84601_84825_85441_85634_87090_87351_88022
924486	contig_10990_pilon	+	1306	1	Intergenic	novelGene_7434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTTAACTTGGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698404	699710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_698400_699700
924487	contig_10205_pilon	-	1749	1	Intergenic	novelGene_143116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225174	223425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_223400_225200
924488	contig_11629_pilon	+	1039	6	Intergenic	novelGene_161190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	202.52861526214	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	218	778	165444	412471	TRUE	65	AAAATGATAAGCAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPPPGLPPDPGYGYAPNQARYYDGCYPGGSGYGGRNDADPAYSQQGHQNTWKREPGYTPPGAPGAGNQNPPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIYCIEDFHK	165226	423812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_165525_251949_252077_311582_311753_412288_412474_420373_420448_423627
924489	contig_13206_pilon	+	7330	1	Intergenic	novelGene_161891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	6997	7314	99490	99807	NA	15	TTATTCTTCTTCTTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFLVFGFIFRSLIHFELVFVYGMRYGSCFIFFADGHPVLPAPFVKKTVFSPFDGLWALVEDQVTTGGWIFIWILNSVPLVNISVIVLVPGCFDYCSCIVGSEVR	92493	99823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_+_92500_99800
924490	contig_7253_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_140209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	109	462	229617	229970	NA	25	ATGTTATCTTTTCATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTLEYIFMLVTWNSILQHFHQMSIALQDSDINLKTCTDLYQSLTECLHNLRKDFENVAKQILPNTNYQAVHCRRSIREKQVNDGSAPEVSLSARDQFQETTHYTIIDTLESCRKKG	229508	230677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_+_229500_230700
924491	contig_17440_pilon	-	239	1	Intergenic	novelGene_7582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAATTGGTGGCTGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2177	1938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1900_2200
924492	scaffold_12124_pilon	+	1452	3	Intergenic	novelGene_22380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2368.5	21	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	809	1450	1508755	1509396	FALSE	40	GCAGTAAAATTATAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSS	1497069	1509398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497077_1506629_1506687_1508010
924493	contig_5954_pilon	+	2513	1	Intergenic	novelGene_28476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1272	1658	192341	192727	NA	45	GTTTTGATGAGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLAESEEDLKHLLMKIKDHSLQCVLHPNMKKTEILTTGPISNIMINRENIELAKDFILLGCTINTNGSRSQEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKGKDVTWRTKVHVTQAIIFSVASYACKNWTVNKED	191069	193582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_191100_193600
924495	contig_5317_pilon	-	827	4	Intergenic	novelGene_76535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	185	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	432	743	43257	35312	TRUE	15	TAGAGGCGGCGCTGGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSTQVGVFKKANQIGLTCLLQSTNSCALETQICFEVLSNFSHQTLEGKFANQKFSGLLITSDFPECHSTRPVTMRFLHPSSRGRTLASGFCSQLLPGCFTTS	43688	33733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_33764_35257_35408_36682_36837_43195
924496	contig_2830_pilon	+	2307	1	Intergenic	novelGene_165855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	705	1040	702530	702865	NA	20	CGCACACCCATGTTCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTRQGYPLSPLLFNIVLEVLARAKRQEKEIKDIQIGKEEVKVSLFTDDMILYTENLKESTRKLLELIEDFSKVAGHKINIQQLVGFLYTYKEKFKKEITISIPFTIPPRR	701825	704132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_+_701800_704100
924497	contig_10074_pilon	-	1814	2	Intergenic	novelGene_57206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CACCAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612281	608916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_609817_611367
924498	contig_11356_pilon	-	913	7	Intergenic	novelGene_175264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	9.26762584963856	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	364	690	328617	196785	FALSE	15	GTCAATGCTCATTGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNLKYCLLILNQPLDDCFRRLWSKAVLKACADGGANRLYDVTEGERKRFLPEFINGDFDSIRPEVRDFYTAKGCELISTPDQDSTDFTKCLQVLQRRIEENGLQVDVIVTLGGLAGRFDQIMASVSTLFQATRITPLPVIIIQEESLVYLLQPGKHRLHVDTGMEGDWCGLIPVGQPCSQVTTTGLKWNLTNDLLGFGTLVSTSNTYDGSGVVTVDTDQPLLWTMAVRL	434426	196561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11356_pilon_-_196904_287662_287775_328521_328669_344171_344268_364499_364573_385794_385865_434353
924499	contig_6477_pilon	-	4096	3	Intergenic	novelGene_154161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTAACAGGCAACGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761996	748143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_748470_754496_754586_758315
924500	contig_14472_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_111176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323390	322720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_322700_323400
924501	contig_854_pilon	-	3450	15	Intergenic	novelGene_36679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.06031501455085	27	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	2329	3123	1706853	1702548	TRUE	5	CCAGCTTCCGGCGGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHLPVSGGPIPESSPAPPAATVPHGGAHIPASSVLVALPAPPRPGSVSASSPGSGPHGSWPPPQESSSGCSLPVHV	1716407	1701235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1701346_1701988_1702201_1702542_1702770_1704478_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710677_1711569_1711655_1711753_1711877_1712276_1712337_1715213
924502	contig_8063_pilon	+	1943	2	Intergenic	novelGene_152434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTGAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583910	585932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_584509_584587
924503	contig_4832_pilon	+	2657	6	Intergenic	novelGene_163417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	58.2772682956228	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	271	1080	497716	502414	FALSE	20	TGATCCAGTAAGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAEIKLCSLLLQEHFGEIVGKIGVHLIRTGSQPLRVIAHDTGTSLDQVKKALCVLIQHNLVTYQVHKRGVVEYEAQCSRVLRMLRYPRYIYTSKTLYSDTGELIVEELLLNGKMTMSAVVKKVADRLTETMEDGKTMDYAEVSNTFVRLADTHFVQRCPLVPATENSDPGPLPPAPTLVINEKDMYLVPKLSLIGKGKRRRSSEEDAAGEPKAKRLKHTTDNKEPIPDDGIYWQANLDRFHQHFRDQTIVSAVANKMDQVTSKWVGQ	496021	503991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_496261_497684_497863_498388_498645_498747_498934_499969_500059_502282
924504	contig_19098_pilon	+	2679	1	Intergenic	novelGene_65846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGTAGACTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407014	409693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_407000_409700
924505	contig_3424_pilon	+	4387	6	Intergenic	novelGene_55572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	45	junction_1	92.495621517994	84	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	731	2196	231	2426	1079046	1081241	TRUE	20	CACTCACAGCAGGTGGGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPPPQAAPSGLVGPPPVGNPRGMFWSNSPYRRRVSSSVPAAPVTCPLQPVTDPFAFSRQVAQDTSLDTLSRSSLPVVPGPAPPAFSQHPALPTPHTGTGDPSQGPCEPVPGPFLQPGVDASLFSSASTPSAQPGPEANRSTERGPSSAPNVPTPPNPPQCIPGVGPDSPYGAAPGPARPLSRQNPRDSAGPPAVSSFFPQPPVQMLDSWVPVQGGPRPSGQHCSPCPEGPGHSVVPRASGLPHFPPQSRAHQSPAHEQQHSPLAPGPGPLAGDERNETAYLQSGNHSTRHFDPENTFRQSPRVGPAWASQEFRQNPGGSKELRPDPALANPLAQGNGPDHHLHYPPGAGAGSAALSMFFQGGEMENEENLSAEKAGSGGPSAFDGFCPNPGLSHRPPAAHMGTGSPSQAFLQGPSSETTQPGGDSQPYFSQSAGSQRDQPTAGSAAAGTWGDPAGPGTCGAFGPQCENVENLEFIQNQEVLPSEPLGLSSSSQSDPFWCGALPGPPTPKSGVTSHVGGGGPHLEAPSAPVLPDSVSSSYSSKDHRAPLSSARPQELVGTFIQQEVVKLDEEASGSFFKQIDSSPVGGEMDETPMSQNYRHSLSQPSTPSPPKPTGVFQTSANSSFEPVKSHFVGVKPVEADRANMVGEVRGSRVRQKKRRPTAALPDASPWQPGAAARQHGDPLHCPDLSAAPQHLCGSWPRPSTHWGGHLQKPGSRHLRKGPRPGLRGL	1074358	1087802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_1074520_1078976_1082627_1084461_1084626_1086762_1086861_1087052_1087180_1087615
924506	contig_4125_pilon	-	4302	19	Intergenic	novelGene_25253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	38	junction_1	203.681191516983	87	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	505	1518	31	1548	3036540	3018244	TRUE	25	AAATGTTTTGTCATTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKLQLLAHQYMISSKIEFYISESLPEYFVPYQAERFRRLGYVSLCDNAKTGCKARELKSVYVDAVGQFLKLIFHQNHVNKYNIYNQVALVAINIIGDPADFNDENNVTSREKLIDHYLGHNAEDPALDGTYTGKPDYISPLDDLAFDMYQDPEVAQIIRKLDERKHDAVQKERYDYAKKLKQAIADLQKVGERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAKVYQQLELHNLMDAELMRRPFDLPLQPLVHPGSPRHQKPKPSLPQQEERLTEKRAMEPLLQEQPSSRSRSVPPQHAAVGQVLPSPDPRPKIDVAGAYSKTWSYREDALLALYKKLMEMPTGTPKEDLKNMLRASVFLIRRAVKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETSHCVERTIPTLLTRTGDSSVRLRIIASNFIQEMALFKEVKSLQIIPTYLVQPLKANSSTHLAMSQIDLLARLLKDLGTEGSGFTTDNVMRSTFLQMTTTRAKTFSTKQFLRDLLK	3036570	3006073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_3008180_3009084_3009176_3010428_3010497_3010721_3010861_3013497_3013607_3014424_3014492_3014707_3014745_3017760_3017869_3018214_3018322_3022464_3022642_3024984_3025159_3025999_3026168_3028987_3029216_3030519_3030676_3031086_3031256_3034948_3035026_3035495_3035559_3035743_3035883_3036451
924508	contig_6479_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_160606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GACATAAAAAACAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98825	100569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_98800_100600
924509	contig_191_pilon	-	5796	4	Intergenic	novelGene_179082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	161	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	979	1479	663189	662689	TRUE	55	ACCTAACACAACACAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLRSWPYLLRLRQLGFLCSLPLQFLLSVASWPSGLTPASALLGQVFQSSLAPQIKCLEAPHSTRKPPALRHSAPSLCGSASLTPPISAQRHPTLPGSLQRTGTQLSRSVGRLQCHLALVSWFCCWFSVTAPSLLLQVLCHCWSSASAASLSIQFQNRFHILGIY	664167	479431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_191_pilon_-_482043_552984_554422_653469_653712_662661
924510	contig_6589_pilon	+	1939	16	Intergenic	novelGene_25715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	52.7869512495486	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	127	1575	460735	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451664	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
924511	contig_2903_pilon	+	4486	1	Intergenic	novelGene_148978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAAACTTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155572	160058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_155600_160100
924512	contig_13172_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_146308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	960	1451	979	1470	NA	50	AAACATAAATTCTCGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDITKGLRSRFETVEDRIRGIKDKHLDTTLFEENSETRTKRNEETLRVMWDSIKSKNLRVIGIPEQEEKTENTERITEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPQRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAPEKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQ	19	1965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_0_2000
924513	contig_15775_pilon	-	385	1	Intergenic	novelGene_148377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTTCACTATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18875	18490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_-_18500_18900
924514	contig_5988_pilon	+	972	4	Intergenic	novelGene_16082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2317	junction_1	1028.90891509188	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	76	474	1218380	1220149	FALSE	45	AAGGGAAAACAGGACTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVLKGWFNFEWGNCIFSYLFLRPEICIYSDLPQLAHT	1209868	1220647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915
924515	contig_9363_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_6737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATGCCTTCAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489887	1488811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1488800_1489900
924516	contig_5936_pilon	-	3974	1	Intergenic	novelGene_53539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAAATTATTAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45669	41695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_41700_45700
924517	contig_7933_pilon	+	2014	2	Intergenic	novelGene_164666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	45	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111812	114454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_113222_113849
924518	contig_6477_pilon	-	376	5	Intergenic	novelGene_154168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5567	junction_1	2881.69875030337	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	183	335	770052	769365	FALSE	10	AGTGGGCTTGTTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNIKHSGNITFDEIVSIARQMRHRSLARELSGTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVECPAS	771288	769323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769371_769552_769666_770018_770106_770616_770699_771241
924519	contig_16231_pilon	-	1899	1	Intergenic	novelGene_176719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGATACTGTTAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151602	149703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_-_149700_151600
924520	contig_5917_pilon	+	2534	1	Intergenic	novelGene_122147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATATAAAAAGGGTTATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247510	250044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5917_pilon_+_247500_250000
924521	contig_14513_pilon	-	1246	3	Intergenic	novelGene_70295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	184	552	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
924522	contig_9185_pilon	+	3808	1	Intergenic	novelGene_166921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	44	135	169	303	824297	824431	NA	5	TTTGGTGATTTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLKGCLTAALKHRAFSSETPLLSQTNHSDRALLLKANVLKTPPAFVVTGREVRAVMSSPRGAGNSGSQSEGLTHCGAKERRGAAQAGWKKNSRLTKKGS	824128	827936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_+_824100_827900
924523	contig_16492_pilon	-	600	1	Intergenic	novelGene_100267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTTCAATAAATCCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66068	65468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_-_65500_66100
924525	contig_5041_pilon	-	3594	2	Intergenic	novelGene_27030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	570	872	311704	311402	TRUE	40	GTTTAAATTAGCATACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLTTSIFSLFIMMLLIGPVVRILVLFMLRCNPLLKAVIFGSSSVSASLSASKVVSSAYHRLLMSLPPIPMASSYSHSPASPIICSAYRLNKCDERIQP	312273	308462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_311120_311336
924526	contig_10904_pilon	-	719	1	Intergenic	novelGene_22604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGTACCTAAAGCACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485396	484677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_484700_485400
924528	contig_12079_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_67572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGTGCCTGACTTCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953072	951095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_951100_953100
924529	contig_9833_pilon	+	1109	2	Intergenic	novelGene_68515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	356	805	215431	215987	FALSE	45	AAGGGGAGGCGGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILVFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSVFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRRESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFVIADCVFFVVCSSLGTILFASFFNWRGQSLRYGTAGQV	215075	216291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_215770_215876
924530	contig_16703_pilon	+	2238	2	Intergenic	novelGene_72782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1787	2188	36063	36464	FALSE	60	AATGAAGAAAAGGTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVTPPCLLKVDLKHLLMTIKDYSLQYGLCLNINKTKILTTGPVSNIMINGEKIEVVKDFIFLGSTSNTHGSSSQEITQRIALGKSAAKDHFDVLKSKGVTLRTKVHLTQAVVFSITSYACESWTVNVVRWPC	34233	36514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_35124_35166
924531	contig_8138_pilon	+	2012	5	Intergenic	novelGene_52422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	474.121028852338	20	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	219	626	280295	306552	FALSE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280076	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306364_306424_306471
924532	contig_120_pilon	-	2557	1	Intergenic	novelGene_165246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GTAAAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47026	44469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_120_pilon_-_44500_47000
924533	contig_18173_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_160763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGGTGTACAGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35270	32856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_-_32900_35300
924534	contig_15744_pilon	+	3394	2	Intergenic	novelGene_83621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1291	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191846	196603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_192984_194346
924535	contig_6488_pilon	-	4377	2	Intergenic	novelGene_44745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_1	0	81	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2094	2396	162760	162458	FALSE	25	AATAGTTCTCTGTGAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPGHPFNSELKPLSKFTLQPKIRQIYKTTTHMRNVLLSSIMYPRPKGQHLPQSNDEKAGRDRKPGQIHTGNPGVKGKGESAATFQGLQPMSQNDLYTNF	165020	160476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_163060_163226
924536	contig_7396_pilon	-	1788	14	Intergenic	novelGene_79622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3122.22329182646	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	84	1124	255163	247733	TRUE	5	TATTTTTGGTGGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMILVDLLLLHK	257437	245935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247766_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
924537	contig_4364_pilon	+	432	1	Intergenic	novelGene_4585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCCTATGGGCATTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2045811	2046243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_2045800_2046200
924538	contig_2332_pilon	-	708	1	Intergenic	novelGene_58641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCACTTGTGGTACTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193476	192768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_192800_193500
924539	contig_10437_pilon	+	1221	7	Intergenic	novelGene_38316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1035.9144779158	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	37	690	431167	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431130	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441823_445405_445476_446951_447055_451075
924540	contig_9668_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_58256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGACCCTTTGCTAAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623918	621831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_621800_623900
924541	contig_960_pilon	+	2187	2	Intergenic	novelGene_108251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535685	645644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_536724_644495
924542	contig_5375_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_169204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGCAAATGTAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44006	41764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_-_41800_44000
924543	contig_12148_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_140348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	78	443	130292	129927	NA	10	TCATATTCTTTGGTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSLILSSIVSNLLLRPSVTLSISEMLLFIFWISNCCFCMISSCEFILAFCSCIIFLTSSIFLSLFSINLSAFSMNLSIFSSFLSALCFNSRIALNIRDLYSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFFICFDIVCCLRDIQ	130369	128946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_128900_130400
924544	contig_10609_pilon	+	2887	1	Intergenic	novelGene_123949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	711	1484	473472	474245	NA	70	AAAACAAAAAAAATAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNQDVRWILAESREYQKDVYLCFTDYAKAFDYMDHNKFWITLLRMGIPEHLIVLMWNLYIDQEAVVRTEQGDTAWFKVRKGVHQGSILSPHLFNLYAEQIIREAGLYEEEWGIKIGGRLINNLQYAVDTTLLAEREEDLKHLLMKIKDHSLQYRLHLNIKQTKILTTGPINNIMINEEKIEVVKDFIFLGSTINTHGSSSQDIKIHIASGKSAAKDVFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSVASYACESWTMNEED	472761	475648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_472800_475600
924545	contig_16715_pilon	-	4048	1	Intergenic	novelGene_178095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	26	367	38388	38047	NA	40	TAACTACTGAATGTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLLISTFMALWSEKMLCSISMLWILLRLTLWPNMWSILENVTCALEKKVYFSAVGWSVWYMSMRSSWLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPATTVELSISLFSAVRICFLYFGV	38413	34365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16715_pilon_-_34400_38400
924546	contig_5457_pilon	-	1219	1	Intergenic	novelGene_139000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	420	719	71566	71267	NA	60	AACTTTCATCAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGTIKRKNLRVIRVPDGGITENRIFEDFLAENFPDVMKEEKISIQESRRTPHKVDPKRKSPRRIIIKLEKTNDKDRILRVAGDKRKVTYKGEPIRLSS	71985	70766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_70800_72000
924547	contig_15371_pilon	+	2983	19	Intergenic	novelGene_151455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	679.642164835454	2	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	820	2649	197031	230717	FALSE	30	AACACGTGGGTATCAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLPTHAFSTLFPVLQDNLEVYLGLQQFIVTSGSGHRLNITAENDCRRLHCSLRDLSSLLQAVGRLAEYFIGDVFAARFSNALTVVERLVKVTLYGSQIKLYNIETAVPSVLKPDLIDVHAQSLAALQAYSHWLAQYYSEVHRQSTQQFVSLISTTMDAITPLISTKVQDKLLLSACHLLVSLATTVRPVFLISIPAVQKVFNRITDASAQRLVDKAQVLVCRALSNILLLPWPNLPENEQQWPMRSINHASLISALSRDYRDLKPSAVAPHRKVPLDDTKMVIHQTLSVLEDIVENISGESTKSRQICYQSLQESVQVSLALFPAFIHQSDVTDEMLSFFLTLFRGLRVQMGVPFTEQIIQTFLNMFTREQLAESILHEGSTGCRVVEKFLKILQVVVQEPGQVFKPFLPSIISLCMEQVYPIIAETLHHNWRYFFKSTVLASVQRGIAEEQMENEPQFSAIMQAFGQSFLQPDIHLFKQNLFYLETLNTKQKLYHKKIFRTTMLFQFVNVLLQVLVHKSHDLLQEEIGIAIYNMASVDFDGFFAAFLPEFLTSCDGVDANQKNVLGRNFKMDRDLPSFTQNVHRLVNDLRYYRLCNDSLPPGTVKL	162835	231051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_162877_177203_177658_180956_181084_186475_186586_195512_195543_196973_197067_198099_198170_205106_205267_208942_209036_212974_213120_215190_215338_216235_216426_220720_220877_222001_222117_222289_222462_225587_225702_226862_226962_227140_227372_230615
924548	contig_3612_pilon	-	1521	1	Intergenic	novelGene_87846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAATAATAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	994947	993426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_993400_994900
924550	contig_253_pilon	-	2112	10	Intergenic	novelGene_129633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	246	551	246937	246632	TRUE	10	GAGCTTGTTCGGATCCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSLGAGASKDASGGPWAEPSSVPPATSPRLSGEEARKATGAGASSQVGQARGDRHAARPHAALTSVAQGTAACPGAGVNSTFLEEGMAKILSTYVSSAV	247182	221208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_221229_230224_230340_231347_231482_231852_231953_232918_232978_234531_234619_235146_235257_239865_239972_241709_241794_245885
924551	contig_12622_pilon	+	1869	4	Intergenic	novelGene_5803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_3	59.6508358887134	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	42	506	349741	398502	FALSE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPQSLAEDEIKTEQEVGEGMDISTRSKDPGSTERAAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGLLNNNNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQVLCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEVSS	349699	399865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_349755_358492_358564_388907_389057_398271
924552	contig_34_pilon	-	1085	4	Intergenic	novelGene_40039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2001.14034157194	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	426	806	230337	224546	FALSE	55	AAATGTAATATATATACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMVCSSITFVNQKLLNVPYTIVPGHIYHRRAPSNFVFKM	247113	224266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_224818_230228_230387_243120_243354_246970
924553	contig_8210_pilon	-	2632	3	Intergenic	novelGene_30220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1451	junction_1	69.5	2	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	39	506	19806	15712	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	19844	13585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144_18325_19801
924554	contig_20506_pilon	+	909	1	Intergenic	novelGene_149731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGCTTCTGTAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14091	15000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20506_pilon_+_14100_15000
924555	contig_1037_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_84605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAAAAAAAAAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306932	305545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_305500_306900
924556	contig_854_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_36382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATCAATACAATATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976415	974737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976400
924557	contig_16098_pilon	-	1103	5	Intergenic	novelGene_46040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1855.81646452444	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	171	458	349988	349343	TRUE	15	ATGGCTTTATTTTCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	350319	348306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348455_348845_349493_349604_349710_349955_350076_350236
924558	contig_13760_pilon	-	2276	2	Intergenic	novelGene_61360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	255	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	106	492	382314	381928	TRUE	30	ATGCCCAGCACAGCAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHSPHYHPELPVSIHPVFLPLPAFSSLLLGTCCPFGLILMVVLRSTFLTGVTVYFIGLSVTWLKGDLQEWLQFQIRRVSKGYSLRSSSSLSRTSKSGLFYEFEFCSAFFFPTLAGTFYCDPGQSGQ	382419	376450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_377202_380894
924559	contig_13863_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_42091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	151	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGGTCAGGAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464540	466502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_464500_466500
924560	contig_10225_pilon	-	4228	2	Intergenic	novelGene_86850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTAATTCTCCACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41524	36911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_41051_41435
924561	contig_3525_pilon	+	1769	4	Intergenic	novelGene_135121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1138	1470	52910	53242	FALSE	30	AGTGGTGGCAGTGAGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHPWGAPLSPKSELNSKTVATLPPHLLLHPFPTPAQLTWWENVKVTGELRFCVSLLLRKAEMMSERRMGETPHSKPLCVLCRATPASSLPIPGVETRPTTEGPGGQGQG	41773	53541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_41867_42220_42288_50645_51347_52633
924562	contig_9363_pilon	+	2079	16	Intergenic	novelGene_6602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	48	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCATTTACGTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754079	765900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_754505_755014_755120_755356_755465_755834_755889_756088_756197_756718_756795_757119_757203_758065_758146_758713_758844_758930_759075_759297_759373_759533_759664_759759_759917_761689_761850_761942_762081_765794
924563	contig_6576_pilon	+	2288	2	Intergenic	novelGene_42432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	65	1078	1301561	1302574	TRUE	40	TTAAATGAATATGCTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1301496	1304224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302873_1303312
924564	contig_14970_pilon	+	1735	9	Intergenic	novelGene_44940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	133	1221	136145	231550	FALSE	25	AGATGCTTCTGGGAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
924565	contig_17440_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_7557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGTCAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2859	1409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1400_2900
924566	contig_8447_pilon	+	6126	2	Intergenic	novelGene_69447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	62	155	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	5267	5632	153565	153930	FALSE	30	TTTTTAACATACATTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLEAHHAGLLLPGLCCWISPAGLSFLGGGGLFSLLWNWLSFKAKVSSPLGGRNYLICTAPPDHLGGSYKTMVRKAVLSNSSHCSGFLVLSPQSPLRCHAIWNMDCQTFRSGSLIRQNTIT	143330	154424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_145905_150872
924567	contig_11574_pilon	+	2594	1	Intergenic	novelGene_64043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366330	368924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_366300_368900
924568	contig_6062_pilon	+	2618	1	Intergenic	novelGene_5288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	977	1282	751491	751796	NA	35	AACTTTTTGGCTCAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQTGYHLNIKKTKILTTGPVGNINIEVVKDFTLLGSTINAHGGSSQEIKQHIALVTSAAKDLFKVLKKKDVTLRTKVHLTQAMVFSVTSYAYER	750514	753132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_750500_753100
924569	contig_6710_pilon	-	522	1	Intergenic	novelGene_95233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
924570	contig_5623_pilon	-	1898	4	Intergenic	novelGene_154837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	412.478955692153	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	572	907	210277	209298	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKRRPWTEPSRSSPFPVLATVWPPMCWASAIGTVTTS	210848	206940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208959_209106_209280_209405_210048
924571	contig_14727_pilon	+	3757	2	Intergenic	novelGene_56639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTAAAAGAAAAGAATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254671	301445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_257134_300150
924572	contig_9516_pilon	+	2477	11	Intergenic	novelGene_106182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1267	1572	883619	884709	TRUE	25	ACCGCTGGGTCAAACACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERACSSAFTRKPPKSESISSPPVLANSTLGSRPTAATMWSVSTFLPSFSLISNLPPLTPTDCTIALGITLTPSRLTFSMVQLLRYSGRIFPMFPFSGKS	882352	913244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_883750_884202_884297_884628_884735_888747_888857_889790_889867_890735_890818_896961_897060_898251_898377_898501_898635_899605_899705_913086
924573	scaffold_4438_pilon	+	4747	1	Intergenic	novelGene_174547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	3982	4350	419014	419382	NA	15	TGTCCCAGCATCCGTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEPVLNDDLPSRLLYGAIKVKSRVKELTEASAIFEGGTMEEDIDVIVFATGYAFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIYPPHLEKPTLACMGLIQPLGSIFPTVELQARWVTRVFKGESAGK	415032	419779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_415000_419800
924574	contig_16322_pilon	+	1158	3	Intergenic	novelGene_87542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGATGAAATACATTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77667	80623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_+_77956_78553_78622_79821
924575	contig_10734_pilon	-	2976	1	Intergenic	novelGene_51093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACACTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550373	547397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_547400_550400
924576	contig_11734_pilon	-	1128	7	Intergenic	novelGene_173218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_2	92.7787092434945	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	275	1126	26773	976	FALSE	25	AAGGGTAATTATTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNDSHTTCQCFHLPSFAVLMALTPKADSALAVITCVGLSLSLLCLLLAAFTFLLCRSIQNTSTSLHLQLSFCLFLAHLLFLVGIDKTEPEVLCSVIAGALHYLYLASFTWMLLEALQLFLTVRNFKVSNYTSEGRFKKNFMYPFGYGIPAVIVAVSAGVGHKNYGTNTHCWLKLDTGFIWSFMGPAAVIILINLVFYFIILWILKSKLSSLNKEVSTIQNTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFIVEVVGKTAELVIAYIFTIINVLQGVFIFVVHCLLNRQ	28475	973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11734_pilon_-_1157_2281_2374_3730_3798_12055_12292_15047_15243_26692_26861_28288
924577	contig_6576_pilon	-	1023	1	Intergenic	novelGene_42286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACCCCACTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333785	332762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_332800_333800
924578	contig_17796_pilon	-	561	1	Intergenic	novelGene_33832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGGACCTTCCTTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98273	97712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_97700_98300
924579	contig_6165_pilon	-	2878	3	Intergenic	novelGene_167403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	2277	2855	405033	404455	FALSE	10	GTGAGGAGGTGCCTGCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFAFSVMLECSREAAGAVQSCGGGCCCCCICCCCSNCSCCALFSLRSLYLLCDSRCSSSSCSSMVFSWGGFHHLAAMPGFFFTAWLRISSLLSFSNSSISSEGLTFLTQYCSFSLSSSSKSLEGFLSSWKARSSNLASFFSVVSVNSPSREEHRELVEELGLTGACRLSPRVSRSWSGGWPFALSPSAMV	434218	404431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_-_406389_422534_422717_433479
924580	contig_7345_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_159182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGATTCCAACTCATAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240362	241121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_+_240400_241100
924581	contig_10958_pilon	+	1773	2	Intergenic	novelGene_5466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAACATCAAAACCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895279	901655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
924582	contig_7840_pilon	+	2504	12	Intergenic	novelGene_68968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	428.238965497359	8	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1721	2128	304368	304775	FALSE	15	ACCTGCCTCCTCAGTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYPAPNVPVVGITPSQMVANVFGTAGHPQAAHPHQSPSLVKQQTFPQYEMSSATTSPFFKPPAQHLNGSAAFNGVDDGKLPSGDKHTEVPAGTCPVDPFEVQWAALESKSKQRTNPSPTNPFSSDLQKTFEIEL	130676	305151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_130710_183033_183152_212375_212461_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299249_299535_301110_301261_303391_303496_304059
924583	contig_15327_pilon	+	934	4	Intergenic	novelGene_70497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACCAGGAGCCGCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401081	411513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_401718_404070_404142_409696_409830_411419
924584	contig_5921_pilon	+	3975	5	Intergenic	novelGene_142237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTCCGCGCCCCCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68520	300495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_71769_82432_82668_87277_87381_231933_232179_300351
924585	contig_5346_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_161849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	644	1057	111627	111214	NA	60	TACTTAAAAAAAAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRQSPEPRQHDRCYLPEEVFLQTQALALEPWLFLSVSFAGPCIVCAEQGLVSTLDCPVSLIATHLAHCMQTLVTLLQSLTVWGCSHCHSNAELYSVGMFKAHTRHSGDTLDLVPTTQVSPSFRIKLLTHTALAAGR	112270	109704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_109700_112300
924586	contig_5019_pilon	+	3458	1	Intergenic	novelGene_109231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCAGCAGATCTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358722	362180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_358700_362200
924587	contig_7963_pilon	-	2331	9	Intergenic	novelGene_58481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	715.321595071056	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	697	2124	125592	120628	TRUE	75	AGAGAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPQLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126288	120297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121956_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125569
924588	contig_2476_pilon	+	2179	1	Intergenic	novelGene_157627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	149	367	132093	132311	NA	55	CTACTCAGCAATAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDSLFNKRCWHNWISICKKLKQGSYLTPCIKTNSKWIKDLNIKYKTVKIMEEKIGTTLGALLHGINRIQTISNNAQTPEEKLDNWELLKIKHLRSSKDFTNSKKTTDRLGKNFGYDKSIRV	131944	134123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_131900_134100
924589	contig_13525_pilon	+	3078	1	Intergenic	novelGene_145081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	233	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTATTGTATAGTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15733	18811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_15700_18800
924590	contig_19558_pilon	-	2493	1	Intergenic	novelGene_164740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2493	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_-_0_2500
924592	contig_17074_pilon	-	2957	13	Intergenic	novelGene_145121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCGGCCGAGAGCTGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225500	207942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_208027_212341_212490_213416_213550_214119_214214_215058_215107_215399_215473_216281_216352_216490_216614_216901_216984_217596_217692_220891_221009_223450_224650_224809
924593	contig_5201_pilon	+	3010	1	Intergenic	novelGene_82177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2471	2779	285458	285766	NA	10	GGTGGTGGTAGTTGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIEDYNLRYRRFNIKKTKILTTGPVSNIMINGEKTEVVEIFMLLGSTVNAHGSSRQEVKHPVALGRCKYAAKDLFKVLKSSDVTVRTTVCPTQAMMFSVPS	282987	285997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_283000_286000
924594	contig_9895_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_144708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	383	721	435581	435919	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQVFSNLETASNLYFKGNQSEYTFTDKTKPLLFALFRVFSYFFFLFFLFCLSIICSPMDIKSKAHKDSTHYRESQHNWAEPKLRSFLNTIKHFEGQSSRDGDLGTMLSGDI	435198	436648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_435200_436600
924595	contig_17964_pilon	+	2191	2	Intergenic	novelGene_33889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	1	3	junction_1	0	50	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	94	465	336364	336735	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAAATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIKGIINMKVSCSLCAQVEGYCIITCEEFTFEGLWNRPGMQVPGRWQPGTLHLGDDLVAVGKRGHSDEGWTQPRVQSCRGVCPAPPTFSPDAPREKASGQVSLIRRLASEPRTSVSLSMRWE	335613	338461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_335669_336325
924596	contig_7356_pilon	+	1438	1	Intergenic	novelGene_60397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	734	1060	441768	442094	NA	55	CATACAGAGGAGAAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLDIQNKPPDDFPMKQKAVELPDREFKSLILRILQELKEKADKNEEKIHKFMENTDKKTGRIQEKNAGTKCQNKFITRNYTKTIRNPENKQDFRNGRCHRRAEEQI	441034	442472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_441000_442500
924597	contig_2547_pilon	+	1052	1	Intergenic	novelGene_165466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440327	441379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2547_pilon_+_440300_441400
924598	contig_4783_pilon	-	3191	1	Intergenic	novelGene_108344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	1333	1845	52372	51860	NA	50	TCGCTAACAACAACAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQEKPPAQPMNLGLPTLYNCVSHFSYINLSIYIYTLHWFCFSREPSLRQYYNEMCKDLELKNQRGRTCLSFLKLKEQKKKFKPLVAILMDSMGKILNNAGSIRRRWKEYTESLYQKELDNIQPFQEVAYDQEPMVVKEEVQAALKALAKNSLQELTVYQLRYFSKRMQH	53704	50513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_50500_53700
924599	contig_9919_pilon	+	3859	2	Intergenic	novelGene_137976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604384	608748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_604612_605116
924600	contig_13014_pilon	-	1700	2	Intergenic	novelGene_169364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453955	450564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_451497_453187
924601	contig_5041_pilon	-	1759	11	Intergenic	novelGene_27078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	835	junction_3	266.92974731191	5	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	151	1416	572892	525456	FALSE	45	TTGAGCATGACTAATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	576443	525112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416
924602	contig_1719_pilon	-	1118	1	Intergenic	novelGene_87289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	312	611	373651	373352	NA	25	CTCAATTCCGACTCATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAFKFCLQYTRKAEFRKLCDNLRMHLSQIQRHHNQSTAINLNNPESQSMHLETRLVQLDSAISMELWQVCCELLASLSGNRLCIFFFLNGYFYLDIY	373962	372844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_372800_374000
924603	contig_546_pilon	-	3968	2	Intergenic	novelGene_117233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	347	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCTATTACATGGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156561	152229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_154722_155085
924604	contig_5921_pilon	+	3378	3	Intergenic	novelGene_142250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCATTCTGTGCTTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365202	389892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_366185_367693_367982_387784
924605	contig_2703_pilon	+	2649	21	Intergenic	novelGene_101691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	1006.39333761706	17	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	163	1434	429879	599821	TRUE	35	AAAAAAGTTTGGTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKEKVAPPQDAAPPSEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTRHFHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTCCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKEATCSSNCAGCGRDIKNGQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEIKGSTFTENHPSTNSMLPWQPRASLQKTSSSFPSSQQPRLQITTKYQRLRRTSGLVPPQLPP	429716	611744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_429895_461803_461939_484117_484302_487719_487830_508991_509119_510785_510880_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610756_611177_611429
924606	contig_7165_pilon	-	3470	4	Intergenic	novelGene_116908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1121	1474	1218607	1218254	TRUE	15	AGCGTGTCGAGTCGCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVTDQGSNLHFTVTCCGTLGQGPQFPTYKMEKNKTGMSWWCLLASGLYSYMERLNYVSLKDLSRSHIFLQKGKEGRHKDLGRASETTHSRGPTHYNLAGVKGAVGLEILKCQKRF	1219727	1198239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1198466_1210504_1210596_1211674_1211769_1216668
924607	contig_16496_pilon	-	1044	3	Intergenic	novelGene_5215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	449	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGATGTTCATCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	47	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_867_1310_1354_3413
924608	contig_9471_pilon	-	3207	4	Intergenic	novelGene_21828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAAAGAAATGAAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417212	412477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_412821_413710_413828_413916_414091_414639
924609	contig_13457_pilon	+	1896	13	Intergenic	novelGene_118345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	75.932490118233	2	105	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	147	890	60777	68762	TRUE	10	GTGGGGGTCAGTGATGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEDWLDCPALGPGWKRREVLRKSGATCGRSDTYYESPTGDRIRSKVELTRYLGPACDLTLFDFKQGVLCYPAPKAHALAVPSRKRKKPSRPVKAQQCQVGPCRGEVRKEAPSDETKADTDTAPASFPAPGCCENCGIRFSVDGTRRKRLKTLCKDCRVQRIAFNREQRMFKRVGCGECTACQVTEDCGACSTCLLQLPRDVASGLFCKCEQRRCLRIVERVSRAQSGGVGLRLALGFAHYGPSCDP	59264	71295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13457_pilon_+_59386_60751_60887_67349_67465_67570_67738_67824_67908_68149_68191_68534_68958_69134_69210_69321_69439_69530_69592_70247_70416_70761_71059_71202
924610	contig_6795_pilon	+	1802	1	Intergenic	novelGene_27700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	219	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112116	113918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_112100_113900
924611	contig_2730_pilon	+	1986	4	Intergenic	novelGene_135361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	533.158513014657	1	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTCCATTCTCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291598	392454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309372_379343_379494_390790
924612	contig_6929_pilon	+	2240	2	Intergenic	novelGene_139439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATATCTCAATAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253067	266164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_253186_264042
924613	contig_6239_pilon	+	3642	2	Intergenic	novelGene_178347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1900	2424	145782	146306	FALSE	40	CTATATAATGATTAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKYLQKQERMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILTILQDLRHKADKHEEKKDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQQEIIQRQQIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRPEKNEDTLRIMWDTIKSKNL	166	147524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_1360_145075
924615	contig_10016_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_117867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGTTAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382124	383583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_382100_383600
924616	contig_4232_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_63331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTATCTGCGAGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466956	468067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
924617	contig_8571_pilon	+	2337	1	Intergenic	novelGene_169187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	244	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCACGGAGCTCTCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499079	501416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_+_499100_501400
924618	contig_5136_pilon	+	2079	2	Intergenic	novelGene_126651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	923	1324	335128	335529	TRUE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPESIRHKTLADIPVEGKALELPDREFKTLIFRAVQEMKENTDKNKENINKIMAKTDKTMDEFRKIIQEQDVKLNKQLEIIRKQQLEIQKRNNKISEMDSATEGFRSRFETMQDRVSKFEDKSLNTTSFEEK	334205	336509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_335710_335934
924620	contig_14563_pilon	+	2739	6	Intergenic	novelGene_135040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAGCTCTGGAATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94675	116052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_96739_107763_107957_108805_108898_110647_110860_113623_113748_115997
924621	contig_17796_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_33827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	274	825	2223	3047	83907	84731	NA	45	TGAAAAATAGGGACAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQWFKIRKSINVIHHINKMKEKDHMIISIDAEKTFDKVQHPFLIKTLSKIGLARKLLNIIKGIYAKPTTHIIPSGKRLKAFPLRTNTRQGYPLSPLLFNIVLEVLARALRQEKEIRGVQIGKEEVKLSLLTDDVILYIKNPNDSTRKLLELVEGFSKVARYKISIQKSVAFLYSNKENFKKELRKTIPFTIAPYEVKYLGINLTKDIKDLYKENYKTLLQETKRELHKWKKIYHLMDSKNQHCENGHFYPKQSTDRIQSQSKFQQHSLLRWKN	81684	85127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_81700_85100
924622	contig_16882_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_148220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATTACGACAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218490	219995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_+_218500_220000
924623	contig_11855_pilon	-	2016	1	Intergenic	novelGene_66915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTGAATGAGCACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	809807	807791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_807800_809800
924624	contig_10058_pilon	+	2262	10	Intergenic	novelGene_67715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	152.47351520676	2	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	77	901	72602	99377	TRUE	30	ACATTGAGTTTGTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKGLQVRR	72525	101640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99355_99407_99532_99808_100583
924625	contig_4803_pilon	-	2568	6	Intergenic	novelGene_150720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	143.659876096285	17	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	2017	2568	48135	41926	FALSE	70	CAAAGAAGAAAAAGTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILFQDPMSFTYIEELGKREVTLPPKYRELLAKNEGIIQPPADSVKPMGPDDAVDALSSDFTFSSPTTGEKNTEKEKSTGEVLKAQSVGVIRSAAPPHEKKRRVEEDTMSDQALDALSASLGTWEPEPELDLSSIKEVDESTSRHVYLIRSSLQTYEVGKRSNFILHVFSRCFFLFFLLSSGKS	50151	41925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_-_42058_45461_45564_46889_46980_47113_47207_47702_47742_48039
924626	contig_20176_pilon	+	1971	1	Intergenic	novelGene_172711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67513	69484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20176_pilon_+_67500_69500
924627	contig_5765_pilon	+	2049	2	Intergenic	novelGene_141390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATGACAAAATAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	652912	826066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_653444_824548
924628	contig_12079_pilon	-	2979	10	Intergenic	novelGene_67527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	323.377316596092	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1061	2218	862522	861365	FALSE	40	AAGTACAAACGTTAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872378	860603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863524_864509_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
924629	contig_9516_pilon	+	788	1	Intergenic	novelGene_106139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACGTCAGCAGTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559650	560438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_+_559600_560400
924630	contig_3095_pilon	+	1137	5	Intergenic	novelGene_75132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	8	733	147280	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147272	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
924631	contig_3155_pilon	+	1696	4	Intergenic	novelGene_26387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	537.872558222567	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	136	462	259780	261211	TRUE	25	ACCTCACTCCAAGGATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKKITVRDAEPNRSRSHHEQQRQGQGTAEATGGSNTGPYRVIPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258100	262550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258228_259771_259978_261082_261230_261334
924632	contig_17213_pilon	-	2585	2	Intergenic	novelGene_179084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAACAAAAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3732	492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17213_pilon_-_1220_1874
924633	contig_13014_pilon	-	3516	1	Intergenic	novelGene_169325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAAAGCACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285062	281546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_281500_285100
924634	contig_6434_pilon	+	1446	3	Intergenic	novelGene_61915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	885.5	2584	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	931153	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_931210_932361_932678_932762
924635	contig_10581_pilon	-	1966	11	Intergenic	novelGene_41409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	77.1518632309032	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	571	1440	627511	609845	FALSE	50	CTGGGCTGCAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRIQGMISLSSESTDSSIPWFLRVQELAHDSLIAATRAQLAKNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKESGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRNDRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCPESSCGKQFTTAGNLKNHLRIHTGEKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHVRKHHLQMGAAGSQEQEQTEVLAEGSPRPLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQELLNQGDLTERRT	649677	609318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_-_609884_612472_612601_615220_615347_618992_619083_619575_619758_620242_620394_627357_627551_628816_629036_632023_632139_633218_633384_649645
924636	contig_1719_pilon	-	2155	13	Intergenic	novelGene_87283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	536.757135231775	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	513	1641	2153	364776	363238	FALSE	50	AGAACGCCTAAAGAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSEQIRNQLTAMSSVLAKALEVIKPAHVLQEKEEQHQLAVNAYLKNSRKEHQRILARRQTIEERKERLESLNIQREKEELEQREAELQKVRKAEEERLRQEAKEREKERILQEHEQIKKKTVRERLEQIKKTELGAKAFKDIDIEDLEELDPDFIMAKQVEQLEKEKKEL	382140	363235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_363313_363716_364065_364686_364873_365093_365211_366305_366405_366802_366903_370004_370181_371601_371811_373441_373648_375201_375358_375730_375868_376035_376227_381987
924637	contig_14546_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_157419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTACTCTTTAGACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83004	83630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_83000_83600
924638	contig_6898_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_35749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2974.86793357659	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	65	805	122646	125646	TRUE	20	GTTGGGGGTGGTTAAAACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWLGVDALGLALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	116764	127619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_116795_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125797_126834
924639	contig_5423_pilon	-	2261	2	Intergenic	novelGene_85216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	26	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAGAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349961	346221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_348159_349637
924640	contig_2924_pilon	+	3623	1	Intergenic	novelGene_140280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAGCAAATTGAAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271333	274956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_271300_275000
924641	contig_5643_pilon	+	1235	11	Intergenic	novelGene_38855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3957	junction_1	1692.65827620344	3	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	22	1023	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233951	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
924642	contig_7728_pilon	-	3739	4	Intergenic	novelGene_64695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCATTTTGAATCAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397574	360439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_360638_360698_361733_394712_395903_396257
924643	contig_12623_pilon	-	5215	3	Intergenic	novelGene_138168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	204	596	113767	113375	TRUE	80	AAAAAAAAAAAGAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGHLGCSHLFAIVNSAAVNTGVHISIRVTAFISLGYVPRSRIAGSYNTSISSFLKKCQINFQSGCTILHSRQQCISVPVAPQPLQHLLFCTFWINTSLIGVRWYLIVVLICISLMANDREHFLMYLLAA	113970	68429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12623_pilon_-_69196_72430_76177_113267
924645	SIRV6	+	1794	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	4	171	4	9	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAATAGTGCAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9003	10797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_9000_10800
924646	contig_11284_pilon	-	4434	1	Intergenic	novelGene_174899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAACAGCACAATTAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6154	1720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11284_pilon_-_1700_6200
924647	contig_6576_pilon	+	1877	10	Intergenic	novelGene_42268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCATGTCTTTTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321862	332126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_322685_322833_323000_323861_324104_325445_325540_326530_326689_329123_329193_330287_330338_330838_330913_331027_331197_332093
924648	contig_12079_pilon	+	2639	10	Intergenic	novelGene_67423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1379	1978	581102	585279	TRUE	20	GGCCTGTACCGCATAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLWVLLLSSLAWDNSLVKVCSLPLHALILLGLGDPLLLIAVVHDALTGELGAVACVLGALLLQVVLDVVIHRLIHGGRGRRGRCHHQVQLLPGLHQVVLRLFGPGAAIPPPRPPCAAAPLPTRQSWLCTQRAPWPAAPGSLSDPQPVSPAPPWPAARATRSASKRSASSWARFLSSSSCRALWICSESSFSAFLVFCS	579723	600678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582170_583661_583759_584145_584305_585247_585378_585891_586058_591619_591713_598002_598155_599466_599548_600607
924649	contig_15320_pilon	-	1004	11	Intergenic	novelGene_176596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	24	junction_10	72.560595366907	22	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	336	1004	164308	156083	FALSE	15	CCCACCCAGCTCAGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHVKKGNFLVLKAKELGLPVGTAAIAPIIAAVKAGKSVTFEGREILPEEICTPPDPGLAFVVVECPDEGFIQPICENAAFKRYQGKADAPVALVVHLAPESVLLDSRYQQWMERFGPDTQHLILNENCASVHNLRSRKIQTQLNLIHPDIFPPLADLRHKGEGATFRVPAVRAECLLKYQLRPRREWQRDAILTCNPDEFIAEALELPDFQESIQESRKSVQDGPAPAEKRSQYPEIVFLGTGSAIPMKIRNVSSTLVNISSDRSLLLDCGEGTLGQLCRHYGDEVDRVLGTLAAVFVSHLHADHHTGLLNILLQRERALASLGKPLHPLLVVA	166903	156082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15320_pilon_-_156125_156251_156291_156794_156934_158572_158670_160981_161101_162987_163074_163158_163298_164300_164397_165901_166015_166677_166751_166842
924650	contig_12786_pilon	-	3115	1	Intergenic	novelGene_103384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTCACAGATAAAATTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588962	585847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_585800_589000
924651	contig_3817_pilon	+	2404	2	Intergenic	novelGene_78393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAGCAGAACAAAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162815	1165490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_1163257_1163527
924652	contig_11338_pilon	+	950	1	Intergenic	novelGene_6379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	84	404	302447	302767	NA	25	TGAGCTATGGCTGCTAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEVPISPHPFQHFLLSVKHLLMKIKDYSLLYGLYLNIKKIKILTTEPISNIILNGEKIEVVKDFILLGSTINTNGSNSQEIKSRIALSKSAAKVLFKVLKSKLSL	302363	303313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_302400_303300
924653	contig_16185_pilon	+	2668	2	Intergenic	novelGene_144760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1625	1993	116139	116507	TRUE	40	TAACTCAGCACAAGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGAIEGLRSRFEMVEDKISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPERGGNRKHREDH	114514	117317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_117081_117215
924654	contig_17144_pilon	-	3098	17	Intergenic	novelGene_29509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2019.49943906281	10	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	147	1166	179764	173283	TRUE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERGKWVVKG	183228	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166845_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
924655	contig_9548_pilon	-	1701	8	Intergenic	novelGene_141051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_6	92.0150830581817	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1557	142	1698	125993	108768	FALSE	10	TGCACTGATGCCTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRQRTLFQTWGSSVVRSVDASGRSSGTERPQSPGSSKSRFPAPAEAAEAQPESDDDVLLVAVYEAERQLSPKDGGFCKSAGAVWIYPTNCPVRDYQLHIARTALFCNTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPSGKVVFMAPTKPLVAQQIEACYRVMGIPQSHMAEMTGSTQAFTRKEIWHNRRVLFLTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVVDEAHKALGNYAYCQAVQQVITNLLIGKIELRSEDSPDVLPYSYERRVEKVVVPLGEELAAIQKAYIQILEAFATSLIQRNVLMRRDIPNLTKYQLILARDQFRKNPSPNIVGLQQGIIEGEFAICISLFHGYELLQQMGMRSLYLFLCGIMDGTKGMTRTKNELVRNEDFMKLYNHLECMFADTCSASASGVSALRKGDKDKKFFYSHPKLKKLEEVIVEHFKSWNDQNTSEKKCDETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLFQHQPVIKVMTFVGHSSGKTMKGFTHKEQVEVIIFGGNENENKID	126134	108764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_108998_111841_111929_112451_112578_112917_113051_115298_115431_117823_117983_124706_124880_125476
924656	contig_2646_pilon	+	3509	1	Intergenic	novelGene_69580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCGAATAAAAATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334389	1337898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1334400_1337900
924657	contig_11417_pilon	+	3056	1	Intergenic	novelGene_103282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	233	931	444745	445443	NA	30	ACAATTCCAGTATTACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GERPYKCIDCGKGFKQSSDLVTHRRTHTGEKPYKCNGCEKKFSDSSTLNKHQRSHTGERPYECPECGKTFGRKPHLIMHQRTHTGEKPYTCLECHKSFSRSSNFITHQRTHTGVKPYRCNDCGESFSQSSDLIKHQRTHTGERPFKCPECGKGFRDSSHFVAHMSTHSGERPFSCPDCHKSFSQSSHLVTHQRTHTGERPFKCNDCGKGFTDSSALIKHQRIHTGERPYKCGECGKSFNQSSHFITHQRIHLGDRPYQCPECGKTFNQRSHFLTHQRTHTGEKPFHCSKCDKSFRQKAHLLCHQNTHLI	444512	447568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_444500_447600
924658	contig_3986_pilon	-	1346	1	Intergenic	novelGene_52722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	93	527	105124	104690	NA	30	TGATTGTAAGGTAAGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIITMFEPIVAATVSIHLVENLPLFHRPFTLPSMISFSRDWSLLITYPKYVRRSLVISASKEHSGCTSSKTDLFVLLTVYGIFFTNTTIQRHQFFLIHCLAFTCYGMIENTMAWVRRTLVCKVVSLLFKSFAADLPNAICRLIS	105216	103870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_103900_105200
924659	contig_13108_pilon	+	2951	1	Intergenic	novelGene_135869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATTATATCTCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42427	45378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13108_pilon_+_42400_45400
924660	contig_8594_pilon	-	3072	6	Intergenic	novelGene_140052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	251.728901797152	14	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1433	2275	492830	461703	FALSE	45	ACATTGATGTCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLRFTYFGHVIRRDQSLEKDVMHAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	494262	460905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_492754
924662	contig_2438_pilon	+	2161	2	Intergenic	novelGene_112064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	715	1053	311851	312412	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	311136	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312305
924663	contig_17144_pilon	-	1422	7	Intergenic	novelGene_29227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1263.52871180498	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	396	1127	172541	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176184	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_167929_170880_170934_172528_172703_175950
924664	contig_9471_pilon	+	5542	1	Intergenic	novelGene_21712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTAAAGACAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118281	123823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_118300_123800
924665	contig_7091_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_131780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGACTTACTGGTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359920	358142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_358100_359900
924666	contig_12391_pilon	-	1995	13	Intergenic	novelGene_103600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGGAGGGGGGAGGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108088	56798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_56855_82434_82551_82753_82832_94093_94219_96546_96638_96771_96848_98715_98893_101752_101932_102039_102093_104598_104697_105917_105998_106555_106603_107269
924667	contig_10496_pilon	+	1717	1	Intergenic	novelGene_59443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202469	204186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_202500_204200
924668	contig_8683_pilon	-	1541	3	Intergenic	novelGene_150272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	381	707	724695	724369	TRUE	65	AAAAAAAAAATTCACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKQAVYIHVKKYHSAIKRNKLQIHRTTWMNWKCIMLSERPDLKGYILYDSIYMTLLQRQNYRDRKHISGHHGLGLGKKVDYKGYEEILERGEFTQLYVSQNSYISIK	725075	722509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_722802_722907_722998_723916
924669	contig_7963_pilon	+	1264	6	Intergenic	novelGene_58396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	858.926446210617	18	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	353	931	56777	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLMLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51387	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51670_56706_56964_57281_57346_57390_57564_57782_57934_63003
924670	contig_2770_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_107419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATTGTGCACATAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230956	233063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_231000_233100
924671	contig_3832_pilon	-	3953	3	Intergenic	novelGene_161460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGATTGCATGTATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	345556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_346992_347047_347567_484896
924672	contig_20527_pilon	+	2585	1	Intergenic	novelGene_138613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGAATAGGAAGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22766	25351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_22800_25400
924673	contig_3956_pilon	+	3001	17	Intergenic	novelGene_15057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1250.6908340993	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	856	2571	81	2651	1281682	1290665	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANTRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVALARGSGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282749_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290417_1290491
924674	contig_1443_pilon	+	4092	6	Intergenic	novelGene_28148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGGAAGAACTCAACCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164420	343404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_164448_164679_166034_318660_320987_327009_327123_331883_331947_343195
924675	contig_11258_pilon	-	1762	2	Intergenic	novelGene_67836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	124	555	354806	349507	FALSE	55	AATACTGAAATAAAATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVERWSLFERSHLPGDDICVPRAKKTKDSREQLVQRTNGPHEPQLHNPKTRKTRSCPATTTNCSDWDHNRGFSTEQEKNVEQKLKFTKKTRLIGLTETRGTPKTKDLRHPSDLELKPFPETTSQPHNRQAHKINNNTQEEHTP	354929	348299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_349874_354741
924676	contig_6445_pilon	-	1497	15	Intergenic	novelGene_76882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_9	814.186413118103	3	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	64	1260	89674	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96330	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
924677	contig_13214_pilon	-	3351	1	Intergenic	novelGene_175707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2375	2680	3418	3113	NA	30	TTTGCCCAGTAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGTFNYGLPLRVIRSASGMKNIPSGTKLLKFSRSICRPIISFKSLGTSHSCNGLGKVTTGMSRTFPRKGCSIKKSRTCIYGYMEIFKFPKGRIVCYIHLP	5792	2441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_2400_5800
924678	contig_3081_pilon	-	907	2	Intergenic	novelGene_133969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGAAAAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191229	1189466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_1189855_1190710
924679	contig_18999_pilon	+	6368	2	Intergenic	novelGene_177320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	3402	3809	13667	14074	FALSE	35	GATGTTCAATTCCAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPASLPPLHFPESLSLNWTVCLPKPSLGLFPQALLEENLALGNLIPESLLSQKTEVEGMMFPFWNWEHFCLKAPERDSLMPWLVLLDTNLMYIHILDSWKSDAIYVRNNKCHFIISESKAPDLRSINHQEQCCQ	9643	16633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18999_pilon_+_10140_10761
924680	contig_12746_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_152192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAGTTGCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579558	581650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_579600_581600
924681	contig_9409_pilon	-	743	1	Intergenic	novelGene_179085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGGACTCAGTCCGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7692	6949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9409_pilon_-_6900_7700
924683	contig_5549_pilon	+	1418	1	Intergenic	novelGene_81599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAATAAAATTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88982	90400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_89000_90400
924684	contig_11574_pilon	-	6777	19	Intergenic	novelGene_64108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	5141	6553	584041	582629	FALSE	75	AAACCAAATAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECFTLRCTPSRHSRVPPLRQQTSPHTSGPHVLQERTSPHTPQSRAQQEHTSPHARVTCAAGTYFTSHATVTCTTGTYFTSRQGHVRSRNLPHLTHQGHMRSRNVLHLTYQGHMRRKNVPHLMPGSHAQQEHTSPHTPGSRVQQECTSPHSPGSRAQQECTSPHTPGSRAQQEHTSPHTPGSCVQQECTSPHSPGSRAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHSPGSCVQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHTPGSYAHQECTSPYTPGSYAQQERTSPHTPGSYAQQERTSPHTSGSYAQQECTSPHTSGSYAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHMPGSYAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHMPGSYAQQECTSPHTPGSYAQQECTSPHMPGSHAQQECTSPHTSGSYAQQECTSPHMSGSHAQQESTSPHMPGSHAQQECTC	630056	582404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_584339_585286_585363_586812_586871_588831_590897_592587_592677_597645_597748_599241_599374_601304_601478_606613_606717_614599_614756_617410_617594_621503_621634_621758_621845_622448_622566_623804_623871_624221_624394_626075_626684_627457_627638_629709
924685	contig_12079_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_67367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCCCACAGGGTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297970	295629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_295600_298000
924686	contig_10973_pilon	-	3442	3	Intergenic	novelGene_150322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	610	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	813	1325	2730	2218	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3767	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1706_1805_2880_3104
924687	contig_12520_pilon	+	1672	2	Intergenic	novelGene_161086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	675	1220	586162	586707	TRUE	40	AGCGTATATCACAAATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKFSVSSSSMILSVFSIFSACSGIPITRKFLLLIVSHIPLRVSSFFFVLFSEFSLNRVVSNCLSPVRLIMSSTVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLTPWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLF	585487	588073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_587068_587981
924688	contig_17968_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_154547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	701	1168	78378	77911	NA	30	AAGCCCCAGGATCCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILVKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSVTPIIRKFLLLIVSHITLRVSSFCFVLFSEFSSSSVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFQNSSNFLSVFSIFPHFSLRFASTLG	79078	76789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_76800_79100
924689	contig_12123_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_144577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTGTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18142	20216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12123_pilon_+_18100_20200
924690	contig_4223_pilon	-	3105	1	Intergenic	novelGene_117278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAAACCTTTTTTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241020	237915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_237900_241000
924691	contig_17144_pilon	-	2069	9	Intergenic	novelGene_29210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1429.26663340855	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	332	1774	172736	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173456	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
924692	contig_5954_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_28536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1553	1876	496855	496532	NA	35	CCCAGCAATCAATGCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTTTKSQSAPSQLWQSTTSDTQTLHYSYFVLSSLPVARPPEKRSKSPSMEVSQSTGQFPRLNSALVQTPGRQEGIPKDLQIRMPTKYYLVTDWYVLHIKLKRFFLM	498407	496038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_496000_498400
924693	contig_13525_pilon	+	2994	1	Intergenic	novelGene_145082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTCACAGAAAAAGAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16579	19573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_16600_19600
924694	contig_4816_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_115598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATTAACCTCTGACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23371	24975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4816_pilon_+_23400_25000
924695	contig_2465_pilon	+	3156	1	Intergenic	novelGene_179086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGTATAAATATTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10816	13972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2465_pilon_+_10800_14000
924696	contig_9366_pilon	+	4159	1	Intergenic	novelGene_166240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811893	816052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_811900_816100
924697	contig_3956_pilon	+	3727	14	Intergenic	novelGene_14990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1117.07785005206	4	150	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	916	2673	1284763	1289956	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284412_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
924698	contig_7123_pilon	+	2474	6	Intergenic	novelGene_170581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1522	2118	653720	654316	TRUE	35	AAGTTGAGAATTTAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPLWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	511595	655360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_+_511615_591696_591933_592058_592888_598305_598408_653384_654493_655180
924700	contig_8362_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_150674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	50	343	63603	63310	NA	30	CTTTGCTAAAACCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVKCFTFVILVLILTPMGMLFGEARFQTESGRQKRQERHRAVSLQAPCQVRAQITSCNLTAACVKVRKAKPGGLGHWTKVRSNCICIEFSWKINALSKSETFPSTTPPLSSGV	63652	61446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_-_61400_63700
924701	contig_14970_pilon	-	1209	7	Intergenic	novelGene_45114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	140.874254409937	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	334	1116	291083	264487	FALSE	55	GAAAAAAACCCACAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEDEPWKREK	315768	264393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_264559_268741_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312010_315611
924702	contig_5020_pilon	+	3189	1	Intergenic	novelGene_27962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230299	233488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_230300_233500
924703	contig_8273_pilon	+	2823	2	Intergenic	novelGene_113100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	70	372	477737	479742	FALSE	70	GAGATAGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQRTSLFQRCKILLMSHNEKLTFTNFPLNGSYFNFDACFVIHAIMINEQMKRSHKGKLNDQKTNISTNIIKTISFYSLFLQILQYFNTIKLPSNMYFHT	477667	482193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8273_pilon_+_477943_479645
924704	contig_17144_pilon	-	2159	12	Intergenic	novelGene_29272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2135.61228567143	49	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	124	1491	179764	166736	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	183205	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_170880_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174742_174902_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
924705	contig_10225_pilon	+	975	6	Intergenic	novelGene_86851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	600.613020171891	8	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	239	718	39837	42680	TRUE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSLFSGLAGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPKPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	39598	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_39913_40141_40303_40965_41053_41437_41523_42609_42704_47515
924706	contig_4422_pilon	+	2481	5	Intergenic	novelGene_155958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.29903810567666	31	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	300	1679	157190	164512	FALSE	30	TGGAAGTCCGGGTAATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASMHSATGAQGLLTFEEVAVSFSQEEWGHLNSAQRALYRDVMWENYRNLISVGFIFAKPKLISQLEQGEEPWVPEGPRPSNLGLIPTFSAGDTPETPPPPKEGCEAGDLQGLFSPALPSGDEASGEPTDKVLYWRTSEGKELIPCAAADCPWPLPSPPDPPKPYQCPQCGKGFSHSSNFNRHRRTHSVEKRFQCPQCNQRLSWSSDLTRHLRTHSGERPFRCTLCGKGFGLSSDYARHQRTHTGERPFPCPQCTRSFSRSSDLATHQRVHTGERPFRCADCGRGFLRSSSLLMHQRVHTGERPYRCGDCGKCFRLGQDLVKHRRTHTGERPYKCTDCTKCFSHSANLITHRRVHTGEKPYKCPECGKSFSQSSHLIIHQRAHTGERPYSCSDCDKSFSSRSYLLKHRRVHTGEKPYGCDICGKSYSQKTNLITHQKLHGADRQLGVIPCELAEPRPGS	156228	165314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_156521_157182_157223_157882_158010_159817_159932_163406
924707	contig_3956_pilon	+	1509	1	Intergenic	novelGene_15293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAATTAAAAAACAAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424704	1426213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1424700_1426200
924708	contig_17989_pilon	+	3823	2	Intergenic	novelGene_150847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	2768	3340	314862	315434	FALSE	30	CTTACCAGATATATGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPCFAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGFHLNIKKTKILTIGPISNIMINGEKIEVVKDFILLRFTINTHGSSSQEIKRHIMLCKSAAKDLFKVLKSKVCLTQAIVFSVTSHAYENWTMNKKTEEELMPLNYDVGENIEYTMDCQKNEQICLRRSTARMLLRSKDGKTLCHVLWTYYQEGPIPGEGHHAW	311890	315917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_+_314658_314861
924709	contig_15857_pilon	-	2950	1	Intergenic	novelGene_152083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTGAAGATATTGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157968	155018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_155000_158000
924710	contig_13206_pilon	-	4861	1	Intergenic	novelGene_161892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	4266	4718	94954	94502	NA	45	AAATGGATGTCAGAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNFFSLKLRTCNQDALIITGDWKAKVGNKEGSVVGKYGIGDRNDAGDRKIEFCKTNNFFIANTFFHQHKQRLYTWTSPDEIHRNRNDYICGERRWNSSISSVGTRPGVDCRTDYQLLISKFKWKLKKTRTSPREPKYDLIYPT	99219	94358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_94400_99200
924711	contig_5209_pilon	+	1952	1	Intergenic	novelGene_136424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTAAAAAAAAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14575	16527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5209_pilon_+_14600_16500
924712	contig_12644_pilon	+	2294	1	Intergenic	novelGene_44552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1585292	1587586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1585300_1587600
924713	contig_6980_pilon	+	1982	1	Intergenic	novelGene_35995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTAAGACAATATCCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241622	243604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_241600_243600
924714	contig_11512_pilon	-	2514	4	Intergenic	novelGene_43280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	480.524713204222	1	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	25	333	378234	368467	TRUE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASR	378258	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368174_368446_368604_374526_374659_378194
924715	contig_1450_pilon	+	2781	21	Intergenic	novelGene_27395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_18	523.243621556919	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	849	2550	37	2586	308979	355748	FALSE	85	GCAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQKKTGMMDTDDFRACLISMGYNMGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	308942	355943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_352967_353034_354170_354330_355589
924716	contig_10319_pilon	-	540	1	Intergenic	novelGene_147250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATGTATTCTGTACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142305	141765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_141800_142300
924717	contig_8386_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_82234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTTCATTAAAAAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63611	65448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_63600_65400
924718	contig_6316_pilon	+	3381	12	Intergenic	novelGene_134708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	212.021127904004	3	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2540	3055	149302	157164	FALSE	35	TTTTGAGTAAAGGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136302	157490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_144111_144171_145291_147170_148632_148737_148840_149004_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156929_157023
924719	contig_2799_pilon	+	2793	13	Intergenic	novelGene_85502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	819.309651813986	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	929	2787	6	2792	601182	729363	FALSE	25	GTAAGAGACATGCTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNPDSTFQKNVLEVGESTKERIENFHLSTAGASDIKATSKPVDKASVPNCVSATSSLDDHKPAESLLAFSNGENSTEKTTETETSRRSYEESADVPVGQNSLVIPAASKDKILDGSKPDTPSASICEAVSASDLTFPGPEKDLIPNQKSETNSSHVESQSSRSPIYPITGDDKLCADSACQQQNTVTSSGKLMAKHCDDIVAQPEDSITGQPITQHPPSAVLCEDPQINAIISDPVRDTQEHADLCPPEVTDKEGQGEDLNLDIPLTNMCEVALDPHPVVPKAEKEVVQDQAVTSDSTFSPASRPGSESVTKDDALSPVPSQKEKGTATPELHQATDCRDDPGGDSSDPNKQPLEDSTASLDTSFSATDLQPRMGNTSSLGLGGQHEEPCPSAASEVLSIEGLDTESSLLSVSKASLATDSVLTGEGPEPATEMPDTKAEDEVDFLSNSKKSSVSEELTVGHITTPMMKQNPKTQVINQESWCTIEPCPEAASLLSPKQSPECDENFLDVGLGRECTSSQSGLKRQSGSDSDLFHSPSDEMDRIVFSKPEEEQLVCDTTGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLPQISNLNKSKDPQSLDGFYSHGMGAERLESESEPTGSGEMEEEEMDSITEVPANCSVLRGSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNQRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSMSWCPSGVQYSAALSADFTCRSFSLEGLTGGADVRNKPSSSLEANSANTKELRHPFSVEARGDSLVSLSEEDLESGQRERRMFDQQTSHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLDNTRLFHNTSANLAESITEENYDFLPQSPSKKDFEGKSGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKEKEKDKKTLNGHTFGSIPIVGPISCSQCMKPFTNKDAYTCA	601176	729364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_602461_603744_603763_607925_608057_681361_681438_687153_687294_696528_696900_699191_699246_702704_702771_704625_704819_707593_707703_718651_718695_721090_721224_729189
924720	contig_5041_pilon	-	3206	21	Intergenic	novelGene_27052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_15	625.630120358667	39	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	1006	2469	576515	521597	TRUE	45	GTCACTTAAAAATGAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERVAECFP	636087	518471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_519174_521561_521619_525501_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581103_581143_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
924721	contig_14208_pilon	-	2505	2	Intergenic	novelGene_129112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	74	225	296	520	324082	323858	FALSE	50	AAAAAAAGTTGAGTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSFFISSFSSLYTYLLFLFPEYLALGNTSTPSSQAVLHGLGTTSPVPVAVPVRSLGAFFLFFSISQSLISPLQQQAPLALFFIYLYVFGLCSSLLFPMPILAQHITISPLLPAYLHRALNITTPSSTGMAYRNLPCTDFWPALSALVCATNNPSQQLPSSWTCPAVPYLSN	324436	321872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_324196_324254
924722	contig_19469_pilon	-	1019	1	Intergenic	novelGene_134986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAGAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36444	35425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19469_pilon_-_35400_36400
924723	contig_20889_pilon	+	2410	6	Intergenic	novelGene_127635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	46.5162337254426	6	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	280	1989	39523	63349	TRUE	30	TTCACAATGGAGAGAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVAIEDVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYRDVMMETFRNLASVGDICKSHGVEDKDNNQKTHVRKHMIENLCERNEDNQCGQTFSQILSHSVLKRTPMEGHPSEFLECGKSLMDHSSLKHHIRSHSGCVASQCKECGQACSCLSYLSTPVRTLTGEKPYESKEYGKAFRHFSVLKTHMRNHSGVRPYECKECGKTFRQSSVLMTHMRTHSGERPYKCKECGKAFSYSSNFTVHIRTHSGERPYECKECGKAFRCSSDVTRHMSIHSGERPYECKECGKAFRLSSHLSTHMRIHGGERPYECKECGKTFRWPPDLTAHTRTHSGERPYKCKECGKAFRRSSHLTTHTRIHSGERPYECKECGKAFRCSSNFTTHMTTHSGERPYECKECGKAFSCPSHLTTHIRTHSGEKPYECKECGKAFSYSSNFTAHIRTHSGERPYECKECGKAFRRSSYLTRHMSTHSGERPYDCKECGKAFRRSSHLSKHMRIHSGEGPYECKECGKTFCWPSDLTAHMRTHSGERPFECKECGKAFRRSSHLTNHMRIHSGERLMNVRNVGKPLAGHHTSLHI	20035	63850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_20076_39283_39526_59533_59661_60758_60820_61830_63675_63754
924724	contig_2342_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_132776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAAATTGGGTTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589365	589832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_589400_589800
924725	contig_11977_pilon	-	2787	3	Intergenic	novelGene_171722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	4.5	43	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	727	2184	95	2278	81846	70699	FALSE	30	TTGGGTTTCATTATGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESVIFEDVAVDFTREEWALLNFAERKLYRDVMMETFRNLASVVSQQVDNGQMVSSEHLIMRFMKNNSQYTMLGEICESHGIEEQHNNQGRHVRRHTIESLQESKEGKVKKRKEGKKCGKPFSKIAYLTRLKRTPAKENPFECHECGKAFMNHSSFKYHIRSHAGYNTYQCKECGVACGCSSHLSTHVKTLTGKKIYKCKECGITCSCSSSLTTHIRTLGREGPYECMEFGKGFRQFSTLIEHKKIHSGKHPYERKEYGNTVSSSSSLSKFISTHSEQRPYKRKECGKAFHQSSSLSNHKRTHTGDKPYECKECGKGFSTSSELTGHVRTHSGEHRYECKECGKAFSCALSFTRHVRTHSEGQPYKEYGKAFSQSSSLSNPTRSHIGEKTYECKECGKAFSKSSKLTIHIRTHSGERPYECKECGKAFSCASSLITHVRTHSGERPYKCKECGKAFSQSSSLSSHKRIHTGERPYECKECEKAFSCASSLTKHIRSHSGERPYECKECGKAFNRSSHLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFRQSSHLINHIRTHSGERPYECKECGKAFSKFSSLSKHKRIHSGERPYECKECGKSFRDVSSLTIHRRNHSGEFPYKCKECGKVFSWSSSLTTHIRTHSGERPYKCKECGKAFNQSSHLINHIRTHSGERPYECKECGKAFSKFSSLSKHKRTHSGERPYQCKECAKSFRDFSSLTTHIRTHNGEIPYKCKECGKQFSWFKSLRKHIRTHSGQSPYQCKQ	81940	70189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11977_pilon_-_72698_73065_73217_81812
924727	contig_14441_pilon	+	1002	4	Intergenic	novelGene_100536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	463.155121602543	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	389	817	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDTQLSGAEDTKSGGAHTPPPPLPPTLTPLKAAAGWQLLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATSPHRSLSSPAPPPADNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_116535_116963_117220_117344_117539
924728	contig_11096_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_143470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAGTAGTAGTCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213892	216045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_213900_216000
924729	contig_15666_pilon	-	1342	3	Intergenic	novelGene_70156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	322	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	184	300	107932	107816	FALSE	45	ATCAGATAGCATGTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFVPHSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110610	106773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107986_110167_110246_110558
924730	contig_7056_pilon	+	2459	2	Intergenic	novelGene_43738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1741	2067	1096353	1189230	FALSE	40	TAATAATTAGACCTACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNITINGENMKVVNDFILLGSTINTHGSSSHEIKRHIAVRKFAAEDFFKVLKSKDVTLRTKVHLTQPRCFQSPHMHMKAGQ	1094612	1189622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_1096423_1188973
924731	contig_500_pilon	+	794	4	Intergenic	novelGene_31063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1128.68861959355	44	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491704	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492066_1492652_1492727_1493615_1493684_1499298
924732	contig_13172_pilon	-	836	1	Intergenic	novelGene_146323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATACATTGTTATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41076	40240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_40200_41100
924733	contig_2114_pilon	+	1479	6	Intergenic	novelGene_104225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	36	junction_4	290.320236979788	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	116	862	136332	138000	TRUE	45	ATTTTTCTTTGAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSENRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPRHSRSRSRT	136216	139895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_136526_136914_137100_137430_137604_137805_138009_138372_138492_139405
924734	contig_3077_pilon	+	2683	9	Intergenic	novelGene_26877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	88.7665477530809	2	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	704	1114	1342656	1346705	FALSE	5	TTCCTTCTCTCCATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337801	1348274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337906_1338376_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342193_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
924735	contig_9437_pilon	+	1980	1	Intergenic	novelGene_141739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCTTAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437782	439762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_437800_439800
924736	contig_233_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_14674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	714	1067	82551	82904	NA	25	GGAATTTCACTGATCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGLWLGGTNRQCGYAWANLGKPEKVHGGSTNQNPAGRFLISRYIYPRETATLGFIGLHSVWANASPFRCFSWFCFTLAESESFTLQHFGVVGRILKVSYFQQTSRLLTTGTPVPA	81837	83905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_81800_83900
924737	contig_17737_pilon	-	3141	1	Intergenic	novelGene_72902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1923	2231	40190	39882	NA	25	AATTGTGGTGTTGGCGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIYRVTLPKKKLVDVQPFQKVAYNQELTVLKKEVQASLKALAKNKTPGIHRIPNEMFQQTDATLEVLTYLCQEIWRTNSWPTDWKRSMFVPILKKGGPTE	42112	38971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_-_39000_42100
924738	contig_1274_pilon	+	3853	1	Intergenic	novelGene_137816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	2528	3163	503659	504294	NA	75	TGTAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISTDIKRQSMMASASSQNKESRNFPEEENFLELLEAEYKRLIYRTIQEIKKENRQNAEHATEEIKKIREEHNHKFDRLQESTERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIEAMEVRTSENEDKALDTNLCEEKSDKRIKEKEETLRIMWDSIKRNNLRVIRVPEWGGITENTERIAEDLLAENFPDIIKDGKISIQNAHQPHIR	501131	504984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_501100_505000
924739	contig_19957_pilon	-	621	1	Intergenic	novelGene_57704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	269	580	158321	158010	NA	30	ACGCACATGGAACATTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISDKIGFKTKSTIKDQEGHYIMIKGTIQHEDITIINIYAPNDRAPKYIKKTLTALKIEIDTSTRRLQHTTLSKGQNIQKETHQRYRRSKGHNQPIRTHRHI	158589	157968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_158000_158600
924740	contig_521_pilon	-	1613	3	Intergenic	novelGene_174732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	155	junction_1	9.5	59	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	18	344	27090	22982	FALSE	70	CAAAGAGAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIIQVMATELARSLNCSGEEASESLMNLSPFDMKNLLHHILSGKEFGVERSMRPIHSTTSSPAISIHEVGHTGVTKTERSGINRLRSEMKQVRRSPWWQQQLGERWCSFLGSL	27107	21712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_521_pilon_-_23170_26338_26441_27053
924741	contig_5669_pilon	+	3303	9	Intergenic	novelGene_86060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	253.361617801513	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	463	1506	186622	189257	TRUE	35	TGTTTTCTGAAAAAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTSSSSEAVQPGPSMGPYSVPKEELKWPPTLQPPVVLGPSAPEPNLLAHPHNDPASFGELLPEVLLEPGPLAASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFGEEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDLKDRMVEQFKELHHLWQSQQRVQAVAQAPPGPGLMADQGPWPMHPVGMQ	178302	192895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_178332_182928_183135_185954_186114_186553_186623_187226_187512_187718_188112_188198_188318_189011_190044_191884
924742	contig_10750_pilon	-	3702	4	Intergenic	novelGene_172614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2158	2502	356818	330024	TRUE	65	TAAAAAAACTCCCAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNKTSAPQKKKKAQQNDKNYLLIITLNVNGLNAPVKKQRVAKTLVTKIKVY	359646	201067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10750_pilon_-_201966_329721_330174_356623_357431_358101
924743	contig_678_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_167809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGTATTTTATTATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110126	107641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_107600_110100
924745	contig_8328_pilon	+	3858	3	Intergenic	novelGene_174041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62612	67229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8328_pilon_+_62818_62874_63246_63947
924746	contig_17198_pilon	+	2673	1	Intergenic	novelGene_62331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCCAGAATCAGAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459282	461955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_459300_462000
924747	contig_13932_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_168863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAACCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9784	11457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13932_pilon_+_9800_11500
924748	contig_12644_pilon	+	1349	10	Intergenic	novelGene_44604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4617.72161499372	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	54	1259	2675526	2680545	FALSE	15	TGTGTTGGAGTGTGTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675472	2680635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679915_2680125_2680229_2680311
924749	contig_3004_pilon	-	2015	10	Intergenic	novelGene_127503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_6	36.2644607172244	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1290	126	1415	296169	288072	TRUE	50	AAAATTATTTAATGTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETQEISHEPLSSITVSTGSLLSYENTDLSLTDPEELTSGQMHIQQIIDKYINEANLMPGKTNFMVPSVDLDLSELEQTFPNLHRQLFKPLEPHPDFDLLSSFSGISQDSRDFYKGSESSSESQHATGSSKSTVSFSTPRNLHFSLNVSLDPQLDPNSAHVAAQSCVTENVIEGSEQSFQQLLPEFSSQEGSQHVDLPSIFSIEERDSSQGLENQNYPSEEVLQIKKEGVPFPVSLENLLSSSDEVNVFNQLNVQHNTPCGSTSSECSIKDQPEDRKRRLSFKELSERRLGVMLDDQGLTEDDKNEAGGVLDIRPHAEEIDSQLHVRTVEMGTSLHTPHSLTIRNEKYFENSTKRETPEILKNLSQSAQSELFLSSGTFSVQNCIPVWETESGHGIMEEPELTLVSTSDISIAETDFENLTLEERSETEAKSCFQVSEFLPLVPETETSACPSVSEHSGEELVTQPAGMP	296823	287226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_287297_287378_287479_287553_287654_287741_288180_289880_290022_290784_291429_292146_292322_295191_295341_296096_296190_296718
924750	contig_14720_pilon	+	2117	1	Intergenic	novelGene_164986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTAATAGCCCAACTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191589	193706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_+_191600_193700
924751	contig_12566_pilon	+	2742	1	Intergenic	novelGene_86025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2238	2555	220627	220944	NA	75	AAGATTTAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVRKLNEVLHWANLLQKDLFFTYACESWTVNKEAQEELMPLITVLTKNIEYTIDCQKNEQICHGRSIVKISLKARMGRLPSPALVTLSGGISPWRRRSCLIN	218389	221131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_218400_221100
924752	contig_1442_pilon	-	3619	3	Intergenic	novelGene_172148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	149	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1506	1844	118184	117846	TRUE	25	GTAGTACTCGTATAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLICLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLICASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	330407	97885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_99504_117688_118582_329299
924753	contig_17880_pilon	+	1538	2	Intergenic	novelGene_167335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	313	612	38667	38966	TRUE	55	GGGAGATACTAAAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHSLHQTESSTARWCPATTTDCSNRDHNRGARTELEKNVEQNSNSQKKTTLTGLTRDWRNPETMVPRHPFTSVMESLLRFTLQPKIRQPHRTKRD	38354	40736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_+_39790_40633
924754	contig_5947_pilon	-	3121	24	Intergenic	novelGene_101542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	80.4906034272052	4	41	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	1659	2678	570728	559786	FALSE	30	CAGGCATTGCAGAGTTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGPNNATLFTAAEIAPFVEILLTNLFKALTLPGSSENEYIMKAIMRSFSLLQEAIIPYIPTLITQLTQKLLAVSKQAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQKLIASKANDHQGFYLLNSIIEHMPPESVDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCIKYGALALQEIFDGIQPKMFGMVLEKIIIPEIQKVSGNVEKKICAVGITKLLTECPPMMDTEYTKLWTPLLQSLIGLFELPEDDTIPDEEHFIDIEDTPGYQTAFSQLAFAGKKEHDPVGHMVNNPKIHLAQSLHKLSTACPGRVPSMVSTSLNADALQYLQGYLQAASVTLL	601450	559342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_559876_560650_560883_561840_561988_563237_563320_564664_564751_564852_564951_565374_565432_567168_567267_569244_569349_570702_570840_574330_574397_575558_575644_576110_576314_576729_576796_577854_577985_578099_578268_580781_580875_582249_582358_583918_584001_584452_584595_584681_584784_586374_586518_589101_589198_601387
924755	contig_9389_pilon	+	2821	6	Intergenic	novelGene_84130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	11.2853887837327	50	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1080	1796	1617968	1649681	FALSE	30	CAATTTTCCACCATGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVCALEAGACSAFSANASGWSMALTLGGSQKPATPCFLNTLSCSSFLHFRSQVWCRENWGPRATISHIHKLQVRISTALTAVWTKHYSSASKLPSALLPLPSLFLTWLLVLRDNVPLDFWKLEKKMDSVVIEDVAVVFSQEEWALLDLAQRKLYIDVMMENFRNLASVVSQNPNDVEKLSSDHVMVQFMKSKTWFSMLGEISELHGSKDQHKNQRRYLRHHEGPVPGEEHHAWLWII	1602658	1650706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1602911_1605007_1605805_1617937_1618349_1633300_1633428_1634373_1634525_1649623
924756	scaffold_880_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_121447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCATAGCTTTGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433428	432473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_432500_433400
924757	contig_20028_pilon	-	3205	1	Intergenic	novelGene_170647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	2001	2447	36653	36207	NA	50	AATGTAGGAAGCATCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTSINNWKEKCTKYLGKLEKVKNEMECININSLGISELKWTSIGNFESDNHMVYYAGNHNLKRNGVAFIIKKNISRSILKYNTVSCRIISIYLQGRPVNKTIIQIYAPTTEAKDEEIEDFYQFLQSEIDQTYTQDSLVITGDWNAKV	38653	35448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_-_35400_38700
924758	contig_5997_pilon	-	2762	1	Intergenic	novelGene_168611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGCCCAGCTTTCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295611	292849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5997_pilon_-_292800_295600
924759	contig_4402_pilon	-	3309	3	Intergenic	novelGene_140783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	1588	2070	116969	116487	TRUE	40	AAGAAAGGTCCCTAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIKRLHHRVKRQPTHWEKIFGYDKSSQHLISKIYKILQSLNNKKTNNPIKKWAKNVNRHFTKEDIQVANRYRRKCSQSLIIREMHIKTTMRYHLTPARLALIQQTQNNKCCRGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWCFLKKLGIEVPYSNPTPWTIS	157303	50290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_50992_115948_117113_155859
924760	contig_12080_pilon	-	1672	11	Intergenic	novelGene_128349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	674.74072798372	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	235	1299	59953	54869	FALSE	30	TTACTCTCAAGTTCACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTEGGEKEKSVQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKTVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFIEQVENIKPEIVSVTAACEELRKSKNFSSLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFDISFLCKLRDTKSADQKMTLLHFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAATDEKDKFVEKMTIFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKVSVEEFFMDLHNFKNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMDSLLEALQSGAAFRRKRGPRQGK	107807	54495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62691_106812_106909_107777
924761	contig_5551_pilon	+	2795	1	Intergenic	novelGene_134259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATTAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598694	601489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_598700_601500
924762	contig_6439_pilon	-	4120	5	Intergenic	novelGene_154230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_4	107.742749175989	2239	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	7	357	221319	205439	FALSE	45	CATAAAATTCAGCATCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVMAGLVKKTTGLVGLAVCESPHERLKTLYIKILDVLQQMPKNAGYRKYTEEITNERLSKVNIEPDIKKLEDKLQSGQIEEVIFQAESELSLARKMVQWKPWEPLVEEPPANQWKWPI	221325	201675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_205541_209806_209873_215385_215503_220951_220997_221298
924764	contig_15025_pilon	+	3260	2	Intergenic	novelGene_155976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAACACATGGCACCTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48326	52475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_49688_50576
924765	contig_10756_pilon	+	2113	2	Intergenic	novelGene_170666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	0	14	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	434	871	88029	89466	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLAHARRKSTASPVPCEDQCDSLPGALQVEEKTEEVEEGRGNLGSSQTTEPQSLAQLEDTSLAQLEATSLPLSGITSELPPTVSLPLFTNNDLEPCSLTIDPLPPPLPPTPPPPPPPPPPPPPPPPLPVAKDSAPETLEKGLPRMEGNENRIPKSASIPSAHLFDSSQLVSARKKLKKTAEGLQRRRVSSPMDEVLASLKRGSFHLKKVEQRTLPPFPDEDDSNNILAQIRKGVKLKKVQKEVLRESFTLLPDTDPLTRSIHEALRRIKEASPESEDEEEALPCTDWEN	87595	90708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_88159_89158
924766	contig_13894_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_62214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGTTTCTGCTCTCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769697	771751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_769700_771800
924767	contig_10973_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_150339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	139	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCTCAGGAGTTAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1037	2845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1000_2800
924768	contig_4136_pilon	+	3527	1	Intergenic	novelGene_161236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGAACAACACACAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18838	22365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4136_pilon_+_18800_22400
924769	contig_7308_pilon	-	3201	12	Intergenic	novelGene_159621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	393.792158965627	12	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	64	1200	610005	593285	TRUE	55	AGATTGAAAGTATAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGVGVIQTLSRAASAAPERSDMLRVPLRRALAGLAKSPKGCVRTTSTAASNLIEVFVDGQSVMVEPGTTVLQACEKVGIQIPRFCYHERLSVAGNCRMCLVEIEKAPKVVAACAMPVMKGWNILTNSEKSRKAREGVMEFLLANHPLDCPICDQGGECDLQDQSMMFGSDRSRFLEGKRAVEDKNIGPLVKTIMTRCIQCTRCIRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQVGTYIEKMFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETRKTESIDVMDAVGSNIVVSTRTGEVMRILPRMHEDINEEWISDKTRFAYDGLKRQRLTKPMVRNEKGLLTYTSWEDALSRVAGKLQSFQGKDVAAIAGGFVDAEALVALKDLLNRVDSDTLCTEEVFPTAGAG	614132	590047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_591566_592801_593435_594218_594334_595002_595138_602039_602226_602693_602825_602915_602998_603662_603740_606201_606310_609309_609402_609944_610010_614073
924770	contig_16310_pilon	-	1219	5	Intergenic	novelGene_70080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGAACTCACGCGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290634	285798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_286018_288629_288705_288966_289064_289560_289633_289878
924771	contig_299_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_129484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399198	1398241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1398200_1399200
924772	contig_10286_pilon	-	2224	3	Intergenic	novelGene_98415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	433	junction_1	90	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	386	1021	406140	405505	FALSE	25	CATTTTCTACCTTTCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHIILRKKLSCFVLAFFLFAIVCVWKEMKKGSYYDSLKWETEGSPLVMGLGKMAMGSGPQSKVSTQHLRRSNQALNCTKASAKAKPQPSFQVWNKDSSSKNLPSRLQNIRKNYLNMNKYKVSYKGPGPGVKLSAEALRCHLRNHVNVSMVESIDFPFNTSEWEGYLPKENIRTKAGPWGKCAVVSSAGSLKSSQLGREIGGFQVLLRLLS	415570	404301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_406192_410089_410233_415379
924773	contig_6208_pilon	-	2385	1	Intergenic	novelGene_53040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGTAATTATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502869	500484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_500500_502900
924774	contig_7229_pilon	-	703	4	Intergenic	novelGene_39813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2656	junction_3	638.233499590863	27713	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	38	652	877522	875654	FALSE	25	CGTCTACTTAAAAGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	878215	875602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350_877535_878190
924775	scaffold_12124_pilon	-	2211	1	Intergenic	novelGene_21983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	724460	722249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_722200_724500
924776	contig_6269_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_170536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCCCAACAGTAAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173644	174346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6269_pilon_+_173600_174300
924777	contig_2161_pilon	-	3994	5	Intergenic	novelGene_114941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	326	685	956354	955995	TRUE	15	GAGGTGGAGTTACCTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQQQRTYSSRTRRPVRDGAGADPRSERAECVCNGGFLAEWGASTHLLVELGLLTHGAREVSACVQEASCQSGVPPGIYTGGDTELWNTCPSRADVGLRAEGLEAIGSRS	956679	938131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_938197_941023_941368_951468_951831_953121_955617_955951
924778	SIRV6	+	701	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	14	68	14	-8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAACTTTGAGTTTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10251	11262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
924779	contig_4888_pilon	+	3325	3	Intergenic	novelGene_178801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1563	1886	357856	358179	FALSE	65	GAAAGAAAAAAAAAGCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANRHVRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKFWTGCGEMGTLMHCWWECKITQPFWKTICMPLPQKARNRHTIRSSNPTSRNIS	344389	359618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4888_pilon_+_345470_346294_346452_357530
924780	contig_6616_pilon	-	4001	1	Intergenic	novelGene_141752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	3011	3346	276095	275760	NA	35	CAACAAATAGGCACTCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEVICDLLMCCKFYHCDEVILMRFPRLDSVLMQSFLRYKREKQAETHGNFIPPRKQCREQSASFGPEVPVLRCSQTKERLMTRTFLQSQQRDALNLDLKPNGL	279105	275104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_275100_279100
924781	scaffold_880_pilon	-	1450	3	Intergenic	novelGene_121481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTCTCATTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497954	492920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_493346_496768_497092_497252
924782	contig_6823_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_131257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAAGATGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503458	501890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_501900_503500
924783	contig_17198_pilon	+	2193	1	Intergenic	novelGene_62425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAACAGACAAATAGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1171224	1173417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_1171200_1173400
924784	contig_15047_pilon	+	1674	7	Intergenic	novelGene_52205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	23	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	20	1204	2194	21020	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEAVPLVGPHREKRKMGQKPEYPFSLSQGSGRGRSRFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGTDQTLFFRW	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3643_4149_4434_4552_4676_20991_21062_21232
924785	contig_9653_pilon	-	2327	2	Intergenic	novelGene_48329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	308	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGAAAACAGCCCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035717	1033209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1034809_1034989
924786	contig_4654_pilon	+	415	1	Intergenic	novelGene_103030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGATCTTGTTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4929	5344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_4900_5300
924787	contig_17968_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_154550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTGGTTTTATTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118028	117186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_117200_118000
924788	contig_17274_pilon	-	1463	8	Intergenic	novelGene_26573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	125	junction_2	326.960772782876	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	4	702	247033	232842	TRUE	55	CTTTAAAAAGAAAGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMFAMVQDREKIFHEIFLDHFKKNKVEIADKITKLFPFLETLRDHSFIPDKLYNDSQEAYRNLVPVSNVVYRVLCHLEETFDESLLQVLFSKVNLKEYPDLIQIHRSFENVFQHKYFSQKSVGEETEKMPSIQSRCKKDTWEVISSCHPENIPEDQQTRTAHCQASDIIVINSEDSAESSEENESWEAWRSALGNGPGEKEISGDDSLKVNHREEHQETSSSAPRSGPGAVMK	247036	231236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_231955_232798_232859_234836_234921_237118_237212_240084_240178_243020_243105_246141_246311_246874
924789	contig_10599_pilon	+	4170	5	Intergenic	novelGene_49880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	62	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1050	1664	141388	142002	TRUE	50	TAAAATGCTTATGAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRREISHHNEGYVCKTNSSIVRNGERLKTFPLRTGTRRGCSSSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLLVDDMILYIENPNDSTRKLLELIEIFSRVAGYKINIQKLVGFLYTNKENDGKEIRKAIPFTVAPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLSIVKMTILQKAIYQ	140338	268762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_143378_176091_176574_226583_226913_243594_243623_268470
924790	contig_14694_pilon	-	2330	2	Intergenic	novelGene_152460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13114	9916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_11651_12518
924791	contig_5684_pilon	-	2344	2	Intergenic	novelGene_81058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGTAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414368	408361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_409448_413110
924792	contig_9484_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_105688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209261	210307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_209300_210300
924793	contig_6266_pilon	+	2439	1	Intergenic	novelGene_171011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCCCATCATCAACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	867921	870360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_867900_870400
924794	contig_8420_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_69355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTACAACAGTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63944	65109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_63900_65100
924795	contig_9366_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_166251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1551	1865	933640	933954	NA	70	TAAGAAAAAAAAAATTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSASAMSYDTSCCSAYSCAIQRPSSFSLASLTLWSPGGAVVKRLAANQKVDCWNPPASLRAVLLCPTGLLCMSRNRLDSRGFSFLFVSCCPGLIFPFYLLAS	932089	934624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_932100_934600
924796	contig_10667_pilon	+	1749	2	Intergenic	novelGene_137316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAGTGCTTCATTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65931	68678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_+_66024_67021
924797	contig_6088_pilon	-	3805	2	Intergenic	novelGene_161264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTTCTTCAGCTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134084	11420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_12293_131151
924798	contig_9416_pilon	-	3478	3	Intergenic	novelGene_177903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAGAGATTTTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162186	34220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9416_pilon_-_35857_159931_161704_162116
924799	contig_13021_pilon	+	2276	13	Intergenic	novelGene_8178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2584.84501469624	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	542	1993	176681	180850	FALSE	55	AAAAATATTTGAAGACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174510	181133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176479_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
924800	contig_1996_pilon	+	4272	1	Intergenic	novelGene_131875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	162	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	909	1235	134417	134743	NA	30	AAGTTGGTAGTATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVEWLCIVNKTRVNIFLVFSAFSHDPSDISSDIPDSTSSSESSLNFWQFPVDTLLQLLLNDLQCVLLMILFDNFHILLDYLLLNVYKYESLPVSWPGSCLPNFLA	133508	137780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_133500_137800
924801	contig_8377_pilon	+	1816	18	Intergenic	novelGene_35017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3037.80448514472	4	19	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	400	1203	38	1240	68257	172989	TRUE	40	TGAACATTACAAACGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTTKSMT	68219	180495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169292_172969_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
924802	contig_401_pilon	+	1672	10	Intergenic	novelGene_42833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1521.63654588662	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	584	991	1713503	1715475	TRUE	40	AATATCTTGAATGGAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711896	1716429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713008_1713152_1713341_1713442_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715758
924803	contig_6427_pilon	+	1311	1	Intergenic	novelGene_162580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1053779	1055090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6427_pilon_+_1053800_1055100
924804	contig_3077_pilon	+	1825	9	Intergenic	novelGene_26653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.53327500624	19	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	499	1329	12050	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9613	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9806_11208_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
924805	contig_12923_pilon	-	2417	1	Intergenic	novelGene_30156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264001	261584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_261600_264000
924806	contig_2069_pilon	+	1327	2	Intergenic	novelGene_23288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	25	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTGGTTACATCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342574	345532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_343652_345282
924807	contig_4103_pilon	-	2962	1	Intergenic	novelGene_52006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGTATCTTTGGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260550	257588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_257600_260600
924808	contig_11338_pilon	+	3420	14	Intergenic	novelGene_6193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	530	junction_4	401.611296076311	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	564	1695	58	1752	6086	11749	FALSE	15	ACGTGAGCTTGGTCTCATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	4611	13417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
924809	contig_15327_pilon	-	1124	4	Intergenic	novelGene_70660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	87	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
924810	contig_9484_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_105677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGTGATGGGAAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166512	168055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_166500_168100
924812	contig_4232_pilon	-	887	1	Intergenic	novelGene_63386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGCGTAGAAGATAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467200_468100
924813	contig_9527_pilon	-	2870	2	Intergenic	novelGene_134034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2273	2641	245438	245070	FALSE	75	GGGGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTKTQGKLMDHSYHSLHQPEPRTTRWCPATTTNRPDRDHNRGSQTEREKNVKQNSNSEKKKKKKDQIYWSDRDWRNPESTVPGHPANSELKPRPKFTLQRKIRQVYKTITHVRNVLRSSI	248232	244840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9527_pilon_-_247299_247820
924814	contig_5482_pilon	-	2789	1	Intergenic	novelGene_144466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTTCACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342829	340040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_340000_342800
924815	contig_12948_pilon	-	2462	1	Intergenic	novelGene_126229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	651	1001	372558	372208	NA	75	CAAAAAAAAGAAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIAHTSKILLKIIQKRLQQNINRELPEIQARIRGRSGTRDITADVRWIQAESREYQKDVYLCFIDYAKAFSCVDHNKLWITLQRMGIPKHLIVLMRNLYIDQEAVVQTEQGHTV	373208	370746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_370700_373200
924816	contig_11160_pilon	+	1483	2	Intergenic	novelGene_168849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACGGAAGAATGGATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	787243	789175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_787402_787850
924817	contig_1143_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_86586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACTATTCAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129043	126936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_126900_129000
924818	contig_6325_pilon	-	907	1	Intergenic	novelGene_143355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382394	381487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_381500_382400
924819	contig_19701_pilon	+	4823	1	Intergenic	novelGene_147893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	3072	3467	108455	108850	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSLTSHAYESRTVNKEDQRRIDAFELWYWWRIFDIPWTARRTNKSVLEEVKPEGSLEVRIVRLHILYFGHIIRRDRSLEKDIKLDKVQSQQKSGRPSTRWMDTVAATSCPNIAKIVRMAQPGSVSFCCT	105383	110206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_105400_110200
924820	contig_8554_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_160285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAGGGCTGGTTGGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79137	80225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_+_79100_80200
924821	contig_7138_pilon	-	2430	9	Intergenic	novelGene_120976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	175	junction_6	50.4961322776309	15	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	146	1444	115371	101068	FALSE	75	GATTTAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPLNILCLLPHLIQHFDSPTQFCKETASRIAKVCAEEKCPTLVNLAHMMSLYSTHTYSRDCSNWINVVCRYLHDSFSDTTFSLVTYLAELLEKGLSSMQQSLLQIIYSLLSHIDLSAAPVKQFNLEIIKIIGKYVQSPYWKEALNILKLVVSRSASLVVPSDIPKTYGGDIGSPEIPFTKIFNNVSKELPGKTLDFHFDISETPIIGNKYGDQHSAAGRNGKPKVIAVTRSTSSTSSGSNSNALVPVSWKRPQLSQRRTREKLMNVLSLCGPESGLPKNPSVVFSSNEDLEVSDQQTSLISTTEDIIQEEEVAVEDNSSEQQFGVFKDFDFLDVELEDAEGESMDNFNWGVRRRSLDSIDKGDTPSLQEYQCSSSTPSLNLTNQEDTDESSEEEAALTASQILSRTQMLNSDSAADETMPDHSDSLLQSQDSTSSATTEEVLQIRDETPSLEASLNNANSQLPEVGRNGIWCLANLGSF	120200	100081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_101284_103431_103636_107622_107800_108129_108205_108333_108496_112246_112445_113477_113619_115245_115417_120100
924822	contig_12019_pilon	+	1572	7	Intergenic	novelGene_87756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	165.021884070635	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	448	1044	639750	642306	TRUE	30	ATATGTTACATTAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQRLQEALQLEVKARRDEEAVRLAQTRLLEEEEEKLRQLLQLKEDQERYIEQAQQEKQELQQEMAQQSRSLQQAQQQLEEVRQNRQQADQEVEAAQRKLRQASTNVKHWNVQMNRLMHPIEPGDKRPTTSSSFIGFQAPLLARRDSSLKRLTRWGSQGNRTPSPISSERQKSLNGGDEAPIPASTPQEDKLDPAPEN	637400	643221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_637686_637838_638001_639749_639833_639942_640142_641782_641874_642082_642499_642885
924823	contig_9177_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_32695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATGAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448823	447452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_447500_448800
924824	contig_6014_pilon	-	1582	1	Intergenic	novelGene_176278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAAGCAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146598	145016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_145000_146600
924825	contig_8156_pilon	-	1900	11	Intergenic	novelGene_98902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCATCAAATTTACTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106957	59895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_60182_66367_66458_68053_68190_77505_77682_89201_89384_94114_94338_96176_96390_100456_100629_100814_100926_102903_103117_106859
924826	contig_9981_pilon	-	2305	1	Intergenic	novelGene_121057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272577	270272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_270300_272600
924827	contig_854_pilon	-	2560	13	Intergenic	novelGene_36661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.21108319357027	3	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1654	2043	1710643	1709595	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1716011	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1706787_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715323_1715551
924828	contig_3601_pilon	+	1682	1	Intergenic	novelGene_132917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCACTAAAACTGCCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298313	299995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_298300_3e+05
924829	contig_9011_pilon	-	1935	1	Intergenic	novelGene_159305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGCCTTCTGGAATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	454494	452559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_452600_454500
924830	contig_3832_pilon	-	2601	1	Intergenic	novelGene_161490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAATTCCTATTCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	484294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_484300_486900
924831	contig_12624_pilon	+	2377	11	Intergenic	novelGene_60964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	321.179326856509	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1295	1993	39740	55160	FALSE	30	ATTATAATGTACTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6188	55544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6268_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
924832	contig_6842_pilon	+	3348	2	Intergenic	novelGene_130776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	571	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2029	2460	1352656	1353087	FALSE	80	ACAAAAGAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTSDDFPVEEKALELPYREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKITQEQNANINSQPEIIQKQQLEIQKINNKILEMDGVVEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLRITQKKEQRKMKRP	1350523	1353975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1352423_1352526
924833	contig_17803_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_175025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAAGATTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46443	45308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17803_pilon_-_45300_46400
924834	contig_12624_pilon	+	2520	9	Intergenic	novelGene_60957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_7	314.718028558899	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1244	1672	39740	50436	FALSE	30	AAAACCAGCTTTCAGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFFLLLKAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSFVSRDLSTSWSN	6097	55823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_50396_50437_54975
924835	contig_5623_pilon	-	2036	6	Intergenic	novelGene_154818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	327.843499249261	151	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	107	841	211595	207141	FALSE	10	GCCTTGTTATGTCTCCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCSVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRNTGCPQAAPRWRVAAPSLPAGDLGPARLLSSWELPGCRGVGSSSHLVPTVQRGTPVLSPPPATSVLPSPARPPLTVICGGHLQGRPVP	211897	205945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207409_210728_210808_211004_211121_211203_211383_211502_211603_211798
924836	contig_14441_pilon	-	786	4	Intergenic	novelGene_100741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	169	381	126577	125875	TRUE	30	ACAGTGGGAAGGGGCGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	126745	121190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_121237_125515_125900_126157_126282_126513
924837	contig_593_pilon	-	3915	1	Intergenic	novelGene_101998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTTTGTTAAAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306877	302962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_303000_306900
924838	contig_8447_pilon	+	2836	9	Intergenic	novelGene_69411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	416.317618381687	3	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	66	995	54716	82214	TRUE	25	GCGAGAAACTTTTTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	54650	84483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82387_82814
924839	contig_1567_pilon	+	2655	2	Intergenic	novelGene_176418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACACCCTTTTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503283	511370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1567_pilon_+_505680_511111
924841	contig_14223_pilon	-	4089	1	Intergenic	novelGene_156977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2894	3193	192569	192270	NA	5	GTCTCTCCTTCCATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	195462	191373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14223_pilon_-_191400_195500
924842	contig_13211_pilon	+	2982	18	Intergenic	novelGene_123132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_11	189.294830547409	66	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	248	1894	38334	122464	TRUE	40	AAGTATAGACCTATCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESYVTPILMSYVNRYIKNLKPSDLQLSLWGGDVVLSKLELKLDVLEQELKLPFTFLSGHIHELRIHVPWTKLGSEPVVITINTMECILKLKDGIQDDHESCGSNSTNRTTAENTKSSVKPRRIQQTAPTDPDLPPGYVQSLIRRVVNNVNIVINNLILKYVEDDIVLSVNITSAECYTVGELWDRAFMDISATDLVLRKVINFSDCTVCLDKRNASGKIEFYQDPLLYKCSFRTRLHFTYDNLNYKMPSVIKIHTLVESLKLSITDQQLPMFIRIMQLGIALYYGEISNFKDGETEGPTCHNKDMLGNITGAEDERRIDMQYPAQYKTQELYSQDDEQPQGWVSWAWSFVPAIVSYDDGEEDYLGNDPASTTQQQKAQTLKDPIVSIGFYCTKATVTFKLTEMQAESSYYSPQKVKSKEVLCWEQEGTTVEALMMGEPFFDCQIGFVGCRAMCLKAIMGVKDFEENMNRSETEACFFICGENLSTKGLTYLTNSLFDYRSPENNGTRAEFILDAAHHKVLQINRTFLQGKVKIWEQFGRSQPKTLL	37611	288399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_37827_38301_38481_57705_57850_82228_82350_99626_99795_102234_102417_105260_105436_113153_113420_117822_117919_118413_118537_119038_119177_122377_122570_129542_129713_135561_135757_145798_145924_192112_192295_287314_287450_288223
924843	contig_7342_pilon	-	1744	4	Intergenic	novelGene_71241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1202	1639	728650	728213	FALSE	40	CTCTTAACAGAACAGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVKKVLFLRELSVWPHATCFLCKWLLQLGTFFFSWLRFTSFPQNVEYFLIFYGFNRNRMAQGLMTREIKQSQMRNWHGCHTNMKRRANYTEIGKPEGTKSYLLRLPARQPTTALSLYATGKRQGPQRFKHLQPLGCFSAVFFV	734869	728107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_729485_730006_730108_734513_734665_734754
924844	contig_9582_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_106861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAAACACAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880879	879185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_-_879200_880900
924845	contig_1172_pilon	+	4374	1	Intergenic	novelGene_162036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGACTCAGCAAACACGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622927	627301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_622900_627300
924846	contig_5628_pilon	-	2622	11	Intergenic	novelGene_157580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	53.0057544045927	6	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	1062	1880	425746	411690	TRUE	40	ATTAATAAACATCTATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLYCVPRVIQVGAHFHVRTRIDVAGMKVRELSDVEFPNAFLVSGKQRTLELQARSQEEMISWMQACQAAIDQIEKRNETFKAAVQGPEGDTQEQELQSEELGLRAPQWVRDKMVTMCMRCQEPFNALMRRRHHCRACGYVVCARCSDYRAKLKYDDNRPNRVCCDCYTFLTGNVLAEDKEDKRRGILEALPRLLPCCCWGTGCVQLCSTNTMPTSPDIGYQHPTGRVDIPLSLGERVGSGVRAEPDVQLPAASWGQVGQERPPGLVCDPLG	427617	410395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5628_pilon_-_411104_411655_411803_412210_412350_412939_413087_416910_417043_417699_417793_418253_418285_418367_418448_425662_426621_426878_426938_427489
924847	contig_15970_pilon	-	3524	4	Intergenic	novelGene_144041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2982	3359	115357	114980	TRUE	35	CTGAATGCCAGTGAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEVSKEDGRNEYRVTEPKRIDIQPFQEVAYDQEAMILKEEVQTSLKALVKNKAPGIDGIPIEIFQQMDAMLEALNHLYQEIWKTATWPTTWKRSISVPIPKRVDPTECRNYPTISLISNVSKFC	158311	100377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_100386_114822_115376_153577_154414_156184
924848	contig_1274_pilon	+	3608	1	Intergenic	novelGene_137780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3172	3531	72205	72564	NA	55	AAAGATAAAACATACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRVELLHRIFFGYNLYGSRLSGFSSAKPLDGFEPPTFRLVVEHKPFELIICIDTEKVFDKIRHPFLIQNSQQTRSTRKLSQADKRYLQKPTANIILNGGKLSAFPLRSETTQGCSFS	69033	72641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_69000_72600
924849	contig_6291_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_164807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGCCCTTCACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417356	419188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_417400_419200
924850	contig_240_pilon	+	2364	1	Intergenic	novelGene_173804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1086	1499	710046	710459	NA	5	ACTTGTTGTTTTGTCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGESTLRCCSTAWLEGVEVYNAKYSGNRKRRKTERAKKLSNEERQKGKKRKKKTNKLKKKRTRKAPKKTEKKKKPTIKEMLSGIPLHVCASRSGVSLPRSSAWPERAPNSRNRKENKQTIQNKQTNKSPGILPAR	708960	711324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_709000_711300
924851	contig_6496_pilon	+	381	1	Intergenic	novelGene_103516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTTAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852528	852909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6496_pilon_+_852500_852900
924852	contig_854_pilon	+	1447	7	Intergenic	novelGene_36251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2810.57461503278	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	134	679	543631	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543497	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545918_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
924853	contig_7644_pilon	-	1875	1	Intergenic	novelGene_64260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTGCACATCATGACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196971	195096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_-_195100_197000
924854	contig_854_pilon	+	1723	7	Intergenic	novelGene_36509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3714.27605104054	10	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	173	697	1649514	1672809	TRUE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQAWELSGISWQG	1612773	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1672774_1672898_1677515_1677609_1678131_1678204_1715233
924855	contig_11933_pilon	+	2394	1	Intergenic	novelGene_107261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAAATTCACCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129460	131854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_129500_131900
924856	contig_6102_pilon	+	3110	22	Intergenic	novelGene_31875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	585.792631229449	1	118	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	841	1716	373928	393075	TRUE	25	TACTCAAACCAGCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370783	395253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373472_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393428_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
924857	contig_9049_pilon	+	2927	7	Intergenic	novelGene_83119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1585.15130718385	1882	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	112	507	88356	108628	TRUE	45	TATTTTGAAAGCATAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APREDARARRGPGDCSRLPAALLPRRCGGGGGGSPAAMALPQTWLQSRYRKNACLFVYYLIQFCGHSWIFTNMTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVSFQVHL	88244	114768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108609_108724_111558_111685_112569
924858	contig_3081_pilon	+	1419	3	Intergenic	novelGene_133933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_2	72	28	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAACTTACTGAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206571	214403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_207704_208765_208932_214282
924859	contig_14353_pilon	-	2287	2	Intergenic	novelGene_82116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGCTGTTGTAACAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98605	95885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_97049_97481
924861	contig_13456_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_153322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACAAAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644394	643501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_643500_644400
924862	contig_5916_pilon	-	3102	2	Intergenic	novelGene_158022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247449	242330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_245318_247334
924863	contig_3004_pilon	-	5255	6	Intergenic	novelGene_127542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	121	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTATGAAAGCAAAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815627	596126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_597333_680968_681194_706961_707247_707370_707891_708143_708275_812739
924864	contig_3382_pilon	-	2632	1	Intergenic	novelGene_124005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCCTCCACAAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112105	109473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_109500_112100
924865	contig_5910_pilon	+	953	1	Intergenic	novelGene_168429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTGTGCACACATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180209	181162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_180200_181200
924866	contig_5302_pilon	-	2382	10	Intergenic	novelGene_81453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	685.861178049578	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	352	936	185066	177300	FALSE	25	AATTTAATGTTACTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209566	175853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142_209175_209418
924867	contig_17440_pilon	-	219	1	Intergenic	novelGene_7578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTTTCGGGACTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1874	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_1700_1900
924868	contig_7744_pilon	+	472	1	Intergenic	novelGene_62589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTGGGTCAAAAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1030574	1031046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_1030600_1031000
924869	contig_15025_pilon	+	1173	1	Intergenic	novelGene_155977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50194	51367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_50200_51400
924870	contig_7333_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_142791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGTAAGATGCAGTCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220739	222031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_220700_222000
924871	contig_3269_pilon	+	2747	2	Intergenic	novelGene_117048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	62	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAGAAACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241891	244917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_+_242536_242814
924872	contig_14450_pilon	+	3931	1	Intergenic	novelGene_48943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTATTTAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527358	531289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_527400_531300
924873	contig_5643_pilon	+	1241	11	Intergenic	novelGene_38790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2321.13586202962	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	69	1031	233973	237983	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAVTRLGSHSWLSPFSQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233606	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237460_237679_237819_237913
924874	contig_6230_pilon	-	3093	1	Intergenic	novelGene_102113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTCACCTGAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170885	167792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_-_167800_170900
924875	scaffold_12124_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_22205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCTATGTGTATTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1361750	1363150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1361800_1363200
924876	contig_16310_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_70068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGTGTCCAGCCTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250851	248713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_248700_250900
924877	contig_6299_pilon	-	1067	1	Intergenic	novelGene_172935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGCTATTTTCCCATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945819	944752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6299_pilon_-_944800_945800
924878	contig_12969_pilon	-	3018	8	Intergenic	novelGene_61688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	59.312042346786	9	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	1362	2705	494387	493044	FALSE	30	AAGTGGAAAAGCCTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHCQGHNVFGNIVYQRKSHFPLRQNHDIFDLCGKTLKSNLYLVNQSRSFEVKKPHKANGGGKSFLHTKHEQFHPEIKFPECGKPLNTKSQFIKHQRTHKIDKPHVCSECGKAFIKKSRLIDHLRVHTGEKPHGCSVCRKAFARKSRLTEHQKSHIREKHYACTECDKTFPKKSQLIIHQTAHTGEKPYVCNECGKDFVKKSRLINHQRVHTGEKPHGCSICEKAFARKSRLIEHQRTHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKTHTGEKSYICSDCGKGFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLLIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKTCLISHQRFHTGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYICSDCGKAFRDKSCLNRHRRTHTGEKPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCIGSVKV	512878	492730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_494450_501410_501559_504289_504386_504665_504793_508997_509204_509784_509935_512175_512301_512431
924879	contig_15449_pilon	+	1124	1	Intergenic	novelGene_33648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	209	364	150944	151099	NA	30	GTGACAGGCAGGTTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHRCGLHKVCKTREAGSADVEATEKFKDGLDKIIQDEEYLPEQIFKVDETGLFWKRITEWTYIYKETKLMPGFKAFKDRITLLLRRNAAEFKLKPFLVYRSENPDKIIWWSTTELTPRPR	150735	151859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_150700_151900
924880	contig_12120_pilon	-	4149	6	Intergenic	novelGene_21397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	613.200260926233	29	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156991	14396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_17742_24245_24357_32302_32405_63560_63901_118559_118731_156911
924881	scaffold_19766_pilon	+	2597	14	Intergenic	novelGene_34419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	156.256275613618	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	1193	2437	847381	851417	FALSE	20	CACCTTCTAATCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	843773	851577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_843901_845085_845163_845497_845971_846043_846225_846509_846659_846988_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
924882	contig_4838_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_144795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCTGGTTTACAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282480	279392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4838_pilon_-_279400_282500
924883	contig_2716_pilon	-	3433	1	Intergenic	novelGene_173559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1946	2254	870111	869803	NA	30	AACTTATTTCCAATTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSQETNRLHLWKETMEKINLISQNKAGVDFRTDRQLLTCQFKLKLKKIRTSTQETKYGLEYISPELRDHLRNRLDMLNTNDRRLDELWNGIKDVIREERGH	872056	868623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_868600_872100
924884	contig_17769_pilon	-	1841	2	Intergenic	novelGene_124243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTTTTCTTGTGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23941	21074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17769_pilon_-_21913_22938
924885	contig_2379_pilon	+	4507	3	Intergenic	novelGene_159436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1408	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2620	2946	215003	215329	FALSE	50	TAGAACAAAATTCTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKKKLGGLALPDFITYYTAMLVKTDWYWYNNRYIDQGNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPQSPSNGEKTVLLTNGPGKAGCPCAKK	175554	216890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2379_pilon_+_177736_213256_213503_214810
924886	contig_17144_pilon	-	2122	14	Intergenic	novelGene_29537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2153.64637535023	20	26	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	157	1161	179764	168228	TRUE	20	GTTTTTTTCTTTCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERGP	183238	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166299_166473_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168236_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
924887	contig_9463_pilon	+	1800	3	Intergenic	novelGene_83812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	148	492	34090	39494	FALSE	35	GTTCAAACCACCAACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGASGQGSWLTRLKGLGFLKTWTEGSFLPRRTYSWRARQYTRAPQSGSTKVKQMLRIVGVKYCLVRVMHSSLDHTPLLVREPTDGFTLMQNSPTSPEAGRLKFSWFTFLFVN	33942	40802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_34161_37756_37876_39339
924888	contig_12050_pilon	-	1408	1	Intergenic	novelGene_62758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	428	769	762817	762476	NA	60	TTTTGTATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSWGRNGGAHSALGGPGWEREPEKAGGGGASIPLLQVEAGTPFLHKGLEVSQRKLLSSSFCSHPHHCEMGTATTPPAIGAEGPRAQPTLQQLHPGCVCPAPPTVRWACQKWR	763244	761836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_761800_763200
924889	contig_7587_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_163717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTACAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197643	197094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_197100_197600
924890	contig_11338_pilon	-	2341	9	Intergenic	novelGene_6385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	288	junction_5	193.495760612474	13	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	299	1321	319426	306724	FALSE	20	ATCATATTCTTTCATTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSAR	323314	305703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
924891	contig_2703_pilon	-	4507	14	Intergenic	novelGene_101827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	71.4901408355473	51	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2355	113	2467	1226936	1186472	FALSE	75	TGTTAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTEELELLSDSKYRNYVAAIDKALKNFEYSSEWADLISALGKLNKVLQNNAKYQVVPKKLTVGKRLAQCLHPALPGGVHRKALETYEIIFKIIGPKRLAKDLFLYSSGLFPLLANAAMSVKPTLLSLYEMYYLPLGKTLKPGLQGLLTGILPGLEEGSEYYERTNTLLEKVAAAVDQSAFYSALWGSLLTSPTVRLPGITYVLSHLNRKLSMEDQLYIIGSDIELMVEAVSTSVQDSSVLVQRSTLDLILFCFPFHMSQATRPDMIRILSAALHVVLRRDMSLNRRLYAWLLGFDNNGAVIGPRSTRHSNPEEHATYYFTTFSKELLVQAMVGILQVNGFGEESTLMQDLKPFRILISLLDKPELGPVILEDVLIEVFRTLYSQCKAELDLQMEPPFSKDHAQLSSKLRENKKTAELIKTANLLFNSFEPYYMWDYVARWFEECCRRTLHVRLHIGPGDSSESSELQLINFCLLVDFLLDIVSLETYIEIQTEHLPQLLLRMISALTSHLQTLHLSELTDSLRLCSKILSKVQPPLLSAGAGGVLQFPKVQNNSVKEWEDKKVSSVSLENPTEVFEDGENPPSSRSSESGFTEFIQYQADRTDDIDRELSEGQGTAAIPVGSTSSETETASTVGSEETIVQASSIVTQGTATRSGKTAQKTAMQCCLEYVQQFLTRLINLYIIQSNSLSQVLATEQQKDLSREQGETSKWDRDSHGDVKERNISKQKSSKEYLSAFLAACQLFLECSSFPVYIAEGNHTSELHSEKSETGKVFSVLFIFKYFL	1253606	1184431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1187138_1191719_1191954_1192665_1192781_1194555_1194676_1197598_1197720_1198831_1198941_1200339_1200450_1201726_1201827_1206167_1206267_1209556_1209747_1211667_1211839_1223657_1223840_1226798_1226990_1253547
924893	contig_6227_pilon	+	2643	1	Intergenic	novelGene_49707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1691	2065	1158753	1159127	NA	50	CACTTAAAGTACAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKHTKRCSKSLAIREMQIKTTRSYHFTTTRMAKLKKIITNVGEDVGKLEPLSTAGGTAKWHRCCKKVWRVWGPCFQGTCRSTGITKFIKKSVLHPTLVSDVWVLKASEQPSKMHQLVPTHLE	1157062	1159705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1157100_1159700
924894	contig_3975_pilon	-	2062	13	Intergenic	novelGene_54911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	39.2989786409548	27	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	35	1294	2191524	2146291	FALSE	70	AAAAAAAAGTTCAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEAAMFDSLLMDSYVSSTTGEGVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPIDEVINTPGVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLNSDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNLCRGKNPPPDFPKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEATWAITNATSGGTPEQIRSKGE	2191558	2145522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2146307_2148067_2148196_2148550_2148677_2149214_2149294_2149467_2149632_2149953_2150054_2150984_2151074_2151546_2151679_2152362_2152458_2153866_2153967_2154378_2154472_2155319_2155454_2191520
924895	contig_7840_pilon	+	2801	11	Intergenic	novelGene_68983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	443.673258152889	2	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	456	1371	197	1567	238014	304882	FALSE	10	CGAAGGGCTGTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLRQSFRRKKDVYVPEASRPHQWQTDEEGVRTGKCSFPVKYLGHVEVDESRGMHICEDAVKRLKATGKKAVKAVLWVSADGLRVVDEKTKDLIVDQTIEKVSFCAPDRNFDRAFSYICRDGTTRRWICHCFMAVKDTGERLSHAVGCAFAACLERKQKREKECGVTATFDASRTTFTREGSFRVTTATEQAEREEIMKQMQDAKKDKAIGGSSVAPGNTATSPSSPTSPTSDATASVEMNNPHAIPRRHAPIEQLARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINELPSTMQRKTDFPIKNAVPEVEGEAESISSLCSQITNAFSTPSEDPFSSAPMTKPVTVVAPQSPVFQGTEWGQSSGAASPGLFQAGHRRTPSEADRWLEEVSKSVRVQPPQASAAPPQPVLQPTPPTAISQPAPPFQGNAFLTSQPVPVSGWEWRSKAQRGLCFPDKYTFQ	212405	306116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_212461_230804_230931_237998_238140_263075_263151_292102_292178_295141_295283_298003_298209_299249_299535_301110_301261_304059_304308_304816
924896	contig_6954_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_64452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCTCTTTCACTGAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695581	696839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_+_695600_696800
924897	contig_10370_pilon	-	1615	1	Intergenic	novelGene_178751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	262	675	21165	20752	NA	40	AAATCTTTGAAATGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLETDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTTAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNDNESVNHLITWMKLEDIMLSETSQSQKDKYCMRPLL	21426	19811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10370_pilon_-_19800_21400
924898	contig_7775_pilon	+	2184	1	Intergenic	novelGene_37465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1386	1703	90324	90641	NA	15	TGGCTTCAGTTCCAGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVKCLCIVNKTQINIFLVFSAFSQELSDSSNDIPRCTFSSEHGLNFWQFPVNVLLQLFWNYLQQNSKLFVILMILFDNVHIPLDHLSLEWEQIRIFSSWLAR	88938	91122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_88900_91100
924899	contig_821_pilon	+	2481	1	Intergenic	novelGene_149390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGTCTACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135831	138312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_135800_138300
924900	contig_6296_pilon	-	2716	3	Intergenic	novelGene_168794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1961	2266	272078	271108	TRUE	35	GCAACACCTGCAGCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGTPERSPTAPQEGAKTALGARYLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPASNKRPPESRLPGRAESKQPAALGQEPAAPGSRGANEQRPRDLISAAAQT	274038	270335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_-_270685_271006_271395_272059
924901	contig_5047_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_158000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	394	705	1239140	1239451	NA	65	CATATAAAAAGAAAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPESLESMRILNSLPHFPPFDQDSSIQSLIKTLSNGHWAPSSSSCHGKGGSCSWRQLFMEAIRHTFHFLLFLTHCLPLLLQANRGQLFYFEWPLASYHFFLK	1238746	1239614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1238700_1239600
924902	contig_8020_pilon	+	6203	10	Intergenic	novelGene_114417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	465.202809880796	1037	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	1654	3441	262718	300606	FALSE	15	TCCTTTTTGAAATCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIGTADDRYLRPHAFYQVHRITGKTVATASQEIIIASTKVLEIPLLPENNMSASIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPQPNGKVLSLQTASIPVECSQRSAQELPHIEKYSINSCSVNGGHEMIVTGSNFLPESKIIFLEKGQDGRPQWEVEGKIIREKCQGAHIVLEVPAYHNPTVTAAVQVHFYLCNGKRKKSQSQRFTYTPVLMKQEHREEIDLSSVPSLPVPHPAQTQRSSSDPGHPHDSVLSAQRSLVCPVQQAYVSLVTSSHLPQLQCRDESTGKEQHVMPSPVVHQAFQVTPTPPVGSSYQPMQTNVYNGPTCLPVNAASSQEFDSILFQQDAAVPSLINLGCQPLSSIPFHSSNSGSTGHLLAHTPHSVQTPPHLQSMGYHCSNVGQRSLSSPVADQVKGQPSPQLQPIAYGPSRSGSATTAPPAASHPLASSPLSGPPSPQLQPMPYQSPSSGTASSPSPATRMHSGQHATQAQSTGQGGLSAPSTLICHSLCDTTSFSPDGATISIKPEPEEQEPNFATIGLQDITLDDVNEIIGRDMSQISVSQGTGVSREAPLPNPESLDSGRPDGL	208644	303368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_+_208987_246161_247297_249814_249955_262681_262882_266684_266858_269338_269480_275447_275504_276490_276618_280347_281353_300484
924903	contig_17753_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_105092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2302	2610	93970	93662	NA	35	ACCAGCAACCCAGCACTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKYLLYDGKFCIINNVHEDFKITCGNVCYTTKLGKKMRKQFQNLNDSSSMLLTLQELKFGERKYSPVLMLRVILCGRGNAGGFSFFFLYLVSFLSFPDFLQ	96271	93596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_93600_96300
924904	contig_12630_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_173066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACCAAAAAAAAACGGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56227	53020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_53000_56200
924905	scaffold_6394_pilon	-	2111	1	Intergenic	novelGene_110973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACACTGGAAGAGACAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325322	323211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_-_323200_325300
924906	contig_10640_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_175155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17559	15242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10640_pilon_-_15200_17600
924907	contig_3081_pilon	+	1457	5	Intergenic	novelGene_133901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	263	junction_4	313.040332864633	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	25	525	14555	43030	FALSE	15	ATTTGAAGGTCTTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGGGGSVMASGRGASSRWFFTREQLENTPSRRCGVEADKELSYRQQAANLIQDMGQRLNVSQLTINTAIVYMHRFYMHHSFTKFNRNIISPTALFLAAKVEEQARKLEHVIKVAHACLHPLEPLLDTKCDAYLQQTQELVILETIMLQTLGFEITIEHPHTDVVKCTQLVRGK	14530	43962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_14713_15539_15622_37254_37384_38990_39052_42959
924908	contig_5988_pilon	+	3112	1	Intergenic	novelGene_16169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACCAAAATTGCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2074185	2077297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_2074200_2077300
924909	contig_14536_pilon	+	2449	2	Intergenic	novelGene_69299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106473	118188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_107614_116879
924910	contig_6365_pilon	+	787	2	Intergenic	novelGene_134003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAATAATTACACATACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40571	43947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_41078_43666
924911	contig_3004_pilon	-	4107	3	Intergenic	novelGene_127543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGGTTGCTATAAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	815627	715314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_715478_807327_807431_811786
924912	contig_5643_pilon	+	1914	14	Intergenic	novelGene_39070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	703.757228514486	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	609	1769	634983	641450	FALSE	10	TCATTGTGTGTGTAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSPGSRHLPHSLPHLSAASALTPAEASSG	631240	641595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_641363
924913	contig_6364_pilon	+	3385	1	Intergenic	novelGene_51761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCACTTGTGGTATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649597	652982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_649600_653000
924915	contig_10307_pilon	+	2838	3	Intergenic	novelGene_170269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	324	junction_1	6	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	438	1317	424	1740	389628	392058	FALSE	25	GTTATGTAACTTATCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387439	393156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387851_389615_390382_391495
924916	contig_10324_pilon	+	1970	8	Intergenic	novelGene_7881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	239	junction_3	145.454390074128	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	6	1010	562068	568878	FALSE	15	ATTTTGCACTGTTTTATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTEDIQWPNGITLDLSSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGRNRKTILEDENKLAHPFSLAIFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLVAGNLLSPEDIVLFHNLTQPRGVNWCEKTSLHNGGCQYLCLPAPRINPHSPKFTCACPDGMLLAKDMRSCLTEAEPAATTEGSSTARSTVRQTVSSVATEPKHTASPPAPSTSRQPTASPEFTTAEMATMSHQALGNIAGRGTEEKPGRVGALSIVLPIVLLVLLCFGAFLLWKNWRLKSINSINFDNPVYQKTTEDEVHICRSQDGYTYPARQMVSLEDDVA	562062	569838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_562183_563152_563293_563818_563961_564083_564237_565188_565372_567235_567314_567956_568115_568842
924917	contig_8978_pilon	-	1460	6	Intergenic	novelGene_49444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	30.6359266221866	8	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	151	732	1522314	1500769	TRUE	60	TGAAAAAAAAAAAATTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EISPEGEKHKPVIEGEEKVQCVSLEINPTATVDSPPVEIKSPQFREASPQMSLTPEGNLDEPDDLETEVLQELTGIDKDGSLPCAVTDVWGEEEETEETESEDRIIVQQNEVSGDEILRNVDQLSEVHIEPEVGGSSRSKCDVDQSLQPEPFFHKVVQSEDFRIASQVQSVQCSPEESFPLRSRSDSPPKTKSKNSLLIGLSTGLFDANNPKDVEDMFTSRSLKAVQNTDGCPHCRRCAARQS	1522464	1495454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1496126_1500711_1500864_1513371_1513621_1514451_1514541_1519893_1520012_1522283
924918	contig_5031_pilon	-	950	5	Intergenic	novelGene_133206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	563.026364835609	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	423	528	950	87220	77738	FALSE	35	AACATAACTGGACTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEFRRTLTLSFFFKFYLTVLQKLGEEDSEDNCGKLDPTFASATLLFQKDPPANIQLFQEVPKDQSEEDMVGRPLPHLAAAMQASGEAVYCDDIPRYKNELSLRLVTSTQAHAKIKSIDTSEAQKVPGFVRFFSADDVPGS	88566	77737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_77814_80342_80513_84576_84661_87127_87308_88126
924919	contig_1494_pilon	-	2634	4	Intergenic	novelGene_179087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAAAAAAATTTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431288	335153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1494_pilon_-_335808_337623_337962_417133_417610_430122
924920	contig_14925_pilon	-	906	4	Intergenic	novelGene_55079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	1722.10536521111	103	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29611
924921	contig_7173_pilon	-	2873	1	Intergenic	novelGene_37544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGCAAATGAAGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508024	505151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_505200_508000
924922	contig_9435_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_156964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACGTACCATTACAAACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393712	394976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_+_393700_395000
924924	contig_9836_pilon	+	2271	2	Intergenic	novelGene_176163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAATAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54341	85645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_54521_83553
924925	contig_7230_pilon	-	2096	7	Intergenic	novelGene_52554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	548.911473332044	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	213	527	164221	134622	FALSE	40	ACGCAGTCTAAAGCCATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177474	133052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164264_171092_171145_176929_177012_177438
924926	contig_3956_pilon	+	2115	11	Intergenic	novelGene_14991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1251.46144966595	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	81	953	1281682	1289095	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGKLQTVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVGPPGAQAEGPLPGREVRVGRG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283985_1284072_1284177_1286171_1286224_1286409_1286606_1287276_1287320_1289026_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
924927	contig_13872_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_179088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTTAATCCTTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126804	125531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13872_pilon_-_125500_126800
924928	contig_11751_pilon	+	2232	1	Intergenic	novelGene_150299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGCTACGGCAGCTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154363	156595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_154400_156600
924929	contig_10575_pilon	+	2903	2	Intergenic	novelGene_141821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	141	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1994	2455	445682	446143	TRUE	0	TTTCCCCGTTTCCTGCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASKWQRKDLTFDLEVCLAPKPLCQLSRHKHMPHADLCFHPLMGFPATGKGPAAGQREGVTTPPHRGADQVKGSPAPVPPTRQGLPGSRAPRGLRANRCLWTPRSVGSPGLRVPQACGLPRSEGSPGLWIPGSVGSPGLRAPQVYRIPGLQTP	443688	446647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_+_446404_446459
924930	contig_4742_pilon	+	3371	1	Intergenic	novelGene_130996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGAGTACTCCAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210225	213596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_+_210200_213600
924931	contig_15664_pilon	+	2143	1	Intergenic	novelGene_171503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACCATTTTAAAACCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34223	36366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15664_pilon_+_34200_36400
924932	contig_10751_pilon	-	2510	1	Intergenic	novelGene_174824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACCCGACTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256615	254105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10751_pilon_-_254100_256600
924933	contig_11908_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_133243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGCCCGGATGGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800815	798436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_798400_800800
924934	contig_13048_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_138936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGGCAAGCCCACAGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495406	497596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_+_495400_497600
924935	contig_15491_pilon	-	3313	1	Intergenic	novelGene_75966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCACCATTCCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45575	42262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_42300_45600
924936	contig_9002_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_116728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTTAAAAAAAAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511243	509127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9002_pilon_-_509100_511200
924937	contig_4091_pilon	+	1794	2	Intergenic	novelGene_173021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAGAACAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10965	13051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12527_12818
924938	contig_10404_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_138692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACTCAGCCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1118695	1120870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1118700_1120900
924939	contig_4891_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_124533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1654	2157	384498	383995	NA	45	AAAAAAAAAGCCCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKNMCCQLDLIDIYRTLHPTAANYTFFSNAHRTFSRMDHILGHKASLNKIQSIEILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGKKKFIESNQNENSSYQNLWGTAKAVLRGQFIAINAYIQKEERAIIKTLTLQLEQAEREQQEKP	386151	383588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_383600_386200
924940	contig_19546_pilon	+	463	1	Intergenic	novelGene_179090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTCTCCTTTGTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1309	1772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19546_pilon_+_1300_1800
924941	contig_348_pilon	+	1794	8	Intergenic	novelGene_67614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	9.49328441476351	36	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	555	1361	320222	345268	FALSE	10	TATCTCTTCATTTTTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDIPYPEAIFELSFFFRNPKPFFTLAKELYPGNFRPNMTHYFLRLLHEKGLLLRLYTQNIDGLERVAGIPASKLVEAHGTFASATCTVCLRPCPGEDFWADVLADRVPCCSVCTGIVKPDIVFFGEPLPERFLLHVADFPMADLLVVLGTSLEVEPFASLSEGVCSSVPRVLINQDVVGTFAWHPRGRDVVQLGDVVHSVEKLVKLLGWTEEMRDLVQRETDKLHAGTGRRGSPHSQEGH	318874	345701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_348_pilon_+_319225_319670_319738_320084_320269_320421_320655_321708_321810_342143_342306_342779_342990_345214
924942	contig_7775_pilon	+	5021	1	Intergenic	novelGene_37463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	145	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAAGAAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70512	75533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_70500_75500
924943	contig_14288_pilon	+	2610	1	Intergenic	novelGene_153824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	218	523	324150	324455	NA	80	AAAAACAAATAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQVANRHMRKCSRSLAIREMQIKITVRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPQSHS	323932	326542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_323900_326500
924944	contig_1337_pilon	+	2089	1	Intergenic	novelGene_84220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAAATAAAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60317	62406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_+_60300_62400
924945	contig_9809_pilon	+	2684	11	Intergenic	novelGene_176745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_9	181.255510261068	4	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2160	129	2288	108357	117674	FALSE	30	TCAGCTTTTGAAAGAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQKSLELREKQAEKEERQKTKKIETSAEKLRKLLKEEKRLKKKKRKSTSSSSSISSADESVSSSSSSSSSHKRRKKRKRNRSESSRSSKRHSSKASSSQIDQNRQDEYYPLPVNTSASFLNQKQEVEKLLEKQDRLPYQKTQVKDKDRYPLSSSSVEIPDDSGGRSEDPRDFYNSCKTQASSSKTEKPYKSERHFSNRRDSADSFCRSSEDKIKNYGYRRVDRDVEGRKEQSRRWEPGSGRYSASPASSEYSWKSLEKYKKCTYSGSRDFSKHEQRYQLNTNQGEYEREDSCGEDAKTEVPEEDGLSSKEQSESRVKKNLPQNLLNIFNQIAEFEKEKGNKPKNL	108228	118070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_114925_115880_115991_116752
924946	contig_2894_pilon	-	1045	1	Intergenic	novelGene_86536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAGTAGATAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178631	177586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_177600_178600
924947	contig_10953_pilon	+	1122	2	Intergenic	novelGene_42605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGCTGTGAGTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463825	464988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_464221_464261
924948	contig_2770_pilon	-	1441	1	Intergenic	novelGene_107412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAACAACGCCACAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180161	178720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_178700_180200
924949	contig_4812_pilon	-	906	6	Intergenic	novelGene_103656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7352.51487315735	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATTGTCTTCAGATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82705	78910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81723_82268_82343_82598
924950	contig_19342_pilon	-	1026	7	Intergenic	novelGene_41074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGAGTTCCCTCGGATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6774	3237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_3320_3615_3843_5183_5292_5412_5520_5958_5988_6133_6184_6351
924951	contig_11285_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_5748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTGAAAAAAAAAAGCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1216237	1217726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_1216200_1217700
924952	contig_9363_pilon	-	2645	18	Intergenic	novelGene_6593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	769.989592344169	24	123	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	814	2013	759562	754431	FALSE	40	AGAAGTGCAAGAGTATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	766195	753798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759677_759807_759916_761691_761857_761961_762076_765791_766002_766093
924953	contig_15500_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_128999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGCCTGACAGAGACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258682	256628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_256600_258700
924954	contig_6488_pilon	+	3542	1	Intergenic	novelGene_44746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2119	2448	163597	163926	NA	20	TTTTTTTTTTTTTTAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIDKKHKKCPTSLVLREMEIKSTMRYHFTPTSMVNSKMLRMWRNWRHLDISLTSSLSHTHTVVNDDSFLGSPIQFLYKRRTQSGICTLLLVKPRKLRDQKTNLMFSIS	161478	165020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_161500_165000
924955	contig_5765_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_141388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGGAGTATTTTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648603	649915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_648600_649900
924956	contig_7843_pilon	-	5793	28	Intergenic	novelGene_152033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_27	46.0788672033448	40	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1810	5430	364	5793	350093	301136	FALSE	25	GAATTTGTGCCCCCAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHPFGKEEAASQKQLFGFFCECLRRGEWELARACVPQLHEGQGDIPKRVEDILQALVVCPYLLRCGQDISPQRLAWVWLLVLEKWFAQEKKLLPAVFRRKLEFLLLSEDLQGDIPEDILKELYEVFAQDSVDPVPDGNRKWEGWPTRLSSEAVSVLWDLLRQAPQPAQAMLELLLREDDGTGLCGWPLQKALVDLIQKALKALQGPDAGPPGVADAIYGALRTLCCPAEPLGVELRLLCEELLEACGTEGNPLQEERLLGCLLHKAGRGLLSLYSHTYAEKATEKPLRATSSGKVSLDHLDPERSMLALFSNPDPAQAWKVAYFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPTLGCLLDREFRPLSRLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLHSTQDQGCSKLLRDACDGLWAHLEVLEWCVQQSSNPIPKRDLLCHLHGGDSHSVLYSLHHLTNLPALREEDVLKLLQKVPAKDPQQEHGSADAPFPDHLGQCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVSSHQHSQCQDCREGPSKDLASAAEPVNDLLSSPGASNLFSTYLARCQQYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDVEGNGPLGLRSPSESSQHTSQPERKSEQGFLGVPRSLAYTLPGCLKAEPKDSYPGPHGHSFLDLKHFTIGISGFLADEFATGAFLRLLQEQLDEISSHNPPEKPKLLEGQSCSGSRDGLQSRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQGSEGHLTPSRRYQPIATQHPSLRQGRRTRRSRADKLKSSLLSSCFHAPDGQDRGSNPSLESTSSELSTSTSEGSLSTVSGWKELDGRLQPQPQSSLIPMMFSPPESLLASCILRGNFAEAHQVVFTFNLKSSPSSGELIFMERYQEVIQELARVEHEIENQNSDGGTGTIWRTGSSRSTLQAIGSAAAAGMVFYSISDVTDKLLSTSGDSIPTLQEDFWISSTLVEPTDPLKEVLEDLSPPAMAAFDLACTRCQLWKTCKQLLETAERRLNNSLESRGRRPDHVLLNADGIRGFPGVLQQISKLLNYSLMSAGQTKSENVEEKGGGPPRYSIAELLQMCWPSLTEDCVASQVILSQQLEQVLQSLREALELPEPKSTPLSSLVEQAAQKVPEAEAHPVHIQTQLLQKSLDKQTPAGGRQADYVGTFFSYCSTLAAVLLRSLSTELDHVAVKVGNPFVLLQQSSSQLVSHLLLERQVPPDRLAALLAQEGLGLSVPQVIVNCCCEPLSLCSSRQNQQTSSLLTHLGILAQLHTSHCLDGLPHSTPTSPRPSENPILEEKPHLSPRNSSPAALTSSALAFLKSRSKLLATVACLGAFQGAKATKPILSWKELRGRREVPLTAEQVARECEHLLEQFPALEASLLAAWKPLQGSSKQGQSLAASLCGRACLSTVLLGLHSPIALDVLTEAFEEALVARDWLRALELTDEYGRDMDELSSIKDAVLSRAAACDKEGWQYLFAVKDASLRSQLTLQFVDRWPLEWCLEILAYCISDPTVQEGLKCELQRKLAELRVYQKILALQATPVWYDWQTLRSCCVEDPSAVMNMILEAKEYSLCEEWGCLYPIPREHLISLHQKHLLHLLERGDSEKALQLLQRIRDPNMCLEVTEQSIDQHPSLATSHFLANYLTTHFCGELTAARHHEIQALYMGSKVLLTLPEQHQASYAHLCPSPLLMLEQLLMNMKVDWATTAVHTLHPLLAGQEIGFTMDDVDSLLSRYAGKALDFPYTLREKRSDSVIHLQETVSQVSDPETLTRSLSTEFSSAAPPGIAIVHSPSRREKSQLPL	350718	301135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_301189_303250_303350_304526_304774_306236_306414_306786_306910_309755_309861_310912_311110_312777_313524_314314_314418_317630_317850_318650_318816_318905_319026_324119_324384_325348_325551_328113_328266_328692_328762_331571_331710_331988_332601_334019_334224_337094_337259_338366_338456_338603_338769_339391_339523_340539_341063_342653_342744_348405_348485_349899_350177_350438
924957	contig_2204_pilon	+	1864	1	Intergenic	novelGene_71682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGTGTAAGGGAACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38876	40740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_38900_40700
924958	contig_8377_pilon	+	2191	20	Intergenic	novelGene_34980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3409.7060774539	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	945	1247	2191	161364	180482	FALSE	45	ATCATTCAGAAATTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDY	68106	180482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_128717_128934_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143623_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
924959	contig_5640_pilon	-	1180	10	Intergenic	novelGene_27233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	285.904326568552	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	275	1180	63466	13928	FALSE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEVPSGTCRPDVPESPDSRQKSPLFQFAEISSSTSHSDVPSKQCQASALLQFAEISSNTSQLGGAEPGKRYGKSALFQLAE	138281	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63304_63476_106749_106840_115411_115512_138206
924960	contig_13577_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_176119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTTGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59933	61443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13577_pilon_+_59900_61400
924961	contig_10003_pilon	+	2697	2	Intergenic	novelGene_88297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	63	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAACCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915111	917862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_+_915866_915919
924962	contig_11602_pilon	-	781	2	Intergenic	novelGene_166600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	437	748	231045	230637	FALSE	20	GTGCAAATCCTGGGGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHKKCTLKLARSDLGRDDDPKASLSCAAGQVVLCTCIPSCVQRTEMSGASCCGGLDPLFWRLDSAAQQGQEPEVRAGGLLLWGTGAAFRRCKQPKPGLDPGK	231481	230603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11602_pilon_-_230840_230936
924963	contig_20825_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_178820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTATGACATAGATGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12875	14890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20825_pilon_+_12900_14900
924964	contig_5020_pilon	+	796	4	Intergenic	novelGene_27920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1252.10551561049	9	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	173	481	124540	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTVADDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	124285	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_124363_124444_124547_124903_125091_125657
924965	contig_6589_pilon	-	2349	13	Intergenic	novelGene_25976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	74.2415352451413	13	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	214	1686	1313859	1300766	FALSE	15	ACCCAGCTCCCATCGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHIVAHFHEWLAGVGLCLCRARRLPVATIFTTHATLLGRYLCAGAVDFYNNLENFNVDKEAGERQIYHRYCMERAATHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLKRKPDIVTPNGLNVKKFSAMHEFQNLHAQSKARIQEFVRGHFYGHLDFNLDKTLYFFIAGRYEFSNKGADVFLEALARLNYLLRVNGSEQTVVAFFIMPARTNNFNVETLKGQAVRKQLWDTANTVKEKFGRKLYESLLVGSLPDMNKMLDKEDFTMMKRAIFATQRQSFPPVCTHNMLDDSSDPILTTIRRIGLFNSSADRVKVIFHPEFLSSTSPLLPVDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVSTNLSGFGCFMEEHIADPSAYGIYILDRRFRSLDDSCSQLTSFLYSFCQQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWKYLGRYYMSARHMALAKAFPDHFTYEPHEADATQGYRYPRPASVPPSPSLSRHSSPHQSEDEEEPRDSLPDEDGERYDEEEEAAKDRRNIRTPRMAAPRLLRLLHQWEQAQLSGHSTLQHSQHPQRAPQPRQLSG	1314623	1300102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_1301078_1301236_1301318_1301909_1302074_1302357_1302454_1304963_1305091_1307157_1307272_1309127_1309207_1309297_1309358_1311189_1311297_1311920_1312042_1312338_1312457_1313765_1313911_1314461
924966	contig_4783_pilon	+	2837	1	Intergenic	novelGene_108332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTGAAAAAAACATTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11788	14625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_11800_14600
924967	contig_16496_pilon	-	1422	2	Intergenic	novelGene_5126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	6	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3482	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
924968	contig_5153_pilon	-	4156	1	Intergenic	novelGene_74346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGGCTCTTGGGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	763708	759552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_-_759600_763700
924970	contig_4486_pilon	+	2684	5	Intergenic	novelGene_38552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGACAGCGACGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141968	177638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_143995_156261_156396_159432_159548_162084_162162_177306
924971	contig_4931_pilon	-	3381	2	Intergenic	novelGene_138359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2143	2601	240251	239793	FALSE	35	GAAGATAGAGGCAGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFQLEKRKRNQTIQNKPSPRIPPVWQHGLGSSSALEGSSTAPQEDDDARSQVFEQKEGEVVRSKEEIKNSIKNQHQQPTNGTQGVGQCRRVESKQPVLPGEETVAVESRGRPSGDEEVWGVGKRLSLVTGYSVSCWKLREADFSYPLFTCL	242461	239012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_-_241107_241174
924972	contig_10370_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_178749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCGACAGACAGAATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17524	16289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10370_pilon_-_16300_17500
924973	contig_12746_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_152193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGACGTTAAAAAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588024	586472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_-_586500_588000
924974	contig_14060_pilon	-	2182	2	Intergenic	novelGene_156057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCTGATATATAATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81536	78364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14060_pilon_-_80304_81293
924975	contig_3960_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_138047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTTCTTGGTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	704840	706138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3960_pilon_+_704800_706100
924976	contig_4364_pilon	+	489	4	Intergenic	novelGene_427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	12130.8807686096	6	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	77	487	1530895	1531666	FALSE	5	TGTGCTGTCTCTGTATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQ	1530448	1531668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618
924977	contig_1443_pilon	+	2579	9	Intergenic	novelGene_28326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1158	1481	776387	804740	TRUE	25	CAAAATGGCCCCCGAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGSVLLVTLLAMVSDKVRHTAEKHHPGRVCICSEGPPGSRSSWLLLLQAGHPCCCSLWFVRGSVQEKQDGVLRETGGRWLFGKMPSPSKVLSSTTHILLQHSLKI	748374	809521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748993_749234_749349_750369_750530_766776_766826_767440_767556_776186_776462_804491_805720_809402
924978	contig_13123_pilon	-	2222	1	Intergenic	novelGene_136887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	84	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATTGTCTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430511	428289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_-_428300_430500
924979	contig_6316_pilon	-	4165	2	Intergenic	novelGene_134711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	96	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCCAACCACTGCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142045	136326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_-_137012_138565
924980	contig_13481_pilon	-	4704	3	Intergenic	novelGene_119272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	134	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3586	3972	93382	92996	TRUE	50	CAATAACACACATGAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGCREIGTLTHCWWECKMIQPLWKTIWCLFKKLEIEIPYGPTIPLLGIYPREIRAVTRIDIGKPMFIAALFTIAKRWKQCKCPSTDEWIKNNDESTKHLTTWMNLEGIMLSEISQSQKNKYCMRPLL	96967	85723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_85976_92339_92477_92652
924981	contig_10780_pilon	-	1849	1	Intergenic	novelGene_155432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAGTGTGTGTAGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112521	110672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10780_pilon_-_110700_112500
924982	contig_1301_pilon	-	2471	14	Intergenic	novelGene_47311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	669	junction_3	591.674236693524	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	83	1459	322831	278293	TRUE	55	GAGAACGAAAGAGGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEEAMEELLQNEVNRQGVDIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHAKSGGTALHVAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEIVNKVGQTAFDVADEDILGYLEELQKKQNLLHSEKRDKKSPLIESTANMDNNQSQKTFKNKETLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSR	322913	268662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_268819_269063_269265_270310_270402_277728_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296765_296918_297008_297691_297767_305264_305410_309751_309912_322794
924983	contig_10930_pilon	-	1391	3	Intergenic	novelGene_37059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	2443.5	14	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	25	414	280370	279421	FALSE	45	GTAAGAAATAAAGCTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRKTQGKKISWMQVGS	280394	278443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_279467_279700_279832_280157
924984	contig_5020_pilon	-	1370	7	Intergenic	novelGene_27904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	592	939	124926	123330	TRUE	25	GCCGCCAAGATCAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126084	119569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656
924985	contig_12019_pilon	-	752	3	Intergenic	novelGene_87654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	4	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8656	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
924986	contig_7707_pilon	-	1654	1	Intergenic	novelGene_72194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647714	646060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_646100_647700
924987	contig_5423_pilon	+	711	1	Intergenic	novelGene_85312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATTCCTGACAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	777249	777960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_777200_778000
924988	contig_4857_pilon	+	2755	3	Intergenic	novelGene_48696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_1	14.5	33	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGTTTCCATTAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139630	1145249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1140133_1141539_1141633_1143089
924989	contig_3095_pilon	+	1678	5	Intergenic	novelGene_75168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1835.71545997739	5	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	40	654	220513	226652	TRUE	15	CCTATTTGTGGTATTCGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLEKKETVWRLPMFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKQT	220473	227854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225711_226126_226404_226645_226824_227001
924990	contig_18735_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_132670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGTAAAATAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31678	33351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18735_pilon_+_31700_33400
924991	contig_1339_pilon	+	2934	1	Intergenic	novelGene_163102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGCATCATCATAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132043	134977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_132000_135000
924992	contig_13496_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_107663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1927	2298	487479	487108	NA	25	GGACTGACACAGTGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGCTLSTYLFNLYAEQIIREAGLYEEEQGIRIGGRLINNLRYADDTLLLAESKEDLKYLLMKIQDHSLQYGLHLNVKKTKILTNGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGCTINTRGSSSQEIK	489405	486735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_-_486700_489400
924993	contig_4782_pilon	+	722	1	Intergenic	novelGene_73655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATAACCACATGAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525984	526706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_526000_526700
924994	contig_15744_pilon	-	1077	5	Intergenic	novelGene_83570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	633	1028	153261	149544	FALSE	5	GTGGCTTCCTGCCCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAIQPVSPSSADEKLGTVCIGSSICHGQDARTCMLQEEVLIIKFFPIDGLATSAIMACEVTTLAHKPRNNSVKAGTFVTKSFLPSTQGAEVFCCLWNFICEQLEGDAAQRFAVDGDVEEHRRVDHGWAQQ	153893	149494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_-_149629_152143_152175_152261_152351_152530_152705_153244
924995	contig_1982_pilon	-	2081	8	Intergenic	novelGene_151314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	117.010029223035	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	690	2070	12	2081	153114	116993	FALSE	40	TAGCAGGAATGGCAATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQMCNQVPLNTSQSESSDLASRLKRKKLLKEYYSTESEPLTDSGQKPSSSDTFLRSSSDADIHVLVHIHKHVSMQINHYQYLLLLFLHESLILLSENVRKDVEAVTGSPASQTSVCIGILLKSAEVALLLHPVDQANTLKSPVSESVSPVVPDCLPTENGEFLSSKRKQVNNSINQIRSVTVNHMADSRSMSVDLSPVPLKDPLLFKSASDTNLQKGISFMDYLSDKNLEKINEDESCGIVYKSGSGEFGSEISDKKDSSTNSHSVLPYREDSSMLSFDNCGNQNVFSSNGKESETMELFVKAEDFVPETASLSENLDIGKEEISTVRTLKSQSSLSGKPKERCPSNMAPLSVSYKNMKRSPSQTSLDTISLDSMILEEQLLESDGSDSHIFLEKGIKKNSVTNYQSPAESVNASANVQSYGETSPDAISTNSEGAQENHDDLSIVVFKITGVNGEIDIRGDDIEICLQVDQVTPDQLGNISLRHYLGNRSVGSDQKAIIHSKTSPKITLRFESGPGAVIHSLLAEKNGYLQCHIEDFSTEFLTSTLTNIQHFLEDETVATDDSSRGSMIPLEPVPVTIHIDHLVVERNDDGSFHIRDCQMLNTGSDLKESTQSDSVLLTCGKCDLKKHHSVTQAPQTSPDVSCPSQDFTREQLMEENEFLKQELAKAKMALAEAHMEKDALLHHIKKMTVE	153125	116992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_117110_119054_119222_138854_138964_139355_139562_145410_145559_146250_146394_150729_150906_152110
924997	contig_2170_pilon	+	364	1	Intergenic	novelGene_178381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149769	150133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2170_pilon_+_149800_150100
924998	contig_6576_pilon	+	1209	3	Intergenic	novelGene_42418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	47	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	89	853	1301228	1303925	FALSE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAVFVSSMNACACIHVFIFTHAICSMYISVSTLIPIRLYPSICAQTFVFTLVMLCSLHPHSVLLFPSPKKKEKISLYDLKCTFPSPSSPMNTGLSKCIYSCRLTKEGSYICPYMLDLFHLALCPPGPSIL	1295688	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301604_1303536
924999	contig_18511_pilon	+	2026	10	Intergenic	novelGene_126886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	407	junction_1	284.047726819123	54	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	175	1950	47371	61308	FALSE	45	AGACAATTCACACTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTEQKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	47196	61384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61191
925000	contig_6876_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_147025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCATCTACGTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139552	138925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_138900_139600
925001	contig_13612_pilon	+	1987	2	Intergenic	novelGene_157267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	444	1542	1985	23698	24141	FALSE	25	TAATGATGTTGAGCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSITSYAWESWTMNKEDQRRIDTFELWCWSRTLNIPWTAKRRNKSVLEEVKPECSLEAKMMRLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEDQQKRGRPSTRWIDTVAATMGLSNNNDYGDGAGLDSVSLCCGKCCYESEQTQRHLTTT	19456	24143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_20883_23582
925002	contig_17144_pilon	-	1717	9	Intergenic	novelGene_29409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1611.77658191202	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	190	1638	172736	166152	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLADILKCTILSTHVLMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183228	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166894_167998_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_181813_181850_183158
925003	contig_15063_pilon	+	1960	7	Intergenic	novelGene_12274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	233	1705	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27931	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
925004	contig_5686_pilon	+	2869	3	Intergenic	novelGene_45473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1	336	226792	227210	TRUE	45	AAACTATGGTACATACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGILSEISEQEVQDSSFTELPAGDRTTGNPRYRLSHTPTLLHPHLASSTSCSHSLLAGKHKLPPSVTWIPPPALASSLSAICWLLLLLFSTSLDFFLTSHHLRLLSVKLPC	226791	271175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_227116_227198_228782_270213
925005	contig_4252_pilon	-	1884	1	Intergenic	novelGene_176361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGTCCTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350829	348945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_-_348900_350800
925006	contig_13026_pilon	-	1311	11	Intergenic	novelGene_146288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	147	junction_1	71.6619843431648	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	509	919	14211	6494	FALSE	5	CCAGGCCTGTGCTGCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDTYPYKGLDGVCKFQPKKAIAFVKDVVNITLNDEEGMVEAVALYNPVSFAFEVTDHFMSYSKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGVPYWIVKNSWGPYWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLV	23008	6101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13026_pilon_-_6570_7412_7539_9215_9323_12667_12737_14178_14261_16280_16337_17181_17269_19878_19985_20919_20991_22263_22370_22975
925007	contig_17560_pilon	-	3785	1	Intergenic	novelGene_167575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTACCAAGGCCTCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31380	27595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_27600_31400
925008	contig_11338_pilon	-	1867	6	Intergenic	novelGene_6384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	350.806271323647	4	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	300	542	319426	318651	TRUE	20	ATTCTTTCATTCTCCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQRASPASLTKFRIWAETSSQTQLITPSRTSHGRWMSCWRPPGTWRTCLTQSSTVWPLTCLMAWRMS	323315	305698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_306964_318590_318769_319185_319266_319381_319429_321311_321459_323165
925009	contig_6364_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_51763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	910	1389	671039	670560	NA	25	TCCTTTACTGGGAACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTICPVFVNVLILSAVFGAFSSYFSRLLMVDLFVSSLLFLIWVCLSRRAMYLLFAHLWA	671948	669748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_669700_671900
925010	contig_854_pilon	-	2538	11	Intergenic	novelGene_36658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	19	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1337	1921	1713144	1709595	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSFFSARRTCLQAAWRSLVSLSSCSSSCAILASRAAMEALYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1715975	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1705377_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710624_1712332_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856
925011	contig_10106_pilon	-	2697	14	Intergenic	novelGene_73875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1655	2056	168840	155527	TRUE	15	GAGGTCCCACCGACCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVQSELLRGILDLKFVEQQLQDLRGGHGAIDADVGDGAIGWSEHRRLMVVEMAVDGEAVASDSALVARCPHIATATHPNITPGAHQLRRVFLQGLQAPGLPVGLSVWSLSGGSSASEIWMLGMVRGFRMVP	173970	132478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_132645_132754_132829_151068_151160_153289_153364_154387_154475_155377_155532_159292_159387_165995_166153_167025_167128_168796_168850_169339_169463_170993_171096_172509_173126_173166
925012	contig_6958_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_69981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703641	705421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_703600_705400
925014	contig_21315_pilon	-	1210	1	Intergenic	novelGene_151573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGCTTAAATGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55998	54788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_-_54800_56000
925015	contig_7457_pilon	-	1908	8	Intergenic	novelGene_31399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	168.636065089825	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGCTCCAAGTCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471731_471954_472039_472730_472768_473151
925016	contig_9982_pilon	+	473	1	Intergenic	novelGene_55717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGATCTTTGCTTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243051	243524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_243100_243500
925017	contig_9799_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_145571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTATTAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072931	1074895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9799_pilon_+_1072900_1074900
925019	contig_500_pilon	+	2587	9	Intergenic	novelGene_31117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	10.0840220150494	27	6	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1263	1323	2585	1706339	1728986	FALSE	40	GGAGAAATTATGTGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPQNAVLSQGENVKEKEMDDGTQIVRSQESVTFQDVAVDFTREEWDQLYPAQKSLYRDVMLENYRNLVALGHQLYKPEVITQLEQEEQWIMESKSLPDTHPDGENRPEIKKSAQNQNISDEKQIHDMIMERLTGDSFWFSIFGGLWDFDYQLELNQENQQRHLGQVSSTHKKITQERILECNKFEENHNLNSNLTMHQRIPSMKIPLTSEIQGNGIKHNSDLIYYQGNCVRENPCEYNECGKIFNQHLLTNHILTAEKTSECGKTFSHSSSLTQPQIILTGEKPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNECGKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECNFCAKAFSQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECEKAFSQSAHLNQHRKIHT	1666745	1728988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1666813_1679996_1680139_1682356_1682874_1684292_1684625_1685662_1685926_1706337_1706426_1723465_1723593_1724325_1724419_1728030
925020	contig_4232_pilon	-	606	1	Intergenic	novelGene_63417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAAGAAAAGTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467500_468100
925021	contig_16098_pilon	+	1263	7	Intergenic	novelGene_46007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	563	937	349292	350024	TRUE	20	GTAGGGGCAGCGTCAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTLPTEHAQVRVRDQSPGNLTLVHLQATFGHVAHATLGLLGAEHGEKVQERGLGSDLKVPDRAVALATEVDNVGVGVKEGQQDATARVQLLQGQRLLQVLLVPQRHLPLAHAAEACGQDLSL	348290	350602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349492_349603_349712_349957_350075_350235_350421_350511
925022	contig_4782_pilon	-	3983	2	Intergenic	novelGene_73649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497596	459263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_462704_497053
925023	contig_9752_pilon	+	3591	1	Intergenic	novelGene_122023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	185	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAACAAGAAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133479	137070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_133500_137100
925024	contig_854_pilon	+	5342	28	Intergenic	novelGene_36585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3432.26352264637	9	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1072	3219	84	3302	1679334	1711849	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEVGWGLGAWRLASPSWRRSWTRSRATRSW	1679250	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1705297_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710686_1711776_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715151_1715198
925025	contig_8616_pilon	-	2104	5	Intergenic	novelGene_72618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	7	774	472035	471268	TRUE	15	ATGTCCACTCTGGCACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISGASTSTFGPFMSRVGPFKSPSTFGSETSTSPFILGPLRLRSKSGIDILGALMFISGIFNLGPFSFASGPSIFASGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNLGIFTLGIFRCQSGPWTSTPGTSTSTLAASISTSGAFKSPSTLGRETSTSPFTFGPFRFKSTSGMEILGALRCRSGILNLGPFSFASGPSIFTSGTSMSTLGPETSISALGRFTSTSGPSPLKPGMLNFGIFNLGIFKCQSGP	472041	464251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_464303_466585_466737_469528_469607_469835_470074_470455
925026	contig_10629_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_52946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATGGGATCCTAATCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406279	408608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10629_pilon_+_406300_408600
925027	contig_9121_pilon	-	2612	1	Intergenic	novelGene_134447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	54	350	133331	133035	NA	65	ACTCTTAAAAAAGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRTDDPGRGLKEEPAVFMHIQNHTRLGTDHIGFSGLRREKEVNEAETETEKQLFKGSCCLLNSWEKNWSWEGSLNPSSTGLYSSNVSALRGLAQILNQRAVITRVQHGNWEASSL	133384	130772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_130800_133400
925028	contig_5718_pilon	+	3954	2	Intergenic	novelGene_110418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	940	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	937	1371	1445826	1446260	TRUE	35	GAATCCCCAAAACTATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAVPFETKAAQLLVSLVSSPSASVSCGLLALGPHARICPAWASVPKLSSSTGKCPEAPYSTRRPSAHRHSAPSLRGLASLAPPISAQRHPTPPESLLLTDIQLSRSVGWLQRHLSPVSSFCCCWFSAAAASLLL	1444889	1572249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1447319_1570724
925029	contig_405_pilon	+	3664	18	Intergenic	novelGene_135315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	953	1261	463405	465643	TRUE	40	ATCCCATAATGTATTTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPLSDCAFLLDAVTLFFQLEVLYSAVDLDILWSKIYLLHPPNDLLMLVDKLPRKEVAYILPILIVHIPGPCDNDLLLRYRWIVKFFPNPCHHTEFHEVCTY	462314	507730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_+_463239_463376_463447_465290_465463_465548_465671_465877_466025_470397_470548_471862_472067_473472_473583_474462_474616_476069_476261_477391_477818_484513_484719_486188_486363_488802_488947_489233_489383_492270_492378_504766_504888_507635
925030	contig_15897_pilon	+	1888	2	Intergenic	novelGene_49576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATATGCTTTTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834164	836101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_834687_834735
925031	contig_6576_pilon	+	4061	26	Intergenic	novelGene_42375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	65	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2315	2617	1277635	1280291	TRUE	55	CTAAAAACAAGGAGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTLCRLASSLCLQKRTRFDSHGVMYSKQRCFNSILDLLNPEIHSSKNSKVRCGSLAASVLLIETIKRVLLAGMHKPDVSSNWPSIFKLKVQVKAHRRL	1255863	1349303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1256033_1257221_1257257_1257590_1257676_1258903_1258974_1259160_1259298_1259669_1259794_1263209_1263363_1264921_1265059_1266074_1266209_1267688_1267815_1269416_1269551_1274006_1274117_1274634_1274751_1274903_1274965_1275175_1275394_1275829_1276104_1276261_1276408_1277549_1277741_1280094_1280299_1282533_1282875_1283467_1283901_1342165_1342282_1345077_1345220_1347463_1347610_1348525_1348626_1349144
925032	contig_4364_pilon	-	1384	11	Intergenic	novelGene_4	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	13	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	62	409	282944	276054	TRUE	55	AGACTGGAATTGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLAESLDWLKSRVLGLSWPGSLHPGSALDHQGGWETMATPVGKGSPPAGPSPRRRSKSFRDHCPRRAGACPSEMNVHSGLEHSGNSQKFTGDTTANSRRVRCVPIDSRTLCWE	283005	144219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_144332_144432_144533_180870_180939_207799_207899_256297_256390_265101_265228_270552_270689_271042_271114_272199_272274_275956_276062_282604
925033	contig_15939_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_160255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1076	1375	62526	62825	NA	30	GGCCACGACAGCTTGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEQNVVYPYNGILFSIKRNGVLIHATKWMNLENIILSEVSQSQKNQIFYDLTYMKYLEFGKCIETKVYQWLPEVGGRGKEESLPRGHQVSVSGDRTIW	61450	64133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_61400_64100
925034	contig_15498_pilon	-	1092	7	Intergenic	novelGene_42652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.844113391166	12	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	4	837	697708	688241	FALSE	5	CTTCCATCTGGCCTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMEAGTGARARSLLWLLLPLLGPVCASGPRTLVLLDNLNLRETHSLFFGSLKNRGFELTFKTADDPSLSLIKYGEFLYDNLIIFSPSVEDFGGNINVETISAFIDGGGSVLVAASSDIGDPLRELGSECGIEFDEEKTAVIDHHNYDVSDLGQEYSIVIEQLSNGRWVPFDGDDIQLEFVRIDPFVRTFLKKKGGKYSVQFKLPDVYGVFQFKVDYNRLGYTHLYSSTQVSVRPLQHTQYERFIPSAYPYYASAFSMMAGLFIFSIVFLHMKEKEKSD	697711	687985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_688391_688482_688590_688714_688836_691490_691595_692421_692509_697262_697374_697554
925035	contig_262_pilon	-	3290	1	Intergenic	novelGene_140617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	128	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2586	2891	50674	50369	NA	30	TATTGAAGTTGTCAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIPKKSDPTECRNYRTISLISHASKILLKIVQNQLQQYINRELPEIQARFRRGHGTGNITAGVRWILAESRESQKDVYLCFIYYAKPFDCVYLNKLRVTL	53259	49969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_262_pilon_-_50000_53300
925036	contig_10627_pilon	-	3403	2	Intergenic	novelGene_60024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2653	3060	484912	483692	FALSE	50	ACAAAGAAAACGTGAGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTDKQTTKNAQPTCSDIAKKKKKGMKQTNLQSINEKNNYRMTLRQQTISKHLQKQDRMVPVGFQNKIPDDLPVEEKALELPDMEFRSLIFRAIQELKQKADKNEEKIDFFNLRTNNFSSQAESRTQDRTSQIPI	487564	483348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_483773_484585
925037	contig_12250_pilon	+	3467	6	Intergenic	novelGene_80576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	47.7560467375598	242	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	230	760	311980	312816	TRUE	35	AGCCAGCATGCCACCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQVLLGQNT	311750	315716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_313596_313684_313753_313856
925038	contig_14219_pilon	+	2921	1	Intergenic	novelGene_54292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAATGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622167	625088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_622200_625100
925039	contig_5041_pilon	+	4491	1	Intergenic	novelGene_27031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2017	2337	318088	318408	NA	70	AATTATAAAAGAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWCSLSFWDGQLFMFHDIGEAFCEQFFSDSLCVFCFLPRSGTLITRRVLLLIVSHIILRVSSFFIVLFSDFFFKQSCIQVFVFNFADLIFHHFKPALQPFCDPVHF	316071	320562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_316100_320600
925040	contig_19330_pilon	-	1409	2	Intergenic	novelGene_163695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGTCCTCTTCACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42565	40434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19330_pilon_-_40557_41278
925041	contig_7308_pilon	-	2363	10	Intergenic	novelGene_159622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	423.72737566611	12	21	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	187	1200	609339	593285	TRUE	55	GAAATACTCCTAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEPGTTVLQACEKVGIQIPRFCYHERLSVAGNCRMCLVEIEKAPKVVAACAMPVMKGWNILTNSEKSRKAREGVMEFLLANHPLDCPICDQGGECDLQDQSMMFGSDRSRFLEGKRAVEDKNIGPLVKTIMTRCIQCTRCIRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQVGTYIEKMFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETRKTESIDVMDAVGSNIVVSTRTGEVMRILPRMHEDINEEWISDKTRFAYDGLKRQRLTKPMVRNEKGLLTYTSWEDALSRVAGKLQSFQGKDVAAIAGGFVDAEALVALKDLLNRVDSDTLCTEEVFPTAGAG	609525	590875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7308_pilon_-_591566_592811_593435_594218_594334_595002_595138_602039_602226_602693_602825_602915_602998_603662_603740_606201_606310_609309
925042	contig_11574_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_64050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAACTAAAAAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422027	422656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_422000_422700
925043	contig_6578_pilon	+	2232	11	Intergenic	novelGene_162236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAACATAAAGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142500	204710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_142590_158136_158259_158597_159282_159901_160177_164329_164572_176611_176784_177744_177931_179852_180032_202760_202829_203687_203824_204631
925044	contig_6424_pilon	+	3509	1	Intergenic	novelGene_109240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCTTGGTAAAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632	4141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_600_4100
925045	contig_8484_pilon	+	4581	2	Intergenic	novelGene_178371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	136	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	911	2293	5069	6451	TRUE	35	TCACAGCCTTTACACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFKWKGKNSRISKALLKKKKKVEGLTIPDFRNYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFEKVPKCIRWGKDSLFKKWCWQNWISICKKKKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTIQALIHGINRIQTITINAQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGKYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKKNNPIKKWAKEMKRQFTKEDIRMANKHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLALIKNTGNSKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREVRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCSSTDEWINRLWYIRTMEYYATRKNNNESVKHFITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	4158	8983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_+_8237_8480
925046	contig_8420_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_69370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237891	236951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_237000_237900
925048	contig_3975_pilon	-	2138	13	Intergenic	novelGene_54838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	209.633194864003	1367	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	928	1677	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079246	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065346_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
925049	contig_6361_pilon	-	2847	5	Intergenic	novelGene_23987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	9	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	30	ATTTGCTCAGCATACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	408765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
925051	contig_18231_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_105888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAACAACATGAAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257167	255677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_255700_257200
925052	contig_6958_pilon	+	2995	4	Intergenic	novelGene_69972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1582	2112	676736	677266	FALSE	60	AGAAAAAAAACAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNVKKTKILTTGLISNIMINREQIEVVKDFLLLGSINQCPWKHQSRNQMIKFTKKDQTYCCVRDWRKQEYGSRTPFNSVLKSLLKFTLQPKIRQAYKINSNTCSSTMYTRLNGHTRPKAKTRRQEGTGKLDEWKWGTRGGEGMSVDTSRGWQPMSQNNYVLIV	645566	678149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_645728_666210_666304_674358_674600_675649
925053	contig_2703_pilon	+	2216	11	Intergenic	novelGene_101706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1329.51578027491	8	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	300	929	559489	603502	TRUE	30	AAAGTTTGGTGTCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAQLRPGAVDTERRDGEGEPGKSISLSQSL	526168	611747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526418_559438_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_603413_603520_605159_605214_610531
925054	contig_9739_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_165097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	317	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	108	317	210841	211050	NA	50	AAAAGATGGAAGCAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIQYSINSNLLSPSFLLLVTSRKLGLYTFACFCLFMPLRSYSICPLWLTNFTHHNVFKLYHIVACMKTSFLLLAVQYSIVCMYHILFISSSVDGHLGCFHLWPL	210733	212955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_210700_213000
925055	contig_4315_pilon	+	803	4	Intergenic	novelGene_46761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	195.170580661009	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	702	101	802	265874	269494	FALSE	40	AAGGGAGCAGAAGAGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKGSSTDGKTDLANGSLSSSPEEMSGAEEGRETSSGIEVEASDLSSSLTGDDGGPTRTSTESRGTDTESSGEDKDSDSMEDTSRYSINDENRVHDHSEEEEQPRRRVQRKRANREQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELGSSARFVYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVLDFESGHKSNVFQVR	251441	269495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_251519_265850_265923_268802_269051_269089
925056	contig_19865_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_170146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCAGGCGGGCGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41600	43372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19865_pilon_+_41600_43400
925057	contig_1143_pilon	-	1668	3	Intergenic	novelGene_86572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_1	67.5	23	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	348	707	100168	99809	TRUE	70	AGTATAAGTAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVCSNNDKNHQIKCNNNISYSKACKQVKRQFSTNIKVLYISCSEWNLFCKKTIQYVIENLGFITDKMKMVSKVVYISISPFFREHRYHFGLEEYTPEMNSVRSFNLSYIFTNFKNNCF	100515	93391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_93839_96112_96166_99347
925058	contig_8452_pilon	-	4913	3	Intergenic	novelGene_47997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	3690	4112	277281	276859	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLEVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILITDKIDFKTKSTIKYKEQHYIMIKGMIHHEDITIINSYTPNDRAPKYTKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTRLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHATAAK	305294	194610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_195332_276778_277618_301941
925059	contig_7378_pilon	-	3419	2	Intergenic	novelGene_120271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	16	507	588196	587705	TRUE	15	CCGGGCACCATCTAGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIKTTMRHHLTPALLARIKNTGNNKRWKSCREIGTLMHCWWEWTIQTFCKMIQRFLRKLEIDVPYNPAIPLLGIYPRAIRAVTRIDICTLMFIAALFTVAKRWKQPRCLSTDEEINKLWYIHTREYYAMIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISHSQRDKYYMRPLL	588211	516236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_516677_585232
925060	contig_6509_pilon	+	2903	1	Intergenic	novelGene_145654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	70	306	186720	186956	NA	15	CCAGTGCCACCTGCTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIPLLGIYPREIRAITQIDISIPMFIAALFTTAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHAMEYDATIKNNDESVKHLITWMKLEDIVLSEISQLQKDKYCMRPLL	186650	189553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_186600_189600
925061	contig_7459_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_174779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	387	1425	1811	138296	138682	NA	75	AATGAAAAAAAAAGAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPASDQNEEPKNLPEEDKVMESLEIEFKRLIFKVLQEIRNEIMQNSDVAKEHTNKAIEKFRKTIQEHNSKFNRLLETIERQQLEIQKINNNVSKLDNSLEDHRSRTEAMEVRISEIEDKALDTNLFEE	136871	138683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7459_pilon_+_136900_138700
925062	contig_21018_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_179091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1177	12	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21018_pilon_-_0_1200
925063	contig_15631_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_151553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTAAACACACACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558355	560193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15631_pilon_+_558400_560200
925064	contig_7919_pilon	+	5268	1	Intergenic	novelGene_28112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	919	2760	1755	4514	1408497	1411256	NA	25	GCTCCTTTGATGAACATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYALAHTQGEEKKQTSGTSNTRGSRRKPAAATPTRRSTRNTRAETVSQSQKSPVSNNSGCDAPDSNNPSVSVSSSAESEKQTRQAPKRKSLRRGRKPPLLKKKFRSSVPPPEKSSSSDSVDEETAESDLPPVLEKEHQSDIESSNTCTVQTNAENKSANGLISCNEHVEAREEHTENHDTKETVKPSYSECYTHNPPVLVGENQKPNPLPSSREEEEVEKVENTGIEDNVLCIESDISKNISEKRGDLLENQDQISGSLESEVKTDTCTDHPPVDFLKCSGSEIEVHQPISSPVDELPENAESVVNEEKIVESSIIEIIDHKDSTVKIEQPLESPKLDSSEGQNIQTVDKKSIESSEVQLPQHVETGDAEIIAKCDSSRNENFSSTQDSENNLLKNDLDSTKLDKCLEEKTESLGEHLTSRDLPNTYTEDIQKHFSEDNNEMIPMECDSFCSDQNESEIEPSVNADSKQLNENSGEHSSENIMLPSDPAVEKVETVSQPSESPIDTVDKAKKPRTRRSRFHSPSTTWSPNRDTAREKKRSQSPSPKKETGKDNRKSRSPSPKKESARGRRKSRSQSPKKDYARERRRSQSRSPKRDSSREGKRSESLSPRRDTSRENRRSQSRVKDSSPREKSRSRSRERESDRDGQRRDRDRERRTRRWSRSRSRSRSPSRSRTKSKSSSFGRNDRDSYSPRWKERWTNDGWRCPRGNDRYRKSDPEKQNENTRKEKNDTNPEADDPNPDKCRNDCPSWVTEKINSGPDPRTRNPEKLKDTHWEENRNENSGNSWNKNFGSGWMSNRGRGNRGRGTYRGGFAYTDQNENRWQNRKPLSGNSNSSGNESFKFVEQQPYKRKSEQEFPFDTPADRSGWTSASSWAVRKTLPADVQNYYSRRGRNSSGPQSGWMRQEEETAEQGNIFSIY	1406742	1412010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1406700_1412000
925065	contig_10777_pilon	+	2378	2	Intergenic	novelGene_101169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACACTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35519	38179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10777_pilon_+_37756_38037
925066	contig_13481_pilon	+	2927	1	Intergenic	novelGene_119376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	165	566	513690	514091	NA	45	CTCCTGGAAGAGAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSTSLLGSVIRFNDHTELTDNITIMSFIREVAGYNSGSGMLRIQFFHQDSLFLALLQAHLLLAPGPLPCAAKCYKTLVALRISALRHSTQPGSLLPEGAQLSHSVGGHTHYSHLSLWARKPNASSPAGLLV	513525	516452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_513500_516500
925067	contig_5020_pilon	+	1290	7	Intergenic	novelGene_27823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	978.835021849954	13	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	250	975	123231	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119580_123226_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
925068	contig_6233_pilon	+	2112	1	Intergenic	novelGene_74820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCACTTAAAGTACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408691	410803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_+_408700_410800
925069	contig_12128_pilon	-	3316	1	Intergenic	novelGene_131980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAACAGAATTAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291825	288509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12128_pilon_-_288500_291800
925070	contig_4640_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_147973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGTTATTATTGTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473605	471592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_-_471600_473600
925071	contig_4604_pilon	+	3375	7	Intergenic	novelGene_19172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_6	935.349251468254	14	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	892	1311	373631	377582	TRUE	25	GAAATGAATCTTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQVSGSIFGSKFDLFMN	371489	380715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_378607_379336_379470_379808
925072	contig_15629_pilon	+	2749	1	Intergenic	novelGene_122485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	500	835	200624	200959	NA	45	AAATATCTTCACAGCAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLFDHLNFWHLFILFDLTGNNFLISKWLPSYMSFKNGKEVLIYFTEWAWLFFFFSFPSSTSMLKDGVIQHILSLKEVTQRDLQRKFICFAKNSVGSTTRSIQLKKKERR	200124	202873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_+_200100_202900
925073	contig_10940_pilon	-	2571	2	Intergenic	novelGene_49169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTTGAACAAAAATAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177115	157164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_157232_174611
925074	contig_5961_pilon	-	4112	2	Intergenic	novelGene_144176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	66	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	1419	1952	302399	301866	TRUE	30	CATCTTTTAGCCAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERVNTDVLGVSELKWTGIGHFEMDNHMVYYAGNDSLKRNSIAFIIKNNISRSILKYNAVSDRIISICLQGRQVNIIIIQIYAPTTKVKDEEIEDFYQLLQSEIDRTCSQDALIIIDDWNEKIGNKEERSVVGKYGLFDRKDARDRMVEFCKNNDFFIADTFFHQYKWQLYMWTSPE	303817	282872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_282881_299713
925075	contig_233_pilon	+	939	1	Intergenic	novelGene_14686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCCTTCCCCTCCCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97201	98140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_97200_98100
925076	contig_7760_pilon	+	2232	2	Intergenic	novelGene_138430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCATTTCAGCTCTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51025	53983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_51402_52127
925077	contig_3956_pilon	+	1372	6	Intergenic	novelGene_14870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1459.68700754648	88	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	84	806	1281682	1290447	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKA	1281598	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284783_1290434
925078	contig_14513_pilon	-	1225	2	Intergenic	novelGene_70232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	187	672	18880	11833	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRACPFKRTEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12174_18735
925079	contig_10953_pilon	+	1227	6	Intergenic	novelGene_42588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	18479.9329154627	17	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	67	405	455261	461135	TRUE	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKRGLPSTAHAECHQVRQHAPGPRHAYAPED	455194	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459524_460326_460404_461127_461224_461550_461639_463817
925080	contig_10766_pilon	+	4381	19	Intergenic	novelGene_151198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	967	junction_2	656.869495372267	174	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	1668	3881	136200	194104	FALSE	80	CAAAAAAAAAAAAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTEDLIVMGAPGSFYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKDNRVKFGSYLGYSVGAGHFQSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDAKELNILYEMKGKKLGSYFGASICAVDLNADGLSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGVGAVMIEMGTELIGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLRGAIYIYNGRVDGISPAFSQRIEGLQISESLSMFGQSISGQIDADDNGYVDVAVGAFQSDSAVLLRTRPVVIVKASLNHSESVNRTKFDCIENGLPSVCIDLKLCFSYNGKQVPDHIVLFYNVSLDVNRKAETPSRFYFSSDGTSEVITRSIQLSSGGVYCTAHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGHHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIIKTTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLVVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPTGLYFIKILDLEEKQINCDVTDNSGVVKLDCSVGYIYVDRLSRLDISFLLDASSLSRAEEDLNITVHAACENEGDVGTLKNNKVTLAIPLKYEVMLSVHGFVNPTSFVYGSHEENEPQTCMEEKINFTFHVRKVDCVEICNRMKECYHVLFQGSSASPLSHDAGTAEGGKGAATHSTHALSSRALISFLPLSCPWSSSPHLLTGQVVKNKQEQVIMLVTSKAIR	134532	194604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_136255_138019_138088_139436_139567_142316_142403_143671_143735_143824_143963_147221_147334_153839_153935_155162_155254_155835_155882_156261_156417_161131_161287_172722_172873_174941_175019_188128_188280_189827_189924_190640_190721_191124_191215_193728
925081	contig_12873_pilon	-	2096	4	Intergenic	novelGene_27177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1547	1978	16860	16097	FALSE	25	AATTCTTGTATCATCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPQLIQPTRAQILFPGMVVIRCYLDDMVGDRFLSSYLLHCHHLGGEQLPTEVAETAFHLQVFFLSLRKAGLWSLFSTNLPYTISILTSFSLQQTKLPFSHCPQQRKPAKPETLGFLLSISFPLYLWLPASLLVISIHPIHFS	19464	15978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_-_16427_16758_17021_17096_18012_18993
925082	contig_6513_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_117774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAACTAGTATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180415	177967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_178000_180400
925083	contig_848_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_83350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTAGGGCTCTCAGCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752350	754001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_752400_754000
925084	contig_6165_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_167425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1213	1563	517923	518273	NA	45	AAATTCCTCAAAGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSGCKHLLIIRMWNVQSTNLGKLELVKNEMDPASMTPGHPFSSVVKALPKFTVQPGIGQPHKTGVMRHSSPGTRTRRQEGTGKLVIGNPRLRRDSVDTLWVVNRLHRAVCVLTV	516710	518526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_516700_518500
925085	contig_6191_pilon	-	3173	1	Intergenic	novelGene_107862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	228	687	305	991	470480	469794	NA	30	GTCTTGCTAAGATGATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNIRKHPLIIGTWNVQSMNIGKLEIVKNEIDLIKIYILGIRELKWTSIGHFESDNHMVYYAGNDKLKRNGIPFIIKKNISRSILKYNAVSDRIIAIWLQGRQVNTTIIQIYTPVTNAKDEKIEDFYQLLQSEIDQKRNQDALIILGDWNAKVGNKEEGPVVRKYGLGDRNEDGNHMIEFCKTNELFIANTFFQRHNLQLYMWTLPDVIHRNQIDNGEAQYHGSAQG	470784	467611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_467600_470800
925086	contig_10494_pilon	-	2177	3	Intergenic	novelGene_102216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	30	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	36	518	1191432	1184815	FALSE	25	ATTAGGGTGTCCACAGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLPAPQLLSSMALLSARVCCSCRGRGGPAEEETEFPRAYQSSPPCSGWQLVTERGIAEQPAQRWCPCVTARRRVSRVRVSRCWWGLSQCSPPCLSLTSSWWRQDIQERFDTQSRRPREDGGRDWGDAATSQGTPGATRSWRRQGRILPWRLWRERGPANTLISDFWSPEL	1191467	1183155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1185020_1185522_1185743_1191374
925087	contig_7051_pilon	+	2622	13	Intergenic	novelGene_64287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	186.811160593317	7	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	943	1539	189176	206198	TRUE	25	TATTGACTAGTGTCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMDCCLIVYHPYRPLLQYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184029	207365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184749_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143_206329_206412
925088	contig_753_pilon	+	1644	1	Intergenic	novelGene_112906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAGAAAAAGAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281428	283072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_281400_283100
925090	scaffold_12124_pilon	+	1886	11	Intergenic	novelGene_22219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3151.72616830841	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1148	1798	1508755	1509405	FALSE	15	TTTTGTTAGTTTGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1509493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491935_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508120_1508221
925091	contig_854_pilon	+	5686	30	Intergenic	novelGene_36601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_29	3260.92380533635	13	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1477	4434	26	4459	1685144	1714980	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1685118	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715276_1715473
925092	contig_6316_pilon	+	4839	1	Intergenic	novelGene_134712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATGGGAAAAAATGAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137206	142045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_137200_142000
925093	contig_5686_pilon	+	1769	1	Intergenic	novelGene_45479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCATCAGAACAATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227443	229212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_227400_229200
925094	contig_12000_pilon	+	1275	2	Intergenic	novelGene_43187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTAAATTCATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558495	560677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_559190_560096
925095	contig_13558_pilon	-	633	2	Intergenic	novelGene_123033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACTAAAAGAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569972	569121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13558_pilon_-_569697_569914
925096	contig_9468_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_59521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1137	1511	488738	488364	FALSE	50	TCCAGAGAACGAACAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQNGLHLIIKQTKILTTGPISNIMINREKTDVVKDFILLGFTINAHGSSSQEIKQRIALSKSAAKDLSKVLKSKDVTLRTKVRLTQAMVFSTASYTCESWTMNKKDRRTHTFELRCW	563505	488339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_488883_562513
925097	contig_16103_pilon	-	2585	5	Intergenic	novelGene_118885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4525.83754679728	51	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	48	147	262	408	735928	735658	TRUE	20	TTCAGCTTTAAGGTATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERCKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAES	743580	722978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723577_734078_735733_735856_735968_737491_737630_743496
925098	contig_4812_pilon	+	1635	4	Intergenic	novelGene_103697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	42	junction_3	47.5908487935327	14	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	77	544	276420	279423	FALSE	25	CCCTATCTCCCCAATTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTVTELTSQNNRDHCALVRSGCAFMVHVCQDEHQLYNEFFTKPTSKLDELLEKLCMSLYDVFRPLIIHVIHLETLSELCGILKNEVLEDHVQNNAEQLGAFAAGVKQMLEDVQERLVYRTHIYIHTDIAGYKPAPGDLAYPDKLVMMEVRFPTWSPLRTAFQCFILVKKGFFSLIITKM	274973	280514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_275029_276398_276491_277571_277712_279166
925099	SIRV7	-	1395	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112506	15	112328	-10	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	9	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCCAAGCGTAATTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2410	1015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2400
925100	contig_9458_pilon	+	3033	2	Intergenic	novelGene_178875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1242	2291	1242	2291	TRUE	65	AGGAAAGAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGIQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	0	4479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9458_pilon_+_2726_4171
925101	contig_1143_pilon	-	4059	1	Intergenic	novelGene_86637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTAAAGTCCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1323202	1319143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_1319100_1323200
925102	contig_8138_pilon	+	3200	1	Intergenic	novelGene_52494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTAAATGGAAGCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401956	405156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_402000_405200
925103	contig_6958_pilon	+	1324	1	Intergenic	novelGene_69980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	9	461	701180	701632	NA	35	TGTTTTCAACAGCAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLMGFGYLVWRFRAIVSRDIPVNWPSDIFSAFVPPPRWLHSAWGLISLQAAIQDTTIVLYLLGATEEEGESGTVVKDTECVANCLHEQLPPFPRDQKNWMVPSYINEHFNQRFYRRMLIKRGKMQNRISSSQGLQTFWSQGVRRTPETTALR	701171	702495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_701200_702500
925104	contig_6710_pilon	-	868	1	Intergenic	novelGene_98346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAAGAAAAAAGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657520	656652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_656700_657500
925105	contig_4364_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAAGACTAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1449427	1448248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1448200_1449400
925106	contig_4857_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_48868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	383	712	1358485	1358156	NA	20	GAATGGATGGTGTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDWTLLITCPKYMRQSLAIVTSKEHSHCTSSKADLFILLAVHGIFSILCQYHNSKASVLLWSSLFIVQLSYAYEVIENTMAWVRCTLVLKVTSLLFNTLNEFTV	1358867	1356614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1356600_1358900
925107	contig_15666_pilon	-	1818	5	Intergenic	novelGene_70141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	805.815231613302	4	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	126	536	110619	108177	TRUE	30	AGCATGTAAACTACGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWAPYS	110744	106766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108191_108579_108859_109098_109215_110617
925108	contig_18544_pilon	-	2355	2	Intergenic	novelGene_152742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	401	junction_1	0	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1471	1791	40293	38474	FALSE	80	AGAAAAAAGAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQQAATAQAAAAAQAAAVAGNIPGPGSVGGIAPAISLSAAAGIGVDDLRRLCILRMSFVKGWGPDYPRQSIKETPCWIEIHLHRALQLLDEVLHTMPIADPQPLD	41763	37909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_-_38686_40184
925109	contig_8697_pilon	-	813	1	Intergenic	novelGene_83219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACCAGACGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52570	51757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_-_51800_52600
925110	contig_13863_pilon	+	3264	1	Intergenic	novelGene_42008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77060	80324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_77100_80300
925111	contig_18184_pilon	-	3134	1	Intergenic	novelGene_123892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1303	1668	682251	681886	NA	85	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHDPYLTPYTETNSKWIKDLNVKAKTIKFLEDNTGTKRWDLIIKKKNTTTNTQTAEDKLDHWDLLKLNTYAHQKTIKRIKRQPTAWEEIFRSNISNRDLISKIYRKLPTTQQQQQQQKTI	683553	680419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_680400_683600
925112	contig_13607_pilon	+	2804	1	Intergenic	novelGene_170173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACCAGAAAGATGTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166474	169278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13607_pilon_+_166500_169300
925113	contig_6164_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_121266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGCTATGGGGCAGTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312273	310690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_310700_312300
925114	contig_15236_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_141541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	331	633	107635	107333	NA	35	GACCCCAATTAGGAGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEDRWQATWRSPRNRETEAEETRTFPLELTENLPLEPHPEFGLLGLLNCEKINFHLLKPPTCSTAVRTAPDYEDIAHKPSLPKLRHNLQDQRRPLSYGI	107965	105529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_105500_108000
925115	contig_5936_pilon	-	2847	1	Intergenic	novelGene_53574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	290	616	284004	283678	NA	70	TGGCTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSDALINTRDWNVKAGNEEGTVVGKDSLGARNDARERMTEFCKMNNFFIAHTFFQQHNWQPSQMEHPGIKLTTSVQQDNGKAQYHQSEQGQGPTVEQTINRSYASSS	284293	281446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_281400_284300
925116	contig_17074_pilon	+	1924	8	Intergenic	novelGene_145129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	206.05111313577	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	53	775	214186	224256	FALSE	25	GTTTGTATAATTTTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEVSCCCPACVIGGQAGPTGQTLVIAKLYWITDRQSTCTAMQEHQKPSVWVELHVILQKNKTKTLKVS	214133	225405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217735_224096
925117	contig_9177_pilon	+	2189	1	Intergenic	novelGene_32705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506356	508545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_506400_508500
925118	contig_5033_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_29084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTACAATTTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664815	666046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_664800_666000
925119	contig_12886_pilon	+	6994	2	Intergenic	novelGene_135475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	179	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1940	2479	300709	301248	FALSE	25	CTTATCTTATTCAGAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPQGGLPCCYQSPPHNMLAVGVASTQDACILAHAVSVSSPQHQLEGGADRPKLISREICPVGFGGLSYGVHKEAGRVLTIGAGSTAGAFCSNLQQPGNQLGGRGGVTLWSDPHGGLPRCHRSPLSRLLAVSAASTQGSCFLAHSSLSQQSSAPVRSGGRLTLTDPQGGLSCWFQRPEI	298611	305763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_298935_299092
925120	contig_3270_pilon	-	3603	2	Intergenic	novelGene_104502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	906	junction_1	0	7	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGCCATGTCTTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369099	362245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_362733_365983
925121	contig_1244_pilon	-	1204	1	Intergenic	novelGene_37943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAAAGAGTGGAAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	801742	800538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_800500_801700
925122	contig_8895_pilon	-	1031	1	Intergenic	novelGene_170451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATGCTTTACAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68221	67190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8895_pilon_-_67200_68200
925123	contig_3948_pilon	+	4717	7	Intergenic	novelGene_53155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTACTCTTGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94356	122928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_95593_99681_99877_102854_102921_115025_115221_116452_116538_119096_119340_120231
925124	contig_9036_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_155450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACTGTAAATTTTCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124175	124874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_124200_124900
925125	contig_1575_pilon	-	1610	16	Intergenic	novelGene_45160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAACTGCAGTTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190537	40198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_40363_130612_130720_143821_143917_146197_146233_149573_149636_150135_150245_166976_167133_167816_167888_169082_169157_171859_171927_180346_180473_181357_181462_183395_183485_183572_183663_185016_185132_190391
925126	contig_11656_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_53974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTTGAGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178211	179538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_178200_179500
925127	contig_14450_pilon	-	1367	1	Intergenic	novelGene_49056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGATAAAGGACATTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1417320	1415953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1416000_1417300
925128	contig_15286_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_124438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACAATATGTGTACTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12637	14254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_12600_14300
925129	contig_11338_pilon	+	4599	16	Intergenic	novelGene_6145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	506.742380307785	42	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	1191	2741	6086	11749	FALSE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	0	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_895_2633_2781_4519_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9899_10544_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719
925130	contig_4364_pilon	+	615	1	Intergenic	novelGene_762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGCAGTGAACGGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532687	1533302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
925131	contig_5921_pilon	-	2357	2	Intergenic	novelGene_142256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	55	312	414425	414168	TRUE	60	ACAAACAAAAGAAATTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASQSSQQETEHPVTSDNMYSHPSPFFLPLCLCCILPAEVSRPGDISSVPLEFAPPTLAGSLSAISLLLVLLFSASFGFFPASHLLPLLSFEHLALCASFASS	414479	411832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_-_413575_413864
925132	contig_10793_pilon	+	1494	13	Intergenic	novelGene_83383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3803.62914694637	4	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	236	1162	146975	163940	TRUE	35	TCATAAGGTAATGTCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146850_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164090_165325_165371_167141
925133	contig_4315_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_46771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	628	1089	280067	280528	NA	40	AAAAAGTAGTCGTCAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAHLFTAWFTDYFKPTVETYCSEKKISFKILLLTDSAPGHPRALMEMYKEINVVFIPSNTTSILQSMDQGVILTFKSYYLGNTFHKVIATIDGDSSDGPGQSKLKTFWKGFTILDAIKNIRDSWEEIRISTLTEVWKKLIPTFMDDFEGFKT	279439	281988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_279400_282000
925135	contig_6497_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_35660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGTTTTTCTTCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880544	882498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_880500_882500
925136	contig_3601_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_132903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	408	1344	1751	217074	217481	NA	35	GTCAGAACCAACGCAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSVTSYACKSWTMNKEDRRRMDSFELWCWQRILNIPWTARRTNIFVLEEVQPECSSETRMVRLRLMYFGHIIRRDKTLEKDIMLGKAEGQRKRGRPSTRWTDTMAALTGSNIANDCAVVQDGAVFRSVGHKVTM	215730	217482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_215700_217500
925137	contig_6876_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_147033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAATTTAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218722	217547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6876_pilon_-_217500_218700
925138	contig_12414_pilon	-	4335	1	Intergenic	novelGene_59659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGGTAAAATCCATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771974	767639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_767600_772000
925139	contig_15236_pilon	+	3189	1	Intergenic	novelGene_141549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1825	2232	122756	123163	NA	10	GTTGTGCACGGGGTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQRDAVAEVLTHLCQEIWKTATWLTYWKRSIFVSIPKKGGPTECGNYQTISLISHASKILLKIIQKQLQQYINRELPEIQAGFRRGCGTNDIIADVRWLLAESREYQKDVYLCFIDYAKALDCVDHNKLWITL	120931	124120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_120900_124100
925140	contig_20641_pilon	+	1694	7	Intergenic	novelGene_52851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1570.44257739304	5	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	46	816	14599	54901	TRUE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRMNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQVGAATHLLLWVCWKQDSVY	14553	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41591_45865_45965_54842_54968_56379
925141	contig_10323_pilon	-	356	1	Intergenic	novelGene_123614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	42	126	231	356	460768	460643	NA	50	GAAGAATCTGCAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEK	460998	460642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460600_461000
925142	contig_5153_pilon	+	1175	10	Intergenic	novelGene_74360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	309.744857169913	29	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	210	1118	956804	1018752	FALSE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAERKGKGSKWRVGNLIPPRKQFWERSASFGPEVPALGCSQTKGRLMLHKDLSPERKERESLLLELMP	956594	1018809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956805_1010285_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018552
925143	contig_34_pilon	-	4133	16	Intergenic	novelGene_39963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGGAAAAAAAAAATGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57515	12165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_12403_12881_12979_17185_17283_19810_19979_20922_21133_33726_33802_35021_35136_35895_36081_38941_39823_42106_42213_42712_42808_46026_46132_47286_47336_50221_50328_55003_55132_56035
925144	contig_12969_pilon	-	2607	6	Intergenic	novelGene_61687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	11.2142766151009	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1533	760	2292	509028	493044	FALSE	25	GTGGAAAAGCCTTGGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEENDQEPGFQAGKPDALSKLERGEEPWTVEDEIQRQARSEIEKVDDYLQGHLQNQRCLKRMEHCQGHNVFGNIVYQRKSHFPLRQNHDIFDLCGKTLKSNLYLVNQSRSFEVKKPHKANGGGKSFLHTKHEQFHPEIKFPECGKPLNTKSQFIKHQRTHKIDKPHVCSECGKAFIKKSRLIDHLRVHTGEKPHGCSVCRKAFARKSRLTEHQKSHIREKHYACTECDKTFPKKSQLIIHQTAHTGEKPYVCNECGKDFVKKSRLINHQRVHTGEKPHGCSICEKAFARKSRLIEHQRTHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKTHTGEKSYICSDCGKGFIQKGNLIVHQRTHTGEKPYICSECGKGFIQKGNLLIHQRTHTGEKPYVCGECGKGFSQKTCLISHQRFHTGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYICSDCGKAFRDKSCLNRHRRTHTGEKPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCIGSVKV	512716	492728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_494450_504289_504386_508997_509204_509784_509935_512175_512301_512407
925145	contig_9375_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_136074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583317	582120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_582100_583300
925146	contig_13863_pilon	-	2138	22	Intergenic	novelGene_41984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAACTCTTCTTGGCTGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81515	48570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_48692_54756_54862_55284_55385_58893_58997_60741_60809_60881_60980_61928_61989_62760_62836_63953_64057_64640_64710_65651_65763_67858_67986_68690_68750_69377_69456_70273_70372_70467_70546_73188_73318_74716_74814_75878_76065_76171_76261_77544_77705_81490
925147	contig_8006_pilon	+	2673	1	Intergenic	novelGene_173941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540519	543192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_540500_543200
925148	contig_12402_pilon	-	2072	1	Intergenic	novelGene_133344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233286	231214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_231200_233300
925149	contig_8284_pilon	+	857	9	Intergenic	novelGene_125711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	696	junction_7	283.760434830157	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	103	756	431923	461340	FALSE	30	CTTTCATTAATATAAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIHNILLCSFCLALYCLCNADKFLSSRYEWKKLIMVHHWPPTVCKEAENDCSNPPGYWTIHGLWADKAEDCNRSWHFNLEEIKDLLPEMKMYWPDIIHRPPNCSQFWKHEWRKHGTCVAQLDALNSEKKYFGKILDLYKQLNLDSMLQKLGIKPSIDYYQVADIRDALASVYGVMPKVQCLPPEKNEDVQSIAQIELCFTKDLQLRNCTQPGLSASLRQKARGADVADSSMGLEVCEDGPVFYPPPRETMR	426610	461441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_426685_431894_431956_436430_436487_438444_438503_441534_441606_449073_449188_457896_457943_458480_458556_461139
925150	contig_12079_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_67414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTAGCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544177	542727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_542700_544200
925151	contig_4232_pilon	-	779	2	Intergenic	novelGene_63380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATAGACGGGGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468165	467237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467489_467637
925152	contig_12866_pilon	+	1973	1	Intergenic	novelGene_174645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGAGAAGGATATCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642384	644357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12866_pilon_+_642400_644400
925153	contig_6132_pilon	+	3302	1	Intergenic	novelGene_163616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	112	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2657	2980	77768	78091	NA	30	CCAAGAGGCAGTCGTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEAGIHRVTVQNELVDFQPFLEVAYDQELMVLKEEVQAALKALTKNKASGIDGILIEVFQQTAAALKVLLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIICIPFQRKVIQ	75111	78413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_+_75100_78400
925154	contig_18184_pilon	+	3405	1	Intergenic	novelGene_123845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	651	1956	22	1977	5096	7051	NA	30	GAAAAATGTTTTGTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGKNPRQMEMAPQAGAHEELSSWYIWQQIASDLTRCQESVSNRSQFYKQGDSPSLVAGGLSVIHTGEKTCQCNKCTETFSDVPSFDLHQQLHSEEKSLTCSECGKSFRYISCLRNHQRAHMGKNRYKSDVCGKEVNQSSHLQSHLNVHTVEKPHKCEECGKRFKHRATLKVHCKGHTGAKPYNCEECGRDFMYPLHFQEHQRIHVGERSFTCDICGVNFHRRAALNNHCMVHMGEKPYKCEECGKGFSRRASVQIHYRIHTGEKPYNCEECGKGFRTSSQILAHERVHSGEKPFRCEECGKYFSRRSHLQLHSKIHTGEKCYNCDDCGKDFRHASQLVAHQRVHSREKRFKCEECGKSFSTRRNLQVHCRIHTGEKPYKCEVCGKTFRYASQCLSHQRGHSGEKPFKCEKCEKSFHQNSLLKAHRRVHSEEKPYRCDECGRGFKWSNNLNTHLRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASILQLHKRVHTGEKPYKCDVCGKVFSQSSNLYCHQRIHTGEKPYKCYECGKGYSHRTDFQIHYRIHTGEKPYHCEECGKAFRAFSLFLSHQRVHSGEKPFRCEECGKYFRNRSNLGHHRRIHTGEKPYNCEECGKDFRYASKLLAHQSVHSGEKPFKCEECGKYLSSRSTLQRHRRIHEGEKHY	5074	8479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_5100_8500
925155	contig_3241_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_146382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	176	487	716412	716101	NA	50	TATTTTAATAAAAACTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGHFTKEDIQAANRYMRKCSRSLAIREMQIKTTMRRYLTPTRLALIQKTQNNKCWRGCEEHLLTAGGNVKWTTTLGIDLALPQKPRNRSTIGSSNTTPWNIS	716587	714307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_-_714300_716600
925156	contig_2264_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_177845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTAAGACAGCCATGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41647	43967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2264_pilon_+_41600_44000
925157	contig_10904_pilon	-	3139	1	Intergenic	novelGene_22773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	699	1211	709438	708926	NA	10	TGATGTTTTTCTGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSVSSFMILGKFSVSNSSMILSMFSVSSPCSGTPIIHRFLLLIVSHIILRVVSFFFILFSDFSSNRIVSKCLSSILLILSSIFSNLLLSPSMTLSISETLLFIFWISNCCFCMISSCEFISTFCFVLFSLILPFFVCIFCEFVCFFHEFAYFFLIFVCFLLQLLNNSEY	710136	706997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_707000_710100
925158	contig_5316_pilon	+	1219	2	Intergenic	novelGene_61219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	575	907	401905	402237	FALSE	75	TGTTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYLEYKSIFWFQVMIRKTLVCHHPNPFVVHCHSVAQVKSLHLFLKHNQCKQSSEYTQRGSFGGITKEIGDSISNKNCKLITGRFLQESLLFNNANVIETLLILNAVNLK	401281	402549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_401835_401883
925159	contig_4151_pilon	+	1769	2	Intergenic	novelGene_65235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_1	0	156	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	111	677	528988	663644	FALSE	5	GCAGTTTGTGTGTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528877	664736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663078
925160	contig_13633_pilon	-	438	1	Intergenic	novelGene_15333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTGGAGGGGGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35047	34609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_-_34600_35000
925161	contig_1275_pilon	+	875	1	Intergenic	novelGene_108770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTCTTCTGTATCGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415686	416561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_415700_416600
925162	contig_5696_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_117563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTACAATCAGTAAATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697204	695756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_695800_697200
925163	contig_14208_pilon	-	6261	4	Intergenic	novelGene_129108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1403	124	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	682	996	353359	317357	TRUE	45	TAATACACCATGACCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTERKRIITEYYEKLYCNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITRQGIERVIRKLPTKKSPGPDGFTHKNKQSLLVMRDGRGEGGKLRRQ	354040	306570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_306838_308213_312726_316870_317430_353117
925164	scaffold_12124_pilon	+	1538	4	Intergenic	novelGene_22261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2043.81522322021	12	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	587	1366	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489082_1508218
925165	contig_16496_pilon	-	1519	2	Intergenic	novelGene_5132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	295	312	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3579	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
925166	contig_9177_pilon	-	780	4	Intergenic	novelGene_32631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1173	junction_3	2811.86015931724	4	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTACGAAAGGATAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32832	25407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_25481_25584_25715_25971_26476_32759
925167	contig_14985_pilon	-	1412	2	Intergenic	novelGene_169090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAACAGTGACATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19878	4001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14985_pilon_-_4018_18482
925168	contig_9375_pilon	-	1317	1	Intergenic	novelGene_136064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	732	1127	347538	347143	NA	35	GAAATTTTATTTTACTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAVKKLKDTLHWANLLQKTSFKVLKSKDVTLKTKVHLTQDMVFSIASYTCESWMMNKLDQKRIELWCWRRILNIPQTAKRTNKPVLEEVQPECSLEARMARLRLTYFGQVIRRDQSLEKDIMLGEVEGE	348269	346952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_-_347000_348300
925169	contig_4151_pilon	+	1785	3	Intergenic	novelGene_65271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	137	7	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	72	710	620441	663644	TRUE	80	TTGTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFIFCRVRLQVLAAERTCSYSEYMSAVVAPAAGYPDTMHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	620369	664800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_620514_663078_663723_663803
925170	contig_21065_pilon	-	2829	2	Intergenic	novelGene_176864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1172	1681	10706	10197	FALSE	30	ATGAGAGAATGTGTGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDITADVRWILAESREYQKFPCFIGYAEAFDCVDHNKLWITLQRMEIPEHLIVLFRNLYIDQQESFKQHGDTAWFKVMKGMHQNCILSPYLFSLDAEHIIQKAGLYEEGRSIRNGGRLIKVTQPCLLKPLSDEDQRLQPSVWITPQHKDNKNPHNWTTEQHHDKLRKD	12018	9048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21065_pilon_-_11475_11615
925171	contig_13464_pilon	-	2410	14	Intergenic	novelGene_125245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAGCCTTTAGAACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527583	440360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13464_pilon_-_440736_460269_460353_489858_489907_496629_496723_500019_500158_500623_500717_502929_503075_506772_506903_510219_510420_510998_511082_513194_513330_516230_516329_520632_520752_526913
925172	contig_7657_pilon	+	2934	3	Intergenic	novelGene_30007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGAAAGAAGTTCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96808	289414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_98642_182380_182555_288487
925173	contig_1150_pilon	-	581	3	Intergenic	novelGene_61383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36526	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTGACTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312899	308927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309920_312882
925174	contig_8386_pilon	+	2369	1	Intergenic	novelGene_82236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAGCCCCAGCTCATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65185	67554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_65200_67600
925175	contig_9919_pilon	+	3486	1	Intergenic	novelGene_137966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	330	3155	3484	572113	572442	NA	65	GGTAATAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRKTIERINKTKNWFFERINKIDKPLARLTIEKQERMQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITAYYEKLYSNKSENLEEMDKFLETHYLSKLPQSDVENLKRPIIREEIE	568958	572444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_569000_572400
925176	contig_4486_pilon	+	3913	5	Intergenic	novelGene_38551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	272	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	84	255	117	371	140856	141110	TRUE	25	CAGAGACAGCGACGGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IINFIWRGKKPRISKALLKKKTKVGGLALPDFRTYYTAMVVKTAWYWYNNGYTDEWNRIENLHVNPSTYGHPIFNKGPKSIRWGKDSLFNKWCWQNWMSICKKMKQDPYLTPYKPIQNGSKT	140739	177638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_143995_156261_156396_159432_159548_162084_162162_177306
925177	contig_8484_pilon	+	3587	1	Intergenic	novelGene_178370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1027	2409	5069	6451	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFKWKGKNSRISKALLKKKKKVEGLTIPDFRNYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFEKVPKCIRWGKDSLFKKWCWQNWISICKKKKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTIQALIHGINRIQTITINAQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGKYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKKNNPIKKWAKEMKRQFTKEDIRMANKHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLALIKNTGNSKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREVRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCSSTDEWINRLWYIRTMEYYATRKNNNESVKHFITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	4042	7629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_+_4000_7600
925178	contig_15384_pilon	-	5339	1	Intergenic	novelGene_85121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	382	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3125	3430	78952	78647	NA	30	GCTCTATAAACTTCACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHLGPAVQVGLSPALLAVIDDQQRAGVESVGSLPLQHSFQAPQFTQDGLKEVTPQVQSVVQVLVEGIAEAFNGEPTAIVFVPAEVMPCVQLVHLKPQETG	82076	76737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_76700_82100
925179	contig_854_pilon	-	4125	21	Intergenic	novelGene_36522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1853	2170	1699021	1697806	TRUE	10	CTGGAACCTCGGTGCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMS	1716403	1612785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612925_1649492_1649843_1656034_1656207_1672795_1672896_1677513_1677608_1678130_1678201_1678754_1678882_1689334_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701340_1701981_1702201_1702542_1702642_1715188
925180	contig_12886_pilon	+	2331	2	Intergenic	novelGene_135472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGATACTTATTCTTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292000	307849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_294192_307709
925181	contig_6048_pilon	-	2559	2	Intergenic	novelGene_73303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATACAATATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2117675	2012242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2014785_2117658
925182	contig_4857_pilon	-	655	4	Intergenic	novelGene_48695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTAAAGGGTGAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143342	1137636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1137784_1139970_1140131_1141537_1141631_1143087
925183	contig_2799_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_85476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGAGCTGTCAATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457049	454665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_454700_457000
925184	contig_2646_pilon	+	2347	6	Intergenic	novelGene_69688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	7	junction_5	53.6939475173878	9	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	1597	2244	2341284	2351504	TRUE	30	TGAGAGACAACATCCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGFDLTAAQAFTVVTVFNSMTFALKVTPFSVKSLSEASVAIDRFKSLFLMEEVHMIKRKPAGPHIKIEMKNATLAWDSSHSSILNSPKLPPRTKKDKRAARGKRDKERQPRRVEHQAALAEQKGHLLLDSDERPSPEEEEGRHIHLGHLRLQRTLYNIDLDVEEGKLVGICGSVGSGKTSLISAILGQFKQFALRKKGCHGANGLLSREFIGV	2339687	2351805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2341317_2342053_2342162_2347129_2347487_2349544_2349617_2351426_2351526_2351723
925185	contig_4884_pilon	-	1492	1	Intergenic	novelGene_63799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTGTGATCCCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252311	250819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_250800_252300
925186	contig_15327_pilon	-	252	1	Intergenic	novelGene_70669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900688	900436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900400_900700
925187	contig_13409_pilon	+	1036	1	Intergenic	novelGene_128458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	166	471	114639	114944	NA	35	TGTCGCAAGACATATAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRSSLALGASRRAGTSGPKDMLCSWCCFLGGMRFPCVSACFSLLYLQRDWLKTLPNLVDFINITAANPPYYIIVIEFTTHKEITSDYKILDNHTILGIMA	114473	115509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13409_pilon_+_114500_115500
925188	contig_4924_pilon	-	4362	13	Intergenic	novelGene_84646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1137.92824356371	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	22	1356	252576	65524	TRUE	35	AAAACCTGTAGTTTCATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252597	60833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_62869_63149_64084_65486_65652_69049_69194_74641_74822_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
925189	contig_5902_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_178130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	504	818	59791	60105	NA	35	AAGTCAGAGGTGACTAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKELKKKFKPQVAILKASMGKILNDSGSIKRRWKEYTESLYHKELVYIQPFQKAACDQELMVLKEEVQGALKRMAKNKAPGTDGIPIEMFQQTDAALEVLTCLC	59287	61554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5902_pilon_+_59300_61600
925190	contig_5718_pilon	-	3322	2	Intergenic	novelGene_110414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATACAACTGATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1497704	1444871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1447773_1497283
925191	contig_8462_pilon	+	853	1	Intergenic	novelGene_159415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218222	219075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8462_pilon_+_218200_219100
925192	contig_10023_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_123492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214858	216684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_214900_216700
925193	contig_3747_pilon	+	1848	7	Intergenic	novelGene_24755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	336	1292	201313	204650	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTISNVS	200977	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203338_204633
925194	contig_14846_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_85383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAGAATGCTGACACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216422	217754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14846_pilon_+_216400_217800
925195	contig_2062_pilon	+	2916	2	Intergenic	novelGene_139019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGCACAGCTTCAAATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139397	1241780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_+_1140635_1240101
925196	contig_20610_pilon	-	2137	1	Intergenic	novelGene_67656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAGCTGAAAGAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113635	111498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_-_111500_113600
925197	contig_4876_pilon	+	1260	4	Intergenic	novelGene_137893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339674	343986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_340043_340860_340994_342555_342715_343386
925198	contig_18511_pilon	-	2754	3	Intergenic	novelGene_126854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCGGTTCCTGTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63418	30161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_-_31827_32273_32622_62677
925199	contig_14643_pilon	-	2208	6	Intergenic	novelGene_99117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	308.141136494302	56	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	300	788	29692	27111	FALSE	30	ATTATTTTGCTGAATTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGSSLQQLSCCLPDPTDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNETSNGYFLERSHSARMTLAKACELCPEEEPDDQDAPDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQRAQENYEGSEEVSPPQTKDQ	34633	25690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_27249_28761_28858_29238_29442_29640_29798_34352_34442_34528
925200	contig_7887_pilon	+	3019	1	Intergenic	novelGene_124863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGAAAACAGCAACAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154827	157846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_154800_157800
925202	contig_16125_pilon	-	3824	1	Intergenic	novelGene_155208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAAGTATTTCTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26319	22495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_22500_26300
925203	contig_10500_pilon	-	2579	8	Intergenic	novelGene_41245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	745.924163131117	4	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	182	1090	1640040	1629460	TRUE	40	TAAAGTGTATTATGATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640221	1626434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1626929_1628464_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
925204	contig_14326_pilon	+	2241	1	Intergenic	novelGene_120783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAATGGTCCCCACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870543	872784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_870500_872800
925205	contig_3424_pilon	-	2646	4	Intergenic	novelGene_55586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	136	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	872	1291	1146360	1144278	FALSE	10	GGCTCCAGCCGACCCCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTALRMQTALSWMRFRSSGLLLLLVFNLRDSVDRFQDFSNEVQRFSSRNQLLYGRVCVAHDDAEILQGQVSVLLHHGQAGTLAAPQGFVLSLEVGDLRLEQTDFLFQLQDVIFCLHSPFLVISSRFCSTCWTTDSRSR	1147231	1142922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_1144336_1144706_1144770_1145413_1145556_1146203
925206	contig_408_pilon	-	2329	2	Intergenic	novelGene_84913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1067	junction_1	0	1	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATAAAGCACTTTCATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136806	131341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133592_136727
925207	contig_10042_pilon	-	3350	1	Intergenic	novelGene_79128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	1804	2211	63546	63139	NA	65	AAAAAAAAAAAGTCTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAALEVLTYLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPTPKKGDPTQCRNYQTISLISHTSKILLKIIQKRLQQYTDRDLPEIQGGFRRGHETKDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVHHNKLWITL	65349	61999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_62000_65300
925208	contig_11338_pilon	-	3259	1	Intergenic	novelGene_6400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	190	630	313440	313000	NA	70	AAATAATAAAAAAAAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLKIFTNQFLQSEIDQTCNQHAWIITSDWNAKVGNKEEGLVVGKHGLGGRNDARDCMIEFCKTNNFFTANTIFTNINSNYTRGTCWLGYTGIKSTASVESDDGKAQHHQSEQARGRLRNRLSIAHKQIQLEAEENYNKSKRAKV	313629	310370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_310400_313600
925209	contig_8330_pilon	+	1464	1	Intergenic	novelGene_71947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGGTACCGAGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1418824	1420288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1418800_1420300
925210	contig_10734_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_51140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	46	522	865876	866352	NA	45	ATGGCTGAAATCAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAWSVGARCAVALPLMMVSAARWENRVRAATRAEASAGRQSRDQRAGSRTTLPWHHLPLPGGAVQVAGLTDSPCSPKAWALTPSILRMRKGNLGREDLPQSQSPRGTSRTHTGSVGPQALAPHRHLGSDSPTGTAGLGSGEVRGYLVSFLNRRCPLSRCYRLNCVPKKICCKS	865830	868514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_865800_868500
925211	contig_13453_pilon	-	3003	1	Intergenic	novelGene_146707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCAATTTTCTTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81188	78185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_78200_81200
925212	contig_4496_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_66647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	709865	708281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_708300_709900
925213	contig_9705_pilon	-	2747	1	Intergenic	novelGene_41723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAGGCTGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184008	181261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_181300_184000
925214	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
925215	contig_8375_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_141254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAACCCAGCAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_0_1600
925216	contig_1348_pilon	-	2698	1	Intergenic	novelGene_174375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1007	1375	611164	610796	NA	15	TCTTCCACTTTGTATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSVGKENGTGSIKRKWKEYTESLYQKELVDVLPFQKVVYDQEPMVLKEEVQAALKVLAKNKSPGIDRIPTEMFQQKDATLETLISAKKFERQLLGQPTGRDPYLRPFQRKMIQRNAEVIK	612170	609472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_609500_612200
925217	contig_6048_pilon	+	2216	10	Intergenic	novelGene_73176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	120.462073330618	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	698	2094	123	2216	1275218	1322985	FALSE	15	CAGGGTGCCAGCCCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLQSENATLRISNSDLSGPYSTNSISSQSPLQQSPDVNGMAPSPSQSESAGSASEGEEIDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNRLFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEPAQPSSASSSGNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALNPALKQEPLSQTDITILTPKLLSTSPMSSVSSYSPIAISLKKPSSAPDPSVSALPNPSAIKKEPQDATGPELPGATEAAQGVLRHVKNELGRSGVWKDHWWSTIQPERRNTTVSSEEMKVEEASSGKEKASSSQARAERNQLQGPSSSEYWKEWPNAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPIVPMSKPSKPSVPPLTPEQYEIYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVIQSVMSLHDPLLQGSVSSESTPKTSASCSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPPIETSKEGKPPEPSEPPASDSQPTTPLPLSGHSALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLTDNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCESPSVGIDYS	1273752	1322985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_1273810_1275152_1275519_1276690_1276757_1278059_1278162_1280997_1281831_1283686_1283853_1284466_1284524_1310375_1310679_1316005_1316195_1322908
925218	contig_5551_pilon	+	3155	2	Intergenic	novelGene_134224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGTTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198503	201829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_+_201150_201320
925219	contig_5258_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_100236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	701	1036	134364	134699	NA	55	CCTGAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTVWQFLKKLKIELPNNPAIPFLGLYPKDLKADIQKETCTQMFVAALFTIAKRWKQPKCPSTNEWINKMWYIHTMDYYPARRKNKVLIHATVWMELDDIMLSKIS	133663	135900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_133700_135900
925220	contig_9345_pilon	-	2275	2	Intergenic	novelGene_24447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATCTTCATCAGTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414512	406066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_407643_413813
925221	contig_13145_pilon	+	2004	8	Intergenic	novelGene_116627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1339.22735872866	3	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	32	748	35323	48861	TRUE	65	AGTAAAATAGTAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCEWTSAGRTMRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRQIRMMLI	35291	58547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37922_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48834_48895_57324
925222	contig_5302_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_81526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1190	1504	1494968	1495282	NA	40	TCAGGATTAATAGAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKREWHKLKLQQFVAYIMQGPSQMSLFCKPFFYQHAYINNLNRFFILSSFHAITVCTPLMHRSPYIFMFVYTSFLRALFFLFSTASDSTLMRGAQGERVRIKT	1493778	1496304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1493800_1496300
925223	contig_6137_pilon	-	2251	4	Intergenic	novelGene_59225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1324445	1312235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1313738_1319526_1319602_1321457_1321503_1323816
925224	contig_18283_pilon	+	3081	2	Intergenic	novelGene_170704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGCCCACCATCCAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76730	80079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_+_77341_77608
925225	contig_5605_pilon	-	2803	4	Intergenic	novelGene_143927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2216	2587	99421	99050	FALSE	45	ATCCTAACAAATTATGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNNAGNIKRRWKEYTESLYQKELVDIQSFQEIAYNQEPMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDRISVAMFQQIDATLEALPHLYQEIWKTVTRPAAWKRSIFVPISKKSDQTECRIIKRCH	269070	98833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_99713_120595_121135_235684_235695_267695
925226	contig_10500_pilon	-	2207	1	Intergenic	novelGene_41212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAACTTGATATAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1560665	1558458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1558500_1560700
925227	contig_17796_pilon	+	3643	3	Intergenic	novelGene_33826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	39	338	79636	79935	TRUE	40	GACGTAACAACATGCATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPGQGVQEASFMEFLAGERTPSNQRNMLSKPSPFCPVHHLHPLNRPYRATLARELPACHQPGFTPLHPQAPAIPFFFLFLFFLLSPFYLYLPPSPVPHLYPFPPSYATLP	79597	83895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_81679_82152_83542_83722
925228	contig_8330_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_71837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACCGGCAGCTTGCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857805	856527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_856558_856665_856755_856966
925229	contig_11855_pilon	-	1535	13	Intergenic	novelGene_66945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2120.49854430247	1	10	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	303	1493	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1091803	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090746_1091736
925230	contig_16632_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_154138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATCTCTTGTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98473	96132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16632_pilon_-_96100_98500
925231	contig_8063_pilon	+	2278	1	Intergenic	novelGene_152416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	373	687	46019	46333	NA	70	AAAAACAAACACACACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNTMDCQKNEQVCLGRSTARLLLGSKGGATSSHVLWTRCQEGPVLEKGIMLGKVEGQRKRGRPAMRWTDTVAATMGSSITTIVRMVQDRAVFLLLYTGSL	45646	47924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_+_45600_47900
925232	contig_10855_pilon	-	1802	3	Intergenic	novelGene_124399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	5.5	39	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	120	1463	1056307	1054079	FALSE	40	ACGTTAAGTGAGAGATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETFRNLTSVDDETPFKANESVSQQNIHENKISKEDKILKFRRNDSWASILGKIGEGLKVEDQHKNQGIPLRDYMVEKLCENNEVNLWGETVTQIPNLNLYKKTTTRVNPCECTECGKVFTSRSSFKRHITSHTGQKPYQCSQCGKGFSFPSELRRHVGIHSGERPYACELCWKTFFHVRSYQRHEKVHSKEKLYECKQCGSTFSFLKSFQRHERTHSKEKFNECKECGKVFKWPSSLTRHMRTHSREKPYECKQCGKAFKWPISLQTHMRTHTEDESYKCKRCGKAFIWPISLHTHKESHCGEKSYECKLCGKAFISPMYLQRHTRVHTVEKVHECNQCGKTFHWRCSLRNHLTTHSGAKPYECEDCGKAFRWHISLREHMRKHSGKIAYECKECGKAFSYLQSLRSHERTHSQEKLHECRQCGKAFIQLFYLRRRENSYWREAL	1056426	1053739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_1055205_1055621_1055806_1056273
925233	contig_10980_pilon	-	1995	2	Intergenic	novelGene_162571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTTTTTTTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360334	358298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_-_360000_360040
925234	contig_5302_pilon	-	2164	3	Intergenic	novelGene_81511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACACAGGGCAGCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413400	1304175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1304299_1364093_1364481_1411746
925235	contig_12837_pilon	-	2768	2	Intergenic	novelGene_57377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTTTTCTGTTTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370667	367817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_368920_369001
925238	contig_10765_pilon	-	1877	2	Intergenic	novelGene_122892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGAGTGTGGGCATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83707	81753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_82880_82956
925239	contig_10953_pilon	+	2048	8	Intergenic	novelGene_42583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	15622.6734104569	25	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	82	546	455261	461588	TRUE	30	AGATGCACTGGAACTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLVSGAIQVSLPAGLRELDASVALV	455179	465898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460438_461550_461639_463465_463529_463817_464866_465557
925240	contig_7843_pilon	-	2723	3	Intergenic	novelGene_152035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	2224	2700	450780	327480	FALSE	40	AATTGACTCCATCATAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKENQRIIDAFALWCCRRILNILWTARITKKSVLEKVQPECSLEARMARLCLTYFGHVIRRDQSLEKNVMLGKVGCHQKRGRPSKRWTDTVAATMGSSTTTIVRMAQDQAVFQSVVHKAAIESELTRQHLTTSAANQKVSSSNPPSAPWKPYGAVLL	453003	327456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_327558_435654_435959_450685
925241	contig_8138_pilon	+	2236	5	Intergenic	novelGene_52478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_1	466.402186958852	6	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	287	850	280633	306552	FALSE	10	CTTAGTAGTGGTGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCARDPIVRILGKGTVPRTCPVGLRSPIPVTRGSCGVKEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280346	307938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280750_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364
925242	contig_10523_pilon	+	2055	6	Intergenic	novelGene_120945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGAACCTGCCCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18804	67004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_19410_20180_21094_26575_26710_31049_31138_39162_39255_66781
925243	contig_6576_pilon	-	3188	1	Intergenic	novelGene_42252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTACTGTGTTTTAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316847	313659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_313700_316800
925244	contig_12116_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_167499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2853	1367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12116_pilon_-_1400_2900
925245	contig_1244_pilon	-	3450	22	Intergenic	novelGene_37898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2655	3146	127306	123541	TRUE	5	CCACCCGCCTTCCCCGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIPLRLLHLLWLTLGGENQTGAEGSYGSLPDGLFGVPHGHKYVVKEGLHLLEEEGGNADGQLTENQNRCMSPALVAVSTQPFQGSLHLKLHILSSKSVSCHGEAANGLGCHFHDNWVIGGEEVPKIVSKSADSGGIPTFHSYEAGYGQDATFPLIGIGAGD	162002	116945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_117016_119361_119537_123481_123591_124312_124547_126074_126272_127295_127433_133413_133688_133770_133880_137089_137279_138275_138402_139096_139345_140497_140713_141067_141275_143772_143896_144546_144637_144770_144863_145572_145709_145948_146081_147587_147841_156907_156997_161220_161387_161923
925246	contig_6509_pilon	+	3327	2	Intergenic	novelGene_145649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	211	315	156634	156738	TRUE	75	AAAAACAAAAACAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKENLQEEITKSIPFAIAPKKIKYLGRNLTRDVKDLYNENYKILPQETKRDLRKLKNIPCSWLGRLSIVKMSVLPKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNFI	156423	184533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_157088_181870
925247	contig_16722_pilon	+	2784	2	Intergenic	novelGene_118284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTGGGTTAAAATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97444	100547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_99782_100100
925248	contig_8138_pilon	-	1123	5	Intergenic	novelGene_52472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGAAGGGGAGGGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307938	280244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280331_288507_288614_304971_305096_306362_306863_307631
925249	contig_7536_pilon	+	3517	3	Intergenic	novelGene_178385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1546	1845	20573	20872	TRUE	30	GTATTTTAATAATTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEALIHGINRIQTITINTQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHYKSDKGLISIIFKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFT	3777	23112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7536_pilon_+_4815_20064_21391_21958
925250	contig_12677_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_110810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTTTTAGTATTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2742	2163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2700
925251	contig_4418_pilon	+	2002	2	Intergenic	novelGene_98381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAACTGACCCATAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	817944	822845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_+_819052_821950
925252	contig_6364_pilon	-	2431	4	Intergenic	novelGene_51786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.32049379893857	33	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	81	1469	1230691	1200993	FALSE	15	ACCCATTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGELVSFKDVTVEFTQEEWQQLDSAQRNLYRDVMLENYSNLVSVGYQSLKSDLIFLLKQEESLMEEGEISSWVYSDFDISPEIKELNPQKSISEEVTLRNIVYSIFEDWKLEIRSHQKNQDKFLSQDAFFNNKLLPEEIDYGCNARGKVVHLNRKSNEHIGAFMQKSHFLAQQKILSNEKPYKCIQCGKFFSGKSGLIVHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKSQLTVHQRTHTGEKPYECSECGKAFIKKSTLSIHQRAHTGEKPYECSECGKAFIRRSQLIEHHRIHTGEKPYRCNECGKAFSRKSKLNLHHRIHTGEKPFECSECKRAFIKKSDLIVHQRIHTGERRYQCSECGKAFIRSSQLIEHQRIHTGEKPYECSECRKAFIQKSQLIVHQRIHTGKKPFECSECGKAFRRKSHLTVHHRIHTGEKPYKCSDCGKTFSKKSTFIIHQRIHTEQKHF	1230771	1200030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1202156_1222020_1222114_1223628_1223756_1230685
925253	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
925254	contig_7357_pilon	-	1401	5	Intergenic	novelGene_36795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2593.97214711338	12	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	250	768	166824	136175	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMLILLTWLNILLTG	167073	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136217_154634_154721_154861_155079_159911_160034_166772
925255	contig_10316_pilon	-	1466	1	Intergenic	novelGene_179092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41333	39867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10316_pilon_-_39900_41300
925256	contig_12644_pilon	-	2019	1	Intergenic	novelGene_44514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGAATTGTGATGGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120230	1118211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1118200_1120200
925257	contig_6283_pilon	-	2786	15	Intergenic	novelGene_100213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	167.345923652969	517	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	89	1888	641399	611758	FALSE	20	CTTGTCATGAATCTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEYLSLVARLIIHFRDIHNKKSQASVSDPMNALQNLTGAPAAGATGINMAGRGPGQTLGGMGSLGAMGQPPPGTSGIAPHGMAVVSTATPQTQLQLQQVALQQQQQQFQQQQAALQQQQQFQAQQSAMQQQFQAVVQQQQQQLQQQQQQQQQQHLIKLHHQNQQQIQQQQQQLQRMAQLQLQQQQQQQQQALQAPPMQQSPMQQPQPPPTQALPQQLQQMHHPQHHQPPPPPPQQPPVAQNQPLQLPPQSVTSQAPALPGQMLYTQQQLKLVRAPMVVQQPQVQPQVQPQVQQQTAVQTPQAAQMVASGVQMITAAMAQGGMQVRARFPPSTAVSAAPPGALPTGGQPPAQVSQSSLPMLPAGSSQAEEQQYLDKLKQLSKYIEPLRRMINKIDKNEDRKKDLSKMKSLLDILTDPSKRCPLKTLQKCEIALEKLKNDMAVPTPPPPPVPPTKQQYLCQPLLDAVLANIRSPVFNHSLYRTFMPPMAAIHGPPITVPAVCTRKRKFEDDERQSIPNVLQGEVARLDSKFLVNLDPSHCSNNGTVHLICKLDDRDLPSVPPLELSVPADYPAQSPLWVDQQWQYDANPFLQSVYRCMTSRLLQLPDKHSVTALLNTWAQSVHQACLSNA	643997	610859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6283_pilon_-_611895_612525_612625_613035_613203_613269_613431_613720_613788_614873_614938_615007_615121_615637_615664_620765_620886_626387_626508_628015_628334_629452_629674_641212_641405_642229_642260_643944
925258	contig_14925_pilon	-	1740	3	Intergenic	novelGene_55359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2121	junction_2	77.5	10	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGTAAAAACAATATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115999	112257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_115208_115821
925259	scaffold_12124_pilon	+	1593	9	Intergenic	novelGene_22321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3481.86859854016	6	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	432	755	1484002	1496374	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPEQITAAKGRFPNKVTLTGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1483570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497114_1508859
925260	contig_14925_pilon	-	913	3	Intergenic	novelGene_55287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	336	10	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	164	304	112844	112704	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWERNSCDCGTKKSASNQTICFRNEKWDEGCLSGEGFLSQGYKKRVHVLLPKHEMFCPTQHHICPKLTFLSPHLVHVPPTTLELVMGGGIVPNFQPFWFS	129472	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112879_116007_116101_129436
925261	contig_10320_pilon	+	2819	2	Intergenic	novelGene_179093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	252	794	435802	436344	TRUE	60	TACACATCCAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKTLTTELKQIQREQQKKPTTTGKKEIVKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMRDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHSLPKLQQSGVENLNRPITREEIEKVLKILPTKKSPGPDGFTGEFYRTFTEELAPVLLKLFQSTEEEATLPNSFYEASIMLIPKPGKDITKKDNYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKNNIPRPSRIHTRYARMVQH	435550	469102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10320_pilon_+_437481_468213
925262	contig_13305_pilon	-	2126	2	Intergenic	novelGene_146783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTCAAAAAAAAAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238415	235511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13305_pilon_-_235726_236503
925263	contig_6915_pilon	+	3343	1	Intergenic	novelGene_162403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2293	2649	177275	177631	NA	0	TTCCCTTGTGTCTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSERRGRWREASEKSKEAEKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQPAPPGQETVAAGSGGTNEQKPWDPTSVAAQTGKQLHTRMEPCSPSGRSKDGAWSQALEQKEGEAERGK	174982	178325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_175000_178300
925264	contig_7730_pilon	-	1853	2	Intergenic	novelGene_156273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	80	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTAGTGGTAGCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175527	173158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_173342_173857
925265	contig_1032_pilon	-	450	1	Intergenic	novelGene_179094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACCACAATCAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111518	111068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1032_pilon_-_111100_111500
925266	contig_8167_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_155661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	413	784	163917	163546	NA	60	AAAAGACTGAAGAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFHCPPASDQWHTPSPPTRQLEVRSHAAPQVTSGMLQCCMLSNCDVLPHITCLATGSALPYPRQVTRGALSNQQVRAPDPPPSDQRECSHAHHSATGINASRTRQLPGQTSTSPYQQLPHTS	164329	162470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_162500_164300
925267	contig_8848_pilon	+	1100	2	Intergenic	novelGene_140464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	159	junction_1	0	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	6	482	93887	94942	FALSE	10	CCTGCCTTTCTACTCTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMEAEDSEKEAAEQEPREEQEEPEEEQAECSGKKRVVPGIVYLGHIPPRFRPLHVRNLLSAYGEVGRVFFQPEDGFVRRKKKAAAAATGAKKRSKYSKDYTEGWVEFRDKRVAKRVAASLHNTPMGARRRSPFRYDLWNLKVSRQACCRTHLPTSLPLP	93881	95560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8848_pilon_+_94104_94682
925268	contig_8552_pilon	+	1723	12	Intergenic	novelGene_80085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	102.750600730182	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	437	976	512086	517971	FALSE	20	GTGAATGTTTAGTTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQSPKRPRSPGSNSKVPEIEVTVEGPNNNSPQTSAVRAPTQTNGSNVPFKPRGREFSFEAWNAKITDLKQKVENLFNEKCGEALGLKQAVKVPFALFESFPEDFYVEGLPEGVPFRRPSTFGIPRLEKILRNKAKIKFIIKKPEMFETAIKESAASSKSPPRKLNSSPNVNTTASGVEDLNIIQVTIPDDDNERLSKVEKARQLREQVNDLFSRKFVPYRKITINPGCVVVDGMPPGVSFKAPSYLEISSMRRILDSAEFIKFTVIRPFPGLVINNQLADQSESEGPVIQESAEPSQLEVPTTEEIKDTDGSSQIKQEPDATW	501352	518718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_501430_509984_510087_510633_510700_511019_511204_512078_512138_512711_512793_513301_513386_513775_513927_515340_515370_516525_516568_517366_517409_517912
925269	contig_4103_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_51998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGTAGATCTTAGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218908	220492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_+_218900_220500
925270	contig_5189_pilon	-	1051	3	Intergenic	novelGene_34864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1090	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	3	329	218643	199152	FALSE	20	TACTTGTTTCAAGCTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDQCLESCRKIDFIVIGVREVRRENLSDCLFCLDDWF	218645	198429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199260_205717_205790_218496
925271	contig_7066_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_42130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACATGAAGAAAGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697112	696482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_696500_697100
925272	contig_17144_pilon	-	3621	14	Intergenic	novelGene_29352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	101	junction_9	2213.21115071137	10	123	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	328	858	179764	173705	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFNETGAPHTGDPGPQP	183409	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
925273	contig_12624_pilon	+	2531	12	Intergenic	novelGene_60960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	354.506524669233	2	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	94	543	11640	38981	TRUE	30	CTAGGAAAACTCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQWTDGRKRTDCPANSGRLTRETRTRSGRTMASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELVCMRIHLGETAQEASIFMQKLKSAAFLLRAGCCPGENKMWDLREQCLEAGTEP	6113	55581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_44521_44632_46682_46768_50396_50437_54975
925274	contig_4469_pilon	-	5308	2	Intergenic	novelGene_21910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATCAAGGCGAAGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459431	451593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_453997_456526
925275	contig_11978_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_62820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1187	1681	422865	422371	NA	30	GTATAGTTTAAGGAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSRNQGVEMGVAPLTITPNDPLAKFLLPVPTTLYSVGLEVLVSKGGILPPTDTSLIPLNWKLRMPYGHFGLLMLLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQGEIRLILHNGGIEEYVCNTGDPLGHLLVLPCPVIRVNGKLQQPNSDITTNGPDPSGMKVWVTPPGKEP	424051	421827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_421800_424100
925276	contig_8864_pilon	+	2156	1	Intergenic	novelGene_135979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCAAATGGAAGAAATGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115294	117450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_+_115300_117400
925277	contig_6738_pilon	+	3731	3	Intergenic	novelGene_166126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	550.5	5	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTCTCAGGCATGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32659	40580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_32756_36540_36701_37105
925278	contig_408_pilon	+	3698	1	Intergenic	novelGene_84928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTGCTATGGAGGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195368	199066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_+_195400_199100
925279	contig_9235_pilon	-	2874	1	Intergenic	novelGene_156231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1371	1709	46974	46636	NA	55	AAAAGAAAAGGGGGAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDVTGLHLAAHI	48344	45470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_45500_48300
925280	contig_12277_pilon	+	1653	14	Intergenic	novelGene_139682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	24	junction_1	180.564270057234	21	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	429	1287	366	1652	345203	408985	FALSE	25	TGCTAGATCCTTATTACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEYVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVVRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRPPSKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVASFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACAADSRSSGSKLSTRNSSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNASGAESLVIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHTVDRDQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKL	205262	408986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_205415_301713_301792_327600_327658_345124_345206_365884_365975_366373_366491_376158_376242_378464_378632_389514_389612_392066_392181_403868_404075_404651_404784_405794_405907_408819
925281	contig_9389_pilon	-	1790	1	Intergenic	novelGene_84125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGGACTGCTTCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1446106	1444316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1444300_1446100
925282	contig_21007_pilon	+	1304	2	Intergenic	novelGene_161533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	6	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	42	464	589	1011	FALSE	45	AATTTCTAAAAACTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	262	1851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
925283	contig_10424_pilon	-	2569	1	Intergenic	novelGene_56794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2169	2528	273127	272768	NA	40	AATAACTCAAAGACGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDAGSIKRRWKKYTQSLYQKELVDIQPFQEVGYDQEPIVRKEEVQAALKELVKNQAPSTDGIPIEIFQQTDATLEVPTHLFQEIWKTATWPTNWKRSISAPVPKKGDPTECGNY	275295	272726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_-_272700_275300
925284	contig_12113_pilon	+	908	1	Intergenic	novelGene_134756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334086	334994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_334100_335000
925286	contig_21315_pilon	+	1873	2	Intergenic	novelGene_151564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	34	519	9959	18296	FALSE	30	GCTATGAGTCAGAATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKEDIQRATKHMKRYSVSLAIREMQIKTTMRYHFTPPRMPKIIILKRLQQYIDRELPEIQARFRRRCGMRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKALDRVDHNKLWVTLQRIRIPEHLIALMRNLYTDQDAVIHTQQGDTVWFKVRKGVHQGCILSVCSANNQRSGTI	9925	19650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_10053_17904
925287	contig_17427_pilon	-	2452	12	Intergenic	novelGene_30310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1205.18925505327	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	64	1047	188879	179220	TRUE	20	TTCGTTGTTTACCTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKVILLICSLSSPR	204706	176947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179259_179702_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
925288	scaffold_15568_pilon	+	4005	2	Intergenic	novelGene_122572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCAGTTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25520	31006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_26031_27511
925289	contig_4989_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_160775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTCAAATCCTTTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9390	7616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_7600_9400
925290	contig_2341_pilon	+	2493	2	Intergenic	novelGene_84344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCTGGCTGAGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24108	113681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_26049_113128
925291	contig_8242_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_80208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCACCCAGTACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253657	254823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8242_pilon_+_253700_254800
925292	contig_10951_pilon	+	1596	11	Intergenic	novelGene_61620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	35.891642481224	22	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	420	1079	160598	209117	FALSE	20	GGACTGTACCTTTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPQGAQYKLLVTKIKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSIVSIQNLMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSFFIQEKENQTWNLQRTKNLKVTIVPSIKGSVYVKSILLSFLIFFSFYLGCLLVAFVHYVRFRRKSIDGRFCSSDDKIHLTSAMISLIQCLLLNLAC	130475	209634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_130664_159183_159306_160488_160660_186217_186264_189499_189602_190250_190335_193060_193149_194837_194910_195358_195453_202326_202371_209049
925293	contig_11720_pilon	-	1106	10	Intergenic	novelGene_43838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
925294	contig_9345_pilon	-	1302	2	Intergenic	novelGene_24713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGGGTGGCTGTGAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	996998	990133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_990698_996260
925295	contig_10078_pilon	-	2779	1	Intergenic	novelGene_159998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1115	1429	169606	169292	NA	15	GCCTTTGCTTTGATTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENADKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGIIEGLRSRFETVEDRISGSGDKHLDTTLFQKNSEKRTKKNEETLRIMWDTIKSKNL	170720	167941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10078_pilon_-_167900_170700
925296	contig_11594_pilon	+	3103	1	Intergenic	novelGene_80902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	878	1333	159867	160322	NA	50	AAAAAGGTCGAGAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKGYTRKLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLHINKENNEKEIRKTIPFIIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLQQKTQRDLHKWKNIPYSWIGRLNIVKMTILRKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIISFIWKGKKP	158989	162092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_159000_162100
925297	contig_1725_pilon	+	2494	17	Intergenic	novelGene_24279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	501.49769441145	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	35	1837	201480	252170	TRUE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNPQTNIMKPFQS	201445	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_252135_252265_252711_252779_255366
925298	contig_10212_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_179095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAGAGTGGCAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2170	2897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10212_pilon_+_2200_2900
925299	contig_15354_pilon	-	2493	9	Intergenic	novelGene_65766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGCGGCCGGGGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674202	663007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_663203_664556_664705_665956_666048_666460_666693_669381_669498_670619_670714_671428_671588_672203_672975_673515
925300	contig_9434_pilon	+	6016	21	Intergenic	novelGene_150484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	133	junction_6	223.652023241463	73	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	876	2631	3031	5661	85566	124169	FALSE	25	TACCAAGCTTCTGCAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEALAKLKEEEERQKREEEERIKRLEELEAKRKEEERLEQEKRERKKQKEKERKERLKKEGKLLTKSQREARARAEATLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKKKKKAQQLENKEVSEQIELSAAVEVVDQGAPDKEESAPPVDPEEEEETEDGGLDDWEAMASDEEREEEGTTVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEEEEESDEEEEEEGESEVSEGDEEGEKVSDDKDAGGTLDRRPSKDMSSESECDSDGDRTKEERTYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDKLRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLIIDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCPFIVALNKIDRLYDWKKSPDCDVAATLKKQKKNTRDEFEERAKAIIVEFAQQGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRLAHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQIRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKDVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKTSEVPYAGINIGPVHRKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMADSLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKMKILPQFIFNSRDPIVIGVTVEAGQVKQGTPLCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDVAKKGQEVCVKIEPIPGESPKMYGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRDEMQKSDWQLIVELKKVFEII	80949	124524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_+_83870_85455_85674_86041_86193_92818_92915_93398_93489_94724_94800_96554_96845_105004_105113_105302_105414_110424_110493_111072_111215_112811_112944_113366_113550_113685_113848_116496_116629_118289_118422_118503_118581_118683_118849_120465_120605_123554_123717_124061
925301	contig_10197_pilon	+	1600	1	Intergenic	novelGene_115182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTTTTGAAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458445	460045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_458400_460000
925302	contig_15720_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_41969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	331	786	307437	306982	NA	45	TCTCAGTAAAAACCAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	307767	306705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_307800
925303	contig_4659_pilon	-	2801	9	Intergenic	novelGene_118191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_8	71.1617874986288	6	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1618	2688	158021	143410	FALSE	25	TTCTTGTCCTAGATACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKSQDSDLKQYWMPDSQCKECYDCSEKFTTFRRRHHCRLCGQIFCSRCCNQEIPGKFMGYTGDLRACTYCRKIALSYAHSTDSNSIGEDLNALSDSACSVSVLDPSEPRTPVGSRKASRNIFLEDDLAWQSLIHPDSSNTALSAGLVSVQEDAGKSPARNRSASITNLSLDRSGSPMVPSYETSVSPQANRTYIRTETTEDERKILLDSVQLKDLWKKICHHSSGMEFQDHRYWLRTHPNCIVGKELVNWLIRNGHIATRAQAIAIGQAMVDGRWLDCVSHHDQLFRDEYALYRPLQSTEFSETPSPDSDSVNSVEGHSEPSWFKDIKFDDSDTEQIAEEGDDNLASEFNFLTF	162650	143296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_143584_144559_144672_145670_145829_147015_147155_150997_151088_152896_153105_157141_157314_158003_158123_161134
925304	contig_17976_pilon	+	1678	4	Intergenic	novelGene_32522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	6	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	167	541	41843	47764	FALSE	25	GGTTGAAGCCAATGAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQES	41676	48901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46737_47757
925305	contig_854_pilon	-	1483	1	Intergenic	novelGene_36389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAAGCCCAAGATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976276	974793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974800_976300
925306	contig_14666_pilon	+	988	5	Intergenic	novelGene_39622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1833.65270703042	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	42	326	477340	483865	TRUE	75	AATAAAAAAAAAAAAATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRGELRLGLGARMREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSR	477298	485234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483321_483861_483968_484674
925307	contig_1244_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_37921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAGTTAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289726	288166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_288200_289700
925308	contig_7444_pilon	+	3591	19	Intergenic	novelGene_174930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	85.2084046454469	49	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	904	2715	8	2722	194989	283746	FALSE	40	AAACAAACATTTTATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLDVLNKRLFWIQYNKEGGDSYIGSCDYDGGSFHLSKHLTQHNLLAISLFGDRIFYSTLKKKAIWIANKHTGKDMVKINLNASFAPPGEIKVVHPLVQPKAKGDAGESGQKLCKSKKGMCRDSVCRQEPKYHVCTCAEGYTLSQDRKYCEGNAQIILWNHGCALGCENTPGSYYCTCPVGFILLPDGKRCHQLDSCPSNASECSHDCVLTSDGPVCFCPEGSALEADGKTCSGCLLSDNGGCSQLCVPLSPLSWECGCFPGYELQLDKKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYEILLSQQMGMVFALDHDPVENKIYFADTALKCIQRVNLDGSKRERLIEDAVDVPEGLAIDWINRKLYWTDRGKSLIERSDLNGTQREIIINKDISQPRGIAVHPMAKRLFWTDMGINPRIESSSLQGSDRRVIATSDLVSPSGITIDYLTDKLYWCDAKQSVIEMAHLDGSERQRLAQNDVGHLFSVAVFEDHVWFSDWASPSVIRVNKRTGQNRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKPGSEADLSNQVTPLDTLSTSQAFEDNITEGLQSQYTLVAEIMVSDQDDCAPVRCGPHARCVSEGDNATCQCLRGFTDNGKLCSDIDECEKDITVCAVASSQCINTEGGYVCKCLEGYRVDGIHCIDTTPPSHLGKDDLHPVRHIYPGCPPSHDGYCLNGGLCMYIEQVDEYACNCIVGFIGDRCQHRELRWWQLRHAGPGRQQNITVVAVCVTGLVLLLLLALWGTRYYRNQKLLSKNPKNPYEESSKDMSSSRPTDSEMGLSSCPQPWFVVLKEHQDLKCGSQPVALKDVQAADVGQLSSLEPGSIQTTSYRKEPQVHGMDAEQSCWIPSSSNKTSGSQGIEKNLHLPFYVARPIAVGVEQPHSSPVS	194981	284615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7444_pilon_+_195114_195809_196013_210696_210840_212564_212671_216188_216312_217132_217259_218569_218707_221501_221651_228312_228418_229600_229825_236421_236590_241345_241475_246793_246911_247763_247890_253976_254122_258223_258392_263125_263244_278978_279085_283549
925309	contig_6589_pilon	+	360	4	Intergenic	novelGene_26133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4393.12106214553	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	86	346	1879768	1880585	FALSE	10	GTTATTCCTCACTGGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDRLKVFDGIPPPYDKVSLTRPYAKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1879532	1880599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879609_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
925310	contig_17144_pilon	-	1803	11	Intergenic	novelGene_29334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	195	1508	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLEPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183276	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166554_172693_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
925311	contig_3394_pilon	+	2265	1	Intergenic	novelGene_152673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	260	559	403360	403659	NA	35	TTGTTATTTGTAATAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNIAKNGNPRTLSCVRAEPAHRPRAIIRTEQRDTAWFKIRKGVRQGCILSPYLFSLYAEQIIRPDYMKKSTGSGLEEDSLTTCDMQMTQPCLLKVKRT	403100	405365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3394_pilon_+_403100_405400
925312	contig_9696_pilon	-	4107	2	Intergenic	novelGene_68774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	613	924	144915	144604	TRUE	75	ATAAAAAAAAATAAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVCKLLRPQALCIELGGRTEALNKLLGHLTGMSLNLQTREPNSMRHLVVQSSLSSYFFVVVVNTSFTQLLPIQLFTGIQLTEAVTVISCATLPLINVIFHHH	145527	141256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_144390_144553
925313	contig_5836_pilon	+	3606	4	Intergenic	novelGene_106268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1123	1566	1818	5366	TRUE	35	CACTATCTAGAATCCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRKQLEIKKINNKISELDDVIEGLRSRSETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVTGIPEQGDKTENTERIKYQLDSYTPVRRKMKRKSRKQYHLQ	695	11747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_2185_5289_5696_5930_6960_11065
925314	contig_4654_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_103052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417427	418198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_+_417400_418200
925315	contig_3747_pilon	+	2032	6	Intergenic	novelGene_24757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4134.29420336773	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	335	1084	201313	203804	FALSE	35	ATACAAGAACAGTTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200978	204752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_203045_203128_203228_203386_203498_203651_203768
925316	contig_5419_pilon	-	2616	1	Intergenic	novelGene_15545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTCCATGGTCCCCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448635	446019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_446000_448600
925318	contig_2067_pilon	-	818	1	Intergenic	novelGene_158929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTCAGTCTTCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598465	597647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2067_pilon_-_597600_598500
925319	contig_9955_pilon	-	2977	2	Intergenic	novelGene_21307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	161	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	1	297	49086	47592	FALSE	30	TTGTTAATAAATGCCATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKV	49086	44911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47597_48794
925320	contig_6710_pilon	-	531	1	Intergenic	novelGene_93787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2	325	653885	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653886	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
925321	contig_11574_pilon	-	2579	10	Intergenic	novelGene_64081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	308.147551637599	2	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1283	1981	451360	449890	FALSE	20	CATATTAGTTCTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463760	449291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454077_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_463675
925322	contig_14208_pilon	-	2357	1	Intergenic	novelGene_129111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGTTGAGTATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324229	321872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_321900_324200
925323	contig_500_pilon	-	3923	1	Intergenic	novelGene_30983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1912	2268	1472041	1471685	NA	70	GTACAATTAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLHIDQEAVVGTEQGDTACLKSGKMCQGCILSPYLFNLYAEPIIQEAGLYKEELGIRIGGRLTNNLICR	1473952	1470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_-_1470000_1474000
925324	contig_6192_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_170337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGAATGGGTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671499	670050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_-_670000_671500
925325	contig_7815_pilon	-	2866	7	Intergenic	novelGene_134358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	28.638067129066	29	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	13	906	390514	341486	TRUE	45	AGAAGCGAGCAGGCCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSEEMGLSGTQLTSFPDTFKSASLNERKDHSSERVVSKYVKRSSPESPGQDQGWMVLGHNEVGDPTSEGGSSQLEARISGSGWSAEAMEPASDPSPGKGYQTQVLGEVKPPESLVLEEASGLSSQSRKTKSRGGAGPDAVILQAVAHDNEWEMLSPQPSQKNMIPEAEVEEETEFLEPRKRKPRTNGLLSEDVGMDTPFEEGMLSPSAADMRPEPPNSLDLNGAHPQRIKLTAPNINLSLDQSEGSVLSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGHGKLPSWQGQSTMKSKRLTKWH	390526	142542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_142678_142800_142957_223657_223813_246758_247113_340325_341752_343747_343828_389966
925326	contig_6445_pilon	-	1543	16	Intergenic	novelGene_76945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	808.674405019309	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	520	1320	77905	43105	FALSE	45	AAAAAGATACATTAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96329	42881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_83585_83679_85287_85477_88146_88216_88473_88504_96266
925327	contig_11548_pilon	+	2641	10	Intergenic	novelGene_66729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1358	junction_4	757.555734819574	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1219	1809	112832	119638	FALSE	25	TCTGGAAACCATTACGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63629	120470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96222_101978_102575_112803_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
925328	contig_14637_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_114559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTATATTTAAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380736	377983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_378000_380700
925329	contig_12951_pilon	+	3343	1	Intergenic	novelGene_68230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1380	1724	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795225	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
925330	contig_4151_pilon	+	2650	1	Intergenic	novelGene_65281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCACCCAGAAATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660241	662891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_660200_662900
925331	contig_16934_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_132529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	42	129	246	374	183138	183010	NA	40	GTTTATAAGACTGTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDVQKTWRQKTKREEHTRLLKLKELKKKFKPQIAILKDSTGKIVNDSGSIQRRWKEYTKSLYQKELVDIQSFQEVAYKQEPMVLKEEVAAALKALAKNKTPGTDRVPVEMFQQTDAAVEVCTL	183383	181924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_-_181900_183400
925332	contig_6302_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_171717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGGAAAGCCAATGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591523	594324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_591500_594300
925333	contig_5280_pilon	+	2133	10	Intergenic	novelGene_52598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	720.538550300493	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	28	804	38343	47402	TRUE	0	TCTGTTTTTTGTTGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQGKTNVQNHQKLTMEKFERNSTIMYMDNL	38315	79509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42999_47326_47508_56218_56333_62043_62065_78042_78826_79203
925334	contig_11681_pilon	+	3090	2	Intergenic	novelGene_102988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1670	2224	211878	212696	FALSE	80	AAAATAAAGAAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLHIDQGAVVQTEQEDTAWFKVRKSVHQGCILSPYLFNLYVEQIIQAAGPYKEEWGIRIGRRLINNLRYADDTTLLAEREENLKHLLMKIKDHSLQYGLHVNIKKTKILATGPISNIKINREKIEIVKDFILLGSTINKSVLEEVQPECSLEARMVKLSLTYLGHVIRRDQSLEKDIMEKVK	210208	213562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_+_212291_212554
925335	contig_4364_pilon	+	1367	1	Intergenic	novelGene_4569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGTAATTAATCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1744394	1745761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1744400_1745800
925336	contig_13456_pilon	+	2334	5	Intergenic	novelGene_153324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.866025403784439	10	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGAAATTTTTGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691707	698428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_691786_693403_693833_694499_694852_696223_697065_697794
925337	contig_2332_pilon	-	1999	2	Intergenic	novelGene_58705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_1	0	22	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGTGGAGTATGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746395	743894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_745863_746364
925338	contig_5799_pilon	-	1782	1	Intergenic	novelGene_50247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	520	840	170855	170535	NA	70	TAAGATATACCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQESSKENGRKTQSLYQKELVDVQPFQEVAYDQGLMILKEEVQAALKALAKNKSPRIDRIPIEMFWQMDAVLEALTHLCQEIWKTASYLANQLKETHIFAHSRER	171374	169592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_169600_171400
925339	contig_2863_pilon	+	2181	2	Intergenic	novelGene_174057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAATTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	7556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_+_157_5531
925340	contig_4857_pilon	-	997	1	Intergenic	novelGene_48743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTTTCTTTGTTCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1196717	1195720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1195700_1196700
925341	contig_5947_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_101571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	800087	798845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_798800_800100
925342	contig_5936_pilon	-	1952	1	Intergenic	novelGene_53550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGATGAAGTGAGAATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100419	98467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_98500_100400
925343	contig_5575_pilon	-	6625	21	Intergenic	novelGene_122058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_20	70.3009779448337	236	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1399	4200	78	4277	224707	136639	TRUE	20	TGTAATTCCTGTCATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLGDSSSDPANPDSHKRKGSPCDTLASSTEKRRREQENKYLEELAELLSANISDIDSLSVKPDKCKILKKTVDQIQLMKRMEQEKSTTDDDVQKSDISSSSQGVIEKESLGPLLLEALDGFFFVVNCEGRIVFVSENVTSYLGYNQEELMNTSVYSILHVGDHAEFVKNLLPKSLVNGVPWPQEATRRNSHTFNCRMLIHPPDEPGTENQEACQRYEVMQCFTVSQPKSIQEDGEDFQSCLICIARRLPRPPAITGVESFMTKQDTTGKIISIDTSSLRAAGRTGWEDLVRKCIYAFFQPQGREPSYARQLFQEVMTRGTASSPSYRFILNDGTMLSAHTKCKLCYPQTPDMQPFIMGIHIIDREHSGLSPQDDTNSGMSIPRVNPSVNPSISPAHTVVRSSTLPPSSSNMVSTRVNRQQSSDLHNSSHSNSSNSQGSFGCSPGNQIVASVALNQGQAGSQSSNPSLNLNNSSIEGTGITLAQFMSPRRQVSSGLATRPRRPNNSFSPNIPPLSSPVGMTNSACNNSNRSYSNIPVTSLQGMNEGPNNSVSFSASSPVLRQMSSQNSPSRLNIQPTKAESRDNKEITSILNEMIQSDNSSSDGKPLDSGLLHNNDRLSDGDNKYSQTSHKLVQLLTTTAEQQLRHADIDTSCKDVLSCTGTSSSASGNSSSGSCPSSHSSLTERHKILHRLLQEGSPSDITTLSVEPDKKDNASTSVSVTGQVQGNSSVKLELDTSKKKESKDHQLLRYLLDKDEKDLRSTPNLSLDDVKVKVEKKEQMDPCNTNPTPVTKPAPEEVKLESQSQFTADLDQFDQLLPTLEKAAQLPGLCETDRMDSAVTSVPIKSEILPTSLQSTTARPTTRLNRLPELELEAIDNQFGQQGTGDQIPWANNAVAAVNQNKPEDQCISSQLDELLCPPTTVEGRNDEKALLEQLVSFLSGKDETELAELDRALGIDKLVQGGGLDVLSERFPPQQATPPLMMEERPNLYSQPYSSPSPTANLPSPFQGMVRQKPSLGTVPVQVTPPRGAFSPGMGMQPRQTLNRPPAAPNQLRLQLQQRLQGQQQLIHQNRQAILNQFAAAAPVGINMRSGMQQQIAPQPPLNAQMLAQRQRELYSQQHRQRQLIQQQRAMLMRQQSFGNNLPPSSGLPVQMGNPRLPQGAPQQFPYPPNYGTNPGTPPASTSPFSQLAANPETSLANRSSMVNRGMTGNMGGQFGTGISPQMQQNVFQYPGSGMVSQGEANFAPSLSPGSSMVQMPIPPPQSSLLQQTPPTSGYQPPDMKAWQQGAMGNSNVFSQAVQNQPTPAQPGVYNNMSITVSMAGGNTNVQNMNPMMGQMQMSSLQMQGMNTICPEQMNDPALRHTGLYCNQLSSTDLLKTETDGTQDKKTEEFFSVVTTD	249104	134205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_-_136542_136626_136684_140380_140471_151566_151751_157546_157722_167134_167538_169852_169955_173394_173710_174858_175028_176688_176807_185356_185538_187907_189229_190504_190653_197995_198137_202517_202614_203838_204019_207723_207902_216141_216240_220144_220312_224618_224725_249044
925344	contig_15047_pilon	-	4535	1	Intergenic	novelGene_52273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	800	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3331	3630	6719	6420	NA	35	ACCCAAGGTCGAGAAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTTRWCLATTTDCSDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNAHKKDRIYWLKGDWRNPENMAPRHPFSSLGKSLPRFTFQPGSGQPHKTKRD	10049	5514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_5500_10000
925345	contig_5084_pilon	+	2902	18	Intergenic	novelGene_64656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_12	202.544369097951	25	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	646	2310	1475752	1485462	FALSE	20	CCAAGCTCTCACCCAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNAPRSTFLDKILVKLKMQLNPEGKIPVKNFFQLFPADRKRVESALSACHLPKGKNDAINPEDFPESVYKSFLMSLCPRPEIDEIFTSYHAKAKPYMTKEHLTKFINQKQRDPRLNSLLFPPAQPDQVQGLIDKYEPSGINVQRGQLSPEGMVWFLCGPENSVLAQDKLLLHQDMTQPLNHYFINSSHNTYLTGSQFSGLSSAEMYRQVLLSGCRCVELDCWKGKPPDEEPIITHGFTMTTDIFFKEAIEAIAESAFKTSPYPVILSFENHVDSPRQQAKMAEYCRTMFGDTLLTEPLEKFPLKPGTPLPSPEDLRGKILIKNKKNQFSGPICPSKEPGEAEGSCPPKVSLGSKDTVWTGEEGAELEDEEVGEEEEEESGSLDEEEIKKMQSDEGTAGLEVTAYEEMSSLVNYIQPTKFISFEFASQKNRSYVISSFTELKAYDLLSKAAVQFVDYNKRQMSRIYPKGTRVDSSNYMPQMFWNVGCQMVALNFQTMDLPMQQNMALFEFNGQSGYLLKHEFMRLPDKQFNPFSVDRLDVVVATTLSITARPRG	1470579	1486054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_1470773_1474040_1474119_1474778_1474848_1475446_1475790_1475874_1475929_1476035_1476112_1480066_1480168_1480326_1480494_1480580_1480728_1480909_1481068_1481337_1481421_1481689_1481775_1482386_1482550_1482687_1482801_1482927_1483025_1484420_1484506_1484645_1484771_1485289
925346	contig_10143_pilon	+	1120	1	Intergenic	novelGene_163334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAGAAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133207	134327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_133200_134300
925347	contig_6445_pilon	-	1489	7	Intergenic	novelGene_76896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	792.296381132437	11	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1008	1412	88578	42950	FALSE	10	CATTAGCCTTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGILGAPDPSFVPCPP	96339	42872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_42996_85291_85477_88146_88216_88473_88594_89993_90107_91007_91854_96306
925348	contig_7272_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_25378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCAATCCCTGCAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	678714	681142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_678700_681100
925349	contig_854_pilon	+	1027	1	Intergenic	novelGene_36743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTAAGGAAACAAACTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715150	1716177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715200_1716200
925350	contig_5988_pilon	+	2888	11	Intergenic	novelGene_16083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1951.21996709751	9	104	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	506	853	1221749	1224777	TRUE	10	CTTAACCTTTTTTCTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209868	1226928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221653_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225073_1225188
925352	contig_17897_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_153394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTTGCGAGCTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12599	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17897_pilon_-_11300_12600
925353	contig_18506_pilon	-	4156	2	Intergenic	novelGene_67954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTGTATTTTCACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19188	14634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_-_17942_18339
925354	contig_9484_pilon	+	1778	10	Intergenic	novelGene_105616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	527.82951793169	3	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	715	1635	100737	104965	FALSE	15	TTTTCTGTAGTTAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVNAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95789	105108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103378_104296_104412_104883
925355	contig_15449_pilon	+	4008	18	Intergenic	novelGene_33569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	832.288694257128	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	821	2466	374	2839	37166	51815	TRUE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTKIQVKMQMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	12848	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_12884_14474_14552_15759_15842_36986_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45071_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_50962_51179_51221_51330_51809_51932_54570
925356	contig_20165_pilon	-	748	1	Intergenic	novelGene_54482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTAATATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73617	72869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_72900_73600
925357	contig_3627_pilon	+	2664	18	Intergenic	novelGene_78439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	328.003217555322	1	118	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	219	1796	294394	314208	TRUE	40	ATCAGGCGATGATAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQW	292735	323633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304586_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314209_314941_315154_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439
925358	contig_299_pilon	+	1817	1	Intergenic	novelGene_129513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGATTGCTGACTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1693250	1695067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1693200_1695100
925359	contig_16775_pilon	-	2588	1	Intergenic	novelGene_107785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150634	148046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_148000_150600
925360	contig_11855_pilon	-	1747	1	Intergenic	novelGene_66884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGAGTGGAATTGCTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608116	606369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_606400_608100
925361	contig_3153_pilon	-	1278	1	Intergenic	novelGene_104678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTTGCAGCTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226288	225010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_225000_226300
925362	contig_9463_pilon	+	1668	1	Intergenic	novelGene_83814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCTGTAGTCTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39071	40739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_+_39100_40700
925363	contig_7976_pilon	-	4538	5	Intergenic	novelGene_169409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	217.716989461089	400	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	26	526	791584	763953	FALSE	5	GCTCATTGTTTCCTCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGQTEESDMNKRRRKGFNNLDEPSCFSSRSVGPNQECVSIKEGGNQNKVKSIANQLLAKFEESTLNPSLLKQDCMRKVCPLNLGGSDTCYFCKKRVYLMERLSAEGHFFHRDCFRCSICATTLRLAAYAFDCDEDKFYCKPHFIHCKTNNKQRKRRAELKLLVETLPPKVLVQP	791609	759940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_764002_766986_767060_768542_768730_787569_787720_791542
925364	contig_6503_pilon	+	732	1	Intergenic	novelGene_145794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917580	918312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_+_917600_918300
925366	contig_12098_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_160663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCACAGATGAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98445	95238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_95200_98400
925367	contig_7327_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_172128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	890	1240	195430	195780	NA	15	ATCCTGAGCATGTTCTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTAECLCIGNKTQVNIFLEFSAFNQDPSDPSDISNDIPCSTSSPESSLNFWQFPVNVLLQPFFNNLQKNFLLTLKLMISFNNFCILLHHHSLEWGQIWISSSRLASSCLPNFLA	194540	196594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7327_pilon_+_194500_196600
925368	contig_15500_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_128989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229116	230753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_+_229100_230800
925369	contig_16210_pilon	-	2444	1	Intergenic	novelGene_147673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTTAAAGAAAAATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52512	50068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_-_50100_52500
925370	contig_709_pilon	+	1009	1	Intergenic	novelGene_57640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAATAAAAAGGCTAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2997967	2998976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2998000_2999000
925371	contig_17194_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_155367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGGGGCATCAAATAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157561	156409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_156400_157600
925372	contig_8616_pilon	+	2649	3	Intergenic	novelGene_72610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	762	2289	17	2305	462681	466105	FALSE	40	AAGGAGATTATGATGTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APEFSMGHKGSKPGLTIGANIQAPQLEVSAPSTSIEGFVGKLKGPQITGPSLEGDIGLKGAKPQGSIGVDISAPKVEGSITGPSVEVQAPDVNVHGAGGKLNMPKMKVPKFSLSGSKGEGAGIDVTLPEGEVTLPGVSGDVSLPEVALGGLEGKVKGTKVKTPEMIIQKPKISMQDVDLSLKSPELKGDIKISAPGIQGDVKGPQVAVKGPQVDIEAPSLEGAKLSGPSGKTGTCRISMADVDLNVAAPKVKGGVDVTLPKVEGKVKVPGVDVTGPKVDVSAPDVEVHGPEWNLNMPKMKMPKFRAPGVKGEGPELDVNLPKENVSIAGPKVSVEAPNVNIEGLGGRLEGSDIKLPEVSVKTSKISVPDLDLHVKGTKVKGEYDVTVPKLEGELKGPKVDIDAPDVDVHGRDWHLKMPKMKMPKFSVPGFKAEGPEVDVNLPKADVDVSASKVNVEVPDVNIEGPEGKLKGPKFKMPVMNIKAPEISIPDVDLHMKGPKVKGEYDVTVPKLEGELKEPNVDISAPDVEIHGPDWNLKMPKMKMPKFSMPSLKGEGPEVDVNLPKADVDISGPKLDISAPDVSFEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKMSLPGVDPDLKGPKMKGNLDVSAPKVEGEMKVPDVDIKGPKVDIKAPDVDVQGPDWSLKMPKMKMPKFSMPSFKAEGPELDVNLPKADIDVSVPKVDIDAPDVSLEGPEGKLKGPKFKMPEMHFKAPKISMPDADLNLKGPRVKGDVDVSVPKIEGTQVRR	462664	466449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_+_463974_464357_465334_466085
925373	contig_11335_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_104915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	157	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGCAAATTCACAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331232	329004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11335_pilon_-_329000_331200
925374	contig_6501_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_150575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACTTATGTCACTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294473	296095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6501_pilon_+_294500_296100
925375	contig_7513_pilon	-	2765	17	Intergenic	novelGene_88952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	82.3473730227625	9	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	1292	2257	163991	146476	FALSE	85	AAAAGAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKISRDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVHQQMPSPSVTASIEHETSFILLDSPFSRMPFVPDFKLGF	185702	145967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_146595_147047_147151_147983_148086_152144_152280_154232_154428_155879_155912_161074_161260_163896_164031_164682_164807_164928_165049_166132_166281_167532_167621_168455_168591_169675_169813_170655_170838_176153_176275_185505
925376	contig_11845_pilon	+	1484	1	Intergenic	novelGene_148145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43984	45468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11845_pilon_+_44000_45500
925377	contig_18916_pilon	+	1478	1	Intergenic	novelGene_136881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGACGGGGAGATATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62777	64255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18916_pilon_+_62800_64300
925379	scaffold_21177_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_145489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATATTGTATGATTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190595	191282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_190600_191300
925380	contig_7272_pilon	-	3015	1	Intergenic	novelGene_25307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGCAAATTGTACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444530	441515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_441500_444500
925381	contig_12812_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_178639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1152	1517	3770	3405	NA	65	GGAAAAAGAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGSSSAFSSTRESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	4921	2676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12812_pilon_-_2700_4900
925382	contig_6842_pilon	+	2181	1	Intergenic	novelGene_130683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAAATCCTTAATCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348661	350842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_348700_350800
925383	contig_4742_pilon	-	2249	1	Intergenic	novelGene_130997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGAGGCGAGATGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218373	216124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4742_pilon_-_216100_218400
925384	contig_610_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_76691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104122	105753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_104100_105800
925385	contig_4496_pilon	+	551	4	Intergenic	novelGene_66686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	371	junction_2	36.4264860903284	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	447	103	549	911702	952512	FALSE	30	GAAGATTCATACTGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRH	911599	952514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_911831_941359_941486_951023_951148_952444
925386	contig_5341_pilon	-	796	2	Intergenic	novelGene_168007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340877	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338476_340752
925387	contig_5690_pilon	-	5736	19	Intergenic	novelGene_119709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1785	2102	961571	961254	TRUE	15	CGAGGCCGCGCTCTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLSCELQEKEDGVTNSTLGFHTPSLDQDHYPQGKGLSRGPLAKLEFLCSSLMVPRRISQDGIFELCNFMSHTKKPSKLHLKQILPSNLLKLDRSSPLAFSWKL	963355	941171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_941194_942384_942424_946169_946260_946597_946717_947523_947605_949480_949641_949756_949857_950056_950168_951056_951256_951461_951590_952104_952219_952699_952894_953128_953314_953392_953571_953685_953834_957589_958995_960427_960537_960782_960870_961088
925388	contig_8712_pilon	+	1859	3	Intergenic	novelGene_58818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.5	6	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	27	386	315133	321793	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAERPCLSCPLPPVAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	315106	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_318025_318222_321684
925389	contig_9363_pilon	-	1728	3	Intergenic	novelGene_6774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTGCATATATCTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1522804	1505362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1505639_1505737_1505862_1521476
925390	contig_8587_pilon	+	1661	1	Intergenic	novelGene_159101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACTAAGCAGAGAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88160	89821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_88200_89800
925391	contig_4068_pilon	-	2671	3	Intergenic	novelGene_161696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	142	junction_1	29	16	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	633	2038	2670	29216	26532	FALSE	30	CTTATCTTCAAATATATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSECENAWFFVHKKYSYIHLYLHFLPDTDSVSLLKIQDAILSYERLVELKKNHCELLTGKIKKMENKVSGLQKELSETKEIKSQLEHQKVEWEREICGLRFTLKQEEEKRRNADMLYEKIREQLRRKEEQYSKEVGMKQQLELTLRTLDMELRTVRNNLNQVVEERNDTQRQLSREQNARMLQDGILTSHLSKRKEIEMAQKKMMQNSEVF	31253	26530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_26682_27264_27449_28917
925392	contig_4418_pilon	-	1311	3	Intergenic	novelGene_98365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	10	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	704	1024	753842	753522	FALSE	50	TAAGTGGTAGAAAATAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCINCLMRNYLFCKPSSKVQFKKKKYFTMRLEEFSGAQLPLLNNLIKNSDQKEEKARAEFQILMDFRLSGAMEAGRTPETIALRQSLNLKPKISSEISLKPNKSLA	759414	753234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4418_pilon_-_754272_757486_757607_759260
925393	contig_10082_pilon	+	717	1	Intergenic	novelGene_63850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGATAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129801	130518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_129800_130500
925394	contig_11253_pilon	-	1606	1	Intergenic	novelGene_126816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGATCATGAAAAGACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31955	30349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_30300_32000
925395	contig_12479_pilon	+	4773	8	Intergenic	novelGene_56875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	405	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	74	412	504682	505020	TRUE	65	TTTTTAAAAAACAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLSKVAGNFACTAVSEVTANVLWTLFSLCPQFLPLPLLSLIKIHSKSRSIIRANLNSLSLTWSGHTVAKLSGPSSFLGLLLPLHVTTSGDVFTLTYRIHSTSTTSLHSS	504608	538144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_507970_512518_512716_514756_514823_516362_516623_518255_518338_531547_531638_535587_535932_537771
925396	contig_1863_pilon	+	3180	1	Intergenic	novelGene_156526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTGTAGAAAGGTGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55060	58240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_+_55100_58200
925397	contig_3521_pilon	-	1789	1	Intergenic	novelGene_165752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	158	469	37127	36816	NA	75	ACAGAAAAAAAAAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFKKIEYLGINLTRDVKDLYNENYKTLLKEIKELNKQKDVSCSWTGRLNIVKMSILPKAIYRFSAIPIKIPTSFFTEIGKPILNFIWNGKRPRIAKAMLKDKNKVGGLTFTDFKTYYTATVIKTAWYWYNNRHTEQWKRTEESRNKPTHLQSNDF	37284	35495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3521_pilon_-_35500_37300
925398	contig_9972_pilon	-	2138	1	Intergenic	novelGene_162793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270208	268070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_-_268100_270200
925399	contig_6740_pilon	-	1598	1	Intergenic	novelGene_142712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	803	1165	688089	687727	NA	60	GAAATGATGAAGTAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRQKEHFKIYPEVQHVSDRIMSIHLQGRPVNTTIIQIYIPTTKAKDEEIEDFYQLLQSETDHTCSQDALIITGDWNVKVGNKEESVVEKCGLGDRSDARDRMIEFCKTSDFFIANTFFQ	688891	687293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_687300_688900
925400	scaffold_12124_pilon	+	1794	9	Intergenic	novelGene_22102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_1	159.758411359152	6	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	310	645	867290	877161	TRUE	50	TATGGAAAATAACATTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPDGKPGGQLRKI	863146	884404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_863427_867260_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677
925401	contig_12709_pilon	+	1028	2	Intergenic	novelGene_147422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	102	467	151141	151506	TRUE	25	TTGCTGGATATAGAAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	151039	154905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_151884_154721
925402	scaffold_9100_pilon	+	1522	9	Intergenic	novelGene_83249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	480.139807113511	4	26	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	100	1098	647136	654304	TRUE	30	GTGACAACTCTGTTAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644840	654846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139_654464_654581
925403	contig_15666_pilon	-	2271	6	Intergenic	novelGene_70129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	133	junction_4	604.172359513409	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	187	1116	110619	107816	FALSE	35	TTAAGATACATTTAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110805	106660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110246_110558
925404	contig_6058_pilon	+	1246	2	Intergenic	novelGene_172421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395078	398570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_+_395736_397981
925405	contig_5770_pilon	+	1920	2	Intergenic	novelGene_74147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74032	77478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_75868_77393
925406	contig_2940_pilon	-	509	4	Intergenic	novelGene_81934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4233	junction_3	6336.9463203239	8	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	50	457	722201	717705	FALSE	20	TATCTGGTATGTTTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGRCLQRWRPSPIGTMAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVHSVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE	723512	717652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_717835_720771_720954_722105_722207_723468
925407	contig_1867_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_54524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GCATAAAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216228	214220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_214200_216200
925408	contig_11304_pilon	+	1866	7	Intergenic	novelGene_156724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.296727041213	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1149	717	1865	485606	491266	FALSE	40	CACCCAGCAAAACCATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKSFDEKKVPKRRSRNLAVEQRLRRLQDRSHTQPVTTEEVVIAATLQASAHQKALARDQANEGKDSAEQGEPDSSTLSLAEKLALFNKLSQPVSKAISTRNRIDTRQRRTNARYQTQPVTLGEVEQVQNGKLVPFAPTVNTSVSTVAPTVTPMYVGDLRAKPSIDDHTSAIDYKLPSSIDNSDSPVRSILKSQAWQPPVEDGGNKGTLKVFGEAESKQVLSSGYSWARKYESFEEAEPSYPVLSRVRGGDSLKEPKYAIPRKGSMELASPSIAHLCDELKEFSTAESSAPGDQDLEDRRPFEEKVEMEDVRRSEFSLRAELGEPTCEQTDTVAGKAAAPAATPMSCKQPDSGEQAQEKLYKNPCAMFAAGEIKAPMVEGILD	457858	491267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_458483_484423_484451_485228_485291_485602_485743_488982_489227_489663_490241_491075
925409	contig_5261_pilon	+	3103	1	Intergenic	novelGene_102485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	739634	742737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_739600_742700
925410	contig_14744_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_65978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATTTAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	930465	928757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_928800_930500
925411	contig_14566_pilon	+	1266	9	Intergenic	novelGene_148834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	318.201194215232	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	399	791	88884	94974	TRUE	50	GGAAATCAATAGGAATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDKCEEKMHLLLLVSFLCCSAMWGPNVISGPEGNSLTVLCHYDPGWETHYKWWCRGAVWSSCKILVKTTGSEQEVKEGHVSIRDNHKQRIFTVTIEKVTEDDADLYWCGIERVGTDLGVLVKVSIDSVP	66751	125227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14566_pilon_+_66856_70344_70518_88762_88939_90606_90937_94966_95056_99199_99308_108219_108313_118470_118579_125142
925412	contig_3269_pilon	-	5779	1	Intergenic	novelGene_117027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1597	1899	153189	152887	NA	35	CTTTGCAATGTAGGTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCHALEACKCWGLGGANMIRSLEGGGREVGKSHRGGHSHASLVGMVVRPETCPKGPVFLPTQDSWALSATLLNSGVRGRAESCWENSSQEVSSHTGIPD	154785	149006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_149000_154800
925413	contig_13494_pilon	+	2950	11	Intergenic	novelGene_167511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2381	2719	45198	58467	TRUE	20	GGCGGCGGCAGGGACGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYAITKAALLEIPAFPWTRTFPPVCKLPSINSLVIGKKRIIFSTGLSAISKTKYLNNCWKFGLIKFASIFCLMHIMWVIPCFCSIGSLLFIAEEYGPKNNPGKISCISRLIG	27317	84187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_29502_32995_33088_41545_41623_45170_45222_45317_45357_48685_48724_49145_49207_51817_51916_55521_55575_58441_58475_83963
925414	contig_854_pilon	+	1676	3	Intergenic	novelGene_36500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1236.5	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	175	654	1649514	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612771	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649802_1715191
925415	contig_2854_pilon	+	3674	4	Intergenic	novelGene_120818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	972	1568	127824	224784	TRUE	15	CTAGGAGGTGTGTGTCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKIEVVKDFILLGSIINAYGSRSQEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQAMVFSVVSYVCESWTMNKEDRRRMDAFELTVLVKNIEYTMDCQENKQICLGRSIARMLLRSETFCLVYFRHVIKRDQSLQKDIMLGKVEGQRKRGRPSTRWTDTVAAAVGSNIAMIVRMVHCRAVFCCALSRSES	126638	226930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_127446_127659_128019_224382_226327_226366
925416	contig_12790_pilon	-	5297	25	Intergenic	novelGene_35187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	55	junction_2	177.806699036404	29	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1312	3939	366	4304	242434	141301	FALSE	15	CGGCCTGGGGGCCTCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRIEKMSILGVRSFGIEDKDKQIITFFSPLTILVGPNGAGKTTIIECLKYVCTGDFPPGTKGNTFVHDPKVAQETDVRAQIRLQFRDVNGELLAVQRSMVCTQKSKKTEFKTLEGVITRTKHGEKVSLSSKCAEIDREMISSLGVSKSVLNNVIFCHQEDSNWPLSEGKALKQKFDEIFSATRYIKALETLRQVRQTQGQKVKECQTELKYLKQNKEKACEIRDQITNKEAQLTSSKEIVKSYENELDPLKNRLKEIEQNLSKIMRLDNEIKALESRKKQMEKDNSELEQKMEKVFQGTDEQLNDLYHNHQRTVREKERRLVDCQRELEKLNKESRLLNQEKSELLVEQGRLQLQADRYQEHIRARDSLIRSLATQLELDGFERGPFSERQIKNFHKLVRERQEREVETANQLMNDFAEKETLKQKQIDEIRDKKIGLGRMIELKSEILSKKQNELKNVKYELQQLEGSSDRILELDQELTKAERELSKAEKNSSVETLKTEVISLQNEKADLDRTLRKLDQEMEQLNHHTTTRTQMEMLTKDKADKDEQIRKIKSRHSDELTSLLGYFPNKKQLEDWLHSKSKEINQTRDRLAKLNKELASAEQNKNHINNELKRKEEQLSSYEDKLFDVCGSQDFESDLDRLKEEIEKSSKQRAMLAGATAVYSQFITQLTDENQSCCPVCQRVFQTETELQEVISDLQSKLRLAPDKLKSTESELKKKEKRRDDMLGLVPMRQSIVDLKEKEIPELRNKLQNVNRDIQRLKNDIEEQETLLGTIMPEEESAKVCLTDITIMERLQMELKDVERKIAQQAAKLQGIDLDRTVQQVNQEKQEKQHKLDTVSGKIELNRKLIQDQQEQIQHLKSTTNELKSEKLQISTNLQRRQQLEEQTVELSTEVQSLYREIKDAKEQVRPLETTLEKFQQDKEELINKKNTSNRIAQDKLNDIKEKVKNIHGYVKDIENYIQDGKDNYKKQKETELNKVMTQLTECEKQKENINKDMGVMRQDIDTQKIQERWLQDNLTLRKRNEELKEVEEERKQHLKEMGQMQVLQMKNEHQKLEEKIENTKRNHSLALGRQKGYEEEIIHFKKELREPQFRDAEEKYREMMIVMRTTELVNKDLDIYYKTLDQAIMKFHSMKMEEINKIIRELWRNTYRGQDIEYIEIRSDADENVSASDKRRNYNYRVVMLKGDTALDMRGRCSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDRENIESLAHALVEIIKSRSQQRNFQLLVITHDEDFVELLGRSEYMEKFYRIKKNMDQCSEIVKCSVSSLGSYVH	242799	140307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_141488_142892_143027_145402_145546_146096_146183_165295_165521_167487_167616_185868_185983_186058_186152_186597_186709_188728_188923_189359_189487_189927_190118_196551_196790_197692_197869_199630_199789_199929_200113_201577_201785_202200_202395_202958_203125_203351_203481_215516_215722_216251_216438_220406_220559_240647_240732_242305
925417	contig_6595_pilon	-	2514	1	Intergenic	novelGene_122558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAGCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	712183	709669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_709700_712200
925418	contig_13699_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_158336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGAGTAATTTCTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130675	131601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13699_pilon_+_130700_131600
925419	contig_3380_pilon	-	1794	7	Intergenic	novelGene_60090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	37.0255167268316	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	321	680	371026	367754	FALSE	50	AACATAAAATGGCGTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQFSALSYRVTMSWNRLNDNGLDAQHLCGLRECIPSPVLTNTDGYKERGESSETMLSGARRLPGSRSPGLSSLSILIWKVCWKLFNIIATHKPPLTDGWWLHMRYYLKSPCTGVLGAP	373135	366639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_367800_368448_368570_369070_369117_369635_369718_370961_371111_371938_372104_373064
925420	contig_8330_pilon	-	1132	6	Intergenic	novelGene_71828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCCCGCACCAGGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857547	853923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_854076_855674_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
925421	contig_16776_pilon	+	4224	3	Intergenic	novelGene_130519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	1356	2453	37116	38213	TRUE	15	CCAGCCCCCTCATTCCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSREKWKQVLFQRKPGFNRGVRQRQRQSQQCKEEWGREIQSPQKRKKEKQIERGRWERGPQKIARIEDFSKVSVYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTITPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIMKMSILPKAIYRYNAIPIQIPPAFFNEMEKQITNLIWKGKRPRINKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTVTVVKTAWYWYNNRHIDQWNRMENPDISSSTYEQLIFDKGPKSINCGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKLKMVKIMEEKIGITLGALIHGINTIPTISKNAQAPEETLGKCELLKIKH	35760	80114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_38828_52648_52660_78968
925422	contig_11505_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_140925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	1333	1764	138875	139306	NA	20	GCAGTGGTGGGGAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLHLKGISLGLLILILSSPPCEVRQGQMLYRLFSKKDIHVANKLMKICSLSLVIREMQIKTTTRYHLTPTKMAMLKKTENNKCWKGCGENGSLIHCWWECKMVQPLWKTAWLFLKRLKIELPYDSAIPFLGIYPRNAKLTT	137542	139610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_137500_139600
925423	contig_5041_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_27006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	309	890	54469	53888	NA	30	AAGTTGTCAAGGATTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVKLSGPSSADLAQLKMIRNICKHPLIIRTWNVQTMNPGKLEAVKNEMEHLKIDVLDINELKWSGIGHFESDNHHLVYYARNEKLKRNSGTFIVKKNISRPILKHNAVSNRIIPIRLQGRPVNMTIIQIYALTTNTKEEEIEDFYQLLQSEIDQTGNQNALIITGDWNVKVGNEEGSVVGKYGLEIILEIV	54777	53286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_53300_54800
925425	contig_12638_pilon	-	3445	1	Intergenic	novelGene_33245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	840	1190	741634	741284	NA	30	TCTGCCAGTGGAAATATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNLGWKGGVCCHSMGRATSSVCINFCMRKTNLNCKPSFKAHTHTQILTSPAFKALCDLDPSYLSSHVSHCFIFIYFSRTVPTIPQFPLFRHAAPPARNPSFLYLPISKSKPSSIV	742473	739028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_739000_742500
925426	contig_4964_pilon	-	2830	2	Intergenic	novelGene_157260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	490	junction_1	0	86	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATACACATTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150349	146925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_-_149527_150120
925427	contig_2438_pilon	-	1311	5	Intergenic	novelGene_112044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.66025403784439	21	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGAGGCTGCAGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313521	305106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310766_311903_312081_312303_312405_312725
925428	contig_854_pilon	+	3009	14	Intergenic	novelGene_36610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	3182.6441836938	2	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	658	1977	14	1990	1689366	1715383	FALSE	10	CTACATGCGTGTGTCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQERSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1689352	1716402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702629_1715219
925429	contig_753_pilon	-	3669	4	Intergenic	novelGene_112908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	663	3006	3668	289928	289266	FALSE	25	CTGAGGGAAAGGATGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGRSKDLTEAESSLVCLKATAFSPRDLSEFMEENLLEWKSAKSSSLFPEAVQSLSSSTPSPDPSRESCLKTSYLEGAAAAFCTLFTVLPDVLVRGIGLISSFRASYLSSAFCSDETELLLKAIKSAKSSCSPTDAGLEYPPKRLNSPKSSAKLEVLVDASAVVVAVESVGCGRVGIDFDTLNAAEKDTGFSLLQLTEENRSRSAKFRGVFTCVCCFCCTG	303802	289264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_290081_298787_299379_300682_300851_301708
925430	contig_11088_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_85051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	43	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGAAGTTTTCTGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14665	17401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
925431	contig_10861_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_39442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTTTCCTAGTCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2436886	2434864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2434900_2436900
925432	contig_7593_pilon	+	835	1	Intergenic	novelGene_127324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACTTGTAGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464228	465063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_464200_465100
925433	contig_13014_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_169367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTACAATGAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535760	537507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_+_535800_537500
925434	contig_8712_pilon	+	3084	3	Intergenic	novelGene_58856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATCTAGAAAGAAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718652	911866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_718726_906749_909429_911534
925435	contig_4232_pilon	-	2847	6	Intergenic	novelGene_63492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	237	junction_3	193.823218423387	2	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	619	1185	614173	611887	TRUE	10	TTTTCTCTAGTTCTTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGKTFQARELCEERPRAFGGCLKGSSVDGGWSGRGQETGDLGGLGQVHHGGASERTLFLPVLLLPSTQRILEPDDFLDDLDDEDYEEDTPKRRGKGKAKGKGVSSARKKLDASILEDRDKPYACDICGKRYKNRPGLSYHYAHSHLAEEEGEDKEDSQPPTPVSQRSEEQKCKLRCRRWWASWSGPG	614791	607803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_609042_610283_610366_611352_611466_611657_612075_613618_613698_613873
925436	contig_10583_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_167919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCATGGTCTCAGGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222692	224765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_222700_224800
925437	contig_12528_pilon	-	2580	10	Intergenic	novelGene_81317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	512.451623733077	9	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	551	1093	966228	947638	TRUE	20	AACCTTCTCGGTGCCTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGTKDLVRPYRIIQPQPFGFRDF	968161	932723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_946964_947706_956052_956217_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
925438	contig_1406_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_25528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTCCAAGGAGCATCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871250	1872854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1871200_1872900
925439	contig_3147_pilon	+	4380	12	Intergenic	novelGene_142277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_1	95.6208940132899	78	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1737	87	1823	115173	128976	FALSE	50	AAAAAAAAGGTAGCTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTDFTGASTSPNTPAHGGHQAVHWFPGTMNAIVALCHFCELHGPRTLFCTEVLHAPLPQGAGSGDSPGQGEQAEEEEGGIQMSSRIHSHSPADGASAEASSPGPKKSDMCEGCRSLAVGHPGYISHDKETSIKYVSHQHPNHPQLFSIVRQACVRSLSCEVCPGREGPIFFGDEQHGFVFSHTFFIKDSLARGFQRWYSIIAIMMDRIYLINSWPFLLGKIRGIIDELQGKALKVFEAEQFGCPQRAQRMNTAFTPFLHQRNGNAARSLTSLTSDDNLWACLHTSFAWLLKACGSRLTEKLLEGAPTEDTLVQMEKLADLEEESESWDNTEAEEEKTLVFPEGAEGQEQIKCPTDLSSLSDCGSWQPRKLPVFKSLRHMRQVLGAPSFRMLAWHVLMGNQVIWKSRDIDLVQSAFEVLRTMLPVGCVRIIPYSNQYEEAYRCNFLGLSPQVQIPHHVLSSEFAVIVEVHTVPRSSLYPVGPEDDQSLSKYEFVVTSGSPVSADRVGPTILNKIEAALTNQNLSVDVVDQCLVCLKEEWMNKVKVLFKFTKVDSRPKEDTQKLLSILGASEEDNVKLLKFWMTGLSKTYKSHLMSTVRSPTASESRN	114655	131533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_114718_115148_115422_116708_116856_117882_118105_119089_119251_121001_121094_123003_123192_125632_125747_126491_126616_127835_127968_128100_128207_128774
925440	contig_16633_pilon	+	3546	2	Intergenic	novelGene_165079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGCAGCAGTCAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101415	106397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_+_104743_106178
925441	contig_19438_pilon	-	2941	1	Intergenic	novelGene_175893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTCCCTCTTGGTTGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8073	5132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_-_5100_8100
925442	contig_9036_pilon	+	1665	1	Intergenic	novelGene_155455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAGCAGCACAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138571	140236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_138600_140200
925443	contig_6724_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_167981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCTGGGGGGAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374305	372369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_372400_374300
925444	contig_14687_pilon	-	1253	1	Intergenic	novelGene_107890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTCTCTCCCATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398804	397551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_397600_398800
925445	contig_11594_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_80880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTGTGCAGGTAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31792	33635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_31800_33600
925446	contig_1008_pilon	-	2224	1	Intergenic	novelGene_121574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGTAAGGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661928	659704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_659700_661900
925447	contig_7396_pilon	-	1887	15	Intergenic	novelGene_79636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3483.69159697829	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	186	1445	255163	246385	FALSE	15	GTGAACCTATTTTTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257087	245942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248237_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
925448	contig_14142_pilon	-	2957	1	Intergenic	novelGene_120474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTACACGAGATAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256915	253958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_254000_256900
925449	contig_14133_pilon	-	1507	2	Intergenic	novelGene_119985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	89	319	295907	295677	TRUE	20	GCAGAGGTCCCCTACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAILLLGMYPREIRGITGIDICTPMFTAELFTIAKRRKQPKCPSTDEWIHKLWYIHTMKYYAMIKNNESMKHNMKESERHYAK	295995	294425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_295599_295661
925450	contig_15245_pilon	+	4790	2	Intergenic	novelGene_145226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGATATTGAGCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92596	97877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_96762_97252
925451	contig_10775_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_157941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	115	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1964	2386	57836	57414	NA	25	GTCTTTCAGAAGTAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIFFHFGFLSPALCTFHYNTLLCVLKPPFEIFSSFTSPFLPFALASQPLRASFRVSSDIRFGIFFLSCLFNNLLISSCMMSLMSFYNSSGLWSLIFNMSNLFLRWSLNSGGIYSRSYFRCSQRVLIFFSFDLNLHVSN	59799	56494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10775_pilon_-_56500_59800
925452	contig_14744_pilon	-	1838	8	Intergenic	novelGene_66125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	112.562001055563	3	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	212	1102	1597397	1587979	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLWSALTSRSKREIPVFNFTIHEIHCQRNIGMCPVCKEPFPKSDMETHMATEHCQVTCKCNKKLEKRQLKTHEETECPLRPALCQHCDLELSVIKLKDHEDYCGARTEQCGNSTANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKPQAAGSWGCRGRGVVNGVSENPPLAPVFCA	1597608	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588072_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589835_1594216_1594335_1596803_1596858_1596969_1597106_1597362
925453	contig_9470_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_176412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAAAAAAAAACTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180744	178293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9470_pilon_-_178300_180700
925454	contig_16205_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_156849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9319	11256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_+_9300_11300
925455	contig_5640_pilon	-	2282	5	Intergenic	novelGene_27294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1850	2209	1260977	1260618	FALSE	45	TTTACCTAGGGGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESFNTATWGLNYQWHSFKHHSNTNAATVRQTGRQVVAMTVYGGTIIPPIIQMMAGNLPKITQVVGGRSKSIYEPTNLDQECVLSTMCLQSQRALIGHYWCKMLMLQPTCITYKRHMHR	1365875	1260544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1261900_1285938_1285955_1304016_1304164_1307913_1308264_1365461
925456	contig_8330_pilon	+	1474	1	Intergenic	novelGene_71728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	95	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	272	334	163719	163781	NA	60	AAAAAAAAGACTAGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSLPLTSGLSSPRTPGVRSFSSSSTPHNQGNRTTIERGPRCTKCQAREGLCPQGRGAEPEWLSVSASRGCCSSTGPAVEAAAVQSGWGKVMRFKLWQLSLSEVRYKLSVV	163447	164921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_163400_164900
925457	contig_13118_pilon	+	2149	4	Intergenic	novelGene_177560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	11.4309521329882	5	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	503	1512	95	1606	7082	11544	FALSE	45	AATTCATAGCAGGGGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSVAFEDVAVDFTQEEWALLDLSQRKLYRDVMMEIFRNLASVVSRKLNDGEKLSSENIILRFMKNDTWSSMVGEMCELHGTEDQDNNKKTHVRRQMVENVCESNEDNQCEQTFIQIPNLSVLKRTPVKVYPSECLEYGTSLMDHSSLKHHIRSDSECNASQCKECGEACSYTPYFSTSVRTLTGEKPYEYKECWKAFHKSSSLTGHTRIYSREMPYECRECGKAFCHPSNLDRHMRIHSGERPYECKECGKAFSQFSHLTKHIRSHSGERPYECKECGRAFHQSSNLTTHMRTHSGERPYECKECGKAFSQSSNLTAHIITHSGERPYKCKECGRAFRHSSHLTRHMRIHSGERPYECKECGKAFRQPSDFTKHMRTHSGERPYECKECGKAFRQSSDFTTHIRTHSGERPYVCKECGKAFNQSSHLTVHIRSHSGERPYECKECGKAFHHSSHLTEHVITHSGERPYECKECGKAFSQSSNLAMHKRTHSGERPYGCKECGKAFRHFSHLTIHMRVHSGERPYECKECGKVLL	6987	12087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13118_pilon_+_7116_8069_8221_9971_11288_11533
925458	contig_4486_pilon	+	1423	2	Intergenic	novelGene_38528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	258	689	145151	145582	FALSE	50	GGAAGGGAACAGAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFVKEDIQVAKRHMKKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLTLIQKAQNNKCWRGCGETGTLTHCWWECKMVQPLWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAILLLRIYPREIRAITQIDIYMHTHVHCSIVHNSENMATTYMLINR	63425	146316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_63508_144975
925459	contig_10734_pilon	-	2196	13	Intergenic	novelGene_51484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	629.09617706675	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	161	634	2305085	2277177	TRUE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEESRLESVYSTKGTRRPVKSLPGALSRQWKKPPGLPS	2305245	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265812_2265927_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270502_2271028_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
925460	contig_10982_pilon	-	2283	9	Intergenic	novelGene_87863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	6	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	785	1084	105768	105469	TRUE	30	CGCAACCACCACAATGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSGSSWDLLNCEKQLGKDEPATFHPHAIIPFHCIPSCQTYGVCSSCESMTCFTQKSSFYLALFLKWVLQDGTEQVTRSLTFCMRFKTNRKDKREYKQN	106552	85301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_-_85356_89553_89757_94489_94604_94722_94798_98694_98819_100565_100690_101927_102037_104421_104533_105183
925462	contig_14338_pilon	+	1968	4	Intergenic	novelGene_174836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	13.0724477007517	226	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACCCATTGTTGTCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30852	43615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14338_pilon_+_31031_37749_37819_39581_39640_41952
925463	contig_5084_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_64540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTCAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	503646	504690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_503600_504700
925464	contig_1666_pilon	+	2622	2	Intergenic	novelGene_160587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTTGCATAGCAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717857	727721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1666_pilon_+_720384_727625
925465	contig_6199_pilon	-	3669	2	Intergenic	novelGene_126331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	34	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAAACTAACTTGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79414	50172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_50570_76142
925466	contig_16098_pilon	-	3336	3	Intergenic	novelGene_45950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1966	junction_1	918	16	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1451	1765	350530	350216	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCSVQVPWRAGGMRLVAWSGEGGRFMGSDIGGDCPGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVSGQEP	351980	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349710_349955
925467	contig_11678_pilon	+	1710	1	Intergenic	novelGene_160830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	82	462	108360	108740	NA	75	TGGTAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKNRAPGIDRIPTEIFQQMNAMLEVLLVSAKKFERQLPGQPTGRDPYLCPFQRKVIQQNVEIIEQMSLISHASKILPKMIQKWLQQYINRELPEIQAGFRRGHVTRDIIADVRWILAERCLPVFY	108278	109988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_108300_110000
925468	contig_6076_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_81760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCAGTGTTCATCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331067	332902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_+_331100_332900
925469	contig_3584_pilon	+	2896	3	Intergenic	novelGene_108167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAAACTTACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517984	521664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_518627_518792_520300_520917
925470	contig_10523_pilon	+	2814	1	Intergenic	novelGene_120950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGGGATTCGTCCCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35080	37894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_+_35100_37900
925471	contig_6847_pilon	-	1452	1	Intergenic	novelGene_143843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCCTGTCAGGGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59282	57830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_-_57800_59300
925472	contig_13698_pilon	+	2050	2	Intergenic	novelGene_179096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	732	1318	2049	54055	54786	FALSE	25	TCCTGAGAGCAGCTCGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQR	52184	54787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13698_pilon_+_52502_53054
925474	contig_15047_pilon	+	1530	5	Intergenic	novelGene_52248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	6	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	234	509	3242	4178	TRUE	35	ACCGGAGAACCTTCCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2612	21645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
925475	contig_10163_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_82618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56589	54221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_-_54200_56600
925476	contig_4402_pilon	-	2399	2	Intergenic	novelGene_140826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAATTCATCAGCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	462266	457413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_458594_461047
925477	contig_7702_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_177295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATGTTTACAAAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82906	80843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_-_80800_82900
925479	contig_4678_pilon	-	2683	1	Intergenic	novelGene_126002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1577	2050	101063	100590	NA	20	CCTTGCTACTGCACCAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRGETVFLVVSDTSDWPSQDLVRGKNSSCGTSAVRGRAFSFTCFGKNLRQSTTTSSGPMISSNFYFTDKNIKASGYMKLVAALRLAPGPLTPRLLSPLPPLMAAIQVHTLMCVCTEGLLHPKHLLCVQLWAESFICMIPSYLLLGCHQPQNPGCQK	102639	99956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_1e+05_102600
925480	contig_10437_pilon	+	662	3	Intergenic	novelGene_38335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1970	junction_2	798	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAATGTGTCAACCTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445414	451573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_445476_446951_447055_451075
925481	contig_2892_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_118980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTAGCACCACACATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14300	16870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_14300_16900
925482	contig_18933_pilon	-	4115	2	Intergenic	novelGene_177291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTCCCCTAACACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15989	11048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18933_pilon_-_12383_13208
925483	contig_4730_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_71695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATACATAAGGTCGCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81646	82607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4730_pilon_+_81600_82600
925484	contig_11548_pilon	+	4112	3	Intergenic	novelGene_66811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	235	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAACAAAAAACTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291889	321751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_295184_319900_320631_321663
925485	contig_14300_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_133119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGTTAGGAGCTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319383	318626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_318600_319400
925486	contig_21417_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_177309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGATGGTTAAGGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6710	8043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21417_pilon_+_6700_8000
925487	scaffold_13505_pilon	+	1664	4	Intergenic	novelGene_111608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAATGAAGATGATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655542	660911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_655632_656007_656130_656809_657693_660341
925488	contig_6445_pilon	-	1591	16	Intergenic	novelGene_76886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_14	705.975624382473	4854	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	116	1354	88578	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRHLPPTPGHRKVGTVAAPILRTPWTCWGSLPQLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88604_89656_89714_96306
925489	contig_854_pilon	+	1274	1	Intergenic	novelGene_36742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715131	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715100_1716400
925490	contig_3601_pilon	+	1394	2	Intergenic	novelGene_132832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACCCAGCAGAACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13659	123261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_13667_121874
925491	contig_401_pilon	-	1895	15	Intergenic	novelGene_42927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGCAAAATAGAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1973155	1946689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1946749_1946934_1947080_1948358_1948493_1948787_1948908_1952091_1952236_1952518_1952658_1957521_1957646_1960854_1960950_1961062_1961162_1961319_1961402_1961680_1961761_1964449_1964544_1965464_1965583_1966090_1966204_1972806
925492	contig_13496_pilon	+	1571	1	Intergenic	novelGene_107659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCTGCATTTTCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445400	446971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13496_pilon_+_445400_447000
925493	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	753	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
925494	contig_5023_pilon	-	2091	7	Intergenic	novelGene_7204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1002	1463	647301	614450	TRUE	35	GAGAACAACTTTGTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYLTSFC	648302	580840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580903_607252_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611817_614397_614464_646853
925495	contig_7549_pilon	-	1021	1	Intergenic	novelGene_164527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAGCAACCCTATAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695492	694471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7549_pilon_-_694500_695500
925496	contig_12125_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_76253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	208	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634963	632105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_632100_635000
925497	contig_2062_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_139020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGAGTCACTATACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1145801	1143971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1144000_1145800
925498	contig_233_pilon	-	2229	3	Intergenic	novelGene_14496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	217	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	52	297	70100	60047	FALSE	40	TAATCAGAAGGTGGAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPVRLTDRRLTTRARATMAACSQNSNRTCEECLKNVSCLWCNTNKACLDYPVKKILPPGSLCKLSSARWGVCWGKSLFSFTSCKVSAFLEILVYAWLT	70151	58114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_60233_61595_61653_70097
925499	contig_10523_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_120946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATTAAGCATTAAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19953	18948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_18900_20000
925500	contig_9195_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_155700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACAAGGATTTTTGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848161	849996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9195_pilon_+_848200_850000
925501	contig_9945_pilon	-	553	1	Intergenic	novelGene_104825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTCATGAAAACAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138665	138112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9945_pilon_-_138100_138700
925502	contig_10855_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_124283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142068	143244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_142100_143200
925503	contig_9883_pilon	+	1961	1	Intergenic	novelGene_87584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	47	409	75548	75910	NA	25	TCCACCATTTTGTCATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSATRTSTVTKADLATATAECPICQQHQHCVPEMASFLGVISQQPGGRLITLDHLHHGKDGVSFLTGIDTYSGYGFAFPAHNASAKTTIYGLTECLIYHLGIPHSITLDQGTQFTANEV	75501	77462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_+_75500_77500
925504	contig_17414_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_156942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCTACAAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66871	65511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17414_pilon_-_65500_66900
925505	contig_8631_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_121949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGCCTTATCAGATACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687357	684787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_684800_687400
925506	contig_3627_pilon	+	2075	1	Intergenic	novelGene_78546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACACAGTGCTAGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664247	666322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_664200_666300
925507	contig_2161_pilon	-	1724	7	Intergenic	novelGene_114928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATACCGTACCCCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859450	834304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_834901_839289_839380_839886_839953_842078_842383_847913_847985_850900_851011_858963
925508	contig_57_pilon	+	2963	24	Intergenic	novelGene_44890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_11	208.100982466666	2	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	128	1429	66895	105867	TRUE	70	AGCAAAGATAAAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSG	66767	129521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_105862_106032_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_122503_122543_129464
925509	contig_7056_pilon	+	1087	2	Intergenic	novelGene_43717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	11	385	935853	937209	FALSE	20	GACGTTGTCTTCTCCACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPGKCCPWVSLMKAAGSPGSYRPRIMTLELLWTPSSIQNTHRHCDNVCSVSLPLLSPSCAELV	935842	937911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_936047_937028
925510	contig_7730_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_156281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGGAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345166	346694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_345200_346700
925511	contig_5084_pilon	-	2203	2	Intergenic	novelGene_64516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1123	1692	371088	370519	FALSE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSRTLSDVVPKNEPLRLEVTQKTTGEELPPQSRVDFSDVDGVKLRTYIRWCGSSQNKKKQLQTFIINWTVEYTKHESRKLEVVRNEMECIKIYILGINELKWTGTGHFESSDHMVYSARNDKLKRNGITFVVQNNISRPILKYSAVSDRIISIRLQGRPVNTIIQIYTYQPTNASFCSLKFHAIKMH	433936	370007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_372181_433906
925512	contig_3151_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_139188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173826	171691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_171700_173800
925513	contig_12120_pilon	-	3554	1	Intergenic	novelGene_21430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAGAAGAGAAATCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123882	120328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_120300_123900
925514	contig_8652_pilon	-	898	1	Intergenic	novelGene_168781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTATGTGTATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169246	168348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8652_pilon_-_168300_169200
925515	contig_1867_pilon	+	1941	3	Intergenic	novelGene_54531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGTAGTTTTGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295189	298988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_295523_295786_295880_297473
925516	contig_17427_pilon	-	2320	11	Intergenic	novelGene_30343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1260.31329438358	6	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	258	1226	184471	178046	FALSE	10	TTGCTTCGTTGTTTACCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204718	176951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182717_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186487_204671
925517	contig_18145_pilon	-	2629	15	Intergenic	novelGene_37356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1366	1680	97865	97184	TRUE	20	CTCTATTCATTCGAATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLRNLSGCSTGYWTSSWSSRLTSSRPPMSSQVTCGTSTTVSRSADGLLWLRAHRKSSIVTAREFMTSASMVSSSRSMRSIFLRMACRAASEHRAAKSAPTCP	101271	90894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_90934_92015_92161_92690_92822_93350_93483_94905_95010_95953_96087_96162_96299_96653_96766_97166_97334_97425_97548_97822_98036_98229_98539_98824_98922_100325_100480_100636
925518	contig_2903_pilon	-	3258	21	Intergenic	novelGene_148976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	298	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTCTGACTGAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208338	150989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_-_151045_160624_160748_166400_166486_175923_176005_176814_176895_177501_177610_180984_181022_182095_182241_182838_182911_189793_189879_190030_190100_190177_190279_192369_192494_194611_194739_196914_197007_198877_199036_199421_199583_202182_202261_202801_202919_206113_206255_207119
925519	contig_8045_pilon	+	3386	1	Intergenic	novelGene_35436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACCTTCATCTAAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424487	427873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_424500_427900
925520	contig_10734_pilon	-	1710	6	Intergenic	novelGene_51513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	607.610730649155	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	774	1655	2274418	2265543	FALSE	45	CAAAGTGATATTGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKPPMRLCTLATTSGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2276436	2265487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270502_2274372_2274510_2275754
925521	contig_6361_pilon	-	1157	1	Intergenic	novelGene_23939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAGTGAGAATAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332145	330988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_331000_332100
925522	contig_11816_pilon	-	1290	1	Intergenic	novelGene_98445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381557	380267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_380300_381600
925523	contig_19891_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_179097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGGCACCATACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9702	11878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19891_pilon_+_9700_11900
925524	contig_11681_pilon	-	1312	2	Intergenic	novelGene_102980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	16	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	55	813	184982	184224	TRUE	65	ACAAAGAAAGAAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGNFSVSNSSMILSLFSVFSACSGTPITHRFLVLIVSHLILRVSSFFFSLFSDFSSNRVESKCLSSISPILSSIISNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCVSMISSWEFILAFCSYIIFLNSSIFLSVFSMNLSIFPSFLSVFCFNSWIILNIRDLNSSSVRSSAFSSTGRSSGVSFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIPWLFSLFIDYRFVCFILLFCFIWLCLSRQAVCSLLFARLWA	185036	183547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_184011_184187
925525	contig_5095_pilon	-	4000	2	Intergenic	novelGene_74957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1316	1639	313454	313131	TRUE	30	GGAGAAAGATGTGGCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSSFLRKRHIIFQNGCIILHSQQQCIRVLISPQPLQHLLFPVFLIHATNAGVRWYLIVVLICISLIASDPEHFLMCLLAIRMSSLVKCLFISFAHFLTGLFVFLL	314769	310464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_-_312402_312706
925526	contig_11378_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_112306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAACCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1070088	1072149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1070100_1072100
925527	contig_10561_pilon	-	1542	1	Intergenic	novelGene_175934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTCATATCCTCATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115617	114075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10561_pilon_-_114100_115600
925528	contig_9995_pilon	-	1588	1	Intergenic	novelGene_47835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGCACATCAGACCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976417	974829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_974800_976400
925529	contig_5779_pilon	+	3899	11	Intergenic	novelGene_106453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	48	401	106725	107078	TRUE	35	TCTCCATTTATTAAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQICNSTIIWTCIVTDRYRLTCISYLALSTKYLSTCIRSKPAHSKRETTYQNVPVLSSPQWLEDVGEGVLTITVTGRALPGALLPSTPTPGPERVFSSPQHSQSRQSLSAKLGFLSQ	106677	166295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_107817_108774_108917_125881_125961_126872_126948_127353_127544_129215_129379_132097_132224_156802_156956_163901_164527_164894_165809_166002
925530	contig_6488_pilon	+	3223	2	Intergenic	novelGene_44737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	94	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	676	1041	62689	63054	TRUE	75	AAAAATTAAATAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKWNWVKKRSLPSEIHIPEGKDSSQRVVSVHLSASSLGCHGHGIHQQILAEWTAHNYSLCFYATDTSNKEDFNKPKRKLDGKAGHRELPEGTLNSHVNRFSLSFKIELMKASKILKMTHV	62013	185641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_64726_185130
925531	contig_5023_pilon	-	3638	1	Intergenic	novelGene_7183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	193	555	577207	576845	NA	85	AAAAACAAACAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFFSADWSLLIIRPKYVRCSLAILASKEHSGCTSSKTDLFVLVVVHGIFNTLCRHHISKASILWFSLFIIRLSHAYEATENTMACIRRALVFKVTSLLFNTLKRSFAADSPNAMRPLIT	577399	573761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_573800_577400
925532	contig_10800_pilon	+	2424	1	Intergenic	novelGene_152624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCATCACCAGAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486508	488932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10800_pilon_+_486500_488900
925533	contig_4342_pilon	+	6186	7	Intergenic	novelGene_178760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_5	244.539703661116	435	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	53	1030	18333	82130	FALSE	50	GTTGCAAAAAATACATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN	18280	87286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4342_pilon_+_18528_29090_29282_37922_38059_43362_43523_50559_50673_52030_52121_82037
925534	contig_854_pilon	+	1693	1	Intergenic	novelGene_36380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCCGAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974727	976420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
925535	contig_2058_pilon	-	2724	1	Intergenic	novelGene_171564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99468	96744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_-_96700_99500
925536	contig_6047_pilon	-	783	1	Intergenic	novelGene_24225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGGCCTGGCGATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157598	156815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_156800_157600
925537	contig_854_pilon	+	4031	24	Intergenic	novelGene_36531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2508.44920875274	9	114	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	653	1962	1050	3011	1679334	1715383	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1612831	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678180_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698929_1715322
925538	contig_11548_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_66805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTAACAATATATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200576	199408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_199400_200600
925539	contig_8138_pilon	+	680	4	Intergenic	novelGene_52475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	503.483862700683	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTTCATCATTAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280272	306610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306220
925541	contig_19402_pilon	+	5299	17	Intergenic	novelGene_80757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1260	junction_11	1205.78468842648	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	793	2382	10	2391	23458	143056	TRUE	70	TAAACTTTCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802
925542	contig_1150_pilon	-	425	3	Intergenic	novelGene_61451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	5	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGGTGGAGGAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	309124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
925543	contig_8330_pilon	+	2413	1	Intergenic	novelGene_71934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	294	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	722	1021	1316216	1316515	NA	35	CTGAACTGTGCATGTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGRLKYLLCMDVSFKRILPIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQVAKRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTRALLARIKDTGNNKC	1315494	1317907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1315500_1317900
925544	contig_12721_pilon	-	1617	3	Intergenic	novelGene_175070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	33	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGACTCAACCGCAATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733418	717095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12721_pilon_-_718290_732517_732638_733115
925545	contig_17274_pilon	-	4470	7	Intergenic	novelGene_26504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2416	2724	115757	115449	TRUE	45	GAACTGACTCACCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITFSRDWSLLITFSKYMRQSLTILASKEHSGCTSSKIDFLFLLAAHSIFNILRQHHNSKVSILQSSLFIVQLSHAYKAIENTMDLVRRTLVLKVTSCFLTL	118172	87681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_87865_95016_95181_96227_96395_98271_98347_100304_100452_104415_104472_114494
925546	contig_5574_pilon	-	6155	5	Intergenic	novelGene_155816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	368	144	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTCAGATTTATTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207448	5466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_6802_7360_8551_16951_17084_45130_45899_204718
925547	contig_14191_pilon	-	2156	2	Intergenic	novelGene_153763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCGGAAACGCCTACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36405	25822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14191_pilon_-_25914_34340
925548	contig_17935_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_170594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGGAAAAGGCAGACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36995	35021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17935_pilon_-_35000_37000
925549	contig_9696_pilon	+	3117	1	Intergenic	novelGene_68821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACCAGGATACGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403831	406948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_403800_406900
925550	contig_5340_pilon	-	4901	6	Intergenic	novelGene_179098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	111	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	371	1000	114555	91620	TRUE	55	AAAAAAATTTAAATTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISADTEKAFDTVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIQGIYAKPMANIILNGERLKEFPLRTGTRQECPLSPLLLNIMLAVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLFLFADDILYIENPKDSMRKVLAIIERFSRVAGYKINTQKSVGFLYTNKENDDKNIRKIPFIIAPKKLKYLGINLIKDVKILYKENYKTLLQEAKRYLHKWKNIPCS	114925	19930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5340_pilon_-_20170_20294_21576_45266_45552_81073_81904_90353_92171_114476
925551	contig_3077_pilon	-	1840	9	Intergenic	novelGene_26654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACAGGGCCTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	9613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9799_11191_11476_12010_12069_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
925552	contig_7057_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_123423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATCTAAATTGGAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1556110	1558139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1556100_1558100
925553	contig_13481_pilon	-	2717	1	Intergenic	novelGene_119536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1471438	1468721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1468700_1471400
925554	contig_7272_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_25430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGTTAAAAAAAAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	980518	977752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_977800_980500
925555	contig_15732_pilon	-	4838	2	Intergenic	novelGene_88848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGTCATGAGAACTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17362	12319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_14343_14547
925556	contig_5718_pilon	+	2560	1	Intergenic	novelGene_110404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAAATCAAGCTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357357	1359917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1357400_1359900
925557	contig_12312_pilon	-	4994	22	Intergenic	novelGene_63952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	811.812110339782	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	993	2982	148	3129	278150	215838	TRUE	35	TAATGCTTTAAATGATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	324167	213838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214983_215116_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_324071
925558	contig_7380_pilon	-	2215	2	Intergenic	novelGene_157509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTATCCAGGTTATGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72244	20332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7380_pilon_-_21699_71395
925559	contig_18328_pilon	+	4121	1	Intergenic	novelGene_132553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	113	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGCATAATGAATTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44305	48426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_44300_48400
925560	contig_18976_pilon	+	4910	1	Intergenic	novelGene_174895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	3521	3898	13373	13750	NA	65	AAAAACCCACAAACAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISNHLQKQGRMVPVGIQNKTPDEFPLEEKVLELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMENTGKKREEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKLQLEIQKINNKISEIVS	9852	14762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18976_pilon_+_9900_14800
925561	contig_6967_pilon	+	777	1	Intergenic	novelGene_174623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19922	20699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6967_pilon_+_19900_20700
925562	contig_12479_pilon	+	1661	2	Intergenic	novelGene_56853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	27	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343809	467463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_343837_465829
925563	SIRV6	+	996	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	351	23	178	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	146	637	1733	10736	TRUE	35	ATGGAAATTGGCGATGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1481	11308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
925564	contig_8907_pilon	+	1068	1	Intergenic	novelGene_85831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTACAACAAAGATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433268	434336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_433300_434300
925566	contig_4812_pilon	+	2700	2	Intergenic	novelGene_103654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGTTAAGGAAAAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78778	81740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_81286_81547
925567	contig_17144_pilon	+	3102	14	Intergenic	novelGene_29314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	987	1292	167621	170751	TRUE	30	CTGAAAACAGCCACTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGLLLRVGIDVLGGSHGVLVQRCHSDLIELKGLDVLL	166067	183229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166924_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176276_179706_179784_181792_181852_183184
925568	contig_3747_pilon	+	2883	8	Intergenic	novelGene_24789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	330	1505	201313	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
925569	contig_1150_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_61445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGGAATGCACAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309894	308979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309227_309812
925570	contig_6365_pilon	-	1125	1	Intergenic	novelGene_134017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141586	140461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_140500_141600
925571	contig_12090_pilon	-	2534	2	Intergenic	novelGene_80484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1516	1938	62567	62145	FALSE	70	TGGTAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKEISVVFISANTTSILQPVDQGLLSTFKSSYFRNTSWEAIAAIDSGSSESGQSKWKTFWKGVTILDAIKNIRESWEEVKIPALTVAGKKLMPTLMDDFKGFTTSVEEVIADVVETARELELKVEPEDVTELLQSDDKT	132653	61548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_-_63905_132475
925572	contig_5549_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_81676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGATAATTTCTTTCCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540294	541923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_540300_541900
925573	contig_3077_pilon	-	1840	9	Intergenic	novelGene_26655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACAGGGCCTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	9613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9799_11191_11476_12010_12069_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
925574	contig_9121_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_134476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCTTGGCTGAAAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272692	270980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_271000_272700
925575	contig_6740_pilon	-	2713	1	Intergenic	novelGene_142723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGGCATGGATCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732844	730131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_730100_732800
925576	contig_10962_pilon	-	1543	1	Intergenic	novelGene_103871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	700	1218	9733	9215	NA	65	AGAAAAAAAAAAAGCTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAINKQIMRGRELRNLKFPVNFLVSEKNPTSPSPSEETNLSRLSTCSLMSPGRVVSPSVPIRPAPPPLIASGLAIRVDWSSAQVEIDKPCSRKSCRILPICIGKSLRRLGKRNFFSIHFYNVLIFTNKNILMRNYLFCKPSSKVPKKKKKNYLCEIKLTTATRRFDGKPRRQ	10432	8889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_8900_10400
925577	contig_2689_pilon	-	242	1	Intergenic	novelGene_100810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAAAGTGTAGCTTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1954	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_1700_2000
925578	contig_15882_pilon	+	1727	3	Intergenic	novelGene_144810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83474	89321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_83490_83779_84496_88325
925579	contig_3123_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_162972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACACATGGTTATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109464	100867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_102147_107469_107520_108843
925580	contig_6952_pilon	-	1415	2	Intergenic	novelGene_173650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTCAAAATCAATGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569150	439150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_-_440415_568999
925581	contig_7165_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_116894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1426	1731	1028365	1028060	NA	25	GGTCTTCTGAAGAGGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISLGYIPRSGIPGSNGMSTSSFLRKCHIIFQNGYIILHSHQQCIRAPISLQPLQHLLFPVFLIRASNARVRWYLTVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	1029790	1027881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_1027900_1029800
925582	contig_21004_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_179099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	116	334	5915	5697	NA	35	ATTTACTGGCCTAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKDLYNENYKPLLQETKGDLHKRKNTPYSWIGRLNVVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPTTFFNDMEKQITNFIWKGKENKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRCID	6030	4825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21004_pilon_-_4800_6000
925583	contig_13217_pilon	+	3511	8	Intergenic	novelGene_140892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCGAAAATGAGGAAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19459	39020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13217_pilon_+_21801_25098_25159_25379_25539_25926_26053_29411_29634_31494_31634_32322_32640_38873
925584	contig_16846_pilon	-	2980	1	Intergenic	novelGene_82854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88514	85534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_85500_88500
925585	SIRV1	-	1570	4	FSM	SIRV1A	SIRV102	1300	4	-270	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	76	96	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGAATCGATGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10636	1006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6814_7552_7815_10282
925586	contig_8138_pilon	+	1902	5	Intergenic	novelGene_52473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	438	junction_2	330.950147303185	1	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	40	522	280295	306552	FALSE	15	ATCCTTCTTAGTAGTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDNDDIEVESDEEQPRFQSAADKRAHHNALERKRRDHIKDSFHSLRDSVPSLQGEKASRAQILDKATEYIQYMRRKNHTHQQDIDDLKRQNALLEQQVRALEKARSSAQLQTNYPSSDNSLYTNAKGSTISAFDGGSDSSSESEPEEPQSRKKLRMEAS	280255	307932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_281036_281064_288507_288616_304973_305098_306364
925587	contig_2054_pilon	+	1616	1	Intergenic	novelGene_51694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAACACTGCCCCATAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145979	147595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_146000_147600
925588	SIRV5	+	709	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	249	0	249	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	2	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8564	11866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858_10992_11311
925589	contig_12106_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_83734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGTGAAGGCTTACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103341	101252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12106_pilon_-_101300_103300
925590	contig_10054_pilon	+	2434	1	Intergenic	novelGene_171213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTTGATAGAGGGTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143167	145601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10054_pilon_+_143200_145600
925591	contig_14679_pilon	-	1859	1	Intergenic	novelGene_174187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAAAAAGGGAATTCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134553	132694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_-_132700_134600
925592	contig_5331_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_112847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAACAACAAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802871	803752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_802900_803800
925593	contig_12837_pilon	-	2380	2	Intergenic	novelGene_57390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	582	junction_1	0	6	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCAAAAAAAAAAAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397539	393779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_394697_396076
925594	contig_15047_pilon	+	1495	6	Intergenic	novelGene_52193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	23	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	CTTCCAGAATCTGCATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21181
925595	contig_5836_pilon	+	1679	1	Intergenic	novelGene_106278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCTGGACTCTCTATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81529	83208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_81500_83200
925596	contig_7066_pilon	+	1908	9	Intergenic	novelGene_42190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	67.1076560460876	2	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	922	1545	998571	1003261	FALSE	20	GGTTAAAGTGACTGCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPLSELDTKDVDALLKKSEAQHEQPEDGCPFGALTQRLLQALVEENIISPMEDSPIPDMSGKESGADGASTSPRNQNKPFSVPHTKSLESRIKEELIAQGLLESEDRPAEDSEDEVLAELRKRQAELKALSAHNRTKKHDLLRLAKEEVSRQELRQRVRMADNEVMDAFRKIMAARQKKRTPTKKEKDQAWKTLKERESILKLLDG	993693	1003624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_993862_994554_994788_996687_996939_997043_997202_998459_998602_998707_998812_1000008_1000119_1000875_1001062_1003068
925597	contig_2550_pilon	+	2979	2	Intergenic	novelGene_135640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATATATACATAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474316	477356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_476986_477046
925598	contig_1694_pilon	-	1587	1	Intergenic	novelGene_144914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412347	410760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_410800_412300
925599	contig_8045_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_35417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTCTCTTTGTTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216438	218118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_216400_218100
925600	contig_20951_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_43135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	328	627	315087	315386	NA	70	CCAAAATAAAACAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIFFANPMIQRHQFFFGQFIIVQLSHAYEAIQNTIFWVRCTLDHKATSFLVNTRCQFVLLFCLCVAVMLEAMPLVFQIPTRLPMVEKFQQSFRTKTD	314759	316248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_314800_316200
925601	contig_14575_pilon	+	3059	1	Intergenic	novelGene_101858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGTGTAGAGATGATGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16646	19705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_16600_19700
925602	contig_15407_pilon	-	2014	2	Intergenic	novelGene_123084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467764	465708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_467375_467416
925603	contig_10877_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_166212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTCCCCACAGTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48092	50413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_+_48100_50400
925604	contig_6513_pilon	+	4315	1	Intergenic	novelGene_117748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAAAGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58757	63072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_58800_63100
925605	contig_15029_pilon	+	2034	1	Intergenic	novelGene_128215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACAGAACAAGAATGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245621	247655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_245600_247700
925606	contig_18096_pilon	+	3108	14	Intergenic	novelGene_58033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	732.64792516496	1566	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	74	1705	40382	76634	TRUE	20	TCTGTGTCTGTTAATGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANWFVNEGLSIFVILVWLGMNVFLFVWYYLVYDVPVKFFYTRKLLGSALAFARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	40308	79132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44145_44257_53717_53803_57289_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77122_78216
925607	contig_10489_pilon	+	922	4	Intergenic	novelGene_165630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	290	784	278750	279498	FALSE	70	AAGGAAATGCAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVIPSENNGLSRGSPSKKNRLSLKFFQKKETKRALDFTESQENEEKVSEYSGSEIDQVVPAAQSSPINCEKRENLLPFVGLNNLGNTCYLNSILQVLYFCPGFKSGVKHLFNVISRKKEALKDEANQKDKGNSTLCMKDTYSMMHRKCYSVFWETFKKHANS	278370	279636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_278495_278584_278920_279013_279241_279400
925608	contig_10404_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_138709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTCCATACCTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1228916	1230975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1228900_1231000
925609	contig_9363_pilon	-	1679	2	Intergenic	novelGene_6681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACTTGTATTTCTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1240409	1237554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1238838_1240013
925610	contig_15518_pilon	+	3194	4	Intergenic	novelGene_127614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	293.647180586953	47	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	400	741	15096	38209	FALSE	35	TCAGTAATCTGGATCTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSARQSLHHCF	11231	40662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16019_38183
925611	contig_755_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_119795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCGTGGCCCCACCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626563	628079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_626600_628100
925612	contig_17144_pilon	-	2159	7	Intergenic	novelGene_29433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1345.91121549677	66	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	1059	1871	169039	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170097	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996
925613	contig_8866_pilon	+	1404	1	Intergenic	novelGene_77807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426021	427425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_426000_427400
925615	contig_9696_pilon	+	1349	1	Intergenic	novelGene_68818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTATTCTTCACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396460	397809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_396500_397800
925616	contig_1275_pilon	-	3480	6	Intergenic	novelGene_108793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	275	junction_5	544.200110253572	24	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	89	904	513735	480304	FALSE	40	ACTAATAATTGATTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRVSSCHCRKNRPLNPLYCAFLGPEYVWS	546795	477727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
925617	contig_2703_pilon	+	2498	2	Intergenic	novelGene_101693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1718	junction_1	0	27	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGACCCCAACAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	526156	561676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434
925618	contig_2924_pilon	-	2338	1	Intergenic	novelGene_140262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1750	2088	84604	84266	NA	25	AACTTCCCTGCTTATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRQQSISSHIKRQSMMASASSQNKESINSLEEENFLELPEAEYKRLIYRTLLEIRKEIRQHAEIAREHTDTVVAELKKVIEGHNAKFNTLQESIERQQSEIQKINNKISE	86353	84015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_84000_86400
925619	contig_16411_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_77392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	323	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1868	2173	397966	398271	NA	70	TTCACAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQALHQTESSTARWCPTTTTVCSDRDHNRGFWTELEKDVQQNSNSQKKKKDQIYWPKGDWGNPESMAPRHPFSSVVKSLPRLTVLPGSGQPHKTKWD	396098	398548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_396100_398500
925620	contig_13044_pilon	+	3283	2	Intergenic	novelGene_99980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	147	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	79	444	39469	39834	TRUE	45	ATCAATTACATGGAAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKQLHGASSRRQNNWLPAIYTLTPPSFLHPHSASSASCGHSVLAGKHRLHPGAAWILPTCTGWLPERHLLATGVAFFYFFWFLPYLSQPPHPFTQIPGSMCHLCFFLKGYETQVNCETAS	39390	42933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_40102_40361
925621	contig_6361_pilon	+	2801	1	Intergenic	novelGene_24023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGGAGCCCTAGTGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427072	429873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_427100_429900
925622	contig_6825_pilon	+	1619	1	Intergenic	novelGene_155128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	793	1155	97542	97904	NA	40	TAGAATTGTATAGTAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTFPDFKPPDIPLFCSDSCLFVYVHFLHEHNEVFWSSHSLQCCPQFVMIHAVECLCIVNETQVNIFLVFSAFSQDSPDISNDIPCSTSSSGHSLNFWQLAVNVLLQLLLKDLQQNFTYV	96749	98368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6825_pilon_+_96700_98400
925623	contig_2940_pilon	+	1393	1	Intergenic	novelGene_81903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTATTTAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455597	456990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_+_455600_457000
925624	contig_408_pilon	-	3974	1	Intergenic	novelGene_84920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCAGTATTATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140287	136313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_136300_140300
925625	contig_5447_pilon	-	2035	4	Intergenic	novelGene_178324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTCAACACCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300659	78606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5447_pilon_-_78908_220738_221242_263525_264299_300201
925626	contig_5084_pilon	+	3907	2	Intergenic	novelGene_64570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1674	1973	630911	631210	TRUE	50	GGCAGCTTTAAAAAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMSSSWLIVSFRSSVSLLSFFLDVLHFTKSGVLKSPTVIVELSISLFSAVKVYVFWSLVIGCVDIYYGYVFMLDHPFHHDIVPFFVFYDGFCFKVYFI	629237	763150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_631332_761337
925627	contig_11289_pilon	+	4447	4	Intergenic	novelGene_178907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	197	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	3716	4432	455040	455914	FALSE	10	CATTCTCTGTCAGTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGIPLNICGSQRGVSLPRSSAWTERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKRSREIKSNTSSQQTALREPASAGWCFWTRTVSVGSRGGQVWVKKGREWESVYHKLLALCSPSGRSKDGARSEVLELKMRGGERQGRKKKKRKKSNTSSQQMALRQPPVRMCGIQAATVSRSRDRGRGKQRRPSRGEEGWGWESLYHQLPVVLSPTGSSMRLLSRTPCLLVSDRSPRWQIHAALAGRGPLH	436652	455929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11289_pilon_+_438050_438775_439563_453508_455186_455343
925628	contig_6063_pilon	-	2969	1	Intergenic	novelGene_27592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1910	2209	26154	25855	NA	35	TCACCTGCAATCAGAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTKNKYFFISELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKVSSILQSFFSLQWFALGRI	28063	25094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_25100_28100
925629	contig_10159_pilon	+	2489	1	Intergenic	novelGene_30816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455966	458455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_456000_458500
925630	contig_3602_pilon	+	2775	3	Intergenic	novelGene_60603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	90	2	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	38	1093	902032	913188	TRUE	35	AATTGTGTGTATAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901994	914938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135_914355_914422
925631	contig_9561_pilon	+	2802	3	Intergenic	novelGene_100852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCTCCCTACGGGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94856	131695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_+_95179_95280_97564_131498
925632	contig_8447_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_69378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAAAAAAAGGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5773	7437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_5800_7400
925633	contig_6842_pilon	-	3513	3	Intergenic	novelGene_130810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	196	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2927	3226	1681364	1681065	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESGTARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKRMAPRHPFISVVKSLLRFTIQPGSGQPHKIKRD	1684604	1680777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1682942_1683077_1683909_1684086
925634	contig_7861_pilon	-	2485	1	Intergenic	novelGene_77404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGTAAAGAAAAATTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66684	64199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7861_pilon_-_64200_66700
925635	contig_10063_pilon	-	1712	1	Intergenic	novelGene_127750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	2	430	447864	447436	NA	45	GGAGGATACATATAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPFLSPANLALNTTYAPSQRPCHTAQFREPPAHSLPGFAPPSPAGSCCATLFLLFFLSFHSFLSPSSLFSFSLSPSSEQHILSFSSCLSAPPTKRCAPKWNLCGPLDPAPLSVTSVAQTPGTCLVLLPATPYDCGPTDPVLC	447865	446153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10063_pilon_-_446200_447900
925636	contig_8554_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_160286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86211	85105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8554_pilon_-_85100_86200
925637	contig_7342_pilon	+	2621	4	Intergenic	novelGene_71129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGAGGTAGTAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83035	86202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_83642_83788_83834_83913_85686_86004
925638	contig_3942_pilon	-	2058	2	Intergenic	novelGene_128605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCCTTAGTGTTCAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79520	77390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_77681_77752
925639	contig_17453_pilon	+	2882	2	Intergenic	novelGene_175787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	38	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1414	1767	7743	20755	FALSE	45	GAAAGGTGATCCAACCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIVINETGHIKIDILGITDLKWTGIAHFELDNHMVYYAGNDKLKRNGVTFNNKRNISRSILKYNAVSDRMISICLQGRPVNTTIIQIYEPTNKAKDEEIEDFYQLLQSEID	6329	21870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17453_pilon_+_7807_20465
925640	contig_7629_pilon	-	2014	2	Intergenic	novelGene_153578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	127	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	508	843	323598	323263	FALSE	55	TTTAAATTCTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLEFSSIYAKYFSWPRLRKITEKNNYHLLHDTIQHHFPVILSKCDKYLVIKITSDIQSTVLGSEGALVGTVVKHSAANQKVTSLNPLAAPQEKDVAVCFCKDPSFGNPMG	324409	322091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_323882_324185
925641	contig_16125_pilon	+	3217	3	Intergenic	novelGene_155277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCAGTGATGTTAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162362	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_162987_163367_164630_164767
925642	contig_10861_pilon	+	2781	2	Intergenic	novelGene_39201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	67	330	372710	372973	TRUE	35	TATGTATCACTACCATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGLDLVQQALGSQAEKWQHVQMGLCWRGSSWLVVWTEDWGMGRTAETCSQAAAMVLAKEQEACPKQWEEELSVLQDALALKSQEGPHAPCRFKDAIPQSLWHLWSHRG	372643	390556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_375398_390529
925643	contig_15067_pilon	+	1653	2	Intergenic	novelGene_154315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	42	320	42	320	TRUE	20	TTGCCCAGCTTTCACATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICRRSGAPQEEAKMEHGARHSSERGGGGERQVRNQKKQEKKSNTGSQQMAPREPPAWVCGIQAAGTSRSRDRGHGKQRRPSRAKRVGVGSDTRNYRLFCLPLDAP	0	4267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_1320_3933
925644	contig_11872_pilon	-	6062	1	Intergenic	novelGene_143149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	725	1081	64495	64139	NA	20	GCAAGGTAAGCTCTGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHTFPRIYFKQSLVGISHKKGPVGPCPDAQRSPTGRLVIPGFYENKETGIDCWSKTLPMLSSVSKYLTCPFVSTHHTCSYRTKKTVALALALPPSSTPASAEPLRTTHCQRELPKL	65219	59157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11872_pilon_-_59200_65200
925645	contig_12031_pilon	-	3471	2	Intergenic	novelGene_137581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAGTCAATCACAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537882	454413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_-_455479_535476
925646	contig_8594_pilon	+	2368	3	Intergenic	novelGene_140063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	44	18	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	101	1051	488239	515792	FALSE	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGNRPQVCRMEGSGGWCWWRGAGKRHRGFIAWRRGEKGFNRYVEQIIQEAGLYKEESGIRIGERLINNLRYEDDITLLAESKEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNINKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKNFISLGSIINAHGSNSQEIKQCIALGKCAAKDLFKMLKSKDITLETKVPLTQAMVFSIASYACESWIMNKEDQRRIDAFELWCWRRILNIPWTARRMNKSVLEEVQPECSLEGRMARLRLTCFGYVIRREQSLEKDIMLGKVEGQQKRARLSMRWTDTVAATMGSSIANDCEEGAGPGSVLFCCT	488138	517109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_488276_496157_496237_514957
925647	contig_7396_pilon	-	1715	10	Intergenic	novelGene_79585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4347.11820535835	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	565	879	248211	246442	FALSE	40	GGGGAGCAGTACAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257439	245605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248283_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257294_257381
925648	contig_15165_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_145321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGTGCTATGCGTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229007	231015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_229000_231000
925649	contig_2768_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_57490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	292	594	667570	667268	NA	30	ATTTCCTGATACCTTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYVRRSLSILSSKGHSGYTSSKTDLSFQQSMVYSIFFDNTIIQRHQFFYFDLPYSLPSFRMHMRQLKITGFGSGAHLQRDIFAFNT	667861	665854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_665900_667900
925651	contig_7815_pilon	-	2195	2	Intergenic	novelGene_134389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	78	junction_1	0	13	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAGAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608847	545725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_547717_608643
925652	contig_5961_pilon	+	352	3	Intergenic	novelGene_144136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	823	junction_2	12	29	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	243	108	350	170421	175793	FALSE	25	GTGGGTCATTACATATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISP	170313	175795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_170478_172940_172984_175650
925653	contig_11318_pilon	-	2442	13	Intergenic	novelGene_48150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	544.770593920046	5	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	923	1864	49997	30548	TRUE	50	GAAAGAAAACTCGGGAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRQRKEGLCQLLWNTAVRMSFPPHLNRPPMGIPTLPPGIPPPQFPGFPPPVPPGTPMIPVPMSIMAPAPTVLVPTVSMVGKHLGARKDHPGLKLKENDENCGPTTTVFVGNISEKASDMLIRQLLAKCGLVLSWKRVQGASGKLQAFGFCEYKEPESTLRALRLLHDLQIGEKKLLVKVDAKTKAQLDEWKAKKKASNGNARPETVTNDDEESLDEETKRRDQMIKGAIEVLIREYSSELNAPSQESDSHPRKKKKEKKEDIFRRFPVAPLIPYPLITKEDINAIEMEEDKRDLISREISKFRDTHKRSYGD	50919	21144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_21173_21294_21514_27448_27736_30503_30566_31126_31211_32293_32348_33898_34085_40499_40661_41174_41233_42569_42738_44531_44582_49722_49844_49955
925654	contig_11055_pilon	-	1707	11	Intergenic	novelGene_142174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	98.3101724136419	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1374	333	1706	176488	152600	FALSE	25	CCTATATCTTCAGCCATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKDPVTDAILHTDLTLTEKEKEIELERVKAESAQVAAKMLEEMQINHQQMTEQREKSHQEHMKQLTEKIERDRVQLLADQERILALKLQEQEQCLKAEFREERIKLQEEIQDLQMRNRETSLLLEHVKAESVQTPEEMMEEIKYQQMMGQKEKSDQEYVKQLIEEMEKDRDQLLTEQDKTLALNSQETMAFKPIMEAPICLIENQNEQLMVNPKALKILDKISQPVVVVAIVGPYRTGKSYLMNRLAGQNHGFCLGSTVRSVTKGIWMWCIPHPSKPNHTLVLLDVEGLGNVKKSDPKNDSWIFILAMLLSSTFVYNSMKTIDHQALEQLYYVTELTELIRAKSSSRADEVEDSTEFVSFFPDFVWTVRDFTLELKIDGNPITEDEYLEDALKLIPGVNPKIQNSNLSRECIKNFFPKRKCFVFDQPTRDNNLLHQIEGVLEEKLDCNFQVKLKNFC	188617	152598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_152782_159355_159553_159753_159864_162131_162260_167701_167898_173506_173695_174693_174797_175941_176136_176412_176513_177112_177336_188532
925655	contig_9696_pilon	+	5323	3	Intergenic	novelGene_68755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	4385	4906	232925	233446	FALSE	20	TATGGCTTATACCTCAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKELNDAGSIKRRWKNYRVTVPKGTGRRLNISGGSYDQEQTVMKEEVQATLKALAKNKAPGIDGILMEMFQKMDATLEALTCLCQEIWKTATCPTGRDPYLCPFQRKVIQQNVEITDNIISITHTNKILLKIIQKQLQQYINRELQEIQAGFRRGCGMRAITADVRWILAES	113516	233863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_116131_168916_169032_231269
925657	contig_3529_pilon	-	3317	2	Intergenic	novelGene_105354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1652	1990	530598	530260	FALSE	20	TTAGATAATTTGTTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKVYSLQYGLHLNIKKTEILTTGPINNIMINGENIEVVKDFILFGSTTNVHGSSSQEIKRLIALGKSAAKGLFKVLKSKDITLRTKVCLTQAMVFSVNSYAYESWAVNKED	543647	528932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_-_531987_543384
925658	contig_16103_pilon	-	648	5	Intergenic	novelGene_118930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGTTGTCTGAAGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792417	789261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_789324_789462_789641_790825_791015_791766_791823_792254
925659	contig_14167_pilon	+	2873	1	Intergenic	novelGene_105536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGAAAAAACAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44509	47382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14167_pilon_+_44500_47400
925660	contig_16541_pilon	-	3153	12	Intergenic	novelGene_126716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	100.723252299154	64	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	95	1582	230706	47287	FALSE	35	AAACGAAGTTGTTTTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPGSITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPMPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPEKSSQNGESRKEMDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVVKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQELRKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTSLQDQLDKTGENKGWSGPKAGFPEPTSNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSPTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQKKKNNSLWIDQSFSKNC	244157	45715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_47341_48079_48388_67211_67273_79866_79999_85346_85485_99719_99933_103107_103216_104630_104791_177351_177488_188036_188197_230688_230755_244111
925661	contig_6164_pilon	-	3255	1	Intergenic	novelGene_121270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	1170	1823	402720	402067	NA	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRSSGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDENLAIQEAQRTPYRRDPKRKSSRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRAETIRLFAETMQARRQWGDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLLFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDEQLQLTSRI	403889	400634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_-_400600_403900
925662	scaffold_19766_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_34305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	29	90	427	516	556456	556367	NA	40	TGAGACTAACAAGGTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCRYRKPLAFTQEGGEISPSHTQLALPLVSFPPLRPQLPTSWLPPRETLVLPLSPELRHVECLRVLIRTSLFLRPLVWLLWQAGFLCLLRLQDVSSVLLGVPNGTALTKRSSTPTSGPPDSVPAEHLRVFRRPELEREPLPRMHGCGAPSWDCCKCSCPDGDCLIHPCGLL	556882	554981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_555000_556900
925664	contig_7293_pilon	-	2147	2	Intergenic	novelGene_54225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	31	96	212	307	329271	188712	FALSE	50	TATATATATATATATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELSSREHSHSRSSRSFREAGPLPSAFSKFLLLSWLVPGTSAVSSSDSSSHTCRTPNGLTLVQEVVLCLRLMVKTLLELVPRARRPQHEACHMSYCTSPDGI	329482	186871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_188753_329216
925665	contig_10765_pilon	+	3173	12	Intergenic	novelGene_122926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	2387	2824	236186	243464	TRUE	30	CTTGGCCACACAGAGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEKKGEGGGETPLSPSPKPCKRKLIQRSVAFLLRLSHAQAKAVAAFEGGWELVDGARKVIFMHCGVFLLLHSFRLRTLRNLQVIHIRQRGVKADHPCGKGVGVSRHGVTGHGERLHVMCLLRGGEGHDEVRVLQQLAGGEVLLL	197894	255648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_199339_202643_202844_203834_203944_222011_222263_225742_225842_227630_227781_236052_236242_239032_239201_242486_242650_243413_243616_252689_252860_255620
925666	contig_7513_pilon	+	8784	1	Intergenic	novelGene_88947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	555	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	7728	8207	140273	140752	NA	25	GGTCAGCAGTTCGAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLSRLHSLHASWCLSTFKSFQSVQKGRREQKEPFSTHLQVKQEKKGQGSEKPVRTVICSEVSWHTPACEGSMLASENVRIWEMGSTGGAWPSPGRAGGPPKGHSMAHVFKPALNREMFTIWFIWATFWLFSVWVTKLKRKHESVEKSEVAFICTCFFN	132545	141329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_132500_141300
925667	contig_9706_pilon	+	896	1	Intergenic	novelGene_20790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATACACTTGCTATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1740	2636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1700_2600
925668	contig_10953_pilon	+	2437	9	Intergenic	novelGene_42571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	18575.7642839904	154	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	246	833	455261	463828	TRUE	25	CACGAGCATTTGCCCCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455015	465882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817_464471_464865_465661_465715
925669	contig_15434_pilon	-	758	2	Intergenic	novelGene_56708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAATGCTTAATTTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33037	31682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_-_32354_32950
925670	contig_5023_pilon	+	1955	12	Intergenic	novelGene_7275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1303.58602032881	9	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	686	1360	629246	646990	FALSE	25	GAAGCAATCCTACTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580856	647585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580864_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618657_625714_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
925672	contig_2646_pilon	-	1904	12	Intergenic	novelGene_69648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	21.9454620772752	3	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	717	1376	2166348	2162768	TRUE	5	TCCCTGGCCTCATCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGETLRPSSGASRSGCSTSSVNTRHSSSTASTFRFSLTGFATMLTGPPKCRVNSRCWRSCEFPDGFEKFSPPILQLDEVDFYYDPAHLIFSHLSISADLESRICVVGENGTGKSTMLKLLLGDLAPVRGIRHAHRNLKIGYFSQHHVEQLDLNVSAVELLARKFPGRPEEEYRHQLGRYGISGELAVRPRCQLVWGPEEPGGLCSDDHALPQLLYSG	2168076	2162154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2162619_2162703_2162792_2162908_2163043_2163231_2163324_2163439_2163529_2164693_2164827_2165979_2166061_2166241_2166446_2166806_2166915_2167008_2167096_2167499_2167801_2167953
925673	contig_11492_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_152258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	784	1128	399767	400111	NA	65	ATAACAATCAAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVENWSTPVASIKPIAIELIPTRGNPMCVRVKLCSTVFSVADFLEVDHQAFLSRHLWVDLAAELVNHLHHRGRQKSVAFKLIPAHGNIEEKNNSFPFLNAVCQALCSVHYIHCI	398983	400619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_399000_400600
925674	contig_2703_pilon	+	2421	15	Intergenic	novelGene_101701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	881.455431982485	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	678	1502	584486	610815	FALSE	70	GCAAAAAAAAAAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRDPPGWPHAWNADGPRSVHAQHVGTKDLSIRNAHGDQQRAQQNPKRRGQNQAGAPPVPGSVSGNLWNVHTGV	526166	611734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_584435_584583_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610756
925675	contig_7457_pilon	+	3388	11	Intergenic	novelGene_31567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	56.2337976665279	23	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1047	1628	863440	865732	TRUE	15	CCCGCTTTATGGCTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTVDIRAQLLIGAGNSSQGIHMTQRDQQEVIRKFRVGILNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARAGQSVYAFVAAKGSRELRRELTNEALEALMEQAVATVQKMDQAEYQAKIRDLQREALVKRAAQAEQRLSRQQQFLAERVRLFCINCSVAVGHGSDLRKVEGAHHVNVNPNFS	859766	868012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_860042_860417_860609_861368_861486_862071_862164_862427_862620_863260_863515_864042_864193_864279_864442_865537_865734_865911_866881_867222
925676	contig_917_pilon	-	2246	3	Intergenic	novelGene_179101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	803	1537	433182	321327	FALSE	55	AGACTAAGCAACGATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPKGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSKSPRHIIITLAKTKDK	434723	320617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_917_pilon_-_321379_432499_433673_434411
925677	contig_14807_pilon	-	704	5	Intergenic	novelGene_124664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	5054.1799223514	2	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	116	607	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38871	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827
925678	contig_6163_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_103795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	22	384	59610	59248	NA	75	ATTCAAGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECGNYRTMSLISHASKILLKIIQKQLQPYIDRELPEIQAGFRRGCGMKAIIAEVRWILAVSGEYQKDVYLCFIDYAKAFDRVNHNKLRNTLRRMGIPEHLIVLMRNLYIDLEAGSSHSNGARGYCIV	59631	58102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_58100_59600
925679	contig_5799_pilon	-	1153	2	Intergenic	novelGene_50258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAGAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211212	210018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_210304_210344
925680	contig_15991_pilon	+	2524	2	Intergenic	novelGene_70949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATCGCTGGGTGTAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127122	130924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_127491_128768
925682	contig_6489_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_128928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174118	173177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_173200_174100
925683	contig_14744_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_66017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATGGCACGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	963734	961397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_961400_963700
925684	contig_2890_pilon	+	2303	1	Intergenic	novelGene_60276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	49	150	163	312	298601	298750	NA	65	AACTACAACAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIYLTGVGRGAGPGNWPPNLAGSECPTLTSLPEVHPTQRGRPLQAAPPLSITFMEVLSGHRHGDAIQALLQAHHCYVIGRHLLGSKHHMAPDGGTPGSKGNK	298438	300741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_298400_300700
925685	contig_15752_pilon	+	2284	2	Intergenic	novelGene_148780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	609	938	345629	346901	FALSE	40	CACAGAAAAAAGGCCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRGFFKCTWLASQLLGNATNQKFRNSVTDICLPKCLAANQKVSSWNPPAAPWKPCNLYGSRLLGLSPTELLGGVELLNFRLAAEHLTVAPPGLLLLSVILIAFKNTI	345020	348247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_345798_346740
925686	contig_10953_pilon	+	2840	2	Intergenic	novelGene_42603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	57	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTTCGTTCACCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461681	465827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_461983_463288
925687	contig_15629_pilon	-	440	1	Intergenic	novelGene_122431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAATAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10165	9725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_9700_10200
925689	contig_5055_pilon	+	3237	5	Intergenic	novelGene_179102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCAGCCATCTAACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21337	102800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5055_pilon_+_21539_21683_22333_22478_23801_100467_101160_102427
925690	contig_16322_pilon	-	2009	13	Intergenic	novelGene_87539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	164.586075926516	7	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	23	1696	108570	77890	FALSE	20	ATGTAATCATTTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKLVFIYMLFRVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVIATFLFAYVESTAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108592	77576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_90062_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93189_95982_96082_103787_103858_108542
925691	contig_10446_pilon	-	2527	10	Intergenic	novelGene_162438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	211.217517043859	16	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	148	1341	199781	172086	FALSE	55	ATGGAGAAAAAGTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTCQHCYRQFPTPFQLQCHIESTHTPHGFSTICKICELSFETEHVLLQHMKDNHKPGEMPYICQVCNYRSSSFSDVETHFRTSHENTKNLLCPFCLKVIKIATPYMHHYMKHQKKGIHRCTKCRLQFLTCKEKMDHKTQHHRTFIKPKQLEGLPPGTKVTIRASVGPLQSGSLPTPSISASTSTLQLSPPRTKTLTAKNPIKSNTNKPNAPKPSASKPNASKPPNGSKSKCKPKISNMQKKQNTLTGSNKKSKVNTALRNLRCRRGVYNCIECCSEIKDFANHFPTYVHCSFCRYNTSCSKAYVNHMMSFHSNRPSKRFCIFKKHSEDLRGITIVCLNCDFLTDVSGLDNMATHLSQRETHTCQVIMKTVSVCIPTSEHLSECRSSPEVPKNVQGTPGQCPPSMDTTDACSLFPKNVNNWTVRPVVGCGLKTSDLGRCPSCMARLP	200606	170899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_172282_172873_172911_173060_173180_181196_181260_187599_187741_188328_188640_190513_190649_198634_198782_199736_199838_200515
925692	contig_6361_pilon	+	1825	1	Intergenic	novelGene_23912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	236	553	202441	202758	NA	20	TACCTTTGGGTATGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTNTQTPEDKLDNWDLLKLKHECSSKDFTKRVKREPTDSEKIFGRYKSDTGPISIIYKKIQHLYNKKTYNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCLLSLAIREMQKKTTIRYHLTLALLARIKNTRNNKCWRGCGQIGTLMHCWWECMITTILESGMALPWKARNRNTIRSSNPTPRNIS	202205	204030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_202200_204000
925693	contig_13021_pilon	-	3812	4	Intergenic	novelGene_8265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	475.647161478151	61	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	3009	3440	227291	226470	FALSE	70	GAATGAAAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKKSRNFPEEENFLELSEAEYESLIYKTLHEIRKEINQNAEHAIEKIKKHNDKFNRLQESTERQQSEIQKISNKTSEADISTESHRSRIEAMEVRISEIEDKKPCRQEGNGMTYMHFQINRSSGNLQKPNQNHKKY	236226	226097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_226575_226964_228719_230502_231882_236024
925694	contig_7253_pilon	-	1642	1	Intergenic	novelGene_140202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATAGCATCCCAGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187162	185520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7253_pilon_-_185500_187200
925695	contig_5881_pilon	+	4046	1	Intergenic	novelGene_129054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	2579	2911	508017	508349	NA	15	TCCCTTCTTGGACTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCRERSGRLLPPHPGSKPKTKPVTTQSVPTHSDPRGQGRTVPEGFKGAACGFELLTFWLAAQLLTTEPSGPYPDSTSFTTDKLQKEKDMDGSKTIENNSQEECQSIVPP	505438	509484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_505400_509500
925696	contig_6533_pilon	-	2251	1	Intergenic	novelGene_114642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACAGGTAGTCCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109377	107126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_107100_109400
925697	contig_16036_pilon	-	2805	2	Intergenic	novelGene_114802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1084	1455	21424	21053	TRUE	30	ATACCTGTTTCGAAGGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTQLHLKRLCLNHCLGHRLRQMLYKTMLNVFPLILASRLITRLKSQRAPKGEVQSVTQEEVCYTPKELLDFSNMCKQKPGEYVLEWLLRVSDNGAKNINMGHSEFIDMDSLSKNTSFNVSA	22507	19624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16036_pilon_-_19759_19836
925698	contig_5003_pilon	+	3829	2	Intergenic	novelGene_120187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21295	25210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_+_22172_22257
925699	contig_11986_pilon	+	3432	3	Intergenic	novelGene_69222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGCCCGTTTCTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748475	755681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_751695_753184_753293_755576
925700	contig_6557_pilon	+	1387	1	Intergenic	novelGene_33036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	651571	652958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_651600_653000
925701	contig_11321_pilon	-	2643	1	Intergenic	novelGene_86661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	43	456	184332	183919	NA	40	AAGAGGCATGGCAAGGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGASLWPSVHQEPHGEERGGSCPKGRVMGYSFSLLQAGFAKAKADCKEGWVDLPQQLTASLGTVFLLSGQRRSRVSVSESKGRCSSSVPGQVHSPALGWPREVAISPPPHGSLLGVGRPCSEPELGCPWTSTPSTL	184374	181731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11321_pilon_-_181700_184400
925702	contig_7843_pilon	-	2898	2	Intergenic	novelGene_152036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_1	0	17	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	107	1102	334275	331861	FALSE	75	AACCAGCCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGRIISETLPASLCNSGSADAPFPDHLGQCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVSSHQHSQCQDCREGPSKDLASAAEPVNDLLSSPGASNLFSTYLARCQQYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDVEGNGPLGLRSPSESSQHTSQPERKSEQGFLGVPRSLAYTLPGCLKAEPKDSYPGPHGHSFLDLKHFTIGISGFLADEFATGAFLRLLQEQLDEISSHNPPEKPKLLEGQSCSGSRDGLQSRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQGSGERGSIILTAGGSRQWGGNRSHHKCGRKRGVHGSHPITEGTS	334381	330064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_332601_334019
925703	contig_13021_pilon	-	2223	8	Intergenic	novelGene_8244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	619.755679313079	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	128	850	236115	215441	TRUE	55	AACTCAATAAAATACTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTGMIPLWEMCLVMTLGLCGLTS	236242	205467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211989_213077_213168_215157_215506_218018_218304_231599_231882_236024
925705	contig_6445_pilon	-	2454	17	Intergenic	novelGene_76887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	855.187093473557	3	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	1459	2217	77863	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77909_80518_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89993_90107_91007_91854_96306
925706	contig_11846_pilon	-	2030	1	Intergenic	novelGene_106017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	567	1464	2030	521025	520459	NA	75	ATAAATAAAATGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIATDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMEKFLETHSLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKIIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELLPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENDRPVSLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVGFILGMQGWFNIRKAINVIHH	522488	520458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_520500_522500
925707	contig_12427_pilon	-	2224	2	Intergenic	novelGene_40559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3404	junction_1	0	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	967	1266	508003	506035	FALSE	0	TTCTCGTTTTCCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLLCRSKPAASVMSTHEPCFLFQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	508969	505076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799
925708	contig_361_pilon	-	1915	3	Intergenic	novelGene_166613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	411	1721	985239	983680	FALSE	20	GGGTGGTAAAATTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKFHENNEGNHCGKLSQLPKLTVFKRTPTEVNPECLECGRAFIDHSSHRHCIRSGCKNTCQCKKCGEACSCPYLSAPVNNLSREKPYECNQCGGDFCSVPSFQTHVRGQKGEYKEYWRICPSSLTLHKKVHNGDKPYECKECGKAFRHSSALITHIRTHSGEKPYECKECGKAFSDPSSLTTHVRIHSGERPYECKECGKAFTNSSALTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSDSSSLTAHIRIHSGERPYECKECGKAFSISSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSGSSAFTTHIRTHSGERPYECKECGKVFSQSSSLITHIRTHSGERPYECKECGKVFSNSSALTTHIRTHSGERPYGCMECGKLFSRSSHLIRHIRTHSGERPYECKECAKAFTDSSSLTRHTRVHSGETMNVSNVEKFLVIALLSVDI	985649	983485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_983746_983910_984099_984182
925709	contig_15327_pilon	-	2972	1	Intergenic	novelGene_70458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGAGTGGCCAAAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302688	299716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_299700_302700
925710	contig_12740_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_159205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTATTGACATCTTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41190	38509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12740_pilon_-_38500_41200
925711	contig_5549_pilon	+	3147	1	Intergenic	novelGene_81705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGCCTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	853378	856525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_853400_856500
925712	contig_13224_pilon	+	1714	2	Intergenic	novelGene_104088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	299	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	977	1345	219789	222784	FALSE	25	AGCTCAGTGGTGAAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLESAVHRGRQVSSECQGEMLDYRRMLMEDFSLSPEIILSCRGEIEHHCSGLHRKGRTLHCLMKVIRGEKGNLGMNCQQAVRRGFSTAVINVVFYQLMNLFLILSQLALSRTFFISVNVRY	218812	223153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13224_pilon_+_219817_222443
925713	contig_11294_pilon	-	745	1	Intergenic	novelGene_50041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTATCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148696	147951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_148000_148700
925714	contig_9435_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_156965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397489	396200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_396200_397500
925715	contig_19744_pilon	+	3144	1	Intergenic	novelGene_120355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	485	808	35549	35872	NA	10	GTTGTTGATTTGTTCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPLCCPLLPTYLPVTAVHSLKTSHLVQCLLTPGVVTIVNDFSTHVSDPIQYCYPDTLCLVTSTLIEVIPMTTAWIQHSFNYEFLSLNVLFSNDNFFISFFLFCLL	35064	38208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_35100_38200
925716	contig_2371_pilon	-	3897	1	Intergenic	novelGene_176553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	851	1183	251482	251150	NA	55	TTGCATATGTAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWPLSGSRRGSAFEALALWDFLSTLSPNSFPTGILTWSCGRRPGLQGRWTLRTSRWPATRTRVSGHRRAWLLPDPPSGLWDLSFLQRLWWCPPGLGHVPPLRVPLPTYR	252332	248435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2371_pilon_-_248400_252300
925717	contig_5765_pilon	+	2207	2	Intergenic	novelGene_141374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGAGAAAGATGTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531583	533967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_532092_532268
925718	contig_7171_pilon	+	1094	9	Intergenic	novelGene_101279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	25.3176692252664	6	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	213	776	1011876	1016709	FALSE	30	ACGAGAAACTAGTTTGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLESYKAAWILTEDHSFEDRMIDDLSKAGKPKEEEEEEVEKKPDPLHQLVLHFSRTALTEKSKLDEDYLYMAYTDIMAKSCHLEEAEEDVGAEEVEVSFEEKETEKQRLLYQQARLHTRGAAEMVLQMISACKGETGSMVSSTLKLGISILNGGNADVQQKMLDYLKDKKEVGFFQSIQALMQTCR	1010705	1017027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1010800_1011560_1011663_1011859_1011957_1012206_1012314_1014046_1014099_1014677_1014741_1016062_1016163_1016456_1016537_1016628
925719	contig_8631_pilon	-	3165	1	Intergenic	novelGene_121945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGCAGCAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675472	672307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_672300_675500
925720	contig_854_pilon	+	3445	16	Intergenic	novelGene_36619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3741.5129536355	1	123	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	756	2271	167	2437	1702628	1715383	FALSE	25	AGTACCATGTGCTACATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGGAALQGAAGQAHGHAEEHQPQLRPLHHPQQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1692683	1716391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692779_1702556_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1715310
925721	contig_4754_pilon	+	2607	6	Intergenic	novelGene_35920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAGACCAGTATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219381	344584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_221203_250626_250697_255991_256183_256367_256744_304348_304481_344567
925722	contig_11986_pilon	-	1449	10	Intergenic	novelGene_69166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	812.126290124332	4	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	688	1311	518015	507353	FALSE	15	TTACATGTCTCATCTTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFINDQYEKYLQEEININRKKRIPDTRVHCCLYFIPATGHALRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVYFKQRITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENTTHCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGNSIVSNGVEEKEPEAQEM	525493	507214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_507489_508545_508598_514823_514921_515235_515332_516431_516550_517890_518029_518366_518577_519051_519181_523616_523809_525350
925724	contig_5779_pilon	-	3243	20	Intergenic	novelGene_106461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	267.698490833362	1	106	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	639	1920	127	2046	181185	129303	TRUE	15	TCTAGGCACTCTATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NWQRSLSLDRSTWDVDSELANKLYERWKKLKNGDVCKRNVLGMTRFSHLKKSKESESFVFFLPRLIAEPGLVLNFSATALRSSVLLPVSSYPKPEAAMRLLHKWFGTDMQMINFTTGEFQLTQACPYQGVNSEESRFGILHLHLQPLEMRRVGVVFTPADYGKVTSLILIRNNLTVIDMIGVEGFGARELLKVGGRLPGMGGSLRFKVPESTLMDCRRQLKDSKQILSITKNFKVENIGPLPVTVSSLKISGYNCQGYGFEVLDCHQFSLDPNTSRDISIVFTPDFTSSWVIRELTLVTAADLEFHFTLNVTLPHHLLPLCADVVPGPSWEESFWWLTVFFVSLSLLGVILIAIQQAQYILTEFMKTRQRQNSSSSLQQNNSPVDVIGSHSHKSNCKNFLDAYGPSDKGRGRNCLPVNAPQSRIQNAAKRSPATYGHSQKKHKCSVYYSKHKAGTSLASSASTTTEEKQTLALGSSLSVLKEDLCPDVMGENWINLKYASGVNVNLQKSLTFPKNLLNKEENTLKNTFVVNNTSSECHMKEEIQICMFPKETDIKTSETMAELKDCELYPLKASKKLPENHLPRNSPQYQSDLPEISRKNNGSNQQVPVKSEADNCETLKKQGDTKSSSEKKSHKASKEDICPEKRDVPPAEQEDPYRKKKLQEKKEGNLQNLNWNKMTWM	183650	107404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_107817_108774_108915_111761_111854_113169_113291_125880_125961_126872_126952_127357_127544_129215_129317_132147_132224_156804_156957_163902_164529_164893_165044_165624_165811_166004_166192_168165_168309_171097_171226_177330_177404_178739_178799_181059_181202_183540
925725	contig_12920_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_166332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCTAAAGTACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121986	120463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_120500_122000
925726	contig_14687_pilon	-	1950	2	Intergenic	novelGene_107905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	41	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTCCCAGAATAATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442303	430602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_432087_441837
925727	contig_2209_pilon	+	794	1	Intergenic	novelGene_140995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGAAATTAAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95881	96675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_+_95900_96700
925728	contig_19352_pilon	+	1751	1	Intergenic	novelGene_122413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTGAGGAGTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319318	321069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_319300_321100
925729	contig_12597_pilon	-	1902	1	Intergenic	novelGene_179103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCATTTTGGTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116723	114821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12597_pilon_-_114800_116700
925730	SIRV6	+	950	10	FSM	SIRV6A	SIRV612	1528	10	11	567	11	-12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	163	492	247	738	1733	10736	TRUE	30	GACACGAACTTTGAGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1098	11258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
925731	contig_8631_pilon	-	1222	2	Intergenic	novelGene_121965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATAACCCACTGCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755396	753874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8631_pilon_-_754676_754975
925732	contig_6442_pilon	+	1586	1	Intergenic	novelGene_166483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTTGTTCATCTCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256790	258376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_256800_258400
925733	contig_4232_pilon	-	1088	1	Intergenic	novelGene_63342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGATTTGGAAGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468059	466971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
925734	contig_3787_pilon	+	3642	1	Intergenic	novelGene_102412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAGAAAATAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554105	557747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_554100_557700
925735	contig_14704_pilon	+	2466	1	Intergenic	novelGene_82709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTCTGACATTAATGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96442	98908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14704_pilon_+_96400_98900
925736	contig_4640_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_147971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAATCCACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412691	414698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4640_pilon_+_412700_414700
925737	contig_19076_pilon	+	3264	1	Intergenic	novelGene_74221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATGCTTTACTTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129703	132967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19076_pilon_+_129700_133000
925738	contig_10962_pilon	-	2714	18	Intergenic	novelGene_103895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	1448	1939	359078	332280	TRUE	70	GAAAGAAAAACACACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTAPATELEAAAPWGVSSVRAAEELTVSWLLSGSAIFSCRRASAAPLLPRPEPRRLQLVLAQEPVVFWRVLRLKLGSSAGGDSLRFLVDFLKLANLACNPEGPGFDVSDLEDPVPFPCYFFWDWDWMLNGNAWLCSGLFLVLPWHLVVQWRRPRLQQKTRRK	377268	311717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_311865_330863_330990_331777_332429_332516_332580_349883_349989_353005_353148_359045_359130_360525_360621_363970_364140_367187_367294_368181_368276_368468_368632_370203_370268_370357_370524_373251_373371_373497_373653_375751_375907_377158
925739	contig_9437_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_141736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1422	1721	382551	382850	NA	60	AAAAAAAGGAGAAGTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKEQNYWPERDWRNPESMASRYPFSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKWD	381129	383297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_+_381100_383300
925741	contig_4000_pilon	+	2458	2	Intergenic	novelGene_176079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	1300	2130	274491	275321	FALSE	50	AATAAAAAATCTACTATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPGGIQNKTPDDFPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHQEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIERQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFQTVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEDTLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTEYTERITEELLTENFPNIINSLGWATAKYTLWRIMGHRTGKVGQGRTVTSFESQASFEGRGNRKPRKDYFVSFFVWLFSSFFFFSCENNS	192619	275649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4000_pilon_+_193123_273694
925742	contig_16098_pilon	-	1396	10	Intergenic	novelGene_46053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1017	junction_8	1152.71669449947	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1269	126	1394	352350	348858	FALSE	20	TCCCAGCTCGGTGAGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSG	354114	348855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
925743	contig_13594_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_174826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAATCAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4146	5658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13594_pilon_+_4100_5700
925744	contig_15405_pilon	+	1012	1	Intergenic	novelGene_112106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136402	137414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15405_pilon_+_136400_137400
925745	contig_7457_pilon	-	1918	6	Intergenic	novelGene_31432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	24	junction_5	153.630205363399	273	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	27	407	473193	471097	TRUE	45	CATAACAATAAATATTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEVSASYPFSLVWWI	473219	468268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471292_471559_471667_472730_472768_473151
925746	contig_18419_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_141465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	114	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTTCAGTTTGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30492	28650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18419_pilon_-_28600_30500
925747	contig_13460_pilon	+	1307	1	Intergenic	novelGene_162184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTCCAGCATCATAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201822	203129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_201800_203100
925748	contig_678_pilon	+	3649	22	Intergenic	novelGene_167845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_20	28.7792442214729	24	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	919	2760	166	2925	495955	529000	TRUE	10	CCTTTTCTCTGGATGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKYTKFLKKISQLILEEIPKAEYSSLFNDFVESEFFLIDGDSLLITCLREKSLNWGQNLHFFYLVERYLVDLKSKGGQFAIVFFKDAEYAYISFPELLPLRSALILHLQRNTTIDVQTEFSGCLSQEWKCFLEERYPYFLIVSEEGLNDVQTHLFNFLIIQSWAMKVHVVLSSGQVSDILRLYAYLMPSKYKNQTFFKKSEKMVEGAYKTLMEQLEDSRVLTLAPLFRDVTWTNMMEEACKSLSLLKELWPEGSDIRRVLCVTSCFLSLSMYHHFLLNRKETASDQVTNNCPALQNVEDLCRMHCLSVACLLHLPLSQRARARFITSHWIKEVNSFFKMKKWCEHFILNNIDIFENLNLTHLSDLSDEPLLKNIAFYYENEHVQGLHLNLESAIAKEYEYLWNTVSNLVEGYEVGKPLPLRTTKLHFLKKNPSPIKESFKVKMPNLGFIPVSCKLVDEFVGDILKDLPFLKRDDPTVASLVKQKEFDELVHWHSHRPLSDEYDQAKCQFDEHSRDPRVLRSMQKFHVFQRFYGNSLESVSSKVIVTQTLKLKKNFSGPQSKKTHETKAEIITRENKKRLFAKEEQKEEQKWNSLSFSVEQELKENLNSGIKNLEDFLKSCKSNSVKFQVEMVGLTACLKAWKEHCQGEGKSSKDLSIAVQMMKRIHSLMDKYPELLQEADHQFIAKCLKYLGFDELASSLHPTQVSGEEIKEKKKNKYSVDIGPIRFQLQFMGHYLIRDERKDPDPRVLDFIPDTWQRELLDVVDNNESAVIVAPTSSGKTYASYYCMEKVLKESDDGVVVYVAPTKALVNQVSATVENRFSKHLPSGEALCGVFTREYRHDALNCQVLITVPACFEILLLAPHRQKWVKKIRYVIFDEVHCLGGEIGAEVWEHLLVMIRCPFLALSATISNPKHLTE	489835	546316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_489895_495848_495959_496144_496209_496962_497153_498909_499252_501165_501283_503702_503847_505519_505679_507810_507947_508737_508894_511211_511318_512449_512566_514057_514219_516809_517063_518336_518504_519208_519368_520923_521074_524608_524729_526131_526228_528880_529158_536499_536860_546109
925749	contig_15838_pilon	-	2016	3	Intergenic	novelGene_174330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	39	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1056	1379	122277	121954	FALSE	55	TGAAAAAAAAATTCAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYYPGSDKLKRNGITFIVKKNISRSILKYSTVSDRIIAICLQGRPVSTTIIQIYSPSTNASDEKIEDFYQLLQSEIDETCNRDALIIAGDWNVKIGNKQDGLVLGK	253613	121316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_123011_178569_178660_253381
925750	contig_1813_pilon	+	471	1	Intergenic	novelGene_105464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	96	470	54416	54790	NA	50	TCATACATGAAGAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVWSSVVSAGNEEGLVLGKYGLGDRKYAGDCMIEFCKTNEFFIANTFFHQHKWQLYTWISPDGIHRNQINYICGKRRWKSSVSLVRARPGASCRTDHQLLICKFKLKLKKIRTGPREPKYDLEYISPEFRDHLKNRFDTLKTNDRRIDELWNDIKD	54320	54791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_54300_54800
925751	contig_18869_pilon	-	2507	1	Intergenic	novelGene_56407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTTGCTCAGAAATGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75955	73448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_73400_76000
925752	contig_15327_pilon	-	505	1	Intergenic	novelGene_70822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAAATAAATTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1552041	1551536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1551500_1552000
925754	contig_18162_pilon	-	2365	3	Intergenic	novelGene_122301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATCTGCTTTCCCGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9150_10018_10809_16363
925755	contig_17144_pilon	+	1701	9	Intergenic	novelGene_29411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCCCTGTCGTTAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166072	183258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166402_172554_172742_173130_173211_173306_173751_174876_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181847_183155
925756	contig_8576_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_88812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1031	1426	933811	934206	NA	20	AGGGCTGGAGTCCAGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSQPPLTFESWKQELLCPQRYQLLPDSFYRRRNVGLIFSNEPISFHFRNDFWSSRQFGVLEGNGTPLPHSRRVVRPTQLGPVMSSSVTIRDSWPFGEMAFVSRTHFQHDLSGSRVLTARGFPHSPMPKLF	932780	934623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_932800_934600
925757	contig_14048_pilon	+	1561	2	Intergenic	novelGene_146347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAAAAGACCTGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636930	645849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_636953_644310
925758	contig_2646_pilon	-	3051	1	Intergenic	novelGene_69579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	202	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTGTTTATAAAAACTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334216	1331165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1331200_1334200
925759	contig_7272_pilon	-	2004	10	Intergenic	novelGene_25368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	599.03028633836	2	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	300	1704	2003	605006	604499	FALSE	35	CAAGTGGCCAGACTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNG	633169	604497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_611629_611658_616565_617709_620502_620570_632105_632194_633027
925760	contig_14513_pilon	-	1302	4	Intergenic	novelGene_70240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	184	603	18880	11982	FALSE	10	CTGCTTTTGTCCATGTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12161_13087_13136_14952_15001_18735
925761	contig_9345_pilon	+	3110	22	Intergenic	novelGene_24564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACAGCCGGCCCGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880893	922028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_881254_881646_881736_883800_883905_884982_885129_885463_885589_885854_885927_890055_890275_892942_893100_893734_893929_896573_896669_897644_897729_898482_898706_900021_900183_902070_902245_905275_905394_906192_906334_913553_913620_913749_913894_914488_914600_916128_916212_919782_919909_921910
925762	contig_15500_pilon	-	2522	1	Intergenic	novelGene_128971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	197	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	1901	2488	147562	146975	NA	45	GCATTAGAGATAAATGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKNIKVVKDFILLGSTINAHGSNSQESKRHIALGQSAAKDLFTLLKSKEVFLSTKVRLIQAMIFSITSYACKSWAMNKEDQRTDAFELWCWQRILNIPWTARGTNKSVSEEIEPECSLEARMARLCLVYFEHVIRRDQPLEKDIMPGRASAKKKEDPEQDGSTKWLQQLAQTCQRLWGWCRIRRCFILLYMGSP	149462	146940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_146900_149500
925763	contig_10494_pilon	+	1850	5	Intergenic	novelGene_102235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.0836477965032	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	744	1106	1273213	1289252	TRUE	35	GGATGGAATTGTATTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKIQGSVGTPLPGVEVRIVSENPQREACSYTVHAEGNERETKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWDKPEETKNAFTPDGWFKTAGSCSSVLQFLGLELAAYMPSYLPIFGFIGLHSL	1272469	1290457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_1273232_1277331_1277445_1283905_1284033_1289148_1289394_1289854
925764	contig_5894_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_83040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAATAAATGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408683	411388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_408700_411400
925765	contig_17144_pilon	-	2090	14	Intergenic	novelGene_29285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1688.02108150273	9	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	130	1713	179764	166445	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLDPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALEPLVPDQPSGSPSVPIPKPGG	183211	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166510_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_179751_179786_181794_181850_183158
925766	contig_11470_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_178949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	986	1351	867	502	NA	5	CCTTGTTGTTCACTCGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	1852	398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11470_pilon_-_400_1900
925767	contig_5891_pilon	+	2019	1	Intergenic	novelGene_151590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAACCAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172929	174948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5891_pilon_+_172900_174900
925768	SIRV6	+	899	9	NNC	SIRV6A	novel	1088	9	NA	NA	11	139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	42	5	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTAATTATGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1098	11107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10721_10819_11031
925769	contig_3956_pilon	+	2240	13	Intergenic	novelGene_14825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1153.02309170285	7	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	719	2157	84	2240	1281682	1289676	FALSE	10	GTGAGGGAGGCTGGGCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQ	1281598	1289676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284777_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493
925770	contig_9668_pilon	+	2298	1	Intergenic	novelGene_58092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTACAAAACCTAATATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143272	145570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_143300_145600
925771	contig_11106_pilon	+	2033	1	Intergenic	novelGene_167447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTTTTACGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120916	122949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_+_120900_122900
925772	contig_18364_pilon	+	2462	1	Intergenic	novelGene_102585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAATACAGAAAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186154	188616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_186200_188600
925773	contig_6445_pilon	-	654	5	Intergenic	novelGene_76966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	972.748425853262	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	177	512	55547	43105	FALSE	15	CTGCCCCCCCTAGCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	64162	42962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55640_64078
925774	contig_10734_pilon	+	1778	2	Intergenic	novelGene_51318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1469782	1471995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1469828_1470262
925775	contig_1516_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_49928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAACAACAAAAGGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121069	123361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_121100_123400
925776	contig_11613_pilon	+	1599	2	Intergenic	novelGene_179104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90498	134764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11613_pilon_+_91150_133816
925777	contig_6445_pilon	+	1597	1	Intergenic	novelGene_77097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	865	1215	1139743	1140093	NA	15	TATCTCTTTGGTCTGTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYMRRSLAILASKEHSGCTSSKTDFFVLAVHGIFSILHQHHNSKASFLLQSSLFIVQLSHACGATENTLVWVRHTLVLKMLFNTLKRSFAADLPSAMHMLIP	1138878	1140475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_1138900_1140500
925778	contig_17214_pilon	+	1489	2	Intergenic	novelGene_153471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80591	117964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17214_pilon_+_81056_116939
925779	contig_10323_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_123607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	248	744	298	1041	460768	460025	NA	50	AGGAAGAAAAAATTGCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFSIYQVVTTSCGPFNFLNGLLGRASDVEVKNEIVENVGRGEILQNTEQERHREDRVKDCVDTEGLHPGENTEDQKTCEDKASSPGTLANVKDEEQVTNMPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKN	461065	460024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460000_461100
925780	scaffold_12124_pilon	+	4706	7	Intergenic	novelGene_22104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_3	138.196719690929	77	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	18	353	867290	877161	TRUE	45	AAAATGATTATGTTACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAEPTMSVIWLSVFLMPVSCLLERDPDPNAPISNIRVDPRRGRVSWDLNGSVAEITCSIGSVYTSKANNNTYCQFYAFSLCKTTNYTIRVTSGPPFSTLLQYPKPDGKPGGQLRKI	867272	884600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_867354_869990_870110_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642
925781	contig_14033_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_167428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAACTAAGACACTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263297	262538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14033_pilon_-_262500_263300
925782	contig_11079_pilon	-	2128	2	Intergenic	novelGene_179105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCTGACAGCATAGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256113	141213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11079_pilon_-_142201_254972
925783	contig_753_pilon	+	5014	1	Intergenic	novelGene_113040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	197	594	3281	3874	1470676	1471269	NA	75	ATGGAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPEIQARFRRGRGMRDITADIRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFHCVDHNELWIKLCRIRIPEHLVVLMRNLYIDQEAVVRTEQGDTVWFKIRKDVRQSYNPFTILFNLCAQQITREAGLYEEECGIRIRGRLINNLRYADDTTLLTESEEDLKHLLMKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPKSNIMVNGKE	1467395	1472409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1467400_1472400
925784	contig_11855_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_66923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	15	338	849690	849367	NA	70	AAAAAAAGCTGTAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAELMTTAPPTKPNTNSSMHPGLMALCWHGETPEPGGLHRGQRDIFVVRICHSAAATKTMPSAAAFHSILQQLRGNDITPLSPPHNHRAAAPSIYAATQRDSQPIDYFPLH	849704	847417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_847400_849700
925785	contig_9739_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_165098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	298	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGATGGAAGCAACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211032	212955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_211000_213000
925786	scaffold_12124_pilon	+	2792	7	Intergenic	novelGene_22372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2171.50644714677	45	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	891	1454	1508626	1509259	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQFSPASPWVPCG	1491956	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509223
925787	contig_5485_pilon	-	2494	1	Intergenic	novelGene_37784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	762	1358	659360	658764	NA	35	ACATGAGAAACTATCTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAVPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	660121	657627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_657600_660100
925788	contig_14513_pilon	-	1324	3	Intergenic	novelGene_70361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	184	366	18880	16489	TRUE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGIPWKPKPTKQF	19063	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_16391_16523_18731
925789	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	35	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
925791	contig_16846_pilon	-	2421	2	Intergenic	novelGene_82875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	172	309	218677	218540	TRUE	45	AAGAAAAATGTGTACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIKKKKKSYYVIRLTTYIHYEIFSLQFSLQQYIRTRFSISNLLWKRFIVLLEKARLFMSELKFFITKCLRHEGVRALKMTHYARKKWVDNPNKYIAPAFAIL	218848	216248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_217621_217799
925792	contig_1107_pilon	-	2586	2	Intergenic	novelGene_126594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	435	junction_1	0	23	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGAAAAAAAAAAGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	859364	856238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_857933_858472
925793	contig_4426_pilon	-	3928	1	Intergenic	novelGene_15389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTAGTATTCCATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451108	447180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_447200_451100
925794	contig_9682_pilon	+	2331	2	Intergenic	novelGene_125307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1411	1803	425762	426154	TRUE	5	GCTCTCTGTGCGGTTGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSRPCSLEPGAWPPCSRTRLRLQPQILSTCGRLFLLCSADCLGCLVVSWLLGCLPVVMGGCPARGSLGLLHFEGAAGEGKEGARRLQVELWRFCASFWGQPSPQLVFPLRDEVLVFSLHLAQADHLTPG	424351	428903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9682_pilon_+_426317_428537
925795	contig_5317_pilon	+	875	4	Intergenic	novelGene_76514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5602.73808061737	96	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	103	513	35282	43326	FALSE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33681	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35263_35410_36684_36839_43197
925796	contig_12622_pilon	+	698	2	Intergenic	novelGene_5846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1	501	467646	475619	FALSE	85	TAAAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQQPLLTDLGWVRAGTETVGLGLYVAYLPCSPLATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTIPGVASPVAGAAARRSGGQHVPSTTPAPRVSSRKSLGWTPSGTRDKPREAIQNKTQQTPEQNRKQKSSVRHENNPLQT	467645	475816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_467907_475379
925797	contig_7963_pilon	-	1036	5	Intergenic	novelGene_58480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	861	junction_1	445.023243774974	9	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	572	829	121604	120628	TRUE	75	AGAGAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	122271	120297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054
925798	contig_17376_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_175400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCAAGCCCCCCTAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10547	11234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17376_pilon_+_10500_11200
925799	contig_10414_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_146946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	72	377	182872	183177	NA	55	AAAAAAAATGCCTAATCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDLFKVLKSKDVTLRTKVHLTQAMVFSVASYACENWIMKKEDRRRIDAFELRCWRGILDIPWTARRMNKSVLEKVQPECSLEARMARLHPTYFRHVIRRDQSLEKDIMFGRGSAKKRKTLTEMD	182800	185235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_182800_185200
925800	contig_10225_pilon	+	2375	4	Intergenic	novelGene_86862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	480.832611206852	9	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1457	1930	46299	47307	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQV	42757	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_43709_44941_45259_46110_46766_47300
925802	contig_7870_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_109098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCAAACTCATTGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845687	843018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_843000_845700
925803	contig_10726_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_132500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95044	97626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_+_95000_97600
925804	contig_17964_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_33929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTTGTGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529415	531234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_529400_531200
925805	contig_13172_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_146328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATACCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77474	78407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_+_77500_78400
925806	contig_17144_pilon	-	1667	8	Intergenic	novelGene_29463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2452.8650303559	97	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	324	1379	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLSLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183405	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167621_174906_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
925807	contig_7119_pilon	+	3042	1	Intergenic	novelGene_41041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	949	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1371	1694	463767	464090	NA	85	AAAAAAAAAAAACCAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITSCEFILAFSSCIIFLNSSIFLSVFSTNLSAFSMNLSIFLSFLSAFHFISWLALNIRDLNSLSGSSSAFSSTGRSSGILFWMPTGTILSCFFICFGIVCCLWDIQ	462396	465438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_462400_465400
925808	scaffold_12124_pilon	-	2130	9	Intergenic	novelGene_22346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAACCAAACCAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509577	1483725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494318_1496353_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508221
925809	contig_6199_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_126414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710711	708771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_708800_710700
925810	contig_17144_pilon	-	2550	2	Intergenic	novelGene_29503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	936	junction_1	0	9	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1824	2267	166806	166363	FALSE	30	TTTCTTAAGAAATTCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168872	166079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167676_167918
925811	contig_854_pilon	-	1710	2	Intergenic	novelGene_36409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2980	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAATCTTTGTCATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993926	991210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_992043_993048
925812	contig_10734_pilon	+	4879	9	Intergenic	novelGene_51199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_8	415.341707964659	12	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	3305	4405	1129441	1142903	FALSE	30	CTGGTGTTAATGTAAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1125320	1143377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
925813	contig_6062_pilon	+	3246	7	Intergenic	novelGene_5310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	321	junction_6	117.753980824429	22	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	2627	3082	815981	822602	FALSE	50	AGCTGTTAAAAATTAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNEEFADIDEDGGTFMDVLDDEGEGIPELDDEDCSQVSTKRHKRKGVDDFDFAGSFQGPRPKKKRNFNDSSLFVSAEEFGHLLDENMGSKFDNIGMNAMANKDNASLKQLKWEAERDDWLHNRDVKSIIKKKKNFKKNRLRTTQKTKKQRK	811467	822766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_+_813515_814664_814766_815502_816063_818929_819020_821615_821678_821772_821855_822462
925814	contig_16907_pilon	-	1771	6	Intergenic	novelGene_87475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	146.248282041192	15	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	44	580	502221	491525	FALSE	30	GAGTTTGAATCCCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLYYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEVR	503171	490333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_491629_493508_493608_495044_495148_499443_499537_502083_502228_503134
925815	contig_6488_pilon	+	3274	2	Intergenic	novelGene_44705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACGACACCTCCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44	6683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_3218_6582
925816	contig_13097_pilon	+	1433	8	Intergenic	novelGene_107724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_6	306.076020969048	11	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	928	1413	196348	227161	FALSE	75	TGGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGK	191008	227181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_225265_225360_226996
925817	contig_3948_pilon	+	3896	2	Intergenic	novelGene_53181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2969	3388	767335	767754	FALSE	75	ATCATTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEWMMDSWMNESADCCMDNWIDSHPVIPFEQRQLPWSEFPSLQGIRLMPSYVLTKTGPGRAMGHGWVSVGPIPTASPSSFQALTFRSRPALITIWKLSTYRMSSTLSKWPFQVISSLGGVREMVWPSTTYRGQYRKTT	764323	768262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_765563_765605
925818	contig_4232_pilon	-	2047	2	Intergenic	novelGene_63436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAACGCACAGAGACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521020	518725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_518941_519188
925819	contig_12427_pilon	+	702	1	Intergenic	novelGene_40434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGGACTTGTAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233673	234375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_233700_234400
925820	contig_7045_pilon	+	1333	1	Intergenic	novelGene_77455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACTCTCAAAAACTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348118	349451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_348100_349500
925821	contig_7009_pilon	-	2274	5	Intergenic	novelGene_23661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCTGGCAGTCAGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573413	510980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_512816_517990_518116_522864_522972_536324_536515_573396
925822	contig_17440_pilon	+	2031	1	Intergenic	novelGene_7552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946	2977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_900_3000
925823	contig_9484_pilon	+	1611	10	Intergenic	novelGene_105615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	533.559951853793	11	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	59	1255	95848	104276	TRUE	10	GTGGTTTTCTGTAGTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQVFSHGY	95789	105104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102085_104260_104412_104883
925824	contig_16110_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_126775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTGAAAATAATTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21635	18764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_18800_21600
925825	contig_7396_pilon	-	2239	16	Intergenic	novelGene_79591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2944.78157650671	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	350	1660	254680	246442	FALSE	50	CAAACTAAACACTAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254735_255049_255191_255295_255381_257014
925826	contig_10130_pilon	-	2623	2	Intergenic	novelGene_172720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	53	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	2078	2503	26254	25829	FALSE	75	TGAACCAAAAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQNFISVHGRVIFHYMYIPHFAYSFVDGHLGCFHLLAIVNNATMNTGVHVPVCVVAFKSLGCIPKSGIAGSYGSSVFSLLRNHQTVFHSGCIILHSHQQQMRSDFSISSLTPIIFQFFDSCHSKGEVVSSCGFDWHLPNG	103521	25708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10130_pilon_-_28176_103365
925827	contig_6533_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_114645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACTTAAAGCACAATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130833	129796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_-_129800_130800
925828	contig_17074_pilon	+	3291	13	Intergenic	novelGene_145123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	238.168868079399	6	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	107	1105	212372	221624	TRUE	25	TACAACCTTGCCATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLGWSSGGVCRAAHLA	207950	225573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220895_221011_221580_221690_223452
925829	contig_2093_pilon	+	1348	1	Intergenic	novelGene_153015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAAAAAAAGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1464641	1465989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1464600_1466000
925831	contig_13823_pilon	+	1630	16	Intergenic	novelGene_145269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTCTGCATTTGAAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279731	303956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_279739_281219_281329_282907_282971_284642_284798_284880_284988_286909_287064_289445_289536_293009_293155_293958_294054_294291_294370_296580_296704_298908_298967_300112_300269_300948_301058_303310_303406_303870
925832	contig_6266_pilon	-	4015	3	Intergenic	novelGene_171010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	265	666	916488	915935	TRUE	20	TATCTTTGGCTATGTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGEELLPQSRVDLKMWMESGFLGPSFVDLARLKMRRNSCKYPLIIGTWNVQSVTLGKLEVKNEMEHIKIYILGIGELKWIGIGRFESGNHMVCYAGKDKLKRSGVAFTVKKNISGSILKYNAISDKIICIRL	916752	865457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_-_868350_915477_916305_916456
925833	contig_12348_pilon	+	5119	8	Intergenic	novelGene_174505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2149	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	2301	2678	3453	4097	TRUE	55	TAACAAAAAAGAGAGCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPAIGCVESKQPAPPGQETAAAGSRGTNEQKPRDPTSVAAQTGKQLHTRMEPRSPSGKSKDGARSQALEQKEGRRQEASEKSKEAEKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQLALPSQETVAA	919	213618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12348_pilon_+_2092_2324_3475_3741_4480_65987_66221_190270_190279_204874_205562_212241_212406_212651
925834	contig_17144_pilon	-	725	5	Intergenic	novelGene_29568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	872.33479811366	25	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	588	138	725	167982	166495	FALSE	15	ACCAGCCCTCTGGGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQ	168222	166494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162
925835	contig_6677_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_114161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393609	395185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_393600_395200
925836	contig_10345_pilon	+	1265	12	Intergenic	novelGene_158359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1557.26491533359	2	51	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	71	808	11670	20524	TRUE	30	TACCCGAGAATGATGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIGM	4368	24390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14194_14672_14746_16896_16977_17188_17231_18808_18903_20420_20533_23026_23170_24084
925837	contig_3866_pilon	+	1877	1	Intergenic	novelGene_112413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATACTACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208065	209942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_+_208100_209900
925839	contig_9848_pilon	-	1678	1	Intergenic	novelGene_79931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTTTTAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77650	75972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_76000_77600
925840	contig_13542_pilon	+	3919	4	Intergenic	novelGene_131557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1032	1415	641735	642118	TRUE	35	ATGTTCCTTAGAAGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTTGTSSDLVPEDEPVRLADAQKTTGEKLPPQSRVYLNDVDGVKLLGPSFANVAQLKMRRNNCKHPLIIGMWNVRSMNLGKLEIIKNEMECININILGISELKWTGIGHFELDSHMVGHTVLGMTT	640703	799814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_643077_770766_772033_789128_789255_799660
925841	contig_4442_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_127942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTCTTCTTTGATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197456	199882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_+_197500_199900
925842	contig_233_pilon	-	2252	11	Intergenic	novelGene_14552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1409	junction_2	1032.00459785797	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	220	1812	105485	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	105704	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461
925843	contig_9582_pilon	+	4230	3	Intergenic	novelGene_106847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33.5	39	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGTAAATCTGTGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560092	564991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9582_pilon_+_560136_560762_564458_564499
925845	contig_6837_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_149829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGACCAGATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63157	61952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6837_pilon_-_62000_63200
925846	contig_15825_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_160192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1123	1434	17941	17630	NA	50	AAAAAGCTGAGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKILSPSRRPNVHHAIPHLTFWPLFSLALPGGQRTILGSTLFLKKAHSGAFAVAASSLSLEHSSPVICTDWSVCLCDSGLCPQVSSSESLVPEGSGQSWRRM	19063	17156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_17200_19100
925847	contig_10437_pilon	-	1902	15	Intergenic	novelGene_38090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	30	junction_3	57.4031571342517	12	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1638	197	1834	48239	9526	FALSE	15	CCCAGCAGTGCTGAGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATASSGPSTIGFSSVDSGVPSCTSSSASGIKRSMASEVPYASGMLIKKIGHRGVDSSGETTYKKTTSSALKGAIQLGITHTVGSLSTKPERDVLMQDFYVVESIFFPSEGSNLTPAHHYSDFRFKTYAPVAFRYFRELFGIRPDDYLYSLCNEPLIELCSSGASGSLFYVSSDDEFIIKTVQYKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCVQAGGKNIRIVVMNNLLPRSVKMHVKYDLKGSTYKRRASQKEREKPLPTLKDLDFLQDIPDGLFLDADMYNALCKTLQRDCLVLQSFKIMDYSLLVSVHNIEHAQREPLGSEAQPSLDTRRPAPQKALYSTAMESIQGEARRGGTMQTDDHMGGIPARNSKGERLLLYIGIIDVLQSYRFIKKLEHSWKALVHDGDTVSVHRPGFYAERFQRFMCTTVFKKIPLKPSPSKKFRSGASFSRRAGSSGTSCCQPTVPGEHKAQVTTKAEVEPGVHLGRPDVLPQTPPLEETSEDSLVSEPNFTPVVGEGLQTLTTSSSLLQKLEITELSH	48435	9457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_9529_9774_9818_14024_14155_14350_14492_15550_15636_15845_15895_16712_16797_17504_17711_19864_20165_20805_20959_21120_21239_21662_21794_24096_24178_26071_26104_48157
925848	contig_3942_pilon	+	611	5	Intergenic	novelGene_128710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	876	junction_2	132.444327926869	6	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	131	439	428548	429999	FALSE	30	TATGAGTCATTTGACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	428246	430171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
925849	contig_4754_pilon	+	1780	1	Intergenic	novelGene_35964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAATTGCCAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383478	385258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_383500_385300
925850	contig_13300_pilon	-	3300	2	Intergenic	novelGene_125830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	87	junction_1	0	70	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	23	331	1118382	1116784	FALSE	25	CCAGGATGCCGCTTATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRLLPRIPCSLHDLCKLCGPGMWDSGYIPAVECSGHHVGSDSCPYGGTVETSSPKLPRESKKGVKTPREGLVFRR	1118404	1113814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_1117033_1118322
925851	contig_8677_pilon	-	919	1	Intergenic	novelGene_174032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCTATTATATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86339	85420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8677_pilon_-_85400_86300
925852	contig_8377_pilon	+	2121	21	Intergenic	novelGene_34981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3398.97707075232	11	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	651	1953	169	2121	131448	180503	FALSE	30	ACAAACGTGAGTCTGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNI	68108	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68341_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164503_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
925853	contig_8651_pilon	+	1517	1	Intergenic	novelGene_168166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATTTAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132577	134094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_132600_134100
925854	contig_15517_pilon	+	2986	2	Intergenic	novelGene_176407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1601	1909	13971	14279	FALSE	70	ATTAGAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGPTSGPADSAIAEAVPDPVQSREQGGKWESFFPKGGVFDLCGTPHVSIYLLPIEGCFSLVLDGRVDSLPLGLFQCGKHLRAPICFTAHHELIWPEGLRLL	12196	15356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15517_pilon_+_12698_12871
925855	contig_16103_pilon	-	2358	2	Intergenic	novelGene_118928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATGCAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789239	786426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_788594_789048
925856	contig_14219_pilon	+	1930	2	Intergenic	novelGene_54385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATGAGATCTGTGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1072782	1077036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_1073367_1075690
925857	contig_3410_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_58934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCCAAAACTTTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47462	44474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_44500_47500
925858	contig_1735_pilon	+	2704	2	Intergenic	novelGene_106903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGCATGGGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155873	158927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_+_156861_157210
925859	contig_14445_pilon	-	2738	2	Intergenic	novelGene_137393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	932	1309	542474	446340	FALSE	30	TAAGAGTGTTGTAGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNQKGRTGSAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSMGKILNDTGSIKSGWKEYTESLYQKELVDVQPFQEVPYEQEPMVLKKEVQAVLHWQNYKAPETDRRLIEMFQQTDEALEVLTHLCQEIWKTAT	543405	444910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_446383_542139
925860	contig_15897_pilon	+	7673	35	Intergenic	novelGene_49529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_24	178.944908496488	1268	65	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1143	3432	63	3494	547767	617919	TRUE	30	GTTACAACCAGTCTAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDEMDAMIPEREMKDFQFRALKKVRIFESPEKLPKERSSLLAVSNKYGLVFAGGASGLHIFPTKSLLIQNKPGDDPNKIVDKVQSLLVPMKFPIHHLALSCDNLTLSVCMMSSEYGSIIAFFDVRTFSNEAKQQKRPFAYHKLLKDAGGMVIDMKWNPTVASMVAVCLADGSIAVLQVTETVKVCATLPSTVAVTSVCWSPKGKQLAVGKQNGTVVQYLPTLQEKKVIPCPPFYESDHPVRVLDVLWIGTYVFTIVYAAADGTLETSPDVVMALLPKKEDKHPEIFVNFMEPCYGSCTERQHHYFLSYVEEWDLVLAASAASTEVSILARQSDQINWESWLLEDSSRAELPVTDKNDDSLPMGVAIDYTNQMEITINDEKTLPPAPVLMLLSTDGVLCPFYMINQNPGIRSLIKSPEQLSLEGERQPKSSGSTPTTPTSSQAPQKIDASAAAAPTSVPPALPTASTSTFSLPSAVGASAVFSFGSSSLKSSASVTGEPPPHSVASDNSKPTLGSGAPTFSFAPPSKTPLAPTPVASPMAPSAVSFSFGSSSFKPTLESTPVPSISMPNIGMKSSFPPSASAVKANLSEKFTAVATSAPVNSSQSTPSMLPFSPASKTGSSGSLSHPTPLSAPSSSVTLKPTVSPSAAGRSAQGSPTPAFSMVQKSPRITPPVAKSGSPQAKALQPPVSEKQGHQWKESDPVMAGIGEEIAHFQKELEELKARTSKACFQVGTSEEMKMLRTESDDLHTFLLEIKETTESLHGDISTLKTTLLEGFAGVEEAREQNERSCDSGYLHLLYKRPLDPKSEAQLQEIRRLHQYVKFAVQDVNDVLDLEWDRHLEQKKKQKRLLVPERETLFNTLANNREIINQQRKRLNHLVDSLQQLRLYNQTSQWNLPSAVPSQSSTHSFDSDLESLRNALLKTTIESHTKPLPRIPAKLSPVKQAQLRNFLAKRKTPPVRSTAPASLSRSAFLSQRYYEDLDEVSSTSSISQSLESEDVRVPCKDEDAVVQVPRHTPVVRTPSIQPSLLPQATPFAKSHLIHGSSPGVIGTSISTSANKIIPQGADSTMLATKTVKHGAPSSSHLISAPQAAAAAALRRQMASQAPAVNTLTESTLKNVPQVVNVQELKNNPTASSAAMGGLI	547704	660399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_+_547812_550494_550691_551333_551486_552335_552535_553187_553259_554492_554557_555066_555171_556819_556927_557854_557922_560634_560762_564348_564511_566822_567298_569355_569532_571150_571246_573896_573984_574189_574340_575743_575903_589819_589924_593344_593528_594235_594322_594426_594511_605092_605357_606194_606357_611557_611658_617906_618033_620920_621006_623330_623393_625630_627461_629321_629393_638882_639040_649837_649991_654118_654291_657390_657531_658444_658470_659028
925861	contig_8263_pilon	-	3698	1	Intergenic	novelGene_83109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAAAATTTAACGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181051	177353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_-_177400_181100
925862	contig_12638_pilon	-	5165	1	Intergenic	novelGene_33139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCTCTTAAAGAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191216	186051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_186100_191200
925863	contig_165_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_117054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCCAGCAAAATCTGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44732	46430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_+_44700_46400
925864	contig_6479_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_160610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTGATTAAACTAGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228899	229343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_228900_229300
925865	contig_14225_pilon	+	2405	1	Intergenic	novelGene_52743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCTCCCCCATGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235711	238116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_+_235700_238100
925866	contig_6277_pilon	+	2951	1	Intergenic	novelGene_80382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTGGTTTCTGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9834	12785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_9800_12800
925867	contig_12250_pilon	+	2147	7	Intergenic	novelGene_80579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_5	45.9072131829217	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	207	737	311980	312816	TRUE	40	ACCTTTATGTCAGAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQVLLGQNT	311773	314554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_313596_313684_313753_313856_313949_314083
925868	contig_6599_pilon	-	1111	2	Intergenic	novelGene_175973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCAACTAGCCCTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
925869	contig_5253_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_61536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAACTACAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38300	36879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_36900_38300
925870	contig_11378_pilon	+	2480	2	Intergenic	novelGene_112267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	99	389	396160	396450	FALSE	35	GACACTGAGCACAGAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTKIYTLLCDPNCSPHTVTAHSSFPPDSPCPFMFSRVPPVSVRRRSLVFLLKFEFCTPPFSCSIWDSVVFPVRVVIGGSQAPSSSSGLRLMKSLVYVALSVSWAHTFLVSLVFFILLYSRWLGPIDPS	395867	398541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_395965_396158
925871	contig_4769_pilon	-	3966	3	Intergenic	novelGene_118023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3378	3695	1182942	1182625	FALSE	15	CTGTTATGTAATCTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNVLLPTYLLLGVSGLFRLIMTHVTEENCPIDFLGCNLYRSKSPGLPPSELLGKFEPPTFWLADELLTIAPPGLLLIYLPLLKKKKKAKQTNKGIMIKIRLVVA	1198322	1182353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4769_pilon_-_1184412_1196132_1197010_1197291
925872	contig_17103_pilon	-	2090	1	Intergenic	novelGene_176951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1260	1568	234237	233929	NA	45	TATACATATATATATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASTRLSPVQLDGARLPPTALTRITTEGPGQSWRRMENKILTHKKKIRFTGLTDWRNLESMAPGHPFSSVVKSLPKFTFSRGLDSLIKQNRTSKVQQSRDND	235496	233406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17103_pilon_-_233400_235500
925873	contig_15063_pilon	+	1534	5	Intergenic	novelGene_12000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2491.19469331484	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	221	691	34808	35848	TRUE	25	CAAGATGCTGGTCCTAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLRN	27148	36800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35384_35844_36158_36266
925874	contig_6842_pilon	+	3486	2	Intergenic	novelGene_130838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATACGGTTTCCAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1837568	1870927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1840997_1870869
925875	contig_4924_pilon	+	4439	1	Intergenic	novelGene_84774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	287	634	247591	247938	NA	65	CCCCCTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSLTNHQIQWLFLVCIIHLFCGTSNLQSKLNLKALPFPIPSTADCFTILPVRPKPPCHHCPNLVIKSPSFHHCHICIIQFYFHGRRCPCSGLHVLHSTQVNMLHLSSGLLEPF	247304	251743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_247300_251700
925877	contig_5019_pilon	+	4454	3	Intergenic	novelGene_109230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3563	3916	490602	551596	FALSE	65	AGAAAGAAAAGACCAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIVKNETKCINIDILGISEPKRTDIGHFESDNHMVYCAGNDNLKRNGIAFIVKKNISRSILKYNAVSDRIISILLQGRPINTTIIQIYAPTAKAKDEEFEDFYQLLQSEID	358056	552134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_+_361259_490241_490604_551244
925878	contig_9653_pilon	-	741	5	Intergenic	novelGene_48307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_1	848.389466872379	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	67	741	1015897	1006972	FALSE	55	AAAAAGAAGAAATTCCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSK	1015963	1006971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777
925879	contig_11816_pilon	-	3146	2	Intergenic	novelGene_98483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAGAGCAAAATGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473305	469798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_470208_470568
925880	contig_7775_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_37496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAGAGCGCGTCCTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247481	245804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_245800_247500
925881	contig_7179_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_78195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTTTAACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271046	1271759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_1271000_1271800
925882	contig_18328_pilon	+	1033	7	Intergenic	novelGene_132546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	445	junction_3	69.7099148057306	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	79	1032	15119	28455	FALSE	40	GTAAGAATCAGGCAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAIRSYALELNLTDSEKATCLYAKWQMNFKIRYETTSNYYKTVTIADNGTAAYNGSICGDDHSGPKIAVQFGSSFSWSVNFTKEMTTYSIDSILFSYNTNDSTTFPEAKDKGIVTVYEPVAIKIPLNNAFRCKSLSALKKNDVVQQYWDILVQAFVQNGTVSTKEFLCDKDKTSTTVAPVIHTTVPSPTVTPTPKGKPEVGTYSVNNGNGTCLLATMGLQLNITQDKAVSVININPNTTDFTGSCHPQTALLKLNSSNINYLDFGFAVKNENRFYLKEVNVSVNLGNGSVFSFVNSNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGTFQINTFNLRVQPFNVMEGKYST	15040	28456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18328_pilon_+_15161_16192_16407_20552_20712_22059_22248_23319_23443_27833_27898_28291
925883	contig_8317_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_19557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATTCAGTTTGTGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16398	17068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
925884	contig_12113_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_134753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309614	311812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_309600_311800
925885	contig_10074_pilon	+	2459	1	Intergenic	novelGene_57109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237747	240206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_237700_240200
925886	contig_10904_pilon	+	1178	1	Intergenic	novelGene_22800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	861649	862827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_861600_862800
925887	contig_1143_pilon	-	3970	4	Intergenic	novelGene_86579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTGTCTTAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315202	107096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_-_109313_283346_283354_313364_314228_314318
925890	contig_7056_pilon	+	3820	3	Intergenic	novelGene_43723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2333	2806	1010050	1010523	TRUE	50	AGTGAAAAAGAGGAAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQRNTLGISQAERTDGIGMLKDSMGKILNDTGSIKNRWKEYKESLYQKELVDVQPLQEVAYDQEPMVLKEEVQAALNGMAKNKAPGNDGIPTEMFQQMDVDAHSSMLRNLEDSFLAKRLEEIHICAHSKERRSKRMQKLSNNITNITHK	960690	1011857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_962759_1009785_1011265_1011584
925891	contig_5696_pilon	-	2460	7	Intergenic	novelGene_117539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTGTTTCTTTGTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649841	641708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_642002_643311_643399_643576_643677_644184_644294_645343_645409_647460_647569_648143
925892	scaffold_12510_pilon	+	3020	4	Intergenic	novelGene_151364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTATAAAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190774	208753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_191662_199364_199444_206082_206221_206837
925893	contig_753_pilon	+	3397	4	Intergenic	novelGene_112909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_3	28.2960539062723	5	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	22	1395	289558	301800	FALSE	70	AAGTCAGGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDDFADFMAFSNSSVSSEQKADDKYDALKEEISPIPLTSTSGSTVKSVQNAAAAPSKYDVFKQLSLEGSGLGVEELRDCTASGKSDDDFADFHSNKFSSMNSDKSLGEKAVAFRHTKEDSASVKSLDLPSIGGSSVGKEDSEDALSVQFDMKLADVGGDLKHVMSDSSLDLPTVSGQHPPAADIEDLKYAAFGTYSSNFAVSSLTSYDWSDRDDASQGRKLSPFVLSAGSGSSSAASVLQKKETPFGSSESITTTSFSKVTTFASEGVLPETTFPAFASFKDGILQTSEQKDYESGNYKDFTSQDLPSAEQSQEVTSPSPASSGASHETPKECSDDFGEFQSEKPKISKFDFLLANSQSKMKSSEEMIKSELATFDLSVQGSHKRSLSLGDKEISRSSPSPALEQPFRDRSNTLSEKPALPVIRDKYKDLTGEVEENERYAYEWRRCLGSALDVSMSLVVFTRM	289536	303802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_290084_298790_299385_300688_300853_301710
925896	contig_10246_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_46920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGTTTAGGAAATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190132	190868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_+_190100_190900
925897	contig_5062_pilon	-	3134	1	Intergenic	novelGene_157853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	97	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATATTCAATAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695371	692237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_692200_695400
925898	contig_2078_pilon	-	5489	15	Intergenic	novelGene_100182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	10	junction_7	62.8964163023099	319	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	27	1580	535379	527520	TRUE	20	AGGTGACTGTATCTGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETDRQVSMRLCLLLLLILAPGGEQSGEAPKAMVLLQPTWFPVFKGQTVTLTCKGSHSPALGDTSWYHEKKLLKEDSEELQVEKSGKYKCKTKGSSLSDPMDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTGTIKSVPTHSDPTYNRMKHCPPVLHHPHNSCYALVHCCSHCVSPSR	535405	505011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_524853_527660_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533475_534554_534576_535345
925899	contig_3866_pilon	-	988	1	Intergenic	novelGene_112382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCATGGAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125526	124538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_124500_125500
925900	contig_7707_pilon	-	1053	2	Intergenic	novelGene_72185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAATAAACAATTACACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	580793	557216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_557627_580150
925901	contig_6740_pilon	-	1430	1	Intergenic	novelGene_142652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAAAAAAAAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28878	27448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_27400_28900
925902	contig_15365_pilon	-	2060	1	Intergenic	novelGene_111128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1622	1930	33147	32839	NA	15	TATTGTTGTTGATGTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDFLTAATVGFDCEVMGNIVKNGNSRTFNCAHEETCTDEETVIRTEQGDTAWFKIRKGVHQRCILSPYLFNLYAEQIIREAGLYEEERGIRIGARLINSL	34768	32708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_32700_34800
925903	contig_11518_pilon	-	3301	1	Intergenic	novelGene_109134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGCTCATCAAATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424227	420926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_-_420900_424200
925904	contig_20199_pilon	+	848	3	Intergenic	novelGene_82599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	88	12	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACAGTCACCTTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40661	44107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_+_41249_42109_42173_43909
925905	contig_1172_pilon	+	5360	1	Intergenic	novelGene_162035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	202	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621977	627337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1172_pilon_+_622000_627300
925906	contig_17790_pilon	-	2837	1	Intergenic	novelGene_128484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	454	753	85172	84873	NA	15	TCCTTTTCTTGTGTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDWYCILSLYLFYLYAEQIIRAAGLYEEELGIRIGGRLINNLCHVDDTTSLAQSEEDLKHLLMKIKDYSFQYGLHFNIKKTKILTTGPLSNIMINRKKD	85625	82788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_-_82800_85600
925907	contig_12948_pilon	+	2267	3	Intergenic	novelGene_126162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTTTGTTATTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32668	110365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_+_33385_92213_92335_108935
925908	contig_7775_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_37477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	127	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1799	2131	119560	119892	NA	35	TCTTCAAATCTTGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMLAKNTEYIRTARRTKTSVLQEVQPECCLEVRMVKLCLTYFGHVIRRDEPPEKEVMLGKVEGQRKRGRPTTRWIDTAAATMGSSITIVRMAWDWAVFHSVTYRVTMSQN	117761	119911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_117800_119900
925909	contig_9706_pilon	-	1396	9	Intergenic	novelGene_20964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGGGTGAGGAGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367063	313492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_313512_324278_324307_337117_337217_346563_346715_350061_350139_357498_357552_363661_363762_365672_365817_366338
925910	contig_7410_pilon	+	4177	10	Intergenic	novelGene_106130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	37.0148452034059	40	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	6	971	890039	933320	TRUE	20	CTTCCCCAGCAAGTGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMAEGEEVSRRQQPHQGLRRRRRTSDPSIGVNHVSSTTSLGENYEDDDLVNSDEVMKKPCPVQIVLAHEDDHNFELDEEALEQILLQEHIRDLNIVVVSVAGAFRKGKSFLLDFMLRYMYNKDSQSWIGGHNEPLTGFTWRGGCERETTGIQVWNEVFVIDRPDGTKVAVLLMDTQGAFDSQSTIKDCATVFALSTMTSSVQVYNLSQNIQEDDLQHLQLFTEYGRLAMEEIYQKPFQTLMFLIRDWSYPYEHSYGLEGGKQFLEKRLQVKQNQHEELQNVRKHIHNCFSNLGCFLLPHPGLKVATNPSFDGRLKGGNSHSC	890033	938538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_890157_913387_913633_925098_925234_925500_925606_928657_928709_928987_929045_930558_930652_933158_935408_936330_936403_937491
925911	contig_15087_pilon	+	1438	17	Intergenic	novelGene_37214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCGTACAGGTCCTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110986	144091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_111066_113390_113517_114532_114591_116811_116908_118079_118174_126036_126091_126680_126762_127598_127687_132603_132723_133431_133527_134810_134896_136587_136665_138314_138374_139527_139650_141726_141787_143036_143125_144034
925912	contig_6199_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_126359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCCCCACATACTCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119456	120656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_119500_120700
925913	contig_3956_pilon	+	1817	6	Intergenic	novelGene_15272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1238.7103939178	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	66	1178	1287287	1289895	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQVREAGPSVHVPGAVPLREPLRASLSLTVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIW	1286550	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289934_1290409
925914	contig_4392_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_117336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1425	1778	579095	578742	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSWDWSLLITCPKYVRQSLAILTSKEHSGCTSSKTDLFILRAVHGIFNILHQHHNSKVSILLQSSVFIVQLSHVYETIENTMAWVRGILVFKVTSLLFNTLKRSFATDLPNAMHS	580519	578202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_578200_580500
925915	contig_19012_pilon	+	2378	1	Intergenic	novelGene_159500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1399	1752	125283	125636	NA	40	AAACTATATTACTTTAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTCSFLRKHHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGMRWYFIVVLICISLMASDREHFLMCWPFEFFFGEVSVHFLCPFFNRILCLFVVEVLDFLVDYGD	123884	126262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_123900_126300
925916	contig_7151_pilon	+	1866	5	Intergenic	novelGene_40746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	64	junction_1	166.66883331925	37	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTGATATTAGATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502502	506803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_502688_503293_503387_504052_504143_505033_505169_505440
925917	contig_7009_pilon	-	2681	1	Intergenic	novelGene_23645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTTCCAACCTTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457523	454842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_454800_457500
925918	contig_5039_pilon	-	1973	1	Intergenic	novelGene_65031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	363	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAAGCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1796560	1794587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1794600_1796600
925920	contig_8420_pilon	-	4546	1	Intergenic	novelGene_69359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	3202	3531	116614	116285	NA	50	TCCCTGAGTAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALTGNTIESLMEQEKSGVQNSNSSKKTRLNGLTETRGIPESMAPGLSVSPELKPFLRPLLQTKIDWTMGHKMILVKSVLLSSSRYMRLNGQLLSRGEMRSQRGSGAG	119815	115269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_-_115300_119800
925921	contig_2036_pilon	-	2394	4	Intergenic	novelGene_131809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1790	2251	422313	421557	FALSE	85	GAGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGSPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPRRKGPRRISESGSRAKGGRRQRVASENPKEAEKEKRGKKKKATPTAYKQHPKSRPPGRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPWDLISAAAQT	507096	421413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_421612_421906_422528_461584_461639_505575
925922	contig_13863_pilon	+	2607	8	Intergenic	novelGene_42020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1303	junction_2	623.017246788497	27	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	977	1723	99260	116147	FALSE	5	TTTCCTCTTTCTCGCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNK	98283	117031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114
925923	contig_6576_pilon	+	676	1	Intergenic	novelGene_42447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAAGTTTCCTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303606	1304282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1303600_1304300
925924	contig_17274_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_26488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGAAAGAAAATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31449	33594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_31400_33600
925925	contig_17008_pilon	-	1444	1	Intergenic	novelGene_124236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	24	377	46187	45834	NA	40	TGACAAACTGACAGACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDVFDVIPQLIRPSVISVQCIKSILEMVSKLQWDIFKFVLWLSWTCSNFLQLQLELVYEKLVVCSRVCPGLVLTDDIELFHCLFPHMQSILFLCIPFGEVHVHKPKKPNPLPSSRF	46210	44766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17008_pilon_-_44800_46200
925927	contig_6871_pilon	+	1731	1	Intergenic	novelGene_21674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCCCTGGAGCTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938754	940485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_938800_940500
925928	contig_13021_pilon	+	1690	1	Intergenic	novelGene_8258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGTCTGTAATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222725	224415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_222700_224400
925929	contig_3948_pilon	+	1877	12	Intergenic	novelGene_53336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1016	1387	1485692	1491198	TRUE	15	TGGCACTTGGCTGCTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFHRVPVLGVVVTHGQRVAAFGGLTVSDHEGAQHIARGQEVTFRILPADALEEPLFCLQRVNMGDIVARDIAFFLGGQGSSPPPFPRLFQDHHLVPLLEAEVFAVNGLIIIQGDHDDVLRNCL	1468142	1495121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1468447_1471755_1471891_1473201_1473354_1482576_1482656_1483426_1483601_1485520_1485750_1485882_1485986_1489827_1489927_1490736_1490842_1491191_1491234_1494195_1494313_1494783
925930	contig_846_pilon	+	4452	8	Intergenic	novelGene_136090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	36	junction_3	24.2335574384457	52	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	981	3470	4450	81578	88808	FALSE	25	TGTGACTTACAGCAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAPLRSLEEEVTCSICLDYLRDPVTIDCGHVFCRSCTTEIRPVCPLCKKPFKKENIRPVWQLASLVENIERLKVDKGRQPGEGAREQQDAKLCERHQEKLHYYCEDDGKLLCVMCRESREHRPHTAILMEKAAQPHREKILNHLTTLRRDRDKIQGFQTKGDSDILAALQKLQDQKQCIVALFETSHQFLREREQHLLDQLAKLEQELTEGREKYKARGIGELARLALVISELEDKAQQPAAELMQDTRDFLNRYPRKKFWIGKPIARVVKKRTGEFSDKLLSLQRGLREFQGKLLRDLEYKTVSVTLDPQSASGYLLLSEDWK	62573	88810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_65991_81525_81998_82169_82266_83800_84032_86568_86592_87806_87923_88177_88211_88746
925931	contig_8712_pilon	-	2290	2	Intergenic	novelGene_58745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACACACTTAAAACATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96166	93645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_95629_95859
925932	contig_15092_pilon	-	2876	8	Intergenic	novelGene_57777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	60	junction_5	120.210359837432	7	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1699	2055	303989	297845	TRUE	45	ATGGAAGAGTCATGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATR	305687	296465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944
925933	contig_5136_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_126648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324049	324793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_324000_324800
925934	contig_678_pilon	+	2595	2	Intergenic	novelGene_167793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	346	699	41884	42237	TRUE	85	GAAGAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISTSIWPTVWIKNTPLRGNLPPIYLTAPCSALGPGPASAAAKSPRPEVGPVTYPEAILPALESEQINKQRENNLLAPLSQELRVGTAPLPSHRHKGSTDSECLSPCIDLCGPISTA	41538	44214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_43033_43113
925935	contig_11825_pilon	+	577	1	Intergenic	novelGene_155408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGCCCTAACAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59220	59797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_59200_59800
925936	contig_20561_pilon	+	2813	2	Intergenic	novelGene_166364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAGTTGCAAAAAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41219	44138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20561_pilon_+_41997_42102
925937	contig_8682_pilon	-	2180	1	Intergenic	novelGene_165283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAAGGAATTGTAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146998	144818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8682_pilon_-_144800_147000
925938	contig_16125_pilon	-	1039	1	Intergenic	novelGene_155285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGATTCGAACTTATGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177346	176307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_176300_177300
925939	contig_7894_pilon	+	2778	1	Intergenic	novelGene_170789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	75	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGAGATTAGACACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228515	231293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_228500_231300
925940	contig_8377_pilon	+	1242	1	Intergenic	novelGene_34983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAGAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68112	69354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
925941	contig_16064_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_179004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAGATATAGCAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28218	29382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16064_pilon_+_28200_29400
925942	scaffold_12510_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_151392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCAAAAAAAAAAAAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343342	341683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_341700_343300
925943	contig_14445_pilon	+	1283	1	Intergenic	novelGene_137360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTCTAAGAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292572	293855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_292600_293900
925944	contig_5023_pilon	+	2844	13	Intergenic	novelGene_7348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1624.02930623188	6	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	140	1528	611764	646990	FALSE	10	GGTGTCTGTAGATGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	609662	648306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631530_639112_639197_643413_643539_646857
925945	contig_16496_pilon	-	1519	2	Intergenic	novelGene_5209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	16	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
925946	contig_13292_pilon	-	2076	1	Intergenic	novelGene_142951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGAACCACCGTCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314933	312857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_312900_314900
925947	contig_10541_pilon	-	2682	2	Intergenic	novelGene_144631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	115	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGTCAGAGCAGAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214931	123400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_125942_214790
925948	contig_12630_pilon	-	3754	6	Intergenic	novelGene_173071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	176.019771616714	8	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	52	810	100972	77421	TRUE	30	CAATTCATTTTGTGGACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRKCKPMKTETIQVSAEVR	101023	73111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_74351_75715_77476_78018_78122_81560_81810_81934_82253_100938
925949	contig_14727_pilon	-	2653	1	Intergenic	novelGene_56684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAACTGTGTGAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427986	425333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_-_425300_428000
925950	contig_9609_pilon	+	1695	1	Intergenic	novelGene_23164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAATACAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841235	842930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_841200_842900
925951	contig_15952_pilon	+	5005	1	Intergenic	novelGene_154062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	118	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	694	1089	267420	267815	NA	40	GGACTACTCAGCAGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGNSCKHPLIIGTWNVKSMNLGKLEVVKNEIDWMKIHTLGIGELKWTDIGHFQSDNHMVCSARNDIEEEWRHIHLQKEHFKVCAVSDRVISMCLQGRPVSMTVIQIYAPTTSAKDKEIEDFYHLLQSEID	266726	271731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_266700_271700
925952	contig_7318_pilon	-	1459	1	Intergenic	novelGene_152223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAAAAACTACCTTCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266955	265496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_265500_267000
925953	contig_6794_pilon	-	706	4	Intergenic	novelGene_149004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	181.272048467367	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	128	646	18797	13983	FALSE	20	TGGTCTGGAAAAGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLETKVTEELLFELFHQVSSWNQPPFLSCSGSRSSHASQDVNMPYPQHHGGNSSPTATPTSPSRYERIMDNMTLSAHTIQRSFCSPENFQRQAMMNSVSRHMSYGGKFGSIQLDQPGFSPTVQSHNHPLNQSSSSQWRQDTSSSQRKVRQNSHPYIGDRHYSREQCYTDHGSDYHYRGSREDFFYEDRNHDGWSHDYDNRRDNSRDGKWRLSRH	20627	13922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6794_pilon_-_14346_15853_15945_18732_18827_20529
925954	contig_5715_pilon	-	2885	1	Intergenic	novelGene_127970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGGATAAAAAAACAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597225	594340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_-_594300_597200
925955	contig_91_pilon	-	2602	1	Intergenic	novelGene_127107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366278	363676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_-_363700_366300
925956	contig_12277_pilon	-	2163	1	Intergenic	novelGene_139671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTGGACTAATAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97394	95231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_95200_97400
925957	contig_11512_pilon	+	2411	9	Intergenic	novelGene_43298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1455	1823	367955	374534	TRUE	10	CAGGCCTCCCGGGAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLGLVFKVGRQGEEGALPLVLAVYNGDAFLPPTEGRVVVTSQGEVRGDAFPKAIAEKGLVHAERAPGSLGLLLQSEDAFFQLKVFWRRVTGELGACTAGVAILWVRQGVVSTQQRPSATSE	366027	409418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_366084_366556_368187_368474_368604_374526_374657_378192_378296_381692_381785_382664_382764_396107_396185_409323
925958	contig_7870_pilon	+	3655	1	Intergenic	novelGene_108927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	3218	3625	267015	267422	NA	45	AATGACAACAAGGATATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACENWTMNKEARRRTDAFELWCWQGILNIPWTAKRTNKSVLEEVQSECSLEARMVKFCLTYFGHVIRRDQSLEKNIMFGKVEGQRKRRRPSTRQSDTVAATMGSSITMTVRMVQDGVVFRFVVHRLL	263797	267452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_263800_267500
925961	contig_5062_pilon	+	1443	10	Intergenic	novelGene_157835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	210.152325706855	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	21	1169	622718	743807	FALSE	65	AAAGGAAAGAGAAAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVVTGKFGERPQPKRLTREAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQMWREYALCCPRHFCIPRRLEVGPAASPSSSNFGP	622697	744081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_622738_706257_706297_716403_716500_723733_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_741864_742909_743066_743702
925962	contig_10940_pilon	+	1443	3	Intergenic	novelGene_49207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGGACCAGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	819314	839031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_+_819804_834339_834964_838701
925963	contig_5502_pilon	-	2757	1	Intergenic	novelGene_155007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCATTCCCACGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458892	456135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_-_456100_458900
925964	contig_10904_pilon	+	1694	2	Intergenic	novelGene_22556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCACTGCTAGACAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397492	405859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_397500_404172
925966	contig_10252_pilon	+	2104	2	Intergenic	novelGene_162914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATTACAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85503	93031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_+_86641_92064
925968	contig_16431_pilon	-	2446	1	Intergenic	novelGene_87611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTGCCACTGAACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195390	192944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_192900_195400
925969	contig_5967_pilon	+	886	1	Intergenic	novelGene_44395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCCTGTGGTGTTACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397104	397990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_+_397100_398000
925970	contig_15047_pilon	+	1690	6	Intergenic	novelGene_52130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	17	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	30	653	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
925971	contig_10345_pilon	+	1731	2	Intergenic	novelGene_158390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3424	junction_1	0	61	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGAGAATGATGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21746	24392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_23170_24084
925972	contig_11117_pilon	+	1045	1	Intergenic	novelGene_148585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	31	375	77057	77401	NA	55	AGTCAAAGGTTGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSWPSKKLSEPYIGETQRKAPRHIIITLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETLRLSSDYLVETMQARRQWDDIYKILKEENHQPRIIYLAKLLFKYHGEIRTFPDKQKFKGL	77026	78071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_77000_78100
925973	contig_8263_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_83076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTATGCCGAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82548	84574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_82500_84600
925974	contig_12520_pilon	+	2432	2	Intergenic	novelGene_161094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	29	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTAGGTGCTCAATAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636071	640439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_636240_638175
925975	contig_821_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_149402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTATAACAAAACTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198619	200077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_198600_200100
925976	contig_10323_pilon	+	4223	1	Intergenic	novelGene_123532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	878	1183	145692	145997	NA	35	ATCCTAGCAAATATGCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVLEEVQPECSLEARIERLRLTYFGHVIRRDLSLEKDIMLGKVQGQQKGGRPSTRWTDTVAATVGSSITTIVRMAQDWAVFRSVVHGIAVSRNRLNST	144814	149037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_144800_149000
925977	contig_15952_pilon	-	3378	17	Intergenic	novelGene_154088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_1	123.110976358731	18	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	14	1666	690905	676011	TRUE	30	AAATTCCACCTCTCAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDRFMEQFTKLKDLFYRSSNLQYFKRLIQIPQLPENPPNFLRASALSEHISPVVVIPAEASSPDSEPVLEKDDLMDMDASQQNLFDNKFDDIFGSSFSSDPFIFNSQNGVNKDEKDHLIEQLYREISGLKAQLENVKTESQRAVLQLKGRISELEAELAEQQHLRQQAADDSEFLRAELDDLKKKREDTEKAQRSLTEIERKAQANEQRYSKLKEKYSELVQSHADLLRKNAEVTKQVSVARQAQVDLEREKKELEDSFQRVSEQAQWKTQEQTEVLESLKQELATNKQELHVLQGSLETSAQSEAKWAAQITELEKERDSLMSAAACRDEELSVLREQLEHAQLKLSSTQESVEQLVKDQRKVLLTESRMAAERVVREALSQLEEPTLISCAGSADHLLSRIKSVSSCIEQLEKSWSQYLAFPEDISGLLRSVTLLAHLTGDTILHGSATCLRAPPEPADSLAETCKQYGRETLIYLASLEEDESLGKADNTALRSCLSKMAAIGEELLPRGLDIRQEELGDLVDKEMAATSAAIETATARIEVWGLLQGLLS	690918	672307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_672540_672822_672924_674631_676155_680220_680358_680437_680546_680678_680766_682592_682729_683186_683331_683570_683673_684778_684896_685303_685393_685908_686093_686786_686860_687196_687295_687614_687756_687879_687956_690888
925979	contig_7775_pilon	-	4664	1	Intergenic	novelGene_37491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	137	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	2529	3026	221774	221277	NA	70	CAAAAAGCAAGGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASPCFQNKESVNSLEEENFLELPETEYKRLICITLLEIRKEIRQNAETARQHTDTVVAELKKVIQEHNAKFNRLQESIEGQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSKIEAVEVRISDTEDKALEANLFEEKSDKRIKKNEETLRVMWDSIKRNNLRVIGVPEQGGG	224302	219638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_-_219600_224300
925980	contig_10904_pilon	+	3708	2	Intergenic	novelGene_22709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCAAGGAAAAAAATCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	637491	641243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_639868_639911
925981	contig_3241_pilon	+	1714	1	Intergenic	novelGene_146416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAAAGAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919630	921344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_919600_921300
925983	contig_2917_pilon	+	3975	3	Intergenic	novelGene_147597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1099	1545	107022	107468	TRUE	10	TGGTTCCTTGAAGCCGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEMPTHLCQEIWKTATWPTNWQRPIFVSIPKKGDPKECENYRSISLISHTSKILLKIIQITIVAVHGLAQADSEKEMERGLITADVVWVLAESREYQEDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLQRIGIPEHLIVLMRYLYTDQQAVA	105923	124059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2917_pilon_+_109737_113027_113114_123983
925984	contig_18113_pilon	+	4020	2	Intergenic	novelGene_137515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	2020	2352	36496	36828	FALSE	40	TGTCAATCACATCCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPSIAPMFSFMNFIVTGITFRSLIHLELVFVYGVRYGYCFIFLQMDIQFCQHHLLKRLLLPHVMDFHCLLKIICPQVDGFISGFSILFHRSMCLSLYQYQAVLTTIAV	34432	38496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_+_35306_35349
925985	contig_11825_pilon	-	1695	1	Intergenic	novelGene_155405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	444	800	42432	42076	NA	45	AAGTTTCAGAACTGAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKAISIKDCFKSKFPGNPKSKLKTKKWAKDMDRHFTKEDIQVANRHEEMLTFISHWRNANQNTMRYHLTSTILALIKKTKNNKCWRGCREIGTLMHCWWEYKIIYYGEQYGASLKS	42875	41180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_41200_42900
925986	contig_16639_pilon	+	988	1	Intergenic	novelGene_173756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGAAGGCACTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28057	29045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16639_pilon_+_28100_29000
925987	contig_9293_pilon	-	3390	2	Intergenic	novelGene_175198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1665	2003	99225	98887	FALSE	65	AAAATCAAATTCGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCIRISNVDPISSSMIFTVFGFIFRSLIHFKFVLLYGARYGSYFIFFADEHPVLPALFVKKTVFSPFDGLWGLVKDQVTIGGWIYIWVLNSVPLLNMSLYQYQAVLTTIAV	101022	97499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9293_pilon_-_99610_99742
925988	contig_9538_pilon	-	736	2	Intergenic	novelGene_176455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAACATGGGTCAGTCGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29368	28479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28644_28796
925989	contig_13714_pilon	-	1698	1	Intergenic	novelGene_179106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGTTATGTTTTATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2939	1241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13714_pilon_-_1200_2900
925990	contig_2798_pilon	+	2912	1	Intergenic	novelGene_120040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTAACCCCCTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135360	138272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_135400_138300
925991	contig_6445_pilon	-	1256	11	Intergenic	novelGene_76908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	796.635776249096	3	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	691	1026	55547	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96338	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55629_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85291_85477_88146_88216_88473_88594_96306
925992	scaffold_15568_pilon	-	1728	1	Intergenic	novelGene_122587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTACATATTCATATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99735	98007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_-_98000_99700
925993	contig_13481_pilon	+	3694	2	Intergenic	novelGene_119282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTATCCATAAAACAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167980	172261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_168391_168977
925994	SIRV7	+	2238	6	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	36	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCCAATCTATTGTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1001	114906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_4094_4176_4722_4808_43024_43083_114683
925995	contig_10323_pilon	+	1460	1	Intergenic	novelGene_123597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	465	995	1459	459964	460428	NA	20	TAGGCCCACTTGCTCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFLQGLAIFSSCFSSSWSLSSSVMCPRSPPVGCSFLHGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRP	458969	460429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459000_460400
925996	contig_15092_pilon	-	2033	4	Intergenic	novelGene_57799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	1462	2031	351089	325078	FALSE	20	GACAGAGACTCTGGCTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIGVFFNPISSILFSSLFLKFRSLKDAWINITQRKGDAKHKDHDSPKHGYEEIAGQQDRHNKRCGVLLLHPAKDVLIVGCPHKPREHQHHHNSSKHHVEGTQEPHDGNHHGSHHQVVGLVIEQVAHHAVVPFGDVSEVRPSEAVRAREEVVPGAQRGDLHVHISRPRVLRLRNPVAATAATDQLSWVKG	352599	325075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_325334_348138_348354_350990_351634_351682
925997	contig_15320_pilon	-	1004	11	Intergenic	novelGene_176597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_10	72.560595366907	16	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	336	1004	164308	156083	FALSE	15	CCCACCCAGCTCAGGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHVKKGNFLVLKAKELGLPVGTAAIAPIIAAVKAGKSVTFEGREILPEEICTPPDPGLAFVVVECPDEGFIQPICENAAFKRYQGKADAPVALVVHLAPESVLLDSRYQQWMERFGPDTQHLILNENCASVHNLRSRKIQTQLNLIHPDIFPPLADLRHKGEGATFRVPAVRAECLLKYQLRPRREWQRDAILTCNPDEFIAEALELPDFQESIQESRKSVQDGPAPAEKRSQYPEIVFLGTGSAIPMKIRNVSSTLVNISSDRSLLLDCGEGTLGQLCRHYGDEVDRVLGTLAAVFVSHLHADHHTGLLNILLQRERALASLGKPLHPLLVVA	166903	156082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15320_pilon_-_156125_156251_156291_156794_156934_158572_158670_160981_161101_162987_163074_163158_163298_164300_164397_165901_166015_166677_166751_166842
925998	contig_19816_pilon	-	3129	1	Intergenic	novelGene_156475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	468	845	124800	124423	NA	25	AATGTGAGTGGATGTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWSKRGRQGQSLFSGKQGPFWAPAAGSQPLTSPSFPRVPFSVHCPHHGDHCCPGSPCGHCSCGGWSCDLEEEELRYRGWA	125267	122138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_122100_125300
925999	contig_15063_pilon	+	2204	6	Intergenic	novelGene_8497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	172	junction_1	3125.35310005126	4	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1398	1949	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	26342	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_26402_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
926000	contig_6434_pilon	+	2781	1	Intergenic	novelGene_61899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAGATTATACCCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910433	913214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_910400_913200
926001	contig_6137_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_59205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1307637	1306036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1306000_1307600
926002	contig_7022_pilon	+	2614	13	Intergenic	novelGene_142120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	106.901401872109	6	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	870	2610	4	2613	34270	143618	FALSE	40	TAGAACTCTTATTAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMESGERLSSSTASSTTPTSSSTPPVASAVSKGGLSTGVASLSSTINPCGAEWWRTADVPTRTGATFFPPLLGIPPLFAPPAQNHDSSSFHSRTSGKSNRNGPEKGVNGSINGNSTSSVSGISTSVLSTTASGSTGQTKTISSGGGNRKCNQEQSKNQPLDPRADKIKDKKPRKKTMESSSNSDSDSGTSSDTSSEGISSSDSDDLEEDEEEEDQSLEESEDDDSDSESEAQHKSNNQVLLHGISDPKADGQKATEKAQEKRIHQPLPLVSESQTHSSFQSQQKQPQVLSQQLPFIFQSSQAKEESVNKHTSVIQSTGLVSNVKPLSLVNQAKKETYMKLIVPSPDVLKAGNKNTSEESSPLTSELRSKREQYKQTFPAQLKKQESSRSLKKVISALSNPKATSSSPAHPKQTLENNHPNPFLTNALLGNHQPNGVIQSVIQEAPLALTTKTKIQSRINENIATASSTPFSSPVNLSTSGRRTPGNQTPVMPSASPILHSQGKEKAVSNNVNTLQTQHHPHPAKSLVEQFRGTDSDIPSSKDSEDSNEDEEEDEEEDEEDDEDDESDDSQSESDSNSESDTEGSEEEDDDDDKDQDESDSDTEGEKTSMKLNKTASSVKSPSMSLSAHSTPRNLHIAKAPGSAPAALCSESQSPAFLGTPSSTLTSSPHSGTSKRRRVTDERELRIPLEYGWQRETRIRNFGGRLQGEVAYYAPCGKKLRQYPEVIKGMQWCLLKEEDVIPRIRAMEGRRGRPPNPDRQRAREESRMRRRKGRPPNVGNAEFVDNTDAKLLRKLQAQEIARQAAQIKLLRKLQKQEQARVAKEAKKQQAIMAAEEKRKQKEQIKIMKQQEKIKRIQQIRMEKELRAQQILE	34266	143619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_34415_97791_97960_98517_98712_108228_108433_108719_109116_116636_117241_119394_119692_120709_120771_121540_121650_133782_133994_139938_140032_140130_140193_143552
926003	contig_7165_pilon	+	1564	1	Intergenic	novelGene_116897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACTAAGACAGAGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1064723	1066287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1064700_1066300
926004	contig_6048_pilon	-	459	1	Intergenic	novelGene_73158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCATCATCAAAAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1155776	1155317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1155300_1155800
926005	contig_17901_pilon	+	2479	5	Intergenic	novelGene_179108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	402	2077	2478	190199	190600	FALSE	80	AAAAAAGAACAAAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENS	1777	190601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17901_pilon_+_2281_2575_3393_48442_48470_188308_188599_189759
926006	contig_15327_pilon	-	2765	3	Intergenic	novelGene_70619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	28	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	9	419	901528	900904	FALSE	25	AGACTCTTGATCTTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901536	898557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
926007	contig_10973_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_150345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	3	518	2086	1571	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRHQTPHSRQHLCRIHNLIQPNPNHGTPHDHTTPPEICGFSNHPSGFRTGYRIKPIHISPQIRLSTLHTQVLKHTRLLPYYYPPFSTVPRSQYQSKFSIHYYRPGLARKGYPKRPGLNTKIRLNLNLKPKRNNQIILPFLPHLSNLRPPTHNLTPPSNLNDNKNTDKQHST	2088	1534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2100
926008	contig_16303_pilon	+	1967	3	Intergenic	novelGene_34108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACCCACTTCCCAGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33145	36815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33554_35039_35766_35982
926009	contig_13097_pilon	+	2702	2	Intergenic	novelGene_107691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCAAAAAAAAAAAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156924	159913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_157397_157683
926010	contig_3747_pilon	-	2475	7	Intergenic	novelGene_24797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTCAACAACGATCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205197	200983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203125_203238_203314_203955
926011	contig_14326_pilon	+	3239	1	Intergenic	novelGene_120739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	262	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	2556	2993	468431	468868	NA	25	CATTATGGTGGCTTCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRGSLTSSLPIWMPFISSSCLTALARNSSTMLNRSSDKGLPCLVPVFKGNSCSCFQRECFQPLSIKNDVGRWFCTDTLYYVEKFPFYTYFIESFYKKWVLDFVKCLFCVN	465875	469114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_465900_469100
926012	contig_14953_pilon	-	2877	4	Intergenic	novelGene_137269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCAACATGGTAGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86955	66608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_68960_75794_75985_81221_81465_86862
926013	contig_9189_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_165110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCCAAAGAGTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273222	275015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_273200_275000
926016	contig_3095_pilon	-	1132	5	Intergenic	novelGene_75173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	412	804	226727	225674	TRUE	30	ATGGTGAGGACTAAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTRPTANPKAQTTLSVSSVIGVGISVLQKWLIQAPLVHLAVINLISRREEGEVTDLGEGMIILGKEVGLSNTFCDWMPIAEPCNVDHRRKDVVHKTDEEVGLSQHHRRLGKHCHFRNVIGCSSRVGAFN	227316	220478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_220594_225460_225710_226125_226404_226648_226828_227005
926017	contig_6058_pilon	-	1632	8	Intergenic	novelGene_172408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	312.43278460808	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	107	1192	401483	386635	TRUE	30	CAAGAAACTGTATTCTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGRERVGRYSPGGLWLSGQLSRHQRTERDEAPGDMEPAAASDPGAETADRLFAAPTAQRVRRRPPARFEKMAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQESAFLFHGNKTEAPSEKMMEAASEKTDPSPGATSASFHFGKKIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSANYFTRNTMNLKRRV	401589	385246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_390750_391339_392479_392667_395659_395744_397985_398065_401302_401398_401480
926018	contig_9972_pilon	+	673	1	Intergenic	novelGene_162800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGTCCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322924	323597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9972_pilon_+_322900_323600
926020	contig_10904_pilon	+	2042	9	Intergenic	novelGene_22675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	949	1311	542731	543093	TRUE	15	ACTGAGGGTCTCCGTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAPISALSPLTLCPPEETLGPHLSRQSGCGAGQGFTSATRMYRDHWGPTTQRSVCMHHSLYRSLWMWFTWPRVKLGLCCQGAGRGGRGEVRATHRWSDRTCHSCPLSNTAGSAGSRQHQ	537652	543988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_537771_538076_538120_539111_539169_539425_539464_539552_539595_540490_540604_541596_541649_542245_543659_543822
926021	contig_7234_pilon	-	2680	14	Intergenic	novelGene_145923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	213	junction_1	113.670915027006	2	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	141	890	510034	411977	FALSE	40	GTTACAGATTTAAACTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFWDLYCAAPERRETCEHSSEAKAFHDYSAAAAPSPVLGNIPPGDGMPVGPVPPGFFQPFMSPRYPGGPRPPLRIPNQALGGVPGSQPLLPSGMDPTRQQGHPNMGGPMQRMTPPRGMVPLGPQNYGGAMRPPLNALGGPGMPGMNMGPGGGRPWPNPTNANSIPYSSASPGNYVGPPGGGGPPGTPIMPSPADSTNSGDNMYTLMNAVPPGPNRPNFPMGPGSDGPMGGLGGMESHHMNGSLGSGDMDSISKNSPNNMSLSNQPGTPRDDGEMGGNFLNPFQSESYSPSMTMSV	587404	410186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_412007_420179_420279_425529_425559_428232_428312_431547_431619_435175_435231_437100_437137_449290_449340_454533_454602_463523_463595_464415_464483_481374_481435_509998_510089_587318
926023	contig_16883_pilon	-	1510	1	Intergenic	novelGene_161741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAACTTCAGTATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351420	349910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_349900_351400
926024	contig_11816_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_98501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581890	580752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_580800_581900
926025	contig_20842_pilon	-	466	1	Intergenic	novelGene_160982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222503	222037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20842_pilon_-_222000_222500
926026	contig_11105_pilon	+	1910	2	Intergenic	novelGene_159809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CATTAAAAAAAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173231	256611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11105_pilon_+_173398_254867
926027	contig_6795_pilon	+	2746	2	Intergenic	novelGene_27694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1059	1571	85574	86174	FALSE	45	CTTAAGTGAGAATAACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLILSSIVSNLLLSPSMTLFISEIFLFIFWISNSCFCIISSCEIYFSISFLYYFLEFFHFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSNAFSFSGRSSGVLLWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLVGYTFFVVCSSVGTILFTSFPNEQGHLGMVQQGRSN	84515	87349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_85976_86063
926028	contig_15031_pilon	+	2772	2	Intergenic	novelGene_138415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	289	762	130666	131139	TRUE	20	GAGGTTCATCCATGTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHWKGTFIYAKKFGRQLAIRPTDWKRSVFMPIPKKGEPTECGNYRTVSLISHTSKILLKTIQKQLQQYVIRELPETQAGFRRGGRTRDMIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYEKAFDCVDHNKLWITLQRMGIPKHLIVLMRNLYTDQEAVVRT	130377	133208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15031_pilon_+_131531_131589
926029	contig_11186_pilon	+	541	1	Intergenic	novelGene_98882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACAAAAAAAACCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271449	271990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11186_pilon_+_271400_272000
926030	contig_6412_pilon	+	1447	1	Intergenic	novelGene_149982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATACAAGTTGAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618534	619981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_618500_620000
926031	contig_20527_pilon	-	3760	6	Intergenic	novelGene_138610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGTAGCTAACACTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29186	22186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_23738_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308_28530_28603
926033	contig_10438_pilon	-	2176	1	Intergenic	novelGene_161682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATGTATATTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92370	90194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10438_pilon_-_90200_92400
926034	scaffold_9100_pilon	+	1259	8	Intergenic	novelGene_83285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	603.913191491246	4	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	26	745	647136	653338	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSMR	647110	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653328_653449_654139_654347_654653
926035	contig_13283_pilon	+	2282	2	Intergenic	novelGene_154017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCCCTTCTTTTCCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48555	51628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_+_49647_50437
926036	contig_3602_pilon	+	1764	6	Intergenic	novelGene_60488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1148.77214450908	16	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	788	1105	169952	170269	FALSE	25	AAGGGAGGGGAGGGATGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPATLWARGTGRGLPGGRSRDRGIVVLVGFGPEGGHRARESRKLAFSYHLRGRLIVGGQGGQHSDPIGCTSETTGDWLSAVRLGGGELLSWPLCKASMPTFLK	161604	170928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_161774_168468_168595_168760_168857_169145_169282_169422_169679_169947
926037	contig_3627_pilon	-	4051	2	Intergenic	novelGene_78415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	351	131	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2974	3417	24132	23689	FALSE	40	GTCCAATAATTGGAAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSGIPLYICASRGVVPLPHSTAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPGIPPARQPILGSISTLERSSTAPQEEARMAHGARYERKEGEVVRGKEAIKRSRKKSNTSSQQMALREPASVGWWNPSSQCFSDKRLCPREAEGAKCG	108948	23054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_25017_106859
926038	contig_8317_pilon	+	812	1	Intergenic	novelGene_20122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16437	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17200
926039	contig_1725_pilon	+	3599	16	Intergenic	novelGene_24264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	587.606013130113	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1743	83	1825	201480	248928	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSAERLRPHVRIAALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKVSWFY	201397	253467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_249157_250979_251188_252129
926040	contig_5815_pilon	+	2315	5	Intergenic	novelGene_141209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	249.783281065807	10	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	60	410	561980	567824	FALSE	35	TAAACCTCATAATCGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDPNADTEWNDILRKKGILPSKESSGELEKEAEEEERRALQEAVVKTYEAMTLEELEDKEDEFNEEDERAIEMYRQQRLAEWKAAKLKNQFGEVLEISGKDYVQEVTKAGFPSVP	561920	569729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_+_561986_564317_564448_566543_566635_566892_566997_567804
926041	contig_3382_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_124046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAAAGAAAGAAGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214927	212353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_212400_214900
926042	contig_5769_pilon	+	2685	1	Intergenic	novelGene_138759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141369	144054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5769_pilon_+_141400_144100
926043	scaffold_9100_pilon	-	1071	1	Intergenic	novelGene_83227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATACACCACGACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326472	325401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_325400_326500
926044	contig_8106_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_139733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTCAGCATATAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75117	74128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_-_74100_75100
926045	contig_299_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_129478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTATCTTTGGCTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1385313	1384496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_-_1384500_1385300
926046	contig_10904_pilon	-	2529	7	Intergenic	novelGene_22525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	412.213941216613	2	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	247	891	354723	352112	TRUE	25	AGGTTCTCAGCCAGGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSLEPCNLTENLAEFLLTDLQQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVTLQCQKPYNVVDYIRFSLLKEGMSEPIRHWRPLGNMAGFSLQNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTATTLGDNPSVSPSTTSGDYTKGNVIRLGLAALVLIIIGAFLIEAWYSQKESPRGSSFPGKQ	362499	348256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_348347_348712_350104_351954_352131_352530_352697_353957_354255_354560_354852_362381
926047	contig_8552_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_80106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCACCTAGCTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561581	563346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_561600_563300
926048	contig_3018_pilon	+	1547	12	Intergenic	novelGene_78850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCTCATTGCAAACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562928	600155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_563044_566733_566846_567964_568088_569965_570088_570203_570434_572320_572360_576712_576887_577774_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008
926049	contig_5961_pilon	+	1683	11	Intergenic	novelGene_144113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	460	junction_1	515.717403235532	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	510	1530	154	1683	144074	202087	FALSE	60	GAAAATGAAATCACAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDE	113742	202087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775
926050	contig_8312_pilon	-	2710	1	Intergenic	novelGene_152913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCAAATTCCTCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1562839	1560129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_1560100_1562800
926051	contig_7887_pilon	+	1826	10	Intergenic	novelGene_124870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	56.4698105731978	5	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	31	960	186133	203804	TRUE	70	CCAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VVSEQEFRNRMIEQYHNHSDHYCLNLDSGMVIDSYRMGNEARFINHSCDPNCEMQKWSVNGVYRIGLYALKDMPAGTELTYDYNFHSFNVEKQQLCKCGFEKCRGIIGGKSQRMNGLSSSKSSQPVVTHKRPGRSKEKRKSKHKLKKRRGHLSEEPSENINTPTRLTPQLQMKPMSNRERNFVLKHHVFLVRNWEKIRQKQEEVKHTSDNIHSASLYTRWNGICRDDGNIKSDVFLTQFSALQTARSVRTRRLAAAEENVEVARAARLAQIFKEICDGIVSYKDSSRQALAAPLLNLPPKKKNADYYEKISDPPGPRHH	185989	205702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_186013_186125_186273_193137_193247_196303_196469_196618_196714_200511_200670_201803_201957_203613_203669_203749_203884_204915
926052	contig_12654_pilon	-	4293	25	Intergenic	novelGene_129277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAACGAAGATGAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	736727	687224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_-_687525_688078_688272_689701_689907_690457_690678_690795_690942_691578_691770_693757_693929_696414_696775_701081_701248_703479_703536_705911_706093_706407_706542_710701_710814_712273_712434_712982_713120_718650_718786_720586_720785_722409_722475_726471_726608_727102_727259_730461_730538_731071_731329_734138_734232_734326_734444_736399
926053	contig_854_pilon	-	2620	11	Intergenic	novelGene_36710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	12	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1568	2248	1714455	1710659	TRUE	15	CTCCTTGAAGGAGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFLRELTSRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLCGTDMVAQQYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAPLPLLLAISSASSSRSCWAWRLARSAAASSSCS	1716405	1705372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1705380_1709634_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712420_1713055_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
926055	SIRV3	-	619	3	NNC	SIRV3B	novel	479	3	NA	NA	6	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	45	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTCTCGTCATAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1976	1013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_-_1354_1559_1765_1902
926056	contig_5039_pilon	-	778	1	Intergenic	novelGene_64777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTATTCCTTCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130453	129675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_129700_130500
926057	contig_6276_pilon	-	3567	12	Intergenic	novelGene_174127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1900	2487	217214	213286	TRUE	20	CCTGGAGCGGAGGAGCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVVSQLLHTDAHHPAGHRPHCHAGDEETRWDLAKGEYGNDNFEDKRQGQLPHGRVYPKPGWPVRNVVHRPGHVGVIDVVTELGGLKGTAVIEQLGNELAGALACVRVRVGNDGGDGGDHDDLQHRVLPQLGGFTPPAPGDVTADEEGSPQAPKDPQQDEGEEFSHVPGGVIFHIEEDKAAVAKGVDGSQCEGRH	237875	176447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_-_176614_197198_197355_198290_198397_202898_203084_207033_207156_211419_211627_211728_211825_213243_213774_217114_217302_218809_219212_225299_225516_236681
926058	contig_15282_pilon	+	2218	8	Intergenic	novelGene_177715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_1	64.2155172295702	20	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	332	937	24048	43988	FALSE	80	TAAAAAGGAAAAAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKKKKPKLLNKFDKTIKAELDAAEKLRKRGKIEEAVNAFEELVRKYPHSPRARYGKAQCEDDLAEKRRSNEVLRGAIETYQEVASLPDVPADLVKLSLKRRSERQQFLGHMRGSLMTLKRLVQLFPNDTSLKNDLGVGYLLIGDNENAKKVYEEVLNVTPNDGFAKVHYGFILKAQNKIAESIPYLKEGIESGDPGTDDGRFYFHLGDAMQRVGNKEAYKWYELGHMRGHFASVWQRSLYNVKGLKAQPWWTSKETGYTELVKSLERNWKLIRDEGLAVMDKARGLFLPEDENLREKGDWSQFTLWQQGAL	7077	45269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15282_pilon_+_7166_14531_14619_22323_22475_24042_24180_27219_27319_31511_31602_36305_36444_43841
926059	contig_8538_pilon	+	1507	3	Intergenic	novelGene_4640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	8	2457	junction_2	3187.5	152	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	64	1437	841232	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRRGRCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840314	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228_842497_842952
926060	contig_2278_pilon	+	2305	1	Intergenic	novelGene_118101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCAAGAGGCCATAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728273	730578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_728300_730600
926061	contig_11525_pilon	-	1480	3	Intergenic	novelGene_171063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCAAAAAAAACCCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3758	870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11525_pilon_-_1703_2012_2390_3487
926062	contig_11422_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_98984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	670	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_700
926063	contig_17144_pilon	-	1551	9	Intergenic	novelGene_29253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1911.71138969772	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	768	1256	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183174	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167614_174677_174761_174876_175001_175971_176271_179700_179786_181794_181850_183158
926064	contig_19930_pilon	+	3272	1	Intergenic	novelGene_178989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	354	2919	3272	25697	26050	NA	15	GCACTGGAGGTGCTCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTHLAFLKLKELKTKFKPQVAVLKDSTGKIVNDAGSIKRRWKEYAESLYQKELVHVQPFQQVAYDQELMVLKEEVQAALKALAKKKKKKAPGIDGIPTEMFQQMDA	22778	26050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19930_pilon_+_22800_26000
926065	contig_11505_pilon	+	3988	1	Intergenic	novelGene_140940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAGAAAGCCTTCCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330270	334258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_330300_334300
926066	contig_19559_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_163430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	273	822	844	1665	64080	64901	NA	15	GCTCAGGGTTCCAGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALTATCHVGGEAGVEVSRVSRDTEAPTATPQVGGVADGGRSVVDDQGCGSSLLLARWAGQQGDISRWGCMGGREGLYCGPHAHRVTGRGGVVPPITRRVGRGGACSSGHWSWVASNRDLALTKCKEMRGCPESSQVGELLLTLYGSVTLCVPSTLMIRNCLVSCPVSGSDSLLALWTPESLELSPSFLYFPSIDLVYVLLALLHSGYVYTDSPSPTGNSIKMPSCAPQAESLLASSQDSHAVLGQLAGHLHSISLLVHFFCSVSSSSRCLI	63236	64922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19559_pilon_+_63200_64900
926067	contig_13004_pilon	+	1661	5	Intergenic	novelGene_112734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	417.431431495042	1	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	218	649	923834	928299	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VALSPVRCLRSGSRTLTLVLPRALPEYGAAVLREYPADTPGQAGPTAAGGPAKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	922445	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922602_923772_923840_926864_926989_927531_927669_928134
926068	contig_7457_pilon	-	3002	8	Intergenic	novelGene_31503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2214	2528	669780	664159	TRUE	40	CACGTTCTATTGAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEVAHSEVKSMSNVRDSNCPPAEGSAPSPLFPNCINEWCHTDKLGLQVWGSTTWVSFRVLLALWSTILSKRFLFRNVRVEIDQRRHQDVGGIHDLIAHDDFSK	671993	661795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_661925_662946_663001_663253_663353_663462_663604_664107_664316_668470_668514_668843_668906_669727
926070	contig_11823_pilon	+	1776	1	Intergenic	novelGene_171026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1249	1665	44278	44694	NA	10	TGTGGGGCAGTTCTACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTPLRHVWLPRCCPAYAGLQAHSPEATCLSPQAASRPSRCPGRLQCYRVHGGSRCFPPPCPNLLSGVGIPTVNVTVGSRCQVSPQLMATPHTMGSGRWDPGGFHCLIFTSRSPNFSSWFESGSSTETCSAFTATSIQ	43029	44805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_43000_44800
926071	contig_16303_pilon	-	2362	8	Intergenic	novelGene_34046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	674.151923772773	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	88	1200	47976	35759	TRUE	25	AGTCTTCAGACATGATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48063	32071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33092_35616_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
926072	contig_5623_pilon	-	2776	4	Intergenic	novelGene_154829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_1	221.604753258288	66	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	657	1583	210277	208132	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKVNQDHHSRQDTRCSQTSQGFAPRDASQEGLSVVDPMGHSYLMHPSSPPTGQQPKQDSCCLALVLGLLQTCSWPRSTHLPSSGHRLFIQRMRGWIR	210933	206938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_208553_208959_209106_209280_209405_210041
926073	contig_8557_pilon	-	433	1	Intergenic	novelGene_179109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAGAGGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622451	622018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8557_pilon_-_622000_622500
926074	contig_20378_pilon	-	1674	1	Intergenic	novelGene_159580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGCAGTAATAATGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121704	120030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_120000_121700
926075	contig_7866_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_171204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTTGAGAAAGACAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423124	424163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7866_pilon_+_423100_424200
926076	contig_4782_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_73614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161837	159289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159300_161800
926077	contig_19982_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_179110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGACAGTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2310	731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19982_pilon_-_700_2300
926078	contig_10109_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_131332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGAATTCGTGCTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191201	188779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_188800_191200
926079	contig_5236_pilon	+	2421	18	Intergenic	novelGene_100879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	159.119354128062	2	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	104	2158	62791	84050	FALSE	30	GGATTTTGTAAAAATGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEASEWCPGTSVTMSVHQALTVSEMLRLGIKTLSLTSWKKHTPQNIGWSEYTR	60622	84313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68453_69712_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81807_83310_83427_84046
926080	contig_15047_pilon	+	1617	6	Intergenic	novelGene_52121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	13	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	30	410	2194	3329	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQTGASSAGTVSGPMMAPTTSP	2164	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2816_3266_3498_4158_4434_4552_4687_21013
926081	contig_3077_pilon	+	1156	5	Intergenic	novelGene_26773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1723.93856836605	9	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	161	658	15176	17590	FALSE	10	TGCGGCACTTGCTTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGVRPQDITAPCSKARRTQVLTDSTMLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	13863	18088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_13986_15137_15259_16170_16328_16936_17054_17449
926082	contig_6048_pilon	-	1534	1	Intergenic	novelGene_73178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	927	1400	1279409	1278936	NA	70	AAAAAAAAACCAGCCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWVRALGRARLRGASNQVVACTQLPWFLLLGRAGALWPGARSVTGPGQAGICVWSPRERTQTLSFLPSGRSELTLQHGTCLSNNQISTGEKLECGNFLCGANTEKLEVQVHPEVPCKKGPGIYFQKTSQRGGPHTIKKAVPGAERVLWTGVPAQRIS	1280335	1278801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_1278800_1280300
926083	contig_9653_pilon	+	5659	1	Intergenic	novelGene_48203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	405	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	4162	4464	189280	189582	NA	75	CATTAAAAAAATAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSAVTHGVTLSRHGPPSVPAPACRERALGYRDSLPGGGHRCPAPDGSRWHEAAAGVSQEGWQPIWEWGGRTATAPSHRLASVKIYSLGNRMGQFFSAL	185118	190777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_185100_190800
926084	contig_8661_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_137937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATCCACTATCAGCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303695	302878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_-_302900_303700
926085	contig_10444_pilon	+	1749	2	Intergenic	novelGene_139471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	0	15	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1743	5	1747	887230	890231	FALSE	45	ATTGGTCATCAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMFLPALVPDRDGNSNLEEAGKQPETSEDLGKNILPSVSAEHSGDLKPSPADPGSVREDSGFLCWKKGCNQVFKTSAALQTHFSEVHTKRPQLPVSDRHVYKYRCNQCSLAFKTIEKLQLHSQYHVIRAATMCCLCQRSFRTFQALKKHLETNHLELSEADIQQLYGGLLVNGDLLAMGDPTLAEDHTIIVEEDKEEESDLEDKQSPTGSDSGSVQEDSGSEPKRALPFRKGPNFTMEKFLDPSRPYKCTVCKESFTQKNILLVHYNSVSHLHKLKRALQESATGQPEPTSSPDNKPFKCNTCNVAYSQSSTLEIHMRSVLHQTKARAAKLEAASGSNNGTGNSSSVSLSSSTPSPVSTSSSNTFTTTNPSSAGIAPSSNLLSQVPTESVGMLPLGNPIGANIASPSEPKEANRKKLADMIASRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQAQTLTQAQAQAQVQAHLQQELQQQAALIQSQLFNPTLLPHFPMTTETLLQLQQQQHLLFPFYIPSAEFQLNPEVSLPVTSGALTLTGTGPGLLEDLKAQVQIPQQSHQQILQQQQQSQLSLSQSHSTLLQPSQHPEKKN	887225	890233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_887300_888558
926086	contig_2703_pilon	+	2350	16	Intergenic	novelGene_101730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1058.61098929997	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	268	1515	559489	610870	FALSE	15	ATGTCTGCCCAGGGGCCGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526199	611705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_594568_594674_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
926087	contig_3270_pilon	-	2054	1	Intergenic	novelGene_104484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTTCATACCCACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319226	317172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_317200_319200
926088	contig_8377_pilon	+	4331	29	Intergenic	novelGene_34933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3272.07035092119	5	67	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1059	3180	83	3262	68257	198034	FALSE	35	TTTATTTAAAATATTTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEENRYTVE	68093	199103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197848_198008
926089	contig_4114_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_15630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATCAAAATGGAAAATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473702	472493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_472500_473700
926090	contig_17976_pilon	-	1774	3	Intergenic	novelGene_32518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACTGGGACAGTCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47966	41665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41855_45522_45583_46441
926091	contig_16643_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_158112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	188	532	163870	164214	NA	75	ACAATAAAAATAAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDVMLEDKPLRLKGTQNTTGEELLPQSSVNLNDMDGVKLLGPSFAEVARLKMRRNSCKRPLIIRTWNVRSMSLGKLKLIKNEMECTNMDILGISELKWTGIGRFELDNHKVLS	163682	165247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_163700_165200
926092	contig_8285_pilon	-	1772	2	Intergenic	novelGene_174980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1425	1742	994706	994389	FALSE	25	TAGAGCTTTACTTATCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFIVFDFIFRSLIDFELVFIYGVRYGCCFIFFADGHPVLPALFVKKTVFFPFDGLWAPVEDQVTIGGWIYISVLNSVPLVSVSVVAPVPGYFDYCSCTVGSEVR	1025853	994358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8285_pilon_-_995153_1024875
926093	contig_9901_pilon	+	1119	1	Intergenic	novelGene_126940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCATTTTTAGTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200830	201949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9901_pilon_+_200800_201900
926094	contig_13300_pilon	-	2295	4	Intergenic	novelGene_125808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	25.9529488797623	1	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2	397	250806	248617	TRUE	35	CCCGGAATCTGAAGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRLGLGGVLDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250807	244138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247440_247547_248782_250575
926095	contig_5539_pilon	-	3895	2	Intergenic	novelGene_104765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	52	312	159238	158978	TRUE	75	ACAAAAACAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNSCKHPLIIRTWKVRSMNLGKLEVVKNETGHINIHILGISGIGHSESDNHMIYYAGNDKLKRIGIALIVKKNISRSILKYNTVRDRIISISLQGRPVNGTIT	159289	155271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_157948_158070
926096	contig_4900_pilon	+	2240	5	Intergenic	novelGene_159065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	483	977	1180473	1180967	TRUE	45	GATAAAGGAAAGCCCATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVKVTGLQNLVRECPHGVEGEASCVSRGQEEEGKICSSVKTVRTHASSGRIPGKALSWPLEDSPTAQASNPQLANIIALCRILFHACFMLLDFTCSSRLFCPPAESQTPGQRQPSSHGSHLLATPWPWSSIQGTHHFFPVHLSEGLVHLTQGPPECGAMVCPD	1179990	1188254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_1181715_1184601_1184685_1185056_1185176_1185906_1186024_1188057
926097	contig_160_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_156331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250072	248585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_-_248600_250100
926098	contig_17144_pilon	-	2125	4	Intergenic	novelGene_29565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_1	950.532949922773	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1509	1952	166806	166363	FALSE	10	CTGTGGACTGGGCCTCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168911	166189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167331_167581_167676_167918_168060_168162
926099	contig_3956_pilon	+	2408	12	Intergenic	novelGene_15229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1184.14015252691	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	78	1889	1284252	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284174	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287440_1288040_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
926100	contig_17602_pilon	-	3913	8	Intergenic	novelGene_174495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	65.9576239965124	196	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	109	1092	43803	26148	FALSE	15	TTTTATATCGATTGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNTVFMCLVLSTSSEALVTTGFATFLPKFIENQFGLSSSFAATLGGAVLIPGAALGQILGGVIVSKFKLTCKNTMKFSLCTSVVALVLSFVFVYTKCENGPFAGVLEPYKGTGELRNLTAPCNANCNCLRSYYYPVCGEDRVQYFSPCFAGCTNSVSERQPKVYYNCSCIEGTIEITSAESFYFEAKPGKCETQCANLPIFLGIFFVTLIFTFMAGTPITVSILRCVNNKQRSLALGIQFMFLRLLGTIPGPIVFGITIDSTCVLWDINECGVKGACWVYNNIKMAHMLVAISVTCKFITIFFNGLAVVLYRPPPSDTDVSFQKEL	51081	23326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17602_pilon_-_26252_28417_28556_29991_30057_31842_32031_36589_36744_43091_43288_43664_43810_50979
926101	contig_6361_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_23918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	451	795	228688	229032	NA	10	CTCTGGCCTCCCTCCAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPNNNILLCYCLWPQLSHLSFIFLDESPSSTLTCCPYPNSLNTLIKLKTMLRTVFFGGVGIRESYIPYNSKSNILVPKKEKYTCVPFHFFFPQCIRALQVTSELERSELPTNN	228237	230755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_228200_230800
926102	contig_7555_pilon	-	381	2	Intergenic	novelGene_179111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAAAGAAAAAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99362	98837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7555_pilon_-_99116_99259
926103	contig_19744_pilon	+	3634	16	Intergenic	novelGene_120363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	194	junction_15	104.982326554944	65	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1159	3477	158	3634	107568	177984	FALSE	80	AAGGAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIEFDPQCGTAQSEDVLRLLIPVRTVQNSGYGPKLTSVHENLNSWIELKKFAGSSGWPSMVLVLPGNEALFSLETASDYVKDDKASFYGFKCFAIGYEFSPGPDEGVIQLEKELANLGGVCAAALMKKDLALPIGNELEEDLEILEEAALQVCKTHSGILGKGLALSHSPTILEALEGNLPLQIQSNEQSFLDDFIACVPGSSGGRLARWLQPDSYADPQKTSLILNKDDIRCGWPTTITVQTKDQYGDVVHVPNMKVEVKAVPVSQKKTSLQQEQVKKSQRIPGSPAVTAASSNTDMTFGGLASPKLDVSYEPMIVKEARYIAITMMKVYENYSFEELRFASPTPKRPSENMLIRVNNDGSYCANWTPGAIGLYTIHVTIDGIEIDAGLEVKVKDPPKGMVPPGTQLVKPKAEPQPNKVRKFVAKDSAGLRIRSHPSLQSEQIGIVKVNGTITFIDEIHNDDGVWLRLNDETIKKYVPNMNGYTEAWCLSFNQHLGKSLLVPVDEPKTNTDDFFKDINSCCSQEATMQEQDMPFLRGGPGMYKVVKTGPSGHNIRSCPNLRGIPIGMLVLGNKVKAVGEVTNSEGTWVQLDKNSMVEFCESDEGEAWSLARDRGGNQYLRHEDEQVLLDQNSQTPPPSPFSVQAFNKGASCSAQGFDYGLGNNKGDRGNVSTSSRPVSTSGKSELSSKHSRSLKPDGRMSRTATDQKKPRGTEGLSASESLMLKSDAAKLRSDSHSRSLSPNHNTLQTLKSEGRMSSSLRAESPGPGSRSSSPKPKTLPASRSSPPGAGSPRSSSPHDKNLPQKSAAPVKTKLDPPRERSKSDSYTLDPDTLRKKKMPLTEPLRGRSTSPKPKSVPKDSKGSPGSENRAPSPHVVQENLHSEVVEVCTSSTLKTNSLTDSTCDESSEFKSVDEGSNKVHFSIGKAPLKDEQEMRASPKISRKCANRHTRLKKEKSSFLFKGDGSKPLEPAKQAMSPSVAECARAVFASFLWHEGIVHDAMACSSFLKFNPELSKEHAPIRSSLNSQQPTEEKETKLKNRHSLEISSALNMFNIAPHGPDISKMGSINKNKVLSMLKEPPLHEKCEDGKAETTFEMSMHHTMKSKSPLPLTLQHLVAFWEDISLATIKAASQNMIFPSPGSCAVLKKKECEKENKKAK	107410	177984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_107767_109166_109286_109896_109985_112280_112331_115990_116164_117380_117526_122039_122256_130481_130538_133818_133935_137853_137952_138751_138869_139774_139916_151814_152040_152925_153059_156119_156243_176506
926104	contig_5945_pilon	-	1475	7	Intergenic	novelGene_104555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	312.076913596632	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	11	487	249693	224540	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHG	249703	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219591_224366_224541_225665_225778_226433_226536_235617_235755_249568
926106	contig_11318_pilon	-	2349	2	Intergenic	novelGene_48167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1077	1376	109012	108713	FALSE	5	GGATCTGGCCTTTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESNTARWCPATTTDCSDQDHNRGSWTELEKDVEQNSNTQKKTRFTGLTRDWRNPESMVPRHPFNSVVKSLPTFTVQPGVGQPHKTKWD	138913	107739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_-_109751_138575
926107	contig_11372_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_176658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTACAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558707	557413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11372_pilon_-_557400_558700
926108	contig_2829_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_174999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATGAATGGTAGCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286962	288301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2829_pilon_+_287000_288300
926109	contig_13760_pilon	-	1520	3	Intergenic	novelGene_61285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	550	897	164646	164299	TRUE	5	TCTTCTGTCTCTCACGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNGDSKNYYDSYAGFPLSVVACGQWPLQPLPGWLLTVWSLQITRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKGISPTLLCDLGQPAHRFQPSWAGKDSPSVDYEGLTEL	165195	161432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_161964_163253_163266_164218
926110	contig_10726_pilon	+	4600	1	Intergenic	novelGene_132501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAATAGAGCCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99683	104283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_+_99700_104300
926112	contig_12790_pilon	-	2383	2	Intergenic	novelGene_35180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATCAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42995	40565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_42850_42896
926113	contig_14822_pilon	-	2124	2	Intergenic	novelGene_145388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCTGTATTTGAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161560	12154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_-_13085_160366
926114	contig_1725_pilon	+	2729	4	Intergenic	novelGene_24285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1399	junction_1	183.47812464221	16	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	7	555	201480	218570	FALSE	35	GGTATGACCTCAACTATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVCEPSF	201473	220744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445
926115	contig_12852_pilon	+	2283	3	Intergenic	novelGene_141449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	241	561	540715	541035	TRUE	35	TCCAAGAGCTTTAGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEIAGKEGITDTKQVSRTQYISPQGFENNPLFSDTIHKIALCADSRYWLHSLDSEWRPLSPALQLHLSGPLEQQLHSLSFRRTILLVHLSGDSTLRNTRGHGYTL	534856	542817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12852_pilon_+_534868_540485_542108_542167
926116	contig_9177_pilon	-	9052	12	Intergenic	novelGene_32710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	19	junction_11	670.138174971191	1332	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	702	1985	597961	571122	FALSE	55	CCACCACAGAAATAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSNRQPPSVRPSQHHFSGERCNTPARNRRSPPVRRQRGRRDRLSRHNSVSQDENYHHLPYAQQQAIEEPRAFHPPNVSPRLLHPAAHPPQQNAVMVDIHDQLHQGTVPVSYTVTTVAPHGIPLCTGQHIPACSAQQVPGCSVVFSGQHLPVCSVPPPMLQACSVQHLPVPYAAFPPLISSDPFLLHPPHLSPHHPPHLPPPGQFVPFQTQQSRSPLQRIENEVELLGEHLPVGGFTYPPSAHPPTLPPSAPLQFLTHDPLHQEVSFGVPYPPFMPRRLTGRSRYRSQQPIPPPPYHPSLLPYVLSMLPVPPTVGPTFSFELDVEDGEVENYEALLNLAERLGEAKPRGLTKADIEQLPSYRFNPNNHQSEQTLCVVCMCDFESRQLLRVLPCNHEFHAKCVDKWLKANRTCPICRADASEVHRDSE	618498	564054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_571185_573608_573709_575781_575904_579673_579759_580660_580768_581259_581422_583495_583667_585881_586050_591999_592214_597869_598064_610074_610225_618049
926117	contig_5686_pilon	-	2967	2	Intergenic	novelGene_45411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATGGGTGGTGGCTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231135	178760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_180955_230362
926118	contig_11285_pilon	-	2340	22	Intergenic	novelGene_5706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	436.490456215651	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	195	2153	796496	784252	FALSE	5	CCCCTCCGCCAGCGTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSHFGFSLDFYKDSSGSVGIVVGAPRALDRSSEETGGVFLCRWRAEGGQCTSLPFNLKDDTQNMGSQTFQTFKAGQGLGASVVSWRDYIVACAPWQHWNVLENTEEAEKTPVGGCWVAHLQSGGRAEYSPCRANTMSRVYVQNDFSHDKRYCEVGFSSLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGADNVLELRMDATNKGEGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798397	784064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785792_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793780_795707_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
926119	contig_15825_pilon	+	1964	1	Intergenic	novelGene_160202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTTAAAGTTTCCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108614	110578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_+_108600_110600
926120	scaffold_13505_pilon	-	3163	3	Intergenic	novelGene_111513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	181	junction_2	3	88	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592625	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_589279_589810_589843_590205
926122	contig_11293_pilon	-	1933	1	Intergenic	novelGene_134665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATAATCACCAAAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28677	26744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_26700_28700
926123	contig_10990_pilon	-	2718	11	Intergenic	novelGene_7438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCGCCCGGCTACAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	733093	708529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_708669_709186_709251_709347_709395_714556_714612_715525_715994_722232_722431_723510_723631_729669_729796_731217_731421_731544_731661_731911
926124	contig_11493_pilon	-	3511	1	Intergenic	novelGene_143704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCGGCACCTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242035	238524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_238500_242000
926125	contig_2730_pilon	-	2362	1	Intergenic	novelGene_135389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	138	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAATATGTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369835	367473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_-_367500_369800
926126	contig_5439_pilon	+	4136	4	Intergenic	novelGene_178268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	416	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1595	2185	1707	2297	TRUE	70	AATAAACAACAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRILQELKQKADKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGRKQKTQRGSLKNC	112	62746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5439_pilon_+_2664_6378_6859_61517_62368_62491
926127	contig_15304_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_30632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	545	1132	98998	99585	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLVMSLTFGICPALSTSIPRPGLDPEIEPEEGSRMSVFFSPTSLPILQFCKLEGTPQMPCLGHHTIDILYDRPLSTRSEPGVPRTLWRSEGGSLRFMQSCGKDGAQAQPSRQGLRAKTYSRWRTLWVAVFSACVWVCPAVFWPRLAVQVCKWTDDSLRALSAAGIGLAGGTPLCLQGPSSQERRTHPGTSAPRP	98453	100264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_98500_100300
926128	contig_18108_pilon	-	3037	1	Intergenic	novelGene_33461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2487	2792	112429	112124	NA	30	CTACTCACTCCCCAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILLSSSSHDPVHMVGQNCQPSTLMWAPYPQTIRKLAKTYSVFPEPNTPQNGIDYHLYGCSCSVSLSNFSASISPLNAGVRQDSVLFLSLSELIQAHRSH	114915	111878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_111900_114900
926129	contig_19098_pilon	+	3242	3	Intergenic	novelGene_65824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGTAGACTGTCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365329	409693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_+_365781_366362_366623_407162
926130	contig_2646_pilon	+	765	1	Intergenic	novelGene_69604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1515934	1516699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1515900_1516700
926131	contig_10765_pilon	+	3552	1	Intergenic	novelGene_122961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	126	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGCGACAGATGAGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371999	375551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_372000_375600
926132	contig_10599_pilon	-	3477	2	Intergenic	novelGene_49881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	52	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTACTATTTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151998	141209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_144670_151981
926133	contig_4125_pilon	-	1453	2	Intergenic	novelGene_25046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAATGATAAGAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206280	204653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_205740_205913
926134	contig_5023_pilon	+	2059	13	Intergenic	novelGene_7228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2420.29655408634	8	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	87	1091	607279	625757	TRUE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDLSQPLMWSEGIPS	580842	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622608_625714_625845_629210_629290_643471_643539_646857
926135	contig_17144_pilon	-	1548	9	Intergenic	novelGene_29202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1598.60931750068	13	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	126	1334	172541	166282	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQ	172666	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_166405_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528
926136	contig_593_pilon	+	1501	12	Intergenic	novelGene_101988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	160.929942151831	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	321	893	300334	420118	TRUE	10	GCCACGTCTGGTGTTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPRMESCLAQVLQKDVGKRLQVGQELIDYFSDKQKSADLEHDQTMLDKLVDGLATSWVNSSNYKVVLLGMDILSALVTRLQDRFKAQIGTVLPSLIDRLGDAKDSVREQDQALLLKIMDQAANPQYVWDRMLGGFKHKNFRTREGICLCLIATLNASGAHTLTLSKIVPHICNLLGDPNSQVECNFYKI	259023	482770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_259059_300048_300529_383566_383646_385617_385722_386475_386568_388564_388641_420091_420160_471623_471777_479016_479095_480193_480287_481277_481424_482673
926137	contig_15327_pilon	+	1847	1	Intergenic	novelGene_70604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	56	171	181	351	898735	898905	NA	15	TAGCTGCCAGGTTTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNLNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898554	900401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_898600_900400
926138	contig_3948_pilon	-	2230	5	Intergenic	novelGene_53204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	126.256435479543	1	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	14	568	856580	840803	FALSE	25	GAGTGTCATGTCTTCTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	856593	839140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852636_856565
926139	contig_2438_pilon	+	1010	3	Intergenic	novelGene_112070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_1	2892.5	3	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	69	356	312035	312871	FALSE	5	GGACTCTGGCTGTGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPPARPSSRWSRSLSFCKQPSPMASTPLTSSRLWTSGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	311966	313525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312083_312310_312409_312729
926140	contig_10225_pilon	+	1196	2	Intergenic	novelGene_86869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	190	729	46299	47259	FALSE	45	TTGAAATATAAACATCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSQMT	46109	47726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_46824_47244
926142	contig_9098_pilon	-	1426	9	Intergenic	novelGene_75792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_8	405.399629224053	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	374	1174	288130	264388	FALSE	20	AACTTGTAGTTTTTCTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWWFQQGLSFLPSALVIWTAAAFIFSYITAITLHHVDPVLPYISDTGTVAPEKCLFGAMLNVTAVLCVATIYVRYKQVHALNPEENRIIRLNKAGLVLGLLSCLGLSIVANFQKTTLFLAHVSGAVLTFGLGSLYMFVQTILSYQMQPRIHGKQVFWIRLLMVIWCAVSAFSMLTCSSLLYNGSFGTDIVQKLHWNPEDKGYVLHMITTAAEWSMSFSFVCFFLTYIRDFQKISLRVEANLQGLTLYDTAPCPVNNERTRLLSRDL	290970	264135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_264496_265551_265645_266729_266813_267336_267515_282568_282709_283905_283974_287999_288160_289190_289280_290715
926143	contig_11160_pilon	+	2762	1	Intergenic	novelGene_168805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307392	310154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_307400_310200
926144	contig_6410_pilon	-	2718	1	Intergenic	novelGene_108640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGCCCACATCACCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366312	363594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_-_363600_366300
926147	contig_17281_pilon	+	560	1	Intergenic	novelGene_105180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGAGGCAGGGCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2049	2609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_+_2000_2600
926148	contig_14807_pilon	+	1931	12	Intergenic	novelGene_124724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	814	1212	54525	55450	TRUE	20	CCAGCCCAGGGCCCGAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRQHFDLKGPPRHFFVPIEHRDAVGPLTAWHVVDSLGTISVVHHVHWLHQAFGPLHFDLEWGHARLAGVHLEGLREVGTDHAWAQTRPRALHLGRIRHIMHRDLEGTAWHLVATIGDVEAVSAGLIGDVLD	50895	56415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_50942_51032_51142_51267_51363_51469_51720_53839_54026_54397_54554_54642_54768_55119_55294_55379_55543_55623_55782_55862_56035_56118
926149	contig_10801_pilon	+	2315	1	Intergenic	novelGene_74061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTAATTTATAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361497	363812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_361500_363800
926150	contig_12836_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_170417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181193	180085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12836_pilon_-_180100_181200
926151	contig_17274_pilon	+	4414	1	Intergenic	novelGene_26484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGCAGTGTAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27387	31801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_27400_31800
926152	contig_10197_pilon	-	3865	3	Intergenic	novelGene_115334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1676590	1672416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1675032_1675270_1675407_1675476
926153	contig_6445_pilon	-	1696	16	Intergenic	novelGene_76961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	803.08537251998	2	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	216	1481	89674	43105	FALSE	60	GACAATTAAAAAAGATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96753	42889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88152_88216_88473_88594_89656_89714_96577
926154	contig_19402_pilon	+	4096	16	Intergenic	novelGene_80798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1234.57026261503	3	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	408	1619	57720	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	36984	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_145822_146261
926155	contig_9482_pilon	-	1255	4	Intergenic	novelGene_44255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGACAAGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738685	734591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_735581_735890_736048_737395_737484_738664
926156	contig_4782_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_73618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGCATGATTAGAAGAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161821	159532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159500_161800
926157	contig_11656_pilon	+	2195	17	Intergenic	novelGene_54029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	138.140327203898	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	517	1554	255	1808	520424	536519	FALSE	15	CCCCTGACCCCTCCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKQLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQAEEEEQNSLEQAS	489365	536906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_489395_508478_508572_513738_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523724_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
926158	contig_7378_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_120240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1161	1484	183358	183681	NA	35	CAACTACGTGAGTCAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKLDSIHVINSDSTLRRQLFPSHILRAFQHEGLIFWHFTRQCSPAMHKVSLANFSEADFQVLLPSLSYSGSSAESYPSRVTLLVFEIPVAKLPVSQPRTSHHSMTN	182197	184347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_182200_184300
926159	contig_10482_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_152842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAAGAGAAGTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143061	144880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_143100_144900
926160	contig_12427_pilon	-	2099	2	Intergenic	novelGene_40481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2507	junction_1	0	3	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	951	1265	316061	315651	FALSE	30	ACCTTAGGCATTAATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDGKYLTLPFPTLLELGEVSMYYCSIALGRIFPF	317011	314816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_315842_315937
926161	contig_9177_pilon	+	1863	7	Intergenic	novelGene_32626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTCCCTGTCACCTCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21305	25405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_21390_21607_21689_21866_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24824_24930
926162	contig_4732_pilon	-	2552	5	Intergenic	novelGene_75498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	19.382659776202	27	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1857	533	2389	1028208	1002282	FALSE	25	CTTTAAAGCATAGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVFEDVTVEFTQEEWALLDFSQRKLYTDVMMDTLRNLDSVFQQDNNGQMSTKNDSWSSMLGEICEFHGIEHPHNNQGKHMRKYSVESLWESKDGEVNKDEEGHHCRESFSWIGNLTRLKRTTGVNPFECLECGKAFMDHSSFKSHIRSCTGKKPYHCKECGEDCTCPYQKPRVREKVCKCKDYGKPCSCSLPLTKHIRTHSGEKLYECKECGKAFNYLSNLTRHIRTHSEERPYKCKECGKAFRCSSSLSVHLKSHSGEKPYACKECGKAFCRPSDLSRHTRTHSGEKPHECKECGKTFTFSSSLTIHIRSHSGEKPYECKQCGKAFSRSSHLTTHIITHSEERPYECKECRKAFKQFAQLSRHVRVHGGEKPYECKECGKAFSEFSQLTKHVRIHSGEKPYECKECGKAFSRSSYLSAHIITHSEERPYECKECGKAFKQFSRLTRHVRVHSGEKPYTCKECGKAFCELSQLTRHVTVHSGYRPYKCKECGKSFSRFSYLTGHIRVHSGHRPYKCKECGKAFNQSSHLTTHMRSHSGERPYKCKECGKAFFQSSHLTDHVRTHSGEKPYECKECEKDFSCFSSFRKHVRTYHGHRPSDSKEYGKAFSSHTSLII	1035612	1002118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_1003888_1004241_1004366_1005572_1005697_1028205_1028437_1035308
926163	contig_12120_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_21433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTCAGCCACGTAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135366	133421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_133400_135400
926164	contig_10050_pilon	+	4442	5	Intergenic	novelGene_119627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1873	2202	336778	350814	TRUE	35	ATCAATCTCAGACCTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVKCLCIVSKTQVNIFLVLSAFSQDPSDISNDIPHSMSSSRSDLNFWQSPVDVLLQSLLNGLQQNFTCVVLLLLGAVESVPTHSNPVYNRMKHCPVLHHPHNRCYA	218145	492374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_219834_336593_336993_350699_351410_352646_353150_491232
926165	contig_5452_pilon	+	3025	2	Intergenic	novelGene_101027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGTGGGGATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528224	532631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_529067_530448
926166	contig_15047_pilon	+	1548	6	Intergenic	novelGene_52145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3027.57826653581	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	11	36	515	550	3482	4178	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPESSVQGHGVPDPPAAALGGPGPDPSRPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2610_2814_3254_3498_4158_4434_4552_4687_21013
926167	contig_3602_pilon	-	559	1	Intergenic	novelGene_60565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCAGTGAGTTTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513741	513182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_513200_513700
926168	contig_11253_pilon	+	2044	1	Intergenic	novelGene_126810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGTTTAAAACATGTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12980	15024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_+_13000_15000
926169	contig_11779_pilon	+	1088	1	Intergenic	novelGene_146444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGAGGTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9504	10592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_+_9500_10600
926170	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
926171	contig_546_pilon	+	3244	1	Intergenic	novelGene_117198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1437	1742	91339	91644	NA	10	GATTGTCCTGGCGTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFHQFLEPYFSPVPSVQLGLFSSVPLVLDHMLSPEMAEYQPVLFGTVTLYIPSIFPSCFLRRSISCPQNLSVFNLRLVFFLSALQMLSMFFSFDFLTPGL	89902	93146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_89900_93100
926172	contig_8330_pilon	+	1773	10	Intergenic	novelGene_71809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	556.890130352434	11	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	711	1010	855707	856687	TRUE	15	GGACACCGCTGCCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837631	857805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853348_853839_854047_855673_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968_857181_857321
926173	contig_16045_pilon	-	2354	2	Intergenic	novelGene_130860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAAAGTAGAATTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41635	38660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16045_pilon_-_40703_41323
926174	contig_13265_pilon	-	3778	12	Intergenic	novelGene_146001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TATAGTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114403	61193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_-_62650_64862_64979_66858_66920_67474_67599_69565_69677_74621_74771_76336_76501_79355_79501_97721_97871_111913_111985_112372_112498_113296
926175	contig_15236_pilon	+	617	1	Intergenic	novelGene_141571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTATGTCTTGAGGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419065	419682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_419100_419700
926176	contig_11978_pilon	-	3442	1	Intergenic	novelGene_62901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	122	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTGAGGTGCAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	776279	772837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_772800_776300
926177	contig_16643_pilon	-	1043	1	Intergenic	novelGene_158113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAGCACTATACATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174176	173133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_173100_174200
926178	contig_9727_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_86386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAATGAAAAAGATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609426	606555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_606600_609400
926179	contig_10661_pilon	-	2253	3	Intergenic	novelGene_174741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGTCACCTCCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155016	114441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10661_pilon_-_114587_151367_151668_153208
926181	contig_12265_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_149442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAATGATTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33154	35734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12265_pilon_+_33200_35700
926182	contig_2480_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_63523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCACCTGACACCGACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237630	235715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_-_235700_237600
926183	contig_12886_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_135522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAACAGTTCATAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758609	756586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_756600_758600
926184	contig_6479_pilon	+	610	1	Intergenic	novelGene_160604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTATACCATTTTATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76423	77033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_+_76400_77000
926185	contig_5643_pilon	+	1278	12	Intergenic	novelGene_38836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	28758	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	65	1066	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
926186	contig_854_pilon	+	5845	31	Intergenic	novelGene_36602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_30	3406.62736180848	6	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1486	4461	26	4486	1685144	1714980	TRUE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1685118	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715667_1715732
926187	contig_7357_pilon	-	1207	6	Intergenic	novelGene_36840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_5	1973.20058787747	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	220	1146	166824	138880	FALSE	20	TTCCCAGCAGGGTCACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMVRTSLLFNTGDFGVHLP	167043	138818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
926188	contig_7031_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_132807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCCGCATCCCCGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366779	364977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_365000_366800
926189	contig_7009_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_23674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	133	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGGTCTTTTAGAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537216	539656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_537200_539700
926190	contig_4068_pilon	-	492	3	Intergenic	novelGene_161704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_2	21.5	13	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	399	92	490	63980	42834	FALSE	35	GTAAGCCTATAGAGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFSDWDSTSLTHKLSRDLKVDDKCPFVSQSMTKSQSASTEFGEMTLIDKEKINIGAVFLLGNYPLHDLCESHLPENKESKEDLSAELDLEMTSEEERERLDERENNRPQVEEERKKFKSSELEVTENTYDPAIDNGANGFIKQGKSGKSDNQQFCIKENDDSD	64071	42831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_42996_61062_61146_63826
926192	contig_8291_pilon	+	3174	2	Intergenic	novelGene_99936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAGTCTAGCATCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9176	13122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_+_9803_10574
926193	contig_11253_pilon	-	3044	2	Intergenic	novelGene_126807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1718	2059	10572	10231	FALSE	20	AGCACGTCTTAATTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKEYNLQYGLHLNIKKTRILTSGPISNIMINGEKTEVVKDFILCGSTVNTHGSSSQEIKQHVALGKSAAKDLFEVLKSKDTTLRTKVCLTQAMIFSAASYPCECWTVNKED	13012	9245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_11314_12036
926194	contig_10451_pilon	+	1314	1	Intergenic	novelGene_138296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAAACCCCAAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98296	99610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_+_98300_99600
926195	contig_12677_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_110740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1500
926196	contig_12464_pilon	-	4476	2	Intergenic	novelGene_68658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTTTGGCAATGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144229	122336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_123523_140939
926197	contig_4180_pilon	+	2262	7	Intergenic	novelGene_8369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1551.55725536207	7	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	320	856	875200	888134	TRUE	55	AGAATTATACTTAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	874105	890085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888645_889189
926198	contig_6578_pilon	+	1963	9	Intergenic	novelGene_162238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAAACATAAAGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158620	204710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_+_159282_159901_160144_164331_164572_176611_176784_177744_177931_179852_180032_202760_202829_203687_203824_204631
926199	contig_17144_pilon	+	1239	7	Intergenic	novelGene_29211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	134	610	166201	167259	TRUE	5	TGGTGGGGGATGTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGDGDQEYRRLRGASGIPETGVVFSLRGHWGSQRAGLEPEVLIGLGAGGEAPQEGLSGVTAEVVPWPWACGALQHLPIKDLVIGARLGLGLSGSFSWSPLKHIGLDQGGDATGPRVVTGLPGPWLLLLLLQHCDLGDGGHAGVPKAGQLEGFSPLP	166067	173460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166286_166465_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168146_173128_173211_173306
926200	contig_2798_pilon	-	3918	4	Intergenic	novelGene_119991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCAGTCATATGATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141638	50270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_51347_51962_52416_52939_53725_140034
926201	contig_990_pilon	-	2369	1	Intergenic	novelGene_76140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	192	524	1685592	1685260	NA	55	AAAAAAAAGCAGCGGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSSFSSVNNCPEVPHSTSEPWPKGTQLSRSAGREAHCAISCQSLLLVSPATVSLPPLLAIFSITSPSLSPGSRSYSMQGSQVQMTCPFLAVLPWWWWDPLPALELTLF	1685783	1683414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1683400_1685800
926202	contig_17144_pilon	-	2217	13	Intergenic	novelGene_29308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1783.07924007569	3	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	183	1922	173640	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173694_181790_181850_183158
926203	contig_17144_pilon	-	2326	14	Intergenic	novelGene_29323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1675.27574697492	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	623	1872	160	2031	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183241	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166519_168172_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
926204	contig_3612_pilon	+	2107	1	Intergenic	novelGene_87838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAAAGTCAAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970185	972292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_970200_972300
926205	contig_11964_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_164715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGTATCTGAATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179007	177202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_-_177200_179000
926206	contig_7119_pilon	+	2244	4	Intergenic	novelGene_40951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	2	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	130	1092	137033	139798	FALSE	25	TGATGGCTGAATCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127528	140950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_138868_139059
926207	contig_10500_pilon	-	2996	3	Intergenic	novelGene_41152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCCTTTATTATGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1215154	1202887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1204543_1204585_1205625_1214852
926208	contig_11316_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_122676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCGTAGTATAACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139418	140526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139400_140500
926209	contig_9554_pilon	-	3981	2	Intergenic	novelGene_170686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	43	357	137455	137141	TRUE	55	GGGAAAAAAAACTTAGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKHGLGDRNKARDGMIEFCETNDLFTAKTFFNNINGTYRNGPCQMEYTRLHLWKETMEKLNIISQSKAGADCRTEHQLLMCKFKLKLKKTKTNPREPKYDPEYIPPDLETISKTDLTH	137497	90854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9554_pilon_-_94173_136834
926210	contig_9345_pilon	+	2046	1	Intergenic	novelGene_24408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAGAATAGCAGCACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155207	157253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_155200_157300
926211	contig_6277_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_80391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTCACCTAAAGCACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100599	102784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_+_100600_102800
926212	contig_854_pilon	+	1396	2	Intergenic	novelGene_36399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCCCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974897	976415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975964_976085
926213	contig_13267_pilon	-	1974	1	Intergenic	novelGene_146611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCCTTGTTTGCACCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133814	131840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13267_pilon_-_131800_133800
926214	contig_17144_pilon	-	2247	15	Intergenic	novelGene_29380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2234.64208429403	34	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1446	2036	167982	166282	FALSE	25	AAATTCTTGAGTGTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQ	183348	166070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_166495_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168266_173355_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179733_179803_179909_181794_181850_183158
926215	contig_17851_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_179112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1004	1369	49718	49353	NA	30	CACAGCACAGCCTGGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSVSDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFHKCFDIVCCFRGIQ	50721	48733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17851_pilon_-_48700_50700
926216	contig_10074_pilon	-	1434	1	Intergenic	novelGene_57205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTACTGCAGTTTTTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610183	608749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_608700_610200
926217	contig_16647_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_170312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	511	984	336711	336238	NA	40	GAACTCAGATTTAAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQGCPSSLLLFNIVLEVLARTLRQERELKGNQVRKEEVKLSLFADDMILYVENPKDSTRKLLKLIEEVSNIAGYKISSQKSGGFLCTNKEYSEKEIKKTISFTIAPRSIKYLGIFLTKDIKGLYNENYKTLPQKTKRYLQNGKTSCTHGLEELI	337221	335966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16647_pilon_-_336000_337200
926218	contig_15970_pilon	-	2666	1	Intergenic	novelGene_144062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGCAAACACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201113	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_198400_201100
926219	contig_11396_pilon	-	897	1	Intergenic	novelGene_71362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACAAAGACTATGGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	798542	797645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_797600_798500
926220	contig_6576_pilon	-	1852	7	Intergenic	novelGene_42317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	64.7087491937699	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	255	614	559860	555376	FALSE	20	TGTAGAAGCACCCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKTGPKQREPFKKRWFALDSQERRLLYYKNPLDAFEQGQVFIGSKEQGYDVSDDLPKGIRGNHWKAGLTIVTPQRKFVFTCPTEKEQREWLRSLRDVLSCPMTPLNLLTTSTESGRSR	569180	554137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_555408_556703_556933_558141_558220_559839_559903_562690_562775_566866_566954_569139
926221	contig_7898_pilon	+	462	1	Intergenic	novelGene_47631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGTAAAAAGAAAAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703371	703833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_703400_703800
926222	contig_5023_pilon	+	2612	11	Intergenic	novelGene_7252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2137.61245552135	3	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	629	1303	629246	646990	FALSE	15	TATTTTTGGTGTCTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580847	648299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_625690_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
926223	contig_13424_pilon	+	983	1	Intergenic	novelGene_151608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGCAAAATAAATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188421	189404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13424_pilon_+_188400_189400
926224	contig_2646_pilon	-	2429	11	Intergenic	novelGene_69658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_10	325.237759185492	11	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	99	1952	2178950	2172056	FALSE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQVRALRAHGLGRAQPPCLQLLPSPGQGRAQPPCLQLLPSPYQGRAQPPCLQLLLSPGQGRAQPPYLQLLLSRALCRLTHEPIPDTKHWSEPPATTAGLCGPLLPQEQPTQDLLMGIELSSFLLHWGGGEWGSGGLALRRSSGVEHGPFSRIRASDLSLLFCCLFSSALPCCFLWPPCWPCGLQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVPFAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC	2181013	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174121_2174225_2174346_2174834_2174977_2175069_2175206_2175405_2176041_2176757_2177024_2178876_2178992_2180956
926225	contig_7548_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_117614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTACGCATGGGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166869	165643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_-_165600_166900
926226	contig_7396_pilon	-	2812	16	Intergenic	novelGene_79557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3517.55478453744	3	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	235	1464	255163	247316	TRUE	20	ATATGGTGCGTGCCCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDVIGWIYYWQRWSAD	257460	245196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247714_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257271_257381
926227	contig_15047_pilon	+	1827	6	Intergenic	novelGene_52143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	47	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	28	651	2194	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2166	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20866
926228	contig_10904_pilon	-	2376	3	Intergenic	novelGene_22630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	342.5	2	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1400	1870	505089	499813	TRUE	25	AAGACTACTCTGTGTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYWNMTVQWWLAQYVYKSAPVRSYVLRSAWTMLMSAYWHGLHPGYYLSFLTIPLCLAAEGRLESALRGRLSPGGQKAWDWVHWFMKMRAYDYMCMGFVLLSLWDTLRYWASIYFCVHLVALVALGLGLALGGGSPSQRKAAPQASGLTPEKLREE	506488	499136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499391_499560_500201_505006
926229	contig_7056_pilon	-	2852	1	Intergenic	novelGene_43750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	1607	2206	1168192	1167593	NA	55	GGTATACTAAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREAASAGWCFWTGQETVSMGSRGRRVCMKKGREWESVYHKFPELCSPSGGSKDGARSEVLEPKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPAANKWHSESYPFGCVESKQPLFPSQETVAAGSRGGRVGMKKGGGWESMYHQLPVVLSPTGTSVRLLSHTPCLLASDRSPRGRIHAALPGRGPLYESLLALRSLSVFPLHLVLG	1169798	1166946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_1166900_1169800
926230	contig_19228_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_174417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	361	678	279093	278776	NA	10	CCTTGCCTTCCTCTCCATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSITESGVLKSPTIIVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	279453	278192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_-_278200_279500
926231	contig_4114_pilon	-	1367	7	Intergenic	novelGene_15605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_5	81.2868719754645	10	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	267	1190	336860	314669	FALSE	50	AGGAAAAGATGAAGCAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDTPAKRAQAEFPTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVIYTGKEGKSSRGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLGDTLYQELTDTLRKYGNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCKYARSKTPRKFRLAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCRLGLKEGRPFAGVTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVRKLCPVTATGDSPGRHLTVVSAERLGSVGKHVEMGFENSWRCPVRLPASHRGNPPQKEWTRLDFVCVLGGLLTHL	368793	314491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_-_315038_315543_315634_318007_318159_321261_321471_327935_328030_336849_336941_368607
926232	contig_9274_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_151165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCAAAATCTGGAACCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	616701	617759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9274_pilon_+_616700_617800
926233	contig_17376_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_175399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGGATGAAAAGAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5530	7448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17376_pilon_+_5500_7400
926234	contig_9937_pilon	+	911	1	Intergenic	novelGene_129196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31904	32815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_+_31900_32800
926235	contig_12180_pilon	-	3458	1	Intergenic	novelGene_160348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77519	74061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_74100_77500
926237	contig_10749_pilon	-	1653	5	Intergenic	novelGene_133510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_2	33.6452076825214	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	177	794	311325	305793	FALSE	25	AGTGGGATGCCTCACACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLLPEYQDAEIVRTRDPEKLASCDIVVDVGSEYDPQRHRYDHHQRSFTETMSSLSPGKPWQTKLSSAGLIYLHFGRKLLAQLLGTSEEDSMVGTLYDKMYENFVEEVDAVDNGISQWEEGEPRYALTTHLSARVARLNPTWNQPNQDTEAGFQHAMALVQEEFLQRLDFYQQSWLPARALVEEAMAKRFKVQVWAKVLWVGGQ	311501	304933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_305958_306076_306230_308321_308482_310998_311112_311298
926238	contig_19778_pilon	-	863	1	Intergenic	novelGene_143756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGTCATCCACTCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21357	20494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19778_pilon_-_20500_21400
926239	contig_15518_pilon	+	1382	4	Intergenic	novelGene_127611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	6	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	409	627	15096	37386	TRUE	25	AACGATCTGCTTTCATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11222	38788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
926240	contig_10331_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_54220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAGCCAGTAGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1415230	1416474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_1415200_1416500
926241	contig_7272_pilon	+	1445	1	Intergenic	novelGene_25431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTTTCACCTAAGGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	982136	983581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_982100_983600
926242	contig_8712_pilon	+	1994	4	Intergenic	novelGene_58781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	455	junction_1	399.961942633991	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	36	515	314974	321793	FALSE	20	TGGTGTGAAGAAGGGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTRLVARAAVKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286985	323272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314967_315188_318064_318222_321684
926243	contig_6108_pilon	+	3533	2	Intergenic	novelGene_171294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	48	junction_1	0	30	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAAAAACCAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	675005	680323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6108_pilon_+_678010_679794
926244	contig_3426_pilon	+	1920	2	Intergenic	novelGene_57932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAAGAAAACGTCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311596	314292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_+_313080_313855
926245	contig_17993_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_61937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTGATATTGAAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83905	85435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17993_pilon_+_83900_85400
926246	contig_8377_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_35097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	255	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGGGTCCTATCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144610	146800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_144600_146800
926247	contig_20951_pilon	-	1803	6	Intergenic	novelGene_43073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3166	junction_2	12072.0472099806	9	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	90	1217	29171	27149	FALSE	40	TTAAAGAAGCAAGGAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDCVRPASTGLSPPHRYRRRFTPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	30023	26562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784_28224_28685_28926_29048_29178_29940
926248	contig_10732_pilon	+	2762	2	Intergenic	novelGene_114710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGGAAAAAATAAATAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126714	211600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_+_129228_211351
926249	contig_1244_pilon	+	2857	19	Intergenic	novelGene_37897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	53.3459765106661	4	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2136	722	2857	133602	161265	FALSE	25	CTCATTGAGCAAATTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGASPSPAKSTLVESRCCRDLMEEKFDQVCQWVLKCRNSKNSLIQMTILNLLPRLAAFRPSAFTDTQYLQDTMNHVLSCVKKEKERTAAFQALGLLSVAVRSEFKVYLPRVLDIIRAALPPKDFAHKRQKAMQVDATVFTCISMLARAMGPGIQQDIKELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSRQIPQLKKDIQDGLLKMLSLVLMHKPLRHPGMPKGLAHQLASPGLTTLPEASDVGSITLALRTLGSFEFEGHSLTQFVRHCADHFLNSEHKEIRMEAARTCSRLLTPSIHLISGHAHVVSQTAVQVVADVLSKLLVVGITDPDPDIRYCVLASLDERFDAHLAQAENLQALFVALNDQVFEIRELAICTVGRLSSMNPAFVMPFLRKMLIQILTELEHSGIGRIKEQSARMLGHLVSNAPRLIRPYMEPILKALILKLKDPDPDPNPGVINNVLATIGELAQVSGLEMRKWVDELFIIIMDMLQDSSLLAKRQVALWTLGQLVASTGYVVEPYRKYPTLLEVLLNFLKTEQNQGTRREAIRVLGLLGALDPYKHKVNIGMIDQSRDASAVSLSESKSSQDSSDYSTSEMLVNMGNLPLDEFYPAVSMVALMRIFRDQSLSQHHTMVVQAITFIFKSLGLKCVQFLPQVMPTFLNVIRVCDGAIREFLFQQLGMLVSFVKSHIRPYMDEIVTLMREFWVMNTSIQSTIIL	116922	161265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_117017_119324_119539_123483_123593_124314_124518_133500_133692_133774_133884_137093_137281_138277_138407_139101_139347_140499_140716_141070_141277_143774_143898_144548_144639_144772_144866_145575_145711_145952_146083_147591_147843_156909_156997_161220
926250	contig_15897_pilon	-	4059	1	Intergenic	novelGene_49526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1481	1825	309065	308721	NA	20	ATTTCTGGCGTAGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGANKDNPCGTMCNSKILEATQMPTEDCCLLGAGESVLTHVQHDPMYNRMKHCLVLHHPHNLCLLEPTVGSHCVNPPHFSLTLYFTKHDVLFQGLIPPDNMSKVCDRKSHHSCF	310545	306486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_306500_310500
926251	contig_18822_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_111738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAACAATCTGTGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216986	216140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18822_pilon_-_216100_217000
926252	contig_14838_pilon	-	2128	1	Intergenic	novelGene_151925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	782	1243	244036	243575	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAIPIQIATFFKEMEKLIINFMWKGKKNWISKALLKKTNKVGGLALPDLRTYHTATIVKTAWYWYNDRYTDQWNRIENPDVNPSTYSHLIFDKSPKSIKWGTDNLFNKWCWQNWMSICKKNKTRPIPHNHIQQKLIQNGPKT	244817	242689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_242700_244800
926253	contig_3747_pilon	+	2171	6	Intergenic	novelGene_24935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	2	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	54	794	202422	203804	FALSE	60	AATAAATAAATTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202368	205181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
926254	contig_15706_pilon	+	444	1	Intergenic	novelGene_172037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13713	14157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15706_pilon_+_13700_14200
926255	contig_12630_pilon	-	2777	4	Intergenic	novelGene_173075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	424	junction_2	20.0388511535855	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	267	725	81986	77421	FALSE	15	TTCATTCTTCCATTGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRKCKPMKTETIQVSAEVR	82252	75368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_77476_78018_78122_81560_81810_81934
926256	contig_1618_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_141800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCTACAAAAACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324340	322621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_-_322600_324300
926257	contig_12635_pilon	+	6012	1	Intergenic	novelGene_60842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	461	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539358	545370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_539400_545400
926258	contig_13952_pilon	+	2056	2	Intergenic	novelGene_133278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAATTCCAAGATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239184	243845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_239341_241945
926259	contig_5945_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_104534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAATTGACCTTACACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21874	24290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_21900_24300
926260	contig_7045_pilon	+	4874	23	Intergenic	novelGene_77434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.2473138275707	38	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	3795	4550	281972	282727	FALSE	55	ACAGAAGATAGGGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSLPVVLILTFTLLACVTSPSAAFPQTTEKIVPNWESGINVDLAVTTQRHHLQHLFHRYGENNSLSVEGFRKLLQNIGIDKVKRIHINHDHDHHSDHDHHSDHDHHSDHDHHSHHNHAASSKNNRKGLCPDHDSDSSGKDPKSKQGKGSRRPENADGRRNVLIKDGIGASEVTSTVYNAVSEGTHFLEAVETLKPGKVLKDVSGSTPPSITEKSHVSRLAGRKTNESVSELRKGFMHSKNTNENTQEVR	230149	283051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_230779_233777_233892_234417_234550_235992_236120_237762_237951_241136_241211_242171_242230_242377_242473_243838_243910_246433_246627_251148_251295_254076_254207_254416_254520_255616_255715_256875_257014_257481_257551_258389_258455_260770_260849_261668_261826_272262_272334_275191_275271_279045_280016_281962
926261	contig_8262_pilon	+	1030	1	Intergenic	novelGene_166103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCCTCCCCAGTAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173239	174269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_+_173200_174300
926262	contig_19342_pilon	+	1315	6	Intergenic	novelGene_41086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	18	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	311	718	5070	6183	FALSE	10	TCCTGTGTTTGCTCTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3247	6780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3812_5027_5293_5413_5522_5960_5994_6139
926263	scaffold_12124_pilon	+	2331	11	Intergenic	novelGene_22087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	183.28417825879	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	752	1114	879089	894124	TRUE	55	CGAAAAACAGACAGCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRRMTPVTHHSGIQLS	859988	895620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860162_867260_867354_872361_872480_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_894081_894174_894452
926264	contig_14176_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_74866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCTGGGGTCTTAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	488848	488303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_488300_488800
926265	contig_5023_pilon	+	2404	14	Intergenic	novelGene_7127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	206.185129658537	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	882	2231	359358	405576	FALSE	5	CTTTGTTGTTTACTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMISAMEKMKCNILSQQQAENWSVDKVSGSLGNDPADPEVTFYASVKQESVSSTRSDSGYEVCAGLKVSPVVETPTDYDLVKESSKCDFDEFVILELEELNDITETCGCSCSSSKSGICEPDFNSAELIAKELYQVFEKCWLLSEVNYQPVSSLNAAGSIVVNEEHVRKQFESGVDVVQEIKFKSRIRGTDDWAPPRFQIIFNVHPPPKRDLVVAAQNFFCAGCGTPVQPKFLKRLRYCEYLGKYFCDCCHSYAESCIPARILMMWDFRRYYVSNFSKRLLDSIWHQPIFNLLTISQSLYSKAKELDRVREMQEQLFHIKKLLRTCRFARSTLKEFEQVPRHLTEEHHLFSLDDLVRIKRRLLAPLLKELLKASLTHVANCELCQGRGFICEFCRSTAVIFPFQTETCRRCSVCRACFHKQCFQSSECPRCARISARRRHVQSLPSPET	320150	405749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_320270_353197_353850_358605_358689_359330_359542_369253_369356_369823_369885_370404_370538_373062_373209_375332_375398_387160_387400_388224_388287_402039_402194_403088_403180_405463
926266	contig_7919_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_28133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAGAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1549559	1547182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1547200_1549600
926267	contig_13915_pilon	+	1324	3	Intergenic	novelGene_178551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGATCCTACTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524	61078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13915_pilon_+_1419_1524_1861_60984
926268	contig_8443_pilon	-	1339	2	Intergenic	novelGene_150601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTTGCGTGAGCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309101	141699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_-_142092_308154
926269	contig_9471_pilon	+	3179	7	Intergenic	novelGene_21809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	792	junction_6	313.841609025246	10	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	776	1387	412726	414943	TRUE	20	TATGAATCTGCATTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVYFSLLDEIVDTLGEGAFGKVVECVDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILGL	411950	417524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_412821_413710_413828_413916_414084_414633_414729_414805_416273_416936_417028_417152
926270	contig_15666_pilon	-	1695	5	Intergenic	novelGene_70167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	712.909882102921	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	64	195	602	796	108757	108177	TRUE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHMDTPYS	110169	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108583_108859_109098_109378_109948
926271	contig_9706_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_20760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAGGGAAAGATTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157	910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_900
926272	contig_10437_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_38390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGAATAAATCCAACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	682514	684709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_682500_684700
926273	contig_8697_pilon	+	1756	1	Intergenic	novelGene_83217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	863	1237	44737	45111	NA	15	CATTCTTCCGTTGATGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHSPVQSLSEELASNYFSSGLIENPEAMVSGVPPVSVRPSSLVFLLEFELCTLLFSCFIRDSLVFPVRAVVGGSRAPSSSAGFRLMNSLVYVVLSVSCANTFLVSLVFFILCYSRWLGPIDAS	43874	45630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_43900_45600
926274	contig_9484_pilon	-	2364	1	Intergenic	novelGene_105699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1135	1500	286134	285769	NA	55	AAAAAAAGATTACAGCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRIKTTRYGHEVVTGHMYTDRLPFYMSVYCNPPFAGHTLRCFPSDSFMISHKHSETTLLTPLTNTFLPKTKVIQNQSHLFVMGSDSSSLWPRITAKLIDLHGECLNFIAASFNFPLSCS	287268	284904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_284900_287300
926275	contig_14208_pilon	-	901	2	Intergenic	novelGene_129074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATAACATGGATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104932	101452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_-_101540_104118
926276	contig_5003_pilon	-	3982	1	Intergenic	novelGene_120226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTCCAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187431	183449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5003_pilon_-_183400_187400
926277	contig_3095_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_75111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	43	807	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147198	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
926278	contig_11964_pilon	+	3079	2	Intergenic	novelGene_164723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2644	3075	242737	243168	FALSE	30	CTTCGAAAGCGCAGATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSITSYAYESWTTNKEERRIINAFELWCWRRILNILWTTRRTNKSVLEEVQPERSLEARMARLHLTYFGHVIRRDQSLERDIMLGKAEGQQKRGRPSTRWTDTVDATVGSNITVIVRMAQDQTGFHSVVHRVTMSRNQLDGT	238506	243172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11964_pilon_+_238833_240419
926279	contig_9438_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_154262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTCATTAAGGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39453	38322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_38300_39500
926280	contig_12074_pilon	-	2492	11	Intergenic	novelGene_53732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	7.78203058333749	40	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	683	1744	17564	10372	FALSE	20	AGCAACTCTGTTGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEFEDQPCCPVSRDWVNSPSVVVSGNLEAPKNEGKCEDSDSPVTKKMKLEPEAPAREVASDVTHRQSFDKQESGQISPTVSSSNFTAEGLATVTITAPSGAKVVDVYRTGAKCVPGEAGDSGKPGPEYHQVGLLRVKPGRGDRTCSMSCSDKLARWNVVGCQGALLMHFLEEPIYLSALVIGKCPYSQEVMQRALIGRCRNVSALPKGFGVQELKIQQSDLLFEQSRCAVQAKRTDSPGRFVPCGAAISWSAVSEQPLDVTANGFPQGITKKGINNHQARSRISKVDLFRSFQKLLSSISEDKWPDSLRRQKLETYQEYKEAASAYQEAWSALRRQAFGSWIKNPPDYHQFK	26137	9623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_-_10505_12160_12248_14782_14883_15381_15528_16968_17588_21203_21264_21886_21942_23356_23426_24024_24216_25185_25296_25963
926281	contig_8866_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_77867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGAACTCCCACTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795922	794556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_794600_795900
926282	contig_17976_pilon	+	1329	4	Intergenic	novelGene_32507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	182	928	41843	47385	FALSE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41661	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46945_47214
926283	contig_4952_pilon	+	2741	1	Intergenic	novelGene_145546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAATAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581339	584080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_581300_584100
926284	contig_17144_pilon	-	1742	12	Intergenic	novelGene_29246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2252.24814774222	45	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	75	1658	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	181847	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166345_166486_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170786_174933_175001_175973_176271_179700_179786_181794
926285	contig_6110_pilon	-	3922	4	Intergenic	novelGene_163278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1274	1741	516784	502241	TRUE	35	AGTGCTCCATTTCATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAVLEVLTCLCQEIWKTATWPTDWRRSIFMPIPKKGDPTECRNYRTMSLISHASKILLNIIQKQLQQYIDKELPEIQAGFRRGRGTRDIIADVRCILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDYVDHNKLWITLLRMGTPGHLIVLIRNLYIDQEAVV	522763	491847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6110_pilon_-_493767_501978_502675_516750_517111_521816
926286	contig_7707_pilon	+	748	2	Intergenic	novelGene_72167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTACAGGAGTCCAGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273934	274743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_274053_274113
926287	contig_9706_pilon	-	2420	1	Intergenic	novelGene_20905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTTACCATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99602	97182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_97200_99600
926288	contig_15486_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_157320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTCCATCCAACGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122230	120984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15486_pilon_-_121000_122200
926289	contig_12340_pilon	-	1805	2	Intergenic	novelGene_122100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	14	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	391	924	12693	12160	FALSE	20	CCCTCTTCAGAATGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVLHVRWVSVRRTLWRTPVRVLPGVGAGRLHARRSSCQVGVRQEDALEDTSGTLSCLVWEPAVCTRGVLTSGGCPSGGRPSVSCLVWRPAVCTRGVLHVRWVSVRSAHTLLRVALELLLAHGDPMCVLLELCSIRFSVADFLEVDHQAFLPRCFWVDSMPQPLGLTVRHVNCFHH	14333	11278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_12960_14209
926290	contig_14536_pilon	-	2999	1	Intergenic	novelGene_69311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	714	1025	213210	212899	NA	80	AAAATAAAAAACTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMAFCRDLKKENHLGNISLPFTSSLPTLHRAWPASAISESPGPEVDPIRHPDPFSWPWRENKLTDGKNELPAPLSQKFRVGTAPLPRHRHKGPTDFECLPPL	213923	210924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_210900_213900
926291	contig_7749_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_170867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	188	567	1672	2238	18026	17460	NA	25	TTGGATTCTTCTATACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLQKWTHYLPKLIQVEKVNKPITKEKTEEVIKKIPNNKKSPGPDGFTGEFYQTFREELTPVILKVFQSIEKEGILPNSFYETNIIPIPKTGKDTTKKENYKPISLMNIDAKILKILANRIQQHIKKIIYSDQVGFIPGMQGWFNIRKSSNVIYHINKRTK	19697	17037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7749_pilon_-_17000_19700
926292	contig_10811_pilon	+	1792	1	Intergenic	novelGene_165807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTGGGCCTTTGGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	412328	414120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_+_412300_414100
926293	contig_12543_pilon	+	1637	1	Intergenic	novelGene_168363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	487	1464	1	1464	183716	185179	NA	35	TATGAAAAGGCCTTTGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTPHQRIHHREKPYVCKECGKAFSHGSKLVQHERTHSAEKHFNCKECGKTFFSAYQFTVHQRLHTGEKPYECKECGKTFSWGSSLVKHERLHTGEKPYQCKECGKAFSRGYQLTQHQKIHIGVKSYECKKCGKAFFWGSSLVKHEIIHTGEKPYECKECGKAFSRGYQLTQHRKIHTGEKPYECQTCGKAFCWGYQLTRHQIFHTVEKPYECKECGKAFNCGSSLVQHERIHTGEKPYQCKECGKAFSRGYYLTQHQKIHTGEKPFECKECGKAFSWGSSLVKHERIHACEKSYECKECGKGFCSVYQLTRHQIFHTGEKPYECKECGKSFNCGSSLVQHERIHTGEKPYQCKECGKAFSRGYHLTQHQKIHTGEKPFKCKECGKAFSWRWGLVKHERVHTGEKPYECKECGKAFGSGYQLSIHQRSHTGEKPYQCKECGKTYIRASSLAQHERIHSSDKPYEYKECEEAFTWTPYSNEKIHIGETL	183715	185352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12543_pilon_+_183700_185400
926294	contig_10877_pilon	+	548	1	Intergenic	novelGene_166216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCATTGCCTTCTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98159	98707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_+_98200_98700
926295	contig_11336_pilon	-	1273	1	Intergenic	novelGene_172667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCATGGTCTGCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55823	54550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11336_pilon_-_54600_55800
926296	contig_13283_pilon	-	2771	2	Intergenic	novelGene_154003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	377	640	7325	7062	TRUE	45	CCTAAATGCACCCATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVPYPPAEHGSAILDSGQEIGGQGIQESSFTELPAKDRTTNNQRYKLSHPLPFFNPTQPSLLPAATVSWPGGTDFNPVPLGFHLPTVASSLSAICLLLVLLSSAFGFFHTSHHLPLLSLKYLLCMPSLLLFERLCNVARLWNCFPAHATTLVGSLGLLFVCFLFLFSAWEPFLARMYYTTWKLHSQSVQPQGGMPESISFFLFCSLFFFPP	7701	4852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_5921_5998
926297	contig_13051_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_140098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	420	758	75171	74833	NA	35	ATTTACTGGCCTAAAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQDPYLTPCTKTNSKRIKDLNIKSKTIKITEEKIGTTLGTLIHGINRIGTISNNAQTPEEKLDNWECLKSKHLCSSKDFTKRQYTIQGKLAQPVQGKVLEAPKTHPNSLRD	75590	74446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13051_pilon_-_74400_75600
926298	contig_5936_pilon	+	2916	2	Intergenic	novelGene_53573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACAGTGAAATGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228480	231521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_228821_228945
926299	contig_15105_pilon	+	2764	1	Intergenic	novelGene_150929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	630	962	217223	217555	NA	65	AAAAAAAAAAAGAATTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNWQKLWDRYIYNEDQKKGSCRGCLYTTKHLMEFGSLACRFSVMIPWGIPVNWPNNVFSASVLPPSSLHSTWGLKSLQAAIQCMTIGLCSPGATEEGESGIGGEYGMCG	216593	219357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_216600_219400
926300	scaffold_13505_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_111576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	184	573	620404	620015	NA	40	CTCTAACTGCACTGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLSRSSHTAWLESHQHMASLCLPCPHLPNPTALPFYSPFLLFSFIFCLFFTFLSLFLSLLSPLLPIHLALHITSSPFPPAYLHCSPSAMSPSGTDTVPQPCPVIPSSCCKLPILTPPPPCGICPAAP	620587	618013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_618000_620600
926301	contig_4151_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_65298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGACTTATAACAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783299	784178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_783300_784200
926302	contig_5779_pilon	+	2493	1	Intergenic	novelGene_106489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCAAAAACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173886	176379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_173900_176400
926303	scaffold_21177_pilon	+	5683	1	Intergenic	novelGene_145490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	91	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	4002	4403	196585	196986	NA	25	CCCCCACCCCTGTCAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNKNYYIEIYLNLTTLISGQSHSLAYASLPYPIPLLFSHSGLVEPQTWLNTIFASAPAPMQLKLVENARARARWWFHFQFKSPMPPPYPGSQLVTLLSTLLRTIKTIRRENPLPTYHQLNPQILSPHLLS	192583	198266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_+_192600_198300
926304	contig_990_pilon	-	3085	1	Intergenic	novelGene_76087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTATCCAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1138710	1135625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1135600_1138700
926305	contig_12427_pilon	-	2028	2	Intergenic	novelGene_40445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	624	974	302796	302446	TRUE	20	TTTTTTTTAATTGTACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQNCCKHPLIIGTWNVLSMNLGKLEVVKNEMEHMSIDILGISELKWTGIDHFESDNHMVYSARIDKLKRNDVTFIVKTSISRSVLKYNAVSNRIISIHLQERPVNECYSNLHTDH	303419	300420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_300524_301494
926306	contig_8552_pilon	+	2405	2	Intergenic	novelGene_80113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	389	709	588517	588837	TRUE	75	CAATATAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRKTKHCENVNSTQSDLQIQCDPDPNSTTFFNEMEKQITNFIWKGKRPRVSKALLKKNNTMGDLTLPDFRTYYTATIVERAWYWYNNRYIDQWNRTENPDIFLHL	588128	590877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_590332_590675
926307	contig_5988_pilon	-	3209	10	Intergenic	novelGene_15899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_7	80.3685953038319	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1059	3177	31	3207	569150	563688	FALSE	35	CCAGCACAGCTACACCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLAQQGQGLMAHRLVTSQQQQQQQQHQQQGSMAGLSHLQQGLMPHSGQPKLNAQPMGSLQQQQLQQHQFQQQQQQLQQQQQLQQQQQQLQQQQQLQQQQVQQQQLQQQQLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQFQQQQQMGLLNQSRTLLSPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVTLGPGMPAKPLQHFSSPGALGPTLLLTGKEQGIVETALPPEVTEGPSTHQGGPLAVGTTPESTAAEPGEVKPSVSGDSQLLLVQPQAQPQPNSLQLQPPLRLPGQQQQVNLLHTAGGGSHGQLGSGSSSEASSVPHLLSQPSVSLGEQPGPMSQNLMGPQHPLGLERPMQSNVGPQPPKPGPVPQSGQGLPGAGVMPTVGQLRAQLQGVLAKTPQLRHLSPQQQQQLQALLMQRQLQQSQTVRQTPPFQEPGTQPSPLQGLLGRQPQLGSFPGSQTGPLQELGAGPRPQGPSRLPAPQGALSTGPVLGPVHPTPPPSSPQEPKRPSPKLPSPSSQLHSEVQLTPTQPGTPKPREPSGRVSPAAAQLADTFFGKGLGPWDPPDNLAEAQKPDPGHLEQVNGQAVPEPPHVSIKQEPREEPCALGAQAVKRETNGEPLGTPGTSNHLLLAGHRSEAGHLLLQKLLRAKNVQLSTGRGPEGLRAEVNGHLDSKLTGLEQKLQGTPSNKEDAAARKPLTPKPKRVQKASDRLVSSRKKLRKEDGVRASEALLKQLKQELSLLPLTEPTITANFSLFAPFGSGCSISGQSQLRGAFGSGALPTGPDYYSQLLTKNNLSNPPTPPSSLPPTPPPSVQQKMVNGVTPSEELGEHPKDAASARETEGALRNASEVKSLDLLAALPTPPHNQTEDVRMESDEDSDSPDSIVPASSPESILGEEAPRFPQLGSCRWEQDDRALSPVIPIIPRASIPVFPDTKPYGALDLEVPGKLPATTWEKGKGSEVSVMLTVSAAAAKNLNGVMVAVAELLSMKIPNSYEVLFSESPAQAGTEPKKREAEGPGGKEKGLGGKSPEAGPDWLKQFDAVLPGYTLKSQLDILSLLKQESPAPEPP	569180	563685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_563712_563900_564029_564106_564240_564915_565047_565135_565312_565486_565563_566229_566390_566542_566711_566833_566975_567110
926308	contig_8978_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_49448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1606957	1608453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1607000_1608500
926309	contig_3956_pilon	+	2588	13	Intergenic	novelGene_15058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1187.30454239377	176	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	600	1803	81	1883	1281682	1290310	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGEPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288018_1289755_1289892_1290297
926310	contig_854_pilon	+	3007	14	Intergenic	novelGene_36700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	3857.54203097128	42	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	158	1840	1705343	1713447	TRUE	40	CTTGTCATAAATGATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQLKPPML	1704898	1715995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713378_1713426_1713482_1714862
926311	contig_4686_pilon	+	2146	3	Intergenic	novelGene_118514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGACTTTTAAAATGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411391	422881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_413260_417840_417997_422759
926312	contig_16643_pilon	+	2023	2	Intergenic	novelGene_158106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1307	1612	116524	116829	TRUE	50	AACAACAACAGCAATCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLRCGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIGVVKNFIIFGSTINDHGSSSHEIKRHVALGKSAAKDLFKVLKCKDVTLRTKVRLNQAMIFSVAA	115217	128500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_116863_128122
926313	scaffold_15568_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_122592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGATACACACATACATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265591	267320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15568_pilon_+_265600_267300
926314	contig_11855_pilon	+	2545	5	Intergenic	novelGene_67104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	39	junction_4	161.686424909452	2	110	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	897	1646	2445507	2446256	FALSE	35	GGAGGAAGAGGTGACTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440095	2447155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440407_2441567_2441665_2443329_2443442_2443588_2443832_2445373
926315	contig_14333_pilon	+	1921	2	Intergenic	novelGene_49102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCCAGGAATGGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	314081	316269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_315487_315753
926316	contig_3469_pilon	+	2675	1	Intergenic	novelGene_34227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	132	399	19	417	614051	614449	NA	25	CTGATTGTCAATTTCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSKLDYMKQNGGIRIAERLINNLQYAGDTTLFAESEEHLKYLLMKIKDYSLQYGLHLVKTAWGQCLTPSNLTRRKENQDQQHKADPHEVEARQASSLQHLYQFYQLSLVRHFTSLLDSIIHCSGHTELTDHTHDCGVY	614032	616707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_614000_616700
926317	contig_11980_pilon	+	1931	1	Intergenic	novelGene_176811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	22	69	386	454	75971	76039	NA	65	GGTTAGAAAAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKALAKNKSPGIDRISIEIFQQTDAVLEVLTHLCQEIWKTATWPTNWKRSIFIPIPKKGDPTECGNYQTISLISHASKILLKIVKNGCSSISTGNWQKFRPDSEEVVEPGISLLVSDGSWLKAENTRKMFTCVLLTMQRHSTLWIITNSR	75585	77516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11980_pilon_+_75600_77500
926318	contig_9471_pilon	-	1833	2	Intergenic	novelGene_21854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1036	junction_1	0	269	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTACAGGTCAGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435228	432938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_434647_435103
926319	contig_3956_pilon	+	2672	12	Intergenic	novelGene_15059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	16	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	772	2148	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284224_1286151_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
926320	contig_19908_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_167613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36280	35447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19908_pilon_-_35400_36300
926321	contig_12468_pilon	-	696	7	Intergenic	novelGene_164874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_6	138.289149570344	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	25	696	54469	10790	FALSE	10	GTAAGTGGTTTGTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAKTFINLMTHISKEQTVQYILTMVDDMLQIFNPFGVDSSVWYKENHQRVSIFFDYAKRSKNTAWSYFLPMLNRQDLFTVHMAARIIAKLAAWGKELMEGSDLNYYFNWIKTQLSSQKLRGSGVAVETGTVSSSDSSQYVQCVAGCLQLMLRVNEYRFAWVEADGVNCIMGVLSNKCGFQLQYQMIFSIWLLAFSPQMCEHLRRYNIIPVLSDILQESVKEKVTRIILAAFR	54493	10789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12468_pilon_-_10983_26889_26988_40622_40677_43865_43971_46717_46832_50860_50903_54403
926322	contig_13301_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_153104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGGCAATGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19973	22203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_20000_22200
926323	contig_7815_pilon	+	3624	8	Intergenic	novelGene_134376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1081	1479	397844	398242	TRUE	5	TGAGGCTGTGGCTGCGCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEMCLQLLVHSHLWGFPTAQALLWEIDQNATKQRSLLLGGLFPEETHLVNVISQRADFEAASFLQFDLDSLCYPVQADQIQTPRDLILRIQDSWVETQNLRLSCQLGLAYDLSMTQGSGRQTPVHWNSMHR	396763	608824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_399329_405672_405830_516272_516370_522521_522672_539502_539669_542323_542525_547609_547720_608646
926324	contig_2332_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_58642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTAGTGTGTGCTGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209207	207871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_207900_209200
926326	contig_5799_pilon	-	2696	1	Intergenic	novelGene_50256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAATTTAAAAAAATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200951	198255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_198300_201000
926327	contig_5047_pilon	-	985	5	Intergenic	novelGene_157995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	25.4889682019496	18	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	124	888	1132145	1085911	FALSE	30	GAGAATAAACTTCGCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASDGARKQFWKRSNSKVPGSIQHVYGAQHSPFDPLLHGTLLKSTPKLPSTPLKAKRGSTFQEFESNTSDAWDAGEDDDELLAMAAESLNSEVVMETAHRVLRNHSQRQEQHRLQEAMLPEERPQPWAQAPPVPGGDPWLVKSVSESHTPRPTESGSEAGPLQRSQSLPHSSTVALSGGVSDHSALGSSALSEREASRLDKFKQLLAGPNTDLEERSELRHMGTSHHQESSAGSRARPLDLRVLCYDAPRPRKD	1132268	1085813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_1086036_1091793_1091974_1095665_1096007_1097090_1097148_1132083
926328	contig_13244_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_86983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384040	383588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_383600_384000
926329	contig_2892_pilon	-	1847	1	Intergenic	novelGene_119030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	199	516	304801	304484	NA	35	AATTTGGAAGACAGTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGILYDIMLQDEPLRLEGSQNTTGEELPPQSRVDLNDMNGVKFSGPSFTDVAQLQVRKNSCKHSLIIKTWNVRSMNESRKPEVVKNETERIMIDILSISKLK	304999	303152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_-_303200_305000
926331	contig_2257_pilon	-	2744	1	Intergenic	novelGene_122500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	30	434	305427	305023	NA	55	ATAGGTTAAAAAAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNPSTYGLMIFNKGPKSIKWGKESLFNKWCWQNWMSICKKMKQDPYLTPYTKTHSKWIEDLNIQPKTIKIIEEKIGPTLEILIHSINRIQTITNNIQTPEDKLDNWDRLKIKHLCSSEDFNKRVKRVQSGKKILAIINSTKV	305456	302712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_-_302700_305500
926332	contig_1143_pilon	+	2050	1	Intergenic	novelGene_86597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAAAGATGGGGGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189630	191680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_189600_191700
926333	contig_15610_pilon	+	2466	3	Intergenic	novelGene_154273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTCTCATGGATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339701	375028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15610_pilon_+_339713_372014_373073_373631
926334	contig_500_pilon	+	1426	10	Intergenic	novelGene_31018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	970.166766878538	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	64	1011	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496700_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
926335	contig_2069_pilon	+	2506	12	Intergenic	novelGene_23242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	319.781304401349	5	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	948	1664	341330	343975	FALSE	10	TGATGTGGTTTTTGATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	323987	344817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
926336	contig_10609_pilon	+	2047	1	Intergenic	novelGene_123968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACAGCAATAACAGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588100	590147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_588100_590100
926337	contig_14353_pilon	+	2133	9	Intergenic	novelGene_82103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1332	1709	80437	82722	TRUE	45	AAAGATCTCAAAGAACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSPLAKGPGSFYACTLVSWMSPPHFQVVDGRQVLQAVAVFTQVLAIHGHLEAVAFTQYPHREVLAAAEGHFPRQAALLRPPGIVDLCVADHSILIEAGVEVEGDVTARAQVDVEPLGAGQDGT	79105	88574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80621_82377_82545_82695_82785_83259_83302_83903_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87474_88544
926338	contig_8059_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_111073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	218	526	11420	11112	NA	20	CTATTTTGTTTTGTAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHYTKEDIQMANRHMRKCSRSVAIREMQIKTTTRYRLTLALLAQIKNTGNNKCWGDRNTYALLVGMQSDRTILENDMALPQKARNRHTIRSSNPIPRNIS	11637	9516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_9500_11600
926339	contig_8538_pilon	+	5898	1	Intergenic	novelGene_4622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	345	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACCTCAATAAAAACAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768726	774624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_768700_774600
926340	contig_16999_pilon	-	1865	1	Intergenic	novelGene_84951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGTTGTTCCATCTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25551	23686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_23700_25600
926341	contig_17274_pilon	-	2068	1	Intergenic	novelGene_26544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAGAAATGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157773	155705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_-_155700_157800
926342	contig_8156_pilon	-	578	1	Intergenic	novelGene_98899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19778	19200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_-_19200_19800
926343	contig_3170_pilon	+	1860	7	Intergenic	novelGene_178865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_1	29.4335409581201	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	304	1035	20174	32284	FALSE	30	GAGTGTATATAAGCTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGIEVVDVAAGGAHSACVTVAGDLYTWGKGRYGRLGHSDSEDQLKPKLVEALQGHRVLDIACGSGDAQTLCLTDDDCVWSWGDGDYGKLGRGGSDGCKVPMKIDSLTGLGVVKVECGSQFSVALTKSGAVYTWGKGDYHRLGHGSDDHVRRPRQVQGLQGKRVIAIATGSLHCVCCTEDGEVYTWGDNDEGQLGDGTTNAIQRPRLVAALQGKKVNRVACGSAHTLAWSTSKPTSTGKLPAQVPMEYNHLQEIPVIALRNRLLLLHHISELFCPCIPMFDLDGCLHETGLGPSVGFDTLRGILISQGKEAAFRKVVQATMVRDRQHGPVVELNRIQVTQGGFI	17080	33109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3170_pilon_+_17228_20017_20180_22345_22438_22645_22786_24412_24601_25200_25399_32176
926344	contig_987_pilon	+	1489	2	Intergenic	novelGene_72315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1446	42	1487	996176	1170960	FALSE	65	GAAGCATAAAGATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDAEERKEYIPDYMPPIVSSQEEEEQVPTDGGTSAEAMQVPLEEDDELEEEEIINDENFLGKRPLDSPEAEEMPAMKRPRLLSTKGDTLDVVLLEAREPLSSINTQKIPPMLSPVHVQDNTDLAPPSPEPPMLAPVAKSQIPTAKPLETKSFTAKAKTKTTSPGQKTKSPKTTQSPAMMGSPIRSPKTISKEKKSPGRSKSPKSPKSPKVTTHISQAPIKPETPNRTPSTTISEKINKEIIQVKQTQTPPDAGKLNNENQPKKAVVTDKTIDDSIDAVIARACAEREPDPFEFSSGSESEGDIFTSPKRISGPECTTPKASTSSNNFTKSGSTPLPLSGGTSSSDNSWTMDASIDEVVRKAKMGTPSNIPPNFPYFSSPSVSPPTPEPLHKVYEEKTKLPSSIEVKKKLKKELKTKMKKKEKQRDKEREKDKSKEKSKEKDKVKEKEKETSKETKYPWKEFLKDEDSDPYKFKIKEFEDVDPKVRLKDGIVRKEK	996134	1170962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_996204_1169542
926345	contig_211_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_129889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACCCAGCTCAAGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378635	376371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_376400_378600
926346	contig_14683_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_166049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	16	360	164493	164149	NA	65	AATAAATGTCAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWECKMIQPFWKTIWHFLRKLEIEIPYDPVIPLLGLYPREIMVATRVDICTPMFMAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDESVEHLKTWMNLEDIMLSEISQS	164508	162590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_162600_164500
926347	contig_10734_pilon	+	4036	21	Intergenic	novelGene_51242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_18	495.442731302014	2	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1160	3483	271	3753	1243300	1321497	TRUE	15	TAAGTTGCCGACTGCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPVAVVVPVDKTTSREKASSTPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIWKKRDLCSIISC	1221285	1328287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1221446_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1275042_1275148_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135
926348	contig_11117_pilon	+	1286	1	Intergenic	novelGene_148568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATGAATAAATAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11329	12615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_11300_12600
926349	contig_15982_pilon	+	5403	23	Intergenic	novelGene_145969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	27	junction_9	43.0671203994896	105	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1028	3087	192	3278	7582	59974	FALSE	25	GTCACTAATCAGTGTTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQTPRRRSRGHARSAPRPNPALRPGVPRSAASPEPRDAHLWLFPSPADLRSAFFRRSKKMRQICCTRERLAVLTCGEAGVEIHELRAGSHGARKPKYIKLEGKMKIHSMDQGAEHMLILSSDGKPFEYNYSIQHARFQCVLQATIIIQIACGDYHSLALSKGGELFAWGQNLHGQLGVGRIVDSTPTPQIVAHLSGVPLAQISAGEAHSMALSMSGNIYSWGKNDFGQLGLGHTNNKDCPSLIEELDNQDVEFLTCGGSHTALLTKDGLVFTFGAGKYGQLGHNSAQNEPRPRLVTELIGNRVTQIACGRYHTLAYVSDLGKVFSFGSGKEGQLGNGGTHNQLIPLPMKLPSKEELKFENHTSEKKLIMIAGGNQSILLWMEKENSYVNLRRKIPTLNEGTIKRWLADVGTKQWQSTKREIREIFSSPACLTGSFLKKRIAAETMSIPLDLNKARNTFQELTQKHWIANMITTCLRDNLLKNLPLRSPHQEALEVFLLLPECPVMQDSNNWESLVVPFAEIVCKISDQSSGVLEKYWASLEESTFSKLVQMLKTAIISQMNHRTGSAENHYHMKPLLEMLKKLHRVNQATCQLPENTFIINELSNWIDFSAEVYRRFFWKMNLETSVDITCSVIISHFPFVFNSLSKIKLFRADSEFKMKVKEQRAFMRLPETVALGGSSQPTFNLTVRRNHLVEDVFNQLNQSENKDFEKQLWVSFSGEVNYGFGGVRSEFFHCIFEEMTRPEYGMFMYPGEAPYMWFPVRPKFEEKRYFFFGILCGLSLYNFNVADIPFPLALFKKLLDQTPSLEDLKELSPVLGKCLQILLDDEGDDFEEVFSICFNVHWDKNDAELIPNGSYIMVDQTNKREYVSKYVDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCDKEIIEIFHPKELKDVIIGNTDYDWETFEKNACYEDDYSDSHPTIVMFWKALHKLTLEEKKNFLLFLTGTDRLQMKGLKNMKITFCCPENLNEKDPIRAQTCFSILYLPKYSTMERVEEALHVAITSNRGFG	7390	62099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15982_pilon_+_7871_10496_10618_11536_11614_13833_14056_15115_15208_15453_15585_18149_18296_20696_20774_21741_21846_22662_22723_24352_24447_28085_28276_30021_30177_41427_41542_42693_42805_43695_43858_46725_46870_47676_47844_50281_50349_53196_53268_58142_58327_58407_58511_59768
926350	contig_9921_pilon	-	1501	1	Intergenic	novelGene_23717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCATGATCCTTTTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61835	60334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_-_60300_61800
926351	contig_5084_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_64573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGGCACCATACAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688028	686015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_-_686000_688000
926352	contig_9609_pilon	+	2055	9	Intergenic	novelGene_23051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	781.712503098166	2	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	48	1064	435659	454609	TRUE	70	TAAAATGTAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435611	456253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454630_455282
926353	contig_7151_pilon	+	3651	4	Intergenic	novelGene_40755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	130.246774325594	65	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAATCATGATACCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	502593	508046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_503212_503293_503387_504052_506685_507738
926354	contig_16897_pilon	+	1694	1	Intergenic	novelGene_174454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCACCTGAATTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56667	58361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_+_56700_58400
926355	contig_3975_pilon	-	2248	12	Intergenic	novelGene_54740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	390.854182190158	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	92	1456	1731202	1719416	FALSE	30	ACAGAACCCCATGCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSRTFIMMKTLKEVWIQKDKGPRYVCTCDFRLPFFLSTTRLILTLVLRQDYVWLSLCRYHQQCY	1731293	1718623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719605_1720287_1720363_1720453_1720512_1720627_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
926356	contig_17144_pilon	-	2254	13	Intergenic	novelGene_29295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1910.768611711	2	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	295	1176	174597	169060	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGEERRDREAWWVPGWQLQHGVTETQKSEVTCPRSQSRPDPVGRSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQGRQTRRTSSPLSSMRSL	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166701_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170730_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174779_181794_181850_183158
926357	contig_4091_pilon	-	3021	2	Intergenic	novelGene_173044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62836	46105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_48467_62176
926358	contig_11742_pilon	+	2472	2	Intergenic	novelGene_166552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGTGAAAAAGAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181936	184922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_182173_182686
926359	contig_4754_pilon	-	1791	1	Intergenic	novelGene_35913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTTACCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188631	186840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_186800_188600
926360	contig_6137_pilon	+	2732	13	Intergenic	novelGene_59269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1190.46969022035	5	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	414	1604	1331821	1353702	TRUE	45	TAAAATGAGATTTTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1331407	1354911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512_1353986_1354066
926361	contig_7898_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_47650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1622	1933	846337	846026	NA	35	CTGTAAACCTTCATCTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAMDHNYHGLHQTESSTTRWCPATTTDCSDRDHNRGSRTELEKNVEQNSDSQKKATLNWPNRDWRNPETLAPRHPFSSVMKSLPRFTLQPKIRKAHKTKRD	847958	845859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_845900_848000
926362	contig_13958_pilon	+	2222	1	Intergenic	novelGene_129543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1761	2093	218869	219201	NA	20	TTTTTTTCTAGCAATCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVCLTQAMVFSVTSYARESWAVNKEDRRRIDAFELWCWRRMLNIPWTTKRMNKSVLEEIQPEWSLEAGMARLCLMYFGYVIRRNQSLEKDIILGRGSAKKRKILNEID	217108	219330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13958_pilon_+_217100_219300
926363	contig_18647_pilon	+	1096	1	Intergenic	novelGene_162841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAGATTATAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57040	58136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18647_pilon_+_57000_58100
926364	contig_1348_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_174372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGTTAAAACCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568282	566593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1348_pilon_-_566600_568300
926365	contig_7898_pilon	+	2369	4	Intergenic	novelGene_47643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	234	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGACTGCACGTGCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775134	779960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_776935_777651_777761_778756_778963_779706
926366	contig_5556_pilon	+	2599	1	Intergenic	novelGene_173271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGCTTCAGCAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54837	57436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_+_54800_57400
926367	contig_7915_pilon	+	1120	2	Intergenic	novelGene_42973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	372	junction_1	0	1	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	354	765	1118	121126	121561	FALSE	50	GTGATAGCAGAACAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCFCLLELKNILDMLQLENNELQGLKLQHDQKVSELEKMQVEVLEEKLELENLQQTAQRQKGEIEWQKQLLEKDKREIERMTAETRALQVCMASLSKEKEDLEEKCDSWEKKLAQTK	120361	121563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7915_pilon_+_121264_121345
926370	contig_4305_pilon	+	1059	1	Intergenic	novelGene_136698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTACAATAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620402	621461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_620400_621500
926371	contig_815_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_175031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAGGTGCCCAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10187	12023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_815_pilon_+_10200_12000
926372	contig_14333_pilon	-	2341	1	Intergenic	novelGene_49118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393002	390661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_-_390700_393000
926373	contig_854_pilon	-	2600	14	Intergenic	novelGene_36169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	222.730075181895	7	22	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	121	1209	493192	471803	TRUE	10	CAACTCGTGCCTGGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIPSSSWVSGQLEHWLQNGPVPPRSSGTEQWGDGGATADRMAQKKKELCIGRKKFNMDPSKGIQYLIEHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	509253	470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_470621_471002_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996_487110_488573_488655_491436_491556_493129_493197_497525_497571_509182
926374	contig_3602_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_60568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	60	183	193	375	521222	521040	NA	35	TTCCCAAAAATTTATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCINWSQPRGVKESEEHQRHKESISPRDRKGHTDQRLHQPETRTGWCLAITNDRPDREHNRESLMEKEKGGVQNSNSGKKTRLNGLTETGGTPESMAPRLSFNPEPKQFPRPTLHKKIGQDYGT	521414	520003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_520000_521400
926375	contig_16221_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_176607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43435	42021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16221_pilon_-_42000_43400
926376	contig_7333_pilon	-	2934	5	Intergenic	novelGene_142808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	39	junction_2	50.6081762168921	1	131	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	635	2494	406076	394458	FALSE	60	AAAAAAAAAATACTGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407207	394017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_405092_405298_405761_406195_406691
926377	contig_15354_pilon	+	2429	9	Intergenic	novelGene_65765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	163	junction_8	65.2183831446319	6	132	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	136	1275	663143	672424	TRUE	60	AAAAAGATGACAAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLEELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYHNGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVGSRLGDSQLVKVRRSFFFLSVITASSSSGFSYVWCFSEVLQFIIFPTIQLSAWLM	663007	674122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_663204_664557_664707_665958_666076_666467_666690_669379_669495_670617_670716_671430_671590_672205_672978_673521
926378	contig_15538_pilon	+	2655	19	Intergenic	novelGene_152637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	31.4903963412402	63	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	106	1653	59790	132045	FALSE	30	TATCTGGATATATGCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYRAASRSLAARPSPCPPPSPGKPAAVARRSEADFMAAARKAVLGPLVGAVDQGTSSTRFLVFNSKTAELLSHHQQRWVEQDPKEILQSVYECIEKTCEKLRELNIDISNIKAIGVSNQRETTVVWDKFTGEPLYNAVVWLDLRTQSTVENLSKRIPGNNNFVKSKTGLPLSTYFSAVKLRWILDNVRKVQKAVEEGRALFGTIDSWLIWSLTGGAKGGVHCTDVTNASRTMLFNIHSLEWDKELCDFFEIPMAILPNVRSSSEIYGLMKAGALEGVPISGCLGDQSAALVGQMCFQDGQAKNTYGTGCFLLCNTGHKCVFSEHGLLTTVAYKLGRDKPVYYALEGSVAIAGAVIRWLRDNLGIISTSEEIEKLAKEAGTSYGCYFVPAFSGLYAPYWEPSARGIICGLTQFTNKCHIAFAALEAVCFQTREILDAMNRDCGIPLSHLQVDGGMTSNKILMQLQADILYIPVVKPSMPETTALGAAMAAGAAEGVGVWSLEPEDLSAVTMERFEPQINAEESEIRYSTWKKAVMKSVGWVTTQAPESGIP	59684	133047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15538_pilon_+_59868_70596_70639_73800_73913_80614_80693_92214_92292_94717_94856_97019_97130_97481_97549_100666_100703_101105_101174_107424_107468_108144_108226_121343_121423_122182_122280_122779_122865_123291_123413_123523_123668_125677_125759_132034
926379	contig_4974_pilon	+	3389	1	Intergenic	novelGene_161410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1256	1651	84044	84439	NA	25	CTGTCACGGGAGAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQEIKRDLHKWKNMLCSWIDRLNIVKMSILPKVIYRYSAIPIQIPTAFFKKMEKLIINFIWKGKRPWISKALLKKNKVGGLALPDLRTSELYSYDSQNSLVLVRQIH	82788	86177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_82800_86200
926380	contig_18055_pilon	+	1549	13	Intergenic	novelGene_117824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	389.161804038143	1	44	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1491	58	1548	41985	85627	FALSE	70	AGGAAGAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPVPHGMMPQMMPPMGGPPMGQMPGMMSSVMPGMMMSHMSQASMQPALPPGVNNMDVAAGMYTLYSGLTTTILKQNSLLGRSQMILKHLLSNCYLNVLGRSTNLTLESLTIIILKQKNPAGPNLKNLRILKDTRIPLLLEVLLQNQTCMIYSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALE	41927	85628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_42054_59718_59800_61361_61414_73645_73719_75199_75321_75562_75617_77924_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
926381	contig_16411_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_77297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAACCTAAATCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81254	83223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_81300_83200
926382	contig_3172_pilon	-	1284	1	Intergenic	novelGene_173678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGACCTATGTACAACAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20118	18834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3172_pilon_-_18800_20100
926383	contig_11304_pilon	+	2331	1	Intergenic	novelGene_156712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAACTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401038	403369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_401000_403400
926384	contig_1443_pilon	+	1288	4	Intergenic	novelGene_28231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_2	35.4432253360529	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATTAAAAAAAGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535991	538691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536229_536604_537612_537727_537987
926385	contig_3095_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_74995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
926386	contig_10766_pilon	+	3064	3	Intergenic	novelGene_151196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAATTAACGGACTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133237	303962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_134489_301930_303279_303497
926388	contig_2768_pilon	+	1506	1	Intergenic	novelGene_57506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1021	1347	767433	767759	NA	20	CTTGCAAGATTGTGGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTLSQLCRPLPSASLLLGFPLLTGPTHGQCSSLLSSLAAFLAAAFCFHYWLFCRAVSGILTAGSLLPGPLSGSAGRPLLGFSPSSVLTALDPCITILLGGTLLPFLS	766412	767918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_766400_767900
926390	contig_4364_pilon	+	1967	7	Intergenic	novelGene_82	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.85861230093008	37	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	150	1115	835739	844797	FALSE	50	TGGGAAAAAAAAGATTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVAVSVSSAAGAYITGSYRSPARCGSRVPTTGDQDQGPLRPASVLPPAMPASPLALGLLPRVLQTLLLLATSLSVQHGGASPLHQGAECRTLAPPDPPRGGGAADPASFNTGWDSPICTRGVVLVSQGERAVMTCNISSDFSEVTIFKRVSGNDCQEIFTVKAPGNITGGGWHLQVQGRVAELVTEEANPTQAGEYKWLLKGRQSNWEVTKLNVTGWDSPICTRGMVLVSQGERAVMSCNISNDFSEVTVCKCVSGNDCQKIFRVKAPGNFTRDGWHLQVQGRVAELVTEEANPTQAGEYRWLLKGHQSNWKATKLNITALETLPTPLSAIKLNTVVGLIIVVLGLGLGLGMAGLILCRRSVGPRSTCR	828193	845649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_828279_835674_835830_838378_838478_839574_839887_841244_841557_842839_842988_844793
926391	contig_9113_pilon	-	1892	1	Intergenic	novelGene_68609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1156	1455	418465	418166	NA	65	ATTTAAAAAAAAAAAGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTEPEKDVEQIVTHTKKDQIYWPDRGWRNPESMAPGHPCSSVVKSFTRFTIQLGTGQPHKTKRD	419620	417728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_417700_419600
926392	contig_5549_pilon	-	2610	1	Intergenic	novelGene_81693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAAAAAAAAAAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	761608	758998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_-_759000_761600
926393	contig_15501_pilon	-	1719	1	Intergenic	novelGene_177571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTCCTTGTACAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7479	5760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15501_pilon_-_5800_7500
926394	contig_10377_pilon	-	1329	2	Intergenic	novelGene_115361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAGAAAAAAAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201570	193069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_194010_201181
926395	contig_8304_pilon	-	3292	1	Intergenic	novelGene_153170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1744	2061	86161	85844	NA	35	TTAGGCTCTAAAAGCTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEVPYDPAIPLLGIYPREITAVTRTDICTPMFMAALFTITKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATVKNNDESVKHLIT	87904	84612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_84600_87900
926396	contig_4151_pilon	+	2760	3	Intergenic	novelGene_65249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAAAAAATATCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554854	557806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_555447_555521_555961_556077
926397	contig_5255_pilon	-	2178	1	Intergenic	novelGene_171556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACCTGGACTGCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51730	49552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5255_pilon_-_49600_51700
926398	contig_19974_pilon	-	3658	3	Intergenic	novelGene_130448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	147	153	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	992	1906	82361	81447	TRUE	35	GCTAGAAGACAGGAGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILASRIQQYIKKLIHHDQVGFIPGMQGWFDIRKTTNAIQHINKRQEHMILSIDAEKTFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGESLKAFPLRMETRQGCPLSPLLFNIVLVVLARAIRLEKEIKGIQMGKEEVKVPLFADDMILYTENPKESTRKLLKLIEDFSKVSGYKINIQKSVGFFYANKENFEEEITKSIPRKIKYLEINLTRDIKDLYNENYKTLVQETKRVLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSVLPKAIYKYDAISIQIPMTFFNEMEKQTPT	238817	19601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_20198_80290_82630_238094
926399	contig_10940_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_49279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTCATAAAGACCCTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	887495	884740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_884700_887500
926400	SIRV7	-	2150	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	116	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	65	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCGTAATTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147802	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1965_2148_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
926401	contig_7056_pilon	-	651	1	Intergenic	novelGene_43684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCATGGTGATGGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849239	848588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_848600_849200
926402	SIRV6	+	785	8	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	-41	557	2	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	26	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1089	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724
926403	contig_6896_pilon	+	1388	1	Intergenic	novelGene_174219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	641	952	175261	175572	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNWKLKFKNQYHIQYLPSSHQKGKKPLGINVAKPVRDMYVENYKRLIKEVKEDRKRWRAIPCLLTGRLNIVKMSILPKMIYRFNVIPIEISAGFFNIGKLIL	174620	176008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_+_174600_176000
926404	contig_19378_pilon	+	2967	1	Intergenic	novelGene_73795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	446	802	34820	35176	NA	35	ACTTTGTATTGATAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAIETTTGDCCIEFCKTNLLDGNTFFQQQTVTIHVDHAGWNTKESNRPRLWKETREKLNTIGQNKAGADCETDPQLLICKCKLSLRKLKHVHKSQSTTVSISHLNSETISRIDLTH	34374	37341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_34400_37300
926405	contig_5461_pilon	-	1766	2	Intergenic	novelGene_156833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	457	1053	801002	800406	TRUE	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAASRHMRKCSLSLAIREMQIKTTMRYHLTPVLLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWQCKMIQPLWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYVTRKNNDESVKHLITSMKMEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	801458	799304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_799747_800134
926406	contig_17195_pilon	-	1592	1	Intergenic	novelGene_168971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATCAAAGATAAGGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43431	41839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17195_pilon_-_41800_43400
926407	contig_12113_pilon	+	1346	1	Intergenic	novelGene_134760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCACTCACATAAAAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362498	363844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12113_pilon_+_362500_363800
926408	contig_3818_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_99248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAACTGTTGGTCACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455071	454008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3818_pilon_-_454000_455100
926409	contig_16703_pilon	-	2200	4	Intergenic	novelGene_72760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	867	1184	26314	25997	TRUE	25	CACCACAAGGTTTTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSCDSFIKLSILHHRAAGDQVAVLFQAGACEVRGTSLWSHSRSLDSRLPDLQVPDQSSGGQEVRHPLKNANRMDRKLTRNKYCSSPLTITVLLCSEVVTLFGLR	27180	14790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_15483_16919_17017_19930_20117_25955
926410	contig_11779_pilon	-	967	1	Intergenic	novelGene_146445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTCAGGATGACGGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10592	9625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_9600_10600
926411	contig_7446_pilon	-	1823	2	Intergenic	novelGene_101964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	3	398	255770	255375	TRUE	90	AAAAAAAAAAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YSFFLLPFFFFFHFCFSPFLSLSSLHSTPVASSHSSLFCLCVCLWLLFLSSLSLIFPIPVLAPHITIYPLLPAYLHCALNITLTSSTGTAYWNLPCTGSRSALSALVHATNNPSQQLPFSWTCPAVPYLID	255772	253839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_254296_254405
926412	contig_11548_pilon	+	1662	5	Intergenic	novelGene_66768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	2	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	230	820	112832	119638	FALSE	15	ATTACGCTGTTCATTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112602	120480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
926413	contig_14953_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_137270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAATAGATGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69172	68100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_68100_69200
926414	contig_6397_pilon	+	3077	1	Intergenic	novelGene_146262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	546	884	470602	470940	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLVTCPKYVRRSLTILASKEHSGCTSSKTDLFVLLVYSTFFASITILLRSSLFNVQLSQAYEAIENTMAWVRCTLVFKVASLLFNALKRSFAADLPNAMRLLIS	470056	473133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_470100_473100
926415	contig_4812_pilon	-	2963	2	Intergenic	novelGene_103702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	170	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1793	2107	876042	875728	FALSE	60	GGGAAAAAAAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMRQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDITEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	878102	874871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_877348_877615
926416	contig_10500_pilon	+	1932	7	Intergenic	novelGene_41289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGGGGCCGACCAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1628557	1640161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637066_1639870
926417	contig_5799_pilon	+	3690	1	Intergenic	novelGene_50249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTCTGGTGAGCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170828	174518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_170800_174500
926418	contig_14530_pilon	+	1516	1	Intergenic	novelGene_108449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1190	1495	19936	20241	NA	20	TGGCGCATGGAGCCAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKNGIREKKPKKQNRTKKAEKKKCSQGCPCASAQSKRVASKPRGTVRLEVAPKLRKEKENKQIKPEQIRANKQTKNPQGSHRHGSTGRESVSQLSSVS	18746	20262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_+_18700_20300
926419	contig_177_pilon	+	2046	3	Intergenic	novelGene_41832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	51	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	70	1146	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415661	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419498_420000
926420	contig_4832_pilon	-	1241	1	Intergenic	novelGene_163425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCATTGTGCTAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	511789	510548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_-_510500_511800
926421	contig_10446_pilon	-	3695	1	Intergenic	novelGene_162447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAGGATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239460	235765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_235800_239500
926422	contig_5201_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_82175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTGCAATGTGTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253094	255574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_253100_255600
926423	contig_14142_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_120501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGAAATCGAAATTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311728	312985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_311700_313000
926425	contig_6059_pilon	+	1804	11	Intergenic	novelGene_44857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTCAGCCAATAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568029	576961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165_573437_575784_575882_576079_576218_576549
926426	contig_15003_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_137345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAACTAGGGGTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310943	312878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15003_pilon_+_310900_312900
926427	contig_17753_pilon	+	3984	5	Intergenic	novelGene_105060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	373.670309229941	3	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2616	3002	146485	146871	FALSE	20	ACTGCTCAGCCTTCTAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	45497	147853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_96134_96231_130836_131040_144508
926428	contig_5230_pilon	+	1213	2	Intergenic	novelGene_173235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTTGAGAAGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55534	58025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5230_pilon_+_56144_57421
926429	contig_10627_pilon	-	983	1	Intergenic	novelGene_60057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTACCTGGGGTGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1210947	1209964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_1210000_1210900
926430	contig_2730_pilon	+	2096	4	Intergenic	novelGene_135367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	3	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291631	392481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291754_379343_379459_388515_388579_390685
926432	contig_10988_pilon	-	647	1	Intergenic	novelGene_104743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441267	440620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_440600_441300
926433	contig_17144_pilon	-	2383	14	Intergenic	novelGene_29226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1973.50656290932	12	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	158	2299	174965	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPALRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	176095	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166688_167289_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
926434	contig_6445_pilon	-	1198	10	Intergenic	novelGene_76894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	867.491630158506	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	481	966	64875	43105	FALSE	10	CATTAGCCTTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	91093	42872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68215_80473_80562_85287_85320_91007
926435	contig_5669_pilon	+	3031	7	Intergenic	novelGene_86050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	218.724331827379	7	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	642	1094	187502	189500	TRUE	45	TTGAAAGCCAAAGAGTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPLTDLEIKFQYRGRPPCALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPVSLEQVRFPSPEDIPSEKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPCAEADATRPNPIQREVKTKLFSLEQFLHELWCAWPLGKLGCERQ	175632	192261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_175734_182928_183135_185949_186124_187341_187512_187718_188112_189450_190117_190940
926436	contig_3153_pilon	+	3209	2	Intergenic	novelGene_104660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGATGAGAACTGTAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163715	200912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_164475_198462
926437	contig_2444_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_83787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	336	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTGGCTATGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256253	258525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2444_pilon_+_256300_258500
926439	contig_5574_pilon	+	3510	1	Intergenic	novelGene_155867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1200	1595	205138	205533	NA	15	TCTGCCCTTCAAGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLMTTNSILKIHLRPGTVSITLPEASWFKVHPSIPGQGLLPFLESPDSSTPLSFPLVPPSASVLTTTKCPVFLYSCLGHHYSHSVGTMFISPCPHYLGILERRHPAARSCDLLACGSSWNLVGRSGVQVT	203938	207448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_203900_207400
926440	contig_6677_pilon	+	4280	2	Intergenic	novelGene_114198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	292	729	576640	577077	TRUE	65	AAAGAACCAATGTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVKLSGPSFADVAQLKIRRNSCKHPLMIGTWNVWSMNLGKLEIVKIEMECINIEIPGISELKWTDIGHSESDNHMVYYARNDQLKRNDIAFIVKKNISRSTLKYDIVSDRIISIRLQGRPINTTIIQIYTPTTNAKDDEIEDF	576348	580743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_+_577592_577706
926441	contig_987_pilon	-	2461	1	Intergenic	novelGene_72321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1127	1669	1032470	1031928	NA	40	ACAGCAACCCTATAGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLKNIHDLWEEVKISTLTGAWKKLTPTLMDDFEGFKTSVEEVTADVVEIARELEAEPEDVTELLQSHNKTLMDEELLLIDEQRKRFFEMESTPGEDAVNIVEMTKKDLEYYINLVDKGTAGFEMIDSNFQRSSTVGKMLSNSIVCYREVFCKRKSQLMWQTSLLSYFKKLPQPPQPLSP	1033596	1031135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_-_1031100_1033600
926442	contig_19352_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_122381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTACGCGTTCTGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125395	127582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_125400_127600
926443	contig_4989_pilon	-	2932	1	Intergenic	novelGene_160787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	390	2542	2931	98434	98045	NA	5	CCCTCCACTCTTGGCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTGYNSGSGTLRIQFFYQDSLFSAVLAGIPLSGPSASALLGQVLQSSFSSSSKCPEAPHSASDPPAQKHSAFSLHKPGSPMRCLLLVSPAGVSPTASHRLQYYSSFLVPWFQELLSTGISGPKD	100975	98043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4989_pilon_-_98000_101000
926444	contig_8006_pilon	+	1774	1	Intergenic	novelGene_173940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	737	1072	529989	530324	NA	25	CAAGGATTTTATTTTACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKILNDTRSIKIRWKKYTESLCQKELVDIQPFQGVAFDQEPMKLKEEVQAALQALVKNKAPGIDRIPVEMFQQTDAALEVLAHLWPRNVEDSYLANQLEEIHIYAYAKER	529252	531026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8006_pilon_+_529300_531000
926445	contig_7843_pilon	-	2207	2	Intergenic	novelGene_152037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	210	junction_1	0	10	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1	744	332556	331534	FALSE	70	AATAAAAACCAGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDVEGNGPLGLRSPSESSQHTSQPERKSEQGFLGVPRSLAYTLPGCLKAEPKDSYPGPHGHSFLDLKHFTIGISGFLADEFATGAFLRLLQEQLDEISSHNPPEKPKLLEGQSCSGSRDGLQSRLHRFSKVLSEAQWRYKVVTSNQGSEGHLTPSRRYQPIATQHPSLRQGRRTRRSRADKLKSSLLSSCFHAPGKWYIVRCLIFF	332556	330070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_331710_331988
926446	contig_7180_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_169044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATGTACAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297335	295152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7180_pilon_-_295200_297300
926447	contig_8964_pilon	-	4651	1	Intergenic	novelGene_168696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	130	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTTCCAGGCAACATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541844	537193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_537200_541800
926448	contig_9375_pilon	+	3186	2	Intergenic	novelGene_136088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	17	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1911	2252	741462	741803	FALSE	15	CAGTTTTTGCTTCATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSTISLISHVSKILLKIIQKRLQQYIDRELSEIQAGFGRERGTRDIIADVRWILAESREHQKDVYLCFVDYAKAFNYVDHNKLCITLQRMGIPEHLTVLMKNLYIDQEAVF	738622	742737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9375_pilon_+_740383_741311
926449	contig_3948_pilon	-	2907	9	Intergenic	novelGene_53182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.52769256906871	27	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	134	1573	792885	767487	FALSE	65	AAAAAAAATTAACCAGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLNGYLESQGPEKAGEKTTTHRSPLCAVLYSKNFKQVVSGSLKGMVNVWEVTTGRDMMEFSVVNARHVELTAMALDESERCLLTGLRDGTIKMWNYNNGECLWTFPNTDQLEISGIIHMSQGFYVTGWSKRITYMRFHKTKPVPLCHHWQTFHTEDVLSMAKYQNQFLGTSSYNGDILFWNVSWFKPILKFNASESPLPLQPKKVQGMDNRPSEDYGASKPCVEQQKWAYKASPLHVGRTVGSTILRQSLTSAPPVMRHLREKEPDRHGLPQKPVSAGSSRKPKVSHDKQPFSKEIERRQRGSQRKMVPANTSVEKIIFLQTRPRLPHTAALLSSCIDGYIYAWSIHGNGGLLGKFPVDFQDNGDVVVGAMATDENDWILVTGDCRGCIKIWDIKDYCISTDHHNQLSRNSGGKAVSETENKFQLLIPKQLQVSPSKYMSLEEKQVVDGQTISLTPPKLLITWKGHLESVEDILYVDSFQMVISAGLDRNVKAWKLDGDAVGMGPTETQPCPMALPGPVFVRT	794235	766152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_767724_771888_772054_772648_772871_788258_788391_790267_790472_790922_791128_791890_791962_792681_792910_794126
926450	contig_12299_pilon	-	4316	1	Intergenic	novelGene_29759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	831	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATTTACCACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645780	641464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_-_641500_645800
926452	contig_12250_pilon	+	3344	2	Intergenic	novelGene_80523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	711	1055	69628	69972	TRUE	40	AAGAACTGATGGTATTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEHTVAKANGTNDEVKELNRRFQRAAPEDKVRYYNEMCKDLELENQKERTRSVFLKLKELKKKIQALSCNTEGFYGQNIERHRKHRKMKGTLPKRSSQHSPISGG	68917	72341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_71415_71494
926453	contig_2342_pilon	-	1286	1	Intergenic	novelGene_132762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACATGAAGAAAGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405654	404368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_404400_405700
926454	contig_3751_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_158626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51184	52873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_51200_52900
926455	contig_14326_pilon	-	2173	3	Intergenic	novelGene_120745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1433	1735	519363	519061	FALSE	50	AGTAAAAAAATTGTCGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLVFWFGALESWFHGTSQLIGLIFCLVHLFYFLVCCVVPGVLKLASGHFKVQQSVSIAWSNRGRRRIWRKKCTVANCLHEQLNGAWLPLLNFLVKDSIE	554113	518622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_520065_548917_549608_554072
926456	contig_5020_pilon	-	3258	1	Intergenic	novelGene_27932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGGTTAGCAGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145099	141841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_141800_145100
926457	contig_12624_pilon	+	1541	13	Intergenic	novelGene_60950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_12	265.560243740579	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	56	916	11640	53324	TRUE	30	CTAGGAAAACTCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLVYYSKRMQSRTSQRERHIRQGLRGSQT	6046	55581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_53241_53344_54975
926458	contig_13037_pilon	-	2158	1	Intergenic	novelGene_155146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1014	1319	45343	45038	NA	20	CGACAGCAGTGGGTTTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCQKKKKSVLEEAQPECSLKARMARLPHVVWARYKDLFLEKNLTLGKVEVSKRVGDSQQDRLKQWTVATTMSSSIATVVKMVQDQAVFPPVVRWVTMSQN	46356	44198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13037_pilon_-_44200_46400
926459	contig_10793_pilon	-	1045	10	Intergenic	novelGene_83438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGGCTTCTATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167265	159204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_159266_159560_159643_160426_160555_161398_161472_162548_162689_163140_163288_163929_164068_165295_165375_166399_166473_167141
926460	contig_16103_pilon	-	1761	5	Intergenic	novelGene_118868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2582.51239106417	7	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATAAAGAACCAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735720	722305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733723_734314_734391_735661
926461	contig_13244_pilon	-	4371	3	Intergenic	novelGene_86910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	634	999	126914	126549	TRUE	15	ACGTAATTCTTTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWVSNCCLCIISSCEFILALCSCIIFLNSSSFSSVFSMNLSIFSSCLSAFSLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSGGESSGVLFWTPTGTILSCFYKCFDIVCCLWGIQ	165527	122941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_126095_126329_127477_165456
926463	contig_4884_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_63833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTCTTTTATCCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596870	599419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_596900_599400
926464	contig_7272_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_25323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAATATTAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536657	534730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_534700_536700
926465	contig_5954_pilon	+	2579	2	Intergenic	novelGene_28795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	91	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1000	1332	1415498	1415830	FALSE	65	TTAAAAAAAAAAAAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHTFKCLYIVNKTQVNIFLVFSAFSQDPSDISNDIPSSMSSSESGLNFWQFPIDVLLQLLLNDFQQNFTCGDINDIVSTFCWITFLWNGDKYGSLPAGRPVSCLSNFLA	1414442	1417077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1414635_1414690
926466	contig_9921_pilon	+	1537	2	Intergenic	novelGene_23713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	212	715	31741	32244	TRUE	50	CAGCAGAACAAACATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHSWPAGAKSSSKSYRRRNLQNSLYFRPAGLSLSLCLSVSIPPSLGRKLERFYRSSATACSAFLRPPAMQSWVYTSSESVLLAPPDSLPPVSSLILCNSSQNSQRLLKMAQRLLKMAEIHRVTVPKRIRRHSAISGGSVCSRTNGTEGICPSCTESVGKKRRSWN	31529	52988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_32993_52914
926467	contig_1406_pilon	+	1302	1	Intergenic	novelGene_25492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAAAAAAAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1350473	1351775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_1350500_1351800
926468	contig_6048_pilon	+	3691	2	Intergenic	novelGene_73302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3024	3329	2074846	2075151	FALSE	70	ATTATTAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVFKSCKWPSKAQQLICIHLEQQRRRVRNRRRIGNVWLTASMNNCPFCHETRRSEWCLATITEHFDQCFHRRILIKRGKYRREFQILMDSRLPGAMEGG	2012242	2075513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2015241_2074820
926469	contig_6691_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_60186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAATTATCTCCTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460438	462800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6691_pilon_+_460400_462800
926470	contig_12312_pilon	-	3549	16	Intergenic	novelGene_64008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	572	922	531411	510306	TRUE	90	TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASISCSVILMISCFRTLRSSSSVVVLQLSVEPLIPSVALCTTVVCGSLAVCKGASSWAGFTRLFLLLLCGLTPPSDFLFNRLLAAEKFLETSMVVRIAPFSFLRALNLRKHSTVS	534356	500264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_502379_504843_504918_505068_505172_505610_505696_506119_506216_506867_506991_510273_510356_510591_510635_515483_515528_525180_525250_526425_526471_527904_527954_531360_531439_531800_531896_533464_533708_534150
926471	contig_4876_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_137905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCAGGGTCATCCACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451421	449809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_-_449800_451400
926472	contig_9982_pilon	+	3631	4	Intergenic	novelGene_55779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	296	junction_2	282.527088180152	2	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2247	66	2312	635612	650052	FALSE	45	GAGAGTCAAATGAAAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVTEKLVFAYESSVHSANVLLSLNDQRKKDVLCDVTVFVEGQRFRAHRAMLAACSSYFHARIVGQMDAELSITLPEEVTVKGFKPLIQFAYTAKLILSKDNVDDVCRCVDFLGVHNIEESCFQFLKFKFLDSTTDQQEGPRKECFLSHCQKTDLQLSPVDQKDLEIDEVEEFLESEHVPIPQCKLSRHQGDARASLALQDSTSQTSESMCSEKDTALTLPSLCPKYRKFQKAFGTDRVHSVDSSVKDSQVSPIQPNETPENECLGGVQDCADLQAILKCEETKTPVEHEETKKQDSASEHPAVKAEATPFAHSSAADPHGLYALSLLHTYDQYGDLNFASMQNTTVLTEKPLSGADGQEEHTLGGSQDLHLKSDPGPREDSSLASGDRSSVEREVAEHLAKGFWSDICSTDSPCQMQLSPAVARDVPEQMYSQKRFECPWLGIRISESPEPGQRTFTTLKSVNCPFISTLSTEGCSGSLEIGNDDYVPEAQQEPCPYACVISLGDDSETDTEGDSESFSAREQECEVKLPFNEQRIISLSRNDFQSLLKMHKLTPEQLDCIHDIRRRSKNRIAAQRCRKRKLDCIQNLESEIEKLQNEKESLLKERDLILSTLGETKQNLTGLCQQVCKEAALSPEQIHILAKYSASDCPLSFLISEKEESTSDGERALPSIFSLRDGPPAVLPASEQSRCYRSSRKNKEPGGGRGQESRQTSTAGGEHAGLLEQCRQSGAISDFCQQMTDKCTTDE	635546	651371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_635846_638028_639376_641682_641890_649593
926473	contig_18177_pilon	+	2241	4	Intergenic	novelGene_179113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATGGCTAGTGATCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1191	169871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18177_pilon_+_2368_27616_28042_48634_48776_169372
926474	contig_18364_pilon	+	2423	1	Intergenic	novelGene_102588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1671	1994	200272	200595	NA	25	AGCCCCAGCCCACTAATCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIRGLTERCRKCSMHVCPHLSPCPSSHSAVRAVALTGGALLHITASAAVSVPAHCVSVADIAPGSLAPPQTAAPEGPLGFGVGHDLTKVWATEACWAQCQDIEDD	198601	201024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_+_198600_201000
926475	contig_9389_pilon	-	675	1	Intergenic	novelGene_83886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAGGTCGACTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52118	51443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_51400_52100
926476	contig_8735_pilon	+	1400	1	Intergenic	novelGene_173716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45599	46999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8735_pilon_+_45600_47000
926478	contig_9363_pilon	-	3520	21	Intergenic	novelGene_6577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_16	667.016137361009	3	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	146	2032	773929	756981	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGYAAEVILRNWVQSLLLGAPRYQHTGMVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTRFCLSSAFTTGLHTGNCVFVCNVSEYKDICACVYVCLCMCLYICVCV	775000	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893
926479	contig_9424_pilon	+	484	4	Intergenic	novelGene_143788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	638	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGGAAACTGGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277472	280144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9424_pilon_+_277640_278585_278762_279552_279628_280078
926480	contig_2684_pilon	+	1281	10	Intergenic	novelGene_172701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	172.53155016538	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	91	1023	150983	162173	TRUE	20	TTTACTTTACGGAACTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMDFFNAQMRLGGLTQAPGNPVLAVQINQDKNFAFLEFRSVDETTQAMAFDGIIFQGQSLKIRRPHDYQPLPGMSENPSVYVPGVVSTVVPDSAHKLFIGGLPNYLNDDQVKELLTSFGPLKAFNLVKDSATGLSKGYAFCEYVDINVTDQAIAGLNGMQLGDKKLLVQRASVGAKNATLVSLPTINQTPVTLQVPGLMSSQVQMGGHPTEVLCLMNMVLPEELLDDEEYEEIVEDVRDECSKYGLVKSIEIPRPVDGVEVPGCGKIFVEFTSVFDCQKAMQGLTGRKFANRVVVTKYCDPDSYHRRDFW	149650	162771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2684_pilon_+_149675_150211_150272_150976_151094_151940_152080_157600_157681_157763_157887_158211_158310_158538_158786_162038_162358_162697
926481	contig_3181_pilon	-	3562	2	Intergenic	novelGene_136932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGCTGTGTTCCAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313395	309500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3181_pilon_-_309543_309875
926482	contig_12677_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_110682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_300
926483	contig_12340_pilon	-	2389	1	Intergenic	novelGene_122101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	1616	2149	12693	12160	NA	75	TTAACTAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVLHVRWVSVRRTLWRTPVRVLPGVGAGRLHARRSSCQVGVRQEDALEDTSGTLSCLVWEPAVCTRGVLTSGGCPSGGRPSVSCLVWRPAVCTRGVLHVRWVSVRSAHTLLRVALELLLAHGDPMCVLLELCSIRFSVADFLEVDHQAFLPRCFWVDSMPQPLGLTVRHVNCFHH	14308	11919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12340_pilon_-_11900_14300
926484	contig_6279_pilon	-	3761	1	Intergenic	novelGene_164763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1387	1713	78204	77878	NA	65	CATATATACCGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIKEASECSLILLNSNTVFNQGDNLQLNTYGEHRAKIVILSHILLTFKVYKLARALSSCISLLPKSQSFIELPNDVFHKYYLNVYFNLVLGNDIHEFIHLMCLLYTS	79590	75829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6279_pilon_-_75800_79600
926485	contig_5715_pilon	+	2713	1	Intergenic	novelGene_127983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	689	1051	640417	640779	NA	25	GAATTACGGTGTTGGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVRRDLKVALECRVAKANGRNYEVKELNRRLQKMAREDKIKYYNEMCKDLELKNQKRRTHLAFLKLKELKIKFKPHIAILKDSMGKILNDAGSIKRWKEYTQSLYQKELVDVQPFQEVA	639728	642441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5715_pilon_+_639700_642400
926486	contig_4604_pilon	+	2726	3	Intergenic	novelGene_19179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	965	8	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCCTGAAATGAATCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377081	380709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_378607_379336_379470_379641
926487	contig_1435_pilon	-	2415	1	Intergenic	novelGene_115528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAACAAACAGAAGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606878	604463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_604500_606900
926488	contig_1339_pilon	+	274	3	Intergenic	novelGene_163147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9682	junction_2	756.5	3	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGGCCTCCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431711	434177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_431736_433677_433797_434046
926489	contig_6503_pilon	-	3060	1	Intergenic	novelGene_145792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	62	415	904944	904591	NA	45	ACAAAAACCCTATCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQKQQGVARRDAVGADTLWAGSAGMCGEVASGIWDAFSTLGETKRQSLLRPPDSVKSGTQLVKDKYVCLAYCADQKTLFRKNLSHLPARSLLCTRSCASFNNCHIPWDGCRTLDSP	905005	901945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6503_pilon_-_901900_905000
926490	contig_15327_pilon	+	1125	1	Intergenic	novelGene_70591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCACTAATGTTAAATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846270	847395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_846300_847400
926491	SIRV7	-	1095	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	112507	-15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATTCTTCCAAGCGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2231	1020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1881_1996
926492	contig_14525_pilon	+	501	6	Intergenic	novelGene_149761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTTCTGGATGCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134619	140230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_+_134733_135616_135698_135834_135940_136972_137066_138536_138600_140184
926493	contig_15047_pilon	+	1516	7	Intergenic	novelGene_52123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	22	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	30	653	2194	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
926495	contig_16643_pilon	-	1584	1	Intergenic	novelGene_158104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106325	104741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_-_104700_106300
926496	contig_10037_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_148961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTTGAGAAGTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318120	319953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10037_pilon_+_318100_320000
926497	contig_10949_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_146695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATACAGGGCACATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133150	134014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_133200_134000
926498	contig_12756_pilon	+	1591	1	Intergenic	novelGene_153229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAATAGAACAGTGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256747	258338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12756_pilon_+_256700_258300
926499	contig_11708_pilon	+	6122	19	Intergenic	novelGene_138955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	241	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTAAACATTGGTAATATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223651	249931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11708_pilon_+_224664_224798_224907_225170_225276_228359_228460_229027_229222_229304_229414_232871_233114_233699_233888_235392_235577_236880_237066_238640_238761_238957_239060_239872_239994_240095_240229_243193_243303_243387_243932_244261_244394_244650_244825_247671
926500	contig_7622_pilon	-	2295	1	Intergenic	novelGene_132437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	633	977	321319	320975	NA	70	GACAGGAAAGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHVLTLASWELLFTGSACPSRISAAGSLLMWILFLECAHSTQLFACFPVARRGCVSAVSPPRLLHFSPLPSGLPLRYDLDGFLNLALFRAVRGSHRIKSLVFPGLCCKRGIGSV	321951	319656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_-_319700_322000
926501	contig_12864_pilon	-	2098	1	Intergenic	novelGene_76350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCCCTGAAGCAATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97005	94907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_94900_97000
926502	contig_4891_pilon	-	2559	1	Intergenic	novelGene_124532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	1650	2153	384498	383995	NA	45	AAAAAAAAAGCCCTGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPKNMCCQLDLIDIYRTLHPTAANYTFFSNAHRTFSRMDHILGHKASLNKIQSIEILQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWVIEEIKDGKKKFIESNQNENSSYQNLWGTAKAVLRGQFIAINAYIQKEERAIIKTLTLQLEQAEREQQEKP	386147	383588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_-_383600_386100
926503	contig_13633_pilon	-	2829	1	Intergenic	novelGene_15337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	100	156	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1618	1947	165778	165449	NA	40	GCAACATGGATGAAACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKLSEMDDVIEGLRSRFETVEDRITGIEDKHLDRTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEWGENRKHREDH	167395	164566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_-_164600_167400
926504	contig_12079_pilon	+	3016	10	Intergenic	novelGene_67543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCGCGCTGACTTCCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860636	872424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863585_864502_864706_866543_866653_867251_867365_868245_868414_871103_871170_871499_871555_871641_871724_872313
926505	contig_5302_pilon	-	1986	2	Intergenic	novelGene_81444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1237	1611	176322	175948	FALSE	25	ACTGGGTTTCCTTTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	178102	175572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176487_177030
926506	contig_3132_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_127427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACCACAATAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216844	216015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_216000_216800
926507	contig_12079_pilon	+	869	1	Intergenic	novelGene_67416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CGATAAAAAAAAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567038	567907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_567000_567900
926508	contig_6206_pilon	+	4652	2	Intergenic	novelGene_168146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2263	2646	53961	54344	FALSE	45	ATGTCATAAAACAATATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLTIQEPQQTTCRIVPKRKSPRQIIITVTKTKDKQRILRAAQEKQKVTYRGETMRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKALKEKNCQPRIIYPAKLSFRYDGEIRSFPDKQKLRDYVKPNQTYMTY	931	56350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_+_2015_52781
926510	contig_10667_pilon	-	2807	1	Intergenic	novelGene_137312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	2339	2668	56950	56621	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYHLRFQGRSAPYLSRAFRYEYGKTTGYLTVLQPCPEFPVLLCAQSKACGLELASEADQLSAWGCYGSNCPHVAINILVCVLTWHVLPVMKVVTPLCLLMKSSSFSVN	59288	56481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_56500_59300
926511	contig_4232_pilon	+	355	1	Intergenic	novelGene_63418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAATAATCTTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467530	467885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467500_467900
926512	contig_15354_pilon	+	4139	3	Intergenic	novelGene_65701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	514	843	111835	112164	TRUE	30	GATCTAGCAGGGAGAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGIQVAGGSIPTPRILKGRHVYVILSDLGQLCLLPSASSNISQLRDITPVPLLQVERLAPSALSTWCHDVAGCANLPCRDVSASCARPVSNPTLNVWPLAQDSGAVG	111321	196361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_114601_189970_190533_196063
926513	contig_15839_pilon	-	1473	1	Intergenic	novelGene_136418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118862	117389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_117400_118900
926514	contig_7629_pilon	+	1116	1	Intergenic	novelGene_153571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCCAAACCACAGCTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301427	302543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_301400_302500
926515	contig_3956_pilon	+	1997	10	Intergenic	novelGene_15060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1792.7048533872	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	81	767	1281682	1284761	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCPRCVCADRDCPAPGHRRAYQARADDEQDGPGPAGAAAGTRGALPDLPAHRGERQRHHLHLRRGRERPHGQHHDRPCPWYRGLWVWPPRLGLHPEAVC	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284049_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285810_1286084_1286224_1286409_1286562_1290381
926516	contig_2455_pilon	-	1107	1	Intergenic	novelGene_119244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1504194	1503087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2455_pilon_-_1503100_1504200
926517	contig_2933_pilon	+	1431	1	Intergenic	novelGene_111301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	114	314	220539	220739	NA	35	CTTTATTAAAACCATCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCFSREPRLRQKGTHLSVWGVRKGLTEQIEAGVRSWKMNRLLPGRGMERTFSTEDTQTKPWRCEEVWGGHCHWKKDVKMGDQCGARPTTAQGSVPGEVMMSCG	220425	221856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_220400_221900
926518	scaffold_21177_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_145479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCCAGTCAGATAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177155	175720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_21177_pilon_-_175700_177200
926519	contig_16011_pilon	+	898	1	Intergenic	novelGene_177375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAGCCAAAGAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7870	8768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16011_pilon_+_7900_8800
926521	SIRV7	-	928	5	FSM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	21	0	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAGCATTAACATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147608
926522	contig_5350_pilon	+	2907	2	Intergenic	novelGene_99348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAAAGATTGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153851	157196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_154207_154644
926523	contig_10904_pilon	-	3320	2	Intergenic	novelGene_22779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	2053	2574	746645	746124	FALSE	30	CCTGTGGGATGGATACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGPSGTKLFHLVKEGKSYQDVHVTNTQLTETEARLPIPSVSEDTAGHYSCIHCTKNVWSEFSEFLELVVTAEEPPWDPTSLRVSLLVCPWFLGPVPSSTNSPQTPDLLPELSSHTLWLPLPQHTCPPCLQTLPRSLETWVLYEHYRWPGHSVPALRERHGWALLGWVGEWGS	826170	745377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_747880_825352
926524	contig_17144_pilon	-	2820	8	Intergenic	novelGene_29177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2411.70947077557	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	70	621	179764	168048	TRUE	35	TCCTCCCAACAGCCTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLSWGRAPLHTIPSSGPRLRSNLSPPS	181842	165354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168230_174888_175001_175973_176271_179700_179786_181794
926525	contig_5317_pilon	+	3583	3	Intergenic	novelGene_76591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2985	3356	359295	359666	FALSE	50	GAAGAACAAACAAATCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNQEVCQGCILSPYLFNLYAEQIIQEAGLYEEHSIRIGERLINNLCYADDTTLLPKSEQDLKHLLMKIKDHGLQFGLHLNIKPKILTTGPISNIMINRENTEIVKDLILLGSTINTHGKSS	355267	359893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_355763_356222_356341_356923
926526	contig_10734_pilon	-	2925	2	Intergenic	novelGene_51097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1656	2129	568812	568339	FALSE	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFFHHFYDVLFFLYLDIFEVRVHLVINSSYNHFRPSGSYAVLSLPAQKQILKPSKLAKQALAAWKTIPETTVEPARTKNLREGWIRHDEQHSPSGSQKQTSSTQLQGQLRAQHQGLPFLHGLFKGMPNHQCSWWQQTKTVCGKTRNQHRVERREV	570632	567542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_570092_570256
926527	contig_15022_pilon	+	2466	3	Intergenic	novelGene_171822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	378	junction_2	7	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	341	655	119392	119706	TRUE	25	ATATCTGTATATTTTACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRGPSSTRFLAASRPVPRPTGTCAVTRKWSSGSGSPPSCLCRYQMWDVEWALGKLMDNGYVCFFIIHATHCLKEILSWLLIHLFIHSINPCWRLLWYNLDPNI	118284	121816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15022_pilon_+_118454_119220_120931_121229
926529	contig_12786_pilon	+	3242	1	Intergenic	novelGene_103445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	231	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGACTAAACCAAAGCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623962	627204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_+_624000_627200
926530	contig_4350_pilon	+	2365	3	Intergenic	novelGene_136375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	471	782	80562	213957	TRUE	65	AAAGGATGAAAAAGATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLTNSTDQKTLPLGKNLCPVYLPPLCSAPGPGPASVIAKSHGPEVGPITHPEPFSWPWRGNKLTGKSNLPAPLSQELRVTTPPFPKYRHKGDPRTLSAFPTA	80091	215995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4350_pilon_+_80837_213920_215007_215461
926531	contig_10766_pilon	+	3303	1	Intergenic	novelGene_151234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATGAATATAGATGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218391	221694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_218400_221700
926532	contig_6159_pilon	+	3131	1	Intergenic	novelGene_128253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAATAGTTTTAGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215800	218931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_+_215800_218900
926533	contig_6325_pilon	+	5424	2	Intergenic	novelGene_143366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_1	0	952	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAGTGGTTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422753	428983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_425453_426258
926534	contig_7179_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_78092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATAAGTATATGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590800	592038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_+_590800_592000
926535	contig_9335_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_147433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGCAGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122624	120659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_120700_122600
926536	contig_10489_pilon	+	1758	2	Intergenic	novelGene_165636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCAGCATCACAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549979	551793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_+_550473_550528
926537	contig_6740_pilon	+	3465	1	Intergenic	novelGene_142719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	210	633	2	634	729381	730013	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKESTRKLLELIEEFSKVAGYKVNKQKSVGFLYTSNEKSEREIRETIPFTIASKRIKYLGINLTRDVKDLYNESYKTLLKEIKDDLNKWKNVPCSYIRRLTVVKISILPKAIYRFNATHDKNSNSLLYRNTKTNPQLYMKWQEAPNSYSNIEREEQSTRITLPDFKTYYIATVIKTAWYWYNNRHIDHWNRISSPEINPHIYG	729379	732844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_729400_732800
926538	contig_15327_pilon	-	2727	1	Intergenic	novelGene_70705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAATGGAAAGAGATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913133	910406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_910400_913100
926539	contig_8712_pilon	+	2012	5	Intergenic	novelGene_58806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	580.392701108482	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	84	563	314974	321793	TRUE	20	TCTAGGGATCCTGGGGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	311724	357760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_311802_314967_315188_318064_318222_321684_323220_357737
926540	contig_5686_pilon	+	1451	2	Intergenic	novelGene_45262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGATTTAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93798	96821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_94518_96089
926542	contig_4232_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_63496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAAAAAAAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677402	678968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_677400_679000
926543	contig_7088_pilon	+	4863	2	Intergenic	novelGene_159793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCAATGCAGCCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707330	718542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7088_pilon_+_708839_715187
926545	contig_8552_pilon	+	5434	1	Intergenic	novelGene_80078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	279	840	3164	4003	471430	472269	NA	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKFEEFRKIMQEKNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRDMWDTLKSKNFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTKNFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRKDPKRKSPRRIMCTLAKTKDRQRILRAAREKQEVTCRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEENCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKEKPNLQELLRRVLQYEDKQLQLTGRT	468266	473700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_468300_473700
926546	contig_15666_pilon	-	1857	5	Intergenic	novelGene_70195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	712.909882102921	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	96	1061	110619	108530	TRUE	20	CCTGTTTGTAATTCAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTAGKKSSGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110714	107605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108859_109098_109378_109948_110231_110543
926547	contig_10864_pilon	-	564	1	Intergenic	novelGene_107103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATTAAGAAATAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1022137	1021573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1021600_1022100
926548	contig_6929_pilon	-	2917	2	Intergenic	novelGene_139428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2213	2551	151163	150825	FALSE	45	AGAACCGACTCAATGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKPSISSSSFVVDSLGFSVYKIISSANRDTLTSSLPIWMPFIFFSSLISLARTSSPMLNKNGDKGHLCLVPVLKGNAFNVSPFRMMLQAMVFSIAPHACESWK	153848	150458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_152824_153296
926549	contig_8570_pilon	-	1457	3	Intergenic	novelGene_120135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTGATTCTTTATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218482	216337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8570_pilon_-_217581_218174_218325_218418
926550	contig_5482_pilon	-	1976	2	Intergenic	novelGene_144511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTAGAATCCAGACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718669	716626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_716697_716763
926551	contig_19055_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_177569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CGAAACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8082	6568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19055_pilon_-_6600_8100
926552	contig_2933_pilon	-	1643	1	Intergenic	novelGene_111325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	722	1099	517578	517201	NA	75	AAGAAAGAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTALGKSAAKDLFKVLKSKYVTLRTKVCLTQAVVFSIASHACESWTMSKEDQRRIDAFESWCWQRTLNIPWTAKRKNKPVLEELQPKCSLETRMARLCLIYFVRVIRRDQSLEKDIKIGKVEGQ	518299	516656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_516700_518300
926553	contig_7396_pilon	-	2615	14	Intergenic	novelGene_79573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3568.94848850603	2	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	125	1432	255163	246385	FALSE	15	GCTAGATATGGTGCGTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYSGKFF	257478	245201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248272_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
926554	contig_3956_pilon	+	1497	9	Intergenic	novelGene_15108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1893.48791915871	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	76	1338	1281682	1290847	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKLPAGDALLQMITIHPARRPLRHHQPPQPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281606	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283871_1284216_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286102_1286143_1290368
926555	contig_12427_pilon	+	3109	3	Intergenic	novelGene_40410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	355	1416	39918	40979	TRUE	75	CAACAAAATAAAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILASRVQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINIIHHINKRKEKNHMIISIAAEKAFDKVQHLFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIIRNGERLKTFPLKTGTRQECPLSLLLFNIVLEVLARAIGQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFVDDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSAGFLYTSKENDEKEIRKTIPFSITPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNNVKMSILPKAIYKYNAILIQIPTTFFKEMEELIINFLWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTCYTATVVKTAW	39563	95186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_+_41141_93280_94035_94408
926556	contig_14508_pilon	-	3010	2	Intergenic	novelGene_79050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1251	1580	57672	57343	FALSE	55	GAAGAAATTAGAGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQIALKALAKNKASGIDGIPIEMFQQMDAVTHLCQEIWKTATWQTDWKRSIFVHIPKKGDPTECRNYQRISLTSHASKILQKIVQKRLQRYIDRKLPEIQVRL	61877	55912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_58601_61555
926557	contig_8964_pilon	-	3401	1	Intergenic	novelGene_168699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAGGAAAAAGATGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541851	538450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8964_pilon_-_538400_541900
926558	contig_11560_pilon	+	1615	4	Intergenic	novelGene_117916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTCATAGGAAGCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152393	160022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11560_pilon_+_152543_153569_153663_158047_158137_158738
926559	contig_13044_pilon	+	2347	1	Intergenic	novelGene_99995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCTACACTAACAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170332	172679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13044_pilon_+_170300_172700
926560	contig_3095_pilon	+	1434	4	Intergenic	novelGene_75162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_1	1290.63317794019	4	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	42	560	220513	226800	TRUE	15	CACCTATTTGTGGTATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220471	227852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_226126_226409_226645_226824_227001
926561	contig_4812_pilon	-	305	1	Intergenic	novelGene_103722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGGATAAAGAGCGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946840	946535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_946500_946800
926562	contig_10016_pilon	+	4548	1	Intergenic	novelGene_117880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	187	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	2385	3371	499775	500761	NA	90	AAAAAAAAGTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTKKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAQIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPLWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	497390	501938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_497400_501900
926563	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
926564	contig_8594_pilon	+	2583	1	Intergenic	novelGene_140037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGAAACTGAGGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384920	387503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_+_384900_387500
926565	contig_3747_pilon	+	2842	8	Intergenic	novelGene_24872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3884.58017062859	7	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	956	1621	202676	203804	TRUE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201046	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_203978_204134
926566	contig_15327_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_70766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	243	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	485	817	1130624	1130292	FALSE	20	AGATGGTGGAGACTCTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRVKPWAGAQHPVSVPEVAFSAERPDFCLWFAFQPLVERFETFCLDPSLVTKQASLVHFPPGFQPIPCKPLFFDLALNHVAFPPLEDKLEQKTKSGLTGYIKGIFGFRS	1131843	1129707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1131058_1131792
926567	contig_9119_pilon	-	1322	1	Intergenic	novelGene_169736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGACTTCAACAACGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46568	45246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_45200_46600
926568	scaffold_13505_pilon	-	3387	3	Intergenic	novelGene_111614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4	15	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663805	659229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_659613_659663_662356_663493
926569	contig_11896_pilon	+	3757	1	Intergenic	novelGene_88033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	283	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTTGTGATTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155858	159615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_155900_159600
926570	contig_14415_pilon	+	798	4	Intergenic	novelGene_77620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	261	junction_3	105.837401496614	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	76	441	33410	37984	FALSE	15	CTCAATTGTATTGGTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAAFQEDDVIVLNGTKEDVELLKTRMEDRRLRARLGKKAKKPKAAEAVSKPHVPEESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33334	38341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_35937_35993_36102_36199_37805
926571	contig_16360_pilon	+	4334	1	Intergenic	novelGene_170081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCTGAAGGAACTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138877	143211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_138900_143200
926572	contig_13740_pilon	-	6039	14	Intergenic	novelGene_34648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	4458.1876475303	3	159	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	2772	3677	161718	157474	FALSE	40	AATACTTTTGTATCTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	178058	155111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162029_165237_166215_170858_171002_173066_173230_176356_176452_176777
926573	SIRV7	-	1440	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	15	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	1001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2133_114680
926574	contig_15092_pilon	-	3823	1	Intergenic	novelGene_57819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	120	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	257	774	2701	3474	332852	332079	NA	60	GAAAACCAAAAGGGAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLKMRKNSCKHTSVIGIWNARSMNQGKLDVVKNEIECIKIAIAGNSELKWTGIGHFELDNHIVYYVDNDKLKRNDTAFIVKKNITLKYNTVSDRIIPVHLQGRPVNTIIIQIYAPTTNAKEEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDAFIITGDWNAKVRNEEGSVVRKYGLGDRNDTRDHMIELCKTDDLFIGNTFFQQHKQRLYTWTSPDEIHRNQIDCICGKRPWRSSISLVRTKARGQLQNRLSIAYMQVQVEAEDN	335552	331729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_331700_335600
926575	contig_5780_pilon	+	1807	2	Intergenic	novelGene_29789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	669	1139	1807	88338	89006	FALSE	45	GGAAAAGGAAGAAGACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNTASGLEKDSLTTWDIQMIQPGFWKSEEDLKHLLMKIKDYGLQYGLHLNIKKTEILTTEPISNIMINGEKIEVVKDFMLLGSTISARGSSSQEIKGCIALGKCVARDLFKVFKSKDVTLRTKVRLTQAMVFSVASYACESCTMSKEDGRRIDVFELWCWRRVLNVPWTARRMNKSVLEEVQPECSLEARMKRLCPTYFGHVIRRDQSLEKDLMLGKVEGQ	87116	89006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5780_pilon_+_87250_87332
926576	contig_6576_pilon	-	2741	1	Intergenic	novelGene_42326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610498	607757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_607800_610500
926577	contig_5423_pilon	+	3471	1	Intergenic	novelGene_85217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	74	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGGTCAAAAAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395033	398504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_395000_398500
926578	contig_10352_pilon	-	2646	10	Intergenic	novelGene_49608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	417	2230	2646	26518	22770	FALSE	35	AGTTATCACACTCACATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQWNFYFDRKSRWEFQLDEISQSCKMSACSGHQVNDGNDLLLERQRKLFTHPQRCFKLLCSNRQLFRPSNVPIFQIKLFTEVLLRRDGCGVVCSGTFCGEVPLSTKLVFHSPQQRFQWIPVRFISLFFFLGQMFCPYF	35893	22769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10352_pilon_-_22817_23719_23783_24829_24962_25654_25810_26498_26611_29267_29432_32944_33015_33881_33961_34018_34983_35033
926579	contig_5209_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_136425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATAGACCACATTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53438	52584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5209_pilon_-_52600_53400
926580	contig_6513_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_117775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACCAGTCACGTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190695	189169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_-_189200_190700
926581	contig_5791_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_35851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAACTAAGACAGTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1069495	1068665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_1068700_1069500
926582	contig_14537_pilon	-	4056	2	Intergenic	novelGene_158651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCCACAACAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57088	52806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_55013_55238
926583	contig_5889_pilon	+	5443	4	Intergenic	novelGene_133689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	263	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1815	2405	233086	233676	TRUE	65	AATATTTAAAAAAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQQHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKTNIIHHINKTNDKNHMILSIDTEKAFDKVQHPFMIKTLNKIVMEGKFLSIIKGIYTKPTASIVLNGETLKAFPLRPGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLGRVIRLEKEIKDNQISREEVKVSLFADDTILYTENPREPTRKLLELTEDFSKVQHTR	231271	287833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_234815_253206_253727_286361_287025_287116
926584	contig_1150_pilon	+	591	3	Intergenic	novelGene_61405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	606	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGCCGGGCGGGGCGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308928	311050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_+_309387_309846_309934_311004
926585	contig_11359_pilon	-	1255	1	Intergenic	novelGene_179114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12555	11300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11359_pilon_-_11300_12600
926586	contig_12139_pilon	+	1617	1	Intergenic	novelGene_146462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCCGATTTTTTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71779	73396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12139_pilon_+_71800_73400
926587	contig_7272_pilon	-	2536	11	Intergenic	novelGene_25363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	466	junction_6	484.324529628637	23	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1023	1512	2534	610299	604478	FALSE	65	GATTAAAAAAAGTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGSGDDTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGIVTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSE	633212	604475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609235_609832_610302_611629_611658_616565_617709_620502_620568_632105_632194_633027
926588	contig_11115_pilon	+	2617	2	Intergenic	novelGene_102786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGCCCAATTACCAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114029	170100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_114037_167490
926589	contig_3601_pilon	+	2245	2	Intergenic	novelGene_132971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAGAATGTGGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1148185	1150473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_1148673_1148715
926590	contig_7070_pilon	-	3063	1	Intergenic	novelGene_104031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	376	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTACTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55942	52879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_-_52900_55900
926591	contig_500_pilon	+	1558	11	Intergenic	novelGene_31048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	431	junction_1	921.99937093254	5	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	180	1157	1492663	1498065	TRUE	15	TGCAATTGCGGGCATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485771	1499575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491928_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
926592	contig_2834_pilon	-	2941	2	Intergenic	novelGene_28025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTTCTGCTTTACAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782863	779759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_781096_781258
926593	contig_13828_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_158293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284670	286580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13828_pilon_+_284700_286600
926594	contig_12964_pilon	+	1193	2	Intergenic	novelGene_131665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACACCTATCTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162550	164172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_+_163730_164158
926595	contig_7963_pilon	+	1163	5	Intergenic	novelGene_58390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	5	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	67	831	51450	63007	FALSE	15	AGAGCTGGGTGACTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51383	63339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
926596	contig_10523_pilon	-	2344	1	Intergenic	novelGene_120951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTATCTTGACAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37903	35559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10523_pilon_-_35600_37900
926597	contig_16103_pilon	-	901	1	Intergenic	novelGene_118944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGATACCACAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955066	954165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_954200_955100
926598	contig_15327_pilon	-	2185	14	Intergenic	novelGene_70764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	89.0927314257421	50	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	396	1241	1157860	1134019	TRUE	20	GATGGTGGAGACTCTGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDTKSTLTTTMRPSRTA	1169108	1129706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792_1131869_1134016_1134067_1137354_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167266_1167443_1168941
926599	contig_6270_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_99889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGAATTATTTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1143039	1144360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_1143000_1144400
926600	contig_3956_pilon	+	2213	10	Intergenic	novelGene_14992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1072.55480161581	19	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1614	81	1694	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282743_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
926601	contig_3077_pilon	+	1689	1	Intergenic	novelGene_26855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATGACAAAAGACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979135	980824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_979100_980800
926602	contig_11448_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_66362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGAGCTGACTCAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236614	238851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_236600_238900
926603	contig_15720_pilon	+	1107	8	Intergenic	novelGene_41874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	3	314	278497	279803	TRUE	20	GATCGAGCAGCCCACCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSECQFLFLKLCHKFLPSTDGHLPHSHQVICVAGKKSLAISRPGQRGALGRLGLATGADNFLLQFIYDDLTLQVPDLDAGARGSTEPVAVGAEAQGIDDVPAI	278494	283997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_278608_279004_279115_279712_279854_280269_280382_281458_281555_281785_281929_282569_282750_283785
926604	contig_12079_pilon	-	3025	10	Intergenic	novelGene_67508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	289.040558476565	8	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	165	2255	871668	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872422	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867356_868264_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
926605	contig_15491_pilon	-	1159	5	Intergenic	novelGene_75958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	539.724003542551	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	152	316	45111	37525	TRUE	35	CTAAAGAAAAGGTCGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGEYCEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELVRIYNKASVFPT	46935	31676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38883_39000_45097_45207_46879
926606	contig_10446_pilon	-	1477	1	Intergenic	novelGene_162524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGAAAAGTTCTGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1711352	1709875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_1709900_1711400
926607	contig_14537_pilon	-	2704	2	Intergenic	novelGene_158653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	681	1238	163057	162500	TRUE	30	CCCGTAGGATAGACCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWGFSLGIYPIWCLLCFLDGQVFIFHDIGEVFCQQFFNDPLFFPCSGTPITLKFLLLIVFHIILWVTSFFFVLFSDFSSNRVVAKCLSSIYLILSSTVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILTFCSCIISLNSSILFVCIFHVCVCLFHEFVYFFLIFVCFLLQLLDSSE	163737	53602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_-_54800_162230
926608	contig_14970_pilon	+	1635	8	Intergenic	novelGene_45007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5302.13221261032	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136136	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177404_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
926609	contig_12837_pilon	+	2768	1	Intergenic	novelGene_57368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	218	646	296440	296868	NA	50	AAAGCAGTGGAGTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLAKNKAPGIGRIPTKMFQQTYGMLEVLTCLCQDIWKTATWPAGWKRTVFVPIPKKGDPTECRNYRTIPFTSHTSKILLKTIQKWLHHYVSRELPVIQAGFRRGRRTKDIIADVRWILAESRDYQKDVYLCFIDYAKAFN	296222	298990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_296200_299000
926610	contig_9132_pilon	-	3978	2	Intergenic	novelGene_121363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2814	3221	47584	47177	FALSE	25	CAAGGTTAGTGAGACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDAALEALTCPCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGEPTECGNYQIISLISHTSNIVLKIIQKRLQQYIDRQLSEIQARCRRGCGTRDIIVDVRWIIVESREHQKNAYLCFIDYAKAFDCVDCSKLWIIL	63856	46419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_50303_63761
926611	contig_3679_pilon	+	1683	1	Intergenic	novelGene_112111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTCTCTGTAAGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569402	571085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3679_pilon_+_569400_571100
926612	contig_2768_pilon	-	4142	1	Intergenic	novelGene_57491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTATTCGTCTAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	677016	672874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_-_672900_677000
926613	contig_2215_pilon	+	457	1	Intergenic	novelGene_163880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCCCAGTCCAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456553	457010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2215_pilon_+_456600_457000
926614	contig_4426_pilon	-	1294	7	Intergenic	novelGene_15440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	748.275220460731	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1179	116	1294	904506	821495	FALSE	55	CACAAACAGAAAGGCAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNEIQTQIQIQDIQVKIGGRDLYLLTGHTQKEGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNE	904621	821494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890137_895571_895641_904482
926615	contig_10197_pilon	-	3495	1	Intergenic	novelGene_115329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	2297	2776	1643665	1643186	NA	25	GCCCCAGACACCCTTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVIKNEMECIKIDILGIHELKWTGIGHFKSHNHLIYYAGNDKLKRNGVITFIVKKNISRSVLKYSTLSDRLISICLQGRPVNTIIIQIYAPTTNDKDEEIEDFYQLLQSEVDQTCSQDALIITGDWNAKVGNEEEESVILKYGLRDRNDARVA	1645961	1642466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1642500_1646000
926616	contig_15666_pilon	-	2004	7	Intergenic	novelGene_70135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	649.141676883149	19	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	69	998	110619	107816	TRUE	25	AAACTACGTGTTTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110687	106759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107355_107404_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110246_110558
926617	contig_5286_pilon	+	4470	1	Intergenic	novelGene_157349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530537	535007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_+_530500_535000
926618	contig_4496_pilon	+	3580	1	Intergenic	novelGene_66691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTCTTCCTGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	945946	949526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_945900_949500
926619	contig_8156_pilon	+	795	1	Intergenic	novelGene_98920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTATCCTGTATATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182936	183731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8156_pilon_+_182900_183700
926620	contig_5799_pilon	+	3163	1	Intergenic	novelGene_50338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1040	1339	710521	710820	NA	65	TTTAAAAAGAAAAAACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPWKHSLIYAKKFGRQLPGQLTGRDPIECGNYRTISLISRASKILLKIIQKWLQQYIHRELPEIQARFRRGCGTRDIIADVRWILAESREYHKDVVMD	709481	712644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_709500_712600
926622	contig_7396_pilon	-	2636	14	Intergenic	novelGene_79554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3516.54661993518	3	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	105	1355	255163	246442	FALSE	35	ACACCTGTAAAATTTGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNNTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISEPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257458	245160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249038_249736_249866_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
926623	contig_8598_pilon	+	2755	1	Intergenic	novelGene_22863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	453	782	3506	3835	NA	40	AAAGGTTGAGAATTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMVCEFCVANVMIIKPSRKVESAVGGTVGVRIGKMVERGGLSGLHLMRVSLALLILVLLPPCGVGGGQHCPHAIFRTSIATTREMQVKMTMRYYFTPTKVAIINTIYF	3053	5808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_3100_5800
926624	contig_13697_pilon	-	2121	1	Intergenic	novelGene_165921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2	310	183606	183298	NA	25	CGGAACACTTAACTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYAGNDNLKTNGVAFIVKKNISRSILKYNTVSDRIISIRLQGRQVNTTITQIYAPTAKVKDEEMEDFYQLLQSEIDRTCSRDAAIITGDWNAKVGNKKDQ	183607	181486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13697_pilon_-_181500_183600
926625	contig_3602_pilon	-	588	1	Intergenic	novelGene_60616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACAACCTTCCTCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903681	903093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_903100_903700
926626	contig_19342_pilon	+	1249	5	Intergenic	novelGene_41072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	26	610	3263	5037	TRUE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPGLAPSRGCLAVKWGPTGASSAGTINRPMMASITSPWRRICARGWRRKGLLRRPTWRARVWSGSADTWRTGRRCCRAQIPQRHM	3237	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4365_5016_5063_6156
926627	contig_15720_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_41859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTTTCTCCTCTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234817	237730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_234800_237700
926628	contig_11337_pilon	-	1950	10	Intergenic	novelGene_107169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGAATTTGTTATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172962	102663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_-_102734_127450_127580_128441_128579_159273_159448_160748_160889_162027_162323_168692_168890_169428_169678_171278_171381_172505
926629	contig_8538_pilon	+	820	3	Intergenic	novelGene_4638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	7	80	junction_2	4376	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	67	756	841232	843061	FALSE	25	CCCAAATAGTGTTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIRRGRCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840311	843125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228_841683_842822
926630	contig_7357_pilon	+	1231	1	Intergenic	novelGene_36904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGGAGCCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389958	391189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_390000_391200
926631	SIRV7	-	888	4	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	14847	0	-14841	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	28	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCGATAAATAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	70878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_70988_78841_78964_114680_114989_147608
926632	contig_7347_pilon	-	3038	1	Intergenic	novelGene_172494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATATGAAATATCTAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23627	20589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_-_20600_23600
926633	contig_17976_pilon	-	1518	4	Intergenic	novelGene_32513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGGACAGTCACCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48865	41662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41855_45522_45583_46441_46791_47948
926634	contig_7457_pilon	-	5405	1	Intergenic	novelGene_31505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7798	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671993	666588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_666600_672000
926635	contig_1301_pilon	+	2359	4	Intergenic	novelGene_47342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATCACACATATGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290390	297886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_292308_296606_296765_296918_297008_297691
926636	contig_3627_pilon	-	2373	1	Intergenic	novelGene_78429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGTTGAGAAGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233800	231427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_231400_233800
926638	contig_12437_pilon	+	3456	7	Intergenic	novelGene_169069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	112	junction_1	72.3895710720819	1	135	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	541	1626	55	1680	36287	49139	FALSE	15	TTTGAGCATTATGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVLNCENSCGSSQPDSDCCAAMASSCSVAAKDDSVSGTTSTGNLSSSFMEEIQGYDVEFDPPLESKYECPICLMALREAVQTPCGHRFCKACITKSIRDAGHKCPVDNEILLENQLFPDNFAKREILSLRVKCPNAGCLHKMELRHLEDHQAHCEFALMDCPQCQRPFQKCHLNIHILTECPRRQVSCVNCAILMAFEDKEIHDQNCPLANVICEYCNTVLIREQMPNHYDLDCPTAPIPCAFSTFGCLEKMQRNHLARHLQENTQSHMRMLAQAVQNLSLALTPVPHCDILPYDSAPLSQVSSGCHPEVQNFQETIQQLEGRLVRQDHQIRELTAKMETQSMYVGELKRTIRTLEDRIAEMEAQECNGIYIWKIGNFGMHLKCQEEEKPVVIHSPGFYTGRPGYKLCMRLHLQLPSAQRCANYISLFVHTMQGEYDSHLPWPFQGTIRLTILDQSETPIRQNHEEIMDAKPELLAFQRPTIPRNPKGFGYVTFMHLEALRQRTFIKDDTLLVRCEVCTRFDMGSLRREGFQPRSTDAGV	35732	50915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_+_35769_36268_36583_40574_40726_41840_42000_43441_43514_46392_46471_48269
926639	contig_9653_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_48260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGTGACATTACAACAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	984914	987068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_984900_987100
926640	contig_8045_pilon	+	2207	2	Intergenic	novelGene_35317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATACTTGATGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44412	46977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_45747_46104
926641	contig_6175_pilon	-	893	3	Intergenic	novelGene_16314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGCTCCGAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481969	1470565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1471222_1478853_1479025_1481903
926642	contig_1694_pilon	-	1209	4	Intergenic	novelGene_144962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	53.5184288093571	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	8	541	1677956	1539630	FALSE	5	TGTTTTTATTCTGTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPRGLSPRQSKSDSDDDDLPNVTLDSVNETGSTALSIARAVQEVHQSPVSRVRGNRMNNQKFACSISPFSIESTRRQRRSESPDSRKRRIHRCDFEGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV	1677963	1538961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1539812_1560249_1560408_1616429_1616493_1677825
926643	contig_10864_pilon	-	1236	2	Intergenic	novelGene_107046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	754	1227	777953	701096	FALSE	20	GAGCATCACCCTCGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSKLLSHSILSNINYSLSPQHSPSWLWVPYFPATSHRTHEPYKGNGSQGLGGWQVPNPWVRCRLLPGPQSLPKGAQLFPPWSGSSLRRLLQVSAAGLSFLGGGGLSSLLWNWLSFRAKLTSPLGGHSYLTCTAPPSHLGGSYKTTARKATHKSN	778706	701086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_701148_777531
926645	contig_10444_pilon	-	1665	1	Intergenic	novelGene_139469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCACTAGATAACGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869122	867457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_867500_869100
926647	contig_8122_pilon	+	2213	2	Intergenic	novelGene_40254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAAAAACCATTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735212	754939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_736608_754121
926648	contig_13633_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_15321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTTGAGCTGGATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5482	7534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5500_7500
926649	contig_6608_pilon	-	2787	1	Intergenic	novelGene_162536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTTGTGCTGGATTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163371	160584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6608_pilon_-_160600_163400
926650	contig_6418_pilon	+	2541	5	Intergenic	novelGene_81144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGGAAGAGAAGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220409	397661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_222301_228278_228672_231839_231984_250911_250996_397632
926651	contig_6479_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_160620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCTGAACTTAAGAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624355	621989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6479_pilon_-_622000_624400
926652	contig_34_pilon	+	901	1	Intergenic	novelGene_40047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237008	237909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_237000_237900
926653	contig_1406_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_25639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGGCCAAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2676471	2675169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2675200_2676500
926654	contig_4845_pilon	-	1379	1	Intergenic	novelGene_53723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTGTTGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1091044	1089665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_1089700_1091000
926655	contig_7815_pilon	-	2317	1	Intergenic	novelGene_134390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	135	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAACCCAGCTGTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	552999	550682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_550700_553000
926656	contig_16205_pilon	-	4835	3	Intergenic	novelGene_156862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	445.5	22	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	105825	103176	TRUE	10	TTTCTTTGAGTTGTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGGCLIRLRSSLDMQSKYHCYSRVFLHEEAVKTNVRKKVKHF	105895	68307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_68405_98837_103466_105785
926657	contig_992_pilon	-	678	1	Intergenic	novelGene_164294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAAAGCTCACTTCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73110	72432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_992_pilon_-_72400_73100
926658	contig_5623_pilon	-	2027	11	Intergenic	novelGene_154833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	293.32727455864	5	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	100	1335	220970	207631	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKEENQSVAVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQVLWHRAQYEPFFHMLSDPEAYVFTCVNQTAEQQELEDEQRRLCDIQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLVIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	239410	206938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211034_218090_218140_218220_218450_220829_221000_239340
926659	contig_3469_pilon	+	4407	3	Intergenic	novelGene_34153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	388	969	353688	354269	TRUE	35	CCTCAACAACATGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYARNDSLKRNGVTFIIKKNISRSILKYNNISDRKMSICLQRRLVNMTIIQIYTPTTKAKDEEIEDFYHLLQSEIDRTCNQDALIITGDRNAKVGNKEEGSAVGKHGLGVRHDAGDRMTEFCNTNDFFIARTFFNNINGDYRRGPHQMEYIGIKSTTSVEREDGKAQYYQSEQGQGPTAEQIISCSRASSR	353300	533603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_355097_355159_355374_531206
926660	contig_1442_pilon	-	1832	1	Intergenic	novelGene_172163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACATAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463491	461659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_461700_463500
926661	contig_12677_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_110844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGGGGGAAATGGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2945	3657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2900_3700
926662	contig_6109_pilon	+	2022	1	Intergenic	novelGene_160386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604281	606303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_604300_606300
926663	contig_11656_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_53996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTATAAAGCACCTAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464588	462488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_462500_464600
926664	contig_2342_pilon	-	3924	1	Intergenic	novelGene_132760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACCCTATCCACTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277066	273142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_-_273100_277100
926665	contig_2799_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_85481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAGGAGCACGACCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496245	497483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_496200_497500
926666	contig_16999_pilon	+	2862	4	Intergenic	novelGene_84959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.9671956592216	28	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1149	1469	112288	112608	FALSE	50	TTCATTAAAGAAAAATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDMYTFSYPIHHQCECFLLCSNFRCLGPNQHCLQHEADFPSAITSHSDCGTDKLLENLVSSLSYLLHHSPTEMHCMISSILGSTISPKAPDAHQSITKALENLIN	50592	114001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_50809_73925_74018_81568_81628_111506
926667	contig_5033_pilon	-	1685	1	Intergenic	novelGene_28941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	187	522	451758	451423	NA	30	AAGATGTGGAGAGACCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNSDSLAATFKELKTRVLRPLHLPRGYWRPSPESPCPTWHSGSPLSRGDACSLSPTHLCLLRGPGTSSSLPWVSASDPPCTMTSGPPWPACGPACDTGRRARTSESACL	451944	450259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450300_451900
926668	contig_9366_pilon	-	2187	5	Intergenic	novelGene_166283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	86	400	1067252	1066938	TRUE	70	AGTTTAAAAACAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALLHNPDHEHWMPVFLLNGAEIATAPVGIACAPVQPAGFITHRVQCFRRMECLHLLWEQLANGVEDEASNTKGVVALSSLHNASNLPYFITLNIDPPEDCKVT	1068579	1059179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_1059948_1061256_1061397_1062003_1062110_1066164_1067286_1068527
926669	contig_14970_pilon	+	1904	9	Intergenic	novelGene_44986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	128	1216	136145	231550	FALSE	15	TCTGCCACCTTAACTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136017	232238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
926670	contig_12864_pilon	+	3638	1	Intergenic	novelGene_76424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCAGCACTACCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242233	245871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242200_245900
926671	contig_10197_pilon	-	4565	4	Intergenic	novelGene_115199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1742	2047	771898	771593	TRUE	50	TCAACAACCTACACATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFETEAAQLLVSLVSSASASVFCGLLALGPHAHICPAGASVPKLCSSTGKCPEAPHSTRKPPAHRHSTPLLHGSAPVLSRTGLLVLLL	826424	640207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_642121_672283_672754_771457_772900_825684
926672	contig_13481_pilon	+	1974	1	Intergenic	novelGene_119351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAGTAAAAAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406498	408472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_406500_408500
926673	contig_567_pilon	-	3567	1	Intergenic	novelGene_34009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622830	619263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_567_pilon_-_619300_622800
926674	contig_18637_pilon	-	1818	2	Intergenic	novelGene_81853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173863	171361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18637_pilon_-_172940_173623
926675	contig_9895_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_144678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	206	517	55007	54696	NA	70	GAAAAAAAAAAAAACTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALPTPPTHTRKGFENKWCFPVLTANSTGYLKLGCKTHPPTCSREEEHASHLATQAGVSPCFDQHMTPYCRQIPVPTSTMRVGLGLQVTACTTYLVTNTGHLS	55212	53721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_53700_55200
926676	contig_6361_pilon	+	4579	7	Intergenic	novelGene_23959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	996	1469	390196	390669	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKTRVVLLKDSTGKIVNDARSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYDREPMILKGEVQVALKALVKNKAPRIDGIPVEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	389200	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_390686_400524_400569_405177_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
926677	SIRV6	+	567	5	ISM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	514	8168	341	623	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTATTGTATGAGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106
926678	contig_15122_pilon	+	2157	1	Intergenic	novelGene_162704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCATAGAGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458394	460551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15122_pilon_+_458400_460600
926679	contig_14034_pilon	-	981	1	Intergenic	novelGene_72646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATCTTTGGCTATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223091	222110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_-_222100_223100
926680	contig_7022_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_142148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGTAAAAAAAACAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159789	160548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_159800_160500
926681	contig_9839_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_88568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGGAAATACTTCAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259446	261510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_259400_261500
926682	contig_5449_pilon	+	2256	1	Intergenic	novelGene_179115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91847	94103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5449_pilon_+_91800_94100
926683	contig_12180_pilon	-	4083	27	Intergenic	novelGene_160349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	2520	3134	101215	98359	TRUE	40	TTTCCAGAACGGCCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIVTPSVYLARIRDSQAMQSTNGHVHDLLPPQAFYHLWLPHMDVRAVTQPEVIPLTPGPHHSGLCKSQGKLSTTFNLAHSLSIQSFNVLRNVTAFTSSPAQFSKVTITPGKYQTFVGQSQSLCISTPTRNLDYSVTKKDFHHFGLQLCGVIPMSQPTILSEAPGVQLPTGRDGCAVRAPTGDVPDALSFSGLQSALACHSSFC	167657	86799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_86954_87631_87739_87821_87916_91461_91636_94534_94644_96480_96561_96666_96814_98274_98369_98669_98848_99034_99116_99201_99373_100192_100339_101186_101412_128394_128568_129569_129759_130302_130447_140607_140795_143819_143975_157491_157601_159044_159178_159602_159759_159842_159964_160746_160883_161350_161501_161891_162008_162106_162306_167302
926684	contig_17066_pilon	+	4465	1	Intergenic	novelGene_130941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATGCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29160	33625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_+_29200_33600
926686	contig_3956_pilon	-	2468	11	Intergenic	novelGene_15236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	537	1932	2468	1286221	1284684	FALSE	35	TAAGGGGAGAGAGCACCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSI	1290965	1284683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287547_1287951_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
926687	contig_5961_pilon	+	1509	10	Intergenic	novelGene_144109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	622.207261724909	2	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1164	346	1509	170421	202162	FALSE	50	GAAGATAAAGAAACCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEKEQKTKEETEERESEQTKK	113726	202162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151627_170396_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775
926688	contig_11631_pilon	+	3045	1	Intergenic	novelGene_104176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCTGTTTAACACACCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52825	55870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11631_pilon_+_52800_55900
926689	contig_7412_pilon	-	2474	2	Intergenic	novelGene_76298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTACAATAAAATATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305035	302269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_302848_303139
926690	contig_5302_pilon	+	1246	1	Intergenic	novelGene_81432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACTCTGAGCAGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175567	176813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_175600_176800
926691	contig_854_pilon	+	2189	7	Intergenic	novelGene_36268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2673.63871904938	11	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	85	411	543600	557691	TRUE	30	AGATATATGACCTCATCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPRSVPRTSSSSASPSSVQPLMRTCAPSGSLRCGTTAPAHLSSWWAPSWTCGMTRTPSRS	543515	564688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556126_556987_557065_557591_557752_562271_562405_563103
926692	contig_16110_pilon	+	3855	1	Intergenic	novelGene_126778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	172	105	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	2620	2991	37600	37971	NA	55	ATAAAGACTCAGCAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNFPEEENFLELSEAEYKRLKYRTLQEIRKEINQKAEQAIEETKKSREEHNDKFNRLQKSKERQQSEIQKINSKISELDNSVETHRSRIEAMEVRISEIEDKALDTNLGKIT	34980	38835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_+_35000_38800
926693	contig_10953_pilon	+	2840	8	Intergenic	novelGene_42572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19857.8786441276	3	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	482	835	459504	463828	TRUE	25	GATGCACTGGAACTTGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKVFI	455015	465899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459344_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463817_464997_465062
926694	contig_5642_pilon	+	864	1	Intergenic	novelGene_153029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	229	597	84457	84825	NA	25	GTTCTTGAAGTAGATAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDHQTVKGKNVLINFSTNTGFKNKYGRGHINQRLHQPETRRTRWCLATTNDHPDREHNRESQMEQEKGGMQNSNSSKKIRLNSLTETGGTPESMAPRFSSSPELKLPRPTLQTGIGLDCGT	84228	85092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_84200_85100
926695	contig_3832_pilon	+	2402	1	Intergenic	novelGene_161497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484493	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484500_486900
926696	contig_12142_pilon	+	2702	5	Intergenic	novelGene_147816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	57	junction_4	21.1541958013062	36	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	783	1920	2702	112362	135987	FALSE	10	ACCCAGCCCGCCCCCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRRWDTPESGMYAINIVTFPLSKSRSKANSGKSAEWRRQSPPPHPDPISHSSPIL	110442	135987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
926697	contig_8710_pilon	+	2450	1	Intergenic	novelGene_73523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTAAACCTTTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	388473	390923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_388500_390900
926698	contig_10958_pilon	+	1911	4	Intergenic	novelGene_5455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5067.1271939828	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAAATTACCGCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888937	901575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_889054_893824_893927_895279_895855_900457
926699	contig_8581_pilon	+	2841	1	Intergenic	novelGene_22854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTATTACCTAGGATATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348557	351398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_+_348600_351400
926700	contig_5020_pilon	+	1537	8	Intergenic	novelGene_27888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_3	468.533099477638	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	324	1253	122915	125772	FALSE	45	GCATACCACCCATAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118501	126056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
926701	contig_9481_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_149657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTGACTCATCCCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161550	163666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_161600_163700
926702	contig_12532_pilon	-	820	1	Intergenic	novelGene_111157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTCTTTGTTAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126703	125883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12532_pilon_-_125900_126700
926703	contig_854_pilon	-	3166	15	Intergenic	novelGene_36631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	104	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2082	2423	1699021	1697781	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAACCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMTETGVSPTR	1715974	1694162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1694529_1695120_1695283_1696537_1696653_1697680_1697810_1698223_1698428_1698912_1699047_1700782_1700911_1701173_1701346_1701988_1702199_1702540_1702690_1704480_1704683_1704882_1704997_1705283_1705434_1706743_1706815_1715114
926704	scaffold_880_pilon	-	1930	2	Intergenic	novelGene_121482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGTTTAGGGTATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498383	493030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_493346_496768
926705	contig_5222_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_59003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGACCCCAAAAGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222395	224479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_+_222400_224500
926706	contig_18272_pilon	+	9707	1	Intergenic	novelGene_7028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	6703	7047	218702	219046	NA	10	GGGCTCGAGGCTGTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIPTQNASLDLPFAILSVSAYAHTQPSLIFLAECSMHRLEEDEVGMFNVQGEAYFFCVGLQRRPLGGTNSSCSTTNLKVGGWNPAVVLQKKGLEICFHKDYSQENPVKHSSTP	211999	221706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_212000_221700
926707	contig_10904_pilon	-	1846	13	Intergenic	novelGene_22674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	180.764503029648	9	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	32	829	544621	542537	TRUE	25	TGCAATGATCCCATGGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCSSSAVLETMQGSATTLTLTALLCLGLCRGQRNQVHTGTLSKPSIWATPASIITKGSSVTIWCQGSLQAGICRLYRDGDPQYWDEHSLWNSRDLCSFSIKSMDVHYAGQFWCAYNRWSGWWSGWSERSDPLLLVMTGAYSKPSLSAHPSPLVTSGGKASLMCSSNDTMDTFHLLKERGASPPQHRKSQFSPGTHHATFPVNPVSTSHGGTYRCYGSSRSSPQVWSHPSDPLDLKVTVSRRGQKALPLSPARLTGAVWSQPILQCCSEDSYDRNL	544652	537396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_537766_538072_538128_539108_539166_539425_539464_539552_539596_540491_540606_541598_541650_542246_542547_543032_543139_543359_543660_543823_544121_544311_544348_544572
926708	contig_14536_pilon	-	2161	2	Intergenic	novelGene_69292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAATAAAATTCCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113258	85444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_86370_112022
926709	contig_5286_pilon	-	1255	2	Intergenic	novelGene_157400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTTGGTTTGTCTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750923	749599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5286_pilon_-_749842_749910
926710	contig_14882_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_115035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGATTCATGGCAACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339707	340861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14882_pilon_+_339700_340900
926711	contig_5643_pilon	+	1224	12	Intergenic	novelGene_38837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2196.16463201398	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	65	1012	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237238_237387_237456_237550_237635_237720_237819_237913
926712	contig_12677_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_110680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1745	4	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
926713	contig_21104_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_175442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	339	677	3253	3591	NA	40	GAGAATTCCAGAAAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHININILGMSELKWTGVGHFESDNHMVYYAGNDKLKRNGAALIIKRNISRSILKYNAVSDRIISYTYKEDQLIRLLFKFLHQPLRPRMKKLKIFANFCSLKLIKHAIKMH	2914	4879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21104_pilon_+_2900_4900
926714	contig_9516_pilon	-	2348	1	Intergenic	novelGene_106160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACAGTGCTCAGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802787	800439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9516_pilon_-_800400_802800
926715	contig_10734_pilon	+	2333	13	Intergenic	novelGene_51507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	196	555	2265456	2265815	TRUE	30	AGTACCAGTTCTCAGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265260	2305180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266074_2267089_2267192_2269290_2269431_2270438_2270505_2270955_2271050_2274374_2274509_2275753_2275884_2277108_2277192_2280841_2280939_2282466_2282538_2285112_2285190_2286285_2286587_2304955
926716	contig_2646_pilon	-	892	1	Intergenic	novelGene_69591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCTAATGCATGATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1450651	1449759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_1449800_1450700
926717	contig_8375_pilon	-	2615	1	Intergenic	novelGene_141302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCTTAAAAGAAATGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163080	160465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_160500_163100
926718	contig_6842_pilon	-	2169	1	Intergenic	novelGene_130769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGGGAGTTACGAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336023	1333854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1333900_1336000
926719	contig_3469_pilon	-	2291	1	Intergenic	novelGene_34205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	30	ACTTGCTCAGCATACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531300_533600
926721	contig_5945_pilon	+	3111	1	Intergenic	novelGene_104538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	70	381	42827	43138	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEYTVSSQSDERESPWGCGPHLYISRRSGFLLSLDPAAASCRLISCSWDLSCQLICRTWDSSICTACEWEPCSPTFQSWACQLLQLCDLGEASTLIHGLGTF	42757	45868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_42800_45900
926722	contig_6182_pilon	+	2082	3	Intergenic	novelGene_171657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCGATTACAGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277896	282278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6182_pilon_+_278814_280883_280994_281223
926723	contig_19352_pilon	-	6615	19	Intergenic	novelGene_122382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_14	194.253334655268	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	208	1680	177600	136984	TRUE	25	CATTTGCTATTTCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHCLLDQFDRDLPVYLKKDPAYFYGYVYFRQVRDKTLKRGYFQKSLVLISKLPYTHFFHTVLKQIAPEYFEKNESYLEAACNDVDRWPAPVPGKTLHLPIMGVVMKFLLFLFKVRIPTCHDKPGTTQIGQLTQQADTHISVILPTVHEVDLFRCFCPVFLHSQMLWELVLLGEPLVVMAPSPSESSETVLALVSCISPLKYCSDFRPYFTIHDSEFKEYTTRTQAPPSVILGVTNPFFAKTLQHWPHIIRIGDLKPAGEIPKQVKVKKLKNLKTLDSKPGVYTSYKPYLNRDEEIVKQLQKGVQQKRPSEAQSVILRRYFLELTQSFIIPLERYVASLMPLQKSISPWKSPPQLRQFLPEEFMKTLEKTGPQLTSRIKGDWIGLYRHFLKSPNFDGWFRTRRKEMTQKLEALHLEALCKEDLLLWIQKHTEVETVDLVLKLKNKLVQADRERLPVKPDTVEELRTHIDAIILALPEDLQGILLKTGMT	179300	130763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_132708_133992_137116_137622_137698_140867_140971_141090_141201_141307_141362_142687_142778_144174_144240_144327_144394_154861_154957_165913_166010_166451_166575_170333_170390_171179_171264_172277_172358_173906_174013_175018_175100_177543_177657_179149
926724	contig_10399_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_114509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478706	480435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10399_pilon_+_478700_480400
926725	contig_19742_pilon	-	3113	3	Intergenic	novelGene_179116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2145	2480	13855	13520	FALSE	45	TGGACATGAAATGAAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQSKQTNKQKSPGGLTSMEAWARKQFHSPAVFRRLSGRSKDGTWRHAFERKEGEVVRGKKEVLRSRKMHTSSQQKTLRESASADRWNPSHTRVKLLLPGQETVAAGSRGG	17662	12886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19742_pilon_-_15433_16013_16092_17173
926726	contig_12869_pilon	+	2174	8	Intergenic	novelGene_75329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	253.015366154319	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	57	524	67397	85638	TRUE	55	AATTCAGACTATATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLVIVEKQDNGTFGFDIQTYKLQNQNTCLSEMCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVEKQDRDS	67340	98445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77646_81602_81706_81899_81964_85616_85694_94365_94433_96917
926727	contig_10832_pilon	-	2662	4	Intergenic	novelGene_179117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	943	1584	81382	80741	TRUE	15	GAGTTCTTTATCTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGMPITRKFLLLIVSHVTFRVSSFFFVLFSEFSRNRVVSNCLASVPLILSFTVSNLLLSPSMTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKILSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSSVLVWTPIGAILSCFLKCFDIVCCFRGIQ	82324	38043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10832_pilon_-_38160_38209_38285_38514_39352_80690
926728	contig_2414_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_158455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	803	1117	142867	143181	NA	55	TCATTAAAAAGACATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKSYLCDVNEVGLAGVMLTRQDSNYKIRLCLKPVSFEIQKREVSRDPETRVRRIACPLDLGSLHLRSSWTRGRLMTRTFPQSRHREKAFFWSWHPGFGLLAS	142064	143849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_142100_143800
926729	contig_10734_pilon	-	2994	1	Intergenic	novelGene_51098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1821	2294	568812	568339	NA	45	GAGAATAACAGCACAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPFFHHFYDVLFFLYLDIFEVRVHLVINSSYNHFRPSGSYAVLSLPAQKQILKPSKLAKQALAAWKTIPETTVEPARTKNLREGWIRHDEQHSPSGSQKQTSSTQLQGQLRAQHQGLPFLHGLFKGMPNHQCSWWQQTKTVCGKTRNQHRVERREV	570632	567638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_567600_570600
926730	contig_14353_pilon	-	2530	11	Intergenic	novelGene_82087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	111	junction_9	480.242740705156	3	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	55	687	104372	83298	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGLPGRCEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104426	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
926731	contig_8259_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_148897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1805	2155	355460	355810	NA	35	CTATAATAAGTAGGTAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIAYAMDCQENEQIYLGRSTARMFLRSKDGKTSSHILWTRYQKGSVLEKDIMLGKAEVQRKRGRSSMRWTDTVAATVGLNIATTVRMVQDWAVFRSAVHEVAVSGNQLDGT	353655	355810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_+_353700_355800
926732	contig_8464_pilon	-	1225	1	Intergenic	novelGene_125369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTACACCCACAGGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792352	791127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8464_pilon_-_791100_792400
926733	contig_7151_pilon	+	3145	1	Intergenic	novelGene_40708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	838	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	229	690	1648	2337	60322	61011	NA	35	CTTAATTTGTAACAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPVRAHRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTMAPGSNQCSSPDPETVARPNVAPQPHRKGPRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRRKKKKQHLQPTNGTQRAACPGARNLSSWQPWVQSLRPWEVEEQTNKGPGFSPTRQTRPGRSLTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRAESKPPAPPQPRDL	58674	61819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_58700_61800
926734	contig_4469_pilon	-	3209	4	Intergenic	novelGene_21943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACAGGAACAGGAGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746084	741431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_741734_742315_742635_743218_743320_743597
926735	contig_19267_pilon	-	1738	2	Intergenic	novelGene_126975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	103	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTATTCTTCGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47327	44964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19267_pilon_-_46607_47231
926736	contig_8161_pilon	-	1601	1	Intergenic	novelGene_156781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGGGACACAGCAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466377	464776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8161_pilon_-_464800_466400
926737	contig_5988_pilon	-	2761	7	Intergenic	novelGene_15948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	982.459795615067	13986	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	1232	2587	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	786595	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456_655553_783294_783526_783652_783800_785835
926738	contig_13021_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_8268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241311	242476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_241300_242500
926739	contig_3095_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_75029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	19	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
926740	contig_10990_pilon	-	7650	6	Intergenic	novelGene_7423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAAACCACTTTGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685233	670555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_670768_671342_674014_674258_674322_674969_675062_675626_675715_680709
926741	contig_5816_pilon	-	1739	2	Intergenic	novelGene_158271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	357	731	406922	406548	TRUE	40	GCTCAAGTAGATACATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQLVPTTGVKENEEHQRHKESISPRDRKGHINQRLHRPETRKTRWCPAITNDRPDKEHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTLESIAPGFSISPELKQLPRPALQTGIGLDCGT	407278	398469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5816_pilon_-_399241_406310
926742	SIRV7	-	905	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	32	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
926743	contig_7342_pilon	-	2897	2	Intergenic	novelGene_71095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1984	2295	57291	56980	FALSE	10	GGTTCCATGTCCTCTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSLTILASKEHSGCTSSKTELFVLLAVHGIFNILHQHPNSKASILLQSSLFIVQLSDAYEAIENTMAWVRRTLVLKVTSLLFNTWKKSFADLPSVMRRLIS	238854	56377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_57311_236890
926744	contig_8814_pilon	-	3673	3	Intergenic	novelGene_167757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAAAAAGAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	368931	310319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_-_313546_321682_321915_368716
926746	contig_383_pilon	+	2062	12	Intergenic	novelGene_126122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	448.148975377866	2	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	570	1713	84	1796	141861	169172	FALSE	55	AAAAATGCTTAAAGTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNNGNRKNYYIAAEEISWDYSKFAQSEMDNEDTDDAPKNTIYKKVVFRKYLDSTFTKHDPRGEYEEHLGMLGPVIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYDDDSPEWFKEDNAVQPNNTYTYVWHATERSGPENPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICRKGTLHKESNMPVDMREFVLLFMVFDEKKSWYYEKKPKRPWTLASSEVKHSHEFHAINGMIYSLPGLMMYEQEWVRWHLLNMGSSRDIHVVHFHGQTLLENGTQQHQLGVWPLRSFKTLEMKASKPGWWLLDTEVGENQRAGMQTPFLIIDRECKMPMGLSTGIISDSQIKASEYLGYWEPKLARLNNDGSYNAWSIEKLSSEFGSNSWIQYFDGNSDASTIKDNQFDPPIVARYIRISPTRSYNRPTLRMELQGCEVNGCSTPLGMESGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPSCARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLQIDLLKIKKITAIVTQGCKFLSSEMYVKSYAIHYSDQGVEWKPYRQKFFMVDKIFEGNSNNKGHVKNFFNPPIISRFIRIIPKTWNQSIALRMELFGCDIY	136717	169438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_136797_141856_142032_143970_144208_145079_145291_148651_148826_150746_150864_153255_153328_154233_154338_157138_157284_159221_159374_164402_164586_169025
926747	contig_10609_pilon	+	2976	2	Intergenic	novelGene_123942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGGGGTTGTTAACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426354	429614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_427480_427763
926748	scaffold_16539_pilon	+	2842	2	Intergenic	novelGene_68381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	234	junction_1	0	29	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	47	487	611337	611777	TRUE	50	GTACATTTCAGAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGFPSFSTVDILGQIVLCARDCPAPCRTFSSICGLCRLKPAPPTPCPNLWQSEMSADITSCSLGVESLGSELLQACRSLAALWVGRQCRQRSDSRLHHCRACESLWAHPQSGGLSGSGWAREGAFFTSSQVMLMPLVWGLESLEP	611290	614921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_16539_pilon_+_613244_614032
926749	contig_13211_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_123138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	928	1515	137220	137807	NA	45	ATAAAATGTTTTGGGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFEAEAARLLVSLVSSASASYGLSSLGPPARICPAGASVPKLSSSTGKCLEAPHSTRKPFAHRRSAPSLRGSASLAPPISAQRHPTLPGSLLLTGIQLSRSVGRLQRRLALVSWFCCCWFSAAAAGSLLLLVVCHCHTSTHSVLKPLPHFRYLLEQHPALSVGNSVLVISRCHNRNTISGWF	136292	138374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_136300_138400
926750	contig_17684_pilon	-	3672	1	Intergenic	novelGene_178834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1949	3358	4239	2830	NA	50	AAACCCAATAGATAAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRETIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNTVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPRTFFKEMEKLIINFIWKGKKPLISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYID	6187	2515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_2500_6200
926752	contig_2933_pilon	+	2441	2	Intergenic	novelGene_111300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCTGGAAGCCTTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219051	251563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_219061_249131
926753	contig_16897_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_174455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGGTATTTCAAATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67135	67625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16897_pilon_+_67100_67600
926754	contig_11779_pilon	-	3093	1	Intergenic	novelGene_146442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTCCATTGGCTCTCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10592	7499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11779_pilon_-_7500_10600
926755	contig_1452_pilon	-	437	2	Intergenic	novelGene_115170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	94	285	52	336	715391	710852	FALSE	20	CTCTTTGTGACAGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQVERSEQRHKGTSYHQESSAGSKARPLDLRFLHREAPRPRED	715442	710750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_710974_715228
926756	contig_10225_pilon	+	2336	12	Intergenic	novelGene_86791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	555.521376726405	283	37	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	1123	2220	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20679	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35614_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46738_47226
926757	contig_6165_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_167418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACCTACAAAAACAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493693	496085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_493700_496100
926758	contig_12622_pilon	+	3503	19	Intergenic	novelGene_5820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	212.607242365289	2	111	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	1424	3301	446467	475619	FALSE	85	AAAAGGAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSTVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTIPGVASPVAGAAARRSGGQHVPSTTPAPRVSSRKSLGWTPSGTRDKPREAIQNKTQQTPEQNRKQKSSVRHENNPLQT	388967	475821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_389057_398346_398491_401825_401940_404556_404650_405789_405878_408752_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419811_433568_433720_446449_446603_449207_449718_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_475379
926759	contig_15720_pilon	-	3147	2	Intergenic	novelGene_41945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	130	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	1088	1564	307437	306822	FALSE	45	TGTCAGACAAAAGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKDEKLTIQEA	308524	305238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306853_306991
926760	contig_5954_pilon	+	1089	2	Intergenic	novelGene_28791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399916	1401130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1400857_1400981
926761	contig_14184_pilon	+	1165	1	Intergenic	novelGene_66578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTATCTACTGCTGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25722	26887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_25700_26900
926762	contig_12661_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_166717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	859	2577	163	2739	72331	74907	NA	40	CAAACGAGTCCCTTCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFQDLYPLVAGEHALSPQNRGKSRSLPRVLSPESLSCVEVPLALSGKHSPGVPKMPLYPPNCAPNLETARDTEKGVFIVPLPQPKFGRPLKPPSYESHQQSRGGVENSEYQDSQSTDNPYVPCVTKSSEPRQERCGSDSSLEPPVYVPPPSYHSPLPHITNPYLEDAVPRHACGGHRQQHPPTEKTSTSCQRSAGSPGTGDEYTASPRSPRGRPQHPCPTTAHDSSVQYIPFDDPRIRHLKLTQPQGFCGETQLYDKLYGSGPAAPQEPAQGKMHPGGAVYGVRGTVPTAAGEWAPAVSAPGPQWPLGRLPRAGEPADIGDQRDSCAVRGEPSDVKGAQHGRSRGRAASPAPQGESSRETVTKLKKFETGLQTKKSSKKKKNETVFCLVSIPVQSESQLPEIDSNNNALKPRAERKNGLDKSPELREQSLLSMSSTDLELQALMGIVASRTELQKQGLGEAEDRQTNDLRFIHPTGHRAPKYAGSWPGHQFRDQQTQTSFTEESRSSQLLPSAKPGGSGNAVLTPNYSDPTASGAPTHTALAPSDQKQRSNVHSLKGQAHLSQSSNSAFSRTSSAMSQAPASTACLRPPHMDVRERGASPVPKDGVVKGEPTSPCNSQAPASTACRRPPHVDVHGHGASPVPRDEVVKGEPTSPCNSQQLFGQFLLKPVSRRPWDLISQLENFNKELQEQPESSHSSSEGSSEESEAEGHQDDGTVSRWSAFSGYSQAGRGDWQPRTPPEEPAQRSGRVKSRSESRSEEETAAPPAQGVLQAEDSRGDSFRSADGNWITGKRNQEVGTRRSKLAISPGPMKRMMVFGSNDIKPAPLFYPAGLREPPESQKFTRDVRSVKLSPVDTLEAESGDERETVFPLSLVNKNRGLSAPDLRSMGLHTSQEQSASKLDGSFEKASAIEIP	72168	74908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12661_pilon_+_72200_74900
926763	contig_8059_pilon	-	1574	1	Intergenic	novelGene_111105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCGGGCACCATCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217773	216199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_216200_217800
926765	contig_2933_pilon	-	2614	11	Intergenic	novelGene_111340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	85	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	1378	1782	731428	728073	TRUE	15	TACCCCAGCCACCTGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSTELAHSHCKGCRGRLGRVTGQVTGQMAVAKSHMPGTGLRSGTAESCRQPGFCTLWEGRWGLWAGTVCRGPAAALRGAAAWRWHKGVGTWGLCWRHSLVPTAAGVWARLARGEVFSSHAGGVLRAVGTRAR	773293	719962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_720046_721151_721225_721498_721575_722535_722588_723411_723507_724877_724971_725124_725262_727189_727366_728025_728098_731048_732720_773207
926766	contig_12479_pilon	+	3825	2	Intergenic	novelGene_56869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACCATTTTTTTTCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467501	471572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_467609_467854
926767	contig_5967_pilon	-	1454	1	Intergenic	novelGene_44401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGGACTTTGAAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413514	412060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_412100_413500
926768	contig_10106_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_73852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	808	1179	47289	47660	NA	55	GTTGTACAAAAAGAAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLHYGLYLNIKKTKILTTGPISNIMMNGKKIEVVKDFILLESTINTVEAAVKKSRRIALGRSAGKDLLKALKSKDVTLKTKVCMTQAMVFSVTSYTHESWTMNKEDQRRIYAFELWC	46481	48223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_46500_48200
926769	contig_5602_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_133000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1441	1827	112687	113073	NA	30	TAATGATGTTGAACATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLAKSEEDLKYLLMNIKHYSLPYGSHLNIKKTKILTTGPISNTVINGEKIKVIKDFILLGSTINTHGSSRQEIRRRIALGKSAAKDLFKVLQSKYVILKTKVRLTQATVFSIASYACESWTMSKED	111246	113454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_+_111200_113500
926770	contig_5799_pilon	-	3566	1	Intergenic	novelGene_50336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTAGCACTGCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711075	707509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_707500_711100
926771	contig_12402_pilon	-	1392	1	Intergenic	novelGene_133386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGTCTAAAGGAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649454	648062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_648100_649500
926772	contig_5779_pilon	-	1165	1	Intergenic	novelGene_106447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	135	467	94343	94011	NA	60	GTTGTTCTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94477	93312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
926773	contig_6576_pilon	-	1633	2	Intergenic	novelGene_42439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAGGTCATAAGTGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1303740	1302049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1302301_1302358
926774	contig_11978_pilon	+	3119	1	Intergenic	novelGene_62902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATCACAATAGAGGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773949	777068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_773900_777100
926775	contig_5643_pilon	-	5497	34	Intergenic	novelGene_38900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_31	370.762235732501	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1135	3408	801	4208	281790	269360	TRUE	15	ATTTTAGTGCTCTGGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPAPPTEDGIKIEENSLKEEENTEGEKEVKSAVPEATVECTQPPAPASEDEKVLVDPPEGEEKVEKTEVKERTEEPMETESKGVADVEKMEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKRSDASEWRDTEGPE	283913	263049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_263672_263844_264009_264749_264946_268686_268820_268930_269040_269294_269434_269736_269809_270276_270407_270512_270611_270873_271040_271138_271284_271619_271754_271857_271947_272033_272121_272204_272386_274798_274975_275149_275388_275710_275836_276984_277103_277217_277350_277432_277575_277958_278133_278257_278380_278659_278798_278948_279150_279633_279826_280745_280843_280923_281056_281430_281637_281751_281956_282595_282793_283052_283226_283393_283530_283784
926776	contig_16125_pilon	-	2140	11	Intergenic	novelGene_155258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	366	junction_10	941.469749912338	6	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	45	1991	303204	144623	FALSE	50	GAATCTCAACAACTATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGRADVKSLMAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHSQSGSGGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDG	303248	144473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_144694_146072_146096_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796_236962_303201
926777	contig_15760_pilon	+	2197	1	Intergenic	novelGene_131067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGACAGGATGGTTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	450900	453097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_450900_453100
926778	contig_12148_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_140328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60310	58351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_58400_60300
926779	contig_11106_pilon	-	1706	1	Intergenic	novelGene_167459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	616	930	295116	294802	NA	25	TAAACTTTCCGCTCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPEPPIMNRVLSDPQSHNVGHAQQHSIIKRKWCIQDLAQAEPEGTSKLHEKVAQMPMVSTPVILLALSQSAPMASWGVPYDQLTEEEKTAWLTDGSAQYAGTT	295731	294025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11106_pilon_-_294000_295700
926780	contig_9836_pilon	-	4808	2	Intergenic	novelGene_176168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	113	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	878	2637	1701	4337	221838	219202	FALSE	15	CAGTTCTAGATGGTGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHSLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGRNLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNLSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDSYLTPHTKLNSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLPGIYPREIRVVTQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYLNTMEYCAMRKNNNESVKHLITRMKLEDITLSEISQSQQYKYCLRPLL	226210	218730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_221974_224645
926781	contig_12620_pilon	+	1724	1	Intergenic	novelGene_98803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAGGCAATCTGAGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217014	218738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_+_217000_218700
926782	contig_11428_pilon	+	2968	1	Intergenic	novelGene_138492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCATATCAGCAGATGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71781	74749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11428_pilon_+_71800_74700
926783	contig_12008_pilon	+	1298	8	Intergenic	novelGene_24992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	629.924420474555	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	40	531	23677	34072	TRUE	35	TGCACATGATGTGAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWQDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQTNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKVDSLF	23637	39731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12008_pilon_+_23682_23785_23928_28026_28185_30089_30219_34014_34124_34640_34714_39002_39215_39300
926784	contig_16496_pilon	-	1355	1	Intergenic	novelGene_5120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1355	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1400
926785	contig_20719_pilon	-	2254	1	Intergenic	novelGene_140580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	159	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGCTGACTAAAGATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200650	198396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_198400_200600
926786	contig_8581_pilon	-	2200	1	Intergenic	novelGene_22861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	817	1122	421607	421302	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGWPKMLSWDASFLPHCGLSSSNRLAWASSRGTVARVSRAARESKPLCISTFQIPSCDTFTLDPLAKLLGQTQDHCVWGVPKVIDTERQVLHCNNLPHVQ	422423	420223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_420200_422400
926787	contig_10324_pilon	-	2810	3	Intergenic	novelGene_7752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	327	662	73397	72898	FALSE	40	TATTAACATAAATATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRHNRKKVTSGNSMEHMTYPTALLASLMSAMAMRILFRRKMSSKMIMTSRMLRMITAEGHPGLPQVQIHTEVRLEAEVHEGDIRASLTTQSGVLHVAVEYSCAQGPQCED	73723	70749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_73056_73134_73241_73325
926788	contig_6445_pilon	-	1672	3	Intergenic	novelGene_77029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTCAGATGAGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595800	540017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_541282_541721_542105_595775
926789	contig_16496_pilon	-	1103	3	Intergenic	novelGene_5190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_870_1301_1354_3413
926790	contig_7839_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_45690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	588	947	173285	172926	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRVAVTEDQQEQRTYSSRTRRPGRDSAGANPQSERAERLCVGGFLVEQGASGHLSVDLGLLTHGARELSVCVHEAFWRSGVPPGTYTDGATELWNTCPSRADAGVRPEGQEAIGSRS	173872	172094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_172100_173900
926791	contig_17796_pilon	+	2004	8	Intergenic	novelGene_33795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	361.669823491662	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	145	1113	53527	110473	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEGHYLIGKKTLYCEIAEGSVRWSGDPPICERVLCAPPPNIENGQYSNMGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKASTSPTTKPCVTNDDNINYRVNLRSARYCEKRLENDV	53382	111364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_73008_74577_74664_75549_75748_96325_96509_96831_96852_110380
926793	contig_20669_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_179118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATATATTTTCTAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90261	91991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20669_pilon_+_90300_92000
926794	contig_7887_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_124862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCAGCATAGTAGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152189	154281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_+_152200_154300
926795	contig_7173_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_37548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550190	548931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_548900_550200
926796	contig_18231_pilon	-	1007	1	Intergenic	novelGene_105898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACATGACACCTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305137	304130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18231_pilon_-_304100_305100
926797	scaffold_12510_pilon	-	1661	1	Intergenic	novelGene_151388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTGCATATGTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306150	304489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_304500_306200
926798	contig_13211_pilon	+	2175	14	Intergenic	novelGene_123136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	89	junction_7	181.534973890879	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	1138	2175	122515	288399	FALSE	40	AAGTATAGACCTATCATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVCALEHEYEPYSRLNPDNKDENETILNPEEVASLEQYIPTRLTSVTLLKCTCTVFMAEFNLLGHLLPVIMGKKNLSNFMNTTNFQPLRPLPSIHILVDKINLEHSVPMYAEQLVHVVSSLSQPSDNLLHYCYAHCYLKIFGFQAGVTSLDCRGSYCLPVPIIPSFSTAVYGKLLKLPMCWTKRSQVPITEGIFELPNLTIQATRAQTLLLQAVYQSWSHIGNVSSSAVKEALMSEVFQSIGVKSKNPLPTLEGSIQNVELKYCSTSLVKCASGTVGSIKICAKAPGDSGKEKLIPLLQGPSDTKDLHSSKWLNESRKPESLLAPDLIAFTVQVPQHMDYCHNSG	99774	288399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_99795_102234_102417_105260_105436_113153_113420_117822_117919_118413_118537_119038_119177_122377_122570_129542_129713_135561_135757_145798_145924_192112_192295_287314_287450_288223
926799	contig_2310_pilon	-	1901	13	Intergenic	novelGene_71604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	238	22	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGCGAAACGAGCGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134644	106065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_-_106125_106686_106739_107849_108071_110705_110784_114929_114993_118096_118168_118358_118428_122874_123052_124479_124635_126506_126679_127455_127953_133365_133447_134438
926800	contig_6164_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_121264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCTGATGTGTTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292799	293351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_292800_293400
926801	contig_5669_pilon	-	5262	9	Intergenic	novelGene_86051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	124	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	4688	5218	187238	175677	FALSE	20	GTACATGCATGGGTAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHLFLFLLLLLSWPKGVVLTGLHDTCGCRAVGADLVDLVGLRRHVPGPIIDEAEIAALVKGASQVGLPLGGVGLIHALGVLPGLLGPGLEDGVVSFLAGAVPRGVAPGDVEELPVPVDPLKPWVLAAVHLGHKPGLQPHPAGCGGSPGGGLVHGRPYLSRDVIQAPTSPGWSITD	193954	175632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_-_175744_182937_183133_185952_186154_186559_186623_187233_187512_187718_188101_188190_188310_189008_190878_191910
926802	contig_6100_pilon	+	2406	1	Intergenic	novelGene_168126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	171	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTTTCTTGGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623822	626228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6100_pilon_+_623800_626200
926803	contig_2438_pilon	+	823	2	Intergenic	novelGene_112074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6285	junction_1	0	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGATGGACTCTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312373	313517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_312409_312729
926804	contig_9127_pilon	-	4367	2	Intergenic	novelGene_103012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTGACTGCTCTGACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177594	172515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_173932_174643
926805	contig_8934_pilon	+	1005	1	Intergenic	novelGene_167235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATTCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586952	587957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_587000_588000
926806	contig_18251_pilon	+	2748	1	Intergenic	novelGene_50175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	122	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2276	2617	142847	143188	NA	25	AGGTCTTATATACTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKIKILTTVPISNIVINGENIEVVKDFILLASTINTHGSSSQKIKRRIASGKSGAKDLFKVLKSKHVTLKTKVRLTQAMVFSIASFACESWTMNKEE	140571	143319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_140600_143300
926807	contig_3956_pilon	+	2944	15	Intergenic	novelGene_15061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1114.38816378847	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	81	2420	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289536_1289854_1289892_1290297
926808	contig_5862_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_54961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	56	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTAATTTACACTGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225317	227470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5862_pilon_+_225300_227500
926809	contig_15821_pilon	+	1389	1	Intergenic	novelGene_25030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCACTTAAAGCACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168187	169576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_168200_169600
926810	contig_8793_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_178075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTGTAGGTGAAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9809	11559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8793_pilon_+_9800_11600
926811	contig_1037_pilon	+	3592	4	Intergenic	novelGene_84591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	350	676	147468	148140	TRUE	25	GCATAGACGACCTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGLRGLQGQLCGEEGPLAQSCGICPVLWVGKAVLETPALRSRMLPQSCGSCLAPKRLELLWTHNLTGQLPGGEGARFSTRRVAYGLFPDVPYAQGDYSPCRESFCS	147118	153370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_147568_147913_149712_151366_152352_153010
926812	contig_14801_pilon	-	2591	1	Intergenic	novelGene_166528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTCCAACTACTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63081	60490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14801_pilon_-_60500_63100
926813	contig_14682_pilon	-	2746	8	Intergenic	novelGene_139111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98.8048994901837	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	512	1759	137297	94398	TRUE	30	CAGTAATCATTTTTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEENKYDYLPTTVNVSSELVKLVFCVLVSFWVIKKEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSRWRRTGKAYQTQE	141979	93374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_93991_94026_94439_95781_96558_119740_119809_122397_122532_124154_124254_137167_137317_141487
926814	contig_10042_pilon	+	1513	1	Intergenic	novelGene_79182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TACAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	813801	815314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_813800_815300
926815	contig_12119_pilon	+	1698	1	Intergenic	novelGene_88676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTGAGTCAGATAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358706	360404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_358700_360400
926816	contig_8276_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_174489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGGGGAAAAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182976	184313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8276_pilon_+_183000_184300
926817	contig_9706_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_20824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1908	2739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1900_2700
926819	contig_6871_pilon	-	1914	4	Intergenic	novelGene_21605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	83.4545784643759	9	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	148	495	428098	427250	FALSE	25	CTACTATAACCCCGCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQDHHLSLTGWKKWVSKVVEPNAIHPSGKDLCQSPLPPLCISVSWRGITMIHFQGPIYTHGDSSASLPPQGMIVQPEMHLPHPGLHPHQTPAPLPNPALYPPPVSMSPGQPPPQQLLAPTYFSAPGVMNFGNPSYPYAPGALPPPPPPHLYPNTQVRWLMSRSF	428550	425830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_427495_427756_427851_428089_428205_428509
926820	contig_15732_pilon	+	3690	14	Intergenic	novelGene_88835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	268.761304977585	29	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	662	2392	85890	386783	FALSE	40	CAGTCACAATGGAATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCWRARGSEGYFEVNIPTDLRGEYSVGISERKEIEELSEASRSSKPLAMVLPSEISCENPGEIFIILRDGVIADTVEVEFTSNNKCIRTRPAIWNKTVWCMKALDFPAGSVSVNVYCDGIVKATTEIKYCTTAKETAFRVADPGHGTCQSDIEEIDDVLTSIFKHEIPHYEFKSLQTEIYPQKEYTHFKELPTLLHCTAKFGLKNLAIHLLQCSGATWASKMKNMEGSDPAQIAERHGHKELKKIFEDFSILEISRNNEQEHDYEEAEYSPTTQNAAFHHGSWQTCRLGAEGAEVNETEEENESESEHSPTEVDSESSDNQYDDLYVFIPGDDPENSSQEPLLSSRPPLPPPRPIAAAVQPDKPHVTLQGITLQDQMERNKNWYDPGGRQEIRDEPKGEEEKEDEKDQEEEEDPYTFAEINNSEYDIILANMSIKKKLGSRSFIINRPPAPTPRPTNIPPKEVTTPYIAQVFQQKTARKQSGSDKFHGPSRKQERAPVESQVFSTLKDCLAAGQEELILLQENVKNGKLSMDEALEKFKHWQMGKSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYSK	11092	388081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_11278_53526_53926_85812_85909_97594_97750_110636_110776_126356_126491_153775_153882_184977_185175_339852_339917_343583_343878_348878_349182_368548_368618_380802_380982_386711
926821	contig_17144_pilon	-	1510	9	Intergenic	novelGene_29375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1977.34780940911	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	333	1298	174965	166282	FALSE	20	AATTCTTGAGTGTGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSVYKRGSGQ	176270	166069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166309_170886_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
926822	contig_854_pilon	+	4770	2	Intergenic	novelGene_36338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	140	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAATGTTGAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	972560	995293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_976738_994700
926823	contig_16125_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_155288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGATATATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195596	196591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_195600_196600
926824	contig_14635_pilon	-	1641	2	Intergenic	novelGene_84381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627409	621552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14635_pilon_-_622473_626688
926825	contig_500_pilon	+	1243	9	Intergenic	novelGene_31019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1023.32081205016	9	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	1492663	1498065	TRUE	15	TGTTTGACTGTGTTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRTLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDKKGELGGRRDLGLRARLAA	1485750	1499589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496827_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
926826	contig_17973_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_176110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTCAGCCTCTCGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12115	11120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17973_pilon_-_11100_12100
926827	contig_17427_pilon	-	2552	13	Intergenic	novelGene_30351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	990.594967122733	4	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1425	35	1459	188879	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
926828	contig_1244_pilon	+	2879	2	Intergenic	novelGene_38086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	208	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATTCAGTTGGACCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1565855	1569154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_1566446_1566865
926829	contig_1725_pilon	+	2525	19	Intergenic	novelGene_24255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	566.180074307821	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1752	772	2523	236154	255519	FALSE	50	GAACAAAGCCAGAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIWIAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNG	201388	255521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236169_240070_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
926830	contig_5643_pilon	+	1927	15	Intergenic	novelGene_39073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	796.366676006136	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	945	1721	636518	641217	TRUE	10	CGGTCATTGTGTGTGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631247	641592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631300_631832_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636181_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
926831	contig_10120_pilon	+	1888	1	Intergenic	novelGene_171759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTTAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260642	262530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10120_pilon_+_260600_262500
926834	contig_10182_pilon	-	1223	1	Intergenic	novelGene_134616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTTTGTTTTATGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249882	248659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_248700_249900
926835	contig_8866_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_77891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTTACTGACTGTAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1061997	1063455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_1062000_1063500
926836	contig_8377_pilon	+	3002	21	Intergenic	novelGene_35113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_20	2620.21554981647	2	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	244	2280	176610	197939	TRUE	50	GAAACAAATATTATTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSSIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	164517	198736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_164590_169245_169307_172947_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_198276_198350
926837	contig_15304_pilon	-	1393	3	Intergenic	novelGene_30638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	439.5	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103604	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102057_102229_103329_103548
926838	contig_14326_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_120751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	24	75	300	374	549096	549022	NA	60	AAATCAAATGTGAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLIHCSWGCKIVQPLWKTVWWFLKKLNIGLPYDPAIPILGIYLEEVKSGTQTETCTPVFVAEVFTVAKRWKQPKCPSKDESIHKIHTIEYCSTIKRNVLMHGNTWMNFENMLSKVSHKRTNSV	549395	547680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_547700_549400
926839	contig_8619_pilon	+	2328	5	Intergenic	novelGene_179119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACCACTCCTTTTTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94919	152509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8619_pilon_+_95213_105080_105091_149870_151151_151445_151646_151964
926840	contig_10482_pilon	+	1703	1	Intergenic	novelGene_152849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTCCTTCCAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163759	165462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_163800_165500
926841	contig_10246_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_46876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCTACAGTTATTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22794	22226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_22200_22800
926842	contig_9995_pilon	+	3965	1	Intergenic	novelGene_47752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCCAGTAATGATGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641059	645024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_641100_645000
926843	contig_19899_pilon	-	2669	1	Intergenic	novelGene_102525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATTAGCTCAAGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156627	153958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_-_154000_156600
926845	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	65	829	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147176	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
926847	contig_5031_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_133191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGGTGCAGAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24959	23059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_23100_25000
926848	contig_12938_pilon	+	1667	5	Intergenic	novelGene_99748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.430895032569	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80684	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_81459_83391_83470_84550_84635_85468_85615_85736
926849	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
926850	contig_18363_pilon	-	1139	1	Intergenic	novelGene_157718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATTACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286669	285530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18363_pilon_-_285500_286700
926851	contig_20257_pilon	-	1604	1	Intergenic	novelGene_179120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42954	41350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20257_pilon_-_41400_43000
926852	contig_5419_pilon	+	3569	1	Intergenic	novelGene_15562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2754	3053	560122	560421	NA	50	TAACTGAAGAAAAGTGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTNDCSDQDHNTGLWTELEKDVEQNSNTQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRQPFSSVVKPLPSFTVQPEIGQPHKTKQD	557368	560937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_557400_560900
926853	contig_15952_pilon	+	4129	2	Intergenic	novelGene_154090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCCGAGGCCCAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	695953	700124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_696383_696424
926854	contig_11293_pilon	+	3336	2	Intergenic	novelGene_134674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1388	1741	71785	72138	TRUE	65	GTGAAAAAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCIWPAARVIRNTPLGKNLSPICLPTPYSALDPGLASAIAECPGVEEGSITRLEPFSLPWRENKLTNEGKNKLPAPLSQEPRVSTAPLSRHSSKGSTDFHCLSPCIHWYGPIPTA	70397	74120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_73125_73511
926855	contig_4180_pilon	+	956	5	Intergenic	novelGene_8358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1702.36341228893	4	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	33	380	882886	888134	FALSE	10	CCAGCTTTGGAGCCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865753	888710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865761_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
926857	contig_7428_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_77680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210722	212523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_+_210700_212500
926858	contig_15732_pilon	-	5399	3	Intergenic	novelGene_88881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGATAAAGAAACCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211349	192686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_192716_205616_209210_209572
926859	contig_11720_pilon	+	1384	11	Intergenic	novelGene_43772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2517.1624103343	5	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	582	1100	87158	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67774	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86380_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
926861	contig_14450_pilon	-	1893	1	Intergenic	novelGene_48975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATACTCACTTGGGGCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040882	1038989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1039000_1040900
926862	contig_7758_pilon	+	386	1	Intergenic	novelGene_163523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACCCCCGGGGGCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98325	98711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7758_pilon_+_98300_98700
926863	contig_17796_pilon	-	732	1	Intergenic	novelGene_33831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	91	423	93601	93269	NA	5	GCCATGCTTGTGCTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFTVAFCSCIIFLNYSIFLSVFAMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCLCKF	93691	92959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_93000_93700
926864	contig_6509_pilon	+	1495	8	Intergenic	novelGene_145634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTCATGTGATCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73443	110725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_73888_74356_74507_74724_74874_76422_76563_77878_78084_78289_78463_91925_92064_110629
926865	contig_14184_pilon	+	2755	1	Intergenic	novelGene_66599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGAAGTACAACTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108680	111435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14184_pilon_+_108700_111400
926866	contig_16098_pilon	-	708	5	Intergenic	novelGene_45945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1211	junction_1	1334.57041309179	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	122	583	349429	348413	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	349662	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604
926867	contig_5020_pilon	+	1010	2	Intergenic	novelGene_27908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	90	479	122915	123416	FALSE	5	TCATTTTTGCCTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEREYGAGPYAPWPFLCAD	122825	123947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123041_123152
926868	contig_3123_pilon	-	4551	28	Intergenic	novelGene_162970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	50	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCAACGATAAGTTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291914	56390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3123_pilon_-_56533_63439_63542_74249_74323_76046_76251_91420_91554_102086_102147_107469_107520_108843_108914_111181_111368_112049_112211_113310_113354_115916_115938_117813_117861_118660_118767_127070_127210_128867_128917_130229_130353_134642_134753_143330_143448_152154_152232_156082_156161_156616_156704_168134_168227_168934_169049_177470_177592_220726_220826_231751_231835_290050
926869	contig_14445_pilon	+	2672	2	Intergenic	novelGene_137358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1906	2226	281562	282053	FALSE	65	CAAACCAAAATGACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEIKQSISNHIKRQSMMASASSQNKESRNFPEEENFLELLEAEYKKLICRTLQEIRKEIKQNTEHTIKEIKKISKEHNEKFNRLQESKSEETLRIIWDSIKRNNL	279656	282499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_+_281826_281996
926870	contig_6175_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_16335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	113	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTCGTCTATTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1521872	1523065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1521900_1523100
926871	contig_11851_pilon	+	4539	1	Intergenic	novelGene_146555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGTAAAGGAGTAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36573	41112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11851_pilon_+_36600_41100
926872	contig_5023_pilon	-	2068	8	Intergenic	novelGene_7354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGAGAAAGGATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648302	614401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630276_647073
926873	contig_2009_pilon	+	2192	9	Intergenic	novelGene_165448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	400.043728078569	2	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2	373	40721	56388	TRUE	45	CAAACAAAAATTGTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDKHSSDASSLLPQNILSQTSKHNDRDYRLPRAETHGSSTPVQHPIKPVVHPTATPGTVPSSPFTLQSDHQPKKSFDANGASTLSKLPTPTSSVPAQKTENLHQETNLYHILAQHLPRLLPLD	40719	67329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2009_pilon_+_41021_56316_56563_58031_58155_59129_59279_61716_61836_63289_63477_64660_64789_66341_66980_67028
926874	contig_5933_pilon	+	3299	2	Intergenic	novelGene_179121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTATGCTGGCATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105183	118764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5933_pilon_+_107930_118211
926875	contig_11088_pilon	-	556	2	Intergenic	novelGene_85047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGGGACATGAAGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
926876	contig_5136_pilon	+	1920	2	Intergenic	novelGene_126616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGAGCTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197656	199985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_198665_199073
926877	contig_5935_pilon	+	3151	1	Intergenic	novelGene_102772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTGTTGTTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1410560	1413711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1410600_1413700
926878	contig_12886_pilon	+	2940	2	Intergenic	novelGene_135531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	883	1374	881241	881732	FALSE	30	GCTTCTTAAAAAAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSASSSTGRPCGVLFWTPTGTILSCVCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFTDCRFACFILLFYLVMSEQVGCAFFVVCLSVGTILFTSFSNRQGQSLRYGTAGQVQLKGSFWNRLFVARTRADSADWQSVQGRFQ	859442	883298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_859450_880365
926879	contig_8552_pilon	+	5401	2	Intergenic	novelGene_80076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	467	junction_1	0	16	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	3131	3970	471430	472269	FALSE	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKFEEFRKIMQEKNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRDMWDTLKSKNFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTKNFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRKDPKRKSPRRIMCTLAKTKDRQRILRAAREKQEVTCRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEENCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKEKPNLQELLRRVLQYEDKQLQLTGRT	466658	473700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_467740_469380
926880	contig_9272_pilon	+	2208	1	Intergenic	novelGene_125957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTTTGCTTTTTTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478813	481021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_478800_481000
926881	contig_8377_pilon	+	2373	21	Intergenic	novelGene_35018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3472.87173676196	10	40	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2076	297	2372	131448	180506	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	68219	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68340_128711_128871_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
926882	contig_9435_pilon	-	5602	29	Intergenic	novelGene_156948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_8	89.3338370315275	861	74	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1248	3747	132	3878	495827	150347	FALSE	25	ATTCAGAGATCTGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRGVRCSSISAGASTSSGSGNRRLSSASPARDPPLPTRPRPAKMLPVYQAVKPNPLQDANLCSRVFFWWLNPLFKIGHKRRLEEDDMYSVLPEDRSEHLGEELQGYWDKEVLTAEKDAQKPSLIKAIIKCYWKSYLVLGIFTLIEESIKVIQPLFLGRIINYFENYDPSDSAALHTAYVHATVLTVCTLFLAILHHLYFYHVQCAGMRLRVAMCHMIYRKALHLSNAALGKTTTGQIVNLLSNDVNKFDQVTIFLHFLWAGPLQAIAVTVLLWMEIGISCLAGMAVVIILLPLQSCIGKLFSSLRSKTAAFTDVRIRTMNEVITGIRIIKMYAWEKSFADLITSLRRKEISKILRSSYLRGMNLASFFVASKIIVFATFTTYVLLGNVITASRVFVAVTLYGAVRLTVTLFFPAAIEKVSEAIVSIRRIKNFLLLDEISQHNTQLPSDGKTIVHVQDFTAFWDKASETPTLRDLSFTVRPRELLAVVGPVGAGKSSLLSAVLGELPPSQGLVSVHGRIAYVSQQPWVFSGTVRSNILYGKKYEKERYEKVIKACALKKDLQLLEDGDLTVIGDRGATLSGGQKARVNLARAVYQDADIYLLDDPLSAVDAEVSRHLFELCICQTLHEKITILVTHQLQYLKAASQILILKDGKMVQKGTYTEFLKSGLDFGSLLRKENEETDQSPVPGTPTLRSRTFSESSVWSQLSSRPSLKEGTQEDQTTENVQATLSEESRSEGKVGLKAYKSYFAAGAHWLIIVFLMLLNAAALVAYVLQDWWLSYWANEQSALNITVNGKGNVTETLDLNWYLGIYSGLTAATVVFGIARSLLVFYVLVNSSQTLHNKMFESILKVPVLFFDRNPVGRILNRFSKDIGHMDDLLPLTFLDFIQTFLQVVGVVAVAVAVIPWIAIPLIPLAIIFFILRQYFLETSRDVKRLESTTLDAGQVGLSLSYALTLMGMFQWCVRQSAEVENMMISVERVIEYTDLEKEAPWEYQKRPPPTWPHEGVIVFDNVNFTYSLDGPLVLKHLTALIKSREKVGIVGRTGAGKSSLISALFRLSEPEGRIWIDKILTTEIGLHDLRKKMSIIPQEPVLFTGTMRKNLDPFDEHTDEELWNALNEVQLKETIEDLPGKMNTELAESGSNFSVGQRQLVCLARAILRKNRILIIDEATANVDPRTDELIQKKIREKFAQCTVLTIAHRLNTIIDSDRIMVLDSGRLKEYDEPYVLLQNKESLFYKMVQQLGKAEAAALTETAKQVYFRRNYPDITHNGPVVMNAFNGQPSALTIFETAL	495958	148622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_150455_167126_167262_180031_180138_180586_180760_188656_188747_202165_202322_214557_214750_216012_216114_227100_227252_279014_279095_326475_326623_328823_328919_329315_329354_329723_329865_332043_332254_336034_336132_352219_352307_352854_352950_365573_365766_367071_367162_372040_372143_382782_383033_384752_384879_386588_386753_387895_387986_410274_410500_422354_422476_423052_423164_495753
926883	contig_6031_pilon	+	3688	1	Intergenic	novelGene_56774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTATTCTCACTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432374	436062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_+_432400_436100
926884	contig_3151_pilon	-	2927	1	Intergenic	novelGene_139187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTCCTCCAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167489	164562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_164600_167500
926885	contig_4392_pilon	-	3009	1	Intergenic	novelGene_117335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTGAGCATACAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572295	569286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_-_569300_572300
926887	contig_3747_pilon	-	2294	8	Intergenic	novelGene_24820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTCAACAACGATCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	200983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201164_202116_202207_202311_202460_202636_202732_203093_203127_203227_203384_203496_203649_203766
926888	contig_4496_pilon	-	648	1	Intergenic	novelGene_66713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AATAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1318461	1317813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_1317800_1318500
926889	contig_12694_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_171994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAGACCCGCAACGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390733	389049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12694_pilon_-_389000_390700
926890	contig_3103_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_146198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACATTCCCAGCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82103	79429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_-_79400_82100
926891	contig_11677_pilon	-	4769	26	Intergenic	novelGene_85881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	648	27	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	2938	3660	262365	258375	TRUE	10	AGCAGGCCCCTCGCCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRCSFSRCSFSRWASSCACESSLSNLLCFFSSSWLRTCWPSRCSLVSCSSAVSRWHFFLSCCRARWLSSLSACRSPSRLSSCLLFCCSTSSLSSNSCWSRFLVKSTSLIARSYFRRHSPPASSSTSPLISAARMRRASITSISITSICFFSASYWVCSSFISFSARSLSAVSASSSWEADSPVLRSSVSSDVSSEIRVSNRSLLSRSSFRSFSTFSSLLRSCWISSSSLFRICSSDS	283115	245556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_245655_245816_245970_246738_246934_247229_247473_250482_250594_254105_254171_257415_257545_258259_258410_258825_258917_259059_259175_259412_259526_259911_260041_260343_260498_262279_262407_262496_262699_263283_263392_263940_264047_264373_264521_264898_265016_266361_266485_266667_266747_267197_267336_269935_270121_270503_270646_274601_274724_281688
926892	contig_233_pilon	-	2638	14	Intergenic	novelGene_14665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_3	1277.318140925	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	410	2086	108727	91657	TRUE	10	ATTTCTCTTTGTATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	109136	78439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724
926893	contig_6839_pilon	-	4634	3	Intergenic	novelGene_161874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	506	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1943	2293	253838	253488	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAAAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVIEGLRSRFETLEDRISGIEDKHLDTTLFEQNSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTDRITEQLLTENFPNIMKAVWPSKKLYEPHIGETPRENQQSIS	255780	229087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6839_pilon_-_229893_231159_232690_253481
926894	contig_14868_pilon	+	3064	1	Intergenic	novelGene_150429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAGCCCAAGAGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71332	74396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_71300_74400
926895	contig_10990_pilon	-	2055	3	Intergenic	novelGene_7410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	13	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTTATGGAAGCAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144758	137493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_138338_142723_143030_143853
926896	contig_7568_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_174004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCTGTTCTGTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67278	66891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7568_pilon_-_66900_67300
926897	contig_7963_pilon	+	781	4	Intergenic	novelGene_58376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1497.34720979026	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	79	420	51450	57909	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRWHCPHHKGSAFQ	51371	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56937_57868_57934_63003
926898	contig_17964_pilon	-	2341	4	Intergenic	novelGene_33879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5735.30704399415	7	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	TRUE	55	AAGAAATTTCAATAAAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134590_134715_135640_136905_136999_139520
926899	contig_14513_pilon	-	1729	2	Intergenic	novelGene_70269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	812	1183	18880	11833	FALSE	15	AACTCTGCTTTTGTCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19691	11286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12073_18748
926900	contig_3147_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_142295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATTTCCTGGGATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358023	357235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_357200_358000
926901	contig_6442_pilon	+	3304	4	Intergenic	novelGene_166480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1760	2272	285468	285980	FALSE	70	CAAAAAAAAAAAAAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPLTDEWINKLRYIHTMEYYAMRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	198556	287012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_199636_210511_210522_217634_218301_285463
926902	contig_12837_pilon	-	2546	1	Intergenic	novelGene_57386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAATTCTCCAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390495	387949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_387900_390500
926903	contig_9535_pilon	-	2851	1	Intergenic	novelGene_124460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	882	1181	118097	117798	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDLLNLQDTAKPQQQKDNPIKKWAKDMNRHFTKEDIQAANRHMRKRSQSLAIREMQIKTITRYLLTPTRLALMQKTPKKYMLRRLWRDQNIYTLLVGL	118978	116127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_116100_119000
926904	contig_1785_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_175096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAAATTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361731	361098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1785_pilon_-_361100_361700
926905	contig_6132_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_163617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1859	2248	89478	89089	NA	20	ATCTTTGGCTATGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKESTGLTPSGAKENEENRIQGKDQSEGLMDHSYQGLHETESSTTRWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVKQNSNSHKKDQIYWAKGDWKNPESMAPRHPFSSAVKSFPRFTVQLGSGQPHKTKLN	91336	88838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6132_pilon_-_88800_91300
926906	contig_11816_pilon	+	3055	3	Intergenic	novelGene_98568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTAATTTTCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1268794	1433800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1268812_1327943_1328903_1431721
926907	contig_13412_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_80003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTAGAGGACCTTAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324692	326526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13412_pilon_+_324700_326500
926908	contig_2100_pilon	+	3136	1	Intergenic	novelGene_50643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAATTAGGAAGTAAGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003642	1006778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1003600_1006800
926909	contig_19342_pilon	+	913	6	Intergenic	novelGene_41108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.61109401705356	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	293	490	4154	6183	TRUE	15	CCAGAATCCTGTGTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPLPEVFPHRRVPARPRGAPLHRRRLRGRHAVRAVRQRRRESEVGAAGAVGGAGGAGVSGRADTIAKGAAQTLRVDLPTLRGCYNQSDAGSRTFQGMFGCESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3619	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3892_4133_4167_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353
926911	contig_6133_pilon	+	3809	3	Intergenic	novelGene_178502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	1508	3058	139311	140966	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPESIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLTIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTTNINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFNKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGLYPREIRVVTRIDICTPKFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRQVVSWVKGETVHNTGETNTTCTRKGHGGPMERSKLPEGLSCWTEGSGDHGLGEYLAQLA	124215	141717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6133_pilon_+_124697_138284_140681_140785
926912	contig_10345_pilon	-	1982	9	Intergenic	novelGene_158383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTCTTAGTTAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24435	13201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_-_14231_14652_14745_16895_16975_17171_17231_18808_18901_20418_20515_21586_21646_23044_23167_24081
926913	contig_19402_pilon	-	3881	16	Intergenic	novelGene_80800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCAGCCATGTCTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	47358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_102161_102225_107509_107689_138560_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144102_144512_146482_146623
926914	contig_10861_pilon	-	2633	10	Intergenic	novelGene_39229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	337.31620509875	6	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1149	1485	2633	609120	603039	FALSE	25	TCTCTCCAGGGAGAACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFRFVCFKVTCFSSCHVFLQNPDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQEKLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRERSRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRERKRSHSRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATSTSDILKVPKPEPVPEPKEPSPEKNSKKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRRPSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRFSGILLPKVNSAEEGAHQHPCLGVAHHPLHLVPGHRQRNHPREHPAPLEKLVGCLLQQVLQGDGTDHHLQQLHHQKLVIPQHPSSQTVQEKVVFL	614427	603038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_603287_603806_603845_605071_605192_605703_605893_606396_606601_607921_608038_608886_610261_611134_611258_611521_611612_614296
926915	contig_16782_pilon	+	3531	1	Intergenic	novelGene_176773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATTAAAATTCTGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63147	66678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16782_pilon_+_63100_66700
926916	contig_6227_pilon	-	900	2	Intergenic	novelGene_49697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	263	676	979309	978896	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMKQKFLYLYYYLDYLEADYSFRSSSQDLDDTDGHKRERVAVELVGHLTSVTGCTAESCPAPQLTPLAQMLVSHLGKTPVYSVQLGILRSARSTPETAAPGCSVNPELKPFLKPTLQTKIRQDYRTKSNTREEYAS	982226	978671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_979451_982105
926917	contig_12638_pilon	+	2119	18	Intergenic	novelGene_33177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	189.225648422092	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	657	1928	269821	274265	FALSE	30	GAAAGACCACTGCTTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAPIQVRCSDYDSDGSHDLIGTFYTSLAQLQSVPAIFECIHPEKQQKKKSYKNSGTICIKTCQVETEYSFLNYVMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLTALWSVGGVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQRTASQYFVLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGSADFEAMEQLDADGGPLRTRSGEAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPAQLVSYFKAQGWAPFKPLPPPAKGPAQFPQA	235663	274456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_241232_241318_244416_244560_269237_269367_269457_269581_269774_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270501_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273449_273584_273761_273999_274124
926918	contig_11258_pilon	-	3936	5	Intergenic	novelGene_67764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	146	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2320	2622	326543	326241	TRUE	70	AAAAAAAAGAAACGGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKCSQSLAIREMQIKTTVKYNFAPTLPAIKIIFKKSENNKCWWGCVEIGTLVHCWLEYKMVKPLRKTVWHFLKKLEIEIAYDPAIPLQGIYLKDIRAVT	328862	249746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_250373_250674_250806_277131_277430_312807_312948_326121
926919	contig_20116_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_159079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAACTTGAACTTGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5039	2431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20116_pilon_-_2400_5000
926920	contig_10002_pilon	+	1504	1	Intergenic	novelGene_157657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410762	412266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10002_pilon_+_410800_412300
926921	contig_10930_pilon	-	2282	8	Intergenic	novelGene_37031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1643.30593869896	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	131	1492	280211	268388	FALSE	15	CTATGATTTTCCAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280341	267597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274249_274290_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
926922	contig_10711_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_118445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCCAAGGTCCCATGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	826353	826936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_826400_826900
926923	contig_2504_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_166857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGGTACATGTGTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400464	401511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2504_pilon_+_400500_401500
926924	contig_20293_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_153510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCGGTCAGCCTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24893	25719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_+_24900_25700
926925	scaffold_12124_pilon	+	3304	10	Intergenic	novelGene_22339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3283.60537320086	2	182	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1541	2320	1508626	1509405	FALSE	25	AGGGGCACACCAGGCCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483581	1510389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497127_1506638_1506687_1508010
926926	contig_17989_pilon	-	1609	1	Intergenic	novelGene_150824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATATATATTTATATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221445	219836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17989_pilon_-_219800_221400
926927	contig_13481_pilon	-	2078	12	Intergenic	novelGene_119484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	46.9738805565971	1	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	99	680	1332898	1325765	TRUE	10	CAAGTTTTGGGGGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTVVVMDVSLSMTRPVSVEGSEEYQRKHLAAHGLTMLFEHMATNYKLEFTALVVFSSLWELMVPFTRDYNTLQEALSNMDDYDKTCLESALVGVCSIVQQEWGGAIPCQVVLVTDGCLGIGRGSLRHSLATHNQRSESNRFPLPFPFPSKLYIMCMANLEELQSTDSLDCLERLIDLNNGEGQIFTIDGPLL	1338574	1305542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1306349_1308589_1308652_1309838_1309958_1317177_1317312_1318640_1318786_1321349_1321443_1325725_1325772_1326683_1326773_1327573_1327730_1331083_1331192_1332676_1332961_1338538
926928	contig_9206_pilon	-	6402	6	Intergenic	novelGene_137482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	14.218298069741	114	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	46	141	211	351	124397	118257	TRUE	25	TTTGAGGTGTCTTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RKPVALREIKKQITRSFSSGAAGIDLSILILPENEARRKRSKERGIQNGYFPGTVNVQGCGHRILSGGVGMPGPCSEGFVQGHDGRELQEPGLSGPAPPSQSLRCLSPLQSLYQPI	132925	112136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9206_pilon_-_117226_117294_118324_124323_124451_127426_127516_130936_130975_132895
926929	contig_10345_pilon	+	2499	3	Intergenic	novelGene_158389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1712	4	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACCCGAGAATGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19567	24387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_21641_23046_23170_24084
926930	contig_14665_pilon	-	3131	1	Intergenic	novelGene_171041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCACCTCCTGTGTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36996	33865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_33900_37000
926931	contig_15666_pilon	-	2252	5	Intergenic	novelGene_70147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	303.426576785884	16	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	129	1172	110619	107848	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110747	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
926932	contig_19402_pilon	-	2185	6	Intergenic	novelGene_80853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	646.109402500846	2	114	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	248	1516	175076	167101	FALSE	30	AAATTTGATGGTGCTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVTVLDAYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193215	166431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168210_168295_170797_171013_174052_174161_175052_175196_193087
926935	contig_7933_pilon	+	2602	1	Intergenic	novelGene_164670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGTGTGTTGCCCGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117076	119678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_117100_119700
926936	contig_8377_pilon	+	1879	7	Intergenic	novelGene_35143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6021	junction_4	1240.86712512751	2	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	133	1074	191158	197939	FALSE	35	TATTATTTATATTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	189177	198744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
926937	contig_11337_pilon	+	3011	1	Intergenic	novelGene_107177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	251	748	149959	150456	NA	30	TAAATTATTTATTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERMKIVIVGISKLKWTGIVRFELGNHVVFYSGNDKLKRSGITYIVKKNILRSILKYDAVRERITSICLPGRTVNTTVIQIYPSTTKAKDDETKDFYELLQSEIDQTCNQDALTVTGDWNGRVGNKKDWVGKYGLSNRSHVRDHMIEFCKINDFFIANAFFFSTT	149708	152719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11337_pilon_+_149700_152700
926938	contig_12103_pilon	+	2585	7	Intergenic	novelGene_54463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	20.8998936733074	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAATATTGATACATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14388	26335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12103_pilon_+_14461_18607_18707_19401_19501_19639_19736_20965_21042_21393_21510_24308
926939	contig_15304_pilon	-	1782	4	Intergenic	novelGene_30659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	374.130399133184	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	499	519	103265	103245	TRUE	15	CCTGAAGCCCCTTGATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	105942	101894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102874_102960_103329_103548_103680_105638
926940	contig_16917_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_161924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGCAGCACTAGATAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63797	62619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16917_pilon_-_62600_63800
926941	contig_7513_pilon	-	2363	1	Intergenic	novelGene_88967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	2027	2362	219719	219384	NA	60	GAGCAGAGAAAGTGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGFSFAFLVGSDPHRGCSKLTLHLQVASPLFTVAGEVLILVYPLSSQPCPETGQRPLALCRVSALLSPYVLSILIHSFTHSFFLSLLHSSDVVSTVSCLPRGARSLEEGGG	221745	219382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_-_219400_221700
926942	contig_12970_pilon	-	3325	1	Intergenic	novelGene_50530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAGAAGAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234875	231550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_231600_234900
926943	contig_11055_pilon	-	1922	1	Intergenic	novelGene_142175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	92	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	148	582	156498	156064	NA	75	ACAGGAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLWGDRNSYALLVGMQNDTTILENDMALLQKTRIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIVRQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNYLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	156645	154723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_154700_156600
926944	contig_5482_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_144467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGGCACGGTTGGCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	347808	346557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_-_346600_347800
926945	contig_3747_pilon	-	903	5	Intergenic	novelGene_24943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAAGAAAAGCCTTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205204	202377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203341_204854
926946	contig_6477_pilon	-	1427	2	Intergenic	novelGene_154191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATTATTTTGATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775608	773622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_773669_774227
926947	contig_2646_pilon	+	1530	2	Intergenic	novelGene_69689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	91	junction_1	0	6	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	754	1056	2341284	2342323	FALSE	50	AGACAACAAAGGAGCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLGFDLTAAQAFTVVTVFNSMTFALKVTPFSVKSLSEASVAIDRFKVSGSFPLASVRSVPGRTNPASAPVGTPTMAVLWFVALKVSASWRERGQWRRWN	2340530	2342797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_2341317_2342053
926948	contig_1442_pilon	+	1364	1	Intergenic	novelGene_172178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	768	1181	788534	788947	NA	15	TGTTGTGTAAACCTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYRYNVIPIQIPTAFFNKMEKLVTNFIWKGKRPRISKALLKKKDKVGGLTLPGLRTYYTAMVVKTTWYWYINRHIHQWNRIENPDVNSSTYGQLIFDKGPKSTKWRKGSLFNKWCWQNWISVCKKERKNP	787766	789130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_787800_789100
926949	contig_11447_pilon	-	1327	1	Intergenic	novelGene_168099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAGCATACTGTCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	499776	498449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_498400_499800
926950	contig_3153_pilon	-	3447	1	Intergenic	novelGene_104640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGCTAATTCTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75078	71631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_71600_75100
926951	contig_14243_pilon	-	1135	2	Intergenic	novelGene_57426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600440	572347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_573324_600281
926952	contig_10176_pilon	-	3318	1	Intergenic	novelGene_72741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATCTTAAGTACCTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269912	266594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_266600_269900
926953	contig_8254_pilon	+	3818	2	Intergenic	novelGene_48370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	198	139	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAGTTGGCGCACGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41332	45394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_44927_45170
926954	contig_1618_pilon	+	2417	1	Intergenic	novelGene_141783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163279	165696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1618_pilon_+_163300_165700
926955	contig_10159_pilon	+	2884	10	Intergenic	novelGene_30777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1951	2367	352738	353194	TRUE	65	AGGATAACATAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDRDHHCGENKTGKCIKKGQKSLAPLHGVLGALWFWHGDLDHLLPIPIWHPVGFDLDVEAAVKGGEVCANAEVPIFRVSIMSKSRCPLSEETRHKGGFLKSSCVRLIKSRPVKCSRDSQYSGIAFSNSQSATFLGDQ	316407	462022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_317380_317760_318147_318830_318993_319495_319656_338199_338316_352583_352963_353002_353442_431855_431939_456758_456901_461977
926956	contig_19402_pilon	+	2283	2	Intergenic	novelGene_80839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGGACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144379	146715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_146606_146658
926958	contig_13097_pilon	+	3445	1	Intergenic	novelGene_107670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1109	1432	17539	17862	NA	40	AAAGGTTGAGAAGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIIHFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYCTATVVKTAWYWYNEGHIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSINGEKTVFLTNGAGKTGYPSAKK	16430	19875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_16400_19900
926959	contig_6375_pilon	-	2092	10	Intergenic	novelGene_72960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	203.168846644641	1	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	155	1675	229189	202748	FALSE	20	CTAAGCTTTCAGTGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDGVKYEVAPQHDRDSSPLADGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPKGVLMYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAVIAITFANYMVQPFFPSCVAPYAAVRLLAAICICLLTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIIAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSYVMGDIALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAVAVIFGVFNWTIPLAVALSCLGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	234035	202330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_204525_204774_204864_205069_205194_206631_206777_207612_207739_228690_229237_233928
926960	contig_9429_pilon	-	1395	1	Intergenic	novelGene_155092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTATCATTAGCCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35797	34402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_34400_35800
926961	contig_5569_pilon	+	1448	1	Intergenic	novelGene_86759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	884	1192	504875	505183	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANITTLLLQSNRKSELIKKNQIFSWARAEERTFPPDLYVLSELLKTAGTDCSDRDHNRGSPTELERNVEQNSISQKKTRLNGLTETGETLRAWPLDTFLAQ	503991	505439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5569_pilon_+_504000_505400
926962	contig_3721_pilon	+	3466	6	Intergenic	novelGene_123833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	140.506796988615	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	251	1108	296742	314296	TRUE	10	GGTTTATTGTTGGTGTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVSLLTNSLLKVFVTDTVKQLQQIKRVRNEKIYLSNQELVDDDQEKVPPQGLFQNFEEQSLSVPSCLLRSELEDEKEEISSPDMCPRPESPVFGASGQEELAKRLAELEISREFLSVLGDDQDWFDEDFGLSSSHKVQKNKVEETIVPVMAESKRPPQKPCETLLAVPHTAEEVEILVHDAAEELWKWKELGHDLRSISIPTKLLDSVSKGQDIESISKRVYKQAVFDLTKEIFEEIFAEDPNLNQPVWMKPCRINSSYFRRVKNPNDLDEIKNFIATEVLKLFSLKKESNHKTDWQKMMKFGRKKRDRVDHILVQELHEEEAQWVNYDEDELCVKMQLADGIFETLIRDTIDVLNQISEKQGRMLLV	296491	316800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_296757_297635_298044_298136_298284_300506_300630_314131_316583_316728
926963	contig_1230_pilon	-	1953	10	Intergenic	novelGene_28875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	235	561	408595	407721	TRUE	45	AGACATGATTGCTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKFFLLGRLILIKPVDNLITLVKNLLFVLIIDLALKFFIFNCCLHVECVGFKRILRRHLVPLFLIFSFVLLSFLDHTLNVFFTQTALVISDGNLVLFSSTLVHSRDV	408884	405246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_405445_405706_405912_406124_406278_406373_406930_407146_407182_407228_407338_407584_407787_408002_408234_408565_408797_408851
926964	contig_2550_pilon	+	3682	1	Intergenic	novelGene_135678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1590	2012	1327043	1327465	NA	65	TAATCAAGGAAAAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSKFSRGGKFLGITGGRIQKINIQNSSRIRKEIEQNAEHIIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRIDAMEVRISEIEDKALDTKLFEEKSDKRTKKHEETLRIIWDSIKRNNL	1325453	1329135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1325500_1329100
926965	contig_2419_pilon	-	4306	2	Intergenic	novelGene_137137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	40	123	233	355	200642	200520	TRUE	35	CTAACACTTACTGAGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWVECSVYVYEFKLVDCSIKIFRVFVELLSGSSSLKKWCVEVSYYYCGAVYLSFQSCQSLFYVFWSPVIWCINITIIMSSWCIDLLIIIYCPFLSFVLDFTLKSILSEINIATPTLF	200874	181964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_-_184682_199285
926966	contig_14353_pilon	+	1684	7	Intergenic	novelGene_82120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	951	1334	139193	151342	TRUE	20	TGAACAGTTTCAGGTGGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSADFQKCPGWERRRFSLGSFSSMSISRGKLGLSCRLNAQQADRISMTSFPRLTEARIRFTPSPLPICQIRASAAWFLKGQSLACSSYQIVLKCIDVSSFGEWQLVLILPGGHLTHDLRGQVAQPVM	138242	157691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_139196_143358_143492_149597_149737_151233_151364_152115_152250_155361_155462_157596
926967	contig_10811_pilon	-	4222	1	Intergenic	novelGene_165783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGATAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16499	12277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10811_pilon_-_12300_16500
926968	contig_10126_pilon	-	3766	1	Intergenic	novelGene_105748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGAAACACAGGGCCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165695	161929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_161900_165700
926969	contig_10973_pilon	-	1401	2	Intergenic	novelGene_150369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	408	1310	2730	1627	FALSE	40	ACGACCCACCAACATAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKLGQPRYPILIQINENNPFLINAIKRLILGSIFAGFIISSSLTPTTVPHMTIPHHLKFAALAITLLGFALAIELSLFTYHLKFDFPLYTHKFSNILGYYPTIIHRSPPFHVLNTSQNLASTIIDLAWLEKAIPKGLASIQKFASTSISNQKGIIKLYFLSFLISLTLGLLLTI	3137	1535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2146_2346
926970	contig_7644_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_64256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178489	180764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7644_pilon_+_178500_180800
926972	contig_9044_pilon	-	2366	1	Intergenic	novelGene_177950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAACAAGAAATAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18917	16551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9044_pilon_-_16600_18900
926973	contig_5791_pilon	-	2826	2	Intergenic	novelGene_35801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2186	2491	1560	1255	FALSE	10	CCTGGTTTTGGTATCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDNLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	106702	919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_-_2562_105518
926975	contig_10404_pilon	+	3634	17	Intergenic	novelGene_138701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	49	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1268	1831	1195610	1224248	TRUE	10	CCTCTGCTGCAGCAGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHPVCALRPGGWAAGPHEAGSPGMLLPESASWASGRVRCMPLCFFSVRPSPKLLSFSRPPSWEKLYRVCHSRSICLQVTRASSGPFSTCSSFTLVNIRLEILGVLGDGHVDDVKGVLVVFLGREEECQQVEGIGIIPPHFEGLLQLLHGAGDLSDEGQLQGDVEDDLGVVGCQLLGSLQCLQCFPV	1194342	1323879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1195790_1201250_1201370_1219198_1219359_1222905_1222979_1224216_1224275_1225688_1225811_1236233_1236326_1241689_1241786_1243613_1243747_1253762_1253832_1254481_1254638_1255600_1255683_1273441_1273555_1279111_1279247_1306438_1306605_1312021_1312200_1323444
926976	contig_9839_pilon	+	1840	1	Intergenic	novelGene_88474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	67	204	121	324	40107	40310	NA	20	ATGTGTTGTCTATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KILNNSGNVKTRWKEYTESLHQKELIHVQPFQEVAYHQKSMVLKEKVQAALKALAKNKALGVDRIPTEMFQQMQCWKYSLAYYKKIGRQLLGQSLEENHICAHCKER	39986	41826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_40000_41800
926977	contig_3612_pilon	+	1343	1	Intergenic	novelGene_87806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840772	842115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_+_840800_842100
926978	contig_4531_pilon	-	3669	1	Intergenic	novelGene_47924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGTAATTATATTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417844	414175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_-_414200_417800
926979	contig_18113_pilon	-	1195	1	Intergenic	novelGene_137537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCATAAAACCAAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169952	168757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_168800_170000
926981	contig_5212_pilon	+	2133	2	Intergenic	novelGene_179122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CACCAAAAGAATAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128721	183236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5212_pilon_+_128973_181354
926982	contig_13718_pilon	+	1692	1	Intergenic	novelGene_142892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATACATGTAACATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146794	148486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_146800_148500
926983	contig_7775_pilon	+	4286	1	Intergenic	novelGene_37462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAACCTGAAGAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70505	74791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7775_pilon_+_70500_74800
926984	contig_8138_pilon	-	1059	1	Intergenic	novelGene_52509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTAACACCTCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473360	472301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_472300_473400
926985	contig_7840_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_68986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	735	1082	230283	229936	NA	80	AGAAAAACTGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNAASELEEDSLTTCDMQMTHTIFLAESEEDLKHLLMKIKDYNLQYGLHLNRQKTKILTTGPISNIMTNGESIEVVKDFILLGSTINVHGSSNQEIKRCITLGKLLQKTSLKC	231017	228960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_229000_231000
926986	contig_11825_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_155416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	122	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGCAAAGTGCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93546	96030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_94771_95301
926987	contig_11294_pilon	-	1101	9	Intergenic	novelGene_50068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTACGCCATATAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349045	311910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_312062_319147_319238_325734_325807_332507_332616_333603_333664_334971_335074_337379_337456_338120_338197_348679
926988	contig_10766_pilon	+	2016	3	Intergenic	novelGene_151223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACATAAAAATAGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195552	340204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_196758_274597_274831_339626
926989	contig_17144_pilon	-	1406	9	Intergenic	novelGene_29237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1972.0344784955	9	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	390	1322	174965	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	179757	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
926990	contig_19115_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_179123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCCAGAAGAAAGGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4768	2141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19115_pilon_-_2100_4800
926992	contig_16496_pilon	+	1523	2	Intergenic	novelGene_5129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAACCAAAGTCACGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1385_3413
926994	contig_11117_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_148596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90210	92318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_+_90200_92300
926995	contig_19179_pilon	+	708	1	Intergenic	novelGene_142368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAAAAAATTTCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22988	23696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_23000_23700
926996	contig_9440_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_59112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGCTCAACACCAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1707629	1706589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_1706600_1707600
926997	contig_13542_pilon	+	1992	2	Intergenic	novelGene_131559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	645258	648723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_646844_648316
926998	contig_11422_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_98967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGGATATGGCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_213_270
926999	contig_7593_pilon	+	2535	1	Intergenic	novelGene_127283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTAACCTTATTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67724	70259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7593_pilon_+_67700_70300
927000	contig_3975_pilon	-	3293	6	Intergenic	novelGene_54932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	137	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	288	593	2356390	2356085	TRUE	10	CGCCTCTCTCCTCAGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTAHTHTHTIPPNYTNQSMSKGKGLLWLLIKTLGVDSRSELRGYAVLIFSLCERSLLSCSEIKNFGEYHHFHFKILVTISKSIILFCFLGWEEENLHICI	2356677	2327695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2327711_2344356_2344935_2347067_2347163_2351503_2351633_2352981_2353058_2354277
927001	contig_9815_pilon	-	167	2	Intergenic	novelGene_164248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGAATTCAGCGCCAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85588	85363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9815_pilon_-_85406_85463
927002	contig_3862_pilon	-	2062	5	Intergenic	novelGene_137403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	17	junction_4	33.6999629079915	15	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	799	1497	468476	465056	FALSE	20	CCCAGCCTTCTTGCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKNKTREKESIRHLDTQQPTQPLRDLHPAPPRAPQEPHQNSHGVIPPESKPLVATKPKLHTPGLPRPPGCPAPLAGGAPLDPPPVQESPHPPLPAAEPASRLSSEEGEADDRDESVEKLGCHYSGRHPQPASFCTFGSRQIGRGCYVFDSRWNRLRCALSLLVEKHLNAQLWRKIPPAPSITSPVSTRAPHRTNTVPTAQGGASSLAAPTVSPSPVLLSPACVSPNGRSVPAHGTTLNAQPAASGAVDPACSAQSRHVCPSSSSPSMPSSLSSVPSSPMSRKPQKLKASKSVRPRESPGNNCQGAGGANSGSSGKKRKSGSPLLAHPFSSSASSHSMESLRKNCVAHSGPPYPSTVMSSHSVGLSCVTSKTNAVGVRHDPSGRGPPSGSPAESIKRMSVMVNSSDSTLSLGPLVHQSGELTVSAHSGFAHSHTPLDKLIGRKRKCSPGTSSVSNNSSKPTKVAKLPAVNNVHVKHAGAIPGAQGLTNSSLLHQPKARP	477400	464490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_465074_467795_468757_473853_473976_474477_474677_477203
927003	contig_13292_pilon	-	2839	1	Intergenic	novelGene_142966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGGAGCAGGGGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416011	413172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_-_413200_416000
927004	contig_1450_pilon	+	2026	3	Intergenic	novelGene_27426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886	1	116	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	132	1148	419840	423253	TRUE	70	TCTAAAAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419708	424771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_423385_424024
927005	contig_13744_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_77178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGACTATCACCCACGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	649486	651381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_649500_651400
927006	contig_18607_pilon	-	2576	6	Intergenic	novelGene_175108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGATCTTGCACCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158116	79081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_-_79339_96658_96787_99295_99446_100038_100496_100928_101769_157372
927008	contig_15114_pilon	+	695	1	Intergenic	novelGene_121245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTAGTTGCCATGGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736780	1737475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_1736800_1737500
927009	contig_5031_pilon	-	3810	1	Intergenic	novelGene_133187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	254	765	611	1375	25850	25086	NA	65	TGACAACAGTAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQQHIKEIIHHDQVGFIPAMQGWFNIRKTINVIHHINKTKHKNHMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKPKANIILNGETLKAFSLRMGTRQGCPLSPLLFNTALEVLARAVRPKKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRTLLELIEDFSKVSGHKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPFTIASEKIKYLRMNLTREIKDLYNENYRILL	26460	22650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22600_26500
927010	contig_14970_pilon	-	1039	4	Intergenic	novelGene_45043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGGGGTAGGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232250	188755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_188830_191970_192204_213683_213786_231620
927011	contig_7898_pilon	-	1678	4	Intergenic	novelGene_47633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCAGCTGCTCCGTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717958	710411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_710907_714162_714278_714403_714577_717063
927013	contig_12479_pilon	+	4423	1	Intergenic	novelGene_56836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	165	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	3453	3842	135475	135864	NA	20	GTTCTGTTGTACATAGGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNIGKNGNSRTLICAHEEPVHTSVIQTEQGDTSWFKVRKGVSQGCILSPYLFSLYAEQIIREAGLYEEERSIRLEEDSLTTCIMQMTQPCLLKVKMKHLKHLLMKTKDHSLQYGLHLNIKQKSSQLDQ	132022	136445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_132000_136400
927014	contig_5684_pilon	-	1293	1	Intergenic	novelGene_81090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCATTTTCTTCCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	513199	511906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_511900_513200
927015	contig_10042_pilon	-	2629	2	Intergenic	novelGene_79136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGGTGGCTGTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83771	81057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_82345_82429
927016	contig_10225_pilon	-	3432	3	Intergenic	novelGene_86796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCCGCTCGGCTCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40074	20684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030
927017	contig_1443_pilon	+	970	1	Intergenic	novelGene_28367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGCTTCCTAAAGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967702	968672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_967700_968700
927018	contig_14973_pilon	+	2426	1	Intergenic	novelGene_171222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATGAAAAAAAATTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177188	179614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_+_177200_179600
927019	contig_19628_pilon	-	853	2	Intergenic	novelGene_166573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25744	21378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_-_21475_24987
927020	contig_15063_pilon	-	4884	5	Intergenic	novelGene_13073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.3923048454133	62	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	4251	4568	34429	34112	FALSE	20	TCACCCGAGTTATCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSSSGEVLPPSLQKPCTENLGTWRRGFLLEQADLGAPASTILLSPLLLLTPGWEILPRAQPEEKASPLGWLRTRAPARPLGLPSETSSSSAGCPALTQAAQPA	39770	33795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34925_35033_35380_35839_36158_36264_39090_39504
927021	contig_5921_pilon	+	1060	2	Intergenic	novelGene_142243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGGCCTAAGATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177730	178861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5921_pilon_+_178704_178774
927022	contig_14640_pilon	+	2553	2	Intergenic	novelGene_168051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTATTGTGCCCACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435557	438476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14640_pilon_+_437696_438061
927023	contig_2854_pilon	+	4960	2	Intergenic	novelGene_120810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	346	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTCCAGCAACGGAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76083	81479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_80098_80533
927024	contig_6589_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_25985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACCCAGGACTGCAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1356600	1357658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1356600_1357700
927025	contig_5864_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_162778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	79	480	108934	108533	NA	50	TAGGAAAATTCACACAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPAVLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWERKMIQPFWKIIWRFLRKLEIEIPHELAIPLLGIYPRELRAVTRIDICTLMFMAALFRIAKMWKQPRYPSTDEWINKLCYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKVEDIMLSEVSQSQKDKYCMRPLL	109012	107304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_107300_109000
927026	contig_8671_pilon	+	2911	1	Intergenic	novelGene_126297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	317	622	998349	998654	NA	60	AAAAAAAAAGCATGCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSMCIVAIYVVEKGISNEEVVGLAKFNHANSGIISITKATFSNYQSFFVSNFLIPITSNYQGILTAYLINFRLQKLVKIFNFFIFGLNGWCVNLNNSRIN	998032	1000943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_998000_1000900
927027	contig_19673_pilon	-	1237	2	Intergenic	novelGene_179069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	102	788	58919	4264	FALSE	25	AGCCCTCAGGCAGGACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLFIFSSCLSAFCLSSWKIPKNTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGENRKHREDH	59020	3814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19673_pilon_-_4740_58708
927028	contig_10017_pilon	+	608	1	Intergenic	novelGene_157002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGGGGGTTTGACACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374206	374814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10017_pilon_+_374200_374800
927029	contig_9848_pilon	-	1407	1	Intergenic	novelGene_79976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	94	345	119196	118945	NA	55	AGTAAAAGAGCTGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSSLSYCGVLCVAVILEAIPSVFQIPAGSPMVDRFQLSFQAKTDFEKGPGSLLLKKFASENLMNSSRTLSGIMPGDESLRLEGTGKELPPQSRVNFNDMDEVKLSGPSFAEVA	119289	117882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_-_117900_119300
927030	contig_16156_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_137098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTATGTTGAGGTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722904	720933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_720900_722900
927031	contig_9177_pilon	-	1237	1	Intergenic	novelGene_32727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATACAAAGACCTGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638786	637549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_637500_638800
927032	contig_18096_pilon	+	2390	3	Intergenic	novelGene_58064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.5	17	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCATAGACTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131012	135067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_131075_132670_133532_133600
927033	contig_8322_pilon	+	2195	1	Intergenic	novelGene_143225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAGAAAGAAAAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179704	181899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_179700_181900
927034	contig_3832_pilon	-	3156	1	Intergenic	novelGene_161485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGATATAATTAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	483739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_483700_486900
927035	contig_7146_pilon	+	2028	1	Intergenic	novelGene_162052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGCATAATTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131452	133480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_131500_133500
927036	contig_10734_pilon	-	2897	1	Intergenic	novelGene_51385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGAATTTTGCCGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1893999	1891102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1891100_1894000
927037	contig_10627_pilon	-	3638	1	Intergenic	novelGene_60018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	876	1427	388459	387908	NA	35	CTGTGGAAAATATTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAQLDIHLQKIETRPTPCTKMNSKWIKDLNIKYKTIKIMEKKIQTMLEALIHGTNRIQTISNSTQTPEEKPDNWELLKVKQLCSSKGFTKRVKRQPTDWEKIFGCKKSNQGLISKIYKILQNLDNTKTNNPIEKWAKAMNRHFTKEDIQAANRYMRKCSQSLAIREMQIRTTVRYHLTPQG	389334	385696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_-_385700_389300
927038	contig_10444_pilon	-	1741	1	Intergenic	novelGene_139473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTGTCTACCTAGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890233	888492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_-_888500_890200
927039	contig_14005_pilon	-	3491	1	Intergenic	novelGene_154725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2273	2761	5637	5149	NA	5	CTAGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGCILSPYLFNLYTEKIIQEAGLYEEEHGIRIGGRLINNMRYADDTTVLVENEEETLTDEDRRLQPSVWITPQHKENILTTRPVSNITINGEKIEVVKDFILLGSTINAHGSSSQEIKRHIALGKSAAKGFFKVLKCKDVTLRTKVCLTQTMVFSITSHA	7909	4418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14005_pilon_-_4400_7900
927040	contig_9982_pilon	+	4052	1	Intergenic	novelGene_55714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGGACCTGAGGCCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218278	222330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_218300_222300
927041	contig_6446_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_149274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTACTTTCTGTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836226	837773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_836200_837800
927042	contig_5799_pilon	+	3738	1	Intergenic	novelGene_50264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231275	235013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_+_231300_235000
927043	contig_14333_pilon	+	1395	1	Intergenic	novelGene_49078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAAATTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242963	244358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14333_pilon_+_243000_244400
927044	contig_15105_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_150928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	630	962	217223	217555	NA	60	AGACAAGGAGAAAGACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNWQKLWDRYIYNEDQKKGSCRGCLYTTKHLMEFGSLACRFSVMIPWGIPVNWPNNVFSASVLPPSSLHSTWGLKSLQAAIQCMTIGLCSPGATEEGESGIGGEYGMCG	216593	218830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_216600_218800
927045	contig_12485_pilon	-	846	1	Intergenic	novelGene_147296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	185	571	763884	763498	NA	30	CAATGGGCACTACTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQDASVGPNPPGIKENEEHQRHKESISPRDRKGHINQRLPQPETRRTRWCPATTNDCPDREHNREPQMEQEKGGVQNSNSGKKTRLNGLTETGGTPSAVAPRRLVNPELKPFPRPALQTKIRLVCGT	764068	763222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12485_pilon_-_763200_764100
927046	contig_5821_pilon	+	370	2	Intergenic	novelGene_179009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAGAAAGGAAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58849	121853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5821_pilon_+_58996_121629
927047	contig_9995_pilon	+	2186	1	Intergenic	novelGene_47735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGATGAAAAAAAAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522462	524648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_522500_524600
927049	contig_8145_pilon	+	2238	1	Intergenic	novelGene_118669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGGACATGTTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884361	886599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_884400_886600
927050	contig_2867_pilon	+	1673	2	Intergenic	novelGene_135149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	81	560	423610	424138	FALSE	45	AATGGCTTAACCGAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATQNSQTILTIMGFIRKVTGYNSGSGTLRIQFFNQDSLFSAIPAGTPLSGPLASALLGQVLQSSLSSTKCPEVPHSQQASCPKALSFLTLLGSAAAFSLSLLLTVSGVTALCLCLCLLGLGGSQRRNPGPRGRIPPIPGSSSLVTMRLPCLCFGIGSL	423529	425251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_423882_423930
927051	contig_10019_pilon	-	545	1	Intergenic	novelGene_86671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTTTTCTATAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251815	251270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10019_pilon_-_251300_251800
927052	contig_4931_pilon	+	3284	1	Intergenic	novelGene_138353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTAGTTTTTTGGATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181996	185280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_+_182000_185300
927053	contig_2550_pilon	+	2666	1	Intergenic	novelGene_135646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	434	859	543631	544056	NA	85	CAACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQRPRKAPEESMSPQFLFRDEETEGQHRDLSKDIQSLAHSTDRHVWVPTLCQVPWQARGPVSILNGTPCNQALQPSVTTAVHTQGVETLGKGCTIWGCGVFPEDREPGAGTSGRGHSMCKALEARRVQQWAVGQRPEQQ	543197	545863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_543200_545900
927054	contig_19790_pilon	+	1392	1	Intergenic	novelGene_109494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGTGTCTATTCATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56160	57552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19790_pilon_+_56200_57600
927055	contig_4759_pilon	-	5338	2	Intergenic	novelGene_106321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	143	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAAAAGCTTACTTCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493003	486455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_491621_492830
927056	contig_11512_pilon	-	2452	4	Intergenic	novelGene_43289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	321.026478658693	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409471	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368171_368470_368522_396123_396210_409314
927057	contig_12079_pilon	+	2937	6	Intergenic	novelGene_67504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	450	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGGGCGTGGAACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860594	868565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864700_866538_866649_867246_867409_868245
927058	contig_610_pilon	+	1600	3	Intergenic	novelGene_76791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	118	junction_1	119	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	31	840	296008	306570	FALSE	15	TCTCCACTCGGCATCCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGSPLSLIFMSLLCQLTGSTASRDLEELVGALGGSVTFPLNSSVKQIGSIVWIFNTTLLTLQPQEPNKSAVMIVTQSHKKERVSFPNRGYSLTLSKLQKNDSGIYRVEIHSLFQQRPFTQEYVLRVYEHLSKPKVTMGLQKKKNGTCMTNLTCSMEQGGEDVTYSWKTANESHDGSILPISWTLGEKNMTFICMARNPISRNFSNPISSWNLCEGAALPSLQEPLVARRFRPLVPMGTLFMQKLEATRKLPGWEEGGSCSNIRVIFPS	295977	307330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_296063_304532_304863_306145
927059	contig_10042_pilon	+	2040	1	Intergenic	novelGene_79169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	53	1039	733820	734806	NA	50	AAAAAAGGTTGAGAATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYITPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITIKAQNSIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLAPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLKIDISFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAERWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMKYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSELSQSQKDKYCMRSLL	733767	735807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_733800_735800
927060	contig_9828_pilon	+	2052	11	Intergenic	novelGene_172255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.17557337438788	3	69	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	293	409	193673	195967	TRUE	40	TCGTAACAGGTGTACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLHEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGGGGGGFFESFKSSGAAASPWMPWG	191203	206021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_+_191274_192169_192242_192833_192921_193609_193748_195925_196054_199517_199628_200728_200844_202644_202769_203713_203817_204237_204373_205051
927061	contig_6616_pilon	-	889	1	Intergenic	novelGene_141758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTCTCTACCATACGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301882	300993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6616_pilon_-_301000_301900
927062	contig_12605_pilon	+	1019	5	Intergenic	novelGene_64211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1820.46608043105	6	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	375	1019	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3877	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6124
927063	scaffold_9100_pilon	-	1930	4	Intergenic	novelGene_83313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_3	29.0631496343164	7	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	437	847	843636	835891	FALSE	50	TTCAATAAAGATGGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEFDCDSLRRLLGKYKFRDLTVEELKNVNMFYPHFRYSVDTYIFKDSSQKDLLNFTGTIPVMYQGNTYNIPIRLWILDSHPFAPPICFLKPTANMGISVGKHVDAQGRIYLPYLQNWSHVRSVWVLKKFIFLHMYL	844072	834807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_836109_839094_839161_841667_841753_843594
927064	contig_15092_pilon	+	2057	3	Intergenic	novelGene_57805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	6	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	55	621	325159	351165	FALSE	10	TTTTTTTTCGGTGAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	325104	352601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
927065	contig_7594_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_55442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTTCTAAGCTCCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549530	551765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7594_pilon_+_549500_551800
927066	contig_3095_pilon	-	1227	5	Intergenic	novelGene_75017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAGAAAAGAGATCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152237	147177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150695_150995_151160_151846
927067	contig_5551_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_134276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1515	1865	761407	761057	NA	80	AATAGAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKKREKVAAEAAYVQTNTSWDLLPWFVGLGSWFHGTYQLIGLITCLVLLFYLLVKSRIWNGLLIVSMNNCHLYHETRRTGWCPVIITEDFDQGFYSGILIKRGKIQNRILNSHGL	762921	760668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_760700_762900
927068	contig_9833_pilon	+	567	1	Intergenic	novelGene_68575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGAGACTCCCCTTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403195	403762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_403200_403800
927069	contig_11505_pilon	+	2155	1	Intergenic	novelGene_140936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	51	494	303540	303983	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERNTARSCVILTIITMFELTVAAYYVNPSYPGSSSFSLIFYFTKHDVLLQGLVPNNTSKVCAMKSRHSSFQGAIWRISSKTDFFWQFKVHPIFSADTTNSKVSILLQSSLLIIQLSHVYETTENTMVWVRCTFVLKVTSLLFNTLKRSFAADLPNAIRCLIS	303489	305644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_303500_305600
927070	contig_12540_pilon	-	1461	1	Intergenic	novelGene_148072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAGAAGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345747	344286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_-_344300_345700
927071	contig_5423_pilon	-	2306	12	Intergenic	novelGene_85282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	230.862020971993	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	161	1150	590431	565326	TRUE	50	TACATTTAAAAATGCATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLRLLVLAVLALEQGVAGPTETVGNSSEGLLEFSLGKFRYFKLNKPFPEEAVLRDISSNATFLIFQIHSQYQNTTVSFSKTLLPSTSGTGTDKGLVFILRPEQSMCTWYLEAADAEPVQSMAVPLSYSERDPVPGGCNLEFDLDIDPNIYLEYNFFEISIKFAPANLGYARGTDPPPCDVGMGQDSRWRLRYDVYQYFLPENDLTEQVLLKHLQRMVEVPQVKANAIKVVTLTANDKTSIYFSSLRVQGVIYNVIVWDPLLNTSAAYVPVHTYAWKSIYQSVLHCLCPAWSLHLFLWTQILENRIILHRFHLHGILLLYTDYKTDTY	590591	558300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569118_569259_573063_573236_574172_574294_576973_577125_579789_579945_590340
927072	contig_17144_pilon	+	2718	2	Intergenic	novelGene_29148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCGAGGAAGAGCATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89797	180075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_90225_177784
927073	contig_4754_pilon	-	3520	1	Intergenic	novelGene_35882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	666	1178	35069	34557	NA	50	ATAGACAACACTTAGAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRRAIPSNSLHHRTPLSPLRTGLLLASSWHSGLSPLGLSVTALSKARASAISKGRPAWYHTAVCFARTSTCTASDCGCSLFMGHSTLLATFCQVPNYPPWADLPTVDVYWSYGFCCSYCCCHFSAAQLSCACHHFSAAEPPSGPLVIFSVTVLDSYHSSLRKFSPLSLS	35734	32214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_32200_35700
927074	contig_11047_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_173950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGGAAAGAAAGAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23455	25642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11047_pilon_+_23500_25600
927075	contig_4884_pilon	-	1940	1	Intergenic	novelGene_63806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAAAAAAAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270104	268164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_268200_270100
927076	contig_9683_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_151269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCAGCATACAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94402	95146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9683_pilon_+_94400_95100
927077	contig_1725_pilon	+	2049	17	Intergenic	novelGene_24301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	569.816362962665	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	637	1908	247068	255543	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	218517	255684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245332_246635_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
927079	contig_11126_pilon	-	1814	1	Intergenic	novelGene_138129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	756	1064	331591	331283	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNDTCSLSLSCTGISVLFYVSVEFLSHDLVGYLCSVQNSTRLTAKTREGWGRGETQETIAGTQVLHDEPLGAPVFKKPHLKGLKQKQKQHNHGLREHLAQLA	332346	330532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11126_pilon_-_330500_332300
927080	contig_9438_pilon	-	1830	1	Intergenic	novelGene_154270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	560	883	290135	289812	NA	20	CCTGAGACTATCGTCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKTLWRFLKKLEIEASYDPAIPRLGIHPRELIKETQTDICTPMFTAALFTKAKKWKQYKCPSTDEWISKMWYIRIMEHYAAIKNNGKCTKHKMDGSVGHNAK	290694	288864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_-_288900_290700
927081	contig_11160_pilon	-	224	1	Intergenic	novelGene_168842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCAGAGTTCGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320875	320651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_-_320700_320900
927082	contig_6544_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_142075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48278	50334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_+_48300_50300
927083	contig_2710_pilon	-	2233	1	Intergenic	novelGene_161782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTCTTTATAGGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952697	950464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_-_950500_952700
927085	contig_7045_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_77440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTGTCTCATTTATTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279629	278864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_278900_279600
927086	contig_9484_pilon	-	1785	1	Intergenic	novelGene_105602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGAGCTGTAAACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68692	66907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_66900_68700
927087	contig_11630_pilon	-	2454	1	Intergenic	novelGene_147179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTCTTTGTTGTAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113212	110758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11630_pilon_-_110800_113200
927088	contig_11505_pilon	-	4593	2	Intergenic	novelGene_140916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	119	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	3712	4179	39851	39384	FALSE	45	GGATATCATACATGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEITSHEGNANPKHQIIKNEIIKNEMECININTLGISELKWTGIGHFESDSRMVCYARNDNLKKNGVEFIVRKNISRSVLKYNAVSDRIISSRLQGRPVNMTIIQIYAPTSKAKDEGIEEFYQLLQSKIDQTCNQDSLIVTGDWNAKVGNKKDQ	43633	38969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_43446_43516
927089	contig_16125_pilon	-	1707	15	Intergenic	novelGene_155241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1199.94723736045	1	100	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	490	1620	155583	117579	FALSE	20	TCTACTTATTACCATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGSTLQVEEKSNSWSWGILKMLKGKDDKKKSIREKSKVSDSDNNEGSSFVFLLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKLTARSMMILLMIASMTMTSILI	236101	117491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_135004_135168_135630_135731_138906_138991_143589_143728_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179591_235796
927090	contig_5479_pilon	-	2518	1	Intergenic	novelGene_133571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117866	115348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_-_115300_117900
927091	contig_8853_pilon	-	2446	2	Intergenic	novelGene_159160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	384	2062	2445	16827	16444	FALSE	35	GTAAAATTTTGCTGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDSGSIKRRQKEYTESLYQKELVDVQPFQKTAYDQELIILKEEVQAALEALVKNKSPGIDKVAIEMFQQRDVVVELLTHLCQEIWKTATWPTNWKRSTFAPIPKKRDSKECRNYRTISLISHT	132435	16442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8853_pilon_-_18086_131632
927092	contig_11088_pilon	+	2984	2	Intergenic	novelGene_85019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	239	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1824	2873	7891	8940	FALSE	40	CAACATCAAAATTTTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	5988	9051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_7588_7666
927093	contig_6445_pilon	-	1313	12	Intergenic	novelGene_76948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	657.073464073906	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	393	1091	74005	43105	FALSE	50	AAAAAAGATACATTAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88208	42882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74035_80449_80562_85287_85477_88146
927094	contig_8581_pilon	-	2317	12	Intergenic	novelGene_22810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	528.221106346654	23	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	120	1802	329972	306855	FALSE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRRLDHSA	339373	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_306865_308963_309147_312483_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264
927095	contig_160_pilon	+	1503	1	Intergenic	novelGene_156315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29555	31058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_160_pilon_+_29600_31100
927096	contig_9485_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_103111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACAAAATATATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216585	215136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9485_pilon_-_215100_216600
927097	contig_10339_pilon	-	2995	3	Intergenic	novelGene_125256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2115	2477	326647	216943	FALSE	65	TGAAAAAGATGAAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGSSQNEESRNFPAEENFLELQEAEYKRLIYRTLREIRKEIKQNAEHAIEKIKKIREEHSDKFNRLQESTERQQSEIQRINNKISESDNSIESHLQMRVSKTKLRLLSRNYAGKKAMG	328761	216424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10339_pilon_-_217022_217452_217562_326472
927098	contig_6031_pilon	-	1420	7	Intergenic	novelGene_56752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	777.446175343062	16	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	80	916	257588	254965	FALSE	10	TTGCCCTGATGACTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLAASYTARKRAARGRAHLWSDGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFQNNLQQTPLHLAVITNQPEIAQVLLGAGCDPELRDFRGNTPLHLACEQGCLASVGVLTQNCPTQHLHSILQATNYNGHTCLHLASIHGYLGIVEHLVSLGADVNAQEPCNGRTALHLAVDLQNPDLVSLLLKCGADVNRVTYQGYSPYQLTWGRPSTRIQQQLGQLTPENLQRLPESEDEESYDTESEFTEDELPYDDCVLGGQRLAL	257784	254460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255656_255778_255868_256163_256375_256704_256814_257469_257602_257718
927099	contig_8687_pilon	-	1658	1	Intergenic	novelGene_169664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATGACTCTCAATAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255574	253916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8687_pilon_-_253900_255600
927100	contig_7843_pilon	-	3436	2	Intergenic	novelGene_152038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	0	44	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAGAAAAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350698	346768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_350177_350670
927101	contig_5676_pilon	+	4197	4	Intergenic	novelGene_159086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2238	2543	217775	221176	TRUE	25	GCATCAATTGGTCCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDCAIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHMDTTLFRENSGKRTKKNEETLRVMWDPIKSKNFQVIGIPEGEKTENTETYKNHLDSYTPIRRTMKRKSGKQYHLY	166704	335972	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5676_pilon_+_168459_217291_217997_221092_221505_334646
927102	contig_5041_pilon	-	2761	1	Intergenic	novelGene_27047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	471	887	488701	488285	NA	35	CTTTCCAAAGTATACTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGRIMVVKPRGTRNYLHLRFYRAKRGSWLYAFLQYLEEIIFTYPGQSQEKTYVQKAPDSGQLTVWEGKIACWEGKSLHSCFTSKCKTWSGRKSSLKKPFQTRPASHRPFFAIRTSYVALILSYTNTDTIFSLTSYLL	489171	486410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_486400_489200
927103	contig_14970_pilon	-	1927	9	Intergenic	novelGene_44936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1356	1670	188827	177322	TRUE	15	GCCTCGGAAGTTGGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232250	136009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
927105	contig_1150_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_61391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	47	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309927	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
927106	contig_15775_pilon	+	670	2	Intergenic	novelGene_148373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTTACCACATGTAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3947	6202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15775_pilon_+_4209_5793
927107	contig_12765_pilon	+	858	1	Intergenic	novelGene_106563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCCTGTTCTCTTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143238	144096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_143200_144100
927108	contig_2332_pilon	+	773	8	Intergenic	novelGene_58665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	141	junction_1	2796.64659978368	39099	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	102	680	331257	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVELSLLGKKKKRLRVDKWWGNRKELATVRTICSHVQNMIKGVTLGFRYKMRSVYAHFPINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	330769	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_330870_331255_331303_331377_331494_332053_332150_332914_333048_333846_333928_334162_334280_334756
927109	contig_8507_pilon	+	362	1	Intergenic	novelGene_179124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTTTGGCTATGTGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4574	4936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8507_pilon_+_4600_4900
927110	contig_13542_pilon	+	1348	7	Intergenic	novelGene_131518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1119.17553980101	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	205	627	464711	505589	FALSE	80	AAAAACAACCAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTSIETCILKAASHLSTSGIWIMALLDGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC	453991	506310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13542_pilon_+_454107_464621_464736_487359_487421_487917_488024_499871_499938_500886_500964_505501
927111	SIRV7	-	838	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	29	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147923	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114941_147625
927112	scaffold_13505_pilon	-	1490	7	Intergenic	novelGene_111532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	530.757556077474	2	41	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	2	940	607284	590218	TRUE	5	CCTCATTTTCTCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLLIFWSPPIAAHLTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGLAARVTLDISSP	607285	588572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589236_589354_590155_590259_596976_597232_597627_597907_601873_602181_607227
927113	contig_6102_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_32295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAAATTTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1481275	1482805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_1481300_1482800
927114	contig_233_pilon	-	2180	12	Intergenic	novelGene_14570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1422.45958562178	3	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	304	1740	104176	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126993	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104324_109914_109976_126898
927115	contig_15063_pilon	+	1606	5	Intergenic	novelGene_10153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3789.50995347683	5	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	15	GCCTTTGCCTGCAGACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
927116	contig_12402_pilon	-	1880	1	Intergenic	novelGene_133364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCATACCATCCTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556817	554937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_554900_556800
927117	contig_13888_pilon	+	2832	5	Intergenic	novelGene_151798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTAAAGGAAGTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338484	444725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_339351_342666_343295_427321_427674_428188_428997_444547
927119	contig_11163_pilon	-	4048	1	Intergenic	novelGene_153055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	235	708	1474	2181	89704	88997	NA	35	AGTAAGTTCTTTACCTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPNQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKKKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYVDQWNRIEIPDVNPSTYSHLIFDKSSKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISLCKKMQQDPYLTPYTKTSSKWIKDLNIKPKTIKFIEVKIGPTLQALIHGINRIQTTTISAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTD	91177	87129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_-_87100_91200
927120	contig_11794_pilon	+	3904	3	Intergenic	novelGene_173198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	165	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	3141	3866	100077	100802	FALSE	70	AAAACAATAGAAAGAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITVINIHAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDVNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVESNNRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTDLNQIERTAKKSPQPPEERK	96407	100840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11794_pilon_+_96940_97206_99032_99293
927121	contig_8330_pilon	-	4952	3	Intergenic	novelGene_71882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	685	1086	1064973	1064572	TRUE	15	TGGAGAGGACTTCCCCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVFMAGQKSRGLLRSQARMTQVCKGGLGRVSCVLCLPPLTSHSKSYLLPWALQPAAPAMDLECGELPACRELPHIPLGVEAVSPHPSLPPHRHHRRWSTNTQLASSKQIFPPRLIGLLLHSGLTPLRQKQPW	1066097	1059829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1060048_1060923_1065073_1065512
927122	contig_10658_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_130094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTTGTGATATACGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417879	418437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_+_417900_418400
927123	contig_2636_pilon	-	542	3	Intergenic	novelGene_52051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	72.5	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTAAGTGTGATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85677	46690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_46955_62471_62624_85551
927125	contig_1146_pilon	+	1799	3	Intergenic	novelGene_84809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	245	592	340209	340556	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINRENIEVVKDFILLGSTINPHGSSRQEIKRHVALGKSAAKDLFKVLKRKAVTLRTKACLIQAMAFSIASYACESCPMNKENGRRIDVFESWCWQRISNIHTMDCLLEERTNLS	339964	345024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1146_pilon_+_341279_344102_344357_344793
927126	contig_2419_pilon	+	4622	2	Intergenic	novelGene_137121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1318	junction_1	0	49	151	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	218	589	116002	169860	FALSE	50	TGACACCATATAACAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMADAKQKRNEQLKRWIGSETDLEPPVVKRQKTKVKFDDGAVFLAACSSGDTDEVLKLLHRGADINYANVDGLTALHQACIDDNVDMVKFLVENGANINQPDNEGWIPLHAAASCGYLDIAE	115784	173893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_116239_169725
927127	contig_4091_pilon	-	3713	1	Intergenic	novelGene_172995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	2629	3075	11776	11330	NA	15	CCTCTGGCACCTGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASQRGSLFATQHRLAKKGSQLKKRKRKQTINSKETNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTQTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVIGKEEIKTSRKKSNTSSQQIALREPASVGWWNPSSWCFSDKRLCPWEAEEAEWG	14404	10691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_10700_14400
927128	contig_5020_pilon	+	2183	6	Intergenic	novelGene_27841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	1027.81729893985	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1567	1869	124540	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123247_124428_124547_124909_125091_125657
927129	contig_7045_pilon	-	3534	1	Intergenic	novelGene_77489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	747	1049	557442	557140	NA	15	GGGGACTCTGGGGCAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSLLSTSKVVSSAYRRLLRSHPPILMPHSSYSPASVIICSTYRLNKYGERIRTPILILNYTISPCSVRMTACWSVYRFHMSTIKCFGISIIQNVHNLL	558188	554654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_554700_558200
927130	contig_19558_pilon	+	918	1	Intergenic	novelGene_164749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGACAGGGGCCTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148793	149711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_148800_149700
927131	contig_13592_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_33719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACTATGAAAAAGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259800	257585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_257884_258017
927132	contig_5013_pilon	-	1687	1	Intergenic	novelGene_110075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGGAAAAATCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21332	19645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_19600_21300
927133	contig_21083_pilon	-	2166	1	Intergenic	novelGene_58018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTCTCTCCAGACTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28772	26606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_-_26600_28800
927134	contig_2043_pilon	-	2395	1	Intergenic	novelGene_169926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTCTAACTGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	799982	797587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_797600_8e+05
927135	contig_3382_pilon	+	2726	1	Intergenic	novelGene_124230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	729	1145	1950964	1951380	NA	75	AAAAATTAAAAAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSTCEQLIFDKGPKSVNWGRDNLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKAKTIKIMEEKIGTMLGALMCGINTMRTVSNNAQAPEERLDKRALLKIKHLMLIKRLHQKSQKTTYRLGRKFWLR	1950235	1952961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_1950200_1953000
927136	contig_7876_pilon	+	1363	2	Intergenic	novelGene_144841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTCGGTCCCAGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5637	7106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_6531_6636
927137	contig_13365_pilon	-	3150	4	Intergenic	novelGene_168081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	124	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGGAAGAAGATGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28532	21324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_-_22096_23055_23799_25945_26231_27181
927138	contig_13460_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_162198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389787	388611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_-_388600_389800
927139	contig_2100_pilon	-	1382	11	Intergenic	novelGene_50673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	876.208200144235	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	79	858	1182812	1172388	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEAPAQSEPDRFRDRVSSGVQAGPVQRVGRHGVSSFWGD	1185489	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173222_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
927140	contig_7962_pilon	+	2122	1	Intergenic	novelGene_149284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTTGCACTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87559	89681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_87600_89700
927142	contig_3747_pilon	+	1800	4	Intergenic	novelGene_24745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4715.0061152311	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	336	791	201313	204173	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVFVEEIL	200977	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202419_204149
927143	contig_8571_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_169177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTTGATTGGTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	437397	436145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_436100_437400
927144	contig_17144_pilon	-	1707	11	Intergenic	novelGene_29466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2169.32174884225	1	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	302	1630	179764	166152	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183409	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
927145	contig_3975_pilon	+	3362	13	Intergenic	novelGene_54820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	0.276385399196283	1	138	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	2179	2847	2060191	2065055	TRUE	10	ACCCTGACTTCCTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSAIWAAMSKSLLTVSLMPGGVLRKSTRLPVLHVFRDDVDGLLGDHGIQPDQPLVLQLLHEIGLGQKGVGRHAALLQALHRHFRVPVVVPHPHLPELASPQTLHQLQRLPGNLPLVLPPRLLGFLGLAGAAQPRAQPVRSIGVMANQFMQAGESDAGGDVEAAVVQVTDLVMFHHLSLVLVEVPDRQTAHPRCSRSPGSGRSRACCPAPEAAVPRPCGSGS	2055131	2079271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2057046_2059841_2059965_2060049_2060205_2060294_2060374_2063812_2063991_2064110_2064265_2064568_2064707_2064949_2065064_2065204_2065303_2065576_2065671_2065860_2065941_2066196_2066303_2079142
927146	contig_6442_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_166476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1567	1887	46277	45957	FALSE	70	AAAAAAGAAAGAAAGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKTTEFLEEKAGALLSGLAFNNRLPNIITKAQTAKDKINKCNLIKIKNFCSSKNFIKKVKTQATDWENIFGKNISNKNLVAKMHINLQLFDNKMTNNPIKSGQRS	48028	45153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_-_46542_46726
927147	contig_3956_pilon	+	3112	16	Intergenic	novelGene_15140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1086.40744147345	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	957	2874	68	2941	1281682	1290847	FALSE	20	AGCCTACGCGACTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281614	1291018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290414_1290472
927149	contig_2550_pilon	-	1387	1	Intergenic	novelGene_135658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAAACCCTGGTGGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1009983	1008596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_-_1008600_1010000
927150	contig_2830_pilon	-	1348	1	Intergenic	novelGene_165848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGTTAATAATGCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665301	663953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2830_pilon_-_664000_665300
927151	contig_10093_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_147507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTGCCAGAAAAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83899	81953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_-_82000_83900
927152	contig_3081_pilon	-	4574	2	Intergenic	novelGene_133910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2460	2951	181718	181227	TRUE	30	GATTAGATTGTGTCATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIMSTTIKFIEEK	184177	88642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_89155_180115
927153	contig_20889_pilon	+	5987	3	Intergenic	novelGene_127641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	161	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTATATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39897	46069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20889_pilon_+_40643_40705_45863_45984
927156	contig_8798_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_143187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTTTTGAAATAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22856	24527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_22900_24500
927157	contig_9843_pilon	+	5363	3	Intergenic	novelGene_114332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	120	junction_1	6	51	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATAAAAAATACGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122745	138575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_125796_130105_130270_136426
927158	contig_13992_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_147615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1889	2194	80340	80035	NA	65	AAAAAAAAAAACAATGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHKYHSLHQTESSTTRWCPATITDCSDRDHNRGPWTELEKNVGQNSNSKKKKEDQTYWSDKDWRNPESMVPGHPYSSIMKSLLRFTLQSKIRQVHKTKQD	82228	79814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_79800_82200
927159	contig_1535_pilon	-	2457	6	Intergenic	novelGene_127254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	51	junction_5	354.938529889332	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	118	1002	134839	129144	FALSE	30	AAGTTATCTTTAATATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEVLTTDAQKLLHQLNALLEQESRCQPKVCGLRLIESAHDNGLRMSARLRDFEVKDLLSLTQFFGFDTETFSLAVNLLDRFLCKMKVQPKHLGCVGLSCFYLAVKSVEEERNVPLANDLIRISQYRFTVSDLMRMEKIVLEKVCWKVKATTAFQFLQLYYSLIQENLPFERRSSLNFERLEAQLKACHCRIIFSKAKPSVLALSIIALEIQAQKCEQLTDGVECLQKHSKINGRDLTFWQELVSKCLTEYSSNKCSKPNVQKLKWIVSGRTARQLKHSFYRITHLPTIPETVP	136005	127688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_-_129336_129570_129670_129751_129831_132498_132753_134578_134840_135888
927160	contig_11316_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_122594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	836	1348	137674	138186	NA	25	GCGGTTTACAGTACCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136838	138222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_136800_138200
927161	contig_6724_pilon	+	1756	2	Intergenic	novelGene_167961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGCTTCCAGCATCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194379	383202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_194441_381507
927162	contig_1150_pilon	-	732	3	Intergenic	novelGene_61434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25453.5	71	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311053	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309498_309812_309927_311002
927163	contig_7707_pilon	+	3120	1	Intergenic	novelGene_72182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548805	551925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_548800_551900
927164	contig_11253_pilon	-	4056	2	Intergenic	novelGene_126808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	138	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3671	4012	10572	10231	FALSE	35	GAATATACCATGGACTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKEYNLQYGLHLNIKKTRILTSGPISNIMINGEKTEVVKDFILCGSTVNTHGSSSQEIKQHVALGKSAAKDLFEVLKSKDTTLRTKVCLTQAMIFSAASYPCECWTVNKED	15024	10186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_11194_11975
927166	scaffold_12124_pilon	+	2086	11	Intergenic	novelGene_22231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3475.21769246187	3	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	272	649	1490385	1508039	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1483992_1484063_1488993_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508118_1508218
927167	contig_14666_pilon	+	704	4	Intergenic	novelGene_39625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1654.15846345573	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	82	588	479860	485115	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASIPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRHPQPILHCRHHSLLGDRRAGAGWGES	477340	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479870_484308_484725_485034
927168	contig_7919_pilon	+	2384	1	Intergenic	novelGene_28144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	109	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624952	1627336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_+_1625000_1627300
927169	contig_3155_pilon	+	1787	5	Intergenic	novelGene_26363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	6	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	78	584	258156	261211	TRUE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258078	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261679_261792
927170	contig_8843_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_156665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	73	222	98	319	127192	127413	NA	70	TCCTTAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSTRIGGRFINLIYRWHIFLAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLRLNMKETKILTARPVSDIMINGEKVEVVKISFYSDPQPTPMEAAVKKSMHCTGQMCCKRPL	127094	128126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_127100_128100
927171	contig_9366_pilon	+	3022	14	Intergenic	novelGene_166280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	189.325367224142	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	981	2943	79	3021	1052847	1087975	FALSE	45	TTCGAAATGAAGTAGCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRVQKTGEKAAPRSKKRKKDEEEKQTMYPNTDTFTHLKQLSLLPLMEPIIGVNFAHFLPYGSGQFNSGNRLLGSFGSATLEGVSDYYSQLIYKQNNLSNPPTPPASLPPTPPPLACQKMANGFATTEELAGKAGVLVSHEVTKPLGPKPFQLPFRPQDDLLARAIAQGPKTVDVPASLPTPPHNNQEELRIQDHCGDRDTPDSFVPSSSPESVVGTAVSRYPDLSLVKEEPPEPVPSPIIPILPSNTGKSSESRRNDIKTEPGTLFFTSPFGTSPNGPRSSLISVAITLHPTAAENISSVVAAFSDLLHVRIPNSYEVSNAPDIPSVGLVSSHRINPGLEYRQHLLLRGPPPASANPPRLASSYQLKQPNAPFPPTNNGVTGYKDSNHGIAEGSALRPQWCCHCKVVILGSGVRKSFKDLTFVSKDSRESFSRVEKDIVFCSNNCFILYSSTAQAKNSESKESVPSLSQSPVKEVSSKAFHQYSNNISTLDVHCLPQLQGRASPPASPPITFPPAFEAAKVEAKPDELKVTVKLKPRLRTIHSGFDDCRPLTKKWRGMKWKKWSIHIVIPKGTFKPPCEDEIDEFLKKLGTSLKPDPVPKDYRKCCFCHEEGDGLTDGPARLLNLDLDLWVHLNCALWSTEVYETQAGALINVELALRRGLQMKCVFCHKMGATSGCHRFRCTNIYHFTCAIKAQCMFFKDKTMLCPMHKPKGIHEQELSYFAVFRRVYVQRDEVRQIASIVQRGERDHTFRVGSLIFHTIGQLLPQQMQAFHSPKALYPVGYEASRLYWSTRYANRRCRYLCSIEEKDGHPVFVIRIVEQGHEDMILSDTSPKGVWDKILEPVACVRKKSEMLQLFPAYLKGEDLFGLTVSAVARIAESLPGVEACENYTFRYGRNPLMELPLAVNPTGCARSEPKMSTHVKRFVCRPHTLNSTSTSKSFQSTVTGELNAPYSKQFVHSKSSQYRKMKTEWKSNVYLARSRIQGLGLYAARDIEKHTMVIEYIGTI	1052768	1087976	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_1052886_1053579_1053742_1056334_1056477_1056623_1056772_1058327_1058507_1058657_1058795_1059692_1059943_1061253_1061394_1062003_1062112_1066166_1067287_1068529_1068667_1070014_1070150_1070421_1070599_1087906
927172	contig_12622_pilon	+	1716	9	Intergenic	novelGene_5834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	238.913393042332	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	262	1455	455010	475513	FALSE	20	AGAGGACCTTCCCCTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQQQNQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	446475	475774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_446603_454875_455251_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
927173	contig_4486_pilon	+	1955	10	Intergenic	novelGene_38608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	918.75819304317	5	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	257	715	377420	407646	TRUE	35	AATAGAGTGTGAGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLISQDEEDGDGDGAGV	360566	413475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_407603_407696_411177_411318_412424
927174	contig_5280_pilon	-	2991	9	Intergenic	novelGene_52584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4.96078370824611	24	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGCGCCTAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78543	38309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_38472_39266_39451_40882_41074_41732_41837_42906_42988_47317_47344_56216_57324_58394_59026_78038
927175	contig_9098_pilon	-	1773	11	Intergenic	novelGene_75835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	179.10499713855	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	456	1325	345261	335775	FALSE	20	TTATATCTATGGCTTCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355641	335326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355581
927176	contig_12677_pilon	-	204	1	Intergenic	novelGene_110885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAATCGGGGGAGCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3315	3111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3100_3300
927177	contig_19402_pilon	+	2277	1	Intergenic	novelGene_80807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAATATGTTTTTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60287	62564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_60300_62600
927178	contig_7416_pilon	+	2056	1	Intergenic	novelGene_134316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAATACAATAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67434	69490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_67400_69500
927179	contig_17144_pilon	-	2730	13	Intergenic	novelGene_29438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2069.63624018006	45	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	757	1623	172736	167839	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALGKGRQGLGREGCWEGTPGAPHKDSPF	179753	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173317_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
927180	contig_17144_pilon	-	1717	8	Intergenic	novelGene_29510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2427.13598754598	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	121	1647	179764	166152	FALSE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183228	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166831_173575_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
927181	contig_6488_pilon	+	1031	1	Intergenic	novelGene_44738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	659	1024	62689	63054	NA	15	TGTTTACGATATTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKWNWVKKRSLPSEIHIPEGKDSSQRVVSVHLSASSLGCHGHGIHQQILAEWTAHNYSLCFYATDTSNKEDFNKPKRKLDGKAGHRELPEGTLNSHVNRFSLSFKIELMKASKILKMTHV	62030	63061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_62000_63100
927182	contig_4364_pilon	-	1765	6	Intergenic	novelGene_641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	589	978	1532546	1531972	TRUE	25	AGACTGAGACCGACCGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPDSSYSCLLIHICWKVDSEARMEPPIQTEYLRSGGAMILIFIVLGASAVISFCILSAMPGYMVVPPDSTVLAYRSFRMSTSHFMMELKVVSWMPQDSIPKKEGWKRASGHRKRSLPMVITWPSGSS	1533134	1530453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093_1531335_1531616_1532054_1532156_1532341_1532422
927183	contig_3382_pilon	-	2268	2	Intergenic	novelGene_124045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAAAGAAAGAAGGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214816	212353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_212761_212955
927184	contig_17144_pilon	-	1576	10	Intergenic	novelGene_29453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2019.9850078896	19	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	730	1545	174965	166106	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTSQECQRLLSVSYIPGLHHPSAYVLSLWTGPPRQPAHFKNVQPHPLAFCTCFL	183237	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166265_173152_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175795_176271_179700_179786_181794_181850_183158
927186	contig_3077_pilon	+	1555	8	Intergenic	novelGene_26732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	589	junction_7	3387.00750467647	6	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	496	1062	13867	17590	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEGQGALVGGLTLDFPAGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	10122	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449
927187	contig_1143_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_86612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAACCAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253290	255053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1143_pilon_+_253300_255100
927188	contig_15687_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_129152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245066	247211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_+_245100_247200
927189	contig_2342_pilon	+	1520	2	Intergenic	novelGene_132744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTGCTCAGACATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21260	23193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_21748_22160
927190	contig_20429_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_169249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTGAAAATTGTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136316	138384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20429_pilon_+_136300_138400
927191	contig_2043_pilon	-	1247	1	Intergenic	novelGene_169922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATATCCTATCATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	756683	755436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_755400_756700
927192	contig_3018_pilon	-	1803	2	Intergenic	novelGene_78765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGATGGAAAGTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	363980	310734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_311592_363034
927193	contig_6163_pilon	+	3785	1	Intergenic	novelGene_103839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTTAGCTGTGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402348	406133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_402300_406100
927194	contig_3015_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_163318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTCAATGGTACCTAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237749	236303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_236300_237700
927195	contig_6760_pilon	-	3137	8	Intergenic	novelGene_150786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCACATATAATTGTTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151426	142249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6760_pilon_-_143207_143923_144044_144319_144764_146238_146399_147623_147738_147934_148075_149276_149455_150402
927196	contig_1263_pilon	-	1592	2	Intergenic	novelGene_170375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	981	1592	31756	10487	FALSE	50	GAGATGGAAAAACTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSIISSANRDSLTSSLPIRMRTRQGCPLSPLQFNVVMEVLARAIRQETEINSIQIGKEEVKLSLFADDMILHIENSKDCMRELLELTKRFSRVSGYKINIQKSVACLFINKKNNEKEIRKTIPFILAPKKIKCLGINLTRDVKDLFKENYKTLPQETQRDLHKWKNIPCSWIDRLNIVKMTILPKVIYKYNAIPFQIPTTFFK	32736	10486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_11035_31692
927198	contig_8049_pilon	-	753	1	Intergenic	novelGene_166868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGGACGTAGCTGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272990	272237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8049_pilon_-_272200_273000
927199	contig_12119_pilon	+	2252	1	Intergenic	novelGene_88639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAGAGAATAGAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107037	109289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_+_107000_109300
927200	contig_9189_pilon	+	2484	1	Intergenic	novelGene_165115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299005	301489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_299000_301500
927201	contig_10196_pilon	-	1625	1	Intergenic	novelGene_132049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTCTTTTTTCATAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642472	640847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_640800_642500
927203	contig_1107_pilon	-	3473	3	Intergenic	novelGene_126603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	123	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1524	1829	954233	953928	FALSE	40	TCCCTCTGAAACAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKRLHQKSKKRTYRLGKKFWTVQVRQKSNLIIYKKIQHLYNKKTKNPIKKWAKEMNRRFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTVRYHLTPALLA	960633	952283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1107_pilon_-_954265_958877_959832_960095
927204	contig_5765_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_141382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTTAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610892	609542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_-_609500_610900
927205	contig_2854_pilon	+	4600	2	Intergenic	novelGene_120792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47447	52131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_49075_49158
927206	contig_12619_pilon	+	3475	1	Intergenic	novelGene_73576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	102	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTTCAGAATTAGAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	873656	877131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12619_pilon_+_873700_877100
927208	contig_12414_pilon	-	2418	2	Intergenic	novelGene_59587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	576	908	374006	373674	TRUE	15	TGGGAGGGTCCAGGCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSLSFREDLQAGPSAHRGQRMLGRGFKLGPKEGIEDGIQATVEKGEGLGDGNPLVHSVLKFTALLDDFQEDEGVDADPNVVGQPAGEESQNENDSGLEGLALLVALGV	374581	372072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_372197_372287
927209	contig_3747_pilon	+	2882	8	Intergenic	novelGene_24766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	6	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	332	1507	201313	203804	FALSE	65	AAAATAAATAAATTTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
927210	contig_1694_pilon	-	3155	1	Intergenic	novelGene_144999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1620	1940	1711464	1711144	NA	25	GATGCTCAGATATTATGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWQEASEKSKEAEKKKATLAANKWHSESQLMRAGVSRQETVSTGSGGGRVWVKKGREWESVYHKLPALCSPSGRSKDGARSEALKRKEGEMARGKQEIKRSGKK	1713083	1709928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1709900_1713100
927212	contig_6129_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_159963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGTTTAGCAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46915	44928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_-_44900_46900
927213	contig_20615_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_146907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCAGGTGGTCCCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20093	18355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_18400_20100
927214	contig_3862_pilon	+	467	1	Intergenic	novelGene_137412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAATAAAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520715	521182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_+_520700_521200
927216	contig_8122_pilon	+	2767	1	Intergenic	novelGene_40210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCCCCGCTCATCTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360429	363196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_360400_363200
927217	contig_14441_pilon	+	2058	5	Intergenic	novelGene_100537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	16	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1445	1873	116728	117610	FALSE	15	CCTACGAGTGTCTCATTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111195	117795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112109_113209_116578_116963_117220_117344_117539
927219	contig_13021_pilon	+	3034	11	Intergenic	novelGene_8156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3156.15060635579	2	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	2095	2736	179683	180850	FALSE	35	CTGAATTAAGTGGAAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174507	181148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176460_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_179690_179985_180211_180440
927220	contig_4213_pilon	+	2030	2	Intergenic	novelGene_124776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	562	888	562	949	FALSE	70	AAACACAAAATCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVHILSYRTNYLVTGNESFKGTNNKTSTHEQPIWAYHYNNLLMTRRQQSISNHIKRQSMMASGSSQNKESIYSLEEENFLELPEAEYKRLIYRTLLEIRKEIFKM	0	2091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_680_740
927221	contig_7396_pilon	+	1923	14	Intergenic	novelGene_79611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTTCTCGTTTGCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245933	257480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246416_247186_247357_247718_247803_248184_248323_248788_249062_249736_249861_250230_250355_250851_250923_251446_251521_252397_252442_253919_253979_254604_254699_255103_255193_257383
927222	contig_15123_pilon	-	1058	1	Intergenic	novelGene_110940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAATAAAATGAATTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343117	342059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_342100_343100
927223	contig_4812_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_103687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAAATTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189225	191051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_189200_191100
927224	contig_12635_pilon	+	2451	1	Intergenic	novelGene_60845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAGAGAAATCTTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542849	545300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12635_pilon_+_542800_545300
927225	contig_5899_pilon	+	852	1	Intergenic	novelGene_146983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	481	840	269864	270223	NA	45	TTGACAGCACCTAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDQRRIHAFQLWCWRRILNTPWTAKRTNKSILEEVLSECSLEARMARLHLTYFGYVIRKDQSLEKDIMLGKVEHQQKRRPSLRWIDTVAATMGSSTTTVRMAQDWTGFILLYKRSL	269383	270235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_269400_270200
927226	contig_8793_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_178076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGCGGGGATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23857	22395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8793_pilon_-_22400_23900
927227	contig_5951_pilon	-	3225	2	Intergenic	novelGene_153237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	454	843	196353	195964	TRUE	50	TTCTACAAACAAAAGGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHRSAILDSYQRPANRGYEKAASRSFQQKTKQPVICDIRFPTPQPSSPPLDLLCFPRPQSLIREALAAWIPPANTGRLSECHSLAASVAFFRFFSFLPYLSPPPPPFAQIPGSVHHLLPEGLRSSVRV	196806	151493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5951_pilon_-_153809_195896
927228	contig_6361_pilon	+	2952	5	Intergenic	novelGene_23980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	85	429	405360	405704	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405275	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
927229	contig_10494_pilon	-	1587	2	Intergenic	novelGene_102215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	1184837	1184438	FALSE	20	TTAGGGTGTCCACAGGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGLQNCDRITFCCLKPPVCDPLLWQPRDAHTIPPGWELLVGTVGVPVLSTSVAVSPACYHRNSWWVLTQEIQRQQSSSGRDSHCTPRPTGPQSQPAPFS	1184838	1183154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1184556_1184652
927230	contig_5532_pilon	-	1963	2	Intergenic	novelGene_175865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	83	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTCCCAGCAATGGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45249	40440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5532_pilon_-_42352_45197
927231	contig_846_pilon	+	1578	7	Intergenic	novelGene_136091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	34.5092580170726	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	630	1427	81578	87857	TRUE	25	GACTGGAAGTGTGTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSAPLRSLEEEVTCSICLDYLRDPVTIDCGHVFCRSCTTEIRPVCPLCKKPFKKENIRPVWQLASLVENIERLKVDKGRQPGEGAREQQDAKLCERHQEKLHYYCEDDGKLLCVMCRESREHRPHTAILMEKAAQPHREKILNHLTTLRRDRDKIQGFQTKGDSDILAALQKLQDQKQCIVALFETSHQFLREREQHLLDQLAKLEQELTEGREKYKARGIGELARLALVISELEDKAQQPAAELMQVSTQEVLDWETHRPGS	65413	88799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_846_pilon_+_65991_81525_81998_82169_82266_83800_84032_87806_87923_88177_88211_88746
927232	contig_18934_pilon	+	3189	1	Intergenic	novelGene_175886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	209	553	116792	117136	NA	65	GTGAAATAAAGGAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPPDNMSKIHETKSCHPRFQGALWLYFFQNRFAHSFGSPWYIQYSSPTHNSKASILLQSSLFTVQLSHAYEVTEDTTAGVRHTLVLTVTSLLFNTLKRSFAADLPNAIYCLIS	116583	119772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_+_116600_119800
927235	contig_6445_pilon	-	1030	9	Intergenic	novelGene_76925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	711.973445782917	1	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	318	803	64875	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96336	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_88113_88216_88473_88594_96306
927236	contig_8447_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_69442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCATGACTGAACCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120159	117301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_117300_120200
927237	contig_15918_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_132717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCGCAATTAAAAAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48999	46690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_-_46700_49000
927238	contig_15118_pilon	+	2262	10	Intergenic	novelGene_74619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	266.583088754475	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	133	903	392523	394139	TRUE	55	AATCGAAAGAAGACGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQCDPRMAPFAHREAPARFEPGPCLLFRSSRESESDGVPSKQDSPGQLRE	392390	399279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393684_393870_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
927239	contig_16492_pilon	+	1253	10	Intergenic	novelGene_100301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_2	102.882289205182	2	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	173	1252	158066	166565	FALSE	15	TGGATGCCCGAACTTTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVLRDPIKKNSSESKPAQSGFSRGNSPLSCPESVEASPAVNEKSVYSTHNYGTTQRHGCRGLPYATIIPRSDLNGLPSPVEERCGDSPNSEGETVPTWCPCGLSQDGFLLNCDKCRGMSRGKVIRLHRRKQDNISGGDSSATESWDEELSPSTVLYTATQHTPTSITLTVNRVRRTKPKKRKKSPEKGRAAPKTKKIKAFREGSRKSLRMKNSPSEAQNLDENTTEGWENRIRLWTDQYEEAFTNQYSADVQNALEQHLHSSKEFVGKPAILDTINKTELACNNTVIGSQMQLQLGRVTRVQKHRKILRAARDLALDTLIIEYRGKVMLRQQFEVNGHFFKKPYPFVLFYSKFNGVEMC	154590	166566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_154662_157964_158158_158439_158546_158928_159081_159418_159478_159993_160182_161131_161171_164830_165074_165986_166136_166513
927240	contig_10575_pilon	-	3812	1	Intergenic	novelGene_141815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	101	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGTTCAGAGGAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310468	306656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10575_pilon_-_306700_310500
927241	contig_10042_pilon	-	402	1	Intergenic	novelGene_79157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTTACTAGTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661556	661154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_661200_661600
927242	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	818	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
927244	contig_7707_pilon	+	1886	1	Intergenic	novelGene_72171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGCATAAAAATTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	516644	518530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_516600_518500
927245	contig_6397_pilon	-	5839	1	Intergenic	novelGene_146261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	96	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	1444	2106	471903	471241	NA	40	CTTTGAATGAAAGAGATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPKEEVQATLKALAKNKASGIDEIPIEMFQQIDATLEALTCLCQEIWKTASWPTNWKRSIFMPIHKKGDPTECGNYQTMSLISHASKILLKSIQKRLQQYIKRELPEIQARFRRGRGTRDIIADVRWILAESREYRKDVYLCFIDYAKTFDCVDHNKLRMALQRMGIPEHLLVLMRNLYIGQEAVVRTEQRDTAWFKIRKGVHQDCILSPYLLVCMLSE	473346	467507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_467500_473300
927246	contig_1575_pilon	-	2357	4	Intergenic	novelGene_45190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190545	181481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_-_183485_183572_183663_185016_185122_190386
927247	contig_4891_pilon	+	2802	2	Intergenic	novelGene_124534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATACCCTATACTAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383588	386914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_386235_386758
927248	scaffold_13505_pilon	-	1626	10	Intergenic	novelGene_111541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_9	412.580527119282	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1180	1497	594063	588797	FALSE	25	CTCCCCCACCAGAAAGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEQLLKPDTNIYCQLHPKAEVAPQLPPGTAPYGLRRGATSDPKSWGKGRS	603252	588667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
927249	contig_13547_pilon	-	1060	1	Intergenic	novelGene_104896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTCCTGAAACGCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194015	192955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_193000_194000
927250	contig_408_pilon	-	2647	2	Intergenic	novelGene_84923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2329	2628	149233	148934	FALSE	45	TAGATTGTGAGAGAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCDFLMCCKLYHYDKVILMRYTRLDSVLIQSLLRYKREKQTETHGNLTLPRKQYQEQSAPFGPEVPAQRSFQTKGRLMDHKHLLPEQTERETLSLELMP	151681	148914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_150510_150629
927251	contig_5988_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_16158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1109	1429	1980196	1979876	NA	90	AAATATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNRMKEQRNTPRYMLMKFQNTLDKKQIIQSSEHKSRIYSKKCNLLKGKELKFSTHVVAVSWRRVDSDSWQPRACRVELLHRVFKAVQDCLPQQLLVGLNHQSYSQ	1981304	1978763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1978800_1981300
927252	contig_16768_pilon	-	1770	1	Intergenic	novelGene_168314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACACCACACTGTTTCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24011	22241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16768_pilon_-_22200_24000
927253	contig_7840_pilon	-	4257	1	Intergenic	novelGene_69054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATTTTATAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433055	428798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_428800_433100
927254	contig_12677_pilon	-	1209	1	Intergenic	novelGene_110790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	105	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTTAGTATTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3370	2161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_3400
927255	contig_8898_pilon	-	1451	3	Intergenic	novelGene_137250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_2	8.5	15	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	9	584	329259	323326	FALSE	35	AAGAATAATTTTGTTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRKLFALAKGECMEENPDSLMNQEVLTPGQLFLMFLKEKIEAWLVSIKIAIDKKAQKTSVSINTENLMKIFNLGTDLTRPFEYLLATGNLRSKTGLGFLQDSGLCVVADKLNFIRYLSHFRCVHRGADFAKMRTTTVRRLLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLMNHLTAVCEVVTQFVYTTSIPALLCNLGA	329267	322458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_323616_324403_324576_329145
927257	contig_17440_pilon	+	161	1	Intergenic	novelGene_7583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACACAGGCATGCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2004	2165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_2000_2200
927258	SIRV6	+	1011	8	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	337	145	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	30	3	TRUE	0	NA	NA	C	coding	162	489	93	581	1733	10736	TRUE	40	AATTCGGCTAACCAACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSCSLPYEEIAQVGRPAVAYVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPKCV	1640	11476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_1736_1845_2027_2470_2621_2743_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
927259	contig_6954_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_64417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1370	1810	57189	56749	NA	55	GTCATTAAAAAGACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNEKKQLQTSLMIGMWNVRSTNLGKLEIVRNEMECMKIDIVGISELKWTGIRHFESDSHMVCYSGNDTLKRNDITFIVKNNISRSILKYSPVSDRIISIRLQGRQLIRLLFKFIHQSLRLKMKKLKIFTNFCSLKWIKCAIKVH	58558	56261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_56300_58600
927261	contig_6724_pilon	-	786	1	Intergenic	novelGene_167976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAATAAAAAAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	357462	356676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_356700_357500
927262	contig_6885_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_83703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGAATACGGGGAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291601	293251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_291600_293300
927263	contig_9668_pilon	-	3983	1	Intergenic	novelGene_58124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2849	3283	232249	231815	NA	50	GGAAGTCAAAGAGATGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESKNFVEEENFLELPEVEYKRLIHRTLQEIRKEIKQKAQYAIQEIKKIRDEYNDKFNRLQESTERQQSENQKINNKISELDNSIESHRNRTEAMEVKICETEDKTLDTNLFEENSEKKDKKHEETLNYVGLYQDE	235097	231114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_231100_235100
927264	contig_9535_pilon	+	2482	1	Intergenic	novelGene_124465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	26	580	232602	233156	NA	85	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPLETPEAMTPAFETTEVMAIRFETEAAWLLVFLVSLASVSCGFSALGPHTSICHAGASIPELCSSTDKCLEAPQSTRKPPAHKHSAPSLCVSASLGPPISAQRHPAPPGSLLCTSTQLSCSMGWLQSQFALLSWFCWCWFSAAATSLLLLVLCCHRTSIHSVSKPLPHFRYLLEQHPTPDTRFCLSHLVLL	232576	235058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_232600_235100
927265	contig_3382_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_124016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTAAAGCGGTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135947	138327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_135900_138300
927266	contig_10766_pilon	-	3291	1	Intergenic	novelGene_151235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	103	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	890	1219	220805	220476	NA	20	CTATAGTGCCATCCCGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISAFWILMRIALWLKMWSVLENVPFTLEKNVYFAAVGWSVLHMSMRSSLLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSYTESGVLKSPTIIVELSISLFSTVRVYVF	221694	218403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_218400_221700
927267	contig_10082_pilon	-	1701	1	Intergenic	novelGene_63877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1209	1541	235246	234914	NA	65	AAGCACAGTTAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTVIPAECPVRGFEVMAITSPYVAFPFNKRLQGRCYISVPIVAGASFSLGSALGHPASCPQKWSPCGHRLFWRHRTNQELAFKLKTCAGETFVLVFITAFHISVVGVQI	236454	234753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_234800_236500
927268	contig_8045_pilon	+	1263	5	Intergenic	novelGene_35386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2266	junction_3	506.080527189103	3	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	10	600	116118	118722	FALSE	50	AATAAATTTATTTTGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGPMDKSAGSGPKSEEKREKMKRTLLKDWKARLSYFLQNSSTPGKPKTSKKSKQQTFIKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFCEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENNAYPRFLESEFYQDLCRKPQITTEPHAT	116108	119385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_116183_117246_117349_117450_117513_118075_118243_118527
927269	contig_6102_pilon	+	1428	2	Intergenic	novelGene_32033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGTGTGGCCCTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535804	537817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_537185_537769
927270	contig_151_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_132564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTAGGATGGCTAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191007	191909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_191000_191900
927271	contig_3948_pilon	+	3710	5	Intergenic	novelGene_53288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	164	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	44	511	1422614	1424054	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGLCPGGSFLAPHQMPGGGLGYLHRRLLSSTGGLLECGTDGQQKIHQTPSHEHEEEAGRGHERSPAGGRQHAKHGHNYDNEDHTEELNARAQQGAEDHGVLGWPEDITMHQLPSRLFHGVFLQQRAGVNVVLRGGGRSCRHHPQTGAKGPSSVNQPLSEQSENTGMSVI	1422570	1428860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1422720_1422798_1422883_1423776_1425383_1426895_1427004_1427097
927272	contig_1210_pilon	+	407	1	Intergenic	novelGene_171520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAAAATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287079	287486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_+_287100_287500
927273	contig_15732_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_88871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATACAATTTCTAGAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129199	130497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_129200_130500
927274	contig_4924_pilon	+	2696	1	Intergenic	novelGene_84780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGCTCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447136	449832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_447100_449800
927275	contig_5896_pilon	+	1949	1	Intergenic	novelGene_159235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87361	89310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5896_pilon_+_87400_89300
927277	contig_16576_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_179125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGACTGTCTTTTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4108	6311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16576_pilon_+_4100_6300
927278	contig_9609_pilon	+	2014	11	Intergenic	novelGene_23042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	914.627798615371	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	59	1075	435659	454609	TRUE	70	GAAAGAAAAAAAATACCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRGGPAAGAEWAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMNNLQIKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	435499	456262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_435537_435637_435726_449845_449889_450162_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282_455928_455992
927279	contig_16211_pilon	-	2162	8	Intergenic	novelGene_150063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_2	271.596789978325	1	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	100	1038	121247	86220	TRUE	60	ACGTGAAAAAGAAAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSGGGFSLGLGFGLTPTAVIQVTNLSSAVTSEQMRTLFSFLGEIEELRLYPPDNAPLAFSSKVCYVKFRDPSSVGVAQHLTNTVFIDRALIVVPCAEGKIPEESKALSLLAPAPTMTSLMPGAGLLPIPTPNPLTTLGVSLSSLGAIPAAALDPNITTLGEIPQPPLMGNVDPSKIDEIRRTVYVGNLNSQTTTADQLLEFFKQVGEVKFVRMAGDETQPTRFAFVEFADQNSVPRALAFNGVMFGDRPLKINHSNNAIVKPPEMTPQAAAKELEEVMKRVREAQSFISAAIEPGKAISCYIGLRLKIIEA	121346	79898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_80001_80384_80499_85311_86404_87605_87785_87912_88078_91745_91862_97474_97609_121086
927280	contig_10753_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_105135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83147	84967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_+_83100_85000
927281	contig_20634_pilon	+	1454	1	Intergenic	novelGene_173429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATGTGCCTCTTAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238871	240325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20634_pilon_+_238900_240300
927282	contig_13331_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_178778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGCTTTGATGGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131	1547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13331_pilon_+_1100_1500
927283	contig_6842_pilon	-	3617	2	Intergenic	novelGene_130809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3031	3330	1681364	1681065	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESGTARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKRMAPRHPFISVVKSLLRFTIQPGSGQPHKIKRD	1684573	1680777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1683902_1684080
927284	contig_8594_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_140025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	215	634	313152	309395	FALSE	25	ATGATTCCCACATACTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSDIWLGPAQGQPYRIPGSLFFRYKSEMSTVSWRNFRSRKIPVFLDQEVHRKVPRETTEGRCLLTVSSDGIVDLGDVRCDVRHSSIIEPIDPYSGVPFNHISIQVMKCSSDMLKRTRLTGKNCRFNHFAHLPTPDYGK	313486	309082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_309679_310396_310499_313118_313292_313411
927285	contig_9144_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_151139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGCTAAAAACATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617700	619509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9144_pilon_+_617700_619500
927286	contig_11115_pilon	+	664	3	Intergenic	novelGene_102842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	715	4	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	410	574	173077	173241	FALSE	15	GTCTGTGGCTTAATTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRGGGACLHSALLRTDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165618	173331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_173005
927287	contig_6137_pilon	+	3374	2	Intergenic	novelGene_59267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCAGCTTTGTCAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1329165	1332676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1329471_1329607
927288	contig_3095_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_75006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	65	829	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147176	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
927289	contig_5918_pilon	-	989	2	Intergenic	novelGene_99584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	26	349	1938350	1938027	TRUE	15	GCTCTATGTGGGTAGGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTGPISNIMRNGEKMEVVKDFILLGSTINTHGNSSQKIKRHIAFGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLAQPMVFSVASYACENWTMKKEDRRRMDAFELWCWRRILNIPWTAKE	1938375	1935500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_1935959_1937844
927290	contig_17753_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_105116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	132	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1033	1359	146777	146451	NA	15	TCACTTCCATTATCTGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIIRILSTCCLVSIFDALFARSWNVPRSPARTACLIMPDKARVSRGINLKTFFPAQIPLQSQTLQIPKGGESRAWGRRGPQGCEAGVGFAAGGSSSMKPGPRPARGH	147809	145732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_-_145700_147800
927291	contig_5686_pilon	+	2003	1	Intergenic	novelGene_45202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1339	1716	57824	58201	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGMLKSTIMIVELSISLFSAVRTAKAVLRGKFIAIDAYIKKEELDKIKTLTTQLEQIEREQQKRPTATRRWEIIKIRAEVNEIENRKIIERINKTKS	56485	58488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_56500_58500
927292	contig_13740_pilon	-	1487	9	Intergenic	novelGene_34701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4902.67847074433	4	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	98	778	165243	158787	TRUE	45	AAAAAATGCCTTTGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSARTSPVRVRPRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGIESIK	165340	157082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158276_158394_158647_158810_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
927293	contig_4213_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_124779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAATACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_0_2100
927296	SIRV7	-	871	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-15	-21	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTATCAGAGCATTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	56058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
927297	contig_15264_pilon	-	1500	1	Intergenic	novelGene_158875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATATTGCATTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112552	111052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_111100_112600
927298	contig_11052_pilon	+	753	4	Intergenic	novelGene_115454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2387.66389780658	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	49	381	102902	106441	TRUE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQVDRVWGELLLGCGDWTNRMYQVPAQLGHLSLP	102799	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_102821_102874_103140_106346_106461_107445
927299	contig_11396_pilon	-	2687	1	Intergenic	novelGene_71343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	489616	486929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_486900_489600
927300	contig_2438_pilon	-	1243	5	Intergenic	novelGene_112043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.66025403784439	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGAGGCTGCAGCGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313506	305105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310712_311903_312081_312303_312405_312725
927301	contig_14727_pilon	+	1332	1	Intergenic	novelGene_56680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGTTAAACTAGAAACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377331	378663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_377300_378700
927302	contig_7356_pilon	-	3828	1	Intergenic	novelGene_60417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2858	3178	478080	477760	NA	75	TAAAGGAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYVTTRHLMGFGSLVWRFRVLISWDVPVNWPNSMFSATVLPPNSLHSAWGLKSLQAAIQGTTIGLYLPGATEEEGRVKNGRRIWSMCLIASINNCFLCHEIRRTG	480937	477109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_-_477100_480900
927303	contig_15327_pilon	-	1957	5	Intergenic	novelGene_70419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCATGAGAACTTACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34372	30526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_30657_31689_31756_32349_32408_32487_32566_32747
927305	contig_854_pilon	+	4738	20	Intergenic	novelGene_36654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4065.50345510741	264	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	1453	3363	1705343	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1698912	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702206_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715151_1715198
927306	contig_13172_pilon	-	3266	3	Intergenic	novelGene_146313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1597	1905	11255	10947	FALSE	10	TGTAGATCTCTTTGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPETLVATALHPGIQYLRKFGSVCGASMTFPCANCAVFSGIVYCLTFHQSYHLSIVCLVPPPFPSIVTNKDHFFLCVNFYMRFYCRGLMQYLSFCD	121183	9585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_12117_50413_50588_120622
927307	contig_2726_pilon	+	1412	1	Intergenic	novelGene_165895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	75	326	168436	168687	NA	45	CGAAAAAACCAAACCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPSVWITPQLKKTKILTTGPINNIMINGGKIEVVKDFILLGSTISTHGSSSQEIKLHILFGRSDAKDLFKVSKSKDVTLKTKLHLTQAMVFSITSYARESWTMNKED	168361	169773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2726_pilon_+_168400_169800
927308	contig_3150_pilon	-	2556	2	Intergenic	novelGene_171913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	0	19	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGGGTTTGTTTTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263674	257596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3150_pilon_-_259302_262823
927309	contig_5961_pilon	+	738	6	Intergenic	novelGene_144112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	544.107342350753	2	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	165	614	144074	202040	FALSE	55	AGATAAAGAAACCTCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQNFGKGNRKNRKRN	113731	202164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170388_201998
927310	contig_17144_pilon	-	1731	10	Intergenic	novelGene_29247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1859.27369995868	1082	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	75	1436	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181847	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
927311	contig_7630_pilon	+	1545	1	Intergenic	novelGene_133663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAATATTTAAGGCAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541960	543505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_542000_543500
927312	contig_12098_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_160670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGGTCAGTGGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125879	124108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12098_pilon_-_124100_125900
927313	contig_2100_pilon	+	1461	2	Intergenic	novelGene_50772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAGAAGTGGTATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298396	1300114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1298722_1298978
927314	contig_3754_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_146831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAGAAAAAAAAGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221012	219975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_-_220000_221000
927315	contig_14562_pilon	+	3774	3	Intergenic	novelGene_174069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	35	junction_1	23.5	3	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	572	1719	93	1811	5152	10001	FALSE	25	CTTACTTTCTCAATTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVVEDVAVDFTQEEWALLDHSQRQLCRDVMMEIFRSLASVASQNLIDGDKLSAENIIVRFMKNDTWSSMVGEICELPGTEDQNNNQKTHVRRHMLENLCESNDDNHCGQTFSQIPNLPVLKRTPMEAYPSECLECGKSLMNHSSLKHHIKSHCGYSAYQCKECGEDCGCPSYLSTAVRTLTGQKSYECKKCGIAVSDSANLTSPIRTHSGQRPYECKECEKAFSRSSDLTVHRRAHSGERPYECKECGKAFSRSSILTSHVRTHSGERPYECKECGKTFRHSSDLTVHRRTHSGERPYECKHCGKAFCQSSHLTSHKRTHSGERPYACKECGKAFSQSCLTSHIRTHSGERPYECKDCGKAFSQSSHLTSHIRTHSGQRPYECKECGKAYSRFSHLTSHIRTHSGEKPYECKECGKAYSRSSHLTSHVRTHNGERPYECKECGKAFSCSSHLTSHVRTHSGERPYECKECGKTFRHSSDLTVHGRTHSGERPYECKDCGKAFSQSFCLTSHIRTHSGERPYECKDCGKAFSRSSHLTSHIRTHSGERPYECKDCGKAFSQSSHLTSHIRTHSGERPYECKECGKAFRRSSHFTAHRRTHGE	5059	11964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14562_pilon_+_5186_6318_6470_8467
927316	contig_6286_pilon	+	2651	1	Intergenic	novelGene_165672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	2238	2651	460384	460797	NA	40	ACCAGATTTACTAGCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRQRQRQEDRLLGKPLGPVHAGPVTSGAPSPRVALHVAQTAQATASTPLGRSRIHLSIHLSIHPSIHPSMSHQPKGSLLPLTHTAFYLPGPLRIWRNSSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKK	458146	460797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_458100_460800
927317	contig_15087_pilon	+	2134	1	Intergenic	novelGene_37244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	542	934	204528	204920	NA	25	CCCGCACTGCACAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPSINCKKNSRPKINPTSEAAGRFEPPTFLLAAKLSGADYPIGKVSTALTLLTRSSVVNNFTFFHHIKDSASRYGWHLSLFQPVRMVEGQSLTSSNFTRGKENQDQQPKADPCEVEVRHVSSLCHLYQF	203986	206120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_204000_206100
927318	contig_10494_pilon	-	2625	2	Intergenic	novelGene_102218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	203	454	1185642	1185391	FALSE	30	TTCATGAGAAACTATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACSGPACTTTALQYGAPLRQGVLLLPGAGGARRGGNGVSQGLSVLTTLLWLATCDRERDCRAASTEMVPVCDRSAACVPRPCEPVLVGTQPVFTPLPLSHFLMVETVSSSLTLTIKQDNAAKWRKGPAHRRAEGAWDPGLLTSCCGSCH	1191476	1183219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1185743_1191374
927319	contig_17687_pilon	+	798	4	Intergenic	novelGene_177974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	35	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6970	35567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_+_7069_30614_30766_34445_34755_35327
927320	contig_12179_pilon	+	4151	11	Intergenic	novelGene_127991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	162.565556007415	312	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	633	1902	436	2337	509827	530744	FALSE	30	GGAGCAAATATTGCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHLRRLVKLQLKRHYHKKFWKLGAVIFFFIIFLILMQREVSVQYSKEESRMERNMKSKNKMFDLMLEAVNNIKDAMPKMQIGAPVRQNIDVGERPCLQGYYTAAELKPVLDRPPQDPNAPGASGKAFKTNNLSAEEQKEKERGEAKHCFNAFASDRISLHRDLGPDTRPPECIEQKFKRCPPLPTTSVIIVFHNEAWSTLLRTVHSVLYSSPAILLKEIILVDDASVDEYLHGKLEEYIRQFSIVKIVRQKERKGLITARLLGASVATAETLTFLDAHCECFYGWLEPLLARIAENYTAVVSPDIASIDLNTFEFNKPSPYGSNHNRGNFDWSLSFGWESLPDHEKQRRKDETYPIKTPTFAGGLFSISKEYFEYIGTYDEEMEIWGGENIEMSFRVWQCGGQLEIMPCSVVGHVFRSKSPHTFPKGTQVIARNQVRLAEVWMDEYKEIFYRRNTDAAKIVRQKSFGDLSKRFEIKHRLQCKNFTWYLNTIYPEVYVPDLNPVVSGYIKSFGQHLCLDVGENNQGGKPLIMYTCHGLGGNQYFEYSTQHEIRHNIQKELCLHAAQGPVQLRTCTYKGHKTVAAGEQIWEIQKDQLLYNSFLKMCLSANGEHPSLVPCNPSDSLQKWIFSQND	485116	532558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_485443_509717_510342_514346_514520_518688_518839_520568_520804_521256_521375_522882_523084_525287_525420_525624_525727_529373_529527_530621
927321	contig_11512_pilon	-	2076	10	Intergenic	novelGene_43344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	899.610629078279	5	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	28	666	580089	556654	TRUE	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	580116	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556146_556430_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068
927322	contig_4812_pilon	-	638	4	Intergenic	novelGene_103658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8937.35830967717	2	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81740	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79232_80223_80339_81179_81286_81543
927323	contig_9609_pilon	-	5898	19	Intergenic	novelGene_23006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333310	314136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_314431_317882_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330303_331386_331692_332692
927324	contig_9668_pilon	-	2638	3	Intergenic	novelGene_58099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTACAAAAAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235449	192973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_195266_227640_227852_235314
927325	contig_2342_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_132774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAACTAGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582995	585321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_583000_585300
927326	contig_10857_pilon	+	2528	8	Intergenic	novelGene_160917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	226.227355389508	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	76	681	454304	469527	TRUE	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLAGLLTLGAVLCAAATVREAAGLMAGGFLCFALVFCALLQVVFWRFYNPTQVEDAVLDTYDLVYEQAVRSPSSVWRQELAAIQDTDCLQGVRSFLKTHLSIVTALVGLGLAFTVYLMLLSSFLWAAIRSGRSLDHRGTYTPTPRARGRRPQEPSLSRYSQRDPALQHPYEMQALDDHLGGRGLADGPGLCQHSRASASRPVLPPVCPQMCSFCDQQRSSEVLAL	454228	471457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_+_454313_457543_457619_463693_463796_467385_467470_467716_467809_468696_468898_469484_470519_470601
927327	contig_15236_pilon	+	767	5	Intergenic	novelGene_141582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	444.384405666986	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	350	625	440245	450343	FALSE	25	CGAGCAGCACATCGATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSQTPSQPTHAPGTTTATHNLTQTAPPAPPGPTLAPQPSSAKIGVFSPQRYFNINPNATQASGNCGPRKSNLLLNFQGGFVNFTFTKEENSYSISEVGAYLTDSNPERIYQGKKSAMVWFETMVGHSFKCVSEQSIKLSPHLQLKTVNVQLQAFDFEGDRFGNVDECTSDYTVVLPVIGAIVLGLCAVGLIVYGVRLRQESPGYQRL	426122	450485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_+_426256_428009_428139_437907_437966_440215_440387_450209
927328	contig_7207_pilon	-	1669	9	Intergenic	novelGene_72074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	258.957253953235	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757950	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696322_696746_734033_734228_737456_737530_737916_738031_757787
927329	scaffold_9100_pilon	+	1659	8	Intergenic	novelGene_83250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	349.780105850775	4	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	115	1113	647136	654304	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644840	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
927330	contig_11677_pilon	-	376	3	Intergenic	novelGene_85952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	10718	junction_2	18631.5	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	12	374	598052	595738	FALSE	35	CAAGGTCAACACCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAKKEAPAPPKTETKAKALKAKKAVLKGVHSHKKKKIRTSPTFRRPKTLRLRRQPKYPRKSAPRRNKLDHYAIIKFPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDVKANKHQIKQAVKKLYDIDV	598063	595735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_-_595892_597212_597397_598027
927331	contig_19185_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_163642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGGCAAGCTGGACGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102433	101022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_101000_102400
927332	contig_2341_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_84347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCATCCTAGTGAGAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25535	26933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_+_25500_26900
927333	contig_1435_pilon	-	3604	1	Intergenic	novelGene_115514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTGTAATCTTTATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571505	567901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_-_567900_571500
927334	contig_1090_pilon	+	1000	1	Intergenic	novelGene_131158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGGCTTACAGAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	884997	885997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_885000_886000
927335	contig_8643_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_179126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACTAGAAAAACAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52573	53026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8643_pilon_+_52600_53000
927336	contig_7428_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_77756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	695	1009	517443	517129	NA	35	AAGTATTAATCCATTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHSCAILASKEHSGCTSSKIDLFILLAVHSIFNILRQHHHSKTSILLWFSLFIGQLSHAYEANENTTAWVRRTLVFKVTSLLFNTLKRSFAADVPNAMHCLIS	518137	516070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_516100_518100
927337	contig_12437_pilon	-	2853	1	Intergenic	novelGene_169085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	17	298	125780	125499	NA	15	TCCTTTCATCCCTGCACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKYSEMKFPETRDELSAAGLRQETQIFLLSPTTLLLFVWGGRRWHEGNPRDSQGRRRFQELCLISDKSESYVLLLSQLAACTRREIHLRFFHLFKVLC	125796	122943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12437_pilon_-_122900_125800
927338	contig_10259_pilon	-	2162	1	Intergenic	novelGene_177190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAAGTCACCTCAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34377	32215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10259_pilon_-_32200_34400
927339	contig_5280_pilon	+	1055	8	Intergenic	novelGene_52659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	189.889011621773	1	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	377	769	319569	327234	TRUE	45	ATGATCCAGCAAGTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQVQNKWTPQLPSCSRVCQPPPEILHGKHTPSDKANFSSGEEVFYSCEPGYDLRGAAFLRCTPQGDWSPAAPRCEVKSCDNILDQLPNGRVLSPPSLQLGAKVSFVCDEGFRLKGRSFSHCVLVGMKSLWSNPVPVCEQIFCPNPPAILNGKHTGNALGNIPYGKEISYTCDPDPDRGMHFSLVGESTIRCTSDNQGNGMWSGPAPRCELSVPAGHNFHLPHLQLQLMSLSFQLGHIWIMNASLGTLGARSLSPA	316107	329867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_316158_317831_318009_318096_318200_319522_319609_324496_324729_327113_327274_329151_329252_329720
927340	contig_10627_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_60004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATATGATTCTCTTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319912	321451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_319900_321500
927341	contig_10331_pilon	-	2434	1	Intergenic	novelGene_54081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTAAATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100919	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_-_98500_100900
927342	contig_5935_pilon	+	3563	2	Intergenic	novelGene_102731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	375	3189	3563	1257157	1257531	FALSE	30	GACAAGGCCAGGAGCCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQIYPPTTKAKDEEIEDFYQLLQSEIDGTCNQDALIITGNWNAKVRNKEGLAVGKHGLGHKNDVGDCMIEFFKINDFFIANTFFHQHKWQLYTWTLPDGIHRNQNQLHLWKETIENLNIVSQ	1210865	1257531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_+_1213880_1256982
927344	contig_10642_pilon	-	3422	2	Intergenic	novelGene_78742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTTGGATAAAATAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1285104	1280316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_1281701_1283066
927345	contig_5485_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_37781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGAAAAAAAAAAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643337	640389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_640400_643300
927346	contig_8362_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_150676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCCTGGAGGTATGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71150	73566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8362_pilon_+_71200_73600
927347	contig_8263_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_83080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTCAGAATCAACTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121053	121903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8263_pilon_+_121100_121900
927348	contig_18991_pilon	+	2844	1	Intergenic	novelGene_179127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1357	4201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18991_pilon_+_1400_4200
927349	contig_1725_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_24306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	32	343	232755	233066	NA	35	GAAAAAATCTTTGTTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARPYQVLIDWFKSRKIRVNFKVTTKKVNKPTHQIKKKNKVSVKTKPTKTKEMKKKSTNKRNSAQESKRNKESVSTTKKKVLQDVVPLLGIYPGEIRAVT	232723	233886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_232700_233900
927350	contig_10642_pilon	+	1705	1	Intergenic	novelGene_78723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACGTCATCTGTCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	919640	921345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_919600_921300
927351	contig_7378_pilon	-	6562	2	Intergenic	novelGene_120294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	462	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	4343	4663	609411	609091	TRUE	70	ATTAAAAAAAAAGAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTQYTKITSKWIKDLNIKPKTIKVIEEKIGPTLQTLIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKKRTYRLGKNFWTLQVRQRSHL	613753	607138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_608642_608694
927352	contig_6361_pilon	+	4883	7	Intergenic	novelGene_23960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	996	1469	390196	390669	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKTRVVLLKDSTGKIVNDARSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYDREPMILKGEVQVALKALVKNKAPRIDGIPVEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	389200	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_390751_400285_400563_408707_411212_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
927353	contig_3241_pilon	+	2518	1	Intergenic	novelGene_146393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	125	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTTGTGGGGTTGTTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	771257	773775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3241_pilon_+_771300_773800
927354	contig_18096_pilon	+	2324	12	Intergenic	novelGene_58026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	696.516396726661	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	247	1545	44197	78246	FALSE	35	ATACAAATATTTGATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRIRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHTAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSIALSNIGDKPGETYLNFARKRIKNPEGGLYVAVTLLAGITGIVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAQRIVRGQTADSLKVHDPKVCSQNISDWGKIKECPIPEFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTFELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQAGQFLPQIS	40308	79025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_40427_42488_42585_44164_44257_53717_53803_57208_57355_59465_59657_62798_62929_66642_66736_69382_69637_70499_70663_71982_72130_78216
927355	contig_9363_pilon	-	2928	6	Intergenic	novelGene_6765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_5	97.8153362208606	23	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1043	1717	1510230	1506537	FALSE	10	GCCCAGTTGTTGTGATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVQVMIQPSIHDHDVPALEALVGVPQCHSKGPITYTWVVQMEPPVTCHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1511272	1505325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509825_1510101
927356	contig_9957_pilon	-	614	1	Intergenic	novelGene_173840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTACAATAAAAAAAATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356778	356164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9957_pilon_-_356200_356800
927357	contig_3081_pilon	-	3144	2	Intergenic	novelGene_133924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	2308	2799	181718	181227	FALSE	30	CGTGATCACTAGCCATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIMSTTIKFIEEK	184116	180881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_183574_183664
927358	contig_3469_pilon	+	2404	1	Intergenic	novelGene_34221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	232	537	570828	571133	NA	30	CTAGGAGTCAGAACCGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQFASVKITALEILWNSSTPSYRVVNRQQWVWFGLWMSNLLQHHLLKKTLLPPLNCLYTFIKNQLVELVKRSISGFFILLHWPMHLSHHQYHTVLISVPK	570596	573000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_570600_573000
927359	contig_9462_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_179129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAGAGGAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28445	29688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9462_pilon_+_28400_29700
927360	contig_4745_pilon	-	2632	2	Intergenic	novelGene_175173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1206	1718	163276	162764	FALSE	45	CTTCATTTAAACTACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTTRYHLTPIRLALIQKAQNNKCWRGYGEIGTLIHCCWECKMVRLLWKWIGCFLKKLKIEVPYNPAIPLLGIYPREIRAITRIDICTPMFIAALFTVAKRWKQPRCPLMDEWIHKLWYIHTMEYYATIKNNDEAVKHRITWWKLELIMLSEFSQAQKDKYYIRPLL	208702	161849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4745_pilon_-_164184_208404
927361	contig_7383_pilon	-	3099	1	Intergenic	novelGene_179131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATAGAACTGTCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17578	14479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7383_pilon_-_14500_17600
927362	contig_9011_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_159274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	151	546	131592	131197	NA	15	TTTCAATGGCTGATTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPDPLCLLISPLDRSCPFSLRYLLELRSTLFTSIVLCPTVQSNLRLQSWPRELFSSGLTESLGAMLSRVPPVSVRPLSLVFLLEFEFCTPLFSCSTRDSLLCSLSGQSLVVAGHHPVLLSLMKSLV	131742	129443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_129400_131700
927363	contig_6446_pilon	-	2747	2	Intergenic	novelGene_149204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACAATGAGATATCACTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304260	280020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_282487_303979
927364	contig_11548_pilon	-	563	1	Intergenic	novelGene_66720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGGACTTGTAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36830	36267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_36300_36800
927365	contig_11564_pilon	+	1625	2	Intergenic	novelGene_158583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCCCCACATCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85268	87778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_85369_86253
927366	contig_4732_pilon	+	3030	1	Intergenic	novelGene_75377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	2067	2501	216528	216962	NA	70	AGGGGAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGGGDATGIWRVHARDAAQHPTMHRMASSRIIWPNNKDKQPNFKTSEHLNRHFFTENIQMAKKRMKKCSTTSLATGETYIKTTMRSHLTPTRMAITFKKKKKKKRKVTSVVQDVEKLEPLSIAGRIVKWCSPRGKQFGGSSKS	214461	217491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_214500_217500
927367	contig_6102_pilon	-	3051	12	Intergenic	novelGene_32092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	159	junction_11	117.446594158106	9	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1101	1951	3051	795596	791050	FALSE	50	GTCAAGAGGGAAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAQASDFPPPLTQPASDQPSTIHLHTATSPAVSPTVSPEISLAVSPAASSEISPEVSPAVSPAPFPTVSPTSSAAPPAVSSEVSLTASPVTSPKTSPAASPAAASPTNKDVSSFSETTADLEEIAGEGNTAGSGDVLRRRIATPEEVRLPLQHGWRREVRIKKGSHRWQGETWYYGPCGKRMKQFPEVIKYLSRNVVHNVRREHFSFSPRMPVGDFFEERDTPEGMQWVQLSAEEIPSRIQAITGKRGRPRNTEKAKIKEVPKVKRGRGRPPKVKITELLNKTDNRLLKKLETQETLNEEDKAKMSKIKKKIRRQVQRGECQTTIQGQARNKRKQETKSSKQKEAKKKSKAEKEKVKTKQEKLKEK	814750	791049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_791098_791584_791651_791969_792071_793461_793673_793833_793936_794104_794214_795041_795103_795193_796446_797091_797278_798168_798763_800356_800495_814567
927368	contig_8843_pilon	-	2758	1	Intergenic	novelGene_156653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	2216	2533	76237	75920	NA	60	ATACATAATCTCTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPKLAGQTAGCWPMGLWKLVNTRICRAEGGLPAQRATETGKFQSEQVRLQAAGSRPKNQISDDDEPDAGPRARKSFATASIYFGSRSYAQGHSLLIRYLRKGVT	78452	75694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_75700_78500
927369	contig_19257_pilon	+	1154	1	Intergenic	novelGene_179132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7840	8994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19257_pilon_+_7800_9000
927370	contig_12050_pilon	-	3110	6	Intergenic	novelGene_62747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_5	124.536902161568	17	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	61	504	704920	696482	TRUE	40	AAATGTTTGTTCGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKGNEPGTKAQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIITSPCVVCRGTGQAKQKKRVVIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFVTFRVGPLLCTAPVGPCSVGAGTVEPFCGVRWGTTEGWLPPWARKGNISHLHIVIKCLLPLRLYARCGENKTFLKMFTS	704980	685797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_686709_693021_693120_694060_694177_695000_696775_697799_697948_704917
927371	contig_12761_pilon	-	2164	1	Intergenic	novelGene_164053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	535	843	218665	218357	NA	15	TGGCCTCTGAGCTGAGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRNWSLLITCPKYVGQNLAILASEEHSVYTSYKTDLFVLLAVHGIFNILHQHHNSKASILVRSSLFTVQLSHAYEATENTTAWVRCTLVLKVTFLLFNT	219199	217035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_217000_219200
927372	contig_165_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_117082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGATATTTGCAATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	447673	445339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_165_pilon_-_445300_447700
927373	contig_7733_pilon	-	2360	3	Intergenic	novelGene_147158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGAGAAGCATAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241634	237019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7733_pilon_-_237210_238074_239441_240830
927374	contig_4845_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_53647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385016	387121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_385000_387100
927376	contig_12580_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_172905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	16	333	224146	223829	NA	20	GTCTGTGTTCAGAGAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSDPMSAAKRNTARSCTILAIVPVLEPIVAGSVSIHFIEGLHLFFPPSLLPSMMSFSRDWSLLITCPKYVRRSLAILPSKGAFWLYFFQDRFVPSPGSPWYIQYSSPTP	224161	222733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12580_pilon_-_222700_224200
927377	contig_20398_pilon	-	3077	15	Intergenic	novelGene_155207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	69	803	181349	177810	TRUE	35	GATCCTAGATGTGAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AWDVDTTVVLTGTCRTVGAPVPMLIGVLAAPDATATVLDTAAFILGTDTAEACTVPDPLATEDPCLAWAATVMVWPALGGIMPRPCTMRMVAAAFPSEETTVLFPFWSATLTPRAGIKRKAEPEASAGLRSGVTLTTVVPAGVDAGALAELALAGLSAAWTGLEVTCKVAEMPLPAVLLPVPKRSWVSLTVVTWDLANVAIMSGVIRRTVWPLASVVMEEGGRRSTSLPWIRKLVAARGMLLPVWGLTPSCPVIATCLMMFCPGTF	181417	163398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20398_pilon_-_164025_164277_164386_164613_164740_165005_165073_171160_171240_171839_171888_173422_173496_173881_174046_175001_175104_175628_175757_175965_176047_176207_176428_176513_176784_177627_177841_180645
927378	contig_11115_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_102781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATCGACTTGACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47392	49122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_47400_49100
927379	contig_17144_pilon	+	1127	8	Intergenic	novelGene_29225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	147	608	166214	173661	TRUE	15	CCCATCAGGTAGGCGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METRNIGDWWKVQFNSVVLQSWTAPTWPEGLQETRYPWIRPLSSSRGIGFQNSCTFTVLGSSCLCRHHVSSLTIGAPFCGFQLQAGTPVTPVAWQGPAGAAHLQGVGCGWEKATELVVEGPGGQGGHLGPAGFSKLWLVAQLTLLFHVQAWLP	166067	176091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166240_172619_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975
927380	contig_9548_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_141072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAATAAAAAAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171170	169530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9548_pilon_-_169500_171200
927381	contig_5488_pilon	+	2552	2	Intergenic	novelGene_178353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2088	2447	469865	470224	FALSE	25	AAACTCTGTGCATTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRQPPVQVCGIQAAAVSRSRDCSRGKQRRLSQVKKGGAWESVYHQLPVVLSPPGSSVRLLSRTPCLLVSDRSPRWRIRAALASRGPLHDSLLALRSLVSFLTPFGAWLSSLSLHLMF	388897	470329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5488_pilon_+_390103_468982
927382	contig_5125_pilon	+	2226	7	Intergenic	novelGene_43447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1364.79930352008	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	37	645	35654	54484	TRUE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKETHS	35617	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54430_54470_54525_58449
927383	contig_15063_pilon	+	4097	6	Intergenic	novelGene_11470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_5	3551.08261801947	67	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	231	1403	34808	36661	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_39092_39506
927384	contig_16667_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_153253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCACTTCCCCAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18860	17361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_-_17400_18900
927385	contig_2799_pilon	+	2892	1	Intergenic	novelGene_85569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACTGTGCATGTAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735608	738500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_735600_738500
927386	contig_10765_pilon	-	2454	2	Intergenic	novelGene_122885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTATTACTCATTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50285	47636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_47753_47947
927387	contig_14048_pilon	+	3451	2	Intergenic	novelGene_146345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	17	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	896	1375	615584	616063	TRUE	60	ATTTTAAAAAGAAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFYKTNDLFTANTFFHQHKQQLYTWTSPDGIHRNQIDYICGKRQWKSSVLSVRIRPGANCGTDHQLLICKFKLKVKKIRTSPREPKYDLEYIPSEFRDHLKNRFDVLNTNDRRPDELWNDIKDIIRKESKRSLKRQKERKDQNGCQKRLSNLLLNVE	614688	626531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_616124_624515
927388	contig_17059_pilon	-	1671	1	Intergenic	novelGene_166089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	554	970	437767	437351	NA	30	CAGACAGGGATTGGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLATCSLWDKNLVEPLWKLIWRFLKKLEIDVPYDPPILLLGIYPREIRAITRIDICTPMFTAALFTIAKRWKQTRCPSTDEWINKLWYIHTMEYHAIIKNNDEAVKHLITWRRLEVIMLSEFSQSQKDKHRIGSLF	438320	436649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_436600_438300
927389	contig_2577_pilon	+	1729	1	Intergenic	novelGene_172076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	410	721	270040	270351	NA	60	GAACAATTCAAGAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNRLTGNGFFGLMPRISIFLHSISFLTTSNFPEFILCTLHVLIINGYFQLFLLILNPVTSANEGPERQLFPSHILSAFQLEGIIFQHCVRQCSAIIHKGFH	269630	271359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_269600_271400
927390	contig_4803_pilon	+	3801	19	Intergenic	novelGene_150709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	961	1344	21658	33266	TRUE	40	ATTTCTGTAAAACCCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCSFLPLLYPPLVCSHLGQAVFVLGCQKVYPGHRRVLCCHFPKKALGGGPAEWVVEAGVWETTSEITAESLASSNLRDEVSAGRGPEKSSDKASRRRSSLMGGNCSLGSFGGSGFPSLSLASSNL	14410	48890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_15020_15970_16039_17579_17650_19567_19664_20125_20170_21584_21674_23592_23714_27344_27441_30768_30847_31014_31065_33243_33328_33806_33910_37478_37574_39338_39438_40572_40618_41848_41933_45460_45566_46891_46980_47113
927391	contig_14414_pilon	+	2385	2	Intergenic	novelGene_166505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	67	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTACTTATTCGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118044	120477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14414_pilon_+_119152_119199
927392	contig_11316_pilon	+	1752	1	Intergenic	novelGene_122607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	676	1188	137674	138186	NA	20	ACCTTAGGCCTCCTACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	136998	138750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137000_138800
927393	contig_6102_pilon	+	691	6	Intergenic	novelGene_31974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1234.66594672405	18	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	55	543	413111	416047	FALSE	10	CTCTGCCCAGATTTGGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKVPKPEQSRWWGLGPGRMSGIWGKRREARCDFTEDQTAEFKEAFQLFDRTGDGKILYSQCGDVMRALGQNPTNAEVLKVLGNPKSDEMNVKVLDFEHFLPMLQTVAKNKDQGTYEDYVEGLRVFDKEGNGTVMGAEIRHVLVTLGEKMTEEEVEMLVAGHEDSNGCINYEELVRMVLNG	413056	416195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_413147_413338_413367_414219_414364_414613_414788_414877_414956_416018
927394	contig_6724_pilon	-	756	1	Intergenic	novelGene_167954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATACCACCAGTTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76545	75789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_75800_76500
927395	contig_1982_pilon	-	3009	1	Intergenic	novelGene_151316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	670	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAAGAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138367	135358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_-_135400_138400
927396	contig_7898_pilon	-	1093	8	Intergenic	novelGene_47528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	36871	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	70	1026	285587	282118	FALSE	25	AAAAGCCCTCTGCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286095	282050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
927397	contig_7898_pilon	-	1019	9	Intergenic	novelGene_47529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3040.83592279738	28	2	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	70	948	285587	282122	FALSE	25	AAAAGCCCTCTGCACTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAGRVGGVGRGYGIWSF	286095	282050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282169_282242_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
927398	contig_5260_pilon	-	739	1	Intergenic	novelGene_144383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGTCAAGAAGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380369	379630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_379600_380400
927399	contig_6445_pilon	-	1490	14	Intergenic	novelGene_76890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1034	junction_11	418.945774689491	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	17	1255	88578	43105	FALSE	10	TAGCCTTTTGTTTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88594	42869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473
927400	contig_8330_pilon	-	2492	9	Intergenic	novelGene_71846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	281	junction_8	145.714135810497	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	122	1105	916108	896249	FALSE	10	GTCTGGTCCTAATGTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPERLLRSGKWRVYIESVAGSGCWEAAALAELARQPPTAMSAFDTNPFADPMDVNPFQDPSVTQLTSAPQGGLAEFNPFSETNAATTVPVTQHPGSSQPAVLQPSVEPAQPTPQAIASAAQAGLLRQQEELNRKAAELERKERELQNTVANLSVRDNNWPPLPFWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICKMLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFTVDTSKGMQFGLSILWFLIFTPCAFLCWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGVYIIQVIGFPNLGNSGWLAVLSVENHLPVLIIMIVVAGFFTLCAVLAVILLKRVHSLYRRTGASFQQAQVEFSQGIFSNRTFRSAASSAAQGAFQEN	916229	894861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_896384_896601_896717_899563_899666_900691_900852_901500_901630_902239_902358_904312_904412_904827_904897_916051
927401	contig_11316_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_122683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTCAAGATTTTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140526	139423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_139400_140500
927402	contig_12479_pilon	+	2148	1	Intergenic	novelGene_56890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCATGAAAGGTAAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578873	581021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_578900_581000
927403	contig_5479_pilon	+	1004	1	Intergenic	novelGene_133588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	133	432	251099	251398	NA	15	CTGTTTTCAATTTTTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGCGRPQRTSMAAGSAHLRDDTGRGQAWLGPWKFLLEDSRSHEDPRCGCVRALFQTLPGVRREEGRMTQGLALSGWFEGLGWWVGRSVGTYCKCEPS	250966	251970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5479_pilon_+_251000_252000
927404	contig_854_pilon	+	4485	30	Intergenic	novelGene_36505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2552.9141610004	13	86	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	1618	3093	1685144	1701257	TRUE	55	ATGAAAATATACACAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQI	1612773	1707227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681884_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692773_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699019_1701253_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748
927405	contig_7333_pilon	-	2823	1	Intergenic	novelGene_142776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198269	195446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_195400_198300
927406	contig_9578_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_67989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAGTTCTTATAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1187353	1185619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9578_pilon_-_1185600_1187400
927407	contig_11309_pilon	-	966	8	Intergenic	novelGene_149876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2414.60052892517	5	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	63	899	65730	56293	FALSE	20	GCTACATCTGTGTTAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	65792	56225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169_60348_61297_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
927408	contig_10868_pilon	+	4109	12	Intergenic	novelGene_173903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	106.46405516099	258	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	1020	3224	502797	521986	FALSE	15	GTACCTCGTGTCCTATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFSELEMKEREGGHPAAKDSEVCKFSPADWERLKGNQDKKPKSVALEEAIADQNDSERCEYSAGNKLDPFEAQEDKDLPVEKFFVERQPLSEPPTDPVAVDMPHSPTLRLDRKRKVSGDSIQTETAVEDMPEDPLLKAKRRRVSKDDWPEREMTNNSSNHLEDPHYNELTNLKVCIELTGLHPKKQRHLLHLRERWEHQVSPAESKPGRQNRKEVTQAVQPEVTAQGNNITEEKPGRKRSEAKGNRSWSEESLKPNDNEQGLPMFSGSPPMKSLSSTNANGKKQTQPSCTPASRPPAKQQKIKESQKTDVLCTDEDEDCQAASLLQKYADTSEKPSGKRLCKTKHLIPQEPRRGLSLTGDYYVENADGKVTVRRFRKRPEPTSDYDLSPAKQEQKPFDRLQQFLPASQSSQLPCATSPQETTQSRPMPPEARRLIVNKNAGETLLQRAARLGYEEVVLYCLENKICDVNHRDNAGYCALHEACARGWLNIVRHLLEYGADVNCSAQDGTRPLHDAVENDHLEIVRLLLSYGADPTLATYSGRTIMKMTHSELMERFLTDYLNDLQGRSDDDSNGSWDFYGSSVCEPNDESGYDVLAHPPGPEDLDDDDDAYSDVFEFEFSESPLLPCYNIQVSVSQGPRNWLLLSDVLKKLKMSSRIFRCNFPNVEIVTIAEAEFYRQVSASLLFSCSKDLEAFNPESKELLDLVEFTSELQTLLGSSVEWLHPSDMTSDDYW	500633	522871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10868_pilon_+_501588_502266_502321_502785_502975_509497_509759_510186_510532_511217_511544_511889_512145_517263_517431_519392_519539_520048_520127_520317_520475_521694
927409	contig_19812_pilon	-	2148	20	Intergenic	novelGene_100992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.706703411158	1	48	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	62	1243	46806	25949	TRUE	20	ACCTTACTAAGTGGTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKGSWKENAKSSQSVPV	48260	15752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19015_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_25997_29879_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
927410	contig_5961_pilon	-	3246	4	Intergenic	novelGene_144133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGTTCAAAGAGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268819	159169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_160213_225191_226398_229233_229605_268193
927411	contig_17833_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_174602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	1431	1850	51808	51389	NA	65	AATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHIFRGHNSIHKFYSLAPQNSCPCHIQNTFTPSHHPKNIKSTTSPKYYLLKHLHQILVRFQAYSILEQNSSSPVKSRIQITCLQSTMVEHAHGRHFQYKWEKWRERRDKQAPRKSKTTVLMCCEVVNHCHRAACVLSV	53238	51260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_-_51300_53200
927412	contig_10892_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_116747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1783	2103	139086	138766	NA	20	GGAAGCATGTGACTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPRQKGCTCPELLGKLANYFFLFVNLFPFQSREIGSGRLTDPTSVQGGTAITEADPGRSRVRREQVNGRKVLSKGGIFFGPRGSLDACTYLSLVEHWFSLFLEA	140868	138491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_138500_140900
927413	contig_5280_pilon	+	1873	2	Intergenic	novelGene_52652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAGGAATAAACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275794	278605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_276112_277049
927414	contig_7057_pilon	+	3067	6	Intergenic	novelGene_123265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAACCCACTGCCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636016	834171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_636669_637099_637367_724803_724972_725513_725678_726867_727153_832640
927415	contig_10312_pilon	-	1709	2	Intergenic	novelGene_159027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	28	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	702	1529	400641	399814	FALSE	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNSHLSIITLNVNGLSTPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKTDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGRSRHEDTTIINIYTPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTVIVGDFNTPLSVKDSKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVAIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKINYMETEKYPAYTSLGNRRNQRWSQKIPRIK	478241	399633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10312_pilon_-_401277_478175
927416	contig_6593_pilon	+	3140	2	Intergenic	novelGene_49842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATTGTAATATATTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1186001	1189293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1186123_1186274
927417	contig_6175_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_16313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGTAAGAAAAAGAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1470565	1472488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1470600_1472500
927418	contig_3956_pilon	+	1507	8	Intergenic	novelGene_14884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1521.25800519417	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	84	983	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNILVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282760_1282807_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284769_1289833_1289892_1290297
927419	contig_11498_pilon	-	3796	1	Intergenic	novelGene_65521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGGCAGATGAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206538	202742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11498_pilon_-_202700_206500
927420	contig_7057_pilon	-	2097	2	Intergenic	novelGene_123424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGAAAAATAAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1564795	1556110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_-_1558143_1564730
927421	contig_7415_pilon	-	2693	2	Intergenic	novelGene_168680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAACCAAAATTACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281348	278487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7415_pilon_-_278972_279139
927422	contig_3832_pilon	+	2937	1	Intergenic	novelGene_161437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGTGTCTCCCACCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113297	116234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_113300_116200
927423	contig_2100_pilon	-	1163	11	Intergenic	novelGene_50681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1004.00119521841	16	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	410	898	1176402	1170268	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWACPLLSARLELLRRGCPCTVTLLTWLAIPKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185495	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170132_1170215_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173321_1176300_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
927424	contig_11574_pilon	-	4646	19	Intergenic	novelGene_64107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	117	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	3444	4445	583607	582606	FALSE	75	AAACCAAATAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYFTSLTRVTCAAGMYFTSHARVTCTAGTYLTSHTRVMCAAGMYFTSLTRVTCAAGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSLTRVMCAAGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSHAGVIRTPGMYFTLHAGVIRTTGTHFTSHPGVIRTAGTYFTSHIRVIRTTGMYFTSHIRVIRTAGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSHAGVIRTTGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSHTRVIRTAGMYFTSHAGVIRTAGMYFTSHTRVIRTTGMYFTSHAGVTCTAGMYFTSHIRVIRTAGMYFTSHVGVTCTAGKYFTSHAGVTCTAGMYLLRNLFFPP	630033	582404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_584222_585286_585406_586812_586871_588394_588455_588831_589011_590762_590897_592587_592674_597645_597748_599241_599374_601304_601478_606613_606717_621503_621634_621758_621845_622448_622566_623804_623871_624221_624394_626075_626684_627457_627638_629709
927425	contig_3700_pilon	+	2859	2	Intergenic	novelGene_138092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCTCTCCTCACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342831	345775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_344918_345002
927426	contig_5718_pilon	+	3218	1	Intergenic	novelGene_110342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	150	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACAGTTTTCACAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588051	591269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_588100_591300
927427	contig_4924_pilon	-	2140	8	Intergenic	novelGene_84705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	657.38442764815	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	69	923	155859	82247	FALSE	60	GAACGTAGGCCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSEYLLLWWTAFPQILHRKWSARNDLKRIHHGEN	252582	81029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_252514
927428	contig_10042_pilon	-	1339	1	Intergenic	novelGene_79156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATTATCACCTCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	659564	658225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_658200_659600
927429	contig_3747_pilon	-	2835	8	Intergenic	novelGene_24821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTCAACAACGATCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	200983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203371_203556_203649_203766
927430	contig_12292_pilon	+	2190	1	Intergenic	novelGene_167006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTGAAAGGTCGGCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289548	291738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12292_pilon_+_289500_291700
927431	contig_16884_pilon	-	2074	14	Intergenic	novelGene_161816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	61.8449100525523	7	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	1317	2072	59205	42521	FALSE	25	ACCGTTATCTCTGTAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCELDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDTYVGRIDNYLIRHPSCVNVTKWNAVVCSGTYAQVYVQAWSTQNLTMTITRDEYPSYPMVLRGINQKAAFQQYQPVIMLEKGYTIHWNGPAPRTAFLYLINFNKNDWIRVGLCYPSDASFQVTFGFLQRQNGSLSKMEDYEPVRSLDELQKQQSERKFYFDSSTGWCLPVILIKATSPCNSSHPVKQKLSVET	77470	42518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16884_pilon_-_42606_48806_48990_53115_53325_55951_56168_59142_59321_62251_62408_63117_63154_64395_64528_67816_67909_70921_71051_74977_75048_75188_75395_75740_75951_77300
927432	contig_7887_pilon	-	2916	2	Intergenic	novelGene_124952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	243	554	865890	865579	TRUE	50	TTTAAAAAAACCTGAGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKGKAAAYFYSLYTVLIRSPGGAAVKRSAVYQKVGDLNPPAALREKDVAVCFRKDLLPWKPYGGSSSLSYRVTISWNQVDGNGKPSLWSYYTQPLNFYGCWI	866132	855752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_856130_863593
927433	contig_5039_pilon	-	2035	1	Intergenic	novelGene_64787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCTATGATGAGGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152034	149999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_150000_152000
927434	contig_10159_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_30833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566965	569056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_567000_569100
927435	contig_11292_pilon	-	1955	1	Intergenic	novelGene_109403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1250	1594	131266	130922	NA	20	GGTAAACTTTCCCAGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLEQAPSWDLHTGLSLCLECFSQIHAWLYLSLASSVCQMLPSHEGSLFTLCNTAKCPHTAWSPIPKPPYLPPVVLAGALVAKWLSVWLLTKRSAVQIYQLLLGNTTGQFYSVL	132515	130560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_130600_132500
927436	contig_15029_pilon	+	2579	1	Intergenic	novelGene_128223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCAGCTTTGGCATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453056	455635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_453100_455600
927437	contig_8418_pilon	-	2529	1	Intergenic	novelGene_166063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGAGCTCACACTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096559	1094030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8418_pilon_-_1094000_1096600
927438	contig_13844_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_79403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTGTTCTACAGGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88020	89378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13844_pilon_+_88000_89400
927439	contig_12677_pilon	-	1404	1	Intergenic	novelGene_110834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTCATCACAATCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3865	2461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2500_3900
927440	contig_13863_pilon	+	1246	9	Intergenic	novelGene_42025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1247	junction_1	638.028494171695	13	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	28	1029	98341	116147	FALSE	50	CCTGTGAAGAAAAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNK	98313	116364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114
927441	contig_12520_pilon	-	2100	5	Intergenic	novelGene_161065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.0499853027618	25	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	10	639	628529	396856	FALSE	90	ACAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVVMASSAHDRLACDPNTKFAVPPQGKNWIALIPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMSHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIVSLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRFRYANARDRNQRRLGDAAKKAISKLQVRTIKKGDKETEPDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRIHS	628538	395394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_396869_412946_413030_414846_414919_432706_432958_628318
927442	scaffold_12124_pilon	+	1616	8	Intergenic	novelGene_22232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3647.48182633847	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	665	1444	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1496348_1496389_1497007_1497102_1508385
927444	contig_8798_pilon	+	2550	3	Intergenic	novelGene_143185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	949	1524	7307	8152	FALSE	20	ATATCTGTAATTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVEGESPWHVAPPGQKGLPTQEKEKKTDKQFKMNKRTKAPGSHQHSSPDWEAAPHSNGALQPLRKKQRWRTEPGTRVKGGGGGERQARNPKKQKERKKKKATLAANKWHSESQPAQAARNPSSRRPPGQETVATGSRGARARAKRGGGWESAHRKLLAVLSPTGRCMRLLSLTPVCWSPIGVQDGGSTLR	5989	9178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8798_pilon_+_6878_7246_7662_7931
927445	contig_5020_pilon	+	1717	9	Intergenic	novelGene_27837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1078.40866558091	4	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	318	1064	121762	124498	TRUE	5	ACCTTGGTGTCTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEEEKLAKRERAFPVSHNRPTERETSAYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKALWMPTRPLPGRKGFRDSGKGPLPMLLVMPLSTVLSW	118462	126081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_121704_121966_122812_123041_123152_123346_124294_124363_124444_124547_124909_125091_125657
927446	contig_7080_pilon	+	1524	2	Intergenic	novelGene_100087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	23	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAGAAGAAGAAAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300797	501023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_300869_499570
927447	contig_10855_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_124343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	986	1408	548948	548526	NA	25	CCACGCCACATATCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGTTVQQTDRHMMAHKDYSPAIPVGPFRTVTEGHYESESTQQHPTTTVSYRVRPGTPKAPNSHCVFNTYVMTVPMSFTREPLKLPLGTPLPFPWPQIPLCVVLGCLFVPLQAPPQPQHHNSAQSPKAKPHWAISGHVTS	549933	548356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_-_548400_549900
927448	contig_10990_pilon	+	1185	2	Intergenic	novelGene_7507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	892	junction_1	0	5	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	194	322	752016	752144	FALSE	20	TCTCCCAGCAAACTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	751456	753007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_751520_751885
927449	contig_15087_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_37235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162885	164977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_162900_165000
927450	contig_9177_pilon	-	2325	1	Intergenic	novelGene_32726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTGCCACCAAGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617517	615192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_615200_617500
927451	contig_9895_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_144687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCCTGGCCTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121075	120310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_120300_121100
927452	contig_6227_pilon	+	2222	3	Intergenic	novelGene_49678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	810	junction_2	528.5	54	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	927	1289	848641	861222	FALSE	70	AGAAAACTATTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLQRKDPSAFFSFPVTDFIAPGYSMIIKHPMDFSTMKEKIKNNDYQSIEELKDNFRLMCTNAMIYNKPETIYYKAAKKLLHSGMKILSQVKKTLCHNNYYKICIPVFFGHRDTDPIQY	847714	862155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_848658_856400_856546_861021
927453	contig_15691_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_60777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGCAGCTGGCCTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94122	91134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_91100_94100
927454	contig_20446_pilon	+	792	2	Intergenic	novelGene_179133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTGACATCACACCAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121	17070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20446_pilon_+_354_16510
927455	contig_2377_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_67899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGTGGCACTTGTTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197519	199458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2377_pilon_+_197500_199500
927456	contig_16098_pilon	-	1652	4	Intergenic	novelGene_45948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1966	junction_1	1078.83558627912	5	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	298	708	350111	349343	TRUE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPDLPPPFSCQEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIAR	350408	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_349062_349172_349493_349604_349710_349955
927457	contig_612_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_155630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACTATACGTGGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250062	252195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_612_pilon_+_250100_252200
927458	contig_13806_pilon	+	2603	1	Intergenic	novelGene_173657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	328	672	98489	98833	NA	10	CTGACGGTTGGTCTCCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRISLWSLTVGLWEWTRKKKNPYYLPEIQAHSKFSMLPLMKTHDINKKSKQKIIGSLKGFMIFKTRALNISNNMTTKKKLIVYHSWMFWPPLKTFLLFGRGDYSVDQKPDLL	98161	100764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13806_pilon_+_98200_100800
927459	contig_18799_pilon	+	626	1	Intergenic	novelGene_171424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTAATTAAATACTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57023	57649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18799_pilon_+_57000_57600
927460	contig_15869_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_177593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAGACTAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40916	39986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15869_pilon_-_40000_40900
927461	contig_10404_pilon	+	2766	2	Intergenic	novelGene_138643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCACCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487241	490110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_489180_489282
927462	contig_12931_pilon	+	978	1	Intergenic	novelGene_166767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAACAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97117	98095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12931_pilon_+_97100_98100
927463	contig_13519_pilon	+	1631	7	Intergenic	novelGene_124641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	94	junction_5	448.949762099156	4	18	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	750	1589	98578	120612	FALSE	25	ATTTTTTCATCCAAGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	97828	120654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116675_116756_120484
927464	contig_3956_pilon	+	3155	15	Intergenic	novelGene_15118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1121.15850251207	2	75	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	853	2562	75	2636	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286099_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
927465	contig_3018_pilon	-	2447	7	Intergenic	novelGene_78887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	519.117734451658	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	456	875	600079	583414	TRUE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCR	625113	569172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_570435_572321_572361_576713_576890_583318_583648_585063_585179_600008_600194_624772
927466	contig_8576_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_88737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	976	1296	638572	638252	NA	35	GGAAGGGACAGGAACTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTEIKSTAFVGGDDGEANVISQKKARGRLQNRPSTAHIKLKLKLKKIKTSQQETKYDLEYIPPEFRDHHKDRFDALNTNGERSDELWEDIKDNMHEESKRSLKR	639547	636848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_636800_639500
927467	contig_1275_pilon	+	1859	1	Intergenic	novelGene_108771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGGAAAAGAACATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415722	417581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_415700_417600
927468	contig_15047_pilon	+	2015	6	Intergenic	novelGene_52182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3061.42317231708	14	112	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	20	793	2194	3981	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRGVGRLSHLPLAEALFGGLTPPFLSFWVTTQVRARSPCSPQTWILLDRAVSPRF	2174	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3545_3858_4434_4552_4687_21007
927469	contig_8620_pilon	-	2495	1	Intergenic	novelGene_173884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	81	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	285	611	105143	104817	NA	35	GGCTACAAGTCCAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNTEKTKILTAGPISNIMINREKTEVVKEFILLGSTINTHQSSNQEIKRHVALGKSAAKDFFKVLKSKDVTLKTKLRLTQAMCFQSPHMPVKAGQ	105427	102932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_-_102900_105400
927470	contig_17144_pilon	-	2120	15	Intergenic	novelGene_29524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2241.18994564249	12	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	132	1484	179764	167934	TRUE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVAWSLPACIMFTSWPPAGAGPPTIQASP	183213	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166178_166491_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168021_172550_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
927471	contig_4426_pilon	-	1864	1	Intergenic	novelGene_15393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCAGAAATTAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483098	481234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_481200_483100
927472	contig_3077_pilon	-	1782	5	Intergenic	novelGene_26881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	978	1382	1343613	1342050	FALSE	70	CAAAACACCAGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVLAAVSGLSSTSATRRSRGPADSGVWWSGQAEKRTCFTDRHFSWYLDGELPHSVFWALLHVLDADLEGSINFLFCGPVVDTFLLAFSELSEHDNEGHFFLPHHLPEVRHRVGHGALGCNVDLLLPVIALGR	1347455	1341649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_1342198_1342587_1342705_1343473_1343630_1345317_1345432_1346608
927473	contig_7894_pilon	+	1938	1	Intergenic	novelGene_170769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAGAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26883	28821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_26900_28800
927474	contig_14441_pilon	+	975	5	Intergenic	novelGene_100514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	406.858083365687	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	368	796	116728	117610	FALSE	10	GCGCTGCCTACGAGTGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	110986	117789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111099_112558_112665_116578_116963_117220_117344_117539
927476	contig_15430_pilon	-	1472	1	Intergenic	novelGene_174698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAAGCAATCTACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70994	69522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15430_pilon_-_69500_71000
927477	contig_3948_pilon	+	2703	11	Intergenic	novelGene_53285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	154	651	1419351	1424054	TRUE	10	GCTGGGTTCGAGAGCTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQFNTKQMPNTTPGYSVAVQKAPFFHRWPFRVRYRRPAENPPNTLHEHEEEAGRGHERSPAGGRQHAKHGHNYDNEDHTEELNARAQQGAEDHGVLGWPEDITMHQLPSRLFHGVFLQQRAGVNVVLRGGGRSCRHHPQTGAKGPSSVNQPLSEQSENTGMSVI	1417071	1434980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1417201_1419326_1419410_1422641_1422720_1422799_1422883_1423776_1425389_1426895_1427004_1427092_1427212_1429093_1429217_1430585_1430715_1430815_1430985_1434910
927478	contig_5452_pilon	-	2293	1	Intergenic	novelGene_101033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	3	302	575585	575286	NA	75	AAAAACTAGAAAAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKPLSHYLPTPCSALDPGQALAIAESPGPEVGYVTSLEPFSLPWRVNKLTKRGKNKLLAPLSQEPRVSTAPLPRYRHKGPTDFECLSPWRDLRGPISTA	575587	573294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_573300_575600
927479	contig_3601_pilon	+	2949	1	Intergenic	novelGene_132947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	99	311	444453	444665	NA	60	AAGACAAATAAAGATCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRLSPESGGPCTIRAKVTAAKLLRNATGDRGMQRSVCHLAAPRGVRRGSCISSEGVRVRGWRCAPLLRPLASGFGAMERSVCCALETTEGSLPVILKRVSH	444354	447303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_444400_447300
927480	contig_3747_pilon	+	2790	8	Intergenic	novelGene_24883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4735.93209583146	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	230	709	201313	202653	TRUE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPGTCIC	201083	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202450_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203505_203651_203768
927481	contig_854_pilon	-	4390	1	Intergenic	novelGene_36337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4946	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTCTGCCTTGAGCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976950	972560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_972600_977000
927482	contig_9535_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_124464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CATCAAAATAAAAAACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226706	228248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_+_226700_228200
927483	contig_9121_pilon	+	3583	1	Intergenic	novelGene_134451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	106	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	905	1441	138261	138797	NA	20	CCTTCCTCACTTTCTACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDNIVDVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCADHNKLWITFQTMELPEHLIVLMQNLYLDQEAIVQTEQGDNSEFHGIRKSVCQDCILSPYLFNMYTEQIIQETGLYEEEWGIRIGGRLVNNFQYSDDTTLLAESEEDLKHLPMTIKDHTAFSMDYNLTYMKQKSSQLDQYAAS	137356	140939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_137400_140900
927484	scaffold_15027_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_163568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGCAAGAGGAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57465	58848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_57500_58800
927485	contig_7963_pilon	-	1136	5	Intergenic	novelGene_58402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGACCACTCTAAGCACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63342	51418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_51523_56705_56970_57285_57563_57781_57934_63003
927486	contig_9580_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_167740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAACCTTTCAGTTAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	842044	840189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9580_pilon_-_840200_842000
927487	contig_17753_pilon	+	2320	2	Intergenic	novelGene_105115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1269	1655	146485	146871	TRUE	60	CATAAGAAAAGAAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEPPAAKPTPASHPWGPLLPHALLSPPFGICSVWLCRGIWAGKKVFKLIPLETLALSGIIKQAVRAGLRGTFQERANRASNMETRQQVDRIRMILIARGLMQSPQWAPVPALGRGASKGQLYLHVN	145216	147579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_147318_147360
927488	contig_14970_pilon	-	2097	10	Intergenic	novelGene_44998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1549	1863	188827	177322	TRUE	15	GGGTCCGGCTGGGCAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232251	136032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192204_213683_213891_216611_216671_221190_221249_224291_224373_231343
927489	contig_5945_pilon	+	2380	2	Intergenic	novelGene_104586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	305	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	516	821	291138	291443	FALSE	35	AGATATTTAGACATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKKLNSHTADMEKVLVVWIEDQTSHNIPLSQSLIQSKALILFNSVKAERGKEAAEEKSEASRGWFMRFKERSCLHNIKVQSEEASADVQVVASYSGDLAN	290156	293002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_290373_290838
927490	contig_5023_pilon	-	1662	9	Intergenic	novelGene_7363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	529	879	647062	639176	TRUE	20	TGCCCATCTCAGCAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647590	618607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
927491	contig_8269_pilon	-	1829	4	Intergenic	novelGene_106245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCATCCAGCTCCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360380	342724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_342799_344511_344677_358159_358306_358936
927492	SIRV7	-	874	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	2	-7	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	61	20	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147668
927493	contig_12886_pilon	+	2729	1	Intergenic	novelGene_135468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	232	546	287027	287341	NA	30	GGGAGACTTACAGAATTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQNLAILASKENSGCTSSKTDLFFLLAVHGIFNILYQHHHSKASILLLSSLFTVQLSHAYEATENTMVWVKCTLVLKVTSLLFNTLKKSCAAHLSNAIRHLIS	286795	289524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_286800_289500
927494	contig_6847_pilon	+	909	4	Intergenic	novelGene_143898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAAGCCTTGCTGGGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237592	245163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_238042_238359_238506_239862_240039_245025
927495	contig_6326_pilon	+	3226	6	Intergenic	novelGene_168541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2227	2589	648585	660094	TRUE	15	TCCGACTAGAGGCCTCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMLTRFPLECGADQHQSRVHFLHGRGPVTAALRHAVIPTENQQTGEKSLPLLREQRHVDLHEDTVHLTELVPNQGAVRPREVANVVQPQVVQDQHVPVFSRQDLLQMPCDVVIDLCII	646358	680319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6326_pilon_+_648595_656631_656783_658007_658193_660077_660289_678950_679165_680090
927496	contig_14684_pilon	+	4111	1	Intergenic	novelGene_99662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	3203	3730	303467	303994	NA	35	AAGCACCAGGGTCAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQGCILSPYLFSVYAEQIIREAGLYEEEWGIRIGGRLINNLRYAGDTALLAESEEDLKDLLMKIKDHSLQYGLHVNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTVSTHGSSSQEIKRLIALGKSAAKGLFKVLKSKDVTLKTKVCLTQAIVFAIASYAWESWTVSKED	300264	304375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_300300_304400
927497	contig_6710_pilon	-	523	1	Intergenic	novelGene_90834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	653876	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653877	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
927498	contig_7275_pilon	-	2680	1	Intergenic	novelGene_111236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATTGTCAGAAGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212725	210045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7275_pilon_-_210000_212700
927499	contig_3956_pilon	+	2127	11	Intergenic	novelGene_15142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1268.10758218694	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	515	1548	65	1612	1281682	1290491	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKTRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281617	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282743_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
927500	contig_16703_pilon	+	1265	1	Intergenic	novelGene_72781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	915	1241	34762	35088	NA	65	AGAAAACCAAAAGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTNPPEPKYDVEYIPPELRHHPKNRFEILNTNDQKPDKLWDDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKRALEHEVAKANGRNDHTKELNKRFQRAAQEDKVL	33847	35112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_33800_35100
927501	contig_19848_pilon	-	3107	1	Intergenic	novelGene_173826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2092	2391	183961	183662	NA	35	CATGGCAGGATGAGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGILEHLIVLMQNLYTDQETVVQTEQGDTMWFKIRKGVCQGCYLFIVLFNLYAEQIIQQARLHEEQHNIRIGGRLINSLQYADDTTLLAESEEVLSTYC	186052	182945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19848_pilon_-_182900_186100
927502	contig_14780_pilon	-	1069	1	Intergenic	novelGene_166391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTTGATGGACACCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157875	156806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_156800_157900
927503	contig_13349_pilon	+	1671	2	Intergenic	novelGene_161118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1078	1383	13047	13352	FALSE	20	TAGTTTATTTTTTTGGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSSPFFFLTENIIKTVTKLHPNAINSIVITPKAIPVISTEGTVKNLLEQNDSYHEVTAKFVVSDAIIVSQFCNKMIILGPKSHHCFTPFPIIRPRKMKVP	392	13640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13349_pilon_+_924_12500
927504	contig_8587_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_159103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATCTTTTTTTTTTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93067	94737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_93100_94700
927506	contig_1517_pilon	+	3437	4	Intergenic	novelGene_179136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	55	534	188103	215249	TRUE	35	CAGCGCAATTGGAAGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SISLILSSNISNLLLSPSMTLSVSEILLFIFWVSNCCFCMISSCKFTLAFCSFIFFLNSSIFLSVFSMNLSAFSMSFFCFSPFHSLSSCQSNRKSPSTLLCLYGFGSCSSLLSLISILPPHITNSPLHPAYLHHALNITPPSSTGMAYQNLPYTDYRPTLVAVVSAKNNPSQQLLFS	188048	230030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1517_pilon_+_188279_214945_216873_220607_221151_229293
927507	contig_7179_pilon	-	1916	2	Intergenic	novelGene_78106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGGTTTGATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	650270	645178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_646029_649204
927508	contig_5649_pilon	+	1314	5	Intergenic	novelGene_82318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTCCTCGGGCCTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204871	207642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_205551_205708_205862_206084_206264_207097_207225_207466
927509	contig_10377_pilon	-	2480	3	Intergenic	novelGene_115360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGTAACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281995	193062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_-_193301_200043_202163_281872
927510	contig_1813_pilon	+	1449	2	Intergenic	novelGene_105470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	161	754	94152	94745	TRUE	35	ATAATTCAAAGGTGTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSRPLLLAVLQGASAASLRVSSKSDEHQSGIQGQPFVRWHESREETKQDRRHRMQRLTEDSGEGEMTCWEIQAPLVFAPHALVSGRSVPRTPRPSWAMALCLKQVFSKDKTFRPRKRFEPGTQRFELYKKAQASLKSGLDLRSVVRLPPGESIHDWIAVHVVDFFNRINLIYGTMAERCSETSCPVMAGGPRYEYRWQDERQYRRPAKLSAPRYMALLMDWIEGLINDEDVFPTRVGERHLASPFHRCGI	93991	96256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1813_pilon_+_94918_95733
927512	contig_1964_pilon	-	2876	2	Intergenic	novelGene_130913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	693	1040	162749	162402	FALSE	25	CAGGGTAGAAGCTGTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWSLIFISKCFKSFSLSASQVVSYAYHRLLMSLPLILRPRSSYSPASQIICSAYRLSKYGGRIQPLRTPFLTLNYAVSSCSVRRTASWSRYRFCVRTIKCSGIPILCSVIHNLL	173996	160565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_163426_173980
927513	contig_4884_pilon	+	2866	1	Intergenic	novelGene_63781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	2103	2585	109008	109490	NA	60	TCCTACAAATCAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGITENTERIVEDLLTEDFPDIMKDGKIPIQDAHRTPHRVDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKERTLRAARGKRKVIYKGESVRISSDSSAETMQARRQWDDIYKALKEKNCQPRIIYPAKLSLKYDGEIRAFPDKQNLREFAKTKQKLQEIPKGVLRLENQ	106905	109771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_+_106900_109800
927514	contig_6227_pilon	+	3072	2	Intergenic	novelGene_49827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTCTCACCCTCCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1399515	1402633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1400388_1400433
927515	contig_6958_pilon	-	1770	6	Intergenic	novelGene_69930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	550.592916772455	10	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	10	1074	189837	149618	TRUE	20	TAAACGGCATCCCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQEMMTHQSSSTEMLQEIRTMMTQLKSYLLQSTELKALVDPTLHMEEELEAIVESALYKCVLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	189846	148588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149004_149336_149939_154425_154590_160928_161061_183108_183418_189698
927516	contig_4519_pilon	+	2665	1	Intergenic	novelGene_123728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGGAGAAAAATGTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747484	750149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_747500_750100
927517	contig_854_pilon	+	1212	2	Intergenic	novelGene_36732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1529	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713401	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713482_1714862
927518	contig_7870_pilon	+	1879	10	Intergenic	novelGene_108993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGCCTATGTTGGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455011	854126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_455973_496468_496595_497821_497928_705749_705835_738947_739040_748850_748908_762132_762204_823988_824167_847510_847613_854025
927519	contig_1442_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_172177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGAAAAACTCCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708165	706899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_706900_708200
927520	contig_11338_pilon	+	2464	15	Intergenic	novelGene_6367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294820	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_295361_298712_298821_298901_299076_300260_300352_300823_300893_306727_306961_307227_307428_314757_314941_315144_315307_315548_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
927521	contig_11413_pilon	-	3830	22	Intergenic	novelGene_103175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	37.8474081524069	114	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	834	2505	860	3364	434408	427725	TRUE	10	GTGAGCATCGCTCTCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDDSAIRALTQFPLPKNLLAKVIQIATSSSTAKNLMQFHTVGTKTKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAALACKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPVLRKIETFLNHYPVDSSWISPEPRLQSDDVLPLGKDSGPLSDPITGKPYMPLSEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILGAIELHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGAHCNVIITQPRRISAVSVAQRVGHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPARGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYPHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPLGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMAPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPDIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGEVQAQQCHIQDQIRQHPAAQVDH	458121	427089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_-_427413_427504_427645_427721_427827_427921_428080_428181_428342_428463_428658_428726_428809_428897_429105_429330_429507_429762_429868_429951_430028_430275_431113_431470_431624_433440_433591_434303_434426_434914_435217_440180_440292_440937_441069_448052_448149_453845_453901_455922_456021_458072
927522	contig_17158_pilon	+	2715	19	Intergenic	novelGene_141141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	21.0475651798492	82	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	782	2349	132	2480	106842	152251	FALSE	30	TATATCATCTGACTGTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRRTLGFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLVSAVVRGLQPTYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGRSLGWTVAPFVVQICKNLDELVKQYESESVKLSISMTSKRENISPDYPLTLLEGLTTIGHFCLLEQPNQSKKTTAVSDTTNLRNAKNAILEELPRIVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLAAHLGVQLIAAVAAVWSRKKVKRHSKMKVKPSASQLTLVDLVCALSTLKTDTVLHLVKEVVKKPPQIKGDEKSSLVDIPVLQFSYAFIQRLPLPTLQENFPSLLGVLKDSVQLNLAPPGYFLLLSMLNDFVTRTPSLEGKKYQKDLQEVTQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVKAQPQISLEESDAEEDLCAEAAAASSMVSASAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKEKAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSALSGYSYTKRAWKKEVLELFLDPAFFQMDTSCVHWRSIIDHLLAHERTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAIFSGEFDQYHPYLPLIQERLTDNLRVGQTPIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMISELIQTFTQLEEYLKEEDESLRNSNKINRTKVSIPDANGPSMGEIPPSELILYLSACKFLDTALSFPPDKMPLFQIYRWAFVPEVDTEGPALLSDLEENHQECKPHTVRILELLRLKYGEISNSDEITVKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFRTLNCAFKTQSKLPADPSGPPLIEDLVTDSPRILQQLEESVEHDFLEHLEC	106710	152486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_+_106997_107806_107919_108496_108686_114127_114258_115550_115673_119036_119093_121097_121203_121300_121368_124391_124537_138421_138505_138725_138836_138962_139110_140318_140381_141421_141551_148683_148821_149988_150045_150276_150439_151466_151597_151999
927523	contig_15327_pilon	-	2740	3	Intergenic	novelGene_70756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGATGGTCAGCTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1252574	1073185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1073307_1073409_1073970_1250515
927524	contig_6552_pilon	+	3749	2	Intergenic	novelGene_163587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCCCTCTCTCACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82746	146024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_+_83377_142905
927525	contig_11908_pilon	-	2624	1	Intergenic	novelGene_133234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGGTTTGACCTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721625	719001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11908_pilon_-_719000_721600
927526	contig_3817_pilon	-	1640	1	Intergenic	novelGene_78398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCACCAGAACTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237767	1236127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_-_1236100_1237800
927527	contig_500_pilon	+	1534	11	Intergenic	novelGene_30992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	971.868020875263	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	313	1047	1492663	1497925	TRUE	15	CCCCAGATCACTGTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSLSRPWPLKHCRCWPLPSSQKIVWWQRATTAFRCCSPTTAPRGR	1485750	1499521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1491816_1492066_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496627_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
927528	SIRV3	-	89	1	FSM	SIRV3D	SIRV311	161	1	-2	74	-2	-74	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAACTCCTTTTATTAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4764	4675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_4700_4800
927530	contig_10126_pilon	+	2153	9	Intergenic	novelGene_105725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	925.371741180267	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	104	916	140715	166639	TRUE	40	TGAGAAATGTGAAACGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGAGSPASGQPPAARPQPSSRRGGAGPSLAPRLMGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139742	185129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140705_140794_161932_161980_162237_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169588_181522_181563_184074
927532	contig_383_pilon	-	1950	10	Intergenic	novelGene_126129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGTACTTTCGAAAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159743	141932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_142032_143970_144207_145078_145290_148650_148831_150745_150862_153253_153324_154229_154335_155145_155412_157138_157282_159219
927533	contig_8284_pilon	+	3185	5	Intergenic	novelGene_125718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	547.317321121852	9	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACAACACAGGACAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436258	499803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_436487_438444_438503_441534_441606_449073_450391_498292
927534	contig_3602_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_60626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTGAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	940647	941367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_940600_941400
927535	contig_11986_pilon	+	6462	3	Intergenic	novelGene_69133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	107	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4614	4943	199300	199629	FALSE	40	GGATCGCAAAGCACTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQAVVEAGTSQVRGSGWRLLLIHVAAGAGEPKIDKSESRALAHRLQRPSNPKTGRQMAGKLLGQVPRTGGQTNRSQLQDAEQAKAHKPCQKVHPYWMQATPTRNLPFH	182498	201148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_182602_187091_187999_195696
927536	contig_9863_pilon	-	1778	1	Intergenic	novelGene_153999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGGAACAATTAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51730	49952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9863_pilon_-_50000_51700
927537	contig_7146_pilon	-	2025	3	Intergenic	novelGene_162049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	882	1202	115826	115506	FALSE	35	AGGAGCATACCTAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLYLKIKKTKIFTTGPVSNIMINREKIEVVKDFILLESTINTHGNIGQEIQRHIVLDKSAAKDLFKVLKSKHITLNTKVRLTQTMVFSIASYACES	219691	114682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_-_115974_130845_131058_219169
927538	contig_16883_pilon	+	2557	3	Intergenic	novelGene_161758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	144	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1892	2275	541989	542372	FALSE	30	TGACATTGGTTAACAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWDIPVNWPDNVFSASVLPPSSLRSAWSLKSLQAAIQGTTIGLCSPGDRLLCNRGRRRVRNRRRIWNVWLIASINNCLFCHETRRTRWCPATITDQFGPRFCRTILIKRGKIQNRISTFCGLQTS	539757	542654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_540357_540534_541087_541248
927539	contig_16209_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_177379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACCAATAAATAGAAAATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8834	7682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16209_pilon_-_7700_8800
927540	contig_8452_pilon	-	1260	1	Intergenic	novelGene_48067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCTCAATCCCAGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536752	535492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_535500_536800
927541	contig_3825_pilon	+	3221	1	Intergenic	novelGene_78049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	631	1011	2549305	2549685	NA	35	ATTAGCCCTGTAAAATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLELENQKGRTCWAFLKLKELKKQIQASSCNTEGFYEQNTEQQKHQKKMEGIHRVTYQKDLVNVQPFQEVAYNQEPMVFSEEVQDALMALAKNKAPGTDRIPTEMFQQMDAMLDELTRLCQKI	2548674	2551895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2548700_2551900
927542	contig_9272_pilon	-	1945	1	Intergenic	novelGene_125991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGATGATAGGGAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	774475	772530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_772500_774500
927543	contig_5836_pilon	+	2995	2	Intergenic	novelGene_106276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	2096	2518	55191	56352	FALSE	35	AGAAACCCTGAGAGTATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIQLQKNETGPIPHTVYKNYLKWINDLNIKPKTIKFVEEKIGPTIQALIHAINRIQTITINTQNPTDNWDLLKIKHPCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNKSIKKWAKEN	53095	56829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_55607_56345
927544	contig_5063_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_110002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTACAATTAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32707	34531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5063_pilon_+_32700_34500
927545	contig_3817_pilon	+	1430	4	Intergenic	novelGene_78326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	679.765318980668	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	23	379	178717	204375	FALSE	45	CCAAGCAACCCCAAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLDPEMALLAEHLLKPPPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKADISGNITVRAGREPPQPHPRQRHQGLRDGSQEVPWLDRAEDLPGEGPEGHQLAGSTACPPRSQGSAVRSPL	178694	205426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_178820_197949_198013_201746_201904_204341
927546	contig_8691_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_72692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACTTTCAGAGTTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152224	150309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8691_pilon_-_150300_152200
927547	contig_9921_pilon	+	4702	4	Intergenic	novelGene_23747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	258.801081914276	4	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	128	883	321085	321883	TRUE	40	TTGATGAAATAAAAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEESSSTSECVSFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVEDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVSKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNNNGRNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDDSNNSISEHFHPTVIGESMYGDFETLKKLGVGDFSSTATSLCGTSGPQTRKKSKL	299188	326543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9921_pilon_+_299290_321058_321744_321786_323958_324798
927548	contig_5954_pilon	+	523	5	Intergenic	novelGene_28417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2202.93876163183	158	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	112	477	97851	98983	FALSE	20	CATCTCATTGATTCATCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLFVRAQELHTLEVTGQETGISPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALTTLEVAGRMLGGKVHGSLARAGKVRGQTPKVAKQEKKKKKTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS	97468	99029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97572_97842_97911_98038_98163_98637_98694_98857
927549	contig_4952_pilon	-	4183	2	Intergenic	novelGene_145540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2683	3036	509928	509575	FALSE	10	CTGCCCCATAGGGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIPIFMHSISCFTTSNFPSFTLRTLHIPIINGCVQLFLAILSRAISANEGPKSLTPSTIINVNSTLRRQLFPSRILSAFQPERLIFWHYIRQRSAAIHKVFTGPFLRSRLPGPSS	565245	508427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_-_510982_563616
927550	contig_9363_pilon	-	1385	10	Intergenic	novelGene_6574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	520.038460116172	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	132	845	757196	754336	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKAIVQAPRLLDRHIH	758761	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754381_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720
927551	contig_15114_pilon	+	3164	15	Intergenic	novelGene_121176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	52.4416099007228	136	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	685	2058	52	2109	651442	677858	FALSE	25	AATAATCCTTTGTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFPPHDTEPGKGRLVREDENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQIRKGINIPQVQASQPTEVNMYYQNTFQTMPYGSSYGIPYSYTTYGSSDAKSQKTDNTAPFKTPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRRLDSMKELHRTNQQQHEKHVQSRVDSSRAIERLEGSSGGIGERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSEFSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLSSDDEETSTDVTNFSLEKDRISKESSKIFEDVLESFCSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAYIGLCLPKLFNPLIRLQLLIWTPLEAKCQDFESMLWFESLLFYGCEEREQEKDDVDVALLPTIVEKVILPKLTVIAENMWDPFSTTQTSRMVGITLRLINGYSSVVNAENRNTQVYLKALLLRMRRTLDDDVFMPLYPKNVLENKNSGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSNKTLQELSIDGLLNRYILMAFQNSEYGDDSIKKAQNVISCFPKQWFVNLKGERTISQLENFCRYLVHLADTIYRNSIGCSDVEKRNARENIKQIIKLLASVHALDHAMTVAGDHNVKEFKSLIEGK	651390	678913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_651614_652151_652256_653279_653498_654004_654198_658662_658787_662559_662660_662747_662864_665290_665491_667331_667477_668358_668481_669734_669812_670208_670276_675200_675348_676587_676743_677740
927552	contig_3721_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_123841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	216	651	715	1365	517711	517061	NA	35	ACCCCGTATAGAAGAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSLVEENTLELPHREFKSLKLRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQRQQLGIQKINNKISEMDDIIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRAKKNEETLRIMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	518425	517060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_517100_518400
927553	contig_6102_pilon	+	1511	5	Intergenic	novelGene_31832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	477.906371583389	52	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	96	545	370803	393836	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQHSLAAGPFDKMGGTPLIPMYHCCYCQTRTKAPRGRPHRRRGP	370707	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371123_393706_393856_393929_394036_394221_394272_394467
927554	contig_16766_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_153363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	182	565	146007	145624	NA	55	CAGACAGGCAGAAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQRMDAALEVLTCLCQEIWKASARPTDWKRSVFTPIPKKGDPAEHRNYRTISLISHAGKILLKIIQKWLQQCIDRKLPDIQLYLQEDLEPGISLLMSDGSWLKAENTRKMFTCILLTCKGIRLCGS	146188	143913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16766_pilon_-_143900_146200
927555	contig_6710_pilon	-	563	2	Intergenic	novelGene_95447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	256	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	657511	653562	FALSE	5	TTGCACCTGTGGTTTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657512	653359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
927556	contig_12638_pilon	-	2813	18	Intergenic	novelGene_33115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGAGCAGAACAGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200485	170876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_171076_171692_171746_173507_173557_178085_178281_180794_180859_180952_181013_182933_183048_183450_183604_185487_185628_188442_188508_191148_191355_191725_191807_194306_194447_195508_195552_198066_198149_198734_198841_199333_199412_199500
927557	contig_7630_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_133646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	101	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAATACTACAAATACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436593	438400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_436600_438400
927558	contig_14744_pilon	-	1287	4	Intergenic	novelGene_65985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	499.371827621685	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	53	562	969897	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSQLHHHWLSCPHPSVMEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969949	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961206_968092_968630_969717
927559	contig_9083_pilon	-	730	1	Intergenic	novelGene_150134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAACATCATCATTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1096253	1095523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9083_pilon_-_1095500_1096300
927560	contig_4156_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_88086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAATAGTATTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227232	226358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_226400_227200
927562	scaffold_12124_pilon	+	1890	10	Intergenic	novelGene_22276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3350.51412306961	7	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	33	374	1473608	1497011	TRUE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRAALVVLLLGLLGALSRGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGAVLPVMMPCASFHS	1473575	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496967_1497122_1506629_1506687_1508010_1508802_1509018
927563	contig_361_pilon	-	3924	4	Intergenic	novelGene_166608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	104	junction_2	31.8224239596337	31	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	562	1689	221	1909	1011845	983839	FALSE	45	CACCAGGGCAAAAGAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVVIEDVAVDFTQEEWALLDLAQRKLYIDVMLETFINLASVVSRNLSDGKTFSSEHTIVRFMKNDSWSSVLGDIYELHGIEDKHNDQGSYLRRHMVEKFHENNEGNHCGKLSQLPKLTVFKRTPTEVNPECLECGRAFIDHSSHRHCIRSGCKNTCQCKKCGEACSCPYLSAPVNNLSREKPYECNQCGGDFCSVPSFQTHVRGQKGEYKEYWRICPSSLTLHKKVHNGDKPYECKECGKAFRHSSALITHIRTHSGEKPYECKECGKAFSDPSSLTTHVRIHSGERPYECKECGKAFTNSSALTRHMRTHSGERPYECKECGKAFSDSSSLTAHIRIHSGERPYECKECGKAFSISSSLTTHIRTHSGERPYECKECGKAFSGSSAFTTHIRTHSGERPYECKECGKVFSQSSSLITHIRTHSGERPYECKECGKVFSNSSALTTHIRIHTGEKPYECEECGKAFSHFSNLTKHIRTHSGERPYGCMECGKLFSRSSHLIRHIRTHSGERPYECKECAKAFTDSSSLTRHTRVHSGVRPYEWKERGKAFIHASVLNEHH	1012065	981823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_985247_985602_985754_986721_986849_1011842
927564	contig_11224_pilon	-	2831	1	Intergenic	novelGene_124450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	281	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	727	1065	16439	16101	NA	5	CTTAGTTTCTCTGGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILEKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGTLITCKFLLLIVSHIILRVSSFFFILFSDFSSNRVVSKCSPSILLILSSIVSNLLLSPSMTLSISEILLPFGFLIVVFV	17165	14334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11224_pilon_-_14300_17200
927565	contig_20780_pilon	-	1124	3	Intergenic	novelGene_179137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3732	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20780_pilon_-_41_136_444_2954
927566	contig_6164_pilon	+	3675	3	Intergenic	novelGene_121301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1828	2130	765470	765772	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQMTQLCLLKAKREDLKHLLMKIKHYRLQYGLYLNIKKTKILITGSISNIMINGENIETVEDFILLGSTVDAHGSSSQEIKNRIALGKSAAKDLLKVFKS	705833	767317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_706095_763691_765245_765456
927567	contig_5247_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_81830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAGGAAGCACTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	365415	367987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_+_365400_368000
927570	contig_12644_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_44588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	683	1021	2109867	2109529	NA	15	TCCACTTATGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYHVGGWARAALGVGGLGLYPCFPSPAGELPAQCGVAEKKQMPPLPTPQVKSHPFSYSLPEALLSSSVEQLRISDRGVVGRIKWNNVHGVSYALGLLLELWRRKCGLSSSL	2110549	2109017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2109000_2110500
927571	contig_11417_pilon	-	1824	1	Intergenic	novelGene_103296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTATAGGGTCGCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497754	495930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_495900_497800
927573	contig_9809_pilon	+	3735	11	Intergenic	novelGene_176756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	233.07801269103	4	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	101	1174	108357	112511	TRUE	30	TCTATTAAAAGCCCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRDLLRQSLNCHGPSLLSLLRNEQQDNPHFRSLLGSAAEPARGPPPQLQGRKEKRVDDFEIQKFISKKADLLFAVSWKSDAPAVSDVNEDSEDHYAVMPPLEQFMEIPSVDRRELFFRDIERGDIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDISHLEITALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYRRSVELNSNSLESYENIMQSSLGFANPGVVEYLLGKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGIRNERKSEQSNRRF	108256	118056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_109124_109325_110410_110496_110652_110783_111181_111338_111746_111819_112250_112357_112466_112585_114806_115991_116752
927574	contig_3789_pilon	-	2179	1	Intergenic	novelGene_79902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAATAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647404	645225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_645200_647400
927575	contig_3956_pilon	+	1331	3	Intergenic	novelGene_14753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.5	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	438	950	795495	796007	FALSE	45	ATTGAAGGAATCCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPGLLANLTALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793986	796388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007_795374_795477
927576	scaffold_12124_pilon	+	2079	12	Intergenic	novelGene_22096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_3	187.89956874321	2	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	703	1068	879089	894124	TRUE	35	CAGACAGAGACTGGGAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEWKMSSHFSSDFVYELQIYKGADPTHLDTHTVIDKNSYELVNPGTYTARIRGKNNLGYFGKTWSSWSPPRSFECDNDRSLGAWPMMLSIVLGTLLTVLLVVLLCRSRMTPVTHHSGIQLS	860241	895737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_860365_867260_867354_869990_870110_877126_877262_877341_877521_879035_879152_880642_880670_883677_883808_885382_885483_894078_894148_894465_894711_894994
927577	contig_15118_pilon	-	1662	1	Intergenic	novelGene_74599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCCTTCACCTGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382932	381270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_-_381300_382900
927578	contig_5758_pilon	-	2988	1	Intergenic	novelGene_119079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCGTTGCCATCGAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146258	143270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_-_143300_146300
927579	contig_17144_pilon	-	2195	10	Intergenic	novelGene_29541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1631.46447126122	14	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	434	1105	172541	167839	TRUE	15	ACTGTTTTTTTCTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALGKGRQGLGREGCWEGTPGAPHKDSPF	174663	166091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172651_173396_173460_173580_173751_174572
927580	contig_4797_pilon	-	2085	2	Intergenic	novelGene_6893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253309	240713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_-_242706_253216
927581	contig_8377_pilon	+	4170	26	Intergenic	novelGene_34928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3146.46951003819	2	65	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	968	2907	83	2989	68257	194595	FALSE	40	CCTAACAATTTCAGATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRWVGFDNICSETHRKLAVLVHTFS	68093	195776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346
927582	contig_9575_pilon	-	2214	3	Intergenic	novelGene_169720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCATCCCACACCAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484745	467525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9575_pilon_-_467630_476843_476912_482703
927583	contig_7078_pilon	+	3298	1	Intergenic	novelGene_130135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	2	307	130630	130935	NA	40	AGATTTTCATTAGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDVRILKTTLYAKLDSKKHGAYGKNEIGVQHPKVLSISHLKKKRNLIIIAQFYTCYVIREERTAGDVVERLAADREVSGSQPPAAPWKPYGAVLLCPTGSL	130628	133926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_130600_133900
927584	contig_6424_pilon	+	3731	2	Intergenic	novelGene_109239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCTTGGTAAAAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369	4141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6424_pilon_+_927_967
927585	contig_3463_pilon	-	2786	1	Intergenic	novelGene_62019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGACAAAGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608358	605572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3463_pilon_-_605600_608400
927586	contig_9871_pilon	+	923	1	Intergenic	novelGene_75641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAAGGATGTAGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362199	363122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_362200_363100
927587	contig_11071_pilon	+	2733	1	Intergenic	novelGene_131041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	2036	2392	192891	193247	NA	70	TAACTAAAAACAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFELVVQSKRMLGPPGQERQEDPRVRGSCCSLGVSFSESFRELLPSRQVCCAQVRLSGSWGPHWWTVCPESKVDVSTPQRSGSVRHQITIGTDSPLPSIRLTAKEKARVSSSPSNKF	190855	193588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11071_pilon_+_190900_193600
927588	contig_1925_pilon	-	2559	2	Intergenic	novelGene_162225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1296	2345	574815	573766	FALSE	55	TATAAAGATAAGGGTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRN	576664	573551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_575799_576352
927589	contig_16322_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_87572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGTACTAGAGAACTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250625	249244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_249200_250600
927590	contig_6137_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_59185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1877	2206	1286232	1286561	NA	35	ATTTGCTATATAATACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGTQAKGGGGGERPGRNKKKRKKSNTSSQQMALRQPPVQVCGIQAATVSRSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVVFLVVLSPTGSSVRLLSRAPCFLVSNRSPRWWITLS	1284355	1287029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1284400_1287000
927592	contig_3789_pilon	+	2321	1	Intergenic	novelGene_79825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198062	200383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_198100_200400
927593	contig_13021_pilon	+	2355	1	Intergenic	novelGene_8121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151298	153653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_151300_153700
927594	contig_5201_pilon	+	1233	1	Intergenic	novelGene_82158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAACTTTCACCTAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143552	144785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_143600_144800
927595	contig_9668_pilon	+	3753	1	Intergenic	novelGene_58246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	89	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595737	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_595700_599500
927596	contig_6439_pilon	-	3501	2	Intergenic	novelGene_154236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1674	2015	337969	337628	FALSE	75	TTAGAAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTVLFPFGFLSPGLCMFHDNTLSSRAALCSLLFSFYFIISICFSYCMFESKFQSLFWHSFCSFLSLLLFNDLLLSSWMMSLVLSHNLSGFWSLVFSASNLFSRWSLNSDGIY	339707	336141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_338736_338800
927597	contig_1719_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_87332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	544	867	511023	510700	NA	35	TAGTAACTGTCAAATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQENEEVGQHLPGSHRVCGGACSGSQPLPRGVTPVPQTLSLETQVMLSSPQLLAGRPQVQAAVFPSLLSRWKILTFSQQYLLIVFFGQMEHCVFLNFPGRLLIKIM	511566	508953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_-_509000_511600
927598	contig_18850_pilon	-	2783	7	Intergenic	novelGene_142431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1	372	181466	181095	TRUE	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LERDLPRLAGVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181466	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177238_177567_177654_177998_178052_178212_179146_180513
927599	contig_10196_pilon	-	1011	1	Intergenic	novelGene_132200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATACAATTAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1235418	1234407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1234400_1235400
927600	contig_3382_pilon	-	1637	1	Intergenic	novelGene_124006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCAAAATTCTCCACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115753	114116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_114100_115800
927601	contig_12550_pilon	-	3458	6	Intergenic	novelGene_175274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAACAGAGAAAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81771	35324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_-_35415_37450_37522_66413_66496_71648_71775_75740_75893_78834
927602	contig_10456_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_163458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCGTGTACTTCTTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24217	23182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_23200_24200
927603	contig_15104_pilon	-	1778	2	Intergenic	novelGene_163358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTTCAGAAATACATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620357	616036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15104_pilon_-_616820_619362
927604	contig_17075_pilon	+	3159	4	Intergenic	novelGene_131760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	804	1133	121926	122255	TRUE	45	GAAAATGGGAAAATGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLTLALLAQIKKAGNNKCWRGCGEIGILMPCWWECKMIQPFWKMTWRFLRKLEIEILYDPAIPFLGIYPRERRVITSGQPGTDTATDT	99726	280669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17075_pilon_+_99888_121283_122787_122874_123176_279475
927605	contig_8269_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_106229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTTCCTCCTAGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282311	283701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_282300_283700
927606	contig_17522_pilon	+	3808	1	Intergenic	novelGene_160799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTAGCTGCCTTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75050	78858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_+_75000_78900
927607	contig_9668_pilon	-	2201	1	Intergenic	novelGene_58268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	1162	1638	667373	666897	NA	45	TATTTTAAAACTTAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVLAIPFGTEASRLLVSLVSLASASVSCGLLALGPHACICPAGASVPKLCSSTDKCPEAPHSARKPPAHGHSAPLLRGSASLAPPISVRRHTTPPGSLLHTGTQLSCSVGRLQCHLALVSWFCCCWFSAAAASLLLLVLCHCRMSIHSQF	668534	666333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_666300_668500
927608	contig_10861_pilon	-	1774	1	Intergenic	novelGene_39463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGAACACTCTCCAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2693072	2691298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_2691300_2693100
927609	contig_11656_pilon	+	2535	22	Intergenic	novelGene_54016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	146.196649474125	1	74	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1794	210	2003	484818	531210	TRUE	25	CTTGGCAGAGCCACAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRPSPHLPCPGEPFPCPASPPTEERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIA	465017	536768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_465770_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528685_531208_531337_535319_535411_536453
927610	contig_3602_pilon	+	889	1	Intergenic	novelGene_60687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTTATAATTAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1274648	1275537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1274600_1275500
927612	contig_17274_pilon	+	1611	1	Intergenic	novelGene_26591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGCCTTCACCTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247947	249558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_247900_249600
927613	contig_11574_pilon	+	552	1	Intergenic	novelGene_64044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTTATTGCATTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372433	372985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_372400_373000
927614	contig_4486_pilon	-	2179	8	Intergenic	novelGene_38539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	210.023419491003	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	275	1492	177451	130815	FALSE	30	GTAAACTGTCTTATGGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQSGMEIPVTLIIKAPNQKYSDQTISCFLNWTVGKLKTHLSNVYPSKPLTKDQRLVYSGRLLPDHLQLKDILRKQDEYHMVHLVCTSRTPPSSPKSCTSRENREALATSSNSSSDHSGSSTPSSSQEALSVGASSSSEGLRQRTLPQAQTDPAESHQFPYVMQGNVDNQFPGGAIPAGFPVYPAFSPLQMLWWQQMYAHQYYMQYQAAVSAQATTNATPAQPTAPQPLNLAHVPGEEPPPAPNLVVQENRPMNENVQMNAQGGPVLNEEDFNRDWLDWMYTFSRAAILLSIVYFYSSFSRFIMVMGAMLLVYLHQAGWFPFRQEAGQQEAPNNNAEVNNDGQNVNNLELEEMHLMDDGLEGESGEDAGEDASAIQRPGLMASAWSFITTFFTSLIPEGPPQVAN	177725	130127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_130974_131464_131583_132279_132604_143870_143994_156241_156397_159433_159548_162084_162163_177304
927615	contig_7707_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_72138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTATCAGTGTTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114105	111888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_111900_114100
927616	contig_13674_pilon	-	4637	1	Intergenic	novelGene_140304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3486	3791	11782	11477	NA	25	GAAGGGAGTCACTGTGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSSLSVFYQFSHSIWCLAEFFISSFDVLGFQDCCFSVWLSFSDLCCGRMAWCFCLECHFARSSDCMFVMREVPCRYLEKELSSVPCDIHQPSPNPSSEG	15267	10630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13674_pilon_-_10600_15300
927617	contig_19269_pilon	-	1682	1	Intergenic	novelGene_175630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCTACACTAAAAATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12644	10962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19269_pilon_-_11000_12600
927618	contig_10225_pilon	-	1721	4	Intergenic	novelGene_86860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	44	325	47709	47428	TRUE	15	TATGGATTTTGGGCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNQDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47752	42101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_42723_45213_45256_46107_46657_47243
927619	scaffold_9205_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_161106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAGAATTTAATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288370	286831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_286800_288400
927620	contig_4364_pilon	+	1423	2	Intergenic	novelGene_86	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	23	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	254	418	859912	861448	FALSE	20	CTAGCCTACTTTATTGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASYSCPANYRKLGGLKQQKLILAVLAVRSPKSRCQQGRAPCSAGGGCLLPTLALGEAASIPLQLLVVPGVSRLCLLSYEDTSHCMRPTLPQRDLVSTDSVFRDSISQRGPVHRYPGQLPQLGTSFVHLDLPARPLRLD	859658	862453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_860006_861377
927621	contig_8377_pilon	+	1203	2	Intergenic	novelGene_34972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAGAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68101	69353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68678_68726
927622	contig_10988_pilon	-	3462	3	Intergenic	novelGene_104717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	640	1131	32414	31923	FALSE	45	AAAAATTTATACACACGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGNFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGTPITHRFLLLIVSPVILRVSSFFFVLFSEYSSNRVVCKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTLSISEILFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFLSAFSMNLSIFFLIFVCFLLQLLENSEY	59275	29591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_32672_58577_58617_58932
927623	contig_17976_pilon	-	1150	2	Intergenic	novelGene_32456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	15	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCCCCTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2258	1028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_1926_2005
927624	contig_19473_pilon	+	2430	5	Intergenic	novelGene_179138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	58	90	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	986	1360	19766	20683	TRUE	25	GGGAAGCATCTGATGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKHQKRKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDKSDQRLISKISSKMLQNLNNEKTNNPIKKWAKDTEFSQSQKDKYCIRPLLQELKKRFKHRRHSLMVTRVGREGGGYSLSR	18780	24943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19473_pilon_+_19999_20541_21312_21361_21566_24611_24793_24886
927625	contig_9177_pilon	-	1027	1	Intergenic	novelGene_32808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATCCACTTGTGTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1573179	1572152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_1572200_1573200
927626	contig_6059_pilon	-	897	8	Intergenic	novelGene_44866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2932.86324541847	3	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	25	789	573264	569146	TRUE	85	AAAATAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573288	568137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
927627	contig_15407_pilon	+	1938	2	Intergenic	novelGene_123101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	941	1468	559858	560385	FALSE	55	CAGATGCCAGAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSKLSVIMLNVNGLNAPIKRQRVADWIKKHDPSICCLQEAYIRLKDTNKLKLKGWEKRYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEVDYIMIKESVHQEDITIINIYAPNDRAPKYIQQTLNDTKKRDRQLHNSSRRLQCTTFCEGQNIQKEAQQRCRRAKCYNQPT	551607	560855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_552011_559320
927628	contig_14525_pilon	-	2556	2	Intergenic	novelGene_149792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	130	300	311649	311479	TRUE	70	AAAAAAAAAAAACCTACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPLSPLLFNSVLEVQAREIRQEKEIKAIQIGKEEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIEHFSKVSGYKINIKKSVGFSTPTKRTLKRESPNQYHL	311778	264164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_266037_311094
927629	contig_9177_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_32688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	411	857	411067	411513	NA	55	ACTGTAAAGGAAAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQHLLKKLQIEISYDPAIPLLAIYPREIRAVTQIDICMPMIIAALFTTAKRLKQPKCSSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDESGKHLTTWMHLEGIVLSEINQSQKGKYCMRPLQKPKKRFTHRKKQSLMVMRKGRGEEGKSLTR	410656	412570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_410700_412600
927630	contig_21386_pilon	+	3714	1	Intergenic	novelGene_177026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	3410	3712	38348	38650	NA	40	AGACTGGGAAAAAATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLWHNWISICKKLKQDPYLTPGTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMVEEIGTTLGALIHGINTIRTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLRSSKDFTKRVKRQP	34938	38652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_+_34900_38700
927631	contig_9036_pilon	+	2572	1	Intergenic	novelGene_155440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	1055	1660	69732	70337	NA	25	TTTGTGGAAAACAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERFFPEGGIFDLRGRLDGSTYLSPIKGCFSLILDAQVYSLPLALSQSGKRLPSTTACLTMYHQLIWPEGLWLPLGQVWQFLAASKPTLPSPATQSDSSTLLLMFMAPRLSYIIDSLFFSGLCCKRDHWTHLTAILAPPLYYFVKQHVDLQYLKIKSLVKKKLFFLGMCNNHVAQSSLFYSVLRMLRVSFSVVPKNCNKA	68677	71249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_68700_71200
927632	contig_14441_pilon	+	788	5	Intergenic	novelGene_100443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.6011363473323	1	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	235	756	125667	126705	FALSE	5	GCAGCCTGGCCGTGTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSCVPLCQQLCSGNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	82323	126737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_82353_112608_112665_125517_125902_126159_126256_126514
927633	contig_3935_pilon	-	2057	2	Intergenic	novelGene_178468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	93	458	84177	83812	TRUE	40	ACAAACGGCACCCAAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFRISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFVNSSNFLSLFSMTLSIFFSCLSAFCLSSWRILSMRDLNSLSGSSSAFSSTEESSGVLIWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	84269	58814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3935_pilon_-_60325_83722
927634	contig_5031_pilon	+	839	1	Intergenic	novelGene_133197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGAACTTGCATATGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38585	39424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_38600_39400
927635	contig_10446_pilon	-	1514	1	Intergenic	novelGene_162479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTAGAGTATGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746306	744792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_-_744800_746300
927636	contig_1225_pilon	+	2683	4	Intergenic	novelGene_44188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300.756084264678	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	88	267	87	353	253442	274411	TRUE	10	CACTCTGGCCTGGTATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHSLKKKNRGVFAGGQEDSSPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	251392	276796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251452_253414_253520_274222_275033_275087
927638	contig_5153_pilon	+	1917	16	Intergenic	novelGene_74361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	270.080103343845	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	274	1668	1007835	1022174	FALSE	15	TCCTGTCTCATGTGATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAGPGLREGAVGPERRAVGPERRAVGPEQGAVGPERRAVGPERRAVGPERRAVGPERRAVGPERGALGPERRAVGPERGAVGPERRAGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956632	1022423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015524_1015779_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
927639	contig_1244_pilon	-	2106	1	Intergenic	novelGene_38081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	449	1350	2	1351	1400961	1399612	NA	45	ATTTCTGAAAATAAAGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YECKDYEKGFSQSSPLTTHIRTNNGQRPYECKECGKAFNRSSSLTQHIRTHNGVRPYICKECGKAFRCSSYLTRHVRIHSGEKPYECKQCGKAFCYSSVLVRHKRTHSGEKPYECKQCGKAFCYSSVLVRHKRTHSGEKPYECKQCGKAFRCSSHLASHIKTHSGERPYECKQCGKAFSQASGLTTHRRTHSGERPFECKECGKAFSQASGLTTHRRTHSGERPFECKECGKTFSRSYNLSLHIRIHSGERPFECKECGKALSCSSALTTHRRTHSGERPYECKECGKAFSCSSALTTHRRTHSGERPYECKQCGKAFVCSSALATHRRTHSGERPYECKECGKGFNQTSHLVIHIRTHKGEKPYECKECGKAFRCCSQLTRHIRTHSGEKPYECKQCGKAFYYSSVLTRHKRTHSGESPYECKECGKVFSCSSALTTHRRTHSRERPY	1400962	1398856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1398900_1401000
927640	contig_11720_pilon	-	1299	9	Intergenic	novelGene_43829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCTGACAAGGGGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98765	67975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78498_86223_86415_87069_87133_93163_93247_94952_95059_95381_95486_98299
927641	contig_8576_pilon	+	5100	1	Intergenic	novelGene_88759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCTATGTGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	726533	731633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_726500_731600
927642	contig_10734_pilon	+	2748	2	Intergenic	novelGene_51492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	399	758	2265456	2265815	TRUE	30	ATCCGGGGTGGAAAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265057	2269904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2267192_2269290
927643	contig_4232_pilon	-	759	1	Intergenic	novelGene_63407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAGGAAGTAAATAAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467400_468100
927644	contig_9571_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_136286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCTACTTCCTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468648	467513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_467500_468600
927645	contig_10857_pilon	-	2578	1	Intergenic	novelGene_160891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGATCTTTATATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34417	31839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10857_pilon_-_31800_34400
927646	contig_10953_pilon	-	1156	2	Intergenic	novelGene_42581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGACCCACAACCCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460344	455179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_455336_459344
927648	SIRV6	+	740	7	NNC	SIRV6A	novel	1528	10	NA	NA	-383	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	29	3	FALSE	0	NA	NA	C	coding	113	342	100	441	2002	10736	TRUE	40	ACTCACCATAAATTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVLPNVSRPISLTSSLLVVFIVYASPICIVPLGMAIVGLDAIVLAISTSAVAKVPTKVRLEAIGSICSQVVVVGMALVVRLGRVEAILLPEGAESLGHVVGRIVRTMGLVVFGLTNVAMPCELLMKHEWSVLWSLLSKSPVIKKCV	1902	11345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3171_10721_10819_11031_11109_11205
927649	contig_7963_pilon	+	1174	5	Intergenic	novelGene_58383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1282	junction_4	894.940326222928	8	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	76	840	51450	63007	FALSE	10	AGCTGGGTGACTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51374	63341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57564_57782_57934_63003
927650	contig_15752_pilon	-	1948	1	Intergenic	novelGene_148795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGAGGGTTTAGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414380	412432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_412400_414400
927651	contig_2637_pilon	-	1826	1	Intergenic	novelGene_100025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCCTGGCCCAGATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36902	35076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_-_35100_36900
927652	contig_12402_pilon	-	2741	1	Intergenic	novelGene_133369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCATAGATTTTTCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587555	584814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_584800_587600
927653	contig_14142_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_120507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAAAGGTTGCTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341746	343579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_341700_343600
927654	contig_20550_pilon	-	2561	17	Intergenic	novelGene_142615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGACACCCTCCTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30184	3744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_3889_10674_10766_12451_12493_12952_12990_15548_15602_15689_15768_15897_15954_18903_19067_19167_19264_19383_19491_19756_19858_20007_20107_20466_20611_21234_21398_24121_24274_24355_24434_29226
927655	contig_10459_pilon	+	3532	4	Intergenic	novelGene_179139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	204	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1254	2303	180608	181657	TRUE	60	AGAATCAAACGAGAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDIIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	155421	187675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10459_pilon_+_155842_179069_179220_179924_182427_187215
927656	contig_11742_pilon	+	3338	1	Intergenic	novelGene_166538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	144	156	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCGGGATCCCACCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86831	90169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_86800_90200
927657	contig_2161_pilon	-	2760	1	Intergenic	novelGene_114935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	683	1138	882598	882143	NA	70	ATCAGAAAAAAAAGAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDAALEVLTRLCQEIWKIATRPTNWKRSIFMPIPKKGDPTEHRNYQTISFISHASKILLKIIKKGLQQNINRGLPGIQVRFRRGHGTRDIIADVRGILAESRDYQKDVYLCFIDRAKAFNCVDHNKLWITLRRIGNPEHLIVPMRNLYID	883280	880520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_880500_883300
927658	contig_5317_pilon	-	971	3	Intergenic	novelGene_76526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGCGGCTGCGAACACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43843	33696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_-_33863_36674_36839_43202
927659	contig_14711_pilon	+	4092	3	Intergenic	novelGene_68911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	478	junction_2	229.5	8	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	1	699	84855	85937	TRUE	20	TCTCAGACCTCAGTTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFVSPAFTPLLIPATPPLLPWLPAPSFTLLPGDHPAVFPRSSSSLCPTAAQTGNLCHLILSPLFIPCQASRAPSADGTLFPGFPGLRAPCVFGGTYGTHLVPNSPPPSRITPLWVR	84854	90806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85050_85433_86242_87717
927660	contig_9668_pilon	-	2545	16	Intergenic	novelGene_58190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_15	841.846541835268	5	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	663	1992	245	2236	605373	503609	FALSE	30	AAGTTAAATGTTTTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669969	503299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610423_610514_662727_662779_669866
927661	contig_16951_pilon	-	4556	8	Intergenic	novelGene_98622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	3462	3986	91396	69709	TRUE	50	AGAATTAGTCCAGACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGFQRTGGWCGHLQQWWQGLPEAAVSRVLPLAVWRGGGVQGAPVVKGGGGGVHTVAVHANRVHQALFGGDCFSDSVLPSSFSWAFSKALEPLGKGWWLKRSSHRRLRHSLARKRRTYPMLFTTGRLRTCCFPSKEAETAQTHCRVLFSFFPDDMGVMSPMRGQRGYQSVPWS	109943	46522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_-_46739_65741_65872_68466_68667_69684_69813_74285_74484_91173_91462_103953_104096_106689
927662	contig_6488_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_44775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTTTATACCAACCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262921	261370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_261400_262900
927663	contig_9843_pilon	+	3256	1	Intergenic	novelGene_114311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	6	389	23977	24360	NA	35	TAATGCTCATAAGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMGTRQGCSLSPLLRNIVLKVLDRAISLEKQIKRIQIGKEEVRVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELMEDFSKVSGYKINIQKSLDSFTPTKELQKGHHQINTIYNSPQEDKILRNKSNLRRKRSIQ	23971	27227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_24000_27200
927664	contig_19712_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_178181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1292	1744	141716	141264	NA	25	AATGTAAATTGTTCTGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTELKDLENSIVQTKDMCPRMFTKDVATQSFFKEIKPVTNRSNQLPQQITHQLRLKVTETERKERKLSASWNSTDRKQAKGTTSVVLQGKKRTIPGAAQRSAQLLEGIQEAGPSWFQRVGPRSPGFQRVGPQPPRFQRVGSSPTWFPRV	143007	140938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19712_pilon_-_140900_143000
927665	contig_1230_pilon	-	1849	8	Intergenic	novelGene_28860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGAGACCGGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408876	404460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_-_404521_405236_405381_406134_406278_406373_406930_407146_407348_407584_407788_408002_408239_408570
927667	contig_6578_pilon	-	1513	1	Intergenic	novelGene_162242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGTTGAGCTAGATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210070	208557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_208600_210100
927668	contig_14575_pilon	-	3227	3	Intergenic	novelGene_101921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAACAGGTTTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406176	351481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_351535_396086_396427_403342
927669	contig_4832_pilon	+	3819	2	Intergenic	novelGene_163397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2968	3435	253986	254897	FALSE	60	CAATGAAAAAGCTGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASASSQNKESRNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRILQEIRKEINQNAEHAIEEIKKISEEHNDKFNRLQESTKRQQSEIRKHNKKISELDNSIESHWSRIEAMQWDDIYKAFKENNYQPRIIYPAKLSLKYDGEIWTFQDKQKFREFAKTKPKL	251018	255281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_254297_254740
927670	contig_8377_pilon	+	2649	11	Intergenic	novelGene_35132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3489.05051410839	5	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	647	1474	192235	197939	FALSE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	180430	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_180510_182902_183052_183262_183395_185724_185817_189180_189272_191119_191207_192218_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
927671	contig_5605_pilon	+	1487	1	Intergenic	novelGene_143949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAACAGAAAAACAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433810	435297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_433800_435300
927672	contig_3612_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_87845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTACAAAAAATTCTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989024	987841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3612_pilon_-_987800_989000
927673	contig_9988_pilon	+	2349	1	Intergenic	novelGene_113054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	28	87	259	345	57336	57422	NA	50	TAATGCGTTAAAAAGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITNAKDEVTQDFYLLLQSEIDQTCNQDALIITGDWNAKVGNEEGSIVGKYGLGDRNNARGHTAEFCKSYIPFFINVNNDYTSGPHQMDYIRIKLTTSVENGKEAQYRQLEQGLG	57077	59426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_57100_59400
927674	contig_16103_pilon	+	2017	1	Intergenic	novelGene_118773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCACTTCCTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496205	498222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_496200_498200
927675	contig_5539_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_104784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	20.5	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1001	1387	287068	286682	FALSE	25	TTATCCGACAATGTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKDYSLQYGLHLNIKKTNILTTGPTSNIMINGEKTVVVKDFILLGSTINTHGSNSQKIKRHMALGKSAAKDLFNVPKGKDVTLRTKVCLDQAMVFSIASYACKSWTMNKEERRRMMPFNYSVGKEY	302050	286426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_-_287921_297220_297298_301979
927676	contig_14687_pilon	-	4795	1	Intergenic	novelGene_107938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAATGAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	517918	513123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_513100_517900
927677	contig_12119_pilon	-	4587	6	Intergenic	novelGene_88682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCCATTTCAGTAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	419581	381430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12119_pilon_-_383874_387129_387245_391866_391980_396521_396683_397973_398054_417906
927678	contig_3956_pilon	+	1560	8	Intergenic	novelGene_14993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1865.88182358686	3	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	121	1041	1282731	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGKTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVISFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282697_1282913_1283793_1283981_1284068_1284220_1284709_1284864_1285066_1285173_1285712_1285812_1290449
927679	contig_13625_pilon	-	2167	9	Intergenic	novelGene_150160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	134.339530202394	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	190	651	43415	34239	TRUE	20	TTCTACTTTTTATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDEPPNSRIFLVISKYTPESVLRERFSPFGEIQDIWVVRDKHTKESKGIAFVKFARSSQACRAMEEMHGQCLSPNDTKPIKVFIAQSRSSGSHRDVEDEELTRIFVMIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFDLLFLYWRTTT	43604	26244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27215_28833_28998_29587_29673_29846_29977_34071_34274_35003_35127_37918_38046_39877_40001_43361
927680	contig_5084_pilon	+	1161	1	Intergenic	novelGene_64525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCTCTGGTTGTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427479	428640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_427500_428600
927681	contig_14441_pilon	+	1489	1	Intergenic	novelGene_100804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCATCCACTTGTGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151228	152717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_151200_152700
927682	contig_34_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_40042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	310	705	231761	231366	NA	45	TAATGGAAATAATTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACKSGTMIKEDRRKIDAFELWCWQRILNIPWTAKRRNKCVLEEVQPECALEARKARLRLTYSGHVIRRDQSPGKDIMLGKVEGQRKRGRPSRRWIYTVATTMGSSVANCEAGAGPSSVAFCCG	232070	230093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_230100_232100
927683	contig_9705_pilon	+	2291	1	Intergenic	novelGene_41741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCCTAGCATTAGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297740	300031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_297700_3e+05
927684	contig_6489_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_128940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGAGGTTGAGAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250910	252189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_250900_252200
927686	contig_6898_pilon	+	1810	5	Intergenic	novelGene_35770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2989.55484771563	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	77	550	124380	125646	TRUE	25	CCAGTGGTATCTAGTATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	123077	127066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125936_126095
927687	contig_16125_pilon	+	2684	1	Intergenic	novelGene_155209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAACAGATGTCTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23631	26315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_23600_26300
927688	contig_5258_pilon	+	2239	1	Intergenic	novelGene_100233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTATTAGAAACAAAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130016	132255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5258_pilon_+_130000_132300
927689	contig_14970_pilon	-	1791	9	Intergenic	novelGene_45033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGTAGGCAGTGTGCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232232	177387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192204_213683_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224375_231347
927690	contig_14514_pilon	+	3893	10	Intergenic	novelGene_137477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	6.142344427149	55	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	527	1584	1251	2834	80353	94997	TRUE	15	GTGTTCATTTTATGTTCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSCPWRRCRPGRAVHWPLLLLAVLILLFSLPFFIEEPNTKPSRYQGTENIKQRSLELPQKANSQAPTVGRRTTACVKSARENSMLGKQLESRAHAAEESRTAEPREDPAVKASPGEQVRAPSTAKMGSQKSQEKQQTVAEILSPGCQDKRTATGRTGTPSLQSQDMKIAREVGSQHKQPTTPRTVPMKDKGTATAKRLTLGGQGMTPTTSAGVRGGRLSTRNRKAGVTPAIIQKKSTSVSIRTQPKATPKVKLKGLPSEERAASQGPTAQRAQRLKATNFKSEPRWDFEENYSLEVAALQTSCPDSVKVKASQSQWLQHLFLPNLTLFLDSKRFTQSEWDRLEHFAPPFGFMELNYSLVQRVVSRFAPVPQQQLLLASLPPGEPQCIRCAVVGNGGILNNSQVGREIDSHDYVFRLSGAVIKGYEQDVGTRTSFYGFTAFSLVQSIFLLGRQGFQHVPLGKNVRYLHFLEGTRDYEWLEALLLNQTLMGNNFHWFRRRPQEAFGEALPLDRYLLPHPDLLRYMKNR	78147	96342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14514_pilon_+_78262_79132_79263_79346_80484_91973_92749_93553_93723_93866_94039_94269_94409_94623_94728_94903_95176_95461
927691	contig_3866_pilon	-	2527	1	Intergenic	novelGene_112421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTGTATTTTCCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227917	225390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_225400_227900
927693	contig_10482_pilon	-	1687	7	Intergenic	novelGene_152831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTATATTCACGCATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127068	116219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_116257_117242_117313_118595_118654_119567_119711_122333_122473_123193_123306_125940
927694	contig_3866_pilon	-	1564	2	Intergenic	novelGene_112411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGATCCATCACACCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263444	203696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_203940_262123
927696	contig_20641_pilon	+	1821	5	Intergenic	novelGene_52874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1326.46268322935	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41544	86669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_41619_44750_44870_45848_45965_54835_54957_85278
927697	contig_7408_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_168747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTGTACGTATAGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16418	18642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_16400_18600
927698	contig_15105_pilon	-	1746	6	Intergenic	novelGene_151022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	916	junction_4	702.528746742793	22	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	41	763	839916	829338	FALSE	25	CTATAACGTCTATTTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISNSHRQTHTHKEMETANRGKIALGLEINLILFYVGAVGTCTVSVTQPSHLEVDYTHKAVTIECTFSPVGCSTKPPISLWFRYGAHQSENLCSRGCHSEADKFTVRESPAQNQVSITVNRVSLNDSAIYICGIAFPSSVKPKAKQTGGGTTLVVRETKLLSKGLRNTLIVLLPLLCIYVTGVGVIFIILSQSESNNLRNKETEEDSRKKSARQIFQDIAQELYRKRYVETSQQPEKDRNSYENRRALYNQQRL	839956	828354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_829398_831006_831085_831461_831513_832201_832309_836187_836548_839849
927699	contig_7119_pilon	+	1957	3	Intergenic	novelGene_40923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	28	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	119	1198	138713	140188	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSQRGSTQRQDPRSKARARGVS	127488	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_139729_140124
927700	contig_3832_pilon	+	1362	1	Intergenic	novelGene_161468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAATCAATCTGCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379507	380869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_379500_380900
927701	contig_366_pilon	-	3709	1	Intergenic	novelGene_51567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	768	1067	748671	748372	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTKAMVPRALHPAIQSLREFEYVYGASMTFPCTSCAGFLSTVYCLTLHPRYHLSIAYLVFPPPPLPSLVTNKDYYILCVNFFMGFYNRGLIQYLSFCD	749438	745729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_366_pilon_-_745700_749400
927702	contig_2689_pilon	-	2641	2	Intergenic	novelGene_100830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	114	422	183240	182932	TRUE	55	TGTTAAGGAAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLNTVLEFLARAVRLEKEIKGTKIGKEEVEVFLFADYMILYTENPKESTSKLLELREDFSKVSGYKINIQKSVGSLYTNKENFEEEITKSIPFMIAPKKIKYLGINLTRDIKGLYKENCKTLMQETKRDLHKWKNIPRL	183353	180578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_-_181444_181577
927703	contig_12142_pilon	-	2174	8	Intergenic	novelGene_147809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAAGAAACAGGGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112701	100375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_100412_102365_102478_104917_104997_106942_106991_107579_107696_108715_108829_109508_109587_111109
927704	contig_3721_pilon	-	1868	1	Intergenic	novelGene_123801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	498	821	75872	75549	NA	55	TGTTTTTACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRVITRTDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNDESVKHLKTWMKLEDMMLSEISQL	76369	74501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_-_74500_76400
927705	contig_7396_pilon	-	2031	13	Intergenic	novelGene_79589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3618.58919235875	2	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	702	1367	248983	246442	FALSE	25	CAAATTCAGTGCTGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257077	245777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_253915_253977_254602_254701_255105_255191_257014
927706	contig_13633_pilon	+	2576	2	Intergenic	novelGene_15296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATCACACTTGCTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2848	125918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_4136_124629
927707	contig_16970_pilon	+	2648	1	Intergenic	novelGene_157618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	113	340	259065	259292	NA	75	ACAAATAAAAATAAAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSPATQPAAEWWEVSPYHSQPDTPPIWLGSVNTLTPMDQHHEADNVCPVRPQPPHQTIVQPSGLTLPAAALHTQTRCPQKSKQQSMPSPPTMTYQNKTKKQDETNKHTINK	258952	261600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16970_pilon_+_259000_261600
927708	contig_15731_pilon	-	2290	6	Intergenic	novelGene_171968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCTCTCTGGATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19952	11644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15731_pilon_-_11685_15120_15368_15885_16013_17410_17482_17789_17995_18352
927709	contig_6109_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_160372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCCCAAGAGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562467	563775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6109_pilon_+_562500_563800
927710	contig_12622_pilon	+	761	3	Intergenic	novelGene_5845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	95	junction_2	49	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1	462	467646	475513	FALSE	70	CTTATAAAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQQPLLTDLGWVRAGTETVGLGLYVAYLPCSPLATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	467645	475812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_467907_469399_469467_475379
927711	contig_14441_pilon	-	979	3	Intergenic	novelGene_100676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	231	368	115441	115304	TRUE	30	GCCCTGTCTGCATCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHSGTHPLARICFASLALFWLREQVFGAGMWQTRHLHRRSQRQKSYGAVLLCTHGVILSPNNKNLHREFALVLL	117787	112797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_113242_115136_115524_117639
927712	contig_10020_pilon	-	1266	1	Intergenic	novelGene_168282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAATAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36983	35717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10020_pilon_-_35700_37000
927713	contig_18794_pilon	+	1442	2	Intergenic	novelGene_54651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	293	601	175816	176296	FALSE	60	CAAAATTCAAATTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHFESDNRVVYCAGNDSLKRNGIVFIVKKNISRFILKYNVFGDRIISICLQGRTVNTTIIQIYAPTTRAKDEEIEDFYQLLPSEILQEQELIHCKYLFSTT	175523	177137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18794_pilon_+_176070_176241
927714	contig_17068_pilon	+	846	1	Intergenic	novelGene_172567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	88	450	9770	10132	NA	40	AAAGTAACATTTGCATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9682	10528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10500
927715	contig_7229_pilon	+	1479	1	Intergenic	novelGene_39853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1284026	1285505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1284000_1285500
927716	contig_11678_pilon	+	3250	3	Intergenic	novelGene_160831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1297	1749	322916	323368	FALSE	55	AAAAAAAAATTGGTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVITPSYDYQTTENHGPANLTHNLNHHSDKNDARDCMIEFSKTNNFFIASTFFHQHKGQLYMWTLPDGIHRNQINYICRKRRWKSSVSSVRTSPAADCGKDHQLLTCKFKLKLMKIRTSPQEPKYDPEYIPPEFRDHLKNRFDALNTND	118363	324869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_118750_175296_175338_322046
927717	contig_3380_pilon	-	2336	2	Intergenic	novelGene_60083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	760	1326	74001	71085	FALSE	10	CGTGGTCATTCTCATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDATLEAPTCLCQEIWKTAIWPTNWMRSIYMPVPKKSDPTECRNYRTISLISHASKIFLGDTIQSMTQKYIDKELPEIQAGFRRGCGMSDIIADVRWILAESREYQKDVYLRFIDYVKAFDCVDHDELWLTLQRMEILEHLIVLMKNLYIDQEAVIRTKQEDTAWFKIRKDVHQGCMFSPYFHIQCVC	74760	70074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_71484_73833
927718	contig_10930_pilon	+	2082	7	Intergenic	novelGene_37037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1630	1980	276899	280149	FALSE	25	TTGTTTGGCAATATGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRK	267670	280251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268579_272838_273013_273952_274319_276717_277013_278443_278637_279700_279739_280143
927719	SIRV5	+	2464	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-38	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	79	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGATTCAAGGTCGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12805_13161
927720	contig_13126_pilon	+	1915	2	Intergenic	novelGene_179140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTCCAATAGGCGTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334312	336554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13126_pilon_+_334985_335311
927721	contig_14814_pilon	+	3014	1	Intergenic	novelGene_137727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	547	1029	311855	312337	NA	10	CCACTTTGGGCTCCTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQLTISKHLQKQDRVVTVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKPLIFRTIQELNQKADKNEEKIDKFMENTDQKMEEFKKIIQEQNAKKNSQLEIIEQQQLEIQKINKKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRISEIEDKHLDIILRKNQKKEQRKMKRP	311308	314322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_311300_314300
927722	contig_1443_pilon	+	3841	6	Intergenic	novelGene_28291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	747986	807109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_748735_748833_748874_766788_766826_767440_767558_776187_776469_804491
927723	contig_6842_pilon	+	2275	1	Intergenic	novelGene_130693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1558	1938	373137	373517	NA	55	AAATATGTAAAACCACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSLGSNHSIPSMSVSTSSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMQEDESTINSSSSIVHRKVGFMVPFTALSVVSHGETSSGRLPSWPWLLPSYNWSVELNLALSSSLTVKMQDSAGYLYACFFIFLSH	371579	373854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_371600_373900
927724	contig_17427_pilon	-	1907	1	Intergenic	novelGene_30410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGAGTTGGTCACCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378814	376907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_376900_378800
927725	contig_9653_pilon	+	1082	1	Intergenic	novelGene_48348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTTCCTTGGCTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1107174	1108256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_1107200_1108300
927726	contig_9653_pilon	-	2194	2	Intergenic	novelGene_48328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGAAAACAGCCCAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1035586	1033209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1034807_1034989
927727	contig_34_pilon	-	2222	5	Intergenic	novelGene_40000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	234.618839823233	13	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1104	1955	224662	212049	FALSE	80	GAATGAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	225765	211781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659
927728	contig_7728_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_64728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	136	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACACTTTTATAAGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752351	754681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752400_754700
927729	contig_7396_pilon	-	1425	9	Intergenic	novelGene_79536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1989.24944624223	1	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	92	279	438	716	248986	248560	TRUE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGSNGLRQKRATWRPL	251494	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245649_247740_247802_248183_248278_248552_248606_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447
927730	contig_3077_pilon	+	2141	8	Intergenic	novelGene_26792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	616.73395845389	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	285	1412	473998	481662	FALSE	25	GATTTAACGTGTGGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467326	482391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
927731	contig_13048_pilon	-	858	1	Intergenic	novelGene_138926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441208	440350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13048_pilon_-_440400_441200
927732	contig_14575_pilon	-	696	1	Intergenic	novelGene_101917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCCTGAGACACGGCAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240267	239571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_239600_240300
927733	contig_14970_pilon	+	1744	10	Intergenic	novelGene_45059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_9	5491.00849087976	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	284	1090	210765	231550	TRUE	15	CCACCTTAACTCTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATQQSHSQTFSTEHGGLEEDKDHPTTPALTSSNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192043	232242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_196136_196257_210762_210859_212611_212702_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231706_231743
927735	contig_12125_pilon	-	2820	1	Intergenic	novelGene_76202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89103	86283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_86300_89100
927736	contig_12869_pilon	+	1080	5	Intergenic	novelGene_75331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	250.992529769314	4	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	39	803	67397	97384	FALSE	20	GTTGATGTTCACTTTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRKLMQQSSNGSVVDYCAGPVYSSYSTLTGSLQMDDNRRIQMLADTVATLPRGRKQLALTRSSSLGEFSWPQSKLQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67358	97661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_77590_77598_94365_94433_96917
927737	contig_8866_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_77917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCTATGAGTAAGCGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1200476	1198025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1198000_1200500
927738	contig_4442_pilon	-	2246	1	Intergenic	novelGene_127941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAACAACAAAAACCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199702	197456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4442_pilon_-_197500_199700
927739	contig_6102_pilon	-	1694	7	Intergenic	novelGene_32156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.201183262411	3	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	258	713	867239	839813	FALSE	25	TAAATCTTTGAGCCGTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLTHFSTCLFFKRLH	867496	838831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839855_841216_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
927740	contig_3956_pilon	+	1810	9	Intergenic	novelGene_14994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1387.02818554635	32	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	311	1291	1287527	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1284729_1284819_1287466_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
927741	contig_13722_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_174633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	43	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTGATAAATTCTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17638	16494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13722_pilon_-_16500_17600
927742	contig_7695_pilon	+	3489	22	Intergenic	novelGene_41673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	289	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGCGGCAGCAGCGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	979563	1201798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_979677_983512_983666_984015_984090_984182_984247_985916_986124_986757_986866_988045_988173_995503_996283_1001188_1001586_1002241_1002344_1003279_1003376_1003934_1004090_1005239_1005456_1005594_1005697_1018532_1018661_1021196_1021319_1036368_1036426_1052098_1052219_1059646_1059709_1094936_1094985_1107038_1107147_1201647
927743	contig_6159_pilon	-	2803	17	Intergenic	novelGene_128260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_9	33.3794472692404	13	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	880	2643	74	2716	275065	240498	FALSE	5	TCTGCAGGGCCCGTCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRIAALNAISTVEDDHEGSFKSHKTQTKEAQEAEAFTLYHQALDLQKHDRFEESAKAYHELLEARLLREAVSSGDEKEGLKHPGLMLKYSTYKNLAQLAAQREDLATAMEFYLEAVMLDSTDVNLWYKIGHVALRLIRIPLARHAFEEGLRCNPDHWPCLDNLITVLYTLSDYTTCLYFIYKALEKDCQYSKGLVLKEKIFEEQPCLRKDSLRMFLRCDMSIHNASVNAAEAQTIMDEVLGLRSRRQALTVREKAPDLKLVQPIPFFTWKCLGESLLAMYSHLTSCEPPQPSLGKRIDLSDYQDPAPQLASSSVVPPISVIQPSPVSIPPAGAVAEPVLAYASVAAASFPCHSHSLLETSLPMGDASGGDRSKKGVKRKKITEESGETAKRRSARVRNTKCKKEEKVDFQELLVKFLPSRLRKLDPEEEDGPFNNYEVQSEAKPDHCPSAGPHRLSLDSATFMESEKQDVHEFLLGNLTNGGILELMMRYLKAMGHKFLLRWPPGLTDVVLSVYHSWRRHSTSLPNPLLRDCSNRHIKDMMLMSLSCMELQLDQWLLTKGRSSTVSPRNCPAGVNGRFGPDFPGTHFLGDLLQLSFASSQRDLFEDGWLEFVVRVYWLKARFLALQGDMEQALENYDICTEMLQSSATLQPAVGAERGDLVIRLPNLHNDSIVSLEEIDKNLKSLERCQSLEEIQRLYEAGDYKAVVRLLRPTLCTSGSDRAKHLEFMTSIPERPAQLLLLQDSLLQLQDCRQCFECSEVALNEAVQQMVNAGEAAAKEEWVATVTQLLLGIEQALSADDSGNILKESSSTTGLIRLTSNLIQVIDCSMAMQEEPKEPYVSSVLPWIILHRIIWQEEDTFRSVCHQQQLQSPVDEGAGM	275138	240410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_240669_242525_242769_247505_247701_248560_248714_249674_249860_251440_251520_252756_252975_253540_253678_256185_256355_257374_257662_259229_259380_260805_260936_264229_264411_265376_265512_266216_266331_274430_274524_275062
927744	contig_8729_pilon	+	2809	3	Intergenic	novelGene_40097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	10	26	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGAATGGAAGAAATGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276488	289549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899
927745	contig_13453_pilon	-	3265	2	Intergenic	novelGene_146712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1185	1523	89002	88664	FALSE	20	CCGCTCTTTTGATGAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGLRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	90409	86921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_89681_89903
927746	contig_7272_pilon	-	2736	2	Intergenic	novelGene_25405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGTTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785820	781360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_783784_785507
927748	contig_19957_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_57745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGTTTTAACCTTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381624	379655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_379700_381600
927749	contig_15120_pilon	+	3676	1	Intergenic	novelGene_108034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619697	623373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_619700_623400
927750	contig_8027_pilon	-	2622	1	Intergenic	novelGene_158858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACAAGTATATTTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493548	490926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8027_pilon_-_490900_493500
927751	contig_1406_pilon	-	386	1	Intergenic	novelGene_25475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGAAAGCAAAAGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194352	1193966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_1194000_1194400
927752	contig_12938_pilon	+	1548	8	Intergenic	novelGene_99692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	591	junction_2	620.043415201463	23	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	123	770	78117	85540	FALSE	30	CAACCGCAATATTCTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLSEVVLAILLFVYEQKLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	51940	86318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79230_80721_80797_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
927753	contig_4891_pilon	+	955	1	Intergenic	novelGene_124507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAAGTAAGTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15084	16039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4891_pilon_+_15100_16000
927755	contig_11493_pilon	-	3933	3	Intergenic	novelGene_143709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	498	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGGTTTCAGGATTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289224	264513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_264908_264951_266908_287641
927756	contig_6823_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_131243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATAAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434638	436680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_+_434600_436700
927759	contig_17522_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_160811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	125	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	321	701	84390	84010	NA	75	AAAAGAAATGAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSHPHLASSASCSHSLLARKPRLHPSVTWIPPYRTGQLPECHLLAAGVAFFRFITFLPYLSLPPSPFSQIPGSMAIFASSWGAARCCSTVELLPGPCRPAGGTPGAFFFGCVFVCSDLFSFDLFV	84710	81944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17522_pilon_-_81900_84700
927760	contig_17144_pilon	-	1459	5	Intergenic	novelGene_29414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1051.16506791274	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	490	1170	168047	166363	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLPGTLSSVAWSLPACIMFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168639	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167645_167991_168060_168162
927761	contig_15063_pilon	+	2120	7	Intergenic	novelGene_12266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	19	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	393	1865	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27771	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
927762	contig_18173_pilon	+	3053	3	Intergenic	novelGene_160766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCAGCTCTCAGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36169	122494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_36469_37562_39925_122102
927763	contig_211_pilon	+	923	2	Intergenic	novelGene_129862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	12	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCCCCACCCCCAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99206	107142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_99881_106893
927764	contig_10892_pilon	-	3338	1	Intergenic	novelGene_116764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCATTTGATTTCTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206906	203568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_203600_206900
927765	contig_16098_pilon	-	1320	10	Intergenic	novelGene_45986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_9	1660.03833809663	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	534	1196	349988	348413	FALSE	30	ACCAGACTCTGAAGACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	352337	348288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350331_350512_350643_350765_350821_352170
927766	contig_10197_pilon	+	1006	1	Intergenic	novelGene_115198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTCTGTTAGACCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564077	565083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_564100_565100
927767	contig_6445_pilon	-	1513	15	Intergenic	novelGene_76932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_14	609.534566497341	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	486	1286	77905	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPCAYKPGCASLPAPLRHLPPTPGHRGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96388	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88544_96306
927769	contig_11986_pilon	-	1190	1	Intergenic	novelGene_69127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTGGACAGCAACTAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135497	134307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_134300_135500
927770	contig_4426_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_15382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTCCTAACCCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351211	350624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_350600_351200
927772	contig_6344_pilon	-	1253	2	Intergenic	novelGene_157101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATCCAAGAAGTTCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	866798	865099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6344_pilon_-_865863_866308
927773	contig_12938_pilon	-	7593	2	Intergenic	novelGene_99738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGCCGAAAGCAAATAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86321	74187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_81106_85646
927774	contig_18173_pilon	+	2354	3	Intergenic	novelGene_160765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGCATTGATTACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36075	39693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18173_pilon_+_36469_37575_38768_38924
927775	contig_9272_pilon	+	2433	2	Intergenic	novelGene_125955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTCGACCCAGTATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	477028	481506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_478087_480131
927776	contig_4782_pilon	-	1874	1	Intergenic	novelGene_73619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161766	159892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_-_159900_161800
927777	contig_14300_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_133101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	641	1105	174598	174134	NA	15	CTGTGTGACCTTGAGTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIQPAPDPLCLLISPPERSCPFSLRYLLEPRSTLLTSIILCPIVQSNLCLKSWPWECFQFWVDRESEGCAFWGSSSLRSLSLVFLLEFEFCTLLFSFVFPVRAVIGGSWAPSSSGLRLMQSLVYVALSVSWANTFLVTLVFFILLYFRWAETN	175238	173174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14300_pilon_-_173200_175200
927778	contig_8620_pilon	+	789	1	Intergenic	novelGene_173882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATTTCTGTTGTAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102193	102982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8620_pilon_+_102200_103000
927779	scaffold_13505_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_111657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GCACAACAATAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	846777	846308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_846300_846800
927780	contig_854_pilon	-	1230	7	Intergenic	novelGene_36266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	580	1023	562395	556096	TRUE	20	AGGCGCCAGCCGGGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQERFCCLVGWGHRTARIASSKTVFRPRWVRAEHSKYFTESNLLGQRQALRIGDGRQLLLLQLLDGVLVIPQVQLGAHQDDRCAGAVVPPHLGAHVLIRGWTDEGEADEEDVRLGVRERPEAVVVLLPGSVPQPQVHRLAVHHHIS	563603	543514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557070_557605_557751_562269_562399_563027
927781	contig_17198_pilon	-	3187	1	Intergenic	novelGene_62337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	2516	2929	525738	525325	NA	50	ATATTAAGGTAACCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDKISIQDAHRTPHKVDPKRKSPRHIIIKFTKTKDTERILRAASDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIFKALKENNCQPRVIYPAKLSLKYNGKIRAFPDKLKFGEFAKTKPKLQEILKGVLQLDNQ	528253	525066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_525100_528300
927782	contig_1090_pilon	-	3633	10	Intergenic	novelGene_131141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2220	2651	487999	486358	FALSE	40	CCACATGTCAACTCCAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCGRIHSTVHYQMDGFPFIGNRSMSNDWIVTIGTFESSFGYFCKAEIRQAFTFWKNIVSLVWEKCDFIQFMKMILPTVASIKPTGQDVAGLVTELISKPGICTSLITVRDTTYPSTKLPGLSNSNTAGAPTSCNIATASTVA	514200	485375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_486564_487773_488876_491870_492069_492663_492889_493595_493705_497085_497171_497426_497532_500229_500394_503617_503709_513834
927783	contig_11259_pilon	-	1419	2	Intergenic	novelGene_144540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCAGCATGCAGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166708	161974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_162221_165535
927785	contig_4091_pilon	-	3494	4	Intergenic	novelGene_173010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	117	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1438	1740	56589	56287	TRUE	20	GCTCTTAACCACTGTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEHVGYVFFFCLLICGHNTFPLLLQLAGSVTQIWYSRAGLAEEELLEWVVCGTYFSHQGGLVISAGQDPVGRACTAWWCDVKCTVQVGRMEGGDCYVWS	312690	10820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11291_55002_57529_115867_115886_312210
927786	contig_2770_pilon	-	1452	6	Intergenic	novelGene_107480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	6	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	213	662	750561	743833	FALSE	40	TCAGCACAACCATCAACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750773	743042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
927787	contig_12864_pilon	+	3419	1	Intergenic	novelGene_76423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGAAATGATCCTCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242233	245652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242200_245700
927788	contig_14970_pilon	+	1654	8	Intergenic	novelGene_45058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	5941.88801163882	14	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	405	953	198516	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTALTSTTGTTPETITKREEVKDWFSQWFQPSHSKNHLHTTTKMAGTDSNTMSAGWDPNEENEDETGKPPSYSGSGIDDDEDFISRTRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192042	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_196136_196257_198393_198523_199729_199856_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
927789	contig_5047_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_157983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAATGTACACGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	856073	854683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_-_854700_856100
927790	contig_15105_pilon	+	1010	1	Intergenic	novelGene_150978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGCCATCAAAACAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	624429	625439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_624400_625400
927791	contig_6316_pilon	+	1901	12	Intergenic	novelGene_134717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_1	148.737330177833	2	55	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	489	1394	147168	157164	FALSE	30	CTGTGGGGAATCTTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	142903	157671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_143045_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
927792	contig_5419_pilon	+	2372	6	Intergenic	novelGene_15552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	42.2582536316871	547	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAAACCAGTACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539319	589563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_539733_540053_540147_541812_541927_550898_551051_586830_586980_588112
927793	contig_8775_pilon	-	3407	2	Intergenic	novelGene_166829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2493	2879	161488	161102	TRUE	65	AACTGAAGAAAAAAATCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIGTWNCTKYESRRIGSLQKWSGTYKDRFLGISELKWTGIRHFELNSHMVYYVRNDRLKRNGITFVLKKEHFKIYPEDQLIRLLFVFTHQLLLPKMKKLKIFTNFCSLKLIKHAINIH	163980	160366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_160432_160638
927794	contig_6375_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_73060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	672974	671804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_671800_673000
927795	contig_1639_pilon	+	2839	26	Intergenic	novelGene_74876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_24	228.860083020172	724	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	776	2331	160	2490	283593	331594	FALSE	25	GAAAACGTGGTGGTGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQALELALDRAEYVIESARQRPPKRKYLSGGRRSVFQKLYDLYIEECEKEPEVKKLRRNVNLLEKLVMQETLSCLVVNLYPGNEGYSLMLRGKNGSDSETIRLPYEEGELLEYLDAEELPPILVDLLEKAQVNIFHCGCVIAEIRDYRQSSNMKSPGYQSRHILLRPTMQTLICDVHSITSDNHKWTQEDKLLLESQLILATAEPLCLDPSVAVACTVNRLLYNKQKMNTRPLKRCFKRYSRSSLNRQQDLSHCPPPPQLKLLDFLQKRKERKAGQHYDLKISKAGNCVDMWKQSPCNLAIPSEVDVEKYAKVEKSIKSDDSQPTVWPAHEVKDDYVFECEAGNQYQKTKLTIVQSLGDPLYYGKVQPCKDEDGGGQASPSHFSADDHSNWFIIGSKTDAQRVVNQYQELVQNEAKCPVRMSHSSSGSASLSQHSPGKETEQPETVSVQSSVLGKGVKHRPPPIKLPSSSGNSSSGNYFTAQQASSFLKSPTPPPASKPPSLSRKSSVDLSQVSMLSPAALSPASSSQRTTATQVMANSPGLNFINVLGSVCGAQALMSGSNPMLGCNTGAVTPAGINLSGLLPSGGLLPNALPGALPASQAGVPFGLKNTSSLRPLNLLQLSGGSLIFNPLQQQQLSQFTPQQPPQQPTTSSPQQPGEQGSDQGSASQEQALSAQQAAVVNLAGVGSFMQSQAAVLSQLGSAENRPEQSLPQQRLQPSSAFQQQQQQIQQLRFLQHQMAVAAAAAQRAQLRRHRHPGSQSGSKVKRGAPATPQL	279669	331943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_279734_283497_283596_286379_286416_287047_287107_287387_287455_289010_289138_290192_290297_293138_293256_293371_293426_296206_296347_297969_298127_298221_298279_307921_307994_309145_309301_310587_310615_311122_311156_311930_312049_312577_312681_312827_312987_314954_315025_315536_315689_321337_321394_324206_324324_328942_329049_330597_330702_331456
927796	contig_12512_pilon	-	5611	5	Intergenic	novelGene_24184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	157	junction_3	411.648742862164	4	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	220	651	599702	592270	TRUE	35	AAATAATTGTAAGTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWTESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFSHKDILIGHERDDDNSEEGFNTIHSGRHEYAFSFELPQTHPKQAQKKRLSVAGSVPQAQYP	599921	586596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12512_pilon_-_591267_591594_591852_592236_592340_595423_595506_599422
927797	contig_11259_pilon	-	2157	1	Intergenic	novelGene_144519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1045	1407	121715	121353	NA	55	GCAACAGAAGAATGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLITNFIWKGKTSRISKTLLKKKNKVGGFTLSHLRTYYTVMVVKTAWYWYNDKHIDQWKRIENPEINPSTYGHLIFDKVSNSIKIGKRQSLQQMVLGKLDIYLQKNETGSIPHTIHKN	122759	120602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_-_120600_122800
927798	contig_9177_pilon	+	1991	1	Intergenic	novelGene_32638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAATAGCAGCACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43916	45907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_43900_45900
927799	contig_6654_pilon	-	3061	1	Intergenic	novelGene_85720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	2519	2962	292211	291768	NA	55	AGAGAAACAGATATCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVTATVRTNLIPFSFVGTDKLLLQGKINFTFSDKNYWNNELTKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRISSDYSAKTMKARRQWDDIFKGLKENNCQPRVIYPAKLSLKYDGEIRAFPDKQKVREFANTKPKLQEILKGVLRLDNQ	294729	291668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_291700_294700
927800	contig_10990_pilon	+	1294	11	Intergenic	novelGene_7444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	369.977891231355	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	765	528	1292	722423	731960	FALSE	60	GAAAATGAAGGAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQSKNCCFLYLACLSFFVLIWIPGNFYYRHFARAVFWGHSSFLCSSVLSQGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKS	708540	731962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708654_709189_709253_709348_709396_714557_714612_715933_715994_722232_722443_723379_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913
927801	contig_7408_pilon	-	2290	6	Intergenic	novelGene_168744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	413	junction_5	76.9867521070996	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	1175	2254	38514	12597	FALSE	40	TAAAGTGAATTTGAGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48317	12560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224
927802	contig_5023_pilon	-	3568	5	Intergenic	novelGene_7168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAAATTGACAGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550885	422090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_422259_431082_431812_432599_432968_439933_440509_549157
927803	contig_3550_pilon	-	670	1	Intergenic	novelGene_179141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	104	457	569	216	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKTEGDEKEKKRMNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKQHLQPTSGTQGAARPGARNPSGLQL	672	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3550_pilon_-_0_700
927804	contig_3751_pilon	-	2285	2	Intergenic	novelGene_158628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAATAAAATACTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58239	55896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_-_56188_56245
927805	contig_10106_pilon	+	2418	4	Intergenic	novelGene_73878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	824.362514647261	1	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3	350	132525	169404	TRUE	50	AAAATAAAGGGGATGAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPWRLPAACDLRFERQFALSSSAKRAPGTTERRVTGQGSRRSSSTPAALRGSLGCPQHLCASVTGGAEQGFSNTLFPGVRNPGPSSVLPKGRGVSTPGQTYNRLPSDCPNPPGPV	132522	174417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_+_132829_169360_169463_170993_171092_172505
927806	contig_9053_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_87930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAGACTAAATCGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114875	116039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_114900_116000
927807	contig_19960_pilon	-	685	1	Intergenic	novelGene_164193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAGGAGAAATAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56500	55815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19960_pilon_-_55800_56500
927809	contig_10104_pilon	+	3737	1	Intergenic	novelGene_160133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	188	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2642	3133	415926	416417	NA	60	AAATGGGGAGATAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFLWKGKKPEISKALLKKKNKVGGLALPDLRTYYIATIVRTAWYWNNDRYTDQWNRIENLDVNPSTYSHPIFDKGPKSIKWETDSLFNKWCWQNWKSICKKMKQNPYLKPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKIIEEKTRSTLETLIHGINRIQTITNNI	413284	417021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10104_pilon_+_413300_417000
927810	contig_9098_pilon	-	1602	10	Intergenic	novelGene_75858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	172.847681464503	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	540	1063	1602	345261	337050	FALSE	40	GGGACCAAACATTTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQ	350892	337049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349641_349841_350326
927811	contig_10163_pilon	+	2192	2	Intergenic	novelGene_82649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGATAGAAAAAAAATTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176482	178939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10163_pilon_+_177240_177504
927812	contig_7078_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_130127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGTCACGTGTATAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74571	73777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_73800_74600
927813	contig_960_pilon	-	2239	2	Intergenic	novelGene_108230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGCAGAGAGGGTCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	435391	432179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_-_433321_434293
927814	contig_16388_pilon	+	627	1	Intergenic	novelGene_179142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGTATCCGGGGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2930	3557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16388_pilon_+_2900_3600
927815	contig_14182_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_76174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAACCTTCATCTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	891	2546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_+_900_2500
927816	contig_14176_pilon	-	2037	1	Intergenic	novelGene_74838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGTATATTATTATTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226300	224263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_224300_226300
927817	contig_12324_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_166655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	925	1251	179498	179172	NA	10	TTCTGCAGGGTTGTGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIPMSEAQQDWGTGATLSAVMAEGPVARCGLLVQTAHPLGFPGRRLAPSAHSAVPGMTGPGLVQGRKPQRAWFSMLSLQGEWDQASWWLVLGSGFPQAGYWPLQVTQA	180422	179170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_-_179200_180400
927818	contig_18473_pilon	-	1416	1	Intergenic	novelGene_169648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGACCTCTGAGCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96856	95440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_95400_96900
927819	contig_6227_pilon	+	2567	2	Intergenic	novelGene_49804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTATGTATAAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1273396	1276024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1274060_1274120
927820	contig_14357_pilon	+	4325	1	Intergenic	novelGene_121685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	138	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	3257	3724	575536	576003	NA	35	GAAAAGCTGGTTCTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLNAAIKRQRVADWIKKHNPSICCLQETHLKDTNKLKLKGWTKIYQANNTQKRAGVAILIADKIDIQVKSTTKDKKGHYIMLKGSIHQEDTTVINIYAPNDRAPEYIKQTLTALKGQIDSSATVVGDFSTPPSVKERTS	572279	576604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_572300_576600
927821	contig_6375_pilon	+	2395	7	Intergenic	novelGene_72934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	273.166259914279	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	201	989	20973	28930	FALSE	30	CGCCTTTTGTATATTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKPGSSNMDSLSARRTLHTFDLLGFGRSSRPAFPRDPEGAEDEFVTSIETWRETMGIPNMILLGHSLGGFLATSYSIKYPERVKHLILVDPWGFPLRPTDPSEIRAPPTWLKAVASVLGRSNPLAVLRVAGPWGPGLVQRFRPDFKRKFADFFEDDTISEYIYHCNAQNPSGETAFKAMMESFGWARRPMLERIHLIRKDVPITMIYGANTWIDTSTGKKVKLQRPDSYVRDMIEGASHHVYADQPHIFNAVVEEICNSVD	16559	30336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_16695_20907_20995_22474_22701_22862_23018_25061_25174_27959_28147_28843
927822	contig_19416_pilon	-	3416	3	Intergenic	novelGene_175523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1603	1923	26276	25956	FALSE	60	ACAATCCACCAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGETRGKEVITGIKQVSRTHYISPQGFEKNLLFSETIYTIACPPDSRYWPQSPDFEWRPLGPGLQLRLPGPLGQQLCSLGFRRTILLVHWSDNSTLRNTRGHGSTL	37725	24462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19416_pilon_-_26687_28757_29078_36853
927823	contig_8594_pilon	-	2383	6	Intergenic	novelGene_140050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	251.728901797152	2	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	744	1586	492830	461703	FALSE	45	ACATTGATGTCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLRFTYFGHVIRRDQSLEKDVMHAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	493573	460905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_492754
927824	contig_1624_pilon	+	2496	3	Intergenic	novelGene_138364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGCCTTCTTGCCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22385	138150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_+_22776_135941_137925_138027
927825	contig_2739_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_165841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGCTCAGCAAGTGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247020	245393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2739_pilon_-_245400_247000
927826	contig_6593_pilon	+	2613	1	Intergenic	novelGene_49840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAACTGAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183260	1185873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_+_1183300_1185900
927827	contig_14575_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_101914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAGAAGGAAACTACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204272	204830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_204300_204800
927828	contig_7151_pilon	-	3178	9	Intergenic	novelGene_40645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	117.708325958702	13	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	1608	2210	12708	5915	TRUE	20	CCCAATGTTTTTCTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGEWRDRREG	14422	1818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_6259_6347_6390_12491_13676_13782
927830	SIRV7	-	2137	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	152	-3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	38	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147766	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1583_1752_2676_2993_3112_43028_43079_114680_114989_147602
927831	contig_6418_pilon	+	2745	1	Intergenic	novelGene_81229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	520	903	1399390	1399773	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVTAILFETEAARLLVSLVSSASASVSCGLLALRPHARICPAGASVPKLCSSTGKCPEAAHSTRKPPAHRHSAFSLHGSAPVLSRTGLLVLLLLVLCCCWSSVTAARLPIHSFKTTSPL	1398870	1401615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1398900_1401600
927832	contig_8060_pilon	+	3467	1	Intergenic	novelGene_104838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAGAGAAGGAATGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230543	234010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8060_pilon_+_230500_234000
927833	contig_12140_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_86525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATAGACTCTCAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25759	28005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12140_pilon_+_25800_28000
927834	contig_12869_pilon	+	1973	5	Intergenic	novelGene_75346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	557	junction_3	208.252851120939	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	978	1739	81642	97384	FALSE	45	GGAAATCTGGTAATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	80664	97618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
927835	contig_7622_pilon	+	2805	1	Intergenic	novelGene_132411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1808	2155	261553	261900	NA	55	AGGAAATCCGGAAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNYTPNKFENLEEMDKSLETHYLPELQQSDVENLNRPITGEEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFAGEFYKTFTEELAPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTQKEN	259745	262550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7622_pilon_+_259700_262600
927836	contig_13525_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_145080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	105	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	363	668	4614	4309	NA	30	CTAATTTCACCATCATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMFFCRDWSLLITCPKYMRRSLAILASKEHSGRTSSKTDLSVLLSIHGIFTILCQHHNSKASILLQSSLFIVQLLHAYEATENTMAWVRCTLVLKGFKQRA	4976	1980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_-_2000_5000
927837	contig_14925_pilon	-	3980	2	Intergenic	novelGene_55251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_1	0	2	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TCAGCTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115782	111430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_114779_115150
927838	contig_6870_pilon	+	1593	1	Intergenic	novelGene_103930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACCCAGAATTATTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1139511	1141104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1139500_1141100
927839	contig_6544_pilon	-	645	1	Intergenic	novelGene_142088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATACCAGTTTATATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86964	86319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6544_pilon_-_86300_87000
927840	contig_7898_pilon	-	2285	15	Intergenic	novelGene_47617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	120	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	1171	1665	589762	586747	TRUE	20	TTTTGGTGTAGGAAGGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCRRDSVQMVPSPRLSSANSESSQASNNCSGSRSDATSSSSTRGRARGREESREQTSTVSSSKADRYSSTPLSSWIAASIKHDSGVCFSSASCCSNATFSSRTTRCSTCSLEASSSLEYWLCCSSMNGMIYIHPFGFGQGHQHAFLSLHQLHCDSITNNILT	600125	571664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_571804_583831_584034_584902_584983_586469_586651_586728_586861_587521_587683_589542_589842_590040_590164_592774_592895_593133_593235_594213_594363_596030_596135_598691_598749_598841_598997_599843
927841	contig_854_pilon	+	4780	16	Intergenic	novelGene_36686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	3981.87839202667	6	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	733	2202	1204	3405	1704560	1714980	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1703356	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715151_1715198
927842	contig_6227_pilon	-	2262	8	Intergenic	novelGene_49797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	94.2746746783795	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	725	1114	1254536	1252813	FALSE	25	AACATTGTAGCTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAGFHLNPKAIEASLQGCCSEVEAQQTGRRQTPPQPMQCELPTVPVQIGSHFLKGVSFNESAADNLKLKTHTMLQLIKEAGCYNGITPRDDFPVTEVLNQVCPSTWRGACKTAVQLLFGQAGLVSGCV	1331873	1251664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1252990_1254206_1254369_1254485_1254582_1254972_1255114_1260479_1260691_1291831_1292061_1308695_1308751_1331830
927843	contig_12312_pilon	+	2554	1	Intergenic	novelGene_63985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1890	2234	419246	419590	NA	35	AAAAATCCATTCCGTTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGKRSWSYRVLLSNGIEPSLYTWWGGGERKRIGSQVREGSHSLSFILRDSQKVRATGRPHKRGIQGSRVEILPARVLKKKNPSSPVTRARRQKGTRKLVIGNPRLGKDIVDAL	417356	419910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_417400_419900
927844	contig_5753_pilon	-	2108	1	Intergenic	novelGene_174318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGGATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177145	175037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5753_pilon_-_175000_177100
927845	contig_3557_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_173612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTGTATTTTCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185451	183463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3557_pilon_-_183500_185500
927846	contig_15666_pilon	+	1790	6	Intergenic	novelGene_70185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTGAAGGTCACCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107158	110630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_108003_108108_108198_108579_108837_109092_109407_110027_110242_110558
927847	contig_11855_pilon	-	1554	13	Intergenic	novelGene_66946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2091.05128397709	7	16	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	322	1512	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1091803	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736
927848	contig_5264_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_165058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGAACAGAAGAAATGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126873	128738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_126900_128700
927849	contig_16360_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_170074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAAAAAAAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104196	105257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16360_pilon_+_104200_105300
927850	contig_13455_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_179143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	285	626	108122	107781	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAAACCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDQSLQYGLHLNMKKTKILTTGSISNIMINREKTNIVKDFILLGSTINTHGSNSREIKRHAAIGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKAPLIQVMVFSIALYACESWTMNKED	108406	103894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13455_pilon_-_105073_107510
927851	contig_5499_pilon	-	1399	11	Intergenic	novelGene_56975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_1	243.713130544909	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	473	1291	106629	93296	FALSE	30	TTCCTAGCAAATCGCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPTEGGDVPEPWETISEEVNLTGDSLSLTLPPPPASPVSRTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLLQREPSSRLRSCSVTDAVAEQAHLPPVTHTHFQSSLGFFSFYLKSPGLLRKSFSCANPLSIEMRHFNPFRMLLLSPFKFLLVLCVFHKWKAY	232458	93187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_-_93572_95835_96013_97211_97345_104538_104706_106563_106667_107104_107167_115229_115281_183294_183349_186417_186457_189031_189114_232311
927852	contig_7045_pilon	+	5809	12	Intergenic	novelGene_77420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	283	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	4434	4817	199064	211464	TRUE	10	GCCGGGCCGCGGGAAGTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSLKILLDHLVAYPQEPLAGPSVTEAASPHLDVVKTGHFIHLRVTNDVPLVIQHIEIDDWTLNLGAAELRITVNPHHGGSVGVPEGGQGRVGVLRQGEGVLLYILHPTCEALEGVKSMFQRYHTKE	167318	224356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_171003_174127_174233_183824_183948_187606_187686_198621_199072_201081_201196_203940_204143_211404_211491_214799_215434_216585_216651_220738_220831_224181
927853	contig_4232_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_63157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	742	1218	26146	26622	NA	35	CTGGAATAAAATGCTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWDSFIRALSSCVSQILCSFVDPSHSLLQPMSAGSGSLHPVLTEKVISPESMYFREDWLVCPGHLPFANHSQWPGVCMWGGGRQEEPHLIHTRCVSHAIARFHYQKRGQEVVAETTNACPIFFLFFQLVLQEVCLLTISFCFFGFIHSSFLNCMLN	25404	27570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_25400_27600
927854	contig_3956_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_14889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1389.2926257632	87	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	84	695	1281682	1290491	FALSE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282871_1289567_1289677_1289758_1289892_1290297
927856	contig_9571_pilon	-	4370	2	Intergenic	novelGene_136315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAATTAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738423	604932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_606340_735460
927857	contig_2204_pilon	-	2700	2	Intergenic	novelGene_71672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16786	13580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_13825_14330
927858	contig_16540_pilon	+	993	1	Intergenic	novelGene_179144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATAAAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158429	159422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16540_pilon_+_158400_159400
927859	contig_15327_pilon	+	2879	4	Intergenic	novelGene_70624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	176	346	898735	898905	TRUE	10	CTGCTCTACCAGCCCCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSFIFVSSIKGTRYLHQLQLLFSLQIIPSPLPSDSPCRHSFQEPQSIFAFSKVCSSSMEMRVALQQILTKPKRLQTEGESSTVPPIWFITSSPNKLTHHHLLSLCPLVYLGHH	898559	902152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_901035_901128_901281_901400_901534_902033
927861	contig_1150_pilon	-	512	3	Intergenic	novelGene_61432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	466	junction_1	25220.5	120	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGGTGTGACTGTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309280_309812_309927_311002
927862	contig_7247_pilon	-	2442	1	Intergenic	novelGene_176693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTAGGGACTGCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146547	144105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_144100_146500
927863	contig_6070_pilon	-	1013	1	Intergenic	novelGene_177493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTCTCCTTGTTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228723	227710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6070_pilon_-_227700_228700
927864	contig_14925_pilon	-	1636	6	Intergenic	novelGene_55309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	909.532715189509	6	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	84	497	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129484	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113179_113222_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
927865	contig_17753_pilon	+	628	3	Intergenic	novelGene_105049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	474	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGCCAGCTGTTGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45449	89183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_45684_75018_75173_88943
927866	contig_5019_pilon	-	1807	1	Intergenic	novelGene_109200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTTAAAAAAAAAAAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159615	157808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_157800_159600
927867	contig_12019_pilon	+	1370	7	Intergenic	novelGene_87753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	156.232376783929	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	31	609	634020	637899	TRUE	25	CTCTTGGAATGAATTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLSEDKYPLIMVPDEVEYLLKKVLSSMSLEVSLGELEELLAQEAQAAQTTGGLSVWQFLELFNSGRCLRGVGRDTLSMAIHEVYQELIQDVLKQGYLWKRGHLRRNWAERWFQLQPSCLCYFESEECKEKRGTIPLDQHCCVEVRGRTARPRREALHVLCEDRLPHIRDERLRHAPAPGVDDCHPDGNPAASRGGRHRCTRT	633989	642640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_634035_635731_635969_636053_636211_637576_637686_637838_638019_641782_641867_642082
927868	contig_5019_pilon	-	3524	1	Intergenic	novelGene_109229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCACATCGCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361580	358056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5019_pilon_-_358100_361600
927869	contig_5020_pilon	+	2651	1	Intergenic	novelGene_27950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTATGTATATTCATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178968	181619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_179000_181600
927870	contig_3627_pilon	+	7003	5	Intergenic	novelGene_78416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3786	141	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	5139	6125	116877	117863	TRUE	35	TGACTGTTAAATGTGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKRGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKYLCSSKDFTKRVKREPTEWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKERNTPFTKEDIQMANRHMRKCSQSLATREMQIKTTMRYHLTSALLARIKNTGNNKCWRGCREIRTLMHCWWECKMIQTFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPRCPTTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYWMRPLL	23054	118905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_24873_73701_75256_77918_79335_116526_118621_118784
927871	contig_19727_pilon	-	1176	1	Intergenic	novelGene_169003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATTGCAATTAAGTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31492	30316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_30300_31500
927873	contig_17144_pilon	-	2152	12	Intergenic	novelGene_29552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1973.6991280167	9	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	74	1093	179764	173283	TRUE	15	CTCTTAAACTGTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERGKWVVKG	181846	166098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166324_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172682_173039_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
927874	contig_602_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_134975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	591056	592632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_591100_592600
927875	contig_16303_pilon	-	1868	7	Intergenic	novelGene_34087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	776.443261860704	12	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	62	730	40530	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	40591	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33554_35039_35764_35980_36029_37169_37275_37562_37701_38579_38856_40433
927876	contig_3747_pilon	+	2123	7	Intergenic	novelGene_24751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4144.08900322697	2	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	336	929	201313	202759	TRUE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPSA	200977	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_203128_203228_203386_203498_203580_204616
927877	contig_9696_pilon	+	2009	2	Intergenic	novelGene_68803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	915	1250	398890	399225	FALSE	30	CAGACTCATATAATTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTIICYIHTVECLCIVNKTQVNIFLVFSAFSQDPSDISNDIPRSTLSSESCLNFSQFPVNVLLQPFLNYLSAKFYLHVILMILLDNFCILLDHISLEWAQIWISSSWLAR	367033	399984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_367041_397982
927878	contig_5302_pilon	-	1532	5	Intergenic	novelGene_81436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	693.947179185851	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	94	627	181037	176474	FALSE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYVRKEEEALKGKAPRIQHRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTTTTATTTATTPSPSQTLHGPIMSWFIKQRASKVRTTKLKMTLLSQGTTEALFQKTSCDS	181234	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176653_177036_177300_179917_179967_180994_181107_181210
927879	contig_12790_pilon	+	4163	2	Intergenic	novelGene_35295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGACGGTACCTAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541815	692804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_+_544000_690825
927880	contig_1450_pilon	+	2938	21	Intergenic	novelGene_27368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	435.976544667256	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	808	2427	316	2742	315791	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244356	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244535_308888_308994_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
927881	contig_6795_pilon	+	2731	1	Intergenic	novelGene_27697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAGACATAAATAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91208	93939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_91200_93900
927882	contig_5023_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_7181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	522	896	548743	549117	NA	15	CCTATTATTTATTCCCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELEIENQKRRTCLAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSMGKILNDAGNIKRRRKEYTESLYQKILVDIQPFQEVAYDQEPMVLKEEFQAELKALVKNKAPGIETIPIEIFQQTDAVLKCSLICA	548221	550372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_548200_550400
927883	contig_7870_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_109049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAACACGGTTCTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636419	638384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_636400_638400
927884	contig_11264_pilon	+	1892	1	Intergenic	novelGene_154208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAACTCAAGTTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521917	523809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11264_pilon_+_521900_523800
927885	contig_12157_pilon	+	3614	1	Intergenic	novelGene_135903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	183	223	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	628	951	140388	140711	NA	30	GTGAGGTTAACCAATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHIQKQDRMVPVGTQNKTPGDFPVEEALELPDREFKSLIFRVIQDLKNKADKNVEKTDKFTEKADKFMENTDEKMEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIHK	139760	143374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12157_pilon_+_139800_143400
927886	contig_9132_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_121380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	359	721	139409	139047	NA	25	ATGCAGCTACATTCAGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVTPVSVRPLSMVFLLEFEFCTPSFCCSIRDSLLCSLPGCSLVVEPSSSSGLRLMKSLVYVAHSVSWAHTFLVSLVFFVLLYSKWLIDIDVPRKHGPQTPTPATLSLKVLDCLQETS	139767	137726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_137700_139800
927887	contig_16411_pilon	-	1315	1	Intergenic	novelGene_77313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTCTGTTTGTTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132479	131164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_131200_132500
927888	contig_8487_pilon	-	3866	6	Intergenic	novelGene_111917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	2292	2981	214092	213403	TRUE	45	GTCTACCGAACGAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVAKGFSTVITHIRPFTIVNSLVGNKVRALAKELPTCNTLIRPCPSVNTPMFNESVLVTKVFPTFAALIRPLSGMDTLVLYKCGFVAVGFPTLAALVRSGSRVDSLVNNEVGAMIKNFPAYATLIWHFSSVNPLVLSKYRFAAEGFPTFATLIRPFSSVDSLVLNKRVFAAEDFPTFAALVMLLSSGEGLLMLGVTAWFPLTLRGLVLENIRAGWEVLTTILPHNECL	217647	207967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_208230_208876_208915_210993_211123_211622_211744_213067_215928_217191
927889	contig_9903_pilon	+	1866	1	Intergenic	novelGene_172017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100764	102630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_+_100800_102600
927890	contig_3155_pilon	+	1792	5	Intergenic	novelGene_26372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	11	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	72	578	258156	261211	TRUE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258084	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261230_261336
927891	contig_9903_pilon	-	1832	2	Intergenic	novelGene_172016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	225	junction_1	0	12	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTACTCTCCTAGGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102636	97666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9903_pilon_-_98328_101465
927892	contig_5718_pilon	-	2245	2	Intergenic	novelGene_110375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCTCTTTTGAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1183578	1155197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1155279_1181414
927893	contig_2783_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_119650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGATTTTTAATAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725857	724401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_724400_725900
927894	contig_10426_pilon	+	3464	1	Intergenic	novelGene_144671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACTTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88711	92175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_+_88700_92200
927895	contig_4232_pilon	-	477	1	Intergenic	novelGene_63422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTCTTCAAATTGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467700_468100
927896	contig_14822_pilon	+	1810	7	Intergenic	novelGene_145405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	507.883762948439	2	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	932	1531	183396	190065	FALSE	15	GACTTTGATGTTTCTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGTAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYIVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDSKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVQKSKEYFSKQK	118360	190344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_119148_171024_171158_183384_183502_185583_185738_186102_186226_186462_186594_189979
927897	contig_6464_pilon	-	1908	6	Intergenic	novelGene_176354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	23.1257432312996	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	74	709	165674	146675	FALSE	80	TTAAAAGAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HKTHRGLSPAQADSQFLENAKRLSMYGVDLHHAKDSEGVDIKLGVCANGLLIYKDRLRINRFAWPKILKISYKRSNFYIKVRPAELEQFESTIGFKLPNHRAAKRLWKVCVEHHTFYRLVSPEQPPKAKFLTLGSKFRYSGRTQAQTRQASILIDRPAPHFERTSSKRVSRSLDGALIGVVDQSLMKDFSGPAGEISAYGPGVLSSVGIQDGDGRREVRTPTKAPHLQLIEGKVW	167341	145475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6464_pilon_-_146857_151981_152155_160179_160278_160823_160977_165644_165733_167326
927898	contig_13300_pilon	-	1400	2	Intergenic	novelGene_125775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	3	467	107616	53582	FALSE	25	CAACTCCTCCCCCTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGLVICFCKDYSQENPWRWAWFGLERKKTILKQSTRDCFKLKFKYSKRKKEEKHLAVPGAKGAQDTSLKCRVRTLQKSALGLSYLRPLLHNPGHKNVLRSAPRRKCGKSESSPQLRKIRFLHRWTRPGETQKETVKQAGPPAAQRCSVCFPRCQ	107618	52648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_53999_107568
927899	contig_4364_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTGCTGCAGTGAACGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1532733	1533298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1532700_1533300
927900	contig_11846_pilon	+	2631	1	Intergenic	novelGene_106024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAGCAATAATCAACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	586481	589112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_586500_589100
927901	contig_2438_pilon	+	1235	4	Intergenic	novelGene_112057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5547	junction_2	301.406701982554	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	246	578	311995	312871	FALSE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	310609	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_310768_311907_312083_312305_312409_312729
927902	contig_9311_pilon	-	295	1	Intergenic	novelGene_178446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAGAAGCAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28228	27933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9311_pilon_-_27900_28200
927903	contig_10734_pilon	+	3007	10	Intergenic	novelGene_51188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	459.600792959378	9	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	1603	2214	1134427	1142903	FALSE	50	AATAAAGTGCCTTATAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1123701	1143696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1123795_1127587_1127745_1128560_1129449_1131084_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
927904	contig_1301_pilon	-	1543	12	Intergenic	novelGene_47314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	510.172212052375	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1092	450	1541	297741	269130	FALSE	50	GAAGGAATCAGAAACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLIIEPEKNASCIESLEQEKVDEEEEGKKDESSCSSEEDEEDDSESEAETDKTKLLASVTNVNTSSAQAAPVAVTTPTVTSSQATPTSPVKKFPTSAAKISPKEEERKDESPASWRLGLRKTGSYGALAEITASKEAQKEKDTAGVMRSASSPRLSSSLDNKEKEKDSKGTRLAYVAPTIPRRLASTSDIEEKENRDSSSLRTSSSYTRRKWEDDLKKNSSSNEGQTYHKSCSFGRRQDDLISSSVPSTTSTPTVTSAAGLQKSLLSSTSTTTKITTGSSSAGTQSRSYLTPVRDEESESQRKARSRQARQSRRSTQGVTLTDLQEAEKTIGRSRSTRTREQENEEKEKEEKEKQDKEKQEE	322913	269127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_269265_270310_270402_278296_278465_279344_279450_283355_283451_284684_284901_292182_292308_296606_296758_297735_297767_305264_305410_309751_309912_322794
927905	contig_6595_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_122538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGTAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528744	530555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_528700_530600
927906	contig_5566_pilon	+	2316	1	Intergenic	novelGene_153680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGTCTTCAAGGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251001	253317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_251000_253300
927907	contig_11816_pilon	-	2162	2	Intergenic	novelGene_98557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1048	1413	1158799	1158434	TRUE	60	AAAAAAAAGGCAACACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIICCFRGIQ	1159846	1157641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1158354_1158396
927908	contig_3018_pilon	-	1923	14	Intergenic	novelGene_78879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	453.320817207427	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	606	1318	1923	570362	562956	FALSE	35	AGCGGTTATGAGACCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENIN	625099	562955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580130_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
927909	contig_10323_pilon	-	1720	3	Intergenic	novelGene_123617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3125	junction_1	115	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	51	545	468796	463240	FALSE	15	GTTTTTTGATCACATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRFLQDSLAEVEEKYKKAMVSNAQLDNEKTNFMYQVDNLKDTLLELEEQLAESRRQYEEKNKELERERHAHSILQFQFAEVKEALKQREEMLEKHGVILNSEIATNGEPSATLSNVGHQDSTKMTKEELNALKSTGDGTLGKYLFLLGLSTPPVSINSPSVHR	468846	462064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_463453_467386_467480_468607
927910	contig_18854_pilon	-	469	1	Intergenic	novelGene_179145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGCTCTACATTCTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1262	793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18854_pilon_-_800_1300
927911	contig_4783_pilon	-	3089	1	Intergenic	novelGene_108364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	183	552	226	777	142786	142235	NA	45	AAAATATGGTACAGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLYTNKENFEEEITTSIIPFIIAPQKIKYLGINLTRDIKDLYNENYKTVLQETKRDLHEWKNIPWSWIGRLNIVKMSILPRAIYRYNAILIQIPAAFFNELEKQITNFIWKGKRPRISKALLTKNSKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYIDLWNRIENPDINSSTYEQLIFEKGPMSINWGKDSLFNKCCWHNWISICKKLKQDPYLTPCALTNSKWIKDFKIENDKDYGRKNGESARSPNTWHEHNMNRK	143011	139922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_139900_143000
927912	contig_15596_pilon	-	3921	2	Intergenic	novelGene_139518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	349	924	210369	65857	FALSE	65	GCACTAGAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNEKKQLQTSINTWNMECTKYESRKIGNHRNEMERINIDILGINELKWSGICHFELDDHMVYYARNDSLKRSGIAFVVKKNISRSILKYNAVSYRIISIRLQGRPVDITIQIYAPTTNAKDEEIGDFYQLLQSEIDQTCSQGALIITGDWNAKVGNNEEGSVVGKYGLGNRNNARGTLPKKIFRWLTDT	210717	62859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15596_pilon_-_65901_209837
927913	contig_6896_pilon	-	1049	2	Intergenic	novelGene_174221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGAGAGCCGAGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298200	297106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6896_pilon_-_297380_297424
927914	contig_4402_pilon	-	3448	9	Intergenic	novelGene_140850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_2	308.013570115019	6	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	844	2532	915	3446	603870	594558	FALSE	70	AAGAAAAAGAAAAACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEESKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGE	604784	594555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818
927915	contig_14637_pilon	-	2809	4	Intergenic	novelGene_114545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGTCTTCTTAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	385560	335437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14637_pilon_-_335556_375173_375369_382899_383562_383726
927916	contig_9132_pilon	-	3216	2	Intergenic	novelGene_121381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1840	2163	183627	183304	FALSE	0	TCCTTTTTTGTTCCTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKSNTCSPQTAPKEPPARRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQDVISAAAQT	185541	182250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_184700_184774
927917	contig_5910_pilon	-	5215	1	Intergenic	novelGene_168428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	149	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACTCTGAAACTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179601	174386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_174400_179600
927918	contig_7728_pilon	-	1283	1	Intergenic	novelGene_64722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAGAAAGGAGGAGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	752390	751107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_751100_752400
927919	contig_14732_pilon	-	1169	1	Intergenic	novelGene_169701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGCAAGGTTGTGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24651	23482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_23500_24700
927920	contig_14931_pilon	-	2931	2	Intergenic	novelGene_179146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACTGATTGATTTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106746	44224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14931_pilon_-_46143_105733
927921	contig_8538_pilon	+	1361	2	Intergenic	novelGene_4645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	543	1310	841232	842045	FALSE	30	TCCAGAAGGAGTCCACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVS	840689	842096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841995_842040
927922	contig_9121_pilon	-	2255	1	Intergenic	novelGene_134441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATAACAGAAGCAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97649	95394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_95400_97600
927923	contig_21006_pilon	-	3961	1	Intergenic	novelGene_177727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	662	979	45905	45588	NA	50	AACAAACACTAACACACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKPYFMIIHKPERNRALFLLQTNKMTAEIMPEITIIFQSLRRNKAYNILKNTSSKSAVIPANNLTYSVNVFMFWTTKATDNKQSGLRWLIPLCISFTLQKKTIF	46566	42605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21006_pilon_-_42600_46600
927924	contig_5941_pilon	-	1856	1	Intergenic	novelGene_84555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAATCCCACAATAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146709	144853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5941_pilon_-_144900_146700
927925	contig_14925_pilon	-	1391	4	Intergenic	novelGene_55331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1014.14178276785	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129478	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_129436
927926	contig_990_pilon	-	1291	1	Intergenic	novelGene_76016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAAAATGGTATAGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538578	537287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_537300_538600
927927	contig_13612_pilon	+	1589	8	Intergenic	novelGene_157299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	143.536385204418	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1032	39	1070	51627	57016	FALSE	25	CAGTGGTTGTAAGATGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDPKNCISERLFMEMADRLAQDGWRDLGYTYLNIDDCWIGGRDDSGNLVPDPKRFPSGMAYLADYVHSLGLKLGIYADMGNFTCMGYAGTTLDRVVQDAQTFAKWKVDMLKLDGCYSTRLERAHGYPKMAAALNATGRPIAFSCSWPAYEGGLPPRRNYNDIQDSWRSVLSILDWFVENQDTLQPVAGPGHWNDPDMLLIGNFGLSFEEAQSQMALWTVLAAPLFMSTDLRTISAKDTDILQNPLMIKIHQDPLGIQGRRILKEKSDIEVFMRPLSSGASALVFFSRRTDMPYRYHSSLAKLNFTSSSVYEAQNVYTGEIISGLRDDTNFTVVINPSGVVMWYLYPIKNLGMPQQ	51128	57535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_51154_51613_51786_52249_52428_52776_52872_53480_53604_55102_55301_56237_56382_56881
927928	contig_8059_pilon	+	1943	2	Intergenic	novelGene_111103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAGAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215402	217780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_215906_216340
927929	contig_9437_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_141724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATGACATCTGAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201332	198792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_198800_201300
927930	contig_501_pilon	-	1918	1	Intergenic	novelGene_134886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTAACTCTAGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261934	260016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_501_pilon_-_260000_261900
927931	contig_5690_pilon	+	2165	1	Intergenic	novelGene_119666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	601	906	123356	123661	NA	35	GCTCTGACAAAGACACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERLEHLHTAGRNVRWWECKMVQSLWKSIWCFLKKLEIEVPYDPAIPLLRIYPREVRAITRIDICTPMFTAALFTIAKRWKEPRCPSTDKWINKLWYIHTM	122755	124920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_122800_124900
927932	contig_11924_pilon	-	762	2	Intergenic	novelGene_128031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79522	77677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11924_pilon_-_78085_79167
927933	contig_16492_pilon	+	994	4	Intergenic	novelGene_100309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	431.076430449275	19	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	404	994	166389	169279	FALSE	20	GTGGGTACCTTCTAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSKLGIAKDCCFLCQHMLHIWRLGVAFLFVLRIKGILIIPRPYPFVLFYSKFNGVEMCVDARTFGNDARFIRRSCTPNAEVRHMINYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSLPTIGAETRRRKARRKELELEQQNEAPEENNDQPPEEVPEKVNVSSDHEEIDNPEEKPEEEKEEVVDDQENLAHSRR	165985	169279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_166632_167388_167403_168549_168800_169195
927934	contig_10082_pilon	-	2712	1	Intergenic	novelGene_63907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTCCTAAGTGTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522450	519738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_-_519700_522400
927935	contig_854_pilon	+	4608	28	Intergenic	novelGene_36552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_14	2937.08418625459	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	695	2088	1910	3997	1702628	1715383	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1649663	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689439_1702054_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
927936	contig_6014_pilon	-	4446	2	Intergenic	novelGene_176277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1210	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTAACTTTCCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200653	131790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_-_135667_200083
927937	contig_13798_pilon	-	2534	3	Intergenic	novelGene_178533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCCTTTAATTATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108555	105313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_-_107119_107165_107586_108246
927939	contig_10453_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_162045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTGTGTGCCTCCTCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226167	228177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10453_pilon_+_226200_228200
927940	contig_17968_pilon	-	2864	3	Intergenic	novelGene_154539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	48	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTATAGGACAGAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83993	20531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17968_pilon_-_22255_81869_82025_83007
927941	contig_753_pilon	-	2191	1	Intergenic	novelGene_113034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTCCTTATCTCATCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1434872	1432681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1432700_1434900
927942	contig_7138_pilon	-	877	2	Intergenic	novelGene_120973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATGTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130735	91863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_92704_130698
927943	contig_9481_pilon	+	3369	2	Intergenic	novelGene_149633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2142	2603	111300	111761	TRUE	15	CCCAGGGGGTGCCACCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPGIPLCSCADWGSSSQAVQYSPARRGSQTKKRKREQTNKQIKTEQIKTNKKALGIPTAWQYGLRSSSSVKRHFTAFQEEAKMAHRATYLRERRRRWREVWKKPKEAEKSNTSYQQMTLREPASVGRWNPSGTGLKPVPPGQETVARGSRGG	109158	113355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_111942_112769
927944	contig_211_pilon	-	2169	2	Intergenic	novelGene_129897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	145	543	588845	588447	TRUE	65	AAAAAAAAAAAGAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNRIENPVVNPSTYSHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTLYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTENPTDKLDNWDLLQIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMN	588989	586674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_-_587113_587258
927945	contig_5894_pilon	-	3686	1	Intergenic	novelGene_83030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTAACATAAAAACTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360061	356375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_356400_360100
927946	contig_5718_pilon	+	1719	1	Intergenic	novelGene_110325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAGAAGAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530436	532155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_530400_532200
927947	contig_10734_pilon	+	3339	8	Intergenic	novelGene_51198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	187	junction_3	379.564734604128	62	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	3006	3338	1134427	1140886	FALSE	25	AAGGGGTAAGTTCTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKK	1125320	1140887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131089_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140662
927948	scaffold_9100_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_83320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAGACATAGCAATGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	850381	851362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_850400_851400
927949	contig_8864_pilon	-	2625	1	Intergenic	novelGene_135958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1784	2149	26836	26471	NA	60	AAAAATCTGACTCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDSRSISLRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRADREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGTPESIAPGFSISPELKPFPRPTLQTKIGLDCGTQNDTHEECAS	28619	25994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_26000_28600
927950	contig_7396_pilon	-	2557	14	Intergenic	novelGene_79569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3349.8353947019	12	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	155	730	255163	248983	TRUE	20	CTAGATATGGTGCGTGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGANRPSKDVHSLMIPTFTMKLTIMVVLQ	257508	245200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248202_248278_248552_248608_248753_249062_250259_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
927951	contig_7963_pilon	-	3492	14	Intergenic	novelGene_58454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	602.94467741549	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	1091	2527	125592	120628	TRUE	20	GGGCCAGGCCAGATGGGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	127425	118201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563_126542_126884_126910_127309
927952	contig_9535_pilon	-	1351	2	Intergenic	novelGene_124470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	357	686	252584	252255	FALSE	10	TGTTGCACGTATTGTGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIPRTARRMKKSASEEVQPEWSLETRILRLHLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQLKRGRPSTRWTDTVAATTGLSITTIVRMAPDQAVFCSVVDRVAMSQN	253213	251589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_252796_253068
927953	contig_17560_pilon	+	1630	1	Intergenic	novelGene_167586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134552	136182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_134600_136200
927954	contig_7942_pilon	+	3253	1	Intergenic	novelGene_155328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2391	2882	124963	125454	NA	70	CAAAAACAAAACCTACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTEKIIEELLRENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSLRHIIITLAKTKDKQRILRAACEKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQTRRQWDDIYKILKEKNCQPRKIYPAKLSFKFHGEIRSFPDKQKLREYVKVKLN	122572	125825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7942_pilon_+_122600_125800
927955	contig_8375_pilon	+	2141	1	Intergenic	novelGene_141316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	169	510	768	1277	218848	219357	NA	20	TGAAGTCGTTGGTCTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVPKKCDPMECRNHQTISLITHASKILLMILQRRLQQYIDRDYQKFKLDSEEDMEQGISFLVSDGSWLKAENTRKMFNLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLRKMGIPENLIVLLKNLYTDQEVVIRTEQGDRILRGLKSGKFVSGWYPFTILFNLYAEQIIREAGLYED	218080	220221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_218100_220200
927956	contig_9233_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_78247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAATGAGCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604078	606329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_604100_606300
927957	contig_3747_pilon	+	1810	3	Intergenic	novelGene_24800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3797.5	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	406	732	203794	204120	FALSE	30	TGACAAAATGTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201306_203592_203651_203768
927958	contig_11121_pilon	+	1106	1	Intergenic	novelGene_167064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTTCAACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294583	295689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_294600_295700
927959	contig_9370_pilon	-	2722	4	Intergenic	novelGene_177243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTCCTGCCCGCAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76589	59916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9370_pilon_-_59935_71916_73403_75274_75390_75486
927960	contig_9687_pilon	+	4641	5	Intergenic	novelGene_172730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	62	junction_1	66.9738755038112	272	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	305	1003	78766	111266	FALSE	20	ATCTTGAACATTTTCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSERDKDRLDRCFAEDRGIRTNVVAGVAGQLSQSADSSVSSDAAAGTGESTLEKTKGLCLNDAEGPLLEPVPNRCVQQDSGFSVAADVPCGDADRKVDFRMEGDIPRNESSDSALGDSDDDTCASAAPSLGHRSDRTEESLEVELPLPRSQSFSNQSVRNFGRSLLAGYCPTYMPDLVLHGTSNDEKLKQCLMADLLHTVHHPVLDEPIAEAVCIVADTEKWSVQVVTSQRKVADGVKLGQDVLVSSQVSSLLQAILQLYKLHFPADFCVMHLEDRLQEMYFKSKMLSEYLRGHTRVHVKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL	78461	114904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9687_pilon_+_78912_80008_80166_104516_104718_108429_108546_111187
927961	contig_12624_pilon	-	3633	11	Intergenic	novelGene_61014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	189	533	847700	843429	TRUE	80	AGATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLKVTTGFSPVSQLLLGFRPVDSTDFSPGLPSADSDSIIDVSCRMRFSLASLGSSSINSGISWLIIGDPFAYRDQALLPYSSLLTLFVSCNTLVAFGKIQVPERRSQSQESL	847888	822675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_824825_832954_833128_834319_834392_835163_835314_835984_836121_840053_840219_840544_840701_842126_842199_843401_843462_846472_846593_847508
927962	contig_383_pilon	+	2188	8	Intergenic	novelGene_126105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	894.331149005575	2	128	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1263	925	2187	130425	135549	FALSE	70	AGACACGAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTINGYVPESIRALGFCFDDTVQWHFCSVGTQDDVLIIHFTGHSFIYGKRHEDTLVLFPMRGESVTVTMDNVGNTMSSSPRSEKLRLRFRDVKCIRHDYEDSYEIIYGPSASTAMDTRKMRDFSENKSEEDATEYDYQYSLASSLGIRSFRNLSLNQEENEFNLTTLALESSSEFIAPSADTAVGSNSSYPSNISWLRDNDLSKPQKTLPHPGATTAGSLLGHATGLDKSSALNPSTGEHSSLYSEEDPLQSDVTGISLLPIGAEGFRSQKHAKYKGSKAERDRAAKLRVSWKEIPAHKTGRHLRQDNISTSRMGPWEDLSSNLLLLKQKNPSKILNGKWHLVSEKGSYEVIQETDEDMTVNKLLNSPQNGSRPWRDSTPLTNKHVKQSGHPRFSGVRRKSLQVRQDGENPGLKKTSFYI	123714	135550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_123869_125164_125331_126209_126388_127918_127996_128779_128992_130287_130432_132625_132843_134510
927963	contig_14970_pilon	+	1963	6	Intergenic	novelGene_45067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	5315.11002332031	4	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	154	885	199747	231550	FALSE	50	GAAGCCAATGGAAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGVFKSTVSLFITLNIPLYLLYLIFSFVKWVVWHPTQPLTQVTTTGTDSNTMSAGWDPNEENEDETGKPPSYSGSGIDDDEDFISRTNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	199593	232628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_199856_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
927964	contig_10135_pilon	+	3171	3	Intergenic	novelGene_106628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGCGGGGGCGGGGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85405	89576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_87253_87806_89055_89500
927966	contig_10864_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_107048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723127	721296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_721300_723100
927967	contig_5836_pilon	+	3199	1	Intergenic	novelGene_106277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	178	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	2033	2587	55191	55745	NA	35	CTTGTACAAGGAAAGGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLAKLDIQLQKNETGPIPHTVYKNYLKWINDLNIKPKTIKFVEEKIGPTIQALIHAINRIQTITINTQNPTDNWDLLKIKHPCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNKSIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQTKTTMRYHLTLALLA	53158	56357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5836_pilon_+_53200_56400
927968	contig_4301_pilon	+	3558	2	Intergenic	novelGene_65135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560918	564692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_561648_561863
927969	contig_8538_pilon	+	3739	1	Intergenic	novelGene_4620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	308	730	734051	734473	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPFFSAGQLSQLLSSPLRTGSSPSPQPGLCPAQSRVIKLFSSASKLAGGTPLRQPVSLLPEGPLLSRSVGQHAHCGRLALARHIVTHWSPAAISLPLFLAISCHLWCYIWLSISWVWEVLSTGTWVQRMHFTPGSTFLW	733743	737482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_733700_737500
927970	contig_7815_pilon	-	3445	1	Intergenic	novelGene_134402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAATAGAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845209	841764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_841800_845200
927971	contig_3095_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_75038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	124	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
927972	contig_11551_pilon	+	2455	2	Intergenic	novelGene_168467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATTCTTCCTCATATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384128	390860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_384181_388457
927973	scaffold_7386_pilon	-	1066	2	Intergenic	novelGene_136598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	154	477	340236	327315	FALSE	30	GCCACGGACTGCCAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSYLVIVRLPEIQARLRRGHRMRDIIADVRWILAESRDYQKDVYLHFINYAKAFDCVDHKKLWITLGRMGYIGKNGNSRTLNCAHEELVHRPRGSRVNRTRGHCVI	340389	326725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_7386_pilon_-_327393_339990
927974	contig_14546_pilon	+	3592	3	Intergenic	novelGene_157408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23515	27314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_+_24037_24199_26793_26836
927975	contig_12837_pilon	-	1077	5	Intergenic	novelGene_57334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTGAAAAGAAAATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166868	159321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_-_159398_161385_161492_163872_163967_166001_166596_166661
927976	contig_2854_pilon	+	1054	4	Intergenic	novelGene_120807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_3	190.327787426499	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	301	519	78938	80798	FALSE	20	TGTTTACACTTTAATTTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDSCGKSAGIREDKWIREDKWWQIFLCAPACPLLTFSPLALQPRLASSVKMHQSLLVSPASE	69081	81333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_77328_78878_78976_80617
927977	contig_5461_pilon	-	1828	1	Intergenic	novelGene_156829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	133	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	660	968	784061	783753	NA	35	AAGCCTTCACCTGAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNHPFCDYFFQGVIIKIRVFLTPYKRQREEMKEGKGNAECRMYYKICRSVEFLMSPTAYPTVITKVLSFCPIDTSKLPEGLNCWAEGCGDHGLGEHLAQLA	784720	782892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_-_782900_784700
927978	contig_18184_pilon	-	1816	4	Intergenic	novelGene_123890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGGAACGGCACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689561	678315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_-_678369_685980_686110_687735_687827_688018
927979	contig_12566_pilon	+	2621	3	Intergenic	novelGene_86027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGGCAACGGGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221752	416598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_223904_366836_367283_416574
927980	contig_15837_pilon	-	2393	12	Intergenic	novelGene_147522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_2	57.5551478264309	225	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	237	1571	37659	7311	FALSE	25	TTTTAATTGAAACTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IANEAVNVLWNICECNNRAVSIFNKEGCLEIVLKYLSRFSTNVDLAISVANCLQTVTEDNPELLKSFSAAGLQILESAMLSSVNSMEYILLKTLVAGTVWNLKDLIPSRSQAEIINAVLKILSEVLEMDAGQTVIQMKVAETQRLKTAAETEEILESANGDVLIEDDEVEEMSHKRKARRKAFVSDLLPPTDKELRQTTALLSAQQTALEIIVNMCCSEDPSDDEWEEFSSSDESDAFMETSFNECGGQLLSPLCLSHEIHTALTNCLIPKKIVEKTAFPNCTAVDICSKNPTWKPLIRKMNTIQCRALVCLQSLVSLLDVDHLGGAPALQTLAQHLSQLLFSQPDFAKHTDFLEAISGALRALLQTMASKNISQCMTPDQLMTLCKAGIYNSNTGVRVNVVSILGITGSVLAKEDGTLETLKTIGCCLLEVATKDPSLVVAGEALDALFDVFADGKEAEKASVQIRLLSALKEFQPVFKMKMRKEGRSKYSQEQLCVLDNVKMNLRRFITYQETVEKRLTS	42833	6488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_7434_9637_9815_12045_12190_17614_17704_24657_24795_26598_26682_26974_27133_27230_27322_36361_36640_37604_37746_40819_40930_42793
927981	contig_15323_pilon	+	2073	2	Intergenic	novelGene_148525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	991	1338	111787	112134	FALSE	35	CCCATGATGTAACATAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNQLHGKGLVCFLCTRYCSSHLRYHNGKKEKKKIKTSHFIKHFHDGQMDRDRNKYNRGVRKKLIVLWRRLGGECWIVDIILNTIIRKFLTEKRPEVLEGESHGDTWKQPVQTP	108419	112869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_109403_111779
927982	contig_10437_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_38427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCTGGGCCCTCATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	825973	823754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_823800_826000
927983	contig_3153_pilon	+	2185	1	Intergenic	novelGene_104694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTTACTAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383655	385840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_+_383700_385800
927984	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	169	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
927985	contig_14954_pilon	+	1720	1	Intergenic	novelGene_165181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTATCTTTGGCTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117200	118920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14954_pilon_+_117200_118900
927986	contig_14441_pilon	-	3940	2	Intergenic	novelGene_100800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	255	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	3514	3939	137503	136583	FALSE	25	TGGGACGCACACTTGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEAPGGLSGAPESSLLFTGEVSTLGHQHSAIAGEMMPLAGLSPGRGRRRADHSPVAGRRGAAGGQLSVPAMHRDGDLEPHPVLVLAGHGRGPPAALLLPRYGQHKGRGPQALLGVPAPGRPVHPERRQAPAGRLRRLSLR	141016	136581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_136866_137360
927987	contig_7428_pilon	-	1618	3	Intergenic	novelGene_77712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATGAGGTCCCTATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510624	330436	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_330496_331422_331720_509362
927988	contig_15720_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_41860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAGGTAGGCAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240233	242535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_+_240200_242500
927989	contig_6710_pilon	-	2421	1	Intergenic	novelGene_89053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTACTACTGTTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600992	598571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_598600_601000
927990	contig_6233_pilon	-	2825	2	Intergenic	novelGene_74746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	452	1291	25799	24960	TRUE	40	CCCAAGAGACAGAAAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEDYEKLYCNKFENREETDKFLETHYLPKLTQTEVVQLNKPITKEEIEKVIKKLPTKKSPGLDGITGEVYQTFREELTLPLLKVFQSIEKDGIFPDSFYEASITLIPKPGKDTTKKENYRPVSFMNIDTKILYKILANRIQQHIKKIIHHDQVGFISGMLGWFNIRKTINVIYHVNKTKDNNHMILLIVVEKAFDKAQHQFMIKTLSKIGIEGKFLKIIKGIYTKATANIILNGESLKAFPLRMGTRQKDVLYHHSYSTLCWRS	26250	22733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6233_pilon_-_22891_23582
927991	contig_9297_pilon	+	3550	2	Intergenic	novelGene_69901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2943	3383	961919	962610	FALSE	20	GAACTAGATGGTGCCCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWRFLRKLEIEVPYDPAVLLLGIYPRETRAVTRIDIRTPVFFAALFTIAKRWKQGKGPLIDEWINKLWYIHTMECYTTMNNDEAVKCHITWWKLELIMLSEFSQSQKDKWCIRPCFQGTSMSIGITNLIKKMFCILLC	958976	962777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_962280_962530
927992	contig_10581_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_41417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATGTTTATTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	619465	621400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10581_pilon_+_619500_621400
927993	contig_4496_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_66707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	468	1407	90	1496	996757	998163	NA	25	GTTACTTGTTTTAGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	996667	998388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_996700_998400
927994	contig_8377_pilon	-	1849	2	Intergenic	novelGene_35094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	49	342	146729	146436	TRUE	65	AAAAAAAAAAACCCTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKWIKGLNIKPKAKKIMEEKIRSMLGTLIYGINRIQTITNNTQTPEDLLDLLKIEHLCSSKDFTKRVKRELTAWEKHFSYDIFNKDLISKIYRKFNTSTTKRQIIQLKNGQRI	146777	144592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_144681_145016
927995	contig_3077_pilon	+	1556	9	Intergenic	novelGene_26661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	67	junction_5	3118.20108145305	2	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	61	1062	9676	17590	FALSE	15	AGTGTGCGGCACTTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQSTAGLSSSRCLHFCGPTALTGWTWPGSTLDGETRSISPPWSRHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9615	18084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13047_13171_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
927996	contig_6014_pilon	+	2972	1	Intergenic	novelGene_176279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGCAAAAAAGAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146871	149843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_146900_149800
927997	contig_6418_pilon	+	5753	1	Intergenic	novelGene_81153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGACAAGTTTCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264407	270160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_264400_270200
927998	contig_14441_pilon	-	1161	5	Intergenic	novelGene_100627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	GATTTGGTGTCCTCAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111389_111799_112037_116572_116961_117218_117343_117538
927999	contig_20641_pilon	+	1735	7	Intergenic	novelGene_52846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	3	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	55	1446	14599	56882	FALSE	55	AAAAAAAGATCTCTGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14544	57171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
928000	contig_10431_pilon	+	2150	1	Intergenic	novelGene_117385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATTAGGAGGCTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2322	4472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10431_pilon_+_2300_4500
928001	contig_3975_pilon	-	1891	1	Intergenic	novelGene_54772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1970307	1968416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1968400_1970300
928002	contig_7815_pilon	+	1670	1	Intergenic	novelGene_134405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1109	1441	852229	852561	NA	35	TGGATTCTACAGGCAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRSRKSLKVPNSKSLDCPEETAGRITDVKCVSGEALKANDEHVSRQWRKSDAFYAVAGNLSELCSNVWWQVELVSDELGYLAEEISKQDLKGAMWFLLAAYSKMRKRWT	851120	852790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_851100_852800
928003	contig_16625_pilon	-	2528	1	Intergenic	novelGene_171114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	571	1014	56590	56147	NA	15	GCTGATTTTTTTTACTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSRTFIAREEKSMPGFKASKDRHTLLLGANAAGEFKLKPVYSFTILKILGSLKVMLNLLCLCSINEEQSPNNRVCLQHGLLNILILSPLLRPTALKKKITFKILLLVHNAPGHPRALMAMYKEINVFMPANNIYFEARGSRSHFDF	57160	54632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16625_pilon_-_54600_57200
928004	contig_9073_pilon	+	3176	3	Intergenic	novelGene_177397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1	37	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	256	1650	216311	217705	FALSE	70	ATCAAAAAAAGAAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSAQHLGRTTQEREDYGYWASAIESSAGHQLSKPNVISQLEQEELSWGEKELLGCLSPDWETRLETKESTPKPNITEDFSHEVIMEREGLWHSTLGETWKPDNWLKGPPKNQDRHLGQVAVTHKETLSERRVCGSSEFERYSSQGSLLDTQHSIPMGKKPHNWNFYGEDAKQNSELIKSQRMFVVKKLYECNECGKAFSQSSSLLKHQRIHTGEKPHKCNVCGKHFIESSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIIHQRSHTGEKPYECGECGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNQCGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECIVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLIVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHRRTHT	175013	219231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_+_175096_192747_192844_216233
928005	contig_615_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_80053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	1076	1690	202032	202646	NA	10	GCCATGTTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPHKSIQGCKSLRVCGPLIPVPSKRAVPTLCFWLRGASSSFVPTPRPGEWVRAPFGIYFRPSGLLVQSAEGGGKRERGFSQMGFFFLNPRERLHACTYLSHLGAAFHWFGVSKQSLCRRVSLNVETASQVHTQHSCLPASLRTSVAAVLQFRCCGSGALRFFQTISLSPITQMVSSTLPCSGLLDIHIESTHLFFQVFVVRGI	200956	202664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_201000_202700
928006	contig_4125_pilon	-	2206	1	Intergenic	novelGene_25090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTTTCACTTAAAGCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	592291	590085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_590100_592300
928007	contig_2733_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_128576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	261	575	739038	738724	NA	70	AAAAAAAAAAAATGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLISKIYKIPQHLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFTKENIQAASSHMKKCLSSLDIREGQIKTTMRYHLTSTLLARIKKTENNKCWRGCGENGTLMHCWWECKMV	739298	737385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_737400_739300
928008	contig_1276_pilon	+	3843	7	Intergenic	novelGene_159756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCACTGCTCACTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79315	301888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_80639_125258_125636_177850_177986_178354_178368_296884_298560_300923_301069_301713
928009	contig_1372_pilon	-	2712	2	Intergenic	novelGene_140524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATCCTACTTTGGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475456	462883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1372_pilon_-_463501_473361
928010	contig_5750_pilon	+	2537	2	Intergenic	novelGene_179147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1126	2124	137951	138949	FALSE	45	GCACTCCAAAATGACAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVGIQIKTPDNSPVEENALEVPDREFKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	136663	139362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5750_pilon_+_136925_137086
928011	contig_10904_pilon	+	2495	4	Intergenic	novelGene_22467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	2	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	528	992	149604	150068	FALSE	35	CATTAAAGAAGGACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143936	151571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_149477_149562
928012	contig_5549_pilon	+	1635	3	Intergenic	novelGene_81607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	86	junction_2	16	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	134	796	304435	334662	FALSE	45	AGTCACACCACAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVSCTWWFERIHNVFLRRVIMGSYSAN	303569	335501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_303647_304378_304443_334007
928013	contig_7963_pilon	+	1144	6	Intergenic	novelGene_58365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1176.26789465666	4	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	251	811	56796	63007	FALSE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCSTWIWTRRRLSGICQNLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51359	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56851_56894_56964_57281_57564_57782_57934_63003
928014	contig_10734_pilon	-	1834	1	Intergenic	novelGene_51515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	1348	1794	2265989	2265543	NA	50	CTACCCAAACTACAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2267336	2265502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265500_2267300
928015	contig_17859_pilon	+	6517	7	Intergenic	novelGene_155720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	95	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	5363	5662	214033	214332	FALSE	10	TTTGTTTGTCAGGGGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETPAKLHQGLRAWNTLHRAGGPALNSTLLMAILSASRAPSPVLGQHGPAYREFPSEACLTQTLRQKGSQGPLGRGRAPHAGIAPAAPIQPALPCCFS	201972	215187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17859_pilon_+_206255_207357_207552_208419_208596_209876_210000_210290_210450_212720_212904_213787
928016	contig_1055_pilon	+	2978	3	Intergenic	novelGene_149728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCATCATCTTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222251	252256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1055_pilon_+_223462_232293_232458_250652
928017	contig_15687_pilon	-	1179	1	Intergenic	novelGene_129138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTATAGGACAGAGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143840	142661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15687_pilon_-_142700_143800
928018	contig_14450_pilon	-	2275	1	Intergenic	novelGene_49015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1854	2162	1180273	1179965	NA	25	CCCAGCATATCCAAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSGEKTGTSLGGLHEVHGSQSGAVSSPRGHLAMSGDIFGCHTGDGVAAGIKWTGNAVKHLQCTGQLSIGKNYLVPDVNSTEVKKPWCRSAAVLKYVQGVKP	1182126	1179851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1179900_1182100
928019	contig_4924_pilon	-	5386	1	Intergenic	novelGene_84749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	232	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	3508	4011	173637	173134	NA	45	AGAAAGGTCTGAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPKYKAKKTIKFIEEKIESMLEALIHGINRIQTITNNTQTPEDKLDNWDLLKIKHLSSSEDFTKSVKREPTDWEKIFGHYKSDKVLISKIYKKIQHLYNRKTNNPIKKWAKEMNRHFTKENIQAANRQMRKCSRSLAIREMEIKTTNEIPSHPWHYWHKSKNWK	177144	171758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_171800_177100
928020	contig_2367_pilon	-	2608	1	Intergenic	novelGene_65335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	43	672	280243	279614	NA	45	TCACAAGCAAAAGGAGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVCPVPTSWLLPHHMPSHPFPLGHTTSPLVESYWPATTWVPLPPYAGSCCTLFLFPFPLFFLPPTQHHTPPLTLPLGLCCTTLAREPLACCQPGSPRCHPPAPTMPFFYFFLPPPPNLVCHLYPFPPNYAAPPRVESHWPATCLGLPYPHIPASSCYTIVFPFPPFSFPHSPVCHLTPFPLGHVALPQLQSHQPTAFYLPPGPVQPHSPLPTGTQVCSAPPAR	280285	277677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2367_pilon_-_277700_280300
928021	contig_5419_pilon	+	2812	4	Intergenic	novelGene_15494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	263.043722601396	4	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAATAAAAATGGTGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238763	252093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240679_241836_241949_249660
928022	contig_1516_pilon	+	1724	2	Intergenic	novelGene_49955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATGAAAATACGGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313857	316099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_314663_315180
928023	contig_5452_pilon	+	394	1	Intergenic	novelGene_101030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAATAAATGGATGAAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550152	550546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_+_550200_550500
928024	contig_8616_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_72548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGAACGCTGGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420152	419308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8616_pilon_-_419300_420200
928025	contig_11855_pilon	-	2424	1	Intergenic	novelGene_67053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCATACCATCAAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2001849	1999425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1999400_2001800
928026	contig_12677_pilon	+	596	2	Intergenic	novelGene_110872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCGTATCTAGTTGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2949	3766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_3100_3320
928027	contig_16098_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_46208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGACCTGGTGATCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719052	716490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_716500_719100
928028	contig_9668_pilon	-	3968	13	Intergenic	novelGene_58194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	821.103356601483	11	123	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1089	2880	3968	553962	503642	FALSE	40	GCTTTGCAAAAGAAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMK	607391	503641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554026_573582_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301
928029	contig_7229_pilon	-	1038	1	Intergenic	novelGene_39873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAACTTTCATTTGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547353	1546315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_1546300_1547400
928030	contig_9235_pilon	-	2788	3	Intergenic	novelGene_156197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1348	1854	46974	46210	TRUE	40	AAAAAAGAACTCCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDIVLVVERQHRGAAGEHADAVPAHDGQAAQDDRDDPTGTDQQEGAEAVAAIVEFHLQHGDVALNGNG	48321	43671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_44038_45641_46419_46676
928031	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
928032	contig_1725_pilon	+	2602	13	Intergenic	novelGene_24259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	800.202730389132	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	90	1286	201480	248740	TRUE	30	TAACTACATTGGAGCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPLSAERLRPHVRIAALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNVVFPTQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRESAL	201390	255856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209837_245280_245391_246542_246681_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
928033	contig_18150_pilon	+	3240	1	Intergenic	novelGene_175823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAAGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16704	19944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18150_pilon_+_16700_19900
928034	contig_16211_pilon	+	1505	1	Intergenic	novelGene_150074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTCATCTAAAGTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117313	118818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_117300_118800
928035	contig_500_pilon	+	1102	10	Intergenic	novelGene_31000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1211.03238276223	11	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	152	835	1493640	1499316	FALSE	10	CGGGCATGTTTGACTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLARRVDCPESAAGVPAGGAPWPTTASWWSPSAATPGTRTAPRSLSAPTTMRCTSMRRAGPSGSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCGWVHGVCFSASGSRVAWVSHDSTVCLANAEKKMAVATLASETLPLLAVTFITENSLVAAGHDCFPVLFTYDSATGTLSFGGRLDVPKQSSQRGLTARERFQNLDSLHKNSVSQISVLSGGKAKCSQFCTTGMDGGMSIWDVKSLESALKDLKIK	1485750	1499583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493678_1495386_1495462_1496522_1496730_1496821_1496898_1497870_1498000_1498048_1498078_1498882_1498974_1499277
928036	contig_5649_pilon	+	751	1	Intergenic	novelGene_82354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	908934	909685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_908900_909700
928037	contig_2278_pilon	+	3035	1	Intergenic	novelGene_118099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	61	321	694355	694615	NA	50	CAAATTACCAAAACCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSWTGIARSRTAQWATPTWMYQGSAGRPLSTSDKGPCATSEPLALSWDFCCSLKHVTVLSSILSDHSAVTSLLSTHRLLLLVSAGIFSWLCLLLGLSRVSGASPF	694294	697329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_694300_697300
928038	contig_5827_pilon	+	3589	1	Intergenic	novelGene_129788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	146	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	2917	3432	206204	206719	NA	40	TGGGACACAGCAAAAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQANNIQKRAGVAMLISDKIGFNVKSTTKAKEGHCIMIKGSIHQEDITIINIYAPNDRAPKYLKQTLTALKREIDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKRVGKDTEKLNATTNQPDLIDIYRTLQPTAAKYTFFSSAHGTFSRTDHRLGHKASLNKIQSIKILQSIFSDIKP	203287	206876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5827_pilon_+_203300_206900
928039	contig_5039_pilon	+	3425	3	Intergenic	novelGene_64908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCTATTGGAACCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773249	867967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_775197_843413_843512_866587
928040	contig_2798_pilon	+	2734	1	Intergenic	novelGene_120019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	118	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	2392	2733	116117	116458	NA	20	CTGTGTACCACCACTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSKFSVERKTVFLIIFFLSPILRNNQWYHNDNYQQPHTSTGSHSMQFSVEFYFVLALKEDEVPDDQDHHIEQECEVHVYVQHGTHKFAEGQPKYPSLLDEVDQAKRHRQEKN	113725	116459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_113700_116500
928041	contig_7679_pilon	-	2400	2	Intergenic	novelGene_173740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	952	1347	2386	1991	TRUE	80	GAGAGAAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNLLLSPSTTSSISEILLFMFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLGSWKIPSISDLNSLSGPSSAFSSTGELSGVLIWMPTGAILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	3337	839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7679_pilon_-_1139_1236
928042	contig_1725_pilon	+	2841	19	Intergenic	novelGene_24260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	668.304007853896	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	811	2436	90	2525	201480	255543	FALSE	20	CTACATTGGAGCACCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201390	255859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_218450_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248611_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
928043	contig_3529_pilon	+	6220	2	Intergenic	novelGene_105369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	59	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGAGCTGCTAGCTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	603117	610896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_605051_606609
928044	contig_8992_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_174428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATACACATTAATGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102233	100499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8992_pilon_-_100500_102200
928045	contig_7396_pilon	-	1280	9	Intergenic	novelGene_79628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4460.39790125276	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	3	347	257475	255153	TRUE	5	CCTATTTTTGGTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSSGKHCRRHYPLFLCCTDLDVLPAFRLFAASTSARREVPAEGGAVASFGALIDAAWGQSLRPRATSEAWAANQATAAVGCQLLVLPRILHFSSALQGYIITDWCVHLVQENGN	257477	245937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257142_257271_257381
928046	contig_10569_pilon	+	1148	1	Intergenic	novelGene_44075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTTATTACACATATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272706	273854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_272700_273900
928047	contig_11258_pilon	-	1996	2	Intergenic	novelGene_67866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTTAACACAGCACCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375872	373615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_374663_374923
928048	scaffold_9100_pilon	+	1068	8	Intergenic	novelGene_83271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	507.112272719619	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	536	1015	651131	654304	FALSE	5	GGCTTGCATGTTGTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644846	654357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649078_650462_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139
928049	contig_8262_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_166104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	74	325	188326	188577	NA	25	TGCTGTGAGTAGCCAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKQKYFIFFFYCTSGEGLQNKQFLMKQEYTYCFMTLVNNPTTCQPSNFSTFFFGENTHSQRYTISKISTSDGAFDPTLCCSLNSLQGGSRTGTEVSLGGTKGYVVGY	188252	190306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8262_pilon_+_188300_190300
928050	contig_13863_pilon	+	3065	2	Intergenic	novelGene_42051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAGCAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312035	315243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_312131_312273
928051	contig_2834_pilon	-	1419	2	Intergenic	novelGene_27994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTCATATACAATCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261019	259378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_-_259505_259726
928052	contig_12605_pilon	+	961	5	Intergenic	novelGene_64176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2136.21821216841	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	384	938	4816	6214	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYSHLLSPSWELLLAWLSLDCWLLELWWLQL	3868	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5743_5953_6124
928053	contig_10159_pilon	-	3659	1	Intergenic	novelGene_30827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAAAGAGAGTATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	520934	517275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_517300_520900
928054	contig_14665_pilon	+	622	1	Intergenic	novelGene_171050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCACCAGCCACTATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65554	66176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_+_65600_66200
928055	contig_6208_pilon	+	2737	3	Intergenic	novelGene_53005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTATAACGTACACTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423128	429027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_423174_426285_426933_426982
928056	contig_18511_pilon	+	1560	9	Intergenic	novelGene_126870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	374.197954797992	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	837	722	1558	51813	59226	FALSE	65	CACAGAAAAGGAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNPSLLMSTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQS	35398	59228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49207_49298_51672_51838_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151
928057	contig_755_pilon	-	1672	1	Intergenic	novelGene_119789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576468	574796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_-_574800_576500
928058	contig_18934_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_175887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1359	1679	117306	116986	NA	50	CTTTAAATCAAGGGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKYYSLQYGLFLNVKKTKMLTTGPISNVMINREKIEVVKDFILLGCTINAHGSSNQEIKQYIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTVRTKVCLTPAVVSSVTSYACES	118664	116584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18934_pilon_-_116600_118700
928059	contig_11493_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_143694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	92	279	194	472	201170	200892	NA	25	ATGCTTTGAAGATGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHELIYIFLLLCFNLCESIFCKFKYILYSDTLSDFLTIQLFIVIGNKRANDFWAGNLHKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGRFRKTLLASLTKEELNKVFDEMYQHNWILFYFFKYVPGFLVRSEILYYLIKLLFNCILFLLMRLHWWFSHCFP	201363	200443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_200400_201400
928060	contig_7720_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_155743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTTCATGTCTAGATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254193	252086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_252100_254200
928061	contig_12837_pilon	+	1536	7	Intergenic	novelGene_57358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	50.815570667092	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	234	1037	285290	311123	FALSE	25	GAACAGATTTCCAGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNALRVWGGGIYEQDEFYELCDQLGIMIWQDFMFACALYPTDRSFMDSVSAEVAYQIRRLKSHPSIIIWSGNNENEAALMTNWYDIPPSDYPMYINDYVMLYVKNIREVVLAGDSTRPFITSSPTNGVESIAEGWVSHNPYDTHFGDVHYYSYSSDCWNWKLFPKARFVSEYGYQSWPSFNTLEKVSSKADWSFRSKFSLHRQHHARGNTEMLYQADLHFKLPQSTDPLHAFRDTIYLTQVRRFHSGIEHASAVNIRDHVDFAGLVG	267013	311622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_267058_282716_282869_285252_285371_286821_286909_289906_290075_302652_302872_310874
928062	contig_10973_pilon	-	2776	3	Intergenic	novelGene_150317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2954	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1706_1805_2661_2738
928063	contig_10589_pilon	+	2087	1	Intergenic	novelGene_129373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAATCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111411	113498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10589_pilon_+_111400_113500
928064	contig_10765_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_122867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	456	598	1053	19059	19514	NA	30	GTAAGTAAAGGGTGTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSKTADLLKPLHDAEPRSRPEAIERVESPVPKDASLPVTSTDDGIYSTSKAFIGPVYKPPEKKKCSERRNQADTIHGENDKGGQEKKHKSNSKKSEIDQELFQFYKEIEELENEQDDLESHCQEPEPSREQLAPYYQDHRKDLLRSDDKEKGELRNAPLLHCRYQEYLGTEPGRYPCDGQAVPTFCDISFTSFRPEWQSMPSFIVPRGPLPPPLPSFNYHLDPQRFNPPPKPLSSIFHTQDESQLHNGCYINSCPISWPCLTSDQDDKYADSRESSSFVHPPRDDCRVHNGRVSNGFCEAREEFWRDPPVDPWNGTDVFMNQEFQEEKLHKLEKLLILLRGLPGSGKTTLS	18461	19516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_18500_19500
928065	contig_4232_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_63413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTCGCACAGCTCCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467468	468135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467500_468100
928066	contig_5210_pilon	+	1048	1	Intergenic	novelGene_65486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2	367	1168345	1168710	NA	80	ACTCCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IINIYAPNDRAPKYIKQILTALKREIDSSTIIVEDLNTTLSVRDRTSRKKLNEDAEDLKGTINQPDLIDIYRTLYSIAAKCTFFSSAHGTFPRTEHILDHRATLNKIHNAEIIQSIFSDHT	1168343	1169391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_1168300_1169400
928067	contig_9051_pilon	-	2607	2	Intergenic	novelGene_170802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	709	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	361	1359	815193	676777	FALSE	60	CAGAAGAAAGGCAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKESIHQEEITITNIYTPNDRAPKYIKQTLTALKRERDSSTIVAGDFNTPLPVKNRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDLYRTLHPTAAKYTFFSNTDGTFYRIDHILGHKASLNKIQNIEILHSIFSDHKAVKVEMNNRKSKEKKPNTWKLNNILLKNYWVIEEIKDGIKKFIDSNENENTFYQNLWDTAKAALRGQFTATNAHIQKEERAIIKTLTLQLEQAEREQQKKSSGTRRKEITRIRAELNETVNRKTIERVNKTKSWFFEKINKIYNPLAKLTKEKQKRKQITRIRNEMGDITTDPTETDRIITEYNKKLYSNIFHMERKPR	815553	675528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9051_pilon_-_676807_814224
928068	contig_7165_pilon	-	2968	1	Intergenic	novelGene_116847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGTTAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300578	297610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_-_297600_300600
928069	contig_2100_pilon	-	806	8	Intergenic	novelGene_50670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	849.207505710531	5	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	78	611	1182812	1170114	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPSLELL	1185488	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170132_1175713_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
928070	contig_177_pilon	-	2412	2	Intergenic	novelGene_41819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1467	1790	418661	418338	TRUE	25	AATGAAAGGGCGGTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHNLEETMSKLLANEGIDDGVEAAVEEAQNLGNIQSPANVTAALTGLLDYPNPHEGICNQNQVVGQPAEQEDEHDGKDDPHGLVLLPHVGLEQCAQGESIAEQHD	420127	415653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_415706_417767
928071	contig_12938_pilon	+	308	1	Intergenic	novelGene_99689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCTGTGTCCTAAATTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941	1249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_900_1200
928072	contig_15720_pilon	-	1005	1	Intergenic	novelGene_41968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	231	686	307437	306982	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKMKKP	307667	306662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_306700_307700
928073	contig_7272_pilon	-	1751	2	Intergenic	novelGene_25278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	369	683	256610	256296	TRUE	15	CAGAGTGTGTCCTTTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFGDPPWVPVPWELGGRGNRSGPSGYNILGDLKMNEERPSHGLFQNLSRFLLLAFGSKVATFLGKESVCVNITIWSLYSFRNTLAVEGVEPEVPQEKRAGNF	256978	251531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_252311_256006
928074	contig_9528_pilon	-	3403	1	Intergenic	novelGene_172337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	214	645	832	1476	111952	111308	NA	35	ACTGAACTGTGTATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVGVQNKTPDDSPLEENALDLPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKSEEFRKIMQERNAKIYSQLETIQRQQLEIQKIYNAIPIQIPTTFFKETEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVRGFTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYTDQLNRTENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLLTNGAGKTGYPSAKK	112783	109380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_-_109400_112800
928075	contig_3627_pilon	-	2586	5	Intergenic	novelGene_78408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTATATACCAAGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320390	834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_1247_91714_91784_275600_276574_317807_318773_320223
928076	contig_15114_pilon	-	3413	1	Intergenic	novelGene_121141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACCAGTGGCAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124165	120752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_120800_124200
928077	contig_8544_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_55939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCAGCATAATGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199144	197551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_197600_199100
928078	contig_15093_pilon	-	1816	1	Intergenic	novelGene_143301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	720	1151	107252	106821	NA	35	GCCCATCAACAGATGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNVQVIGVPEQGEKTENTKRIIEELLTENFANIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPTHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQKVTYRGETIRLSLDYSAETMQARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLLFIYDG	107971	106155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_-_106200_108000
928080	contig_2757_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_164575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATCTAAAGTACAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136935	137869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2757_pilon_+_136900_137900
928081	contig_17144_pilon	-	1509	10	Intergenic	novelGene_29276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2352.76762689664	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	234	1214	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRDREAWWVPGWQLQHGVTETQKSEGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183206	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172508_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176095_181820_181850_183158
928082	contig_15691_pilon	+	1582	9	Intergenic	novelGene_60763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAAAAAGGCAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29233	114438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_+_29802_32386_32514_32812_32986_41296_41468_43426_43485_50448_50579_50661_50755_51871_51984_114288
928083	contig_17074_pilon	+	1624	3	Intergenic	novelGene_145131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	296.5	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	841	1275	220934	223810	FALSE	30	GTGCACAGCAATGCAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGHRLDSHVYGPQPHDPDPLYPSGLVSCLPRPGQHWPESLCLLRGHFTDPADCGCWLALLPAPVGPLHRLPGIGAHHHCSDTGTGQKAGVKQAWHLPDPSHHLPAPLTQHESGLVFNSTFPPLFRRTDSATCTRQDLVFIS	216891	224159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_217694_220895_221011_223452
928084	contig_8588_pilon	+	1007	7	Intergenic	novelGene_146508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	167	junction_5	72.1749417888385	2	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	972	36	1007	378323	385204	FALSE	25	CCTCTTATTGTTAAGGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWQHSKIIQAFMTQGEHRQALRYIQTMKPPVASGNDVILHLTVLLFNRCMVEAWTLLRHHSNRLNVEELLKHTYEVCQEMGLMEDLLKLPFTDTEQECLVKFLQSSASVQNHEFLLVHHLQRANYIPALRLNQTLKINLMNDRDPRLRERSVARNSILDQYGKILPRVQRKLAIERAKPYHLTTSSVFREVSKPRPLSAVPKQAVTGTVLTRSAFINNVLSKIGEVWASNESKNGISPYVGPNIEEPSPIVYSLPDPELPEAFVGTPISKASQKISRLLDLVRPVPQPSQYLNFIQQTPSTRSPLYLASSPLPLSQLKGSHQNTSRASELHLLET	378287	385204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8588_pilon_+_378433_380089_380235_380310_380443_381187_381339_381975_382127_382453_382562_385029
928085	contig_10793_pilon	+	362	5	Intergenic	novelGene_83442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1191.07669253495	2	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTAGTTCTCATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163985	167269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_164072_164789_164820_165329_165377_166401_166473_167141
928086	contig_5947_pilon	+	3012	1	Intergenic	novelGene_101591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAGAAGGAGATGTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882523	885535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_882500_885500
928087	contig_13854_pilon	+	1414	1	Intergenic	novelGene_154120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTTGGCCAGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238840	240254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_+_238800_240300
928088	contig_10733_pilon	+	2063	1	Intergenic	novelGene_109976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465140	467203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10733_pilon_+_465100_467200
928089	contig_16322_pilon	-	1212	5	Intergenic	novelGene_87498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	687	junction_4	342.169091970622	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	35	448	37060	32956	TRUE	15	TGTGCAGTGTGTACCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	37094	31680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986
928090	contig_5350_pilon	+	2965	2	Intergenic	novelGene_99371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1308	1670	257040	257402	FALSE	25	GACACTGACTTGACGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKQKGRTHSAFLKLKELKKKFKPQVAILKDSIGKILNDRGRIKRRWKKELVDIQPLQEVAYDQELMALKKEVQAALKALAKSKVLGTDGIPIETFQQTDAELEVLTCLCQKIWKTAT	255548	258697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_255644_255827
928091	contig_4364_pilon	+	1958	6	Intergenic	novelGene_397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	30553	junction_1	11846.9669975062	156	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	81	1208	1530895	1532568	FALSE	5	GACTGGCTCCTGTCCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	1530444	1533318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531096_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532424
928092	contig_5169_pilon	-	3425	3	Intergenic	novelGene_178878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	114	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	404	742	189118	188780	TRUE	40	AAAAAAGTGTGGTATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRTGITGSNGMSISSFLKKCHITLQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIHDSNAGVRWYLAVVLICISLMASDREHFLMCLLAT	189521	98622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5169_pilon_-_100529_168707_169086_188380
928093	contig_4857_pilon	-	1725	3	Intergenic	novelGene_48774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1918	junction_1	1053.5	19	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	64	447	1216861	1213415	FALSE	35	GAAATATTTATTTGAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVSKILI	1216924	1212136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1213529_1214576_1214709_1216723
928095	contig_16928_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_146921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1485	1934	36622	37071	FALSE	30	GCAGCTCTACAAAGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIIVLVQCCSVDSSLVTPCDQKAGGSNPHRGTAKSRNRQDSNRFEMCTHTQTSLLLPYQLSHYLTFHICDNRKIYYPTIFTLMRRVSRVASENLGSTTLHHPVPSAGSVATFICWTGPGSSVATASRWTHRKCSATRHLFWVPIFYAI	34050	37340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16928_pilon_+_34894_35980
928096	contig_9113_pilon	-	584	1	Intergenic	novelGene_68579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	104	340	311519	311283	NA	10	TCCATTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSEHSLTKVNEVTKKRTREKDVFGKGYDKCNFTTMKKYLCMSWIELWSSKNVSTWLGHDSQYCVIVLHSVIDVIFLCVVNRITMMLKRCISGSYADEIYKIRLCLKPISFER	311622	311038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_311000_311600
928097	contig_12638_pilon	+	2297	8	Intergenic	novelGene_33365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	125.628379739286	3	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	534	1013	1524483	1530346	TRUE	25	CTGAAAGGATTTTGAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGR	1515495	1539674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530561_1534864_1535060_1538799
928098	contig_15666_pilon	-	3471	2	Intergenic	novelGene_70116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	3108	3470	98571	98209	FALSE	35	TTGACACCAATTTATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPARDQNKEPGNHLKEEKVLELLELEFKRFIYRALQEIRKEIRQNSDQCQEHTDKAIEEFRKTIQKQNNKFNRLLEIIGRQQIEIQKINNKISELDNSVEGHGSRIETMEVRISEIEDKA	102170	98207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_101191_101682
928099	scaffold_8345_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_107001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCATCTGCTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545083	544548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_-_544500_545100
928100	contig_13718_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_142907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1953	2255	261901	262203	NA	30	CGGTATGTAACCCAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWSFKRLDWTVLICIGQLTAWSLAWLKRPASAGLGSPPETCSQIYAGTALQPFQAPGRQGLSDRHCQRPHRRGICWSGVPRTFWPGECHSAAMGLSVL	259948	262666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_+_259900_262700
928101	contig_13014_pilon	-	829	1	Intergenic	novelGene_169330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATGCTATTTATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299727	298898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_298900_299700
928102	contig_854_pilon	+	3901	22	Intergenic	novelGene_36485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3385.25144314766	18	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	1471	3144	1702628	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1612770	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678853_1701219_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
928103	contig_1082_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_170430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATGAACAGAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56754	57942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_56800_57900
928104	contig_9706_pilon	+	2300	1	Intergenic	novelGene_21014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536511	538811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_536500_538800
928105	contig_20223_pilon	-	2079	1	Intergenic	novelGene_177228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	20	63	334	396	41978	41916	NA	20	GAGCCTTGTGTTCCCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAANSGRENATATAHSRSSWRQPVNVFLSSGRPPSVEELLREAQLNLQSLLQGTEREGGLRLSRRREASCAAAGGRQRRKRTGTAREKESNYKHSEKQSTHYISHLSPSRLMILKGCFHRCPPPPSPRSVK	42311	40232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20223_pilon_-_40200_42300
928106	scaffold_8345_pilon	+	2667	1	Intergenic	novelGene_107023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAGAAAAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600029	602696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_8345_pilon_+_6e+05_602700
928107	contig_3081_pilon	+	3292	2	Intergenic	novelGene_133986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1433	2110	2971957	2972634	TRUE	45	ATCAATTACATGGAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKIMQEPNAKINSQLEIIHRQQLEIQKINNKISEIDGVIEGVRSRFETVEDRISGIEEKHLDTPVFEENTEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDKKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRATREKQEVQYRGETIRQSSDYSAETMQARRQWDDIHKISKEKQIASQE	2970524	2973953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_2972721_2972857
928108	contig_7416_pilon	+	1588	1	Intergenic	novelGene_134344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCTTCACTCTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925958	927546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_926000_927500
928109	contig_13215_pilon	+	3075	1	Intergenic	novelGene_145902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	76	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	263	789	2287	3075	262042	262830	NA	50	GACATATATAAAATCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIVQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWD	259755	262830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_259800_262800
928110	contig_3424_pilon	-	3692	1	Intergenic	novelGene_55514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	287	864	2262	3125	220410	219547	NA	25	AACTGGGAGTAGTATTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGCTEAPLQTKKRRGLPADCSLSFRPQTPPVLLQSPPSLYRRRRPRRACRSTQAPPRGVPRPPPGQPRHRQPGRPRAGAREGQARTKRRRRKHASHVAPRARCHGGSDPDRGLNASAMRSRSSPTPCNPEPQKFRRGLRQAVRPTHSLPLSPHPSPKGEGRGQERRKRGDVHPGLLLWKPLSLHGAGLSGSRLARLTAWTSTSGICAFRPSTITSAGPWPSPLPAAPSSARPQCRVKEGLLRALQLGGNNPLMVVDVGLQEMHFLYFFQGKEVSLALVGIVEEESP	222671	218979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_-_219000_222700
928111	contig_8820_pilon	+	1289	1	Intergenic	novelGene_79277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTCCTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116486	117775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_+_116500_117800
928112	contig_7333_pilon	-	2717	5	Intergenic	novelGene_142818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_4	59.7803270315578	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	449	2308	406076	394458	FALSE	45	TAAACAATAATGGAAGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPTLRGDGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPRQAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPESGEEAVALVEDLEREPGRPGHSVTVSVKGQEVRSEKMTPLKSSRELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARSPDLGPQEQMNPKEKLRPFQRSGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNSQLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSARVAVLPSSGLEEETPSCPIQETSEAEAEKQAEEAEEAIEEDSEGDEEDMEVPPGAVLTRAPVLFQSPSGFEAGFKNEKNPNRDISEEVQLHRTLLARSERKISRHHNQGKGSESECRSGRQWEKTPGDRRGKLILPERSLGKVLNHQKPYLGEKPYKYLRYGKSFGPNSHLMHQISHQMENPYKCADCGKSFSRSARLIRHQRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGEKPYQCGECGKRFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHVCPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHREIHTREKLLSQSAPK	407651	394048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_-_395327_397929_398401_405092_405298_405761_406195_407321
928113	contig_8689_pilon	+	1844	1	Intergenic	novelGene_170024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATATACATAGCCAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98642	100486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_+_98600_100500
928114	contig_10973_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_150362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAGCGTAAGAGACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	3305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_3300
928115	contig_14727_pilon	+	5258	1	Intergenic	novelGene_56651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	452	769	287295	287612	NA	35	GGAAGATATTGGGTCTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVIAIPFEAEAARLLVSLVSSASAFYGLLALRPHTRTCPAAASVPKLSSSTGKPTPPGSLLLTGIQLSCSVGQLQHHLSPVSWFCCCWSAAAASLLL	286843	292101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14727_pilon_+_286800_292100
928116	contig_4180_pilon	-	3434	1	Intergenic	novelGene_8321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGGTGGATGATCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785552	782118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_782100_785600
928117	contig_13244_pilon	+	6495	4	Intergenic	novelGene_86908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	3436	4428	126607	130563	FALSE	65	AAAAAAAGAAAAATTGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPPEENALELPDREFKSLILKILQELREKADKHEEKIDKFMENTDEKLEEFRKIMQEHNAKINSQLEIIQRQQLETQKINNKISEMDNVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLNTTLFQENSEKRTKTNEETLRVTWDTIKSKNLRVTGIPEQGEKTGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLQKWKNIPCSWIGRLNILKMTIPPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGPIPHTVYKNYFKMDQRPKYKA	122941	132630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_125542_125771_127112_129832_130253_130495
928118	contig_9706_pilon	+	3443	1	Intergenic	novelGene_21048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGAAAAGAAAGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700821	704264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_700800_704300
928119	contig_8552_pilon	+	2686	1	Intergenic	novelGene_80110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	149	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCACACATAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567039	569725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_567000_569700
928120	contig_5556_pilon	-	2541	1	Intergenic	novelGene_173277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGCCTGACCTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191930	189389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5556_pilon_-_189400_191900
928121	contig_16303_pilon	-	1368	2	Intergenic	novelGene_34085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35206	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33144_33847
928122	contig_709_pilon	+	2557	11	Intergenic	novelGene_57627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	31.3075070869592	16	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	642	1547	2691473	2701317	FALSE	45	AAGAAATGCTTATTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVEAGETACKLARKWGYTVKGIQKYKAKIIFAAGNFWGRTLSAVSSSTDPTSYDGFGPFMPGFEIIPYNDLPALERALQDPTVAAFMVEPIQGEAGVIVPEPGYLTGVRELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDHENVRPDIILLGKALSGGLYPVSAVLCDDEVMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAITALEVLEEENLAENADKMGSLLRHELMKLPSDVVSAVRGKGLLNAIVIRETKDYDAWKVCLRLRDNGLLAKPTHGDIIRLAPPLVIKEDEVRESVEIIHKTILSF	2681021	2702327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_709_pilon_+_2681063_2686056_2686218_2688679_2688904_2691257_2691483_2691590_2691687_2694537_2694666_2695515_2695639_2696600_2696730_2697534_2697649_2698790_2698936_2701156
928123	contig_3956_pilon	+	2358	11	Intergenic	novelGene_14841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1148.24326690819	10	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	585	1758	84	1841	1281682	1290491	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285100_1288006_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928124	contig_10434_pilon	+	2435	1	Intergenic	novelGene_82064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	89	307	184894	185112	NA	30	GGAAGCCTACAGATTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVPYDPAILLLGIYPREIRAIIRKDICTPMFTATLFSRAKRWKQPRCPSRDKWINKLWHTHTVEYYITIKNNNESAKHLIIWMNLEGIMLSEISRKRTNII	184805	187240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_+_184800_187200
928125	contig_5643_pilon	-	2731	9	Intergenic	novelGene_38718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	427	junction_1	180.04231273509	20	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	1154	2191	36806	31788	FALSE	25	AAACTCTGCTCCTGGAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVELLPCTVYQDTVCGCRKNQYRHYWSPSLFQCLNCSLCFNGTVHIHCQERHDTVCNCHAGFFLRGNKCITCSNCRSDPECTKLCLPTTGTVKGPQDTGTTVLLPLVILFGLCLLSLFIGIMCRYQRWKPKLYSIVCGKPAPVKEGEFEGVIAKPLAPAFSPSSSFSPTLGFTPTPGFRPTPSSRPTPSSYFSPSEWSNFTNASPPREVAPPYQEAGPFLTAAAASTQIPAPPQKGEERSHTLLADADPAMLYAVVDGVPPSRWKEFVRRLGLSEHEIERMELQNGRCLREAQYSMLAVWRQRMPRREATLELLGRVLCDMDLRGCLEDIEEALQGPAPRIPR	38483	31247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_32081_32204_32509_32657_32687_33009_33121_33283_33358_36330_36410_36658_36809_37081_37211_37461
928126	contig_299_pilon	+	1639	1	Intergenic	novelGene_129469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272267	1273906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1272300_1273900
928127	contig_5423_pilon	-	2853	15	Intergenic	novelGene_85240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	283.327891104196	1	129	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1552	2547	504182	497362	FALSE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKGPVSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTENGKASRQ	534678	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498376_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506931_507022_515749_515831_517366_517496_518866_518958_520068_520150_520534_520738_532555_532792_534094
928128	contig_20641_pilon	-	1748	7	Intergenic	novelGene_52830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	473	802	56705	56376	TRUE	30	AAGCGAAGAGGTCCGGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQLKGVERISQTSVVVDPLVIVEEVIVDFKGNCHGPMTDQLKLHQSFIAAPIETSHIVVIRGVVTKAVLPHFAWRISGCVGETVLFHQPKILGILSCDEIWEATFTA	57177	14537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54960_56371
928129	contig_7286_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_108667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGGTGAATACACTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279578	280871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_+_279600_280900
928130	contig_6975_pilon	-	1776	1	Intergenic	novelGene_74312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAGAACCACCAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551224	549448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6975_pilon_-_549400_551200
928131	contig_2924_pilon	+	934	1	Intergenic	novelGene_140249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTTTATGTTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26850	27784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_26800_27800
928132	contig_7629_pilon	-	2601	1	Intergenic	novelGene_153597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAACTAGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398092	395491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_395500_398100
928134	contig_10600_pilon	+	2024	1	Intergenic	novelGene_169866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	881	1456	158026	158601	NA	45	AAATATTTTCACCAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSISSLGLIIGCKGHTETHRSLTVLGFIREVTDYNSGSGMVRIQLFNQNSLFSTMQQSGLFPAPGPLCLWRQVLQSSFSSGGTPLCQQASAQRCSALLLCGSVSLAPPPRAQRHYTLPGSLLPEGAQLSCSMGLEAHHTISCQSPGSAASAAVVSLPLLSTVSGVTALRLLHLGGSQHRGPGSKGYAHS	157145	159169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10600_pilon_+_157100_159200
928135	contig_3161_pilon	+	1176	1	Intergenic	novelGene_84497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	76	393	29518	29835	NA	65	ACCTAGTTTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTRRSFFSHSPVGHKSKFKVSAPRERFLCWLWRKVCIINLPLVWELLCAGTLGPKDALCSRHCFLGGMSFPCVSARFSLLYIKRDCIKTLSNLVNLISITSSQ	29442	30618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3161_pilon_+_29400_30600
928136	contig_2438_pilon	+	1381	6	Intergenic	novelGene_112041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2828.44518419573	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	62	769	310588	312903	FALSE	10	TTTTTTGGATGGACTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGGTGTGCGGCPRGDQRQRGVDGGIQVSRTQPCWVQRIPFFPGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMATPDPLILPHACPAFP	305104	313515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312141_312240_312409_312729_312806_312852
928137	contig_4604_pilon	+	1689	9	Intergenic	novelGene_19150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2728	junction_5	362.851359891347	6	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	223	1347	360296	367611	FALSE	40	GTAGAATGTAAAATGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETGVIEKLLTSYGFIQCSERQARLFFHCSQYNGNLQDLKVGDDVEFEVSSDRRTGKPIAIKLVKIKPEILPEERMNGQEVFYLTYTPEDVEGNVQLETGDKINFVIDNNKHTGAVSARNIMLLKKKQARCQGVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGKEKVSLRDQNDCLTLLNSNHCHVIMQYGHFQNSVISEFNLKHNFLTTALLTFWAV	359054	367953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_359179_360197_360308_361428_361527_363854_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287
928138	contig_12299_pilon	+	2286	1	Intergenic	novelGene_29721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACCTCTTCACCATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34267	36553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_34300_36600
928139	contig_20614_pilon	+	2384	12	Intergenic	novelGene_107605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_8	169.905369870242	22	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	766	2298	86	2383	451169	504684	FALSE	30	GAAGCTGGTCAGTCAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVSWAVAAAPPPRLPEQDGGWTSAPSRAMDASGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPAGGGSSNGSSGSSSGGGSGSGAVDHSMQRSFSQVPLPSFSPSAASPQAPALQVKVPPTTVPTPPRATPVLQPRPQPQPQPQAQLQQQTVMITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSSQVQPVAIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGIKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTDAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQRNKLLKGIDLGSLVDNDMDLKIDDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCFLTFLCLSFNPLTSLLQWGGARDSNQHPYAGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIQPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNIIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQRRRTTPATAAGFEDEAKTSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSVLVEIHLTAAMGLQTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPERSAVPDSLRWLCHPLGQKFFME	451083	504685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_+_451257_480201_480634_481636_481819_482712_482860_484638_484861_486792_486908_487094_487277_489017_489211_489774_489957_492970_493248_496052_496223_504576
928140	contig_16523_pilon	+	3820	1	Intergenic	novelGene_179148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	188	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1887	2936	8832	9881	NA	60	AACAACTAAGAAGAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKTDKHEEKINKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVTEGLRSRFETVEDRISRTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRKDPKRKSPRHIIFTLAKIKDKQRILRAAREKQEVTYTGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFTFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	6945	10765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16523_pilon_+_6900_10800
928141	contig_5375_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_169219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATGTTGTTGGAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90522	93130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_90500_93100
928142	contig_12402_pilon	-	3124	4	Intergenic	novelGene_133387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAAAGAAAAACTTCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653055	649465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_649706_649829_650040_650155_650835_651060
928143	contig_12414_pilon	-	3467	2	Intergenic	novelGene_59605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTAGGCTGTTTCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	714098	523607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_-_525847_712870
928144	contig_16666_pilon	-	2207	2	Intergenic	novelGene_61776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1148	2089	117829	116888	TRUE	5	TCCCTTTCCCTCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVDRTTTQDGQALPVQVVQVSSELFSSKHIDQGIEATVAKCNRLGHAEGQPQVFLHVTAGKEAEEFERLQENHDVVGRPEEEKHDNHQKDQFNGSSFLAVLAGKQRPDDPEVTVTHNEQGEQEAENIGFHIAEHWPDVLEDLGVAAKAFASFLLCKHELGRRHQNGCCPDAQADGDTVLHGPVSHGVGGQDNGQVPIDADDGDEEDAPKQSDEEEGSNKFAHSIAEALVTDHIVNPERQGGYKEQVGQGQVQEIDVGDALGLPAVGKGKHHQQISHQAKGKDKGVEYRQEESPEGHNVPLIAGFSLLIIHEV	118976	106072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_106153_116849
928145	contig_11572_pilon	+	2520	2	Intergenic	novelGene_100072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAAGCGCTCGGCGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301213	304663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_303660_304589
928146	contig_2069_pilon	+	2378	3	Intergenic	novelGene_23466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	608	junction_2	164	7	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	1248	2315	1436133	1439381	FALSE	15	TGATGAGTTGAGGCCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNQLERDGEGASCPSSPPCNSSSPIPWQNRKSPSPLAFCPCPSPTPTSKELPFHLHPFYPAYLLLLPPPYLFPYGAPPSVQYPHLFMLPQGTSCSTMAVPSLLMTANEPGHHNTWGETLLPSPGAFEASGQAPPSQAWNPGPRAAQTCSLGLQQAGVVAPAKRAPLGSRVGTAALPYPLKKQNGKILYECNVCSKRFGQLSNLKVHLRVHSGERPFQCAACKKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHECPLCYKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCSGCPSRFTQHVHLKLHHRLHTPQPCSLTHAHLPLASLTYLAGWQRRALDLLAVPSERKVGWDMDKDKVSSAPQRKQGQPA	1434885	1439444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1436748_1437870_1438000_1439057
928147	contig_3956_pilon	+	1931	9	Intergenic	novelGene_15032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1160.9573635582	3	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	81	953	1281682	1289548	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKCSTSTRSRTAWWPAFSGPPRRGRCVRRTCGVCALMSMM	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284829_1289166_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928148	contig_13300_pilon	-	2065	4	Intergenic	novelGene_125816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	29.1699998095456	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1240	1641	247599	247079	TRUE	40	AAAGGAAAAGAGGGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAAGLCRKNKWTPWRQGDSSMPPPCGISLNCILLSGQAPELPKAMCPCLLPPGCSLDPCRHFQETKQEWKYKLKDWDWALTCSEEVAERPYEAPVRLRSEQGWDPVLGSSPHLLAWSRGGGGSLVPSALASP	248968	244182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_247930_248059
928149	contig_6576_pilon	+	2819	2	Intergenic	novelGene_42433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	302	1009	1301867	1302574	TRUE	60	CTGGGAAAAAAAATAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1301565	1317900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302727_1316242
928151	contig_610_pilon	-	3050	1	Intergenic	novelGene_76681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCAGAAGCCAAGTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35197	32147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32100_35200
928152	contig_13481_pilon	+	2617	5	Intergenic	novelGene_119550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1041	junction_1	171.453164158612	2	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	355	1005	1568681	1586220	FALSE	20	TTCCTTATGTTGTCAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI	1568326	1587832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1568721_1576151_1576348_1576596_1576791_1578050_1578132_1586080
928153	contig_15245_pilon	+	3108	1	Intergenic	novelGene_145218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	138	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCAATCTGGGATCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44574	47682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15245_pilon_+_44600_47700
928154	contig_10627_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_60044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATCCCCAAAAAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843350	845827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_843400_845800
928155	contig_1076_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_101110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGGATTCTGTAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56471	59140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_56500_59100
928156	contig_6066_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_149278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	34	junction_1	0	292	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	370	777	32472	31815	FALSE	25	TTAACCACAGTGTGGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPETLTGKRSSPARPTMGSRLPCWLAFCLLGATSVSAGHTGAGVSQVPRHRVTKKGQAVALSCDPISGHVGLYWYRQNLGQGLELLTYFQNKFPGDTSGMPEARFSADRPDGSSSTLRIQPVEPGDSAVYLCASS	32841	31814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6066_pilon_-_32123_32372
928157	contig_6823_pilon	-	2930	2	Intergenic	novelGene_131236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1719	2309	336339	335749	FALSE	20	TTTGTTATAGCCCTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKQAFTQASVAATKAWSKISDSRTPTGSFATIRQAVNEPYIDFVNRLQTAISRQIDNQQVAEVLCLQLAYENANSDCRAVLTSLKARDPSLADMTKACQNVGTETHKAQILAAALRPSTTTCSGCSKPGHFKKDCHSSKHKNANTKLPSQKCPCCGKGFHWANQCRSQFDNQGNPLSGNERRGESSPALKNPESP	420440	335127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_337846_420228
928158	contig_13853_pilon	-	2986	1	Intergenic	novelGene_176560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTGTGCTGTGCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38647	35661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13853_pilon_-_35700_38600
928160	contig_5643_pilon	+	1152	12	Intergenic	novelGene_38776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2196.16463201398	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	71	703	233973	237564	TRUE	15	ACCTCTTTGTTGATTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTGLPCPHPQRVSRGSDLPSGESCQIR	233604	238194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237165_237391_237456_237550_237635_237720_237819_237913
928161	contig_5260_pilon	-	2670	1	Intergenic	novelGene_144425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTGTTGTTGTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564162	561492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_561500_564200
928162	contig_12802_pilon	-	1269	1	Intergenic	novelGene_114249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAATACAACAATCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136754	135485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12802_pilon_-_135500_136800
928163	contig_11702_pilon	+	416	1	Intergenic	novelGene_142009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGTGTATGACGTGAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515437	515853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11702_pilon_+_515400_515900
928164	contig_14871_pilon	+	1924	1	Intergenic	novelGene_63732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGAAACAGAGAGAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287693	289617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_287700_289600
928165	contig_610_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_76660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATGACTTATTCATATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32257	30501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_30500_32300
928166	contig_5260_pilon	-	1150	2	Intergenic	novelGene_144349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGCTCTGTAAACTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76579	75374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_75447_75501
928167	contig_15491_pilon	-	2013	4	Intergenic	novelGene_75962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	507.605052071873	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	107	547	46982	40096	TRUE	45	GAGTGAGGGGAAAAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMVLLVYEAIGRSISGSNPVENISFPSRGNQNHSQPTRSSLEYSVSPMKALPTRGKGPVKGFVEFLISEGSFLVGRPWTEG	47088	37301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_37560_38887_40335_45107_45207_46879
928168	contig_9609_pilon	+	1791	7	Intergenic	novelGene_23074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	827	junction_6	593.224170669627	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	321	794	453647	454609	TRUE	75	AAATGTAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKFSDSSREDDARQLFALSCTAEEQGVLPEDLSGVIRRLWADHGVQACFSRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF	450275	456255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_450305_450479_450641_453012_453142_453645_453776_453861_454016_454418_454634_455282
928169	contig_854_pilon	+	2940	12	Intergenic	novelGene_36708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4243.10314870833	2	128	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	187	1920	1706758	1715383	FALSE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1705329	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1705444_1706685_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1715310
928170	contig_10642_pilon	+	1535	1	Intergenic	novelGene_78683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCGGTGGTTCGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209103	210638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_209100_210600
928171	contig_21412_pilon	-	2220	1	Intergenic	novelGene_142851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	131	310	25558	25379	NA	40	ATATTATACTGTATGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKANERTDEVKELNRRCQRAAREDKAKYYNEICKPLELENQKNMLSISQAERTEEKIQDSSCNFEGDYGQNIERPRKKQKKMEGIQSHCSKKNWSMFNHFKR	25688	23468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21412_pilon_-_23500_25700
928172	contig_3018_pilon	-	1857	14	Intergenic	novelGene_78854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	503.499070117778	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	630	1226	1855	570362	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	624989	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576721_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585131_600008_600194_600655_600766_624772
928173	contig_19518_pilon	-	3945	1	Intergenic	novelGene_170738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	1700	2068	71616	71248	NA	75	GATTAAAAAGAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSPSGKSKDGARSQAIKRKEGEVVRGKQEIQREKKKGNTSSQQMALREPASAGWCFWKRDCVRGKQRRPSVGEEGWRVGKCISQIASTLQPFRKKQRWRSEPGTRVKGGGGGKRQVRNQ	73315	69370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_-_69400_73300
928174	contig_11493_pilon	+	2786	1	Intergenic	novelGene_143720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCCCAAAAGAAAATCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	316547	319333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_316500_319300
928175	contig_16775_pilon	+	2830	14	Intergenic	novelGene_107771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	265.495807252467	2	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	120	1475	130489	174136	FALSE	20	TAGTCAGTTGCTCATCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKVKFNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130369	175491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134231_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
928176	contig_7138_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_120984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158248	160510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_158200_160500
928177	contig_5967_pilon	-	2350	11	Intergenic	novelGene_44356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	563.631581797898	2	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	180	596	488569	424051	TRUE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYS	517612	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389308_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430698_430797_465412_465533_482468_482550_488455_488583_501673_501743_517515
928178	contig_7887_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_124857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105508	103720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7887_pilon_-_103700_105500
928179	contig_17796_pilon	+	2084	4	Intergenic	novelGene_33816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	969	junction_2	64.9974358468599	5	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	14	406	53527	73011	TRUE	50	ATAGAAAATGGACAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACRRESPFTSWRTVGPLLMSVVFHLLITHTDACAPPPRYETMRLMDPIKDSYAPGESVKYQCRLGYMVKPSFARTAVCQADNSWTPLSEACTKKRCSNLGDPGNGRVIFTNETLEFGSQIDFVCDEG	53513	75575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_53627_72384_72571_72904_74664_75549
928180	contig_5200_pilon	+	2317	20	Intergenic	novelGene_140150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGCCTCGGCGCTTCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132339	180556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_132398_138789_138908_140335_140401_141707_141854_142375_142439_142834_142926_143760_143858_144757_144866_146951_147124_148411_148512_151816_151969_152453_152551_153704_153800_154069_154143_155311_155411_165672_165844_166650_166739_175658_175762_177462_177599_180271
928181	contig_13481_pilon	+	1954	1	Intergenic	novelGene_119323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATATTCTCAACAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303956	305910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_304000_305900
928182	contig_16431_pilon	-	3767	1	Intergenic	novelGene_87609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGACAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195425	191658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_191700_195400
928183	contig_4732_pilon	-	3027	1	Intergenic	novelGene_75378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	902	1240	216590	216252	NA	50	ACAACAACAACCCTAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSIPGMYPPDASSIPSPSHHSQEYLQIWPSVPLGAESPAGFTTTLALALPLPHSQSCQIQILLETSSSLVFHEPHAPGFLPTLRQDVLCLSCQLLLLFPDFTQAFLWVLP	217491	214464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_-_214500_217500
928184	contig_13244_pilon	+	1149	1	Intergenic	novelGene_86985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACCCAGCAGAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394546	395695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_394500_395700
928185	contig_14744_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_66046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATTTTCACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1326510	1328708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1326500_1328700
928186	contig_6101_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_114295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361220	362948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6101_pilon_+_361200_362900
928187	contig_11378_pilon	+	2851	1	Intergenic	novelGene_112251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	857	1171	357743	358057	NA	50	TAAAAAAATTCACATCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSTYEQLIFGKGPNSINWGKDSLFYKRCWHNWISICKKMKQDPYLTPCTKTNSKWIRDLNIKSKMIKIMEEKIGTTLGALMHGINTIGTISKQGTSTRRETA	356886	359737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_356900_359700
928188	contig_854_pilon	+	2181	13	Intergenic	novelGene_36695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_12	3583.83565762066	8	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	165	2048	1705343	1714980	FALSE	25	AGACCTCAGGCCTGCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704891	1715113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
928189	contig_240_pilon	+	1998	1	Intergenic	novelGene_173809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGAACTCGTCATCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767337	769335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_767300_769300
928190	contig_10882_pilon	+	2470	1	Intergenic	novelGene_172749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	426	2044	2469	21461	21886	NA	40	AGGACAGAGATTTCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERFFPKWGVFDPRRRPDARTYLSLIKGCFSLVLDGRVDSLLLGLFRCGKHLLSTTACLTAHHELIWPEGLRLSLGQVWQLLAASESSLPPPATQSDSSTLPLMFRAPRLSYIIDSLVYSGLCCKRDHQKCLTTPPSWLHL	19417	21887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10882_pilon_+_19400_21900
928191	contig_16310_pilon	-	1486	3	Intergenic	novelGene_70095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACAGGCGTCAGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289941	287715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_-_289064_289556_289631_289877
928192	contig_7057_pilon	+	2231	2	Intergenic	novelGene_123186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACACACACACACTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359854	440072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_359875_437861
928193	contig_2784_pilon	-	4085	3	Intergenic	novelGene_179149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	372	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	2167	2790	57201	35061	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCASQGGSFQATQYRLARTGPTQEKEKKTNKQLKTNKKKHYKMTAINSHLSIITLNINGLNAPIMRQRVTEWMKKQDPSIYYLQETHPRKKYIYLLKSKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKRGFKTKSTTKNKEGHYIMIKGTIHNEDITIINIHVPNDRAPKYIKQTLTTWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	59367	33765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2784_pilon_-_35145_38973_39379_57066
928194	contig_8660_pilon	-	957	1	Intergenic	novelGene_136484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCGCTTGTGATATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232623	231666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8660_pilon_-_231700_232600
928195	contig_5936_pilon	+	879	1	Intergenic	novelGene_53594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTATGTTTTGCTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495964	496843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_496000_496800
928196	contig_15092_pilon	-	1309	1	Intergenic	novelGene_57758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGGAAATAAACTGCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252485	251176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_251200_252500
928197	contig_1516_pilon	+	1656	1	Intergenic	novelGene_50016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	326	823	354571	355068	NA	15	GATGACTGCCGTGGATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSIFFANTAIQRHQFFFGLPYSLSSFSHTYDVTENTVAWVRHTLVFKVTSLLFNTSERSLKKSVFLPTLFCTGADFLVTVVENGGFLGSKKGVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLKFGVQQDVDMVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRR	354245	355901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_354200_355900
928198	contig_177_pilon	+	2255	4	Intergenic	novelGene_41822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	419.550023504018	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	74	1219	417672	419027	TRUE	10	CTAGTTTGTGGTATTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTLCPKLCQLLELGLSYHWAHSTLFSEIF	415657	420148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418730_418939_419390_419474
928199	contig_9440_pilon	-	565	1	Intergenic	novelGene_59029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTTAAAAAACAGCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258325	257760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_-_257800_258300
928200	contig_12520_pilon	+	2744	1	Intergenic	novelGene_161080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	118	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	281	846	850	1695	543656	544501	NA	55	AAAAAAGTTGAGAATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISVTVCGLGTCDFSGTKKEEPIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTRMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	542806	545550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_+_542800_545600
928201	contig_14219_pilon	+	2398	1	Intergenic	novelGene_54305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTCCATAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648411	650809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_648400_650800
928202	contig_9633_pilon	+	2850	3	Intergenic	novelGene_139629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1209	1514	1044775	1045080	FALSE	30	CGGCTGCTAACCAAAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVSMSGLELNGGEGVLGGSCKAGDRDETGGVVVKALVMLGADAGASREGSFWETKVSNAWIVSSEDGEILGPVEMVAATGSSGGFLEGVVTNLMTDGVGS	1041384	1046416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_+_1042241_1043611_1043729_1044539
928203	contig_11978_pilon	-	854	1	Intergenic	novelGene_63130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTCATTTGCTGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1949496	1948642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1948600_1949500
928205	contig_6063_pilon	-	2326	13	Intergenic	novelGene_27580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	478	junction_2	422.395771167279	4	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	804	1898	45585	17150	FALSE	40	TGAAGCTTTAGTAACAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAYMAYRVTTKTSLSMFSKSEFSVKRRFSDFLGLHSKLASKYLHIGYIVPPAPEKSIVGMTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKELSANTAAFAKSAAMLGNSEDHTALSRALSQLAEVEEKIDQLHQEQAFADFYMFSELLSDYIRLIAAVKGVFDHRMKCWQKWEDAQITLLKKRETEAKMMVANKPDKIQQAKNEIREWEAKVQQGERDFEQISKTIRKEVGRFEKERVKDFKTVIIKYLESLVQTQQQLIKYWEAFLPEAKAIA	48919	16721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_17201_18547_18620_18746_18828_20065_20210_25914_26121_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_44364_44507_45549_45594_45743_45811_48191
928206	contig_1428_pilon	-	2819	1	Intergenic	novelGene_158401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAACCAACTAACAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128725	125906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1428_pilon_-_125900_128700
928207	contig_18364_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_102579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGCCTTTCCCTAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159142	157867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18364_pilon_-_157900_159100
928208	contig_6898_pilon	-	3644	14	Intergenic	novelGene_35679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	2982	3494	115957	104554	TRUE	20	AGCTTCCTGCTAACGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDPLLPLVLVEFVLLQDPLGQQLVPSQVARLVHLFIEVTVLGLDSIGGQQHGSLRWAVNIIIENALLHLQEEQALGDVLDQFLGYILRVKFGPELEEQGAFLPYILGSHLLIEFQPGGEALSVLVLQTKKPNFPQANSFHHLETAACRWCWAGWQTPVLHPWWSHAH	127701	59530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104629_112964_113065_114249_114525_115894_115979_116669_116817_117863_117962_119611_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126549_126827
928209	contig_4114_pilon	+	2927	4	Intergenic	novelGene_15641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1552	1875	573982	574305	FALSE	15	CGTGGCGTAGCCCGTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQYKLHLNIKKAKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILPGSTINADGGSSQEIKRRIALGKSAAKYLFKLLKSKNVTLRTKVRLTQATAFSIGSYTCESWTMNKED	566505	575357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_567174_569005_569106_570031_570145_573311
928210	contig_10172_pilon	-	3489	1	Intergenic	novelGene_179150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2969	3430	136856	136395	NA	45	TTCCTAGAATCAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHQEDITIINIYAPNDRAPNYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTQKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDLYRTLHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINYRKSKEKNQLHGN	139824	136335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10172_pilon_-_136300_139800
928211	contig_10734_pilon	-	2566	11	Intergenic	novelGene_51154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.5016853613433	53	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	140	2035	946522	921807	FALSE	40	GATTGTTTTTAAATAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGLWAPLVRSTARGAGLAPAASGGRAYGVFKVTLPTPTFPGAGETPMNLSATFLAGCQNLGSEVEISTIEKQRKELQLLIGELKDRDKELNDMVAVHQRQLLSWEEDRQKVLTLEERCSKLEGELHKRSEIIRSLIKKIKTLESNQNECQMALQKTQQQLQEMAQKAAHASLLSEDLEARNQNLSNTLVDLSAQVGQLQAREQALTTMIKLKDKDIIEAVNHIADCSGKFKVLEHALRDAKMVETSIVKEKQDYKQKLKALKVEVSKLKEELNEKTTENNDQREEIIRLKQERSYLHDELVFTVEREKRKDDLLDIAKSKQERTNTELHNLRQIYVKQQRDLQFLHVNVENSQELIQLYDSKAEEPKALESGRDMCLSDLENSHSKDDVKREKDQKLLVKDQKFETMLVQQNRSDKSCYDVCKEKRLQVNTSFGEKSVTAVSSLFTKDSVEKQKSWSLGGKIQIEPENKSTLCKIHAKSAKDTEIGILNREKQLSESSLADEKQWHNFNVYLGLANSSGSKPPEKLNVECQDQKDRPEISYCQNNEACLSESDICDESRCCHPSNLVIEAPGHMSDVQWMSIFKPCKVGRIVRHKPTCTCSESVSGAKYNSSASEPVVSIHHPACLGSSSSTLRGEEKIIETDSSADRKSSSKTLLIDQDAALPSEKINRGLPSDIK	946661	921275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_921840_922702_922863_925178_925905_927718_927835_928205_928295_934893_934996_937941_938114_940494_940597_942037_942205_943852_944046_946486
928212	contig_8284_pilon	+	3211	5	Intergenic	novelGene_125719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	547.317321121852	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	2051	2365	450767	451081	TRUE	20	CAAGGAGCCCTGCTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIIADVRWTLAESREYQKDVYLCFIDYANEFNCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLLRNLNIDQEAVVGTEQGDTAWFKVRKGVHQGCILSPYLFSLYAEKII	436258	600369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_436487_438444_438503_441534_441606_449073_451265_599706
928213	contig_2100_pilon	-	1531	11	Intergenic	novelGene_50686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	896.337771155495	99	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	101	1198	1182812	1170252	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPAGGASWCLIVLGRLRIPSLPTWWWDSALGRSRQVHLADLSAWPSTTRSSELKRSWAARLSLPARSSETPSPTKLWAV	1185511	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172430_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
928214	contig_11413_pilon	+	3889	15	Intergenic	novelGene_103160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	160.248993119827	710	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	2	1234	366306	369244	TRUE	5	CCACGTGGGCCCTGCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPDSPHSASFISPESIKQPLQPTEEPAKEVEVASAKERTPTEVLEILPPRETEIAPAKDVGPATETEMALAKDMEPSTKSDVALAKDTEPFIDSDLTLVKDMVLPKETEVVPGKDVVLPTETNVSLDKDTVLSTETAVTLGKNLTLLKETEAALPIKMDLASAEGMVSLSEIEVAMAKDNVTSAEISLAKELSLYPETEVALASAVTLPAETKVVLTKDVAPPPEAEVTLVKDTAPPPKAEVAPLKVLTPSSETEVAPVRDVAPSSETEVAPVRDLAPSSETEVAPVKDVPLLPEEVALVMGMPLPPKTEVAVPKDVALPSATDVTQANNLTPTKDVAPPSKAEVTPAPVQDVEIARTQEGISEDSQLESLQDEGQSVAPTSVISPGMVLCLLSVFLSTTVEVQLANR	366304	426371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_366385_367194_367867_368118_368576_369219_369322_401251_401353_402182_402399_406041_406228_406836_406897_407020_407314_408831_408946_410819_410913_419493_419576_421707_421821_423791_423877_425136
928215	contig_10196_pilon	+	2190	14	Intergenic	novelGene_132254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_13	23.0338058734928	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	123	1103	1889615	1893242	TRUE	35	TTACGCGAGAGAACTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSWTSAPSCHCNAHNKSKYWKDERSRTLAGILVTFNLELMEIDADLRRGGEHLLLFTQELAAAYTRYLKGETPPSSQACCACRLRPNVGRCYICRRRRRNKEPVYRYSEIFNLVSSFISQAEKETPKTSAIMLLGAVREIALHKDPALRWENMGTTESLKLAVPLLMARMTQLLQRTLVLGDLPQPLCQKFTRFFQAVPLPPYCFGFTNCLNVAPWDHRLLTTVLRGQNITGPRRRSGKKEFLWEVFAVVRARVERLEGLGQYRELVRYLKAVKCEDSVGLRDLRDKVPFYLCKCGDFTGAAYALLSPVNTLACCTACRLTPAHFESYLKMLWTGGVPAGNDIQDTGHWTVSVGEEPGALVSPRR	1889492	1896375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1889646_1889722_1889892_1890714_1890841_1890953_1891017_1891650_1891774_1892187_1892344_1892786_1892841_1892983_1893543_1893679_1893791_1894286_1894374_1894657_1894766_1894868_1894988_1895234_1895320_1896098
928216	contig_9828_pilon	-	1947	1	Intergenic	novelGene_172246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTAAGCCTTCACCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62005	60058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9828_pilon_-_60100_62000
928217	contig_16411_pilon	+	2672	1	Intergenic	novelGene_77296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAACCTAAATCATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80551	83223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_80600_83200
928218	contig_17144_pilon	-	1550	8	Intergenic	novelGene_29320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2452.8650303559	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	157	687	179764	167588	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFNALAHLPLWGCLALL	183238	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167634_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
928219	scaffold_9205_pilon	-	2861	8	Intergenic	novelGene_161095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	22.9435865388414	207	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	374	1579	155284	143923	FALSE	30	CAAGTAGTTAATGTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKHSNTLKPDSSRLENIKSWVLGAFALLFLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQGVFIFIFHCALQKKVRKEYGKCFRHSYCCGSLPTESPHSSVKASTTRTSARYSSGTQSRIRRMWNDTVRKQSESSFISGDINSTSTLNQGHSLNNARDTSAMDTLPLNGNFNNSYSLRKGDYNDSVRVVDCGLSLNDTAFEKMIISELVHNNLRGGSKTHNLELTLPVKPMIGGSSSEDDAIVADASSLMHGDNPGLDLHQKELEAPLIPQRTHSLLYQPQKKVKPEGTDSYVSQLTAEAEDHLQSPNRDSLYTSMPNLRDSPYQESSPDVEEDLSPSRRSENEDIYYKSMPNLGAGHQLQMYYQISRGNSDGYIIPINKEGCIPEGDVREGQMQLVTSL	165708	142640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_144678_149936_150034_150798_150928_153211_153381_155228_155305_163062_163130_164478_164700_165643
928220	contig_10371_pilon	+	2685	11	Intergenic	novelGene_175464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.3846103238861	79	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	552	1073	27180	58222	FALSE	25	CTATAAGTGTATGGATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAGPGEVSKKSSDGSFKDSKAELETESSTRASRSLTTKTSKRRSRNSVEGTREASTHSASVSDVNSTSLWRENAEPEPAVKPKGDSPPSDAEGDIGPTGQEKSEVSDNSEIPNELSSSLRRLPRPGSARPAPPRVKRQENAEVLTVDRTGSGKAVSNVIVDSQNSDNEEDDQFVVEAAPQLSEMSEIEMVPAVELEEEEKHGGLVKKILETKKDYEKLQPSAKPGEKEKSLVYESAWKKEKDIVSKEIEKLRMSIQTLCKSALPLGKIMDYIQEDVDAMRNELQLWRSESRQHAEALHKEQSITDCAVEPLKAELAELEHLIKDQQDKICAVKANILRNEGRIQKMVYSTSLSSRR	10062	59834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10371_pilon_+_10137_11172_11249_21435_21538_24885_24910_25842_25928_26581_26666_27073_27198_27418_27456_28901_28979_54507_54732_58056
928221	contig_12427_pilon	-	1020	2	Intergenic	novelGene_40470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6854	junction_1	0	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGGAAAAAGCGACTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315469	313594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365
928222	contig_1117_pilon	+	3028	3	Intergenic	novelGene_179151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	64	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1141	1884	1422	57337	FALSE	75	AGTACAATAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQHLLFPGFLICASNAGVRRYFTVVLICISLMASDHCISEMQIKTTMRHHLTQALLARMENTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMMQLFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRTDICTTMFMAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVKHLITWMKPEDIMLSEISQSQNDKYCMRPLL	281	58481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1117_pilon_+_1427_30509_30732_56820
928224	scaffold_13505_pilon	-	3718	10	Intergenic	novelGene_111536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_5	421.482070558724	2	165	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	1	1386	603207	596651	TRUE	10	ACCGTTTCCCCTCATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGKWLPGTSALGSGVGVSLVFLKKFWKKLFSHLCPQVTHKSQNLSLSPPSTSLETVPSSYSSYFSEQTLGPAWNVGRGPSQAQKAPWNGRGLQSGGGKKCPQGQVFSLY	603207	588581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594275_595062_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
928225	contig_14441_pilon	+	1085	4	Intergenic	novelGene_100405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	8	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	497	1045	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	67431	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67779_125517_125902_126159_126283_126514
928226	contig_7963_pilon	+	3078	7	Intergenic	novelGene_58561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	210	junction_5	129.271892622574	32	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	955	1539	249135	250653	TRUE	15	GTACAGTGGTTTCTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKVQLTNACIPSSLLSTLPS	247403	253515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_247738_248514_249345_250120_250250_250407_251281_251519_251683_251956_252094_252903
928228	contig_5600_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_174948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	483	648	1130	65583	66065	NA	40	TGAAGGAAGAAGTCCAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQMSCGMTSKTPCLKKARGHLKDRKERKDQNGCQKRLKLALECQIAKMNRRNDEVKELKRRFQRVAPEDKVKCYNDMCKDLELGNQKGITCLAFLKLKELKKKFKPRFAIVKDSVGKIPDNSGSIKTRWKEYTKSLYQNELVNIPSFQEVAYDQKTMV	64935	66066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_64900_66100
928229	contig_11815_pilon	-	808	1	Intergenic	novelGene_50875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGCATTGCATTGGGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9204	8396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_8400_9200
928230	contig_1624_pilon	-	1046	1	Intergenic	novelGene_138376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCACCCTCTAATAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172248	171202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1624_pilon_-_171200_172200
928231	contig_3789_pilon	-	3599	2	Intergenic	novelGene_79911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	3011	3514	692110	691607	FALSE	50	TTGCTTTTTCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAEMSWAASIGQVCAAQTGGLVRSRSLPGISNPRSWLAKHCCGSAAQRTQIHRSRKPQAKDREISARLCSKAPEGIPGAAACRVPPAQNANSKLQSASPHFRGTSLRPPQGCALQSLRIPAIAAREELESAHGMSVCLLALKEKVLRSLSSSDLAQAGTPDSPLRK	695304	691521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_693836_694019
928232	contig_10838_pilon	-	3351	1	Intergenic	novelGene_129162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGACAATTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56746	53395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_-_53400_56700
928233	contig_6823_pilon	-	476	1	Intergenic	novelGene_131215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	5	367	213337	212975	NA	75	AATAAAAGGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMDKFLETHSLPKLRQSDVEDLNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGSDGFTGEFYKTFTEELVPVLLELFQSIKEEATLPNSFYEANITLIPKPGKDVTKKENYRPISHEYRCKNSEQNSSQ	213341	212865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_212900_213300
928235	contig_1339_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_163092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAAATCCCCCTGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31118	32322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_31100_32300
928236	contig_8822_pilon	-	1329	1	Intergenic	novelGene_117942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTCCCAGCAGCAGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310051	308722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8822_pilon_-_308700_310100
928237	contig_15918_pilon	+	3065	3	Intergenic	novelGene_132713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2489	2824	58708	59043	FALSE	80	AAGTAAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKHKESISPRDRKGHINQRLHHPETRRTTWCPATTNDHPDREHNKESLMEQEKSRVQNSSSTKKTRLNGLTETGRTPENMAPGVSVNPELKQFPRPTLQTNTGPDYGT	37223	59284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15918_pilon_+_38736_42044_42944_58630
928238	contig_3155_pilon	+	1643	3	Intergenic	novelGene_26374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	622.5	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	29	90	263	352	261316	261405	FALSE	30	AAGATTTGACCATCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPNRKRTKKITVRDAEPNRSRSHHEQQRSISNAANLPSAASWESSVPSDLASSSGSTLCAGKDITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	258084	262696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259297_261224
928239	contig_5690_pilon	-	3340	1	Intergenic	novelGene_119701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	2958	3296	915962	915624	NA	10	CCACTTGTGGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCKLYHYDEVICDLLMCCKFYHCDEVILMRFTRLDSVLMQSLLRYKREKRAETHGKLTPPRKQCWEQSTSFGPEVPAQRSSQTKERLMTWTFLQSRQRKHSPGAEALNLDV	918919	915579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_-_915600_918900
928240	contig_9538_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_176452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAACAGCCTCTGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28633	28097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28100_28600
928241	contig_6956_pilon	+	1416	2	Intergenic	novelGene_179153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAACGAAAAAGAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551408	650920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6956_pilon_+_551987_650082
928242	contig_6138_pilon	-	2033	1	Intergenic	novelGene_159693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACTGTATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609392	607359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6138_pilon_-_607400_609400
928243	contig_5732_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_119573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	218	670	98904	98452	NA	65	AAAACAAAAAAACCCACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFFMKEPYLTLELSGNSPMLQKSSNLNCCCQDLRGGPCDFTWCLSCSWLILTAPSSTHIISIPDLHLGNPKAFQIQEYPRQKSPFPSMVSSNFSPIMLSLFTQNPSQNLGSPCDFSLELIIHVSWVIPGPDITPVPSFPLATAVGQHPPK	99121	97796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_-_97800_99100
928244	contig_10311_pilon	-	2326	4	Intergenic	novelGene_50460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	290	junction_1	1124.14836901343	1	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATATTCACTTAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68366	65140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_66754_67180_67261_67491_67582_67823
928245	contig_12520_pilon	-	2596	1	Intergenic	novelGene_161066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	264	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAATCTTTGTTGGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407441	404845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_404800_407400
928246	contig_15327_pilon	-	1984	12	Intergenic	novelGene_70775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.853649817584	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	285	1112	1157860	1135719	TRUE	45	ATTAAAAGGCAAAGATGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169114	1129719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1135102_1135149_1135692_1135785_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153285_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167435_1168941
928247	contig_2799_pilon	-	2973	1	Intergenic	novelGene_85594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1664	1966	781803	781501	NA	20	CCCACTCTTCAGAACCCGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHLEKCKPRIKKKFGKN	783466	780493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780500_783500
928248	contig_5039_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_65068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGATAGGGAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871433	1869099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1869100_1871400
928249	contig_17880_pilon	-	1914	3	Intergenic	novelGene_167322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	70	10	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCAAGTCTCCTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27114	24764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_25755_25794_26319_26714
928250	contig_5959_pilon	+	937	1	Intergenic	novelGene_150201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTATAAAATACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334483	335420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5959_pilon_+_334500_335400
928251	contig_17046_pilon	-	1502	1	Intergenic	novelGene_176867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1502	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17046_pilon_-_0_1500
928252	contig_5419_pilon	+	1311	2	Intergenic	novelGene_15466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAATCTGTATCCCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39621	41251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_40660_40978
928253	contig_16934_pilon	+	3814	1	Intergenic	novelGene_132527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	191	610	174585	175004	NA	70	AAAGGAAAAAAAAAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IILKGETLKAFPLRTGTRQGCPLSPLLLNIVLEVLARAIRLEKEIKGIQTSKEEVKVPLFADDMILYTENPKESIRKLLKLIKDFSKVSGNKVNMQKSVGFLYTNKENPKEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKVLYKENYKTLLQETKRDLHKWEKIPCSWIGRLNIVKMSVLLKVIYSYNAIPIQIPRAFFNEMEK	174394	178208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_174400_178200
928254	contig_16496_pilon	-	1482	2	Intergenic	novelGene_5127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3542	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
928255	contig_8561_pilon	-	1579	1	Intergenic	novelGene_161634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAACCCTGATACCAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34723	33144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8561_pilon_-_33100_34700
928256	contig_10437_pilon	+	2071	2	Intergenic	novelGene_38336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1970	junction_1	0	12	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTATCATTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	445608	451700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_447055_451075
928257	contig_10197_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_115322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAGTTGGTTCCGACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605671	1607170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1605700_1607200
928258	contig_10000_pilon	+	2344	2	Intergenic	novelGene_139328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGGTCTGCAGTTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240800	268660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10000_pilon_+_240864_266379
928259	contig_7521_pilon	-	788	1	Intergenic	novelGene_160544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCATACACTTGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273593	272805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_272800_273600
928260	contig_14142_pilon	-	4390	1	Intergenic	novelGene_120438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTCTTTTTTTCTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76259	71869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_71900_76300
928261	contig_14450_pilon	-	3106	1	Intergenic	novelGene_49018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	8	27	278	304	1190873	1190847	NA	60	AAAGTGCAGGACAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAHSKPVHRPRGSSSNRKGNTAWFKIRKGVCQGCILSPYLFNLYTEHIIREAGLYEEEWGVRIGGRLINNLQYADDTTLLAKSEEDLKHLLMKIKDYSL	1191150	1188044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1188000_1191200
928262	contig_12733_pilon	-	1980	2	Intergenic	novelGene_129606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGGCGCCCTTGATTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389815	387091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12733_pilon_-_387737_388480
928263	contig_11017_pilon	-	3677	2	Intergenic	novelGene_128066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAGGAAGGAAAAAGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218420	152936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_156168_217974
928264	contig_12624_pilon	+	1558	13	Intergenic	novelGene_60963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	352.129434851574	3	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	185	868	11640	46723	TRUE	30	CTAGGAAAACTCTTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTWGKRQTRC	6159	55581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6272_8278_8344_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46692_46768_50396_50437_54975
928265	contig_3469_pilon	-	1948	2	Intergenic	novelGene_34168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	263	junction_1	0	17	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	235	651	393930	393161	FALSE	75	CATAAAGAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNLCPVGVGLIASGQCDVVVAGGVELMSDVPIRHSRKMRKMMLDFNKAKTMGQRLSLISKFRLNFLAPELPAVAEFSTSETMGHSADRLAAAFAISRLEQDEYALRSHSLAKKAQDEGLLSDVVPFKVPGKMVCVTL	394164	391863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_393368_393720
928266	contig_6477_pilon	+	2882	2	Intergenic	novelGene_154196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATGAAAAAAAAAATCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	796914	800046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_+_798630_798879
928267	contig_5910_pilon	+	4040	1	Intergenic	novelGene_168421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTTTATCTCCTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141731	145771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_+_141700_145800
928268	contig_11752_pilon	+	1866	4	Intergenic	novelGene_37591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1431	junction_3	1368.17989395482	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	107	844	84194	88933	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFGKPFSFFGYFLYRVTEVIIVYGSWLGQNDSSHSEKWKVSVRKLYFHNVFTFQ	84087	89955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667
928269	contig_10734_pilon	-	2289	13	Intergenic	novelGene_51481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	601.601866316549	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	742	1800	2274500	2265543	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305180	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275805_2277109_2277191_2280839_2280932_2282592_2282644_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
928271	contig_9363_pilon	-	3564	18	Intergenic	novelGene_6558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	120	junction_16	642.623203218557	2539	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	547	1644	23	1666	773241	756981	TRUE	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVMFKQDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTRFCLSSAFTTGLHTGNCVFVCNVSEYKDICACVYVCLCMCLYICVCV	773263	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175
928272	contig_13097_pilon	+	3130	15	Intergenic	novelGene_107716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	55	junction_8	551.730196004962	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	146	1708	184733	264394	FALSE	65	AAATATAAAAATTCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184587	265816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
928273	contig_5549_pilon	+	2644	1	Intergenic	novelGene_81694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACACTGCATGGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759746	762390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5549_pilon_+_759700_762400
928274	contig_5605_pilon	+	2718	1	Intergenic	novelGene_143934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAACAACGTTTCATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242566	245284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_+_242600_245300
928275	contig_10658_pilon	-	2175	2	Intergenic	novelGene_130087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	319	junction_1	0	13	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1773	2147	314228	313854	FALSE	40	GTAAACTTTCACCTATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKYRTKLKFLKKTGLTILLETRGTSKTITLRYRFNVELKPLQEVIFQPTDRVAYKINNNTCEECVPLKNLLYKTKQSPFAQKPRRQGGAGKVDGWKQGKRVEMVRVLTHYGDCNQFHKTNCV	317314	313825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10658_pilon_-_315479_316792
928276	contig_20615_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_146908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGTGAAATATAGGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21674	20331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_20300_21700
928277	contig_1009_pilon	-	2995	1	Intergenic	novelGene_121730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137619	134624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1009_pilon_-_134600_137600
928278	contig_11751_pilon	-	2209	2	Intergenic	novelGene_150301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	747	1280	161096	160563	TRUE	5	GATGGCGTGGTGCTTCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFSSFLSFCLNSWIILNIRDLNSLSVRSRVFSSTGRSSGVLFWTPTGTIPSCFCKCFDIVCCLQGIQSLFFSFIDCTFVCFILLFCFIWLCLSRQAACSFLVCGHDTFHLLLQWAGSVTQVWYSRSGPAEGEFLGLVGCGTYQDSTDRESVQGRFQQTMPVLLGSVMFSARCR	161842	159510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_-_160426_160548
928279	contig_11548_pilon	+	1720	7	Intergenic	novelGene_66760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	974.034008646515	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	553	885	118990	119638	FALSE	30	GGAAACCATTACGCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	101996	120473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_102178_102442_102575_112803_112857_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
928280	contig_7342_pilon	+	1622	10	Intergenic	novelGene_71229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	370.803665063725	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	63	1223	716998	730034	TRUE	70	TAAAAAAGAAGAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPLQLPAVWEVGGGDRKPRMAETLAGPGDSGSDTAAVDSNASETGTRRLSDLRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSALMERLKKAVKEEGQDPDELDIELDVTSKKTTKKCVKGQKIEEEGTEDNGLEEDSRDGQEDMEAGLENLQNIDMMDISVLDDTEVDNGSAPDFGEDGTDSILYSLCDSKDYVAAQLRQLPTQLTEHAVAFVFLFFLKQDIEEPLLEPENEKILDILGETCKSEPGKEEGSELEQPFAQETSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEEQEEGDLDLASESTHAQWSKADSLLAVVKREPEEQTGDGERTDCEPVGLEKPVEQSSQAAEDADASGEEVAEAPREASSPEPRDSKEDVKKFDFEACNEVPAAPKESSTSEGADQKMSSRTRSCQQQFW	716935	738094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_717184_718360_718449_722812_722878_722963_723172_727514_727572_728492_729013_729997_730111_734516_734667_734756_734870_738034
928281	contig_7247_pilon	-	1786	2	Intergenic	novelGene_176695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1104	1403	157788	157489	FALSE	30	AAACTATTTGTTCTGTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHGYQGLHQNESTTAIWCPAITSECSDQDHNRGFWTELEKDVEQNSNSPKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPFSSVVKSFPRFSVQPGSGQPYKTKWD	158969	157105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_158674_158751
928283	contig_1154_pilon	+	4799	6	Intergenic	novelGene_87080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAATAATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291060	403029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_291405_339702_339949_341934_342922_350468_351501_380298_380393_400933
928284	contig_5429_pilon	-	643	1	Intergenic	novelGene_127771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAACTTCAACAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27487	26844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5429_pilon_-_26800_27500
928285	contig_5041_pilon	+	1977	1	Intergenic	novelGene_27086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCACTACATGCTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539564	541541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_+_539600_541500
928286	contig_7356_pilon	+	1410	1	Intergenic	novelGene_60438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATCCACTTGTGGTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559062	560472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_559100_560500
928287	contig_1275_pilon	-	894	2	Intergenic	novelGene_108854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	397	807	747710	747300	TRUE	15	AGCCGCTCCAAGTCGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRNAFFILDLGLHVLDGITRLHLQSDGLACQGLHEDLHTTPQTKNKMQGRLLLDVVVRKSAAIFQLLACKDEPLLVRRDAFFILDLSLYVLDGVTGFHLQGDGLSR	748106	746571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_746634_747274
928288	contig_5936_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_53575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAATTCAGTAAATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296351	297200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_296400_297200
928289	contig_2093_pilon	-	1334	1	Intergenic	novelGene_152954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAGCTCTTTTCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997547	996213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_-_996200_997500
928290	contig_12566_pilon	-	3645	2	Intergenic	novelGene_86015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	169	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1333	1659	58023	57697	FALSE	40	TGTGTAAGAATTTAGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESSTARWCPATTTHCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHSFSSVVKSLPRFTVQLGIGRPHKTKGNEAKQSRDKG	91568	55710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_58688_90900
928291	contig_4924_pilon	+	2332	11	Intergenic	novelGene_84669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.3	2	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1105	1548	64074	74749	TRUE	20	CGGTTTCATCTGAATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMSREKTRKSKNREPLGLRSVRFAVVFGALQLDLQAFHADLKAIHSLDSSLCRDRIVVANKTWKTSLAQIGLFVNEDFSRDNISKRHEHLQNVLVSKLLWKVVNKEVCPLWTFSGCLQRSAAAASSGCTEWAVLRLRTAEFLSRPG	62969	155832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_64112_65501_65663_69054_69196_74645_74827_82366_82483_114578_114713_127723_127785_132966_133128_137219_137300_145996_146130_155810
928292	contig_11316_pilon	+	881	1	Intergenic	novelGene_122692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	201	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139821	140702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_139800_140700
928293	contig_12079_pilon	-	2914	9	Intergenic	novelGene_67539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	339.723324927801	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1000	2157	862522	861365	FALSE	45	TTGAAAGTACAAACGTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872424	860607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_864561_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
928294	contig_9119_pilon	-	1928	1	Intergenic	novelGene_169735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCTTCGTTAAAACCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45175	43247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9119_pilon_-_43200_45200
928295	contig_1948_pilon	+	2013	1	Intergenic	novelGene_31196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGGTACAGAGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560699	562712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_+_560700_562700
928296	contig_11304_pilon	+	1666	1	Intergenic	novelGene_156723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	2	406	453454	453858	NA	20	TCTTCTAGGGAACCCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDRHSGYGFAFPAHNASAKTTIHGLTECLIDHHGIPHSIASDQGTHFTANEVQQWAHTHGIHWSYHVPHHPEAAGLIERWNGLLKTQLQYQGGGISLQGCGSVLKEAVYALNQRPVYSTVSPIARIHGSRNQGV	453452	455118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_453500_455100
928298	contig_13800_pilon	+	1635	11	Intergenic	novelGene_153728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	226.999757709122	14	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1461	50	1510	114337	162575	FALSE	45	CCTAACTTTAGGAAATAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTRDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	114287	162700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159540_159684_162246
928299	contig_6227_pilon	+	3152	4	Intergenic	novelGene_49698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.5464684983719	25	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	321	2075	1030330	1043182	FALSE	30	ATTTCTATTTGTTAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPALALVSFEDVAVTFTGEEWQYLDLAQRILYQEVMLETCGLLVSLGHPVPKPELIFLLEHRQELWTMKRGLSQSISPGEKAKPKTTEPTASLPTSDETSFQEQVTQGASKDFRLEQARDQEGPSEKQEGNMRPGTYPHKETCPRKLSPDLGTDDSLCIRMLQERVTPEDALHEQDSHGPGKDSMTEAGKNPYNCKECGKGFSKNWTLVRHQKIHAGVKPYECNECGKACHYMADFIRHMRFHTGEKPYKCIECGKAFKRRSHLTEHQRVHTGEKPYECKECGKAFTHRSSFIQHNMTHSGEKPFLCKECGKAFHYSSSFAQHMRIHTGKKLYECSECGKTFTHRSTFIQHNMIHMGEKPFLCKECGKAFCLSSSFTQHMRIHTGEKPYGCSECGKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECGKAFCDSSSLIQHTRIHTGEKPYKCSVCGKAFTHHSVFIRHNRTHSGEKSLECKECGKAFYYSSSFTRHMRIHSGERPYVCNECGKTFTQPANFVRHSRIHTGEKPFECKKCEKAFCDNFALTQHMRSHTGEKPFECSECGKAFSHSSSFIHHQKIHARV	1030009	1044259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1030348_1033871_1033999_1036229_1036326_1041668
928300	contig_3956_pilon	+	1250	6	Intergenic	novelGene_14995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1250.12856938796	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	81	731	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282744_1289136_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928301	contig_7019_pilon	+	3321	2	Intergenic	novelGene_149449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	536	952	490108	490524	TRUE	25	CCTCCCACCTAATCTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYSRNGKLKRNDITFIVKKTISRSILKYNAVSDRIISIGLQGRPVSMTVIQIYAPTTKAEDDEIEDFYQLLQSEIDQTCNQDAFIITSDRNVKVGNKEEGLAVGKYGLGDRNDTGDRMTEFCKTNDLVITNTFSAT	489572	539815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_+_492376_539297
928302	contig_14441_pilon	+	1374	6	Intergenic	novelGene_100583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.282736920834	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	760	1188	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111198	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111383_111990_112154_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
928303	contig_8394_pilon	-	2422	1	Intergenic	novelGene_27302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAAAATAGAAAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31712	29290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_-_29300_31700
928304	contig_14925_pilon	-	948	4	Intergenic	novelGene_55080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3404	junction_2	223.42933260131	9	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	85	258	153	410	29675	27020	TRUE	10	GGCTGTGCTCCTGATTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVAFNLLMTLQLWSS	29827	25789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27018_27127_27995_28041_29569
928305	contig_1462_pilon	-	5945	5	Intergenic	novelGene_178279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	212	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2341	3390	187725	108544	TRUE	60	ACAAGAAAATATATATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNAPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQERRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQREIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSSFETVEDRISGTEDKHLDTSLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSRNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAQTMQARRQWDDIYKILKENNCQPRVIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQDLLKGVLRSEDKQLQPTGST	221323	104252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1462_pilon_-_105632_107367_108816_186947_187784_187907_188514_219647
928306	contig_5574_pilon	+	5993	1	Intergenic	novelGene_155834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACGTTATAAGTCAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94966	100959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_95000_101000
928307	contig_12923_pilon	-	1681	9	Intergenic	novelGene_30069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	298.209972167263	7	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	41	1525	64605	45496	FALSE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPKKCIPLSLSSLCGSNLRLVRHIHRVGSWKNIRGLRGTSFSPERDSLS	68224	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45645_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196
928308	contig_18404_pilon	+	1348	2	Intergenic	novelGene_173052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCTCCACAAACTTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2255	6238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18404_pilon_+_3399_6033
928309	contig_5649_pilon	+	4280	37	Intergenic	novelGene_82427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	318	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	1405	2034	1424795	1428483	TRUE	20	AGTGTCATGGACCCGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGPWASPSTRCRAPQAVIQFFSRSTLFSRPIRGRTRASSAAASSSRRFQDSRISSRAGQSTRLAARDLAVWLSISHEIRLIRLSSGSPSENCGSPPARLFSAKLISITCGHPSRARPRLSAPSGPRRLEGRRRTLSCGGSPQASTWAVGSPRALYPSLRSSRRLQKLRELANCTPPTGLMPLAVRSSFLSSGSPGRTAAKSWAPASPS	1420169	1471438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1421562_1424782_1424867_1425199_1425283_1426422_1426508_1426795_1426868_1426952_1427037_1427778_1427856_1427991_1428077_1428411_1428496_1429326_1429405_1430698_1430783_1433300_1433373_1434012_1434100_1435978_1436061_1436380_1436469_1437231_1437304_1438320_1438407_1439992_1440081_1440167_1440251_1441885_1441953_1442350_1442444_1443212_1443297_1445534_1445621_1448085_1448145_1448337_1448429_1451024_1451108_1455959_1456046_1457244_1457334_1458324_1458371_1459677_1459768_1462955_1463040_1463442_1463526_1464249_1464319_1465199_1465279_1468635_1468728_1469774_1469858_1471388
928310	contig_11846_pilon	-	1160	1	Intergenic	novelGene_105948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAGGAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273171	272011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_272000_273200
928311	contig_4469_pilon	-	5723	2	Intergenic	novelGene_21945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1133	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGAGCCAAGTGAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757513	751623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_751966_752132
928312	contig_15518_pilon	+	1514	2	Intergenic	novelGene_127609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	508	junction_1	0	4	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	438	551	15096	15209	FALSE	30	TTAAATTGTATCTTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGR	11193	16172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886
928313	contig_17684_pilon	-	2801	2	Intergenic	novelGene_178837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1098	1702	2799	4239	3142	FALSE	55	TCTACATAAATGGAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRETIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQR	6179	3139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_5357_5595
928314	contig_11338_pilon	+	1698	8	Intergenic	novelGene_6388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306201	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_306961_314755_314941_315144_315340_315548_315654_318590_318769_319185_319266_319381_319429_323165
928315	contig_15666_pilon	-	2233	9	Intergenic	novelGene_70189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_6	597.286978239941	4	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	533	1602	13	1614	132068	107816	FALSE	25	ATATTTCTCAGTCAATCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLALLLLVVLLPDGNNEDGFQGPTFYLIQTSSFANSTWAQNQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFSDEEMIELEELFRVYLIGFIREVQDRASDFQMEYNEDLLVVIQLHPGCLLSSDNTFEKNRLKRQRRLVSMLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	132080	107196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558_110627_111256_111357_131446_131711_132007
928317	contig_3077_pilon	+	1705	10	Intergenic	novelGene_26651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	3331.79297742889	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	63	1133	9676	17511	FALSE	10	CAGTGTGCGGCACTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVVPEEQAAGRCHGVGPGLG	9613	18083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17058_17455
928318	contig_14792_pilon	-	2516	1	Intergenic	novelGene_170484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAATATGACAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20893	18377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14792_pilon_-_18400_20900
928319	contig_5485_pilon	-	2555	2	Intergenic	novelGene_37769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	2103	2462	595400	594645	FALSE	40	ATTATGCTAAAGATCATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVQVEAEENFQASSCNIERSYGKKIEQCRRHQNKMEGIHRVTVPKRIVDVQPFEEVAYDQELMVLKEEVQAAVKALGKDKAAVIDGIPIEMFQQMDAMLEAFIYLCQEIWKTAIWPAD	597502	594551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_594974_595369
928320	contig_10549_pilon	+	2659	1	Intergenic	novelGene_110610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	96	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTTTATAAACACGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	183049	185708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_183000_185700
928322	contig_2278_pilon	-	5201	1	Intergenic	novelGene_118105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCTGGAGTAAAGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	758068	752867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_752900_758100
928324	contig_18804_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_163788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTACAACAATGAAAAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5653	7218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18804_pilon_+_5700_7200
928325	contig_9218_pilon	+	4271	1	Intergenic	novelGene_157687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2484	2858	341959	342333	NA	70	ACTAAGAAAGAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQVFDLNPGLPNSAEPKILFRKTFNWLTFSSMYFIIISFLTTQKFCMLSIGFFLSGRQVSLSSFSLGLDSGLIRLSVLHMKDASYFVNFHVKSRYLGEHINEKCRKVGIFLKVSLKRVKYLSA	339475	343746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9218_pilon_+_339500_343700
928326	contig_13015_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_165533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTGCTTTTTTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35641	36351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13015_pilon_+_35600_36400
928328	contig_16776_pilon	+	3803	4	Intergenic	novelGene_130497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	969	1847	37116	78126	TRUE	65	AAACTACAACAATAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSSREKWKQVLFQRKPGFNRGVRQRQRQSQQCKEEWGREIQSPQKRKKEKQIERGRWERGPQKIARIEDFSKVSVYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTITPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENYKTLLQETKRDLHKWKNIHCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYKATVIHIPMAFFNEMEKQITNFIWKGKGPWISKVLLKMKNEVGGLTLPDFRNYYTATLVKTAWYWYNHKYINQQSRIENPDLNSYTYEQMIFDKGPKSINCRKDSLTNGAGITVYPSAKK	34363	175359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_35273_37056_37538_77669_79133_174409
928329	contig_17274_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_26520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAACTCTATATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125175	127745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_125200_127700
928330	contig_6439_pilon	-	3957	4	Intergenic	novelGene_154228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	69	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAATCTCAAGTCATCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339726	103424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_104647_107270_107587_161765_161773_337314
928331	contig_5765_pilon	+	1329	1	Intergenic	novelGene_141420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATTCACAATATTATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921081	922410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_921100_922400
928332	contig_5686_pilon	+	1247	3	Intergenic	novelGene_45289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1539	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAACTCCCTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93831	172691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170347_171647
928333	contig_17560_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_167587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	1816	2124	146721	146413	NA	40	ACACACAAGTGAAATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYTESLYQKEMVDVQTFQAATYDQESMVLKALAKNKVPGIDGIPTEMFQQMDAALEALTRLCREIQKTASWPTDWKRSIFVPIQKKGDPTECRNYRTISLV	148536	146410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_146400_148500
928334	contig_6929_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_139394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTGAAAATGATGACTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108238	106103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_-_106100_108200
928335	contig_6102_pilon	+	2744	22	Intergenic	novelGene_31731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	148.697565502582	4	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	715	2148	348	2495	210569	228987	FALSE	15	CTTTTTCTCTCACTAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLEEKVSSFSEAKQRGGGSWLFLPHALVIFLQAYPLKCKYRLRRHCKISFLTILKKNIKMAKERGLISPSEFAQLQKYLEYSTKKVSDVLKLFSEDGEMAKYLQGDAIGYEGFQEFLKIYLEADNVPSNLSLALFRSFQADHCSKETVHKEVVCLSDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIITQMMRVAEYLDWDVFELRPILQQMMKEIDYDGSGSVSLTEWLRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDNGQHMWRPKRFSRPVYCNLCEASIGLGKQGLSCNLCKYIVHDRCAMKAMPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCVSGRCDRCQKKIRSYHSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQATGNECDCGLFRDHILPPSSIYPSVLASGQDRKTSKTSQKSMEDLNSGTSEALRIDPVSNTHPLLVFVNPKSGGKQGERVLWKFQYLLNPRQVFNLQKDGPEPGLKFFKDVADCRILVCGGDGTVGWILETIDKASLPAVPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQNLGKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPLDLSNLSLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTKRPHGDSHINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGHRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQSPCTIKITHKNQMPMLMGPPPRSSNFFGFLC	210221	229236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_210611_216094_216300_216698_216776_217097_217231_217480_217556_218015_218066_218402_218478_218671_218792_218886_219002_219530_219620_219751_219872_220090_220190_220361_220446_220705_220780_220949_221025_221434_221521_221611_221702_226861_226950_227975_228161_228274_228396_228586_228648_228903
928336	contig_12019_pilon	-	755	3	Intergenic	novelGene_87661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	1189	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8659	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
928337	contig_12605_pilon	+	634	3	Intergenic	novelGene_64188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	395	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	24	392	3897	4829	FALSE	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3873	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
928338	contig_9752_pilon	+	1822	1	Intergenic	novelGene_122028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	426	770	148378	148722	NA	15	GCAACAGGTTCGTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRDLEDIFVPVLKKDDPTECENYRTISLIPHASKILLKIIQKWLQQYIDKELPEIQAKFRRGCGTRDIRWILAESREYQKDVYLCFIDYTKAFDCVDHNKSWKTLKEWEFQNT	147952	149774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_+_148000_149800
928339	contig_7056_pilon	-	1331	3	Intergenic	novelGene_43677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCATCTTCTTCAGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	812185	808768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_808811_810826_810886_810955
928340	contig_14247_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_179154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTGAATTATTTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241575	242639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14247_pilon_+_241600_242600
928341	contig_20719_pilon	+	2898	2	Intergenic	novelGene_140565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1460	1972	16653	17165	FALSE	30	ATTGGAAGAGCGTAGTCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTQALLARIKNTGNNKCWRGCGEIGTFMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDISFNPAIPFLGIYPREIRVITRIDICTPMFTAALFTIAKQWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVNHLITWMKLEDIMLSEISQPQKDKYCMRPLL	15152	18091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_+_16550_16590
928343	contig_13901_pilon	-	260	1	Intergenic	novelGene_146640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAGCCAATGATGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161476	161216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13901_pilon_-_161200_161500
928344	contig_10494_pilon	+	670	1	Intergenic	novelGene_102125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGTTAAAAAAATAATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255696	256366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_+_255700_256400
928345	contig_9272_pilon	-	3014	1	Intergenic	novelGene_125901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACCAGACCAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268021	265007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_-_265000_268000
928346	contig_16744_pilon	+	458	1	Intergenic	novelGene_178199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGACAAGAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13448	13906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16744_pilon_+_13400_13900
928347	contig_2783_pilon	+	3063	2	Intergenic	novelGene_119646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	65	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	2352	2897	393123	393950	FALSE	10	ATTCTCCGTTCTCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKNKQERPPKKQKKKTYEKRNALRDPSAHLCKPRGKSPCHAAPPGQKGLPTQEKEKKTNNSKQTNEQKPRDPTSAAAQTGKQLHTRTELHSPSGRSKDGARSQVFERKEGEVVRGKEEIKRSRKKATLAANKWHSESQLVRAGVSRTRDCVRGKQRGPSRGEEG	390771	394116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_+_393649_393930
928348	contig_7411_pilon	-	1891	3	Intergenic	novelGene_136987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAGGATACCAACTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	175500	173021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_173894_174145_174458_174793
928349	contig_16496_pilon	-	841	3	Intergenic	novelGene_5232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTAACACATATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1234_1301_1354_3413
928350	contig_19812_pilon	-	2248	20	Intergenic	novelGene_100984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	54	junction_2	92.0709409734969	1	75	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	683	2052	61	2112	46806	15879	FALSE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48259	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
928351	contig_20550_pilon	+	2076	15	Intergenic	novelGene_142622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	289.028077514688	3	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	116	1288	19003	30928	TRUE	10	TGCCTGTTTTGTGCTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPESVQSAKRLLDQIVEKGRPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPLRITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIKKIQNDAGVRIQFKPDDGTTPDRIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGRGQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLFTIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNPGPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAAPTGAPTTTQTNGQGRSAKSSSSWTG	15936	38537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_+_15955_18905_19069_19169_19269_19388_19491_19756_19860_20009_20111_20470_20613_21236_21398_24121_24274_24355_24436_29228_29358_30890_30967_37487_37548_37627_37774_37993
928352	contig_12540_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_148083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTTGAGAATTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939677	941036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_939700_941000
928353	contig_19228_pilon	+	2550	1	Intergenic	novelGene_174410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	75	476	16812	17213	NA	20	CCTACTCCGATAGGGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESECLSSISLILSSIVSNLLLSPSMILSISETLLFTFWISNCFCMISSHELILAFYSCIIFLNSSIFPSFLSAFCFYSWIALSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSTGVLFWTPTGTILSCFLYVFILSAVFGTFSSYFFHLLIVDMFVLSCFFVLFGYV	16737	19287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19228_pilon_+_16700_19300
928354	contig_5095_pilon	+	1969	1	Intergenic	novelGene_74942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	66	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTTCACCAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157405	159374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5095_pilon_+_157400_159400
928355	contig_6842_pilon	-	1998	1	Intergenic	novelGene_130640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCCCAGCACCCACAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187005	185007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_185000_187000
928356	contig_10596_pilon	-	3174	4	Intergenic	novelGene_173582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1805	2305	161603	161103	FALSE	65	GGAAAAAGAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITHKFLLLIVSHITLRVSSFSFVLFSEFSSNRIVSKCLSSIPLILSSTISNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSYLSFFPSVLGEFRVLEI	249680	160233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10596_pilon_-_162405_166190_166539_247305_247774_249493
928357	contig_17500_pilon	-	4101	3	Intergenic	novelGene_157913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	1352	1837	280127	220638	FALSE	25	TCGTCTCTCGGCAAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCRSRGLSSKGRNVPTWRRITDSIELEVKNATWPLWAPYASGSTCKEGSYHLAGVSDPDYQEEIGLILHNGGKEKYVQNAGDPLGHLLVLPCPVITVNGKLQQPNSNMTTNDPDTSGMEVWVTLPAEVTAEDKGKMEWVVEEGSSKYQLRPRDQLQKRGL	281528	218373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17500_pilon_-_221114_280117_280436_280485
928358	contig_10948_pilon	-	1194	1	Intergenic	novelGene_124956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCAACTGGTTTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16725	15531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_15500_16700
928359	contig_10500_pilon	-	2787	7	Intergenic	novelGene_41258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	823.55914582176	4	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	352	804	1635143	1629460	TRUE	70	AGAAAAAAAAAAAAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640218	1626836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1636940_1636973_1639959
928360	contig_11338_pilon	-	1701	9	Intergenic	novelGene_6232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_8	89.9387812625899	26	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	115	1269	17283	12948	TRUE	30	TATTATGGAAACCTGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGALVTLSAVQGFPAAHPGGHQSVWPRDGH	21396	12423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12795_12886_13032_13118_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
928361	contig_8377_pilon	+	1842	17	Intergenic	novelGene_35000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2862.27328523588	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1215	627	1841	154883	180506	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	68138	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68201_137655_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
928362	contig_15120_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_108037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	680124	681797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_680100_681800
928363	contig_15653_pilon	-	2875	2	Intergenic	novelGene_176961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1800	2219	45602	45183	TRUE	20	AGTCATGAGTGCTCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDPEAVARPNVAPQPCRKGPRRLSESGSRAKRGGEAASGKRESKRSRKRKKGKKKNNNTCSLQTAPKEPPARSCRIQAAGSPGSRACSPGKQRSK	47401	43917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15653_pilon_-_44364_44972
928364	SIRV3	-	610	2	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	976	979	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACGACCAAAGCGACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8938	7780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_8208_8755
928365	contig_9177_pilon	-	5069	35	Intergenic	novelGene_32617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	1606.81867123037	511	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	883	2652	107	2758	26442	16653	TRUE	20	AGTGCCTTTGCATCCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	32832	10629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_11122_11615_11760_12845_12969_13082_13173_13274_13369_13555_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_32759
928366	contig_13292_pilon	+	2219	2	Intergenic	novelGene_142935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	861	1178	176143	176460	FALSE	65	GTGAAAAAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNCIKRQSMMASASFQNKESGNFPEEKNFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNTEHAIEEIKKITEEHNDKFNRLQESIERQQSEIQKINIKFQN	175052	177501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13292_pilon_+_175469_175698
928367	contig_4114_pilon	+	2036	1	Intergenic	novelGene_15624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATAGTGATCCTACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413489	415525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_413500_415500
928368	contig_8015_pilon	-	1454	4	Intergenic	novelGene_176682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAAAAATAAACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679126	560927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8015_pilon_-_561280_675841_675895_677657_677990_678409
928369	contig_7056_pilon	+	1234	10	Intergenic	novelGene_43647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAGGTGCTTAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722474	728707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724504_724601_725155_725319_725469_725606_725661_725733_725812_725991_726938_727079_728560
928370	contig_3424_pilon	+	2390	1	Intergenic	novelGene_55511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTAATGGTGTTGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202194	204584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3424_pilon_+_202200_204600
928371	contig_9428_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_179155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGGTCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13054	14623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9428_pilon_+_13100_14600
928372	contig_34_pilon	-	1701	8	Intergenic	novelGene_39999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1603.44352655687	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	757	1431	214146	212049	FALSE	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247098	211778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_214481_214639_215288_215458_224659_224818_243214_243354_246970
928373	contig_9912_pilon	-	1258	2	Intergenic	novelGene_177456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTCTATGGGTTTTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79226	76821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9912_pilon_-_77690_78836
928374	contig_11656_pilon	+	1539	1	Intergenic	novelGene_54036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGCAGTGTCTTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	515269	516808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_515300_516800
928375	contig_6439_pilon	+	2964	1	Intergenic	novelGene_154248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCACTGTTGACGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387144	390108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_387100_390100
928376	contig_17144_pilon	-	2537	15	Intergenic	novelGene_29231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2026.98984119964	35	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	666	2001	328	2328	174965	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWSVS	176265	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166290_166501_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
928377	contig_6509_pilon	+	3931	9	Intergenic	novelGene_145621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1906	2601	72913	73608	TRUE	25	AGGTGTGTCCCAAAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTLAWNALFFSESVPCRPPPFLCSRFFLTGFRDSTLEASEEQSDSLVSRVLVESDKELTSDQAGEEMVFQLSVLQCLECWSVWLGLCFWEAVLPWEEVEEAESELNREGSFNTSGDPLAQPELPTEPSSSSLPRGSLSDSEEQNLSLLFPNRTSLPFVSFFRFFFTLFFSFCCLELEDSRVLLPGSTACADSLSFSPVPMVTFTSSSSDVSDKMRCAAFFGAIVLFLV	71007	226684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_73889_74356_74507_76422_76563_77878_78084_78289_78463_91927_92064_110629_110777_224543_224589_226630
928378	contig_4065_pilon	-	4788	3	Intergenic	novelGene_133396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTGGGGGGTTTTGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547214	401407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4065_pilon_-_402696_542876_543215_544052
928379	contig_854_pilon	+	461	1	Intergenic	novelGene_36705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGCTGCCCAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704978	1705439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1705000_1705400
928380	contig_5400_pilon	+	1386	1	Intergenic	novelGene_162833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAAAAATTTAAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	279312	280698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5400_pilon_+_279300_280700
928381	contig_2058_pilon	-	1063	1	Intergenic	novelGene_171562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTAAAAAAAAAAAAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81882	80819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_-_80800_81900
928382	contig_6059_pilon	-	2286	16	Intergenic	novelGene_44856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4575.7274753736	3	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	256	1989	584299	569223	TRUE	75	TGAAAAAAAAAATAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLELMKQ	584875	568025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569850_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181_584355_584675
928383	contig_6062_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_5242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTCCTAAACTGTGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538159	536717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6062_pilon_-_536700_538200
928384	contig_9731_pilon	+	2526	1	Intergenic	novelGene_154388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	296	790	26364	26858	NA	85	AAAAGAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIEKQKGRTHLAFFKLKELKKKFKLRAAILKDSLGKILNGIGSMKIRWKKYTESLYQKELVNVQPFQEAAYGQESMVLKEEVQAALKALAKNKAPGIDRRTIEMFQQTEATLQALTCLCPETWKTSTWPIIWKRPIFVPIPQKDDPTEYGNYQTVSLLS	26068	28594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9731_pilon_+_26100_28600
928385	contig_8447_pilon	-	2208	2	Intergenic	novelGene_69401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39936	36189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_-_36522_38060
928386	contig_11098_pilon	-	1715	1	Intergenic	novelGene_166685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAAAGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	246817	245102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11098_pilon_-_245100_246800
928387	contig_12046_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_83462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAATAGAGAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235635	234563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_234600_235600
928389	contig_2903_pilon	+	1051	1	Intergenic	novelGene_148980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTACCACTGTATATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184425	185476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2903_pilon_+_184400_185500
928390	contig_3747_pilon	-	2502	3	Intergenic	novelGene_24874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCTCCCAATAACTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201538_203080_203127_203227
928391	contig_1244_pilon	+	2245	13	Intergenic	novelGene_38002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5121	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1471	1830	933775	947611	TRUE	0	TTCTGCCTGGGCTCCCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGSFLSTTNSTPHKQDSLGLEISTSSCGIPVFRISPIDNDVTSIQQRNQFFNEIINSLTSLHEKYDPPRLLQLGDHLLQGVSTNHFGSLCLTGQEIINFGDCPVKSTDHKAVVIHVQN	922784	948812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_923330_923427_923551_923725_923827_924214_924348_924582_924714_927035_927231_928762_928900_931621_931690_933737_933856_934499_934564_946437_946618_947576_947655_948440
928392	contig_12000_pilon	-	2143	1	Intergenic	novelGene_43196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	596165	594022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_594000_596200
928393	contig_9434_pilon	-	2939	6	Intergenic	novelGene_150482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATAAAAGAGTGGCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369313	67108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9434_pilon_-_67280_68717_68846_69070_69280_69997_70166_229933_229975_367091
928394	contig_9185_pilon	-	1043	3	Intergenic	novelGene_166911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	192	572	491444	489663	FALSE	50	CAAATAAATCAAGATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYTDFKINFIQLLQLSIDVQQGTDNTWSRSLGSCRCGPPAKNSFLSITDSTWLAILLGGEVSAKKIWAASSHPRQDNWSLFSWSNRERRRVEQQEEMECLANCLHEQLPPLPRDQKNWMVPGYHY	492121	489191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9185_pilon_-_489854_491254_491475_491960
928395	contig_3095_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_75085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
928396	contig_11338_pilon	-	1787	9	Intergenic	novelGene_6350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	410	junction_8	104.883193958804	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	100	1248	315636	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKWYYINHITGTITNLTSLPYVIPQLIDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	315735	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545
928397	contig_9183_pilon	-	3861	7	Intergenic	novelGene_40292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	73	junction_6	411.812659672656	2422	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	260	1582	323783	318417	TRUE	20	ACCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	326017	310596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743_323834_325808
928398	contig_1150_pilon	-	548	2	Intergenic	novelGene_61389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	18	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309904	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
928399	contig_5236_pilon	+	2387	18	Intergenic	novelGene_100877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	174.129451110215	1	93	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	759	2168	70504	84085	FALSE	30	TTAAAGGGGGGATTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60614	84304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62872_64037_64104_66489_66612_67072_67219_68420_68505_69704_69812_70462_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74123_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
928400	contig_2100_pilon	+	1269	1	Intergenic	novelGene_50771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1188635	1189904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1188600_1189900
928401	contig_7521_pilon	+	1855	2	Intergenic	novelGene_160542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTGCAACAACTGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265143	267347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_+_266660_267008
928402	contig_6227_pilon	+	1763	1	Intergenic	novelGene_49708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTCCTGATAAAAACTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1162866	1164629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1162900_1164600
928403	contig_4924_pilon	+	2259	2	Intergenic	novelGene_84716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAAGTACAGACACTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102354	108458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_102362_106206
928404	contig_10324_pilon	+	2587	7	Intergenic	novelGene_7878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	221.574981038524	808	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	198	731	549502	568878	FALSE	30	CCTGACTTCAGCACACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVSPTSGFATEAPSARTALMSSRRHACLSPASLGNSAVGDGSTAAFLSSGDVMAKWTARMAPTSKTVPTASPEFTTAEMATMSHQALGNIAGRGTEEKPGRVGALSIVLPIVLLVLLCFGAFLLWKNWRLKSINSINFDNPVYQKTTEDEVHICRSQDGYTYPARQMVSLEDDVA	538646	570734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_538808_549465_549586_550276_550400_565316_565372_567235_567314_567956_568115_568842
928405	contig_4674_pilon	-	2041	1	Intergenic	novelGene_174131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATAAATTTATTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3356	1315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_1300_3400
928406	contig_817_pilon	+	1635	1	Intergenic	novelGene_132476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTCTGAACTGTGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	717634	719269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_717600_719300
928407	contig_3602_pilon	+	1330	1	Intergenic	novelGene_60623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTGTGTATAAACTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913608	914938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_913600_914900
928408	contig_2161_pilon	-	1979	7	Intergenic	novelGene_114929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	44.3721634461166	12	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	216	1073	898136	865203	TRUE	30	TAAAACCATCCACTTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHTLMRGTPPLQRPHFKLFQLLVLTGLFHFCLGDSQVTKAVKEMAVLSCDYNIPTQQLMNFRIYWQKNNEVVLTIISGNISVWPKYKNRTIVDIANNLSIVILALRLSDKGTYTCIVQKTDNGVYRREHLALVKLSIRVDFHDPIITDLGNPSADIKKILCSTSGGFPEPRLSWLENGEQLNVINLTVSQDPETELYNISSELHFNLTRNHTFVCLIKYGDQQVSQTFPWIISKPSPLVDPFPLWVTILITIIGICGMTVLITCCWNHTRAYLQGPAASSRGNI	899975	838800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_839705_865200_865253_866440_866549_866810_867093_872539_872858_898036_898148_899771
928409	contig_14405_pilon	-	1793	1	Intergenic	novelGene_85672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGAAGTCATTAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	783047	781254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_781300_783000
928410	contig_5965_pilon	+	744	1	Intergenic	novelGene_154657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAACCCAACCTCATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128479	129223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5965_pilon_+_128500_129200
928411	contig_5482_pilon	+	3032	1	Intergenic	novelGene_144503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAAAAAATTCTCCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627394	630426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5482_pilon_+_627400_630400
928412	contig_7569_pilon	+	2053	1	Intergenic	novelGene_114600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGATATACTGCTGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169874	171927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_+_169900_171900
928413	contig_15476_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_174658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTAGATCTCCAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101464	103907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15476_pilon_+_101500_103900
928414	contig_12250_pilon	-	2730	1	Intergenic	novelGene_80525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	398	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1802	2116	70545	70231	NA	30	TTGAGGGTACATTAGGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIFIVFGFIFRSLIHFELVFVYGVRYGSCFIFLQMDIQFCQHHLLKRLSFPHLMDFGTLSKISDRRWMDLHLGLNSVLLVNVSIVVPVPGCFDYCGCIVSSEVR	72346	69616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_69600_72300
928415	contig_13295_pilon	+	1650	8	Intergenic	novelGene_31216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGGCCGCGATTCAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54553	59747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13295_pilon_+_55302_55406_55782_55914_56021_56646_56735_56806_56888_59104_59195_59381_59441_59644
928416	contig_9098_pilon	+	1926	1	Intergenic	novelGene_75769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	189	494	33817	34122	NA	75	AAGACAGGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSGILSNEVPEDEPLRLEGTQNMTGEKLPPQSRVNLNDMNGVKLSEPSFVDVEGLKMRRNSCKHPLIIRTWNVRSMNQGKLEIVKKKNGTLEDQYPRHQ	33628	35554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_33600_35600
928417	contig_7398_pilon	+	1377	1	Intergenic	novelGene_166179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGCATGTGCTATTTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300889	302266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_300900_302300
928418	contig_5889_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_133701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTACAACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313025	313839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_313000_313800
928420	contig_11978_pilon	-	2020	2	Intergenic	novelGene_62849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCATAGGCCCTGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571231	564856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_564921_569275
928421	contig_7057_pilon	+	698	7	Intergenic	novelGene_123349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	545.531748745102	7	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	8	376	939100	943233	TRUE	5	TGCTGCTCTTCGTGGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLVRLDAMFRAFKSLDRDGTGQIQVNIQEWLQLTMYS	939092	943707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206_943399_943550
928422	SIRV7	-	911	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147953	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
928423	contig_4315_pilon	-	1566	6	Intergenic	novelGene_46798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	405.305317014223	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	139	432	334049	330731	TRUE	45	GAAAACTCCCAAAACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCKEPWWYNIYELGC	335757	327081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327666_327706_328250_330723_330773_333534_333729_333991_334109_335678
928425	contig_14643_pilon	-	2352	1	Intergenic	novelGene_99112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20946	18594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14643_pilon_-_18600_20900
928426	contig_15991_pilon	-	1022	7	Intergenic	novelGene_70904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1342	junction_6	2325.96766004077	3	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	68	955	105108	100445	FALSE	15	AAGGTTGTGTTTGTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWVGTTTEWS	106349	100377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975_105142_106315
928427	contig_5566_pilon	-	1971	1	Intergenic	novelGene_153682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1104	1454	253491	253141	NA	30	TGGAGCAAATCATTTAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGEKIEAVKDFILLGSTINTHRSSSQEIKRRIAFDKSAAKDLFEVLKSKDVTLKTKVRLTRAMVFSIASYACKSWTMNKEDRRRIDAFELWCWQRILNIPWTARRTNKSVLEEV	254594	252623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_-_252600_254600
928428	contig_9216_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_163512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	617188	618571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9216_pilon_+_617200_618600
928429	contig_2069_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_23300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460750	459487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_459500_460800
928430	contig_13625_pilon	-	1626	9	Intergenic	novelGene_150163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	28	junction_8	109.016913825333	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	457	1068	39925	29843	TRUE	25	ATGCTGGCAGATTCCCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPKSYTEEDLREKFKVYGDIEYCSIIKNKVTGESKGLGYVRYLKPSQAAQAIENCDRSFKAILAEPKNKASESSEQDHYSSMRQETLGHEPRVNMFPFEQQPEFASFEKNDNRGQEAISKRLSVVSRVPFTEEQLFSIFDIVPGLEYCEVQRDPYSNYGHGVVQYFNVASAIYAKYKLHGFQYPPGNRIGVSFIDDGSNAAE	43581	27113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13625_pilon_-_27253_28833_28998_29587_29977_34071_34252_35003_35127_37918_38046_39877_40001_42099_42261_43361
928431	contig_15327_pilon	-	787	4	Intergenic	novelGene_70662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	35	junction_1	2553.27349799342	31	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	130	432	901528	900679	FALSE	15	CACATGTGGTGGGGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRMNAKSDCSQTSVMWALLLRSDKLLICRRDG	902157	900323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900773_901199_901281_901400_901536_902035
928432	contig_15666_pilon	-	2067	6	Intergenic	novelGene_70138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	435.21976058079	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	552	983	108757	107848	FALSE	30	ATGTAAACTACGTGTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQRLWPSSPLFPTAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110680	106763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108008_108103_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110238_110558
928433	contig_6489_pilon	-	1874	2	Intergenic	novelGene_128922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGTTCTGAAATTCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115395	113349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_113481_113652
928434	contig_10016_pilon	+	1405	1	Intergenic	novelGene_117871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGGGGGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426178	427583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_+_426200_427600
928436	contig_7867_pilon	-	2151	1	Intergenic	novelGene_162747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGCCAGAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257413	255262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7867_pilon_-_255300_257400
928437	contig_5799_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_50259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1	309	219442	219134	NA	70	CAAATAAAAATGAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVAWFRSQQVGVLAVCFVTTVVVPHSAWRSSLPVLVGFLKWPVNLGIFRRAGILESSANVDGSVNTACKVKARACKRESPSSPSRPAYWTRRQSKFCFCLC	219442	218531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_218500_219400
928438	contig_11056_pilon	+	1816	1	Intergenic	novelGene_130357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCTAAAGGAGACTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109817	111633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_109800_111600
928439	contig_5765_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_141412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1610	1933	868070	868393	NA	45	AGATTAGTAAGTAAGCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFSFFQCFTHLHLEAVICANHKHGKAKTSTPLSLKGKSFLKLRQGPEVRHPQGTASDLDRAEGERRCLEQGRERYTHQNRRERKAPQGTSSGSEAGEGGESSGVD	866460	868502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_866500_868500
928440	contig_14094_pilon	+	2533	1	Intergenic	novelGene_145906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	2230	2532	231314	231616	NA	55	TGAAGAAAAAAATTCAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEDQTWDDIKVIIHEESKRSLKRQERKKRRKWMSEETLKLPLEHRIAKANGRSDEVKELNRRFQKTAREEKVKNYNEIRKDLELGNQKGRTRSAFLKLKE	229084	231617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14094_pilon_+_229100_231600
928441	contig_6190_pilon	+	2272	1	Intergenic	novelGene_177345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGGTGATATAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6190_pilon_+_0_2300
928442	contig_14275_pilon	+	3209	2	Intergenic	novelGene_162862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAAGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	298942	302208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14275_pilon_+_299516_299572
928443	contig_11396_pilon	-	4410	11	Intergenic	novelGene_71259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_10	131.644255476644	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	3093	4343	133947	121478	FALSE	10	GATGGGGAGGTTCTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHSALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENNEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVLGNLAAAQELCEEALKHYEDFPKLWMMKGQIEEQEELVEKAREAYSQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKVGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAVFLEARPQRKTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSERKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCENAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGEVLVLVAARIKNTF	137203	121410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_121631_122169_122297_124392_124508_125485_125578_126107_126242_127268_127446_127615_127736_128716_128856_130392_130515_133875_134185_134348
928444	contig_10126_pilon	+	2181	9	Intergenic	novelGene_105727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	1754.75190108887	4	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	91	1029	140715	166639	TRUE	30	CCAACTGTGACACTCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSPASGQPPAARPQPSSRRGGAGPSLAPRLMGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139755	185023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140705_140794_161932_162305_165408_165724_166466_166667_169472_169584_172549_172575_181522_181563_184074
928445	contig_15327_pilon	-	1714	4	Intergenic	novelGene_70646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	4	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	127	537	901528	900904	FALSE	40	CCTAAATTGAATGTATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902154	899726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
928446	contig_5642_pilon	-	3324	4	Intergenic	novelGene_153020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2174	2503	27936	27607	FALSE	60	ATAAGAAGGGAGAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPPAWVCGIQAAGSSQSRDRGRGKQRRLSRGEEGWGVGKRTPQITGCFVSHWTLREAALSYPCLLVSDRSPRWWTRAALAGRSTLHESLLALRSLSVFSLDLVLG	32168	26785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_-_28062_28332_28584_28962_30297_31705
928447	contig_14220_pilon	-	2361	1	Intergenic	novelGene_159847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAAAAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264617	262256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14220_pilon_-_262300_264600
928448	contig_14467_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_138238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTAAAGAAAAATGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257738	258995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_257700_259000
928449	contig_6494_pilon	-	838	7	Intergenic	novelGene_108554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1265	junction_1	602.398170279057	10	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	29	760	8286	2635	TRUE	20	CATGGCCTGACTTGACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8314	2102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6490_6751_6883_8256
928450	contig_14467_pilon	+	3415	1	Intergenic	novelGene_138284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	117	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAGCAGTCAGGAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376548	379963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_376500_380000
928451	contig_19974_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_130477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1024	1332	238913	238605	NA	60	TAGAAACGTATAAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDPNATINQLDLMDIYPTLHPTAAKYTSFSDALGTFSRIEHILDHKARLNRIQSIKMLQSIFSDHKARKVEINNRISKEKKIKHMETEQHLAEKLLGYKRN	239936	238082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_238100_239900
928452	contig_7357_pilon	-	2216	9	Intergenic	novelGene_36832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2123.27658054715	3	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	180	1130	166824	137724	TRUE	10	GCTTACAGCTTGGTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDARAHL	167003	135635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137735_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
928453	contig_18039_pilon	-	2639	1	Intergenic	novelGene_171257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1917	2225	232719	232411	NA	75	ATTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDTVLQGLNKWKDIPCSWIGRVINTVKMSISPKQLHKFSAIPIKIPTAFFTEAEKQSSNLYDTTVPILSIYPEKMKTECKQKPVHQCSLQHFSQQSKCGN	234635	231996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18039_pilon_-_232000_234600
928454	contig_4213_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_124810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGTTATACTTGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41876	43812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_41900_43800
928455	contig_17687_pilon	+	1292	3	Intergenic	novelGene_177975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	10	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAGAGAATAAACTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7016	35534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17687_pilon_+_7069_30614_30766_34445
928456	contig_5020_pilon	+	1489	9	Intergenic	novelGene_27816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1041.54536627072	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	134	1198	119485	125772	FALSE	45	ACCCATAAAGCAAGCTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQRETLQGRIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126063	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118549_119438_119497_119574_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
928457	contig_19880_pilon	+	2143	3	Intergenic	novelGene_179156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	1547	1936	2193	2858	FALSE	10	GTGGTTTGTTTACTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELRSPSGKKQRWRMEPGTRVKGGGGGERQVRNQKKQKKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQPALPGQETVAVGSRGGRAGVKRGGRWESTHHKLLVGLSPAGRSVRLLSRTAVCWSPIGVQDGGSALC	575	3065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19880_pilon_+_1187_1257_2216_2491
928458	contig_15857_pilon	-	2074	1	Intergenic	novelGene_152077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1540	1890	122112	121762	NA	60	AAACGAGAATGAAAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYTPNDRAPKSIKQTLIAMKRETDSSTIIVGDFNTPLSVKNRTSRKKFNKDTEDLKDTISQLELIDIYKTLHSMLQSTHSFPMHMNILQNRLHLRPQSNPR	123651	121577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15857_pilon_-_121600_123700
928459	contig_4180_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_8320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGAAAAGACCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781676	783415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_781700_783400
928460	contig_9993_pilon	+	1654	2	Intergenic	novelGene_179157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	582	1072	1653	958468	959049	FALSE	40	AACTGCTGACAGAAAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSLVEENALELPDREFKSLILGILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIE	957150	959050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9993_pilon_+_957345_957590
928461	contig_17144_pilon	-	1192	6	Intergenic	novelGene_29396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	391.952037882188	4	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	182	901	167982	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183233	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_181794_181850_183184
928462	contig_8576_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_88822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATCTACTTGACGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003373	1001613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_1001600_1003400
928463	contig_12079_pilon	+	1936	1	Intergenic	novelGene_67370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGACTAAGCTTGCCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302620	304556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_302600_304600
928464	contig_11281_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_125428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229315	227857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_227900_229300
928465	contig_10126_pilon	+	1307	5	Intergenic	novelGene_105724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	647.618328956184	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	122	1192	140715	166639	FALSE	65	ACTTGTTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139724	166754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140705_140794_161932_162305_165408_165724_166334
928466	contig_5600_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_174956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215951	218262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_216000_218300
928467	contig_16310_pilon	+	2372	2	Intergenic	novelGene_70062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	220	591	206857	207228	FALSE	20	GGCTATGTATATTTTCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRGSSFLHKQSFLEKSRSRAETKRDNAKLAFVSPNRGFIRLMEVSRQEMVSSLLIKGVWVSGKRVCLVHTQEVSQDGTTAPRTGWQDLLWGAAPAQSPRGARSIPVAGLLHAPRTRSGWFF	206522	209009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_206585_206699
928468	contig_7933_pilon	+	1774	2	Intergenic	novelGene_164667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	41	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112055	114457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_113222_113849
928469	contig_10740_pilon	+	4973	1	Intergenic	novelGene_152242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	178	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	4249	4629	15406	15786	NA	75	AAAGTCATCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHWTVSSTARWCPATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRHPLSSVVKLSPRFTVHLGVDSPVKPNGTNEVQESSDKGQKAEGDKEAGDREPKVE	11157	16130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_+_11200_16100
928470	contig_15047_pilon	+	1385	5	Intergenic	novelGene_52257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	119	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	75	350	3242	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2771	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997
928471	contig_2278_pilon	+	1443	1	Intergenic	novelGene_118126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTGAACACCACTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1015478	1016921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_+_1015500_1016900
928472	contig_3956_pilon	+	1542	7	Intergenic	novelGene_15187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1183.53351593157	3	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	14	625	1282731	1286416	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1282717	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284224_1286151_1286224_1286409_1286606_1287276_1287368_1290374
928473	contig_17470_pilon	-	752	1	Intergenic	novelGene_110544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTGTATATTCTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285817	285065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17470_pilon_-_285100_285800
928474	contig_13283_pilon	-	2394	2	Intergenic	novelGene_154005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	30	422	7706	6964	FALSE	75	AAAAAAAAAATCCACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKENRERGEMHAEVPYPPAEHGSAILDSGQEIGGQGIQESSFTELPAKDRTTNNQRYKLSHPLPFFNPTQPSLLPAATVSWPGGTDFNPVPLGFHLPTVASSLSAICLLLVLLSSAFGFFHTSHHLPLLSLKYLLFYPF	7735	4991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_6978_7327
928475	contig_7182_pilon	-	1121	6	Intergenic	novelGene_117144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2192.64857193304	3	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	109	750	889318	886962	FALSE	10	GTACTGTTGTCCTTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSQPLQYIELHRDSAGPGRAGRHWATLCLADEKLLNMGKGDPKKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDASVNFSEFSKKCSERWKTMSVKEKGKFEDMAKADKARYEREMKTYIPPKGETKKKFKDPNAPKRPPSAFFLFCSEYRPKIKGEHPGLSIGDVAKKLGEMWNNTAADDKQPYEKKAAKLKEKYEKDIAAYRAKGKPDAAKKGVVKAEKSKKKKEEEEDEEDEEDEEEEEDEEDEDEEKIEM	891368	886590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_886977_887076_887233_888169_888345_888814_888961_889168_889333_891274
928476	contig_12570_pilon	+	1814	4	Intergenic	novelGene_79359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	232	633	190479	196329	TRUE	60	AAAAAAAGCACCTATAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQVNVLLGRLLQLGNGDGLTHNSGDGLGVGHQPPGVRGEEASTMEDARGKANVLLELLLDPSAPGALLKDHLLIHFILPKGVGGNQVSSMAQGQFHKALAVAQSDGILAWHGAQRLGCAPHYDDDGIAAPIL	190247	199043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_190544_194619_194823_196195_196367_197899
928477	contig_7119_pilon	+	2035	3	Intergenic	novelGene_40898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	28	11	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	152	880	138713	139798	FALSE	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRWGLAGADATAGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127455	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_138803_139159
928478	contig_16594_pilon	-	2943	2	Intergenic	novelGene_53868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTCAAAGCAGAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152386	149056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_151607_151993
928479	contig_6710_pilon	-	558	2	Intergenic	novelGene_91513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8303	junction_1	0	32	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	657173	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGAGTKLELKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657173	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657142
928480	contig_4125_pilon	-	1909	1	Intergenic	novelGene_25160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAGGTTTAAACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900430	898521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_898500_900400
928481	contig_9706_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_20754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCAGTACGAAAGGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138	1588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_100_1600
928482	contig_7004_pilon	+	3597	11	Intergenic	novelGene_126491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGTCCCGTCGCTACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408280	414527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7004_pilon_+_408611_408831_408918_409054_409220_409351_409514_409613_410096_410781_410938_411125_411355_411635_411995_412402_412592_412709_412813_413191
928483	contig_8122_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_40225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCGGAACAAAACTCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531831	530403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_-_530400_531800
928485	contig_8075_pilon	-	3186	3	Intergenic	novelGene_42512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	789299	781201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8075_pilon_-_783121_785916_786090_788205
928486	contig_14225_pilon	-	1244	1	Intergenic	novelGene_52741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAGAAAAAGAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170481	169237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_169200_170500
928487	contig_8330_pilon	-	2568	1	Intergenic	novelGene_71901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACCTTACCAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120406	1117838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_1117800_1120400
928488	contig_5686_pilon	+	2342	2	Intergenic	novelGene_45380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	2	13	junction_1	0	14	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGGACTTGGCAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154204	156946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_155751_156150
928489	contig_16103_pilon	-	694	4	Intergenic	novelGene_118881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2980.21017155949	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	62	403	743628	722968	FALSE	15	TGCCATCTCAGAGTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAARSGGGENRSVSKSWVGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKKKKFKKRCSGFQL	743689	722676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723010_735940_735975_737495_737630_743496
928490	contig_14501_pilon	+	1446	2	Intergenic	novelGene_172025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCTTAACAAAAGAAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12325	21945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14501_pilon_+_12334_20507
928491	contig_15304_pilon	+	1096	3	Intergenic	novelGene_30676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2017	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	438	657	1094	106226	107223	FALSE	30	CAAAAGAAGGGGCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQVKWTSRSSWPTSITRHVTVGVREIMRKSLGLGGKMKTEGPPGSSGADLLLHVGLAGSVGNVAGVGLAGPAAGRHSHRATEGVQARRLQDGWEGVCARLVSRVPGHRHWLWEVVGDHAGQHHCGSGCGPTAGGQGEDCWGCGGG	105488	107225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_105962_106042_106374_106933
928492	contig_16228_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_147952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87489	86170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_-_86200_87500
928493	contig_10456_pilon	-	2004	1	Intergenic	novelGene_163449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1309	1761	9790	9338	NA	25	CAGCTAATTGGCCGACGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPQELEHIPPELRNHLENRFDTLNTNDRRTDKLWNDIKDIIHEESKRTLKRQERKKRPIWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQRVAQEDKIKYYNEMCNDLDLENQKGRTHMAFLKLKELKKNSSPSYNIEGFYGENIK	11098	9094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10456_pilon_-_9100_11100
928494	contig_15047_pilon	+	1492	6	Intergenic	novelGene_52206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3018.18760185645	8	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	180	455	3242	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCSGSWRPRSSCCCSRGPWYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2237_2728_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
928495	contig_15838_pilon	+	3552	1	Intergenic	novelGene_174340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	1687	2097	249408	249818	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMSILPKVIYRYNAIPIQNPMAFFNDMEKQITNFLWKRKRPWVSKALLKNKVEGPILPDFRTYYTTTVVKTAWYWYNRYINQLNRIENPDINSSTYEQLICGKGPKSVNWGKDSLFNKWCWHNWMFICEKLKQDP	247721	251273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_+_247700_251300
928496	contig_10404_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_138687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	528	923	1105269	1105664	NA	15	GACGTTTAACCTGTCTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIVSGDFLCPHPPPARSTTGDTPGRYPALAREPRPRRLLATGRQPQPRLSRAVMDQPVIALSTTAVRDDLGPPLAAPPPSCRPATVHSRARLPFSHLPRSRPLRLRLPFILPAFLSLTHPRTRGPFCLVFT	1104741	1105942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1104700_1105900
928497	contig_16496_pilon	+	1532	2	Intergenic	novelGene_5139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCTATTAAAAAACAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	3592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
928499	contig_1443_pilon	+	6584	4	Intergenic	novelGene_28332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	228	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGTCGCAACCGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	760741	809488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_766826_767440_767556_776186_776478_809394
928500	contig_9571_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_136289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGGTGTAAGAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492768	490220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_490200_492800
928501	contig_4874_pilon	-	1915	1	Intergenic	novelGene_78629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGACTTCCGCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260758	258843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_258800_260800
928502	contig_12520_pilon	-	1927	2	Intergenic	novelGene_161064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	399326	395394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12520_pilon_-_396597_398601
928503	contig_17144_pilon	-	1701	11	Intergenic	novelGene_29270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2252.43202783125	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	441	1406	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183202	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179729_181813_181850_183158
928504	contig_21315_pilon	+	2605	2	Intergenic	novelGene_151562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1908	2234	10776	11102	TRUE	50	ATATTCTCAACAACGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFGSLVWRFRVMVSWNIPVNWPNNMFRASLLPPSLLHSAWSLKRLQAAIQGTTISLYSPAATRGKRRAGNRRRMWNVWLIASLNNCLLSHGTKITGWCPAIITKHFD	8868	11522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_11375_11423
928505	contig_4125_pilon	-	4022	8	Intergenic	novelGene_25122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_7	436.428828618115	3	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1594	1941	812726	811045	FALSE	50	AAAAAAAAAAGCTGGGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	816888	808963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_816642
928506	contig_15498_pilon	-	654	1	Intergenic	novelGene_42630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGCCTAAGACAGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	671882	671228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_-_671200_671900
928507	contig_7080_pilon	+	801	1	Intergenic	novelGene_100089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGGCTACCTCTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458193	458994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7080_pilon_+_458200_459000
928508	contig_10044_pilon	-	764	1	Intergenic	novelGene_156378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAATTCATGTAGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50218	49454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10044_pilon_-_49500_50200
928509	contig_4659_pilon	+	2081	1	Intergenic	novelGene_118263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1287	1598	899288	899599	NA	20	TGGCAGTCCATGGTATATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISQDSLLLPDPRMQAARFLQWRQRTRSFIFGERKPSPEKRPPFGGTPVKTSVHCSVTVSEAYQLSIPVHVDRASLEFFGTFFLNMISNDWHTFKKSVQHER	898001	900082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_898000_900100
928510	contig_11338_pilon	-	1542	9	Intergenic	novelGene_6356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	30	junction_1	290.494406142356	70	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	299	970	319426	300286	TRUE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLCQFSFLSDDLLDFEKQTLVPQQ	323314	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300261_300354_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
928512	contig_5935_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_102753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	259	597	1326019	1325681	NA	30	TTAAAGTCACCAAGTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYNLQYGLHCNIKKTKTLTTGPVSNIMIKGENIVAKDFILLGSTINLHGSSSQEIKRCIALGKSAAKDFFKMFKRNDVPLRTKVCLTQAMVFSVASYACESWTMNKED	1326277	1324925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_1324900_1326300
928513	contig_7157_pilon	+	2150	4	Intergenic	novelGene_131269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170406	363624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_170746_199791_200388_204945_205117_362580
928514	contig_6433_pilon	+	1771	1	Intergenic	novelGene_162765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAGTTTATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285121	286892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6433_pilon_+_285100_286900
928515	contig_3095_pilon	-	1151	5	Intergenic	novelGene_75115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGAGTGAGGCAGTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152247	147204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147284_149670_149895_150412_150695_150995_151157_151842
928516	contig_8284_pilon	+	1563	1	Intergenic	novelGene_125728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482097	483660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_+_482100_483700
928517	contig_4674_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_174143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	378	2046	2423	258195	257818	NA	40	TAAGGCATTTCCAGATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGITENTERIVEDLLAENFPDMKDDKISIQDAHRTPYKVDPKRKSPRHIIIKLNKTKDKERILRAARDKRKVIYKGESIRISSDYSAETMQARRQWDDIHKALKKKNCQPRIIYSAKLSLKYDGE	260240	257815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_-_257800_260200
928518	contig_2716_pilon	-	2153	10	Intergenic	novelGene_173556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.0693183362771	22	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	226	1485	709581	667062	FALSE	35	CCAATGTGTATAATGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNKNAGFWSTFVPLWLAASPNSKGSPQSYGKGKLPPGPTPLPIIGNILHVDVKDISSSLRNFSKAYGPVFTLYFGMKPTVVLHGYEAIKEALIDLGEEFSGRGHSPVAERASKNFGVIFSNGKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSTEDRIQEEARCLVEALRETNASPCDPTFILACAPCNVICSIIFQKRFEYTDQDFLNLLEKLDENTQIVSSPWMQFCNAFPMLIDYFPGSHNKLLNNVAYLRSYFLEKVKEHQESLDINNPRDFIDCFLIKMEQEKHNQESEFITENLIITVSDLFVAGTGTSTTLRYGLLLLMKHPKVSAKIQEEINHVVGRHRSPCMQDRSSMPYTDAVVHEIQRYIDIIPNNLPHAVTRDIKFRNYFIPKGTTILTSLSSVLHDNKEFSNPEVFDPGHFLDDSGNFKKSDYFMPFSAGKRICLGEGLARMELFLFLTTILQKFTLKPLVDPKDIDTTSVASGFVSVPPSYQACFIPA	723529	666393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_667244_678339_678482_691890_692079_694763_694903_702787_702965_704082_704244_709137_709288_709460_709624_711234_711337_723448
928519	contig_17860_pilon	-	2432	2	Intergenic	novelGene_169236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATGCAAGAGAAAAGAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14951	4677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17860_pilon_-_6911_14752
928520	contig_3956_pilon	+	1433	7	Intergenic	novelGene_15062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1142.60001993504	4	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	421	909	1289515	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283850_1289183_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928521	contig_3601_pilon	+	727	1	Intergenic	novelGene_132953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTAATGTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	456882	457609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_456900_457600
928522	contig_9668_pilon	+	3812	1	Intergenic	novelGene_58245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595678	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_595700_599500
928523	contig_6217_pilon	+	3014	1	Intergenic	novelGene_109689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATGACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914746	917760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_914700_917800
928524	contig_3147_pilon	+	2302	1	Intergenic	novelGene_142293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGCTCTCAGTTATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351114	353416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_351100_353400
928525	contig_19378_pilon	+	2592	1	Intergenic	novelGene_73796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	71	427	34820	35176	NA	35	ACTTTGTATTGATAATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALAIETTTGDCCIEFCKTNLLDGNTFFQQQTVTIHVDHAGWNTKESNRPRLWKETREKLNTIGQNKAGADCETDPQLLICKCKLSLRKLKHVHKSQSTTVSISHLNSETISRIDLTH	34749	37341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_+_34700_37300
928526	contig_7070_pilon	+	2173	1	Intergenic	novelGene_104060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	23	388	231452	231817	NA	70	TGGAATAAAAAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAYKAWQMGMSWSEKHGHRYLVLPLSSWKKSRQTVPQGTASEPLDTAAFRLRVLTEWRLSALNVHPQSCTILYSGVSWHKPSGQETRVLGLESRGTKTMLVEEWKASSTGRMGDSQWPLLGYFWEERR	231429	233602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_231400_233600
928527	contig_9297_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_69888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGAAGCTGGTTGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	935789	937489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_935800_937500
928528	contig_7396_pilon	-	2579	15	Intergenic	novelGene_79576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3317.03686000205	3	60	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	97	1431	255163	246442	FALSE	35	GAAAAAAGTTCTTGTGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDHTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257083	245293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248238_248566_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
928529	contig_4900_pilon	-	2312	1	Intergenic	novelGene_159049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCATGTATGATGTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534921	532609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_532600_534900
928530	contig_8710_pilon	+	2059	1	Intergenic	novelGene_73540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	82	249	96	344	473667	473915	NA	30	AGGTACCAGGTGAGCACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRASFRVFSDIHFGLFFLSCLFNDLLLSSCMMSFHNLSGLQSLVFNVSNLFLRWSLNSGDIYSRWYFGSHGLILIFFSFNLNLHMSNRWSVPQSASGLVLTDDIELFHCLFP	473571	475630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8710_pilon_+_473600_475600
928531	contig_91_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_127138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAAGCCATCCACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1167627	1169127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_1167600_1169100
928533	contig_3151_pilon	-	2146	1	Intergenic	novelGene_139185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGGCTGATTTTTCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156141	153995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3151_pilon_-_154000_156100
928534	contig_19098_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_65822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCATGGCTTGGGTCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	367074	365222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_365200_367100
928535	contig_14390_pilon	+	1388	5	Intergenic	novelGene_178888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_1	232.889458756724	3	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	41	556	6137	24252	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWLKLDKSFIWSFMGPVATIILINLVFYFIILCILKSKVSSLSKEVSTVRNTRVMTFKTIAQLFILSCSWILGFFMVEAVGTTAGLVIAYIFIIINVLQGVLLFVLYCLLNHQVRMEYKKWFSGMRKGFEMESTELSHSTTHTKMEEPGKSSEFVQRRDTKNTTFAQPEPPTHLTTVSSLKTEK	6096	25084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14390_pilon_+_6164_7505_7598_8686_8868_23033_23130_24132
928536	contig_10331_pilon	+	2314	1	Intergenic	novelGene_54067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1032	1472	71795	72235	NA	30	CTCCTATATGCAAAGCCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKGPGLSRAPKGRLPDTQGGRSLGQSGRQAMEYGTGESSGEGTVDAVPVWPRALSHGLCSDPLSYQYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQGNDFFFNFLKQSYWIIWGKKKVDLTS	70763	73077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_70800_73100
928537	contig_13780_pilon	-	707	1	Intergenic	novelGene_149045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	29	346	576602	576285	NA	75	ACAAAATAAAAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTLSSRIIMSQNQLNGNRFLVLPPSSLHSVGILKACKWPPKAQQLVCIHLEQQRKKKSQELEEVMECGANCHHETRTGWCLATITEHFDQRFCRRILIKRGNMQHRISNSRGL	576630	575923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_575900_576600
928538	contig_12239_pilon	+	1785	1	Intergenic	novelGene_170472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	923	1372	29060	29509	NA	60	ATCATTAAAAAGACAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLGKLEVVKNEMEYLKINILGISELKWTGIGHFESENHVVYYARNDKLKRTSVAFIVRKNISRSILKYNAVSNGKTSILLQGSPVNTTIIQVYTPTTRANDEEIKGFYQLLQSEIGQTCSQDISIIIGDWNAKVGNRRRLGSWKIWPW	28137	29922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_28100_29900
928539	contig_14536_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_69318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTGAAAGAGAGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239250	237263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_237300_239200
928540	contig_9684_pilon	+	1787	3	Intergenic	novelGene_178249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCTCCTCCCTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5124	76755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9684_pilon_+_5516_75033_76153_76478
928541	contig_11816_pilon	+	2936	1	Intergenic	novelGene_98485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTCATGTGACAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470675	473611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_470700_473600
928542	contig_2463_pilon	+	3890	1	Intergenic	novelGene_43014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1197	1568	423979	424350	NA	45	CAGTGAAGTTAAAAATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILKEEVQATLKALVKNKPPGIDRIPAEMFEQMDAVLEVLTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKGDPTESGNCQTISLISHASRVLLNNSKMVAAVHRQETAKNSSQIQKRMWNGGYHC	422782	426672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2463_pilon_+_422800_426700
928543	contig_10867_pilon	-	691	6	Intergenic	novelGene_159452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2334.20525232894	5	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAGGTCTTTGATTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91460	86776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86901_87085_87364_87722_87840_88193_88256_88603_88683_91429
928544	contig_5623_pilon	-	959	2	Intergenic	novelGene_154835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	208462	206940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207857_208419
928545	contig_6489_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_128946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACTCACAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292376	294115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_+_292400_294100
928546	contig_8330_pilon	+	1791	10	Intergenic	novelGene_71819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_4	233.908339122638	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	275	1141	853343	856687	TRUE	20	TACGAATCTTATTTTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853068	857551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
928547	contig_7416_pilon	+	385	1	Intergenic	novelGene_134331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATATATTGCTTGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	864086	864471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_864100_864500
928548	contig_4213_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_124780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAATACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_0_2100
928549	contig_14034_pilon	+	1510	1	Intergenic	novelGene_72670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATTATTACAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383905	385415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_383900_385400
928550	contig_16303_pilon	+	2180	2	Intergenic	novelGene_34021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTGGCCTTGTTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20490	52806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_20576_50711
928551	contig_10299_pilon	-	3391	1	Intergenic	novelGene_79794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATATATTATAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727281	723890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_723900_727300
928553	contig_6364_pilon	-	2768	15	Intergenic	novelGene_51726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1328.33158549378	2	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	841	1245	458664	445006	TRUE	45	TTCAGAAAAAAGTTTACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFGPAIGFPQATGLSVSAVPGALGPLAIASSAVTGRMTIPGAGGIPGNSVLLVTNLNPDVS	521133	435307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_436284_436419_436498_439242_439371_439764_439982_440667_440780_444993_445155_447074_447153_457080_457256_458661_458773_466201_466369_472493_472631_477565_477736_486627_486713_490716_490802_521045
928554	contig_13123_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_136912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTTGCTAAAGCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455256	456500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_455300_456500
928555	contig_3103_pilon	+	5919	7	Intergenic	novelGene_146180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	137	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCGGCGGCGGCTGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27579	159904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_32731_62289_62521_75292_75366_94990_95082_98603_98735_115723_115804_159742
928556	contig_15952_pilon	+	284	1	Intergenic	novelGene_154095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTTCTTATGATCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722212	722496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_+_722200_722500
928557	contig_3147_pilon	+	5228	3	Intergenic	novelGene_142292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2412	161	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	962	1315	341622	341975	TRUE	25	GATAGTCCTCGAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSQLEKRKRKQTIQNKQTNKKPQYPTSMVAQTRKEFHTQMELRSPLGRSKDGARSQVFEQKEGEVVRGKEEIKTSGKKQHQQPTNGTQGTGQCGWVESKQPVLPGQETVAAGSRGG	340660	448083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_+_343622_434623_434971_446163
928558	contig_253_pilon	-	2902	2	Intergenic	novelGene_129763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAACCACTAATGCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743565	740466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_742114_742310
928559	contig_10235_pilon	-	844	5	Intergenic	novelGene_46477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1142	junction_4	693.470439168102	2	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1	342	220706	219405	TRUE	30	AATTTAGTGGTGTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAAQNPESNTAGLDVFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLISPPPRRSG	220706	217920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10235_pilon_-_218320_219301_219485_220089_220197_220354_220481_220677
928560	contig_9177_pilon	-	2659	17	Intergenic	novelGene_32544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	763.766016096389	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	45	2234	9011	2136	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETHRKRCFGKNESWKRHGRSWLRFGSNSTSSCLQSFEMSTRALLI	9055	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2268_2421_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8608_8686_8789_8903
928561	contig_546_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_117172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTCAAGAAAAGGGAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55251	55853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_55300_55900
928562	contig_1337_pilon	-	6667	2	Intergenic	novelGene_84219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTTGAAGTTTTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60670	53937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_60126_60191
928563	contig_8269_pilon	-	2139	1	Intergenic	novelGene_106226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273164	271025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_-_271000_273200
928564	contig_13055_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_104960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	55	168	197	364	107019	106852	NA	55	ATTAAAAAGAAAATACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILKVDFFVDDVLYLGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGEGSAQCLRLCVCKSTVTNTVYDSRHFLKS	107215	105760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13055_pilon_-_105800_107200
928565	contig_3747_pilon	+	2545	8	Intergenic	novelGene_24893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3983.31691340936	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	109	1470	201313	204120	FALSE	45	AAATGACAAAATGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNILSSSSCHHLLTLRWIPALSTTMCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	201204	205195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203369_203611_203651_203768
928566	contig_5023_pilon	-	2529	1	Intergenic	novelGene_7391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	1231	1935	647301	646597	NA	15	CTCATTGTTACCTGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYLKGRREKKVSRVDHKVGWGPPGSWLLLINFQNSLLVYQEPVTGFLPFLWAHLGSTKFLTPSDLLSRLVKITHLLSVLGDFPSPHFL	648531	646002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_646000_648500
928567	contig_546_pilon	-	1135	5	Intergenic	novelGene_117202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTATTCACTTCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140395	103330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_-_103530_119793_119882_123934_124065_136648_136837_139865
928568	SIRV7	-	2370	9	NNC	SIRV7A	novel	2247	6	NA	NA	35774	-76	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	3	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGAACTATTTAATTCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78964	1081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_4095_4180_4725_4811_5034_5118_12419_12567_43028_43078_78841
928569	contig_4659_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_118252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAAAAATTTTTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	865505	863988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_864000_865500
928570	contig_13530_pilon	-	944	1	Intergenic	novelGene_175571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAATCAGTGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32379	31435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13530_pilon_-_31400_32400
928571	contig_11447_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_168108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCACCATCCCCCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	558892	558155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11447_pilon_-_558200_558900
928572	contig_16525_pilon	-	1315	7	Intergenic	novelGene_133788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2119	junction_1	1152.22393656789	63	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	30	458	97608	91591	FALSE	0	CTCTCTTGCTTTCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKKPLDRKAMSDSLVVCEVDPELKEKLRKFRFRKETDNAAIIMKVDKERQMVVLEEEFQNISPDELKMELPERQPRFVVYSYKYVHGDGRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLVQTAELTKVFEIRTTDDLTETWLREKLSFFR	97637	90733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91663_91787_91862_93365_93449_95674_95725_96924_96975_97069_97167_97605
928573	contig_12622_pilon	+	2837	12	Intergenic	novelGene_5826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_5	202.693352237616	2	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	630	2603	446467	475513	FALSE	25	GTACAATTTGTGGATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKELSESVQQQSAPVPLISPKRQIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDSEYISDDEQKSKNEPEDAEDKEGSRMDKEPSAVKKKPKSTNPVEIKEELKSTSPTSEKADPGAVKEKTSPEPEKDFPEKAKPSPHPTKDKLKGKDEMDSPTVHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKAPPSTTAAGSQSPSETPVLTRSSSQTPTAGVTATTSTTSTVMAPVAAATGSPVKKQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQQQNQQQQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSGSTSTLASSVSADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSKNTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	419345	475747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_419817_433574_433716_446449_446603_449207_449718_454875_455251_457156_457348_460455_460537_463384_463464_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
928574	contig_7410_pilon	-	2414	1	Intergenic	novelGene_106065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1217	1564	318499	318152	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEHNAEINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSITEGLRRRFEMMEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKRNEETLRIMWATIKSKNFRVIGVPERGENRKHREDH	319715	317301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_317300_319700
928575	contig_4213_pilon	+	3293	2	Intergenic	novelGene_124797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	2235	2777	16657	17943	FALSE	30	AGGTGTGCCAGACTAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEVAQAALKALVKSKAPGIDRIPIEMFQQTHAVLEMLTCLCQEIWKTATWATDWKRSIFAPIPKEGDPKECENYHTMSLVSHKNKILLKMIQKQMQQYINKELPEIQVDSKEEVKEGIYIVADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFYCVDHNKLWVMLRRMKISEHLIVLMRNL	14422	18459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_16728_17471
928576	contig_12249_pilon	+	1912	3	Intergenic	novelGene_121012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	114	18	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAAAAAAATAGAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177560	184520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12249_pilon_+_177688_181475_181559_182818
928577	contig_3747_pilon	+	3191	6	Intergenic	novelGene_24854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1576.86694429175	4	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	322	843	201313	202508	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMVRLILRYSILLSHGGH	200991	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202740_202870_203128_203228_203651_203768
928578	contig_9609_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_22945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ACAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148053	149413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_148100_149400
928579	contig_19438_pilon	+	3229	1	Intergenic	novelGene_175895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCCATCTCAAAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6184	9413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19438_pilon_+_6200_9400
928580	contig_17144_pilon	+	2310	14	Intergenic	novelGene_29476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	608	1033	168284	172637	TRUE	15	AGGGATTATGTTTGTCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLWSMGGGLLLRVGIDVLGGSHGVLVQRCHSDLIELKGLDVLCRQSPCDVPIMLHPPGFIAATGAGGTQTPLNHVGLRLGAGGVPAHPDAVRISGHGMESGQWWASALHEDHGGGVRVPACVVGHKGHLPGFQRQVESAV	166076	182862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166595_168194_168310_168996_169106_170751_170933_172527_172742_173130_173211_173307_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181852_182842
928581	contig_10437_pilon	+	1969	9	Intergenic	novelGene_38302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1092.27377520473	2	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	49	588	431167	443867	TRUE	40	TTAAATCAATGATGTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQLWFLLGFQCCGGPGSTAETENREAGVSQCAKPGGLLK	431118	452159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443753_443977_445309_445476_446951_447055_451075_451244_451324
928582	contig_6220_pilon	-	776	1	Intergenic	novelGene_177233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGTTGAAGCTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57809	57033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6220_pilon_-_57000_57800
928583	contig_5039_pilon	-	549	1	Intergenic	novelGene_64893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGGCCAGCCCCTACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583012	582463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_582500_583000
928584	contig_2799_pilon	+	666	1	Intergenic	novelGene_85474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGTCACATAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432031	432697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_432000_432700
928586	contig_9363_pilon	-	2522	1	Intergenic	novelGene_6495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402782	400260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_400300_402800
928587	contig_3469_pilon	-	2463	1	Intergenic	novelGene_34197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	30	TTGTCGATAGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531100_533600
928588	contig_16775_pilon	+	2109	16	Intergenic	novelGene_107780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	259.954577228835	5	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	140	1504	134135	174136	FALSE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPHLPLAFLVLSPATRGRAFRLGPAVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKEKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130644	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130722_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159391_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
928590	contig_1694_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_144968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTATAGAAAGAAATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1574563	1572298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1572300_1574600
928591	contig_6710_pilon	-	527	1	Intergenic	novelGene_91249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
928592	contig_266_pilon	-	4214	4	Intergenic	novelGene_166299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1459	1767	645569	645102	TRUE	35	ATCATATGCAAGGTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAIPFEAEAARLLVSLVSSASASYGLLALRPHAHICPAGASVPKLCSSTHVKCPEAPHSARKPCAHRHSAPSLCSLLLLVLCHCRMSVHSQF	662572	625257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_627168_644564_645161_645319_646548_662092
928593	contig_3382_pilon	-	535	1	Intergenic	novelGene_123983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTAACCAAAAGGTCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45025	44490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_44500_45000
928596	contig_678_pilon	+	2444	2	Intergenic	novelGene_167835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	10	507	405270	405767	TRUE	70	AGAAAAAGAAGAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNRTRHIQSCAILTIIMLEPFVAATVPVHLLRVFFFCTDLLPSIMFFSRDWSLLITCPKDVRGSLLILASKEHSGCTSYKTDLFVFLATHGIFSILHQHHYSKASILLQSSLLIFQLLNAYEATENTMAWVRHTIVFKVTSFLFNTLKKSFAADSLNAMRLLIS	405260	409921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_406142_408358
928597	contig_13519_pilon	+	1209	10	Intergenic	novelGene_124637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	419.060353943097	5	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	389	1156	98653	120612	FALSE	20	CAAGACTTGTACTGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKRLQEKCQALDRKNSATPSELNEKQELVYNNKRLELQVESMRSEIKMEQTKTEEEKARLATLQLTHSRLLQEHSNTLKTIEELKMKESEKVDKAVVEELNEKLELAEKALASKQLQMDEMKQTIAKQEEDLETMTVLRAQMEVYCSDFHAERAAREKIHEEKEQLALQLAILLKENNVFEDGGSRQSLMEMQSRHGARTSDPDQQAYLVQRGAEDRNWQQQQQRNIPIHSCPKCGEVLPDIDTLQIHVMDCII	57110	120665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_72486_72670_79401_79476_98559_98676_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513_115645_116672_116756_120484
928598	contig_5718_pilon	+	2645	1	Intergenic	novelGene_110351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	2047	2370	660787	661110	NA	30	GGGTTCTACTGGGAAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDGIHRNQIDYICGKSRWKSSVSSVRTRPEADFGANHQLLICKFKLKLKRIRASPREPNRTLSISHLNLETISRINLMHLPLMTEDQMRCGMTSRTSYMKKAKGH	658740	661385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_658700_661400
928599	contig_11338_pilon	-	1723	10	Intergenic	novelGene_6223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	107.398990730251	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	820	1587	14544	12549	FALSE	10	CCTGACTCCCACCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYSKWAGWGQGAGVAGPFPVLTWPPLCLPVEQSR	21395	12412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_14986_15189_16641_16770_17075_17288_21286
928600	contig_10958_pilon	-	2219	5	Intergenic	novelGene_5320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_2	50.3810480240338	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2079	141	2219	111415	10771	FALSE	25	AGGAGGGACGGACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREAAAAELVPPPALAVAPAAAMEEPPPPPEPEPESEPERCLAARQECKLGDTACKNSEPDLEDFSDETNAENLYGTSPPSTPRQMKRMSAKHQRNNVGRPASRANLKEKMNAAYQPPHKDTGKTVENVEEYSYKQEKKIRATLRTTERDHKKNVQCSFMLDSVSGSLPKKSIPDVDLHKPYLSLGCSNAKLPVSVPMPIARTARQTSRTDCPADRLKFFETLRLLLKLTSVSKKKDREQRGQENTSAFWFNRSNELIWLELQAWHAGRTINDQDLFLYTARQAIPDIINEILTFKVNYGSFTFVRNGASFNGTSVGGQCKAPHETKTVGYSTYHEHLQRQRVSFEQVKRIMELLEYIEALYPSLQALQKDYEKYAAKDFQDRVQALCLWLNITKDLNQKLRIMGTVLGIKNLSDIGWPVFEIPSPRPSKDNETEDEGHDPGDLEELESSADESEGEHISGQSGQEIRQPPENSADIQSQDCVSKKLERLESEEESAGWGAPDSSTEVGFSRHCRTSIYRPFVDKALKQMGLRKLILRLHKLMDGSLQRARIALIKSDHPMEFSEFPDPMWGSDYVQLSSTPPSSEQKCSAVSWEELNSMDLPSFEPAFLVLCRVLLNVIHECLKLRLEQRPAGEPSLLSIKQLVRECKEVLKGGLLMKQYYQFMLHEVLDGLEQTDCNMDAFEEDLHKMLMV	111555	10770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_10921_15629_15873_34164_35526_48864_49056_111281
928601	contig_6576_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_42445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAGTAGCATCTGAGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304069	1303400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303400_1304100
928602	contig_11656_pilon	+	2384	3	Intergenic	novelGene_54041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	98	24	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAAGTGCAGTGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527502	537497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_527581_531208_531337_535319
928603	contig_13399_pilon	+	2706	1	Intergenic	novelGene_179158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	99	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	748	1077	38786	39115	NA	55	AACAAAGATACAGAAGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKITTECPEDSRQYPNILKKDRMILVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDRDFKSLIFSAIQELKQKADKNEEKIDKFLENTDKKIEEFRKIIQEQNAKINSQQEIIQKHN	38038	40744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13399_pilon_+_38000_40700
928604	contig_5423_pilon	-	3943	2	Intergenic	novelGene_85208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319647	315647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_318560_318616
928605	contig_20446_pilon	-	935	2	Intergenic	novelGene_179135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGCTGCACTGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17213	121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20446_pilon_-_357_16513
928606	contig_16103_pilon	+	3576	2	Intergenic	novelGene_118891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	28	junction_1	0	144	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGACCCCTTTGTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	728899	732656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_731216_731396
928608	contig_17790_pilon	+	2142	1	Intergenic	novelGene_128490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATTATGTATGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118738	120880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17790_pilon_+_118700_120900
928609	contig_854_pilon	-	5841	32	Intergenic	novelGene_36501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.41347756775527	12	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	2327	2743	1706853	1702673	TRUE	10	CTCTGCGCGCCTCACCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQPRCLMEELTYPLRLF	1716407	1612771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612925_1649492_1649847_1656036_1656198_1672788_1672896_1677513_1677609_1678131_1678196_1678749_1678848_1679248_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694593_1700785_1700911_1701172_1701346_1701988_1702201_1702542_1702725_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712337_1715213
928610	contig_10958_pilon	+	2469	5	Intergenic	novelGene_5371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	236.816780444292	10	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1681	2301	808966	810961	FALSE	40	AACAATGTTAGAAGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAGMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASVILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVRRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPELWIWSMANLAITSKQGCLNQP	807285	811129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_809057_809421_809546_809844_810038_810166_810315_810896
928611	contig_6593_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_49850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	309	821	1214737	1214225	NA	50	AAAAAAATGTTTTTCAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTQIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCLSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHCITWMKLEDIMLNEISQSQKDKYCMRPLL	1215045	1213040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6593_pilon_-_1213000_1215000
928612	contig_11982_pilon	+	3000	5	Intergenic	novelGene_100255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAAAATTTAAAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91651	194092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11982_pilon_+_92719_137940_138237_182216_182357_191987_192663_193270
928613	contig_6635_pilon	+	3338	2	Intergenic	novelGene_127002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGCATTTATGGTCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205363	372584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6635_pilon_+_206654_370536
928614	contig_10481_pilon	+	3801	3	Intergenic	novelGene_170521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1684	2052	3283	3651	TRUE	30	TCCAAAGTTTTTAATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSCFVILGKFSVSSSPVILSMFSPRSGTPVTHRFLLLIVSHITVKVSLFSFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTPSMSEILLFIFWIFFFLIIFQVMVYRRNSVS	1599	23115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_3742_21289_22054_22220
928615	contig_10861_pilon	-	3027	2	Intergenic	novelGene_39186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	2643	2972	284913	284584	FALSE	10	GGAGGGATGGTGTGGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQGPCTSQPAKPPQPAMKWQGLSRREKDRGWEGIYRWLLGALFPAGSSVELLSCTPCSLIYDRSGRWQIHAALADRGPQHVSLFALHSLSVSYSILCLAEFFISSFDS	385639	284528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_286853_384936
928616	contig_10095_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_57246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	587	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTAGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265010	263275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_263300_265000
928617	contig_12079_pilon	+	2221	6	Intergenic	novelGene_67463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1353	1790	585608	586045	TRUE	25	CCAGGAGCACCGCAGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIHWMANQLQLSSPHPKLCHLNFHRKMADLLISHPRAHPQAHPQTVAHKLHAVTSKGPQLLDTQTCLPDNGLPDSFQDSDRQPGPCGQQAGPTHRSSCFWCFSSRAWAFICCTSMVSGLRRRMYSSWFPIHSCRIRLLIRRRGA	581048	600698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581130_584336_586056_591616_591713_598002_598155_599466_599550_600608
928618	contig_12078_pilon	-	1435	1	Intergenic	novelGene_74133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAAAATAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	703559	702124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_702100_703600
928619	contig_16492_pilon	+	2039	8	Intergenic	novelGene_100311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	56	junction_5	202.758426685148	11	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	512	1539	308	1846	172164	194136	FALSE	55	AATGGTTTAAAAGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAQQAELSQTALEEGGNNSLAAPTEAGSIDNLGENRQLTGSDPAVISVVGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPVECPLRITTDPTVLATTLNMLPGLIHSPLICTTPKHYIRFGSPFIPERRRRPLLPDGMFSSCKKRWIKQALEEGMTQTSSVSQETRTQHLYQSNENSNSSSICKDNADLLSPLKKWKSRYLMEQNVTKLLRPLSPVTPPPPNPGSKSPQLTAPGPSHPGEEDCRNGYNLMFSPITSLTTASRCNTPLQFELCHRKDMDLTKVGYLDSNTNNCADRPSQLNSGHSDLAPHPSIGPTSESGFPSRSGDGHQTLVRNSDQAFRTEFNLMYAYSPLNAMPRADGLYRGSPLVGDRKPLHLDGGYCSPAEGFPSRYEHGIMKDLSRGSMSPGGERTCEGLPSAPQNPPQRKKVSLLEYRKRKQEAKESAGGGADSVQSKSKSAGAGQGSSNSVSDTGAHGVQGSSTRAPSSPHKKFSPSHSSMSHLEAVSPSDSRGTSSSHCRPQENISSRWMVPTSVERLREGGSIPKVLRSSVRVAQKGEPSPTWESNTTEKDSDPVDGEGPETLSSALCKGATVYSPSRYSYQVRQEIADPWA	171450	194329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16492_pilon_+_171650_172055_172299_177801_177932_184045_184294_189449_189921_191928_192228_193409_193544_194014
928620	contig_511_pilon	-	1988	1	Intergenic	novelGene_132729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGATTTATTTCTGGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52724	50736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_-_50700_52700
928621	contig_854_pilon	+	4662	27	Intergenic	novelGene_36491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3047.11549311843	5	104	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	970	2913	493	3405	1687025	1713333	TRUE	0	TGCGTGTGTCCCGTTGTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQVLTRRPLA	1612770	1716407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649679_1685180_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704626_1710063_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713196_1713308_1713461_1715174_1715556_1715658
928623	contig_12638_pilon	+	2295	12	Intergenic	novelGene_33080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	601.87577313013	21	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1476	1775	182987	185581	TRUE	20	TTTCTACAGTTTGTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQKQSCSNGKQSSKGKRWTYEALCGLITL	170765	191930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171748_171972_172046_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185497_185628_188442_188509_191152_191358_191727
928624	contig_6102_pilon	+	2662	20	Intergenic	novelGene_31892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	455.126051761146	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	71	1312	373473	393134	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLARYHCPSRSSSWLTSSAWIAGLHSTMVKGRCS	373402	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379399_393034_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
928625	contig_6418_pilon	+	1192	1	Intergenic	novelGene_81237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1438875	1440067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1438900_1440100
928626	contig_3789_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_79909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGATCATCTGTAGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	687211	688809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_687200_688800
928627	contig_15548_pilon	+	3067	2	Intergenic	novelGene_173488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAGATAACCAAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	317325	324446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15548_pilon_+_317487_321540
928628	contig_9183_pilon	-	2200	8	Intergenic	novelGene_40319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	410.923499509312	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	921	1919	322898	312131	FALSE	30	TGATATGAAATCCATGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGVDLENKVITVHRVFPNGLAAQEGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHTDALAILRQARDPRQAVIVTRKPALEDTPDLNSSTDSSASISVASDASVDSTAEVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGTASEQSETVQPGDEILQLASSAMQGITRLEAWNVIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKGTTVAGDP	325918	311849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318347_320557_320727_322743_322960_323024_323834_325868
928629	contig_6217_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_109588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATACCTTGAGAGAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250781	248598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_248600_250800
928630	contig_13206_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_161897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	33	102	210	311	114609	114508	NA	80	GTATCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFVPIPKKGDSTECGNYRTISLISHKSKVLLKIIQKRLQQYINRELPKIQARFRRGCGTRDIIADVRWIMAESREYQKDVYLCFTDYAKAFTCEDHNKLWIT	114818	112052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13206_pilon_-_112100_114800
928631	contig_6673_pilon	-	4212	2	Intergenic	novelGene_164014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	92	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	3724	4080	62423	62067	FALSE	15	TCTGTGCCTTAGTCATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYAVAYTKSVEVPDLPWYTVEEDIKSLREIGMLEWIYRVRPTDLHMECPGDTPFTTTVRNQFVKGAPASLKTAVIAILCKSDLTVGTALTVNCNRADGTPWWKGPTGRTQLTNTRCT	121066	61934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_63088_118007
928632	contig_20719_pilon	-	2167	1	Intergenic	novelGene_140566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTAGGTGAAGGTTTACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24405	22238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20719_pilon_-_22200_24400
928633	contig_13021_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_8108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTTTCTTGCTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121229	122780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_121200_122800
928634	contig_3956_pilon	-	761	4	Intergenic	novelGene_15252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCCTTGGCGGCGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291015	1284795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1290540
928636	contig_10437_pilon	+	2380	1	Intergenic	novelGene_38216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATACAGTGTTTCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241377	243757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_241400_243800
928637	contig_8587_pilon	+	2695	1	Intergenic	novelGene_159100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATATTCAGAGAGATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82057	84752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8587_pilon_+_82100_84800
928638	contig_7457_pilon	+	2447	11	Intergenic	novelGene_31329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_2	284.24723393553	255	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	301	1392	285206	290630	FALSE	35	GAACCAGCTTCACTAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMSTESANSFTLIGEASDGGTMENLSRRLKVTGDLFDIMSGQTDVDHPLCEECTDTLLDQLDTQLNITENECQNYKRCLEILEQMNEDDSEQLQMELKELALEEERLIQELEDVEKNRKIVAENLKKVQAEAERLDQEEAQYQREYSEFKRQQLELDDELKSVENQMRYAQMQLDKLKKTNVFNATFHIWHSGQFGTINNFRLGRLPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANKMGLKFQRYRLVPYGNHSYLESLTDKSKELPLYCSGGLRFFWDNKFDHAMVAFLDCVQQFKEEVEKGETRFCLPYRMDVEKGKIEDTGGSGGSYSIKTQFNSEEQWTKALKFMLTNLKWGLAWVSSQFYNK	280833	291685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_280945_281202_281332_284482_284542_285204_285296_285391_285529_285689_285885_286780_286928_288204_288355_289036_289098_289582_289726_290461
928639	contig_3588_pilon	-	2379	1	Intergenic	novelGene_72892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	85	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATCAGAGAATAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135692	133313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3588_pilon_-_133300_135700
928640	contig_6823_pilon	-	1438	2	Intergenic	novelGene_131240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATCACTAGCCATTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	421547	418992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6823_pilon_-_419305_420421
928641	contig_14243_pilon	-	2577	1	Intergenic	novelGene_57439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1276	1608	688650	688318	NA	50	TAGTCAAGAAATCAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEHRVSKANRRNDEVKELNRRFQRLAQEDKVKYYNDMYKDLEIENQKKRTCFTFLKLKELKRKFKLRVAILKDSMRKIFNDAGSIKRRWKEYRVAIPKRTG	689925	687348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_-_687300_689900
928642	scaffold_15027_pilon	-	2686	2	Intergenic	novelGene_163553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	35	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGAAGAACCATGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48333	34238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_-_34500_45908
928643	contig_16541_pilon	-	1243	8	Intergenic	novelGene_126717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	109.409360491986	2	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1107	136	1242	104777	48080	FALSE	60	TATGAATCAAAAGCAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPEKSSQNGESRKEMDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVVKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQELRKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTSLQDQLDKTGENKGWSGPKAGFPEPTSNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSPTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQ	177475	48078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_48388_67211_67273_79866_79999_85346_85485_99719_99933_103107_103216_104630_104791_177353
928644	contig_13753_pilon	+	1845	1	Intergenic	novelGene_136511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160334	162179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13753_pilon_+_160300_162200
928645	contig_8656_pilon	+	2600	1	Intergenic	novelGene_162365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1527	1826	645097	645396	NA	15	TCCCAGCTTATATTCCCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLITEIPQVDSFNKEEFIPSQSSRLQVQIQDISSRGRLSVLALEEGPCHQSFLVLGASQCRKLRSKGRTLLPALLSWWYEVPVSLCSFLSFISQERLA	643570	646170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8656_pilon_+_643600_646200
928646	contig_16622_pilon	-	1451	5	Intergenic	novelGene_48476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1256.44824306455	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAAAACTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121963	111924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115244_121583
928647	contig_10982_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_87848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCATTTCCCAGTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16014	17896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10982_pilon_+_16000_17900
928648	contig_18162_pilon	-	3008	3	Intergenic	novelGene_122314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAATTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
928649	contig_5620_pilon	-	1683	1	Intergenic	novelGene_161329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAGGAAAGAAAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109508	107825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_107800_109500
928650	contig_18610_pilon	-	3032	1	Intergenic	novelGene_168063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACAATTTTAAGAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34501	31469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18610_pilon_-_31500_34500
928651	contig_2323_pilon	+	3924	2	Intergenic	novelGene_151845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	2933	3364	136463	136894	FALSE	55	TGAAAAAACACTCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRVSEIEDKHLATTPFEEKSEKRMKKNEENLRIIWDTIKSKNLQVIGVPEQGEKTEDTERITEELLTENFSNIMKDEKLTIQEAQQNPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKEVTYRGETIRLSLDYSAETM	68329	137454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_+_70324_135524
928652	contig_12528_pilon	-	1969	10	Intergenic	novelGene_81328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	536.700021967809	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	954	1355	959940	937646	TRUE	55	ATACAATATAATGTCGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKENLVRIFRKKKRIRHSLSSLFSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENGVDVSRSLTDDWTLEEPSTESLDASSPSREASPSPREISCDSSSQYQLTASKRFQQKGLDHPSEFIGFFLC	968134	932871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937654_946943_947151_956052_956217_959917_960131_963878_964021_964909_964971_966191_966274_967656
928653	contig_10134_pilon	-	1895	4	Intergenic	novelGene_16218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	693.05892005418	104	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	76	231	392	622	34974	33552	TRUE	30	TAAGTGTGTGTCTAAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKCHGAHTPGNNSIQWFHRGIPIPTQIQPSYSFNATASSSGEYRCQTSQTSLSDPVQLDVFSDWLLLQTPHLVFQEGETIVLRCHSWKNWLLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLHSSQPVTITVQGPANSPFFLFWYQITFILVMGLLFTVDTGLYLSLQRDLQSLMGNRNNYNVTWSKSPQDK	38746	32183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33353_33447_33731_34922_35178_38558
928654	contig_3018_pilon	-	1825	11	Intergenic	novelGene_78849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	750	junction_3	218.635770174965	40	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1080	746	1825	583440	562929	FALSE	60	GGAAAAAAAGACAAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRKK	585601	562928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063
928655	contig_7171_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_101424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1135	1704	1493816	1494385	NA	60	AAAGTCATTAAAAAGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKKISTQEAQRTPYREDPKRKSPRHIIIKLAKTKDKDRTLRAARDKGKFTYKGEPFRLSSDCSAETMQVRRQSEIHQTCNQDALIITGNWNAEVGYEEERSKKPKIKPTAVESIPTHSNSIGQSRTALQGFQGAASGFKLLTFWLSAKCLVTAPPGLQYSLGDKNDARDCVIEFCKTNDLFIGNTFF	1492681	1494719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1492700_1494700
928656	contig_7839_pilon	+	2533	12	Intergenic	novelGene_45731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	593	junction_1	512.666469637823	6	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	82	2250	952473	956984	FALSE	5	CACTTCTGCTCTCCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDREELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950917	957267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
928657	contig_8772_pilon	-	2047	8	Intergenic	novelGene_21119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	1741	2046	19240	15808	FALSE	15	TCGTAGAGGTCCCCCAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFLNLGLQLLDFLIVQFLQKGNLFLQGFHFTLKVETCQRSVVNILSERLQGAFGFLSLQHLLLQLLPETRDVLGQVVALHLDAGLVVGELIHLPTQLPHLL	23421	15806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_-_15918_16549_16609_19020_19117_19199_19362_19994_20123_20475_21522_21965_22051_23061
928658	contig_6304_pilon	+	2015	1	Intergenic	novelGene_122253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	128	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGTGTATTAGGGCCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134321	136336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6304_pilon_+_134300_136300
928659	contig_6842_pilon	+	1766	12	Intergenic	novelGene_130734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_9	30.8185840681713	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	537	1611	154	1764	1225675	1267274	FALSE	60	GAAAGAGAACATAGAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGEVLEYILCSGSLTAADIGRVSSTCRRLRELCQSSGKVWKEQFRVRWPSLMKHYSPTDYVNWLEEYKVRQKAGLEARKIVASFSKRFFSEHVPCNGFSDIENLEGPEIFFEDELVCILNMEGRKALTWKYYAKKILYYLRQQKILNNLKAFLQQPDDYESYLEGAVYIDQYCNPLSDISLKDIQAQIDSIVELVCKTLRGINSRHPSLAFKAGESSMIMEIELQSQVLDAINYVLYDQLKFKGNRMDYYNALNLYMHQVLIRRTGIPISMSLLYLTIARQLGVPLEPVNFPSHFLLRWCQGAEGATLDIFDYIYIDAFGKGKQLTVKECEYLIGQHVTAALYGVVNVKKVLQRMVGNLLSLGKREGIDQSYQLLRDSLDLYLAMYPDQVQLLLLQARLYFHLGIWPEKSFCLVLKVLDILQHIQTLDPGQHGAVGYLVQHTLEHIERKKEEVGVEVKLRSDEKHRDVCYSIGLIMKHKRYGYNCVIYGWDPTCMMGHEWIRNMNVHSLPHGHHQPFYNVLVEDGSCRYAAQENLEYNVEPQEISHPDVGRYFSEFTGTHYIPNAELEVRYPEDLEFVYETVQNIYSA	1224576	1267276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1224717_1225661_1225798_1227793_1227889_1235867_1235990_1239171_1239319_1239615_1239753_1241367_1241505_1243647_1243828_1244604_1244738_1250261_1250474_1254659_1254818_1267107
928660	contig_1037_pilon	-	1548	1	Intergenic	novelGene_84602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	1163	1546	287920	287537	NA	45	AAACTACAGTACACTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTRQGCPLSLLQFNTVLKVLAKAVRQEQEIKGFQIGKENVTLSLFADDMILYIENPKDSTRKLLELVERFRRVAGYKMSIQKSVGFLYTKKENFDKEIRKTIPFIIAPKKRKYLRINLTRDVKDLFK	289082	287534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_287500_289100
928661	contig_8866_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_77840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTACCTCACTCAACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	618892	620757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_+_618900_620800
928662	contig_11983_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_172082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATGATGTTCAGTGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6050	4250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11983_pilon_-_4200_6000
928663	contig_18850_pilon	-	2880	8	Intergenic	novelGene_142435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182429	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177678_178212_178316_178966_179146_180513_181159_181216
928664	contig_16532_pilon	-	1565	2	Intergenic	novelGene_110049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1002	1322	200269	199949	FALSE	60	AAAAAAAAAATCCAGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHVNQRLHQPETRRTRWCLAITNVCLDREHNRESLMEQDKSGMQNSKSSKKIRLNGLTETGGTPQSMTPGLSVNLELKPFLSPTLQTKIRLDYGTENDTHEECAS	201307	199705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16532_pilon_-_200843_200879
928665	contig_12923_pilon	-	2233	15	Intergenic	novelGene_30199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_14	57.603544746369	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	55	1962	577837	511076	FALSE	35	TCAACAATTTCTACATGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNRFDGTQQLQQHANILLIISGGGRPGLGTMGSRYLLLLSGLSILLALSGDAVVSNAQVCGVVGQPVTLPCTYSGTLVPMCWGRGTCSLLGCRDLIVHTNRSHVTFQKDYRYKLKGSLLARNVSLTIENAVKTDSGLYCCRIEYWGLGNDKKLTIALEIKGEDNGNKTQPLVDVCISEDAARTWIQLKNTWSNGTKKDIAQRATQLIQEVELTVWKQTFASPGRHENSVLDIVYETKRCCETSKKTILEAGNNTMDIDCTHAFKETTRDQRAVALITYRALGDILNGTFFNDRKRLQEVQLNSHVADLVLTVITYVGLSLSLLCLLLAAVTFLLCQPIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVGINQTKPKALCSVIAGALHYLYLASFTWMFLEGLHLFLTVRNLKVANYTSAGRFKKRFMYPFGYGIPAVIVAVSAGAGHKNYGTNTHCWLKLDKGFIWSFTGPVAVIILINLVFYFMILWILKSKLSSLNKEVSTIQDTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFMFEAVGKTAELVINYIFTIINVLQGVLLFIVHCLLNRQVRMEYKKWFSGMWKGVETESTELSHSTTHTKMEKLQKSSEFAHTRDTRDTESTQRQPPTHLVTVSWLKTKK	585698	510804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_511196_512190_512287_515299_515481_518311_518404_521107_521175_527660_527897_529572_529768_533635_533746_535905_536014_538385_538522_539237_539315_551471_551805_576504_576535_577710_577845_585651
928666	contig_12344_pilon	+	1780	4	Intergenic	novelGene_164863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.76029781788188	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGAGTATCATCTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30773	97662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12344_pilon_+_30827_65268_65351_72849_72960_96127
928667	contig_11642_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_172912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAACTTTCACCTAATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191785	193137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11642_pilon_+_191800_193100
928669	contig_3832_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_161492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGATCTATGTACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	484337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_484300_486900
928670	contig_299_pilon	+	3387	2	Intergenic	novelGene_129449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2060	2395	934144	934479	FALSE	25	TGCAGTCCCACTCCTAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRSIQELKQKADKNEEKIDKFMENTKKMEEFKKIIQEQNTKLNSQLEIIQKQELEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETMEDRIGKIEDKHLDTTLRKNQKKEQRKMKKP	931953	935471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_933746_933876
928671	contig_5961_pilon	-	1329	2	Intergenic	novelGene_144189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	836	1294	346288	345830	FALSE	65	CAGAAGAAAGGAAATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQSANMIHKHTPNPPPGSSQVYLLFQRTWDILLNRPHISHKASLNKIQTIEILQSIFSDYKAIKVEMNYRKGKKKSNTWKLNNSVLKNYCVTEEIKDGIKKFTESNKNENTSYQNLWDAVKAVCRGQFIAISALIQKEERAIIKTLTLQLE	347377	345794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_346618_346871
928673	contig_10734_pilon	-	2358	15	Intergenic	novelGene_51331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.6508488420533	4	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	540	1623	342	1964	1659205	1601237	FALSE	20	TTTAGTAATTTCTGCCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGKLVVWDIRRPPPSAITFLGFPYIKPCKLVHLQKEGITVLTTIDSYIVTGDIKGNIKFYDHTLSIVNWYSHFKLSPIRTLSFSKTPPPPAAEKSNYPPDCTLKGDLFIVRNFVIATSDATVYHLTADGTKLEKLFVEPKDAICTVACHPYQPLLAVGSLCGMIKVWDYESKTYLFSRVFEKGIGVQSLTYNPEGAILGVGFTEGTVYILDAMSLENEIAEPFKYSRSGVTHISFSHDSHYMATADENYTVALYQVVVKHGQRVWEYLARLRSHHRSIQSLLFGVNLDSNEPRLLSLGRDRLLIEYNLLKTCKDHLEVLDIHRTDQGCYPTCMVWYPPLTKELFLLICNSGYKVKLFNSTTKMCRKTLLGPTYGSPIEQIQLLPVKTTSELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHKTSAIICHPNGVAGMTLSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWEINLSALEAAVSLGGEDLTPFYGLVAGGREGQFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETREVSEHICLSEVPYVMRAIGFYPSEEKHYL	1687353	1600842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1601249_1616124_1616269_1616476_1616568_1623239_1623404_1624479_1624595_1642310_1642496_1643488_1643663_1653400_1653553_1654008_1654260_1655343_1655539_1659065_1659281_1661411_1661463_1662299_1662378_1667393_1667475_1687297
928674	contig_12179_pilon	+	1923	1	Intergenic	novelGene_127993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1182	1502	490179	490499	NA	5	TTGGTGCCTGTTATCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKTEFGTEKVGCCSKRYLKCGSGFEIEWIEQWQKQRTCNSREAAVAENLQWQRSGCGREPTAAEPGDQCKTELEPAHGARELSACAWHKAFWWSAVPPGTYWWSY	488997	490920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12179_pilon_+_489000_490900
928675	contig_7629_pilon	-	2864	1	Intergenic	novelGene_153587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAACCTTCATCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351379	348515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_348500_351400
928676	contig_17734_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_179159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	1335	1673	1991	2329	NA	30	GCCCAAACGTAGCCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKTAPKEPPAPRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSR	656	2331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17734_pilon_+_700_2300
928677	contig_19185_pilon	-	3178	2	Intergenic	novelGene_163655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACAAACCCATTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148325	144784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19185_pilon_-_147212_147574
928678	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	8	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
928679	contig_7201_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_152537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	987034	988923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_987000_988900
928680	contig_1442_pilon	-	1071	3	Intergenic	novelGene_172152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	47	316	369310	304845	FALSE	35	TTCAGATGTAAACATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAHAGNRPLPRSVVVMESPWDELTLAFSRTSMFPFFDIAHYLVSLMAMKRQPGAVTVAWKNPFSSWFTAMLHCFGGGILSCILLAEPPVRFLANNTNILLASSI	369356	304089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_-_304846_349654_349812_369198
928681	contig_8674_pilon	-	2123	2	Intergenic	novelGene_102883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCACAAACAAAAGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41392	39212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_41238_41294
928682	contig_3942_pilon	-	656	6	Intergenic	novelGene_128685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGCCGAGGCCCGGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	429820	426533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426702_428007_428157_428244_428321_428491_428584_429447_429588_429789
928683	scaffold_12124_pilon	+	1538	1	Intergenic	novelGene_22394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	601	1380	1508626	1509405	NA	35	AAATGTGTGGTAAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508025	1509563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508000_1509600
928684	contig_12689_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_145046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAAAAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168432	166710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12689_pilon_-_166700_168400
928685	contig_13592_pilon	-	971	1	Intergenic	novelGene_33682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTAAACCTTCATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20160	19189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_19200_20200
928686	contig_4732_pilon	+	2152	3	Intergenic	novelGene_75412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTATGCATGGTCATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541258	546458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4732_pilon_+_541424_544342_546191_546319
928687	SIRV7	-	911	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	-2	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAAATCCTAAGAGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114968_147611
928688	contig_8373_pilon	-	2740	1	Intergenic	novelGene_176377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	18	57	245	301	26504	26448	NA	50	ATGTAGTACATTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAAVTEIPQVDGFNKEKFILSQPSGLEVQIQGASSRGRLSVSVVSGGRSLSSIFRWSRSFSGKGTPGPKDLLCSRHCFLGGMRSPCLSARFSLLCLRRD	26748	24008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_24000_26700
928689	contig_5033_pilon	+	6662	1	Intergenic	novelGene_28971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	678	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	6074	6541	475531	475998	NA	5	CCTCCTCCCTCTGACTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALILSLNWTQEEMTLWSTKISVEGGGGEALSSSSLGLSATSWLFKTQFPKLGLLNREQPSKVRDKKRITWGRMGQGRWPVVVDASLPAYHHPLLLLEAMPSWCWDSTPVSQGQFSFPWLSSWGASRLRLRQLWSVGFGLLLPYQRPRLASKC	469457	476119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_469500_476100
928691	contig_3155_pilon	+	1123	3	Intergenic	novelGene_26398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	622.5	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258112	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259262_261517
928692	contig_16513_pilon	+	2120	3	Intergenic	novelGene_179160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACAAGTCCAAATAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185616	228697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16513_pilon_+_185624_187488_188137_227232
928693	contig_5649_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_82316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTATATGGGAAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193636	195021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_193600_195000
928694	contig_7009_pilon	-	2426	1	Intergenic	novelGene_23677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	116	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539646	537220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_537200_539600
928695	contig_6102_pilon	-	2674	1	Intergenic	novelGene_32408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1318	1782	1825251	1824787	NA	20	GGGTGAGTGTCAGAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMPGFGGEELNDGETDFPWAPAPRACNFLCAPQKAPWRSHSQRGARAFAATSPGTERRGAVIPRAGRRPEPSLPGKWGRAPVSPALFPGLKRGCSQPGFHPAGDAESHPCVGVAVRKAPRVRGRGGLSAFRRQEEPQHSGSRRLPRQNALAG	1826568	1823894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1823900_1826600
928696	contig_5018_pilon	-	1423	1	Intergenic	novelGene_46924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACGAGGGGATTGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21769	20346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_-_20300_21800
928697	contig_610_pilon	-	1422	5	Intergenic	novelGene_76735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1326.68277576066	10	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	74	814	252557	214101	FALSE	30	CAAAGTGGATTCCTGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRPGLLFSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVDQKILPSSATMHKIT	252630	213492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214149_214221_214263_220517_220785_234998_235302_252475
928698	contig_13702_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_102648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	948	1247	211071	211370	NA	50	AAAAAACCTAAGGGTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210123	211416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210100_211400
928699	contig_13153_pilon	+	2553	2	Intergenic	novelGene_107281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	227	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGATTCCTGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64130	88487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13153_pilon_+_65987_87790
928700	contig_935_pilon	-	3818	10	Intergenic	novelGene_45548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	357	junction_4	246.791760072143	80	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	514	1545	55	1599	370806	346623	FALSE	20	AAGTTTATTTCTGACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEVKTNQMPNAVQKLLLVMDKRASGMNDSLELLQCNENLPSSPGYNSCDEHMELDDLPELQAVQSDPTQSAIFQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIHIGDVCLPPGHPDAINFDDSGVFDTFKSYDFTPLDSSAVYVLSSMARQRRASLSCGGPGGQDFARSGFSKNCGSPGSSQLSSNSLYAKAVKNHSSGTVSATSPNKCKRPMNAFMLFAKKYRVEYTQMYPGKDNRAISVILGDRWKKMKNEERRMYTLEAKALAEEQKRLNPDCWKRKRTNSVRFTK	377434	344403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_346783_352422_352741_358168_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062_368292_370637_370822_377395
928702	contig_11378_pilon	+	984	1	Intergenic	novelGene_112305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAATGGCTTCTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1063818	1064802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11378_pilon_+_1063800_1064800
928703	contig_6137_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_59221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	128	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAAAAAGAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1312222	1314338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1312200_1314300
928704	contig_1443_pilon	-	1117	7	Intergenic	novelGene_28363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	262	junction_6	43.6081032225281	8	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1053	64	1116	954245	950794	FALSE	30	GCCCTGCTGAAAATGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLI	954308	950792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_950948_951203_951401_952464_952576_952724_952905_953099_953268_953748_953945_954198
928705	contig_12120_pilon	-	1928	2	Intergenic	novelGene_21431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCTAGATATAGATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139895	121389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_-_123261_139838
928706	contig_10549_pilon	+	4073	3	Intergenic	novelGene_110592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	110	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	3268	3654	313469	313855	FALSE	55	AGAGCAGAATTAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLISDKIDFKVKSTTKDKEGHYIMIKGSIHQEDITIINIYAPNDRTPKYMKQTLTALKRETDSSTIVVGDFNTPLSVKDRTSRKKLNKDTEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAAKYTFFSNAHGHSPE	114987	314274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10549_pilon_+_116438_304371_305330_312609
928707	contig_11823_pilon	-	2480	1	Intergenic	novelGene_171020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	381	785	27784	27380	NA	70	TGAGAAAAAAAATGAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLALEHREAKPNGRNDEVKELNRRFQRAAQDDKMRKYLELENRKGRTRSVFLRLKELKKKFKPQAAILKDSMGKILNHPGNIKRWKEYTESVHEKELVDVHPFQEVAYIKGRSPSCTEGTGKKQGSRN	28164	25684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_-_25700_28200
928708	contig_9653_pilon	-	974	4	Intergenic	novelGene_48316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1102.35696981009	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	50	337	1016616	1014149	TRUE	35	CTCCCAGGAAAGTTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETIRSFKHKPE	1016665	1013068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1013684_1014126_1014178_1015797_1016036_1016595
928709	contig_9633_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_139604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGCAAATGTCATGAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464277	462065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9633_pilon_-_462100_464300
928710	contig_19941_pilon	-	2770	1	Intergenic	novelGene_139758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	165	617	37525	37073	NA	45	AACTGGACCAGTAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGFIREVTGYNSGLGTVRLQFFHQDSVLLAVLAGTRLSGPRPLPCSGKCYEALLAPTSKSPEAPRHSAFLLCGLGSPLRSLLLVSLATAFHCLPGYNSLSLCFSLSYSPSPSLPPSLSLSLLLQETLHRKYADFPFLIGLFKFLKIFEL	37689	34919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19941_pilon_-_34900_37700
928711	contig_12864_pilon	-	5183	6	Intergenic	novelGene_76441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	568	junction_5	382.890271487798	62	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTGAAAGAGTTGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252184	242241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_-_242888_243778_243826_244598_244767_245704_249843_251887_251999_252111
928712	contig_14744_pilon	-	2483	1	Intergenic	novelGene_65914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAAAAGCCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85672	83189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_83200_85700
928713	contig_9363_pilon	-	3538	15	Intergenic	novelGene_6571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	638.694830677918	7	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	1059	2270	761958	755435	TRUE	50	ATGCTGAAATAATAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERLRITTSWL	763016	753419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755856_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944
928714	contig_5620_pilon	-	740	1	Intergenic	novelGene_161352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAGAAAAGAAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355308	354568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_354600_355300
928715	contig_3956_pilon	+	1678	8	Intergenic	novelGene_15063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1789.17962046456	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	598	1479	1284132	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKERASRPWTTSWTNCRWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283753_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285808_1290449
928716	contig_8377_pilon	+	1118	2	Intergenic	novelGene_35154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8924	junction_1	0	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	23	313	196203	197939	FALSE	35	TATTATTTATATTTATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	196180	198744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_196218_197663
928717	contig_6159_pilon	-	3159	20	Intergenic	novelGene_128248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	17	junction_12	33.4447077495722	20	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1028	3084	74	3157	275065	191913	FALSE	30	TGCCTACATCGAAGGAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRIAALNAISTVEDDHEGSFKSHKTQTKEAQEAEAFTLYHQALDLQKHDRFEESAKAYHELLEARLLREAVSSGDEKEGLKHPGLMLKYSTYKNLAQLAAQREDLATAMEFYLEAVMLDSTDVNLWYKIGHVALRLIRIPLARHAFEEGLRCNPDHWPCLDNLITVLYTLSDYTTCLYFIYKALEKDCQYSKGLVLKEKIFEEQPCLRKDSLRMFLRCDMSIHNASVNAAEAQTIMDEVLGLRSRRQALTVREKAPDLKLVQPIPFFTWKCLGESLLAMYSHLTSCEPPQPSLGKRIDLSDYQDPAPQLASSSVVPPISVIQPSPVSIPPAGAVAEPVLAYASVAAASFPCHSHSLLETSLPMGDASGGDRSKKGVKRKKITEESGETAKRRSARVRNTKCKKEEKVDFQELLVKFLPSRLRKLDPEEEDGPFNNYEVQSEAKPDHCPSAGPHRLSLDSATFMESEKQDVHEFLLGNLTNGGILELMMRYLKAMGHKFLLRWPPGLTDVVLSVYHSWRRHSTSLPNPLLRDCSNRHIKDMMLMSLSCMELQLDQWLLTKGRSSTVSPRNCPAGVNGRFGPDFPGTHFLGDLLQLSFASSQRDLFEDGWLEFVVRVYWLKARFLALQGDMEQALENYDICTEMLQSSATLQPAVGAERGDLVIRLPNLHNDSIVSLEEIDKNLKSLERCQSLEEIQRLYEAGDYKAVVRLLRPTLCTSGSDRAKHLEFMTSIPERPAQLLLLQDSLLQLQDCRQCFECSEVALNEAVQQMVNAGEAAAKEEWVATVTQLLLGIEQALSADDSGNILKESSSTTGLIRLTSNLIQVIDCSMAMQEEPKEPYVSSVLPWIILHRIIWQEEDTFRSVCHQQQLQSPVDEGISETPLLPSSLMLLNTAHEYLGRRSWCCNSDGALLRFYVRVLQKELSVPTSEDTHPYKEELETALEQCFYCLYSFPSKKSKARYLEEHSAQQVDLIWEDALFMFEYFKPKTLPEFDSYKTSTVSADLANLLKRIAIIVPRTERPALSLDKV	275138	191910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_192090_193412_193575_209567_209684_240511_240669_242525_242769_247505_247701_248560_248714_249674_249860_251440_251520_252756_252975_253540_253678_256185_256355_257374_257662_259229_259380_260805_260936_264229_264411_265376_265512_266216_266331_274430_274524_275062
928718	contig_776_pilon	-	1716	3	Intergenic	novelGene_139940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCACAGAAATATACAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	938834	880264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_-_881339_885059_885521_938653
928719	contig_12250_pilon	+	1953	7	Intergenic	novelGene_80575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	24	junction_6	68.9679877431068	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	230	760	311980	312816	TRUE	30	TAAAACATTGTCTTGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATPPGAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLASKLQELEQEYGEPFLAAMEKLFFEYLCRLEKALPALQAQQVLLGQNT	311750	314366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312609_312684_312969_313132_313596_313684_313753_313856
928720	contig_11751_pilon	+	1789	2	Intergenic	novelGene_150304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATGACAACAGCATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160041	162017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11751_pilon_+_160369_160555
928721	contig_8729_pilon	+	623	1	Intergenic	novelGene_40150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTTAAAGTAAAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698879	699502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_698900_699500
928722	contig_4797_pilon	+	488	1	Intergenic	novelGene_6898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTAAAAAATCCAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301211	301699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4797_pilon_+_301200_301700
928723	contig_10636_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_172276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	70	213	141	353	116296	116508	NA	45	AGAATTGACTAGACAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTARSQHVLWTQDPCAAKLLEPGDRKLLTLKAAKSSGRHPAAGDSMVGFLAHGARKMSAFGQKPRERRAYEHSWEEAVLVEELYPEPELYFVTSLINPIIRSIVSEFCVATATNY	116155	116880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10636_pilon_+_116200_116900
928724	contig_6327_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_147480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGGATTCCATTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27428	26333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6327_pilon_-_26300_27400
928725	contig_240_pilon	-	2679	1	Intergenic	novelGene_173805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACACCCTTTTAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711639	708960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_-_709000_711600
928726	contig_13172_pilon	-	865	1	Intergenic	novelGene_146319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATAACAAAGATACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17660	16795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_16800_17700
928727	contig_19974_pilon	+	2127	3	Intergenic	novelGene_130454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTACCAATTTGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79482	134136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_+_79880_80166_81684_133923
928728	contig_10437_pilon	+	1980	11	Intergenic	novelGene_38188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	613.060323296166	3	119	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	654	1154	231647	232651	FALSE	30	GTAACAAGTGTCCGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPPSSSSASPGSPITSGQGLSSWPSTTLLFMQSAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	224783	233477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_224807_229666_229841_230252_230363_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231733_231934_232055_232163_232318_232510
928729	contig_10182_pilon	+	1249	1	Intergenic	novelGene_134614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGACAAGAACAGGCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223941	225190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_+_223900_225200
928730	contig_2799_pilon	+	1709	2	Intergenic	novelGene_85517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	601	1227	614692	615318	TRUE	70	AAAAAAGAAAAAGTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKTAWYWYNNRYVDQWNTIENPDINSSTYEQLIFDKGPRSVNWGKDSLLNKWCWHNWIYICKKLKQDPYLTPCKKTNSKWIKDLNIKSKMIKIMEEKIGTTLGALIHGMSRIGTISNNVQALEERLDNWELLKIKHLCSSKEFTKRVKRHRTDWEKIFGYDKSDQCLISEIYKILQNLNNKKTNNLIKNWAKDMSRHFAKERYSGG	614091	674558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_615339_674096
928731	contig_3956_pilon	+	1968	12	Intergenic	novelGene_14931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1237.81018318108	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	81	1640	1281682	1290491	FALSE	40	TAACGCATTAAAAGGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGITRRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286416_1289599_1289677_1289758_1289892_1290297
928732	contig_16776_pilon	-	1108	1	Intergenic	novelGene_130541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115145	114037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_-_114000_115100
928733	contig_4470_pilon	+	2622	1	Intergenic	novelGene_171779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1548	1913	260933	261298	NA	80	CGACAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTMLGVLIHGINRIETISNNAQAPEERLDNWELLKIKHLRSSKYFTKRVKRQPTDWENIFGYDKPDQHLISKIYKTLQNLNNKKTNNPIKTWAKDINRHFAKEDIQAANRHMRKCS	259385	262007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4470_pilon_+_259400_262000
928734	contig_4402_pilon	+	1017	4	Intergenic	novelGene_140799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	281	junction_3	368.608494506329	3	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	128	367	224421	228454	FALSE	40	TTAGAAAGATAAATGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYDEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSEINKMTPSNIAIVLGPNLLWAKNEG	223704	229104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_223791_224379_224462_226245_226327_228336
928735	contig_1276_pilon	+	1606	1	Intergenic	novelGene_159775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	70	408	219037	219375	NA	25	TTTAGCTATACTGACTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLLPRSIFVVFLPRQICSFFWQSMVYSILFANTTIKGVNSSVFLICCPAFARISCDRKYHGLSQACFAFQHLKEVFCSRLAQCNTSFHFLTPASMGVNCGSKQNEILDNLGLFSIYYDVAYWSSCENFCLLYVEV	218967	220573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_219000_220600
928736	contig_20165_pilon	-	2614	2	Intergenic	novelGene_54492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1215	1529	273390	273076	FALSE	10	AGGTGAGCGGTTGGGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYYLIPTRLALIQKTHTNKCWRGCGETGTLIHCWWERKMIQPLWKSIWRFLKKLQIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAATRIDICTPVFITELFTIAKR	298529	271990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20165_pilon_-_274534_298458
928737	contig_5059_pilon	+	3537	3	Intergenic	novelGene_140710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1938	2312	175516	219198	TRUE	20	AGGCAGCTCTTCCTCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTNTDLFQLVGQIAVFQISWHRSKNLQGCICLLKHLNWYSVNPWSLLFHQCLQCSLDFFLQYHWFLIICYLLKCLNIDQFFLYNDSVYSFHLLLMLPVSFNIFPIESINIATRGLNSFFSSSA	173578	220612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_175866_219173_219955_220143
928738	contig_7056_pilon	+	2335	8	Intergenic	novelGene_43648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCATTTTTGGAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722474	729396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722632_723222_723276_723723_723817_724504_725317_725471_725606_725661_725733_725812_725989_728557
928739	contig_8259_pilon	-	948	1	Intergenic	novelGene_148885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257171	256223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8259_pilon_-_256200_257200
928740	scaffold_12124_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_22192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1279149	1280254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1279100_1280300
928741	contig_3081_pilon	-	4979	2	Intergenic	novelGene_133919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	886	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	4264	4563	179906	179607	FALSE	75	CATAATAAAAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHSYQDLHQTGSSTARWCPAPTTDCSDQDHNRGFWTELEKNVEQNSNTYKKDQIYWPKANWRNPESMAPRHPYSSVVKSLPRFTVQPGIGQPHKTKWD	313968	179190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_184049_313847
928742	contig_13519_pilon	-	3673	2	Intergenic	novelGene_124640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1066	1389	91422	91099	TRUE	40	GTGTGAGAGGATCAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSLFIHSSVDGHLGCFHLFAIVNNAAMNIGVHVSIRVTTLNSLGYIPKSGVAGLYDISISSFLRKCHIIFQNGCHFAFPPAVHKSSDLPAASPTFVTSSVFDSCQ	92487	88637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_-_90181_90357
928744	contig_19647_pilon	+	3741	1	Intergenic	novelGene_144014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAAAGGCACTTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91576	95317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19647_pilon_+_91600_95300
928745	contig_9098_pilon	-	2654	11	Intergenic	novelGene_75840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	138.753882828554	23	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1338	2207	345261	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350575	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535
928746	contig_14744_pilon	-	2433	5	Intergenic	novelGene_65997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	484	junction_3	263.754028405255	100	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	68	577	969897	968300	TRUE	20	CATTTATTGGGTGTTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969964	960497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_968630_969717
928747	contig_3721_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_123836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGAAGAGAAGAAGGCCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307516	309495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_307500_309500
928748	contig_3601_pilon	+	818	1	Intergenic	novelGene_132932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATTAAAATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382900	383718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_382900_383700
928749	contig_11656_pilon	+	3532	21	Intergenic	novelGene_54018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	143.224255976423	1	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	631	1896	23	1918	465719	528195	TRUE	20	TTGTCTCTATCTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWSPSLPTQTWGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLRYKPQFPAPGWNVEKQKAVCEATFLTLLRFA	465696	537357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465753_465788_465824_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528687_531208_531337_535319_535411_536453
928750	contig_10667_pilon	-	758	1	Intergenic	novelGene_137313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTATGGTGCTGTTGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60416	59658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10667_pilon_-_59700_60400
928751	contig_990_pilon	+	1270	2	Intergenic	novelGene_76015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	47	junction_1	0	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	57	174	261	434	537499	537672	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAGTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPAVPEFLKTPPADQPPTRSSAPVLPTNTVSSAKPGPALVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQQQHYNYQTILPAPLKYGLGSMLSSQSGFYCDVL	530698	538508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_530827_537366
928752	contig_6364_pilon	+	2665	3	Intergenic	novelGene_51754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGCCCGTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613940	773082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_615683_615851_616606_772913
928753	contig_1575_pilon	+	2139	1	Intergenic	novelGene_45187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	65	198	106	303	178581	178778	NA	75	CCAGAAAAAAAAAAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFALCPNLGSILENVPCALEKKVYLAAVEWSVRYMSMRSSWLIVAFRSCVSLLSIFLDVLSFIESGVWKSPTTIVELSISLFSAVRVCFMYFGAMSLGV	178475	180614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_178500_180600
928754	contig_3956_pilon	+	2587	12	Intergenic	novelGene_14851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1138.33784873	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	404	2068	1285728	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928755	contig_18081_pilon	-	605	1	Intergenic	novelGene_23829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAACTGGCTTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	392537	391932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_-_391900_392500
928756	contig_10726_pilon	-	4604	1	Intergenic	novelGene_132502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1893	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104287	99683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10726_pilon_-_99700_104300
928757	contig_6014_pilon	+	1873	2	Intergenic	novelGene_176275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTCAATTAAAAAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120942	123159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_121101_121444
928758	contig_12951_pilon	+	3349	1	Intergenic	novelGene_68226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1386	1730	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795219	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
928759	scaffold_12510_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_151393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATCTAGTGCTGCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353801	352456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_-_352500_353800
928760	contig_10962_pilon	+	1565	11	Intergenic	novelGene_103914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	440.748511058177	1	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	711	854	1564	397851	408955	FALSE	20	ATGGATTTGAATCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLGSSRAMLEIQYENEVSLCLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDVDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDTSQTKESLQYSLETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFR	391602	408956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_+_391808_392235_392364_393691_393844_394536_394697_396308_396486_397819_397915_401845_401951_402637_402793_403811_403977_407192_407358_408898
928761	contig_10708_pilon	+	1373	1	Intergenic	novelGene_174352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1023	1370	399938	400285	NA	85	GGTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRAEINEIENRRTIERINKAKSWFFERINKINKPLVKFTKEKQERAQITQIRNEMGGITTDSTEIKRIITEYCEKLHSNKFENLEEMEKSLETHYLCKLTQTEFENLNRPITGD	398915	400288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10708_pilon_+_398900_400300
928762	contig_14013_pilon	-	2958	1	Intergenic	novelGene_178897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	525	477	1001	194237	193713	NA	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	194713	191755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14013_pilon_-_191800_194700
928763	contig_9696_pilon	+	2167	1	Intergenic	novelGene_68816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTTTTCTACTGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393397	395564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_393400_395600
928764	contig_11448_pilon	+	665	1	Intergenic	novelGene_66382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	369000	369665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_+_369000_369700
928765	contig_4754_pilon	-	2464	6	Intergenic	novelGene_35929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	72	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGACCTGCAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285109	268760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_-_268800_276820_277028_277612_277726_280268_280396_280672_280763_283221
928766	contig_2817_pilon	-	451	1	Intergenic	novelGene_104347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCTACAGTACAATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293280	292829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2817_pilon_-_292800_293300
928767	contig_10074_pilon	+	1984	14	Intergenic	novelGene_57118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	261.361863454941	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	568	1707	2	1708	312831	329992	TRUE	35	CAGCACCCTTACTACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFTSIAKLTPEAANPFFKLLTMLMEFAGGPPGMPPFASYILQRIWEVIEYNPSQCLDWLAVQTPRNKLAHSWVLQNMENWVERFLLAHNYPRVRTSAAYLLVSLIPSNSFRQMFRSTRSLHIPTRDLPLSPDTTVVLHQVYNVLLGLLSRAKLYVDAAVHGTTKLVPYFSFMTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEHSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDTREEELEDVKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFLLVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSNIPMSLGPYFPCRENIKLIGGKSNIRPPRPELNMCLLPTMVETSKTTSFLIISSSTYYAELQSTVKNLLKH	312829	341551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_312867_314083_314189_315818_315967_320557_321193_323132_323291_324793_324873_326378_326506_327139_327248_328517_328623_328738_328864_329911_330002_338513_338594_341265_341407_341505
928768	contig_7843_pilon	+	3236	3	Intergenic	novelGene_152057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTAAATTTAGCCCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	541809	547708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_544856_547249_547395_547663
928769	contig_16790_pilon	-	1630	2	Intergenic	novelGene_171675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATAGAGAAACAGGATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14958	13193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16790_pilon_-_13649_13783
928770	contig_16303_pilon	-	3027	8	Intergenic	novelGene_34055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	718.402990766921	14	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	417	1331	40611	35759	TRUE	25	CCATTTTTATGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	59296	32576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33554_35039_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_58999
928771	contig_8210_pilon	+	2074	2	Intergenic	novelGene_30259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	871	1449	170159	171353	FALSE	65	TAAAAGAACATGTAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDNQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFNPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSEGCRA	169288	171978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_170721_171336
928772	scaffold_12124_pilon	+	2032	4	Intergenic	novelGene_22075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	966	junction_3	106.584343232119	23	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	851787	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_852462_854703_854804_857165_857236_857793
928773	contig_7009_pilon	-	4670	4	Intergenic	novelGene_23600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	105	515	632373	631963	TRUE	35	CCTCCAACAGCTATCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWNVRSMNLGKLKVIKNEMECLKINILGIIVLKWTGNGHFESDNHMVNYARSDKLNRNGVALIVKKNISRYILKHNAVSDRITSICLQGRPVNTTIIQTYTPTTNAKDEEIEDFYQLPQSEIDQTRNQDALIIAGD	632477	422751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_425135_622125_622310_622352_623507_631528
928774	contig_3942_pilon	+	2149	8	Intergenic	novelGene_128689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	460.109525559083	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	57	791	426591	429999	TRUE	30	GAGGCAGTCTCATGAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426534	559671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936_431160_559473
928775	contig_11493_pilon	+	985	2	Intergenic	novelGene_143701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGGAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219492	220767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_+_219633_219922
928776	contig_7707_pilon	+	3324	1	Intergenic	novelGene_72220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTGATACAGAGGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	805558	808882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_805600_808900
928777	contig_4232_pilon	+	525	2	Intergenic	novelGene_63412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467422	468057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467633_467742
928778	contig_15182_pilon	-	1504	1	Intergenic	novelGene_136441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACTTTCACTTAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305587	304083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_-_304100_305600
928779	contig_6847_pilon	+	753	1	Intergenic	novelGene_143900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243079	243832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_243100_243800
928780	contig_21386_pilon	-	2906	2	Intergenic	novelGene_177027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAATCACAGCAGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39732	36673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21386_pilon_-_39432_39584
928781	contig_17976_pilon	+	1472	4	Intergenic	novelGene_32486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	98	junction_3	1173.59542527322	6	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	223	1071	41843	47385	FALSE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41620	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46742_46909
928782	contig_3956_pilon	+	2976	14	Intergenic	novelGene_14852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1055.251309141	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1081	2457	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285149_1286149_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
928783	contig_10042_pilon	-	1220	1	Intergenic	novelGene_79208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	365	799	1049225	1048791	NA	50	ACTCATATTACCAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINREKTEVVKDFILLGSTINVHGSSSQEIKRRIALRPSAAKDLSKGFKSKDVTLRTKVRLTQVMVFSIASYACESWTMNKEDQRIDAFELWCWRRILNIPWTARRMNKYVLEEVQPECALEATMERLHLTYLGHVPGEGHHAW	1049589	1048369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1048400_1049600
928784	contig_10404_pilon	-	1966	2	Intergenic	novelGene_138691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAGGAGAATGAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1120878	1118678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1119814_1120047
928786	contig_8793_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_178077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGATAAAATTTTGACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28161	26248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8793_pilon_-_26200_28200
928787	contig_9177_pilon	+	791	7	Intergenic	novelGene_32623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCAGGATGTCATCTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21210	24802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_21392_21608_21689_21866_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696
928788	contig_14441_pilon	+	876	4	Intergenic	novelGene_100732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	533.161013828531	26	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	288	836	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120548	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120687_125517_125902_126159_126283_126514
928790	contig_10734_pilon	-	2147	13	Intergenic	novelGene_51508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_10	422.410435937476	4	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	91	1902	2305085	2265543	FALSE	35	CAAATTCATTCTATGAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305175	2265297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
928791	contig_15025_pilon	+	2381	1	Intergenic	novelGene_155978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2027	2338	54888	55199	NA	40	TTAGAAATTGGAAATGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVKNIEYIMNSQKKEQICLGRGIARMLLGSEGGEILFQILWTCIKRDQSLEKDIMLSKVRVNKKRKTVNEMDCHSGCKNGLIHSNHREDGTGLGSVSFCCT	52861	55242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_+_52900_55200
928792	contig_7707_pilon	-	1035	1	Intergenic	novelGene_72228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATATCTGAATTCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924638	923603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_923600_924600
928793	contig_6589_pilon	+	304	3	Intergenic	novelGene_26135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6874	junction_2	1866.5	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTGGCCTGGCCTGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1879747	1880608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1879819_1880150_1880274_1880498
928795	contig_3018_pilon	-	1000	5	Intergenic	novelGene_78882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	750	junction_2	226.806497922789	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	526	999	570362	566778	FALSE	35	GAACTGAAATTACTATTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPK	572774	566776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321
928796	contig_9177_pilon	-	2165	14	Intergenic	novelGene_32546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	990.417579735195	17	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	42	1724	9309	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGLMGEPEGSFVDYQTTMVRDYGRLASQAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCSALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGAETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	9439	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2774_4566_4704_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251_7419_7591_7739_8487_8549_8723_8789_8903_9054_9147_9319_9407
928797	contig_17427_pilon	-	2432	12	Intergenic	novelGene_30328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1129.22011411226	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	739	1335	179819	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181404_184272_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
928798	contig_16934_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_132538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250175	252561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16934_pilon_+_250200_252600
928799	contig_12920_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_166354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTTTTTTTGGTAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236445	235286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12920_pilon_-_235300_236400
928800	contig_10023_pilon	-	2504	1	Intergenic	novelGene_123489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGAACACTAACGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209488	206984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_-_207000_209500
928801	scaffold_12124_pilon	+	1981	10	Intergenic	novelGene_22254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3093.73219411262	4	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	195	563	1490385	1508039	FALSE	30	AGGGTCACATGTATACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497016_1497122_1506629_1506687_1508010
928803	contig_6439_pilon	-	2431	1	Intergenic	novelGene_154251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTAGTACTTACCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393698	391267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_391300_393700
928804	contig_6938_pilon	+	2695	1	Intergenic	novelGene_69065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAACATATACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149604	152299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6938_pilon_+_149600_152300
928805	contig_953_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_130005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	186	521	295494	295829	NA	65	GAAATCATTAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPSGWKALKIRLGKSCLLRVESTLMMWMESSFQDLHLLMWHDLMRRNSCKHPLIIETWNVQSMSLGKLEIVKNEIEHTNIDILGVSELKWMDIAHFESSSHMATMLGMTN	295308	296732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_953_pilon_+_295300_296700
928806	contig_11986_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_69231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAGTTTCTCATTAAACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773024	771571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_771600_773000
928807	contig_14666_pilon	+	1406	5	Intergenic	novelGene_39590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	5	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	86	1000	477340	484834	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMQGFRALLGHVPKEGVCALVHERGDGRAGVWRGREEYP	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484386_484720
928809	contig_1472_pilon	-	2784	1	Intergenic	novelGene_86131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCTAGAAGATGAGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	566334	563550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_-_563600_566300
928810	contig_5023_pilon	+	2428	17	Intergenic	novelGene_7197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2014.98985341738	3	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	472	1848	611764	646990	FALSE	25	ATGTGGTGACATTTGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580819	647570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609646_611680_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625679_625750_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
928811	SIRV6	+	693	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	84	6	-24	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTACACATATGACACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
928812	contig_3095_pilon	+	1235	5	Intergenic	novelGene_74985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	15	GGTCTTAGGTGGAGTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
928813	contig_3956_pilon	+	1857	9	Intergenic	novelGene_14903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1387.56165966598	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	672	1292	1288971	1290447	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFAAPARWWPRPASAKA	1281599	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283850_1287424_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290400
928815	contig_3472_pilon	+	2751	1	Intergenic	novelGene_166936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAACAAAAACCACTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	304412	307163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_304400_307200
928816	contig_12638_pilon	+	2665	17	Intergenic	novelGene_33114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	545.857922076569	1	91	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	225	1436	171697	198080	TRUE	40	ATAAGAAATCTCATTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDIDIEAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAICKPDFPSRLKLQL	170859	200477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171748_173509_173560_178085_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191799_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
928817	contig_12031_pilon	+	1088	2	Intergenic	novelGene_137573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCAGGACATTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383350	385210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12031_pilon_+_383559_384330
928818	contig_1406_pilon	-	2665	1	Intergenic	novelGene_25637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGTTGCAATCCCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2668694	2666029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_2666000_2668700
928819	contig_2438_pilon	+	1262	6	Intergenic	novelGene_112033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2769.85046527786	3	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	77	364	310588	312053	TRUE	5	CTCTGGCTGTGTCTGGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAASARSLPLPSPLVRSPQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVSPSKEDPGLQHGLQADGADLSVSASSRVLWHQHH	305089	313528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310772_311949_312083_312305_312409_312729_313206_313238
928820	contig_7307_pilon	+	2991	3	Intergenic	novelGene_177663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1610	1921	359737	360048	TRUE	20	TGGTCTTGCACAATATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKKEYLAAVGWSVLYMSMRSGWLTVAFRSSISLLSFFLDVLSFTESGVLESPTIIVELSISLFSAVRVCFMYFEALSLSVNIYYGYVLLVY	331910	366909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7307_pilon_+_332728_358944_360157_365947
928821	contig_21399_pilon	+	3275	1	Intergenic	novelGene_173672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	124	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	220	543	140434	140757	NA	20	TCTTTCCTGGCTTGAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPWSSGPRILPSFFSTILVSASILKVTQGPSGCWSSNHRIKIAVQKEAVRRKSKRSLLPSLQGIFLKILHKIYAYFLFAKTYRVVILSCKVLKIKQSFCKRRVLF	140214	143489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21399_pilon_+_140200_143500
928824	contig_3956_pilon	+	1533	8	Intergenic	novelGene_14914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2021.58940299105	4	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	459	1370	1284132	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281600	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1283793_1283865_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285810_1290452
928825	contig_14525_pilon	-	1645	1	Intergenic	novelGene_149767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	98	297	74	370	157347	157051	NA	30	ACCGTGCTTCCCAAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARWRAAPPGGLQYLRSGVKLTVMAKTATSRALSRQSTRVSVGTGAGTGAGLGQREDAAPIQCPRPRGRGETPCCPPRLRPERRAGANCSPSASPGQPRDPGCLEPRVLPPVSLTGSEGEI	157420	155775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_155800_157400
928826	contig_5649_pilon	-	3035	1	Intergenic	novelGene_82397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1918	2247	1186842	1186513	NA	40	AGGATGCAATATTGAAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIVRNEVELININILGISELKWTGIGHFELDNHMVYYARNDNLKRNGVAFIVKKNITRSILKYNAVRDRIISISPQGRPVNTTIIQIYTPTTKAKDEEIEDIY	1188759	1185724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1185700_1188800
928827	contig_6108_pilon	+	2575	2	Intergenic	novelGene_171296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGCCAAAAGAATGAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	691751	695261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6108_pilon_+_692154_693088
928828	contig_9609_pilon	+	4436	18	Intergenic	novelGene_23020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	225.655676704721	3	82	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	2387	3550	324002	330367	TRUE	15	GGCTTCCTTTGAAGTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTGSVPSLWLVQPSLLLSGRPPSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYAVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPLKRGLVAAYSGDSDNEEELVERLESEEEKLADWKKMACLLCRRQFPNRDALVRHQQLSDLHKQNMDIYRRSRLSEQELEALELREREVNRGQCATGKSMLGYLPFSF	319056	332100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324276_324332_324411_324485_325138_325225_325631_325717_325929_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329168_329765_329946_330229_330619_331388_331487_331563
928829	contig_3975_pilon	-	1634	7	Intergenic	novelGene_54832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	177	junction_2	129.700509722291	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	424	1173	2064115	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGDRWCNPGEPEQKGRGSGRASLEAILPSCILSFIYPFIRSGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2064842	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568
928830	contig_12250_pilon	+	2066	5	Intergenic	novelGene_80616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	26.089988501339	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	197	1273	350196	352314	TRUE	10	TCCTGTAGTTGGAGGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEDSPPGPGYPRLAGPQELGRASGCRKLHRRALGRAECGVSCEVAAAAAIRHSSRQPSGGPAALRMTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGEVIRINQGFLSRGRTRHYCHGAAGHVQRASSWGH	349567	354969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_349747_350178_350544_351345_352017_352256_352443_354304
928831	contig_6325_pilon	+	5411	2	Intergenic	novelGene_143367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	426	junction_1	0	936	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAGTGGTTAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422766	428983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_+_425453_426258
928832	contig_6137_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_59220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	120	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGGCAAATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1314324	1312222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1312200_1314300
928833	contig_21207_pilon	+	3290	1	Intergenic	novelGene_175730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GATTAAAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	3291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21207_pilon_+_0_3300
928834	contig_10930_pilon	-	1047	5	Intergenic	novelGene_37052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_2	1208.33322701149	11	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	131	1045	280211	274077	FALSE	35	AGTCTGTCAAAAAGAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNL	280341	274074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
928835	contig_4496_pilon	-	2579	2	Intergenic	novelGene_66711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GACAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1277760	1267809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_1270318_1277689
928836	contig_6410_pilon	+	1779	2	Intergenic	novelGene_108637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACATGTATATCACACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312691	314637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6410_pilon_+_313710_313876
928837	contig_14243_pilon	+	1865	1	Intergenic	novelGene_57432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCCTTCTTTCAGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	666563	668428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_666600_668400
928838	contig_4812_pilon	+	392	3	Intergenic	novelGene_103657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	178	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGTCATAAAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79011	81226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_79240_80221_80339_81179
928839	contig_5229_pilon	+	750	1	Intergenic	novelGene_117697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGGGGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551436	552186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_+_551400_552200
928840	contig_10345_pilon	+	909	8	Intergenic	novelGene_158365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1411.06311058039	2	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	67	486	11670	23074	TRUE	50	AGCTGAAAATACAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGSEHNLSSSLEEGRKNNTSSTMAMVSEFLKQAWFIDDEEQEYVKTVKGSKGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGVLELVIRH	4372	24412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_4425_11655_11736_11831_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14663_23046_23170_24084
928841	contig_17144_pilon	+	2149	3	Intergenic	novelGene_29190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1554	1871	167621	168283	FALSE	25	CCAGGATTTGAACCCAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	168561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_167681_167922_168060_168162
928842	SIRV3	+	405	2	ISM	SIRV3A	SIRV307	779	5	4143	6	2103	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	13	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTTAGGTTAACGTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6106	8933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6334_8755
928843	contig_12654_pilon	+	1211	7	Intergenic	novelGene_129278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	145.780276062604	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	978	234	1211	690536	701204	FALSE	65	CTGGAAAAAATAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRQENLRWVSELSYVEEKEQWQEQINQLKKQLDFSVSICQTLMQDQQTLSCLLQTLLTGPYSVMPSNVASPQVHLIMHQLNQCYTQLTWQQNNVQRLKQMLNELLRQESQHPEKPGSKERGSSASHPASPSVFCPFSFPAQPVNLFPLPGFTNFSSFTPGMNFSPLFPSNFGDFSQNISTRTEQQQPLAQNPSGKTEYMAFPKPFESSSSAGAEKQSSRRSRQFDEESLESFSSMPDPIDPTTVTKTFKTRKASAQASLASKDKTPKPKSKRRSSTQLKSRVKNIGYESASMSSTCEPCKSRNRHSAQTEEPVQAKAFSRKNHEQ	689752	701204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_689910_690459_690680_690797_690944_691580_691772_693759_693932_696570_696777_701085
928844	contig_3132_pilon	-	4901	9	Intergenic	novelGene_127416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	106	junction_8	95.2729631112626	99	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	183	1094	229252	221606	TRUE	45	AAAATTTGTATTAGGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASRDAEIWKDMQTYYGQVLKKSADLQTNACVTAARSAPKHIREALQNVHEEVALRYYGCGLVIPECLENCWILDLGSGSGRDCYALSQLVGEKGHVTGIDMTESQVEVAKNYIEYHMEKYGFQASNVTFIHGYIEKLGEAGIKNESYDIVISNCVINLVPDKQQVLQEVYRVLKYGGELYFSDVYANLELPEEIRKHKVLWGECLGGALYWKDLAILAQKIGFCPPRLVTANLITIQNKELERVVGDCRFVSATFRLFKLPKTGPAKRCQVIYNGGITGHEKELIFDANFTFKVNKNFFEF	229434	208873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3132_pilon_-_210949_219873_221776_222117_222250_223790_223873_224860_224931_225837_225975_227106_227258_228800_228929_229210
928845	contig_5451_pilon	-	914	1	Intergenic	novelGene_167168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGGAGAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383741	382827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_382800_383700
928846	contig_8866_pilon	-	2162	3	Intergenic	novelGene_77869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	56	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTGTAGGTTCTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	927930	824980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_826713_867824_867901_927576
928849	contig_1725_pilon	+	2304	16	Intergenic	novelGene_24284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	578.222387052671	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	18	1370	201480	248492	TRUE	45	GTCAAGTGTCAAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQVRLLGVGAPPGHLL	201462	252742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246608_247705_247755_248345_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711
928850	contig_6956_pilon	-	2427	6	Intergenic	novelGene_179152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	2001	2426	289191	288766	FALSE	55	AAAACTCAACTATATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYHEDITIINIYTPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNPPLSVKDRTTKKIFSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNNIQNAEIIQSIFSDHNTIKVEINNRKSKE	650456	288764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6956_pilon_-_289220_398703_398985_437482_437536_535552_536184_635298_635385_649535
928851	contig_5894_pilon	+	2878	2	Intergenic	novelGene_83024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2181	2576	378349	378744	FALSE	20	TGGATACTCAGTCGTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKKATPTDGTQGAGQCRWVESKRQWGEASSSQPRDCGHRKQRRPRWGEEVWGIKSIYWLPVVMSPAGSSVKLLSCTPCSLISDRSPRWWICAVVADRGPLHVSLHALCSQSVFYSIWYLAEFFISSFDA	302924	379046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_+_303614_376857
928852	contig_11678_pilon	+	3120	3	Intergenic	novelGene_160838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAATACATATATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191057	200295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_192405_193013_193279_198787
928853	contig_14666_pilon	+	1319	1	Intergenic	novelGene_39630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	335	1008	22	1029	483933	484940	NA	85	TTAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	483911	485230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_483900_485200
928854	contig_6063_pilon	-	1154	11	Intergenic	novelGene_27593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	603.109185803035	1	13	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	528	896	36264	26550	TRUE	30	GAAAGTAAGCTCTATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKVKVGKEDSSSTEFVEKRRAALERYLQRTVKHPTLLQDPDLRQFLESSELPRAVNTQALSGAGILRMVNKAADAVNKMTIKMNESDAWFEEKQQQFENLDQQLRKLHASVEALVCHRKAK	70261	25918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6063_pilon_-_26121_26493_26558_27527_27622_27875_27990_28867_28944_36187_36267_45549_45594_45743_45811_48191_48356_52941_53066_70135
928855	contig_6361_pilon	-	4320	7	Intergenic	novelGene_23963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4906.79526835546	12	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	5	TTTGCCTTAGTGGTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	389454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_390364_390511_391720_405873_407674_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
928856	contig_11823_pilon	+	1350	2	Intergenic	novelGene_171031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTTGTTTTCTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82410	148058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_83540_147837
928857	scaffold_13505_pilon	-	381	4	Intergenic	novelGene_111501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6160	junction_1	3957.90696651091	9	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	348	33	380	547805	541857	FALSE	40	AAGATGGGTAAGTGAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKD	548327	541855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_542033_547363_547465_547734_547806_548295
928858	contig_8453_pilon	-	3374	1	Intergenic	novelGene_125138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCCAAATAATGACATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243919	240545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8453_pilon_-_240500_243900
928859	contig_12227_pilon	+	3823	5	Intergenic	novelGene_127401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	585	3238	3822	151612	152196	FALSE	45	AAAATTACATGATCATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDVTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEKMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRSTTGEEIEKALNKIPNQKKPWPRWLHWRILQNIHRRAGTSSTQAISEHRKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQIGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKE	135682	152197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_+_137293_137744_137947_138008_139168_149758_149821_151407
928860	contig_14807_pilon	-	953	5	Intergenic	novelGene_124654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8845.20269340958	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	23	739	39773	37362	FALSE	5	TCTGTGGTCTGCATGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEGEAGFFGNPNPSALELIQQAHCPLIRPGAHWRAGPSPRQHGHHLAYTWGCGGECLCAILSLSLCIALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGHPHLQEVGFYQV	39795	37147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37493_37649_38298_38741_38827_38887_39750
928861	contig_3822_pilon	+	2789	12	Intergenic	novelGene_133314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	810	1217	290871	296285	FALSE	45	ACATATACACCCAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQPSKLKGQKLYLRVQVCSRKPKCSKGRIESRSSQSSQWNSANLGKWVRSRQETTTRQKTCHCISWCQQRQSLSLIRNNSCTRFLSHEPNVSKHSRFSRGVLSTFKSCFMNNDSCRLLHYKAHRKIKIHKTKKV	277220	297857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_+_277267_277370_277510_277901_278000_280890_280943_281138_281227_282994_283046_284585_284717_285129_285216_290752_290882_293519_293643_295722_295830_296118
928862	contig_17198_pilon	+	1914	2	Intergenic	novelGene_62343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593127	649702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_+_594926_649586
928863	contig_5551_pilon	-	2989	1	Intergenic	novelGene_134223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCATTACTTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182725	179736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5551_pilon_-_179700_182700
928864	contig_10377_pilon	+	1502	9	Intergenic	novelGene_115385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	765.015849509015	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGCCTGGATGTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209083	257266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_220809_220952_227487_227769_245160_245257_251691_251750_252537_252616_255017_255169_256868
928865	contig_12402_pilon	-	3321	2	Intergenic	novelGene_133395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAATGCAAATAACCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685829	682091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_684649_685065
928866	contig_8322_pilon	-	2425	1	Intergenic	novelGene_143268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	540	869	451553	451224	NA	40	ATCGTTGAAATGGCAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPFWKSIWRFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAVRRIDICIIMFIAALFMIAKRWKQNRRPSTGKWINKLWYIHAMEYYAMIKKNNEFVKNNMEESGRHYAKRI	452092	449667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_449700_452100
928867	contig_11986_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_69220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTTATCATTAGTAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744822	746429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_+_744800_746400
928868	contig_7945_pilon	+	1024	1	Intergenic	novelGene_161602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATGATTTTAGACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394313	395337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7945_pilon_+_394300_395300
928869	contig_6088_pilon	-	1134	4	Intergenic	novelGene_161275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGCTGGGTATATAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235010	231884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6088_pilon_-_232036_232911_233036_234064_234189_234275
928870	contig_11281_pilon	-	2611	1	Intergenic	novelGene_125478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	135	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1575	2012	869516	869079	NA	50	AAAATAGGGAAACAGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASPQNKEYRNFTGEENFLELPEAEDKRLIHRTLQEIRKEIKQNTEDTIEEIKKIRQEHTDEFNRLQESTERQQSDIKKINNKISELDNSIESHRSRIEAMEVRISEIEDKALDTKLFEEKSDKRIKKKRRNPKNYVGLYQEK	871090	868479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_868500_871100
928871	contig_6375_pilon	+	3586	6	Intergenic	novelGene_73019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	194	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGGTATCTGTTTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	405977	613291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_408380_409438_409659_420377_420797_611688_611783_611833_612001_613007
928872	contig_3975_pilon	-	3086	7	Intergenic	novelGene_54775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	528	junction_1	273.283379581627	6	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	1917	2483	2018377	2016131	FALSE	10	TCCCGAGCTTCTGTTTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETKGVKEEVKLA	2021457	2015527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2016159_2016418_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018612_2019775
928873	contig_7718_pilon	+	636	1	Intergenic	novelGene_129411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATAGGACTTTTTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266260	266896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7718_pilon_+_266300_266900
928874	contig_15476_pilon	+	1707	1	Intergenic	novelGene_174655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTGCAAGCATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68378	70085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15476_pilon_+_68400_70100
928875	contig_20748_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_138184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCGGCCTTTCATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197643	198469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20748_pilon_+_197600_198500
928877	contig_8330_pilon	+	2946	7	Intergenic	novelGene_71921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	1694	1996	1284267	1287055	TRUE	35	TCATAGACAAGCGAGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLMSPEQGSPPIHVVLRLDHIHHLVGIQLESTLQLIQAIHILHGLLTVSFLSFLFLLFSTTLALPDAPQIPWEKHWFLCQMLTELKRGSIGIHVTFHIV	1282573	1298174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1284273_1286210_1286418_1286965_1287062_1287706_1287800_1290584_1290759_1295059_1295232_1297669
928878	contig_12046_pilon	-	2377	14	Intergenic	novelGene_83458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	63.4987769532313	6	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	1196	2050	222227	215718	TRUE	45	AGAATTATTCCAGAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADICHQVFNENTRSLEISQSYTTTQRELSDYSVLCKRRRIELGWEVIKDHLQKSQNDFDLVPWLQIATQLISKYPASLPNCELSPLLIILSQLLPQQRRGERTPYVLRCLMEVALCQGKISNLEGSQKSDLLKLWIKIWSITFRSISSEQIQAENFSLLGAIIQGSLVEVDREFWKLFTGSACRPSCPAVCCLTVALTICVIPETAKTGLEQNISEVSRSVSLRELIMKWLIFYQLEDDLEDTTELPPILHSKFPHLSLEKILVSLAVKNCKAAMNFFQSAPE	246844	213177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_-_213282_215494_215719_216548_216645_217874_218070_218572_218945_220381_220552_222206_222371_224132_224372_225034_225212_236011_236169_239280_239427_240980_241094_241178_241281_246726
928879	contig_546_pilon	+	3181	4	Intergenic	novelGene_117230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2745	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGACAAAAAAAAATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147631	156168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_546_pilon_+_147676_152818_153989_154156_154805_154849
928880	contig_5264_pilon	+	1264	1	Intergenic	novelGene_165053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	345	650	90370	90675	NA	35	CCACCCCAAACTTGGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLLEFDFCSCSIQDSVVFPVRVIIGGSRAPSSSSVLRLMNSLVYVGSCLIAPGDGDFGWERYWAGLDGRVLTVCISPCPLFLYSLSFHLILSPILQPCL	90025	91289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_90000_91300
928881	contig_7630_pilon	-	7480	1	Intergenic	novelGene_133632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1022	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	4849	5199	385035	384685	NA	40	CAATGTCACGGAACAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSLPPGPLPCHPGQQRGEPRRLPHLGLLQFSLLMAWVRLGTSAQALSWEGQGAFSPSLDPHKLAVKLEAKRWPETQGISYYKRSPPFLWQPGSDGFFQPLGPEHLALDALPLTPL	389883	382403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_382400_389900
928882	contig_10958_pilon	+	3044	1	Intergenic	novelGene_5324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1691	2020	65487	65816	NA	50	AAGTATATTTCCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRCFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTLMFMAALFTKRWKQPRCPTTDEWINKLWYIHTMEYYATMKNNDESVKHLTTWMKLEDIMLSEISQSQKDK	63796	66840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_63800_66800
928883	contig_7357_pilon	-	2229	9	Intergenic	novelGene_36802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1745.44148695251	7	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	587	1348	154622	136424	FALSE	15	TTTTCTGGACCTAGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167006	135542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154663_154888_155079_159911_160034_166772
928884	contig_5050_pilon	-	3177	1	Intergenic	novelGene_110266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1808	2107	499291	498992	NA	55	GAAGAAAGCAAAAAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVFQIPAGSHMVGKFQWSFQTKTDQEERAGSPLLKKLTSENLMSSRGTLSDIVPEDEPLRLEGTQKMTGEELLPQIRVDLNDVGGVKLSKPSFAKVA	501098	497921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_497900_501100
928885	contig_12391_pilon	-	986	1	Intergenic	novelGene_103611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCTTCATGTATGATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87851	86865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_-_86900_87900
928886	contig_8849_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_179161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGCAACACTTCATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250911	252911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8849_pilon_+_250900_252900
928887	contig_2799_pilon	+	1123	1	Intergenic	novelGene_85520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	408	714	1121	628487	628894	NA	20	GTCCGTATTTTCCATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKCSVSSSSMILSVFSVFSPCSAIPITRIFLLLIVSHITLRISSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTSSISEILLFIFCISNCCLCIISSCEFILAFCSYIIFLNSSNF	627773	628896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_627800_628900
928888	contig_15063_pilon	+	1967	7	Intergenic	novelGene_12272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	8	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	240	1712	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27924	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
928889	contig_12299_pilon	+	1996	1	Intergenic	novelGene_29752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366506	368502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12299_pilon_+_366500_368500
928890	contig_12078_pilon	-	3930	3	Intergenic	novelGene_74111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAGTAAAAAGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377217	353219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_355447_375474_375883_375922
928891	contig_854_pilon	-	2042	11	Intergenic	novelGene_36662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	3	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	1654	2040	1710643	1699281	FALSE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSLH	1716011	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1709603_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715323_1715551
928892	contig_15327_pilon	+	3219	1	Intergenic	novelGene_70531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACCTTGGTGGTGTGGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504321	507540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_504300_507500
928893	contig_18272_pilon	-	3027	1	Intergenic	novelGene_7037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACAACAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241101	238074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_-_238100_241100
928894	contig_1406_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_25439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	69	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAAAAACTATCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480768	478391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_478400_480800
928895	contig_14034_pilon	+	2517	3	Intergenic	novelGene_72649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACGGCTGGACGGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286198	298569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14034_pilon_+_287221_296626_297099_297546
928896	contig_11294_pilon	-	3168	3	Intergenic	novelGene_50042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	248	616	217327	216959	TRUE	25	AATCCATCTCATTGAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGLVWFYSKLSGIVHNLSRPINQDGLDCDTVTITSKSQWLTLQRIISPSCSVSMAVLLHAILTLGHRLLDLPMARTLPGQSLFKFLLKSDTHNFWPHFIILSKSHDLSGVQQQDRYIILL	217574	181726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_181742_190307_190626_214739
928897	contig_16496_pilon	-	1279	3	Intergenic	novelGene_5192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1036_1291_1354_3413
928898	contig_11110_pilon	-	2773	1	Intergenic	novelGene_177263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	885	1205	479033	478713	NA	50	AAACTAACTTGAATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRNNENDQNTLEFNHLMKSQDIMLSEKMQEGMMDFLRCQECNIILFFLTRIMVTQRFTSDKSLSCTFMLLIFLLCTIVQYRKLKINYFSLKCLSTEQRCTQNRMK	479917	477144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11110_pilon_-_477100_479900
928899	contig_4180_pilon	+	2057	9	Intergenic	novelGene_8325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	190.425469344308	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	163	1347	800745	821915	FALSE	30	AGAATGGAGAATCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSYLKNKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN	790833	822625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_790890_800638_800766_802493_802660_810963_811077_811814_811993_813450_813616_814802_814973_820004_820097_821635
928900	contig_6446_pilon	-	3451	1	Intergenic	novelGene_149223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	118	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	2868	3179	404434	404123	NA	25	GGATGTTGCTGGAGAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESISPRDRKGHINQRLNQPETRRTRWCPATTTNCLDRKHNRESPVEQEKSGVQNSKSSKKTRLNGLTETRGTPEDMVPGLSVNPELKPFPRPTLQTKIRLGY	407301	403850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_403800_407300
928901	contig_854_pilon	-	1562	2	Intergenic	novelGene_36317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGCTTGGTAAAGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562352	559685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_560426_561530
928902	contig_15244_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_118069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	80	243	114	356	720040	719798	NA	80	AAAAATTAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEALACPCPLPLCPLLISLFEYSHKQSCPAQGWASRYMVRVGPRDWKGMFPVHFHIVCASELTFSQSFPTACCFYNFFLTERRLSLKHKKILEVHDLLSDVRAQIPTLHFIDIFSTF	720153	719037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_719000_720200
928903	contig_21007_pilon	-	406	2	Intergenic	novelGene_161512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAAGAGAGAGGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	947	256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_-_280_564
928905	contig_2069_pilon	+	2430	14	Intergenic	novelGene_23262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	303.41987624705	4	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1005	1721	341330	343975	TRUE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324033	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766_344320_344451
928906	contig_500_pilon	+	2527	1	Intergenic	novelGene_30981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	394	717	1466121	1466444	NA	25	AAGCTGGTGCCTGGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQQDAFWSADVRVWWQWHWWLGPWGQLLRQREPPGLGQPRQHRVCCRCLKKRAVSTCCLERGVPGRGDFSPAGIRRLPPSLGRRIGCKQKTQTRPAGAASQVAATH	1465727	1468254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1465700_1468300
928907	contig_17144_pilon	-	1372	7	Intergenic	novelGene_29362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2550.18284747497	4	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	278	1078	174965	166363	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTIQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176215	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166699_168280_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172661_174952_175001_175973
928908	contig_13547_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_104856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATTACATCATTATGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20000	18364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13547_pilon_-_18400_20000
928909	contig_2341_pilon	-	4496	1	Intergenic	novelGene_84351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	128	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	3688	4047	53258	52899	NA	35	GTAGAACCTTCTAATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDGISGIEDKHLDTTLFEENSEQRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFQVVGIPEHGQKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLTKTKDSPESSW	56945	52449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2341_pilon_-_52400_56900
928910	contig_17964_pilon	-	2426	4	Intergenic	novelGene_33858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5735.30704399415	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	TRUE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_134352_134423_135640_136905_136999_139520
928911	contig_8594_pilon	-	2311	2	Intergenic	novelGene_140065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	19	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGTGTGTATTCAAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	496220	492333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_494398_495973
928912	contig_7513_pilon	+	1432	1	Intergenic	novelGene_88972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAAAAAAAAGAATGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253720	255152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_253700_255200
928913	contig_2798_pilon	+	2336	3	Intergenic	novelGene_120023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1565	1924	116117	116476	TRUE	15	CTCTTCCCAGATACTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSKFSVERKTVFLIIFFLSPILRNNQWYHNDNYQQPHTSTGSHSMQFSVEFYFVLALKEDEVPDDQDHHIEQECEVHVYVQHGTHKFAEGQPKYPSLLDEVDQAKRHRQEKNTVYHH	114552	170452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_116679_120451_120600_170390
928914	contig_3747_pilon	+	1634	3	Intergenic	novelGene_24958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	7595	junction_2	2002	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	257	583	203794	204120	FALSE	80	GTAAAAAAAAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	203306	205171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203386_203498_203651_203768
928915	contig_6374_pilon	+	1300	1	Intergenic	novelGene_158443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTGCCGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348418	349718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_+_348400_349700
928916	contig_12239_pilon	+	1423	10	Intergenic	novelGene_170467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_2	80.7671550404825	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	560	1069	45336	74567	FALSE	5	CTTTGTGGTGTTGCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLDNTLEEIIFKLVPGLREQELERESEFWKKNKPQENGQDDTSKVDKPKVDEEGDENQDDKDYHRSDPQIAICLDCLRNNGQSGDNVVKGLMKKFIRCSTRVTVGTIKKFLSLKLKLPSSYELDVLCNGEIMGKDHTMEFIYMTRWRLRGENSYPMVLQYRPRIDFG	22083	74921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12239_pilon_+_22111_24520_24810_44658_44813_45246_45344_47054_47111_47222_47283_49926_50076_55192_55292_59284_59375_74519
928917	contig_9091_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_32430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26095	26982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9091_pilon_+_26100_27000
928918	contig_1948_pilon	-	1758	1	Intergenic	novelGene_31198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACAGGTTCTCTAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587660	585902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1948_pilon_-_585900_587700
928919	contig_4392_pilon	+	4069	20	Intergenic	novelGene_117308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	124.391260125331	211	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	723	3161	378985	655344	FALSE	5	GTCCTGCCTTCAGCCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVKKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPESTPEVKAWLQRRRKVRKVPKSFQRTRSHPKRPKTEEDEEASAVADGDEFPTPELATDQLKVSEKPEAAVKLGNIGAASEEETFADRMQPDQNLLHNINLSGNSCSSTSIMEEMKTEEDEACATVAPSNPEEADGAVTLSSGCVKSEEADPAKLSWPRSPESCSSVADTNGVWTEGEESDLESCGSGLEPGEVPEVPSGERNGFKVPHRIEAETKTAKSWRHPLSKPPARSPMTLVKQQAASDEELPEVPSTEEEVEETESWAKPLVHIWQTKSPNFVAEQEYNAAVARMAPHCAICTLLMPYYKPDSSNEENESRWETKLDEVITSGEKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEVCDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTQNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCMFCRHRIKKVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKAIAVGQTVITKHRNTRYYSCRVIAVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCVKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYLGSNIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGEKKRQRVLSSRFKNEYVDDPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ	273713	656252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4392_pilon_+_273854_307329_307491_308176_308353_343418_343614_378934_379039_384173_384312_464336_464531_468579_468819_471078_471399_474144_474254_488930_489113_490691_490906_492144_492222_516721_516778_518997_519107_581318_581505_601911_602083_645308_645429_649029_649123_655167
928920	contig_16496_pilon	-	1519	2	Intergenic	novelGene_5133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	295	312	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3579	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
928921	contig_7189_pilon	+	691	1	Intergenic	novelGene_117663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGTAAGAAGAACAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551592	552283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7189_pilon_+_551600_552300
928922	contig_6086_pilon	-	3377	1	Intergenic	novelGene_171456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2516	2857	27154	26813	NA	65	GAAAAAGATGAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGGIRENTERIVEDLLAENFPHILKDEKISVQEAHQTTHKVDPKRKSPRHIIIIIAKTKDKERILRVTRDIRKVVYKGESMRISSDYSAGKKAMG	29669	26292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_26300_29700
928923	contig_3789_pilon	+	2145	8	Intergenic	novelGene_79848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	257.929906631034	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	172	627	445610	465911	TRUE	20	TGAAGGCTACAGTGTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDIGDWFRSIPAITRYWFAATVAVPLVGKLGLISPAYFFLWPEAFLYRFQIWRPITATFYFPVGPGTGFLYLVNLYFLYQYSTRLETGAFDGRPADYLFMLLFNWICIVPCLYILTSFAVADDSSDNVSTLCLGAAEQRHDCVILVWNTI	445438	473613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_+_445763_457261_457374_464035_464101_465785_465913_467056_467110_468585_468697_472202_473321_473378
928924	contig_10082_pilon	+	1064	1	Intergenic	novelGene_63900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAATAATTAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461809	462873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10082_pilon_+_461800_462900
928925	contig_13765_pilon	+	1261	1	Intergenic	novelGene_165869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGTGCAGAGAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11063	12324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13765_pilon_+_11100_12300
928926	contig_13760_pilon	+	1273	1	Intergenic	novelGene_61329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	657	1094	279500	279937	NA	75	AAAAGATAGAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQIYTPTTNVNYEEIEDVYQLLQFETDQTCNQDALIITGDWNMKVGNKEEATIVGKYGFGDRNKAGDRMIEFCNTNNFFIANTFFHQHKKQLYTRTSPDGIHRNQINYICGKRQWKSQYHQSGQGQGLTVEQTINCSYATSS	278843	280116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_278800_280100
928927	contig_5189_pilon	+	1383	6	Intergenic	novelGene_34865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGCAAGAACAGCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198429	228230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_+_199333_200427_200512_204911_205038_205696_205792_218496_218615_228173
928928	contig_3077_pilon	-	3418	2	Intergenic	novelGene_26768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCTGGGTTAACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	13517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_13985_15135
928929	contig_13481_pilon	+	2010	1	Intergenic	novelGene_119528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGATAGTTTCTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1466605	1468615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_1466600_1468600
928930	contig_7707_pilon	-	2380	1	Intergenic	novelGene_72133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCCTCCACTAGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90588	88208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_88200_90600
928931	contig_12977_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_122815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGCAGCCTGTTTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77585	78749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12977_pilon_+_77600_78700
928932	contig_10904_pilon	-	1408	5	Intergenic	novelGene_22726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	43	junction_1	445.577364214117	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	30	794	662714	651376	FALSE	20	AGCCATTCACTTGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662743	650761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662665
928933	contig_10319_pilon	-	1155	1	Intergenic	novelGene_147233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGCTCTTTTTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27112	25957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_26000_27100
928934	contig_5575_pilon	+	6556	20	Intergenic	novelGene_122056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	253	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2048	2359	136253	136649	TRUE	55	TAAAAAGGAAGGACGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRPEEWLQIEISKISEKYIIYLYISVCLLFKFHIPLKVVIQSVAAEGGSSAGPGGSVVLMWVFEFPADQAGSGKGPRLPDSLYTGRQQTPEPVAPVEHSSSL	134205	224725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5575_pilon_+_136542_136626_136681_140377_140471_151566_151751_157546_157721_167133_167538_169852_169955_173394_173712_174860_175028_176688_176806_185355_185538_187907_189224_190501_190663_198008_198140_202523_202614_203838_204022_207727_207910_216150_216242_220146_220314_224620
928935	contig_3103_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_146192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	210	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	95	288	36	323	72081	72368	NA	10	GCTCACCTCATTTGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIFWIFNCCFCMISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIALNIRDLSSLSGSSSGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIW	72045	74461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_72000_74500
928936	contig_7045_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_77430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAGAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217199	218779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_+_217200_218800
928937	scaffold_12124_pilon	-	1974	8	Intergenic	novelGene_22359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1167	1502	1508404	1508069	TRUE	80	CTAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509570	1486528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491964_1494268_1494329_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
928938	contig_9219_pilon	+	2964	2	Intergenic	novelGene_179162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	464	1633	2341	3510	TRUE	50	GTGTATTTTCACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINIIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSITPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHEKQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIK	1877	5580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9219_pilon_+_3956_4694
928939	contig_14683_pilon	-	3148	3	Intergenic	novelGene_166054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAATAATAATGAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176338	172925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_173816_173896_174202_174385
928940	scaffold_13505_pilon	-	2093	10	Intergenic	novelGene_111518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	436.181664498228	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	1	1128	603249	595273	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSESATKPSI	603249	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589777_589843_590205_590259_594013_594275_595062_595299_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
928941	contig_11816_pilon	-	2393	1	Intergenic	novelGene_98599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTTTAACTGCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1432817	1430424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1430400_1432800
928942	contig_2204_pilon	-	2664	2	Intergenic	novelGene_71674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16757	13588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_-_14916_15420
928944	contig_15838_pilon	-	2219	1	Intergenic	novelGene_174341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGATATATTGGTCGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266852	264633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_264600_266900
928945	contig_16541_pilon	-	3757	1	Intergenic	novelGene_126744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAACCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394013	390256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16541_pilon_-_390300_394000
928946	contig_10722_pilon	+	2784	8	Intergenic	novelGene_70980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	106	417	4077	4388	TRUE	15	ATTTTTGGTGTTTATGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDYESIHHTADRQNQEGMLAWRRVSACAGRVLSGWRHGACLCGTSQRSETFPACPCDVPFHACVSWQHLSDPETCSEIENEIFSFCVHVYLNFSNHLWCAWP	3971	9737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10722_pilon_+_4499_5545_5643_5730_5843_6185_6529_6637_7033_7088_8261_8495_8562_9665
928947	contig_6230_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_102115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCATGTGTCAAAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173550	175515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6230_pilon_+_173600_175500
928948	contig_17144_pilon	-	2704	4	Intergenic	novelGene_29484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2470.74244352223	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1747	2067	173856	173536	TRUE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METQGGKQNHRQKQEGAKEPYRVGQEAVLTTTFLAVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	175602	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166345_172679_172740_173128_173209_173305
928949	contig_4832_pilon	+	3953	1	Intergenic	novelGene_163404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	2822	3421	394314	394913	NA	45	AAAAACAACAGCATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEFLIFKNIYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDINKLWTTLQRMGIPEHLIVLMRNLYIDHEAVIQTEQGDTAWFKVRKGAHQGCILLPHLFNLYAEQIIQEAGLLEERGIRTGGKFINNLRYADDTILLAESEGDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTVGPISNIMINGENIEVVKDFILLGSTINTHGRSSQEIR	391492	395445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_391500_395400
928950	contig_8317_pilon	+	943	2	Intergenic	novelGene_19349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	40933	junction_1	0	33	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTTTCTGTTATTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16207	17249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16283_16381
928951	contig_12479_pilon	+	1742	1	Intergenic	novelGene_56868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAACTGTAACTCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465120	466862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_+_465100_466900
928952	contig_4103_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_52018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	726	1070	518948	518604	NA	65	AAAAAAAAATTACAGCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTAALFIIAKRCKQPKFPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMIENNDECAKHLTTWMNLEGFMLSEIKSTTEGQILYETTIIKTQEKVYTQKETLFGGYKGGEDRGGGITNQIVDKW	519673	517367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_517400_519700
928953	contig_3018_pilon	-	2075	15	Intergenic	novelGene_78874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_13	461.980237451688	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1458	616	2073	600079	562944	FALSE	70	CAGAAGGAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYE	625095	562941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_600806_600912_603367_603441_624772
928954	contig_9011_pilon	+	1999	1	Intergenic	novelGene_159278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1373	1951	155523	156101	NA	65	AGGAAAGAAAAGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQVYTPTTNAKDEEMEGFYQHLQSKIDQTCNLDALIIIGDWNANVGNKEGLVVAKYGLGDRNNARDHIIEFCKTNNLFIINTIFQQHIWQLYTWTSLDGIHRNQIDYICGKRQWRSSISSVRIRSGTDCGTGHQLLICKFKMKLTKIKTSPRELMYNLQYTPPEFGDDLKIRSDTLNTNDQRKTRRVVG	154150	156149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_154200_156100
928955	contig_11720_pilon	+	1439	10	Intergenic	novelGene_43808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	88	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	207	1007	68064	98324	FALSE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYTFSSR	67857	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98306
928956	contig_20602_pilon	-	1738	12	Intergenic	novelGene_133716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	296.929131428543	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	510	1391	23530	10026	FALSE	15	TTATTTTTTTTTTTATGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29541	9678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_24993_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
928957	contig_776_pilon	+	2467	1	Intergenic	novelGene_139904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	995	1294	245186	245485	NA	40	TATGACTATTTCAGACAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHGSCFIFLHVEIQFSQHHLLNRLFFPPPNGLSTLVENQLTLDVCIYFWTLNSISLVYVSIVIPVSGCFDYCSCIICFKIRKCESSYFVFLFQHCYST	244191	246658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_776_pilon_+_244200_246700
928958	contig_1443_pilon	+	2900	1	Intergenic	novelGene_28336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTCTAGAACAGTTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	779230	782130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_779200_782100
928959	contig_7342_pilon	-	3371	1	Intergenic	novelGene_71213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATACTGAAGTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	685105	681734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_-_681700_685100
928960	contig_5059_pilon	+	2397	1	Intergenic	novelGene_140715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	167	310	200760	200903	NA	60	ACCTAAAGCACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYNYGRHLWLSTLQLFPTVIPANRILLVQTLEALVLHNPLPNPRDACVDASKQSSMLASVSSGNLLETHLFLGPTPGLQIRNSRNGIQQSVLTSSPGGSDVC	200593	202990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_+_200600_203000
928961	contig_4884_pilon	-	2022	1	Intergenic	novelGene_63831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTAATGTTGCTCCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	585223	583201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4884_pilon_-_583200_585200
928962	contig_15839_pilon	-	1734	1	Intergenic	novelGene_136422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	229	840	138376	137765	NA	25	TTTCATCACTGAACTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVLLAEVIQWSLGAQCLQLPDYLPIMSPSQVSGSHFFPINILTLTSDTSRGWQLSWHYNSATLTIRLWVWFSAISALLVQEIRLSFKAQVETLRSLMWHLSFDSEALSTSPSPVCLLKVGPTNQLPYTSHSDKTVERYHRSVYQSLTFHQYLICWLHICIATSCHGLEVPSSLPEAESSTALRLTRLEDQFRKLILKILCL	138604	136870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15839_pilon_-_136900_138600
928963	contig_10225_pilon	+	2362	12	Intergenic	novelGene_86802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	601.774813048731	1	92	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1176	2246	45262	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20684	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20926_35632_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45263_46116_46608_47057
928964	contig_20527_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_138622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTCAACGGCAGTAGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28942	27662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_27700_28900
928965	contig_9462_pilon	-	1694	1	Intergenic	novelGene_179128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGACTATGGACCTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10282	8588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9462_pilon_-_8600_10300
928967	contig_6710_pilon	-	526	1	Intergenic	novelGene_93779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	421	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	3	320	653879	653562	NA	5	ACCTGTGGTTTTGCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	653881	653355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653400_653900
928968	contig_5020_pilon	+	1714	7	Intergenic	novelGene_27863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_4	394.752841098776	9	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	630	1400	123186	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118466	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
928969	contig_8538_pilon	+	1772	1	Intergenic	novelGene_4617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACCCTGCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725753	727525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_725800_727500
928970	contig_10990_pilon	-	959	2	Intergenic	novelGene_7515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGGGGCTTTCCTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753010	752010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_752143_752183
928971	contig_13172_pilon	-	3442	3	Intergenic	novelGene_146309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	876	1184	11255	10947	TRUE	10	CGTCAGGGCATTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPETLVATALHPGIQYLRKFGSVCGASMTFPCANCAVFSGIVYCLTFHQSYHLSIVCLVPPPFPSIVTNKDHFFLCVNFYMRFYCRGLMQYLSFCD	12130	3514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_3574_3635_4884_9995
928972	contig_405_pilon	-	689	1	Intergenic	novelGene_135324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATCATACATGAAGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534379	533690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_405_pilon_-_533700_534400
928973	contig_9646_pilon	+	2294	1	Intergenic	novelGene_117465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	131	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTTTATCCTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346876	349170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_346900_349200
928974	contig_15449_pilon	+	2566	14	Intergenic	novelGene_33599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	608.511093965665	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	81	1880	37805	54621	FALSE	30	ATTAATTTCTTGAGATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEIYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	37724	55307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_38069_43216_43279_44271_44314_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47318_48296_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
928975	contig_7022_pilon	+	672	1	Intergenic	novelGene_142138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGTCCTCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102895	103567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_+_102900_103600
928976	contig_10466_pilon	-	1364	1	Intergenic	novelGene_173618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACGACCCCATGTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53420	52056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10466_pilon_-_52100_53400
928977	contig_7753_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_41470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	112	462	570473	570123	NA	25	TTTTTTTTTAACACTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFISCLVLNQNLESHPRICPLLLVDHQVLSVLLVSSLESARFQHALSIPATPPYSTYKLPFWGCLLYALIISHPANSEPSLLHILSLGALSTYRSSFFKVLLFLKCRFDNGHFSV	570584	568482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_568500_570600
928978	contig_6873_pilon	-	2021	1	Intergenic	novelGene_129828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAGAATAAGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470403	468382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_468400_470400
928980	contig_1856_pilon	-	2562	13	Intergenic	novelGene_84894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	18.6508489529744	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	10	1515	493965	455300	TRUE	85	AAGTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDEMVLTGLIRKLGHQLTEIRERALRNILCKIEHHLICYADLIQERLLFLHLLEWFNFPSVPMKEEVLNLLNSLVKYPSAVQHLVDLGAVEFLSKLRSNVEPNLQAAIDGILDGLFILPSEVPTLHSTSSQANPTDFSQEPEILTGYFPQDKSNFQQTEVPPRPVVNWTVKCLKFSAFPWLPLTTTDRHVLSSNESSLRSNNHTLIWNTCELLKDVIMQDFPAEIFLQRPKIVQGLLSLLKLAFGGDGKHRLALQSMSCLQQLCTNLRNRLNFHRDPGFFSSKQDTVSQNSSLSYCHEARGTHHSQNASPGSSSPRPSVVGRTGQRPRGDGQDWDAVSSSGSSSHAHVNSRMSVPSPLDVGHVDLPELGAEDTLGLQLQQLSLPQFCVSVLESAVPLLRTGSRQMIIRVLELLAEDMILIGDAVSADIWDDSSLFAIDMKEKLLTVFESLGETMSHHKSSASWEQPEAMLVHHRMAFVSISLFTVRLLQTLLPVEKLLWPIWNS	493974	452832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_453788_455207_455327_466419_466591_474892_475009_478430_478613_481399_481566_483809_483961_484876_484992_486733_486825_487623_487714_490000_490179_493409_493598_493934
928981	contig_11448_pilon	-	3380	1	Intergenic	novelGene_66412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAGTTAGAAAACCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	530916	527536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11448_pilon_-_527500_530900
928982	contig_1836_pilon	+	2614	3	Intergenic	novelGene_71043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACATACACACAAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700319	704490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_702411_703093_703197_704070
928983	contig_5698_pilon	+	2177	7	Intergenic	novelGene_55012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	836.726491885026	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	20	679	4103	19370	FALSE	25	ATATACCTGTTTTGTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAQYNMDQFTPVKIEGYGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	4083	20868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4139_7835_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
928984	contig_12624_pilon	+	1260	9	Intergenic	novelGene_60962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	17	junction_6	415.304688602236	1	39	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	83	535	11640	46691	TRUE	25	GGAAAACTCTTCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDGRKRTDCPANSGRLTRETRTRSGRTMASSKKKLEGLVAATITPMTENGLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEYL	6124	55584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6200_11632_11708_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_46682_46768_50396_50437_54975
928985	contig_4426_pilon	-	1760	1	Intergenic	novelGene_15394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGAAAAAGATAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494385	492625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_492600_494400
928986	contig_5375_pilon	+	346	1	Intergenic	novelGene_169232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCTATTGTTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174046	174392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5375_pilon_+_174000_174400
928987	contig_7410_pilon	+	2804	7	Intergenic	novelGene_106093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	286.76495408067	1	128	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	102	515	405351	407457	TRUE	55	AAAAACAATCCTAATACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRYGRYGGETKVYVGNLGTGAGKGELERAFSYYGPLRTVWIARNPPGFAFVEFEDPRDAEDAVRGLDGKVICGSRVRVELSTGMPRRSRFDRPPARRPFDPNDRCYECGEKGHYAYDCHRYSRRRRSRFLRLSQSP	405249	413518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_405379_406602_406784_407069_407247_407429_407879_408138_408214_408298_408414_411840
928988	contig_7513_pilon	+	1293	1	Intergenic	novelGene_88982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCAAAGAGCTGAAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305114	306407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_305100_306400
928989	contig_15518_pilon	+	868	3	Intergenic	novelGene_127603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	258	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	3	485	11052	37386	TRUE	60	TCAAAAAAGAAAAATTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11049	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_37273_37389_38035
928990	contig_4151_pilon	+	1739	2	Intergenic	novelGene_65237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	165	665	663144	663644	FALSE	40	AGAATATTTACATTTTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	528880	664718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_528989_663087
928991	contig_5832_pilon	+	6889	27	Intergenic	novelGene_134138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_10	67.6328847572815	299	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1422	4269	49	4317	229618	269157	FALSE	55	ATAAAAAGAGTACAATTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPVPTIKEKYPVLKDVMDFIKDQSLSHDSVVKVLSLKKAQAQSILEVLRIIQYCAESLGQPHCFHPPFILFLLELLTCQKEFTNYFGHLEGCGAELHKEIRETYYQLVLFLVKAIKGFSSLNDRSLLPALSCVQTALLHLLDMGWEPSDLAFFVDIQLPDLLMKMSQENISVHDSVISQWSEEDELADAKQNSEWMDECQDGMFEAWYEKIAQEDPEKQRKMHMFIARYCDLLNVDISCDGCDEIAPWHRYRCLQCSDMDLCKTCFLGGVTPEGHGDDHEMVNMEFACDHCQGLIIGRRMNCNVCDDFDLCYGCYAAKKYSYGHLPTHSITAHPMVTIRISDRQRLIQPYIHNYSWLLFAALALYSAHLASAEDVDGEKLDPHASSSATTLRSQCVQLVGDCLMKAHQGKGLKALALLGMLPDGESTPQNQSLPVLLPTHTSGEQLEKKAVQAAEEPSEAGAFVNCNGKGAAHKETRPLGFKETDKVDEGVSLTKDPSCQTQTVDSTADASTPPGLTEPLAKPESWTFYNSDAEDSEASSRKPVEEKAVTPSPEQVFAECSQKRILGLLAAMLPPLKSQGPTVPLIDLEHVLPLMFQVVISNAGHLNETYHLTLGLLGQLIIRLLPAEVDAAVIKVLSAKHNLFASGDSSIVPDGWKTTHLLFSLGAVCLDSRVGLDWACSMAEILRSLNSAPLWRDVIATFTDHCIKQLPFQLEHTNIFTLLVLVGFPQVLCVGTRCVYMDNANEPHNVIILKHFTEKNRAVIVDVKTRKRKTVKDYQLVQKGGEQECSDSQAQLRQYSQHFAFIASHLLQTSMDSHCPEAVEATWVLSLALKGLYKTLKAHGFEETHATFLQTDLLKLLVKKCSKGTGFSKTWLLRDLEILSIMLYSSKKEINTLTEPGDLELDEQEDKEEEVERLVSSPSETEQKKLDPLEGLDEPTRICFLMAHDALNAPLHVLRAIYELQMKRTDSFFLEVQKRFDGDELTTDERIRTLAQRWQPSKSLRLEEQSVKAVDTDMIILPCLSRPARCDQATAESNPVTQKLISSTESELQQSYAKQRRSKSAALLHKELNCKSKRAVRDYLFRVNDATAVLYARHVLASLLTEWPGHMPVSEDILELSGPAHMTYILDMFMQLEEKQQWEKILQKVLRGCQENMLGTMALAACQFMEEPGMEVQVRESKHPYNNNTNFEDKVHIPGAIYLSIKFDSQCNTEEGCDELAMSSSSDFQQDRHNFSGSQQKWKDFELPGDTLYYRFTSDMSNTEWGYKFTVTAGHLGRFQTGFEILKQMLSEDRVVPHLPLAKIWEWLVGVACRQTGHQRLKAIHLLLKIVRCCTHRDLCDLALLKPLWKLFTHMEYSLFEDVTQPGILLPLHRALTELFFVTENRAQELGLLQDYLLALTTDDHLLRCAAQALQNIAAISLAINYPNKATVLWNVEC	229569	271729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5832_pilon_+_229656_230339_230505_231108_231229_231960_232123_233704_233835_235497_235637_237542_237709_238009_238273_239193_239364_243638_243790_245154_245337_246804_247086_247767_247943_248489_248623_250921_251122_253270_253391_254717_254910_255752_255854_257370_257507_257597_257958_259490_259635_261151_261321_261494_261594_262052_262219_266355_266510_267125_267198_269076
928992	contig_859_pilon	-	1561	2	Intergenic	novelGene_132815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTGTGGCCTTATAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141049	55943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_-_56488_140032
928993	contig_7362_pilon	-	2636	2	Intergenic	novelGene_147553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	46	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	432	2205	2636	375934	375503	FALSE	15	CTGTCTGACTTCTAAGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERFFPKEGIFDPSSKPYTSTYLLLIQGCFSLVMGGHVDSLAMALSRCRKCASRAPLHACLTAHPELIRPEGLRLSPGQDWQLLAASEPSLPPPATESSSSTLPLMFSAPKLPNIINSLVFSGLCCKRVHWKCLTTPPSWPCL	378193	375502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7362_pilon_-_377870_377924
928994	contig_5686_pilon	+	6202	2	Intergenic	novelGene_45363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	4936	5280	136974	137318	FALSE	85	AAAACTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPHSLFLTSAFQSYASVSGRGASITSGILAAEVCGKCFQLPSLSIRKAPCIGGLELMLTANQVYPVQLPWEVMGSVGSHRCMHGTQLSFSEGWWHVAEQKWMPEIFRKFKKCC	130688	138240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_134705_136054
928995	contig_4426_pilon	-	976	1	Intergenic	novelGene_15372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCAGGCCTTAGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155323	154347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_154300_155300
928997	contig_17464_pilon	+	2111	1	Intergenic	novelGene_178511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	80	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATGTTCAGAAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28692	30803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17464_pilon_+_28700_30800
928998	contig_12654_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_129268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAGAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184472	185702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_184500_185700
928999	contig_2114_pilon	-	2326	1	Intergenic	novelGene_104279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	622800	620474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_-_620500_622800
929000	scaffold_880_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_121485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGGAGGAGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498374	496461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_-_496500_498400
929001	contig_10795_pilon	+	1129	2	Intergenic	novelGene_171293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCAGTTTTTCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214779	215963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10795_pilon_+_214906_214960
929002	contig_14744_pilon	-	1560	5	Intergenic	novelGene_66002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	526.110432799047	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	72	581	969897	968300	TRUE	15	CCATTTATTGGGTGTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969968	960498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960997_964235_964332_966278_966333_967968_968630_969717
929003	contig_12644_pilon	-	1799	1	Intergenic	novelGene_44586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGAGCAGGTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2104453	2102654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_2102700_2104500
929004	contig_6137_pilon	+	3618	14	Intergenic	novelGene_59222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1260.78529580979	1	126	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	1359	2501	1313581	1345111	TRUE	65	GAAAAAAAAAAGTACCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYEVFMHFNLKLMLLLLIFFPPHSMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKKVKLLLTMDNLESTVNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLFFLIHNSSHQKQNKTHHQ	1312222	1354118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1321460_1321507_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1345051_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
929005	contig_6102_pilon	+	1759	9	Intergenic	novelGene_31930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_2	308.05212119867	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	162	1013	380930	394507	FALSE	25	TACTCAAACCAGCTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	380768	395253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
929006	contig_12629_pilon	+	1650	1	Intergenic	novelGene_150650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGTAAACTCTTAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103842	105492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12629_pilon_+_103800_105500
929008	contig_1452_pilon	+	1949	4	Intergenic	novelGene_115158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGAGAGACGAAAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698306	715442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_698651_698708_699951_700536_700690_715232
929009	contig_10494_pilon	-	5027	1	Intergenic	novelGene_102233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGGACCTGCAATAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1269183	1264156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10494_pilon_-_1264200_1269200
929010	contig_10331_pilon	+	1739	16	Intergenic	novelGene_54137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	339.455537916562	1	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	615	1125	1739	538112	546368	FALSE	55	TCAGAAGAAAATGAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKKKRRIIAVKKEEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRAINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIEEEGNIILKEEEPVEDDIERKENIKPSLGSKKNLLESVPTQSDQEKEVIMKK	409524	546368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514582_520528_520621_528506_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538151_541971_542045_543774_543864_544890_544989_545719_545964_546296
929011	contig_19459_pilon	-	650	6	Intergenic	novelGene_59897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9628	junction_4	6441.90786646316	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	345	650	11335	7039	FALSE	30	CCTCTGAAGGGCAGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQ	15638	7038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503
929012	contig_9888_pilon	+	1830	2	Intergenic	novelGene_162271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCATCATTTCTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207108	211083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9888_pilon_+_208307_210451
929013	contig_7151_pilon	+	840	4	Intergenic	novelGene_40788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	206	544	529081	536486	TRUE	25	TGTCTAGTGGCTGAGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQHAFSILVTDTCTSCPSLMGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFIFDFSLMHVSMLWYSGNLNTLVPLLQRRNL	528875	551199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529327_536393_536490_549638_549729_550996
929014	contig_12297_pilon	-	918	1	Intergenic	novelGene_161384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAATTGTTCTGTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775913	774995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_775000_775900
929015	contig_1301_pilon	-	1157	3	Intergenic	novelGene_47369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TACAAAAAAAAACAACAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598249	595263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_595837_595965_596224_597923
929016	contig_1939_pilon	-	1170	1	Intergenic	novelGene_144896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGTTGAGAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020505	1019335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_-_1019300_1020500
929018	contig_6050_pilon	-	1551	1	Intergenic	novelGene_123116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGAGTGATGAGGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	359242	357691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_357700_359200
929019	contig_9363_pilon	-	1533	1	Intergenic	novelGene_6479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	54	326	345302	345030	NA	40	ACAATAATTTATGTTCTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EELKEKFKPQVAILKDSMGKILHDAGNIRRWKVYTASYSTKPLIDVQPFQEVAYDKKAMVLKEEVQAALRALVKNKAPGIEILCTYIITIAYFKFFPYLYCSSLVPL	345355	343822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_343800_345400
929020	contig_12079_pilon	-	2043	4	Intergenic	novelGene_67549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	496.021728914728	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	185	1819	868372	861365	FALSE	30	ATGTGTTTATGTGGACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQIDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	868556	861140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862633_866570_866650_867247_867410_868246
929021	contig_5451_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_167190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAAGGATCCCTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	748507	746769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_746800_748500
929023	contig_4962_pilon	-	2518	4	Intergenic	novelGene_107391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	7.25718035235908	32	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	359	1063	439967	416338	FALSE	15	ATCCACTTGTGGTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIYPLAVPKGRRLCCEVCEAPAKRVCTACTVTYYCGVVHQRADWGSIHEKICQLLIPLRTSMPFYNSEEERQHGLQQLQQRQKHLIEFCYTVAQKYLFEGKHEEAVPAALHSLRFRMNVYGLSSVELVPAYLLLSEASLGLGRIVQAEEYLSQAQWTVLKSTECCYATHSLLHRNLGLLYMAKENYEEARYHLANDVNKLNVNTSMFLRTALFSLVFVLFLQSIPLKLSVCK	440325	414882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4962_pilon_-_416619_426758_426931_427777_427920_439857
929024	contig_2450_pilon	-	5791	3	Intergenic	novelGene_160302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	43	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAGGAAAAAAAAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428765	421811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_-_427031_427209_427394_428377
929025	contig_19775_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_147751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATTGCTTAGCACCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212072	209434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_-_209400_212100
929026	contig_10496_pilon	+	1193	1	Intergenic	novelGene_59442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAACTACAACAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202421	203614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_+_202400_203600
929027	contig_2100_pilon	+	1641	13	Intergenic	novelGene_50667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACGCGAGGGTTAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169918	1185471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170143_1170215_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169_1173374_1174204_1174403_1175562_1175785_1176282_1176418_1176765_1176836_1178767_1178825_1180187_1180284_1182725_1182824_1185422
929028	contig_12050_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_62753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCTACAGCCGAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	708541	707504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_707500_708500
929029	contig_5928_pilon	+	2945	1	Intergenic	novelGene_40363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191977	194922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_192000_194900
929030	contig_6277_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_80403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGACCCACCTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	544261	542168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6277_pilon_-_542200_544300
929031	contig_4908_pilon	+	2196	1	Intergenic	novelGene_117382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACCCACATCTTTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228921	231117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_228900_231100
929032	contig_10861_pilon	+	1709	3	Intergenic	novelGene_39264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	270	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGTTAAAAAGAAATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1337587	1341419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_1337768_1339483_1339649_1340055
929033	contig_10446_pilon	+	2006	1	Intergenic	novelGene_162443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACAATAAAATGCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193705	195711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10446_pilon_+_193700_195700
929034	contig_7398_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_166169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCCTTTTACACAACATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179771	181243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_179800_181200
929035	contig_12605_pilon	+	1228	5	Intergenic	novelGene_64214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	9	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	519	710	1228	5156	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQTPEYRFPPSQGSGRGRSRPLFGESALESDSPREHAFLSETDPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3882	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5286_5728_6005_6124
929036	contig_4759_pilon	-	1827	2	Intergenic	novelGene_106320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGACTACCTGGACACCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485707	483775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4759_pilon_-_484380_484484
929037	contig_10930_pilon	+	2232	6	Intergenic	novelGene_36998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	149	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCCTTGAAGCTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267429	279162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_272833_273013_273952_274319_276717_276885_278375_278637_279049
929038	contig_4751_pilon	+	2240	1	Intergenic	novelGene_173736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1358	1792	392569	393003	NA	60	TATAATAAAATATGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHIQCQKEHLKISLKYNAVSDRIISIHLQGKPVNVTIIQIYTPTTNAKDEEIEDFYQLLQFEIDQTCNQDALIITGDWSVKFGNKEEGSVVGKHGLSDRNDARGHMIEFCKTNNLFIANTFFQQHKQTTIHVDLAGWNTQEPN	391211	393451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4751_pilon_+_391200_393500
929039	contig_361_pilon	-	2903	1	Intergenic	novelGene_166624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	348	1047	269	1315	1144158	1143112	NA	55	TGTGAATAAAACTACTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDHTFKHHISSHTGYKAYYCKGCEEACSWPSFIKPYLRTLTGEKLCKDCGEPCCSSSLTKHIRTHSRERPYECKECSKAFSQSSDLITHMRTHSGERPYVCKECGKAFSFSSSLTIHIRTHSRERPYECKECGKAFRHSSNLTIHMRTHSGERPYECKACGKAFSRSSFLCNHIKIHSGQRPYECKECGKAFKQASSLIQHRRTHSGERPYECKECGKAFSRSSHLTQHERTHSGERPYECKECGKVFGCLPYLTRHMRTHSGERPYVCNECGKSYSRSSTLSYHIRTHTGERPFACKECGKAFTCFSRLTAHVRTHSGERPYECIQCGKAFSCFSQLTRHMRTHNGERPYECKECGKAFSQSSTLSGHIRTHSGERPYECKECGKAFNHSSYLTIHKRAHTGDRPYVCKQCEKAFSRSSQLTRHMRSHSGERPYEC	1144426	1141523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1141500_1144400
929040	contig_14838_pilon	-	3257	2	Intergenic	novelGene_151902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	129	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1648	2109	58147	57551	FALSE	60	GAAGTACAATAAGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRVCREIRTLTHCWWECKMIQPFWKMTWRFLRKLEIDIPFHPAIPLLGIYPREIRVVTRVDICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWIKFCMRPLL	59794	56402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_-_57576_57710
929041	contig_13118_pilon	-	1949	1	Intergenic	novelGene_177561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAAGGCATCTCTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12292	10343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13118_pilon_-_10300_12300
929042	contig_12046_pilon	+	1398	9	Intergenic	novelGene_83459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAACATTCGGCTGCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220396	247004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_220554_222208_222373_224134_224374_225036_225204_236007_236168_239279_239424_240975_241094_241177_241283_246860
929043	contig_7138_pilon	-	796	1	Intergenic	novelGene_120974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92668	91872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_-_91900_92700
929044	contig_6159_pilon	-	812	1	Intergenic	novelGene_128255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	147	444	323	766	216816	216373	NA	55	CCTTGAAGGAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHRSRIQAVEVRISETEDKALETNLFEETSDKTVLKNEETLRIMWESIKRNNLRVIGVPEQSGITENTERIVEDFFAENFPDTVKDDKIPIQGSHQTPRKVDPKRKSPRHFIIKLTKTKDKERILRAARDKRKVIYKAELRINSD	217138	216326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_216300_217100
929045	contig_854_pilon	-	3004	14	Intergenic	novelGene_36691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.13175484008477	1	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	1876	2889	1710643	1704922	TRUE	5	CACTTTCTTCCGTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMDTLADIVLGAHEVLHLRAELLVEPLQLCLLLHGLLQGPGQRQRLGLLLSGLCLGPVTLLCILGRDGLLLCQELVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHHHTWACRVAICFSRFCLASSSSSSCSLKEFFSSSICRAEGARHCPIPECPAAGTPERRSPLSACWTCCQTD	1716004	1704601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704687_1704891_1705032_1705340_1705447_1706757_1706994_1709118_1709338_1709641_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856
929046	contig_13067_pilon	-	2197	1	Intergenic	novelGene_141341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCATCACATCAAACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44152	41955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13067_pilon_-_42000_44200
929047	contig_20596_pilon	+	3705	2	Intergenic	novelGene_157237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1974	2273	93625	93924	TRUE	55	CAACAACAACAATTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSIFTPEFRDHLKNRFDAFNTNNQRSDELWNDIKDIIHKESKRSLKRQDRKNRPKWMSEETLKLALERRAAKAKGKNDEELNRRYQRVAREDKVKVV	91651	95676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_94308_94627
929048	contig_13863_pilon	+	1208	7	Intergenic	novelGene_42038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1303	junction_2	655.848475047569	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	102	689	99260	114124	TRUE	55	TGTGAAGAAAAACAAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGA	99158	116366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114325_115313_115381_116114
929049	contig_19402_pilon	-	2223	13	Intergenic	novelGene_80819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTTATCTTTGTAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146717	79192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_79278_81347_81452_83578_83748_97643_97799_102161_102225_107509_107689_109781_109815_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144335_146234
929050	contig_11293_pilon	-	747	1	Intergenic	novelGene_134681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGATGCTATTGAGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132512	131765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_-_131800_132500
929051	contig_9706_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_20777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	88	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTCGTTAATACCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266	690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_300_700
929052	contig_19459_pilon	-	1176	8	Intergenic	novelGene_59875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	60	845	16240	7003	FALSE	10	TCCTGTCTTCTTGTATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	19023	6671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
929053	contig_6710_pilon	-	1173	1	Intergenic	novelGene_98345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAGAAAAAAGAATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657824	656651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_656700_657800
929054	contig_9297_pilon	+	2241	8	Intergenic	novelGene_69881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	367.492162904079	3	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	717	1895	910891	912790	FALSE	20	CTGGTCTAATTTTTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEDETADKDEL	909256	913136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910612_910709_911101_911207_911446_911700_911869_912227
929055	contig_361_pilon	-	1261	1	Intergenic	novelGene_166623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGAGGGTAGAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1110350	1109089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_-_1109100_1110400
929056	contig_10904_pilon	+	1686	1	Intergenic	novelGene_22506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATATTGTATGATCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331441	333127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_331400_333100
929057	contig_14665_pilon	-	2770	4	Intergenic	novelGene_171039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	182	junction_2	101.141265344841	10	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1907	2293	34686	32580	FALSE	5	GTTGTCGTTGTTACGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPSKPQPPARPPPPVFPANRAPSAAAPAPAPAPAPVATGTAASAPSQTPGSAPAPQAQGPPYPTYPGYPGYCQMPMPMGYNPYAYGQYSMPYPPVYHQSPGQAPYLGGQQPSYPFPQPPQQSYYPQQ	40227	32102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14665_pilon_-_32755_33687_33894_34680_34805_38439
929058	contig_16535_pilon	+	3103	1	Intergenic	novelGene_167722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	2727	3101	426340	426714	NA	35	TAGACTTAAGTCCCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSEVKVRALMGKKWDPETWDGEIWAGNQEAGGTEPLNCVESLLSTEQGLSLPTEEITPSLSAKLPSPVKPLVPPPPSDEVNPAVSEEPLSESLPGASPEVHSSQDIPKCSQNTSSLPILASRPI	423613	426716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_423600_426700
929059	contig_11422_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_99039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1684	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1700
929060	contig_11338_pilon	-	1418	9	Intergenic	novelGene_6361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.965387637965	33	13	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	300	797	319426	298788	TRUE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKPAGPGAIQEMVHRD	323315	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298832_315291_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
929061	contig_854_pilon	+	1563	8	Intergenic	novelGene_36216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2559.27547942613	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	120	578	543600	560639	TRUE	20	CTTCAGGTGCAGCTTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDRWRD	543480	563800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557597_557752_560622_560721_562271_562405_563029
929062	contig_14536_pilon	+	2746	6	Intergenic	novelGene_69314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCTTCCTAGGCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227017	402265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_+_228468_261005_261226_362671_362815_363495_363681_401463_402004_402057
929063	contig_5020_pilon	+	1361	8	Intergenic	novelGene_27834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1115.1883706535	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	150	551	119485	123416	TRUE	15	CCCAAGCCCCCAGTCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENQRDQIKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEREYGAGPYAPWPFLCAD	118462	125994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119507_122924_123041_123152_123446_124201_124363_124444_124547_124909_125091_125657
929064	contig_14362_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_142509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACGAATTTGCTCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11348	12216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14362_pilon_+_11300_12200
929065	contig_9988_pilon	+	2308	1	Intergenic	novelGene_113051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55825	58133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_+_55800_58100
929066	contig_15327_pilon	-	2206	13	Intergenic	novelGene_70762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.1669816408259	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	14	1264	1169101	1135719	TRUE	25	AGACTCTGTCCAGTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAEKQVPGGSGGGGSGGSGGGRGAGGEENKENERPSAGSKANKEFGDSLSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLILMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLAGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYSQRVEEISPNIRYCAYNIGDQSAINELMQMRLRSGGTEGLLAEKLEALISQTRAKQAATMSEVLWRGRTVPVKIDKVRIFLLGLADNEEAITQAESEETKERLFESMLSECRDAIQAVREELEPDQKQRDYSLDGESAKVSNLQYLHSYLTYIKLSTAIKRNENMAKGLQKALLQQQPEDDSKRSPPGPRT	1169114	1129698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1135053_1135149_1135692_1135852_1137313_1137379_1138467_1138567_1149210_1149352_1153213_1153297_1153707_1153818_1154609_1154693_1155472_1155669_1157798_1157913_1167375_1167443_1168941
929068	contig_17144_pilon	-	2069	10	Intergenic	novelGene_29549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1859.27369995868	9	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	575	1728	77	1804	179764	166363	FALSE	15	TCTTAAACTGTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181849	166097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_172568_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
929069	contig_9482_pilon	-	3232	6	Intergenic	novelGene_44332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCGGCCACTTAAACACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1275879	1253582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1253611_1259502_1259789_1262354_1262491_1264831_1264884_1272799_1274523_1274872
929070	contig_5649_pilon	-	1106	1	Intergenic	novelGene_82422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCAACAACAACAACAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1368756	1367650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1367600_1368800
929071	contig_5794_pilon	-	2200	8	Intergenic	novelGene_69807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	4794.30798564553	17	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	63	854	747241	745105	TRUE	50	GATAAAAAATATGTGGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPQTKRSRGFGFVTYSCVEEVDAAMCARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSVKPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEYNLRDYFEKYGKIETIEVMEDRQSGKKRGFAFVTFDDHDTVDKIVVQKYHTINGHNCEVKKALSKQEMQSAGSQRGRGGGSGNFMGRGGNFGGGGGNFGRGGNFGGRGGYGGGGGSRGSYGGGDGGYNGFGGDGGNYGGGPGYSSRGGYGGGPGYGNQGGGGYGGGGGYDGYNEGGNFGGGKLFKVLFKC	747385	743666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743765_743856_745278_746056_746135_746226_746323_746404_746495_746807_747019_747097_747245_747326
929072	contig_8552_pilon	+	736	1	Intergenic	novelGene_80114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCTGTCGAGTTGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600579	601315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_600600_601300
929073	contig_4857_pilon	-	3271	11	Intergenic	novelGene_48711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1399	junction_4	1828.26956710437	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	896	1831	1226315	1178809	FALSE	20	TCCCAAGCTTTATCATGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1227298	1177368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406
929074	contig_15491_pilon	-	2119	6	Intergenic	novelGene_75938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	326.309914038786	3	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	61	585	46982	37437	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKAASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNL	47042	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32279_37436_37560_38887_39037_40256_40317_45107_45198_46879
929075	contig_4876_pilon	+	1192	8	Intergenic	novelGene_137896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAATCCTGGTTGACATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	362300	398382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4876_pilon_+_362409_372759_372861_373083_373401_374340_374527_386279_386412_395661_395799_396689_396836_398317
929076	contig_17144_pilon	+	1510	10	Intergenic	novelGene_29566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	42	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	586	903	167621	168283	TRUE	30	TGTGGTCAGAGAGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166204	173209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166576_166750_166838_167239_167327_167580_167681_167922_168060_168162_168309_168996_169105_170751_170933_172527_172742_173130
929077	contig_2933_pilon	-	1625	1	Intergenic	novelGene_111324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	704	1081	517578	517201	NA	75	AAGAAAGAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTALGKSAAKDLFKVLKSKYVTLRTKVCLTQAVVFSIASHACESWTMSKEDQRRIDAFESWCWQRTLNIPWTAKRKNKPVLEELQPKCSLETRMARLCLIYFVRVIRRDQSLEKDIKIGKVEGQ	518281	516656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_516700_518300
929078	contig_854_pilon	-	2086	11	Intergenic	novelGene_36663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1654	1971	1710643	1709668	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRHLSNQLLLLLLALLVTAL	1716011	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699287_1709560_1709725_1709993_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715323_1715551
929080	contig_15720_pilon	-	2207	3	Intergenic	novelGene_41943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	352	888	307437	306623	TRUE	45	TGTCAGACAAAAGGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTADDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKTDKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSQLEIIQKQRLEIQKINNNISEMDSVIEGLRSRFETIEHRISETEDKHLATTLLEEKSEKEQRKKKHKVSVKTKPTKTKEMKKKIHKQKELSTEE	307788	305238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305442_305506_306719_306996
929081	contig_9233_pilon	-	1484	1	Intergenic	novelGene_78261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCATGCCCACGGTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711216	709732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_-_709700_711200
929082	contig_14405_pilon	+	3046	2	Intergenic	novelGene_85678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	496	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CGACTTGAAAAAGAAATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915569	918729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_916440_916553
929083	contig_1301_pilon	-	1727	1	Intergenic	novelGene_47367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCACCAACCTTTAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	578701	576974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_577000_578700
929084	contig_5918_pilon	+	2763	1	Intergenic	novelGene_99568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATAATGTATTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1734091	1736854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_1734100_1736900
929085	contig_6375_pilon	-	2681	7	Intergenic	novelGene_73015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	36.4451642882838	48	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	1151	1846	397099	395248	FALSE	40	ATTCATTCAACATATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHNVHNHITNDKRFNGSESIKSSWNISVVKFLLEKLKQELVTSPHNYTDKELKGACVAYFLTKRREYRNSLNPFKGLKEKEDKKLRSRRYRLFANRSSIMRHFGPEDQHLWKDVTEELMSDEEDSLNEPGVWVARPPRFRAQRLTELCYHLDANSKHGTKANRVYGPPSDRLPSAEVQLLPPELYNPNFQEEEDEGGDENGLVSPSFDQPHKTFCPDLNSFIEIKVEKDE	408303	394412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_395668_395950_396064_396709_396814_397040_397103_401503_401825_407409_407621_407688
929086	contig_16643_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_158108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATTATCGATTCATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139255	141393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16643_pilon_+_140590_141157
929087	contig_9727_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_86388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGAGAAACTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643321	641889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_641900_643300
929088	contig_19737_pilon	+	929	1	Intergenic	novelGene_158989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTTTCTGGCTGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122645	123574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_122600_123600
929089	contig_6589_pilon	+	567	7	Intergenic	novelGene_26123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3496.98848614379	12	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	89	547	1879023	1880585	FALSE	5	CCTCACTGGCCTGGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIFWRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKRKEKAKLHYRKKKQLMRLRKQAEKNVEKKINRFTEVLKTHGLLV	1878517	1880605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1878543_1878959_1879024_1879202_1879305_1879498_1879585_1879758_1879819_1880150_1880274_1880498
929090	contig_14405_pilon	-	1109	1	Intergenic	novelGene_85612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAACTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30911	29802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_-_29800_30900
929091	contig_17144_pilon	-	1971	12	Intergenic	novelGene_29543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1742.99997866318	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	226	1050	179764	167672	TRUE	15	AAACTGTTTTTTTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTEREPPYTLYHLLDQGSEAIFLHRPECLFLELCPPWPGACQLVSCSPHGHQPGRGHQQYRPHPDDLGPG	183307	166093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168218_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174962_179736_179786_181794_181850_183158
929092	contig_6217_pilon	+	5341	2	Intergenic	novelGene_109697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	172	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	4547	4909	1015061	1015423	FALSE	25	TTTTGAAATTCTGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKATSGLEEDSSTLLAEKEEDLKHLLMKIKDCCLQYGLHLNIKKTKLSTTGPISNIMINREKIDVVRDFILLGSTINAYGSSSQDIRQHIALGKSAAKDLFKLLISKGVTLRIKVRLT	1010423	1015855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_+_1014588_1014678
929094	contig_2646_pilon	+	1664	10	Intergenic	novelGene_69522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	269.434295341504	4	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	699	1265	566553	573396	FALSE	25	CTTTCTAACATATCGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEAKERANGMELDGRRIRVDFSITKRPHTPTPGIYMGRPTYGSSRRRDYYDRGYDRGYDDRDYYSRSYRGGGGGGGGWRAAQDRDQIYRRRSPSPYYSRGGYRSRSRSRSYSPRRY	554024	573795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_560336_560613_565255_565390_566428_566586_567966_568156_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
929095	contig_11364_pilon	+	2787	1	Intergenic	novelGene_65168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	2119	2496	110692	111069	NA	25	AGGGTTGCTGCGAGTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTKDQSLQYGLHLNIKKTKILTTETISNIMINGEKIEVDKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRRIAMGKSAAKHLFKVLKSKDVTLRTKVCLTQAMMFSITSYARESWTMSKEDRRRIDAFELWCW	108573	111360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11364_pilon_+_108600_111400
929096	contig_7201_pilon	-	3634	1	Intergenic	novelGene_152524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATACCCTCCCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333497	329863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_-_329900_333500
929097	contig_17198_pilon	-	1490	1	Intergenic	novelGene_62334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGAAAGCTTATACCATCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	498762	497272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_497300_498800
929098	contig_9335_pilon	-	2123	1	Intergenic	novelGene_147473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCCTTGCTATTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901890	899767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_899800_901900
929099	contig_8304_pilon	+	2400	2	Intergenic	novelGene_153160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	208	552	8959	9303	FALSE	70	CAGTAAAAAAAAAAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGPISSIIINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRHVALGKSAAKDLFKVLKSKDVTSYACKSWTMNKEDQRRIDAFELWCWQEILNIPWTAKRTNKSVLEEVQPECSLEARMARLHLTYLGHVVGRDQSLEKDIMLGKVQGHRKRGRSSTRWIDTVPATVGSSITIVSIAQDRACFVL	8703	11151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_+_8882_8929
929100	contig_14970_pilon	-	2125	10	Intergenic	novelGene_44948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1557	1871	188827	177322	TRUE	10	GCCGCCTCGGAAGTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGITTCPSMNPYLQVSNPTLRAFSICARVGSVLLKALQRSAASVREML	232242	136012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182457_188755_188830_191970_192199_213675_213891_216611_216671_221175_221261_224302_224375_231347
929102	contig_3942_pilon	+	1979	1	Intergenic	novelGene_128606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	18	338	77448	77768	NA	35	AAGGAACCATGGTGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKHLLMKIQDYSLQYGLNLNIKKIKILTTRPISNIIINGEKIEVVKDFILLGSTINPHGSSSQEIKQCIALGNSAARDLSKVLKNKDVTLKTKLCLTEAMVFSIASYARES	77430	79409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_77400_79400
929103	contig_4857_pilon	+	3639	3	Intergenic	novelGene_48794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1237173	1245130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1238717_1242189_1242269_1243113
929104	scaffold_12124_pilon	+	2374	11	Intergenic	novelGene_22337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3172.38362119085	1	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1423	2202	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483577	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508113_1508238
929105	contig_8597_pilon	+	3113	2	Intergenic	novelGene_158708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTCCCAAGGTGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76628	80032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8597_pilon_+_77038_77328
929106	contig_7051_pilon	-	2170	2	Intergenic	novelGene_64356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATTATAGTCACGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352399	325867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_326178_350539
929107	contig_3602_pilon	+	1724	3	Intergenic	novelGene_60516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2020	junction_2	294	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	766	1083	169952	170269	FALSE	20	CTCCGGCACCCAGCCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSPATLWARGTGRGLPGGRSRDRGIVVLVGFGPEGGHRARESRKLAFSYHLRGRLIVGGQGGQHSDPIGCTSETTGDWLSAVRLGGGELLSWPLCKASMPTFLK	168756	170910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_168857_169145_169282_169422
929108	contig_16496_pilon	-	1486	3	Intergenic	novelGene_5193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1033_1081_1354_3413
929109	contig_4783_pilon	-	547	1	Intergenic	novelGene_108357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	414	132	545	116924	116511	NA	60	AAATCTCAAAAGATGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKSRRYKEIKDWYKLRKIGVNIKVTTKQTNNPTSQNDKLEKYKDSANTKSTTRKKMKRKYIKKNNSAQKIKWNKENSEQHTKIDIKMTALNSYLLIITLNVNGLNAPIKRQRVADWIKKPRSSLQETHRRLKDTNR	117055	116508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_116500_117100
929110	contig_10225_pilon	-	2962	10	Intergenic	novelGene_86844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	38	319	47709	47428	TRUE	10	TTTGGGGGCCATTCTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47746	34791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39911_40139_40305_40967_41054_42607_42723_45213_45256_46107_46324_46687
929111	contig_10973_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_150375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	359	871	2730	2218	NA	40	GACGACCCACCAACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	3088	1536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_3100
929112	contig_20293_pilon	-	2490	2	Intergenic	novelGene_153536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGACTTGATTGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	126743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_126751_141187
929113	contig_854_pilon	+	1978	16	Intergenic	novelGene_36496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	2303.20734821876	11	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	175	1668	1649514	1704639	TRUE	15	TGGTGCTGCCCAGTGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREVQ	1612771	1705441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685175_1704625_1704689_1704893_1704999_1705285
929114	contig_5797_pilon	+	845	1	Intergenic	novelGene_56956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	336	653	377992	378309	NA	15	GATCGTGTTTTTTTATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILQNVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSMRSSWLIVVFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVFKSPTIIVELSISVFSAVRVLCILEPRHWVRRCLLWLCLHDGSSH	377656	378501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_377700_378500
929115	contig_21208_pilon	-	2093	2	Intergenic	novelGene_175777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	727	1062	66948	66613	FALSE	35	AAGTTTGAGATTATTTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMGVHVSIRVTALISLGYIPRSGIAGSYGTSTGSFLRKHQIDFKSGCTILHSHQQCISVPVSPKPLQHLFCVFWINASLVRVRWYLTVVLICISLKASDRKHFFMYLVAV	68138	65581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21208_pilon_-_67140_67603
929116	contig_7070_pilon	+	1369	1	Intergenic	novelGene_104051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	465	903	1367	184668	185132	NA	20	GGGGCCTCTACCCAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRQTAVYLLEFYWQKTGQRSYICCPPRKEKNHPWSSSEISKTVGRSTGSRAFSVSKCGATISWISKGRPQLPRFQRVGSLPTWFRSVGLPLKCARGMGPLPKAEGAGLPCSRGRRTGPAGVKGVGSLPRWTRRMGPPAELLSQWAWKVELKPRA	183765	185134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7070_pilon_+_183800_185100
929117	contig_5084_pilon	+	5549	32	Intergenic	novelGene_64579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	89.872623470842	152	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	908	2727	1513	4239	749074	821524	FALSE	25	TATGTACATTGGAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSAQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFMYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGVNEESCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGEPEGESQQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCTAVSGYSDQVIHQRRAAASLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAARQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASMTGSVSDTVNGLSVQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLAEFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGTPKSLHMTSSLTTDSLVRKQGKGSNPSGGR	725398	822834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5084_pilon_+_725539_728620_728732_729894_730087_735359_735414_736239_736444_739963_740160_741039_741108_741927_742138_742612_742694_743554_743649_748499_748560_748971_749115_750341_750427_751024_751143_752493_752580_755581_755750_756010_756145_757487_757556_758584_758679_759470_759643_774468_774607_779888_780115_784216_784345_793684_793780_803992_804066_811500_811660_813277_813381_814342_814432_817615_817772_818347_818508_819236_819453_821306
929118	contig_11422_pilon	-	900	1	Intergenic	novelGene_99038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26228	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1644	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1600
929119	contig_12078_pilon	-	1419	1	Intergenic	novelGene_74128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	494	1192	606875	606177	NA	50	AGGTCATTAAAAAGACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSCKHPLIIGTWNVQSMNLGKLETIKNKMEHIKINILGISQQKWTGTGHLESHNHKIYCATNDKLKRNGFTFIVKKNISRSILKYNTISDRIISIRLPGRPVNMTVIQIYTVITNAKDEEIEDFCQLLQSEIDQSCNQDALIITVDWNAKVGNKEEGWVVGNSSLGGRNYARDCLIEFCKTNNFFIANNFFYNIKDDYTCGPCWMEYTGIKSTMSVERDDGKAQYHQAK	607368	605949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_-_605900_607400
929120	contig_6578_pilon	-	1903	2	Intergenic	novelGene_162239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	600	1001	165362	164916	FALSE	20	CCTTGCAATGTGTCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGEWNAGNSGVKPVLPGQQTVATGCRGGQVGVKTGAGCERVYHWLPVVLSPAGSPVKLLSRTPVRWSLIGIRDGGSVLCQLIGDLCMYLSSLSLSLHLMLRVSGLPFSLFGLIFQIFAVAWCFCL	165961	164013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_165019_165063
929121	contig_14711_pilon	+	2250	4	Intergenic	novelGene_68927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1006	junction_3	98.4626268636425	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1291	2007	89060	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGEYGYHPVHDSAPGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	87769	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_89326_89463_89673_90032_90194_90489
929122	contig_12391_pilon	+	2917	2	Intergenic	novelGene_103591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2030	2341	125116	125427	FALSE	55	GAAGAAAGCAAAAGGTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHLVIRTWNVQSMNQGKLEVRNEMEHLNINILGISELKWTGVGHFASENHMVCCDGNDRLKRNDVAFIIKKDISRSILKYNTISDRIIHAYKEDQLI	47092	126003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_47737_123730
929124	contig_5485_pilon	-	1553	1	Intergenic	novelGene_37723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	1090	1464	242827	242453	NA	50	AAAAACCACATTGATTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQLLWITVLQVLKKLKTELPYDSAILLRDIYPKDLKAETQKETCAPMFTAALFTIAKRWKQSKCPSADEWINKMWHIYTTEYYTANRRNEVLTHATIWMELQDIMLNEISQPQKDKYCITSLT	243916	242363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_-_242400_243900
929125	contig_13300_pilon	+	2464	2	Intergenic	novelGene_125837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1394	1765	1172123	1172494	TRUE	50	ATCGATATACCAGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVVMRRTWITRTFLVGTSRGTATLEHGLVIAFKIQHAMTIQPCICTPVHLSQRKENLCSDKNLYMYVHSCFIPNSWKLLPCPSKGKWSKYRGTSTPSNTPQPYKRVNCRYARWLGWISRELC	1170729	1173498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_1172960_1173264
929126	contig_6069_pilon	-	1792	1	Intergenic	novelGene_8019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACGTATGTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112690	110898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_-_110900_112700
929127	contig_7720_pilon	-	4184	3	Intergenic	novelGene_155761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3074	3391	676311	675994	TRUE	35	AGAGCGGCGGACGAACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMHLRTEIKRLKLCCLGFPVKTKGFKCISNAKKHGCLLSAAEALLQTGAHLSQGVCYNSDTLLPRGEMGHSLVFCQVVLKQLLSIAVACASLASHLSDLDSAQE	679384	669403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_-_669601_672869_673087_675614
929128	contig_2783_pilon	-	835	1	Intergenic	novelGene_119656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACCTAAAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742010	741175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2783_pilon_-_741200_742000
929129	contig_5643_pilon	+	556	1	Intergenic	novelGene_38767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTATTGTGTGATTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	203949	204505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_203900_204500
929130	contig_13740_pilon	-	1020	7	Intergenic	novelGene_34678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_3	4523.75645589174	5	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	135	500	160838	157474	TRUE	30	ATTGTGTAATTATAGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	161127	156800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058
929131	contig_3956_pilon	+	2335	8	Intergenic	novelGene_15064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1195.85436967441	2	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	425	1276	1287527	1289956	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283818_1287424_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
929132	contig_10225_pilon	+	2236	15	Intergenic	novelGene_86808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	555.123207504608	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	86	1087	20776	42680	TRUE	20	ATCCTAGACTTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20690	47751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46290_46365_46807_47363
929133	contig_1225_pilon	+	2739	2	Intergenic	novelGene_44168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	1	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAGTTTGAAAATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250652	276774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_274222
929134	contig_5145_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_131408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGCACAATTTAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737141	739041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_737100_739000
929135	contig_14441_pilon	+	1318	6	Intergenic	novelGene_100341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	442.170826717458	69	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	730	1278	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	6204	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6425_6604_6913_121638_121691_125517_125902_126159_126283_126514
929136	contig_11720_pilon	+	1341	10	Intergenic	novelGene_43793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	245	1306	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67819	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
929137	contig_1717_pilon	-	2299	2	Intergenic	novelGene_146113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	2	116	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGCCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138310	125031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_-_126638_137617
929138	contig_7630_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_133645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACTCACAGTAGAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438395	436593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_436600_438400
929139	contig_593_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_102035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGATTTTAAATCATATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576241	577501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_+_576200_577500
929140	contig_5023_pilon	+	1869	11	Intergenic	novelGene_7270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1436.88245865833	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	74	568	607279	629214	TRUE	25	GAAGCAATCCTACTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGNW	580855	647585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607328_618524_618668_622527_622624_625648_625852_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
929141	contig_19744_pilon	+	1587	1	Intergenic	novelGene_120386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTATGTTTGAGCCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163487	165074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_163500_165100
929142	contig_6102_pilon	-	3540	26	Intergenic	novelGene_31893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.195959179422654	10	66	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGATTAGTAAGGAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395264	373402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373477_373641_373725_373902_373955_374378_374499_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375730_375966_376037_376205_376302_378885_379031_379329_379493_379624_379793_379953_380208_380317_380408_380537_380630_380897_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
929143	contig_6902_pilon	-	1663	2	Intergenic	novelGene_135563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTCTTTGCAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289224	285621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_286673_288612
929144	contig_6898_pilon	+	2529	14	Intergenic	novelGene_35714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	592	1779	125	1903	59668	127080	FALSE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQPPSPLCLVCALFLPTSISYSSGI	59543	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125620_127008
929145	contig_6847_pilon	+	3688	14	Intergenic	novelGene_143852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	245	junction_1	473.886898847614	1162	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	336	1787	77788	110600	TRUE	65	GGAAAAAACAAACTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	74043	113502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_74108_77516_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
929146	contig_7292_pilon	-	4024	19	Intergenic	novelGene_175359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	115	junction_6	91.2961535570967	21	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	30	1067	266437	156014	TRUE	30	TTCTCTCACCAATTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVLADVSYLMAMEKSKATPAARASKKIVLPEPSIRSVMQKYLEERKEITFDKIFNQKIGFLLFKDFCLNEINEAVPQVKFYEEIKEYEKLDNEEDRLCRSRQIYDTYIMKELLSCSHPFSKQAVDHVQTHLAKKQVPPTLFQPYIEEICESLRGNIFQKFMESDKFTRFCQWKNVELNIHLTMNDFSVHRIIGRGGFGEVYGCRKADTGKMYAMKCLDKKRIKMKQGETLALNERIMLSLVSTGDCPFIVCMTYAFHTPDKLCFILDLMNGGDLHYHLSQHGVFSEKEMRFYATEIILGLEHMHNRFVVYRDLKPANILLDEHGHVRISDLGLACDFSKKEAACECWHPWVHGS	266466	123192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_-_125575_128358_128522_133469_133566_134593_134661_135453_135555_136024_136092_155932_156041_161028_161125_163565_163697_166249_166329_171853_171954_176034_176127_178299_178352_180138_180201_184951_185027_187054_187157_202372_202447_241754_241832_266366
929147	contig_407_pilon	+	1087	1	Intergenic	novelGene_176521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAGGAAAAAATAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239840	240927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_407_pilon_+_239800_240900
929148	contig_4974_pilon	+	4365	2	Intergenic	novelGene_161390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	2222	2563	76650	76991	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKGHSLQYGLHLNIKKTEILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGNSSQEIKRHIALVKLAAKDLFKVLQGKDVTLKTKVRLTQAMVFSIASYACESWTMNKED	9404	78793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_11215_76238
929149	contig_4180_pilon	+	1080	6	Intergenic	novelGene_8385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1927.60622534791	3	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	229	633	875318	888172	FALSE	75	CAAAAGAAAATAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQDRVVQGAVLIVTGSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGKAPGNACDL	874314	888619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875368_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888141
929150	scaffold_15027_pilon	+	1593	14	Intergenic	novelGene_163567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_8	157.052586075172	1	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	42	129	414	542	76390	76925	TRUE	35	ACACATTGTATAGTGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKDSRPPWISRTACRTASFNIYVHAFIEFPQGSRHCRAPDIFSVQMHIIPYCHFFCVFLILLQTAIMWEHQEIKKWKRKMILTGENT	48951	102822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_66198_66324_76385_76483_76889_76970_77393_77530_81943_82059_82650_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775
929151	contig_2867_pilon	+	601	1	Intergenic	novelGene_135167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	51	156	223	378	570336	570491	NA	25	TGTTACATGTATGTTTACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNETGLWKTVWQFLKKLSIELPYNSTITSNSTCRYILKRIESSDSNRHTYTSANCKSIPNSQKVETTQVPINRRMDKQNVVHTMEYYSATKRNDILIHAMTWMNLENIMSEISQSQKDKYMILLI	570113	570714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_+_570100_570700
929152	contig_2278_pilon	-	1574	2	Intergenic	novelGene_118079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTCACATTCGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613374	611741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2278_pilon_-_611778_611836
929153	contig_1150_pilon	-	528	2	Intergenic	novelGene_61436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	8	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGGTGTGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309888	308932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
929154	contig_11258_pilon	-	2253	1	Intergenic	novelGene_67765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCCTAGTGACCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276322	274069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_274100_276300
929155	contig_3077_pilon	+	2772	5	Intergenic	novelGene_26820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1060	junction_3	301.482171943881	19	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1273	2049	476826	481662	FALSE	25	TTCAGAGATTTAACGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	475553	482385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
929156	contig_1374_pilon	-	827	2	Intergenic	novelGene_179163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAGGGACAAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51992	14132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1374_pilon_-_14413_51445
929157	contig_10980_pilon	+	981	1	Intergenic	novelGene_162568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	68	304	283007	283243	NA	65	AATTATAACAATAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICGFRCLSPPGDINLPARHRSRMIVIKSMGLVHTSHFMHILKKTFVDWHFLTLIYEKTMAILAFRIHHASASGTMCWSFWSVCFTLGDQIILFLSSLPLL	282939	283920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_282900_283900
929158	contig_1867_pilon	+	1402	6	Intergenic	novelGene_54509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5518.78245267921	5	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	137	748	213588	220943	FALSE	5	GGACTGTGTGTTGTTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAGVILGGAYLYRYFALQPDDVYYCGIKYIKDDVILNEASADAPAARYQTIEENIKIFEEDEVEFISVPVPEFADSDPANIVHDFNKKLTAYLDLNLDKCYVIPLNTSIVMPPRNLLELLINIKAGTYLPQSYLIHEHMVITDRIENVDHLGFFIYRLCHDKETYKLQRRETIRGIQKREASSCSTIRHFENKFAVETLICS	194817	221597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_194879_213512_213645_215603_215811_218786_218898_219457_219609_220857
929159	contig_13348_pilon	+	1666	1	Intergenic	novelGene_162689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	287	715	283604	284032	NA	40	AGAATTTGTAGGACATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNRASGLEEDSLTTCVMQMTILLAESEEDLKHILMKIKDYSLQYGLHLSIKKTKILTTGPISNIMINREKTEVVKDFILLGSTINTHGSSSQEIKRHAALGKSAVKDLFKVSKSKDVTLKTEVRLTQAMVFSITSHACES	283317	284983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_283300_285000
929160	contig_12425_pilon	-	2527	10	Intergenic	novelGene_46665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	399	junction_5	598.821641246115	9	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	116	1138	211174	204225	FALSE	15	TCTGGGTGCTCTCAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEIVAGIPRTDQYWKKI	226607	202835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204829_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048_211200_226517
929161	contig_3825_pilon	+	1904	1	Intergenic	novelGene_78048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	21	302	2547320	2547601	NA	45	TGTAGAGTAGCTAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLSVCPMCWPAYFCCLRLGSLEKQNEQSVKIYREISIKEMTHAVVEAGTSQAHGSGWRPLLIHTAAEAGKPKIGRSDRRALADRLRRLTNPNIGRRDGR	2547299	2549203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_2547300_2549200
929162	contig_3956_pilon	+	1487	8	Intergenic	novelGene_15083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	2	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	80	1288	1281682	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281602	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284174_1286183_1286224_1286409_1286606_1287276_1287436_1290521
929163	contig_2069_pilon	+	1316	1	Intergenic	novelGene_23560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATACTTCTGCAAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2252399	2253715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_2252400_2253700
929164	contig_19459_pilon	-	1084	8	Intergenic	novelGene_59891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_7	7391.85557052559	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	135	920	16240	7003	FALSE	40	TACTTAACTCAAATTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16680	6838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_16570
929165	contig_9363_pilon	-	1595	10	Intergenic	novelGene_6583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1152.98435096936	1	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	143	1078	786587	754313	FALSE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGDWSCDV	787908	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754336_774893_775045_776046_776192_776977_777124_777528_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541_786648_787826
929166	contig_10616_pilon	+	2964	2	Intergenic	novelGene_175609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTCCAGATATTGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1006029	1023329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10616_pilon_+_1008502_1022837
929167	contig_2100_pilon	-	1023	9	Intergenic	novelGene_50710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1019.92768585572	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	78	677	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKINKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPFAN	1185488	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170287_1173270_1173374_1174204_1174403_1175562_1175573_1176805_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
929168	contig_15047_pilon	+	1472	7	Intergenic	novelGene_52221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	5	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	12	635	2194	4178	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2182	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21013_21062_21232
929169	contig_5502_pilon	+	2283	2	Intergenic	novelGene_154987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	666	junction_1	0	42	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1285	1596	395703	398610	FALSE	25	TCTTGGTTGTCTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	394418	399297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_395841_398436
929170	contig_7976_pilon	-	3865	1	Intergenic	novelGene_169398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCCTTGGCTACCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37228	33363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_33400_37200
929171	contig_5153_pilon	+	2225	16	Intergenic	novelGene_74364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	304.648139480432	2	96	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	380	1513	1009994	1022174	FALSE	25	ATATTCTAGAATTTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956647	1022886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007947_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014975_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
929172	contig_10307_pilon	+	2201	4	Intergenic	novelGene_170271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	11.3137084989848	2	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	133	954	389628	390449	TRUE	30	TGAGCCAAATCTTAAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLNVSFANRNYDLDYDSVQPYFFDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYNLAFASFSPGGGGGGGGSFSTADQLEMVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSGKLGPSRPVKGGGWISSILLGG	387465	392557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387519_387780_387851_389618_390633_391493
929173	contig_12873_pilon	+	3525	5	Intergenic	novelGene_27196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_2	1291.44744376223	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	2622	2945	19035	19855	FALSE	15	TTTGTAGTATTATTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLVCHVFGFYPKRVWVMWMRGEQEQPGTQQGDVLPNADGTWYLQVFLNVTAMEASGLSCRVRHSSLGDQDIVLYWDHHNSMAWIILAVIVPLVLLIGFIFWFRKRC	16001	20435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12873_pilon_+_16418_16753_17021_17096_19264_19611_19703_19851
929174	contig_10627_pilon	+	2734	19	Intergenic	novelGene_59950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	113.20673757378	3	153	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	579	1613	174446	177436	TRUE	35	CACCTATGTTGTAGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRLACDFLARGGSFITKVFRSRDYQPLLWIFQQLFRRVQATKPQASRHESAEIFVVCQGFLAPDKVDSKFFDPKFAFKEVEVQAKTVTELVTKKKPKAEGYAEGDFTLYHHASVTDFLRAANPVDFLSKTSEISLDDEELAQHPATTEDVRACCQDIKVLGRKELRSLLNWRTKLRRHVAKKLKEQAKALDISLSSGEEEEEGNEEESTAGTRRQPSKEEEEEEQLNQTLAEMKAQEVAELKRKKKKLLREQRKQRERVELKMDLPGVSIADEGETGMFSLRTIRGHQLLAEVAQGDMSTADTFLSDLPSDDIYVSDAEEDDDTSLTFHPLPSGSTVCSLLK	172541	179001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_172594_172705_172801_172971_173078_173388_173436_173555_173636_174247_174627_174709_174826_174941_175047_175129_175231_175460_175542_175633_175784_175918_176055_177073_177181_177378_177538_177622_178222_178309_178410_178516_178701_178783_178879_178959
929175	contig_12081_pilon	-	937	4	Intergenic	novelGene_166985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGGCAGGTCTGCACGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18650	16472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_-_16547_16841_16992_17069_17243_18110
929176	contig_5999_pilon	-	3061	1	Intergenic	novelGene_45593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTGAGTTTCTAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6854	3793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_3800_6900
929177	contig_3747_pilon	+	2383	7	Intergenic	novelGene_24776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4393.17446601986	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	246	986	202422	203804	FALSE	25	CAAAATGTTGAGTTTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200981	205201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201194_202388_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
929178	contig_13097_pilon	+	4583	2	Intergenic	novelGene_107668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	164	98	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	725	1033	1399	1707	TRUE	25	CTGTAAGCCTTCACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTKKKLSKDTEDLKGTISQRDLIDIYRTLHPTSAKYTFFSNAHGTFSRIDHILDHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKTFLESNEKENTSYQNLWDTAKVVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTQLKQIEREQQKKPTTTGRQEIVKIRAEINEIEKRTTIERINKTKSWFFERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDVENLNRPITREEIEKVIKNSQPEKALAQMASLENSTKHLQKGLYQYYSSYFRA	674	19971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_4273_18986
929179	contig_12624_pilon	+	1318	11	Intergenic	novelGene_60945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_10	292.120540188464	3	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	84	782	11640	53324	TRUE	15	ATCTTGATTTCTGCTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSKKKLEGLVAATITPMTENGLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLVYYSKRMQSRTSQRERHIRQGLRGSQT	6018	55492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_53241_53344_54975
929180	contig_10042_pilon	-	1002	2	Intergenic	novelGene_79258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGGCTTCCTTATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1264183	1261225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_-_1261637_1263592
929181	contig_5727_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_7994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTGCTCAGCATACAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568148	566455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_-_566500_568100
929182	contig_2054_pilon	+	1182	1	Intergenic	novelGene_51685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACTGAACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122988	124170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2054_pilon_+_123000_124200
929183	contig_4782_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_73627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTGAGGAAAAATCACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251485	253696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_251500_253700
929184	contig_17066_pilon	-	4204	2	Intergenic	novelGene_130964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	93	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCCCGGAAGTCCCAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	414269	409711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17066_pilon_-_412589_412942
929185	contig_9833_pilon	+	4496	5	Intergenic	novelGene_68478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	441	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	3593	4105	216973	217485	TRUE	40	ATTGCAACTACAACATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASVGWCFWTRDCVRGNRGGRVWVKKGKEWESVYHKMLELCSPSGRSKNGTQSEVLELKEGEVGRGKEEIKRSRKKATPAAHRWYSREPPVRVCGIQAAAVSQSRDCGRGKQRRPSRGEEGWGVGKRISPITSCFVSHWKLCEAAFSYPVCWSPIGVRDGGSALR	92045	221902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_92057_99170_99178_213017_213180_213560_217711_221736
929186	contig_15236_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_141560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTAGCTCTTAACCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	342361	341377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_341400_342400
929187	contig_13941_pilon	+	5496	7	Intergenic	novelGene_174659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCTTCCTGCTGAACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58593	81735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13941_pilon_+_62402_71896_72055_73175_73406_75444_75608_76586_76768_80056_80673_81395
929188	contig_5302_pilon	+	1987	1	Intergenic	novelGene_81533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	238	612	1563587	1563961	NA	45	TAATTTAAATCAACACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLRYGLHHNMKKTKILTTGPVNNVMINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGSSSQIKRCVALGISAAKDVFKLLKSKDVTLKTKVCLTKAMMFSVASYAWENWTVNREDRRRIDTLELWCW	1563349	1565336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_1563300_1565300
929189	contig_17144_pilon	-	2853	18	Intergenic	novelGene_29298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2266.93001099295	13	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	450	1353	137	1489	179764	170838	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRAEILTASGWAGTPPAPSLRPT	183218	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_166413_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170903_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181790_181846_183158
929190	contig_3787_pilon	+	754	1	Intergenic	novelGene_102350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGAATTCAAAATATACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31415	32169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_31400_32200
929191	contig_5280_pilon	-	3013	2	Intergenic	novelGene_52630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTCATAAGCAGAAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57875	46151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_47506_56216
929192	contig_1154_pilon	-	1331	1	Intergenic	novelGene_87048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAGTTTGAAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83896	82565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_-_82600_83900
929193	contig_8238_pilon	-	2724	1	Intergenic	novelGene_165236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	624	1073	63376	62927	NA	60	AATAATGTTGACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNSAASVKSRWKEYTESLYQKQLVDVQPFQEVAYIQELMVQKEEVQAALKAKTKLQELTEYQLGCFSKWMQRWKWSLVNVKKFGRQLPGQLTGRDPYLCPSQRKVIHKECGNYRTVSLLSQTSKILLKIIQKQLQQYIDRELLEI	63999	61275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8238_pilon_-_61300_64000
929194	contig_15063_pilon	+	4066	5	Intergenic	novelGene_13864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	191	junction_4	3352.29417712706	7	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	200	1372	34808	36661	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34608	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266_39092_39506
929195	contig_1008_pilon	-	2294	1	Intergenic	novelGene_121567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTGCCTTGTGTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	604120	601826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_601800_604100
929196	contig_5125_pilon	+	2279	8	Intergenic	novelGene_43410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1567.97152202377	2	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	190	1185	35654	58893	FALSE	20	TAATGTTTGTATCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25703	59987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_25850_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_58544_58681
929197	contig_14838_pilon	+	2820	1	Intergenic	novelGene_151903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1170	1490	57798	58118	NA	50	GAAAAAAAAATCCTGTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRVTTLISLGYIPRSGIAGWNGMSISSFLRKRHVIFQNGCIILHSHQQCVRVLISLQTLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	56628	59448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14838_pilon_+_56600_59400
929198	contig_13863_pilon	+	2187	21	Intergenic	novelGene_41986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	151	junction_1	401.154508886539	8	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	591	1776	282	2057	55383	81541	FALSE	20	TGGTGGTGTTATTTTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRLATAMAGKTDRKEFVRKKTKMNPFSSSTNKEKKKQKNFMMMRYSQNVRSKNKRSFREKQLALRDALLKKRKRMK	55005	81671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55286_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76262_77545_77708_81493
929199	contig_6954_pilon	-	1813	2	Intergenic	novelGene_64421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	65	772	97100	95509	FALSE	65	CTAAAGCACAATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTKKTTRYCKKPKETYVKWKNMSSSWIGRLNIVKMSILPKAINRYNAILIQIPPALFNDTEKQITNFIWKGKRPWISKALLKKTNKVGGLTLPDFRTYYTAMVVKAAWYWYNNRYTDQWNRIENPDINSSTYEQLIFDKGPKSINWGKDSLFNKWCWYNWISICKKMKQDPYLTPYTKTNSKCIKDLNIKSKTIKIMEEKIETTLGALIHGIYRIYTITNNAQTPKEKLDNWEHLKIKHLCSSKDFTKTVKRQPTD	97164	94467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6954_pilon_-_95547_96430
929200	contig_19899_pilon	+	2499	1	Intergenic	novelGene_102539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAGAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420041	422540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19899_pilon_+_420000_422500
929201	contig_17549_pilon	-	1925	2	Intergenic	novelGene_162606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1248	1715	401335	400868	TRUE	40	TGAATGGATGCAGGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAADRHMRKCSQSLAIREMQIKITMRYHLTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETKTLIRCWRECKMAQPLWKSIWHFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIRAVTQIDIRTLMFIAALFMIAKRWKQPRYPSMDEWINKLRYIHTVE	402582	400229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17549_pilon_-_400341_400768
929203	contig_8552_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_80077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	467	junction_1	0	13	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGACGGGATGGTTCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467450	471263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_467740_469380
929204	contig_3956_pilon	+	1809	10	Intergenic	novelGene_14863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1346.98289283133	8	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	401	1206	84	1289	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGISLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286416_1290441
929205	contig_8461_pilon	+	424	1	Intergenic	novelGene_163927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400783	401207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8461_pilon_+_400800_401200
929206	contig_10973_pilon	+	1956	1	Intergenic	novelGene_150341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCCGATGAACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1047	3003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1000_3000
929207	contig_7179_pilon	-	1913	1	Intergenic	novelGene_78079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTTTTTTAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533774	531861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_531900_533800
929208	contig_6510_pilon	+	1808	1	Intergenic	novelGene_173521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AATAAATTAAAAAAAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206425	208233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6510_pilon_+_206400_208200
929209	contig_3956_pilon	+	2917	14	Intergenic	novelGene_14996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1055.251309141	17	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1022	2398	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285112_1286168_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929210	contig_8898_pilon	-	1973	3	Intergenic	novelGene_137226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACCTCCATGGCCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149982	134479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_-_134817_136767_136956_148534
929211	contig_10500_pilon	-	4063	7	Intergenic	novelGene_41244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	144	junction_4	744.860035323565	9	151	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	182	583	1640040	1635136	TRUE	30	TATTATGATATATCTTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKDE	1640221	1626427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635145_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
929212	contig_13021_pilon	+	2022	3	Intergenic	novelGene_8220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1990.5	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1333	1719	180464	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	178850	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_179326_179376_180211_180440
929213	contig_3747_pilon	+	2537	9	Intergenic	novelGene_24802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4648.37769919517	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	228	1142	201481	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGKKPTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201145_201414_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202752_202975_203128_203228_203386_203498_203651_203768
929214	contig_14030_pilon	-	1390	1	Intergenic	novelGene_62246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATGTATCTTACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371928	370538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_-_370500_371900
929215	contig_1433_pilon	+	2804	3	Intergenic	novelGene_178604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGTTGAGAAGTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83431	178984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1433_pilon_+_84182_166321_166742_177350
929216	contig_9698_pilon	-	2423	4	Intergenic	novelGene_82502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1114	1488	254947	239193	FALSE	15	TATTTCTTGGGACTCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTSFRNVQYYPWPEFQQPSSCAHSCQPCSPLICLHVAVSNLHSKCKSNDVTPFISLQLLSRTISVVQQSKMFEHFAFLHSFSFLALQVVLETWLFLPEAFLEVQQLNLKTLLWQIQWQDFFAN	263061	238257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_-_239206_254499_254667_254752_255883_262883
929217	contig_14666_pilon	+	1287	1	Intergenic	novelGene_39631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	335	1008	4	1011	483933	484940	NA	35	AAGTGCTCCCTTTATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	483929	485216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_483900_485200
929218	contig_16666_pilon	-	2210	3	Intergenic	novelGene_61772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	1147	2088	117829	116888	TRUE	15	TTTCCCTCGCTCTGAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVDRTTTQDGQALPVQVVQVSSELFSSKHIDQGIEATVAKCNRLGHAEGQPQVFLHVTAGKEAEEFERLQENHDVVGRPEEEKHDNHQKDQFNGSSFLAVLAGKQRPDDPEVTVTHNEQGEQEAENIGFHIAEHWPDVLEDLGVAAKAFASFLLCKHELGRRHQNGCCPDAQADGDTVLHGPVSHGVGGQDNGQVPIDADDGDEEDAPKQSDEEEGSNKFAHSIAEALVTDHIVNPERQGGYKEQVGQGQVQEIDVGDALGLPAVGKGKHHQQISHQAKGKDKGVEYRQEESPEGHNVPLIAGFSLLIIHEV	150533	106068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_106153_116849_118955_150512
929219	contig_8210_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_30263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAACAGTACACATGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495267	495869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_495300_495900
929220	contig_7662_pilon	+	5714	8	Intergenic	novelGene_176564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	141	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2612	2986	407172	407546	TRUE	75	AAAGCAAATTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVALRCCSTAWLEGIEVYNTRYSGNRKRRKIYIERNRAMKEDKKGKRGKRKQNKLKKKKKAPKERGKKKKKRKKKCSQGSLCTSVEAEGESPCHAAQPGQKGLPTQEKEKKTNKQFKTNK	404560	620839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7662_pilon_+_407683_511880_511900_526046_526440_526664_526833_563401_564995_587475_587645_608555_608581_620614
929221	contig_1863_pilon	-	2281	2	Intergenic	novelGene_156518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	697	1050	46958	46605	FALSE	15	TTAAGCCCAGTTGTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDSSVQYGLHRSSKKTKILTTGLVSNIMINREKIEVVKDFILFGSTVNAHGSSSQEIKPCEQPSKILHWSHPFGSKGERRKQVYSKGLMDHNYNGLHQTESSTTRLSCPATTTD	49101	45373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_47496_48942
929222	SIRV6	+	531	1	FSM	SIRV6A	SIRV603	1969	1	1244	194	6	-14	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGGTAGTGCCGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	10774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10200_10800
929223	contig_6059_pilon	-	2682	15	Intergenic	novelGene_44825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	4031.31589963539	8	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	414	2228	584299	569146	TRUE	25	CACATGATGTTATACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLRPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584712	567791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578206_578326_580594_580711_580921_581116_584181
929224	contig_10500_pilon	+	1663	1	Intergenic	novelGene_41153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1233013	1234676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1233000_1234700
929226	contig_11933_pilon	+	2808	1	Intergenic	novelGene_107250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGAGGAATGTTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101906	104714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_+_101900_104700
929227	contig_8615_pilon	-	2871	1	Intergenic	novelGene_165213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	152	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67286	64415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8615_pilon_-_64400_67300
929228	contig_9389_pilon	+	994	1	Intergenic	novelGene_84161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAATAAACCAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1981912	1982906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_1981900_1982900
929229	contig_5050_pilon	+	1395	6	Intergenic	novelGene_110240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	819	1337	26036	32275	TRUE	10	GGGGGTTCTGCTCACACGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLPAQGDVRCPEWVNSSNRISHLFLVAQVKIGIMGKFQGQHVCWVVPENLLPEITGFRKVPLANVSTADTCSRSRCVSGWVSEISTITFRAWASSGLSRTEVPVPISRRPLEMTWPIAKAGSASLSFDMQPSRPPRLLSLVHLTHWVRMASNSLQASLLGVESGSPASFQA	25217	33437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_26045_28221_28396_28941_29114_30029_30112_32193_32279_33382
929230	SIRV1	-	670	3	FSM	SIRV1A	SIRV107	744	3	0	74	0	-74	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	104	315	27	341	11617	11142	TRUE	35	TCAAACACCCCCAGAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRIGVLSAAVPALLHPFPLIADGKVKVYSAVAVDLRFSIKNLLAKTVGASAPLFPAILLPVAFKLAICGFVERPGSIVICIVVTSITDYKISILHSPVRSI	11643	10721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV1_-_10792_10882_11243_11403
929231	contig_6446_pilon	-	2321	1	Intergenic	novelGene_149188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAACTTAAGCCTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231838	229517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_229500_231800
929232	scaffold_13505_pilon	-	8056	2	Intergenic	novelGene_111606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGACGGAAGGCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	663815	655389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_655649_656018
929233	contig_18829_pilon	+	1304	1	Intergenic	novelGene_177703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCCAGCTGGTAGGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12927	14231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18829_pilon_+_12900_14200
929234	contig_1244_pilon	-	3005	15	Intergenic	novelGene_37919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGCTGTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294913	280078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_281774_281915_282066_282242_282295_282949_283060_284463_284515_284677_284757_284856_284969_287074_287169_287420_287498_289999_290085_291702_291778_292444_292616_293409_293470_294001_294078_294795
929235	SIRV7	+	1893	3	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	52	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAATCCTATGAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	114744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3147_114674
929236	contig_16594_pilon	+	1880	9	Intergenic	novelGene_53845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATACCAGCACCTCAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117785	335635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121162_124167_124260_132997_133151_135250_135507_149155_149351_165477_165649_242312_242430_335583
929237	contig_19352_pilon	+	2082	1	Intergenic	novelGene_122402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	1063	1497	282907	283341	NA	30	ATTCAAGCCTCGAGTCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSYGGNDKLKKNGITFILKRNISRSILKYNPVSDRIISIRLQGRPVNTTIIQIYTPTTKAKDEDIEDLYQLLQSEMDQTCNQDALIITGNWNAKVGNEEGSVVGKYSIGDRNDAGDHMIEFCKTNNLFIVNTFFQQHTWQLYM	281844	283926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_281800_283900
929238	contig_8310_pilon	+	1242	3	Intergenic	novelGene_75590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	218	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAATCTCGTTAGCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310998	314409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_311031_313065_313429_313562
929240	scaffold_12124_pilon	+	2323	9	Intergenic	novelGene_22342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3481.86859854016	3	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1372	2151	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483600	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497145_1508130
929242	contig_11933_pilon	-	4370	2	Intergenic	novelGene_107275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAATGAAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	238923	228467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11933_pilon_-_231399_237484
929243	contig_6102_pilon	-	1794	1	Intergenic	novelGene_32063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAATATTAAATGATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597427	595633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_595600_597400
929244	contig_6842_pilon	-	2545	8	Intergenic	novelGene_130643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	87.093897253341	2	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	199	648	204349	189633	FALSE	35	AGGTCAGCATCGAAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRKLRRRPNDPVPIPDKRRKPAPAPQLNYLLTDEQIMEDLRTLNKLKSPKRPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVRKTSDSTKMRIYLGQLQRGLFVIRRRSAA	210364	187735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_189732_192865_192951_201762_201869_203049_203072_203234_203300_204276_204373_207181_207311_210318
929245	contig_20825_pilon	+	2108	1	Intergenic	novelGene_178822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTGGTATAATGATTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51914	54022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20825_pilon_+_51900_54000
929246	contig_10930_pilon	-	2281	8	Intergenic	novelGene_37019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1643.30593869896	1	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	131	1030	280211	274043	TRUE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQNFMKVQEILQSVKKSSAVI	280341	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274103_274151_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
929247	contig_848_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_83333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTCTGTGGATCCTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542265	544212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_848_pilon_+_542300_544200
929248	contig_10311_pilon	+	2451	11	Intergenic	novelGene_50475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCAGGGGCGCCGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65330	71730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65633_65747_66756_67182_67260_67490_67585_67826_67957_68259_68407_68641_68754_68869_69038_70224_70360_70448_70495_71498
929249	contig_1244_pilon	-	2194	1	Intergenic	novelGene_38005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGCTTTTTATCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	924982	922788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_922800_925000
929250	contig_13456_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_153257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	760	1095	4723	5058	NA	10	TCTTTGGTTTTGGCAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNRTEIRSFLGCNLYGSRSPGFSYMAPLGGFEPPTVQVVPLAIELILTHSDSVGQSRTAPYGFQGVTSGFKLLTFWLAAELLTTVSPGRVQAVCITQTSKPDLLLPSYF	3963	5893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_4000_5900
929251	contig_4900_pilon	-	1360	1	Intergenic	novelGene_159069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTAAAAAAAAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1181355	1179995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1180000_1181400
929252	contig_6767_pilon	+	2371	1	Intergenic	novelGene_174613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	1324	1869	9132	9677	NA	75	GGAAAAAAAAAAAAGAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIRDHSLQYGLHFNIKKTKILATRPISNIMINGEKIEVVKNFILLGSTINTNESSSQEIKRCIALDKSAAKDLFRVLKSKDVTLRTKVHLTQAMALSVASYTCESWTISKEDRRKIDAFELWCWRRKLNIPWAAKRANRSVLEEVQPECSLEARVARLRLTYFGHVVRISPWRRTSCLVK	7808	10179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6767_pilon_+_7800_10200
929253	contig_12677_pilon	+	549	2	Intergenic	novelGene_110828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTGTTGTCATGTAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2185	2945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_2654_2864
929254	contig_12750_pilon	+	2231	1	Intergenic	novelGene_172624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86322	88553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_+_86300_88600
929255	contig_9939_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_158610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441614	440262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9939_pilon_-_440300_441600
929256	contig_15063_pilon	+	1858	5	Intergenic	novelGene_12270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	312	1721	28164	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27852	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
929257	contig_17068_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_172564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	113	475	9770	10132	NA	10	CGGAGGCATTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIYRDLISHDEMFSDVYKIREIADGLCLEVERKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKEYIKDYTKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE	9657	10428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17068_pilon_+_9700_10400
929258	contig_7078_pilon	-	1298	1	Intergenic	novelGene_130222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCCACTGCCTTCTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966847	965549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_965500_966800
929259	contig_11258_pilon	+	1423	6	Intergenic	novelGene_67799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	235	junction_1	80.7886130590197	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	116	640	285655	292582	FALSE	65	TATAAGAGACAAAAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDGGQYWCGINKRWWKDGVYSRDPTFQVVISVFPAPAPMSSTPTSTTTSTATTEGLPVLSMALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	283970	293365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_284075_285643_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
929260	contig_5236_pilon	-	2699	15	Intergenic	novelGene_100943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	184.658938233132	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	90	2006	1011714	1006770	TRUE	15	CCTTTTAGGTCTTGGAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1011803	1005864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006333_1006544_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
929261	contig_2342_pilon	+	1712	1	Intergenic	novelGene_132779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGAGAAACTATTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	600389	602101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2342_pilon_+_600400_602100
929262	contig_14744_pilon	+	1729	6	Intergenic	novelGene_66067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	4	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	828	900	1727	1382976	1386616	FALSE	35	AAATGGAGTTTATCCTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAIPQLQGYLRSLFAL	1382076	1386618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
929263	contig_9462_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_179130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGCTGAGAAGCTCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37628	36871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9462_pilon_-_36900_37600
929264	contig_211_pilon	+	1982	2	Intergenic	novelGene_129875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAATGGTCGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260455	262733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_211_pilon_+_261259_261554
929265	contig_9706_pilon	+	3007	17	Intergenic	novelGene_20937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	678	junction_16	499.194409617886	13	74	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1947	7	1953	231608	698356	FALSE	35	AGCTGGGACTGACAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAMPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNSRRRQGILWGHFKLRMGEHKPDPWGATEHGCWSMGGPRSIERGPGMGVYVSSGFRMHTQGESKSRITKRPTELKSHVCHSVL	231601	699410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_423619_423725_455989_456099_555500_555638_688565_688730_698010
929266	contig_10902_pilon	+	1687	3	Intergenic	novelGene_65694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	325	junction_2	33.5	4	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	576	1110	1685	201964	218576	FALSE	35	GTATGCAAACCTGAAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYRKNPVHFQHFSHPGDSDYGGVQVMCQDEVDDRPECPYGASCY	200854	218578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_202060_209426_209783_218452
929267	contig_12277_pilon	-	3380	2	Intergenic	novelGene_139690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAGAAACTATTTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267453	232623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_-_232633_264082
929268	contig_3956_pilon	+	2681	12	Intergenic	novelGene_15183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1177.85635936891	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	713	2142	18	2159	1282731	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLITILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282713	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285763_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929269	contig_6795_pilon	-	4366	3	Intergenic	novelGene_27654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	3527	3874	35422	35075	FALSE	15	GCCATGTTGCCCGGAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKKKQRRKKKWPQGCACASVQSKGLASKLHGTAWLEGDPKLRKEKENKQVKAEQIRVNKQKSPGRPTSVAAQAGKQFHSPAVLCSLSGRSKDGARSQVFERKEGEAVRGKEEI	65305	34582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_36748_51376_51641_63368
929270	contig_9239_pilon	-	1327	2	Intergenic	novelGene_137182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	995	1327	196531	196199	FALSE	55	AAAAGATCAACAACATCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQHPARNYCVIEEIKDGIKKFTESIENENIPLGHSKSSAPRSIYSNKCTHPKRRKGQNQNISPTTQTNEEQQKKSSGTRRKLIIKIRAELNEIEKQLEELTRPKAGSL	197674	196198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9239_pilon_-_197379_197527
929271	contig_3975_pilon	+	1202	1	Intergenic	novelGene_54703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTGTTTAATGAGAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1343266	1344468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1343300_1344500
929272	contig_17880_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_167324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	249	junction_1	0	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAAGTGTGTCAAGTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31471	26715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17880_pilon_-_26922_31323
929273	contig_13097_pilon	+	1153	3	Intergenic	novelGene_107728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	461	junction_2	58	8	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAATGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205372	225598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_206085_215273_215382_225265
929274	contig_10286_pilon	-	1360	3	Intergenic	novelGene_98407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	306.5	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTATATCATGAAGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415524	380183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_381306_410139_410233_415379
929275	contig_12654_pilon	+	4056	1	Intergenic	novelGene_129292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	169	123	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2205	2567	756394	756756	NA	25	CCCCCACAAGAGTGCCATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLAFEHRVAKVNGRNDDVKEMNRRFQRAAQKYKVKYYNDMCKHLELENQKGRTCSAFLKLKELRKKFKPRIAILKYSMGKIFKDTGGIKRRWKEYTELLYQKELVNAVFSGDSI	754189	758245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_754200_758200
929276	contig_8019_pilon	-	1186	4	Intergenic	novelGene_126984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCTCTGATGTAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188494	97792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8019_pilon_-_97858_152410_152552_170551_170728_187690
929277	contig_5096_pilon	+	2508	1	Intergenic	novelGene_111983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAAACAGCCTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81091	83599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5096_pilon_+_81100_83600
929278	contig_4496_pilon	+	2790	7	Intergenic	novelGene_66683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	38	junction_1	140.639511596927	3	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	794	2385	159	2543	911498	998163	FALSE	20	CTTGCTATTCTACCTACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRAMVVMGGVSGQSTVSGELQESVLQDRSIPHQEILAADEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESGMDKSDLKKDKNDYLPLYSASTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILDSQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTQSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLSNQPAFSSIDKQVYAAMPINSFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDEANHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFPEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG	909695	998410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_+_909838_911481_911831_941359_941486_951023_951148_952444_952529_996162_996282_996564
929279	contig_8447_pilon	+	2228	3	Intergenic	novelGene_69426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82054	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82329_82501_83307_83342
929280	scaffold_19766_pilon	+	2374	15	Intergenic	novelGene_34431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	5	junction_1	147.607933529388	1	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	83	2212	844727	851417	FALSE	15	CCTTCTAATCTGGGCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKAKKFLQEFYHDEESGKQFKYGKQLVQLAHREQVALYVDLDDIAEDDPELVDSICENAKRYARLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEHRLMMEQRSRDPGATRSPQNQYPPELMRRFELYFQGPSSSKPRVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPRMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSKFIKFQELKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHISVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRVVKMNKSEDDEARAGELSREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVTGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPAQFEPLDMKLMRRYIAMCRDKQPTVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDTVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSEGRSVRFSEAEQRCISRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNTARTRITFV	844644	851579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_+_844731_845085_845163_845497_845663_845845_845971_846043_846225_846509_846648_846978_847129_847335_847451_847534_847667_847882_847967_848288_848683_848960_849045_849980_850150_850925_851036_851215
929281	contig_4486_pilon	+	2275	10	Intergenic	novelGene_38613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1573.48804167173	2	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	848	1270	399314	412464	FALSE	30	TGATGTAATAGAGTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAEHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	376125	413469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390295_391086_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411189_411318_412424
929282	contig_2093_pilon	+	2045	1	Intergenic	novelGene_152976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACTATTGGGTACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1338648	1340693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1338600_1340700
929284	contig_14603_pilon	-	4331	2	Intergenic	novelGene_165987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	345	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4414	11	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14603_pilon_-_3408_3479
929285	contig_7164_pilon	-	2339	1	Intergenic	novelGene_172147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCGGATATTGTGGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	571829	569490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_569500_571800
929286	contig_6576_pilon	-	2876	4	Intergenic	novelGene_42422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTAAATTCTTGTTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304281	1295734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1295756_1301208_1301445_1301616_1303042_1303087
929287	contig_7815_pilon	-	3561	2	Intergenic	novelGene_134404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAATAGAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845501	841764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_845088_845263
929288	contig_11816_pilon	-	888	2	Intergenic	novelGene_98537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATTCTCAACAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1055542	1054538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1055200_1055315
929289	contig_17144_pilon	-	2183	11	Intergenic	novelGene_29489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1904.63715442076	2	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	598	1797	313	2109	179764	166152	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183394	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_172675_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
929290	contig_614_pilon	+	4198	1	Intergenic	novelGene_132615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCTTGTTAATTAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	390996	395194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_614_pilon_+_391000_395200
929291	contig_5403_pilon	-	1278	2	Intergenic	novelGene_87979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTTGAGTATTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556163	428703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_-_429395_555576
929292	contig_17796_pilon	+	3446	1	Intergenic	novelGene_33835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	49	125	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGTATTTGAGCAATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104072	107518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_104100_107500
929293	contig_15952_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_154075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1055	1375	343533	343213	NA	50	AACTTTAGACATAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSASSQNKESRNFPERKFLGIIRCKIQRLTYRTVQEIRKEIKQNAEHAIEKIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSAIQKINNKMSELDNSIENHRSKTEAMLSQN	344587	342002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_342000_344600
929294	contig_7019_pilon	-	1689	1	Intergenic	novelGene_149448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTTTAGGCGCACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481812	480123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_480100_481800
929296	contig_5686_pilon	-	2675	1	Intergenic	novelGene_45488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTCTGTGCCAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241044	238369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_238400_241000
929297	contig_6919_pilon	-	1186	1	Intergenic	novelGene_163973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	6	311	23402	23097	NA	30	AGGTCTGGTGTAAGTTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMVFSIASYVWESWTMNKEDTRRYDAFELWCWQRILNIPWTSRRMNKSVWEEVQPECFLEMRMVRLCLAYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVERHQKRGRPSTR	23407	22221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_22200_23400
929298	contig_6276_pilon	+	2041	1	Intergenic	novelGene_174115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAATAAGTAAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29394	31435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6276_pilon_+_29400_31400
929299	contig_18687_pilon	+	2529	1	Intergenic	novelGene_178194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTAATACGACTGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13459	15988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18687_pilon_+_13500_16000
929300	contig_6735_pilon	-	3425	7	Intergenic	novelGene_15664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	918	junction_1	484.646864565668	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	1974	2945	545229	542464	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLFFHQYFSTYRPPSSPLPSSLLLDISLIPIAPSSLSLSPPSPKTTLILFAVSEASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDVITDIEMVDEGWWRGRCHGHFGLFPANYVKLLE	548445	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545945_546577_546634_547243
929301	contig_13244_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_86906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAATAAAATAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100308	99425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_99400_100300
929302	contig_11594_pilon	+	1922	1	Intergenic	novelGene_80901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGTACAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155183	157105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_155200_157100
929303	contig_8683_pilon	-	1986	1	Intergenic	novelGene_150248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	76	231	95	325	521164	520934	NA	80	TCACCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCNPLPGAHPQRAARGLLSPLFPVSKARITGMARRGQPMRICEGRPCRVTITSHFRSEAKRRYFIRMKGEQLEEWFQQESSSFGNCTHSVRSQYLATEQPKYIKSKH	521258	519272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8683_pilon_-_519300_521300
929304	contig_7182_pilon	-	2228	2	Intergenic	novelGene_117123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	6	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	456	779	614270	613947	FALSE	65	AGACAGGAAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESLVVPFTGHWPGLSHSVSPLYLRAVPHPRIQPTADRKYSGKEIPESSKKQNLNLPHAEHYAESTGKKWCVGIPCCSLPPLHRSSVSLQYSLFEHCSPCVLSLFPK	616424	612497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7182_pilon_-_614647_616345
929305	contig_642_pilon	-	1325	1	Intergenic	novelGene_178571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	781	1125	149163	148819	NA	45	AATCAATCGACATAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDIATDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLVEMDKFLETHSLPKLEQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIYRRACSSTTQDISEHKRGSNTSKFIL	149943	148618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_642_pilon_-_148600_149900
929306	contig_10864_pilon	-	1591	2	Intergenic	novelGene_107089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1132	junction_1	0	7	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGACTAACGAGGTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925066	918726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_919612_924360
929307	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	8109	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929308	contig_17144_pilon	+	1933	10	Intergenic	novelGene_29255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACCAGGCCTCCCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	183179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166493_172527_172742_173130_173211_173308_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181852_183158
929309	contig_11375_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_152662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTATGGCCATGACCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185940	187524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11375_pilon_+_185900_187500
929310	contig_15897_pilon	-	1714	1	Intergenic	novelGene_49518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGAGGGGGAAACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161499	159785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15897_pilon_-_159800_161500
929311	contig_5302_pilon	-	2296	9	Intergenic	novelGene_81454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	711.224120794564	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	235	993	209238	177300	TRUE	25	TAATTTAATGTTACTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209472	175854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176839_176980_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209142
929312	contig_6102_pilon	-	3686	3	Intergenic	novelGene_32310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAGAAAAAAACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601917	1555081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_1557241_1560405_1561902_1601886
929313	contig_5988_pilon	+	2303	4	Intergenic	novelGene_16107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1590.65381386258	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	473	775	1225050	1225410	FALSE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSGTSRGNKLQESTSQTTPGGPELLSREPPQHCLVCAQFQWGWAVCFPLERSLLVPASVCGCFASSELQAGQIPFYTLPSQKECRFVCVPSYPPTPLA	1222580	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
929315	contig_6050_pilon	-	2922	11	Intergenic	novelGene_123110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	49.6375865650215	95	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	359	1318	346938	323202	FALSE	50	CAAAAGTTTCACTCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNSEGASESAASVALHPSMAVPAPVAQPIPASSQQVLVQAAGFATRGAQMELISFPRVQQVPQQVQSMQHVCRAQVQYVEEGDTVYTNGAVRTAYAYNPKPQKYASSSATAYFEAPGSAQETVAASSPPVVPSHSMVGITMDVAGTPITSSASAYLIHGGIDITRHSLAHTSRWSPATLQWLLDNYETAEGVSLPKSSLYNHYLRHCQEHELDPVNAASFGKLIRSVFTGLRTRRLGTRGNSKCHYYGIRLKPDSLLSQLQEDTQCMAMQQQPVHQKPRYQPAQKTDSLGDSGSNSSLHSTPEQAIAAQSQHHQRYIV	358237	321597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6050_pilon_-_323207_323676_323793_328068_328189_329320_329503_339993_340256_340902_340983_344449_344540_346833_346949_357597_357772_357986_358099_358175
929316	contig_17097_pilon	-	1708	1	Intergenic	novelGene_179164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTATACCCCTGCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10120	8412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17097_pilon_-_8400_10100
929317	contig_3004_pilon	+	4232	5	Intergenic	novelGene_127541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	145	765	585940	586560	TRUE	40	ATGAGACTAAATGGGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKTDREQRARRDSCRGPLPANAARIHHLGLLSETSKRGYEKAASQSVQRERKQPVICDIRFPTPHTSSPRLGLLCFPQPQSLDWETAAAWIPHTRTGGCLSAICWLLVLLFFRFFLFLPCLSPPPPPLAQIPCSVHHLCFLLRGCRAPVICDICFSTLYPSSPTLGPLCFPRTQSLVQKHQPALAGSLSAICWLLVLLFFPCFF	585795	683635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_587546_590217_590564_647099_648059_681493_681975_682939
929318	contig_15491_pilon	-	2441	7	Intergenic	novelGene_75940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	187	junction_1	375.942112860773	9	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	73	744	46982	37061	TRUE	10	GTCTTTGGCCTCCTAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQAVVLEKKKELSNAVSVQGLNRTMENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMAIGRSISGSNPVENISFPSRGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLRAFDICLKLSSQAAITVALCNTVVKNMGFEVRSKLESMIGHSTIV	47054	30744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37054_37200_37440_37560_38887_39040_40256_40317_45107_45207_46879
929319	contig_14445_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_137354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCTAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268840	266551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_266600_268800
929320	contig_6206_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_168152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	393	752	138817	138458	NA	35	GTATATGAATATCTAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVGKLEMAKNEMECINVDILGFSELKWTGIGHFESDNHMVYSAGSDSLKRKGIAFIVKKNISRSVLKYSAVSNRIISIRLSGQPVNTIVIQIYPPTTKAKDEEIEYFYQLLQSEVDQT	139209	137314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_137300_139200
929321	contig_14048_pilon	+	3447	1	Intergenic	novelGene_146348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1815	2171	655052	655408	NA	30	CATCTTTAGGATAAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNNTGSIKSRWKEHTESLYQKELVDDQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKALVKNKAPGIDGISMEMFQQTDAALAVLTCLCQEIWKTASWPTRWKRFIFMPIPQKVDLTVRES	653237	656684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_+_653200_656700
929322	contig_854_pilon	+	3656	20	Intergenic	novelGene_36514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3533.97292221636	12	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	1688	2896	1702628	1715249	FALSE	30	TAGAATTCCAAGTCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDACQSPRLPLLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1612775	1716009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649601_1687057_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698405_1701997_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709609_1715130
929323	contig_454_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_178253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTAAATCTGGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3743	3163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_454_pilon_-_3200_3700
929324	contig_14244_pilon	-	4448	1	Intergenic	novelGene_169447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	3737	4042	8852	8547	NA	35	TCTGAAATACCTTCAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDTLLKSSISCSSFLVDSLGFSVYNIISSANRDTLTSSLPIWMPFISLSSLIALAKTSSTMLNKSGDRGHPCLVPILKKNAFKVSPFRMMFIVGFV	12588	8140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14244_pilon_-_8100_12600
929325	contig_7347_pilon	+	2014	3	Intergenic	novelGene_172496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	4.5	15	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	1610	2014	56977	84186	FALSE	30	CCAGCGAGATGGATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWMKSECWQREEDEACRLPSEEGREIWERDSKNQKNRDKRQEKFLVTGPFPPRDLPEGDFELMHLNYGLVKNIEYTTDYQKNEQICLGRSTARMLIRSKDGFVSCTLDMLSGGTSPRRRTSYLVKQKKKKGRP	55367	84186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7347_pilon_+_56992_57984_58148_83959
929326	contig_1406_pilon	+	2657	5	Intergenic	novelGene_25594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	455.741908869483	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	184	525	2179513	2185260	TRUE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2176190	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2176336_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143_2185798_2185874
929327	contig_13592_pilon	+	1270	3	Intergenic	novelGene_33732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1872	junction_1	196.5	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATCATTTCAAGAAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267177	269600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_+_267282_267365_268000_269068
929328	contig_3095_pilon	+	3317	1	Intergenic	novelGene_75138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	84	446	149574	149936	NA	20	TTATATTTGGAGATGTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLTPSVPHSSISLGPIPLPLHHLLPTCMCLTSWVLLHLSLLIPTLTPFLAFSEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNGTSLCCSPRHGNL	149490	152807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_149500_152800
929329	contig_6919_pilon	-	1591	1	Intergenic	novelGene_163968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	328	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGATACGGGTCTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6880	5289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_5300_6900
929330	contig_16110_pilon	-	1801	2	Intergenic	novelGene_126783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	186	512	51235	50909	TRUE	25	ACTTTTGAGACGGTCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKALEMKPRNTCFQEALWLYFSQDRLFVLLAVHGIFNILQQHHNPKASILLLSSSFILQLSHAYEATGNIMVWVRRALVLKVTSLLFNTLKRSFAAHLPNAICHLIS	51420	49464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_49968_50122
929331	contig_4180_pilon	-	844	1	Intergenic	novelGene_8332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATACAGACAAAATAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857234	856390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_856400_857200
929332	contig_13300_pilon	-	1991	5	Intergenic	novelGene_125820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	26.4799452416352	5	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1	402	250812	248617	TRUE	40	TGGAAAGGAAAAGAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGGGRLGLGGVLDQVAAEGDVGVELVAEDGILAFALEEAHPHLVLLAQLQHQALALHDAAVAHLRVQDHRLLPVPHDVQLTPCLCSCPVLREKFRSCPTFALEIPPPPSVSPAQPSRRRAFCLSLQQPDLSVS	250812	244185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_244442_246913_247149_247267_247870_248120_248782_250575
929333	contig_11574_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_64109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAACAACAAAAAATTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595394	597572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_595400_597600
929334	contig_12935_pilon	+	290	1	Intergenic	novelGene_165728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACAAAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232806	233096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12935_pilon_+_232800_233100
929335	contig_9345_pilon	-	937	1	Intergenic	novelGene_24725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAAAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1020975	1020038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_1020000_1021000
929336	contig_10837_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_160659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTAAATTTTTGCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138255	139072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10837_pilon_+_138300_139100
929337	contig_9739_pilon	+	1390	1	Intergenic	novelGene_165081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	296	891	269	1159	2427	3317	NA	40	GTACTCTCACAAATTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLRLKDTNRLKLKGCKKIYMYQANNTQKRAGVPILISDKIDFKVKSITKDKERHYIMIKRSICQEYITIINIYTPNNRAPNYVKQTLNSSEERERQLHNSSRRLQNTTFGEGKNIQKGAQQRHRRAKCYNQPTSSHRHIPNTPPNSRQVYFSNAHGTFSRIHRILAHKASLNKIQNIEVLQSIFSDHKAIKVEINNPKSKEKKSNTWKLNNTLLKNYWLIEEFKDGIKKFIGSNENENTSYQNLWDTTKALLRGQFIAINAYIQKEERVIIKALTLQLEQVESSKRSPQVPEGRK	2158	3548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9739_pilon_+_2200_3500
929338	contig_3975_pilon	-	1699	1	Intergenic	novelGene_54673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGTTTCAAAAGATGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	840796	839097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_839100_840800
929339	contig_8954_pilon	-	2995	1	Intergenic	novelGene_130274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	209	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	937	1260	115033	114710	NA	10	TTGGTAGGCAGTTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSCEFILAFCSCIIFLNSSIILTVLSMNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGTFSTFSSIGKSSGVLFWMPTGTILFCFGKCFDIVCCLRGIQ	115969	112974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_-_113000_116000
929340	contig_15752_pilon	-	1659	1	Intergenic	novelGene_148793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	27	84	216	299	410464	410381	NA	45	GTCTCAGAATATGAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGLYEEERGIRIGGRLINNLQRADDTTLLVESKEDLKHLLLKIKDYNLQYGLHFDIKKTEILTTGPVSNIMINGEKIEFDGDFILLESTISAHGSSS	410679	409020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_-_409000_410700
929341	contig_16362_pilon	+	1750	1	Intergenic	novelGene_161168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	38	117	194	310	253860	253976	NA	70	TAAAAAAGATAAACATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLFFSILRLSLHFNSKLPQYFFLLLLLLSLFHTQPSSTDHNLPIPLPSACLHHVLNIALPNSTGMTLEPSLRLPLVHLVGQEGATNNPCKPFPFSWTCPDTP	253666	255416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_253700_255400
929342	contig_12120_pilon	+	4309	1	Intergenic	novelGene_21414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	328	987	2239	3225	39386	40372	NA	25	GGGTTGTTAACCAATGTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKMTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKIEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	37147	41456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_37100_41500
929343	contig_16496_pilon	-	571	2	Intergenic	novelGene_5239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	7	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	301	318	1225	1208	FALSE	60	GAGCCTAACCAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3585	954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
929344	contig_3975_pilon	-	1084	7	Intergenic	novelGene_54780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	426.450856879586	8	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	188	886	2018596	2015729	FALSE	5	CTCTCCCGAGCTTCTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVRNFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALSTDIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEEDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSDEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPETLFFSGSLR	2018783	2015530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2015756_2016423_2016468_2016965_2017119_2017369_2017501_2017590_2017700_2018280_2018422_2018502
929345	contig_6509_pilon	+	2886	3	Intergenic	novelGene_145650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAAACAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156652	184533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_+_157151_181734_182862_183272
929346	contig_12125_pilon	-	2047	1	Intergenic	novelGene_76216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGCACCTTATTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	220675	218628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_-_218600_220700
929347	contig_10225_pilon	+	2241	15	Intergenic	novelGene_86786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	555.123207504608	1	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	1125	2003	42707	47511	FALSE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRHRGSRYSPTRAISPGAPRSPPMGLQKWRKRKKSRTRGSLPSSSLLRTWRT	20679	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46267_46308_46766_47360
929348	contig_2894_pilon	-	1359	3	Intergenic	novelGene_86541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	169	junction_1	12.5	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	767	1357	235935	229223	FALSE	25	GCACATGGAGATTGTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAH	236701	229220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_-_229363_232502_232734_235715
929349	contig_11989_pilon	+	3935	2	Intergenic	novelGene_68445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCGGGGTTATCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51518	55545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_52793_52884
929350	contig_9439_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_176912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATGTCTGCCTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171957	169954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_-_170000_172000
929351	contig_11816_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_98559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	74	400	1173665	1173991	NA	35	CATTTAGGTTCACTCAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGSSPNCTEDIGKVTPENDRIPTEMFQQMDTMLEVLSHLCQEIWKTATWSTDWKRSISVSTPKKHDPTECGNYLTISLISHASKILLKIIQKQLQQYIERELPEIQVGFRRGGRTREIIADVRWILAESREY	1173591	1175255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1173600_1175300
929352	contig_835_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_152150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTAGCAGACACAGCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199950	200874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_835_pilon_+_2e+05_200900
929353	contig_15120_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_108038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684780	683678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_-_683700_684800
929354	contig_12080_pilon	-	452	1	Intergenic	novelGene_128419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573559	573107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_573100_573600
929355	contig_6589_pilon	+	2535	8	Intergenic	novelGene_25722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	22	junction_1	46.6047207909242	45	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	86	970	460735	475240	FALSE	70	AAATTTTAAAAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPVHPPAGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQGILQETGKEGERLGASLEGTASHSLGLWEGRGPEVQICVLSVPTTWLLSFLRPLASEDKQ	451705	476805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_466985_467196_470064_470142_474991
929356	contig_5999_pilon	-	946	1	Intergenic	novelGene_45602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAGACTGTGAGAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63786	62840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5999_pilon_-_62800_63800
929357	contig_9366_pilon	+	1866	3	Intergenic	novelGene_166238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTCATGAAGGGTGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791163	806393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_792471_805330_805344_805847
929358	contig_665_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_158201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTTTTTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161539	162430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_161500_162400
929359	contig_7146_pilon	+	1081	1	Intergenic	novelGene_162051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	598	918	123234	123554	NA	65	AGCAGCAAAAGAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEDQRSCGTTSKTSYEKKEKRSFKRQERKKRPKWVPEETLILALECKVPKEKRRNEVKELNRRFQSVARKDKVKYYNEMCKDLEIENQKGRTCLGFLKLKELKKT	122636	123717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7146_pilon_+_122600_123700
929361	contig_6898_pilon	+	1954	4	Intergenic	novelGene_35785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1655.10127249731	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124934	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_126219_126505_126751_126805
929362	contig_1986_pilon	-	1493	2	Intergenic	novelGene_64121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	192	491	97611	97312	TRUE	55	TAAAAAAAAAGTCAACCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNCQGLHQTESSTARWCPAATNDYSDWDHNRRSWTEMEKDVEQNSNTHKKDQIYWPERDWRNPESLASRHPFSSVMKSLPRFTIQPKIRQPHKTKRD	97802	91989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1986_pilon_-_92275_96594
929363	contig_19342_pilon	+	1361	7	Intergenic	novelGene_41088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13138237134266	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	408	806	4349	6183	FALSE	45	TCTGAGAGAGGAAATAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQGTDPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3255	6738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3896_4285_4365_5094_5293_5413_5522_5960_5994_6139
929364	contig_16883_pilon	-	2238	3	Intergenic	novelGene_161770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	30	junction_1	1.5	11	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	1263	1775	710499	701053	FALSE	25	TTTGAATTTTATGTAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKYHSVVLLLFLLYSEMFDVKIQVDFSLFFRPQTLNLTAVNAAVLIENLEIFRKNGFDFIIDEDAPVTERVKLISLPTSKNWTFGPQDIDELIFMLSDCPGVMCRPSRVRQMFASRACRKSVMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIASLDVVSQN	711761	700589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_701197_709798_709969_710300
929365	scaffold_17542_pilon	-	2028	1	Intergenic	novelGene_139217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	53	445	21242	20850	NA	40	TTGGGGAAAATTGTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRAPGIDAYQSRCFNKWMQCWKCSFVYAKKFGRQLPGQPTGRDPYLCLFQRKGDPTEYRSYQTISLISHTSEILLKIIQKQLQQYIDKKLPEIQAGFRRGCGTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDCAKAFDYVDHDKLGITL	21294	19266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_19300_21300
929366	contig_9571_pilon	-	3627	1	Intergenic	novelGene_136327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGATTAGTCCGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738423	734796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9571_pilon_-_734800_738400
929367	contig_8140_pilon	+	1622	1	Intergenic	novelGene_86450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	560	949	802092	802481	NA	75	AGTACAATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPSDLLLSMGIFPSSHEHIKIFLLKQHTHFINPESSSNYCPFFHFQSQFLKEVSCLLSAQFTFYLESDFAAVNIDFLITKFGGYLVVLILFYLSASAETLLNNSLLFKLCFCFCGSIFLSVFFLTYFF	801532	803154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8140_pilon_+_801500_803200
929368	contig_9011_pilon	-	1208	1	Intergenic	novelGene_159310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCATATTCCCCAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480782	479574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_479600_480800
929369	contig_10176_pilon	-	1736	10	Intergenic	novelGene_72731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	107	junction_2	220.563475928315	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	411	1236	75	1310	274981	261068	FALSE	25	GTCTGGAGGCAATTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVKIWNMKTTECSNTFKSLGSTAGTDITVNSVILLPKNPEHFVVCNRSNTVVIMNMQGQIVRSFSSGKREGGDFVCCALSPRGEWIYCVGEDFVLYCFSTVTGKLERTLTVHEKDVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLKLWKP	275055	260641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
929370	contig_7410_pilon	-	3037	2	Intergenic	novelGene_106115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1806	2213	544299	543892	FALSE	50	AGGTAACCACAAAGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASASSQNKESRNFTEEEIFLELPEVEYKRLIYSTFQEIRKIRQKAEQAKEHTDKATKELKNIIEEHTDKFNRLQQSVAREQTEIQKINNKFSELDNSIESHRSRIEAVEVRISDIEDKALDTNIFEEKSDKRI	584724	543067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_545125_583744
929371	contig_4803_pilon	+	1759	1	Intergenic	novelGene_150729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1261	1575	73396	73710	NA	20	CTTTTTAAGCACATCGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVILLAPYISLLPHESPFTSCLSPSRLSVSSRHFQLVHLNPHSLSLTLLPLFLAGLVQKSHRSGASDESSSLSSRQTLLPLPTPLLAAFPYPPTCSSNHLPYT	72135	73894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4803_pilon_+_72100_73900
929372	contig_3095_pilon	+	1234	5	Intergenic	novelGene_75033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3097.12482594745	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	203	826	149709	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149651_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929373	contig_11572_pilon	+	1804	1	Intergenic	novelGene_100076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAGACCCAGAGTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	371566	373370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_371600_373400
929374	contig_7119_pilon	-	2064	2	Intergenic	novelGene_40978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1187	1933	139626	138880	FALSE	35	CAGGAGGGTCAGCAACAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140949	138748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_139693_139829
929375	contig_12227_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_127400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAGACAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135634	134944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12227_pilon_-_134900_135600
929376	contig_3095_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_74996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	28344	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	68	832	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929377	contig_16148_pilon	-	2869	12	Intergenic	novelGene_50362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	271	junction_11	427.295183162318	1	140	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	1136	2557	111433	59018	FALSE	30	AACAATTGTGTAATGTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153095	58705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_59177_63746_63850_74696_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
929381	contig_6914_pilon	-	4646	3	Intergenic	novelGene_151769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2949	3506	889478	888921	FALSE	45	GGAAAAAAATCTTTTACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTERIIEEMLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPDRIDPKRKSPRRIIITLTKTEEKQRILRAAHEKQEVTYRGETIKLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCPPRILYPAKLSFKYDGEIRTFPDKQKLREYVKTKPNLPELLKGVLRSENKQLQLTGRI	992047	887780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6914_pilon_-_889941_989489_990912_990983
929382	contig_4232_pilon	+	1097	1	Intergenic	novelGene_63328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGGAAAAAAAAAAACCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466956	468053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
929383	contig_13456_pilon	-	4919	1	Intergenic	novelGene_153291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	137	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	295	681	328670	328284	NA	30	AGTCTCCACATCCTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCTKERNTARSCAILTIVVIIEPLVAVTVSIHLKEDESSSLSLTFYFTRHDVLLQGLVPPITCPKYVRQSLAILASKEHSGYTSSKTDLFVLLAVHSILNILHQHHNSSSVFLIHCPAFTCIRGN	328964	324045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_324000_329000
929384	contig_1759_pilon	-	3490	2	Intergenic	novelGene_171320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAAGATGAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11447	7563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_8172_8565
929385	contig_2036_pilon	+	5775	3	Intergenic	novelGene_131807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2417	2755	476537	476875	TRUE	55	AAAAGAAAAGGTTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDITLFEKNSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLSVTAVPQRGRKQKTQRRSLKKC	420952	482583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_423060_476227_478026_480713
929386	contig_6270_pilon	-	1805	1	Intergenic	novelGene_99811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34556	32751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_32800_34600
929387	contig_4125_pilon	-	3515	12	Intergenic	novelGene_25128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_6	395.886827471298	2	181	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	111	791	822728	813780	TRUE	55	GAATAAACAGACTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846554	808982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813415_813773_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
929389	contig_8330_pilon	+	1738	8	Intergenic	novelGene_71808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	613.645945915701	6	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	120	665	852673	856364	TRUE	40	AAGAAGTACGAATCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEVSRGAWWTICGRGDGRCWAETVSSSSH	837631	857545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854068_856196_856271_856362_856560_856667
929390	contig_3751_pilon	+	1750	2	Intergenic	novelGene_158641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTATTTTCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192247	194178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3751_pilon_+_193718_193898
929391	contig_4301_pilon	+	3249	1	Intergenic	novelGene_65141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCCCTAAGGGCTGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	646632	649881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_646600_649900
929392	contig_7411_pilon	-	3413	2	Intergenic	novelGene_136995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_1	0	22	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAGTGGATTTATCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232074	225080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_227822_231402
929393	contig_9388_pilon	-	4313	1	Intergenic	novelGene_179165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	2008	2355	162236	161889	NA	45	AGAGCTTAAAATAACTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLYINQEAVVQTEQVDIVWFKVRKGVHQGCILSTYLFNLYAEQIIREAGLCEEWGIRVGGRLINNL	164243	159930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9388_pilon_-_159900_164200
929395	contig_16525_pilon	-	1927	1	Intergenic	novelGene_133805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAAGATCGCCAGTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93413	91486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_-_91500_93400
929396	contig_11338_pilon	+	2503	10	Intergenic	novelGene_6201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	612.901498540818	4	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	36	578	8000	11105	TRUE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHARRHRRRLGCCQQPGLRPCPLLLVGTDQRLPLELPGTSDRHHSVQCCHLRDYCLEAHSEVF	7964	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_8189_8743_8909_10669_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_12896_12973_13060_13245
929397	contig_13021_pilon	+	2323	3	Intergenic	novelGene_8091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGTGGGGGTCCGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36889	60759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_37188_43101_45083_60715
929398	contig_8330_pilon	+	2933	1	Intergenic	novelGene_71777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	2329	2649	712884	713204	NA	65	ATTATTATAATCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASASAQNKESRNLLEEENFLELPKVEFKRLIYKALQEIRKNAEQAKNTQTKQQRNSRRLCKSIMTYLTLQESIERQQTEIQKINNKISELDNSIEVIGGKLRQW	710555	713488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_710600_713500
929399	contig_4213_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_124781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAATACATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_0_2100
929400	contig_16846_pilon	-	930	1	Intergenic	novelGene_82889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTATGGTATTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	355696	354766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_354800_355700
929401	contig_6557_pilon	-	2084	2	Intergenic	novelGene_32967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGCGTTCTCATATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	386250	382910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_-_384033_385288
929402	contig_4659_pilon	-	3452	9	Intergenic	novelGene_118229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_6	171.156361260691	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	27	1052	860030	819799	FALSE	40	AATCTTGTAGCCAAGAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMESGAENQQSGDAAVTEAENQQMTVQAQPQIATLAQVSMPAAHATSSAPTVTLVQLPNGQTVQVHGVIQAAQPSVIQSPQVQTVQSSCKDLKRLFSGTQISTIAESEDSQESVDSVTDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAPGVPRIEEEKSEEETSAPAITTVTVPTPIYQTSSGQYIAITQGGAIQLANNGTDGVQGLQTLTMTNAAATQPGTTILQYAQTTDGQQILVPSNQVVVQAASGDVQTYQIRTAPTSTIAPGVVMASSPALPTQPAEEAARKREVRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLENQNKTLIEELKALKDLYCHKSD	883995	817398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_819944_836792_836944_838858_839042_843216_843360_847628_847730_852958_853001_853789_853937_859916_860039_883977
929403	contig_7272_pilon	-	1926	10	Intergenic	novelGene_25370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	610.122230214954	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1	489	633138	617484	TRUE	55	AGAAGGTAAAGACGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQVFSQFFKT	633138	604529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607015_609184_609235_611629_611658_616565_617709_620502_620568_632105_632194_633027
929404	contig_6208_pilon	-	2403	1	Intergenic	novelGene_53035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	597	1807	2403	494246	493650	NA	35	TTTGATGCAATGAAGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKET	496052	493649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_493600_496100
929405	contig_854_pilon	-	2010	9	Intergenic	novelGene_36633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	971	1477	1699021	1696580	TRUE	25	TCACTCAAGGGGGAGCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMRLECLQLGESALSCQLLLSDLYQLLLLGHHLLLLPAHLQQRLDLGEEPPPLPVPQLEVGGTVPL	1702633	1694203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1694529_1695120_1695290_1696540_1696644_1697675_1697805_1698222_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988
929406	contig_6176_pilon	+	3648	5	Intergenic	novelGene_179166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	3155	3646	64257	68286	FALSE	60	AATTAACAACAGAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYKKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEQEIKPTIQALIHDINRIQTITINAHTPIDKLDNWDSLKIKQLCSSKDFTKRVKREPRDCKDTEDLKSTISQLDLIDLCRTLHPTAAKYTLFSNAHETFSRIDHILGHRAILKKVQNVEIIQSIFSDHNAIKV	41912	68288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6176_pilon_+_42690_43091_44329_44541_44833_63407_64529_68066
929407	contig_5640_pilon	-	843	6	Intergenic	novelGene_27239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	249.570030252032	3	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	11	637	63466	24907	TRUE	40	CAGAGGTAATTTCTAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTVMKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMAGSLGHLQA	63476	13932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_45441_45638_57925_58169_63304
929408	contig_3956_pilon	-	2368	11	Intergenic	novelGene_15250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	86	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	15	TGGCGGCGAACTTGGCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284868_1285081_1285155_1285700_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
929409	contig_3789_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_79910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGTTTAAAGGAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710939	688150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3789_pilon_-_688761_710616
929411	contig_16535_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_167715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395477	397724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16535_pilon_+_395500_397700
929412	contig_20527_pilon	+	3031	1	Intergenic	novelGene_138606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCATGAGCCTGGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15663	18694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_15700_18700
929413	contig_13145_pilon	+	1879	6	Intergenic	novelGene_116630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	70	junction_4	1234.47083400135	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	51	156	385	540	43606	48825	TRUE	30	AGCCATATTCTCTCACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETARDPYRK	37939	58594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46424_48800_48895_57324
929414	contig_14807_pilon	-	661	4	Intergenic	novelGene_124662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	1876.46695207302	8	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	73	564	38669	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38741	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632
929415	contig_6497_pilon	+	1847	2	Intergenic	novelGene_35643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1023	1385	755514	757014	FALSE	35	TCTGAATGCTTACAATGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSLCLMAASNSYIPAAVLQSHRRPSFLLVLCLALQSHAVSQLIHFPSFLDESHCIVLHVQNMNHQLQILPKSIQHVNNSILETFLRERDSSIKFHSKVHFKAPLVTGSLLVWQPTLLLM	754491	757476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_755551_756688
929416	contig_6086_pilon	+	3401	1	Intergenic	novelGene_171458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATATGCACAGGAAGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26292	29693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_+_26300_29700
929417	contig_10434_pilon	-	1923	2	Intergenic	novelGene_82067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1306	1653	212598	212158	FALSE	65	TAAAAATACAGATGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLPKTKDKQRILRAAQEKQEVKYRRQTIRLSSDYLAETMQERRQWDDVYKILKEEYVKVKPNLKELFKGVLRSEDKQLQPTGRT	213903	211887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10434_pilon_-_212252_212344
929418	contig_3956_pilon	+	2547	13	Intergenic	novelGene_14822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1516.53648479759	5	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1256	2023	1288971	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281597	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282976_1284068_1284231_1284734_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286446_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929419	contig_10225_pilon	+	3022	14	Intergenic	novelGene_86803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1120	1962	42707	47259	FALSE	10	GCTAGATTCCTGGCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSQMT	20684	48319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46824_47244
929420	contig_8820_pilon	-	3011	11	Intergenic	novelGene_79289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1128.12270609185	3	148	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1358	2353	168430	166441	FALSE	35	GAAATGGTGTGTGAAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSKILKVIRKNLVKKCLELFTELAEDKENYKKFYEQFSKNIKLGIHEDSQNRKKLSELLRYYTSASGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQEEKKTKFENLCKIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	171422	165782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841_167176_167531_167801_168029_168178_168295_168487_168652_168814_169016_169338_169664_169787_170116_170503_170600_170763_171273
929421	contig_8447_pilon	+	2802	2	Intergenic	novelGene_69402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGTGCCCAGCACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36534	39936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_37235_37834
929422	contig_12531_pilon	-	4081	3	Intergenic	novelGene_177825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	992	1309	4718	4401	TRUE	40	GGATCAATTTTTAATATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSRWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLCFTESGVLKSPTIIVELSISLFSAVRVCFMYFGALSLGA	5709	995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12531_pilon_-_1311_1810_3817_3949
929423	contig_3956_pilon	+	1613	8	Intergenic	novelGene_14913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1626.65028289954	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	82	915	1281682	1290310	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRG	1281600	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1284736_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287416_1290304
929424	contig_5452_pilon	-	2449	2	Intergenic	novelGene_101022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGCATCTGACTATTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	471070	468534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_469705_469791
929425	contig_4783_pilon	-	2201	2	Intergenic	novelGene_108365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	1715	2200	142786	142301	FALSE	40	GAAAAAATGGGGAGAGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPRAIYRYNAILIQIPAAFFNELEKQITNFIWKGKRPRISKALLTKNSKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYIDLWNRIENPDINSSTYEQLIFEKGPMSINWGKDSLFNKCCWHNWISICKKLKQDPYLTPCALTNSKWIKDFKIENDKDYG	145112	142299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_144348_144959
929427	contig_5574_pilon	+	4503	4	Intergenic	novelGene_155818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	35	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2193	2588	205138	205533	FALSE	15	TCTGCCCTTCAAGGCTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLMTTNSILKIHLRPGTVSITLPEASWFKVHPSIPGQGLLPFLESPDSSTPLSFPLVPPSASVLTTTKCPVFLYSCLGHHYSHSVGTMFISPCPHYLGILERRHPAARSCDLLACGSSWNLVGRSGVQVT	16407	207448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_+_17097_18183_18356_140501_140629_203933
929428	contig_20615_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_146911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATGTGTATTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139756	140937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_+_139800_140900
929429	contig_11566_pilon	+	2166	1	Intergenic	novelGene_166708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAACAACAGACCACTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207817	209983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11566_pilon_+_207800_210000
929430	contig_3601_pilon	-	1911	2	Intergenic	novelGene_132904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTAGCTAAAGCAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222107	220002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_220010_220203
929431	contig_2770_pilon	-	1471	6	Intergenic	novelGene_107478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	14	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	218	667	750561	743833	FALSE	40	AACATTGCTGTTCAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750778	743028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
929432	contig_5018_pilon	+	2716	7	Intergenic	novelGene_47190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	320.172045764287	43	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCTCCTGTGTCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1586925	1593202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1587091_1588171_1588632_1590287_1590424_1590509_1591013_1591093_1592050_1592607_1592706_1592804
929433	contig_20356_pilon	+	398	1	Intergenic	novelGene_159557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGCTGCAAGATGGGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256493	256891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_256500_256900
929434	contig_504_pilon	-	906	1	Intergenic	novelGene_54395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATTAAAAATGACATCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7687	6781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_504_pilon_-_6800_7700
929435	contig_854_pilon	-	4657	25	Intergenic	novelGene_36636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	1568	2248	1714455	1710659	TRUE	25	ATGGAGTTCGGAGTCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFLRELTSRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLCGTDMVAQQYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAPLPLLLAISSASSSRSCWAWRLARSAAASSSCS	1716405	1694486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1694524_1695119_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1698983_1699024_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706804_1709508_1709718_1709989_1710154_1710540_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712420_1713055_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
929436	contig_19812_pilon	-	2183	19	Intergenic	novelGene_100986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	84.2211961239165	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	657	1974	74	2047	46806	15879	FALSE	0	GTGGTTTTTGTCTTGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSESSKKRKPKVIRSDGAPAEGKRNRSDTEQEGKYYSEEAEVDLRDPGRDYELYKYTCQELQRLMAEIQDLKSRGGKDMAVEIEERRIQSCVHFMTLKKLNRLAHIRLKKGRDQTHEAKQKVDAYHLQLQNLLYEVMHLQKEITKCLEFKSKHEEIDLVSLEEFYKEAPPDISKAEVTMGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48272	15742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_35121_35255_38513_38629_40209_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
929437	contig_5439_pilon	-	3475	2	Intergenic	novelGene_178269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2109	2474	2065	1700	FALSE	35	AGCCCAGACCAGGAAGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLWGIQ	4235	698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5439_pilon_-_2664_2725
929438	contig_11338_pilon	-	1304	7	Intergenic	novelGene_6351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_1	270.169082859852	4	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	153	761	319426	295358	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLC	321461	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311
929439	contig_19412_pilon	-	2690	2	Intergenic	novelGene_178694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1094	1459	2271	1906	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	3364	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_326_991
929440	contig_6446_pilon	-	2331	2	Intergenic	novelGene_149175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	948	1658	127278	126568	FALSE	0	TGTTTGTGTTTTCTGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLIFKAIQELKQKADKNKEKKIDKSMEKADKLMENTDKKMEEFRKITQQQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKMSEMDSVIEGLRSRLETVEDRISKIEDKHLDTTLFEEKSDKRMKKNEENLRIMWDTIKSKNLHVISIPEQGEKTENTERITEELLTENFPNIMKEEKAAIQEAQRTPYRTNPKRKSPRHTIINLPKPKTNEES	154434	125894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_-_127888_154096
929441	contig_6929_pilon	+	1593	5	Intergenic	novelGene_139400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6083	junction_3	4883.60297321557	18	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	874	1194	127236	130939	TRUE	5	GCCTTTGTGTATCTTTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	126066	132316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_126643_126938_127242_127703_127787_130707_130971_131948
929442	contig_2730_pilon	+	2080	4	Intergenic	novelGene_135363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_3	173.013165844555	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291607	392473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685
929443	contig_6175_pilon	+	593	1	Intergenic	novelGene_16366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTCCTTGGAAACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1766890	1767483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_+_1766900_1767500
929444	contig_408_pilon	-	1813	2	Intergenic	novelGene_84917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAATCTGTATCTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133561	131704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_133202_133245
929445	contig_2438_pilon	+	2129	4	Intergenic	novelGene_112004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2614.88087682785	10	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	683	1021	311851	312412	FALSE	10	TGGATGGACTCTGGCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTHGKHVFTSAHLLSFTQVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	280742	313520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_280848_311125_311190_311337_312083_312305
929446	contig_7293_pilon	-	432	3	Intergenic	novelGene_54261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCAGAGCTCCTTTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336575	335720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_335803_336109_336254_336369
929447	contig_13101_pilon	-	2989	1	Intergenic	novelGene_172787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	447	2542	2988	237115	236669	NA	35	AGTCTGCAACTAAGCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEGYLQHDAQEVLQCILGNIQETCQLLKKEVKNVAELPTKVEEKPHQKEEMSGTNSIEMDNMRHSEEYKEKLPKGNAKRKSDTEFGNMKKKTKVFKEYLEENQRQTRSKRKATGDMLEIPAKIIPKYTCENECAGPSQKKSRVKINWL	239656	236667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_-_236700_239700
929448	contig_3095_pilon	+	1481	5	Intergenic	novelGene_75166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1837.80324028444	8	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	40	681	220513	226800	TRUE	25	CTAGCCTTTTGAACTATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILNEALILQVLVLTTMMSACGAEDIVADHVGCYGTNVYQSYGPRGQYTHEFDGDELFYVNLCHVFTIDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220473	227808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225461_225566_226107_226409_226645_226814_227021
929449	contig_15518_pilon	+	1273	4	Intergenic	novelGene_127606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	126.323218592449	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	459	914	15096	38055	FALSE	60	CTTCAAAAAAGAAAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPAPSFLL	11172	38414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_38035
929450	contig_6795_pilon	-	1875	11	Intergenic	novelGene_27664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	95.3209840486343	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	866	1288	74661	46152	FALSE	35	AACATGCTGTGGATATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134394	45564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_119021_119195_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
929451	contig_12630_pilon	-	3003	2	Intergenic	novelGene_173074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_1	0	13	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	1	360	81810	78012	FALSE	15	TTCATTCTTCCATTGTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVSVQSTCHWEEGNVSAVTCSVSHLTANRSLSLDLHRDTGTSVISSILYTILILIVLIIVLSIYFLKTTGSRY	81810	75368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_78122_81560
929452	contig_17144_pilon	-	2566	14	Intergenic	novelGene_29240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2063.13171211594	7	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	1088	2482	172736	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLSMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	179784	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166697_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173447_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
929453	contig_1435_pilon	+	1384	1	Intergenic	novelGene_115477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGGTTTCAAACCACCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336575	337959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_336600_338000
929454	contig_12993_pilon	-	1122	1	Intergenic	novelGene_136742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTAAAAGCACAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156222	155100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12993_pilon_-_155100_156200
929455	contig_14023_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_165377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237740	236223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_236200_237700
929456	contig_9177_pilon	-	4550	30	Intergenic	novelGene_32581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1117.00089259351	8	134	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	773	2322	25	2346	25669	16653	TRUE	15	TAACCTCTGCCGGCTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	25693	1713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2826_13576_13696_13890_14089_14296_14417_14811_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20104_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25620
929457	contig_5794_pilon	+	2251	7	Intergenic	novelGene_69762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	586.104489167437	12	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	233	2056	719184	733994	FALSE	30	TTGAATCAGTAGTTTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCQLCMLDRKAQTKDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEEAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSESASYSQVAHIPKPDALYFDDCMQLLAETFPFVDDNEVSLATFQSLVPDIPSNVESPVFTAPSQTQSPETPDLQATIAHIDDMLQDVDQVWEELLSIPELQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN	695410	734189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_695546_718509_718607_719183_719229_730261_730529_731318_731409_731978_732171_732764
929458	contig_7657_pilon	+	1325	1	Intergenic	novelGene_30038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTTCATCTAAAGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234522	235847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_234500_235800
929460	contig_9197_pilon	+	1094	4	Intergenic	novelGene_154359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	157.863513482023	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGAGTTTTCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52522	93174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9197_pilon_+_52731_80734_80892_92373_92417_92488
929461	contig_11281_pilon	+	2332	3	Intergenic	novelGene_125523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1178	2029	1007122	1008132	FALSE	60	CAACTCATAAAAATAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQNPAKLSLRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVL	1005130	1008435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_1005573_1006386_1007852_1008010
929462	contig_16869_pilon	+	2562	1	Intergenic	novelGene_137588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCAAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45140	47702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_+_45100_47700
929463	contig_5092_pilon	-	4498	2	Intergenic	novelGene_62284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATTACAAGAAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378292	373618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_-_374125_374300
929465	contig_10953_pilon	+	2934	8	Intergenic	novelGene_42584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	61	junction_7	18000.7896890267	19	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	82	861	455261	463828	FALSE	20	TGCACTGGAACTTGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKALTKCQEEVSRIPAIHPGMFRPKCDENGNYMPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPHTRSRGHHNCSVFI	455179	465901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_462728_462921_463817
929466	contig_14694_pilon	+	2710	1	Intergenic	novelGene_152481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	233	702	1994	2695	192277	192978	NA	45	TGAAAACAGAAGACATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKKKILTAGAISSIMKNGEKFEVVKDFILLGATINTHGSSSQEIKRRIALGRSATKDLFKVLKSKEVTLNAKVRLTQAVVFSVTSCARESWTMNKKDRRRIDAFELWCWQRILNIPRTAKRTNKSVLEEVQPECSLEARMARLHLTYFGQVIRRDQSVEKDIMFGKAEGQGKRGKPSTGWIDTVAITMASSIATIVRVAQDWAVFCSVVRRVAMSQN	190283	192993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_+_190300_193000
929468	contig_2078_pilon	-	2968	16	Intergenic	novelGene_100170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	76.5240412477601	5	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	581	1746	226	1971	533253	506860	TRUE	10	CATTTGGCCTTTCCCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVFVSGWLILQASYPVFEGDNVDLRCQGKEDNEIIDRIYYKDKKKLDEYENKKCFTLFSVSRDNGEYYCIASGENAWTLYEWTEHSNHLRIQVQELFSPPKLTARPSKPIEGRPVALKCETWLPPQRSHIQLQFCFFRGSQALGAGWSRSPALQIPTMWTEDSGSYWCEAQTISSTIRKRSLPSQIYVQRIPVSDVNLEVRAPGGQVIEGEDLVLVCSVAKGTGTITFSWHREGRVSLGRKTERSLRAELPVLAVKESDAGRYYCTADNVHGPILSKWIAVIVRVPVSRPVLTLWTPRAQGVVGDVVELHCEAQRGSPPILYRFYHEDVILGNNSAPSGGRVSFNLSLTAEHSGNYSCEADNGLRAQRSHQVTLNVTVPVSHPVLTIRAPSAQAVVGDVVELHCEVQRGSPPILYWFYYEDVILGNSSAPSGGGASFSLTAEHSGNYYCEASNDLETQRSEAVAVNIIVPSRNTAGVVGGLLSILGFAAAAAVLLYYFRTQRKSGGIVTGTPGYRPNESSESSLSRPSGTGPQELELVYRNENPEDSNLLYSQILIIQQAKGNSGVRAVEYLRWLLTGF	535387	504719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_-_505662_505743_505776_506836_506907_508726_508796_514636_514723_515320_515346_521684_521793_522157_522431_529455_529735_530102_530388_531775_532061_532301_532569_533231_533307_533365_533475_534554_534576_535345
929469	contig_9561_pilon	-	1343	1	Intergenic	novelGene_100855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTAAAGAACACACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182221	180878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9561_pilon_-_180900_182200
929470	contig_5910_pilon	-	4056	1	Intergenic	novelGene_168420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACACACAGACGTACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145771	141715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_141700_145800
929471	contig_1275_pilon	-	405	3	Intergenic	novelGene_108798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	137.5	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTGCAGCAGCAGCAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546950	505943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_506003_513632_513806_546777
929472	contig_960_pilon	+	3428	1	Intergenic	novelGene_108239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATCTCTTTGCCCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441738	445166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_441700_445200
929473	contig_3956_pilon	+	2223	11	Intergenic	novelGene_14872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1526.18650564078	9	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1617	84	1700	1281682	1290491	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDELFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282884_1283803_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287431_1290335
929474	contig_15304_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_30655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	790	1233	103122	105744	TRUE	30	CAAAAGAAGGGGCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQHGQRAVRGQRAGRGSVGGWSHLKPMAGSSFYVFVSEQPLGSLPYHIPVVGDDRPLQLHHRREDPLHLEEGDGGTVAHAEQEERDEDGDGGPQPIQLPILGLRTALIWVQLWRQGDGLLSVVVVQCLVQHHAGEGAFSLPAILGH	101859	107225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_102106_102578_103327_103546_103683_105641_105962_106042_106374_106483_106523_106931
929475	contig_10109_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_131337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGATAGGTTAAGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239022	236875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_-_236900_239000
929476	contig_7898_pilon	+	2782	9	Intergenic	novelGene_47621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	460.845401816054	1	96	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	1727	2587	590052	599921	FALSE	55	ACCAAAATAAAGTATTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIVGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLEMFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTGSSDSALRPTSTEGQGSLSLSPLSRSSGSRSDFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLVPPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDKEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK	588109	600116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_+_589819_590034_590169_592778_592897_593135_593238_594211_594368_596035_596137_598693_598752_598838_598971_599844
929477	contig_5463_pilon	-	542	1	Intergenic	novelGene_144769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCGCCGCTTGGATTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9815	9273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5463_pilon_-_9300_9800
929478	contig_11293_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_134685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	1008	1496	157739	158227	NA	55	GAAAGCAAAAGGCTATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYARNDKLKRSGVTFIIKKNISRSILRYPVSDSIISICLQGIPVNATIIRIYTPATKARNEEIEDLYQLLQSEIDHTCSQDALIIAGDWNAKVGNETGSVVGNYVLCDRNDTRDCMIEFCNISDLFITDTFFQQRKWRLYTWASSDGKHRNQIDYICGRR	156731	158474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_156700_158500
929479	contig_16211_pilon	+	5804	5	Intergenic	novelGene_150072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1101	1538	132631	133068	TRUE	60	AAGTAAAGACCAAAATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNNNNNKVIQFGKEEVKLSLFADDVVLYIENPKDSMRKLLEQIEKFSSVARYKINIEKSIGFLYTNKEKDKKQIRKTIPFIIAPKNIKHLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQEIKRDPHKWKNIPCSWIGRINIVKITILPKAI	99502	235294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_+_100197_129289_129527_132461_134948_227289_228210_233827
929480	contig_7378_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_120259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGTAAGCCTGCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434003	432798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_-_432800_434000
929481	contig_14546_pilon	-	1114	1	Intergenic	novelGene_157402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	763	1113	13941	13591	NA	85	ATAAAAAAAAAAAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKSRRYEEIKDWFKLRKIEVNTKVIAKETNNPTHQNKRQEKHKDLANTKSTTMKKMKRKYKKNIDSAQKIKWSKETLNNTQKRHQNDSTKLIPINNYAECKWTKCTNKETESGRM	14703	13589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14546_pilon_-_13600_14700
929482	contig_10734_pilon	+	2311	10	Intergenic	novelGene_51201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_9	403.859191938948	23	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	739	1839	1129441	1142903	FALSE	35	AACTGGTGTTAATGTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1127120	1143375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
929483	contig_10864_pilon	-	3995	2	Intergenic	novelGene_107095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	899	1417	963351	962529	FALSE	80	TACCAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLRPWSPHLPPSNSVPQGVWMRLWSFHELSLYKLCWFPLYCVLSHPSPKIPLAIVNNAAMNIGVHMSIQVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCVRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLVCISLMASDLEHFLMCLLAI	964249	959950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_962891_963194
929484	contig_6919_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_163974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	885	1241	23453	23097	NA	40	AGCAAAAACCCAATTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKSKDVTLRTKVLTKAMVFSIASYVWESWTMNKEDTRRYDAFELWCWQRILNIPWTSRRMNKSVWEEVQPECFLEMRMVRLCLAYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVERHQKRGRPSTR	24337	22327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_22300_24300
929485	contig_11304_pilon	-	1593	1	Intergenic	novelGene_156736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAAAAAAAAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567334	565741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_565700_567300
929486	contig_12277_pilon	+	2084	3	Intergenic	novelGene_139702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTTTCCGTGTTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323936	449888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_325660_395698_395912_449740
929487	contig_10864_pilon	-	2679	2	Intergenic	novelGene_107129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAACAGAATAACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1547875	1498354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_-_1500343_1547184
929488	contig_253_pilon	+	2398	10	Intergenic	novelGene_129632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	16	junction_6	6.52819147625261	54	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	67	579	230239	234924	TRUE	25	CACACTCAACCCTTGGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSCNKEGSEQAQKENEFQGAEAMVLESVMFAILAERSLGPKLYGIFPQGRLEQFIPSRRLDTEELSLPDISAEIAEKMATFHGMKMPFNKEPKWLFGTMEKYLNQVLRIKFTGESRMKLHKLLSYNLPLEMENLRSLLESTPSPVVFCHNDCQEGNILLLDGREDSEKQKLMLIDFEYSSYNYRSPDCRGCS	221174	247182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_221229_230226_230341_231348_231483_231852_231955_232920_232980_234533_234622_234896_235259_239867_239975_241712_241795_245886
929489	contig_4881_pilon	-	3648	4	Intergenic	novelGene_179167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	124	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	1358	1981	59017	50724	TRUE	50	AGAAAATTATAGACCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCLQSLAIREMQMKTTMRHHLTPALLARIKNTGNNKCWRVRGEMRTLMHCWWECKMIPFWKMIWRFLRKLEVDIPFNPAIPLLGIYPREIRVITRIDMCTPMFMAALFTIAKRWKQPRCSSADEWINKLWYIPTMEYYATRKNNNESVKHLIIWMKLEAIMLSEISQSQREKYCMRPLLVTTKIVTFWV	60374	546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4881_pilon_-_1724_9486_9818_50564_50758_58427
929490	contig_14415_pilon	-	1957	4	Intergenic	novelGene_77593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	234.765130857772	2	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	303	1418	19037	16882	FALSE	0	TCCTCGCGGCTGCTTTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRLRPTRSGLLACTVICIFIFLYLRNLTPEDAEEEPTYPVIAECGFYPDELCSALFEGKGAAPQIAKFCKNPHRSEILAHLHTPGNCSRISQGLRFITRPLSAEEGNFSLAYIITTDNELAASVQLLRAIYVPQNVYCIHVDEKAPKKYKTAVQTLVNCFENIFISSKVASAGFTRLQADINCMKDLVHSKFQWNYVINLCGQDFPIRTNKEIIHYLRSKWNGKNITPGVIQPPSTKFNTNQSHSKFTPEANIYISPNKRFKEKPPHNLTVYFGSAYYVLTRKFVEFVLTDIRAKDLLQWCKDIQSPEQHYWVTLNRVKDAPGATPNAGWEGHVRAIKWKHEEGNAHDGCKGKTTATTTRKPSSCTKTIQ	23795	16342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_-_17037_18076_19097_22152_22319_23718
929491	contig_8377_pilon	-	1843	15	Intergenic	novelGene_34966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.54523626091314	2	54	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTTAGCGTAAGAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180508	68098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68327_136288_136396_140773_140969_143514_143588_154866_154990_161224_161386_164383_164588_169243_169315_172898_172979_173625_173680_176591_176697_177247_177343_177428_177512_179526_179664_180381
929492	contig_12148_pilon	+	1557	1	Intergenic	novelGene_140344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATGTAGTACATGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125809	127366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_125800_127400
929493	contig_14814_pilon	+	2576	2	Intergenic	novelGene_137735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAAGTTTGGGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354841	357837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_+_357131_357550
929494	contig_2450_pilon	+	1350	2	Intergenic	novelGene_160303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGCAATAGTGTACGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425779	427344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2450_pilon_+_427099_427313
929495	contig_11512_pilon	-	2145	9	Intergenic	novelGene_43303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	380.558286435863	4	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	192	971	396169	367967	TRUE	15	CTCAGCAACGGGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPESDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	409465	366718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367172_367245_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382733_396128_396210_409314
929496	contig_7912_pilon	-	958	3	Intergenic	novelGene_129568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCCACTTGTGCTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106114	80104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_80655_103158_103286_105833
929497	contig_20527_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_138603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	454	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGTAGCCAAAAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15429	17270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_15400_17300
929498	contig_14970_pilon	+	1790	9	Intergenic	novelGene_44970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5999.65258890046	11	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136025_177347_177433_182324_182595_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
929499	contig_14467_pilon	+	1068	3	Intergenic	novelGene_138254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	34	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	112	687	318578	319153	TRUE	0	GCCCTGGCTCCTCCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAPSSPAVGRAPGNCIQRGPEEGGGVASTAATTPRMQSIKCVVVGDGAVGKTCLLICYTTNAFPKEYIPTVFDNYSAQSAVDGRTVNLNLWDTAGQEEYDRLRTLSYPQTNVFVICFSIASPPSYENVRHKWHPEVCHHCPDVPILLVGTKKDLRAQPDTLRRLKEQGQAPITPQQGQALAKQIHAVRYLECSALQQDGVKEVFAEAVRAVLNPTPIKRGRSCILL	306516	319735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14467_pilon_+_306560_318509_319221_319421
929500	contig_7119_pilon	+	2300	3	Intergenic	novelGene_40966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	58	1212	137033	139798	TRUE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	136975	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707_140222_140282
929501	contig_854_pilon	-	352	2	Intergenic	novelGene_36734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	351	1	351	1715189	1713459	FALSE	20	ACCTCGCGGTTCATAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGVELKGLQQRKPGGLAGICRPEVSWPGGNWGLGGRGHSSPQKVDRGCCTVRKGRWSRLSIFAAGEEETYSAVLASAPSALPSTSSSEQSPAPFRAIRRGTTKGRSPRLELVLEGA	1715189	1713457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1713477_1714856
929502	contig_3627_pilon	+	2086	16	Intergenic	novelGene_78435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	331.454706139802	1	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	124	1041	294394	309452	TRUE	50	AGTTCAAAAGGATTAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQESISNPTFTEDSSCCTSANCTTDYIWCSGSAPAPVTAAGTDFSSFYYTATADSATAFITAATAESWFIAAPCPYSFTATTSTKVRSTVQILRKE	292706	318628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292777_294340_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304534_304729_309361_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315154_315963_316050_318589
929503	contig_6445_pilon	-	1692	3	Intergenic	novelGene_76893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1015	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTAGCCTTTTGTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49124	42872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_47776
929504	contig_7254_pilon	-	5015	2	Intergenic	novelGene_145855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1416	1772	238356	238000	TRUE	25	CGAGTTGATTCCGACTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGVLEQGDKTENTERIIEELLTENFPNIMKHEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITCAKTKDKQRILRRACEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETTQARRQWDDI	239771	231114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7254_pilon_-_233744_237385
929505	contig_177_pilon	+	1963	3	Intergenic	novelGene_41833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	5	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	70	1146	417672	418748	TRUE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415661	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_419136_419721
929506	contig_7962_pilon	+	1258	1	Intergenic	novelGene_149283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCTTGTTGCTCCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85145	86403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7962_pilon_+_85100_86400
929507	contig_2798_pilon	+	5743	1	Intergenic	novelGene_120035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	345	5399	5743	132966	133310	NA	30	TTGACAAAGCACCTGGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQPYSGRRLCRTFTAREKSMRGFKTSKSRLTFLLGANAAGEFQLKSMLIKHSESSRALKNYAKSTLPMLYKWNSKAWMIAYLFTTWLTEYFKPVVENYCSGKKKKRFLQKYYCS	127567	133310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_127600_133300
929508	contig_15273_pilon	-	2666	2	Intergenic	novelGene_140421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	514	843	42702	42373	TRUE	35	ATATAGTGATGTGTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNIRKTINVIHYINKTKNKNHVILSIDAEKAFDKVQHPFLIKTLSKIEGKFLNTVKGIYMYKANNQHHPKWREFESIPVENGNQTRMPFITTLFQECAGGHSLNN	43215	39692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_-_40045_40901
929509	contig_3956_pilon	-	1523	1	Intergenic	novelGene_14697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTCGAGAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11106	9583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_9600_11100
929510	contig_13074_pilon	-	1138	1	Intergenic	novelGene_153405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATATATATCTACCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23561	22423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_22400_23600
929511	contig_1275_pilon	-	1704	10	Intergenic	novelGene_108746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	509	junction_3	119.968926017851	41	5	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1380	324	1703	444565	388468	FALSE	35	CTCTAATCCCATCATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESIASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSTENSTSRGNTEPVAELQSNSETAQSTSPSPAGPSTKHAENESVETQANDISVETAEPMDVDHQEHNAEVNSVLDLPATTKADSVDAEMRVLGNSAAKVEGDTKERDLERATEKTEPGDEDLVVAQQITAQRPEHQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPIKPNPLDLQQLQHRAAVIPPMVSCTPCSIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQMDLECRSSTSPCGSSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPP	456935	388466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_388554_395563_395760_397806_397937_400308_400859_411396_411524_440363_440504_442110_442174_444477_444696_448396_448525_456870
929512	contig_3822_pilon	-	1866	13	Intergenic	novelGene_133313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_6	1015.29826966704	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	831	1035	1865	292774	277222	FALSE	75	AGAAAGAGAAAAAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTSRCTRPNGRLLSGGKMRRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASSILWCRGYLKQHGIQPRERRRRRSRSGTRSPKKPRSPKRKLSRSPSPRRHKKEKKKDKDKERSRDERERSTSKKKKSKDKEKDRERKSESDKDVKQVTRDYDEEEQGYDS	296920	277220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_280890_280939_281136_281227_282994_283046_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547_293641_295720_295831_296119
929513	contig_11493_pilon	-	3134	1	Intergenic	novelGene_143700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAGCAAATGTAAAGCAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218419	215285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11493_pilon_-_215300_218400
929514	contig_11316_pilon	+	1590	1	Intergenic	novelGene_122619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	395	907	137674	138186	NA	35	CGACCCACCAACATAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137279	138869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137300_138900
929515	contig_17144_pilon	+	1137	5	Intergenic	novelGene_29201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCCAACCTGGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	172660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168038_172598
929516	contig_19402_pilon	+	2204	1	Intergenic	novelGene_80842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTTTCAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144504	146708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_144500_146700
929517	contig_5686_pilon	+	2250	1	Intergenic	novelGene_45487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	699	1253	239068	239622	NA	35	AGAGAAGTGGGGTGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDQRPTYKSKMIKIMEEKIGTTLGALIHGINRIRTISNNTEIPEEKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDKSNQRLISKICKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDINMHFAKEDIQAANRYMRKCSQSLAIKRNANQNYSEIPSHPTKASINKKTKTTVRYHFTPTRLALIKNTK	238369	240619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_238400_240600
929518	scaffold_12124_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_22188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGAGGGTACTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1243273	1241585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1241600_1243300
929519	contig_9199_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_65629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACCCAGCAGAGAAGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71951	69304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_-_69300_72000
929520	contig_13744_pilon	+	2228	1	Intergenic	novelGene_77158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACATCTATTTTGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196020	198248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13744_pilon_+_196000_198200
929521	contig_17796_pilon	+	1551	1	Intergenic	novelGene_33836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACAGCAGGGCAGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105068	106619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_105100_106600
929522	contig_5594_pilon	-	831	1	Intergenic	novelGene_150121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGCTGGAGAAGGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127704	126873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5594_pilon_-_126900_127700
929523	contig_2476_pilon	+	2223	1	Intergenic	novelGene_157629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	332	652	164791	165111	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKNEVVKDFILLGSTINTHGSSSQKIKRHAALGKSATKHLFKVLKSKDVSLKTKVHLTQAMVFSIASYAYES	164459	166682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_164500_166700
929524	SIRV3	+	424	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4753	1818	2694	403	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGAATACGGCTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6697	7121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6700_7100
929525	contig_4857_pilon	-	1330	13	Intergenic	novelGene_48721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2496.76131746486	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	184	618	1234343	1214663	TRUE	40	ATAAAACAATCTTCCTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHSIGDTKVPFCLQSCVKPLKYAIAVNDLGTEYVHRYVGKEPSGLRFNKLFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIKQGVNNAEKFVQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMLVFLQNLELLGAFF	1238719	1178621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213449_1213529_1214576_1214709_1216754_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226315_1226411_1226440_1234301_1234361_1238553
929526	SIRV7	-	1041	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	112569	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGCGTAATTAGTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2169	1010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1543_1660
929527	contig_17144_pilon	-	1259	9	Intergenic	novelGene_29472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2471.6723557897	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	308	927	132	1058	179764	166277	FALSE	30	TTAAGAAATTCTTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSCLQERVWSVS	183213	166075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166310_166557_166843_167248_167331_167581_167636_174888_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
929528	contig_859_pilon	+	1500	1	Intergenic	novelGene_132828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTGGAAATTCTAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124970	126470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_859_pilon_+_125000_126500
929529	contig_990_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_76068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCCTGTTCCATCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071001	1071672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_1071000_1071700
929530	contig_8617_pilon	-	1024	1	Intergenic	novelGene_73381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61802	60778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
929531	contig_16752_pilon	+	3917	1	Intergenic	novelGene_177680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	250	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	3124	3546	84945	85367	NA	10	GTGCAGGCTCCAGTGCCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSGIPLHVCGSRRGVSLARSSAWPERAPNSRKGKENRQTIQNEEKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGKSKDGARSQALERKEGEVARGKQEIKRSRKKKKQHQQPTNGTQRASQCGLVFLDKRLCPWEAEEAECG	81821	85738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16752_pilon_+_81800_85700
929533	contig_6059_pilon	-	1112	7	Intergenic	novelGene_44836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	3166.90818815801	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	98	661	571639	569146	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	572952	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866
929534	contig_10057_pilon	-	319	1	Intergenic	novelGene_162349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTACAGCCTGGCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90609	90290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10057_pilon_-_90300_90600
929536	contig_18395_pilon	+	2660	4	Intergenic	novelGene_177563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTCACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26059	102520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18395_pilon_+_26069_36548_38665_57402_57673_102255
929538	contig_13021_pilon	-	2609	10	Intergenic	novelGene_8139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCGGCCGCCTCCCGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180081	174506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176057_176403_176499_176586_176664_177133_177276_177362_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178584_178669
929539	contig_9036_pilon	-	2562	1	Intergenic	novelGene_155443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTACTGACTATAAACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82194	79632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_-_79600_82200
929540	contig_11656_pilon	-	3249	22	Intergenic	novelGene_54024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	314	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	2898	3218	485891	468861	FALSE	55	AAGAGATCAAAAGGCAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARRGKSLGAKFCIPSGTSRAATTLGWFSLLMIWISRHHRSRFRGLSSCRHCLIAICSPVSCSLIETRGIIKTMALGHPSDLELKSFLETTLQPNNREAHKIKNNT	537357	468829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_-_468994_484724_484824_485802_485921_489322_489394_507864_507928_508475_508567_510822_510911_513707_513833_520382_520502_521769_521900_522655_522851_523725_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526193_527469_527581_527842_527891_527999_528100_528536_528687_531208_531335_535317_535410_536452
929541	contig_10734_pilon	-	1753	7	Intergenic	novelGene_51466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	139	junction_4	520.421223625632	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	140	1249	2274500	2265543	FALSE	45	AAATCACATGATCATCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIPRSVALNSNRVNLLCFQGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2275884	2265038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270557_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754
929542	SIRV6	+	509	4	FSM	SIRV6A	SIRV616	531	4	18	4	18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	19	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCGCTTGAAAAAGTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2303	10784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2815_3106_3165_10724
929543	contig_2798_pilon	-	1458	1	Intergenic	novelGene_119999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGAAATGAGTAAAGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84794	83336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_83300_84800
929544	contig_7165_pilon	+	3406	5	Intergenic	novelGene_116823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	163	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAACTATATGTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224159	407786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_224243_370245_370514_390432_390624_401612_401883_405192
929545	contig_6873_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_129850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814745	812906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_812900_814700
929546	contig_15146_pilon	-	1908	1	Intergenic	novelGene_116967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATGGAAGAAATAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612970	611062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_-_611100_613000
929547	contig_5057_pilon	-	1839	1	Intergenic	novelGene_151530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1119	1439	568873	568553	NA	10	GCCACTGTTGCCTTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLATECLTTALPGLLQRGGLGKSFMKHWIHEGQHIGDPNNKPVQCGEAIPCGFYTSPHYTQPFFTSTCPSAFWEVSICRFTKASSPIMLIDATCHFTFLKNSHII	569991	568152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_568200_570000
929548	contig_10892_pilon	+	4104	1	Intergenic	novelGene_116748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	93	282	550	831	151479	151760	NA	30	CTCCACACAATATTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGKAFNNSSALTTHLRTHSIEKPYECQECGKTFGYYSSLTVHVRVHTGEKPYVCKDCGKAFTRSSCLTRHVRSHSGERPYKCKVCGKAFRDYSSLIQHIRTQSGERPYECKECGKVFSRSSFLATHIRTHSGERPYECKECGKTFSSSSSFCNHIRTHRGERPYECKECGKAFSRSSHLTRHLMTHSGERPYKCKECGKAFIDYSSLIYHIRTHSGERPCECKECGKAFTSVSSLNRHVRTHSVDNPYKCEECGKSFRAYSSLTRHIRTHSGEKTY	150929	155033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_150900_155000
929549	contig_6445_pilon	+	933	1	Intergenic	novelGene_77071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTAACTTGAATTGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	693674	694607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_693700_694600
929550	contig_5988_pilon	+	2308	5	Intergenic	novelGene_16103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1685.43050880183	13	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	478	780	1225050	1225410	FALSE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRSGTSRGNKLQESTSQTTPGGPELLSREPPQHCLVCAQFQWGWAVCFPLERSLLVPASVCGCFASSELQAGQIPFYTLPSQKECRFVCVPSYPPTPLA	1219938	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1219959_1222595_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
929551	contig_5623_pilon	+	2246	15	Intergenic	novelGene_154827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1798	2118	214788	216948	TRUE	20	GCTGCCGGAACACGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNSSRWFHTGPEHTLTSELDTILHSISLPWKSPACTTSFIRSSAFTLLPWISSMQNGCSRDHRDAEEGFFTGMGGGLVRSFWTWGVGLLCSSRMAKMEEECTMVR	206933	217419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207429_210723_210808_211004_211121_211206_211381_211501_211603_211798_211939_212136_212266_212424_212593_212660_212717_213619_213749_213844_213943_214680_214906_216282_216371_216833_216981_217323
929552	contig_8138_pilon	+	3484	1	Intergenic	novelGene_52508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTTTCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464047	467531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_464000_467500
929554	contig_3095_pilon	+	1386	5	Intergenic	novelGene_75087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	4	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	347	970	149709	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147457_149636_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929555	contig_5039_pilon	+	3130	1	Intergenic	novelGene_64805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	1531	1944	208433	208846	NA	40	ATTTATATCAAGGAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQNPDVLSPCPLLHVTVSLLPAASGTAPPATPISHTSNTLCAGHAVGSFLRAVCNPGPALRCPSHRGAPGLPTWFFTCGGEWRQCSYAAGITGPGHLDELVSTCPPTLPDPMTVCCSFSLSRQLAEYRGRPGMNE	206902	210032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_206900_210000
929556	contig_10042_pilon	+	1704	1	Intergenic	novelGene_79125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGCAAAAATCAATGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52340	54044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_52300_54000
929557	contig_5461_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_156821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTTGAGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260533	262080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_260500_262100
929558	contig_3832_pilon	-	1611	1	Intergenic	novelGene_161474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGTTGTATACCTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401345	399734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_399700_401300
929559	contig_18395_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_177564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCATTCAGTAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36138	38654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18395_pilon_+_36100_38700
929560	contig_5554_pilon	+	1219	1	Intergenic	novelGene_179168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCGAGTGTGAATATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115817	117036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5554_pilon_+_115800_117000
929561	contig_12938_pilon	-	1548	8	Intergenic	novelGene_99693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	89	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAGAAGTGAAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86318	51940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52044_78097_78179_79039_79228_80719_80795_81369_81459_83391_83468_84548_84632_85465
929562	contig_1639_pilon	+	3010	1	Intergenic	novelGene_74904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	1907	2332	306652	307077	NA	20	CGAGGCAGCTGTGAGTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERGIIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIYYAKAVDCVDQNKFMDNIANNGNSRTVVFMRNLYLDQEAVIRIEQGDSTWYKVREGVRQGCIFSPYLFSLCAEQIIREAGPYEEECGIRIGRRLTNNLQYADDTILLKMKKT	304745	307755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_+_304700_307800
929563	contig_14563_pilon	-	2216	1	Intergenic	novelGene_135036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGGAAGTAGGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64974	62758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_-_62800_65000
929564	contig_10324_pilon	+	3142	19	Intergenic	novelGene_7742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1231.61725455938	3	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	302	1486	69577	76226	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPYLFYFNIVKCASPLVLLEFQCPTPQICVEKCPDRYLTYLNARASPDFGYYKQFCVPGFQNNKGVAEVLRDGDCPAVITPSKPLAQRCFPAIHAHKGVLMVGNETTYEDGHGHRKNITDLVEGAKKANGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKHLSQERLLPAHEKHHQSGCPGQSD	68716	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_68799_68964_69076_69379_69441_69529_69654_69771_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75865_76034_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80423_80478
929565	contig_854_pilon	+	4865	28	Intergenic	novelGene_36604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	3524.20494842717	2	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	857	2574	1681	4254	1700894	1715383	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1685230	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1699551_1699687_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1715211
929566	scaffold_9100_pilon	+	1558	9	Intergenic	novelGene_83280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	564.909450708695	3	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	77	373	647136	650500	TRUE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGA	644878	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650455_650495_650581_651029_651204_651950_652069_653344_653449_654139
929567	contig_15165_pilon	-	116	1	Intergenic	novelGene_145311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTCATAGTTACTCCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1991	1875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_-_1900_2000
929568	contig_16185_pilon	+	725	1	Intergenic	novelGene_144729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGTTGATTCTAGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79789	80514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_+_79800_80500
929569	contig_10182_pilon	-	3556	1	Intergenic	novelGene_134617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	438	3118	3555	265631	265194	NA	20	TGCTCCTAGGGACCACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVHTVPTASVPHTGFGPMMVRALLRIQKAPWDLREPRGTRGAPHPAGLQMPGGARSGWEKLSIWRSSCSSSQGVLMSGQPPLWPPLFPASTVSHQDIPKPPPNSGLTPSSPVHNPLAPYHPEVHQMETPLYSTADPCHPLWPHLS	268748	265192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_265200_268700
929570	contig_854_pilon	+	1540	3	Intergenic	novelGene_36733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	764.5	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	189	521	1715005	1715383	FALSE	10	CTACATGCGTGTGTCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRRLHLPFLTVQHPLSHQAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1713435	1716402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713482_1714862_1715052_1715097
929571	contig_10988_pilon	-	580	1	Intergenic	novelGene_104742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATTTAAAAAAAAAAGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330630	330050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10988_pilon_-_330000_330600
929572	contig_20578_pilon	-	1300	1	Intergenic	novelGene_179169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAAGGACATGATACATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16824	15524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20578_pilon_-_15500_16800
929573	contig_1339_pilon	-	1175	2	Intergenic	novelGene_163107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	364	666	247573	247271	TRUE	60	TATATATATATATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHLTESSTARWCLATTTDCCDWDHNRGFWTELEKDVEQNSNSKKKKKKKKKPTRFAGLTDWRNPKSMAPGNPFSPVVKSLPKFHHSAGDCTAS	247936	246696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_246891_246955
929574	contig_8576_pilon	-	4569	3	Intergenic	novelGene_88731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	944	1744	627439	626639	TRUE	50	TTTCACCAAAAAAAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKGQNQNINYRTQTNEIEQQKKPTATGRKEIVKIRAEINEIENIKTIERINKTKSWFFERINKINKPLARLTKEKQERMQITQIRNAMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLQQSDGENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFSEELVPVLLKLFQSTEKEATLPNSFYEASVSLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDVRILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGM	631231	623511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_623954_624255_628263_631111
929575	contig_2933_pilon	+	1189	1	Intergenic	novelGene_111349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAACAATAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845037	846226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_845000_846200
929576	contig_4364_pilon	+	760	3	Intergenic	novelGene_745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	39680	junction_1	9963	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	756	4	759	1530895	1532011	FALSE	10	AGCGCTTCCGGTGTCCCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMEEDIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGN	1530891	1532012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1531018_1531096_1531337_1531618
929577	contig_16231_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_176720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	241	645	161608	162012	NA	50	AAAAATAATTCACCGTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQEDITIINIYTPNDRAPKYIKQTLTGPKREIDSSTIVVGNFNTPLLLKDRTSRKKLHKDTEELNATLNQLDLIDIYRTLHSTAAKYTFFSNAHGTLSTIDHILGHKASLKRIQRIKYYKASFLTIKP	161367	162977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16231_pilon_+_161400_163000
929578	contig_9727_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_86272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGCAGAGAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109556	108178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_108200_109600
929579	contig_4531_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_47884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTTGTAATATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293169	293915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_293200_293900
929580	contig_10444_pilon	+	2676	7	Intergenic	novelGene_139457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	97	junction_1	70.4501399730492	10	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	770	2310	367	2676	712175	887220	FALSE	15	CCCAGCAGCATGTTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKTPITSVPLGPLASSPTKSSEGKDSGAAEGEKQEVGDPDCFSEKAEPAEEEEEEEDEAEEEEEEEEEEEEEEEDEGCKGLFPSELDDELEDKPHEESGAAAGSSSKKDLALSNQSISNSPLMPNVLQTLSRGTASTSSNSPSSFVVFDGANRRNRLSFNSEGVRANVAEGGRRLDFADESANKDNATAPEPNESTEGEDGSFVSHHQHAGSLCELGVGECPSGSGVECPKCDTVLGSSRSLGGHMTMMHSRNSCKTLKCPKCNWHYKYQQTLEAHMKEKHPEPGGSCVYCKSGQPHPRLARGESYTCGYKPFRCEVCNYSTTTKGNLSIHMQSDKHLNNMQNLQNGGGEQVFSHTAGAAAAAAAAAAAAANIGSSCGAPSPTKPKTKPTWRCEVCDYETNVARNLRIHMTSEKHMHNMMLLQQNMTQIQHNRHLGLGSLPSPAEAELYQYYLAQNMNLPNLKMDSAASDAQFMMSGFQLDPTGPMAAMTPALVGGEIPLDMRLGGGQLVSEELMNLGESFIQTNDPSLKLFQCAVCNKFTTDNLDMLGLHMNMERSLPEDEWKAVMGDSYQCKLCRYNTQLKANFQLHCKTDKHVQKYQLVAHIKEGGKANEWRLKCVAIGNPVHLKCNACDYYTNSLEKLRLHTVNSRHEASLKLYKHLQQHESGVEGESCYYHCVLCNYSTKAKLNLIQHVRSMKHQRSESLRKLQRLQKGLPEEDEDLGQIFTIRRCPSTDPEEAIEDVEGPSETAADPEELAKDQESGGEKDQSKWTASSSQGEKELTDSPATSKRISFPGSSESPLSSKRPKTSEETKPEQMYQCPYCKYSNADVNRLRVHAMTQHSVQPMLRCPLCQDMLNNKIHLQLHLTHLHSVAPDCVEKLIMTVTTPEMVM	711808	887220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10444_pilon_+_713289_722310_722808_784303_784536_854597_854706_874782_874917_875068_875270_887196
929581	contig_12969_pilon	-	2300	2	Intergenic	novelGene_61649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1535	1840	6917	6612	FALSE	45	ACTCCCCAGCAACAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVLELRSTLFTSIILCLIVQSNLCLKSWLQEWFQFWANREYRVHVFQVPLVSVRPLSLVFLLEFEFCTLLFSCCIKDSLLCCLSGWSLVVVRHHLVLVSG	22665	6151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_8354_22567
929582	SIRV7	+	2092	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	57	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTAATTTGTTATTAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014	114942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
929583	contig_19977_pilon	+	1598	1	Intergenic	novelGene_175620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAAAAAAAAATTCAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62872	64470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19977_pilon_+_62900_64500
929584	contig_14326_pilon	-	4144	2	Intergenic	novelGene_120741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_1	0	6	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	30	383	487141	473411	FALSE	55	GAAAGGAAATAGTAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSHFLQSLRMLPLRAFRTDARKIHTAPARALYLLRPLPILLATGGGYAGYRQYAKYRERELEKLGLEIPLKLAGPWEVGIRWTHHGSSSSTAVSCFLNCPEVETFEKVKCAFLELMSPVGFGQIWK	487170	469649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_-_473737_487113
929585	contig_5033_pilon	-	6519	1	Intergenic	novelGene_28972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	658	128	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1406	1720	474714	474400	NA	35	AATCCCAGCCAGGCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMRGHLNARRHLAASSTEEPITEMGWLCPGAPCGCFNFPINGTKVPCWGLVFSVRMWPRQEVHCWEGATPLVCMQCVCVVVGVLGTKEKKEGRQGGVLSAYLV	476119	469600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_469600_476100
929586	contig_2332_pilon	+	495	6	Intergenic	novelGene_58676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3277.64055381306	76	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4	402	331257	334269	TRUE	10	TTTGCGTCTTTTTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMKTILSNQTLDIPENVDISLKGRTVIVKGPRGTLRRDFNHINVVIQESGSLVEIRNFLGEKYIRRVRMRPGVACSVSQAQKDELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVKNKDIRKFLDGIYVSEKGTVQQADE	331253	334839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_+_331303_331377_331458_332962_333048_333846_333928_334162_334280_334756
929587	contig_3956_pilon	+	2544	14	Intergenic	novelGene_14831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1455.96687409485	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	335	1273	1284763	1288974	TRUE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKRNPTRWSRTGRLSVRSRTCSASPSPRTSTTVCT	1281598	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1284729_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287302_1287487_1287536_1287968_1288077_1288872_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929588	contig_9706_pilon	+	1999	13	Intergenic	novelGene_20935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_12	632.369068573795	127	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	250	1470	231608	366533	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFISLLALITITFPSDLDLISNSAGIQLDLHLNLHHNWHKQDFSFSD	231358	367062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_366398
929589	contig_14508_pilon	-	1756	10	Intergenic	novelGene_79047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	655.180909895395	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	145	708	117502	43875	FALSE	45	AAAAAAAAGGTTTATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADNKEAKHGGHKNGKKGGLSGSSFFTWFMVIALLGVWTSVAVVWFDLVDYEEILGKLGVYDADGDGDFDVDDAKVLLGLKERSASEPTVSSEERESHGAPGEQAPSGEEPQNIEDDVKEQIQSLLHETLHTEHDDITYQVYDEQVYEPLEDERIEVSDNAVEDSNIIPEDVSVPPAEEQQEVPPDT	117646	42826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14508_pilon_-_43883_49687_49733_54504_54541_54910_54950_63387_63421_74524_74600_77847_77941_109280_109350_111889_112040_117486
929590	contig_11285_pilon	-	1976	2	Intergenic	novelGene_5729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CTCAAAAAAAAAAAGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	897259	894344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_895503_896441
929591	contig_18194_pilon	+	2458	6	Intergenic	novelGene_55948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1381	1728	4994	5341	TRUE	5	CATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDDAWLQLSVVETSDGRTAFTACSQSPVDISLLALAFADDLAEWSTMLVETLVIAAATPSPTPVAHNGRLTPAVTGARAKPRMVRMPETVLVELATMWEMVQSLCILPTLSARA	3348	22229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_+_3526_3790_5503_7036_7162_18866_18975_20363_20415_21944
929592	contig_10196_pilon	-	3082	1	Intergenic	novelGene_132249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	312	939	862	1800	1805117	1804179	NA	50	CATATATATACACACACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFCKTNNFFTANTFFQQHKQQLYTWTSPDGIRRNKIDYICGKRGWRSLISSVRTTPGADCGTDRQLLICKFKLKLKQIKTNPQGPKYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTKDRRSDELWDDIKGIIHEESKSSLKRLERKKSPEWMSEQTLKLALERRVPKVNGRNEVTELNRRFQRAAHEDKVKYYNDICKDLEVENRKGRTHSAFLKLKELKKKFKPQAAVLKDSMGKILKDTGSIKRRWREHTESLYQRELADVQPFQEVAYDQEATALKEEVQTAMKGLVKNKAPGTDRYQLRCFNKRIKCWRYSLV	1805978	1802896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1802900_1806000
929593	contig_11794_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_173197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1141	1527	96952	97338	NA	15	CCAGGCTGAGCTGCGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHLCFFLRGCRALVICDICFPTLYPSSPTLGPFCFPRTQSLVQKHQTALAGSLSAICWLLVLLFFSASFDFLLASRHIPLPSLKYLVLCAIFASSRGAVELHSSVELLPGLGCRAGGIQGLLFVCLF	95811	97384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11794_pilon_+_95800_97400
929594	contig_5125_pilon	+	2410	8	Intergenic	novelGene_43430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	3	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	180	1313	35654	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25977	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26084_26471_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
929595	contig_7816_pilon	-	2261	2	Intergenic	novelGene_66527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAAGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209152	206748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_207660_207802
929596	contig_2227_pilon	+	1347	3	Intergenic	novelGene_142334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3432.5	2	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	77	451	230510	231819	TRUE	25	GCATTTTAACCAATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKFLRTKGLTSERQLQTFSQSLQELMAEHYKHHWFPEKPCRGSGYRCIRINHKMDPLIGQAAQRIGLSSQELFRLLPSELTLWVDPYEVSYRIGEDGSICVLYEASPAGGSTPNSTNVQMVDSRISCKEELLLGRTSPSKNYNMMTVSG	230433	232756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_230517_231451_231851_231891
929597	contig_5945_pilon	-	2656	7	Intergenic	novelGene_104577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	288.709003823727	2	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	26	754	249708	219523	TRUE	50	ATTATATTAACCAACAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAVSRDLNAYPREHLYVMVNAKFGEESKESIGDEEEEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSQSVSSQYNMAGVRTEDSIRDFEDGMEVDTTPAVAGQFEDADVDH	249733	216801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_218691_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235755_249568
929598	contig_10541_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_144654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCGGCCTTTTGAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318322	319926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_318300_319900
929599	contig_12790_pilon	-	1938	10	Intergenic	novelGene_35254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAGTCGCGGAGCCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313340	306046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306131_307244_307339_308741_308840_309576_309754_309871_309922_310030_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312033_312347
929600	contig_854_pilon	-	5283	33	Intergenic	novelGene_36564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.39194109070751	29	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	2379	3185	1706853	1698224	TRUE	15	GCTCCAGACTCACCCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPPPPPAALPAPGCSAASSSSPSAGAGSAPPPPPLWPQGHGKSLPAPASWRSGGTGAPQPRHTALSPPGAAPAAATSPP	1716118	1672818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1672896_1677513_1677608_1678130_1678196_1678749_1678848_1679248_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694524_1695117_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1698945_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1715303
929601	contig_6270_pilon	-	2855	1	Intergenic	novelGene_99856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATTAAATAAAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	775700	772845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_772800_775700
929602	contig_12411_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_145677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATTAAAAAAAAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290706	291858	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_290700_291900
929603	contig_7695_pilon	-	2160	4	Intergenic	novelGene_41572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	41.4835978296108	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	56	1123	397040	390473	TRUE	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLLSGGEVLAFREGGGKMKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPVLAIQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPLTVLSPLSPSGPHIGASWPALAPSLLQLPHLALMVEPRPQPRPSLPMGVRQLQRLRLTPMGLRAPPLPPTVTSHPLTAPRLPLPMGFVRLPLPTMPREQLPP	397095	388146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_388902_390190_390785_390839_391259_396703
929604	contig_4213_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_124805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAGAAGAAAGGAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32843	33592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_32800_33600
929605	contig_6795_pilon	-	1252	1	Intergenic	novelGene_27701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCAGCAATGGATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116087	114835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_114800_116100
929606	contig_2100_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_50599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTATGTCTGAGCAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	697560	696122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_696100_697600
929607	contig_10074_pilon	+	3094	1	Intergenic	novelGene_57107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237112	240206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_237100_240200
929608	contig_17144_pilon	-	1540	8	Intergenic	novelGene_29273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2452.8650303559	4	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	124	612	179764	174873	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFK	183205	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167653_174872_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
929609	contig_8375_pilon	+	2667	13	Intergenic	novelGene_141273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	122.063820966283	40	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	110	1294	31124	41535	TRUE	20	GATCTGTGCAATGTCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITEGDQLHVKCTIQVTHLAQAFPEIIIQKDKAIVAHSRHGNEAVYSVMAAEEHNGNYTCKVEASRISKVSSIVVNITELFSKPKLESSITRLDEGESLSLQCTIPGAPPANFTIWKENMTVTQTQNFTKVASEWDSGTYMCTAAIGNVVKRSNKVQITVCEMLSEPWIFHDSRSEVVKGRTIAISCQSINGSLPISYHLLKANKTLESFQKSSSDPAVFKDKPTKDTEYQCIAENCHSHGKIISKVLRVKVIAPVEEVKLTIMLSEEVESGKAFVLQCCVNEGSGPITYRFYRENENKPFHETTTNDTQAIWHKAEASKEQEGQYYCTASNRANFARSLPQSNKLTVKVFLAPWKKGLIAVVVIGVIIVTLLLGARCYFLKKAKGEDSYFIPF	30857	65681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_+_30926_31082_31359_35207_35457_37050_37327_40524_40813_41398_41539_42570_42599_43354_43432_45562_45617_46934_46998_51082_51140_59731_59755_64613
929610	contig_16098_pilon	+	1582	1	Intergenic	novelGene_46234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	59	180	247	426	766786	766965	NA	25	GGAATCTTTATTGTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGTPRERSEDWYGSAVPLLTDPAPETPNPGGTLEARATAPSAPSAPYAPPSALVSQAAPQAPVRSTFWVPQPWEERPHNPGMVSWAEPELRPGASVFLGNPQSRRQRPGSPEPDWGLQPRVTLEQISAFWRREGRTSVGF	766539	768121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_766500_768100
929611	contig_5799_pilon	-	1900	1	Intergenic	novelGene_50227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	110	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACACAATAGCATCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119300	117400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_117400_119300
929612	contig_14225_pilon	-	2094	1	Intergenic	novelGene_52755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	126	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1487	1795	368848	368540	NA	35	ATGTGTAAGGTTTAATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDTLLKSSISSNSFLVDSLEFSVYKIISSANRYTFTSSLPIWMCFISFSSLTALARTSSTMLNKSGDKGHPCLVPILKGNAFKLSLFRGSGQSWRRM	370334	368240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_368200_370300
929613	contig_15666_pilon	-	1886	6	Intergenic	novelGene_70181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	642.644847485763	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	191	1225	110619	107816	FALSE	25	GGAAAGTGATGTTGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110809	107154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108859_109098_109378_109948_110246_110558
929614	contig_4874_pilon	-	1102	1	Intergenic	novelGene_78638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGCTTCAAGTCCTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397727	396625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4874_pilon_-_396600_397700
929615	contig_7843_pilon	-	4119	5	Intergenic	novelGene_152052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	69.7329728320828	6	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTGGAGGGACCTCCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547708	501030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_501753_520634_520790_541803_544856_547249_547393_547661
929616	contig_8820_pilon	-	3912	2	Intergenic	novelGene_79284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	701	junction_1	0	105	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	2879	3250	167103	166441	FALSE	20	TGGTGTGTGAAAATGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERIMKAQALRDNSTMGYMAAKKHLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMIKLGLGIDEDDPTADDSSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD	169981	165778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8820_pilon_-_166551_166841
929617	contig_6215_pilon	-	2919	10	Intergenic	novelGene_21207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	765	junction_5	584.51019908938	4	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	57	1418	243029	228234	FALSE	30	AGACAAAGTGTGTAGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSVLGLCSVASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFMLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFHLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPDSCAENKAFISVNMLLCIGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITIYTMYLTWSAMTNEPDTTCNPSLLSIIGYNTTSTISKDGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD	243085	226732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_-_228370_229717_229949_230069_230215_231669_231761_231862_232033_233714_233853_234066_234147_235190_235361_238588_238751_242990
929618	contig_7173_pilon	-	827	1	Intergenic	novelGene_37534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCCACTGGTAGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216730	215903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_-_215900_216700
929619	contig_19412_pilon	+	1811	1	Intergenic	novelGene_178699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCCTGTGGAAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190	2001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_+_200_2000
929620	contig_9482_pilon	-	1132	1	Intergenic	novelGene_44254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAGAATGAAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735706	734574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_734600_735700
929621	contig_4125_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_25274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3396487	3398567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_3396500_3398600
929622	contig_6397_pilon	-	2183	1	Intergenic	novelGene_146269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAACTGACAAACTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501811	499628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_-_499600_501800
929624	contig_8330_pilon	+	1130	2	Intergenic	novelGene_71724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1	453	162372	162824	TRUE	15	TTCACTGTCCAGCTGGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCLALPSLAQPNSSQPCPALPCPACPDLPFIAQAFPAQLCLLSPCPALPSFPNPVLPSPALPCPVLLHCLPLRLRAYSHPQKGHSKNLINPNPNFALISTCTTPGATLAPGPAVVLPCSFPSSCPGPAPGCPLPSLFLRHTDTDSCPQS	162371	164443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_163304_164245
929625	contig_4900_pilon	-	2011	7	Intergenic	novelGene_159077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	244.100673675615	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	132	659	1188120	1181643	TRUE	55	TAACAATCTGCAGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCGCGLLGVGIWLSVSQGNFATFSPSFPSLSAANLVIAVGTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLWQTGCYDKVKMWFDDNKYVLGTVGMCILIMQILGMAFSMTLFQHIHRTGKKYDA	1188251	1180007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1180920_1181202_1181715_1184601_1184686_1185057_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
929626	contig_13004_pilon	-	1507	1	Intergenic	novelGene_112592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTAGGTGGTGTCCTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57283	55776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_-_55800_57300
929627	contig_5967_pilon	-	1935	7	Intergenic	novelGene_44350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	507.419178019734	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	374	916	412501	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	465527	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424041_430724_430797_465406
929628	contig_6266_pilon	+	2159	4	Intergenic	novelGene_170978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	36	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCAGATTTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87695	129985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_88576_88618_89016_117484_117843_129461
929629	contig_3015_pilon	-	2870	1	Intergenic	novelGene_163312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	638	1168	157998	157468	NA	20	TATTGGCACCTTTGAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQKTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDHPVEKKSLDLTDREFKSLLFRIIQELKQKKDKNEEKTDKFMEKADKFMENKDKKMEEFNKIIQEQNAKINSQLKFIQKQELEIQKINNKISEMDSVIKGLRSRFETMKDRICEIEDKHLDTTLFEEKFCSFLNVVCLIYFLPSFEF	158635	155765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3015_pilon_-_155800_158600
929630	contig_6871_pilon	+	2172	2	Intergenic	novelGene_21566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	194	1141	134070	135017	FALSE	25	GGATAAACGAGTGTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121939	136048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121966_133902
929631	contig_13265_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_146004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGATACCTTTTGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73261	74187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13265_pilon_+_73300_74200
929632	contig_11086_pilon	-	2433	12	Intergenic	novelGene_61194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1415	1750	45735	43247	TRUE	50	ATCGATGATTAAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLLSCAFQVIQPDGSCSFPEMRRTNGFNGHSTAQLSAHHVGVVHVPVVITDVAPGTLVKDFHSPSTGTAPIHQAEPSVLWAVSSTVLRGCRARWVRYGVVAWKQKLGLVS	52228	35276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_-_35326_42516_42823_42918_43248_45326_45418_45491_45814_46371_46685_47653_47696_47784_48112_48739_48893_49650_49739_50805_50948_51957
929633	contig_5253_pilon	+	1744	1	Intergenic	novelGene_61567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCATTACACTACAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211455	213199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_+_211500_213200
929634	contig_13301_pilon	+	1423	8	Intergenic	novelGene_153120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	283.256788379847	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	430	1158	171502	172980	FALSE	65	AGAAAATGAGAAAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGWSNWVPWGPCSATCSKGTQTRQRACDNPVPKCGGHCPGEARESKPCDTQQVCPIHGAWATWGPWEPCSGTCHGGRHAPTERRSRTCSAPEPSTKPPGKPCPGPAYEQRGCTGLSPCPVAGGWGPWSSVSPCSVTCGLGQTLERRTCDKPLPQHGGPFCAGDSTRTHICSVAVPCPVDGEWEPWGEWTTCSRRNMKFISCEEIPGQQTRSRDCKGRKFNGQRCVGKQQDIRHCYNVQRCR	169185	173245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13301_pilon_+_169282_169368_169520_170822_171003_171499_171671_171809_172002_172203_172378_172631_172824_172978
929635	contig_7629_pilon	-	2585	2	Intergenic	novelGene_153594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACATTTTGTCTCACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422342	382049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_-_384285_421992
929636	contig_753_pilon	-	1452	4	Intergenic	novelGene_112983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_3	97.5602378020882	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	157	687	1210648	1196902	FALSE	75	AATAAAATTTAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GECAARRRVLTLAGFGCCRPEELGGGGSSKSSSGGGSSCEEVVTVATAASATMARLVAVCRDGEEEFPFERRQIPLYIDDTLTMVMEFPDNVLNLDGHQNNGAQLKQFIQRHSMLKQQDLSIAMVVTSREVLSALSQLVPCVGCRRSVERLFSQLVESGNPALEPLTVGSKGVLSVTRSCMTDAKKLYTLFYVHGSKLNDMIDAIPKSKKNKRCQLHSLDTHKPKPLG	1210804	1196136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1197005_1199447_1199702_1202716_1202798_1210555
929637	SIRV7	-	1722	2	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	111684	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3054	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2635_2961
929638	contig_16761_pilon	+	2833	2	Intergenic	novelGene_146901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	422	841	344360	344779	TRUE	40	GGAAGTACAACCAGAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFVIALCTSLFLYLVHCENVIPASSLSSNVDCSVGGGAGLSRSFKVESPPLSGIAMSEGSSLHKVCPLQDSRDDKQVQGYEAPLLTPIQANSEGPLASVLPLAGPGLRGDCIMVRVLPLPSSASSLPFPGCHPKSSTK	343938	405521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_+_346499_405248
929639	contig_10225_pilon	+	1925	12	Intergenic	novelGene_86809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	592.986251286551	4	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	699	1673	39882	47494	FALSE	20	TTCTGATCCTAGACTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFEAVGTVRPGLYLQELPAAPRWAYRNGGRGRRAGPGEVCRAALS	20691	47746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35590_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42627_46319_46783_47363
929640	contig_5451_pilon	-	2840	1	Intergenic	novelGene_167195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACATATAATGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	848847	846007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5451_pilon_-_846000_848800
929641	contig_1406_pilon	+	1868	4	Intergenic	novelGene_25592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	430.144420191896	4	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	184	525	2179513	2185260	FALSE	35	TAGCCAAATCCAGCTGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2176190	2186603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2176336_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
929642	contig_10930_pilon	-	1403	5	Intergenic	novelGene_37049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1836.06937505095	3	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	975	428	1402	279894	274026	FALSE	50	AAGAGGAAAATGAAGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLNYLGCTWRDSFDLTYFEQGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLE	280356	274024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_274325_276723_277013_278443_278637_279700_280025_280059
929643	contig_18506_pilon	+	1135	1	Intergenic	novelGene_67957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATAAAATCTAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32475	33610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_32500_33600
929644	contig_14326_pilon	+	1543	1	Intergenic	novelGene_120784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCAAAGCTGTCAGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	870959	872502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14326_pilon_+_871000_872500
929645	contig_7201_pilon	+	2319	1	Intergenic	novelGene_152503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACCTTGCCTATTTTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150486	152805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7201_pilon_+_150500_152800
929646	contig_11463_pilon	-	3816	1	Intergenic	novelGene_179170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	338	655	3479	3162	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGCRVQYMSMRSSWLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFTESGMLKSPTTIVELSISFFRAVRVCFMYFGALLLGA	3816	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11463_pilon_-_0_3800
929647	contig_8412_pilon	-	2280	1	Intergenic	novelGene_118395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGAATATACACAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	696151	693871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_-_693900_696200
929648	contig_3095_pilon	+	1275	5	Intergenic	novelGene_74964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	103	867	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147138	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929649	contig_7569_pilon	-	4164	1	Intergenic	novelGene_114593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1015	1353	101362	101024	NA	55	AGTCAATAAAAATGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSGTLSDTLSEDEPLRLEGTQNTTGEELSPQSRDDLNDMDGVKLSGPSFTDVTRLNMRRNRCKHPLIIGTWNVRSMNLGKLEVIKNEMEHMKIDILGITELKWTGTGNFE	102376	98212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7569_pilon_-_98200_102400
929650	contig_4091_pilon	+	5358	3	Intergenic	novelGene_172998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1967	2476	56711	57220	TRUE	10	TATGATTCTTTTCTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELLDREFKSLILRIIQELKQKADRNEEKIDKFMEKAEKFMENTDKKMEEFRKIMQEQNTKINPQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKQLEYNSVPGKLRKKKNEETLRVMWETIKSKNFQVIRVPE	10691	157519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12028_56080_58035_155451
929651	contig_9345_pilon	-	1841	6	Intergenic	novelGene_24630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	7	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	269	700	955353	948024	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELFSKDQRWSEGGF	1001343	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948064_949491_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
929652	contig_14807_pilon	+	1220	6	Intergenic	novelGene_124652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGCAACGAAATAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36753	39796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37420_37576_37648_38297_38438_38632_38744_38830_38883_39616
929653	contig_5236_pilon	-	2365	17	Intergenic	novelGene_100895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	302	739	83405	77054	TRUE	15	TCCTGACATCAGTGGGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFCGVCFFQDVKLKVFIPNLSISDTVKAWWTLGFCVDLSKAVVAHLVHEAVEQHWRALAVHTELPSRRVVVVLLDVFARVCAASNSDHPQKLVDIVRRIPSEASENDQNVADIKLPHDLIGFFFCGCHCLPYSRNMGIIPCVIVH	84327	62791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_62879_64042_64108_66493_66613_67070_67217_68411_68503_69702_69811_70439_70603_71864_72045_72868_73034_74061_74152_75043_75201_75463_75651_76985_77102_77238_77344_81584_81775_83310_83426_84046
929655	contig_755_pilon	+	4086	1	Intergenic	novelGene_119768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACATTATTTATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83016	87102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_755_pilon_+_83000_87100
929656	contig_4091_pilon	-	4048	3	Intergenic	novelGene_173033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCTCCATTAAGAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38769	16002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_17603_36189_37276_37407
929657	contig_14687_pilon	+	902	1	Intergenic	novelGene_107954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCAGTGGTTAAGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599936	600838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_599900_600800
929658	contig_10196_pilon	-	1914	2	Intergenic	novelGene_132203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAATAAATAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251193	1249007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1250169_1250440
929659	contig_14925_pilon	-	1254	3	Intergenic	novelGene_55324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	336	7	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTGCCTTTGGCTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129477	112096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113087_115877_116101_129436
929660	contig_14219_pilon	-	2766	1	Intergenic	novelGene_54293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAACATTTAGGTCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625094	622328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_-_622300_625100
929661	contig_10460_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_157460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTGCTTGCCTTATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38075	39543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10460_pilon_+_38100_39500
929662	contig_17144_pilon	-	3595	10	Intergenic	novelGene_29559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2198.36399327172	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	482	1449	2112	3560	173384	166152	FALSE	10	GCTTCCTGTAATTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFYILKCTILSTHVLMSRRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183216	166116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166889_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173321_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
929663	contig_3837_pilon	+	2597	1	Intergenic	novelGene_104025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGATTTTTCATATGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138288	140885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3837_pilon_+_138300_140900
929664	contig_4659_pilon	-	1813	1	Intergenic	novelGene_118164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATTAAAAACTTTTTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87363	85550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_85600_87400
929665	contig_3382_pilon	-	2402	1	Intergenic	novelGene_123990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	1121	1708	56412	55825	NA	30	CTGGCTCAACAGCACCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPKKGDPTECGNYRTISLKSHTSKILLKISQKQQQYIDRELPEIQAGFRRGCGTRDITADVGWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDHVNHNKLWTMLQRMGIPEHLTVLMRNLYIDQETVVRTEQGDTLWFKVRKGVYQGCILSPYLFNLYAEQSEKLDYMKKNGASGLEEDSLTTCVTQMTQSCLLKVKRT	57532	55130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_55100_57500
929666	contig_3956_pilon	+	2589	9	Intergenic	novelGene_15203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1225.00285713953	3	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	116	1537	1286091	1289956	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1282846	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283837_1286084_1286224_1286409_1286606_1287285_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
929667	contig_3252_pilon	+	2152	2	Intergenic	novelGene_61510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTCATCAAGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	633443	651323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3252_pilon_+_634077_649804
929668	contig_5918_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_99510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACAATAAAAATGTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431183	429422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_429400_431200
929669	contig_6847_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_143903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAAAGACCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260662	261479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_260700_261500
929670	contig_14822_pilon	+	1541	1	Intergenic	novelGene_145410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAAAACTGCTTACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171012	172553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14822_pilon_+_171000_172600
929671	contig_5023_pilon	+	1987	7	Intergenic	novelGene_7373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	912	junction_1	891.156629829397	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	71	745	629246	646990	FALSE	25	TGTTACTGCCTTAGTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	625809	648232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
929672	contig_11754_pilon	+	3345	2	Intergenic	novelGene_176974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	98	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	2217	3266	49660	50709	FALSE	35	GGGAATCAGAGCAGTTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSDKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTLRVIRIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKHEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRT	42258	50788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11754_pilon_+_42573_47757
929673	contig_5992_pilon	-	1374	2	Intergenic	novelGene_176606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	371	676	169654	169349	FALSE	40	CACAGACTCACAGACCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKLNSSLHCCTSPTSTHEWTQVVTTSKQTKLRTCLLSLTSSPGRGFHMMGTDFLPQTACLKFKKQNCNFFFPSASPAFKCKSPVLSAVLGSSVCLFKCKI	170071	168650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5992_pilon_-_169817_169863
929674	contig_4301_pilon	-	3244	1	Intergenic	novelGene_65134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	104	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1106	1435	562330	562001	NA	70	AAATTGAAATAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLCKKMQQDPHLTPYTKTNSKWIKDLDIEPETVKFVEEKIGSTLEALIHGINNIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKRELADWEKIGGITSQTKV	563435	560191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_-_560200_563400
929675	contig_12644_pilon	+	1431	8	Intergenic	novelGene_44682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4992.7716444754	295	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	606	1379	2678073	2680576	FALSE	30	AGAAATATGTGTTGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLLDLFIPYT	2677277	2680628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680540
929676	contig_18592_pilon	+	1626	1	Intergenic	novelGene_114785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14036	15662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18592_pilon_+_14000_15700
929677	contig_9177_pilon	+	2139	15	Intergenic	novelGene_32614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1	330	1947	2276	TRUE	5	CTCGGCACTGGGCCCGGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGTYGALGHEGTWSQGGDRGCAVGLGRARPGVWQALWGVLGLGRLGPDSFGGGRHSLWAGSALNKQCPSAHLEALKAGTCTVAAESEPASSVPLPALVLSEASLPVLQ	1946	10667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2729_6538_6588_6686_6817_6906_7088_7250_7417_7589_7741_8489_8582_8895_9056_9149_9315_9403_9509_9727_9861_10294_10485_10577
929678	contig_5153_pilon	+	1864	8	Intergenic	novelGene_74406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	189	junction_7	255.19092492341	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	736	1326	1015039	1022174	FALSE	90	AAAAAGAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	1014303	1022712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
929679	contig_6898_pilon	+	3926	15	Intergenic	novelGene_35693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2375.18562217691	5	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	566	1701	254	1954	104574	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_63950_64038_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125999_126081
929680	contig_12540_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_148061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATAAGTGGTGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	211999	214215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_212000_214200
929681	contig_16870_pilon	+	719	1	Intergenic	novelGene_155482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAAGTCATCCATCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42889	43608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16870_pilon_+_42900_43600
929682	contig_14970_pilon	+	2004	9	Intergenic	novelGene_44982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4959.99072422268	3	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	557	1303	182519	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTENGFISAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136015	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182544_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
929683	contig_10749_pilon	-	637	1	Intergenic	novelGene_133421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAACGTGTTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73052	72415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_72400_73100
929684	contig_13740_pilon	-	1699	11	Intergenic	novelGene_34688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4001.14593710352	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	278	1183	161718	157474	TRUE	40	GGAAATTGTGTAATTATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165404	156804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157300_157452_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162027_165237
929686	contig_15518_pilon	+	798	3	Intergenic	novelGene_127585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	347.5	6	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	279	752	15096	16176	FALSE	10	CTCATGCTTGTTGTCGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGEASIPLHLALF	11046	16222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11237_15007_15202_15808
929687	contig_5302_pilon	-	2343	9	Intergenic	novelGene_81430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	724.682128591564	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	347	790	182005	177300	TRUE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209572	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176851_177030_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182926_183024_185037_185087_209391
929688	contig_6879_pilon	-	6082	4	Intergenic	novelGene_178593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6206	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	5206	5949	137851	137108	FALSE	35	CCAAAGAATGTTTCTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSEKRGMWQEASEKSKEAEKKKKSYTSSQEMAPREPPAWVCGIQAAGASWSRDRGRGKQRNKRTKAPGSHQRRSRDQEAAAHSDGAPQPRRKKQRWCLEPGTRAKGGGGGERQGRNQKKQEKKKSNTSSQQMASREPPAWVCGIQAAGASQSRDCGRRKQRSLSQGEEGWVVGKCTPQITSCFVSHWTLREAAFSYPCLLVSDRSPRWWICTALPGRGPLHESLLALRSLSVFSLHLVLG	164618	136974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6879_pilon_-_138068_138366_140050_144255_145124_162180
929689	contig_8885_pilon	+	1118	1	Intergenic	novelGene_115585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCAGCTTCAAGTTCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261327	262445	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_+_261300_262400
929690	contig_16525_pilon	+	2907	11	Intergenic	novelGene_133885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	44.69776280755	294	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	15	1079	219713	226764	FALSE	30	TGCTTTTTAACACTTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAAPFLRLRSGLRLGARGLCTRLATPPPRAPDQAAGIGSRGSTQAQGSQQQQRRSEGPSYAKKVALWLAGLLGAGGTVSVVYIFGNNSVDETGAKIPDEFDNDPVLVQQLRRTYKYFKDYRQMIIEPTSPCLLPDPLREPYYQPPYTLVLELTGVLLHPEWSLATGWRFKKRPGIETLFQQLAPLYEIVIFTSETGMTAFPLIDSVDPHGFISYRLFRDATRYMEGHHVKDISCLNRDPARVVIVDCKKEAFRLQPYNGVALRPWDGNSDDRVLLDLSAFLKTIALNNVEDVRMVLEHYALEEDPLEAFKQRQSRLEQEEQQRLAELSKSSKQNLFFGSLTSRLWPRSKQP	219698	228592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16525_pilon_+_219821_220730_220885_221236_221269_221490_221513_223044_223104_223194_223315_223737_223843_223952_224052_225050_225208_225558_225666_226662
929691	contig_2770_pilon	-	1497	6	Intergenic	novelGene_107446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1801.97320734799	10	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	214	633	750561	743799	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADVLSTPFPLL	750774	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743832_744068_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
929692	contig_3878_pilon	+	1272	1	Intergenic	novelGene_174793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTAACCTACTGCGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229213	230485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3878_pilon_+_229200_230500
929693	contig_6007_pilon	+	2431	1	Intergenic	novelGene_87904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAGAAATGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27472	29903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6007_pilon_+_27500_29900
929694	contig_720_pilon	-	1978	1	Intergenic	novelGene_155175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1107	1472	237242	236877	NA	70	AGAAAAGAATGAATAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWIPICCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGRSSGVLFWSPTGTILSCFCKCFDIICCLRGIQ	238348	236370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_-_236400_238300
929695	contig_18244_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_177675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGGCAGGTTTATATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274744	524303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18244_pilon_+_274892_278606_279054_279787_279974_345459_345665_524046
929696	contig_4845_pilon	-	2292	1	Intergenic	novelGene_53668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAAAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648338	646046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_-_646000_648300
929697	contig_8617_pilon	-	1116	1	Intergenic	novelGene_73438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63152	62036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63200
929698	contig_15123_pilon	-	1020	1	Intergenic	novelGene_110898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108948	107928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15123_pilon_-_107900_108900
929700	contig_9366_pilon	+	4323	14	Intergenic	novelGene_166235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	318.035463766256	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	775	2328	870	3197	778816	947482	FALSE	30	TCCTCAGTAAGTTTAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGLETTETENTVETEIKEQSAEEDAEAEVDNKQPVPPLQSSVSEESASSMVSVGVEAKISERLCAFCYCGEKSSLGQGDLKQFRVTPGFILPRKNQPSNKKDIDDNSNGTCEKIQNTAPRKQRGQRKERSPQQIIISCVNVSTQTASDDQAGKLWDELSLVGLPDAIDVQALFDTTGTCWAHHRCVEWSLGVCQMEEPLSVNVDKAVVSGSTERCAFCKHLGATIKCCEEKCTQMYHYPCAAGAGTFQDFSHFFLLCPEHIDQAPERSKEDANCAVCDSPGDLLDQFFCTTCGQHYHGMCLDIAVTPLKRAGWQCPECKVCQNCKQSGEDSKMLVCDTCDKGYHTFCLQPVMKSVPTNGWKCKNCRICVECGTRSSSQWHHNCLVCDSCYQQQDNLCPFCGKCYHPEYQEDMLHCNMCKRWVHLECDKPTDHELDSQLKEEYICMYCKHLTVAMDSIQPGDEMEVAELRTDYNNEMEVEGPEDPMVFLEQAVSKDVRGQEFIPGIVPDAVEVHAEEQQKAPESLDTDCLLISESSENKMHLELESQVSREVNSEKLEVSSKVMHICHEDQNENKMEVTENIEVIAHQDIVQQEQLHSSEEPKVVVSPEESRPPKSTIESVSVPPETLKSPSEESTSVCSKEQLPTERLQAEMEQKENSKSSTGFMEFEMTPAIEGYVKDSSCQGDTSLKLPSETESSFSSVADISKANVSSPPTLPSDLPSHDMLHCYPSALNSSAGNIMPTTYISVTPKIGMGKPAITKRKFSPGRPRSKQVG	766512	948608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_+_767339_778772_778862_845092_845229_855680_855882_859063_859213_869119_869230_918087_918251_926693_926866_928718_928834_942410_942581_942987_943140_943924_944039_944954_945027_946754
929701	contig_11294_pilon	-	2494	1	Intergenic	novelGene_50044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	246	614	217327	216959	NA	55	AACTAGACTAATAAGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIGLVWFYSKLSGIVHNLSRPINQDGLDCDTVTITSKSQWLTLQRIISPSCSVSMAVLLHAILTLGHRLLDLPMARTLPGQSLFKFLLKSDTHNFWPHFIILSKSHDLSGVQQQDRYIILL	217572	215078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11294_pilon_-_215100_217600
929702	contig_5302_pilon	-	2583	9	Intergenic	novelGene_81418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	710.044496845092	4	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	252	836	185066	177300	FALSE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209566	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186008_209418
929703	contig_16122_pilon	+	2580	1	Intergenic	novelGene_134532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGAAAAAATTGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205739	208319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16122_pilon_+_205700_208300
929704	contig_12677_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_110820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTTTTAGTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2901	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
929705	contig_2414_pilon	+	2910	1	Intergenic	novelGene_158494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	122	369	536	904	337890	338258	NA	70	AAAAAAAAACACGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFIEKHIGSTLEALIHGINRIQTITNNTQIPEYKLDNWDLLNIKTLMLIKRLHQKSKKTLCTGKKSFRHYKSDKGLISKIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAMELNRHFTKEDIQVANRHMRK	337354	340264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_337400_340300
929706	contig_8611_pilon	+	1685	1	Intergenic	novelGene_166564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AATAAAAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110811	112496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8611_pilon_+_110800_112500
929707	contig_7898_pilon	-	598	6	Intergenic	novelGene_47543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_5	2159.3805963748	4	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	528	70	597	285587	283800	FALSE	15	TGCTGAACATCTCCCCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLN	286095	283798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
929708	contig_19342_pilon	-	2212	4	Intergenic	novelGene_41117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	213	584	6469	5783	FALSE	20	TCCCCTGGAAGGTGCGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGTQIHSNTTCSKRSPESQSWCEQILHNSIPHKAVISPLGCERHIRALGTVAASSLSVAPSLSTCGKKIACERAGRSQDHEVPEEPTSHGLLGSFQNYDCRPRAGSGNKRKGDVWRLDQPSS	6780	4154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_5994_6139_6193_6361_6474_6572
929709	contig_8420_pilon	+	1295	1	Intergenic	novelGene_69352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAAAATAGTACAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55029	56324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_55000_56300
929710	contig_3832_pilon	-	2580	1	Intergenic	novelGene_161491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGAGCACAATTAAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	484315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_484300_486900
929711	contig_665_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_158203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTTGTTGTTTTCTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171446	172155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_171400_172200
929712	contig_4402_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_140848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	594280	594654	NA	20	GTTCTCTAGATTTCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VDSNFSESSFVLDIFSALAIFFPVSLLSFIFLAGAVDEFLSFSGVLSIFSISGSILRFGDGFTISVTSSLEIFNEDDSKSLSTPFSSVFLFLFSPLLSSGLLFSVGFLAFSSLLVSFSDLTSLE	594278	595105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_594300_595100
929714	contig_5640_pilon	-	1060	9	Intergenic	novelGene_27238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	73	junction_8	216.001012729107	1	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	906	155	1060	63466	13928	FALSE	35	GTAATTTCTAAGAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEVPSGTCRPDVPESPDSRQKSPLFQFAEISSSTSHSDVPSKQCQASALLQFAEISSNTSQLGGAEPGKRYGKSALFQLAE	143893	13927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21858_24851_24933_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206_138281_143822
929715	contig_8726_pilon	-	3289	3	Intergenic	novelGene_178261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	78	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	2204	2599	199020	198625	TRUE	25	CGGTAGTGTGACTTTTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKYKSEKLKNCKVLRDPTDAAMRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYSAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRAESKRPAALSPEPAAPGSRGANEQRPQDVINAAAQT	201223	102348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8726_pilon_-_102498_197831_198199_198450
929716	contig_10437_pilon	-	1534	7	Intergenic	novelGene_38322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	694	1017	446992	443860	TRUE	20	CCACGTCATTCTGTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHILSAGWVKVDATFVEEESWATCIHTNRHGPFVSHGLCQGNLTAIGKLSVLGTRGSSVFGVIPALSIHGFVGIGSFRIDAFVIDDVLESPGHEATVAAFIAVFFI	451706	432098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_432227_439686_439814_441716_441866_443746_443976_445308_445475_446950_447053_451073
929717	contig_10990_pilon	-	890	2	Intergenic	novelGene_7518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAATTTGCCTCCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753010	752070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_752145_752194
929718	contig_5196_pilon	-	2063	1	Intergenic	novelGene_38695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCATTAAAAAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265582	263519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5196_pilon_-_263500_265600
929719	contig_11281_pilon	-	2954	1	Intergenic	novelGene_125500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAATGTTCACTGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	941669	938715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_938700_941700
929720	contig_10042_pilon	+	1257	3	Intergenic	novelGene_79230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1184405	1208848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1184478_1207151_1207641_1208152
929721	contig_5643_pilon	+	1411	11	Intergenic	novelGene_38814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1958.85553576572	14	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	579	1199	236700	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
929722	contig_17572_pilon	-	2713	2	Intergenic	novelGene_178423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	12	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	211	636	1357	1992	9977	8941	FALSE	95	ATAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTRALLARIKNSGNNKCWRACGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRKIRVITRIDICTSMFMAALFTAALFTVAKLWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAGRKNNNESVNHLITWMKLEGIMLSEISQLQKDKYGARENEENRIQAKD	11333	8219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17572_pilon_-_8985_9385
929723	contig_19402_pilon	+	4271	13	Intergenic	novelGene_80806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	1378.17327516858	4	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	153	1412	57720	143056	TRUE	75	AACTTTCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	57567	146706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_142957_143063_143802_145684_145734
929724	contig_9099_pilon	+	2343	1	Intergenic	novelGene_149893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTGTAAAACTTCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259133	261476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_+_259100_261500
929725	contig_3155_pilon	+	1350	4	Intergenic	novelGene_26361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATGTAGAATAAAGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258078	262492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258167_259209_259269_261247_261312_261353
929726	contig_16148_pilon	-	2831	13	Intergenic	novelGene_50354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	505.405420320053	2	130	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	1119	2534	111433	59018	TRUE	35	AAAGCTTCTGTCTTAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFPWTENRYDVNRRRHNSSDGFDSGIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSSIFHSGKSQGLHENNVSDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNQNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLQSQPVKNGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKGQTKENKVGTSFPHESTYGVGNFNTFKSTTKNFSPSANSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESHAGSEKDDDSFNLRNSNSTHQERDINRNFDESEIPQENGNASVISQQVIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTIENDDTETSSSDTSDDDDV	153078	58684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_-_58883_58918_59177_63746_63840_74692_74885_75358_75527_77699_77841_78423_78609_85707_85775_88827_89052_89186_89311_111370_111491_150789_151734_152961
929727	contig_10861_pilon	-	2405	1	Intergenic	novelGene_39254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAAATTATATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1099213	1096808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_1096800_1099200
929728	contig_2703_pilon	-	8544	6	Intergenic	novelGene_101773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTCAGAAGGTAAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611732	596246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609400_610754
929729	contig_5033_pilon	+	3648	2	Intergenic	novelGene_28949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	1235	1651	452335	452904	FALSE	0	CCCTGGGCTCCTCTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPALCPECRNAYPPIYCTLSCCTFWALSASAPVASRAWQFLHRGPCWEKPPLQVCSWAGPRPPFHALFSVSAQLSCFLPLPTLARLTLRPKGRCMALWSAAGEVVPLLTNIYVLSPFMIQPVTREEMGKDTGRGLGED	451100	454901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_452640_452792
929730	contig_10609_pilon	+	6148	25	Intergenic	novelGene_123929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	562.95657858755	9	124	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	721	2775	400460	508780	FALSE	5	TGGTTATCTGGTGCTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADTAKCGIHSMFPLHLAALNAHSDCCRKLLSSGFEIDTPDKFGRTCLHAAAAGGNVDCIKLLQSSGADFHKKDKCGRTPLHYAAANCHFHCIETLVTTGANVNETDDWGRTALHYAAASDMDRNKTILGNAHENSEELERARELKEKEAALCLEFLLQNDADPSIRDKEGYNSIHYAAAYGHRQCLELLLERTTSGFEESDSGATKSPLHLAAYNGHHQALEVLLQSLVDLDIRDEKGRTALDLAAFKGHTECVEALINQGASILVKDNVTKRTPLHASVSVINGHTLCLRLLLEIADNPEVVDVKDAKGQTPLMVAVAYGHIDAVSLLLEKEAKVDAVDIMGCTALHRGIMTGHEECVQMLLEQEVSILCKDSRGRTPLHYAAARGHATWLSELLQMALSEEDCSFKDNQGYTPLHWACYNGNENCLEVLLEQKCFREFIGNPFTPLHCAIINDHESCASLLLGAIDSSIVSCRDDKGRTPLHAAAFADHVECLQLLLSHSAEVNAADNSGKTALMMAAENGQAGAVDILVNGAQADLTIKDKDLNTPLHLACSKGHEKCALLILDKIQDESLINAKNNALQTPLHVAARNGLKMVVEELLAKGACVLAVDENVSRSNGPRSALGTAVQKEE	361246	512153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10609_pilon_+_361316_374913_374980_386436_386639_389596_389740_390915_391129_400432_400512_406869_406985_415518_415602_416763_416828_418780_418850_420314_420456_422067_422149_426657_426770_477871_477944_486428_486631_490586_490681_491948_492067_493322_493540_497627_497716_498779_498864_500774_500921_501395_501479_503653_503737_504833_504926_508721
929731	contig_10286_pilon	+	3009	1	Intergenic	novelGene_98419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAATAATAATAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	417460	420469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_+_417500_420500
929732	contig_5696_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_117587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	59	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	278	837	1381	2217	744601	745437	NA	65	ACCACATAAATAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVEINNRKIKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVTEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFVAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTTGRKEIVKIRAEINEIETRKTIERISKTKSWLSERINKIDKPLARLTKEKQERTQITQIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLSSNKFKNLEEMEKFLETHGLPKLQQSDAENLNRPITREEIEKVIKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIYRRACTSTTQAISEHRRGSNTSKFIL	743220	745658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_743200_745700
929733	contig_14694_pilon	-	2048	1	Intergenic	novelGene_152482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATGAGTTTGTTTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192993	190945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14694_pilon_-_190900_193000
929734	contig_8712_pilon	-	1557	1	Intergenic	novelGene_58848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	653835	652278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_652300_653800
929735	contig_8875_pilon	+	3310	3	Intergenic	novelGene_179171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2735	3136	3732	4790	FALSE	10	TGGTGCTTCTGCCTAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKATPAANKRPPESRPPGRTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLREAALSYPVCWSPIGVQDGGSALR	1	4964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8875_pilon_+_1509_2504_3867_4523
929736	contig_7919_pilon	-	1321	1	Intergenic	novelGene_28140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAAGTGTAGCCACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1595435	1594114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1594100_1595400
929737	contig_2257_pilon	+	738	1	Intergenic	novelGene_122503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAGGGTAGTTCAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	310833	311571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2257_pilon_+_310800_311600
929738	contig_5623_pilon	+	2329	1	Intergenic	novelGene_154853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATCATTCAAAAAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221939	224268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_221900_224300
929739	contig_15886_pilon	+	4311	1	Intergenic	novelGene_144329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	68	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTAAAAGAAAAAGGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2027	6338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_2000_6300
929740	contig_15029_pilon	+	3861	1	Intergenic	novelGene_128179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACACAAAAAAAAAAACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159821	163682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_+_159800_163700
929741	contig_16761_pilon	-	3531	4	Intergenic	novelGene_146899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	944	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1516	1881	30512	30147	FALSE	35	TCAGAAGTCTGACCCACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNTKKTKILTTGPISNIMINREKIEVVKDFILLGSTVNTRGSSSQEIKRCIVLGKFATKDLFKVLKSKDVILKTKVRMTQAMVFSIASYACESWTMNKEDRRIDAFEL	221678	28496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16761_pilon_-_30630_159579_159793_169313_169420_220599
929742	contig_3956_pilon	+	2268	10	Intergenic	novelGene_14853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1072.55480161581	9	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	373	1749	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282859_1286148_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929743	contig_10182_pilon	-	3771	2	Intergenic	novelGene_134630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1426	2013	385722	385135	FALSE	50	TCCAAAAAGAAGAAAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEGNFLELLEVEYKRLIYRTLQDIRKEFMQNAEQAKEHTDKAIEELKKIRKEHNHKCNRLQESIERQQSEIQKINNKTSELDNSIGSHRSRIEVMEVRISEIEDKALDTNLFEEKSDKRILKNEETLRIMWDWSTRTGEVTENTERILEDLLAENFPDIMKDEKIPIQDAHRTLHKVDPKRQSPRHNQTCQNER	387686	383376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_386801_387339
929745	contig_9098_pilon	+	1797	1	Intergenic	novelGene_75865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAGGCTTTCCTCCAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381306	383103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_+_381300_383100
929746	contig_6930_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_178892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTAAACCTTCACCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954096	956298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6930_pilon_+_954100_956300
929747	contig_3948_pilon	-	1131	6	Intergenic	novelGene_53317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	549.233283769292	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	12	812	1485208	1468245	FALSE	25	GACTTCATCAACAGGTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFVSGMSNPEVIRALERGYRMPRPEHCPEELYNIMTRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP	1485219	1467925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468454_1471804_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485111
929748	contig_854_pilon	-	2190	15	Intergenic	novelGene_36699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.06031501455085	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	363	1826	2188	1706853	1704894	FALSE	35	ACACAGGGGCGGGAGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLN	1718909	1704891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861_1715079_1718892
929749	contig_10424_pilon	+	1594	1	Intergenic	novelGene_56816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333629	335223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_333600_335200
929750	contig_11821_pilon	+	2593	2	Intergenic	novelGene_176320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1241	2398	9862	11019	FALSE	70	CAAAAACAAAACCTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMVPVGVQIKTPDDSPVEENSLELPDREFKSLILRIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKFEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKLSEMDDVIEGLRSRFETVEDRINGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIVIPEQGEKTENTERIIQELLTENFPNVMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSLRHIIFTLTKTKDKQRILRVANEKQEVTYRGETIRRSSDYSADTMQARRQWDDIYKILKEKTCQPRIIYPAKLLFKFNGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLQSEDKQLQPTGRTYNAGSYEPDTNIGNERSRTLQNQKKYNRESEQSIDG	7963	11214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11821_pilon_+_8279_8936
929751	contig_14780_pilon	-	2447	1	Intergenic	novelGene_166385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCAAAAAAAAGAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99243	96796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14780_pilon_-_96800_99200
929752	contig_3095_pilon	+	1195	5	Intergenic	novelGene_75052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	162	785	149709	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147327_149696_149896_150413_150696_150996_151163_151848
929753	contig_1694_pilon	-	3460	3	Intergenic	novelGene_144941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1032	1475	526338	525895	TRUE	50	ATAAAGAATCACAGCAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQRFIVVLSHCKVHSSVDGHLGCFHLFAIVNNAAMNIRMHMSTRVTTLISLGYIPRSRIAGLNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPNSPQPLQHLLFPVFLIRASNARVRWYLIVVLICISLMASDREHFLKCLLAI	542738	522725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_524214_525397_527035_542403
929754	contig_15821_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_25022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCCAGCAATTCTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124608	125353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_124600_125400
929755	contig_10904_pilon	-	1258	5	Intergenic	novelGene_22756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	54	junction_3	402.971773205022	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	34	915	662714	652299	FALSE	20	CATCTCTACTGTTGTTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGSAVTPIFTALLYLGLCQRQCNQIQAGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGKEKLSFMGLGAHRVHDLQGRWVSWMEFLDPKADWACPALCDFFVYNP	662747	651955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_652496_660333_660634_661462_661763_662408_662445_662665
929756	contig_11720_pilon	+	1543	11	Intergenic	novelGene_43784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2594.6321145781	7	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	626	1522	78465	98482	FALSE	45	TATTTCCCAAGAATTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67798	98503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_75746_75942_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
929757	scaffold_12124_pilon	+	1074	4	Intergenic	novelGene_22196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAAAAATAATTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1321035	1479892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1321315_1462294_1462479_1462925_1462986_1479341
929758	contig_7695_pilon	+	1645	2	Intergenic	novelGene_41645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTACGTAAGTGTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	769824	777329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_+_770207_776066
929759	contig_9332_pilon	+	2203	1	Intergenic	novelGene_60731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGATGAGAAAAAAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548611	550814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9332_pilon_+_548600_550800
929760	contig_11281_pilon	-	585	1	Intergenic	novelGene_125507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTCCAGCTTTTGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	951306	950721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_-_950700_951300
929761	contig_2043_pilon	-	1673	1	Intergenic	novelGene_169900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGGAGATACGTAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674716	673043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_673000_674700
929762	contig_11422_pilon	+	601	2	Intergenic	novelGene_98968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGGATATGGCATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_213_270
929763	contig_11829_pilon	+	4129	1	Intergenic	novelGene_128145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1729	2037	194641	194949	NA	40	AGTTTGTAACAGGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDQELENQKGHAHLAFFKLKELKKKFKPQVTILKESMGKILNNPGSIKKRWKEYTESLCQKQLVDVQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQAAGKALVKKQGSRN	192912	197041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11829_pilon_+_192900_197000
929764	contig_10766_pilon	-	4635	9	Intergenic	novelGene_151213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	93	129	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGACCCTACAGGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376696	178574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_180686_184535_184562_219439_220162_220821_220961_264067_264070_293088_294066_318253_318560_355821_355837_376359
929765	contig_15152_pilon	-	1488	1	Intergenic	novelGene_126972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCAGGAGCAGCCGCAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205327	203839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15152_pilon_-_203800_205300
929766	contig_4908_pilon	+	2704	4	Intergenic	novelGene_117372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	51	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	904	1227	44748	45071	TRUE	20	TGGAATGATATTTTCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIPEHLIVLMRNLKIDYEAVVQTEQGNTVWFKIRKGVRQACLLSSYLLRPYAERIIQETGLREEEHDIRIGGRLTNSLQYADDLTLLGENEEDLKHLLMKIKNYSL	43844	237732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4908_pilon_+_45266_103270_103733_235862_236100_237148
929767	contig_7031_pilon	-	2858	2	Intergenic	novelGene_132782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2213	2551	197874	197536	FALSE	80	AAAAAAAAAGAAAAAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSITSYACKSWSVNNEEQRGIDAFELWCWQRILKIPWTARRSNKSVLEEVQENALQKQRWRDFISHTLAMLSGGTCPWRRTSCSLKYRVNKKEEDPERDGLTQWLLRWAQA	200157	197228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_199870_199940
929768	contig_15407_pilon	+	2559	1	Intergenic	novelGene_123104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	1545	2072	559858	560385	NA	55	GAAATAATAAGAATTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSKLSVIMLNVNGLNAPIKRQRVADWIKKHDPSICCLQEAYIRLKDTNKLKLKGWEKRYQANNTQKRAGVAILISDKIDFKVKSTTKDKEVDYIMIKESVHQEDITIINIYAPNDRAPKYIQQTLNDTKKRDRQLHNSSRRLQCTTFCEGQNIQKEAQQRCRRAKCYNQPT	558313	560872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_558300_560900
929769	contig_4857_pilon	-	3861	16	Intergenic	novelGene_48716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_11	2429.75715658993	373	125	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	2683	3618	1226315	1178809	FALSE	50	TGATGTAAAAGAAATAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRVKSVINLLFAAYTGDVSALRRFALSAMDMEQRDYDSRTALHVAAAEGHVEVVKFLLEACKVNPFPKDRWNNTPMDEALHFGHHDVFKILQEYQVQYTPQGDSDNGKENQTVHKNLDGLL	1245292	1178565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1178966_1181948_1182013_1182112_1182190_1183097_1183160_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1231106_1231280_1234301_1234361_1238553_1238718_1242190_1242271_1243122
929770	contig_8598_pilon	-	2755	1	Intergenic	novelGene_22864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTGCAATAACGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5808	3053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_3100_5800
929772	contig_7426_pilon	+	2772	1	Intergenic	novelGene_27511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTGTCTAGATCCTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966969	969741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7426_pilon_+_967000_969700
929773	contig_7057_pilon	+	1813	1	Intergenic	novelGene_123412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGAAAGAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1400483	1402296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_1400500_1402300
929774	contig_13021_pilon	+	2297	12	Intergenic	novelGene_8200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3010.47063122821	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	381	1286	176597	178735	TRUE	40	ATATTCATCGAATTGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174612	180042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175892_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_179690_179985
929775	contig_15327_pilon	-	726	3	Intergenic	novelGene_70690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6092	junction_1	91.5	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	330	380	900954	900904	FALSE	30	TCCAAGTGTTTAACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	901497	900557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400
929776	contig_854_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_36329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATTGAAGAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701271	699747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_699700_701300
929777	contig_10734_pilon	+	1988	1	Intergenic	novelGene_51276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATTTCAATTTAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1336660	1338648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1336700_1338600
929778	contig_672_pilon	+	2487	2	Intergenic	novelGene_174853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	741	1337	303364	303960	TRUE	45	AAAAAAGAGTAATCTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTRMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	302623	305155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_672_pilon_+_304559_304603
929779	contig_1443_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_28204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	135	440	344287	344592	NA	25	TTCTAATGAGTGAGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLLLLLGVWGPVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344152	344892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344200_344900
929780	contig_1932_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_167341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATTTTTGACAATTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119716	118590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1932_pilon_-_118600_119700
929781	contig_17144_pilon	+	1211	5	Intergenic	novelGene_29382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2870	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	315	897	1211	167621	168280	FALSE	25	TAGATGCAGCTCTGGAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166071	168280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162
929782	contig_10904_pilon	+	3541	1	Intergenic	novelGene_22791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	428	1006	826273	826851	NA	75	GAAATGGAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEASKEDGRNTPSLYQKEFIDIQSFQEVAYDQELTALKEEVQVALKALAKNKAPGIDRTPIEMSQQMDAALEVLTCLCQEIWKTATWSTDWKRSIFMPIPKKGDPTKCRNYQTISLISHPSKILLKIIQKRLQQYIDWELPEIQAGFRRGCGTRDVIADIRWILAESREYLFTCVLLTMQRHSTVWIITNY	825845	829386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_825800_829400
929783	contig_15327_pilon	+	1530	1	Intergenic	novelGene_70839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTATGCCCGATCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1657389	1658919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_1657400_1658900
929784	contig_10948_pilon	-	677	1	Intergenic	novelGene_124966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACTGAAGAAAAAAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90364	89687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_89700_90400
929785	contig_16103_pilon	-	2003	8	Intergenic	novelGene_118828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4256.12873827081	2	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	18	572	743628	733331	TRUE	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWVGTMAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERSSWLKRSWTVLRSVWPLPCKSWRRRRKLPMRARGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743645	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735973_737495_737597_743539
929786	contig_17453_pilon	+	2116	1	Intergenic	novelGene_175788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	46	366	9552	9872	NA	15	TGCTGGATCTTCCTCAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAPGIGGIPIKRFQQMDAALKVLTCLCQEIWKTVSWSTDWKRLLFLLIPKKGDAGECKNCQTIITHKYKVSLKIIQKRLQQYINRELPEVQAGFRRGHETRDIITDVRWILSDSKEYQKYV	9506	11622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17453_pilon_+_9500_11600
929787	contig_12402_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_133392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	104	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	217	654	1692	2345	655057	655710	NA	35	GAAGTACCATATGATCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKTAWYQYNNRYIDQWNRIEKPDINSSTYEQPIFDKDPKSINWGKDNLFNKWCWRNWISTCKTLKQDPYFTPCRKTNSKWINDLNIKSKTIKIMEEKIGTTLGALIQAINRIQNITNNAQTPEEKLDNWELLKIEHLCSSQDFTERVKRQPTDWKKNFSYDKYDQCLISKIYKILQNLNNRKTNNPIKKWTKDMNRHFAKEDIQVANRYMRKCSQ	653365	655914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_653400_655900
929788	contig_8636_pilon	-	1931	2	Intergenic	novelGene_141919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTCTAATCAATGACTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383509	377272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8636_pilon_-_378376_382681
929789	contig_2940_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_81922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGTGAAATTGCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548828	547289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_547300_548800
929790	contig_12414_pilon	+	3141	1	Intergenic	novelGene_59581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1544	2614	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	371440	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_371400_374600
929791	contig_12148_pilon	-	4595	1	Intergenic	novelGene_140335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2017	2382	86534	86169	NA	35	CTTTCCCCAGAACCAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSRIIFLNSSNFLSVFSKNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGILFWTPTGTILSYFCKCFDIVCCLRGIQ	88550	83955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_-_84000_88600
929792	contig_11538_pilon	-	2823	3	Intergenic	novelGene_152290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	304	792	300410	299922	TRUE	25	GTGGCCATCTAAGATACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLFNISMLWILLRLALWPNMWSTLQNVPRALEKKVYLAAVGTSVQYTSTRANWLTVAFKSSMSLFSFFLHVLSFTESGVLKSPTTIVELSISLFRVCFVYFGALSLGGYIFIMVMSSWCTDPSIIIYCPSLSFAVDFTLKSILSEINIASPALFC	300713	177172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_-_177821_181340_181893_299090
929793	contig_14023_pilon	-	2091	3	Intergenic	novelGene_165361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTTGAGAATTTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92235	88381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_89389_91088_91378_91440
929794	contig_17003_pilon	+	3022	1	Intergenic	novelGene_179172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTATTCTACGCGTTAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26141	29163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17003_pilon_+_26100_29200
929795	contig_13894_pilon	+	3021	7	Intergenic	novelGene_62145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2175	junction_1	2325.65878958104	10	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	2283	2993	524838	528117	FALSE	50	GATCTCAATAAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPLRQKKAHLMEIQVNGGTVAEKVDWARERLEQQVPVSQVFGQDEMIDVIGVTKGKGYKGVTSRWHTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPARVAFSVARAGQKGYHHRTEINKKIYKIGQGYVIKDGKLIKNNASTDYDLSDKSINPLGGFVHYGEVTNDFIMLKGCVVGTKKRVLTLRKSLLVQTKRRALEKIDLKFIDTTSKFGHGRFQTMEEKKAFMGPLKKDRIAKEEGA	521646	528145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_+_521769_522677_525025_525637_525799_526477_526580_526851_526948_527459_527580_528072
929796	contig_5727_pilon	+	337	1	Intergenic	novelGene_8001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTTTAATCTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1129622	1129959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_1129600_1130000
929797	contig_5350_pilon	+	710	1	Intergenic	novelGene_99352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCACTTTGGGAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174858	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_+_174900_175600
929798	contig_3825_pilon	-	2307	2	Intergenic	novelGene_78001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGGCTTCTTGATTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454324	1451490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_-_1451861_1452387
929800	contig_7870_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_109031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAAGCGGTAGGATGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	583688	586278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_583700_586300
929801	contig_12622_pilon	-	659	1	Intergenic	novelGene_5782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACTAATTTTTAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152805	152146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_-_152100_152800
929802	contig_1516_pilon	+	3411	2	Intergenic	novelGene_49954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAATGAAAAAATACATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	312499	316349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_315386_315824
929803	contig_5423_pilon	-	1737	1	Intergenic	novelGene_85203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTCTGGGAGGTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295728	293991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_294000_295700
929804	contig_1725_pilon	+	2663	15	Intergenic	novelGene_24296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	608.595656794713	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	44	625	218463	245317	TRUE	50	TCAAAAAAGAGAAGTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQASCHPAE	209831	252881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245073_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248911_249014_249157_250979_251188_252129
929805	contig_3469_pilon	+	2463	1	Intergenic	novelGene_34198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAACAACATGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531140	533603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_531100_533600
929806	contig_2703_pilon	+	3877	13	Intergenic	novelGene_101697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_6	947.067795737043	3	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	474	3404	3877	602068	609403	FALSE	80	AAAAAAAATAAAATAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRDPPGWPHAWNADGPRSVHAQHVGTKDLSIRNAHGDQQRAQQNPKRRGQNQAGG	526166	609403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578915_582631_582668_596351_596400_597823_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320
929807	contig_3956_pilon	+	2618	14	Intergenic	novelGene_14885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1323.67449832457	3	52	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	1114	2094	1287527	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1284729_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287368_1287494_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929808	contig_19476_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_116805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTATAATGTAGGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135999	134710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19476_pilon_-_134700_136000
929809	contig_3077_pilon	+	1825	9	Intergenic	novelGene_26656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.53327500624	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	499	1329	12050	17590	FALSE	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELWLSEYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9613	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9806_11208_11479_12013_12071_13047_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
929810	contig_9752_pilon	-	3161	1	Intergenic	novelGene_122027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTAATGTAATATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148145	144984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9752_pilon_-_145000_148100
929811	contig_12624_pilon	-	2833	1	Intergenic	novelGene_61007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGCAAACTAGTTCCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	781429	778596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_778600_781400
929812	contig_3956_pilon	+	1823	9	Intergenic	novelGene_15197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1623.28854104869	1	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	174	1655	1284252	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERFIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLPPVCVRPLADPARRPLRHHQPPQPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1282758	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282894_1284213_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287498_1290335
929813	contig_4125_pilon	+	2776	1	Intergenic	novelGene_25182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	78	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2059	2400	1256262	1256603	NA	55	ACAACAACAACATGGAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYALHLNIKKTKILTTGPINNIVINRKNIEVVKDFILLGFTINTHGISSQEIKQCIALGKSAAKDLFKVLKSQDVTLRTKVRLTQAMVSSITSCAWQNWTMNKEN	1254203	1256979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_+_1254200_1257000
929814	contig_11552_pilon	+	1757	1	Intergenic	novelGene_171664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATGCTGAAAGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18804	20561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11552_pilon_+_18800_20600
929815	contig_4754_pilon	+	1229	1	Intergenic	novelGene_35923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCTAATTCTTTTCCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256798	258027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4754_pilon_+_256800_258000
929816	contig_15613_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_147213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	185	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1890	2246	169506	169150	NA	65	CAAAAAAAGGATATAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPTASCGNLSFPSLFSSDPSYPHSPSLPYPQLLRSGSAGTHCKFVSPHVSLHFRPASSFSFSSSATQVWISGTSFSLSHYQPHRARSAGTGCKLRSPHDSLYFRLAGPFPLSTLGTCD	171395	169012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_-_169000_171400
929817	contig_6027_pilon	-	1135	1	Intergenic	novelGene_74455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	143	432	105	536	324316	323885	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPARWGQIPCPKLRGQGCHTQGAEELGLPGTREWSRHSDGLGEWGHPNARDQSCHSSGPGGRAEAKGPSPRIWRVWPILKVWKTGLLSKWCQRTEDYFQVLRANVTCFADLLSACYPFFPLQFLPFVMEMSVVPVPPLYVGSK	324420	323285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6027_pilon_-_323300_324400
929819	contig_15047_pilon	+	1907	6	Intergenic	novelGene_52219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3068.53850554299	5	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	635	1261	3242	4686	FALSE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2179	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_3048_3171_3460_4158_4434_4552_4687_21013
929820	contig_4931_pilon	-	5151	1	Intergenic	novelGene_138350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAGACGTCCATAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161927	156776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4931_pilon_-_156800_161900
929821	contig_10159_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_30836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACCAAAAGTATGTAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577391	574640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_-_574600_577400
929822	scaffold_6394_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_110949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATGAATCTAAGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99396	99920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_6394_pilon_+_99400_99900
929824	contig_19459_pilon	-	780	8	Intergenic	novelGene_59898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	7	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	708	72	779	16240	7081	FALSE	35	AAAATGCTGTCCCTATACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEG	19035	7079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
929825	contig_1435_pilon	+	740	1	Intergenic	novelGene_115484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCTATATTCATGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374524	375264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_374500_375300
929826	contig_20402_pilon	-	3088	1	Intergenic	novelGene_72849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219200	216112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_-_216100_219200
929827	contig_12622_pilon	+	2368	1	Intergenic	novelGene_5847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473448	475816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_473400_475800
929828	contig_16098_pilon	-	1119	9	Intergenic	novelGene_46011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1526.83045882639	4	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	95	997	352350	348413	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354083	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350322_352282_352352_353990
929829	contig_10225_pilon	-	2596	3	Intergenic	novelGene_86858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	30	311	47709	47428	TRUE	35	TCACGAAAACTATCCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47738	41799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_42723_45213_45256_46107
929830	contig_9054_pilon	-	3005	3	Intergenic	novelGene_160678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1764	2096	475295	474963	TRUE	35	ACAATCGGTGGGTAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEALLLMDEQRKWFLEMESTRGEDAMNIDEMTTKDLEYYINLVDKAAAGFEKSDSNFERNFTVGKMLSTSIACYREILHKRKSQLMRQTILLSYCKNCHSHPNLQQPPP	477058	470473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9054_pilon_-_470579_473073_473289_474373
929831	contig_19743_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_173160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGGGACACAGCCAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268921	341359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19743_pilon_+_269435_283775_283970_308858_308990_338664_338760_341305
929832	contig_7165_pilon	+	1919	1	Intergenic	novelGene_116895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTTTGCCAATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1046023	1047942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1046000_1047900
929833	contig_9706_pilon	+	1547	1	Intergenic	novelGene_20765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGATGGCAGAGACCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159	1706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_200_1700
929834	contig_6576_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_42390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTCAATTACAAAAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291287	1293532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1291300_1293500
929835	contig_15047_pilon	+	1151	4	Intergenic	novelGene_52152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	67.7839705731869	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	27	695	2194	21201	FALSE	20	TCCAGAATCTGCATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENMTRLWGFGDLDIFGHFELVVSCSAYQHLQ	2167	21657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3473_21111
929836	contig_6434_pilon	+	2995	15	Intergenic	novelGene_61904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1316.0364581514	1	45	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	720	1715	924065	932457	TRUE	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSERKPATEVDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLIQCKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSHRTTFQNLIEGFEALLK	913739	933836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6434_pilon_+_913770_916994_917139_917927_918016_918871_919000_919663_919761_921519_921686_923998_924150_924283_924379_925547_925741_927365_927491_927959_928133_929899_930018_931098_931210_932361_933272_933370
929837	contig_6885_pilon	+	3424	1	Intergenic	novelGene_83672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	1968	2396	210461	210889	NA	20	CAATGCCCATTTTATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVCSCFFSLEMFQQTDAMLEVLNHLCQEIWKRATWPTNWKISIFMPILKKGDPTECGNYQIIPLISHKSKILFKIIQKWLQQYIDRKLPEIQARFRRGHETSDIIADVRWFLAKSRKYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKL	208493	211917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_208500_211900
929838	contig_990_pilon	+	2420	4	Intergenic	novelGene_76007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAAAAAAATTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303514	490828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_+_304510_311365_311874_399492_399940_490358
929839	contig_1867_pilon	+	1573	1	Intergenic	novelGene_54596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	1250	1573	512462	512785	NA	45	GAGAACCTAGAGGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALQLEQIEKEQQKKSSGTRRKEIIKIRAEINEIQNWGKKKRINKTKSWFFEKINKVDKARVKLMKEKQERKQITQIRNEMGDITIDPTEIKRIITEYYEKLYSNKF	511212	512785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_511200_512800
929840	contig_3956_pilon	+	1939	9	Intergenic	novelGene_14839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1390.87975756354	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	185	1243	1286442	1290310	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYPKHVGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYHSPALPLCQCADRPAPPHGAYLPCGDPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281598	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282764_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289174_1289593_1289677_1289758_1289892_1290297
929841	contig_7057_pilon	+	493	6	Intergenic	novelGene_123330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	988.550332557731	3	18	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	162	467	938907	943696	FALSE	10	CATCTGCCTCCCGCTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDQRLGCCHTPRAFSVLEESLLSLHPVTPVPVTPPAAVLPGPRPTCPVPLFLLCFQPARPRKK	937155	943722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_937190_938323_938358_938661_938752_938903_938962_939052_939118_943510
929842	contig_18061_pilon	-	714	1	Intergenic	novelGene_179173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTCTGTGTGTGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9799	9085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18061_pilon_-_9100_9800
929843	contig_6599_pilon	-	911	1	Intergenic	novelGene_175970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCATACCCGGCCGTCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261648	260737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260700_261600
929844	contig_20614_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_107614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTCTTTCAGCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492880	492168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20614_pilon_-_492200_492900
929845	contig_15849_pilon	+	3007	3	Intergenic	novelGene_176055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	817	1116	60743	104001	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPISNIMINRENVEIVKDFILLGSTINTLGSIGQEIKCHIALDISAAKNLLFQVLKSKDVTLRTEVHLTQAIVFSIVSYAYESWRTNKKTEEELMPLN	38197	105892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15849_pilon_+_38709_60437_60819_103777
929846	contig_16210_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_147675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAATGGTGTATCTTTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61637	62854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_+_61600_62900
929847	contig_7398_pilon	+	1211	1	Intergenic	novelGene_166171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	504	818	224312	224626	NA	20	AAGCATGCTCTATTCTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKHYSFQYGLHFNIKKTKILTTGPISNIMINGEKTEVVKDFILLGFTIKAHGSSSQEIKGHIALDKSAAKDLFKVLKSKDVTLRIKVRLTQAMVFSIASICI	223808	225019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7398_pilon_+_223800_225000
929848	contig_1856_pilon	-	2693	1	Intergenic	novelGene_84889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379393	376700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_376700_379400
929849	contig_10867_pilon	-	485	6	Intergenic	novelGene_159461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3108.07325524995	2	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	139	450	88226	86870	FALSE	20	ATTCCCTATGAGTTCATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQKHTL	91456	86834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86885_87085_87237_87726_87840_88193_88256_88603_88683_91426
929850	contig_8322_pilon	+	3829	7	Intergenic	novelGene_143237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	448	junction_1	344.126268815516	46	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	806	2482	287401	295697	FALSE	15	CTAGGAGCTTTCTTAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISAAREYEIEFIYAISPGLDITFSNPKEVSILKRKLDQVSQFGCRSFALLFDDIDHNMCPADKEVFSSFAHAQVSITNEIYQYLGEPETFLFCPTEYCGTFCYPNVSQSPYLRTVGEKLLPGIEVLWTGPKVVSKEIPVESIEEVSKIIKRAPVIWDNIHANDYDQKRLFLGPYKGRSTELIPRLKGVLTNPNCEFEANYVAIHTLASWYKSNMNGVRKDVVMTDSEDSTVSIQIKLENEGSDEDIETDVLYSPQMALKLALTEWLQEFGVPHQYSSRQVAHSGAKASVVDGAPLVAAPSLNATTVVTTVYQEPIMSQGATLSGEPAALAKEEEKKQPDEEPMDMVVEKQEETDHKNDNQILTEIVEAKMAEELKPMDTDKESIAESKSPEMSMQEDSISDVAPMQTDEQTNKEQFVPGPNEKPLYAAEPVTLEDLQLLADLFYLPYEHGPKGAQMLREFQWLRANSSVVSVNCKGKDSEKIEEWRSRAAKFEEMCGLVMGMFTRLSNCANRTILYDMYSYVWDIKSIMSMVKSFVQWLGRCTRNNLFSSNIVSL	286595	297044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_+_287524_290053_290226_291573_291673_292427_292713_293832_293992_294461_295076_295472
929851	contig_9883_pilon	-	646	1	Intergenic	novelGene_87595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGGCAAGGCCAAAACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98155	97509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9883_pilon_-_97500_98200
929852	scaffold_12124_pilon	+	1828	5	Intergenic	novelGene_22352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1845.61417622969	7	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	884	1663	1508626	1509405	FALSE	35	TGGTAAACTTGACTGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483912	1509570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1497093_1497122_1506629_1506687_1508010
929854	contig_3060_pilon	+	3153	5	Intergenic	novelGene_178028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	128	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAGATATATCTTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308219	393940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3060_pilon_+_310747_325040_325260_340968_341168_346134_346196_393793
929855	contig_5947_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_101479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1089	1472	332996	333379	NA	15	TCATGCGTGTGTGTATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLAPANHLKAGSSNLSLREGTWPSQSHTTKKRQEGEKDPGSLLLSLMWPPGGKQAGHLVLCVDSDTQRGVKCGVRPREQLLKVVRMSQPGDWETGLFTGAGGHRHDNRQSTASCVTRDGGVCLAD	331907	333514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_331900_333500
929856	contig_5222_pilon	-	2337	1	Intergenic	novelGene_59014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGTAACTGCTTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	350830	348493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_348500_350800
929857	contig_9468_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_59529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTTTATCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564436	565645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_+_564400_565600
929858	contig_15264_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_158874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	105273	104255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15264_pilon_-_104300_105300
929859	contig_15327_pilon	-	5627	18	Intergenic	novelGene_70796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_17	79.9063898688241	232	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	893	1777	1247326	1238924	TRUE	25	AACTGGGAAGGTGGCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKKLGPLSPGGFNPIISSQTSDSEEQSSSENVPPGYEVVSLLEALNGPLTPSPAVPPLHVLGDSHLSGMLPSYGSDGHLPPVRTLSPLDRLSDCSSQGLKLKKSLSKSVSQNSSVLHEEEDERSCSESETHLSRRRSAQYLREEYGDTPESENLTLSSSGAVDQSSCTGTPLSSTISSPEAYRNRVTPVSCLVLMRGVPFDSCLQRPRQQQPGPVGYVHGVLPEPALPDQHRHHFLHVRRLLHPPWPGRRGRGSPFPPGCQEGPIRGRRGVATGISRCQLCWPPSRRAGRRGK	1261899	1227658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1231357_1237043_1237155_1238882_1238932_1239958_1240025_1240296_1240564_1240880_1240993_1243630_1243740_1244476_1244716_1247242_1247356_1247540_1247701_1248422_1248495_1252640_1252689_1253496_1253541_1253850_1253918_1255461_1255580_1256021_1256169_1261345_1261435_1261781
929860	contig_8375_pilon	-	1844	11	Intergenic	novelGene_141271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	621	1001	41444	37283	TRUE	25	AAAATATGGTCTTGTTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTAISPFFHGARKTSFDCQLVALGEASGEVGSIGGRAVILSFLLLASLCLVPNCLGVICSGLMEGLVLIFSVKPIGDWTRPFIHTALEHKGLSRLHLLTQHDSQLDLLNRAITLTLRTLLMIFP	55475	28962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_29049_31082_31356_35204_35456_37049_37327_40525_40813_41394_41532_43354_43430_45559_45612_46932_46996_51080_51139_55190
929861	contig_3942_pilon	+	582	5	Intergenic	novelGene_128746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5889.65280704219	29	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAACTGAAGCAGTAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	792267	795496	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_792304_793509_793680_793791_793882_795075_795179_795313
929862	contig_6164_pilon	+	2634	1	Intergenic	novelGene_121268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330416	333050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_330400_333000
929863	contig_8681_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_157191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACACAAAACCTTCATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31302	32268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_+_31300_32300
929864	contig_11338_pilon	+	3126	10	Intergenic	novelGene_6191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	424.058550581152	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	152	1318	6086	11802	FALSE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSPQAFGIQHVKAGFGQAGSSHSSFCTC	4517	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_4667_6083_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10579_11719
929865	contig_12578_pilon	+	3172	2	Intergenic	novelGene_179174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	18	401	155021	155404	TRUE	45	ACAATATGAGTATATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LFADDMILYIENPKDSTRNILELMERFSTVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKTTPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNILCSWIGRLNIVKMTILPKAISKYNAIPI	155003	158912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12578_pilon_+_157902_158638
929866	contig_9895_pilon	+	3224	2	Intergenic	novelGene_144696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	2092	2589	407845	408342	FALSE	45	TCAAGGCGATATAAAGTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASACSQNKESRNFPEEENFLELPEGEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHAIEEIKKIREVHNDKFNRLQESIEGQQSEIQKINNKISELDNSIKSHKSRIEVMEVRISEIEDKAVDTNLFEEKSDKRILKNEETLRIMWDSINRNNLRVIGVPERGDNRKYRENC	299437	408977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_+_300814_407129
929867	contig_5261_pilon	-	2713	2	Intergenic	novelGene_102500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1622	2020	844201	843803	FALSE	20	CCAGCCGCTCCACGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRAESKRPAALSPEPAAPGSRRANEQRPQSLARAADQTRKEPHTRTQPPQPHRKGQRRRSEPGT	846125	843109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_844946_845248
929868	contig_854_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_36362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCCCGAGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974688	976418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974700_976400
929869	contig_12402_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_133394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACCAACAAAAAAAAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	684071	681854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_681900_684100
929870	contig_17274_pilon	+	4457	3	Intergenic	novelGene_26519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_2	271.5	12	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAACAACTCTATATCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121814	127745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_122046_122741_123572_124349
929872	contig_7963_pilon	-	4221	11	Intergenic	novelGene_58444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_10	387.15583425799	1	116	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	2570	3622	120716	118203	FALSE	20	GTTCTGAGTCATAGTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	126298	117603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
929873	contig_12042_pilon	-	3103	1	Intergenic	novelGene_170438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGAAAAAAAATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171085	167982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12042_pilon_-_168000_171100
929874	contig_13481_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_119297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTACAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190840	193334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_190800_193300
929875	contig_3018_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_78953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAGAAAAAGACAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1394743	1397181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_1394700_1397200
929876	contig_4845_pilon	+	2848	14	Intergenic	novelGene_53640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	46	junction_8	35.6367272818499	21	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	848	2544	305	2848	355239	462301	FALSE	30	CACCCTTCCACAGAGCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVPEKNAVRILWGRERGTRALGAQRLLQELVEDKTRWMKWEGKRVELPDSPRSTFLLAFSPDRTLLASTHVNHNIYITEVKTGKCVHSLVGHRRTPWCVTFHPTISGLIASGCLDGEVRIWDLHGGSESWFTDSNNAIASLAFHPTAQLLLIATANEIHFWDWSRREPFVVVKTASEMERVRLVRFDPLGHYLLTAIVNPSNQQGDDEPEIPIDGTELSHYRQRALLQSQPVRRTPLLHNFLHMLSSRSSGIQTEPFHPPEQASSTQQDQGLLNRPSAFSTVQSSTAGNTLRNLSLGPTRRSLGGPLSSHPSRYHREIAPGLTGSEWTRTVLSLNSRSEAESMPPPRTSASSVSLLSVLRQQEGGSQASVYTSATEGRGFPASGLAAESDGGNGSSQNNSGSIRHELQCDLRRFFLEYDRLQELDQSLSGEAPQTQQAQEMLNNNIESERPGPSHQPTPHSSENNSNLSRGHLNRCRACHNLLTFNNDTLRWERSTPNYSSGEASSSWQVPSTFEGMPSSGSQLPPLERTESRTPNSSRLELSSSASPQEERTVGVAFNQEIGHWERIYTQSSRSGTVSQEALHQDMPEESSEEDSLRRLSPAAYYAQRMIQYLSRRDSIRQRSMRYQQNRLRSSTSSSSSENQGPSVEGTDLEFEDFEDNGDRSRHRAPRNARMSAPSLGRFVPRRFLLPEYLPYAGIFHERGQPGLATHSSVNRVLAGAVIGDGQSAVASNIANTTYRLQWWDFTKFDLPEISNASVNVLVQNCKIYNDASCDISADGQLLAAFIPSSQRGFPDEGILAVYSLAPHNLGEMLYTKRFGPNAISVSLSPMGRYVMVGLASRRILL	307798	462301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4845_pilon_+_307982_355117_355374_355736_355796_356325_356510_357872_358046_358990_359058_359620_359768_360037_361075_393180_393361_404237_404319_404913_405015_449658_449770_461187_461377_462221
929877	contig_7815_pilon	+	2801	5	Intergenic	novelGene_134377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	831	1238	397835	398242	TRUE	25	CCACATGGACTTTCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSMQEMCLQLLVHSHLWGFPTAQALLWEIDQNATKQRSLLLGGLFPEETHLVNVISQRADFEAASFLQFDLDSLCYPVQADQIQTPRDLILRIQDSWVETQNLRLSCQLGLAYDLSMTQGSGRQTPVHWNSMHR	397004	547682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_+_399329_405672_405830_516272_516370_522521_522672_547609
929878	contig_5686_pilon	+	2759	18	Intergenic	novelGene_45239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1496.04722322447	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	688	2064	694	2757	189037	241650	FALSE	25	GACTGACCTTGCACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQT	93785	241652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176667_176722_182638_182789_189031_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597
929879	contig_40_pilon	+	3600	3	Intergenic	novelGene_178419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1102	1752	1102	1752	TRUE	25	ATTACCGACCGATATCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDFPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	0	6763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_40_pilon_+_2060_4990_5464_5695
929881	contig_10958_pilon	-	1611	2	Intergenic	novelGene_5458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901492	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
929882	contig_12644_pilon	+	4256	2	Intergenic	novelGene_44544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1496860	1501230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1498363_1498476
929883	contig_960_pilon	+	2570	1	Intergenic	novelGene_108279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1189	1512	985325	985648	NA	70	GACACCACAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQNQWMAANNYLSVCLSVYLPVCLFIYLSTYHPLYKLEEGPGIYFQKSAHENPTDQNCPIPADHGDDAVPGSISFHCARYGRESGADLTAADNNKAINHYSLIVQK	984136	986706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_984100_986700
929884	contig_7630_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_133666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAACTTCATTTATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554537	553218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_-_553200_554500
929885	contig_2496_pilon	-	3505	1	Intergenic	novelGene_168517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAAGGTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167181	163676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_-_163700_167200
929886	contig_9784_pilon	+	3481	5	Intergenic	novelGene_165707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	45	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCGAGATGCTGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415717	512569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9784_pilon_+_415725_439998_440638_508648_509753_510732_511690_511795
929887	contig_7839_pilon	+	2535	12	Intergenic	novelGene_45719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	498.956630388117	3	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1165	2250	955026	956984	FALSE	5	CTTCTGCTCTCCTTTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVTAEEPSAAVPDEIPPPLRVMRMHLAWKK	950898	957269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_950999_952472_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954033_954238_954545_954896_955063_955277_955469_955586_955735_955883_956153_956428_956763_956877
929888	contig_13214_pilon	+	3814	2	Intergenic	novelGene_175708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	69	1211	2510	3652	TRUE	30	ATCTAGGCGACTAAGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSPSTLANAPTTFIDGSGKTGKGVVTWQTDGAWQHFITQKASTTQHAELLAAVAAFEIFKSMPFNLVADSAYVVHTIQHISDVTLRFSPDYELFTLFKRLQTLLNSHNSPFFVVHVRSHTPLPGPLSDSNSHADLLAGSAFSDARTSHNFFHLNAQGLQKQFSLSLTEAQQIVCTCPDCQHFSPMSFAAGINPRGLVANQLWQMDVTHYPPFGKLKYLHVSIDTCSGFLYATALSGECSTHACRHFTQAIATMGCPQALKTDNGPAYTSAKFQQFCATWNILHSTGTPYNPQGQAIIERAHHTLKQLLNKQKGGDDGSRVCDQNERLAKALFTFNFYRLPKMVALLQNDILSPLTPDLAHRSTIKILRIPLSGKDLQNY	2441	6357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_+_5941_6042
929891	contig_5041_pilon	-	2084	1	Intergenic	novelGene_27004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCAAAAAGAACAAGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26692	24608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_24600_26700
929892	contig_10734_pilon	-	4724	16	Intergenic	novelGene_51257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1058	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTGGAACAGAGGCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1334970	1278831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1280231_1281765_1281884_1284376_1284434_1284977_1285061_1286266_1286427_1288094_1288258_1288358_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306212_1321455_1321509_1327927_1328053_1328140_1328285_1328866_1328917_1332592_1332718_1333285
929893	contig_14243_pilon	+	2630	1	Intergenic	novelGene_57421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	131	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTTGTCTGCCTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547941	550571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14243_pilon_+_547900_550600
929894	contig_5145_pilon	+	1917	1	Intergenic	novelGene_131379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTTTAATTTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545196	547113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_545200_547100
929895	contig_15036_pilon	-	1965	1	Intergenic	novelGene_107148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACCATCTCAAACACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63511	61546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_-_61500_63500
929896	contig_5690_pilon	+	2127	1	Intergenic	novelGene_119700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGCCATCCACTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	905224	907351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_905200_907400
929897	contig_12951_pilon	+	3350	1	Intergenic	novelGene_68220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1387	1731	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
929898	scaffold_13505_pilon	-	416	4	Intergenic	novelGene_111494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2903.85184807275	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	214	351	541982	541845	TRUE	15	TCATTCGTAATCTTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAWSYCKRREPAGVRQSSGSLPQKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDG	547806	540201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_540267_541844_542033_547363_547455_547734
929899	contig_9267_pilon	+	2480	1	Intergenic	novelGene_162011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCCAACATCCATTCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332194	334674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_332200_334700
929900	contig_5317_pilon	+	1121	5	Intergenic	novelGene_76527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5724.27220264725	10	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	210	620	35282	43326	FALSE	50	AAATACATTAAACTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33702	43827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_34291_34415_35258_35410_36684_36839_43197
929901	contig_12019_pilon	-	2242	1	Intergenic	novelGene_87727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	326	661	599610	599275	NA	60	CCAGAATTCATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCIISVFWILLRAALWPKMWSILENDPRALEKNVYFAAVGWSVLYMSVRSKWLIVALRSSVSLVSIFLDVLSYTKTGVLKTPTFIVELSIFLYSAVRVCFMYFGALTLGA	599935	597693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_597700_599900
929902	contig_17311_pilon	-	494	5	Intergenic	novelGene_57833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	1233	junction_1	8230.391135906	32633	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	36	392	123675	119271	TRUE	15	TATGTGTCTGGTTTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLDYAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKK	123710	118796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_118880_119251_119274_121530_121642_123344_123555_123642
929903	contig_8045_pilon	+	2217	1	Intergenic	novelGene_35453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAAAAAAGGATGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460286	462503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_460300_462500
929904	contig_19816_pilon	-	841	1	Intergenic	novelGene_156454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAACCCCAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7617	6776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_-_6800_7600
929905	contig_13215_pilon	-	2673	1	Intergenic	novelGene_145889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACAATACATCTGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114745	112072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_-_112100_114700
929907	contig_12250_pilon	+	2178	6	Intergenic	novelGene_80581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	78.6139936652502	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	97	384	312091	312692	TRUE	20	AGCCCTAGCATCTCTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGPASLRLAAAASWQVVRGRRVELFPRVLEFMQSLRFAAPGLVRYRHHERLCMGLKAKVVVELILQARPWAQVLNALNHHFPESGHLVRNPKATKQDLMKILESQETFRQQVKQLAEAPVDLAAGT	311994	314739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_312172_312302_312408_312506_312595_312678_312969_313132_313596_313684
929908	contig_10976_pilon	-	1654	2	Intergenic	novelGene_155594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	494	1183	143703	143014	TRUE	80	CACCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTHFAKEDIQAANRQMKKCSGSLVIREMQIKSTMRYHVTPTRLALIQKTQNNKCWRGCGETGRLIHCWWECKMVQPVWKSIWHFLKKLEIEIPYDSAIPLLEIYPREITAITRIDICTAMFTAAPFTVAKKWKQSRCPSVDELIHKLWNIHTMEYYAAVKNKDEAVNRLITWKNLEVIMLSEFSQSQKDKYCIRPLLQELKKRFKHRRKYSLMVMRVGSEGEGYLLTR	144196	142022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10976_pilon_-_142373_142892
929909	contig_10197_pilon	-	3939	1	Intergenic	novelGene_115330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	159	480	2823	3302	1643665	1643186	NA	30	TTCAAGCCTCAAGTTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVIKNEMECIKIDILGIHELKWTGIGHFKSHNHLIYYAGNDKLKRNGVITFIVKKNISRSVLKYSTLSDRLISICLQGRPVNTIIIQIYAPTTNDKDEEIEDFYQLLQSEVDQTCSQDALIITGDWNAKVGNEEEESVILKYGLRDRNDARVA	1646487	1642548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_-_1642500_1646500
929910	contig_14176_pilon	-	2358	15	Intergenic	novelGene_74832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	160.016835848926	1	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	68	1894	231844	223488	FALSE	20	TTTGGAAACCACGTCGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLFFKTHYRLELMEKELCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSLMEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARREYEKAMKEYEGGRGESSKRTLKKRN	231911	223023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14176_pilon_-_223510_224513_224603_224792_224964_225337_225468_226911_226958_227104_227244_227658_227732_228426_228649_228926_229056_229152_229257_229406_229638_229738_229930_230207_230293_231227_231369_231790
929911	contig_5023_pilon	+	2041	14	Intergenic	novelGene_7317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2068.14169509875	1	31	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	28	1635	607279	646990	FALSE	30	GCAGGTAGAATCTTAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607251	647396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616482_622560_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
929912	contig_13823_pilon	+	2522	1	Intergenic	novelGene_145244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAGATATTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78096	80618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_78100_80600
929913	contig_3956_pilon	+	1770	8	Intergenic	novelGene_14828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	84	731	1281682	1286416	TRUE	40	TGGAATAATAAATTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTCDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281598	1290982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284226_1286153_1286224_1286409_1286606_1287276_1287558_1290413
929914	contig_12624_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_61090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTTGCCACAGAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	890046	889362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_889400_890000
929915	contig_16210_pilon	+	4721	1	Intergenic	novelGene_147680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	206	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	4323	4712	69500	69889	NA	40	AACTCTGATACTGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDQRRIDAFELWCRQRILTIPWTAKRTNQSVLEVQPECSLEARMGRLCLTYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKAEGQRKRVRLSTRWTDTVAATMGSRITRTVRMVQDQAEFRSAVHMVTMNQNQLHST	65177	69898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16210_pilon_+_65200_69900
929916	contig_14048_pilon	-	975	1	Intergenic	novelGene_146341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAAATTTTAGTACAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589554	588579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14048_pilon_-_588600_589600
929917	contig_4301_pilon	+	3540	2	Intergenic	novelGene_65099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAACACCTCATCAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482279	640161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4301_pilon_+_483643_637984
929918	contig_15666_pilon	-	1481	4	Intergenic	novelGene_70159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	804.016721771935	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	278	475	108141	107816	FALSE	30	TGATGGGCAGAGCCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGDVVCAAREVRWEWEKARGGELPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110748	106809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108731_110678
929919	contig_2646_pilon	+	1256	3	Intergenic	novelGene_69534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	709	junction_1	140	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	860	1210	566553	568284	FALSE	60	GTGAAATTAAGAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRRRHVGNRANPDPNCCLGVFGLSLYTTERDLREVFSKYGPIADVSIVYDQQSRRSRGFAFVYFENVDDAKEVSKSLSVLLEISVLLLIPNTNDQLLGYGQFLLYSVDRICKCN	564660	568330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_565390_566422_566586_567966
929920	contig_233_pilon	+	2543	9	Intergenic	novelGene_14614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	1326	1871	105585	108657	FALSE	30	GAGGACTGGAGATGGACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGLAWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCEVLGGRGDRRRVETITRMPHCRRGTS	78141	109329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92226_101680_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107471_108400
929921	contig_16098_pilon	-	1226	9	Intergenic	novelGene_46012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1499.98520305202	26	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1128	98	1225	352350	348292	FALSE	30	GTACCAGACTCTGAAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSASLRLLQLLPPPPRLLPPPFGESLSSLGSRMSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQQCRSYRSAWIDWRRQSRPSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFS	354086	348290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348471_349404_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
929922	contig_10225_pilon	+	1654	13	Intergenic	novelGene_86834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	525.462944036547	5	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	999	1538	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	21385	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_21494_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46278_47324
929923	contig_9177_pilon	+	1708	1	Intergenic	novelGene_32792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGAGAATTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1489464	1491172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_1489500_1491200
929924	contig_1639_pilon	-	3955	21	Intergenic	novelGene_74895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGCAAAAACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330832	283493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1639_pilon_-_283594_286377_286414_287045_287103_287386_287453_289008_289136_290190_290295_293136_293254_293369_293423_296203_296346_297968_298127_298221_298284_307924_307994_309145_309320_311907_312049_312577_312683_312827_312985_314952_315024_315535_315687_321335_321392_324204_324321_328939
929925	contig_5047_pilon	+	859	1	Intergenic	novelGene_158008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTCCATGATTCCCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1624757	1625616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5047_pilon_+_1624800_1625600
929926	contig_10930_pilon	-	2592	7	Intergenic	novelGene_36992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	5	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	25	1587	280370	268388	FALSE	25	GGTTAAATCACTTACTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
929927	contig_13021_pilon	+	3500	12	Intergenic	novelGene_8187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3606.73649560934	2	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	498	1316	176653	178735	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASCFKWIGYGWSSTDWIYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174518	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175903_176061_176404_176471_176579_176707_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178537_178585_178670_180211_180440
929928	contig_14970_pilon	+	1932	10	Intergenic	novelGene_44941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	41	junction_6	5937.91904772067	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	133	1362	136145	231550	FALSE	25	ATCTTCGTTTTTGAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136012	232120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
929929	contig_16098_pilon	+	1458	3	Intergenic	novelGene_46233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	10.5	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	97	591	766291	767258	FALSE	15	TCTTTATTGTATCACTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSTPEQPSGHMEETSASESASWAPLPCGPCVPIMLTLASLAALFLLTTAVLAERLFRRSLRQDPSNHTPTLVWRPGGELWIEPTGTPRERSEDWYGSAVPLLTVTSGSQFPWTWRVGRWGVDRAWEAGEASKCLCLAARGCGSGNWVWGCTILGQSLQAYLLN	765979	768125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_766076_766290_766604_767076
929930	contig_10953_pilon	+	1387	7	Intergenic	novelGene_42578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	17324.6821680001	33	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	85	639	455261	461289	TRUE	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVSSFPCARPSSLEVSGRAEKR	455176	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461298_461544_461639_463817
929931	contig_9290_pilon	-	1901	1	Intergenic	novelGene_77519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGATTTTCTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159899	157998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9290_pilon_-_158000_159900
929932	contig_17144_pilon	-	2752	16	Intergenic	novelGene_29241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1976.12130082026	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	803	2412	46	2457	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLSKVTEQVSTQVGAMAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181818	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173413_173644_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
929934	contig_6842_pilon	+	2821	4	Intergenic	novelGene_130811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCTTGTCTTAGTCTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680777	1850939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1682927_1836461_1837000_1841379_1841488_1850913
929935	contig_16125_pilon	-	4402	16	Intergenic	novelGene_155235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	940.529174927014	57	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	783	2352	38	2389	236934	117592	FALSE	65	ACTTCATCAAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHQAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDCDSLKQKKTSLVALSSRPVDDDQQVYDDVAEQDNISSHNPNEGMFPPPPDDDIYDGVEEEEADDGFPAPPKQLDIGEEVYDDVDASDFPPPPTDSSQGINIGKSKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFKYEGEIKVLYSTTTVPSFTSKKWGNRDLQVKPGESLEVIQNTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRCYLVDVDGEIYDDIADDCIYDND	236971	115578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_117615_118857_118890_121148_121183_135004_135168_135630_135731_138906_138974_141938_141965_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151728_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
929936	contig_9177_pilon	-	3170	2	Intergenic	novelGene_32721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	156	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACTGTGGAAACTAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	615519	612161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_615162_615349
929937	contig_12312_pilon	+	4002	13	Intergenic	novelGene_63957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	184	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATCTTCATAGCTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213841	256442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_215984_218222_218326_218673_218880_223841_224029_229403_229543_233702_233833_234965_235165_237713_237908_241327_241505_242254_242410_245860_246011_246885_246971_256307
929938	contig_9233_pilon	+	2337	2	Intergenic	novelGene_78252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAACCCAACAATAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657534	659966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9233_pilon_+_657754_657848
929939	contig_13592_pilon	-	5304	16	Intergenic	novelGene_33740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	188	junction_7	121.807060550692	381	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	841	2526	279	2804	387919	298289	FALSE	70	TTAAGAATTAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNKESCGKKEKSRRKGTTSSPNFEEEDKKEKKTSSSANSAYSIRSVSSEKRKLKSDHTDILYCNTKRRQELKRFSVATDTSRKRPKISSSSQEPVELQEASFSNDNQIISQSPSSNGTKTNISIRADFKPKDIKLINVPSKLDHELKNLSSPKTAKDVQPKAEGQACEKKWAHLLAQSQKMKELKKEKSSKLRDSSEKCVLEKCKRNEFSQDYNSNKIIKEPLEPRKRKISFKIPIKSRDTLQKLVEENVFRLDSNKSKTKQEEKECLESSHVSLNLTRHKIVHLCSDSTCKTVHEWKEKHHHEHQESNDSSSSKNLTQNFEAPCSSVSPESVQDTDEEMQIVEELHAARVGKSVDLPVVPPSGELMSMEIDLVEDDVHSSAANTASDKKLLIVIDTNILMNHLKFIRILKTTEIPGFDRLVLIIPWIVVQELDRMKAGKLLKHAQHKAVPAVHFINDSLKNQDRKLWGQSIQLASQKLYGLSDENNDDRVLKCCLQYQELFPCSLVILCTDDRNLRNKGLISGVKSLSKEELSAELLNLSLNTDECHQPCISKHQLKAEATSLKESFEEKSANSGLSILLESIISELEKSLGTALSLILETEMKIAFGNLWMEMLYLKPPWTLIHLVQCFKKHWLAVFGLVMEKNLLLTIESLYENLCKANNAVDFTTAKFLLQDSKSLLHAFSTRSDYDGILPQAFAQVNKLLQTFTEVKAKLKPNPSENTVGKKQEDTSLMTSSNQEITLFSGSQLPQPNRHQEIWSILENVWITIYQNSTDVFQRLGSNSALSTSKIASFEEAFLYLQKLMVAVKDILEGIQRILAPNSNYQDVETLYNFLIKYEV	388197	295788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_298362_308909_309042_326680_326869_332877_333027_337466_337606_339905_340070_341523_341670_348351_348446_351343_351533_351918_352021_353143_353274_354500_354561_359369_360109_381314_381374_383032_383114_387838
929940	contig_5538_pilon	+	5901	5	Intergenic	novelGene_23706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	120	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1382	1705	112568	112958	TRUE	35	TTGACCAGGGCAAAGTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTGVHMSIHVTALISLGYIPRSGIARMYGISISGSLRTCHIIFQNGCIMLHSHQQCIRVPPISPQPLQHLLFPVFLIHASNDGVRWYLTVVLICISLMDNDPLPII	111056	196256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5538_pilon_+_111309_111438_112873_112939_114374_176040_176293_193727
929941	contig_6059_pilon	-	860	7	Intergenic	novelGene_44872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4799.68702972739	2	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	416	859	571435	569146	FALSE	5	GTGAGTTTTCCCCCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573354	569144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571535_571651_572866_572958_573165
929942	contig_8122_pilon	+	1992	1	Intergenic	novelGene_40207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTTGTCCAATGCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356349	358341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8122_pilon_+_356300_358300
929943	contig_5947_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_101550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1846	2154	590037	589729	NA	70	TTTTTAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPYRVVLSTLFCRVAMSQNRLDGNGFGFYLPYKIIKFMPSHPCGTWSKNQGSLCLASADTHTETKPDAFKSILTHSDPTEQTDPWQPHVCQNRTVLDGVFSG	591882	589576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_589600_591900
929944	contig_9319_pilon	+	2309	1	Intergenic	novelGene_154640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTTGTGAGTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72806	75115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9319_pilon_+_72800_75100
929945	contig_19179_pilon	+	671	1	Intergenic	novelGene_142377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAAGATTTCTTTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32835	33506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_32800_33500
929946	contig_6229_pilon	-	6981	5	Intergenic	novelGene_179175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	267	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	157	489	544076	543744	TRUE	10	TGGTGCTTCTGCCTAGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQRGVARSDRAEARALQTDQLMVCSEANSNARGFSTSGETQQQRVYSAIQNQWEAALDQRKISTCVWPNTQIKNTLLWEKPLIYLPTPCSALDPGQLQGLLHPFSQR	544232	285847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6229_pilon_-_286289_286942_288306_411977_412115_418707_421622_542106
929947	contig_11720_pilon	+	1106	10	Intergenic	novelGene_43839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	6	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	10	1071	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68054	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
929948	contig_12391_pilon	+	2021	13	Intergenic	novelGene_103605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	280.775711200239	1	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	600	1322	98789	107379	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA	56809	108078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96828_98699_98895_101754_101934_102041_102095_104600_104699_105919_106003_106560_106620_107234
929949	contig_960_pilon	+	2837	5	Intergenic	novelGene_108301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	948	junction_3	307.173708998671	7	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	742	1074	1049072	1055443	FALSE	55	AAGAATTTAGCAAGAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKLDVIKALGYWTEPEDVQETPAPESTSGSVSAANLSVAIQDEGRSDGSNLPSSSTNESALQCSASFKDDAGENTALLEAGRSDPQRGGPVSSCAFPRAAGGVVDTAPA	1039164	1057206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1039765_1046762_1046846_1049013_1049111_1053830_1054030_1055348
929950	contig_6515_pilon	-	5553	5	Intergenic	novelGene_177992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	4834	5301	318185	317718	FALSE	50	GGAAAGTAAAGATCAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGRIHHEHITIINIYASNDRAPKYIKQTLTTLRGEIDSSTIIVGHFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNADIIQSIFSDHNAIKVETNNRKSKEKKINYMETE	579512	317465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6515_pilon_-_318619_398782_399986_517754_518678_574159_575603_578681
929951	contig_7202_pilon	+	914	1	Intergenic	novelGene_19111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCACACCTGTTCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167547	168461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_167500_168500
929953	contig_6451_pilon	+	991	2	Intergenic	novelGene_173702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAACCCTCCCCTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	122668	315203	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6451_pilon_+_123029_314572
929954	contig_2332_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_58708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	17	358	774667	774326	NA	25	GTTTGCTCTATAAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQFRLIATLYTTEQNTSQSCTIVTIVAMLEPIVTATVSVHLVEGLPCFCQPSTLPSLMSFSRDWSLLITCPKYMRQSLAILASKKHSAVLLAKQICSFFSSPWYIQYSSPAP	774683	772490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2332_pilon_-_772500_774700
929955	contig_1715_pilon	-	2340	13	Intergenic	novelGene_127179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_7	250.104422636271	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	115	1554	284622	248253	FALSE	15	TTCCCTAGCAGTTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAPDDLAVLKNLRSEEQKKKNRKKLPEKPKPNGRTVEMAEDEVVHTPRNVSAKQPLEPDKKNEKSKKNKKKSKSDAKAVQNSSRQDGKEVDEGAWETKISHREKRQQRKRDKVLTDSGSLDSTIPGIENTITVTTEQLTTASFPVGSKKNKAGDSHLNTQVSNFKSGKGDSTLQVSSGLNENLTVNGGGWNEKSVKLASQISTGEEKWNSVSPASAGKRKTEPSAWGQDTGDVNANGKDWGRSWSDRSIFSGIAAWSSVDRGMNTSEKNSASFASLTLNSAVSGSTAEPVSQSTTSDYQWDVSRNQPYVDDEWSGLNGLSSADPSSDWNAPAEEWGNWVDEERASLLKSQEPIPDDQKISDDDKEKGEGAPQAGKSKKKKKKKKKQGEDNSLAQDTEELEKEIREELPANTSKARPKQEKAFSLKTISTSESTEVLIKNSQPTKTLPPAVSTEPSIILSKSDSDKSSSQVPPMLQETDKSKSNIKQNSVPPSQTKSETSRESPKQIKKKKKARRET	312005	247466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_-_248324_248985_249143_251383_251525_252371_252480_256575_256701_262484_262584_265651_265742_267998_268236_269564_269634_271063_271241_271925_272011_284541_284644_311912
929956	contig_8576_pilon	-	1148	1	Intergenic	novelGene_88821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	680	1075	996438	996043	NA	50	AATGGGATGACATATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGHRSRIESMEDRISKTEDKCLDTNLFEEYSEKMRKNKESLRVTWDTIKRNNLCIIEFQNRRQKKSTEKIFDDLLAENFPNIMKDEKISIQAAPRTPYRTDSKRKSPRHTIIKLSKTKNKEEILRAAQEK	997117	995969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_996000_997100
929957	contig_3956_pilon	+	1969	12	Intergenic	novelGene_14905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1464.79824013327	13	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	83	715	1281682	1284815	TRUE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPGAC	1281599	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284691_1284800_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287436_1290521
929958	contig_20378_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_159575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACTCTAACCCAGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113950	112283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_-_112300_114000
929959	contig_854_pilon	+	2890	13	Intergenic	novelGene_36704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3863.28792305064	8	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	115	1866	1705343	1714980	FALSE	40	AATGATAGAATTCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704941	1716004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709640_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
929960	contig_4832_pilon	+	3955	1	Intergenic	novelGene_163405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	2822	3421	394314	394913	NA	35	AAACAACAGCATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEFLIFKNIYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDINKLWTTLQRMGIPEHLIVLMRNLYIDHEAVIQTEQGDTAWFKVRKGAHQGCILLPHLFNLYAEQIIQEAGLLEERGIRTGGKFINNLRYADDTILLAESEGDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTVGPISNIMINGENIEVVKDFILLGSTINTHGRSSQEIR	391492	395447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_391500_395400
929962	contig_3956_pilon	+	2692	12	Intergenic	novelGene_14823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	85	2166	1281682	1290491	FALSE	20	GAGCCTACGCGACTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281597	1291017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284216_1286129_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
929963	contig_359_pilon	+	1808	2	Intergenic	novelGene_179176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAGAAAAAAAAAAGAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125286	136561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_359_pilon_+_125317_134783
929964	contig_12605_pilon	+	973	5	Intergenic	novelGene_64203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2960.6692972198	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	651	321	971	4816	6243	FALSE	5	GTGTGGGGTCTGAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSGRE	3874	6245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4478_4795_5072_5728_6005_6124
929965	contig_7959_pilon	-	3414	3	Intergenic	novelGene_178213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	100	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	738	1724	5738	4752	TRUE	60	GAAAAAGAAATAAAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTIPKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPLEENALELPDREFKSLILRILLQLRQKADKHEEKIDKFIENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQEEKTESTERIIEEPLTENFPNIMKDEKLALQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAARKKQEVTYRGETKRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDEQKLREYVKVKPNL	6475	2228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7959_pilon_-_3245_3814_4086_4348
929966	contig_17130_pilon	-	3069	3	Intergenic	novelGene_176548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1559	1915	22641	22285	TRUE	35	AAGTACAGCCAGAATGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKVAFECSVAKVKGRNDEVKELNRRFQRVAEKDKVKYYNDTCKDLELENQKGRTHSTFLKLKEPKKKFKPRAAILKDSMGKIPNKRRKHQKKTEGIQSHCTKKNWSTFSHFRR	24294	21049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_-_21892_21972_24129_24223
929967	contig_16882_pilon	-	1029	1	Intergenic	novelGene_148232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCTATAAAAAGACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351881	350852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16882_pilon_-_350900_351900
929968	contig_10331_pilon	+	4498	11	Intergenic	novelGene_54097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	74	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3519	3836	321296	325413	FALSE	30	GTTAAGAGCTCAGCTGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRWQPESHPSSPPHFHRDIVSGQGEIRSFVVCDNSATKSSYLRLRTSRCLSWSAISITSSHEDSRFLDKSNFLILGHVSAIPPFPPAPFTAQFLRETSCNLLS	304596	326075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311290_312016_312168_312477_312542_312622_312689_318101_318200_318790_321525_325324
929970	contig_7357_pilon	-	2462	9	Intergenic	novelGene_36797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2114.46594542806	11	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	390	1580	160025	136424	FALSE	15	TTTCTGGACCTAGTACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167085	135541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160102_166772
929971	contig_6415_pilon	+	3376	6	Intergenic	novelGene_175842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGTCTTCCTTTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80312	121944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6415_pilon_+_80982_81344_82986_87541_87654_88384_89148_89425_89598_121925
929972	contig_14744_pilon	+	538	1	Intergenic	novelGene_65915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTATCGGATACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88526	89064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_88500_89100
929973	scaffold_13609_pilon	+	2072	1	Intergenic	novelGene_124408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATGTTAGAAGAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536704	538776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_536700_538800
929974	contig_9653_pilon	+	3173	1	Intergenic	novelGene_48212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	181	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	1733	2125	292230	292622	NA	15	GCCTAGAGCGCCATTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNEERQKGKKRKKKTKQITKEKKEQERPPKKTEKKKKNQRKKKCSQGSLCTSVEAEGDFLTTQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAETRKQLHTRTELCSPSGRSKDGAQSQALE	290497	293670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_+_290500_293700
929975	contig_11538_pilon	+	267	1	Intergenic	novelGene_152297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGCTTCTGTCTATAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205773	206040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_205800_206000
929976	contig_15063_pilon	+	1926	7	Intergenic	novelGene_12280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3646.33575966644	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	183	1691	28164	39515	FALSE	25	ATGTGTATATATTCTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTADPPLCPVTVAEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27981	39750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266_36600_38942_39092_39506
929977	contig_6689_pilon	-	2613	1	Intergenic	novelGene_175254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCTCCATATTCCCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17506	14893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6689_pilon_-_14900_17500
929978	contig_10109_pilon	+	1913	1	Intergenic	novelGene_131323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCTGACGACAACAACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	102828	104741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10109_pilon_+_102800_104700
929979	contig_6958_pilon	+	3084	1	Intergenic	novelGene_69974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	176	531	1671	2201	676736	677266	NA	60	AGAAAAAAAACAAACCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNVKKTKILTTGLISNIMINREQIEVVKDFLLLGSINQCPWKHQSRNQMIKFTKKDQTYCCVRDWRKQEYGSRTPFNSVLKSLLKFTLQPKIRQAYKINSNTCSSTMYTRLNGHTRPKAKTRRQEGTGKLDEWKWGTRGGEGMSVDTSRGWQPMSQNNYVLIV	675065	678149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_675100_678100
929980	contig_8589_pilon	+	945	2	Intergenic	novelGene_107363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTGTCATTTTGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212434	213440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_+_213319_213379
929981	contig_14970_pilon	-	1797	9	Intergenic	novelGene_44943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1261	1611	188827	136199	FALSE	10	GCCGCCTCGGAAGTTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIGPSKVLGRSVTDVQSSLSAGAEALKQYVSYWEVLDVRMYTPVLLAAQMETGTIRGISLKPNAQGFLHLRQGRQCAIESLAEVSCLGPRDAVAAIFLHMEYTSISAGYVQIDLR	232155	136012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177427_182350_182457_188755_188830_191970_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
929982	contig_1275_pilon	+	654	3	Intergenic	novelGene_108856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2171	10	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	62	526	747279	747982	FALSE	15	GCATAATTGTGTCTGTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMS	746575	748110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_746631_747272_747738_747976
929983	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	3	401	117788	116936	TRUE	10	CTGAGAGCTGGGTGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117790	111215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111378_113644_113711_116577_116961_117218_117343_117538
929984	contig_10766_pilon	-	1779	1	Intergenic	novelGene_151214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTTCTTTACTGAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180961	179182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_179200_181000
929985	scaffold_2602_pilon	+	5388	3	Intergenic	novelGene_127711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	152	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1937	2242	544358	544663	TRUE	25	ATTTGCATTGAGCTTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLYPDTLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYQIISSATRDSLTSSLPIWMRFIYFSSLTALTRTSSTVLNKSGDKGHPGLVPVLKGNAFKVSPFRMMLAAGFV	464723	615447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_465866_543563_546361_613998
929986	contig_12630_pilon	-	2065	7	Intergenic	novelGene_173077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	161.41526845032	1	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	52	567	100972	81597	TRUE	15	AAATTGTGCTTCTGTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECVVLGVEGPVPPNNSLMQQKDKENSTSVNTLLSVLVDTKAVLSCHPIPLTTLVLATWKIIFRDNTSCTRAYRKDTHETVETNCTDKGITWASSPDQNPALQIEPVAITHDGYYVCDMVTSEGNFMHGYHLQVLVPPKTTILLTAHRTVVCKAVAGKPAAQISWTPEGKCVTKQEDQGNDIVPALSLT	101023	75446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_-_76760_77429_77476_78018_78122_81560_81619_81667_81810_81934_82253_100938
929988	contig_6325_pilon	-	1246	1	Intergenic	novelGene_143375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAGAACAATAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	546859	545613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6325_pilon_-_545600_546900
929989	contig_10734_pilon	+	2064	8	Intergenic	novelGene_51203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	190	junction_7	421.485129376725	1	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	157	1257	1129441	1142903	FALSE	30	TAACAAGTCCTTCGTATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRTNFFLKQARRHESKDKSSKKHKSEEHNDKEHSSDKGRERLNSSENGEDRHKRKERKSSRGRSHSRSRSRERRHRSRSRERKKSRSRSRERKKSRSRSRERKRRVRSRSCSRSRHRHRSRSRSRTRSRSRDRKKRIEKPRRFSRSLSRTPSPPPFRGRNTAMDAQEALARRLERAKKLQEQREKEMVEKQKQQEMAAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGDKSQSAEIWEKLNFGNKDQNVKFRKLMGIKSEDEAGCSSVDEESYKTLKQQEEVFRNLDAQYEMARSQTHTQRGMGLGFTSSMRGMDAV	1129284	1143710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134456_1139039_1139120_1140659_1140893_1141326_1141417_1142723
929990	contig_17144_pilon	-	1668	8	Intergenic	novelGene_29203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1472.90285366229	63	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	126	1373	172541	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	172666	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528
929991	contig_3956_pilon	-	2490	10	Intergenic	novelGene_15253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	1200	1991	1289541	1286583	TRUE	10	GCAGGCCCCAGGTGGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1290996	1284812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284825_1285108_1285171_1285710_1285821_1286081_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289696_1289951
929992	contig_15327_pilon	-	1668	4	Intergenic	novelGene_70645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	11	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	77	487	901528	900904	FALSE	35	AATTGAATGTATAGAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902104	899722	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
929993	contig_10877_pilon	+	3779	1	Intergenic	novelGene_166217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	100	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	1080	1520	108539	108979	NA	5	TTCCCGTTGTGCTGCTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTISCPDLPLLLSSTSSWAAMAPLYLLRLRSHACSGHQNPNPCCGLLAGHPQMPSIPPWAPHGGLGAGSGAARAWCCMAASARGQPRIGEPRLCPARGARWLVPVCEASSGRRVRCGRTVGSREVRRELGGARALGALQVPGWR	107459	111238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10877_pilon_+_107500_111200
929994	contig_19558_pilon	+	3145	1	Intergenic	novelGene_164741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2590	2931	5823	6164	NA	50	CAGAAGGACAAATACCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQVASRHVKKCSRSSAIREMQMKTTMRCHLTPTRLALIQKTQNNKFWRGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKLIWCLLKKLEIEVPYDPAIRLLGIYPREIRAVT	3233	6378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19558_pilon_+_3200_6400
929995	contig_5878_pilon	-	1580	1	Intergenic	novelGene_145733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	381	692	322597	322286	NA	10	CGCTGCCCCGCTTCCCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAPLTVTSSDPLVKFFLPVSVTLFSVSLEVLVPKEGMLPSGDTTLIPLNWKLRILPGYFGLLMPLEQQLKKGVTVLAGVTDPDYQGEIGLILCNGSKEEYV	322977	321397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5878_pilon_-_321400_323000
929996	contig_6270_pilon	-	1146	6	Intergenic	novelGene_99824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAACACTCGACTACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47596	39016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_-_39479_40396_40556_43474_43532_45416_45455_45576_45711_47300
929998	contig_11396_pilon	+	4449	2	Intergenic	novelGene_71344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCCTACCAAGGAGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486982	491524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_+_487170_487262
929999	contig_7839_pilon	-	2403	2	Intergenic	novelGene_45716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTCATTGGAACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	939041	936135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_-_938321_938823
930000	contig_15063_pilon	+	2181	6	Intergenic	novelGene_11471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_4	3022.71575904848	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	1375	1926	36064	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27138	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_36158_36266_36600_38975_39092_39506
930001	contig_6441_pilon	+	1160	1	Intergenic	novelGene_172893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCGCAGGTGCTCCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	329796	330956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6441_pilon_+_329800_331000
930002	contig_11338_pilon	-	1496	8	Intergenic	novelGene_6229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	89.0079106780139	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	77	1063	17283	12948	TRUE	30	ATTATGGAAACCTGACTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEQDVENELLDYEEDEEPQPPPESTPAPSKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGALVTLSAVQGFPAAHPGGHQSVWPRDGH	21358	12422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12795_12886_13032_13118_13458_14577_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17288_21286
930003	contig_12279_pilon	-	1225	6	Intergenic	novelGene_50077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	52	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	412	714	77185	75050	TRUE	25	GCAAGGGCGTGGGGCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERVLLGGKGGERGGQMVSFCPVLLNGQVPLPGKVVVLVVISEEGLGVVGAPGQQALRSLLSWSQELIFLRSRPIAANHKCCFIHFHSSPVGVLNVFQA	77596	57328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12279_pilon_-_57477_68290_68471_69358_69445_71631_71709_75029_75094_76926
930004	contig_10286_pilon	-	807	2	Intergenic	novelGene_98408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCCCCTCACTGCCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382589	380703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10286_pilon_-_380766_381844
930005	contig_11309_pilon	-	438	3	Intergenic	novelGene_149874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	6620	junction_2	24	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	73	369	60277	56293	FALSE	20	TACATCTGTGTTAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRWNRPKMSLAQKKDRVAQKKASFFRAQGRAAES	60349	56223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56928_57018_60169
930006	contig_6189_pilon	-	1216	1	Intergenic	novelGene_164941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	71	406	84799	84464	NA	65	AAAGAAACAAGGAAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DWGCGRQPGSPAPGVSGGRWLEGMWGLWAGGCGVLVKRFSEAGVGACTDHPLGNRQHAPLLCCRDRKGLSIRGAPAVCHLIHFLQQTSHVAEFPAHKGRDECPGEGERVGRGSQPHKWVQVCVAHEHCFLPRLP	84869	83653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_83700_84900
930007	contig_6163_pilon	-	748	6	Intergenic	novelGene_103809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	375.775677765339	9	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACAAACCCATGCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93956	75949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_76138_77094_77238_86907_86975_89577_89676_93043_93112_93772
930008	contig_6898_pilon	+	2202	14	Intergenic	novelGene_35708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	9	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	131	1864	59668	125646	TRUE	30	TTTCAGTGCCATTAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59537	127673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125760_127448
930009	contig_19459_pilon	-	791	7	Intergenic	novelGene_59888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4360.87523389004	4	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	72	596	16240	6952	FALSE	55	AATTAAGATATACTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKPCF	19035	6756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_6964_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
930011	contig_3956_pilon	+	1377	3	Intergenic	novelGene_14758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	100.5	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	13	996	794009	796007	FALSE	45	ATTGAAGGAATCCATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSQEQNQSPGGLDPYLSRTLFLLLLLAASTPSAKACLVYNSGNGSSINCHPTAEPPHHLPADTVYLAVEFFNLTQLPANILQGASNLQELHLSNNRLENLSAEFLLPVPQLKVLDLTHNALSQLPAGLFQASAALHTLVLKENCLEVLRALWLNGLKALAYLDLSALQILDLGDNQLEVLPSDLLRGPLRLERLHLESNRLRVLGGDLLAPQPGLRYLFLQNNSLATVAAGAFQGLKELDMLDLSDNLLTSVPTGLWASLGQPARAMKEGFDISSNPWVCDKNLDDLYRWLVANNDTMFSRKDTLCAGPEDMKGRVLLEVARSQ	793996	796388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_794041_795007_795478_795525
930012	contig_14682_pilon	-	1916	6	Intergenic	novelGene_139113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	103.416439698918	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	504	839	137297	119737	TRUE	40	TAGTATATCACAAAATCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKCSGHPMLCSLPTMYTFLLGAIFIALSSGRILLVKFSANEEDHQSRNLRCASWKEFSNFMKWSIPAFLYFLDNLIVFYVLSYLQPAMAVIFSNFSIITTALLFRIVLK	141975	93648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94370_96201_96558_119736_119809_122397_122532_137167_137313_141487
930013	contig_8260_pilon	-	1970	1	Intergenic	novelGene_163243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAAGTTATAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147870	145900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_-_145900_147900
930014	SIRV3	+	517	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4752	1726	2693	495	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTAATAAAGAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6696	7213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6700_7200
930015	contig_10953_pilon	+	1561	9	Intergenic	novelGene_42582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	641	junction_6	17756.3137133669	13	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	82	924	455261	463828	FALSE	0	CGTCTGGCTCTGGCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKALTKCQEEVSRIPAIHPGMFRPKCDENGNYMPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPHTRSRGHHNCSEPLELEDLTSGLGLTKQGVGEVFI	455179	464465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_462728_462921_463465_463529_463817
930017	contig_1725_pilon	+	2672	20	Intergenic	novelGene_24282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	732.096511355612	2	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	23	1603	201480	248410	TRUE	20	AGGGTCTGATTGTATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAGNFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLADFFKENWGRIRERFEPAEEAAQLPG	201457	255663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209862_218449_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247742_248334_248448_248575_248700_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
930018	contig_15691_pilon	-	1432	1	Intergenic	novelGene_60786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATGAAAGGAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	173817	172385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15691_pilon_-_172400_173800
930019	contig_4151_pilon	+	1560	1	Intergenic	novelGene_65283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	173	475	663342	663644	NA	20	ATTTTAAGCAGTTTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIDDTSSEVLDELYRVTKEYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSKLLNECRDMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSNCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGVNKMLDEENI	663169	664729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4151_pilon_+_663200_664700
930020	contig_15471_pilon	+	1187	1	Intergenic	novelGene_175221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAAAAAAACCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299398	300585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_+_299400_300600
930021	contig_7704_pilon	-	842	1	Intergenic	novelGene_154630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	133	348	405217	405002	NA	35	AGTTAGTCTCTCATACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELGAELLGEATIFIVGGGCLVLEYWRHQKQQRNKEEEQRAAWNAMQDEVGRLSLTLEALQAHVQAVPSQSALEELQAQLQEVHAQVCSRGRPPSTQKAPATQAAPATQAATTCEK	405349	404507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7704_pilon_-_404500_405300
930022	contig_6210_pilon	-	894	1	Intergenic	novelGene_171875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTACAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52101	51207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6210_pilon_-_51200_52100
930023	contig_16776_pilon	+	2391	1	Intergenic	novelGene_130540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCATTCTTAACTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104507	106898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16776_pilon_+_104500_106900
930024	contig_14441_pilon	-	1315	6	Intergenic	novelGene_100333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	117794	117215	TRUE	35	GCCAACTGTCAGAGAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSL	117796	5859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_6040_6605_6916_114107_114152_116570_116962_117210_117343_117538
930025	contig_3095_pilon	+	1249	5	Intergenic	novelGene_74967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3097.12482594745	4	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	218	841	149709	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147162	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149651_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930026	contig_4180_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_8410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTTTGGAGCCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888090	888710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_888100_888700
930027	contig_2854_pilon	+	3988	4	Intergenic	novelGene_120805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	121.973585482905	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	133	903	68566	77341	TRUE	30	CAGTCTCTTGGAGAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAEPLLLLEEIEKENKRIQENRAFSAGTLYPETNKTKNKGVCNSMSELTADSTPKKTQNQTQQNMVGKFSQLPFKVESKPCTSNCKTDSLRAVPTEQKQEMWGSSQSYTCNVDLETDGPSPSATPSSPKEAVSFVSRGASGHHPRVPVLQHQAEPFLPNHMRSTCGSRSGCGSSPAAKPACPPVSPPTRLPQPPPSVADARLAGASDHGDSSVTGVQRFRDTLKVPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITGEAN	68433	82470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_+_69192_77196_80098_80525_80778_82393
930028	contig_6576_pilon	-	2927	3	Intergenic	novelGene_42411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	80	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAAAGGAGTGGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304281	1295687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1295756_1301204_1303150_1303367
930029	SIRV7	-	1705	3	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	111627	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	65	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3111	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1067_1146_2676_2993
930030	contig_3956_pilon	+	3211	13	Intergenic	novelGene_15199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2031	junction_1	763.253393739953	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1315	2691	1286460	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282766	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
930031	contig_17194_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_155362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAATTACAGTTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82196	80807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17194_pilon_-_80800_82200
930032	contig_3956_pilon	+	2467	12	Intergenic	novelGene_15176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1199.21414350543	7	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	750	2253	26	2278	1282731	1290816	FALSE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDIPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1282705	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289156_1290521
930033	contig_17976_pilon	+	1434	5	Intergenic	novelGene_32481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1282.89867097912	4	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	234	836	41843	48315	FALSE	20	TGAGTGGCTGCCAGAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGGNAKWYSYCGKLRGSSSKN	41609	48913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46700_46741_46952_48253
930034	contig_7066_pilon	-	2038	3	Intergenic	novelGene_42151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	307	3	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTCAATAAATGTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	757829	748026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_-_749881_750340_750424_757728
930035	contig_14441_pilon	+	1573	3	Intergenic	novelGene_100781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	7	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	989	1537	125667	126705	FALSE	5	CCTGGCCGTGTGTCCGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	124678	126741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
930036	contig_17108_pilon	+	562	2	Intergenic	novelGene_109526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCTGGGGTTGCCATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72227	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_+_72320_77673
930037	contig_6005_pilon	-	1336	4	Intergenic	novelGene_158893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	115.042987134761	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	768	1094	326574	311978	FALSE	15	GTTAAGTGGCATTTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFAERIIYDVIVEPPSVGSMTDEHGHQRPVAFLAYRVNGQYIMEGLASSFLFTMGGLGFIILDRSNAPNIPKLNRFLLLFIGFVCVLLSFFMARVFMRMKLPGYLMG	327341	311735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6005_pilon_-_311997_320205_320404_321980_322075_326558
930039	contig_2043_pilon	-	2736	1	Intergenic	novelGene_169928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAACTGAAGAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	811825	809089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2043_pilon_-_809100_811800
930040	contig_11160_pilon	+	728	2	Intergenic	novelGene_168828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318194	321139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11160_pilon_+_318414_320630
930041	contig_1090_pilon	-	3832	1	Intergenic	novelGene_131156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATATACCTTATTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	562356	558524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_558500_562400
930042	contig_9098_pilon	-	2803	11	Intergenic	novelGene_75826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	13	junction_1	153.283397665892	3	117	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	1403	2272	345261	335775	TRUE	40	AATACCTTAAAAATTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	349764	327579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_327712_335375_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546
930043	contig_10331_pilon	+	905	11	Intergenic	novelGene_54159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	365.135878817735	1	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	535	903	542032	545882	FALSE	50	GGAGGGAAATATAATACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLGGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALPEKVVNKPCKECENVKEIKVKEENESEIKEIKIE	501907	545884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_501957_507020_507087_511869_511961_514501_514506_534734_534767_536900_536978_537997_538153_541971_542045_543768_543864_544890_544989_545719
930044	contig_3155_pilon	+	2524	5	Intergenic	novelGene_26380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	539.100813855813	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	63	461	258156	261152	TRUE	55	AAAAATAGTACAAGTTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSEVLPVYFPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGALHPLVALPMLLSSQSCREPTSS	258093	263351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259345_259771_259953_261082_261836_261971
930045	contig_829_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_168930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242558	243971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_829_pilon_+_242600_244000
930046	contig_19412_pilon	-	3017	3	Intergenic	novelGene_178697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	2139	2597	1193	482	FALSE	10	GTGGAGGGACGGCGTGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKGKRGKRKQNKLKKKRTRKAPKKTEKKKQRKKKCSQGSLCTSVEAEGEFLATQLRLARKGSQLKKRKRKQTNNSKRTNEQKPRDPTSAVAQTGKQLHTRMELRSPSGRSKDGAWSQALERKEGRRREASKKSKEAEKKKKAKKKKQH	3384	61	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_502_754_2514_2566
930047	contig_12081_pilon	+	1040	5	Intergenic	novelGene_166969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	886.388599881564	2	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	158	487	16400	17227	TRUE	20	TATATTATTTTTATTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSAKQEAEDCVSDKPVYAGVLGKECLWPIQPLLGTLRKSSLAPTSPAPPLNMGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEKVIRKERKKIPMLPKGHHLPSSCFALNIAQRSKANTQAYPLGILQKNWVKCGLNNQPKINSRMNKKQLS	15725	18648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15864_16380_16519_16938_16992_17069_17245_18112
930048	contig_6375_pilon	-	412	1	Intergenic	novelGene_73050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525889	525477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_525500_525900
930049	contig_3382_pilon	-	1842	1	Intergenic	novelGene_124044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTCCTTAGAAGCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	212098	210256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_210300_212100
930050	contig_6059_pilon	-	2156	15	Intergenic	novelGene_44870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	5214.71284943292	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	299	844	584374	576615	TRUE	55	GTGGAAAAAAAACATTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVCFYRTCLKCESND	584777	568162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575794_575883_576080_576219_576550_576658_580594_580711_580921_581116_584181_584411_584515
930051	contig_17108_pilon	-	2149	2	Intergenic	novelGene_109528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTCTCTGCTTGCTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78779	76344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_77077_77362
930052	contig_20951_pilon	-	1731	6	Intergenic	novelGene_43074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	12763.9376933609	7	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	798	25	822	29171	27685	TRUE	40	CTTAAAGAAGCAAGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPATPKLTMDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPS	29958	26563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27790_28224_28685_28926_29048_29178_29940
930053	contig_12402_pilon	+	1826	1	Intergenic	novelGene_133366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	339	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTATATGTGTTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554991	556817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_555000_556800
930054	contig_4339_pilon	-	3104	1	Intergenic	novelGene_146069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	53	130	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	172	519	2144	2662	295378	294860	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLQVTGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNNIKDEKLATQEAQRTPYRTDPKRKSPRHIIITLTKTKDQQRILRAAREKQEVTYRGKKIRLSSDFSAETMQGRRQWDDTYKTSKENNCQPRIIYPTKLSFKYDGEIRTFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVL	297521	294417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4339_pilon_-_294400_297500
930055	contig_20951_pilon	+	1736	2	Intergenic	novelGene_43133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	322	642	293930	294250	FALSE	75	GTATCCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLVLGYQRVRGPFLPGSLLSQSNHYIWSFYWNLSSAAHFSPACQGLSVVFPVRVVIGRSPAPSSSSGLRLMESLVYVALSVSWANIFLVSLVFFIPLCSRWVGTN	290166	295344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_290187_293628
930056	contig_11692_pilon	+	1475	3	Intergenic	novelGene_179177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	9	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGCTATCCACTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28815	44933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11692_pilon_+_28854_42883_43091_43703
930057	contig_8106_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_139738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTCAGCACCACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117125	118591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_117100_118600
930058	contig_12079_pilon	+	3977	4	Intergenic	novelGene_67421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	158	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	3253	3690	585608	586045	FALSE	15	TCTTCCTGGTCAAGCATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIHWMANQLQLSSPHPKLCHLNFHRKMADLLISHPRAHPQAHPQTVAHKLHAVTSKGPQLLDTQTCLPDNGLPDSFQDSDRQPGPCGQQAGPTHRSSCFWCFSSRAWAFICCTSMVSGLRRRMYSSWFPIHSCRIRLLIRRRGA	579723	586332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_581168_581923_582172_583663_583762_584145
930059	contig_10042_pilon	+	2270	10	Intergenic	novelGene_79110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	292.870847530671	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	8	973	6321	49620	TRUE	85	TAAAGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDQFLGQAASITRQATQTQPAPLDFSQVTGIWMTAANPPRKS	6313	54077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_46944_47001_47035_49529_50060_53219
930060	contig_10297_pilon	+	1238	1	Intergenic	novelGene_112570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCCAGATGCTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971622	972860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10297_pilon_+_971600_972900
930061	contig_15323_pilon	+	2833	1	Intergenic	novelGene_148543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	106	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1502	1975	196599	197072	NA	65	TGAAAAAAAAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMVQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	195097	197930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15323_pilon_+_195100_197900
930062	contig_6361_pilon	-	5007	10	Intergenic	novelGene_23924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4897.5675368266	38	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	50	AAAAACATTTTAAAATGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	496323	250602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_250781_254327_256082_256151_256518_395556_396127_409609_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
930064	contig_14711_pilon	+	1912	9	Intergenic	novelGene_68918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	458	junction_2	301.551716128428	7	29	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	506	1669	88011	90570	FALSE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSCVGVGVCVCVCVCMCKLSLIPQVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85566	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85593_85912_86009_86151_86242_87717_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
930065	contig_854_pilon	-	1647	1	Intergenic	novelGene_36386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTATTAAAGATTTGGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976420	974773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974800_976400
930066	contig_20951_pilon	+	3079	3	Intergenic	novelGene_43130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4	19	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAGTGGTTTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	286845	313345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_286955_289624_289758_310508
930067	contig_9127_pilon	-	2334	1	Intergenic	novelGene_103001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAGAATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64975	62641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9127_pilon_-_62600_65000
930068	contig_11855_pilon	-	2279	12	Intergenic	novelGene_67147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	265.150136792954	1	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	62	1450	2723908	2710017	FALSE	30	ATAACCCTGAATTTATGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLALPGCCCAADDCYPRTLTMEEIIEDPPTSAVLLDHCHFAQVIFNSVEKFYVPGGDITCYYTLTKHFIPRRKDWIGIFRVGWKTTREYYTFMWVTLPTDLNSESAKQQEVQFKAYYLPKDDEYYQFCYVDQDGVVRGASVPFQFRPESEDDILVVTTQGEVEEIDQRNKELCKENQELKDSCVSLQKQNSDMQAELQKMQGLQEELETLKSINKKLEQKVKEQEDCWELELLHIHFTEYLHLHRLKEQNQKMSSENEKMGIRIDQLQAQLLIQEKEMEKLIQGDQDKTKQLEHLKKENDELFLSLTDQKKHQKKLEQTVKEMKQKETAATRKQQELTDQNFDLSKRLSENEFIFKTLQREKEKIEGENDLLKRENSRLLSYMGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGKTTLPFLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2731350	2709187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2711716_2711876_2713483_2713580_2716010_2716098_2716379_2716503_2717121_2717225_2718335_2718434_2718633_2718760_2719583_2719718_2719882_2719986_2723728_2723919_2731299
930069	contig_295_pilon	+	1576	1	Intergenic	novelGene_176828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	502	831	132450	132779	NA	70	AAAAAAAAAGAGACATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIWQYLTLAELVTPLLSLFSKRWINRHRLLVPCFQMAEGSLRISLDHPISGSPSSLKSNRMECPEVTAQPSETLSLLPLFSDFFTPFPLLLFCFLFLHQITQILDWE	131948	133524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_295_pilon_+_131900_133500
930070	contig_6868_pilon	+	483	1	Intergenic	novelGene_179178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATCAAAAAAAAAAGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6630	7113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6868_pilon_+_6600_7100
930071	contig_9267_pilon	-	1482	1	Intergenic	novelGene_162009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCCCCACCCTGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	275409	273927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_-_273900_275400
930073	contig_12327_pilon	-	1696	1	Intergenic	novelGene_140635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCAAAGGCTGATATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158553	156857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_156900_158600
930074	contig_15036_pilon	+	2976	1	Intergenic	novelGene_107153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2182	2490	118257	118565	NA	75	CTTTAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCCTAVMRSYAVEMGPHKSMQGEWHSKSIDPLCLCLGKGAVPTLVPGLGEQSVYFFPFVNLFTLQGRENGSGHLTDPVSRLGDWAIAEAGPGLSAEQGAGR	116075	119051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15036_pilon_+_116100_119100
930075	contig_6842_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_130768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAGAAATAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1332414	1334068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1332400_1334100
930076	contig_5590_pilon	-	1267	1	Intergenic	novelGene_163069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGGAAGAAGATGAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005892	1004625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_1004600_1005900
930077	contig_19155_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_173366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAAAACCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428537	429701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_+_428500_429700
930078	contig_8865_pilon	+	1326	1	Intergenic	novelGene_164460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	126	428	404251	404553	NA	30	GGGTACAAGGTTGATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAGLYEEERGIRIGKRFIDSLRYVDDTTLLAKSEDNLKHSVMKVKDYNLQYGLHINIKKTKILTTRPINNIIINGDEIEVIKDFILLGSTINAHGSSSQEIKQCIALGKSAANDLLKVLKSKDITLMTKVHLTQAMILSIT	404125	405451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8865_pilon_+_404100_405500
930079	contig_8674_pilon	+	4476	1	Intergenic	novelGene_102913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATCAAGAATTCCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191985	196461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_192000_196500
930081	contig_9995_pilon	+	582	1	Intergenic	novelGene_47807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2	316	847081	847395	NA	75	CTAACAAAAACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQSSSAALSEIPQVDGFNKEKFIFSQSSRLQVQIQGVSSRRSPHSPSALEKGPYDESVFPWSGSISAQEPQVHRTRSAPDTAFLVVRGSHVSLLTSFTSQKRLA	847079	847661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_+_847100_847700
930082	contig_7840_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_68992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGAGTCGTCCACATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	236252	238067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_236300_238100
930083	contig_5643_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_38924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCACCAAGGAACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	406076	407936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_406100_407900
930084	contig_9717_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_179179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1261	1665	5562	5158	NA	35	ACAGTCTAGGAAACCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNRTKHCLVLHILTIIAMFESIVAATVSIHLLRVFLFFTEPLLRKYDVLLQGLAPPDNKSKVLKMATSFLSFLKSILDVLLPRQICLLFWQSMVYSIFFPSTVIQMHQFLFGFPYLLSSFHMHMRQLKIPCLG	6822	5122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9717_pilon_-_5100_6800
930085	contig_19564_pilon	-	1873	5	Intergenic	novelGene_29598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.826066038658	6	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	159	1013	15529	12201	FALSE	45	AAAGAAACCTTTGCAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYQEA	15687	11340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_-_12212_12691_13259_13554_13666_13945_14055_15472
930086	contig_6059_pilon	+	2344	17	Intergenic	novelGene_44850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAAAGGTTTTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567808	584767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_567954_567997_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165_573444_575787_575882_576079_576218_576549_576645_578184_578326_580594_580709_580919_581116_584181_584341_584701
930087	contig_14575_pilon	+	2833	1	Intergenic	novelGene_101927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGCCCAGCAAAACTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403343	406176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_403300_406200
930088	contig_1244_pilon	-	1413	1	Intergenic	novelGene_38073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCTCTAATCTCAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1269334	1267921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_1267900_1269300
930089	contig_18859_pilon	-	1676	1	Intergenic	novelGene_150564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAATAAAAAAACTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277928	276252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_276300_277900
930090	contig_11855_pilon	+	1513	5	Intergenic	novelGene_67109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	162.879364868605	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	527	1273	2445507	2446468	FALSE	25	CAGCCACCCAATGGCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLPPSATGAQGVLRMAAFRGCPGRIGGGGDGGQGLGKTNLVLVLPFPFRFGMSLGTDFGNSGLVRLRGRRGFGAIPIYAVKPG	2440119	2446708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440428_2441567_2441665_2443329_2443442_2445497_2446007_2446221
930091	contig_3627_pilon	-	2838	11	Intergenic	novelGene_78457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTTGTGAGAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323553	306607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_307908_309389_309490_309605_309769_312559_312787_313381_313492_314035_314208_314945_315156_315967_316054_318606_318780_320234_320416_323437
930093	contig_6902_pilon	+	2778	2	Intergenic	novelGene_135548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	168	641	38664	39137	TRUE	70	AAAAAAAAAAGAAGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTLPLRTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIAQEEVKLSLLVDDMILYIENPKDSMRNLLELTERFSRVVGYKINIQKLVRFLDTNKENNETEIRKTIPFIIAPKKVKYLVINLTRDVKYLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFLKEMDKLIINFIWKGKKPQIIKHY	38496	171861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_40203_170789
930094	contig_1443_pilon	-	4448	1	Intergenic	novelGene_28377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCCTCAAGATTGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1024490	1020042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_1020000_1024500
930095	contig_5210_pilon	+	2221	9	Intergenic	novelGene_65406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	18.8215302247187	31	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	825	1982	387196	429457	FALSE	30	CTATACTTTTTCTGAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLMDFVSPQHYPPREIVAHIIQKILLSDSETVDVLKEAYVLLMKIQQLHPANAKTVEWDWKLLTYIMEEEGQNLPGRVLFLRYVVQTLEDDFQQILRRQRQHLQQSIASTVLSCDKQPHNVRDVIKWLVKVVTEDELTQPPNGNQTSSETGILKASSSQPSPQADLTKNTNQLIVCQLQRMLSIAVEVDRTPTCSSNKIAEMMFGFVLDIPERSQREMFFTTMESHLLRCKVLEIIFLHSCETPTRLPLSLAQALYFLNNSTSLLKCQSDKTQWQTWDELIEHLQFLLSSYQHVLREHLRSSVIDRKDLIIKRIKPKPQQGDDITAVDVEKQIEAFRCRLIQMLGEPLVPQLQDKVHLLKLLLFYAADLNPDDEPSPNTWSGP	383449	429696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_+_384187_387108_387342_388160_388231_394462_394618_407432_407586_409217_409347_418739_418897_419074_419160_429194
930096	contig_9839_pilon	-	763	6	Intergenic	novelGene_88599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCAGCAGGGGGGTGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550022	538700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_-_538802_544669_544768_546479_546576_547651_547836_548602_548775_549910
930097	contig_15882_pilon	+	746	1	Intergenic	novelGene_144811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TATAATAAAAAAAAATTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116199	116945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15882_pilon_+_116200_116900
930098	contig_5845_pilon	+	1186	2	Intergenic	novelGene_98887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATACAGAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97204	102952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5845_pilon_+_97892_102453
930099	contig_4103_pilon	-	2826	12	Intergenic	novelGene_51887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_11	28.9308094518143	11	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	165	1427	53593	48971	TRUE	30	TGTAGTAGTTTGAGTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLGLLPRKAWVALLSQILRPPHAACPRAVRFHSQVSRTESSRLLQQGLQVAEAVLTSQLKPNQEKSNFIIKTPKGTRDLSPQQMVVREKILDTVVSCFKRHGAKGLDTPAFELKETLTEKYGEESVLIYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKCYHVGKVWRRESPTIAQGRYREFCQCDFDIAGEFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAACGVPESKFRAICSSIDKLDKMSWKDVRHEMVTKKSLAPEVADRIGDYVQRHGGVSLVEQLFQDPRLSQNKQVLEGLGDLKLLFEYLTLFGIAEKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPNQAGKDSLSMGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRMKVGPRYG	53757	46917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_47915_48333_48481_48715_49235_49326_49455_49761_49856_50128_50228_50474_50583_50689_50816_51528_51625_51759_51880_52148_52224_53440
930100	contig_6048_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_73336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAGAAGAAAGGTCTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2828168	2826380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_-_2826400_2828200
930101	contig_5403_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_87978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCAAGCTAACCAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	428598	430208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5403_pilon_+_428600_430200
930102	contig_13577_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_176118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGTTAAAGCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59933	61431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13577_pilon_+_59900_61400
930103	contig_13525_pilon	+	686	1	Intergenic	novelGene_145093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAGCACATTAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106171	106857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13525_pilon_+_106200_106900
930104	contig_12644_pilon	+	2749	2	Intergenic	novelGene_44578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1761	2087	2059145	2059813	FALSE	40	AGTAGAGGGTCAGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEVQAALKVLAKKTRLQELMEYQLRYFNKRMQSWKCSLNKLWITFRRIRISEHLSVLMRNLYIDQEAVAQTEQGDTAWFKVRKGVCQGYLLSPYLFNLYAEQVI	2057384	2060475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2059271_2059612
930105	contig_6199_pilon	+	2922	4	Intergenic	novelGene_126394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGTCCTACCCACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	553013	735881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_553360_564469_565068_616258_616297_733941
930106	contig_12391_pilon	+	5772	3	Intergenic	novelGene_103612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	191	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	4149	4667	91710	92228	FALSE	35	TAGGTGAAGGGAAGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLGINLTSDVKDLYNENYKTLLQQAKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKISILSEVIYRYSGISMIPPAFFDEMEKQMTNFIRKGKWPRLSKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTAMVVETAWYWYNNRYIDQWNRIENPGINSSTYEQLIFEKGLKSVNWGKDSLFNKMVLA	87077	93333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_87587_87879_87964_88154
930107	contig_1443_pilon	+	441	1	Intergenic	novelGene_28206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	100	405	344287	344592	NA	10	CTGTTATGATCTCTTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVNPLFALPNIITRAQWFKIQHLQPSPLPCNRAMSIVNKYTQHCKPENTFLHDSFENVTAICDLPRIICKNGRYNCHKSPRPINMTNCSLTTGNYPNCSYSNAALYKFFVVACDPPQPTDPPYHLVPVHLDKIV	344187	344628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_344200_344600
930108	contig_17144_pilon	-	1604	12	Intergenic	novelGene_29261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2142.99804282931	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	108	1520	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183189	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166334_167588_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170918_174664_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
930109	contig_19974_pilon	-	3295	2	Intergenic	novelGene_130455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTTCAGAATTAGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140631	85001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_85903_138237
930110	contig_6217_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_109698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAATTCTTCACAGGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014027	1012202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_1012200_1014000
930111	contig_4402_pilon	+	974	1	Intergenic	novelGene_140789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAGAGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155491	156465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_+_155500_156500
930112	contig_8671_pilon	-	2217	1	Intergenic	novelGene_126241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1081	1389	194063	193755	NA	70	AAAGACAGGAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEAIPPVFQIPAGSCLVDRFSGASRLRQNRKEEPGNLLKKSASENLMDSSGTLSDIVPEDEPLRLEGTQNMTGEELPPQSRVDLNDKDGVKLSGPSFSDVS	195143	192926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_-_192900_195100
930113	contig_15327_pilon	-	676	3	Intergenic	novelGene_70701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_2	1377.5	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	132	440	901528	901100	FALSE	35	AAAATACTTCGGTTTAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQVRQKDGFV	902159	900863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901281_901400_901536_902035
930115	contig_18473_pilon	-	3293	1	Intergenic	novelGene_169637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	83	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTGGTATGAATCCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34468	31175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18473_pilon_-_31200_34500
930116	contig_2480_pilon	+	2886	16	Intergenic	novelGene_63531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	90.858718165439	1	134	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	598	1995	263206	278994	FALSE	15	CCCAAGTCTGCCTGTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPYSSAGPSHLDSHDSSQLFNGLKTAATSVWETRVKLLCCCIGEDDHTRVAFSSTAELFSTYFSDTDLVPSDIAAGLTLLHQQQDNIRDKQEPAEVISHSSGTSQEADLDAELENCHHYMQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGFAVLLLSTVPGGRTNQNLAGSS	251383	279885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_254203_254356_261089_261237_261950_262006_263141_263401_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278538_278780_278923
930117	contig_10437_pilon	-	3675	1	Intergenic	novelGene_38464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	540	3135	3674	1109022	1108483	NA	50	AAACCAACAGCCAACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEAQALGPANRFINPKCAKYILKTNLIKEAEEMRSKFTREATSVVDLNEMQTMWFQTEGAWACKAMNKFGEALKKYHEIERHFIEITDDQFDFHTYCMRKITLRYYVDLLKLEDVLRQHPFYFTAARTAIEIYLKLHDNPPTDENKEHEADTANLSDKELKKLCNKQKRAQKKAQVNLC	1112156	1108481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_1108500_1112200
930118	contig_11816_pilon	+	1164	1	Intergenic	novelGene_98609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATCAATTGAGATGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492181	1493345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1492200_1493300
930119	contig_13014_pilon	-	893	1	Intergenic	novelGene_169354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAAAGAGCCCCAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409538	408645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13014_pilon_-_408600_409500
930120	contig_3469_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_34222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTCAAGAGAATAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573505	571492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_571500_573500
930122	contig_7898_pilon	-	1061	7	Intergenic	novelGene_47533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3181.47961734089	2	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	51	527	285587	283843	TRUE	25	CTCTTAAAAGCCCTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILVTD	285637	282055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283851_283954_284106_284229_284318_284421_284598_285533
930123	contig_5643_pilon	+	1806	15	Intergenic	novelGene_39082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	771.727442105021	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	578	1734	72	1805	631341	641172	FALSE	45	CAGCAGACAAGGAGAAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHLPQTSRQHLIPEALSSRGAPRMVRWFHRDLSGLDAETLLKGRGVHGSFLARPSRKNQGDFSLSVRVGDQVTHIRIQNSGDFYDLYGGEKFATLTELVEYYTQQQGVLQDRDGTIIHLKYPLNCSDPTSGGTTATCLGGQAETLLQAKGEPWTFLVRESLSQPGDFVLSVLNDQPKAGPGSPLKVTHIKVMCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKEDMYENLHGKNKKEEKMKKQR	631269	641173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632042_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641108
930125	contig_15491_pilon	-	2281	5	Intergenic	novelGene_75933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	621	junction_3	234.494136387245	7	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	116	721	46982	32303	FALSE	10	CTTTGGCCTCCTAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENRSNLENVDEDGYTQLDFTSRDSARRPIVSEKGTCSASPHWRLIAVTLTILFLITLVVAVILGTMGAFSSPCPPNWIIHEKSCYLFRKSQDSWDRSKGQCFQLGSSLLKIDSSKELEFIIKQVSSQPDNSFWIGLSRPQTEEPWLWEDGSKFSSNLFQIRSTVNHENLPHNCVWIHVSIVYDQLCSVPSYSICEKTIVK	47097	30742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_45107_45207_46879
930126	contig_14666_pilon	+	682	3	Intergenic	novelGene_39628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1614.5	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	129	590	483933	485144	FALSE	65	TAAAAAAAAAAAAATGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRWREGTATSGRVSLKMRVFPPASAAYSALQTPLSAWRQEGWGGVGGELIGLGSSADM	483259	485236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_483317_483861_484223_484972
930127	contig_10176_pilon	-	1702	10	Intergenic	novelGene_72730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	275.651461804689	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	289	645	272005	267902	TRUE	35	TGGAGGCAATTTTTAATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVCGRFRVDSV	275055	260638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261155_262991_263141_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268557_268677_270329_270450_271918_272037_273752_273864_274909
930128	contig_6191_pilon	-	1852	1	Intergenic	novelGene_107863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	228	687	666	1352	470480	469794	NA	60	AAATATTAAACAATGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNIRKHPLIIGTWNVQSMNIGKLEIVKNEIDLIKIYILGIRELKWTSIGHFESDNHMVYYAGNDKLKRNGIPFIIKKNISRSILKYNAVSDRIIAIWLQGRQVNTTIIQIYTPVTNAKDEKIEDFYQLLQSEIDQKRNQDALIILGDWNAKVGNKEEGPVVRKYGLGDRNEDGNHMIEFCKTNELFIANTFFQRHNLQLYMWTLPDVIHRNQIDNGEAQYHGSAQG	471145	469293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6191_pilon_-_469300_471100
930129	contig_19402_pilon	+	3265	18	Intergenic	novelGene_80756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1648.99619880333	1	91	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	787	2364	10	2373	23458	143056	TRUE	70	AATAAACTTTCAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	23448	146702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81426_83571_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143065_143802_144324_146339
930130	contig_13097_pilon	-	1183	1	Intergenic	novelGene_107673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTAGAGGTGTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40684	39501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_-_39500_40700
930131	contig_17171_pilon	-	1650	1	Intergenic	novelGene_147364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTCACAGTAGTCAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240948	239298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17171_pilon_-_239300_240900
930132	contig_14744_pilon	-	2652	7	Intergenic	novelGene_65989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_5	461.016871226591	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	68	577	969897	968300	TRUE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969964	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_965701_965811_967273_968630_969717
930133	contig_2703_pilon	+	1328	6	Intergenic	novelGene_101786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	716.081112723971	3	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	202	453	607675	610870	FALSE	30	AAAAAGTTTGGTGTCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	603470	611745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
930135	contig_16594_pilon	-	4288	10	Intergenic	novelGene_53828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	126	junction_6	2749.8538547025	1	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	325	1524	272836	121101	TRUE	40	AATAGCAGGTACTTCAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	273160	115804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_134026_134081_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
930136	contig_7173_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_37547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTACAACAATAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540143	541347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_540100_541300
930137	contig_10126_pilon	-	4991	1	Intergenic	novelGene_105768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	126	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	216	651	1897	2547	184883	184233	NA	30	TACAACGGGTGGCAGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKAGPLAATSPRLRIWVPGFLSSFSMVGAVQSKGKWFAKSPGMVVLAGEEVESSPSSPWQIKLCSVKEAVKGLQDHDKDPGVGAAEARELLGPWLLWSVPRWAAWLVWQHQPPCVGTCRAVVGLKCWRARVVGRQELPSLLGPRAWPSWCSGGWAAAPQHCGSMWDRKLMGNGPKTTKAVHFLWIRTLAYSEQEGSGLGAESLGTWLRWTMSRLA	186779	181788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_181800_186800
930138	contig_3155_pilon	+	1742	4	Intergenic	novelGene_26362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	537.872558222567	2	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	181	516	259780	261298	FALSE	40	TGAATAAAGTGATGAAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGAKVTSVPGKTSHTFSTSHNVTALVILT	258078	262524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258197_259717_259978_261082_261135_261212
930139	contig_12961_pilon	-	1676	2	Intergenic	novelGene_178883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	8	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCATCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191391	189419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12961_pilon_-_190931_191226
930140	contig_2798_pilon	+	1428	2	Intergenic	novelGene_120039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGGTTGCTATCGAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133323	134877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_133331_133456
930141	contig_854_pilon	+	2693	12	Intergenic	novelGene_36598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	2062.67800333803	8	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	70	1674	1685144	1715383	FALSE	10	CTACATGCGTGTGTCCCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEEKSDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1685074	1716402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1698946_1715198
930142	contig_7396_pilon	-	2070	15	Intergenic	novelGene_79531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3468.77995078079	4	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	146	1279	255163	247765	TRUE	20	TATGTATTGTGTGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVELFLCRGSWLIW	257047	245099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245856_247729_247802_248188_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257014
930144	contig_9313_pilon	-	977	1	Intergenic	novelGene_86490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTTGAGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467938	466961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_-_467000_467900
930146	contig_5686_pilon	+	4628	19	Intergenic	novelGene_45357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1697.64067672872	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	130	1299	170242	208237	TRUE	35	AAAAAGTTCCAATCTCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDPLQLGWLSLQDMPNKSRNYYHTCRAEPQQPVLTE	129889	231137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_129993_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_202991_208133_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_225481_230381
930147	contig_9668_pilon	+	1992	1	Intergenic	novelGene_58168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCATTTCCTTTTAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	487646	489638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_487600_489600
930148	contig_3832_pilon	-	2601	1	Intergenic	novelGene_161438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	92	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTAGAGTCCCAGCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115902	113301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_113300_115900
930149	contig_7340_pilon	+	2774	1	Intergenic	novelGene_159892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTCCCAGCGGGGGCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94628	97402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7340_pilon_+_94600_97400
930151	contig_9235_pilon	+	2219	3	Intergenic	novelGene_156217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	183	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	397	1005	45805	47109	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNSAASQKEGGREYEKPGAGG	45010	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46355_47050
930152	contig_12970_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_50518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTGAACAACCACAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107391	105088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12970_pilon_-_105100_107400
930153	contig_9481_pilon	-	486	1	Intergenic	novelGene_149677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGAACATGCAATAGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	442492	442006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_442000_442500
930154	scaffold_12124_pilon	+	1755	4	Intergenic	novelGene_22081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	455.376767084137	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCCATCTGTTGACGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855738	859317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_856049_857165_857236_857793_857922_858070
930155	contig_5686_pilon	+	2990	14	Intergenic	novelGene_45282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	275	junction_13	1520.10446931556	28	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	21	1946	93843	211355	FALSE	25	GCATCTCAAATCAGGTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93822	212399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
930156	contig_5918_pilon	-	2523	1	Intergenic	novelGene_99509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424094	421571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_-_421600_424100
930157	contig_7333_pilon	+	3880	2	Intergenic	novelGene_142823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	968	1633	408961	409626	TRUE	40	GAGTCGAAACAAAGTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEDKPLRLEGTQNTTGEELPSQSRVNLNDMDGVKFSGSSFAEVARLKIRRNSCKHPLIIGTWNVRSMKLGKLEVIKNEMECINIDILGNSELQWTGTGHFESGNFMIYYAGNDKLKRNGIAVIVKKSISGSILNYNVVRIIPIHIQGRPVNTAVIQIYAPTTNAKDGEIKDFYQLLESEIDQTCNQDALIITGDWNAKVGNKEEGSVVGKYGLGETPEIT	407993	419916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7333_pilon_+_410389_418431
930158	contig_6898_pilon	+	2716	8	Intergenic	novelGene_35724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2934.58431503353	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	437	910	124380	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59565	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113077_123021_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125810_126061
930159	contig_1516_pilon	+	958	1	Intergenic	novelGene_49941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATGACACAGGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209906	210864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_209900_210900
930160	contig_3386_pilon	-	2903	14	Intergenic	novelGene_34571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAACCGTTGCGGGTGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509841	470161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_-_470213_476264_476403_485244_485297_486415_486539_488103_488187_491943_492072_494391_494547_497714_497820_498658_498718_504778_504909_506042_506119_506536_506632_507642_507738_508228
930161	contig_3095_pilon	+	1035	5	Intergenic	novelGene_75096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	4	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	163	636	149859	151151	TRUE	15	GATGGGTCTTAGGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147187	152236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147258_149766_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930162	contig_8377_pilon	-	3557	2	Intergenic	novelGene_35067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	114	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAAAAACTGCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121453	117848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_118817_118864
930163	contig_10095_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_57228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCTGGAGAAGGATGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178015	179861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_+_178000_179900
930164	contig_9333_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_120320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAAACTGTTTTCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120502	121273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_+_120500_121300
930165	contig_10599_pilon	-	2004	3	Intergenic	novelGene_49887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCGTTTAGCAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165619	161391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_-_161486_162078_162179_163809
930167	contig_11304_pilon	+	1466	1	Intergenic	novelGene_156720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	83	252	77	328	439914	440165	NA	15	AGTTTTTAGCTGCACTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPWTARRTNKSDSEEVQPECSLEARMVRLHLMYFGHFIRRDQSLEKDVMLGKVERQRKRGRPSTKWIDTVAAAISSNEATILKMAQDWAAFCTVVCGVAMSRNRLDGT	439837	441303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_439800_441300
930168	contig_12605_pilon	+	681	4	Intergenic	novelGene_64212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	4	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	374	679	4816	5778	FALSE	10	ACTGAGGTGCTGGGCTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREA	3878	5780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
930169	contig_17684_pilon	-	3336	1	Intergenic	novelGene_178836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	469	1410	1762	3171	4239	2830	NA	55	ACACCATATACAAAAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHSLHKLQQSDVENLNRPITRKEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEASITLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGMQGWLNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRETIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNTVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPRTFFKEMEKLIINFIWKGKKPLISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYID	6000	2664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17684_pilon_-_2700_6000
930170	contig_4486_pilon	+	2074	11	Intergenic	novelGene_38589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1681.39520636881	6	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	629	1063	399314	412464	FALSE	35	AATAGAGTGTGAGGTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	311794	413475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_311815_342989_343086_360535_360643_377340_377476_385369_385488_389958_390052_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
930171	contig_15410_pilon	-	1912	12	Intergenic	novelGene_130575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	95.6147573242845	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	885	1751	56848	54277	FALSE	15	GCAATTCTTCCTGATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVALVLIWDDAREGKDSKDKLVLEFTFTKPVLAVRMRHDKIVIVLRNRIYVYSFPNNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGHKCGSLQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDVACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLVELRRGTDPATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIGQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAFDVYLDICDDDDF	59626	54115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15410_pilon_-_54387_54631_54778_54855_54958_55038_55248_55355_55436_56111_56207_56333_56440_56829_57005_57295_57401_57488_57564_57669_57870_59278
930172	SIRV7	-	907	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	34	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
930173	contig_14441_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_100700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGATATGCGCTTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115741	115200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_115200_115700
930174	contig_5602_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_133033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTCCCACAGGTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567361	565835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_565800_567400
930175	contig_10134_pilon	-	1919	4	Intergenic	novelGene_16259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	790.073976845769	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAATTCTTAGCATTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39202	32514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33126_33230_33731_34922_35164_38635
930176	contig_1331_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_37853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	951	1265	201485	201799	NA	35	AAATAGTTGTTATATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSWDIPVNWPNSIFSASVLPPSSLSRAWGLKSLQVAIQGTTIAWSNKGRRVRNRRKMWNVFLTASMNNCLLCHETRSGWCLATITKYFDQRFYRRILIKRRKT	200534	202370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_+_200500_202400
930177	contig_10196_pilon	+	3235	27	Intergenic	novelGene_132073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1353	1937	820930	823232	TRUE	10	CCCGGACGGAGTGGCCGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLNVVDEHLVYPRRMAGRQGVELGLKDDQEPQDRSLHILQGRGVRGHVSFFQLRGREQGASNHFLHDVQQAAEVVGVAAFRQVHQQLSGQLADLGVSVLRDVGELRDDYRVDQLLLIELPVDEQHKGQDVQHLDAHGAAGLVPEEPLHQLLQVVDPAVLGWVDGLCPVRYQVQERGLRSLVGASLNELKVSLL	810612	836389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_810752_810958_811127_813886_813984_814233_814332_814592_814687_815963_816154_817306_817442_817942_818065_819479_819634_819905_820012_820880_821005_821258_821372_821853_822013_822101_822184_822524_822629_823180_823325_824804_824947_825749_825880_828577_828654_828994_829119_829717_829772_830250_830368_831260_831403_832310_832425_834240_834325_835665_835836_836336
930178	contig_8843_pilon	+	913	1	Intergenic	novelGene_156643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGATTCTTTAGCAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44188	45101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_+_44200_45100
930179	contig_20742_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_150659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCTTTCACCTGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113973	114744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_+_114000_114700
930181	contig_9653_pilon	-	992	8	Intergenic	novelGene_48308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1102.48106096927	1	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	903	90	992	1016667	1006972	FALSE	55	AAAAAGAAGAAATTCCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSK	1016756	1006971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1015844_1015921_1016036_1016595
930182	contig_7179_pilon	-	2064	1	Intergenic	novelGene_78121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	112	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1406	1708	759587	759285	NA	55	GGGGAAAGAGGGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQADCVFFVVCSSRGHNTFRLLLQLAGSVTQMLYGRAGLAEEELLGRVVCGTYYSHQSWLVISAGQVPVGRACAAWWCDVKRTVQVGRMHRGDCYVWT	760992	758928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_758900_761000
930183	contig_12644_pilon	-	1609	5	Intergenic	novelGene_44488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	603	junction_1	465.53376622969	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	608	1387	1035245	1026128	FALSE	55	ACACTTGTTTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSSQMFLDQLSAGGSASLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRGSTDTASIFGIIPDIISLD	1035852	1025905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1034213_1034395_1035121
930185	contig_10095_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_57233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	78	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGATTTGTCAAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196361	194738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10095_pilon_-_194700_196400
930188	contig_17427_pilon	+	1504	3	Intergenic	novelGene_30404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	53.5	10	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	166	363	332084	352528	FALSE	70	GAAAAAAAACAAAACAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAVAASRTVSVGSGLRGLRRTLPLVVILGATGTGKSTLALQLGQRLGGEIVSADSMQVYEGLDIITNKVSAQEQRICQHHMISFVDPLVTNYTVVDFRNKATTLVPSSQFRLIVTLWTAE	331918	353669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_332090_351661_351803_352477
930189	contig_14563_pilon	+	3065	20	Intergenic	novelGene_135024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGTACACAAGCACGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55389	111160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14563_pilon_+_55424_56438_56568_57837_57962_59087_59235_59424_59572_65264_65405_66606_66647_75195_75374_76340_76511_80678_80773_81215_81316_82384_82531_83279_83524_89286_89356_91433_91588_91927_92086_96549_96739_107763_107957_108805_108898_110643
930190	contig_8167_pilon	-	2574	1	Intergenic	novelGene_155646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	904	1257	53180	52827	NA	35	TCAGGGAACATCTAGCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAFQIQISTIFFKEMEKTIINFTWKGKRPWISKALLKKKKAGGHMLPDLRIYYTAMVVKSAWCWYNDRYIDQWNRIKNPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKKTVF	54083	51509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_51500_54100
930191	contig_11855_pilon	+	2674	1	Intergenic	novelGene_67097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAATGGAGGCTGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2435828	2438502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2435800_2438500
930192	contig_7165_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_116856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCAAATGGTTGGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352828	353744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_352800_353700
930193	contig_10404_pilon	+	2297	2	Intergenic	novelGene_138676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTGCAGGTGAGTGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1088353	1091676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1090629_1091654
930194	contig_2161_pilon	-	337	1	Intergenic	novelGene_114947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTATTTCTTGCAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	944086	943749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_943700_944100
930195	contig_4103_pilon	-	5407	16	Intergenic	novelGene_51997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	252.969791784623	56	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	723	2172	40	2211	269709	221696	TRUE	70	AATAGAGAAAAGTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELGCSTPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADLDKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDMSQLTPPSQDQSQVPRVPMHTLAMVVPPQEPDRSSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQNLLPPFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKDTVSLHQQCAHKEVCPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFTDNDVVDESPPLAKQIDFVPVQPLPSPQCNFSSDIGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHGQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSSRVPTGSNSSSQTTECLTPEPCSQTPSNVTSQSVIPVYPSVDIDAHTESNHDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVW	269748	215521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_216014_216555_216652_218862_219026_219250_221703_222229_222378_222871_222984_223150_223297_229274_230028_238934_239038_239972_240117_240287_240416_243058_243147_253240_253298_264115_264226_269082_269275_269525
930196	contig_12324_pilon	+	817	1	Intergenic	novelGene_166652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156765	157582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12324_pilon_+_156800_157600
930197	contig_4083_pilon	+	1877	2	Intergenic	novelGene_152333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136327	138269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_137262_137326
930198	contig_15732_pilon	+	1846	1	Intergenic	novelGene_88869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCACTAACAACAATGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113318	115164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_113300_115200
930199	contig_8303_pilon	-	2026	6	Intergenic	novelGene_154913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.066409682377	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	312	680	36230	29167	FALSE	15	GCAAGTATTGTTTCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYRGAQAAIVVYDITNEESFARAKNWVKELQRQASPNIVIALSGNKADLANKRAVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAKTSMNVNEIKLPKSEPQNPGANSTRGRGVDLTEPTQPTRSQCCSN	51587	27820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8303_pilon_-_29278_34001_34083_35771_35895_36176_36329_51333_51366_51406
930200	contig_15169_pilon	+	4002	3	Intergenic	novelGene_179180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	2078	2710	98204	98889	FALSE	5	CAGTTGTTCTGTCTCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFSVSSSAMILSVFSVFSPCSGTPITRKFLLLIVSHIILRVSLFSFILFSEFSSNRVVSKCLSSIPLIPSSTVSNLLLSPSMTLSISEILLFIFWISNCSFCIISSCEFILAFCSCVIFLNSSIFLSVFSMNLSIFPSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPAGTILSCFYKCFDIVCCPWGHSVVIFLFY	2865	100181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15169_pilon_+_4650_97910_98207_98259
930201	contig_7357_pilon	+	1955	1	Intergenic	novelGene_36916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	524143	526098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_524100_526100
930202	contig_6215_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_21246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	593189	595116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6215_pilon_+_593200_595100
930204	scaffold_12124_pilon	+	1762	8	Intergenic	novelGene_22262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3814.4942639616	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	940	1590	1508755	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473573	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1489000_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497108_1508288
930205	contig_5261_pilon	+	2682	1	Intergenic	novelGene_102480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGTATTTCTGACATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661393	664075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_+_661400_664100
930206	contig_6847_pilon	+	1115	10	Intergenic	novelGene_143873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	611.115090896132	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	446	997	102091	110600	TRUE	15	AGAGCTCTGACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	82094	111719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99989_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
930207	contig_19769_pilon	+	823	5	Intergenic	novelGene_102293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3637	junction_2	117.406345654739	13073	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	16	789	87249	89322	FALSE	10	CTTAGCTGTGTACTGTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAEGIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISSANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAARRTGRLRGTKTVQEKEN	87233	89356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19769_pilon_+_87387_87466_87609_87820_88040_88841_88958_89163
930208	contig_7151_pilon	-	2834	6	Intergenic	novelGene_40774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_3	899.144571245359	2	125	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	281	634	551063	535558	TRUE	30	ATTCATTTATAATTTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKAPGIAVLLTGEPSSPTAILFLMTTRPGLRV	551343	527308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_535501_535650_536388_536494_549638_549729_550996
930209	contig_5136_pilon	+	2216	1	Intergenic	novelGene_126657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376814	379030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_376800_379000
930210	contig_13571_pilon	-	2558	2	Intergenic	novelGene_128119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	578	907	242387	221152	FALSE	30	TTGACACAGTGGCTGCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDAGGIKRRWKEYRVIYQKELVDAQPFQEVAYDQEPVVLKEEVQAVLKTLAKNKSPGTYGISVEMFQQTDAVLEMLTHLCQEIRKTATWPTDWKIHICTHFKER	242964	219500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_-_221185_242090
930211	contig_12566_pilon	+	2916	1	Intergenic	novelGene_86028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTTAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249149	252065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_249100_252100
930213	contig_11825_pilon	-	2218	2	Intergenic	novelGene_155422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	32	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTTGTTGTGTTAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120687	118395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_-_119186_119259
930214	contig_1150_pilon	-	540	2	Intergenic	novelGene_61437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	73052	junction_1	0	7	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGGTGTGACTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309900	308932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812
930215	contig_11720_pilon	+	1216	9	Intergenic	novelGene_43831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2941.86496970884	6	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	277	837	86302	98387	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHAGTLATG	68047	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_86263_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98363
930216	contig_8059_pilon	+	3210	2	Intergenic	novelGene_111076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1969	2364	34497	34892	TRUE	60	AGATGAAAAGAAAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASFQNRNFPEEENFLELLEAEHKRLIYRALQEIRKEIKQNAEQAIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQKSEIQKISNKISELDNSVESHRSRVEAMEVRISEIEVKALDTNLFEKKSGKRIKKMRKP	32528	35782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_35142_35185
930217	contig_5018_pilon	+	3431	10	Intergenic	novelGene_47116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1455	1847	1429979	1431761	TRUE	40	TGGGAGCAGCAGAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPAAFIGVHCLQVHGVSDHMVLIRNPITPQHVSGLAGNVQGFPTVIPLQQRDHFRSVLVSILQTAKLQAGVKTQRNLSEHVCQLLLDQLVPGQWDAKLDPVHGVLPGCVQTELSSSKHTPCNAIPGIV	1427829	1434601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5018_pilon_+_1429162_1429856_1429995_1430767_1430929_1431272_1431399_1431671_1431776_1432206_1432431_1432508_1433537_1433806_1433868_1434048_1434200_1434495
930219	contig_7083_pilon	-	962	4	Intergenic	novelGene_125156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAGATGCACACATCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155326	25016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7083_pilon_-_25077_108121_108230_153946_154017_154602
930220	contig_10904_pilon	-	1903	8	Intergenic	novelGene_22729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	364.684767425014	15	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	219	1202	662171	652201	TRUE	25	ATTTCTTTGCTAAAGCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662699	650774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652165_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662222_662310_662445_662665
930221	contig_7035_pilon	-	1684	1	Intergenic	novelGene_83517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	204	503	265843	265544	NA	15	GGGGAAAGCTTTCTCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNESVLKEVQPEYSLAVRMARPHLMYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQQKRGRPSRRWIDTVAATVGSNVTIVRMAQDWAVFPSVVRRVTMSWNRLST	266046	264362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7035_pilon_-_264400_266000
930222	contig_408_pilon	-	2227	2	Intergenic	novelGene_84915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGGGCTTTATAAAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133661	131354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131867_131946
930223	contig_17144_pilon	-	2520	15	Intergenic	novelGene_29449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1873.81751692493	2	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	104	1318	174965	168280	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKEPPPMLQSCI	183215	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168312_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174976_181813_181850_183158
930224	contig_10930_pilon	-	2490	7	Intergenic	novelGene_36994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	2	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	15	1493	280370	268388	FALSE	35	GGAATGGAGGTTAAATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280384	267390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276929_278443_278637_279700_279832_280157
930225	contig_14744_pilon	+	3787	4	Intergenic	novelGene_66029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGCGTACTACTGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291741	1418440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1292442_1367221_1367570_1414725_1414824_1415799
930226	contig_2069_pilon	-	581	2	Intergenic	novelGene_23509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	0	6	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCATTGTGTCTGTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509077	1508366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942
930227	contig_12147_pilon	+	1082	2	Intergenic	novelGene_179181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	22	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAATAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6418	40839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12147_pilon_+_6863_40201
930228	contig_5023_pilon	+	2867	15	Intergenic	novelGene_7212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2093.49197100277	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	88	1008	607279	625842	TRUE	30	GTGCATCTGAATGCAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANSQAELGLHCQPLQQIPCPAQTREPGHRLGGS	580841	648137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618611_625746_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
930229	contig_21007_pilon	+	343	1	Intergenic	novelGene_161549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	170	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	2	6	337	342	964	969	NA	40	TTGCATTGCAATACAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMR	627	970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_600_1000
930230	contig_19974_pilon	-	349	1	Intergenic	novelGene_130489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGAAAAGAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351322	350973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_351000_351300
930231	contig_6847_pilon	+	4070	13	Intergenic	novelGene_143869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	595	junction_12	410.962175537144	2	174	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	1230	2681	77788	110600	TRUE	35	ACTTCTCAAGCTCTGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	76558	112990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
930232	contig_500_pilon	+	816	7	Intergenic	novelGene_31080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1085.46355944771	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATGTTTGACTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1492696	1499585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1492727_1493615_1493721_1494244_1494277_1496854_1496898_1497870_1498078_1498882_1498974_1499277
930233	contig_9833_pilon	-	2847	2	Intergenic	novelGene_68509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1205	1528	215789	214522	FALSE	60	GAGAACAGGATATAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSHHTQKLLQNGSKT	216993	213202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214562_215505
930234	contig_9235_pilon	+	2046	3	Intergenic	novelGene_156219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	621	1001	46898	47278	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTQRPLCPLEMSTLLPKTESCQPMGGCSYVATTPVFGKILWASTAAREELLPARRREGENMRSLELVGRVSSWEQCTGKGGDRVLAWNIFPPSWSFDFALSQRSSIVRLLKGSSGPSSKTNVPM	45023	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_45862_46717
930235	contig_1309_pilon	+	2346	1	Intergenic	novelGene_73982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1628	1936	286849	287157	NA	65	CAAAAATAAGGCAGAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDYSFQYGLHLNIKKKIPHYCTNKQHHDKENIELVKGFISLGSTINAHGSSSQEVKQRIALGKSAAKHLFKALKSEDVTLRTEVCLAQARVFSVASYAC	285221	287567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1309_pilon_+_285200_287600
930236	contig_762_pilon	+	957	1	Intergenic	novelGene_135934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATTTGTTGTAACATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150192	151149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_762_pilon_+_150200_151100
930237	contig_12540_pilon	+	4042	3	Intergenic	novelGene_148058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1073	1444	210985	216282	FALSE	50	ATTGAAAGATAATCCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRQAFLSQCKCGFPLPVVPIFLPALRCSGFKEFSESSSNLCNHVRGGHGAPVLLESLAAALPCECTGTKCSHKQRVYPVCLFRPSQQCPVHQDAQGAGEQVPLPTAPAAAALLTAHQHLVTV	209912	218880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12540_pilon_+_211219_213069_213192_216266
930238	contig_14953_pilon	-	3675	2	Intergenic	novelGene_137294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	143	138	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCAGCCTGGGATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331033	326995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_330395_330757
930239	contig_8443_pilon	+	1592	1	Intergenic	novelGene_150623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTTTCCATTTATCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868241	869833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8443_pilon_+_868200_869800
930240	contig_11961_pilon	-	2507	1	Intergenic	novelGene_153686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCTCCAAAGTACATTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76306	73799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11961_pilon_-_73800_76300
930241	contig_3956_pilon	+	1682	9	Intergenic	novelGene_14997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1387.56165966598	4	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	365	1519	1287527	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283830_1287496_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289876_1290463
930242	contig_17144_pilon	-	2548	15	Intergenic	novelGene_29454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1907.65382668056	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	709	2130	131	2260	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLALKPDPVGRSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183238	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174792_179700_179786_181794_181850_183184
930243	contig_13823_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_145265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTATCTCCCAGCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263617	261844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_261800_263600
930244	contig_1867_pilon	-	1951	1	Intergenic	novelGene_54625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCATTTTATGTAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598997	597046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_597000_599000
930245	contig_9668_pilon	+	574	1	Intergenic	novelGene_58080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGGTTGAGAAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74719	75293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_74700_75300
930246	contig_7179_pilon	-	2145	1	Intergenic	novelGene_78174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAATAAAAAAAAAAACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1062182	1060037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7179_pilon_-_1060000_1062200
930247	contig_15354_pilon	+	2984	1	Intergenic	novelGene_65722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1442	1783	561305	561646	NA	30	GCATTCAAAAGTGGTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEAVKNEMKRTNIDILGISELKWTGIDHFESDNHMVYYAGNDKLKKNGTAFIVKKNISRSIVKYNAVSDTIISICLPGSPVNTTITQIYEPTTKAKDEETRFLPTSAV	559863	562847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_559900_562800
930248	contig_17059_pilon	-	2192	2	Intergenic	novelGene_166094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACCTACACACGTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	525625	484032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_484498_523898
930249	contig_9727_pilon	-	2934	11	Intergenic	novelGene_86371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	208.030887129772	18	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	145	1191	598065	579311	FALSE	15	TCCCAGCTTGCAGGAGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKGMARLISRVHKVKHGEQQEGQHYNIPHQDLKTVFPHGLPPRFLMQVKTFSEACLMVRKPALELLQYLKNTNFAHPAVRYILYGEKGTGKTLSLCHVVHFCAKQDWLILHIPDALRWVKNCRDLLQSTHNKQRLDQPLEASTWLKNFKTSNERFLSQIKVQEKYVWNKRESTEKGSPLGEVVEQGITRVRNATDAVGIVLKELKRQSSSGLFHVLVAVDGVNALWGRTTLRREDKSVIAPEELALIHHLRKMVKNDWNGGAIVLTLSQTGSLFKPRTAYLPQELLGKEGFDALDPFIPILVSNYSPKEFESCIQYYLENNWLQHEKGQVCFCVFLSGHMSPTESEP	622887	577567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_-_579491_581732_581823_582360_582421_583066_583226_583313_583395_583896_584028_584739_584833_584956_585066_590071_590174_598023_598078_622755
930250	contig_9538_pilon	-	179	1	Intergenic	novelGene_176459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCTAAGGAGTGTGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29071	28892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_-_28900_29100
930251	contig_19032_pilon	-	2391	14	Intergenic	novelGene_172546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	151	junction_13	982.914516499559	8	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	534	2075	162634	157239	FALSE	20	TACCTGGTGTCTTTTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFQEGEDELGDEEEAAGDENGHGEQQPQPPATPQQQPQQQRGAAKEAAGKSSGPTSLFAVTVAPPGSRQGQQQAGGKKKAEGGGGGGRPGAPAAGDGKTEQKGGDKKRGVKRPREDHGRGYFEYIEENKYSRAKSPQPPVEEEDEHFDDTVVCLDTYNCDLHFKISRDRLSASSLTMESFAFLWAGGRASYGVSKGKVCFEMKVTEKIPVRHLYTKDIDIHEVRIGWSLTTSGMLLGEEEFSYGYSLKGIKTCNCETEDYGEKFDENDVITCFANFESDEVELSYAKNGQDLGVAFKISKEVLAGRPLFPHVLCHNCAVEFNFGQKEKPYFPIPEDYTFIQNVPLEDRVRGPKGPEEKKDCEVVMMIGLPGAGKTTWVTKHAAENPGKYNILGTNTIMDKMMVAGFKKQMADTGKLNTLLQRAPQCLGKFIEIAARKKRNFILDQTNVSAAAQRRKMCLFAGFQRKAVVVCPKDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGFNMRGGNFRGGAPGNRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	166128	156922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158360_158694_158950_159223_159393_159618_159748_160165_160286_160595_160860_161304_161418_161876_161977_162553_162694_164676_164751_164837_164950_165840
930252	contig_15371_pilon	+	1440	1	Intergenic	novelGene_151439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCATAGTAGACAGTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117984	119424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15371_pilon_+_118000_119400
930253	contig_11386_pilon	-	1940	4	Intergenic	novelGene_82747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	354	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	962	1279	14013	13696	TRUE	30	ACTAATCTAGAGCTTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFMPTALLCPDNPRVSWESSHLPESLLLTLPPPPSFPGHFQPRLRWIQVCSCSPPSTTPQWSIFSTRGWGTRDSVSNQGPRRLQTIPSDTPHICDVSWRGDNGS	14974	7853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_-_7963_11059_11259_11368_11585_13558
930254	contig_6412_pilon	+	2103	2	Intergenic	novelGene_149964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTGACCATAAAGCCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	255473	361991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_+_257387_361801
930255	contig_15063_pilon	-	2234	2	Intergenic	novelGene_14474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAACTATTTGTTCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94683	91153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_91357_92652
930256	contig_3956_pilon	-	1857	10	Intergenic	novelGene_15224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1089	1664	1286221	1284227	TRUE	35	CCAAGGCACCATCAGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1291004	1283954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1283973_1284051_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287325_1289756_1289891_1290296
930258	contig_10732_pilon	-	1891	2	Intergenic	novelGene_114682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GACAAAAAACAAAAAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	73820	63474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_63825_72279
930259	contig_13968_pilon	-	1722	1	Intergenic	novelGene_106871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	86	261	85	345	44602	44342	NA	65	AATTCAAATTTACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEDSLTACGYADGTTLFAESEEDLKNLLMKIKDYNLQYRLHLNIKKTKIFTTGPISNIMKKEKRFRLSKISFYLAPQSTPIEAAAKNEMTHCIGQICCKRPLQSVKKQRYHFED	44686	42964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13968_pilon_-_43000_44700
930260	contig_7992_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_115550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636326	637697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_636300_637700
930261	contig_5903_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_173227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAGTTAGAGGTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467464	469542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5903_pilon_+_467500_469500
930262	contig_8260_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_163269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	529565	530887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_529600_530900
930263	contig_9177_pilon	-	1862	11	Intergenic	novelGene_32565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1044.45928594656	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	539	1423	4646	2152	FALSE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTFVSSFQEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	7321	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3284_4277_4386_4517_4688_6472_6590_6688_6815_6904_7089_7251
930264	contig_4426_pilon	+	1678	4	Intergenic	novelGene_15429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1262	1567	821865	904521	FALSE	60	ATTAAGAAATCAAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRESFSVSESIFSSTLEGFTDRASSESCNCHHHQIKAPLFLAAIPTPLFLLHPLGAFAQRAGNQTGCQLVPVSYFQLPFLFSSFPDLLSLCLNLVLHFSTG	820603	904632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_821945_868808_868894_890036_890139_904482
930266	contig_1450_pilon	+	1790	14	Intergenic	novelGene_27401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	369.489332544128	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	109	1740	329113	355901	FALSE	60	GAAAAAAAAAAAGTTACGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLALTTYAVGTQPCAPSPAPPLPAFRVGSVPALSPERGELGPTWH	325691	355951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351292_355767
930267	contig_6361_pilon	+	4889	7	Intergenic	novelGene_23957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1002	1475	390196	390669	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLEIENQKGRTCSAFLKLKELKKKFKTRVVLLKDSTGKIVNDARSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYDREPMILKGEVQVALKALVKNKAPRIDGIPVEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	389194	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_390751_400285_400563_408707_411212_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
930269	contig_5020_pilon	+	1591	2	Intergenic	novelGene_27930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAGCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136736	138371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_137271_137314
930270	contig_11742_pilon	+	2667	1	Intergenic	novelGene_166542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAATTGGAAGTCCCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121644	124311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11742_pilon_+_121600_124300
930271	contig_3956_pilon	+	1688	8	Intergenic	novelGene_14946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	1582.63520878364	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	81	1199	1281682	1290491	FALSE	40	ATTGGAATAATAAATTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDKL	1281601	1290980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1287963_1288077_1288874_1289151_1290479
930272	contig_16578_pilon	+	2325	1	Intergenic	novelGene_148697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	918	1229	361768	362079	NA	55	CAGGAAGCATCAAAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSRTLSDRVLEDEPLRSEGTKNTTREALPPQSRVDLNDVVGVKLSGPSFADVALLKRGRNSCKHTFNNQKVECTKYESRKIGYRQKMKPINIDILGISELK	360850	363175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_360800_363200
930273	contig_11338_pilon	-	1555	9	Intergenic	novelGene_6366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	21	junction_3	316.508194996591	1	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	299	1015	319426	295358	FALSE	20	CTAGAGTTGATTCAGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLCHLLC	323314	294817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_306727_306964_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
930274	contig_5794_pilon	+	3235	1	Intergenic	novelGene_69732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	147	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387455	390690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_387500_390700
930275	contig_7657_pilon	+	1014	1	Intergenic	novelGene_30047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGGTAAGTAGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311201	312215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7657_pilon_+_311200_312200
930276	contig_12429_pilon	+	797	1	Intergenic	novelGene_136224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCGACTCACAGTGACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379337	380134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12429_pilon_+_379300_380100
930277	contig_12079_pilon	-	2030	8	Intergenic	novelGene_67523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	402.394871554126	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	240	1265	871513	861365	FALSE	35	ACAAACGTTAACTCTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTREIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872429	860599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861834_864595_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871500_871555_871641_871725_872314
930278	contig_9649_pilon	+	1341	1	Intergenic	novelGene_160684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAGGAAAAAAAAGGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9591	10932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9649_pilon_+_9600_10900
930279	contig_14871_pilon	+	351	1	Intergenic	novelGene_63735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGTGTGGATCCGCACGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288222	288573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_288200_288600
930280	contig_12884_pilon	-	1076	1	Intergenic	novelGene_104974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2	361	526853	526494	NA	15	GCCATCCACTTGTGCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKHLPQQGRCGREARGPRGHRKQKLKRQGGYGHDLWGFTGWSHGLWCFQGRSHHSENGAPKAKGAELLSQWAWKAELKPRAEGPPLRIWRVWPIPRVWRAGLLRKLSQRTEDYFQSLEG	526854	525778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12884_pilon_-_525800_526900
930281	contig_12178_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_156548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTTGTGTTGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250661	248195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12178_pilon_-_248200_250700
930282	contig_6958_pilon	+	1986	1	Intergenic	novelGene_69953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGTCCTAAAAACAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172213	174199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_+_172200_174200
930283	contig_5889_pilon	+	1378	1	Intergenic	novelGene_133692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TCACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249167	250545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_249200_250500
930284	contig_1717_pilon	+	2039	1	Intergenic	novelGene_146116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATGAAGTAAAAGAGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162732	164771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_162700_164800
930286	contig_4538_pilon	+	509	1	Intergenic	novelGene_153083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAACCAAAGCAAACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200307	200816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4538_pilon_+_200300_200800
930287	contig_17964_pilon	+	1542	1	Intergenic	novelGene_33884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCAGAGCTCTGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139277	140819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_139300_140800
930288	contig_17144_pilon	-	769	5	Intergenic	novelGene_29450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	773.229711987324	5	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	109	567	167257	166277	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLLGLPGTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183220	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166371_166486_166843_167248_167268_181813_181850_183158
930289	contig_6361_pilon	-	6540	9	Intergenic	novelGene_23928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4976.37807546814	44	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	4933	5292	261348	260989	FALSE	30	CGGCTCAACTGCACCTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDAGSIKRRWKEYTESPYQKELVDIEPFQEVTYGQEPMILKGEVQAALKALVKNKAPRIDGIPTEMFQQTDAALEVLTCLCQEIWKTATWPIDWKRSIFMPVPKKGNPSECRNY	496323	259740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_262749_327202_327827_380610_381397_409626_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288_436395_496262
930290	contig_17144_pilon	-	1845	10	Intergenic	novelGene_29330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2004.08333160076	4	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	189	1076	179764	173536	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVRWSATSRARGGSD	183270	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166311_172523_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
930291	contig_10953_pilon	+	1691	9	Intergenic	novelGene_42575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	641	junction_6	17756.3137133669	110	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	217	1059	455261	463828	FALSE	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKALTKCQEEVSRIPAIHPGMFRPKCDENGNYMPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPHTRSRGHHNCSEPLELEDLTSGLGLTKQGVGEVFI	455044	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_462728_462921_463465_463529_463817
930292	contig_3584_pilon	-	2948	1	Intergenic	novelGene_108158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	2205	2591	443420	443034	NA	65	ATGCAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSEPHINVDPKRKSQRHIIIKLAKTKDKERISRAARDKRKVIYKGESLRLSLDYSAETMEARGQWHDIYKALKENNCQPRIIYLAKLSLKYDGEIRAFPDKQKFREFTKTKLKLQEILKGVLWLENK	445624	442676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_-_442700_445600
930293	contig_5640_pilon	-	2257	1	Intergenic	novelGene_27284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCATAATCATAAAATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1097157	1094900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_1094900_1097200
930294	contig_14807_pilon	+	486	3	Intergenic	novelGene_124703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	150	467	37320	38373	FALSE	20	TTTTCACCATGTACTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFSATMSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVWSLSAPAQDNILLMRMTWKGWSRTRM	37170	38392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37648_38297
930295	contig_3956_pilon	+	1492	9	Intergenic	novelGene_15014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1690.80634886879	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	81	791	1281682	1284841	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTWGLLSEPGKWRT	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284741_1284798_1284864_1285066_1285173_1285712_1285777_1290502
930296	scaffold_19766_pilon	-	2460	2	Intergenic	novelGene_34459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATTATGAATCGAACACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904362	895151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_19766_pilon_-_896732_903482
930297	contig_8312_pilon	+	4260	1	Intergenic	novelGene_152887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAGAAAGAAAAAAAAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272989	277249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_+_273000_277200
930298	contig_2419_pilon	+	258	1	Intergenic	novelGene_137138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAGGAAAAAAATCAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186169	186427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2419_pilon_+_186200_186400
930299	contig_7056_pilon	+	1666	9	Intergenic	novelGene_43638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGAGGTGCTTAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	721905	728707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_722575_723711_723819_724691_724785_725183_725318_725469_725606_725661_725733_725812_725991_726946_727077_728559
930300	contig_16869_pilon	-	1800	1	Intergenic	novelGene_137594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATGGTAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70507	68707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16869_pilon_-_68700_70500
930301	contig_5643_pilon	+	1133	11	Intergenic	novelGene_38821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2744.45822704591	4	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	410	778	236700	237564	TRUE	20	CACAGCTTCCATCCGTACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRQIR	233610	238100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236304_236588_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237442_237550_237635_237720_237819_237913
930302	SIRV3	-	417	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	10	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTTCGTCCACCAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7202	6785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6800_7200
930304	contig_7548_pilon	+	4402	1	Intergenic	novelGene_117636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	3218	3655	207565	208002	NA	35	TCCCAGCATGAAATAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLAQVPVAQSAEVNIMPCAPSGRGRNEVLGFQYFFGKPEFEVPFFDIVFRTLNDCPLVVQVSIKLFKDNWACAWRTILSSHLGACPPPEVHSVRCFSTPGHGTICVAQGWGEWIRLLQLPQGLRAIPGMHPVTTQFGSLLRGL	204347	208749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_204300_208700
930305	contig_15165_pilon	+	418	2	Intergenic	novelGene_145299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGGATTGGCTCTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446	1003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_720_858
930306	contig_7207_pilon	-	1495	8	Intergenic	novelGene_72081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	122	junction_7	177.028534538408	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	595	1494	696514	671669	FALSE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDE	758478	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_758376
930307	contig_935_pilon	-	2348	10	Intergenic	novelGene_45550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	300.199110879495	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	154	768	368085	358205	TRUE	40	GAGAAAAAAGTTTATTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQLSSDVSHQEYPRPSWNQNTSDISENTYRENEVDWLTELANIATSPQSPLMQCSFYNRSSPVHIIATSKSLHSYARPPPVSSSSKSEPAFPHHHWKDETPVRHERANSESESGIFCMSSLSDDDDLGWCNSWPSTVWHCFLKGTRLCFHKGSNKEWQDVEDFARAEGCDNEEDLQMGTHKGYGSDGLKLLSHEESISFGESVLKLTFDPGTVEDGLLTVECKLDHPFYVKNKGWSSFYPSLTVVQHGIPCCEIH	368238	344410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_345495_346640_346783_352422_352741_358168_358208_358248_358314_359247_359405_361935_362049_362132_362245_362606_362749_368062
930308	contig_563_pilon	-	3874	1	Intergenic	novelGene_169755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	94	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	3003	3503	395321	394821	NA	25	AACTTCGAACTGCTGACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGERFFPKGVFLIHAVEHTQLLIFCWIEGCFSLVLGGHVDSERLGLSQCGKRAPEHGCLPALPLTPELLRPEGLRLSVGQIWQLLAASELSLSLSPPATQSSSSTLPLMFRAPRLPYIIESFVFLGLCCKMVHRKHLTTPPSWPRSEANTSNSNLFFKTVVQSFVV	398323	394449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_563_pilon_-_394400_398300
930310	contig_2704_pilon	-	2841	1	Intergenic	novelGene_75319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCATTTCATCCTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330011	327170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_-_327200_330000
930311	contig_8330_pilon	+	2085	13	Intergenic	novelGene_71812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_7	544.072579921303	2	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	96	1199	852673	856687	TRUE	30	TAATAAACCGCTCCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837655	857787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
930312	contig_6673_pilon	-	2652	1	Intergenic	novelGene_164007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTCCTCCTCTTATACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18028	15376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6673_pilon_-_15400_18000
930313	contig_10331_pilon	+	4296	15	Intergenic	novelGene_54100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	3519	3836	321296	325413	TRUE	15	TTCCGGCTTTGACCGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTRWQPESHPSSPPHFHRDIVSGQGEIRSFVVCDNSATKSSYLRLRTSRCLSWSAISITSSHEDSRFLDKSNFLILGHVSAIPPFPPAPFTAQFLRETSCNLLS	304596	371651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_304852_305128_305221_308949_309010_309528_309598_311131_311290_312016_312168_312477_312542_312622_312689_318101_318200_318790_321525_325324_325414_332861_333044_350130_350216_355497_355627_371587
930314	contig_14744_pilon	-	1780	8	Intergenic	novelGene_66008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	345.354653558764	3	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACCATTTATTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969968	960502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961244_962457_962609_964176_964410_965701_965811_967273_967450_968343_968655_969717
930315	contig_610_pilon	-	1621	4	Intergenic	novelGene_76746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1256.39590363335	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	52	720	252557	220501	TRUE	30	ATATTGTCAAAGTGGATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVGKNYL	252608	213499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214383_220482_220785_234998_235302_252475
930316	contig_1759_pilon	+	1122	1	Intergenic	novelGene_171344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATGTGTATTTTCACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83059	84181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_+_83100_84200
930318	contig_6102_pilon	-	2870	19	Intergenic	novelGene_31847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	4	79	11	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGCAAACCGTAATCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395261	370729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371192_372704_372746_372938_373074_373198_373272_373402_373476_373632_373725_373902_373955_374376_374503_374585_374768_374890_374973_375259_375312_375445_375488_393027_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394035_394219_394272_394465
930319	contig_7272_pilon	-	1342	10	Intergenic	novelGene_25364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	433.780225402931	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	54	932	633189	606935	TRUE	65	GATTAAAAAAAGTGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPCSPPAAWAARRSPKMASATGAVAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDGEEEENEKEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTAPQRNLKTARHHPKMTKEVQVVLVVAVEAQQKISGLVDCLLIPKLLI	633242	604475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605068_606908_607028_609184_609235_609854_610248_611629_611658_620502_620568_632105_632194_633027
930321	contig_2100_pilon	+	763	7	Intergenic	novelGene_50762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCGGGATCCTCTCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170055	1185511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170199_1174184_1174386_1176756_1176836_1178767_1178825_1180187_1180284_1182725_1182824_1185422
930322	contig_4654_pilon	-	1666	2	Intergenic	novelGene_103094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1252	junction_1	0	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAACAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494948	492941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4654_pilon_-_494533_494873
930323	contig_14711_pilon	+	1784	10	Intergenic	novelGene_68913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	373.744548661677	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	335	1543	86227	90570	FALSE	15	GACCTCAGTTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRRGRLCECSEAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGRCQCGRCSCSGQSSGRLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQHAITTTINPYFQATESPPS	85429	90811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90175_90512
930324	contig_8452_pilon	-	2098	3	Intergenic	novelGene_47998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCCTTTTCTCTTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297391	230006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_-_230126_232362_232868_295917
930326	contig_6431_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_179182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAGAAAAACATAAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169854	168518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6431_pilon_-_168500_169900
930327	contig_9515_pilon	-	1265	10	Intergenic	novelGene_73801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	162	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1	807	72653	66703	TRUE	20	AGGAATGGCTTGTCCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEWKRARVGHLGQVHLSSGIRDLIQSRGLGVCLVSRKVFLGVALLQRWLGAQDLDHLGRLLPISDNLHLGLALPLTVPNGQGQVPCLVALQDVGLATTPGKDGLTQVQDEAVPSVEAVPAQRSLRGSDVLLPLHVVEFLDGSWGGPWGGLVEC	72653	30326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_30346_65806_65901_66072_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68347_68727_68822_69341_69476_71787_71873_72459
930328	contig_14790_pilon	+	1089	1	Intergenic	novelGene_127920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	390	926	256754	257290	NA	25	CATCATGGATTGAATTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGNSRTLNCAHEEPVCSSRGSLRKEQGNTAWVKVRKHVRQGYILSLYLFNLYAEQIIQEAGLYEEEQGIRIGGRLINNLCYADDTTLLAESEEDLKHSMMNIKDYSLQYGLHLNIKKTQIFTTGPTNNIMINGENIEDVKDFILFGSTINTMEAAVKKSNKILHWASLLQKISLKC	256364	257453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14790_pilon_+_256400_257500
930329	contig_10074_pilon	-	508	1	Intergenic	novelGene_57164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAAAAAAAAAACACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	528860	528352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_-_528400_528900
930330	contig_9429_pilon	-	1771	1	Intergenic	novelGene_155091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	47	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCATACTCTCAGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29198	27427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9429_pilon_-_27400_29200
930331	contig_12050_pilon	-	3647	13	Intergenic	novelGene_62624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	569	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCACTTTACAGGAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356768	338915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_-_339190_340473_340565_341362_341420_342202_342254_342344_342421_345187_345286_347184_347367_348910_349021_349697_349797_350554_350719_350994_351178_351507_351631_354629
930332	contig_8812_pilon	+	733	2	Intergenic	novelGene_57258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGATTGACTAATTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8323	9474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8812_pilon_+_8823_9240
930333	contig_5125_pilon	+	2222	7	Intergenic	novelGene_43441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1413.6597205677	2	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	195	1319	35654	58893	FALSE	25	TCAGTACCCAAGTTTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	26350	59796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53699_53842_53984_54293_54525_58449
930334	contig_2863_pilon	-	2144	2	Intergenic	novelGene_174063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTGTAGAAATTGTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87983	68310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2863_pilon_-_70036_87564
930335	contig_9737_pilon	+	2236	1	Intergenic	novelGene_165256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCAGTACAACTTGGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11392	13628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9737_pilon_+_11400_13600
930336	contig_11259_pilon	+	5462	1	Intergenic	novelGene_144538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCATGTGAGAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144694	150156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_144700_150200
930337	contig_14970_pilon	+	2357	9	Intergenic	novelGene_44971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5657.02940900743	3	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136012	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177685_182315_182459_188757_188834_191800_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
930338	contig_11293_pilon	+	4171	3	Intergenic	novelGene_134677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1040	1414	116764	117138	TRUE	60	CAAAAAAAAGAATTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKFEVARNEMELMKIDILGISDLKWTGIGHFESDNHVVYYTRNDKLKRNGIAFIVKKNISRSLLKYNTVSDRIISICLQGRPVNTTIIQIYTPTTRPKMKKLMFFTNFCSLKLIKHAIKMH	115724	223990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_118755_221970_222438_223316
930339	contig_9414_pilon	-	1077	1	Intergenic	novelGene_131074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAAAAAAAAATATATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364111	363034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9414_pilon_-_363000_364100
930340	contig_14445_pilon	-	2983	2	Intergenic	novelGene_137351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2563	2937	247663	247289	FALSE	35	TGTTTGCATAGAAAATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPTMLPKAGGVLHMAHSGLFPAWASVTALENQANSLAAGTPLFLCGLGSPLPPSFFQWANQPTTSPSSVFQHFHPGLGGSQPRDPMSKGRTPPQTLLDGSEVLLNCGIGPCINLAGWQNQPVP	250642	247242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14445_pilon_-_249763_250179
930341	contig_3095_pilon	+	1153	5	Intergenic	novelGene_75130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	18	743	147280	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147262	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930342	contig_615_pilon	+	1279	1	Intergenic	novelGene_80047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	422	739	52476	52793	NA	10	TCGAGGCTCTCTGTCCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKNASSGLEADSVTTSDTLDESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPLNHIMINGERIEVVKDLILLGSTINAHGSSSQEIKRHCVRQICCKRHL	52054	53333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_+_52100_53300
930343	contig_5620_pilon	-	683	1	Intergenic	novelGene_161327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATGGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91515	90832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_-_90800_91500
930344	contig_14811_pilon	+	1028	1	Intergenic	novelGene_74502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGTGGACAGATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	396945	397973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14811_pilon_+_396900_398000
930345	contig_9895_pilon	-	3205	1	Intergenic	novelGene_144684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCCTTAGTGGTTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94996	91791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9895_pilon_-_91800_95000
930346	contig_6871_pilon	-	2031	4	Intergenic	novelGene_21543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGGAGGAAGTGGTACAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136045	121892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_-_121977_129786_129841_133938_134168_134381
930347	contig_11386_pilon	+	3286	5	Intergenic	novelGene_82800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	69.656299069072	55	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	323	769	90888	93371	TRUE	35	TAAGGACAGTGTCTTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWEATYLLAPVLLVLRVSDSREQETAPVLLQKLEVTSSRSQVQKSRYSIQDERSSGYFIINMTGLRTADSGFYYCGNYNSFSSVVHILRSFHLIVSQASTPSTTRSTVSTTVQASATNLATDRYCHHLCLFSPPFPPTLSPVPNTPT	90565	96189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_90946_91207_91256_91357_91547_93219_95212_95512
930348	contig_14796_pilon	+	2083	2	Intergenic	novelGene_159375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGGTTAAAGCTCTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167396	190787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14796_pilon_+_167744_189051
930350	contig_12327_pilon	-	4862	1	Intergenic	novelGene_140662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	41	103	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGATAATATCTCTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1079483	1074621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12327_pilon_-_1074600_1079500
930351	contig_5871_pilon	-	1158	1	Intergenic	novelGene_160169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGTTTCTAGTATCCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	283301	282143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_282100_283300
930353	contig_4125_pilon	-	3435	12	Intergenic	novelGene_25130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408.318584092988	15	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	84	764	822728	813780	TRUE	30	GAAAGCCTTATTACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKNSLSRELSPDLAPYCCAACHVDEDWSHSHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCPVTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQRLTWNKAPKSVLVIKKICDASLLQPFKELCMYLMEENNMIVYVEKKVLEDPAIVSDENFGPVKKKFCTFREDYDDISNQIDFIICLGGDGTLLYASSLFQGSVPPRHGLPPGLPGLPDPPSTLRTSSPKLLR	846527	809012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_810130_810511_811211_812053_812137_812627_812786_812915_813016_813265_813879_815228_815315_815466_815576_815898_816029_820537_820622_822555_822775_846490
930354	SIRV7	-	384	2	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-40	-22812	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTTTGGTCATCCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114956	78849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_78964_114686
930355	contig_9335_pilon	-	3268	1	Intergenic	novelGene_147437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	149	450	2609	3058	209739	209290	NA	50	CATGAAATAGTTAGTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSPVLLWQLDFPLYHIREVIVLYCNCLPVHLSPLLGSELPGAVTVSHVCFPASHAGPGLCQALHKCVRGNNEVRRGRGGGSNEGKGEVRRKEGRGFICTSIFSLKIDVDAPITIHSRGLVFHKLRKKRKEKQKISPQSSDNNKLGRG	212347	209079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9335_pilon_-_209100_212300
930356	contig_17144_pilon	+	2657	15	Intergenic	novelGene_29245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	134	622	166201	167259	TRUE	40	CCCATCTGTGAAAAAACGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRGDGDQEYRRLRGASGIPETGVVFSLLTRPSLVDSPQRAGLEPEVLIGLGAGGEAPQEGLSGVTAEVVPWPWACGALQHLPIKDLVIGARLGLGLSGSFSWSPLKHIGLDQGGDATGPRVVTGLPGPWLLLLLLQHCDLGDGGHAGVPKAGQLEGFSPLP	166067	181844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166313_166480_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173762_174890_175003_175975_176270_179699_179784_181792
930357	contig_3525_pilon	+	1413	3	Intergenic	novelGene_135132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAGTAGGCATCCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547678	652808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3525_pilon_+_548012_569053_569135_651809
930358	contig_10793_pilon	+	1040	11	Intergenic	novelGene_83439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3289.80267037401	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	255	632	160548	163940	TRUE	30	TTTTAGTTCTCATAAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	159214	167270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
930359	contig_8377_pilon	-	4055	26	Intergenic	novelGene_34931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.17575507653593	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCGTAAGAACAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198931	68093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68138_68218_68328_136288_136399_140773_140974_142255_142388_154880_154990_161224_161386_164383_164656_172899_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182892_183046_183256_183406_185675_185811_189175_189270_191115_191249_192229_192350_193991_194115_194344_194523_196079_196145_197843
930360	contig_9373_pilon	-	929	1	Intergenic	novelGene_162717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAGAAGGACACTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187479	186550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9373_pilon_-_186600_187500
930361	scaffold_12124_pilon	-	1592	4	Intergenic	novelGene_22233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1076	1423	1508502	1508025	TRUE	5	GGCGCCGGAGGGCGGCGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAVSGRLISLYKKKNTNGVEISDVFNFQAICKWPGKFLVSKHHRPGRATGRAHHSIKTNKQIPMRANWGAGWGSSQPLCLCLSEMVSLANSRSPSSNPAVNTWVVFCRESLSLL	1509577	1473570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473668_1506628_1506684_1508007_1508265_1508394
930362	contig_13740_pilon	-	1416	9	Intergenic	novelGene_34713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3964.53286773801	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	72	560	165243	161045	TRUE	25	TACTGTGGAGGAAGGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRPRRSLSSRSAAGNRAEATESAMEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCL	165314	157110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160073_160135_160648_160730_160801_160904_160980_161270_161574_161722_161919_162031_165237
930363	contig_8598_pilon	-	1936	1	Intergenic	novelGene_22880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCATCCACTTGTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49878	47942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_47900_49900
930365	contig_13718_pilon	-	1957	1	Intergenic	novelGene_142913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGAGTAATTGTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272232	270275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13718_pilon_-_270300_272200
930366	contig_11572_pilon	-	1368	1	Intergenic	novelGene_100050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAATTGACGGCACATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	249354	247986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_248000_249400
930367	contig_7230_pilon	+	2904	2	Intergenic	novelGene_52528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCACCTTTTGGGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34197	114580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_+_36696_114174
930368	contig_10500_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_41254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	70	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTAGTCTAGGCAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626835	1628702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1626800_1628700
930369	contig_3700_pilon	+	2279	2	Intergenic	novelGene_138093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCTCTCCTCACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343411	345775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_344918_345002
930370	contig_13794_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_168553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAGCCATTAGGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71686	73750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13794_pilon_+_71700_73800
930371	contig_10051_pilon	-	961	1	Intergenic	novelGene_175601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAAGATGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444777	443816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10051_pilon_-_443800_444800
930372	contig_6446_pilon	+	838	1	Intergenic	novelGene_149213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	469	807	355346	355684	NA	20	TATGCAGTGTACGCATGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSNYGVGKEYCIYHGLPEERTNLSWRKYMPECSLEVRMVRHHLTYFGQVIRRDQFLEKDIMLGKVEGQQKRGKPSKRWIDTVAATMGLSITMIVRMAQDWAGFLLLYVELV	354877	355715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6446_pilon_+_354900_355700
930373	contig_15136_pilon	+	1528	1	Intergenic	novelGene_175568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GACAGGAAAGAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10026	11554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15136_pilon_+_10000_11600
930374	SIRV7	-	2143	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	32934	5	-73	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
930375	contig_9027_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_156368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	229	junction_1	18.5	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	103	384	190964	204303	FALSE	45	ATCCTGGAGGAGGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVLGAILLASKVWDDQAVWNVDYCQILKDITVEDMNELERQFLELLQFNINVPSSVYAKYYFDLRSLAEANNLSFPLEPLSRERAHKLEAISRLCEDKYKDLRRPTRKRSASADNLTLARWSPAIIS	190861	204595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9027_pilon_+_190966_198745_198909_204186
930376	contig_10377_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_115335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGCAGATTGAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_0_1200
930377	contig_19179_pilon	+	5230	1	Intergenic	novelGene_142370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1281	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTGTTGTAGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31045	36275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19179_pilon_+_31000_36300
930378	contig_3956_pilon	+	1621	8	Intergenic	novelGene_14854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1801.08780055447	4	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	425	1102	1284132	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283840_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1290347
930379	contig_9325_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_158811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	795	1109	9091	8777	NA	55	GAGGAACAAAGAAAACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKMEEFKKIAQEQNAKINSQLKIIQNQQLKVQKINKKISEMERVIQGLRSRLETMEDRISEIEDKHLDTILFEEKSEQRMKKNEETLRIMWDTIKSKHL	9885	7880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9325_pilon_-_7900_9900
930380	contig_7843_pilon	+	2144	1	Intergenic	novelGene_152034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAACAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320157	322301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_+_320200_322300
930381	contig_7009_pilon	-	1561	2	Intergenic	novelGene_23584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGATGCTAGCCCTAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243439	241727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_243192_243342
930382	contig_16722_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_118294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTCAGGAATGGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137654	138366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_+_137700_138400
930383	contig_1759_pilon	-	3151	2	Intergenic	novelGene_171319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCCACAAAGGGTAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10407	7209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_8076_8122
930384	contig_16775_pilon	-	2174	1	Intergenic	novelGene_107795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCAAGTAGAGGAGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195260	193086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_193100_195300
930385	contig_5020_pilon	+	1653	7	Intergenic	novelGene_27906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1086.8064327295	6	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	228	875	122915	124560	TRUE	5	TGTCTCCTCCCTCTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AYTLNSQPQELPSILQGPAKQLPCQRSLFSSSTFPGLSPDVIPPAEFLYLVLLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTGELG	121840	126088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_121966_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124672_124854_125091_125657
930386	contig_10258_pilon	+	1738	1	Intergenic	novelGene_155054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTCATTTCTGTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114721	116459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10258_pilon_+_114700_116500
930387	contig_8394_pilon	+	2723	1	Intergenic	novelGene_27326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	548	856	116376	116684	NA	40	CCAAACTTATAAGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPAEDRTTGNQRYRLSHPPPFFTLTWPPLLPAATVSWPGNTSFTPVSLGFHPPTLASSLSAFCQLLVLLFSASLDFFLTSHHLPLLSLKYLAPCAIFASS	115828	118551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8394_pilon_+_115800_118600
930388	contig_12427_pilon	-	1662	5	Intergenic	novelGene_40452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2469.20669193569	15	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	156	692	316061	314393	FALSE	15	TGACAGTTTGGACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325994	313422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315937_316079_325856
930389	contig_6059_pilon	-	2106	16	Intergenic	novelGene_44852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3905.58225222423	2	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	76	1674	581095	569146	TRUE	50	AATAAAAATTCCTTAAACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITRRSLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGNIFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEAAERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGEDMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDEGGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDEMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEDTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	584236	567813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573278_573376_573439_575786_575883_576080_576219_576550_576646_578185_578326_580594_580711_580921_581116_584181
930390	contig_8322_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_143215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGACTATCTCCTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50515	48399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8322_pilon_-_48400_50500
930392	contig_7963_pilon	-	2114	4	Intergenic	novelGene_58491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	671.377357047105	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGTAAATTGGAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123988	120826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_121959_122054_122489_122993_123258_123704
930393	contig_15273_pilon	+	2854	1	Intergenic	novelGene_140418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	2272	2622	31172	31522	NA	55	TAATAATAATAGTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTKDTREVLVQRPKGRHEPQPSPPEPRRTRWCPATITNLSDRDHNRGSQTEQEKNVEKNSNSQKKKKTRLTGLTETGPQTSFNSELRLLPKFTLQLKIRQVYKTNSNTREERAS	28900	31754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15273_pilon_+_28900_31800
930394	contig_854_pilon	+	4158	24	Intergenic	novelGene_36576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2799.64702676608	2	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	1561	3567	1696571	1715383	FALSE	20	AAGGGGTTTTCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1678797	1715974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1678849_1679250_1679448_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695279_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
930395	contig_3721_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_123827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	246	738	318	1055	238873	239610	NA	70	AATAGAGAACAGAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIILGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNNEIIHSIFSDHNAMKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLGDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKQPTTTGRKEIVKIRAEIN	238555	239612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_238600_239600
930396	contig_2636_pilon	-	2107	1	Intergenic	novelGene_52053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTATGAATATACAATATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56117	54010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_54000_56100
930397	contig_11505_pilon	-	3758	2	Intergenic	novelGene_140932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACCAAAACAAAACACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289847	285851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_288906_289143
930398	contig_10990_pilon	+	2333	2	Intergenic	novelGene_7500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1019	junction_1	0	11	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	824	1384	738920	744410	FALSE	55	AGAAAATAAATTTGTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGNQRAPL	738096	745359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_738954_743883
930399	contig_7272_pilon	-	4088	17	Intergenic	novelGene_25343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	715.386335748035	1	131	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	1697	3502	605006	593320	FALSE	25	GTTGCTGAAGTGTTGAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKDLKKESDEKSSSRSSGDKTNTSDRNSKTQASVKKEDKRSSEKSDKKENKDTKKIEGKDEKNDNGSSGQTSESIKKSEEKKRISSKSPGHMVILDQTKGDHSRSSRRRHEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEILPFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETRVDRPERSGREVSGHSVRSAPTGNRSNAPGYGNREGDRGVITDRGSGTQHYPEERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPGYHDARRMGDGRAGTGVISQHASNASPINRIVQIGGNSMPRGSGSGFKPFKGGPPRRF	618661	592733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_597550_597696_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503_603668_603885_603969_604443_604611_604709_604814_604922_605073_606908_607028_609184_609237_609832_610095_616565_616614_617512
930400	contig_5062_pilon	-	2465	1	Intergenic	novelGene_157845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCCAAGAACTCTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638709	636244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_-_636200_638700
930401	contig_6898_pilon	+	3423	12	Intergenic	novelGene_35740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2367.22197962642	10	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	326	1516	115973	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCRTGVCHAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	104574	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_104600_114302_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126775_126925
930402	contig_4736_pilon	+	2125	1	Intergenic	novelGene_168639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1218	1553	376500	376835	NA	10	TTTTCTTTGTTTTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIIRSQGSRSQVAALNYQRQGECGDHNGQQNQHNNQNNGLSRRDLWHWLVDHDVHRSETESLLNALLDLYKQTGSRSSERKSNLNHQNTKPWLLNQFLYLSQFISPKLSE	375282	377407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_+_375300_377400
930403	contig_13863_pilon	+	2440	4	Intergenic	novelGene_42040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1574	junction_2	168.718700801067	7	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTGTGAAGAAAAACAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104902	116364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_105583_110561_110639_113947_115381_116114
930404	contig_12293_pilon	+	2018	1	Intergenic	novelGene_165582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGAATCCTAATTAAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	2023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12293_pilon_+_0_2000
930405	contig_4832_pilon	+	3955	1	Intergenic	novelGene_163406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	2822	3421	394314	394913	NA	35	AAACAACAGCATGTGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEFLIFKNIYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDINKLWTTLQRMGIPEHLIVLMRNLYIDHEAVIQTEQGDTAWFKVRKGAHQGCILLPHLFNLYAEQIIQEAGLLEERGIRTGGKFINNLRYADDTILLAESEGDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTVGPISNIMINGENIEVVKDFILLGSTINTHGRSSQEIR	391492	395447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4832_pilon_+_391500_395400
930406	contig_10980_pilon	+	2428	1	Intergenic	novelGene_162560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGACATTGTTATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	189237	191665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10980_pilon_+_189200_191700
930407	contig_5350_pilon	-	2589	1	Intergenic	novelGene_99372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAATGAACTCGACACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258727	256138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5350_pilon_-_256100_258700
930408	contig_10749_pilon	-	2565	18	Intergenic	novelGene_133434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1439.66514753404	3	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1073	1765	150754	136250	FALSE	40	AAACTAAAAACTTGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	169057	135449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150781_151347_151475_151767_151900_153558_153676_154232_154266_154356_154381_155181_155324_167011_167395_168302_168346_169012
930409	contig_16883_pilon	-	1980	2	Intergenic	novelGene_161740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGAGCTTCCAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416368	323918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_325676_416145
930410	contig_5620_pilon	+	2038	1	Intergenic	novelGene_161333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	59	433	146574	146948	NA	75	AAAAAAAAAAAAGACCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNDTTILENDMVLPQLEIPYDPAIPLLGIYPREVKAVTQIDICTPMFTAALFTIAKRWKQRRHPSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQMDKYYMRPLP	146515	148553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5620_pilon_+_146500_148600
930411	contig_1925_pilon	-	2069	1	Intergenic	novelGene_162222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289891	287822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1925_pilon_-_287800_289900
930412	contig_6862_pilon	-	1985	1	Intergenic	novelGene_63753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTTGATAAGCTTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94578	92593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6862_pilon_-_92600_94600
930413	contig_18533_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_174047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAATAAACTACTTCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117316	119301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18533_pilon_+_117300_119300
930414	contig_16506_pilon	+	2593	1	Intergenic	novelGene_166556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	400	1056	31979	32635	NA	30	CCAGTAGGATGGTAGATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRCGGRLINNLHYADNTTLLAESEEDLKHLLMMIKDYSFQYGLHLNIKKAKILTTGPKSNIMINGEKTEVVKDFILLGSTVNTHGSRSQEIKRHIALGKSAAKDFFKVLKSKHVTLKNKVHLTQAIVFSIASYACKSWTVNKEDQRIDAFELCYWRRTLNIPGTARRTNKSVLEEVQPECSLEARMLRVCLTYFGHIMRKDQSLEMDIMLDKVEGQ	31579	34172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16506_pilon_+_31600_34200
930415	contig_11720_pilon	+	1527	11	Intergenic	novelGene_43802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_10	2631.12027281156	4	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	227	1378	68064	98482	FALSE	30	TTGCAATATGTTACTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHQGFWMEKSSVCSACRRGQGDMEPKESHLRKGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67837	98631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_95901_95992_98299
930416	contig_4426_pilon	-	1767	7	Intergenic	novelGene_15438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	861.279813223709	26	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	813	1766	843924	821045	FALSE	45	TTGGTGAAAAATCAAACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPELLLGQSPSRNDAKIINSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLE	904632	821043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_843869_843950_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890137_904482
930417	contig_10765_pilon	-	2297	1	Intergenic	novelGene_122883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTGGACTTTGGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46665	44368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_44400_46700
930418	contig_3103_pilon	+	1318	1	Intergenic	novelGene_146206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATACTCAAATTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126753	128071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_126800_128100
930419	contig_10953_pilon	+	1337	1	Intergenic	novelGene_42594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCTGACTGATGGGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458535	459872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_458500_459900
930420	contig_17144_pilon	-	1775	11	Intergenic	novelGene_29274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2252.43202783125	1	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	439	1398	174965	166445	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLVPDQPSGSPSVPIPKPGG	183205	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166508_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179710_181799_181850_183158
930421	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
930422	contig_7457_pilon	-	1887	2	Intergenic	novelGene_31594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTGCAGTCTCTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	958594	955413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_956939_958232
930423	contig_1516_pilon	+	1783	12	Intergenic	novelGene_49992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1161.56266929974	15	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	759	1640	354943	363092	TRUE	5	CCTGTTTCCTCTCTTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFASFIRKAADVHEVRKVLGEKGKNIKIISKIENHEGVRRFDEILEASDGIMVARGDLGIEIPAEKVFLAQKMMIGRCNRAGKPVICATQMLESMIKKPRPTRAEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVRMQHLIAREAEAAIYHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	335203	363733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_335269_347227_347395_347975_348068_352897_353030_353505_353680_354814_355065_356022_356174_356372_356526_359957_360125_362116_362299_362985_363155_363652
930424	contig_8978_pilon	-	1795	1	Intergenic	novelGene_49430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAACATGGGTGTGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	500014	498219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_498200_5e+05
930425	contig_10196_pilon	-	3699	1	Intergenic	novelGene_132282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	155	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	234	863	2204654	2204025	NA	50	ATTGTAAATTAAAAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFLHHWECFWFFSQVILGFYHPRGQAVYRLQPGGSSGAGGWHWEGPSLSQQIAQASAPRSLCDEETACSPTAAAGPLGAPGVTLWEVSALPSSHSSVACLDTARTGTWGPGVSRNLGPAGISIRRWVGKQPRATFLTCSEFLWCHLPPLDPQYPSWCRAKLGVQSPEMWSWTTTAEHLEQDRPLPQGPCYPSLPPCSTSPIPSLATAC	2204887	2201188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_2201200_2204900
930426	contig_12427_pilon	-	755	5	Intergenic	novelGene_40477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1111.3076475486	12	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	104	502	316061	315362	TRUE	25	CTGGAAGTGTCTATGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYR	325942	314044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314228_315291_315565_315748_315842_315958_316079_325856
930427	contig_15092_pilon	-	1316	1	Intergenic	novelGene_57825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	662	1039	346859	346482	NA	30	ATAGGCATTGCAGACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPETCSPPLGLVIRSLREFGCIYEASMTLPWSSCADSLSIVYCLTLHQSYHSSIVYLVKTCYFLIVLATRKFSNIGPTFSPVNNWLKPLPHSHRTNALHLAPVPTTLYCLPHRGPEGAAIHHFF	347520	346204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_346200_347500
930428	contig_8149_pilon	-	2079	2	Intergenic	novelGene_169949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTAGAACTGCCCCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	508588	506412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8149_pilon_-_507461_507557
930429	contig_678_pilon	+	1212	1	Intergenic	novelGene_167839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTGTTAATTTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	427616	428828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_427600_428800
930430	contig_15114_pilon	+	1271	2	Intergenic	novelGene_121093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGACACAGCTATTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27186	29369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_+_28317_29228
930433	contig_12654_pilon	+	1932	2	Intergenic	novelGene_129283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	255	junction_1	0	9	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGGCTCACCTGCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718877	722434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_720787_722411
930434	contig_10016_pilon	-	2010	1	Intergenic	novelGene_117855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATTTTAAGAGTGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322539	320529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10016_pilon_-_320500_322500
930435	contig_615_pilon	-	2563	1	Intergenic	novelGene_80040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1825	2154	10929	10600	NA	75	TCTTAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVSFLSNVYLCEGTPGCILAQLGISCIISSRGTFPSVFLPLPTSLALFLHSSDIFILLKIDELLKSTTKQDISDFTIAHSVTVLKLYTSFNPYDENFKNLFLPTLQEE	12753	10190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_10200_12800
930436	contig_3956_pilon	+	2010	9	Intergenic	novelGene_15080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1291.55259644159	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	80	724	1281682	1285761	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVRGCPRPRQN	1281602	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284291_1285752_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287558_1290409
930437	contig_12644_pilon	+	2074	2	Intergenic	novelGene_44557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	1553	2074	1695922	1696443	FALSE	55	GGAGAAACAATAAGACTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIERLRSRFEMVEDRISGIEDKHWDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNFRVIGVPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAHEKQEVTYR	1694177	1696443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1694539_1694730
930438	contig_18290_pilon	+	664	1	Intergenic	novelGene_174941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	101	535	88939	89373	NA	55	AATTTTATGGAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFSIASYACKSWTLNKEDRRRTDTFELWCWQRILNIQWTAKRTNKSILEEVQPKCFLEASMARLRLTYFVHVVRRDQSLEKDIMFAKVEGQRKRGRPSMKWIDTVAATMVSTIATILRTVQDQAVFLSVVHRLTISQNRLNGT	88838	89502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18290_pilon_+_88800_89500
930440	contig_16666_pilon	-	627	1	Intergenic	novelGene_61798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCAGTGTTGCTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127749	127122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_-_127100_127700
930441	contig_5031_pilon	-	2451	1	Intergenic	novelGene_133178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATGCTGCTTAAAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24903	22452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22500_24900
930442	contig_14357_pilon	-	3645	1	Intergenic	novelGene_121699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAGAAATCAAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700433	696788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_-_696800_700400
930443	contig_7963_pilon	+	464	3	Intergenic	novelGene_58351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	68	403	39310	40190	FALSE	60	AAAAAAAAAGGTAATGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHEDTHSKGDESQHKPPNSGQHFVFGRIRLCLPLHGDRTIQAGVLHMAGIDIALLGGHFQHHQDLEGPVSIMDQIGGHNPSCFFMSIPEPPDLNAAWIEICHMADKQVVVL	38479	40251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38539_39301_39405_39949
930445	contig_7171_pilon	+	1810	1	Intergenic	novelGene_101349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	165	498	1267	1764	1308243	1308740	NA	55	ACTGAAAAGAAAATTCAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTKIKLTTSVERDMEKLNIISQKKARSQLWNRPSIAHIQVQVELKKIRTSPWKPEYNLEYIPPKFRNHLKNTFDTLNTNDRRPDELWNDIKDIIHEESNRSLKRQERKKRPKWMSEGTLKLAVECQVAKAKGRNDEVKELNRRFQKVAREDESIIMKCAKIWT	1306976	1308786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1307000_1308800
930446	contig_17427_pilon	+	1953	5	Intergenic	novelGene_30408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	62	junction_3	150.265390226758	196	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTATGGTGTTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361675	368757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_361855_362103_362182_364741_364852_365169_365769_367770
930447	scaffold_12124_pilon	-	2016	6	Intergenic	novelGene_21984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	218	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1226	1573	857198	852247	TRUE	35	CAGCAGTACTTGACAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRNSVCLTEFLLKMSIRTTVSTTADMPATGRIAATSPWLCSGRPKCKVSLQSLQMSLCLWRTRICRLCSPLDSELGTRNTFLSCPFWTIWNRKWVCWEWWYGTYCVPQNVHQLG	858981	762123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_762489_798017_798035_852185_852461_854702_854801_857162_857231_857788
930448	contig_9706_pilon	-	2822	1	Intergenic	novelGene_21024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCTACATGCATGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579266	576444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_576400_579300
930449	contig_11538_pilon	+	3642	1	Intergenic	novelGene_152289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACATCACTTTGTGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176378	180020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11538_pilon_+_176400_180000
930450	contig_2799_pilon	+	4061	2	Intergenic	novelGene_85530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATGAAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	665519	669747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_668285_668451
930451	contig_14868_pilon	+	1137	1	Intergenic	novelGene_150463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATACATTTCATTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222367	223504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_+_222400_223500
930452	contig_6871_pilon	+	2203	2	Intergenic	novelGene_21551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	218	1165	134070	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEPPARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWVSKPPGVRRSNDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121895	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_122012_133968
930453	contig_6199_pilon	+	2224	1	Intergenic	novelGene_126342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTGTTCTGGATTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84718	86942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_84700_86900
930454	contig_10748_pilon	+	4793	3	Intergenic	novelGene_150752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	3122	3511	179254	189837	TRUE	30	TCCTCAAAGTAGAGTTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPCISQALLKKKKKVGGLALPDLRTYYIITVVRTAWYWSNDRYINQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKDPKSIKWGTDSLFNKWCWQNWMSICKEMKQDLYLTPYQNSLVLVQRQIH	176132	220150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10748_pilon_+_179604_189797_190763_219793
930455	contig_7816_pilon	-	2003	1	Intergenic	novelGene_66529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGGAGAGGTGACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213938	211935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7816_pilon_-_211900_213900
930456	contig_10864_pilon	+	2233	1	Intergenic	novelGene_107071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	1162	1533	879963	880334	NA	40	GGAGAAGGATGTAGAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWAVRRCCWDPTAGIPWLTCGFPPSSPGNAAQPLLRGLCEPTVGPGTVPDEAVPSQHHQAQVSRAGWKGRASRRMVLGIALCPPKMWVGILTSILGDITLFENRVFLCYANEAMSVYVNEAS	878801	881034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_878800_881000
930457	contig_6842_pilon	+	1921	1	Intergenic	novelGene_130832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	14	367	1800363	1800716	NA	25	AGTCCACTTGACAGCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKGGMLPPGDTSLIPLNWKLRMPPGHFGLHMPLDQQAKKGVTILAGVIDPDYQEEIRLILHNGGKEEYVWNAGDPLGRFLILPCPVIKVNGKLQRPNSSMTANSPDPSGMKVWVTPPGKEP	1800349	1802270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1800300_1802300
930458	contig_16796_pilon	-	1353	1	Intergenic	novelGene_178933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CGAAACAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6906	5553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16796_pilon_-_5600_6900
930459	contig_15327_pilon	-	706	3	Intergenic	novelGene_70700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_2	1286	33	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCGGTTTAATTTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902157	900857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901536_902035
930460	contig_9696_pilon	+	3772	6	Intergenic	novelGene_68792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	34	148	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	511	909	274561	274959	TRUE	30	CGAGAAGCCCGAATTCTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKKEIRERQKQNKETKNKTKNRKKKCPQGCPCVSVQSKGVASKPHGTAQLEGLPIREKKKKTNKQIKTEQIRANKQKSPGGPTSEAAQAGKQFHSQSAFCSLSRRSKDDALSQVFERKEAEVVRGKGEI	274050	561552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_275342_389872_390442_392896_394275_457536_457581_560289_560467_561239
930462	contig_5236_pilon	+	2171	17	Intergenic	novelGene_100889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	177.446371740168	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	940	1950	73022	84085	FALSE	40	AAAGGGGGGATTTTGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60643	84306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_61920_62068_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68518_72008_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
930463	contig_11678_pilon	-	1612	1	Intergenic	novelGene_160834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	68	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGTGCCCAGGTAGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148985	147373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_-_147400_149000
930464	contig_18283_pilon	-	2007	1	Intergenic	novelGene_170703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	402	998	71375	70779	NA	50	TGTATTTTCACCAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRHFTKQDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMPALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNKESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	71776	69769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18283_pilon_-_69800_71800
930465	contig_5302_pilon	-	2031	5	Intergenic	novelGene_81446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	752.810069008113	3	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	17	394	209199	177220	FALSE	15	GATACTTTTTACTGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLVSGPSSQCPPCACYLLDQHNKASQPPHGWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209215	175582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_186045_186076_209088
930466	contig_7410_pilon	+	1768	2	Intergenic	novelGene_106102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	396	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGATTTGTGTTTAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409779	412183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_+_411246_411881
930467	contig_13592_pilon	-	687	1	Intergenic	novelGene_33749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATGGATAACATAGCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351092	350405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_350400_351100
930468	contig_11816_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_98518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989202	986085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986100_989200
930469	contig_6059_pilon	-	1336	10	Intergenic	novelGene_44859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	4494.89260778893	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	190	1122	573432	569146	TRUE	85	AAAAAATGAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	576175	568031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575794_575883_576080
930470	contig_9098_pilon	-	2193	12	Intergenic	novelGene_75832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	156.435290136209	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	453	1322	345261	335775	FALSE	30	TTGAGAAGCCCAGTTTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350437	334903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349584_350330
930471	contig_19518_pilon	+	2470	3	Intergenic	novelGene_170716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1271	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1198	1578	33331	33711	TRUE	35	AGGGAAGCAGCCGGAAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMGVHMSIRVTALISLGYIPKSGIAGSYGISIAGFLRKHHIVFQIGCIILHSHQQCIRLDLPAASPTFVIFSLIRTSNARVRWHLIVVLICISLMASDGEHFLMCVLIICMSSLVKYLFISFAHF	32133	49281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19518_pilon_+_34440_47621_47728_49223
930473	contig_987_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_72267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	102	563	438522	438983	NA	75	CAAAAAAGAAAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYHSKIPLQSGRRMTGMRKVGKNTSSTFSGRSISGKTELEDLETDSLNLPMLKYVLERFHVKEKKKDYMYTKGREKPNLKTLNRPTCEWEQTLRHLTATCNMYRPGARVQCRPVYNMFKYSEVANQANRLLNKALLSSYINKYIFIMTKSKNM	438420	439859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_438400_439900
930474	contig_6898_pilon	-	1875	2	Intergenic	novelGene_35792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTCTCTAGAAGCTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127648	125671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_126910_127011
930475	contig_854_pilon	-	1946	9	Intergenic	novelGene_36659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.64575131106459	4	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	1203	1865	1713144	1710103	TRUE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSFFSARRTCLQAAWRSLGLVVQLLLQLCDLGLQGSNGGLVLGLDSALHLLQLDLELLVLALQLLPCIFVLLGVAALQVQVGVDLVNLQVCLLQPIVHQLRVALLLVQLLLQLGDASLQAPLLLQCQGSFAAAIGNLVGQLIPLLLGLALGTLGSCQLLLQLNHLSLHALQLLLVLLGLCQDLLPGGARVLQLPHAVLHLGLGLPKLLDGFISVLVG	1715977	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699290_1710032_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712487_1713082_1713164_1713414_1713477_1714856
930476	contig_16156_pilon	-	1872	1	Intergenic	novelGene_137066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1050	1382	62677	62345	NA	60	AAATTTAGGAGGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIGSLVWRFRVMVSWVIPAKWPNNMFSASVLPPGSLPEVIKACKQPSKAQLIPIYREQQRKKESQEKEEEMDVRLTASVNNASFAMRSELDGARLPLLNILIKDSVEES	63726	61854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_61900_63700
930477	contig_7078_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_130224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	275	828	414	1241	968635	967808	NA	65	AAAAAAAAAAGACCAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFITTLIQHVLEVLARAIGLEKEINGIQIGRVEVKVSLFADDMILYTENPKESTRKLLELIDFSKVSGYKINIQKSVAFLYTNKENLKEEITKSIQFTVAPKKIKYLGINLAREVNDLYNENYKALLQETRRDLHKWKNIPYSWIGRLNIVKMSILPKVTYRYNAIPIQIPTAFFNETEQQITNFTRKGKRPQITKALLKKKNKVGGLTLPYFRTYYTAMVIKTACYWYNNRYIDQRNRIENPDINSSIYEQLIFDKSPESINWGKDSLFNKWC	969048	966295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_966300_969000
930479	contig_11285_pilon	+	1739	1	Intergenic	novelGene_5720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTTAAAAAAAAAAAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836026	837765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_836000_837800
930480	contig_12886_pilon	-	3333	1	Intergenic	novelGene_135459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1667	1975	253391	253083	NA	25	CAGCCCAGGAAGCAGCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWAWAGLVFSRWLPRWTAENRVQLSWSCWGQLLRFLLRVERSFAACPGLRESPAQASSLALMDSGSQGEMGAIKGPRGRGRREKRNRGEKREPGWLAQQREG	255057	251724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_-_251700_255100
930481	contig_5033_pilon	-	1465	2	Intergenic	novelGene_29080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	652535	652164	TRUE	20	GCTGAGCTTAGAATTGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGFLNRSQGAREPSCSSSSSSSSPHPASTSSAPANLGPVGEVGAARAPSRPGHSVEGGEQGEEQRVGGEPPPPPGSRARLDPSVGLCSGRSTSACPSPGTPFGSLGSPSLSPRRCEEELQGPG	652537	649945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_650876_652002
930482	contig_9098_pilon	-	2082	1	Intergenic	novelGene_75866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	21	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1735	2043	422955	422647	NA	20	GACATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSKLYHYDVIRWISGSYTDEAYKLDSVLIQSLLRHKREKRAERHGKLIPPRKQCWEQSTSFGLEVPVQRSSQTKERLMTWTFLQSLQRKRSPGADALNLDL	424689	422607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_422600_424700
930483	contig_5352_pilon	+	3021	1	Intergenic	novelGene_177073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	132	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	153	462	2121	2582	372206	372667	NA	60	AATCCACAAACAAAAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGTIKSKNLQVIRVPEQWEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYMIDPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILRAALEKQEVTYTGETIRLSSDYSAETMQARGQWDDIYTTLKEKHCQPRVIYLQNSHSNMMVKLGHFQINRN	370085	373106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_+_370100_373100
930484	contig_665_pilon	+	1593	9	Intergenic	novelGene_158222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	44	junction_7	82.8370954041726	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	380	1591	352975	360682	FALSE	30	GGCAGGGTCCCAGCAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHYRILDFTATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLKSKTSCANLKKFEEVINQETFWVASEILREPNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFSSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATLLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKCETSPVAP	344681	360684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_+_344847_352162_352321_352918_353160_355476_355861_356888_357101_357187_357312_357938_357963_359001_359226_360623
930485	contig_14441_pilon	+	1154	6	Intergenic	novelGene_100411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	462.015757307042	12	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	20	1114	72712	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFHPPAMDSRLLCGVVLCLLGTGSMDTGVTQIPRNRIAQTGKKVTLQCSQTKGHKYMYWYRQDPGLGLQLIYYSLDVNDINKGEASKGYSVFRKEQDKFSLSLEAATPNQIALYLCATSYLHGYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	72692	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_72761_72890_73191_121190_121239_125517_125902_126159_126283_126514
930487	contig_10437_pilon	-	1969	4	Intergenic	novelGene_38331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	691	1014	446992	443860	FALSE	20	CATCAATTTTTACTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHILSAGWVKVDATFVEEESWATCIHTNRHGPFVSHGLCQGNLTAIGKLSVLGTRGSSVFGVIPALSIHGFVGIGSFRIDAFVIDDVLESPGHEATVAAFIAVFFI	451703	442904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_443976_445308_445475_446950_447053_451073
930488	contig_2219_pilon	-	760	1	Intergenic	novelGene_67218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAGAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407778	407018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2219_pilon_-_407000_407800
930489	contig_3095_pilon	+	1237	5	Intergenic	novelGene_75063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4555	25	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	63	827	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147178	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930490	contig_11492_pilon	+	2362	1	Intergenic	novelGene_152266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTGAGTAAATAGGAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	436459	438821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11492_pilon_+_436500_438800
930491	contig_9363_pilon	+	6872	3	Intergenic	novelGene_6608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	387	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATCTGGAAAGGTACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	768401	776351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_773741_773893_773970_774894
930492	contig_8712_pilon	+	1963	4	Intergenic	novelGene_58779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	577.82407934134	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	172	492	315133	321793	FALSE	35	AATTCTCATGGTGTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTRLVARAAVSAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286984	323264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287021_314997_315188_318064_318222_321684
930493	contig_15092_pilon	-	1796	10	Intergenic	novelGene_57775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	127.294157246654	3	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	966	1703	303989	296486	FALSE	15	TGGAATTTGACTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTACIECTLELYPPQVNFPMCTIASMPRLPEHCIEYVRVLQWPKEQPFGEGVPLDGDDPDHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVIKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLYTYTFEAERENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATLEGKNRTLYLQSVTSIEERTRPNLSKTLKELGLIDGQELAVADVTTPQTVLFKLHFT	304954	296392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_296572_296914_296970_297063_297128_297248_297350_297683_297763_297848_297886_298415_298470_302766_302881_303029_303133_303944
930494	contig_2069_pilon	+	2080	12	Intergenic	novelGene_23237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	345.329474967011	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	237	1079	333898	341321	TRUE	20	AACTTCTGTCTTAAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323950	345503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341453_342604_342729_343519_343652_344889
930495	contig_10404_pilon	+	3259	2	Intergenic	novelGene_138737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CGCAAATACAAATAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1611621	1615819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1614060_1614998
930496	contig_15047_pilon	+	1391	3	Intergenic	novelGene_52270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	229	627	4112	4510	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQNAEFLNFLTFFLRPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWGKRGWGRSLFSESMSLSGDFQQGWG	3883	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_4687_21013_21084_21136
930497	contig_10973_pilon	+	1435	1	Intergenic	novelGene_150357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCAATAAGTAGAAATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_3000
930498	contig_5988_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_16063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	100	477	1174852	1175229	NA	40	TAAAATACCTTCCAAGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHRNIKKTKILTNGSIRNIMINREKTEVVKDFILLGSTINTHGSSRQEIKRHIALGKSPAKDLFKVFKSKDVTLKTKVCLTQATVFSVTSYACKSWTTNKEDQRRIDAFELWCW	1174752	1176112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1174800_1176100
930499	contig_16907_pilon	-	3966	1	Intergenic	novelGene_87427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGACAGACACTGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346161	342195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16907_pilon_-_342200_346200
930500	contig_12620_pilon	-	1703	1	Intergenic	novelGene_98796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTTGGCTATGTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156389	154686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12620_pilon_-_154700_156400
930502	contig_16303_pilon	-	1635	1	Intergenic	novelGene_34056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCATTTTTATGTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34214	32579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_32600_34200
930503	contig_8153_pilon	-	3271	1	Intergenic	novelGene_34811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGTATATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147960	144689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8153_pilon_-_144700_148000
930505	contig_16098_pilon	-	1216	9	Intergenic	novelGene_45777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	332.690147697524	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	612	947	34781	31519	TRUE	5	AGCTCTCTTGGCTTTGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDEDEDEEDYHNEGYLEVLPDSTPATSTAVPPAPVLSNPGLRDSAFSMESGEDYVNVPESEESAEASLDGSREYVNVSQELQPAARTEPATSSSQDVEEEEEEGAPDYENL	36336	31090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_31341_31499_31587_31679_31743_32109_32173_34565_34661_34734_34799_35298_35749_35907_36011_36295
930506	contig_8544_pilon	+	1206	1	Intergenic	novelGene_55932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATGGAAACTGAAGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139243	140449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_139200_140400
930507	contig_610_pilon	+	1284	4	Intergenic	novelGene_76720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCCAGGAACGCTGGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213487	252572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214266_220684_220785_234998_235290_252457
930508	contig_7412_pilon	-	2167	9	Intergenic	novelGene_76328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_7	1151.90244134432	8	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	488	1921	375758	364445	FALSE	5	GCTTCCTCTCATTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLQERKIEDNAEADIPRNLTIQHTVNSSALLTTTQPTTQPTTQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTSQPTTQPTTQPPTDSPTQPPTEPFCPEPITSCSDLEINAAEDMLAEALTDFSLKLYRAFSEVKKAETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGDSTKRNLESVLSYPKDFPCVHQALKAFTSKGVTSASQIFHTPDLAIRDAFVNASQSLYGSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKKTNNKISQLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDHKKTRMEPFYFKSSEIKVPMMTSKKYPVAHFTDPTLKAKVGRLQLSHNLSLVILVPQHVKHRLEDMEKALNPTVFKAVLRKLEMIKFQPTLLMIPRVKVKSNQDMLGIMEKMEFFDFIFDLNLCGLTKEQDLQVSAMQHQTMLELTESGVEAAAASSISVARTLMIFEVTQPFLFVLWDQQHRFPVFMGRVYDPRA	378024	364198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7412_pilon_-_364699_365778_365999_370208_370349_370542_370747_373393_373529_375277_375801_376924_377055_377239_377315_377784
930509	contig_18859_pilon	-	1927	2	Intergenic	novelGene_150537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71275	69299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18859_pilon_-_70980_71028
930510	contig_6612_pilon	+	2211	1	Intergenic	novelGene_148175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTATGAGTTGAAACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68944	71155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_+_68900_71200
930511	contig_11328_pilon	-	2013	1	Intergenic	novelGene_88432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTCGAGAAGGGAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	689770	687757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_687800_689800
930512	contig_16103_pilon	+	1515	3	Intergenic	novelGene_118863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTTTTTGAGAGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722289	733588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_723674_733288_733369_733537
930513	contig_9727_pilon	+	3055	5	Intergenic	novelGene_86369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAGAAGATCCCGACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	577567	583989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9727_pilon_+_579490_581731_581823_582360_583228_583315_583394_583892
930514	contig_14970_pilon	+	2256	10	Intergenic	novelGene_44949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5794.52777824384	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	133	555	136145	182514	TRUE	15	CCACCTTAACTCTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASGWFQVDCLCFLGWLFATL	136012	232242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182595_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
930515	contig_1443_pilon	+	499	1	Intergenic	novelGene_28354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTTCTTTTGAAATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	915729	916228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_915700_916200
930516	contig_7720_pilon	+	1469	1	Intergenic	novelGene_155740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTTATGGTCCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224008	225477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7720_pilon_+_224000_225500
930517	contig_7294_pilon	+	1035	1	Intergenic	novelGene_172593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGCCTACTAGAATGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	92992	94027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7294_pilon_+_93000_94000
930519	contig_9121_pilon	+	2660	1	Intergenic	novelGene_134448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATGATAAACCAGAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130772	133432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_130800_133400
930520	contig_5686_pilon	+	1877	10	Intergenic	novelGene_45273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1387.82099390055	3	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	491	1054	176692	200560	FALSE	35	TGCGAAGGACGTCAAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITW	93818	201383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_176648_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410
930521	contig_8647_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_178123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAACTCAATAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1003042	1004294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_1003000_1004300
930522	contig_12923_pilon	-	905	1	Intergenic	novelGene_30129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCGCTATTTTAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152923	152018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_152000_152900
930523	contig_13823_pilon	-	4389	2	Intergenic	novelGene_145260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	1460	2818	244512	243154	TRUE	45	CGAAAAGATTAGTCCAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDTTTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKVTKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILASRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHTIISIDAEKAFDKVQHPFLLKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGIRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKMIKYLGINLTMDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFI	245971	241461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_-_241544_241664
930524	contig_11720_pilon	+	1181	10	Intergenic	novelGene_43799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2409.69290087829	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	939	241	1179	68064	98452	FALSE	40	ACGTTTGGAAAATAATCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAENPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFC	67823	98454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95461_98367
930525	contig_2703_pilon	+	3403	1	Intergenic	novelGene_101844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	417	2985	3401	1331580	1331996	NA	40	CACCAACTTATTTGAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKRQSMMASASSQHKESINFMGEENFLELPEAECKTLIYTTLQEIRKKIEQNIEKSKEHTDKAVVELKKVIQEHNDKFNKLQESVERQQSEIQKINNKISELDNSIESHRSRTEAVEVRISDTEYKAL	1328595	1331998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1328600_1332000
930526	contig_16516_pilon	-	636	2	Intergenic	novelGene_173250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCAGAAATTATTGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18437	17383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_-_17932_18349
930527	contig_7151_pilon	-	1773	1	Intergenic	novelGene_40703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGTCTCTCTCTCTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53072	51299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_51300_53100
930528	contig_5059_pilon	-	1302	1	Intergenic	novelGene_140727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTACACTGATGATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247188	245886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5059_pilon_-_245900_247200
930529	contig_8544_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_55936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1002	1406	166409	166005	NA	45	AGCAATGTTGCAAGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISVDAEKALDKKIKHPFLMKTINKVGMEGKFLSMIQGLCEKTTVNIILNGEGLRAFPLKSETRQECLLSPLLSNTVLEVLGRAIRQEKEIKVIQVRKEKVKLCLHIEKYTDEIILYIESPKESARKLLEIIE	167410	165599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_165600_167400
930530	contig_9053_pilon	+	837	1	Intergenic	novelGene_87921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATACAACTTTTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80184	81021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_80200_81000
930531	contig_9024_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_177490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCCCAATTCGGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7861	8946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9024_pilon_+_7900_8900
930532	contig_12923_pilon	+	761	1	Intergenic	novelGene_30113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGAAAGCGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55733	56494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_55700_56500
930533	contig_14441_pilon	+	1248	6	Intergenic	novelGene_100621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.282736920834	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	634	1062	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111215	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112108_112154_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
930534	contig_2703_pilon	-	911	5	Intergenic	novelGene_101785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTATTCAGCATGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	607247	601906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606151_606811
930536	contig_5389_pilon	-	1775	1	Intergenic	novelGene_143036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	66	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	309	1465	1773	472028	471720	NA	55	TAAGCATACAAGACCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHNPHQPEPGRTRQYPATTDCSDRDHNRRSWKEWEKTVQQNSNLQKKTRLTGLTETGGTPKTMVPRHLANSELKPLPKSTFQPKIRQAYKTKTHMRNVLLSS	473492	471717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_-_471700_473500
930538	contig_7025_pilon	-	2568	18	Intergenic	novelGene_104381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	765.057823990084	1	120	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	652	1959	411	2369	90925	49239	FALSE	15	GCCAATATTTTGTCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVVQDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVIYEKPFFEGKCMELETEMCSFITEGGETEQTTGEDGLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKSGFTGHQYLLEEGEYKDWKDWGGYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGCKGSSIDVLGIVANLKETGYGAKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGLYTSFEDWGGKNCKISSVQPICLDSFTGPRRRNQIHLFPEPQFQGCSQSFEETTNQIDDLFSANWVAYDGENFSGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGTTFKSLRFIDAEFSEPTIILFEREDFKGKRVELNAETINLRFLGFNTQIRSVQVIGGIWVAYEYSNYRGRQFLLSPAEIPNWYEFSGCRQIGSLRPFAQKRIYFRLRNKATGLFMSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGSLVTSGSKLGLALHQNVDSQFWSMKSDGRIYSRLKPNLVLDVKGGTQYDQNHIILNTVSKEKLTQVWEALVL	95112	49039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65740_65830_66741_66775_66975_67103_72956_73103_73191_73319_73866_74025_74671_74708_76457_76585_85337_85478_88024_88191_90920_91010_94786
930539	scaffold_12124_pilon	+	2792	7	Intergenic	novelGene_22373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2171.50644714677	19	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	891	1454	1508626	1509259	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQFSPASPWVPCG	1491956	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509223
930540	contig_7356_pilon	+	931	1	Intergenic	novelGene_60436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AACAAAAAGAATGATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539317	540248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_539300_540200
930541	contig_9653_pilon	-	1403	1	Intergenic	novelGene_48258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATGGAAGAAATGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	911640	910237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_910200_911600
930542	contig_2834_pilon	+	2257	2	Intergenic	novelGene_27991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGCACTTGTAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250552	253083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_251691_251964
930543	contig_5423_pilon	+	1966	1	Intergenic	novelGene_85199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGGCCTTGGTGTTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260113	262079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_+_260100_262100
930544	contig_10437_pilon	-	789	3	Intergenic	novelGene_38333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCTCACTGCCATAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	451701	445390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_445475_446950_447052_451097
930545	contig_6361_pilon	+	2897	5	Intergenic	novelGene_23976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	177	521	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405183	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
930546	contig_5779_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_106444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	182	514	94343	94011	NA	90	CTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94524	93306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93300_94500
930547	contig_5936_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_53593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGTTGAGGGTCACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	492906	495060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_492900_495100
930548	contig_11572_pilon	-	2209	1	Intergenic	novelGene_100071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAACTTAAAACACACATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	303422	301213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_301200_303400
930549	contig_5261_pilon	-	3168	2	Intergenic	novelGene_102476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	141	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	375	980	662590	661985	FALSE	35	GGAGGAATGGCAACGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRELAEIQTGFRRGHGMRDIIADVTWILAESKEYQKDVSLCFIDYEKAFNCVGHNKLWITLRRMGIPEHLIVLMRNLHIAEKVVVFQTEQRDTVWFKIRKGACQGCILTLYLFNLCAEQTIQEAGLYEEERGIRTGGRLINNLRYADGTTLLTESEEDLNLLLMKIKDYSLHYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKI	663453	659796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5261_pilon_-_662689_663177
930550	contig_19155_pilon	-	954	1	Intergenic	novelGene_173367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTAAACCTTCACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485368	484414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19155_pilon_-_484400_485400
930551	contig_10904_pilon	+	2122	2	Intergenic	novelGene_22515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTCCCGGGCTGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	345667	347865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_347022_347097
930552	contig_5918_pilon	+	504	1	Intergenic	novelGene_99515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACAATAAAAAAAAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	510966	511470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_511000_511500
930553	contig_9653_pilon	-	2139	11	Intergenic	novelGene_48194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	704.75017559416	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	647	1498	186221	175913	FALSE	25	ATGTGAAGCAGTGTTGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	201000	175271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843_188967_194043_194351_196881_196987_200892
930554	contig_4974_pilon	-	2558	1	Intergenic	novelGene_161408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATCAGCAATGATAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78793	76235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_76200_78800
930555	contig_10500_pilon	-	2884	8	Intergenic	novelGene_41227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1033.53380324447	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	683	1198	1635203	1629460	TRUE	15	TTTCTATATTGTATCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1639977	1626408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627603_1628191_1628615_1629390_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635617_1636940_1637067_1639834
930556	contig_12638_pilon	-	2034	1	Intergenic	novelGene_33302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGCTGAGAAGTTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1222936	1220902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1220900_1222900
930558	contig_5643_pilon	+	1041	10	Intergenic	novelGene_38815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2299.90832882262	6	23	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	68	829	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_237382_237456_237550_237635_237720_237819_237913
930559	contig_16125_pilon	-	1206	6	Intergenic	novelGene_155274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1801	junction_5	462.150451692952	4	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	636	1205	236037	151780	FALSE	70	AACAGAAAGAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDLKGPVSEENQDGGMHSDGTGNQDEEQESEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKK	236672	151778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_151850_153016_153052_153469_153490_155570_155618_179440_179598_235796
930560	contig_3956_pilon	+	3158	15	Intergenic	novelGene_15065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1312.85903932709	7	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	81	1772	1281682	1288876	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGKLQTVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHA	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283985_1284072_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288063_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
930561	contig_12644_pilon	+	2821	1	Intergenic	novelGene_44521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	1979	2443	1197506	1197970	NA	30	AAGGTTGTAATCTTTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVTTPPLETPEAMAPPFETPEVMAIPFEAEAARLLVSLVSSASASYGLLALRPQACICPAGASVPKLSSSTSKCPEAPHSARKPSVHRHSAPSLRGSASLAPPVSAQRHPTPPGSLLLTGIQLSLRGSAPAPLSPVSWFCCCLFSAAAASLLL	1195527	1198348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_1195500_1198300
930562	contig_6270_pilon	+	1270	7	Intergenic	novelGene_99820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	136.608219209371	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	462	857	39429	45668	TRUE	25	TACAATTGCTGGGTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPKAVVNLEPPWINVLQGDNVTLKCHGANTSEDSSTQWFHRGDLIPTHVQPSYSFSATAHSSGEYRCQTGQTNLSDPVQLSVFSDWLLLQTPRLVFQDGETIVLRCHSWKNWFLYKVTFYQNGKSKKFFGKNSNFTIPQANHNHSGDYHCTGMIGQNLQSSQPVTITVQGSNNVRNSSLVMTMRNSSGSLLVMVAAVVSGISVMAVVAAVLTISYLRRKQISAHPGNPERREMGETLPEQPASFPNAEEAAKVEAEKIVTYSLLKHPEGPEEEIGPPDYENCP	37407	47671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_37666_39225_39481_40398_40558_43476_43534_45418_45457_45578_45713_47302
930563	contig_7051_pilon	+	2102	11	Intergenic	novelGene_64290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	209.545221849605	1	87	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	595	951	199288	206198	FALSE	30	GCAAATTCTCCAGCTATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184049	207349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191842_197585_197653_199211_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
930564	contig_17074_pilon	+	1514	1	Intergenic	novelGene_145135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCATGAAATTTGTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223985	225499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_224000_225500
930565	contig_10143_pilon	+	3413	2	Intergenic	novelGene_163326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	577	918	20197	20538	TRUE	10	TCCTTTTGCTTTCTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRTLIARREKSMPSFKASKDRRTLLLGANAAGDFKLKPMLIYHSENSRALKNYAKSTLPVLYKWNNKAWMTADLFTTWNILSPLLRPTAQKKRFLSEYYCSWTTHLVTPEL	19620	24585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_+_20747_22298
930566	contig_7151_pilon	+	1436	1	Intergenic	novelGene_40700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTGGTTAGATCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37185	38621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_37200_38600
930567	contig_20641_pilon	+	2050	7	Intergenic	novelGene_52787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1306.88859722455	8	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	1147	1743	54874	56882	FALSE	20	AAGCTCCGCCTTATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14221	57189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45874_45965_54835_54968_56379
930568	contig_7744_pilon	+	1777	1	Intergenic	novelGene_62443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTCCATACCTCCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27914	29691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7744_pilon_+_27900_29700
930570	contig_10752_pilon	-	3006	2	Intergenic	novelGene_153048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	124	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	112	441	226952	225307	FALSE	30	ATGAGAAACTATTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFLRKLEIDIPFDPGNPLLGLYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTRAKRWKQPRCLSTDEWINKLWYIHTMEYYATIKNNDETMKHRITWWKLELITLSEFSQSQKDKYCIRPLLQELKKRFKHRRKHSLMVTGVGREGEGYSLTR	227063	222741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10752_pilon_-_225533_226848
930571	contig_3956_pilon	+	2115	11	Intergenic	novelGene_14898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1540.95605388343	5	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	718	1596	1285728	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1283872_1283976_1284054_1284267_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287482_1289845_1289892_1290297
930572	contig_3155_pilon	+	1819	4	Intergenic	novelGene_26359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1215.28085459928	3	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	80	481	258156	261211	FALSE	25	CACCTCACTCCAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258076	262549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258175_259209_259329_259731_259879_261094
930574	contig_14536_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_69327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGAGCTAAGTGGTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335800	333713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_333700_335800
930575	contig_12566_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_86026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGGACGGTCAGCGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221734	224222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_+_221700_224200
930576	contig_3103_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_146183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42310	42875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3103_pilon_+_42300_42900
930577	contig_7894_pilon	+	796	1	Intergenic	novelGene_170799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATTAAAAAGACAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332471	333267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_+_332500_333300
930578	contig_4402_pilon	-	4989	14	Intergenic	novelGene_140849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_3	256.84715598671	10	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	997	2991	1998	4988	610133	594555	FALSE	70	GAAAAAGAAAAACTGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIGGNYPEKLPARDSHNQKDNTKTKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEENECFLNPELLETSRKSREPTGGEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKREKDKPKAKGDKTKRKNDGSTVSKKENVKPAKGPQEKVDGEREKSPRSEPPLKKAKEETPKTDNANKSTSSSQKDEKIIGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTNKEEKAKKPTEKSKPLDSKGEK	614305	594553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_596736_596839_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610344_612401
930579	contig_678_pilon	-	419	1	Intergenic	novelGene_167850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TCAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533556	533137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_-_533100_533600
930580	contig_12080_pilon	-	5056	27	Intergenic	novelGene_128346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	622.374144260337	9	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	555	2459	116535	62705	TRUE	20	CTGGGATGTCATCACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPALPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMHLGLHQVLQDLREIDNDDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFSEVFQILLNTVKDSKAETHFLSILQHLLLIRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIDIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAIELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLRGEKEALDAEKQHIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLSKELEDAKKEMASLSAAAVAIVPPVPSSTNAPPAPPLPADSGTVIPSLPTHLPEEVSKPPPPPSLPEGYTIPPPPPPPPLPGSVCIPPPPPLPESASIPLPPSLPGSTAIPPPPPLPGDTGIPPPPPLPGVAGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGVVGIPPPPPLPGSTCILPPPPLPGDTGIPPPPPLPGGPGMPPLPPPLPGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLAPKKLYKPEVQLRRPNWSKFVAEDLSQECFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTS	164185	45197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_-_46055_46577_47139_54876_54964_56919_57056_57180_57344_57911_58039_58754_58885_58984_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106909_107777_108591_109504_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113011_113189_113301_114211_114321_115727_115868_116523_116603_117720_117768_118004_118136_118500_118603_120728_120885_164134
930582	contig_9937_pilon	-	2427	1	Intergenic	novelGene_129204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAACACAGCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101888	99461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9937_pilon_-_99500_101900
930583	contig_5419_pilon	+	2198	1	Intergenic	novelGene_15469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCACTTTTGTTATGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62233	64431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_62200_64400
930584	contig_17144_pilon	-	601	1	Intergenic	novelGene_29186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	4	15	292	306	166377	166363	NA	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	166668	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166100_166700
930585	contig_7247_pilon	-	633	1	Intergenic	novelGene_176696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGATAAAAACTCTCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160842	160209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_160200_160800
930586	contig_11017_pilon	-	2623	1	Intergenic	novelGene_128062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1558	1944	106710	106324	NA	10	CAATGCCTTCGGGGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISDILLFIFWISNCCFCMISICEFILAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLFAFSMNLSIFSSFLSAFCFSSLIALNIRDLSSLSGSSSAFSSTGKSSDVLFWTPTVTILSYFCKCFDIVCCLWGIR	108267	105644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_-_105600_108300
930587	contig_2093_pilon	+	3762	1	Intergenic	novelGene_153012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTGTGTATATATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1457200	1460962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1457200_1461000
930588	contig_5264_pilon	+	2042	1	Intergenic	novelGene_165049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCTATTGGTAAAATATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16703	18745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5264_pilon_+_16700_18700
930589	contig_12574_pilon	+	2774	2	Intergenic	novelGene_179183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	831	1169	1399	1737	FALSE	25	TGAGTACTGTGAGCCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMGVHMSIRVMTLISLGYIPRSGIAGLYGISISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISLQPLQHLLFPVFLIRASNAGVRWYLIVVLICIYLIASDREHFLMCPLAA	409	3342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12574_pilon_+_907_1065
930590	contig_3095_pilon	-	1020	4	Intergenic	novelGene_75140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGGCAAGAAAGGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152180	149647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_149889_150414_150695_150995_151162_151847
930591	contig_6903_pilon	-	2473	3	Intergenic	novelGene_179184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1363	1725	181614	181252	FALSE	65	CAACATCAAAACAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPNDSPVEENPLELPDREFKSLILRILHELKQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLQIIQRQQLKIQKINNKISEMDGVIEGLGSRFETVEDRISRN	183292	180503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6903_pilon_-_182431_182475_182703_182973
930593	contig_10073_pilon	-	1144	1	Intergenic	novelGene_179185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	235	705	438	1142	74556	73852	NA	60	GGAAGAAAGGAAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYMKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNIPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTLHPTAAKYMFFSNAHGTFFRIDHILGQRAILNKIQNMEIIQSIFSDHKAIKVEINNRKSKEKKSTTWKLNNALLTHHWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIATDAHIQKEERDKIKTLTTELKQIENSKKIPQP	74993	73849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10073_pilon_-_73800_75000
930594	contig_11815_pilon	+	1058	1	Intergenic	novelGene_50889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	291	602	97220	97531	NA	50	CTGACTACTTTAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIPFESEAARLLVSLVSSASASVSCGLLALGPHACICPAGASVPKLCSSTGISARRHPTPPESPVHADTQLSLSLCRLHHHLTLVSWFCYCWFSAAAASLLL	96929	97987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_+_96900_98000
930595	contig_15666_pilon	-	1625	7	Intergenic	novelGene_70194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	593.714694856788	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	64	1113	110619	107816	FALSE	5	GCTCTCTTGCTGCTGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110682	107303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110022_110141_110246_110558
930596	SIRV7	+	2119	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	42	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAATAGATATGTTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1008	114963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
930598	contig_20596_pilon	+	3320	3	Intergenic	novelGene_157229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1309	1608	93625	93924	TRUE	35	GAAACTGACTCAATGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSIFTPEFRDHLKNRFDAFNTNNQRSDELWNDIKDIIHKESKRSLKRQDRKNRPKWMSEETLKLALERRAAKAKGKNDEELNRRYQRVAREDKVKVV	61960	129915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20596_pilon_+_62033_92388_95224_129502
930599	contig_1694_pilon	-	1721	1	Intergenic	novelGene_144984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	317	703	1646910	1646524	NA	40	ATTAATAATTATGTTCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASASSQNKESRNLPEEENFLELPQAEYKRLRYKTLQEIRKEIKQNPEHAIEETKKIREEHNDGFKRLQESIERQQSEIQTINNKISELDNSIESHRSRIEAREVKISEIEHKALYTNLFEEKSDKRI	1647226	1645505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1645500_1647200
930600	contig_6654_pilon	+	2228	2	Intergenic	novelGene_85738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	3	335	436731	437063	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSIKPKTIKIIEEKIGSTLEALRHGINRIQTITNNIQTLEDKLDNWNLLKIKHICLSKDFTKRVKREPTGWEKNFGYYKCDKGLISKIYRKIQHLYNKKTNNPIKNGPKK	436728	439610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_438041_438694
930601	contig_7272_pilon	+	1032	1	Intergenic	novelGene_25428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGTACAGTAATAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970453	971485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_970500_971500
930602	contig_15970_pilon	-	2646	1	Intergenic	novelGene_144060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGCAAACACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201093	198447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15970_pilon_-_198400_201100
930603	contig_5200_pilon	-	2245	1	Intergenic	novelGene_140153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAATTATTTTTATTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174660	172415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_-_172400_174700
930604	contig_5302_pilon	-	2132	1	Intergenic	novelGene_81543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCTAGGCAAAGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1633798	1631666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1631700_1633800
930605	contig_15327_pilon	-	855	4	Intergenic	novelGene_70687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2915.88709581759	4	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	366	416	900954	900904	FALSE	25	CACGGTGTAATTTACAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGLVVCWGSVICLLGDCGSPSLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902154	900464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901469_902089
930606	contig_3956_pilon	+	2786	14	Intergenic	novelGene_15086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1144.81363047472	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	659	1980	280	2259	1284252	1290491	FALSE	20	AGCCTACGCGACTTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYPKHVGHCPRGPRQVHADRLPGLLYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281602	1291018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282817_1284173_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
930607	contig_6031_pilon	-	1033	4	Intergenic	novelGene_56767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.19630631713	17	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	107	607	257696	254907	FALSE	40	TTAAACAGATTTTTACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQSNPAVLAASYTARKRAARGRAHLWSDAWSFHRAMFQPAEHSQEWAMEGPRDGLKKERLLDDRHDSGLDSMKDEEYEQMVKELREIRLEPQEAPRGAEPWKQQLTEDGDSFLHLAIIHEEKALTMEVIRQVKGDLAFLNFRKTCRGCQRVKMRRAMTRSQSSQRMSCPMMTVCLEASAWHYEQKVKHGLVYLYKNRVLFF	257802	254480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6031_pilon_-_255013_255394_255471_256721_256814_257469
930609	contig_3866_pilon	-	1825	1	Intergenic	novelGene_112442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGGGTTGTTAACCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295527	293702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_293700_295500
930610	contig_12270_pilon	-	363	2	Intergenic	novelGene_113809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	6	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	333	31	363	14409	13854	FALSE	15	GGTTATGCTGCTTATAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQHQAGRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQY	14439	13853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
930612	contig_7247_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_176697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAAGGAAATAGTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161267	161046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7247_pilon_-_161000_161300
930613	contig_13760_pilon	-	2278	2	Intergenic	novelGene_61361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	108	494	382314	381928	TRUE	30	ATGCCCAGCACAGCAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCQHSPHYHPELPVSIHPVFLPLPAFSSLLLGTCCPFGLILMVVLRSTFLTGVTVYFIGLSVTWLKGDLQEWLQFQIRRVSKGYSLRSSSSLSRTSKSGLFYEFEFCSAFFFPTLAGTFYCDPGQSGQ	382421	376450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_377202_380894
930614	contig_2924_pilon	+	1305	1	Intergenic	novelGene_140283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAACAACAACAAAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358986	360291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_+_359000_360300
930615	contig_15039_pilon	-	1242	1	Intergenic	novelGene_110179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTATATGCAAGGTACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	356845	355603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15039_pilon_-_355600_356800
930616	contig_6898_pilon	-	1186	4	Intergenic	novelGene_35746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACCCTAGAAAGACAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126525	115900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_115979_116669_116817_117863_117871_125571
930617	contig_5727_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_7970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAAGTTACTAATGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192898	193959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_192900_194000
930618	contig_6014_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_176284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	98	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318700	320523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6014_pilon_+_318700_320500
930619	contig_10225_pilon	+	1203	7	Intergenic	novelGene_86811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	473.74102160944	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	83	646	20776	39885	TRUE	30	CCAGGAATGTGATTAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSAARTPG	20693	40675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38642_39864_39913_40145
930620	contig_6208_pilon	+	1072	3	Intergenic	novelGene_53038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTGTCTTTCAATGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493946	503656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_494298_496608_496730_503056
930621	contig_13904_pilon	+	834	1	Intergenic	novelGene_165500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGGTGTCGGGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125205	126039	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13904_pilon_+_125200_126000
930622	contig_2704_pilon	+	2886	1	Intergenic	novelGene_75318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCCACATTGCAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327125	330011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_327100_330000
930623	contig_5643_pilon	+	1075	11	Intergenic	novelGene_38824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2938.09826928917	3	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	183	974	236199	238083	FALSE	15	GTACCCAGCCACCTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGMPQLHPTH	233610	238184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233687_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237782_238057
930624	contig_817_pilon	+	2145	1	Intergenic	novelGene_132474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGAAGGAGAGGGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698201	700346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_817_pilon_+_698200_700300
930625	contig_10930_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_37073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAACAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	287332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287300_289100
930626	contig_11681_pilon	-	2702	2	Intergenic	novelGene_102989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	153	500	213346	212999	TRUE	10	CTTTTTATTCCTGTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIGCWTGLKPSWRVGVSAELRDFVRDSMRLWIPALPLWDAETLKLVLRREILNLLLYGTQHGSSPQGWLDLGLLREAHLAWTLASSWRHLHSSVSTVTGSLRIFKGPRSSHLR	213498	210667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_210782_210910
930627	contig_7521_pilon	-	2594	1	Intergenic	novelGene_160561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATCACCTTTTATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352076	349482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7521_pilon_-_349500_352100
930628	contig_10205_pilon	-	2265	1	Intergenic	novelGene_143122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAAAAAAAAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254934	252669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10205_pilon_-_252700_254900
930629	contig_151_pilon	+	2773	1	Intergenic	novelGene_132565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	89	270	84	353	191822	192091	NA	80	ACAAAAAAAAAAAAAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNNKKTNNPVIKWAKDFNRHFTKEDIQMTTKTMKRCSVSLVIRETQIKTTMRYHFTPIRMAKIKKKTKKLKITNLARMWMWGNWNPYSLMVGMQNGTAIVENSVAVPQKAKNRTAI	191738	194511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_151_pilon_+_191700_194500
930630	contig_4812_pilon	+	709	5	Intergenic	novelGene_103660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCATCTGCTCGGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79011	82335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_79240_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268
930631	contig_19342_pilon	+	1086	4	Intergenic	novelGene_41056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	18	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	29	514	3263	6197	FALSE	20	ACCTTCCAGAATCCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSPDSSDRVMASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTCRPCAAATTRATPRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCVSHSLKVRS	3234	6769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_5123_5243_6163
930632	contig_13348_pilon	-	3631	3	Intergenic	novelGene_162686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	49	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGATGGATATCCGGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267263	253550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_-_254336_254444_256049_266021
930633	contig_240_pilon	+	720	1	Intergenic	novelGene_173799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGATAGATACATTTACAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594732	595452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_240_pilon_+_594700_595500
930634	contig_14142_pilon	-	1864	2	Intergenic	novelGene_120530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	938	junction_1	0	4	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGCCTGTTTGGGCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351011	349034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796
930636	contig_4422_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_155955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	8	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	200	676	53120	54426	FALSE	50	AATTCTGAAAATTTAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHHSISDHLTTLRCWAMGFYPMEITLTWQRDGEDQTQDTELVDTRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYMCRVQHEGLLEPLTLRWELSSQPDIIGFVAGLVLLGVVVVVVAGAVIWRKKSSGRDEDPVLFQAATVPRALICLSQILKRETAALCGTE	52308	54770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4422_pilon_+_52490_53101_53379_53479_53600_54162_54228_54393
930637	contig_7408_pilon	+	1195	1	Intergenic	novelGene_168748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAACAAATAATTTAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22793	23988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_22800_24000
930638	contig_13348_pilon	+	2748	1	Intergenic	novelGene_162674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCCCATTCTCAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26764	29512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13348_pilon_+_26800_29500
930639	contig_4402_pilon	-	1521	2	Intergenic	novelGene_140852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	88	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACATAAGAAACATAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597914	595197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595933_597128
930640	contig_5928_pilon	+	5408	3	Intergenic	novelGene_40374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	152	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2820	3146	237764	238090	FALSE	60	AAAAAAATTATGGATAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATCKKMQQDPYFTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTINFIEEKTGSMLEALMHGINRIQTITNTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKTEPTNWGKNLDITSQTKV	232149	240352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_233061_233225_234180_236809
930641	contig_5602_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_133003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAATGAAATAGAGAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308226	307675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_307700_308200
930642	contig_16103_pilon	-	2120	10	Intergenic	novelGene_118860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3868.40430624091	4	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCACCCTCTGACCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743687	722286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_732167_732247_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735735_735856_735975_737495_737630_743496_743547_743625
930643	contig_13494_pilon	+	1700	1	Intergenic	novelGene_167517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CATTAGATTAAATAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78510	80210	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13494_pilon_+_78500_80200
930644	contig_5302_pilon	+	1935	1	Intergenic	novelGene_81402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCCAGTAATGTTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164458	166393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_164500_166400
930645	contig_10263_pilon	+	3486	1	Intergenic	novelGene_135858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTAAACTTCCACTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	928017	931503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10263_pilon_+_928000_931500
930646	contig_14970_pilon	+	1859	10	Intergenic	novelGene_44952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6118.16508642022	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	368	1107	133	1239	136145	231624	FALSE	15	ACCTTAACTCTTTGTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFEYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDTSDVSLLQGAGTDT	136012	232244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177424_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231533_231579
930647	contig_10943_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_168265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	119	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGCACAACTTATACAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41277	39185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10943_pilon_-_39200_41300
930648	contig_4783_pilon	-	554	1	Intergenic	novelGene_108362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTGGCTGGTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127886	127332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_-_127300_127900
930649	contig_15613_pilon	+	924	1	Intergenic	novelGene_147207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTGGACAGATTTACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133547	134471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_133500_134500
930650	contig_11338_pilon	+	2038	10	Intergenic	novelGene_6389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306205	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_306961_307227_307428_314757_314941_315144_315340_315548_315654_318590_318780_319195_319264_319381_319429_321311_321459_323165
930651	contig_12605_pilon	+	680	4	Intergenic	novelGene_64165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	167	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	30	398	3897	4829	TRUE	20	CCGTGAGGCCACACTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3867	5768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
930652	contig_2069_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_23367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGGTCTAAAAAAGTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1031319	1032011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1031300_1032000
930653	scaffold_17542_pilon	-	3814	1	Intergenic	novelGene_139251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	93	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAACAACAACAACAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	545053	541239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_-_541200_545100
930654	contig_10319_pilon	-	2540	1	Intergenic	novelGene_147257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAGCTGAAAGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247240	244700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10319_pilon_-_244700_247200
930655	contig_5302_pilon	-	2190	8	Intergenic	novelGene_81451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	757.410761228337	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	34	711	209238	177300	FALSE	30	ACTGTACATAGCCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGLKAPECASGMYKETVYSAFNLLMHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209271	175820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209196
930656	contig_11248_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_142554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAATTAATTCTAGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	296217	294484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11248_pilon_-_294500_296200
930657	contig_7151_pilon	-	2474	5	Intergenic	novelGene_40775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	1009.88647257996	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	140	469	551063	530111	TRUE	50	TAGCACAAAATGTACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMRWKEMRLTSERREATGRFKCEGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKELYYSVFEYPIFLFPGTYKSEQ	551202	527379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529337_530062_530179_536388_536494_549638_549729_550996
930658	contig_6873_pilon	+	4112	7	Intergenic	novelGene_129810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	31	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	3433	3801	197575	249703	FALSE	50	TCTCAATAAAATAAGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKSQINEMGDITTDPTEIKRNITQYYEKLYSNKFENLKEMDRFLETHYLPKLTQSDVEDLNRPITREEIEKVKKKTPNQKKPWPRWLHWRILQNIYRRACTSTTQAISEHRGGSNASKFIL	137762	250014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_137838_138367_138806_161849_163286_177065_177285_194409_195003_196903_197738_249497
930659	contig_9482_pilon	+	2297	6	Intergenic	novelGene_44216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGCTGTCTCCCAGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123688	283239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_123906_197871_198229_199791_199949_248753_248851_249582_249762_281949
930660	contig_17427_pilon	-	1946	9	Intergenic	novelGene_30323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	992.507296887534	18	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	298	894	179819	178046	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204690	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177668_177712_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_188830_188890_204653
930661	contig_19459_pilon	+	1180	7	Intergenic	novelGene_59867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATAATTTTGTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6668	19120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7789_7945_10267_10330_12582_12707_15506_15700_16201_16265_18988
930662	contig_10324_pilon	-	1168	1	Intergenic	novelGene_7863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTTCCCATTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446900	445732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_445700_446900
930664	contig_9363_pilon	+	1732	11	Intergenic	novelGene_6580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCCTTGCATTCTCTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753795	786576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_754505_755045_755125_755362_755405_774894_775043_776035_776192_776977_777124_777528_777664_780573_780696_780849_780912_781253_781354_786543
930665	contig_10973_pilon	-	897	2	Intergenic	novelGene_150387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACGATCATACAAAGACGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2505	1549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_2309_2367
930666	contig_5794_pilon	-	2035	2	Intergenic	novelGene_69748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	940	junction_1	0	3	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTCCTGATATAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	494637	492506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_492554_492649
930668	contig_15165_pilon	+	263	1	Intergenic	novelGene_145312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCGCCGGTGAAATACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1875	2138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15165_pilon_+_1900_2100
930669	contig_11752_pilon	+	1462	8	Intergenic	novelGene_37607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1472.32973791296	4	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	107	1159	84194	105606	FALSE	10	GATGTCCAGTTGTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLRKCQSPQRGLWNIFKLWVWTVLYCDFMGRHGTDCWTYHYSEMPMNWAKARRFCQENYTDLIAIQNKREIEYLENMLPFKSTYYWIGIRKIGGVWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKSKEDCVEIYIKRPKDAGKWNDDACYKQKTALCYTASCLPWSCSGHGECVENINNYTCNCNMGYYGPQCQFVVQCKPLKAPELGTMACTHPLGGFSFSSQCAFNCSEGTDLIGIEETTCGAFGNWSSLEPSCQVIQCEPLAEPDWGTMDCSHALANFSFNSTCTFSCSEGTKLIGEKETVCGSSGIWSSPSPICQKSDRSFSVIKEGNYNPFFIPVAVMVTAFSGLHE	84087	105909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11752_pilon_+_84197_85034_85117_87159_87547_88667_88776_92873_93060_94223_94410_96442_96535_105597
930670	contig_7630_pilon	+	2596	2	Intergenic	novelGene_133636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	40	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	845	1183	402036	402374	TRUE	60	GAAAAAAAAAAGCAGATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQVANRHMKCSRSSAIREMQIKSTMTCHLTPTGLALIQKTQNNKCWRGCGETGTLIHCWWECKMVQPLWKSIWHFLNKLEIEVSKHPAILLLGIYPREIKAVT	401191	404077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7630_pilon_+_402912_403201
930671	contig_6199_pilon	+	3225	2	Intergenic	novelGene_126412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	198	557	693235	693594	TRUE	15	ACCAACGTGTGGTGGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFTRDWSLLITRPKYIRRSLAIFASKEHSGCISSKMDLFGLLVVHDTFDILRQHHNSKSSILLQSPLFTVQLSNTYEVTENIMVWVRCNLVLKLTFLLFNVLKRSSADLPNTICRLIS	693037	696410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_693762_693909
930672	contig_13097_pilon	+	2103	17	Intergenic	novelGene_107703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	552.123853858896	2	64	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	200	1273	184733	243884	TRUE	40	GAATATGAATGAGTCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGGPWDVHVHSDMAKDLDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITAEDCTMEVTPGAEIQDGRFNLFKVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGK	184533	264614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_185980_186026_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_196695_196765_205974_206085_225265_225360_226996_227161_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
930674	contig_5023_pilon	-	1636	8	Intergenic	novelGene_7367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	531	881	647062	639176	TRUE	35	CGAGTCCTGTGAGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647592	622533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_622618_625604_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
930675	contig_5988_pilon	+	681	8	Intergenic	novelGene_16086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1851.93965608924	40	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	71	604	1218380	1224805	FALSE	30	AAAAACTTTTGTACTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQIQPFSV	1209873	1224882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1224784
930676	contig_15063_pilon	-	1704	1	Intergenic	novelGene_14475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTTGGCTAAATATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93928	92224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_92200_93900
930677	contig_854_pilon	-	1023	6	Intergenic	novelGene_36281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	180	536	563319	562338	TRUE	10	TTCTCTGTGGGCACCAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563498	543549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543633_556080_556200_557000_557052_557583_557751_562270_562404_563028
930678	contig_20199_pilon	-	1763	2	Intergenic	novelGene_82574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	138	junction_1	0	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	160	480	43987	41931	FALSE	15	AGAGTGGCTGCTGGAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRCLSGGGEGDCPSGGLDSSRGKIRLGCGDIAGRELRALRPEGLPAGGEKKESMFTFPHTCPSSPGIGFWNSEPPCSPPQNENSEEHPDTIESEPSELEQVSHCVPRVWLQVRCPHPRAPHNLSGLGGFMVMVLPEVSYPLHWTHPRTPTNSSRNTCQR	44146	40647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_42171_43906
930679	contig_6208_pilon	-	2784	1	Intergenic	novelGene_52999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	286	861	1852	2712	414398	413538	NA	30	CCACGGTAGTCAAGACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNISKTINVIHHINKTKDKNHMIPSIDAEKAFNKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLSVIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPMRTGIRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAVRLEKEIKGIQIGREKVKVSLFADDMISYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENSKTLLQETKRDLRKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPAAFFNEMEKQITNFIWKGKRPQ	416249	413465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_413500_416200
930680	contig_10962_pilon	-	2902	7	Intergenic	novelGene_103923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.74535599249993	4	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGACTAACTCGAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642736	486921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10962_pilon_-_487363_556164_556427_616144_617917_621235_621362_639028_639141_641517_641663_642692
930681	contig_3747_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_24975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1075	1398	251749	252072	NA	50	GGAAAAAATATACTGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWCFLKKLEIEVPYDPAILLLGIYPREIRAVTRIDICIPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTNEWINKLWYIHTMEYYTTIKNNDEAMKHNMEESGDHYAE	250674	253134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_250700_253100
930682	contig_9345_pilon	-	1819	6	Intergenic	novelGene_24631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2080.64422715658	5	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	269	745	955353	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAIRKKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	1001343	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948042_949491_949607_952439_952561_955197_955356_997013_997093_1001156
930683	contig_19352_pilon	+	649	1	Intergenic	novelGene_122405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCCGGATTCTCTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	295281	295930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_+_295300_295900
930684	contig_7111_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_175941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCTAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82194	80642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7111_pilon_-_80600_82200
930685	contig_3523_pilon	-	2375	3	Intergenic	novelGene_171483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACCTAAAACTCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210346	85881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_86867_86984_88323_210294
930686	contig_6102_pilon	+	2977	8	Intergenic	novelGene_32090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	98	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACGGCAGGCAAAGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	791049	797471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_791097_791583_791653_791971_792073_793462_793672_793832_793936_794104_794212_795039_795099_795189
930687	contig_1450_pilon	-	2530	2	Intergenic	novelGene_27438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	120	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	1532	1873	423081	422740	FALSE	45	TGGCCCATGCAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKRKVVGEPPPGSPILGAKRLASSWLEKAKGLLVPSGRVGEPRRSSALRMGGGVMDVGLSSSPVAAAVAAALGNPAKLKLCWRRGRSAERSRAPARARRSSALWMKWQRGP	425086	422082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_423513_423986
930688	contig_5967_pilon	-	2103	8	Intergenic	novelGene_44361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	436.736085254316	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	134	1084	488569	388566	FALSE	15	TGTTTTACTGTAGTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILASDFQVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDINVLKKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517635	387546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424055_430708_430809_488455_488583_517515
930689	contig_3747_pilon	-	2591	5	Intergenic	novelGene_24805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	1930	2337	202940	201238	FALSE	35	GATTTCAACAACGATCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAALGTTMREHVFSKSACMEISSPIVLTCRLVFQEKRVFVAQVIQGLFALLRALHPEDFGHSASQDPDGFDSSHFTHLHYHPASHLLPTAVHLLWVVKDHFERLDLLEHHHDWAGFVQVLETRKKQKTQDPRRTF	205201	200983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201573_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
930690	contig_2069_pilon	+	1546	12	Intergenic	novelGene_23249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	168	junction_1	282.568765857121	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	194	1036	333898	341321	TRUE	10	ACCCAGGTTTGCCTGGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323993	343645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519
930691	contig_5528_pilon	+	5194	4	Intergenic	novelGene_179186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2676	201	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	3517	3855	32634	35634	FALSE	15	CATGAATCTCTCCTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSHFSFVSLASGLSVLLIFSKNQLLVLLILSIFFLQLAGSVTQIWYGRTGLAEEELLGWVVCGTYYSHQSRSVISAGQVRVGRACAAWWCDVKPTVQVGRMQWGDCYVWS	18104	36973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5528_pilon_+_19936_20047_20536_31436_32740_35401
930692	contig_1867_pilon	+	1585	1	Intergenic	novelGene_54595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	324	1262	1585	512462	512785	NA	45	GAGAACCTAGAGGAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLALQLEQIEKEQQKKSSGTRRKEIIKIRAEINEIQNWGKKKRINKTKSWFFEKINKVDKARVKLMKEKQERKQITQIRNEMGDITIDPTEIKRIITEYYEKLYSNKF	511200	512785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_511200_512800
930693	contig_13680_pilon	+	1078	1	Intergenic	novelGene_149615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAGCCGTTAATGCACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534525	535603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_534500_535600
930694	contig_17427_pilon	-	2007	9	Intergenic	novelGene_30358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1377.11872559159	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	162	911	188879	181330	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTVRACGKRAEWLAIWTLCRIGSSSPSTWPASPSSPHQFRLR	204804	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178020_181300_181449_182689_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
930695	contig_10403_pilon	+	3516	2	Intergenic	novelGene_175809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	320	799	114038	115056	FALSE	85	CAATTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQHPERRKGHNENINPTTGTSRKRAAKEVLRLQKKGNNKNWSRLNEIENRKTIERVNKTKSWIFERSRKIDKQLARLTKEKQERKQVTHIRNEMGNITTDPTEIKRIIPEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLLKLTQTEVEQLNKPITKEDIEKVI	113718	117773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_+_114438_114976
930696	contig_9485_pilon	-	1684	2	Intergenic	novelGene_103113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	60	junction_1	0	18	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGCAACTTGAAAGATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262243	259217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9485_pilon_-_260835_262176
930697	contig_5981_pilon	-	1568	4	Intergenic	novelGene_35504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	529	1098	37888	30157	FALSE	30	CAGTTAGTACACATACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRHSSWMADNQPGNRGGQVHLRTCLRHLLMGTLHSGAVVAAALLVRAVIIGFAPLAASRAPSAIELLKLYLLCVSNDVRNFWSRRQKVFEFRELVGVDPVVFRKLYVKLYVEITLFKGITILWHSFTSNYTDTSWFDYFARGVLHHNLTGIEVLKCELEPTQSLSEPDLVWHVQIVPISLEHLMFLLL	38416	29686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_-_30176_34580_34726_35627_35758_37612
930698	contig_8354_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_24167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGACATGAAAATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	594333	592325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_592300_594300
930699	contig_11338_pilon	-	1390	8	Intergenic	novelGene_6345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	292.7928152347	3	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	300	701	319426	298853	TRUE	40	TTGATTCAGGGGCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEP	323315	294811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298856_315555_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
930700	contig_9839_pilon	+	2521	1	Intergenic	novelGene_88519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCCCCAAACAGAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47005	49526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_47000_49500
930701	contig_9440_pilon	+	2104	1	Intergenic	novelGene_59049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1295	1633	466143	466481	NA	25	ACCTGGGGATATACTGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTKRYHYTPLECLKCKKLTIPSIGKAAKELELSYTAGGNAKWCNQFAKWFGNLFKSETYDPIILFLAIYLREKKAYIHTKSCIPMVIATLITIANNRTQPNVHQQVNG	464848	466952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9440_pilon_+_464800_467000
930702	contig_6946_pilon	-	2347	1	Intergenic	novelGene_59760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	95	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATAGTGGTGATAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135746	133399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6946_pilon_-_133400_135700
930703	contig_16411_pilon	+	4384	2	Intergenic	novelGene_77265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACCTGAAGGAAACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10084	14514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_14094_14139
930704	contig_18081_pilon	+	709	1	Intergenic	novelGene_23823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTTTTTTGAGATATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194080	194789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_194100_194800
930705	contig_1082_pilon	+	860	2	Intergenic	novelGene_170420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGAGATACTAACTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11413	12726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1082_pilon_+_11598_12050
930706	contig_5005_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_84335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGACCAATTTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629245	630703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5005_pilon_+_629200_630700
930707	contig_18189_pilon	+	3306	2	Intergenic	novelGene_170759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	147	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAAAAATTAGAGCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55962	59649	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18189_pilon_+_58653_59033
930708	contig_15025_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_155979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	413	802	55151	54762	NA	65	GAAAAAAAAGACCAAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAMYEPILAATVTIHLIDSLPLFVDPYFTKHDVLLQRLVPLDTCPKYLKQNLTTFASKEHSGYTSSKTDLFLLLAVHDIFNILHQHHNSNDSILLRSSLLTVQLSHAYDNTNGLGQVHFSPQSDISAF	55563	53432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15025_pilon_-_53400_55600
930709	contig_17144_pilon	-	2807	14	Intergenic	novelGene_29475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_2	2358.34918945611	1	111	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	1439	2521	170784	166363	FALSE	30	CTTAAGAAATTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179783	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174876_175001_175973_176271_179700
930710	contig_6509_pilon	-	1203	5	Intergenic	novelGene_145631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	143	junction_1	44.6563265394725	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1056	146	1201	78389	73428	FALSE	65	AAATAAAGTGAAAAAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLSGIRAGYPLSERQQVALLMQMTAEESANSPVDTTPKHPAQSAVCQKGTPNSASKTKDKVNKRNERGETRLHRAAIRGDARRIKELISEGADVNVKDFAGWTALHEACNRGYYDVAKQLLAAGAEVNTKGLDDDTPLHDAANNGHYKVVKLLLRYGGNPQQSNRKGETPLKVANSPTMVNLLLGKGTYTSSEESSTAESSEEEDAPSFAPSSSVDGNNTDSEFEKGLKHKAKNPEPQKTVTPVKDEYEFDEDDEQDRVPPVDDKHLLKKDYRKETKSNSFISIPKMEVKSYTKNNTIAPKKAAHRILSDTSDEEEVNVTMGTGEKLRLSAHAVLPGNKTRESSNSKQQKE	78534	73425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6509_pilon_-_73889_74356_74505_76420_76564_77879_78084_78289
930711	contig_14513_pilon	-	1231	2	Intergenic	novelGene_70296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	184	537	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMSLIYPVLSKEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12185_18729
930712	contig_6740_pilon	+	2385	1	Intergenic	novelGene_142706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGAGTGGGGTGCAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660783	663168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_660800_663200
930713	contig_4736_pilon	-	2435	1	Intergenic	novelGene_168629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1744	2088	253041	252697	NA	25	GTCAGGAAATGTGTGTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKASKQDGRNTVTIPKELVDVQPFQEVAYDQEQMVLKEEVQAALEALAKNKASELTEYQPRCFNKRMQHWKHSLIYAKKSGRQLPGQSTEEIHICPFQRKVIQPNAEIIKQYH	254784	252349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4736_pilon_-_252300_254800
930714	contig_11338_pilon	-	1208	3	Intergenic	novelGene_6349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	558	junction_2	53	23	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299456	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907
930715	contig_5039_pilon	-	3141	3	Intergenic	novelGene_64984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1017.5	1	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	602	1806	1335	3140	1680376	1678571	FALSE	25	CAACCAGCTCCATGGACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALEHPVRALGLSETSDSPAVVLESPGVAMEVSEPQNLETLKPVTKTAELPAAGPSVISEQSERSVAVMLEPSMTKILDSFATAPVPATTLVLKSSEPVVAMSVEHQMKSVLKPLESTSPEPSKIMLVEPPVAKMLESTETLVDSSEIPAEVHPEPSTSTTVDFPESSAPEVLRLPEQPVEVPLGSAASSMTRPQELQELPKTTALELPESSVASVMELPGPPATSMPEMQGPPVTPVLELPGPSAIPVPELPGPPSTPVPELPGPPATVVSELPGPSVTPVPQLLQELPGLPASSVGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPVVTAAVELPGQPVVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTMEHPGQPEVTTATGLLRQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQSSVTGVPELSGLASATRALELSGQPVATGALELSGQLMATGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTVAQELPTTLVGETSVTVGVDPLMAQESHMLASNTMETHMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASNTMDSQMLASSTMDSQML	1687107	1678569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1680625_1682882_1683050_1686188
930716	contig_11422_pilon	-	632	1	Intergenic	novelGene_98960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_600
930717	contig_9011_pilon	-	2585	1	Intergenic	novelGene_159354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTCGAGTAGACAGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762647	760062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_760100_762600
930718	contig_9481_pilon	+	2950	2	Intergenic	novelGene_149623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	516	917	59201	59602	TRUE	35	GAGCATAGCTATCAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHGMTSGTSYMKKAKVIKKTEKKEKTKMDVRRDSEIALECRVAKVNRRNEVRELNRRFQRAARENKVKDYNETCKELELENQKGRTHSAFLKLEELKKKFKPRVAILKHSLGKKLNDAGSIKRRWKEYTVIV	58685	61832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_+_61441_61637
930719	contig_16310_pilon	+	1325	4	Intergenic	novelGene_70090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8087	junction_1	510.758259845105	4	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	39	389	285976	289698	FALSE	5	GCTGCCTCGAGCCTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEVGSGFRRGGNWELRTLAQVVP	285937	290634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558
930720	contig_7840_pilon	+	2137	2	Intergenic	novelGene_69006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAAAATGAAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278049	280620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_+_279672_280105
930721	SIRV5	+	778	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	180	0	180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	10	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8495	11866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV5_+_8586_10858_10992_11311
930722	contig_8357_pilon	-	4847	1	Intergenic	novelGene_39754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	147	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	2610	3314	776192	775488	NA	35	TTCCCTAATGGCAAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLARWNTQESNQLHLWREMMEKLSIISQNKARGRLRIRPSVTHMQVQTSPREPKYDLEYIPPEFRNHLKNRFDMLNANDQRPDELWNDIKDSIHEESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKLALEHLVAKAKGKNDEVKELNRRFQRAAREDKVKYYDDMCKDLEIENQKGRTRLTFLKLKELKKKFKPRVAILKDSTGKIIKRHRKHQKKMEGIHRITVPKRIGRRSTISGDNI	778801	773954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_-_774000_778800
930724	contig_15666_pilon	-	3207	4	Intergenic	novelGene_70125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_2	82.5631071766722	47	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	161	1126	110619	108530	FALSE	20	CACCTTCTGCACGACATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110779	106448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108859_109098_109378_109948_110246_110558
930725	contig_20951_pilon	-	426	1	Intergenic	novelGene_43068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGCAAGGAGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26985	26559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27000
930726	contig_8829_pilon	-	3872	1	Intergenic	novelGene_140943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	3136	3594	7002	6544	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSIVKGRKAPARLLHFSPLSRSRTLFYTHRSTWHSSVVEVDAHSINSSSLSITLRCLPRKYSKISPLPPLVMNVIKPSRTLTGFNIPDRGSLQLRRRSSLPMEYSQNGQGCGAPKDLCFVLFFICLLTFVEALRGTFPPSLIWFPRTGEKP	10137	6265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_6300_10100
930727	contig_14208_pilon	+	2256	2	Intergenic	novelGene_129102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAATGACAGACAAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242860	247503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14208_pilon_+_244870_247256
930728	contig_16119_pilon	+	4224	2	Intergenic	novelGene_164276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAATGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257761	262147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16119_pilon_+_258224_258385
930729	contig_1982_pilon	+	2337	2	Intergenic	novelGene_151308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATGTTTTTATATTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	99554	107860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1982_pilon_+_100266_106234
930730	contig_10489_pilon	-	2430	2	Intergenic	novelGene_165632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1364	2032	436273	435366	FALSE	85	AAATAAAAAAACAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQKQQSLLDHIEADHDGFSKLPKQGIRKFSGGRELLELLEVEYKRLIYRTLQEIRKQIRQNAEQAKERIDKTIEEFKIRDEHMTNLTGCKNPSRDSKQKSRSLTIKFQRIVEDLLAENFPDIMKDEKIPIQDAHRTPHKVDPKRKSPTHIITLAKTKDKERLFKSGWGLTKSHLQRRVNRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKAMKEKNYQPRIIYPAKFSQI	437636	434967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10489_pilon_-_435710_435948
930731	contig_17144_pilon	-	523	4	Intergenic	novelGene_29557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2999.43776212958	7	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	388	507	174965	166129	FALSE	15	CCTGTAATTTTGGTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFIPGNLHTLRMCSPTH	179755	166112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166176_174892_175001_175973_176271_179700
930732	contig_17144_pilon	-	839	7	Intergenic	novelGene_29481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1433.86510484386	6	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	265	795	45	839	172736	166078	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALVFL	173169	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166086_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128
930733	contig_4114_pilon	+	2403	3	Intergenic	novelGene_15600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGTTTAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289034	485278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_289409_289585_290770_484433
930734	contig_12605_pilon	+	634	3	Intergenic	novelGene_64189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	1	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	24	392	3897	4829	FALSE	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3873	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
930735	contig_6898_pilon	+	3569	14	Intergenic	novelGene_35702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2195.9531445406	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	577	1734	134	1867	59668	125646	TRUE	15	ACTGTGACTTGATCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IALTLERDPVRAPGPRARAVCTACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59534	127705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126520_126876
930737	contig_7207_pilon	-	3562	1	Intergenic	novelGene_72092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCTTGGCATAGACGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	713759	710197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_710200_713800
930738	contig_12547_pilon	-	2722	1	Intergenic	novelGene_179021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTGTGGTTTTAATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7273	4551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12547_pilon_-_4600_7300
930739	contig_833_pilon	-	2760	3	Intergenic	novelGene_176482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	210	530	202958	202638	TRUE	20	ATTATTTTTTTGATATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPISLLNLLELRGTLLTTITLCPTVQSNPCLKSWPQKLFYLWADRESGGHAFQGSSILRPLSLVILLESEFCTPPFSCSIRDSLLCSPSGCSLVVAGHHLVLLVSG	203167	200035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_833_pilon_-_200158_200437_202179_202270
930740	contig_4952_pilon	+	1202	2	Intergenic	novelGene_145520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAGCTAATGGTTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	351841	354014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4952_pilon_+_352798_353768
930741	contig_6724_pilon	-	2043	1	Intergenic	novelGene_167982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACAGGTCTACACAGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375758	373715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_373700_375800
930742	contig_17274_pilon	+	1167	8	Intergenic	novelGene_26515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	73.5157903349439	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	752	1165	122016	124406	FALSE	20	GGAAGTATTTGCTCTTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHPTCGSWTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLKCEFLLLKVYCCSESSFFANIPYYYYNREDSQVLKEPMWLNKIKKRLNEKGYHQVGGFVQDMRLIFQNHRASYKYKDFGQMGLRLEAEFEKNF	118098	124408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122042_122741_122851_123129_123208_123427_123572_124349
930743	contig_720_pilon	+	2974	2	Intergenic	novelGene_155173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	103	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	1014	1757	240795	241538	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLINNFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFREEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYRSDKGLISIICKKIQHL	229851	242755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_720_pilon_+_230389_240318
930744	contig_5452_pilon	-	765	1	Intergenic	novelGene_101019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGCCCTAGAGAGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453198	452433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_452400_453200
930745	contig_8377_pilon	-	1838	17	Intergenic	novelGene_35083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.45236875482778	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGCTGCTGTGTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180499	131523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143589_154870_154990_161224_161297_164299_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179663_180381
930746	contig_253_pilon	+	3264	11	Intergenic	novelGene_129757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	163	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	1748	2134	705264	707497	TRUE	25	GAACCTCCCTGAGCACCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVQLRSRLTGCLLMMPLRAWGTIALHLLKSIFVQSLLSQHLFIPRLAHAHTFTKFSAAEIAEDRHPDLPLHPALVSVLSPTAPAVQPGHTPLLCTVIVLLRLLLVLLLCPQPLLFPALGGSGRTVLH	702011	716713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_+_703050_703115_703412_703699_703906_704483_704649_705221_705389_707235_707928_709852_709939_711529_711652_712423_712694_714364_714449_716575
930747	SIRV3	-	980	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	1486	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	22	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTACCATGTAATGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	7273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
930748	contig_6047_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_24240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	265719	265136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_-_265100_265700
930749	contig_6557_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_33027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTTAAAGCCATCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	632287	633509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_632300_633500
930750	contig_8330_pilon	+	1722	1	Intergenic	novelGene_71903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	31	348	1151913	1152230	NA	20	AGTCTTGTACATAGGGTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDVISRSVVRGVSSGVWPVPSMYIYTHIYGHSGKAHCLLWILHPACHHLVPSSWDLSQQTAILSDDLGIRQPPQPVSQQPAVLPADLGFVSPCSYMSQEKLPS	1151882	1153604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_1151900_1153600
930752	contig_6898_pilon	+	1899	3	Intergenic	novelGene_35788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125484	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125659_125910_126711_126779
930753	contig_3018_pilon	+	2143	16	Intergenic	novelGene_78832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	1755	2141	600066	625094	FALSE	20	TCGCTCTGGGAAAATGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMLMTFASGKFDYYGVLCIGIQNTGACQPQCSLQTSKCIHKSCDVHTADTRTPVICSTPRESLHTSAIRGPPIAVTADSGPGSTHPVSQQERRGDGDAALSVYTPSVTAPELRHSLRLGPLRPLSVTA	550961	625096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_551009_561477_561580_562782_563044_566733_566846_567964_568081_569956_570088_570203_570434_572320_572360_576712_576887_577774_577838_580097_580175_583417_583647_585062_585179_600008_600196_624774_624900_624962
930754	contig_18715_pilon	-	2232	1	Intergenic	novelGene_122998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAATAAAATAAATTAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321709	319477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18715_pilon_-_319500_321700
930755	contig_17144_pilon	-	3185	17	Intergenic	novelGene_29477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2032.20606634607	3	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1309	2256	173384	167839	TRUE	30	CTTAAGAAATTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALGKGRQGLGREGCWEGTPGAPHKDSPF	183351	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166587_166762_166843_167248_167331_167581_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172590_172670_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
930756	contig_7587_pilon	-	4573	4	Intergenic	novelGene_163718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1046	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	762	1133	246793	246422	TRUE	20	CAGGCAACATTTTGTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	247554	219534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7587_pilon_-_220013_230263_230583_231364_233093_245506
930757	contig_12312_pilon	-	1411	1	Intergenic	novelGene_63937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	306	329	214932	214909	NA	30	TGATGGAGATGTTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215237	213826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_213800_215200
930758	contig_5571_pilon	-	908	1	Intergenic	novelGene_75522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAAAACTGTGAGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179059	178151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5571_pilon_-_178200_179100
930759	contig_8452_pilon	+	4559	3	Intergenic	novelGene_47996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	326	146	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3474	3857	304209	304592	FALSE	25	CATCTATAACGCCATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVSCALEKNVYFVAVGWSVLYMFVRSSWLIVAFRSSVSLLSFFYRCSFTESGVLKSSTIIVELSISLFSAVRVYVFWSPVIGCVDIYYGYVFMVDCPFNHYIMPFLVFYGGFCFKVYFTCD	178254	305294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_178757_179017_179948_302167
930760	contig_1076_pilon	+	1043	1	Intergenic	novelGene_101152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1057240	1058283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_1057200_1058300
930761	contig_10482_pilon	+	568	1	Intergenic	novelGene_152838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGGTTTAACTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126673	127241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_126700_127200
930762	contig_9406_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_136185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGGCAGACAATCCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438104	436348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_436300_438100
930763	contig_13863_pilon	-	1537	5	Intergenic	novelGene_42041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAGTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116837	105285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_105568_110550_110639_113947_114323_115311_115379_116112
930764	contig_20951_pilon	+	2091	1	Intergenic	novelGene_43134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	14	307	311268	311561	NA	30	AATAAGTGGTTTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERSPMSAVNVGNFSPRTHALLYTRELIWERDPMNALTVGKLSPRRQISLDTTEFTLGINSMDEVRENIRQEVTVHLEMKNFGYSEYGRAFSRKSSATVCRD	311254	313345	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_311300_313300
930765	contig_6631_pilon	+	1566	1	Intergenic	novelGene_174297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCCTAATAAGACCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1050580	1052146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6631_pilon_+_1050600_1052100
930767	contig_5765_pilon	+	1169	1	Intergenic	novelGene_141363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGCTGCTAACCAAAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397567	398736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5765_pilon_+_397600_398700
930768	contig_18511_pilon	+	1868	10	Intergenic	novelGene_126882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	331.950725184653	6	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	99	662	47371	51984	TRUE	65	ACAGAAAAGGAAAAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASEIHMPGPVCLIENINGKLTANQTALKILSAVKQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPNMPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWITMFPWQLC	35473	59229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_47350_47561_48082_48211_49187_49298_51672_51780_51955_52462_55272_55554_55976_56134_56905_57119_59151
930769	contig_7171_pilon	+	3296	6	Intergenic	novelGene_101346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	70.2071221458336	6	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	4	507	1301684	1307418	TRUE	30	CCTCCTTAAAAGTGGGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMAVAAAASRGLWGLVTRRFLAPTQPGLTFSLPPMSSTVQDEASKAAPVEAPGHSYQSLRVTSGPEHILHVQINRPEKRNAMNRAFWREMVECFNKISEDASCRAVVISGEGKTFTSDPSGKEESFQFFILWGLACCCDAGSYATDIQMPAGSPMVDRFQLSFQTKTD	1301680	1558341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_+_1301736_1302170_1302379_1302523_1302613_1307263_1308564_1494738_1494832_1556790
930770	contig_2636_pilon	-	2940	2	Intergenic	novelGene_52094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	16	372	69362	69006	TRUE	30	TTTGCTGGGTATAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LISTFMALWSEKMLCNTLMLWILLRLALWPNMWSILENVPCALEKKVYLAAVGWSVQYMSMRSSWLIVAFRSYVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPATIVELSISLFNGVRVCCMYFGALSLGA	69377	64916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2636_pilon_-_66848_68368
930771	contig_12080_pilon	+	5419	26	Intergenic	novelGene_128345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	54	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2786	3235	107843	108292	TRUE	0	CCTCGTCCGGGCTCCGGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELGLQELQIQRAEVEAYPFQVEVGEYQGLQEKEGVEGFQDHQEEGEGEGAFLVLQAREEVGGCQYPQAGGEVGVYKYFQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVEGCPQPQAKEGVGGCQYLQVKEGVGEWQYFQVKKGVGGC	45197	164175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12080_pilon_+_46055_46577_47139_54876_54966_56921_57058_57181_57346_57913_58039_58754_58891_58991_59225_59436_59539_59881_59977_62605_62713_106793_106911_107779_108589_109502_109685_110388_110454_111359_111476_112085_112203_112891_113015_113196_113300_114210_114320_115726_115871_116525_116609_117724_117810_118006_118606_120731_120852_164133
930772	contig_9955_pilon	-	3329	3	Intergenic	novelGene_21294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1051	junction_1	484.5	10	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	542	1234	49296	47546	TRUE	15	TATTTTGGTGTCACTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49837	44886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48794
930773	contig_9706_pilon	+	1039	1	Intergenic	novelGene_20877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGGATTTAGGTTAGCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2952	3991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3000_4000
930774	contig_12120_pilon	+	2309	2	Intergenic	novelGene_21419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAGGTCGAGAAGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53549	95201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12120_pilon_+_54103_93445
930775	contig_11328_pilon	-	3593	8	Intergenic	novelGene_88447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1967	2296	840232	839645	TRUE	5	GTCCAGCGCGGTGTTCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYTSFGDPKNHFPGLQHAISSVCNTVVSCCQVHSSSWRCQVFRELLHNTWGCHESELSRWQWAWFFGLSLWLALSLLGSHLTHPPYSKAELGTFSIYSPSICHTNTQMA	842198	829358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_829425_830563_830620_830708_830906_833268_833350_836364_836680_837924_838109_839246_839833_840090
930776	contig_1275_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_108807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGATAAGTTGTTGATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	569361	571168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_+_569400_571200
930777	contig_13876_pilon	+	2712	1	Intergenic	novelGene_174243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	167	504	28	531	35214	35717	NA	30	TCACAGACTTGAATCCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLKKTKYNEMCKDMVLENQKGRTPLAFLKLKELKEKLKPRVAVLKDSMGKKLNDAGSIKKKVEEYTESLYQKEMVDIQPFQQVPYYQELMVLKEKVQAALKALAKNKSLGINKIPIKMFQQIAATLEVLICLCQEIWKTATWPANWKRSIFMPIPKKGDPTECGNYRPVSSISHAR	35186	37898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_35200_37900
930778	contig_20026_pilon	-	2504	2	Intergenic	novelGene_175416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGATTGTCATATACAATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93757	91085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20026_pilon_-_91261_91428
930779	contig_10930_pilon	-	1959	6	Intergenic	novelGene_37017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	183	1163	278514	268388	FALSE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIINIIPTWCTIQRENWWHVTISPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279109	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276897_278443_278637_279049
930780	contig_5574_pilon	-	5848	4	Intergenic	novelGene_155831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	600	1064	100360	99896	TRUE	55	GAAAAAACAGACCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGRSPLAFCFPQSWKLPRSPESQCLTQAHLLGTATSALCHTLLLSKGTFPDCLPDITPAPSPMPTHSHYLGLLSLSLIAPTTMSVLISSCLLLCPQLKTKPTAIELIPTHSDPIGHSRTVPWGFQGCNLYGSRLPHLSPLELLVGLNHQPFG	100959	69803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5574_pilon_-_70375_70556_70642_70815_70989_95940
930781	contig_2798_pilon	+	2455	3	Intergenic	novelGene_120038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	101	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1274	1618	129737	130081	TRUE	45	AATGATTTCAAACACACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETFIPFQVVLELFLLLESHLVFYFGCLLKPSCPVFVYVLILSAVFRTFSSYFLHLLIVVLSVSPAFLFYLVMSEQAACAFFVVCSSVGMILFTSLSNGLGQSLGYGAAGQVQ	128463	193500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_+_130576_170381_170518_193293
930782	contig_17274_pilon	+	3168	3	Intergenic	novelGene_26546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	527	junction_1	185.5	8	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	62	406	162087	162431	TRUE	65	CTAATAGAAAAGACAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKNGASGLEEDSLTTCDMQMTQPLLAESEEDLKHLLVKIKDHILQYGLHLNIKKTKILTVGPITNIMINREKIEVVKAFILLASTVNTHGSSSQEIKRRIALGNLLQKTSLKC	162025	167868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_163980_165066_165236_166823
930783	contig_2577_pilon	+	2163	1	Intergenic	novelGene_172053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAAGCAAAGATTTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94323	96486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_+_94300_96500
930784	contig_12746_pilon	+	2339	2	Intergenic	novelGene_152187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAAAACTACAAGGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	547306	553893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12746_pilon_+_548048_552295
930786	contig_15360_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_171265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	481	837	217256	217612	NA	70	TTACAATGACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPGLAPCRKTNSKWIKDLNVLTKTRKFLEEQAEATLAGLVFNSGLFDVITKAQTAKDKINKWDLIKIKNFCSSKNFTKKVKRQASNQESIFGNDISDKNLITKIYIKLRQQQRDK	216775	218784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15360_pilon_+_216800_218800
930787	contig_1694_pilon	-	3428	2	Intergenic	novelGene_144987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	251	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAGAAAAGAAAAGAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1670294	1666691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1694_pilon_-_1669045_1669219
930788	contig_1275_pilon	-	1001	1	Intergenic	novelGene_108776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	182	546	455	1000	438729	438184	NA	50	CCAGATAGAATACACAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLHIDILGISELKWTRIGHFELNSHMVCYAGNDSLKRIGFRFIVKKNISRSVLKYNAVSDGIIPICLQGRPVNTTIFQIYTPTTKAKDEEIEDFHQLLLSEIDGTWNQDALIMTGDWNGKVENKEGSVVGKYGLGDRNDAGDCMIEFGKTNDFFIADTFFHQHKWQLYTQTSPGRIHMNL	439183	438182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_438200_439200
930789	contig_7322_pilon	+	3005	5	Intergenic	novelGene_164904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	104	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	1555	2013	292766	293224	FALSE	40	AGAGACTAACTTGAACTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQINTTMRYHLTPTRLVLIHKTQNNKCWRGCGETGTLVHCWWECKTVQPLWKLIWRFLKKLEIEVPYDPAIPLLGIYLREIRAVTPIDICMSMFISALFTIAKRWKQPRCPSTDKWINKLWYIHTREYYATIKNNDESVKHNMEESGNHYAE	97374	294216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7322_pilon_+_98711_195460_195468_198180_198290_198744_198822_292740
930790	contig_821_pilon	+	1463	1	Intergenic	novelGene_149419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACTAAAGAAAAAATTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	278109	279572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_+_278100_279600
930791	contig_5484_pilon	-	2114	1	Intergenic	novelGene_151092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAGGCGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218723	216609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5484_pilon_-_216600_218700
930792	contig_4426_pilon	+	2077	1	Intergenic	novelGene_15357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	1527	1931	49543	49947	NA	50	TATAGTGAAAGATAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMVSASDQNKESKNLPEEENFLELPEVEFKRLIYRALQEIRKEIMQNTDQAKEHTEKATEELKKIIQGHNGKESLERQKTEIQKINNKISELDNSIESHKSRTEAMEVRISETEDKALDTNLFEEKSDKRIKNK	48016	50093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_+_48000_50100
930793	contig_4968_pilon	+	1244	1	Intergenic	novelGene_177568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	218	657	101	757	155359	156015	NA	60	AAGCAAAAGGTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPLPLAVYFCKKLGSENFMNSSRTLSDIALEDEPLRLEGAQNTTGEELLPQSRVDLNDVVGVKLLGPSFADVAQLKMRRKSCKHPLVTGTWNVRSMNLGELEIVKNEMERIKIHILDINELRLTDTGHFELDNHMVYYTRNDKLKRNNITFIVKKNISRPILKYNPVSGRIIPVCLQGISVNMTIIQTYATTANAKDEEDFYQLLESEIDQTCNQVR	155258	156502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4968_pilon_+_155300_156500
930794	contig_5918_pilon	+	814	1	Intergenic	novelGene_99547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAATCAAGGGGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	746089	746903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_746100_746900
930795	contig_16148_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_50386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	1204	1674	142995	143465	NA	60	AAAAAAGCATCTTACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPQTHPNSLRNQTAGQKTVGTWSQGTSSSTGITVYKGMFYILHSTLVSSHLRYSTGLTPSGARENEENKIQGEDQSKGLMDHNYHGLHQTESSTTRWCLATTDCSDQDHNRGSQTELEKNVEQNSNSQKKTRLTGLTATGETPKVWPPDTLLAQ	141791	143711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_141800_143700
930796	contig_15092_pilon	+	1344	1	Intergenic	novelGene_57826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATAATGTCAAATTAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346204	347548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_346200_347500
930797	contig_17144_pilon	-	2142	11	Intergenic	novelGene_29521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	211	junction_7	2022.81224042174	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1144	1863	167982	166363	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173611	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580
930798	contig_11572_pilon	-	1064	1	Intergenic	novelGene_100043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	6	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	344	667	201929	201606	NA	35	TTGTATATACAGCATGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWHFLRKLEIENLYGPAILFLGIYPREIRAITCIDICTPVLIAALFTVAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYTVIKDNDEPVKHLITWMNLEGIMLSEISQL	202272	201208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_-_201200_202300
930799	contig_5779_pilon	+	5732	2	Intergenic	novelGene_106513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	363	662	256420	256719	TRUE	85	AGGCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILSINAEKAFDKDQHPFMIKTLNKIGTEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPLRMGTRQGCPLSPLLLNIVLEVLARAITLEKEIKSIQIGRE	256057	293325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_257225_288760
930801	contig_7914_pilon	+	1947	1	Intergenic	novelGene_165021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAAGCAGATTGCCCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106460	108407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7914_pilon_+_106500_108400
930802	contig_9112_pilon	+	1562	4	Intergenic	novelGene_60206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	847	junction_2	194.18605053459	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	234	1085	108641	114303	FALSE	90	AAAACAAAAAAAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHQRTHTGEKPYRCSWEGCEWRFARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL	108407	114780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112128_113625_113750_114251
930803	contig_18055_pilon	+	1610	14	Intergenic	novelGene_117810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	390.953151750827	1	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1047	563	1609	77213	85618	FALSE	55	CTTTAGAAAAGGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIR	40656	85619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40737_41921_42054_59718_59800_61361_61397_73607_73719_75199_75321_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605_84757_85571
930804	contig_10958_pilon	+	2428	5	Intergenic	novelGene_5410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	7	134	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	888255	894000	TRUE	15	TTACCGCTTGATTGCACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888221	901582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894279_895264_895855_900457
930806	contig_14970_pilon	+	1777	4	Intergenic	novelGene_45085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	11938	junction_1	313.080749257369	5	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACCTTAACTCTTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215942	232240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_216674_221180_221253_224295_224375_231345
930807	contig_11416_pilon	-	593	1	Intergenic	novelGene_145356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTATTTAAAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348621	348028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11416_pilon_-_348000_348600
930808	contig_1210_pilon	-	5487	3	Intergenic	novelGene_171516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	126	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	586	963	271524	271147	TRUE	45	AAATAAGTATGTATTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITVYYEKLYSDKFENLQKMDIFLETHYLPKLTQTEVEQLNKPITKEEIEKVVKKLPTTTTKSPGPDGFTGAFYQTFREEITPLLLKVFQSIEKDGILPNSFYEASITLIPK	284720	262679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_263944_267886_271532_284142
930809	contig_8898_pilon	+	1382	1	Intergenic	novelGene_137241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGGTTGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	282514	283896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8898_pilon_+_282500_283900
930810	contig_2689_pilon	+	3491	1	Intergenic	novelGene_100816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTTTTTAATAGACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121012	124503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2689_pilon_+_121000_124500
930811	contig_10642_pilon	+	4215	2	Intergenic	novelGene_78645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2744	3109	114163	114528	FALSE	30	CCTCAATGAGGTGAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKTLNNTGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPFQEVAYDKELMVLKEEVQAALKALVKNKVPETDEIPIEMFQQTYAMVEVLALLCQEIWKTSALPTDWKRSIFVPIPKKSDPTEIIKQYH	49080	115634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_+_51824_114162
930812	contig_15732_pilon	+	701	1	Intergenic	novelGene_88857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGACATAAAGATCTATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51208	51909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_51200_51900
930813	contig_6102_pilon	+	2588	19	Intergenic	novelGene_31894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	433.726249927928	10	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	71	1831	373473	394507	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	373402	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378995_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
930814	scaffold_2602_pilon	+	2905	17	Intergenic	novelGene_127689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	243	junction_1	465.455048682201	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	722	2169	137	2305	25608	68818	FALSE	40	AATAAACAATTCTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRCEARGPADGLTDGPVLLLPRLRRPRESRRSGGCGSSSGNRRGAMAADSREEKDGELNVLDDILTEVPEQDDELYNPESEQDKNEKKGSKRKSDRMESTDTKRQKPSVHSRQLISKPLSSSVSNNKRVVSTKGKSVTEYKNEEYQRSERNKRLDADRKIRLSSSASREPYKSQPEKTCLRKRDPERRAKSPTPDDSERIGLDVDRRASRSSQSSKEEVNSEEYGSDRETGSSGSSDEQGNNTENEEEGVEEDVEEDEEVEEDAEEDEEVDEDGEEEEEEEEEEEEEEEYEQDERDQKEEGNDYDTRSEASDSDSESVSFTDGSVRSGSGTDGSDEKKKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRRRPEDYDIHNSRKKPRIDYPPEFHQRPGYLKDPRYQEVDRRFSGVRRDVFLNGSYNDYVREFHNMGPPPPWQGMPPYPGMEQPPHHPYYQHHAPPPQAHPPYSGHHPVPHEARYRDKRVHDYDMRVDDFLRRTQAVVSGRRSRPRERDRERERDRPRDNRRDRERDRGRDRERERERLCDRDRDRGERGRYRR	25471	69418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_25636_36849_36952_37302_37632_37742_38152_44015_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_56687_56771_57959_57997_58092_58133_58241_58305_65344_65480_68593
930815	contig_12605_pilon	+	1125	4	Intergenic	novelGene_64187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	380	955	4816	6048	FALSE	40	GAGGAAGAAGAGCTCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWGKRGRGRSFFSGKA	3872	6218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
930816	contig_8581_pilon	-	3356	18	Intergenic	novelGene_22820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	532.972346835508	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	706	2121	43	2163	386058	312538	TRUE	25	GACTCGAGTCATGTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIAAQLLAYYFTELKDDQIKKIDKYLYTMRLSDETLLDIMARFREEMKSGLSRDSNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVDHEQHQNVRMESEVYDTPENIMHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKKKIKDKKLPVGFTFSFPCRQSKIDEAVLITWTKRFKASGVEGADVVKLLDKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRYIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYIGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEMNKEGLHNAKEILTRLGVEPSHDDCISVQHVCAIVSFRSANLVAATLGAILCRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIQETLAHFRLTKEMLMEVKKRMRDEMELGLKKATHEKATVKMLPSFVRSTPDGSENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNALPGADL	386100	306339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312483_312561_314673_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016_324166_326006_326312_327807_328042_329826_329983_339264_339449_339553_339654_340261_340358_344625_344746_353025_353175_366650_366814_385995
930817	contig_7396_pilon	-	2836	16	Intergenic	novelGene_79564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3104.42903965	3	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	204	1592	255163	246442	FALSE	20	GATATGGTGCGTGCCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257472	245197	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
930818	contig_6871_pilon	+	2199	2	Intergenic	novelGene_21555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	66	junction_1	0	4	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	214	1161	134070	135017	FALSE	5	CGAGTGTGTTCTTGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEPPARTQGHPAQISCVVSAAQRVSWTWVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121896	136055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_133940
930819	contig_10252_pilon	-	1636	1	Intergenic	novelGene_162913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATCACTGGCCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84473	82837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10252_pilon_-_82800_84500
930820	contig_17144_pilon	-	2735	14	Intergenic	novelGene_29474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1819.97983927971	2	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	493	1482	394	1875	174965	167343	TRUE	30	CTTAAGAAATTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALALT	179761	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167354_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
930822	contig_17427_pilon	+	2212	11	Intergenic	novelGene_30373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGGAATCTTCGCGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177024	204713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_178130_178683_178824_179136_179224_179351_179475_179656_179845_181271_181366_184495_184613_186417_186495_188037_188139_188766_188892_204658
930823	contig_11816_pilon	+	1379	2	Intergenic	novelGene_98576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTAAAAATGAAATTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1299270	1307137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_+_1299287_1305774
930824	contig_3095_pilon	+	1234	5	Intergenic	novelGene_75034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3097.12482594745	3	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	203	826	149709	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149651_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930825	contig_3529_pilon	+	2666	8	Intergenic	novelGene_105398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	93.8781233345465	1	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	77	715	790486	806158	TRUE	20	TTTTTGAAAGATGTGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKETPPPLVPSAAREWNLPPNAPACMERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEVRQLLPLPFPLLNHTQALQRPKTT	790409	810485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806844_807636_807746_808481_808551_809397
930826	contig_12079_pilon	-	4049	12	Intergenic	novelGene_67432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1522.61219646581	6	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	466	1194	600692	585216	TRUE	15	TGTGCGGAGGCTCATGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRYRPSLETTTKRYTSLGTSAPSAWSPKVDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKGEGRTLGWGC	638836	579723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582170_583662_583756_584142_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598146_599463_599543_600607_600885_601782_601831_609189_609274_638695
930827	contig_15087_pilon	-	2474	25	Intergenic	novelGene_37201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	995.401927998881	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	529	1590	101	1690	158925	118167	TRUE	30	GTAAAATGAGTGACGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAARLTGSDSASSDASISQSVCQSASVKEPETMAKPAQGASYRGSIHDFPNFDPNQDAEMLYNAMKGFGSDKEAILELITSRSNRQRQEISQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPLAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEILASRTNQQIHQLVEAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREKDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQHLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRWELSGDFQKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEKSLYSMIKNDTSGEYKKALLKLCGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVSRVELKGTVHPAGDFNPDVDAKALRKAMKGIGTNEDTIIDIITHRSNAQRQQIRQTFKSHFGRDLMADLKSELSGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKTLIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGNREEGGEGRDQAREDAQGLCRK	181166	110647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_111066_113390_113514_114530_114591_116811_116908_118079_118185_126037_126092_126681_126762_127598_127690_132609_132724_133432_133528_134811_134894_136585_136665_138314_138374_139527_139651_141727_141787_143036_143133_144010_144105_145209_145267_146896_146977_147978_148070_148982_149097_149621_149717_150480_150572_158907_158948_181088
930828	contig_6612_pilon	-	2314	11	Intergenic	novelGene_148160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_5	186.851384795511	40	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	673	2022	34	2055	72592	16917	FALSE	10	ACCTTCTCCCCCGCACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEYNRIQIADLMEDKFQGAACLDTLIELFQDIEDLKDLAKTLKREKIKVEKKIKLKRTPVKNRKQETTSSATPAPTTSKAPTSERAEDTPAGQKRKSTTKEKPGTKRNKASQEQNQTPCPSAASTSVTTGHPPPPQISSSTPSSTSLPEEEGERGVASTSVQNQRSKAAARKGVLQKNPMTVMVLSATKPFEYESPEKGKNTMFHATVITESKYFQVKVFNTKLKQKFTRKKVITISNYFQYKGILEVNEASFVSEAGPDQKIDVSKNSIRKAKKTPNINTLHKEASGNVYGLFTLHKKTVNKKNTIYEIQDRTGKMIVVGKGKCHDIKCEEGDKLQLFCFRLRKTDQGRKLTSENHSYIENMKTTSTQASDSKGMNLPQKQHQLPQTVVYIPPPSMSLPQPPQMLLLTPPNSSLNQKMKDTVAQTDVKRMKLPQEQYQLPQTLMTITPPPKNSLQPPQMFLLTPSKSSLTEKPILKTEPKEASREEGVQRGPKKVMVLKATEPFVYDYGKEERKMFHATVATESEFFRVKVFDISLKEKFIPNRVIAISNYVGRNGFLEVYRVSSVSNLNADQKMDISSTLIANANATPKISHLCLQVQGTFVNGVFKVHKKRVVEKHIFYEIQDDTGKMEVSVFGQLTRIKCEEGDECQFICFELESNEERRQLKSVLHSFIKVIKTKEHNK	72625	16657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6612_pilon_-_16947_19327_19517_21399_21820_36288_36454_46708_46877_61951_62141_64167_64576_67224_67264_67488_67657_71390_71525_72480
930829	contig_7728_pilon	-	1359	2	Intergenic	novelGene_64719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	591	1028	745827	745390	FALSE	65	TGAAAAAAAAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSSMHIIITVSKIKDRQRILRAVHEKQEVRYRGQTITLSSDYSAETMEARRQWDDIYKTLKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDDEIRTFPDNQKLREYVKTKPNVQELLKGVLGSENKQLQLTGRI	748412	745058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_-_745881_747875
930830	contig_8505_pilon	-	1498	1	Intergenic	novelGene_173190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGGATAGGAATAACAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85218	83720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8505_pilon_-_83700_85200
930831	contig_17144_pilon	-	2374	14	Intergenic	novelGene_29447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2185.36322790282	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1370	2086	167982	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183206	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166840_167248_167331_167581_167676_167918_168092_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173188_174933_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
930832	contig_8291_pilon	-	2082	2	Intergenic	novelGene_99946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTTTGGCTACGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268841	239590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8291_pilon_-_240085_267253
930833	contig_13331_pilon	-	1851	1	Intergenic	novelGene_178780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCACCAGTTTTGGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4980	3129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13331_pilon_-_3100_5000
930834	contig_9843_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_114315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACAGTTCTGTTATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40838	41885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_40800_41900
930835	contig_11574_pilon	-	2114	9	Intergenic	novelGene_64095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	325.979653314436	2	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	540	1967	454111	449890	FALSE	45	AGTCATCAAATTATAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463682	449742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_456375_456544_463479
930836	contig_11968_pilon	-	2264	1	Intergenic	novelGene_172503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	197	559	10024	9662	NA	45	AGCCTTAAATAAAATGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIQYSLPTITVRMHQFFFFSFFIIQLSHSYEAIENTMAQVRCPLVIKVTSLLFNTLKKSFAADLPNAIHCLISSVLLPWMLIVDPSRVKSLTSLVSSSFVSDIVYWSSCDDFCCLHIQV	10220	7956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11968_pilon_-_8000_10200
930837	contig_7695_pilon	-	1403	2	Intergenic	novelGene_41581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	229	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	243	884	390227	388811	FALSE	20	CTACTGACCACTGATGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYSAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATNPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASLGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM	390469	388291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_389019_389793
930838	contig_13680_pilon	+	2759	2	Intergenic	novelGene_149573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	44	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	208	699	214200	215269	FALSE	40	AGAGTAGAACTACCTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCGSAILDSYRRPANGVRESSLTERLAGDKTTGNLRYTVSQPPTLLHPHSASCASRGHNLLSGKHQLLGFHTSEWAGSLSAICWLLVLLLFPLLLISSLPLTTSPSFHSNTWLRAPSLLLPEGLVLLHCSVSRLSLSSFSFCSLNTWSCIPLGLLARLYCNT	213992	217329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13680_pilon_+_214575_215152
930839	contig_10930_pilon	+	527	3	Intergenic	novelGene_37047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGGCTGAGTGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272919	276785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_273013_273952_274324_276722
930840	scaffold_9100_pilon	+	1462	9	Intergenic	novelGene_83279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	568.503902801027	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	94	963	647136	654304	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644861	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653412_654231_654536_654582
930841	contig_9647_pilon	+	2220	4	Intergenic	novelGene_127382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGAAATGAAAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45761	48305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9647_pilon_+_46087_46154_46674_46735_47135_47328
930843	contig_6724_pilon	+	554	1	Intergenic	novelGene_167988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATCTACAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400350	400904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_+_400400_400900
930844	contig_12624_pilon	+	1963	3	Intergenic	novelGene_61078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	75	392	875135	875652	FALSE	65	ATTAATACAAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLEHWNWEEQGCQTLERFPGLLLRMDPQLNGFKVVAGNKPLLPVEHDRGPVIIPLLQDKDDVPWHDLELLWCLRYKLKPHTVSLPFQSPAGDQTRDPALSLDHIPSHDAMEQALWTWGQETQLQAPSAI	874072	877223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_874131_875118_875186_875385
930845	contig_4678_pilon	-	2913	3	Intergenic	novelGene_126047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	62	703	562186	561490	TRUE	35	ACATACCTTCCAGCATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKTNSKWIKDLNIKSKTVKIMEEKIGTMLGAIIHGINTIGTISNNAPAPEERLDKWELLKIKHLSSSKDFTKRVKRQPTDWEKNFGYEKSDQCLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWAKDMNRHFAKEDIQAANRHVKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTRNNKCWRGCGETGTLIHCWWEYKMLQPLWKSIWHFFKKLEIEAPYDPAIPLLGIHPREIRAVT	562247	558986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_559987_560279_561574_561628
930846	contig_8538_pilon	+	1895	1	Intergenic	novelGene_4654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	207	99	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	533	1602	224	1825	841460	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	841236	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841200_843100
930847	contig_1442_pilon	+	3129	8	Intergenic	novelGene_172171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGTGCCTACAAACATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	627941	651045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1442_pilon_+_630145_630208_630283_631652_631734_636533_636770_642281_642422_648722_648806_649511_649676_650897
930848	contig_3956_pilon	-	757	1	Intergenic	novelGene_14696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTCTTTTGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5165	4408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_4400_5200
930849	contig_1521_pilon	-	636	2	Intergenic	novelGene_145444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	467	junction_1	0	1	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGACCGGATGGGCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163892	160493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_-_160907_163669
930850	contig_6137_pilon	+	2052	10	Intergenic	novelGene_59271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1339.43731506467	2	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	163	1041	1336783	1353702	FALSE	20	TTCTCATATTAGTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1336220	1354713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1336315_1336714_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
930851	contig_16382_pilon	+	1391	1	Intergenic	novelGene_160229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCACTCTTCAGCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233491	234882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_+_233500_234900
930852	contig_14441_pilon	-	1218	7	Intergenic	novelGene_100560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	1	678	117797	116671	TRUE	10	GCAGTGCTGGCTGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLTCTAPDHGTDVLGDGLGPGLSPLVVGREPIELDLAAEVVAGIVPEGGRHSQAAAQAVAGVIGAGLQPRLGVRADPAEGHLAIHPPAQLHVVGVEAGG	117797	111196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111301_111345_111384_112110_112152_112399_112664_116577_116966_117218_117343_117538
930853	contig_1210_pilon	-	2195	1	Intergenic	novelGene_171522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	25	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTAACCGTAACCCTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	292550	290355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_290400_292600
930854	contig_15407_pilon	-	1997	8	Intergenic	novelGene_123072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGCTAATGTCGCCGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469137	449456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_-_449878_463739_463820_464980_465111_465966_466068_467556_467606_467708_467850_467976_468087_468172
930855	contig_7357_pilon	-	1362	1	Intergenic	novelGene_36951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1051	1359	1164838	1164530	NA	50	AAGCAGATACATGAGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAKRQCDDIYKALKKNNCQPRIICPAKLCLKYDGKIRVYPDKEKFRGSVKTKSKLQEILKGVMNPRCYVNPELKPFPKTTPQTKIRLDFKTQNNTRKEYAC	1165888	1164526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_1164500_1165900
930856	contig_6578_pilon	-	1389	1	Intergenic	novelGene_162232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAACAAAACAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84463	83074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_83100_84500
930857	contig_14871_pilon	-	3363	1	Intergenic	novelGene_63741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	321601	318238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_-_318200_321600
930858	contig_34_pilon	-	1812	8	Intergenic	novelGene_40003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	4	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	160	1545	247052	212049	FALSE	80	GAATGAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247211	211781	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
930859	contig_7457_pilon	-	1291	4	Intergenic	novelGene_31705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4026	junction_2	353.217905674229	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	142	483	1176842	1174926	FALSE	25	GAAACAGCTGGCTTGCCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQNLHSFDPFADASKGDDLLPAGTEDYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGIADDYDKKKLVKAFKKKFACNGTVIEHPEYGEVIQLQGDQRKNICQFLVEIGLAKDDQLKVHGF	1176983	1174117	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_1174971_1175539_1175642_1175967_1176132_1176811
930860	contig_18251_pilon	+	306	2	Intergenic	novelGene_50169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3192	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTCCGTTACTGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53999	55196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_54027_54917
930861	contig_15491_pilon	+	3272	1	Intergenic	novelGene_75926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	146	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGGAGTGGCAATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13618	16890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_+_13600_16900
930862	contig_1090_pilon	+	712	1	Intergenic	novelGene_131164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTCAAATAAACCTGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	917947	918659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_+_917900_918700
930864	contig_7457_pilon	+	3942	8	Intergenic	novelGene_31539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_7	152.121594758393	1322	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	327	1139	762721	771926	FALSE	15	TTTTTGGTGAGAGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFKAEVQSSRGLTKENLVFLAQKLFNSSSNHLEDYSNMSVSWSQFNRENLPGRNYTFWQWFDGVMEVLKKHLKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLINKPDGTFLLRFSDSEIGGITIAWKFDSQERMFWNLMPFTTRDFSIRSLADRLGDLNYLIYVFPDRPKDEVYSKYYTPVPSKAIDGYVKPQIKQVVPEFVNASADSVGGSATYMDQAPSPAVCAQAPYNMYPQNPDSVLDTDGDFDLDDTMDVARRVEELLGRPMDSQWIPHAQS	760258	774729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_760522_762657_762865_764333_764429_764530_764662_765741_765898_770753_770806_771159_771268_771799
930865	contig_6445_pilon	-	1334	14	Intergenic	novelGene_76904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	632.503385401516	3	23	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	16	1104	88578	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVPTKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	88593	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85320_88139_88216_88473
930866	contig_9777_pilon	-	1607	1	Intergenic	novelGene_154429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAAAGGATCCTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35707	34100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9777_pilon_-_34100_35700
930867	contig_9668_pilon	-	2748	14	Intergenic	novelGene_58186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	18	junction_13	904.568954852442	1	139	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	542	1918	605373	504120	FALSE	20	TTTTTCCTGAAAGTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTE	670493	503289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_669866_670221_670306
930869	contig_7548_pilon	+	2500	5	Intergenic	novelGene_117628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	160.855525239266	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	243	773	193023	203301	TRUE	35	TTTAAAGATAATTGGGCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHNNFVAILDLPEGEHQYKFFVDGQWTHDPSESCPVHRQDPTTRSPMSPNPRSGLKRPPSSRHICSRSS	192780	207765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200360_200455_203187_203322_206058
930870	contig_3270_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_104490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAATAAAGAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332512	331944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3270_pilon_-_331900_332500
930871	contig_6137_pilon	+	2661	1	Intergenic	novelGene_59212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	147	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTTAGAAAAGAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311669	1314330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1311700_1314300
930872	contig_17144_pilon	+	1865	9	Intergenic	novelGene_29300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTAAGTTCCTGAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	183219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166822_173330_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181852_183158
930873	contig_3956_pilon	+	2332	11	Intergenic	novelGene_15235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_4	817.761945800855	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	628	1887	243	2129	1284763	1290491	FALSE	25	TTTCAGAGGGCCGCGGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284520	1290694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
930874	contig_7091_pilon	-	2399	1	Intergenic	novelGene_131783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAATGTCTGTCGTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375963	373564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7091_pilon_-_373600_376000
930875	contig_6740_pilon	-	2965	1	Intergenic	novelGene_142722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTACTTTGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	732844	729879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_729900_732800
930877	contig_14441_pilon	+	1344	5	Intergenic	novelGene_100730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	477.55542872006	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	503	1303	121136	126705	FALSE	5	CCGTGTGTCCGGGGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120480	126746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_120819_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
930878	contig_8044_pilon	-	1251	1	Intergenic	novelGene_132376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGAGTTGGGCACACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376757	375506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8044_pilon_-_375500_376800
930879	contig_16303_pilon	-	2595	7	Intergenic	novelGene_34053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	720.294769907123	15	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	63	899	47976	35759	TRUE	25	CCATTTTTATGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48038	32576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33554_35039_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_47897
930880	contig_3975_pilon	-	2372	13	Intergenic	novelGene_54856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	226.282578992629	2	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	1182	1931	2064115	2056837	FALSE	30	ATAAATGTCTGTTTGTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079241	2056395	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065304_2065576_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
930882	contig_15821_pilon	+	349	1	Intergenic	novelGene_25023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGACTAGTTTTTAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127192	127541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_127200_127500
930883	contig_14682_pilon	-	2665	6	Intergenic	novelGene_139112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	78.8299435493899	1	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	765	1679	119805	94370	FALSE	35	AGCATTTTACAGTAATCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIFSNFSIITTALLFRIVLKRHLTWIQWASLLILFLSIVALTAGAKTSQHNLAGHGFHHDAFFHPSNSCLLFKHECPRKDNCTAKEWAFAEAKWNATASVFSHFHLGLGHVLIIVQCFLSSMANIYSEKILKEGKQLAESIFIQNSKLYFFGVLFNVLTLSLQSSNRNQIKNCGLFFGHNVFSVALIFVTAFQGLSVAFILKFLDNMFHVLMAQVTTVIITTVSVLVFDFRPSLEFFLEAPSVLLSIFIYNASKPQGLEHTSRQERIRDLSGSLWERSSGDGEELERLTKPKSDNESDEDAF	142011	93383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_-_94439_95776_96558_119740_119809_122393_122532_124154_124254_141487
930884	contig_10324_pilon	+	2841	10	Intergenic	novelGene_7753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_9	967.451226958346	4	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1251	1591	2841	72946	76691	FALSE	30	AATGTTAACACGCTCAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILVWAFGMGGDPGRRRYWDLLDLLDWTDVDGGQRWWIDYLFCPQTFFEHLESLAGA	71355	76691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440
930885	contig_10711_pilon	+	2260	2	Intergenic	novelGene_118416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	872	1177	209156	209461	FALSE	15	TTTTTTGATTCCATCTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRVLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPVWMPFISFSCLIALPRISSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMSAIGFA	207449	210544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10711_pilon_+_207673_208507
930886	contig_15327_pilon	-	3635	3	Intergenic	novelGene_70462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	109	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	2907	3452	309789	308521	FALSE	60	TGAAGGGAGAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGLWTHTVSRLKVLSRLVREKKGAADNPGSPRKQGRVEPRTYPRHSGWDSVLPDQSFPEPTRDTLAGTGSVLPDQSFPEPTRDTLAGTGSVLSDQSFPEPTRDTLAGTDSCAAGPKFPRTYPRHSGWDSVLPDQSFPEPTRDTLAGTDSVLPDQSFPEPTRDTLAGTDSVLPDQSFPKPT	312695	308337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_308734_309392_309578_309641
930887	contig_14537_pilon	+	1965	1	Intergenic	novelGene_158649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCCATTGGAGTGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52806	54771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14537_pilon_+_52800_54800
930888	contig_5961_pilon	-	1462	1	Intergenic	novelGene_144153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAACCCACAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206943	205481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_205500_206900
930889	contig_7815_pilon	-	3571	2	Intergenic	novelGene_134403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAATAGAAAAAAAATTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	845385	841764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_845235_845284
930890	contig_19514_pilon	+	1221	1	Intergenic	novelGene_166315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTACAATAATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	53448	54669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19514_pilon_+_53400_54700
930891	contig_15062_pilon	-	2946	1	Intergenic	novelGene_162290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	78	237	83	319	31277	31041	NA	10	ACCTTGTTGTCAGGTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVYLCFIDYAKAFDCVDHNRSWITLRRMGIQEHLLVLMRNPYIDQEAVVQTEQGDTAWFKIRKGTCPGYNFSPYLCSLYAEQMLFFMKKNGASGLEEDSLTTCVM	31359	28413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15062_pilon_-_28400_31400
930892	contig_14970_pilon	-	1561	6	Intergenic	novelGene_45053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGAGAGAAAGAGAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232251	191970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_192204_213683_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
930893	contig_10023_pilon	+	1471	1	Intergenic	novelGene_123464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	857	1171	57496	57810	NA	15	CTACAGCCCTGTACTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCIDNSGCNSGLKGSKCCEDGAGWGSVLFCHTLGHYELEPTGWHLPTTTTTFILHGNDIFSQPQWVLFSQKPLVPSNKVCSAEVALLGSSCSLVGIHGGLPLT	56639	58110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10023_pilon_+_56600_58100
930894	contig_7031_pilon	+	1820	1	Intergenic	novelGene_132810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1059	1373	382400	382714	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKHYSFHYGSHLHIRKTKILTTGPISNIIINGEKFEVAKDFILLGCTVNTHGSSSQEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHPDPSHGIFNHLKCM	381341	383161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_+_381300_383200
930895	contig_6076_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_81769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	543	908	442865	442500	NA	90	AAAATAAAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRFSSRKTINVIHHINKTKDKNHMILSIHAEKAFDKVQHQFMIKTLNKIGIEGKFLNIIKGIYTKPTANIILNGETLKAFYLRMGTKQACPLATLIQHCAGGPGQSNQARKRNKGHPNW	443407	441684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6076_pilon_-_441700_443400
930896	contig_5718_pilon	+	3155	1	Intergenic	novelGene_110419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	33	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	927	1361	1445826	1446260	NA	40	GGATAAACAAACTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPFETPEVMAVPFETKAAQLLVSLVSSPSASVSCGLLALGPHARICPAWASVPKLSSSTGKCPEAPYSTRRPSAHRHSAPSLRGLASLAPPISAQRHPTPPESLLLTDIQLSRSVGWLQRHLSPVSSFCCCWFSAAAASLLL	1444899	1448054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_+_1444900_1448100
930897	contig_3956_pilon	+	1881	10	Intergenic	novelGene_14844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1321.77205221804	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	495	1488	232	1719	1286220	1290847	FALSE	20	ACTGTGTGGAGCCTACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281598	1291009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282819_1286195_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289822_1290526
930898	contig_9484_pilon	+	1723	12	Intergenic	novelGene_105619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	608.144026546996	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	54	1547	95848	104924	FALSE	5	GGTGGTGGTTTTCTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTISLGLRERSQNSQTQS	95794	105100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101276_101642_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104878
930899	contig_11572_pilon	+	1074	1	Intergenic	novelGene_100085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	46	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426956	428030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_427000_428000
930900	contig_14441_pilon	+	767	4	Intergenic	novelGene_100769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	489.604602374882	1	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	190	738	125667	126705	FALSE	5	TGTGCAGCCTGGCCGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APTFGGGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121831	126734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121872_125517_125902_126159_126283_126514
930901	contig_7357_pilon	-	2054	9	Intergenic	novelGene_36806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2291.94807628249	5	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	214	1326	166808	136424	TRUE	15	GTTTTTCTGGACCTAGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSCFCCCSNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167021	135544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136260_136410_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_166772
930902	contig_10225_pilon	+	2140	9	Intergenic	novelGene_86852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	633.029311623877	21	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	597	2036	42707	47636	FALSE	20	TCTTGATTCTGATCCTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLFYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	39746	47740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_47147_47347
930904	contig_17144_pilon	-	2105	16	Intergenic	novelGene_29271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2135.56977148697	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	810	2021	172541	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLGPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183202	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166349_166421_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172655_174669_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
930905	contig_10904_pilon	-	1537	6	Intergenic	novelGene_22730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	31	junction_4	419.153241667054	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	224	937	661760	651376	FALSE	30	AATTTCTTTGCTAAAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSGANVTSLNAELGTMNRIVFLK	662752	650775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652444_652496_660333_660634_661462_661763_662310_662445_662665
930906	contig_14077_pilon	-	3136	2	Intergenic	novelGene_174868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2246	2548	62645	62343	TRUE	55	TGAAATGAAGAAATGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECLKIHILDIGELKWTGTGHYKSDNHRVKYAKNDKLKRDVSFIVKKNISRSILKYNVASDRIISICLQKRPVNTTIIQIYTPITNAKDEVIRFLPTSAV	64890	61600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_-_61695_61848
930907	contig_2755_pilon	-	5219	2	Intergenic	novelGene_158298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	4075	4380	260419	241965	FALSE	20	TAATTTTTCTTCCATGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPERLRLSPGQVWQLLAASEPSLPPPATQSSSSTLPLMFRVPKAPYIIESLFFPSLCCKRVHQKHLTTLPSWPHPDFFFLHVNLFLSFDNSGLIKYLPFCD	264493	241125	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_-_242041_260189
930908	contig_14023_pilon	+	1434	1	Intergenic	novelGene_165350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTCTTCTGGCACTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46577	48011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_+_46600_48000
930909	contig_15952_pilon	-	1226	1	Intergenic	novelGene_154089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTGTGTTTAAGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	676030	674804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_674800_676000
930911	contig_13780_pilon	-	2431	15	Intergenic	novelGene_149083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1647.89869289372	3	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	728	2302	686613	657588	FALSE	20	CGCACGCCCGGGAGCGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIKIADFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLSNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADGDLKEDGIPSRKSSGTAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSTTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSAVPDQSTPVASTHSVSSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKVANELKL	775065	657458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_657934_665729_665988_673979_674084_676399_676618_684610_684717_685243_685357_685725_685826_686087_686208_686403_686674_694786_694858_699201_699268_702167_702217_713180_713235_727438_727631_774830
930912	contig_19851_pilon	+	2749	2	Intergenic	novelGene_29868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	8446	junction_1	0	5	109	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	95	288	81	368	53637	54149	FALSE	20	ATTGTTCCGTGTAAGCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNEEPPPPAVQVQGLGPQREEKQKTKMAKFVIRPATASDCSDILRLIKELAKYEYMEEQVRLTEKGNAAAGRGRDKSGASHPPRGQHCVPFCRFVRRWFRRAPLLPLSGCRSAQGALDSGR	53556	56530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19851_pilon_+_53703_53927
930913	contig_15034_pilon	+	1707	2	Intergenic	novelGene_143643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCGTATTAACTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60750	62932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15034_pilon_+_60903_61377
930915	contig_11227_pilon	-	1372	1	Intergenic	novelGene_163190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	831	1136	202089	201784	NA	45	ACCCTTAAACAAGCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLQADVIWGCGHLKARLHWMSKMASLTCLGSLAGLSTRAPTWDVSRMAVSGSLTSYLVSDFPQSEQMEASWPFTDSLGSHLASLPLVQTVMSPLRFKRDS	202919	201547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_-_201500_202900
930916	contig_8589_pilon	+	973	1	Intergenic	novelGene_107362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCTCTTCAGTCCGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184739	185712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8589_pilon_+_184700_185700
930917	contig_5302_pilon	-	2591	9	Intergenic	novelGene_81410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	702.028622991969	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	278	919	185066	177220	FALSE	25	CCCTGAGGAATAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	208902	175547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_208796
930918	contig_15067_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_154319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAAAAAAAATTAAAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24741	25813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_24700_25800
930919	contig_9609_pilon	+	2974	24	Intergenic	novelGene_23003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	329.918950922334	2	111	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	75	1928	311574	329800	TRUE	20	ATGATACTGTGTCTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSDKRVSRTERSGRYGSIIDRDDRDERESRSRRRDSDYKRSSDDRRGDRYDDYRDYDSPERERERRNSDRSEDGYHSDGDYGEHDYRHDISDERESKTIMLRGLPITITESDSFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNPRPKFEDWLCNKCCLNNFRKRLKCFRCGADKFDSEQEVPPGTTESVQSVDYYCDTIILRNIAPHTVVDSIMTALSPYASLAVNNIRLIKDKQTQQNRGFAFVQLSSAMDASQLLQILQSLHPPLKIDGKTIGVDFAKSARKDLVLPDGNRVSAFSVASTAIAAAQWSSTQSQSGEGGSVDYGYLQPGQDGYAQYAQYSQDYQQFYQQQAGGLESDASSASGTAVTTTSAAVVSQSPQLYNQTSNPPGSPFQTEEAQPSTSTSTQAPAASPTGVVPGTKYVPDTSTYQYDESSGYYYDPTTGLYYDPNSQYYYNSLTQQYLYWDGEKETYVPAAESSSHQQTGLPPAKEGKEKKEKPKSKTAQQIAKDMERWAKSLNKQKENFKNSFQPVNSLREEERRESAAADAGFALFEKKGALAERQQLIPELVRNGDEENPQGSGCCLQWRQ	311499	333330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_311591_313099_313266_314274_314431_317900_317953_318440_318515_320955_321040_321846_321908_322284_322351_322601_322763_323261_323360_323984_324073_324253_324332_324411_324485_325138_325225_325625_325717_325932_326022_328274_328437_328863_329014_329095_329163_329765_329946_330229_330282_331401_331485_331563_331694_332694
930920	contig_11564_pilon	+	1711	2	Intergenic	novelGene_158569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAGGTATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57179	59321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58660_59090
930921	contig_9871_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_75727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATATTTTTGGATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599737	601805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_599700_601800
930922	contig_11720_pilon	+	1473	9	Intergenic	novelGene_43823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2331.25373994338	1	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	296	1192	78465	98482	FALSE	20	GTACTTGAGAATTTGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67910	98763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68150_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
930923	contig_5916_pilon	-	1632	1	Intergenic	novelGene_158053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGATCCCTCTGTATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	455543	453911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5916_pilon_-_453900_455500
930924	contig_7707_pilon	+	1659	2	Intergenic	novelGene_72225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAGATCTTGGACCTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	824264	832059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_825425_831560
930925	contig_6458_pilon	+	2388	4	Intergenic	novelGene_163738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	22	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAGATACCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39960	243753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_+_41379_210114_210357_213052_213394_243366
930926	contig_9955_pilon	+	2084	1	Intergenic	novelGene_21384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTTGTAAAAACCGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587967	590051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_588000_590100
930927	contig_3956_pilon	+	3049	14	Intergenic	novelGene_15114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	991.320522685889	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	905	2569	1285728	1290491	FALSE	30	GTCAGTGCCATTGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1290971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285688_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
930928	contig_13740_pilon	-	1502	10	Intergenic	novelGene_34705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4014.55634742703	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	89	826	165243	158742	TRUE	50	AAAAAAATGCCTTTGAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGWQFWR	165331	157083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160073_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
930929	contig_7119_pilon	-	1996	4	Intergenic	novelGene_40961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	459	899	140491	140051	TRUE	30	CTGCTTTAGTGACAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGRWRGSLCAEAAELEEEVCFQVLLGRRGLAAHSPRMGLPVQLLRRPPAPGGSKKARPVEEKSGVWVAPSGRQRDVAGQVLLLDAQGYGRKLCKVWSSASRDSPGSGFGSWVLALGRPPLAAAGLGPSPPSGSRDEMQTISEGE	140949	127546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137096_138706_139220_139640
930930	contig_8568_pilon	+	821	2	Intergenic	novelGene_156934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACATCATACCAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60005	64106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8568_pilon_+_60068_63347
930931	contig_7963_pilon	+	1112	6	Intergenic	novelGene_58361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1176.26789465666	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	98	778	51450	63007	FALSE	10	AGCTGGGTGACTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51352	63341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56828_56911_56964_57281_57564_57782_57934_63003
930932	contig_17311_pilon	-	3506	3	Intergenic	novelGene_57866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	33	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTCTCCCTGGCGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158003	153870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17311_pilon_-_156403_156510_156601_157119
930933	contig_10948_pilon	+	1476	1	Intergenic	novelGene_124977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACCCAGTCAATCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148915	150391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_+_148900_150400
930934	contig_6163_pilon	+	1108	1	Intergenic	novelGene_103821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	217	549	113086	113418	NA	50	CATGAAGAAAGCAAAAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCYAGNDKLKKNGIAFIVKKNISRSILKYNAVSDRIITIHLQGRPVNTTIPTTNAKGEEIEDFYQCLQSKIDQTCSQDRLIITCDWNAKVRNKEERSKTYCHGVDSDSQ	112869	113977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_+_112900_114000
930935	contig_5947_pilon	-	2456	1	Intergenic	novelGene_101529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	232	699	532	1230	519851	519153	NA	20	GAGCGTAGTCGATGTCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTMKFTEEKTGPMLQAFIHGINRIQTITISTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDCTKRVKREPTDWEKMLGQYKSDKGLISIIYKKIHHLYNKKTNNPIKKWAKKMNRHFTKEDTQAAHKHMRKCSRPLAIREMQIKTTMRYHLTPALLAGTKNTENSKCWRGCGEIGTLMHCWWQCKTIQPFWKMIWCFLRKLQIRSSNPTPRNIS	520382	517926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_-_517900_520400
930936	contig_16228_pilon	+	3735	8	Intergenic	novelGene_147919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	259.042585735415	2	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	341	1060	59945	71794	TRUE	10	CCACTTGTGGTATTTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGVDPGAEVKEITWSFGDFSAYRDMLCVSSGTDSPTWVSLQDKYKQRVHVPNMTTLMIENLTLGDSGEYQARITLPEGRGSIQVLTKYLSTTHGWCNVTLECNVSARATENLNIIWESKGLLKDLEQRETPRPDTDPWTLAVSLPLSQPQSKLNASITCVVSNPKDQKNATLDLGEVCVHVGEKENDKNNSLGIILGAFVAVLVTLGAGLFLWKTRRKKKKMEPGRGSTFARGLQGQ	47749	75089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16228_pilon_+_47886_48931_49035_59843_60200_69497_69790_71434_71574_71760_71849_72142_73821_74146
930937	contig_2100_pilon	+	393	4	Intergenic	novelGene_50767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTGGATCCCTGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170233	1173292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_+_1170338_1171934_1171994_1172341_1172449_1173169
930938	contig_11121_pilon	+	1017	1	Intergenic	novelGene_167067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	45	410	319724	320089	NA	40	AGGCACCCAGCAGCAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHSLSDLQSLVFNASNLSLRWFLNSGGIYSRSYFGSRGHVLIFFSFNLNLHMSNLWSIRQLAPGLVLMMILSFSIVPFSDVVDLIVFHLLRSTCVVVVYVSLRNDYSLGNPMVQFYSVS	319679	320696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11121_pilon_+_319700_320700
930939	contig_9113_pilon	-	2269	2	Intergenic	novelGene_68583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	414	1245	242	1486	348512	347268	FALSE	35	AATGTGACTGGAAATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGPEGGEGFVVKLRGLPWSCSIEDVQNFLSECKIRDGVAGVHFIYTREGRQSGEAFVELESEDDVKMALKKDRESMGHRYIEVFKSHRTEMDWVLKHSGPNSADTANDGFVRLRGLPFGCTKEEIVQFFSGLEIMPNGITLPVDPEGKITGEAFVQFASQELAEKALGKHKERIGHRYIEVFKSSQEEVRSYSDPPLKFMSVQRPGPYDRPGTARRYIGIVKQAGFDRMRSGAYSTGYGGYEEYSGLSDSYGFTTDLFGRDLSYCLSGMYDHRYGDSEFAVQSTTGHCVHMRGLPYKATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEEAVAAMSKDRANMQHRYIELFLNSTTGASNGAYSSQMIQGMGVSTQSTYTGLDSQSVSSCYGAGYSGQQNSMGGYD	354278	346484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9113_pilon_-_348590_354114
930940	contig_8671_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_126280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTGTGGCATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	613728	614804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8671_pilon_+_613700_614800
930941	contig_10864_pilon	+	2208	2	Intergenic	novelGene_107110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	869	1168	1084941	1085240	FALSE	60	AAAAAAAAACACTTTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQLLAGMIAEPAFLSEYTIFALDPSKQLKTQTDSVVSPSTAFCVPFVGKQSNLVILEANFMLLAIYHLSKRLQCPVANPALKQSESKLLNSDGWCASW	1072238	1086280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1072248_1084081
930942	contig_5585_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_143077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	58	468	409846	409436	NA	35	ATTAGAAGATTATCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPWTAKRTNKSFLEEVQPECSLEARMVRLHLTYFGHVIRKDQSLEKDTLGKVEGQRKRGRPSTRWIDTVAATMGSNITMITRMVQDRAMFRSVVHGFAMSQRLLDSTEQQQRIKQCCRPFLYLLNSLSWQNFLWPI	409903	409265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5585_pilon_-_409300_409900
930943	contig_7158_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_163730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGAGGTAATTGAAAATACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1116732	1115246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_-_1115200_1116700
930946	contig_7095_pilon	-	3547	1	Intergenic	novelGene_166471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	22	168	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	504531	500984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_-_501000_504500
930947	contig_17144_pilon	-	1215	7	Intergenic	novelGene_29219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1841.41799226092	2	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	36	920	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHLEGMGGF	175000	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166386_172558_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
930948	contig_16098_pilon	-	2376	5	Intergenic	novelGene_45857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	635	junction_1	224.179615487225	7	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	38	760	214903	212605	FALSE	25	TCTGCATACAGCCTGTACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLYDYNPNLATYMKPEMWQKCLDCINELMDILFANPNIFVGENILEESENLHNVDQPLRVRGCILTLVERMDEEFTKIMQNTDPHSQEYVEHLKDEAQVCAIIERVQRYLEEKGTTEEICRVYLRRILHTYYKFDYKAHQRQLTPPEGSSKSEQDQAENEGEDSAVLMERLCKYIYAKDRTDRIRTCAILCHIYHHALHSRWYQARDLMLMSHLQDNIQHADPPVQVGWEGHALGVVKRDRPGPCPFFGQTS	214940	210988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_212911_213146_213338_214339_214434_214567_214694_214897
930949	contig_15047_pilon	+	1306	7	Intergenic	novelGene_52133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	8	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	30	668	2194	4409	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCGMGPSRSGQPLWRPLERSKDTHVVCSTRG	2164	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3443_4319_4434_4552_4687_21013_21062_21232
930950	contig_2933_pilon	+	2526	10	Intergenic	novelGene_111339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	81	junction_7	319.897900378647	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	203	937	721545	731128	FALSE	35	TACTAACCACTAACCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGTLVGVCLLGVLALVISWAALGLELAVSVGSSDFCVDPDTFVTKMVEEHSVLSGDILQYYLACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDTVAELLKTVPRESPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQPKRGPDEDGEEEAAPGPRQAPDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPATAHTVSNAPVTEYMSQNANFQNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSSSGH	719962	732717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_720047_721152_721226_721499_721576_722536_722593_723416_723510_724880_724974_725126_725264_727191_727366_728025_728102_731053
930951	contig_7297_pilon	-	810	1	Intergenic	novelGene_169696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	162	614	147521	147069	NA	40	ACCAGGCAAAGATGTCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLSKKKKGTKIKTLTTELKQIEREQQKKSTATGRKEMIKIRAEINEIENRKTIERINKTKSWFFERINKINKLLARMTKEKHERTQITSIRNEMGAITTNPTEIKRILTEYYEKLYSNKFENLEEMDKSLETHYLPKLQQSDVENLNRP	147682	146872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_-_146900_147700
930952	contig_3956_pilon	+	1822	8	Intergenic	novelGene_14998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	1348.46403930773	2	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	81	650	1281682	1286084	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIP	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284219_1286078_1286224_1286409_1286606_1289767_1289892_1290297
930953	contig_5280_pilon	-	1083	2	Intergenic	novelGene_52640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATACTTTCTATTATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103294	101566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_-_101815_102459
930954	contig_7919_pilon	-	669	1	Intergenic	novelGene_28026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCAACTTTTGGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3984	3315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_3300_4000
930955	contig_7457_pilon	-	1907	8	Intergenic	novelGene_31437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	184.762174766617	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATCAAACTACATAACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473215	468278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470434_470858_471003_471191_471292_471559_471667_472326_472533_472730_472768_473151
930956	contig_5562_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_179187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAATGAACAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148725	149200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5562_pilon_+_148700_149200
930957	contig_1154_pilon	+	2073	1	Intergenic	novelGene_87113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAATAATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400956	403029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_401000_403000
930958	contig_2577_pilon	-	2589	3	Intergenic	novelGene_172065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTTCTTCTCATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176012	150685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_151089_151157_152119_174787
930959	contig_1016_pilon	+	1580	1	Intergenic	novelGene_173255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	1224	1580	634909	635265	NA	50	CTCAAGCCAAAAGAACTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISHLNLETISRVDSLNTNDRRPDELWNDIKDIIREESKRSLKRQERKKRPKWMSEETLKVALESQVAKVKGRNGEVKELNRRFQRAAGEDKVKYYNDMCKELKIKNQKGRTCSAF	633685	635265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1016_pilon_+_633700_635300
930960	contig_7196_pilon	+	3037	2	Intergenic	novelGene_147160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	411	983	34841	46546	FALSE	35	ATATCTCTTTAAAGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDITQSLDSILFQDRSQNVLFDDECNAISLQFVIPNIVYHRWSNSEWPIPVHFSSLMPRISIFKRSISFLITSNFPRFILRTFHVPIISGCLQLSLLILSHATSANEAFSIHVIKTDSTLRGQLFPSHILSAFQSESLIFWHYIRQCSTAIHKVFTGLFFQKYIARFFFPVCLSLEAPLKPVHHSDPGGI	34430	48600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7196_pilon_+_35087_46219
930961	contig_9955_pilon	+	2275	4	Intergenic	novelGene_21394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAGGAAGCACTCGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	731461	735854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_731663_731717_733388_735073_735216_735592
930962	contig_9272_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_125935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTCATCATCCAGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402010	402958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9272_pilon_+_402000_403000
930963	contig_12761_pilon	+	2301	2	Intergenic	novelGene_164058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTGCCGTGAAGTGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245595	248532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_245605_246240
930964	contig_7396_pilon	+	1882	13	Intergenic	novelGene_79634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTCCTTTCTCGTTTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245941	257477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_+_246416_247186_247354_247716_247825_248192_248276_248550_248608_248753_249062_249736_249877_250294_250355_250851_250930_251466_251558_254565_254699_255103_255193_257383
930966	contig_7933_pilon	+	617	3	Intergenic	novelGene_164685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6639	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGAGACGAGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	197937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_186078_189402_189558_197893
930967	contig_16389_pilon	+	1854	2	Intergenic	novelGene_177136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	740	1126	22158	22544	FALSE	60	ATATCTGACCAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGPKSNTRIKGEKIEVVKDFILLGFAINIHGSSSQEIKRCIASGKSAAKVLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQAMVFSITSYAWENWIMNKEDQGRMDALNCDVKEEY	21373	23272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16389_pilon_+_21665_21709
930968	contig_11518_pilon	+	1948	1	Intergenic	novelGene_109128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAATTACAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70037	71985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11518_pilon_+_70000_72000
930969	contig_3095_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_75086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
930970	contig_854_pilon	+	1338	2	Intergenic	novelGene_36737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714859	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1714983_1715188
930971	contig_14225_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_52756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATCATACATGAAGAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376080	375048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14225_pilon_-_375000_376100
930972	contig_3601_pilon	+	3682	5	Intergenic	novelGene_132858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	148	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	2806	3246	160627	161067	TRUE	5	ACGGCGTGGTGCTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHFCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPAWQPKLGSSSTLKRSSATPQEEAKMAHGARYLSKGGRRWRETSKKSKEAGKKKSNTSSQQMALREPARAGWCFWTRNCVRGKQRGPSVGEEG	128875	161647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_129066_129114_129239_129743_130819_159210_161178_161321
930973	contig_16578_pilon	-	4499	1	Intergenic	novelGene_148670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2302	2610	229104	228796	NA	60	AGAGATCATTAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQDRPQKKVTKTYHNQNCQNKRQRKNPDSSLGKTQNQLQRGTNKTSSDYSAETMQAITQQKPCRQEGNGMTYIKLLKKKIANQELHIQKNCLSDIMVKSGHF	231405	226906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_-_226900_231400
930974	contig_4402_pilon	-	4294	15	Intergenic	novelGene_140854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	270.834886442433	8	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	765	2295	1998	4292	610133	595214	FALSE	60	GGTAAAGGAAATAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDKNFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLPEEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCHQNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRSPISRQQDPLMIPVTSSSSHPPPSISSLASNQSSLAPPVPGNSSSTPAPVPDITATVSISVHSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLLHGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSERSQRTQGPSLPAAPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPSGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVPPPGFPPAPANLSTSWVSSGVQTVHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDEFTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFSRSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQSPTKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDVKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEKYYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYAAAGQSHRSRNIVTIRRIIQKQKRRRVKMLQE	614305	595211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4402_pilon_-_595273_595309_595933_596736_596839_597128_597492_599317_599387_600516_600572_600684_600764_600897_600995_602003_602342_602447_602552_603818_603992_609496_609637_610040_610138_610254_610344_612401
930975	contig_12622_pilon	+	2729	15	Intergenic	novelGene_5823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	178.113298040252	5	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	1833	2426	465550	475513	FALSE	85	TAAAAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEMRQSLEQERDRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPCQQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNPETLNKSSQGSSSSTQSAPPETASASKEKETSAEKSKDSGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSSKSSCWSSSEEKRGSARSEHNASTKSLIPKESRLDTFWD	408751	475816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12622_pilon_+_408809_412056_412135_413371_413488_419333_419811_433574_433716_446449_446603_454875_455116_457156_457348_460455_460537_463384_463464_464980_465192_465541_465782_467745_467907_469399_469467_475379
930976	contig_3153_pilon	-	723	1	Intergenic	novelGene_104681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTGTATTTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291131	290408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_290400_291100
930977	contig_10904_pilon	-	1694	7	Intergenic	novelGene_22542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	287.209418369245	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	63	686	396033	378023	TRUE	5	TTTGTGTGTGGCTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNTNGKTEGISVEQAEGAAMISQFLFLLCFGLCLSQRDMTGDENLAEFLLTDLHQGNAGEYTCEYYTILSPYTTSQPSDVLLLLVTGGFPKPSLQAYPSRNVTAGKKVPLRCQKPYNVVDYVRFALLKEGMSEPIRDWRPLGNMAEFSLKNVTVKDTGNYSCVYYQKSSPFWASHPSDSLEIWVTGKVFLIWTNGIILIIIFTLLFLLLLLSALLIYKYTRRGMKQ	396095	374473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_375424_377964_378037_379301_379395_388738_389054_389359_389492_389761_389798_395999
930978	contig_6445_pilon	-	1202	12	Intergenic	novelGene_76878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	782.630993973068	1	24	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	286	963	77856	43105	FALSE	5	CTTTTGTTTCTTTATTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSNTESPSRSPPRTRGAWTRTLCTSAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68054_73979_74051_77848_77924_80504_80562_88465_88594_96306
930979	contig_2550_pilon	+	2609	2	Intergenic	novelGene_135656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1311	1628	1002301	1002618	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDLPVEEKALDLTDREFKSLIFRIIQELKQKADKNEGKIDKFVEKSDKKMENTDKKMEEFKKIIQEQNAKINSHHTKTTIRNPKDKQQDFRNGQ	1000816	1003599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_1000902_1001075
930980	contig_13740_pilon	-	2015	7	Intergenic	novelGene_34699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3225	junction_1	2928.47524319397	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	891	1247	160838	158585	TRUE	40	AAAAATGCCTTTGAGACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNKFTCNLYVEIGLELMT	162231	157081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158761_160071_160135_160648_160730_160801_161270_161574_161722_161919
930981	contig_18290_pilon	-	1259	1	Intergenic	novelGene_174940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	872	1174	77076	76774	NA	20	GGGTTGACACAGTGGCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARFCLTYFGYVIRRDQSLEKDIMLGKITSQQKRAIPSTRGIDRVAVTMDSNTAIIVRMPQDRALFCSVVYRVAMMAPNSSKICMKIYLEFVIDDSRRNC	77947	76688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18290_pilon_-_76700_77900
930982	contig_854_pilon	-	2259	10	Intergenic	novelGene_36609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1308	1628	1698345	1696580	TRUE	30	ATGCAGAAATCAGCTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANLFQLLLLGGQAGPELLSLGTQLCLRLELLLQLQLLRHELRLECLQLGESALSCQLLLSDLYQLLLLGHHLLLLPAHLQQRLDLGEEPPPLPVPQLEVGGTVPL	1716407	1687095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1687113_1689336_1689384_1692622_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698426_1715180
930983	contig_12312_pilon	-	1721	3	Intergenic	novelGene_63938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	831.5	14	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGGAGATGTTAATTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218249	213826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215255_215717_215985_218223
930984	contig_7963_pilon	-	2298	10	Intergenic	novelGene_58474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	610.290964809733	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	694	2088	125592	120628	TRUE	80	GAAAAAGGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPWSGQIIF	126285	120294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120652_120693_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
930985	contig_10003_pilon	-	2489	1	Intergenic	novelGene_88255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	164	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATAGCCAGATCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	742470	739981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_740000_742500
930986	contig_6576_pilon	-	2002	10	Intergenic	novelGene_42279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	680.361577797578	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	122	691	339439	330294	TRUE	75	TAAAAAAAAAAAAAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPIASSEKIHPVILR	339560	323106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_324102_325444_325538_326528_326687_329133_329193_330287_330336_330860_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339398
930987	contig_11656_pilon	+	2433	22	Intergenic	novelGene_54023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_9	148.24726540709	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1389	1043	2431	521815	536480	FALSE	50	AGAAGAAGAGCAGAATAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQA	468821	536482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_468997_484730_484826_485804_485923_489324_489395_507865_507931_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521707_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
930989	contig_8447_pilon	+	2344	1	Intergenic	novelGene_69427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGCGAGAAACTTTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82135	84479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_82100_84500
930991	contig_6316_pilon	+	5732	2	Intergenic	novelGene_134723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	5194	5574	282391	282771	FALSE	35	GTAGAAATTTTTGAAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHTYQVLHPTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKDQIYWPEGDWRNRKSMAPRHPFSSVVKLPLRFTVQPGSGSPGKPNETNEVQESSDKGRKAAGDKDAGDTEPNIE	167116	282929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_169466_279546
930992	contig_10331_pilon	+	3944	1	Intergenic	novelGene_54210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	193	582	2448	3029	856748	857329	NA	40	ACATATCAATGATTGTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQMDAALEVPTHLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKNGDPTECGNYLTISFISHISKILLKIVQKQLQQYINRELLEVQAGFRRGHGMRDITADVRWILAKSREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKLWITLQRLGIPECLIVLMTDLFIDQEAVIQTEQGDTKHQKTKPIAFESIATHSDPTGQSRTAP	854300	858244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_854300_858200
930993	contig_10437_pilon	+	1340	8	Intergenic	novelGene_38329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1230.20630425161	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	21	815	440502	451175	FALSE	30	AATTTCTATCATTGCCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHDLGMNQHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	440147	451700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_440157_440490_440510_440836_440877_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
930994	contig_10196_pilon	-	3267	26	Intergenic	novelGene_132074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	127.148958312681	14	27	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	513	1542	101	1642	835804	822004	TRUE	25	CGTGACAACGAGCGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSVRGGVSPCQVGAAKRAAGAAREEPPGASLPTMAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPHTRSAEGRQTEFIITAEILRELSVECGLNNRIRVIGQICEVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPDRPPEARHAVLALLKAIVQGQGDRLGVLRALFFKVIKDYPSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELAEFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYITPMVHMICLLCIRTASPMDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTVNVKELCEPCWKLMRNLLGTHLGHSAIYNMCRILEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLKNSPTSVLPSFYEAMTCPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQAVTWDILLSIIERLLQQLLTLGSPELRAIVHDLLTTVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIHNLQQLMERFFRNESRSAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEVCVREPRLRVLRVGTTRPYRGLPRFLLCPRRS	836403	810682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_810755_810960_811123_813878_813981_814228_814332_814592_814687_815963_816154_817306_817442_817942_818066_819480_819632_819905_820013_820881_821005_821258_821376_821857_822185_822525_822630_823181_823320_824801_824946_825752_825880_828577_828652_828993_829120_829720_829770_830249_830368_831260_831406_832311_832423_834238_834326_835666_835834_836332
930995	contig_17440_pilon	-	454	1	Intergenic	novelGene_7585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTTTAAGCATGCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2645	2191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_-_2200_2600
930997	contig_12566_pilon	-	3199	1	Intergenic	novelGene_85991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	116	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	325	978	1757	2734	15909	14932	NA	25	ACGTGTTTTTGGGAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYQLRCFNKQMEPWRCSFVYANKFGRQLPGNWKKSIFVPIPKKGDPKECIKYQTRPLILYTSKILLKIIQKQLQQYIDGELPAIQAGFRRGHGTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDHNKLWITLPRIRIPEHLIVLMRNLYIYEEAVVQTEQGDTVWFKVRKGVRRGCILSPYLFNLYAEQIFQEARLYEERGIRIGGRLINHLNYEDDTFLAESEDDLMHLLMKTKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTRPTSNIMINREKTEVIKDFILLGSTINIHRSSSQEIKRRIAVGKSAAKHLLKVLKSKDVTLED	17665	14466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12566_pilon_-_14500_17700
930998	contig_20641_pilon	+	2428	9	Intergenic	novelGene_52856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1379.22958567455	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	292	846	38568	71492	TRUE	80	AAAAGGAAGAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGFQPQMNPG	14615	86678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14716_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_71463_71525_73084_73243_85286
930999	contig_3601_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_132864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCCCAAAACATGTATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141801	142550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_+_141800_142600
931000	contig_18251_pilon	+	3435	1	Intergenic	novelGene_50140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	97	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	776	1171	6146	6541	NA	25	ATCTTTTATTATGTATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVKRLHQKSKKRTYRPGENNWLLQVLQSLIAKIYRKIQHRYNKKKHNPIKKQAKDINRHFKKEDIPAANRHMRKCSQSVAIKEMQIKATMRSHFTLTLLAQIKKRENNKCWRGCWQIGTLMHCWWECKMI	5370	8805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_5400_8800
931001	contig_9038_pilon	-	837	1	Intergenic	novelGene_143331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACACAAACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433218	432381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9038_pilon_-_432400_433200
931002	contig_14405_pilon	+	1767	2	Intergenic	novelGene_85679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCCTATAGAACAAAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	921914	989906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14405_pilon_+_923589_989813
931003	contig_19352_pilon	-	853	1	Intergenic	novelGene_122388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAATAAGAAGCTACTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161499	160646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_160600_161500
931004	contig_14970_pilon	+	1855	10	Intergenic	novelGene_44990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	6591.38774799696	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	124	1020	136145	231375	TRUE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYQYYSESYKESTNSRMADHLGVPFGPGFDSRSLHRCQQSKKVWAEEKVGD	136021	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213760_221211_221253_224295_224375_231345_231706_231743
931005	contig_15825_pilon	-	2631	1	Intergenic	novelGene_160211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGTTGCCACCTGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	196307	193676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_193700_196300
931006	contig_12965_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_65205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CTGAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	415357	416786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12965_pilon_+_415400_416800
931007	contig_1452_pilon	-	1322	2	Intergenic	novelGene_115122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACACACCTTAACAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257013	228024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_229151_256817
931008	contig_16121_pilon	+	2351	7	Intergenic	novelGene_6866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	485.617705150415	1	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	151	759	51510	58910	TRUE	30	TTGGCAAGAAGTGGGGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKLQAILSYKYIFNGCNILLYIVLTAKYALNLISLVVDIMEKTCTDALPLTMNSSEKQETICIFGTGDFGRSLGFKMIQCGYSVVFGSRNPQMSSLLPNGAEVLSYSEAAQNSDIIIVAIHREHYDFLTELAEVLNGKILVDVSNNLKINQYPESNAEYLAQLVPGTRVVKAFNTVSAWALQSGALDASRQAEMTAKLSKE	33625	64536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_+_33709_51442_51628_57743_58202_58877_59396_60693_60856_62565_62871_63896
931009	contig_14142_pilon	-	1030	11	Intergenic	novelGene_120610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	142.71751819591	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	161	787	591064	585474	TRUE	15	CTTTGCTCTTTCCTTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQAVHFQQGHEELSRLGQYRKELGAQLQQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLKEGTGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFIIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVEDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSPSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFNQARLDDSPRAPGQGSGFRRQGPSDHRHGNSQR	591356	584555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_584737_585025_585076_585461_585534_588714_588839_589171_589273_589369_589422_590496_590607_590678_590754_590850_590947_591055_591101_591232
931010	contig_4105_pilon	-	1727	14	Intergenic	novelGene_21507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	692.604004964098	8	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	25	897	137447	105968	TRUE	20	GAGACCTTTCTTAACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASAKKKNKKGKTISLTDFLAEDGGTGGGSTYVPKPVSWADETDDLEGDVSTTWHSNDDDVYRAPPIDRSILPTAPRAAREPNIDRSRLPKSPPYTAFLGNLPYDVTEDSIKEFFRGLNISAVRLPREPSNPERLKGFGYAEFEDLDSLLSALSLNEEVTGEFEWMLLIKHRIKTGMIVLLAEIEIGILTKQIQTGGPALPQTASMTTPLEEVMIALETVKYRDRYDSDRYRDGYRDGPRRDMDRYGGRDRYDDRGSRDYDRDDYTRDDYRRDDRAPKTQTESKASEYS	137471	100046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_-_100232_100868_100942_102073_102154_102710_102925_104163_104262_105787_106012_108693_108733_108971_109098_114240_114380_115284_115333_116985_117103_119337_119547_121847_121986_137434
931011	contig_854_pilon	+	1422	7	Intergenic	novelGene_36232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2799.28042837202	4	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	116	586	543600	562332	TRUE	35	AATATAACTTCAGGTGCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIAGPENRL	543484	563793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562309_562405_563029
931012	contig_15471_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_175217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	206	514	247324	247016	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLLQLRSTLFMSIILCPIVQSNLCLSWPQEWFYSFGLTENPEAMSSGVPPVLVKPLSLVLLLKFEFCIPLFSCPIRDSLSCSLSGQSLVVAGHHLVLLVSG	247529	245152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15471_pilon_-_245200_247500
931013	contig_6445_pilon	-	1565	15	Intergenic	novelGene_76913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_13	833.894428790208	3	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	172	1335	88578	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88604_89993_90107_96306
931014	contig_13823_pilon	+	607	1	Intergenic	novelGene_145278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCTTCATGGAACGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	326472	327079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13823_pilon_+_326500_327100
931015	contig_6228_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_164516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATATCTAGCTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512625	511216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6228_pilon_-_511200_512600
931016	contig_4213_pilon	-	1384	1	Intergenic	novelGene_124782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAATTTTCTGTGCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3552	2168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_2200_3600
931018	contig_15732_pilon	+	1243	1	Intergenic	novelGene_88864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGCTCCAGGAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87949	89192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_87900_89200
931019	contig_299_pilon	+	1842	1	Intergenic	novelGene_129438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	138	417	1033	1449	890237	890653	NA	45	AGAATTACATATCCAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAPASDQNKEPGNLPEEEKVLELLEVEFKRLIYRTLQDIRKIMQNTDQAKEHTDKAVEEFRKAVQDQNDKFNRLLEFTGRQQIEIQKINNKFSELDNSIESHRSRIEAMEVRISETKDKGLDTNLFEEKSDKRIFKK	889204	891046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_889200_891000
931020	contig_15010_pilon	-	1455	1	Intergenic	novelGene_175329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTTAGCAGCCAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91176	89721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15010_pilon_-_89700_91200
931021	contig_12624_pilon	+	1548	12	Intergenic	novelGene_60936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_11	280.300930377064	52	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	198	920	11704	53324	TRUE	25	GGAAAACTCTTCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLVYYSKRMQSRTSQRERHIRQGLRGSQT	5968	55584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_32960_33049_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_53241_53344_54975
931022	contig_3956_pilon	+	2907	15	Intergenic	novelGene_14999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1319.39410375384	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	708	2127	81	2207	1281682	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGASLSLTVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287347_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289576_1289737_1289892_1290297
931023	contig_17144_pilon	-	1898	8	Intergenic	novelGene_29220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2273.03475107439	9	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	679	1230	173384	166736	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRDEETETQMFTYPRSPSLPTTGQTPCRGPRSSQPSGPQHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	175000	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166823_170887_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876
931024	contig_10129_pilon	-	2628	5	Intergenic	novelGene_128155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATTTAAAAAATTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605396	446483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_446600_449284_449355_455187_455335_461331_461853_603622
931025	contig_12180_pilon	-	3307	2	Intergenic	novelGene_160353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	937	1389	116429	115977	FALSE	55	AAGAAACTCAGCAAAGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSRSTLFCLYVFGSCSSLSPLSHTHLGSTYHNPPLHPTKLHHTLNITPPSSTDTAYWNLSCTDLPACLRGCSQCHKQPIPATPLQKDLPCCTISERLTLPIGERSKKYCAHRRANNKQHKACQLRYTQIKQNKKKDETNKSTINKREK	117586	114058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_-_116693_116913
931026	contig_8145_pilon	-	1693	1	Intergenic	novelGene_118661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACTGACAGAAAAGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	849487	847794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_-_847800_849500
931027	contig_8063_pilon	-	2625	1	Intergenic	novelGene_152411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	74	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	242	592	13742	13392	NA	30	ATATGGATGTTATCCTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIQQKKTLPSPAPSSQSLLCLSPLLQPLCQSISLRVFLFLLTFYFTKHDVLLQQLISPDNIQYSSTPPQSKGVKILLWSSLLIVQLLHAYEATENIMAWVRRTSVFKVTSLFLTL	13983	11358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8063_pilon_-_11400_14000
931028	contig_17144_pilon	-	2060	11	Intergenic	novelGene_29496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1772.39125477418	3	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1527	250	1776	174965	166363	FALSE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176187	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166560_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
931029	contig_15130_pilon	+	1231	9	Intergenic	novelGene_177111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTTTGAGAGAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257569	308804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15130_pilon_+_257688_263181_263254_272770_273033_273953_274051_283114_283280_285133_285245_291601_291760_305846_305991_308700
931030	contig_18113_pilon	-	2244	1	Intergenic	novelGene_137527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAGAAGAGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119579	117335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18113_pilon_-_117300_119600
931031	contig_3723_pilon	+	1915	1	Intergenic	novelGene_178978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCGGGATCTTTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464579	466494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3723_pilon_+_464600_466500
931032	contig_4659_pilon	+	1569	1	Intergenic	novelGene_118222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATCCACCAGTTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765890	767459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_765900_767500
931033	contig_14679_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_174180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70038	71236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14679_pilon_+_70000_71200
931034	contig_5588_pilon	-	2005	1	Intergenic	novelGene_172836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTCACAAACAGCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	946899	944894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_944900_946900
931035	contig_12181_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_178087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATCTTTTATTATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5818	7110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12181_pilon_+_5800_7100
931036	contig_4119_pilon	+	1738	2	Intergenic	novelGene_179188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGAAAATATACATAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2367	4255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4119_pilon_+_3232_3381
931037	contig_2010_pilon	-	3452	3	Intergenic	novelGene_176264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	2287	2883	1679	1083	FALSE	45	GTGATTCTAACTCACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQMANRHVRKCSRSLTIREMQIKTTMRYHLTPALLERIKNTGNDKCWRGCGEMGTLMHCWWERKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDITFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMQYYAMRKNSSESVNHLITWMKLEDILLSEISQSQKDKYCMRPLL	206546	513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2010_pilon_-_2929_116414_117400_206494
931038	contig_10143_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_163346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACTTCCAAGACTAAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272040	271504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10143_pilon_-_271500_272000
931039	contig_3018_pilon	-	1566	13	Intergenic	novelGene_78871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	434.850517100098	9	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1431	136	1566	600079	562941	FALSE	75	AGAAGGAAAAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYAVSVKRPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYET	624793	562940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583603_585048_585179_600008_600194_624772
931040	contig_15304_pilon	-	1915	3	Intergenic	novelGene_30634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	664	junction_2	107.5	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	6	21	465	485	103265	103245	FALSE	20	GTTTATCATGGAGGTAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	105908	101814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103329_103548_103680_105638
931041	contig_8330_pilon	+	1451	2	Intergenic	novelGene_72004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	322	891	2131558	2132127	FALSE	60	GAATTGAAGAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPVIIRTWNVRSMNLGKLEVTKNEINCIEINILGISELKWTDIGHFESDSHMVYSAGNDQLKRNEVAFIVKKHILRPLLKYSAVSDRIASTCLQGRPVNTTYSNLHQPVMPKMRKLKIFTSFCSLKLIKHALIIIGNCNEKLGNEEGMVVGKYGLGDRNDTRDHMIEFCKTNDFFIANTFFQ	2127502	2132687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_2127703_2131436
931042	contig_10940_pilon	-	1499	3	Intergenic	novelGene_49222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1129.5	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGTTTGATTTTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	893173	874035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10940_pilon_-_874961_875126_875675_893147
931043	contig_19012_pilon	-	1969	1	Intergenic	novelGene_159472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAATTCCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8478	6509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_-_6500_8500
931044	contig_2100_pilon	-	1841	12	Intergenic	novelGene_50674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	821.571272241125	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	470	1413	80	1492	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGMCYMVSYFYQAKKKTTAIKLVQTHSNPIGQIFQLPGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185490	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180301_1182634_1182822_1185420
931045	contig_12951_pilon	+	490	1	Intergenic	novelGene_68242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACTTGAATTAGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	828901	829391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_828900_829400
931046	contig_854_pilon	+	1628	7	Intergenic	novelGene_36211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2799.28042837202	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	124	747	543600	562280	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIEREILCSGGPAPRLHHQGWNSLRPHSLAFCCVVWEGFFAQGPSPDRGLCSLVALSQTR	543476	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562104_562405_563029
931047	contig_5954_pilon	+	340	4	Intergenic	novelGene_28431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2160.41297492452	9	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTGATTCATCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97525	99031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_97533_98059_98163_98637_98694_98857
931048	contig_10904_pilon	-	2021	7	Intergenic	novelGene_22732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	348.782963396373	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	352	1335	662171	652201	TRUE	45	ACAGTGAGAGAATAAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRPVTIWCQGSLQAESYHLYKEQVSQLLGMWVAWNFRDKARFSIKSMSPNSAGQFQCIYNSSSGWSERSDYLQLVVTGMYSKPSFSAHPSPIVTSGGNVSLLCNSKDTMDTFHLLKEGGAGPPQHRESRFSAGRHQAVFPVDSVNISHGGIYRCYGSFRFSSHVWSHPSDHVDLKVTGTFEKPSLSAHPGPSVTLGENVTLQCRSESWCDTFHLFKEGFIAPPQHLHWQNNTGPFQVNFTMSLVNSVHAGTYRCYSSHSTSPYLLSQPSDPLELIVSEAANTTSLSKHKPDFKSASNSQDYTVENLIRMGMTGLVLVVLVVLLYQS	662743	650789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_651441_652165_652299_652444_652496_660333_660634_661462_661763_661936_662445_662665
931049	contig_3334_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_137677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACCTAACAACAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	735588	736946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3334_pilon_+_735600_736900
931050	contig_5236_pilon	-	2021	10	Intergenic	novelGene_100963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	226.492471190927	5	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	61	1221	1011714	1006673	FALSE	25	ATAAATTGCCTTTTAGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVARPHSCVNNVLQGMRDLASV	1011774	1005872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006731_1008541_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
931051	contig_3155_pilon	+	1905	4	Intergenic	novelGene_26364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	1141	junction_3	654.274322351786	2	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	78	584	258156	261211	FALSE	30	GTGATGAAGTTGCATTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258078	262532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082
931052	contig_7345_pilon	-	2724	2	Intergenic	novelGene_159197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1685	2341	323389	322733	FALSE	30	AACTTCATTCTCAAATGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDCPLEENALELADRELKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDNVIEGLRSRFETAEDRVSGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGKKTENTERIIEELLTENFPNILKDEKLAIQEAQRNPYRRDPKRKSPRQRCQI	325334	322349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7345_pilon_-_324598_324858
931053	contig_11124_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_179189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71392	70319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11124_pilon_-_70300_71400
931054	contig_5031_pilon	-	2672	1	Intergenic	novelGene_133192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	195	588	59	646	25673	25086	NA	35	GTGGGGTGCAGAAATCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRKTINVIHHINKTKHKNHMILSIDAEKAFDKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKPKANIILNGETLKAFSLRMGTRQGCPLSPLLFNTALEVLARAVRPKKEIKGIQIGREEVKVSLFADDMILYTENPKESTRTLLELIEDFSKVSGHKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPFTIASEKIKYLRMNLTREIKDLYNENYRILL	25731	23059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_23100_25700
931055	contig_2323_pilon	-	952	1	Intergenic	novelGene_151852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCATTTTTGTATTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131684	130732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2323_pilon_-_130700_131700
931056	contig_18251_pilon	+	1118	7	Intergenic	novelGene_50143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1127.51284791891	3	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	70	678	35759	53991	TRUE	30	GAATAGTGTGAATAGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTLQESYSQKRAGQRASSCKRYQFLCISLMLHLVLLASLGTLELMCYQQFILCTKGTTSEPPQSITEQLKRNLTLCVEMYNNVSSEHIISKNLSENKIRKLKNLVSQYCKDLKQKRKDPTCSKLWISHGEKCYYFSTEQKNHFCFEKNNSDCTMNHSLLMSINNEMNSNRAQSVLGFVLFIHCLPSPNSSVELNCTLNHES	28601	55322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_+_28660_35747_35799_44812_44912_48577_48794_50696_50879_53919_54027_54917
931057	contig_2892_pilon	+	1673	1	Intergenic	novelGene_118999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGCATGAATCATTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114768	116441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_114800_116400
931058	contig_8689_pilon	-	2470	2	Intergenic	novelGene_170025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CCAAATTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110427	100483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8689_pilon_-_101229_108702
931059	contig_5623_pilon	+	2078	1	Intergenic	novelGene_154847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1509	1808	208699	208998	NA	25	CACACCACCTACCTGCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQLDFYYTTWPRNVPRTAPVGHSRAGVGVLPAEKAGTCSKSLRNTGLGGHSGAEGRVLVPVACRDLCSLTGMLETEGPLVGLRHPHLSNFSLLFVFPC	207190	209268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207200_209300
931060	contig_8377_pilon	+	1322	10	Intergenic	novelGene_34926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	4576.13009991609	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1155	168	1322	68257	173000	FALSE	20	TCCAGGTAAGAGTTGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESWPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKR	68089	173000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161362_164383_164590_169245_169307_172896
931061	contig_5033_pilon	+	2224	4	Intergenic	novelGene_28931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGTGTTTGTGAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449430	465158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_451773_462933_463033_464549
931062	contig_3956_pilon	+	2085	11	Intergenic	novelGene_14906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	611	1836	83	1918	1281682	1290847	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281599	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287431_1290511
931063	contig_20527_pilon	+	1984	5	Intergenic	novelGene_138589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1242.62554697704	9	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGTTGTTAACCAATGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13494	28846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_24938_25417_25614_26238_26346_27308
931064	contig_2890_pilon	-	2067	1	Intergenic	novelGene_60267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATCTAAAGTACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264281	262214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_-_262200_264300
931065	contig_5341_pilon	-	876	2	Intergenic	novelGene_168020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTCAGTGCTTTTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340893	337805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338601_340812
931067	contig_4305_pilon	+	1716	1	Intergenic	novelGene_136694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAACTTTCACCTAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535031	536747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4305_pilon_+_535000_536700
931068	contig_2161_pilon	+	453	1	Intergenic	novelGene_114950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAAGGAGGAGTGTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	967471	967924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_+_967500_967900
931069	contig_10415_pilon	-	2570	2	Intergenic	novelGene_179190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	1399	2154	241638	240883	FALSE	55	CAAATAAGAAATGAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNFLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVMDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGN	244432	240466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10415_pilon_-_241744_243139
931070	contig_7843_pilon	-	917	5	Intergenic	novelGene_152016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	266.083633468878	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	163	591	197188	181279	TRUE	40	CAGAATGATATACCAAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYKGRPSGCWGRRGPLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKTGKHK	197350	178266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_181233_181296_182922_183092_187939_188132_197137
931071	contig_3747_pilon	+	2280	3	Intergenic	novelGene_24915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4993	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	784	1116	202819	203151	TRUE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTILSSNKSSSFLLLGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLVSEWGWL	201465	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_203532_204398
931072	contig_15666_pilon	-	2404	6	Intergenic	novelGene_70151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	1	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	187	1356	110619	107816	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110805	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
931073	contig_10793_pilon	-	3986	11	Intergenic	novelGene_83408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	427	84	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAGGCGGCGCCGCGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	168751	130905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_130997_152853_152970_159130_159266_159560_159642_160425_160555_161400_161473_162547_162693_163145_163288_163929_164068_164789_165375_166399
931074	contig_10734_pilon	+	2812	1	Intergenic	novelGene_51384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCCTGAAGAGGAAAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1891102	1893914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1891100_1893900
931075	contig_10003_pilon	-	2289	1	Intergenic	novelGene_88299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCAGGGTCACACAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	926787	924498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_924500_926800
931076	contig_8801_pilon	-	1677	1	Intergenic	novelGene_66240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATACTTACACACATATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179689	178012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8801_pilon_-_178000_179700
931077	contig_5317_pilon	+	1353	1	Intergenic	novelGene_76595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	152	459	323	781	387522	387980	NA	35	GGATAACTGAGACAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETLTFTLSFCWSPSGALFKSSAAKQKVSSLNSPAAPWKPLAEGNRRRSSMFFLSQTLTGYLNFLYCTPWRQKPSINAIHKSTGVYQDQRKARGLKGAHTHASASVSRCADGGPFHLTGCRPLGTTESLQGLVNEVPLIKQKETGGSYQNR	387199	388552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_387200_388600
931078	contig_11163_pilon	+	1366	1	Intergenic	novelGene_153056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAGAAATCCACAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89652	91018	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11163_pilon_+_89700_91000
931079	scaffold_12510_pilon	+	3450	2	Intergenic	novelGene_151427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	3073	3450	829604	829981	FALSE	60	AAAAAAAAAGCAACACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDKREKEGKENKTNQKKKKKSNTSSQRMALIEPPTRARRIQAAGGPGSRDCGPGKQRSKRTKAPGSNQRSSPDLEAVARPNVAPQPRRKGPRRLSESGTRAKGGGRQRVASENPKEAEKEKRGK	826405	829981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_828927_829052
931080	contig_9871_pilon	-	2597	1	Intergenic	novelGene_75628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCATTGCCATCTAGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335955	333358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_-_333400_336000
931083	contig_8254_pilon	+	944	1	Intergenic	novelGene_48404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTATTTCACTTCAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128679	129623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_128700_129600
931084	contig_15063_pilon	+	1969	7	Intergenic	novelGene_12271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	246	1718	28164	39515	FALSE	15	CTTATACTGCGTTCTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27918	39766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
931085	contig_17144_pilon	-	2872	17	Intergenic	novelGene_29500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2080.98134808887	2	123	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	691	2076	513	2588	174965	166363	FALSE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQEDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183217	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169048_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179719_179786_181794_181850_183158
931086	contig_14273_pilon	+	759	1	Intergenic	novelGene_21170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATGAGAAACTAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327462	328221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_327500_328200
931087	contig_8647_pilon	+	629	1	Intergenic	novelGene_178124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACTCTCTTTCGTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1131153	1131782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8647_pilon_+_1131200_1131800
931088	contig_15327_pilon	+	5346	2	Intergenic	novelGene_70461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	2503	2952	309852	310301	FALSE	30	CTTTGAAATCTTGAAACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSLTRQILMVRRAVQQSVSLKLLLLLYSHRAAAKPSQAWPQWRSVPSKPKEPPPPPAGIRRQKPAFVFLASVITNLYHSSWARFPVGAFMGIWGKGKRRAPLLVNGLHHEDLEQAKEDVSPSCAVFSPECAKVDVCSCFVTVSSSLLP	305385	312695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_+_305882_307845
931089	contig_1759_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_171318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCATAATCAAAACATTAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7937	6566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1759_pilon_-_6600_7900
931090	contig_11855_pilon	+	2056	5	Intergenic	novelGene_67115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	174.396817631515	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	436	1185	2445507	2446256	FALSE	30	TGGTGTTCAGAGCTATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQGAPRFLLTFDFDETIVDENSDDSIVRVAPGQRLPESLRATYREGFYNEYMQRVFKYLGEQGVRPRDLRAVYEAIPLSPGMGDLLQFVAKQGDCFEVILISDANTFGIESALRAAGHHGLFRRILSNPSGPDARGLLTLRPFHTHSCPRCPSNMCKHKVLSDYLRERAHDGVHFERLFYVGDGANDFCPMGLLAGGDVAFPRRGYPMHRLIQEAQKAEPSSFRASVVPWETAADVRLHLQQVLKAC	2440252	2447127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440407_2441567_2441665_2443329_2443442_2443768_2443832_2445497
931092	contig_7605_pilon	+	724	1	Intergenic	novelGene_172950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAGAGATGAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210627	211351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7605_pilon_+_210600_211400
931093	contig_6364_pilon	-	2082	6	Intergenic	novelGene_51826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_5	5.95315042645489	1	70	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	935	1333	1588512	1587638	FALSE	10	AACTGTGCCCTTGTGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSYSAKFASCFYGPFRDAAQSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDMVREVKDKHPELPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGKQARVGFFDLCLGD	1589930	1586888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_-_1587815_1588113_1588201_1588290_1588379_1588465_1588934_1589040_1589381_1589757
931094	contig_14973_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_171219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATGAAGAAAGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156819	155605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14973_pilon_-_155600_156800
931095	contig_10569_pilon	+	1677	1	Intergenic	novelGene_44076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCAGTTTTGTCTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276729	278406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10569_pilon_+_276700_278400
931096	contig_7963_pilon	-	718	3	Intergenic	novelGene_58416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCCCAGCTCCACAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63340	57332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_57563_57781_57938_63008
931097	scaffold_13505_pilon	-	1594	2	Intergenic	novelGene_111506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1038	1352	583853	583539	FALSE	45	CTAAATGACGCAGGAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESSKSVRTRPGADCITDHQLLICKFKMKLKKIRTGPQEPKYDLEYIPPELRDHLSNRSDTLNTNDRRPDEWWNHIKDIIHEESKRSFKRQKERKDLNGCQKRP	590872	583296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_584768_590749
931098	contig_20819_pilon	-	1471	4	Intergenic	novelGene_55654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAAGTGGGACGCGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43617	40962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_41207_41306_41392_41524_41567_42517
931099	contig_11629_pilon	+	946	5	Intergenic	novelGene_161188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	195.489769553294	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	63	944	164886	412417	FALSE	10	CACCGTGGATGCCGGCGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSASSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTMKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTPSRPAFNVQVKSAQPSSHYMSAPSPGQFYGAGAGPQGYSTQPVPVPGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLPPDPGMYPVPGPKKTYITDPVLAPCVPAMQPKGGHPGSMGPPAAPSSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPTDEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCFKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIP	164823	412419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11629_pilon_+_165260_165442_165525_251949_252077_311582_311753_412288
931100	contig_935_pilon	-	1250	1	Intergenic	novelGene_45572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGTATAGATAGGATTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608168	606918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_935_pilon_-_606900_608200
931101	contig_7378_pilon	+	2590	1	Intergenic	novelGene_120261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	50	397	438021	438368	NA	35	GAAACGTAGGATCTCAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKRKFKAQIAIVKDSMGKILNDAGSIKSRWKEHTESLYQKELVDIQPFQEVAYDQELMILKEEVQAVLKALAKNKALRIDGIPIEMFQQTDAVLVYAKKFGRQLPGQLTGRDLYLCPFQRKVIQENGEII	437971	440561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7378_pilon_+_438000_440600
931102	contig_4125_pilon	-	536	1	Intergenic	novelGene_25192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGATCAAAGAACCCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1375854	1375318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_1375300_1375900
931103	contig_854_pilon	+	4527	25	Intergenic	novelGene_36605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	3599.84488091732	62	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	1956	3770	1702487	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRVSMVIGLHSEGTCLSRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1686988	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702206_1702416_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
931104	scaffold_13505_pilon	-	394	5	Intergenic	novelGene_111500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3227	junction_1	4931.36636111129	4	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	372	21	392	547805	541337	FALSE	30	TCAGGGACAGAGAGATCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLT	548315	541334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_541353_541848_542033_547363_547465_547734_547806_548295
931105	contig_8373_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_176378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGTACATTAACCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26761	24008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8373_pilon_-_24000_26800
931107	contig_14970_pilon	+	1941	9	Intergenic	novelGene_45002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5039.45676635885	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	54	491	136145	192069	TRUE	15	CCACCTTAACTCTTTGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDPPALLTLSPVCPDTMNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPRKENTEPTLKTSIPATLQTMT	136091	232242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_191998_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
931108	contig_854_pilon	-	1069	7	Intergenic	novelGene_36286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGCTCAAGGCGCGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563800	543568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556200_557000_557063_557589_557751_562270_562362_563302
931109	contig_5643_pilon	-	2519	1	Intergenic	novelGene_39152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAGCTATAACTAGTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	667572	665053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_-_665100_667600
931110	contig_4426_pilon	-	1590	5	Intergenic	novelGene_15437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	722	junction_1	549.994772702432	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	508	1524	65	1588	890034	820955	FALSE	65	AGGTAAAACATTAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDK	890098	820952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991
931111	contig_7635_pilon	-	3236	1	Intergenic	novelGene_171366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTATGAAATCACGTAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	87451	84215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7635_pilon_-_84200_87500
931112	contig_6199_pilon	+	2357	1	Intergenic	novelGene_126422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATGAATTTTAAGATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722382	724739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_+_722400_724700
931113	contig_7119_pilon	+	1863	1	Intergenic	novelGene_40987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	106	708	139196	139798	NA	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	139090	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_139100_141000
931114	contig_9807_pilon	+	1359	1	Intergenic	novelGene_32902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTATATGAGCTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118657	120016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_118700_120000
931115	contig_5352_pilon	-	2464	1	Intergenic	novelGene_177077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1699	2055	529396	529040	NA	20	TATTTGGGCAATTTTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWIPHPWVWRLQCVRKAWCPVAASSPSWVTSIRPVSIESLLTHGNPVCVRAELSSIEFSVADFFRSRSSGLSPEAPVGELKPPPFLLAVKCVNLLHHTRTPPGPFHQNPLPLSGSKS	531094	528630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_528600_531100
931116	contig_15063_pilon	-	1540	5	Intergenic	novelGene_10550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	797	1120	35891	35108	TRUE	25	TGAGGTAGTCACATTGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	27135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_27170_34608_34923_35035_35380_35839_36156_36264
931117	contig_12951_pilon	+	3350	1	Intergenic	novelGene_68221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1387	1731	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795218	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
931118	contig_12605_pilon	+	934	4	Intergenic	novelGene_64218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4099	junction_3	1912.54548239309	4	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	290	934	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	4265	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_4535_4795_5072_5728_6005_6124
931119	contig_11215_pilon	-	5149	2	Intergenic	novelGene_118964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	99	113	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	1382	1735	5042	4689	TRUE	25	CGAGAAGACTTTGCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGLLISLTPHSLVSSVNPPKAVVSLDPPWYRLLEKDNVSLKCLPEGNSTQWWHNGSLISSQSSSYFIKSARVNDSGEYQCQTSSTLHSDPVQLEVHIGESIKGKREITKKGWNKRP	6423	1221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11215_pilon_-_1565_1617
931120	scaffold_13609_pilon	+	2758	1	Intergenic	novelGene_124407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAAAAAAACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536027	538785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13609_pilon_+_536000_538800
931121	contig_1725_pilon	+	2251	1	Intergenic	novelGene_24326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGAACCCTAGTGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261203	263454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_261200_263500
931122	contig_10734_pilon	-	1366	1	Intergenic	novelGene_51405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTGTGCTCTTTAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2063914	2062548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2062500_2063900
931123	contig_854_pilon	+	1388	7	Intergenic	novelGene_36271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2749.11646412685	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	78	452	543600	557691	TRUE	25	TAACTTCAGGTGCAGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKVSWTECGTTAPAHLSSWWAPSWTCGMTRTPSRS	543522	563797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543624_545920_545989_556082_556201_557001_557079_557603_557752_562271_562405_563054
931124	contig_11086_pilon	+	1835	1	Intergenic	novelGene_61195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACCCAAACCAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45330	47165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11086_pilon_+_45300_47200
931125	contig_3797_pilon	+	4081	2	Intergenic	novelGene_120108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	2287	3198	502859	503770	FALSE	70	CCCTGAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISTDAEKSFNKVKHPFLIKTLNKIGTVGKFLNIIKRIYAKPTANIILNRERLKTFPLRTRARQECPLSPFLFNIVLEVLARAIKQEKEIKCIQIGNEKVKLSLFADDMILYIENLKDSMRKLLEPIERFSRVAQYKINIQNSVGFLYTNKENNEKEIRKTIPSIIGSKKIKYLGINSTRDIKDLYKENYKTLLEETEKGLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMTILHEAICKYNVILIQTRTTFFKEMEKVLINFIWKEKQPRISKALLKKKNKVGGLALPDLRNYYTATVVKTAWYGINHYCKE	496265	504653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3797_pilon_+_497261_501567
931126	contig_2703_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_101837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGATTATAGCAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1257423	1258875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1257400_1258900
931127	contig_17560_pilon	+	1547	2	Intergenic	novelGene_167585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAATTCAACTGGAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123805	125540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_+_124672_124859
931128	contig_10437_pilon	+	1412	7	Intergenic	novelGene_38294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1034.01364701933	3	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	51	881	431167	451175	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431116	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432198_441768_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
931129	contig_10451_pilon	-	546	1	Intergenic	novelGene_138294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGCCATACTCTCAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83465	82919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10451_pilon_-_82900_83500
931130	contig_7420_pilon	-	1702	1	Intergenic	novelGene_85868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTGTATTTTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376608	374906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7420_pilon_-_374900_376600
931131	contig_4429_pilon	-	4205	2	Intergenic	novelGene_50811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1321	1641	180081	179761	FALSE	25	CAGATGTTACCCTAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVTTLISLGYISRSGIAGSNGMSISSFLRKGHIIFQNGCSILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAAVRWYLTVVLICIYPMASDHEHFLMCLLAI	236765	177196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_180199_235562
931132	contig_15939_pilon	+	2273	1	Intergenic	novelGene_160257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1616	1951	84043	84378	NA	55	AAAAAGTCATCTACAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASATSQNKESRNFPEEENFFELLETEYKRLIYRTLQEIRKEIKENPEHATEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQKINNKISELDNSTESQRSRIEAMEVRISEIE	82427	84700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15939_pilon_+_82400_84700
931133	contig_1276_pilon	+	3955	3	Intergenic	novelGene_159755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAATGAAAGTTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79278	169718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1276_pilon_+_80415_125034_125947_167811
931134	contig_12142_pilon	+	1902	6	Intergenic	novelGene_147813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	41.7296057973233	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1120	1701	108736	135686	FALSE	65	AAAAAGCAGAAGTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACLRGPPPTVCQARAENRVPNPGGPQSEFCQPGALQTCLPRLTEPSWRRGPGQQRPPLLWGSACPS	107616	135887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124894_135489
931135	contig_8357_pilon	+	1338	1	Intergenic	novelGene_39680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGAGTGGCTGATGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	140572	141910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8357_pilon_+_140600_141900
931136	contig_4364_pilon	-	1945	6	Intergenic	novelGene_550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	47	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	765	1154	1532546	1531972	TRUE	15	TGAGACCGACCGCGGCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPDSSYSCLLIHICWKVDSEARMEPPIQTEYLRSGGAMILIFIVLGASAVISFCILSAMPGYMVVPPDSTVLAYRSFRMSTSHFMMELKVVSWMPQDSIPKKEGWKRASGHRKRSLPMVITWPSGSS	1533310	1530449	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_1530518_1530887_1531015_1531093_1531335_1531616_1532054_1532156_1532341_1532422
931137	contig_1535_pilon	+	3085	2	Intergenic	novelGene_127222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGCAGCTACAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40616	44651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1535_pilon_+_40712_41661
931138	contig_9389_pilon	+	299	4	Intergenic	novelGene_84022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2136.54570640451	3	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCACTCCTCCCGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584379	586202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_+_584404_584805_584892_585654_585764_586122
931139	contig_12605_pilon	+	635	3	Intergenic	novelGene_64186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	7	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	25	393	3897	4829	FALSE	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3872	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
931140	contig_10734_pilon	-	1957	10	Intergenic	novelGene_51488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	489.524889340624	2	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	503	1471	2274500	2265543	FALSE	80	AAATAAAAGGAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSEKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2281121	2265056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2265841_2265930_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839
931141	contig_5200_pilon	+	2245	1	Intergenic	novelGene_140154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	29	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	1030	1359	173445	173774	NA	45	AAAAAAGATTTACAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPFWKTIWHLLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPRETRAITRIDVRTPMFTATLFIITKRWKHPRCPSTDEWINKQWYIHTMEYYAMVNNDESAKYLTTWMNLEGVMLNE	172415	174660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_172400_174700
931142	contig_10437_pilon	-	1895	1	Intergenic	novelGene_38238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAGATCCAATATTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343951	342056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_342100_344000
931143	contig_266_pilon	-	1517	2	Intergenic	novelGene_166310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	30	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAGACATACTCAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738901	737065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_266_pilon_-_737737_738055
931144	contig_9505_pilon	+	1281	1	Intergenic	novelGene_121861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	757	1080	561649	561972	NA	70	CGCCAAAAGAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYSSTLQMGFILILKHSGRFGFRGSSQKQIYVTTLAVLVEEPSGAVCAGRWSVSAVTECVTTSWLRKMATLLPRVKEANYPLKSSLNQKTIYLNKEGMSAMSIVLF	560892	562173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9505_pilon_+_560900_562200
931145	contig_14513_pilon	-	1447	4	Intergenic	novelGene_70325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1268.16332631969	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	198	470	18880	13056	TRUE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPTDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSGKFLHLFAHR	19077	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12223_13013_13136_14952_15001_18735
931146	contig_15977_pilon	-	2385	2	Intergenic	novelGene_137214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	101	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTCCTCGCCCAGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80287	77769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15977_pilon_-_78340_78472
931147	contig_6102_pilon	+	2207	16	Intergenic	novelGene_31906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	518.042186184356	3	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	602	1453	380930	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	374890	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_374976_375262_375300_375445_375513_378971_379032_379330_379487_379617_379687_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
931148	contig_9036_pilon	+	1086	1	Intergenic	novelGene_155442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTCTAACTCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76975	78061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9036_pilon_+_77000_78100
931149	contig_10627_pilon	+	2027	1	Intergenic	novelGene_60039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACATACAGGTAGGATATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	664500	666527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_664500_666500
931150	contig_5039_pilon	-	2789	2	Intergenic	novelGene_64774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1562	2065	129118	128615	FALSE	30	ATGGTAGACTGCTTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHLQKQDRMVPVSVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLLLRILQELKQKANKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIRKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLGTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNF	131062	127890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_129565_129947
931151	contig_2438_pilon	+	1312	5	Intergenic	novelGene_112047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	5931	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	60	659	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305106	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
931152	contig_11855_pilon	-	2534	6	Intergenic	novelGene_67114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	934	1536	2446229	2445627	TRUE	20	AGTCCCTCCAATCCCGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAHVSGSLPGHHAGAKGAGLRLLRLLDEAVHGVAATREGHVAACQQPHGAEVVGPVAHVKEALEVHAVVGPLAQVVAEHLVLAHVGGAARATVRVEWSQCQQPPGVWTRRVAEDATEQTVVAGGAQRALYAEGVGIRDENNLEAVALLGHKLEQVAHAGRQGDGFVDGTQIPRPHALLAQVLEDALHVLVVEALTVGGT	2447162	2440241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2440407_2441574_2441663_2443327_2443442_2443575_2443828_2444460_2444586_2445372
931153	contig_5092_pilon	+	1747	2	Intergenic	novelGene_62286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAATGACTCGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	389963	396895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5092_pilon_+_391619_396803
931154	contig_13760_pilon	-	2947	2	Intergenic	novelGene_61370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAATGCAGTACATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	478351	475292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_477278_477389
931155	contig_9843_pilon	+	2494	1	Intergenic	novelGene_114307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	573	1922	2494	9508	10080	NA	35	AACTGACTCAATGGCACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFILLGSIINAQRSSSQEIKRIIFGTCAAKDLFKVKKKNKDITLRTKVQLTQAMVFLIASYACESCTMSKEDGRRINASELSCWRRILNMPWTARRTKKSVVEEVPERSLETRMVRLCLTYFGHVNKREQSLEKGIMLGRVESQRKRGSLSVRWIDTVAATTGSNIATIVRMVQDWAVFRSVVHGVAMSR	7586	10080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9843_pilon_+_7600_10100
931156	contig_821_pilon	-	1912	2	Intergenic	novelGene_149403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGAAGCCCCAGCCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204013	200713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_201924_203311
931157	contig_14209_pilon	-	2287	6	Intergenic	novelGene_88358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	513	821	40498	38053	TRUE	70	AAAAAAAAAAAGAGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESVSCRAATAAASSLTACVKSSRSTSFLDDLGHVLSALILEPGQAEQLGHAPHTHHAVLIQQLSQAAATQPLQAWQQVHVCHTQHIIGHLRGQLQVWSLYM	41010	36113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14209_pilon_-_37217_37299_37421_37712_37810_37907_38073_40135_40343_40416
931158	contig_10541_pilon	-	1890	1	Intergenic	novelGene_144655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGAAAGAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343394	341504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_341500_343400
931159	contig_10013_pilon	+	1768	15	Intergenic	novelGene_125067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	66.1385759182173	2	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	543	1632	104	1735	369179	378938	FALSE	15	CTACGGGGATAGCCTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQLAVLTGEPLIFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCTYIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVTRLIHLLSQKILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAVLPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTLLLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQLEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGPGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYDKVFSRRADRHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRAREWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYVRASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPGNGHCPQHGRQDSHRH	368843	378971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10013_pilon_+_368943_369174_369307_369380_369505_369786_369901_370021_370098_372715_372860_373335_373400_373646_373816_373983_374167_374412_374532_374687_374845_375208_375326_375412_375483_375908_376030_378892
931160	contig_8674_pilon	-	2390	1	Intergenic	novelGene_102880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGAAAATAGGGAAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12292	9902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_-_9900_12300
931161	contig_10296_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_168871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79325	80456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_79300_80500
931162	contig_11896_pilon	+	3757	1	Intergenic	novelGene_88034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTTGTGATTGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155858	159615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11896_pilon_+_155900_159600
931164	contig_6137_pilon	-	2821	14	Intergenic	novelGene_59203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTTTGAGGATTCCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354909	1305933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1305961_1323816_1323947_1328104_1328336_1331695_1331859_1332172_1332308_1333463_1333519_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
931165	contig_16633_pilon	-	631	1	Intergenic	novelGene_165065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTGTTAAAGCCATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48310	47679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_47700_48300
931166	contig_6102_pilon	-	2752	19	Intergenic	novelGene_31902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.229061423645426	1	104	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1563	1901	380562	379707	TRUE	20	TCCAGTTGATATCTAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLFTCSTSSSNSAAVGRGVRRSRRKCRRPDGTSSRVSHSSRKPLFSTAVRLTLHLLPRKSSLSKSLSKTSTSSSWPGIDVTITSKTSFQRGLRSSRTTRLRKLRPASFSLT	395259	373922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373955_374377_374497_374585_374760_374886_375015_375443_375531_375634_375767_379396_379485_379615_379793_379953_380040_380158_380208_380317_380411_380537_380636_380899_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393867_394465
931167	contig_5799_pilon	-	1755	2	Intergenic	novelGene_50309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTCCATAGCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572539	570564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_571450_571669
931168	contig_1472_pilon	+	1868	1	Intergenic	novelGene_86140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	60	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGTACTGCCTAGCAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	719321	721189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_719300_721200
931169	contig_5236_pilon	-	2334	13	Intergenic	novelGene_100951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	212.003979915472	9	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	60	1811	1011714	1006391	FALSE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKFSRTSLAQISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLSLYSFYQWLEDPAPESAMLMTPKRLHEPALGLNWHLS	1011773	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006505_1007296_1007386_1007705_1007944_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
931170	contig_10953_pilon	+	1289	8	Intergenic	novelGene_42590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	17295.6043749236	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	246	662	459504	463828	FALSE	20	TAGTGGAACACGTCTGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAEQEPRGKTRGQGHGRPARPHLQPCPNSKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKEPLELEDLTSGLGLTKQGVGEVFI	455215	464455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455295_459337_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463465_463529_463817
931171	contig_5623_pilon	-	2925	17	Intergenic	novelGene_154825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	386.572109823963	2	98	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	696	1703	212265	209298	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGAGTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDRHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGPWTEPSRSSPFPVLATVWPPMCWASAIGTVTTS	275926	206929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207866_208429_208553_208959_209106_209280_209401_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212266_212424_212470_218046_218140_218220_218450_220829_221000_239340_239459_275886
931172	contig_7173_pilon	+	1228	2	Intergenic	novelGene_37546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAACAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540094	541364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7173_pilon_+_540832_540873
931173	contig_6445_pilon	-	1494	15	Intergenic	novelGene_76914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	609.551223341854	2	53	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	49	792	88578	64862	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGQGWHHPLHILGALHVPE	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64918_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
931174	contig_10296_pilon	-	2038	1	Intergenic	novelGene_168874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTACTATCTAGTTAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188809	186771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_186800_188800
931176	contig_6710_pilon	-	1345	1	Intergenic	novelGene_98342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GATAAAAAATAATCTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	657175	655830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_655800_657200
931177	contig_5696_pilon	+	4039	16	Intergenic	novelGene_117552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	614.308283084859	2	146	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1337	4011	27	4037	689252	737882	FALSE	35	CCTGCCAAACTTGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTLDKPLKMATQEKVSDEICQFDYAFLRELSPHLGIDAVKFGKELQEEERKDRAKMQKGFNSRMRSEAKRLKSFVTYNPYSSWTPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCCSLILFGASLRRLPIEDHKKLHPDCEFLLGKDVGNIGKYDIRVKNLEKNLRGDKVRYQEEEPRLESFKNWPFYAQGIFPSELSAAGFVFTGKKDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLQSKKSSEEIAQYIQSYKGFFDVTGEDFVNSWVKRELPMLSAYCNDSIFAHEELRLDSFKNWPHESLVGITALAKAGLYYTGVKDIVQCFSCGGCLENWKEGDDPLEDHAKYFPNCQFLQNMKSSAEVIPCLQSHGELSEITETTSESNVEDSVAISSTVSGVAREEAQWFREAKSLSERLRAVYTSASFRHMFLLEVSSHLATDQLLSCDLSISSKHISNHVQKPFVLPEVFAKLNSVMCVEGEAGSGKTSLLKKIALLWASGCCPLLNRFRLVFYLSLSSARLDQGLANIICDQLLETEGSVTEMCLRNIIQQLKNQVLFLLDDYKEMCSIPQVIEKLIKKNHSSKTCLLIAVHTKRTRDIRRYVHTILEIKEFPFYNTIYILRKLFSHNMTRLQNLMIHFGKKESLRGIQKTPLFVAAVCANWCQYPFDQSFDDIAVFKSYMECLFLKHKTEAELLKATVSSCGELALKGFFSSCFEFSDDDLTEAGVDANEDLVMYLMSKFTAQRLRPVYQFLNPVFQEFVAGRRLIELLDSDRLEDQDLGLNYLKQINSSMIAIGICKNFLIYVSSHPSTKGGPKIVSHLLHLVDDKQLFETISENDDYLKHHPEMSLKMECFRILWQLYPQGYLLQVSEELLVLALKIAYGSNTVAACSPFILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSCSKLEEIKFSGFFEAIPFVITLPNFISLKILNLGQQVFHDKEISEKFGSLQVGTDSMASNNMVFKIYTPDTLGSLNNLEELFLPTGDGIYQVAKLIIQQCQQLRCLRVLSFSQTLSDDSVMEIAKVAINGGFQKLENLQLSINNKITEEGYRNFFQELD	684392	737884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_684416_689248_689817_692386_692487_699374_699457_700408_700461_705014_705135_707517_707618_712911_712994_714014_714073_714624_716737_730428_730597_731914_732065_732417_732505_733586_733650_734430_734596_737775
931178	contig_11720_pilon	+	1303	10	Intergenic	novelGene_43807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	6	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	207	1268	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67857	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
931179	contig_6576_pilon	+	2319	5	Intergenic	novelGene_42324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	15.8823801742686	18	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	30	1112	599349	605897	TRUE	25	CATTGCATTGGGCAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGSDLTCKMNFPSLLLAGVRWRCCPAPLRSSLFQALHSSCCREKSTAPTKIIPNVAFCGENTKESGNALDKFFSSEQQASILRVLNTASNKELEAFKLLRGRKATNIVEHREKFGPFQNLESLMNVPLFQYKTTIQVCNSILFPETKKKKRKLQENRLLGKLIKPDIGRERLKALNSIVSIVFGTRRIAWAHLDRKMAVLDWQQDERCRMMKGTYLSSVYLEEMSLVVSKMPKADFYILEKTGLPIQNSSLFPILLHFHIVEAMLYTLLNKTFAQDGQHQVLSMNRNAVGKHFELMIGDTRTSGKELVKQFLSESVLKAEPRVFFPSDKVVQYRQMISSTEQNRVEELYDSLLQAIAFYELAVFDTEP	599319	607173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_599380_600400_600865_604575_604726_605459_606951_607019
931180	contig_7164_pilon	-	4882	18	Intergenic	novelGene_172144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	83	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTTGAGGCTCCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	560564	499227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7164_pilon_-_499474_501029_501156_503298_503406_507711_507843_510864_511178_512320_512416_513082_513274_515778_515875_516717_516786_522108_522206_526223_526300_532064_532189_533607_533759_534309_534398_544290_544442_552293_552409_554407_554520_557969
931181	contig_3111_pilon	-	1218	1	Intergenic	novelGene_129980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTTAAAAAAAAAAGCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112747	111529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3111_pilon_-_111500_112700
931182	contig_12414_pilon	+	1957	14	Intergenic	novelGene_59618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	107.867714293862	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	104	1375	533562	606875	FALSE	15	ACTTTGTCTTTGTGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLFGCVQGFIQAELKQCFLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANISKESIVDIEGVVRKVNQKIGSCTQQDVELHVQKIYVISMAEPRLPLQLDDAIRPEVEGEETSTSQAVFRLQSGICQLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVFCIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVVEEIADTLVQIFKGLQERFETEIQMVNKQFPCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGIEMGDEEDLSTPNEKLLGRLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGEEILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP	529812	607457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_529871_533516_533610_547805_547904_572412_572516_581024_581106_590501_590614_591474_591610_594018_594167_598846_598994_600305_600349_602678_602760_604056_604169_604420_604493_606783
931183	contig_8487_pilon	-	4562	3	Intergenic	novelGene_111922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	330	2081	294733	287018	FALSE	15	TGCTTCCCCCAGTATTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAELRDPAQVSMTFEDVAVTFTPEEWGQLDLAQRTLYREVMLETCRLFVSLGDSEKLETTELISCHQAMSEEVSLQDQMTQGASRNSRLEQAMDQKGPSNIQEGNLRPRTDLQKETLPRDISPEHDGMWTYESVCLGDVQEQVSPGDTFLKHDASGPGKDPSVHKEKNPYKCKECGKVFNRNCLLTQHERIHSGVKPYECRECGKTFSKSTHLLQHHVIHTGDKPFECTECGKAFNRRSHLTRHRRIHTGEKPYECSECGKTFTHRSTFVLHKRSHTGEKPFVCKECGKAFRDRPGFIRHYIIHTGEKPYECIECGKAFNRRSYLTWHQQIHTGVKPFECNECGKAFCESADLIQHYIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLKQHQRIHTGEKPYACSECGKAFTHYSTFVLHKRAHTGEKPFECKECGKAFSDRADLIRHYSIHTGEKPYECIECGKAFNRRSHLTRHQRIHTGEKPYECIECGKAFCRSTNLIRHAIIHTGEKPYECSECGKAFSRSSSLTQHQRIHTGRSPISVTDVDRPFTSGKTSVSIQELLEKDFLNVTTEENLWPKEPSYSVSDCS	295062	284536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8487_pilon_-_288613_293645_293773_294703
931184	contig_3601_pilon	-	1295	3	Intergenic	novelGene_132860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	986	1291	130167	129862	FALSE	65	AAGAATGAAGAAAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	202193	129857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_130848_160291_160580_202176
931185	contig_16303_pilon	-	998	1	Intergenic	novelGene_34115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTACCAGCTCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34685	33687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33700_34700
931186	contig_9836_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_176164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACCAGAATTGTAGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68350	67613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_67600_68400
931187	contig_6552_pilon	-	2036	2	Intergenic	novelGene_163581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32161	29945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6552_pilon_-_30335_30514
931188	contig_10225_pilon	+	1563	8	Intergenic	novelGene_86853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	657.927574948452	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	336	1322	42707	47511	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPDPSAGRVLSGGEHVSSVRGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDPTRRSRGSRYSPTRAISPGAPRSPPMGLQKWRKRKKSRTRGSLPSSSLLRTWRT	40236	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46816_47344
931189	contig_3956_pilon	+	1663	7	Intergenic	novelGene_14842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1562.83958976388	2	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	84	941	1281682	1288915	TRUE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVRGCPRPRQTPGVSAFYCPAVCALPFTLCPLSVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281598	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284328_1287932_1288077_1288874_1289082_1290452
931190	contig_14925_pilon	-	1671	5	Intergenic	novelGene_55345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	7	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	5	TGTGTGCACTTGCCTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	112102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
931191	contig_12951_pilon	+	3343	1	Intergenic	novelGene_68231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	1380	1724	796605	796949	NA	65	GATGAAAAGAAAATACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQRQQSISNHIKRQSMMASTSSQNKKCRNLPEEENFLELLEAEYKRLIYRTLQEIRKEIKQNAEHGIEEIKKIREEHNDKLNRLQESIERQQSEIQDINSKISELQPHKTKRD	795225	798568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_795200_798600
931192	contig_6915_pilon	+	1652	1	Intergenic	novelGene_162422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCGTCATTTTATTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263267	264919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_263300_264900
931193	contig_21007_pilon	+	1316	2	Intergenic	novelGene_161522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	1854	junction_1	0	42	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	48	470	589	1011	FALSE	35	TAAAAACTACGTATCTGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALKEDPSVPASSQHEDFELRSYSSTKRVLLQDVAHPWFTGPTENVLLGGFPQPLALAWRSPILLRVPCVPFSQFPFYSILTSPHASELTFCSHCFIKVFSNKHGVKIISFLQLQEKEVEIKEKMRIALQYNNCFHLYS	256	1857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21007_pilon_+_283_567
931194	contig_16303_pilon	-	1739	8	Intergenic	novelGene_34061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	687.734880099972	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	171	1004	40611	35759	TRUE	35	GTTATGTAAAAGCTTATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45421	32689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33121_35454_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38785_40443_40731_45370
931195	contig_1856_pilon	-	926	1	Intergenic	novelGene_84877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTCTGTTTGTTAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	240082	239156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_-_239200_240100
931197	contig_10861_pilon	-	1319	1	Intergenic	novelGene_39212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACCAGGTACTTAATTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512231	510912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_-_510900_512200
931198	contig_6654_pilon	-	1061	1	Intergenic	novelGene_85762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATACACCCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584673	583612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_-_583600_584700
931199	contig_8866_pilon	-	2120	3	Intergenic	novelGene_77912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	71.5	3	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	109	429	1205994	1169864	FALSE	35	GAAATGGACAGTGTCATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACSLVQFCYFQDLPAARDFLFPHLREETPSGAARRDPSKSADWEDDGWGAWEETEPQEPSLKMWTLDFQATWLCSQKHHAIPPQQRSEKLSQTESHVNPETLSIK	1206102	1168172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8866_pilon_-_1170005_1182622_1182688_1205879
931200	contig_3147_pilon	-	1823	2	Intergenic	novelGene_142294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTAGAACAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	353424	351134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3147_pilon_-_351458_351924
931201	contig_9995_pilon	-	2685	1	Intergenic	novelGene_47712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACCTCGATTTGCAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	360841	358156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_358200_360800
931202	contig_15063_pilon	+	1770	5	Intergenic	novelGene_12278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	4	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	219	1628	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27945	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
931203	contig_7342_pilon	+	3366	1	Intergenic	novelGene_71214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	64	195	153	347	681892	682086	NA	10	GCCCCAGTGCTCCAGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGPFRQQANKDHYNKLRQTCAKVRRKCRHTLCTQSFVQVSPASHRPFHLMTHMCIPEVCWPERPLPGLTPGRKKALKGIAEQMKEIRAEIQPNEKAFGHVKVQPANLYCVNCK	681739	685105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_681700_685100
931204	contig_5718_pilon	-	2087	1	Intergenic	novelGene_110424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	55	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGAAGAGATGCACACATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1465263	1463176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1463200_1465300
931205	contig_4364_pilon	+	2330	1	Intergenic	novelGene_23	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTCCTGTGTCATTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276299	278629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_276300_278600
931206	contig_12050_pilon	+	2919	7	Intergenic	novelGene_62741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	42	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	511	843	686048	686380	TRUE	35	AATGTCAAGTCCATGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRWGGRLSVLTETTTHMGGKLDLQDPLGLPVCLPQAPRAPTFKLLGTFGNFVSDAQQSLWAGVQGWGHAGQVPGKAACRGRLIRGTPQKFVKEKPINSRLGAAQGSSFS	685537	705050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_686711_687343_687463_693024_694174_694998_695128_696707_696777_697800_697947_704916
931207	contig_3155_pilon	+	1470	5	Intergenic	novelGene_26389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	55	561	258156	261211	TRUE	30	TGAAGTTGCATTACACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258101	262536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261350_261765
931208	contig_854_pilon	+	4300	24	Intergenic	novelGene_36572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	3201.04256527868	14	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	183	1946	1679334	1698310	TRUE	30	TAGAATTCCAAGTCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSSWRRSCSCRSSSRRRQSCVPRLRSSGPA	1678749	1716009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697806_1698222_1698401_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709609_1715130
931209	contig_3747_pilon	+	2326	5	Intergenic	novelGene_24929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4685.11542013641	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	938	1264	203794	204120	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	202366	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202864_202955_203128_203228_203651_203768
931210	contig_2438_pilon	+	1312	5	Intergenic	novelGene_112048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4923	junction_1	500.790562510916	5875	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	60	659	310588	312871	FALSE	5	TGGACTCTGGCTGTGTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQPGRENFQNWLKDGTVLCELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPKKSKENPRNFSDNQLQEGKNVIGLQMGTNRGASQAGMTGYGMPRQIL	305106	313524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_305138_310559_310768_311907_312083_312305_312409_312729
931211	contig_3095_pilon	+	1253	5	Intergenic	novelGene_74968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	79	843	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147162	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
931212	contig_5643_pilon	+	677	7	Intergenic	novelGene_38828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1788.3746500353	2	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	612	65	676	233973	238192	FALSE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSPSNSTRGRERPSQLLGSPCPNSIQHTENLPSSTQLPSVPPEEGVRGLESPTLSCTINKVYCTQ	233610	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236741_238002
931213	contig_11816_pilon	-	3123	1	Intergenic	novelGene_98520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAACAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	989208	986085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_986100_989200
931214	contig_14970_pilon	+	1469	6	Intergenic	novelGene_45052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	167	junction_2	5840.16278540248	4	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	666	770	231446	231550	FALSE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	191970	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_196136_196257_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
931215	contig_3956_pilon	+	2289	12	Intergenic	novelGene_15000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1388.88634857435	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	81	1184	1281682	1289152	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMDMVLWARRHWPQHPD	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284777_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1289105_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931216	contig_15825_pilon	-	2422	2	Intergenic	novelGene_160212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	140	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1051	1461	199460	199050	TRUE	20	CACTGACTGCTCTGACAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSICKKMKQDPYFTLYTKTKSKWIKDLNIKQKTVKIIEEKIGSMLEALTHAINRIQTITNNTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFIKRVKREPTDWENIFGYYKSDRGLISKIYKKIQDLYKKRQIIQLRNRQRK	200510	197961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_198161_198287
931217	contig_9098_pilon	-	1448	11	Intergenic	novelGene_75857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	150.210152786022	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	798	649	1446	345261	336317	FALSE	30	TACACAGTCTAAGCCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPA	350581	336314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350406
931218	contig_5020_pilon	+	1487	7	Intergenic	novelGene_27895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_2	473.205616572284	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	245	1174	122915	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	119453	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
931219	contig_14814_pilon	-	777	1	Intergenic	novelGene_137691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCACAGTATAGGGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77281	76504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14814_pilon_-_76500_77300
931220	contig_14687_pilon	+	3545	1	Intergenic	novelGene_107939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	117	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTCTCCTTTATTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514143	517688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_514100_517700
931221	contig_13633_pilon	+	1701	13	Intergenic	novelGene_15300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	464.71229899082	27	52	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1068	328	1395	22853	49142	FALSE	35	TTCTGTGTGATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSILLVIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVSGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEIDLVQIKQMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5022	49448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22111_22774_22890_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
931222	contig_9919_pilon	-	2843	1	Intergenic	novelGene_137946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1155	1508	527634	527281	NA	35	AATGGGCAGGGAACAATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSAAVNMGVHISIRVTALISLGYIPRSRVAGLYGTSISSFLRKCQIDFQSGCTILHSHQQCISVPVSPQPLQHLLFCVFWINASLVGVRWYLIVVLICISVMANDHEHVIMCLSAA	528788	525945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_-_525900_528800
931223	contig_854_pilon	+	5231	28	Intergenic	novelGene_36615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_27	3587.22160446022	95	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1328	3987	1	3987	1692680	1714980	TRUE	20	TACCATGTGCTACATGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1692679	1716393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715019_1715187
931224	contig_11846_pilon	-	1515	1	Intergenic	novelGene_105946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAATTAAAAAAAAAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263537	262022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_262000_263500
931225	contig_13074_pilon	-	2228	1	Intergenic	novelGene_153455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGACTTAGTATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	612742	610514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_-_610500_612700
931226	contig_5452_pilon	-	611	1	Intergenic	novelGene_101032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAGGAAATAATAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	572773	572162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5452_pilon_-_572200_572800
931227	contig_15135_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_119846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGCTACTCTATAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13276	15305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15135_pilon_+_13300_15300
931228	contig_10732_pilon	-	3183	1	Intergenic	novelGene_114699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAAGGTTCGAACCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101114	97931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10732_pilon_-_97900_101100
931229	contig_3825_pilon	+	3972	3	Intergenic	novelGene_77956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	23	junction_1	1504	38	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAAACTTCAGGCTGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13008	17306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_13772_13904_14198_14390
931230	contig_4180_pilon	+	2417	5	Intergenic	novelGene_8355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_1	1663.72133709344	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	166	513	882886	888134	FALSE	30	TAGATAACACCTTACTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865731	890038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
931231	contig_13760_pilon	+	1088	3	Intergenic	novelGene_61321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.5	2	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	399	974	202899	203597	TRUE	35	CACCAACCAGAGCCGCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLTLLPAPPPILPASASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKKVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGEDPRAGRGGQGLGSCPAPAPHCHGFLCCWLRGIASQEALGLKGPPWCTLLPRGAGLRPPH	202500	204556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_+_203118_203240_203631_204475
931232	contig_15837_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_147523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	4	582	66528	65950	NA	35	AAAGACCAGATTTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMPFITTPINIVLEVLAREIRQEKEIKGIQIDNEEVELSLFVDDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKLNIQKSVGFLYTSKQNDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKNLNKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGK	66531	64088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15837_pilon_-_64100_66500
931233	contig_4156_pilon	+	3255	1	Intergenic	novelGene_88121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	63	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	701	1003	452195	452497	NA	35	AGAGTCCAGCAGCATGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLITCPKYERRNVVILASKEYSDCTSSKTDLFVLLAAHGTFKILRQYHKSNTSILLQSSLFTVWLLHAYEVTENTMAWVGHTLVLKVVSFAF	451494	454749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_+_451500_454700
931234	contig_6069_pilon	+	1128	9	Intergenic	novelGene_8086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	64	junction_8	76.9998985388942	1	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1041	88	1128	598509	601026	FALSE	20	TGCCAGTACAACTTCCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVREPVRCSCSTQGTGFSCPSGVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVSEYLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVQKSIPASFGARAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSMPTYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFIIVAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPVIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILFVFDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITATVATFLLQLFEHDKDLKVVNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEYINEYYAKIGQFDKMKSPFEWDIVTRGLVAMTVEGFVGFFLTIM	598421	601026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6069_pilon_+_598604_598694_598801_598899_599012_599099_599161_599708_599884_600225_600342_600411_600560_600637_600762_600922
931235	contig_8772_pilon	+	1723	9	Intergenic	novelGene_21111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	9	1409	15355	23105	FALSE	15	AACTCTTGCTGTGTCAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAMSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15346	23419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
931236	contig_6241_pilon	+	2185	2	Intergenic	novelGene_156445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACATGAAGAAAGAAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	533713	537280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6241_pilon_+_534258_535639
931237	contig_11269_pilon	-	2548	1	Intergenic	novelGene_145805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	927	1337	251391	250981	NA	65	GGAAAGAAAGAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRIQFFHQDRLFSALPTGAPLWPLASALLGQVLQSSFSSADKCPEASHSASKPWLKVLSSSSLGWETHISCWSLLLTFLCHHFSLSSVLQLSLSFSFSQSPGSRRVSVQGSQVQRTCYTCGYFFLVVPYFKPSHL	252317	249769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11269_pilon_-_249800_252300
931239	contig_5419_pilon	+	3415	10	Intergenic	novelGene_15500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	592.510103054979	4	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	TRUE	35	GGTGAATGTACATATGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614_250823_251057
931240	contig_1406_pilon	+	2202	4	Intergenic	novelGene_25465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGTGCTTATCTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	765292	794585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_766730_773612_773797_776545_776808_794266
931241	contig_11422_pilon	+	652	1	Intergenic	novelGene_98961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6786	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGTTGGAGGGGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_+_0_700
931242	contig_2703_pilon	+	1890	4	Intergenic	novelGene_101784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	590	junction_3	270.556627878322	7	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	314	775	602068	606298	FALSE	45	CAAGTCAATATAGCTATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRGEASLARPLTAAGCIFPSWLRSMRGYVITSILAVFMLSCIPCSLSELI	601754	607413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_602152_603413_603520_605155_605221_606091
931243	contig_2890_pilon	+	1807	1	Intergenic	novelGene_60301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	61	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGGGAAGTTGTTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	422511	424318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2890_pilon_+_422500_424300
931244	contig_11292_pilon	-	828	1	Intergenic	novelGene_109435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGACCCCAAAAAACACAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273210	272382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11292_pilon_-_272400_273200
931245	contig_11590_pilon	+	1667	1	Intergenic	novelGene_125615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTACAGGCAGCAAATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	997033	998700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11590_pilon_+_997000_998700
931246	contig_2716_pilon	-	1378	1	Intergenic	novelGene_173565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGAAAGAAAAGATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	910947	909569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2716_pilon_-_909600_910900
931247	contig_17144_pilon	-	2016	13	Intergenic	novelGene_29532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2280.02666133291	1	59	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	828	1739	170784	166363	FALSE	25	TTTTTCTTTCTTAAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181846	166085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170876_174572_174751_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
931248	contig_5718_pilon	-	3408	1	Intergenic	novelGene_110415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1448293	1444885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5718_pilon_-_1444900_1448300
931249	contig_4093_pilon	-	3006	6	Intergenic	novelGene_27612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	279	junction_5	1863.92300270156	2	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	143	880	69245	41737	FALSE	45	AAGAAGAGAAGATCTCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGPALPHPGRWRRGGEGPGVLHAGRGAWVRTRSRGPARSCQPEHPVMDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	71859	39610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_71728
931251	contig_2114_pilon	+	3736	2	Intergenic	novelGene_104246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	869	junction_1	0	9	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	2433	2996	162419	165991	FALSE	70	AAAAAAGAAGAAGAAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETSNQKQQQQQQQQQQQHVTSWPGKQVETLRLWEEAVKARKKEAANLCQTSTAATTPVTLTTPFNITSSVSSGTMSNPVTVAAAMSMRSPVNVSSAVNITSPMNIGHPVTITSPLSMTSPLTLTTPVNLPTPVTAPVNIAHPVTITSPMNLPTPMTLAAPLNIAMRPVESMPFLPQALPTSPPW	159986	166731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2114_pilon_+_162555_165563
931252	contig_10926_pilon	+	3329	1	Intergenic	novelGene_137502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	2972	3307	6737	7072	NA	40	GATAACAAATGCCATCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVKSVEYIPRTAKRMNKFVLEEVRPECSLAARTVRLYLMYFGHVIRRDQSQEKDIMLGKAEGQQKRGRPSVRWTDIVAATIGSSIAAIMRMAQDRAVFHSVVHRVAMTQN	3765	7094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10926_pilon_+_3800_7100
931254	contig_8598_pilon	+	2440	1	Intergenic	novelGene_22874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1050	1403	15933	16286	NA	35	AAGGTTGAGAAGTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWHFLRKLEIDIPFDPVIPLLGIYPREIRVITRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINELWYIHTMEYYATRKNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKAKYCMRPLL	14883	17323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_+_14900_17300
931255	contig_5732_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_119602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAAACCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	364791	366043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5732_pilon_+_364800_366000
931256	contig_17144_pilon	-	1894	9	Intergenic	novelGene_29467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2441.14654158656	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	890	1606	167982	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183409	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168050_174866_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
931257	contig_11304_pilon	-	1469	1	Intergenic	novelGene_156673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTTTGCTTTACTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151304	149835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_-_149800_151300
931258	contig_9982_pilon	-	1633	14	Intergenic	novelGene_55757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	281.800130605838	1	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	351	1493	347427	339852	FALSE	25	AGCCTCAACTGTCCGATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKQYGSEGFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGVYSSSVLHGMVFKKETEGDVTSVKDAKIVVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVIVTGGKVADMALHYANKYSIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLKEMGHCHSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAIDDGVNTFKVLTRDRRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKASEVISKLYAVHQEGSKNAGLDIEAEVPAVKDMLEAGVLDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDEDQNE	353563	339711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_-_339930_342683_342804_343093_343259_343336_343409_343910_344027_344110_344199_344277_344345_345132_345312_346182_346321_347208_347271_347369_347544_349531_349624_350197_350255_353478
931260	contig_3426_pilon	-	1026	1	Intergenic	novelGene_57974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGTCTCATACAATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570774	569748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3426_pilon_-_569700_570800
931261	contig_5020_pilon	+	1414	4	Intergenic	novelGene_27915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_2	506.064774071023	3	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	2	445	123231	124560	TRUE	10	CCCTCTCTTGTAGCTGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTGELG	123229	126096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123364_124167_124363_124444_125091_125657
931262	contig_11978_pilon	-	2432	1	Intergenic	novelGene_62960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGACAGGAAAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1094484	1092052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_-_1092100_1094500
931263	contig_11316_pilon	-	679	1	Intergenic	novelGene_122659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGCGTTGGTGTAGGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138863	138184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_-_138200_138900
931264	contig_6137_pilon	+	2865	19	Intergenic	novelGene_59190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1386.07684771725	163	88	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	690	1382	1331821	1346752	TRUE	20	TATTAGTATTCTTTATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSRKTIGKVRGEFGESGYCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTM	1294879	1354719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1294950_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1331697_1331883_1332211_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346753_1347441_1347557_1348119_1348281_1353512
931265	contig_6364_pilon	+	4527	13	Intergenic	novelGene_51719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	131	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGCGGAGGCAACAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	433248	521112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6364_pilon_+_436283_436418_436500_439765_439985_440671_440788_445010_445153_447070_447147_457077_457255_458660_458794_466229_466365_472487_472639_486625_486734_490712_490800_521044
931267	contig_2799_pilon	+	558	1	Intergenic	novelGene_85596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAACAGAATTGGCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	782978	783536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_783000_783500
931268	contig_10074_pilon	+	2415	2	Intergenic	novelGene_57108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TACCAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237740	240202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10074_pilon_+_239710_239756
931269	contig_5023_pilon	+	2369	16	Intergenic	novelGene_7266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1931.9836438231	1	61	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	563	1692	76	1767	607279	646990	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580853	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609639_611792_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
931270	contig_14441_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_100508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	477.088762705642	46	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	398	1198	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	108128	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_108362_120971_121239_125517_125902_126159_126283_126514
931271	contig_2888_pilon	+	1675	1	Intergenic	novelGene_151488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAATATACTAGAAATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57048	58723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2888_pilon_+_57000_58700
931272	contig_13702_pilon	+	1516	2	Intergenic	novelGene_102651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	935	1234	211071	211370	TRUE	70	AAACCTAAAAAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPGMRQQQAERGHDRGSSVQTQDVSFKRCNSRDIMGTALTGAAPNSLASSQEAWYMQLSPEKDSIQSKPRHIQRRWELFRLTPSRKTGIWIFQIPTPQ	210136	273732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_211609_273688
931273	contig_7707_pilon	+	1631	1	Intergenic	novelGene_72140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	691	1167	126794	127270	NA	25	AATTAGGTACACTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKGASGLEEDSLTICYADDTALLAESEEDLKHLLIKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINREKIEVVKDFILLGSSINTHGSSSQEIKRCIALGKSTAKDLFEVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSIASYACKSWTTNKEDQRRIDAFQL	126103	127734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_126100_127700
931274	scaffold_880_pilon	+	2688	3	Intergenic	novelGene_121477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	684.5	48	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	608	907	484926	485828	TRUE	50	AAAAAAAAAATTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYSWLPMLLNERLNTGFFCLPIALEKLPPNYSMHCAEVTGELAVHCSEWPRSPTTFPDPHVLVLNLTQDACPVSERLSVSTQCLLRAPRTDKTQTRCC	484318	489052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_484938_485540_486607_488049
931275	contig_3956_pilon	+	2379	12	Intergenic	novelGene_14936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1222.39086281255	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	734	2205	81	2285	1281682	1290816	FALSE	40	GTGGACAGAAACTAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYPWTTSWTNCRWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1290910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284221_1286149_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289870_1290462
931276	contig_6102_pilon	-	2084	9	Intergenic	novelGene_31844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.330718913883074	424	15	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCAAACCGTAATCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395264	370728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371162_379322_379493_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
931277	contig_15967_pilon	+	2303	3	Intergenic	novelGene_179191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	810	1163	28883	29236	TRUE	65	AAAAAAAACAACAAGGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSTDEWINKLWYVHTMEYYATRKNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSEKDKYCMRPLL	26148	30423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15967_pilon_+_26490_28414_29679_29725
931278	contig_12786_pilon	-	4075	3	Intergenic	novelGene_103446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCACCAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	647756	623962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_626401_645949_645986_646155
931279	contig_5988_pilon	-	2817	1	Intergenic	novelGene_16161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGATTTATAGCCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1994885	1992068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1992100_1994900
931280	contig_15732_pilon	-	3436	2	Intergenic	novelGene_88889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1323	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2710	3012	218826	218524	FALSE	15	GCCACTGGCTATGTCAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAARVGKQFHIQVVFHSLSGRSKDGEWSQVFDRKEEEVVRGMEEIKRSRKKQHQQPTNGTQGAGQCRRVEFKQHWGEVGASWPRECGCRKQRGPSGGEEE	221758	218099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_-_219832_220054
931282	contig_15219_pilon	+	1766	1	Intergenic	novelGene_40841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGGTCATGGGCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35216	36982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15219_pilon_+_35200_37000
931283	contig_3956_pilon	+	3173	15	Intergenic	novelGene_14821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1122.4086640719	2	100	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	555	2654	1284132	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281597	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931284	contig_9024_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_177489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	23	964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9024_pilon_+_0_1000
931285	contig_15518_pilon	+	3429	5	Intergenic	novelGene_127617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	277.415752977368	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	310	834	15096	38068	FALSE	35	CAGTAATCTGGATCTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPGQQPSTPYLLLGGLLVGLKLLPSSSDGPV	11321	40663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_37273_37330_38035
931287	contig_5317_pilon	+	953	4	Intergenic	novelGene_76516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	661	junction_1	5328.87713834308	7	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	103	513	35282	43326	FALSE	35	ATGCAAGTACATGTTTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33686	43766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36684_36839_43197
931288	contig_6217_pilon	-	2285	4	Intergenic	novelGene_109603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	374845	352430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_354037_366764_366934_374083_374167_374418
931289	contig_4156_pilon	-	2567	1	Intergenic	novelGene_88131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATTAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	590417	587850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4156_pilon_-_587800_590400
931290	contig_6374_pilon	-	2419	1	Intergenic	novelGene_158436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	218	565	86350	86003	NA	60	ACTTAAAGCACAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAERSTPFHLHHILVRQQGAGVALCMIQQGADTARLSDFPRSHRESFGQSRASKLSAGPPCSPHVLAEGVPTDECEFSPCGWVHWKTAPTIVCAALGKWEPLCSWHSSVPTKC	86567	84148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6374_pilon_-_84100_86600
931291	contig_3956_pilon	+	1775	10	Intergenic	novelGene_14904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1456.50304191619	3	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	83	658	1281682	1285126	TRUE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIIST	1281599	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284229_1285124_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287398_1290511
931292	contig_5341_pilon	-	933	2	Intergenic	novelGene_168017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGTGCTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	340893	337804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338624_340779
931293	contig_5020_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_27927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	123	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGGAGAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138003	136350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_136400_138000
931294	contig_15407_pilon	+	1511	9	Intergenic	novelGene_123070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	707.780498724711	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	320	1204	449761	470402	FALSE	25	CTGGTTTATGCACAGTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIARVLCSVITTLFLPVLLRSSNNSRVD	449441	470709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468243_470316
931295	contig_7078_pilon	-	2841	2	Intergenic	novelGene_130166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTCCAAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	639210	608266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_-_610583_638685
931296	contig_20241_pilon	+	1198	1	Intergenic	novelGene_159752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTCTGTTTCAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274030	275228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20241_pilon_+_274000_275200
931297	contig_6208_pilon	+	3483	2	Intergenic	novelGene_52996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1136	1441	413902	414207	FALSE	70	AAAAAAAAAAAAAGTTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPETLLKSSISSSSFLVDSLGFSVYEIISSANRETLTFSLPIWMPFISFSSLTALASTSSTVLNNSGDRGHPCLIPVLMGNAFKVSPFRMMLAVGFV	411727	416249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_+_411847_412885
931298	contig_10948_pilon	-	1544	1	Intergenic	novelGene_124975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	296	891	85	975	140524	139634	NA	30	GCACCAGTTTCAAGTAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDITADVRWILAENREYQKNFYLCLIDMDHNKLWITFQKMGALDTLNCTHEEPAHRSRTEQGDTMWFKVRKSVCRGCILLPYSFNLYAEQIIQEAGLYEEHGIRIGGRFINNLQYADNITLLAESEEDLKHLLIKNKSLQYGLHFNIKKTKILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILFGSTINIHGSSSQEIKRCIALGKPAAKDLCKVLKSKDVTLRTKVCLTQAMVFSSASYVCQSWTMSKKDRRRTDAFELWCWQSILNIPRTSRRMNRSVLEEVQPECSLQARMGRLCLTYIGQVIRRDQSLEKDNMLGKAEYQQKEEDP	140608	139064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10948_pilon_-_139100_140600
931299	contig_5253_pilon	-	1094	1	Intergenic	novelGene_61576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAATAGCAACTGCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	264582	263488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5253_pilon_-_263500_264600
931300	contig_7728_pilon	+	1260	1	Intergenic	novelGene_64723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGACCTCGACCACGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	751130	752390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_751100_752400
931301	contig_13863_pilon	+	1894	12	Intergenic	novelGene_42087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	405.962462133086	4	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	125	1267	474588	489638	TRUE	65	AAAAAAAAAAAAATCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSKFWKRCGTSHQYQGCWGKASKFWFCGF	455992	490596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_456093_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_489001_489556_489676_490006
931302	contig_10500_pilon	+	3233	8	Intergenic	novelGene_41267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGCAAAACTCAGACCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626845	1640127	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1628751_1629390_1629573_1630548_1630730_1633137_1633231_1635076_1635615_1636938_1637066_1639870_1639977_1640026
931303	contig_3956_pilon	+	1457	6	Intergenic	novelGene_15027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1301.86798101804	3	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	81	935	1281682	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284207_1289782_1289892_1290297
931304	contig_16303_pilon	-	2314	6	Intergenic	novelGene_34058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	787.581767183573	9	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	70	630	47976	35759	TRUE	25	CATTTGCCATTTCAACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48045	32591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33555_35037_35764_35980_36029_37169_37302_40433_40731_47897
931305	contig_13101_pilon	+	878	1	Intergenic	novelGene_172774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAATGAAATAAAAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49673	50551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13101_pilon_+_49700_50600
931306	contig_13700_pilon	-	2102	1	Intergenic	novelGene_68271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	877	1332	90123	89668	NA	25	ATGGTCTTGGGGAACATCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIEDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHDISRIQTITINAQTPKDKLDDWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKVFGQYKSDKGLTSIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCS	90999	88897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13700_pilon_-_88900_91000
931307	contig_7027_pilon	+	1383	1	Intergenic	novelGene_164331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAGAAAGCAAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63500	64883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7027_pilon_+_63500_64900
931308	contig_1435_pilon	+	5858	24	Intergenic	novelGene_115470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	134	junction_21	77.4312793680607	343	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	962	2889	74	2962	286782	329270	FALSE	40	AGTAACTTGGTAACAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCGFFSGIRGHAYCNQETPSIAAGMDERALLGLNPNADSDFRQRALAYFEQLKISPDAWQVCAEALAQRTYSDDHIKFFCFQVLEHQVKYKYSELTTVQQQLIRETLISWLQAQMLNPNPEKTFIRNKAAQVFALLFVTEYLTKWPKFFFDILSVVDLNPRGVDLYLRILMAVDSELVDRDVVHTSEEARRNTLIKDTMREQCIPNLVESWYQILQNYQYNNSEVTCQCLEVVGAYVSWIDLSLIANDRFINMLLGHMSIEVLREEACDCLFEIVNKGMDPVDKMKLVESLCQVLQAAGFFNIDQEEDVDFLARFSKLVNGMGQSLIASWTKLIKNGDIKNAQEALQAIETKVALMLQLLIHEDDDISSNIIGFCYDYLHILKQLTVLSDQQKANVEAIMLAVMKKLTYDEEYNFENEGEDEAMFVEYRKQLKLLLDRLAQVSPELLLASVRRVFSSTLQNWQTTRFMEVEVAIRLLYMLAEALPLSHGAHFSGDVSKASALQDMMRTLVTSGVSSYQHTSVTLEFFETVVRYEKFFTIEPQHIPCVLMAFLDHRGLRHSNGKVRSRTAYLFSRFVKSLNKQMNPFIEDILNRIQDLLELSPPENGYQSLLSSDDQLFIYETAGVLIVNSEYPAERKQALMRNLLTPLMEKFKILLEKLMLAQDEERQASLADCLNHAVGFASRTSKAFSNKQTVKQCGCSEVYLDCLQTFLPALSCPLQKDVLRSGVRTFLHRMIICLEEEVLPFIPSASEHMLKDSEAKDLQEFIPLINQITAKFKIQVSPFLQQMFMPLLHAIFEVLLRPAEENDQSAALEKQMLRRSYFAFLQTVTGSGMSEVIANQGAENVERVLVTVIQGAVEYPDPIAQKTCFIILSKLVELWGGKDGPVGFADFVYKHIVPACFLAPLKQTFDLADAQTVLALSECAVTLKTIHLKRGPECVQYLQQEYLPSLQVAPEIIQEFCQALQQPDAKVFKNYLKVFFQRAKP	286708	332166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1435_pilon_+_286842_295763_295847_297761_297819_298431_298502_299251_299471_300356_300542_300640_300810_302026_302264_303215_303255_303388_303452_307596_307722_308104_308250_308408_308529_308891_308987_309603_309674_311440_311680_312577_312864_314124_314315_314833_314951_317019_317136_317828_317877_319393_319466_326491_326549_329243
931309	contig_5413_pilon	+	2516	1	Intergenic	novelGene_168091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCAACTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333858	336374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_+_333900_336400
931310	contig_9121_pilon	-	855	1	Intergenic	novelGene_134431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCACTAGATGACTAAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55756	54901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_-_54900_55800
931311	contig_3529_pilon	+	2379	9	Intergenic	novelGene_105404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_1	89.5195509372115	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	39	701	790564	806420	TRUE	15	GTTGGCCTTTTTTTTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERQLEAARYRSDGALLLGASSLSGRCWAGSLWLFKDPCSAPNEGFCSAGVQTEAGVADLTWVGDKGILVASDSGAVELWELDENETLIVSKFCKYEHDDIVSTVSVLSSGTQAVSGSKDFCIKVWDLVQQMVLNSYRAHSGQVTCVAASPHKDSMFLSCSEDSRILLWDTRCPKPASQIGESESQWWEDGGARNPPRRGFFGQSQRQSYQMPTHCDVGT	790525	810474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3529_pilon_+_790601_790854_791041_792027_792170_792674_792725_806012_806084_806243_806844_807636_807746_808481_808551_809397
931312	contig_7051_pilon	+	2411	14	Intergenic	novelGene_64329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_13	519.107757508328	1	106	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	668	2007	312	2318	331836	348229	FALSE	15	CCAGAATCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSALEPKKEHKEKEKQGRSRSGSSSSGSSSSNSRSSSSSSTVSSSSYSSSSGSSRTSSRSSSPKRKKRHSRSRSPTVKARRSRSRSYSRRIKIESNRARVKIRDRRRSNRNSIERERRRNRSPSRERRRSRSRSRDRRTNRSSRSRSRDRRKIDDQRANLSGSSHKHKDQQPLPVVNAEE	321837	348322	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_322784_322886_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867_347510_348191
931313	contig_10953_pilon	+	330	1	Intergenic	novelGene_42606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1	318	464134	464451	NA	5	CACGTCTGGCTCTGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQQPQHGTPRSRPAVKGNAQGERTTPPPALGTFAILLSYLTSSLGFSSLFAWGRATLFPFPSTTHPGSQPFHPQPLLTLCQLHCPVFSAHQACPQPRPGSCKNKR	464133	464463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_464100_464500
931314	contig_19701_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_147885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	113	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAACTAGAAAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55516	58092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19701_pilon_+_55500_58100
931316	contig_17144_pilon	+	2429	13	Intergenic	novelGene_29217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	278	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	20	GCAGGACAGGTTGTACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	174968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170931_172525_172742_173131_173211_173306_173463_173583_173752_174574_174760_174875
931318	contig_8544_pilon	+	1092	8	Intergenic	novelGene_55906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	13	junction_4	386.065818645643	25	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	753	1091	34461	90624	FALSE	45	TAAGTATTGGTAATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHKAFQQDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQL	18367	90625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_27777_27946_32276_32381_34382_34485_83417_83520_83788_83836_90458
931319	contig_5419_pilon	-	3139	2	Intergenic	novelGene_15538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACAAAAAAAAACTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	446424	418100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_-_420300_445484
931320	contig_5918_pilon	+	2000	1	Intergenic	novelGene_99543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGCGGAGTCAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727685	729685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_727700_729700
931321	contig_5566_pilon	+	1943	2	Intergenic	novelGene_153670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAACTTTCACCTAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198216	200245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5566_pilon_+_199338_199423
931322	contig_4083_pilon	+	2299	1	Intergenic	novelGene_152326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAATACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61209	63508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4083_pilon_+_61200_63500
931323	contig_14687_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_107934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGAAGGATGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	495645	495208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_495200_495600
931324	contig_10930_pilon	-	699	1	Intergenic	novelGene_37081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTTTGTCCACAGGATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288719	288020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_288000_288700
931325	contig_9186_pilon	-	1526	1	Intergenic	novelGene_85354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGTTACTTCATGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	472767	471241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_471200_472800
931326	contig_16496_pilon	-	1531	2	Intergenic	novelGene_5200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	4	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
931327	contig_5041_pilon	-	3239	17	Intergenic	novelGene_27062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	835	junction_3	385.636846454991	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	738	2217	198	2414	605390	525456	FALSE	45	AAATGTAAATCAGAGTACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARNLSRPDELEDPEDSKEDENVPTAPDPPSQHLHGHGTGFCFDSSFDVHKKCPLCDLMFPPNYDQSKFEEHVESHWKVCPMCSEQFPPDYDQLCFERHVQTHFDQNVLNFD	616708	524630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559
931328	contig_7022_pilon	-	2660	1	Intergenic	novelGene_142131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGCAGATAACCATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46855	44195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7022_pilon_-_44200_46900
931329	contig_3627_pilon	+	2604	18	Intergenic	novelGene_78440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	325.875992717717	1	103	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	796	2388	215	2602	294394	323562	FALSE	70	AGATGAAAGAAAAGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQFGGQKNPPWATQFTATAVSLAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSRERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKSEKEEEEEDDRKSEDDKEEEERKRQEEMERQRRERRYILPDEPAIIVHPNWAAKSGKFDCSIMSLSVLLDYRLEDNKEHSFEVSLFAELFNEMLQRDFGVRIYKSLVSLPEKEDKKEKDKKSK	292739	323564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294340_294459_297718_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309391_309492_309607_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589_318776_320225_320418_323439
931330	contig_4180_pilon	+	570	1	Intergenic	novelGene_8411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACCAGCTTTGGAGCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888136	888706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_888100_888700
931331	contig_7119_pilon	+	2505	3	Intergenic	novelGene_40908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	3	124	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	200	1354	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
931332	contig_11989_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_68460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTCAAGCTGAAGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115041	116185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_115000_116200
931333	contig_19890_pilon	-	2299	1	Intergenic	novelGene_138545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAATCATCTTTAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152767	150468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19890_pilon_-_150500_152800
931334	contig_7688_pilon	+	3298	3	Intergenic	novelGene_160396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	145	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATATCATCTCCATTTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76909	84991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7688_pilon_+_78735_78792_78855_83580
931335	contig_5899_pilon	-	2189	1	Intergenic	novelGene_146978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAAAAAAAAAATACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158083	155894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_-_155900_158100
931336	contig_2125_pilon	-	2212	1	Intergenic	novelGene_147733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGCTTCCCTTCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	631773	629561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_-_629600_631800
931337	contig_2770_pilon	-	1326	6	Intergenic	novelGene_107481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	25	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	218	667	750561	743833	FALSE	10	ATGGGTGTCGGTCTGTCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750778	743173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
931338	contig_13954_pilon	+	1543	2	Intergenic	novelGene_130058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCTTTAAGTGGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91218	93126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_91782_92146
931339	contig_9839_pilon	+	910	1	Intergenic	novelGene_88578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACACTGAATTCAGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	323221	324131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_323200_324100
931340	contig_7106_pilon	-	3030	1	Intergenic	novelGene_148309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	122	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCCAGCTTTATGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	416140	413110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7106_pilon_-_413100_416100
931341	contig_12074_pilon	+	941	1	Intergenic	novelGene_53779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTGGTTTCCTTCTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54646	55587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12074_pilon_+_54600_55600
931342	contig_1863_pilon	-	2044	1	Intergenic	novelGene_156517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	460	813	46958	46605	NA	15	TTAAGCCCAGTTGTGTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDSSVQYGLHRSSKKTKILTTGLVSNIMINREKIEVVKDFILFGSTVNAHGSSSQEIKPCEQPSKILHWSHPFGSKGERRKQVYSKGLMDHNYNGLHQTESSTTRLSCPATTTD	47417	45373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1863_pilon_-_45400_47400
931343	contig_3956_pilon	+	2540	13	Intergenic	novelGene_15220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1343.54502829476	5	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	188	2020	1284120	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHASGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1283853	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286418_1286606_1287276_1287536_1287968_1288063_1289130_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931344	contig_10990_pilon	+	3381	17	Intergenic	novelGene_7483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	464.217082839484	24	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	1430	2509	722379	744736	TRUE	60	AGTGCAAAAACTTTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATGEYKRREETSGRK	714799	752151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_715994_720157_720247_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731992_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738958_744699_744780_749169_749501_750918_751083_751451_751520_751885
931345	contig_7840_pilon	-	2545	11	Intergenic	novelGene_69030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	354.631653973528	1	132	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	662	1288	393286	367557	TRUE	0	CTTTCTGTCCTGGCTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYITVALLIWNFGVVGMISIHWKGPLRLQQAYLIMISALMALVFIKYLPEWTAWLILAVISVYDLVAVLCPKGPLRMLVETAQERNETLFPALIYSSTMVWLVNMAEGDPEAQRRVSKSSNYNAQSTENVAQNSVAANDDGGFSEEWEAQRDSHLGPHRSTPESRAAAQELSSNIQPSEDPEESISFSIVFWLVKPQQQRVETGTQP	445726	364879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_366114_367533_367627_373192_373371_378785_378873_389409_389509_393093_393315_395375_395444_403175_403288_406674_406882_427609_427738_445608
931347	contig_8254_pilon	+	3126	1	Intergenic	novelGene_48401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	127	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1926	2288	127000	127362	NA	10	TGCCCTTAGGGATCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSVSEILFIFWISNCCLCVISSCEFILEFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLCIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSVVLFWMPTGTILSYFCKCFDIVCCFRGIE	125074	128200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_+_125100_128200
931348	contig_10642_pilon	-	872	1	Intergenic	novelGene_78727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTGATCATTAGGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	971241	970369	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_970400_971200
931350	contig_8617_pilon	-	956	1	Intergenic	novelGene_73431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAATATGTCTGACAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62987	62031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62000_63000
931351	contig_3747_pilon	+	1591	7	Intergenic	novelGene_24860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	317	1324	201313	204565	FALSE	30	CAACACTGTGATCATAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSSLFFESVALCSPVGNIFIWENVFLFFM	200996	204832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203323_204482
931352	contig_18168_pilon	+	991	5	Intergenic	novelGene_122086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	494	901	24927	26087	FALSE	10	CGCGGAGGAGGCGCCCGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLPSQGERLGQPLVLHMTRISLLLSRGHHHSCPFLEGPVPHRPGLHKLHVLGLVLPIPLPGQGDLRRVEAQGPAPQLDLMFRDGVVSHLCLWGYLCAAASPSRSPGTDGATPHTCPPGRPSHSRPPGPSPTCAG	23484	26177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_+_23842_24381_24417_24825_24935_25038_25312_25960
931353	contig_8377_pilon	+	2423	20	Intergenic	novelGene_35019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3634.43881824219	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1215	1207	2421	154883	180506	FALSE	20	CGTGAGTCTGTTTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	68219	180508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68338_128717_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136391_140768_140976_142257_142384_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
931354	contig_6361_pilon	-	3480	7	Intergenic	novelGene_23964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	4913.11696719438	15	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	25	CCAGGTAGCTGTCTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436455	390594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_390827_400359_400599_408739_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
931355	contig_1335_pilon	-	3419	3	Intergenic	novelGene_166518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGATTGTGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621485	498775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1335_pilon_-_500878_501620_502395_620942
931356	contig_7912_pilon	-	2925	1	Intergenic	novelGene_129576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAAGAAGGCAATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	320801	317876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7912_pilon_-_317900_320800
931357	contig_13856_pilon	+	2558	2	Intergenic	novelGene_179192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGAAAATCACATCAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21589	24553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13856_pilon_+_23914_24319
931358	contig_5033_pilon	-	1458	6	Intergenic	novelGene_28956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	500	junction_5	791.590298070915	9	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	129	1100	477189	451466	FALSE	70	TAAGAAAGCAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLGECFRPALHHDLGPPMACLWTCL	477317	451107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_477113
931359	contig_15063_pilon	+	1549	5	Intergenic	novelGene_10323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	237	1409	34808	36661	FALSE	30	AAGATGCTGGTCCTAAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27132	36801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
931360	contig_12132_pilon	-	2476	1	Intergenic	novelGene_179193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTCAGCAGTTCTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151068	148592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12132_pilon_-_148600_151100
931361	contig_1836_pilon	+	5921	1	Intergenic	novelGene_71040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	173	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCAGCAATTCTACTCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	679229	685150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_679200_685200
931362	contig_7627_pilon	-	5130	7	Intergenic	novelGene_175557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	4230	4757	10721	9874	FALSE	50	AAAGATAAATATAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGIQESEREGRDREMRPKEAEKEKREKKKKKKKKSNTCSPHTAPKEPPALARGIQAACSFEPRARGPGKQRSKRTKAPVPRPCSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGNERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPQPRDLGHGKQGSPSRG	269217	9500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_-_10303_10622_11922_42571_43053_44332_44641_68437_68657_267157_269034_269072
931363	contig_13995_pilon	+	1798	1	Intergenic	novelGene_164086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	1441	1797	50335	50691	NA	25	TGTGAGTCAGAACCAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQPKCPSMNKWINKIWYVYGILNIPWTVRRTNRSVLEKVQPECSLELKMVRLCFMYFEHFIRRKQSLEKDIMLGKAEDQQKRGSSSMRWIDTVAAVMASNIAKVVWMAQDQAVLYIGS	48894	50692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13995_pilon_+_48900_50700
931364	SIRV7	-	1820	6	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	282	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	65	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147636	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1944_2334_2676_2993_3112_3809_3897_114680_114989_147608
931365	contig_14744_pilon	+	2740	1	Intergenic	novelGene_65922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGAAAAGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	119908	122648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_119900_122600
931366	contig_17144_pilon	-	2057	16	Intergenic	novelGene_29443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2225.29217457444	9	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	77	1015	179764	173344	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALDPPPQALWPSPSHSLHPADALHPLAPARPLE	181849	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166086_167601_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173440_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
931367	contig_12007_pilon	-	3181	3	Intergenic	novelGene_179194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACACAACATATTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	192580	137903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12007_pilon_-_137996_139007_141074_191557
931368	contig_2703_pilon	+	194	1	Intergenic	novelGene_101656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACGGTGTGAGGCCGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1373	1567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1400_1600
931369	contig_8552_pilon	-	1313	14	Intergenic	novelGene_80083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACAGGATATGGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518947	500134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_500270_500893_500951_501352_501440_509995_510078_510637_510699_511018_511222_512704_512791_513299_513393_513759_513926_515339_515370_516525_516564_517364_517397_517903_517985_518785
931370	contig_17144_pilon	-	2048	12	Intergenic	novelGene_29303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2155.46169240792	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	142	1476	179764	166640	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESREAHHWPDSMPWPEIL	183223	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166645_170893_170936_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
931371	contig_17127_pilon	-	4588	4	Intergenic	novelGene_168299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	225	junction_3	405.003978032589	146	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1508	4524	65	4588	55987	48896	FALSE	35	AAACTCAAGGAATGGGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVGQLAGSGKVARLLEALCRQMEHFLDHWKRFVAKKRAEHFYLNFYTAEQLVYLSMELKKPSPSEAALMMLSFIKGNCTPSDVSKASSRTDGAASRHCVKTGMAELSPMCFSEFILVDKLRVIMEQSMECMSTFLPHCLDLDALGHCLAHLSTMSGTPVERHLPRGLQVGQPNLVVCGQSEVLLAALAIYMEAPSQPLPTYDEVLLCTPGTTFEEVALFLRRCLTLGSRGHKVYSLLYADQLSYEVGSRAEELFQSLCLQRHREDYQLVLVCDCDREHCYLPSAFSQYKVLVTPQASLETIQTYLARHFQVPQQTLSAAAVFQDRMCVGVVASQRAGVGKSLYVKRLHSKLKMKFTGTKVPLKVIRLMDPQVDESQVLGTLLPFLDAQHQKRPTIFHFDVTSSVQSGIWGFLFKLLVLQYLMDVNGKMWLRNQCHLYIIEILEGNSVLPKRSSKLVTHAPQFAFLDIFPKVTCRPPKEVIDMGLNPESSHREPGMDHTEFCSETFQRPYQYLKRFHQKQNLDTFQYQEGFIEGTPEECLQHFLFYCGVINPSWSELQNFARFLNYQLKDCEASVFCDPNFIGDTLRGFKNFVVTFMIFMARDFATPTLNTSDQSPGKHMVTMDGVKEEDLAPFTLRKRWESEPHPYVFFNGDHISMTFIGFHFQPNKNGGVDAISHLHGKVIKKDVMMMELYRGLLLQRVPFNVDFDQLPRHEKLEKLCLALGIQWAIDPDETYELTTDNMLKILAIEMRFRCGIPLVIMGETGCGKTRLIKFLSDLRRGGVDAETMKLVKVHGGTTADMIYSKVREAENIAIFNKSHHQLDTILFFDEANTTEAISCIKEVLCDHTVNGEPLVENSGLHIIAACNPYRRHSQEMICRLESAGLGYRVSAEETAEKLGSIPLRQLVYRVHALPPSMIPLVWDFGQLNDAAEKLYVQQIVQRLVDSIKIEQNEICLITEVLSASQGFMRKRENECSFVSLRDVERCVKVFKWFHDHSEMLLSKLESFLCKSSVIKNKFKRNPVLWSLVQAIGVCYHASLEKKESYRKAICSFFPEPYNDSKVIRDEVTQTQDLFLNCVPPRENIAKNLALKENVFMMVVCIELKIPLFLVGKPGSSKSLAKTIVADAMQGQAAYSDLFRNLKQVHLVSFQCSPHSTPQGIIGTFKQCARFQQGKDLQQYVSVVVLDEVGLAEDSPKMPLKALHPLLEDGCIEDDPAPHKKVGFIGISNWALDPAKMNRGIFVSRGSPNEEELIESAKGICSDSLIQDRIQEYFASFAKAYEAVCKSQDKEFFGLRDYYSLIKMVFARAKASNKKPSPQDIAQAILRNFSGKDNIHALDIFMANLPETKCFKEVSTIQLIQQNIYGGHQKGSGRELEDAECRYLLVLTKNYVALQILQQTFFSKEQQPEIIFGSSFPKDQEYTQVCRNINRVKICMETGKMVVLLNLQNLYESLYDALNQYYVYLGGQKYVDLGLGTHRVKCRVHPDFRLIVIEEKDVVYRYFPIPLINRLEKHYLDINTMLEKWQKNIVE	56051	48895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17127_pilon_-_52118_53699_53856_54072_54267_55035
931372	contig_19412_pilon	-	2678	2	Intergenic	novelGene_178696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1094	1459	2271	1906	TRUE	20	GCTGGAACTCCTCCATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRIPSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCFRGIQ	3364	20	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19412_pilon_-_326_991
931373	contig_20641_pilon	+	1484	7	Intergenic	novelGene_52805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	64	1455	14599	56882	FALSE	45	ACTATCAATCAGAAATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	56911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
931374	contig_12148_pilon	+	1503	2	Intergenic	novelGene_140346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	1040	1501	129934	130395	FALSE	65	GGAAAACTCAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLRQQTISKHIKKQDRIVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDNEYKSLIFRAIRELKQRADKNEEKIDKFMEKADKLMENRDKKMEEVRKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNNISEMDSVTEGLRSRFETMEDRISETENKYLDTTMF	128838	130397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12148_pilon_+_129473_129528
931375	scaffold_2602_pilon	-	2778	1	Intergenic	novelGene_127707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCTATTTCATACAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75861	73083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_-_73100_75900
931376	contig_7234_pilon	-	3651	1	Intergenic	novelGene_145919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTGTGTTTTATTGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	400111	396460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7234_pilon_-_396500_400100
931378	contig_10973_pilon	-	943	1	Intergenic	novelGene_150385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAAGACGACCCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2485	1542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1500_2500
931379	contig_5643_pilon	+	1282	12	Intergenic	novelGene_38792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	2	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	69	1070	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233606	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
931380	contig_19628_pilon	+	1977	2	Intergenic	novelGene_166576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	1241	1678	26392	26829	FALSE	55	TCAGCAAAAACAAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFGFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	24863	27128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_+_26004_26291
931381	contig_16622_pilon	-	919	5	Intergenic	novelGene_48484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1286.29552883465	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AGAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121936	111933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112205_112977_113041_113602_113739_115153_115292_121625
931382	contig_12923_pilon	+	1720	6	Intergenic	novelGene_30102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTATGCGGCCCCGAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45371	57128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_46389_48960_49075_51060_51306_52199_52360_53916_54072_57099
931384	contig_20028_pilon	+	2719	2	Intergenic	novelGene_170654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	30	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	1641	2240	60191	60790	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVSVQNKTPDDSPLEENSLELPDREFKSLLLRILQELRQKADKHEEKIDTFMENTDKKLEEFRKIMQGQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHWYTTLFEENSEKRAKKNGETLRVIWDTIKSKNLRVIAIAEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQ	58298	61269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20028_pilon_+_58904_59155
931385	contig_18274_pilon	-	2405	2	Intergenic	novelGene_164039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTGAATGCATATATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55709	53255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18274_pilon_-_55145_55193
931386	contig_3956_pilon	+	1814	6	Intergenic	novelGene_15096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1516.60853221917	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	78	1295	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVKLSWGRKGLLVCSSLRIKPTAGGAASWGGGREGREAQAGRCVECGHLGCLVTPAAPPAGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281604	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282908_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289858_1290122
931387	contig_10225_pilon	+	2080	13	Intergenic	novelGene_86774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	547.429117684554	2	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	119	1069	20776	42680	TRUE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20657	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35781_37078_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46397_47112
931388	contig_3469_pilon	-	1131	1	Intergenic	novelGene_34241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAATAGTTTGAAAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	655666	654535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_654500_655700
931389	contig_14956_pilon	-	3287	2	Intergenic	novelGene_102956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2022	2387	1820	1455	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSSVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	3841	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14956_pilon_-_249_802
931390	contig_6842_pilon	-	641	1	Intergenic	novelGene_130744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAGTCAGACCATTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1272924	1272283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1272300_1272900
931391	contig_5023_pilon	+	1975	12	Intergenic	novelGene_7208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2027.71180732216	3	47	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	704	1378	629246	646990	FALSE	20	AGCAATCCTACTCTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580841	647587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614489_629206_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
931392	contig_17144_pilon	-	1769	5	Intergenic	novelGene_29191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	872.33479811366	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	755	1474	167982	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	168839	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162
931394	contig_15063_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_12997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3879.69151479857	5	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	220	1395	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28181	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
931395	contig_9528_pilon	+	1914	1	Intergenic	novelGene_172340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAATGGAAGGAATACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182320	184234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9528_pilon_+_182300_184200
931396	contig_9098_pilon	-	1960	12	Intergenic	novelGene_75853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	32	junction_5	145.543154828234	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	163	1521	350397	335775	FALSE	20	TCTTGCTATTTATATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPAVGRVLRLFRNQLPWLRTGSSQANAEEAVKEPERARELPLPRFVGGQHFFEYLLVVSLKKKHSGDDYEPTITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLSAIPLFCFPDGNEWAPLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350559	335335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340743_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_350330
931397	contig_9609_pilon	-	6103	19	Intergenic	novelGene_23007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	245	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333323	314136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_314431_317882_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322917_323228_323360_323984_324069_324247_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330303_331386_331487_331563_331692_332692
931398	contig_12677_pilon	+	515	1	Intergenic	novelGene_110684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCGATGAGGGATTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_500
931399	contig_10511_pilon	-	2782	2	Intergenic	novelGene_126901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	744	1340	609543	608947	TRUE	50	TTGACCTCAAAAGAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHLCFFLRDCRALVICDIRFPTPYPSSPTLGLLCFPRTQSLLRETPAAWIPPARTSWLFERHLMAAGVAFFPLLLISSLSLTTSPSFHSNTRLHEPSLLLPEGLRSSVQVWSHFRSGLARWWDPGAFIHLFVLNCLFSFPFELAARSGQAVLHGLETSPLACTDVQRDPSGHFFSRWFFSSFFCFLGGFSCSFFFSF	610286	482100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_-_483300_608703
931400	contig_4223_pilon	-	4747	4	Intergenic	novelGene_117265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	132	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCTGGAGCAAAGGAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	256900	126850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_-_127107_127957_131546_209271_209673_256398
931401	contig_8663_pilon	-	2081	2	Intergenic	novelGene_58014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATCCATTTTGGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299464	297339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8663_pilon_-_298546_298589
931402	contig_3956_pilon	+	1961	11	Intergenic	novelGene_15223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1682.11932097577	4	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	145	825	1284132	1288915	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLGPEAPGQVGPHGAVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1283910	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283978_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285786_1287496_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289840_1290452
931403	contig_14711_pilon	+	2534	7	Intergenic	novelGene_68916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	363	junction_4	313.785489360699	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	301	660	86227	88283	TRUE	10	CCTCAGTTGTCATTTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCR	85463	90813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_89673_90032_90194_90489
931404	contig_3095_pilon	+	1129	5	Intergenic	novelGene_75129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	9	713	147270	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMFHYGCPDELSPNMAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147261	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147312_149669_149896_150413_150696_150996_151163_151848
931405	contig_5200_pilon	+	2774	3	Intergenic	novelGene_140146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	60	106	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	377	676	107162	107461	TRUE	35	GAGAGGAAGAGCCTCTACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLQWTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWAELEKDVEQNSNSQKKDQIYWPKGDRRNPGSMAPRHPFSSVVKSFTRFTIQPGSGQPHKTKRD	106785	229945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5200_pilon_+_108484_108677_108927_229118
931406	contig_3410_pilon	+	2015	2	Intergenic	novelGene_58925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGAGCTACAGCTGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13700	30458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_15598_30340
931407	contig_17144_pilon	-	1709	9	Intergenic	novelGene_29473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2164.12623462103	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	375	1049	172736	166736	FALSE	30	TTAAGAAATTCTTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKGSPLPCSRAASKAHWQDLGRAGVGDLPAAQPSGPQHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	183399	166075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_168244_168310_168992_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173313_181806_181850_183158
931408	contig_7904_pilon	+	592	2	Intergenic	novelGene_160021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCTTTTCTTGTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394737	398724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7904_pilon_+_395119_398513
931409	contig_4180_pilon	+	2706	6	Intergenic	novelGene_8368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1693.30087107992	5	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	320	850	875200	888134	FALSE	25	TGTCCTCTGATTTTGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIGKRLSTSSASTY	874105	889990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888091
931410	contig_11386_pilon	+	4315	3	Intergenic	novelGene_82847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	208	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGTCCCCTGTTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464793	469925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_465623_466108_469317_469647
931411	contig_15098_pilon	-	2933	1	Intergenic	novelGene_176877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	1346	2395	3913	2864	NA	35	TGCTGTCTACAAGAGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQIISKHLQKQDSMVPVAIQIKTTDDSPVEENALEVPDREFKSLILGICQELRQKADKHEEKIDKFMENTDRKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGISKQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLSIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRASHEKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWGDIYEILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPTGRT	5258	2325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15098_pilon_-_2300_5300
931412	contig_13612_pilon	+	1860	1	Intergenic	novelGene_157302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCAGCAGGAGCCCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55457	57317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13612_pilon_+_55500_57300
931414	contig_19012_pilon	+	3836	1	Intergenic	novelGene_159477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	94	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGAGGATTGGGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28375	32211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19012_pilon_+_28400_32200
931415	contig_17144_pilon	-	2105	12	Intergenic	novelGene_29324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1818.15618163744	4	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	171	2021	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183252	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166526_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
931416	contig_13456_pilon	+	1968	7	Intergenic	novelGene_153318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	59	junction_1	40.7325286336226	24	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	630	1460	613892	620779	FALSE	25	TACCTGCAGTAGTGCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATVCVQQLLKTLFGTNLASQFDGLSSNPSKSQGRAQRLGSSSVRPGLYHYCFMAPYTHFTQALADASLRNMVQAEQEPDASGWFDVLQKVSSQLKTNLTGVTKNRADKNAIHNHIRLFEPLVIKALKQYTTTTSVQLQKQVLDLLAQLVQLRVNYCLLDSDQVFIGFVLKQFEYIEVGQFRQSEAIIPNIFFFLVLLSYERYHSKQIVGIPKIIQLCDGIMASGRKAVTHGNCGPQSSQGARSVSLPSHPLPGLGFAGAVSARTGTGLGGAVKKK	603641	621287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_604217_613837_613916_614487_614712_616412_616492_616647_616810_619513_619570_620493
931417	contig_6227_pilon	-	2415	2	Intergenic	novelGene_49810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGCTGACCATGCCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1320204	1316910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_-_1318931_1319809
931418	contig_15047_pilon	+	1529	6	Intergenic	novelGene_52155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	164	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	27	494	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2783_3334_3498_4158_4434_4552_4687_21013
931420	contig_1406_pilon	+	2443	1	Intergenic	novelGene_25649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATTTTATATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2774716	2777159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2774700_2777200
931421	contig_6361_pilon	-	3558	4	Intergenic	novelGene_24013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7846	junction_1	1857.22092265717	1	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2982	3320	420979	415399	TRUE	45	GAAGATTACATTTGAAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	423960	410981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870
931423	contig_3155_pilon	+	1737	5	Intergenic	novelGene_26373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	72	578	258156	261211	TRUE	35	ATTACACCTCACTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258084	262545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261272_261446
931424	contig_7467_pilon	+	4208	2	Intergenic	novelGene_69484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACTCAGAAAAAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93188	97686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7467_pilon_+_97239_97528
931425	scaffold_9100_pilon	+	1906	5	Intergenic	novelGene_83281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	642.060112061168	5	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	1089	1676	647136	654618	FALSE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGRMCVLCVV	646047	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651172_654590
931426	scaffold_12124_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_22412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	34	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	200	493	1509112	1509405	NA	45	AAACCTTCATCTAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508912	1510559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508900_1510600
931427	contig_3956_pilon	-	2051	11	Intergenic	novelGene_15143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	878	1453	1286221	1284227	TRUE	30	GGCGACGACGGCGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1291010	1281617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281667_1282691_1282906_1283812_1283973_1284051_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286625_1287313_1287326_1290362
931429	contig_1275_pilon	-	1133	1	Intergenic	novelGene_108779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGATAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	443904	442771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_442800_443900
931430	contig_5316_pilon	-	2031	4	Intergenic	novelGene_61260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGTTTAGTCCCCTACTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	551008	540057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_-_540999_543404_543535_544131_544255_550171
931431	contig_7158_pilon	+	1727	1	Intergenic	novelGene_163733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTCCCCTCCGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1154587	1156314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7158_pilon_+_1154600_1156300
931432	contig_361_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_166614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAAAAAGAGGAAGACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	995146	998059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_361_pilon_+_995100_998100
931433	contig_4857_pilon	+	3875	2	Intergenic	novelGene_48732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	42	142	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1430	2008	1194283	1194861	FALSE	85	AAAAAAAAAAAAAAAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	1192676	1196728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1193990_1194166
931434	contig_5910_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_168432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGATATCATACATGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190555	188472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5910_pilon_-_188500_190600
931435	contig_14288_pilon	+	2090	1	Intergenic	novelGene_153826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGTTCATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	375845	377935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_+_375800_377900
931436	contig_4223_pilon	+	1828	1	Intergenic	novelGene_117276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	43	378	209202	209537	NA	25	TTTGCTTCTAATGTAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLRRTEILEHLIVLMRNLYIDQEAAIRTEQGDAAWLEVRKGVHQGCILSPYLFYLYAEQIIQEARLYEEHSIRIGGRLINNLCYADVTTVIAESEEDLKHLLMKIKDYSLQYGLHLDIKKRQKSS	209159	210987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4223_pilon_+_209200_211000
931437	contig_10042_pilon	+	1628	6	Intergenic	novelGene_79100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	238.809212552615	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	10	963	6321	53427	FALSE	80	AAAAAAAAAAAACAGTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKVSSPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42736_49857_50060_53219
931438	contig_18491_pilon	+	3107	1	Intergenic	novelGene_176625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGCCAAAAACATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32469	35576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18491_pilon_+_32500_35600
931439	contig_19342_pilon	+	1440	7	Intergenic	novelGene_41085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.91070819942883	8	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	439	846	5070	6183	FALSE	15	GAATCCTGTGTTTGCTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3243	6777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3846_4285_4365_5016_5293_5413_5522_5960_5994_6139
931442	contig_5352_pilon	-	1536	1	Intergenic	novelGene_177072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAGAAAACTGCTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288330	286794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_286800_288300
931443	contig_13740_pilon	+	3137	1	Intergenic	novelGene_34744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	45	112	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	173	522	815	1336	303816	304337	NA	60	ATAAATAAATATAATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKKKMEGIHGVTVRKRMVNVQPFQEVAYDQELMVLTGEGQAALKSLGKNKTLGIDRIPIEMFQQTDAALEVLTYLCQEIWKTATWPTDWKRSIFVPIPKKDDPTECGNYRTISLIPRASKILLKIIQKRLQQYMDRELPEIQAGLRRGHGTKDIIADVRWVLTESREYQKEV	303001	306138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_303000_306100
931444	contig_3956_pilon	+	954	3	Intergenic	novelGene_15066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1951	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	81	386	1281682	1290447	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITVCSTTGRSCPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282901_1290347
931445	contig_3269_pilon	-	2377	1	Intergenic	novelGene_116999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1538	1879	36668	36327	NA	40	TTATAGCAGCACTAGATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSVTASALILGHPWEASYPHHSTPSTWMWQSGGVRCLALPLSRSQLAKTWNSLNPKLHHWHSTGWPHTLICLVIHLLYGPRHGLNCVTQKCLSTWLVHDSQCCVIVHHFVI	38205	35828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3269_pilon_-_35800_38200
931446	contig_7963_pilon	+	756	4	Intergenic	novelGene_58393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	997.020561473032	5	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1	432	51384	57937	TRUE	10	GAGCTGGGTGACTCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLITVPVLRVVIIPHNVHPEENVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51383	63340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51448_57350_57564_57782_57949_63027
931447	contig_116_pilon	-	1164	10	Intergenic	novelGene_154903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	149.926237007436	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	636	529	1164	281233	272378	FALSE	15	GCCCAGCTGGCAGGGGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKAPPNLFKIIQKALEKGSLLGCSIDITSAADSEAVTFQKLVKGHAYSVTGAEEKLIRIRNPWGEVEWTGKWNDNCPNWDTVDPEVRERLTRRHEDGEFWMSFGDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDSYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWINPQYVIKLEEEDEDQEDGESGCTFLVGVIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVHQLIGQTNIHLNKNFFLTHRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKNGDFCVRVFSEKKADYQVVDDEIEANLQEFDVSEDDIDDGFRKLF	288660	272377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_116_pilon_-_272426_273507_273545_275945_276167_278967_279138_281073_281235_281943_282019_283324_283387_285621_285706_286887_287057_288523
931448	contig_5093_pilon	+	1633	2	Intergenic	novelGene_135098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAAGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	628783	630512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_629749_629844
931449	contig_1244_pilon	-	1958	13	Intergenic	novelGene_38000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1024.72910715738	67	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	85	1407	948448	923434	TRUE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQVCGLELVQVSRQASPCPASPLRFPSMMGTDMKCCQPT	948532	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923331_923428_923529_923707_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
931450	contig_8386_pilon	+	3892	1	Intergenic	novelGene_82201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	596	152	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	2536	2895	13492	13851	NA	30	TCTACCTTTCATGATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKDKKGKRGKTKQIKKKKKKKDPQKTEKNHQLKKKCSQESLCTSVHAEGGSLLATQLCLARKGSQLRKRKRKQFKTNKRTKAPGFHQRGSPDRVAVPQSNGAPQPLRKKQRWCTEPGI	10956	14848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_+_11000_14800
931451	contig_17144_pilon	-	2136	9	Intergenic	novelGene_29490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1707.76818904089	4	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	323	1042	174597	167578	TRUE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLPSLAPSWEEGAACALGAREGRREAGQVLQSPAPGLSEAEPLTTGLGERTGQSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPR	183402	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170854_173652_173751_174572_174761_183243
931452	contig_17427_pilon	-	2476	12	Intergenic	novelGene_30370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_9	1166.23311818453	1	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	53	1399	188879	178046	FALSE	45	TAAAGTTAATACCAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHNKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176968	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_188038_188140_188767_188890_204653
931453	contig_11719_pilon	-	1381	1	Intergenic	novelGene_154755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTGTGAGGATGGCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30870	29489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11719_pilon_-_29500_30900
931454	contig_4900_pilon	+	5267	4	Intergenic	novelGene_159040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	342	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	3464	3838	67311	91391	FALSE	20	GTCTCCATGTTTCGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPGHAAPPGQKGLPTQEKERKTNKQFKTNKQTKSLGSHQLSSPNWEAAPLSNGAPQPLRRSKDGARSQVFEQKEGEVVRGKEEIKRSRKKSNTSCQQMAQYFSPPSPIGRVCHSDMVQQGRSS	0	92820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_+_1782_1828_2720_66519_67607_91312
931455	contig_1274_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_137820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCTAACTCACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	549424	550432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1274_pilon_+_549400_550400
931456	contig_13888_pilon	+	2427	3	Intergenic	novelGene_151806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1931	2239	351377	481325	FALSE	55	TCAAAACAAAACAAGTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAISTCVWPTMKIKNTPLWEKLLSLLPPYYLLCTGSRTASATAESPGPEVGCFTCPGPFSQPWRGNKLTNRGKNNLLTPLNQEPREGTMPMPTPITHTCLGQ	349446	481513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_351383_427212_427471_481280
931457	contig_4125_pilon	-	3266	5	Intergenic	novelGene_25129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	496.490873531428	3	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1269	1616	812726	811045	TRUE	30	GAAAGCCTTATTACTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHPNVPAIMITPICPHSLSFRPIVVPAGVELKITLSPEARNTAWVSFDGRKRQEIRHGDSISITTSCYPLPSICVQDPVRDWFESLAQCLHWNVRKKQTHFTEEEEEEGGEEQG	814124	809012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_810130_810511_811211_812053_812137_812627_812786_812915
931461	contig_15063_pilon	+	1484	5	Intergenic	novelGene_9923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3984.1458541951	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	236	1411	34808	36661	FALSE	25	AACTAACCATGTCTGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35034_35380_35839_36158_36266
931463	contig_10196_pilon	-	2166	15	Intergenic	novelGene_132075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_11	143.201388802979	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1680	487	2166	828648	816052	FALSE	15	ATCAAGGCGCTGCCCGTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNLLGTHLGHSAIYNMCRILEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLKNSPTSVLPSFYEAMTCPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQAVTWDILLSIIERLLQQLLTLGSPELRAIVHDLLTTVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIHNLQQLMERFFRNESRSAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDRDPQVRKLATQLLVDLAEGCHTHHFSSLLDIVEKVIARSLFPPPELEERDVPAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHAARVYEMLVHHIQLHYKHMYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADALHRLGLPNKDGAVRFSPYCLCDYVEPECGLEKKASGPLSPPTGPPSPAPTGPAVRFGYLPYSLLFRVLLQCLKQETDWKVLKLVLSKLPESLRYKVLIFTSPCSVDQLSSALCSMLSGPKTLERLRGTPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYLDKTKQREMVYCLEQGLIYRCASHCVVALAVCSVEMPDVI	829476	816051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_816154_817306_817442_817942_818066_819480_819632_819905_820013_820881_821005_821258_821376_821857_822014_822102_822185_822525_822630_823181_823320_824801_824946_825752_825880_828577_828652_828993
931464	contig_11417_pilon	-	921	2	Intergenic	novelGene_103334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	588820	587823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_588677_588752
931465	SIRV6	+	715	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	62	6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	37	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTTATTAGCCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
931466	contig_13021_pilon	+	2218	13	Intergenic	novelGene_8182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2911.0553391339	4	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	166	1281	174676	179986	TRUE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	174510	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176023_176471_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178735_179985_180211_180440
931467	contig_13123_pilon	+	2117	5	Intergenic	novelGene_136901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.156670623723	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	434413	446216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434601_436402_436476_439030_439102_443433_443550_444546
931468	contig_17144_pilon	-	1391	9	Intergenic	novelGene_29507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1972.0344784955	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	388	1152	174965	166321	FALSE	25	TCTTTCTTAAGAAATTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPHLAGPAP	179755	166081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166345_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
931469	contig_2036_pilon	+	2061	2	Intergenic	novelGene_131805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1499	1810	483652	483963	FALSE	60	ACAGGAAACATTAAAACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNHSLHHPEPRRIRWCLATTTNSSDRDHNRGFWTEWEKNVEQNSNSQKNTRLTSLAETGGTPKTMAPGHPIHSEQKTLVKSTFQPKIRQAYTTNNNTSEERDS	412785	484214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_+_413804_483171
931470	contig_5033_pilon	-	1946	4	Intergenic	novelGene_28929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	83.8265404802613	15	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	329	421	453393	453301	TRUE	30	CAGGAGAGAAGTACGGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCFYVLWVHLGRKCGALSWKGFPRSSLFLNRGTSASTGHFYRVWLRALDKDITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRRTLAKSSYRRQRWLPLRSWWQMWSCTLVKQSFICQWSKQATPPGPTCWINM	456853	449430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450235_452579_453459_456495_456604_456698
931471	contig_14575_pilon	+	2664	16	Intergenic	novelGene_101896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.0729524541522	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	675	1988	2662	51080	63924	FALSE	70	AAGCAAAAAAATTAGCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEPREAKRERREKIEEKDPKR	32553	63926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_33359_33436_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_50300_50435_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_63867
931472	contig_20641_pilon	+	1448	7	Intergenic	novelGene_52838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1063.95796700601	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	58	1419	14599	56882	FALSE	45	ACTATCAATCAGAAATGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGIGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14541	56911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14738_16766_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
931473	contig_14744_pilon	-	1294	1	Intergenic	novelGene_65903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAAAGGGACGAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3763	2469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_2500_3800
931474	contig_14556_pilon	+	826	1	Intergenic	novelGene_138509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAATAATAATAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43489	44315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14556_pilon_+_43500_44300
931475	contig_15182_pilon	+	1962	1	Intergenic	novelGene_136445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	336	1625	1960	398154	398489	NA	35	CAGCAAACAAGTTTCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSLTIRCSKGHSGCTSSKTDWFILLVVPGIFNILRQHHNSNTSILLQSSLFTVQYLHAHKVTENIKAWVRYILTLKATSLLFNTLRGLLQQISSVQYVVFLLNCTLDEGL	396529	398491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15182_pilon_+_396500_398500
931476	contig_9437_pilon	-	657	1	Intergenic	novelGene_141714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGATAAAAAAAACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103348	102691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9437_pilon_-_102700_103300
931477	contig_13004_pilon	+	1465	5	Intergenic	novelGene_112707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	415.972354850656	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	837837	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_926828_926989_927531_927669_928134_928212_928299
931478	contig_19974_pilon	-	955	1	Intergenic	novelGene_130486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCCAAGGTTGTAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318436	317481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_317500_318400
931479	SIRV7	-	904	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATGAAAAATCCTAAGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
931480	contig_9484_pilon	+	2450	11	Intergenic	novelGene_105628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	615.919442784525	1	116	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	50	1333	95848	103511	TRUE	5	GGTGGTGGTTTTCTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVWQVP	95798	105100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95898_97156_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103376_103495_104412_104883
931481	contig_11505_pilon	+	4046	2	Intergenic	novelGene_140931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	70	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	1397	1954	271359	271916	TRUE	75	AAAAAAATCCACAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKKENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAPCTPYRRDSKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILKTAREKQEVTYRRETIRLSSDYSAETMQASRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	269962	315411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_+_272589_313991
931482	contig_17144_pilon	-	2571	14	Intergenic	novelGene_29316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1861.35779479301	4	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	1440	2276	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWISSSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183235	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167341_168186_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_179700_179786_181794_181850_183158
931483	contig_6102_pilon	-	2506	20	Intergenic	novelGene_31890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.223296878269436	5	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGAACCTTGACTCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395264	373232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373258_373395_373476_373632_373725_373902_373937_374381_374499_374585_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375531_375634_375730_375966_376037_376205_376292_378875_378946_393047_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
931484	contig_3122_pilon	-	2117	1	Intergenic	novelGene_64403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1628	2005	432699	432322	NA	65	GAGAGAAAGAAAAGATCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVKVGNKEGTVVGKYGLGHRNYTTDLMIEFCKTNDLFIANTFSQQHKRRLFTWTSPDGKHRNQINYICGKMMEKLNIISQNKASGRLWNRPSIAHMQVQVNLEKIKTSPREPKYNLEYIYHTCM	434326	432209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_432200_434300
931485	contig_12078_pilon	+	1824	1	Intergenic	novelGene_74083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	786	1091	143336	143641	NA	40	GGCCGGGGATAAACGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCSEYVPLLQPDACAYTNHPCLSRTVRAYATHLLAIYLGNWAESIQDEWPELAYLLTDLTTWGQDIRDSKVPIIKLAQTSSLFGHIETTQDARTQSADIK	142550	144374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12078_pilon_+_142600_144400
931486	contig_16098_pilon	-	1561	8	Intergenic	novelGene_45939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1449.66526748595	3	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	213	818	350768	349356	TRUE	25	GACTCTGAAGACTGGTTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPVLALSLHVQLQGVPAWHGLHAQTWPGGEQV	352244	348284	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349448_349633_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152
931487	contig_16496_pilon	-	1527	2	Intergenic	novelGene_5206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	7	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	8	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
931488	contig_11117_pilon	-	2823	3	Intergenic	novelGene_148582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1489	2007	75854	75336	FALSE	20	GTCCCCCAGTAGTTATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSPEVAPRCCSTAWLEGIEVYNARYSGNKKRRKIRRDEKLSNEEREKGKKREKKTKQIKKTKNKKSPPKIEKNRKKKKKAAKKEMSSGIPLHVCASRGRSLLATQHRLARKGSQVKKRKRKQTNSSKQTNQQKPQDPTSAVAQTGKQLHTRTELRSPSGRSKDGARSQVFE	107958	74519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11117_pilon_-_75965_76042_77230_107767
931489	contig_1472_pilon	+	971	1	Intergenic	novelGene_86126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	5	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	342	628	969	457687	458028	NA	70	AAAGAAGGAAAGAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKDFSLKREIDSSKIIVVDFNTSLSVKDRTSRKLNKDMETLNATVNQLDLMDIYRTLHPTAAKCTFFSKAHGTFSGIDHILGYKASLNKIESIEILQSIFSDHKAIKVEINNR	457059	458030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1472_pilon_+_457100_458000
931490	contig_16594_pilon	+	2800	10	Intergenic	novelGene_53841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAATCAGGCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117292	273160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133149_134023_134081_135251_135507_149146_149351_165477_165648_272661
931491	contig_10892_pilon	+	2075	2	Intergenic	novelGene_116735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGAAAATGGTATTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56916	123638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_58470_123116
931492	contig_854_pilon	+	1396	7	Intergenic	novelGene_36221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	5	88	junction_4	2201.47682754605	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	119	637	543600	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543481	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557651_557752_562271_562405_563029
931493	contig_10734_pilon	+	5708	24	Intergenic	novelGene_51230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	456.131249144503	11	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1331	3996	256	4251	1243300	1333513	FALSE	30	GTGGTACTTAAATTCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTAPSAETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEAIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLSRNVQAEDEANGLQMAHASRATSPLSTSAASVVPSSSPATPSNIPHKSSQPIAKEPSTTPHISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKIGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMATTPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKLDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESKYIKDTDEEKASLQKSISITSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENASAKSLHSVVQSLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDTQAEEEERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNNYDSDDQGKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMAEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF	1198743	1334970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1240226_1240306_1243189_1243364_1247303_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268293_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1299543_1299651_1306092_1306214_1321457_1321511_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
931494	contig_8195_pilon	-	2269	1	Intergenic	novelGene_170068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAACAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	609054	606785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_-_606800_609100
931495	contig_11459_pilon	-	1788	1	Intergenic	novelGene_179195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAATAAGGAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51787	49999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11459_pilon_-_50000_51800
931496	contig_2646_pilon	+	1397	1	Intergenic	novelGene_69568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAGATGTGATGTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1073004	1074401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_1073000_1074400
931497	contig_5686_pilon	+	2667	19	Intergenic	novelGene_45291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1690.84430750505	1	67	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	887	2661	6	2666	93843	241668	FALSE	30	GCAAACTTCCAGCCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KMQYLEAEELLVDEDDNIFDEEVSPSRVSVAFRRGDPGKCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQVSMVQTLQSLKDDKLLQTMTDLAP	93837	241669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170294_170347_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043_224203_241597
931498	contig_17144_pilon	-	1829	11	Intergenic	novelGene_29328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2448.97230690753	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	158	1534	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183266	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172508_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179781_181790_181850_183184
931500	contig_10437_pilon	+	1601	8	Intergenic	novelGene_38299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1740	junction_1	583.72533378818	9	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	49	1071	431167	451175	FALSE	30	CTATCATTGCCACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431118	451705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
931501	contig_15120_pilon	+	2880	2	Intergenic	novelGene_108033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1532	2110	458766	459344	FALSE	70	CAAAAACAAAACCTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRRKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSDKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTLRVIGIPEQRENRKHREDH	457091	460114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15120_pilon_+_457249_457391
931503	contig_5062_pilon	+	1303	2	Intergenic	novelGene_157848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAGTTCTTATAGTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644154	652789	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_644567_651898
931504	contig_15029_pilon	-	3904	3	Intergenic	novelGene_128228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	201	185	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	260	783	3027	3809	534084	533302	FALSE	35	TCCTCAGAGGACAATTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTAINSHLSTITLNVNGLNACIKRRRVTEWIKKQDPSICCLQWTHLRNKDINILKIKGWKKIYQANSYQKRAGVAILISDKTDFKTKSTIKHKEEHYIMYKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKRETHSTTVIVGVFNTLLSVKDRTSRKKLNKDTEDLKGTISQPDLTDIYRTLHPTAAKYTFFSNAYGTFSRIDHILGRRTILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNRKSKEKKSITWKLSNTLLTNN	537937	533206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_536189_536358_537122_537778
931505	contig_5686_pilon	-	3481	3	Intergenic	novelGene_45474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	158	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGGATCTGTGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301089	226791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_227119_227199_228704_299439
931506	contig_7891_pilon	+	1395	2	Intergenic	novelGene_179196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	717	1058	100207	100589	FALSE	10	TTTCTTTGTTCTCCTCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRKDVLYISMFWILLRLALWPNMWSILGNVPCALEKKVYLAAVGWTVRFMSMRSSWLIVAFSSSVSLLSFFLDVLSFTESGLLKSPTTIVELFWSPVVGCINIYYSYVLLVY	99490	100926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7891_pilon_+_100485_100525
931508	contig_16185_pilon	-	1053	5	Intergenic	novelGene_144750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	50.6359556046887	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	128	499	87671	82386	FALSE	10	CTGGCGCGTGCATGCGATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	96650	81831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623
931509	contig_12869_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_75353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	450	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCACACACCAACTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97661	96114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_-_96100_97700
931510	contig_2480_pilon	+	1456	2	Intergenic	novelGene_63573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCAAGAAGGCAACTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610806	612570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_611696_612003
931511	contig_2703_pilon	+	223	1	Intergenic	novelGene_101790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAGTTTGGTGTCCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611521	611744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_611500_611700
931512	contig_10129_pilon	-	1589	3	Intergenic	novelGene_128152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTACCATGATCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348279	288969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10129_pilon_-_289951_347529_347821_347962
931514	contig_9708_pilon	-	3919	2	Intergenic	novelGene_67253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	244	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	757	1098	32170	31829	FALSE	60	AAAATACTCAACAAAATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSFSSFMILGKFSVSNSSLILSVFSVFSPWSGTPITRRFLLLIVSHITLRVSSFFLFLFSDFSSNRIVSKCLSSVSLILASVVSNLLLSPSMTPSISEILLFIFGILIVVFV	127394	29007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9708_pilon_-_32911_127378
931515	contig_11563_pilon	+	3009	2	Intergenic	novelGene_142300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGAGTGCCTCTGCGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104672	108180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11563_pilon_+_107282_107780
931516	contig_4686_pilon	-	1804	2	Intergenic	novelGene_118585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAGTAATCTAATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804488	802491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_-_803724_803916
931517	contig_7272_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_25393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCATAATACTCTGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754769	753003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_753000_754800
931518	contig_10500_pilon	+	1920	1	Intergenic	novelGene_41151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	251	756	332	1087	1202901	1203656	NA	35	TATACCATTCGATCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANIIFNGERLKKLPLKTGTRQECPLSLLLFNIVLKVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSMRNLLELIERFSRVAGYKINVQKSVGFPYTNKENNEKEIRKTIPFIIARKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWTGSLNTVKMTILPKAIYKYNSIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKEKKPRISKALLKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWY	1202569	1204489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1202600_1204500
931519	contig_3095_pilon	+	1034	6	Intergenic	novelGene_75171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1944.19591605373	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	232	756	225596	227034	FALSE	15	AGTCTTTTATTGCATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGSVACAQEVSRDTVQCPSTRTEE	220478	227312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220595_225480_225711_226126_226409_226645_226704_226749_226787_227001
931520	contig_11256_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_150886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGGGTCCTGGACAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2114	3190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11256_pilon_+_2100_3200
931521	contig_17059_pilon	-	1487	1	Intergenic	novelGene_166092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	457	870	466304	465891	NA	50	GGAGTGCAAAAACAAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEIIKNEMECINIDILGVSDLKWTGIGHFELDNHMAYYAGKDNLKRNDVNSSSKKNISRSILKYNAISDRIISICLQGRRVNPTIIQIYVPTTKTKDRDFYPLLRSETDRTCNQDALIITGDWKAKVGNKDR	466760	465273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17059_pilon_-_465300_466800
931522	contig_3956_pilon	+	3023	16	Intergenic	novelGene_14958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1277.56840912728	9	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	625	1878	81	1958	1281682	1288915	TRUE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVGPRCRRSGHSGGFAPGGSGGLGASSTRPVCALPFTLCPLSVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281601	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287595_1287903_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290357_1290628
931523	contig_4659_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_118248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAATCTCTCTTCGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	836861	847648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_+_836945_837256_839042_843256_843359_847625
931524	contig_21083_pilon	-	1386	1	Intergenic	novelGene_58016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCGGCTGAACGGTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3383	1997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21083_pilon_-_2000_3400
931525	contig_16650_pilon	+	1266	1	Intergenic	novelGene_61950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTCATCTAATGTACAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206630	207896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16650_pilon_+_206600_207900
931526	contig_6270_pilon	+	1425	1	Intergenic	novelGene_99829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAGAGATGCTTGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91335	92760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6270_pilon_+_91300_92800
931527	contig_3900_pilon	-	860	1	Intergenic	novelGene_84183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAAACCGTGTTCAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217710	216850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_216800_217700
931528	SIRV3	-	403	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	8	68	8	-68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	14	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTCTCCTTTAGCACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1974	1068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
931529	contig_9288_pilon	+	2019	2	Intergenic	novelGene_171598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGTATTTTCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5042	67300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9288_pilon_+_6041_66279
931530	contig_9981_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_121052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTGGTATTAAGCTAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252426	249720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9981_pilon_-_249700_252400
931531	contig_11551_pilon	-	2858	1	Intergenic	novelGene_168482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGATACATCACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	605250	602392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_602400_605200
931532	contig_1154_pilon	+	2416	2	Intergenic	novelGene_87110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	9	30	271	300	396259	400913	FALSE	70	TAAAAAAAAAATAATAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCSLQYGLLLNIKKTEILTTGPISNIVINGEKIEVVKDFILLGSAINTRRGSSQEIKERIALGRSAAKDLFKVLKSKDVTLRTKVCLTQAMLFSVTLYA	395988	403029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1154_pilon_+_396287_400911
931533	contig_2704_pilon	+	2246	1	Intergenic	novelGene_75312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	582	1016	246030	246464	NA	30	CACAGCATTGCTATAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLAFLKLRELKTKVKPLVAIFKNSMGKILNDAGSIKKRWKEYTKSLYQKELVDVHPFQQVVYDQEPIVLKGKVQTSLKALAKNKSPEIDRIPVEMFQQMDAVLEVLTYLCQEIWKTSTWPTDWKRSIFVPIPKEGDPVACRNY	245448	247694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2704_pilon_+_245400_247700
931535	contig_753_pilon	-	4022	2	Intergenic	novelGene_113036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	179	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2488	2853	1451298	1450933	TRUE	0	TCGGCGTGGTGCTTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCFYIIFLNSSNFLSVFSMNLSVSFSCLSAFCLSSWRILSIKDLNSLSGSSSAFSSRGQLSGVLFWMPTGTILSCFCKCFVIVCCLRGIQ	1453785	1449101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_-_1449373_1450034
931536	contig_13021_pilon	+	3175	12	Intergenic	novelGene_8204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2571.50440580819	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	169	1074	176597	178735	TRUE	25	AAGGCAATGCATGGCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLG	175997	181109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440_180478_180520
931537	contig_10904_pilon	+	606	1	Intergenic	novelGene_22714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAAGAAAAAGCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648928	649534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_648900_649500
931538	contig_19378_pilon	-	3493	1	Intergenic	novelGene_73772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	134	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAAGGCTCACCCCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18315	14822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_14800_18300
931539	contig_2100_pilon	-	1648	13	Intergenic	novelGene_50750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	836.139687127031	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	108	1412	1182812	1170268	TRUE	25	TAGCCCATAAGAGTGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185518	1169928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170143_1170245_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
931540	contig_8544_pilon	-	1152	1	Intergenic	novelGene_55935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTGACAATATCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163509	162357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_-_162400_163500
931541	contig_2710_pilon	+	4861	1	Intergenic	novelGene_161791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	220	663	521	1183	1061374	1062036	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLNKIGIEGKFFNIIKGIYTKTTANIILNGETLKAFPLRMGTRLGCPLSPLLFNTVLEVLARAIRLEKEIKGTQIWREEVKVSLFADDLILHTVNPRESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSVGFLYTNKENFQEEITKSIPVTTAHKTIKYLGINRTRDVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKTSIPNHQLHMEREQAPNK	1060853	1065714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1060900_1065700
931542	contig_15760_pilon	+	3176	1	Intergenic	novelGene_131052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	107	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATACATGAGAAACGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24014	27190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15760_pilon_+_24000_27200
931543	contig_14666_pilon	+	1035	2	Intergenic	novelGene_39619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	58	744	477340	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHILTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477282	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477360_484273
931544	contig_11656_pilon	+	1449	1	Intergenic	novelGene_53965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGGAGAAAAAAACCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151116	152565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_151100_152600
931545	contig_13244_pilon	+	4105	2	Intergenic	novelGene_86907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	91	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	522	3584	4105	126607	127128	FALSE	50	ACGAACTGCTGAAAGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPPEENALELPDREFKSLILKILQELREKADKHEEKIDKFMENTDEKLEEFRKIMQEHNAKINSQLEIIQRQQLETQKINNKISEMDNVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLNTTLFQENSEKRTKTNEETLRVTWDTIKSKNLRVTGIPEQGEKTERGSL	122941	127128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_125734_125815
931547	contig_10106_pilon	-	2383	1	Intergenic	novelGene_73859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1043	1405	109156	108794	NA	25	GTAGCTAGTCCTTGTAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDRSLLITCPKYTRHSLAILASKAHAGCTSSKTDLFILLAVHVIFNILYQHHNSKASILLRSSLCIVQLLYAYKVIENTMAWVRHNLVLKVTSLLFNTLKRSFVADLPNAMHLLIS	110198	107815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_107800_110200
931548	contig_253_pilon	-	1959	1	Intergenic	novelGene_129627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGATGTCATTCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144622	142663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_253_pilon_-_142700_144600
931549	contig_8544_pilon	+	952	8	Intergenic	novelGene_55909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_4	386.065818645643	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	613	951	34461	90624	FALSE	45	TAAGTATTGGTAATAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHKAFQQDASSADIRKAYRKLSLTLHPDKNRDENAETQFRQLVAIYEVLKDDERRQRYDDILINGLPDWRQPVFYYRRVRKMSNAELALLLFIILTVGHYAVVWSIYLEKQL	18507	90625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8544_pilon_+_18597_19249_19423_27777_27946_32276_32381_34382_34485_83417_83520_83788_83836_90458
931550	contig_5315_pilon	+	3849	2	Intergenic	novelGene_175347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	106	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAATCAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1839	19443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5315_pilon_+_3847_17601
931551	contig_13992_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_147643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGAAATAGCCAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535946	534537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13992_pilon_-_534500_535900
931552	contig_15047_pilon	+	1648	6	Intergenic	novelGene_52146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	27	650	2194	4178	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2167	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
931553	contig_11978_pilon	+	624	6	Intergenic	novelGene_63059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_5	2755.83806490875	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	29	619	1827946	1831883	FALSE	5	CTCCCCTTCTCTTGTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFGAVAAAMSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1827917	1831888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1827951_1829079_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
931554	contig_5964_pilon	-	1814	5	Intergenic	novelGene_80357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	51.895929512824	11	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	621	1259	42416	41276	TRUE	15	AAATTTGTCTTTTCTTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNEYLRPGIDPQKEQLPGKISPKYDGLGTDDGACSRILQEPVIPGDAHHESDSHGPAKNAMSHEETNPYICKECGKVFNKRHLLTQHEQIHSGLKPFECTECGKTFSKSTTLLQHHIIHTGEKPYECTECGKAFNQRAHLTQHQRIHTGEKNPLSARNVGKPFVIGQRYFDTTASTLERSPMSAVSVGRPSTASHTSLSTKGFILGEALSV	47411	39142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5964_pilon_-_39550_41127_41465_41966_42566_45794_45923_47068
931555	contig_9653_pilon	-	2523	8	Intergenic	novelGene_48192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1267	junction_1	246.577387777682	1	115	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1027	1878	186221	175913	FALSE	25	GAAGCAGTGTTGATTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRDLNLGEMKSGVPVLAVSLALEGKASHREMTSKLLSDLCGTVMSTNDVEKSFDKLLKDLPELALDTPRAPQLVGQFIARAVGDGILCNTYIDSYKGTVDCVQARAALDKATVLLSMSRGGKRKDSVWGSGGGQQSVNHLVKEIDMLLKEYILSGDISEAEHCLKELEVPHFHHELVYEAIVMVLESTGESTFKMILDLLKSLWKSSTITVDQMKRGYERIYSEIPDINLDVPHSYSVLERFVEECFQAGIISKQLRDLCPSRGRKRFVSEGDGGRLKPESY	189866	175267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_175974_178100_178241_178910_179022_179275_179384_182567_182683_184264_184363_186002_186225_188843
931556	contig_17976_pilon	-	1539	1	Intergenic	novelGene_32527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTCGGTATTTCGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48045	46506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_46500_48000
931557	contig_12864_pilon	+	3810	2	Intergenic	novelGene_76455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2023	2523	311612	312164	FALSE	85	ATAAAAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNQLGSVLIFCFCFQFYLPIFVVWCNSFEVCTIRPGYHAVEKVRAPKAHCGVFLCHGMRGSRVRIDKSMQTRRELGHLNYACLNTTSPINPFFFTAALWPTAAVEIYTSRVLEAVNGTDVRLKCTFSSFAPVGDTLTATWNFRPQDGGSEQFVSRLLSFSRETAD	309589	313451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_311857_311908
931558	contig_1225_pilon	+	2017	3	Intergenic	novelGene_44157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	540	908	274522	275688	FALSE	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTDGFRSAPANHRGVLPGLPFPLLTSPLPSPSSHSSSLTTLSGLSACSSCGSWSRGQGNIFLSLLVGEFNAGPWSWQSLTGMERVTRSSSSRGIKFEMNSCHEIHDFSPKLFLDADGREVW	250599	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_274222_274564_275361
931559	contig_13379_pilon	+	1061	1	Intergenic	novelGene_175879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	63	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCAGATTCATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214494	215555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_214500_215600
931560	scaffold_4805_pilon	-	2587	1	Intergenic	novelGene_161019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGACAAGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	398883	396296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4805_pilon_-_396300_398900
931561	contig_4407_pilon	+	926	1	Intergenic	novelGene_122263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATCTTTGCGGTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2590	3516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4407_pilon_+_2600_3500
931562	contig_6595_pilon	+	1680	1	Intergenic	novelGene_122540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	1005	1313	563389	563697	NA	35	GTATATTTTCACACACACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSALITRPKYMRRSVAMLASKEHSGCTSSKTDLFALLAIHSIFNILHQHHNLKASFLLQSFLFPVQLSHAYKVIENAIVWVKSTSVLKVASFFLTL	562384	564064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_+_562400_564100
931563	contig_12250_pilon	+	1897	4	Intergenic	novelGene_80624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	30.1367254727885	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	278	1300	350196	352020	TRUE	15	TTAAGCTCTTTCTTCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTISGHPRSWSCRWLPVLLLLLLRTSRGPGVEGVTHYKAGDPVILYVNKVGPYHNPQETYHYYQLPVCCPEKIRHKSLSLGEVLDGDRMAESLYEIRFRENVEKRILCHMQLSSVQVEQLRQAIEELYYFEFVVDDLPIRGFVGYMEESGFLPHTHKIGLWTHLDFHLEFHRDQIIFANVSVRDVKPHSLDGLQPDNFLGLTHTYSVHWSETSVEHRSDRRRGDDGGFFPRTLEIHWLSIINSMVLVFLLVGFVAVILMRVLRNDLARYNLDEETTSGGSGDDFDQGDNGWKIIHTDVFRFPPYRGLLCAVLGVGAQFLALGTGEVIRINQGFLSRGRTR	349918	354730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_350544_351345_352021_352271_352443_354304
931565	SIRV7	-	903	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	82	21	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147923	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114989_147608
931566	contig_5231_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_65901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGATTCTCAAATGGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239710	240876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5231_pilon_+_239700_240900
931567	contig_2924_pilon	-	3623	1	Intergenic	novelGene_140281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCCTTTTTTATAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274956	271333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2924_pilon_-_271300_275000
931568	contig_8304_pilon	-	1627	1	Intergenic	novelGene_153167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGTGTTTCTGTTCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71685	70058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8304_pilon_-_70100_71700
931569	contig_5485_pilon	+	1870	1	Intergenic	novelGene_37785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTATAATGTGACAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	658251	660121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5485_pilon_+_658300_660100
931570	contig_13872_pilon	-	1341	1	Intergenic	novelGene_179089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATTTAATCCTTACACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126872	125531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13872_pilon_-_125500_126900
931571	contig_10482_pilon	-	1772	7	Intergenic	novelGene_152828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GTGTAAAAAAAAAAGTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127102	116178	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_116257_117243_117313_118595_118654_119563_119710_122331_122474_123192_123310_125940
931572	contig_6898_pilon	+	1940	4	Intergenic	novelGene_35777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3278.14703758083	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	4	318	124416	125542	TRUE	25	AATTGTGGGGCAACCTAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKVCRQGQRVKLPMI	124412	127516	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124464_124782_125034_125526_126149_126500
931573	contig_17144_pilon	-	448	2	Intergenic	novelGene_29417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	131	370	166391	166152	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174760	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166423_174661
931574	contig_15674_pilon	+	2151	1	Intergenic	novelGene_179197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	332	999	5	1003	526	1524	NA	55	GGAAAAAAAAAATCTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMFPEGVQTKTPDDFAVEEKALELPDRELKFLILRILQELKQKADKHVEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKKEETLRVTWDTIKSKNFQVIGVPEQGQKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRIDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDKQKLREYVKAKPNLQKLLKGVLRSENKQLQLTGRI	521	2672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15674_pilon_+_500_2700
931575	contig_19727_pilon	-	2159	2	Intergenic	novelGene_168990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56182	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032
931576	contig_9189_pilon	-	1883	2	Intergenic	novelGene_165105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTAAAATGCAGAACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252920	241318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_-_243005_252723
931577	contig_610_pilon	-	2747	1	Intergenic	novelGene_76684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	157	474	1002	1475	42753	42280	NA	40	TATATAATGTTATTCAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKELELENQKEIAHSAFLKLKELKKKFKPQVAILEDSMGKIVNDAGSIKRRWKEYTESLFQKELVDIQPLQEVAYDQEPMVFKEEVQAALKPLTKNKAPGIDRIPIEIFPQTDATLEVLTHLCQEIWKTVTWPTNWKKSIIVPIRKKGDPTECRNY	43754	41007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_41000_43800
931578	contig_3747_pilon	+	2689	8	Intergenic	novelGene_24822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3869.49268414518	10	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	330	929	201313	203114	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRNQAFHSGLQHPSS	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202725_203073_203128_203228_203386_203498_203651_203768
931579	contig_9345_pilon	-	2210	1	Intergenic	novelGene_24429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACTTAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274878	272668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_272700_274900
931580	contig_3721_pilon	+	1407	1	Intergenic	novelGene_123825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAACATATCCAGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234153	235560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3721_pilon_+_234200_235600
931581	contig_6397_pilon	+	2803	2	Intergenic	novelGene_146281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTAAGCAAAGGAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	567362	570228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6397_pilon_+_567603_567665
931583	contig_8598_pilon	-	5243	3	Intergenic	novelGene_22892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	182	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	873	4371	5243	177533	176661	FALSE	20	CATGAATCTCTCCTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSQRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKLGSSSTLEWSSTAPQEEAKMAHRAGYLSEGRGRWREASKKSKEAGKKKATLTANKWCSESQLVRAGVSGQETVSMGSRGGLVWVKKSREWESVYHKLPELCSPSGRSKDGALSEVLERKEGEVGRGKEEIKRSGKKATPADNKWHSESHPFGSVESKQPLFPGQETVAAGSRGGQVGVKKGGGWESVYRQLPVVLSPAGSSVRLLSRTPCLPVSDRSPRWWIRAALAGRGLL	188194	176660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8598_pilon_-_178221_180888_184057_187679
931585	contig_2310_pilon	+	1370	2	Intergenic	novelGene_71636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAACCCTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	481399	482808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2310_pilon_+_481800_481838
931586	scaffold_17542_pilon	+	2693	1	Intergenic	novelGene_139239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	39	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTGTAGTGAACAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448476	451169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_448500_451200
931587	contig_18162_pilon	-	2875	3	Intergenic	novelGene_122322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAATTCTAGGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10813_16372
931588	contig_8110_pilon	-	1437	1	Intergenic	novelGene_158614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCGGGAATAGTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132388	130951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8110_pilon_-_131000_132400
931589	contig_10838_pilon	+	1458	1	Intergenic	novelGene_129174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATGAAATAGAGAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124931	126389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_124900_126400
931590	contig_14353_pilon	+	3463	9	Intergenic	novelGene_82081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1366	1743	80437	82722	TRUE	20	GCCAGGCAGTCCTCTGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHPSPLAKGPGSFYACTLVSWMSPPHFQVVDGRQVLQAVAVFTQVLAIHGHLEAVAFTQYPHREVLAAAEGHFPRQAALLRPPGIVDLCVADHSILIEAGVEVEGDVTARAQVDVEPLGAGQDGT	79071	104411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80621_82377_82545_82695_82785_83259_83302_83903_83953_84505_84542_87365_88742_90976_91053_104332
931592	contig_14041_pilon	+	1814	1	Intergenic	novelGene_144031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTTACAAGAAAACCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34540	36354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14041_pilon_+_34500_36400
931593	contig_1210_pilon	-	1587	3	Intergenic	novelGene_171515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAATTCTTCTGTCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259968	242990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1210_pilon_-_244088_244256_244732_259953
931594	contig_12605_pilon	+	1053	5	Intergenic	novelGene_64193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2960.6692972198	101	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	343	1029	23	1051	3897	6216	FALSE	40	GAGGAAGAAGAGCTCAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPKPNGLCPVPAGLGGGGADRGADRDGLTAGAGPGSHTLQEMYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVI	3874	6218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4489_4699_5072_5728_6005_6124
931595	contig_8198_pilon	-	3234	1	Intergenic	novelGene_178073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	215	648	1868	2515	92532	91885	NA	85	AAAAGAAATGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQRQQTISKHVQKQDRMVPVGVQNKTPDDSPVEENGLELPDREFKSLILRILQELREKADKHEEKIDKFMENTDKNLEEFRKIMQEQNVKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRMSGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNVRVIGIPEQGKKTENAERITEELLTENFPNIKKDEKLAIQEA	94399	91165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8198_pilon_-_91200_94400
931596	contig_3754_pilon	+	2669	1	Intergenic	novelGene_146818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTAAAAAAAAAAAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78503	81172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3754_pilon_+_78500_81200
931597	contig_19402_pilon	-	2166	4	Intergenic	novelGene_80793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGCCAAAGATACACCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58046	35551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_37075_47344_47387_55277_55354_57521
931599	contig_7843_pilon	-	2553	1	Intergenic	novelGene_152043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATTCCATGGGAGCCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452936	450383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_450400_452900
931600	contig_11816_pilon	-	1873	1	Intergenic	novelGene_98578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAACCAATAAAAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335335	1333462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1333500_1335300
931601	contig_11281_pilon	+	1495	2	Intergenic	novelGene_125461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGTCCTTAATTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	829877	832667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11281_pilon_+_830935_832229
931602	contig_6445_pilon	-	1458	15	Intergenic	novelGene_76928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	579.050388170854	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	49	1143	88578	44555	TRUE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQHERPGRL	96339	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49790_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
931603	contig_7702_pilon	-	3692	2	Intergenic	novelGene_177296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	38	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	272	571	88716	88417	TRUE	40	ACAAGGACAATTGTAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENAPCALEKKVYLAAVGWSVWYMSMRSSWLIVAFNSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTTIVELSISLFSTVTVCLPVIGCINIYYSYVLLMF	88987	85247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7702_pilon_-_88222_88269
931604	contig_5457_pilon	-	2153	1	Intergenic	novelGene_138995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAAAAAGTCCAAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26056	23903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5457_pilon_-_23900_26100
931605	contig_12837_pilon	+	1037	1	Intergenic	novelGene_57343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTTATATCTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207115	208152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_207100_208200
931606	SIRV7	-	893	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	2	-14	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	45	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAGCATTAACATGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147955	56051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
931607	contig_15407_pilon	+	3946	4	Intergenic	novelGene_123041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	1091	1600	333130	333639	TRUE	50	TCCACAAACAAAAGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIETTLGALIHGINTIQTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDRSNQHLMSKIYKILQNLNNKKTNNPIKKCAKHKNRHFAKEDIQAANRHVKKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLIQTRLASIQKTQNNKCWRGCGETATLIHCW	272546	375170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_272754_332246_334996_373659_373751_374271
931608	contig_14472_pilon	+	2221	1	Intergenic	novelGene_111190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAAGGAGAAAATAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431480	433701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_+_431500_433700
931609	contig_11823_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_171028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAGAAAAAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63531	64970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11823_pilon_+_63500_65000
931610	contig_2646_pilon	+	1221	8	Intergenic	novelGene_69514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	219.93236437132	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	554005	565383	TRUE	20	CTTTCCTTTCTAACATATCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVEAARSASSLSGSESSAFSEAVTEPPKRRPEKWTAAIEAHRAVTAARSHERQRRAELRRAGIPFCFQKWKCSWIWEIRKAYPCKVSLQGRFQAFQIKVQVQI	554003	573790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_+_554189_565255_565390_566422_566586_569609_569726_570832_570917_572011_572072_572767_572842_573385
931611	contig_6291_pilon	+	2100	1	Intergenic	novelGene_164793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGAAGGAGACAGGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382462	384562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6291_pilon_+_382500_384600
931612	scaffold_12124_pilon	+	3078	9	Intergenic	novelGene_22279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3257.50943974074	8	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1109	1888	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473576	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490361_1490409_1491906_1491976_1494270_1494307_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
931613	contig_8375_pilon	-	936	1	Intergenic	novelGene_141283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGGGCCAGGTTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100079	99143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_99100_100100
931614	scaffold_12124_pilon	+	2448	9	Intergenic	novelGene_22315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2180.32543084169	4	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	468	920	1484002	1508039	FALSE	25	GTGTGGTAAACTTGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPEQITAAKGRFPNKVTLTGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483534	1509567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489063_1491933_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
931615	contig_20602_pilon	-	1584	12	Intergenic	novelGene_133724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	395	junction_11	209.637546318512	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	397	1392	24969	10026	FALSE	15	TGTTGTGTTTACTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGQPHLSRQDLATLDVTKLTPLSHEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVHTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKLDDPSCPRPECYRSCGSSTPDEFPTDIPGTKGNFKLVRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29525	9833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_24914_25010_26213_26336_26429_26558_28884_28949_29483
931616	contig_14666_pilon	+	718	2	Intergenic	novelGene_39632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	2	634	483933	485144	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLCRADAISWREGTATSGRVSLKMRVFPPASAAYSALQTPLSAWRQEGWGGVGGELIGLGSSADM	483931	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484373_484951
931617	contig_4091_pilon	+	2649	6	Intergenic	novelGene_173013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	35.8530333444745	10	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAGGAAATAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10831	34946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21118_21311_21378_21461_25756_25821_26470_27439_34062
931618	contig_10437_pilon	+	2030	11	Intergenic	novelGene_38202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_2	536.222192752221	1	101	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	62	1204	229668	232651	FALSE	30	GTAACAAGTGTCCGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EERRSSGSRPGHLRDAAAAEMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIAFAIVFIITRLVILPFWILHCTVVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHVFWAYLILRMAYKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHHKND	225711	233477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225772_229666_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231947_232055_232163_232318_232510
931619	contig_11720_pilon	+	968	7	Intergenic	novelGene_43847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2816.90364387724	5	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	166	684	87158	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQVRERGRRKQTRSSRSNICSFVPLRYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68110	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_87054_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
931620	contig_8138_pilon	-	1848	4	Intergenic	novelGene_52474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCAGCGGCGGCAGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307934	280271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280331_288507_288614_304971_305085_306364
931621	contig_5280_pilon	+	2143	8	Intergenic	novelGene_52596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	700.8037950694	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	29	1225	38343	78235	FALSE	30	CTCACGTAGTATTTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVAPARFLLMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGTFRTHMYNIDSFDYDASNHWLADLAKEELRRKCTQVHRISSFLRTFWRSGHNICSSAVCCACCHCL	38314	79153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56335_78034
931622	contig_12765_pilon	+	2576	1	Intergenic	novelGene_106561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	73	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTGTTACTCTGGCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120471	123047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_+_120500_123000
931623	contig_10196_pilon	+	1048	9	Intergenic	novelGene_132141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	384.287896634802	3	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	13	450	1034566	1044901	TRUE	25	AGTATTTATTCCCGTAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAPVMVLGCGLIGRRSLAVLGACARRSLGPALLGVLFHHTDLRKSAVVEQAAMKVELLPALTDNYMYLLIDRDTKEAAIVDPVQPQKVMETVKKHGVKLTTVLTTHHHWDHAGGNEKLVKLESGLKVYGGDDRIACRHHATLLDTSATS	1034553	1050779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_+_1034639_1038292_1038469_1039041_1039107_1043818_1043894_1044852_1044941_1046370_1046475_1046980_1047083_1050131_1050212_1050506
931625	contig_13952_pilon	+	2068	1	Intergenic	novelGene_133279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAATTCCAAGATTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241777	243845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13952_pilon_+_241800_243800
931626	contig_11572_pilon	+	1079	1	Intergenic	novelGene_100084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	426951	428030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11572_pilon_+_427000_428000
931627	contig_11285_pilon	-	1513	15	Intergenic	novelGene_5671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	458.162857597201	2	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	211	1323	789442	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANMSGFLLLIGAYEAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	790200	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789209_789259_789282_789440_789509_789926_790053_790182
931628	contig_14441_pilon	+	1463	6	Intergenic	novelGene_100515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	381.824776566424	22	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	848	1276	116728	117610	FALSE	15	TACGAGTGTCTCATTTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	110991	117797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111386_111998_112040_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
931629	contig_20527_pilon	+	2750	5	Intergenic	novelGene_138564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	1	148	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	683	1309	13527	27453	FALSE	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12844	28894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
931630	contig_6361_pilon	+	2993	5	Intergenic	novelGene_23979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	126	470	405360	405704	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405234	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
931631	scaffold_13505_pilon	+	3633	2	Intergenic	novelGene_111609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	134	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	812	1324	659510	660022	FALSE	30	AACTCAAGATATTTCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASLLTSQQPWAVLLSFHHAEPSSHREPWSFALISPSLSPSRGLRDDLSWGCPPRTQGQGGRKVRKLCSSPVSLLCLHRKKVLKKLSCSNATDLIVVKYFPCTWTPLWSPSIGGKSLLPVTASDIFTVRLPDCHQGGGDSLLKRALGTVAKLIGQKLFLRQSRCMALLLL	657055	662331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_657111_658753
931633	contig_12425_pilon	-	324	1	Intergenic	novelGene_46627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGACCTCATAGCTGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91193	90869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_90900_91200
931634	contig_6266_pilon	+	3984	3	Intergenic	novelGene_171009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	26	122	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1655	1990	867112	867447	TRUE	40	CACAACACACTGACAGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVECLCIVNQTQVNIFLVFSAFSQDPSDISNGIPCSTSSSESSLNFRQFSVLVITAATVFELSSAKFYFHVIVMILIDNFHILLAHFSLEWAQILISFSQLEPWWCRG	865457	916735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6266_pilon_+_868238_915380_916308_916458
931635	contig_8617_pilon	-	1142	1	Intergenic	novelGene_73459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCAATCCCTATCATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63219	62077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_62100_63200
931636	contig_19160_pilon	-	1846	1	Intergenic	novelGene_178943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	213	642	509	1150	10576	9935	NA	50	ACGAGAAACTGAGCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITRRFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSNLLLSPSMTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFVIVCCLRGIQ	11084	9238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19160_pilon_-_9200_11100
931637	contig_6589_pilon	-	904	1	Intergenic	novelGene_25814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGGGGGGATTTAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727258	726354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_726400_727300
931638	contig_10475_pilon	+	1196	1	Intergenic	novelGene_148750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	581	928	275668	276015	NA	15	CAGGGCTGAGGGGCCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METKKDLENSVVKTKDIRLRIFSKDVATRSFVKRLNSNQLPQQKTHQFRLKGTEKEQNKRTLSASWNFIDRKQLKDLHLLSSKKERAIPGAAWRSGELLEGAREAGPSQYQRMRP	275087	276283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10475_pilon_+_275100_276300
931639	contig_4426_pilon	-	3932	5	Intergenic	novelGene_15402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	297	junction_1	77.8086595437809	3	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	893	2682	207	2888	819391	799730	FALSE	30	AATAAATTTTATTGGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEKERLRNRNCLELKVKDKDKIKHALAESKNKELTKSKSSELAEAYTKEKQLKDAVSNRSQSLDTKNIMSLGKSSFVSDTSLNRSPRSESEKPGLSSRSVSMISIASSEDSCHTTVTTPRPPVEYDSDFMLEGSDSQMSFSQSPFLPVAKSPALHERELDSLAELPERIKPTYANRLPTSHLRSSSVEDVKLIINESRPIVEVRRCSIPSVICEHAKQFQTISEESNQGTLLAVPRDICPSPKPEVSSNVPERDFSNMSNIHSSFAVSPTRSVNSKYISADTNVIKSTVPVNTLIGSPVHLEPSNQVGVIRNKSWEIPVDRLESLSTSDFICPNSSKPDQDSSGQDFCNSENKVLKEQNTDFSSLHQTEPPGNSCAQESASFMPSLPPCSYHSQLLSDAESTSKHMSLSYVANQEPDILQQKNSVPIISSVLDTDNESTKDKENTFVPADVPKTDAIVSVYSESTIEEASPTFEKANTLPVLPSEKDFNGSDASSQLNTHHAFSKPVCKSSSGLEVENSTTDTQVISHEKGNKLESFVLTHLNDKCDSDLCEMSAGVPKENLSEQGNPKHCPESEKCLLSIEDEESEQSILSNLENHSQQSVPPEIHKYSQFIKVEIEENAEDDKTENHVPQRVTRNRANTMASQSRQFLAACTLLSEKDNESSSPRGRIRLTEEDDPQVHHPRKRKVSRVPQPVQVNPFLLQAKEKTQQSLAAVVDSLKLDEIQPYSSERANPYFEYLHIRKKIEEKRKLLCSVIPQAPQYYDEYVTFNGSYLLDGNPLSKICIPTITPPPSLSDPLKELFRQQEVVRMKLRLQHSIEREKLIVSNEQEVLRVHYRAARTLANQTLPFSACTVLLDAEVYNVPLDSQSDDSKTSVRDRFNARQFMSWLQDVDDKFDKLKTCLLMRQQHEAAALNAVQRLEWQLKLQELDPATYKSISIYEIQEFYVPLVDVNDDFELTPI	819597	798685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_799916_800548_800645_802509_802654_806901_807001_817234
931640	contig_5643_pilon	+	1963	15	Intergenic	novelGene_39081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	731.58299499881	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	412	1239	584	1822	634983	641450	FALSE	10	CCGGTCATTGTGTGTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHLPHSLPHLSAASALTPAEASSG	631265	641591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641377
931641	contig_5945_pilon	-	1347	7	Intergenic	novelGene_104556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	339.468416138461	1	35	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	24	521	249708	219602	TRUE	10	TGACTGTGCCTTCGTTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLQACISMLPGAMSFLKSFPPPGPAEGLRQQQPDTEAVLDGKGLGTGTLYIAESRLSWLDGSGLGFSLEYPAISLHAEDSDDDVEPVAEFRFVPSDKSALEAMFTAMCECQALHPDPEDEDSDDYDGEEYDVEAHEQGQGDIPTFYTYEEGLSHLTAEGQATLERLEGMLSH	249731	215588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_-_216323_219509_219606_224431_224541_225669_225778_226433_226501_235684_235755_249568
931642	contig_3747_pilon	+	2683	7	Intergenic	novelGene_24831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4393.17446601986	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	565	1305	202422	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200984	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201448_202320_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
931643	contig_12761_pilon	-	2024	1	Intergenic	novelGene_164047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	90	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTCTAGGGGTTAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58228	56204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_-_56200_58200
931644	contig_15067_pilon	+	687	1	Intergenic	novelGene_154317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACCCTGCTAGTATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21513	22200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15067_pilon_+_21500_22200
931645	contig_3832_pilon	-	2638	1	Intergenic	novelGene_161489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTTTAGGTATGATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	484257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_484300_486900
931647	contig_10853_pilon	-	2842	3	Intergenic	novelGene_179198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAACTCCCAGGGATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136839	103493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10853_pilon_-_104938_105153_105847_136134
931648	contig_5988_pilon	-	1589	4	Intergenic	novelGene_15918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	565.192002774278	13862	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	60	1415	655459	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	655518	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549_653773_655456
931649	contig_6870_pilon	-	1015	1	Intergenic	novelGene_103968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAGAAGGATCTCCAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1424187	1423172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_-_1423200_1424200
931650	contig_294_pilon	+	1139	1	Intergenic	novelGene_166757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGATCTTTCTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372855	373994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_294_pilon_+_372900_374000
931652	contig_16594_pilon	-	4358	11	Intergenic	novelGene_53811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2867.13694999036	2	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	255	1046	165546	121101	TRUE	30	CCTAATAAAACTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	335653	115146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115991_116096_118551_121086_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135320_135510_149149_149351_165486_165649_293805_293888_335583
931653	contig_8538_pilon	+	1881	1	Intergenic	novelGene_4651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	609	1830	2	1831	841232	843061	NA	35	AAAGTTGTTGCATTCCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	841230	843111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841200_843100
931654	contig_9594_pilon	+	2438	1	Intergenic	novelGene_73910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTCCTTGCCACACAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112099	114537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9594_pilon_+_112100_114500
931655	contig_5981_pilon	+	4958	6	Intergenic	novelGene_35539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	138	junction_4	72.2811178662865	1	178	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	3619	4191	313385	317012	FALSE	30	TTGCTATTAACAATTTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQAFSLYEDEIGDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLRRESPESEGPIYEGLVL	306253	317779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_307603_308170_308327_311271_313394_313869_314110_314545_314690_316832
931656	contig_7230_pilon	-	1404	7	Intergenic	novelGene_52556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	354.438248813841	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	239	553	164221	134622	FALSE	30	CAGAATCTCCTTAGATGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CVIWWSQHLGKYLRFTFPGITWVLVYRTDKYKRLKAEVEKQSKKLEKKKETITESAGRQQKKKIERQEEKLKNNNRDLSMVRMKSMFAIGFCFTALMGMFNSIFDGRVVAKLPFTPLSYIQGLSHRNLLGDDTTDCSFIFLYILCTMSIRQNIQKILGLAPSRAATKQAGGFLGPPPPSGKFS	177620	133770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7230_pilon_-_134721_150914_151060_162610_162679_164218_164266_171092_171153_176933_177012_177564
931657	scaffold_9100_pilon	+	927	4	Intergenic	novelGene_83273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	728.031745339599	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	82	249	108	356	647136	649118	TRUE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKG	644847	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649363_654523
931658	contig_8843_pilon	-	684	1	Intergenic	novelGene_156642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTACAGTAATCCAGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42032	41348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8843_pilon_-_41300_42000
931659	contig_9468_pilon	-	1518	14	Intergenic	novelGene_59451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGCGCCGGAAATACGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206069	150443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9468_pilon_-_150576_172513_172567_172893_172971_173052_173128_173539_173658_175889_175932_177205_177311_189779_189927_192802_192870_200358_200576_201340_201503_203176_203262_205634_205777_205973
931660	contig_8377_pilon	+	1085	1	Intergenic	novelGene_35016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATATTGAAAATGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68219	69304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68200_69300
931661	contig_9132_pilon	-	2043	2	Intergenic	novelGene_121382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1297	1674	183030	182653	FALSE	25	GTTTGATTTGCACAGTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKGPSPSPPQQTRPGRSRSPERSPHSPTGKGKDGARSQAPEQMEGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGRTESNHLAPPSQETLDTGSRGAPAGAKRSGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	184651	182283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9132_pilon_-_183120_183444
931662	contig_12503_pilon	-	3989	1	Intergenic	novelGene_143813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTGCTTTTTCTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68931	64942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_64900_68900
931663	contig_34_pilon	+	2293	3	Intergenic	novelGene_40026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTCTGTATGTTTATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216045	218848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_216966_217370_218572_218676
931664	contig_8138_pilon	+	1993	4	Intergenic	novelGene_52462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	500.631601080076	2	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTTAGTAGTGGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280122	307934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288606_304973_305091_306364
931665	contig_9809_pilon	+	3357	9	Intergenic	novelGene_176759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	81	junction_4	149.822394854708	4	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	97	1017	108394	114954	TRUE	30	TCTATTAAAAGCCCTCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRCSPCSGTSSRTIRTSGASWGRRLSLPGARRPSYRAEKRRELTTLKYRNSFPKKQISFLRFRGSQMRLQFLTLTRTVKALCPLRDVPSHSNHGDPLSYYQTGDVIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYYSKNFSEDDYASALRKKQSASWALKCVKIGVDYFKVGRHVDAMNEYNKALEIDKQNVEALVARGALYATKGSLNKAIEDFELALENCPTHRNARKYLCQTLVERGGQLEEEEKFLNAESYYKKALALDETFKDAEDALQKLHKYMQVILYFLLEN	108297	118056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9809_pilon_+_108512_108903_109029_110410_110496_110652_110783_111746_111819_112241_112362_112466_112590_114806_115991_116752
931666	contig_8729_pilon	+	2705	3	Intergenic	novelGene_40108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	10	1	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAGAAAGAAAAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276519	289476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8729_pilon_+_276611_286404_286442_286899
931667	contig_13456_pilon	+	1629	1	Intergenic	novelGene_153274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	1165	1587	126227	126649	NA	30	TAAGCCTAGCGAGATGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFIREVTGYNSGSGSTWNNKQFRIQFFNQGSSFSAIPAGRPLSAVCLASAFPGQVLQSSLALLRYPTLPGSLCPKALSSLAPWARKHPAATPLSGPRSPLCHLALLLPTVLQLSSSPGSRRFSAQGLQVQRTRSAPGSS	125062	126691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_125100_126700
931668	contig_8295_pilon	-	1653	2	Intergenic	novelGene_176349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAAAAAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	766481	764006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8295_pilon_-_764398_765219
931669	contig_12312_pilon	-	1421	1	Intergenic	novelGene_63943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	58	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	325	348	214932	214909	NA	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIWGWVHFLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215256	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_213800_215300
931670	contig_4024_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_177898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1	351	175211	174861	NA	25	CCCCGTGGAATTCTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVVARTKEAVASRVVLHSLSRRSKDGTQSQVFKRKEEKEVRGREETKRSQKKKKKQHQQQRNVTEEASWCGQGESVQHETHVSHAAVTTCWEVANWLAWRQQTGLPEAANRPAGKL	175211	173376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_173400_175200
931671	SIRV7	+	1959	5	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	3	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGTGTATATGTAAGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1125	147876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2338_2993_3111_43027_43083_114683_114993_147610
931673	contig_11855_pilon	-	2948	4	Intergenic	novelGene_67151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	269	junction_1	43.7340447096615	11	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1813	2121	2711839	2710017	FALSE	40	AAATAACCCTGAATTTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLDVDSLPYQAPASAQGGARQNPGLVYGNPYCGIQESSSPNLASITKCPTCNVHFTDDMNKEDHTLEQHVQALCLDCPICDKSFPIDQRQIFEDHVLCHSL	2715259	2709189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_2710197_2710709_2710739_2711739_2711876_2713483
931674	contig_4125_pilon	-	1761	1	Intergenic	novelGene_25051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	174	522	1238	1759	286274	285753	NA	35	ATTTTTCAAAGAGAGCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIEFCKTNDFTANTFFLQHKQQLYKWPSPDGIHRNQIDYICGKRQRKSSISLVRTRPGADCGTNHQLLICKFKLKLKKIRTSPQKPKYDLEYIPPEFRDHLKNRCDALNTSDRGPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKWVSEEALKIARERQAAKVNRRNDEVKELNR	287511	285750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_285800_287500
931675	scaffold_13553_pilon	-	725	1	Intergenic	novelGene_73743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAGATTAACAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2626	1901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_1900_2600
931676	contig_6885_pilon	-	3302	2	Intergenic	novelGene_83700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	1393	1833	284288	283848	TRUE	35	CAAGAATGGTGAGTATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRRFQRATREDKVKYYKDMFKELEIENQKGKTLSAFLKLKELKKKIKSRVAIVQDSMGKILNDAESIKRRWKEYTESLYQKELVDVQLFQEVAYDQEPMVLKEEVQAALKALVKKEAPGIDRIPIEMLQQTDAVLDVLTHLCQEI	285680	280683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_-_281654_283348
931677	contig_4114_pilon	+	4802	1	Intergenic	novelGene_15632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	64	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	384	1803	2186	484082	484465	NA	70	ATGACATACTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQSHVKCQEPATSQLKQLKLGFQYIRCHTVVMRAYAVQMGPHKSMQGERYPKSVDPLCLCLGKGAVPTLGSWLRGAGSLFFLFVNLFTLQGRENGSGHVRDPTSGSGGWAITEAGPGPNAEQGAGR	482279	487081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4114_pilon_+_482300_487100
931678	contig_17964_pilon	-	2498	3	Intergenic	novelGene_33859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	10345	junction_1	1529.5	8	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	888	1334	139592	135358	FALSE	0	TCTCTGGCTGGTGTGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHNQFVKMMIIFSIAFITVLILKVYMFKCVWKCYRFIKYTNSAEERNSSKMPQKVVLPSYEEALSLPSKTPEGGPSTTPPIRRCDPRQAPALVLGEAELPHNLLLCFGGPCGLGGPPSRLQDNLLVSPSLACFSVGPVRCSQLGQTF	140479	134193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_-_135640_136905_136999_139520
931679	contig_14463_pilon	+	1455	1	Intergenic	novelGene_179199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	982	1347	54158	54523	NA	5	TTGTTGTTCACTCGTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	53176	54631	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14463_pilon_+_53200_54600
931680	contig_10196_pilon	-	2438	1	Intergenic	novelGene_132202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAAGACCTACCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1251424	1248986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10196_pilon_-_1249000_1251400
931681	contig_7138_pilon	+	1656	2	Intergenic	novelGene_120992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTTGAGGATGGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	217016	396838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_218181_396346
931682	SIRV7	-	1543	3	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	110841	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	29	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAGTGTTAATATGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3897	1002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2340_2993_3112_3809
931683	contig_3948_pilon	-	2292	6	Intergenic	novelGene_53217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	282.866046035928	1	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	62	592	866476	842667	TRUE	70	ACAAAAAAAAATGCAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAEVCLNVTDTLMPGVSHSS	869629	839324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842723_852427_852636_856565_856712_866355_866480_869571
931684	contig_8330_pilon	+	2234	13	Intergenic	novelGene_71795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_7	544.072579921303	889	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	221	1324	852673	856687	TRUE	5	CGCTGCCCAGCCTTGGCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837530	857811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
931685	contig_7119_pilon	+	1881	4	Intergenic	novelGene_40950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	2	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	130	867	137033	139935	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTARKTTTT	127528	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139364_139917
931686	contig_14441_pilon	+	1155	6	Intergenic	novelGene_100488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	438.643089538636	4	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	567	1115	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92176	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92708_121635_121691_125517_125902_126159_126283_126514
931687	contig_11846_pilon	-	2303	1	Intergenic	novelGene_105968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAATAAAAAGAAAACAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294903	292600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_-_292600_294900
931688	contig_7138_pilon	+	2393	1	Intergenic	novelGene_120983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAGAAAGCGCTGAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143684	146077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_143700_146100
931689	scaffold_13505_pilon	-	1569	9	Intergenic	novelGene_111516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	447.362112136243	4	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	370	1113	1	1113	603219	590218	TRUE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSVLVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGLAARVTLDISSP	603219	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_596976_597232_597627_597907_601873_602243_602576_602698_603171
931690	contig_16496_pilon	-	699	2	Intergenic	novelGene_5238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	25	ATTGGGACCCGTAGGGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
931691	contig_10182_pilon	-	1280	1	Intergenic	novelGene_134636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATTTATAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	407438	406158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10182_pilon_-_406200_407400
931692	contig_10951_pilon	+	1181	1	Intergenic	novelGene_61634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	209	630	515	1144	215885	216514	NA	55	GAAAAAGACAATTACCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKQISNVIWKGKRPRISKALLKKKNKVGGLTLSDFRTYYTAMVVKTAWYWYNRYIDQWHRIENSDINSSTYEQLIFDKGLKSVNWGKESLFNKWCWHNWISFCKKLKEDPYFTPCTKTNSKWIKDLNIKSKMIKITEEKTGTTLAALIHGINRIQNITNNAQTPEEKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDSEKFLATTYPIRV	215370	216551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10951_pilon_+_215400_216600
931693	contig_3077_pilon	+	1686	10	Intergenic	novelGene_26658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_7	3285.98849588092	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	62	1210	9676	17590	FALSE	65	AAAATACAAAAGATTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9614	18066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15259_16144_16328_16936_17054_17449
931694	contig_3747_pilon	+	2504	8	Intergenic	novelGene_24904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	7	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	119	1126	201481	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201362	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
931695	scaffold_12510_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_151372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGTTGGCAAATTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209344	211926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12510_pilon_+_209300_211900
931696	contig_18035_pilon	+	1515	2	Intergenic	novelGene_178682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3029	4738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18035_pilon_+_3852_4045
931697	contig_8606_pilon	+	1837	1	Intergenic	novelGene_159393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	339	1498	1836	44084	44422	NA	50	ACATAAGAACATGTACACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNIPWTARRTNKSVLEEVHPECFLEARMAGLRLTYFRHVIRRDQSLKRDIMLGKAEGQQKRGRSSTRWTDIAAAMMGSSIATIVRMEQDWVVFCSVVHRVTMSQNSTPPNKN	42586	44423	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8606_pilon_+_42600_44400
931698	contig_14925_pilon	-	1632	4	Intergenic	novelGene_55279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	3	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	36	449	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116100	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
931699	contig_5039_pilon	-	2340	1	Intergenic	novelGene_65069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCAGATAGGGAAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1871439	1869099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_1869100_1871400
931700	contig_5588_pilon	-	763	1	Intergenic	novelGene_172839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGGTCTGTTCCACAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1002719	1001956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5588_pilon_-_1002000_1002700
931701	contig_18850_pilon	+	1616	11	Intergenic	novelGene_142422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	937.093639931464	2	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	77	1009	176401	180704	TRUE	20	CCCCAGCCAGACGCAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEAGEPARCGGSIGGSREKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	171916	181468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_171969_176376_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515_181030_181186
931702	contig_5686_pilon	+	2323	16	Intergenic	novelGene_45234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	1519.97805539715	1	48	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	58	1692	93843	215355	TRUE	40	ACCCTACTAGGAAAAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFFTASVERLLPRLIVLLKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVLTQYFQTLRLRKIVTGQYIRKPGGILAKH	93785	220045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208410_212622_212666_215305_215475_219533
931703	contig_2414_pilon	+	2948	1	Intergenic	novelGene_158491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	38	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	189	570	1598	2167	308864	309433	NA	30	CTTCTCTAAATAGATGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRNLKDSPWPTNWKRSVFVPVQRKVIQQNSEIIQQYHKYHTQVKFAEDNSKTIVAVHRQELPEIKARFRRGHGTSSIIAYVDESWPKAEEYQKMFTCVLLIMQRHLTIWKTLQRMGTPEHLMVLTRNLHIDEEAVIRIERGDSAWFKIRKGVHQHCILSPYLLNLYAQQKIPEAGLYEEEHQDWWKTH	307266	310214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2414_pilon_+_307300_310200
931704	contig_12081_pilon	+	1127	5	Intergenic	novelGene_166970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1143.0861734795	6	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	159	572	16400	17227	TRUE	15	TATTATTTTTATTGTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKGDPNKPRGKMSSYAFFVQTCREEHKKKHPDSSVNFAEFSKKCSERWKTMSLKEKSKFEDMAKSDKARYDREMKNYVPPKGDKKGKKKDPNAPKRPPSKANTQAYPLGILQKNWVKCGLNNQPKINSRMNKKQLS	15725	18650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12081_pilon_+_15865_16380_16550_16845_16992_17109_17245_18112
931705	contig_4228_pilon	-	1172	1	Intergenic	novelGene_151179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTTCTAAGTTTGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	614745	613573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4228_pilon_-_613600_614700
931707	contig_233_pilon	-	2265	12	Intergenic	novelGene_14586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1311.00934555488	2	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	241	1266	105485	92266	TRUE	20	AGAAGCTGGGCTCTGTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICSPATWGRAVSARHRAAAARKWRGAAERITVPLCAPGWVNVSAGSASVTGLRTPRSASTGATASVTPSTVSATKARYAAERRGGNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	107322	78139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94003_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300
931708	contig_13862_pilon	-	2588	2	Intergenic	novelGene_179200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	57	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	47	1429	70296	68914	TRUE	85	AAAAAAAAAAAAAACATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRGVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	70342	67695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13862_pilon_-_68791_68849
931709	contig_6504_pilon	+	2690	3	Intergenic	novelGene_158782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAACTCCCAACAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222761	280362	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6504_pilon_+_224050_274402_275293_279850
931710	contig_14023_pilon	-	3921	1	Intergenic	novelGene_165370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	121	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGCGGAAACAGGAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181819	177898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14023_pilon_-_177900_181800
931711	contig_7452_pilon	-	628	1	Intergenic	novelGene_109157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGGTGACTTTCTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176741	176113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7452_pilon_-_176100_176700
931713	contig_3095_pilon	+	791	4	Intergenic	novelGene_74983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1141.34929895375	2	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	684	107	790	147280	151109	FALSE	25	TGCGCAAAGGCAATGCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKG	147173	151110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996
931714	contig_14621_pilon	-	2065	16	Intergenic	novelGene_105860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	143.049579594706	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	587	1764	11	1774	463794	396356	FALSE	25	TTTCTATTATGAGAGTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPPGSSTVFLLALTIIASTQALTPTHYLTKHDVERLKASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDVKKACAFIKSNLDPSNVDSLFYAAQSIQALSGCEISISNETKDLLLAAVSEDSSVVQIYHAVAALSAFGLPLASQEALGALTARLSKEETVLATVQALQTASHLSQQADLRSIVEEIEDLVARLDELGGVYLQFEEGLETTALFVAATYKLMDHMGTEDQVIQLMNAIFSKKNFESLSEAFSVASAAAALSQNRYHVPVVVVPKGSPSDTREQAVLRLQVTNVLSQPLTQATVKLEHAKSVASRATVLQKTSFTPVGDGFELNFMNVKFSSGYYDFSVKVEGDDRYIANTVELRVKISTEVGITNVDLSTVDKDQSIAPKTTRVTYPAKAKGTFIADSHQNFALFFQLVDVNTGAELTPHQTFVRLHNQKTGQEVVFVAEPDSKNVYKFELDTSERKTEFDSASGTYTLYLIIGDATLKNPILWNVADVVIKFPEEDAPSTVLSKNLFTPKQEIQHLFREPEKRPPTVVSNTFTALILSPLLLLFALVIQTLKYLAILGTVTFLAGNRMLAQQAIKRTAH	463804	396064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14621_pilon_-_396369_401994_402080_405147_405248_407256_407344_408572_408768_411137_411253_413462_413555_425862_425969_427322_427442_428924_429102_431658_431779_432842_432919_437107_437284_437850_437947_460397_460592_463781
931715	contig_5222_pilon	-	4679	1	Intergenic	novelGene_58990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1020	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGGGGCACAGAAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176694	172015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5222_pilon_-_172000_176700
931716	contig_8312_pilon	-	3177	1	Intergenic	novelGene_152894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	479	820	277552	277211	NA	60	CTAATTATCAAATAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGATFQSFISWIRGSSTKNSDDIVSHAALSGQSPVCFSLPILPILGSEEKKISSNISRYGLRLTGTTRYKEKLGPFYAVTFLTMSSKSGTKYLTIFFFFLLEHQVFIFYDYF	278030	274853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_274900_278000
931717	contig_854_pilon	+	2846	16	Intergenic	novelGene_36626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	3015.92601294454	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	696	2091	141	2231	1694500	1715383	FALSE	40	GTCATAAATGATAGAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1693141	1715998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706866_1715305
931718	contig_10541_pilon	+	1047	1	Intergenic	novelGene_144626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGTTATGTAACTAAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108743	109790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_+_108700_109800
931719	contig_4486_pilon	+	2527	13	Intergenic	novelGene_38595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1064.43509731166	2	119	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	456	1298	343083	399436	TRUE	30	TTGTTTGTATTGTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTK	332628	413430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_332991_342989_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399437_407608_407696_411177_411318_412428
931720	contig_13042_pilon	-	3405	3	Intergenic	novelGene_179012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAATGTTGCTGGTATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10319	2540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13042_pilon_-_4085_4527_5058_8988
931721	contig_12605_pilon	+	1028	5	Intergenic	novelGene_64177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1820.46608043105	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	384	1028	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3868	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6124
931722	contig_4252_pilon	-	2800	2	Intergenic	novelGene_176359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTCTCAATAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219100	208779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4252_pilon_-_209555_217075
931723	contig_10990_pilon	+	2750	17	Intergenic	novelGene_7443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	328.999976253799	2	95	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	816	2451	281	2731	722379	752144	FALSE	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNQGEDCYFFFYSTCTKGDSCPFRHCEAALGNETVCTLWQEGRCFRQVCRFRHMEIDKKRSEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLELSEMIDS	708537	752163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
931724	contig_9098_pilon	-	1943	11	Intergenic	novelGene_75856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	138.753882828554	2	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	820	1689	345261	335775	FALSE	25	CACAGCGGGGAGCCAGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	350057	335520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535
931725	scaffold_12124_pilon	+	1166	8	Intergenic	novelGene_22061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	562.588623404058	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	487	1044	846536	848022	FALSE	15	TAGCTTTGTAGTATGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVHDAFGLDFCIWCEVGVQLHSFACGDPVVPAPFVEEAVLHPLN	829658	848144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_836043_836149_837230_837403_844265_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847737_847890
931726	contig_14970_pilon	+	1882	9	Intergenic	novelGene_44935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5343.63422096797	19	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135992	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177447_182398_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
931727	contig_12677_pilon	+	1446	1	Intergenic	novelGene_110745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGGCAGCTTCACATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11	1457	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1500
931728	contig_10734_pilon	-	2379	13	Intergenic	novelGene_51473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	334	junction_10	422.410435937476	2	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	74	1885	2305085	2265543	FALSE	60	GGAAAGAAAAAAATCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305158	2265048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
931729	contig_9090_pilon	-	3462	5	Intergenic	novelGene_179201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	169	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	2120	2782	131571	130909	TRUE	45	AGGTGTAGAGAGATGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPSFMILGKFSVSSSSMILSVSSVFSPLFWNSITRKFLLLIVSHVILRVSSVFFILFSDFSSNRIVSKCLSSIPLILSSTISNLLFSPFMTLSSSEILLFIFWISNCCFCIISSYEFILAFCSCIIFLNSSIFLSAFSINFSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLISLSGSSTAFSSTGKSSGVLFWVTTGTILSCFSKCFDIVCCLRGIH	172507	79372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9090_pilon_-_79736_130591_131763_135931_136362_169321_169602_171289
931730	contig_9919_pilon	+	1084	1	Intergenic	novelGene_137972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACTAATTTGTTCTATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	598947	600031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_598900_6e+05
931731	contig_14683_pilon	-	2302	1	Intergenic	novelGene_166048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	66	201	106	306	160398	160198	NA	65	AAAAAAAAAAAAGTCCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIWKGKSPGISKALLKKKKKAGGLTLPDFRTYYAAMVLKTAWYWYSNKYIDQRNRIENPDINSSTYEQLIFDTKKSINQGKDSLFNKWCWHNWISSCKKLK	160503	158201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_158200_160500
931732	contig_8978_pilon	+	2645	12	Intergenic	novelGene_49467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	217.964550912632	1	104	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	580	1740	904	2643	1749586	1765137	FALSE	30	GTAAGTTTGGTGTCAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHN	1680868	1765139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1696766_1696943_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747261_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922
931733	contig_7943_pilon	+	745	1	Intergenic	novelGene_173139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCTGTTGCTGTTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161846	162591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7943_pilon_+_161800_162600
931734	contig_678_pilon	+	2172	1	Intergenic	novelGene_167833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTCACCTGAAGTACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402329	404501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_678_pilon_+_402300_404500
931735	contig_4519_pilon	-	3406	7	Intergenic	novelGene_123662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2373	2783	78799	69283	TRUE	70	TTAAAAAAAAAAAAGCGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHFQSASILPFQSASILFKLLPFRSTSILFFNACKCWSASILGGRLGGRSAFLSLLAVCVMKKYSYNISRRVTSGLWVTSTYGDRKKSGTGLGLLASSVTGLPRCFGKHFNLNATSISTKSSWFDGWHFPELGGLL	82483	68215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_68478_68921_69319_70705_70917_77854_78012_78792_78935_79731_81324_81838
931736	contig_11720_pilon	-	3377	11	Intergenic	novelGene_43995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	84	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	138	488	272327	271841	TRUE	5	ACTTGCTGCGGCCCTGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQQVPLWNPVSKILRSILLAPCPCCPIQQARCLPPCGGSSSCPSLLLLLIREPIQEVLVGAVSQEGGSVGNATGPDLVDGKSQVDCGQQDYKTKVGRVGETGQVADHEVEIDGTD	272464	262996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_264425_265204_265811_266167_266238_266451_266608_267751_267912_269815_269906_270031_270151_270547_270697_271265_271340_271803_271958_272093
931738	contig_10734_pilon	-	4180	14	Intergenic	novelGene_51460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	584.259446300799	2	124	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	225	2030	2305085	2265543	TRUE	80	ACAAAACAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEYPTRRTLCSSDRNCKKGWMDPQSKGVQTGKCVQYKGNQKTCEVSAWCPVEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIHFSGHSYTTRNIYPDLNITCTFDKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDLQGGIMGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305309	2261948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2262856_2264299_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274516_2275766_2275885_2277109_2277191_2280839_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
931739	contig_17144_pilon	-	1527	10	Intergenic	novelGene_29296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1952.46519072368	5	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	105	1232	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183216	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166552_170886_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174976_181813_181850_183158
931740	contig_854_pilon	+	2910	16	Intergenic	novelGene_36627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3113.2172954821	4	14	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	629	1890	430	2319	1697720	1715383	FALSE	20	AAGGGGTTTTCTACCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRPQACRCLPVPPASSAAVPSAPLLPLLPESDTKESGSRAQAWERVTSGLSSPFLPKSTRWRVKEGRPLGMGQSVFYESSFLPTNGVLIA	1693145	1715974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696593_1697673_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706809_1715107
931741	contig_6595_pilon	-	3840	4	Intergenic	novelGene_122527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1734	2153	470768	470349	TRUE	15	CACTCTACTCTTTTGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWGSLSFLDGQLFLFRDNGEVFCHQFFYDPLCVFCFLPVFWNSNHLEIFAFDCIPRNSQGFFIFRHSFFRFFLKQCCIPVFVFNFADPVFHYFIPVLLSPSMTLSVSEILLFIFWISNCCFCVISSCEFILHFFPVLLS	472501	81051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6595_pilon_-_81953_82120_82545_290798_290803_469990
931742	contig_18108_pilon	-	2794	7	Intergenic	novelGene_33476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1	348	262111	261764	TRUE	20	GTTGCCGAAGCCGGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSTYFIILWDAIRKGGHLEKDSCTNTLILELILCFLPPKQFNANLLGYGFTRQEGKGGLVSGDTQTQGTKSIVTLCLRRDFQPGYGVVSWSSVVKVRHFTKQKKLSLKIQNINAT	262111	226779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18108_pilon_-_226874_244343_244448_245847_245920_247182_247263_250805_251000_252191_252334_260003
931743	contig_5020_pilon	+	423	2	Intergenic	novelGene_27918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124167	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_124267_125761
931744	contig_16322_pilon	-	1897	14	Intergenic	novelGene_87543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	184.797858539297	1	71	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	50	823	103834	86531	TRUE	35	GACATGAATTTTTTAGCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSTPLLAVRGSEGLYMVNGPPYFTESTVLHRESGKNCKVYTFSKDGTLFAWGNGEKVNIINVTNKGLLHSFDLPKAVCLEFSPKNTVLATWQPYTTPKDGTAGAPNLQLYDVKTGTCLKSFIQKKMQNWCPSWSEDETICARNVNNEVHFFENNNFNTIANKLHLQKIHDFVLSPGPQPYKVAVYVPGSKGAPSFVRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLRPHL	108568	77673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79931_81564_81679_86029_86545_89498_89616_89813_89959_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93066_93186_96006_96082_103787_103858_108542
931745	contig_13244_pilon	-	4228	2	Intergenic	novelGene_86909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	408	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTAATTCTTTTTCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132637	122941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_125510_130977
931746	contig_14441_pilon	-	671	3	Intergenic	novelGene_100754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTAGCACAGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126745	121200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_121237_125515_125901_126495
931747	scaffold_9100_pilon	+	1806	9	Intergenic	novelGene_83267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	480.139807113511	1	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	98	595	647136	651161	TRUE	45	GTACTTAAAAATTTTAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSEFTH	644842	655066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651096_651147_651204_651950_652069_653324_653449_654139
931748	contig_3747_pilon	-	1768	1	Intergenic	novelGene_24960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCAAGCAACAGGCCGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205203	203435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_203400_205200
931749	contig_3584_pilon	+	1276	5	Intergenic	novelGene_108175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1500.63994682269	4	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	437	1123	530695	531381	FALSE	5	TTTCTGTGCTCTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSFSGRWTKDEGCVVKWRAQLCTPFLSSLCSALRAVVALLLWGQLFAVDSGNEATDDGCPKPPEIANGYVEHSVRYQCKKFYRLRSEGDGVYTLNSQKQWINKAVGETLPECEAVCGQPKNPVDQVQRIIGGSLDAKGSFPWQAKMISRHNLTTGATLINEKWLLTTAKNLFLNHTDNATAKDIAPTLKLYVGKNQLVEIEKVVLHPDYSKVDIGLIKLKQKVSVDERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNSLFSFTQQLKYVALPVAAKGECEKHYEGSTVPEKKEPKSPVGVQPILNEYTFCVGMSKYKEDTCYGDAGSAFAIHDQDDNTWYAAGILSFDKSCATAEYGVYVKVPSILDWVQKIIADN	527066	531534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3584_pilon_+_527101_528334_528468_528774_528877_529607_529683_530602
931750	contig_2703_pilon	+	1499	8	Intergenic	novelGene_101782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	671.737770750656	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	44	637	602068	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	599786	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
931751	contig_3956_pilon	+	2240	13	Intergenic	novelGene_14964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1440.41055827458	3	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	647	2047	1286220	1290816	FALSE	20	ACTGTGTGGAGCCTACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRQVVAETRKRKGLKEGIPASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1282843_1282913_1283793_1283976_1284054_1284220_1286150_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289643_1290409_1290460_1290535
931752	contig_3601_pilon	-	3258	2	Intergenic	novelGene_132877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	381	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	832	1992	159782	155021	FALSE	35	GGAACCCAAGGTTGAGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGFQNKTPDDSSLEENALELLRILQDLRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKIYNAIPIPIPTPFFKEMEKLIIHFIWKGKKSRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIGNPDVNPSIYSHLIFDKGPKSIRWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEERIRPTLQALIHGINRIQTITINAQTPIDKLDNWDLLKIKHLCSLKDFTKRVKREPTDREKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNRIKKWAKGMNRYFTKEDIQMVNRHMRKCSQSLAIRECKLKLQ	160613	153754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_155882_159482
931753	contig_10990_pilon	-	3129	15	Intergenic	novelGene_7490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	291	713	744373	743951	TRUE	35	TACGTTTACCATTTTAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRSRLAPGMPSGWGWAPLLPSEFCCTLSAFSSLISSSVLMRTSCIDFVLPAGSSDSPLLATMGGKTTGFLISLSVFNLMQVTSFLLFCLSASCCRCFFSASTSEKVLIRILEEFLVPEVESSAFEGPSVLSLVCNSPRF	750946	714828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722232_722430_723510_723631_729669_729803_731226_731421_731544_731665_731914_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738950_743881_744386_744697_744778_749330_749499_750916
931754	contig_16883_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_161715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTATGGGGAAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128881	128152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_-_128200_128900
931755	contig_5690_pilon	+	1187	7	Intergenic	novelGene_119746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	522.985553231529	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	26	712	1086480	1105490	FALSE	30	AGAGAAATTTCACGTGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEYDIDEVMYDEDSPYQNIKILHSKQFGNILILSGDVNLAESDFAYTKAIMGSGREDYTGKDVLILGGGDGGILCEIVKLKPKMVTMVEIFDQMVIDGCKKYMRKTCGEVLDNLKGECYQVLIEDCIPVLKRYAKEGRKFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLRLILDLSMKVLKQDGKYFTQGNCVNLTEALSLYEEQLGRLYCPVEFSKEIVCVPSYLELWVFYTVWKKTKP	1086454	1105965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5690_pilon_+_1086568_1087638_1087798_1088256_1088346_1094155_1094271_1095255_1095336_1103515_1103632_1105450
931756	contig_1443_pilon	+	2464	10	Intergenic	novelGene_28226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	53.4404017875042	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1519	2169	538954	541541	FALSE	50	TTAAAGAATGGAAATGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVDSSAAMLDLAERLLKGGSESGEPYVPGVFFRQFLPVSPKVQFDVVVSAFSLSELPSKADCTEVVQTLWRKTSHFLILVENGTKAGHRLLMDARDLVLKGKEKSPLDPRPGFVFAPCPHELPCPQLTASKPLACSFSQAYHPIPFSWMNKKPKEEKFSLVILARGSPEEAHRWPRITQPVLKRPRHVHCHLCCPDGHMQHAVITARRHGRYGGV	535986	541836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_+_536088_536234_536604_537644_537727_537987_539009_539386_539458_539649_539758_540006_540076_540746_540798_541028_541125_541340
931757	contig_10765_pilon	-	2777	1	Intergenic	novelGene_122951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	62	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	143	745	332009	331407	NA	75	CAGGCAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEEIQAALKALSKSKAPGIDGISIEMFQQTDAALEVLTRLCQEIWKTTTWPTDWKRAIFMPIPKKGGPMECGNYRTILLISHASKILLKNVQKWLQQYIDRELPEIQARFRGGPGTRDITADVRGILAESREYQKDVSLCFIDYAKAFDCVYHNKLWITLLRMGIPEHLIVLMRNLYIDQEAVVRTEQGDTAWFKVR	332151	329374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_329400_332200
931759	contig_4232_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_63318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTCATAATTGGAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468094	466912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
931760	contig_16322_pilon	-	2016	14	Intergenic	novelGene_87538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	177.322559029663	1	87	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	405	1703	91538	77890	FALSE	20	ATGTAATCATTTTTGGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLFVPEMLTMKFTSLKTTILIQLQINYICKKFMILCYHLDPNHTRLYQYPNFGGPHAALANKSFFKADKVTMLWNKKATAVLVIASTDVDKTGASYYGEQTLHHIATNGESAVVQLPKNGPIYDVVWNSSSTEFCAVYGFMPAKATIFNLNCDPVFDFGTGPRNAAYYSPHGHILVLAGFGNLRGQMEVWDVKNYKLISKPVASDSTYFAWCPDGEHIVTATCAPRLRVNNGYKIWHYTGSVLHKYDVPSNAEIWQVSWQPFLDGVFPAKTITYQAVPSEVPSEEPKVATAYRPPALRNKPITNSKLHEEEPPQNMKPQSGSDKPLSKTALKNQRKHEAKKAAKQEARSDKSPDLASAPAPHSTPRNTAPQSSSGDPEIDKKMKNLKKKLKAIEQLKEQAAAGKQLEKNQLEKIQKEKALLQELEDLELGI	108579	77576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_77956_78553_78620_79819_79949_81564_81679_85980_86553_89498_89616_89813_89912_90096_90171_91475_91559_91948_92049_93083_93186_96006_96082_103787_103858_108542
931761	contig_6488_pilon	+	2178	1	Intergenic	novelGene_44771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGTTTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	237999	240177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_238000_240200
931762	contig_5961_pilon	+	2104	10	Intergenic	novelGene_144107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	606.879287120431	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	178	1044	144074	197215	TRUE	50	GAAGATAAAGAAACCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKYLLIL	113718	202162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197197_197889_201775
931763	contig_5125_pilon	+	2407	9	Intergenic	novelGene_43433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1721.29856049873	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	403	1152	35654	58735	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIHSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQAQISTRTAANQKCQSEVQQPPTIISQLPVGASIPLLNAK	26032	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26082_26191_26502_35610_35768_49981_50017_50076_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58615
931764	contig_1594_pilon	-	2743	2	Intergenic	novelGene_138858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGGCAATAACCAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	802022	799216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1594_pilon_-_800998_801060
931765	contig_15991_pilon	+	827	5	Intergenic	novelGene_70868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	30	93	730	822	103606	103698	FALSE	35	TAGACATGGGCAGAAGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRNRCLFPSTSLLFSKITLCKGSLRPLGGGSHPLGGLSRGGCRPVFSCRLSTPVFCRELLNGHRGHLHALGPVCHLRLSSCKFRSRSSPFTLKFFLGHSLFSSRLLFLFNLFRISVEVEVRHDLPRVLPGNGATHAQDFPGQHPPHQTNRVRSLVVARDGNVHVAQRRVRVTQSNGGQVHVRRLCERLVVSPGVGHHQKTRLPEGCLDLVSEGSRSEAPGNGSGSSSSSKLQHRPTWPVFLEDMTLTSAGFSMATMARAANRSFSHVLFRFMM	100375	103703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_+_100543_100885_101049_101159_101288_102023_102271_103581
931766	contig_9471_pilon	+	2294	1	Intergenic	novelGene_21848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	231	590	423764	424123	NA	75	AACAAGGAAAAAAAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRRQQSISNHTKRKSMMASASSQNKESRNFPEEAEYKRLIHITSRNRKKIKQNAEHAINVIKKIREEHNDKFNRPQESIERQQSEIQKIDNKISESDNSIESYRRRIEAMEVRISETR	423533	425827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_423500_425800
931767	contig_3956_pilon	-	541	1	Intergenic	novelGene_15286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGTCCAGGGCCGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1291015	1290474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1290500_1291000
931769	contig_10324_pilon	+	1060	1	Intergenic	novelGene_7747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATACACATTCTGGCACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69336	70396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69300_70400
931770	contig_7151_pilon	+	1093	2	Intergenic	novelGene_40758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCATTTTTCTTATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	507618	509297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_508142_508727
931772	contig_6898_pilon	+	3791	14	Intergenic	novelGene_35663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2305.93179769509	9	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	601	1806	72	1877	11417	125646	TRUE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSRSRQKESSYLLDPSILNPCLFDIDGINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	11345	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_11501_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126625_126770
931773	contig_854_pilon	+	1566	9	Intergenic	novelGene_36657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3158.57712971759	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	467	1404	74	1477	1700894	1707138	FALSE	55	ATGAAAATATACACAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQTGQEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQVHGGSALSCSCPSATVTQPKAKATVKGVEPGLHPGRPSTVGRPCGD	1699032	1707227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699053_1700840_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748
931774	contig_15118_pilon	+	2176	10	Intergenic	novelGene_74612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	293.666855845569	2	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	507	1524	40	1563	392042	398743	FALSE	20	TGTTGGACCACAGCCATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTDPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPGRDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	392002	399356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392785_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394463_394755_395049_395141_395233_395346_398644
931775	contig_10500_pilon	-	2856	8	Intergenic	novelGene_41274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1040.88861173558	1	143	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	509	1018	1635596	1629460	TRUE	90	AAAGAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSPRTLDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640240	1626845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628615_1629390_1629573_1630546_1630728_1633135_1633231_1635076_1635177_1635575_1635617_1636940_1637067_1639878
931776	contig_5988_pilon	+	1819	1	Intergenic	novelGene_16064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCACCACCACCACTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1206074	1207893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1206100_1207900
931777	contig_8576_pilon	-	2970	2	Intergenic	novelGene_88734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	944	1744	627439	626639	FALSE	35	TAGGACCAACACTACAGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHISKKKGQNQNINYRTQTNEIEQQKKPTATGRKEIVKIRAEINEIENIKTIERINKTKSWFFERINKINKPLARLTKEKQERMQITQIRNAMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLPKLQQSDGENMNRPITREEIEKVIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFSEELVPVLLKLFQSTEKEATLPNSFYEASVSLIPKPGKDVTKKENYRPISLMNIDVRILNKILANRIQHHIKKIIHHDQAGFIPGM	631231	625412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_628263_631111
931778	contig_6513_pilon	+	2960	2	Intergenic	novelGene_117758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAATAAAATTACATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112465	115481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6513_pilon_+_112734_112789
931780	contig_2100_pilon	-	916	8	Intergenic	novelGene_50765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	710.416951443277	1	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	289	864	1174340	1170268	FALSE	30	AAATGGCAGCTCCAGGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185493	1170215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175622_1182727_1182822_1185420
931781	contig_20527_pilon	+	1670	5	Intergenic	novelGene_138593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	3	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	16	642	13527	27453	FALSE	20	TTCAGCCTGGGAGTGGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13511	28481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
931783	contig_7051_pilon	+	3483	10	Intergenic	novelGene_64281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	197.651207939643	4	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	136	354	184159	189145	TRUE	25	TTATCCTACCCCTAACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAVAAAERSRADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRF	184023	209417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188761_189144_189170_199230_199323_199978_200055_201865_201914_203048_203155_206143_207230_207720
931784	contig_10011_pilon	+	2167	9	Intergenic	novelGene_68107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	76.6045037840465	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	33	851	326304	331554	TRUE	15	GTGTGGCTGGGCTTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRYREGPWCASGVLHLGGWS	326271	334180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331644_332074_332229_332413_332447_332994_333045_333190
931785	contig_11512_pilon	+	2230	1	Intergenic	novelGene_43316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAAGACGAGATTCGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	394107	396337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_394100_396300
931786	contig_8538_pilon	-	1929	2	Intergenic	novelGene_4641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTCGCTGCGACAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	843100	840318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_840371_841223
931787	contig_11989_pilon	+	420	1	Intergenic	novelGene_68462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTTCCACCAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134432	134852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11989_pilon_+_134400_134900
931788	contig_5331_pilon	+	792	1	Intergenic	novelGene_112798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGAGAAACTAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556528	557320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_556500_557300
931789	contig_5023_pilon	+	2377	9	Intergenic	novelGene_7349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1749.05638845636	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	112	1065	611764	646990	FALSE	10	TTTTGGTGTCTGTAGATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFKQLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	609690	648302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618654_631410_631550_639072_639197_643413_643539_646857
931790	contig_17976_pilon	-	1622	4	Intergenic	novelGene_32508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGACAGTCACCTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48063	41661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41856_45522_45583_46441_46677_46930
931791	contig_5217_pilon	+	1778	1	Intergenic	novelGene_135732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACGTAGGTTGTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514276	516054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_+_514300_516100
931792	contig_3787_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_102367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTAATGCCTTCAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	372620	370611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_-_370600_372600
931793	contig_15613_pilon	+	2209	1	Intergenic	novelGene_147214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169044	171253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15613_pilon_+_169000_171300
931794	contig_1699_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_72838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGTTTAAAAGACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166922	167738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1699_pilon_+_166900_167700
931795	contig_9011_pilon	-	2570	1	Intergenic	novelGene_159355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGCCCTGGCTCAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	762647	760077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_760100_762600
931796	contig_15666_pilon	-	1919	6	Intergenic	novelGene_70163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	642.896881311459	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	818	1249	108757	107816	FALSE	10	TGTTGCTTTGATTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110706	107145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110238_110558
931797	contig_854_pilon	-	2795	13	Intergenic	novelGene_36667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.21108319357027	11	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	729	2066	2794	1710643	1699280	FALSE	40	ATGAGAAGCAACCCTTCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSLLSGLCLGPVTLLCILGRDGLLLCQELVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLGST	1716387	1699278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1699290_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709201_1710017_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1714988_1715180
931798	contig_5961_pilon	-	1876	2	Intergenic	novelGene_144130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAGAAAAAAAAAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149388	145459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_-_146443_148495
931799	contig_8651_pilon	+	1257	1	Intergenic	novelGene_168171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAATAAAAAAAGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149260	150517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8651_pilon_+_149300_150500
931800	contig_14711_pilon	+	1633	5	Intergenic	novelGene_68928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	502.936626226406	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	740	1540	89060	90717	FALSE	20	AGACCTCAGTTGTCATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGEYGYHPVHDSAPGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSRSMDSCVSPDGGLCSGHGHCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGALATNCSMACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPSLWQDNGNFVRWWGSIRQQPGRGPTHCQGAVSTLLYFQ	88320	90810	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_89326_89463_89673_90032_90194_90489_90536_90598
931801	contig_9011_pilon	+	2678	2	Intergenic	novelGene_159307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTTGAGGGAGGAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463568	466469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_+_464312_464534
931802	contig_5023_pilon	-	1824	10	Intergenic	novelGene_7359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1575	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	531	881	647062	639176	TRUE	20	AAGGCTTCCCCTCCTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647592	616506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_616580_618522_618666_622525_622621_625643_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
931803	contig_1450_pilon	+	1352	1	Intergenic	novelGene_27440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTACAGAAGGAAAACAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	423383	424735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_423400_424700
931804	contig_3747_pilon	-	2172	6	Intergenic	novelGene_24938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCTTCACCCAGTAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205181	202368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
931805	contig_15105_pilon	-	2062	1	Intergenic	novelGene_150943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332862	330800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_-_330800_332900
931807	contig_7870_pilon	+	3099	1	Intergenic	novelGene_108902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACGCTACCCCAGGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199281	202380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_199300_202400
931809	contig_10541_pilon	-	3524	3	Intergenic	novelGene_144635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGCACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331892	166941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_167640_167685_169026_330406
931810	contig_13435_pilon	-	3762	3	Intergenic	novelGene_179202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	309	53	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	227	661	230981	230547	TRUE	20	CCCCCATAGGATTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTSFQNKESRNFPEEENFLELPEAEYKRLIYRTLQEIMKEIMQNAEHTIEEIKKIREEHNDKLNRLQESTERLQSEIQKINNKISELDNSKESHRSRIEAMEIRISEVEDKALHTNLFEEKSDKRIKKMKNPKNYVGLYQEE	231207	37605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13435_pilon_-_37848_46791_48472_229367
931811	scaffold_9205_pilon	-	1811	1	Intergenic	novelGene_161103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAGAGCGAGAAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	248230	246419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9205_pilon_-_246400_248200
931812	contig_6418_pilon	-	1385	2	Intergenic	novelGene_81091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAATTTACATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64104	61481	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_-_62784_64021
931813	contig_10126_pilon	-	1641	1	Intergenic	novelGene_105741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	15	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	159	524	154423	154058	NA	25	AACATGGATCTCTTCCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFSRDGSLLTTCPKYVRCSLAILASNEHSGCTSSKTDLFVLLAVYGIFNILHQHHNLKVSVLPWSSLFIIQLSHAYKVTENIIVRVRCTLVFKVTSLLFNTLKRSFAANLPNATRLLMS	154581	152940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_152900_154600
931814	contig_12464_pilon	-	2353	1	Intergenic	novelGene_68652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAGATAGTAGGCACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111164	108811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12464_pilon_-_108800_111200
931815	contig_7396_pilon	-	2976	17	Intergenic	novelGene_79532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3352.69900078187	4	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	462	1389	288	1676	255163	246442	TRUE	20	TATGTATTGTGTGAAGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257490	245099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_245886_245927_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257142_257294_257381
931816	contig_17964_pilon	+	2499	3	Intergenic	novelGene_33869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAAGTGAAAAATGTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134195	140479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_135637_136899_136997_139518
931817	contig_10793_pilon	+	1879	15	Intergenic	novelGene_83369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3119.00345479456	49	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	132	725	146975	160592	TRUE	55	TAAAAATGTCAAATACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQVILFIKIPVYL	130870	167252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160783_161195_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
931818	contig_13144_pilon	+	1833	2	Intergenic	novelGene_178456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAACGAACAAAAGCCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72554	103726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_+_72598_101936
931819	contig_3233_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_56591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGACTATTCATCAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	759436	760637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_759400_760600
931820	contig_5280_pilon	+	1055	1	Intergenic	novelGene_52632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	351	1053	2	1054	57363	58415	NA	20	CTTCCAGCTACAGAGCCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTNHSETHLGKCSSYRAPTNRSETRLGKSSSYRAPTNRSETHLGKYSSYRAPTNLSETHLRKSSSYRAPTNRSETHLRKSSSYRVPTNRSETHLGKSSSYRVPTNRSETHLGKCSSYRVPTNRSETHLSKSSSYRVPTNRSETHLGKSSSYRAPTNRSETHLSKSSSYRAPANRSETHLGKSSSYRAPTNRSETRLGKSSSYRAPTNLSETHLRKSSSYRAPTNRSETHLRKSSSYRAPTNHSETHLRKSSSYRAPTNRSETHLRKSSSYRAPTNRSETHLSKSSSYRVPTNRSETHLSKSSSYRVPTNRSETHLRKSSSYRVPTNYSETHLGKSSSYRAPANRSETHLGK	57361	58416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_57400_58400
931821	contig_15236_pilon	-	847	2	Intergenic	novelGene_141617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	27	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATGAGATCAGGTTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608510	607424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_607497_607735
931822	contig_10324_pilon	+	1972	15	Intergenic	novelGene_7749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_14	1160.03566315692	1	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	31	1551	69809	80346	FALSE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGILEARQLAMRIFEDYTVSWYWIVIGLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTEGLCGQTGAGGEEEKANGFLMET	69778	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_69856_69948_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_79374_80276
931823	contig_6497_pilon	-	2718	3	Intergenic	novelGene_35651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGGCATAGTGGACCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	882498	793118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_-_793680_794132_794663_880871
931824	contig_4125_pilon	-	3913	3	Intergenic	novelGene_25045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2714	3067	205135	204782	FALSE	25	GTGCATACTGTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSAAVNMSVHISIRVMALNSLGYIPRSGIAGSSGTSISSFLRKRHINFQSGCTILHSHQHCISVPVSPQPLQRLLSCVFWINASLVGVRWYLIVVLICISLMANDREHFLMCLLAA	385403	203935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4125_pilon_-_206313_342384_343179_384661
931825	contig_9653_pilon	-	811	6	Intergenic	novelGene_48305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2547	junction_4	513.215977927422	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	21	809	1015897	1006954	FALSE	25	TCCCTCTTTTCTGAAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFR	1015917	1006951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777
931826	contig_15244_pilon	-	1104	1	Intergenic	novelGene_118058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTGTGAGGACCCACTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	595746	594642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_-_594600_595700
931827	contig_383_pilon	-	3933	2	Intergenic	novelGene_126102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	251	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGGAGCACAACTGAGGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	125915	120686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_-_123867_125162
931828	contig_18184_pilon	+	620	1	Intergenic	novelGene_123888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	42	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCACTTAGAAACCAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621156	621776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18184_pilon_+_621200_621800
931829	contig_6442_pilon	+	1896	1	Intergenic	novelGene_166479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCATTTCAGGAAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198115	200011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6442_pilon_+_198100_2e+05
931830	contig_17144_pilon	-	311	1	Intergenic	novelGene_29185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166378	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166100_166400
931831	contig_12250_pilon	-	1743	7	Intergenic	novelGene_80661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	216	junction_6	118.373702034419	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	786	1514	378386	375947	FALSE	40	AGCATTTTAAATAAACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSAFASLPGAGTTEAPFEEDQVSLELLLPPDSDYSLLLTFIYSGRVVGETQVHGLDCRLVAEPSGSQVGMEQVVFPKPDPLEPTQRLLSQLKRGILVASNPQGLFVQRLCPIPISWDAPQTPPGPGPHLLPSNECVELFKTAYFCRDFIRYIQGLGPLPKFQVTLNFWEESPDPGHTPQSLITVQMEQAFARHLLKQAATPSPSLEDPPASSPLFLLSPLNRDILHTGDLPSSVIILSDCV	380572	375717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_376118_376266_376383_377316_377659_378286_378758_379009_379194_379537_379719_380523
931832	contig_10467_pilon	-	3372	1	Intergenic	novelGene_175409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	15	48	293	340	106504	106457	NA	30	CTTATTTTTGCTCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLYPRKPVVRLITFVCGLSSHGLVTPTQVFGWGCAKKITVAHRGDWSVGESQLQSGEENPPPAEKERLARDDAVGFPAHGVKKPSTSGQRPRAREKSMPDPQIWGLLTCTTA	106796	103424	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10467_pilon_-_103400_106800
931833	contig_19402_pilon	+	4139	17	Intergenic	novelGene_80796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_15	1188.41059823615	2	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	425	1278	730	2007	57720	143056	TRUE	65	AAAAAAAAAAAGGACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	36662	146715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144221_144356_145614_146264
931835	contig_7009_pilon	+	2896	6	Intergenic	novelGene_23606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	353	junction_1	448.218964346668	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	252	1112	444955	518263	FALSE	80	CTAAAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSNKCLRCPRLGAAPRAAATVATTPQSRRSGPKPGRDARPRRGGRGERTRQDRGIPSSKVTLHTRGSVLAPRVRRRNPHTLRTMEADDGQDMSQISGKESPPISDTPDDGDEPMPVPEDLSTTSGGQQNSKNERGVASNVKVETQSDEENGRACEMNGEECAEDLRMLDASGEKMNGSHSDQGSKALSGVGGIRLPNGKLKCDICGIICIGPNVLMVHKRSHTGERPFQCNQCGASFTQKGNLLRHIKLHSGEKPFKCHLCNYACRRRDALTGHLRTHSVGKPHKCGYCGRSYKQRSSLEEHKERCHNYLQSMGLPGTLYPGKRGELAATLELALPLQQAGEEGPPHRALAAEPEACLAATAGMMEGYF	430700	520047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_430938_444940_444995_453481_453602_506372_506634_512647_512816_517991
931836	contig_17144_pilon	-	1191	9	Intergenic	novelGene_29499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2481.98594564413	7	36	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	127	636	179764	173456	TRUE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHPGPGRTQASSLRATSPTR	183208	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173512_174907_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
931837	contig_3956_pilon	+	2518	13	Intergenic	novelGene_15067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1373.17493777094	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	377	1171	1284120	1288915	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKPCGQGCRGGQEPRRPAQAGGGPEAPGQVGPHGAVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281609_1282790_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1287435_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931838	contig_9871_pilon	+	2264	1	Intergenic	novelGene_75678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATCCCCAGCATGTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497652	499916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9871_pilon_+_497700_499900
931839	contig_14077_pilon	-	3936	1	Intergenic	novelGene_174864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	342	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTAGAATTTACAGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40414	36478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14077_pilon_-_36500_40400
931840	contig_3822_pilon	-	848	9	Intergenic	novelGene_133318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	922.553656976113	1	35	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	127	582	292774	281133	TRUE	35	CAGGGGTATGACAGCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIGAVPLAALGAPTLDPALAALGLPGANLNSQSLAADQLLKLMSTVDPKLNHVAAGLVSPSLKSDTSSKEIEEAMKRVREAQSLISAAIEPDKKEEKRRHSRSRSRSRRRRTPSSSRHRRSRSRSRRRSHSKSRSRRRSKSPRRRRSHSRERGRRSRSTSKTRDKKKEDKEKKRSKTPPKSYSTARRSRSASR	293643	277236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3822_pilon_-_277267_277370_277510_277901_277998_281131_281227_284585_284718_285133_285216_290752_290881_292754_292805_293547
931841	contig_10296_pilon	-	1103	1	Intergenic	novelGene_168872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACGCAGGAAGCATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88175	87072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_87100_88200
931842	contig_19402_pilon	+	2157	12	Intergenic	novelGene_80818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1252.65420027019	3	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	478	1173	97756	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	79180	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_144293_146233
931843	contig_11720_pilon	-	1106	10	Intergenic	novelGene_43840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
931844	contig_7457_pilon	+	2060	1	Intergenic	novelGene_31373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAAAAAAAGTCAGCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	383779	385839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_383800_385800
931845	contig_12790_pilon	-	737	1	Intergenic	novelGene_35185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACCAATAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	128077	127340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_127300_128100
931848	contig_7119_pilon	+	2213	4	Intergenic	novelGene_40932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	157	1488	137033	140225	FALSE	25	TGATGGCTGAATCCTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127501	140950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139458_139707
931849	contig_20527_pilon	+	2178	5	Intergenic	novelGene_138578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	15	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	75	701	13527	27453	FALSE	80	ACAATTAAAAAAAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13452	28930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
931850	contig_5461_pilon	+	2149	1	Intergenic	novelGene_156820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1759	2124	254261	254626	NA	45	GAAGAAAGAAGTCTAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLAFEHRIAIVKRRNDEVKEMNRRFQRAAQEDKVKYYNETCKDLELENQKGRTCLAFLKLKELKKKIQASSCHFEEFCGENIERIENIEASNEGGRNTQNHCTKKNWSAFNHFRR	252502	254651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_252500_254700
931851	contig_10481_pilon	+	4631	1	Intergenic	novelGene_170531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCACAACATTTGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75636	80267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10481_pilon_+_75600_80300
931852	contig_4315_pilon	+	2932	3	Intergenic	novelGene_46739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAAAAAAAGCCCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164541	168323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_+_165789_166489_168023_168171
931853	contig_6202_pilon	-	1288	1	Intergenic	novelGene_139835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGACTCCCTCTTGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	868417	867129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6202_pilon_-_867100_868400
931854	contig_18607_pilon	-	2751	1	Intergenic	novelGene_175114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	285926	283175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18607_pilon_-_283200_285900
931855	contig_12644_pilon	+	1175	10	Intergenic	novelGene_44600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	4832.37373105011	1	35	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	54	1103	2675526	2680545	FALSE	45	AAGAGGCAGTGAGAAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNPAA	2675472	2680617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680533
931857	contig_4232_pilon	-	883	1	Intergenic	novelGene_63389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGACGGAAGCGTAGAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
931858	contig_5961_pilon	+	1515	4	Intergenic	novelGene_144145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	566	junction_1	785.094049567736	4	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	882	632	1513	194214	202108	FALSE	80	ACAAAAAACAAAAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIHFRVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEITEK	193582	202110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_194394_197215_197361_197664_197889_201775
931859	scaffold_12124_pilon	+	2463	9	Intergenic	novelGene_22322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_3	2172.73704115339	3	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	529	924	1489034	1508039	FALSE	40	TTGACTGGAAATTATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRSPQHLPRSPFQMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1483570	1509578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
931860	contig_3956_pilon	+	2839	13	Intergenic	novelGene_15111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	952.267830409771	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	747	2244	76	2319	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281606	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285760_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931861	contig_10904_pilon	-	1096	4	Intergenic	novelGene_22641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	295.17151322955	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	6	692	515110	507101	FALSE	20	CCAAATCATCTTGGTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSPEEWTYLVVLLISIPIGFLFKKAGPGLKRWGGSGCRPGAYLVHLWPPHLAFSDHHPWDLGPHSGPALLVSLASEVQDLHLAQRKEMATGFSKGPTLGLLPDVPSLMETLSYSYCYVGIMTGLLFLLSSHLFPLEAVREDAFYARPLPARLFYMIPVFFAFRMRFYVAWIAAECGCIAAGFGAYPVAAKARAGGGPTLQCPTPSRSGGGREASQDPPGPITKGWPWL	515115	506696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_507421_510099_510260_514793_514925_515034
931862	contig_15087_pilon	+	1956	2	Intergenic	novelGene_37121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATTACAGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1857	164977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_2276_163439
931863	contig_7151_pilon	-	746	2	Intergenic	novelGene_40807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	65	316	577690	569462	FALSE	30	ACCTTTTGACTATTGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YGLRLNIKKTKIVTTGPISNIMISREKIEVVKDFILLESTINAHGSSSQEIRQCIALGKSAGKDLFKVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSITSYAWERWTMNKED	577754	569031	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_569696_577672
931864	contig_16496_pilon	-	766	3	Intergenic	novelGene_5226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1982	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	303	344	1225	993	FALSE	40	TTATAAAAAGATAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKNCENIECFA	3587	570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1021_1211_1354_3413
931866	contig_12864_pilon	+	1741	6	Intergenic	novelGene_76444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGATCTCTTGTGCTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	242248	249632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12864_pilon_+_242888_243778_243823_244598_244766_245710_245913_246327_246348_248963
931867	contig_15063_pilon	+	1870	5	Intergenic	novelGene_12269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	2	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	323	1732	28164	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27841	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
931868	contig_3956_pilon	+	2906	14	Intergenic	novelGene_15215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1120.82284334048	3	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	526	1581	1074	2654	1286091	1290761	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDLFGWWGWDT	1282896	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290479_1290727
931869	contig_8017_pilon	+	2888	1	Intergenic	novelGene_65362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	65	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	68	367	973037	973336	NA	90	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLKIIQKRLQQYNDRELPEIQAGFRRGGGMRDIIADVRWILAKSREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDLNKLWITLRRMGIAEHLIVLMQNLYVDQEAVI	972969	975857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8017_pilon_+_973000_975900
931870	contig_1225_pilon	+	2480	4	Intergenic	novelGene_44169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	122	439	250814	274411	TRUE	10	CTTTCCACTCTGGCCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEQ	250692	276791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274676_275014
931871	contig_6445_pilon	-	1548	14	Intergenic	novelGene_76900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	759.245374343195	2	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	517	1317	77905	43105	FALSE	15	ACATTAGCCTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	90102	42873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85483_88456_88594_89993
931872	contig_6724_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_167987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	54	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	416	781	392365	392000	NA	10	TTGCTCTCCATTCTCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSTSEILLFIFWISNCCLCIISGCEFILAFCSCIIFMNSSKFLSVFSMTLSIFSSCFSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGESPDVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLQGIQ	392780	390298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6724_pilon_-_390300_392800
931873	contig_6795_pilon	-	2023	12	Intergenic	novelGene_27672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	29	junction_5	90.4293706401862	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1031	1453	74661	46152	FALSE	40	TAAAGTGTCAGTGAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRNAAAIHPSLEIPLLIPKEKPPITVVGDVGGRIAIIVDDIIDDVDSFLAAAETLKERGAYKIFVMATHGLLSSDAPRLIEESAIDEVVVTNTIPHEIQKLQCPKIKTVDISMILSEAIRRIHNGESMSYLFRNIGLDD	134379	45581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_-_46311_70580_70728_71982_72054_74615_74765_110795_110852_119021_119195_122975_123156_124204_124272_127904_127958_128910_129062_129286_129402_134247
931874	contig_9014_pilon	+	1364	4	Intergenic	novelGene_106809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3294	junction_3	1224.55007610505	6	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	2	376	150940	152329	TRUE	15	GTCACCCCTTGAACCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150938	153409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151036_151578_151763_152234_152334_152425
931875	contig_1244_pilon	-	579	1	Intergenic	novelGene_37926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTAACTTGAGCTGTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	334991	334412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_334400_335000
931876	contig_14807_pilon	-	532	3	Intergenic	novelGene_124690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	2034	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	20	439	38402	37247	FALSE	5	TCTGTGTCTGTGGTCTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	38421	37153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298
931877	contig_3382_pilon	-	1739	2	Intergenic	novelGene_124047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAGAACAGGAAGAATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	214432	212460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_212805_213037
931878	contig_14970_pilon	+	1700	8	Intergenic	novelGene_45008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7215.59493070957	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	162	863	177395	221234	TRUE	25	GATCAGAATGATTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPVQRIL	136178	232158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_221217_221253_231339
931880	contig_14441_pilon	+	903	5	Intergenic	novelGene_100408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	466.767875929782	7	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	39	863	67671	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSAQCTQNSHCSMKIQSTELKDSGMYFCASSPSTAVPLCSYERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	67632	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_67737_122126_122188_125517_125902_126159_126283_126514
931881	contig_5881_pilon	+	1245	1	Intergenic	novelGene_129046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATGAGTCTTAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397560	398805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_+_397600_398800
931882	contig_14353_pilon	+	453	2	Intergenic	novelGene_82113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGCAGGCTGCGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80203	82413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_80621_82377
931883	contig_15304_pilon	+	1989	7	Intergenic	novelGene_30660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	1322	1684	103601	106520	TRUE	30	CAAAAGAAGGGGCCCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMEMVVHSPSSSPSWASAQLSSGCSSGRQGDGLLSVVVVQCLVQHHAGEGGCVHLFVVHVPGEVDLTVIMAHVYYQARHRGGSGDHEEVLGLGGEDEDRGPSRELRSWALALCQTWLAA	101951	107225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_+_102366_102473_103327_103546_103684_105641_105712_106200_106374_106483_106532_106931
931884	contig_3956_pilon	+	2343	13	Intergenic	novelGene_14948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1430.85138553939	3	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	443	2197	1284132	1290847	FALSE	15	ATTTGGTATGGTGGTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQEPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1290993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283906_1284099_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289043_1290496
931885	contig_5302_pilon	-	1899	2	Intergenic	novelGene_81537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAACATATAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1600503	1592072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1593950_1600481
931886	contig_6477_pilon	-	440	5	Intergenic	novelGene_154183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5016.74241914013	1	26	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	387	53	439	773121	769559	FALSE	20	CAGCTGTAAGTGACCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPKFDPNEIKVVYLRCTGGEVGATSALAPKIGPLGLVGDDIAKATGDWKGLRITVKLTIQNRQAQIEVVPSASALIIKALKEPPRDRKKQKNRTIKEILGTAQSVGCNVDGRHPHDIIDDINSGAVEC	773173	769557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6477_pilon_-_769666_770616_770699_771241_771329_772404_772479_773084
931887	SIRV7	-	1872	5	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-22	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1164_1383_2676_2993_3112_43028_43078_114680
931888	contig_5770_pilon	-	576	7	Intergenic	novelGene_74180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4697.30588564693	6	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	30	557	264932	261919	FALSE	20	GAAGAATGTTGGTTGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLQKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQGRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKPEEEVAQKKKSKFSLK	265787	261899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_-_261940_262764_262957_263576_263676_263926_264062_264766_264808_264892_264946_265771
931889	contig_987_pilon	+	1806	3	Intergenic	novelGene_72360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCTACCATTACTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2016089	2129893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_987_pilon_+_2016130_2032449_2033611_2129288
931890	contig_6470_pilon	+	1513	1	Intergenic	novelGene_145593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTACAGTAGGACAAACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	904410	905923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6470_pilon_+_904400_905900
931892	contig_17144_pilon	-	1759	10	Intergenic	novelGene_29286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2445.62834461821	2	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	130	618	179764	174873	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFK	183211	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166871_167223_167331_167581_167676_167918_167965_174664_174756_174872_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
931893	contig_9988_pilon	-	2309	1	Intergenic	novelGene_113053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGCGTAAATTTGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59386	57077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9988_pilon_-_57100_59400
931894	contig_5302_pilon	-	2797	10	Intergenic	novelGene_81411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	518.206331946201	3	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	295	1440	209238	176905	FALSE	25	CCCTGAGGAATAAGCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYVRKEEEALKGKAPRIQHRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTSTATGISQIGSLAGPC	209532	175547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176917_176998_177300_179917_179967_180994_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
931896	contig_15047_pilon	-	1974	4	Intergenic	novelGene_52264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGGGCGATGTAGTCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8589	3330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_-_3498_4157_4433_4551_4659_7164
931897	scaffold_880_pilon	+	2519	7	Intergenic	novelGene_121461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	534.604968385276	44	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	66	473	456080	485563	TRUE	50	AAAAAAAAAATTTTTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLLRLEISPAPEILNCCLTPEMLPLRPFSENRTRPHKEILEFPTREVYVPHTVYRNLLYVYPRRLNFASKLASGRNITIKIQFMCGEDASNALPVIFGKSSGPEFLQEVYTAVTYHNKSPDFYEEVKIKLPAKLTAEAGRLGREPHGILMAADAPE	456014	489052	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_456181_479497_479616_482290_482362_484798_484852_484895_484938_485540_486607_488049
931898	contig_10428_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_162599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGTGTGTTTGGTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	221790	223355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_+_221800_223400
931899	contig_10766_pilon	+	1941	1	Intergenic	novelGene_151215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	36	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	135	500	179965	180330	NA	55	TCCAACAAGAAAAAAGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKILNDTGSIKSRWKENIESLYRKELFDVQPFQEVTYDQEPMILKEEVQAVLKALVKNKAPGIEWIPIEIFQQTDAVLEVLTHLCQEIWKTAGRDQPTGSDPYLCPFQREVIQQNAEIIE	179830	181771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_+_179800_181800
931900	contig_7379_pilon	-	886	1	Intergenic	novelGene_150017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAGCTAATGTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465200	464314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7379_pilon_-_464300_465200
931901	contig_3956_pilon	-	2312	10	Intergenic	novelGene_15207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	1277	1897	1289011	1284227	TRUE	15	CCCCAGCCCGGGCGGAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSARPSGKGRAFIPMAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1290958	1282851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286226_1288970_1289227_1289491_1289891_1290296
931902	contig_1735_pilon	-	2647	1	Intergenic	novelGene_106902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1	339	154176	153838	NA	50	AAATCTTGCTTTAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLLVSLVPSASASVSCGLLALGPHACICPAGASVPKLCSSTDKYPEAPHSARKPPAHRHSALSLRGSAPVPPRTGLLVLLLLVLCCRRFSAAVGSLLLLVLCHCRTSIHSQF	154176	151529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1735_pilon_-_151500_154200
931903	contig_3095_pilon	+	1225	5	Intergenic	novelGene_75004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	66	830	147241	151151	TRUE	15	ATTGGATGGGTCTTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147175	152232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
931905	contig_3077_pilon	+	2001	8	Intergenic	novelGene_26804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	658.673218040073	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	147	1274	473998	481662	FALSE	20	GAGATTTAACGTGTGGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467417	482389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467511_473944_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
931906	contig_10765_pilon	+	841	1	Intergenic	novelGene_122989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTCGGAACCAACTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	514950	515791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_+_515000_515800
931907	contig_12969_pilon	-	1438	1	Intergenic	novelGene_61654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAATGTTTATTGGAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114300	112862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_-_112900_114300
931908	contig_1996_pilon	+	4621	1	Intergenic	novelGene_131873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1258	1584	134417	134743	NA	30	AAGTTGGTAGTATTCCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHTVEWLCIVNKTRVNIFLVFSAFSHDPSDISSDIPDSTSSSESSLNFWQFPVDTLLQLLLNDLQCVLLMILFDNFHILLDYLLLNVYKYESLPVSWPGSCLPNFLA	133159	137780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1996_pilon_+_133200_137800
931909	contig_19954_pilon	-	2995	2	Intergenic	novelGene_173747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	359	682	75314	74991	TRUE	55	TTATACAGATTATTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEQTLATEHRIAKTKGRNDEVKELNRRFQRAALEDKVKYYNDRCKDLELENQKGRTPLAFLKLKELKKKLFRAEILKDSMGKTLNDTGSIKSRWKEYRVTVPKRTG	75672	16503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19954_pilon_-_18485_74658
931910	contig_10225_pilon	+	2267	11	Intergenic	novelGene_86848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	510.804904048503	3	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	790	1287	42707	46774	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFML	35713	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46540_46766
931911	contig_5928_pilon	+	1634	3	Intergenic	novelGene_40350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1009	1434	292218	292643	FALSE	40	ATCCAAGAAGCTGGACTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLKEKVQAALKVLAKNKAPGIHGIPVEIFRKTCSTGGTHSSTPRNLESSYTASQRKEIICVHVPKKRDPTECGNYQTISLISHASKVMQQYINTELPEVQAGFRKRGISLLMSDGSWVKAENIRRLLTCVLLTIQRHLTM	129345	292843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5928_pilon_+_129838_191010_191332_292022
931912	contig_5236_pilon	-	2117	11	Intergenic	novelGene_100944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.8502019383911	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	131	1393	1009762	1006770	TRUE	10	GCCTTTTAGGTCTTGGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1009892	1005865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006584_1006763_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727
931913	contig_7457_pilon	-	1947	6	Intergenic	novelGene_31406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	125.220765051169	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	103	402	471666	471097	TRUE	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRTVITTRSPTRSPTRTGGGERTLRPSRRGEMPSRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKSMAMESTGGGGTNGGCKEVSASYPFSLVWWI	473215	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471290_471559_471667_472730_472768_473150
931915	contig_11601_pilon	+	2420	1	Intergenic	novelGene_141028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1550	1900	46175	46525	NA	65	AAGCAAAAAGTGATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGTLLRQEACCPKLLSSLALWVGAPTVATSFHGPGSPPHRLVMVFLFCCCQFSATLAATSRYLMSAFCLLGLRGSQHRDPGSKGSAPLLTLLLGGSRFPPINATHFSLFLSLIR	44625	47045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11601_pilon_+_44600_47000
931916	contig_16716_pilon	+	1836	1	Intergenic	novelGene_169290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	43	132	329	460	196785	196916	NA	30	TAGTGTAAGTCACTTGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQEIWKIAIWPTNWKRSIYVPIPKESNAAEYRNYRTISVSHSSKILLKIIQKQLQQYIDRKLPEIEARLRRRRGTKDIVADKTWILAESREYQKDVYLCFIDYTKTFDCMDHNKLRITLQRMGIPEHLIVLTRNLYIEQGDTAWLKVRKGVC	196456	198292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16716_pilon_+_196500_198300
931917	contig_10225_pilon	+	1580	5	Intergenic	novelGene_86859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	426.691926335617	6	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1110	1466	47280	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	41811	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46181_47250
931918	contig_10793_pilon	+	3711	13	Intergenic	novelGene_83386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3577.31401411108	2	32	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	514	888	160548	163945	TRUE	15	TTTACTGGTGATATTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEGK	130870	168751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151413_151500_152866_152874_159196_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163295_163944_164090_165047_165377_166401
931919	contig_8538_pilon	+	1953	2	Intergenic	novelGene_4642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	8832	junction_1	0	17	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1830	54	1883	841232	843061	FALSE	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCLVLLLCVRCCHHHLTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840324	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840375_841228
931920	contig_628_pilon	-	1410	1	Intergenic	novelGene_130244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	781	1152	193969	193598	NA	85	AAGAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPETTVPTASRGLSLERLAPRPWSHFLALLSEFMQTAGLFSRPGKERLAEPHGMCSLYCACLHPTEIPAGTANPFCAASDVPGRCGGGQVPSWVPGTYSLVHFYIFMVHASLFRFCVWHMFS	194749	193339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_628_pilon_-_193300_194700
931921	contig_3627_pilon	+	1071	3	Intergenic	novelGene_78510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	11211	junction_2	1181	8	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	64	453	630860	634316	FALSE	10	TTTTTTCTGGATATCTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKLVLALSLILLLESSVQGYPMRRARYQWVRCNPDSNSANCIDEQGPVFDLLPGESNRILHPRTDPFSMTKFQNLQDVFPLSEDLSGSGSGSGSGSGSGSESVFPTEMDQEDQPADKNDAIYHHFRSRGRNLPSDKQNLGQDGTEEDLTM	621335	634934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_621391_630851_631000_634066
931922	contig_12050_pilon	+	2435	3	Intergenic	novelGene_62726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	277	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1038	1430	677686	678078	TRUE	35	TGGAGGCAAGATGAGAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEQIAKINSQLEIIQKHTIRNPKDNKISEMDSVTEGLRSRFKTVEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGVQEQREKTENTERIIEELTENFPNIIKMKS	676648	730534	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12050_pilon_+_678340_727785_728015_730019
931923	contig_11328_pilon	+	807	6	Intergenic	novelGene_88404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2420.13293849739	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	99	755	644338	647995	FALSE	20	CACAAGCCTTTTCATTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FVALNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADSLGDEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRKPLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRASTSKSESSQK	643645	648047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_+_643657_644250_644383_644805_645017_645228_645376_647064_647223_647899
931924	contig_5643_pilon	+	1028	10	Intergenic	novelGene_38839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2232.82707916043	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	62	763	233973	237919	FALSE	15	GTACCCAGCCACCTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHEKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAVTRLGSHSWLSPFSQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFV	233613	238184	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236903_237376_237460_237679_237802_237913
931925	contig_16594_pilon	-	1200	4	Intergenic	novelGene_53862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1805.13932980255	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	95	688	272836	135439	FALSE	5	CTTTTTTCTGTGTGCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVREDLSVQLTEPPALDDLVGMSRVPAWQLQPRRERLSVCSSC	272930	134926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_135564_149226_149351_165477_165649_272662
931926	contig_6361_pilon	-	3875	6	Intergenic	novelGene_23967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4521.2031584524	3	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	55	393	420979	415399	TRUE	15	TGTCTTTTTAATGACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436319	399589	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_400587_408734_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
931927	contig_2476_pilon	+	2237	1	Intergenic	novelGene_157626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGAAAAAAATTACCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126949	129186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2476_pilon_+_126900_129200
931928	contig_593_pilon	-	2937	1	Intergenic	novelGene_102025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	2460	2813	490154	489801	NA	35	TGGGCACAAAACAACCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQSCPAQERQSLSIQHLVIIVTNSTIIPQEEPSVGSHSHVVGHDQCWRPKQLKCEMEMSHPWDVTAYQGTPTPPTVIHIRQRRLHACRDVTPDPHDNKLPWEISKVALDYHLAFNRA	492613	489676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_593_pilon_-_489700_492600
931929	contig_17144_pilon	+	1823	11	Intergenic	novelGene_29561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	437	754	167621	168283	TRUE	25	AGGCGGACGATGGAGTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166120	176221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166384_167447_167681_167922_168060_168162_168309_168996_169099_170744_170869_173370_173463_173583_173749_174571_174760_174875_175003_175975
931931	SIRV6	+	777	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	47	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
931932	contig_15172_pilon	+	1956	10	Intergenic	novelGene_158762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	164.024388430501	2	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	232	738	244771	267627	TRUE	45	AATTAAAGCTCATTTTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITTDQQKRSSFFRCVLL	243183	268896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15172_pilon_+_243298_244653_244778_248919_248981_252814_252876_256836_256915_258364_258455_258974_259041_260340_260392_267534_267770_267820
931933	contig_5302_pilon	-	1811	5	Intergenic	novelGene_81437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	765.191601822707	2	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	74	400	181300	177220	TRUE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	181373	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176805_177044_177300_179917_179967_180998_181107_181210
931934	contig_2087_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_65569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1172	1513	71331	71672	NA	30	ATTTCAAAGTGTTCTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHYAFPHLGLHLWSGLPGTRFHDLLVWLTSAYPSQLSSYFTLFGSCSQACVKSTWHLGHACLTILITLCDNFSLTGHWTLSSTVLAMSFVSTGTVFCLLFYPQHQASAWHTVP	70159	71914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2087_pilon_+_70200_71900
931935	contig_14219_pilon	+	1188	1	Intergenic	novelGene_54279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAATAAATAACAAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	284637	285825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14219_pilon_+_284600_285800
931936	contig_6888_pilon	+	2635	2	Intergenic	novelGene_147066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	854061	856813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_854411_854527
931937	contig_16486_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_179203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGACCAAAATTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6087	7287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16486_pilon_+_6100_7300
931938	contig_9609_pilon	-	2417	20	Intergenic	novelGene_23010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTTACAGCAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	331952	314180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_314431_317881_317951_320953_321038_321844_321907_322283_322351_322601_322764_323263_323360_323984_324073_324255_324327_324406_324476_325130_325224_325630_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093_329168_329765_329944_330227_330305_331386_331487_331563
931939	contig_8594_pilon	-	2599	7	Intergenic	novelGene_140051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	270.83251281927	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	960	1802	492830	461703	FALSE	45	ACATTGATGTCTATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARLRFTYFGHVIRRDQSLEKDVMHAFFTVTVPKELYVVDHGSNVTLECDFDTRGPVELGAITASLQKMENDTSSHNERATLLEEQLPLGKALFHFPRVHVSDAGHYRCLIVYKSSWDYKYLTLKVKGSYKKINTHVLRVPGTGEVELTCQAEGYPLAEVSWPDVSVPANTSHTKTPENLYQVTSVLRLKPHPGQNFSCVFWNENVKERTSAIIDLQDQMKLEDPATMLFHVFIPTCIITLIFVAAMLILRKRLCQKLSSREDTTGRSATIVKRDVNRAI	494007	460905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_461709_463837_463888_466604_466740_475734_476005_487004_487311_492754_493657_493874
931940	contig_15825_pilon	-	1340	1	Intergenic	novelGene_160207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTGCTTTTTAACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	161870	160530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15825_pilon_-_160500_161900
931941	contig_9435_pilon	-	1075	2	Intergenic	novelGene_156962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCAAAAAAGAAAAAGGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377250	363343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9435_pilon_-_364403_377234
931942	contig_14441_pilon	+	1262	4	Intergenic	novelGene_100493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	534.101322056239	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	674	1222	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92208	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92733_125517_125902_126159_126283_126514
931943	contig_610_pilon	-	1589	3	Intergenic	novelGene_76772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_1	1530	3	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	57	512	252557	229689	FALSE	65	CTCAGAAAAAAGAACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSLTLGCLQRSWDFLESRMCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHGLWQDGGVGRSTTPSLHSKDPKN	252613	228611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_229760_234998_235302_252475
931944	contig_6445_pilon	-	1473	15	Intergenic	novelGene_76962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	849.55218695931	1	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	463	1173	77905	44555	TRUE	65	AATGACAATTAAAAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELQHERPGRL	96342	42892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44582_49739_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_83585_83679_85287_85477_88146_88216_96306
931945	contig_11417_pilon	+	1204	1	Intergenic	novelGene_103316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTGTGACAGGAAATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559483	560687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_+_559500_560700
931946	contig_3956_pilon	+	2409	12	Intergenic	novelGene_14963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1203.82121623651	4	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	603	1812	81	1892	1281682	1290491	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286218_1289070_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931947	contig_9333_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_120316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	754	1056	101396	101094	NA	15	GTACTGAGACTTTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENVPCALEKNVYFAAVGCSVLYKSVRSSWLIVPFRFSVSLLSFYLDVLSFTESGVLKSPIVVELSISFFSAVKVCFTYLGALSLGAWMFIMVMSS	102149	100660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9333_pilon_-_100700_102100
931948	contig_5125_pilon	-	2108	8	Intergenic	novelGene_43442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGGAAAAGAGGGGGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	26350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26500_35608_35766_49979_50109_53630_53706_53840_53984_54293_54522_58446_58630_58946
931949	contig_9833_pilon	+	2944	1	Intergenic	novelGene_68472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTACCGAATGAGCAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57200	60144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_+_57200_60100
931950	contig_20742_pilon	-	3287	1	Intergenic	novelGene_150666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	887	1192	167153	166848	NA	70	ACATGGAAATAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSISFFTISNFLTFILCTFHIPIINGSLQLFLLILSHATSANEGPESFILSIKVDSTLRRQLFPGSILSAFQPKRLIFQHYIRQYSTAVHKVFTGQFFQK	168039	164752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20742_pilon_-_164800_168000
931951	contig_3975_pilon	-	1917	12	Intergenic	novelGene_54851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	256.255941273596	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	106	996	2066301	2060179	TRUE	20	GAACGTTGTACATCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLEAGGASGGWPVRGGVDGVLQRAHESGGEEPEAGQHVSRRLSGRGQSHEAAATPAAGPAVCRGHPGAHLHHHGIHGEREGLGMGTGLWVRMSGPGLLTCTWPADCRGHGIH	2079246	2056378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060282_2063811_2063992_2064111_2064160_2064639_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
931952	contig_12090_pilon	+	2229	3	Intergenic	novelGene_80490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1440	1817	258201	258578	FALSE	45	GCACAGCAATAAAGTGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPPKAERVGLPSPEARRMEPPGAEWVESPLRCTRRMGLPKAEGVELLSQWTRKARLMPRAKGPPPRIWGVWLTPRVWRAEPLPRWSQRTKGIARGEGEGGTCPRTQVRGDHQTHVARRHRMTY	131666	258990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12090_pilon_+_131740_154483_154662_257012
931953	contig_3956_pilon	+	2872	14	Intergenic	novelGene_14855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1388.69571432415	3	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	949	1608	1286130	1288993	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLP	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285114_1286095_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288069_1288982_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
931954	contig_7357_pilon	+	955	5	Intergenic	novelGene_36838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACCCTGGCGCACGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137439	167040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_166772
931955	contig_10953_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_42609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGCAAATAGGCTAGAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	465360	464287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_464300_465400
931956	contig_1225_pilon	+	2838	3	Intergenic	novelGene_44177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	274	3	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251344	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222
931957	contig_14666_pilon	+	860	4	Intergenic	novelGene_39558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	122	466	477340	484834	FALSE	80	TATTAAAATAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFHVPKEGVCALVHERGDGRAGVWRGREEYP	477218	485228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483294_484743
931958	contig_6795_pilon	+	3791	4	Intergenic	novelGene_27652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	349	945	1054	1650	TRUE	20	TAGGATTTCAGGATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPIDKLDNWDLLIIKHLCFSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNSSKKWAKEMNRHFSKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIETTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRDCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIYTMEYYATRKNNNESVNHLISWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	705	109981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6795_pilon_+_1680_84635_85440_107924_109551_109594
931960	contig_9161_pilon	-	2281	1	Intergenic	novelGene_160640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	5	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCACCACAGAAAAACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62171	59890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9161_pilon_-_59900_62200
931961	contig_6102_pilon	+	3759	29	Intergenic	novelGene_31887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_17	560.712329386942	2	104	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	315	1769	373473	380005	TRUE	20	AAACCAGCTGTGGCTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFGDCHINSRPRARSRGL	372709	395258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379793_379955_380039_380160_380210_380319_380636_380898_380971_381064_381138_393038_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394276_394467
931962	contig_17074_pilon	-	2319	1	Intergenic	novelGene_145158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	31	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	69	210	117	326	296931	296722	NA	25	ATATTTACTATATTCCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKGKKIRFNLRKKNPKLSAKRVLHFCDYIYWKRWRKIKMPFSLRTCELSANQLISGIEEPLVIVKYQKFMQVSLLNIFHINEAMVQSLLFSTQDKFFVSANSQWRGN	297047	294728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_-_294700_297000
931963	contig_3817_pilon	+	1801	1	Intergenic	novelGene_78328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATCTCACATTTTAGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181378	183179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_181400_183200
931964	contig_20615_pilon	-	2126	1	Intergenic	novelGene_146913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTACCACTTTACTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188895	186769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20615_pilon_-_186800_188900
931965	contig_5280_pilon	+	1912	9	Intergenic	novelGene_52612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	205	junction_1	487.431725988369	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	6	1076	38343	78098	FALSE	60	TATAATATTAACATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMPRSLKAGSLCPRAMSLARRIAPAVLHLLGGVTLLLLCPPAVRGDCGPPPDIPNAHLPLGGLTSFPEKETVTYKCNEGFVKVPGKPDSVVCLNNKWSEVAEFCNRSCGVPTRLLFAVLKKPYSEQNYFPAGSTVEYECRLGYQKDQSLSGNVTCLQNFTWSKPAEFCEKKLCSNPGEIKNGHVNITAGVLFGSLIFFSCNTGYKLVGATFSFCSLVGDGVGWSAPLPECQEIFCPEPPKINNGKIREEQHNYVYGQSVTYECTEGFTLMGESSVQCIVKDDQGAWSGLPPNCKESPPATKVPPAAQKPTSATVPGTEVPRAPQKPTSATVPGAMILASGHICITLTVLIMMLVTIG	38337	78934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5280_pilon_+_38473_39267_39451_40882_41075_41732_41833_42902_42989_47318_47508_56218_56333_62043_62065_78042
931966	contig_8309_pilon	-	1850	1	Intergenic	novelGene_176438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	1363	1689	34726	34400	NA	25	TTGACAATTTCAATCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDKFFPKRGVFDLRSRPDTSNYLSLIKGCFSLVLVAQVNSLPLGLSGWGKHLPSTTACLTMHHELNWPEGLLLPLGRYGNSLLLLNRLSLPQHSVRFLNFAFDVQGS	36088	34238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8309_pilon_-_34200_36100
931967	contig_9243_pilon	+	2182	1	Intergenic	novelGene_60330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGTGCATATATACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36433	38615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9243_pilon_+_36400_38600
931968	contig_990_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_76132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGGCAGTCTGCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1605908	1604458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_1604500_1605900
931970	contig_13456_pilon	+	1910	1	Intergenic	novelGene_153258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TGCAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7934	9844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_+_7900_9800
931971	contig_854_pilon	+	5689	30	Intergenic	novelGene_36600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_29	3260.92380533635	4	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1477	4434	26	4459	1685144	1714980	TRUE	30	ACAGTAAGCTGGTTTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1685118	1716344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715378_1715511
931972	contig_8978_pilon	-	5884	11	Intergenic	novelGene_49464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAAGCAGCAGAAGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1775667	1680834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_-_1681323_1684922_1685018_1743809_1743973_1745491_1745591_1747110_1747299_1753102_1753184_1754510_1755057_1758865_1759050_1762405_1762814_1764956_1765139_1772217
931973	contig_4505_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_176040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGCAGTGTGCGGTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169522	170946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_+_169500_170900
931974	scaffold_9100_pilon	-	1532	1	Intergenic	novelGene_83314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCAGTGTTATCCATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	838274	836742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_-_836700_838300
931975	contig_9053_pilon	-	2432	3	Intergenic	novelGene_87966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	207	524	683917	682688	TRUE	70	AAAAAAAAAAAAGCCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLPSWTPIRDQQTGGTRKQLHGAPFFVRLHVFGFCSSLLSPIPILAPHIMISPLHPAYLHYALNITPASSPGKTYWNLPCTDYQPTLVAVVSATNNTSQQILFS	684123	680055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_681452_682175_682936_683847
931976	contig_7980_pilon	+	460	1	Intergenic	novelGene_179204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGACTGCTCTGACCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5523	5983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7980_pilon_+_5500_6000
931977	contig_3077_pilon	-	1840	9	Intergenic	novelGene_26657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACAGGGCCTTGTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18086	9613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_9799_11191_11476_12010_12069_13043_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
931978	contig_8377_pilon	+	1794	17	Intergenic	novelGene_35088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3181.34423239611	1	93	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1215	579	1793	154883	180506	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNIT	136290	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_136373_137710_137738_140774_140966_142257_142384_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
931979	contig_8626_pilon	-	3050	1	Intergenic	novelGene_174854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	57	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	336	1011	1684	2694	3022	2012	NA	80	AAAAACAAAAGAAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRILPVGIQIKTPDDSPLEENALEVPDREFKSLILGIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMKQEQNAKINSKLEIIQKQQIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTALLEENSEKRTKKNEEILRVLWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQQTPYRRDPKRKSPRHTIFTLTKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVL	4705	1655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8626_pilon_-_1700_4700
931980	contig_15777_pilon	+	2553	1	Intergenic	novelGene_75732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGGAGTCAGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13206	15759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15777_pilon_+_13200_15800
931981	contig_7963_pilon	-	2388	10	Intergenic	novelGene_58475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	727.248968186546	1	63	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1181	2251	123098	120628	TRUE	80	GAAAAAGGAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126314	120294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120305_120500_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563
931982	contig_5727_pilon	+	3845	5	Intergenic	novelGene_7997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAACTCCTCTTTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	737241	766350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_737475_738038_739023_739261_739672_763867_765655_765919
931983	contig_9653_pilon	-	2688	8	Intergenic	novelGene_48299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	560	junction_7	934.953889510175	4	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	213	1262	1016667	1006903	FALSE	45	TGAGTTGGCATGCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVLRNHGVVALGETVEEAFHYIFNVQIACEIQVHALAGAGGVDNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1018026	1005476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016779_1017925
931984	contig_610_pilon	-	3097	8	Intergenic	novelGene_76671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	479.227183992677	2	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	117	740	38502	32917	TRUE	35	CAAGATCCATGACTTATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFYKADINIRSSHSTVTRNYNLQVYRRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAEAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	45016	30506	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_30797_30849_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37890_38285_38538_44935
931985	contig_401_pilon	+	1792	3	Intergenic	novelGene_42851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2039	junction_2	202	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTGAATGGAATGACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1714224	1716433	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1715234_1715419_1715486_1715716
931986	contig_5467_pilon	+	1676	1	Intergenic	novelGene_111976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CATATCAAAACAAAATAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167054	168730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5467_pilon_+_167100_168700
931987	contig_1715_pilon	+	2343	13	Intergenic	novelGene_127180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGCGCGGCCGCCGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	247466	312005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1715_pilon_+_248324_248985_249143_251383_251524_252370_252480_256575_256701_262484_262583_265650_265742_267998_268236_269564_269634_271063_271239_271922_272010_284539_284646_311913
931988	contig_4857_pilon	-	3032	12	Intergenic	novelGene_48769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2627.70366707958	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	449	1171	1226315	1212207	TRUE	25	ATTTATTTTAAGCTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFLNKMAGNEYVGFNNATFQSERESGDRNFAIGYYLKEKKCFPEGTDMVGILDFYFQLCSLEVTCESASVMAATLANGGFCPITGERVLSPEAVRNTLSLMHSCGMYDFSGQFAFHVGLPAKSGVAGGILLVVPNVMGMMCWSPPLDKMGNSVKGIHFCHDLVSLCNFHNYDNLRHFAKKLDPRREGGDQRHSFGPLDYESLQQELALKETVWKKVSPESNEDISTTVVYRMENLGEKS	1238733	1209602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1210354_1211096_1212354_1213435_1213529_1214576_1214709_1216723_1216901_1219558_1219610_1220174_1220242_1226259_1226319_1226406_1226440_1231106_1231280_1234301_1234361_1238553
931989	contig_12250_pilon	-	3311	2	Intergenic	novelGene_80538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATAATTGTGAGGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	420855	242508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_-_242960_417995
931990	contig_14953_pilon	-	4433	6	Intergenic	novelGene_137285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	163	155	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2884	3240	328058	264601	TRUE	40	AACCTTCACCTGAAGTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKSTNKRNSANKENVNTTKKALQNPIPLQGTYPREIRTITRIDIYTPIVIAALFTIDALDEWINKLWYIHTMEFYAKIKNNDESVKHLITWIKLKDIMLSEISQSPKGKYCMRLLL	330986	216707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14953_pilon_-_216918_220058_220273_220529_221091_264392_264923_328023_330191_330235
931991	contig_7976_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_169402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTCAGCAAATACAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	707682	705736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7976_pilon_-_705700_707700
931992	contig_5057_pilon	-	2566	2	Intergenic	novelGene_151510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1039	1410	503971	503600	TRUE	30	TGTATGGGAGCAGATAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWKLLNSIINITSKILLKIIQKRLWQYINRELPEIQARFRSGGGTRDIIANVSWILAESKEYHKDVYWCFIDYAKAFDCVDHNKLRITLQRMGIPEHLIVLMRNLFIDQEAVVQTEEGDTTWF	505009	501595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5057_pilon_-_501672_502519
931993	contig_5189_pilon	-	2031	10	Intergenic	novelGene_34853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1416.6730195936	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	196	660	235808	204971	TRUE	25	AATTACTTCTCTAATGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEI	247745	198104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199333_200427_200512_204911_204979_218633_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736_235850_244175_244275_247690
931994	contig_6445_pilon	-	1566	7	Intergenic	novelGene_76935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	701.968106271376	2	62	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	979	1557	88578	42888	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKLCSLPPLACKSGQQNEEWGWLQWGAVK	90609	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_42972_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88604_89656
931995	contig_5623_pilon	-	3265	10	Intergenic	novelGene_154808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	349.539379437822	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	428	1186	210778	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211877	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210797_211066_211118_211203_211383_211502_211603_211798
931996	contig_17144_pilon	-	2123	12	Intergenic	novelGene_29554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1704.09444700038	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	614	1861	172541	166363	FALSE	15	GTCTCTTAAACTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	174930	166100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173301_173460_173580_173704_174876
931997	contig_2703_pilon	-	2101	13	Intergenic	novelGene_101753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTCGGGATGCCAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611734	564175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_564207_577993_578073_578758_578913_582629_582668_584461_584602_599638_599819_602056_602149_603410_603529_605150_605212_606090_606164_607654_607730_609318_609399_610754
931998	contig_1836_pilon	+	2628	3	Intergenic	novelGene_71069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	332	1246	994248	995162	TRUE	35	GTTCTGTTTAAAACAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDTGSRGGTPSLFLLPTHSERFLSPAPTGCWPQKKEDGFEKISHEEFEEKNETKLHEDRLISVNKSHPLQKPPSVFISEEASGYLTSPWLTVFIPAIYTGVFVVSLPLNIMAIVVFIVKMKIKKPALVYMLHLAMADVLFVTVLPFKISYYFSGSDWKFGSEMCRFVTAAFYGNMYASIMLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFICLAIWAVAIGAVMPLVLKEQTTQVPGLNITTCHDALNQTLHDSYYTYYFTAFSAVFFFVPLSISTVCYVSIIRCLSSSKVANRSKKTRALFLSAAVFCVFIICFGPTNVLLIVHYSLLSYNSSVEAFYFAYLLCVCVSSISCCIDPMIYYYASSDCQRYLCSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSTNLNSSIYKKLLT	970651	996698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1836_pilon_+_970766_994030_995345_995498
931999	contig_2733_pilon	+	2985	2	Intergenic	novelGene_128597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	121	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1336	1734	919026	919424	TRUE	20	TGAGGTGGCTGTGAAGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCISQAEKELKKKYKPRVAILKDSMGKVLNDTGSIKRRWKEYTESLYQKEFVPVTPFQEVAYDQEMMALKEEVQAALKALVKNKAPGIDGLPIEMFQQTDAALEVLSCLAKKIGTQLPDQLRGSEPYSCPS	917690	921030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_+_919636_919990
932000	contig_7066_pilon	+	980	1	Intergenic	novelGene_42108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGAGTTTTTTGTATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182839	183819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7066_pilon_+_182800_183800
932001	contig_20610_pilon	+	2096	1	Intergenic	novelGene_67630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACACAAATTTACAAGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	2096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20610_pilon_+_0_2100
932002	contig_1263_pilon	+	2193	6	Intergenic	novelGene_170391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGCAGTTGCCAGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51827	76805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_+_52853_59852_60191_63287_63454_63985_64125_65038_65325_76566
932003	contig_3948_pilon	-	780	3	Intergenic	novelGene_53305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	261	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATCAACAGGTTTGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1473342	1467922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471776_1471889_1473199
932004	contig_14142_pilon	-	1676	10	Intergenic	novelGene_120521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	338.039701079877	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	5	853	355495	350223	TRUE	5	CCTGTTTGGGCTTCTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMSASQDTRSRDSGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREVGPRSHLKPVFPKPMCLPATSFCFLF	355499	349030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350294_350595_350750_351180_351291_351640_351810_352763_352904_353497_353631_354021_354071_355472
932005	contig_3956_pilon	+	2427	11	Intergenic	novelGene_15087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1413.9443730218	3	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	565	1698	553	2250	1284132	1290847	FALSE	10	CGCGACTTATTCTTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPPPQPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281602	1291024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284058_1284136_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289906_1290400
932006	contig_14970_pilon	+	1853	11	Intergenic	novelGene_44957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6580.27277854042	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182398_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345_231952_232151
932007	contig_9515_pilon	-	1205	9	Intergenic	novelGene_73817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1	807	72653	66703	TRUE	20	CCACAGTCTCAACGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEWKRARVGHLGQVHLSSGIRDLIQSRGLGVCLVSRKVFLGVALLQRWLGAQDLDHLGRLLPISDNLHLGLALPLTVPNGQGQVPCLVALQDVGLATTPGKDGLTQVQDEAVPSVEAVPAQRSLRGSDVLLPLHVVEFLDGSWGGPWGGLVEC	72653	57305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_57340_66053_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68347_68727_68822_69341_69476_71787_71873_72459
932008	contig_19561_pilon	-	389	1	Intergenic	novelGene_179205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19561_pilon_-_600_1000
932009	contig_3469_pilon	+	2386	1	Intergenic	novelGene_34203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAACAACATGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531217	533603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_531200_533600
932010	contig_5881_pilon	-	2236	1	Intergenic	novelGene_129049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATTCCCCCTACGTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470796	468560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5881_pilon_-_468600_470800
932011	contig_15820_pilon	+	1111	1	Intergenic	novelGene_174597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	175	528	9	536	149949	150476	NA	65	TCCATGAAAAAAAAAAACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRMEHQDWSLTPCNMQMTQTCLLKSEEDLKHLLMKIKDHSLQYGSHFNKEQIKILTTGPISNIINGENTEIVRDFILLGCTINVQGSSSEEIKQCIALSKSAAKDLFKVLKSKDVTLKTKMCLTQPMVFSVISYPCESLTMNKEDRRIDAFELRRWRIIPNIPWTARRMNKSVLKEV	149940	151051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15820_pilon_+_149900_151100
932012	contig_854_pilon	-	3342	13	Intergenic	novelGene_36706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.21108319357027	3	121	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	2750	3340	1709307	1705286	FALSE	35	ACTCTCAAGACAAGAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSSISVRNCLLSRSSSAFCSMASSRARASDSALVSFSRASASARSRSSAYLAEMVFSSARRHLVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQL	1716403	1705283	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1705434_1706743_1707002_1709122_1709336_1709508_1709710_1709975_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713497_1714855_1715208_1715261
932013	contig_3095_pilon	+	1226	5	Intergenic	novelGene_75098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	54	818	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147187	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932014	contig_15063_pilon	-	1327	4	Intergenic	novelGene_14255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	804	1127	35891	35108	TRUE	40	CAATAGGACAGATGGGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKDGGMAKILMVISGGNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36803	34795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_34924_35035_35380_35839_36156_36264
932015	contig_3956_pilon	+	1794	8	Intergenic	novelGene_15260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1595.89515537167	3	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	110	985	1285728	1289798	TRUE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSSLPDSVQSKWSVVSMVS	1285078	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285173_1285712_1285827_1286084_1286129_1287285_1287536_1287968_1288077_1288874_1289196_1289744_1289892_1290297
932016	contig_11096_pilon	+	2506	2	Intergenic	novelGene_143486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	146	445	289728	290027	TRUE	30	ACCTTGGACCCCTGGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIGTMLGALLHGINTVRTISNNAQAPEERLDNLEFLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKFFGYDKSNQHLISKIYKIVQHLKNRKTTQLKNGQRI	289582	292304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11096_pilon_+_290041_290256
932017	contig_7898_pilon	-	1094	8	Intergenic	novelGene_47527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_7	1860.64388679548	31	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	70	1026	285587	282118	FALSE	25	AAAGCCCTCTGCACTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286095	282049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
932018	contig_12079_pilon	-	5248	5	Intergenic	novelGene_67472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1277	junction_4	657.032343191718	68	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	140	412	638707	600804	TRUE	30	CCTGGCATTCTCAGACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSVRCAGVCRSLFHGFLALQIGRVPSPATTESCVSEGLRRTSQEPKMPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLQYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQELRKESPPPVQIPRQVLPGRCA	638846	594655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_598152_599463_600885_601782_601879_609189_609274_638695
932019	contig_5696_pilon	+	1371	1	Intergenic	novelGene_117582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATAGTTTCTCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	725274	726645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_725300_726600
932020	contig_5794_pilon	+	1727	10	Intergenic	novelGene_69806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.314269680527354	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATATGAGACCGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743287	749533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_743585_743686_743763_743854_743975_745131_745276_746054_746122_746213_746321_746402_747011_747094_747234_747322_747453_749494
932021	contig_2537_pilon	+	868	1	Intergenic	novelGene_33432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAACCGCTTCCACATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274758	275626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2537_pilon_+_274800_275600
932023	contig_7356_pilon	+	605	1	Intergenic	novelGene_60434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	67	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGAACATTGCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	535720	536325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7356_pilon_+_535700_536300
932025	contig_6058_pilon	-	1527	8	Intergenic	novelGene_172414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	393.145348829313	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	162	1034	398054	390684	TRUE	40	CATTCTAAGAACTTATAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQENRQCSFGLAELWAPDGVLILPRKRRQLIWQRYYPEQTSVFAVCHQNAGEPSRRWEQ	398215	385327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386685_387840_387906_390664_390857_390978_391339_392479_392667_395659_395744_397985
932027	contig_12709_pilon	+	2153	1	Intergenic	novelGene_147410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	118	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAAACCATGTTCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45286	47439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12709_pilon_+_45300_47400
932029	contig_14666_pilon	-	1098	2	Intergenic	novelGene_39635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATGCCCGAGCCGGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485244	484027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_484371_484489
932030	contig_5945_pilon	+	1340	7	Intergenic	novelGene_104572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCCAGTGCCGAGGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215597	249585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5945_pilon_+_216323_219509_219591_224366_224541_225669_225778_226433_226536_235617_235742_249559
932031	contig_9235_pilon	-	2710	3	Intergenic	novelGene_156226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1233	1571	46974	46636	TRUE	35	TTAATAACTCTCCAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDVTGLHLAAHI	48312	45084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_45258_45669_47054_47159
932032	contig_20527_pilon	+	1929	6	Intergenic	novelGene_138582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1158.2056121432	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	44	670	13527	27453	TRUE	50	AAAAATAATGACCATGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13483	28943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_28521_28751
932033	contig_5623_pilon	-	1371	1	Intergenic	novelGene_154813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAATTTTACATTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206956	205585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_205600_207000
932034	contig_401_pilon	+	729	1	Intergenic	novelGene_42946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCAAGCTCTTAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2227826	2228555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_2227800_2228600
932035	contig_10225_pilon	+	1896	5	Intergenic	novelGene_86857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	546.120865743106	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	37	1317	42629	47636	FALSE	35	CACACAGGGACTCCAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSSSSSAHTDYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	41505	48215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46827_47210
932036	contig_1339_pilon	-	1987	1	Intergenic	novelGene_163091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTTCAAAGCAATTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30599	28612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_-_28600_30600
932037	contig_3866_pilon	-	2375	19	Intergenic	novelGene_112397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	370.388505574523	2	41	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	521	1639	205942	180258	TRUE	65	AAAAAATGAAAATTTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSEKTEWHPALVVSPSCNDDITVKKDQCLVRSFTDSKFYSIARKDIKEVDVLNLPESELSAKPGLQKASVFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAKKEEEEEVPEEELDPEERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQGGCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTIHHHEPKVKEEKKDLEESMEEVLKEDQEMPLVEVKSEPEENIDSNSESEREEIELKSPRGRRRIARDANSIKKEIEEEKTEDKLKEIDTDNKDVDDDYETPEKKENELLLGRKNTPKQKEKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQER	222537	170658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3866_pilon_-_170750_172275_172418_174189_174275_177422_177621_180037_180262_180390_180642_182062_182295_183054_183153_183327_183423_184717_184791_199817_199988_200497_200575_201701_201782_205903_206037_209046_209113_209211_209306_218673_218793_220622_220734_222501
932038	contig_17144_pilon	+	2168	3	Intergenic	novelGene_29174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACGGAGGACAAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165354	168015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_167331_167581_167681_167922
932039	contig_3153_pilon	-	3977	2	Intergenic	novelGene_104645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1249	1563	197308	196994	TRUE	75	TTAAAAAAAAAAAAAACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDIVADVRWIMVESREYQKDVYLCFIDYAKAFNCVDHNKLWITLQRMRIPEHLIVLMRNLYIDREAVVRTERGDTARFKVRKGVCQGCILSPYLFNLYAEQII	198556	100975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3153_pilon_-_103379_196982
932040	contig_7171_pilon	-	2919	6	Intergenic	novelGene_101345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAGGATCGACTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1557973	1301680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7171_pilon_-_1301737_1302172_1302376_1302521_1302610_1307260_1309217_1495380_1495883_1557859
932041	contig_1380_pilon	-	1308	1	Intergenic	novelGene_138863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTCCAGACACTATGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14683	13375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_13400_14700
932042	contig_13481_pilon	+	1910	6	Intergenic	novelGene_119307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_3	160.307953639238	1	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	531	1593	318	1910	283783	469732	FALSE	70	AAGGACAAGAAAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLSSGASGGKGVDANPVETYDSGDEWDIGVGNLIIDLDADLEKDQQKLEMSGSKEMESPVSTPAVLPLHLLVPVVSNDISSPCEQIMVRTRSVGVNTCDVALATEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWQETEDGMLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTRHDWAPPRFCDSPTSDLEMRNGRGRGKRMRPNSNTPVNETAAASDGKGTSSSSKTRAGANSKGRRGSQNSSEHRPPASSTSEDVKASPSSANKRKNKPLSDMELNSSSEDSKGSKRVRTNSMGSATGPLPGTKVEPTVLDRNCPSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLKYHQAHAHTDDDSKPEADGDSEYGEEPTLHAELGSCNGASVSQKGSLSPARSATPKVRLIEPHSPSPSSKFSTKGLCKKKLSGEGDTDLGALSNDGSDDGPSVMDETSNDAFDSLERKCIEKEKCKKPSSLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPA	248564	469732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_248653_251968_252071_283655_283951_414927_415154_466806_466895_468621
932044	contig_9898_pilon	-	1559	1	Intergenic	novelGene_178451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	452	871	3780	3361	NA	25	GTGTGAAGGCCGTAAACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPGISLLMSDASWLKAETTRKMFTCVLLTMQRHWTVWTITNYGLTLRIVGIPEHLIVFMRNLYIDQKAVVRTEQAWFKARKCVGQGCILSPYLFNLYAEQIIQEVGLYEKERGIGIGDSLATCIMQMKQPCLLKVKRT	4231	2672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9898_pilon_-_2700_4200
932045	contig_3747_pilon	+	1968	3	Intergenic	novelGene_24879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3797.5	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	580	906	203794	204120	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	201081	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201599_203613_203651_203768
932046	contig_15047_pilon	+	1597	7	Intergenic	novelGene_52124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2814.05288981331	9	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	30	545	2194	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2164	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2636_2743_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4681_20989
932047	contig_11088_pilon	+	467	2	Intergenic	novelGene_85057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14752	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
932048	contig_20641_pilon	+	1670	7	Intergenic	novelGene_52845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1776.16184197524	2	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	57	659	14599	45875	TRUE	55	AAAAAAAAAGATCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKVSFTMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLEYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPSEQ	14542	57169	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16925_38564_38675_41462_41619_45865_45965_54835_54968_56379
932050	contig_14986_pilon	+	2262	1	Intergenic	novelGene_59729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	110	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	741	1790	151004	152053	NA	15	TAATGTGTCTTGTTCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSKDDAPHELESQFILRLPPEYASTVRRAVQSGHVNLKDRLTIELHPDGRHGIVRVDRVPLASKLVDLPCVMESLKTIDKKTFYKTADICQMLVATVDGDLYPPVEEPVATADPKASKKKDKDKEKKFVWNHGITLPLKNVRKRRFRKTAKKKYIESPDVEKEVKRLLSTDAEAVSTRWEIIAEDETKETENQGLDIASPGMSGHRQGHDSLEHDELREIFNDLSSSSEDEDETQHQDEEDINIIDTEEDLERQLQDKLNESDEQHQENEGTNQLVMGIQKQIDNMKGKLQETQDRAKRQEDLIMKVENLALKNRFQAVLDELKQKEDREKEQLSSLQAELESLLEK	150263	152525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14986_pilon_+_150300_152500
932052	contig_16999_pilon	+	6023	2	Intergenic	novelGene_84942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	124	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTACCCTTTATTAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4716	10870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_6005_6135
932053	contig_3382_pilon	+	2830	12	Intergenic	novelGene_124159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	354.689970546972	1	125	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	47	877	931459	958158	TRUE	55	AAATTTCAAGATTGAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSAKLRPPSGNGVAMADPEVCCFITKILCAHGGRMALDELLRKIALSEAQLCEVLEAAGPDRFVVLETDASRWVVATTRARVCRRKFCQRPCENLHLCKLNLLGRCNYSQSQRNLCKYSHEVLSEDNFRVLKNHELSGLNQEELAVLLVQSDPFFMPEICKSYKGEGRQQICSQQPPCEKLHICEHFTRGNCSYSNCLRSHNLLDRKVLAAMREHGLDHSVVRNIQDICNSKHARGRRNPPGRREPFPHIVEMWDTEAEAKVETGFFRAIRNFFRPPTPLAKGPAHPVPM	931412	981325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_+_931755_951752_951889_955423_955683_958018_959116_959551_959648_962492_962617_965250_965418_967481_967603_971872_971974_972811_973049_978965_979048_981257
932054	contig_2867_pilon	-	1080	1	Intergenic	novelGene_135154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAAAAAAAGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482743	481663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_481700_482700
932055	contig_8260_pilon	+	2311	1	Intergenic	novelGene_163267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	148	447	989	1435	521061	521507	NA	80	AAAAGAAATGAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQIKTPDDSPVEENALEVPDREFKSLIFGIFQELRQKADKHEKKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNMISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTNINEETLRVM	520072	522383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8260_pilon_+_520100_522400
932056	contig_6086_pilon	-	4134	3	Intergenic	novelGene_171459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3273	3614	27154	26813	FALSE	65	GAAAAAGATGAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGGIRENTERIVEDLLAENFPHILKDEKISVQEAHQTTHKVDPKRKSPRHIIIIIAKTKDKERILRVTRDIRKVVYKGESMRISSDYSAGKKAMG	133689	26292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_29959_96296_96744_133668
932059	contig_3956_pilon	+	1423	6	Intergenic	novelGene_15084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1567.02975083436	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	80	535	1281682	1284120	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVCRQRLSCARPSPSVSSPC	1281602	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282713_1282913_1283793_1283978_1284054_1284267_1284684_1284821_1290409
932060	contig_17144_pilon	+	2122	12	Intergenic	novelGene_29262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	0	CTCCCTGTCTCTCCTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	183189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168308_168996_169099_170744_170902_174849_175003_175975_176270_179699_179784_181792_181852_183158
932061	contig_12528_pilon	-	1320	9	Intergenic	novelGene_81319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_5	592.094956489244	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	207	845	966228	933323	FALSE	35	TATATTCTTCCAAAAGGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQLMSTPVASKCSSGSEREHTGELSPTCIFPSFACDFLDGDSSFECCFIDPLTGSHFTCRRSPRLLTNGYYIWTGDSFLCDKDGNVTLSPSQTSVMYKENLVSLSASKSWLHGSIFGDVDPSPREDIWLEGLNAYHCNENETSLLQEVSFQAILLAACFIFSACARWFPGGMLASVFTCSVMMTLAYVVKSLFLSIASYFKATTCAWFAKI	967817	932847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_-_933339_937397_937459_937559_937622_943700_943777_956052_956166_959917_960131_964909_964971_966191_966274_967656
932062	contig_4388_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_161968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	14	394	698391	698011	NA	50	AAAACCTACTTACAAATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPNQTLFFFPLHFSSSQSTPPSSIQTSIFGTSASSQVLSSSHSHLHILLGPSAVNTESFRSLELGLSSPASSEGASAIDTSPHSVALNNINLSSYRSRSQRFKIRVTGLKGEQQRKAGREVPQPL	698404	696681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_696700_698400
932063	contig_6316_pilon	+	1937	14	Intergenic	novelGene_134702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_3	149.46543801081	2	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	681	1586	147168	157164	FALSE	30	CTTTGTTCTTAAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPDSVFRCVQMLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136289	157515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_139486_139564_140479_140644_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148750_148840_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
932064	contig_3832_pilon	+	2410	1	Intergenic	novelGene_161495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484485	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_484500_486900
932065	contig_11338_pilon	-	1067	6	Intergenic	novelGene_6357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	52	junction_2	232.267604284368	7	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	152	541	319426	295341	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTAVGFTQERDLYGASLDQSVPSSLLIRKLF	323314	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_318590_318769_319185_319264_319381_319429_323165
932066	contig_2069_pilon	+	2228	11	Intergenic	novelGene_23235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	330.262032331905	5	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	930	1529	342065	344117	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLPLSTCSPSWRTTSPPQNPSTNPGIRHSLLGHWAPLWACPLALVNPQDSRPKAPRLRILQSPSTSEQIGHSVVI	323945	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_333050_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341453_341985_342077_342574_342729_343519_343652_343766_343846_343894
932067	contig_10930_pilon	-	2475	7	Intergenic	novelGene_37000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	4	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	669	1517	276835	268388	FALSE	30	GACTACTTTGTTAATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280389	267429	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276948_278443_278637_279700_279832_280157
932068	contig_10734_pilon	+	2185	9	Intergenic	novelGene_51202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	464.863420802283	1	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	771	1175	1139110	1141057	TRUE	40	AAACTGGTGTTAATGTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAATGGSVLNVAALLASGTQVTPQIAMAAQMAALQAKALAETGIAVPSYYNPAAVNPMKFAEQEKKRKMLWQGKKEGVSSFIYSFNSTKENHARSKSSFSLAANQKVDSSNPPAAPWKPYGAVLLCPIESL	1127597	1143374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1127745_1128560_1128605_1129370_1129449_1131067_1131281_1132609_1132784_1134332_1134377_1139039_1139120_1140662_1141417_1142723
932069	contig_6902_pilon	-	1167	1	Intergenic	novelGene_135567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCGAACATTAATGACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	431272	430105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_-_430100_431300
932070	contig_11326_pilon	+	3164	3	Intergenic	novelGene_173912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	2129	2467	169071	169409	FALSE	70	CAAAAACATACAAACAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARFSSFMILGKFSVSSSSMILSVFSVFSPCSGIPITHKFLLLIVSHITLRVSSFFFVLFSEFSSNRVVSTCLSSIPLILSSTVSNLLLSTSVTSSISEILLAFGFLIVIFV	131292	170106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11326_pilon_+_132906_132983_133431_169002
932071	contig_16110_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_126792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTTATAACTTAAAATAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88774	88025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16110_pilon_-_88000_88800
932072	contig_10958_pilon	+	2063	4	Intergenic	novelGene_5431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	8	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGGGATAAATACAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888222	901711	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889030_895279_895855_900457
932073	contig_6164_pilon	+	2781	3	Intergenic	novelGene_121298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1385	1714	765921	766250	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYYGLPEEWNKPVLREVQPECSSEARMVRPCLLYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRKRGGPSVRWIDTVAATMGSSITMIVIMARDHAVFPSVVQRVAMSWNRLDGT	613112	767317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6164_pilon_+_613558_686117_686644_765507
932074	contig_14071_pilon	-	1653	1	Intergenic	novelGene_177671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTATGTGTATTTTCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	444501	442848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14071_pilon_-_442800_444500
932075	contig_5404_pilon	-	1938	1	Intergenic	novelGene_179206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	7	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	493	1083	262287	261697	NA	65	CAGCGCAACCAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQQTISKHLQKQDSMVPVGVQNKTPDDFPVEEKALELPDRVCKSLILRIIKELKKKADKNEEKIDKFLEKADKFMEKFRKIIQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKKNNKISEMDGVIKGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTTKSKNFRVIGVLEQGEKIETQRGSLKNC	262779	260841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5404_pilon_-_260800_262800
932076	contig_16775_pilon	+	2117	16	Intergenic	novelGene_107755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	239.677134680989	4	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	478	1764	143936	174136	FALSE	15	ACTCTATTATTTGTTGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130236	174489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134209_137037_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
932077	contig_8885_pilon	-	1506	1	Intergenic	novelGene_115584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	614	1048	254828	254394	NA	40	CAAATGTAAATGGCCTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDEKLATQEVQRTPYRIDPKRKSPRRIIIALAKTKDKQRILRAAQEKQKVIYRGETIRLSSDYSAETMHARRQWDDIYKTLKKNCQPRIIYPSKLLFKYDGEIRTFPDKQKLKEYVKTKPNLQELLNRVLQSENKQHQLTGSI	255441	253935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8885_pilon_-_253900_255400
932078	contig_15304_pilon	-	491	2	Intergenic	novelGene_30691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	107220	106696	FALSE	20	CCCCAGCCAGGATGCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIVCLPLLGSHRFKEGVFWGPLPGLGDAQPGCL	107222	106590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_106791_106931
932079	contig_20191_pilon	-	1197	1	Intergenic	novelGene_179207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	261	786	284	1069	1324	539	NA	60	ATCAAAAAGAAGAAAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTLIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKNQLHGNSIIPCLHITG	1607	410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20191_pilon_-_400_1600
932080	scaffold_880_pilon	+	2126	3	Intergenic	novelGene_121429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	334	junction_1	140	345	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCTAAAAGGATGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	408584	426627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_408781_420188_420365_424873
932081	contig_8045_pilon	-	1249	1	Intergenic	novelGene_35326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	426	26	451	78544	78119	NA	60	TAGAAAATAAGGAAAAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGGLHAAIMVEAMPPVFHISAGLLMWTRFSSASKLRRTRKEDLVIYFSKLTNENFMESNRILSDIVLEDEPLRLEDTQNTTGKKLLPQSNDVGGVKCSGPSFADVAQLRMRSNNCKYPLVIRTWNVQSMNQGKLEIVKNETLEDRYPRH	78569	77320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_-_77300_78600
932082	contig_20641_pilon	+	1764	7	Intergenic	novelGene_52817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	64	1455	14599	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
932083	contig_15498_pilon	+	2321	10	Intergenic	novelGene_42691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	74	463	785456	795568	TRUE	30	CAGCTATAATTTGCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDLPLPGNFTSFLTVAAGFFEELPLGFLMTNGVGLAFLAGVLALGGAFLGRSLAFPLWAAGTLTVGLDPLCFMDAVFPGDLAGVFFCNLLLGGGSSSSESSSDESSSSSSSPLESSGSFFGNRTPGLG	785382	826121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15498_pilon_+_785725_786211_786324_795559_795666_797089_797344_803536_803622_813229_813385_814785_814863_820915_821055_823745_823912_825236
932085	contig_7457_pilon	+	2478	10	Intergenic	novelGene_31658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_9	168.446496616054	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	451	1614	1029409	1040252	FALSE	10	CTGGTGTCTCATGTCCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHVLRYQDTPGVKMIVVLGEIGGTEEYKICRGINEGRLTKPVVCWCIGTCATMFSSEVQFGHAGACANQASETAVAKNQALKEAGVFVPQSFDELGEIIQSVYEDLVAKGVIVPAQEVPPPTVPMDYSWARELGLIRKPASFMTSICDERGQELIYAGMPITEVFKEEMGIGGVLGLLWFQRRLPKYCCQFIEMCLMVTADHGPAVSGAHNTIICARAGKDLVSSLTSGLLTIGDRFGGALDAAAKMFSKAFDSGIIPMEFVNKMKKEGKLIMGIGHRVKSINNPDMRVQILKDYVKQHFPATPLLDYALEVEKITTSKKPNLILNVDGFIGVAFVDMLRNCGSFTRTLSGSEEAETGAVSSSVGRYFICSSRTHEHVTEPGTLLQ	1028958	1041116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1029472_1030317_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1040131
932086	contig_16098_pilon	+	1432	9	Intergenic	novelGene_46148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3.30718913883074	8	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	34	672	456107	457620	TRUE	15	TCTGGCAGAGGCCGCCCCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELAFTNNTTHQCHEGGKSDRKEWPGASDDALPSRVSMGQGSLDILLLGSLQVLLFPTPGLQGRGLQGSAIGEGQGPWLQQGALVDGVEVDGCLLLTLASREEGDSCNSGGHCAAQCCDSCHGNLLVRKLLRAGVAWSYHIGLQQGAFQVDVVVTQSLVDGSQHLLSYNLTVLQVMVPIREDLRLHNGHDTILLADAGITGQHVGIFHDGEG	456073	460410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_456223_456458_456663_456827_456998_457095_457182_457557_457718_457850_457909_458407_458621_458707_458842_460152
932087	contig_3627_pilon	+	2169	13	Intergenic	novelGene_78566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_1	99.626350541522	3	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1183	1755	1302176	1307800	FALSE	15	CCGGAGAGGTACCTTGTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLVQIPHFKEVIIMATNCENCGDRTNEVKSGGAVEPLGTRITLHITDPSDMTRDLLKSETCSVEIPELEFELGMAVLGGKFTTLEGLLKDIRELVTKNPFTLGDSSSPGQAEKLQEFSQKLDQIIEGSMKAHFIMDDPAGNSYLQNVYAPEDDPEMKVECYTRTFDQNEELGLNDMKTEGYETGLAPQR	1299255	1308214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1299443_1299574_1299737_1300108_1300200_1300520_1300592_1301195_1301283_1301430_1301961_1302121_1302189_1302575_1302647_1303592_1303683_1304164_1304276_1304930_1305018_1306912_1306979_1307665
932088	contig_5236_pilon	-	2270	11	Intergenic	novelGene_100965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	160.748903573244	1	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	167	1378	1010248	1006770	FALSE	40	CATAAATAAATTGCCTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALAKLITVNTPDLVLFVGEALVGNEAVDQLVKFNRALADHSMAQTPRLIDGIVLTKFDTIDDKVGAAISMTYITSKPIVFVGTGQTYCDLRSLNAKAVVAALMKA	1010579	1005877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006899_1007035_1007135_1007221_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009577_1010221_1010289_1010453
932089	contig_20446_pilon	-	799	2	Intergenic	novelGene_179134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGCTGCACTGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17077	121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20446_pilon_-_357_16513
932090	contig_1725_pilon	+	2626	17	Intergenic	novelGene_24261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	595.902620898541	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	739	2220	90	2309	201480	255543	FALSE	20	TACATTGGAGCACCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201390	255860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201698_236027_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
932091	contig_15093_pilon	+	1812	1	Intergenic	novelGene_143291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTGCATTGGAAGGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	41475	43287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15093_pilon_+_41500_43300
932093	contig_9471_pilon	-	221	1	Intergenic	novelGene_21742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTATTGTTCTGATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230809	230588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_-_230600_230800
932094	contig_1867_pilon	-	1705	2	Intergenic	novelGene_54594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGTATGAAGTCATCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512785	510430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_510584_511233
932095	contig_8377_pilon	-	810	7	Intergenic	novelGene_35092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTACAGGAAATTTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172987	142355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161382_164379_164588_169243_169307_172896
932096	contig_5201_pilon	+	2048	1	Intergenic	novelGene_82197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTGTAAACCTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	518396	520444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5201_pilon_+_518400_520400
932097	scaffold_12124_pilon	+	2124	8	Intergenic	novelGene_22325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3802.71352095434	2	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1175	1954	1508626	1509405	FALSE	40	AACTTGACTGGAAATTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483572	1509575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1483785_1489041_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1508010
932098	contig_12379_pilon	-	3037	1	Intergenic	novelGene_148929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	61	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2177	2476	89632	89333	NA	45	AAAAACCCCAACCCAGACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHNYHGLHQTESSTTRWCPATTTDCSDRDNNRGSWTELEKNVEQNSNSEKKDQTYWPEKAWRNPESMAPGHPFSSVMKSLLRFTLWPKIRQPHKTKQD	91808	88771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12379_pilon_-_88800_91800
932099	contig_7882_pilon	-	1623	1	Intergenic	novelGene_175007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATATAAGCTAGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184118	182495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7882_pilon_-_182500_184100
932100	contig_2703_pilon	+	2469	17	Intergenic	novelGene_101722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1060.22026013466	28	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	281	853	559489	596431	TRUE	30	AAAGTTTGGTGTCCTAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHGKTRSPPRSF	526186	611747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596502_599692_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610756_611283_611336
932101	contig_15084_pilon	+	2717	1	Intergenic	novelGene_116668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAAGTGTTCCAGAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18558	21275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15084_pilon_+_18600_21300
932102	contig_2100_pilon	-	1221	10	Intergenic	novelGene_50682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	918.945289146446	5	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	411	872	1176402	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWACPLLSARLELLRRGCPCTAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185496	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173327_1176333_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
932103	contig_5023_pilon	-	1965	13	Intergenic	novelGene_7334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	397	747	647062	639176	TRUE	15	TCGGACACTGATCCTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647458	607301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_607990_614393_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
932104	contig_8254_pilon	-	479	2	Intergenic	novelGene_48359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGAACTTTGCAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3804	2981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_3216_3559
932105	contig_11253_pilon	-	3017	2	Intergenic	novelGene_126821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	2332	2676	188807	188463	TRUE	20	GAGACTGTCTCTTCCCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKHRIFQNDCILLHSYQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLSCASNARVRCYLIVVLICISPMASDREHFLMSVGRLNVFFGEVSVHFLCPFFNWMMCLFLVEVLDFLVDYTDLTFI	191138	103731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_103801_188190
932107	contig_6048_pilon	+	4620	23	Intergenic	novelGene_73335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	20	junction_4	24.4304122217026	164	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	944	2835	159	2993	2843787	2879980	FALSE	25	GTGCATGTGATGTTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSGECVCTREHWLRVCSSSYSSEALDFETEHRLDPVFDSPRMSRRSLRLVTPVFTAGDGPDTKGRTCARNTASVKDRESRTVKQRRSTSKPAFSINHMSRKVTSSAVSQSSCHSLRGNMALQPPVLDASLIREQTKVDHFWGLDDDSDLKGGNKAAVQGNGDLAAAADTAAVNGYTCSDCSLLSERKDVLTAHPPALGPTSRVYSRDRSQKSGASFCVNRILWLAKCTSSSFSSFLVQLFQVVLMKLSYESENYKSKSYESKDCESKSFKSKSHESKAHSGYGGRTEVNELLREDARLGVNGEPLCEDCKGKKERLETNASPHLQLSQSHRVTRAAWHIVSYAGHMLVQVLRRTAAVGWFVSSAVWSVLWLAITAPGKAASRVFWWLGFGWYQFVTLMSWLNVFLLTRCLQNICKFLVLLIPLLLLLGAGLAFWGQGDFLSFLPVLNWTNGYKAQRADDPKNIFTPDAAHLRLPLEGDGKEAFQWHWLSDIERQVTALSGRCQLHEEKLRELTLLLQRLQAHTDKADSDQDGVLSLLRNLQARADQADGDREGMLMLVHQLVEQRVKETHSEGVQGTETDFMTFHQEHELRISNLEDMTGKLTEKSEVIQKELEQTKLRTTSRTAEEQHLLSTVRQLELQLEHLKSELANWRNLKTSCEKVDTIHEKVDTQVRETIRLMFSDDQQDGSLEWLLQKFSSQFVSKDDLQILLQDLELQILKNITHHISVTKQAPTSEAVVSAVHEAGVSGITEAQARIIVNNALKLYSQDKTGMVDFALESGGGSILSTRCSETYETKTALISLFGIPLWYFSQSPRVVIQPDIYPGNCWAFKGSQGYLVVRLSMTIFPTTFTLEHIPKTLSPTGNITSAPKDFAVYGLESEYQEEGLLLGQFTYDQDGESLQMFHALKRPEKAFQIVELRIFSNWGHLEYTCLYRFRVHGDPIK	2822869	2881607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6048_pilon_+_2822941_2843699_2843840_2851291_2851481_2853736_2853922_2855032_2855060_2855164_2855348_2858542_2858741_2859297_2859382_2859672_2859787_2861032_2861132_2861651_2861746_2862609_2862669_2862791_2862938_2863429_2863736_2865012_2865100_2865756_2865801_2866888_2867025_2868512_2868768_2869527_2869613_2873770_2873887_2877436_2877605_2879360_2879454_2879866
932108	contig_15063_pilon	+	1553	5	Intergenic	novelGene_12736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	7	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	2	1411	28164	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	28162	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
932109	contig_6551_pilon	-	1449	1	Intergenic	novelGene_155545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	513	947	168464	168030	NA	45	TGGAAAGAATACACAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIIQIYIPTTKAEDEEIEDFYQLLWSEINQTCNQDVLIITCDWDGKVGNKRGGLVVGKYGLGGRNDAGYRMMEFCKTNDFFIAKTFFHQYKWLLYTWTLPDRVHRNQIDYICGKRRWRSSVSSEQGQGPTTKQTISCSYASSC	168976	167527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6551_pilon_-_167500_169000
932110	contig_17144_pilon	-	1485	8	Intergenic	novelGene_29230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2105.97360295103	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	282	1190	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176219	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166502_172650_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
932111	contig_4469_pilon	-	2615	1	Intergenic	novelGene_21939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	905	1243	643331	642993	NA	25	CCTCAGTAGCATAGAGTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDIGERREEQKPKTCKQTKKNPRGACCWSGEMRDYEMEKNRKGEEEEKNEEIKIRKVKEPQSSQGSHRCSYEVWGSRSQLLQYSLARRRRGMKRQVFREQKEKEDIERRETE	644235	641620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4469_pilon_-_641600_644200
932112	contig_5799_pilon	-	3140	2	Intergenic	novelGene_50245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	1857	2177	170855	170535	FALSE	40	AGAACAGGCAGTTATAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQESSKENGRKTQSLYQKELVDVQPFQEVAYDQGLMILKEEVQAALKALAKNKSPRIDRIPIEMFWQMDAVLEALTHLCQEIWKTASYLANQLKETHIFAHSRER	306762	169571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5799_pilon_-_171384_305434
932113	contig_5686_pilon	+	1864	5	Intergenic	novelGene_45256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1390.80936418332	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	179	856	170282	211355	FALSE	80	AAAATAAAAACATGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSLEVSPSRVSVAFRRGDPGVTHSLKIPLLSRSLRPNSRKCTNDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93791	212363	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171713_208245_208722_211283
932114	contig_3095_pilon	-	1206	5	Intergenic	novelGene_75118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTCAAGAGTGAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152247	147208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150691_150994_151146_151829
932115	contig_17144_pilon	-	2280	14	Intergenic	novelGene_29309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1675.27574697492	10	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	147	1985	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166501_168187_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
932116	contig_20662_pilon	-	1954	1	Intergenic	novelGene_177640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1003	1368	2114	1749	NA	15	TGCAGCTATGAGGTCTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	3116	1162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20662_pilon_-_1200_3100
932117	contig_8310_pilon	+	2986	1	Intergenic	novelGene_75614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	901	1242	325484	325825	NA	15	GACCCCTGCGTTTCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPVCPWPWGQQSRHPGCLPQHHLLPAPLSVASDSPLRLKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDCKFSEKHFGI	324583	327569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_324600_327600
932118	contig_3900_pilon	-	2466	1	Intergenic	novelGene_84196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTTTTTGTGTGTAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534453	531987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3900_pilon_-_532000_534500
932119	contig_3956_pilon	+	732	2	Intergenic	novelGene_15285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2304	junction_1	0	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1289872	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1289892_1290297
932120	contig_1575_pilon	+	2357	4	Intergenic	novelGene_45191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	319	junction_2	207.417453460407	3	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	306	2051	2356	183620	190544	FALSE	30	GTAATGCCATTTCAGCATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKPTEGALIALAMKMGLDGLQEDYIRKAEYPFNSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYHSKGQTLALTQQQRDLYQQEKAQMGSAGLR	181481	190545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1575_pilon_+_183487_183574_183665_185018_185124_190388
932121	contig_202_pilon	+	1646	2	Intergenic	novelGene_127072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	333	716	230941	231370	FALSE	45	AACAGGAATTCAGCATAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGIQNKTPDDFPVKEKALKLPDRKLKSLIVRIIQELKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMENTDKNGRNQENNAGTKCQNKFTTRNYTKTAIRNPNDKQFEMVEDRISGIEDKHLDTTLRKTQKKE	230608	232300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_202_pilon_+_231240_231285
932122	contig_14807_pilon	-	851	6	Intergenic	novelGene_124670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	5559.47337793788	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	155	754	39657	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARARNEPHVFPNAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39916	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_39620_39796_39900
932123	contig_6445_pilon	-	1535	16	Intergenic	novelGene_76938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	904.235161153705	2	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	572	1309	77863	43105	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKCFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55501_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77916_80504_80562_85293_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
932124	contig_16496_pilon	-	1317	3	Intergenic	novelGene_5135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3	338	3585	980	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVVLKFCYWAVVKILNALHDLIF	3587	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1049_1258_1354_3413
932125	contig_3956_pilon	+	3067	15	Intergenic	novelGene_14886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1114.38816378847	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	819	2460	84	2543	1281682	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIILLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289594_1289792_1289892_1290297
932126	contig_14441_pilon	+	777	4	Intergenic	novelGene_100777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	488.532723798746	4	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	189	737	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	122148	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_122188_125517_125902_126159_126283_126514
932127	contig_18081_pilon	+	1365	4	Intergenic	novelGene_23779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	63	614	90717	112338	FALSE	80	ATTAAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90654	113089	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
932128	contig_9995_pilon	-	1896	1	Intergenic	novelGene_47830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTTACGTCTGAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	953613	951717	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_951700_953600
932129	contig_14575_pilon	-	2097	23	Intergenic	novelGene_101878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCAGAACTCTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63926	17253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_17272_19960_20119_20521_20565_20883_21036_21521_21609_22648_22703_26338_26426_27682_27778_28956_29020_30471_30591_33860_33916_39339_39503_40650_40700_41531_41650_42755_42849_44947_45004_47300_47374_54375_54489_57255_57384_59256_59374_59880_59983_61541_61637_63867
932130	contig_7357_pilon	-	2319	9	Intergenic	novelGene_36809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1892.34077517106	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	680	1441	154622	136424	FALSE	15	TGTTTTTCTGGACCTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167069	135545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154663_154855_155079_159911_160031_166772
932131	contig_17144_pilon	-	1518	10	Intergenic	novelGene_29546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1607.48776467513	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	838	1338	167257	166277	FALSE	15	CTTAAACTGTTTTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDLSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183198	166096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_166417_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168010_173323_173460_173580_173751_174572_174761_181801_181850_183158
932133	scaffold_13505_pilon	-	1075	5	Intergenic	novelGene_111455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	315.716249185879	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	395	670	532469	531050	FALSE	30	GCAGACCTTAGCAGGACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTTGRRCPGLQGSSKLCLRQSSSSSCSLPLAWYWNQPSVTVIVGENAHLHCLDNSSTNATGSNITWWLILPGNYIQWSSTFLGSGSGPTGKLIIENVNKSHGGIYQCRFGQDPEAKGSCGTYLRPRPFLDMGEGTKNRIITAEGIILLFCAVVPGTLLLFRKRWQNEKFRMVTHDDYEDENLYEGLNIEDCSMYEDISRGLQGTYQDVGSLQVGDVQLEKP	535616	530644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_531164_531299_531369_532376_532488_532714_532991_535516
932134	contig_2069_pilon	+	2720	12	Intergenic	novelGene_23238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	80	junction_2	297.630588048589	4	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	199	1041	333898	341321	TRUE	15	TACTGATGTGGTTTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCVFCKKLEPGSKEDVGLEGDFRGYGAADRYGPDPTQAWPASSLAHIPNYNNFSPPTTSSTTIKGISGIGVTEFIALYDYEARTEDDLTFTKGERFHILNNTEGDWWEARSLITGQTGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKIGRKDAERQLLSPGNPQGAFLIRESETTKGAYSLSIRDWDQTKGDHVKHYKIRKLDTGGFYITTRAQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKPQTLGLAKDAWEINRESIALERGWVPAASGTCGWARGTAARR	323985	344814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333888_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519
932135	contig_1932_pilon	+	2026	1	Intergenic	novelGene_167339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	84	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	354	671	88203	88520	NA	10	TTTTTTCTGAGTTTTCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWIVLYMSMRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLVVLSITESGVLKSPTIIVELSISLFSVVRVCFMYFGALSLGA	87849	89875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1932_pilon_+_87800_89900
932136	contig_9955_pilon	-	2000	2	Intergenic	novelGene_21313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGTAGGCTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49839	45867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_47737_49708
932138	contig_7293_pilon	-	334	2	Intergenic	novelGene_54267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGTCAGCTATAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336575	336118	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_-_336241_336363
932139	contig_15063_pilon	+	1540	5	Intergenic	novelGene_11542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	76	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	230	1402	34808	36661	FALSE	30	ACAAGATGCTGGTCCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27139	36799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
932140	contig_12000_pilon	+	1720	6	Intergenic	novelGene_43171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	603	junction_1	451.024433927919	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	5	634	417192	490720	FALSE	15	ATGGGGTCCCTATGAGTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISSMLDVNGLFSLSHITQLVLSHNKLTTVPANIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLNLGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLNENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPDIGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGKVADEQSWY	417187	491806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_+_417301_449720_449772_484101_484223_488476_488596_490220_490304_490573
932141	contig_20374_pilon	+	1985	1	Intergenic	novelGene_166018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	99	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCTATGCCGTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26892	28877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20374_pilon_+_26900_28900
932142	contig_16411_pilon	-	1257	1	Intergenic	novelGene_77342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGACAATAAGCCTAAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215359	214102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_-_214100_215400
932143	contig_1008_pilon	-	1898	2	Intergenic	novelGene_121555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	242	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	975	1313	538601	538263	FALSE	20	GCCAAGTCTTCTCTCCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISAQPLQHLLSPVFLICASNAGVRWYLIVVLICISLMASDHEHFLMCLLAI	540010	537677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1008_pilon_-_539061_539495
932144	contig_3956_pilon	+	1506	8	Intergenic	novelGene_14938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	81	707	1281682	1286416	TRUE	30	TAGAAGGCAGGAAGTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYHDHHPPALACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1290922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284181_1286129_1286224_1286409_1286606_1287276_1287378_1290413
932145	contig_11338_pilon	+	2051	7	Intergenic	novelGene_6347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCACATCCCTGGCTATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294813	315474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_295361_298712_298830_298910_299077_300827_300893_306726_306961_307227_307425_314749
932146	contig_5539_pilon	+	2808	2	Intergenic	novelGene_104774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAGATGCGGCAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258745	273578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_258820_270844
932147	contig_8954_pilon	+	3457	8	Intergenic	novelGene_130292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	267.924220172612	13	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	1133	1762	165021	185921	TRUE	35	GAACTACTTGTATTCTAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQYQQADLISLGKVVLALACNSLAGIQRENLQKAMELVTINYSSDLKNLILYLLTDQNRMRSVNDIMPMIGARFYTQLDAAQMRNDVIEEDLAKEVQNGRLFRLLAKLGTINERPEFQKDPTWSETGDRYLLKLFRDHLFHQVTEAGAPWIDLSHIISCLNKLDAGVPEKISLISRDEKSVLVVTYSDLKRCFENTFQELIAAANGQL	163888	187776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8954_pilon_+_165036_169411_169552_173747_173878_174335_174401_182928_183068_185780_186868_186957_187322_187391
932149	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	13444	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
932150	contig_16724_pilon	-	1245	7	Intergenic	novelGene_105299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	824.926141475035	5	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	142	798	569099	541872	TRUE	25	GCAATGTTTGTGTACCGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSCGRCFAPAPPCARPTASNSAHPSAPGAGGLRVSGAAFPSPTAAEMAEISRIQYEMEYTEGISQRMRVPEKLKVAPPNADLEQGFQEGTQNASVIMQVPERIVVAGNNEDITFSRPADLDLIQSTPFKPLALKTPPRVLTLSERPLDFLDLERPPPAPQNEEIRAVGRLKRERSMSENAVRQNGQLVRNDSMYGISNIDTTVEGTSDDMTVVDAASLRRQIIKLNRRLQLLEEENKERAKREMVMYSITVAFWLLNSWLWFRR	575940	541140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_541427_541710_542004_543916_544002_560939_561029_567595_567766_568918_569140_575839
932151	SIRV7	-	1758	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	111627	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3111	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2682_3026
932152	contig_5947_pilon	+	475	1	Intergenic	novelGene_101478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACATACCAAAACTTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	322324	322799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5947_pilon_+_322300_322800
932154	contig_14551_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_162550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGGATGAGAAGGCAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	190147	188648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14551_pilon_-_188600_190100
932155	contig_10958_pilon	-	2154	5	Intergenic	novelGene_5403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	141	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCGAGGCCAAGCGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901492	888217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_888275_888847_889053_893823_894105_895279_895852_900453
932157	SIRV6	+	831	5	NNC	SIRV6A	novel	1163	5	NA	NA	20	47	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	33	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCATCGCGCGCCTAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2492	11378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11114_11210
932158	contig_11293_pilon	+	4535	3	Intergenic	novelGene_134678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	3312	3653	119036	254332	TRUE	55	AGTTTACAGACAGAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDYSLQYGLHLNKKKTKILTTGTISNIMIKGENIEVIKDFILLGSTINAYGSSSQEIKRCIALGKSAAKDLFKVLKSKDFTLRIKVRLTQAMKFSIASYACESWTMKKED	115724	256409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11293_pilon_+_119203_254157_254741_255935
932159	contig_15518_pilon	+	2331	4	Intergenic	novelGene_127604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	227.23996127442	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	2	469	11055	15019	TRUE	50	TAGTAAAAAGAATATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFNQALSPRGIQPLSENHTWADSDLHLRVPRLLPQGCHPEVVQKWE	11053	39600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11390_14886_15202_37273_37389_38035
932160	contig_15248_pilon	+	658	1	Intergenic	novelGene_149154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTTCAAGTTGTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141197	141855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15248_pilon_+_141200_141900
932161	contig_10307_pilon	+	1384	3	Intergenic	novelGene_170261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGTCTTTGGCAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	387268	392308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387801_390342_390382_391495
932162	contig_5758_pilon	+	2162	3	Intergenic	novelGene_119093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCTATACCAGAAGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209517	282383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5758_pilon_+_211382_280005_280061_282140
932163	contig_21315_pilon	+	2642	2	Intergenic	novelGene_151563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTGGGAAAAAAAAAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8868	52526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21315_pilon_+_10984_51999
932164	scaffold_13505_pilon	+	1702	7	Intergenic	novelGene_111571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	199.751859955184	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTATATTCTCTATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608622	635806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_+_608884_608980_609105_609537_609623_609748_610099_613391_613529_623354_623423_635129
932165	contig_14970_pilon	+	1443	8	Intergenic	novelGene_45004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	6803.58453542045	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	36	1094	136145	231899	FALSE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLTLSPVCPDTMNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHEFDGSNSHLEAAHLNGWLLPKATQIRLPDPRPSPRPTSQVAATC	136109	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216655_231761
932166	contig_14182_pilon	-	1365	1	Intergenic	novelGene_76176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACTGGAACTAATAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27063	25698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14182_pilon_-_25700_27100
932167	contig_17144_pilon	-	2423	12	Intergenic	novelGene_29346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2038.17668477174	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	324	1619	179764	167278	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTAGRIISGQVSQTQPVAA	183405	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_172573_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
932168	contig_8177_pilon	+	1130	2	Intergenic	novelGene_86511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCCAAAGTACAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114884	118005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8177_pilon_+_114934_116924
932169	contig_5586_pilon	-	940	1	Intergenic	novelGene_143597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACTTGATGGCAGTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602464	601524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_601500_602500
932170	contig_17976_pilon	-	1025	1	Intergenic	novelGene_32531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAATTTGGCAGTGGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48460	47435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_47400_48500
932171	contig_5023_pilon	-	2430	16	Intergenic	novelGene_7184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	401	751	647062	639176	TRUE	40	GGAAAGAAATAGATTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWYLETGDA	647462	580768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_580898_607251_607341_607933_608100_609595_609717_611684_611817_614399_614477_616410_616580_618522_618617_622548_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639200_643416_643539_646857
932172	contig_10753_pilon	-	568	1	Intergenic	novelGene_105167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTGCCATGAGTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	441841	441273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10753_pilon_-_441300_441800
932173	contig_3095_pilon	+	2282	5	Intergenic	novelGene_75163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1987.52753125586	1	139	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	254	805	225596	226800	TRUE	30	AATGTGACTTCCCAGGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSRFESFDPQGGLRNIAVLKHNLDILIKCSNSTAATNDVPEVTVFPKSSVMLGQPNLLICLVDNIFPPVINITWFSNGHPVTEGVAETNFLPKDDHSFSKISYLTFLPSADEVYDCKVDQWGLDEPLLKHWEPEIPTPMTELTESVVCALGLAVGLVGIVVGTILIIRGLRSGGVSRHQGSL	220471	245830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_220591_225461_225711_226126_226409_226645_226824_244376
932174	contig_5649_pilon	-	2971	2	Intergenic	novelGene_82440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATATAGTATTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1491942	1488915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1491719_1491774
932176	contig_13456_pilon	-	2443	1	Intergenic	novelGene_153306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAATTCAAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	532962	530519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13456_pilon_-_530500_533000
932177	scaffold_13505_pilon	-	7073	2	Intergenic	novelGene_111605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	131	96	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGACGGAAGGCTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	662832	655389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_655649_656018
932178	contig_3472_pilon	+	1376	2	Intergenic	novelGene_166943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGCTGATAGACTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	925709	927788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_+_926059_926761
932179	contig_7123_pilon	-	1738	1	Intergenic	novelGene_170591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	70	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	989	1354	649376	649011	NA	0	GGCTGTTTTGTCTCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLKSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSFLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFRGIQ	650364	648626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7123_pilon_-_648600_650400
932180	contig_12402_pilon	-	2106	2	Intergenic	novelGene_133385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTACCTTGGTGAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644848	642611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_644126_644256
932181	contig_18673_pilon	-	201	1	Intergenic	novelGene_179208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGAGTCCAGTACAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3287	3086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18673_pilon_-_3100_3300
932182	contig_233_pilon	+	2831	16	Intergenic	novelGene_14657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	2050	2619	105585	108783	TRUE	10	TTCCTCTTCTAAGCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGLAWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCEVLPPSISPPNVWLLPSSGTRRSQAPTPRTPGRC	78220	127017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91680_92144_92359_93764_94007_94722_94914_98310_98454_99781_99872_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107471_108400_108586_108687_108818_109917_109978_126899
932184	contig_6102_pilon	+	1264	6	Intergenic	novelGene_31939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	607	junction_4	271.653897450414	5	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	388	507	394006	394507	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	393354	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
932187	contig_17008_pilon	-	1468	1	Intergenic	novelGene_124235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	24	377	46187	45834	NA	40	ATTAGCCAATGAAAACCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDVFDVIPQLIRPSVISVQCIKSILEMVSKLQWDIFKFVLWLSWTCSNFLQLQLELVYEKLVVCSRVCPGLVLTDDIELFHCLFPHMQSILFLCIPFGEVHVHKPKKPNPLPSSRF	46210	44742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17008_pilon_-_44700_46200
932188	contig_11551_pilon	+	1421	1	Intergenic	novelGene_168481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACTCCACAAAAAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	574722	576143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_+_574700_576100
932189	contig_4232_pilon	-	922	1	Intergenic	novelGene_63360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAATAGTATTTTAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468066	467144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_468100
932190	contig_3956_pilon	+	2114	7	Intergenic	novelGene_15265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1152.14747561046	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	12	1394	1286130	1290062	FALSE	45	TCAGAGGGAAACTCAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQVREAGPSVHVPGAVPLREPLRASLSLTVSRASGRCRRPAESAQWHMAPAGCPPWGWGVGVQL	1286118	1290782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289781_1289977
932191	contig_3155_pilon	+	1822	5	Intergenic	novelGene_26406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	3	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	35	541	258156	261211	TRUE	25	CACCTCACTCCAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258121	262549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261527_261583
932192	contig_19579_pilon	-	1460	5	Intergenic	novelGene_59382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	626.76844807313	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	106	690	13090	7943	FALSE	55	TAAAAAAAATCTATATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTDGRNAFSLDYFRQDHNTFLVSPVTLTSEGTYRCCGSSKPHLLLWSLPSETLDLLVTDPYGLEQGYTHILIGVSAAVVFILLFLLLFFLCRWYQAKHRATDGETKNQVKYKSSNTLWDASQQPCVYVTLALP	13195	7172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8007_8569_8613_8704_8825_12012_12181_12900
932193	contig_17158_pilon	-	1205	1	Intergenic	novelGene_141149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGACACAAACATCTTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135409	134204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17158_pilon_-_134200_135400
932194	contig_299_pilon	+	820	1	Intergenic	novelGene_129456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAGTCAGTAAGTAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	970242	971062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_970200_971100
932195	contig_7760_pilon	+	2719	1	Intergenic	novelGene_138433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCCCAGTTACTTAACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90392	93111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7760_pilon_+_90400_93100
932196	SIRV3	+	257	2	ISM	SIRV3A	SIRV304	1083	8	6172	-3	4132	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8135	8940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_8208_8755
932197	contig_3523_pilon	-	2001	1	Intergenic	novelGene_171481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	119	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTTATATTTTTAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19095	17094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3523_pilon_-_17100_19100
932198	contig_15354_pilon	-	941	1	Intergenic	novelGene_65698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	565	897	79921	79589	NA	65	AAAAAGGCAGGAAAGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTYSLEIPFFNNGNNYTHGPHQMEYTGIKSTTSVEREWRSSISSVRTRPGVDCRTDHQLLICKFKMKLKKIKTSPREPKYNLEHIPPEFRDHLKNRFDALNTNDRRPNEL	80485	79544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_-_79500_80500
932199	contig_20786_pilon	-	805	1	Intergenic	novelGene_159696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGTTGTTCAGTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1071	266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20786_pilon_-_300_1100
932200	contig_10740_pilon	+	1297	2	Intergenic	novelGene_152240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29	8454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_+_758_7885
932202	contig_15449_pilon	+	3410	13	Intergenic	novelGene_33570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	849.636768795283	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	549	1610	46876	51340	TRUE	15	TTAAACTTTCTGGTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGKI	14501	55779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_14552_15759_15837_43216_43328_44648_44762_45020_45074_45574_45707_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51932_54570
932203	contig_10217_pilon	-	1577	10	Intergenic	novelGene_87410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	583.341523752024	3	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	134	601	130155	114050	TRUE	20	AAAGGCATTCTGTTTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTINFNLIGYINELS	130288	108889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_-_109472_110874_110962_112193_112290_112999_113148_113986_114093_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
932204	contig_2940_pilon	-	1201	1	Intergenic	novelGene_81867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCACCAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131308	130107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2940_pilon_-_130100_131300
932205	contig_3956_pilon	+	3024	16	Intergenic	novelGene_15033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1242.61361474738	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	864	2595	81	2675	1281682	1290665	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284777_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290443_1290511
932206	contig_17144_pilon	-	1376	9	Intergenic	novelGene_29321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1996.64126957624	5	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	157	1167	179764	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLGCLQERVWSVS	183238	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166312_173326_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
932207	contig_1337_pilon	-	1723	1	Intergenic	novelGene_84234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	111	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	347	901	172269	171715	NA	50	AAACCAGGCAAAGACACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKNVSSKRHQNRAGVPMLISDKRDFKIKSTTKDKDGHYIMIKGMIQHEDITIITTYTPNDRAPKHIKQTLTALKRETDSSTITVGDFNIPLSVKDRTSRKKLIEDTEDIKATISQLELTDIYRTLEPTAAKYTFFSNAHAMSSRIHILGHKATLNKTQNTEIIQSIFSDHNAIKIEINKRKSK	172615	170892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1337_pilon_-_170900_172600
932208	contig_5643_pilon	+	819	8	Intergenic	novelGene_38877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3100.87772959166	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	85	390	236700	237435	TRUE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGSSLAWPSVSPPTTCQSWI	236485	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237238_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237968
932209	contig_11017_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_128093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATAGCTATGAACCAGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274088	275164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_274100_275200
932210	contig_10311_pilon	-	2074	2	Intergenic	novelGene_50498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTCTAGCTAGAACTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333971	331157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_332345_333084
932211	contig_10437_pilon	+	2052	11	Intergenic	novelGene_38193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	604.301985765395	2	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	119	547	229668	230926	TRUE	30	GTAACAAGTGTCCGAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHQGLPRGPAGYISPLTERPEWLEEPPFCLPSPGAFSPRMLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREAGDSRFT	225147	233477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_225265_229666_229841_230252_230371_230564_230680_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231720_231947_232055_232163_232318_232510
932212	contig_3077_pilon	+	1811	10	Intergenic	novelGene_26878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.0976319266304	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	234	1013	1338614	1346705	FALSE	35	ACCCTGGGCACTAAAGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337803	1347503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337906_1338432_1338464_1338513_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
932213	contig_5696_pilon	-	2448	1	Intergenic	novelGene_117511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAGAGAGAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338358	335910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_335900_338400
932214	contig_16382_pilon	-	1780	1	Intergenic	novelGene_160230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCCCACAGAGTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	235271	233491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16382_pilon_-_233500_235300
932215	contig_11259_pilon	+	2002	1	Intergenic	novelGene_144520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGACATCCATTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121768	123770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11259_pilon_+_121800_123800
932216	contig_3956_pilon	+	3116	16	Intergenic	novelGene_14910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1086.40744147345	1	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	481	2592	1284120	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYPKHVGHCPRAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281599	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1282842_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932217	contig_14341_pilon	+	3546	1	Intergenic	novelGene_111797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	135	408	2591	2998	388774	389181	NA	25	CATCATGCTTGATAGAGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDGSWQKAETTRKDVYLCFIDYAKAFYCVDHKKLWLTLRRMGMPKHLIVLMQNLNIEQEAVFEKNKGILHGLKSGKVCARVVSFDHIYSICMLSKYSEKLDYMKKNAASGLKEDSSTACSMQMTQSCLWKEKRT	386183	389729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14341_pilon_+_386200_389700
932219	contig_10225_pilon	+	1196	2	Intergenic	novelGene_86875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	2	1078	46329	47636	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	46327	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_46620_46850
932220	contig_3956_pilon	-	2438	11	Intergenic	novelGene_15245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	CAGCCGTGGAGGCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
932221	contig_17144_pilon	-	2278	14	Intergenic	novelGene_29562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2085.60829887382	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	790	1506	174597	172639	TRUE	20	CACCCACTAGCCTTTTGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKVTPSEGHPSTLETSSNPDRALKAGAQESHMSREGPVIHPPHLEALPHSICIFSLSFPPIPTTANAPGGRQWADPRVPGFLETLRPGWGSPTLQHH	183215	166138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172834_173035_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175969_176271_179700_179786_181790_181850_183158
932222	contig_11145_pilon	+	3529	4	Intergenic	novelGene_160508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	570	2959	3528	236602	237171	FALSE	35	GGATCATAAGGAACTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQGLRQKADKHEEKVDKFKENTEKKLEEFRKIKQEQNPKINSQLEIIQRQQLEIQQINNKISEMDNVKEGLRSRSETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKRNEETLRVMWDTIKSKNFRVIGIPEQGEKTENTE	3485	237172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_5505_58693_58708_141014_141461_236122
932223	contig_17427_pilon	-	1807	8	Intergenic	novelGene_30309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1005.32039770454	5	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGTTGTTTACCTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204691	176947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179703_188070_188140_188767_188890_204653
932224	contig_177_pilon	+	1756	3	Intergenic	novelGene_41836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	66	1142	417672	418748	TRUE	15	CCACTTTTAGTTGGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415665	420201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418772_419610
932225	contig_13021_pilon	-	2057	9	Intergenic	novelGene_8243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	497.448222808163	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	170	1225	236115	210494	TRUE	45	TACTATTAAAAACACTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMWKKTFLVFLFSLSIQNAVLDDERTKKTDECPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLDPVATPVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYRNQADKESVPRLEPRQYVPTAQDGKSFLQSPELHYATPTFQKVASGKHEACNDYKTNDYKTNYVYSDLI	236284	205455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211926_212044_212125_213077_213168_215157_215269_218018_218304_231599_231882_236024
932227	contig_2552_pilon	+	1927	1	Intergenic	novelGene_139013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTGCTTTCAGTCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150731	152658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2552_pilon_+_150700_152700
932228	contig_17427_pilon	-	2352	11	Intergenic	novelGene_30360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1137.26392715148	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	316	1260	184322	178046	FALSE	10	ACTTGCTTCGTTGTTTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	188858	176953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184532_184613_186417_186492_188742
932229	contig_34_pilon	+	3178	4	Intergenic	novelGene_40035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	857	1237	222931	223311	TRUE	40	TGAGAGAGAGAGAGATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLAVSTGGHLLFMGPYCRWLGGVGGATSPQAPDVGRRRLCLMARVCQMSRTCHFTAETVEVRVLVYTLLYCSNEGLCCSNGPTQVYARGKALKVHGSLMPVPGQRAVPTLGSWLRGAGSLFFPVC	222074	247107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_224818_230228_230389_243215_243353_246969
932231	contig_7057_pilon	+	407	2	Intergenic	novelGene_123359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	77	385	943281	943696	FALSE	5	GTGGCATCTGCCTCCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAADYVFLNGNPRPAPSVPRCGVTMDPRIRGHVFMGPGTHRPLHAPSPGHQLLRQQPGPHMPQRTMPELPPLSHTAFSVLEESLLSLHPVTPVPVTPPAAVLPGPRPTCPVPLFLLCFQPARPRKK	943204	943718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_943433_943539
932232	contig_14722_pilon	+	2064	2	Intergenic	novelGene_110231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTATTTATAGTCCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146083	148777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14722_pilon_+_147844_148473
932233	contig_17274_pilon	+	2001	1	Intergenic	novelGene_26594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	290	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	1378	1728	258412	258762	NA	60	AAAGAAATACAACAGGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDTIKSKNLLVIGIPEQGEKTENRERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQETQRTPYRRDPKRKSPRHIIITLAKTKDKQRILRAAREKQVVTYRGETIRLTIRLFGRNHAGKKAMG	257034	259035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_257000_259000
932234	contig_10307_pilon	+	1238	3	Intergenic	novelGene_170268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	2	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	1	735	387440	392058	FALSE	30	CCAAATCTTAAGTTGTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNSSERLRERAGGPRRCKNRASRTSTLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387439	392561	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387519_390288_390382_391495
932235	contig_7396_pilon	-	1842	9	Intergenic	novelGene_79581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4250.56360233558	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	416	730	248211	246442	FALSE	35	GTAGGAAATGTTTGTCAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257074	245329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248283_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257014
932236	contig_11338_pilon	+	3300	7	Intergenic	novelGene_6197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	281.697236999821	4	122	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	891	1604	8000	11802	TRUE	40	AAAGCTGAATTTAACCTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEAFGIQHVKAGFGQAGSSHSSFCTC	7029	13607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_7537_7616_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10587_11727_12511_12619
932238	contig_17144_pilon	-	1869	7	Intergenic	novelGene_29536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2610.52853311781	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	102	680	179764	167278	FALSE	20	GTTTTTTTCTTTCTTAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSSCSSPSVGLPGSAVVPGRIISGQVSQTQPVAA	183183	166088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_167328_167581_167630_174880_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
932239	contig_10404_pilon	-	1325	3	Intergenic	novelGene_138707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	227	junction_2	6.5	5	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	50	153	145	297	1219346	1219194	FALSE	65	TTACCAAAAAAAAACAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATLKSKQDDLHRKALQTLERAQQLAPNDPQVILYVSLQLALVRQISSAMEQLQEALKVWRDDANALHLLALLFSAQKHYQHALDVINMAITEYPENFK	1224275	1218165	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_-_1219359_1222905_1222979_1224216
932240	contig_15047_pilon	+	1677	6	Intergenic	novelGene_52171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	1	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	24	647	2194	4178	TRUE	30	TGGAAGACCGGAGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2170	21639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20987
932241	contig_8174_pilon	-	3684	1	Intergenic	novelGene_160062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTCCCCATGTTCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301816	298132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8174_pilon_-_298100_301800
932242	contig_8059_pilon	+	3152	13	Intergenic	novelGene_111108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	78.4422558319175	7	48	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	287	625	266127	279478	TRUE	85	AATTAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVAREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKVRNFTFL	241708	343565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_241748_245301_245375_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279503_283690_283736_292994_293044_327563_327640_336424_336520_338665_338935_341596
932244	contig_8210_pilon	-	3472	8	Intergenic	novelGene_30221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	857.680831173966	3	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	614	1348	24031	15712	FALSE	90	GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAESCLSHSWLQQWDFGNLFHPEETSSSSQIQDHTIKSSEDKTSKPSCNGTCSDREDKENIPEDSSTVSKRFRFDDSLPCPQELVSDLLC	53054	13587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15995_18144_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712_29926_37631_37803_52874
932245	contig_854_pilon	+	1404	7	Intergenic	novelGene_36276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	9	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	58	636	543600	562402	TRUE	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543542	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
932246	contig_4659_pilon	-	1766	1	Intergenic	novelGene_118262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	580	879	893128	892829	NA	25	CAGACATGGCTTCCAATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKGGAQNSNSSKKIRLNGLTETGDTPESMAPGFSISPELKQFPRPTLQTGIGLDWTVGHKVILERSVSLSSSRYKRLNGHLLSGGEMGRQRGLGAG	893707	891941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4659_pilon_-_891900_893700
932247	contig_4531_pilon	+	2549	1	Intergenic	novelGene_47842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTGTACCACATCGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81237	83786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_81200_83800
932248	contig_3601_pilon	-	3864	2	Intergenic	novelGene_132856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2052	2357	130167	129862	FALSE	45	GAATTATCAAAATCCTAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQKADKNEEKIDKFMEKADKFMETTDKKREEFRKIMQEQNAKRNSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMESVIEGLRSRFEMVEDRISRIEVKHLDTTLRKN	161690	128354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3601_pilon_-_131084_160555
932249	contig_18506_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_67941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAGAACTCAGCCACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18506_pilon_+_0_800
932250	contig_1244_pilon	-	1820	10	Intergenic	novelGene_37988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_6	772.958529863594	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	25	1200	946523	923405	FALSE	15	TGCTTTTTATCCAGACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQVNFLSSW	946547	922784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439
932252	contig_5331_pilon	-	3348	1	Intergenic	novelGene_112756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	126	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACTAACATGGCTGATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33236	29888	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_-_29900_33200
932254	contig_15518_pilon	+	1570	2	Intergenic	novelGene_127607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2	370	11190	15019	FALSE	10	TCACTCATGCTTGTTGTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSGDQALSPRGIQPLSENHTWADSDLHLRVPRLLPQGCHPEVVQKWE	11188	16219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11426_14886
932255	contig_8661_pilon	+	963	1	Intergenic	novelGene_137936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGACTGCTGCTTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	301877	302840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8661_pilon_+_301900_302800
932257	contig_10958_pilon	+	1036	2	Intergenic	novelGene_5476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGCACGCTGCTTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	895568	901207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_895855_900457
932258	contig_5125_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_43464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58944	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_58900_60000
932259	contig_20527_pilon	+	2043	7	Intergenic	novelGene_138597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1371.07533831418	3	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	424	900	24977	27453	TRUE	20	GTGGGGTTGTTAACCAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13546	28844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_23436_23740_24915_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27631_27878
932260	contig_3602_pilon	+	1838	1	Intergenic	novelGene_60622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGTGTATAAACTCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	913102	914940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_913100_914900
932261	contig_7839_pilon	+	756	5	Intergenic	novelGene_45735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	627	junction_3	587.834745060208	2	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	753	3	755	952473	954343	FALSE	25	TGGGCTCAGATGAGGAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEDKDNEEKPKIED	952470	954344	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7839_pilon_+_952620_953274_953482_953593_953754_953917_954052_954238
932263	contig_7293_pilon	+	481	3	Intergenic	novelGene_54266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	9872	junction_1	634	2	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335760	336671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7293_pilon_+_335804_336110_336241_336363
932264	contig_1399_pilon	+	1482	1	Intergenic	novelGene_166668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100918	102400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1399_pilon_+_100900_102400
932265	SIRV3	-	1159	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	1665	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4477	43	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATACAAGTTTCTCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	7094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
932266	contig_14618_pilon	-	3233	6	Intergenic	novelGene_136782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	36.9626838852376	167	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	606	2576	35866	24996	FALSE	15	CTCAGGCTGTGTTACTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLTPKHEAKGVSSKDTDWSQEKKRKPTILEPVTFEDVTVVFTEAEWKRLSSEQKHLYKEVMLEIYRNLLSLEPKPELQPCSSCLLAVSCQRFLSQHVLPIFPGFCAEHHFHPGCSSPGHQKQPEQQDSEQSCWRENTEGQEREEVSRLLCGRRGERGTSRAFSSPPQRRSASPREGNTEVGVEPNSAQKIKSVVRGQGLKELETSRFGALSSREDEPDCGLKSDFITRQRSLLQEKPYVCSECGRGFTRKSVLLMHQRTHAGEKPHMCKECGQGFRWKSGLLIHYRTHSGEKPHVCKECGLSFNQESSLLLHERTHSGEKPHVCEQCGRGFNHQSALIRHQRTHSGEKHYLCLECGRGFSRKSGLFLHQRTHSGEKPHMCKECKRSFRRKSDLLIHQRTHSGKKPHVCKDCGQGFNWESSLPLHQRIHTGEKPHVCKECGRGFTQKSVLLMHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHQRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSGLIGHQWKHTDKKPYVCSECGKGFTQKSSLLIHQRTHSGEKPYVCNECGRGFTQKSVLLNHQRTHSGEKPHVCKECGRGFSHKSNLITHLRTHSGEKPYVCLECGRGFSQKSILLTHQGTHSGEKPYLCKECGRGFNRESSFLLHQRTHSG	39387	24338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_-_26747_32011_32139_35599_35659_35832_36096_37931_38219_39298
932267	contig_12677_pilon	-	1081	2	Intergenic	novelGene_110743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1746	10	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_83_737
932268	contig_3018_pilon	-	1595	12	Intergenic	novelGene_78856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	478.061443542201	6	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	525	1069	1593	570257	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	625056	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570428_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583602_600115_600194_624772
932269	contig_9706_pilon	+	2094	15	Intergenic	novelGene_20893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_14	706.134566148835	5	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	406	1221	345	1565	231608	366533	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPSDIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALRHADSSNFYITEKNRNEIKNGSILRLTTSPAQTAQQLHERIQSWSMDAKLEALKDLAYLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDLLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILEAMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGTDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNNSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFISLLALITITFPSDLDLISNSAGIQLDLHLNLHHNWHKQDFSFSD	91190	367062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_91366_111977_112074_231534_231686_261970_262012_262966_263040_300317_300369_313340_313511_324271_324308_337118_337219_346565_346718_350061_350141_357500_357552_363661_363785_365684_365817_366398
932270	contig_1037_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_84595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGAGTTTCCAATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195375	196323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_+_195400_196300
932272	contig_6847_pilon	+	3360	13	Intergenic	novelGene_143867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	571.51632498313	1	101	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	1230	1661	77788	96836	TRUE	70	AAAAAAAAAAATCCCAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQLEQKMEQARAVPTSFPYLNG	76558	112352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96773_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104164_109821_109891_110424_110608_111608
932273	contig_8330_pilon	+	1421	5	Intergenic	novelGene_71833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	387	junction_1	71.6706878716816	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCTGCCTTGTGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	855447	857761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855535_855624_855716_856196_856560_856667_856755_856968
932274	contig_10307_pilon	+	2267	3	Intergenic	novelGene_170270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	168	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	150	1169	389925	392058	FALSE	25	GTTATGTAACTTATCTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTELLGGDMVNQSFICDPDDENLIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSGSPSPARGHGGCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLNDGSSPKACASPDSTAFSSSSDSLLSSVESSPRASPEPRALHEETPPTTSSDSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQPPAKRSEAGSHSSGGHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPATKRAKLDSGRVLKQISNNRKCASPRSSDTEENDKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSIQAEEQKLISEKDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCE	387439	393156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10307_pilon_+_387499_389834_390382_391495
932275	contig_34_pilon	-	1563	8	Intergenic	novelGene_39993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1417.50364071087	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	237	1292	230337	212049	FALSE	80	GAAAAAAAAAAAGAAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247018	211777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215348_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
932276	contig_5031_pilon	-	2193	2	Intergenic	novelGene_133181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTTCTTCAAACCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24905	22598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_23509_23622
932277	contig_2703_pilon	+	465	1	Intergenic	novelGene_101662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAATGCGAGTGCCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2623	3088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_2600_3100
932278	contig_17130_pilon	+	3148	2	Intergenic	novelGene_176549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAGATTGTTACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21049	24294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17130_pilon_+_24131_24227
932279	contig_15326_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_157703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	318	1822	2139	23888	24205	NA	85	CACCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPVSFNILPIESFDFPTKASTRLSPVQLDGAWLPPLTALTGITTEKDVEQNSNSQKTDQIYWPKGDWRNPESMAPRQPFNSVVKSLPRFTVQPGSGQPHKTKWD	22066	24482	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15326_pilon_+_22100_24500
932280	contig_14142_pilon	+	1933	10	Intergenic	novelGene_120542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATCCTTAGACACTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349396	355493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_+_349685_349799_349876_350135_350221_350384_350522_350609_350750_351183_351291_351640_351806_352763_353633_354023_354071_355474
932281	contig_16633_pilon	-	4821	1	Intergenic	novelGene_165072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1129	87	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	139	420	3748	4167	84529	84110	NA	25	ACCGAAAGGTCAGTGGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGCPCASAQSKGLASKLRGTAQLEGAPKPRKEKENKQIITEQIRANKLTKKPQGSHQRGGTSGKQFHSQAVFCRLSGRSKDGAQSQVFERKEEEVVRGKEEILRSRKKQHQQPTNGTQGAGQWNLSSTGGKLMPPSQ	88276	83455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16633_pilon_-_83500_88300
932282	contig_13145_pilon	+	2024	8	Intergenic	novelGene_116623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1331.37506023675	1	111	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	202	780	37980	48850	TRUE	50	AATTAAGTTTAAATAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKMMKLRWKKMAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKHTESRNGYVKSE	35266	58524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37913_38013_41026_41115_43396_43660_46346_46424_47201_47281_48811_48895_57324
932283	contig_1036_pilon	-	2580	2	Intergenic	novelGene_178582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	789	1298	260441	259932	TRUE	65	AGGAAAGAAAAAAATCACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNRRDPESYVGHN	261229	257152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1036_pilon_-_257461_258957
932284	contig_1275_pilon	-	1634	13	Intergenic	novelGene_108790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	733.209208245202	1	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	232	1353	513735	459431	TRUE	15	GTACGTTTCCTTACTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQITRNKCGSSL	546945	456870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_456973_459251_459465_463449_463537_464410_464584_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495829_505923_506003_513627_513806_546784
932285	contig_2227_pilon	+	2416	1	Intergenic	novelGene_142351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCCCCTAAAGATTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	370191	372607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2227_pilon_+_370200_372600
932286	contig_10324_pilon	+	2036	2	Intergenic	novelGene_7754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3147	junction_1	0	1	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1342	1869	72946	73556	FALSE	20	CTTCTCACCCCCACTTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRWGPGGWGPGWGDPQACLGPDACVSAPPQGCGICHVLHAVPTGHLLPVVSLHRLLGQHCRVSTTRPLAWLGARLAWKWPTVWGQHQNLVGEWILSPHAPGVPNP	71604	73723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_73061_73143
932287	contig_14687_pilon	+	1075	1	Intergenic	novelGene_107971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTAGTTAAAAGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745626	746701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_745600_746700
932288	contig_19352_pilon	-	1556	6	Intergenic	novelGene_122372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	903	junction_5	296.528986778696	1	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	160	702	122805	104000	FALSE	20	TATGTAATTGTGTGTGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLTISSLFSRLFGKKQMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	122964	103145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738
932290	contig_4486_pilon	+	2241	12	Intergenic	novelGene_38598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1291.4977275107	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	380	1143	94	1236	343083	412464	FALSE	30	TGATGTAATAGAGTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	342989	413469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_343093_360535_360643_376092_376194_377340_377476_385369_385488_389958_390052_391120_391206_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
932291	contig_11088_pilon	+	553	2	Intergenic	novelGene_85042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGAGAAGTTTTCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
932292	contig_10973_pilon	+	839	2	Intergenic	novelGene_150354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCGATACGGTTGTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1731_2259
932293	contig_665_pilon	-	690	1	Intergenic	novelGene_158217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGAAGCCATCTGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333026	332336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_665_pilon_-_332300_333000
932294	contig_12312_pilon	-	1409	1	Intergenic	novelGene_63961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	321	344	214932	214909	NA	50	ATAAATAATGCTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGWVHFLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215252	213843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_213800_215300
932295	contig_5643_pilon	+	1018	12	Intergenic	novelGene_38820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	1	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	954	65	1018	233973	237935	FALSE	25	AGCAACAGGGTGGTGGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGY	233610	237935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
932296	contig_11476_pilon	-	1350	1	Intergenic	novelGene_170499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAGAAACAAGCACCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15022	13672	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11476_pilon_-_13700_15000
932297	contig_9653_pilon	-	1166	7	Intergenic	novelGene_48302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	98	junction_6	1028.77188109577	2	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	32	1015	1040020	1006903	FALSE	60	GAAAAACATTATGAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSDASQGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1040051	1006751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595_1016676_1039998
932298	contig_2100_pilon	-	1658	13	Intergenic	novelGene_50689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	836.139687127031	1	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	108	1412	1182812	1170268	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185518	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170143_1170245_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
932299	contig_16496_pilon	-	1448	3	Intergenic	novelGene_5194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1982	4	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_673_759_1354_3413
932300	SIRV6	-	1126	5	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	55	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTGTAAGCGTTTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11824	7231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_7451_7808_7923_10723_10825_11035_11109_11205
932301	contig_17144_pilon	-	2138	11	Intergenic	novelGene_29471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2181.4368292481	2	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	331	1851	179764	166363	FALSE	30	TTAAGAAATTCTTGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183183	166075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166601_172533_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_182079_183158
932303	contig_13244_pilon	-	2409	1	Intergenic	novelGene_87011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	61	186	263	448	497955	497770	NA	40	TGTCCAAAGCAGAGATGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPVHRPRGSHSNRTKNTAWFKIRNGVSQDCILSIYLFNLYAGQIIQEVGLYEEERGIRIRGRLINNLPYADDTTLLAESEGDLKHLLMKVKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINREKIGVIKDFILLGSTINAHGSSSQQAK	498217	495808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_-_495800_498200
932304	contig_854_pilon	+	1482	7	Intergenic	novelGene_36293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2223.48750090183	18	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAACTTCAGGTGCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543619	563795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557162_557533_557752_562271_562405_563029
932305	contig_9121_pilon	+	5839	3	Intergenic	novelGene_134443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	108	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	3669	4244	154524	155099	FALSE	20	TGTAACAATCTTTGTTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIDAKILNKILANRLQHHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSIKVIHHINKREEKNHMIILIDTEKAFNKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGISAKQMANIILKGERLKTFPLKTGTRQGCRLSPLLFNIVLEVLARAVRQEKEIKGIQIGKEEVKLCLFADDMILYTENPKDSERNLLELIDTAE	106803	156694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9121_pilon_+_108358_149760_151322_153970
932307	contig_16103_pilon	+	899	1	Intergenic	novelGene_118879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTAGCCCAGTCGGGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722478	723377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_722500_723400
932309	contig_14683_pilon	+	1793	1	Intergenic	novelGene_166050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCCACTTGTGGTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165351	167144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_+_165400_167100
932310	contig_1964_pilon	-	1175	1	Intergenic	novelGene_130919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTAGGAGTGGGATTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193386	192211	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_-_192200_193400
932311	contig_6102_pilon	+	2218	15	Intergenic	novelGene_31873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	349.554300765523	5	55	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	613	1464	380930	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370781	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_370901_379650_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
932312	contig_19032_pilon	+	1755	10	Intergenic	novelGene_172549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	875	1330	159243	160649	TRUE	60	GAAAAATCAAATGATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWKVFSFYFCFLLCSLLIVFIFWANYNSFSLEACKQAHFSPLGSSRHVCLIQNEISLLTGGDLNKLPKTLWGSLQQCVQFSSICHLLLKTCHHHHFIHNGVRPKNVVFTRIFCCVFSNPGSFSGSWQANHHYNFTIFLLFRPLWSSDSIL	156951	161978	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_+_157295_157737_157810_158174_158360_158694_158949_159222_159393_159618_159749_160163_160284_160593_160862_161306_161416_161874
932313	contig_2755_pilon	-	1875	2	Intergenic	novelGene_158303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCAACAGTTTATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263015	260785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2755_pilon_-_261518_261872
932314	contig_20211_pilon	-	3311	1	Intergenic	novelGene_147668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1965	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	489	2703	3191	40784	40296	NA	35	TACTGTAAAGAAGACCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLTSLSVLCQFLISFGAWLSSLSLHLMLRVSGFPFSLFGLVFQIFAVKGWCGASAYSTMLPGSPLDSFEETRMTHILGLSSVSSCSVSGHAFLAGMSQKWCCALSTSHQELTSSTCPTTDDIYLDHLVMLVPAHFLHGKDPMFPSVVDKYLVQRFSNIIPH	43486	40175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20211_pilon_-_40200_43500
932316	contig_3382_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_124007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGAGACAGCCACTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115828	114844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_114800_115800
932317	contig_7202_pilon	-	1005	3	Intergenic	novelGene_17530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	7	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29884	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
932318	contig_12605_pilon	+	871	5	Intergenic	novelGene_64192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2008.85751112417	110	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	24	461	3897	4991	TRUE	5	GTGTGGGGTCTGAGTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRLHRPERGPAHLDGGGHGCSDHPAQVGEGPGGRE	3873	6245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4888_5072_5795_6005_6124
932319	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	605	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
932320	contig_6065_pilon	-	1499	1	Intergenic	novelGene_132693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCCCAGCATAGTAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	480647	479148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6065_pilon_-_479100_480600
932321	contig_13417_pilon	+	2989	2	Intergenic	novelGene_179209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	2209	2709	58718	59289	FALSE	35	AGGTATAGAACCTTCTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKNKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSKNNISCKTLVQI	56509	59569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13417_pilon_+_59178_59248
932322	contig_6102_pilon	+	1474	9	Intergenic	novelGene_31915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	366.757327806821	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	32	99	407	505	393738	393836	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPAAGPFDKMGGTPLIPMYHCCYCQTRTKAPRGRPHRRRGP	375516	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378999_393716_393856_393929_394036_394221_394272_394467
932323	contig_3602_pilon	+	1664	1	Intergenic	novelGene_60685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTTTTTAAGTCCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1258447	1260111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_1258400_1260100
932324	contig_252_pilon	-	1081	1	Intergenic	novelGene_99919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCTTCTGACTTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	178043	176962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_252_pilon_-_177000_178000
932325	contig_12425_pilon	-	1929	10	Intergenic	novelGene_46670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	779.571677268999	3	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	25	825	211174	204941	TRUE	10	TTTGCTTTCTGGTAGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWQLLATFCCLVVLISAQSRLYFNPLSDELVNHVNKHNTTWQAGHNFYNVDMSYVKRLCGTLLNGPKLPQRVHFAKEMDLPENFDARENWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLECTSM	211198	203272	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_203652_203708_204323_204829_204959_206565_206670_207180_207328_207651_207738_208645_208765_209381_209497_210302_210389_211048
932326	scaffold_4438_pilon	-	2617	1	Intergenic	novelGene_174552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2190	2498	422904	422596	NA	5	TTCCTGTACTCCGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAVFKRKEGEEVTGTEETKRGQKKATQQQRNGSDEASQCGQGESVWHGTSTSHATVVACREPVDWPIGKPGISPLGNWELAHQEAVNLSSRKLGLDPPGR	425093	422476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_422500_425100
932327	contig_11548_pilon	+	2214	12	Intergenic	novelGene_66749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1091.83244256829	2	76	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	1047	1379	118990	119638	FALSE	30	GGAAACCATTACGCTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63702	120473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63881_84701_84810_86979_87080_96086_96226_102002_102178_102442_102480_102535_102575_112803_112884_117679_117856_118975_119121_119346_119402_119491
932328	contig_91_pilon	+	4808	31	Intergenic	novelGene_127120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCATCGCATGAAGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	674704	773735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_91_pilon_+_675917_677827_677966_678080_678181_679764_679958_683470_683680_687698_687847_689416_689532_691101_691224_700334_700442_702214_702294_703347_703408_706816_707031_707149_707262_710646_710841_710976_711102_717754_717871_726372_726441_729178_729231_731184_731248_736671_736787_738666_738805_746746_746864_750342_750457_750696_750874_755410_755528_756395_756482_756889_757037_771351_771423_772280_772409_773298_773371_773636
932329	contig_19342_pilon	+	1905	3	Intergenic	novelGene_41123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	17	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	765	1136	5070	6001	FALSE	15	CCTTCCAGAATCCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSK	4305	6770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5293_5413_5522_5960
932330	contig_5744_pilon	-	587	1	Intergenic	novelGene_149349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTGTCATCTCTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	688433	687846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5744_pilon_-_687800_688400
932331	contig_16846_pilon	-	1680	1	Intergenic	novelGene_82900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGACCCACTTGCAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	438432	436752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16846_pilon_-_436800_438400
932332	contig_9720_pilon	-	1110	2	Intergenic	novelGene_116791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTAACAGACCTCACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	393998	391775	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9720_pilon_-_392091_393203
932333	contig_14720_pilon	-	874	1	Intergenic	novelGene_164997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCACTGTCTTAGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231018	230144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14720_pilon_-_230100_231000
932334	contig_6981_pilon	-	4031	10	Intergenic	novelGene_177316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	47.2957597347679	71	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	467	1105	146398	135849	FALSE	35	AAGAACTAGATGGTGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCRTGGPGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGWNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAMKGLNGGRINVASCSLGAAHASVVLTRDHLNVRKQFGKPLASNQYLQFKLADMATRLVAARLMVRHAAVALQEEREDAVALCSMAKLFATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRMLISRSLIHE	148849	132922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6981_pilon_-_135902_138228_138332_138926_139080_139407_139506_139602_139739_146302_146441_146842_146920_147329_147405_148020_148192_148748
932335	contig_17440_pilon	+	962	1	Intergenic	novelGene_7599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGTCTGACAAAAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3052	4014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_3100_4000
932336	contig_10793_pilon	-	1105	10	Intergenic	novelGene_83436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGCAAGCTGAAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	167268	159134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_-_159256_159553_159642_160425_160555_161398_161472_162548_162685_163137_163298_163939_164078_165311_165372_166399_166473_167141
932337	contig_17144_pilon	-	770	5	Intergenic	novelGene_29358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2022.0692990103	2	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	126	446	172541	168280	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYPPPMLQSCI	172666	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166323_168209_168310_169009_169099_170744_170934_172528
932339	contig_17198_pilon	-	1370	1	Intergenic	novelGene_62332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGGAACCTCATACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	493146	491776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17198_pilon_-_491800_493100
932340	contig_14970_pilon	+	2369	11	Intergenic	novelGene_44989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5899.51683106337	1	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	126	590	136145	191822	TRUE	15	TCTGCCACCTTAACTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISKCGSLLP	136019	232238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191800_192205_210762_210849_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
932341	contig_20058_pilon	-	2611	8	Intergenic	novelGene_109284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	85	junction_4	687.678882108473	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	409	1230	1233	2462	40533	30516	FALSE	50	GAAAAATGGCAGGTAAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGEGKAGPPGGSSRAAFPQGGRGRGRFPGAVPGGDRFPGPAGPGGPPPPFPGNLIKHLVKGTRPLFLETRIPWHMGHSIEEIPIFGLKAGQTPPRPPLGPPGPPGPPGPPPPGQVLPPPLAGPPNRGDRPPPPVLFPGQPFGQPPLGPLPPGPPPPVPGYGPPPGPPPPQQGPPPPPGPFPPRPPGPLGPPLTLAPPPHLPGPPPGAPPPAPHVNPAFFPPPTNSGMPTSDSRGPPPTDPYGRPPPYDRGDYGPPGREMDTARTPLSEAEFEEIMNRNRAISSSAISRAVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIKQSKVSADDRCKVLISSLQDCLHGIESKSYGSGSRRERSRERDHSRSREKSRRHKSRSRDRHDDYYRERSRERERHRDRDRDRDRERDREREYRHR	49597	30366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20058_pilon_-_30703_32764_32919_33550_33667_39197_39703_40135_40247_40376_41605_45576_45681_49540
932342	contig_17144_pilon	-	3967	15	Intergenic	novelGene_29322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2029.85581698679	1	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	2020	3672	173384	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEVRSLQGEGSGNPCPYVQETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183240	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166864_167218_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
932343	contig_6445_pilon	-	959	9	Intergenic	novelGene_76924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	707.338806725603	2	24	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	318	731	64152	43105	FALSE	20	GATACATTAGCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96342	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64174_85405_85477_88146_88216_88473_88594_96306
932344	contig_8576_pilon	+	5544	3	Intergenic	novelGene_88720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	763	1275	524080	524592	TRUE	15	TGGACCACTAGGGCCCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRFIHLVRRFPDSSLFFIILQYSIVCMYHSLFIHSSVDGHLGCFHLFAIVNNAAMNIGVNMSICVMALISLGYIPRSGIPGSYGISISSLLRKCHIVFQNGCNILHSHLQCIRVPISPQPLQHLLFSVFFFFICASNAGVRQYLTEVLICISLMVSDREHFLMCLLAA	523317	631231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_+_524989_624506_628254_631105
932345	contig_11496_pilon	-	3665	2	Intergenic	novelGene_172131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAAAATACTAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201487	197452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11496_pilon_-_198681_199050
932346	contig_17144_pilon	-	2272	15	Intergenic	novelGene_29485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1743.03842733993	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	58	2073	179764	166277	FALSE	30	TCTTAAGAAATTCTTGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLWLPGTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	181830	166077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
932347	contig_7396_pilon	-	1616	8	Intergenic	novelGene_79587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1989.01562157192	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	97	294	266	559	248986	248261	TRUE	30	GAAAGTCCATTGTTTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMC	250301	245748	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248267_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240
932348	contig_14353_pilon	-	1553	9	Intergenic	novelGene_82111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	505.380549685086	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	457	951	83931	80452	FALSE	35	AGACATGGAATTGTGTAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNTPGQMFPNPGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104409	79849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86357_87214_87438_104333
932349	contig_20527_pilon	+	1982	4	Intergenic	novelGene_138618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1500.96998267417	25	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAATAATGACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24902	28938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25023_25436_25592_26268_26346_27308
932351	contig_2100_pilon	-	1758	12	Intergenic	novelGene_50718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	13	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	108	1412	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185518	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
932352	contig_11639_pilon	-	2881	1	Intergenic	novelGene_151150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAATCAACTCATTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17790	14909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_-_14900_17800
932353	contig_12923_pilon	+	1500	3	Intergenic	novelGene_30163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACGTAAAGAACGTCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297024	338572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_298162_337691_337868_338385
932354	contig_5125_pilon	+	2287	8	Intergenic	novelGene_43444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1542.87632263211	3	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	129	1262	35654	58893	TRUE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	26416	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449_59086_59157
932355	contig_3956_pilon	+	2012	8	Intergenic	novelGene_15267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_1	549.273731988943	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	63	1493	1286220	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1286157	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932356	contig_18759_pilon	+	2889	1	Intergenic	novelGene_179210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTATCTGATTCAATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12941	15830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18759_pilon_+_12900_15800
932357	contig_15070_pilon	-	1310	1	Intergenic	novelGene_164892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATGTAGAAAAAGTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425292	423982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_-_424000_425300
932358	contig_17144_pilon	-	1416	7	Intergenic	novelGene_29194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	89	junction_2	1605.54525179316	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	39	1121	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170822	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744
932359	contig_5623_pilon	-	3871	5	Intergenic	novelGene_154805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_2	221.197310110227	1	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	1016	1792	210277	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211292	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041
932360	scaffold_12124_pilon	+	1546	5	Intergenic	novelGene_22077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	464.221391148663	2	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAACTGGCGTCTTCTAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	852018	858977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_852462_854703_854804_857165_857236_857793_858108_858358
932361	contig_854_pilon	+	920	1	Intergenic	novelGene_36739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCCAAGTCTTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715091	1716011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715100_1716000
932363	contig_15047_pilon	+	1748	7	Intergenic	novelGene_52224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2821.15358595656	6	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	11	346	2194	2833	TRUE	30	CCGGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGE	2183	21646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_3080_3212_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21062_21232
932364	contig_10038_pilon	+	1558	1	Intergenic	novelGene_160330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGGAAAAAAGTCCTGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187573	189131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10038_pilon_+_187600_189100
932365	contig_12969_pilon	+	1498	1	Intergenic	novelGene_61656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATATACACAGTCTTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	142734	144232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_142700_144200
932366	contig_1406_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_25612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGATTGGTCCAGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2215849	2216848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2215800_2216800
932367	contig_2733_pilon	-	773	1	Intergenic	novelGene_128535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATTGCCACTCCTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	223785	223012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_223000_223800
932368	contig_5050_pilon	+	1429	1	Intergenic	novelGene_110299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGATTTATTCTGATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	694612	696041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_+_694600_696000
932369	contig_9392_pilon	-	1896	2	Intergenic	novelGene_178292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	567	1330	1896	148522	147956	FALSE	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTKKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEKEATLPNSFYEASITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHH	174962	147955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9392_pilon_-_149196_174306
932370	contig_19459_pilon	-	830	8	Intergenic	novelGene_59896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6899	junction_7	6093.85228851879	7	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	759	72	830	16240	7030	FALSE	30	GGCAGAATAGTGAGAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQLAQFRSLLSNVEGENAVPIQHNNRPPQPLK	19035	7029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7789_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16265_18988
932371	contig_14288_pilon	-	1817	1	Intergenic	novelGene_153820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	124	375	824	1198	284288	283914	NA	75	TACAATTAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCVSIWLGHDSWYCGDFPICCKFCLYDVNEGGWVAVVLVKQDLIYKILCPEQSLEIQKREVSRERGGPHTTQKAVPGAEPVLWTQGPCTEKLLVRGNIDEKANRERKPSPGADTQNLEFYPTLL	285111	283294	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14288_pilon_-_283300_285100
932372	contig_13021_pilon	-	1958	9	Intergenic	novelGene_8235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	518.828593443923	3	104	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	158	928	236063	212121	TRUE	40	CTTACTAGATGAAATATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQYWTMRGQKCPSPRLSSQTTVVTKGQNVSLICSIEKKSPTIMYAFYRGDKYLRTKDNGESNIFNLRISEARDLGPYKCKVQDSISSAYRCSKYSPDFNFTLLVLNISVIQTEAGLYITLRCISPNGLLPINYTFFEKNVAISPAISKDVREPAEFNFTQKSTQGDEEYRCKAKNRLLNNAKYSQHTLIPLTDGDGCALCLQVLLPGLLLVLIVIAVILACWILPKYKARKSMRDNVSRDYGDTPMEAVEYANFYR	236220	205441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_206260_210465_210559_211873_211940_212067_212125_213088_213168_215157_215269_218018_218286_231599_231882_236035
932373	contig_6885_pilon	+	3271	1	Intergenic	novelGene_83677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1	396	210494	210889	NA	15	CTCTTTTCCATTAAGGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQQTDAMLEVLNHLCQEIWKRATWPTNWKISIFMPILKKGDPTECGNYQIIPLISHKSKILFKIIQKWLQQYIDRKLPEIQARFRRGHETSDIIADVRWFLAKSRKYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDHNKL	210493	213764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6885_pilon_+_210500_213800
932374	contig_14871_pilon	+	1362	2	Intergenic	novelGene_63706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGAAAGAGTTAACATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197549	199331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_198625_199044
932375	contig_8712_pilon	+	2115	4	Intergenic	novelGene_58800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	660.981761388988	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	203	670	314974	321821	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSASSPSAWTPCRMWTTTVPTAKLSWAPTSVCRTRPTWRRP	308582	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_308779_314967_315188_318064_318197_321699
932376	contig_5062_pilon	+	2411	7	Intergenic	novelGene_157859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	420	junction_5	98.0028344261305	3	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	226	681	67	747	723798	741875	TRUE	80	AAAAAAAAAAAAGGAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERDGCSEQESQPCAFIGIGNSDQEMQQLNLEGKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFYIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLKDTERMYLCLSQERIIQFQVSS	723731	744072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5062_pilon_+_723900_733904_734080_739284_739423_739579_739693_741722_743066_743422_743527_743702
932377	contig_5489_pilon	-	2116	1	Intergenic	novelGene_177633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	644	991	43783	43436	NA	40	AATTGACATAAGTTGTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFEKNSLLSGLNQDHLAFISSVVTAKSTQVRFEAPSPQRWKLGTVSSNVQPEPLLLRVELWTCSLEMRTLGLFPFVHTDNVFSLGSKNKAGVCVCIKKLILKLTDTFCALNFQG	44426	42310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5489_pilon_-_42300_44400
932379	contig_11088_pilon	+	1678	3	Intergenic	novelGene_85036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	83.5	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	1053	1481	17314	17742	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPVTVEWSEKFSDLISSSLTKNGDFAYPWMSGFSSSHTMFSFAPCSPLLQHRSLRVALWYFLQIPIPPGKQLGLAGSNEVVPVLNLMISQDMVILLPLGTCVGLGFCFRCCCSELYRCSS	14159	17939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_16250_16336_17123
932380	contig_8571_pilon	-	2525	1	Intergenic	novelGene_169188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	221	12	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	342	641	501263	500964	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAATCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKTRYKRLMDHNYHSLHQTESSTTRWCSATTTDCSDRNQNRGSWGTSYHQESRARSRAHPLDRGPCADKLLVRGNTEEKKADRDKKPSPGADALNLDF	501604	499079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8571_pilon_-_499100_501600
932382	contig_18395_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_177565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCATTCAGTAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36724	38654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18395_pilon_+_36700_38700
932383	contig_1964_pilon	+	1714	1	Intergenic	novelGene_130918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1259	1624	193310	193675	NA	25	GCTTAAACTGTTTGAGTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNFPKNRFPNEYKLLQADFYQTALPQRSNNLFNTRLYCTEHTRYTLFNSHYNPAKLVLYSYFTIKEILANFPTLLDRATKWQRTQSCQAPYSFPYCCCCWLPSSQFRLMGIPYEESRTVS	192051	193765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1964_pilon_+_192100_193800
932384	contig_7410_pilon	-	2640	1	Intergenic	novelGene_106067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	50	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	1443	1790	318499	318152	NA	65	AAAAATCCACAAACAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFRKIMQEHNAEINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSITEGLRRRFEMMEDRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKRNEETLRIMWATIKSKNFRVIGVPERGENRKHREDH	319941	317301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7410_pilon_-_317300_319900
932385	contig_3956_pilon	+	1120	5	Intergenic	novelGene_15266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1128.47693263974	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	7	870	1286130	1290761	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQLPSYLYPRGLGASSTRPVCALPFTLCPLSVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQGECRPAGATPPPGVTGPKCWVLRTPAVCRDLFGWWGWDT	1286123	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287880_1288156_1290721
932386	contig_5602_pilon	-	1453	1	Intergenic	novelGene_133002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	289	870	280	1149	292259	291390	NA	65	CAAAAAAGAAGAAAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERKARRYQVMVDCFKLRKIRVKFMVTTKKVNKHTHKKKRKNKVSAKPKPTKTKEMKKKNTQAKVTQHRRVRRTKKLSAPQKKHYKMTATNSHLSIITLNVNGLNAPMKRRRVTEWIRRQDPSICCLQETHLRNKYLNLLKVKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKEKEGHYIMIKGMIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTVIVGDFNTPFSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLVDIYRTLHPTAAKYTFFSKAHECSPE	292538	291085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5602_pilon_-_291100_292500
932387	contig_9706_pilon	+	951	1	Intergenic	novelGene_20813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAATATGTCTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1783	2734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1800_2700
932388	contig_14970_pilon	+	1255	6	Intergenic	novelGene_45048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7072.17178524391	4	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	188808	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_188830_191970_192122_192177_192205_216613_216674_224281_224375_231345
932389	contig_8377_pilon	+	4591	28	Intergenic	novelGene_34936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2712.7551896168	3	135	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1083	3252	83	3334	68257	197939	FALSE	35	TTAAGAATAATGGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68093	199196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
932390	contig_3095_pilon	+	895	5	Intergenic	novelGene_75012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	103	828	147280	151151	TRUE	35	AGTCAGCAATACTCCAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	151904	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932391	contig_10176_pilon	-	1748	10	Intergenic	novelGene_72722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	299.345582525912	4	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	75	920	274981	264352	TRUE	30	TACATGCTCATCCACTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMLATGAQDGKIKVWKIQSGQCLRRFERAHSKGVTCLSFSKDSSQILSASFDQTIRIHGLKSGKTLKEFRGHSSFVNEATFTQDGHYIISASSDGTVDLEHEDHRMFKYL	275055	260622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_262995_263149_264220_264397_267074_267196_267804_267933_268559_268677_270329_270441_271918_272048_273752_273864_274897
932392	contig_7009_pilon	-	2583	2	Intergenic	novelGene_23673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	1985	2332	537881	537464	FALSE	70	AAAAAAAAAACAACCTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNTESKESKGLQTLPFCPRQPETQLFPNNLFSYAESDLKQCFLLKRAAFSPRLMGSDAVASAPFPGQPSQPGTSQGVSLPACSPAVLALCSATHFVLRSLLMDTWNAHRVRESCA	539865	537212	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_537801_537870
932393	contig_13592_pilon	-	1575	1	Intergenic	novelGene_33686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGCCTTTTGCACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216566	214991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13592_pilon_-_215000_216600
932394	contig_12624_pilon	-	1275	1	Intergenic	novelGene_61115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTACTTTTCTAATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	948758	947483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_947500_948800
932395	contig_7138_pilon	+	1008	1	Intergenic	novelGene_120990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACCTTTCTATGCTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204806	205814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7138_pilon_+_204800_205800
932396	contig_1275_pilon	-	1801	17	Intergenic	novelGene_108789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_16	604.133108263403	2	73	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1590	210	1799	513735	448471	FALSE	75	AGCAGAAAAAACAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTGVPARRMMKNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQQIARPSQEEKVEEKEED	546954	448468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470238_470266_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777_546817_546854
932397	contig_7093_pilon	+	2282	1	Intergenic	novelGene_157973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	28	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTGGATCACTTTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	84549	86831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_+_84500_86800
932398	contig_7446_pilon	-	1289	1	Intergenic	novelGene_101960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCACATTCCCCCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	243436	242147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7446_pilon_-_242100_243400
932400	contig_7157_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_131285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	29	343	837077	837391	NA	35	AAGAGTGCATAGATTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSSSQSVEMDPVLVFPLLHLCHQLLTWHDHSPTLATQSWAIAHKLDRHCLSDQLPVQLFSDPSHPELDQSSHIRRMSFRLPDRQMPAPAGSHCPSGFVNSQRVYHSTDTTLL	837048	839109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7157_pilon_+_837000_839100
932401	contig_19186_pilon	+	2085	1	Intergenic	novelGene_176047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTGTGATATCAATAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47243	49328	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19186_pilon_+_47200_49300
932402	contig_10042_pilon	+	1993	12	Intergenic	novelGene_79210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	113	junction_2	59.410881937251	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	23	988	1054190	1090129	FALSE	15	GGTATATTCTTTTTCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMASKGGTIKAASGFNAAEDAASLRKAMKGLGTDEDGIINILAYRNTAQRQEIRTAYKSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRSAEEIQRISQIYKQQYGRSLEDDICSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDNLMKQDAQDLYEAGEKKWGTDETKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLAIVKCMRNKPAYFAERLYKSMKGLGTDDDTLIRVMVSRAEIDMLDIRANFKRLYGKSLYSFIKDDTSGDYRKVLLILCGGDD	1054167	1091134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_1054199_1059991_1060080_1062014_1062110_1066550_1066665_1067526_1067618_1069287_1069368_1072059_1072117_1076257_1076352_1082122_1082219_1082808_1082868_1084870_1084994_1090069
932403	contig_20819_pilon	-	2151	2	Intergenic	novelGene_55648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAAAATAAATACTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43375	35426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_37316_43113
932404	contig_5302_pilon	-	1854	1	Intergenic	novelGene_81520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	187	576	1435297	1434908	NA	60	GATAGGAAAGAAAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLEVVRNEMECLKIDILGISELKWTDIGHFELNSHMIYYAGNDKSKRNGITFIVKKDISRSVLKYNTVSDKIISGAHKEDQLIRLLCKFMHQPLMPKVKKLKIFSSSFFFNCTLDEGLQNRLASH	1435483	1433629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_1433600_1435500
932405	contig_4604_pilon	+	2267	1	Intergenic	novelGene_19192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGCTTTTAAGACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	527250	529517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_527200_529500
932406	contig_5346_pilon	-	896	1	Intergenic	novelGene_161865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGATAATTCGAGACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474040	473144	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5346_pilon_-_473100_474000
932407	contig_13571_pilon	+	1809	1	Intergenic	novelGene_128118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTCGCTATAGCGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219500	221309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_219500_221300
932408	contig_12638_pilon	+	1744	14	Intergenic	novelGene_33095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.254613760085	1	38	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	471	1592	182987	199604	FALSE	20	AATGCAGTGTGCTCATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170787	199756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171090_180801_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
932409	contig_8617_pilon	-	1037	1	Intergenic	novelGene_73386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATAGGGATTTAGGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61821	60784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8617_pilon_-_60800_61800
932410	contig_3410_pilon	-	3178	10	Intergenic	novelGene_58909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	496.495744887464	1	120	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	915	1454	29768	15414	FALSE	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRRKKKPSCLRGEAKVPHLPADKARNVLGPEQQHLLTTAPSSSSSSLESSASAAFRRVPAKNQPEAPGTEKASGAGGAPASCASSEPSPGSCGTQVNVTCIVNVCSSSDHGSQCPSQASSMTGDMDASPSGSPKDEQVPFSKEECPFQSQPGSPETLQQNSEEKPLPLGVQDAGMKLC	57775	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15695_19446_19655_29162_29198_29752_29854_30424_30472_30868_30963_31468_31619_32120_32250_34217_34324_57472
932411	contig_14441_pilon	+	1153	6	Intergenic	novelGene_100386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	462.935848687483	2	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	565	1113	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	46983	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47160_67434_67634_121198_121239_125517_125902_126159_126283_126514
932412	contig_3747_pilon	+	2320	6	Intergenic	novelGene_24920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	2	61	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	185	925	202422	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202237	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
932414	contig_14577_pilon	+	1946	1	Intergenic	novelGene_164622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	48	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAGGATCACAACAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5793	7739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14577_pilon_+_5800_7700
932415	contig_12125_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_76209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTCCCCAGATGATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136146	138857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_136100_138900
932416	contig_7357_pilon	-	2345	9	Intergenic	novelGene_36818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1353	junction_8	1890.6231115693	4	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	223	1473	166824	136424	FALSE	5	TTTCTTTGTTTTTCTGGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167046	135551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
932417	contig_7057_pilon	+	488	6	Intergenic	novelGene_123345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	765.312380665569	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	486	1	486	938907	943716	FALSE	5	GTGGCATCTGCCTCCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGISPVPAPCHACSSYPPGSRTPRSTSHVPSAFVPALLSARQAQEEIKAPHCCS	938906	943718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941466_943558
932418	contig_6102_pilon	+	3827	27	Intergenic	novelGene_31833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	549.537007922963	2	129	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	96	1580	370803	375983	TRUE	15	AACCAGCTGTGGCTCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPVRE	370707	395259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375734_375975_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380047_380287_380398_393061_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
932419	contig_8676_pilon	-	1235	1	Intergenic	novelGene_142215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAAGGAAAAATTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	483009	481774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8676_pilon_-_481800_483000
932420	contig_9235_pilon	-	2709	3	Intergenic	novelGene_156207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1348	1686	46974	46636	TRUE	15	GACGGCGTCGAGCTCTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDVTGLHLAAHI	48321	43961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_44039_45643_46145_46190
932421	contig_16775_pilon	+	2565	17	Intergenic	novelGene_107754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	248.251062120084	1	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	420	1826	134135	174136	FALSE	50	TGAGGATCTTTAATAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDIGSNNCGYYDLQAVLTHQGRSSSSGHYVSWVKRKQDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130233	174875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_133849_133936_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173216_173325_173984
932422	contig_10801_pilon	+	2092	1	Intergenic	novelGene_74046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCATTTAAGTGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280400	282492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_280400_282500
932423	contig_11720_pilon	+	1481	10	Intergenic	novelGene_43850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2730.38166282506	6	20	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	435	1076	78465	98361	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYEEEATGN	70870	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_71214_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95390_98337
932425	contig_17144_pilon	-	1520	6	Intergenic	novelGene_29173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2810.97686934631	17	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	101	541	179764	166277	FALSE	40	TACACCGAGGCCCAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQSVS	183208	165297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166290_174933_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
932427	contig_3018_pilon	-	1748	12	Intergenic	novelGene_78848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	457.375986895278	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	610	1251	583440	570057	TRUE	30	ACTCTGGACTGTGAAGGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVEFRAIYKRIRKF	625103	562874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570093_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585131_624768
932430	scaffold_12124_pilon	+	855	1	Intergenic	novelGene_22408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	216	651	33	683	1508755	1509405	NA	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508722	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508700_1509600
932431	contig_1717_pilon	+	2865	1	Intergenic	novelGene_146121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	489	821	211769	212101	NA	25	GTGCACCTTAGTCCTCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIDVQGLIRVSLIRKSVGLKDGRSRYSLVTRNTSFTCGEVKEDLFRVSDEQSSCFLAPPSPVNWNMDGGDGVTEAGPSLKSHSTLLLCLEPFLAILRVMLTKGNGNHFK	211280	214145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1717_pilon_+_211300_214100
932432	contig_8980_pilon	+	1376	1	Intergenic	novelGene_73998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	452	1030	110803	111381	NA	75	AGAAATAGAAAAGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSCKHPLIIKMQTVQSMILGKLETVKNEMECININILGIRELKWTGTGHFKSDDHTVYSARNDKLKRNDVAFIVKKNISRSILKYNAVSDRIISIHLQGRPVNTTVIQIYSPTSKAKDEETEHFYQLLQSEIDRTRNQDALIITGDWKVGKKEGSVVGKHGLGDRNNAGERMMEFCKTNDFVIANTFFP	110351	111727	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8980_pilon_+_110400_111700
932433	contig_9406_pilon	-	2277	9	Intergenic	novelGene_136146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	427.234255853858	2	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	1	1179	57798	34784	FALSE	15	TAGCACGGTGGGTGACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHTTFEHDIQALGTQVRQLQEDAARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKALLDACEGRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLWMEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASEEIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIGQSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPSTKVSEEAESQQQWDTSKGEQISQNGLPAEQGSPRMAETADTGEMVNGAAEQRTSSKESSPIPSPTSNRKAKISSDKHEVSASTQSTPASSRAQTLPASVVTITSESSPGKREKDKEKDKEKRFSLFGKKK	57798	33685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9406_pilon_-_34963_39049_39162_43998_44063_44737_44851_45934_46132_48558_48644_49440_49580_51141_51387_57753
932434	contig_11455_pilon	+	1900	2	Intergenic	novelGene_179211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	1202	1627	381660	382085	FALSE	15	TTCCTCTTCTATGTTCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRDSLTSSLPIWMLFISFSCLTALARTPSTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSVSPLRTMLTIGFAKMPFIMLRNFPSIPILFRVFIRDGCWTLSNAFSASIEMLM	379828	382358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11455_pilon_+_380056_380685
932435	contig_3956_pilon	+	814	5	Intergenic	novelGene_14819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1961.30356842076	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	85	567	1281682	1290665	FALSE	45	GGACAGAAACTAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281597	1290912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282897_1284739_1284864_1285066_1285101_1290542
932436	contig_11594_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_80912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACTGAAGAAAAAATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300875	303122	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_+_300900_303100
932437	contig_14513_pilon	-	1189	2	Intergenic	novelGene_70367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	54	165	175	339	18880	12143	FALSE	20	CATTAGAACTCTGCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCIGN	19054	11292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_18725
932438	contig_5302_pilon	-	2920	9	Intergenic	novelGene_81417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_5	701.977908751408	1	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	322	1173	209238	177300	FALSE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209559	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
932439	contig_2078_pilon	+	1763	7	Intergenic	novelGene_100128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	115.316472756016	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	13	906	266397	308891	TRUE	35	GCAAAATACTTATTCACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSGSMDSLLTRWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGSPASGAQLSSGPPGPSHRGQC	266384	311799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286268_306345_306646_308290_308406_308827_308962_310937_311110_311184
932440	contig_6129_pilon	+	767	2	Intergenic	novelGene_159964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45713	46903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6129_pilon_+_45795_46217
932441	contig_15629_pilon	-	3564	4	Intergenic	novelGene_122487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	1952	2386	493412	492978	FALSE	30	AAAATTTCGGGAATGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEGLWGDGNSYVLLVGMQNMQPFWKMIWRFLRKLEIVIPFDPAIPLLGIYPREIRAITRIDRCTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	607725	491799	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15629_pilon_-_493549_493589_493934_494058_494612_606807
932442	contig_13244_pilon	+	2210	4	Intergenic	novelGene_86927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	253.958439294482	2	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	16	327	239761	250915	TRUE	20	TCAATAGTGTTCTTACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAAGKMADGKAGEEKPENPQRAGAAGGPEEEAEKPVKTKTVSSSNGGESSSRSAEKRSAEEEAGDFPTKPTKISKFGFAIGSQTTKKASAISIKLGSMNQRKCLQKQR	239745	254405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13244_pilon_+_239825_245131_245345_250880_250935_252541
932444	contig_5643_pilon	+	1167	11	Intergenic	novelGene_38845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	1857.4266095865	4	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	53	955	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233622	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237261_237550_237635_237720_237819_237913
932445	contig_5020_pilon	+	998	6	Intergenic	novelGene_27848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1057.81956873561	424	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	381	683	124540	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119578_124319_124363_124444_124547_124909_125091_125657
932446	contig_4426_pilon	-	1784	6	Intergenic	novelGene_15435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	752.773166365539	2	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	571	1713	71	1783	904546	820925	FALSE	70	AACATAAAGAAAGGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASYSKTPKIDRSDVGKEIKEKSSMKRKLPFTISPSRNEERDSDTGPEKKKTKKEAGSKKPAPAGILFGYPLSERKQMALLMQMTARDNSPDSTPNHPSQTTPTQKKTPSSSSRQKDKVNKRNERGETPLHMAAIRGDVKQVKELISLGANVNVKDFAGWTPLHEACNVGYYDVAKILIAAGADVNTQGLDDDTPLHDSASSGHRDIVKLLLRHGGNPFQANKHGERPVDVAETEELELLLKREVPLSDDDDSYTDSEEARSVNPSSVDENIDSETEKDSLICESKQIIPNKAPLPSALDEYEFKDDDDEEINKMIDDRHILRKELRKENESEIEKNNLFAKQEKAFYPKSFKNKKQKSSRVLYSSSESSDEEVLQNKKVSTPCSVPESSNSDIQTKKEYVVSNEHKQKGKVKRKLKNQNKNKENQELKQEKEGKENTRVTNLTVNTALDCSEKTREEGNFRKSFSPKDDTSLHLFHISTGKSPKHSCGLSEKQSTPLKQEHTKTCLSPGSSEMSLQSDLVRYDNTESEFLPEGSSVKSCKHKEKSKHQKDFHLEFGEKSNTKIKEEDHSPTFENSDCTLKKMDKEGKTLKKHKL	904616	820923	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4426_pilon_-_821944_868806_868955_881692_881836_887176_887378_889991_890130_904482
932447	contig_11386_pilon	+	2608	1	Intergenic	novelGene_82797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATTCCATAAAGATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78694	81302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11386_pilon_+_78700_81300
932448	contig_8045_pilon	+	1580	8	Intergenic	novelGene_35450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	94.9751847288844	2	82	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	488	1464	115	1578	452026	460882	FALSE	25	AGTCCTAATATTTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSRLAIVTKYITKGWKEVHELYKEKALSVETEKLLKYLEAVEKVKRTKDELEVIHLIEEHRLVREHLLTNHLKSKEVWKALLQEMPLTALLRNLGKMTANSVLEPGNSEVSSVCEKLCNEKLLKKARIHPFHVLLALETYKTGHGLRGKLKWQPDNEILKALDDAFYKTFKTVKPTGKRFLLAVDVSASMNQRVLGSILNASTVAAAMCMVVTRTEKDSYVVAFSDEMVPCPVTADMTLQEVLMAMNQIPAGGTDCSLPMIWAQKTNTAADVFIVFTDNETFAGSVHPAVALREYRKVK	435023	460884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452600_457235_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460729
932449	contig_10511_pilon	+	2165	4	Intergenic	novelGene_126910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACGGCGTGGTGCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606824	652656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10511_pilon_+_607525_650243_651230_651382_651735_652529
932450	contig_12678_pilon	+	1937	1	Intergenic	novelGene_179212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTCTGATGTCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45908	47845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12678_pilon_+_45900_47800
932452	contig_15666_pilon	+	1608	6	Intergenic	novelGene_70179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGAGACTCTGTGAGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107154	110617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108086_108198_108579_108859_109098_109137_109947_110246_110558
932453	contig_17144_pilon	-	1410	10	Intergenic	novelGene_29365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2480.27030088095	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	38	682	179764	167672	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVTEQVSTQVGAMAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQELCPPWPGACQLVSCSPHGHQPGRGHQQYRPHPDDLGPG	181810	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166286_166503_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168033_174718_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
932454	contig_6576_pilon	-	2342	3	Intergenic	novelGene_42385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	76	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATATGTACAGCTAGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304281	1286438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1286579_1301204_1302644_1303518
932455	contig_10135_pilon	+	2501	6	Intergenic	novelGene_106642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	90	junction_4	72.7488831529392	7	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	1466	1912	112384	113630	TRUE	10	CAGCTGTTCAGTTTTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWKNRTVDIGVVTLEDALNYGFRCEE	110918	114678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10135_pilon_+_112466_112698_112812_113079_113155_113343_113422_113531_114015_114473
932456	contig_9177_pilon	-	1371	8	Intergenic	novelGene_32539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1034.19543804913	3	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	136	930	4646	2152	FALSE	10	CCTCTGCCGGCTTCATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKKAAAFEDQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH	6550	1710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2278_2382_2458_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472
932458	contig_5125_pilon	-	890	1	Intergenic	novelGene_43463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCACTTCCATTTCCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59643	58753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_58800_59600
932459	contig_9538_pilon	+	505	1	Intergenic	novelGene_176453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTAGCGTCCGCGGGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	28128	28633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_28100_28600
932460	contig_12402_pilon	+	2969	2	Intergenic	novelGene_133389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1779	2177	652161	652559	FALSE	20	TTGCACTGGGAAAGTCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNIGKNGNSRTLYCSHEEPVMDQDAVVHTEQGDTVWFKVKKGVCQGCIFSPNLFSLYAEQIIRKAGLYEGEWGIRIGGRLINNLHYADDASFLSENEEDSKHLTDEDQRPQTLVWITVQHKENKNPHNWAK	650170	653351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_650912_651123
932461	contig_14441_pilon	+	756	4	Intergenic	novelGene_100762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	505.486124658454	6	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	195	716	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPQYFGEGTRLTVLDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	121645	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121691_125517_125902_126186_126283_126514
932462	contig_7119_pilon	-	1112	1	Intergenic	novelGene_40991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	146	441	459	899	140491	140051	NA	20	AACGGCTTGTTGACTGCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGRWRGSLCAEAAELEEEVCFQVLLGRRGLAAHSPRMGLPVQLLRRPPAPGGSKKARPVEEKSGVWVAPSGRQRDVAGQVLLLDAQGYGRKLCKVWSSASRDSPGSGFGSWVLALGRPPLAAAGLGPSPPSGSRDEMQTISEGE	140949	139837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_139800_140900
932463	contig_5686_pilon	-	2271	2	Intergenic	novelGene_45472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTGGATCTGTGCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229143	226791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_227119_227199
932464	contig_10779_pilon	+	3109	1	Intergenic	novelGene_165511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGGCTGTTAACTCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22573	25682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10779_pilon_+_22600_25700
932465	contig_4508_pilon	+	3198	2	Intergenic	novelGene_177531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2250	2549	44689	44988	TRUE	60	AAGATGAAAAGGAAATACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAWRQQSISNHIKRQSMMASASSQNKESRNFPEEENFLDLPEAEYKRLIYRTLQEIRKEINQNAEHTIEEIKKIREEHNDKFNRLQESIERQPSETQKI	42439	46038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4508_pilon_+_45019_45419
932466	contig_3155_pilon	+	579	2	Intergenic	novelGene_26425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTACACTGTGGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261789	262448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_261875_261954
932467	contig_13905_pilon	+	2351	1	Intergenic	novelGene_130414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	128	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	300	903	1207	2109	76707	77609	NA	35	TAGGTATAGAACCTTCTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPVGVQNRTPHDFPVEENALELPDREFKSLILRILQEIRLKADKHEEKIDKFMENTHKKLEEFMKIMQEQNAKINSQLEIIQRQKLEIKKINNKISEMDGVIEGLRSRFETMEDRISGMEDKHLDTTLFQEYSENRTKKNEETLRVMWDTIKSKNWRVIGIPEQEEKTESTERIIEELLTENLPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRNPKRKSPRYIIITLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQK	75500	77851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13905_pilon_+_75500_77900
932468	contig_17427_pilon	+	1612	4	Intergenic	novelGene_30341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGGGGAGGCGGGCCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176951	181358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_178130_178683_178833_179646_179845_181271
932470	contig_14575_pilon	+	2796	27	Intergenic	novelGene_101890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	105.283478982913	6	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	791	2170	41622	70600	TRUE	45	GAAATTTCAAGCATAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGGRRNRKFHYHGQQGAGEASKGNDDDEEELYECRRPSNKPPRHKGRHRSRNNAAKASPQVAVDLKHILERELSKSPDAAQQQLNLAMINYVLVVYGLGLSLLGIGRPEELSEAENQFRQILALYPNEGLDCLAYCGIGSVYLKRNRFSEALSHFQTARNVISRLLGVLTWPTSNVVIEETWPSKIRALLERFIEECKFPPVPEGICSYHDHCGSLKIQIYVTDPDFKGFIRILCSQICKIEFHVNCWKKLKATSYGDKHDKDFLNASCLTPDCQGVICRITVFNSKGGVKCEFEHKVIKEKVPPRPILKQKCSSLEKLKEKEEKKLKRKIQKEEAKKLAKERLEEDLRESNPPQNEEKKGLTAAGSFLTRHEASLKDLDFTILSILWNEKYGHKLGSIEGKKLEYFYEPTSLKEARCLIWLLEDHREKFPAMHSALDEFFDLLGFCSMTGRWHTTW	21584	80794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_21610_22649_22704_26341_26420_27690_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47376_51064_51146_54377_54491_57257_57379_59252_59376_59882_59985_61543_61637_62293_62359_63867_64005_68967_69220_70559_70634_72115_72163_73355_73413_74805_74886_76192_76364_80556
932471	contig_9698_pilon	+	3885	1	Intergenic	novelGene_82493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	119	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	311	640	160206	160535	NA	25	TACCTGAATGTTTTGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSENMLCNISVLCILLRLVLWPNMWSVLENVPCALEKKVYLVAVGWNVHYISVRSSWLIVAFSSSVSLLSFFLNVLSFTESGVLKSPTTIVELSISLFNAVGVRFV	159895	163780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_159900_163800
932472	contig_13460_pilon	+	1524	1	Intergenic	novelGene_162183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184001	185525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13460_pilon_+_184000_185500
932473	contig_13876_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_174249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATTCCCACTAGCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51494	52890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13876_pilon_+_51500_52900
932474	contig_12644_pilon	-	2288	15	Intergenic	novelGene_44484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_4	455.593608070049	6	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	506	1521	13	1533	1151228	1031845	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADGAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQQISSSMDISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGSWAPMRSKKEVQEVSASYNGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGVKMEMHFRTSQH	1151240	1025895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1026422_1027249_1027288_1030066_1030210_1031796_1031885_1034213_1034395_1035121_1035253_1037082_1037244_1043225_1043300_1055955_1056062_1062523_1062659_1063291_1063383_1068356_1068405_1068664_1068750_1123231_1123677_1151204
932477	contig_1275_pilon	-	548	4	Intergenic	novelGene_108778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	538	junction_2	119.702408775541	2	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	288	259	546	444565	440367	FALSE	25	AGTGAGTATATTGGGAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDDKEDSKENTKERDKTESTAEEPEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQ	448524	440364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_440504_442110_442174_444477_444696_448396
932478	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	598	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
932479	contig_11338_pilon	-	2761	11	Intergenic	novelGene_6146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	2	96	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	1669	2361	8898	6306	TRUE	45	GGGACAAAGGCAGAAGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKLLRWLHRQVVLPFLLPSVWQPVVAQCPPVSLSYSQKAQISSCRGPGVSGWWEKAKVTGRLRFFVFLLLRNTVLTAERTLSWAPWIRLLWISSSLSFFLASRSKEALASNLCMFRLERMPTTVGRVLVLSCHSPVELHPSLALAHGNVPVPMLLLLLDHQRQLCVRRGMVGEGGFRQGLGQDAQDFFEAQEQVAGNVVPGRQVLDLQVPGSLQQLIHKHNEVLDSVLG	13094	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_893_4517_4664_6081_6129_6246_6327_7358_7534_7613_7734_7966_8187_8741_8921_9811_10015_10515_10590_11725
932480	contig_5023_pilon	+	1232	3	Intergenic	novelGene_7380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2736	junction_2	342	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAATCCTACTCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	638817	647585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_639197_643413_643539_646857
932481	contig_14970_pilon	+	2207	10	Intergenic	novelGene_44958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5460.81810675486	2	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	133	579	136145	191898	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITIIM	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191890_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
932483	contig_13571_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_128102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTCCTCTGTCCTTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	52282	54451	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13571_pilon_+_52300_54500
932484	contig_6102_pilon	+	2311	13	Intergenic	novelGene_31845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	533.348775818101	5	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	75	899	370803	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFITAPLGAPRG	370728	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373712_393040_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
932485	contig_4024_pilon	-	1980	1	Intergenic	novelGene_177893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	306	1675	1980	56025	55720	NA	5	TATTCCGTTTCGTGCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRESASAGGWNPSSWCFPAKRLWLWEAEEAEWGGEVRWGGSIYRQFPVGLSPAGSSMKLISRTPYLLVSDRSPRWRIRAVLADRGPLHVCLLALCSLSVS	57699	55719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4024_pilon_-_55700_57700
932486	contig_9848_pilon	+	2018	2	Intergenic	novelGene_79921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAAGAATTATCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59600	67093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9848_pilon_+_60504_65978
932487	contig_10930_pilon	-	1928	7	Intergenic	novelGene_37040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2141.98934015399	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	860	1465	274277	268388	FALSE	30	ATTTCGTTCCAATCAGATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280661	267924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268573_272914_273009_273950_274325_276723_276757_278492_278637_279700_279832_280157
932488	contig_17144_pilon	-	1373	7	Intergenic	novelGene_29502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2738.15435101822	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	601	1089	167257	166363	FALSE	30	TTCTTAAGAAATTCTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183276	166078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167590_174931_175001_175973_176271_179700_179745_183167
932490	contig_9313_pilon	+	1314	5	Intergenic	novelGene_86470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1052.16978192685	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	127	450	387329	461613	TRUE	35	GATACCAGTATTACTGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387202	462605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601_461814_461941
932491	contig_4364_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_38	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGCTTGGACCATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	308688	306853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_-_306900_308700
932492	contig_5481_pilon	+	2023	2	Intergenic	novelGene_144571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATCTGTCGAGGTCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297689	299878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5481_pilon_+_299525_299690
932493	contig_10958_pilon	+	1610	4	Intergenic	novelGene_5426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	5150.56579416281	5	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	33	419	888255	895766	TRUE	35	ATTAAACTTTTATGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAENNYFPRRAFELFCSFLLFFIFFLKMYNHDRNLILCCFSVKEKYTHKAVTPPVKFCCCLVLAN	888222	901560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889025_895576_895855_900457
932494	contig_34_pilon	-	1691	8	Intergenic	novelGene_40016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	3	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	53	1438	247052	212049	FALSE	40	ACTGTATTATTTAAGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247104	211795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
932495	contig_11338_pilon	+	1697	10	Intergenic	novelGene_6369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	397	702	295240	298980	TRUE	45	GAGGACAAAGGCAGAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINFLEKHTTKSFISYFMAQRMAFPIFHGTKDVVQKSFLINQVGFGGIRQDPAGQRVHLRLLSQSPNPYEPFPVLLLDLQRQRQYTRKMKTPCRLLMMVKR	294843	323314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_295361_298712_298837_298919_299068_300819_300893_306727_306961_318587_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
932496	contig_5684_pilon	+	1832	3	Intergenic	novelGene_81039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	224	3	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	40	357	403611	442067	FALSE	55	AAGAGAAGGAATTAAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPTAVARPPGSWRMELRCGGVGSQAVGRGMDGDTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAHTHTHTHFFFRSPPSLSEAWGNW	403571	443542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607_441646_441997
932497	contig_3187_pilon	-	3534	4	Intergenic	novelGene_176234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	2791	3507	579108	578061	FALSE	0	TCCTCGCTCTCTGTTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKQHLQPTNGTQGAARPGIQAACSFEPRARGPGKQRSKRTKAPVPRPRSRPDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALRARHLSKWRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRPPESRPPGHTESNHPAPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGVGKRTPQITGCFVSLWMLCEAALSYPVCWSPIGVQDGGSALR	584083	578033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3187_pilon_-_578570_578900_580239_582114_583050_583358
932498	contig_6445_pilon	-	1543	15	Intergenic	novelGene_76934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	790.484277425644	2	34	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	393	1182	136	1317	89674	43105	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	90092	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68038_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89707_89989
932499	contig_14666_pilon	-	1290	3	Intergenic	novelGene_39626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGCCAATCACCTCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	484944	479855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_479942_483203_483330_483866
932500	contig_2596_pilon	+	3532	1	Intergenic	novelGene_53484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2515	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	700102	703634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2596_pilon_+_700100_703600
932501	contig_5623_pilon	-	2087	12	Intergenic	novelGene_154832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	388.8023143828	5	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	478	1488	211523	207538	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSMLVAPSPCARSRGDLYPKGLNCTS	239402	206938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207613_208446_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211540_218220_218450_220829_221000_239340
932502	contig_20527_pilon	+	2719	5	Intergenic	novelGene_138572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	7	153	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	652	1278	13527	27453	FALSE	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12875	28894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
932503	contig_12079_pilon	-	3034	10	Intergenic	novelGene_67545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_9	305.412289645762	2	125	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	219	2330	871530	861365	FALSE	25	GGGGTCCTGTAAAACTTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872425	860660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871721_872310
932504	contig_3410_pilon	+	1610	1	Intergenic	novelGene_58929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGGCTGTGACACGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13771	15381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_+_13800_15400
932505	contig_12402_pilon	+	2759	2	Intergenic	novelGene_133370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAATAAGACTAAGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	584814	719801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_586965_719192
932507	contig_7151_pilon	+	1773	1	Intergenic	novelGene_40706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACATACAAACATAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58152	59925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_58200_59900
932508	contig_6208_pilon	-	3517	1	Intergenic	novelGene_53028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	47	144	222	365	493001	492858	NA	60	GAAGAAACAATAAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRSVYIAPCYHNSF	493222	489705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_489700_493200
932509	contig_8484_pilon	+	5648	2	Intergenic	novelGene_178369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	460	1383	1978	3360	5069	6451	TRUE	35	TCACAGCCTTTACACATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYKAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFKWKGKNSRISKALLKKKKKVEGLTIPDFRNYYTATVVKTAWYWYNNRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFEKVPKCIRWGKDSLFKKWCWQNWISICKKKKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTIQALIHGINRIQTITINAQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGKYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKKNNPIKKWAKEMKRQFTKEDIRMANKHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLALIKNTGNSKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREVRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQPRCSSTDEWINRLWYIRTMEYYATRKNNNESVKHFITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	3091	8983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_+_8237_8480
932510	contig_5039_pilon	+	2800	2	Intergenic	novelGene_64806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1201	1614	208433	208846	FALSE	40	ATTTATATCAAGGAAATGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEQNPDVLSPCPLLHVTVSLLPAASGTAPPATPISHTSNTLCAGHAVGSFLRAVCNPGPALRCPSHRGAPGLPTWFFTCGGEWRQCSYAAGITGPGHLDELVSTCPPTLPDPMTVCCSFSLSRQLAEYRGRPGMNE	207052	210032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_207551_207730
932511	contig_233_pilon	-	2757	16	Intergenic	novelGene_14632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1489.88986020966	3	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	120	2264	126907	78640	FALSE	15	GTGTCCTAGAAGCTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLENPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	127026	78146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105641_107351_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
932512	contig_8693_pilon	+	716	1	Intergenic	novelGene_150881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGGGAAAAAATAGAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1170949	1171665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8693_pilon_+_1170900_1171700
932513	contig_11338_pilon	-	2253	14	Intergenic	novelGene_6375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	195	junction_7	189.614932126157	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	1271	2173	314779	295354	FALSE	5	ACTTTGTTGTGTGTTTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQYDVQEEDPVLTVITYMGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323315	295273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_307230_307429_314758_314939_315142_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
932514	contig_4974_pilon	-	2008	1	Intergenic	novelGene_161407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATGATAATTTTTCTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78237	76229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_-_76200_78200
932515	contig_14618_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_136802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCAATAATTGAGTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401668	402634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_401700_402600
932516	contig_10765_pilon	-	3221	4	Intergenic	novelGene_122844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2813	3112	18497	15716	FALSE	25	TACGCAAGATGGCGGCCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQRLQQIRSFAFVPLRRTSSFEINGGYRDPIIPSFLLDSAEVSSSMMGENPGLLSWFQSFVVWSTDEFFSMTQGFHFHLSIRHLTLQLCIDLYLLIKTF	33700	15606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_15765_18246_19515_28912_29038_32030
932517	contig_11512_pilon	+	1408	1	Intergenic	novelGene_43338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGTGTCTCTGAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554958	556366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555000_556400
932518	contig_10765_pilon	-	509	1	Intergenic	novelGene_122996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTGTAAACTTTCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	701550	701041	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10765_pilon_-_701000_701600
932519	contig_16594_pilon	-	2804	8	Intergenic	novelGene_53839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_6	2937.91499022622	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	266	934	165546	121101	TRUE	75	CAAAAGACAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306513	116698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_165477_165649_306350
932520	contig_9177_pilon	+	806	6	Intergenic	novelGene_32624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGCAACAGAAGTGTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21210	25003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_21392_21610_21689_21866_21972_22740_22896_24609_24824_24930
932521	contig_14868_pilon	-	2171	1	Intergenic	novelGene_150449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	180	543	1281	1823	142019	141477	NA	45	AAAGTTTAAAGATTACCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFNILYFYANKNRYQLNSFYMYNSVTLITFFKSATILAIVFQAICLGCVFLGSKTSKAYKYIYREIYIKEMAHVIVEARKSQVRGSGWRPLLTHVAAGASEPKIGMSDSRPLAHRLRRPMNPKVDRQDGRYAASSDPKSWRLHEQEPAAGSKVSKSPRVLPESSPVFDAGHTPRKLPFY	143299	141128	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14868_pilon_-_141100_143300
932522	contig_17976_pilon	+	1198	4	Intergenic	novelGene_32515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1218.80050322711	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	180	797	41843	47385	FALSE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLERAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41663	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46490_46888
932523	contig_8377_pilon	+	1241	1	Intergenic	novelGene_34993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAATAGAAAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68118	69359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69400
932524	contig_2703_pilon	+	1591	9	Intergenic	novelGene_101762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	685.199594552565	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	136	729	602068	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	584512	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_584592_596351_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
932525	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	90	junction_3	3292.9636632523	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	64	822	147241	151151	TRUE	15	AGGTGGAGTTTTCAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151002_151163_151848
932526	contig_10003_pilon	-	2872	1	Intergenic	novelGene_88293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAAGTTTTTGCAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	903093	900221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10003_pilon_-_900200_903100
932527	contig_3956_pilon	+	3006	16	Intergenic	novelGene_14941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1282.11486051584	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	699	2100	455	2554	1284132	1290491	FALSE	15	TGGTGTCATCGTGAGCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282776_1282859_1282894_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932528	contig_2550_pilon	+	2895	1	Intergenic	novelGene_135629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTTGCTCTTGAACGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	410465	413360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2550_pilon_+_410500_413400
932529	contig_14273_pilon	+	1042	2	Intergenic	novelGene_21169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	54	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGACCGAAGAAGAATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	318510	319601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_+_318861_318909
932530	contig_7095_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_166473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGCAGATAACTTGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556863	557685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7095_pilon_+_556900_557700
932532	contig_9900_pilon	-	573	1	Intergenic	novelGene_159501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGGACGAAACAAACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5241	4668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9900_pilon_-_4700_5200
932533	contig_7357_pilon	-	2007	8	Intergenic	novelGene_36784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1709.08558914421	8	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	255	1124	166808	136424	FALSE	15	TTCTGGACCTAGTACTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGGSCFCCCSQASCMVHLQCLCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167062	135540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154663_160001_160034_166772
932534	contig_17144_pilon	-	847	3	Intergenic	novelGene_29126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	167	634	12299	11832	TRUE	15	CCACAGGGCTCTTTTTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKEDFPVEKSPLPRLSEVFLGGGDELFSWTALYAVTRKFFSGTNPLCPLSLLLAPPRSSFLDLSEKDSSSNSSVFLCFSFPGGAYTRPSHLPDFSSSWFLFTPAMTFDINLGSSSNSDSFLPLALSLSWSSISSLWKSAIFFSKSSRSLYLLGD	13438	10027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_10124_11714_12356_13328
932535	contig_17440_pilon	+	682	1	Intergenic	novelGene_7560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCACTGATAGTTAACAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1416	2098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17440_pilon_+_1400_2100
932536	contig_5864_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_162779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	111	512	108934	108533	NA	50	TAGGAAAATTCACACAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIKTTVRYLPTPAVLAQIKNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWERKMIQPFWKIIWRFLRKLEIEIPHELAIPLLGIYPRELRAVTRIDICTLMFMAALFRIAKMWKQPRYPSTDEWINKLCYIHTMEYYAMRKNNNESVKHLITWMKVEDIMLSEVSQSQKDKYCMRPLL	109044	107304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5864_pilon_-_107300_109000
932537	contig_16103_pilon	-	329	2	Intergenic	novelGene_118710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6219	junction_1	0	36	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCAAGTCTACACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199133	198316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_198548_199035
932538	scaffold_12124_pilon	-	2272	6	Intergenic	novelGene_22341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1167	1502	1508404	1508069	TRUE	10	TGAGGCTCCTCTGGGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509570	1483590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490421_1497066_1497121_1506628_1506684_1508008
932539	contig_11678_pilon	+	2320	1	Intergenic	novelGene_160858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	150	453	1128	1580	322916	323368	NA	40	TTCATAGACACATCCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVITPSYDYQTTENHGPANLTHNLNHHSDKNDARDCMIEFSKTNNFFIASTFFHQHKGQLYMWTLPDGIHRNQINYICRKRRWKSSVSSVRTSPAADCGKDHQLLTCKFKLKLMKIRTSPQEPKYDPEYIPPEFRDHLKNRFDALNTND	321788	324108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11678_pilon_+_321800_324100
932540	contig_7753_pilon	+	999	1	Intergenic	novelGene_41485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	464	997	1020007	1020540	NA	30	TAGGAGAATGAAGTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNPIIKRAKDLNRHFTKEDIQMATKHTKRCSASLAIREMQIETTMRFHFIPTRMVKIKKKPHTHTHTHTENNKCWRGYEETGTLTHCWWECKMVQLLWKPVWRFLKKLKTEPCDSAIPLLRIYTKDLKAETETDTCTPMFTAVLFTIAKRCKQPKYPPIDECINKVWYIHTMEYYSA	1019543	1020542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_+_1019500_1020500
932541	contig_10500_pilon	-	657	2	Intergenic	novelGene_41302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTGAAAAATACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1639471	1638751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1639249_1639311
932542	contig_15732_pilon	+	2169	1	Intergenic	novelGene_88910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1008	1364	298934	299290	NA	20	AGCTCCTGTCCAGAGGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPSLWKSIWHFLKKLEIEVPYNPAILLLRIYPIQIRAITRIDICTPMYIAALFTVTKRWKQPRCPLTDEWINKLWYIHTMEYYATIKSNDESVKHLITWRNLEGIMQSEISQLQKLI	297926	300095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15732_pilon_+_297900_300100
932543	contig_57_pilon	-	2194	19	Intergenic	novelGene_44895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	89	12	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATATTCTTGGGCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129529	89475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_-_89556_93292_93449_94249_94328_99288_99422_100635_100734_102980_103132_104958_105075_105860_106029_106705_106875_107570_107612_113342_113460_114646_114769_115013_115110_116994_117092_117796_117941_120225_120475_120734_120809_122503_122546_129466
932544	contig_9836_pilon	-	6345	3	Intergenic	novelGene_176157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	172	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	3873	5459	26775	25189	FALSE	30	TCCAAACTCCCTAAGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIAKPGKDVTKKENYRPISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKRIHHDQVGFIPAMLGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISIDAEKAFDKVQQPFLIKTLNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPMANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFADDMILYTENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIPKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFSIAPKKIKYLEINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPHSWIGRLNIVKMTILPKAIYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIIHFIWKGKKPRISKVLLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNRYINQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTKNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFG	226403	24302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_-_27266_29934_31502_224588
932545	contig_17144_pilon	-	1764	10	Intergenic	novelGene_29263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1994.25965098719	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	82	960	174597	167278	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAWWVPGWQLQHGVTETQKSEVTLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQGRIISGQVSQTQPVAA	183192	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174611_181815_181850_183158
932546	contig_17743_pilon	+	764	1	Intergenic	novelGene_176427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTAAGAGCTTCCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76567	77331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17743_pilon_+_76600_77300
932547	contig_14441_pilon	+	792	4	Intergenic	novelGene_100652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.390643937584	12	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	184	612	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112006	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112036_116573_116963_117220_117344_117539
932548	contig_8330_pilon	+	1725	7	Intergenic	novelGene_71818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	549.711262593575	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	187	534	853343	855118	TRUE	15	GGACACCGCTGCCCAGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSECHTRPSP	853047	857805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855350_855434_855535_855624_855686_857006
932549	SIRV7	-	1938	6	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	107	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147918	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2005_2521_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
932550	contig_11055_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_142172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCAGTTGGCCCGGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134933	136432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_+_134900_136400
932552	contig_5686_pilon	+	2730	15	Intergenic	novelGene_45235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1153.98913490093	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	318	2543	182699	224324	FALSE	35	TTTAGGTGAAAGTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQGGTCSFVTSWWWFNFELFLIFLIIVFSDGIFFFLTSQVNN	93785	224511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171702_182684_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043
932553	contig_3077_pilon	+	2083	8	Intergenic	novelGene_26806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	764.739865068174	2	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	546	1358	476794	481662	FALSE	25	CAGAGATTTAACGTGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTCCMAIDHPCPPFGLASRASSASIQKLATSGPICLVSFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467426	482387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476690_476909_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
932554	contig_7396_pilon	-	2500	13	Intergenic	novelGene_79578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3366.6395295936	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	113	1105	255163	247765	TRUE	35	GATGAAAAAAGTTCTTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVSLDLTTLFLCRGSWLIW	257466	245296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248532_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
932555	contig_6189_pilon	+	2839	1	Intergenic	novelGene_164923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	76	399	78	401	NA	35	AGACAAGTGAACGCCTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAGPFGCVESKQPVFPSQEIVATGSRGGRVGVKKGGEWESVYRKLLVVLSPAGRSMKLLSPTPCLLVSDRSPRWRIHAVLAGRGPLHESLLALRSLSVFSLHLVLG	2	2841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_+_0_2800
932556	contig_7019_pilon	-	1292	1	Intergenic	novelGene_149465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	21	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1136244	1134952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7019_pilon_-_1135000_1136200
932557	contig_16622_pilon	-	1962	4	Intergenic	novelGene_48459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1420.6170021039	3	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTCATGTCAATTTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121938	111849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115295_121444
932558	contig_4180_pilon	+	751	5	Intergenic	novelGene_8402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	62	409	882886	888134	FALSE	35	TGCATCATTGATGGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875327	888476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
932559	contig_20378_pilon	+	945	1	Intergenic	novelGene_159582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAGCCTGGGAGTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136006	136951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20378_pilon_+_136000_137000
932561	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	101	826	147280	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147179	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932562	contig_3095_pilon	+	1210	5	Intergenic	novelGene_75117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	36	800	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147205	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932565	contig_5041_pilon	-	2713	20	Intergenic	novelGene_27069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	671.944455889439	10	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	522	1569	126	1694	620136	569985	TRUE	30	TCCTAATAGTCTCACGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSLSIIIDRYTMTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAGPSLTW	636080	525071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525187_525447_525658_526413_526497_532092_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570005_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_620101_620169_635987
932566	contig_9955_pilon	-	2100	4	Intergenic	novelGene_21316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	824.856081723082	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	693	176	868	49296	47546	TRUE	35	TTATTTAGGCAGATAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49784	46136	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46927_47103_47737_48794_49380_49692
932567	contig_2214_pilon	+	1714	1	Intergenic	novelGene_144250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAGCTCAAGTTAATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269872	271586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2214_pilon_+_269900_271600
932568	contig_1939_pilon	+	1682	2	Intergenic	novelGene_144864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAGCAACGATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	281328	283077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1939_pilon_+_282741_282807
932569	contig_19974_pilon	-	2135	1	Intergenic	novelGene_130480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	568	1203	256891	256256	NA	25	GCGAGGATCGGGGAAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISFSSFLMLGKFSVCNSSMILSVFYVFSPCSGTLITCNFLLLIVSHIILRVSSFFFVLFSDFSSKYVQVFVFSFSDPVFHHSNLLLRPSMTLSVSEILLFIFWISNCCFCMISSCEFILAFCSCFIFLNSPSFWSVFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIALNIRDLSSLSGSSSAFSSTGRSSGILFWMPPGTILSFFFIRFDIVCCLRNIR	257458	255323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19974_pilon_-_255300_257500
932570	contig_11763_pilon	+	2121	1	Intergenic	novelGene_179048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTATCTTAACTGTAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11770	13891	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11763_pilon_+_11800_13900
932571	contig_10500_pilon	-	2798	2	Intergenic	novelGene_41242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	108	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCTTGTATTTCTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1629298	1626419	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627682_1627762
932572	contig_1450_pilon	-	2707	20	Intergenic	novelGene_27396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	41	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	52	990	355898	349016	TRUE	10	AGTCCTCCTCGATGTTCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRGSQLAPFRAESGNRTHAEGGKRRRRAGRAGLGAHGVSGEGNWSGRGGLEVTLAVQRRGEGHVVQSTRHGVGAGVGGHSRDAILGLVWRQLPAQLIHRDVVLVPGQDLEGSHDLVCRICVSRLTRHKVDEGLECHYPQAVGIHDAHDAGKLCLSLGVVANIITQADEAGFELLGTQRAGVIPVKVVKGGPELVHLLLADALGVPGQDLVLHLIDGPGDGGEELFPAHADVLHSVVGVLVVEDERLLDELVVTLQLVDLWLVVDNALLVLPQVAELVLQGPVHLNGDSSDLLHLRLDPGPYDVGLGPKLLA	355949	308958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_309002_315756_315877_322453_322541_324995_325084_325652_325732_329044_329127_331945_332038_339442_339534_340844_341074_342471_342621_345693_345846_346444_346552_347010_347150_348035_348220_348940_349077_350343_350524_351264_351413_352391_352470_354166_354328_355587
932573	contig_5020_pilon	+	1409	7	Intergenic	novelGene_27849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1162.93574867899	4	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	792	1094	124540	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119293_119596_122812_122939_124197_124363_124444_124547_124909_125091_125657
932574	contig_9852_pilon	-	1713	1	Intergenic	novelGene_138476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTTTTGATCTATTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	349326	347613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9852_pilon_-_347600_349300
932575	contig_6898_pilon	-	2860	6	Intergenic	novelGene_35750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	2390	2716	124838	122725	TRUE	5	TCTGAGCCTTTCTTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127701	116764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_116795_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479
932576	contig_9609_pilon	-	2139	13	Intergenic	novelGene_23023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1158	1472	325405	324438	TRUE	70	AAAAAAAAAAAGGCAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIWIKLLYYLSNTTRHIEKEGWNVCIIQSWLIGQERIILVQQNKVSPTVTSSVLRTTGLPESQADWRFDYTAGDSGTQQLLRWSSLLCLDADDASDSNPPACC	329537	320949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_321039_321847_321907_322283_322353_322602_322762_323260_323360_323984_324070_324250_324327_324406_324483_325135_325716_325928_326020_328272_328435_328861_329012_329093
932577	contig_5033_pilon	-	2383	7	Intergenic	novelGene_28918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_6	1026.09872007197	5	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	690	1139	464569	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	468905	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547_464983_468629
932578	contig_7411_pilon	-	4050	2	Intergenic	novelGene_136994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	186	junction_1	0	138	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTAGATGCCCATCAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232074	224443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_227822_231402
932579	contig_9919_pilon	+	1972	2	Intergenic	novelGene_137942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	543	1429	1971	198673	199215	FALSE	35	GATTCTATGAAGCCAGCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQAEREQQKKPSGTRRKEIIRIRAELNEIDNRKTIERVNKSKSWFFEKINKIDKPLAKLKKEKQERKQITCIRNEMGNITTDPTEIKRIITEYYGKLYSNKFENLEEKDKFLETHYLPKLTQTEVEQLSKPITKEEIEKIVKKLPTKKKPWPGWLHWRILPNFQRRVNTTTTKGISEHRK	194822	199216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9919_pilon_+_196065_198486
932580	contig_10557_pilon	-	2793	1	Intergenic	novelGene_171926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	1237	1542	255690	255385	NA	5	GGGCATCCTTGTCTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLISLGYIPRSGIAGSYGKSVSSFLRKCHIIFQNGYIILHSHQQWIRVPISLQPLQHLLFPVFLIRASNARVRWYLIVVLICISLMASDCEHFLMRLLAA	256926	254133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10557_pilon_-_254100_256900
932581	contig_12938_pilon	+	1138	6	Intergenic	novelGene_99740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	42	junction_2	886.085684344353	3	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	20	592	78117	85540	FALSE	25	CTTGCTAATTTATTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSLDNYVAEGLRHSIEHYNDTIAAWDSIQSFLQCCGIHNKSDWKDITPKSCPEGEVEGCYKKAQEWFHTNFLYIGIITICVCVIQVLGMSFALTLNCQIDKSSRVLGL	78097	86086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_78180_79040_79230_81371_81459_83391_83470_84550_84635_85468
932582	contig_5686_pilon	+	2088	13	Intergenic	novelGene_45258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1725.12098408263	1	111	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	499	1908	176692	211355	FALSE	15	ATCTGCCCCAGCATCCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93795	211535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176667_176722_182638_182789_189078_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
932583	contig_12550_pilon	-	2283	2	Intergenic	novelGene_175279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	1424	2224	46645	45845	FALSE	25	GTGTATATACCATGGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEIQAGFRRGCGTRDIIADAIWILAESREYQEDVCLCFIDYAKAFDCMDHNKLWIVLQIIVIPEHLTVLMRNLYTDQEAVIQTEQEDTAWFKVRKGVHQSCILLPDLFNLYAEQIIQDAGLYEEEQGIRTGGRLINNLPYADNTTFLAENREDLKHLLMKIKDHSLQYGLPLNIKKTKILTTGPISNIMINGEKMEVVKDFILLGSTINTHGSSSQENKRYIALGKPAAKDLFKVLKSKDVTLKTKVHLTQAMVFSITSYAFETG	48227	45785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12550_pilon_-_47143_47301
932584	contig_5317_pilon	+	1053	4	Intergenic	novelGene_76517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5602.73808061737	6	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	127	537	35282	43326	FALSE	10	TACCTGTTTTTGGTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	33686	43842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35234_35410_36684_36839_43197
932585	contig_13915_pilon	+	4780	3	Intergenic	novelGene_178550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	366	4415	4780	62555	62920	FALSE	20	CCCATCCGGGGGCGAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGARNPSCQRPWVKSLRPREAEEQTNKGPRISPARQPRPGSSRTPERSPTAPQKRAKTALGARHPSKRRGRQREASEKPKEAEKATPASNKRHPESCPPGAHGIQATGAPQPRDPGHGKQGS	0	62920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13915_pilon_+_3319_60571_61309_62195
932586	contig_15118_pilon	+	2093	10	Intergenic	novelGene_74609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	255.844040070325	2	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	53	571	392042	393515	TRUE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVSPGNT	391989	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392717_393498_393680_393942_393991_394117_394376_394623_394749_395049_395141_395233_395346_398644
932587	contig_10986_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_71512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	130	393	917	1309	185863	185471	NA	15	TATCCCCACCTGGGGAGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILGRYLVIFHGIREAFCQQIFNKSLYFLLPPSPPRSSTPVTRRLFLLVESGGGIFMKPLNTWLPSVQFALSVIQINLTKLHVRDFPCRQDQCLNGRLILSNLPSSSGHKFVLVMICRFSHWVEAFPRH	186779	185430	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10986_pilon_-_185400_186800
932588	contig_14666_pilon	+	1664	5	Intergenic	novelGene_39591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	2	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	86	1258	477340	484834	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKPAVPRPVGGRAHPADVRCPQHHGSLRPPPGPLPDGGLHLPGQDVHQGGGRPAADRADQEQKLLCGVDPPQRQGRRLRHPAPGAQHGCHLSRQQHGHPGALQQGFRALLGHVPKEGVCALVHERGDGRAGVWRGREEYP	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484341_484417
932589	contig_7992_pilon	+	2917	12	Intergenic	novelGene_115534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.472411122811	5	46	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	417	1385	606395	645332	FALSE	30	CTCCAGCTAATCTCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGELPPNINIKEPRWDQSTFVGRASHFFTVTDPRNILLSKKQLENARKTIHDYRQGIVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRSTPAVLFWQWINQSFNAIVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVISRVLMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPVQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEADLQAKIRETHPELRRVYFNKGL	582321	646864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7992_pilon_+_582403_582635_582962_606385_606559_609963_610135_611209_611309_614478_614555_615800_615887_617128_617257_622063_622114_637907_637958_638730_638779_645235
932590	contig_19990_pilon	-	2733	2	Intergenic	novelGene_30774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	102	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1386	1760	149661	149287	FALSE	35	CTATCACAAAGTGATGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPQRQALQNDSNKLTPESIITLNVNGLNAPVKRQRVTESIEKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKTKGWKKTYQANNYQKRPGVAILISDKTDFKTKSTIKDKGHYIMIKWMIHHEEITIINI	151128	148313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19990_pilon_-_150964_151045
932591	contig_6888_pilon	+	1856	1	Intergenic	novelGene_147059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9219	11075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6888_pilon_+_9200_11100
932592	contig_5033_pilon	-	1904	6	Intergenic	novelGene_28913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1360.42487480934	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	51	401	456896	451954	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTCSPRGLSCTLRDGMRAWFCLLWSCLSYITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSRQALGTFNPDATSSADHRETCPQSPEAGVLDVPLTLGLLAGPRADGQATGRGWGQF	456946	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451731_451926_452129_453095_453124_456495_456604_456856
932593	contig_854_pilon	-	1572	7	Intergenic	novelGene_36711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.98142396999972	6	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	979	1368	1710643	1709595	TRUE	10	GACAGCGCCTTGGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1715991	1709217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710667_1711561_1711652_1711754_1711843_1715214
932594	contig_3233_pilon	+	1414	7	Intergenic	novelGene_56580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	297.547008424253	4	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	120	632	741808	745484	TRUE	15	TCCCCAATGGGATTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGIVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFSYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGTGGGARFYLAWFPRDLPNWRVEWGLDEDWKPSSL	741688	748040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3233_pilon_+_741902_742724_742836_743705_743819_745289_745697_746254_746424_746936_747016_747718
932595	contig_5236_pilon	+	1289	11	Intergenic	novelGene_100882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	132.232522474617	14	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	100	1047	62791	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPLNGWQTEPSGFLRNVGQLFECHLLPPTDVRMTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60626	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67128_75594_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
932596	contig_3004_pilon	-	2001	4	Intergenic	novelGene_127471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	176	junction_3	10.6562449087639	5	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	556	927	229489	227814	FALSE	35	TGGAGTATTGTTTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQHQVHAVQQLAKVMGWQVLSFSNHVGLGPIESIGNASAITVASPSGDYAISVRNGPESGSKILVQFPRSQCKDLPKSDVLQDSKWNHLRGPFKEVQWNKMEGRNFVYKMELLMSALSPCLL	236254	226739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_-_228026_229329_229490_232331_232450_235817
932598	contig_10068_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_148700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCCTCCATAACAGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44374	42960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10068_pilon_-_43000_44400
932599	contig_11720_pilon	+	1114	11	Intergenic	novelGene_43820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2297.89230382975	6	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	18	1079	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67890	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67900_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
932600	contig_13074_pilon	+	1262	3	Intergenic	novelGene_153426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_2	739	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	275	433	451016	451174	FALSE	20	TAACATTTCTGATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403725	452003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002
932601	contig_15286_pilon	+	674	1	Intergenic	novelGene_124431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAACATTCCCCTTGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2668	3342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15286_pilon_+_2700_3300
932602	contig_5020_pilon	-	1440	7	Intergenic	novelGene_27902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	580	927	124926	123330	TRUE	40	CATAGAAAATGGCTGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126072	119487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656
932603	contig_9955_pilon	-	2703	3	Intergenic	novelGene_21308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1010	1	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	12	725	49317	47546	TRUE	15	TGTGTTTGTGTTATGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAEMSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49328	44931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46869_47504_47737_48794
932604	contig_12630_pilon	+	524	1	Intergenic	novelGene_173086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	327	197	523	88955	89281	NA	10	GAGCCCTGTCATTGGTTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKIFCIISTFWILLRIALWPKMWSVLENIPCASEKNAYFAAVGWTVLYTSMRSSRLIVPFRSSVSLLSFCLDVLSFTESGVLKSPSIIMELSISLSRRVCFMYF	88758	89282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12630_pilon_+_88800_89300
932605	contig_10414_pilon	+	2247	1	Intergenic	novelGene_146934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTGTGTCAGTTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	847	3094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10414_pilon_+_800_3100
932606	contig_5954_pilon	+	3116	11	Intergenic	novelGene_28516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	740.688632287549	27	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	310	1884	438796	443196	FALSE	5	GGGTCTGATTTTTTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSESRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPSATPLASAPRPAAPASNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMSQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQNTTTTTTSAGTGSIPPWQQQQAAAAASPGAPQMQGNPTMVPLPPGVQPPLPPGAPPPPPPPPPGSAGMMYAPPPPPPPPMDPSNFVTMMGMGVAGMPPFGMPPAPPPPPPQN	438435	444428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_438560_438610_438840_439037_439128_439445_439630_439717_439834_439940_440049_440761_440943_441208_441483_441740_441801_441925_442106_442858
932607	contig_854_pilon	+	1033	5	Intergenic	novelGene_36307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3264.24412192164	18	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	20	622	556108	563192	FALSE	20	GAAGCTGGGCCCAGCTGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSMLHSSPPSQMVLTLQGSYAKPDGAPAGHAVPSLWCFLAAGCRAWLMSSSCWRLV	556088	563603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562396_563029
932609	contig_14647_pilon	+	1815	1	Intergenic	novelGene_167384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	141	641	160260	160760	NA	60	TATTAGAAAATTAATAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTPTRLALIQKTENNKCWRDCGETGTLIHCLWECKMVQPLWKSLWRFLKELEIEVPYDPAIPLLGIYPREIRAITQIDICTPMFIVALFTIAKRRKQPRCPSTDEQRWINKLWYSHTMEYYTMIKNNIESTKRLITWMNLEGILLSDISPKRTNIV	160119	161934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14647_pilon_+_160100_161900
932610	contig_7286_pilon	-	1803	4	Intergenic	novelGene_108697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	109.776540703781	8	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	1166	1738	290899	286948	FALSE	10	TAATTGCCTTGTGGGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDHYGKLSYCLKTDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292064	286882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758
932611	contig_17796_pilon	-	3032	7	Intergenic	novelGene_33758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	110	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1163	1537	15037	14663	TRUE	65	TAGAAGCAAAGAATGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNNHTDVIAQYQQWKALNTEPDFSLCTRTQSLCRSFLTDEPLTSHLLVCHEEEQLLNWVCKAENIWKENRHCSPCHYICNVPEGGLQKHPGAVVLGKGRRVRGGVSLQKVTLKHPAYYWILLF	32140	8152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_-_8243_11783_12179_13652_15312_16867_17091_18024_18198_20415_20617_31849
932612	contig_3956_pilon	+	1806	8	Intergenic	novelGene_14899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1102.51984109131	3	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	83	697	1281682	1289148	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLSSSRGPVTWQRSTSGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284161_1289039_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932613	contig_9363_pilon	-	1179	4	Intergenic	novelGene_6554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	635.636339077271	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755464	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754130_754282_754503_755012_755124_755360
932614	contig_34_pilon	-	1713	8	Intergenic	novelGene_40012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1334	junction_1	1154.17142291316	3	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	64	1449	247052	212049	FALSE	75	TAAGAATGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILGTAFGMAFYLLHSVSGESGYAQNGDLEDAEPDDYSFSCYSQLEVNGSQHSLTCALDDPDVNSTNLEFEICGALLEVNCLNLNKLQDMYFIRTKKFLLIGDSEICVKLGQKSITCKIMNIVKIVKPEPPFDLRVVYREGANDFLVTFNTSHLKKIYVKDLLHDVAYRQEKNENNWMNVNLSSTKLALLQRKLQSGAMYEVKVRSIPDGNYFEGYWSAWSPSYHFRTPETNGTGKMDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	247115	211784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215458_224659_224818_230228_230387_243214_243354_246970
932615	contig_10734_pilon	-	1963	9	Intergenic	novelGene_51493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	634.798971624088	3	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	889	1479	2267149	2265543	FALSE	75	ATAAATAAAAGGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305084	2265058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2274372_2274501_2275750_2275885_2277109_2277191_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
932616	contig_16714_pilon	+	2213	1	Intergenic	novelGene_161559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	1006	1395	620389	620778	NA	45	GGAGATAGCAAAAGGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVVSHSVHYSHCNGAWVYFPESYFIPPLFYKVLSAGPVCIFWKLVWEVSKLFPNLKACRSFGQRCIAGLILNQAHLLAGGGISFCSVVPIRKIITTPCFTYLTVSLRSFEKHLNLRILKGLTTQGLLF	619383	621596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16714_pilon_+_619400_621600
932618	contig_15105_pilon	+	1486	2	Intergenic	novelGene_151026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	427	783	828792	829148	TRUE	5	CCTTTCGTGAGTCTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTVLLPHCNIRGNNFRPDLILPLKSVLAPSLPPISLPPSSSLSFPSFRPSTQLSPIVPLLPQPIKTILPLRIEARVVTLNLLQDNGYHMPHMLKNIGYVIKIEVFEDVRLRFFPSKL	828365	831460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_829397_831005
932619	contig_8146_pilon	+	3725	2	Intergenic	novelGene_179213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	32	99	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	126	497	24286	24657	TRUE	40	TAGAGAGATGAGAAACTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWLGRLDIVKMSILPKAIYKYNAIQIQIPTTFFKEMEKVIINFIWKGKKPGISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAW	24160	125138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8146_pilon_+_25845_123097
932620	contig_7119_pilon	+	2486	3	Intergenic	novelGene_40904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	124	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	200	1354	137033	139798	FALSE	50	AATAAATATCTGATGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
932621	contig_10324_pilon	+	1906	13	Intergenic	novelGene_7751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1687	junction_10	920.069411632743	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	1	1332	70028	79380	FALSE	10	TCCCCTAACCCTCTGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	70027	79954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273
932622	contig_18251_pilon	-	1675	1	Intergenic	novelGene_50141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTTCTATGACATTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10577	8902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18251_pilon_-_8900_10600
932623	contig_5649_pilon	-	2835	3	Intergenic	novelGene_82417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAACAGTCTCTTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1514308	1328756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_-_1329403_1509859_1511361_1513620
932624	contig_11677_pilon	+	1554	1	Intergenic	novelGene_85876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	537	603	1139	150258	150794	NA	30	TCGGAAGAAAGGCCTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKNYSLWYGLYLNIKKTKILTTGPVRNIMINGENTEVVKDFILFGSTINTHGSNSQEIKQRISLGKSAKELFKVLKCKDVTLRTKANLTQAMIFSITSYACESWLMNKEDQSKIDAFELSCWRRILNTPWTARRTNKSVLEEVQPEYSLEARIARLHLTYFGHVIRRDQSWRKTTC	149655	151209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11677_pilon_+_149700_151200
932625	contig_16126_pilon	+	1526	1	Intergenic	novelGene_141876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTACACAGATAATGGAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42732	44258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16126_pilon_+_42700_44300
932626	contig_8732_pilon	+	4551	4	Intergenic	novelGene_179214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	210	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2112	2462	94498	94848	TRUE	25	GTGTCTCTAATTTAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMDPVGVQNKTPDDSLVEENTLELPHREFKPLILRILQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQDAKINSQLEVIQRQQFEIQGKQQDFRNG	92386	235402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8732_pilon_+_95314_111786_112058_233556_234146_234638
932627	scaffold_13505_pilon	-	2063	5	Intergenic	novelGene_111544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	68	junction_1	451.596266038593	3	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	43	1020	603235	594258	FALSE	5	GTTTTCTTTATGTTGTGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFSTEGAQSRQQRPMEPPSATPRRRLIHWQGSLLTVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSGVIIA	603277	593214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_594275_596976_597232_597627_597907_601873_602237_603171
932628	contig_13214_pilon	-	4404	2	Intergenic	novelGene_175710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	135	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	3428	3733	3418	3113	FALSE	30	TTTGCCCAGTAAAATCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMGTFNYGLPLRVIRSASGMKNIPSGTKLLKFSRSICRPIISFKSLGTSHSCNGLGKVTTGMSRTFPRKGCSIKKSRTCIYGYMEIFKFPKGRIVCYIHLP	6935	2441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13214_pilon_-_5930_6019
932629	contig_5013_pilon	-	1062	1	Intergenic	novelGene_110076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACTTGGATACAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20723	19661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5013_pilon_-_19700_20700
932630	contig_19737_pilon	+	2452	2	Intergenic	novelGene_158962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	941	1363	27071	27493	FALSE	55	AGGGACACCAACCCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDAALKVLTLCQEIWKIATWPADWKRSIFMPIPKKGDPTKCGNYQTILLISHASKVLLKIIQKRLQQYIDRKLPEIQAGFRRGCGVRDIIADVRWILAEREYQEYVYLCFIDYAKTFDCVDHNKLWITLRRMGIPEQLCS	18972	28582	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19737_pilon_+_19750_26907
932633	contig_6278_pilon	-	3674	1	Intergenic	novelGene_119826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGTACTTTATCTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	536865	533191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6278_pilon_-_533200_536900
932634	contig_10225_pilon	+	1945	13	Intergenic	novelGene_86797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	613.542915957981	1	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1476	1832	47280	47636	FALSE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20684	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35626_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40145_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46355_47264
932635	contig_8377_pilon	+	3521	19	Intergenic	novelGene_35121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2316.14983576806	8	45	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	507	2210	179603	197939	FALSE	20	TTCTGCTTCAGCTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	169278	199250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176707_177273_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
932636	contig_3747_pilon	+	2235	7	Intergenic	novelGene_24774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	4	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	332	1276	201313	204240	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSIADFAN	200981	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203324_204221
932637	contig_13004_pilon	+	1444	4	Intergenic	novelGene_112702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	253.8507873185	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	161	466	923669	928299	FALSE	35	TGCTATCTCAATAAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAQALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	837801	929277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_837917_923623_923840_926828_926887_928222
932638	contig_12761_pilon	+	1214	2	Intergenic	novelGene_164064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAGCACGGGGTGGTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	328690	330255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12761_pilon_+_329542_329892
932639	contig_17144_pilon	+	2227	12	Intergenic	novelGene_29250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTGAAAAAACGATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	181849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168164_168310_168996_169099_170744_170869_174562_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792
932640	contig_17427_pilon	+	1486	6	Intergenic	novelGene_30288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	250.647162361755	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTTCGCTCAAAAAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	176472	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151373_155749_155795_171334_171426_172209_172309_175413
932641	contig_18511_pilon	+	1974	10	Intergenic	novelGene_126872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	400.645436055496	2	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	223	1731	48154	61308	FALSE	20	TTTGAATGTTCTGAGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAILLSSTFIYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIRAKSSPGNSEVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFSLELEANGQPITADEYLELSLKLKKGTDQKTKSFNEPRLCIRKFFPQKKCFIFDRPAQRKNLIRLEQLQEGELNPEFVEQAAEFCSYIFSHSKPKTLSGDIAVNGPRLEILVLNYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLTEKEKEIEVERVKAESAEAANKMLEEMQKKNEQMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMEKDRAQLLAEQERTIALKLTKQLLKEGFENESKKLLKEIQDIKRRNSATGPRCIIL	35400	61551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35552_48082_48211_49187_49298_51672_51870_52218_52462_55272_55554_56905_57119_59151_59255_59753_59948_61197
932642	contig_5817_pilon	-	1124	1	Intergenic	novelGene_169581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	153	503	103499	103149	NA	80	TAAAATATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECENYQTISLISHASIILVRIIQKQLQQYIDRELPEIQVRFRRGFGMSDILANVRWILAESREYQKDVYLCFIDYTEAFDCVDHNKLWITFRRMGILEYLIMLMKNLYIVQEAVI	103651	102527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5817_pilon_-_102500_103700
932643	contig_5317_pilon	+	769	1	Intergenic	novelGene_76600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGACCAACATCGGGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	424206	424975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_424200_425000
932644	contig_3155_pilon	+	1740	5	Intergenic	novelGene_26396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	4	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	47	553	258156	261211	TRUE	40	GAATAAAGTGATGAAGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258109	262525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261504_261630
932645	contig_3747_pilon	+	1669	9	Intergenic	novelGene_24896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4881.08602157348	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	49	1197	201313	203804	TRUE	60	GAAAAAAAGAGAAACCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDSENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201264	204323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201536_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768_204103_204149
932646	contig_9515_pilon	-	1205	9	Intergenic	novelGene_73818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	166	5	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	1	807	72653	66703	TRUE	20	CCACAGTCTCAACGGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHLLPLLNIHRVHVRIDHSPEGTKQAGGVQAAEWGAGRRGLSFPVLEELLEDGTLAALGQNLHLRVWGILHAGDEALGHLEGHLPLLLVSFSPLPDVDLATEPVVQHEAVIRYEQLEWKRARVGHLGQVHLSSGIRDLIQSRGLGVCLVSRKVFLGVALLQRWLGAQDLDHLGRLLPISDNLHLGLALPLTVPNGQGQVPCLVALQDVGLATTPGKDGLTQVQDEAVPSVEAVPAQRSLRGSDVLLPLHVVEFLDGSWGGPWGGLVEC	72653	57305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9515_pilon_-_57340_66053_66246_66343_66498_66684_66852_68195_68347_68727_68822_69341_69476_71787_71873_72459
932647	contig_6439_pilon	-	2384	1	Intergenic	novelGene_154232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAATCAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218264	215880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_-_215900_218300
932648	contig_6735_pilon	-	662	3	Intergenic	novelGene_15759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATGCTGAGCTAAATAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568227	541987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542594_542790_542818_568198
932649	contig_19812_pilon	+	2084	18	Intergenic	novelGene_100997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1374	1679	35180	40325	TRUE	20	GTATTTACCTTCCTGTAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGCLILLVGLVERHEQVLLHRERCLHDAVEARLEAAQVLLFHLNLLEDFLLVGQTFSVLLCQPFPLLQLPVQACKGLLMRISHGDFSLADIWRSLLIKLL	15776	44679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_+_15946_19012_19206_19855_19975_22718_22804_22949_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29943_31750_31859_32102_32142_33048_33133_35126_35254_38512_38631_40211_40355_42335_42438_42566_42707_44545
932650	contig_17144_pilon	+	2416	11	Intergenic	novelGene_29221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTCGGGAGGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	175000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166989_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173750_174583_174760_174875
932651	contig_11983_pilon	-	2584	1	Intergenic	novelGene_172081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACATAAAGAGGCAGACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2750	166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11983_pilon_-_200_2800
932652	contig_6192_pilon	+	2434	2	Intergenic	novelGene_170335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATTTAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159305	172699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6192_pilon_+_161200_172159
932653	contig_11855_pilon	-	1376	11	Intergenic	novelGene_66975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_1	2025.0212937152	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	131	1291	1087425	1078661	FALSE	20	TACTCATGCCAGGTACTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILS	1091804	1078575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1078665_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736
932654	contig_3382_pilon	-	946	5	Intergenic	novelGene_124010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCTGAGAGAACAAATAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123518	120175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3382_pilon_-_120317_120453_120671_121874_121957_122477_122755_123289
932655	contig_14353_pilon	-	2500	1	Intergenic	novelGene_82135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TACAAAAAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300980	298480	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_298500_301000
932656	contig_16703_pilon	+	9337	16	Intergenic	novelGene_72748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1134	junction_13	1128.24458735191	11	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	638	1917	207	2123	6490	40668	FALSE	80	CAAAATAAGAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSTLACTGREFRCEDGETCIVLSERCDGFLDCSDGSDERACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSSCVYNIYYRVLGESIWKALETHSNKTSTVLKVLKPDTTYQVKVQVQCLSKVHNTNDFVNLRTPEGLPDAPQNLQLSLYSEAEGVIVGQWAPPAHSHGLIREYIVEYSRNGSKTWTSQRAASNFTEIKDLLTSALYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDDYSENSLSFTLTTDGDVKVNGYVVNLFWAFDAHKQEKRTLNFRGSILSHKVGNLTAHTSYEISAWARTDLGDSPLAFEHVMTKGTRPPTPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSVTTSLHNRTVIVSGDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTDKTSAVIKWESPYDSPDQDLLYAIAVKDLIRKTDRSYKLKSRNSTVEYTINKLEPGGKYHVIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHILLFWKSLALKEKHFNESRGYEVHMFDSAMNISAYLGNTTDNFFRISNLKMGHNYTFTVQARCLFGSQICGEPAVLLYDDLETGADASAIQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYAKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA	5730	47882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_+_5863_6415_6540_6706_6877_9183_9297_9928_10034_11219_11293_15396_15480_16921_17019_19932_20118_25958_26079_27099_27265_28512_28688_29681_29789_32822_33016_38544_38758_40600
932657	contig_14666_pilon	-	1415	6	Intergenic	novelGene_39623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	750	1286	484480	479882	TRUE	10	TCTCCGCGGGGTTCTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRASNICWVSSATDRARYCWLPRAVSGAKPGMKKCRRGKGTMFTASLRRSALSWSASGCGSRCRRGPRCRCRSRRRCSPGAGGWTGRRCRAPPRCPRLWEALQAVAALALAPDHVHHALDQLGPLGVVALGPVVAGPGVTVDKTVGLEEGSKFARSDAVHGPRLQVHQDSPGAESPW	485229	477314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_-_477395_479832_479901_483220_483317_483861_483983_484100_484237_484315
932658	contig_17144_pilon	+	1406	7	Intergenic	novelGene_29415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	71	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	895	1212	167621	168283	TRUE	15	GCTGGGGGGACCCAGACCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166073	170811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169105_170751
932659	contig_5686_pilon	-	3986	3	Intergenic	novelGene_45304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCACACATGAGGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100402	94171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_95340_96127_98347_99803
932661	contig_5894_pilon	-	3502	2	Intergenic	novelGene_83002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	148	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	2123	2641	87022	86504	FALSE	50	CTGAAAAGAGAAATTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDKIKSKNLRVMGVPEPGEKTENTQRIIEELLTENFPSIMKDEKLAIHEAQQTPYNRDPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILRAAHEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQERRQWDDIYKILKEKNYQPRITYPAKLSFKYDGESRSFPDKQKLRDYVKAKPNLQELLKGVL	198322	85642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5894_pilon_-_88003_197180
932662	contig_5643_pilon	+	1238	11	Intergenic	novelGene_38818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1857.4266095865	2	95	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	66	740	233973	237284	TRUE	15	CCAGCCACCTCTTTGTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNG	233609	238188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237326_237550_237635_237720_237819_237913
932663	contig_8377_pilon	+	1051	2	Intergenic	novelGene_34939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAAAAGAAATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68095	69353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68123_68329
932664	contig_2770_pilon	-	1344	5	Intergenic	novelGene_107450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1975.11687945296	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	750776	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743851_744644_744680_746600_746745_747765_747797_750558
932665	contig_10674_pilon	+	1783	2	Intergenic	novelGene_6441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	564	junction_1	0	7	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	462	863	209105	211925	FALSE	75	TAGGAAAAAATAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAASGSNASGSESDQDERGDSGKPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASEHSDPEDNDPSDVDQHSGSEAHNDGEDEGHRSYGGSHQSEAEGSEKAQSDDEKWGREDKSDQSDDEKIHNSDDEERAQGSDEDKLQNSDEDEEKMQNTDDEERPQLSDDDRQQLSEEEKANSDDEQPAASDNDDEKQNSDDEERPQISDEEKQNSDDERPQASDEERRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEAESDTEMPKGTPGMFLRVCFR	208643	212845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10674_pilon_+_209364_211782
932666	contig_3004_pilon	+	1218	1	Intergenic	novelGene_127526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTTCTTATAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432122	433340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_432100_433300
932667	contig_20527_pilon	+	1221	5	Intergenic	novelGene_138584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	43	669	13527	27453	FALSE	20	TACAGACAGTCCTTGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13484	28005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
932668	contig_10902_pilon	+	1412	9	Intergenic	novelGene_65689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	357.460115782167	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	38	1204	168491	209786	TRUE	35	GGGTAAGAATCAGGATCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGGFELQPQDGGPRVALAPGETVIGRGPLLGITDKRVSRRHAILEVVGGQLRIKPIHTNPCFYQSSGKSQLLPLKINLWRWLNPGDCFSLLVDKYIFRVFSTHSETEMECTLRNSQMLEEDNTLDETSKPPLINSPDEKTAAPHLEESTEIANTSTMPTKSVSVVKECGDFSQQQPDLAQRRRVLPAWMLAENLSDQTLSAPVNSGDNDVVQGSGKEGICKGKTQVNITEQGRKRLMSSRSSESLSAEEDPGKKCKNADQEESVISSEEVPQSFSAVTVRSTEVNNVKTITQRNKIPVQELDKISEQRIVTRGTPSQKDEAVSCSESCFSAQGSSSHDESPGSHPKSDSDPTKPEPSNAEATVSVPQGSEEDKAKRTSCMYGANCYR	168453	234691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10902_pilon_+_168587_178811_178884_189008_189182_196150_196299_196627_196761_201874_202060_209426_209800_218452_218579_234622
932669	contig_8420_pilon	+	2025	14	Intergenic	novelGene_69331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	282.472452445424	1	111	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	31	1053	10943	35433	TRUE	15	TTCCGTGTTTTACATTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAAAVVSGGSGPSTDTRLNQETTQWLRWDKNPLTLELVKQLVAEDNKEELQKCFGARMEFGTAGLRAAMGAGVSRMNDLTIIQTTQGFCRYLEKQFSDLKQRGVVISFDARAHPASGGSSRRFARLAATTFISQGVPVYLFSNITPTPFVPYTVSHLKLCAGIMITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDR	10912	58782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14732_14901_21336_21444_26911_26997_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35442_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
932670	contig_2730_pilon	+	1889	1	Intergenic	novelGene_135386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	108	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCCAATGCCTTCAGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	339653	341542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_339700_341500
932671	contig_7963_pilon	+	1298	6	Intergenic	novelGene_58566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	235.34689290492	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	2	9	448	456	251581	251589	TRUE	5	GTTTCTAGTGTGTTTCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYQIQFTTAIEVLLNTYPSVQKAVGSSEKIFEYLDRTPCCPASGPLASLNLEGYVQFQDVSFAYPTQPDVPVLKGLTFTLSPGEVTALVGTNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQLLLDGKPLPQYEHRYLHKQWDKSHRYLEEVFEKILPMV	250216	253523	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_250250_250407_250597_251106_251281_251529_251671_251952_252094_252903
932672	contig_19378_pilon	-	1223	2	Intergenic	novelGene_73784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACATTTTTCTTGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17290	16022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_16120_16164
932673	contig_6079_pilon	+	1843	1	Intergenic	novelGene_160127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAGATAAAAATTATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538304	540147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6079_pilon_+_538300_540100
932674	contig_4180_pilon	+	1019	5	Intergenic	novelGene_8392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	88	534	875290	888134	FALSE	75	CAAAAGAAAATAAAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875202	888619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
932675	contig_10930_pilon	-	2293	6	Intergenic	novelGene_37011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	981.844875731396	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	504	1352	276835	268388	FALSE	40	ATGCACTGGGAAACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279833	267446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700
932676	contig_15063_pilon	-	2311	5	Intergenic	novelGene_12338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1344	1763	35527	35108	TRUE	30	CACAATGGTAGAATCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	39770	28152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_28202_34608_36156_36264_36597_38972_39090_39504
932677	contig_3747_pilon	+	2345	5	Intergenic	novelGene_24944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_4	1878.15727509706	5	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	278	943	202676	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202398	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
932678	contig_6217_pilon	-	387	1	Intergenic	novelGene_109625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTTGAGTATTTAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	440776	440389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6217_pilon_-_440400_440800
932679	contig_8310_pilon	+	2379	1	Intergenic	novelGene_75612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	147	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	1733	2074	325484	325825	NA	80	AATACAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGGPVCPWPWGQQSRHPGCLPQHHLLPAPLSVASDSPLRLKPTAPLCRAVLPQPPLRSSAMSVGSTKTVSHPKRSDKAGRLTHRSKELRFGKKQSGDHKQLDCKFSEKHFGI	323751	326130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_323800_326100
932680	contig_5023_pilon	+	2244	13	Intergenic	novelGene_7271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2491.10801429582	16	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	846	1235	618569	629249	TRUE	15	GCAATCCTACTCTGCTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHVRRGRSGHLGTG	580855	647588	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611824_616348_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625805_629210_629290_639083_639197_643413_643539_646857
932681	contig_6361_pilon	-	3046	5	Intergenic	novelGene_23985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4364	junction_4	3093.03693802709	12	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	191	529	420979	415399	TRUE	25	TTGCATTATTTACTGGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPSQVVIVSQPGSGPPVQTSNWHTGLCDCFTDCEVCLCGTFCIECLACQVAGDMNECCLCGTSVAMRTHYRTKYGIPGSICDDCLVTHCCLPCSLCQMKRDIKRRIAMRTF	436455	408702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_-_411210_415388_415504_419465_419591_420870_421003_436288
932682	contig_13283_pilon	-	2131	1	Intergenic	novelGene_154025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCACTTCCATATGTAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126347	124216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13283_pilon_-_124200_126300
932683	contig_14925_pilon	-	916	5	Intergenic	novelGene_55219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1702.13579070531	5	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	215	751	29675	26007	FALSE	20	GTTGTATATTCTGCTACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAGAGNKLIFGTGTLLSVKPNIQGSDPAVYQLRGSKSSNISVCLFTDFNSSLSVTKTSEPSVFFTDKTAVDMKAIGSRSNGALAWSNNKNFACNETFYQGSFYSSSGIVCDATLMEKSFETDMNLNFQNLSVIGLRILLLKVVGHQDCRKSHAPSLLLLVVHPLPLQAEKRTLCPPWKRRLPLTLWPHLAMPPTGSYPALVIKMLKSYQIYCKSLCSLIAAFHHPVFSARGGLLPPLLAVEKHPPPKRL	67884	25841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_26327_27060_27127_27995_28041_29569_29828_67822
932684	contig_8377_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_35025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGTATGAAACAGCATGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69339	68244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68200_69300
932685	contig_7707_pilon	-	2006	1	Intergenic	novelGene_72210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGCCCCGTAGGGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	741751	739745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_739700_741800
932686	contig_6740_pilon	-	2684	3	Intergenic	novelGene_142662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	1221	1805	622837	622253	TRUE	55	AATGATGAAAAGCAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVTGYKINIQKSVGFLYTNKENDENEIRKTIPFIVAPKKIRYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLQETQRDLHKWKNIPCLWLGRLNIVKMTILPKAVYKYNAIPIQIPTTFFKEMKKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVRGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYID	624057	367530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_-_368099_520837_521142_622245
932687	contig_10930_pilon	-	1463	8	Intergenic	novelGene_37042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1817.79243780438	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	594	1433	276835	268321	FALSE	30	AATTCCTAAATATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLIIRFPHSL	280337	268290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268346_268421_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278549_279700_279832_280157
932688	contig_3956_pilon	-	842	3	Intergenic	novelGene_15240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	363	734	1290644	1289866	TRUE	40	AAAGCCCACGGTACCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGPRRHAEGQAGRGDVSRREKNVMTWGCGHALAESHPGLPAAAASEGHLQFVQEVVQGRDALLQAFALAGLGHHLAGAAGGVEGVSGQDLPVVEHTLGEGLAARVRPQVSREANDSLTGR	1291006	1284714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284802_1289844_1289891_1290297
932689	contig_18162_pilon	-	2649	3	Intergenic	novelGene_122328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16539	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
932690	contig_17964_pilon	+	2396	5	Intergenic	novelGene_33882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	454	1035	139584	142722	FALSE	25	CACCGATCAGCAGGCTCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHALLAGEIIHVVHGLEVEKGGHFHVGAAEGHDAQAEVQQLQGHQWDLGGAGSAPRGELEVGRQLDVGAQQSEQAQEEVHDLQGQEGQEVLLPVLKGRSSIVGVSLAHCQRTPNMSPHLQLSALPQIKWPSPKSSPPARLSSGHPIWVHSGTLGAARSQDPGLESWCCRRRMCKGTGPVYRDTCFRGSRSKS	135345	144083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17964_pilon_+_135637_136899_136997_139518_139617_140844_140967_142295
932691	contig_16722_pilon	-	705	2	Intergenic	novelGene_118291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	282	junction_1	0	1	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAGGAAAGGCAATTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132460	130821	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16722_pilon_-_130886_131819
932692	contig_3956_pilon	+	1723	4	Intergenic	novelGene_15281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2250	junction_2	87.2136584614028	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	644	1411	1288971	1290491	FALSE	65	CAAAAAAATTTAAAATTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1288327	1290803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932693	contig_10005_pilon	-	1215	1	Intergenic	novelGene_148918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAGAACGAGAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149368	148153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10005_pilon_-_148200_149400
932694	contig_16964_pilon	-	1349	1	Intergenic	novelGene_143127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCACCGTCTTGACCTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	202318	200969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16964_pilon_-_201000_202300
932695	contig_4531_pilon	+	1604	1	Intergenic	novelGene_47843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAAAGTATCTCTATTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94722	96326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4531_pilon_+_94700_96300
932696	contig_8269_pilon	+	1239	1	Intergenic	novelGene_106253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTTTCTGAGTTGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348041	349280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_348000_349300
932697	contig_10424_pilon	+	2366	1	Intergenic	novelGene_56793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAATATTTTAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	259472	261838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_259500_261800
932698	contig_3095_pilon	+	1240	5	Intergenic	novelGene_74998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	90	junction_3	3292.9636632523	6	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	68	826	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_151002_151163_151848
932699	contig_16666_pilon	+	2182	2	Intergenic	novelGene_61775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	170	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	26	1159	106098	117928	FALSE	70	AACAAAATAAATAAAATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALASATARMRTGWLIGTSRGLLPGPSEELTMSSPSPESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLETLKLFRFFSSCDVKKDLRLALSVTETVAFGHCCLNPLIYVFAGEKFRRYLYHLYRKCLAILCGGSVHIHFSPSESQSSRRESVLSSNSPHYMSDGDTSILL	106072	118951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_106155_116851
932700	contig_12605_pilon	+	1069	4	Intergenic	novelGene_64217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4099	junction_3	1912.54548239309	4	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	425	1069	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	4130	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_4535_4795_5072_5728_6005_6124
932702	contig_9609_pilon	+	3717	19	Intergenic	novelGene_22937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	587	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	1097	1651	76769	77921	TRUE	25	TCCGAGGCAGTCAGCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWLASNSRGWGHCLRPDQKGVPSSSTFSGGKHLKSCMMLSWKHSCQCPRAHATQSCQVCGRTLRTPRTGCSRVSTCGPSMSAREVDALLMAIDGLGRQSEEPLKLILGPLQSVLNSAGKEPHSTDRIGGILRSCSRGGGSVGLSHVRHEHRGTSPGALGACLQQWLQIVGAASSHIASGLETV	72839	80698	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_+_73063_73494_73592_73671_73766_75368_75561_75654_75750_76028_76109_76311_76446_76587_76773_77019_77093_77177_77367_77455_77522_77618_77822_77901_78069_78149_78301_78380_78467_78623_78731_78929_79600_79692_80123_80223
932703	contig_5023_pilon	+	2040	12	Intergenic	novelGene_7299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2222.47150787266	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	54	1262	607279	643495	TRUE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGNCQVPLTMTF	580875	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625852_643467_643539_646857
932705	contig_12142_pilon	-	2605	1	Intergenic	novelGene_147838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	151	456	887	1342	220119	219664	NA	35	TGAGACTAACGAGGTACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQTTKDKLDNWDLLKIKHLCCSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSEKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHLTKEDIQMANRHMRKCS	221005	218400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_-_218400_221000
932706	contig_12019_pilon	+	765	3	Intergenic	novelGene_87677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	106	420	5225	8336	FALSE	15	TCCTGTGATGTTATGGATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPEWPGRGGWGCLHRPDPEWRLDLPDPVMLETIPQSGEVYSCQVEHPSLTSPLTAEWRAQSESAQSKMLSGIGGLVLGLLFLGVGLFIHFRNQKALSPSGILS	5119	8681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_+_5400_6114_6226_8307
932707	contig_10661_pilon	-	2498	1	Intergenic	novelGene_174744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTAAATACTACTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	148240	145742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10661_pilon_-_145700_148200
932708	contig_5590_pilon	-	2990	2	Intergenic	novelGene_163008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	135	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAGCCAACAAATGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268114	264952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5590_pilon_-_265388_265559
932709	contig_11574_pilon	-	1455	7	Intergenic	novelGene_64096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	313.395782783793	2	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	242	1408	456525	449890	FALSE	25	GTCCAAGAGCCGAGTGACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	463696	449842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451628_454828_454889_456384_456540_462651_462686_463503
932710	contig_12250_pilon	+	2635	2	Intergenic	novelGene_80514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	963	1292	123254	123583	FALSE	40	TGAGAATAGCAGCACAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIAALFTIAKRWKQPRCSSTDERINKLWFIHTTEYYATIKNNNEAVRHLITWRKLEVIMLSEFSQSQKDKYCIRPLLEELKKRFKHRRKHSLMVMRVGREGEGYSLTR	3484	124926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12250_pilon_+_4433_123239
932711	contig_7031_pilon	-	1065	1	Intergenic	novelGene_132799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCTGTTAAAACCCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	335730	334665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7031_pilon_-_334700_335700
932712	contig_15047_pilon	+	1341	6	Intergenic	novelGene_52140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	2	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	28	651	2194	4178	TRUE	45	TTGAGAGAGGAAATAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2166	21622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4205_4649_4676_20984
932713	contig_16999_pilon	-	1894	1	Intergenic	novelGene_84950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACGCTGCAATGTAAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25551	23657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_-_23700_25600
932714	contig_10953_pilon	-	1090	7	Intergenic	novelGene_42589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	215	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGCTGCTGCTGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	464448	455215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_-_455320_459734_459779_460338_460401_461121_461217_461546_461636_463463_463527_463815
932715	contig_14732_pilon	-	1041	1	Intergenic	novelGene_169710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGAGATTGTGATGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	96781	95740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14732_pilon_-_95700_96800
932716	contig_8991_pilon	+	1420	1	Intergenic	novelGene_170941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226533	227953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8991_pilon_+_226500_228000
932717	contig_10134_pilon	-	2197	5	Intergenic	novelGene_16255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	713.292147370206	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAGCATTTGAAGTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39210	32507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33731_34922_34951_35024_35178_37632_37774_38558
932718	contig_10176_pilon	-	1668	10	Intergenic	novelGene_72723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	276.32258836278	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	75	632	274981	267902	TRUE	35	AATACATGCTCATCCACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QVVLELIELRELGAARSLLRQTDPMIMLKQTQPERYIHLENLLARSYFDPREAYPDGSSKEKRRAAIAQALAGEVSVVPPSRLMALLGQALKWQQHQGLLPPGMTIDLFRGKAAVKDVEEEKFPTQLSRHIKFGQKSHVECARFSPDGQYLVTGSVDGFIEVWNFTTGKIRKDLKYQAQDNFMMMDDAVLCMCFSRDTEMCGRFRVDSV	275055	260624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10176_pilon_-_261167_263046_263149_264224_264393_267068_267196_267804_267933_268593_268677_270329_270450_271918_272048_273752_273864_274897
932719	contig_6102_pilon	-	1856	7	Intergenic	novelGene_32157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	605.201183262411	1	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	237	686	867239	841181	TRUE	20	CTCTAAATCTTTGAGCCGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDVSL	867475	838834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_841168_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
932720	contig_11512_pilon	-	2365	7	Intergenic	novelGene_43302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	406	junction_5	337.193523398986	3	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	174	1004	396169	367967	FALSE	35	GATGAGAGAGAGAGTGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPERPQPSPEGLDTDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRENYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396342	366605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378299_381695_381783_382663_382764_396108
932721	contig_19957_pilon	+	1144	1	Intergenic	novelGene_57736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACTGCTATGGTGTGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302988	304132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_+_303000_304100
932723	contig_16622_pilon	-	1874	5	Intergenic	novelGene_48493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1590.80472953157	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	513	908	115450	112952	FALSE	40	ACTTAAAATACTTTAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121938	111985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115469_121444
932724	contig_8773_pilon	-	2571	1	Intergenic	novelGene_74518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	1437	1838	29392	28991	NA	25	CGAGGTACAGTAGTCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRKLEIDIAFDPAVPLLGIYPREIRFVTQIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNDESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYYMRPLL	30828	28257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8773_pilon_-_28300_30800
932725	contig_16496_pilon	-	1535	2	Intergenic	novelGene_5195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	1	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
932726	contig_3095_pilon	+	1223	5	Intergenic	novelGene_75016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	ATTGGATGGGTCTTAGGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932727	scaffold_12124_pilon	+	1821	7	Intergenic	novelGene_22289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1991.39708077855	6	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1314	1649	1508963	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAATPLHLDTACTQIFSASKYLYPDTQLYPAYRYSPASRYSFTSRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489098_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509100_1509206
932728	contig_15146_pilon	+	1303	1	Intergenic	novelGene_116942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAAAAAAAAAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	229573	230876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15146_pilon_+_229600_230900
932729	contig_14925_pilon	-	1677	5	Intergenic	novelGene_55300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	2	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
932730	contig_854_pilon	-	1735	1	Intergenic	novelGene_36350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	85	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGTGTTGGAGTAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	976420	974685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974700_976400
932731	contig_14450_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_48923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAGCAGTAGGAAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	22785	21261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_21300_22800
932732	contig_9011_pilon	-	1628	1	Intergenic	novelGene_159325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCACCTGGCCCACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564910	563282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9011_pilon_-_563300_564900
932733	contig_9098_pilon	-	2869	7	Intergenic	novelGene_75836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	65	junction_1	151.576163473461	8	103	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	1439	2422	345375	335775	FALSE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTCGISAPYPVHPYELCLPSSFSMQILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	346813	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156
932735	contig_6412_pilon	-	1679	2	Intergenic	novelGene_149963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAACATAATGCCAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254468	252734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6412_pilon_-_253898_253952
932736	contig_7870_pilon	+	1420	2	Intergenic	novelGene_109083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGACTCTGCACTCATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	785119	786734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_785322_785516
932737	contig_12402_pilon	+	2741	2	Intergenic	novelGene_133390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1031	1429	652161	652559	TRUE	35	GTCCCACCAAGAAACTACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNIGKNGNSRTLYCSHEEPVMDQDAVVHTEQGDTVWFKVKKGVCQGCIFSPNLFSLYAEQIIRKAGLYEGEWGIRIGGRLINNLHYADDASFLSENEEDSKHLTDEDQRPQTLVWITVQHKENKNPHNWAK	651130	689293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_+_653621_689042
932739	contig_8375_pilon	-	1446	1	Intergenic	novelGene_141317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	87	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACATCGTCCATGTTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222546	221100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8375_pilon_-_221100_222500
932740	contig_3380_pilon	-	1977	1	Intergenic	novelGene_60137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAGAAATGATGAAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	608303	606326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3380_pilon_-_606300_608300
932742	contig_9363_pilon	-	2150	17	Intergenic	novelGene_6604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	813	junction_16	494.485144967723	1	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	544	1635	243	1877	761958	754431	FALSE	20	TGGGTGAAGACACTGTTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	765916	754157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791
932743	contig_14666_pilon	+	1692	4	Intergenic	novelGene_39559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1676.85108329737	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	121	1407	477340	484940	FALSE	65	CTTTATTAAAATAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477219	485225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477357_479863_479944_483205_483317_483861
932744	contig_14142_pilon	-	2074	9	Intergenic	novelGene_120529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	647	junction_6	170.267436698859	1	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	880	1569	351273	349539	FALSE	5	CTGCCTGTTTGGGCTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	354091	349033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350523_350605_350750_351180_351810_352763_352904_353497_353631_354021
932745	contig_6898_pilon	+	2974	6	Intergenic	novelGene_35758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3511	junction_5	1472.93576234675	2	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	35	916	119670	125646	FALSE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	119635	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
932746	contig_10904_pilon	-	1056	1	Intergenic	novelGene_22690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	156	471	8	478	588499	588029	NA	55	AAAGAAAGGAAACTTTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEKATNAVTEMNGRIVATKSLYVALAQRKEELQAHLTNQYMHRMASVRAVPNPVINPYQPARLSGYFMAAIPQTQNHAAYYPPSQIAQLRPVLAGLLRVPELIHSKICLVLSAQLLLDYHLVLETSFFTGSTSHVNTTC	588506	587450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_587400_588500
932747	contig_9751_pilon	+	3440	2	Intergenic	novelGene_177537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	117	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	2097	2462	27554	27919	TRUE	80	AGGAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSSVLVWTPFGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	25457	29456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9751_pilon_+_28591_29149
932749	contig_6489_pilon	-	1524	1	Intergenic	novelGene_128930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	41	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	885	1262	190878	190501	NA	40	AAAAATACCCTGAAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHHQLSQPPVVKENEEQQRHKESSSPRNRKGHVNKRFHQPETGRTKWCLAVTHDRPDREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTETGGTPESMTPGFSISPELKQFPRPTLQAGIGLDCGT	191762	190238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6489_pilon_-_190200_191800
932750	contig_7207_pilon	+	3432	1	Intergenic	novelGene_72093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GGAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	710327	713759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_+_710300_713800
932751	contig_3956_pilon	+	3083	15	Intergenic	novelGene_15097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1498.55317978811	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	78	1229	1281682	1286416	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKDAPLAACWGCAAADDHHPPALACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281604	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286089_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289225_1289493_1289623_1289786_1289892_1290297
932753	contig_990_pilon	-	2437	1	Intergenic	novelGene_76173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGATCTTTTACGTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2014637	2012200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_990_pilon_-_2012200_2014600
932754	contig_14740_pilon	+	2495	1	Intergenic	novelGene_174680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	255	578	27894	28217	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPLKPVQHHSNTQTTIDRRVVAALEVRWLGLKHRCLHGGENSTTEPQLPLISSLEGSLSCSSDLPLPTQFMEIPELWKSDFVSSIVHNACKEHQRKVYDIRIKLL	27639	30134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14740_pilon_+_27600_30100
932755	contig_15365_pilon	-	4051	2	Intergenic	novelGene_111136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	118	423	140270	139965	TRUE	20	TCTTAAACTCCTCTTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPLALPVINFYLDGVVVREDTLYYLFVLEFVEYCSVPKMWSVLENVLCALEKNVYFAPVGWSVLYMSVRSNRLTVPFRSFVSLLSCFQNVLSFTDSGVLKSPAITVELSISLFSAVRVCFLYFGALSLGAYIFIMVMSS	140387	136206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15365_pilon_-_139310_139439
932756	contig_11574_pilon	-	2581	11	Intergenic	novelGene_64079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	312.326495834087	3	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	556	1983	454111	449890	FALSE	20	CATATTAGTTCTGTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	462853	449291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456522_462651_462686_462778
932757	contig_10953_pilon	+	1475	9	Intergenic	novelGene_42591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	18996.4569509027	11	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	39	923	455261	463908	FALSE	15	GAACACGTCTGGCTCTGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKNPEGRPEARAMEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKALTKCQEEVSRIPAIHPGMFRPKCDENGNYMPLQCYGSIGYCWCVFPNGTEVPHTRSRGHHNCSEPLELEDLTSGLGLTKQASDTSHPYMATAFLLPPHPPV	455222	464460	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_462728_462921_463465_463517_463843
932758	contig_9538_pilon	+	143	1	Intergenic	novelGene_176463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCCGGTGGTGCGCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29265	29408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9538_pilon_+_29300_29400
932759	contig_12391_pilon	+	1404	9	Intergenic	novelGene_103602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	270.724490949748	1	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	3	899	56804	107341	FALSE	25	TGTCAATTCTTCAAACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGININGPTN	56801	107846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12391_pilon_+_56858_82438_82553_82755_82834_94095_94222_96549_96640_96773_96852_98719_98895_101754_101916_107320
932760	contig_8829_pilon	-	2854	1	Intergenic	novelGene_140942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCAAAAAAAAAAAAAAACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9119	6265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8829_pilon_-_6300_9100
932761	contig_10734_pilon	+	2206	2	Intergenic	novelGene_51461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1571	1876	2264610	2264915	FALSE	5	TCTTTGCCTGGTTTTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSMYSIISSANRESLTSSLPIWMPFISFFCLIALARTSSTMLNRSGGKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAIGFA	2262405	2265245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2263005_2263638
932762	contig_4429_pilon	+	1552	1	Intergenic	novelGene_50773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTGTACTTCTTAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6105	7657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_6100_7700
932763	contig_13786_pilon	-	2484	1	Intergenic	novelGene_174574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	119	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATACACCTAGAAGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136476	133992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_-_134000_136500
932764	contig_3747_pilon	+	2627	7	Intergenic	novelGene_24762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	55	junction_1	4374.27661638661	2	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	333	1232	201313	203804	FALSE	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200980	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201415_202364_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
932765	contig_17144_pilon	-	2157	12	Intergenic	novelGene_29264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2097.67994234008	2	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	582	1749	114	1862	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVGAWLAAPAPGDECCWYRFFTDGVTETQKSELSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKGSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183192	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_168992_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174978_181820_181888_183158
932766	contig_12677_pilon	-	712	1	Intergenic	novelGene_110874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTAATGACACACCAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3663	2951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_3000_3700
932767	contig_11056_pilon	+	2582	1	Intergenic	novelGene_130350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	30	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGACAGACTGACAGACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26739	29321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11056_pilon_+_26700_29300
932768	SIRV7	-	909	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	-15	-7	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	27	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACATGAAAAATCCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147940	56044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70859_70988_78841_78964_114686_114961_147608
932769	contig_8377_pilon	+	2612	15	Intergenic	novelGene_35002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3795.10791772024	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	560	1683	395	2077	128927	173800	FALSE	35	CTGCTTCCACTAAAGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERGKYANFLLMNIHTLTFESIQFKKEFSAFDLTQIFSVDET	68148	174335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68334_128717_128934_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646
932770	contig_9177_pilon	+	2801	22	Intergenic	novelGene_32647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	48.5451376091111	2	119	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	1283	2713	105101	109340	FALSE	20	AGTCATGGTGTCATAGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFLHNSIIASHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTIGMQKADIYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPFFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGGCGDEGKGKDANLLAPRREERTCWTPVNPTSSQVRQSPVAGTWVGNGYHLSIHQKWTMSWDGNHQAQKPYLSVEVIALCSSALYI	57868	109428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_57938_93432_93639_99894_100009_100303_100440_100685_100781_101008_101142_101378_101453_101959_102081_102242_102318_102531_102610_102825_102932_103075_103148_105097_105258_105449_105606_105683_105853_106001_106149_106639_106764_106956_107026_108265_108441_108511_108611_108874_108968_109098
932771	contig_8377_pilon	-	1879	17	Intergenic	novelGene_34985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAATTTCCTCCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180505	68112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68139_68219_68354_137708_137737_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154990_161224_161393_164388_164588_169243_169304_172896_173004_173644_173680_176587_176697_177247_177343_177430_177529_179558_179664_180381
932772	contig_9706_pilon	-	1547	1	Intergenic	novelGene_20766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGGTCGGGCTAGGCTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1706	159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_200_1700
932773	contig_11175_pilon	+	2168	1	Intergenic	novelGene_61183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	38	394	389268	389624	NA	15	GTTTTTCTTCTATTGTATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLKVIKNEMEHININILGICELKWTSIGHFELDNHMVCYARNDRLRNGVAFIIKKNISGSVLKYSAVSDRIISICLQENLLLNIEQLERMEEVMKKRAEQKISKGGLRRQSKVL	389230	391398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11175_pilon_+_389200_391400
932774	contig_1516_pilon	+	1971	2	Intergenic	novelGene_50026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCATTGATCCATTTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	474004	478652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_475558_478234
932775	contig_3956_pilon	+	3160	15	Intergenic	novelGene_15020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1312.10131359696	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1263	2639	1286460	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284065_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286416_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932776	contig_10583_pilon	+	2329	2	Intergenic	novelGene_167920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGGATGTAGAAAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222692	225088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_+_224835_224901
932777	contig_10323_pilon	+	2072	2	Intergenic	novelGene_123576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCCACCTTACCTGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	458014	460133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459336_459382
932778	contig_8447_pilon	+	2641	1	Intergenic	novelGene_69403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGTGCCCAGCACATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37295	39936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_37300_39900
932779	contig_5502_pilon	+	1199	4	Intergenic	novelGene_154975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	627.635244389606	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	202	513	395703	398610	FALSE	25	ATCTTGGTTGTCTAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRQPAAARQRHDRYAAPKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	357681	399296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357732_377756_377826_395620_395841_398436
932780	contig_9535_pilon	-	2545	1	Intergenic	novelGene_124463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAACAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	222428	219883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9535_pilon_-_219900_222400
932781	contig_15063_pilon	+	1786	8	Intergenic	novelGene_12275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_5	3710.21927950907	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	225	1418	28164	38987	TRUE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27939	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36352_36486_36569_38975_39092_39506
932782	contig_8310_pilon	+	3754	21	Intergenic	novelGene_75557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	358.315656928357	847	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	479	1440	996	2435	296664	324814	FALSE	75	ACAAAAAAGGAAAAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCMEDCIVLVDYTVRKFCIQSLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVRTLNPTHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMDMMHTEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVASLEKHLQTLHGSASHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLPHTVEDFWRMIWEWKCHTIVMLTEVQEREQEKCYQYWPAEGSVTHGEITIELKSDTLSEAISMRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	215095	326133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_215184_272452_272569_278058_278251_279371_279475_279714_279789_283388_283526_290040_290132_294706_294784_295395_295478_296628_296727_302457_302578_303836_303998_307971_308108_308705_308856_309224_309319_310953_311031_313065_313201_316632_316759_317718_317886_320576_320713_324739
932783	contig_6980_pilon	-	1302	3	Intergenic	novelGene_36073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGACCATTTCTGGCTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	373891	370586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_-_370639_371428_371522_372734
932784	contig_3747_pilon	+	2266	3	Intergenic	novelGene_24945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6234	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	957	1283	203794	204120	FALSE	40	TTTGTATGGTAAAAATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	202408	205103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_203080_203329
932785	contig_14666_pilon	+	1288	5	Intergenic	novelGene_39580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	2	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	519	998	484461	484940	FALSE	85	TTAAAATAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485230	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_483968_484410
932786	contig_8386_pilon	-	2558	2	Intergenic	novelGene_82230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	594	908	57535	57221	FALSE	75	ACCACATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKTTMRYHLTRTLLAQIKKTENNTCWRGCGEIGTPMHCWWECKMVQPFWKMIWRFLKKPETEISHDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICIPMFTVALFTVAKR	58228	55570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_57793_57892
932787	contig_9053_pilon	+	2523	2	Intergenic	novelGene_87929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	868	1206	112256	112594	FALSE	25	CCTCTTTCCATTACGAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNDMSVSSFLRKRHIIFQNGCVILHSHQQCIRVLISPQPLQHLLFPVFLIRASNARVRCYLIVVLICISLMASDSEHFLMCLLPI	111346	113911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_+_111536_111577
932788	contig_19459_pilon	-	772	4	Intergenic	novelGene_59862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5073.27674081445	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	7	438	16240	7003	FALSE	10	TGTCTTCTTGTATTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIMASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAEENAVPIQHNNRPPQPLKGRIVRASF	16246	6668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7081_12584_12704_15503_15702_16203
932789	contig_15047_pilon	+	1399	6	Intergenic	novelGene_52169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	24	647	2194	4178	TRUE	20	GGAGACTAGCCCACCCTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2170	21376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
932790	contig_1725_pilon	+	2514	15	Intergenic	novelGene_24270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	635.509742374624	4	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	1483	2193	249033	255543	FALSE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201404	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207421_240093_240131_244924_245069_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
932791	contig_7707_pilon	-	1819	1	Intergenic	novelGene_72189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	1468	1818	606471	606121	NA	80	CAAAAACAAAAAAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKIPTQEAHRIPHKVDPKTKSPRHIIIKLTKTKDKKRILRAARDERKVIYKGKSIRISSDYSAETMQARRQWDDIYKALKENNSQPRSIYPAELSLKYYAEIRVFPDKQKFREF	607938	606119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_606100_607900
932792	contig_2093_pilon	+	1841	1	Intergenic	novelGene_152955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCTGGGCCAATCCCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1014734	1016575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1014700_1016600
932793	contig_854_pilon	+	2632	17	Intergenic	novelGene_36622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3997.02135189443	6	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	167	1876	1702628	1712283	TRUE	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGGAALQGAAGQAHGHAEEHQPQLRPLHHPQQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGPGIGGEAAPGGSHRPAGGGAGRGAEQHGAGERSAEEGKPAD	1692683	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692779_1702556_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711756_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1715013_1716283
932794	contig_12570_pilon	-	3422	3	Intergenic	novelGene_79336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	100	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTTGCCCATTTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257864	83176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_-_83762_254983_257435_257478
932796	contig_4496_pilon	-	1660	1	Intergenic	novelGene_66611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGAGAGACCAAAGAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	521607	519947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4496_pilon_-_519900_521600
932797	contig_4505_pilon	-	2555	4	Intergenic	novelGene_176039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	203	520	261123	260806	TRUE	30	GCAGCACGACTAACTTTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFWILLRIALWPKMWSILENVPCALEKNVYFAAVGWSVLYMSVRSSWLIVPFKSSVSLLSFFLVVLSFTESGVLKSPTIIVELSISLFSVVRVCCMYFGALSLGA	261325	154361	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4505_pilon_-_154553_155410_156772_157348_157757_260730
932798	contig_5302_pilon	-	1503	4	Intergenic	novelGene_81455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	290.385184807275	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	63	617	181037	176743	FALSE	25	TTTAATTTAATGTTACTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYVKEEALKGKAPRIQHRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTSTATGISQIGSLAGPRHLASSRSPPPERRRQSPKARAIDSNCSEWWGSDVLMYHLMTGIPCAFYHLSC	181099	175856	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176844_176931_177300_179917_179961_180994
932800	contig_3956_pilon	+	880	4	Intergenic	novelGene_15242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1222.82332693194	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	134	730	1286460	1290847	FALSE	10	GGTATGGTGGTGACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1284733	1290997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284817_1286409_1286606_1287276_1287338_1290457
932801	contig_1225_pilon	+	2910	3	Intergenic	novelGene_44155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	261.5	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTGGCCTGGTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250597	276797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274232
932802	contig_15376_pilon	+	935	2	Intergenic	novelGene_154693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	8	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAGCAAGGCCTGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233355	255770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15376_pilon_+_234278_255757
932803	contig_1262_pilon	-	2750	2	Intergenic	novelGene_133552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	336	806	339238	251878	FALSE	75	CACCAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLMDRGRLNIVKMTSLPKAIYKYNAISIQIPTAFFKEMEKLIINFIGRKKPQISITLLQKNNKVGGLALPDFRTYYTITVVKTAWYWYNDRDIDQWNRTENPDVNLSTYGHLIFDKGPKSIKWGTDSLFNKRCWQNWMSICKNNETGPIPHTINKN	339573	249933	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1262_pilon_-_252207_339096
932804	contig_19402_pilon	+	3864	13	Intergenic	novelGene_80789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_12	1138.24538459664	4	98	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	25	1554	29462	143862	FALSE	15	CTCTTGCTGCAATTTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCKVYLLDDTVYECSVEKHAKGQDLLKQVCQHLNLLEKDYFGLAVWDNGTSKTWLDPAKEIRKQISGFPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQELYYPQLPALLPPKRKPAK	29437	146172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_29516_36971_37077_47346_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_130468_130598_143802
932805	contig_10766_pilon	-	3796	19	Intergenic	novelGene_151199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCGGCCATCTAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	194604	135126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10766_pilon_-_136253_138017_138086_139434_139570_142318_142403_143671_143733_143822_143962_147220_147332_153837_153932_155159_155252_155833_155877_156256_156416_161130_161286_172721_172872_174940_175019_188128_188277_189821_189922_190638_190718_191116_191214_193727
932806	contig_1450_pilon	+	2771	20	Intergenic	novelGene_27367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	425.69933337706	2	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	835	2508	70	2577	244426	355748	FALSE	80	TGCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244356	355942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_309009_322511_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
932808	contig_6557_pilon	+	756	1	Intergenic	novelGene_32969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCAATGGTTAAGCGCTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	384208	384964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6557_pilon_+_384200_385000
932809	contig_5210_pilon	-	2530	4	Intergenic	novelGene_65426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGTCGCGGCCGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467077	459108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5210_pilon_-_459345_460037_460237_463028_463204_465157
932810	contig_10907_pilon	-	1638	1	Intergenic	novelGene_144913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	35	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	645	944	55156	54857	NA	40	AGCCCGCAGGAGAAATGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPIGNIMINGENIEAVNDFILLGSTINAHGSGSQEIKRCTALGKAAKDLLKMWKSTDVTLRTKVHLTHVVFLISSYACESWTMYKEDRRIDACELRCW	55800	54162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10907_pilon_-_54200_55800
932811	contig_4091_pilon	-	6030	6	Intergenic	novelGene_172989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1170	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTGGGAAAAGAGGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61897	10679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_11290_21114_21308_21411_21460_26750_27508_28178_31416_60712
932812	contig_6208_pilon	-	2632	10	Intergenic	novelGene_53030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	480.898952451693	3	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	141	2555	513736	492303	FALSE	35	AATAATGAGACTGATTCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENSSDSDSSCGWTVISHEGSDTEMVNSERGLASDSRELTPECSSLEQEELQVLQSEQGENSQNCTMLTGETAYSAVEETRSALKAEEGKSPEDNVYFGTVSDDSDIVTLEPPKLEEIGTQEEAVIVKEAQSPEDFNMGSSSSSQYTFCQPETERWWEKLWKIPECIRGWDDQLKHHVPSQPAFQVFPSQPGGDESSSDDTSPQPSPALRRRRARRRTVSGSDSEDREAHPSKEAVPKRQFTSGLNKCVVLALVIAVSMGFGHFYGTIQVQKHQQLVRKLQEDELNDVKDSLSPCQQEQESLTDYKSLKKNLARCWTLTEAEKMSFETQKKNLATENQYLRLSLEKEEKALRSLQEELRKLREQIRVLEDKGTSTELVTENQRLRQHLEEEQKKTHSALSQRETFLAEAKMLKKELDRERLLTAALRAEVQQLGSSQSYGNPDSPNVLTEKREIEALRGRLSALEQKLTFEQQRSDLWERLYVEAKDQTGKQETDGRKKGGRGSHRAKTKSKETFLGSVKETFDAMKNSTKEFVRHHKEKIKQAKEAVKENLKKFSDSVKSTFRHFKDTTKNIFDEKGNKRFGAPKEEAAKKSGTVYREYLHPQYKATTQNRNSRGPTGQRAGRREKPIHSGKHTNSQRCSAEHDCSENYHSVRKGCSDVFDCARQESISLFNVVLNPVRIDEFRQLIQRYLLKELDGFHHWKELDQFISQFFLNGVFIHDRKLFIDFVSDVKDYLKAMKEYQVDDDGAFENLDGYIYRHFLGDTFSPPYGPRIIVDKVRRTIQEGRPGQPDVLTCVLLIQNF	530178	492225	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_492397_492897_494298_496608_496731_503057_503298_505007_505104_507293_507499_508305_508383_510804_510926_513676_513748_530049
932814	contig_6710_pilon	-	569	2	Intergenic	novelGene_92325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	11731	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	657511	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EASFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657513	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
932815	contig_2730_pilon	+	2067	4	Intergenic	novelGene_135365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_3	173.013165844555	1	111	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GTTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291622	392475	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685
932816	contig_7342_pilon	+	1242	8	Intergenic	novelGene_71239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	379.974435230282	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGTAAAGTGACTTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	718421	734867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_718449_722812_722878_722979_723168_726444_726528_728490_729008_730009_730111_734516_734667_734756
932817	contig_12677_pilon	-	438	2	Intergenic	novelGene_110690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	885	9	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_309_746
932820	contig_15063_pilon	+	1602	5	Intergenic	novelGene_12100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3970.56576573163	2	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	238	1413	34808	36661	FALSE	10	CCCTGCCTTTGCCTGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNYWDQGTVVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27533	36850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27577_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36266
932822	contig_15063_pilon	+	2036	7	Intergenic	novelGene_12267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2152.83526231495	1	97	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	487	1464	357	1820	28164	39515	FALSE	40	ACTTGTGGCCATGAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSASLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27807	39731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34628_34926_35034_35380_35836_36158_36266_36600_38975_39092_39506
932823	contig_15449_pilon	+	1300	3	Intergenic	novelGene_33613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_2	221.5	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	2	298	51206	54621	FALSE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	51204	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_51330_51809_51932_54570
932825	contig_16594_pilon	-	4691	11	Intergenic	novelGene_53812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2864.56375212701	1	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	325	1524	272836	121101	TRUE	45	GAAATTGCCCTAATAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	273160	115154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115318_115564_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_134026_134081_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
932826	contig_5031_pilon	-	1990	3	Intergenic	novelGene_133176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAGAATTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	130923	21955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_22978_23417_24327_130864
932827	contig_12624_pilon	-	2789	2	Intergenic	novelGene_61094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3104	junction_1	0	18	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	132	392	903621	900246	FALSE	10	CCATTCATCCGTTGGTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARKINTWGSWAALLGETPLLTHSLPPSLSCLLAASRPPGFHLTMSLAEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFTAVQDPHSRICFNIGCMHTILENMPDAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYRTEK	903752	897848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_-_900333_903447
932828	contig_13945_pilon	+	3326	3	Intergenic	novelGene_173456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGAGTAGAATGGCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76008	91886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13945_pilon_+_78608_78821_79533_91870
932829	contig_14666_pilon	+	1423	5	Intergenic	novelGene_39525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	50	junction_4	33.7379608156747	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	107	697	444587	446376	TRUE	10	GGGGCCGTCCTCCTCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHIVAYAASVVEAWKKVLPGRWTSCSALGAPGMGLQESSSWASVHRTVTVLNSSRNVCAVSLILVQTLM	444280	447855	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_444384_444583_444715_445537_445704_446079_446741_447493
932830	contig_17800_pilon	-	1360	2	Intergenic	novelGene_179215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	450	911	1360	2891	2442	FALSE	70	TCAGAAAAAAGAACAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDTSPVEENTLDVPDKELKSVVLGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLKNKISEIDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKRLDTTLFQEN	151144	2441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17800_pilon_-_2944_150286
932831	contig_6740_pilon	+	2229	1	Intergenic	novelGene_142686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	24	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTAATAATTCTTGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	623159	625388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_623200_625400
932832	scaffold_17542_pilon	+	2530	2	Intergenic	novelGene_139232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	121	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCCTCCAAGGTCGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382443	385104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_382539_382669
932833	contig_13300_pilon	-	2126	3	Intergenic	novelGene_125771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	740.5	2	101	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACATCCGCTGTAATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49714	45541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45893_45933_47630_49635
932834	contig_5302_pilon	-	1886	3	Intergenic	novelGene_81433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	616	junction_1	614	21	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	1132	1506	176322	175948	FALSE	25	GTTTCCTTTTCAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSGFSSEQLEIFPEKLTCLSSPNTKFPASHKWLQSTVQRSYGPNLVCIPSDSENFFHRSISSSSMSSQFLGSCERGQTPDLQQLVPIFQQHQTRPPSLSLRSCRKGRGKWRTITTKARSPEDL	181103	175567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998
932837	contig_10734_pilon	-	6566	2	Intergenic	novelGene_51207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1223	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATCTTGAGCAGGAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1140849	1132734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_1132783_1134331
932838	contig_10904_pilon	-	1044	2	Intergenic	novelGene_22612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTCTGTGTGTGTATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	505494	499132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_-_499812_505129
932839	contig_13888_pilon	+	3442	4	Intergenic	novelGene_151786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	758.961278473561	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	106	597	337589	338879	TRUE	40	AGATAAACAGAGGTTTAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YNCGLKPVKEASTLSEPVIGSISACGASCLSERQTMRATLAVTAWMVSLVSCYSYTSTTLPDIENEDFIQDCVRIHNKFRSEVNPTASDMLYMTWDTKLAQIAKAWAKTCQFKHNEQLKPPHKLHPNFTSLGENIWTGSVSIFSVSSAITNWYSEIKYYDFKTRKCQKVCGHYTQVSICPIISLNYHFKGKEKTGILC	337483	345098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_337763_338561_339363_342670_344133_344198
932840	contig_1225_pilon	-	3394	4	Intergenic	novelGene_44104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAAGAATGTTGCTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	112786	75	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_-_1617_2062_2590_23197_23344_111606
932841	contig_11551_pilon	-	1182	1	Intergenic	novelGene_168478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	144	435	249	683	564098	563664	NA	75	ATTAAAAAAAAAAAAAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFAITSYACESWTMNKEDQRRINAFELWCWPRILNIPWTAKRTNKSVWEEVQPECSLEARMARLCLTYFGCVIRRNRSLEKDIRLGKVEGQRKRGRPSTRWIETVAETMGSSIATTVKMGQDRALFCSVVHRVAMSRNQLDGT	564346	563164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11551_pilon_-_563200_564300
932842	contig_15434_pilon	+	672	4	Intergenic	novelGene_56706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	590.246464528919	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	71	442	31239	33214	FALSE	30	TTCAAATTTACTGTCGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EATKVRIQTQPGYANTLRDAAPKMYKEEGLKAFYKGVAPLWMRQIPYTMMKFACFERTVEALYKFVVPKPRSECSKPEQLVVTFVAGYIAGVFCAIVSHPADSVVSVLNKEKGSSASQVLKRLGFKGTLCSYHHDWHSDCTAVVHL	31168	33444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15434_pilon_+_31265_32182_32356_32952_33064_33152
932843	contig_20293_pilon	-	2368	1	Intergenic	novelGene_153543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCCAGCACCATTTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	141302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_141300_143700
932844	contig_17144_pilon	-	2265	15	Intergenic	novelGene_29242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1743.03842733993	1	42	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	654	1965	48	2012	179764	166321	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLSKVTEQVSTQVGAMAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLLGLPHLAGPAP	181820	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166356_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
932845	contig_20694_pilon	-	1552	1	Intergenic	novelGene_141248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCTAAGCAGGGACGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45600	44048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20694_pilon_-_44000_45600
932846	contig_12492_pilon	-	2238	4	Intergenic	novelGene_77496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	102	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1332	1637	209822	106003	TRUE	20	TAGCTTGATATATTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSVSSSRFVMESLGFSVYSIISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSSTALNRSGDKGHPCLVPFLKGNAFKLSPFRMMLAVGFC	211153	98792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12492_pilon_-_99098_105706_106009_180121_180192_209592
932847	contig_20951_pilon	-	1259	3	Intergenic	novelGene_43041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	8	3166	junction_2	9254	1	93	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	101	661	28019	27149	FALSE	10	GGAGTGGCTCTGTGGTGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESTGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF	28119	26550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504_27687_27784
932849	contig_10058_pilon	+	2142	11	Intergenic	novelGene_67723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	162.342877885049	3	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	376	1131	67	1197	72602	99568	FALSE	20	CAAGATTCTTGTTGTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILSFLASFQDCPTSGCNYFLRSFLSTMKCHFGSCLWMSPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFERFSSRSTTCPSNIYQVLHASSPIFLHHAVFCPADTHHPISSLSGAKKGTSGKKVIYSQPTARNEGDFRQTSSFLV	72535	100513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_96622_96728_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98806_98912_99055_99357_99407_99532
932850	contig_11413_pilon	+	1263	1	Intergenic	novelGene_103193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTTCCATATAAAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	570795	572058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11413_pilon_+_570800_572100
932851	contig_8377_pilon	+	2131	20	Intergenic	novelGene_35027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3561.66012911764	1	59	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	523	1572	84	1655	131448	176656	TRUE	25	TGAGTCTGTTTTATTACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDPCRYFVGNL	68282	180510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68334_131415_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176624_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
932852	contig_3942_pilon	+	1218	5	Intergenic	novelGene_128694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	433.558170837547	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	51	488	426591	428300	TRUE	30	TGAGTCATTTGACAAGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQVHGHWGNQGMREGGMCAHLAGHLSPHCFAGTKCQRQVGVHVPAWGA	426540	430173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428587_429453_429607_429798_429853_429936
932853	contig_8552_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_80105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTGGCATGACACAGCTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	563299	561581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_-_561600_563300
932854	contig_11422_pilon	-	945	1	Intergenic	novelGene_99041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1689	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1700
932855	contig_17976_pilon	+	2286	4	Intergenic	novelGene_32504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1051.232081364	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	199	498	45526	47123	FALSE	30	AATGAGTGGCTGCCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIQTNTLIQSEVNPQDDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLAGVR	41660	48911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45577_46443_46679_47109
932856	contig_5020_pilon	+	1082	5	Intergenic	novelGene_27913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_2	456.784960347864	2	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	44	769	123231	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	123187	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
932857	contig_10299_pilon	-	1999	1	Intergenic	novelGene_79737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAAGAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	377664	375665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10299_pilon_-_375700_377700
932858	contig_14970_pilon	+	1603	7	Intergenic	novelGene_45057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	316	junction_1	5557.44846779727	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	186	902	210765	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	192021	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192205_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
932859	contig_3747_pilon	+	1997	4	Intergenic	novelGene_24795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4810.32271959654	4	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	597	923	203794	204120	FALSE	45	TAAATGACAAAATGTTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201316_203298_203386_203498_203651_203768
932860	contig_2100_pilon	-	1758	12	Intergenic	novelGene_50671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	974.890788543402	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	335	889	1176787	1173520	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLR	1185488	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173210_1173275_1173527_1174233_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176864_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
932862	contig_6633_pilon	-	2760	1	Intergenic	novelGene_143167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCAATTACTGATCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82125	79365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6633_pilon_-_79400_82100
932863	contig_6445_pilon	-	1635	16	Intergenic	novelGene_76917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	718.955044182566	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	436	1311	95	1405	95958	43105	FALSE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLESLERVGAPDPLGPSLIHYKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96374	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88584_95891_95985_96306
932864	contig_10904_pilon	+	790	1	Intergenic	novelGene_22692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATCTTCATGCCTCTCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	587953	588743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_588000_588700
932865	contig_8377_pilon	+	1684	17	Intergenic	novelGene_34994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3668.06202237639	2	30	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	570	1457	154883	177463	TRUE	50	GAACACAAAAGATGCCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKNEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAYHGCSANFLSRTLESLLTRTKTVMLTSFPMIIIELNSLR	68118	180458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68179_136325_136373_140781_140959_142253_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161380_164389_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176690_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179594_179666_180383
932866	contig_12951_pilon	+	1235	3	Intergenic	novelGene_68241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	228.5	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	26	523	820027	833659	FALSE	25	AGATGCGTGCACACTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSVSLELAELCLLSGFQMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRTFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQEQWKELSHEDLEPPPEHVPPPPRPPKRILEPHNGKCKEFFRNHQWVKDETEEGQGEVPIEAETRTPLNASHSMER	820001	834371	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12951_pilon_+_820096_832852_833054_833431
932867	contig_15029_pilon	-	830	1	Intergenic	novelGene_128198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCACAGTGGAGAGGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	184532	183702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15029_pilon_-_183700_184500
932868	contig_16322_pilon	-	1917	5	Intergenic	novelGene_87504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_4	399.9789838229	6	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	795	1166	36469	32956	TRUE	25	AGTTTCAATTTATTGTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLFFFFFFDRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57631	31693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_37098_57465
932870	contig_18145_pilon	-	1159	1	Intergenic	novelGene_37367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACGGGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98982	97823	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_97800_99000
932871	contig_10225_pilon	+	1231	3	Intergenic	novelGene_86868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	510	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	228	1115	46299	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPCLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	45219	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_45259_46110_46825_47274
932872	contig_15354_pilon	+	4217	2	Intergenic	novelGene_65700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	514	843	111835	112164	TRUE	80	ACAATAAAAAAGGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWGIQVAGGSIPTPRILKGRHVYVILSDLGQLCLLPSASSNISQLRDITPVPLLQVERLAPSALSTWCHDVAGCANLPCRDVSASCARPVSNPTLNVWPLAQDSGAVG	111321	158442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15354_pilon_+_115245_158148
932874	contig_11579_pilon	+	2273	2	Intergenic	novelGene_171946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	602	955	109617	109970	TRUE	20	GTAGGTAAAGTCCCCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRGAAAAENLQQQRSSSVREPAAAEKQQCQRTSSSRTRSPALDSTGADPQSERAACLCTRGFLAEWGASGYLSVELGLLIHGARELSACVQEAPWWSGVPPGTYWWSYRASEHLPQ	109015	111379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11579_pilon_+_111031_111121
932875	contig_7357_pilon	+	2001	14	Intergenic	novelGene_36891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	111.497499109587	1	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1073	1612	269181	273311	FALSE	30	TACAAATGGCATTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDSDFKQAEEYLSFAFEHCHRSSQKNKRMILIYLLPVKMLLGHMPTIELLKKYHLMQFAEVTKAVSEGNLLLLSEALTRHETFFIRCGIFLILEKLKIITYRNLFKKVYLLLKTHQLSLDAFLVALKFMQVEDVDIDEVQCILANLIYMGHIKGYISHQHQKLVVSKQNPFPPLSTVC	251765	273700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_252250_253750_253841_256778_256853_257939_258002_258971_259017_260054_260110_263525_263630_268156_268233_269098_269206_270136_270238_271244_271319_271479_271606_272519_272644_273221
932876	contig_2100_pilon	-	1731	12	Intergenic	novelGene_50672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	787	junction_2	705.484722878445	3	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	434	1305	78	1382	1182812	1170268	FALSE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSKAKFAGQKFRNPFAN	1185488	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170338_1171934_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
932877	contig_9552_pilon	+	1902	1	Intergenic	novelGene_167938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTTTTAAGAGGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104468	106370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9552_pilon_+_104500_106400
932878	contig_3956_pilon	+	1665	9	Intergenic	novelGene_15028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1605.9617640218	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	81	602	1281682	1286416	TRUE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282856_1283931_1283976_1284054_1284267_1284684_1284743_1286183_1286224_1286409_1286606_1287276_1287485_1290347
932879	contig_14666_pilon	+	1217	1	Intergenic	novelGene_39634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	305	918	14	931	484023	484940	NA	70	TTTATTAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	484009	485226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484000_485200
932880	contig_15752_pilon	+	822	1	Intergenic	novelGene_148777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	326	685	336869	337228	NA	35	ATGATATCATATAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHQFRSEEDLKHLLMKINDYSLQYRLHLNIKKTKILITEPISNMMINGENTEVAQDFILLELIIDAHGRSSQEIRRVVLGKSATKDLIKVLKSKDVTLRTKLCLAQAMVFSIASYACES	336543	337365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_336500_337400
932881	contig_12479_pilon	-	2591	2	Intergenic	novelGene_56899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAATAATAATAATAATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629782	626660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_627556_628086
932883	contig_5317_pilon	+	705	3	Intergenic	novelGene_76556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	16	51	293	343	43276	43326	FALSE	25	CTAAATGGTGTTTGTAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35349	43688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
932884	contig_7119_pilon	-	2029	3	Intergenic	novelGene_40878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1305	1793	139626	137020	TRUE	15	GGCCCACACCTCGTTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDDRAAFRSLTHKVTMSWS	140930	127408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137074_139191
932885	contig_14513_pilon	-	1288	4	Intergenic	novelGene_70363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	134	junction_1	1205.74071286768	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	187	747	18880	11833	FALSE	20	ATTAGAACTCTGCTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDVAVTQATQTYLNEESDFALTNSTKACLNDGSEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19066	11291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_13087_13136_14952_15001_18735
932886	contig_5020_pilon	-	1667	1	Intergenic	novelGene_27929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACCATTTTACATGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	138371	136704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_136700_138400
932888	contig_14744_pilon	-	2483	6	Intergenic	novelGene_66016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	531.174020449043	1	110	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	56	565	969897	968300	TRUE	65	ATCATAATAATAAAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APRSQLHHHWLSCPHPSVMEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGESSQPQGVSAPDL	969952	960526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962463_962609_964176_964398_965701_965811_967273_968630_969717
932889	contig_3948_pilon	-	1246	2	Intergenic	novelGene_53150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	1	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	625	987	12182	311	FALSE	20	GCAGTGAGGCGGGCAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHKREQCQGNAPPLATVSLATNSIYTPSAAPTAVQQAPPPASRQISTYITVPPSPLIQTLVQGNILVSDDVLMSAMSAFTSLDQPMPQGPPPVQVRRRQTFHRVFIPGLHIDSCGFRIL	12806	51	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_539_12047
932890	contig_6445_pilon	-	1354	13	Intergenic	novelGene_76892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	740.969461621433	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	23	1120	96360	43105	FALSE	10	TTAGCCTTTTGTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVAAGPAPPPATNAWAPANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96382	42870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68038_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_96306
932891	contig_7695_pilon	-	362	1	Intergenic	novelGene_41681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAATACAATGGAAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041688	1041326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7695_pilon_-_1041300_1041700
932892	contig_14682_pilon	+	2339	2	Intergenic	novelGene_139116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATACCTGGTATGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	104546	131257	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14682_pilon_+_105662_130033
932893	contig_3004_pilon	+	1090	1	Intergenic	novelGene_127563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	8	421	863146	863559	NA	30	ATCTCAGCAATGTCCTAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAMVFLITSYARKTWPMNKEDRRRTDAFQLWCWRRILNIPWTARRMNRSVLEEVQPECSLEVRMGRLCLTYVGRVVKRDWFLEKDIMLGKEEGRRKRESPSTRWIDTVAATIGSDIAMIVRMTQDRAVFRSVVRRVAMS	863138	864228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3004_pilon_+_863100_864200
932894	contig_1331_pilon	-	1564	8	Intergenic	novelGene_37839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3357.38736495617	5	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATACCTGTGTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	193857	159250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1331_pilon_-_160214_160867_160949_166406_166534_167067_167118_170279_170331_177728_177880_193604_193652_193763
932895	contig_20951_pilon	-	724	1	Intergenic	novelGene_43061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAAGGAGTGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27281	26557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27300
932897	contig_3956_pilon	+	3089	15	Intergenic	novelGene_15122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1312.10131359696	6	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	1189	2565	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281607	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286157_1286421_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932898	contig_2770_pilon	-	1093	3	Intergenic	novelGene_107436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	84	446	744128	743582	FALSE	20	GTCGTGTTAAATGCTTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEDDDCKMKTYFQLLSPSSRRIKLNLLLTSCKKKKKKVHLFILFLYSKTECQKYLLSTHTQKKICMYWLVVVSPKDRATPQFYNINTCTIP	744645	742934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743851_744034_744171_744604
932900	contig_5415_pilon	+	2324	1	Intergenic	novelGene_146142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	44	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCCTTTGGACCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	219478	221802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5415_pilon_+_219500_221800
932902	contig_6677_pilon	-	4101	1	Intergenic	novelGene_114199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	2729	3043	578015	577701	NA	25	CATGTCATTAAGGTCAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPPEMTEHRPILFGTVTVYSFHRLLMLPALFSILPIESFSIAARGFNFFFSSFNLRNANYVLPFHFLPQGLCTCLCNTLLCLLEPPFEIFCSALLLHHFFFLL	580743	576642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_576600_580700
932903	contig_16496_pilon	-	2346	2	Intergenic	novelGene_5199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3926	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1676_3255
932904	contig_10426_pilon	-	2598	2	Intergenic	novelGene_144662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	500	1108	60334	59405	FALSE	25	TTGGTAAAGTAGCGGGTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSTAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEKLSNEERQKGKRGKRKLIKKKKLQPTNGTQGAARLGVRNPNSRQPWAQIPWPREAEEQTNKGPSPSPAQQTRPGRSRTPERSPTAPQERAKTALGARHLSKRRGRQREASEKPKEAEKATPAANKRHPESRPPGCLESKQPVPSSQETLATGSRGAPAGAKRG	60833	57914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10426_pilon_-_59831_60151
932905	contig_10304_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_166492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	83	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	351	1100	1450	69627	69977	NA	45	TGTCACCTCTACAACAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYICKKMKQDPYLTPYTKTNSNWIKDLNIKPKTIKILEEKIGSVLETLIHRINSIPAITSNIQTPEDKLDNWDLKKIKHYLSKDFNPKSKKRTYRLGRVFGYYKSNKGLISKIYRKI	68527	69977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10304_pilon_+_68500_70000
932906	contig_11088_pilon	+	626	3	Intergenic	novelGene_85032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	77	junction_1	1553	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13625	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_13696_14663_14937_17119
932907	contig_12270_pilon	-	354	2	Intergenic	novelGene_113461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3690	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	16	354	14409	13848	FALSE	15	GCTGCTTATAGCTGCTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRGSKMVPQTLFLMSLLLWASGASGDVVVTQSPASLAASPGERVTINCKSSQSASSSYTSWYQQKPGQAPKLLIYGTSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTFTISSFQAEDAAVYYCQYGY	14424	13847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12270_pilon_-_14138_14360
932908	contig_16496_pilon	-	1352	1	Intergenic	novelGene_5119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1352	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1400
932909	contig_13954_pilon	+	1584	1	Intergenic	novelGene_130059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCTTTAAGTGGAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	91542	93126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13954_pilon_+_91500_93100
932910	contig_6458_pilon	-	665	1	Intergenic	novelGene_163741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGAGTTATGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	83165	82500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6458_pilon_-_82500_83200
932911	contig_4674_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_174149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGGGCAAAGCAAAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	343619	344450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4674_pilon_+_343600_344400
932912	contig_15952_pilon	-	1517	1	Intergenic	novelGene_154092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	247	744	732	1475	712121	711378	NA	40	CCAAATGGATGTCAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYGGNDSLKRNGVAFIIKKNISRSILKYNTISDRIISIHLQGRPINMTVIQIYPPTTKAKDEEIEDFYQLLQSEIDRTCNQSALIITGDWNLKVGNEEGSVVGKYGLADRNDAGDHMIEFCKTNDYFIADTFFQQHKQQLYMWTLPDGIHRNQIEYICGKRQWKSSVSSVTSRQGADCGTDHQLLICMYKLKLKKIRTSPQEPKYNLDYIPPEFTDHLKSRFDVFNTNDRRPDKLWNDIKDIIRA	712852	711335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_711300_712900
932913	contig_6898_pilon	+	2233	14	Intergenic	novelGene_35730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2138.52114194745	3	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	72	1358	59668	124828	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACPALPDSSQPNFANSAALSTTMPKTINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEPRWYKRTWRRPVPS	59596	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122712_123042_123145_124370_124451_124782_125008_125481_125887_127410
932914	contig_6871_pilon	+	2208	5	Intergenic	novelGene_21542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	360.411830410712	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	79	1182	121971	135017	FALSE	40	GTAAAGGATAAACGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQGATSENSGPPRTDFLRGFSCPESVMDLGKPMKSMLVVALLVVFQCGSDWSEREPLAGGCRDGRRLWSDRIGTRCACAKMRSQTITSETTPQWTTPCTSLCASRRMCGTLRPGSFQSCTQSFALWAFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121892	136043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121981_129792_129843_131812_131899_133940_134096_134214
932915	contig_13097_pilon	+	2022	14	Intergenic	novelGene_107710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	575.721836598278	2	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	682	1809	196348	264394	FALSE	55	CAAGAAAGAATATGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLEVIPVTSTTNKITVQQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSRNSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTVSTAPPLIPPPGFPPPPGAPPPSLIPTIESGHSSGYDSRSARAFPYGNVTFPHLTGSAPSWPSLVDTSKQWDYYARREKDRDRERDRDRERDRDRDRERERTRERERERDHSPTPSVFNSDEERYRYREYAERGYERHRASREKEERHRERRHREKEETRHKSSRSNSRRRHESEEGDSHRRHKHKKSKRSKEGKEAGNEPAPEQESTEAAPAE	184547	264607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_191524_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205974_206085_215273_215382_225265_225360_226996_227154_243883_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
932916	contig_529_pilon	-	1560	3	Intergenic	novelGene_179216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAGAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180651	130138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_529_pilon_-_130669_133558_133708_179770
932917	contig_5023_pilon	+	1997	14	Intergenic	novelGene_7251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2125.38692892215	1	10	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	82	957	607279	629238	TRUE	15	AGGATTTGGGCTTGTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENPDI	580847	647348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609658_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625818_629227_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
932918	contig_20199_pilon	-	742	2	Intergenic	novelGene_82546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44145	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41150_43906
932919	contig_20527_pilon	+	2156	5	Intergenic	novelGene_138580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	23	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	52	678	13527	27453	FALSE	80	CAATTAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13475	28931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
932920	contig_9099_pilon	-	932	1	Intergenic	novelGene_149928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCCCCAGACACCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	425090	424158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9099_pilon_-_424200_425100
932921	contig_8195_pilon	+	2501	2	Intergenic	novelGene_170062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATATCCACACAATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	461281	464756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8195_pilon_+_461392_462365
932922	contig_10541_pilon	-	2326	2	Intergenic	novelGene_144634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAGCACAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	169313	166941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10541_pilon_-_167640_167685
932923	contig_9484_pilon	+	1831	12	Intergenic	novelGene_105627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	514.45548522782	2	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	50	1699	95848	104965	FALSE	5	CTTGGTGGTGGTTTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95798	105097	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100667_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
932924	contig_5961_pilon	+	1320	2	Intergenic	novelGene_144147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2253	junction_1	0	3	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	492	827	1318	197721	202099	FALSE	70	AGAGAAGGAACAAAAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEENEI	196894	202101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_197889_201775
932925	contig_12277_pilon	+	2488	1	Intergenic	novelGene_139698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTATAGTCGCCATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277673	280161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_277700_280200
932927	contig_15666_pilon	-	1835	6	Intergenic	novelGene_70166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	3	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	737	1168	108757	107816	FALSE	15	TGATGTTGCTTTGATTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110617	107148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
932929	contig_3694_pilon	-	3184	3	Intergenic	novelGene_179217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	133	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGACAAACAAAAACAGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	197297	3805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3694_pilon_-_5484_173692_174711_196809
932930	contig_2733_pilon	-	2834	1	Intergenic	novelGene_128554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CATTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	557862	555028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2733_pilon_-_555000_557900
932931	contig_1225_pilon	+	2870	3	Intergenic	novelGene_44173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	319	1	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251316	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251508_253416_253520_274222
932932	contig_10949_pilon	+	1327	1	Intergenic	novelGene_146691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATTTAATGAAGAACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79125	80452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10949_pilon_+_79100_80500
932933	contig_20794_pilon	+	1234	1	Intergenic	novelGene_161389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTCGAGAAGACACAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19948	21182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20794_pilon_+_19900_21200
932934	contig_3956_pilon	+	1401	6	Intergenic	novelGene_15279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1122.2430396309	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	398	886	1289515	1290491	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1288014	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1288077_1288874_1288985_1289024_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932935	contig_7151_pilon	-	727	1	Intergenic	novelGene_40704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	192	725	57727	57194	NA	50	CGAGAATGAAAACACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSICCPQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDVTIINIYTPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIILGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKGKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLES	57918	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_57200_57900
932936	contig_13726_pilon	-	1573	1	Intergenic	novelGene_179218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	95	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	381	1143	431	1573	11813	10671	NA	45	AATCAAGTTGAAGTACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLNWFSSLVSHKDVDDSASSSKEVTASPWSEVAIQIHKISPPVDQVLVKGEAQGEHMCDIFLQLCQNEKYKEAGWFVLLSLDKLMKERDALRASESRLKCCIHDLKASTCALKESLISCSNRAKIAENQTQSLIVRVAELQCQLNCKPREVSEVKVRALIGKRWDPETWDGDIWADNQEAGDTEPINSIESLLPAEPVPSEEIASCLSAKPPCPEKPLAPPLPSKESSPSPAASKEHLPESLPGASPEADALQDNAECSQNNSTLPILASRPITRLKSQRAPKGEVQSVTQEEVRYTPKELLEFSKMYKQKPGEYVWEWLLRVWDNGARNIKMDQSEFIDMGPLSTDFSFNVSATEVRKGSNSLFGWVAEAWIMRWPTL	12243	10670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13726_pilon_-_10700_12200
932937	contig_20314_pilon	-	2401	2	Intergenic	novelGene_125641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	921	1316	7302	6907	TRUE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHPLEPLRSWPYLLRRRQLGFFCSLSLQLLLPVASWPLGLMPAFALLGQVFQSSVAPLISARRHPTPPGSLLHIGTQLSRAPWVSSSAISHWTPGSAAVGSLPLPLLCCCRASAAAAPLYIHNFKTASTF	8222	5752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_-_6828_6896
932938	contig_3081_pilon	-	3839	1	Intergenic	novelGene_133922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	129	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	2454	2945	181718	181227	NA	50	AGTTCACACACAAAATGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTILPKAIYKYNAMPIQISTFFKEVKKLISNFIWKGKRHQISKALLKNNVRGLALPDLRTYYTATVVKTAWYWYNYRYTDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFNKGPKSIKWGKDSLFNKWCLQNWIAICKKMKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIMSTTIKFIEEK	184171	180332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_180300_184200
932939	contig_15021_pilon	-	2453	1	Intergenic	novelGene_26968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCGGATTCTCCCTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	266836	264383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15021_pilon_-_264400_266800
932940	contig_15047_pilon	+	1223	7	Intergenic	novelGene_52191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	252.887601295297	11	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	CCTTCCAGAATCTGCATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4194_4590_4681_21008_21062_21232
932941	SIRV7	-	911	5	FSM	SIRV7A	SIRV706	949	5	29	9	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	37	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGAAAAATCCTAAGAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147928	56040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114680_114989_147608
932943	scaffold_13505_pilon	-	6545	2	Intergenic	novelGene_111613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	55	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	3	326	664529	664206	TRUE	25	TATCCCTTAAAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALTNRNLFSSILVGYKSKFRVSAPEEGFLCLSALEEGPCHQSSRGLEASSCRNPGSKGRTLLLALLSWWYEVPILSLLPSPFISCKIKGDAGHSPVNLPLHWIKNST	664531	657896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_663796_663885
932944	contig_10990_pilon	+	3423	15	Intergenic	novelGene_7486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	384.183682684229	2	123	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	1385	3208	723556	749517	FALSE	35	CAGAAAACCCTGAGGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKPSAPYGRKGAASDRCAGFGTWRSIKNAVRFLVTGKISQWDVKNLTVLSITTEDAMLMAFSYLRAKLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQGDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKGECFL	714807	749732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_715368_715412_715994_722232_722433_723512_723633_729671_729796_731270_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733944_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169
932945	contig_6576_pilon	-	1883	12	Intergenic	novelGene_42273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	4	268	junction_4	543.858483051222	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	494	1485	4	1488	339439	322526	FALSE	20	TATGTCCCCAACCTAGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWCWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339442	322130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339398
932946	contig_1037_pilon	-	1831	1	Intergenic	novelGene_84601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAGTAGAATTTATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232482	230651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1037_pilon_-_230700_232500
932948	contig_8377_pilon	-	2155	17	Intergenic	novelGene_35005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.45236875482778	3	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAACTAAATGCATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180510	68157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68335_131417_131569_135046_135189_136283_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143589_161226_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173682_176591_176697_177247_177343_177428_177523_179555_179664_180381
932949	contig_9653_pilon	-	3025	7	Intergenic	novelGene_48275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2050	junction_6	568.187004622793	2	136	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	349	1050	84	1133	1016667	1006903	FALSE	20	GATGGATTTGATGTGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLLVLDLQKYKVFTHTVAASGGGGVNMSSHQKWKVGEVEFEGLMRTLDNLGYRTGYAYRYPLIREKPRHKSDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1016750	1005010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777_1016036_1016595
932950	contig_3956_pilon	+	2732	14	Intergenic	novelGene_14826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1126.14178219684	4	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	84	1409	1281682	1287396	TRUE	15	GCCGCGGAAATGGCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGGGLLSGLQHLTVWVSLPQNDLDDGSLCGAHRGCAMREHCGPGGRRPVPGEDRHHHHL	1281598	1290703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1287220_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
932952	contig_9363_pilon	-	1012	1	Intergenic	novelGene_6553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATGTGTCAGGATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	754397	753385	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_753400_754400
932953	contig_16098_pilon	-	1171	10	Intergenic	novelGene_45940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1613.75702272525	20	4	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1014	158	1171	350768	348286	FALSE	30	AGACTCTGAAGACTGGTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIWGVTLISRQQTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRGVQGLQKDQGHPPLSLPFTPSFFKPQWQIRKNNNKMALFSGT	354027	348285	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348411_348919_349062_349172_349231_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_353990
932954	contig_3095_pilon	+	1249	5	Intergenic	novelGene_74972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	75	839	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147166	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932955	contig_3956_pilon	+	1492	7	Intergenic	novelGene_15194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1860.52901676438	3	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	23	970	1282758	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKEGIPALDNFLDKL	1282735	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283934_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1290449
932956	contig_17427_pilon	-	2550	13	Intergenic	novelGene_30356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1136.54351727801	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	46	1203	188879	179167	TRUE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSEERLIAVQRWYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITITVRNSVWCSMTWWALWR	204706	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179355_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184477_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
932957	scaffold_13505_pilon	-	1700	9	Intergenic	novelGene_111534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	445.934412217761	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	17	54	1180	1233	594063	594010	TRUE	5	CCCTCATTTTCTCTCCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGSRDPWSLPQLLPAEGSSTGRGPCSQVFADLSRHEGCNARDKCLPSWSSRLGERETDKQINLHGTSGVVSLLIFWSPSITAQPTIESVPFNAAEGNDVLLLLRNPPTDTLIYIWYKGESRDHNNKIASYLTGATQPNATGPAHSGRETIYPNGSLLFQNVTLEDTGIYTLQITKTNGDNEALAGQIRVHPELPKPFITSNSSNPVEDQDSVTLTCDPETQNTTYQWLINHQSLPDRARLELSTDNRILTIHNVTRNDKGPYECETWNPVNARRSDPFILNVLYGPDTPTISPSDWHYPPGANLTLSCNATSNPPAQYSWLINGNYLQSTQVLFIPNVTVSDGGNYTCHVRSNVTGLSRTTVKTITVSDDGSEGAWNISAGAITGIVTAILVGMAVVTTLGCFLLTRTRG	603252	588573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_593980_594138_596976_597232_597627_597907_601873_602237_602570_602698_603171
932958	contig_12046_pilon	+	1765	1	Intergenic	novelGene_83461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	713	1018	233380	233685	NA	5	GCGTTATTTGCTTCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDALLKSSISPSSSLEDSLGFCVYKTISSANRDTLTSSLPIWMPFISFSSLTALARNSSTILNKNGDKGHPCLVPVLKWNTFRFSPFRMMFAVGFV	232667	234432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_232700_234400
932959	contig_9954_pilon	-	3923	2	Intergenic	novelGene_178453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	2662	3030	401585	401217	FALSE	15	TCGAGCTCTATTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	404372	400323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9954_pilon_-_403665_403790
932960	contig_2770_pilon	-	542	3	Intergenic	novelGene_107490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1500.5	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TCTTGCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744680	743770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744229_744423
932961	contig_818_pilon	+	1544	2	Intergenic	novelGene_167996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	902	1213	685567	696829	FALSE	15	TTTGCCTTTGTATATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSGVPLLSVRPLSLVFLLELEFCTSPFSWTELEMDVEQNSNTHKKARFTGLTETGEIPRVWPPDTLLAQWWGHSQGSPFTWGLDSPIKQNRTNEAQQSRDKD	684665	697160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_818_pilon_+_685651_696601
932962	contig_18162_pilon	-	2723	3	Intergenic	novelGene_122329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
932963	contig_15047_pilon	+	1655	6	Intergenic	novelGene_52194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	12	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	TTCCAGAATCTGCATCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4428_4566_4687_21013
932964	contig_6589_pilon	+	2294	5	Intergenic	novelGene_25978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	1915	2292	1307201	1311980	FALSE	20	ACTCGTACCGGCCGGCGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVRIGSDESSSILWVHTGGKDCRCVAKMALFIIVKSSLSSILFMSGRLPLQQRLIKLPPELLLHCVGRVPKLLADRLALERFHIEIVGPSRHDEEGDHCLFTAIHSKKIVEPGQGLQEDVSPLVG	1305286	1311982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_1307272_1309127_1309213_1309302_1309357_1311188_1311295_1311918
932965	contig_13172_pilon	-	3012	2	Intergenic	novelGene_146310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	868	1176	11255	10947	TRUE	20	GGCCGTTAGTTTTGCATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPETLVATALHPGIQYLRKFGSVCGASMTFPCANCAVFSGIVYCLTFHQSYHLSIVCLVPPPFPSIVTNKDHFFLCVNFYMRFYCRGLMQYLSFCD	12122	4013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_5368_10464
932967	contig_13021_pilon	+	2224	14	Intergenic	novelGene_8188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3118.53809059393	3	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1065	474	1538	176597	180467	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFGDLVPGLIIAVASLLPPTQGFAVAEATLKRLSAPDYLRFVPHQPQPLTPCQVIRVTETAAGIEGEFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIPTLFLCFVKLIKQLIPSCFSWSKTEVQVVPGVEEA	174521	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174724_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178528_178585_178670_178731_179985_180049_180130_180211_180440
932968	contig_7440_pilon	+	2705	1	Intergenic	novelGene_61172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAAAAAAATTGGAAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78112	80817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7440_pilon_+_78100_80800
932970	contig_16141_pilon	-	1689	2	Intergenic	novelGene_179219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	991	1356	1385	1020	TRUE	5	GTAGTCTCCTCTCTTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKCFDTVCCFRGIQ	2375	43	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16141_pilon_-_190_832
932971	contig_17074_pilon	+	3178	11	Intergenic	novelGene_145116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	224.105867839287	1	128	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	92	607	208015	216459	TRUE	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPS	207923	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216455_216616_216903_216979_217591_217694_220895_221011_223452
932972	contig_3956_pilon	+	2078	11	Intergenic	novelGene_15034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1280.03196835079	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	81	1880	1281682	1290816	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287436_1290521
932973	contig_12410_pilon	-	1331	2	Intergenic	novelGene_167274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAACAAAGAAAACGCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90781	89386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12410_pilon_-_90234_90297
932974	contig_14807_pilon	-	747	7	Intergenic	novelGene_124681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	7481.81358732998	3	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	231	650	38402	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39918	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38415_38644_38741_38827_38887_39750_39796_39900
932975	contig_854_pilon	+	1728	7	Intergenic	novelGene_36203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2351.07715857127	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	138	452	543600	556290	TRUE	25	AACTTCAGGTGCAGCTTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTVCRPTPSSLSSLCCPCSLFWGCPSGRLGW	543462	563798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556442_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
932976	contig_11564_pilon	-	2152	2	Intergenic	novelGene_158574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATCACTATTGTGTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72565	69703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_71728_72437
932977	contig_17921_pilon	-	359	1	Intergenic	novelGene_179220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGCATACAGTGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3038	2679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17921_pilon_-_2700_3000
932978	contig_18162_pilon	-	2674	4	Intergenic	novelGene_122330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10561_10609_10809_16363
932979	contig_11512_pilon	-	1357	1	Intergenic	novelGene_43337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	556315	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555000_556300
932980	contig_3956_pilon	+	2000	12	Intergenic	novelGene_14930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1464.79824013327	1	19	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	81	740	1281682	1284841	TRUE	40	TTAACGCATTAAAAGGTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDTWGLLSEPGKWRT	1281601	1290818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284691_1284799_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287477_1290335
932981	contig_9177_pilon	-	1537	10	Intergenic	novelGene_32627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	424	junction_9	2100.46878365547	20	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	87	698	26442	25227	TRUE	25	TGAAGAAGGTGGGGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEALAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDECKQNGKKRVLETVWVGSSSVFFIEHMLCARYSF	28420	21872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25481_25584_25715_25971_26070_26312_26476_28367
932982	contig_15449_pilon	+	3662	15	Intergenic	novelGene_33596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	668.081123633277	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	420	1263	1195	2457	44662	51815	TRUE	25	CCAATATATTTGTCAGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGMAKVMKTRKTIQSQMSIELDHTSPMFLLV	36991	55659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_38069_43216_43279_44271_44318_44652_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51161_51245_51330_51809_51932_54570
932984	contig_1380_pilon	-	1214	1	Intergenic	novelGene_138875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	375	840	1214	88518	88144	NA	45	CATCGAGTAGCTAAAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHRNQIDYICGKRSWKSSMSSVRTRPGVDCGTDHQLFICKFKLKLKKIRTSPREPNYDLEHIPPEFRDHLKNTFDALNTNDRRPDDLWNDIKDIIHEESKRSLKRQERKKRPKRMSEERLKLALE	89357	88143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_88100_89400
932985	contig_10864_pilon	+	1254	1	Intergenic	novelGene_107126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGCACTGTGCGGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1194120	1195374	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10864_pilon_+_1194100_1195400
932986	contig_16775_pilon	-	418	1	Intergenic	novelGene_107748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	40	123	244	366	96395	96273	NA	15	GGGTGGGTCGGTAATCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FFPHFCLLLLQLLDNSEYQVVLVPFLPLESHLVFYFGCLLEPSCPVFVNVLILSAIFGAFSSYFSHLLIADLFVSSFSFLAMSEQAGCVLFVVCSSVATILFASFSNWEGQSLRYGTAGKV	96638	96220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_-_96200_96600
932987	contig_8228_pilon	+	1468	1	Intergenic	novelGene_81786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACCCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133572	135040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_+_133600_135000
932988	contig_3095_pilon	+	1208	5	Intergenic	novelGene_75114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	37	801	147241	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147204	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
932990	contig_10225_pilon	+	2720	13	Intergenic	novelGene_86817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	2	103	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	1096	2604	42707	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20702	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41531_42623_42726_45216_45259_46110_47046_47123
932992	contig_16125_pilon	+	1404	4	Intergenic	novelGene_155271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGACTTTGAAGGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151755	236861	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_151879_155553_155611_179438_179596_235794
932993	contig_6898_pilon	+	2322	3	Intergenic	novelGene_35782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	4	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	31	366	124837	125646	TRUE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124806	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_126664_126765
932994	contig_2062_pilon	-	453	1	Intergenic	novelGene_139028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAACTCTATGGATCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1169950	1169497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2062_pilon_-_1169500_1170000
932995	contig_5136_pilon	+	928	2	Intergenic	novelGene_126643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATCTGTTCTGTAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315531	324723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5136_pilon_+_315887_324150
932996	contig_10930_pilon	-	990	5	Intergenic	novelGene_37050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2489.30546287514	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	20	640	280370	276804	TRUE	55	GTTAGAAAAAGAGGAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKDPGGRFPGGHHPLPDSLDECFTPFDSY	280389	274032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_274303_276723_276888_278443_278637_279700_279832_280157
932997	contig_11505_pilon	-	1456	1	Intergenic	novelGene_140933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCTAGGATCTGAGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	288568	287112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11505_pilon_-_287100_288600
932998	contig_10377_pilon	+	1054	2	Intergenic	novelGene_115337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAACAAGTAAGTGGCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9194	12876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_9664_12291
932999	contig_3956_pilon	+	3346	13	Intergenic	novelGene_15204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1124.07639556018	5	200	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	1050	2297	1286460	1289956	FALSE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1282849	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286228_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
933000	contig_3095_pilon	+	1139	5	Intergenic	novelGene_75133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	7	732	147280	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147273	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933001	contig_17144_pilon	-	2603	15	Intergenic	novelGene_29395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2182.98882479587	3	86	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	1330	2523	173384	166152	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183228	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166303_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179808_181669_181843_183154
933002	contig_753_pilon	+	4743	4	Intergenic	novelGene_113037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	175	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	1363	1755	1451285	1451677	TRUE	30	CTGTAAACCTTCACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDNVIEGLRSRFEMVEDRISGNEDKHLDTTLFQENSEKRAKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIKKDEKWPSKKLNEPHIEETPKENHQSISYSHSPKPKTNKES	1449540	1482082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_753_pilon_+_1449809_1450190_1452695_1455390_1456799_1481519
933003	contig_4429_pilon	-	3705	1	Intergenic	novelGene_50808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	73	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	821	1141	180081	179761	NA	25	CAGATGTTACCCTAAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIRVTTLISLGYISRSGIAGSNGMSISSFLRKGHIIFQNGCSILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAAVRWYLTVVLICIYPMASDHEHFLMCLLAI	180901	177196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_-_177200_180900
933004	contig_5023_pilon	+	1883	12	Intergenic	novelGene_7320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2396.89791257487	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	27	602	607279	625842	TRUE	25	TTTGGAAGCAATCCTACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIPCPAQTREPGHRLGGS	607252	647581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614434_625788_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639168_643406_643539_646857
933005	contig_8377_pilon	+	4682	28	Intergenic	novelGene_35014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3534.66837461713	13	144	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1526	2683	176610	192238	TRUE	20	TATTTGTAGAGCTCTTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDITGNLK	68216	199114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68341_131430_131572_136291_136373_140767_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161230_161390_164389_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183393_185666_185817_189180_189272_191119_191207_192218_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
933006	contig_9443_pilon	+	2892	4	Intergenic	novelGene_167122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	153	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGAGGGGTGCCAGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9764	67146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9443_pilon_+_12199_13621_13888_15454_15603_67102
933008	SIRV7	-	914	5	NNC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	52	19	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147602
933009	contig_6316_pilon	+	2026	14	Intergenic	novelGene_134694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	186.516493551814	1	125	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	774	924	1697	148854	157164	FALSE	35	TGAGTAAAGGAAATCTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRHMAYQICQSINFLHRNKLTHTDLKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLENTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWAQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPTHMIQKTRKRKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPAKRITLDEALQHPFFDLLKKK	136254	157493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6316_pilon_+_136382_140479_140644_142566_142734_144111_144171_145291_145515_147102_147170_148632_148743_148847_149008_149209_149305_149541_149672_153045_153129_155951_156032_156849_156941_157023
933010	contig_3095_pilon	+	1210	5	Intergenic	novelGene_74984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	107	832	147280	151151	TRUE	45	TCTGAATACAATAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933011	contig_3469_pilon	-	2256	1	Intergenic	novelGene_34207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	136	411	89	499	533515	533105	NA	15	CCCTGTTCTTCTTCATATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSHDILASKERSGCTSSKMDLFILLAVHGIFSILRQHHNSKVSVLLRSSLFVDQLSHAYKVLKVTSLLSNTLKRSFAADLPNAMHFLFLHCCIECGSSKMKSLTILIFSPFIMTLVIGPFVRGFVFFMLRCNPY	533603	531347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_-_531300_533600
933012	contig_20402_pilon	+	3088	1	Intergenic	novelGene_72850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	165	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTGAAATATATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	216112	219200	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20402_pilon_+_216100_219200
933013	contig_17144_pilon	-	1588	10	Intergenic	novelGene_29282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2210.2696221206	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	580	1293	174597	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEERQGGLVGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183208	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172523_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174917_175973_176271_179700_179752_183180
933014	contig_17756_pilon	-	3207	1	Intergenic	novelGene_179221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	125	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACGTTTAAATTATGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	36634	33427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17756_pilon_-_33400_36600
933015	contig_17427_pilon	-	2317	12	Intergenic	novelGene_30319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1044.24484162298	8	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	32	703	188879	179740	TRUE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKDEDSQEPRPEGSEWSRTQWPQTILCT	204674	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179819_182727_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204653
933016	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_74991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3097.12482594745	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	207	830	149709	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149651_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933017	contig_7963_pilon	-	1119	5	Intergenic	novelGene_58362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGACTTGTATTACTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63338	51354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_51531_56716_56970_57284_57559_57853_57932_63000
933018	contig_10403_pilon	-	2212	2	Intergenic	novelGene_175810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTATGATTCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150814	114366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10403_pilon_-_115333_149568
933019	contig_6898_pilon	-	1779	11	Intergenic	novelGene_35677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1115	1654	115957	59656	FALSE	20	AGCTTCCTGCTAACGGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPNLDPLLPLVLVEFVLLQDPLGQQLVPSQVARLVHLFIEVTVLGLDSIGGQQHGSLRWAVNIIIENALLHLQEEQALGDVLDQFLGYILRVKFGPELEEQGAFLPYILGSHLLIEFQPGGEALSVLVLQTKKPNFPQANSFHHLVKQLLAGGVGLDGKLQFCIHGGHTHIDRLGHGGG	127336	59530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104633_112966_113065_114249_114525_115894_115980_116671_116817_117863_117960_119611_119776_122610_122741_122981_123021_126818
933020	contig_4812_pilon	-	842	6	Intergenic	novelGene_103663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6972.1678522537	2	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	137	619	82334	79235	FALSE	25	CTTGAGAGAATGCTTCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82722	79011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82594
933021	contig_8377_pilon	+	4061	28	Intergenic	novelGene_34929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3330.8850432682	1	119	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	759	2280	83	2362	68257	191161	TRUE	50	GTGAAATTCAATAAACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSMTLTECHLNMNWK	68093	198700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189244_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
933022	contig_7357_pilon	-	2285	9	Intergenic	novelGene_36826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2123.27658054715	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	220	1137	166824	137724	TRUE	55	AACAATGCTAATAAAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEAHL	167043	135573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137855_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
933023	contig_3956_pilon	+	1889	9	Intergenic	novelGene_15264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_2	515.009208048749	2	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	519	1560	25	1584	1286091	1290491	FALSE	65	AAACATCCAAAAAAATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1285808	1290796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933024	contig_20550_pilon	-	2049	15	Intergenic	novelGene_142620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAGCTATCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29546	12084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20550_pilon_-_12491_12952_12991_15551_15602_15689_15768_15897_15954_18903_19067_19167_19264_19383_19493_19759_19858_20007_20107_20466_20610_21234_21398_24121_24267_24348_24434_29226
933025	contig_3409_pilon	-	2381	14	Intergenic	novelGene_172305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1830	2186	110990	60562	TRUE	65	TAAAAAACAAGATTTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSTNYLYLRQTKDQSSRHAGLSMVPTSHCTRNVTRYNCTWGRQAIIWNEHTPRLYFKLQCETLYCIPYYSNKFFHSFFRTSGAFRYIQHGFHGNGQWSGFCYCFCFYRAAGIFRGLI	243887	55663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3409_pilon_-_55773_60475_60615_97276_97405_110814_111050_134448_134669_151420_151623_167741_167916_168487_168603_170286_170355_174533_174943_179885_179999_222176_222381_237652_237780_243749
933026	contig_17144_pilon	-	2632	15	Intergenic	novelGene_29448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1964.71498166621	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	737	2214	131	2344	179764	166363	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183212	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170929_173318_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
933027	contig_13519_pilon	+	469	3	Intergenic	novelGene_124627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	169	junction_1	468	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	336	132	467	66179	67762	FALSE	65	ACTAAAAGAGAAAGTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELG	57028	67764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592
933028	contig_5413_pilon	+	2176	1	Intergenic	novelGene_168094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAATTAGATGTTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391881	394057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5413_pilon_+_391900_394100
933029	contig_14575_pilon	-	2629	25	Intergenic	novelGene_101869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTATCCACCACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63885	17091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_17272_19960_20115_20520_20565_20883_21036_21521_21609_22648_22706_26343_26428_27687_27778_28956_29022_30471_30761_32689_32847_33859_33916_39339_39503_40650_40700_41531_41650_42755_42855_44955_44997_47295_47373_50297_50433_51062_51144_54375_54489_59250_59374_59880_59983_61541_61637_63867
933030	contig_11512_pilon	+	1640	1	Intergenic	novelGene_43370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGGCTGCTACAGATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554965	556605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555000_556600
933031	contig_11483_pilon	-	1263	1	Intergenic	novelGene_172688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	161	486	747	1232	47237	46752	NA	15	TCTGCGAGTGATTGGAGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQRQQTISKHLQKQDRMVPVGIRNTRPDDFPVEETALDLPDTKFKSLILRILQELKQKADKNEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINTQLEIRQRQQLETRKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRISGIEVKHLDTTLLRKTQKKEQRKMKKP	47983	46720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11483_pilon_-_46700_48000
933032	contig_1230_pilon	+	1548	7	Intergenic	novelGene_28835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1044	junction_1	588.549464550111	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1476	73	1548	405241	407741	FALSE	55	AAGAGTACTGGAAAAGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVD	404453	407741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405235_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588
933033	contig_7963_pilon	-	2366	8	Intergenic	novelGene_58470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	605.751447647078	8	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	779	1282	123938	122315	TRUE	85	AAAAGGAAAAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAGRISGNFANGE	126197	120292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122489_122993_123132_123746_124083_125563
933034	contig_8317_pilon	+	679	1	Intergenic	novelGene_19400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTACATAAAGAATTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	17059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
933035	contig_15047_pilon	+	1678	6	Intergenic	novelGene_52207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21004
933036	contig_14353_pilon	-	2460	10	Intergenic	novelGene_82093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	556.511843628476	1	126	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	306	1082	88616	80452	FALSE	35	AATCAAAGTATGGATGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLADVKSSSSPRGAERWLSAVPSLLGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVSKNPPISFPLHPQAPSPSSQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVPSGIPPMVYPSLTYTLPYFTAIPGGLYPSKSIIVSGTILPCAQRFHINLRSGSDIAFHLNPRFNENAVVRNTQINNSWGSEERSLPGKMPFSCGQNFSVWILCESYCLKVTVNGQHLCEYRHRLKNLPAINNLEVGGRHPADQCAGIERPRALG	104424	79073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83296_83901_83953_84505_84542_86256_86357_88487_88750_90961_91054_104344
933038	contig_15327_pilon	-	629	3	Intergenic	novelGene_70681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1760	2	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CCTAAAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_900864_901449_901536_902035
933039	contig_8254_pilon	-	1616	3	Intergenic	novelGene_48371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCATGGAAGAAAGGAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	129094	43673	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8254_pilon_-_44440_127739_128120_128624
933040	contig_3747_pilon	+	2483	6	Intergenic	novelGene_24856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4513.6517544002	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	320	1081	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200993	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201370_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933041	scaffold_12124_pilon	+	1652	9	Intergenic	novelGene_22336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3481.86859854016	9	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	426	749	1484002	1496374	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPEQITAAKGRFPNKVTLTGQDLDLLDALGEDDKKPTTPPKKPIPEDDLNLEDALGGGQDNEPAQPYPPKPKPDPNPHQPGSSGRFSDSDLADGTGGGGGGGEPQR	1483576	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497088_1508768
933042	contig_10126_pilon	+	2506	8	Intergenic	novelGene_105728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1437.21639970877	2	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	160	1035	162049	166639	TRUE	10	TTGATCTGTGGTGTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQRVHSLPAGVAAQGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139780	185175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139824_161932_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169751_172549_172575_181522_181563_184074
933043	contig_3956_pilon	+	1939	9	Intergenic	novelGene_15029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1360.59224237095	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	650	1417	1288971	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283863_1283976_1284054_1284114_1287992_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933044	contig_9189_pilon	+	3020	3	Intergenic	novelGene_165103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACAACTAAAGTCCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	239649	252920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9189_pilon_+_240315_240845_243007_252726
933045	contig_14472_pilon	-	2452	1	Intergenic	novelGene_111174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGACCAGATTTACTGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325159	322707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14472_pilon_-_322700_325200
933047	contig_9288_pilon	-	2054	2	Intergenic	novelGene_171597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAATAGAATATGGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	67300	5007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9288_pilon_-_6043_66281
933048	contig_8167_pilon	-	1447	1	Intergenic	novelGene_155648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	8	367	111425	111066	NA	35	TTTTGGCACATCTAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPMPSVQLGLLPSVPSVPNHMLPPEMVECQSVLFHMMTLYSFHLLLMLPVSFNIFPVESFTIAARGLNFFFSSFSLRNAERFGFLSPGLCTCHYNTLLCLLKLPFEIFCSALLLHYFFLLL	111432	109985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8167_pilon_-_110000_111400
933049	contig_10930_pilon	-	2429	8	Intergenic	novelGene_37012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2005.48668834846	3	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	650	1321	276835	268555	FALSE	40	ATGCACTGGGAAACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEMGVW	280391	267446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268570_272837_273009_273950_274325_276723_276904_276989_277013_278443_278637_279700_279832_280157
933050	contig_12079_pilon	-	1518	2	Intergenic	novelGene_67502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1	306	862255	861807	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPPNSSGLQLKSLCLLS	862255	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861854_861996
933051	contig_10042_pilon	+	2335	9	Intergenic	novelGene_79097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	221	junction_4	244.292825058371	1	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	10	1680	6321	53427	FALSE	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QGFMYLPGSTINEISTNPEEAGKFVFEVIPASWDQNRAGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPSGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFIREHGLNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLMNADEAKAQQEMMKQLSILPPDNYNLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDSPLSPSAQKNDPKKPPVARSSVGWDASEDPPISRTGSFNNTTSDSDTTSPTGLQPSDGYLDDSSKPSKEKLGDWKLQSRKRTQTLPNRKSFFTSSLHGTSSSKVEISKNKLCSPSETKEGEGHRRTMSQDLRHLSDSQRTSTYDNVPALPASPGDEASAPSSQAYDSKRDTLASPNSEAGPGTTDSGEEELKSSQRMVQELQKEIETQKQVYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLSEELEKEKKKFAALEITLRNAERSREDVERRNKALEEEVKEFVRVMKEPKTDA	6311	54082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10042_pilon_+_6403_8818_8936_26600_26809_42598_42732_43878_43953_45874_45997_46837_47035_49529_50060_53219
933052	contig_6958_pilon	-	1642	3	Intergenic	novelGene_69919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	6	241	junction_2	331.5	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	26	604	161022	149618	FALSE	10	TCCCCTTTTGTGAAGGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	161047	148579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928
933053	contig_11145_pilon	+	1721	1	Intergenic	novelGene_160510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	246	738	984	1721	6854	7591	NA	50	TCAACTACATGGAAACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANNDQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVMDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKK	5870	7591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11145_pilon_+_5900_7600
933054	contig_17274_pilon	+	3448	7	Intergenic	novelGene_26517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	197.498874820986	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	77	484	118629	122898	TRUE	35	GGTGATAGTCTTTGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEDGNWFTPREFEIQGGYTRSKNWKMSVRCGGRPLRWLIKEEFLPDPPRTYHRRKKKRLEPHNNDLVDPYPGNSDDCEVCRKRGKLFCCDTCSRSYHEECHIPPVEVERTPWSCIFCKMKDSSGNEQCQQEAEILEREMLPEEQLVSQLQAPSLLLSLHT	118552	157715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17274_pilon_+_118674_119766_119815_120646_120689_121929_122046_122741_123572_124349_126278_157352
933055	contig_1918_pilon	+	3099	5	Intergenic	novelGene_168336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAGAAAAAAAGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	153364	313365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1918_pilon_+_154871_155143_155728_186302_186694_221304_221434_312876
933056	contig_17796_pilon	+	1756	6	Intergenic	novelGene_33824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	485.383724490222	1	76	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	318	668	75600	110237	FALSE	35	GAAACTACTTATTCTGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGKEVFAYSDVVHYSCNRQSGSDQYSLVGQESLVCSANGEWSSEPPKCKVVKCIFPDVQNADRIAGLGTKFTYQSKVTFRCHAGFVINGSNTITCEEDGLWVPPIPQCVKAVFLFF	72515	111325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17796_pilon_+_72571_72904_73008_74554_74664_75549_75748_96325_96509_110217
933057	contig_17144_pilon	-	1396	10	Intergenic	novelGene_29184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2332.70733401617	3	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	135	1040	179764	167672	TRUE	10	CTTGAGTGTGCCTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLVSCSPHGHQPGRGHQQYRPHPDDLGPG	183216	166065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_167612_167676_167918_168002_173604_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
933058	contig_17144_pilon	-	912	6	Intergenic	novelGene_29408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1793.46152453851	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	261	833	172736	166152	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183218	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166479_170895_170934_172528_172828_179731_179786_181794_181850_183158
933059	contig_9186_pilon	-	2023	1	Intergenic	novelGene_85355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCCTTGTCTTGTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	475027	473004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9186_pilon_-_473000_475000
933060	contig_9698_pilon	+	1076	1	Intergenic	novelGene_82507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTAAAATGAAGTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	254576	255652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9698_pilon_+_254600_255700
933061	contig_4678_pilon	-	2413	1	Intergenic	novelGene_125999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	69	368	83382	83083	NA	15	AAGCTCGCCTTCTCTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHNSTPSLNGSDIHKIRLEQDLKAQVSYMRKWPKHPWSPLLSYYLPSPRLHLWPHGEFLMISSPRKRKLVPGLQMILHHMQAPLTSGKQQYHSPFLGPP	83450	81037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4678_pilon_-_81000_83400
933062	contig_7119_pilon	+	2683	1	Intergenic	novelGene_40984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	95	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	226	828	139196	139798	NA	30	TATTAACCTAAAGGTTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	138970	141653	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_139000_141700
933063	contig_20951_pilon	-	293	2	Intergenic	novelGene_43087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	1	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCTAACTTGCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27616	27111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
933064	contig_3747_pilon	-	2866	8	Intergenic	novelGene_24866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCGGGATAGCCCCCGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201025	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202737_202867_203127_203227_203384_203496_203649_203766
933065	contig_7513_pilon	+	1818	1	Intergenic	novelGene_89007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAACTCTGGAAGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642453	644271	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7513_pilon_+_642500_644300
933066	SIRV3	-	630	2	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	16	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTCATCTATTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7822	7119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_7243_7315
933067	contig_6102_pilon	+	2323	15	Intergenic	novelGene_31919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	440.969780074299	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	192	911	379014	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEQVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	376235	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_379998_380536_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
933068	contig_1230_pilon	+	2147	9	Intergenic	novelGene_28865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1236.63896813096	1	55	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	646	1941	85	2025	405241	408754	FALSE	40	TCAATACTTGAATATGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	404470	408876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_404521_405206_405446_405707_405914_406126_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
933069	contig_12427_pilon	-	1528	4	Intergenic	novelGene_40560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1490.98982782133	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	257	673	510486	505932	FALSE	0	TTCTCGTTTTCCTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSSRPVPGILKTFPLLCWETRLTSKTDKWPQSEHRPGATAKIIFPTSRPVPRRPLTWSRRSRRLHGMHLNRKQRWSCTMNSPNPSSWTRMTGPRPRRKAAVAEGAVRVEHRVLHKPRTHLGLQTQAPLASSKQNIN	520383	505076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520257
933070	contig_7059_pilon	-	4601	5	Intergenic	novelGene_178356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	137	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATGGGAAAAAATTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313324	112613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7059_pilon_-_114530_133574_134687_163528_163592_308468_308882_312227
933071	contig_17976_pilon	-	2534	4	Intergenic	novelGene_32503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGACAGTCACCTTCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	48888	41660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_-_41855_45522_45590_46441_47887_48060
933072	contig_9653_pilon	-	717	5	Intergenic	novelGene_48303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2547	junction_4	538.464657614592	8	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	150	659	1009606	1006903	FALSE	40	CATTTAAGTTGATCATTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKNKKKEKVEA	1014185	1006844	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126
933073	contig_11258_pilon	+	2111	2	Intergenic	novelGene_67867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	61	438	373676	374053	TRUE	20	TTCTTCACTTTCAGCGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDSKSLGRLERTVGGITDMKGNSGEGSEGSEESSKAGDGTDCENQRQRNSGSRTRILMQDSIRADPWLKRAECLQTERTRNQEVEDEKTRTWLVPLIPSFPPISLIGKENVYLVPVLPLYFGSR	373615	375987	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_374661_374921
933074	contig_8712_pilon	+	1726	2	Intergenic	novelGene_58813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTGGTGAACTATTTATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315022	323245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315188_321684
933075	contig_14481_pilon	+	4933	1	Intergenic	novelGene_153856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	163	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	953	2862	48	2909	206021	208882	NA	35	AAGCTTGTGTAAAAGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSSPILSGKVTSEKEMALISQMNNMLQTVNNEKSVSFLPTPSEFVTASVNLTTKVETRDNVDLRGNHITQSHPQVLGTTIKSPDKVNYTVKPNAYNSGDMHNYCINYVNSELPVESSNQGSLPFHNYSKMNNSNKHRRFSGTAVYENPQRESSSNKMMVQQPISESVLSLVKKESSNPDSLLASISLLNPKYGTIKTQAEIEEPCDLGRGHNIDGHNLYTNENQNLESVTEKPKWDSFSSVDSPMMPRITSVFSLQSQQASEFLPPEVNQLLQDVLNTKSDVKQDSHNTPSKGLPLHADQSFRKHEGEGKRVESSRDLKMQGIFPIPSGSVGVSELTNDLNLKCNGKQVLSMSQNVRDSEKTPRISGIGTLLKTQSDAIITQQLVKDKLRATTQNLNSLCIQSPLLNSEQKKAIFVQTPKGLFVPLHIANKPGLHVSGRPLSLVNTQSVPASLLLNKKPGMILTFNNGKLEDVSSVKIENAQSCGGVTTKEPCRTPFLKVEPSNNCLTPTLCSSVGSCLSMKNSSENTLSLKGPYVIKTSANSSVKTVPTPVLSEHQGTKLNILDSVKQPNEVFPKPPLYTLLPDGKQAVFLKCVMPNKTDLLKPKVVQNSTYHQNIQPKKPEGTPQKILLKVFNPVLNVTAASNLPVSHSASLLQKAEVPSNQPVEGQQKEPESSRDALPVLLDDLMPANEIVITSTAACPESPEEPVCITNCSDARVLRSKTDCTNERSFNRKKASKRKFSRIKAHVGSKDFETAFATRDRNCKRKCRNSYQEPPRKKATLHRKCKEKANPENSHETFEPRFSKDTVRTLRLFPFSSKQLVKCPRRNQPVVVLNHPDADVPEVVNVMKTIAKFNGRVLKVSLSKRTVNALLKPVCWNPSKTTYDEFSKRHKTFKPVSSVKERFVLKLTLKKTSKNNYQIVKTTSESVLKAKFNCWFCGRVFDNQDAWAGHGQRHLVEATRDWNMLQ	205973	210906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14481_pilon_+_206000_210900
933076	SIRV6	+	644	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	123	16	123	-16	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	34	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGGCGATGACTATGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10360	11314	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
933077	contig_17840_pilon	+	2133	1	Intergenic	novelGene_154303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTTTCAGTTCTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76013	78146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17840_pilon_+_76000_78100
933078	contig_14142_pilon	-	1653	11	Intergenic	novelGene_120533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	425.350161631567	1	90	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	295	1152	351794	349539	FALSE	15	GAAACTGCCTGTTTGGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI	355508	349037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14142_pilon_-_349684_349796_349877_350132_350223_350384_350520_350605_350750_351180_351291_351640_351813_352845_352904_353497_353631_354021_354071_355472
933079	SIRV3	+	934	3	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	4	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATCGTGGTTTCTTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4007	6746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV3_+_4069_4595_4780_6057
933080	contig_11171_pilon	+	1424	1	Intergenic	novelGene_48624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTACCATAAGCGGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378398	379822	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_378400_379800
933081	contig_5153_pilon	+	1808	17	Intergenic	novelGene_74365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	298.046497788097	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	253	1560	1007835	1022174	FALSE	15	TTCCTGTCTCATGTGATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIGLDNVASYAGQFNQDYLSGMKVTLAQRKEGACSTSAAGKLHQAEGMLRLAANMSGTFGGSNVPNLYPGAYPGQPPMAYPGQPPVPPPVQQQLVPSYPVYPASGAVTPAVPPAQFGNRGTIADAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGTDEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILAMMKTPILFDVYEIKEAIKGAGTDEACLIEILASRSNEHIREMSRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLLISLSQGNRDESTNVDLSLVQRDVQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQRMTGRDIEKSICREMSGDLEQGMLAVVKCLKNMPAFFAERLNRAMRGAGTKDRTLIRIMVSRSEIDLLDIRAEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND	956653	1022422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5153_pilon_+_956801_1005517_1005581_1007792_1007907_1009183_1009271_1009984_1010040_1010237_1010375_1011707_1011796_1012035_1012131_1012820_1012935_1014969_1015061_1015426_1015507_1016078_1016136_1017337_1017432_1018942_1019039_1020147_1020207_1020453_1020577_1022114
933082	contig_7357_pilon	+	2208	10	Intergenic	novelGene_36830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1226	1603	139801	154908	TRUE	25	AACCAGCCCCCACGCTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	135611	167086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136104_136219_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154720_154860_155083_159916_160034_166772
933083	contig_7963_pilon	-	2768	10	Intergenic	novelGene_58426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	566.840256636038	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	1708	2760	120716	118203	TRUE	20	TCTTAATATTTTTGCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKSEKHRGRAGVDEDDKGPRASRPPQLKKSKKASGSSSGAALGPPGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPVGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKTSEKTESSATQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG	123316	102720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_102728_118201_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120736_120939_121959_122054_122262_122349_122489_122993
933084	contig_9463_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_83803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	16	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	58	177	127	303	4293	4117	NA	80	TAAACCAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQEVAYDQEPVVVKEEVQAALNALAKNKAPGIDRVPIEVFQLMDAALEVLIHLCQEFGRHLPGQPTGRDTHLCPFQRKVIQQNLEIIKQYHYYHTQVKFC	4419	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9463_pilon_-_2100_4400
933085	contig_13021_pilon	-	3324	5	Intergenic	novelGene_8208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	113	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCCAGCTAATCTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181151	177022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_177259_177357_177792_178170_178281_178521_178584_178669
933086	contig_3787_pilon	+	1867	1	Intergenic	novelGene_102368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	445	810	371198	371563	NA	60	AAAAAAAAAAGCCTTTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSKYSKKLDHMKKNSASGLKEGSLITWVCYADDTPLLAESEEDLKLLLMKNKDYSLQYGLNLNIKKTKILTTGPISNVMINEEKIEVVKDFVLFGSTVNTHGSSSQTMYCTGHICCKRPL	370753	372620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_370800_372600
933088	contig_5686_pilon	+	1396	3	Intergenic	novelGene_45270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CATAATACTAGATTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	93805	96812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93974_94940_95482_96125
933089	contig_8354_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_24152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	360	453	812	551216	550857	NA	30	TCGGAATTTAGTATACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSENLCSKDSECLVLEQSRVFFSFCRYESPEIALNCGIMLRECIRHEPLAKIILWSEQFYDFFRYVEMSTFDIASDAFATFKVTFIKTVHSSKQTCKSDFWACCFSYPPYPRSLHTAAL	551668	550163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8354_pilon_-_550200_551700
933090	contig_3747_pilon	+	2246	7	Intergenic	novelGene_24858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	4259.74364121703	3	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	318	1247	201313	204183	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLMVFPRFLWRRYYRLW	200995	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203280_204135
933091	contig_9187_pilon	+	330	2	Intergenic	novelGene_179222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	10	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCAGCTGTACCACACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2237	10307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9187_pilon_+_2465_10204
933092	contig_9363_pilon	-	2694	18	Intergenic	novelGene_6576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	728.021069887879	2	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	88	1902	766195	755098	TRUE	35	AGTGCAAGAGTATATGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDAGTWKTNGVVKGSQIGSYFGASLCSVDMDIDGNTDLILIGAPHYYEQSRGGQVSICPLPRGRAKWQCKAVLLGEQGHTWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYIFLGASGLGVNPSHSQRIAGSQLSPRLQYFGQSLSGGQDITLDGLVDLAVGAQGHMLLFRSQPVLRVEVTMEFTPREVARKVFECHGPVARNQNAGEVRICFRVRKITRDRLTVGEIQSIITYDLALDAGRPNPRAVFDETKNSTYRQTQTLALMENCDTLKLQLPDCVEDPVTPIVLRLNFSLEGRPSPSFGNLRPVLAMDAQRLFTALFPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTSENNMPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKSSPDTDQSGAV	773223	753795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755134_755549_755664_755804_755889_756088_756197_756718_756795_757122_757207_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_766002_766093_766235_773175
933093	contig_5324_pilon	-	2468	1	Intergenic	novelGene_102074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	125	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	199	600	33	632	444540	443941	NA	45	AAAGCACACCAGACCCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAADPEEPQTMSNLEKHLFNLKFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444572	442104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442100_444600
933094	contig_5023_pilon	+	1650	7	Intergenic	novelGene_7368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	912	junction_1	891.156629829397	2	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	506	1381	625679	646990	FALSE	35	ATTACTAGAAACTTTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	625173	647259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
933095	contig_854_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_36400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACCCCGAGGGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	975374	976420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_975400_976400
933096	contig_5050_pilon	-	1073	1	Intergenic	novelGene_110257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAGCCGAAGATTAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	287672	286599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5050_pilon_-_286600_287700
933097	contig_9297_pilon	+	900	1	Intergenic	novelGene_69836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTTAATCGCTATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643930	644830	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_643900_644800
933098	contig_5988_pilon	+	2439	10	Intergenic	novelGene_16067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2317	junction_1	1138.72889933155	2	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	110	823	1218380	1224777	FALSE	30	CCAGTGCATAGTTTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209834	1226393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753
933099	contig_8907_pilon	+	1900	1	Intergenic	novelGene_85788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	104	322	58030	58248	NA	15	GCCCTTTTTCAGTAACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIVSGESLRHKLVSHSKIYTLALLHCLQSPQRVSMSPPFHPRFPVTICPVFLSLPAFSSLLLGRCFPFGLVYFIELRSMFLICVVVCFIGLSNLWLKSGLQEWLQF	57926	59826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8907_pilon_+_57900_59800
933100	contig_20428_pilon	-	2819	2	Intergenic	novelGene_169316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	2	358	20945	20079	FALSE	30	TGTATGAGTGACTAACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILGTSELKWTGVGHLELDIHKVYYARNEKLKRNSVAFIIKKNTSRSFLKYKAVSDRTTSTHLEGRSVNTIIQIYAPITNDIYEGTKDFYQLLQSETDQTCNHHVLIITVDWNAKVGNK	20946	17617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20428_pilon_-_20192_20701
933101	contig_14687_pilon	-	2408	1	Intergenic	novelGene_107929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAGAAACCATGCAGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473949	471541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_-_471500_473900
933102	contig_3018_pilon	-	1884	14	Intergenic	novelGene_78855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	453.320817207427	4	70	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	489	1467	416	1882	600079	562932	FALSE	65	AGGAAAAAAAGACAAGGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERYCRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETRRK	625000	562929	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577841_580103_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772
933103	contig_5684_pilon	+	658	2	Intergenic	novelGene_81054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	448	junction_1	0	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	89	412	403755	441865	FALSE	75	TTTTAAAAAAAAAAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTRDGGGGSKDAGSEDYENLPTSASLSTHMTAGAMAGILEHSVMYPIDSVKTRMQSLHPDPKAQYTSVYGALKKIVRTEGFWRPLRGINVMVMGAGPAHAMYFACYENMKRTLNDVFHHRGNSHLANGILKAFVWS	403666	442111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_+_403821_441607
933104	contig_6589_pilon	+	2030	17	Intergenic	novelGene_25719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.7700642445184	1	83	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	233	1666	460735	507033	TRUE	20	TCTGGAGGAGTCTACCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTFCPECGKSIESTFKFCPYCGKCLPTEEHGGSPAFVKPLTSSFRGSRRDLNSSSEISCKKVKWSSSVISPPSSLFSDSDNSESEEFLSPSERPKGSTSLSASLSGLGVSRRQGPGSRNKPPTPKGSPQTARRSPQTLKRSQVTISLEALPMGTVLIDKSGQHWKLGSLQTRDDQGILYEAEPDSAPASAFTCESSPQKQRFSLKLDAKDGRLFNEQNFFQRAAKPLQVNKWKKLYSTPLLAIPTCVGFGVHQDKYRFMVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRVSAYDPVDLHMVP	451699	509759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_451727_452179_452321_457292_457356_460733_460874_463619_463770_465119_465180_467000_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478087_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_507045_509406
933105	contig_15720_pilon	-	1718	1	Intergenic	novelGene_41958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAATGAGAAACTATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307024	305306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15720_pilon_-_305300_307000
933106	contig_3956_pilon	-	2373	9	Intergenic	novelGene_15068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1064	1915	1289815	1284227	TRUE	35	GAGAACGCTGACGTCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRAPRTMMLPMGPLSPSP	1291015	1281601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282898_1284051_1284275_1287433_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1290270_1290406
933107	contig_10482_pilon	+	1906	8	Intergenic	novelGene_152804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1505.08128467182	1	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGCCATGCAAGGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	77238	127161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_77347_116180_116260_117245_117298_118597_118655_119568_119710_122342_122476_123194_123312_125942
933108	contig_18415_pilon	-	4057	1	Intergenic	novelGene_118313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1758	2078	29203	28883	NA	70	AGCATTATTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSPPAAFFNETEKQITNFIWKGKRPQISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTTTVVKTTWYWYNNRHTDQCNRIENPHVNSSTHEQVVFDEGPKSINWGKDSLFNK	30960	26903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18415_pilon_-_26900_31000
933109	contig_20527_pilon	+	3056	5	Intergenic	novelGene_138563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1242.62554697704	10	130	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	773	1300	24916	27453	FALSE	25	CTAACTGACCGACTATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNNYILCNTCQNLVLPPRYYVPDFNCGCTFCYHSGEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12843	29209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25444_25614_26238_26346_27308
933111	contig_8310_pilon	+	3861	4	Intergenic	novelGene_75611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.50708685174	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	762	1106	316729	324814	FALSE	15	GACCCCTGCGTTTCAGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKMVQDFIDIFSDYANFK	315967	327569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_316759_317718_317886_320576_320675_324764
933113	contig_19459_pilon	+	1122	8	Intergenic	novelGene_59887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTATGGCAAGCAAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6753	19060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7116_7788_7939_10262_10334_11334_11424_12584_12707_15506_15700_16201_16265_18988
933114	contig_4232_pilon	-	594	2	Intergenic	novelGene_63371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGAAAAAATAGAAGATAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467240_467551
933116	contig_3095_pilon	+	1248	5	Intergenic	novelGene_74975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	74	838	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147167	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933117	contig_1452_pilon	+	2034	3	Intergenic	novelGene_115151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATACGATGATGGCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698266	715426	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_699951_700533_700687_715229
933118	contig_17108_pilon	-	4503	1	Intergenic	novelGene_109555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	51	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	2443	2988	446547	446002	NA	25	TTGGACGTGTTATCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLTGWHTQGSDRLHLWKEIVEKLNIISQNKARGRLGKDHWLLICKLKLKLKKIETCPQDPKYDLEYIPPEFREHLKNRFDTVNTNDKRPGKLWDDIKDIIHEESETKNQKPLLSSQFRLMVTKESERSLKRQERKKSPKWMLEETLKLTLDCRVAKVNGRNDEVNSCTYFDFKGQLEKTK	448989	444486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17108_pilon_-_444500_449000
933119	contig_854_pilon	+	1497	3	Intergenic	novelGene_36727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_2	372.5	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	104	520	1713068	1714980	FALSE	70	TTAAAAGTAAAAATAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPHRERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1712964	1715957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713194_1713308_1713482_1714862
933121	contig_20641_pilon	+	1504	6	Intergenic	novelGene_52850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1431.36027610102	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	46	636	14599	54901	TRUE	15	CTCTGTGAAAGCTCCGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMFMVSTLLALFETKHLVGAATHLLLWVCWKQDSVY	14553	57181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_45924_45965_54835_54968_56379
933122	contig_14970_pilon	+	2103	11	Intergenic	novelGene_45036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	6989.95785752675	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	606	1424	207723	231550	FALSE	10	GTCTGTACTTCTGCCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTVTTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	182320	232229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_182459_188757_188830_191970_192205_196136_196257_207681_207823_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
933123	contig_6494_pilon	-	659	5	Intergenic	novelGene_108562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1217.4360352807	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	230	583	3457	2635	TRUE	20	CACATGGCCTGACTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	6884	2104	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5665_6783
933124	contig_5023_pilon	+	1596	4	Intergenic	novelGene_7375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2736	junction_3	376.273245867356	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	605	994	631542	646990	FALSE	5	TCCTACTCTGCTTTCGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	630937	647592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_631550_639072_639197_643413_643539_646857
933125	contig_4857_pilon	-	1356	2	Intergenic	novelGene_48739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAATTTAAAAAAAAAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195680	1193535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193928_1194716
933126	contig_17144_pilon	-	4110	11	Intergenic	novelGene_29516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2445.11673340967	26	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	2730	3830	170784	166363	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFLLPNPPATVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	179781	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168078_168162_168310_168996_169099_170744_172191_173939_174761_174876_175001_175973_176271_179700
933129	contig_3747_pilon	+	2876	8	Intergenic	novelGene_24810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4986.03480754405	1	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	330	956	201313	202945	TRUE	15	ATGTTGAGTTTTTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMRRKFPACSFLMGGCLSLLELTEKDSVKVMRFPYMLTLRIHVPASWSPKLPL	200983	205205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202658_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203643_203768
933131	contig_13021_pilon	+	801	2	Intergenic	novelGene_8222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3981	junction_1	0	1	21	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	122	508	180464	180850	FALSE	45	GAAGACTGAATTAAGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	180112	181143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_180211_180440
933132	contig_15375_pilon	+	1385	1	Intergenic	novelGene_178793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTCTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19605	20990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15375_pilon_+_19600_21000
933135	contig_5020_pilon	-	1051	5	Intergenic	novelGene_27914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	594	941	124926	123330	FALSE	20	TGCCCAGCACACCGCGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126086	123219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656
933136	contig_15449_pilon	+	3251	11	Intergenic	novelGene_33598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	603.685754345752	3	185	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	1256	2209	47319	54621	FALSE	15	TATATTTGTCAGGTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	37479	55663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_38069_43216_43474_45574_45701_46863_46990_47161_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
933139	contig_17427_pilon	-	2242	12	Intergenic	novelGene_30377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1065.98141642586	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	11	880	188879	179445	TRUE	45	CACTTACCAAAATATGCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WYIMADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQLQRKSHLYLNCRARSGEWKIKRMFPTW	188889	177087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179711_181289_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767
933140	contig_5961_pilon	+	2226	10	Intergenic	novelGene_144117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	460	junction_1	526.296306721922	4	15	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	129	1148	144074	197386	TRUE	40	GTGGGTTGAAACAAACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKKTEVKPERISTKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLQKQKRQEAGREDGGMSAKSSLGNALDSKDKTQKINGEMSEKNETTERGAITAKELYTMMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISCMYVKVFV	113767	202351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170478_172940_172984_175650_175796_194230_194394_197215_197889_201775
933141	contig_15491_pilon	-	2086	7	Intergenic	novelGene_75954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	467.173653176442	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACACTAGGCTCCTCCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46992	30924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_33111_33172_37096_37200_37440_37560_38887_39027_45165_45207_46879
933142	contig_13453_pilon	-	5225	2	Intergenic	novelGene_146710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	124	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	3294	3629	86897	86562	FALSE	5	GTCCGTCTGGCCAGTGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSISVSFLKDPSNLAYLLPSGVCVLLVMVCILLMPCIKASSVNPVFSSMNFTLFGFIFRSLIQIELVFVYGVRYESCFRFLQMDIQFCQHHLLKRLSFPHLVDFGPLLKIR	103893	84965	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_89950_103652
933143	contig_3130_pilon	+	2460	1	Intergenic	novelGene_103561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGCTGTAGTCAGCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66232	68692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3130_pilon_+_66200_68700
933144	contig_15047_pilon	+	1736	7	Intergenic	novelGene_52141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	4	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	28	651	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2166	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4664_20326_20400_21013
933145	contig_13097_pilon	+	1711	1	Intergenic	novelGene_107671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	21	407	18281	18667	NA	25	CTGTAAGCCTTCACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TKEDIQMANRHMRKCSQSLAIREMQIKTTLRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCAEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTQIDVCTPMLMAALFTTAKRWKQPRCP	18260	19971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_18300_20000
933146	contig_12654_pilon	+	3850	1	Intergenic	novelGene_129294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	158	37	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	2186	2548	756394	756756	NA	35	ACCAGTCCCTGAAGAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSEETLKLAFEHRVAKVNGRNDDVKEMNRRFQRAAQKYKVKYYNDMCKHLELENQKGRTCSAFLKLKELRKKFKPRIAILKYSMGKIFKDTGGIKRRWKEYTELLYQKELVNAVFSGDSI	754208	758058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12654_pilon_+_754200_758100
933147	contig_2703_pilon	+	910	2	Intergenic	novelGene_101633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAAATGGATGGCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1346	3291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1734_2768
933148	contig_8269_pilon	+	1747	1	Intergenic	novelGene_106266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGAGCCTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413158	414905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8269_pilon_+_413200_414900
933149	contig_14925_pilon	-	2221	5	Intergenic	novelGene_55258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	1743	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	30	CTTCACCTTGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	111551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
933150	contig_9696_pilon	-	1733	1	Intergenic	novelGene_68844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	85	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	213	566	588759	588406	NA	35	CACCTGCAAACCGAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWRFLKKLQTEILYDPAIPLLGIYPREIRAVTLIDICTPMFTAALFTIAKRWKQPKCPLTDEWINKLWYTHTMEYYTMKNNDKCEKQLTTWMNLEGIMLSEISQSQKDKYCKKPLL	588971	587238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_587200_589000
933152	contig_6898_pilon	-	2327	11	Intergenic	novelGene_35745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	1208	1798	124838	119624	TRUE	25	ATTCCTCGGATACATCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLLLSLLSLFLNLLQPLHQFFLLPFNLLLLLFCHFTLLLLIFTHRSICFWCFSSRACAFICCTSMVSGLRRRMYSSWFPMHKAKIRLLIRSRGA	127701	114336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_114525_115894_115979_116669_116817_117863_117962_119611_119784_122622_122742_122980_123142_124368_124462_124780_125006_125479_125700_126881
933153	contig_14970_pilon	-	1799	3	Intergenic	novelGene_45056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTTTCTTGGAGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232847	192014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_192224_224286_224373_231343
933154	contig_2834_pilon	+	1492	5	Intergenic	novelGene_28004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3761	junction_3	1019.86331804806	5	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	45	620	274763	290707	FALSE	25	AGTCATTGTCTAATATGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274718	291579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274868_277842_277916_285323_285434_285547_285746_290617
933155	contig_14970_pilon	-	1758	7	Intergenic	novelGene_45133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	134.561530741723	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	806	1210	285651	268709	FALSE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315770	268160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285646_285807_290934_291170_311919_312047_315339_315469_315611
933157	contig_15327_pilon	-	1668	4	Intergenic	novelGene_70651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	8	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	123	533	901528	900904	FALSE	50	GACTAAATTTACCAATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902150	899768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
933158	contig_5020_pilon	-	1325	7	Intergenic	novelGene_27824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	425	943	125663	123330	TRUE	20	AGAGGGGTCAGCGGAGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPFVEGPGPLLLEHGKGTVASAAVLAQGRVHVSRLDYVDRGGDDSGTEACPKGRGEMARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126087	118461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118564_119436_119584_123196_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125091_125656
933159	contig_343_pilon	+	2007	1	Intergenic	novelGene_163903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATGAAAAAAAATCCACAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103217	105224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_343_pilon_+_103200_105200
933160	SIRV7	+	1901	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	85	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTTAATCCTATGAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1005	114742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_43027_43083_114683
933161	contig_3861_pilon	-	1751	1	Intergenic	novelGene_57882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGCTATAGTCTATCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134765	133014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3861_pilon_-_133000_134800
933162	contig_18272_pilon	+	2766	8	Intergenic	novelGene_6976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	155	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1710	2033	122452	124285	TRUE	15	GACTGGTCGTCGCTCACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWLQGLGDAVEVKFVGIPFAMHFGHNVFVIVISEGPAQLVVIHVGLALPLPPASGHLIGVRHFELPVGALPGDTAGIGTIRKELEEELPQLDLPPGLARRLLVGPRI	120742	184518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_122732_124241_124295_126334_126399_128543_128600_157860_157925_168458_168670_172645_172794_184337
933163	contig_9366_pilon	-	1691	1	Intergenic	novelGene_166222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATTTCCAAATAAGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147673	145982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9366_pilon_-_146000_147700
933164	contig_6418_pilon	+	2105	1	Intergenic	novelGene_81135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGTCCAAATGGAACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	150572	152677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_150600_152700
933165	contig_16578_pilon	+	1638	1	Intergenic	novelGene_148687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	171	516	193	708	322067	322582	NA	50	GACAAGAACAGGCAAATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWCLLITCPKYMRQSLTILASKEYSDCTSSKTDLFGLLSVYGIFSILCQHCNSEVSILLQSSLFIVQLSNAYEVIENTMAWVRYTLTLVVKATSLLFNSLKRCFPADLPNAMRHFMSYLLLSWVLIADPSKMKSLTTSVFSPFIMMLLIGPLVRIFVFFTLRHNPY	321874	323512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_321900_323500
933166	contig_17144_pilon	-	1408	10	Intergenic	novelGene_29458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2341.75409089473	1	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	191	721	179764	173705	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFNETGAPHTGDPGPQP	183272	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166344_172679_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
933167	contig_11564_pilon	-	1636	2	Intergenic	novelGene_158564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCCCAGCATGTATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59196	57177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_-_58710_59092
933168	contig_15063_pilon	+	1908	7	Intergenic	novelGene_12276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_5	3737.29513002236	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	223	1551	28164	38987	TRUE	15	TATTCTCCTTATACTGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQRGK	27941	39759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36569_38975_39092_39506
933169	contig_10225_pilon	+	2784	11	Intergenic	novelGene_86818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	582.532926108044	1	139	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	1080	2666	42707	47636	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20704	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35628_35785_37035_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110
933170	contig_10455_pilon	+	1150	1	Intergenic	novelGene_177435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTTAACTAGTTAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108305	109455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10455_pilon_+_108300_109500
933172	contig_15244_pilon	+	2102	2	Intergenic	novelGene_118078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	66	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	480	1622	2101	809879	810358	FALSE	35	GAATTCCAGAACAGGGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGFQTKTPDNSPVEENTLEVPDKELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVI	807924	810359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15244_pilon_+_808462_808794
933173	contig_18420_pilon	-	1489	1	Intergenic	novelGene_109334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	115	348	5	352	27078	26731	NA	50	TACATGAAGAAAGCAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WMRTYQGTLYLYHSLDFWLDFWLFCCSAAGYNQYQDLALFAVLAFPDFLTPRLLLFSTVPRGMGFYVLYLKSPPRVCQFVVLWWLVCCCDTGSFPINISDTSRVTLGGQVSAELPD	27082	25593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18420_pilon_-_25600_27100
933174	contig_5020_pilon	+	1433	1	Intergenic	novelGene_27963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATACCTATTAAAAATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252761	254194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_252800_254200
933175	contig_3948_pilon	-	2494	7	Intergenic	novelGene_53201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	300.421740595154	3	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	75	830	866476	840803	FALSE	20	GTGTCATGTCTTCTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGRFERDEDGTGFWHWTRFRQETKMAVNVYSTSVTSDNLSRHDMLAWINESLQLNLTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALKKVKFQAKLEHEYIQNFKILQAGFKRMGVDKIIPVDKLVKGKFQDNFEFVQWFKKFFDANYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869642	839138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_847989_852463_852636_856565_856712_866355_866480_869571
933177	contig_11512_pilon	-	1544	14	Intergenic	novelGene_43388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1288.45172441727	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	303	1133	586598	556654	FALSE	70	ACTGAAAAAAAAAAAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVRALHCWWLGTILLPWTLWWSATLSWTPRRPPSSRWRTVAASPRSPSQPSLLRPSSTSCRAWDTVSPALASMHRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	608508	556242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556784_561299_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571074_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586712_592746_592904_608476
933178	contig_3956_pilon	+	2527	13	Intergenic	novelGene_14911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1404.24155092111	3	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	559	1680	83	1762	1281682	1289798	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVGPRCRRTLPDSVQSKWSVVSMVS	1281599	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287558_1289745_1289892_1290297_1290336_1290381
933179	contig_7408_pilon	-	2410	8	Intergenic	novelGene_168737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	223.734536576593	3	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	489	1568	38514	12597	FALSE	35	GAATCAAAGTTCTGAGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKGSMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSYFLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVSLILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLQHPLAWILLLSLIVCVSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVIGTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGSLSNMYEILSSEETLTCGIEQHTGENVSRRNGNLTAF	48742	11754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_-_13229_24283_24445_26364_26456_36880_36938_38375_38596_47224_47360_47827_48040_48682
933180	contig_5020_pilon	+	1385	8	Intergenic	novelGene_27825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	915.526613262464	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	344	1069	123231	125772	FALSE	5	TGTCTCCTCCCTCTCTTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126088	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122882_123217_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
933182	contig_10973_pilon	-	1428	1	Intergenic	novelGene_150331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2455	1027	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1000_2500
933183	contig_3862_pilon	-	1732	1	Intergenic	novelGene_137437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAATGATAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642298	640566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3862_pilon_-_640600_642300
933184	contig_14744_pilon	-	1592	7	Intergenic	novelGene_65990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	342.381082356423	2	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969964	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_961135_961180_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968680_969760
933185	contig_9982_pilon	+	2873	18	Intergenic	novelGene_55738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	105.983938196829	1	22	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	736	2211	370	2580	315214	338345	FALSE	25	GAGACTTGTTTTATTACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPRSEPHCLVLNLDTWSVWCYLCDDEVQYCRSNRLGQVVDYIRKQAGITSLQSAKGNGNIELENKKLEKENKNEQEREKKENMAKENPSMNSTSQITVKGLSNLGNTCFFNAVMQNLSQTPVLRELLKEVKMSGTIVKIEPPDLALTEPLEITLEPPGPLTLAMSQFLTEMQETKKGVVTPKELFSQVCKKAVRFKGYQQQDSQELLRYLLDGMRAEEHQRVSKGILKAFGNSTEKLDEELKNKVKDYEKKRSVPSFVDRIFGGELTSTIMCDECRTVSLVHESFLDLSLPVLDDQSGKKSINDKNLKKTMESEDKDSEEEKDNDSYMKERKDVSSGTSKHLEKKAKKQARKQAKNQRRQQKIQGKVLLLSDICTMDDPEDNEHDAEVLLQGEVDVKSNHISPADVIDKENCVNQKDLNGREKVLENETDNRKSTEEVDVGNVHVGNVHVENDREDLVSSPTECPEDLNGIYLKEGSDGDVDISSGFKNLNLNAALQPEEINTEILNNSHTAGTNIYEVVNEDPETAFCTLADRDAFHTYECSVEHCLYQFTRNENLRDANKLLCEVCSRRQCNGPKANIKGERKHVYTSAKKQMLISLAPPVLTLHLKRFQQAGFNLRKVNKLIKFPEILDLAPFCTLKCKNVAEENTRVLYSLYGVVEHSGTMRSGHYTAYAKARPANSHLSNLVLHGDIPQDFDAESTKGQWFHISDTHVQAVPTAKVLSSQAYLLFYERIL	307581	338638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9982_pilon_+_307690_311157_311260_313037_313152_315168_315273_316048_316153_317260_317446_318517_318614_322719_322851_323659_323748_324996_325076_326517_326610_326942_327000_327937_328115_330452_331132_332138_332234_333522_333610_337965_338123_338220
933186	contig_3018_pilon	-	1738	12	Intergenic	novelGene_78860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	436.98417998106	2	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1071	666	1736	583440	562938	FALSE	75	GAAAAAAGGAAAAAAAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	625094	562935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583629_600038_600194_624772
933188	contig_16431_pilon	+	2187	1	Intergenic	novelGene_87617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTGTTTTTTTGGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226058	228245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_+_226100_228200
933189	contig_19386_pilon	-	2136	3	Intergenic	novelGene_179223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAAGGAAAAAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	108411	647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19386_pilon_-_864_914_1674_107250
933190	contig_8397_pilon	-	2464	2	Intergenic	novelGene_177735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	2028	2336	280116	279808	FALSE	80	AAAAAAAAGAAACAAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEKSRVQNSNSSKKTRLNGLTDTGAIPEDMAPGLSISPELKPFLNPTFQRLDWTVGHKMILVKRVLLSSSRYMRLNGQFLSGGEMRRQKGQELVEWTWEI	282186	279679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8397_pilon_-_280419_280461
933191	contig_5918_pilon	+	1758	1	Intergenic	novelGene_99544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGCGGAGTCAACCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	727927	729685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5918_pilon_+_727900_729700
933192	contig_6488_pilon	+	3256	2	Intergenic	novelGene_44706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAACGACACCTCCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62	6683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_+_3218_6582
933193	contig_9363_pilon	+	2783	2	Intergenic	novelGene_6473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	455	1368	365	1732	4469	6682	FALSE	35	AAACTGGATATCCATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIISIDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKENDEKEIRKSIPFSIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYKENYKTLLHETQRDLHKWKNIPCSWIGRLNIVKMAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICRKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHTQYRGN	4104	7733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_+_5815_6660
933194	contig_7876_pilon	+	956	2	Intergenic	novelGene_144848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTATTGAGAAGTGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	300383	301468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_+_301080_301208
933195	contig_854_pilon	+	2043	9	Intergenic	novelGene_36529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3092.75294034296	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	146	1021	1649514	1715383	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEGIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKSKKDQGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYESSFLPTNGVLIA	1612800	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649847_1656036_1656194_1671958_1671987_1672803_1672898_1677515_1677609_1678131_1678196_1678749_1678809_1715335
933196	contig_16594_pilon	-	3850	9	Intergenic	novelGene_53825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2760.31038789119	2	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	280	1284	149347	118290	FALSE	65	CTTCAAAAAAGAAAAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQMSLAILYIPSRNTHKNPSATRLTSTYCMLTRRNDNMEIHRTLLPVHFVHLIDICAEVIFLSKRTTPSFFF	306456	115723	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118501_121104_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149353_165480_165649_306350
933197	contig_14683_pilon	-	1431	1	Intergenic	novelGene_166058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAATCTGTGGGGTGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177930	176499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14683_pilon_-_176500_177900
933198	contig_10217_pilon	+	1223	1	Intergenic	novelGene_87404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	725	1087	97663	98025	NA	70	AGATAGGGGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEDRRRIHGFELCCWQRIFHILWTAKRMNKSVLEEVQPESSLEARMARLHLTYFAHTIGRDQSLEKDMLGKVEGQRKRGRPSTRRIDTVAATTGSSITMIVRMAQDWAVFHLLYMRSL	96938	98161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_+_96900_98200
933199	contig_17144_pilon	+	1420	8	Intergenic	novelGene_29440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	894	1211	167621	168283	TRUE	25	AAGTTACTTCACTTTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166074	181813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168309_168996_169117_179740_179784_181792
933200	contig_5961_pilon	+	1200	1	Intergenic	novelGene_144185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGTTTTCGTTGTATAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	333880	335080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_333900_335100
933201	contig_7119_pilon	+	2116	4	Intergenic	novelGene_40929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	349.026582878089	49	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	939	1388	139776	140225	FALSE	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127497	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707_138802_139106
933202	contig_15070_pilon	+	2005	2	Intergenic	novelGene_164902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCAATTGCTGAAGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	522114	524296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15070_pilon_+_522976_523152
933203	contig_11986_pilon	-	3143	6	Intergenic	novelGene_69210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1713	junction_2	1115.52846669191	1	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	25	966	744270	736169	FALSE	40	GTTTAAAGAAAAAGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENEDLKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGTHGLTSPGGNNVQLIDKVWQPGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWRFHSMPACAATNLPRVDDVLASLQVPSHKCKVMYYTEVLGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSIQSHSSSTVSR	744294	733991	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11986_pilon_-_736275_736942_737122_738285_738538_740666_740802_743116_743252_744135
933206	contig_1856_pilon	+	3025	2	Intergenic	novelGene_84873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	957	1856	212952	213851	FALSE	25	GGGTTGTGGAACAATGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINAQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKKMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTITKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEFCATRKNNNESMNL	186223	215020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1856_pilon_+_186291_212062
933207	contig_2100_pilon	-	801	7	Intergenic	novelGene_50708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	916.750420416229	2	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	54	455	1182812	1170268	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKFRNPFAN	1185464	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170295_1176352_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
933208	contig_8106_pilon	+	1116	3	Intergenic	novelGene_139747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	558	557	1114	210792	211349	FALSE	50	CCAGCACATGAATAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDITTHPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLERMDKFLETHYLHKLQQSDVENLNRPITREGVEKVIKKLPTKNSLGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSIEEEATLPNSFYEDSIMLIPKPGKDITKKENYRLISLMNIDAKILNKILANRIQHHIKKIIHPDQVGFIPGMQGWFNIRKSINV	144071	211351	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8106_pilon_+_144371_209732_209887_210688
933210	contig_6898_pilon	+	1885	4	Intergenic	novelGene_35776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2839.00385503241	1	29	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	24	461	124416	125646	TRUE	30	TTCAGTGCCATTAAAAGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124392	127674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124464_124782_125008_125481_125724_126327
933211	contig_14513_pilon	-	1254	3	Intergenic	novelGene_70229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	184	552	18880	11982	FALSE	10	CTTTTGTCCATGTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19063	11279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
933212	contig_8484_pilon	-	2739	2	Intergenic	novelGene_178372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATATTATGTTGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7376	4520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8484_pilon_-_6192_6308
933213	contig_17737_pilon	+	749	1	Intergenic	novelGene_72916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAAGTAAAAGAAATGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101268	102017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17737_pilon_+_101300_102000
933214	contig_12411_pilon	+	925	1	Intergenic	novelGene_145680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTTAATGAGAAACTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	376348	377273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12411_pilon_+_376300_377300
933215	contig_8712_pilon	+	1742	2	Intergenic	novelGene_58810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	96	291	8	298	314974	321821	FALSE	30	ATTCTCATGGTGTGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKMSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPAASSPSAWTPCRMWTTTVPTAKLSWAPTSVCRTRPTWRRP	314966	323265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_315140_321696
933217	contig_6873_pilon	+	2289	2	Intergenic	novelGene_129849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCACCAAAAGAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	804191	806593	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_+_804916_805028
933218	contig_18850_pilon	+	1625	11	Intergenic	novelGene_142424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	937.093639931464	6	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	86	1018	176401	180704	TRUE	20	CCCCAGCCAGACGCAGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGGLGSSSSGSGGYEEQQIQEKVATFRLMLLEKDVNPGGKEETPGQRPAVTETHQLAELNEKKNERLRAAFGISDSYVDGSSFDPQRRAREANKPAPEPPKPYSLVRESSSSRSPTPKQKKKKKKKDRGRRSESSSPRRERKKSSKKKKHRSESESKKRKHRSPTPKSKRKSKDKKRKRSRSTTPAPKSRRAHRSTSADSASSSDTSRSRSRSAAAKTHTTALTGRSPSPESGRQGEGDAPCRESSTTNTGQPSSPEPSTKQTSSPREDKEKDKKEKSAARPSPSPERSSTGPEPPAPTPLLAEQHGSSPQPLATSPLSQEPGNPPAEASPTRGAFAT	171968	181468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_+_172008_176354_176463_176669_176835_177030_177109_177566_177630_177740_177774_178001_178053_178213_178307_178948_179148_180515_181030_181186
933219	contig_8145_pilon	+	1201	1	Intergenic	novelGene_118659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	208	516	833804	834112	NA	40	TACAAATAAGGGGTGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINGENIEVLKDFILLGSIINAHGSSSQEIKGRTALGKSAAKDLFKVLKSKDVTLRTQLRLTQATVFSIASYACESWTMNKEDRRRTYALELRCWQRIPNIP	833596	834797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8145_pilon_+_833600_834800
933220	contig_11720_pilon	+	1354	9	Intergenic	novelGene_43813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2331.25373994338	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	357	1253	78465	98482	FALSE	10	CTCCTTCACTCCACTTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67867	98583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_78378_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
933221	contig_15952_pilon	-	2566	1	Intergenic	novelGene_154076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	156	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1055	1375	343533	343213	NA	35	CGGCTGCCTACAAGAGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSASSQNKESRNFPERKFLGIIRCKIQRLTYRTVQEIRKEIKQNAEHAIEKIKKIREEHNDKFNRLQESIERQQSAIQKINNKMSELDNSIENHRSKTEAMLSQN	344587	342021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15952_pilon_-_342000_344600
933223	contig_2703_pilon	+	1294	3	Intergenic	novelGene_101647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGAGAACTTTGAAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	3610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1759_2579_3349_3496
933224	contig_7051_pilon	+	2084	12	Intergenic	novelGene_64291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	196.833024844464	1	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	110	454	184159	197588	TRUE	25	TTGACTAGTGTCTTGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATS	184049	207367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191842_197585_197642_198514_198551_199230_199323_199978_200047_201833_201872_203048_203168_206143
933225	contig_9668_pilon	-	3167	1	Intergenic	novelGene_58094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTTCCCTCATCAACCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162316	159149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_159100_162300
933226	contig_6102_pilon	+	2670	18	Intergenic	novelGene_31835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	471.429358587698	1	57	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	96	1343	370803	393075	TRUE	5	CAGCTGTGGCTCTTTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	370707	395262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371121_378980_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394847_394929
933228	contig_8059_pilon	-	1109	11	Intergenic	novelGene_111113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGTCATGCACTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338896	254812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_-_254998_266050_266139_275613_275710_278417_278554_279381_279453_280287_280330_283694_283734_292992_293042_327561_327633_336422_336519_338660
933229	contig_854_pilon	+	1314	8	Intergenic	novelGene_36282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2608.86268128392	4	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	42	620	543600	562402	TRUE	35	GTTTGGAAATATAACTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543558	563786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029_563252_563316
933230	contig_4232_pilon	+	1166	1	Intergenic	novelGene_63343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGCACAGCTCCGGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	466971	468137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467000_468100
933231	contig_20641_pilon	+	1787	7	Intergenic	novelGene_52792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2474	junction_3	654.480879951601	4	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	87	1478	14599	56882	FALSE	15	GCTCCGCCTTATTTTTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSGPLRFAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14512	57191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
933232	contig_3747_pilon	+	2200	6	Intergenic	novelGene_24930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4493.16532524678	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	144	821	202689	203804	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGCLSLLELTEKDSVKVKNLVPKMSDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202366	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202765_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933233	contig_4364_pilon	+	1391	6	Intergenic	novelGene_544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	24348.5515988118	5	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	210	1280	1531112	1532647	FALSE	5	ACTGTTCCCTTGGTTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKRSLLPPNASTLSGSVAPSWPRCPPSSRCGSVSRSTTSRALPLFTANASRQTASRCHPCRMSLSRVQVAHLHASC	1530449	1532758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4364_pilon_+_1530519_1530888_1531018_1531100_1531337_1531618_1532058_1532160_1532343_1532422
933234	contig_1076_pilon	+	353	1	Intergenic	novelGene_101084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAGCATAAGTATATAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8749	9102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1076_pilon_+_8700_9100
933235	contig_8576_pilon	-	3135	7	Intergenic	novelGene_88799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGTTGTTCCGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	916976	893652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8576_pilon_-_893738_902726_902839_909854_910783_913245_913398_914229_914308_914835_914976_915336
933236	contig_11720_pilon	-	1124	9	Intergenic	novelGene_43826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGAAGAGGGGCCGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	67932	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78478_86253_86415_87069_87162_93131_93265_94952_95056_95377_95486_98299
933237	contig_2069_pilon	-	1920	2	Intergenic	novelGene_23551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	102	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAGAAATGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1540682	1538715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1540397_1540443
933238	contig_14536_pilon	-	2686	3	Intergenic	novelGene_69274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCAGCTCTCAATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118188	25133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14536_pilon_-_25150_29817_31177_116877
933239	contig_7457_pilon	-	2693	6	Intergenic	novelGene_31441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	164.24201654875	1	140	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1262	1735	471570	469283	FALSE	25	TGATATCTGGGAGATTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSAYPTRDCDWRPAPAKKPALLTGPWKPSEQPARGP	473215	468324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470327_470492_470902_471003_471191_471290_471559_472768_473151
933240	contig_6445_pilon	-	1417	15	Intergenic	novelGene_76915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	737.703164683244	4	37	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	73	1080	89674	44574	TRUE	15	TACATTAGCCTTTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTA	96339	42874	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
933241	contig_5642_pilon	+	3152	2	Intergenic	novelGene_153024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAAAGAAAATATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64897	68186	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_66748_66884
933242	contig_4180_pilon	+	2652	7	Intergenic	novelGene_8357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1707.08881497777	8	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	25	681	865772	888134	TRUE	60	TAAAAAATGAATACATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865747	890262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085_888633_888789
933243	contig_19402_pilon	+	2087	3	Intergenic	novelGene_80772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3398.5	16	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	7	705	23458	29530	TRUE	90	ACAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIMTTEKSLVTEAENSQHQQQKEEGEGAVNSGQQETQLEEASQTAPEGDNQCEQKLKTSNGDTPTHEDLTKNKDRTSESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKDIELAKEKSEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSAETQPAQEERREDPDFETKEGGGLEECCNTEVKEGSPESKAERELKASQKSIRRQRNMHCKVYLLDDTVYECSVEVSVF	23451	55101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_23929_29302_30582_54770
933244	contig_4091_pilon	+	1396	1	Intergenic	novelGene_173026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	645	1082	13212	13649	NA	75	AAAAACCTACAAAAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	12567	13963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12600_14000
933245	contig_1867_pilon	+	1882	1	Intergenic	novelGene_54571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	123	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCAGCTGTATTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	448013	449895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_448000_449900
933246	contig_10973_pilon	-	663	1	Intergenic	novelGene_150393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTTCTCCACCGTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2501	1838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_-_1800_2500
933247	contig_6578_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_162243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	1059	1526	212643	212176	NA	75	ATGTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAPLTITPSDPLARFLLPVLSTLCSAGLEVLVPKGGMLPPGDESLIPLNWKLRIPPGYFGLLIPLDQQAKKGVTIMAVVIEPDYQEEIRLILHNGDKEEYVWNAGDSLGHLLVLPCSVIKVNEKLQQPNSDMTTDDPDPSGMKVWVTPPGKEP	213701	210396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_210400_213700
933248	contig_1450_pilon	+	2318	15	Intergenic	novelGene_27369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	322.824279300864	3	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	680	2043	80	2122	244436	355748	FALSE	85	CAAAAAAGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPSKPTTICSRKRTGIEICFWTRPGRSSKERRSQHGATPTSAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	244356	355944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_244531_308888_308920_339440_339534_340844_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
933249	contig_8864_pilon	-	2009	1	Intergenic	novelGene_135957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	28	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1168	1533	26836	26471	NA	60	AAAAATCTGACTCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDSRSISLRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRADREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGTPESIAPGFSISPELKPFPRPTLQTKIGLDCGTQNDTHEECAS	28003	25994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_26000_28000
933250	contig_13894_pilon	-	1344	6	Intergenic	novelGene_62208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	259.635590780617	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	321	966	294	1259	762268	750013	FALSE	35	AGCAAGCTTTACAGACTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLTWFQKRLSPAQHYEVTWYMSWSPCSRCAVQVAKFLKSNSTVNLSIFVARLYYPRELETKDGLHSLWQAGAQVQIMFFQDFKYCWENFVNNEGKPFQPWKNLDENSKDWDTELKDIHRNTTDLLTEEMFYSQFYNREKKSSIPRKTYLCYQLNEPQPVKRCLHYKVLIGLPGHRKGYHAVTRFIDGIVSMNLDPARSYDITCYFTWSPCNRYARKLVSFIEDYPNLRLKVYTSRLYFHWCWTNMQGLQHLQNSRVTVAVMTFRDFEYCWKNFVDNQGKPFEPWEKLDLYSQSTERRLRRILKPLTPDVLNEDFGNLHL	762561	749927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13894_pilon_-_750064_750744_750861_751107_751376_753070_753240_761484_761600_762021
933251	contig_12938_pilon	+	1477	6	Intergenic	novelGene_99719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	669.642292571191	3	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51951	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79269_81371_81510_84550_84635_85468
933252	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	60	824	147241	151151	TRUE	20	GAGTTTTCAGTGTCTGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147181	152251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933253	contig_10197_pilon	+	1105	1	Intergenic	novelGene_115175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	75	476	380928	381329	NA	25	CCAGCTATTGTTCAGAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQTLKRHLAKLCQETDLVWRKALPMALLRVQSTPRRKLKLSSFELLYRHPLLETSNMTNIACLNNDQPPSLRVGDVQVTKYLPSLWSALSSLHRYAHLRSPPEPEVSLYLFQCGDWVLLKVSKANPLQQKRTSPFEVPLATPMAVKLNGLKAWIHHT	380853	381958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_380900_382000
933254	contig_17144_pilon	-	2403	15	Intergenic	novelGene_29361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2026.98984119964	23	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	255	2366	174965	166106	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPQPPQSQECQRLLSVSYIPGLHHPSAYVLSLWTGPPRQPAHFKNVQPHPLAFCTCFL	176192	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166276_166547_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973
933255	contig_13379_pilon	+	2137	2	Intergenic	novelGene_175876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTCAGATTCATCCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170732	215555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13379_pilon_+_171817_214502
933256	contig_10930_pilon	+	860	5	Intergenic	novelGene_37044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	183	758	276899	280292	FALSE	40	GAAATCGTAAGTTACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRVEVVLMVTCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALLLSCLCNRFLQNIYILVHQEQGIFLRNGCFCFVWQYDSMFIHCS	268339	280394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268464_276840_277013_278443_278637_279700_279834_280156
933258	contig_10861_pilon	+	1216	1	Intergenic	novelGene_39228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	60	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	599262	600478	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_599300_600500
933260	contig_3095_pilon	+	1242	5	Intergenic	novelGene_75069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	101	826	147280	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147179	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933261	contig_3747_pilon	+	1072	1	Intergenic	novelGene_24965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAAAATGTTGAGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204127	205199	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_204100_205200
933262	contig_854_pilon	-	2726	8	Intergenic	novelGene_36168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	149.324601907033	1	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	235	768	487057	471988	FALSE	10	CAACTCGTGCCTGGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHKLLTANVQDIAKFLHKGEGLNKTAIGIYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQ	491537	470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_487012_487110_488573_488655_491436
933263	contig_11548_pilon	-	2366	11	Intergenic	novelGene_66732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	104	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAAGGGAGGGGGGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120481	63629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_63880_84700_84810_86979_87079_96085_96222_101978_102186_102465_102573_112801_112902_117681_117845_118970_119121_119346_119399_119488
933264	SIRV7	-	2475	6	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	149	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147956	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1841_1889_2676_2993_3100_3809_3897_114680_114989_147608
933265	contig_20199_pilon	-	769	3	Intergenic	novelGene_82562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1345	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGCTGCTGGAGCGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44190	40646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20199_pilon_-_41250_42110_42171_44084
933266	contig_7318_pilon	-	2697	1	Intergenic	novelGene_152206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	120	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	1400	1753	115074	114721	NA	75	TCAAAATAAAAAACAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNIKSHKEADHDGFSKLPKQRIKKSSRGRELLGITRGRIQKINIKNTSRDQEGDQSKCRPSKEHTDKAIEELKKIREEHDDKFKRLQESTERQQSEIQKINNKMSELDNSIESHRR	116473	113776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7318_pilon_-_113800_116500
933267	contig_16951_pilon	+	1661	4	Intergenic	novelGene_98652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_1	311.229818622831	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	38	628	85909	106818	FALSE	15	TGTGGCTAATTTTTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAEGLPCLPEHGARAGTWRSPERSVREGCLVAETQPPKGLLVPLLLAIPQEAELWRQPPRGGPATTAGGVRTNLLSSGSPSASGLRPPASSPKRNGTSLEGNRCASSLSPDGQDARRPRNRNPSTWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDMIMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF	85871	107851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16951_pilon_+_86029_91263_91463_103952_104099_106692
933268	contig_10296_pilon	-	2315	1	Intergenic	novelGene_168890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGGGACTTAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	954706	952391	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_-_952400_954700
933269	contig_10734_pilon	-	1083	2	Intergenic	novelGene_51543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCGCTTCTCTAATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2346655	2345493	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2345808_2345886
933270	contig_8538_pilon	-	1095	1	Intergenic	novelGene_4659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	184	555	2	556	842668	842114	NA	15	CAGGAGGGATGCCTTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGVAGLYFKSNGLTGQGLHEDLHSTSQPKHQVQGRLFLDIVVRQGAPVFQLFPGKDQPLLVRRNAFLVLDLCLDVLNGVAGLYFKSNGLTGQGLHEDLHSTSETKDQVQSRLFLDVVVRQGAPVFQLFPSKDQPLLVRRNAFLVLDLCLDILNSVAGLYFKGNGLTGQGLHEDLHSTSQTKHQV	842669	841574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_-_841600_842700
933271	contig_3956_pilon	+	2529	8	Intergenic	novelGene_15167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1170.3520837765	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	25	699	1281682	1288038	TRUE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNASSRSRASTSSRGLASCTWRSA	1281657	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284260_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
933272	contig_16303_pilon	-	2676	5	Intergenic	novelGene_34086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	745.113078666587	20	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	270	371	37218	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	37610	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_33863_35764_35980_36029_37169_37302_37424
933273	contig_6445_pilon	-	1680	16	Intergenic	novelGene_76884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	861.516322151434	1	76	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	66	875	89674	64852	TRUE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDVLGELPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVA	96332	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55622_64036_64193_64849_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
933274	contig_14970_pilon	+	2166	12	Intergenic	novelGene_45010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6302.63740019582	2	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	435	1308	160	1467	177395	231550	FALSE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASDKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITSTLHSNNHAAAQEQNGWLWSWFGNSQPKTQDVTTAATTDMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATHRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136180	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188766_188830_191970_192205_196136_196257_210762_210859_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
933275	contig_6576_pilon	+	4212	1	Intergenic	novelGene_42434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	221	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	235	708	283	990	1301867	1302574	NA	35	AAGGCTAATTTACCCAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1301584	1305796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1301600_1305800
933276	contig_7342_pilon	+	2955	11	Intergenic	novelGene_71127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	1207	1776	80783	81445	TRUE	15	CGGCCTCAGAGACCTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDIIVIVTPSRIHEASSPGSLLLTGLQTSASRYPPKSRAWALRKRRDTPSPGTRATFLSCSLSRDTTSGGSACTSSKGVSKVLESTFITTTSSRALSRTLCSQWGVAAQSSGSLAGEVSGDGKGGGPTCPRRPGPTPTHLRETGVNPNEVGHGRAADQGVVSCRCHPRILQAPSLGLAPPQTPLPHQQ	76649	82866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7342_pilon_+_76791_76885_77083_77201_77271_77666_77774_77843_77889_78710_78786_79009_79047_79131_79230_80345_80981_81073_82560_82801
933278	contig_3095_pilon	+	1205	5	Intergenic	novelGene_74986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	18	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	97	801	147270	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIPVCTASLLSSTDSYQITPEDNGPKWSPGTRMFHYGCPDELSPNMAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147173	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147312_149669_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933279	contig_8712_pilon	-	1567	10	Intergenic	novelGene_58872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	69	junction_9	53.4383225877053	2	7	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	60	183	650	832	883892	882780	TRUE	15	CAGGCAGGTCTGTTTCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGHDFSLDLRSTGIDPPGLGSLVGLSCVSRFRAGLSDTVGLWESLQQRGEAKLLQVAEEKFTIEPFKAESLKDVEDLGNLARIQRTRNPSEEAAGELPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVTILTAFSSLQHLDLDSLSENKIGDRGVAQLSATFPQLKALETLNLSQNNITDVGACKLAEALPSLAVSLLRLSLYNNCICDAGAKSLAHVLPDMVSLRVLDVQYNKFTAAGAQQLTASLKKCPHVETLAMWTPTIPFGVQEHLQQLDSRISLR	895660	881520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_882234_882757_882856_883618_883703_883869_883954_886898_886986_888549_888643_889205_889287_893149_893222_894282_894442_895564
933280	contig_3095_pilon	-	1226	5	Intergenic	novelGene_75105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTACAGACAGGAATAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152251	147191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149893_150411_150695_150995_151160_151846
933281	contig_233_pilon	-	2562	15	Intergenic	novelGene_14645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1418.46127647431	1	81	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	530	1593	543	2135	105485	78579	FALSE	20	ATGGGGTGTCCTAGAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127003	78151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105592_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
933282	contig_12938_pilon	+	1263	5	Intergenic	novelGene_99725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	645.986213088174	3	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	91	405	78117	84629	TRUE	25	CCGCAATATTCTCATTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGISSLKLLKYVLFFFNLLFWFCGCCILGFGVYLLMYNNFGVLFHNLPSLTLGNVLIIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKVAIKKHKSGFTPISCILESSLSVYV	51972	86321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_+_52046_78099_78180_79040_79214_84550_84635_85468
933283	contig_8377_pilon	+	3448	18	Intergenic	novelGene_35123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3013	junction_8	1672.56526760377	4	153	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	678	2037	117	2153	176610	197939	FALSE	10	GACTCCTTTTGGTGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	172941	199234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185666_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
933284	contig_7815_pilon	-	2469	1	Intergenic	novelGene_134419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	1801	2238	949658	949221	NA	25	GAACTGATGGTATTACGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYTRIKSILSVRTMPGANCGIDHQLLTRKFKWKLKKIRASPQEPKYDLKCIPPEFKDYLKNRFEALNTNDRRLDKLWHDIKDIIHEESKRSLERQEREKRPKWMSEETLKLALEHRIAKVNGRNDEGNKLNRRFQRAAREDKVS	951458	948989	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7815_pilon_-_949000_951500
933285	contig_14871_pilon	+	1749	9	Intergenic	novelGene_63712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	772	junction_8	519.787155959052	1	53	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	52	1236	213613	233218	FALSE	35	GAATTGAGAGCTAGAAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCPPKNPAPESDRDPDTMDPEEDFVDPWTVQTSSAKGVDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIEQATGQKPHRFLRRGVFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHLGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAHGYAVENAKDIIACGFDIKKTFIFSDLDYMGMSPGFYRNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKIGFPAIQAAPSFSNSFPQIFKGKTDVQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDSAKQIKTKVNKHAFSGGRDTVEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDRLEQIKQDYSSGAMLTGELKKELIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRQLTFDFQ	213561	233731	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14871_pilon_+_213695_214767_214877_218965_219086_219645_219829_224338_224440_227361_227475_227652_227827_230158_230300_233056
933286	contig_233_pilon	-	2741	15	Intergenic	novelGene_14636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1322.51182626555	4	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	748	2247	4	2250	109972	78640	FALSE	15	GGGTGTCCTAGAAGCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	109975	78148	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
933287	contig_9955_pilon	+	1941	4	Intergenic	novelGene_21314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTCTTGACGCGAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45959	49820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_47138_47513_47737_48794_49225_49710
933288	contig_7119_pilon	+	2230	3	Intergenic	novelGene_40906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	74.5	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	368	1081	138965	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWGLAGADATAGLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGNLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127606_138744_139217_139336
933289	contig_19727_pilon	-	2814	2	Intergenic	novelGene_168993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCCAGCTTATTTTTGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56837	13573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_14583_55032
933290	contig_5423_pilon	-	1769	1	Intergenic	novelGene_85219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	113	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTACCCTGGGTTCCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	397419	395650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_395600_397400
933291	contig_4232_pilon	-	1228	1	Intergenic	novelGene_63310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATTGGAGCAGGTCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_466900_468100
933292	contig_5686_pilon	+	2171	15	Intergenic	novelGene_45276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1537.43425942081	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	511	1584	182699	215355	TRUE	20	GAGCCCTAGTTCTGAGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVLTQYFQTLRLRKIVTGQYIRKPGGILAKH	93819	220093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171733_172507_172591_182571_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208410_212622_212666_215305_215475_219533_219670_219761
933293	contig_10793_pilon	+	1440	13	Intergenic	novelGene_83392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3697.91104224924	2	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	246	1046	152890	163940	TRUE	35	ATACAATTTTAGTTCTCATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130871	167264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_151387_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164090_165325_165377_166401_166473_167141
933294	contig_9183_pilon	-	3680	7	Intergenic	novelGene_40291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	430.374029833999	1	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	79	1401	323783	318417	TRUE	20	ACCATCCACTTGTGGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELPCRLRPPPHQTSPIKHPLLKRQARMDYSLDATAEDPWIRISDCIKNLFSPIMSESHGHMLLQPNVHLGEEDGTQGHPDGALPKLDTANGAPKVYKTADNSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRAPDLKRLPSAASSTQPTPAAREHSGPHLRASSSIKQRISSFETFGSSQLPDRAAQRLSLQAPIGEAAKPSGKQEGGWVSGLFRQGAPSTSQRQQSEKEQLPLAPPTASEASDPGVSESPPPGLQPTQKTLPTDPDPLLRLLSAQTEDSQGPVVKTLGQRARSFPLTRTQSCEVRPSDEKTNRLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSVSCGQTPCSPKEGAPTTPSSNEDPAANSSAETPASDTGFSLNLSELREYTEGLTEPKEADDWSHSSPQSGQSVISLLNSEELKKLIEEVKVLDEAMLKMMKLKFELMWFGAWPSRDLRSNQSDFRTFFELFTLLH	325928	310596	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9183_pilon_-_312325_314770_314891_315233_315493_318244_318531_320557_320727_322743_323834_325900
933295	contig_2438_pilon	-	1311	5	Intergenic	novelGene_112045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8.66025403784439	10	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGAGGCTGCAGCGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313521	305106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_305137_310558_310766_311903_312081_312303_312405_312725
933296	contig_7357_pilon	-	2266	9	Intergenic	novelGene_36811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2114.46594542806	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	256	1389	159968	136424	FALSE	15	TTGTTTTTCTGGACCTAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSFLACKSRNGGGFSSSLGRCCPRHASTLGFLAFLPNPRLPRLGRLPGVPVANRQPPRDPDALLGSLTHPSSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167045	135546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160016_166837
933297	contig_6497_pilon	+	1978	1	Intergenic	novelGene_35659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGTTTTTCTTCGGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	880520	882498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6497_pilon_+_880500_882500
933298	contig_7730_pilon	-	1700	1	Intergenic	novelGene_156271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	72	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGTGCACTCCAGCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162451	160751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_160800_162500
933299	contig_11285_pilon	-	1775	13	Intergenic	novelGene_5672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	483.092612469102	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	647	1585	788506	784252	FALSE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	790251	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788583_789133_789509_789926_790053_790182
933300	contig_3956_pilon	+	2046	10	Intergenic	novelGene_14956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1645.58824335454	4	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	468	1407	128	1534	1284763	1290491	FALSE	10	GTGGTGACTGTGTGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGDLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1284722_1284864_1285066_1285173_1285712_1285786_1287377_1287530_1287965_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933301	contig_17144_pilon	-	1095	6	Intergenic	novelGene_29267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	603.125326942917	4	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	129	800	167934	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183198	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_167980_181806_181850_183158
933302	contig_6578_pilon	-	3305	1	Intergenic	novelGene_162244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	155	468	1059	1526	212643	212176	NA	75	ATGTAAAAAAAAAAAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVAPLTITPSDPLARFLLPVLSTLCSAGLEVLVPKGGMLPPGDESLIPLNWKLRIPPGYFGLLIPLDQQAKKGVTIMAVVIEPDYQEEIRLILHNGDKEEYVWNAGDSLGHLLVLPCSVIKVNEKLQQPNSDMTTDDPDPSGMKVWVTPPGKEP	213701	210396	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6578_pilon_-_210400_213700
933303	contig_15666_pilon	-	2840	4	Intergenic	novelGene_70154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	340.813080082845	1	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	130	1080	110619	108530	FALSE	35	GATAGCATGTAAACTACGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTAGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWGEKELGPSGERMDESP	110748	106769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_108859_109098_109378_109948_110231_110558
933304	contig_12605_pilon	+	613	3	Intergenic	novelGene_64190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1966.5	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	24	371	3897	4829	FALSE	10	GTACGAGGGGCTGTGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQHPPGDVWL	3873	5071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4520_4801
933306	contig_12000_pilon	-	794	1	Intergenic	novelGene_43204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACATGAAGAGGACAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	642110	641316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12000_pilon_-_641300_642100
933307	contig_18869_pilon	-	1939	2	Intergenic	novelGene_55976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	289	831	53041	52499	TRUE	20	TCTATGGTCGTTTAACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSRQAHKPAGEGGPTPAMALEAELIELRESDGDEVVDLTCESLEPTVIDLTQNDSVVITEERRRPRRNARPPEGQTVSCVVSSDEEGLVRDRDVYVISSVHHNALEGETLSYPLPGYIWCRICMDGYSEIEQSGRCIYSTECGHIFCSQCLCNSLKYTKTCPVCLKKIRGREYHRIYI	53329	51298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18869_pilon_-_51689_51780
933308	contig_16167_pilon	+	2906	2	Intergenic	novelGene_179224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1655	2110	21981	22436	FALSE	40	CTGCTTCAAACTTATAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKMNSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENS	1883	23232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16167_pilon_+_3347_21789
933309	contig_6589_pilon	+	1620	13	Intergenic	novelGene_26266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	117	452	2227924	2228753	TRUE	15	TCCCGCTTCCTCCGAACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSPAAERSLRPVWVPRTASCTVHDHVAHRGVQGPGHLPELRLLWRACSRVAVKRKQRQGTPASWAHLIYLARLRASGFVLSITTRFFCFRDASQVVTQRCQEPRVHTLFT	2227807	2233441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_2227988_2228062_2228125_2228212_2228299_2228380_2228484_2228732_2228805_2228892_2228984_2229061_2229165_2229235_2229306_2229393_2229437_2230171_2230246_2231856_2232217_2232515_2232561_2233110
933310	contig_20356_pilon	+	2704	1	Intergenic	novelGene_159555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCTGCTCACAGGCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179814	182518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20356_pilon_+_179800_182500
933311	contig_13021_pilon	+	3791	11	Intergenic	novelGene_8134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	2686.95952518827	2	144	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	172	1275	174676	178549	TRUE	40	AATTAAGTGGAAATTGTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGPW	174504	181151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178539_178585_178670
933312	contig_5023_pilon	+	2156	11	Intergenic	novelGene_7358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1411.60830615295	1	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	128	1228	618569	646990	TRUE	45	CAAATAAAATATTGCTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	616498	648282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857_647374_647737
933313	contig_20527_pilon	+	2892	6	Intergenic	novelGene_138551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1158.2056121432	2	144	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	661	1287	13527	27453	FALSE	10	GACTCTGCCCTGTTTGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12805	29058	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13021_13081_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
933314	contig_3081_pilon	-	1529	1	Intergenic	novelGene_133947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACTGACAGAGAACAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	315348	313819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_313800_315300
933315	contig_17144_pilon	-	1962	9	Intergenic	novelGene_29238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2433.09273353894	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	14	1294	179764	166736	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFCQCPWRKTVGGSKGTWFPGDPQARLGQSNSATPLRDLPAAQPSGPQHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	179777	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_172638_172740_173132_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
933317	contig_6165_pilon	+	2186	5	Intergenic	novelGene_167411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	6	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAAAGCACACCACCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	485610	507882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6165_pilon_+_487467_490281_490347_503348_503410_503875_503980_507782
933318	scaffold_12124_pilon	+	2090	9	Intergenic	novelGene_22244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3570.62450551371	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	185	553	1490385	1508039	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473571	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506638_1506687_1508010
933320	contig_8330_pilon	+	1586	10	Intergenic	novelGene_71797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	609.436716247972	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	209	952	852673	856687	TRUE	35	GGCATTTTACAAGAAGTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837542	857535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855307_856414_856560_856667_856755_856968
933321	contig_6059_pilon	-	1617	10	Intergenic	novelGene_44838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2603.0043515755	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	6	1166	576206	569146	TRUE	25	GTGCACATGATGTTATACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKNLDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	576211	567794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165_573439_575786_575883_576080
933322	contig_6842_pilon	-	2179	1	Intergenic	novelGene_130808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	1593	1892	1681364	1681065	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYQGLHQTESGTARWCLATTTDCSDRDHNRGFWTELEKDVEQNSNTHKKDQIYWPKGDWRNPKRMAPRHPFISVVKSLLRFTIQPGSGQPHKIKRD	1682956	1680777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_-_1680800_1683000
933323	contig_15518_pilon	+	2156	4	Intergenic	novelGene_127590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	1	105	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	585	803	15096	37386	TRUE	40	ACAAAACCATTGCTATTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
933324	contig_9389_pilon	-	439	1	Intergenic	novelGene_84074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTGGTATTCCCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1040750	1040311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1040300_1040800
933325	contig_8284_pilon	-	3200	4	Intergenic	novelGene_125717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	307	690	451611	451228	TRUE	80	ATTTGAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYSIFFTNTIIQRHQFFFSLPYSSSLFIVQVSHAYEVIENTTAWARHSLILKVTSLLFSTLKGSFADLPNATCGLISWLLIPWALIVDSSKMKSLTTSIFSPFIMMLLIGPVVRIFVAFMLRCNPY	451917	436258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8284_pilon_-_436486_438443_438501_441532_441603_449071
933326	contig_14925_pilon	-	1902	4	Intergenic	novelGene_55357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_3	722.375863999406	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	78	383	116065	115146	TRUE	10	CTACTGTCTTTTGCCTGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKG	129478	112238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_115208_115821_116101_129436
933327	contig_7457_pilon	-	1663	8	Intergenic	novelGene_31440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	167.247220165422	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	27	671	473193	469327	TRUE	45	AAATATTTTTATATCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEPVASPEDPWVKVEYAYSDNSLDPDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473219	468289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469031_469075_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471292_471559_471667_472730_472768_473151
933328	contig_7876_pilon	-	4705	6	Intergenic	novelGene_144842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	105	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	2804	3211	183947	183540	TRUE	25	TAGGGGACCTCTGCATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRNALRDPSAHLWKPKGSLPAMQLSLARKGSQLKKRKRKQTNNSKQTNEQKPRDPTSVAAAPQEEAKIAHRARYLSKGGGGGERQVRNQKKQEKKSNTSSQQTALREPASAGWCFWTRDCVCGKQRGPSVGEEG	243565	12640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7876_pilon_-_12725_13246_14229_81240_81246_183116_184620_209143_210493_242783
933330	contig_7843_pilon	-	907	4	Intergenic	novelGene_152010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	233.033617031249	1	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	190	621	197188	178533	FALSE	30	TACTAAATGTTGTTTATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTYKGRPSGCWGRRGPLAEMEEELRYAPLSFRNPMMSKLRTYRKDLAKLHREVGSTPLTATPGSRGDTKYSTYAVENEHMNRLQSQRALLLQGTDSLNQASQSIERSHRIATETDQIGSEIIAELGEQRDQLERTKSRSGDQ	197377	178246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7843_pilon_-_178548_182917_183092_187939_188132_197137
933331	contig_8452_pilon	+	1853	2	Intergenic	novelGene_48037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1115	junction_1	0	4	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	71	1156	432928	434013	FALSE	20	GAGGTACCCACTGGGAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLNMDDNFTTPSTTPQGADCDLYAHHSTAQILMPLHYSIVFGIGLLGNLLALVVIFQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIVYYALGFNWKIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCMSIDRFFAVVHPLRYNKMKRIEYAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIIPMSKDEAKRTTCMEYPNFEDTEFLPWILLGACLIGYVLPLIIILICYSQICCKLFKTAKQNPLTEKSGVNKKAFNTIIFIIIVFVICFTPYHIAIVQHMIKKLRFPDLLDCSQKHSFQISLHFTVSLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMKMLKRQVSVSISSAVRSAPEENSRELTETQTMIHSKSLNGK	423959	434710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8452_pilon_+_424012_432909
933332	contig_7051_pilon	+	2075	12	Intergenic	novelGene_64293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	181.734253356309	1	99	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	268	807	107	913	184159	206198	FALSE	25	AGCTATATTGACTAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADYSRGARLPGGLGLWSLRGPLRRLVLFYQGKLCSMAGNFWQSSHYLQWILDKQDLLKERQKDLKFLSEEEYWKLQIFFTNVIQALGEHLKLRQQVIATATVYFKRFYARYSLKSIDPVLMAPTCVFLASKVEEFGVVSNTRLISAATSVLKTRFSYAFPKEFPYRMNHILECEFYLLELMYVQDMGQEDMLLPLAWRIVNDTYRTDLCLLYPPFMIALACLHVACVVQQKDARQWFAELSVDMEKILEIIRVILKLYEQWKNFDERKEMATILSKMPKPKPPPNSEGEQGPNGSQNSSYSQS	184052	207360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_184191_187539_187647_188681_188767_189144_189215_191793_191846_197585_197642_198514_198551_199275_199323_199978_200047_201833_201914_203048_203168_206143
933333	contig_14698_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_168135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGTCTCTATTCACCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111831	112300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14698_pilon_+_111800_112300
933334	contig_4812_pilon	+	849	4	Intergenic	novelGene_103645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTGCCACCAATGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78706	81685	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_79240_80221_80339_81179_81274_81580
933335	contig_13365_pilon	+	2061	1	Intergenic	novelGene_168082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	136	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAACCACTGCCATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44395	46456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13365_pilon_+_44400_46500
933337	contig_4180_pilon	+	756	2	Intergenic	novelGene_8408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	3662	junction_1	0	4	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTTTGGAGCCGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	886336	888710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_886468_888085
933338	contig_14744_pilon	-	1689	6	Intergenic	novelGene_66065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGCCCCACCATTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1386578	1382076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1383209_1383301_1383401_1384428_1384572_1385181_1385231_1385818_1386004_1386497
933339	contig_10904_pilon	+	2561	6	Intergenic	novelGene_22527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTCCCGACTCCAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	348614	362499	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_350113_351954_352142_352532_352697_353957_354254_354559_354853_362376
933341	contig_3472_pilon	-	1707	1	Intergenic	novelGene_166954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	3	365	995319	994957	NA	55	ATCTACAAACAAAAGTAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILYINDERLNVFPLRLRIRQVCLHSPLLFNFVLQALDGAVRQEKINKRHTIAKEKVKLSLFTDNIILYAKNSKESTKKLLELINEFSNIIGYKINIQKSIKFLYIIQNEIKKQLHSQWYQ	995321	993614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3472_pilon_-_993600_995300
933342	contig_5020_pilon	+	1226	7	Intergenic	novelGene_27872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	979.701938800209	6	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	357	911	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118468	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_122957_124247_124363_124444_124547_124909_125091_125657
933343	contig_3202_pilon	-	1505	1	Intergenic	novelGene_167386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	1017	1379	1059	697	NA	5	TTTCGCCTCCTTCTCCAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILFIFWISNCCLCIISSCEFILAFYSCIIFLNSSHFLSVFSMNLSIFSSCFSAFSLSSWRILSIGDLNSLPGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	2075	570	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3202_pilon_-_600_2100
933344	contig_9609_pilon	-	1646	1	Intergenic	novelGene_23015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGAAAAAAAAAAAGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319810	318164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_318200_319800
933345	contig_3747_pilon	+	1330	6	Intergenic	novelGene_24828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5798.82305299963	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	576	1088	202144	204083	FALSE	60	AAAAAAGAGAAACCATCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNGFKTHQKNSGLSDFLRS	200984	204325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201549_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203017_204029
933346	contig_5815_pilon	-	4291	5	Intergenic	novelGene_141244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	233	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2842	3153	1137676	1091116	TRUE	60	AAAAAAAAGAAAGGCCCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLERLQGDQNFMHSWWEGIMLQPFGKMIWRFLRKLEIEIPYDPGIPLLGIYLREIRAVTPIDICTPKLIAALFTTKRWKQRRCPSADEWINYGTYTQWNIIQR	1284933	1089851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5815_pilon_-_1089963_1090088_1091205_1137453_1138224_1274438_1274791_1282991
933347	contig_6102_pilon	-	1654	6	Intergenic	novelGene_32145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	614.336259714499	2	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	268	405	847055	841252	TRUE	15	TCTTTGAGCCGTCTACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPFPTLSSSLRPEEPLSPRGAFWGPRPSLLLPSSEGSEKRPRPGRKPRSCHRRGVKSPAAAAREARPPIPLPRSQCSLLLQSGTIEGTMSLLNFVLKTVKMLILIGLVWTSIIGKTGKMIQMKTCLILTVSLR	867466	838827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_847011_847094_867237
933348	contig_9199_pilon	+	2844	6	Intergenic	novelGene_65608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	122.555130451565	6	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	77	622	42527	56249	TRUE	25	GACACATCAGCTGGACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKG	42450	59152	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_42575_49937_50003_54512_54673_55404_55498_56069_56407_57087
933349	contig_11338_pilon	-	2579	14	Intergenic	novelGene_6376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	257.826279755467	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	224	1477	319426	301785	TRUE	25	TTTGAGATGTCCTCAGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQEEDPVLTVITYMGLGLSLLCLLLAALTFVLCKAIQNTSTSFHLQLSLCLFLAHLLFLIGIDRTEPQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARQIQKQIFVASV	323239	298185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_299077_300261_300354_300825_300893_301732_301822_306727_306964_307230_307429_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
933350	contig_12570_pilon	+	690	1	Intergenic	novelGene_79342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCCTTGGTGATTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159815	160505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_159800_160500
933351	contig_3956_pilon	+	1475	6	Intergenic	novelGene_14856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1301.86798101804	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	84	956	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284198_1289755_1289892_1290297
933352	contig_15327_pilon	-	888	4	Intergenic	novelGene_70692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	4	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	132	542	901528	900904	FALSE	30	TCCAAGTGTTTAACAATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902159	900557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
933353	contig_20314_pilon	+	2039	2	Intergenic	novelGene_125633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCATTATATGATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5744	7865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20314_pilon_+_6485_6566
933354	contig_17144_pilon	-	1721	11	Intergenic	novelGene_29406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1466.89474741714	1	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	35	1642	174965	166152	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174999	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166294_167923_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876
933355	contig_854_pilon	+	1709	2	Intergenic	novelGene_36687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1704481	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704650_1714862
933356	contig_3956_pilon	+	3089	15	Intergenic	novelGene_14890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1114.56946249872	1	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	83	1759	1281682	1288915	TRUE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRPLSVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1281599	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287449_1287958_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933357	contig_3095_pilon	+	1226	5	Intergenic	novelGene_75071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	4	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	61	672	147241	151002	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPIFPQS	147180	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150680_150984_151163_151848
933358	SIRV3	-	438	1	Antisense	novelGene_SIRV3A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	18	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAACCTTGAAAAGAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7212	6774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV3_-_6800_7200
933360	contig_16496_pilon	-	1492	2	Intergenic	novelGene_5213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	20	GATGTTCATCCTCTTCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	43	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
933361	contig_7272_pilon	+	1626	9	Intergenic	novelGene_25367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	84	440	604573	606992	TRUE	15	CGCGGCGGACGCGACGCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFYLLPYLLFLSLVFVLSPELLELLFSSLSFFKSFLEGSYFFNRNQLPVQFSAMKVCDTSGHFCAGRHSYNAIAFGPRTSSICNYLCTQNLSIFAKEVLQISSFGIRRQSTNPDIFC	604489	633265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_+_604590_604702_604804_604917_605071_606906_607074_609857_610303_617448_617718_620502_620566_632103_632193_633026
933362	contig_6102_pilon	+	2696	15	Intergenic	novelGene_31870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_14	435.526569633981	14	67	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	556	1671	39	1709	370803	376333	FALSE	80	CTAAAAGAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVRESSIQSPSPH	370764	377320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207
933363	contig_3956_pilon	+	1595	8	Intergenic	novelGene_15069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1451.1488481861	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	81	1427	1281682	1290847	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1290511
933364	contig_14356_pilon	+	418	2	Intergenic	novelGene_179225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	CAATCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	54437	86477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14356_pilon_+_54459_86080
933365	contig_18162_pilon	-	3219	2	Intergenic	novelGene_122304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
933366	contig_8712_pilon	+	1939	4	Intergenic	novelGene_58771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	358.738840321975	5	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	191	466	315133	321793	FALSE	25	TTCTCATGGTGTGAAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLRTRLVARAAVTPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANANRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286980	323266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287019_314980_315188_318109_318222_321684
933368	contig_15449_pilon	-	1605	4	Intergenic	novelGene_33611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGAAGGGTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55776	49501	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_49553_51103_51329_51808_51930_54568
933370	contig_5458_pilon	+	354	1	Intergenic	novelGene_179226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACCCACAATCAATAAACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124167	124521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5458_pilon_+_124200_124500
933371	contig_2209_pilon	-	3689	1	Intergenic	novelGene_141027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1207	1509	388011	387709	NA	65	TGTATTGGAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALTSLGYSPRSGIAGSYGTSISSFLSKHQIDFQSGCTILHSHQQCIGVPVSPQPLQHLLFCVFWINASLVGVRWYLIVVLICISLMNDHEHFLMCLLAA	389217	385528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2209_pilon_-_385500_389200
933372	contig_2033_pilon	+	602	1	Intergenic	novelGene_71530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGTAGATGTCACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	110580	111182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2033_pilon_+_110600_111200
933373	contig_233_pilon	+	3245	14	Intergenic	novelGene_14640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	140	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	185	558	2116	2673	105585	108817	FALSE	10	TTCCTGGGAGCAGGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGPTWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCELLAPGAARPQLHALPAGADLVLGALLGQD	78149	109389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79132_91467_91677_92138_92359_93764_94007_94722_94909_98306_98454_99781_99869_101673_101769_104151_104308_105460_105703_107299_107467_108396_108580_108727
933374	contig_6873_pilon	-	1855	1	Intergenic	novelGene_129851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	58	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATAAAAAAAAAAAAAAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	814761	812906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6873_pilon_-_812900_814800
933375	contig_15047_pilon	+	1500	7	Intergenic	novelGene_52181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	5	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	20	652	2194	4178	TRUE	30	TGGAAGACCGGAGAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGTRDPQRQM	2174	21639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3507_4158_4434_4552_4676_20998_21062_21232
933376	contig_7292_pilon	+	1442	1	Intergenic	novelGene_175360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTCTCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124341	125783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7292_pilon_+_124300_125800
933377	contig_12079_pilon	-	2042	11	Intergenic	novelGene_67459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1256.63663801435	2	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	476	1285	600738	580949	FALSE	60	TTTACAGAATAATAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEAGWV	638844	580191	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_580964_584263_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607_600885_601782_601879_609189_609274_638695
933378	contig_8864_pilon	-	2657	1	Intergenic	novelGene_135959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	40	55	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1816	2181	26836	26471	NA	60	AAAAATCTGACTCAAAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNTKDSRSISLRDRKGHINQRLHQPETRRTRWCPATTNDRADREHNRESLMEQEKGGVQNSNSSKKTRLNGLTKTGGTPESIAPGFSISPELKPFPRPTLQTKIGLDCGTQNDTHEECAS	28651	25994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8864_pilon_-_26000_28700
933379	contig_6599_pilon	-	638	1	Intergenic	novelGene_175964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCCCCGCGCCCCCGCGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261305	260667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260700_261300
933380	contig_17144_pilon	-	1474	7	Intergenic	novelGene_29215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1822.68953442129	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	691	1179	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	174922	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168036_173575_173751_174572_174761_174876
933381	contig_6375_pilon	-	1994	7	Intergenic	novelGene_72964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	6	junction_6	210.313786730421	3	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	1040	1603	204550	202748	FALSE	55	TGGACAACAATAAAAAGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHNFIYFRLFFVGSREGHLPDAICMIHVERFTPVPSLLFNGIMSLIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDWPRPLKLSLFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTVNSLIGIGIALSGLPLYFLIIRVPEHKRPLCLRKMVASTTRYLQVLCMSVATEMDLEDGEEMPKQRDPKSN	220575	202356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_-_202855_203069_203254_203487_203638_204427_205194_206631_206777_207612_207739_220450
933382	contig_11017_pilon	+	1250	10	Intergenic	novelGene_128091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	752.073545129697	3	25	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	167	598	271206	283682	TRUE	5	TTTATTCTCTTTGTCTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKQNSDTNWWKGTCKGRTGLIPSNYVAEQAESIDNPLHEAAKRGNLSWLRECLDNQVGVNGLDKAGSTALYWACHGGHKDIVEVLFTQPNIELNQQNKLGDTALHAAAWKGYADIVQLLLAKGYFSWAALVRETEEMTVSHL	268803	295071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11017_pilon_+_268855_271090_271221_272063_272128_274945_275000_276704_276813_277773_277824_282295_282375_283620_283724_285452_285552_294559
933384	contig_2703_pilon	+	2424	16	Intergenic	novelGene_101720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	949.152229916548	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	282	1565	559489	610870	FALSE	65	TCTTGGCAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526185	611729	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
933385	contig_7933_pilon	+	617	3	Intergenic	novelGene_164686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6639	1	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGAGACGAGCGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185659	197937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7933_pilon_+_186078_189402_189558_197893
933386	contig_5031_pilon	-	1643	3	Intergenic	novelGene_133199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGCTCTGAAATAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191872	54175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_-_55257_189770_189915_191454
933387	contig_6445_pilon	-	1601	16	Intergenic	novelGene_76940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	842.349623902622	4	69	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	625	1125	77863	49873	TRUE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVFLAQP	96382	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55488_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88150_88216_88473_88594_89656_89714_96306
933389	contig_15063_pilon	+	1564	6	Intergenic	novelGene_12282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3689.79981028782	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	457	1374	128	1501	28164	36740	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGTRPTPATDHWAPRPYSAPCGDQPLCVCPCVHSN	28036	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36523_36637
933390	contig_7728_pilon	+	3936	1	Intergenic	novelGene_64718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	51	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	387	1257	1643	746079	746465	NA	20	CACTTTGTTCATGAGCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSAFSVNLSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIDCCLPGIQ	744822	748758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_744800_748800
933391	contig_3956_pilon	+	1663	8	Intergenic	novelGene_15234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1335.58897807946	3	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	984	1472	1289515	1290491	FALSE	30	TTTATTTCAAGATTTCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284510	1290682	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286250_1289004_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933393	contig_14744_pilon	-	2469	11	Intergenic	novelGene_66129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	61.460881868063	1	102	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	970	1683	1590996	1588029	FALSE	15	GCTGAGCCTCATGATTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSPPKVVDDPDDIFQKFLQQTNQLESLMGLPSSPPVEDSIIIPCEFCGVQLEEEVLFHHQDQCDQRPATANHHVTEGFPRQDSRPRETSPELPRRRVRHQGDLSSGYIDDIKQETAKGPTYPLSPSRPINNMTATCNRLSEPGCQPSPSRILKLNNSDSRGRNRNSHNGAMAPGHVPENLMPSSPRRPAGRNGASGRSEGGRNSRVTPTAASYHNRTAKAKSPKQQGAGDAEEEE	1604762	1587242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_1588080_1588334_1588408_1588600_1588884_1589735_1589857_1590810_1591036_1591677_1591718_1593001_1593188_1593928_1594339_1596935_1597106_1601762_1601822_1604697
933394	contig_10892_pilon	-	1359	1	Intergenic	novelGene_116742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGTGCTGTTGTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118821	117462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_-_117500_118800
933395	contig_7357_pilon	+	2322	9	Intergenic	novelGene_36789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGGCTCTTGCAGGCCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135541	167017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_136567_137568_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139971_154561_154720_154861_155083_159916_160034_166772
933396	contig_12015_pilon	+	1323	1	Intergenic	novelGene_164292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGATACCACTTTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38640	39963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12015_pilon_+_38600_40000
933397	contig_401_pilon	+	2115	13	Intergenic	novelGene_42832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1415.52033032223	1	58	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	56	754	1711949	1714079	TRUE	10	GTTCTCGGTCCTTCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRVRRQWGWL	1711893	1728755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712621_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714053_1714097_1714325_1714476_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716_1716273_1724169_1724348_1728517
933398	contig_12969_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_61691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCTAACAAAGTAAAGTCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	564919	566913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12969_pilon_+_564900_566900
933399	contig_10734_pilon	-	2141	9	Intergenic	novelGene_51504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	93	junction_7	475.046247748575	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	777	1835	2274500	2265543	FALSE	65	AAAAGAAAATTATAGACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2281475	2265236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275805_2277109_2277191_2280839
933400	contig_15449_pilon	+	2262	10	Intergenic	novelGene_33606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	667.868250480587	3	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	86	817	46876	49509	TRUE	20	GGCCATGTTTATTGGTTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDTKL	45616	55623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_45701_46874_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49449_49497_49557_51106_51330_51809_51932_54570
933401	contig_7753_pilon	-	1018	1	Intergenic	novelGene_41492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	207	621	396	1016	1188358	1187738	NA	65	CAAAAAAGAAGAAAGGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGTIHREDITIINISAPNDRAPKYLKQTLTTLKREIDTSTIIVGDFHTLLSVKDRTTKKKLNKDTEELKGTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINNTQSKEKKSTTWKLNNTVLIHQWVIEEIRDRIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAH	1188753	1187735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7753_pilon_-_1187700_1188800
933402	contig_5389_pilon	+	2132	1	Intergenic	novelGene_143025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCATCTGTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	432892	435024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_432900_435000
933403	contig_1090_pilon	-	1336	1	Intergenic	novelGene_131132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCACTGGCCAAACTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	453061	451725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1090_pilon_-_451700_453100
933404	contig_5502_pilon	+	1638	7	Intergenic	novelGene_154961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	516	junction_1	358.624068102271	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	85	1086	357713	398610	FALSE	20	GACGTTCACCAGTTTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATPPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDNIQKKLDTYLQ	357628	399162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_398436
933405	scaffold_13505_pilon	-	2040	11	Intergenic	novelGene_111517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_7	226.266214888569	2	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	1494	1811	594063	588797	FALSE	5	TTTTCTCTCCTTCTGCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVVTTLGCFLLTRTRGASGQSDLGHQQPLTSTPGHGQSDSSASPAPGMAPAVPIYEQLLKPDTNIYCQLHPKAEVAPQLPPGTAPYGLRRGATSDPKSWGKGRS	603231	588567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_589810_589843_590205_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_599811_600147_601873_602237_602570_602698_603171
933407	contig_10011_pilon	+	3231	9	Intergenic	novelGene_68097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	102	junction_8	77.7141195343549	105	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	712	2139	60	2198	322928	333194	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKKLSDHLLNSLEELVPYDFEKFKFKLQNTSLEKEHPRIPRGLLQMARPVKLATLLVNNYGEEDAVRLTLQVLRGINQRLLAEELYKATGQDYPTQEGGTDSSAVLCSSGENKPKSLKIPDGPDGDRQQQSGEGIASLQSGQPEAERGFQKKSQDRRRDQGPDGQGKPAVRSMTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKVSGLGLLGPCALPHQVPEEWSSPCFLEVGRTCGDAAHGPPAGYCDFLCS	322868	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325551_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994
933408	contig_14687_pilon	+	1654	1	Intergenic	novelGene_107957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAGATAAGTAAGGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	606654	608308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14687_pilon_+_606700_608300
933409	contig_8420_pilon	+	2074	13	Intergenic	novelGene_69336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	310.283427781046	1	113	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	432	1583	29058	51079	TRUE	85	TAAATTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITASHNPKQDNGYKVYWDNGAQIISPHDKGISQAIEENLEPWPKAWDDSLIDGNLLLHNPSVSINKDYFEDLKKYCFHRSVNRETKVKFVHTSVHGVAHDFVQSAFRAFDLAPPVAVPEQKDPDPEFPTVKYPNPEEGKGVLTLSFGLADKTKAQIVLANDPDADRLAVAEKQDSGEWRVFSGNELGALLGWWLFTSWKEKNQDLSALKDIYMLSSTVSSKILRAIALKEGFHFEETLTGFKWMGNKAKQLIDQGKNVLFAFEEAIGYMCCPFVLDKDGVSAAVISAELASFLATKNLSLSQQLKAIYVEYGYHITKASYFICYDQGTIKKLFENLRNYTGRISIQKLVESLKFPALGTSQLAMMTVNLTKKLFSLLVKAAK	10922	58934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8420_pilon_+_11036_14728_14901_21336_21444_29018_29103_29242_29437_33794_33985_35331_35430_36804_36986_37073_37168_39046_39177_41728_41918_51048_51183_58546
933410	contig_5302_pilon	+	1400	7	Intergenic	novelGene_81480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	259	junction_1	90.5108955994924	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	39	788	318287	334107	FALSE	25	AACCCACCCAGAGGCTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAADRAATACEKMAVPPTYVDLGKSARDVFTKGYGFGLIKLDLKTKSENGLEFTSSGSANTETTKVTGSLETKYRWSEYGLTFTEKWNTDNTLGTEITVEDQLAHGLKLTFDSSFSPNTGKKNAKIKTGYKREHINLGCDVDFDIAGPSIRGAVVLGYEGWLAGYQMNFETAKSRVTQSNFAVGYKTDEFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVNKKLETAVNLAWTAGNSNTRFGIAAKYQIDPDASFSVGTCGSCISQGMGPT	306710	334719	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_+_306746_318283_318354_318938_318989_319808_319962_320055_320109_328185_328414_333908
933411	contig_14684_pilon	+	1278	1	Intergenic	novelGene_99642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	46	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGGAACCACATAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35498	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14684_pilon_+_35500_36800
933412	contig_4315_pilon	-	2730	11	Intergenic	novelGene_46799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	272.489284192975	1	149	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	550	1653	15	1667	347265	328146	FALSE	50	AGAAAACTCCCAAAACATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMEEEEEEKGRVLEVDRPALTPGKGEATRLTPRQLPGQAERSHGVPLKETTEQMVSVKPSGFQTSMAREGHPPGLDKTKAAPPGPGMPHPPPGPGTPHPPRGTKSAVSHQSSMTSLAGSGTSERLPQKSFLQAGGPHLEEPWMASPETDSGFVGSETSRVSPVTQAPEHRLSHNSTLGTSTRPVTASVPQDGASHPQARGPVVPRTAAEPSTPRSRAQRHVSSPGSPRQQRAPSFHLERALTAEMAVPSSEFKVRKRISEQLLPSKALSSPPTPAPAAAPLTHGPAETTPSFLLTRTGRDQAIRELQEEVSRLRLRLEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGTMCPQDLPQPKQLLSGPPKPPPSQLRRTGTPSS	347279	327082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_328250_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338970_339142_340931_341095_343485_343698_344460_344568_345795_346070_347119
933413	contig_9389_pilon	-	833	1	Intergenic	novelGene_84075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTCCGGGGCTGCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1045093	1044260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9389_pilon_-_1044300_1045100
933414	contig_11338_pilon	+	2506	11	Intergenic	novelGene_6200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	532.223862674345	7	101	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1215	16	1230	7691	11749	TRUE	25	GCTGAATTTAACCTCTAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICPVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	7675	13610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_7734_7964_8189_8743_8924_9814_9954_10560_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_12702_13286
933415	contig_7963_pilon	+	987	5	Intergenic	novelGene_58346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGTGTTGCCGTCGGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38352	48867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_38555_39271_39397_39951_40234_43550_43819_48757
933416	contig_10225_pilon	+	1320	2	Intergenic	novelGene_86872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	9	1202	46299	47636	FALSE	20	CTAGACTTGACTTTTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	46290	47754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_47226_47369
933418	contig_6102_pilon	+	3814	29	Intergenic	novelGene_31862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	573.446628479308	1	89	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	52	1614	370803	379407	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLPARPSKPGALCAGERITQQLWPKLQALHETGYADPVLGFIRSMLPYCAWDSWCLEPGQ	370751	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_376251_376307_378980_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393626_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
933419	contig_7396_pilon	-	1606	10	Intergenic	novelGene_79630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1473.48675252835	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	436	1104	248986	246442	FALSE	15	AACCTATTTTTGGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	251492	245939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447
933420	contig_16666_pilon	+	2041	2	Intergenic	novelGene_61789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	397	762	117272	117692	FALSE	80	AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PESDLDFVYDEEAEACNEGDIVAFGALFLPIFYSFVFAFGLVGNLLVVFALTNSRKPKSITDIYLLNLALSDLLFVTTLPFWIHYVVSNQGFSNAVCKLITAFFFIGLFGGIFFITIISIDRYLAIVLAANSMRNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKGSECLGSYPQVLQDIWPVLRNVEANVLGFLLPLLIMSYCYFRIIWTLFSCKNRKKARAIKLIFLVVVMFFLFWTPYNVMIFLGWPSA	116875	118971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16666_pilon_+_117621_117675
933421	contig_5777_pilon	-	2527	2	Intergenic	novelGene_173315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	849	junction_1	0	4	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGTGAGTGGTCAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42822	39571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_-_40165_40888
933422	contig_19579_pilon	-	1597	7	Intergenic	novelGene_59380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_6	590.42037754656	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	65	198	106	303	13090	12135	TRUE	55	AAAAAAAATCTATATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSVSFPVIKPSIWAVPGAVVPQHSSVTICCRGPPGMTTMRLQRAEFTEWDDKIPHGAQEVVKFSIQDVTQIHATIYYCEYWKEGTWSGISDPLKLVVTGP	13195	7171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19579_pilon_-_8090_8173_8227_8442_8481_8569_8613_8704_8825_12012_12143_12900
933423	contig_11061_pilon	-	4674	2	Intergenic	novelGene_173347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTAATCAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198854	147919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11061_pilon_-_149640_195900
933424	contig_12142_pilon	+	1745	8	Intergenic	novelGene_147814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	34.3879428324071	2	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	892	1743	108736	135831	FALSE	20	GGATACCCCTGAGTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRERIRDESASCSWSEFSKALQATEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIVGRHRFNAENCEVSAFPRDVEIRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMPKTKILATGGASHNRDILQVLADVFGAPVYVTDTANSACVGSAYRAFHGLAAGAEVPFADVVKLAPRPRLAATPTPGATQVYEALLPQYAKLEQRIVSQTRGGPRVNSASPAPCRLACPDSRSPVGDAAPDSRDLLCSGVLPAPPDSLSVPAWPGPPGTQPQHVFLKMDGLPLPVPSCPTAGKRLSFPVFHSRR	107660	135833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12142_pilon_+_108533_108716_108833_109514_109589_112307_112405_121926_121986_124835_124924_128235_128331_135489
933425	contig_233_pilon	-	2304	14	Intergenic	novelGene_14667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_3	1277.318140925	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	80	1756	108727	91657	TRUE	25	CAAAATTTCTCTTTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVSPVPSA	108806	78443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92214_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724
933426	contig_854_pilon	-	2771	13	Intergenic	novelGene_36683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.21108319357027	28	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	2067	2651	1706853	1702673	FALSE	35	TTTAGACCTGGACAGACAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGKGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1715994	1702552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705427_1706739_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712485_1715208
933428	contig_7057_pilon	+	487	7	Intergenic	novelGene_123341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	778.624142674471	2	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	414	73	486	938907	943703	FALSE	10	CATTGCTGCTCTTCGTGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKWQAIYKQFDVDRSGTICGRELPGAFQAAGFHLNEHLYSMIIRRYADEGGNMDFDNYISCLCSCSAFSPPGPGRNKST	938682	943704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941107_941208_941288_941405_941495_943646
933429	contig_6058_pilon	-	798	4	Intergenic	novelGene_172418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	472.942796634951	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	234	705	2	706	392651	390684	TRUE	35	AAGTAGTCATCATGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQENRQCSFGLAELWAPDGVLILPRKRRQLIWQRYYPEQTSVFAVCHQNAGEPSRRWEQ	392652	387838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_387923_390675_390857_390978_391339_392479
933430	contig_6980_pilon	+	2020	9	Intergenic	novelGene_36017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_4	456.138119844198	4	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	107	1003	356720	372790	FALSE	25	TAACACTTTATCCTGACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGQLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346076	373807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364869_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
933431	contig_19775_pilon	-	2534	1	Intergenic	novelGene_147746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCAGTTGATTGCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	185460	182926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_-_182900_185500
933432	contig_19812_pilon	-	2017	18	Intergenic	novelGene_100996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	104.147951721341	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	504	1515	397	1911	40271	15879	FALSE	25	TTCCAGCCTATTAAAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGDPHQQTLARLDWELEQRKRLAEKYRESLSNKEKILKEIEVKKEYLSSLQPRLNSIMQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48270	15772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40209_40357_44547_44692_46710_46843_48235
933433	contig_854_pilon	+	2810	21	Intergenic	novelGene_36482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2886.59938119234	2	48	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	549	1650	493	2142	1687025	1702028	TRUE	40	AGAACCTGGAGAAGCAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARRTWP	1612770	1705400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649679_1685180_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1702012_1702204_1702545_1702691_1704481_1704517_1704595_1704689_1704893_1704999_1705285
933435	contig_3095_pilon	+	1226	5	Intergenic	novelGene_75103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	50	814	147241	151151	TRUE	15	TGGAGTTTTCAGTGTCTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147191	152249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933436	contig_1734_pilon	+	2618	4	Intergenic	novelGene_164369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCTTGTTACTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58853	251979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1734_pilon_+_59869_149237_150008_192156_192391_251380
933437	contig_3095_pilon	+	1227	5	Intergenic	novelGene_75094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	56	820	147241	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147185	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933438	contig_3410_pilon	-	1509	2	Intergenic	novelGene_58902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTTGAGCCTTGGCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15347	13689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_14702_14850
933440	contig_5023_pilon	+	1293	8	Intergenic	novelGene_7262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1682.51187338504	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	64	1047	614407	647344	FALSE	15	AATCCTACTCTGCTTTCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRGFLITRQSRQGQFLYKFSKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSSFPFSTLSPRDFALHPPRKSPLCGPPLLAILVSGPLEHLTSQSACLSPKRFGWSTKVASLLETFPRTGVPNVINFYVFHQEEALCF	580850	647590	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_614397_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629251_647079
933443	contig_6418_pilon	+	2050	13	Intergenic	novelGene_81210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	238.30109047636	3	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	437	1314	632	1945	1388801	1444680	FALSE	15	GTCTGTCACTTTCACTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYDHFTNLYPQLIEKPSIMDKVQDFMTKQHEWVQKNVKDYKGDPFWRHVGYVMAQLDGLYMGAMKRALLEGKKPLTLSQIHFLNAVGDLLDLIPSFSLIKSNSLKFIQRLEMGHCSALIKVLPGFENIFFAHSSWYTYAAMLRMYKHWDFNIKDKDTISSRLSFSSYPGFLESLDDFYILSSGLILLQTTNSVFNKTLLKQVVPQSLLAWQRVRVANMMANDGRMWAETFSKCTYNNQYMVLDLKKVEPNHSLGNGTLYVVEQIPTYVEYSEQTEILRRGYWPSYNIPFHEKIYNWSGYPLLVQKLGMDYSYEMAPRAKIFRRDQGKVTDMASMKYIMRYNNYKEDPYSNGDPCSTICCRADLASVNPVPAGCYDTKVADMYLASKLTAYAISGPTVQNGLPVFYWNRFNKTLHQGMPEAYNFDFITMQPTLKLDRK	1341084	1444785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6418_pilon_+_1341238_1341716_1341866_1375717_1375938_1379238_1379344_1388796_1388881_1390222_1390362_1409655_1409797_1410277_1410423_1428929_1429122_1429227_1429369_1441095_1441282_1441958_1442066_1444497
933444	contig_12528_pilon	+	1801	10	Intergenic	novelGene_81323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTCTCTTGTTTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	932852	968137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12528_pilon_+_933333_937390_937459_937559_937622_943700_943773_947003_947129_956037_956217_959918_960131_964909_964969_966189_966280_967683
933445	contig_7214_pilon	+	3640	6	Intergenic	novelGene_179227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	1725	2393	330451	429619	TRUE	50	AAAAAATTGTGAGCTAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGALTHSINAIQTITNNAQTPKDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWRFLRKLEIDIPFEPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFSQ	43101	431017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7214_pilon_+_43786_221641_221798_329393_330109_330281_330529_429028_430429_430579
933446	contig_12923_pilon	-	2847	15	Intergenic	novelGene_30108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	406.56955250044	2	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	676	1908	68226	49694	TRUE	30	GGCTCAGACTTTGAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGEKDSLQVEP	101244	45916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49248_49520_49726_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_64467_64618_68196_68281_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602_93733_101173
933447	contig_12671_pilon	+	299	1	Intergenic	novelGene_19236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGTACAACAATAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	209733	210032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12671_pilon_+_209700_210000
933448	contig_16185_pilon	-	2753	1	Intergenic	novelGene_144759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	71	76	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	981	1346	116287	115922	NA	30	ATAATATTCTTTGTCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSISEILLFIFWISNCCLCIISSWEFIFAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFYSSLSAFCLSSWRILSIGDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDIVCCLWGIQ	117267	114514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_114500_117300
933449	SIRV7	-	2130	4	ISM	SIRV7A	SIRV703	2498	5	32980	8	-22	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	75	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_3809_3897_114680
933450	contig_12644_pilon	-	2793	3	Intergenic	novelGene_44522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8729	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	2073	2372	1196248	1195949	FALSE	75	AGATTGAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQGLHRTESSTARWCPATTTDCSDQDHNRGFWTELEKDVEYNSNSQKKDQIYWPKGDWRNLESMAPKHRFSSVVKLSLRFTVQPGSGQPCKTKWD	1229326	1195527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_-_1197931_1197999_1198349_1229285
933451	contig_1867_pilon	-	2703	11	Intergenic	novelGene_54608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	195.008948512626	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	154	1629	551098	517583	FALSE	45	TTTGCAGATTATACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIQPRPGRFRGRRQLVAAPGPRASDNCDSGGGADAAPACGEPVQATLSSLKMVDVGKWPIFSLCSEEELQLIRQACVFGNAGNEVLYTTVNDEIFVLGTNSCGCLGLGDVQSTLEPRRLDSLSGKKIACLSYGSGPHIVLATTEGEVFAWGHNAYSQLGNGTTNHGLVPCHISTNLSNKQVIEVACGSYHSLVLTSDGEVFAWGYNNSGQVGSGSTANQPIPRRVTGCLQNKVVVNIACGQMCSMAVVDAGEVACGYAHTLVLTDEGQVYAWGANSYGQLGTGNKSNQSYPTPVMVEKDRILEIAACHSAHTSAAKTQGGNVYMWGQCRGQSVTLPHLTRFSCTDDVFACFATPPVTWRLLSVEPDGHLTVAESLKREFDNPDTADMKFLVDGKYIYAHKVLLKIRCEHFRSSLANNEDEIVEMSEFSYPVYRAFLEYLYTDSINLSPEEAIGLLDLATFYRENRLKKLCQQTIKQGICEENAIALLSAAVKYDAQDLEEFCFRFCINHLTVVTQTSGFAEMDHDLLKNFISKASRVGAFKN	566895	516508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_-_517724_531511_531643_532494_532635_537549_537677_538245_538437_546225_546369_547864_548024_548580_548748_550593_550745_550972_551129_566772
933452	contig_13021_pilon	+	2105	13	Intergenic	novelGene_8197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2346.45490876959	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	75	1061	174676	177795	TRUE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEK	174601	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177889_178522_178585_178670_178731_179985_180058_180162_180211_180440
933453	contig_3956_pilon	-	2438	11	Intergenic	novelGene_15246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	CAGCCGTGGAGGCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
933455	contig_6842_pilon	+	2029	1	Intergenic	novelGene_130807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAACATTTTTCTGGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1680777	1682806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6842_pilon_+_1680800_1682800
933456	contig_3942_pilon	+	387	5	Intergenic	novelGene_128653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1074.72563359213	2	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAACTCCTTGGGGACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176968	180099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_177005_178309_178490_179045_179177_179714_179729_180073
933457	contig_10296_pilon	+	2054	1	Intergenic	novelGene_168873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATAACAGAAATATCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186755	188809	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10296_pilon_+_186800_188800
933458	contig_11720_pilon	+	1409	10	Intergenic	novelGene_43848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3020.13290525965	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	427	1011	86302	98361	FALSE	25	TATCGTACTTGAGAATTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRRGRRFHPANSWAQEEEATGN	70345	98759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_70509_76925_76961_78408_78526_82247_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95472_98299
933459	contig_610_pilon	-	1121	3	Intergenic	novelGene_76754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTGAGTTGTTTAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	252589	213532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214245_234998_235302_252483
933460	contig_15105_pilon	+	1988	2	Intergenic	novelGene_150944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGCAATGAGTAGCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330800	332862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15105_pilon_+_331065_331138
933461	contig_2770_pilon	-	538	5	Intergenic	novelGene_107487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1975.11687945296	2	6	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	214	537	750561	743762	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKRRIKLNLLLTSCK	750774	743760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743801_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
933463	contig_5643_pilon	+	1568	10	Intergenic	novelGene_38782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	2091.29821456009	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	71	595	233973	236936	TRUE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMV	233604	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_237281_237376_237456_237550_237819_237913
933464	contig_9646_pilon	+	1565	1	Intergenic	novelGene_117462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	32	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATATTCCATTGTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	344938	346503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9646_pilon_+_344900_346500
933465	contig_5871_pilon	-	391	1	Intergenic	novelGene_160170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATAGTTTCCCATGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309988	309597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5871_pilon_-_309600_310000
933466	contig_7202_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_18571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	46	471	29911	28004	FALSE	25	CATTGAGACTCATTACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHVSIGNQGMHGRN	29956	27939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
933467	contig_13724_pilon	+	1507	1	Intergenic	novelGene_179228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	322	759	107609	108046	NA	30	GTTGGAACAGGACTGAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQNETSCKHPLVFRMWNIRSMNLGKLKVIKNEMECIKIYILGISELKWTDIGHFESESHMVSYASNDKLKRNGITFIIKKSISRSILKYNCVSDRIISICPQGRPANVTIIQIYRTTTNAKDEELKIFTNFCSLKLITHAIKMH	107287	108794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13724_pilon_+_107300_108800
933468	contig_3956_pilon	+	1850	11	Intergenic	novelGene_15170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1155.57942608892	1	22	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	19	1038	1281682	1289148	TRUE	10	TGGCCTCTCTGCAGGGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETFQVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTSTRVRCRPARSSSRGPVTWQRSTSGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1281663	1290713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284078_1285706_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1289006_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933469	contig_10311_pilon	-	3323	10	Intergenic	novelGene_50425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1047.40032084145	4	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	33	719	71526	68584	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSRALRGNLDMSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVSFFSPCCTAGDVVKCRYC	71558	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65526_65604_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68754_68868_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70493_71497
933470	contig_10734_pilon	-	2357	13	Intergenic	novelGene_51498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	607.368292764411	1	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	919	1887	2274418	2265543	FALSE	50	ACGTAATACACCACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKPPMRLFSFYRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305184	2265072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271061_2274393_2274510_2275754_2275885_2277109_2277180_2280844_2280937_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
933472	contig_17144_pilon	-	1886	9	Intergenic	novelGene_29235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1972.0344784955	2	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	382	1218	174965	166736	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQPSGPQHAPHRQDHSAGGGGEEARALGVQ	179749	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166823_172670_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
933473	contig_3627_pilon	+	2231	16	Intergenic	novelGene_78447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	327.271304374011	1	100	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2052	178	2229	294394	318724	FALSE	60	AAAAGAAGAGGAAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGSGEGLVRAVGAVGGRARFITSYRIYRRAGDDCLGSTAAAGRRRRKTSRGFFFLPYIMAQFGGQKNPPWATQFTATAVSQPAALGVQQPSLLGASPTIYTQQTALAAAGLTTQTPANYQLTQTAALQQQAAAAAAALQQQYSQPQQALYSVQQQLQQPQQTLLTQPAVALPTSLSLSTPQPAAQITVSYPTPRSSQQQTQPQKQRVFTGVVTKLHDTFGFVDEDVFFQLSAVKGKTPQVGDRVLVEATYNPNMPFKWNAQRIQTLPNQNQSQTQPLLKTPPAVLQPIAPQTTFGVQAQPQPQSLLQAQISAASITPLLQTQPQPLLQQPQQKAGLLQPPVRIVSQPQPARRLDPPSRFSGRNDRGDQVPNRKEDRSERERERRRSRERSPQRKRSRERSPRRERERSPRRVRRVVPRYTVQFSKFSLDCPSCDMMELRRRYQNLYIPSDFFDAQFTWVDAFPLSRPFQLGNYCNFYVMHREVESLEKNMATLDPPDADHLYSAKVMLMASPSMEDLYHKSCALAEDPQELRDGFQHPARLVKFLVGMKGKDEAMAIGGHWSPSLDGPDPEKDPSVLIKTAIRCCKALTGIDLSVCTQWYRFAEIRYHRPEETHKGRTVPAHVETVVLFFPDVWHCLPTRSEWETLSRGYKQQLVEKLQGERKEADGEQDEEEKDDGEAKEISTPTHWSKLDPKTMKVNDLRKELESRTLSSKGLKSQLIARLTKQLKVEEQKEEQKELEKS	292763	318726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_292901_294353_294467_297723_297897_298391_298437_300295_300329_302711_302906_304324_304440_304535_304729_309361_309492_309610_309770_312560_312787_313379_313494_314037_314205_314941_315153_315965_316050_318589
933474	contig_5260_pilon	-	682	1	Intergenic	novelGene_144336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	75	228	161	388	48556	48329	NA	20	TGCTCGCGATCACTAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KARRYPLIIDCFKLRKIRVNFTVTTRKVNKPTQQNQEEKHKVSVKTKSTKTKEMEKKNPQTRNSAQERGTKHMSAPQKKALQNDSNKLTPINNYTECKWPNAPIKRRRVTEWIKKTGSINMLSTRGTS	48716	48034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5260_pilon_-_48000_48700
933475	contig_1406_pilon	+	967	1	Intergenic	novelGene_25677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGTGCACTAGTTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3266580	3267547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_3266600_3267500
933476	contig_14970_pilon	+	1000	2	Intergenic	novelGene_45051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	191968	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_192085_231367
933477	contig_4232_pilon	+	833	1	Intergenic	novelGene_63455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATCTAATCTTATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	542778	543611	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_542800_543600
933478	contig_7119_pilon	+	3131	3	Intergenic	novelGene_40945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_2	409	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	895	1980	138713	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127514	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137227_138155
933479	contig_34_pilon	+	1545	7	Intergenic	novelGene_40011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	341	709	212125	212493	TRUE	10	GCTCTGCGTCTTCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	211784	243332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212560_212973_213049_214059_214150_215287_215458_224659_224813_230223_230389_243215
933480	contig_10311_pilon	+	1906	11	Intergenic	novelGene_50397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	250	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCGGGCTCGCCCCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65123	71559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_+_65920_67182_67260_67490_67585_67826_67961_68263_68407_68641_68754_68868_69038_69807_69947_70223_70360_70448_70493_71497
933481	contig_7963_pilon	-	965	6	Intergenic	novelGene_58349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1313.09152765525	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	32	328	48841	43622	TRUE	15	AGCTCTGCTCTCTGATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSISPTFSSSMMVLHVSEAPWTAAVTVLLMVLSNPMVQGRATPENYVVQARDDCYAFNGTQRYVRRHSYNREELLRFDSDLGEFVAVTELGRPGRRVLEQPEGLSWRS	48872	38417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_38563_38892_38917_39293_39405_39949_40232_43546_43819_48741
933482	contig_15491_pilon	-	2164	5	Intergenic	novelGene_75951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	394.974920089871	1	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAGTTGCTTATCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47042	30765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37440_37560_38887_39040_40177_40249_46890
933483	contig_16205_pilon	-	5557	4	Intergenic	novelGene_156861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	420.021428024809	2	115	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	71	400	105825	103176	TRUE	25	ACTGACTTCTTCCTTACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEASCQNGDETIETIEAAEALLNMDSPDPMLDEKRLNNNIFSSSEDDIVAPVTHVSVTLDGIPEVMETQQVQETYAGSPGISSPEQPKRKKGGCLIRLRSSLDMQSKYHCYSRVFLHEEAVKTNVRKKVKHF	105895	60616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16205_pilon_-_61720_79785_79793_99128_103466_105785
933484	contig_6898_pilon	+	2562	4	Intergenic	novelGene_35768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2839.00385503241	1	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	14	508	123044	125646	FALSE	20	ACTTTACTGTGACTTGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVPRMRLRSWQMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	123030	127700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_123063_124377_124464_124782_125008_125481
933485	contig_10734_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_51094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTCAACTTGGAAGGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	550489	549087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_549100_550500
933487	contig_11316_pilon	+	1748	1	Intergenic	novelGene_122644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	170	513	46	558	137674	138186	NA	45	TGACCAACATTCGAAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGPTPVSALLHSSTIVVAGVFLLIRFHPLIEINPLALSLTLCIGAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLIIVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAILFMCSGSIIHSLSNEQDIRKIGGLYKTLPFTTTALIIGSLALTGIPFLTGFYSKDLIIEAISTSYTNA	137628	139376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_137600_139400
933488	contig_6576_pilon	+	2202	1	Intergenic	novelGene_42437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	26	559	1302041	1302574	NA	50	CCAAATATTAAATGAATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1302015	1304217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302000_1304200
933489	contig_14744_pilon	-	1627	6	Intergenic	novelGene_65996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	402	junction_4	297.527544943321	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	381	1146	154	1299	969897	960824	FALSE	20	TTTATTGGGTGTTTATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRRPVILDPADPTGNLGEHPERWQRLAEEALVWLSYPCFKNWDGSPVGSWNVPPERNSLIWTFQDHAHSSRHITLDTEATAQAEEGWTCTIL	970050	960495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_962457_962609_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
933490	contig_17180_pilon	+	1046	1	Intergenic	novelGene_178946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCACAAAGCAACAGCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12514	13560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17180_pilon_+_12500_13600
933491	contig_5686_pilon	+	3533	16	Intergenic	novelGene_45283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1499.82139677437	2	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	684	2055	487	2541	176692	219943	FALSE	45	AAAAAATTCTGCCATCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEGQQRNILSYGIGRGGLMNTMFQPSESTIGDKVVSIETSRSQILRYGEKQQTPRRQSFTDC	93822	220935	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172591_176652_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_219761
933492	contig_6361_pilon	+	2914	5	Intergenic	novelGene_23983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	324	2591	2914	415471	436319	FALSE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHQTVITDGSRDAIFGPVVGPHCDTCSTQTAFIHVTSNLTCKALNAKCSTKTDFAIGEAITQASVPVGGLDWRTTPRLRHNDHLGRLHFQCRLLKGYALQEMSPGLG	408702	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_411212_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
933493	contig_11003_pilon	-	1425	1	Intergenic	novelGene_105441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCACACTCGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121966	120541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11003_pilon_-_120500_122000
933494	contig_5642_pilon	+	1839	2	Intergenic	novelGene_153023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAGTGAGACCAAAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	64897	67196	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5642_pilon_+_65740_66199
933495	contig_12277_pilon	+	2064	1	Intergenic	novelGene_139691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTCTTTTCCCCATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232681	234745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12277_pilon_+_232700_234700
933496	contig_8228_pilon	-	1802	1	Intergenic	novelGene_81783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	191	576	1015	1590	111391	110816	NA	80	TGAAAAAAAAAAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISNCEFTSAFCSCIIFLNSSIFLSVFSMNLSTFSSFLSVFCFNSWTILNIRDFNSQSVRSSAFSSTGRSSGVLFWTPTGTILSCFCKCFDMVCCLWGIQWLFSSFTDCRFVLSCILFYLVMSEQAGCAFFVVCSSVGTILFTSFSNGQGQSLRYGTAGQVQLKGSCWDRFFVPGTRADSTDQESVQGRFQ	112405	110603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8228_pilon_-_110600_112400
933497	contig_3956_pilon	+	2251	11	Intergenic	novelGene_15001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1282.05401212273	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	742	2088	1286460	1290847	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLTLGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284198_1286155_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289648_1290521
933498	contig_17144_pilon	-	1643	8	Intergenic	novelGene_29278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2123.60157107049	2	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	477	1434	126	1559	179764	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEAGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183207	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166755_173592_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
933499	contig_9177_pilon	-	3511	25	Intergenic	novelGene_32570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1711.97362500371	39	141	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	558	1677	3	1679	25606	18984	TRUE	20	AACCTCTGCCGGCTTCATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEVRGRGAGLLGTWARPVGSCCSKLGKMILTPTSRTCSCN	25608	1712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2067_14881_15021_15163_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20100_20248_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584
933500	contig_7730_pilon	+	6800	1	Intergenic	novelGene_156307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	131	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGCTCTAAACTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	469257	476057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_469300_476100
933501	contig_4232_pilon	+	887	1	Intergenic	novelGene_63385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	70	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCCTGTCGCACAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467244	468131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467200_468100
933502	contig_17427_pilon	-	1867	11	Intergenic	novelGene_30325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1228.19070587592	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	31	1122	188879	177694	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGYGDSPSKGAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNKTVPRN	204691	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177718_179397_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
933504	contig_3747_pilon	+	2862	8	Intergenic	novelGene_24788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	3	99	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	330	1505	201313	203804	FALSE	50	GATATTCTTTGTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205161	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933505	contig_8210_pilon	+	2711	1	Intergenic	novelGene_30224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	161	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACAGTTGAGTAAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13632	16343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_+_13600_16300
933506	contig_7411_pilon	-	2805	1	Intergenic	novelGene_137056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2406	2705	993616	993317	NA	35	ACATCACGTATTTTAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEEDRRRIDAFELWCWRGILNIPGTARRTNRSVLEEVQSEYCLEARMSRLSLMYFACVIRREQSLEKDIMLGKVEGSVKKRKTQRDGWTQWLQQWAPA	996021	993216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7411_pilon_-_993200_996000
933507	contig_20641_pilon	-	2375	8	Intergenic	novelGene_52824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGAAGAGGTCCGGACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86648	14536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14770_16768_16914_38520_38688_41460_41617_45846_45962_54832_54962_71457_71532_85292
933508	contig_17074_pilon	+	2317	1	Intergenic	novelGene_145159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAAAAGACAGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	294730	297047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_294700_297000
933510	contig_9439_pilon	+	1321	1	Intergenic	novelGene_176908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	234	705	289	993	107838	108542	NA	70	GAAATGAACAAAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSVIEGLRGRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIDIPEQGEKTENTERITEQLLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSQRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYLAETMQARRQWDDVYKILKEKNCQPTIIYPAKLSFKYDGEIRSFPDKQKLREYIKVKPNLKELLKGVLRSEDKQLQLTGRS	107549	108870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9439_pilon_+_107500_108900
933511	contig_7788_pilon	-	800	1	Intergenic	novelGene_177606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	105	315	484	798	140203	139889	NA	35	GCACAAAGACCTGGAGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTSPLEPKYNLEYIPSEFRDHLKNNHRRPDKLWDDIKDIIHEESKRSLKGQERKKRPKWMSEEILKLALEHRVAKAKGRNEEVKEMNRRFQRAAREDKVKYYNE	140686	139886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7788_pilon_-_139900_140700
933512	contig_14925_pilon	-	1585	6	Intergenic	novelGene_55274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	933.344009462749	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	82	495	116065	114666	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129482	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113098_113184_113268_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
933513	contig_11171_pilon	+	1529	1	Intergenic	novelGene_48619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCCATCTGGTAGAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263213	264742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11171_pilon_+_263200_264700
933514	contig_17144_pilon	-	2810	17	Intergenic	novelGene_29564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	36	junction_15	2159.7248803016	1	94	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	361	1086	1538	2623	170784	166363	FALSE	25	TCCCAGGCAACCTGCACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183218	166175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_171026_171076_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_181794_181850_183158
933515	contig_4857_pilon	+	3252	1	Intergenic	novelGene_48879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	134	405	274	678	1389919	1390323	NA	35	GAACTCTTCAAGAGATCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPCSFQNRPTNTRSPVRVTEKGQAAWVGTSSLTQCGIAKDLPAGGLVPWPTDLLTPSAFSNQDQMEKPQPPTTLVITFCLDAASNQSRFPVGPKSAWVMGFRVSNESLISLSKSLVCAKKICKNQNKQPFFLI	1389645	1392897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1389600_1392900
933516	contig_3956_pilon	+	1143	5	Intergenic	novelGene_15239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1402.53455839776	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	259	615	1289647	1290491	FALSE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284683	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285104_1289605_1289677_1289758_1289892_1290297
933517	contig_8330_pilon	+	1579	8	Intergenic	novelGene_71829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	149.917528348497	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	479	955	855440	856687	TRUE	30	CCAGCAAATGGGCATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853940	857525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_854060_854995_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
933518	contig_233_pilon	+	1851	10	Intergenic	novelGene_14635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	329	838	78477	91651	TRUE	15	GGAAGCCGTCATCCGTGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHCAPDDGGHFRPLHALSRIHHLDEVVVSPIPPRHCIVNPAALRISFLAKPAREGYLGQLHSRALLAAVLLKGAL	78148	104247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79144_91475_91677_92138_92316_93808_94016_94731_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151
933519	contig_6980_pilon	+	2052	9	Intergenic	novelGene_36044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	489	junction_4	551.877647219019	2	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	71	964	356720	372790	FALSE	15	TTTCAGACTGTTACTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346112	373878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
933520	contig_4068_pilon	-	2701	1	Intergenic	novelGene_161707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	2016	2594	74425	73847	NA	35	AATATCATAGTCACACTCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQRQHTITKHLQKQDRMVPVGVQNKIPDNSPLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFSKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKVNNKISEMEDVIEGLRSRFETVEHRISGIEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNMRVIGIPEQGENRKHGEDH	76440	73739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4068_pilon_-_73700_76400
933521	contig_13740_pilon	+	1621	10	Intergenic	novelGene_34714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTACTGCCGCTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	157116	165403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157531_158265_158393_158639_158759_160069_160138_160651_160729_160800_160897_160975_161269_161573_161723_161918_162031_165237
933522	contig_15886_pilon	+	1345	1	Intergenic	novelGene_144330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAGAAAAAGCAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5910	7255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15886_pilon_+_5900_7300
933523	contig_12964_pilon	-	1470	1	Intergenic	novelGene_131713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAAAAGGGAAGAACACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	579465	577995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12964_pilon_-_578000_579500
933524	contig_6137_pilon	+	2144	6	Intergenic	novelGene_59164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	721.828068171362	1	102	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCGAAATAAAAAATGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1239040	1307422	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1239266_1240374_1240550_1267505_1267568_1268908_1268969_1300358_1300431_1305872
933525	contig_7457_pilon	-	1784	7	Intergenic	novelGene_31401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	176.969630162918	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	80	243	450	692	470910	469327	FALSE	25	GCATTGCTCCAAGTCTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VQDDGASSLARRPLGQGKPRLFVEGTRKGSVVSRANSIGSTSASSVPNTDDEDSDYHQESYKESYKDRRRRAHTQAEQKRRDAIKRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473202	468234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470468_470902_471003_471191_471292_471559_471667_471948_472039_473142
933529	contig_3975_pilon	-	2258	14	Intergenic	novelGene_54839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	71	junction_13	208.346405901496	1	97	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	509	1530	268	1797	2066301	2056837	FALSE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079249	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2075022_2075182_2079146
933530	contig_12180_pilon	+	2146	2	Intergenic	novelGene_160355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	657	1489	2145	171638	172294	FALSE	30	TATTTGATGGTGAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINKKISEMDGVIEGLRSRLETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEEIVRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLAETFPHIMKDEKLTIQEAQRTPCRRDPKRNSPRHVIITIAKTKDKQSILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSTETLQARRQWDDIHKILKEKNCQPRIIYPVKLSF	169786	172295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12180_pilon_+_170600_170962
933531	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	218	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	65	829	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147176	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933532	contig_3956_pilon	+	1317	6	Intergenic	novelGene_14864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1615.59049266824	4	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	354	797	1284763	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282697_1282913_1284714_1284864_1285066_1285173_1289848_1289892_1290297
933533	scaffold_12124_pilon	+	2224	9	Intergenic	novelGene_22039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	547.052085614341	3	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	289	780	846536	852375	TRUE	20	CTGGCGTCTTCTAAACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829574	858981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
933535	scaffold_17542_pilon	+	532	1	Intergenic	novelGene_139220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTTCTGACATCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	257920	258452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_17542_pilon_+_257900_258500
933536	contig_13021_pilon	+	4716	6	Intergenic	novelGene_8142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2784.61573650657	75	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	573	1145	176681	177567	FALSE	40	TATTTGAAGACTGAATTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGVAQTGSGKTLSVSFESTFVYSEAYARENGFRIKGIQEYCNKTFVSPPTPQQYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRVIAFEHCIFKFGS	174506	181138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176506_176588_176909_177137_177280_177364
933537	contig_3956_pilon	+	1687	8	Intergenic	novelGene_15092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1184.8975672597	1	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	78	1172	1281682	1290491	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281604	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282743_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933538	contig_15500_pilon	-	2252	1	Intergenic	novelGene_129003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	73	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTCACACATACTAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	272088	269836	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15500_pilon_-_269800_272100
933539	contig_12312_pilon	-	5041	21	Intergenic	novelGene_63966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	813.515732791936	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	997	2994	98	3091	326065	215838	FALSE	5	ATTTTCTGCCTTTTGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326162	213887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215985_218223_218329_218676_218770_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241466_242312_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
933540	contig_13144_pilon	+	2689	2	Intergenic	novelGene_178463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	68	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1653	1982	103596	103925	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQTNKSPGIPPARQPKPGSSSTLERSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASKKSKEAEKKKQH	101873	104632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13144_pilon_+_102114_102183
933541	contig_854_pilon	+	3411	15	Intergenic	novelGene_36701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	4117.47928138723	41	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	158	2068	1705343	1714980	TRUE	10	GCTACATGCGTGTGTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1704898	1716401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862_1715980_1716057
933542	contig_7457_pilon	+	3007	19	Intergenic	novelGene_31648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	174.040225235432	2	143	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	81	1088	1005828	1030427	TRUE	20	GTATGAAGGTGTACTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAKAISEQTGKELLYKYICTTSAIQNRFKYARVTPDTDWARLLQDHPWLLSQSLVVKPDQLIKRRGKLGLVGVNLTLDGVKSWLKPRLGQETMVGKAKGFLKNFLIEPFVPHSQAEEFYVCIYATRDGDYILFHHEGGVDVGDVDTKAQKLLVGVDEKLDPEDFKKHLLVHAPEDKKEILASFISGLFNFYEDLYFTYLEINPLVVTKDGVYVLDLAAKVDATADYICKVKWGDIDFPPPFGREAYPEEAYIADLDAKSGASLKLTLLNPKGRIWTMVAGGGASVVYSDTICDLGGVSELANYGEYSGAPSEQQTYDQACGLLVHRDLCHHVLL	1001598	1041103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_1001653_1005801_1005987_1007131_1007255_1009678_1009742_1010215_1010407_1010899_1010980_1012250_1012382_1013162_1013282_1014360_1014447_1030371_1030429_1032644_1032773_1033460_1033555_1035307_1035463_1036574_1036726_1036920_1037065_1038841_1038956_1039311_1039395_1039680_1039758_1040131
933543	contig_5623_pilon	-	3148	3	Intergenic	novelGene_154830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_1	250	64	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	854	1318	210277	209176	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQVGGVGSCHVGSLWPLAFLPCTQFPGKVPCEPKSL	211130	206938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_208553_208959_209405_210041
933544	contig_12923_pilon	+	707	2	Intergenic	novelGene_30188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATGTGCTTTGGAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	501688	502466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_+_502213_502283
933545	contig_7894_pilon	-	2844	1	Intergenic	novelGene_170790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	72	219	135	353	231225	231007	NA	90	AGAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPTGWEKIFAYDKSDQCLISKIYKILQNLNNKKTNNPIKKWVKDMNRHFSKEDIQVANRHMKKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPTRLALIQKIQNNKCGRGCGETGTLIHCWWEC	231359	228515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7894_pilon_-_228500_231400
933546	contig_3956_pilon	+	1759	7	Intergenic	novelGene_14950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1125.77642343209	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	156	1253	1287410	1290491	FALSE	10	GGTATGGTGGTGACTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSSPPSLARLASFVSAWENPLPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281668_1287320_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933547	contig_16156_pilon	-	529	1	Intergenic	novelGene_137091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACGCCTTTGCATGGTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	668757	668228	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16156_pilon_-_668200_668800
933549	contig_4232_pilon	-	525	1	Intergenic	novelGene_63421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTAAGGTATCAGGCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	467609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467600_468100
933550	contig_3081_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_133953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCCACTACCACCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	610669	609255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_-_609300_610700
933551	contig_9484_pilon	+	1793	12	Intergenic	novelGene_105626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	602.291450823882	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	461	1386	283	1668	98584	104965	FALSE	10	CATATGGCTTGGTGGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRKLLLYSCCQRRGCRDAVRARCCGRGPRPSSARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVIVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	95798	105090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95900_97189_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101219_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103380_103495_103641_104260_104412_104883
933552	contig_3627_pilon	-	881	1	Intergenic	novelGene_78417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGTTTTCCTGAAACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26295	25414	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_25400_26300
933553	contig_14450_pilon	-	3136	3	Intergenic	novelGene_48941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	414	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	523231	519193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_520978_521521_521719_522076
933554	contig_383_pilon	+	2542	1	Intergenic	novelGene_126126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTCATCTTCTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139490	142032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_139500_142000
933555	contig_5419_pilon	+	3780	9	Intergenic	novelGene_15505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	528.45693710557	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	FALSE	55	AATGCATATGAAAATAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
933556	contig_9955_pilon	-	3517	4	Intergenic	novelGene_21299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	824.856081723082	1	123	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	199	912	49317	47546	TRUE	20	AATTATTTTGGTGTCACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRYYGFGRTVYPEEHRSWRERCRTRSRSRTPFRLTEKDRMELLEIAKANAAKALGTANLDLPASLRTVPKETNCGTAAPNNAVKFEVSVPCLSKGNTWKN	49828	44889	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_46430_46480_47737_48794_49380_49692
933557	contig_6599_pilon	-	701	1	Intergenic	novelGene_175977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCAGGACGGTGGCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	261541	260840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_260800_261500
933558	contig_4091_pilon	+	4771	5	Intergenic	novelGene_172988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	147.922910666333	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	1571	1942	27470	28511	FALSE	45	CTCATGGAAAATTCATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSLNNIINITCNGVLSGNCQKFSRFQKRTWTRDIIADVRWILAESREYQKDVYLCFIDYAKAFDCVDRNKLWMTLQKNGNSKTFNCAHEETYIDQEAVFRTEQGDTAWFKIRKGVCQDCIL	10679	31340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_11291_21115_21311_21414_21461_26751_27511_28180
933559	contig_11855_pilon	+	2015	6	Intergenic	novelGene_67100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	170.987718857233	2	80	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	56	171	381	551	2443397	2443712	TRUE	35	TGAAGGAGGAAGAGGTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCSSRSAGGSSGSGSGSRAFKGDAAAARGDGGQVEGTAQEHIVHSPSGLEGLVSRSPKIQGWIRHRVPSNSPCRERSGPAGLFSERLFLVTTRGFDHSRQSCQRSSGQQLEAKSVPTSGAQGDVLTMSGCFPVAGLRCLSPRCGTLILLNSRDSWATETPSWILVRPEGDSSDEVKRTLEGR	2440084	2447151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_+_2440301_2441567_2441665_2443329_2443438_2443582_2443832_2445373_2445871_2446303
933560	contig_6199_pilon	-	2193	1	Intergenic	novelGene_126413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	22	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	110	333	1772	2104	694641	694309	NA	35	ATTCGGAAGAGGATGTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIHRITVPKRTGQHSNISGGVAYDQEPMVLKGEVQATLEALANNEASGINRIPVEMFQQRDAALKVLTSLCQEIWKTAAWPADWKRSIFVPIPQMTQQNADIIEQYLS	696412	694219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_694200_696400
933561	contig_10930_pilon	-	1585	2	Intergenic	novelGene_37061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGTAAGAAATAAAGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280389	278447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_279819_280175
933562	contig_7151_pilon	-	2306	6	Intergenic	novelGene_40779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	874.422918272388	3	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	134	751	551180	529179	FALSE	10	CTTCAGTCTTCTTTATTCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVAEEPQSKQGYQHPKLIPSTIAVVFILLLSACFIASCLVTHHKFLRCKRGTRVFKLPEYHSMLTCIREKSKMKGSTWNCCPVDWRAFQSNCYIILNDNKTWAESVRNCTGMGANLVTISTEAEQNFIIQFLNTQFSYFLGLTNQNSEGQWQWLDRTPLNPTTIRKNAVLSLLMKKINGAGIIFLVSLRQIGFVRNLQRHSTRNL	551313	527623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_529321_530077_530179_535501_535654_536388_536494_549638_549729_551152
933563	contig_17106_pilon	+	2470	2	Intergenic	novelGene_127664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	50	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	1505	1906	37681	38082	TRUE	55	AATGAAAACTACAAGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKFLETHCLPKLMQTEVEQLNKPITKEEIENVIKKLPTKKSPGLDDFAGEFYRTFREQLTALLLKVIQTIEKDGILPNSFYEARITLIPKPGKDTPKKENYRPVSLMNIDAKILNKILANRIQQHIKKNNSP	36176	38738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17106_pilon_+_38221_38312
933564	contig_13021_pilon	+	2265	13	Intergenic	novelGene_8191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2570.71993807182	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	448	1983	176597	180850	FALSE	55	AAAAAATATTTGAAGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174539	181132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174716_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
933565	contig_6740_pilon	+	2443	3	Intergenic	novelGene_142684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGGTTTTGCATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	620451	623000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_620635_620676_622205_622268
933567	contig_18850_pilon	-	1977	8	Intergenic	novelGene_142432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	3	374	181466	181095	TRUE	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LERDLPRLAGVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181468	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177108_177568_177654_177998_178061_178256_178306_178947_179146_180513
933569	contig_12638_pilon	+	1947	16	Intergenic	novelGene_33097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	583.086827915782	1	89	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	499	1500	294	1793	171697	199604	FALSE	10	TGCAGTGTGCTCATTCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADDIDIEAMLEAPYKKVRKNMLMSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWFAGKMITAAYVPLPTYHNLFPDSMTATQLLVPSRR	170790	199758	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_171071_171683_171771_178133_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_195520_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
933570	contig_15047_pilon	+	1623	7	Intergenic	novelGene_52134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2814.05288981331	7	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	29	652	2194	4178	TRUE	20	TCCAGAATCTGCATCTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2165	21657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013_21120_21181
933571	contig_3747_pilon	+	2209	4	Intergenic	novelGene_24823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4810.32271959654	2	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	797	1123	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201556_203338_203386_203498_203651_203768
933572	contig_7093_pilon	-	2099	1	Intergenic	novelGene_157972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	26	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	275	886	86374	85763	NA	40	ATGTTTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNRGIRIGGRLGNNLRYADDTTLLAENEKDLKHLLMKIKDHILQDGLHLNIKKTKILTTGPISNVKINGEKIEVVKDFILRGSTINTHGTAVKKSNDNCIGQIYCKRPLYTPALLARVKNTGNNKRWRGCQEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRQIRVVARIDICTPMFMVALFTIAK	86648	84549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_84500_86600
933573	contig_15047_pilon	+	1358	5	Intergenic	novelGene_52251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3237.5251736473	10	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	222	497	3242	4178	TRUE	10	TCTGCATCTTTGCTATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2624	21664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21181
933575	contig_3956_pilon	+	1742	9	Intergenic	novelGene_15212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1379.54149425633	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	285	1220	1284132	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVRGCPRPRQTPGVSAFNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPPALDNFLDKL	1282883	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284058_1284315_1287466_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289764_1290457
933576	contig_4213_pilon	-	2437	2	Intergenic	novelGene_124813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	156	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGCAGGGAATAATCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46216	43740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_-_44012_44050
933577	contig_14441_pilon	+	1504	4	Intergenic	novelGene_100728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	663	1463	121136	126705	FALSE	5	CCGTGTGTCCGGGGACTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120473	126746	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
933579	contig_16098_pilon	-	1398	9	Intergenic	novelGene_46158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2045	junction_6	1472.95519280119	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	153	1247	458816	456273	FALSE	35	AAATGCTAACTCCATCACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSHQHPALTPEQKKELFEIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKHCQVVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASQSLFISNHAY	460279	456121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_456369_456459_456660_456824_457000_457097_457182_457557_457719_457851_457907_458405_458618_458704_458838_460148
933580	contig_15236_pilon	-	5502	1	Intergenic	novelGene_141656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	72	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCTCCACAATGTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	715738	710236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15236_pilon_-_710200_715700
933581	contig_10500_pilon	-	3547	8	Intergenic	novelGene_41278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	901.494926242414	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	161	745	1640040	1633149	TRUE	40	TTCTTTTCATTAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVVRPRERMVGSQRSTPNSLPLL	1640200	1626863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629573_1630553_1630728_1633135_1633217_1635076_1635204_1635518_1635617_1636943_1637067_1639871
933582	contig_1452_pilon	-	2051	3	Intergenic	novelGene_115152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	65	TACAGAAAAAAAAAATTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
933583	contig_3956_pilon	+	1639	10	Intergenic	novelGene_15198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1338.05758424869	2	26	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	510	1430	1285728	1290491	FALSE	20	AGGGCCGCGGAAATGGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282765	1290700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284114_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287530_1289851_1289892_1290297
933584	contig_5316_pilon	+	2341	10	Intergenic	novelGene_61211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_4	284.312425960519	1	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	359	1750	453918	550408	FALSE	70	TTAAAAAAAAAAAAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDSSYALTPRTEEKYKKINEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLASGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVNQRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT	396004	550999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5316_pilon_+_396221_453775_453972_474052_474257_511666_511805_521316_521504_523563_523612_540826_541000_543405_543536_544132_544269_550086
933585	SIRV7	-	1595	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	112316	5	112138	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	71	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2600	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_2600
933586	contig_6898_pilon	+	1647	4	Intergenic	novelGene_35773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2839.00385503241	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	2	475	124380	125646	TRUE	20	TACTTTACTGTGACTTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124378	127699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_124464_124782_125008_125481_125773_126653
933587	contig_16310_pilon	+	966	6	Intergenic	novelGene_70081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3478.18259440185	4	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	176	508	285976	289927	TRUE	20	CAAAGCTGCCTCGAGCCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AALKSHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDTAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	285800	290630	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16310_pilon_+_286021_288632_288705_288966_289061_289558_289633_289879_290328_290572
933588	contig_6576_pilon	+	2040	2	Intergenic	novelGene_42438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	12	545	1302041	1302574	TRUE	15	GAGAAGTTTCCTTTTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1302029	1304281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1303047_1303258
933589	scaffold_9100_pilon	+	1186	8	Intergenic	novelGene_83274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	512.55402900871	1	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	107	1099	647136	654763	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAAAESGFHLLLPPTPARRAVPVQSSPVPSSSKTSMATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPSEECVYCVLYSFWFLHPTCLAHFFFPTLSNPGLQCVNPILHVLCITVLKDLMLCTVSQ	644848	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644931_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653430_654585
933590	contig_10904_pilon	+	2494	4	Intergenic	novelGene_22468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	753.810026170756	2	144	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	110	1078	149100	150068	TRUE	35	CATTAAAGAAGGACTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143936	151571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_146149_146226_149097_150406_150492
933591	contig_5423_pilon	-	2132	9	Intergenic	novelGene_85235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	255.290245358102	1	97	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	865	1734	504182	498292	TRUE	45	TGAAATGCAAAATATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPPSISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEIPLERAKDQLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYNLVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKHQRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDSERLKGILERGKEELAETEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEIDETPPVEKSKELILPIPENIRSLLGV	507649	497055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_497402_498239_498342_499854_499995_501581_501813_502180_502336_502610_502782_504059_504239_506641_506732_506931
933592	contig_6599_pilon	-	1035	2	Intergenic	novelGene_175979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGTTGATATAGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262715	260854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6599_pilon_-_261479_262304
933593	contig_8138_pilon	-	1975	6	Intergenic	novelGene_52495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	187.4178219914	2	15	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	38	376	481932	462914	TRUE	40	TGACAGTTCCACAATAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCGDCVEKEYPNRGNTCLENGSFLLNFMGCAVCSKRDFMLITNKSFKEEDGEEIVTYDHLCKNCHHVVARHEYTFSIMDEFQEYTMLCLLCGKAEDTISILPDDPRQMTLLF	481969	441818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_441986_442630_442776_461626_463007_470224_470296_472816_472953_481893
933594	contig_19596_pilon	-	715	1	Intergenic	novelGene_179229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCTAAAAGTGGATGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21642	20927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19596_pilon_-_20900_21600
933595	contig_9839_pilon	+	2591	2	Intergenic	novelGene_88551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	77	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	2125	2544	264578	264997	FALSE	60	TTTACAGAAAAAAATATATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFMLLEKGICNEEVVGLAKLCHAISRIVFITKTIFCNHQHFFFVSNFCIPITSNYECILTACSINFRLQKLVKIFSFFIIGLSGWCVNLNNSCFTWSLFRHMDIIPSLTVLYFRIDLEMFFLTMNAMLFLFNLSFQYML	220054	265044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_220095_262493
933596	contig_8520_pilon	-	2396	1	Intergenic	novelGene_85452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	103	312	1612	1923	260523	260212	NA	50	CCAAAATAGATGTCAGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYAGNDNLKRNAVAFIVKKNISRSILKYNTVSDRIISIHLQGRPVATTIVQIYTPTIKAKNEETEDFYQLLLSEIDETCNQDALIFTGNWNAKVGNKEKDW	262134	259738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8520_pilon_-_259700_262100
933597	contig_1406_pilon	+	2734	4	Intergenic	novelGene_25595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	430.144420191896	3	133	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	184	525	2179513	2185260	FALSE	10	TATTTTAGTTTGTGGGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2176190	2187469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2176336_2179474_2179551_2183697_2183885_2185143
933598	contig_6576_pilon	+	4360	4	Intergenic	novelGene_42407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3978.18275095552	3	134	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	93	1289	1301228	1302574	TRUE	25	CAACCACTTACGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295684	1305686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1301398_1301547_1303539_1303579
933599	contig_2703_pilon	+	2572	17	Intergenic	novelGene_101696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1035.37047830414	2	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	302	1501	559489	608355	TRUE	70	CAAAAAAAAAAAAAAGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPDQGINIYRKPPIYKQHDAAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRGRRPSRMATCLECGWTEECPCPTCWNQTQEHCSGTPGSGLMNQSWNKIVELCTVILPDISIM	526165	611735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584592_596351_596400_599674_599822_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607649_607731_608248_608367_609320_609402_610756
933602	contig_10331_pilon	+	1686	15	Intergenic	novelGene_54132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	364.638540620876	2	81	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGATGATATTGAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409506	545922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10331_pilon_+_409749_410752_410808_501845_501957_507020_507087_511873_511961_514501_514582_520528_520621_528501_528641_534686_534767_536900_536978_537997_538153_541321_541453_541971_542045_543768_543864_545719
933604	contig_2703_pilon	+	2210	14	Intergenic	novelGene_101728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	944.093146793517	1	98	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	773	1348	602068	610870	FALSE	70	TGGCAAAAAAAAAAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRDPPGWPHAWNADGPRSVHAQHVGTKDLSIRNAHGDQQRAQQNPKRRGQNQAGAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526193	611732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_584447_584576_596363_596400_602059_602152_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610766
933605	contig_610_pilon	-	5553	7	Intergenic	novelGene_76657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	476.558729037904	2	133	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	39	740	68933	32917	FALSE	20	GCAATGTCTGAGACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSCPQKIRRWKKMAQHHLWILLLCLQTCRLGKPKITQSLMTSVNSSCNVTLTCSVEKEEKNVTYRWSPLGEEGNVLRIFQTPEDQELTYTCTAWNPVSNNSDSISTQQLCAAAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	68971	28103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769_37887_38285_38538_68887
933606	contig_610_pilon	+	2537	8	Intergenic	novelGene_76675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGAGTTTGTTTCACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	31477	68982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_32985_34645_34710_35446_35548_37078_37131_37767_37890_38285_38540_44935_45277_68886
933607	contig_854_pilon	+	3961	21	Intergenic	novelGene_36596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3523.12837227087	3	50	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	1993	3201	1702628	1715249	FALSE	30	TAGAATTCCAAGTCTTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDACQSPRLPLLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1683951	1716009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694534_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699045_1702012_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709609_1715130
933608	contig_3956_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_14937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	177	534	81	614	1281682	1286416	TRUE	45	GGACAGAAACTAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1290912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284138_1286179_1286224_1286409_1286606_1287276_1287440_1290233
933609	contig_191_pilon	-	3453	3	Intergenic	novelGene_179083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACTAACTTGAAATATAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	634526	479487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_191_pilon_-_479805_480025_481754_633118
933611	contig_8317_pilon	+	692	1	Intergenic	novelGene_19402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTGTGTAGTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16380	17072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_+_16400_17100
933612	scaffold_12124_pilon	+	2029	8	Intergenic	novelGene_22305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3467.08378312144	3	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1211	1861	1508755	1509405	FALSE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473590	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486578_1490337_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1508010
933613	contig_3956_pilon	+	1257	5	Intergenic	novelGene_14933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1949.50115414175	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	81	791	1281682	1284761	TRUE	20	TGGGTGAATGGCCCATAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGKLRVPLRCGWGPRAPPLWVTVRPAPRCVCADRDCPAPGHRRAYQARADDEQDGPGPAGAAAGTRGALPDLPAHRGERQRHHLHLRRGRERPHGQHHDRPCPWYRGLWVWPPRLGLHPEAVC	1281601	1290840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282907_1283844_1284267_1284684_1284829_1290441
933614	contig_1450_pilon	+	2908	21	Intergenic	novelGene_27379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	533.536435025763	2	54	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	866	2601	114	2714	245441	355748	FALSE	80	TGCAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSPVRCGVSHWGSLLSHQTVSQAPCTFRHGVWAAELAMGPGHSGQWQEETFTAWCNSHLRKAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDWIRRTIPWLENRVPENTMQAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWMLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEVWTDGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITVDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL	245327	355942	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_245477_308888_309004_315758_315879_322455_322543_324997_325086_325654_325734_329046_329129_331947_332034_339440_339534_340853_341076_342473_342622_345694_345846_346444_346554_347012_347154_348039_348223_348943_349079_350345_350526_351266_351414_352392_352474_354170_354330_355589
933617	contig_7229_pilon	+	1398	1	Intergenic	novelGene_39845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	65	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAAAGACCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1126127	1127525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_1126100_1127500
933618	contig_5643_pilon	+	1142	12	Intergenic	novelGene_38785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	2	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	69	1070	233973	237983	FALSE	25	CTTGCCCCAACTCCATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233606	238055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
933621	contig_9112_pilon	+	1621	4	Intergenic	novelGene_60199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	535.995232151265	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	299	964	108641	113625	TRUE	90	CAAAAAAAAAAAACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLPMCSIFQELQIVHETGYFSALPSLEEYWQQTCLELERYLQSEPCYVSASEIKFDSQEDLWTKIILAREKKEESELKISSSPQEDTLISPTLSYNLETNSLNSDVSSESSDSSEELSPTTKFTSDPIGEVLVNSGNLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWNCVPGELHSPGKIRSGTVGKPGDKGSGDTSPDGRRRVHRCHFNGCRKVYTKSSHLKAHL	108342	114784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9112_pilon_+_108743_111553_112113_113620_113750_114251
933622	contig_3747_pilon	+	2391	8	Intergenic	novelGene_24793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	4032.45291228502	3	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	366	1101	330	1430	201313	204227	FALSE	55	AAATTTTAAATGACAAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSHVQQS	200983	205188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203592_204207
933623	contig_3956_pilon	+	2221	8	Intergenic	novelGene_15144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1366.90133707818	1	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	526	1377	1287527	1289956	FALSE	60	ATCCAAAAAAATTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281618	1290800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1283793_1283976_1284054_1284253_1287447_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
933624	contig_7093_pilon	-	2092	1	Intergenic	novelGene_157971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	268	879	86374	85763	NA	40	ATGTTTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNRGIRIGGRLGNNLRYADDTTLLAENEKDLKHLLMKIKDHILQDGLHLNIKKTKILTTGPISNVKINGEKIEVVKDFILRGSTINTHGTAVKKSNDNCIGQIYCKRPLYTPALLARVKNTGNNKRWRGCQEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRQIRVVARIDICTPMFMVALFTIAK	86641	84549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_84500_86600
933625	contig_16496_pilon	+	1023	1	Intergenic	novelGene_5114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCAATAACAAAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	1023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_0_1000
933626	contig_16594_pilon	-	3276	10	Intergenic	novelGene_53840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	126	junction_6	2749.8538547025	1	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	325	1524	272836	121101	TRUE	25	CTTGTTAAAATGTAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	273160	116816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_134026_134081_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
933628	contig_8330_pilon	-	2033	12	Intergenic	novelGene_71805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCATGCGGGCAGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857794	837620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837684_852603_852682_853009_853124_853232_853347_853836_854058_854993_855089_855283_855348_855432_855536_856187_856269_856361_856558_856678_856755_856966
933629	contig_16883_pilon	+	930	1	Intergenic	novelGene_161717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGCCACATTTCATGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149536	150466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16883_pilon_+_149500_150500
933630	contig_15063_pilon	+	1434	4	Intergenic	novelGene_14195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	120	1292	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34688	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
933631	contig_5145_pilon	+	580	1	Intergenic	novelGene_131419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATACCAAAAAGAATTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	834847	835427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_+_834800_835400
933632	contig_15666_pilon	+	1634	1	Intergenic	novelGene_70132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACTTCTAATCCCCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106756	108390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_106800_108400
933633	contig_19628_pilon	-	1239	1	Intergenic	novelGene_166577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGGAGTCTCCTGCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26232	24993	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19628_pilon_-_25000_26200
933634	contig_16322_pilon	-	1419	6	Intergenic	novelGene_87502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	475	junction_5	373.95957000724	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	254	667	37060	32956	TRUE	20	GTTTCAATTTATTGTGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVISQRYPDIRIEGENYLPQPIYRHIASFLSVFKLVLIGLIIVGKDPFAFFGMQAPSIWQWGQENKVYACMMVFFLSNMIENQCMSTGAFEITLNDVPVWSKLESGHLPSMQQLVQILDNEMKLNVHMDSIPHHRS	57681	31692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537_34626_36310_36438_36986_37098_57465
933636	contig_10500_pilon	-	3049	5	Intergenic	novelGene_41279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	951.761918759098	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTTTTCATTAAAACCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1640215	1626863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1627538_1627631_1629334_1629424_1629573_1630546_1630728_1639871
933637	contig_10930_pilon	-	1752	4	Intergenic	novelGene_36985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2346.96584267148	6	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	9	737	280370	268388	FALSE	15	CTTACTGTGCTTCATTTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280378	267372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_278443_278637_279700_279832_280157
933638	contig_5649_pilon	+	2608	2	Intergenic	novelGene_82448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	105	488	1509546	1509929	TRUE	70	GGAAAAAAAAAAAACCCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWEKDSLFNKWCWQNWISICKKMKQDPYLSCIQKLLQNGSKN	1509441	1514308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_1511356_1513614
933639	contig_18162_pilon	-	2722	3	Intergenic	novelGene_122331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10813_16368
933640	contig_14441_pilon	-	987	5	Intergenic	novelGene_100615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	579	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	3	407	117794	116936	TRUE	10	TGAGAGCTGGGTGTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAKQAVFIGLVHGGSGLLGPPGVGGLGLACLGVCALGGYQHEWGREDCSSEHWLGVGGEGPVRHDEGPEAPGSPPGLLSGLLLLGHGHQHEGADQHGVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	117796	111214	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_111386_111987_112038_116576_116961_117218_117343_117538
933641	contig_12677_pilon	+	1450	1	Intergenic	novelGene_110714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACGGCAGCTTCACATGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_0_1500
933644	contig_10437_pilon	+	1414	7	Intergenic	novelGene_38280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1243.99513218054	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	187	900	439767	451175	FALSE	25	ATCTGTCTTCAAATTTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLLKVNVTQVSLLLLEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGNHCGIASFPSYPEI	431081	451689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447025_451126
933645	contig_13888_pilon	-	2755	3	Intergenic	novelGene_151800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTGGGAATTTGAATGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	482091	338484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_-_339355_342667_344285_481823
933646	contig_5389_pilon	+	1002	1	Intergenic	novelGene_143018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCGGAATCAGTTGACAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401187	402189	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5389_pilon_+_401200_402200
933647	contig_12923_pilon	-	3365	16	Intergenic	novelGene_30076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_13	309.466781559651	1	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	822	2273	68226	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	101239	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69662_69784_73224_73314_75647_75908_77618_77720_93602_93733_101173
933648	contig_10930_pilon	+	2002	6	Intergenic	novelGene_36995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	107	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	1361	1900	276899	280292	FALSE	40	GAAATCGTAAGTTACATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEYIKAGENAKSPKRSVESHQLRLFRDIKLRLRFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALLSCLCNRFLQNIYILVHQEQGIFLRNGCFCFVWQYDSMFIHCS	267398	280394	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268467_274204_274328_276729_277001_278464_278637_279700_279834_280159
933649	contig_19402_pilon	-	3832	18	Intergenic	novelGene_80790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	27	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTGCATGTTTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146715	29471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_29514_36969_37072_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79242_81357_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796_144221_144356_145617_146267
933650	contig_8377_pilon	+	2167	19	Intergenic	novelGene_34991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	3613.94231064794	1	110	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	142	1098	68257	161274	TRUE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTGVITTQMPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSVTASVWDQMKPNIL	68115	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_131430_131572_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161230_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176705_177245_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
933651	contig_5183_pilon	+	1730	1	Intergenic	novelGene_179230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	239	580	392229	392570	NA	25	TTGCCCATTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQSLASKEQSGCTSSKTDLFVLLAVCGIFSILQQYLNSKASILPESSLFIVQLSHAYEAMENIMAWVRHTLVLKVTSLLFEHLKEVFCRFAQCSASFDFLTAASLGVDYEFK	391990	393720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5183_pilon_+_392000_393700
933652	contig_854_pilon	+	2072	6	Intergenic	novelGene_36719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3493.85414692714	1	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	119	682	1710020	1714980	FALSE	40	CCACTGAGCGTCACAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGSSGQWPKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1709631	1716370	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1709722_1709991_1710047_1712326_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714886
933653	contig_19604_pilon	-	3459	12	Intergenic	novelGene_77234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	44.2371520312363	30	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	2654	3169	257693	255934	FALSE	10	ACGTGTTATCTCGGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGLTVGDVDIFEINEAFASQAVYCVEKLRIPPERVNPLGGAVALGHPLGCTGTRQVVTLLNELKRRGKRAYGVVSMCIGTGMGAAAVFEYPGK	267736	255643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257036_257273_257454_257635_257827_258469_259674_259778_260664_261807_261962_263725_263769_264035_264116_266317_266376_267640
933654	contig_6296_pilon	-	3043	3	Intergenic	novelGene_168793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACACCTGCAGCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273979	270335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_-_270685_271006_271595_271873
933655	contig_3956_pilon	+	2365	12	Intergenic	novelGene_14928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1310.46038847119	1	56	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	474	1422	943	2364	1286220	1290796	FALSE	65	AACATCCAAAAAAATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKL	1281601	1290797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284870_1286154_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289665_1290466
933656	contig_16098_pilon	+	891	1	Intergenic	novelGene_46238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGGAATCTTTATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	767225	768116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_767200_768100
933657	contig_3832_pilon	+	4232	3	Intergenic	novelGene_161456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	173	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	876	1265	346235	346624	TRUE	65	AAAAAAAAGAGGAAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKDLQLENLKGRTHSAFLKLKELKKKFKSRVAILKDSIGKKLNDTGSIKRRRQEYKESMYQKELVDVQPFQEIVCDQELMILKEEVQAALTALAGKKRHQELMEYQLRCFNKQMQLWKCSLVYVKKFR	337966	486895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_+_338001_345393_346977_484280
933658	contig_10140_pilon	+	1222	1	Intergenic	novelGene_148432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGAAACGGTGTATCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	341986	343208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10140_pilon_+_342000_343200
933659	contig_15407_pilon	+	2509	10	Intergenic	novelGene_123076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	668.219192248239	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	297	1301	449761	470398	TRUE	30	TTGTGTAGTGACATTCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAAHFFEGTEKLLEVWFSRQQPDANQGSGDLRTIPRSEWDILLKDVQCSIISVTKTDKQEAYVLSESSMFVSKRRFILKTCGTTLLLKALVPLLKLARDYSGFDSIQSFFYSRKNFMKPSHQGYPHRNFQEEIEFLNAIFSNGAAYCMGRMNSDCWYLYTLDFPESRVINQPDQTLEILMSELDPAVMDQFYMKDGVTAKDVTRESGICDLIPGSVIDATLFNPCGYSMNGMKSDGTYWTIHITPEPEFSYVSFETNLSQTSYDDLIRRVVEVFKPGKFVTTLFVNQSSKCRTVLSSPQKIEGFKRLDCQSAMFSDYNFVFTSFAKKQQQQQS	449464	472474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_449871_463735_463823_464983_465111_465966_466070_467558_467602_467704_467850_467976_468070_468151_468308_470257_470686_471553
933660	contig_16775_pilon	+	2195	16	Intergenic	novelGene_107765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	296.79979035632	4	49	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	292	1587	134135	174136	FALSE	25	CATTTGATTATACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKDVKFPLMLDVYELCTPELQEKMVSFRSKFKDLEDKKVNQQPKISDKKSSPQKEVKYEPFSFADDEWIKFDDDKVSIVTPEDILRLSGGGDWHIAYVLLYGPRRVEIMEEETEQ	130361	174744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_133849_133936_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145066_152199_152256_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165276_168016_168146_172805_172867_173984
933662	contig_3747_pilon	+	2171	6	Intergenic	novelGene_24939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	54	794	202422	203804	FALSE	60	AATAAATAAATTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202368	205181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933663	contig_7893_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_177699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACTTAAAGCACAACAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10259	11468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7893_pilon_+_10300_11500
933664	contig_18162_pilon	-	2721	3	Intergenic	novelGene_122332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16365
933665	contig_6576_pilon	+	1651	1	Intergenic	novelGene_42440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	217	489	1302302	1302574	NA	80	AAAAAAAAGGAAAAAATAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1302085	1303736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1302100_1303700
933667	contig_6102_pilon	+	2746	23	Intergenic	novelGene_31908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_22	396.002473070164	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	67	1482	375264	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	374910	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394592_394739
933668	contig_5236_pilon	+	1925	15	Intergenic	novelGene_100890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	132.002396391358	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	535	1608	76	1683	62791	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEPSGFLRNVGQLFECHLLPPTDVRMTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYCLLLLPCFIVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60650	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69775_74031_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
933669	contig_383_pilon	+	2681	1	Intergenic	novelGene_126125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTCATCTTCTGAGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139351	142032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_383_pilon_+_139400_142000
933670	contig_7286_pilon	-	852	6	Intergenic	novelGene_108705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6432	junction_2	3662.83472736622	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	53	790	292049	286948	FALSE	15	GATTAATTGCCTTGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGPKKHLKRVAAPKHWMLDKLTGVFAPRPSTGPHKLRECLPLIIFLRNRLKYALTGDEVKKICMQRFIKIDGKVRTDITYPAGFMDVISIDKTGENFRLIYDTKGRFAVHRITPEEAKYKLCKVRKIFVGTKGIPHLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTIQIDLETGKITDFIKFDTGNLCMVTGGANLGRIGVITNRERHPGSFDVVHVKDANGNSFATRLSNIFVIGKGNKPWISLPRGKGIRLTIAEERDKRLAAKQSSG	292101	286885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7286_pilon_-_287050_288348_288507_289249_289422_290758_290857_291315_291497_292022
933671	contig_19604_pilon	-	5143	7	Intergenic	novelGene_77232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_6	44.7648175344085	35	131	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	4338	4853	257693	255934	FALSE	10	ACGTGTTATCTCGGTGGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGLAKLKPAFKEGGSTTAGNSSQVSDGAAAVLLARRSKAEELGLPILGVLRSYAVVGVPPDIMGIGPAYAIPVALQKAGLTVGDVDIFEINEAFASQAVYCVEKLRIPPERVNPLGGAVALGHPLGCTGTRQVVTLLNELKRRGKRAYGVVSMCIGTGMGAAAVFEYPGK	262778	255643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_256010_256724_256871_256979_257036_257273_257454_257635_257827_258469_259674_259778
933672	contig_15327_pilon	-	1023	4	Intergenic	novelGene_70668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2497.06601167584	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAAAGAAAAAAAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	902159	900434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901241_901348_901536_902035
933673	contig_8045_pilon	+	1913	9	Intergenic	novelGene_35444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	130.969223483993	1	105	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	186	818	452026	457287	TRUE	50	GTTACTTTACAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEESINQMQPLNEKQIANSEDGYVWQVTDMNRLHRFLCFGSEGGTYYIKEQKLGLENAEALIRLIEDGRGCEVIQEIKLFSQEGRTAKQEPMLFALAICSQCSDISTKQAAFKAVSEVCRIPTHLFTFIQFKKDLKESMKCGMWGRALRKAVADWYNEKGGMALALAVTKYKQRNGWSHKDLLRLSHLKPSSEGTCHCDQIYYKGLERGP	434952	462494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8045_pilon_+_435117_452004_452606_457234_457457_458269_458417_458681_458820_459450_459568_460378_460493_460736_460877_462224
933674	contig_7869_pilon	+	1486	1	Intergenic	novelGene_150001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTGAGGAACCAGACTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100322	101808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7869_pilon_+_100300_101800
933675	contig_9696_pilon	+	6602	7	Intergenic	novelGene_68750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	131	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	3201	3563	39618	39980	TRUE	40	AAAATAAGACTTATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKLKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQNPIDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFNKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKDK	33681	275461	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_+_33825_33884_35158_37833_40470_96369_96531_272645_274548_274774_274943_275142
933676	contig_4812_pilon	-	853	3	Intergenic	novelGene_103721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_1	942	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCACAATTTATTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952245	944834	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944939_946403_946960_952052
933678	contig_13481_pilon	-	775	1	Intergenic	novelGene_119491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTATTCCGACTCATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1335445	1334670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_-_1334700_1335400
933679	SIRV7	+	1054	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	33	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGTTCTCTCTTCCGCGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1029	114917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1843_114676
933681	contig_12547_pilon	+	1815	3	Intergenic	novelGene_179023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTCTAACTCACAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4557	9740	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12547_pilon_+_4869_5407_6081_8909
933682	contig_1450_pilon	+	844	1	Intergenic	novelGene_27391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTCTTCCACCGTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	299078	299922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_299100_299900
933683	contig_1719_pilon	+	1783	1	Intergenic	novelGene_87376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTGTAAACACTCATTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	790009	791792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1719_pilon_+_790000_791800
933684	contig_6445_pilon	-	1435	14	Intergenic	novelGene_76899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	43	junction_2	683.134742875135	2	57	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	123	1097	88578	44574	TRUE	15	ACATTAGCCTTTTGTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTA	90100	42873	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_89993
933685	contig_13863_pilon	+	2108	21	Intergenic	novelGene_41988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	463.004630106439	1	85	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	536	1611	261	1871	55383	77619	TRUE	45	TGAAAACCATAGTAAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFCKALILLRNKNLINPSSLLELFFELLRCHDKLLRKTLYTHIVTDVKNINAKHKNNKVNIVLQNFMYTMLRDSNATAAKISLDVMTELYRRNIWNDAKTVNVITTACFSKVTKILVAALTFFLGKDEEEKQDSDSESEDEGPTARDLLVQYATGKKSSKHKKKLEKAMKVLRKHKKKKKPEVFNFSAIHLIHDPQDFAEKLLKQLESSKERFEVKMMLMNLISRLVGIHELFLFNFYPFVQRFLQPHQREVTKILLFAAQASHHLVPPEIIQSLLVTVANNFVTDKNSGEVMTVGINAIKEITARCPLAMTEELLQDLAQYKTHKDKNVMMSAKTLIQLFRTLNPQMLHKKFRGKPTEASLEARVQEYGELDAKDYIPGAEVLEAEKEEENAENDEDGWESASLSEEEDADGEWVDVHHSSDEEQQEISKKLNSMPVEERKAKAAAISTSRVLTQEDFQKIRMAQLRKELSAAPGKAEKRKYIEIDSDEEPRGELLSLRDIEHLHKKPKSDKETRPKRICEEENQNESIFKFHK	55034	81642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_55191_55278_55386_58894_59006_60736_60809_60881_60983_61931_61990_62762_62838_63955_64058_64641_64712_65653_65758_67540_67599_68692_68752_69379_69457_70274_70373_70469_70547_73189_73320_74718_74814_75878_76070_76176_76246_77558_77708_81493
933686	contig_13854_pilon	-	1925	1	Intergenic	novelGene_154125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATGTGTTAGTTTTGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381127	379202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13854_pilon_-_379200_381100
933687	contig_5988_pilon	-	1973	9	Intergenic	novelGene_15847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	184.512702814738	1	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	463	1356	255359	242253	FALSE	50	ATGTAAAATAATCATCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREKLIRLQSLYIDQFKRLQHLLKEKKRRYLHNRKVEHEALGSSLLTGPEGLLAKERENLKRLKCLRRYRQRYGVEALLHRQLKERRMLATDGAAQQAHTTRSSQRCLAFVDDVRCSNQSLPMTRHCLTHICQDTNQVLFKCCQGSEEVPCNKAVPVSLSEDPCCPLHFQLPPQMYKPEQVLSVPDDLEAGPMDLYLSAAELQPTESLPLEFSDDLDVVGDGMQCPPSPLLFDPSLTLEDHSIKEIAEGPVDILGQIQMNVDGCRSQGSRNSEKASAPLPQSGVATANGEAEPTSIS	260583	241635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_242385_243168_243289_249401_249656_253927_254025_254689_254857_255235_255400_258790_258940_259719_259979_260569
933688	contig_9593_pilon	-	984	1	Intergenic	novelGene_59711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTCACCCAGTTCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346763	345779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9593_pilon_-_345800_346800
933689	contig_7151_pilon	+	1029	6	Intergenic	novelGene_40787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	266	607	529141	535531	TRUE	35	TCATAGTCATAAATCCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSSFLSPSQGPLQRFLVECRCRFLTNPICLKLTRNIIPAPFIFFINNDSTAFFLMVVGFTFMPDHVWVKWRPVQPLPLPFTVLICKSQEIGKLGIQKLNNKVLLLSLCADGD	528875	551101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_529334_530062_530181_535500_535652_536387_536493_549636_549731_550998
933690	contig_19812_pilon	-	2038	19	Intergenic	novelGene_100995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	102.385512695286	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	335	1008	921	1928	31778	15879	FALSE	30	AGCCTATTAAAGTGTCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMELHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	48274	15768	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22805_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33099_35124_35255_38513_38611_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710_46843_48235
933691	contig_4091_pilon	-	4074	3	Intergenic	novelGene_172997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	4	402	156786	155854	TRUE	15	CCTCTGGCACCTGGTGGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMEKLIINFIWKEKKPRISKVLLKKKKKVGELPLPDVRTYYTAAAWYWYNVRYSEQWNRIENPDVNPSTYHHLIFNNGPKSIIWETESLFNKWCWQNWMSVCKKISRTHTSHHIQKPIQNGSELLCTAGGNSK	156789	10691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_-_13961_155450_155890_156423
933692	contig_1516_pilon	+	1072	3	Intergenic	novelGene_50021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	924	junction_1	151	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	38	117	313	429	362289	363092	FALSE	5	TGTTTCCTCTCTTCTACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YHLQLFEELRRLAPITSDPTEAAAVGAVEASFKCCSGAIIVLTKSGRSAHQVARYRPRAPIIAVTRNHQTARQAHLYRGIFPVLCKDPVQEAWAEDVDLRVNLGMNVGKARGFFKTGDVVIVLTGWRPGSGFTNTMRVVPVP	359984	363735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1516_pilon_+_360125_362116_362299_362985
933693	contig_3956_pilon	+	1221	6	Intergenic	novelGene_15282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1146.71984372819	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	317	1063	1289515	1290847	FALSE	15	GGTGACTGTGTGGAGCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1288886	1291005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1289020_1289066_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290414_1290511
933694	contig_177_pilon	+	2035	2	Intergenic	novelGene_41829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	890	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	70	1146	417672	418748	FALSE	40	AGGTGGATGGAACCAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVTEILGFLHSCLNPIIYAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415661	419637	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647
933695	contig_9363_pilon	-	1064	7	Intergenic	novelGene_6595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	626.737961369999	11	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	59	796	777582	754067	FALSE	40	AGAAGTGCAAGAGTATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLFSLMQYSEKFWTHFTFKDFEKNPNPRSLVTPIRQLSGRTHTATGIRKAVRELFHSSNGAREDARKILVVITDGEKYGDPLGYEDVIPEADREGVVRYVIGVGDAFSSEKNREELRTIASKPSSEHVFQVNNFEALKTIQNQLKEKIFAIEGTQTGSTSSFEYEMSQEGFSAAITSNGPLLGAVGSFDWAGGAFLRTSKDKATFISTTRVDSDMNDAYLGKEAQQILS	777640	753798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754092_773606_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777124_777528
933696	contig_10838_pilon	+	1839	2	Intergenic	novelGene_129173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACAAAGGAAAGAAATGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114187	116085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10838_pilon_+_114296_114354
933697	scaffold_880_pilon	+	2526	2	Intergenic	novelGene_121410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	366	767	335699	336100	TRUE	70	AATAATAAACATGTAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLRLHVRTPPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMSGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLLIHVRTPPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMSGLGPS	335333	337962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_336684_336786
933698	contig_2100_pilon	-	1415	10	Intergenic	novelGene_50679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	979.476781466564	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	84	869	1182812	1175444	TRUE	5	GAGTGCTCTCTCTGCGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGTGSVWSPEVLPAHSTVTTLSRWILSTHCFGDNGLSNFF	1185494	1169918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170195_1173275_1173374_1174204_1174370_1175436_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
933700	contig_3956_pilon	+	2588	12	Intergenic	novelGene_15101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	994.598145521285	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	688	2064	1286460	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281604	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284173_1286181_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933701	contig_500_pilon	+	1231	11	Intergenic	novelGene_30996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1147.32545077672	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	1492663	1497925	TRUE	15	ATTGCGGGCATGTTTGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGSARRLPRVRRRGARRRSAMAYHSFLVEPISCHAWNKDRSQIAICPNNHEVHIYEKSGAKWVKVHELKEHNGQVTGIDWAPESNRIVTCGTDRNAYVWTLKGHVWKPTLVILRINRAARCVRWAPQENKFAVGSGSRVISICYFEQENDWWVCKHIKKPIRSTVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFKCRIFSAYIKEVEERPAPTPWGSKMPFGELMFESSTSCAWPMLRRRWLSRPWPLKHCRCWPLPSSQKIVWWQRATTAFRCCSPTTAPRGR	1485750	1499579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_500_pilon_+_1485804_1492652_1492727_1493615_1493721_1494244_1494468_1495353_1495462_1496522_1496627_1496699_1496730_1496821_1496898_1497870_1498078_1498882_1498934_1499379
933702	contig_8681_pilon	-	1297	1	Intergenic	novelGene_157203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	85	465	155037	154657	NA	50	GAAAATACTAAACGACCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRNSKHPLIIGMWNVQSMNLGKLEIIKNEMESINTTILGISELNWTGIGHYESDNLMVYYAENDSLRSGVAFVVKKNISRSTLKYHAVIDRIISIRVQGRPVNTTVIQIYLPTTKAKDEEIEDFY	155121	153824	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8681_pilon_-_153800_155100
933703	contig_3956_pilon	+	2186	10	Intergenic	novelGene_15112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1506.42948805085	2	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	76	834	1281682	1288038	TRUE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARK	1281606	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284829_1288035_1288081_1288943_1289223_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933704	contig_3095_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_75035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933705	contig_18272_pilon	+	1984	1	Intergenic	novelGene_7094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	89	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGATGTGGGTTTGGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539853	541837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18272_pilon_+_539900_541800
933706	contig_9706_pilon	+	537	1	Intergenic	novelGene_20885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGATTTAGGTTAGCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3455	3992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_3500_4000
933707	contig_7840_pilon	-	2673	11	Intergenic	novelGene_68989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGCCCAAGATCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	305344	230851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_230931_237998_238138_263073_263149_292100_292173_295137_295281_298001_298207_299238_299530_301105_301259_303005_303153_303411_303496_304059
933708	contig_2646_pilon	-	1785	10	Intergenic	novelGene_69657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	330.29530371218	1	100	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	103	720	2178886	2174850	TRUE	20	TTGTTGGCTAAACGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHADKRRAVPDHQPGDGADRLAAGGHQVSPERALPGCAGECEPAHVPAGAGAERPRVRPGGDEELPERHARVQIWDERQDCHREAGQGHG	2178988	2171578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2646_pilon_-_2172191_2172825_2172938_2173785_2173884_2173984_2174123_2174255_2174346_2174834_2174977_2175069_2175213_2175957_2176041_2176757_2177013_2178876
933709	contig_16516_pilon	-	1688	1	Intergenic	novelGene_173246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	82	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	81	386	1610	1305	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPDALLKSSISSSSFLVDSLGFSVYKIISSENRDTLTSSLSIWMPLISFSSLSALARASSTMLNKSGYKRHPCLVPVLKGNIFKLCPFRMMLAVGFV	1690	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16516_pilon_-_0_1700
933711	contig_2637_pilon	+	1649	1	Intergenic	novelGene_100017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTATGAGTCAGAGCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2692	4341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2637_pilon_+_2700_4300
933712	contig_9053_pilon	-	1040	1	Intergenic	novelGene_87954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	81	246	59	304	304595	304350	NA	50	GAGGAAAAACATAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRFSGIEDKHLDTTLFQENLEKRTKKNEETLRVMWDTFKSKNLQVIGIPERGRKQKTQRGSLKNC	304653	303613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9053_pilon_-_303600_304700
933714	contig_6365_pilon	-	1355	1	Intergenic	novelGene_134019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGTATCTGTTAGAGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	187903	186548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_-_186500_187900
933715	contig_7207_pilon	-	1564	8	Intergenic	novelGene_72087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	196.856728177046	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2	382	758050	737526	TRUE	35	ATGAATTTCTTTTATAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFAAASSQCSVSSEPRLVDAEPFSSAAASSSRCTAPPRGAPSPAIRLRSRVGPSPYSLCLPLPLTVPRPSCSLPFIFPSENGSCCRARQGCVICISKIVNDSSCNPDATFFIQYNFLDYLLSVQID	758051	675715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_675844_675937_676193_686423_686622_695223_695326_696315_696746_737456_737530_737916_738031_757787
933716	contig_7428_pilon	-	2225	1	Intergenic	novelGene_77700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	50	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAATTAAAAAAATGAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260008	257783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7428_pilon_-_257800_260000
933717	contig_10217_pilon	+	1475	10	Intergenic	novelGene_87411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAGAAATAACAAAATCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	109063	130288	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_+_109474_110875_111019_112195_112292_113001_113148_113986_114103_114739_114808_116139_116314_117214_117255_128886_128996_130115
933718	contig_5125_pilon	-	2701	7	Intergenic	novelGene_43435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAGGAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59959	26040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26496_35607_35766_49979_50109_53630_53706_53840_53984_54293_54522_58446
933719	contig_8386_pilon	-	2071	7	Intergenic	novelGene_82216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	26	junction_2	135.345237571676	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	562	1032	21302	18699	FALSE	25	TTGGTAGTCTTTGAATACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRQTFSPFGQIMEIRVFPDKGYSFVRFNSHESAAHAIVSVNGTTIESHVVKCYWGKETLDMINPVQQNQIGYPQAYGQWGQWYGNAQQIGQYMPNGWQVPAYGMYGQAWNQQGFNQTQSTAPWMGPNYGVQPPQGQNGSMLPNQPAGYRVAGYETQ	31559	17659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8386_pilon_-_18826_19753_19897_20735_20860_21225_21311_21431_21528_21779_22024_31346
933720	contig_2100_pilon	-	1242	10	Intergenic	novelGene_50732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1034.37203470165	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	408	836	1176402	1171931	TRUE	20	ATAAGAGTGCTCTCTCTGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFWACPLLSARLELLRRGCPCTVTLLTDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILR	1185493	1169922	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170325_1171926_1171994_1172341_1172451_1173171_1173345_1176318_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
933721	contig_4230_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_179231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAGAGGAAAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35167	34341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4230_pilon_-_34300_35200
933722	contig_7396_pilon	-	2943	5	Intergenic	novelGene_79535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3469	junction_2	641.4859702285	12	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	15	329	248890	248155	TRUE	20	TTTATGTATTGTGTGAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYRVLACIPVI	248904	245101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_247357_247718_247802_247878_248278_248552_248608_248753
933723	contig_3747_pilon	+	2839	8	Intergenic	novelGene_24839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3884.58017062859	5	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	772	1437	202676	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200984	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202372_202617_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933724	contig_18544_pilon	+	872	6	Intergenic	novelGene_152746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCTAAAGAAAAGACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	38093	53277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_38279_38472_38661_40228_40322_47684_47852_49124_49315_53228
933725	contig_15449_pilon	+	676	3	Intergenic	novelGene_33616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_2	221.5	1	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGGTTGCATTTCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51285	55080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_51330_51809_51932_54570
933726	contig_6445_pilon	-	1266	12	Intergenic	novelGene_76929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	837.801895753958	1	57	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	59	1039	88578	43105	FALSE	25	AGATACATTAGCCTTTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKCSNTESPSRSPPRTRGAWTRTLCTSAFVRTKRLQISTQRPRTQPKPPTALTSLRSSSRVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_55485_55613_64139_64205_64855_64941_68010_68107_73979_74056_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88604_96306
933727	contig_15666_pilon	-	2084	7	Intergenic	novelGene_70160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	672.97622543445	2	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	165	836	110619	108819	TRUE	25	CTATGCAGGGGAGGGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQARSLGVQRYYS	110783	106875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_106906_107090_107976_108103_108198_108579_108854_109098_109378_109948_110246_110558
933728	contig_10323_pilon	+	565	1	Intergenic	novelGene_123611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACCTGGCATATTCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	460190	460755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_460200_460800
933729	contig_7056_pilon	+	2012	8	Intergenic	novelGene_43705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	73	junction_1	177.290261251694	1	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	222	1292	928641	937151	FALSE	35	GATCAGTCTGTAATTAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GKEDAAREIRRFSFCFSPEAEAEAEAATGPGPCERLLSRVASLFPALRPGGFQAHYRDEDGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEKKECRRDHRPPCAQEVPRSMVHPNVICDGCNGPVVGTRYKCSVCPDYDLCAACEGKGLHREHSKLAFPSPFGHLSEGFSHSRWLRKLKHGHFGWPGWEMGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAESVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	926314	937871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_926489_928593_928690_929211_929442_929535_929678_930556_930638_935330_935546_935846_936043_936993
933730	contig_4924_pilon	+	2084	10	Intergenic	novelGene_84673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	1219	1548	74758	127734	TRUE	20	GCAGAGTTAGTGCCGCACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPAVPFVKPVAPSPPFRAAILLMVPASALILFNPTVAPANPCRVPREVKEFMAAPAVELGVEAATGLVRAPRALLVVERGFALVVVAEVWAAAAAAASVARFYLPAIC	64693	252617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_+_65650_69047_69192_74639_74820_82345_82483_114578_114690_127714_127785_145994_146130_155810_155860_197778_197860_252396
933731	contig_5779_pilon	-	772	2	Intergenic	novelGene_106438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	165	497	94343	94011	TRUE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHLCIVPGFGSALAAATSAARLLCRRGLRQPSRQSPRTRAFFVIRCIGSPACPTMSDAAVDTSSEITTKDLKEKKEVVEEAENGRDAPANGNANEENGEQEADNEVDEEEEEGGEEEEEEEEGDGEEEDGDEDEEADAATGKRAAEDDEDDDVDTKKQKTDEDD	94507	93302	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_-_93546_93978
933732	contig_14925_pilon	-	1677	5	Intergenic	novelGene_55301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	6	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
933733	contig_10323_pilon	-	817	1	Intergenic	novelGene_123606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	268	804	13	816	460768	459965	NA	35	TTCAGAACCCAGATTTAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPGDRTRASLEEPKHLSDLGSESPDPVVEQHHGSALDIKNEKEESAEKQENEKQEDFKTSLGEVSIQPCQESVPSHIPDVERASGTDTGGQCGSPTESVDEAGVAHVGEQVGLVASSPPECSEDPVNQDENHAVDVPEYPSTVCSLEKELANQEVAEPKEAPTQSAEVGREPSDEDNKTESMDEKPTEVQTIPCSPAAKSNHQPTGAGKVESESEPLDLKQTHEEKNSPQGETLDTSQKKTKTKKKKNRKKKLPVPVGTHKDVEEELA	460780	459963	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_-_460000_460800
933734	contig_17144_pilon	-	1346	8	Intergenic	novelGene_29515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2581.79338081584	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	361	1152	174965	166277	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLGLGCLQERVWSVS	179728	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166320_166534_166843_167248_167277_173614_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
933735	contig_6980_pilon	+	2097	9	Intergenic	novelGene_36014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	489	junction_4	551.877647219019	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	117	1010	356720	372790	FALSE	20	ATTTCAGACTGTTACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLYPSLEDLKVDKVIQAQAAFSANPANPAILSEASAPVSQDGNLYPKLYPELSQYMGLSLNEEEICANMAIVPGAPVQGLVARPSSMNYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGVFVQLVQANSPSSLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEVNGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPGFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTVPEV	346066	373877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6980_pilon_+_346168_356704_356771_361146_361226_362331_362442_364872_365032_368206_368383_370468_370641_371430_371523_372735
933738	contig_10958_pilon	+	1895	5	Intergenic	novelGene_5446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4731.09678087439	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATTAAACTTTTATGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888238	901557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889017_893878_893894_895279_895855_900457
933739	contig_6985_pilon	+	995	1	Intergenic	novelGene_179232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTTCACTCTCCAAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	47197	48192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6985_pilon_+_47200_48200
933740	contig_5586_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_143508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	49	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	120	363	141	503	233361	233723	NA	10	TTTTCCTTTTGTCTTTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSRDWSLLRICPKYMRQSLAILASKEHSGCISSKTDVFVLLAVLGIFSILHQHPNIKVSVLLWSSLFTVQLLRAYEAIENKMAWVRRVLVLKVTSLLFKTLKRSFVADLPNAICHLIS	233220	234383	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_+_233200_234400
933741	scaffold_12124_pilon	-	1943	7	Intergenic	novelGene_22309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	339	1604	1942	1506651	1473604	FALSE	10	GCCCCGCGCCGCGGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTSPCSPIFFEAELLFLVCDEAGDGPSHSNHYSPYDPRDDPGGFSLLVAVISGAPPRHLRPAEGQGLTGGARLVRVWIRLRFRWIRLCWLICPVHHQGHLLNSGHLLEKEMV	1509577	1473602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473610_1490351_1490408_1491904_1492001_1496344_1496387_1497005_1497122_1506628_1506684_1508006
933742	contig_8412_pilon	+	2005	5	Intergenic	novelGene_118386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	41.5293570862829	2	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	323	832	689323	692711	FALSE	70	AAATGAAATTTAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGVQTALRNEDYEQAAAHIHRYLCLDKSVIELSRQGKEGSMIDANLKLLQEAEQRLKAIVTEKFAIATKEGDLPQVERFFKIFPLLGLHEEGLSKFSEYLCKQMASKAEENLLLVLGTDMSDRRAAVIFADTLTLLFEGEPFLHSQISDSCILAFILSPYYDPFNSIL	684906	693884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8412_pilon_+_685089_686711_686795_689265_689441_690471_690666_692513
933743	contig_10930_pilon	-	1837	6	Intergenic	novelGene_37014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	3	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	16	978	279066	268388	FALSE	30	CACTATTGAACCATTTATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSQERFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSHVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279081	267528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_276832_278535_278637_279049
933744	contig_6387_pilon	+	619	1	Intergenic	novelGene_165423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTAGAAGGAGGAAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16447	17066	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6387_pilon_+_16400_17100
933745	contig_14030_pilon	+	2147	1	Intergenic	novelGene_62243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCAGCTCACAGGCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361143	363290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14030_pilon_+_361100_363300
933746	contig_12503_pilon	-	2769	1	Intergenic	novelGene_143814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTTTGTGTCAGTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68315	65546	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12503_pilon_-_65500_68300
933747	contig_8317_pilon	-	642	1	Intergenic	novelGene_19994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	15	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTCTCATATCTCGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17054	16412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8317_pilon_-_16400_17100
933748	contig_10930_pilon	-	2197	6	Intergenic	novelGene_37005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	37	junction_3	1842.38981760104	5	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	128	634	280211	274196	TRUE	40	TAAGACTACTTTGTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKGVASMHHTLPKCIIMIWKQHLESFFFQRWIHTLASLLPTQQP	280338	267432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_278443_278637_279700_279832_280157
933749	contig_3747_pilon	+	2809	8	Intergenic	novelGene_24869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4900.46630017835	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	700	1407	202422	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201043	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202314_202425_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933750	contig_6375_pilon	+	2044	10	Intergenic	novelGene_72962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1426	1782	207723	229033	TRUE	25	TATCTCAGCTCCAACACTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKRHADSSQKADGSIGGHAAGEERLHHVVGKGDGNDGLASGLDDEEGGPESYEGKESPEGLEDVGIAGPRFLNGGAQFCITKGPKDREEAPNSPDDQGEAKGGTIHEHAFGGDEDA	202333	241011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6375_pilon_+_202855_203069_203259_203493_203640_204434_204526_204778_204874_205067_205194_206629_206776_207611_207739_228692_229237_240952
933751	contig_854_pilon	+	1400	3	Intergenic	novelGene_36730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	764.5	3	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	78	338	1713444	1715343	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEVQGPGLGKSDQRALQPFLAKKHKMASQGGQAPGDGPECFL	1713366	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713482_1714862_1714962_1715219
933752	contig_17531_pilon	-	1440	2	Intergenic	novelGene_179233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	393	1088	52134	50465	FALSE	35	TCTCGGATTCACAATAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERRKTEGGRERKEKNEQIKIRKIKELPSSQGSHRCSYEVWGSRSQFSQHSLVRRRRGIQCLVFRNQKEKEETETRIQKKQKKNKGKKKKKATPAAHKRHPRSRPPGRAESKQPAALGPEPAALGSRGANEQRPQSLARAADQTRKEPHTRTQPHSPTGKGKDGAQSQAPEQKEGEAARGKRETKRSRKSNTSSQQMAPREPPARAHGIQATSAPQPRDLGHGKQGSPSRG	52526	50112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17531_pilon_-_50938_51911
933753	contig_3602_pilon	-	2287	1	Intergenic	novelGene_60620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGCCACTCCACAGGCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	914904	912617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_-_912600_914900
933754	contig_9313_pilon	-	2482	1	Intergenic	novelGene_86483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	192	579	1603	2181	426838	426260	NA	10	TTCTCGGCCACTGTGTGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLILRIIQELKQKADKNEEKIDKFMENIDKKLEEFRKIMQEQNAKINSPLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDKISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKTEDTLRVMWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHREDH	428440	425958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_-_426000_428400
933755	contig_4812_pilon	-	983	4	Intergenic	novelGene_103719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	970.674107114341	1	54	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGAGAAAATTTCTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	952237	944293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_944451_944834_944933_946416_946960_952052
933756	contig_7056_pilon	+	1655	7	Intergenic	novelGene_43709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	250.626160291024	2	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	325	1044	929602	937151	FALSE	15	GAGTACTGCCTCCTTGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPPGNWSPRPPRAGDARTGPSAVSGPSEDPSVNFLKNVGESVAAALSPLGIEVDIDVEHGGKRSRLTSASPNSSSTEEKCNSQPNSCSSEPSKPEGNAEHTAQSLVEQMKKITLEPMGQPEEQMESDNCSGGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQMPESEGPSSLDPSHDGPTGLKEAALYPHLPPEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKHPPPL	928630	937762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_928690_929211_929411_929535_929672_930556_930638_935330_935546_935846_936043_936993
933757	contig_3747_pilon	+	2281	6	Intergenic	novelGene_24840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4513.6517544002	2	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	214	879	202676	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200984	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201159_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
933758	contig_2100_pilon	-	1555	12	Intergenic	novelGene_50759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1217.84641922799	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	528	857	1175737	1173349	TRUE	10	CTTCAGTGGTTTTGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLGIYRRPL	1185468	1169962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170333_1171934_1171984_1172341_1172444_1173171_1173374_1174233_1174403_1175601_1175782_1176301_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
933759	contig_3975_pilon	-	1874	12	Intergenic	novelGene_54849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	229.924888921262	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	358	1077	101	1177	2066301	2059870	TRUE	20	GAACGTTGTACATCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGIQPGRGPSFPLSGQHQKPLTMGRSPSNQMCGLSGSC	2079241	2056378	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060068_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
933760	contig_17427_pilon	-	2517	13	Intergenic	novelGene_30339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1227.23511228832	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	826	1422	179819	178046	FALSE	15	TGCTTCGTTGTTTACCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204706	176950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181442_182693_182800_184283_184368_184468_184574_186417_186496_188038_188140_188767_188890_204671
933761	contig_4429_pilon	+	3718	3	Intergenic	novelGene_50812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	1836	2186	179032	179382	TRUE	45	TAGTAAGAAGACCAGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEKLIINFIWKGKKPRTSKALLKQENKVGGLTLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIENPDVNPSTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWHNWLSICKRMKQDPYLTP	177196	268608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4429_pilon_+_179643_242378_242713_267670
933763	contig_4421_pilon	-	582	2	Intergenic	novelGene_177250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	18	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAGTAATCCACCACATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	358319	271901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4421_pilon_-_272079_357914
933764	contig_9653_pilon	-	782	6	Intergenic	novelGene_48306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2547	junction_4	513.215977927422	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	257	771	12	782	1015897	1006972	FALSE	55	AAAAAGAAGAAATTCCGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKYMAQRQQREKTRWLNSPNTYMRVNVPEESRNGETSPRTKITWMKAEDSCKVSGGTPIKIEDPNQFVPLNTNPNEVLEKRNKIREQNRYDLKTAGPQSQLLAGIVVDKPPSTMQFEEDDHAPPAPPNPFSHLTEGELEEYKKTIERKQQGLEDTEEELLSDDASSVSQIHSQTQSPQNVPEKLEENHELFSKSFISMEVPVMVVNGKDDMHDVEDELAKRVSRLTTSTTIENIEITIKSPEKIEEGLSPEGSPSKSPSK	1015908	1006971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007196_1007813_1007910_1009485_1009610_1013596_1013684_1014126_1014247_1015777
933765	contig_2125_pilon	+	2389	1	Intergenic	novelGene_147732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	90	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGAGCAGAATTAAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	629230	631619	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2125_pilon_+_629200_631600
933766	contig_3122_pilon	-	2225	13	Intergenic	novelGene_64388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	122.877620917001	1	136	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	648	1944	281	2224	277170	257999	FALSE	55	GGAAAAAGGAAGCAGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKLKLLENSLSRQQSFLRGEWLSSCTRMSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTTVETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKLAEMLDQRQTIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLGDLLTERKALVVPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEMESQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNSGDNLIVEEAVQELNSFLTQENMRLQELTDLLQEKHCTMSQEFSKLQSKVEMAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNRHLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLRSGSALLQSQSSTEDPKDEPAELKQDPEDLCTQSSVSKASQEEVNEIKSKRDEEERERERREKEREREKEREREKEKEREREKQKLKESEKERDSAKDKEKGKHDDG	277450	257997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3122_pilon_-_258329_258447_258570_258896_259033_260012_260193_261488_261609_261811_261890_262063_262211_265224_265344_269697_269881_270032_270181_270292_270461_276264_276420_277112
933767	contig_2933_pilon	-	1936	2	Intergenic	novelGene_111362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	45	junction_1	0	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	126	1385	850204	848945	FALSE	35	GGAGAAAGGGGGATGGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKARLFRLWLALGSVFMILLIIVYWDNVGTAHFYLHTSLSRPHLPDPLPTPGPEEGKDFMSDVDEFLDKLLSSGLKQNDPSRKKTEQPPLLASSKPALSNMEESVRGYDWSPHDTKQNPDQDRLQAERRRVLRDFCANSSFVFPTKERSFDDIPNYELNHLIVDDRHGIIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSESLLDQGVPYREPLDIPREHVHNSSTHLTFNKFWRRYGKFSRHLMKIKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELENEEFYQKFAIPMLKMYSNLTSLPTSVSEAFSAGLKVSFTNFIQYLLDPHTERLAPFNEHWRQVYRLCHPCQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLRLLKVDQLLHFPPSYRNRTASSWEEDWFARIPLAWRQQLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD	874202	848393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_850290_874162
933768	contig_2036_pilon	-	979	5	Intergenic	novelGene_131835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	263.271722750469	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	112	441	661441	647908	TRUE	30	CCTCTAGACAGTGAGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGAVSAGEDNDDLIDNLKEAQYIRTERVEQAFRAIDRGDYYLEGYRDNAYKDLAWKHGNIHLSAPCIYSEVMEALKLQPGLSFLNLGSGTGYLSTMVGLILVWNKSWD	661552	617043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2036_pilon_-_617228_631747_631855_636558_636731_647832_647931_661134
933769	contig_2730_pilon	+	1996	4	Intergenic	novelGene_135369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_3	173.013165844555	2	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	71	216	112	327	379372	390814	FALSE	75	AAAAAAAAAAAAAGATATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEKPLSSDQAPGTKPDLPVSLRLWGQKSVSENTASSPMASNNTASIAQARKLVEQLKMEANIDRIKVSKAAADLMAYCEAHAKEDPLLTPVPASENPFREKKFFCAIL	291701	392483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685
933770	contig_3095_pilon	+	1171	5	Intergenic	novelGene_75125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	36	761	147280	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147244	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
933771	contig_3956_pilon	+	2822	14	Intergenic	novelGene_14857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1643.30663548373	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	506	1375	1284132	1287503	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRRPRTPPTCPSWWRA	1281598	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282966_1283980_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286129_1286224_1286409_1286606_1287457_1287536_1287968_1288063_1288936_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933772	contig_11512_pilon	-	2575	5	Intergenic	novelGene_43284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	422.308832491105	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	28	621	396169	367967	FALSE	30	GGAACCCTTGGAACCTAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNSMKSTPAPPDKAEELLQLPDTKMGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	396196	366012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_368181_368470_368604_374526_374659_378194_378275_396134
933773	contig_16724_pilon	-	4405	1	Intergenic	novelGene_105282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	133	402	2871	3272	514785	514384	NA	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNSSTPHHRKPLPLLLLLPCTPSRLVTRRWHTEFDYCHCFFTSMKLSAPRNVDTEQKTQCPTVFLISRNKVTGRCPPPFLSSMSLKGASNFCSIQTLDAEDFGECSFSSFQPLLYRNTQKDIEVDIEQGSSP	517655	513250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16724_pilon_-_513200_517700
933774	contig_15304_pilon	-	1065	3	Intergenic	novelGene_30496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2800	junction_1	314.5	3	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	198	1022	54100	52925	FALSE	10	GCAGCCCTGCTTTTCCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPEAGTQSATISKNSGNSFPPQVHLLPPPAEELALNELVTLTCVVRGFSPQDVLVRWRHGAQQLPQNNYLTWPPRQEPGQEAVTFAVTSVLRVEAQTWKQGDNFSCLVGHEALPLDFTEKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEADGVCY	54297	52881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53320_53491_53813_53991
933776	contig_2069_pilon	+	2724	8	Intergenic	novelGene_23180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	225.024443116742	3	123	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	164	688	76142	89492	FALSE	25	CCCAGCTACCACCACTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAHIVPCTISQLLSATLVDEVFKIDNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDASSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIIPLEDMNEFTAHILEVVNAHMMLSKSNNQPSAGRALISNPGMGEAGSFGANSFIPVNGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFNDLQAQLHYMNTASIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE	69941	91528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_69949_75862_75950_76072_76187_80971_81047_81591_81709_87422_87531_87707_87803_89407
933777	contig_20279_pilon	-	1580	3	Intergenic	novelGene_179234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	100	801	116341	114392	FALSE	50	GGAAATAGTAAAGATCAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNIRVKFMVTTKKVNKPTHKNKDENHKVSAKTKPTKTKEMITKPTNKSNSAQESKKNKENFSTTKKALQNDSNKLTSINNYTECKWTQMHPQRDGEWREWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANHDQKEQEWQF	116440	113612	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20279_pilon_-_114708_114952_115072_116074
933778	contig_7207_pilon	-	1307	8	Intergenic	novelGene_72084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	234.108295191672	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	867	440	1306	696514	671690	FALSE	55	AGGAAGAGAAGAAAGATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGE	758397	671688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676181_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738031_758376
933779	contig_4232_pilon	-	551	1	Intergenic	novelGene_63420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGTAAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467600_468100
933780	contig_7119_pilon	+	2265	3	Intergenic	novelGene_40970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	460	2	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	963	1541	139647	140225	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	136988	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707_138967_139051
933781	contig_5649_pilon	+	1535	2	Intergenic	novelGene_82300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCATCCGTAACAGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160351	162299	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5649_pilon_+_160703_161115
933782	contig_14287_pilon	+	3572	1	Intergenic	novelGene_24060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATGAAAGTTAATACAAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27913	31485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14287_pilon_+_27900_31500
933783	contig_16211_pilon	-	2177	1	Intergenic	novelGene_150109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	141	423	1753	2175	241364	240942	NA	45	TGAACAATAGCATCAATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFGISEAERTEEKVQASGHNTEGFYGQNTEQCRKHQKKMEGIHSHCTKELVNVQPFQEVAYDQESLVLKQEVHAALKSLAENKASGDDGIQLRCFNKQIQHWKCSLIYAKTLGRQLSGQSTGRDPYLCPFQRKVIQQNVEI	243116	240939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16211_pilon_-_240900_243100
933784	contig_15063_pilon	+	2075	7	Intergenic	novelGene_12268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	178	junction_5	3709.97685302752	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	490	1473	348	1820	28164	39515	FALSE	15	TACTGCGTTCTTGTGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTEGEVNAEEEGFENLWAMASTFIVLFLLSLFYSTTVTLFKVK	27816	39770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266_36600_38975_39092_39506
933785	contig_11720_pilon	+	1106	10	Intergenic	novelGene_43841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	10	1071	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68054	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
933786	contig_3956_pilon	+	1550	9	Intergenic	novelGene_14945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1688.83665118181	2	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	443	1066	1284120	1290491	FALSE	40	GTGCCATTGGAATAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGQYTRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282751_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1290413
933787	contig_3956_pilon	+	2848	13	Intergenic	novelGene_15219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_6	794.901998676566	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	214	2325	1284120	1290491	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1283827	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933788	contig_7202_pilon	-	1077	3	Intergenic	novelGene_17542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	129550	junction_1	5137	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	46	318	29911	28475	TRUE	10	AGCTGTTGTCTTGGCGATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPRSRRHRLFSTAAMTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKVNE	29956	27623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_27951_28042_28634_29797
933790	contig_7051_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_64323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTAACTTCTTGTTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241237	240764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_240800_241200
933791	contig_9235_pilon	+	1685	3	Intergenic	novelGene_156212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	227	691	45805	47193	FALSE	25	TAGTATGGTTTTCAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLLEL	43974	48187	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_46255_47178
933792	contig_9484_pilon	+	3002	15	Intergenic	novelGene_105649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_8	434.049894855983	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	262	1344	126829	206935	TRUE	45	AATTGAAAACAATGTCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKERAAVEEKYGKDLLNLGRKRPCGQSEINTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSEPVWWVQEPPSCLDSEPRHVHSTADKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	126567	213163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_175467_175546_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198282_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513
933793	contig_6445_pilon	-	1474	14	Intergenic	novelGene_76891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	10	junction_9	616.918252426944	1	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	77	1240	88578	43105	FALSE	10	TTAGCCTTTTGTTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96367	42870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88594_96306
933794	contig_15153_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_166456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	166	501	934	1434	136576	136076	NA	25	ACTCCCTGAGGGACTGAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTNSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINTQTPEDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRAKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQAANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMR	137509	135389	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15153_pilon_-_135400_137500
933795	contig_12567_pilon	+	2241	2	Intergenic	novelGene_179235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCGCTCACCCCTGAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8609	11193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12567_pilon_+_9219_9561
933796	contig_3956_pilon	+	1911	9	Intergenic	novelGene_15175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1625.54405796183	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	478	1446	1284132	1290447	FALSE	45	GGACAGAAACTAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQSVCSTTGRSCPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1282696	1290912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283978_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1290347
933797	contig_11512_pilon	-	2178	9	Intergenic	novelGene_43369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1215.48616173735	3	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	138	812	609650	556329	FALSE	5	TGCAGTGGCCTGTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGETITGLLQEFDVQEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKVRLGAGQKSISEVLFLLTSGLLATVLPSLRDTKLPKTRNAAVNTS	622338	554962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556450_580051_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_608476_608513_609587_609669_622219
933798	contig_20527_pilon	-	2284	7	Intergenic	novelGene_138549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	223	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAGCGTAAACAGGAAAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37342	12755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_-_13604_24903_25022_25433_25613_26237_26346_27308_27446_36171_36243_36519
933799	contig_233_pilon	-	2683	16	Intergenic	novelGene_14557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_11	1311.84188410375	2	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	141	2243	108727	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	109968	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105576_105638_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914
933800	contig_5696_pilon	-	2730	7	Intergenic	novelGene_117577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	54	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAGTCTGGCAGAGCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	738242	714998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_-_715128_715172_716735_730426_730595_731912_732064_732416_732504_734429_734592_737771
933801	scaffold_12124_pilon	+	2022	11	Intergenic	novelGene_22277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3472.35310560432	1	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1200	1850	1508755	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473575	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496393_1497007_1497122_1506638_1506687_1508010_1508490_1508570
933802	contig_15327_pilon	-	1726	8	Intergenic	novelGene_70734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	311.904681933832	3	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	8	946	967479	960305	FALSE	10	GCACCTTGATCTGTTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNKNHSEGGGVIVNNTESILMSYDHVEVTFNDMRNMPEAFKGTKKGTVYLTPYRVIFLSKGKDAMRSFMMPFYLMKDCEIKQPVFGANYIKGTVKAEAGGGWEGSASYKLTFTAGGAIEFGQRMLQVASQASRGEAPHGAYGYSYMPSGAYVFPPPVANGMYPCPPGYPYPPPPPEFYPGPPMMDGAMGYMQPPPPPYPGPMEPPVSGPDVPSTPAAEAKAAEAAASAYYNPGNPHNVYMPTTASHRSLLLPAPPLGPSWGLGRCGEDLVLPGWMINSKQELALVGGRDPCLERCFPVSYTSSEPMGTVR	967486	959524	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_960512_960689_960767_961481_961605_961814_961950_962807_962901_963791_963928_965036_965146_967420
933803	contig_5229_pilon	-	1978	6	Intergenic	novelGene_117714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	39.4481938750052	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	302	655	656695	656098	TRUE	30	CAGTTGCTGAATCAAGGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAVAGPGLYSYIREDLFTSEIFKLELQNVPRHASFSDVRRFLGRFGLQPHKTKLFGQPPCAFVTFRSAAERDKALRVLHGALWKGRPLSVRLARPKADPMAKKRRREGEGEPPATHIADVVTPLWTVPYAEQLEQKRLECEQVLQRLAKLGAPTVPCCRGCSHRGTSTTKPAAHWRRSGRHLYRSGWLILCTLKSSFGLSPPIPFPALRFFPELIT	656996	652367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5229_pilon_-_652637_653638_653715_653903_654053_655173_655380_655474_656303_656546
933804	contig_9706_pilon	-	473	1	Intergenic	novelGene_20888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGATTGATGAGTAGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3977	3504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_3500_4000
933805	contig_11720_pilon	+	1862	8	Intergenic	novelGene_43805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	40	junction_2	2600.62238233662	2	106	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	218	1120	68064	98482	FALSE	5	GTTTTCTGACTTTTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFAGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67846	99224	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
933808	contig_15518_pilon	+	2162	4	Intergenic	novelGene_127591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	195	junction_2	158.101936174805	2	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	72	219	585	803	15096	37386	TRUE	20	CCATTGCTATTGAGTTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11046	39392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_37273_37389_38035
933809	contig_2867_pilon	-	1486	1	Intergenic	novelGene_135185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	129	390	24	413	796629	796240	NA	50	AAAATGTAGAGACAGGTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LNPQSVPMEAAVKKSNNVLHFGKSVAKDFFKMLKSRDVTLRTKVHLTHVMVFSLASYACKSWTVNKEGQRRIDAFELWCWQRIVEYTMGYQKNEQICHGRSTARMCLRSEDSETSSHVLWTCYQERPVPGERHHAW	796652	795166	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2867_pilon_-_795200_796700
933810	contig_7056_pilon	+	460	2	Intergenic	novelGene_43722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGGAATAACAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	957174	957792	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_957613_957770
933811	contig_18544_pilon	+	1512	9	Intergenic	novelGene_152741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TATACAGAAAATTAAATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	37908	58239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18544_pilon_+_38279_38472_38684_40182_40322_47684_47856_49133_49315_53228_53269_54740_54803_54895_55029_58034
933812	contig_3948_pilon	+	2352	3	Intergenic	novelGene_53378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	104.5	2	117	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	372	884	1813956	1860572	FALSE	15	CAAAGGGTCTGGGCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSQSNRELVVDFLSYKLSQKGYSWSQFSDVEENRTGASEGTESEMEIPSAVNGNPSWHLADSPAVNGATGHSSSLDAREVIPMAAVKQALREAGDEFELRYRRAFSDLTSQLHITPGTAYQSFEQDTFVELYGNNAAAESRKGQERFNRWFLTGMTVAGVVLLGSLFSRK	1813325	1862040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1813586_1813844_1814331_1860434
933813	SIRV7	-	2029	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33035	18	28	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	91	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTATTCTTCCAAGCGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114888	1021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
933814	contig_7207_pilon	-	1749	9	Intergenic	novelGene_72082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_8	235.844095749713	2	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	897	851	1747	696514	671672	FALSE	75	GAAGAAAAAGGAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKD	758026	671669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_737456_737530_737916_738105_746740_746860_757787
933815	contig_10734_pilon	+	1707	7	Intergenic	novelGene_51467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	417	776	2265456	2265815	TRUE	45	CTGCACATAATTAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265039	2275884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266070_2267087_2267190_2269280_2269431_2270438_2270505_2270955_2271050_2274374_2274509_2275753
933816	contig_17144_pilon	-	1544	7	Intergenic	novelGene_29530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1757.48270893976	1	76	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	205	735	170784	166894	FALSE	25	TTTTCTTTCTTAAGAAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSLTRVVLIVLLLPGSECGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLSHHWPDSGKGSG	179746	166084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166932_167612_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_179691
933817	contig_9267_pilon	+	2175	1	Intergenic	novelGene_162012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	135	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCCCCAATAAACCCAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	332466	334641	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9267_pilon_+_332500_334600
933819	contig_5302_pilon	-	2464	9	Intergenic	novelGene_81449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	711.599738265832	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	386	829	182005	177300	FALSE	35	ACAAAACCATTGTAGTGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTDNSLHYS	209566	175664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182937_183024_185037_185126_185963_186008_209418
933820	contig_7396_pilon	-	2164	14	Intergenic	novelGene_79584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3149.46903574247	3	62	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	76	996	254680	248560	TRUE	50	AGCAGTACAACAAATTGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGSNGLRQKRATWRPL	257061	245601	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246416_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248606_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_257006
933821	contig_17144_pilon	-	1880	10	Intergenic	novelGene_29342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1706.49992675066	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	864	1796	167982	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAERRPSSCPAFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183401	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166845_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169025_176042_176271_179700_179786_181794_181850_183158
933823	contig_3825_pilon	+	1979	4	Intergenic	novelGene_77960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1676	junction_3	807.909373355425	6	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCAGGAGTTTTATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13048	15854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3825_pilon_+_14471_14780_14912_15231_15302_15498
933824	contig_3747_pilon	+	1384	6	Intergenic	novelGene_24796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5594.04474776525	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	330	959	201313	202945	TRUE	45	AAATGACAAAATGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMYLLKKRRKFPACSFLMGGCLSLLELTEKDSVKVMRFPYMLTLRIHVPASWSPKLPL	200983	205195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201551_202132_202206_202309_202458_202643_202740_202870_203071_204895
933825	contig_17144_pilon	+	2348	13	Intergenic	novelGene_29506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	715	1137	166796	168210	TRUE	15	CTGTGTCGGGAGGGGAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGGMLGSRRLGSWKASHLCHDSGHPGAQAATGWVWDTWPEMILPAGTTAEPGSPTEGDEQEQKGKQTQALSAQPLSPLTQGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGKIASEPWSRRWYSV	166081	175000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166837_167238_167331_167581_167654_167887_168060_168164_168310_168996_169099_170744_170872_172564_172742_173131_173211_173306_173463_173590_173754_174576_174760_174875
933826	contig_12644_pilon	+	1213	9	Intergenic	novelGene_44683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4886.79923205108	1	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	214	1149	2678055	2680545	FALSE	35	CTTGATCAAAGAGGCAGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2677289	2680609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679148_2679505_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
933827	contig_3095_pilon	+	1233	5	Intergenic	novelGene_75075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3331.44295876426	5	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	61	804	147241	151132	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWVRSASPPPRDHRESGVHPGPAGGSGGHRCWHHFHHQGRAQRQCC	147180	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150998_151163_151848
933828	contig_10500_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_41305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACTCTGTCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1638761	1640141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1638800_1640100
933829	contig_15047_pilon	+	1701	6	Intergenic	novelGene_52166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	7	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	26	361	2194	2833	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGE	2168	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2859_3221_3498_4158_4434_4552_4687_21013
933831	contig_17144_pilon	+	2363	13	Intergenic	novelGene_29214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGATGAGGGTCCGGTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	174905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168164_168318_169013_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173307_173463_173583_173762_174576_174760_174875
933832	contig_17144_pilon	-	1580	10	Intergenic	novelGene_29244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2575.24165472814	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	879	1286	173384	172491	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAVEHHG	181843	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166300_172428_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173680_174595_174761_174876_175001_175973_176246_179691_179786_181794
933833	contig_14353_pilon	+	1894	1	Intergenic	novelGene_82117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	910	1209	100543	100842	NA	35	CAGAGCTGGAGAAGGATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNQNTGNNKCWRGCGEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWHFLRELEIEIPYDPAIPLLGIYSREIRVVTRIDICTPMFMAALLTIANDGNNLHAHQQMNG	99633	101527	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_99600_101500
933834	contig_7457_pilon	-	2035	7	Intergenic	novelGene_31425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_6	147.778456556503	2	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAATAAATATTGCCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473213	468266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471292_471559_471667_471948_472039_472730_472768_473120
933835	contig_16109_pilon	-	2800	1	Intergenic	novelGene_80333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	37	124	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	112	339	1380	1718	275246	274908	NA	15	GTCTGCCATGACTGCCTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIGVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKCHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNARVRWYLIVVLICISLMARDREHFLMCLLAI	276625	273825	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16109_pilon_-_273800_276600
933836	contig_11512_pilon	+	2583	13	Intergenic	novelGene_43372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	119	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGGAGACAAGACGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554965	608513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555403_555484_556120_556226_556870_567665_567802_570037_570085_571041_571107_573287_573397_580032_580153_581643_581706_582714_582776_586511_586637_592797_592903_608475
933837	contig_854_pilon	-	3834	18	Intergenic	novelGene_36488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	2037	2354	1699021	1697806	TRUE	10	TCTGCGCGCCTCACCGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIWSSSSFFSLASVVTFSSCSFWRALSSSSSCSSSSWMFCCIFFFSICRCWQRSSSSSTLASRSWQISSSSCFLAVRRDRSSSASAHSSVSAWSCSCSCNFSAMS	1716402	1612770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1612925_1649492_1649676_1685178_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702686_1715046
933838	contig_16411_pilon	+	2327	9	Intergenic	novelGene_77334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	665.519862588638	1	102	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	91	1068	184151	241370	TRUE	40	CAGCTCAGGGAGGAAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIYSSYRNFVGPPHFKTICRLLGYQGIAVVMEELLKIVKSLLQGTILQYVKTLIEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIIEYAELKTDVFQSLREVGNAILFCLLIEQALSQEEVCDLLHAAPFQNILPRVYIKEGERLEVRMKRLEAKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIAREGDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRSYLQDPIWRGPPPTNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPVGTNEFTAEQCFGDGLNWAGCSIIVLLGQQRRFDLFDFCYHLLKVQRQDGKDEIIKNVPLKKMADRIRKYQILNNEVFAILNKYMKSVETDSSTVEHVRCFQPPIHQSLATTC	184060	242782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16411_pilon_+_184184_185348_185440_187185_187317_231227_231301_231773_231869_238096_238336_240227_240376_241202_241483_241635
933839	contig_14666_pilon	+	1329	3	Intergenic	novelGene_39627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1614.5	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	945	130	1074	483933	484940	FALSE	30	TAGCCAAGTGAATTGATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	483258	485195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_483317_483861_484191_484253
933840	contig_3627_pilon	-	2136	15	Intergenic	novelGene_78455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	521	841	316019	314150	TRUE	30	GCAGTTTGAGTTAATTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRGNFFSFTIILLFFMPVLHQPPCVHPEASRPAAACILGRGFPTLSGWEGNAKHPGKIKPLSPHELELYAPCGSPQGDGSESLQNVTIVCTHLDQCLSEPYNNE	323549	297850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_297862_300292_300327_302709_302904_304322_304438_304533_304731_309362_309490_309605_309769_312559_312786_313377_313492_314035_314209_314945_315156_315967_316054_318593_318774_320223_320420_323439
933842	contig_14925_pilon	-	609	2	Intergenic	novelGene_55362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_1	0	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	73	429	116065	115709	FALSE	45	GGAAAAAAATGTTCAGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGRWYLVSRNWGLSGGKGSWRCKLWTSVSIWYHAGNKT	129473	115528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_116101_129436
933843	contig_10990_pilon	-	3382	18	Intergenic	novelGene_7487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	379	708	751051	749304	TRUE	95	AAAAAAAAAAAACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLELSGFTAAMTAGWTSTALRFGTNLGAETTLTTDGFTFTLGLALPLFSKGCVAHFTFNIESPIPEVSTSTFWDDFVGGRFVGCQATAGTVVSTGFSSTWVLQEATSP	752161	714807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715362_715413_715994_722232_722473_722600_722697_723510_723633_729669_729803_731226_731428_731549_731661_731911_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882_738952_744697_744772_749163_749499_750916_751085_751450_751518_751883
933844	contig_3956_pilon	-	2435	11	Intergenic	novelGene_15248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	GCCCAGCCGTGGAGGCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
933845	contig_7151_pilon	-	2287	13	Intergenic	novelGene_40666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	129	junction_1	106.745283528386	2	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	181	2184	18419	1924	FALSE	25	AACCCAATGTTTTTCTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QIWTEKFRCEGQESELTFCRRVPCPRSTCHHSGAVHIVCSEYTEVRLVKNGSSQCEGQVEMNISGVWRPLCASHWNMANANVVCQQLKCGVAIFTPTGSYFVEGRDQIWKHRFHCSGDESFLWNCPMTALGISECTEGNTASVICSENQTQLLPPCNDSMSDPADFATSEESATNCSENRWLRLVNGSSSCDGRVEVYHKGSWGTICDDGWDVNDAQVVCRQLGCGWALNATVSAHFGEGKGPIWLDDLKCTGQESHVWTCPSQGWGQHDCRHKEDAGVFCSESLALRLVSDDHDCAGWLEVFYNGTWGSVCRSPMEPTTLSVICRQLGCGDTGELNVLAGIRTLSQPLWVDGIQCRKSDTSLWQCLSDPWNNRSCSPKEVAHIICAGNKPKSCPTAAPCTDKEKLRLRGGDTTCSGRVEIWHNGSWGTVCDDSWSLAEAEVVCQQLDCGSALEALQEAAFGPGNGSIWLDEVRCRGRESSLWACAAQPWGQNNCKHEEDAGVRCSGKRTTSSLTVGGTSSGSDPVSDIFSLPVVICLILGALLFLVLIFLGTQLHRWRTELRVLSSFEGALDEALYEDIDDYILQPEKEDLLDNSGKLSDESLTKLPYYTGNNEEDTDPESVLDPPGKQTDATENGYDDIEELPVSEIPPTPGMSEKHFSQRKGMVPGIPRQMPLSSFLEKLPTLGWKGKLPPWSWGKEKTLDTMMLSLAPCSTIFGATKSAKNLL	18691	1820	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_-_2089_3098_3245_4310_4395_4630_4730_5148_5287_5683_5717_5943_6259_6347_6390_12491_12807_13360_13676_13782_13876_18160_18479_18570
933846	contig_5954_pilon	+	1636	1	Intergenic	novelGene_28789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CACCAAATTAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1391171	1392807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_+_1391200_1392800
933847	contig_3956_pilon	+	2119	11	Intergenic	novelGene_14954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1536.05580627788	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	81	1232	1281682	1286416	TRUE	10	GGTGGTGACTGTGTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLRCDAPLAACWGCAAADDHHPPALACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1291002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285822_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287320_1290347
933848	contig_12479_pilon	-	768	1	Intergenic	novelGene_56900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATCCGAACAAAACCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	643535	642767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12479_pilon_-_642800_643500
933849	contig_6102_pilon	+	2287	15	Intergenic	novelGene_31920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	487.367339354401	1	84	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	106	906	379014	393075	TRUE	35	GTATCTTTCATTAAACATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGSRCKVSLTAVLNSGFLDEVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	378908	395233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380157_380210_380548_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
933850	contig_9995_pilon	-	2109	1	Intergenic	novelGene_47728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	111	336	1324	1659	494352	494017	NA	30	CTGCTTCTGTAAAGATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRILIFKPSISFLTTSNFPRFILHTFHVPIFNGCLQLFLLILSHATSANDGPKSFTPSFEEAAIPPSYFHCLRGSSSRTISDSVLLLFIKFSLANFFIGEEELKVIEMFS	495675	493566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9995_pilon_-_493600_495700
933851	contig_7323_pilon	-	743	2	Intergenic	novelGene_173215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTACACTAGCAGCCAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114851	83474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7323_pilon_-_83482_114115
933852	contig_8377_pilon	-	8055	9	Intergenic	novelGene_34952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTAGCGTAAGAACAAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	164497	68096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68327_124717_131569_136288_136399_140773_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154992_161228_161389_164386
933853	contig_12079_pilon	+	2170	3	Intergenic	novelGene_67541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATAGCATGCTGTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860610	868519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862441_867342_867409_868245
933854	contig_14450_pilon	-	4008	2	Intergenic	novelGene_48974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	141	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGGGAGGGGGAGGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1043026	1038973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_-_1042833_1042877
933855	contig_12605_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_64205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2964.38926045484	7	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	381	1019	4816	6231	FALSE	20	CAGGTAGAGAGGGGTGTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKS	3875	6232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3965_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6124
933856	contig_854_pilon	+	1531	1	Intergenic	novelGene_36397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCAAAAGCAAGGAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	974851	976382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_974900_976400
933857	contig_12948_pilon	-	2198	3	Intergenic	novelGene_126160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACGGCACCTAACAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62889	19308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12948_pilon_-_20039_61004_61635_62051
933858	contig_7919_pilon	-	2388	4	Intergenic	novelGene_28101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	803	1177	1312342	1311968	FALSE	20	GTACATTTTTGCCCATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLGKLKVAKIETEHINTDILGIREMTWTGIGHSESDNQMVYYARNDKSKQNGIAFIVKKNTSRFILTYNTVSDRITSICLQGRPVNMTIIQIYAPTTKTKDKETEVFTNFCSLKLIKHAIKMH	1342168	1310756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7919_pilon_-_1312507_1325397_1325815_1341257_1341351_1342040
933860	contig_14353_pilon	+	713	1	Intergenic	novelGene_82127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	23	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	142	429	77	505	190587	191015	NA	35	AAAGCAGTGCTGGGAGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYGQIRSVALNPSAHWNYLESLNKILTPMESEFLGMGSMRADQLCGLTSGQRSPGQKMGLAGATARQGYILGLVLLPSSQEAHTPSTQPQPAQVHCRPGRCPLPYTVPPPHEVAWGLSWIELCPPKNICQLGWVMIPSVV	190510	191223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_+_190500_191200
933861	contig_7056_pilon	-	1744	7	Intergenic	novelGene_43707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGGTTTAAAAGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	937821	928592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_928688_929209_929442_929533_929676_930554_930634_935325_935495_935843_936041_936991
933862	contig_13633_pilon	-	1594	11	Intergenic	novelGene_15330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCCGGAGGGGGAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49451	22009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_-_22139_22772_22885_23682_23747_28323_28440_28649_28744_31245_31365_31602_31768_37184_37358_37436_37514_39319_39431_49017
933863	contig_18140_pilon	-	2666	1	Intergenic	novelGene_179236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	2140	2505	256430	256065	NA	20	CAGTTCAGTCACTCACGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	258569	255903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18140_pilon_-_255900_258600
933865	contig_10958_pilon	-	1773	2	Intergenic	novelGene_5465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	17	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAGAGGAATTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901654	895279	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
933866	contig_3449_pilon	+	4320	14	Intergenic	novelGene_73721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	467.376905289118	1	168	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	775	1803	512166	524373	TRUE	25	TATTCCTCATCACATTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVNEHTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVVAPIKPFYTVKCNSTPAVLEILAALGTGFACSSKNEIVLVQELGVSPENIIYISPCKQVSQIKYAAKVGVNIMTCDNDVELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRHLLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEFGFKMNMLDIGGGFTGTEFQLEEVNHVISPLLDVYFPEGSGIKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVENDKFSSGEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFACKLSEDLNTIPEVHKARR	493420	527119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3449_pilon_+_493774_496888_497027_498816_498859_506311_506457_512069_512268_514851_515026_515530_515704_517799_517935_519226_519309_519557_519633_520314_520478_523894_524012_524365_524572_524800
933867	contig_16303_pilon	-	2456	8	Intergenic	novelGene_34042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	673.918907493736	1	100	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	363	1092	96	1187	45428	35759	TRUE	25	GTCTTCAGACATGATTGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQVSLSLLQEARARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45523	32070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33086_35504_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40731_45370
933868	contig_8934_pilon	+	3567	2	Intergenic	novelGene_167237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	2360	2740	675657	676037	FALSE	30	CAACAGGTTGCACATTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHKLIISLLHASKIMLMIIQKLLQQHIDSEVPEIQTRFRRGQEMRDVITDIRWILAESREYQKIVHLCFIDYAKAFDCVDCNISKNGNLEHLIVLMWNLYIYQEAVIQTDQGDTMWFKIRTGMCSI	588492	676864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_+_588786_673590
933869	contig_2069_pilon	+	1760	1	Intergenic	novelGene_23383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	103	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	347	646	1058170	1058469	NA	15	AGCTTCTCCTCACTATTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCETNEFINGDTEMSNSRDSYSVNSEWFSSTLARASSARAARRIMSTLVGSKGGFCMWSRLAWLCWNCVAARLSSRKPRRLPMLPFCTAMARAARLSP	1057823	1059583	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_1057800_1059600
933870	contig_4315_pilon	-	1930	8	Intergenic	novelGene_46793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	270.902723711456	3	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	40	843	339053	328205	TRUE	25	CTCCCAAAACATCCTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEDSLHRPSQRSPMHPASASNCPTRARDRPADSSITWGSQYGSKSTERLSAEPGGAEQAILTGRRRARSSSVPREVPRLTLTSESEPTSPRPFSEKSRTTEDSPQAARDRMRGGGSTRWPDRVTFRGHYTGQEYHVLSPKTIQRGSGTVSCSHCQPIRTQDPGGAATRDPLGPSPTKTPRCPMCHRVVPPPEGESPDTATSGAEKAATRRNVPSNFSPRQRNEQAGSPPAATHRAVVSSNCTPSTSPSGLCLCLLGACHALPSSHCVLCVPRTYLSPSSY	339092	327076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4315_pilon_-_327915_327955_328250_333534_333729_333991_334109_335678_335775_337185_337333_337998_338115_338964
933871	contig_7009_pilon	+	1999	2	Intergenic	novelGene_23680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGCATTAGCACTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	538136	540181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_538502_538547
933872	contig_13760_pilon	-	2100	1	Intergenic	novelGene_61266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	146	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTTACTGAGTTGTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4468	2368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13760_pilon_-_2400_4500
933873	contig_19564_pilon	+	725	4	Intergenic	novelGene_29645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATTGTGTGCGGGGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12846	15565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19564_pilon_+_13257_13552_13663_13942_14055_15472
933875	contig_14441_pilon	+	1058	5	Intergenic	novelGene_100393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	281.609991832676	8	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	497	1018	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	47264	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_47571_121197_121239_125517_125902_126159_126256_126514
933876	contig_13074_pilon	+	1749	4	Intergenic	novelGene_153420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1380.10080147148	1	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	193	657	403694	451174	FALSE	30	TAACTGACTGACAAGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNCLKSPTSDDISLLHESQSDRASFGEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403324	452266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403396_403572_403817_449108_449279_451002
933878	contig_16431_pilon	-	2218	1	Intergenic	novelGene_87618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	93	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AATAAAAAATAATAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	245321	243103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16431_pilon_-_243100_245300
933879	contig_10627_pilon	+	2889	5	Intergenic	novelGene_59917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	106	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1824	2168	227647	268078	TRUE	30	AGTTTTACTGCAAACCCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFNKENFILSQSSRLQVQIQGISSRGRLSVSVSSGGRSLWCISLPSVWEHLSSRTSDPKDALRSWHCFLGGVRSPCVFAYFSLLYLKRGWLKTVSNLEDLISITAANPSYCYR	61192	281194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10627_pilon_+_61478_61610_61664_226161_227981_268067_268732_281126
933880	contig_6902_pilon	+	1423	9	Intergenic	novelGene_135572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	592.330724764468	2	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	570	1421	469856	490127	FALSE	65	GCAGGAAAAACAAAGAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEK	434398	490129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460405_466978_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731
933881	contig_14666_pilon	+	1137	2	Intergenic	novelGene_39608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	54	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	187	846	484281	484940	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477264	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477328_484157
933882	contig_11548_pilon	-	2257	10	Intergenic	novelGene_66751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCAGGCCGATTTCGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120482	63734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_63880_84700_84810_86979_87079_96085_96222_101978_102178_102442_102573_112801_112899_117681_117854_118973_119149_119487
933883	contig_14970_pilon	+	2054	10	Intergenic	novelGene_44959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5794.52777824384	3	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	133	498	136145	188829	TRUE	15	AACTCTTTGTGCTGTGATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICALQQTKKTAHQSQTCPIPLKDQLP	136012	232249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182386_188757_188830_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
933884	SIRV6	+	542	4	FSM	SIRV6A	SIRV606	545	4	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	24	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTTGAAAAAGTAATAGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2288	10788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724
933886	contig_3956_pilon	+	2322	10	Intergenic	novelGene_15088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1373.80796364982	2	41	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	1036	1803	1288971	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281603	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284813_1287948_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
933887	contig_3956_pilon	+	1113	6	Intergenic	novelGene_15150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1579.64839125674	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	49	807	1281682	1290665	FALSE	30	GTCAGTGCCATTGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVICKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVALARGSGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281633	1290971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282812_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284769_1290491
933888	contig_14666_pilon	+	1559	4	Intergenic	novelGene_39573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1797.4654377762	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	143	1258	483215	484940	FALSE	50	AAAAAAAAATGTCTTGGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPGLSWWTWSLGPWTASDLANLGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477249	485241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477344_479904_479944_483205_483284_483893
933889	contig_854_pilon	-	3138	20	Intergenic	novelGene_36580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	69	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	225	707	1707003	1704926	TRUE	25	CTGTAAGGGGTACAGGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHLVKLLLLLLQVGDTLPLVVQVHQQVIQLLLQPCLGLLQLVIGGHLLLEMLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLRVSCSWDSRAEKSFVSLLDLLSD	1707227	1679250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1679394_1680806_1680901_1681765_1681885_1683922_1684079_1685074_1685249_1686940_1687113_1689336_1689453_1692598_1692804_1693123_1693240_1694457_1694524_1695117_1695283_1696536_1696644_1697675_1697738_1701210_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704683_1704885_1704997_1705281_1705434_1706743
933890	contig_5889_pilon	+	844	8	Intergenic	novelGene_133679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	232	junction_4	85.4691733424206	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	816	29	844	20445	197026	FALSE	45	ATACAAGGTAAAGTACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LQESLNQNFMLIITHREVQREYNLNFSGSSTIQEVKRNVYDLTSIPVRHQLWEGWPASATDDSMCLAESGLSYPCHRLTVGRRSSPAQTREQSEEQNTDVHMVSDSDGDDFEDATEFGVDDGEVFGMSSSALRKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCAESIVSYLSQNFITWAWDLTKDTNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNV	20416	197026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5889_pilon_+_20520_84621_84709_128187_128284_138338_138466_139429_139494_140470_140553_168758_168914_196896
933891	contig_10734_pilon	-	1642	5	Intergenic	novelGene_51486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	14	junction_3	594.980829523103	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	564	1154	2267149	2265543	FALSE	75	ATAAAAGGAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2275997	2265054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2274372_2274510_2275754
933892	contig_9363_pilon	-	1402	2	Intergenic	novelGene_6494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAAAAGGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401733	400260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_401170_401240
933893	contig_6739_pilon	+	1746	1	Intergenic	novelGene_155875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	181	546	201	746	72026	72571	NA	40	GGGTCAGCGAAAGAGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVYYTRNDKLKRNGITFIVIKKISGSVLKYNAVSDRITSIRLQRRPVITTNIQIYASSTNAKDEEIEDFYQLLQSEIDQTCSQDALIITGNWSTKIGNKEEGSVVGKYGLDHKNDAGDHIIEFCKTSDFFIANTFFQQHKCDSTCGVEGRSPSCTKGIGKKTKLQELMEYQLKCFSKRMQC	71825	73571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6739_pilon_+_71800_73600
933895	contig_10904_pilon	+	2452	2	Intergenic	novelGene_22703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	3	362	631834	632193	TRUE	50	GAAGAGAAACATAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATKNSGQGVREDNFKELPAGDRVPGNQQYTLTHPPPFFPCSASVISQQAVVAQPGKHQLLAPWIRPAHTCRLCQCHFFVAVVPFFLLLLVSSLSLTSFPFFLLNTWLHVPTPLPLDRL	631831	635045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_632263_633024
933896	contig_19378_pilon	-	966	4	Intergenic	novelGene_73788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	70.7153920067383	1	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGGTAAAATTTCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	19131	16785	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19378_pilon_-_17040_17682_17716_18062_18353_18742
933897	contig_19457_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_179058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACCACAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13100	14439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19457_pilon_+_13100_14400
933898	contig_5623_pilon	+	4822	3	Intergenic	novelGene_154852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	378	4445	4822	299178	299555	FALSE	40	CTCAATAGCACTTTAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKEAQRKIDAFELWCWRRILNIPWTARRMNKSFLEEVQREWSLEGRMVRLCITYFGHVIRRDQSLEKDIMLGKVEGQRKRRRSSRRWIDTVAATMGSSLTVIVRMVQEWAVFRSVVHGVAMSWNQ	220647	299555	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_224112_297997_298513_298712
933901	contig_15744_pilon	+	2700	1	Intergenic	novelGene_83628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	105	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATGAAAAGAAAACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224750	227450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15744_pilon_+_224800_227400
933902	contig_15666_pilon	+	2007	9	Intergenic	novelGene_70184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGCTGGGAGACAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107156	132067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108105_108198_108579_108859_109098_109137_109947_110246_110558_110629_111256_111359_131448_131695_132006
933903	contig_5779_pilon	+	2927	2	Intergenic	novelGene_106531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	338972	497355	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5779_pilon_+_341212_496667
933904	contig_8020_pilon	-	2626	11	Intergenic	novelGene_114391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	8	junction_4	60.0424016841432	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	98	1006	152275	149938	TRUE	30	ATCCACTCAAGTTTCTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPVGLEGPRALRGMYLLLLLLLPAPPTPITCAQTLPDAPSVPTPLSTPSTLTMPPGPPSTPSLRERARALMQAFSLVDGHNDLPLILRKFYQNRLQDVNLRSFSGGQTSLDRLRDGLVGAQFWSAYVPCQTQGRDAVRLTLEQIDLIHRICASYSELELVTSAKALNNTHKLACLIGVEGGHSLDSSLSVLRTFYVLGVRYLTLTHTCNTPWAESSTKGIHPFYNNVSGLTSFGEKVVAEMNRLGMMVDLSHVSDAVAQRALEVSQAPVIFSHSGARGVCKNTRNVPDNILQLLGPRRKPS	153220	146908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8020_pilon_-_148208_148301_148438_149108_149185_149828_149962_150255_150433_150547_150618_150901_151044_151127_151258_151580_151708_152036_152321_153168
933905	contig_12638_pilon	+	2513	15	Intergenic	novelGene_33133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_9	591.31992186971	2	13	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	373	1101	182987	194329	TRUE	25	TCTCATTTCTCAAATATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRKKSKSRSRSHERKRSKSKERKRSRDRERKKSKSRERKRSRSKERRRSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLPHSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTGRLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAGKNRQIVL	178083	200485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_178281_180794_180861_180954_181009_182931_183050_183452_183606_185489_185628_188442_188509_191152_191358_191727_191806_194303_194442_195502_195554_198068_198151_198736_198843_199335_199415_199503
933906	contig_4232_pilon	+	1092	4	Intergenic	novelGene_63183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1824	junction_3	1439.7357010538	3	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	114	614	146362	149200	FALSE	75	AAAAGACAACAATAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGVAVSDGVIKVFNDMKVRKSSTPEEVKKRKKAVLFCLSEDKKTIILEEGKEILVGDVGQTVDDPYATFVKMLPDKDCRYALYDATYETKESKKEDLVFIFWAPECASLKSKMIYASSKDALKKKLTGIKHEVQANCLEEVKDRCTLAEKLGGSAVISLEGKPL	146248	149678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_146365_148230_148539_148806_148884_149087
933907	contig_3956_pilon	+	3053	14	Intergenic	novelGene_15186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1328.00135452986	1	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	779	2340	14	2353	1282731	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKLHG	1282717	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282903_1283807_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289896_1290297
933908	contig_7963_pilon	+	931	5	Intergenic	novelGene_58395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	898.630763995981	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	210	800	56777	63007	FALSE	15	AAGTCCTGTCCTCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNGMAISAPNTLICHVDKFFPPVLNVTWLRNGQTVIDGVGESIFLPRTDYKFYKFHYLTFVPSAEDVYDCKVEHWGLEEPLLKHWEAQEPIQVPETTETVVCALGLAVGLVGIVAGTVLIIKALRSSSDPRDRGPL	51385	63138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51536_56717_56981_57331_57564_57782_57934_63003
933909	contig_7396_pilon	-	1793	15	Intergenic	novelGene_79642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3183.73189521546	1	64	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	459	1380	143	1522	255163	246452	FALSE	30	GCAGAGTGAGTGAATTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METEQPEETFPNTETNGEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRNTDEMVELRILLQSKNAGAVIGKGGKNIKALRTDYNASVSVPDSSGPERILSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNRCEAVCRC	257496	246180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247185_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251521_252397_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_257381
933910	contig_18162_pilon	-	2723	3	Intergenic	novelGene_122333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10809_16363
933911	contig_11734_pilon	-	1128	7	Intergenic	novelGene_173219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	199	junction_2	92.7787092434945	5	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	852	275	1126	26773	976	FALSE	25	AAGGGTAATTATTTCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSNDSHTTCQCFHLPSFAVLMALTPKADSALAVITCVGLSLSLLCLLLAAFTFLLCRSIQNTSTSLHLQLSFCLFLAHLLFLVGIDKTEPEVLCSVIAGALHYLYLASFTWMLLEALQLFLTVRNFKVSNYTSEGRFKKNFMYPFGYGIPAVIVAVSAGVGHKNYGTNTHCWLKLDTGFIWSFMGPAAVIILINLVFYFIILWILKSKLSSLNKEVSTIQNTRVMTFKAIAQLFILGCSWGLGFFIVEVVGKTAELVIAYIFTIINVLQGVFIFVVHCLLNRQ	28475	973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11734_pilon_-_1157_2281_2374_3730_3798_12055_12292_15047_15243_26692_26861_28288
933912	contig_12605_pilon	+	874	5	Intergenic	novelGene_64178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1832.92203530319	3	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	384	737	4816	5980	TRUE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAGLRGTGPSRSGQPSWCPLERSKDTHAVCSTRG	3868	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5882_6005_6124
933913	contig_16303_pilon	-	1928	6	Intergenic	novelGene_34103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	294.328795737012	1	105	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	119	835	38799	35715	TRUE	25	AAGCCATCCACTTGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGAMQSLFITVIFHSLRAQHCTGLEDTSSK	40495	33140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_35025_35804_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433
933914	contig_13633_pilon	+	3808	9	Intergenic	novelGene_15326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	530.817235496362	93	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	90	854	22038	31785	FALSE	75	TAGTAAAAAAAAATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQHVGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQVSIG	20289	34739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_20313_21971_22065_22119_22177_22774_22886_23675_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599
933916	contig_14984_pilon	+	3474	2	Intergenic	novelGene_174158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	412	750	60518	60856	TRUE	25	AGTGTGAGTCATCCAACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLLSLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCITLHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFWIRASNAGVRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	60106	80206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14984_pilon_+_61619_78244
933917	contig_7119_pilon	+	2080	1	Intergenic	novelGene_40982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	277	834	96	929	138965	139798	NA	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	138869	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_138900_140900
933919	contig_8377_pilon	+	1461	1	Intergenic	novelGene_34989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	74	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAACTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68115	69576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68100_69600
933920	contig_10225_pilon	+	1794	4	Intergenic	novelGene_86855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	650.538238691624	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	341	1678	46299	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	41027	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_41053_41437_41523_42609_42726_46184
933921	contig_2854_pilon	-	3023	2	Intergenic	novelGene_120823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	1349	1822	225542	225069	FALSE	20	GAATGACGCCTCTTGGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIILPKVINRFNAIPMKIQMGFYAEMERSILKFIQNCNNNQEKEEQRCRSHNLNFRTYYEATVSKTTLWPSDFQQGSQDHVTGKNSLFNKWEDCWAKWISTCYLTPHIKINSKWINDLNGGVKTIKLLKENTGMNLFNLRFGNALLHMTPKASSTKE	226930	223867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2854_pilon_-_226325_226364
933922	contig_11285_pilon	-	3005	27	Intergenic	novelGene_5701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	428.354461140185	4	87	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	641	1926	891	2816	794634	784252	FALSE	5	CCTCCGCCAGCGTGCTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLHRLLGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMDSWADHKLAEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRVCPGRGGAELAVHLPPGAHYMQALSDLEGFERLICNQKKENETKVVLCELGNPMENDARIQITMLVSVGNLEEAGEYVSFRLQIRSKNSQNPNSEMVLLNVPVRADAHVELRGNSVPASLVVASDEGNREEKSWGPKVEHTYELHNKGPGAVSGLRLNLRLPGQSQSSDLLYILDVRPQGGLNCSSQPSSNPRQLDWRLPAPSRSPVYPKHHKRERRQALQPGSQQPSKLQEPILVNCDLVPCTVVQCELQEMARGQRAMVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	798486	784062	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785495_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_787750_787832_788127_788208_788488_788582_789133_789197_790161_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748_793961_794413_794467_794607_794662_794775_794820_794965_795014_795339_795518_795682_795746_796126_796293_796415_796514_796604_796727_798342
933923	contig_5794_pilon	+	2365	2	Intergenic	novelGene_69776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	1055	2287	732759	734366	FALSE	65	AAAAAAAATTTAAAAAGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQCLNIQNDKLVETSTVASPETKPTEIGNNYHFYSSIPSLEKEVGDCSPHFINAFEDFFGTIQPTDNTNQLTVNSLNSDATINPDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSSATLSQSLSELLSGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSMASPEHSVESSIYEDTPLGFSDSEMEEKDSAPESVKQNGPETQPLQSSGDTVQPLSPSPGHSASVHDAQCENTPKKELPVSPGHRKTSFTKDKHSNRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVDDFSEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDENGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKNKLLQN	731704	734444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_+_733968_734342
933924	contig_3747_pilon	+	2911	8	Intergenic	novelGene_24855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	4076.97680110332	1	126	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	322	1164	201313	203228	TRUE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLLPL	200991	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203216_203386_203498_203651_203768
933925	contig_14441_pilon	+	1357	6	Intergenic	novelGene_100595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.282736920834	2	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	743	1171	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111200	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111382_112004_112154_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
933926	contig_11285_pilon	+	1839	12	Intergenic	novelGene_5565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	522.189699864549	3	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	414	1397	767140	769760	FALSE	10	CTTGACTTGGCCACCCTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCCRGARTRTQCPDGQFCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWHLLYR	763512	770202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_763551_766116_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769297_769740
933927	contig_11304_pilon	+	2334	1	Intergenic	novelGene_156718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	42	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	494	838	439002	439346	NA	5	TCTGTCACGTGGGGTTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTPEHLIVLMQDPFIDQEAVIQTEQRDTVWFEVRRGVHQGCIISSYLFSLYTEQVIREAGLYEEEWGIRIGRRLTNNLCYADDTALLAESEEDLKHLLMKIKDYSLPMDYTST	438508	440842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11304_pilon_+_438500_440800
933928	contig_854_pilon	-	1453	6	Intergenic	novelGene_36720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	3.2	5	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1028	1339	1711796	1710103	FALSE	25	CAGAGAGAGGCTGACGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRASRRRFSSNARALPFAAAIGNLVGQLIPLLLGLALGTLGSCQLLQLNHLSLHALQLLLVLLGLCQDLLPGGARVLQLPHAVLHLGLGLPKLLDGFISVLVG	1716403	1709988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1710148_1710536_1710665_1711562_1711657_1711751_1711877_1712276_1712327_1715506
933929	contig_9668_pilon	-	2402	15	Intergenic	novelGene_58191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	828.627769020467	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	990	2111	553962	503609	FALSE	55	GAGCATCAAGTTAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669889	503317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554023_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610423_610514_669866
933930	contig_6302_pilon	+	2235	1	Intergenic	novelGene_171686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	98	21	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGTAAACATTCACCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40303	42538	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_+_40300_42500
933931	contig_14744_pilon	+	1689	6	Intergenic	novelGene_66066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6040	junction_2	3096.27733899921	15	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	789	900	1688	1382976	1386577	FALSE	20	CCCAGCTCCAAGGCTACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEKAEKPDPKEKKPEAKKDASGKAKKANLKGKKPKKGKPHCSRNPVLVRGIGRYSRSAMYSRKAMYKRKYSAAKSRIEKKKKEKVLATVTKPVGGDKNGGTRVVKLRKMPRYYPTEDVPRKLLSHGKKPFSQHVRKLRSSITPGTVLIILTGRHRGKRVIFLKQLDSGLLLVTGPLSLNRVPLRRTHQKFVIATSTKIDISGVKIPKHLTDAYFKKKKLRKPRHQEGEIFDTEKEKYEVTEQRKIDQKAVDSQIMPKIKAI	1382076	1386578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_+_1383210_1383302_1383402_1384429_1384574_1385183_1385233_1385820_1386006_1386499
933932	contig_14744_pilon	-	1400	5	Intergenic	novelGene_66012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_1	428.86091859716	2	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	90	983	969897	960925	FALSE	35	TAGCAAATACCATTTATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEELRYIQARNLDKFIEDYLLPDTPFRLQVKKAINTICSFLKERCFQYASHPVRVPKVVKGGSSGKGTALKGRSDADLVVFLSNLTSFQDQLEHRKVFIEEIRKQLEACKREEKFDVKFEVRSPLENPRVLSFTLIAPDLDEQVDFDILPAFDALGQVTKGYRPHPQIYVQLISECSQGGEFSTCFTELQRAFLKQRPAKLKSLIRLVKHWYQECKKQLNKSLPPQYALELLTVYAWERGSNKPDFNTAQGFRTVLELVLDYKQLCIYWTKYYDFENPIIGEYLNRQLQKRSLKETA	969986	960507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_964176_964410_967273_967450_968343_968630_969717
933933	contig_20602_pilon	-	1552	10	Intergenic	novelGene_133710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	305.067853209296	2	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	321	1202	23530	10026	FALSE	15	TTTTTTTTTTTATGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLKHILILQNKIDLVKESQAKEQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLKYNIEVVCEYIVKKIPVPPRDFTSEPRLIVIRSFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILKGVLKVGQEIEVRPGIVSKDSEGKLMCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29560	9675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19855_21146_21282_23430_23590_26429_26573_28907_28949_29483
933934	contig_5302_pilon	-	2152	5	Intergenic	novelGene_81434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	823.332367577031	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	278	826	181069	176894	FALSE	25	GTTTCCTTTTCAAAACCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWPAKRGSCTCSSTQAGRRGTTTERRRGAQGKSTKNPTQITLFTIPRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTSTATGISQIGSLAGPRHLASSRSPPPERRRQSPKARGNRPGALLTPS	209563	175567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181340_209452
933935	contig_7728_pilon	+	2052	1	Intergenic	novelGene_64729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	118	152	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	1	321	752628	752948	NA	50	AATTACACTTTTATAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTVAAEVISASCHFFQSRGFLGSQAKSKRRRRGGRASSRLRTGSRRGRLLASTVTQQVQAKPANDAYRDKLRCKRQPQVSVTVETGRNEGLRIYSLKVLRGFCLKL	752627	754679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7728_pilon_+_752600_754700
933937	contig_11574_pilon	-	2379	10	Intergenic	novelGene_64084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	322.566100030504	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	45	773	456525	451671	TRUE	25	ACATATTAGTTCTGTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQFFLH	462687	449292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451686_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456534_462651
933939	contig_14744_pilon	-	3231	1	Intergenic	novelGene_65919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	990	1346	121659	121303	NA	35	TAAAGGAGTGTACTGTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYRYNAIPIQIPRAFFKKMEKQITNFIWKGKRPRISKAPLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNKYIDQWNRIENTDINSSTYEQLIFDKGPKSINWGKRQPL	122648	119417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_119400_122600
933941	contig_9400_pilon	-	580	5	Intergenic	novelGene_146591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	686.810199400096	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	63	192	115	306	135537	123503	TRUE	35	AAAAGGACTATGATTTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSWFSPKENILIIIFPVLAILLSWGQFGVVTLKYASDPMKGKTILLFVAGLLLTIVVIVGAILFIPGEYSTKNASGLGLIVIPTVILILLQYFVLMTVEPY	158630	121364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9400_pilon_-_121576_123439_123517_132506_132600_135452_135561_158539
933942	contig_8476_pilon	+	2353	2	Intergenic	novelGene_121352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	111	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	697	1530	195220	196053	TRUE	30	AATGAAGTCACTCCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKTGPTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIICKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYNLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCRWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPVIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQRRCPSDEWINKL	194523	249407	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_+_196845_249375
933943	contig_20819_pilon	-	855	3	Intergenic	novelGene_55653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATACCAGAGGTGCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	42991	40909	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_-_41207_41306_41400_42526
933944	contig_20641_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_52843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1226.78038884267	5	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	58	1353	14599	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14541	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379_56467_56562
933945	contig_6361_pilon	+	1310	1	Intergenic	novelGene_23968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTCACGTCCTTCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	402504	403814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_402500_403800
933946	contig_14970_pilon	+	1618	8	Intergenic	novelGene_45032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5399.96663254997	3	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	40	621	177395	221234	TRUE	10	CCTTAACTCTTTGTGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATTTRLVRGPIPLTDLSRLDIQVGVKKMVPILQRIL	177355	232245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216623_216674_221180_221253_224295_224375_231345
933949	contig_12079_pilon	-	2235	10	Intergenic	novelGene_67453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1222.25033301006	1	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	299	900	2	901	600738	583739	TRUE	20	CGGAATTCGTCACTGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSTAPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEIHKSGYLSSERLVPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLRDSAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEQKTKKAEKELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRVARAAGQGGAGETGCGSG	600739	580154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_581161_581917_582170_583662_583744_584163_584305_585247_585379_585892_586057_591617_591715_598004_598152_599463_599548_600607
933950	contig_17144_pilon	-	1533	8	Intergenic	novelGene_29233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2585.92016544224	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	301	906	333	1238	174965	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176270	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166434_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173694_174572_174761_174876_175001_175973
933951	contig_3956_pilon	+	1731	9	Intergenic	novelGene_15206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1534.02941118318	1	73	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	903	310	1212	1284120	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282850	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284258_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1289637_1289677_1289758_1289892_1290297
933952	contig_8377_pilon	+	1903	16	Intergenic	novelGene_35021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3429.19138897528	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	452	1359	31	1389	68257	176610	TRUE	25	TACAAACGTGAGTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAGDNLTLSHNKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSRHNTSPESLICLKMMKNN	68226	180502	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136397_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_176555_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
933953	contig_6533_pilon	+	1406	3	Intergenic	novelGene_114621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	986	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAATAAGACAAAATATAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10496	26439	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6533_pilon_+_10567_13450_13560_25212
933954	contig_16322_pilon	-	968	3	Intergenic	novelGene_87500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1055	junction_2	249.5	1	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTGTGCAGTGTGTACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34620	31684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16322_pilon_-_32416_32926_33081_34537
933955	contig_2770_pilon	-	1427	6	Intergenic	novelGene_107479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3001	junction_1	811.076223298403	8	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	183	632	750561	743833	FALSE	35	ACAACCATCAACATTGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750743	743037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747797_750558
933956	contig_13021_pilon	+	2307	13	Intergenic	novelGene_8189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	2	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	154	2004	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174522	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
933957	contig_9910_pilon	-	4557	4	Intergenic	novelGene_178499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	4065	4373	318642	318334	FALSE	15	TGCCTAGAGCGCCATTTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRDKEGIKEVEKSNTNSQQMAPREMAAWLCGIQAAGASWSRDCGRRNQRSPSQEKRSGGWERAHRKLPVVLSPTGRSMRLLSRTPICWSPIGVQDGGSVLR	396109	318149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9910_pilon_-_318973_319057_321340_350156_350165_394665
933958	contig_5643_pilon	+	867	8	Intergenic	novelGene_38829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2581.63809727586	4	33	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	86	261	159	419	236700	237564	TRUE	15	CACCTCTTTGTTGATTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLRDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGQIR	233610	238193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233618_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237238_237550_237635_237720_237819_237913
933960	contig_3956_pilon	+	2020	11	Intergenic	novelGene_14900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1485.81324533065	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	443	1332	495	1826	1284763	1290816	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281599	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284750_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288071_1290501
933961	contig_18208_pilon	+	344	3	Intergenic	novelGene_176202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAATTTAAAAAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	154491	155514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18208_pilon_+_154570_154729_154835_155353
933962	contig_5686_pilon	+	2877	15	Intergenic	novelGene_45218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1153.98913490093	3	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	741	2226	465	2690	182699	224324	FALSE	35	TTTAGGTGAAAGTTTACAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEAIPEFHKKLSLLSFWTKCCSPAGVYHSSADRMIRQLEASFARTVNKEYPGLADSVFRTLVSQILDRAEPLHSSSLSLEVITVFQYHSYFASHGASDLESYLIQLAKQGGTCSFVTSWWWFNFELFLIFLIIVFSDGIFFFLTSQVNN	93703	224511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171725_182642_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_222754_222917_224043
933963	contig_11846_pilon	+	706	1	Intergenic	novelGene_105908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCCAAAAGAAGCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1535	2241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11846_pilon_+_1500_2200
933965	contig_6445_pilon	-	1382	15	Intergenic	novelGene_76888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	893.955829731091	2	42	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	660	1145	64875	43105	FALSE	5	GCCTTTTGTTTCTTTATTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96339	42867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73302_73979_74051_77848_77912_85405_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89709_96306
933966	contig_854_pilon	+	929	5	Intergenic	novelGene_36676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4133.85161653149	1	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	37	642	1700894	1714919	FALSE	35	ACCAAAGAGTCAGGGTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRAWGPALCRAPPNGPERCR	1700857	1715206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1714862
933967	contig_2770_pilon	-	1528	6	Intergenic	novelGene_107471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	1488.92062918075	4	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	216	641	750561	743833	FALSE	35	ATTAACTTAAAGTCGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750776	742945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744656_746600_746745_747765_747797_750558
933968	contig_15866_pilon	+	1431	8	Intergenic	novelGene_63672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	769.432337797795	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	292	717	620763	633093	FALSE	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNPAIQNDFSYYRRTLSRMRINNVPAEGENEVNNELANRMSLFYAEATPMLKTLSDATTKFVSENKNLPIENTTDCLSTMASVCRVMLETPEYRSRFTNEETVSFCLRVMVGVIILYDHVHPVGAFAKTSKIDVHNKTFE	608179	633807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15866_pilon_+_608230_613655_613766_619613_619745_620762_620841_623215_623333_624424_624505_626203_626331_633069
933969	contig_3956_pilon	+	1975	10	Intergenic	novelGene_15110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1349.52181746071	9	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	653	1630	1286460	1290665	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281606	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284138_1286179_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289196_1290521
933970	contig_12677_pilon	+	1337	2	Intergenic	novelGene_110706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCACGGCAGCTTCACATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	9	1455	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_+_488_596
933971	contig_19402_pilon	+	1354	2	Intergenic	novelGene_80846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145060	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_145494_145800
933973	contig_17144_pilon	-	911	4	Intergenic	novelGene_29192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1622.57107360167	2	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	62	616	169039	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	169100	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166587_167918_168060_168162_168310_168996
933974	contig_12677_pilon	-	766	1	Intergenic	novelGene_110821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTTTTAGTATTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2930	2164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2200_2900
933975	contig_854_pilon	+	1896	15	Intergenic	novelGene_36456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	489.215495482725	1	81	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	44	805	1453661	1459076	TRUE	10	CAGTCTGTTTAGTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDETSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQTLPKSAKQKERAHTSTEEIPEAIWSEAKMGPKITEKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECSGALEYYDKAFDRITTRNEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVISWQKLRGTCLPLMPFWPH	1451287	1465464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1451321_1453650_1453784_1454087_1454134_1454899_1455037_1455691_1455778_1456389_1456461_1457301_1457417_1458336_1458466_1459021_1459170_1460075_1460235_1460534_1460621_1460745_1460955_1464205_1464349_1464541_1464815_1465336
933976	contig_19402_pilon	-	3119	17	Intergenic	novelGene_80754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATTAAAAACAAGACGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144519	23448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_23927_29298_29514_36969_37075_47344_47387_55277_55354_57521_57741_70437_70526_79121_79275_81348_81452_83577_83748_97643_97799_107509_107688_130466_130595_138557_138661_139813_139895_142955_143058_143796
933977	contig_3975_pilon	-	2098	13	Intergenic	novelGene_54828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	263.611456503696	1	75	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	80	1099	2066301	2060320	TRUE	10	TGTACATCTCTCTGCTCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRVWATRLGQEDHVNRARGLLGWAGTMGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGEVLQRAHESGGEEPEAGQHVSRRLSGRGQSHEAAATPAAGPAVCRGHPGAHLHHHGIHGEREPGGFPQDPPRHQADR	2079220	2056372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059804_2059958_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064107_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
933978	contig_14970_pilon	+	1287	9	Intergenic	novelGene_44939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5661.60742965282	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	133	615	136145	191948	TRUE	30	AGGTAAGGAAATGCTCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITISNLSCTKKTSALKF	136012	224372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188834_191908_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295
933979	contig_5020_pilon	+	631	3	Intergenic	novelGene_27912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1180.5	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	3	575	123186	126023	FALSE	10	CAACCTTGGTGTCTCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGALLPFFSFPSLFISLPSPPLATTSLPSPIFSPLLSTLSPPFLSVLVVLTPPWHQPGSQAPSPLKS	123183	126079	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123364_124167_124365_125825
933980	contig_10861_pilon	+	918	6	Intergenic	novelGene_39231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	46	348	603123	605721	TRUE	30	GGCCACAGTTCTCCCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLGNDEFLVVELLEVMVGAVALEDLLKETTYEFFEGGWMFSWVVSLAVTGNEMKRMMSYSQTRMLMSAFFCLTGDLLLLCLGGGGIRLGGVLLLGDGRLLGLGRLLGEYDLDRDL	603077	608971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10861_pilon_+_603289_605072_605190_605701_605897_606406_606605_607927_608041_608887
933981	contig_20641_pilon	+	1239	6	Intergenic	novelGene_52804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1757.58568496674	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	647	1237	54874	56876	FALSE	35	ATAGAGTATATCTCTCAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPK	14535	56878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16880_38542_38690_45848_45965_54835_54968_56379
933982	scaffold_12124_pilon	-	1326	2	Intergenic	novelGene_22391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACGTCCCCTTGTTCCCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1509577	1506645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1506653_1508258
933983	contig_15666_pilon	-	1568	6	Intergenic	novelGene_70180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	748.123519213238	2	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	261	786	122	907	110619	107816	FALSE	25	GGAAAGTGATGTTGCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110740	107154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108850_109098_109138_109948_110246_110558
933984	contig_8581_pilon	-	1359	8	Intergenic	novelGene_22848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	590.281738335386	1	43	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	690	63	752	324073	309144	TRUE	15	GCCACTCTGCATGATTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTNFRVLLVKIRSGKRRTVEMHNKIYTIPIEVMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCKQKSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVATLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPSCEIGLIVGTGSNACYMEEMKNVETVEGNDGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTGYDKLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFE	324135	306868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8581_pilon_-_307245_308912_309147_312509_312640_314552_314737_319156_319257_321766_321863_323311_323432_324016
933985	contig_17144_pilon	-	2685	12	Intergenic	novelGene_29387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2331.2317178509	2	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	1408	2394	169039	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	176270	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169101_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173751_174876_175001_175973
933986	contig_12079_pilon	+	2788	7	Intergenic	novelGene_67536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACATCACCCTGGAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860606	871159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864700_866538_866638_867273_867407_868246_868414_871103
933987	contig_11720_pilon	+	1073	9	Intergenic	novelGene_43775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2211.49216805645	2	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	217	678	78465	98361	FALSE	25	TTCTATCGTACTTGAGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSEEEATGN	67786	98756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76965_78422_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93188_98337
933988	contig_5623_pilon	-	2264	14	Intergenic	novelGene_154845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	405.088331371095	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	521	1566	71	1636	220970	207631	FALSE	25	TTGACCCGGCCCCCACAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPGVDCPMEFWTKLQLREILERRGSGELYEHEKDLVWKMRHEVQEYFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHVCMRQETYLEALSHLQSPLDPSTLLADVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSEGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	239381	207002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210044_210210_210728_210808_211004_211118_211203_211383_211502_211603_211798_211943_212143_212182_212424_212590_220928_221000_239340
933989	scaffold_13553_pilon	-	1950	14	Intergenic	novelGene_73745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	648	junction_13	947.829679104699	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	618	1854	96	1949	55965	7223	FALSE	35	GTGAGTAGTTAGAGAGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VANPDGDFRLAIVNSSVLDRPRALVLVPQEGMMFWTDWGDLKPGIYRSNMDGSAVHRLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLDCIERISFSGQWRSVILDNLPHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILASQLTGLMDMKIFYKGKTTGSNACVSKPCSLLCLPKANHSRICRCPDGVSSRVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEDSTCLHSQYRCRNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCHESGTCIPLSYKCDLEDDCGDNSDESHCETHQCQSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAVYHTCEASNFQCHNGHCIPQRWACDGDMDCQDGSDEDPVSCETKCNGFHCPNGVCIPSSKHCDGLHDCSDGSDEQHCEPLCTRFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDATFAGCSREPEFHKVCDEFSFQCQNGVCIGLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSHYFRFQCENGHCIPNRWKCDWENDCGDWSDEKDCGDSHILPFPTPGPSTCLPNYYRCSSGNCVMDSWVCDGYRDCADGSDEEACPSPANVTATSTTTQLGRCDRFEFECRQPKKCIPNWKRCDGHQDCQDGQDEANC	57239	7221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13553_pilon_-_7372_18356_18513_19438_19574_20376_20509_21226_21359_22477_22586_24972_25099_31395_31516_34118_34242_37786_37901_40258_40433_54887_55027_55719_55967_57145
933990	contig_17427_pilon	+	1889	6	Intergenic	novelGene_30297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	220.672245649515	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCCTTGGTGTCATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147977	176875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_171334_171426_172209_172309_173596_173669_175453
933991	contig_177_pilon	+	2499	3	Intergenic	novelGene_41834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	445	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	68	1096	417672	418748	FALSE	10	GTTTGTGGTATTTTGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSWRCHTGEKLSILARIKFISKMEEFSFENLSLDYFFGDDSNYSYSTGIPSILSDSAPCRPESLEINKNVVITIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYNRVSCSVTDVYLLNLAMADLFFALSLPIWAASKKNGWTFGTLLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLIQKRHLVKFICLGIWGLSLFLSLPIVLFRKAIHPPYSSPVCYEDIGNNTTKWRLVLRILPQTFGFILPLLVMLFCYGFTLRTLFEAHMGQKHKAMRVIFAVVLVFLLCWLPYNLVLVTDTLMRIGVIKETCERRSDIGWALDVAFIGQKFRHGLLKIMATHGLISKDFLAKEVRPSFVGSSSGNTSTTL	415663	420151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_+_415707_417647_418559_418606
933993	contig_15063_pilon	+	1516	4	Intergenic	novelGene_13532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5984	junction_3	1364.74767712652	3	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	202	1374	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	34606	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_34926_35037_35380_35839_36158_36266
933994	contig_1452_pilon	-	2028	3	Intergenic	novelGene_115157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	35	TTTATACAGATATCATCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
933995	contig_19098_pilon	-	3618	1	Intergenic	novelGene_65844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	108	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	211	636	1888	2523	407806	407171	NA	40	AAATTGACACCTTTAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKAQVETKKIRTSPQEPMYDLEYIPPEFRDHLKNRFDALNTNDQRPDELWNDIKDIIHEESKRSLKRQEKKKRPKWMSEETLKLALEHRVAKAKGRNDEVKELNRRFQGAAQEDKVKYYNDMCKDLEMKNQKGRTHSAFLKLKELKKKFKLQVAILKDSTEKILNDAGSIKRRWKEYTESLYQKELVNAQPFQEVAYDQEPMVLKEEVQLR	409693	406075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19098_pilon_-_406100_409700
933996	contig_2894_pilon	+	5353	6	Intergenic	novelGene_86562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	123	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	109	330	4483	4812	691236	691565	FALSE	15	CATGAATCTCTCCTCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGIPLHVCGSRRGVSLPRSSAWPERAPNSRKGKENKQTIQNKQMNKSPRIPLARQPRPGSSSTLKQSSAAPQEEAKMAHGARYLSEGRGRWREASMKSKEAEKEKQH	518062	692106	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2894_pilon_+_518671_518728_519011_519184_519789_535422_536307_686455_687852_690527
933997	contig_6440_pilon	+	563	1	Intergenic	novelGene_161647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAATCAATAACATCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291	854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6440_pilon_+_300_900
933998	contig_3956_pilon	+	1511	7	Intergenic	novelGene_15195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1521.52592448794	3	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	22	1347	1282758	1290847	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1282736	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285807_1290449
933999	scaffold_9100_pilon	+	1753	10	Intergenic	novelGene_83243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	537.91912742932	3	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	496	1521	647136	654618	FALSE	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATLKDQLIVNLLKEEHPPQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELPIRRMCVLCVV	644291	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644412_644564_644916_647111_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653324_653449_654139_654292_654578
934001	contig_5770_pilon	+	1268	1	Intergenic	novelGene_74150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTCTCTATCAGCCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78813	80081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5770_pilon_+_78800_80100
934002	contig_3956_pilon	+	2018	9	Intergenic	novelGene_14961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1120.1747003816	3	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	81	1502	1281682	1290491	FALSE	15	TGACTGTGTGGAGCCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283872_1287381_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934004	contig_5791_pilon	+	1322	1	Intergenic	novelGene_35837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAGAAAGATTGATGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1041093	1042415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5791_pilon_+_1041100_1042400
934005	contig_12638_pilon	+	1916	16	Intergenic	novelGene_33170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	201.959886005998	1	81	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	143	775	269238	270624	TRUE	20	AGACCACTGCTTGCCACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGNWTELGRTERVRNSSSPEFSKTLQLEYHFETVQKLRFGIYDIDNKTPELGDDDFLGGAECSLGQIVSSQILTLPLMLKAGKPAGRGTITVSAQELKDSRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQGDGKWHLTYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPLQHFCGGEPGAMLRL	235651	274459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_235794_269237_269367_269457_269638_269787_269863_269950_270023_270163_270245_270410_270487_270604_270692_270827_270915_271008_271069_271147_271282_271386_271442_271693_271746_273469_273584_273761_273999_274124
934006	contig_16148_pilon	+	1596	10	Intergenic	novelGene_50365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTCACATAAAAATGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58796	111490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16148_pilon_+_59184_63754_63847_74693_74884_75357_75527_77699_77841_78423_78548_85722_85785_88854_89054_89201_89311_111367
934007	contig_5777_pilon	+	2955	1	Intergenic	novelGene_173320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	109	330	413	742	41101	41430	NA	35	AGTCACTATGAGTCAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYNTVSDWIISTRLQGLPVVTAIIQIYTPTTKAKDEEVENFYELLQSEIHQTCNQDAPVITGDWNVKVGNEERLVVGRYGHGDRNYAEDRMIEFHKTNFFTTNTFFSTT	40688	43643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5777_pilon_+_40700_43600
934008	contig_19143_pilon	-	1491	1	Intergenic	novelGene_177833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	86	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	697	1050	13352	12999	NA	15	CTAGATCTTTATGTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKMLCNISVIWILLRLALWPNMWSLLENIPCVLEKKVYLAAIGWSVRYMSMRSSWLIVAFRSSVSLLSFSLDVLSFTESGVLKSPTIIVELAISLFNAFRVCFMYFGALSGA	14048	12557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19143_pilon_-_12600_14000
934009	contig_14807_pilon	-	664	6	Intergenic	novelGene_124707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4945.40350628743	6	23	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	639	24	662	39773	37253	FALSE	20	ATGAGGGCCTTGGCAGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKDPGVAMGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALH	39796	37250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750
934010	contig_3095_pilon	+	1019	5	Intergenic	novelGene_74977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3099.60936046786	1	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	190	813	149709	151151	TRUE	10	TTGTCCCTTCCTGTATCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147172	152043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149669_149896_150413_150696_150996_151163_151848
934011	contig_5020_pilon	+	1534	8	Intergenic	novelGene_27839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	919.329169802079	2	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	292	1221	122915	125772	FALSE	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118462	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122883_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
934013	contig_6102_pilon	-	1242	8	Intergenic	novelGene_32174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	668.229521854244	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	15	48	448	495	844954	841252	TRUE	45	TAGCATGGAGGACGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRPGRKPRSCHRRGVKSPAAAAREARPPIPLPRSQCECDTPPRGGRRSGRPRPRWGLRGSRPGLPPHATLQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKMIQMKTCLILTVSLR	867346	839329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839993_840273_840299_841192_841256_844910_844955_846136_846188_846753_846824_846979_847094_867134
934014	contig_3018_pilon	-	1321	11	Intergenic	novelGene_78872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	750	junction_3	218.635770174965	1	63	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	355	1065	255	1319	583440	562944	FALSE	70	CAGAAGGAAAAAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYE	585110	562941	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063
934015	contig_3956_pilon	+	2532	14	Intergenic	novelGene_14921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1275.16750959033	2	11	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	518	1554	977	2530	1286220	1290679	FALSE	35	ATTTATTTCAAGATTTCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVCVRPLADPARRPLRHHQPPQPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFL	1281601	1290681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285110_1286157_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289877_1290347
934016	contig_3948_pilon	-	1973	13	Intergenic	novelGene_53333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	416.19415708163	1	82	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	855	1508	1485208	1468427	FALSE	65	GAAATAAATATTTAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHGKLVKLHAVVTEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSEEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTGCPTLR	1510982	1467961	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_1468448_1471778_1471889_1473199_1473354_1482576_1482654_1483424_1483605_1485096_1485237_1485600_1485751_1485883_1485988_1489829_1489929_1490738_1490842_1491191_1491232_1494198_1494313_1510766
934018	contig_12765_pilon	-	2435	2	Intergenic	novelGene_106541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	39	100	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	76	351	174427	6039	FALSE	25	AGTGACAAGGACCTTCCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKFGRQLPGKPTGRNSYLCPFQRKVMQENVEIIKTLSSISHASKILLKIIQKQLQQYIDRELPEIQAGFTRGRVTKDITADVRWILAENREYQKDVYMCFIDYAKAFNCVDHKKYG	174502	3954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12765_pilon_-_6191_174303
934019	contig_15543_pilon	+	549	4	Intergenic	novelGene_164367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2007.711854049	46	24	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTTGAGTAAACATTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230510	236337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15543_pilon_+_230618_232790_232927_235940_236088_236178
934020	contig_5640_pilon	-	938	7	Intergenic	novelGene_27240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	264.845657359569	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	684	85	768	63466	21879	TRUE	35	GGCAGAGGTAATTTCTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKGNNRNKDHSAEGEGAGKRPKRKCLQWHPLLAKKLLDFSEEEEEEDEEEDIDKVQLLGADGLEQDVGETEDDESPEQRARRPMNAFLLFCKRHRSLVRQEHPRLDNRGATKILADWWAVLDPKEKQKYTDMAKEYKDAFMKANPGYKWCPTTNKPVKSPTPTVNPRKKLWAFPSDSSRDLPSPKKAKTEEMPQLNFGMADPTQMGGLSMLLLAGEHALSTPEVLVY	138281	13934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5640_pilon_-_14009_21782_21894_41179_41248_45441_45638_57925_58169_63304_63476_138206
934021	contig_7629_pilon	+	3747	1	Intergenic	novelGene_153557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	94	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGGTTTAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	234904	238651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7629_pilon_+_234900_238700
934022	contig_2093_pilon	+	1549	1	Intergenic	novelGene_153003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	202	609	223	831	1418890	1419498	NA	30	AAGACATTCCCTATTTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLIFIPFGSEHRLTQPHFLQTPCAETGPSSLYPNCWRESSSDWAENPEQGSRSPPDSEGHWLPGPPAAVDAPITSAPLGYCCSWNQAQSFFAPLDITFAQQAGPPQGSCLQPHRVSPGMSHPAWPFLPSSPAMSRSCLIAESLRARKRCPPSVLSPKPSSVHIFSPFWSPLPQLYQSPLQGPPTRTEDPFSYHRQDQHRPW	1418667	1420216	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2093_pilon_+_1418700_1420200
934023	contig_5586_pilon	-	1153	5	Intergenic	novelGene_143575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGGTTTAAGAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	430616	391110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5586_pilon_-_391238_392797_392875_392971_393126_416879_417011_429952
934024	contig_3747_pilon	+	1809	4	Intergenic	novelGene_24783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4715.0061152311	3	62	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	332	802	201313	204199	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETQGFCGGDIIDCGNNIRP	200981	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202402_204143
934025	contig_10311_pilon	-	1694	11	Intergenic	novelGene_50473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1030.17346112196	4	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	452	1243	68953	65773	FALSE	45	AAGAAAGCATTTGAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI	71559	65321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_65918_67180_67261_67491_67582_67823_67962_68264_68409_68643_68754_68868_69038_69821_69948_70224_70358_70446_70493_71497
934026	scaffold_12124_pilon	-	2511	1	Intergenic	novelGene_22396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	20	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	318	2192	2509	1508404	1508087	NA	30	TCTAACCCAGCTGTGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVR	1510595	1508084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1508100_1510600
934027	contig_9705_pilon	-	3117	1	Intergenic	novelGene_41714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	77	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	99	300	2	301	132879	132580	NA	20	TTTCACTGTAGGTATTGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEKFQWSYQTKTDWEEGPGDGLLKKLASENLMDSGGTLSDVMLKDEPLRLEGTQNKIGEELPPQSRVDLNDVGRVKLSGRSFGDVTRLKMRENSCKHP	132880	129763	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_-_129800_132900
934028	contig_8330_pilon	+	1949	14	Intergenic	novelGene_71800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	16	junction_1	550.965886679043	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	203	1306	852673	856687	TRUE	40	CAAGAAGTACGAATCTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837607	857544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837683_838848_838908_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
934029	contig_3747_pilon	-	2819	8	Intergenic	novelGene_24863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	114	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCGCAAACCGTCGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205183	201014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202460_202640_202741_202867_203127_203227_203384_203496_203613_203766
934030	contig_9177_pilon	+	744	7	Intergenic	novelGene_32622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	23	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCAAACTCACAGGCCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21210	24760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_21392_21610_21689_21869_21972_22740_22896_23253_23356_23962_24025_24696
934031	contig_5981_pilon	+	1772	9	Intergenic	novelGene_35491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	326.423804279038	1	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	392	1179	80	1258	23508	37804	TRUE	15	TTATTTTTTGTGTCACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGGGSGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYNGKTTKLQLSKNVLCSACNGQGGKSGAVQKCGACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEGEVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQEKEHEVFQRDGNDLHMPYKIGLAEALCGFQFTFKHLDARQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVRGEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPEVPNVIGDTEEVELQEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEEGSSHHGPGVQCAHQ	23428	38416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5981_pilon_+_23586_25399_25624_28120_28202_28458_28593_29980_30178_34582_34728_35629_35758_37612_38118_38215
934032	contig_10734_pilon	-	2094	4	Intergenic	novelGene_51006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	655	junction_3	198.061157782697	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	93	698	320632	311551	FALSE	10	AGCCTTAGTGTTCTGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEVAEGGFLDIDVEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320724	310154	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320452
934033	contig_15087_pilon	+	1807	5	Intergenic	novelGene_37266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1175.97417063471	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	39	620	284653	301944	TRUE	25	GGCAGCTAATTATTTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLLMQAPLLIALGLLLVGPAAPARVLLIQQGSFSWDNCDKGKDPAVIKSLTLEPDPIAIPGDVTVSVEIKTSVPLESPQKVELTVEKEVAGFWVKIPCVEQIGSCTYADFCNVLDSFIPPGENCPEPLHTYGLPCHCPFKTGTYSLPKSNFTLPELELPGWLSTGNYRSKIILSNKNKRLGCVKISASLKGK	284614	303245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_284743_289297_289451_301237_301421_301788_302173_302286
934034	contig_19604_pilon	+	1951	4	Intergenic	novelGene_77251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	285.545092761196	3	85	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	44	403	273206	273988	TRUE	20	GAACAGCAGGTCTCCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	273162	275816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_273319_273484_273577_273833_275301_275580
934035	contig_17144_pilon	-	1422	8	Intergenic	novelGene_29216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1835.9090391411	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	226	531	174597	173344	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVSALQDPPPQALWPSPSHSLHPADALHPLAPARPLE	174938	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166363_167581_167676_167918_168060_168162_168333_173152_173450_173575_173751_174572_174761_174876
934036	contig_854_pilon	-	3377	15	Intergenic	novelGene_36692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.06031501455085	1	83	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2115	2504	1710643	1709595	TRUE	10	CAGCTGGGCCTCCACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1716403	1704613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1704687_1704891_1704997_1705282_1705432_1706741_1706994_1709118_1709343_1709524_1709719_1709988_1710148_1710536_1710663_1711558_1711662_1711781_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715071_1715208
934037	contig_610_pilon	-	1536	4	Intergenic	novelGene_76733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1454	junction_2	812.289904460771	6	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	111	842	252557	214183	FALSE	15	GTGGATTCCTGAAGTTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCYRGKEWYLVLELLLLPQLFRVNSIQARSEHRVFAVTGSTTSLDVPKPGSYQRFAWIYLADSQKIVETNVNQQPTWFQPALQGRIHLENNGTLNIYRVQKNDSTEYLLQALETSGVEQESLFLLEVHDPVSKPVIKAEEKKEENSSCYLKLLCETSSKSVNYTWYVDSALSQQEHQNAVFEIPLKPEYHPKSFTCKVSNPASSQSDKVYFIPPCDVARSSGVAWIATWLVVMVPVVLSLLLP	252667	213488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_214263_220517_220785_234998_235302_252475
934038	scaffold_12124_pilon	-	3467	9	Intergenic	novelGene_22332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2141	2476	1508404	1508069	TRUE	35	ACTGAAACCTCCAACCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510544	1483572	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1484066_1489006_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
934040	contig_10197_pilon	+	595	1	Intergenic	novelGene_115305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAAAGAATGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1345598	1346193	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10197_pilon_+_1345600_1346200
934042	contig_7963_pilon	+	3002	8	Intergenic	novelGene_58469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	140	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	28	87	222	308	120635	120945	TRUE	20	CCTATTGGTTGGTCTAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSSAWAWILGLGTRLPVVHALPEAVPVVLPSDEPFLPLSQSFHSLLLPHPPLPPPLPPRSSHCYFPHWRTQKMIWPDQGGKAVETGKGPGSRGSSGITHL	120290	126470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_120366_120488_120709_120932_121969_122067_122271_122358_122489_122993_123131_123745_124053_125576
934043	contig_3956_pilon	+	2050	9	Intergenic	novelGene_15157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1239.87831434177	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	497	1494	36	1529	1281682	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281646	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1286115_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289181_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934044	contig_3956_pilon	+	1988	11	Intergenic	novelGene_15002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1381.82411688319	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	81	692	1281682	1285731	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELLLPAPMARSCPGRSASSSWTPSSRCLMQS	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284176_1285100_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287387_1289848_1289892_1290297
934045	contig_6059_pilon	+	1916	14	Intergenic	novelGene_44860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGCTCCGCTGCAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	568035	581105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_+_568245_569144_569237_569823_569951_570652_570746_571300_571456_571539_571653_572866_572958_573165_573444_575792_575882_576079_576218_576549_576653_578193_578326_580594_580702_580916
934046	contig_10990_pilon	+	2779	19	Intergenic	novelGene_7449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	432.315628296197	1	117	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	784	2352	427	2778	722423	752120	FALSE	35	TTTCAGAAATGATTGATAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATAVRSVTVKLHWEMKPSAPYGRKGAASDRCAGFGTWRSIEIPCYWENQPMGCQKLNCAFHHNRGRYVDGLFLPPSKTVLPTVPESQEEEVKASQLTVQQNKLSVQSNPSPQLRSVMKVESSENVPSPTHPPVVINAADDDEDDDDQFSEEGDETKTPTLQAPPEVHNGLRVASARKPGVTVKQGECLNFGIKTLEEIKSKKMKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSSKQVVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEAPETNIDKTSKKVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVAVVPLLSEDKSVTVPETEKTRDSLVLSPTHSSSDPSPPEVSGPSSSQTATKTRRLSSASTGKPPLSMEDDFEKLIWEISGGKLEAEIDLDPGKDEDDLLLE	708549	752121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_714557_714612_715933_715994_722232_722425_723512_723633_729682_729796_731217_731422_731545_731663_731913_731995_733027_733139_733956_734008_736162_736262_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751451_751520_751885
934047	contig_14357_pilon	+	1163	1	Intergenic	novelGene_121691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	217	543	594531	594857	NA	15	GTCTTCTCTGAGCATAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCPTYVRRSLAILASKEHSGCTSSKTDLALLAVHGLVNTLRQHHNSNASSLLWSSLFTVQLSHAYEATVNIMAWVRHTLVLKVTFLPFSTFRRSFADLPNAIHPLIS	594314	595477	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_594300_595500
934048	contig_2799_pilon	-	2089	1	Intergenic	novelGene_85595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	139	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1074	1376	781803	781501	NA	25	ACCGAGCCCATCAGCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKAVWASFSTRTLQPIRSFSSRTWKHRRTRHWRWVGVHVRGQRTQGQWERELVSTEQEAAASAERKQVSRRSLRPLLVLQMQGHLEKCKPRIKKKFGKN	782876	780787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_-_780800_782900
934049	contig_8978_pilon	+	2585	14	Intergenic	novelGene_49465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	224.733688549872	1	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	1576	2496	1755032	1772309	FALSE	45	TTTTTCTCCTTAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680847	1772398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1684923_1685023_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1754683_1754906_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
934050	contig_6102_pilon	-	3682	25	Intergenic	novelGene_31898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.199826313471363	346	39	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACATCAATCTGTATATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395258	373435	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373726_373902_373955_374378_374499_374585_374777_374896_374973_375259_375312_375445_375539_375643_375730_375966_376037_376205_376292_378875_379031_379329_379482_379612_379782_379949_380037_380158_380206_380311_380635_380897_380968_381061_381150_393004_393143_393275_393433_393538_393639_393722_393855_393928_394034_394219_394270_394465
934051	contig_5684_pilon	-	690	3	Intergenic	novelGene_81031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	559	junction_2	876.5	1	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGCAATAGGAGATTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361460	351298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5684_pilon_-_351696_358661_358810_361315
934052	contig_8814_pilon	+	2984	5	Intergenic	novelGene_167756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	152	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTCCAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	309085	336537	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8814_pilon_+_309870_310276_310305_334164_334404_334541_335901_335963
934053	contig_15449_pilon	+	1577	4	Intergenic	novelGene_33609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	419.380760434026	4	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	77	559	49356	54584	FALSE	65	CCAATAAAAAAAGAAAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKRRFPGSMEGFVTLDEVGDEEDSELQKLRKSGMAFKSGDKNDDGLVEIKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETEYSLQQPSSLSEIKEISE	49279	55602	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_49557_50962_51189_51889_51932_54570
934054	contig_5302_pilon	-	2262	8	Intergenic	novelGene_81415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	576.07163670176	2	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	81	246	189	434	185066	181901	TRUE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSL	209159	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177099_180987_181107_181210_181374_181900_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
934055	contig_10225_pilon	+	2319	4	Intergenic	novelGene_86863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	480.832611206852	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	387	1164	1058	2221	46473	47636	FALSE	30	TAAACATCTTGATTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	43080	47734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_43688_44942_45259_46110_46197_46424
934056	scaffold_12124_pilon	+	1647	1	Intergenic	novelGene_22413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	97	294	200	493	1509112	1509405	NA	45	AAACCTTCATCTAAAGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508912	1510559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508900_1510600
934060	contig_3956_pilon	+	3162	15	Intergenic	novelGene_15070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1233.17301035556	1	64	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	843	2532	107	2638	1282731	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYAVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282707_1282913_1283793_1283976_1284054_1284258_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934061	contig_8538_pilon	+	2442	1	Intergenic	novelGene_4647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	112	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	609	1830	543	2372	841232	843061	NA	15	TAGTGTTGTTTATTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840689	843131	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840700_843100
934063	contig_4924_pilon	-	1478	13	Intergenic	novelGene_84672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1076.70139262884	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	20	865	252576	82429	TRUE	15	ATGTCCCTGTGGCGTCTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPP	252595	64047	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82434_114617_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
934064	SIRV7	+	1335	1	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGTGATTTAGGTCCTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1038	2373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1000_2400
934065	contig_5899_pilon	+	1525	1	Intergenic	novelGene_146989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTCATTAATATTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	506787	508312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5899_pilon_+_506800_508300
934066	contig_6902_pilon	+	3156	15	Intergenic	novelGene_135592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	481.364790179433	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	953	2859	298	3156	462106	496871	FALSE	60	GAAAAAGAAGGAGAAAAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQDGHQNKNSMKKKKVPPAQPKPGVTAPPEVAPVPKSWASNKQGGQGDGIQVNSHFQQEFPSLQAAGDQEKKEKEANDDNYGPGPSLRPPNVACWRDGGKSAGSPSPSDQDEKLPGQVDSTAATSEQNDILKVVEKRIACGPPQAKLNGQQTALASQYRAMMPPYMFQQYPRMAYPPPVHGPMRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSSEDQGPKSSENTENRKEADEVNSTKSSSQIPAQPSVAKGPYGKGALFNQERGTSSHLPPPPKLLAQQHPPPPDRQAVPGRAGPFPPKQQVPDEDEIWKQRRRQQSEVSAAVERARKRREEEERRMEEQRKAACAEKLKRLNEKLGIVEKQPSPEEIREREREKEREREKELEKEQEREREKEKERERERQQEKEKELEKEQEKQREMEKERKQEKEKELEQQWEKEKELQKTREQEKECELEQKEGEKVEEKVESKEPALEPVIEKQESENSSTKEEEPVFTRQDSSRSEKETTQVAHETEPESGAQPRPAVLSGYFKQFQKSLPPRFQRQQEQMKQQQWQQQQQQGILPQTVSSQPSSGAVPPPPHRPLYQPMQPHPQHLASMGFDPRWLMMQSYMDPRMMSGRPTMDIPPIHPGMIPPKPLMRRDQMEGSPNSSESFEHIARSTRDHAISLSEPRMMWGSDPYPHAEPQQATTPKITEEPEDVRPEAPLEQEQITPAYPVEHSQLDSHPKVDFLRESCETEVQKFLSRSVEDIRPHHSETNNLSACFEVSDQKTISTPQEEQISAGESQPVLKRSVSHGSNHTQKSEEQRNEPSVSIPKVTSRCIDSKEPAERPEEKPKKDGFIRSSEGPKPEKLYKSKSETRWGPRPSSNRREEGNDRPVRRSGPIKKPILRDMKEEREQRK	460254	496871	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_460420_461973_462152_463511_463614_465111_465238_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471537_471683_473716_473771_489731_490357_493532_493703_494121_494372_495313_495525_496273
934067	contig_9836_pilon	+	4322	3	Intergenic	novelGene_176159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	439	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	2827	3312	30923	224698	FALSE	25	GGTGTTTCTGGACAAGAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRSRKKKIKAVLAANKWHSESQLVQAGVSGQETVSVGSRGGRVWVKKGREWESICHKLPDLCSPSGRSKDGARSEVLERKEGEVGRGKEEIRRSGIKATPAANKWHSESHLFGCVESMQPLFPGEETVAAGSRGGAQYFSPPSSTGRVSHSDMVRQGRSS	28037	225708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9836_pilon_+_30560_30618_31330_224619
934068	contig_3469_pilon	+	3889	2	Intergenic	novelGene_34234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	1941	2459	631870	632388	TRUE	20	ATGCTCTACATTCTACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPVGVQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFIENTDKKLEEVRKIMQEQNAKINSQLGQKQLEIQKINNKISEIDDVIEGLRSRFETVEDRISGIENKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRATWDTIKSKNFRVIGIPERGEKRKHREDH	629929	633949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_633212_633342
934069	contig_5727_pilon	+	2043	9	Intergenic	novelGene_7964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1304.70331277843	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	326	1288	176719	179323	FALSE	15	ACTTGATGTAGTTGTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAPKHFLPEMLSRVIILSLDRSDEDKEKASSLISLLKQEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPKLEVDIPLVKSYLAQFAARAIISELVSISELAQPLESGTHFPLFLLCLQQLAKLQDREWLTELFQQSKVNMQKMLPEIDQNKDRMLEILEGKGLSFLFPLLKLEKELLKQIKLDPSPQTIYKWIKDNISPKLHVDKGFVNILMTSFLQYISSEVNPPSDETDSSSAPSKEQLEQEKQLLLSFKPVMQKFLHDHVDLQVSALYALQVHCYNSNFPKEEAFLAWKEDITQEFPGKGKALFQVNQWLTWLETAEEEESEEEAD	175551	180078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_175589_176202_176318_176462_176570_176652_176869_176954_177214_177545_177751_177921_178134_178272_178344_179257
934070	contig_11422_pilon	-	1032	1	Intergenic	novelGene_99044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGTGTTAGTAAAACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1776	744	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_700_1800
934071	contig_10930_pilon	-	1442	1	Intergenic	novelGene_37076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGGTGCCTGGGTATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289055	287613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_287600_289100
934072	contig_7357_pilon	-	1579	9	Intergenic	novelGene_36836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1921.20056458846	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	418	1257	212	1468	166824	136424	FALSE	15	TTCTTGCAAACTGTTTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEGKETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167035	136312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154555_154721_154861_155079_159911_160034_166772
934073	contig_10734_pilon	-	2083	10	Intergenic	novelGene_51500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	489.627774972674	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	563	1621	2274500	2265543	FALSE	40	ATCCATCAACGTAATACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305178	2265080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2286322_2286447_2304960
934074	contig_1150_pilon	-	619	3	Intergenic	novelGene_61410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	50907	junction_2	11072.5	18	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTGACTGTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	311051	308928	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1150_pilon_-_309385_309812_309927_311002
934075	contig_7730_pilon	+	1413	1	Intergenic	novelGene_156268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCATTTCCTGGAGGCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95805	97218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_95800_97200
934076	contig_9807_pilon	+	2148	15	Intergenic	novelGene_32858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	480.712295686817	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	109	1926	109130	158783	FALSE	35	AACCACGTGTGGAGCATAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPFEIKKVFASLPQVERGVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGDHSRFVNCVRFSPDGNRFATASADGQIYIYDGKTGEKVSTLGGSKAHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDKTSKIWDVNVNSVVSTFTMGSTVLDQQLGCLWQKDHLLSISLSGYINYLDKNNPSKPLRVIKGHSKSIQCLTVHKNGGKSYIYSGSHDGHINYWDSETGDNDSFAGKGHTNQVSRMTVDEAGQLVSCSMDDTVRYTNLTLRDYSGQGVVKLDIQPKCVAVGPGGYTVVVCIGQIVLLKDQKKCFSIDPDYEPEVVAVHPGGDMVAVGGADGNVHLYSILGSTLKNEGKTLEAKGPVTDLAYSQDGAFLAVCDASKVVTVFSVADSYSENNVFYGHHAKIVCLAWSPDNEHFASGGMDMMVYVWTLSDPETRVKIQDAHRLHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVKEWTITY	109021	159005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109146_109556_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139399_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_148960_149049_151711_151820_154095_154270_156624_156770_158676
934077	contig_3956_pilon	+	2820	15	Intergenic	novelGene_15209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1082.03108333639	2	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	307	1473	1284120	1288915	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTAPGQVGPHGAVHHRGVGRAHHRGGWRAAPGDLPEGPGGGPRLYPHQEIRPGGLVPGDCQ	1282853	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287382_1287503_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934079	contig_10324_pilon	+	2491	14	Intergenic	novelGene_7750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1199.42745216947	10	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	464	1395	17	1411	69965	79380	TRUE	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVIAMVMSLLFIVLLRFLAGIMVWVMIIMVILVLGYGIFHCYMEYSRLRGEAGSDVSLMDLGFQTDFRVYLHLRQTWMAFMIILSILEVIIILLLIFLRKRILIAIALIKEASRAVGYVMCSMLFPLVTFFLLCLCIAYWASTAVFLSTSNEAVYKIFNDTACPVAGRTCNPETFPSSNESQLCPGARCQFAFYGGESGYHRALLGLQIFNAFMFFWLANFVLALGQVTLAGAFASYYWALRKPDDLPAFPLFSAFGRALRYHTGSLAFGALILAIVQIIRVILEYLDHRLKAAQNKFAKFVMTCLKCCFWCLEKFIKFLNRNAYIMIAIYGTNFCTSARNAFFLLMRNIIRVAVLDKVTDFLFLLGKLLVVGSVGILAFFFFTHRIRIVQDTAPPLNYYWVPILTVIVGSYLIAHGFFSVYGMCVDTLFLCFLEDLERNDGSAERPYFMSSNLKKLLNKTNKKSTES	69948	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_70062_72928_73061_73143_73244_73328_73422_73582_73668_74487_74751_74831_74927_75797_75902_76009_76084_76199_76271_76440_76530_78365_78451_79273_80253_80559
934080	contig_3956_pilon	+	1960	9	Intergenic	novelGene_15238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1246.20824278088	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	442	1329	111	1439	1286220	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284683	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284765_1286190_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289790_1290297
934081	contig_8594_pilon	-	2298	1	Intergenic	novelGene_140019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	707	1048	164374	164033	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNRHFTKEDIQAANRQIRKCSRSLVIREMQIKTTMRCHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCREIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIEIPYDPAIPLLGIYPREIRTIT	165080	162782	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8594_pilon_-_162800_165100
934082	contig_11258_pilon	-	1405	7	Intergenic	novelGene_67821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	129.647813539433	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	5	865	360591	328661	TRUE	10	ATGTTTCTGTGGATCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMTQWDCATWLPSALLLLLVPGCVTLSGPSTVTGVVGESLSVQCCYEEQFKENDKYWCREQLAPIGPCDKIVETSGSEREKTKGRVSIRDHPAQLSFTVTVKNLTVKDGGQYWCGISKRWWKDGVYSRDPTFQVMISVFPAPMSSTPTSPTTSTATTEGLLVPSTALATVMEDEGTYWCGIALKWLKDGAYPFDPAFQAVVSVSPATSSTPTSTTTSTTTTEGPPVLSTTLTTAGATHSTSSQENSKQSQSLRVELLHRVFLAAIFMEADCQDFLHGAAWWVQTANL	360595	327107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_327648_328660_328767_330514_330657_332213_332319_353055_353146_354741_355099_360530
934083	contig_2100_pilon	-	1451	11	Intergenic	novelGene_50714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	824.766930714369	1	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	84	1316	1182812	1170057	FALSE	15	TAAGAGTGCTCTCTCTGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQMPSLTIWNPVGNRSCVIL	1185494	1169921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170114_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
934084	contig_1867_pilon	+	1057	1	Intergenic	novelGene_54528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTTGTTCCTGCATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277346	278403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1867_pilon_+_277300_278400
934085	contig_3956_pilon	+	2602	13	Intergenic	novelGene_14953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1187.70296511095	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	81	1502	1281682	1289148	TRUE	10	TGGTGGTGACTGTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRSTSGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1281601	1291001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1289072_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934086	contig_6361_pilon	+	2886	5	Intergenic	novelGene_23977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	166	510	405360	405704	TRUE	45	CAGAATCTCACCAGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405194	436319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415389_415503_419464_419589_420868_421008_436290
934087	contig_6102_pilon	+	1865	13	Intergenic	novelGene_31926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	397.063806795163	2	60	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	3	548	379956	393075	TRUE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	379953	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393560_393640_393746_393856_393929_394036_394221_394276_394523
934088	contig_17144_pilon	-	2375	16	Intergenic	novelGene_29368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1884.16615922152	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	131	1882	174965	166562	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGALPPL	183208	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166753_166843_167248_167328_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_174973_181776_181850_183158
934089	contig_5302_pilon	-	2577	9	Intergenic	novelGene_81456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	733.717322526189	1	108	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	889	1215	181300	177220	FALSE	25	TTTTAATTTAATGTTACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209558	175857	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181367_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185970_186076_209142
934090	contig_6102_pilon	+	2970	23	Intergenic	novelGene_31843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	538.081972080171	2	68	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	1643	2494	380930	394507	FALSE	35	CGGTGAATGGAAAGCAACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370728	394983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372935_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374496_379425_379491_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
934091	contig_9833_pilon	-	3557	2	Intergenic	novelGene_68470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	110	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	774	1295	215789	215268	TRUE	75	AAAAAAAGAAAAAGACCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	216562	48624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_50015_214395
934093	contig_7963_pilon	+	1076	6	Intergenic	novelGene_58364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1176.26789465666	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	93	482	51450	57459	TRUE	5	GCTGGGTGACTCTGTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEAPEVTVFPKEPVELGQNRL	51357	63342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57281_57332_57447_57564_57782_57934_63003
934094	contig_4486_pilon	+	1152	2	Intergenic	novelGene_38617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	927	junction_1	0	1	55	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAGAGTGTGAGGTCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411215	413474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_411318_412424
934095	contig_8377_pilon	+	1879	18	Intergenic	novelGene_35010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3913	junction_1	2363.2817938981	1	78	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	609	1827	52	1878	68257	180455	FALSE	50	ATGAACACAAAAGATGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKI	68205	180456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
934096	contig_16496_pilon	-	704	2	Intergenic	novelGene_5235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAGTAAAATCCACCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3591	764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1330_3452
934097	contig_14970_pilon	+	2010	10	Intergenic	novelGene_44976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5954.04083142048	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	132	578	136145	191898	TRUE	25	AAACCCTGGAGGTCCTTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITIIM	136013	232140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191890_192205_196136_196257_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
934098	contig_610_pilon	+	1480	2	Intergenic	novelGene_76770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCACCGCAGCCACCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227716	229300	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_229090_229193
934099	contig_15047_pilon	+	1613	6	Intergenic	novelGene_52217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3061.42317231708	8	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	317	954	15	968	2194	4686	FALSE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRSHHPISDREATLRCWALGFYPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2179	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3460_4179_4434_4552_4687_21013
934100	contig_3975_pilon	+	1035	6	Intergenic	novelGene_54859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGACACGGTGTTAGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2056462	2079207	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_2056950_2059897_2059964_2060049_2060245_2065824_2065941_2066196_2066303_2079142
934101	contig_3956_pilon	+	2260	11	Intergenic	novelGene_15015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1466.37096602463	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	81	875	1281682	1284867	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDR	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284878_1285012_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287389_1290357
934102	scaffold_12124_pilon	+	2850	10	Intergenic	novelGene_22358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3826.20673129632	1	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	949	1512	1508626	1509259	FALSE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQFSPASPWVPCG	1486527	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494321_1496979_1497122_1506629_1506687_1508017_1508120_1508221_1509154_1509223
934104	contig_6870_pilon	+	377	1	Intergenic	novelGene_103936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAATAAAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1168441	1168818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6870_pilon_+_1168400_1168800
934105	contig_7229_pilon	-	628	3	Intergenic	novelGene_39815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3961	junction_1	46.5	8	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	186	561	21	581	877468	875654	FALSE	30	GTTACGTCTACTTAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877488	875606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350
934106	contig_7071_pilon	-	2120	1	Intergenic	novelGene_177742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	124	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2955	835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7071_pilon_-_800_3000
934107	contig_12301_pilon	-	320	1	Intergenic	novelGene_110027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACATTCAATAGAGGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123721	123401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12301_pilon_-_123400_123700
934108	contig_2799_pilon	+	1280	2	Intergenic	novelGene_85521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	698	1240	628487	629596	FALSE	65	GGAAAGAAAAGAATGAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILGKCSVSSSSMILSVFSVFSPCSAIPITRIFLLLIVSHITLRISSFFFVLFSEFSSNRVVSKCLSSIPLILSSTVSDLLLSPSMTSSISEILLFIFCISNCCLCIISSCEFILAFCSYIIFLNSSNFLSVFSMNLFIFSSFLSAFCLSSWRILSIRDLNSLSGELAVGVER	627789	629636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2799_pilon_+_629001_629567
934109	contig_854_pilon	+	3220	14	Intergenic	novelGene_36620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4206.271793687	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	569	1710	167	1876	1702628	1712283	TRUE	20	TACCATGTGCTACATGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGGAALQGAAGQAHGHAEEHQPQLRPLHHPQQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGPGIGGEAAPGGSHRPAGGGAGRGAEQHGAGERSAEEGKPAD	1692683	1716393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692779_1702556_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711756_1711879_1712278_1712488_1715253
934110	contig_17144_pilon	-	1527	9	Intergenic	novelGene_29384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1996.41420739785	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	517	1236	167982	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173650	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168203_172644_172740_173128_173209_173305_173460_173580
934112	contig_3747_pilon	-	2681	7	Intergenic	novelGene_24901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGCTGGCTTTGTTCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205206	201310	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202454_202632_202737_202867_203384_203496_203649_203766
934113	contig_19957_pilon	-	1560	1	Intergenic	novelGene_57741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATGAGGACAATTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	366581	365021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19957_pilon_-_365000_366600
934114	contig_19402_pilon	+	2564	6	Intergenic	novelGene_80825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2492	junction_4	298.072071821565	5	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	72	590	107581	143056	TRUE	30	TAGTTTTCATAGCACAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	107509	145770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802
934115	contig_8377_pilon	+	2000	18	Intergenic	novelGene_34943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3547.78983297516	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	404	1212	789	2000	154883	180509	FALSE	20	GTGAGTCTGTTTTATTACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQVCAFTKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITN	68095	180509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142290_142384_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176717_177273_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
934116	contig_11088_pilon	+	513	2	Intergenic	novelGene_85038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCACCCAAGCCTGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
934117	contig_854_pilon	+	669	6	Intergenic	novelGene_36236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2790.70497186643	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGGTAAGAGCCCCTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543488	562399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557060_557591_557739_562271
934118	contig_5302_pilon	-	2514	5	Intergenic	novelGene_81419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	822.172541198014	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	329	628	209238	181066	TRUE	30	CCTGACCCTGAGGAATAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLEDPGRGQGGEGGQEANHQEATECLHAVHEGDESQGHRRVHAQGKRRHQPDPGTQVARAVSGRTSQVL	209566	175552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_179917_179967_180998_181107_181210_181374_209142
934119	scaffold_13505_pilon	-	1584	7	Intergenic	novelGene_111530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	484.789788350465	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTTTCTCTCCTTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	602302	588571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_588944_589242_589279_590169_590259_594013_594138_596976_597232_597627_597907_601873
934122	scaffold_12124_pilon	+	3245	9	Intergenic	novelGene_22280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	3288.74724439261	1	62	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1276	2055	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473576	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490225_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497145_1507994
934123	contig_9297_pilon	+	2352	9	Intergenic	novelGene_69864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	303.369308764087	2	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	167	1465	909195	912242	FALSE	25	ATTTACACTGGTCTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSLVAAVLLLLGAAHAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDVGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVNDP	908945	913129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9297_pilon_+_909014_909096_909317_909406_909639_910041_910180_910506_910620_910709_911101_911207_911446_911700_911751_912227
934124	contig_10324_pilon	+	1157	2	Intergenic	novelGene_7773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTGTACAGACTCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	79312	80754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_80186_80470
934125	contig_8775_pilon	-	1577	1	Intergenic	novelGene_166827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTCAGCATACAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135098	133521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8775_pilon_-_133500_135100
934126	contig_10930_pilon	-	2538	7	Intergenic	novelGene_37013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2084	junction_4	1028.3606155214	1	89	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	520	1563	35	1597	280370	268388	FALSE	40	ATGCACTGGGAAACTAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280404	267446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
934128	contig_5643_pilon	+	1234	12	Intergenic	novelGene_38842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	2513.96587351999	7	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	60	1022	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233615	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236887_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
934129	contig_17427_pilon	-	2006	8	Intergenic	novelGene_30352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	943.635587739769	2	85	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	53	913	188879	178046	FALSE	10	CTTGCTTCGTTGTTTACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERVVGRLEAVSQASDMHRGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181427_188794_188890_204653
934131	SIRV7	-	413	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113503	0	113325	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	24	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTGTTAATATGAATCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1413	1000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_1000_1400
934132	contig_3956_pilon	+	907	5	Intergenic	novelGene_15130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2125.56208742535	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	88	783	1284763	1290847	FALSE	30	GTCAGTGCCATTGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPSLARLASFVSAWGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281612	1290971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281658_1284720_1284864_1285066_1285173_1285712_1285807_1290452
934133	contig_8377_pilon	+	2624	9	Intergenic	novelGene_35137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3361.90449884809	1	27	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	488	1315	192235	197939	FALSE	20	GATTCTGCTTCAGCTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	182893	199248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189212_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
934134	contig_5033_pilon	-	2039	8	Intergenic	novelGene_28926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1164.92383915019	1	125	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	148	1080	477189	450673	TRUE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPTEAGGRRWGPVLLAVFLAASRAGLVAAFKVATPYSLYVCPEGQDVTLTCRLLGPVPRSPVHDVTFYKTWYRSSRGEVQACSERRPIRNLTFQDLHLHHGTHQTANTSQDLAQRHGLESSSDHHGNFSITIRNLTLLDSGLYCCLVVEVRHHHSEQRVHGAMDLQVQTASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	477336	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450142_450426_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463022_464547_464986_477113
934135	contig_5623_pilon	-	1200	1	Intergenic	novelGene_154811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	76	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TTAAAAAAGAAAAAAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	206766	205566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_205600_206800
934137	contig_17144_pilon	-	1202	7	Intergenic	novelGene_29563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1681.51754376813	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	46	372	174965	173705	TRUE	20	GCAGCCCCACCCACTAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLGGETGAPHTGDPGPQP	181849	166145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166770_167612_167676_167918_168002_173644_173751_174568_174761_174876_174968_181806
934138	contig_4519_pilon	-	1502	3	Intergenic	novelGene_123679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATCACAGTCTTTGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81318	78911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_-_78935_79731_79866_79973
934139	contig_5331_pilon	+	3819	2	Intergenic	novelGene_112799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGCGGAAAAAAGCAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	597341	601512	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5331_pilon_+_600766_601117
934140	contig_6740_pilon	+	699	1	Intergenic	novelGene_142689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGTCTATCCTATATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625014	625713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6740_pilon_+_625000_625700
934141	contig_4857_pilon	+	4900	3	Intergenic	novelGene_48728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	179	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	2422	3417	1194283	1198618	FALSE	25	GCAGAGGCTTCTGGACAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRRQTITNHLQKQDRMVPVGVQNKTPDDSSLEENALALPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENMDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLAIQKINNKISETDNVTEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRITWDTIKSKNLRVIGVPERGENRKHRDIQKSVGFLYTNKENHEKEIRKTIPFSIAPKKRKYLGINLTRDVKDLYQENYKRLLQETQRELHKWKNIPCSWIDRLNIVKMTILPKAVYKYNAIPIQIPTTFFKEMEKLIINFIWKGKKPRISKALLKKKNKVGGLTPCHI	1191861	1200101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_+_1194851_1197946_1198361_1198604
934142	contig_11855_pilon	-	1505	12	Intergenic	novelGene_66949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1956.83677110799	1	11	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	432	1299	98	1396	1102035	1079293	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN	1102132	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079259_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
934143	contig_7229_pilon	-	2371	3	Intergenic	novelGene_39803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3961	junction_1	46.5	2	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	123	737	877522	875654	FALSE	40	ACTAAAGCAAATGGACCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRVRRGGRKRPVPKGATYGKPVNHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHREMRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR	877644	874019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_-_875960_876729_876867_877350
934145	contig_9363_pilon	-	1009	7	Intergenic	novelGene_6589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	597.151479014236	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	13	42	530	571	754472	754431	TRUE	35	GAAGTGCAAGAGTATATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFSQNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	756176	753797	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754113_754307_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756088
934146	contig_3956_pilon	+	2965	12	Intergenic	novelGene_14865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1222.39086281255	2	165	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	608	1827	84	1910	1281682	1289956	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281598	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284132_1286129_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289545_1289586_1289677_1289758
934148	contig_5935_pilon	-	1087	1	Intergenic	novelGene_102672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	71	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTATTCCCCCCCCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	509592	508505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5935_pilon_-_508500_509600
934149	contig_4232_pilon	-	262	1	Intergenic	novelGene_63354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCAGAAGATAAGGGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467348	467086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467100_467300
934150	contig_7202_pilon	-	535	3	Intergenic	novelGene_18572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	112080	junction_1	13872	2	4	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	46	471	29911	28004	FALSE	25	CATTGAGACTCATTACCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTASPSQVRQNYSQDSEAAVNRQINLELHASYVYLSMSYYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIVLHDIKKPDYDDWESGLNAMECALQLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHVSIGNQGMHGRN	29956	27939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_-_28169_28486_28634_29797
934151	contig_5605_pilon	-	1502	5	Intergenic	novelGene_143928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	20	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCCCACAGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	379280	143908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5605_pilon_-_144974_214818_214826_262751_262814_368342_368580_379149
934152	contig_15063_pilon	+	1548	5	Intergenic	novelGene_9760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	3	12	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	239	1411	34808	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27130	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934153	contig_7357_pilon	+	2722	5	Intergenic	novelGene_36837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	1669	2046	139801	154908	FALSE	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSCIPMLASRQVPLLPLTLYLDTDGFSGTGEGGGRVVGFGLGGAVVGEISSCLQCVSSLLKLLLERYAWMVASRSVIVMLFMCIWLLLTHLYFLSMSARMSVVDSTVLSPLELALGKTSVSDKL	137332	155584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_+_137737_137820_139060_139775_139973_154561_154720_154860
934154	contig_7207_pilon	-	4867	1	Intergenic	novelGene_72091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	667	129	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	423	3522	3944	710238	709816	NA	20	ACTGCTGTTCATAAGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLFQSVGQVAVFQISWHRRVLPVLHPFVETSQLILHQFLEPCFFPVPSVQLGLLPSVPSVPNDMLPLEMVERQPVLFGTVTVYSFHLLLMLPVSLNIFLIESFTIATRGLNYFISFSLRNAEHVLPFWFSVSSSLHTTL	713759	708892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_708900_713800
934155	contig_7093_pilon	-	2077	1	Intergenic	novelGene_157970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	32	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	203	612	253	864	86374	85763	NA	40	ATGTTTATTTTCACCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNRGIRIGGRLGNNLRYADDTTLLAENEKDLKHLLMKIKDHILQDGLHLNIKKTKILTTGPISNVKINGEKIEVVKDFILRGSTINTHGTAVKKSNDNCIGQIYCKRPLYTPALLARVKNTGNNKRWRGCQEIGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPRQIRVVARIDICTPMFMVALFTIAK	86626	84549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7093_pilon_-_84500_86600
934157	contig_7396_pilon	-	2891	16	Intergenic	novelGene_79552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3260.87790769432	1	142	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	405	1574	252437	246442	FALSE	50	GGAAATACAGTAATTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFQSQTAVAPSGMSISADIETIGEILKKIIPTLEEGLQLPSPTATSQLPLESDAVECLNYQHYKGSDFDCELRLLIHQSLAGGIIGVKGAKIKELRENTQTTIKLFQECCPHSTDRVVLIGGKPDRVVECIKIILDLISESPIKGRAQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRRGRPVGFPMRGRGGFDRMPPGRGGRPMPPSRRDYDDMSPRRGPPPPPPGRGGRGGSRARNLPLPPPPPPRGGDLMAYDRRGRPGDRYDGMVGFSADETWDSAIDTWSPSEWQMAYEPQVEYHYSYAGGRGSYGDLGGPIITTQVTIPKDLAGSIIGKGGQRIKQIRHESGASIKIDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVKQYADVEGF	257456	245124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7396_pilon_-_246476_247186_247357_247718_247802_248183_248278_248552_248608_248753_249062_249736_249866_250240_250355_250851_250924_251447_251512_252390_252442_253919_253977_254602_254701_255105_255191_255295_255381_257381
934158	contig_1244_pilon	-	1496	12	Intergenic	novelGene_38020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1070.01213401632	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	422	1269	58	1326	948448	922962	FALSE	25	ATATTTATGCTTTTTATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQASWGCPGTDHVRDSCEAAP	948505	922791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923022_923726_923827_924214_924349_924583_924715_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
934159	contig_14525_pilon	-	954	6	Intergenic	novelGene_149760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	306.46148208217	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAGGAGCAAGGGTAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141734	134618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14525_pilon_-_134744_135621_135700_135835_135940_136972_137036_140186_140260_141223
934160	contig_10437_pilon	-	1715	9	Intergenic	novelGene_38211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAACCGAGTCTTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	233456	230309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_-_230373_230569_230681_230900_230962_231067_231116_231342_231437_231619_231745_231940_232052_232160_232325_232518
934161	contig_7707_pilon	-	965	1	Intergenic	novelGene_72143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	11	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAGCATACAGATTGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127734	126769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_-_126800_127700
934162	contig_9833_pilon	-	1486	9	Intergenic	novelGene_68558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GCATAATACCTTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260328	249393	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_249495_250050_250180_251067_251170_251778_251891_252272_252455_254641_254809_256793_256962_258502_258606_259906
934163	contig_12297_pilon	-	1422	1	Intergenic	novelGene_161375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	259	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTAGTTTTTGTGTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	711209	709787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12297_pilon_-_709800_711200
934164	contig_8447_pilon	+	1779	9	Intergenic	novelGene_69409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	416.317618381687	1	89	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	25	1053	54617	82214	TRUE	50	AACACTCACACACACAGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QQKQQVEKMEQEHAVRRREEAKRIRLEQERDCARFQEQLKLMKKEVKTEVEKLPRQQRKDSMKQKMEEYVQKKQLLDQEFLAKQKEDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNQTLKEWRDKLRPRKKALEEELNQKKREQEMFFKLSEEPECLSPPTPNKATKFFPYSSADAS	54592	83484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_54728_61158_61252_65556_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71963_82073_82527_83070
934165	contig_10437_pilon	+	2904	9	Intergenic	novelGene_38207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	141	junction_1	517.83105353001	1	108	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	955	1575	229668	231447	TRUE	5	TTCTTCTTCTCTTCGGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKVG	228713	233275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231751_231947_232055_232163_232318_232510
934166	contig_4232_pilon	+	843	1	Intergenic	novelGene_63396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	245	3	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACCTCTGCGCTCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467266	468109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_+_467300_468100
934167	contig_7207_pilon	-	1206	6	Intergenic	novelGene_72080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	126	junction_5	192.99575124857	3	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	300	900	306	1205	696514	671669	FALSE	70	AGAAAAAGGAAAAGAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEEKKDE	758450	671667	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671791_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_758376
934168	contig_6576_pilon	-	2549	1	Intergenic	novelGene_42436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	83	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTGTGTGGTTAGACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304281	1301732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1301700_1304300
934169	scaffold_14128_pilon	-	2285	1	Intergenic	novelGene_169531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	81	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGTCCCATACGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543615	541330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_541300_543600
934170	contig_6175_pilon	-	989	1	Intergenic	novelGene_16354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGGCTAATTCCTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1695547	1694558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6175_pilon_-_1694600_1695500
934172	contig_17144_pilon	-	2343	15	Intergenic	novelGene_29302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1679.77219817304	1	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	239	720	1457	2176	167982	166363	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183221	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166202_166329_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_172569_172740_173271_173405_173575_173751_174572_174761_174876_174950_175973_176260_179696_179786_181794_181850_183158
934173	contig_3155_pilon	+	1556	2	Intergenic	novelGene_26423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	82	426	259928	261405	FALSE	30	ATGAAGTTGCATTACACCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQVPDLASTPWLPSQCCSARSHAGSQRPRNSAEGKLLHGWLRWWLHHLVRSQGHLCAGKDITYLQHFSQCNCFSHINLKLQFRHMLLGCLSGAQTFRHFSNLIRTHVMVAVPS	259846	262535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259950_261082
934174	contig_18168_pilon	-	1433	7	Intergenic	novelGene_122066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	304	junction_3	72.7774385064187	3	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	9	1049	27110	23837	FALSE	15	TATGTGGTGATCTGCTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPWTLLLLLLGVLVLAMTQTRAGSHSLRYFRTAVSRPGPGEPQYILVGYVDDTQFVRFDSYAANSRMEPRAPWMEQEGPEYWDEQTRIAKGNAQISRVSLRTALGYYNQSDNVSHTYQRMYGCEVGPDGRLLRGYSQYAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARAAENVKAYLEGKCVESLRRYLENGKEMLQRTDAPKTQVTHHPISEHEVKLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDMELVETRPVGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLSLRWKSHSQSTVLIMGIIAALVLFVIVAVVAGAVIWRKKSSGGNRGNYALAAT	27118	23452	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18168_pilon_-_23842_24381_24415_24823_24935_25038_25315_25964_26241_26483_26754_27040
934175	contig_10500_pilon	+	2176	8	Intergenic	novelGene_41281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAGAACTAGCAGCTATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626884	1640220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1627148_1628634_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637069_1639874
934176	scaffold_13505_pilon	-	3165	2	Intergenic	novelGene_111604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCTGATATCCTGCAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	660841	654721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_657861_660815
934177	contig_6902_pilon	+	1783	11	Intergenic	novelGene_135578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	621.311363166649	2	94	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	912	1271	469856	471644	TRUE	65	GAGAAAGAAAGAAAGCAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRFPPSLSETNKGLRGRGPPPSWASEPERPSILSASELKELDKFDNLDAEADEGWAGAQMEVDYTEQLNFSDDDEQGSSSPKENSRIKVQNPLKTLKTEKKQMKLTALNHLLRYLPSHQ	434427	490151	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6902_pilon_+_434630_460253_460420_461973_462152_463503_463594_466890_467115_469804_469891_470397_470532_470611_470700_471541_471683_473716_473771_489731
934178	contig_9833_pilon	-	3938	4	Intergenic	novelGene_68507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	147.85353112681	3	89	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1452	1973	215789	215268	TRUE	35	CTGGACAGAGCTAGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	221929	213059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214577_214819_216720_217382_217711_221736
934179	contig_3956_pilon	+	1616	7	Intergenic	novelGene_15270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1125.77642343209	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	121	1101	1287527	1290491	FALSE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDHGAQLHAREEGGPIPEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1286539	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286594_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934180	scaffold_15027_pilon	+	1677	14	Intergenic	novelGene_163557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	160.555360136742	1	98	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	538	1614	63	1676	48927	102845	FALSE	60	AGACTGAAAACGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGARLSWSRLDRKQELEVRELVRHVTGLQDEADPNFQLAQHFAWSNLRFHRFLDVNSHKIEKTIKGIYEKFIIHSDLSKAASWKRLTEEFLNASLPSIKEIKDSRPPWISRTACRTASFNIYVHAFIEFPQGSRHCRAPDIFSVNYVGTPRDKEVEKKDDFDWGKYLMEGEEIDFVPSVDTPNWSEESEDEDDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQLPNRKPGPRVSWKGNGRSWLEEHVVLQYWTARSLWFPHSLHLHSNLAVVWDQHLYSSDSLYVPDDRVFVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKITVRNNIVVTHLTHNCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVRGHSSDGVLPGNSSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFIGFKEELTEIEKYIINNDTTVTLSIVVDKLSPRLAQLKVLHRVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDSVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLFDCAKEFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSE	48864	102846	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_15027_pilon_+_49073_55949_56004_56116_56226_66198_66324_76447_76483_76889_76970_77393_77533_81952_82059_82609_82700_83479_83574_88155_88403_90039_90243_91101_91218_102775
934181	contig_5686_pilon	-	1259	2	Intergenic	novelGene_45466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCAATATCATCTCATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	224408	222021	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_222912_224039
934182	contig_8377_pilon	-	2964	1	Intergenic	novelGene_35068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	23	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAGAATACGCAATAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121453	118489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_118500_121500
934183	contig_6576_pilon	+	3070	12	Intergenic	novelGene_42260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	107	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	2383	2793	330326	337938	TRUE	10	GACGGCCTCGTTAGCCGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQSPGGMPGITGGIPGISGGTPGINGGYLEAFLVLLGPVADLAVPLEGYNLAEVEQAVVEMKLMLQSHHHHIHQNHLVASFFDSLAFSVQEVVVFHPCLFLEYLPYHIFPILYLFSQVLHLVQHLLSLYLPACNE	321070	339565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_322685_322833_323000_323861_324104_325444_325540_326530_326689_329123_329193_330287_330338_330837_330908_331023_331197_332093_332229_337917_338052_339401
934184	contig_2703_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_101853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATCTGATATCAGCAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1407447	1406597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1406600_1407400
934186	contig_7457_pilon	-	1833	8	Intergenic	novelGene_31419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	146.71226873005	1	113	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	283	750	471570	469327	FALSE	15	TTTCCTTTAGCATTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPSRGYDDLQTIVPTCQQQDFSIGSQKLSKAIVLQKTIDYIQFLHKEKKKQEEEVSTLRKDVTALKIMKVNYEQIVKAHQDNPSEGEDQVSDQVKFNVFQGIMDSLFQSFNASISVANFQELSACVFSWIEEHCKPQTLREIVIGVLHQLKNQLY	473218	468243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471290_471559_471667_471948_472027_472726_472768_473151
934188	contig_14666_pilon	+	1745	4	Intergenic	novelGene_39592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1730.26863681787	1	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	261	1445	483215	484940	FALSE	50	AAAAAAAAAATGTCTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPGLSWWTWSLGPWTASDLANLEPSSSPTVLSTVGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477254	485240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483321_483861
934190	contig_6847_pilon	+	3406	13	Intergenic	novelGene_143866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	103	junction_12	489.204534309412	2	145	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	483	1452	1230	2681	77788	110600	TRUE	30	AGTTGATATGCAGCTGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP	76558	112304	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102184_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110630_111608
934191	contig_6086_pilon	-	3374	1	Intergenic	novelGene_171455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	14	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	2513	2854	27154	26813	NA	65	GAAAAAGATGAAAAGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDSIKRNNLRVIGVPEQGGGIRENTERIVEDLLAENFPHILKDEKISVQEAHQTTHKVDPKRKSPRHIIIIIAKTKDKERILRVTRDIRKVVYKGESMRISSDYSAGKKAMG	29666	26292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6086_pilon_-_26300_29700
934192	contig_9482_pilon	+	1783	8	Intergenic	novelGene_44315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	159	480	1028	1507	1240897	1242621	FALSE	35	AGTCAGAACTGATTCAACGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLWFRWLKRTGENRDLGILHFLWHLGVTEILVHDDALDELRVLQPPAHLALHLDELEVHISALHVCHCEDGVHRDLGHLLVTAVHHFGAQGGLGRLDQGLGVHHVHEDTVADEVQVLNGDAGGLLIAIGDPDGVDPAVQQLFCLLQQGSGQDCKQPG	1236140	1242897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_+_1236493_1237258_1237440_1238171_1238316_1238940_1239102_1239796_1239899_1240809_1240965_1241039_1241233_1242402
934193	contig_10892_pilon	+	2465	3	Intergenic	novelGene_116731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCAGTGTTTGTATGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1068	160061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10892_pilon_+_1972_23677_24742_159563
934194	contig_9696_pilon	-	2155	1	Intergenic	novelGene_68817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	79	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	104	315	1262	1576	394303	393989	NA	35	ACTTCCCCAATATGGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQTGPTGTCPALIPCLHCQPGMCHKQPIPATPLHLDLPCCTIPEWLTLPIGEGGEKYRAHRRPNNKECRACLLSHNQIKQKSRTKQTTLQSINEENNHLMPQRQ	395564	393409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9696_pilon_-_393400_395600
934195	contig_5600_pilon	+	1142	3	Intergenic	novelGene_174950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	441	914	92795	93905	FALSE	30	TGCTATTTGGAAATATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLQLWKLIWCFLKKLEIEGPYNPAIPLLGIYPREIRAITRIDTCTLMFIAALFTIAKRWKQPRCPSTEEWINKLWYIHTMEYYAMIKNNDEAVKHLLTYRKLHNWTKPKLRSFLNTIKHFEGQSSRGMVPGFSISPELKQFPRPTLQTGIGLDCGT	92354	94133	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5600_pilon_+_93104_93322_93396_93813
934196	contig_5023_pilon	-	2160	13	Intergenic	novelGene_7318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	504	854	647062	639176	TRUE	25	GCAGGGGAGGGGGTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGFLGVSWPKRPGREWWSQPTHWTSHPLHSSPHEASEHCHDHFGVHFNQVFWKGIHSCSNFSGHGNGIFCIVELLLSIQVLSLQKVIVNGTWLNGINEIQNGQTGANLWVLETGDA	647565	607252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608100_609595_609723_611684_611741_618521_618666_622525_622623_625647_625849_629214_629287_630196_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
934197	contig_12326_pilon	+	1339	1	Intergenic	novelGene_177635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	53	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATATTGAGGAAGTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123127	124466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12326_pilon_+_123100_124500
934198	contig_15087_pilon	+	2876	1	Intergenic	novelGene_37238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	146	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAAAGTAAAGACAAAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	170223	173099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_+_170200_173100
934199	contig_1452_pilon	-	2055	3	Intergenic	novelGene_115139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1178	4	98	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	52	660	715391	699652	FALSE	60	AAAAATTAGGAAAATAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQVGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698256	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700680_715228
934200	contig_14807_pilon	-	701	7	Intergenic	novelGene_124704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	8380.06827073755	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	164	637	38669	37247	FALSE	30	CGTTGCCTATCAATAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLRRASKILVSPWAAAKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37503_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38868_39760_39796_39900
934201	contig_3956_pilon	+	2237	13	Intergenic	novelGene_15075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1404.24155092111	2	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	81	779	1281682	1284841	TRUE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWGLLSEPGKWRT	1281601	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284732_1284801_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287378_1289833_1289892_1290297
934202	contig_177_pilon	-	2981	1	Intergenic	novelGene_41842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	81	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	107	324	1467	1790	418661	418338	NA	25	TGGTTGGAGCAATGGCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHNLEETMSKLLANEGIDDGVEAAVEEAQNLGNIQSPANVTAALTGLLDYPNPHEGICNQNQVVGQPAEQEDEHDGKDDPHGLVLLPHVGLEQCAQGESIAEQHD	420127	417146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_177_pilon_-_417100_420100
934204	scaffold_12124_pilon	-	3006	11	Intergenic	novelGene_22247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	25	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2067	2402	1508404	1508069	TRUE	5	TGGCGCCGGAGGGCGGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510582	1473571	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1473668_1486527_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007_1508646_1508757
934205	scaffold_4438_pilon	-	2617	1	Intergenic	novelGene_174553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	2190	2498	422904	422596	NA	5	TTCCTGTACTCCGTGTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQAVFKRKEGEEVTGTEETKRGQKKATQQQRNGSDEASQCGQGESVWHGTSTSHATVVACREPVDWPIGKPGISPLGNWELAHQEAVNLSSRKLGLDPPGR	425093	422476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_-_422500_425100
934206	contig_3956_pilon	+	1757	8	Intergenic	novelGene_15124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1332.38206201663	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	74	1057	1281682	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVRPLLGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281608	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285189_1289833_1289892_1290297
934207	contig_17144_pilon	-	978	4	Intergenic	novelGene_29277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	770.862287744489	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	195	683	167257	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183206	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167299_181744_181850_183158
934208	contig_12079_pilon	+	2732	9	Intergenic	novelGene_67546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2025	2336	863558	867268	TRUE	20	TGTCTCCATATTATCGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNSTRVLTLLFKSFRASNDRFWSFSRVSMLGPGVLADQVEHGDQVLEQHEIGPGEFICHCLRASILSSSLCLSRAPIHSSNRSLDSSFRGILRRKSLKNHSQ	860694	871521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862630_863468_863581_864501_864578_864618_864698_866537_866650_867246_867409_868245_868414_871103_871170_871499
934209	contig_6163_pilon	-	1354	1	Intergenic	novelGene_103771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	128	384	971	1354	6934	6551	NA	40	TGGAGTAGGAACTATAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPYHLAISLLGTYPREIRAITQTDICTPMFTAALLTTGNRWKQPKCPTRMNWINKLWYIYTMECYAMIKNNDEFVKHLMTWINLEDIILSEISQSQKDKYCMIFTIIKKKKFTHRKKQSFEVGPRW	7904	6550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6163_pilon_-_6600_7900
934210	contig_13021_pilon	+	2202	13	Intergenic	novelGene_8190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_11	2058.39324305526	2	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	616	1851	138	1988	174676	180850	FALSE	35	GTTTTCACAGAAGTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174538	181064	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
934211	contig_4812_pilon	-	1193	6	Intergenic	novelGene_103635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7352.51487315735	3	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	246	662	81738	79235	FALSE	20	GCTAAGTATTGTCTGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSRTEGNIDDSLIGGNASAEGPDGEGTESTVITGVDIVINHHLQETSFTKEAYKKYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAEQIKHILANFKNYQFFIGENMNPDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKC	82678	78703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81286_81547_81814_82252_82343_82598
934212	contig_6898_pilon	-	3407	10	Intergenic	novelGene_35743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1577	1903	124838	122725	TRUE	25	CAGGGTAAAATTTGGCCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127701	114318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_114525_115894_116817_117863_117962_119611_119776_122610_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126062_126874
934213	contig_6439_pilon	+	2594	2	Intergenic	novelGene_154252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTAGACTACTATCTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	391267	480090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6439_pilon_+_393529_479757
934214	contig_6576_pilon	+	2198	2	Intergenic	novelGene_42435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	237	944	1301867	1302574	TRUE	35	TGAGAACAGAGAAGTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1301630	1304273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1303180_1303624
934215	contig_17936_pilon	+	1891	9	Intergenic	novelGene_29961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	818	junction_1	733.505187013016	13	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	264	1040	91140	121021	TRUE	25	TACTATTACCAGCCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	79202	126576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
934216	contig_13021_pilon	+	2210	13	Intergenic	novelGene_8199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2570.71993807182	2	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	511	1536	376	1911	176597	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174611	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175898_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
934217	SIRV7	+	2096	4	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	79	2	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAACTTTTTAATCCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	114895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_2679_2996_3111_3808_3901_114683
934218	contig_11548_pilon	-	2201	12	Intergenic	novelGene_66743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGACGGGAAGAGAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	120473	63650	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_-_63821_84720_84810_86979_87079_96085_96198_101989_102178_102442_102573_112801_112902_117681_117854_118973_119121_119346_119399_119488_120167_120209
934219	contig_7963_pilon	+	2211	6	Intergenic	novelGene_58559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	188.571896103317	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	641	1351	247659	250348	TRUE	15	GTACAGTGGTTTCTAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHSRLQGDVFQAVLRQETEFFQQNQTGAITSRVTEDTSTLSESLSEKLNLLMWYLVRGLCLLGLMLWESLTLTMVTLVTLPLLFLLPKKLGKWEQLLAVRVQKSLAESSQVAIEALSAMPTVRSFANEEGEDRRFRQKLQEMKTLNKQEALAYAVTYWTTSISGMLLKVGILYIGGQLVTSGTVSSGNLVAFVLYQIQFTTAIEVRSLQFHSPVLSLPPSQYQLCSFPSIYPSYIT	247018	253515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_247738_248514_248721_249146_249345_250120_250597_251106_251216_253012
934220	scaffold_12124_pilon	+	1796	11	Intergenic	novelGene_22290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3280.10360964406	2	86	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	190	558	1490385	1508244	TRUE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVALPGL	1473578	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508224_1508929_1509023
934222	contig_2933_pilon	+	1252	1	Intergenic	novelGene_111329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	61	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATTTATAGTACCAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	641967	643219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_+_642000_643200
934223	contig_2703_pilon	-	1778	11	Intergenic	novelGene_101758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGCCTGGCAAAGTGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611725	578764	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_578913_582629_582674_596349_596399_599670_599819_602056_602132_603469_603515_605150_605220_606090_606164_607654_607730_609318_609396_610750
934224	contig_6589_pilon	+	1671	1	Intergenic	novelGene_25711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	282	623	443128	443469	NA	90	ATTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKDHSLQYGLHLNIKKTKILTTGSISNIMINGENTEVVKHFILLGSTINTHGSSSQEIKRHIALGKSAAKDLFKVLKSKDVTFRTKVYLTQAMVLSVASYACESWTTNKED	442846	444517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_442800_444500
934225	contig_17427_pilon	-	2584	13	Intergenic	novelGene_30329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	1132.22608902404	2	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1344	144	1487	188788	178046	FALSE	15	CTTCGTTGTTTACCTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METALQKVSNRAAPHVQAFDSLLAGPVAEYLKISKEIGGEVQKHADMVHTGLKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	204695	176948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417_186496_188038_188140_188757_188890_204653
934227	contig_3956_pilon	+	2142	13	Intergenic	novelGene_15232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1147.57603233947	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	634	1905	39	1943	1284252	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWHFFPFLQRETQTSKKI	1284213	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290368_1290767
934228	contig_1406_pilon	-	3160	1	Intergenic	novelGene_25679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	133	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGAGGAGAAACTGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3747491	3744331	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_-_3744300_3747500
934229	contig_17144_pilon	-	1594	9	Intergenic	novelGene_29455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2374.0233748586	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	165	498	157	654	179764	167672	TRUE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNLPHPDDLGPG	183238	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_167946_174894_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
934230	contig_10058_pilon	-	2440	9	Intergenic	novelGene_67722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGCCCGCACTAAACTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101620	72533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_-_72663_97060_97132_97297_97404_97628_97777_98057_98259_98434_98538_98695_98882_99530_99968_100561
934231	contig_8377_pilon	+	1709	17	Intergenic	novelGene_34941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3505.29593470277	1	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	471	1416	209	1624	136354	177449	TRUE	25	GCTGCACAAGGTAATCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPCN	68095	179463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136298_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177349_177445_177508_179436
934232	contig_13021_pilon	-	2095	12	Intergenic	novelGene_8177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTGCCGGCCGCCTCCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	181117	174509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174719_175893_176060_176403_176499_176586_176721_176845_176904_177142_177284_177370_177526_177618_177792_178170_178281_178521_178606_179970_180083_180459
934233	contig_12402_pilon	-	849	3	Intergenic	novelGene_133360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGTGTATGCGCACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537432	531072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12402_pilon_-_531109_534445_534711_536884
934234	contig_11639_pilon	-	383	1	Intergenic	novelGene_151152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAACAATCACATGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	34648	34265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11639_pilon_-_34300_34600
934235	contig_9235_pilon	+	1376	3	Intergenic	novelGene_156227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	300	1316	45805	46865	FALSE	25	CTCTGGAAATGTCAACTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIQTTHHCWSGIQPQ	45107	46925	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_46775_46818
934236	contig_4924_pilon	-	2160	12	Intergenic	novelGene_84685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	427	junction_3	1032.40672842275	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	484	1455	20	1474	252576	65524	FALSE	70	GATTAATGTAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252595	64837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
934237	scaffold_12124_pilon	+	2081	10	Intergenic	novelGene_22310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	166	543	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473602	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
934238	contig_3956_pilon	+	3016	15	Intergenic	novelGene_15021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1289.74902636924	3	69	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	804	2415	81	2495	1281682	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIIIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284222_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285783_1286157_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934239	contig_3832_pilon	-	2411	1	Intergenic	novelGene_161494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGCTCTTCTTCGTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486895	484484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3832_pilon_-_484500_486900
934240	contig_12125_pilon	+	1298	1	Intergenic	novelGene_76222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTTGGCCAGGTAGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	354703	356001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_354700_356000
934241	contig_3948_pilon	-	2184	6	Intergenic	novelGene_53191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	310.388788457315	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTGTCTTGCCATGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	869614	839121	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842657_847881_847947_856652_856712_866355_866480_869571
934242	contig_401_pilon	+	1757	10	Intergenic	novelGene_42815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	683	junction_2	1119.04444466509	2	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	61	1023	1711949	1715475	TRUE	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGALTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGSYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF	1711888	1716440	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712624_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713704_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716
934244	contig_10749_pilon	-	1228	12	Intergenic	novelGene_133457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1488.8387842946	2	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	77	1027	155250	136250	FALSE	25	ATTTAGTTTTATAAGCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIITLAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEVCCSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLESPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	155326	136048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143641_144588_144628_145189_145263_149595_149671_150658_150788_151767_151892_153550_153676_154232_154266_154356_154381_155181
934245	contig_7321_pilon	-	2783	1	Intergenic	novelGene_53106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	67	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	154	465	2102	2566	12092	11628	NA	35	TGCACTGATTTTTAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKNFSQSVGSLFTLLVKSSDELKCLIFRRSQLSSLSSGVRVLLVMVFILLMLCIRASSIDPMFSSMNFIVFGFIFRCLIHFELVFVYGVRCGSCFICFADGHPVLPAPFVKKTVCSPFDGLWALVKTRLLKVDGFTSGFSILYHWSVYLSLYR	14193	11410	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7321_pilon_-_11400_14200
934246	contig_16611_pilon	-	1333	2	Intergenic	novelGene_177713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTGCTTAGTGCCTATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62946	61559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16611_pilon_-_62791_62844
934249	contig_3956_pilon	+	1930	11	Intergenic	novelGene_15208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1270.39170730921	2	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	308	409	1284120	1285075	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVF	1282852	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284213_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287328_1289599_1289677_1289758_1289892_1290297
934250	contig_13863_pilon	-	2076	21	Intergenic	novelGene_41989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	113	12	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCAGAGAAATCCTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	81628	55043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_-_55189_55284_55385_58893_58994_60727_60812_60881_60980_61928_62006_62782_62836_63953_64052_64636_64685_65631_65754_67555_67604_68694_68740_69371_69459_70273_70372_70467_70555_73200_73318_74716_74814_75878_76080_76187_76264_77547_77705_81490
934251	contig_6576_pilon	-	3060	12	Intergenic	novelGene_42261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	635.747103937792	1131	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1479	127	1605	339439	322526	FALSE	40	GATATAAAGTTGACTTCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRKKKKQLKPWYCNRDFDDEKILIQHQKAKHFKCHICHKKLYTGPGLAIHCMQVHKETIDAVPNAIPGRTDIELEIYGMEGIPEKDMDERRRLLEQKTQESQKKKQQDDSDEYDDDDSAASTSFQPQPVQPQQGYIPPMAQPGLPPVPGAPGMPPGIPPLMPGVPPLMPGMPPVMPGMPPGLHHQRKYTQSFCGENIMMPMGGMMPPGPGIPPLMPGMPPGMPPPVPRPGIPPMTQAQAVSAPGILNRPPAPAATVPAPQPPVTKPLFPSAGQMGTPVTSSSTASSNSESLSASSKALFPSTAQAQAAVQGPVGTDFKPLNSTPATTTEPPKPTFPAYTQSTASTTSTTNSTAAKPVASITSKPATLTTTSATSKLIHPDEDISLEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMPGYLPGAMPPYGQGPPMVPPYQGGPPRPPMGMRPPVMSQGGRY	339565	321070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_322687_322835_322996_323858_324102_325444_325538_326528_326687_329121_329193_330287_330336_330837_330914_331028_331197_332093_332233_337921_338049_339404
934253	contig_12125_pilon	+	1230	1	Intergenic	novelGene_76245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	116	351	177	527	577928	578278	NA	15	GGACCGGGCACTGTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSDGSWLKAENSRKMFTCVLLTMQRHSTVDHNKLWITLRRMGILEHLIVLMRNLYIDQEAVIQTEQGDTAWFKVRKGVCQRCILSLYIFNLYAKQIIREAGLYEEEHSIRTGGRLH	577751	578981	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12125_pilon_+_577800_579000
934254	contig_5023_pilon	+	2255	11	Intergenic	novelGene_7302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2428.21257100774	1	88	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	441	1326	42	1367	607279	647385	FALSE	50	AGATCTCTCCAAATAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSDFNHLLTEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDCSPPSQKVTPLWPTSAGHPCLWAFGASDKPVSLFESQEIWMVYKSSLITRNFPQNWGPKCHQFLCFPPGRSSLFLTVGFGLVLELTHL	580887	648273	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609698_611662_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625733_647118
934255	contig_3956_pilon	+	2238	10	Intergenic	novelGene_15003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1431.57104410539	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	970	1719	1287410	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284829_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289064_1289758_1289892_1290297
934256	contig_11978_pilon	+	414	4	Intergenic	novelGene_63082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6366	junction_3	2590.68849707735	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	411	4	414	1829081	1831222	FALSE	45	GAACACATCCATAAGCTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILM	1829077	1831222	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161
934257	contig_10437_pilon	+	1580	7	Intergenic	novelGene_38273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	719.443477047827	3	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	119	1087	431167	451212	FALSE	30	CTATCATTGCCACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGKHSAGASTLVTKDIFEWQEIVEITVALLVFPLTQKSRGCLHSIKSQER	431048	451705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445488_451075
934258	contig_14925_pilon	-	1482	5	Intergenic	novelGene_55270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	928.495389056941	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	36	449	116065	114666	TRUE	10	GCCTTTGGCTTGATTCATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116100	112091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_112146_112298_113277_114664_114779_115150_115208_115821
934259	contig_5324_pilon	-	2366	2	Intergenic	novelGene_102064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	100	567	444408	443941	TRUE	20	TGGCATATGAGTGTGCATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFAAKELSRSAKKCDKEEKAEKTKIKKAIQKGNMEVARIHAENAIRQKNQAVNFLRMSARVDAVAARVQTAVTMGKVTKSMAGVVKSMDATLRTMNLEKISALMDKFEHQFETLDVQTQQMEDTMSSTTTLTTPQNQVDMLLQEMADEAGLDLNMELPQGQTGSVGTSVASAEQDELSQRLARLRDQV	444507	442016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5324_pilon_-_442425_442549
934260	contig_7730_pilon	+	5725	2	Intergenic	novelGene_156308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGCTCTAAACTCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	470259	476057	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_471341_471413
934261	contig_10437_pilon	+	1591	8	Intergenic	novelGene_38301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	959.457414694495	2	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	49	981	431167	451096	FALSE	30	TATCATTGCCACATACCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFWKPWREPISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLLGRQLW	431118	451706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447044_451075
934262	contig_3155_pilon	+	2201	3	Intergenic	novelGene_26417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1289	3	95	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	547	867	259780	261211	FALSE	35	ATTACACCTCACTCCAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258830	262545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261088
934263	contig_2069_pilon	-	671	3	Intergenic	novelGene_23533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	940	junction_1	618	3	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	16	297	1509802	1508747	FALSE	10	TCCATTGGCATTGTGTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSTRSMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLA	1509817	1508372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_-_1508813_1508942_1509111_1509754
934265	contig_16496_pilon	-	866	3	Intergenic	novelGene_5230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1982	2	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	98	297	3	299	3591	1185	FALSE	75	TATTTAAAAAAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPKIHGLQKVKHYHCTA	3593	617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1234_1283_1354_3413
934267	contig_3956_pilon	+	2189	6	Intergenic	novelGene_15273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2250	junction_4	510.68291532026	2	42	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	455	1672	1287290	1290491	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1286835	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934268	contig_14513_pilon	-	1251	3	Intergenic	novelGene_70317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_2	1249.5	2	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	189	557	18880	11982	FALSE	15	GAACTCTGCTTTTGTCCATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEQRKLIEQRLLDTLRLQLTDTSAYYTYLLLLLKSAIYLAIVGFCLLRRTAVYGGGKSP	19068	11287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12158_13087_13136_18735
934269	contig_3956_pilon	+	1801	9	Intergenic	novelGene_14922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1622.49304698048	6	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	355	1053	1284838	1289548	TRUE	15	GGCCGCGGAAATGGCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPASSWVRGCWGGVLGLMVFSGLPCRGRCVRRTCGVCALMSMM	1281601	1290702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1284762_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286594_1289418_1289892_1290297
934270	contig_2577_pilon	-	2635	2	Intergenic	novelGene_172077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	537	1796	280425	279166	TRUE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAILPKAIYKYNAIPIQIPATFFKEMEKLIINFIWKGKKPQISKALLKKKNKVGGLSLPDLRTYYTATVVKTAWYWYNDRYIDQWNRIEKPDVNASTYGHLIFDKGPKSIKWGKDSLFNKWCWQNWISICIKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFIEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDNWELLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKSFGQYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLAIREMQIKTTMRYHLTPALLARIKNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPFWKMIWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHNEKEQ	280961	277881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2577_pilon_-_278372_278816
934271	contig_17809_pilon	-	2476	2	Intergenic	novelGene_179237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	120	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	752	1633	2801	1131	FALSE	65	AAATGAAATAGAGAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISRHLRKQDRMAPTGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVVWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNISS	3552	287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17809_pilon_-_1153_1941
934272	contig_8978_pilon	+	2779	13	Intergenic	novelGene_49468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	220.69152679702	1	111	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	848	2680	1749586	1772309	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1680887	1772408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1681172_1684923_1685023_1743815_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
934273	contig_12605_pilon	+	819	4	Intergenic	novelGene_64164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	393	425	817	4816	5865	FALSE	15	GCTTGTGGAGACCAGGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDV	3827	5867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
934274	contig_3975_pilon	+	1117	1	Intergenic	novelGene_54752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACTGAAGCTGGGGTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1825577	1826694	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_+_1825600_1826700
934275	contig_5033_pilon	-	1741	10	Intergenic	novelGene_29057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3290.13405483203	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	187	999	540619	532125	TRUE	10	TGATTTTTGTTTGTTTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	542236	531045	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531205_531541_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092
934276	contig_1725_pilon	-	2778	19	Intergenic	novelGene_24271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	384	842	255470	251033	TRUE	25	CGGCGGACAGAGGAAGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQMSLAYSLIVRSLENFPAAAMFLSTIVFQAFGFLQLTDFFLTLDIGFVVCKDFKPVMIKEHVDYVFEEVRLLGRKEAIINLINDQLQLWKGFIIFVCVIPFLVQSSHIIYPHAEDEQVLFPGFLCHFHIGPIHGSDSQGPIQHKLHIACP	255853	201411	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_-_201704_209774_209855_218440_218554_236018_236132_239623_239738_240047_240107_244919_245067_245295_245389_246540_246690_247022_247188_247649_247759_248347_248446_248573_248724_248851_248911_249014_249160_250982_251187_252128_252263_252709_252775_255364
934277	contig_3747_pilon	+	1199	5	Intergenic	novelGene_24824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	4793.846263701	5	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	330	956	201313	204963	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDKGHWAPFLSIRRPRCSQPLSLYP	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202719_204889
934280	contig_15327_pilon	-	1080	4	Intergenic	novelGene_70657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2871.79634065896	5	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	89	270	108	377	901528	901025	FALSE	10	CATGTGGTGGGGAGTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLGKCYLLAGRLRLSFGPPEAARRSVKWPKTSAFEMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGQTRNRGASRDSPLSEIDRASDPEVAFPEVGEGDRPGFQNRLEVSECGHRRPAGG	902140	900321	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901284_901423_901531_902035
934281	scaffold_12124_pilon	+	2099	10	Intergenic	novelGene_22293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	1	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	188	565	1490385	1508039	FALSE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473580	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
934282	contig_12414_pilon	+	1536	1	Intergenic	novelGene_59602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	290	873	132	1004	373182	374054	NA	15	CTTAGTGTTATGTTCTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	373050	374586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_373000_374600
934283	contig_3956_pilon	-	2833	14	Intergenic	novelGene_15161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1661	2236	1286221	1284227	TRUE	35	GGCAGATACGAACGAGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1290993	1281654	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283976_1284056_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286625_1287874_1288075_1288872_1289228_1289493_1289675_1289756_1289845_1290374
934284	contig_15063_pilon	+	1545	5	Intergenic	novelGene_11778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	10	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	229	1401	34808	36661	FALSE	15	TGCTGGTCCTAAGTGAGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27140	36805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934285	contig_13300_pilon	-	2069	3	Intergenic	novelGene_125762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAATGTTGGCTCTCTCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46877	44712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_45882_45923_46583_46636
934286	contig_17144_pilon	-	1390	10	Intergenic	novelGene_29310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2352.76762689664	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	252	1181	174965	166277	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTDGLPPATGPPDSWGGGNGRLLGLPGTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166425_172638_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176084_181813_181850_183158
934287	contig_10930_pilon	-	2259	7	Intergenic	novelGene_37038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1773.72157404205	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	516	1551	25	1575	280370	268388	FALSE	25	GCAGTCTACTTTTTTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTDAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274313_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
934288	contig_3956_pilon	+	1554	6	Intergenic	novelGene_15192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	1300.35247529276	1	41	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	7	705	1282731	1289755	TRUE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKEPLSP	1282724	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1289738_1289892_1290297
934289	contig_3956_pilon	+	2804	15	Intergenic	novelGene_15179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1082.03108333639	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	823	2472	20	2491	1282731	1290491	FALSE	65	AAAAAAATTTAAAATTAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282711	1290804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287416_1287484_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934290	contig_20641_pilon	+	1866	8	Intergenic	novelGene_52814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1498.25029924365	2	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	64	843	14599	45868	TRUE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAPSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPSIHLYHLSEKCTREREPLGNSCRGHEEVQKESLPVTKLELGPNRRQ	14535	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_44750_44870_45848_45965_54835_54968_56379
934293	contig_5461_pilon	+	1687	1	Intergenic	novelGene_156822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACTGCCCTGAAATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	260533	262220	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5461_pilon_+_260500_262200
934294	contig_13021_pilon	+	2300	12	Intergenic	novelGene_8183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2698.96068763301	3	97	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	165	1997	174676	180850	FALSE	30	TTAAGTGGAAATTGTACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGILFRLMVIYMRFFAEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	174511	181153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178626_178731_179985_180211_180440
934296	contig_15118_pilon	+	3707	15	Intergenic	novelGene_74593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	253.765479069449	1	102	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	332	999	1626	2624	392042	394139	TRUE	20	CATCTCAGCTTCCAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQCESSRESESDGVPSKQDSPGQLRE	378637	399003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_379782_379884_380022_380151_380263_391808_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393461_393559_393684_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
934297	contig_16594_pilon	-	1915	8	Intergenic	novelGene_53843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	130	junction_3	2648.51591096075	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	277	834	240	1073	165546	121101	TRUE	50	ACAATAGACAGCACAAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IAHHLGRKGKPKVAAAAALRAALPGALRTVSERSLERRRGESEKQGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306183	117726	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_306046
934298	contig_11340_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_173922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAACAGTTTATACGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232213	234221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11340_pilon_+_232200_234200
934299	contig_19342_pilon	+	1179	6	Intergenic	novelGene_41098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.13687742827162	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	3	395	3266	5272	TRUE	30	CCTGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASQTLLLLLSGALALTQTLAGSHSLRYFRTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRLEPRAPWVEREGPEYRDEQTRSPRAPHRLSEWTACGGRDLPEVGSHGGALWRGAKIHLSCAVREAN	3263	6762	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3853_5170_5293_5413_5522_5960_5994_6139
934300	contig_3956_pilon	+	2555	13	Intergenic	novelGene_15227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1147.57603233947	1	93	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	444	1335	114	1448	1284252	1289148	TRUE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1284138	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289027_1289081_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934301	contig_6227_pilon	+	1392	5	Intergenic	novelGene_49820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTCAAAGTCTTTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1359532	1373237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1360309_1360506_1360665_1369224_1369462_1372882_1373048_1373181
934302	contig_15838_pilon	-	988	2	Intergenic	novelGene_174347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAAAACAGAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	327631	326580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_327514_327576
934303	contig_21004_pilon	-	1448	1	Intergenic	novelGene_179100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCAAGAGATCAGGAAGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10580	9132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_21004_pilon_-_9100_10600
934305	contig_10126_pilon	+	2465	8	Intergenic	novelGene_105726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	862.825661677363	1	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	280	1155	162049	166639	TRUE	15	AATTTTGATCTGTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPGAQPLGSPRQRVHSLPAGVAAQVRAWQGPAGSATGRLGPLLCLLLAASCAWPGVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCIVSSLHPVGPMQWYRGAGPDRQLVYSFKGGIDRLGRFPRVTNVSDYAKRDNMDFSIRISNITPADAGTYFCVKFKKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSSPMVSGPSARTTAGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTANLSEIIRVPPTLEVTRPPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNLSAHREDVVLTCQVVHDGQPAVTKNLTLKFTAPP	139750	185171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_139837_140716_140794_161932_162305_165408_165724_166334_166667_169472_169607_181522_181575_184074
934306	contig_8377_pilon	+	1279	2	Intergenic	novelGene_34950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCACTGTTCTCCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	68096	69432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68786_68842
934307	contig_15047_pilon	+	1629	7	Intergenic	novelGene_52183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2814.05288981331	6	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	190	573	20	592	2194	4178	TRUE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAAENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3359_3409_3498_4158_4434_4552_4676_20984
934308	contig_11338_pilon	+	469	1	Intergenic	novelGene_6212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAATCTACAGCTTTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11969	12438	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_12000_12400
934309	contig_17144_pilon	-	2280	13	Intergenic	novelGene_29311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	2076.64597869577	1	82	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	612	1839	147	1985	179764	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLASSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170865_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
934311	contig_8377_pilon	+	1876	17	Intergenic	novelGene_35001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3538.04314734855	1	58	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	116	937	68257	164393	TRUE	20	CGTGAGTCTGTTTTATTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGKSNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRKLR	68141	180508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_143450_143589_161226_161394_164387_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
934312	contig_7963_pilon	-	2431	9	Intergenic	novelGene_58482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	657.183276852812	1	118	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	702	1049	125592	123113	TRUE	75	AGAGAAAAAGGAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLIITKL	126293	120297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120825_120949_121069_121572_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123750_124051_125563
934313	contig_13863_pilon	+	1946	12	Intergenic	novelGene_42069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	308.292444612187	1	70	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	337	1014	796	1809	479416	490279	FALSE	35	AGTTAAATTGAGGTGGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKSEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHVKAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	455700	490416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477630_477791_478582_478757_479276_479423_481370_481474_481992_482174_483175_483275_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
934314	contig_16452_pilon	-	2080	1	Intergenic	novelGene_179238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	100	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	733	1782	2982	1933	NA	55	CTCAGCAAAAACAAAACCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIKEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLTKIKDKQRILRAAREKQDVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFRFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	3714	1634	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16452_pilon_-_1600_3700
934315	contig_3095_pilon	+	1231	5	Intergenic	novelGene_75072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	61	825	147241	151151	TRUE	15	CTTAGGTGGAGTTTTCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147180	152243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
934316	contig_4812_pilon	+	897	6	Intergenic	novelGene_103655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAACGAGCGCGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	78910	82678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_+_79240_80221_80339_81179_81286_81547_81739_82268_82343_82598
934317	scaffold_12124_pilon	-	3033	9	Intergenic	novelGene_22362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2192	2527	1508404	1508069	TRUE	80	CCTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510595	1486529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
934319	contig_17560_pilon	-	1946	1	Intergenic	novelGene_167576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	108	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACATCTGTCAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49818	47872	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17560_pilon_-_47900_49800
934320	contig_3095_pilon	+	1236	5	Intergenic	novelGene_75005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	65	829	147241	151151	TRUE	15	TTAGGTGGAGTTTTCAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147176	152244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
934321	contig_13863_pilon	+	2282	11	Intergenic	novelGene_42034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	780	junction_10	666.917806030098	57	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	357	1074	4	1077	98341	118962	TRUE	20	TCACCCAGTGTCCTTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAAGLGARPSLALLLLLAGARGSTGSAFDPVPPRFNVSLDAAPELRWVPVLRRYDLDFLRAAVARVVEERVPRYIYSVVGKLMGMLERFLPQPFTAEIRSVCEVLNLPLTDCLLINLAYESTAFCTSIVAQDSKGHIFHGRNLDYGFQSILRNLTVDVQFIKNGQIAFTGTTFVGYVGLWTGQSPYKFTISGNERGGGWQWEHVIKGLIYRHSMVSWLIRSTLSESNNFAAAVYKLAKTPLIADVYYIVGGMFPGEGVVITRNRDGPVDIWTLDPSNGAWFRVETNYDHWKPVPEEDDRRTPAIKALNATGKANLSLETLFQVLSVVPVYNNCTIYTTVMSAAYPDKYMTRIRHWG	98337	120774	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_98547_99210_99376_104447_104575_105491_105583_110561_110639_113947_114121_114261_114325_115313_115381_116114_116144_118886_118965_119571
934322	contig_14575_pilon	+	2197	21	Intergenic	novelGene_101871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	123.176489233944	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	347	694	20526	26356	TRUE	65	AGAAGAAGCAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17091	63921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20124_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30763_33862_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47300_47376_59252_59376_59882_59985_61543_61641_63867
934324	contig_6189_pilon	-	4407	2	Intergenic	novelGene_164925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	300	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6176	2	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6189_pilon_-_3306_5072
934325	SIRV3	+	534	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4735	1726	2676	495	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	29	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGGTAATAAAGAAGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6679	7213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6700_7200
934326	contig_1725_pilon	+	1939	12	Intergenic	novelGene_24291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	761.343798927455	3	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	247	1215	245349	251163	TRUE	20	TTGGAGCACCTTTCTTACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKACSYSSHRFVGADFHRRHRSLRDRQYEVYAEWGPDYRNHGWGQCGNGRGSRGRELVHLRHEGR	201501	255864	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201709_245309_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_250971_251188_252129_252265_252711_252779_255366
934327	contig_16496_pilon	-	1481	3	Intergenic	novelGene_5205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1982	3	48	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	6	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_434_481_1354_3413
934328	contig_2496_pilon	+	1065	1	Intergenic	novelGene_168510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGAGAGGTTCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18852	19917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2496_pilon_+_18900_19900
934329	contig_12644_pilon	+	1278	10	Intergenic	novelGene_44678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4706.27966880291	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	581	1225	2679113	2680576	FALSE	25	GAAATATGTGTTGGAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVKKRSLLHKLLDLFIPYT	2677218	2680629	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2677396_2677585_2677693_2678054_2678198_2678731_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311_2680450_2680522
934330	contig_7202_pilon	+	1077	3	Intergenic	novelGene_17543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	29	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
934331	contig_9481_pilon	-	2699	1	Intergenic	novelGene_149644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGATGTAGGCTGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135716	133017	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9481_pilon_-_133000_135700
934332	contig_14666_pilon	+	1539	5	Intergenic	novelGene_39611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	2	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	397	1194	73	1266	477340	484940	FALSE	20	GTGAAGTGCTCCCTTTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477267	485213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484395_484556
934334	contig_5643_pilon	+	1275	12	Intergenic	novelGene_38826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	8	43	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	65	1066	233973	237983	FALSE	15	CCACCTCTTTGTTGATTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233610	238192	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
934335	contig_15063_pilon	+	1522	5	Intergenic	novelGene_9301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	868	junction_1	3079.70342525056	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	241	1413	34808	36661	FALSE	75	ATAAAAATTAGAAATAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YLSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27128	36770	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934336	contig_1450_pilon	+	2638	3	Intergenic	novelGene_27416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	886	1	128	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	139	1155	419840	423253	TRUE	70	TCTAAAAGGGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTTLVSATIFDLSEVLCKGNKMLNYSTPSAGGCLLDRKAVGTPAGGGFPRRHSVTLPSSKFHQNQLLSSLKGEPAPALSSRDNRFRDRSFSEGGERLLPTQKQPGSGQVNSSRYKTELCRPFEENGACKYGDKCQFAHGIHELRSLTRHPKYKTELCRTFHTIGFCPYGPRCHFIHNAEERRALAGARDLSADRPRLQHSFSFAGFPSAAATAAATGLLDSPTSITPPPILSADDLLGSPTLPDGTNNPFAFSSQELASLFAPSMGLPGGGSPTTFLFRPMSESPHMFDSPPSPQDSLSDQEGYLSSSSSSHSGSDSPTLDNSRRLPIFSRLSISDD	419701	424771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_419897_422293_424210_424244
934337	contig_11594_pilon	-	1207	1	Intergenic	novelGene_80911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTTCCTTTTCTGTGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	290216	289009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11594_pilon_-_289000_290200
934338	contig_2703_pilon	-	1975	12	Intergenic	novelGene_101759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGATTTCATTGTCTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	611736	578783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_578913_582629_582666_584467_584591_594567_594672_596349_596399_602058_602149_603410_603515_605150_605220_606090_606164_607593_607730_609318_609399_610754
934339	contig_9049_pilon	+	1983	8	Intergenic	novelGene_83135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1538.0454599051	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	327	914	90226	112652	FALSE	50	AAATAGTTGAGTACTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTARFFSFGKDSVVDTFYAIGLVMQFCQSMSLLELLHIYVGIESDRLLPRFLQLTERIIILFVVITSQEEVQEKYVVWVLFIFWNLLDMVRYTYSMLSVIGISYANLTWLSQTLWMPIYPLCVLAEAFAIYQSLPYFESSGTYSTKLPFDLSIYFPYVLKIYLMMLFIGMYFTYSHLYSERRDVLRVFPIQKKKM	88318	113721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9049_pilon_+_88388_89285_89470_90152_90257_95926_96055_104284_104398_108616_108724_111558_111685_112569
934340	contig_6898_pilon	+	3325	13	Intergenic	novelGene_35737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	2352.48453767501	1	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	532	1599	23	1621	104574	125646	TRUE	10	CTGTGACTTGATCTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	104551	127706	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_104637_112970_113067_114251_114527_115896_115981_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_123085_123145_124370_124464_124782_125008_125481_126523_126878
934341	contig_16594_pilon	+	1803	10	Intergenic	novelGene_53844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	786	1124	121092	133143	TRUE	25	GAGCAAGTCCCCCTTTGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEILHLGNILVASQMFGRYYGYLAVAVAAKGTLVADVVAADTVAGVAPCTMGTTLVAGVMHNIEPGGRNAVCCCNCMLARACWYWKIPVLKTAVAPLVFSRAGLFGNGGSTA	117774	272753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121159_124169_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135517_149155_149257_149307_149351_165477_165648_272661
934342	contig_17144_pilon	-	2895	17	Intergenic	novelGene_29542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1761.80323882769	1	117	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	840	2523	102	2624	179764	166363	FALSE	15	ACTGTTTTTTTCTTTCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183183	166091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
934343	contig_20527_pilon	+	1243	2	Intergenic	novelGene_138621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAATTAAAAAAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27637	28931	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_28063_28113
934344	contig_3956_pilon	+	1756	10	Intergenic	novelGene_14929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1514.67273896801	1	21	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	263	792	81	872	1281682	1286416	TRUE	60	ATCCAAAAAAATTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQSAADDHHPPALACDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1290800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284755_1286120_1286224_1286409_1286606_1287276_1287466_1289730_1289846_1290409
934345	contig_18194_pilon	-	2166	5	Intergenic	novelGene_55954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	106.951799891353	1	128	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	126	1142	18897	4642	TRUE	10	CCCTAAGCTCTTGCTGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20411	3352	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_3528_3792_5501_7034_7162_18866_18976_20364
934346	scaffold_12124_pilon	+	1977	8	Intergenic	novelGene_22353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3514.41553186476	1	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1034	1813	1508626	1509405	FALSE	35	GTGGTAAACTTGACTGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1483958	1509569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1484063_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491954_1497034_1497122_1506629_1506687_1508010
934347	contig_6102_pilon	+	2692	7	Intergenic	novelGene_31895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	715	junction_6	456.385071330487	2	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	345	764	373928	374979	TRUE	80	AATAAAACTAAAAGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGR	373405	377313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_375730_375966_376039_376207
934348	contig_1339_pilon	+	3071	1	Intergenic	novelGene_163101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	19	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGCATCATCATAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131906	134977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_131900_135000
934349	contig_13097_pilon	+	2477	1	Intergenic	novelGene_107682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAGATTACAGCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80368	82845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_80400_82800
934350	contig_15047_pilon	+	1632	7	Intergenic	novelGene_52142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2814.05288981331	12	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	28	651	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2166	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4271_4324_4434_4552_4687_21013
934352	contig_5125_pilon	-	2416	7	Intergenic	novelGene_43443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCGCGCGGCGGCGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59990	26399	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_-_26492_35601_35766_49979_50107_53630_53706_53840_53984_54293_54567_58448
934353	contig_3956_pilon	+	3135	15	Intergenic	novelGene_15156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1765	junction_8	816.551521800739	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	858	2577	40	2616	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281642	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934355	contig_3956_pilon	+	1176	5	Intergenic	novelGene_15103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1228.78507071009	2	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	88	657	1286442	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGDLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281605	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1286437_1286606_1287276_1287431_1289833_1289892_1290297
934356	contig_12624_pilon	+	1509	12	Intergenic	novelGene_60952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	14	junction_1	328.055175766375	2	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	130	1092	11640	55160	FALSE	40	GAATCTAGGAAAACTCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGSTVSRVSAARDGAAVDRRTQTDRLPGEFGQIDAGDANPDRTMASSKKKLEGLVAATITPMTENGEINFSVIGQYVDYLVEEQGVKSIFVNGTTGEGLSLSISERRQVAEEWVTKGRNKLDQVVIHVGALSLKESQELAKHAAEIGADGIAVIAPFFLKPWNKDVLINFLKEVAAAAPALPFYYYHIPALTGIKIRAEELLDGIQDKIPTFQGLKFSDTDLLDFGQCVDQNQQRQFAFLFGVDEQLLSALVMGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6073	55577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6196_11632_11708_30348_30423_32960_33049_38761_38820_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
934357	contig_3956_pilon	+	2435	13	Intergenic	novelGene_14867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1397.59132826207	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	557	1627	1284132	1289798	TRUE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHPASWSLSTLWRSSVQSKWSVVSMVS	1281598	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284058_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287400_1289637_1289677_1289758_1289892_1290297
934358	contig_7119_pilon	+	2059	4	Intergenic	novelGene_40915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	190	1350	137033	140225	FALSE	40	AATATCTGATGAACACTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127468	140934	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139247_139667
934359	contig_6898_pilon	-	1527	9	Intergenic	novelGene_35751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	781	1107	124838	122725	TRUE	15	GCCACAGCTCTGAGCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAPAQVPGPCGSALPVLAEPS	127094	116772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_116817_117863_117966_119615_119784_122618_122741_122981_123142_124368_124462_124780_125006_125479_125872_126873
934361	contig_12843_pilon	+	3063	2	Intergenic	novelGene_179239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	97	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGGGAAAGCGCACACCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4024	7217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12843_pilon_+_6100_6229
934362	contig_11307_pilon	+	762	2	Intergenic	novelGene_105262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGGAGTTGTTAACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	302232	307647	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11307_pilon_+_302324_306976
934363	scaffold_13505_pilon	-	1618	2	Intergenic	novelGene_111612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAATAATTGCTGATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	661917	657668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_13505_pilon_-_657704_660334
934364	contig_10225_pilon	+	1745	3	Intergenic	novelGene_86861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1020	junction_2	68	1	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	528	1587	45	1631	42707	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	42662	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_42726_45216_45259_46110
934366	contig_3747_pilon	+	1740	7	Intergenic	novelGene_24846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5418.81696805985	1	75	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	582	1208	202144	204674	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLA	200987	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202137_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203280_204668
934367	contig_16053_pilon	+	2165	3	Intergenic	novelGene_178317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	1618	2163	8178	8723	FALSE	35	CTTTCCCAATATCATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTE	5561	8725	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16053_pilon_+_6207_6258_6387_7333
934369	contig_10734_pilon	-	1132	4	Intergenic	novelGene_51505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	585.750989945576	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	239	829	2267149	2265543	FALSE	70	AAAAAAAGAAAATTATAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2270971	2265239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269468_2270952
934370	contig_5031_pilon	+	3055	1	Intergenic	novelGene_133163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	831	95	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTAAAACAAAAATGATATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5440	8495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5031_pilon_+_5400_8500
934371	contig_10801_pilon	+	2276	1	Intergenic	novelGene_74060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAATGGATATATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361497	363773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10801_pilon_+_361500_363800
934372	contig_10930_pilon	-	1114	5	Intergenic	novelGene_37051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2101.70554252969	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1077	36	1112	280370	274041	FALSE	50	CAGAATGTTAGAAAAAGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDFRSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLS	280405	274038	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_274292_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157
934374	contig_3956_pilon	+	2916	14	Intergenic	novelGene_14834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1525.11880224025	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	617	1854	554	2407	1284132	1290491	FALSE	15	ATGGTGGTGACTGTGTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287992_1288077_1288874_1289190_1289758_1289892_1290297
934376	contig_16999_pilon	+	1642	1	Intergenic	novelGene_84992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAATGCAAATCAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131221	132863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16999_pilon_+_131200_132900
934377	contig_14415_pilon	+	643	2	Intergenic	novelGene_77625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTATTGGTTTTGCCGTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35938	38346	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_36010_37774
934378	contig_11720_pilon	+	729	6	Intergenic	novelGene_43862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3591	junction_5	1586.12251733591	2	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	705	23	727	86302	98467	FALSE	30	TCTACAGAAATGAGCTGCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLEN	86279	98469	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
934379	contig_3956_pilon	+	1434	8	Intergenic	novelGene_14832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1365.69476973504	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	84	701	1281682	1286416	TRUE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRICDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281598	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284198_1286155_1286224_1286409_1286606_1287276_1287327_1290504
934380	contig_11574_pilon	-	1982	5	Intergenic	novelGene_64086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	305.214985706797	1	44	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	49	1386	454111	449890	FALSE	25	TACATATTAGTTCTGTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	454159	449293	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_454081
934381	contig_7368_pilon	-	3955	3	Intergenic	novelGene_158799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATTTAGACTTGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45941	41092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7368_pilon_-_41179_41717_44256_44610
934382	contig_10159_pilon	+	1452	1	Intergenic	novelGene_30815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAGATTAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	452889	454341	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_452900_454300
934383	contig_6735_pilon	-	820	6	Intergenic	novelGene_15794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	774.782446884285	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	32	673	544974	542177	FALSE	45	CCCAGTCCTAAAGTTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGEGSDEISFDPDDLILHECFL	545005	542029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542204_542565_542601_542790_542857_543005_543292_543788_543894_544851
934384	contig_9073_pilon	+	1011	1	Intergenic	novelGene_177400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	269	810	124	933	405856	406665	NA	60	AAAAGAAGAGATTGAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDKTSRKKLNKDKEELNATINQLDLIDIYQTLHPTAANYTFFSNTQGIFSRIDHILGHKASVNKIQSIKILQSIFSDHKHIKVEINNIKSKEKKSSTWKLNILLKNYSVIEEIKDRINKFIESNENENTSYQNLWDITKAVVRGQLIAINAHIQKEERAIIKTLTLQLEKVEREQQKKPSHARRKKIIRAELNEVKNRKTTERVNKSKSWFIEKINKNNKPLTKLTKEKQERKQITHIRNEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLTNLKT	405732	406743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9073_pilon_+_405700_406700
934385	contig_7963_pilon	-	2172	10	Intergenic	novelGene_58468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	610.290964809733	3	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1473	699	2171	125592	120291	FALSE	75	AGGAAAAAAAGAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKPGLSINQWTLLLLACMITMTLLSTPWTSALSSGRWRIVITGTHRSLLLMCGLCSPTAISTIPQTTMLWPWHESYRMCLSSVMPRCQMNPWNQGLYQSLQPCPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREK	126290	120289	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121679_121856_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
934386	contig_17753_pilon	+	764	2	Intergenic	novelGene_105113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGCAAACATCTCTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	145012	146026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17753_pilon_+_145204_145453
934387	contig_20641_pilon	+	2153	7	Intergenic	novelGene_52853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1794.08091604959	1	117	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	35	379	14599	45875	TRUE	45	AATTATGAAACCAGATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKAQTGASEQ	14564	86648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_45848_45965_54835_54968_70265_70299_71366_71525_85286
934388	contig_3747_pilon	+	1617	2	Intergenic	novelGene_24849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	200988	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201534_204134
934389	contig_19812_pilon	-	2212	19	Intergenic	novelGene_100987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	108.184242137723	2	101	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	446	1341	737	2077	38519	15879	FALSE	5	AGTGGTTTTTGTCTTGTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQASLPVQEYLFMPFDQAHKQYETARHLPPPLYVLFVQATAYGQACDKTLSVSIEGSVDEAKALFKPPEDSQDDESDSDAEEEQTTKRRRPTLGVQLDDKRKEMLKRHPLSVMLDLKCKDDSVLHLTFCYLMNLNIMTVKAKVTTATELITPISASDLLSPDSVLSCLYPGDHGKKTPNPANQYQFDKVGILTLRDYVLDLGHPYLWVQKLGGLHFPKEQPQYTVIADHSLSASHMETTMKLLKTRVQSRLALHKQFASLEHGIVPVTSDCQYLFPAKVVSRLVKWVTIAYEDYMLHFTKDIVEAGLAEDTNLYYMALIERGTAKLQAAVVLNPGYSSIPPVFQLCLNWKGEKTNNNDDNIRAMESEVNVCYKELCGARPGHQLLTNQLQRLCVLLDVYLETESHDDSVEGPKEFPQEKMCLRLFRGPSRMKPFKYNHPQGFFSHR	46831	15743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19812_pilon_-_15943_19010_19202_19862_19979_22716_22802_22950_23055_24570_24686_25257_25355_25939_26042_29838_29948_31756_31857_32101_32143_33051_33130_35121_35255_38513_38629_40206_40357_42337_42436_42567_42682_44547_44692_46710
934390	contig_15063_pilon	+	1937	4	Intergenic	novelGene_10610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3105.72288954869	2	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1375	1863	36064	36661	FALSE	20	ACTAACCATGTCTGTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27136	36735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34615_34926_35037_36158_36266
934391	contig_5125_pilon	+	862	1	Intergenic	novelGene_43465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59128	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_59100_60000
934392	contig_3469_pilon	+	2463	1	Intergenic	novelGene_34199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCAACAACATGGATTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531140	533603	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_531100_533600
934393	contig_16594_pilon	-	4074	9	Intergenic	novelGene_53822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	2759.50310008433	2	192	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	361	1227	165546	121101	TRUE	70	TCAAAAAAGAAAAAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	306304	115721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165480_165649_306046
934394	contig_7229_pilon	+	744	3	Intergenic	novelGene_39818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	631	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	77	234	362	595	876778	877495	FALSE	25	TCTGCACGAACCGCAGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILAVTVELESIAPSPSSTARATNSVVELVALPEATALAACRCQPTHLPVLVDWLSDPLGVRVSSDSFVEWINEDHFKEFVRGIFTNPVRIQDPQGPTVASSSLLSHRLKASGKLQLVNTMIDGLAIGCTFRHWAFAATPAHADPIDDITLLGLVSQSARLIRPGGAGSPVQRRELAVLPAADSQKKAHHIGLLLPP	875646	877644	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7229_pilon_+_875959_876728_876865_877348
934395	contig_12312_pilon	-	1402	1	Intergenic	novelGene_63942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	46	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	306	329	214932	214909	NA	30	TGCTTTAAATGATGGAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215237	213835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_213800_215200
934396	contig_7009_pilon	-	4494	10	Intergenic	novelGene_23602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGCGCCGGGCCCGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	540176	429996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_430034_444944_444992_453478_453600_496797_496860_506372_506631_512644_512815_517990_518116_522864_523001_536324_536889_537202
934397	contig_11681_pilon	-	1206	1	Intergenic	novelGene_102984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATCAGGTAGTTCTAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199188	197982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11681_pilon_-_198000_199200
934398	contig_11512_pilon	-	2163	11	Intergenic	novelGene_43355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1264.91631739021	1	112	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	198	572	576922	556848	TRUE	5	AGTGGCCTGTGTCTTTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVPLTSPLSLRWRTVAASPRSPSQPSLLRPSSTSCRAWDTCPLPA	582739	554959	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556129_556425_556866_561325_561378_566278_566340_570032_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580072_580156_581645_581707_582716
934399	contig_3956_pilon	-	2413	11	Intergenic	novelGene_15196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	1050	2096	1289011	1283937	TRUE	15	TTGTCCATGATGGCCCGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSARPSGKGRAFMYRRLCLFGDLERQSTFDSSLTVSRYETTGSDFLMGIQAWSSSRSFRQISRCSSPAPAMMCSPDSSMMHCTMGSDLARRFRPSTSLGRSAGFLASTATLTTGLTLNFITRMLWACSKVVMVPVFTRNWSTPTRPTMFPHGTSSFCCLLFPEVHDCIKHLEDGVQDELAERPGQLLAIGAGSRLTELAVGWVKIPVAPELLHHVLHFPGSLSRPQVALTLGGELGHVHLSKLLQGEGPAVEARPKAHGTKDRVDHDVAHGAALALAVGGDDDVDVLHDALEGLVELLGFQLQLQQGPVHLVHHQHGLDTLGDGLAQDSLCLHTHQTRSPPPPRHHQ	1290994	1282738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1282913_1283793_1283976_1284056_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285758_1287312_1287533_1287965_1288075_1288872_1289253_1289780_1289891_1290296
934400	contig_4900_pilon	-	2070	6	Intergenic	novelGene_159064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	308.247043781445	1	109	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	124	504	1188120	1184667	TRUE	60	AAAAAAAGTCAAGAATCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCGLLGVGIWLSVSQGNFATFSPSFPSLSAANLVIAVGTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLIILLAELILLILFFVYMDKVNENAKEDLKQGLHLYNTENNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYLVLGENTVPDRCCIENSQGCGRNATTPLAATIR	1188243	1179986	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4900_pilon_-_1181488_1184601_1184686_1185067_1185190_1185919_1186022_1187601_1187677_1188057
934401	contig_15118_pilon	+	2419	11	Intergenic	novelGene_74598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	161.602134886888	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	270	813	923	1735	393966	398682	FALSE	15	CAGCCATGTTCATTGGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSQANRTVLDNFGNDMSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLYPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLVSSESEGHTKHSC	379998	399366	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_380022_380151_380263_391630_392088_392169_392450_393651_393680_393942_393991_394117_394376_394463_394749_395049_395141_395233_395350_398644
934402	contig_13021_pilon	-	2167	12	Intergenic	novelGene_8194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	1146	1544	178197	177233	TRUE	35	CAGCAACGAAGCGACGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSIRRINPSPHHDTHPQSEECCGLHSVLVHQCLYECNLSGSLQQAVLLLLAKLHSTSEFAYQVLSDPQFSLFGVQSPYQAFYLLHQGQGRLFFSGWFSHTLKNLLVFQVLRYRFPHLSKSRICGPLGAPP	181151	174574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_174720_175896_176060_176403_176499_176586_176706_177131_177276_177362_177526_177618_177787_178172_178281_178521_178584_178669_178727_179978_180209_180438
934403	contig_13074_pilon	+	1214	3	Intergenic	novelGene_153428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1894	junction_2	739	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	230	388	451016	451174	FALSE	25	CATTAACATTTCTGATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEGTEPDQEPPPPYQEQVPVPVYHPTPSQTRLATQLTEEEQIRIAQRIGLIQHLPKGVYDPGRDGSEKKIRECVICMMDFVYGDPIRFLPCMHIYHLDCIDDWLMRSFTCPSCMEPVDAALLSSYETN	403770	452000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13074_pilon_+_403817_449108_449279_451002
934405	contig_18096_pilon	+	1451	6	Intergenic	novelGene_58052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	881.855861238105	1	71	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	10	789	69419	76634	TRUE	35	TAAAATCAATGAGCCCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFKACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNATSLRLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLETQMQERDNADFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF	69409	79114	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18096_pilon_+_69637_70499_70663_71982_72130_75381_75507_76507_77101_78918
934406	contig_12638_pilon	+	1890	10	Intergenic	novelGene_33371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	113.186288049698	2	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	408	1227	112	1338	1515842	1539123	FALSE	25	TGAAAGGATTTTGAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRQAQILARRRPPSTSPQREARPPSPWIFTPCRSAASMSDKLPYKVADISLASWGRKALDIAENEMPGLMRMREMYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLIALGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLSGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMEEACQEGNIFVTTTGCVDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGHHVILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVLAQIELWTHPDKLSPSIHSLELVTQPWPLLHPSYCSGYGKGH	1515730	1539675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_+_1515870_1521145_1521337_1522656_1522733_1524399_1524550_1529413_1529527_1529955_1530164_1530254_1530343_1530442_1530561_1534864_1535026_1539029
934407	contig_3948_pilon	+	1382	13	Intergenic	novelGene_53289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	14	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	325	438	1423869	1425377	TRUE	15	CGTGTCGCCGTAATGACGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LWPLPRRKLLGSPPNARGRFRILTQKAPFFHRWPFRVRYRRPAENPPNTLHEHEEEAGRGHERSPAGGRQHAKHGHNYDNEDHTEELNARAQQGAEDHGVLGWPEDITMHQLPSRLFHGVFNVILLVIVSDVLPEGPDDDHAQDA	1422570	1458415	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1422720_1422799_1422883_1423776_1423907_1425301_1425383_1426895_1427004_1427092_1427212_1429093_1429217_1430585_1430715_1430815_1430985_1434910_1435015_1437836_1437882_1439631_1439748_1458389
934408	contig_18230_pilon	-	913	1	Intergenic	novelGene_179240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGCAAAAAGCCGACAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7226	6313	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18230_pilon_-_6300_7200
934409	contig_7840_pilon	-	3054	9	Intergenic	novelGene_68988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	282	55	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCCGCTCACAGGCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	306117	230819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7840_pilon_-_230929_237998_238127_263074_263168_292093_292173_295136_295281_298001_298216_299283_299521_301100_301222_304188
934410	contig_11815_pilon	-	1572	1	Intergenic	novelGene_50959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	13	72	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	991	1356	501134	500769	NA	10	CCACTGGGACGGGTTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFWGIQ	502124	500552	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11815_pilon_-_500600_502100
934411	contig_8059_pilon	+	1652	19	Intergenic	novelGene_111079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	79.4601577311968	1	52	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	352	942	246371	283715	TRUE	15	TCTTGTCATATATTCCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKLKVRNFILTTMLATRNFSGTSQPRVC	59677	341742	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8059_pilon_+_59729_90281_90342_173928_173984_241681_241748_245301_245375_246324_246398_254901_255005_266055_266140_275614_275710_278417_278541_279370_279466_280294_280341_283697_283736_292994_293037_327557_327640_336424_336520_338661_338891_340277_340374_341596
934412	contig_7963_pilon	+	1212	5	Intergenic	novelGene_58371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1313.42957557686	3	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	88	459	51450	57296	TRUE	15	CAGAGCTGGGTGACTCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALATLPQFLITVPVLRVVIIPHNVHPEERMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNGDSPGPISPQRPLK	51362	63338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_57252_57564_57782_57934_63003
934413	contig_2078_pilon	+	1906	7	Intergenic	novelGene_100139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	110.322884701629	1	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	403	1131	286189	311030	FALSE	20	TACTTATTCACGTGCATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRLCVYEPIPQPQVLIHSSSKTSGWCNFTLECGTPGATENLTVTWLGKGLPGHLEKRGTQEPTPNSRIVSLSLPLSQVNTHVICVVSNPADQKNATLDLGSICLWRGSLWSKWLWKGIFATVLVVILGAGVWIWKRRKTETEKGGSTLLPVVPSSAVALQALPTEDSADLQTSEIDSHCPPYAEISLLRHPKTSIKRSSGHTRSPEQTLAENTVYEMIRTKI	266444	311805	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285651_285766_285919_286268_306345_306646_308290_308402_308815_308962_310937
934414	contig_9705_pilon	+	1083	9	Intergenic	novelGene_41765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	419.091707595128	1	49	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAGAAAAAGAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	534675	540638	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9705_pilon_+_534738_535760_535907_536361_536520_537441_537571_537913_538044_538146_538276_538830_539020_539266_539370_540601
934415	contig_9471_pilon	+	859	8	Intergenic	novelGene_21843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	545.312155502493	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	217	654	60	713	414053	417296	TRUE	40	CTTATCAAATTTATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYIEVYNTKMKRDEHTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSKDAEHELLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFSPLKKTL	413993	417511	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9471_pilon_+_414084_414633_414729_414805_414936_415630_415714_416192_416273_416936_417028_417152_417335_417403
934416	contig_13798_pilon	+	1136	2	Intergenic	novelGene_178535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAACAAAGAAAAACGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	106411	107666	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_+_107346_107464
934417	contig_15063_pilon	+	1762	5	Intergenic	novelGene_12279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	451	junction_1	3247.18281745885	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	212	1621	28164	36661	FALSE	25	AGATGCTGGTCCTAAGTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDYWGQGITVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27952	36802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34613_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934418	contig_17144_pilon	-	686	4	Intergenic	novelGene_29193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1930.7494802681	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	372	20	391	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFYCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170803	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166446_168162_168310_168996_169099_170744
934420	contig_16496_pilon	-	1509	2	Intergenic	novelGene_5210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	49	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	30	TAATGATTTTAATCGATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	26	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
934421	contig_7730_pilon	-	1426	1	Intergenic	novelGene_156293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	87	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTGGAAGTAAAAAAATAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	404921	403495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_-_403500_404900
934422	contig_7119_pilon	+	2390	5	Intergenic	novelGene_40925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	398.371685740842	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	238	1248	137033	139798	FALSE	30	TGATGAACACTGATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127492	140940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_133881_133954_136976_137097_138707_139022_139165
934423	contig_15957_pilon	+	487	1	Intergenic	novelGene_179241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	162	486	2	487	3552	4037	NA	60	GGAAGAAAGGAAATAGTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNIEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYQNLWDTAKAVLRGQFIAIDAHIKKEERDKIKTLTTELKQIEREQQKKPTTT	3550	4037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15957_pilon_+_3600_4000
934424	contig_5623_pilon	+	1841	9	Intergenic	novelGene_154822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1039	1422	209004	210200	TRUE	25	AGTAGGCCTCCATGATGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKVIGEDEWDSFTVDSKLGLEIPQKVAKINVEQLPTFTDHDVVTVPIADAQHIGGHTVASTGKGELLDGSVQGLPGFLDLSQLSRASLLKAAVAAMLLLFSWMLAMVSEWSTTSMRPVRSPVERQP	206906	211543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_207768_208418_208554_208961_209106_209280_209409_210046_210212_210730_210810_211008_211121_211206_211382_211501
934425	contig_9706_pilon	+	849	1	Intergenic	novelGene_20823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAATATGTCTGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1887	2736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_1900_2700
934426	contig_5499_pilon	+	2427	11	Intergenic	novelGene_57012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	223.867014095422	3	101	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	398	1222	824307	840037	FALSE	50	GTAAAGGTATTAAAGAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATGKKRNSPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803417	841242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_823756_823790_824166_824332_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911
934427	contig_15821_pilon	+	438	1	Intergenic	novelGene_25026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTATGGGTCTGTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	156598	157036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_+_156600_157000
934428	contig_7009_pilon	+	1819	3	Intergenic	novelGene_23679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTACCATAAGTTGTTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537823	539814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_538356_538435_538516_538607
934430	contig_5671_pilon	+	983	5	Intergenic	novelGene_79471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3794	junction_4	418.042088192086	4	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	1	423	370430	531238	FALSE	30	TATATATTTTATTATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAEKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVTTVAEKTKEQVTNVGEAVVTGVTAVAQKTAEGAGTIVAATGFGKKDQMGKNEEGASQEGILQDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA	370429	531798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5671_pilon_+_370551_376738_376781_392775_392919_521218_521303_531205
934431	contig_19032_pilon	-	919	5	Intergenic	novelGene_172541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1239.56955734642	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	83	601	159230	157239	FALSE	20	CCTGGTGTCTTTTATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDEDYKQRTQKKAEVEGKDLPEHAVLKMKGNFTLPEVAECFDEITYVELQKEEAQKLLEQYKEESKKALPPEKKQNTGSKKSNKNKSGKNQFNRGGGHRGRGGYNRRGNMPQRGGGGGGSGGIGYPYPRGPVFPSRGGFSNRGNYNRGGMPNRGNYNQNFRGRGNNRGYKNQSQGYNQWQQGQFWGQKPWSQHYHQGYY	159312	156920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19032_pilon_-_157293_157737_157810_158174_158348_158736_158950_159223
934432	contig_3956_pilon	+	1316	9	Intergenic	novelGene_14827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1680.58609103342	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	338	1069	1284264	1290491	FALSE	10	GCTGGTGGGGGTGGGACACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1290738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282868_1284182_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285753_1289599_1289677_1289758_1289892_1290297
934433	contig_854_pilon	-	2697	9	Intergenic	novelGene_36166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	253.08644768142	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	195	641	487156	474689	TRUE	10	CAACTCGTGCCTGGGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHPHCCPRPCSSCRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDVETALVHPDRQLPLLL	487350	470029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471653_471762_471882_471991_472061_473586_473750_474241_474314_474678_474742_476702_476788_483477_483627_486996
934434	contig_3956_pilon	+	2398	11	Intergenic	novelGene_15126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1025.08302102805	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	452	1882	1286220	1290491	FALSE	15	TGACTGTGTGGAGCCTACGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281610	1291007	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283890_1286153_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934435	contig_11512_pilon	-	801	4	Intergenic	novelGene_43367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	504.402837246404	2	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCAGTGGCCTGTGTCTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561380	554962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_555382_556481_556786_556842_556866_561325
934436	contig_4519_pilon	+	3406	9	Intergenic	novelGene_123663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	92.92604586444	13	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	2322	3242	214863	220662	FALSE	30	GACGGACAGGTTGACTCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKFLETHGLPKLQQSDIENLNRPITGEEIEKAIKKLPTNKSPGPDGFTGEFYKTFTEELVPVLLKLFQSITLIPKPGKDITKKENYRPISLMNINAKILNKILANRIQYHIKKIIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIHHINKRKEKNHMIISTDAEKAFDKVQHPFLIKALNQIGIEGKFLNIIKGIYAKPTANIILNGERLKTFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQTGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELIERFSRVAGYKINIQKSVGFLYTSKDND	68215	220826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4519_pilon_+_68480_68923_69319_70705_70919_77856_78014_78794_78937_79733_80881_214859_215072_215116_215826_220659
934437	contig_6445_pilon	-	1516	15	Intergenic	novelGene_76921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	908.170309592033	1	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	69	755	89674	64923	TRUE	20	GATACATTAGCCTTTTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPATNAWAPQSGHSSSTYSQDPMDLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGPDFLPCAQVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYANTESPSRSPPRTRGAWTRTLCTSAMRLESWRTPRTKRLQISTQRPRTQPKPPTALTSLRSSSRKGSLCR	96335	42876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77852_77949_85291_85477_88146_88216_88473_88594_89668_89714_96306
934438	contig_15304_pilon	-	2116	7	Intergenic	novelGene_30656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4600.66029379359	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	399	1202	106308	103245	TRUE	15	TTGTCCTTGTTTTTTAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTTAPTVFPLAPCCGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	107225	101859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_102104_102574_103329_103548_103680_105638_105960_106040_106371_106480_106523_106931
934439	contig_14441_pilon	+	1111	6	Intergenic	novelGene_100526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	380.282736920834	3	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	503	931	116728	117610	FALSE	15	CGCTGCCTACGAGTGTCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111194	117790	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111240_112108_112154_112401_112665_116578_116963_117220_117344_117539
934441	contig_6576_pilon	-	2472	2	Intergenic	novelGene_42430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGACACTGGCAATGTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1304264	1301353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_-_1303070_1303508
934442	contig_5023_pilon	+	2471	16	Intergenic	novelGene_7201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1931.9836438231	1	95	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	605	1818	99	1916	607279	646990	FALSE	30	AGTTATTGTGGATGTCTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580830	647545	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609684_611711_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
934443	contig_15821_pilon	-	668	1	Intergenic	novelGene_25025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	156	533	154136	153759	NA	35	GCATAGTCAATGTCACTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVHSYQDLHQTESSTARWCPATTVDCSDQDHNRGFWTELEKDVEHNSNSQKKKDQIYWPKGDWRNPESMAPRYPFSSVAKLPSRFTVQLGSGQPSKTMRVTRYRSPVIRPRRQKGSRKLMIGNTK	154291	153623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15821_pilon_-_153600_154300
934444	contig_1061_pilon	-	1248	1	Intergenic	novelGene_179242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGAGAGTTATCTGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1271	23	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1061_pilon_-_0_1300
934446	contig_7357_pilon	-	1492	9	Intergenic	novelGene_36835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2114.46594542806	2	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	141	1331	160025	136424	FALSE	35	TGCAACATTTACTATGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEGDKFGSVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	166198	136262	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137565_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160031_166063
934447	contig_11512_pilon	-	1035	10	Intergenic	novelGene_43387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	899.610629078279	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	43	654	580089	556615	FALSE	40	AAAAAAACTGACCCCGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDAALRPPSLDLDL	580131	556233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556654_556719_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068
934448	contig_854_pilon	-	1495	6	Intergenic	novelGene_36267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	461	916	563319	557717	TRUE	20	AGGCGCCAGCCGGGGACAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATWRMLQERFCCLVGWGHRTARIASSKTVFRPRWVRAEHSKYFTESISLASARPCG	563779	543514	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543634_545915_545989_556080_556329_557577_557751_562270_562399_563025
934449	scaffold_880_pilon	+	1838	2	Intergenic	novelGene_121412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	64	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	105	428	336137	336460	TRUE	80	TGTAAAAAAGAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLRPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMSGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDGTRPFMSGLGPS	336032	337973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_336684_336786
934450	contig_4857_pilon	-	1834	2	Intergenic	novelGene_48738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCTCAGGAAGAAGCAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1195152	1193258	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4857_pilon_-_1193269_1193328
934451	contig_8377_pilon	-	1978	17	Intergenic	novelGene_34942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.45236875482778	3	76	9	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTAGCGTAAGAACAAACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180471	68095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68320_135047_135194_136288_136370_137714_137737_140772_140974_142255_142386_143449_143568_161222_161386_164383_164591_169243_169299_172898_173003_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177498_179531_179664_180381
934452	contig_3956_pilon	+	1931	9	Intergenic	novelGene_14942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1437.15999783427	2	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	285	858	81	938	1281682	1286416	TRUE	15	GCACCTCCAGCTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDCPEVPLRAPVRGAPGRRGCHGY	1281601	1290957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284857_1286156_1286224_1286409_1286606_1287276_1287517_1290393
934453	contig_7963_pilon	-	2392	8	Intergenic	novelGene_58486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	26	junction_5	665.100728906409	1	118	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	287	864	695	1558	125592	121986	TRUE	55	CAAGCGGAAGAGAGAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKVWFCGFLLGNGKGKVLNEVEWG	126286	120309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_122270_122349_122459_122993_123132_123746_124051_125563
934454	SIRV7	-	1941	4	ISM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	33136	5	-49	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	54	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCGTAATTAGTGTTAATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114787	1008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680
934455	contig_17144_pilon	+	1826	11	Intergenic	novelGene_29289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	19	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	898	1215	167621	168283	TRUE	20	TCTTCAGGGTAAGTTCCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	183213	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167327_167580_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172651_179725_179778_181785_181848_183155
934456	contig_10793_pilon	+	1379	14	Intergenic	novelGene_83368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3465.62997850737	1	64	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	651	1028	160548	163940	TRUE	0	GTTCGCTTGTTTTTGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	130870	167221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_130982_146954_146992_151420_151500_152866_152970_159125_159214_159531_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164090_165325_165377_166401_166473_167141
934457	contig_10437_pilon	+	1806	9	Intergenic	novelGene_38275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1090.76847193848	3	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	100	1137	431167	447450	TRUE	30	CTATCATTGCCACATACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSFTVSHCHQQRTRDFHFENWDSPRQIGMVGHPRRRLYF	431067	451705	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_447335_447493_451078
934458	contig_7898_pilon	-	649	6	Intergenic	novelGene_47539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4943	junction_5	2159.3805963748	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	75	647	285587	283755	FALSE	25	GTTTGACAATGGCAGCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQ	286100	283752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286074
934460	contig_5419_pilon	+	3653	9	Intergenic	novelGene_15501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	528.45693710557	3	156	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	FALSE	40	GAATGTACATATGACATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614
934461	contig_8138_pilon	-	2099	5	Intergenic	novelGene_52455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAGAACCACCTCCTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	307928	280111	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_-_280332_288509_288623_304980_305096_305562_305650_306364
934463	contig_4686_pilon	+	2930	2	Intergenic	novelGene_118574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	1346	1645	772963	773262	FALSE	15	TTTCTTCCTAACTCTGGCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLESTVAATVSVHLAEVFLFSLTLHFTKHDVLLQGLVSPDNMSKVQEMMILTFKEHSGCTSSKKYLFILLADYAIFSILRQYHTTKASILWSSLLIIQL	748260	774547	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4686_pilon_+_748667_772023
934464	contig_15092_pilon	+	2353	3	Intergenic	novelGene_57789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	302	junction_2	132	3	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	188	567	462	1028	325159	351165	FALSE	30	CAGCCAACCTGCAACCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLLMFIHASLRLRNFKNKLENKMEEIGLKKTPMGIVLDALEQQEESLSKFTDYISKVKE	324697	352490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348358_350992
934465	contig_10734_pilon	+	5830	25	Intergenic	novelGene_51232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	476.874151739452	1	124	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	714	2145	1546	3690	1279318	1321486	TRUE	25	TTGCCAGTGGTACTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELEKDLALRVQEVAELRRRLESNKPAGDVDMSLALLQEISSLQEKLEAAHTDHQREITSLKEHFGVREEMHQKEIKALHTATEKLSKENESLKSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGVGMETAELAELKTQIEKVKLDYQHEIENLQNKQDSERSAHAKEIEALRAKLMKVIKEKENSLEAIKSKLDKAEDQHLVEMEDALNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDSFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEIEKLRQQLEAAKNQLKNLEIEKNAESSKASSITKELQGKELMLTNLQENLSGVSQVKEALEKDLQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEEFNSLSSELEKLREHLADMEAKFRERDEREMQLMKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKEKYAEELQQRLTKANDNASVLQRTIGEITLKAEQSQQEAAKTHEEEKKELQKKLLDLEKRMEVSHNQCQDLKARYEQASSETKTKHEEVLQGLQKMLLATEQKLKAAQEENGDLLREMEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMQQMTKEKTETLASLEDTRQTNEKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRSRDAVTSHQKKTQGIRDSVLHLKSLAGIMAGRREICAQ	1198764	1334964	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_1198810_1243189_1243385_1247255_1247831_1260392_1260518_1262354_1262578_1267422_1267621_1268188_1268282_1270218_1270280_1279287_1280233_1281767_1281885_1284377_1284436_1284979_1285064_1286269_1286427_1288094_1288261_1288361_1288578_1297381_1297499_1299543_1299651_1306092_1306214_1310195_1310254_1321457_1321506_1327929_1328048_1328135_1328287_1328868_1328919_1332594_1332720_1333287
934466	contig_3975_pilon	-	2297	12	Intergenic	novelGene_54741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.325777501364	2	115	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	102	1148	1731202	1720624	TRUE	30	ACAGAACCCCATGCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLR	1731303	1718623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_1719609_1720251_1720363_1720453_1720505_1720621_1720705_1721301_1721380_1721489_1721617_1721709_1721871_1721982_1722099_1722629_1722804_1728239_1728386_1730454_1730603_1731186
934467	contig_3956_pilon	+	2312	10	Intergenic	novelGene_15104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1056.94854284503	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	417	1793	1286460	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281605	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283866_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934468	contig_5698_pilon	-	1950	4	Intergenic	novelGene_55029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTTTTTTAAAAAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20889	4083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_-_4146_7815_8025_11129_11187_19267
934469	scaffold_12124_pilon	+	3007	7	Intergenic	novelGene_22357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3707.52046521661	3	158	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	1038	1817	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1486526	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1486562_1490329_1490409_1491906_1491976_1494275_1494316_1496979_1497122_1506629_1506687_1508010
934470	contig_15063_pilon	+	2042	5	Intergenic	novelGene_12264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	1	34	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	498	1497	409	1905	28075	36661	FALSE	30	CACAAGATGCTGGTCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVSGAWFSESAPGFLWGGEEDSTIVITTVWTTGAKESRSLSPQSQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27666	36798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_28207_34615_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934472	contig_4782_pilon	+	771	1	Intergenic	novelGene_73674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	177	534	151	684	599730	600263	NA	65	ATCAAAAAAGAAGAAAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDVNLLKVKGCKKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTVKDKEGHYIMIKGTIHYENITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLRGEIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDLEVQKGTISQLDLIDIYRALHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHREILNKIQNVEIIQSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHQWVIEEIRDGIKKFLE	599579	600350	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4782_pilon_+_599600_600400
934473	contig_6915_pilon	+	2653	1	Intergenic	novelGene_162407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	1603	1959	177275	177631	NA	0	TTCCCTTGTGTCTTGTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAHGARHLSERRGRWREASEKSKEAEKKATLAANKWHPESRPLGCVESKQPAPPGQETVAAGSGGTNEQKPWDPTSVAAQTGKQLHTRMEPCSPSGRSKDGAWSQALEQKEGEAERGK	175672	178325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6915_pilon_+_175700_178300
934474	contig_13786_pilon	-	1841	1	Intergenic	novelGene_174576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAGGGAGAATGAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	136376	134535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_-_134500_136400
934475	contig_8978_pilon	+	2413	12	Intergenic	novelGene_49483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	216.668616223482	2	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	482	2314	1749586	1772309	FALSE	85	TAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELLPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIVVAAVTAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGVGVYAAIWQLCLALMFKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFLFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRSDPPLAVLTQDNMTVDDIENMVNGTSYNGFPVIMSRESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTANQDPASIMFN	1721277	1772408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8978_pilon_+_1721361_1743881_1743974_1745492_1745593_1747112_1747301_1749567_1749691_1750845_1751053_1753104_1753186_1754512_1755059_1758867_1759055_1762410_1762810_1764922_1765140_1772218
934478	contig_9955_pilon	-	2534	2	Intergenic	novelGene_21385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	735	1040	592772	592467	TRUE	20	CTATTGGTGCATTTAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFSSFMILRKFSVSSSSMILSVLSVFSLFWNSDDSKIFAFDCIPHYSQGFFILFSDFSSNRVVAKCLSSILLILSSIISDLLLSPSVTLSISEILLFIF	593506	590625	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_591844_592190
934479	contig_13798_pilon	-	2401	1	Intergenic	novelGene_178537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	89	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1832	2197	107565	107200	NA	30	CTAGCTGAAGAGGAGCCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIVCCFRGIQ	109396	106995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13798_pilon_-_107000_109400
934480	contig_16622_pilon	+	831	1	Intergenic	novelGene_48455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGACTTCCTGTCCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	111804	112635	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_111800_112600
934481	contig_2703_pilon	+	1467	2	Intergenic	novelGene_101648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGTAACTTCGGGATAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1347	4100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_1458_2743
934482	contig_10793_pilon	+	1405	15	Intergenic	novelGene_83417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3173.77251862827	2	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	21	998	131682	163940	TRUE	30	ATTTTAGTTCTCATAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLQVVEMVGRENELRANTWSSYNMADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKIKARQLTVQMMQNPQILAALQERLDGLVETPAGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEKAKVEDEKKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPK	131661	167269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10793_pilon_+_131713_146954_146992_151413_151500_152866_152970_159125_159268_159562_159644_160427_160557_161400_161473_162549_162690_163141_163288_163929_164068_164789_164820_165325_165377_166401_166473_167141
934483	contig_5623_pilon	-	3280	4	Intergenic	novelGene_154804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	442	junction_2	192.097776029697	3	27	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	764	1201	209301	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	210064	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280
934485	contig_3956_pilon	+	2293	11	Intergenic	novelGene_14916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1439.23075286766	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	374	1125	465	1589	1284120	1290310	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAVVAAILGATRLVRICLGESTAIRHYGELHSRPDPGHHGQEGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKLHG	1281600	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282742_1282823_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1287352_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289896_1290297
934486	contig_5020_pilon	+	1640	8	Intergenic	novelGene_27874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	999.401514785275	3	53	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	407	829	122915	124251	TRUE	5	ACCTTGGTGTCTCCTCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEREYGAGPYAPWPSPQVPWLWLWPSLRMW	118470	126081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119386_119596_122812_123041_123152_123400_124201_124363_124444_124547_124909_125084_125657
934489	contig_3956_pilon	+	1945	10	Intergenic	novelGene_15022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1371.05110619644	2	52	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	199	600	573	1172	1287410	1289833	TRUE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGAL	1281601	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282799_1282913_1283793_1283976_1284054_1284213_1287377_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289504_1289831_1289892_1290297
934491	contig_14925_pilon	-	1648	5	Intergenic	novelGene_55352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	672	junction_4	639.865366698339	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	81	494	116065	114666	TRUE	35	ACTGCATTTATTAAACTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129481	112123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
934492	contig_14711_pilon	+	1859	9	Intergenic	novelGene_68919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	403.676676778582	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	1232	1627	89519	90570	FALSE	20	CTTATCTCAGACCTCAGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACAHANVTLALASTLDDGWCKERTLDNQLFFFLVEEEAGGRVVLRVRPLEKEADHTQAIVLGCIGGIVAVGLVLVLAYRISVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDNNPLYKSAITTTINPYFQATESPPS	85579	90802	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88639_88839_89214_89326_89457_89673_90032_90194_90489
934493	contig_7119_pilon	+	2528	3	Intergenic	novelGene_40893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	223	1377	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127435	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
934494	contig_10990_pilon	-	1126	1	Intergenic	novelGene_7511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	63	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAAATATATGTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753007	751881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_751900_753000
934495	contig_3956_pilon	+	2390	12	Intergenic	novelGene_15226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1184.14015252691	6	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	319	960	5	964	1284120	1288038	TRUE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIFASSRSRASTSSRGLASCTWRSA	1284115	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287286_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934496	contig_10734_pilon	-	1779	6	Intergenic	novelGene_51483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	484.720372998701	2	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	378	1137	154	1290	2305085	2265543	FALSE	70	TAAAAGGAAAGAAAAAAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPACCSWEDVFQYETNKVTQIQSVNYGTIKWLLHTIVFSYACFALWSDRLYQKKEPVISSVHTKVKGAAEVKEEIMENGVQKTVWNIFDTADYTFPLQGNSFFLMTNFLKTEGQVQGLCPEATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305238	2265053	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
934497	contig_15666_pilon	-	1105	1	Intergenic	novelGene_70126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATACATTTAATTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107763	106658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_106700_107800
934498	contig_17144_pilon	-	1471	6	Intergenic	novelGene_29389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2414.1815507538	1	81	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	143	1180	181707	166363	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQQEAVLTTTFLAVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTDYVQETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	181849	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166853_172638_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173782_181695
934499	scaffold_12124_pilon	+	1241	10	Intergenic	novelGene_22274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	193	570	1490385	1508039	FALSE	25	TCACCTGTTTTACCACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473575	1508710	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
934500	contig_7963_pilon	+	3821	13	Intergenic	novelGene_58453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTCCCTCCCGGCGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118201	127381	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123131_123746_124085_125566_126910_127309
934501	contig_7548_pilon	+	2225	7	Intergenic	novelGene_117634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	143.321026603449	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	216	557	193023	200396	TRUE	25	TGAAGTACCCTTTTTTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNTSSERAALERQGGHKTPRRDSSGGAKDGDRPKILMDSPEDADLFHSEEIKAPEKEEFLAWQHDLEVNDKAPAQARPTVFRWTGGGKEVYLSGSFNNWSKLPLTRSHPGSA	192807	207689	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7548_pilon_+_193182_198392_198557_200377_200455_200728_200844_203187_203322_206058_206128_206397
934502	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
934504	scaffold_12124_pilon	+	3020	10	Intergenic	novelGene_22248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3416.85033652664	4	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	155	532	1490385	1508039	TRUE	35	TATATGTGTTGAAATCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473571	1510597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473643_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509154_1509223
934505	contig_9235_pilon	+	1718	3	Intergenic	novelGene_156218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	183	1	103	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45010	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45643_45991_47187
934506	contig_16578_pilon	+	4491	1	Intergenic	novelGene_148666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	79	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAAGATGAGTTGTTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	226906	231397	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16578_pilon_+_226900_231400
934507	contig_5317_pilon	+	720	3	Intergenic	novelGene_76555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	6856.5	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTAAATGGTGTTTGTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35333	43686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36683_36839_43197
934508	contig_3975_pilon	-	2235	13	Intergenic	novelGene_54844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	220.801129727384	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	118	1134	2066301	2060446	TRUE	10	CGTTGTACATCTCTCTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENDSASRLPVCEKGLVASP	2079258	2056375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060499_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
934509	contig_12427_pilon	-	1471	6	Intergenic	novelGene_40460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2504.21468728222	7	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTTCTTTTTGTTTGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	325976	313508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315431_315494_315562_315744_315842_315958_316079_325856
934510	contig_15353_pilon	+	1918	1	Intergenic	novelGene_151998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	160	483	744	1226	553104	553586	NA	50	AGAGGGAATAAACAGCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDRMVPLGVQNKTPDDFPVEEKALDLPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFQKIMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTLRKTQKKEQRKMKRP	552360	554278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15353_pilon_+_552400_554300
934511	contig_8712_pilon	+	1661	5	Intergenic	novelGene_58795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	325.963571584311	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	73	579	314974	321879	TRUE	25	AAGAGTCCCCCTTTTGATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANANVLSLLQQDDRDEAHLQCWCPHLALLRKPVPAGVRGGLLLHPLLRGRPAGCGPLLSQLQSSPGHLQAFVGLGQRGGGRELKEVLSSSHPAPPWWRFC	301982	323008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_302049_314967_315188_318123_318222_321684_322772_322818
934512	contig_14666_pilon	+	1203	5	Intergenic	novelGene_39556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1536.84667013336	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	125	991	477340	485019	FALSE	85	TAAAATAAAAAAAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEVIGEEHGIDPAGSYHGDSALQLERISVYYNEAHGKKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVATTRPSRSSSAGFPSTSRPCSEGRRLCTGTRARGWTCRSLERPRGISMTWCPSTNRFKMPRWLWRKAERSRSGRRPSQKTSDVNGREAAGQMPSAGGRAQPLPEEFLLR	477215	485231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479834_479944_483205_483317_483861_484122_484689
934513	contig_6102_pilon	+	2369	18	Intergenic	novelGene_31899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	462.303582158006	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	794	1645	380930	394507	FALSE	30	CTGTATCTTTCATTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	373437	395231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375492_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
934514	contig_9807_pilon	+	1894	11	Intergenic	novelGene_32899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	673.573782150107	1	35	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1	531	109592	139427	TRUE	35	GATTTTAAGAATGGAATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVSKIIGGDPKGNNFLYTNGKCVILRNIDNPAIADIYTEHAHQVVVAKYAPSGFYIASGDVSGKLRIWDTTQKEHLLKYEYQPFAGKIKDIAWTEDSKRIAVVGEGREKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNKVINSVDIKQTRPYRLATGSDDNCAAFFEGPPFKFKFTIGTAALSTV	109591	159339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_+_109679_122892_122984_126623_126772_128536_128718_139403_139478_140300_140382_140723_140958_145115_145204_147121_147279_156679_156770_158676
934515	contig_4180_pilon	+	1121	6	Intergenic	novelGene_8387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1811.97677689313	2	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTCCTATAACTCAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	874345	925129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_874405_875179_875364_886082_886187_886317_886468_888085_888693_925112
934517	contig_8377_pilon	-	4123	26	Intergenic	novelGene_34930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.17575507653593	1	123	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGCGTAAGAACAAACCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	198746	68093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68138_68218_68328_136288_136399_140773_140974_142255_142388_154880_154990_161224_161386_164383_164656_172899_173004_173644_173681_176591_176697_177247_177343_177428_177506_179434_179472_179565_179664_180381_180510_182892_183046_183256_183406_185675_185811_189175_189270_191115_191249_192229_192350_193991_194115_194344_194521_196079_196217_197660
934518	contig_5023_pilon	-	2659	12	Intergenic	novelGene_7335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1002	1505	647301	643482	TRUE	20	TTCTTCATCGGACACTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYYFALLSFSSASRFSVFRRS	648302	607308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611817_614399_614481_616411_616580_618522_618666_622525_622618_629191_629273_639133_639195_643411_643542_646857
934519	scaffold_12124_pilon	+	2026	11	Intergenic	novelGene_22255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2989.92397227756	4	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	195	572	1490385	1508039	TRUE	45	ATCAATAAATGCGAAATGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473573	1509550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1509468_1509524
934521	contig_9235_pilon	+	2838	2	Intergenic	novelGene_156225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	323	1471	45805	46953	FALSE	30	AGATCCCTTTGTGAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45069	48320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45246_45658
934522	scaffold_9100_pilon	+	1597	8	Intergenic	novelGene_83265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	514.446998519492	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCTGTTAATTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	644842	654850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644921_647124_647248_648995_649114_650406_650581_651039_651204_651963_652069_653324_653449_654139
934523	contig_3956_pilon	+	1561	9	Intergenic	novelGene_14816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1424.43869976037	3	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	87	773	1281682	1286042	TRUE	20	GGAAATGGCCTCTCTGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMQQPQVWTSLVLCATDCLLEGPPGL	1281595	1290708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1285967_1286224_1286409_1286606_1287276_1287294_1289758_1289858_1290413
934524	contig_17144_pilon	-	2112	14	Intergenic	novelGene_29407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2244.57943768337	2	85	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	627	1884	25	1908	179764	166277	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRVSPGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESTAPSGWACPLRGLGCLQERVWSVS	179788	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166351_166739_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170943_172528_172693_173644_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
934525	contig_15047_pilon	+	1223	4	Intergenic	novelGene_52223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	40.5407887880287	3	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	348	662	3242	21082	FALSE	35	AGACCGGAGAACCTTCCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRAVPRALMCLSQLLKVRPWKA	2183	21643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2256_2570_2826_3221_3498_21023
934527	contig_10500_pilon	-	3029	7	Intergenic	novelGene_41261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	827.864001847861	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	541	1053	1635203	1629460	TRUE	90	AGAAAAAAGAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRRTVGDWKNYFTVAQNERFDEDYKKNMANTSLTFHFQF	1640221	1626843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1628751_1629390_1629573_1630549_1630728_1633135_1633231_1635076_1635272_1636940_1637063_1639871
934528	contig_3956_pilon	+	1746	7	Intergenic	novelGene_15133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1142.60001993504	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	734	1222	1289515	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281612	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283987_1288996_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934529	contig_10930_pilon	-	1703	2	Intergenic	novelGene_37063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAGCAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	289048	284940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_285074_287478
934530	contig_9484_pilon	+	2831	14	Intergenic	novelGene_105668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	561.793398399454	1	132	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	232	699	407	1105	187875	206935	TRUE	25	GATTTGGGATTTATTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	138542	213231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_138701_168513_168615_175467_175550_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513
934531	contig_4103_pilon	-	1866	18	Intergenic	novelGene_51926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	515.895686996501	1	134	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	703	1251	83809	80996	TRUE	15	ACCTACTGTCTTATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	91922	77536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80652_80932_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662_83827_84799_84898_85362_85478_85646_85815_86828_86889_87789_87883_91263_91331_91838
934532	contig_15047_pilon	+	1897	6	Intergenic	novelGene_52196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3009.77879585859	4	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	281	846	20	865	2194	4178	TRUE	20	CCAGAATCTGCATCTTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGLCPVPAGLRGGGADRGGGADRGGGADRGGGADRGGGADRGGGADRGAGLTAGAGLTAGAGLTAGAGLTAGAGPGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_2999_3498_4158_4434_4552_4676_21004
934533	contig_11855_pilon	-	1556	13	Intergenic	novelGene_66947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2091.05128397709	1	7	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	324	1514	1087425	1077702	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILRTTVRRILDEY	1091805	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1090572_1090765_1091736
934534	contig_10011_pilon	+	3244	9	Intergenic	novelGene_68085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	77.8793136847006	56	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	592	2211	325794	333194	FALSE	20	TTGCATTTATTGTCATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPPARRGPFLSPARLAGEKGCILSSRLRRNAHSTSRLQGLSSNSFCGSLVRREPKRAEGKKRPKSLELAISSEKGEPLNPEILLTLEEIKIVSPDTVGTPGKMAIPDIEATVAPEKGSRNPEQSVIQEGGTFRNVLTSVSLTGEEKTQEHPESTTPSEENRIGSAEAPEMLHEPSNPKAPPFLGKKGHQNPGHLASLGMVACKGRPWEGESAGGTCVHGSSSCSGGHGALDGRLSSCPRCQTPLPKEQLLHSLSPEPPPPCERHMKQPRLLFCEDHRELVCLICSLSQEHRGHQVRPIEEVALEFKEQIHWQLEHLKELRKSGEEQKYQGDKETANFLKQTEAQKQKVRHQMQQLCQFLEKQEQLFVAWLEELGQTIGQVREKYGSRVSQDIALLDELIGELEAKQCQPAWGLVQDIEVTLHRAKTVTIPEPWATPPEVKEKIHLFYHKSEFVEKSMKRFSESLRSEVEMLTVPAVTAAQAHAVKCQIKVSGLGLLGPCALPHQVPEEWSSPCFLEVGRTCGDAAHGPPAGYCDFLCS	322857	334227	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_+_323205_325549_326407_328221_328530_328966_329063_330807_331039_331473_331497_332112_332229_332413_332447_332994
934535	contig_10437_pilon	+	1655	1	Intergenic	novelGene_38171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTTGCAGAGTGATCACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162436	164091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_162400_164100
934536	contig_3155_pilon	+	1426	5	Intergenic	novelGene_26399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	44	550	258156	261211	TRUE	25	CACCTCACTCCAAGGATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258112	262549	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261318_261779
934537	contig_2730_pilon	+	2090	4	Intergenic	novelGene_135362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	711	junction_3	173.013165844555	3	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TGTTTAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	291598	392474	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2730_pilon_+_291744_309344_309386_379343_379459_390685
934538	contig_12079_pilon	-	2221	6	Intergenic	novelGene_67513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	357.778367149273	2	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	171	1451	871668	861365	FALSE	25	CGTTAACTCTTTATTGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862331_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871725_872314
934539	contig_1725_pilon	+	2835	20	Intergenic	novelGene_24273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	550.789184499635	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	827	2484	56	2539	201480	255543	FALSE	55	GTAAAATACAAATGATTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HVRIAALPAVPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTLMRIFVDIEKLTWSKAWEITQKTFAYTNHTVLPEALERWPLELVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRVAALFPKDVDRLRRMSLIEEEGGKRINMAHLCIVGAHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSEIEPDKFQNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEEYVKDLSQLKKLHSFLGDDVFLRELSNVKQENKLKFSQFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFVPRTVIIGGKAAPGYHMAKIIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPATDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRVDDVAALDEKGYNANEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEAYVKCQEKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAAAGKFSSDRTIKEYAKDIWNMEPSDLKISLSNESSNGVNKARGN	201424	255839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245045_245345_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247755_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
934540	contig_14970_pilon	+	1804	9	Intergenic	novelGene_44999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_5	3411.32783668984	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	111	1199	136145	231550	FALSE	25	TTTGATCAGAATGATTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136034	232155	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
934541	contig_2058_pilon	+	1572	1	Intergenic	novelGene_171561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTTCAAGTTGAAGTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	74766	76338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2058_pilon_+_74800_76300
934542	scaffold_12124_pilon	+	2826	5	Intergenic	novelGene_22374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1102.88768693825	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	857	1636	1508626	1509405	FALSE	30	TATATATGTGTTGAAATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1494269	1510595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506671_1508010
934543	contig_9668_pilon	+	4488	3	Intergenic	novelGene_58161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	79	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCCATCATTATATATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	457468	599490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_+_457863_540280_541457_596572
934544	contig_1225_pilon	+	1816	4	Intergenic	novelGene_44147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	300.756084264678	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	276	596	253442	275578	FALSE	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETSFFLFWWGSLMLVPGAGRASQVWKG	250591	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253414_253520_274222_274381_275493
934545	contig_5967_pilon	-	2334	11	Intergenic	novelGene_44375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	546.18985710099	2	79	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	169	1326	488569	388566	FALSE	40	GAACCAACAAATGTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSIGMLMLSATQIYTILTVQLFAFLNLLPVEADILAYNFENASQTFDDLPARFGYRLPAEGLKGFLINSKPENACEPIVPPPLRDNSSGTFIVLIRRLDCNFDVKVLNAQRAGYKAAIVHNVDSDDLISMGSNDSKYRYHFSSKIDIPSVFIGESSANSLKDEFTYEKGGHVILVPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517601	387557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412605_423963_424041_430682_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_501673_501743_517515
934546	scaffold_880_pilon	+	1853	2	Intergenic	novelGene_121411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	51	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	132	455	336137	336460	TRUE	80	AAGAAAAAAAAAAAAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGLRPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDRTRPFMSGLGPSCQDSALHDRTRPFMTGLGPSCQDSALHDGTRPFMSGLGPS	336005	337980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_880_pilon_+_336669_336790
934547	scaffold_9100_pilon	+	1421	7	Intergenic	novelGene_83275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	487.84104879447	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	269	810	69	878	649053	654304	FALSE	30	TGACAACTCTGTTAATTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLPDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVDSEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPISTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDVVKVTLTPEEEARLKKSADTLWGIQKELQF	644851	654847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_644863_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652069_653330_653449_654139
934548	contig_8330_pilon	+	1847	10	Intergenic	novelGene_71820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	452.627255143529	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	163	522	853343	855486	TRUE	15	GCTCCGTGAGGACACCGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRTLTLSPHRRDAGRLPREQSSCQVH	853071	857796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853126_853234_853348_853839_854027_854995_855090_855412_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
934549	contig_615_pilon	-	666	2	Intergenic	novelGene_80030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATTTGCAGTGTGCGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12171	2870	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_615_pilon_-_3189_11823
934550	contig_2311_pilon	-	2433	2	Intergenic	novelGene_169817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1406	1861	275062	274607	FALSE	65	AGAAATGAAAAAAAATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSAIEELRSRFETMEDRISEIEDKHLDTTLFEEKSEKRMKKNEETLRIMWDTIKSKNLQVIRIPEQWEKTENTERITEELLAENFPNIMKDEKLIQEAQRTLYRIDPKRKSPRRVIITLAKTKDKQRILSTAQEKQKVIYRGETIRLSSD	276823	274034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2311_pilon_-_275363_275718
934551	contig_10324_pilon	+	961	1	Intergenic	novelGene_7777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	52	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	87	264	81	344	79887	80150	NA	10	TCCAGGCCTGGCGAGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSGGASQCLGSDGPGLRGLHLLPPHLMAHGGVSGVAGCRELELSTPWISPLTLWSGQDPTPFLLWNNWLKGRQKHFFMIFSTSTYIKGSVSCFFFCLNSSDGAPEECLPLYAS	79806	80767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_+_79800_80800
934552	contig_5236_pilon	+	2308	17	Intergenic	novelGene_100892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	140.020743440927	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	225	2066	67078	84085	FALSE	10	TGTGCCTTATTTGTTTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEDAKVMSWWDYGYQITAMANRTILVDNNTWNNTHISRVGQAMASTEEKAYEIMRELDVSYVLVIFGGLTGYSSDDINKFLWMVRIGGSTDTGKHIKEHDYYTPTGEFRVDREGSPVLLNCLMYKMCYYRFGQVYTEAKRPPGFDRVRNAEIGNKDFELDVLEEAYTTEHWLVRIYKVKDLDNRGLSRT	60669	84327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60687_62751_62879_64042_64108_67062_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
934553	contig_10225_pilon	+	2214	14	Intergenic	novelGene_86769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	543.728417241527	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	130	1131	20776	42680	TRUE	20	TCTGATCCTAGACTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20646	47747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_44018_44073_45216_45259_46110_46438_47132
934554	contig_5302_pilon	-	2787	8	Intergenic	novelGene_81441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	748.932546484444	2	141	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	329	727	209238	181914	TRUE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVHPPIPDARLWCTWAPRGHPPPGHCAPLREAGTAAL	209566	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181370_181900_182025_185045_185126_185963_186076_209142
934555	contig_7051_pilon	+	1826	14	Intergenic	novelGene_64353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	4	junction_2	518.841631958399	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	492	1476	351	1826	331836	347016	FALSE	65	GAACCAAAAAAAGAGCATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWDQGGQPWQQWPLNQQQWMQSFQHQQDPSQIDWAALAQAWIAQREASGQQSMVEQPPGMMPNGQDMSTMESGPNNHGNFQGDSNFNRMWQPEWGMHQQPPHPPPDQPWMPPTPGPMDIVPPSEDSNSQDSGEFAPDNRHIFNQNNHNFGGPPDNFAVGPVNQFDYQHGAAFGPPQGGFHPPYWQPGPPGPPAPPQNRRERPSSFRDRQRSPIALPVKQEPPQIDAVKRRTLPAWIREGLEKMEREKQKKLEKERMEQQRSQLSKKEKKATEDAEGGDGPRLPQRSKFDSDEEDEDTENVEAASSGKVTRSPSPVPQEDQSEPEMTEEEKEYQMMLLTKMLLTEILLDVTDEEIYYVAKDAHRKATKAPAKQLAQSSALASLTGLGGLGGYGSGDSEDERSDRGSESSDTDDEELRHRIRQKQEAFWRKEKEQQLLHDKQMEEEKQQTERVTKEMNEFIHKEQNSFLLEAREADGDVVNEKKRIPSETTSAL	321879	347016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_+_321938_322784_322886_328188_328270_330091_330170_331803_331924_334316_334506_335893_336118_337641_337814_338673_338865_342961_343100_343373_343474_344168_344223_345366_345538_346867
934556	contig_3018_pilon	-	1897	15	Intergenic	novelGene_78875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	539.280529776403	2	68	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	478	1473	600079	570057	TRUE	65	ACCAGAAGGAAAAAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKGSAPEIDPSSDGSNFGWETKIKAWMDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKKF	625090	562943	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563040_566733_566844_567962_568081_569956_570067_570216_570435_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_600655_600766_624772_624901_624965
934557	contig_7627_pilon	-	1838	2	Intergenic	novelGene_175556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	90	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1035	1400	11747	11382	TRUE	60	AGGGACGAAACAATCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNIWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	12781	2640	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_-_2824_11126
934558	contig_11055_pilon	-	1037	2	Intergenic	novelGene_142173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTTTATTTTTATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	165892	144605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11055_pilon_-_145571_165820
934560	contig_6871_pilon	+	2169	3	Intergenic	novelGene_21562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	566.5	1	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	53	1171	129801	135017	FALSE	70	TAAAAGAGAGGAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSENSGPPRTDFLRGKPMKSMLVVALLVVFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPIMYSVICFVGLLGNGLVMLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAMADILFLLTLPFWAYSAAKSWDFGVHFCKFIFSVYKISFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLAVVLSIPEVLYSGIQKSSSEQALRCSLITEHVEALITIQVAQMVVGFLIPLMAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSSCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHARRSSMSVDVETTTTFSP	121903	136015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6871_pilon_+_121948_129792_129843_133940
934561	contig_3956_pilon	+	1676	9	Intergenic	novelGene_14927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1437.15999783427	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	81	824	1281682	1286042	TRUE	50	GGGAAACTCAAACATCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGRPPGL	1281601	1290787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284800_1286025_1286224_1286409_1286606_1287276_1287378_1290413
934562	contig_4232_pilon	-	1178	1	Intergenic	novelGene_63335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	975	7	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAATACAGGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468134	466956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467000_468100
934563	contig_15047_pilon	+	1228	6	Intergenic	novelGene_52256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	3018.18760185645	3	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	82	357	3242	4178	TRUE	20	GAATCTGCATCTTTGCTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2764	21661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_20997_21062_21232
934564	contig_19604_pilon	-	2244	2	Intergenic	novelGene_77235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	103	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGAAACAGCCCTGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262778	259234	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_-_260540_261839
934565	contig_5236_pilon	-	2267	14	Intergenic	novelGene_100956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	204.429238636423	2	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	557	1674	74	1747	1011714	1006447	TRUE	10	TTGCCTTTTAGGTCTTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDFFTIFSKGGLVLWCFQGVSDSCTGPVNALIRSVLLQERGGNNSFTHEALTLKYKLDNQFELVFVVGFQKILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEIQQQSALSLLNGTFDFQNDFLRLLREAEESSKIRAPTTMKKFEDSEKAKKPVRSMIETRGEKPKEKAKNSKKKGGKKEGSDGGPLAAGKADSSVKTAVPVGPENGVELSKEELVRRKREEFMQKHGRGMEKSSRSLKSDAPKEKGKKAPRVWELGGGANEVLDYSTPTTNGTPEAALPEDINLIRGTGPGGQLQDLDCSSSDDEGASPSTTRPSATKGTLGGMFGMLKGLVGSKSLSRADMESVLDKMRDHLIAKNVAADIAVQLCESVASKLEGKVMGTFSTVTSTVKQALQESLVQILQPQRRVDMLRDIMDAQRRQRPYVVTFCGVNGVGKSTNLAKISFWLLENGFSVLIAACDTFRAGAVEQLRTHTRRLSALHPPENHSGRTMVQLFEKGYGKDAAGIAMEAIAYARNQGFNVVLVDTAGRMQDNAPLMTALPPDSVYTASTNGWKTQHQSRQC	1011787	1005867	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_-_1006194_1006252_1006516_1007305_1007386_1007705_1007920_1008025_1008199_1008506_1008594_1008740_1008860_1008960_1009053_1009468_1009620_1009727_1009891_1010127_1010289_1010453_1010618_1010912_1010997_1011597
934566	contig_8377_pilon	+	2392	22	Intergenic	novelGene_34960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3793.19240200645	1	65	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	567	1704	338	2041	131448	177309	TRUE	50	TCAGAAATTGAACATTACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHLPTHANSQAPSAGSDNHTHSSEVALTALTPTLGSNDITGVPGDGSTFTTSPADTNFTSVTPLSPALSSPTADLPSRTSNIMTRDNSSDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGTPGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQVSEHTTGVQQIFYQGRSKVF	68097	180487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68340_128711_128871_131430_131572_135049_135197_136291_136373_137710_137738_140783_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177246_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
934567	contig_5020_pilon	-	1540	7	Intergenic	novelGene_27900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCTGGGAGACGGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126086	119479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_119595_121703_121963_122811_123035_123146_123358_124424_124537_124899_125097_125663
934568	contig_6102_pilon	+	1575	7	Intergenic	novelGene_32165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	1212	1538	846793	867300	FALSE	0	TCGTGGCCTCTTCTCGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFKIVTSSKATECKFGFLKIYINIFTVFNTKFNKDIVPSIVPLCRSRLPTQRDRRWRGGEGRGGFPATPNAASAYHYADLPSAGCRTHIVNGAGGWVDGPLWRQLLGI	839081	867337	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_839996_841186_841256_844910_845001_846088_846187_846752_846826_846981_847098_867122
934569	contig_17144_pilon	-	2462	12	Intergenic	novelGene_29236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1693.07130572844	2	78	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	664	1995	384	2378	174965	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFGTPACPPSPRSQCWRRRRRSQGPGSPVTTRGPVASPPWSRPMCFRGDQEKLPLSPSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	179751	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166823_168168_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700
934570	contig_17074_pilon	+	2104	2	Intergenic	novelGene_145118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTTGCCATTATCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207933	225575	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208016_223553
934571	contig_13215_pilon	+	4560	4	Intergenic	novelGene_145873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	1425	1955	9230	9760	TRUE	55	CAGCCCTATAAAACAAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRTIQELKQKADKNEEENRQIHGKYRKKNGTIQENNAGTKCQNKFHLEIIQKQQLEIQKINNKISEMDSVIEGLRSRFETVEDRIRETLGYNSEEKSEKRTKKNEETLIIMWDTIKSKNLQVIGIPEWGENRKHRSIEELLTENLPNITKDEKLAIHKAQRTPYRIDPKRKITKA	7461	68056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13215_pilon_+_8061_8404_10739_66290_67287_67425
934572	contig_11417_pilon	-	503	1	Intergenic	novelGene_103273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAAACCTACAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	297031	296528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11417_pilon_-_296500_297000
934573	contig_233_pilon	-	2135	10	Intergenic	novelGene_14553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1140.36736554282	3	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	220	1695	105485	78579	FALSE	15	GAAGCTGGGCTCTGTGACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	105704	78138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98425_101673_101770_104152_104309_105461
934575	contig_16185_pilon	-	2286	6	Intergenic	novelGene_144745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	89	junction_4	50.526824558842	2	120	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	834	1622	104189	82386	FALSE	30	AGTGAACGTTGGTATCAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLETMRGELRFDITKAGTLHGFTAWFSVRFQNLEEDKPQLVLSTGPFHPMTHWKQTLFMMDDPISVHTGDVVTGSVVLQRNPVWRRHMSVTLSWSVTSGQDPTSQRVGEKIFPIWR	105022	81721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87641_87772_96623_96800_104048
934576	contig_18511_pilon	+	1623	9	Intergenic	novelGene_126865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	420.163881717598	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	516	1107	1622	55332	59232	FALSE	65	AAAAGGAAAAAGAGATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENAVLALAQIENTAAVQKAIAHYDQQMSQKVQLPTETLQELLDLHRASEKEAIKVFMKSSFKDVDQKFQKELGDKLQAKQDDYYKQNIKASMDYCEALIQDIFHPLEEDVKQGIFSKPGGYLLFIQKKQELKNKYYQVPRKGIEAEETIKKYLESKEDVADALLRTDQSLT	35391	59233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18511_pilon_+_35619_47350_47561_48093_48202_49187_49272_51672_51861_52218_52449_55272_55554_56905_57119_59151
934577	contig_821_pilon	-	3227	2	Intergenic	novelGene_149422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	87	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2400	2987	414390	413803	FALSE	15	GATTACCTGTGTTTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQNIIREETKTSLKRQEGKKRPKQMSEETLKLALECRVARAKGRNDEVKKLNRRFQRAAREDRVKYYNDMCKDLELENQKGTTRLAFLKLKELKKKSKPRAAILEDSTGKILNDSGSIKRRWKEYTESLYQKELVDVQPMVVKEEIQTALKALANNKAPGIDGIPIEMFQQMDAALEVLTSLCIEIWKTASWPTD	421430	413562	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_821_pilon_-_415522_420162
934578	contig_4232_pilon	-	870	1	Intergenic	novelGene_63393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	59	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGACAGCTATTGGACGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	468135	467265	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467300_468100
934579	contig_610_pilon	-	2820	5	Intergenic	novelGene_76666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	474	junction_1	301.88356613105	2	130	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	9	407	37881	32917	FALSE	30	GATCCATGACTTATTCATAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAMSLHTHHAELLSVLAVPFLLALILSPVLLFHLYKRRQGAYLKTFNKSSDKSSATASDDVSNKIVYEQIVIAPRDTQPAETRIYDEISQPKVPPSKEEAVNTIYSIVQCSDKMGKTSTCGRKPLGTSSYETVI	37889	30503	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_32983_34644_34708_35444_35546_37075_37133_37769
934580	contig_18162_pilon	-	2718	3	Intergenic	novelGene_122334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGAGAAGTTAGAGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9695_9895_10822_16381
934581	contig_12605_pilon	+	1026	5	Intergenic	novelGene_64184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1820.46608043105	3	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	645	382	1026	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3870	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6124
934582	contig_10930_pilon	-	2366	7	Intergenic	novelGene_37033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	728	1576	276835	268388	FALSE	15	CTATGATTTTCCAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280394	267597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278454_278637_279700_279832_280157
934583	contig_3817_pilon	+	800	1	Intergenic	novelGene_78335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCAATGAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204667	205467	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3817_pilon_+_204700_205500
934585	contig_12102_pilon	+	1559	1	Intergenic	novelGene_151051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	106	321	117	437	38818	39138	NA	15	CCTTCTCAACCTTTATTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVQPLWKSIWCFLKKLETEVPYNPAILLLGIYPREIRAITRTDICTPMFIAALFTIAKRWKQPRCPSADEWINKSWSIHTMEYYATIKNNEAVKHNMEEAGGHYAE	38701	40260	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12102_pilon_+_38700_40300
934587	contig_15666_pilon	-	1724	4	Intergenic	novelGene_70146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	276.97693445885	2	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	120	644	110619	107848	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQAQVVTSSFALCLTLPWEPTPRTPGVQHISSAQPRNHGPKTDT	110738	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_109098_109138_109948_110246_110558
934588	contig_3956_pilon	-	1677	6	Intergenic	novelGene_15275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	22	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	888	790	1677	1289815	1287350	FALSE	25	CACCAGGCCCACAATGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDA	1291010	1287349	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
934589	contig_2728_pilon	+	2225	1	Intergenic	novelGene_179243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	126	381	1618	1998	9901	10281	NA	25	ATAATCTATTCACTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTYPVEMGPHNSLQGERHSKSVDLLCLCLGKGVMPTLSSWLMGANRLFFPHLLVCSLWENGSEHMRGPTSGPGYLAITESVPDPVQSREWVGKWERGFSQRGMFLIHVVGRMQVLIFHQSRAASH	8283	10508	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2728_pilon_+_8300_10500
934590	contig_10740_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_152241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTTTTATACATTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8456	6895	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10740_pilon_-_6900_8500
934591	contig_6576_pilon	+	3121	2	Intergenic	novelGene_42405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	448	1347	90	1436	1301228	1302574	FALSE	45	ATAAAATGCATGCTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSPDSLNLPSPPVDFMQNLEDSNNEIQCEEFPIPLDSDQDLNESLPLPPAELL	1295677	1304259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301221
934592	contig_12605_pilon	+	640	3	Intergenic	novelGene_64221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	4099	junction_2	2135	2	15	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	236	640	5056	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	4820	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_5072_5728_6005_6124
934593	contig_6159_pilon	-	2623	2	Intergenic	novelGene_128251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1608	2051	216816	216373	FALSE	75	ATAAAAAGAAAATACATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSHRSRIQAVEVRISETEDKALETNLFEETSDKTVLKNEETLRIMWESIKRNNLRVIGVPEQSGITENTERIVEDFFAENFPDTVKDDKIPIQGSHQTPRKVDPKRKSPRHFIIKLTKTKDKERILRAARDKRKVIYKAELRINSD	218917	215800	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6159_pilon_-_217831_218324
934594	contig_5643_pilon	+	2045	16	Intergenic	novelGene_39086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	337	junction_3	656.984708091952	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	426	1281	553	1833	634983	641217	TRUE	10	TTGTGTGTGTAGCCTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCEGGRYTVGGSETFDSLTDLVEYFKKTGIEEASGAFVYLRQPYYATRVNAADIESRVLELNKKQESEETAKAGFWEEFESLQKQEVKNLHQRLEGQRPENKSKNRYKNILPFDHSRVILQGRDSNIPGSDYINANYVTNQLLGPDENAKTYIASQGCLEATVNDFWQMVWQENTRVIVMTTREVEKGRNKCVPYWPELGMQRVYGPYSVTNCAEHDAAEYKLRTLQVCPLDNENLIREIWHYQYLSWPDHGVPSEPGGVLSFLDQINQRQESLPHAGPIIVHCSAGIGRTGTIIVIDMLMESISTKGLDCDIDIQKTIQMVRAQRSGMVQTEAQYKFIYVAIAQFIETTKKKLEVMQSQKGRESEYGNITYPPAMKNTHAKASRTSSKHREDMYENLHGKNKKEEKMKKQRSADKEKSKDSFKKK	631296	641598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_631349_631435_631559_631850_632046_634800_634992_635156_635274_635373_635488_635633_635731_636174_636255_636430_636581_637768_637901_638045_638201_640216_640285_640385_640538_640636_640729_641102_641244_641412
934595	scaffold_12124_pilon	+	2240	9	Intergenic	novelGene_22033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	547.052085614341	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	307	798	846536	852375	TRUE	30	AACTGGCGTCTTCTAAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFTCIIYNTSFMNCSWVPGPAAPADVQYRLDVWTSLLEDGTECPQYIRDSAGTHVGCHFDISSEPKQPQYIFFLNGTSEETTIPFLDFAPFEAFRMEKYNPPSNITSHYNGSNHIIQWENPQRRFEYASHILDYQLDIQKKVRTQHHCPKRTRQKRIPGAKL	829556	858979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_829716_844270_844398_846515_846646_846716_846899_847602_847753_852325_852462_854703_854804_857165_857236_857793
934597	contig_7078_pilon	+	2326	1	Intergenic	novelGene_130223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATAAAGGGCATCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	966295	968621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7078_pilon_+_966300_968600
934598	contig_11396_pilon	-	583	1	Intergenic	novelGene_71337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAATAGAGAATAGAAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	486378	485795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11396_pilon_-_485800_486400
934599	contig_17703_pilon	-	2629	3	Intergenic	novelGene_179244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1496	1876	5965	5585	FALSE	55	AGTCTCAGCAAAAACAAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	8044	4831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17703_pilon_-_5993_6232_6933_7276
934600	contig_3077_pilon	+	1219	10	Intergenic	novelGene_26662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2123	junction_8	2903.32291531915	2	18	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	60	1211	9676	17590	FALSE	0	CCCCGTCCTTCTGCTGCCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVCDFLREATVHRLLGQQVPYATKGNQWVGYDDKESVKSKVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9616	17598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_16936_17054_17449
934601	contig_854_pilon	+	5738	35	Intergenic	novelGene_36563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2923.96076945551	12	55	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1421	4266	459	4724	1679334	1714980	FALSE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1671956	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1671987_1672803_1672898_1677515_1677604_1678131_1678196_1678749_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695162_1699011_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
934602	contig_11422_pilon	-	951	1	Intergenic	novelGene_99021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTAGTTCCGCTCAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	993	42	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11422_pilon_-_0_1000
934604	contig_10973_pilon	+	329	1	Intergenic	novelGene_150330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	17	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGATTACAGTTGCCCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	258	587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_300_600
934605	scaffold_12124_pilon	+	2019	8	Intergenic	novelGene_22252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2018.75291874434	3	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1197	1847	1508755	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473572	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486578_1491924_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
934606	contig_7202_pilon	+	1005	3	Intergenic	novelGene_17531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2664	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGCGAGGGGGATGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27623	29884	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_27951_28042_28634_29797
934607	contig_5794_pilon	-	658	4	Intergenic	novelGene_69804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	767	junction_1	1182.04239442679	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAATTTTTAACTTTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	745250	743251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5794_pilon_-_743603_743694_743765_743856_743980_745136
934608	contig_5020_pilon	-	1551	6	Intergenic	novelGene_27898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	28	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	681	1022	124475	123330	TRUE	35	GAGACGGAACACCTAATGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALRATLGEVPIGRRAYVRTGNGGGRRKVRERKRLIHTFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126085	119471	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_119595_122811_123035_123146_123362_124165_124544_124906_125090_125656
934609	contig_13042_pilon	-	3386	3	Intergenic	novelGene_179014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTTTCCATCTCTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10319	2559	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13042_pilon_-_4085_4527_5058_8988
934611	contig_3948_pilon	-	2457	7	Intergenic	novelGene_53215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	290.885668643579	1	126	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	132	399	404	802	852494	840803	FALSE	25	ATTTCAAGAGTGTCATGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869598	839147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852597_856561_856712_866355_866480_869571
934613	contig_17144_pilon	-	2832	16	Intergenic	novelGene_29468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1932.2139863092	3	87	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	817	2454	302	2755	179764	166152	FALSE	30	TAAGAAATTCTTGAGTGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSLAPMTRSFMGRCWRAPQAQGQGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183409	166074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166645_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
934614	contig_14441_pilon	+	896	5	Intergenic	novelGene_100640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	406.858083365687	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	282	710	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLVLRGGVGGRGRFCTKLKHCGDRGATGNTLYFGDGTRLSVIDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111305	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112618_112665_116578_116963_117220_117344_117539
934615	SIRV7	-	1825	7	NNC	SIRV7A	novel	2462	5	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	68	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAGTGTTAATATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114938	1005	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1400_1442_1719_1823_2171_2292_2676_2993_3112_43028_43078_114680
934616	SIRV5	+	2579	5	NNC	SIRV5A	novel	2474	18	NA	NA	-38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	973	7	2	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATGTAAAACATTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8277	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11133_12176_12437
934617	contig_11316_pilon	+	875	2	Intergenic	novelGene_122675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTAATTGAAAACCACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139404	140495	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11316_pilon_+_140073_140288
934618	contig_20951_pilon	-	480	1	Intergenic	novelGene_43076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAATAAAGTGCAAACCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27060	26580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_26600_27100
934619	contig_3747_pilon	+	2347	5	Intergenic	novelGene_24771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	2	76	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	958	1284	203794	204120	FALSE	55	TAAATAAATTTTAAATGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200981	205183	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201548_203070_203128_203228_203386_203498_203651_203768
934620	contig_3077_pilon	-	1598	8	Intergenic	novelGene_26748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGGAGAAGTCTGAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18088	11276	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
934621	contig_17144_pilon	+	1645	8	Intergenic	novelGene_29434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	894	1211	167621	168283	TRUE	15	TGTTGCAGAGTTGGACTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166074	172645	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527
934622	contig_7272_pilon	-	1539	12	Intergenic	novelGene_25362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	684.686391383277	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	611	1267	610206	604954	TRUE	65	TTAAAAAAAGTGAAGAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAAVAASDQAEGKKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLVSRLKQAIEEEGGDPDNIELTVSTDTPNKKPTKGKGKKQEADELSGDASVEDDAFAKDCELENQEAHEQDGSDELKDSEEFGENEDENVHSKELLPAEENKIAHELIEAEAIEDIEKEDIESQEIGAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEKEGSLAEADHTAHEEMEANTTGKEAEDDNISVTIQAEDAITLDFDGDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGPDAIAQSPEKESKDYEMNANHKDGKKEDCLKGDPVEKEARESSKKAESGDKEKDSLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDKGSSSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGSECKGSYKCSKSWGQMLWHCNYVFQHRSVQMYRTPSSH	633169	604473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_604611_604709_604814_604922_605073_606913_607028_609184_609235_609832_610248_611629_611658_616565_616614_617510_617709_620502_620568_632105_632194_633027
934623	contig_5023_pilon	-	2212	7	Intergenic	novelGene_7324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	993	1493	647301	643482	TRUE	25	GCAGGGGAGGGGGTGACACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648293	607252	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607341_607933_608098_609592_609723_611684_611834_639076_639195_643411_643539_646857
934624	contig_1380_pilon	-	2736	2	Intergenic	novelGene_138893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGGTTTTGCATAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	795355	705142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1380_pilon_-_706720_794196
934625	contig_2480_pilon	+	2000	14	Intergenic	novelGene_63529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	84.6489443937859	1	99	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	741	1913	265974	279119	FALSE	25	CAGTACATTGGATTTTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQFAAAAYGWPLYIYRNPFTGFCKIGGDCCRSRTTEYELVGGDQLNCHFGSILQTTGLQYRDFIHISFHDKVYELPFLVALDHRKESVVVAVRGTMSLQDILTDLSAESETLDLGCELQDCVAHKGISQAARYVYRRLINDGILSQAFSVAPEYRLVLVGHSLGAGAAALLALMLKNTYPHVRCYAFSPPRGLLSKSLYEYSKSFIVSLVLGKDVIPRLSVTNLEDLKKRILRVIAHCNKPKYKILLHGCWYELFGGDPDNFPTELDGVNQENLTQPLLGEQSLLTHSSPAYNGSDDSPLHSPSKYPALYPPGRIIHLEEKGPSGRLCCSAAQYSARWSHESEFSRILIGPKMLTDHMPDILMRALDHLVSDRAACVSCPAQGASHMDMV	251383	279206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2480_pilon_+_251563_261836_262006_263141_263369_265014_265138_265931_266060_268070_268198_270345_270430_271795_271874_274104_274186_274280_274409_277042_277112_277209_277283_278532_278784_278923
934626	contig_3956_pilon	+	2174	11	Intergenic	novelGene_15071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1267.33768191434	1	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	883	1650	1288971	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282824_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284706_1287447_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934627	contig_15666_pilon	-	2248	6	Intergenic	novelGene_70143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	609	junction_4	501.69528600536	2	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	31	1200	110619	107816	FALSE	30	TAGCATGTAAACTACGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110649	106767	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
934628	contig_4604_pilon	+	2436	8	Intergenic	novelGene_19169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1746	junction_7	896.263513546259	2	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	892	1608	373631	379856	FALSE	85	AAAACAAAAAAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	371489	380684	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
934629	contig_5454_pilon	-	272	1	Intergenic	novelGene_145500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCATTTAACGGTTAGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	137059	136787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5454_pilon_-_136800_137100
934630	contig_5023_pilon	-	1956	6	Intergenic	novelGene_7329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1001	1501	647301	643482	TRUE	25	TTTTATTGCTTTAGGTAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFGTPVLGKVSSNEATFVDHPNLLGLKQADWLVRCSKGPETRMASRGGPQRGDFLGGWRAKSRGDRVEKGKEERLVTDPWASWGCPGPSGQAGSGGLNPPTGLHTLFIPLPMRQANTVMTILGFTSTRSSGRAYTRAPIFRAMEMAYFALLSFSSASRFSVFRRS	648301	607277	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_-_607353_630260_630313_631413_631554_639076_639195_643411_643539_646857
934632	contig_14441_pilon	+	1004	5	Intergenic	novelGene_100570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	2	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	416	964	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111196	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111301_121528_121691_125517_125902_126159_126283_126514
934633	contig_3956_pilon	+	1382	6	Intergenic	novelGene_15078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1459.68700754648	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	383	1152	80	1231	1281682	1290847	FALSE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281602	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1290413
934634	contig_10424_pilon	+	4145	25	Intergenic	novelGene_56799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	160	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	3057	3470	317607	319652	TRUE	35	CAGGAGAGTCGAGCACCGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGALGFFNRSLGCALKGSPDGGGGSVCSIIEGGMYIGCGGIGTALPQPNFISKDIIIFPFKFFKALSASLLFINATKPQFLSLALSSSVLGHIIFTLANGPNLPNSWHSISSFICGLIFPRYKLVVLGSPTSCEPGA	290326	347229	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10424_pilon_+_291641_292818_292995_294204_294324_296962_297077_298980_299138_303352_303428_304146_304245_305648_305802_307378_307504_308729_308814_309753_309836_310863_311038_312275_312474_313413_313536_317541_317781_317959_318127_319579_319667_319761_319792_319876_319972_320538_320603_323695_323822_327221_327309_329326_329460_341003_341055_347154
934635	contig_10930_pilon	-	1579	3	Intergenic	novelGene_36996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3254	junction_1	492.5	3	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	152	598	274034	268388	FALSE	60	ATAGCATTAAAAGAAAGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	274185	267406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950
934636	contig_9235_pilon	+	2251	3	Intergenic	novelGene_156209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	262	42	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	240	881	45805	46953	FALSE	20	TCCCTTTGTGAAGAGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	43961	48323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_44040_45643_45849_46355
934637	contig_12626_pilon	-	1801	1	Intergenic	novelGene_80418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTCAAGCTTTGTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	103627	101826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12626_pilon_-_101800_103600
934638	contig_5623_pilon	+	2058	1	Intergenic	novelGene_154865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	13	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	ATAAAAATAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	253140	255198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_+_253100_255200
934639	contig_15449_pilon	+	2913	13	Intergenic	novelGene_33594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	124	junction_2	566.129616833067	8	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	830	2493	191	2683	37166	54621	FALSE	25	ACTTTGTAGAGACTGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSFQQSSLGRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNLGMSSSLNQQGALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPLPLSSQHRGDADQASNILASFGLSARDLDELSRYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGRDGRSATRDPPYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQESGYYDRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPGPLQERSLFEKKRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLEMGDPFMLQQSTNPAPGILGPPPPSFHLGGPAVGPRGNLGAGNGNLQGSRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNKINEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQELGRVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAEPFGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVDHCLKKALWFQGRCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPSDKKSKTDGSQKTESTAEGKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVDEEEAAALLESGSSVGDETDLANLGDVASDGKKDPSDKTVKKDASALAAAKKKLKKVDKIEELDQESEAALENGIKNEENTETGAESAENADDPNKDTSENADGQSDENKEDYTIPDEYRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEDIAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLAEERRQKKEA	36975	54851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_38069_43216_43279_44648_44762_45020_45074_45574_45701_46863_46990_47162_47331_48213_48346_49037_49082_49186_49557_51106_51330_51809_51932_54570
934641	contig_17281_pilon	-	544	1	Intergenic	novelGene_105178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTAGGAGAGGCAGAGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2593	2049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17281_pilon_-_2000_2600
934642	contig_11285_pilon	+	1087	4	Intergenic	novelGene_5654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_3	92.5346781842714	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	28	777	768710	769878	FALSE	20	CACTTCAACTGTCTCTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	768682	770188	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_768857_769085_769320_769421_769653_769740
934643	contig_16622_pilon	-	1669	5	Intergenic	novelGene_48470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1256.44824306455	1	68	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCAATAAATTGATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121966	111875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115297_121470
934644	contig_3956_pilon	+	1438	7	Intergenic	novelGene_15076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1642.05629894011	2	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	81	695	1281682	1290276	FALSE	15	GCCTACGCGACTTATTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANTRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMSVATLAAW	1281601	1291019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282749_1282853_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284765_1290248
934645	contig_5020_pilon	+	1563	9	Intergenic	novelGene_27814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	871.911943661744	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	586	1248	123294	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118460	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119596_122812_123041_123152_123208_123253_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
934646	contig_13800_pilon	+	1988	14	Intergenic	novelGene_153714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	278.6670512346	1	142	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	256	1713	114337	162575	FALSE	40	ATATTATAAAATTTCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYDSTVRLPEEDEEEEEEEEEVEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDSSGQEDETQSSNDDPSQAVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSEIEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIAFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSNSNQNGVSSNGPGEILSKEDVKVEGLHVNGPTGGNKKPLHADTDTNGYETDNLTTDPKLAHMTARNENDLDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAISHGKFEELDNIDD	95632	162850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13800_pilon_+_95668_95759_95829_98357_98435_114262_114436_125048_125211_125888_126022_127741_127807_131981_132055_139618_139771_140994_141077_142264_142360_154784_154913_159543_159684_162246
934647	contig_6929_pilon	+	686	3	Intergenic	novelGene_139415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	6083	junction_1	1333	2	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	87	264	54	317	127755	130939	TRUE	35	AGCACCTGTTAATAAAGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPPRQRQPREDGNEEDKENQDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDGKETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE	127701	132286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6929_pilon_+_127787_130707_130971_131948
934648	contig_8772_pilon	+	1704	8	Intergenic	novelGene_21110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	53	junction_6	4105.60529729087	2	61	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	419	1260	36	1295	15355	21997	TRUE	25	AAAACTCTTGCTGTGTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPPSPLPPSAAMSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRNQSGFTPSG	15319	23417	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21966_22053_23063
934649	contig_15558_pilon	-	2395	2	Intergenic	novelGene_179245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	426	1970	2395	34759	669	FALSE	45	TGGGCAAAGGAAATGAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPVSFFCKWISSFAKMKQDPYLTPYTKTTSKWIKDLNIKPKTIKFLEEKIGSTLQALIHGINRIQTTTINTQNPTDKLDKWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGQYKSDKGLISIIYKKIQLLYNKKTNNPIKK	36728	668	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15558_pilon_-_1051_34715
934651	contig_5419_pilon	+	1702	1	Intergenic	novelGene_15564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCCTTGAAGTCGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	573789	575491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_573800_575500
934653	contig_5698_pilon	+	1985	6	Intergenic	novelGene_55036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1535	junction_1	325.96478337391	1	74	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	37	114	530	643	19257	19370	FALSE	35	TTGCTCAGTAATACAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPHPEEVDGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAHVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEVQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA	7816	20712	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_8025_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
934654	contig_6735_pilon	-	2227	13	Intergenic	novelGene_15712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1097.58351681723	1	56	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	703	1440	545923	542771	FALSE	30	TGCTGAGCTAAATAGTACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAPTTAYKKTTPIEAASSGARGLKAKFESMAEEKRKQEEEEKAKQMAKQQKERKAVVKMSREAQQPEMIVEEPVAPAPLPNKISSKAWPPAESCPSSEPEPVKTSRGLPVSSLPSRQTIPEDDENPPALPPRTPDVLQVEEEPIYEAEPEPEPEPEPELEPENDYEDADNMHRHEQDDDAQGDYEDVDNMDRHEQDDDADGDYEDVIEPENSSALAGSSGYPAGAIGISAVALYDYQGGRLGVA	568282	541983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6735_pilon_-_542857_543005_543292_543788_543894_544851_545064_545874_545945_546595_546636_547243_547355_551179_551235_552840_552950_554249_554374_564157_564232_564784_564869_568198
934655	contig_20739_pilon	-	910	1	Intergenic	novelGene_83182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	18	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTATCATCAGTCAGAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	155108	154198	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20739_pilon_-_154200_155100
934656	contig_16303_pilon	+	2454	9	Intergenic	novelGene_34050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1500	1868	37468	38717	TRUE	40	TACAAACAGAACGGTGGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARVSLLLSRGHHHSRPLLEGPIPRRPGLHKLCVLGLVLPIPLPGQCDLRRVEAQGPAPQSNLSIRAGVMSHVCSGRLCGSASPVHTPSISAATRCIPSPSRLYLSLWSSHWPPTFAWCSGR	32123	45519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_+_33124_35442_35496_35538_35766_35982_36032_37173_37302_37425_37706_38586_38848_40426_40736_45372
934657	contig_12079_pilon	-	2311	5	Intergenic	novelGene_67524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	340.267909153949	1	80	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	519	1547	862393	861365	FALSE	35	TACAAACGTTAACTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	866580	860600	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862478_862547_862630_863468_863584_864504_864701_866539
934658	contig_15384_pilon	-	995	1	Intergenic	novelGene_85156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGGATTCTATAGGGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	171898	170903	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15384_pilon_-_170900_171900
934660	contig_3956_pilon	-	2864	15	Intergenic	novelGene_15165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	1693	2268	1286221	1284227	TRUE	35	CCAGGCAGATACGAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1290999	1281657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289149_1289571_1289675_1289756_1289913_1290405
934662	contig_12427_pilon	-	1550	5	Intergenic	novelGene_40466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2487.69225387707	5	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	135	551	316061	315376	TRUE	25	GGGAGTTTGACTAAAGTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDVLVCFFSLLLKPAITAVEVVTLPRTARSPRESESSAATTVANQAILLVTVTMLMSRSAILVANLDTFKKTAPK	325973	313521	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315597_315748_315842_315958_316079_325856
934663	contig_1725_pilon	+	2941	20	Intergenic	novelGene_24268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	654.495568169459	3	73	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	340	1023	76	1098	201480	245317	TRUE	20	CATTGGAGCACCTTTCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQASCHPAE	201404	255862	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245073_245297_245391_246542_246690_247022_247187_247639_247742_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252129_252265_252711_252779_255366
934664	contig_6102_pilon	+	1762	5	Intergenic	novelGene_31935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	512	junction_1	316.446677972767	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	92	406	392993	393438	TRUE	30	TTATACTCAAACCAGCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLHRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDR	392901	395250	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393149_393279_393856_393929_394036_394221_394272_394467
934665	contig_4399_pilon	-	782	2	Intergenic	novelGene_179246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTGGAATGCTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	195470	170162	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4399_pilon_-_170624_195149
934667	contig_8602_pilon	+	2331	2	Intergenic	novelGene_179247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTCGAGAACTTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	76661	121974	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8602_pilon_+_77584_120565
934668	contig_9482_pilon	-	1891	7	Intergenic	novelGene_44308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_3	83.5477242192881	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	901	1665	1240827	1236365	FALSE	0	GCCTTTCTCTTCTGCTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIQQIKETGANLAVCQWGFDDEANHLLLQSNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVKEISFGTTKDRMLVIEQCRNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALAENSGMNPIQTMTEVRARQVKETNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE	1242897	1236138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9482_pilon_-_1236493_1237258_1237440_1238171_1238310_1238915_1239102_1239796_1239917_1240815_1241234_1242403
934669	contig_6589_pilon	-	1948	13	Intergenic	novelGene_26271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	16	junction_12	52.8884439173625	1	128	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	988	1896	2230610	2227865	FALSE	15	TTCTTCAAGCTTGGCCAGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIGRGKLPAEEFKAKVEAVVEKLGVPFQVLVATHAGLYRKPLTGMWDHLQEQANEGVPLSIEDSLFVGDAAGRPANWAPGRKKKDFSCADRLFALNLGLTFTTPEEFFLKWPAASFELPAFDPRTVASSGPLCFPESSSLLSSDPEVVVAVGFPGAGKSTFLKEHLVSAGYIYVNRDTLGSWQRCVTTCEASLKQKKRVVIDNTNPDALSRARYIKCAQDAGVPCRCFLFTATLEQARHNNRFREMTGSLHAPVSDVVMYGYRKQFEAPTLAEGFSQLLEIPFRLHLVPQLEQLYRQFSDG	2232822	2227812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_-_2227983_2228056_2228119_2228208_2228297_2228378_2228489_2228740_2228803_2228891_2228989_2229065_2229159_2229232_2229304_2229388_2229438_2230171_2230244_2230523_2230632_2230737_2230796_2231914
934670	contig_14925_pilon	-	2002	6	Intergenic	novelGene_55336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1050.38202574111	1	116	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTTGCCTTTGGCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163866	112098	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115817_116101_163341_163681_163835
934671	contig_6102_pilon	-	1532	9	Intergenic	novelGene_32154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	533.374106514368	10	9	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	303	785	867239	839973	TRUE	20	ATCTTTGAGCCGTCTACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQPASAKWYDRRDYVFIEFCVEDSKDVNVNFEKSKLTFSCLGGSDNFKHLNEIDLFHCIDPNDSKHKRTDRSILCCLRKGESGQSWPRLTKERAKLNWLSVDFNNWKDWEDDSDEDMSNFDRFSEMMNNMGGDEDVDLPEVDGADDDSQDSDDEKMPDLE	867541	838828	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_839527_839923_839993_840273_840299_841192_841256_844910_845001_846088_846188_846753_846824_846979_847094_867237
934672	contig_19727_pilon	-	514	1	Intergenic	novelGene_169008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGTGTGCTGTCGCAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60533	60019	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19727_pilon_-_60000_60500
934674	contig_10930_pilon	-	2379	8	Intergenic	novelGene_37026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1998.6316645676	1	89	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	316	951	25	975	280370	274196	TRUE	5	TTTTCCAGTTTTGTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNSIYVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTHRFGHTPVQTRLSCLAKNNSVYVLVNIGDKKPCNSRDSTCPSNGYYQYNTNVVYDTEGKLVARYHKYHLYSEPQFDVPKKPELVTFNTSFGRFGIFTCFDILFHDPAVTLVEGFQVDTILFPTAWMNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTVASMHHTLPKCIIMIWKQHLESFFFQRWIHTLASLLPTQQP	283955	267591	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274321_276723_277013_278443_278637_279700_279832_280157_280380_283940
934675	contig_14575_pilon	+	2141	21	Intergenic	novelGene_101872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	123.830488975858	1	74	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	141	686	17236	26356	TRUE	60	GATCCAAAAAGAAGAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKSSENGEVVNNFRSSTMDDLNLEDLTMADYALLEDCSYVEDLESAPGSVTHNSVRLTEVYSDGVGMHCKDYTRSEKNLEFDICRIWCSKPVSVLKEYCDAIKVFIFWPLLFHHQNGSLLTQLHPCMEANNSRACELSLAKLQHIELMEDIVDLAKKVVNDSFFIGSLLRIGYKIENTNIT	17095	63912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_+_17277_19965_20120_20522_20566_20884_21036_21521_21610_22649_22704_26341_26428_27684_27780_28958_29022_30473_30729_33860_33918_39341_39505_40652_40702_41533_41652_42757_42849_44947_45006_47302_47389_59266_59376_59882_59985_61543_61637_63867
934676	contig_15063_pilon	+	1533	5	Intergenic	novelGene_10121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3429.81277732473	3	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	219	1391	34808	36661	FALSE	20	GATGCTGGTCCTAAGTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLGPGDPGDCLLSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27131	36803	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34632_34926_35037_35380_35839_36158_36266
934678	contig_10734_pilon	-	2274	13	Intergenic	novelGene_51487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	505.061293035036	1	107	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	729	1787	2274500	2265543	FALSE	80	AATAAAAGGAAAGAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGIEIYWDCNLDSWFHRCQPKYSFRRLDDKTTNAALYPGYNFRYAKYYKELNFETRTLIKVFGIRFDILVFGIGGKFDIIQLIVYIGSTLSYFGLATVFIDFLINTYSSQCCRRYIYPNCECCRRNEYYYRKKYETIVEPKSTLKYVSFVDEPYIRMVDQQLPGKSLQHIKGKEVPRPPKDFTDLSKLYLPLHEPPPTPGQLQEMQLLSNEQATCRSSDSGSSDSPSWCQCGKCLPSQLPVPTSRCLEELCCRKKPGACITTSDLFQKLVLSRQNLQFLLLYQEPLLVLDPESTNSQLRHCAYRCYTTWRFSSPDVADFAILPSCCRWRIRREFPKSKGQYSGFKSPYFQQI	2305077	2265055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2266074_2267089_2267192_2269290_2269432_2270439_2270506_2270956_2271048_2274372_2274510_2275754_2275885_2277109_2277191_2280839_2280920_2282464_2282538_2285112_2285182_2286277_2286447_2304960
934679	contig_19402_pilon	-	3903	14	Intergenic	novelGene_80805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCCTGCCGAAGCTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	57556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_57741_70437_70526_79121_79205_79246_79269_81354_81452_83577_83748_97643_97789_107509_107688_130466_130643_138560_138661_139813_139895_142955_143058_143796_145820_146259
934680	contig_3956_pilon	+	1099	4	Intergenic	novelGene_15016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1073.61445593844	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	91	579	1289515	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1289511_1289677_1289758_1289892_1290297
934681	contig_6137_pilon	+	3094	19	Intergenic	novelGene_59192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	267	junction_7	1135.3333944999	8	55	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	396	1191	690	1880	1331821	1353702	FALSE	30	TGAGATTTTGAGAAGTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKKKFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQFENLLGINAHTEDLLRNPSYIQEAKAKGLVIFCWGDDTNDPENRRKLKEFGVNGLIYDRIYDWMPEQPNIFQVEQLERLKQELPELKSCLCPTVSRFAPSSLCGDPDIRMDANGIDNAENA	1294879	1354916	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1294950_1300358_1300431_1305872_1305970_1313654_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336792_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347557_1348119_1348281_1353512
934682	contig_854_pilon	-	1159	7	Intergenic	novelGene_36270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	264	620	563319	562338	TRUE	20	AGCCTGCAAGGCGCCAGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPHEAASNDCSNMRVAYWILGLPFFPLGRREHKGLGRSACKFTPASSTKKTSTKLCSQLLKNTTGRGLRGQLGHHLALRRSPGGSEPSGWEGWSATPRGCCRSVSAASWAGGTGRPG	563582	543522	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_543635_545915_545977_556080_556205_557003_557055_557626_557751_562270_562404_563028
934683	contig_6239_pilon	+	4542	4	Intergenic	novelGene_178348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	1900	2424	145782	146306	TRUE	30	GGTTACCAGGGATGGGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPQKQQTISKYLQKQERMVPVGIQNKTPDDSPVEENALELPDREFKSLILTILQDLRHKADKHEEKKDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQQEIIQRQQIEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLDTTLFQENSEKRPEKNEDTLRIMWDTIKSKNL	166	209842	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6239_pilon_+_1360_145075_146820_205539_206259_208956
934684	contig_11937_pilon	-	2679	3	Intergenic	novelGene_171585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	970	1335	290110	289745	TRUE	50	ATCAAAGATGAAAAGCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	291079	244147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11937_pilon_-_244350_264203_265233_289631
934685	contig_3469_pilon	+	2258	2	Intergenic	novelGene_34208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAACAGTTTGAAGAACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	531458	615509	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3469_pilon_+_533227_615019
934686	contig_17427_pilon	-	1707	9	Intergenic	novelGene_30376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	885.978405140329	2	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	53	799	188879	178125	TRUE	45	ACTTACCAAAATATGCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADMQNLVERLERGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEE	204695	177086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_177937_178066_178130_178694_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_188840_188890_204653
934687	contig_13300_pilon	-	2676	4	Intergenic	novelGene_125767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	605.835144426454	1	49	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	67	366	49737	47432	TRUE	10	TGCTAGTTCTTTTCCAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSLDIGGKKEYLIAGKAEGNGKMHITLCDFIVPWDTLSTTQKKSLNHRYQMGCECKITRCPMIPCYVSSPDECLWMDWVTEKNINGHQAKFFACIKRSDNSCAWYRGAAPPKQEFLDIEDP	56066	45004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_-_46746_46862_47630_49635_49761_56023
934688	contig_18162_pilon	-	2757	4	Intergenic	novelGene_122335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAAAAAAAGGTTGAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	8145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_9744_9840_10232_10290_10809_16363
934689	contig_12425_pilon	-	1126	6	Intergenic	novelGene_46703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	694.829648187237	2	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	222	669	325	993	208821	204313	FALSE	25	AATATAGCCATTTGGGCTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRTTVKKCWPLTWVGLFLQAFGAVEAISDRVCIHTSENVNVEVSAEDLLTCCHMECGDGCNGGFPAGAWNFWTEKGLVSGGLYDSHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCKGEGEETPECSKTCEPGYSPSYKEDKHYGYSSYSVPSSEKEIMAEIYKNGPVEGAFAVYTDFLVYKSGVYQHVTGEEVGGHAIRILGWGVENGTPYWLAANSWNTDWGDNGELL	209145	204179	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12425_pilon_-_204323_204825_204959_206552_206670_207180_207328_207651_207738_208645
934690	scaffold_12124_pilon	+	2039	8	Intergenic	novelGene_22250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4031.44704359441	2	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1227	1877	1508755	1509405	FALSE	25	GTGTGGTAAACTTGACTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473572	1509567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473650_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496970_1497139_1508010
934691	contig_17427_pilon	-	2290	10	Intergenic	novelGene_30308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	472	junction_5	1053.78713853099	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	200	1192	184471	178046	FALSE	20	TTCGTTGTTTACCTATACTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKLERALLVTASQCQQPAANKLSELLAPISEQIQEVTSFREKNRGSKLFNHLSAVSESIQALGWVAMAPKPGPYVKEVNDAAMFYTNRVLKEYKDVDKKHVEWVKAYLSIWTELQAYIKEFHTTGLTWSKTGPVAKELSGLPSGPSAGSGPPPPPPGPPPPPVPTSSGSDDSASRSALFAQINQGESITHALKHVSDDMKTHKNPALKAQSGPVRSGPKPFSAPKPGVSPSPKPAAKKEPPLLELQGKKWRVENQENVSNLVIDDTELKQVAYIYKCVNTTLQIKGKINSITVDNCKKLGLVFDDVVGIVEIINSRDVKVQVMGKVPTISINKTDGCHTYLSRNSLDCEIVSAKSSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFKTVWNGQKLVTTVTEIAG	186475	176947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_-_178130_178683_178828_179140_179224_179351_179476_179657_179843_181270_181449_182693_182800_184281_184368_184468_184613_186417
934692	contig_17144_pilon	-	2030	11	Intergenic	novelGene_29479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2239.37643999396	1	91	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	326	1744	179764	166363	FALSE	30	CTTAAGAAATTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183407	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166526_172554_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174755_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
934693	contig_17144_pilon	-	1098	6	Intergenic	novelGene_29385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1972.43903834821	1	32	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	101	1018	174597	166152	FALSE	20	GAAATTCTTGAGTGTGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRDCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174697	166071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166430_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572
934694	scaffold_4438_pilon	+	1131	1	Intergenic	novelGene_174556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	60	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	201	606	463	1068	428680	429285	NA	65	AATAGAAAGAGAACAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKVMIQHEDITIINIYAPNDRAPKYIKKTLTALKREIDSSTIILGDFNTPLSVKDRTTKKKFNQDTEDLKGTIKQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFPRIDHILGHRAILNKIQNVEIIHSIFSDHNAIKVEINTRKSKEKKSTTWKLNNTLLTHHCVIEEIRDGIKKFLESNENENTSYKTFGTQQRQSSEDNL	428217	429348	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_4438_pilon_+_428200_429300
934695	contig_15047_pilon	+	1711	6	Intergenic	novelGene_52106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3000.14208996841	2	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	77	700	2194	4178	TRUE	30	CCGGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2117	21646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4434_4552_4676_21013
934696	contig_1406_pilon	+	1818	3	Intergenic	novelGene_25598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	867	junction_2	42.5	1	67	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	19	360	2179513	2185260	FALSE	25	TTCAACAGTTGGTCTGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGAIGLMFLMLGCALPIYNQYWPLFVLFFYILSPIPYCIARRLVDDTDAMSNACKELAIFLTTGIVVSAFGLPIVFARAHLIEWGACALVLTGNTVIFATILGFFLVFGSSDDFSWQQW	2179494	2186718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1406_pilon_+_2179551_2183697_2183885_2185143
934697	contig_10904_pilon	+	2576	2	Intergenic	novelGene_22455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	1	142	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	96	1064	149100	150068	FALSE	15	AGGACTTGTGTGTTCTTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSRPTPPGLQPLLICSCRPLVSGRNRHCPRAMPVTVTRTTITTTTSSSSGLGSPTIVGSPRALTQPLGLLRLLQLLSTCVAFSLVASVNAWTGPMGDWSMFTWCFCFAVTLIILIVEVCGLQPRFPLSWRNFPITYACYAALFCLSTSIIYPTTYVQFQPHGRVRDHAIAATAFSCIAFVAYATEVAWTRARPGEITGYMATVPGLLKVLETFVACVIFTFLTNTSLYQHKAALEWCVAVYAICFILAAVAILLNLGDCTNVLPISFPTFLSGLALLSVLFYATALVIWPLYQFDERYGGYPRRSWDVTCSKSHSYYICSWDRRLAVAILTAINLLAYVADLVYSARLVFVRV	143874	151580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10904_pilon_+_143968_149097
934698	contig_10311_pilon	-	3745	7	Intergenic	novelGene_50418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	710.889212340588	8	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	70	561	70470	68843	TRUE	5	GTTGCTTTGGTCATTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FQSGAEGEFGHVWWLRGLQQPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLCKYCPLRA	71557	65124	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10311_pilon_-_67261_67491_67962_68264_69038_69807_69948_70224_70358_70446_70480_71497
934699	contig_14711_pilon	+	2062	12	Intergenic	novelGene_68908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	358.793133151534	3	70	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	276	831	620	1450	86227	89543	TRUE	15	GACCTCAGTTGTCATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLEPCQPPFSFHHVLPLTTEAKVFEREVGLQNVSGNLDSPEGGFDAILQAAVCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFRPSDGRCHLDSNGLYSRSPEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSATLPVYQELSKLIPKSTVGELSENSSNVLQLIMDAYNSLSSTVTLQHVSPLPGVHISYESQCGGPEKREGETGDRGQCNHVQINQTVNFWVTLQATRCLTEPQLLRFWALGFSEELTVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCPPRIWSLGAGLPMGQAPYAAGRDGASVDAVAAVDKALGVYASVMMPAVSDTRAFSVEVLAAANVECVTVMPTARAEPVSAAGPWTAVSVLMEASAVGMDTANAIAASAWMATMVLYVISAQAARHPARDTGTVQSAGLSGLVPWPPIAAWLVLMPT	84052	90811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14711_pilon_+_84100_84807_85050_85433_85593_85912_86009_86151_86242_87717_87865_88085_88280_88688_88864_89105_89326_89463_89673_90032_90194_90489
934700	contig_14513_pilon	-	1230	2	Intergenic	novelGene_70387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	73	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	52	159	187	345	18880	18722	TRUE	60	TAAATTTAAAAAACATTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRGMCM	19066	11305	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12161_18691
934701	contig_13021_pilon	+	3313	11	Intergenic	novelGene_8195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3981	junction_10	2048.92588689782	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	100	951	174676	177567	TRUE	20	TGTAAATGTCTGTTTTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQDVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRVIAFEHCIFKFGS	174576	180865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_174720_175894_176061_176404_176502_176588_176723_176842_176909_177137_177280_177364_177792_178170_178282_178522_178585_178670_180211_180440
934702	contig_10500_pilon	-	4068	8	Intergenic	novelGene_41243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	913.568200597447	3	203	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	294	885	189	1073	1640040	1629480	TRUE	30	ATATATCTTGTATTTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALNEMKDLKIDEKERLTVDYVKGILQPTPTCETWDQIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTWTQEIVDLIQNKGDLEKSKRAPTHIRIPFIEWIIPGIGCGLEQASAMPSPRTLKTHLPIDLVPPSFLEKNCKMIYIARNPKDNMVSYYHFHRMNKGLPDPGTWEEYFESFLAGKVCWGSWYDHVKGWWEAKDQHRILYLFYEDMKKNPRHEIQKLAEFMGNNLDDEVLEKIVHHTSFDIMKDNPMANYSSVPTAFMDHSISPFMRKGWEIGRTTLLWLRMKDSMKTTRKTWLTPV	1640228	1626420	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_-_1629019_1629082_1629567_1630544_1630728_1633135_1633231_1635076_1635204_1635518_1635617_1636940_1637067_1639871
934703	contig_17144_pilon	-	1319	9	Intergenic	novelGene_29405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1713.50451834099	1	70	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	524	1240	172541	166152	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	174662	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166348_167989_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172651_173305_173460_173580_173751_174572
934704	contig_3975_pilon	-	1060	5	Intergenic	novelGene_54847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	233.472696476483	1	28	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	172	519	83	601	2060387	2056837	FALSE	20	AACGTTGTACATCTCTCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVTTTAREANTVSGQPGWARRTICSLLMLLHTGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSWAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079249	2056377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060113_2060205_2060294_2060401_2079180
934705	contig_15666_pilon	-	1784	6	Intergenic	novelGene_70165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	398.27176651126	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	191	1114	110619	107816	FALSE	10	TGTTGCTTTGATTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKNSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110809	107145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108109_108198_108579_108859_109098_109138_109948_110246_110558
934706	contig_5686_pilon	-	2415	14	Intergenic	novelGene_45241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	717	1403	208699	202982	TRUE	10	GCCACGGGCCGCCCGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSVNLQGRSDL	241665	93787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93901_170213_170341_171641_171800_172507_172636_182628_182787_189031_189098_200407_200560_202871_203011_208041_208721_215303_215473_219531_219668_222752_222912_224039_224201_241595
934707	contig_3077_pilon	-	1562	8	Intergenic	novelGene_26751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	7	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAGTAGCAGACCAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	18083	11307	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_-_11476_12010_12069_13017_13174_13864_13985_15135_15262_16144_16326_16934_17052_17447
934709	contig_5033_pilon	-	2304	16	Intergenic	novelGene_28990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3570.95613464455	5	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	524	1575	24	1598	566787	532125	TRUE	5	CCTGGGCCTGAGTGTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAELDCAMYALLLLASVVGVALGSPVLGLKECSKGSAVWCQDVKTAADCGAVKHCLQTVWNKPTVKSLPCDICKDVIMAAGSMLKGNGTEEEILENLEKTCEWLRNPNLTASCKQIVDAYLPVILDMIKGEMSRPEEVCSALRLCQSLQKHLAELNHQKQLESNKIPELDMSQVVAPFMANIPLLLYPQEGPHSKPQPKADGDVCQDCVQLVTDVQVAVRTNSTFVKALVDHVEEECDRLGPGLADVCKNYINQYSEIAVQMMMHMQPKEICGLVGFCDELKEMPMQPLIPAKVAMENVIPALELVEPIKKDLAQAKDSVYCEVCEYMVKEVVKLIDNNRTEEEIIHALEKVCSKLPTSMSQECQEVVDTYGSAILSILLQEASPELVCSMLHLCPIQGLPALKAHVSPLKDGGFCEVCKKLVSYLDHSLEKNSTKQEILAALEKGCSFLPDPYKKQCDDFVTQYEPVLLEILVEVMDPSLVCLTVGACPSAHKPLLGAEKCVWGPSYWCQNMETAAQCNAVEHCKRHVWN	566810	530983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_531441_531533_531648_531989_532161_533382_533491_533794_533876_534197_534356_534446_534634_534970_535067_536504_536637_540604_540662_542092_542237_542663_542865_544559_544686_545249_545325_547551_547686_566747
934710	contig_3956_pilon	-	749	1	Intergenic	novelGene_14695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	20	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTCTTTTGATTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5157	4408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_4400_5200
934711	contig_5936_pilon	+	1541	2	Intergenic	novelGene_53545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAGCTACACATTAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	69656	125202	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_+_70555_124559
934712	contig_20527_pilon	+	2140	5	Intergenic	novelGene_138579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1000	junction_1	797.197395567748	1	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	73	699	13527	27453	FALSE	30	GAGAAACTATTTGTTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13454	28894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308
934713	contig_2100_pilon	-	1004	9	Intergenic	novelGene_50769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	845	junction_2	536.798248297254	1	28	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	912	92	1003	1182812	1173327	FALSE	25	CCAAGTTCACCGCCAGTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLYTAKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGKGVSKAVEYINKSIAPALVSKKLNVVEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEALELLKNAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAW	1185502	1173325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1173374_1174204_1174403_1175562_1175786_1176283_1176418_1176765_1176836_1178767_1178827_1180189_1180286_1182727_1182822_1185420
934714	contig_1275_pilon	-	1776	15	Intergenic	novelGene_108784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	605.439947981833	1	88	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	253	1173	513735	464510	TRUE	55	GGAAGAGGAAAAGAAAGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPSTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQTSQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTGYEQFHPGPSQVDHDSLESKRPRLEQVADSHFQRVSAAVLPLVHTLPEGLRSSADAKKDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQRNRK	546959	448447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448525_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464522_468121_468189_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_495661_495855_505868_506003_513627_513806_546777
934715	contig_2069_pilon	+	1596	7	Intergenic	novelGene_23286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	328.803259310691	2	32	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	93	755	341384	343975	FALSE	10	CTGATGTGGTTTTTGATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQFNSVQELVRHYTEENDGLCHLLTAVCTIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	339663	344816	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_339709_341058_341103_341380_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
934716	SIRV7	+	979	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	43	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGGATATTTGAACTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1018	2080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV7_+_1674_1756
934717	contig_5041_pilon	-	2948	19	Intergenic	novelGene_27073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	638.488927947158	1	120	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	729	2190	126	2315	620136	526468	TRUE	30	GAATTCATCCTAATAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPGSLSIIIDRYTMTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGYYLPNDDGEFYQFCYVTHKGEIRGASTPFQFRASSPVEELLTMEDEGNSDMLVVTTKAGLLEFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLVSEVQTLKNLDGNKESMITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKEIKRSLENQAERKMEGQNSPSPQQVSQYLNTCSEQNGHVPAVPNKQPVLQYGNPYAAQEIRDGEDVAFYPDEIQRPPVRVHSWGLEDNVVCSQPARTKLFFCLGRRECTHCS	636080	525078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526518_532136_532242_532755_532940_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_620101_620169_635987
934718	contig_19342_pilon	-	2051	6	Intergenic	novelGene_41077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGACTGAGTTCCCTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6754	3241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_-_3320_3615_3889_4130_4375_5031_5292_5412_5988_6133
934719	contig_16496_pilon	-	1521	2	Intergenic	novelGene_5208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	14	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
934720	contig_9363_pilon	-	1937	9	Intergenic	novelGene_6600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1193.5816635237	2	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	64	681	786587	777382	TRUE	20	TCGCACACTCCAGCTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGVLDTVWSSLRDQGWWLEPPQEIKAPNKTGILYQCDYSMGKCEPIPLEVPLQAVNMSLGLSLAATTTPSRLLACGPTVHLICKENIYLNGFCFMFGSNLLQQPQTFPETLAGCPRLETDIAFLIDGSGSISPNEFEQMKKFVSTVMDQFKTFKTLVKANGSSSPSIADIATQSWLSFMILSCSVWMQTKHSFQPYVKAALING	786650	753939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754393_773864_773968_774893_775045_776046_776192_776977_777660_780570_780689_780836_780908_781246_781352_786541
934721	contig_17144_pilon	-	1070	6	Intergenic	novelGene_29312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	147	635	179764	174873	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFK	183228	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166495_174864_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
934722	contig_57_pilon	+	3043	24	Intergenic	novelGene_44892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	225.547315839537	1	138	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	972	2916	126	3041	66895	129542	FALSE	65	AGAAAAAGAAAAAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCSSSRLCPWPPPRPKSPSLFTVSCRKKRPGPPPSSAATQSMTGGGVLIAVLDTGVDPGAPGMQVTTDGKPKIIDIIDTTGSGDVNTATVVEPKDGEIIGLSGRALKIPASWTNPSGKYHIGIKNGYDFYPKALKERIQKERKEKIWDPIHRAALAEACRKQEEFDIANNSSSQANKLIKEELQSQVELLNSFEKKYSDPGPVYDCLVWNDGEVWRACIDSNEGGDLSNSTVLRNYKEAQEYGSFGTAEMLNYSVNIYDDGNLLSIVTSGGAHGTHVASIAAGHFPEEPERNGIAPGAQILSIKIGDTRLSTMETGTGLIRAMIEAINHKCDLVNYSYGEATHWPNSGRICEVINEAVWKHNIIYVSSAGNNGPCLSTVGCPGGTTSSVIGVGAYVSPDMMVAEYSLREKLPANQYTWSSRGPSADGALGVSVSAPGGAIASVPNWTLRGTQLMNGTSMSSPNACGGIALILSGLKANNVNYTVHSVRRALENTAVKADNIEVFAQGHGIIQVSSLLIQNTSFANKLGFTVTIGNNRGIYLRDPVQVAAPSDHGVGIEPIFPENPEKISLQLHLALTSNSTWVQCPSHLELMNQCRHINIRVDPRGLREGLHYTEVCGYDIASPHAGPLFRVPITAVIAAKVNESSHYDVAFSDVHFKPGQIRRHFIEVPEGATWAEVTVCSCSSEVSAKFVLHAVQLVKQRAYRSHEFYKFCSLPEKGTLTEAFPVLGGKAIEFCIARWWASLSDVNIDYTISFHGIVCTAPQLNIHASEGINRFDVQSSLKYEDLAPCITLKSWVQTLRPLSAKIKPLGSRDILPNNRQLYEMILTYTFHQPKSGEVTPSCPLLCELLYESEFDSQLWIIFDQNKRQMGSGDAYPHQYSMKLEKGDYTVRLQIRHEQISDLERLKDLPFIVSHRLSNTLSLDIHETHSLALLGKKKSSNLTLPPKYNQPFFVTSLPDDKVPKGAGPGCYLAGSLTLSKTELGKKADVIPVHYYLISPPTKSKNGSKDKEKD	66769	129544	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_57_pilon_+_66964_74477_74607_82077_82174_84079_84185_87099_87225_89393_89558_93295_93451_94251_94329_99289_99418_100637_100738_102984_103134_104960_105089_105883_106023_106708_106867_107564_107642_109430_109538_113308_113464_114649_114767_115010_115112_116996_117094_117798_117937_120222_120468_120729_120809_129464
934726	contig_11512_pilon	-	2293	15	Intergenic	novelGene_43386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1166.43764540255	2	99	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	489	1400	586598	556654	FALSE	10	TGTACCGGCTGTGATGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622304	555760	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567800_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586805_592797_592923_609596_609669_622219
934728	contig_5698_pilon	+	2145	7	Intergenic	novelGene_55008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	920.569705852486	1	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATACTATCCATCCATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4083	20814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5698_pilon_+_4148_7817_8020_11129_11210_11791_11871_17147_17220_18789_18853_19229
934729	contig_17144_pilon	+	1928	10	Intergenic	novelGene_29209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	126	19	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	30	GGGAGAAGGCCACAGAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	173406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306
934730	contig_3155_pilon	+	1781	3	Intergenic	novelGene_26421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1141	junction_2	718.5	3	74	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	146	472	259780	261211	FALSE	45	GATTTGAATAAAGTGATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	259231	262520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261082
934731	contig_1452_pilon	+	1736	4	Intergenic	novelGene_115136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAGGAAAAGCTAAATACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698251	700679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_698483_698528_699473_699535_699951_700533
934733	contig_17144_pilon	+	900	4	Intergenic	novelGene_29199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGTGGTGGGCCTGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	170919	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166303_167922_168310_168995_169099_170744
934734	contig_9924_pilon	-	4377	4	Intergenic	novelGene_175925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTGAGAATAGCAGCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	159765	103937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_-_105454_153120_154582_157864_158844_159344
934735	contig_11512_pilon	+	1496	1	Intergenic	novelGene_43377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCGCCCAGGTCAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554970	556466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_555000_556500
934736	contig_3018_pilon	-	2083	14	Intergenic	novelGene_78831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	578.947504544023	2	96	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	1169	1690	570362	566730	TRUE	55	CTTGAAAAAAGAGAGAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNW	625115	550960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_551009_561477_561574_562778_563020_566721_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570428_576751_576893_577802_577834_580093_580175_583440_583648_585063_585179_600008_600194_624772
934739	contig_3747_pilon	+	2890	8	Intergenic	novelGene_24861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	2	95	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	314	1489	201313	203804	FALSE	15	ATGTTGAGTTTTTTGTCTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200999	205205	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
934740	contig_12869_pilon	+	2212	7	Intergenic	novelGene_75321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	352.989809421682	2	122	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	350	1111	81642	97384	FALSE	5	CTCTGTGTGTGTATGTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTLICKVREDSPAHCSGLQTGDILANINGVSTEGFTHKQVVDLIRSSGNLLTIETLNGAMILRRMELEAKLQVLKQTLKKKWVEFRSLQLQEQRLLHGDAANCPSLENMDIDESSLFGTLPGPGPALVDRNRLSSESSCKSWLSSVTMDSEDGYQMCGSEDSSGGSFSRQTSTDDECFVPKDGDDFLRKSSWRRNRSVSNASSGSLSPLCEGNFSSMFGTLPRKSRRGSVRKQLLKFIPGLHRPVEEEESRF	67289	98485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12869_pilon_+_67571_77304_77355_81623_81706_81899_81994_85623_85694_94365_94433_96917
934741	contig_3956_pilon	+	2445	12	Intergenic	novelGene_15200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1348.21777675334	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	463	1392	541	1932	1284763	1290491	FALSE	15	TGGTGACTGTGTGGAGCCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCECIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1282780	1291004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284256_1284737_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286184_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934742	contig_5023_pilon	+	3061	14	Intergenic	novelGene_7198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2384.56609130193	2	118	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	736	1191	618569	630273	TRUE	10	TTTGGTGTCTGTAGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLRKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDCCSVTYQMPWSSSNSMKRLKSLLTGTE	580821	648303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611808_616476_616582_618524_618668_622527_622624_625651_625831_630191_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
934743	contig_11802_pilon	+	1994	1	Intergenic	novelGene_177137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	78	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGTGCAATGTTCAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8345	10339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11802_pilon_+_8300_10300
934744	scaffold_12124_pilon	+	1365	5	Intergenic	novelGene_22298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4676.82025392253	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	418	1197	1508626	1509405	FALSE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473584	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473677_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1508476
934745	contig_4924_pilon	-	2125	12	Intergenic	novelGene_84678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	1044.1325317227	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	371	1116	316	1431	146100	65524	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAGATTTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252565	64829	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_65652_69049_69194_74641_74822_82359_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197791_197862_252398
934746	contig_3956_pilon	+	2490	13	Intergenic	novelGene_15173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1620.50699371112	3	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	405	1218	793	2010	1286460	1290491	FALSE	30	GTCAGTGCCATTGGAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281671	1290971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281679_1283924_1283976_1284054_1284238_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286211_1286433_1286606_1287276_1287530_1288874_1289229_1289493_1289655_1289781_1289892_1290297
934748	contig_10225_pilon	+	2164	13	Intergenic	novelGene_86805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	580.887748527105	1	125	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	1102	2049	42707	47636	FALSE	20	ATCCTAGACTTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20689	47751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_35625_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46275_46349_46724_47287
934749	contig_11338_pilon	+	1903	3	Intergenic	novelGene_6211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	349	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	453	1449	1901	13152	13604	FALSE	40	AAAAGCTGAATTTAACCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGKFCSTRSWAKAMQRCTDFTKITTCEAAAVRPPSYSQAAVQPPEAPEPRDAPRQRHLVKLQHVQEVKELAVLLAVLELDVVLLQSVQRELGLIVHKHLHGLWGGGKQGRGEQGLLLRLLPAQGTFQRRLLCWEASQRACCIPTLIKISL	11561	13606	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_11636_11719_12521_12578
934750	contig_17427_pilon	+	2222	9	Intergenic	novelGene_30287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	197.835158654876	1	111	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	10	879	147949	175536	FALSE	5	CCTTGGTGTCATTTTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVKMASPISLWLLAVVLLLGSYASRALGHLDPPTPLPLVIWHGMGDSCCNPLSMGAIKKMVEKKIPGIYVLSLEIGKTLTEDVENSFFLNVNSQVSTVCQTLAKDPKLQRGYNAMGFSQGGQFLRAVAQRCPSPPMISLISVGGQQQGIFGLPRCPGETSHICDLIRKTLNVGAYSKAIQERLVQAEYWHDPIKEDTYRNHSIFLADINQERGVNESYKKNLMALKKFVMVKFLNDSIVDPVDSEWFGFYRSGQAKETIMASLPAGPLGAKGNGQCREACLPGYRRRPSSTV	147939	176879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17427_pilon_+_148073_151312_151423_152121_152250_152572_152644_155691_155795_171334_171426_172209_172309_173596_173636_175431
934751	contig_15449_pilon	+	1329	3	Intergenic	novelGene_33615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	935	junction_2	221.5	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATATATTTGTCAGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	51213	55661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_+_51330_51809_51932_54570
934752	contig_8538_pilon	+	1512	1	Intergenic	novelGene_4649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	80	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	502	1506	5	1510	841232	842737	NA	35	GAAACAGCTGGAAGACGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFA	841227	842739	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_841200_842700
934753	contig_3956_pilon	+	1552	7	Intergenic	novelGene_15152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1519.67259814591	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	49	1032	1281682	1290491	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLSRSVPFQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281633	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282812_1287947_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289816_1290347
934754	contig_233_pilon	-	2642	16	Intergenic	novelGene_14615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1362.52519487409	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	539	1620	81	1700	126907	92211	TRUE	20	CTAGAAGCTGGGCTCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVMPGQHALLLTLVGLLFLGSVLPQECTQYKVSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDGVRRFGMPVPQVHQRLLEQAEGCVQWARALPLQRV	126987	78141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92320_93922_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108814_109914_109976_126898
934755	contig_3956_pilon	+	1404	9	Intergenic	novelGene_15221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1294.8916701794	1	9	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	186	1370	1284120	1290665	FALSE	20	GAGGGCCGCGGAAATGGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLGCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1283855	1290699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284054_1284151_1286175_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289623_1290605
934756	scaffold_12124_pilon	+	1969	8	Intergenic	novelGene_22365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_4	2932.62619645997	1	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	68	445	1490385	1508039	FALSE	35	AAATGTGTGGTAAACTTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1489029	1509563	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
934757	contig_5236_pilon	+	2439	18	Intergenic	novelGene_100880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	163.233100144238	2	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	95	1270	62791	74126	TRUE	30	TGTAAAAATGTGCCTTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTKLGFLRLSYEKQDTLLKLLILSMAAVLSFSTRLFAVLRFESVIHEFDPYFNYRTTRFLAEEGFYKFHNWFDDRAWYPLGRIIGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMLASITALATYRMPGFLSSCTV	60622	84319	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_60678_62751_62879_64042_64104_66489_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73025_74060_74153_75044_75201_75463_75653_76987_77105_77241_77345_81585_81775_83310_83427_84046
934758	contig_3386_pilon	+	2650	14	Intergenic	novelGene_34554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	636.286685042309	1	143	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	252	1448	476274	507672	TRUE	35	AGCCAGCCCAGTAGAAAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPSRRTGLPWSLRLAVFSGSWFASCCPHPQRLFGPYSRSRHAFLLLLPAAAAAGASPVLTSRPLAGPASGLPAALPPRGSAAMAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLITQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDEEKQLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRKTCCNIY	470059	509365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3386_pilon_+_470306_476268_476405_485246_485299_486417_486541_488105_488190_491949_492074_494393_494549_497716_497820_498658_498721_504781_504900_505996_506121_506538_506635_507647_507741_508231
934759	contig_4924_pilon	-	2136	8	Intergenic	novelGene_84707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	255	junction_4	1179.08605214689	1	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	151	795	155859	82377	FALSE	30	TTGTCTGAACGTAGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGLLFTYRGEVCRYSEGQRAKTPPTAACTTDATAQHCHLGEPDRSGRTYPTVPGATAAGHLLEQPGCVQWHSANGWHECFTVTESGHTGCRCSRGPDLSHHHQRKSSLYNEQCPGSPHKPCGCFNPQFHCWCSHEFLDLSWDSARIGWSHCRIE	252465	81035	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252398
934760	contig_3956_pilon	+	1449	5	Intergenic	novelGene_15132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1502.52909705603	1	48	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	70	930	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVLGPPAPVQCAPCRSRSVPFQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281612	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1287903_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1290347
934761	contig_19352_pilon	-	937	7	Intergenic	novelGene_122376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	581.975371758405	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	137	628	122754	104000	FALSE	25	ATGTCTTTTGAGCCCACGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNICFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERIQEGAEELQKMLQEDELRDAVLLLFANKQDLPNAMAISEMTDKLGLQSLRNRTWYVQATCATQGTGLYEGLDWLSNELSKR	123050	103690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19352_pilon_-_104087_105884_106011_108444_108517_112796_112907_113281_113363_122738_122772_122931
934762	contig_4093_pilon	-	2797	6	Intergenic	novelGene_27625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2672	junction_5	1027.49571288643	1	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	738	112	849	69245	41737	FALSE	25	TATTGATGATGGGAGGCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDKNELVQKAKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSVAYKNVVGARRSSWRVVSSIEQKTEGAEKKQQMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTAFDEAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN	72535	39788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_41797_45447_45544_45619_45784_46300_46425_68951_69257_72435
934763	contig_12677_pilon	-	1561	1	Intergenic	novelGene_110756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCCCCAACTCATCTTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1601	40	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1600
934764	contig_10225_pilon	+	2434	13	Intergenic	novelGene_86810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	85	1086	20776	42680	TRUE	25	GACTTGACTTTTTTTTAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPVLLIQTTCPCGCTGSSRVSPSCW	20691	47757	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46540_46925
934765	contig_17200_pilon	+	2832	2	Intergenic	novelGene_178850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	143	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	1892	2260	2985	3353	TRUE	20	TGAAGCTGCTTTCTTATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGEVGPRFHSSAWSEGAEAYNAWYSGIRKRRKRQRDEAKRSRKRKKGKKKKKKKATPAAHKRHPRSRPPRRVESKRPAALSPEPAAPGSRGANGQRPQDVISAAERPRGSRTPKRSPTAP	1093	4251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17200_pilon_+_3643_3968
934768	contig_4180_pilon	+	1010	5	Intergenic	novelGene_8398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	4	60	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	46	492	875290	888134	FALSE	65	AACAAAAAAGACACAAGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875244	888652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
934769	contig_7056_pilon	-	2072	10	Intergenic	novelGene_43655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1324.06440296908	1	87	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	1200	1643	725925	724731	TRUE	80	TAAGAAAAAGGAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANNTDM	729693	722483	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725186_725319_725471_725585_725661_725734_725813_725993_728561
934770	contig_854_pilon	+	3184	13	Intergenic	novelGene_36641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3608.7657708542	3	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	583	1752	8	1759	1697717	1714980	FALSE	5	CATGCGTGTGTCCCGTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQALDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1697709	1716405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702652_1711815_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714480_1714862
934771	contig_3956_pilon	+	1762	11	Intergenic	novelGene_14926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1357.26085923083	2	11	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	286	861	458	1318	1285728	1290310	FALSE	15	CACCTGACACTTTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLCADRPAPPHGAYLPCGDPVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1290754	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283832_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287503_1289621_1289677_1289758_1289892_1290297
934772	contig_6102_pilon	+	2443	20	Intergenic	novelGene_31916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_19	419.85265190002	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	298	897	373	1269	379014	393075	TRUE	20	CTCAAACCAGCTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSNSGPNSRLYMKLVMRILCLDSSEVCFPTVPGTPGAWNLDNESPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	375648	395255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_375730_375966_376039_376207_376295_378881_379032_379330_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467_394809_395037
934773	contig_7165_pilon	+	3498	4	Intergenic	novelGene_116909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	56	junction_1	24.5356882927706	173	81	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	576	1731	78	1808	1198317	1218066	FALSE	15	ATTGTGTGTACTTACTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMPRLLLRVWPRGLAVGPGAPCRPLSARSGPSQYLQSSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLDDGHFRKTEQFCKSFENGSGKELHEQLVAQDKKNKHTSYISGPWFDMYLAARDSIVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTFRAGLLEPEVFHLNPAKSDTDTFKRLIRLVPPSLSWYGAYLVSAYPLDMSQYFRLFNSTRIPKPGRDELFTDDKARHLLVLRKGHFYVFDILDKDGNIVSASEIKAHLKYILSDNSPAPEFPLTYLTSENRDIWAELRQKLVSDSNAETLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGTAAVHFEHAWGDGVAVLRLFNEVFQDSTQNPAVTPQSRPATTDSSVAVQKLSFKLSDALKTGITTAKRKFDETMETLTIDCIQFQRGGKEFLKKQKLSPDSVAQLAFQMAFLRQYGKTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASIFTMRCSEAFVREPSKHSAGELQQLMAECSKYHGQLTKEAAMGEAGVESMLLGLVALSALGGVGNVLPHI	1198239	1219756	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7165_pilon_+_1198469_1210507_1210589_1211668_1211776_1216675
934774	contig_3747_pilon	+	2615	8	Intergenic	novelGene_24899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	1	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	38	1213	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201275	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
934775	contig_6677_pilon	-	1409	7	Intergenic	novelGene_114212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCACCATCCGGGCCGCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626423	584905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6677_pilon_-_584982_594905_595578_615714_615858_616164_616307_624371_624546_625425_625530_626325
934776	contig_10496_pilon	-	2151	9	Intergenic	novelGene_59421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	115.797708850391	1	81	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	465	1398	63	1460	55398	38747	TRUE	20	TTCTCTTTCCAAAGTTGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTSAGSPSPIRATIPVFCPLCPKTALHPWEPKKQLPDAQFLARRFLLRRKFIPDPQGTNLMFAFFAQHFTHQFFKTSGKMGPGFTKALGHGVDLGHIYGDNLERQYQLRLFKDGKLKYQVLDGDVYPPSVEEAPVLMHYPQKISPRNQMAVGQEVFGLLPGLMLYATIWLREHNRVCDLLKAEHPTWDDEQLFQTTRLILIGETIKIVIEEYVQQLSGYFLQLKFDPELLFGVQFQYSNRIAVEFNHLYHWHPLMPDSFKVGSQEYSYEQFLFNTSMLADYGVEALVDAFSRQGAGKIGGGRNIDQHVLHVAVEVIKESRELRLQPFNEYRKRFGMRPYTSFEELTGEKEMAAELEELYGDIDAMEFYPGLLLEKCHPNSIFGESMIEIGAPFSLKGLLGNAICSPEYWKPSTFGGEIGFNIVKTATLKKLVCLNTKTCPYVSFRVPDPSQADPPTVERPSTEL	55657	37997	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10496_pilon_-_38395_38452_39103_40679_40828_47753_48041_50488_50736_52476_52561_52664_52842_55299_55444_55640
934777	contig_8538_pilon	+	2392	1	Intergenic	novelGene_4646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	113	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	609	1830	543	2372	841232	843061	NA	35	CAAGAAATTTCATTGCACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGV	840689	843081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8538_pilon_+_840700_843100
934778	contig_34_pilon	+	874	5	Intergenic	novelGene_40021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	234	620	212376	215323	TRUE	40	ATAGACGACTCTTAAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGPAGALHTSYKLLLLRLLKWWRKSALQKVFHFISGLNAIHLMNLTVQEAFRIETHIQVLFWFLTQLFQSLLVIREIGPYNRLNSFFHNTQVKMTNRATEKKLRMLTVCKTGSIFPVPLVSGVLKW	212142	224779	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212559_212971_213049_214059_214151_215287_215458_224659
934779	contig_13481_pilon	+	622	2	Intergenic	novelGene_119370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	621	2	622	469406	470086	FALSE	20	CCTGCATACTCCGACATCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDETSNDLKPEKIQSKSLKSARPIAPAIPPQQIYTFQTATFTAASPGSSSGLTTTVVQAMPNSPQLKPIQPKPTVMGEPFTVNPALTPAKDKKKKDKKKKESSKELESPLTPGKVCRAEEGKSPFRESSGDGMKMEGLLNGSSDPHQSRLASIKAEADKIYSFTDNAPSPSIGGSSRLDSTTPTQPMTPLHVVTQNGAEASSVKTNS	469404	470086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13481_pilon_+_469426_469485
934780	contig_17144_pilon	-	1613	9	Intergenic	novelGene_29360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2093.01754352418	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	292	879	106	984	174597	167278	TRUE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQGRIISGQVSQTQPVAA	174702	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166754_166843_167248_167328_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572
934781	contig_7057_pilon	+	1177	10	Intergenic	novelGene_123312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	886.878852361151	1	68	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	90	273	282	554	938907	941417	TRUE	15	CTTTCAGCCCGCCAGGCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSGCARADRRVLSHRPRPREPNAAGGPGAADELTVGRRNRHAHPGRGHQCHQVRRGLEEPQPPRTHYSNIEANESEEVRQFRRVFAQLAGDDMEVSATELMKILNNVVTRHPDLKTDGFGIDTCRSMVAVMDSDTTGKLGFEEFKYLWNNIKKPYINSLTWTGQGPSAAVNSQGLFRQQASI	936016	943665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7057_pilon_+_936131_937142_937211_938655_938752_938903_938962_939052_939118_941037_941100_941208_941288_941405_941523_942970_943030_943206
934782	contig_7707_pilon	+	1152	1	Intergenic	novelGene_72141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	158	477	212	688	126794	127270	NA	25	AATTAGGTACACTGCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKGASGLEEDSLTICYADDTALLAESEEDLKHLLIKIKDYSLQYGLHLNIKKTKILTTGPISNIMINREKIEVVKDFILLGSSINTHGSSSQEIKRCIALGKSTAKDLFEVLKSKDVTLKTKVRLTQAMVFSIASYACKSWTTNKEDQRRIDAFQL	126582	127734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7707_pilon_+_126600_127700
934783	contig_20527_pilon	+	2251	7	Intergenic	novelGene_138561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	156	junction_5	1140.26528346112	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	713	1339	13527	27453	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12814	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36519
934784	contig_5093_pilon	+	1348	2	Intergenic	novelGene_135107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	34	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCATTGAAGAATTGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	896135	898142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5093_pilon_+_896445_897103
934786	contig_7119_pilon	+	2196	4	Intergenic	novelGene_40931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	157	936	137033	139689	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTARACSHGSPDHRAGCHGSPLQGTHCHSSSVHGASHHRSPVHGDQKPCPWGPQPQRHCPYCS	127501	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139243_139508
934788	contig_10224_pilon	+	3272	2	Intergenic	novelGene_179248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	2176	2637	2176	2932	FALSE	10	CCTCTGGATGCTCCGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALIELPARARRIQAASGPGSRDCGPGKQRSKRTKALGSNQRSSPDPEAVAHPNVAQQPRRKGPRRLSESGSRAKGVGRQRVASENPKEAEKEIRGKKKKTTPAAYKRHPKSHPPSRAESKQPAAPGPEPAAPGSRGANEQRPRDLISAAAQT	0	3567	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10224_pilon_+_2561_2855
934789	contig_6361_pilon	+	3047	5	Intergenic	novelGene_23974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	34	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	180	524	405360	405704	TRUE	30	TTTTCTGTTATCTTGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKVKDHSLQYGLHLNIKKTKILSTGPINNIMMNGENTDVVIKAFILLGSTINTNGSSSQVIKGHIALGKSAVKGFFKVLKSKDVNLRTKVSQTQVIVFSITSYAYKTWTMNKED	405180	496323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6361_pilon_+_407676_415388_415503_419464_419589_420868_421002_496142
934790	contig_11574_pilon	-	3479	10	Intergenic	novelGene_64066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	32	junction_2	301.533856584409	22	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	610	1833	78	1910	456525	449890	FALSE	15	CATAGTTGTCGCGTGTATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WVGFLFTQGPFGSPGATLGAGTVSRMSTSQDQSGCSTNQEPLSRCCDARRDLELAIGGVLRAEQQIKDNLREVKAQIHSCISRHLECLRSREVWLYEQVDLISQLKEETLQQQAQQLYWLLGQFNCLIHQLECSQNKDLANQVSVCLERLGSLTLKPEESTVLLFEADTAALRQTMTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQEVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	473936	448320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450853_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_454747_454889_456384_456540_473873
934791	contig_6847_pilon	+	2574	13	Intergenic	novelGene_143871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	520.25140156787	1	162	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	273	1319	77788	102682	TRUE	20	TATGACAAGCCTTTGTGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPSGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTAIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRVTSDKPVDHFLQLLSAS	77515	112447	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6847_pilon_+_77988_81026_81091_82021_82127_96730_96861_98610_98758_99888_99984_101151_101275_102054_102188_102632_102750_104095_104160_109788_109891_110424_110608_111608
934792	contig_5988_pilon	+	2873	10	Intergenic	novelGene_16077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2051.2561342736	3	32	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	84	770	1218380	1224777	TRUE	10	TTTCTTGTTTGTGGTGTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGWSFFFNSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1209860	1226938	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1209912_1218347_1218436_1218867_1218977_1219915_1220039_1221697_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1225223_1225280
934793	contig_11338_pilon	+	3200	15	Intergenic	novelGene_6192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	484.205160810066	6	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1842	3	1844	4520	11749	TRUE	25	TTTAACCTCTAGTCCAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKMSFPSWTRPSGVSSKTLSHFFDKVEDLGRDFKPDSAKNTIQNLIMFVDELLEASGDLEVQNLSTRHHIASYLLLGLEEVLSILAQALPEPSFTYHSPSNTELSLMIQEQEEHGDRNVTVGQSQARMQLNWAVAAQDKDSGPTVVGILSSLNMQRLLANASLDLEAKKKDKLEEIHRSLIHGAQLKVLSAVNTVFLSNRNTKNLSLPVTFAFSHPPETPGPRQELICAFWEYDNDTGGHWATTGCQTLGSRNGSTTCRCSHLSSFAILMAHYNVQDPTLALITKVGLAFSLVCLLLCILTFLLVRPIQSSRTTVHLHLCICLFVGSAIFLAGIENEGGQVGLRCRLVAGLLHYFFLAVFCWMSLEGLELYFLVVRVFPGEGLSTRWLCLIGYGTPGVIVGVSAAVNSQGYGRVLYCWLEPTNGFLWSFLGPVTVIILCNAVIFVITVWKLTQKFSEINPNMKKLKKARMLTSTAVAQIFVLGSTWVFGLFLFDPRSWVLSYIFSILNCLQGFFLFLLHCLLNKKVREEYWKWVCLVTRSKYSEFSSTTSATSHQTRALRPSESSM	4517	13616	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_+_4667_6085_6131_6248_6327_7358_7537_7616_7734_7964_8189_8743_8924_9814_10007_10508_10736_10853_10921_11049_11142_11265_11435_11539_11636_11719_12920_13430
934794	contig_854_pilon	+	1093	6	Intergenic	novelGene_36227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	60	junction_1	3042.23361364639	3	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	116	622	543600	562402	TRUE	20	ATGAGCGTCTCAGAGGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543484	563498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
934795	contig_5317_pilon	+	973	4	Intergenic	novelGene_76499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6314.33988808191	4	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATACCTGTTTTTGGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33660	43840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36764_36839_43197
934796	contig_12605_pilon	+	791	4	Intergenic	novelGene_64173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1959.24974302807	2	44	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	408	384	791	4816	5880	FALSE	15	AGGCCTGCGGGGGACGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVET	3868	5880	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728
934797	contig_10482_pilon	+	1652	5	Intergenic	novelGene_152833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3149	junction_1	251.380563091103	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	38	394	119584	123281	TRUE	30	GCAAGGGCTTGCATTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL	118632	127170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_+_118655_119568_119710_122331_122476_123194_123312_125942
934798	contig_5988_pilon	+	1911	2	Intergenic	novelGene_16114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTGTAAAAAATAAAGAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1224930	1226906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1226209_1226273
934799	contig_11338_pilon	-	2013	3	Intergenic	novelGene_6209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	138	417	135	551	13454	13038	TRUE	35	TGGAGAAGATGTAGGACAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVTLPWRVPGLWSFGRLHCRLTVGRWPDCCCLTGGDLCEVGAALHGLGPAPRGTELPSHCHPPGHGPGGAVSTQAGTALEGSLPRDLAPDTSACSP	13588	11375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_11440_11554_11637_11721
934801	contig_3956_pilon	+	2511	12	Intergenic	novelGene_15233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1158.14862233004	1	160	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	623	1999	1286460	1290491	FALSE	10	GTGGTGACTGTGTGGAGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284228	1291003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286220_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934802	contig_14441_pilon	+	1478	4	Intergenic	novelGene_100731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	464.298036466521	1	74	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	638	1438	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	120498	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_121239_125517_125902_126159_126283_126514
934803	contig_3956_pilon	-	1774	9	Intergenic	novelGene_15174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	573	1202	1774	1286452	1281672	FALSE	15	GGCAGTGGATTCTCCCAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYIIRGPLGSQLLIPESSSGSSCSSSRARSILFIISTGLIRSAMAWRRTVSVCTHTHAVHHHQGTISDTEGSCHLRGEVNVAGRVNEIDEEAGAVLTLLDEVQVVLRKLVEEGDGGGLDGDTALLLILPSVSEAGLPSPGGGNDAGLADQGVGQRGLAVVHVGNDRHVSDIGLLVHDGPDLVYCEVHLAAD	1291004	1281671	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281679_1282692_1282913_1283793_1283973_1284056_1284176_1286404_1286604_1287274_1287412_1289603_1289675_1289756_1289891_1290296
934804	contig_3956_pilon	+	1563	6	Intergenic	novelGene_15035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1301.86798101804	2	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	81	710	1281682	1289755	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMEPLSP	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1289737_1289892_1290297
934805	contig_854_pilon	+	2500	9	Intergenic	novelGene_36666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2650.64411688461	2	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	18	1121	1710001	1714980	FALSE	20	ACAGGTGTTTTCCACTGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1699278	1716359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1699287_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
934806	contig_8210_pilon	-	3006	6	Intergenic	novelGene_30222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	996.233827974136	2	156	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	151	606	24031	18141	TRUE	75	TTATAGTAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEIAVLELAKSCPHVINLHEVYENTNEIILILEYAAGGEIFNLCLPELAEMVSENDVIKLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGNACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPE	29813	13592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8210_pilon_-_15993_18140_18325_19801_19851_21487_21615_23935_24081_29712
934808	contig_14441_pilon	+	1021	4	Intergenic	novelGene_100670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	428.475073824475	5	32	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	415	843	116728	117610	FALSE	10	GGCGCTGCCTACGAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	112399	117788	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_112665_116578_116963_117220_117344_117539
934809	contig_14925_pilon	-	1683	5	Intergenic	novelGene_55306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	895.406716246868	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	83	496	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129483	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113281_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436
934810	contig_8447_pilon	+	1506	6	Intergenic	novelGene_69416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	383.524914444942	3	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	20	625	65602	83609	FALSE	10	ACTTTTTTGCATTTTTGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLELAMKRITAENRREICDKERECLNRKQELLRDREAALWEMEEHHLQERHQLVKQQLKDQYFLQRHELLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSEGKTRMAMYKKSLHINGGGSASEQREKIKQFSQQEEKRQKSERLQQQQKHENQMRDMVIQCDRNTNELQQLQNEKCHLLVEHETQKLKALDESHNLHS	65582	84490	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_65687_67608_67734_69680_69870_70811_70938_71848_71917_83596
934811	contig_5502_pilon	+	1650	8	Intergenic	novelGene_154968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	458.912690108758	1	77	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	323	972	81	1052	357713	398670	FALSE	55	TATATGAAAAATAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPRWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGGDQGLLNTFFSNWATTDIRKHLPFIYNLSSISIYSYLPAFKVFGANAKVVHFLGQTKPWNYTYDPKTKSMKIDAHDPAMIHPEFLNTWWDIFTTSVLPLLQQSGLVKETASYLKVEEVSGDVSHLSLGETPAAAQPFVSSEERKERWEQGQADYMGADSFDN	357632	399268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_360694_360831_362720_362896_363179_363343_377698_377826_395620_395841_398436_398571_398660
934812	contig_854_pilon	+	2987	14	Intergenic	novelGene_36696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	4379.14271554113	1	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	700	2103	165	2267	1705343	1715249	FALSE	35	ATAAAAAGGGGTTTTCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEQLPSVPSARPSRSGMSWPTRLPIAAAKALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEDGQTTPPPLPNRAAPPVHLLGTAVTAPPKSPVPTRPRDLRPADACQSPRLPLLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1704891	1715969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711573_1711656_1711756_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862_1714960_1715000
934813	contig_10583_pilon	-	2627	1	Intergenic	novelGene_167921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	17	58	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGATGAAAAAAAAAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	225319	222692	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10583_pilon_-_222700_225300
934814	contig_6102_pilon	+	1932	7	Intergenic	novelGene_31929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	342	junction_2	307.361576793341	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	162	689	380930	393643	TRUE	25	AAGTGCCTAGGCTGTCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCR	380768	395156	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393856_393929_394272_394467
934815	contig_14666_pilon	+	1716	4	Intergenic	novelGene_39569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1676.85108329737	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	379	1140	291	1430	483256	484940	FALSE	70	TTTATTAAAATAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSIRSSKLGALFQPDSFVHSNSGAGNNWAKGHYTEGAELIESVMDVVRGESEGCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRILNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	477230	485226	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_477397_479869_479944_483205_483317_483861
934816	contig_18035_pilon	+	5478	5	Intergenic	novelGene_178681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	128	387	2787	3173	4864	5250	TRUE	10	TGCCGGAAGTCTCTCTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKRTKAPVPRPRSRLDPEGAAHPNAAPTAPQERAKTALGARHLSKRRGGSERQARNQKKQKRQHQQPTNGPQRAARPGARNPTTRRPPAKRPWTREAGEPQPGLRGVGGGKAHTANYRLFCLPLDAP	1783	44845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18035_pilon_+_2882_2994_3437_3617_5577_42066_43740_44539
934817	contig_3942_pilon	+	973	7	Intergenic	novelGene_128680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	362.784447786224	1	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	67	801	426591	429999	FALSE	30	TATGAGTCATTTGACAAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVLARLLPFLALLLLLQGPAAARASPPRALHEVATTCKAGILCPRAPIKNSSALPVNVSLYYESLCGGCRGFLVRELFPTWLMVQEILNITLVPYGNAQEQNVSGKWEFTCQHGERECLLNKVEACLLDKLEKTTAFLTIVCMEEMDDMEKNLKPCLQIYAPEVSSDTITECAMGDRGTQLMHVNAQLTDALQPPHKYVPWVVVNGKPMSEQDELLSLVCHLYQGEKPDVCQIGTRSQREVCFQ	426524	430171	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_+_426705_427976_428160_428247_428323_428493_428587_429453_429607_429798_429853_429936
934818	contig_5686_pilon	-	2468	16	Intergenic	novelGene_45401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	899	1570	208699	203000	TRUE	45	AGTTACACCTATGGAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	241665	171651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_171782_172506_172594_176665_176720_182644_182789_189031_189089_198547_198595_199758_199868_200398_200560_202890_203002_208029_208721_212478_212664_215303_215474_219530_219670_222760_222914_224040_224201_241595
934819	contig_2161_pilon	-	1606	2	Intergenic	novelGene_114902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	82	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTGGCTGCAGTGATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	753600	751957	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2161_pilon_-_753269_753305
934820	contig_15666_pilon	-	1878	6	Intergenic	novelGene_70170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	718.305060541829	2	78	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	93	764	110619	108819	TRUE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQARSLGVQRYYS	110711	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108153_108579_108854_109098_109378_109948_110246_110558
934821	contig_5033_pilon	+	2272	5	Intergenic	novelGene_28930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCCCTTGGGCTGCAGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	449430	456918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_+_450711_451536_452147_452911_453121_456492_456604_456856
934822	contig_16362_pilon	+	523	1	Intergenic	novelGene_161166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCCGCAACCACCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	241835	242358	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16362_pilon_+_241800_242400
934823	contig_6494_pilon	-	651	7	Intergenic	novelGene_108572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1023.85688290242	3	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	555	27	581	8286	2635	TRUE	40	AAAAGACACATGGCCTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVQISKKRKFVADGIRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPSGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA	8312	2110	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6494_pilon_-_2178_2631_2829_3297_3486_5564_5660_6395_6426_6864_6883_8256
934827	contig_10437_pilon	+	1456	8	Intergenic	novelGene_38290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	973.091748511109	2	38	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	116	571	432132	443867	TRUE	45	ATAAAAATCTGTCTTCAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLEALEGAHQFKDSSYGCSCRPQQTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKLLGFQCCGGPGSTAETENREAGVSQCAKPGGLLK	431116	451683	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432092_432216_439691_439815_441717_441862_443762_443977_445309_445406_446969_447055_451088
934828	contig_408_pilon	-	920	1	Intergenic	novelGene_84919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAAAAAAAAAGCCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132889	131969	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_132000_132900
934829	contig_6286_pilon	+	3284	2	Intergenic	novelGene_165675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	23	104	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	773	1321	489824	491157	FALSE	25	ACACGGGGTCACGAGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTGHLFKTWFTEYFNPTIETYCSEKKIQNLIAIDNASGPQRAWRSIRSLMLFSCLLTQHPFCNPWIKEVIFTFKSYYLINTFCKATAAIDGDSSDGSGPSTLKTFWKRFTILDAMKNIHDSWEVKISVLTGVWKKLIPILMDEFEGFTTSVEEVTADVVEISRELEVDPEDVTELLQSHDKT	489051	493120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6286_pilon_+_490027_490811
934831	contig_20641_pilon	+	1568	6	Intergenic	novelGene_52848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	1442.1451244587	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	273	822	455	1276	41548	56882	FALSE	40	AAAAGATCTCTGTGAAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14547	57174	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_41462_41619_45848_45965_54835_54968_56379
934832	contig_14666_pilon	+	1056	1	Intergenic	novelGene_39637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	36	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	219	660	128	787	484281	484940	NA	15	GATCGTGAAGTGCTCCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLENTDACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALSVAELTQQMFDARNIMAACDPRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDDQLLTVQTRNRSCFVEWIPHNVKVAVCDIPPPGLNMAATFLGNNTAIQELFSRVSEHFSAMFRRKAFVHWYTSEGMDVQEFGEAERNIHDLVSEYQQIQDAKVALEEGGEVAEWEEAEPEDQRR	484153	485209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14666_pilon_+_484200_485200
934833	contig_6208_pilon	-	3840	3	Intergenic	novelGene_52965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	201	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	2895	3521	153252	152626	FALSE	50	GAGGAAAAACATAAAGTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEDRISGIEEKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKTLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLTIQETQRTPYRRHPKRKSPRHIIITLTKTKDKQRILRAAREKQEVTYTVETIRLSSDYLAETMQVRRQWDDIYKILKEKNCEPRIIYPAKLLFKFDGEIRSFSDKHKLREYVKVKPNLEELLKGVL	281787	152306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_154585_246760_248278_281742
934834	contig_15327_pilon	-	1072	1	Intergenic	novelGene_70640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAGCTAATCTCCTTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	900664	899592	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_899600_900700
934835	contig_5686_pilon	-	1892	11	Intergenic	novelGene_45402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	225	678	277	954	208699	202982	TRUE	40	AATGAGTTACACCTATGGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSEGRSDL	211537	171655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_171800_172507_172588_176649_176720_182636_182787_189031_189096_198548_198594_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208041_208722_211283
934836	contig_8258_pilon	+	1607	1	Intergenic	novelGene_130447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	77	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTCTGTTTACTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44262	45869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8258_pilon_+_44300_45900
934837	contig_1339_pilon	+	2903	1	Intergenic	novelGene_163103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	34	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGGCATCATCATAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	132074	134977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1339_pilon_+_132100_135000
934838	contig_16496_pilon	+	914	2	Intergenic	novelGene_5231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATTAAAAAACAAAAAATCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	621	3595	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_+_1352_3411
934839	contig_854_pilon	+	1566	2	Intergenic	novelGene_36731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	78	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACATGCGTGTGTCCCGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1713390	1716403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1713416_1714862
934840	contig_4213_pilon	+	2030	2	Intergenic	novelGene_124777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	562	888	562	949	FALSE	70	AAACACAAAATCAACAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSCVHILSYRTNYLVTGNESFKGTNNKTSTHEQPIWAYHYNNLLMTRRQQSISNHIKRQSMMASGSSQNKESIYSLEEENFLELPEAEYKRLIYRTLLEIRKEIFKM	0	2091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4213_pilon_+_680_740
934841	contig_9653_pilon	-	212	1	Intergenic	novelGene_48310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAAAGAAGAAATTCCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1007185	1006973	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9653_pilon_-_1007000_1007200
934842	contig_9902_pilon	+	1026	1	Intergenic	novelGene_179249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	8	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCGTGTGAACTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	773277	774303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9902_pilon_+_773300_774300
934844	contig_6445_pilon	-	945	9	Intergenic	novelGene_76959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	753.875808323228	1	38	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	49	408	88578	64866	TRUE	60	AATTAAAAAAGATACATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APPPATNAWAPLPPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGANPWSSSCT	96339	42886	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_55480_55613_64139_64205_64855_64891_85315_85477_88146_88216_88473_88594_96306
934845	contig_10437_pilon	+	1484	8	Intergenic	novelGene_38320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	941.58630805158	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	27	653	431167	445329	TRUE	25	TTCTATCATTGCCACATACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PISSRTLPMGVPAGPSRMTWVVWVLLLCTSAMAQLHKDPTLDNHWDLWKKTYGRQYKEKNEEVARRLIWEKNLKFVTLHNLEHSMGIHSYDLGMNHLGDRTSEEVMSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIGWKVPV	431140	451703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439815_441717_441868_443748_443930_445309_445427_446951_447055_451072
934846	contig_13021_pilon	-	2568	10	Intergenic	novelGene_8202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1333	1638	179591	178181	TRUE	30	AACCGAGGTGCCCCAAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVVLCVTHSSEVQNSGHTARLAKTLQPQLQEKHTCPPKVVFMHCVSSRQALPRSQDSLENVSLSGRSRHDDYCVGEFITPSFGFNKNNGFILLLTHDLFH	181153	175912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_176060_176403_176499_176586_176721_176840_176909_177137_177278_177362_177526_177618_177792_178170_178256_179360_180209_180438
934847	contig_16496_pilon	-	920	2	Intergenic	novelGene_5229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	1	65	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	70	TTTAAAAAAAAAGAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	615	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
934848	contig_18194_pilon	-	1642	4	Intergenic	novelGene_55963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	114.135397177602	1	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	130	1140	18897	4642	FALSE	15	TTGGAATGGTGTAGGTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	20415	4139	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7040_7162_18866_18976_20364
934849	contig_9014_pilon	+	1331	5	Intergenic	novelGene_106810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2324.63728353479	8	9	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	150949	152329	TRUE	35	TCATAAATAAAGCTGCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA	150948	153610	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9014_pilon_+_151036_151578_151763_152234_152334_152425_153328_153551
934850	contig_3747_pilon	+	2271	5	Intergenic	novelGene_24825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4446.14782705209	1	79	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	179	540	330	869	201313	203804	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNNMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200983	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202170_203320_203386_203498_203651_203768
934851	contig_854_pilon	+	3287	16	Intergenic	novelGene_36637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	4205.03251619083	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	445	1338	4	1341	1694500	1702466	TRUE	40	CCTTGTCATAAATGATAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRFKAERIQSILGAWAVG	1694496	1715994	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702206_1702416_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709311_1715174
934852	contig_16594_pilon	-	3958	8	Intergenic	novelGene_53826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2957.44273841784	2	208	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	259	891	165546	133040	TRUE	70	ACTTCAAAAAAGAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAEFLKLYFPRYQRGLLLKKPTVPPQSLTLVFSNTNRL	306202	115724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_118551_121082_121158_124164_124289_132997_133152_135258_135510_149149_149351_165477_165649_306046
934854	contig_2251_pilon	-	1968	1	Intergenic	novelGene_128461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAAGTAACTGCTAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55191	53223	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2251_pilon_-_53200_55200
934856	contig_14530_pilon	-	2572	1	Intergenic	novelGene_108448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAAGGACTATGCAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20842	18270	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14530_pilon_-_18300_20800
934857	contig_3956_pilon	+	2945	14	Intergenic	novelGene_15036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	1276.02576906331	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	81	1334	1281682	1287419	TRUE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPAPSPPLSTPTTCA	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285161_1286084_1286224_1286409_1286598_1287377_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934858	contig_9177_pilon	+	1086	9	Intergenic	novelGene_32625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGGGAGGGGGTTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	21219	25479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_21392_21610_21689_21866_21957_22731_22896_23254_23356_23962_24023_24697_24821_24928_25075_25327
934859	contig_854_pilon	+	2730	19	Intergenic	novelGene_36483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2976.29107787644	2	43	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	693	2082	493	2574	1687025	1705285	FALSE	15	TGGTGCTGCCCAGTGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQG	1612770	1705441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1612927_1649494_1649679_1685180_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704569_1705282
934860	contig_11564_pilon	+	1538	3	Intergenic	novelGene_158567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGCCATCCATCCATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	57179	59204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11564_pilon_+_58231_58307_58706_59115
934861	contig_610_pilon	-	2306	1	Intergenic	novelGene_76765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	116	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	349	1050	110	1159	229060	228011	NA	60	GCAAGGAAAAAAAATCAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKHLQKQDRMALIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKSEEFRKTMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISETDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLFFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	229169	226863	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_226900_229200
934862	contig_7151_pilon	+	1930	1	Intergenic	novelGene_40705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	117	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	1014	1379	59135	59500	NA	55	GAAAAGTTAAAGAAGTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCPCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKCFDIVCCFRGIQ	58121	60051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7151_pilon_+_58100_60100
934863	SIRV7	-	909	5	NIC	SIRV7A	novel	889	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	29	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCCTAAGAGATCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	56037	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78964_114686_114961_147608
934864	contig_5020_pilon	+	1319	6	Intergenic	novelGene_27910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1561	junction_1	512.132248545237	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	75	1004	122915	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLLTEGAPFSSSSPSPGRLQEISIMVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	122840	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
934866	contig_14925_pilon	-	1218	6	Intergenic	novelGene_55361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	909.532715189509	2	36	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	146	559	116065	114666	TRUE	35	CCAAAAGGTCGGCACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	276330	112618	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129436_129503_276286
934867	contig_5696_pilon	+	892	3	Intergenic	novelGene_117578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1208	junction_2	11	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	221	892	716331	732012	FALSE	50	AGCAAGCTTGAAGAAATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILQFLQGKTLTLDVLSLQYFFDHPESLLLLRSIQFSIRGNKRPPRADLSFLDTCWDKSQAPTIDEDYASAFESMKEWQQNLAEKEENIMSFENIRLRVPPDISTGYWNLSSNQYKIPVLEVHVTNSDAVDQGMLRVLMVVFSASQHIELYLNNSSGFIESIHPALELYKTSLTKCSISQSELSEAEQKLLLTLPSLESLEVTGTTKLEDQIFPNLDKFLCLKELSVKLEGELNVFSIIPEEFQNFHHMEKLLIKISAEYDPSKLVKLIQNSPNLRVFHLECNFFSDFESLMTVLVSC	716110	732012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5696_pilon_+_716737_730428_730597_731914
934868	contig_854_pilon	+	2251	12	Intergenic	novelGene_36715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	3488.24851738064	1	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	417	1254	69	1322	1709551	1714919	TRUE	10	GGGTTTTCTACCCACCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLSIKQQEQTSWSAWGPALCRAPPNGPERCR	1709309	1715977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714452_1714484_1714862_1715429_1715557
934869	contig_11258_pilon	-	1489	5	Intergenic	novelGene_67798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAACACAAGCCGAGTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	293207	283714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_-_284073_285641_285778_288173_288277_291778_291912_292448
934870	contig_4924_pilon	-	2473	12	Intergenic	novelGene_84660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	538.156971170898	1	137	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	374	1228	133038	65524	TRUE	85	TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252444	62882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_145994_146130_155818_155860_197791_197862_252404
934871	contig_9833_pilon	-	2917	3	Intergenic	novelGene_68471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	173	522	932	1453	215789	215268	TRUE	45	AGATTAGTCCAAAGGACTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINTKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGIEDKHLDTTVSGKLRKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNL	216720	48796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_49276_214039_214577_214819
934873	contig_9199_pilon	+	983	2	Intergenic	novelGene_65625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCACATTGCCTGGTGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58034	59102	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9199_pilon_+_58724_58808
934875	contig_854_pilon	-	5226	27	Intergenic	novelGene_36617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.53846153846154	546	14	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	2950	3537	1706853	1702673	TRUE	15	GCCCTTGCGAGTCTTGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAQSLQVLLELSLGFFCSLQASQTILYLLLHVAHLGVQGGDLLLQVLLGLLLLLQLLLEGVLLILHLLQLGAQAQLLPVLLLQQLLSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLQLGDLVGQLRAHSLALIELHLQLLQLGLHFLPFVLGVPLALHQDLHLIGQLPSLVLQGLLRLLKVGFHPLRLF	1716405	1692679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1692792_1693117_1693240_1694457_1694529_1695120_1695283_1696536_1696644_1697675_1697808_1698220_1698428_1698912_1699051_1700786_1700911_1701173_1701346_1701988_1702201_1702542_1702690_1704480_1704687_1704891_1704997_1705283_1705434_1706743_1706994_1709118_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712283_1712442_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856
934876	contig_3155_pilon	-	1769	3	Intergenic	novelGene_26377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCACTTCCGTGTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262545	258090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_258190_259769_259977_261082
934877	contig_16103_pilon	-	1565	8	Intergenic	novelGene_118883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3130.00814369417	3	68	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	65	649	743628	733331	TRUE	0	TGCTCTCCTGCCTCCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743692	722796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735721_735892_735975_737495_737630_743496
934879	scaffold_12124_pilon	-	1922	6	Intergenic	novelGene_22364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1150	1485	1508404	1508069	TRUE	50	TGAAGAGAAAAAATTTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509553	1489029	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1489092_1491887_1491974_1494268_1494330_1497005_1497121_1506631_1506684_1508007
934880	contig_6414_pilon	+	1728	1	Intergenic	novelGene_157005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	27	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	71	216	193	408	1312	1527	NA	35	AACGTTGAGAATTTAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLKIKHVYSSKDFTKRVKREPTDWEKTFGQYKSDKGLISIIYEKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKDDIQMASRHMRKCLRSLAIREMQIKTTMRYHLIPALLARIKNTGNKTRNRHTIRSSNPTPRNIS	1119	2847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6414_pilon_+_1100_2800
934881	contig_149_pilon	+	1308	1	Intergenic	novelGene_173784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	69	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAACTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	72901	74209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_149_pilon_+_72900_74200
934882	contig_854_pilon	-	2852	11	Intergenic	novelGene_36712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.4	5	48	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	1568	2410	1714455	1710103	TRUE	10	GACAGCGCCTTGGTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLSLFLRELTSRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLCGTDMVAQQYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAAAAIGNLVGQLIPLLLGLALGTLGSCQLLPQLNHLSLHALQLLLVLLGLCQDLLPGGARVLQLPHAVLHLGLGLPKLLDGFISVLVG	1716405	1709217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710667_1711561_1711651_1711754_1711877_1712276_1712420_1713055_1713191_1713305_1713480_1714450_1714479_1714861
934883	contig_10437_pilon	+	1056	8	Intergenic	novelGene_38305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	957.335353777263	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	325	1056	441733	451175	FALSE	30	AGGATGTCTTCATTCTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLMSSLRVPSQWQRNVTYKSNPNQILPDSVDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMDGKCRYDPKNRAATCSKYTELPYGSEVALAEAVANKGPVSVGVDASRPTFFLYKSGVYFDPSCTQNVNHGVLVIGYGKLNGKDYWLVKNSWGVNFGDQGYIRMARNSGNHCGIASFPSYPEI	431119	451175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439797_441713_441868_443748_443977_445309_445476_446951_447055_451075
934884	contig_9098_pilon	-	1601	7	Intergenic	novelGene_75849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	168.251217595066	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	760	1161	337551	335775	FALSE	20	CTTGCTATTTATATCTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	347388	335334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337590_343617_343767_345156_345298_346957
934885	contig_5686_pilon	-	2623	16	Intergenic	novelGene_45277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	831	1502	208699	203000	TRUE	35	GCAGCAGGCGCTCAACAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	224202	93819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93897_171569_171800_172507_172588_176649_176721_182636_182787_189031_189096_198548_198594_199758_199887_200411_200560_202871_203002_208029_208716_212477_212664_215303_215473_219531_219668_222752_222914_224040
934886	contig_3956_pilon	-	1810	8	Intergenic	novelGene_15222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	788	1726	1289815	1283972	FALSE	35	GTCAATGAGATTGATGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGVDVLHDALEGLVELLGFQLQLQQGPVHLVHHQHGLDTLGDGLAQDSLCLHTHT	1291008	1283887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1283973_1284051_1284213_1287460_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289899_1290304
934887	contig_8697_pilon	+	2589	2	Intergenic	novelGene_83215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	69	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTCAGGTTGAGAAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33817	55835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8697_pilon_+_35507_54935
934888	contig_3018_pilon	-	795	7	Intergenic	novelGene_78861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	400.169963890345	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	624	171	794	570362	562938	FALSE	70	GGAAAAAAGGAAAAAAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKENPECPVLKRSSESTENINSGYETR	585178	562936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572332_585090
934889	contig_9345_pilon	+	1392	3	Intergenic	novelGene_24352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	77	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAAAGAGAATCTCAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	141104	142780	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_+_142143_142272_142417_142570
934890	contig_10126_pilon	+	2890	5	Intergenic	novelGene_105761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	788.516130145731	1	152	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	281	601	184093	184466	FALSE	40	TAAAGATTTCTGGGTAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNNDITYAELNLPRGKKPAPQAAEPNNHTEYANIEASPPRRSEDTLTYARAFLLGIRQRPDPEEVNGLGRFRAVPHELPVPHGATMLGGSSPAPRTPGWPGPGTQE	166564	186755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_+_166667_169481_169584_181504_181563_184074_184238_184290
934891	contig_20293_pilon	-	3650	1	Intergenic	novelGene_153539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	110	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATGAGTTTGGGAGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	143670	140020	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20293_pilon_-_140000_143700
934892	contig_9098_pilon	-	1810	12	Intergenic	novelGene_75839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	187.713558821118	1	86	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	304	975	348543	337108	TRUE	20	TTTATATCTATGGCTTCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METFSFVLTNVDGSRKIGYCRRVLPTGRGPRLPTVYCILSCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSLGW	350572	335327	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337120_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345298_346957_347036_347761_347832_348541_348660_350330_350425_350479
934893	contig_3747_pilon	+	2067	6	Intergenic	novelGene_24946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5809.63443256114	1	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	21	983	202455	204120	FALSE	20	AATGTTGAGTTTTTTGTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEGLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFNSRWIPALSTTMCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	202434	205204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203537_203623_203762
934894	contig_15092_pilon	+	2267	3	Intergenic	novelGene_57787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTAAAAAACTCTCTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	324697	352408	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325330_348136_348356_350992
934895	contig_11227_pilon	+	3089	1	Intergenic	novelGene_163219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	147	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	168	507	2436	2942	495593	496099	NA	45	CATTAACCTTACAACAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKGSIHQEDITIIKIYAPNDRAPKYTEQTLTALKREIDSSTIIVEDFNTPLSVKDSTSRKKLNKDTEDLNATVNQLNLIDIYRTLHPTAAKCTFFSNTYGTFSRIDHILGHRASLSRIQSNEIIQSIFSDHKAIKAEINNRKSRGKKIKDMETEQHLAQKLLGYRRK	493157	496246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11227_pilon_+_493200_496200
934896	contig_8330_pilon	+	1752	9	Intergenic	novelGene_71825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_3	152.588038112429	1	83	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	236	711	135	845	853991	856687	TRUE	10	CACCGCTGCCCAGCCTTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853856	857808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
934897	contig_8712_pilon	+	1976	4	Intergenic	novelGene_58783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	577.82407934134	1	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	180	500	315133	321793	FALSE	25	TCATGGTGTGAAGAAGGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSTRGAGGAPGPYQAAAGPSSVPSAPPSYEETINSYYPTPPAPAPGPTTGLVSGPDGKGMNPPAYYTQPVPVPNANAIAVQTVYVQQPVSFFDRPIQMCCPSCNKMIVTRLTYNAGALTWLSCGSLCLLGCVAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPNCKALLGTYKRL	286987	323269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_+_287015_314980_315188_318064_318222_321684
934898	contig_3956_pilon	+	2452	12	Intergenic	novelGene_15125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1217.86708960128	1	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	619	1860	74	1933	1281682	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281608	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284184_1286148_1286224_1286409_1286606_1287447_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934899	contig_3956_pilon	+	1790	9	Intergenic	novelGene_15091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1382.42164673988	1	56	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	439	1104	1287410	1290310	FALSE	10	TGGTATGGTGGTGACTGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGARGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281604	1290996	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281722_1282790_1282913_1283793_1283900_1287316_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289501_1289833_1289892_1290297
934900	contig_10958_pilon	+	1493	5	Intergenic	novelGene_5409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	5419.11133743347	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	34	435	888255	894000	TRUE	40	TGTATGGAACTAACAAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCGEEYLRSAMLCRAACSTSRKLVPALGALGSRQKHSLPDLPYDYGALEPYINAQIMQLHHNKHHAAYVNNLNIAEEKYKEALAKDDVTTQIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPKGRYTLMHPFLHFVHNRNNC	888221	901050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_+_888278_888850_889054_893824_894030_895418_895855_900457
934901	contig_854_pilon	+	3903	21	Intergenic	novelGene_36638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	4061.06714146664	1	77	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	607	1824	1323	3146	1702239	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCEGRGPGKGRPWPRLHTAAFRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1694496	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701992_1702304_1702542_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
934903	contig_6634_pilon	+	2620	1	Intergenic	novelGene_171149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	44	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	131	396	1392	1787	343720	344115	NA	35	TACCAAGTAATGGTAGACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRRQQTISKHLQKQDGMDPVGIQNETPDDSPVEENALQLHDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIQRQQLEIQKINNKISEMDDVIEGLRSRFETVE	342328	344948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6634_pilon_+_342300_344900
934904	contig_854_pilon	+	1079	3	Intergenic	novelGene_36741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACATGCGTGTGTCCCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715127	1716401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715566_1715713_1715844_1715890
934905	contig_1301_pilon	-	3621	1	Intergenic	novelGene_47269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	256	152	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGAAAAGAGCAACACCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	228771	225150	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_-_225200_228800
934906	contig_17_pilon	+	7070	5	Intergenic	novelGene_173971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	194	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	2988	3539	139090	181089	TRUE	60	TGTTAAATGCAAAAAAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLNRSGEKGCIYQKRRKGQNQNINRELKQIEREQQKKPKTTGRKEIAKTRAEINEIENRKTIERINKTKSWFSERINKIDKPLARLTKEKQERTPITKIRDEMGDITTDPTEIKRIITEYYEKLYSNKFENLEEMDKFLETHYLLKLSQSDVENLNRPITREEIEKVIKKTSNQKKPWPRWLH	136102	222042	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17_pilon_+_139116_180563_181991_219057_219072_219304_221662_221783
934907	contig_2834_pilon	+	1722	5	Intergenic	novelGene_28006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2211.39870896227	1	63	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	158	477	76	552	274813	290707	TRUE	40	AAAATCCTTTACAAGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPDILHNKQISIRICTDCKYKGFYLFIKCVVILRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALEPPEPKKSRRCVLL	274737	292115	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2834_pilon_+_274911_285342_285434_285547_285746_290617_291578_291815
934908	contig_14970_pilon	-	1652	6	Intergenic	novelGene_45134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	151.756383720752	1	42	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	365	1108	291083	268709	FALSE	70	GATTATTTAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYMVTVIVGLIIHGGIFLPLIYFLVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKAELDSIDSQHQVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVPFLDIETCI	315806	268164	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_268974_280559_280695_285611_285807_290934_291170_311919_312003_315611
934909	contig_3077_pilon	+	2694	10	Intergenic	novelGene_26866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	77.2643370370689	1	124	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	703	1140	1342592	1346705	FALSE	20	TGGATGACTGATTCATTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPLLAHRRGNLWTLPDPHPGHEGAPRIHCAAAHHPGTTWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1336608	1348259	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1336662_1337732_1337906_1338432_1338617_1338919_1339005_1340771_1340839_1342061_1342200_1342589_1342707_1343513_1343629_1345320_1345435_1346611
934910	contig_10225_pilon	+	2810	12	Intergenic	novelGene_86813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	464.335551225869	1	117	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	573	1722	975	2696	41486	47636	FALSE	20	GATCCTAGACTTGACTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISCPEVLALPGSAHTDYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20693	47750	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40970_41053_41437_41523_42608_42726_45216_45259_46110
934911	contig_14970_pilon	-	1858	10	Intergenic	novelGene_44994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	61	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCTGGGCAATGAGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232251	136028	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_136211_177265_177437_182328_182445_188750_188830_191970_192067_192110_192204_216611_216671_221175_221249_224291_224373_231343
934912	contig_11720_pilon	+	1106	10	Intergenic	novelGene_43842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2243	junction_2	1895.9101270568	4	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	353	1062	10	1071	68064	98482	FALSE	85	TTAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPRHTNTSARDNTINLIHTFRDYLHYHIKCSKAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	68054	98517	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93261_94959_95061_95383_95486_98299
934913	contig_5189_pilon	-	1774	8	Intergenic	novelGene_34866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1084.52741518401	3	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	315	948	22	969	235808	199237	FALSE	25	AATACTTGTTTCAAGCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKVFDLYKNMYFYFQPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS	235829	198431	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_199372_204911_205038_205696_205790_218496_218671_220258_220403_228136_228245_230388_230485_235736
934914	contig_4180_pilon	-	646	5	Intergenic	novelGene_8401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATCCAAAAGAATCTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888356	875312	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_875362_882858_882929_886080_886187_886317_886467_888084
934915	contig_7963_pilon	-	1854	8	Intergenic	novelGene_58490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_6	690.656623387173	1	90	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	107	550	125592	123113	TRUE	15	GTATTGTCACTCTTCCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPIPTPGWERTSLAKILSFLLSLMQPMDSQPQRIITKL	125698	120488	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563
934916	contig_13899_pilon	-	1876	1	Intergenic	novelGene_165574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	84	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGTGGTCTTCATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59861	57985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13899_pilon_-_58000_59900
934917	contig_19402_pilon	-	3825	11	Intergenic	novelGene_80816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCACTAGAGCAGACACCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	146713	79168	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_79275_81348_81440_83568_83748_97643_97798_102161_102225_107509_107672_138548_138661_139813_139895_142955_143058_143796_146482_146623
934918	contig_3787_pilon	+	3831	2	Intergenic	novelGene_102351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	135	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	3217	3582	176081	176446	FALSE	25	ACCGCAGCCACCAGGACGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKYLDIVCCFRGIQ	38872	176695	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3787_pilon_+_41497_175488
934919	contig_1521_pilon	+	770	2	Intergenic	novelGene_145443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACCTATCAGGAAAAACAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	160444	163977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1521_pilon_+_160909_163671
934920	contig_14441_pilon	+	782	4	Intergenic	novelGene_100774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	488.532723798746	4	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	194	742	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YERHFGPGTKLKVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	122143	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_122188_125517_125902_126159_126283_126514
934921	contig_8772_pilon	+	1570	9	Intergenic	novelGene_21095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3436	junction_1	3652.81295502179	1	57	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	140	1540	15355	23105	FALSE	50	TACCAGCAAGAGTAAAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSNRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVFATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDITRLREKLQEEMLQREEAEGTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHDEEIQELQAQIQEQHVQVDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESNEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHEDLE	15215	23135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8772_pilon_+_15918_16549_16611_19022_19119_19201_19364_19996_20123_20475_20697_21478_21523_21966_22053_23063
934923	scaffold_12124_pilon	-	1681	3	Intergenic	novelGene_22377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	135	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1170	1505	1508404	1508069	TRUE	35	CACAGCAACCACTACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1509573	1497060	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1497121_1506628_1506684_1508007
934924	contig_3956_pilon	+	1937	10	Intergenic	novelGene_15249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1239.56470854355	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	774	1541	1288971	1290491	FALSE	30	GGGACAAGGGTAGACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284740	1290887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286505_1287976_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934925	contig_12079_pilon	-	3143	10	Intergenic	novelGene_67542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	305.694029228856	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	703	2112	290	2401	871530	861365	FALSE	25	AATAGCCTTCCTTGTTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872428	860622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871793_872314
934927	contig_10867_pilon	-	445	5	Intergenic	novelGene_159454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2751.83914637102	4	22	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	112	444	88226	86780	FALSE	20	AATGTTAGGTCTTTGATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKKGDIVDIKGTGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQVKGKIFAKRINVRVEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEALSCWNLFPMSSWHNRCKIKTSAV	88685	86778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10867_pilon_-_86853_87122_87237_87726_87840_88193_88256_88603
934928	contig_11656_pilon	+	2913	21	Intergenic	novelGene_54015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	136.014925651562	1	101	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	692	2079	169	2247	484818	536519	FALSE	75	GAAGAAAGAAAGAAAAAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPSFAAPVPISPAPGSLSPAPRPRRQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQIMRRLNHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEMDIVVSEDLSGAVKFSSSLPYPNNLNSVLAQRLEKWLQLMLMWHPRQRGTDPVYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCVSDGKLNEGRTLDMDLVFLFDNSKVTYEMKISPRPQPESVSCILQEPKKNLSFFHLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSVQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKHLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTDGDSQEMVRLLLQAIQGFEKKVRVIYSQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIACSKVRGPVSGSPDSMNASRLSHPGQLMTQPATAPDGLAESAKKSEELVAEAHTLCTRLENAMQDTMKTQDQSFMTLDWSWLQAEEEEQNSLEQAS	465005	537185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11656_pilon_+_465087_484730_484826_485804_485923_489324_489395_508478_508568_510823_510914_513717_513843_520395_520504_521771_521902_522657_522853_523727_523843_524926_525051_525829_525982_526131_526194_527470_527581_527842_527893_528001_528102_528538_528687_531208_531337_535319_535411_536453
934929	contig_3956_pilon	-	2120	11	Intergenic	novelGene_15166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	16	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	363	716	1290644	1289885	TRUE	35	CCAGGCAGATACGAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGPRRHAEGQAGRGDVSRREKNVMTWGCGHALAESHPGLPAAAASEGHLQFVQEVVQGRDALLQAFALAGLGHHLAGAAGGVEGVSGQDLPVVEHTLGEGLAARVRPQVSREAK	1291006	1281657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284745_1285696_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287488_1289852_1289891_1290296
934930	contig_12312_pilon	-	630	1	Intergenic	novelGene_63970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	7	24	460	483	214932	214909	NA	45	CAGATGAACAAACACCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLQKLFWASHIAADPAWLPWAVLPGSFSEVSFAAAGESGLWGAPSIWGWVHFLPFPNLILLVSHSTKPNFILSGRQRFTRFCLQHAPEQRLFQGHFRPHFLPWPSKVAIAGTHCVSWCSLPLEGQSSWALALPILPVGPLPGAPRYHCLQRSMLRPYSF	215391	214761	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_214800_215400
934931	contig_3018_pilon	+	578	2	Intergenic	novelGene_78806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	24	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTCAGCATAATGCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	512966	513599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_+_513386_513440
934932	contig_5125_pilon	+	2538	8	Intergenic	novelGene_43424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1542.87632263211	1	82	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	378	1511	35654	58893	FALSE	30	GGTATTACAGTCACAGCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFPGPLENQRLSFLLEKAIAREAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	25971	59920	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_26007_26202_26502_35610_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
934933	contig_16622_pilon	-	2017	5	Intergenic	novelGene_48480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1590.80472953157	1	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	525	992	121443	112952	FALSE	65	AAAAAACAAAAAACTTCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCGLVLLQCGGGVSGEQIRGREKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQSEFPFQTL	121967	111926	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115457_121377
934934	contig_2703_pilon	+	2294	16	Intergenic	novelGene_101738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1154.92976217411	1	100	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	242	1081	559489	605177	TRUE	15	CTGCCCAGGGGCCGCATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPISTDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPIFTCAII	526229	611709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559430_559523_564148_564208_577994_578073_578758_578915_582631_582668_584461_584528_596341_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603512_605155_605221_606091_606153_607656_607732_609320_609402_610756
934935	contig_17144_pilon	-	1355	9	Intergenic	novelGene_29520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2288.47167545832	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	153	1286	179764	166152	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLEPTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183260	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166307_173323_173460_173580_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
934936	contig_11088_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_85048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
934937	contig_9177_pilon	-	3799	25	Intergenic	novelGene_32592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1787.40309712085	17	105	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	812	2439	84	2522	25986	16653	TRUE	15	TGTAACCTCTGCCGGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDFGLFLSDDDPKKGIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLVRELMEEKKDEVTGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRMGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQMGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASTEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGENDTDPHFQDVLMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNELLQHVRTHTTGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSCKLLSAAKILADATAKMVEAAKGGSRPSRQ	26069	1715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2288_15159_15267_15424_15554_15706_15842_16049_16164_16261_16379_16549_16680_17438_17606_18196_18492_18834_19003_20025_20125_20272_20482_20700_20810_20908_21023_21210_21392_21609_21687_21864_21967_22737_22894_23251_23357_23963_24025_24696_24825_24931_25075_25327_25481_25584_25715_25971
934939	contig_9484_pilon	+	2611	14	Intergenic	novelGene_105664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	478.202019650308	2	119	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	12	944	126829	206935	TRUE	20	CAATGTCTTTATTTTATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAMKGSLFRGNFWSSDILSTIGYDNIVQHLNNGRKNCKEFEDFLKESTLKQALEVFKQQVDNVAQCHIQLAHTLREEARKMEEFREKQKLQQKKTELIMDAVHKQRSLQFKKTMNAKKNYEQKCRDKDEAEQAVHRSANLVNSRQQEKLFVKLATSKTAAEDSDKAYMLHVNMLDKIREEWQSEHIKACEVFEAQECERINFFRNALWLHVNQLSQQCVTSDDMYEGVRKSLETCSIEKDIEYFVNQRKTGQSPPAPVMYENFYCPQRNAAPPGKATGPGPTVARRGLPPVPPSVQGDPDYSLLADYSLLYQ	126817	213172	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_126862_168513_168615_182686_182722_187809_187917_193425_193489_196661_196761_197343_197390_198354_198435_201121_201221_202520_202618_202734_202823_204859_204895_206885_206944_211513
934940	contig_3956_pilon	+	2222	10	Intergenic	novelGene_14887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1056.94854284503	1	51	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	601	1698	1287410	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283883_1286528_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934941	contig_11088_pilon	-	478	2	Intergenic	novelGene_85056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATCTCTCCAGAAACCGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	17402	14741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_-_14935_17117
934942	contig_2438_pilon	+	1211	4	Intergenic	novelGene_112054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2614.88087682785	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	27	440	310588	312412	FALSE	15	CAGTCTTTTTTGGATGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQPPLPFRMANRGPAYGLSREVQQKIEKQYDTDLEQILIQWITSQCRKDVSRPQRELINGLYPEGQAPVKKIQASSTAFKQMEQISQFLQAAESYGINTTDIFQTVDLWEGKNLACVQRTLMNLGGLAVARNDGLFSGDPNWFPK	310561	313510	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_+_310727_311914_312083_312305_312413_312739
934943	contig_6898_pilon	-	2003	10	Intergenic	novelGene_35713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	28	27	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	1089	1445	124838	114494	TRUE	10	GGCGATTGCTCAGCTTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVFSSARVFSKSSCTIWAFCCHSTASLSFFCRAISSWEIRAVSSAISKASAPGFSSGPERPAAGPPWPLRLLDAPWPASQPHSGHASAQTWIRSSHWSLLSLCCSRTLWGSNLSPAK	127706	59541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_59679_104551_104629_112964_113065_114249_114525_115894_115953_123024_123142_124368_124462_124780_125006_125479_126041_127346
934944	contig_10734_pilon	+	1917	9	Intergenic	novelGene_51499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	383	742	2265456	2265815	TRUE	35	AAAACAGTTTCAGGTTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFRFSISLCCSLGRPCVSRNLSISSRFSNLLEVRTLEATVLAFAFGELSPDPPAAAAGQDGKVSHVRGAEAPGRVAPVGTVPQLAVGGLWIQHQQGLLVEQEELQVLSGQDELLEQI	2265073	2281092	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_+_2266074_2267089_2267192_2269290_2269427_2270429_2270505_2270955_2271044_2274370_2274505_2275749_2275884_2277108_2277192_2280927
934945	contig_16098_pilon	-	1186	9	Intergenic	novelGene_45975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1499.98520305202	9	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1068	118	1185	352350	348289	FALSE	25	CCAGACTCTGAAGACTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFFKPQWQIRKNNNKMALFSG	354106	348287	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348350_349346_349493_349604_349710_349955_350076_350236_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
934946	contig_13021_pilon	+	1613	8	Intergenic	novelGene_8210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2882	junction_6	2499.22342224254	1	74	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	220	1314	177472	180850	FALSE	40	TGAATTAAGTGGAAATTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGTNVPNIHNGMNQQAAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ	177167	181149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_+_177280_177364_177526_177618_177792_178170_178282_178522_178585_178670_178731_179985_180211_180440
934947	contig_9363_pilon	-	2141	12	Intergenic	novelGene_6563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	862.857945846675	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	71	472	759301	757151	TRUE	35	TTATATATGTGTCAGGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FPFEKNCGNDGICQDDLSVTFSFMNLDTLVVGGSRDLNVTLTVRNQGEDSYRTQVAFFYPPGLSYRRVSGAQNQRSQRFWRLSCESGPSHEGPGTLKSVSCNINHPIFPGNSEVTFNTTFDVDSDASFGNKLLLKANVTRTTCPRPKNLNSSWNCL	759371	753386	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755429_755545_755664_755804_755889_756088_756192_756718_756760_757122_757203_758070_758151_758720_758844_758930_759073_759296
934948	contig_4924_pilon	-	2702	13	Intergenic	novelGene_84664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	704.712722201986	1	103	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	49	1458	252525	65524	TRUE	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTATWGNLTGLGGLTPQYLALLQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAAAQTSATTTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLNNINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQSAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY	252573	62883	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4924_pilon_-_64084_65479_65652_69049_69194_74641_74822_82347_82480_114575_114711_127720_127785_132966_133126_137217_137298_145994_146130_155810_155860_197778_197862_252404
934949	contig_10642_pilon	-	1656	2	Intergenic	novelGene_78696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	43	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTCCATTCCATCCTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	463024	461268	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10642_pilon_-_462624_462723
934950	contig_10930_pilon	-	2317	7	Intergenic	novelGene_37035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1694.6961051731	1	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	681	1529	276835	268388	FALSE	15	GCCTATGATTTTCCAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	280388	267599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277013_278495_278637_279700_279832_280157
934951	contig_17144_pilon	+	1740	10	Intergenic	novelGene_29251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	73	8	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGTGAAAAAACGATACCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	181849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166433_172518_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174760_174875_175003_175975_176270_179699_179784_181792
934953	contig_14513_pilon	+	1272	3	Intergenic	novelGene_70273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGGCCTCTATCTGTAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11287	19049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12164_14918_15001_18735
934954	SIRV6	-	657	4	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	3	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCAGACTTTCGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11351	2759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV6_-_2828_3105_3164_10723_11109_11205
934955	contig_3956_pilon	+	2142	9	Intergenic	novelGene_15004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1403.3094811908	1	67	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	453	1362	81	1442	1281682	1290310	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSELHSRPDPGHHGQEGQYPKHVGHCPRGPRQVHADRLPGLQGRHHCLRPGWGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1281601	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281689_1282697_1282851_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289802_1289892_1290297
934956	contig_13004_pilon	+	1973	5	Intergenic	novelGene_112731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	193	junction_1	335.388580604647	1	109	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	86	961	922526	928299	FALSE	10	CCTTGGCTTCTTGGATTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELLCCENIQQTPRAKPDPQLLEDQRVLQTLLRMEERYLPCVSYFQCVQNEIKPHMRKMLAYWMLEVCEEQHCEEDVFLLAMNYVDRFLSCVPTRKTQLQLLGSVCMLLASKLRDSKPLTIEKLCIYSDHAVSHRQMLDWELLVLGRLKWDLAAVIAHDFLALILHRLSLPSDRLALVKKHAQTFLALCATDFAFAMYPPSMIATGSVAAAVQGLDACSMTADELAEMLAGITGTEVDCLRACQEQIETALRDSLRDSRSNSSPVPKALRASSSEGPSQTSTPTDVTAIDL	922440	929311	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13004_pilon_+_922724_923623_923840_926828_926989_927531_927669_928134
934957	contig_8377_pilon	+	4344	29	Intergenic	novelGene_34932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3272.07035092119	1	134	14	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1056	3171	83	3253	68257	197939	FALSE	45	GTACATAAGACATTAAATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYIIQKLNITNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENTVDIYGYVVKLRRQRCLMVQVEYILIHQALVEYNQFGETEVSLSELHPYLQNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQAENRSKNRNSNIIPYDFNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	68093	199030	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140976_142257_142387_154874_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383_180510_182893_183052_183262_183399_185672_185817_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663_197749_197823
934958	contig_3956_pilon	-	2199	12	Intergenic	novelGene_15163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.287479787288034	1	39	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	1113	1613	1286221	1284217	TRUE	35	CCAGGCAGATACGAACGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASSSGGPSYRSSQRYFWAVTGEGRWMVIICSSASPAGSQRRITAFRRGLPSLSLSSLSSLMSSFSISFAVSSFLKFMIASNTLKMGSRMSWQNVRGSFLPSGLVADLLNLPLDGSKYRSPQSFFIMSSTFLARSAGPRWPSPLAANLATYISANCFRVKAQPWR	1290913	1281657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283973_1284051_1284227_1284729_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287500_1289816_1289891_1290296
934959	contig_14133_pilon	-	742	6	Intergenic	novelGene_119941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1884.12957091597	6	40	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	209	630	73	702	209116	206601	FALSE	25	TCTCAAGTAGTATCATTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPSRNGMILKPHFHKDWQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSELKLATQLTGPVMPIRNVYKKEKARLITQDEKDFKAFASLRMARANARLFGIRAKRAKEAAEQDVEKKK	209421	206560	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_207407_207459_208214_208389_208585_208728_209012_209131_209363
934960	contig_6958_pilon	-	1508	3	Intergenic	novelGene_69944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	241	junction_2	331.5	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1	504	160947	149618	FALSE	40	GGAGAGTTTAATAAAAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	160947	148613	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_149939_154425_154590_160928
934962	contig_5317_pilon	+	945	4	Intergenic	novelGene_76533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	311.598388242872	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTATACCTGTTTTTGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33708	43838	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_33766_35258_35410_36734_36839_43205
934963	contig_5302_pilon	-	2129	4	Intergenic	novelGene_81413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	725.170784482295	1	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	161	787	181300	176894	FALSE	30	CTGACCCTGAGGAATAAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYITLFTIPRRKKKCIRYLPGEGRCPSPVPSDDSALGCPGSPAPQDSPSYLLLPHFPTELLASPAESAPTSPGLSAALSLPAPWAPTGPLQHPAEYTSTATGISQIGSLAGPRHLASSRSPPPERRRQSPKARGNRPGALLTPS	181991	175551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177323_180998_181107_181210_181374_181904
934964	contig_14970_pilon	+	1643	8	Intergenic	novelGene_45031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5712.32579603089	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAACTCTTTGTGCTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	177350	232246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_177442_182324_182459_188757_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
934965	contig_12312_pilon	+	997	10	Intergenic	novelGene_64009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	80.4829557908972	1	45	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	17	460	506925	531442	TRUE	70	TAAGAAAAGAAAAAAAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLINQMLTINPAKRITADQALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLRKFNARRKLKGAILTTMLVSRNFSAAKSLLNKKSDGGVKPQSNNKNSLVNPAQELAPLQTAMEPQTTVVHNATDGIKVIPTVRKQEIIKITEQLIEAINNGDFEAYT	506908	534353	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_+_506991_510273_510358_510593_510637_515485_515530_525182_525252_526427_526477_531353_531443_531804_531896_533464_533710_534152
934966	SIRV4	+	1464	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	102	1	102	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	49	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATATTGTAACCTGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1102	3402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
934967	contig_2394_pilon	+	1175	2	Intergenic	novelGene_177761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGATAGAGGAAATTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27167	28700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2394_pilon_+_27742_28099
934968	contig_3956_pilon	+	1555	7	Intergenic	novelGene_15261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1330.43531931804	1	43	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	40	864	1285728	1290310	FALSE	10	TGGTGGTGACTGTGTGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKPLSLTVSRASGRWYLWCPEQETRPCLRGVPGGRHPHVCREGLPACQRVIWLHG	1285148	1291001	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287507_1289743_1289892_1290297
934969	contig_5686_pilon	+	2749	19	Intergenic	novelGene_45290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	41	junction_16	1626.70887259302	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	792	2379	9	2387	93843	221818	TRUE	20	TTACTTGATCCAGCTGGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKMQYLEAEELLVDEDDNIFDEGLPARLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENTSAVKKPQAKLKKMHNLGHKNNSPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMRRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFATSPASKAARESLSEINRSYKEYTENMCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKCKPPVSRSRSSSLSLTVESALESFDFLNTSDFDEEEEDGEEVCIVGGGADSVFSDTETEKNSYRSVHPEARGHLSEALTEDTGVGTSVAGSPLPLTTGNESLDITIVRHLQYCTQLVQQIVFSSKTPFVTRNLLEKLSRQIQVMEKLAAVSDENIGNIGSVIEGPSSLSKPTQE	93834	224176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_212480_212666_215305_215475_219533_219670_221783_221886_222754_222917_224043
934970	contig_19342_pilon	+	3449	9	Intergenic	novelGene_41068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3.40725329260975	4	95	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	831	1238	5070	6183	TRUE	15	AGGTGAGCCCTACCGTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCWALGFYPTDITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAMVVPSGEEQRYTCHVQYERLTEPLTLRWESTISIMGIVAGLVLFGALLVGAVVAAVVILRKKSSGGKGRSYTQAGSSDSAQGSYVSLTA	3234	10795	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_3327_3622_3892_4133_4540_5006_5293_5413_5522_5960_5994_6139_6186_6353_6466_8698
934971	contig_11318_pilon	+	656	1	Intergenic	novelGene_48165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCAAGCGATACCAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	66059	66715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11318_pilon_+_66100_66700
934972	contig_20819_pilon	+	2161	2	Intergenic	novelGene_55647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCGGGACTGTCGGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35416	43375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_37318_43115
934973	scaffold_9100_pilon	+	1486	7	Intergenic	novelGene_83286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	549.247970713897	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	44	667	647232	653338	TRUE	30	GACAACTCTGTTAATTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQNKITVVGVGAVGMACAISILMRDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCNLLVVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGVNVAGVSLKNLHPDLGTDADKEQWKEVHKQVVVRMR	647188	654848	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_9100_pilon_+_647262_648995_649114_650406_650581_651029_651204_651950_652065_653324_653449_654139
934974	contig_3077_pilon	+	1679	6	Intergenic	novelGene_26819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	838.080330278667	1	72	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	295	888	79	966	475601	481662	FALSE	35	ACACTTGACATTCAGAGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	475522	482375	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_475622_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481026_481218_481533
934975	contig_233_pilon	-	1895	11	Intergenic	novelGene_14660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1570.00949041718	1	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	77	1102	105485	92266	TRUE	25	TGTACAATTTTTTTGATGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGERNVSVASANAPRSSKVRHASASSPPKAA	105561	78343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92140_92352_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461
934976	contig_16125_pilon	-	1513	4	Intergenic	novelGene_155272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1187.46798787261	2	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	56	1342	236934	179442	TRUE	75	AGAAAGAAAAGAAAGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNAKAKHLTQQLPYHHLHHPIQPANHHCQHLIQHNQHPQAYLPETLNLPLI	236989	151769	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_151850_153016_153046_179379_179591_235796
934977	contig_7119_pilon	+	1636	2	Intergenic	novelGene_40891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	47	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	334	912	139647	140225	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127421	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127563_139454
934978	contig_233_pilon	-	2063	13	Intergenic	novelGene_14672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1205.17892574321	2	57	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	635	1908	97	2004	107460	78640	FALSE	40	AGGGAGCACTTGAAGAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRVRGGAESGRHRRGHSGRDRADRHPPAEHLEGPDPPERPQGVQAIREGEAQVPVEQ	108486	78580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79140_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401
934979	contig_8712_pilon	-	1950	3	Intergenic	novelGene_58809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	87	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	1319	1624	321940	318168	TRUE	55	TAAAAACAGAAGACAGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVWRFVTFDDGPLEREDHLNRTSTRVGLGESWKGLLSAHGRLHVGRVLQTLVGAQESFAVGTVVVHILQGVHAEGDEAAARHAPGHRLPQESQVRAPAL	323258	314966	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_315187_318061_318214_321680
934980	contig_3948_pilon	+	1385	11	Intergenic	novelGene_53284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	448	873	1419351	1425377	TRUE	20	CACAAGCCGGCTCTGCTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKQFNTKQMPNTTPGYSVAVQKAPFFHRWPFRVRYRRPAENPPNTLHEHEEEAGRGHERSPAGGRQHAKHGHNYDNEDHTEELNARAQQGAEDHGVLGWPEDITMHQLPSRLFHGVFNVILLVIVSDVLPEGPDDDHAQDA	1416777	1430851	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_+_1417185_1419310_1419410_1422641_1422720_1422799_1422883_1423776_1423907_1425301_1425378_1426895_1426999_1427090_1427212_1429093_1429217_1430585_1430715_1430815
934981	contig_6589_pilon	+	2814	11	Intergenic	novelGene_25743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	72.7434533136831	37	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	212	639	1855	2493	479605	509430	FALSE	20	TGATTTGATCTGGAGGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFPRLGRSLQSVLDDHPKHIIPERSVFQVACRLLDALEYLHENEYVHGNVTAENIFVNPDDLTQVTLVGYGFAFRYSPGGKHVAYVEGSKSLHEGDLEFISVDLHKGCGPSRRSDLQTLGYCMLKWLYGCLPWTNCLPNTNSIMQLKEKFLDNPESLVEKCSRWNTPSGTLQEYLKVVMSLKYDEKPPYSVLRNNLEALLQDLRNFPEPAV	465576	509751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6589_pilon_+_467196_470064_470142_474991_475059_478001_478089_479600_479707_481817_481911_483843_483977_490403_490525_505399_505459_506884_506992_509406
934982	scaffold_14128_pilon	-	2272	1	Intergenic	novelGene_169530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGTCCCATACGTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	543602	541330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_14128_pilon_-_541300_543600
934983	contig_3747_pilon	+	2155	5	Intergenic	novelGene_24852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4466.91058646801	4	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	743	1069	203794	204120	FALSE	15	TGTTGAGTTTTTTGTCTATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSDHVKEKQQLYLLVSFCPSSWTLTFSETQQSLQWGMGPPQPLTSQCRRSSAGHLLGLKQCGLVGQRQCCDIWMSAGWVLKHTRKTQACLIFSDLEIEAFLLVLSQG	200990	205206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201336_203064_203128_203228_203386_203498_203651_203768
934984	contig_3964_pilon	+	1832	1	Intergenic	novelGene_174203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	90	273	139	411	58840	59112	NA	25	CCAGACACCCTTTTAGCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIESPDVNPSTYGHLIFDKDPKSIKWGKDSLFNKWCCQNWISICEKMKQDPYFTPYTKTTSKWIKDLNIKPRTMKFIEEKIGPTLQALIHGINRIQTITINVPTPKDKLDNWDLLKLKHLCSSKDFTKRVKRVPTD	58701	60533	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3964_pilon_+_58700_60500
934985	contig_854_pilon	+	1920	4	Intergenic	novelGene_36726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1529	junction_3	1491.05339348469	2	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	27	521	1712393	1714980	FALSE	45	GTCACAATAAAGAGTACCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1712366	1716379	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
934987	contig_16103_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_118874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATACTGAAAATTGACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723377	722335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_722300_723400
934988	contig_19604_pilon	+	2308	6	Intergenic	novelGene_77244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	276.989097258358	1	127	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	119	360	229	588	273206	273988	TRUE	10	CAGCAGGTCTCCTTTGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEELGPSIEEDCQKYILKQQQEESEKPVQVPAVDSSVPRTVGLAGITTLDDPLGQVPERFDAFICYCPSDIQFVQEMIRQLEQTNYRLKLCVSDRDVLPGTCVWSIASELIEKRCRRMVVVVSDDYLQSKECDFQTKFALSLCPGAHQKRLIPIKYKAMKKEFPSILRFITVCDYTNPCTKSWFWIRLAKALSLP	270029	275819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19604_pilon_+_270055_270731_270867_273137_273319_273484_273577_273833_274945_275055
934989	contig_13740_pilon	-	1554	10	Intergenic	novelGene_34711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3344.7951089697	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	689	1174	160838	157474	FALSE	70	TGTAAAAAAAAAAAAAATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165407	157093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161074_161270_161574_161722_161919_162031_165237
934990	contig_12427_pilon	-	2213	6	Intergenic	novelGene_40550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2680	junction_5	254.625686057004	1	109	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	237	860	522337	506035	FALSE	45	AGAACAAAGATCATCTGATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRTKASAESCSC	578188	504681	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_506131_507799_507929_510397_510617_520312_520440_522284_522346_577960
934991	contig_3747_pilon	+	2171	6	Intergenic	novelGene_24940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_5	1859.69477065458	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	54	794	202422	203804	FALSE	60	AATAAATAAATTTTAAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	202368	205181	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
934992	contig_5502_pilon	+	1808	8	Intergenic	novelGene_154971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	622.233009705646	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	181	546	75	620	357713	377719	TRUE	25	TCTTGGTTGTCTAATTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWPPCLSPGAPLLRVANLQLPDSDMTGWKMGKGRMKKPKTEDQAFVTLTTNDAYAKGALVLGSSLKQHRTTRRLAVLTTPQVSDSMRKVLETVFDEVIMVDVLDSGDSAHLTLMKRPELGVTLTKLHCWSLTQYSKCVFMDADTLVLANIDDLFEREEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVYQPSAETYNQLLQFASEKGSFDGMYLVY	357638	399297	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5502_pilon_+_357720_359024_359070_360694_360831_362720_362896_363179_363353_377709_377826_395620_395838_398432
934993	contig_16103_pilon	-	1321	8	Intergenic	novelGene_118887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	67	699	743628	733331	TRUE	15	CCTGTGGGAACCCTCATTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743694	723090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
934994	contig_16594_pilon	+	4650	12	Intergenic	novelGene_53809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	66	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3942	4295	149311	272805	FALSE	15	TTGAATCAGGCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWWLSLVQLKTLAQAVMGHRASWHWLAAFAGPTWPCSSAESSYCAHLFPIVFLSVGVDEDICSSPWSNDLSMNQSRRLRVHFQLGSFSMDVQIYIPCLAVSKSPFGTLYILPVLAI	115146	273160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115995_116098_117327_117518_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133149_134023_134081_135251_135507_149146_149351_165477_165648_272661
934995	contig_3956_pilon	+	2027	10	Intergenic	novelGene_15137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1392.74938144168	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	943	1710	1288971	1290491	FALSE	50	AAATTTAAAATTAACGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281614	1290808	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283868_1283976_1284054_1284267_1284684_1284819_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
934996	contig_18850_pilon	-	1959	8	Intergenic	novelGene_142430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	1	345	181439	181095	TRUE	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVLERDLPPLLAGDLLRDLRRTGDRVLDLRLAGVLERDLPRRAGVLERDRRLVDVLDRDLRRAGVLDRDLPLRAGVLERDLPLVAGDRECDLPRLADLDLPLLWVFLLLDQPGR	181439	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177101_177565_177631_177996_178055_178214_178306_178947_179146_180513
934997	contig_3627_pilon	-	1936	11	Intergenic	novelGene_78572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGGGTCGGCGCTGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1344075	1313489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_-_1313652_1315433_1315527_1319933_1320014_1322839_1323216_1323351_1323423_1324677_1324987_1327427_1327534_1327914_1328055_1328373_1328557_1328797_1328879_1343740
935000	contig_12923_pilon	-	1438	9	Intergenic	novelGene_30064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	298.209972167263	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	421	1266	41	1306	64605	45465	FALSE	10	CTACTGATCTGTTTTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAYRNRRNKTTSIP	68224	45332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45506_51167_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196
935001	contig_20527_pilon	+	4091	2	Intergenic	novelGene_138605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	118	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	3538	3837	19245	19544	FALSE	25	TATGACTCTGTGGATCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHKYLHFFRPFRELCPHTSLSLIFQSSSFQVLMIQPNHWPQPMNKYTVTHLAISPSRQSDEQPGVLLEVLPIGGISLYHCPSGRSQKGAVVLSLSTIE	15662	19798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_17274_17318
935002	contig_14807_pilon	-	781	7	Intergenic	novelGene_124680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	9395	junction_1	4514.86303471348	171	34	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	40	684	39773	37247	FALSE	5	TGTCTGTGGTCTGCATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGRRPARCYRYCKNKPYPKSRFCRGVPDAKIRIFDLGRKKAKVDEFPLCGHMVSDEYEQLSSEALEAARICANKYMVKSCGKDGFHIRVRLHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAFGKPQGTVARVHIGQVIMSIRTKLQNKEHVIEALRRAKFKFPGRQKIHISKKWGFTKFNADEFEDMVAEKRLIPDGCGVKYIPNRGPLDKWRALHS	39917	37149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_-_37400_37485_37649_38298_38438_38632_38741_38827_38887_39750_39796_39900
935003	contig_17144_pilon	-	1044	6	Intergenic	novelGene_29413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2477.69316905867	1	54	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	221	666	300	965	179764	166152	FALSE	25	AGAAATTCTTGAGTGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183381	166072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166346_174889_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
935004	contig_11512_pilon	-	2156	7	Intergenic	novelGene_43347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1544.80891482841	2	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCTGTGTCTTTTTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	582776	554958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556376_556430_556826_573301_573392_576895_576942_580068_580156_581645_581707_582716
935005	contig_14970_pilon	+	1425	6	Intergenic	novelGene_45044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	6348	junction_2	3787.14275410896	2	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	34	105	620	724	231446	231550	FALSE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	188755	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_188830_191970_192205_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
935006	contig_19342_pilon	+	1640	1	Intergenic	novelGene_41134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	75	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCAGAATCCTGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5131	6771	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19342_pilon_+_5100_6800
935007	contig_13714_pilon	-	5867	2	Intergenic	novelGene_179107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	132	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	1256	2557	310363	309062	TRUE	25	CATTCCCCTTGAGAATGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIKTLNKIGVEGKFLSIIKAVYTKPTANIILNGETLKVFPLRTGTRQGCPLLPFLFNIVLEVLARAIRLEKEVKDIQIGREEVKISLFADDMILYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQISVAFLYTNKENLEEEITKSIPFTIVPKKIKYSGINLTREVKDLYNENYKTLLQETKRDLHKWKNITCSWIGRLSIVKMSILPKVIYRYNAILIQIPTTFFNEMEKQITNSIWKEKRPQISKALLKKNNQVGGFTLSDFRAYYTTTEVKIAWYWYNRYIDQWNRIENLDINSSTYEQLIFDKGLKSINWGKDSLFNKWCWHNWISICKKLKQDPYLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKIETMLGALIHGINIIRAISNNVPAPQERLDKWELLKIKLLCSSKDFTKRIKRQPIAWEKKFWLQQI	311618	248067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13714_pilon_-_249758_307441
935008	contig_3956_pilon	-	1693	7	Intergenic	novelGene_15241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	230	690	1002	1691	1289516	1284733	FALSE	30	CGTGGAGGCCAGACCCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSSHSALLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPAWSSSRSFRQISRCSSPAPAMMCSPDSSMMHCTMGSDLARRFRPSTSLGRSAGFLASTATLTTGLTLNFITRMLWACSKVVMVPVFTRPQVALTLGGELGHVHLSKLLQGEGP	1291005	1284730	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284809_1287364_1287533_1287965_1288061_1288898_1289228_1289494_1289675_1289756_1289891_1290296
935009	contig_10500_pilon	+	3760	6	Intergenic	novelGene_41282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	115	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGCCCCTAAGGTTCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626994	1637621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938
935010	contig_13740_pilon	-	3363	9	Intergenic	novelGene_34628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_8	4206.15783702894	1	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	118	357	203	559	161718	160897	TRUE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RVRFVFVRGDLSHLARLREIGLKRLSPRWREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIV	165327	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160899_161058_161270_161574_161722_161919_162029_165237
935011	contig_14970_pilon	-	1010	2	Intergenic	novelGene_45087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	71	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTGTTGTTTTGGTGTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232228	216632	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_216725_231310
935013	contig_15449_pilon	-	3555	13	Intergenic	novelGene_33597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	24	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGGTAACGCCAAGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55659	37059	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_38070_43215_43308_44640_44760_45019_45073_45573_45701_46861_46979_47158_47330_48215_48340_49160_49554_51103_51163_51250_51329_51808_51930_54568
935014	contig_5967_pilon	-	2254	10	Intergenic	novelGene_44376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	414.149582328909	2	118	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	213	642	605	1246	423985	388566	FALSE	40	GAACCAACAAATGTTTTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSHIPEFSLPLEYYLIPFLIIVGICLILIVIFMITKFVQDRHRARRNRLRKDQLKKLPVHKFKKGDEYDVCAICLDEYEDGDKLRILPCSHAYHCKCVDPWLTKTKKTCPVCKQKVVPSQGDSDSDTDSSQEENEVSEHTPLLRPLASVSTQSFGALSESRSHQNVTESSDYEEDDNEDTDSSDAENGINEHSVVVQLQPDGERDHNIANTV	517628	387557	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5967_pilon_-_388931_389224_389306_403376_403471_412498_412588_423972_424055_430708_430797_465406_465533_482468_482550_488455_488583_517515
935015	contig_14441_pilon	+	1428	5	Intergenic	novelGene_100598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	282.324281633727	2	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	262	789	600	1388	121136	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRMRQGRGRENSWRPFPLCYNEQYFGQGTRLTVVDNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	111201	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_120726_121239_125517_125902_126159_126283_126526
935016	contig_19402_pilon	+	4350	13	Intergenic	novelGene_80801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1276.33005516685	1	85	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	729	1463	83744	143056	TRUE	40	AAAAAGGACTGACTGTGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEVSAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	47361	146721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_47390_55279_55356_57523_57743_70439_70629_83527_83754_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_142957_143063_143802_144315_144352
935017	contig_1225_pilon	+	2486	4	Intergenic	novelGene_44150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	4	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	221	556	250814	274863	FALSE	10	TTCCACTCTGGCCTGGTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEQGTLEEESKHKKKGKSHVLRTH	250593	276793	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274357_274790
935018	contig_17074_pilon	+	2371	7	Intergenic	novelGene_145114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	270.245361765111	1	120	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	439	762	214186	223883	FALSE	50	TGAAAAATCACCATGAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSTSPDWFSIPHSLHSSGGLTQQHAHARIWCSSANIFPTSSLANKQLWWAEGSLHLAV	207920	225492	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213521_214105_214218_215061_215112_215404_215475_223711
935020	contig_20527_pilon	+	2238	7	Intergenic	novelGene_138546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1351.07283502983	12	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	124	870	23541	27453	TRUE	25	CTCTGTGAGTGACTAATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRSAAKLLAQVPRTRGQMNRSHLQDTEQAKASDLCQKVHLYWMQATPPRKLRFNRLATHRRSHHGGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	11085	29159	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_11135_23466_23740_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27638_27975
935021	contig_17144_pilon	-	1383	6	Intergenic	novelGene_29198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1661.62551737749	1	69	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	120	1088	170784	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	170903	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166808_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744
935022	contig_7119_pilon	+	2362	2	Intergenic	novelGene_40967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_1	0	3	60	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	58	1212	137033	139798	FALSE	25	ACTGATGGCTGAATCCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	136975	140948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707
935023	contig_17144_pilon	-	1666	10	Intergenic	novelGene_29558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1907.24071260092	1	51	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	716	1417	172736	166363	FALSE	10	TCCTGTAATTTTGGTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	175000	166113	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166457_168200_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173456_173580_173751_174572_174761_174876
935024	contig_6952_pilon	+	811	1	Intergenic	novelGene_173649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	30	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	303	509	811	385538	385840	NA	30	AGGCAGAGAGGGTTAGGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALTGNTTEPLMEQQKGGVQNSNSSKKTRLNGLTETGRTRKAWPLDSLSAQNQNNFRGQLFRQGLDWTVGHKLILVKGVPLSSSRYKRPKGQLLSGGEMG	385029	385840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6952_pilon_+_385000_385800
935025	contig_5020_pilon	-	1509	9	Intergenic	novelGene_27851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	593	940	124926	123330	TRUE	20	GCAGAGGGGTCAGCGGAGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARDVICHEISLQEGILDEVIGHQLSTVDNGITSNIGRGPFPESLKPFLPGNGLVGIHSALVSPATSSPGLSLEPDLHHIRRLGHSHSQGTCGAACQEAATDASIFRAFGVELLD	126085	118463	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_118564_119436_119571_122804_122910_122987_123035_123146_123362_124165_124361_124442_124544_124906_125090_125656
935026	contig_11512_pilon	-	2935	15	Intergenic	novelGene_43379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1151.91289220344	1	166	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	138	1259	609650	556654	FALSE	35	ATAAATTTGTAACTTTGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRELQDVDLAEVKPLVEKGEEQDIETLHGSIHVTLCGTPKGNRPVILTYHDIGMNHKTCYNPLFNSEDMQEITQHFAVCHVDAPGQQDGAASFPMGYMYPSMDQLAEMLPGVLHQFGLKSVIGMGTGAGAYVLTRFALNNPEMVEGLVLINVNPCAEGWMDWAASKISGWTQALPDMVVSHLFGKEEMHNNVEVVHTYRQHIVNDMNPTNLHLFINAYNSRRDLEIERPVPGTHTVTLQCPALLVVGDDSPAVDAVQVECNSKLDPTKTTLLKMADCGGLPQISQPAKLAEAFKYFVQGMGYMPSASMTRLMRSRTASGSSVTSLEGARSRSHTSEGARSRSHTSEGARLDVIPSSSTTGDSTGPKSMEVSC	622338	554977	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556866_561325_561378_566278_566315_567751_567803_570036_570089_571049_571107_573287_573392_576895_576953_580068_580156_581645_581707_582716_582780_586515_586637_592797_592904_609587_609669_622219
935027	contig_14441_pilon	-	774	4	Intergenic	novelGene_100743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	161	373	126577	125875	TRUE	25	TAGCACAGTGGGAAGGGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	126737	121194	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_121237_125515_125900_126157_126282_126513
935028	contig_12938_pilon	-	1548	8	Intergenic	novelGene_99694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAGAAGTGAAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86318	51940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12938_pilon_-_52044_78097_78179_79039_79228_80719_80795_81369_81459_83391_83468_84548_84632_85465
935029	contig_9484_pilon	+	1599	11	Intergenic	novelGene_105640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	578.440498236422	2	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	485	1458	7	1464	97198	104965	FALSE	5	GGTGGTGGTTTTCTGTAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLTLVFRRLRILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDAATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKIEPSKITKFETAFLSHVISQHQALLGTIRAEGKISEQSDAKLKEIVANFLAGFEA	97191	105100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_97228_98472_98611_100422_100564_100655_100823_101219_101369_101633_101756_101854_102080_103265_103374_103495_103641_104260_104412_104883
935032	scaffold_12124_pilon	+	2182	10	Intergenic	novelGene_22295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3637.21849701963	1	119	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1401	2051	1508755	1509405	FALSE	45	ATGAGAAATGATTCATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473583	1509536	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1502265_1502401_1506629_1506687_1508010
935033	contig_11338_pilon	-	1821	11	Intergenic	novelGene_6362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	256.520194136836	1	47	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	369	1110	300	1409	319426	295227	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSKFIMSAT	323315	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295251_300825_300893_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
935034	contig_9235_pilon	+	2784	3	Intergenic	novelGene_156224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	183	3	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	382	1149	272	1420	45805	46953	FALSE	35	GAAAGATCCCTTTGTGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGSTSIPLVKALRSSISDYVNYDIIIRHYNYTGKLNISADKDNGIKLTSVVFILICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYVANLLLSGATTYKLTPAQWFVREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNSFRSFLLISACWVISVILGGLPIMGWNCISMLSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIKIMSCCKCPSGDSTGKFKRPIIAGVEFSRSKSDNSSHPQKDDGDNPETIMSSGNVNSSS	45062	48317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_+_45110_45182_45246_45643
935035	contig_6206_pilon	-	826	1	Intergenic	novelGene_168151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	51	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGTACAACATTAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	135734	134908	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6206_pilon_-_134900_135700
935036	contig_18145_pilon	-	2385	13	Intergenic	novelGene_37360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	81	14	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCTCACAGTGGATCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	101266	92807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_-_92822_93350_93483_94905_95010_95953_96087_96162_96299_96653_96774_97173_97333_97423_97548_97822_98036_98229_98539_98824_98982_100325_100480_100636
935037	contig_11574_pilon	-	2050	9	Intergenic	novelGene_64092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	305.264613696052	1	68	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	475	1428	397	1824	454111	449890	FALSE	40	ACAGAAGTATGACTTAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFGSLKTMQIPEHLVAHTNSSSTGPFLEKRGYIPVPEQKSSSGTTAVPLSEWLLGSKPAQGHQAPYVPSTNPQDWLTQKQALDNSQTSPRAYNFFSNVWGNRKGLENWLLKSQQQEVPEKPSYQKSNSCFSTSSFSIEDKKVGDLEILGQDEVDLSHWLVTPQKPHKLEKPENGSCETSEKFKLLFQVFQEPYHVSDWLVKPDSCTSCQGNQPKGVEIENLSNLKCLNDHLEAKKPSSAPSMVPVDWLVQNLQEPYKVEEVCRANEPCTSFSECVCDENCEKEALCTWLLKKGGKDKNGMPVDPKPELEKLKDSLSMWLCPSRRETAEQAKASQAMAPSRIADSFQVIRNSPLSGWLIRPSCKEGSPKEVPITEDKADKQKLVSPMATSWCPFNTADWVLPRKNTGKLSQVSSGKDKWLLRKKAREVLLNSPLQEEGNFSADCYGLPAVCDLFACMQLKVDKEKWLYRTPLQM	473937	449663	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_-_449896_450250_450392_450808_451826_452780_452925_453434_453525_454081_454191_454477_454567_456375_456540_473873
935038	contig_6199_pilon	-	2150	1	Intergenic	novelGene_126341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	100	303	1836	2138	85033	84731	NA	35	ATAAAGAGACAGTGTGTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNHCKQRKDWFKVRKIGVNIRVIRKETNNRTHQNKKEKRKDSVNTKSTTVKKMKRKYIKKNDLAHKIYWNNETVSNTDTKDIQMTTLNSYLSIIMLNVN	86868	84718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6199_pilon_-_84700_86900
935039	contig_3956_pilon	+	1329	7	Intergenic	novelGene_14830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1562.83958976388	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	84	611	1281682	1288038	TRUE	25	TAAATTTGGTATGGTGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAEPPFSASSRSRASTSSRGLASCTWRSA	1281598	1290990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284103_1287958_1288077_1288874_1288912_1290347
935040	contig_9235_pilon	-	2430	2	Intergenic	novelGene_156233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	100	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1270	1608	46974	46636	FALSE	15	GGACCCCATGGTGCCCACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGWQLSVLGRRVDISRGHNGLWVVPIVLLGVGGVVRLTAAEFHSSNDGSFEFASRVSTGTLAAGHDFDEGPAHLLVGQSVNDGIGARIKHSQHQEVLRSEEDVTGLHLAAHI	48312	45813	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9235_pilon_-_47093_47161
935041	contig_16303_pilon	-	2120	6	Intergenic	novelGene_34039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	295.6	1	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	37	483	47976	38757	TRUE	35	CAGACATGATTGTCACAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILAMQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENAPTPSSSPMAVSSGTTVGPWGTGSMATTVMTT	48012	32065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33101_37135_37302_37424_37701_38596_38856_40449_40719_47897
935042	contig_17144_pilon	+	1078	5	Intergenic	novelGene_29206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	18	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTGTGGTCAGAGAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	166067	173206	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168002_173167
935045	contig_3956_pilon	+	2052	9	Intergenic	novelGene_15072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1311.20085703907	4	41	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	713	1528	1287419	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1284178_1287388_1287536_1287968_1288077_1289147_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935046	contig_15991_pilon	-	900	6	Intergenic	novelGene_70930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	6398	junction_3	647.402378741382	3	40	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	35	898	105108	100469	FALSE	25	AACCACCACCGAGTGGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSRNTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPRADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLRYVDIAIPCNNKGAHSVGLMWWMLAREVLRMRGTISREHPWEVMPDLYFYRDPEEIEKEEQAAAEKAVTKEEFQGEWTAPAPEFTAAQPEVADWSEGVQVPSVPIQQFPTEDWSAQPATEDWSAAPTAQATEWV	105142	100466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15991_pilon_-_100540_100882_101049_101159_101289_102024_102271_103583_103703_104975
935047	contig_9525_pilon	-	1414	1	Intergenic	novelGene_179250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGCCTGGTCAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1919	505	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9525_pilon_-_500_1900
935048	contig_10050_pilon	-	884	1	Intergenic	novelGene_119643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTTGTCTCTTCAGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	330527	329643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_-_329600_330500
935049	contig_5097_pilon	-	765	2	Intergenic	novelGene_178184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	38	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTGAGCATAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	163656	132776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5097_pilon_-_133477_163591
935051	contig_10500_pilon	+	1380	1	Intergenic	novelGene_41306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACTCTGTCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1638761	1640141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1638800_1640100
935052	contig_16103_pilon	-	2115	8	Intergenic	novelGene_118859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	4775	junction_1	2385.44639214465	2	114	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	57	689	743628	733331	TRUE	10	TCCCACCCTCTGACCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILSDKLKEAETRALNLLRDR	743684	722286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
935053	contig_19040_pilon	+	1028	2	Intergenic	novelGene_179251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	723	304	1026	368744	369466	FALSE	60	CAAGGAAAAAAATCAACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTATNLHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVAEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKIKGWKKIYQANSYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGTIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTALKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDLIDIYRTIHPTAAKYTFFSNAHGTFSRIDHILGHRAILNKIQNTEIIHSIFSDHNAIKVEINTRK	368120	369468	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19040_pilon_+_368221_368540
935054	contig_12677_pilon	-	261	1	Intergenic	novelGene_110835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGAACTAGGTGGCTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2881	2620	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2600_2900
935055	contig_6445_pilon	-	1466	14	Intergenic	novelGene_76957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	836.924717192963	2	52	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	762	1247	64875	43105	FALSE	55	ATTAAAAAAGATACATTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	89714	42885	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64937_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88465_88594_89656
935056	contig_6302_pilon	-	2379	2	Intergenic	novelGene_171685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTTTTATATATGTCATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	89728	40254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6302_pilon_-_41686_88780
935057	contig_5217_pilon	-	644	5	Intergenic	novelGene_135780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3834.41371007355	3	24	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	228	632	559890	557689	FALSE	25	CCCATCTTAGCACATGTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSWDARLPTLRSNNELVRTKTLVKNCIVLVDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISSLLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKGK	560391	557676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5217_pilon_-_557799_558299_558430_558674_558808_559858_560095_560368
935058	contig_6710_pilon	-	562	2	Intergenic	novelGene_92106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7744	junction_1	0	51	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	2	355	657505	653562	FALSE	0	CCTGTGGTTTTGCTCTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFGGGTKVDIKRADAKPTVFIFPPSLEQLGTASASVVCIVNEFYPRDITLKWKVDNADQTKNFQNSFTEQDSKGTYSLSSTLTIPSTEYKSHSRYSCEVTHKTLSSPIVESFIRDEC	657506	653354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6710_pilon_-_653882_657471
935059	contig_4105_pilon	+	1182	9	Intergenic	novelGene_21506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTGTATCTGTTTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100046	114315	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4105_pilon_+_100234_100868_100941_101402_101430_102726_102927_104164_104264_105789_106014_108691_108870_108973_109093_114239
935060	scaffold_12124_pilon	+	1892	8	Intergenic	novelGene_22312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3181.74649768177	1	71	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	98	475	1490385	1508039	FALSE	25	TAGGGTCACATGTATACTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473605	1509456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473677_1490358_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
935062	contig_854_pilon	+	2347	17	Intergenic	novelGene_36597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	2174.65691259564	2	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	604	1815	6	1820	1683971	1702631	TRUE	15	TGGTGCTGCCCAGTGACACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKRRPRPMRPRSRR	1683965	1705441	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700860_1702591_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285
935063	contig_3747_pilon	+	1829	4	Intergenic	novelGene_24954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_3	1653.18467073572	8	16	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	200	451	203322	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	203021	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203128_203228_203386_203498_203651_203768
935064	contig_5125_pilon	+	2166	6	Intergenic	novelGene_43449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2348	junction_1	715.896919954263	2	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	11	1069	35729	58893	FALSE	10	TGTTTGTATCTGACTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAQMWKVNVRKMPTNQNVSPSQRDEVIQWLVKLKYQFNLYPETFALASSLLDRFLATVKAHPKYLSCIAISCFFLAAKTVEEDERIPVLKVLARDSFCGCSSSEILRMERIILDKLNWDLHTATPLDFLHIFHAIAVSTRPQLLFSLPKLSPSQHLAALTKQLLHCMACNQLLQFKGSMLALAMISLEMEKLIPDWLPLTIELLQKAQMDSSQLIHCRELVAHHLSTLQSSLPLNSVYVYRPLKHTLVTCDKGAFRLHSSSVPGADFYKDSSKPEVPVRGTAASYHHLPAASGCKHTSAKRKVEEMEVDDFYDGIKRLYNEDSASENVGSVCGTDLSRQEGHASPCPPLQPVSVM	35718	59990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5125_pilon_+_35768_49981_50111_53632_53708_53842_53984_54293_54525_58449
935065	contig_10958_pilon	-	1380	2	Intergenic	novelGene_5472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACAACTATCTTCTTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	901299	895317	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10958_pilon_-_895852_900453
935066	contig_17936_pilon	+	2206	10	Intergenic	novelGene_29957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	880.965505693737	1	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	250	1347	79133	121021	TRUE	20	CCAGCCTAGTGTCTTGAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLRSNTYDLQESNVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	69112	126584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_69333_79103_79300_90973_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114922_118635_118827_121017_121063_125766
935067	contig_8330_pilon	+	1453	7	Intergenic	novelGene_71817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	716.402296199559	2	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	28	789	852673	857151	FALSE	5	GCCCAGCCTTGGCGCTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QAHGSPPEKMSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKDVVPRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAATRPSFLQLREQLEHIKTHELHL	852645	857815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855316_856977
935068	contig_11285_pilon	-	1145	10	Intergenic	novelGene_5710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	417.89111937719	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	643	963	786112	784252	FALSE	15	AAGCCCCCCTCCGCCAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTVLALAWLPSLRQRPLDQFILQSHASFNVSALPYAVPALSLPRGEALVQTQLLRVLEERDIPIWWILVGVLGGLLLLTLLVLAMWKVGFFKRNRPPLEEEDEEE	789964	784069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787431_787533_787625_789184_789282_789440_789509_789926
935069	contig_11285_pilon	+	1774	17	Intergenic	novelGene_5673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	1358	1738	789939	790626	FALSE	20	AGGCTGAGCTCTGATGGGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFSMQHKSRCQSSLLRLQGHVEAEHNGAQLVPEVSLIPKEGLGGVADRAVLPAQVQAQGGARLLRGQQQHPPALAWLLPVQLQLSIQVQLFRNVVPGGSHTYLDVEAAHCCAGLGQDTILHSRIQ	784061	790662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_784120_784200_784307_785381_785505_785707_785813_786071_786185_787045_787170_787282_787431_787533_787621_787742_787832_788124_788208_788488_788581_789132_789284_789442_789509_789926_790052_790181_790335_790427_790487_790570
935070	contig_7207_pilon	-	1216	6	Intergenic	novelGene_72083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	212.148627146159	1	30	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	891	326	1216	696514	671681	FALSE	70	AAGAAAGATGAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANNSVSYGGVKNSLKEANHDGDFGITLAELRALMELRSTDALRKIQESYGDVYGICTKLKTSPNEGLSGNPADIERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIVSLGLSFYQPPEGDNALCGEVSVGEEEGEGEAGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSVGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEE	758470	671680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7207_pilon_-_671794_675717_675844_675937_676193_686423_686622_696315_696746_758376
935071	contig_5020_pilon	+	1104	6	Intergenic	novelGene_27860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1296.37179852078	13	21	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTCTCCTCCCTCTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	118466	126085	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119576_124209_124363_124444_124551_124909_125091_125657
935072	contig_14744_pilon	-	2996	1	Intergenic	novelGene_65920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	59	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	118	357	990	1346	121659	121303	NA	20	CCTCAGGAACCATGGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSILPKAIYRYNAIPIQIPRAFFKKMEKQITNFIWKGKRPRISKAPLKKKNKVGGLTLPDFRTYYTATVVKTAWYWYNNKYIDQWNRIENTDINSSTYEQLIFDKGPKSINWGKRQPL	122648	119652	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_119700_122600
935073	contig_2933_pilon	-	2093	1	Intergenic	novelGene_111326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	53	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	125	378	1172	1549	517578	517201	NA	75	AAGAAAGAAAAGAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTALGKSAAKDLFKVLKSKYVTLRTKVCLTQAVVFSIASHACESWTMSKEDQRRIDAFESWCWQRTLNIPWTAKRKNKPVLEELQPKCSLETRMARLCLIYFVRVIRRDQSLEKDIKIGKVEGQ	518749	516656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2933_pilon_-_516700_518700
935075	contig_5686_pilon	-	1173	4	Intergenic	novelGene_45288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCAGTCTAGGCAGCAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	172675	93831	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_93901_170213_170341_171641_172228_172284
935076	contig_10973_pilon	+	850	1	Intergenic	novelGene_150348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTAAGCTGTGGATGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1534	2384	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10973_pilon_+_1500_2400
935077	contig_16303_pilon	-	3403	8	Intergenic	novelGene_34088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	719.336400540705	16	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	58	1098	45428	35759	TRUE	10	TCCACTTGTGGTATTTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVWALLVQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	45485	33134	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_33863_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_38579_38856_40433_40714_45404
935078	contig_299_pilon	+	2664	2	Intergenic	novelGene_129472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	151	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAAGTGTTTGAGCGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1298218	1301138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_299_pilon_+_1299781_1300036
935079	contig_854_pilon	+	3393	16	Intergenic	novelGene_36682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3928.25015270441	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	548	1647	723	2369	1706758	1714980	FALSE	40	AATGATAGAATTCCAAGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELDEEQSNTELVNDRLKKANLQIDQINTDLNLERSNAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIAALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRAEKKLKDVMLQVDDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDCSDEEVDGKADGAEAKTAE	1702074	1716004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1702159_1702528_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705441_1706748_1706998_1709122_1709336_1709640_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711879_1712278_1712488_1713084_1713194_1713308_1713482_1714862
935080	contig_5727_pilon	+	1512	13	Intergenic	novelGene_7938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1128.44460308082	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	672	841	1512	173359	175498	FALSE	25	CAGAGTCAGGGACTCTTATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGNIKFIGELGKLDLIHESILHKCIKTLLEKKKRVQLKDMGEDLECLCQIMRTSLMDQYFARMCSLMLSKELPARIRFLLQDTVELREHHWVPRKAFLDNGPKTINQIRQDAVKDLGVFIPAPMAQGMRSDFFLEGPFMPPRMKMDRDPLGGLADMFGQMPGSGIGTGPGVIQDRFSPTMGRHRSNQLFNGHGGHIMPPTQSQFGEMGGKFMKSQGLSQLYHN	168146	175498	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5727_pilon_+_168388_169833_169952_171210_171329_171891_171995_172577_172703_172797_172865_173290_173443_173717_173796_174030_174115_174203_174303_174721_174864_174960_175122_175474
935081	contig_10058_pilon	+	1704	9	Intergenic	novelGene_67728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	155.843621540954	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	275	828	61	888	72602	99377	TRUE	35	ATTGGGCAGACCCATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILCPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESNTGLQVRR	72541	100326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99352_99411_99543
935082	contig_3747_pilon	+	1800	4	Intergenic	novelGene_24956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_3	1653.18467073572	1	25	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	171	422	203322	203804	FALSE	55	ATAAATAAATTTTAAATGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	203050	205182	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_203128_203228_203386_203498_203651_203768
935083	contig_1225_pilon	+	2790	3	Intergenic	novelGene_44189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	90	junction_1	274	1	105	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	251392	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_251504_253416_253520_274222
935084	contig_6898_pilon	+	3875	12	Intergenic	novelGene_35732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2281.07589520152	4	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	609	1817	114654	125646	FALSE	15	TACTGTGACTTGATCTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLRETHLQEDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERALLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQNEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASQDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59653	127704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113067_114251_114680_116671_116819_117865_117963_119612_119777_122611_122743_122983_123145_124370_124464_124782_125008_125481
935085	contig_7119_pilon	-	2457	3	Intergenic	novelGene_40928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	126	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1315	2061	139626	138880	TRUE	10	AGCCCTGCTGTGGCGTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140940	127497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137096_138706
935086	contig_10106_pilon	-	2547	6	Intergenic	novelGene_73898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	129	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAGGGAAGAGGGAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	174572	165992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10106_pilon_-_166153_167025_167128_168796_168850_169392_169463_170993_171088_172504
935087	contig_3956_pilon	+	1446	6	Intergenic	novelGene_15037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1797.90518103709	1	57	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	280	843	81	923	1281682	1290491	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282856_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284829_1290347
935088	contig_3602_pilon	+	2832	2	Intergenic	novelGene_60605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	180	junction_1	0	1	125	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	351	1056	35	1090	902032	913188	FALSE	40	ACAAAATTAATTGTGTGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPSTESPGDPNMDTMNTNITDYYDYDDTTLYPEEPVDGPRKPLKMETLDTIALFIFTLVFLVGVPGNALVVWVTGSEARRAINAIWFLNLAVADLLSCLALPILFTSIILHSHWPFGDAACRILPSLILLNMYASILLLAAISADRFLLVFNPIWCQNFRGARLAWTACGVAWVLALLLTIPSFLYRVVNVEHYPVKFICGLNYSRDKHKEVMVASVRLIVGFLCPLIILSVCYTFLLLRSWSRKATRSMKTLKVVVAVVSSFFVFWLPYQVTGMLLALHDSDSEIFRKVKRMDALCISLAYINCCINPIIYVVAGKGFHTLYRKSLRSILRNVLTEDSVGRESKSFTRSTVDTTTEKTEAV	901997	914930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3602_pilon_+_902035_912135
935089	contig_14807_pilon	+	625	6	Intergenic	novelGene_124698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	187	579	37341	38886	FALSE	55	TGCAACGAAATAGAAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNSSALNLVKPHFLEMWIFWRPGNLNLALRRASITCSLFWSLVRMDMMTWPMWTLATVPWGFPKAPRIPVCSPVSPSTGQHLVDADDMEGMEPHSDVKAVFASKMRILASGTPRQKRDLGYGLFLQYR	37154	39796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14807_pilon_+_37400_37485_37645_38293_38387_38717_38744_38830_38887_39750
935090	contig_16303_pilon	-	2137	8	Intergenic	novelGene_34112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	735.581097514345	1	112	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	183	947	40611	37221	TRUE	35	TAGGCTACTAGACTGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAGPHTLQFTYGCELRDDGGTMGHWQYGYDGNDYLSLDMDLLQYTAVSFIARYTKQKWEASGNSIKRDKAYLEKECIWWLQRYLECGRERLTRTEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWAWVLELWSLQL	47960	33180	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33545_35036_35764_35980_36029_37169_37256_37424_37701_38579_38856_40433_40731_47897
935091	contig_3956_pilon	+	2244	9	Intergenic	novelGene_15218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1290.67317101387	1	103	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	958	1725	1288971	1290491	FALSE	15	CTGTGTGGAGCCTACGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1283827	1291010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1283976_1284068_1284245_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288063_1288886_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935092	contig_7119_pilon	-	2431	3	Intergenic	novelGene_40953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	117	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1324	2070	139626	138880	TRUE	30	AGACCTAGCCCATGCCACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140949	127531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127602_136977_137096_138706
935093	contig_3956_pilon	+	2889	15	Intergenic	novelGene_15106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1440.17421706896	2	53	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	542	1629	915	2543	1285728	1290665	FALSE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGNGRQPWVGLGQCVSTAPRHHVLLTPGDVTPARLPFRVASGTTLCHRPNIHT	1281605	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283865_1283976_1284054_1284267_1284684_1284870_1285074_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289896_1290511
935094	contig_10246_pilon	-	2492	8	Intergenic	novelGene_46911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	127	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAATGCACAGTCCCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	186141	144753	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10246_pilon_-_144805_148216_148335_168073_168273_169670_169780_171153_171291_175052_175210_176319_176381_184481
935095	contig_3956_pilon	+	1806	8	Intergenic	novelGene_14932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1299.54992208841	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	703	1470	1288971	1290491	FALSE	30	TAAAAGGTTTATTTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1284000_1287944_1288077_1288904_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935096	contig_10749_pilon	-	1381	14	Intergenic	novelGene_133460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1261.84827809174	2	46	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	201	606	636	1241	150667	136250	FALSE	30	GATTTTTTAATTAAAGCGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLETLSQSPPKGVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIPQPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS	160008	136109	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10749_pilon_-_136287_142194_142365_143587_143644_144588_144628_145189_145263_146512_146555_147655_147749_149595_149683_150658_150786_151767_151900_153558_153676_154232_154266_155154_155324_159942
935097	contig_3956_pilon	+	1581	6	Intergenic	novelGene_14955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1122.2430396309	2	39	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	81	1070	1281682	1290491	FALSE	10	GGTGGTGACTGTGTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVPFQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1287953_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935098	contig_3948_pilon	-	1478	6	Intergenic	novelGene_53225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	307.058691458164	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	465	81	545	866424	840803	FALSE	30	AAAGTTTTCTGCTTAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCNYDGKDYDPVAARQGQETAMAPSLVAPALSKPKKPVSTSSAAPQRPISTQRTTAASKAGPGVVRKNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLKLTVEDLEKERDFYFGKLRNIELICQENEGENDPVLQRIVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY	869596	839869	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_840860_842501_842655_847881_848004_852427_852552_866415_866480_869571
935101	scaffold_2602_pilon	+	1284	13	Intergenic	novelGene_127696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	620.257518204245	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	409	726	47545	55116	TRUE	45	AGACAGAGAGCGAGATAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKERKRARGISPIVFDRSGSSASESYAGSEKKHEKLSSSVRAVRKDQTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNAAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGGSPIHWVLPAGMNAKMLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKMRHKRRMHSQPRSRGRPSRREPVRDVGRFAYS	44023	68718	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_2602_pilon_+_44106_44561_44616_45179_45275_47172_47282_47476_47595_52863_52949_54040_54208_55100_55203_56687_56771_58068_58133_58241_58309_65346_65480_68593
935102	contig_13097_pilon	+	2067	16	Intergenic	novelGene_107708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	579.516863909546	1	90	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	345	1038	193	1230	184733	243870	TRUE	55	CAAGAAAGAATATGAATGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAGEVERLVSELSGGTGGDEEEEWLYGDENEVERPEEENASANPPSGIEDETTENGVPKPKVTETEDDSDSDSDDDEDDVHVTIGDIKTGGPQYGSYGTAPVNLNIKTGGRVYGTTGTKVKGVDLDAPGSINGVPLLEVDLDSFEDKPWRKPGADLSDYFNYGFNEDTWKAYCEKQKRIRMGLEVIPVTSTTNKITQGRTGNSEKETALPSTKAEFTSPPSLFKTGLPPSSTSSQSQTSTASRKANSSVGKWQDRYGRAESPDLRRLSGAIDVIGQTITISRVEGRRRANENSNIQVLSERSATEVDNNFSKPPPFFPPGAPPTHLPPPPFLPPPPTLSTFFIF	184540	264607	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_184818_186124_186165_190439_190498_191575_191680_195137_195203_195749_195858_196264_196396_205980_206085_215279_215382_225265_225360_226996_227120_243846_243939_245488_245545_253986_254201_263407_263546_264246
935104	contig_3747_pilon	+	2886	8	Intergenic	novelGene_24841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4080.16704339918	2	131	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	246	741	755	1495	202422	203804	FALSE	45	AAATGACAAAATGTTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	200985	205195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202198_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
935105	contig_3155_pilon	+	1813	3	Intergenic	novelGene_26419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1141	junction_2	718.5	2	110	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	170	496	259780	261211	FALSE	35	TAAAGTGATGAAGTTGCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	259207	262528	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_259329_259731_259978_261082
935106	contig_3747_pilon	+	2139	8	Intergenic	novelGene_24787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	4586.5556593512	3	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	330	749	201313	203229	TRUE	50	AGATATTCTTTGTAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGSRRSGLPFWAATSFELNTPY	200983	205160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202343_203064_203128_203228_203386_203498_203651_203768_203946_204255
935107	contig_10599_pilon	+	2454	8	Intergenic	novelGene_49872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1073.345960546	1	118	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	721	1161	154203	163915	FALSE	45	TATTAACAAATGGCAAGTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGADVVSKFLNRHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGGMMSVDETLMCSFQILKPSEKKAKYQYGGLNSGRPVTPPRTANPPKKR	123325	165208	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10599_pilon_+_123571_146885_147018_148809_149034_150905_151002_154179_154252_158529_158682_161352_161488_163810
935108	contig_14970_pilon	+	2080	10	Intergenic	novelGene_44997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5939.23479919762	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	115	630	136145	192069	TRUE	5	CTCTTTGTGCTGTGATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTLLLTVMAPATPRKENTEPTLKTSIPATLQTMT	136030	232251	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188808_191970_192205_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224366_231345
935109	contig_8377_pilon	+	1044	11	Intergenic	novelGene_35006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	33	junction_4	3193.43618849665	1	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	99	419	68257	164429	TRUE	30	AATGCCAGCTACATTGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMYLWLKLLAFGFVFLDMGVLVTDSQLTSTAPSTLDNSISADRTMNLTTAATTPAKESCDKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQEPSCYPGIR	68158	177489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136291_136373_137710_137738_140774_140880_164394_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430
935110	contig_9484_pilon	-	1384	10	Intergenic	novelGene_105646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	65	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	330	1053	1382	101227	98589	FALSE	20	CATTTCCTCTGCTTGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFYFKITKLSTALMPVCIGSRTEILGMIPGAFSPTRLRFLEPIGPFPSMALPSASTTRPSSSSPTGTSTMAPVLFTISPSLISLSFPNTTTPTLSGSKFRDIPFNPEENS	105072	98586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_-_98609_100387_100562_100653_100773_101210_101356_101593_101754_101849_102080_103268_103334_103506_103641_104260_104417_104893
935111	contig_7045_pilon	-	750	1	Intergenic	novelGene_77473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	39	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTGCAGTTCTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	382354	381604	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7045_pilon_-_381600_382400
935112	contig_10404_pilon	+	1242	7	Intergenic	novelGene_138675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2938.29060282789	2	65	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	178	612	1089653	1099854	FALSE	15	CTGTTGCTCGGAATCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTQKTADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQSLYK	1087865	1100484	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10404_pilon_+_1087960_1089569_1089668_1091654_1091686_1097965_1098110_1098197_1098305_1098722_1098846_1099839
935113	contig_17144_pilon	-	1578	8	Intergenic	novelGene_29252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2603.94806995462	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	77	679	179764	167373	TRUE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGLGTWSLTRVVLIVLLLPGSLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYLGPG	181849	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167377_167918_167929_174656_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
935114	contig_13740_pilon	-	3243	8	Intergenic	novelGene_34636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	97	junction_5	3606.01714824949	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	498	863	160838	157474	FALSE	25	TACTTGGTGTAATGTTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165411	155093	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161574_161722_161919_162031_165237
935115	contig_3956_pilon	+	1966	12	Intergenic	novelGene_15129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1616.39851174156	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	491	1476	70	1545	1281682	1290491	FALSE	45	GGACAGAAACTAGAAGGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCSTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFDLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281612	1290912	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284221_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286138_1289140_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290309
935116	contig_5041_pilon	-	955	8	Intergenic	novelGene_27071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	556.743849796039	1	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	115	528	569991	532113	TRUE	30	TCATCCTAATAGTCTCACGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLQDEKTKCNKYADELAKMELKWKEQVKIAESVKLELAEVEDNYKLQLAEKDKEINGLTSHLDNLSREKMEKMLLFIQMKFRGHLLEYTPGDWKTMLSAASLLETLVGLMS	570918	525074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525182_525440_525658_526413_526497_532092_532242_554550_554623_565859_565986_569904_570009_570821
935117	contig_11253_pilon	-	840	2	Intergenic	novelGene_126818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTATTTAAACACGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	56049	54841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11253_pilon_-_55566_55933
935118	contig_7009_pilon	+	3259	3	Intergenic	novelGene_23672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGTTCCAGCAATAATGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	537065	540497	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_+_537874_537924_538365_538486
935119	contig_17144_pilon	+	1793	9	Intergenic	novelGene_29208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	901	1218	167621	168283	TRUE	30	TGTGGTCAGAGAGAGAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKSRRANRPRRMCSSDSSGGQGHQGEACIVGGPAPAGGHEVNMIQAGRLQATEDKVPGRGIQDGGERLLLSLGPEDGIVCKGALPQLRGLRHPLQLGPGLANVL	166067	173209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166838_167239_167331_167581_167681_167922_168060_168162_168307_168995_169099_170744_170928_172554_172742_173130
935120	contig_20602_pilon	-	1632	10	Intergenic	novelGene_133718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	313.64279438421	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	163	492	796	1287	19264	10026	FALSE	15	TCTTATTTTTTTTTTTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCKPIFSKIVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTKIDPTLCRADRMVGQVLGAVGALPEIFTELEISYFLLRRLLGVRTEGDKKAAKVQKLSKNEVLMVNIGSLSTGGRVSAVKADLGKIVLTNPVCTEVGEKIALSRRVEKHWRLIGWGQIRRGVTIKPTVDDD	29562	9680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20602_pilon_-_10090_13343_13517_17104_17275_19179_19325_19759_19817_23493_23590_24914_25010_26213_26558_28884_28949_29483
935122	contig_19402_pilon	+	3989	12	Intergenic	novelGene_80803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1532.34716520466	2	142	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	219	1067	70444	138603	TRUE	30	GCATTTTTCAATAAACTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGSC	57521	146693	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_57724_70427_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_107511_107689_138594_138663_139815_139897_142957_143063_143802_145942_146155
935123	contig_15047_pilon	+	1424	7	Intergenic	novelGene_52149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2857.07685211457	8	88	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	27	962	2194	4686	TRUE	30	CCGGAGAACCTTCCAGAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLNPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPADITLTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVAPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLFVGAVVAAVVIWRKKSSGRDGSRV	2167	21646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4235_4434_4552_4687_21013_21062_21232
935124	contig_854_pilon	+	2640	13	Intergenic	novelGene_36571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1985.12285514021	1	126	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	415	1248	272	1519	1679334	1715205	FALSE	20	GTTGCAGCTGTCACCACTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETCILKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQSPFSSTPSPPPRI	1677580	1716326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1677609_1678131_1678204_1678760_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1715165
935125	contig_8674_pilon	+	3379	1	Intergenic	novelGene_102906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	38	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	117	354	298	651	173785	174138	NA	0	CGCGGTTGTTCTGTCTCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALWSEKILCIISVFWILLRVALWPKMWSVLENVPWALEKNVYFAAVGYSVLYMSMRLSWLIVSFRSSVSLLSFFLDVLSFTESGVLKSPTITVELSISLSVLLELFMYFGALSLGV	173487	176866	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8674_pilon_+_173500_176900
935126	contig_3956_pilon	+	1920	8	Intergenic	novelGene_15149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1102.51984109131	2	52	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	750	1517	1288971	1290491	FALSE	15	GGGTAGACATTTCTCTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281630	1290894	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284198_1288815_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935127	contig_7357_pilon	-	3537	3	Intergenic	novelGene_36922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	138	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTGCAGTGTTGCAGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	589279	583409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_584081_584327_584486_586571
935128	contig_1225_pilon	+	1916	1	Intergenic	novelGene_44207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTCTGGCCTGGTATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274878	276794	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_274900_276800
935129	contig_3956_pilon	+	1543	11	Intergenic	novelGene_15188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1508.84636726209	1	64	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	179	1345	1284838	1290816	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGITEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPHACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1282718	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282872_1284812_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286416_1289091_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290347_1290542
935130	contig_10217_pilon	-	1460	10	Intergenic	novelGene_87414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	551	junction_1	422.566088044737	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	352	1059	134	1192	130155	109341	FALSE	95	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGIKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQSGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVERSREKIQKHVSSTSSSFLEV	130288	109072	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10217_pilon_